JPH05506994A - セルロースまたはヘミセルロース分解性酵素 - Google Patents
セルロースまたはヘミセルロース分解性酵素Info
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Abstract
(57)【要約】本公報は電子出願前の出願データであるため要約のデータは記録されません。
Description
【発明の詳細な説明】
セルロースまたはヘミセルロース分解性酵素発明の技術分野
本発明は、セルロースまたはヘミセルロース分解性酵素、その酵素をコードする
[lNA構成物、その酵素の生産方法およびその酵素を含んでなるセルロースま
たはヘミセルロースの分解剤に関する。
発明の背景
セルロースを分解できる酵素がバイオマスを液体燃料、ガスおよび飼料タンパク
質に転化することはすでに示唆されている。しかしながら、セルロース分解酵素
によるバイオマス由来の発酵性糖の製造は、例えば、今日使用されているセルロ
ース分解性酵素の効率の悪さに起因して、いまだα−アミラーゼによる殿粉から
のグルコースの製造と経済的に競合できない、さらに、セルロース分解性酵素は
、β−グルカンの分解用として醸造業で、小麦粉の性質を改良するために製パン
業で、セルロースの非結晶部分を除去してバルブの結晶セルロースの割合を高め
るために製紙業で、そしてグJレカンの消化を改善するために飼料業で使用され
ているようである。セルロース分解性酵素のさらに重要な用途は、例えば綿含有
織物の硬さを的で(例えば、ヨーロッパ特許第220016号参照)の使用また
番よ「ストーンウォッシュ」様の外観を織物に付与するために色の局所的変化を
もたらす目的で(例えば、ヨーロツノi特許第307564号参照)生地を処理
することにある。
セルロース分解性酵素の寞用上の検針は、既知セルラーゼ調製物が各種の単一セ
ルラーゼ成分の複雑な混合物として存在し、そしてかなり比活性が低い可能性が
あるなどの性質により抑制されてきた。
多酵素系で単一成分の生産の最適化は困難であるため、セルロース分解性酵素の
工業的に存効な原価での生産が困難であり、そしてそれらの実用化は、所望の効
果を達成するにはかなり多量の酵素を使用する必要があることに起因する困難性
によって妨げられてきた。
上記に指摘したセルロース分解性酵素の短所は、高比活性の単一成分の酵素を選
択使用することによって改善される可能性がある。
単一成分のセルロース分解性酵素は、例えばトリコデルマ・レーセイ(Tric
hoderma reesei)から単離された(Teeri ら、Gene
51゜1987、 43〜52ページ、 PJ、^buja、Biochem、
Bio h s、Res、Cows。
156、1988.180〜185ページ、およびP、J、 Kraulis+
Biochemis±U訃、 1989.7241〜7257ページ、参照)
、ティー・レーセイ(工。
■且旦)のセルラーゼは、セルロースへのパインディングに役立つターミナルA
6i域、酵素のコアーにAfii域を連結するBl域および触媒活性ドメイン
を含むコアーから構成されていることが見い出された。別のティー・レーセイの
セルラーゼのA領域は強く保持されていることが見い出されており、そしてファ
ネロシエーテ・クリソスポリウム(PhanerochaeLe 仙nμ出!吐
岬)により生産されるセルラーゼとも強い相同性を有することが観察された(S
issら、Gene旦、 1988.411〜422ページ)。
発明の要約
驚くべきことに、トリコデルマ・レーセイまたはファネロシエーテ・クリソスポ
リウムのいずれとも近値しない他の糸状菌は、ティー・レーセイのセルラーゼの
A領域に相同性のある領域を含む酵素を生産しうることが見い出された。
従って、本発明は、トリコデルマ(Tr+choder■a)またはファネUシ
ェーテ(PhanerochaaLo)以外の糸状菌から誘導される可能性があ
り、そしてトリコデルマ・レーセイ(□j+oderma reesei)のセ
ルラーゼのターミナル八領域に相同的な謔バインディングドメインを含んでなる
セルロースまたはヘミセルロース分解性酵素に関する。
この酵素では、糖パインディングドメインが、次のアミノ酸配列工
xaa Xaa Gln Cys Gly GIY Xaa Xaa Xaa
Xaa Gly ’Xaa Xaa Xaa Cf1M X≠■
aa
または不溶性のセルロース性基質もしくはヘミセルロース性基質に対して酵素を
パインディングしうる前記配列の副配列を含んでなる。
’Xaa Jは、別の酵素の糖バインディングドメインのアミノ酸配列における
変異を示すことを意図する。ハイフンは、(他の類似の酵素との比較で)アミノ
酸配列における「大きな相違点」を示すこと「ヘミセルロース」の語は、グルカ
ン(1i粉の一部分)類、マンナン類、キシラン類、アラビナン類、ポリグルク
ロン酸またはポリガラクツロン酸を含むことを意図している。「糖パインディン
グドメインJ(rcBDJ)は、糖基質、特に前記のようなセルロースまたはヘ
ミセルロースに対して酵素をパインディングさせうるアミノ酸配列を示すことを
意図している。「相同」の語は、本発明の酵素の糖パインディングドメインを構
成するアミノ酸配列と、ティー・レーセイのセルラーゼにみられるA領域(rA
sI域」はティー・レーセイのセルラーゼのセルロース(すなわち、糖)パイン
ディングドメインを表わすのに使用される語である)を構成するアミノ酸配列と
の同一性の程度が高いことを示すことが意図されている。
現在のところ、セルロースまたはヘミセルロース分解性酵素は、固体基質(セル
ロースを含む)へのパインディングを介する結果、そのような基質に対する酵素
活性を高める酵素分子中の糖パインディングドメインの機能により一定の望まし
い特性をもつティー・レーセイのセルラーゼのAel域に対するその相同性に基
づき糖パインディングドメイン(または「A Si域」)と同一視できるアミノ
酸配列を含むものと信じられている。従って、各種微生物に由来する糖パインデ
ィングドメイン含有酵素の同定および調製は相当な興味がもたれている。
本発明のセルロースまたはヘミセルロース分解性酵素は、ティー・レーセイのセ
ルラーゼのA領域をコードする[lNAの少なくとも一部を含むプローブにより
別の糸状菌のゲノムまたはcDNAライブラリーをスクリーニングすることによ
り都合よく同定されうる0種内(すなわち、異なるティー・レーセイのセルラー
ゼ)および種間で異なるセルロースまたはヘミセルロース分解性酵素の糖パイン
ディングドメインとの相同性が観察されることが、前記スクリーニング方法が現
に興味のある酵素を単離する簡便な方法であると信じられる理由である。
発明の詳細な記述
本発明の酵素に含まれる糖バインディングドメイン(CBD)は、特に、フミコ
ーラ(Humicola) 、例えばフミコーラ・インソレンス()Iusic
ola 1nsolens) 、フザリウム(Fusarium) 、例えばフ
ザリウム・オキシスポラム(Fusarium oxμ且コ憇)、またはミセリ
オブトーラ(勺y(1)Io吐肢■)、例えばミセリオプトーラ・サーモフィル
(h夏月m佳眩」肋μ!旺恒−扱)の菌株より誘導可能である。
上記に示されるアミノ酸配列における変化のいくつかは、「保存的(conse
rvative) J 、ずなわち本発明の各11cB[l含有酵素間のこれら
の位置では、一定のアミノ酸が好ましい、従って、先に示した配列の1位のアミ
ノ酸はTrp又はTyrが好ましい、2位のアミノ酸はGlyまたはAlaが好
ましい、7位のアミノ酸はGln、 lieまたはAsnが好ましい、8位のア
ミノ酸はGlyまたはAsnが好ましい、9位のアミノ酸はTrp、 I’he
または丁yrが好ましい、10位のアミノ酸はSet。
Asn、 ThrまたはGinが好ましい、12位のアミノ酸はPro、Ala
またはCysが好ましい、 13位のアミノ酸はThr+^rgまたはLysが
好ましい。
14位のアミノ酸はThr、 Cysまたは^snが好ましい、18位のアミノ
酸はGlyまたはProが好ましい、 19位のアミノ酸(存在するとすれば)
はSer+ Thr、 Phe+ LeuまたはAlaが好ましい、20位のア
ミノ酸はThrまたは1.ysが好ましい、24位のアミノ酸はGinまたはI
leが好ましい、26位のアミノ酸はG11.^spまたはAlaが好ましい、
27位のアミノ酸はTrp、 PheまたはTyrが好ましい、29位のアミノ
酸はSet、 HisまたはTyrが好ましい、32位のアミノ酸はLeu+
lio、 Gin、 VatまたはThrが好ましい。
本発明の特定のCBD含有酵素の例は、以下のアミノ酸配列の1つを含むもので
ある。
Lau;
Ser Gly Ala Thr Cys Thr Lys 工l@ kSn
Asp ’rrp Tyr Hls Gin cysL@u;
Trp Gly Gin cys Gly Gly 工1@Gly Ph@入I
n GIY Pro Thr cys cys G1n5ar Gly Sir
Thr Cys Val Lys Gin Asn Asp ′rrp Ty
r Sir Gin CysLau;
Trp Gly Gin Cys Gly Gly Asn Gly Tyr
Ser Gly Pro Thr Thr Cys AlaGlu Gly −
Thr Cys Lys Lys Gin Asn Asp Trp Tyr
Ssr Gin Cys ThrPro;
Trp Gly Gin Cys Gly Gly Gin Gly Trp
Gin Gly Pro Thr Cys Cys SerGln Gly −
Thr Cys Arg 八la Gin Asn Gin Trp Tyr
Sir Gin Cys LsuAsn;
Trp Gly Gin Cys Gly Gly Gin Gly Tyr
Sar Gay Cys Thr Asn Cys GluAla Gly S
er Thr Cys 入rg Gin Gin Asn Ala Tyr T
yr Sar Gin cys工1C2
rrp Gly Gin Cyg Gly Gly Gin GlyTfr s
@r GlyCY* Arq入sn Cys Glusir cly Sir
Thr Cys xrg 入1a Gin Agn AJp rf Tyr s
sr (:ln CYIIauI
TrpGIY Gin Cys Gay GlyGin Asr+ Tyr S
ir Gly Pro、 ’rhz” Thr Cog Lx!l
5ar Pro Ph@ Thr Cys Lys Lye 工1a Agn
入sp Phe Tyr sar Gin CysGin:または
Trp Gly Gin Cys Gly Gly入an Gly Trp T
hr Glyλla Thr Thr Cysλ1aSar Gly Lau
Lys Cym Glu Lye Ilaλgn Ajp TL? 智r 7y
y Gin 劉Van 。
本発明のセルロースまたはヘミセルロース分解性酵素は、前記糖パインディング
ドメインに隣接し、そしてそれを酵素の触媒活性ドメインに結合する連結BH域
(ティー・レーセイのセルラーゼについて確立されている命名法を使用)を特定
するアミノ酸配列をさらに含むことができる1本発明の酵素に関して確認された
前記BlI域の配列は、このような配列が親水性で非荷電の一定のアミノ酸が優
先的であり、そして特にグリシンおよび/またはアスパラギンおよび/またはプ
ロリンおよび/またはセリンおよび/またはスレオニンおよび/またはグルタミ
ンに雪むごとにより特徴付けられることを示す、このB jl域の特異な構造は
、特に、主としてグリシンとアスパラギンからなる短い反復単位を含む配列によ
って配列に柔軟性を付与する。このような反復単位は、セリン/スレオニン型の
B 95域を含むティー・レーセイまたはビー・クリソスポリウム(!i。
印互gガ力復)のB5ff域配列には見い出されていない、この柔軟構造が、不
