JP2021524852A - 抗muc1抗体−薬物コンジュゲート - Google Patents
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Abstract
Description
(i)配列番号1のアミノ酸配列を有する相補性決定領域(CDR)CDR−H1、配列番号2のアミノ酸配列を有するCDR−H2、および配列番号3のアミノ酸配列を有するCDR−H3を含む重鎖可変領域、ならびに
(ii)配列番号4のアミノ酸配列を有する相補性決定領域(CDR)CDR−L1、配列番号5のアミノ酸配列を有するCDR−L2、および配列番号6のアミノ酸配列を有するCDR−L3を含む軽鎖可変領域
を含む、コンジュゲートに関する。
本明細書で使用される場合、以下の表現は、一般に、それらが使用される状況が別様に示す場合を除いて、好ましくは、下記に示されているような意味を有することが意図されている。
(i)配列番号1のアミノ酸配列を有する相補性決定領域(CDR)CDR−H1、配列番号2のアミノ酸配列を有するCDR−H2、および配列番号3のアミノ酸配列を有するCDR−H3を含む重鎖可変領域、ならびに
(ii)配列番号4のアミノ酸配列を有する相補性決定領域(CDR)CDR−L1、配列番号5のアミノ酸配列を有するCDR−L2、および配列番号6のアミノ酸配列を有するCDR−L3を含む軽鎖可変領域
を含む、コンジュゲートを提供する。
抗体は、MUC1のエピトープと特異的に結合する。エピトープは、MUC1の細胞外タンデムリピートにある。ある特定の実施形態では、抗体は、グリコシル化依存的様式でMUC1に結合する。特に、抗体は、前記タンデムリピートのトレオニン残基が、N−アセチルガラクトサミン(Tn)、シアリルα2−6N−アセチルガラクトサミン(sTn)、ガラクトースβ1−3N−アセチルガラクトサミン(TF)、またはガラクトースβ1−3(シアリルα2−6)N−アセチルガラクトサミン(sTF)で、好ましくはTnまたはTFでグリコシル化されている場合、より強力に結合する。好ましくは、炭水化物部分は、α−O−グリコシド結合によりトレオニン残基に結合されている。MUC1のタンデムリピートドメインにあるエピトープは、特に、アミノ酸配列PDTR(配列番号13)またはPESR(配列番号14)を含む。このエピトープに対する結合は、好ましくは、上記に記載のようにグリコシル化依存性であり、特に、上記に記載の炭水化物部分が、配列PDTRまたはPESR(配列番号13および14)のトレオニン残基にそれぞれ付着されている場合、結合が増加する。
MUC1に結合することが可能な抗体は、配列番号1のアミノ酸配列を有する相補性決定領域(CDR)CDR−H1、配列番号2のアミノ酸配列を有するCDR−H2、および配列番号3のアミノ酸配列を有するCDR−H3を含む重鎖可変領域、ならびに配列番号4のアミノ酸配列を有する相補性決定領域(CDR)CDR−L1、アミノ酸配列5を有するCDR−L2、配列番号6のアミノ酸配列を有するCDR−L3を含む軽鎖可変領域を含む。
抗MUC1抗体は、1つまたは複数の抗体重鎖にCH2ドメインを含んでいてもよい。IgG型の天然ヒト抗体は、CH2ドメインにN−グリコシル化部位を含む。抗体に存在するCH2ドメインは、N−グリコシル化部位を含んでいてもよく、または含んでいなくともよい。ある特定の実施形態では、抗体は、CH2ドメインにグリコシル化部位を含まない。特に、抗体は、IMGT/Eu付番方式による297位に対応する重鎖の位置にアスパラギン残基を含まない。例えば、抗体は、重鎖にAla297突然変異を含んでいてもよい。こうした実施形態では、抗体は、好ましくは、Fcγ受容体に結合することにより抗体依存性細胞性細胞傷害(ADCC)および/または抗体依存性細胞性ファゴサイトーシス(ADCP)および/または補体依存性細胞傷害(CDC)を誘導する能力が強力に低減されているかまたは完全に欠如されている。この点で、能力の強力な低減は、特に、そのCH2ドメインにN−グリコシル化部位を含み、ヒト細胞株またはCHO細胞株で産生することにより得ることができるグリコシル化パターン、例えば本明細書に記載のようなグリコシル化パターンなどの一般的な哺乳動物グリコシル化パターンを有する同じ抗体と比較して、10%もしくはそれよりも低い、特に3%もしくはそれよりも低い、1%もしくはそれよりも低い、または0.1%もしくはそれよりも低い活性への低減を指す。こうした実施形態では、抗体は、特にIgG1型抗体である。
Asn−GlcNAc−GlcNAc−Man−(Man−GlcNAc)2
を含み、式中、Asnは、抗体のポリペプチド部分のアスパラギン残基であり、GlcNAcは、N−アセチルグルコサミンであり、Manは、マンノースである、二分岐複合型N−連結炭水化物構造である。末端GlcNAc残基は、ガラクトース残基をさらに保持してもよく、ガラクトース残基は、任意選択でシアル酸残基を保持してもよい。さらなるGlcNAc残基(二分GlcNAcと称される)が、ポリペプチドに最も近いManに付着されていてもよい。Asnに付着されているGlcNAcにフコースが結合していてもよい。こうした実施形態では、抗体は、特にIgG1型抗体である。
抗体は、好ましくは、宿主細胞にて組換え的に産生される。抗体の産生に使用される宿主細胞は、抗体産生に使用することができる任意の宿主細胞であってもよい。好適な宿主細胞は、特に、真核生物宿主細胞、特に哺乳類宿主細胞である。例示的な宿主細胞としては、ピキア・パストリス(Pichia pastoris)細胞株などの酵母細胞、SF9およびSF21細胞株などの昆虫細胞、植物細胞、EB66アヒル細胞株などのトリ細胞、CHO、NS0、SP2/0、およびYB2/0細胞株などのげっ歯動物細胞、ならびにHEK293、PER.C6、CAP、CAP−T、AGE1.HN、Mutz−3、およびKG1細胞株などのヒト細胞が挙げられる。
本発明によると、抗体は、1つまたは複数の細胞傷害剤にコンジュゲートされている。細胞傷害剤は、抗体とのコンジュゲーションに好適な任意の細胞傷害剤であってもよい。1つよりも多くの細胞傷害剤が抗体に存在する場合、こうした細胞傷害剤は、同一であってもよくまたは異なっていてもよく、特にすべて同一である。細胞傷害剤と抗体とのコンジュゲーションは、当技術分野で公知の任意の方法を使用して達成することができる。細胞傷害剤は、特に融合または化学カップリングにより共有結合で、または非共有結合で抗体に付着されていてもよい。ある特定の実施形態では、細胞傷害剤は、特にリンカー部分を介して共有結合で抗体に付着されている。リンカー部分は、細胞傷害剤を抗体に付着させるのに好適な任意の化学的実体であってもよい。
(a)-(Succinimid-3-yl-N)-CH2CH2-C(=O)-GGFG-NH-CH2CH2CH2-C(=O)-,
(b)-(Succinimid-3-yl-N)-CH2CH2CH2CH2CH2-C(=O)-GGFG-NH-CH2CH2CH2-C(=O)-,
(c)-(Succinimid-3-yl-N)-CH2CH2CH2CH2CH2-C(=O)-GGFG-NH-CH2-O-CH2-C(=O)-,
(d)-(Succinimid-3-yl-N)-CH2CH2CH2CH2CH2-C(=O)-GGFG-NH-CH2CH2-O-CH2-C(=O)-,
(e)-(Succinimid-3-yl-N)-CH2CH2-C(=O)-NH-CH2CH2O-CH2CH2O-CH2CH2-C(=O)-GGFG-NH-CH2CH2CH2-C(=O)-, および
(f)-(Succinimid-3-yl-N)-CH2CH2-C(=O)-NH-CH2CH2O-CH2CH2O-CH2CH2O- CH2CH2O-CH2CH2-C(=O)-GGFG-NH-CH2CH2CH2-C(=O)-
のいずれかにより表される構造が挙げられ、式中、-(Succinimid-3-yl-N)-は、以下の式:
(a)-(Succinimid-3-yl-N)-CH2CH2CH2CH2CH2-C(=O)-GGFG-NH-CH2-O-CH2-C(=O)-,
(b)-(Succinimid-3-yl-N)-CH2CH2CH2CH2CH2-C(=O)-GGFG-NH-CH2CH2-O-CH2-C(=O)-,および
(c)-(Succinimid-3-yl-N)-CH2CH2-C(=O)-NH-CH2CH2O-CH2CH2O-CH2CH2-C(=O)-GGFG-NH-CH2CH2CH2-C(=O)-
