ES2278079T3 - Proteinas morfogenicas oseas (bmp), receptores de bmp y proteinas de union a bmp y su utilizacion en el diagnostico y en el tratamiento del glaucoma. - Google Patents
Proteinas morfogenicas oseas (bmp), receptores de bmp y proteinas de union a bmp y su utilizacion en el diagnostico y en el tratamiento del glaucoma. Download PDFInfo
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Abstract
Procedimiento para el diagnóstico del glaucoma en una muestra obtenida de una célula o de un líquido corporal mediante la detección de la expresión alterada de un gen miembro de la familia morfogénica ósea, comprendiendo dicho procedimiento las etapas siguientes: a) extraer ADN de una muestra de tejido o de líquido obtenida de un paciente del que se sospecha que presenta un glaucoma; b) obtener una pluralidad de cebadores de PCR, en el que dichos cebadores comprenden cada uno una secuencia constituida por de 18 a 1.547 nucleótidos contiguos de SEC ID nº 1, SEC ID nº 3, SEC ID nº 5, SEC ID nº 7, SEC ID nº 37, SEC ID nº 39, SEC ID nº 41, SEC ID nº 43, SEC ID nº 45, SEC ID nº 47 o SEC ID nº 53; c) amplificar regiones del ADN extraído utilizando dichos cebadores para obtener un producto de PCR; d) resolver el producto de PCR; y e) identificar las diferencias entre la secuencia del ADN extraído amplificado y la secuencia del cebador; en el que una diferencia entre la secuencia amplificada y el cebador es diagnóstica de glaucoma.
Description
Proteínas morfogénicas óseas (BMP), receptores
de BMP y proteínas de unión a BMP y su utilización en el diagnóstico
y en el tratamiento del glaucoma.
La presente invención da a conocer
procedimientos y reactivos para el diagnóstico y el tratamiento del
glaucoma y los trastornos relacionados.
Los "glaucomas" son un grupo de
enfermedades debilitantes de los ojos que son la causa principal de
ceguera irreversible en los Estados Unidos y en otros países
desarrollados. El glaucoma primario de ángulo abierto
("PoAG"), la forma más común de glaucoma, se caracteriza por la
degeneración de la malla trabecular, conduciendo a la obstrucción
de la capacidad normal del humor acuoso de salir del ojo sin cierre
del espacio (es decir, el "ángulo") entre el iris y la córnea
(Vaughan, D. et al., (1992)). Una característica de dicha
obstrucción en la enfermedad es la presión intraocular ("IOP")
incrementada, que resulta en la pérdida gradual de la visión y en
ceguera si no se trata adecuadamente y a tiempo. Se estima que la
enfermedad afecta a entre 0,4% y 3,3% de la población adulta de más
de 40 años (Leske, M.C. et al., (1986); Bengtsson, B.,
(1989); Strong, N.P., (1992)). Además, la prevalencia de la
enfermedad se incrementa con la edad hasta superar el 6% de las
personas de 75 o más años (Strong, N.P., (1992)).
Debido a que la IOP incrementada es una
característica fácilmente medible del glaucoma, se realiza un
cribado diagnóstico de la enfermedad mayoritariamente mediante la
medición de la presión intraocular (tonometría) (Strong, N.P.,
(1992); Greve, M. et al., (1993)). Por desgracia, debido a
que los intervalos de presión glaucomatosa y normal se solapan,
estos procedimientos resultan de valor limitado a menos que se
obtengan múltiples lecturas (Hitchings, R.A., (1993); Tuck, M.W.
et al., 1993; Vaughan, D. et al., (1992); Vernon,
S.A., (1993)). Por ello, con frecuencia se llevan a cabo
procedimientos adicionales, tales como el examen directo del disco
óptico y la determinación del grado de pérdida del campo visual del
paciente, con el fin de mejorar la exactitud del diagnóstico (Greve,
M. et al., (1993)).
El glaucoma afecta a tres tejidos diferentes del
ojo. La IOP incrementada asociada con el PoAG se debe a cambios
morfológicos y bioquímicos en la malla trabecular (TM), un tejido
situado en el ángulo entre la córnea y el iris. La mayor parte del
humor acuoso nutritivo sale por el segmento anterior del ojo a
través de la TM. La pérdida progresiva de células de la TM y la
acumulación de residuos extracelulares en la TM del ojo glaucomatoso
conduce a un incremento de la resistencia a la salida de flujo
acuoso (Lutjen-Drecoll y Rohen, 1996; Rohen, 1983;
Rohen et al., 1993; Grierson y Calthorpe, 1988), elevando de
esta manera la IOP. La IOP incrementada, así como otros factores,
tales como la isquemia, causan cambios degenerativos en la cabeza
del nervio óptico (ONA), conduciendo a una "excavación"
progresiva de la ONA (Varma y Minckler, 1996; Hernández y Gong,
1996; Hernández et al. 1990; Hernández y Pena, 1997;
Morrison et al., 1990) y la pérdida de células ganglionares
y axones retinianos (Quigley et al., 2000; Quigley, 1999;
Quigley et al., 1995; Kerrigan et al., 1997). Los
mecanismos moleculares detallados responsables de los daños
glaucomatosos en la TM, ONA y células ganglionares retinianas son
desconocidos.
La terapia actual del glaucoma se centra en
reducir la IOP, un factor de riesgo importante del desarrollo y
progresión de glaucoma. Estas terapias reducen la IOP, pero no
tratan directamente los mecanismos patogénicos, por lo que la
enfermedad continúa progresando. Como mínimo la mitad de los
pacientes con glaucoma no han sido diagnosticados, y cuando el
glaucoma ha sido diagnosticado en estos pacientes, ya han perdido
aproximadamente el 40% de sus células ganglionares retinianas. Por
lo tanto, son necesarios procedimientos para la detección y
diagnóstico precoces del glaucoma.
En vista de la importancia del glaucoma, y a lo
inadecuado por lo menos en parte de los procedimientos de
diagnóstico anteriores, resultaría deseable disponer de un
procedimiento mejorado, más exacto para diagnosticar el glaucoma en
sus primeros estadios. Además, resultaría deseable disponer de
nuevos agentes terapéuticos que tratasen los mecanismos patogénicos
glaucomatosos.
La presente invención supera éstas y otras
desventajas de la técnica anterior proporcionando procedimientos
para el diagnóstico precoz del glaucoma.
En determinadas formas de realización
específicas, la invención proporciona un procedimiento para
diagnosticar el glaucoma en una muestra obtenida de una célula o
líquido corporal mediante la detección de la expresión alterada de
un gen miembro de una familia de proteínas morfogénicas óseas, Este
procedimiento se proporciona en la reivindicación 1. Se
proporcionan formas de realización ventajosas en la reivindicación
dependiente 5.
En general, los procedimientos de la invención
pueden incluir obtener una muestra de un individuo y extraer el ADN
de dicha muestra. A continuación, se utilizan unos cebadores de PCR
seleccionados para miembros específicos de la familia del gen de
BMP con el fin de amplificar regiones relevantes del gen extraído,
obteniendo un producto de PCR. El producto de PCR se resuelve
mediante una técnica que identifica efectivamente las diferencias
en la secuencia de ADN entre la forma normal y la mutada del gen
específico de la familia de BMP que se está evaluando (el ADN
extraído). Las diferencias identificadas entre las secuencias son
indicativas de glaucoma.
La muestra de tejido o de líquido para la
utilización en los procedimientos de la invención puede ser de
células de sangre o de la boca.
Típicamente, las secuencias de cebador
presentarán una longitud de entre aproximadamente 10, 15 ó 18
nucleótidos y aproximadamente 20, o aproximadamente 30 nucleótidos.
Las secuencias más largas, por ejemplo de 40, 50, 80, 90, 95, 100,
incluso hasta la longitud completa, resultan todavía más preferidos
para determinadas formas de realización. Las longitudes de
oligonucleótidos de por lo menos aproximadamente 18 a 20 nucleótidos
se encuentran bien aceptadas por los expertos en la materia como
suficientes para una hibridación suficientemente específica para
que resulte útil como sonda molecular, tal como describe Lathe
(1985), cuya referencia se incorpora específicamente a la presente
memoria como referencia con este fin. Preferentemente, la secuencia
de nucleótidos consta de 20 a 100 nucleótidos contiguos de SEC ID nº
1, SEC ID nº 3, SEC ID nº 5, SEC ID nº 7, SEC ID nº 37, SEC ID nº
39, SEC ID nº 41 SEC ID nº 43, SEC ID nº 45, SEC ID nº 47 o SEC ID
nº 53. Se contempla asimismo que las secuencias de cebador consten
de secuencias de por lo menos 10, 15 ó 18 nucleótidos contiguos a
las secuencias de genes de receptor de BMP y de proteínas asociadas
a BMP, las secuencias de las cuales son conocidas.