溶性基質に対してA領域を介してパインディングした酵素の触媒活性ドメインの
作用を促進し、そのため本発明の酵素に有益な特性を付与するものと考えられる
。
本発明の酵素に含まれるBf+i域の具体例は、次のアミノ酸配列を有する。
xla Arg Thr Asn Val Gly Gly Gly Sar
Thr Gly Gly Gly Asn Asn Glycly Gly A
sn Asn Gly Gly Asn Pro Gly Gly Asn P
ro GIY Gly Asn Pr。
Gly Gly Asn Pro Gly Gly Asn Pro Gly
Gly Asn Pro Gly GIY Asn CysSar Pro L
eur
Pro GIY GAY Asn Asn ASn ASn Pro Pro
Pro Ala Thr Thr Ser Gln Trpcly Gly S
er Asn Asn Gly Gly Gly Asn Asn Asn G
ly Gly Gly Asn AsnAsn Gry Gly Gly Gl
y Asn Asn Agn Gly Gly Gly Ash Asn As
n Gly GlyGly Asn Thr Gly Gly GIY Sar
Ala Pro Leu;Val Phe Thr Cys Ser Gly
Asn Ser Gly Gly Gly Sir Asn Pro Sar
AsnPro Asn Pro Pro Thr Pro Thr Thr
Phe 工1a Thr Gln Val Pro Asn Pr。
Thr Pro Val Ser Pro Pro Thr Cys Thr
Val Ala Lys;Pro Ala Lsu Trp Pro Asn
Asn Asn Pro Gin Glr+ Gly A!In Pro Ag
n G奄■
Gly Gly Asn ′Asn Gly Gly Gly Asn Gin
Gly Gly Gly Agn Gly Gly cy■
Thr Val Pro Lys;
Pro Gly Sar Gin Val Thr Thr Sar ThrT
hr Sar Ser S@r Sir Thr ’rhrSir Arg A
la Thr Ssr、 Thr Thr Sir Ala Gly Gly
Val Thr sar Ils Th■
Thr Ser Pro Thr Arg Thr Val Thr 工le
Pro Gly Gly 入1a Ser Thr ThrAla Sar T
yr Asn;
clu Ser Gly Gly Gly Asn Thr Asn Pro
Thr Asn Pro Thr ksn Pro ThrAsn Pro T
hr Asn Pro Thr Agn Pro Trp Asn Pro G
ly Asn Pro ’rhr As■
Pro Gly Asn Pro Gly Gly Gly Asn Guy
Gly Asn Gly Gly Asr+ Cys 5a■
Pro Leu;または
Pro Ala Val Gln工Is Pro Ser Sir Sir T
hr Sar Sir Pro Val Asn GinPro Thr Se
r Thr Ser Thr Thr Sar Thr Ser Thr Th
r S@r Sar Pro Pr。
Val Gin Pro Thr Thr Pro Ser Gly Cys
Thr Ala Glu Argもう一つの態様では、本発明はトリコデルマ・
レーセイのセルラーゼのターミナルA 8N域に相同的な糖バインディングドメ
インに関する。そしてこの糖バインディングドメインは次のアミノ酸配列または
不溶性セルロース性もしくはヘミセルロース性の基質に対する一部分にパインデ
ィングさせることのできるそれらの副配列を含んでなる。
具体的な塘パインディングドメインの例は、前記のアミノ酸配列を有するもので
ある。
さらなる態様では、本発明はセルロースまたはヘミセルロース分解性酵素から誘
導される連結Bjl域であって、アミノ酸類グリシンおよび/またはアスパラギ
ンおよび/またはプロリンおよび/またはセリンおよび/またはスレオニンおよ
び/またはグルタミンに豊んだアミノ酸配列を含んでなる領域に関する。前述の
ように、これらのアミノ酸は、しばしば短い反復単位を生じる場合がある。Bf
iJl域の配列の具体例は前記に示したものである。
本発明は、異なるセルロースまたはヘミセルロース分解性酵素のいろいろな領域
を混ぜる機会を提供し、そうすることでCHD + B 8i域および触媒活性
ドメインの新規な組み合わせを創製することでこのタイプの酵素の新規な活性プ
ロフィールをもたらす、従って、本発明の酵素は、アミノ酸配列がある天然のセ
ルロースまたはヘミセルロース分解性酵素から誘導されるCHDを特定するアミ
ノ酸配列、アミノ酸配列が他の天然のセルロースまたはヘミセルロース分解性酵
素から誘導される連結BeJI域を特定するアミノ酸配列、ならびに前記COD
もしくはB Ql域のいずれかを供給する酵素または第三の酵素から誘導される
触媒活性ドメインを含んでなるものであることができる。具体的なL!i様では
、触媒活性ドメインが天然に存在しない酵素がCBDまたはB wI域のいずれ
かを含んでなる。この態様では、CBDおよびBTil域が欠失する酵素から改
善された性質をもつ酵素を構成できる。
本発明の酵素は、エンドグルカナーゼ(セルロース繊維における低結晶質の非晶
賀領域を加水分解できる)、セロビオヒドロラーゼ(またエンドグルカナーゼと
しても知られている、4セロビオ一ス単位を除去することによって非還元鎖端か
らセルロースを分解できる)またはβ−グルコシダーゼのようなセルラーゼであ
ることが好ましい。
またさらなる態様では、本発明は前記のようなセルロースまたはヘミセルロース
分解性酵素をコードするDNA配列を含んでなるDNA構成物に関する。
例えば、本発明の酵素をコードするDNA配列は、セルロースまたはヘミセルロ
ース分解性酵素を産生ずる、アミコーラ(Humicola)、フザリウム(F
usariu膳)、またはミセリオブトラ(M celio thora)の1
菌株のような微生物のcDNAまたはゲノムライブラリーを作製し、そして、前
記のような、酵素の全もしくは部分アミノ酸配列に基づき合成されるオリゴヌク
レオチドプローブまたはティー・レーセイのセルラーゼに由来るすA領域の部分
もしくは全DNA配列に基づくプローブにハイブリダイゼーションすることによ
る常法、あるいは適当な酵素活性を発現するクローンの選別法、あるいは天然の
セルロースまたはヘミセルロース分解性酵素に対して産生される抗体と反応性の
タンパク質を生産するクローンの選別法による陽性クローンのスクリーニングに
より単離できる。
また、本発明の酵素をコードする011^配列は、確立された標準法、例えば、
S、L、 BeaucageおよびM、11. Carutbers+ Tet
rahedronLetters 22.1981.1859〜1869ページ
に記載されたホスホアミシト法またはMatthes ら、The EMBOJ
、 ’4.1984.801〜805ページに記載された方法により合成的に調
製できる。ホスホラミド法によれば、オリゴヌクレオチド類は、例えば自動DN
Aシンセサイザーにより合成され、精製され、アニール化され、連結され、次い
で適当なベクターにクローニングされる。
最後に、DNA配列は、標準的な技法に従う、合成起源、ゲノム起源またはcD
NA起源のフラグメント、適する場合には、完全なりNA構放物のいろいろな部
分に対応するフラグメントの連結によって調製されたゲノムと合成の混合起源、
合成とcDNAの混合起源またはゲノムとcDNAの混合起源からなることがで
きる。従って、本発明の酵素CBDをコードするDNA配列は、ゲノム起源であ
るが、本発明の酵素の8ml域をコードする[lNANA配列成起源であること
ができ、あるいはその逆であってもよく、本発明の酵素の触媒活性ドメインをコ
ードするDNA配列はゲノムまたはcDNA起源からなることが都合よい。
DNA構成物はまた、例えば米国特許第4,683,202号明細書または1?
、に、 5aikiら、5cience 239.1988.487〜491ペ
ージに記載されるような特定のプライマーを使用するポリメラーゼ連鎖反応によ
って調製することもできる。
また、本発明は前記のような挿入DNA flI成物放物持する発現ベクターに
も関する。この発現ベクターは、好ましくは、特定の宿主有機体で酵素の発現を
可能にする適当なプロモーター、オペレーターおよびターミネータ−配列、なら
びに問題の宿主有機体でベクターの復製を可能にする復製起源を含んでもよい。
次に、得られた発現ベクターを、糸状菌細胞のような適当な宿主細胞に形質転換
する。宿主細胞の好ましい例としては、アスペルギルス(ハとn1」■)の−の
種であり、最も好ましくはアスペルギルスt ’) t’ (ハP」山■■肛■
憇)またはアスペルギルスニガー(ハフ恒l扛)が挙げられる。糸状菌細胞は、
プロトプラストの形成、プロトプラストの形質転換、次いで細胞壁の再生を伴う
それ自体既知の方法で形質転換できる。宿主微生物としてのアスペルギルスの使
用は、ヨーロッパ特許第238,023号(Nova Tndustri^/S
)に記載されており、その内容は引用することにより本明細書の内容となる。
また、宿主細胞は細菌、特にストレプトミセス(Stre tow ces)お
よびバチルス(BactlluS)−さらにイー・コリー(旦、 coli)の
菌株であってもよい、sii細胞の形質転換は、例えば、Sambrookら、
Mo1ecular C1onin : A Laborator Manua
l、 Co1d Spring 1larbor。
1989、に記載されるような常法に従って実施することができる。
適当なりNA配列およびベクターの構成物のスクリーニングは、標準的技法(S
ambrookら、上記参照)により実施してもよい。
本発明はさらに、前記のようなセルロースまたはヘミセルロース分解性酵素の生
産方法であって、本発明の発現ベクターで形質転換された細胞を酵素の生産を行
う条件下で培養し、次いで培養物から酵素を回収することからなる方法に関する
。形質転換された宿主細胞の培養に使用される培地は、問題の宿主細胞を増殖す
るのに適するいずれの常用されている培地であってもよい0発現された酵素は培
地中に分泌されるものが都合よく、そして培地からの遠心もしくは濾過による細
胞の分離および硫酸アンモニウムのような塩による培地のタンパク質成分の沈殿
、次いでイオン交換クロマトグラフィーまたはアフィニティークロマトグラフィ
ーなどのクロマトグラフ操作を始めとする周知の方法で回収できる。
前記のような組換えDNA技法、ならびに当該技術分野で周知の発酵法および変
異または他の方法を使用することにより、高純度のセルロースまたはヘミセルロ
ース分解性酵素を高収率で提供することができる。
さらに本発明は、セルロースまたはヘミセルロースの分解剤であって、前記のよ
うにセルロースまたはヘミセルロース分解性酵素を含んでなる剤に関する。酵素
の特異性に応じて、前記用途の一つ(または一つ以上であってもよい)に使用さ
れることが予期されている。特定のB様では、前記分解剤は本発明の2種以上の
組み合わせまたはセルロースもしくはヘミセルロース分解性活性を有する1種以
上の他の酵素と本発明の1種以上の酵素との組み合わせを含んでよい。
図面の簡単な説明
図1はプラスミドpSX224の構築を示し、図2はプラスミドp)lW485
の構築を示し、図3はプラスミドpHW697およびpHW704の構築を示し
、図4はプラスミドpl(W768の構築を示し、図5はプラスミドpsX32
0の制限地図を示し、図6はプラスミドpSX777の構築を示し、図7はプラ
スミドpCaHj 170の構築を示し、図8はプラスミドrM4の構築を示し