のいずれかにより表される構造を含む。
(a)-(Succinimid-3-yl-N)-CH2CH2CH2CH2CH2-C(=O)-GGFG-NH-CH2-O-CH2-C(=O)-
のいずれかにより表される構造を含む。
により表される薬物−リンカー構造を有し、
式中、ABは抗体を表し、yは、抗体にコンジュゲートされた薬物−リンカー構造の単位の、1抗体当たりの平均数を表し、抗体は、上記式により表される薬物リンカー構造にチオエーテル結合でコンジュゲートされており、抗体は、上述の抗MUC1抗体を表し、好ましくは、抗体は、重鎖可変領域および軽鎖可変領域または重鎖および軽鎖の以下の組合せa)〜d):
(a)重鎖可変領域は、配列番号10のアミノ酸配列を有し、軽鎖可変領域は、配列番号12のアミノ酸配列を有すること、
(b)重鎖可変領域は、配列番号11のアミノ酸配列を有し、軽鎖可変領域は、配列番号12のアミノ酸配列を有すること、
(c)重鎖は、配列番号15のアミノ酸配列を有し、軽鎖は、配列番号16のアミノ酸配列を有すること、および
(d)重鎖は、配列番号19のアミノ酸配列を有し、軽鎖は、配列番号16のアミノ酸配列を有すること
のいずれか1つである。
本発明によるコンジュゲートの抗体部分は、核酸によりコードされていてもよい。前記核酸の核酸配列は、抗体をコードするのに好適な任意のヌクレオチド配列を有してもよい。しかしながら、好ましくは、核酸配列は、核酸を発現させようとする宿主細胞または生物の特定のコドン使用頻度、特にヒトコドン使用頻度に少なくとも部分的に適応している。核酸は、二本鎖または一本鎖DNAまたはRNA、好ましくはcDNAなどの二本鎖DNA、またはmRNAなどの一本鎖RNAであってもよい。核酸は、1つの連続核酸分子であってもよく、または各々が抗体の異なる部分をコードする幾つかの核酸分子で構成されていてもよい。PankoMab変異体(PM−N54Q)の重鎖のヌクレオチド配列は、配列番号17により表されてもよく、PankoMab変異体(PM−N54Q)の軽鎖のヌクレオチド配列は、配列番号18により表されてもよい。
コンジュゲートは、特に、医薬において、特に、疾患、特に本明細書に記載のような疾患、好ましくはがん、感染症、炎症性疾患、移植片対宿主病、および免疫不全の治療、診断、予後、検出、および/またはモニタリングにおいて有用である。
抗体のMUCI結合親和性を増加させる方法は、
(i)配列番号1のアミノ酸配列を有する相補性決定領域(CDR)CDR−H1、配列番号8のアミノ酸配列を有するCDR−H2、および配列番号3のアミノ酸配列を有するCDR−H3を含む重鎖可変領域、ならびに
(ii)配列番号4のアミノ酸配列を有する相補性決定領域(CDR)CDR−L1、配列番号5のアミノ酸配列を有するCDR−L2、および配列番号6のアミノ酸配列を有するCDR−L3を含む軽鎖可変領域
を含んでいてもよく、
方法は、CDR−H2の8位のアミノ酸残基を、アスパラギン以外の任意のアミノ酸残基に置換して、配列番号2のアミノ酸配列を有するCDR−H2をもたらすステップを含む。
(a)MUC1結合親和性を増加させようとする抗体をコードする核酸を準備するステップ、
(b)前記核酸に突然変異を導入して突然変異核酸を産生し、突然変異は、CDR−H2の8位のアミノ酸残基をコードするコドンに、前記コドンがアスパラギン以外の任意のアミノ酸残基をコードするように導入されるステップ、および
(c)突然変異核酸を発現させて、MUC1結合親和性が増加された抗体を産生するステップを含む。
(a)
(i)配列番号1のアミノ酸配列を有する相補性決定領域(CDR)CDR−H1、配列番号8のアミノ酸配列を有するCDR−H2、および配列番号3のアミノ酸配列を有するCDR−H3を含む重鎖可変領域、ならびに
(ii)配列番号4のアミノ酸配列を有する相補性決定領域(CDR)CDR−L1、配列番号5のアミノ酸配列を有するCDR−L2、および配列番号6のアミノ酸配列を有するCDR−L3を含む軽鎖可変領域
を含む抗体をコードする核酸を準備するステップ、
(b)前記核酸に突然変異を導入して突然変異核酸を産生し、突然変異は、CDR−H2の8位のアミノ酸残基をコードするコドンに、前記コドンがアスパラギン以外の任意のアミノ酸残基をコードするように導入されるステップ、ならびに
(c)突然変異核酸を宿主細胞にて発現させることより、MUC1結合親和性が増加された抗体を産生するステップ
を含んでいてもよい。
下記に示されている式(1)により表される抗体−薬物コンジュゲートであって、抗体はチオエーテルを介してリンカー構造に接続されている抗体−薬物コンジュゲートは、抗体を還元することによりジスルフィド結合から変換されたスルフヒドリル基を有する抗体を、公知の方法により得ることができる(例えば特許公開文献、米国特許出願第2016/297890号明細書に記載の方法(例えば、段落[0336]〜[0374]に記載の方法)により得ることができる)化合物(2)と反応させることにより産生することができる。この抗体−薬物コンジュゲートは、例えば、以下の方法により産生することができる。
-(Succinimid-3-yl-N)-CH2CH2-C(=O)-GGFG-NH-CH2CH2CH2-C(=O)-,
-(Succinimid-3-yl-N)-CH2CH2CH2CH2CH2-C(=O)-GGFG-NH-CH2CH2CH2-C(=O)-,
-(Succinimid-3-yl-N)-CH2CH2CH2CH2CH2-C(=O)-GGFG-NH-CH2-O-CH2-C(=O)-,
-(Succinimid-3-yl-N)-CH2CH2CH2CH2CH2-C(=O)-GGFG-NH-CH2CH2-O-CH2-C(=O)-,
-(Succinimid-3-yl-N)-CH2CH2-C(=O)-NH-CH2CH2O-CH2CH2O-CH2CH2-C(=O)-GGFG-NH-CH2CH2CH2-C(=O)-,および
-(Succinimid-3-yl-N)-CH2CH2-C(=O)-NH-CH2CH2O-CH2CH2O-CH2CH2O-CH2CH2O-CH2CH2-C(=O)-GGFG-NH-CH2CH2CH2-C(=O)-
-(Succinimid-3-yl-N)- CH2CH2CH2CH2CH2-C(=O)-GGFG-NH-CH2-O-CH2-C(=O)-,
-(Succinimid-3-yl-N)-CH2CH2CH2CH2CH2-C(=O)-GGFG-NH-CH2CH2-O-CH2-C(=O)-, および
-(Succinimid-3-yl-N)-CH2CH2-C(=O)-NH-CH2CH2O-CH2CH2O-CH2CH2-C(=O)-GGFG-NH-CH2CH2CH2-C(=O)-
-(Succinimid-3-yl-N)- CH2CH2CH2CH2CH2-C(=O)-GGFG-NH-CH2-O-CH2-C(=O)-,および
-(Succinimid-3-yl-N)-CH2CH2-C(=O)-NH-CH2CH2O-CH2CH2O-CH2CH2-C(=O)-GGFG-NH--CH2CH2CH2-C(=O)-
により表される構造を有し、
これは、エキサテキカンの1位のアミノ基の1つの水素原子を除去することにより導出される基を表す。上記に記載の反応スキーム(式8)では、式(1)の化合物は、薬物からリンカー末端までの1つの構造部分が1つの抗体に接続されている構造を有するものと解釈することができる。しかしながら、この説明は、便宜的に示されるものであり、複数の上述の構造部分が1つの抗体分子に接続されている場合が実際には多く存在する。同じことが、下記に記載の産生方法の説明にも当てはまる。
産生された抗体−薬物コンジュゲート(例えば、抗体−薬物コンジュゲート(1))を、下記に記載の共通手順に従って、濃縮、緩衝液交換、精製、ならびに抗体濃度および1抗体分子当たりのコンジュゲートされた薬物分子の平均数の測定に供して、薬物−抗体コンジュゲート(1)を特定することができる。
Amicon Ultra(50,000MWCO、Millipore Corporation)容器に、抗体または抗体−薬物コンジュゲートの溶液を添加し、抗体または抗体−薬物コンジュゲートの溶液を、遠心分離機(Allegra X−15R、Beckman Coulter,Inc.)を使用して遠心分離(2000G〜4000Gで5〜30分間の遠心分離)することにより濃縮した。