Resultan útiles como sondas de hibridación las
moléculas de ácidos nucleicos con tramos de 10, 18, 20, 30, 50, 60,
65 o incluso hasta 100 nucleótidos aproximadamente, complementarios
a cualquiera de entre SEC ID nº 1, SEC ID nº 3, SEC ID nº 5, SEC ID
nº 7, SEC ID nº 37, SEC ID nº 39, SEC ID nº 41, SEC ID nº 43, SEC ID
nº 45, SEC ID nº 47 o SEC ID nº 53. Los expertos en la materia
reconocen que los cebadores o sondas con una longitud de
nucleótidos de aproximadamente 18 nucleótidos proporcionan una
hibridación altamente específica con una secuencia diana. El tamaño
total del fragmento, así como el tamaño de los tramos
complementarios, en última instancia dependerá del uso aplicado que
se pretenda para el segmento particular de ácidos nucleicos. Los
fragmentos más pequeños generalmente resultarán útiles en formas de
realización de hibridación, en las que la longitud de la región
complementaria puede ser variada, tal como entre aproximadamente 10,
18, 20 ó 30 y aproximadamente 50, 60, 70, 80, 90 ó 100 nucleótidos,
o incluso de longitud completa según las secuencias complementarias
que se desee detectar.
En las formas de realización específicamente
preferidas, los cebadores constan de secuencias contiguas de SEC ID
nº 1, SEC ID nº 3, SEC ID nº 5, SEC ID nº 7, SEC ID nº 37, SEC ID nº
39, SEC ID nº 41, SEC ID nº 43, SEC ID nº 45, SEC ID nº 47 o SEC ID
nº 53. En otras formas de realización preferidas, los cebadores
consisten de secuencias contiguas a genes de receptor de BMP (dadas
a conocer en Dijke et al., 1993; Astrom et al., 1999;
Nohno et al., 1995, que se incorporan a la presente memoria
en su totalidad como referencia) o de genes asociados a BMP, tales
como la cordina (NCBI NM_029130), la gremlina (Murphy et al.,
1999; McMahon et al., 2000), la folistatina (NCBI NM_003892)
o bambi (NCBI NM_005791). Más preferentemente, los cebadores
consisten de una secuencia contigua a SEC ID nº 3. En determinados
aspectos, por lo menos algunos de los cebadores pueden incluir
además un marcaje detectable.
En otras formas de realización, la invención
proporciona un procedimiento para tratar el glaucoma mediante la
administración a un paciente que lo necesita, de una composición que
comprende una secuencia que consta por lo menos un compuesto
seleccionado de entre el grupo constituidos por un agonista BMP2, un
agonista BMP4, un agonista BMP5, un agonista de BMP7, un agonista
de Smad 1/5, un antagonista de la cordina, un antagonista de la
gremlina y un antagonista de la folistatina.
En aspectos adicionales, la presente invención
proporciona un procedimiento para identificar un agente terapéutico
para el tratamiento del glaucoma. Pueden identificarse agentes
terapéuticos, por ejemplo mediante:
- a)
- la obtención de una primera composición que comprende una población de células recombinantes que expresan BMP-2A, BMP4, BMP5 o BMP7;
- b)
- la obtención de una sustancia candidata;
- c)
- la incubación de dicha composición y dicha sustancia candidata;
el ensayo de dicha composición para su capacidad
de activar rutas de señalización de Smad inducidas por BMP y/o la
expresión génica regulada por BMP; y la identificación de una
sustancia candidata que inhiba o estimule estos efectos corriente
abajo de la BMP.
Otro aspecto de la invención son kits
diagnósticos que contienen secuencias de la presente invención y
reactivos adecuados, tales como un marcaje detectable unido a una
proteína, péptido o al anticuerpo mismo. Alternativamente, el
marcaje detectable puede unirse a una segunda secuencia que se
hibride selectivamente a una secuencia de la invención.
Entre las formas de realización relacionadas se
incluyen kits terapéuticos que incluyen formulaciones
farmacéuticamente aceptables de las secuencias de ácidos nucleicos
o de secuencias de péptido o de proteína dadas a conocer en la
presente memoria. Estos kits resultan útiles en la detección de la
expresión alterada de genes y proteínas BMP en muestras clínicas
para el diagnóstico del glaucoma.
Los dibujos forman parte de la presente
especificación y se incluían para demostrar adicionalmente
determinados aspectos de la presente invención. La invención podrá
entenderse mejor haciendo referencia a uno o más de estos dibujos
en combinación con la descripción detallada de las formas de
realización específicas presentadas en la presente memoria.
Fig. 1. Secuencia de nucleótidos y de
aminoácidos de BMP2A.
Fig. 2. Secuencia de nucleótidos y de
aminoácidos de BMP4.
Fig. 3. Secuencia de nucleótidos y de
aminoácidos de BMP5.
Fig. 4. Secuencia de nucleótidos y de
aminoácidos de BMP7.
Fig. 5. Ruta de señalización de proteína
morfogénica ósea. Los dímeros de proteína morfogénica ósea (BMP) se
une a un complejo de membrana compuesto de receptores 1 y 2 de BMP,
que son serina/treonina quinasas. Los Smads (Smad1/Smad5)
reguladores resultan fosforilados y se asocian con un
co-Smad (Smad 4). Este complejo Smad resultante
entra en el núcleo, en el que se asocia con factores de
transcripción (TF) y regula la expresión génica. Las proteínas
asociadas a la BMP actúan como antagonistas de la BMP añadiéndose a
BMP y evitando la interacción de BMP con receptores de BMP.
Fig. 6. Expresión de BMP en células y tejidos de
la TM humana. Gel de agarosa teñido con bromuro de etidio de
productos PCR de BMP procedentes de muestras de ADNc generados a
partir de análisis de PCR-RT de la expresión de BMP
en células (carriles 1 a 5) y tejidos de la TM (carriles 6 y 7)
humanas. L = marcadores de pares de bases. C = carril de control
negativo de PCR. Se utilizó la \beta-actina como
control interno positivo de la PCR-RT.
Fig. 7. Expresión de receptores de BMP en
células y tejidos de la TM humana. Gel de agarosa teñido con bromuro
de etidio de productos PCR procedentes de muestras de ADNc
generados en análisis de PCR-RT de receptores de
BMP en células (carriles 1 a 5) y tejidos de la TM (carriles 6 y 7)
humana. L = marcadores de pares de bases. C = carril de control
negativo de PCR. Se utilizó la \beta-actina como
control interno positivo de la PCR-RT.
Fig. 8. Expresión de BMP en astrocitos de la ONA
humano, tejidos de la ONA y en astrocitos cerebrales humanos. Gel
de agarosa teñido con bromuro de etidio de productos PCR procedentes
de muestras de ADNc generados en análisis PCR-RT de
la expresión de BMP en astrocitos de la ONA humana (carriles 1 a 5),
tejido de la ONA (carril 6) y astrocitos cerebrales humanos (carril
7). L = marcadores de pares de bases. C = carril de control negativo
de PCR. Se utilizó la \beta-actina como control
interno positivo de PCR-RT.
Fig. 9. Expresión de BMP en líneas celulares de
lámina cribosa humana. Gel de agarosa teñido con bromuro de etidio
de productos PCR procedentes de muestras de ADNc generados en
análisis PCR-RT de células de lámina cribosa humana
(carriles 1 a 9). L = marcadores de pares de bases. C = carril de
control negativo de PCR. Se utilizó la
\beta-actina como control interno positivo de
PCR-RT.
Fig. 10. Expresión de receptores de BMP en
astrocitos de ONA humana, tejidos de la ONA y astrocitos cerebrales
humanos. Gel de agarosa teñido con bromuro de etidio de productos
PCR procedentes de muestras de ADNc generados en análisis
PCR-RT de la expresión de receptores de BMP en
astrocitos de cabeza de nervio óptico (ONA) humana (carriles 1 a
5), tejido de la ONA (carril 6) y astrocitos cerebrales humanos
(carril 7). L = marcadores de pares de bases. C = carril de control
negativo de PCR. Se utilizó la \beta-actina como
control positivo de PCR-RT.
Fig. 11. Expresión de receptores de BMP en
líneas celulares de lámina cribosa humana. Gel de agarosa teñido
con bromuro de etidio de productos PCR procedentes de muestras de
ADNc generados mediante análisis de PCR-RT de
células de lámina cribosa humana (carriles 1 a 9). L = marcadores de
pares de bases. C = carril de control negativo de PCR. Se utilizó la
\beta-actina como control positivo de
PCR-RT.
Fig. 12. Inmunotransferencia western de BMP y de
la expresión de receptores de BMP en cultivo de células de TM
humana, astrocitos de cabeza de nervio óptico (ONA) y en células de
lámina cribosa. Detección quimioluminiscente de proteínas BMP y
receptores de BMP en células de malla trabecular humana (carriles 1
y 2), astrocitos de la ONA (carriles 3 y 4) y células de lámina
cribosa (carriles 5 y 6). El tamaño de las proteínas se indica en
kDa.
Fig. 13. Expresión de ARNm de proteínas
asociadas a BMP en células de TM humana. Gel de agarosa teñido con
bromuro de etidio de productos PCR procedentes de muestras de ADNc
generadas en análisis de PCR-RT de células de TM
humana (carriles 1 a 5). L = marcadores de pares de bases. C =
carril de control negativo de PCR. Se utilizó
\beta-actina como control positivo interno de
PCR-TM.
Fig. 14. Expresión de ARNm de proteínas
asociadas a BMP en células de lámina cribosa humana y en astrocitos
de la ONA. Gel de agarosa teñido con bromuro de etidio de productos
PCR procedentes de muestras de ADNc generadas en análisis
PCR-RT de células de lámina cribosa (LC) (carriles 1
a 7) y en astrocitos (ONA) de la ONA (carriles 8 a 11). L =
marcadores de pares de bases. C = carril de control negativo de PCR.