、図9は〜43kDのエンドグルカナーゼシグナルペプチドとEndo 1のN
末端のSOE融合を示し、
図10はプラスミドpCaFIj 180の構築を示し、図11はエフ・オキシ
スポラム(旦、■〃1m堕)のC−ファミリーセロビオヒドロラーゼのDNA配
列および誘導されたアミノ酸配列を示す、
図12はエフ・オキシスポラムピーファミリー セルラーゼのI)NA配列およ
び誘導されたアミノ酸配列を示す、図13はエフ・オキシスポラムのC−ファミ
リー エンドクルカナーゼのDNA配列および誘導されたアミノ酸配列を示す、
図14.A−Eはエッチ・インソレンス(旦、 1nsolens)エンドヌク
レアーゼ1(EGI)のDNA配列および誘導されたアミノ酸配列を示す、なら
びに
図15.A−Dはビー・ロウタス(fi、 1autus) (NCIMB40
250)ナーゼのCBDおよびBtIJI域の融合の[lNANA配列び誘導さ
れたアミノ酸配列を示す。
本発明は、以下の実施例によりさらに具体的に説明するが、いずれかの方法に特
許請求された発明の範囲を限定することを意図しない。
実111
エッチ・インソレンス(H,ins鄭遺り)由来のA領域含有クローン際公開第
−089109259号に記載されている)から、Koplanら、BiocJ
+em。
J、 183 (1979)181〜184ページに記載される方法に準じmR
N^を調製した。 20.000クローン含有のc[lNAライブラリーを、0
kayas+aおよびにほぼ従って得た。
cDNAライブラリーは、4種のZ、 reeseiセルラーゼ遺伝子における
A領域のN末端部分の公表された配列(Penttil’Mら、Gene 45
+(1986)、 253〜63 ; 5aloheisoら、Gene 63
. (198B)、 11〜21 ;Shoemaker ら、BIotech
nology+ 1983年10月、 691〜696HTeeriら、Gen
e 51 (1987) 43〜52)に従って設計されたアンチセンス構造の
オリゴヌクレオチドプローブを使用して、Gergenら、Nucl、 Ac1
dsRes、 7 (8) 、 1979.2115〜2136ページに記載さ
れるようにスクリーニングされた。これらのプローブの配列は次のとおりであっ
た。
N0R−8045−−err GCA CCCGCT GTA CCCMT G
CCACCGCA CTG CCC(−CBHl) GTA−3’
N0R−8075’−AGT CGG ACCCGA CCA ATr CTG
GCCACCACA TTG GCC(−CBH2) CCA−31
NOR−8085’−CGT AGG TCCGCT CCA ACC入AT
ACCTCCACA CTG GCC(−EG コ) CCA−31
スクリーニングでA領域のプローブによくハイブリダイズする多数の候補を得た
。制限マツピングで興味深いクローンを17個に滅し、その中の8個を十分に配
列決定()laltinerら、Nucl、 Ac1ds Res。
13、1985.1015〜1025ページに記載されるように)し、ターミナ
ルCBDならびにBwI域の存在を確認した。
CHDについて得られた推定アミノ酸配列は以下のとおりである。
λ−工! Trp Gly Gin Cys Gly Gly Gin Gly
Trp Agn Gly Pro Tbr CysCys Glu Jua
Gly Thr Thr Cys Arg Gin GlnAsn Gin T
rp Tyr Ser GlnCys Lau;
λ−s: rrp Gly Gin Cys Gly GlyLys Gly
Trp Ash Gly Pro Thr ThrCys Val Ser G
ly 入1a Thr Cys Thr Lyg IIs Asn Asp T
rp Tyr His Glr{
Cys L@uy
cBTl−2: Trp Gly Gln Cys Gly GlyLys G
ly Phe Asn Gly Pro Thr CysCys Gin Sa
r Gly Sar Thr Cys Val Lys Gln Jsn As
p Trp Tyr Sar GlnCys Leu;
λ−a: Trp Gly Gln Cys Gly Gly Asn Gly
Tyr Ser Gly Pro Thr ThrCys Ala にlu
Gly −Thr Cys Lys Lys cln Agn Asp Trp
Tyr Sar GinCYS Thr pro;
に−91Trp Gly Gln Cys Gly Gly Gin Gly
Trp Gln Gly Pro Thr CysCys ser Gln G
IY −Thr cys Argλla Gln、Asn Gln Trp T
yr 5erGln(:’fs Leu ASn;
入−11: Trp Gly Gin Cys Gly Gly Gln cl
y Tyr Ser に工Y CYG Thr AsnCys Glu Ala
Gly 5er Thr Cys Arg Gln Gln Asn Ala
Tyr Tyr Ser Gincys xla;
入−!9: Trp Gly Gln Cys Gly Gly Gin Gl
y Tyr Ser Gly Cys Arg λ5ilCys Glu Si
r Gly Sar ’rhr Cy!i krq kll!L Gin Al
!n Asp ’rrp Tyr S■秩@Gln
cysシU;および
−43kD: Trp Ala Gin Cys Gly Gly A、sn
Gly Trp 5@r Gly Cys ’rhr Th■
Cys Val Ala Gly Sar Thr Cys Thr Lys工
le Asn Asp Trp Tyr His GinCYS Lau
B p!!域について得られた推定アミノ酸配列は次のとおりである。
Asn CYS Sar Pro Lau:A5: Pro Gly Gly
Asn Asn Asn Asn Pro Pro Pro Ala Thr
Thr SirGln Trp Thr Pro Pro Pro Ala G
ln Thr Ser Ser Asn Pro Pro Pro ThrGl
y Gly Gly Gly Gly Asn Thr Leu His Gl
u Lys;A8: Gly Gly Sar Asn Asn Gly Gl
y Gly Asn Asn Asn Gly Gly GlyAsn Asn
Asn Gly Gly Gly Gly Asn Asn A、sn Gl
y Gly Gly Asn Asn As■
Gly Gly Gly Asn Thr Gly Gly Gly Ser
Ala Pro Leu;All: Val Phe Thr Cys Ser
Gly Asn Ser Gly Gly Gly Sar Asn Pr。
Ser Asn Pro Asn Pro Pro Thr Pro Thr
Thr Phe工le Thr Gin Van Pr。
入sn Pro Thr Pro Val Ser Pro Pro Thr
Cys Thr Val Ala Lys;A19: Pro 八la Leu
Trp Pro Asn Asn Asn Pro Gln Gin Gly
Asn Pr。
Asn Gin Gly Gly Asn Asn Gly Gly Gly
Asn Gin Gly Gly Gly Asn GlyGly Cys T
hr Val Pro Lys;CBH2: Pro Gly Ser Gin
Val Thr Thr Sar Thr Thr Sir Ser Ser
5erThr Thr Sir Arg Ala Thr Ser Thr
Thr Sar Ala Gly Gly Val Thr Ser工le T
hr Thr Sir Pro Thr Arq Thr Val Thr工l
e Pro Gly Gly Ala 5arThr Thr Ala Ser
Tyr Asn;A9: Glu 5er Gly Gly Gly Asn
Thr Asn Pro Thr Asn Pro Thr AsnPro
Thr Asn Pro Thr Asn Pro Thr Asn Pro
Trp Asn Pro Gly Asn Pr。
Thr Asn Pro Gly Asn Pro Gly Gly Gly
Asn Gly Gly Asn Gly Gly AsnCys Sir P
ro Leu;またはProに−Val Gln工1a Pro sar Sa
r 5er Thr Sir Sar Pro Val Asn GinPro
Thr Sar Thr Sar Thr Thr Sar Thr Ssr
Thr ’I’hr Sir Sar Pro P秩B
Val Gln Pro Thr Thr Pro Ser Gly Cys
Thr Ala Glu Argn−例」−
CIIDクローンの1つの完全な配列は、工、胚μ咀!−由来のセロビオヒドロ
ラーゼ(CBH2) き著しい類似性を示す。
A、 or凹で発現しそしてそれからの分泌用!+、 1nsole口s CB
H2遺伝子を担持する発現ベクターρ5X224の構築を、図1に機運する。
pUc19レプリコンを含むベクターp777.7由来のTAKAアミラーゼプ
ロモーターの調整領域およびL」住u工由来のグルコアミラーゼクーミネーター
は、ヨーロッパ特許第238.023号明細書に記載されている。 psX21
7は、1.8kbフラグメント上にH,1nsolens CBF12遺伝子を
担持するクローニングベクターpcDV1−pLl (OkayamaおよびB
erg、上記、参照)から構成されている。CBI12遺伝子は、構築に際して
使用される3種の制限部位、すなわち、単一配列におけるメチオニン開始コドン
におけるRa11部位、このBalf部位の下流62nb、のBstB1部位お
よびBstBIの下流860bpの^va11部位を含む、Ava目部位は、ポ
リA Si域の遺伝子上流の非翻訳C末端部分に位置しCおり、そしてこれは最
終の構築に際して不必要である。クローニングベクターの遺伝子の上流にポリG
jJ域は存在しない、この領域は、切除されそしてTAKAプロモーターの末端
のBam旧部位近くに翻訳開始コドンを置くオリゴヌクレオチドリンカーによっ
て置き換えられている。
発現ベクターpsX224で、ヨーロッパ特許第238.023号明細書に記載
されるように選択マーカーとし、ニー・ニドランス(A、 n1dulans)
由来のamds遺伝子を使用してL」DJ封IFO4177を形質転換した。
形質転換体をYPD培地(Sheyvan ら、Methods on Yea
st Genetics。
Gold Sprjng Harbor Laboratory+ 1981)
で3〜4日間生育し、ドデシル硫酸ナトリウムポリアクリルアミドゲル電気泳動
で上澄の新規タンパク質類について分析した。 H,1nsolens由来のC
BH2は、相当なグリコジル化を有するタンパク質饋を示す65kDの見かけの
Mwを有するバンドを形成し、このタンパク質はアミノ酸成分を基準とする51
kDの一一をもつものと算出されている。この完全な酵素はセルロースによくパ
インディングするが、A 63域の除去およびBtu域が除去された可能性のあ
る55kDおよび40kDの酵素分解産物はパインディングしない、この酵素は
濾紙に対して一定の活性を有し、グルコースを放出する。予想されるように、カ
ルボキシメチルセルロースの形態の可溶性セルロースについて測定したところで
は非常に限定されたエンドグルカナーゼ活性を有している。
裏施炭主
フザリウム・オキシスボーム Fusartum ox s oru鋼 1ツム
DN^の蓋
フザリウム・オキシスポラムの凍結乾燥培養物、をリン酸緩衝液で元へ戻し、5
枚のフォックス(FOX )培地(酵母エキス6%、 K、HPO41,5%、
Mg5Oa・78*O0−75%、グルコース22.5%、寒天1.5%、pH
5,6)プレートの各々に5度スポットし、37℃でインキュベーシヨンした。
インキエベーシコンの6日後、プレートからコロニーをかきとり、0.001%