UV検出器(Nanodrop 1000、Thermo Fisher Scientific Inc.)を使用して、製造業者により規定された方法に従って、抗体濃度の測定を実施した。この点で、抗体で異なる280nm吸光係数を使用した(1.3mLmg−1cm−1〜1.8mLmg−1cm−1)。
Sephadex G−25担体が使用されているNAP−25カラム(カタログ番号17−0852−02、GE Healthcare Japan Corporation)を、製造業者により規定された方法に従って、塩化ナトリウム(50mM)およびEDTA(2mM)を含むリン酸緩衝液(50mM、pH6.0)(本明細書ではPBS6.0/EDTAと呼ばれる)で平衡化した。抗体の水溶液を、NAP−25カラム1つ当たり2.5mLの量でアプライし、その後3.5mLのPBS6.0/EDTAで溶出させた画分(3.5mL)を収集した。この画分を共通手順Aに従って濃縮した。共通手順Bを使用して抗体の濃度を測定した後、PBS6.0/EDTAを使用して抗体濃度を20mg/mLに調整した。
NAP−25カラムを、ソルビトール(5%)を含む酢酸緩衝液(10mM、pH5.5;本明細書ではABSと呼ばれる)などの任意の市販の緩衝液で平衡化した。抗体−薬物コンジュゲートの水性反応溶液(およそ2.5mL)を、NAP−25カラムにアプライし、その後、製造業者により規定された量の緩衝液で溶出を実施して抗体画分を収集した。収集した画分をNAP−25カラムに再びアプライし、緩衝溶液で溶出を実施したゲル濾過精製工程を、合計で2回または3回繰り返して、未コンジュゲート薬物リンカーおよび低分子量化合物(tris(2−カルボキシエチル)ホスフィン塩酸塩(TCEP)、N−アセチル−L−システイン(NAC)、およびジメチルスルホキシド)を除く抗体−薬物コンジュゲートを得た。
抗体−薬物コンジュゲートのコンジュゲートされた薬物濃度は、抗体−薬物コンジュゲートの水溶液のUV吸光度を280nmおよび370nmの2つの波長で測定し、その後下記に示されている計算を実施することにより算出することができる。
A280=AD,280+AA,280=εD,280CD+εA,280CA 等式(1)
A370=AD,370+AA,370=εD,370CD+εA,370CA 等式(2)
また、抗体−薬物コンジュゲートの1抗体分子当たりのコンジュゲートされた薬物分子の平均数は、上述の「5.共通手順E」に加えて、以下の方法を使用して高速液体クロマトグラフィー(HPLC)分析により決定することができる。以降、抗体をジスルフィド結合により薬物リンカーにコンジュゲートする場合に、コンジュゲートされた薬物分子の平均数をHPLCにより測定する方法を記載するものとする。この方法を参照すると、当業者であれば、抗体と薬物リンカーとの接続パターンに応じて、コンジュゲートされた薬物分子の平均数をHPLCにより適切に測定することが可能である。
抗体−薬物コンジュゲート溶液(およそ1mg/mL、60μL)を、ジチオトレイトール(DTT)の水溶液(100mM、15μL)と混合する。混合物を37℃で30分間インキュベートすることにより、抗体−薬物コンジュゲートの軽鎖と重鎖との間のジスルフィド結合を切断する。得られる試料をHPLC分析に使用する。
HPLC分析を、以下の測定条件下で実施する。
HPLC装置:Agilent1290 HPLC装置(Agilent Technologies,Inc.)
検出器:紫外線吸光分光計(測定波長:280nm)
カラム:ACQUITY UPLC BEH Phenyl(2.1×50mm、1.7μm、130オングストローム;Waters Corp.、P/N 186002884)
カラム温度:80℃
移動相A:0.10%トリフルオロ酢酸(TFA)および15%2−プロパノールを含む水溶液
移動相B:0.075%TFAおよび15%2−プロパノールを含むアセトニトリル溶液
勾配プログラム:14%→36%(0分から15分)、36%→80%(15分から17分)、80%→14%(17分から17.01分)、および14%(17.01分から25分)
試料注入:10μL
または
HPLC装置:Agilent1290 HPLC装置(Agilent Technologies,Inc.)
検出器:紫外線吸光分光計(測定波長:280nm)
カラム:PLRP−S(2.1×50mm、8μm、1000オングストローム;Agilent Technologies,Inc.、P/N PL1912−1802)
カラム温度:80℃
移動相A:0.04%水性TFA溶液
移動相B:0.04%TFAを含むアセトニトリル溶液
勾配プログラム:29%→36%(0分から12.5分)、36%→42%(12.5分から15分)、42%→29%(15分から15.1分)、および29%→29%(15.1分から25分)
試料注入:15μL
F−3−1. 抗体の軽鎖および重鎖は、コンジュゲートされた薬物分子の数に応じてそれぞれLiおよびHiにより表される(iは、コンジュゲートされた薬物分子の数を表す。つまり、本発明によるコンジュゲートされた薬物分子の数は、L0、L1、H0、H1、H2、H3などにより表される)。
i個の薬物分子に結合された軽鎖のピーク面積の補正値(ALi)
i個の薬物分子に結合された軽鎖のピーク面積の補正値(AHi)
コンジュゲートされた薬物分子の平均数=(L0ピーク面積比×0+L0ピーク面積比×1+H0ピーク面積比×0+H1ピーク面積比×1+H2ピーク面積比×2+H3ピーク面積比×3)/100×2
下記には、本発明によるコンジュゲートの抗体部分の具体的な実施形態が記載されている。
(i)配列番号1のアミノ酸配列を有する相補性決定領域(CDR)CDR−H1、配列番号2のアミノ酸配列を有するCDR−H2、および配列番号3のアミノ酸配列を有するCDR−H3を含む重鎖可変領域、ならびに
(ii)配列番号4のアミノ酸配列を有する相補性決定領域(CDR)CDR−L1、配列番号5のアミノ酸配列を有するCDR−L2、および配列番号6のアミノ酸配列を有するCDR−L3を含む軽鎖可変領域
を含む抗体。
(i)
(a)配列番号9のアミノ酸配列と少なくとも90%同一であるアミノ酸配列を有し、
(b)配列番号1のアミノ酸配列を有する相補性決定領域(CDR)CDR−H1、配列番号2のアミノ酸配列を有するCDR−H2、および配列番号3のアミノ酸配列を有するCDR−H3を含む重鎖可変領域、ならびに
(ii)
(a)配列番号12のアミノ酸配列と少なくとも90%同一であるアミノ酸配列を有し、
(b)配列番号4のアミノ酸配列を有する相補性決定領域(CDR)CDR−L1、配列番号5のアミノ酸配列を有するCDR−L2、および配列番号6のアミノ酸配列を有するCDR−L3を含む軽鎖可変領域
を含む抗体。
(i)
(a)配列番号9のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を有し、
(b)配列番号1のアミノ酸配列を有する相補性決定領域(CDR)CDR−H1、配列番号2のアミノ酸配列を有するCDR−H2、および配列番号3のアミノ酸配列を有するCDR−H3を含む重鎖可変領域、ならびに
(ii)
(a)配列番号12のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を有し、
(b)配列番号4のアミノ酸配列を有する相補性決定領域(CDR)CDR−L1、配列番号5のアミノ酸配列を有するCDR−L2、および配列番号6のアミノ酸配列を有するCDR−L3を含む軽鎖可変領域
を含む抗体。
(i)
(a)配列番号10のアミノ酸配列と少なくとも90%同一であるアミノ酸配列を有し、
(b)配列番号1のアミノ酸配列を有する相補性決定領域(CDR)CDR−H1、配列番号7のアミノ酸配列を有するCDR−H2、および配列番号3のアミノ酸配列を有するCDR−H3を含む重鎖可変領域、ならびに
(ii)
(a)配列番号12のアミノ酸配列と少なくとも90%同一であるアミノ酸配列を有し、
(b)配列番号4のアミノ酸配列を有する相補性決定領域(CDR)CDR−L1、配列番号5のアミノ酸配列を有するCDR−L2、および配列番号6のアミノ酸配列を有するCDR−L3を含む軽鎖可変領域
を含む抗体。
(i)
(a)配列番号10のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を有し、
(b)配列番号1のアミノ酸配列を有する相補性決定領域(CDR)CDR−H1、配列番号7のアミノ酸配列を有するCDR−H2、および配列番号3のアミノ酸配列を有するCDR−H3を含む重鎖可変領域、ならびに
(ii)