Se utilizó \beta-actina como control positivo de
PCR-RT.
Fig. 15. Ilustra la expresión incrementada del
antagonista de BMP gremlina (CKTSF1B1) en células glaucomatosas de
la TM. Se evaluó la expresión génica utilizando series génicas
Affymetrix (chip génico Affymetrix U133A).
Se ha propuesto que la malla trabecular
desempeña un importante papel en el flujo normal del humor acuoso,
y se ha planteado que constituye el sitio principal de resistencia
al flujo hacia afuera en los ojos glaucomatosos. Las células de la
malla trabecular humana (HTM) son células especializadas que
revisten los canales de flujo externo por los que el humor acuoso
sale del ojo. La alteración de la función sintética de las células
puede encontrarse implicada en la patogénesis del POAG, glaucoma
por esteroides y otros tipos de glaucoma.
A pesar de años de investigación intensiva, los
mecanismos moleculares exactos responsables del daño glaucomatosa
en el ojo no se conocen. La investigación recientemente ha sugerido
que los factores de crecimiento podrían resultar importantes en el
mantenimiento de la homeostasis normal en los tejidos oculares
asociados al glaucoma, y que las alteraciones en el factor de
crecimiento/receptores del factor de crecimiento podrían desempeñar
un papel en la patogénesis del glaucoma. Los factores de crecimiento
son una familia muy grande de polipéptidos que controlan el
crecimiento y diferenciación celulares. Estas moléculas presentan
una diversidad de efectos específicos de células sobre la expresión
génica, composición y deposición de la matriz extracelular, la
organización citoesquelética y la regulación de funciones
celulares. La TM expresa una amplia diversidad de factores de
crecimiento, receptores de factor de crecimiento (Tripathi et
al., 1993a; Tripathi et al., 1993b; Tripathi et
al., 1994a; Tripathi et al. 1994b; Wordinger et
al., 1998; Wordinger et al., 1999), así como
neurotrofina/factores neurotróficos y sus receptores (Liu et
al., 2001; Wordinger et al., 2000). Los astrocitos de la
ONA y las células de la lámina cribosa, dos tipos celulares de la
cabeza del nervio óptico, expresan factores de crecimiento,
neurotrofinas y sus receptores (Lambert et al., 2001; Pena
et al., 1999). El humor acuoso también contiene una
diversidad de factores de crecimiento, incluyendo FGF2, EGF,
TGF\beta, HGF (Tripathi et al., 1996; Tripathi et
al., 1991; Tripathi et al., 1992; Hu y Ritch, 2001), así
como neurotrofinas (Chundru et al., 2000). Se ha informado
de niveles incrementados de TGF\beta-2 y HGF de
humor acuoso en pacientes de POAG (Tripathi et al., 1994c;
Inatani et al., 2001; Picht et al., 2001). Pueden
encontrarse implicados factores de crecimiento en el glaucoma
mediante la alteración del desarrollo y/o funcionamiento normales de
la TM y
de la ONA.
de la ONA.
La presente invención surge en parte del
reconocimiento de que las proteínas morfogénicas óseas (BMP) no sólo
inducen la formación de hueso y de cartílago, sino que son
citoquinas multifuncionales que presentan un amplio abanico de
efectos sobre numerosos tipos celulares (Hogan 1996; Reddi, 1997) y
se expresan en células tanto de la malla trabecular humana (HTM)
como de la cabeza del nervio óptico (ONA) (Wordinger et al.,
2002). Las BMP son miembros de la superfamilia TGF\beta y existen
aproximadamente 15 a 20 genes de BMP en el hombre, 3 receptores de
BMP y varias proteínas asociadas a BMP que funcionan como
antagonistas de las BMP (Yamashita et al., 1996). Las BMP
señalizan por medio de un complejo receptor que consiste en
BMPR-I y BMPR-II. Se ha informado
de que los miembros de la superfamilia TGF\beta y TGF\betaR
(Agarwal et al., 1997; Lambert et al., 1997) y GDNF y
GDNFR (Wordinger et al., 1999; Liu et al., 1999) se
expresan en células tanto de la HTM como de la ONH.
Las BMP y receptores de BMP se expresan en
tejidos oculares (Obata et al., 1999; You et al.,
1999), aunque los trabajos anteriores se han centrado en el
desarrollo ocular. La función de las BMP resulta importante en el
desarrollo ocular debido a que la alteración dirigida de los genes
que codifican las BMP en ratones conduce a defectos severos del
desarrollo en la retina y el cristalino (Jena et al., 1997;
Luo et al., 1995; Dudley et al., 1995). La
BMP-2, BMP-4 y BMP-7
se encuentran implicadas en el desarrollo de la retina y del
cristalino (Jena et al., 1997; Furuta y Hogan, 1998; Reddi,
2000; Trousse et al., 2001). BMP-6 y
BMP-7 aparentemente también desempeñan un papel en
la protección de las neuronas frente a daños hipoglucémicos o
isquémicos (Nonner et al., 2001; Liu et al., 2001) y
BMP2 se ha demostrado que potencia la expresión de neurotrofinas de
células ganglionares (Zhang et al., 1998). Los ratones
heterocigóticos knock-out haploinsuficientes para
Bmp4 presentan fenotipos oculares entre los que se incluyen la
disgénesis del segmento anterior, IOP elevada, y anormalidades del
nervio óptico (Chang et al., 2001). Se dispone de información
muy limitada sobre el papel de las BMP en el ojo postnatal huno.
Mohan y colaboradores (1998) informaron de que
BMP-2 y BMP-4 y los receptores de
las BMP se expresaban en células de la córnea adulta y sugirieron
de que la función de las BMP podría incluir la proliferación y
apoptosis de los queratocitos. You y colaboradores (1999)
corroboraron este estudio e informaron asimismo de la expresión de
BMP-3, BMP-5 y BMP-7
en células de epitelio corneal y estromales ex vivo y en
cultivo. Informaron de que el nivel de transcripción de las BMP era
más elevado en el estroma, mientras que el nivel para los receptores
era más elevado en el cultivo de células epiteliales corneales.
Mediante la utilización de
PCR-RT, los presentes inventores descubrieron ARNm
para BMP, receptores de BMP llamados BMPR-IA,
BMPR-IB y BMPR-II, así como las
proteínas de unión a BMP gremlina, cordina, folistatina y bambi, en
la HTM, lámina cribosa (LC) y líneas celulares de astrocitos y
tejidos del ONH (Wordinger et al., 2002). Los presentes
inventores descubrieron además que las células de HTM y ONH expresan
proteínas BMP-2, BMP-4,
BMP-5 y BMP-7.
El glaucoma se diagnostica mediante la
caracterización de cambios genéticos en los genes de miembros de la
familia de señalización de BMP. Tal como se utiliza en la presente
memoria, la expresión "gen miembro de la familia de las proteínas
morfogénicas óseas" y "familia de señalización de BMP" se
refiere a todas las BMP, receptores de BMP y proteínas asociadas.
La expresión "cambios genéticos" es bien conocida por los
expertos en la materia. Existen numerosos ejemplos de enfermedades
asociadas a cambios genéticos en genes específicos (por ejemplo ver
Cummings, 1997; Strachan et al., 1996; Jorde et al.,
1999). Los cambios genéticos en un gen específico (por ejemplo BMP)
pueden determinarse utilizando una diversidad de técnicas bien
conocidas por los expertos en la materia, tales como SSCP, DGGE,
ASO, RFLP, análisis de heterodúplex, CCM, PTT y corte por ARNasa
(ver Birren et al., 1998).
El glaucoma puede estar causado por la expresión
alterada de uno o más genes de la familia de las BMP en el ojo, que
conduce a IOP elevada y/o a neuropatía óptica glaucomatosa. La
expresión "expresión alterada del gen de BMP" se refiere a una
expresión de este producto génico diferente de la normal. El término
también puede referirse a alteraciones de la secuencia del gen o
proteína. El gen normal de la BMP ha sido bien caracterizado (ver
lo expuesto anteriormente), y la expresión de la BMP ha sido
informada en una diversidad de tejidos, incluyendo la TM y el NOH.
Los cambios genéticos en la región codificante de los genes de la
familia de BMP puede alterar la función de estas proteínas. Los
cambios genéticos fuera de la región codificante también pueden
conducir al glaucoma.
Es bien conocido por los expertos en la materia
que los "cambios en el exterior" de la región codificante de
un gen específico resultan importantes en la regulación de la
expresión génica. Por ejemplo, la región más arriba (5’) de la
región codificante de la mayoría de genes es conocida como la región
promotora que "promueve" y regula la expresión de ese gen. La
región promotora contiene numerosas secuencias de nucleótidos
reconocidas por diversos factores de transcripción y proteínas de
unión a ADN que son responsables de la activación o represión de la
expresión génica. Las regiones más abajo (3’) del gen puede
determinar la poliadenilación del producto génico, regulando de
esta manera el procesamiento y traducción del ARN en el producto
génico.