のツウイーン(Tween)−8015mLに入れ、濃く曇つた懸濁液を得た。
それぞれ液体フォックス培地300sLを含む4個の1リツトルフラスコに前記
胞子懸濁液2曽りを接種し、30℃および240rp−でインキュベージロンし
た。インキュベーション4日目に培養物を4層の滅菌ガーゼを介して濾過し、次
いで滅菌水で洗浄した。1体をワットマン濾紙上で乾燥し、流体窒素で凍結し、
冷却乳鉢中で微粉砕し、新鮮な溶菌緩衝液(10mM Tris−CI、 pH
7,4,1%305.50mM HDTA。
100μL DEPC)75mLに加えた。十分に混合された懸濁液を1時間6
5°Cの水浴中でインキュベートし、次いでベンチトップ遠心機により4000
rpmおよび5”Cで10分間遠心した。上澄をデカントしエタノール沈殿した
。氷上で1時間後、溶液を20分間19.000rpi+にて遠心した。上澄を
デカントしイソプロパツール沈殿した。10分間10+ OOOrpmにて遠心
した後、上澄をデカントしベレットを乾燥した。
TER溶液(lod↑ris−FICl、 pH7,4+ 1mM HDTA、
100μg RNA5e A)1mLを各チューブに加え、これらのチューブ
を2日間4°Cで保存した。これらのチューブを集め、30分間65゛Cの水浴
に置き、不溶性のDNAを浮遊させた。fjI液を、フェノール/C)ICh
/イソアミルアルコールで2度、CHCh /イソアミルアルコールで2度抽出
し、次いでエタノール沈殿した。ペレットを定着させてエタノールを除去した。
70%EtOHを加え、DNAを一20°Cで1夜保存した。デカントおよび乾
燥後、TERlmLを加え、1時間65°Cでチューブをインキュベージロンす
ることでDNAを溶解した。ゲノムDNA 1.5mgを得た。
−゛イジェネレートプライマーによる 、クローニングおよび一良臭犬DNA
(i区列迭一定
PCR(米国特許第4,683.195号および同4.683,202号参照)
を使用するC−ファミリー(命名は、Henrissatら、Gene 81(
1)、 1989゜83〜96ページによる)セルラーゼ由来のDNAを増幅す
るため、各「センス」オリゴヌクレオチドを、各「アンチセンス」オリゴヌクレ
オチドと組み合わせて使用した。従うて、以下のプライマーの組み合わせが使用
された。
一工立ヱヱ:」−−1立47−2
ZC3220ZC3221
zQ22Q: GCCAACTACGGT ACCGG(A/C/G/T) T
A(C/’1’) TG(e/T)GA(C/’!’) (A/G/T) (C
/G) (λ/G/C/T) CA(G/A) ?GEユλ2λ: GCG T
TG GCC、TCT AG入入T(G/入) TCCAT(C/T) TC(
λ/G/C/T)(C/G/T)(A/T)(G/λ) GA(G/入)CAP
CR反応では、フザリウム・オキシスポラム(ハ旦亘憇oxysg聾艷)ゲ/ム
DNA1μgを鋳型に使用した。10倍(7)PCRm衝液は、100mMTr
is−HCI、 pH8,3,500mM MCI、 15mM MgCl、
0.1%ゼラチン(1’erkin−Elmer CeLug)である0反応液
は以下の成分を含めた。
脱イオン水 35.75μし
1OxPCRtlk街液 5 μL
鋳型 ロN^ 5 μ L
プライマー1 2 IL(40ピコモル)プライマー2 2 IL(40ピコモ
ル)Taqポリメラーゼ 0.25μL (f、25U)PCR反応は次の条件
で40サイクル行った。
72℃ 2.0分
各反応液5μLをアガロースゲル電気泳動で分析した。 DNAフラグメントの
大きさは、[lNA分子量マーカーから推定した0反応をZC3220およびZ
C3221でプライムし、C−ファミリー セルラーゼのフラグメントに対する
候補である適当なサイズの2種の1)NAフラグメントを生成した。これらの2
つのフラグメントを含むアガロース区分を切り取り、[lNAを熔離し、制限酵
素にpnlおよびZbalにより消化した。これらのフラグメントを、前記2種
の制限酵素で切断したベクターpUc1Bに連結した。μ0.c9LLを連結体
で形質転換し、得られたコロニーからミニプレツブ(mini prep)DN
Aを調製した。これらのインサートのDNA配列を測定し、2つの新規なC−フ
ァミリーセルラーゼ(1つが新規なセロビオヒドロラーゼでもう1つが新規なエ
ンドクルカナーゼ)が同定されたことが明らかにされた。
C−ファミリー セルラーゼに対して、前記のようなI’CRクローニング手順
を、既知のF−ファミリー セルラーゼ内に保存されたセルラーゼ配列をコード
する他のプライマーを使用して利用した(I(enrissatら、上記、参照
)、以下のプライマーの組み合わせをフザリウム(Fusariu*)ゲノムD
N^の増幅に使用した。
プライマーl −プライマー2
ZC3226ZC3227
Lコ石匝= TCCTGA CGCCAA GCT Tr(A/G/T) (C
/T) (A/T) (A/T)(A/C/T)AA (C/T)GA (C/
T)TA (C/T’)AALコLU: CACCGG CACCAT CGA
T(G/A/)T C(A/C/G/T)A(G/入)(C/T)T C(八
/G/C/T)G T(A/G/T)A TPCR反応は、次のように40サイ
クル行った。
94℃ 1.5分
50℃ 2.0分
72℃ 2.0分
180bpのバンドを、アガロースゲルフラグメントから溶離し、制限酵素をH
rndlHおよびC1alで消化し、次いで)Iindl I IおよびAcc
lで消化したpHc19に連結した。連結されたDNAでE、 coliを形質
転換し、単離されたコロニーからミニブレプDNAを調製した。クローニングさ
れた[lNAの[lNA配列を決定した。このフラグメントは、F−ノア4ミリ
−セルラーゼの新たな構成員に相当する配列をコー二曵盈策
フザリウム・オキシスポラムを発酵によって生育し、いろいろな時間に試料を採
取してRNAを抽出し、セルラーゼ活性を分析した。活性の分析は、総セルラー
ゼ活性のアッセイと色澄明化のアッセイを含む、最高の色澄明化を示すフザリウ
ム・オキシスポラム試料は、ポリ(A) +RN^が単離された全11N^から
抽出された。
フザリウム・オキシスポラムのcDNAライブラリーを構築するために、第一1
1cDNAを2種の反応液(一つは放射能標識したdATPで、他の一つは放射
能標識しないdATP )で合成した。2.5X反応混合物を、以下の試薬を次
の順序で混合することにより室温で調製した。5Xの逆転写酵素緩衝液(GJb
co−BRL、 Gajthersburg、 Maryland)10μL。
200mMのジチオスレイトール(−70″Cで保蔵された原液由来または新た
に調製)2.5μLおよび各オリゴヌクレオチドミリン酸(dATP。
dGTP、 dTTPおよび5−メチルdcTP+ Pharwacfa [、
KB Biotechnology+^1a翔ada、 CA、から得た) 1
0mMを含む混合物2.5IL0反応混合物を2つのチューブに7.5μLずつ
分注した。10μC1/μLのstpα−dATP (Amersham+ A
rliArlln Heights、 IL) 1.3μLを一つのチューブに
加え、もう一方のチューブには水1.3μLを加えた。各混合物の7μLを最終
反応チューブに移した。それぞれのチューブで、5−ルのTriトHCI (p
H7,4)および50μMのHDTA 14u L中フザリウム・オキシスポラ
ムのポリ(A) +RN^5μgを、lag/μLの第−鎖ブライ? (ZC2
938: GACAGAGCACAGAATT(:ACTAGTGAGCTCT
+s) 211 Lと混合した。このRNAプライマー混合物を4分間65℃に
加熱し、氷水で冷却し、次いで微量遠心管で短時間遠心した。 RNAプライマ
ー混合物8μLを最終反応チューブに加えた。 200U/μLの5upers
cript(商標)逆転写酵素(Gtbco−BRL) 5 u Lを各チュー
ブに加えた。ゆるやかに攪拌した後、チューブを30分間45℃でインキュベー
ションした。 10mMのTris−HCI (p)17.4) 、 1 mM
のEDTA80#Lを各チューブに加え、試料を回転させて、闇単に遠心した。
各チューブから3μLを採取し、TCA沈殿により取り込まれたカウントと反応
液中の総カウントを測定した。各チューブからの試料2μLをゲル電気泳動で分
析した。各試料の残りを、オイスターグリコーゲンの存在下でエタノール沈殿処
理た。核酸を遠心によりペレット化し、次いでこれらのベレットを80%エタノ
ールで洗浄した。エタノール洗浄後、試料を10分間通気乾燥した。第−鎖の合
成は、ポリ(A)+ RNAからDNAの転換率33%に相当するフザリウム・
オキシスポラムcDNA 1.6μgを与えた。
第二鎖cDNAの合成は、ヘアピンDNAをもたらす第二鎖合成の第−鎖ブライ
ミングを促進する条件下で第−鎖反応液由来のRNA −DNAハイブリダイゼ
ーションによって行った。2つの第−鎖反応液のそれぞれに由来する第−鎖生放
物を、水71ul−に再懸濁した0次の試薬、5X第二鎖緩衝液(100mM
Tris、 pH7,4,450+aM KCI、 23mM I’1gCbお
よび50mM(N)In)zsOa)20μL、5aM β−NAD3μLおよ
び各10mMのデオキシヌクレオチド三リン酸混合物3μLを、室温で上記反応
チューブに添加した。α−” P dATP 1μLを、第−鎖合成用の未標1
!gldATPを含む反応混合物に加え、一方、第−鎮合成用の標識dATPを
含むチューブには水1uLを含めた0次に、各チューブに、7U/μLのE、
coli DNAリガーゼ(Boehringer−Mannhefm、 fn
dianapolls。
IN) 0.6a L、8 U/ II LのE、coli DNAポリメラー
ゼI (Ageershas)3.1μLおよび2U/uLのRNase [1
(Glbco−BRL)を加えた0反応液を2時間16℃でインキュベーション
した。インキュベーシッン後、各反応液由来の2μLを使用してTCA沈殿性カ
ウントと反応液の総カウントを測定し、次いで各反応液由来の2μLをゲル電気
泳動により分析した。各試料の残りに、2.5Mg/μLのオイスターグリコー
ゲン2μL、0.5のHDTA 5u LおよびLow−のTris−4CI
(pH7,4) +1−一のEDTA200tlLを加えた。試料をフェノール
−クロロホルムで抽出し、次いでイソプロパツール沈殿させた。遠心後、ペレッ
トを80%エタノール100uLで洗浄し、通気乾燥した0反応の各々によって
得られた二本鎖cDN^は、約2.5μgであった。
ムングビーン(■ung been)ヌクレアーゼ処理によりヘアピンの一本鎖
DNAを切り取った。各cDNADNAペレット5μLに再懸濁し、次いで各チ
ューブにIOXムングビーン緩衝液(0,3M酢酸ナトリウム、pH4,,6,
3M NaC1および1hM Zn5On)2.5μL、 10−のDTT 2
.5a L50%のグリセロール2.5μLおよびIOU/l!Lのムングビー
ンヌクレアーゼ(New England Btolabs、 Beverly
MA) 2.5/7 Lを加えた0反応液を30分間30’Cでインキュベー
ションし、各チューブに10−MのTrts−HCI (pH7,4)および1
a+M EDTA 75 u Lを加えた。2uLのアリコートをアルカリ性
アガロースゲル分析により分析した。LMのTris−HCI (ρ117.4
) tooμLを各チューブに加え、試料をフェノール−クロロホルムで2度抽
出した。 DNAをイソプロパツールで沈殿させ、次いで遠心によりペレット化
した。遠心後、DNAのベレットを80%エタノールで洗浄し、通気乾燥した。
2つの反応のそれぞれからのDNAの収量は、約2μgであった。
このDNAの末端をT40NAポリメラーゼで処理して平滑にした。水24μL