(a)配列番号12のアミノ酸配列と少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を有し、
(b)配列番号4のアミノ酸配列を有する相補性決定領域(CDR)CDR−L1、配列番号5のアミノ酸配列を有するCDR−L2、および配列番号6のアミノ酸配列を有するCDR−L3を含む軽鎖可変領域
を含む抗体。
(i)配列番号9のアミノ酸配列を有する重鎖可変領域、および
(ii)配列番号12のアミノ酸配列を有する軽鎖可変領域
を含む抗体。
(i)配列番号10のアミノ酸配列を有する重鎖可変領域、および
(ii)配列番号12のアミノ酸配列を有する軽鎖可変領域
を含む抗体。
(i)配列番号20または23のアミノ酸番号20〜136により表されるアミノ酸配列を有する重鎖可変領域、および
(ii)配列番号21のアミノ酸番号21〜133により表されるアミノ酸配列を有する軽鎖可変領域
を含む抗体。
(i)
(a)配列番号15のアミノ酸配列と少なくとも90%または少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を有し、
(b)配列番号1のアミノ酸配列を有する相補性決定領域(CDR)CDR−H1、配列番号2または7のアミノ酸配列を有するCDR−H2、および配列番号3のアミノ酸配列を有するCDR−H3を含む重鎖、ならびに
(ii)
(a)配列番号16のアミノ酸配列と少なくとも90%または少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を有し、
(b)配列番号4のアミノ酸配列を有する相補性決定領域(CDR)CDR−L1、配列番号5のアミノ酸配列を有するCDR−L2、および配列番号6のアミノ酸配列を有するCDR−L3を含む軽鎖可変領域
を含む抗体。
(i)配列番号15または配列番号22のアミノ酸配列を有する重鎖可変領域、および
(ii)配列番号16のアミノ酸配列を有する軽鎖可変領域
を含む抗体。
(i)
(a)配列番号19のアミノ酸配列と少なくとも90%または少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を有し、
(b)配列番号1のアミノ酸配列を有する相補性決定領域(CDR)CDR−H1、配列番号8のアミノ酸配列を有するCDR−H2、および配列番号3のアミノ酸配列を有するCDR−H3を含む重鎖可変領域、ならびに
(ii)
(a)配列番号16のアミノ酸配列と少なくとも90%または少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を有し、
(b)配列番号4のアミノ酸配列を有する相補性決定領域(CDR)CDR−L1、配列番号5のアミノ酸配列を有するCDR−L2、および配列番号6のアミノ酸配列を有するCDR−L3を含む軽鎖可変領域
を含む抗体。
(i)配列番号19のアミノ酸番号20〜460により表されるアミノ酸配列を有する重鎖可変領域、および
(ii)配列番号16のアミノ酸番号21〜239により表されるアミノ酸配列を有する軽鎖可変領域
を含む抗体。
(i)二分GlcNAc残基を保持するグリカンの相対量は、組成物中の抗体のグリコシル化部位に付着されているグリカンの合計量の少なくとも0.5%であること、
(ii)少なくとも1つのガラクトース残基を保持するグリカンの相対量は、組成物中の抗体のグリコシル化部位に付着されているグリカンの合計量の少なくとも30%であること、
(iii)コアフコース残基を保持するグリカンの相対量は、組成物中の抗体のグリコシル化部位に付着されているグリカンの合計量の少なくとも60%であること
の1つまたは複数を有するグリコシル化パターンを有する、実施形態28に記載の抗体。
(i)二分GlcNAc残基を保持するグリカンの相対量は、組成物中の抗体のグリコシル化部位に付着されているグリカンの合計量の少なくとも0.5%であること、
(ii)少なくとも1つのガラクトース残基を保持するグリカンの相対量は、組成物中の抗体のグリコシル化部位に付着されているグリカンの合計量の少なくとも30%であること、
(iii)コアフコース残基を保持するグリカンの相対量は、組成物中の抗体のグリコシル化部位に付着されているグリカンの合計量の40%またはそれよりも少ないこと
の1つまたは複数を有するグリコシル化パターンを有する、実施形態28に記載の抗体。
(a)-(Succinimid-3-yl-N)-CH2CH2-C(=O)-GGFG-NH-CH2CH2CH2-C(=O)-,
(b)-(Succinimid-3-yl-N)-CH2CH2CH2CH2CH2-C(=O)-GGFG-NH-CH2CH2CH2-C(=O)-,
(c)-(Succinimid-3-yl-N)-CH2CH2CH2CH2CH2-C(=O)-GGFG-NH-CH2-O-CH2-C(=O)-,
(d)-(Succinimid-3-yl-N)-CH2CH2CH2CH2CH2-C(=O)-GGFG-NH-CH2CH2-O-CH2-C(=O)-,
(e)-(Succinimid-3-yl-N)-CH2CH2-C(=O)-NH-CH2CH2O-CH2CH2O-CH2CH2-C(=O)-GGFG-NH-CH2CH2CH2-C(=O)-, および
(f)-(Succinimid-3-yl-N)-CH2CH2-C(=O)-NH-CH2CH2O-CH2CH2O-CH2CH2O-CH2CH2O-CH2CH2-C(=O)-GGFG-NH-CH2CH2CH2-C(=O)-
からなる群から選択される任意の構造を有するリンカーを介して、それにコンジュゲートされており、
抗体は、-(Succinimid-3-yl-N)の末端に接続されており、抗腫瘍化合物は、1位のアミノ基の窒素原子を接続位置として、式(a)〜(f)の最も右側の−(CH2)n2−C(=O)−部分(n2は、1または3の整数を表す)のカルボニル基に接続されており、GGFGは、ペプチド結合を介して連結されているグリシン−グリシン−フェニルアラニン−グリシンからなるアミノ酸配列を表し、
-(Succinimid-3-yl-N)-は、以下の式:
(a)-(Succinimid-3-yl-N)-CH2CH2-C(=O)-GGFG-NH-CH2CH2CH2-C(=O)-,
(b)-(Succinimid-3-yl-N)-CH2CH2CH2CH2CH2-C(=O)-GGFG-NH-CH2CH2CH2-C(=O)-,
(c)-(Succinimid-3-yl-N)-CH2CH2CH2CH2CH2-C(=O)-GGFG-NH-CH2-O-CH2-C(=O)-,
(d)-(Succinimid-3-yl-N)-CH2CH2CH2CH2CH2-C(=O)-GGFG-NH-CH2CH2-O-CH2-C(=O)-,
(e)-(Succinimid-3-yl-N)-CH2CH2-C(=O)-NH-CH2CH2O-CH2CH2O-CH2CH2-C(=O)-GGFG-NH-CH2CH2CH2-C(=O)-, および
(f)-(Succinimid-3-yl-N)-CH2CH2-C(=O)-NH-CH2CH2O-CH2CH2O-CH2CH2O-CH2CH2O-CH2CH2-C(=O)-GGFG-NH-CH2CH2CH2-C(=O)-
からなる群から選択される任意の構造を有するリンカーを介して、さらなる作用剤または化学療法剤、好ましくはDX−8951またはDXdなどのトポイソメラーゼI阻害剤にコンジュゲートされており、
抗体は、-(Succinimid-3-yl-N)の末端に接続されており、抗腫瘍化合物は、1位のアミノ基の窒素原子を接続位置として、式(a)〜(f)の最も右側の−(CH2)n2−C(=O)−部分(n2は、1または3の整数を表す)のカルボニル基に接続されており、GGFGは、ペプチド結合を介して連結されているグリシン−グリシン−フェニルアラニン−グリシンからなるアミノ酸配列を表し、
-(Succinimid-3-yl-N)-は、以下の式:
(a)重鎖可変領域は、配列番号10のアミノ酸配列を有し、軽鎖可変領域は、配列番号12のアミノ酸配列を有すること、
(b)重鎖可変領域は、配列番号11のアミノ酸配列を有し、軽鎖可変領域は、配列番号12のアミノ酸配列を有すること、
(c)配列番号15または22のアミノ酸配列を含む重鎖、および配列番号16のアミノ酸配列を含む軽鎖、
(d)配列番号19のアミノ酸配列を含む重鎖、および配列番号16のアミノ酸配列を含む軽鎖、