La expresión alterada de los genes o mutaciones
de las BMP en la secuencia de los genes que es indicativa de
glaucoma puede detectarse utilizando técnicas bien conocidas por los
expertos en la materia. Por ejemplo, se contempla que pueda
utilizarse un fragmento de ácidos nucleicos de prácticamente
cualquier longitud, estando preferentemente limitada la longitud
total por la facilidad de preparación y utilización en el protocolo
pretendido. Las secuencias de ácidos nucleicos dadas a conocer en
la presente memoria también pueden presentar utilidad como sondas o
cebadores en formas de realización de hibridación de ácidos
nucleicos. Como tales, se contempla que presenten utilidad
particular los segmentos de ácidos nucleicos que comprenden una
región de secuencia que consta de por lo menos una secuencia
contigua de 14 nucleótidos de longitud que presenta la misma
secuencia, o es complementaria, a una secuencia contigua de 14
nucleótidos de longitud de BMP-2A (SEC ID nº 1),
BMP-4 (SEC ID nº 3), BMP-5 (SEC ID
nº 5), BMP-7 (SEC ID nº 7), BMP-RIA
(SEC ID nº 37), BMP-RIB (SEC ID nº 39),
BMP-RII (SEC ID nº 41), cordina (SEC ID nº 43),
gremlina (SEC ID nº 45), folistatina (SEC ID nº 47) o bambi (SEC ID
nº 53). Las secuencias complementarias o idénticas contiguas de
mayor longitud, por ejemplo las de aproximadamente 20, 30, 40, 50,
100, 200, 500, 1.000 nucleótidos (incluyendo todas las longitudes
intermedias) e incluso hasta las secuencias de longitud completa de
aproximadamente 1.547 nucleótidos (para BMP-2A),
1.946 nucleótidos (para BMP-4), 2.153 nucleótidos
(para BMP-5) y 1.878 nucleótidos (para
BMP-7), 2.932 nucleótidos (para
BMP-RIA), 2.032 nucleótidos (para
BMP-RIB), 3.611 nucleótidos (para
BMP-RII), 3.561 nucleótidos (para cordina), 4.049
nucleótidos (para gremlina), 1.386 nucleótidos (para folistatina) y
1.523 nucleótidos (para bambi), también resultarán de utilidad en
determinadas formas de realización.
Se pondrá fácilmente de manifiesto que las
"longitudes intermedias", en este contexto, se refieren a
cualquier longitud entre los intervalos indicados, tales como 14,
15, 16, 17, 18, 19, 20, etc.; 21, 22, 23, etc.; 30, 31, 32, etc.;
50, 51, 52, 53, etc.; 100, 101, 102, 103, etc.; 150, 151, 152, 153,
etc.; incluyendo todos los números enteros comprendidos en los
intervalos entre 200 y 500; entre 500 y 1.000, entre 1.000 y 2.000,
hasta, e incluyendo, secuencias de 2.001, 2.002, 2.050, 2.051 y
similares.
La capacidad de estas sondas de ácidos nucleicos
y cebadores de hibridarse específicamente a secuencias codificantes
y cebadores de BMP para amplificar específicamente secuencias de BMP
permite que resulten de utilidad en la detección de la presencia de
secuencias complementarias en una muestra dada. Sin embargo, se
contemplan otros usos, incluyendo la utilización de la información
de secuencia para la preparación de cebadores de especies mutantes,
o de cebadores para la utilización en la preparación de otras
construcciones genéticas.
Las moléculas de ácidos nucleicos con regiones
de secuencia que consisten en tramos contiguos de nucleótidos de
10, 20, 30, 50 o incluso de 100 a 200 nucleótidos aproximadamente,
idénticos o complementarios a BMP-2A (SEC ID nº 1),
BMP4 (SEC ID nº 3), BMP-5 (SEC ID nº 5), BMP7 (SEC
ID nº 7), BMP-RIA (SEC ID nº 37),
BMP-RIB (SEC ID nº 39), BMP-RII
(SEC ID nº 41), cordina (SEC ID nº 43), gremlina (SEC ID nº 45),
folistatina (SEC ID nº 47) o bambi (SEC ID nº 53) se contemplan
particularmente como sondas de hibridación para la utilización, por
ejemplo, en ensayos de evaluación de SNP y de hibridación en fase
sólida, además de transferencia southern y northern. Esto
permitiría analizar genes estructurales o reguladores de BMP, tanto
en tejidos como en células. El tamaño total del fragmento, así como
el tamaño del tramo o tramos complementarios, dependerá finalmente
del uso aplicado pretendido del segmento particular de ácidos
nucleicos. Los fragmentos de tamaño más reducido generalmente
resultarán útiles en formas de realización de hibridación, en las
que la longitud de la región complementaria contigua puede
variarse, tal como entre aproximadamente 10 y aproximadamente 100
nucleótidos, aunque pueden utilizarse tramos complementarios
contiguos mayores, de hasta aproximadamente 1.547 nucleótidos (para
BMP-2A), de 1.946 nucleótidos (para
BMP-4), 2.153 nucleótidos (para
BMP-5) y 1.878 nucleótidos (para
BMP-7), 2.932 nucleótidos (para
BMP-RIA), 2.032 nucleótidos (para
BMP-RIB), 3.611 nucleótidos (para
BMP-RII), 3.561 nucleótidos (para la cordina),
4.049 nucleótidos (para la gremlina), 1.386 nucleótidos (para la
folistatina) y 1.523 nucleótidos (para bambi), según la longitud de
las secuencias complementarias que se desee detectar.
La utilización de una sonda de hibridación de
aproximadamente 10 a 14 nucleótidos de longitud permite la formación
de una molécula dúplex que es tanto estable como selectiva. Las
moléculas con secuencias complementarias contiguas a lo largo de
tramos de más de 10 bases de longitud resultan generalmente
preferidas, aunque, con el fin de incrementar la estabilidad y la
selectividad del híbrido, y de esta manera mejorar la calidad y
grado de las moléculas híbridas específicas obtenidas, generalmente
resulta preferido diseñar moléculas de ácidos nucleicos con tramos
complementarios al gen de 15 a 20 nucleótidos contiguos, o incluso
de mayor longitud donde se desee.
Pueden seleccionarse sondas de hibridación de
cualquier parte de cualquiera de las secuencias dadas a conocer en
la presente memoria. Sólo se requiere revisar la secuencia
proporcionada en la SEC ID nº 1, SEC ID nº 3, SEC ID nº 5, SEC ID
nº 7, SEC ID nº 37, SEC ID nº 39, SEC ID nº 41, SEC ID nº 43, SEC ID
nº 45, SEC ID nº 47 o SEC ID nº 53 y seleccionar cualquier parte
continua de la secuencia, de entre aproximadamente 10 nucleótidos
de longitud y la secuencia de longitud completa, que se desee
utilizar como sonda o cebador. La elección de secuencias de sonda y
cebador puede encontrarse gobernada por diversos factores, tales
como, únicamente a título de ejemplo, que puede desearse utilizar
cebadores que partan de los extremos de la secuencia total, o de
los extremos de las secuencias codificantes del dominio funcional,
con el fin de amplificar más ADN.
El procedimiento de selección y de preparación
de un segmento de ácidos nucleicos que incluye una secuencia
contigua de entre el interior de BMP-2A (SEC ID nº
1), BMP4 (SEC ID nº 3), BMP-5 (SEC ID nº 5), BMP7
(SEC ID nº 7), BMP-RIA (SEC ID nº 37),
BMP-RIB (SEC ID nº 39), BMP-RII (SEC
ID nº 41), cordina (SEC ID nº 43), gremlina (SEC ID nº 45),
folistatina (SEC ID nº 47) o bambi (SEC ID nº 53) puede
alternativamente describirse como la preparación de un fragmento de
ácidos nucleicos. Evidentemente también pueden obtenerse fragmentos
mediante otras técnicas, tales como, por ejemplo, mediante rotura
mecánica o mediante digestión con enzimas de restricción. Pueden
prepararse fácilmente segmentos o fragmentos pequeños de ácidos
nucleicos mediante, por ejemplo, la síntesis directa del fragmento
por medios químicos, como es práctica común utilizando un
sintetizador automático de oligonucleótidos. Además, pueden
obtenerse fragmentos mediante la aplicación de tecnología de
reproducción de ácidos nucleicos, tal como la tecnología PCR^{TM}
de las patentes US nº 4.683.202 y nº 4.682.195 (cada una
incorporadas a la presente memoria como referencia), mediante la
introducción de secuencias seleccionadas en vectores recombinantes
para la producción recombinante, y mediante otras técnicas de ADN
recombinante generalmente conocidas por los expertos en biología
molecular.
De acuerdo con lo expuesto anteriormente, las
secuencias de nucleótidos de la invención pueden utilizarse por su
capacidad de formar selectivamente moléculas dúplex con tramos
complementarios de genes o ADNc de BMP. Dependiendo de la
aplicación contemplada, se deseará utilizar grados diversos de
selectividad de hibridación para conseguir grados diversos de
selectivamente de la sonda hacia la secuencia diana. Para las
aplicaciones que requieran selectividad elevada, típicamente se
deseará utilizar condiciones relativamente restrictivas para formar
los híbridos, por ejemplo se seleccionarán condiciones de salinidad
relativamente reducida o de temperatura elevada, tal como las
proporcionadas por NaCl 0,02 a 0,15 M a temperaturas de 50ºC a 70ºC.
Estas condiciones selectivas toleran poco o ningún desapareamiento
entre la sonda y la cadena molde o diana, y resultaría
particularmente adecuada para examinar los genes de BMP.