の合計容量で2つの試料に由来するDNAを再懸濁した後、合わせた。このDN
Aに、10XT4tIk衝液(330+mM Tris−酢酸塩、PII7.9
.670@M KAc、 1005M MgAcおよび1 mg/sLのゼラチ
ン)4μL、tanのdNTP 4μL、 50mMのDTT 4μLおよびI
U/μLのTA DNAポリメラーゼ(Boehrjnger−Mannhei
+g) 4 g Lを加えた。これらの試料を1時間15°Cでインキュベーシ
ョンした。インキュベーシッン後、10m11のTric−HCI (pH7,
4)および1ml’lのEDTA 160μLを加え、次いで試料をフェノール
−クロロホルムで抽出した。 DNAをイソプロパツールで沈殿させ、次いで遠
心によりペレット化した。遠心後、DNAを80%エタノールで洗浄し、次いで
通気乾燥した。
このDNAを水6.5μLで再懸後、Eco Rrアダプターを平滑化されたD
NAに付加した。このDNAに、1μg/μLのEco R1アダプター(tn
vitrogen、 San Diego、 CAカタログ$409−20)
1 u L、 IOX リガーゼ緩衝液(0,5M Tris、 pH7,8お
よび50@M MgCh) I II L、 10mMのATP O,5μL
、 100mMのDTT O,5μLおよびIU/μLのTA 11NAリガー
ゼ(Boehringer−Mannheim) 1 g Lを加えた。この試
料を室温で1夜インイキユベーシヨンした後、リガーゼを15分間65℃で変性
した。
第−鎖プライマーによってコードされたSsl クローニング部位を、Sslエ
ンドヌクレアーゼで消化することにより露出させた。このDNAに水33u L
、 IOX Ssl B衝液(0,5M Tris、 pH8,0,0,1M
MgCl*および0.5M NaCI) 5 u Lおよび5U/uLの5s1
2μLを加え、この試料を2時間37゛Cでインキュベーションした。 10m
MのTris−HCI (pH7,4)およびLsMのEl)TA 150μL
を加え、試料をフェノール−クロロホルムで抽出し、次いでDNAをイソプロパ
ツールで沈殿させた。
cDNAをセファロースCL2B (Pharmacia IJB Biote
chnology)カラムでクロマト処理してcDNへのサイズを選択し、そし
てアダプターを含まないものを除去した。セファロースCL2Bカラム1.l■
Lを1uLのプラスチンクス使い捨てピペットに流し込み、そのカラムを50倍
カラム容量の緩衝液(1OnM Trts、 pH1,4および1 d EDT
A)で洗浄した。
試料をのせ、1滴ずつ画分を集め、ボイド容積中のDNAを集めた。
分画したDNAをイソプロパツールで沈殿させた。遠心後、DNAを80%エタ
ノールで洗浄し、次いで通気乾燥した。
フザリウム・オキシスポラム(Fusariu■!腸)のcDNAライブラリー
を、Eco R1および5stlで消化したベクターpYcDEI3’ (国際
公開第W090/10698号参照)にそのcDNAを連結することにより樹立
した。10Xリガーゼ緩衝液8μL、10醜りのATP 4μL、200閣−の
[lTT 。
4μLおよび1単位のTA DNAリガーゼ(Boehringer−Mann
heim)を含むリゲーシタン反応溶液80aL中、cDNA 400nHに3
90ngのベクターを連結した。室温で1夜インキユベージ町ン後、オイスター
グリコーゲン5ugおよび10mMのTris−HCIおよび1閣阿のE[lT
A 120μgを加え、試料をフェノール−クロロホルムで抽出した。 Dll
l^をエタノールで沈殿させ、[lN^ベレットを80%エタノールで洗浄した
0通気乾燥後、DNAを水3μLに再懸濁した。電気穿孔性成分DHIOB細胞
(Gibco−BRL、)37 p Lを上記DNAに加え、Bio−Rad
Gene Pulser(Mode111652076)およびBio−Rad
pulse Controller(Model 1165209B)エレク
トロポレーションユニット(Bto−Rad Laboratortes+ R
icbmond、 C^)により電気穿孔法を完了だ、 SOC(Hanaha
n、J、 Mo1. Biol、 166(1983)、 557〜580)の
4uLを電気穿孔法で処理した細胞に加え、次いで細胞懸濁液400μLを10
枚の150m5 LBチアンシリンプレートの各々に広げた。1′&インキユベ
ーシヨン後、LB asp培地培地10奢Lプレートに加え、細胞を培地から採
取しこ、グリセロール原液とプラスミド調製物を各プレートから作製した。ライ
ブラリーのバッフグランド(インサートを含まないベクター)を、インサートを
含まないベクターの連結と電気穿孔性後の数個のクローンの力価測定により約1
%において確認した。
cDNA−イブ−1−のスクリーニング完全鎖長のセルラーゼcDNAクローン
を、PCRで生成したゲノムオリゴヌクレオチドプローブへのハイブリダイゼー
シヨンによりフザリウム・オキシスポラム(Fusarium ox s or
um) cDNAライブラリーから単離した。
PCllで生成したオリゴヌクレオチド!l: ZC3309,C−ファミリー
セロビオヒドロラーゼの一部分をコードする40mer ATT ACcAAC
ACCAGCGTT GACATCACT GTCAGA GGG CTT C
; ZC3310C−ファミリー エンドグルカナーゼをコードする28婿er
、 AACTCCGTT GATGAA AGG AGT GACGTA G;
およびZC3311,F−ファミリー セルラーゼをコードする40rzer、
CGG AGA GCA GCA GGA ACA CCA GAG GCA
G[;G TTCCAG CCA C@T4ポリヌクレオチドキナーゼで”Py
ATPを使用して末端標識した。キナーゼ反応では、各オリゴヌクレオチド17
ピコモルを脱イオン水で12.5μLに調整した。これらに、IOXキナーゼ緩
衝液(I X : 10!IIM塩化マグネシウム、O,b+M HOT^、5
0■門Tris、 pH7,8) 2 p L、 200mMのジチオスレイト
ール0.5.L。
”P yATP(150m(:i/mL、 Amersham) I II L
、Taポリヌクレオチドキナーゼ(IOU/μL、BIIL)2μLを加えた0
次に、これらの試料を混合し、37°Cで30分間インキュベーションした。オ
リゴヌクレオチド類を、岨み込みが起っていないヌクレオチド類よりTE (I
OIIMTris、 pH8,0,1mM EDTA) 180μL、 7.5
M酢酸アンモニウム100μL、イガイのグリコーゲ7 (20mg/wL、
Gibco−BRL) 2 p Lおよび100%エタノール750μLを使用
する沈殿によって分離した。ベレットを蒸留水200μLに溶解した。これらの
オリゴヌクレオチドに取り込まれた放射能量を測定するために、l : 100
0希釈のオリゴヌクレオチド10μLをBeckman LS1800液体シン
チレーシッンシステムで読み取った。活性は、ZC3309について115X1
0’ cps、 ZC3310について86xlO’ Cp−およびZC331
1について79X10” cpsであった。
I初に、 20,0OOcDNAクローンを、C−ファミリー セロビオヒドロ
ラーゼ、C−ファミリー エンドグルカナーゼおよびF−ファミリー セルラー
ゼのクローンに相当する3種のオリゴヌクレオチドのそれぞれの混合物で探査し
た。−70℃で保存された力価測定済みのグリセロール原液からcDNAライブ
ラリーをとり出した。 150m5のLBチアンシリン(IO00μg/■し)
プレート5枚に、それぞれ4000クローンをまいた。 Bjotrans O
,2μm137■■フイルターを使用して標準的な方法(Sambrookら、
Mo1ecular リμ区1+ 1989)によりリフト(IHt)を複写し
た。これらのフィルターを減圧下にて2時間80″Cで焼き、次いで80mLの
予備ハイブリダイゼーション溶液C3xDenhardt’s (I X :
0.02%Fico11.0.02%ポリビニルピロリドン、0.02%ウシ血
清アルブミンPentax Fraction 5 (Sigma、 St、
Louts。
MO)、 5XSSC(I X : O,15M塩化ナトリウム、0.15Mク
エン酸ナトリウム、 pH7,3))、100 u g /閤り変性超音波処理
サケの精液[INA 、501リン酸ナトリウム(2日6.8)、1請hビロリ
ン酸ナトリウム、10011M^TP、 20%ホルムアミド、1%ドデシル硫
酸ナトリウム)中、37℃にて結晶北国(Pharvacia LKB Bio
technology+ Alameda、 C^)で−夜処理した(Ulrt
chら、EMBOJ、 3 (1984)361〜364ページ)。
予備ハイブリダイゼーシヨンされたフィルターの1つを、80 x 10’cp
na ZC3309,86xlO’ Ca1p ZC3310および79X10
’ cap ZC3311を含む予備ハイブリダイゼーション溶液80mLを入
れた結晶他国に入れ、次いで37°Cに一夜放置しプローブ処理した0次に、フ
ィルターを高緊縮まで洗浄した。これらのプローブ処理されたフィルターを、結
晶化血中室温で低1g!縮洗液(2XSSC,0,1%5DS) 400WLで
3度洗液した。
このとき、4個の1リツトル容積のプラスチック箱を使用した。塩化テトラメチ
ルアンモニウム洗浄(TMMCl、:3M塩化テトラメチルアンモニウム、50
5M Tris−)1(:1. pH8,0,2sM !1DTA、1 g /
L 5DS)で68℃にて20分間さらに洗浄し、その塩基組成1585〜1
588と無関係に28mer ZC3310について高緊縮洗浄を行った(Wo
odら、Proc、 Na目。
Acad、 Sci、 82 (1985) ) 、次に、これらのフィルター
を乾式プロットし、ワットマン3問紙に固定し、オートラジオグラフィー用プラ
スチックラップで被覆した。これらを増感紙とKodak XAR−5フイルム
を使用して一70°Cで一夜さらした。
複写フィルター上に2つの推定上の陽性物が現われた。コロニーを有するプレー
ト上の対応する領域を採取し、1χポリメラ一ゼ連鎖反応(PCll) 11衝
液(100mM Tris FICI、 p[18,3,500mM MC1,
15+wMMgC1,0,1%ゼラチン、Perktn Elmer Cetu
s)に入れ、70μg/mLアンピシリンを含む100+u+ LBプレート上
に10倍希釈物5個をのせた。これらのプレートを一夜37℃で生育した。各推
定クローンの希釈物2つを上述のように再スクリーニングして選択した。単離さ
れたクローンの1つからpZF[1196が見い出された。これを、2XYTブ
ロス(1リットル当り:16gバタトートリブトン、Logバクトー酵母エキス
、10 g NaCl )中で一夜生育した。迅速沸騰法(Holsesおよび
Quigley、 Anal、 Biochem、 114(1981)、 1
93〜197)により23μgの[INAが精製された。制限酵素分析により、
このクローンの鎖長は約2 、000塩対であることがわかった。配列分析は、
それがPCRによってC−ファミリー セロビオヒドロラーゼフラグメントに相
同的なフラグメントを含むことを示した。
追加のセルラーゼcDNAクローンを単離する試みに際し、2X10’クローン
のcDN^ライブラリーを、約LO0,000cDN^クローンを含む20枚の
150mm LBプレート(100μg/mLアンピシリン)上にまいた。
第一スクリーニング法と同様にリフトを複写した。ハイブリダイゼーションを予
備ハイブリダイゼーシリン緩衝液中30℃の温度にてホルムアミドにより実施し
たことを除き、上記と同様に3種のセルラーゼに相当するオリゴヌクレオチドで
前記ライブラリーをスクリーニングした。 TMACLにより洗浄を67℃で2