(e)配列番号15または22のアミノ酸番号1〜446により表されるアミノ酸配列を有する重鎖、および配列番号16のアミノ酸番号1〜219により表されるアミノ酸配列を有する軽鎖、ならびに
(f)配列番号19のアミノ酸番号1〜446により表されるアミノ酸配列を有する重鎖、および配列番号16のアミノ酸番号1〜219により表されるアミノ酸配列を有する軽鎖
のいずれか1つを含み、抗体またはその抗原結合性断片が、以下の式(式中、星印*は、抗体との接続点を表す)
により表され、
式中、ABは抗体を表し、抗体は、配列番号10のアミノ酸配列を有する重鎖可変領域、および配列番号12のアミノ酸配列を有する軽鎖可変領域を含み、yは、抗体にコンジュゲートされた薬物−リンカー構造の単位の、1抗体当たりの平均数を表し、yは、1から10までの範囲、2から8までの範囲、3から8までの範囲、7から8までの範囲、または7.5から8までの範囲であり、抗体は、上記式により表される薬物リンカー構造にチオエーテル結合でコンジュゲートされている、コンジュゲートまたは抗体。
により表され、
式中、ABは抗体を表し、抗体は、配列番号11のアミノ酸配列を有する重鎖可変領域、および配列番号12のアミノ酸配列を有する軽鎖可変領域を含み、yは、抗体にコンジュゲートされた薬物−リンカー構造の単位の、1抗体当たりの平均数を表し、yは、1から10までの範囲、2から8までの範囲、3から8までの範囲、7から8までの範囲、または7.5から8までの範囲であり、抗体は、上記式により表される薬物リンカー構造にチオエーテル結合でコンジュゲートされている、コンジュゲートまたは抗体。
により表され、
式中、ABは抗体を表し、抗体は、配列番号15または22のアミノ酸配列を有する重鎖、および配列番号16のアミノ酸配列を有する軽鎖を含み、yは、抗体にコンジュゲートされた薬物−リンカー構造の単位の、1抗体当たりの平均数を表し、yは、1から10までの範囲、2から8までの範囲、3から8までの範囲、7から8までの範囲、または7.5から8までの範囲であり、抗体は、上記式により表される薬物リンカー構造にチオエーテル結合でコンジュゲートされている、コンジュゲートまたは抗体。
により表され、
式中、ABは抗体を表し、抗体は、配列番号19のアミノ酸配列を有する重鎖、および配列番号16のアミノ酸配列を有する軽鎖を含み、yは、抗体にコンジュゲートされた薬物−リンカー構造の単位の、1抗体当たりの平均数を表し、yは、1から10までの範囲、2から8までの範囲、3から8までの範囲、7から8までの範囲、または7.5から8までの範囲であり、抗体は、上記式により表される薬物リンカー構造にチオエーテル結合でコンジュゲートされている、コンジュゲートまたは抗体。
により表され、
式中、ABは抗体を表し、抗体は、配列番号15または22のアミノ酸番号1〜446により表されるアミノ酸配列を有する重鎖、および配列番号16のアミノ酸番号1〜219により表されるアミノ酸配列を有する軽鎖を含み、yは、抗体にコンジュゲートされた薬物−リンカー構造の単位の、1抗体当たりの平均数を表し、yは、1から10までの範囲、2から8までの範囲、3から8までの範囲、7から8までの範囲、または7.5から8までの範囲であり、抗体は、上記式により表される薬物リンカー構造にチオエーテル結合でコンジュゲートされている、コンジュゲートまたは抗体。
により表され、
ABは、抗体を表し、抗体は、配列番号19のアミノ酸番号1〜446により表されるアミノ酸配列を有する重鎖、および配列番号16のアミノ酸番号1〜219により表されるアミノ酸配列を有する軽鎖を含み、yは、抗体にコンジュゲートされた薬物−リンカー構造の単位の、1抗体当たりの平均数を表し、yは、1から10までの範囲、2から8までの範囲、3から8までの範囲、7から8までの範囲、または7.5から8までの範囲であり、抗体は、上記式により表される薬物リンカー構造にチオエーテル結合でコンジュゲートされている、コンジュゲートまたは抗体。
1. 抗MUC1抗体の産生
カバット/Eu付番方式によるAsn54(配列番号11のアミノ酸位置57)のコドンを、Asn以外の任意のアミノ酸、特にGlnのコドンに突然変異させることにより、ヒト化PankoMab抗体の重鎖の核酸配列(例えば、WO2011/012309を参照)を修飾した。
突然変異抗体のγ1型重鎖およびκ型軽鎖のコード配列を含むベクターを、ヒト骨髄性白血病由来細胞株NM−H9D8(DSM ACC2806)にトランスフェクトした。N54X突然変異(PankoMab N54X/PM−N54X、XはN/Asn以外の任意のアミノ酸である)またはVHおよびVLのフレームワーク配列にアミノ酸突然変異を含む異なるαMUC1抗体を、得られたクローンで発現させて、ヒトグリコシル化パターンを有する構築物を産生させた。上清中のαMUC1抗体の濃度は、プロテインAコーティングピンを使用したOctet測定により決定したか、またはプロテインAクロマトグラフィーによる精製後にUV280吸光度により定量化した。異なるαMUC1抗体の結合特性を、抗原−ELISAにより決定し(実施例2を参照)、また、選択された精製抗体をスキャチャード分析により(実施例3を参照)、Biacoreにより(実施例4aを参照)、DRX2 switchSENSE(登録商標)技術により(実施例4bを参照)、またはフローサイトメトリーにより(実施例7)分析した。
ThermoFisher scientificのGeneArt(商標)により合成されたPM−N54Qコード配列(配列番号17により表されるPM−N54Qの重鎖のヌクレオチド配列および配列番号18により表されるPM−N54Qの軽鎖のヌクレオチド配列)を、発現ベクターにクローニングし、得られたプラスミドをCHO細胞にエレクトロ−トランスフェクトした。プールした細胞を選択圧力下で増殖させることを応用し、基本手順を用いてPM−N54Q突然変異体抗体を製造した。CHO細胞株で産生された抗MUC1抗体(PM−N54Q)を、実施例8および9に使用した。
CDR2−H2にグリコシル化部位を含む(Fabグリコシル化)ヒト化抗TA−MUC1モノクローナル抗体を指すPankoMab−GEX、およびFabグリコシル化を欠如するヒト化抗TA−MUC1モノクローナルを指すPM−N54Q(実施例1−1)、PankoMab−ADC、およびPM−N54Q−ADCを、WO2014/057687およびWO2015/115091などの公知の方法により産生した。PankoMab−GEX抗体は、配列番号19を含む重鎖および配列番号16を含む軽鎖を含み、したがって、PankoMab−GEX抗体は、式2の薬物−リンカーに連結される。上記で言及したPM−N54Q抗体は、配列番号15を含む重鎖および配列番号16を含む軽鎖を含み、したがって、PM−N54Q抗体は、式2の薬物−リンカーに連結される。
Fab部分のN−グリコシル化部位がノックアウトされているPankoMab N54Xの抗原結合特性を、そのFab部分にN−グリコシル化部位を有するPankoMabと比較した。
2つの要因:腫瘍細胞に対する抗体の親和性および結合部位の数が、抗体の治療適合性に特に重要である。
TA−MUC−1由来グリコシル化ペプチドに対する、MUC1特異的抗体PankoMabのFab脱グリコシル化型(PM−N54Q)の結合を、表面プラズモン共鳴分析(Biacore)により評価した。ストレプトアビジンセンサーチップを、ビオチン化TA−MUC1ペプチドでコーティングした(Tnグリコシル化または非グリコシル化)。PankoMabおよびPM−N54Qを、HPS−EPで3,600から4.9nMまで1:3系列希釈した。希釈物を50μL/分で注入した。各濃度の最大結合を、それぞれ応答ユニット(RU)として決定し、「1部位特異的結合」を使用してGraphPad Prismで評価した。図2は、PankoMab−GEX(登録商標)と比較して得られた、PM−N54Qとの結合曲線を示す。PM−N54QおよびPankoMab−GEX(登録商標)の親和性(KD)は、それぞれ388nMおよび652nMであると算出された。したがって、この実験の設定では、親和性のほぼ2倍の増加が検出可能だった。
チップにスポッティングされた一本鎖DNA(96量体)およびリガンドにカップリングされた相補的DNAを使用する蛍光接近感知法は、結合定数および親和性を決定するための新しい方法である。本研究では、ストレプトアビジンを、ビオチン化TA−MUC1ペプチドを捕捉するためのリガンドとして使用した。ペプチドに対するPankoMabの結合は、蛍光の変化をもたらした。オンレートおよびオフレートは、結合および解離中に算出することができる。感度がより高いため、表面プラズモン共鳴と比較してより迅速な相互作用をモニターすることができる。これは、SPRとは異なるが、液体系で測定される「至適標準」法であるKinExAとより同等の結合動力学をもたらす。
