高効率の構造探索エンジンを新たに開発して、高精度のシミュレーション計算を行い、自由エネルギーが相対的に低く実現確率 の高い構造を得ることによって、ホモロジーが低い 部位に対する立体構造モデリング、X線結晶解析や NMR実験情報による構造モデリング、低分子化合物 とのフレキシブルドッキング等に応用し、タンパク 質の分子認識をエネルギー理論の面から評価します。 研究成果は、ソフトウェア・データベースとしてまとめられ、分子シミュレーションシステム「myPresto (旧称:prestoX)」(JBICホームページより)として公開しています。[概念図1] 荻野目洋子さん命名の計算機「頭脳」と「ビンゴ」(NEC express5800+MDserver x2) 【研究課題】 (1)高効率の構造探索エンジンの開発 従来の分子シミュレーションは、現実のありのままを計算していたため、分子の運動は遅く、もっ
Expired:掲載期限切れです この記事は,ロイター・ジャパンとの契約の掲載期限(30日間)を過ぎましたので本サーバから削除しました。 このページは20秒後にNews トップページに自動的に切り替わります。
H19年度「統合データベースプロジェクト」事業成果に対する外部評価の結果 H19年度に開発したサービス(17件)について2008年7月22日-8月12日にかけてウェブサイト上で実施した外部評価の結果をまとめました。 なお、昨年度に実施しまし[H18年度の事業成果に対する外部評価の結果と対応はこちらよりご覧いただけます。 文部科学省委託研究開発事業「統合データベースプロジェクト」は、 大型プロジェクトの成果公開が不十分 データベース(DB)の所在情報や利用法が不明 DBの構築・管理がばらばらで、検索・解析・応用が困難 DBやエントリーへの信頼性の高い注釈の不足 (詳細はreport_DB.pdfを参照) という生命科学系DBの現状を背景に、これらの問題を解決することを課題として発足しました。しかし、実際に取りかかってみますと、DBを取り巻く問題は上記4点にとどまらず、その周辺にある問題を
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