Evidentemente, para algunas aplicaciones, por
ejemplo en las que se desee preparar o identificar mutantes que
utilizan una cadena cebadora mutante hibridada con un molde
subyacente o en el caso de que se desee aislar secuencias
codificantes de BMP de especies relacionadas, equivalentes
funcionales, o similares, resultarán típicamente necesarias
condiciones de hibridación menos restrictivas con el fin de permitir
la formación del heterodúplex. En estas circunstancias, puede
desearse utilizar condiciones tales como concentraciones salinas de
0,15 M a 1,0 M, a temperaturas comprendidas entre 20ºC y 55ºC. De
esta manera pueden identificarse con facilidad especies de
hibridación cruzada como señales de hibridación positiva con
respecto a las hibridaciones de control. En cualquier caso, se
aprecia generalmente que pueden obtenerse condiciones más
restrictivas reduciendo las concentraciones de NaCl o mediante la
adición de cantidades crecientes de formamida, que sirve para
desestabilizar el dúplex híbrido de la misma manera que la
temperatura incrementada. De esta manera, pueden manipularse con
facilidad las condiciones de hibridación, y de esta manera
resultarán generalmente en un procedimiento de selección dependiendo
de los resultados
deseados.
deseados.
En determinadas formas de realización, resultará
ventajoso utilizar secuencias de ácidos nucleicos de la presente
invención en combinación con un medio apropiado, tal como un
marcaje, para identificar la hibridación. Se conocen en la técnica
una amplia diversidad de medios indicadores apropiados, incluyendo
ligandos fluorescentes, radioactivos, enzimáticos u otros, tal como
avidina/biotina, capaces de proporcionar una señal detectable. En
formas de realización preferidas, resultará probablemente deseable
utilizar un marcaje fluorescente o una etiqueta enzimática, tal
como ureasa, fosfatasa alcalina o peroxidasa, en lugar de reactivos
radioactivos u otros reactivos ambientalmente no deseables. En el
caso de las etiquetas enzimáticas, se conocen sustratos indicadores
colorimétricos que pueden utilizarse para proporcionar un medio
visible para el ojo humano, o espectrofotométricamente para
identificar la hibridación específica con muestras que contienen
ácidos nucleicos complementarios.
En general, se contempla que las sondas de
hibridación indicadas en la presente memoria resultarán útiles
tanto como reactivos en la hibridación en solución, así como en
formas de realización que utilizan una fase sólida. En las formas
de realización que implican una fase sólida, el ADN (o ARN) de
ensayo se adsorbe o fija de otra manera a una matriz o superficie
seleccionada. Este ácido nucleico de una cadena fijo se somete a
continuación a hibridación específica con sondas seleccionadas bajo
condiciones deseadas. Las condiciones deseadas dependen de las
circunstancias particulares basándose en los criterios particulares
requeridos (dependiendo, por ejemplo, del contenido de G+C, el tipo
de ácido nucleico diana, la fuente de ácido nucleico, el tamaño de
la sonda de hibridación, etc.). Tras el lavado de la superficie
hibridada para eliminar las moléculas de sonda unidas no
específicamente, se detecta, o incluso se cuantifica, la hibridación
específica, por medio del marcaje.
Se entenderá que la presente invención no se
encuentra limitada a las secuencias particulares de ácidos nucleicos
y de aminoácidos de BPM-2A (SEC ID nº 1), BMP4 (SEC
ID nº 3), BMP-5 (SEC ID nº 5), BMP7 (SEC ID nº 7),
BMP-RIA (SEC ID nº 37), BMP-RIB
(SEC ID nº 39), BMP-RII (SEC ID nº 41), cordina (SEC
ID nº 43), gremlina (SEC ID nº 45), folistatina (SEC ID nº 47) o
bambi (SEC ID nº 53). Por lo tanto, los vectores recombinantes y
segmentos aislados de ADN pueden incluir variadamente las regiones
codificantes de BMP mismas, las regiones más arriba o más abajo de
los genes, las regiones codificantes que portan alteraciones o
modificaciones seleccionadas en la región codificante básica, o
pueden codificar polipéptidos mayores que, sin embargo, incluyen
regiones codificantes de BMP o pueden codificar proteínas o
polipéptidos equivalentes biológicamente funcionales que presentan
secuencias variantes de aminoácidos.
Los segmentos de ADN de la presente invención
comprenden proteínas y polipéptidos BMP equivalentes biológicamente
funcionales. Estas secuencias pueden surgir como consecuencia de la
redundancia de codones y la equivalencia funcional que es conocido
que se producen naturalmente dentro de las secuencias de ácidos
nucleicos y las proteínas codificadas de esta manera.
Alternativamente, pueden crearse proteínas o polipéptidos
funcionalmente equivalentes por medio de la aplicación de
tecnología de ADN recombinante, en la que pueden introducirse
cambios la estructura de la proteína, basándose en consideraciones
de las propiedades de los aminoácidos que se intercambian. Pueden
introducirse cambios diseñados por el hombre mediante la aplicación
de técnicas de mutagénesis sitio-dirigida, por
ejemplo para introducir mejoras en la antigenicidad de la proteína o
para someter a ensayo mutantes de BMP con el fin de examinar la
actividad de unión a nivel molecular.
El agente terapéutico para el tratamiento del
glaucoma puede ser: un péptido o proteína, un mimético de péptido,
un oligonucleótido u oligonucleótido derivatizado, o molécula
pequeña similar a fármaco, que en su totalidad afectan a uno o más
aspectos de las rutas de la BMP ocular. Los agentes terapéuticos
preferidos son los que son: (1) agonistas de BMP2, BMP4, BMP5 o
BMP7, (2) antagonistas de cordina, gremlina, folistatina o bambi,
y/o (3) agonistas de Smad1, Smad5 y/o Smad4.
El agente puede administrarse directamente al
ojo (por ejemplo: gotas o pomadas oculares tópicas; dispositivos de
liberación lenta en el fondo del ojo o implantados contiguos a las
escleróticas o dentro del ojo; inyecciones periocular, conjuntival,
subtenones, intracameral o intravitreal) o parenteralmente (por
ejemplo: oralmente; inyecciones intravenosa, subcutánea o
intramuscular,: administración dérmica, etc.) utilizando técnicas
bien conocidas por los expertos en la materia. Los siguientes son
ejemplos de posibles formulaciones incorporadas por la presente
invención.
(a) | Formulación ocular tópica | % en peso |
Agente que incrementa la expresión de BMP-4 ocular | 0,01 a 2 | |
HPMC | 0,5 | |
Cloruro sódico | 0,8 | |
BAC | 0,01% | |
EDTA | 0,01 | |
NaOH/HCl | cs para pH 7,4 | |
Agua purificada | cs para 100 ml |
\vskip1.000000\baselineskip
(b) | Formulación ocular tópica | % en peso |
Antagonista de gremlina | 0,01 a 2 | |
HPMC | 0,5 | |
Cloruro sódico | 0,8 | |
BAC | 0,01 | |
EDTA | 0,01 | |
NaOH/HCl | cs para pH 7,4 | |
Agua purificada | cs para 100 ml |
\vskip1.000000\baselineskip
(c) | Formulación ocular tópica | % en peso |
Agonista de smad 1/5 | 0,01 a 2 | |
HPMC | 0,5 | |
Cloruro sódico | 0,8 | |
BAC | 0,01 | |
EDTA | 0,01 | |
NaOH/HCl | cs para pH 7,2 | |
Agua purificada | cs para 100 ml |
Se contempla adicionalmente que los compuestos
de la invención podrían formularse en dispositivos de inserción
intraocular.
La presente invención resulta asimismo útil para
el descubrimiento de nuevos agentes terapéuticos contra el glaucoma
que se encuentren implicados en la ruta de señalización de la BMP
(ver la fig. 5). Algunos ligandos selectivos de BMP se unen a
receptores serina/treonina quinasa de la BMP de tipo I y II
(BMP-RI y BMP-RII) transducen
señales a través de las proteínas Smad. La señal de la BMP es
propagada por Smads mediante interacciones
proteína-proteína y proteína-ADN
(Attisano y Tuen Lee-Hoeflich, 2001). Las proteínas
reguladoras Smad1 y Smad5 se activan (mediante fosforilación)
mediante receptores de BMP unidos a ligando (von Bubnoff y Cho,
2001). A continuación, estos Smads reguladores interaccionan con
Smad4 para formar un complejo heteromérico que se trasloca hacia el
núcleo. Este complejo puede activar o reprimir la transcripción de
genes selectivos que reconocen este complejo transcripcional,
dependiendo de que cofactores nucleares se encuentran presentes.
La ruta de señalización BMP/Smad se encuentra
regulada negativamente por varios mecanismos. Determinadas proteínas
de unión a BMP (tales como gremlina, BAMBI o folistatina) se unen a
BMP e inhiben su interacción con receptores de la BMP. Además,
existen proteínas Smad inhibidoras (por ejemplo Smad6 y Smad7) que
se unen e inactivan los receptores de la BMP (Kowabata et
al., 1998; Itoh et al., 2000; Miyazono, 2000). Los
presentes inventores han descubierto que las células de la TM
humana, los astrocitos de la ONH y las células de lámina cribosa
expresan mensaje y proteína para el complejo receptor de la BMP. De
esta manera, estas células podrían responder a ligandos endógenos de
la BMP.