非還元および還元SDS−PAGEを使用して、抗体の純度および同一性を分析する。非還元ゲルのバンドパターンは、約160kDaに主バンドを示し、重鎖および軽鎖ならびにそれらの組合せの理論的アーチファクト(約25、50〜55、75、110、135kDa)を示す。還元ゲルは、25および50〜55kDaに別個の軽鎖バンドおよび重鎖バンドを示す。Fabグリコシル化を欠如するため、PM−N54Qは、予想通り、より小さな重鎖を有する(図4の右側を参照)。
FcγRIIIa(CD16a)のFcγR結合アッセイは、PerkinElmerのAlphaScreen(登録商標)技術に基づく。AlphaScreen(登録商標)プラットフォームは、PerkinElmerの簡単なビーズに基づく技術に依存し、洗浄ステップを必要としないため、伝統的なELISAのより効率的な代替法である。
N54QおよびN54Dを一過性に発現させ、プロテインAクロマトグラフィーにより精製した。細胞表面TA−MUC1に対する2つの変異体の結合を、2つの異なる癌細胞株を使用して、Fabグリコシル化を有するPMと比較した。舌扁平上皮癌系統HSC−4は、TA−MUC1を中程度に発現し、卵巣癌細胞株CaOV−3は高度に発現する。腫瘍細胞を、系列希釈した抗体と共にインキュベートし、結合した抗体を、フィコエリトリンコンジュゲートヤギ抗ヒトIgG(重鎖および軽鎖)抗体を使用して検出した。バックグラウンド染色の対照のために、ヒトIgG対照が含まれていた。結合を、フローサイトメトリーにより分析した。
8.1 細胞株
TA−MUC1を中程度〜高度に発現する細胞として、ヒト乳がん細胞株MDA−MB−468、ヒト膵がん細胞株HPAC、およびヒト肺がん細胞株NCI−H441を使用した。ヒト結腸直腸がん細胞株HCT−15を、TA−MUC1陰性細胞として使用した。こうした細胞株は、ATCCから購入した。各細胞株を、使用説明書に従って培養した。各がん細胞株上のTA−MUC1の発現レベルを、フローサイトメトリーにより確認した。
培養培地を使用することにより1.25×104細胞/mLの濃度を有するようにMDA−MB−468懸濁物を調製し、80uL/ウェル(1000細胞/ウェル)で黒色透明底96ウェルプレートの各ウェルに添加した。ブランクウェルの場合、培地のみを80uL/ウェルでウェルに添加した(N=3)。細胞はすべて、MDA−MB−468に適切な条件で終夜インキュベートした。
細胞生存率(%)=100×(T−B)/(C−B)
T:試験ウェルのルミネセンス強度
C:未処置ウェルの平均ルミネセンス強度
B:ブランクウェルの平均ルミネセンス強度
培養培地を使用することにより1.25×104細胞/mLの濃度を有するようにHPAC懸濁物を調製し、80uL/ウェル(1000細胞/ウェル)で黒色透明底96ウェルプレートの各ウェルに添加した。ブランクウェルの場合、培地のみを80uL/ウェルでウェルに添加した(N=3)。細胞はすべて、HPACに適切な条件で終夜インキュベートした。
細胞生存率(%)=100×(T−B)/(C−B)
T:試験ウェルのルミネセンス強度
C:未処置ウェルの平均ルミネセンス強度
B:ブランクウェルの平均ルミネセンス強度
9.1 細胞株
TA−MUC1を中程度〜高度に発現する腫瘍細胞として、ヒト乳がん細胞株MDA−MB−468およびHCC70、ヒト膵がん細胞株HPAC、およびヒト肺がん細胞株NCI−H441を使用した。ヒト結腸直腸がん細胞株HCT−15を、TA−MUC1陰性腫瘍細胞として使用した。こうした細胞株は、ATCCから購入した。ヒト卵巣がん細胞株OVCAR−5を国立がん研究所から購入し、TA−MUC1低発現腫瘍細胞として使用した。各細胞株を、使用説明書に従って培養した。各がん細胞株上のTA−MUC1の発現レベルを、フローサイトメトリーおよびIHC染色により確認した。
MDA−MB−468細胞を、マトリゲル(BD)に懸濁し、1×107細胞を、各雌ヌードマウスの身体右側に皮下移植し(0日目)、20日目にマウスを無作為にグループ化した(N=6)。グループ化した後、各ネイキッドPankoMab溶液、対照hIgG−ADC溶液、またはPankoMab−ADC溶液を、3mg/kgの用量で静脈内に単回用量投与した。ビヒクル(酢酸緩衝溶液)投与群を、対照群として確立した。投与後、各マウスの腫瘍の長さおよび幅を、21日間にわたって週2回デジタルノギスで測定した。
推定腫瘍容積(mm3)=1/2×長さ(mm)×幅(mm)2
TGI(%)=(1−T/C)×100
T:ネイキッドPankoMab、対照hIgG−ADC、またはPankoMab−ADCの平均推定腫瘍容積(mm3)
C:ビヒクル処置群の平均推定腫瘍容積(mm3)
HPAC細胞を、生理食塩水(株式会社大塚製薬工場)に懸濁し、3×106細胞を、各雌ヌードマウスの身体右側に皮下移植し(0日目)、11日目にマウスを無作為にグループ化した(N=6)。グループ化した後、各ネイキッドPM−N54Q溶液、対照hIgG−ADC溶液、PankoMab−ADC溶液、またはPM−N54Q−ADC溶液を、10mg/kgの用量で静脈内に単回用量投与した。ビヒクル(酢酸緩衝溶液)投与群を、対照群として確立した。投与後、各マウスの腫瘍の長さおよび幅を、21日間にわたって週2回デジタルノギスで測定した。
推定腫瘍容積(mm3)=1/2×長さ(mm)×幅(mm)2
TGI(%)=(1−T/C)×100
T:ネイキッドPankoMab、ネイキッドPM−N54Q、対照hIgG−ADC、PankoMab−ADC、またはPM−N54Q−ADCの平均推定腫瘍容積(mm3)
C:ビヒクル処置群の平均推定腫瘍容積(mm3)
10.1 in vitroにおける、TA−MUC1陽性がん細胞株および陰性細胞に対するPankoMab−ADCの細胞傷害活性
PankoMab−ADCが、ヒトがん細胞株に対する標的依存性および薬物依存性細胞傷害活性を示すか否かを調査するために、ヒト乳がん細胞MDA−MB−468(TA−MUC1陽性)およびヒト結腸直腸がん細胞HCT−15(TA−MUC1陰性)に対する、ネイキッドPankoMab、対照hIgG−ADC、およびPankoMab−ADCのin vitro有効性を評価した。図8に示されているように、ネイキッドPankoMabおよびhIgG−ADCは、各細胞株に対して活性をほとんど示さなかった(IC50>100nM)。こうした条件下では、PankoMab−ADCは、TA−MUC1陽性細胞MDA−MB−468に対して用量依存性細胞傷害活性を示した(図8A、IC50<10nM)。しかし、PankoMab−ADCは、TA−MUC1陰性細胞HCT−15に対しては活性を示さなかった(図8B、IC50>100nM)。こうした結果に基づき、PankoMab−ADCは、in vitroにおいて、TA−MUC1陽性がん細胞株に対して標的依存性および薬物依存性細胞傷害活性を示すと結論付けた。
抗原結合親和性の向上が細胞傷害活性の増強に寄与し得るか否かを調査するため、ヒト膵がん細胞株HPACおよびヒト肺がん細胞株NCI−H441に対する、PankoMab−ADCおよびPM−N54Q−ADCのin vitro有効性を評価した。それらに対するPM−N54Q−ADCの細胞傷害活性は、PankoMab−ADCの細胞傷害活性よりも1.5倍強力だった(図8Cおよび図8D)。PM−N54Q−ADCのPankoMab−ADCに対する、HPACに対する効力比は1.917であり(1.611〜2.280、95%CI)、NCI−H441に対する効力比は1.663であった(1.495〜1.849、EC50の95%CI)。こうしたデータは、PM−N54Q−ADCの細胞傷害活性が、PankoMab−ADCよりも有意に強力であることを実証した。こうした結果は、PankoMab−ADCの抗原結合親和性の向上が、細胞死滅活性の有意な増強に寄与し得ることを示唆する。