0分間2度行った。8と20との間のシグナルが20枚のプレートの各複写フィ
ルター上に見い出された。パステルピペットの大きい方の端で第一のプレートか
ら15個のプラークを採取し、IXPCI? @@液(Perkin−Elme
r Cetus) 1wLに入れた。3種のオリゴヌクレオチド混合物を使用し
、前記III薗プラークに対してPCRを行った。各混合物には、ベクター特異
的オリゴヌクレオチドZC2847と、さらに各混合物中には異なる特異的オリ
ゴヌクレオチド(ZC3309,ZC3310またはZC3311)を含めた。
Pharvacia 1IILrapure dNTPと共にAmplitaq
ポリメラーゼ(Perktn−Elmer Cetus)を使用し、そしてPe
rkin Elmer Cetus法に従った。
各プライマ−16ピコモルを反応容量40μして使用した。 IXPCR@衝液
中20μLを、DN^を除きPCHに必要なすべての試薬類を含むマスター混合
物20μLに加えた。最初に94℃で1分45秒変性後、94℃45秒、45℃
1分および72“C10分の最終伸長を伴う72℃2分の28サイクJしを、パ
ーキンエlレマー(Perkfn ELwerンサーモサークラーで行った。1
5プラークのうち10個が、C−ファミリー特異的オリゴヌクレオチドZC33
09およびZC2847でプライムしたとき1つのバンドを得た。
他の混合物は、特異的な生成物を与えなかった。従って、PCllによヮて最大
のバンドを生成された5個のプラーク(すなわち、完全鎖長Cファミリー セロ
ビオヒドロラーゼである可能性がある)とPCRバンドを生成しない5個のプラ
ークとを、70μg/■Lアンピシリンを含む100mm LBプレート上に5
つの10倍希釈物としてまいて、l夜生育した。複写リフトを各10倍希釈物2
つのとった。3種のオリゴヌクレオチド混合物を使用し前記のように予備ハイブ
リダイゼーションおよびハイブリダイゼーションを行った。単離されたクローン
が接種した10個すべてに見られた。これらをつまようじで希釈プレートから採
取し、70Mg/sLアンピシリンを含む100■a+LBプレート上で単一コ
ロニーを単離した。C−ファミリー セロビオヒドロラーゼに対して特異的な2
種のオリゴヌクレオチド(ZC3409(CCG TTCTGG ACG TA
CAGA) オよびZC3411(TGA Tl、T CAA GTT CAT
CAA))を使用し単離された細菌コロニーについてPC[lを行った0条件
は、25μL反応容積で各プライマー10ピコモルを使用すること以外前記条件
と同じにした。マスター混合物25μLを含むPCRチューブにつまようじでコ
ロニーを加えた後、サイクルを行った。10個のうち5個が、C−ファミリー
セロビオヒドロラーゼと予想されるサイズの強いバンドを与えた0次に、単離さ
れたコロニーをTerriftcブロス(Sambrookら、上記、A2)
20抛Lで生育し、迅速沸騰法でDNAを単離した。これらのクローンを、サン
ガージデオキシシーケンシングにより部分的に配列決定を行った。配列分析から
、PCRによりC−ファミリー セロビオヒドロラーゼに特異的なバンドを与え
ない5個のクローンは、F−ファミリー セルラーゼクローンであることを示し
た。
C−ファミリー エンドグルカナーゼのクローニングのため、2×lO′クロー
ンをZC3310のみで再スクリーニングした。予備ハイブリダイゼーションお
よびハイブリダイゼーションの条件は先に使用したものと同様であった。ホルム
アミドを含まない予備ハイブリダイゼーシッン溶液1mL当りI XIO’ C
PHの末端標識ZC3310で30°Cにて10時間フィルターをハイブリダイ
ゼーションした。60°Cで2分間のTMACL洗浄を2回行った。複写フィル
ター上に7個の弱いシダナルが見られた。プラークをピペットの大きい端で採取
し、LBブロス1■し中に入れた。これらを、70Mg/■Lアンピシリンを含
む100m5+LBプレート上に5つの10倍希釈物としてそれぞれまいた。複
写リフトを各2つの希釈物から採取し、前記のように処理した。予備ハイブリダ
イゼーション、ハイブリダイゼーションおよび洗浄を第一水準のスクリーニング
として行った。単一コロニーハイブリダイゼーションの目的で単離された3つの
コロニーを同定しそして画線培養した。単離されたものを、Terriftcブ
ロス(1リットル当り212gトリプトン、24g酵母エキス、4■Lグリセロ
ール、オートクレーブおよび0.17M KHxPO4,0,72M KJPO
aの10抛L) (Sambrookら、上記、A 2 ) 50抛Lで一夜生
育し、標準的な方法によるアルカリ溶菌およびPEG沈殿(Maniatis
19B9.1.38〜1.41)でDNAを単離した。制限酵素分析から、一つ
のクローン(pZFH223)は他のものより長かったので完全配列決定用に選
んだ、配列分析は、初めてクローニングされたPCRフラグメントを含むことを
示した。
聾]圀折
これらのcDN^を酵母発現ベクターpYcIIE8 ’において配列決定した
。
New England Nuclearからの35−3dATP (M、D、
Biggin ら、ナル−Nat1. Acad、 Sci、 USA 80
.1983.3963〜3965ページ参照)を使用するジデオキシチェインタ
ーミネーシロン法(F、 Sangerら、hμ−Natl、 Acad、 S
ci、 USA 74.1977、5463〜5467ページ)を、すべての配
列決定反応に使用した。これらの反応は、Pharmaciaからの変性t7
DNAポリメラーゼ(S、 TaborおよびC,C,Richardson、
Proc。
Natl、Acad、 Sci、 usA 84.1987.4767〜477
1ページ、参照)で触媒され、そしてAD旧プロモーター(ZC996: AT
T GTT CTCGTT CCC↑TT CTT)に相補的なオリゴヌクレオ
チド、CYCIターミネータ−(ZC3635: TGT ACG CAT G
TA ACA TTA)ニ相補的なオリゴヌクレオチドまたは目的のDNAに相
補的なオリゴヌクレオチドによりプライムされた。二本鎖鋳型は、N a OI
Iで変性(E、Y、 ChenおよびP、H,Seeburg+那4 1985
.165〜170ページ)した後、配列決定用オリゴヌクレオチドとハイブリダ
イゼーションさせた。オリゴヌクレオチド類は、八pplied Biosys
tems Model 380八DNA シンセサイザーにより合成した。配列
決定反応に使用したオリゴヌクレオチド類を下記シーゲンシングオリゴヌクレオ
チド表に列挙する。
C−ファミリー セロビオヒト町九二九1A迭X、訂とZlj411 TGA
TGT CAA GTT CAT CAAZC3408TCT GTA CGT
CCA CAA CGGZC3401ATG ACT TCT CTA AG
A AGGZC3406TCCMCATCAAG TTCGGTZ(j410
.11iGG CCA ACT CCA TCT GAAZC3309ATT
ACCAACACCAGCGTT GACATCACT GTCAGA GGG
CTCZC)409 CCG TTCTGG ACG TACAGAlニスL
えリー セルー−ゼ 蝮にA広亙月1ライマーZC3413CCA TCG A
CG GTA TTG G)iTZC1311CGG AGA GCA GCA
GGA ACA CCA GAG GCA GGG TTCCAG CCAZ
C34L2 GAG GGT AGA GCG ATCGTTZC3739T(
1,A TCT CAT CGA GCT GCA CCZC3684GTG
ATG CTCAGT GCT ACG TCZC]310 AACTCCGT
r GAT GM AGG AGT GACGTA GZC3750TCCAA
T AGCTTCCCA GCA AGZC:1683 TGT CCCTTG
ATG TTG CCA AC完全鎖長cDN^クローンのDNA配列ならび
に誘導されるアミノ酸配列を、添付図11(C−ファミリー セロビオヒドロラ
ーゼ) 、同12(F−ファミリー セルラーゼ)および同13(C−ファミリ
ーエンドグルカナーゼ)に示す。
1隻五土
実施例1に記載したcDNAライブラリーを、配列;N0R−770: s’
GCTTCGCCCATGCCTTGGGTGGCGCCGAGTTCCAT
3’のアンチセンス構造の35bPオリゴヌクレオチドプローブでもスクリーニ
ングした。
この配列は、旦、 1nsalensにおける本発明者らのコドンの偏りの知見
を利用し、その微生物から精製されたEGIアルカラーゼフラグメントのアミノ
酸配列から誘導した。 1.6kbの完全なりローンは、図14A−Hに示され
るように1.3kbの完全なコーディング配列を含んでいた。このプローグ配列
N0R−770は、Metsaa Alasssに位置していた。
′rA2に機運されるように、ポリメラーゼをさらに含むEGI遺伝子をニー・
オリーゼ(A、 or■観)発現プラスミドに挿入した。 EGIのコーディン
グ領域を、開始Metコドン中のNco1部位からpH11480由来の145
0bpフラグメントのようなポリAwi域のBa5a1部位下流まで切除した。
これを、TAKAプロモーターとpUc19の大部分を含むpSX224由来の
3.6kb Ncol−Narlフラグメント、およびAMGターミネータ−と
共に残余部を含む960bpのNarl−Ba−)夏フラグメントに連結した。
この96bρフラグメントは、挿入された遺伝子以外はp777 (ヨ−ロフパ
特許第238.023号明細書に記載)と等価である99f;0から採取した。
こうして得られた発現ベクターをp[IW485と命名した。
ポリAテールをもたない完全鎖長EGI遺伝子による発現プラスミドpH147
04は図3に示す、 Bst[!11部位から下流のMea1部位の1300b
pが、ンカー(2645/2646 )に挿入された。このリンカ−は、末端と
CBDおよびBsI域の付加に使用するC末端に近いPvuI部位に2つの停止
コドンを有するBst[!11部位の下流コーディング領域を含む。
短11EGI ’遺伝子を有する発現プラスミドpHW697は、69bpのB
stETI−Ba−旧リンカー(2492/2493 )を使用して同様に構築
された。
このリンカ−では、本発明者らはVa14m+をLeu4□に代えたPst1部
位を挿入し、そして少なくとも13個のアミノ酸のコーディング領域:Kazs
PKPKPGHGPR5Dassを除去した。むしろあまり有用でない配列を、
有する短いテールは、ASW域およびBSJI域のわずかに上流の?、−ree
seiで見られるものに対応するC末端を切除して[EGI ’を提供した。
〜43kDエンドグルカ −ゼ のCBDおよびB; がCに・れたEGI ’
の −1立ヌ]」シλ匪系デンマーク特許出願第736/91号明細書に記載さ
れるエイチ・イソレンス(+(、1solens)の〜43k11エンドグルカ
ナーゼは、良好な洗浄特性を示した。触媒ドメインのほかに、43k[lセルラ
ーゼはC−末端CBDとBSi域を有するので、この領域をEGI’(それ自体
CB[lまたはB領域をもたない)に移した。この構築は、図4に機運されるよ
うに2工程で行った。 43kDセルラーゼのBfil域にEG4 ’のC末端
を結合することが意図されているPstr−旧ncrlリンカ−(028103
0M )を、psχ320中の43kDセルラーゼ遺伝子由来のC末端旧nc2
−EcoRrioobpフラグメントと共にPs t I −BcoRrでpU
c19にサブクローニングした(図5 ; DK736/91の記載に従う)、
サブクローンpl’1i767からCBDオヨびEGI域を、2SObp(7)
Pstl−8gll17 ラグメントトシテ切す取り、5.7kbのpHW4e
s (図2)のBstEII−8glllフラグメントとpow697 (図3
)由来の残在するBstEII−Pstlフラグメント55bpに連結した。得