Pueden utilizarse diversos procedimientos para
descubrir nuevos agentes terapéuticos contra el glaucoma, y estas
técnicas son bien conocidas por los expertos en la materia. Por
ejemplo, pueden descubrirse agentes péptido o miméticos de péptido
que actúan como agonistas o inhibidores de las BMP a través del
modelado molecular de estructuras receptoras de la BMP (Nickel
et al., 2001). La transducción de señales de BMP implica
seleccionar grupos de proteínas Smad (Kawabata et al., 1998;
Itoh et al., 2000; Attiseno et al., 2000). Pueden
descubrirse agonistas seleccionados de BMP y de Smad utilizando
ensayos basados en células. La célula experimental debe expresar el
receptor o receptores de BMP apropiados y poseer la ruta apropiada
de señalización de la BMP. Debido a que uno de los efectos
principales de la señalización de la BMP es la alteración de la
expresión génica, pueden descubrirse agonistas de BMP y de Smad
mediante cribado para genes inducidos por BMP. La inducción de
genes regulados por BMP puede asimismo someterse a ensayo mediante
la cuantificación de niveles de ARNm utilizando
PCR-RT cuantitativa (Wang et al., 2001),
micromatrices de ADN o constructos de gen informador. Existen
inhibidores naturales de la señalización de la BMP, las proteínas de
unión a BMP (también conocidas como proteínas asociadas a BMP),
tales como la cordina, la gremlina y la folistatina. Pueden
descubrirse antagonistas de las proteínas inhibidoras utilizando
ensayos de unión a ligandos. Por ejemplo, pueden añadirse agentes
de ensayo a gremlina recombinante purificada, y los agentes que se
unen a la gremlina se identifican utilizando una variedad de
técnicas conocidas por los expertos en la materia. Para determinar
si estos
agentes son antagonistas de la gremlina, se utiliza un ensayo basado en células similar al indicado anteriormente.
agentes son antagonistas de la gremlina, se utiliza un ensayo basado en células similar al indicado anteriormente.
Se contempla que se utilice cualquier modelo de
cribado in vitro e in vivo conjuntamente con la
presente invención para identificar nuevas terapias para el
glaucoma centradas en la familia de genes de la BMP. Estos modelos
son bien conocidos por los expertos en la materia y su práctica se
ha convertido en rutinaria. Pueden diseñarse péptidos o miméticos
de péptido de tamaño reducido basados en el conocimiento de la
estructura/función de la BMP, BMPR y/o productos génicos de
proteína de unión a BMP. Pueden utilizarse ensayos de unión a
ligando para detectar moléculas pequeñas que se unen a BMP, BMPR o
proteínas de unión a BMP. Los ensayos basados en células pueden
detectar los efectos de diversos agentes sobre las rutas de
señalización de la BMP. Las líneas celulares
knock-in que contienen promotores de genes de la
familia de la BMP acoplados a un gen informador pueden generarse
para buscar agentes que alteran la expresión de genes de miembros de
la familia de la BMP. Estos ensayos pueden utilizarse para
identificar moléculas tanto agonistas como antagonistas. Pueden
utilizarse ensayos ex vivo, tales como segmentos anteriores
cultivados en perfusión procedentes de ojos humanos (Clark et
al., 1995a; Pang et al., 2000), para examinar los efectos
de agentes sobre la IOP y sobre la señalización de la BMP en tejido
de la RT. Pueden generase modelos de roedor del glaucoma utilizando
técnicas bien conocidas para crear cepas estables de ratón y de
rata transgénicas, knockout o knock-in para miembros
de la familia de la BMP. Estos modelos de roedor pueden utilizarse
para cribar para agentes que alteran el fenotipo o fenotipos
similares a glaucoma (por ejemplo la tonometría para evaluar los
efectos sobre la IOP, la histología para evaluar los efectos sobre
la neurología óptica glaucomatosa).
La presente invención proporciona
procedimientos, composiciones y kits para la detección precoz del
glaucoma. Los kits pueden contener un segmento de ácidos nucleicos
que codifica un polipéptido o proteína BMP. El kit puede contener
adicionalmente reactivos para detectar una interacción entre una
muestra y un ácido nucleico o péptido de la presente invención. El
reactivo proporcionado puede marcarse radioactivamente,
fluorescentemente o enzimáticamente. El kit puede contener un
agente marcado radioactivamente conocido capaz de unirse o de
interaccionar con un ácido nucleico o péptido o proteína de la
presente invención.
El reactivo del kit puede proporcionarse en
forma de una solución líquida, unido a un soporte sólido o en forma
de polvos secos. Preferentemente, en el caso de que el reactivo se
proporcione en una solución líquida, ésta es una solución acuosa.
Preferentemente, en el caso de que el reactivo proporcionado se una
a un soporte sólido, el soporte sólido puede ser un medio
cromatográfico, presentando una placa de ensayo una pluralidad de
pocillos, o un portaobjetos de microscopía. En el caso de que el
reactivo se proporcione en forma de polvos secos, estos pueden
reconstituirse mediante la adición de un solvente adecuado, que
puede proporcionarse.
Todavía, en otras formas de realización, la
presente invención se refiere a procedimientos diagnósticos y kits
asociados para el diagnóstico del glaucoma. Se propone que se
utilicen los péptidos y ácidos nucleicos asociados a BMP de la
invención para detectar polimorfismos o mutaciones en los ácidos
nucleicos de la BMP procedentes de muestras del paciente. En
general, entre estos procedimientos se incluye, en primer lugar,
obtener una muestra que se sospecha que contiene este polimorfismo o
mutación, poner en contacto la muestra con un péptido o ácido
nucleico de la presente invención, según sea el caso, bajo
condiciones efectivas para permitir la formación de un complejo, y
detectar a continuación la presencia del complejo.
En general, la detección de la formación de
complejo se conoce bastante bien en la técnica y puede conseguirse
mediante la aplicación de numerosos enfoques. Por ejemplo, la
presente invención contempla la aplicación de ELISA, RIA, técnicas
de fluorescencia indirecta y similares. Generalmente, la formación
de complejo se detecta mediante la utilización de un marcaje, tal
como un marcaje radioactivo o una etiqueta enzimática (tal como la
fosfatasa alcalina, la peroxidasa de rábano picante, o similar).
Evidentemente, pueden apreciarse ventajas adicionales de la
utilización de un ligando secundario de unión.
Los ejemplos siguientes son representativos de
las técnicas utilizadas por los inventores para llevar a cabo
aspectos de la presente invención. Debe apreciarse que, aunque estas
técnicas son ejemplares de formas de realización preferidas para la
práctica de la invención, los expertos en la materia, a la luz de la
presente exposición, apreciarán que pueden introducirse numerosas
modificaciones sin apartarse del espíritu y el alcance pretendido
de la invención.
Cultivo celular: se generaron células de la TM y
de la ONA a partir de ojos de donantes tal como se encuentra
descrito (Steely et al., 1992; Steely et al., 2000;
Wilson et al., 1993; Clark et al., 1994; Clark et
al., 1995b; Clark et al., 1995c; Clark et al.,
1996; Clark et al., 2001a; Clark et al., 2001b;
Dickerson et al., 1998; Wordinger et al., 1998;
Wordinger et al., 1999; Wordinger et al., 2000;
Wordinger et al., 2002; Lambert et al., 2001; Agarwal
et al., 1999; Liu et al., 2001). Se cultivaron células
de la TM a partir de explantes de TM de donantes de edades
comprendidas entre 6 días y 90 años. Se generaron células de
astrocitos de cabeza de nervio óptico humano y de células de lámina
cribosa (LC) a partir de cabezas de nervio óptico cuidadosamente
diseccionadas (donantes de edades comprendidas entre 2 días y 90
años) y caracterizadas según trabajos anteriores (Lambert et
al., 2001; Clark et al., 1995a). Las células se
cultivaron hasta la confluencia en los medios siguientes: medio F10
de Ham (JRH Biosciences, Lenexa, KS) que contenía suero de feto
bovino al 10% (HyClone, Logan, UT) y antibióticos (Gibco
BRL-Life Technologies, Grand Island, NY) para las
células de la RT; medio de Eagle modificado por Dulbecco (DMEM,
HyClone) que contenía FBS al 10% paras las células de LC; y medio
de cultivo de astrocitos (AGM, Clonetics, San Diego, CA) que
contenía FBS al 5% para los astrocitos de la ONA.
PCR-RT: también se diseccionaron
tejidos de TM y de ONA procedentes de ojos de donante (Wordinger
et al., 1998; Wang et al. 2001). Se extrajo ARN total
de las células y tejidos de TM y de ONA utilizando extracción con
TRIzol (Gibco BRL-Life Technologies) y se preparó
ADNc mediante procedimientos estándar de transcripción inversa
(Wordinger et al., 1998; Wordinger et al., 1999;
Wordinger et al. 2000; Wordinger et al. 2002). Se
diseñaron cebadores de PCR utilizando el programa informático Oligos
4.0 (ver los pares de cebadores en la Tabla 1). Todos los pares de
cebadores se diseñaron de manera que la amplificación de secuencias
de ADN genómico potencialmente contaminado produjera productos PCR
de ARNm que fueran sustancialmente de mayor tamaño del esperado
debido a que las secuencias de intrón que se extrajeron durante el
procesamiento del ARN se incluirían en el ADN genómico. Los
cebadores de PCR de la \beta-actina,
AGGCCAACCGCGAGAAGATGACC (corriente arriba) y
GAAGTCCAGGGCGACG
TAGCAC (corriente abajo), con una temperatura de hibridación de 55ºC rindieron un producto de PCR de 350 pb.