PankoMab−ADCが、in vitroだけでなくin vivoでも有効性を示すか否かを調査するため、MDA−MB−468保持マウスに対するネイキッドPankoMab、対照hIgG−ADC、およびPankoMab−ADCの抗腫瘍有効性を評価した。図9に示されているように、ネイキッドPankoMabおよび対照hIgG−ADC(3mg/kg、単回投与)は、抗腫瘍有効性を示さなかった(TGIは両方とも、41日目で−18%だった)。対照的に、PankoMab−ADC(3mg/kg、単回投与)は、腫瘍成長を著しく阻害した(TGIは、41日目で97%だった)。さらに、PankoMab−ADCは、対照hIgG−ADCおよびネイキッドPankoMabと比較して有意な抗腫瘍有効性を示した(両方とも41日目でP<0.001)。体重変化の点では、薬物治療により引き起こされる体重減少は、すべての薬物処置群で一切観察されなかった。
PM−N54Q−ADCが、TA−MUC1陽性腫瘍細胞に対して、PankoMab−ADCと等しいかまたはそれよりも大きな抗腫瘍有効性を有するか否かを調査するため、種々のタイプのTA−MUC1陽性腫瘍細胞に対するPankoMab−ADCおよびPM−N54Q−ADCの抗腫瘍有効性を比較した。
細胞株DSM ACC2806、DSM ACC2807、およびDSM ACC2856は、下記の表に示されている日付にて、Glycotope GmbH,Robert−Rossle−Str.10,13125 Berlin(DE)によりDeutsche Sammlung von Mikroorganismen und Zellkulturen GmbH(DSMZ),Inhoffenstraβe 7B,38124 Braunschweig(DE)に寄託された。
(i)
(a)配列番号15のアミノ酸配列と少なくとも90%または少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を有し、
(b)配列番号1のアミノ酸配列を有する相補性決定領域(CDR)CDR−H1、配列番号2または7のアミノ酸配列を有するCDR−H2、および配列番号3のアミノ酸配列を有するCDR−H3を含む重鎖、ならびに
(ii)
(a)配列番号16のアミノ酸配列と少なくとも90%または少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を有し、
(b)配列番号4のアミノ酸配列を有する相補性決定領域(CDR)CDR−L1、配列番号5のアミノ酸配列を有するCDR−L2、および配列番号6のアミノ酸配列を有するCDR−L3を含む軽鎖
を含む抗体。
(i)配列番号15または配列番号22のアミノ酸配列を有する重鎖、および
(ii)配列番号16のアミノ酸配列を有する軽鎖
を含む抗体。
(i)
(a)配列番号19のアミノ酸配列と少なくとも90%または少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を有し、
(b)配列番号1のアミノ酸配列を有する相補性決定領域(CDR)CDR−H1、配列番号8のアミノ酸配列を有するCDR−H2、および配列番号3のアミノ酸配列を有するCDR−H3を含む重鎖、ならびに
(ii)
(a)配列番号16のアミノ酸配列と少なくとも90%または少なくとも95%同一であるアミノ酸配列を有し、
(b)配列番号4のアミノ酸配列を有する相補性決定領域(CDR)CDR−L1、配列番号5のアミノ酸配列を有するCDR−L2、および配列番号6のアミノ酸配列を有するCDR−L3を含む軽鎖
を含む抗体。
(i)配列番号19のアミノ酸配列を有する重鎖、および
(ii)配列番号16のアミノ酸配列を有する軽鎖
を含む抗体。
Claims (55)
- 細胞傷害剤にコンジュゲートされた抗体を含むコンジュゲートであって、抗体は、MUC1に結合することが可能であり、
(i)配列番号1のアミノ酸配列を有する相補性決定領域(CDR)CDR−H1、配列番号2のアミノ酸配列を有するCDR−H2、および配列番号3のアミノ酸配列を有するCDR−H3を含む重鎖可変領域、ならびに
(ii)配列番号4のアミノ酸配列を有する相補性決定領域(CDR)CDR−L1、配列番号5のアミノ酸配列を有するCDR−L2、および配列番号6のアミノ酸配列を有するCDR−L3を含む軽鎖可変領域
を含む、コンジュゲート。 - 配列番号2の8位のアミノ酸が、グルタミン、ヒスチジン、トリプトファン、チロシン、リジン、およびアルギニンからなる群から選択されるか、またはCDR−H2が、配列番号7のアミノ酸配列を有する、請求項1に記載のコンジュゲート。
- 抗体の重鎖可変領域が、配列番号9のアミノ酸配列、または配列番号9のアミノ酸配列と少なくとも90%同一であるアミノ酸配列を有する、請求項1に記載のコンジュゲート。
- 抗体の重鎖可変領域が、配列番号10のアミノ酸配列、または配列番号10のアミノ酸配列と少なくとも90%同一であるアミノ酸配列を有する、請求項1から3のいずれか一項に記載のコンジュゲート。
- 抗体の軽鎖可変領域が、配列番号12のアミノ酸配列、または配列番号12のアミノ酸配列と少なくとも90%同一であるアミノ酸配列を有する、請求項1から4のいずれか一項に記載のコンジュゲート。
- 抗体の重鎖可変領域が、配列番号10のアミノ酸配列を有し、抗体の軽鎖可変領域が、配列番号12のアミノ酸配列を有する、請求項1から5のいずれか一項に記載のコンジュゲート。
- 抗体が、Fc領域を含み、好ましくは、IgG1型抗体、IgG2型抗体、またはIgG4型抗体である、請求項1から6のいずれか一項に記載のコンジュゲート。
- 抗体の重鎖が、配列番号15、特に配列番号22のアミノ酸配列を有し、抗体の軽鎖が、配列番号16のアミノ酸配列を有する、請求項1から7のいずれか一項に記載のコンジュゲート。
- CDR−H2が、配列番号8のアミノ酸配列を有する、請求項1に記載のコンジュゲート。
- 抗体の重鎖可変領域が、配列番号11のアミノ酸配列、または配列番号11のアミノ酸配列と少なくとも90%同一であるアミノ酸配列を有する、請求項1または9に記載のコンジュゲート。
- 抗体の重鎖可変領域が、配列番号12のアミノ酸配列、または配列番号12のアミノ酸配列と少なくとも90%同一であるアミノ酸配列を有する、請求項1、9、および10のいずれか一項に記載のコンジュゲート。
- 抗体の重鎖可変領域が、配列番号11のアミノ酸配列を有し、抗体の軽鎖可変領域が、配列番号12のアミノ酸配列を有する、請求項1および9から11のいずれか一項に記載のコンジュゲート。
- 抗体が、Fc領域を含み、好ましくは、IgG1型抗体、IgG2型抗体、またはIgG4型抗体である、請求項1および9から12のいずれか一項に記載のコンジュゲート。
- 抗体の重鎖が、配列番号19のアミノ酸配列を有し、抗体の軽鎖が、配列番号16のアミノ酸配列を有する、請求項1および9から13のいずれか一項に記載のコンジュゲート。
- 抗体が、以下の特徴:
(i)二分GlcNAc残基を保持するグリカンの量が検出可能であること、
(ii)少なくとも1つのガラクトース残基を保持するグリカンの相対量は、組成物中の抗体のFcグリコシル化部位に付着されているグリカンの合計量の少なくとも25%であること
の1つまたは複数を有するグリコシル化パターンを含む、請求項7、8、13、および14のいずれか一項に記載のコンジュゲート。 - 抗体が、哺乳動物細胞での産生により得ることができる、請求項1から15のいずれか一項に記載のコンジュゲート。
- 抗体が、NM−H9D8(DSM ACC2806)、NM−H9D8−E6(DSM ACC2807)、NM−H9D8−E6Q12(DSM ACC2856)、およびそれらに由来する細胞株からなる群から選択されるヒト細胞株での産生により得ることができる、請求項1から16のいずれか一項に記載のコンジュゲート。
- 抗体が、CHO細胞株またはそれに由来する細胞株での産生により得ることができる、請求項1から16のいずれか一項に記載のコンジュゲート。
- 抗体が、(i)請求項1から14のいずれか一項に記載の抗体をコードする核酸を含む宿主細胞を準備するステップ、(ii)抗体の発現に好適な条件下で宿主細胞を培養するステップ、および(iii)宿主細胞により発現された抗体を得るステップを含む産生方法により得ることができる、請求項1から18のいずれか一項に記載のコンジュゲート。
- 抗体が、配列番号10のアミノ酸配列を有する重鎖可変領域および配列番号12のアミノ酸配列を有する軽鎖可変領域を含む抗体、または配列番号11のアミノ酸配列を有する重鎖可変領域および配列番号12のアミノ酸配列を有する軽鎖可変領域を含む抗体と、TA−MUC1に対する結合を競合する、請求項1から19のいずれか一項に記載のコンジュゲート。
- 抗体が、MUC−1と結合することによりMUC1発現細胞へと内部移行されるという活性を有する、請求項1から20のいずれか一項に記載のコンジュゲート。