られた発現プラスミドpHW768は、EGI ’のGlnnzxに付加された
〜43kDエンドグルカナーゼのCBDおよびBa域を有する。
〜43kllエンドグルカ −ゼ のCB11およびBh <Cに・れたEld
の ブースミドの 。
このプラスミドは、このケースではC末端リンカ−がEGIの完全配列を提供す
ること以外は、pHW768と同様に構築された0図3に3段階の工程を示す、
PvuT−1(inc11リンカ−(040M1041M)をpUc18にサ
ブクローニングしてpH14775を得た。 p!IW755中に、psx32
0 (図5)由来の旧ncrl−EcoRrの1000bpフラグメントを挿入
してpF[11776を得た。
これからCB[1およびBSJi域を、250bpのPvul−8glllフラ
グメントとして切り取り、次いでpHW48!5 (図2)由来の5.7kbの
BstEII−8glllフラグメントと98w7o4(図3)由来の9obp
のBstEII−Pvulフラグメントに連結した。得られた発現プラスミドp
)IW777は、完全なEGI配列中の八39*3sに付加された〜43k[l
エンドグルカナーゼのCBDおよびB領域を含む。
実施例2に記載したように、発現プラスミドp)!W4E+5. pFIW70
4゜pHW697. p)IW76BおよびpHW777で紅肛u憇IFO41
77を形質転換した。
前記のようにYPD培地で生育させた形質転換体に由来する上澄を、5O5−P
AGEで分析した(もとのEGrは見かけMw53kDを示す)、EGf’は予
想されるようにわずかに小さな分子量を示し、そしてCBDとB領域が付加され
た種は、一定の糖の付加と共にCBDおよびBF4域の大きさに対応して分子量
が増大する。〜43kDのエンドグルカナーゼに対して産生されるポリクローナ
ル抗体AS169は、〜43kl]のCBDおよびB領域が付加されたEGI
とEGI’だけを認識した。一方、Lin5olens由来のセルラーゼ調製物
に対して産生されたポリクローナル抗体AS78は、4種のすべてを認識した。
カルポキンメチルセノ日」−ス形態の可溶性セルロースについて測定したところ
、4種すべてがエンドグルカナーゼ活性を示した。
リンカ−
B云ム区n: Bs t E 2− Psセ1−BarI)!15 ’ GTC
ACCTACACCMCCTCCGCTGGGGCGAG3 ’ −GATGT
GGTTGGACGC(、ACCCCGCTCLμj註任: ””E2−Xma
1−PI/uニーBamH1w: pst、ニーHincエエ
スm
なるCBDおよびBh 〜43kDのエン゛グルカ −ゼAI域クローン由来の
各種CB[lおよびB領域の〜43kDエンドグルカナーゼに対する影響を試験
するために、本発明者らは〜43kDエンドグルカナーゼのオリジナルCBDお
よびB’l域を他のC−末端CBI)類およびB領域類、すなわちA−1,A−
8,A−9,A−11およびおよびA−19(実施例1、参照)で置き換えた。
また、作用を試験するために、本発明者らは43kOエンドグルカナーゼのBI
JiRを削除した構成物も創製した。
フラグメント:
すべてのフラグメントは、製造元の指示に従い、(Perkin−Eiser/
Cetus)パーキン・エルマー/シータスDNAアンプリフィケーシジンシス
テム(Aspliffcation System)を使用するPCR増幅によ
って作製した。
1 ) PCRフラグメントは、ps!320 (図5)のBaa+ [11部
位の上流56bpから〜43kDエンドグルカナーゼ遺伝子のコーディング領域
内の717bpまでのDNAをカバーし、そして同時に、Ba域の非常に初期の
コーディング領域の708位にKpn1部位と702位にS■a1部位を導入す
るように作製された。このPCI!フラグメントは、プライマーN0R1542
とN0R3010(下記オリゴヌクレオチドの一覧を参照)で作製した。
2 ) PCRフラグメントは、1)で導入されたI[pn1部位と共にフレー
ム中の8wt域の非常に初期ににpn1部位が導入されているA−1のCB[l
およびBfJ域を含み、そして遺伝子のコーディング領域の下流にXho1部位
を導入するように作製された。使用したプライマー二N0R3012上流および
N0113011下流。
3 ) PCRフラグメントがA−8由来のCODおよびBtil域をカバーし
、そして発現ベクターのXho1部位が遺伝子の下流にあることを除き、2)と
同様、プライマーj N0R3017およびN0R2516。
4)プライマーがA−9由来のCHDおよびBa域をカバーするN0R3016
およびNO費3015であること以外、2)と同様。
5)プライマーがA−11由来のCHDおよびBa域をカバーするN0R302
1およびN0112516であること以外、3)と同様。
6)プライマーがA−19由来のCBDおよびBa域をカバーするN0R303
2およびN0R3022であること以外、2)と同様。
7)〜43kDエンドグルカナーゼ由来のCBDを含み、モしてpsX320上
の遺伝子に由来るすXho1部位の下流がBwI域の非常に後期にPvufI部
位を導入しているPCRフラグメント。
プライマー: N0R3023およびNO[12516。
■止金並立上
1)+2)は、pToC68(DK736/91に記載されている)のBawl
(I −Xhol中にBamHI−Kpnlおよび1pnI−Xholとして挿
入されているので、43kDのコアー酵素をA−1由来のCBDおよびBjl域
と共にコードする。
1 ) + 3 ) : A −8CBD /Bjl域と共ニ43kD酵素を提
供すルコト以外、前記と同様。
1 ) +4 ) : A−9CHD オJ:ヒBS!域ヲ’&ムコト以外、a
記と同様。
1 ) + 5 ) : A−11CHDおよびB領域を含むこと以外、前記と
同様。
1 ) + 6 ) : A−19CBI]およびBjJl域を含むこと以外前
記と同様。
1)+7)は、pToC68のBamHI−Xholに、BamHI−3oar
およびPvull−Xholとして挿入されているので、BeJl域を含まない
43kD酵素をコードする。
第1ゴヌクレオチド :
NOR1542: 5’ −CGACAACATCACATCAAGCTCTC
C−31NOR2516: 5’ −CCATCCTl’rAACTjliTA
GCGA −31叉施班旦
、CBDへの 、巴ξ(とΔ社丘
バチルス・ロータス(Bacillus IauLuすNCIMB40250
(PCT/[1K91100013に記載)によって生産されるエンドグルヵナ
ーゼハ白」は、触媒ドメイン(コア) (Ala (32) Val (555
))とビー・ズブチリス(B、 5ubtitis) xンドグルカナーゼ(R
,M、 Mackayら、1986゜Nucleic Ac!ds Res、
14.9159〜70)のCBDに相同的なC末端セルロースパインディングド
メイン(CBD) (G In556− Pro700)からなる。
酵素が、CMC分解性コア酵を産生ずる!1.5ubtillisまたは■但で
発現される場合には、前記CBDはタンパク質分解的に開裂される。
この例では、このコアタンパク質は、フミコーラインソレンス(Humicol
a 1nsolens) (0に736/91に記載)由来の〜43kDエンド
グルカナーゼのBfil域とCBDと融合された。
散丘宜■J築
〜43kDエンドグルカナーゼをコードするcDN^遺伝子を含むプラスミドp
caHj 170は、図7に示すように構築した。 pcaHj170をXho
lrおよび5ailで消化した。 223b9のXhorl 5ailフラグメ
ントを弔離し、次いでBamHおよび5alzで消化したplJc19 (Ya
nisch−Perron ら、1985、 Gene 33.103〜119
)に連結した。このXholl−Bag旧連結によりRa@旧部位を再生した。
得られたプラスミド(It’12)を、EcoRlおよびBamH[で消化し、
次のリンカ−110R3045−N0R3046と連結した。
こうして得られたプラスミド(1M3)は、EcoRVおよびSac[Iで消化
し、445bp旧nc[l−5acllのpPL517フラグメン]・に連結し
た。
pPL517は、完全なバチルス(4acillus) [1ndo I遺伝子
を含む(PCT/DX91100013)、この連結生成物を、1M4と命名し
た。 43kdalエンドグルカナーゼ由来の糸状菌シグナルペプチドでバチル
スのEndo 1シグナルペプチドを置き換えるために、4種のPCRプライマ
ーを、1スプライシングバイオバーラツプエキステンシコン(Splicing
by 0verlap Extension)” (SOε)融合用に設計した
(R,M、 Hortonら、(f989) : Gene、 77、61〜6
8) 、5 ’プライマーNO1?3270および3′プライマーN0R327
5を使用し、プラスミドpcatlj109 (DX 736/91)由来の4
3k[+シグナル配列を増幅し、5′末端のBclr部位にそしてバチル入梗包
」遺伝子と21bp相同体を3′末端に導入した。
43kda 1遺伝子に2fbpあ相同性を導入する5′プライマーN0R32
76および5oar1部位をカバーする3′プライマーN0113271を使用
して、特有の5acll部位までのEndol遺伝子5′部分を増幅した。これ
らの2つのPCI?フラグメントを混合し、溶融し、アニール化し次いでtaq
ポリメラーゼで埋めたく図9)、得られたハイブリッドを、プライマーN0R3
270およびN0R327Lを使用して増幅した。ハイブリッドフラグメントを
、BC工および5acTIで消化し、TF44に由来する676bpの5acl
r−Sa11フラグメントに連結し、アスペルギルス(7)発現ベクターpTo
c68(Dに736/91 )をBamHIで消化した。この連結生成物、pc
aHj180 (図10)、は43kDシグナルペプチドをコードする読み取り
枠を含め、そして成熟〜43kOエンドグルカナーゼの最初の4つのN末端アミ
ノ酸(MeL(1)−^rg (25) )をハ並」のコア(Set (34)
−Val(549))に融合し、次いで43kDのBfiJI域およびCHD
(Ile (233) −Leu (285))にペプチドl1e−5er −
Glu(リンカ−によってコードされている)を融合した。 pcallj18
0は、ヨーロッパ特許出願公開筒238,023号明細書に記載されるようにp
丁oc90との。
同時形質転換によるアセトアミド上の選択を1吏用してアスペルギルスオリーゼ
(ハと四区■■虹■憇)の形質転換に使用した。
Endo 1コアならびに〜43kDのCBDおよびBl域の配列は、添付の図
15A−Dに示す。
Fig・2Ncal
183 Ndel
235 BbeI
Stu I 3220
omHI
Fig、 7
NNOR327
6Fi、 10
agaccqga a ttcgcggccgccatct a tcca a
cqgtc ta 9 cttcac t tca ca@a tgta t
cgc
YR
ttqatqtqqqaqqac Fig、 11qa attcgcqqc
cqcctqc t tcqa aqca tcagctca tt qaq
a tc agt ca a =@atgca tacc
MHT
qa a ttcqcqqcc qcctaqa ta a qtcactac
ctq a tc tctga a ta at=c tt@tcatca t
qa a q
E
TGTCGGGGC入入入入λ入入TCTCT’ITCT八GGATAGGへG
人入C八T入TTGGGへGTTTGG入CTTGT入TAT入入入TGATA
CAffrTrCATAT’rATATT入T’rTrCAACAT入TTrT
入T?rC入CG入入入入入AAThr八1aLauLeuGlyLeuThr
A1aLeuLeuLauGlyLeuVaIAsnG1yGlnLYSPro