TAGCAC (corriente abajo), con una temperatura de hibridación de 55ºC rindieron un producto de PCR de 350 pb.
Se llevaron a cabo reacciones de PCR tal como se
ha descrito (Wordinger et al., 1998; Wordinger et al.,
1999; Wordinger et al., 2000; Lambert et al., 2001;
Wordinger et al., 2002) utilizando anticuerpo de taq start de
inicio caliente con las condiciones de ciclo siguientes: 2 minutos
a 94ºC, 2 minutos a 92ºC, y 40 ciclos de 30 segundos a la
temperatura de hibridación óptima, extensión durante 90 segundos a
72ºC y desnaturalización durante 45 segundos a 92ºC. Se examinaron
los productos de PCR amplificados mediante electroforesis horizontal
en geles de 1,5% de agarosa. Con el fin de garantizar la
especificidad de los productos de PCR-RT, se llevó
a cabo análisis de transferencia southern con sondas diseñadas
utilizando Oligo 4.0 que se hibridaban a una región dentro del
producto de PCR amplificado. Se secuenciaron los productos de PCR
para verificar la especificidad de las reacciones de PCR. La Tabla
2 lista los miembros de la familia de BMP expresados en TM y ONA
humanas.
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Inmunotransferencia western: se extrajo proteína
a partir de un cultivo celular utilizando tampón de lisis, y las
proteínas se separaron mediante electroforesis en gel de
poliacrilamida desnaturalizante previamente a la transferencia
electroforética a membranas de nitrocelulosa (Lambert et al.,
2001). Las membranas se bloquearon con 5% de leche (para BMP) o 3%
de gelatina (para BMPR) y se incubaron con los anticuerpos primarios
siguientes: BMP2, BMP4, BMP5, BMP7 (en su totalidad de Santa Cruz,
Santa Cruz, CA) o BMP-RIA, BMP-RIB,
BMP-RII (de Jackson Immuno Research, West Grove,
PA). Las membranas se lavaron, se incubaron con anticuerpos
secundarios (IgG de cabra antiratón-peroxidasa de
rábano picante para las BMP, Santa Cruz; anticabra de
burro-peroxidasa de rábano picante para los
receptores de BMP, Jackson Immuno Research) y se revelaron
utilizando el sistema de inmunodetección de quimioluminiscencia
WesternBreeze (Invitrogen, Carlsbad, CA).
Expresión de ARNm de BMP, de BMPR en células y
tejidos de TM humana: los productos de amplificación esperados de
los pares de cebadores de BMP-2,
BMP-4, BMP-5 y BMP-7
en células y tejidos de TM humana se muestran en la fig. 6. Las
transferencias southern con sondas específicas verificaron que eran
los productos de PCR esperados. Todas las líneas celulares y
tejidos de TM humana expresaron el mensaje para
BMP-2, BMP-4 y
BMP-7. Sin embargo, el mensaje para
BMP-5 se presentó en cantidades reducidas o
indetectables en las muestras de tejido de TM humana (fig. 6,
carriles 6 y 7). Las reacciones de control sin ADNc no resultaron en
productos de amplificación, indicando que los reactivos y cebadores
se encontraban libres de contaminación por ADN o ARN (fig. 6, carril
C).
La fig. 7 muestra los productos de amplificación
de tamaño esperado para los pares de cebadores de
BMP-RIA, BMP-RIB y
BMP-RII en células y tejidos de TM humana. Todas las
células y tejidos de TM humana expresaron el mensaje para los
complejos de receptores de BMP. Las transferencias southern con
sondas específicas verificaron que eran los productos de PCR
esperados. Se detectó un producto de amplificación alternativo (de
350 pb) en la reacción de BMP de la BMP-RII. El
producto de amplificación alternativo se encontraba presente en
todas las células y tejidos de TM humana. Esta banda alternativa se
está identificando en la actualidad para determinar si es una forma
procesada alternativa del receptor. Las reacciones de control sin
ADNc no resultó en productos de amplificación (fig. 7, carril C),
indicando que los reactivos y cebadores se encontraban libres de
contaminación con ADN o ARN.
Expresión de ARNm de BMP y de receptor de BMP en
células y tejidos de ONA humana: se muestran en la fig. 8 los
productos de amplificación del tamaño esperado para los pares de
cebadores de BMP-2, BMP-4,
BMP-5 y BMP-7 en astrocitos de ONA
humana y tejidos de ONA. Todos los astrocitos de ONA y tejidos de
ONA expresaron el mensaje para la BMP respectiva. Se utilizaron los
astrocitos cerebrales humanos como línea celular de control
positivo. Las transferencias southern con sondas específicas
verificaron que eran los productos de PCR esperados. Con la
excepción de BMP-2, todas las demás BMP fueron
expresadas por los astrocitos cerebrales humanos (fig. 8, carril
7). Las reacciones de control sin ADNc no resultaron en productos de
amplificación (fig. 8, carril C), indicando que los reactivos y
cebadores se encontraban libres de contaminación con ADN o ARN.
La fig. 9 muestra los productos de amplificación
de tamaños esperados para los pares de cebadores de
BMP-2, BMP-4, BMP-5
y BMP-7 en cultivo de células de LC humana. Todas
las líneas celulares de LC expresaron el mensaje para cada BMP. Las
transferencias southern con sondas específicas verificaron que eran
los productos de PCR esperados. Las reacciones de control sin ADNc
no resultaron en productos de amplificación (fig. 9, carril C),
indicando que los reactivos y cebadores se encontraban libres de
contaminación con ADN o ARN.
Los productos de amplificación del tamaño
esperado de las parejas de cebadores de BMP-RIA,
BMP-RIB y BUT-RII en astrocitos de
ONA humana y de tejidos de ONA se muestran en la fig. 10. Todas las
líneas celulares de astrocitos de ONA expresaron el mensaje para
BMP-RIA y BMP-RIB. Las sondas
southern con sondas específicas verificaron que eran los productos
de PCR esperados. Con la excepción del tejido de ONA (fig. 10,
carril 6), se expresó BMP-RII en todas las líneas
celulares de astrocitos de ONA. Aparentemente, el mensaje para todas
las BMP (Fig. 10, carril 7) es una discrepancia respecto a la
expresión de la BMP-RII en tejido de ONA y en líneas
celulares de ONA. La expresión reducida de tejido de ONA podría
reflejar un nivel reducido de expresión. Las reacciones de control
sin ADNc no resultaron en productos de amplificación (fig. 5, carril
C), indicando que los reactivos y cebadores se encontraban libres de
contaminación con ADN o ARN.
La fig. 11 muestra los productos de
amplificación de tamaño esperado para los pares de cebadores de
BMP-RIA, BMP-RIB y
BMP-RII en cultivo de células de LC humana. Todas
las líneas celulares de LC expresaron el mensaje para cada receptor
de BMP. Las transferencias southern con sondas específicas
verificaron que eran los productos de PCR esperados. Las reacciones
de control sin ADNc no resultaron en productos de amplificación
(fig. 11, carril C), indicando que los reactivos y cebadores se
encontraban libres de contaminación con ADN o ARN.
Expresión de proteínas BMP y proteínas
receptoras de BMP en células y tejidos de TM y ONA humanas: la fig.
12 representa la detección de inmunotransferencia quimioluminiscente
de las proteínas BMP-2, BMP-4,
BMP-5, BMP-7,
BMP-RIA, BMP-RIB y
BMP-RII en células y tejidos de TM y ONA humanas.
Todas las líneas celulares estudiadas expresaron las proteínas BMP
respectivas. Las proteínas BMP se detectaron en las líneas celulares
que presentan los pesos moleculares siguientes: 54 a 56 kDa para
BPM-2, 25 a 27 kDa para BMP-4, 55 a
57 kDa para BMP-5 y 77 kDa para
BMP-7. Se detectaron bandas múltiples para
BMP-2 y BMP-4, que con toda
probabilidad representan formas glucosiladas y parcialmente
glucosiladas de estas BMP, tal como se ha observado en otros
estudios. Sin embargo, los presentes inventores no llevaron a cabo
estudios de glucosilación, al encontrarse fuera del alcance del
presente estudio. Se detectaron las proteínas receptoras de BMP en
líneas celulares con los pesos moleculares siguientes: 38 kDa para
BMP-RIA, 64 kDa para BMP-RIB, y 57
kDa para BMP-RII. Se detectaron bandas múltiples
para BMP-RIB y BMP-RII en las
células de TM, que con toda probabilidad representan formas
glucosiladas y parcialmente glucosiladas, tal como se ha observado
en otros estudios. Los niveles de expresión de proteínas para los
receptores de BMP eran aparentemente más reducidos en las células de
TM que en las células de ONA. Por ejemplo, no se detectó
BMP-RII en células de TM y la
BMP-RIB se encontraba a niveles muy reducidos.