- 細胞傷害剤が抗腫瘍剤である、請求項1から21のいずれか一項に記載のコンジュゲート。
- 細胞傷害剤が化学療法剤である、請求項1から22のいずれか一項に記載のコンジュゲート。
- 化学療法剤が、微小管阻害剤、トポイソメラーゼI阻害剤、DNA損傷剤、DNAアルキル化剤、およびDNA副溝結合剤からなる群から選択される、請求項23に記載のコンジュゲート。
- 化学療法剤がトポイソメラーゼI阻害剤である、請求項24に記載のコンジュゲート。
- 抗体が、以下の式(a)〜(f):
(a)-(Succinimid-3-yl-N)-CH2CH2-C(=O)-GGFG-NH-CH2CH2CH2-C(=O)-,
(b)-(Succinimid-3-yl-N)-CH2CH2CH2CH2CH2-C(=O)-GGFG-NH-CH2CH2CH2-C(=O)-,
(c)-(Succinimid-3-yl-N)-CH2CH2CH2CH2CH2-C(=O)-GGFG-NH-CH2-O-CH2-C(=O)-,
(d)-(Succinimid-3-yl-N)-CH2CH2CH2CH2CH2-C(=O)-GGFG-NH-CH2CH2-O-CH2-C(=O)-,
(e)-(Succinimid-3-yl-N)-CH2CH2-C(=O)-NH-CH2CH2O-CH2CH2O-CH2CH2-C(=O)-GGFG-NH-CH2CH2CH2-C(=O)-,および
(f)-(Succinimid-3-yl-N)-CH2CH2-C(=O)-NH-CH2CH2O-CH2CH2O-CH2CH2O-CH2CH2O-CH2CH2-C(=O)-GGFG-NH-CH2CH2CH2-C(=O)-,
からなる群から選択される任意の構造を有するリンカーを介して、細胞傷害剤または抗腫瘍化合物にコンジュゲートされており、
抗体は、-(Succinimid-3-yl-N)の末端に接続されており、細胞傷害剤または抗腫瘍化合物は、1位のアミノ基の窒素原子を接続位置として、式(a)〜(f)の最も右側のカルボニル基に接続されており、GGFGは、ペプチド結合を介して連結されているグリシン−グリシン−フェニルアラニン−グリシンからなるアミノ酸配列を表し、
-(Succinimid-3-yl-N)は、以下の式:
により表される構造を有し、その3位で抗体に接続されており、1位の窒素原子上でこの構造を含むリンカー構造のメチレン基に接続されている、請求項1から26のいずれか一項に記載のコンジュゲート。 - リンカーが、以下の式(a)〜(c):
(a)-(Succinimid-3-yl-N)-CH2CH2CH2CH2CH2-C(=O)-GGFG-NH-CH2-O-CH2-C(=O)-,
(b)-(Succinimid-3-yl-N)-CH2CH2CH2CH2CH2-C(=O)-GGFG-NH-CH2CH2-O-CH2-C(=O)-,および
(c)-(Succinimid-3-yl-N)-CH2CH2-C(=O)-NH-CH2CH2O-CH2CH2O-CH2CH2-C(=O)-GGFG-NH-CH2CH2CH2-C(=O)-
からなる群から選択される任意の式により表される、請求項27に記載のコンジュゲート。 - リンカーが、以下の式(a):
(a)-(Succinimid-3-yl-N)-CH2CH2CH2CH2CH2-C(=O)-GGFG-NH-CH2-O-CH2-C(=O)-
により表される、請求項27または28に記載のコンジュゲート。 - 抗体が、重鎖可変領域および軽鎖可変領域または重鎖および軽鎖の以下の組合せa)〜d):
(a)重鎖可変領域は、配列番号10のアミノ酸配列を有し、軽鎖可変領域は、配列番号12のアミノ酸配列を有すること、
(b)重鎖可変領域は、配列番号11のアミノ酸配列を有し、軽鎖可変領域は、配列番号12のアミノ酸配列を有すること、
(c)重鎖は、配列番号22のアミノ酸配列を有し、軽鎖は、配列番号16のアミノ酸配列を有すること、および
(d)重鎖は、配列番号19のアミノ酸配列を有し、軽鎖は、配列番号16のアミノ酸配列を有すること
のいずれか1つを含む、請求項30または31に記載のコンジュゲート。 - 抗体が、脱フコシル化、フコース低減、N−連結グリコシル化、O−連結グリコシル化、N末端プロセシング、C末端プロセシング、脱アミド化、アスパラギン酸の異性化、メチオニンの酸化、重鎖の234位および235位にある2つのロイシン(L)残基のアラニン(A)への置換(LALA)、プロリン残基のアミド化、およびカルボキシル末端の1つまたは2つのアミノ酸の欠失または欠如からなる群から選択される1つまたは複数の修飾を含む、請求項1から36のいずれか一項に記載のコンジュゲート。
- 抗体が、重鎖のカルボキシル末端の1つまたは2つのアミノ酸の欠失または欠如を含む、請求項37に記載のコンジュゲート。
- 抗体が、両方が1つのカルボキシル末端アミノ酸残基を欠如する2つの重鎖を含む、請求項38に記載のコンジュゲート。
- コンジュゲートされた細胞傷害剤、特に薬物リンカー構造の、1抗体当たりの平均数yが、1から10までの範囲である、請求項1から39のいずれか一項に記載のコンジュゲート。
- コンジュゲートされた細胞傷害剤、特に選択された1つの薬物−リンカー構造の単位の、1抗体当たりの平均数yが、2から8までの範囲である、請求項1から40のいずれか一項に記載のコンジュゲート。
- コンジュゲートされた細胞傷害剤、特に選択された1つの薬物−リンカー構造の単位の、1抗体当たりの平均数yが、3から8までの範囲である、請求項1から41のいずれか一項に記載のコンジュゲート。
- コンジュゲートされた細胞傷害剤、特に選択された1つの薬物−リンカー構造の単位の、1抗体当たりの平均数yが、7から8までの範囲である、請求項1から42のいずれか一項に記載のコンジュゲート。
- コンジュゲートされた細胞傷害剤、特に選択された1つの薬物−リンカー構造の単位の、1抗体当たりの平均数yが、7.5から8までの範囲である、請求項1から43のいずれか一項に記載のコンジュゲート。
- 1抗体分子当たりのコンジュゲートされた細胞傷害剤の数が、8である、請求項1から44のいずれか一項に記載のコンジュゲート。
- 請求項1から45のいずれか一項に記載のコンジュゲートを含む組成物。
- 医薬において使用するための、請求項1から45のいずれか一項に記載のコンジュゲート。
- がん、感染症、自己免疫疾患、または免疫不全障害の治療に使用するための、請求項47に記載のコンジュゲートまたは請求項46に記載の組成物。
- がんが、TA−MUC1を発現することにより特徴付けられる、請求項47または48に記載のコンジュゲートまたは組成物。
- がんが、卵巣がん、乳がん、膵臓がん、肺がん、結腸がん、胃がん、肝臓がん、腎臓がん、血液がん、子宮内膜がん、甲状腺がん、白血病、半水癌、黒色腫、癌腫、奇形腫、リンパ腫、肉腫、中皮腫、神経芽細胞腫、神経膠腫、直腸がん、副腎がん、皮膚がん、脳がん、子宮頸がん、腸管がん、腸がん、頭頸部がん、消化管がん、リンパ節がん、食道がん、結腸直腸がん、耳鼻咽喉(ENT)がん、前立腺がん、膀胱がん、子宮がん、およびそれらの転移からなる群から選択される、請求項49に記載のコンジュゲートまたは組成物。
- 組成物が、さらなる作用剤と組み合わせて使用される、請求項46から50のいずれか一項に記載のコンジュゲートまたは組成物。
- それを必要とする対象のがんを治療するための方法であって、がんを有する対象に、実施形態1から45のいずれか一項に記載のコンジュゲートまたは請求項46に記載の組成物の治療有効量を投与するステップを含む方法。
- がんが、TA−MUC1を発現することにより特徴付けられる、請求項52に記載の方法。
- がんが、卵巣がん、乳がん、膵臓がん、肺がん、結腸がん、胃がん、肝臓がん、腎臓がん、血液がん、子宮内膜がん、甲状腺がん、白血病、半水癌、黒色腫、癌腫、奇形腫、リンパ腫、肉腫、中皮腫、神経芽細胞腫、神経膠腫、直腸がん、副腎がん、皮膚がん、脳がん、子宮頸がん、腸管がん、腸がん、頭頸部がん、消化管がん、リンパ節がん、食道がん、結腸直腸がん、耳鼻咽喉(ENT)がん、前立腺がん、膀胱がん、子宮がん、およびそれらの転移からなる群から選択される、請求項52または53に記載のがんを治療するための方法。
- さらなる療法剤を投与するステップをさらに含む、請求項54に記載のがんを治療するための方法。
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