Expresión de ARNm de proteínas asociadas a BMP
en cultivo de células de TM humana y en células de ONA humana: en
la fig. 13 se muestran productos de amplificación de tamaño esperado
para los pares de cebadores de proteínas asociadas a BMP en líneas
celulares de TM humana. Las líneas celulares de TM humana expresaron
el mensaje de DRM (gremlina), cordina, folistatina y NMA (BAMBI).
Las transferencias southern con sondas específicas verificaron que
eran los productos de PCR esperados. No se observaron diferencias
aparentes en la expresión del mensaje entre líneas celulares. Todas
las células de TM humana examinadas no consiguieron expresar el
mensaje para las proteínas asociadas a BMP llamadas nogina y
Cer-1. Las reacciones de control sin ADNc no
resultaron en productos de amplificación, indicando que los
reactivos y cebadores se encontraban libres de contaminación con ADN
o ARN.
Los productos de amplificación de tamaño
esperado para los pares de cebadores de proteínas asociadas a BMP
en astrocitos de ONA y en líneas celulares de LC se muestran en la
fig. 14. Todos los astrocitos de ONA y las líneas celulares de LC
expresaron el mensaje para DRM (gremlina), folistatina y NMA
(BAMBI). Las transferencias southern con sondas específicas
verificaron que eran los productos de PCR esperados. La mayoría de
las células de LC y de los astrocitos de ONA expresaron el mensaje
para cordina. Todos los astrocitos de ONA humana y de las células
de LC examinadas no consiguieron expresar ARNm para las proteínas
asociadas a BMP llamadas nogina y Cer-1. Las
reacciones de control sin ADNc no resultaron en productos de
amplificación, indicando que los reactivos y los cebadores se
encontraban libres de contaminación con ADN o ARN.
La fig. 15 muestra un nivel incrementado de
expresión de los antagonistas de BMP llamados gremlina (CKTSF1B1)
en células glaucomatosas de TM. Se evaluó la expresión génica
utilizando series génicas Affymetrix (chip génico Affymetrix U
133A).
Todas las composiciones y/o procedimientos dados
a conocer y reivindicados en la presente invención pueden llevarse
a cabo y ejecutarse sin experimentación indebida a partir de la
presente exposición. Aunque las composiciones y procedimientos de
la presente invención han sido descritos en términos de las formas
de realización preferidas, resultará evidente para los expertos en
la materia que pueden introducirse variaciones en las composiciones
y/o procedimientos y en las etapas o en la secuencia de etapas del
procedimiento descrito en la presente memoria sin apartarse del
concepto y alcance de la invención. Más específicamente, resultará
evidente que determinados agentes que se encuentran relacionados
tanto química como estructuralmente pueden sustituirse con los
agentes descritos en la presente invención, consiguiendo resultados
similares. Todas las sustituciones y modificaciones evidentes para
los expertos en la materia se considera que se encuentran
comprendidos dentro del alcance y del concepto de la invención tal
como se define en las reivindicaciones adjuntas.
Las referencias siguientes, en el grado en que
proporcionan detalles de procedimiento ejemplificativos u otros
detalles suplementarios a los proporcionados en la presente
memoria.
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\hskip-.1em\dddseqskiptgccacctga gaaaggctac
\hfill20
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 28
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 20
\vskip0.400000\baselineskip
<212> ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Homo sapiens
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\vskip0.400000\baselineskip
<400> SEC ID nº 28
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\hskip-.1em\dddseqskipacagacaggc tcatccgact
\hfill20
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<210> 29
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<211> 20
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<212> ADN
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<213> Homo sapiens
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<400> SEC ID nº 29
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\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipcactacgacc caggcttcat
\hfill20
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\vskip0.400000\baselineskip
<210> 30
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 20
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<212> ADN
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<213> Homo sapiens
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<400> SEC ID nº 30
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\hskip-.1em\dddseqskipctccgcagct tcttgcttag
\hfill20
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\vskip0.400000\baselineskip
<210> 31
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 20
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<212> ADN
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<213> Homo sapiens
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\vskip0.400000\baselineskip
<400> SEC ID nº 31
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipatccttcttc atctggctgc
\hfill20
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<210> 32
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<211> 20
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<212> ADN
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<213> Homo sapiens
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<400> SEC ID nº 32
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\hskip-.1em\dddseqskipaattggtgtc ctgaggatcg
\hfill20
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<210> 33
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 20
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<212> ADN
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<213> Homo sapiens
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<400> SEC ID nº 33
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\hskip-.1em\dddseqskipatagtgagcc cttcccacct
\hfill20
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\vskip0.400000\baselineskip
<210> 34
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 20
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<212> ADN
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<213> Homo sapiens
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\vskip0.400000\baselineskip
<400> SEC ID nº 34
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipaatgaacaga cccgcatttc
\hfill20
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 35
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 21
\vskip0.400000\baselineskip
<212> ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Homo sapiens
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> SEC ID nº 35
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipgatcgccact ccagctacat c
\hfill21
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 36
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 16
\vskip0.400000\baselineskip
<212> ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Homo sapiens
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> SEC ID nº 36
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipgggcacggca atgacc
\hfill16
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 37
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 2932
\vskip0.400000\baselineskip
<212> ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Homo sapiens
\newpage
\vskip0.400000\baselineskip
<400> SEC ID nº 37
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 38
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 532
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Homo sapiens
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> SEC ID nº 38
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 39
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 2032
\vskip0.400000\baselineskip
<212> ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Homo sapiens
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> SEC ID nº 39
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 40
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 502
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
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<213> Homo sapiens
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\vskip0.400000\baselineskip
<400> SEC ID nº 40
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 41
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 3611
\vskip0.400000\baselineskip
<212> ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Homo sapiens
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> SEC ID nº 41
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 42
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 1038
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Homo sapiens
\newpage
\vskip0.400000\baselineskip
<400> SEC ID nº 42
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 43
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 3561
\vskip0.400000\baselineskip
<212> ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Homo sapiens
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> SEC ID nº 43
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 44
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 94
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Homo sapiens
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> SEC ID nº 44
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 45
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 4049
\vskip0.400000\baselineskip
<212> ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Homo sapiens
\newpage
\vskip0.400000\baselineskip
<400> SEC ID nº 45
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 46
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 184
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Homo sapiens
\newpage
\vskip0.400000\baselineskip
<400> SEC ID nº 46
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 47
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 1386
\vskip0.400000\baselineskip
<212> ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Homo sapiens
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> SEC ID nº 47
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 48
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 317
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Homo sapiens
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> SEC ID nº 48
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 49
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 699
\vskip0.400000\baselineskip
<212> ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Homo sapiens
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> SEC ID nº 49
\vskip1.000000\baselineskip
\newpage
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 50
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 232
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Homo sapiens
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> SEC ID nº 50
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 51
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 804
\vskip0.400000\baselineskip
<212> ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Homo sapiens
\newpage
\vskip0.400000\baselineskip
<400> SEC ID nº 51
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 52
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 267
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Homo sapiens
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> SEC ID nº 52
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 53
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 1523
\vskip0.400000\baselineskip
<212> ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Homo sapiens
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> SEC ID nº 53
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 54
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 260
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Homo sapiens
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> SEC ID nº 54
\vskip1.000000\baselineskip
Claims (5)
1. Procedimiento para el diagnóstico del
glaucoma en una muestra obtenida de una célula o de un líquido
corporal mediante la detección de la expresión alterada de un gen
miembro de la familia morfogénica ósea, comprendiendo dicho
procedimiento las etapas siguientes:
- a)
- extraer ADN de una muestra de tejido o de líquido obtenida de un paciente del que se sospecha que presenta un glaucoma;
- b)
- obtener una pluralidad de cebadores de PCR, en el que dichos cebadores comprenden cada uno una secuencia constituida por de 18 a 1.547 nucleótidos contiguos de SEC ID nº 1, SEC ID nº 3, SEC ID nº 5, SEC ID nº 7, SEC ID nº 37, SEC ID nº 39, SEC ID nº 41, SEC ID nº 43, SEC ID nº 45, SEC ID nº 47 o SEC ID nº 53;
- c)
- amplificar regiones del ADN extraído utilizando dichos cebadores para obtener un producto de PCR;
- d)
- resolver el producto de PCR; y
- e)
- identificar las diferencias entre la secuencia del ADN extraído amplificado y la secuencia del cebador;
en el que una diferencia entre la secuencia
amplificada y el cebador es diagnóstica de glaucoma.
2. Procedimiento según la reivindicación 1, en
el que dicha muestra de tejido de o líquido es sangre o células
bucales.
3. Procedimiento según la reivindicación 1, en
el que los cebadores comprenden secuencias constituidas por de entre
20 a 100 nucleótidos contiguos de SEC ID nº 1, SEC ID nº 3, SEC ID
nº 5, SEC ID nº 7, SEC ID nº 37, SEC ID nº 39, SEC ID nº 41, SEC ID
nº 43, SEC ID nº 45, SEC ID nº 47 o SEC ID nº 53.
4. Procedimiento según la reivindicación 1, en
el que los cebadores comprenden secuencias constituidas por de 20 a
50 nucleótidos contiguos de SEC ID nº 3.
5. Procedimiento según la reivindicación 1, en
el que el producto de PCR se resuelve mediante SSCP, DGGE, ASO o
RFLP.
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