GlyG 1 uThr LysG 1 uVa l Hi s ProG 1
n LauThrTh rPhaA rgCy sThrLys`rgG l
yG 1yCys
Fig、14A
コ10 コ20 ココ0 340 コ50 コロ0G l y LauG 1
y ProGlyG 1ycysGl yAspTrpG l yAsn Pr
oPro ProLysAspua l Cys Pr。
GACGTCGAGTCGTGCGCCMGAACTGCATCATGGAGG
GCATCCCCGACTACAGCCAG’rACAspVaIGluser
CysA1aLysAsnCys11eMetG1uGIYIleProAsp
TyrSarG1n?yr430 440 450 460 4フ0 480G
GCGTCACCACCAACGGCACCAGCCTCCGCCTGCAGC
AC^TCCTCCCCGACGGCCGCGTCG 1yVa lTh !−
Th rA S nG 1’fTh rS @ r IJuArqrAuG l
nHi S工1 @TJau@PrO^spG1yArgVa1
CCGTCGCCGCGTGTCTACCTGCTCCAC入AGACGA入に
CGCCCI:CT^TG八GATへCTCC^CCTGProSerProA
rgvalTyrLeuLeuAspLysThrLys入rqArqT yr
G1uM@tIJuH1’!ALeuTh rG 1 y Ph eG 1uP
h eThrPh eAspVa IAspA 1 aTh r Lys Le
u ProCysf l yMetAsns 5r
610 620 6’IO640650660GCTCTGTACCTGTCC
GAGATGCACCCGACCGC;TGCCAAGAGCAAGTACAA
CTCCGGCGG’E’AlaLeuTyrLauSerGluMatHis
ProThrGlyA1aLysSarLysTyr入snsarG1yGly
Fig、 14B
GOCT’ACT’ACGGTACTGGCTACTGCGATGCTCAGT
GCTTCOTGACGCCCTTCkTCkfi.CGGb
Ala?yr?yrGlyThrGlyTyrCygAspAlaGlncys
PheVa lThrProPhsXleAsnGlyフ)0 740 750
760 770 フ8oTTGGGCAACATCGAGGGCAAGGGC
’r’CGTGCTGCAACC;AGATGGATATCTCGGAGGTC
AACLeuGlyAsnlleGluclyLysclysercyscys
AsnG1uMatAsp工1eTrpGluValAsn790 800 8
10 820 8コ。 840TCGCGCGCCTC(;CACGTGGTr
CCCCACACCTGCAACAAGAAGGGCCTGTACCTTTGC
GAGSarArg入1as@rHlsvalVa1proHl!iTl1rc
ysAsnLysLYSGIYL@u’l’yrLeucysG1■
clyGlu(;luCysAlaPheCluGlyValCysAspLy
sAsnClycysGlyTrpAsnAsnTyrArgVa lAsnV
a lThrAspTyrTyrG 1yArgclyG luc l u P
heLysVa IAsnTh rkeuLys
970 980 990 1000 1(+10 1020ProPheThr
ValValThrGlnPheLeuA1aAsnArg^rgGlyLys
LeuGluLysrleHxs1030 1040 1050 1060 1
0フ0 10110CGCTTCTACGTGCAGGACGGCAACGTC
ATCGAGTCCTTCTACACCJliACAAGGAGGGAG’l’
b
ArgPheTy rVa l G lnAspG 1 y r,ysVa I
X l eG l us e rPheTyr’rh r`sn LysG
l uG lyVal1090 1100 1110 1120 11コ0 1
140CCTTACACCAACATGATCGATGACGAGTTCTGC
GAGGCCACCGGCTCCCGC入^GTACATGProTyrThr
AsnMatIleAspAspG1uPhaCysGlu入1aThrG1y
SerArgLysTyrMtGluレ+uG l yA l aTh rG
l nGlyMatG lyGluAl a LsuThrA rgGlyM*
tVa L@Le uA laMaセ
SarllaTrpTrpAspGLnGlyGlyAsnMetG1u丁rp
L@u入spHisc;lyGluAlaGlyProCysA1aLysG
lyG1u(;1yAlaProSerAsn工1eValGlnVa1C;1
uProPh*ProGluVal1330 1340 1コ50 1360
1370 1180人AGCCCAAGCCCGGCCACGGCCCCCGG
AGCGACT入AGT(;GTGATGGGATAGAGGGATAGALy
sProLysProG1yHisGlyProArgSerAspEND14
50 1460 14フ0 1480 1490 1500ATAGTGGAT
AGCACATAGATCGGCGGTTrTGGATAGTT’l’AATA
CATrCCGTTGCCGTTGTFig、14E
I1eSerPrO八snIleTyrG1yThrAsnG1n^spLeu
SerG1yThrGluAsnTrpSerSarA l″qjlrgTAu
G IYGI’fksnArqLeuTh rG 1yT”/rAs nTrp
G 1 uA SnAsnA 1@ass rserAl a
ThrAspCysAspLys ProGlyA laVa lVa lTh
rAl a PheHisAspl,ysserLeuG kuAsn
G1yAlaTyrSerI1eValThrL@uG1nMET八laGly
TyrValSerArqAspLysAsnG1yProVa lAspG1
userGluThrAla ProserProArqTrpAspLysV
aIGIuPheAlaLysFig. 15A
AsnA 1 aProPhess rLauG l n ProAspLeu
AsnAs pG L yG l nVa lTyrMET`、spG l u
G 1 u
ValAsnPheLaut/alAsn^rgTyrGlyAsn入1aSa
rThrSerThrGlyfLaLys入1aTyrLauG lnA 1
aA l aGlu LauVa IA l a LY SS@r X l e
AspLaus e r Ly S` 1aVa l Ly 5AsnVa I
AspProl(isAlaclu工1ePheGlyProAlaLeuTy
rGlyPheCLy八1aTyrI、euserLauG1nAspAlaP
rOASpTrpproserLeuGlnGlyASnTyryerTrpP
he工1eAspTyrTyrLeuASpGlnJ’1ETLySASn入1
al(1sTh rGl nAsnG 1yLysArgLeuLeuAsp
ValLe浮`sp
ValHisTrpTyrProGluA1aGlnGlyG1yG1yGln
Arg工1eValPheGlyGly八1aG1yAsn工leAspThr
GlnLysAlaArgValのnAlaProArgSerLeuTrpA
spProAlaTyrG l nG 1uAspsarTrpI 111G1
’/Th r’rT:pPh@Sa rse rTyrLeuProLeuZ
1eoroLyS−u
(:1nSerSar工1 @G l nThrTYrry rProG I
YThrLys LeuAl a I 1 eTh rGl@uPheset’
7”yr
G1yGlyAspAsnHisrleSerGlyGly工1aA1aThr
ALaAsp^1aLauGly11ePhaG1yLysTyrGlyVal
TyrA1aA1aAsnTyrTrpG1nThrG1uAsp入5nThr
AspTyr?hr5er^1 ax l aTy rLysr、eu’ryr
ArgAsnTyrAs PGIYAsnLysse rc IYPheG I
YSs@r工1eLys
Va l AspAl aA 1 aThrsa rAspTh rG 1uA
snS erSe rVa 1TyrAl a S e rua lTh rA
s pGlu
G l uAsnsarG 1urAul(L S Leu z l eVa
I LeuAsn Ly 5AsnPh eAspA sp吹@rOr 1eA
snA l a
ThrPhaG lrl Louse rに l’iAs PLYsTh !’
?YrTh rs e rG l yArgVa 1Trpf 1yPhaAs
pc l n
ThrG l’fSerAsp X l eTh rGluG l nA 1
aA 1 a I l eTh rAs n工1 aA 5獅`SnAj nG
1 nPh aThrT yrThrL4kuPrOPrO’LteuSer
AlaT’/r)IISIl@VaITJauL Y57A1aASpSe r
Th窒fluPrO
5s rThrThrSerThrSerTh rTh rsers erPr
oProVa IGI n ProThrTh rPros■窒fly
Val八1aGlyserThrへysThrLysXleAsnAspTrp
TyrHisGlnCysLau−−−要約書
トリコデルマ(Trichoderma )またはファネロシエーテ(Phan
erochaete)以外の糸状菌から誘導されるセルロースまたはヘミセルロ
ース分解性酵素であって、トリコデルマレーセイ(Trichoderma r
eesei)セルラーゼのターミナルA 55域に相同的である垢バインディン
グドメインを含んでなり、そして糖パインディングドメインが下記のアミノ酸配
列(α)aa
(α)
または不溶性セルロース性基質もしくはヘミセルロース性基質に当該酵素をパイ
ンディングしうる前記配列の副配列を含んでなる酵素。
補正書の翻訳文提出書
(特許法第184条の8)
平成4年11月1日
Claims (23)
- 1.トリコデルマ(Trichoderma)またはファネロシェーテ(Pha nerochaete)以外の糸状菌から誘導されうるセルロースまたはヘミセ ルロース分解性酵素であって、トリコデルマレーセイ(Trichoderma reesei)セルラーゼのターミナルA領域に相同的である糖バインディン グドメインを含んでなり、そして糖バインデイングドメインが下記のアミノ酸配 列 【配列があります】 または不溶性セルロース性基質もしくはヘミセルロース性基質に当該酵素をバイ ンディングしうる前記配列の副配列を含んでなる酵素。
- 2.フミコーラ(Humicola)、フザリウム(Fusarium)または ミセリオプトーラ(Myceliopthora)の−菌株から誘導されうる請 求の範囲第1項の酵素。
- 3.請求の範囲第1項に示されるアミノ酸配列における変化が次のものから選ば れる請求の範囲第1項の酵素:1位におけるアミノ酸がTrpまたはTyrであ り、2位におけるアミノ酸がGlyまたはAlaであり、7位におけるアミノ酸 がGln,IleまたはAsnであり、8位におけるアミノ酸がGlyまたはA snであり、9位におけるアミノ酸がTrp,PheまたはTyrであり、10 位におけるアミノ酸がSer,Asn,ThrまたはGlnであり、12位にお けるアミノ酸がPro,AlaまたはCysであり、13位におけるアミノ酸が Thr,ArgまたはIysであり、14位におけるアミノ酸がThr,Cys またはAsnであり、18位におけるアミノ酸がGlyまたはProであり、1 9位におけるアミノ酸が(存在するなら)Ser,Thr,Phe,Leuまた はAlaであり、 20位におけるアミノ酸がThrまたはLysであり、24位におけるアミノ酸 がGlnまたはIleであり、26位におけるアミノ酸がGln,Aspまたは Alaであり、27位におけるアミノ酸がTrp,PheまたはTyrであり、 29位におけるアミノ酸がSer,HisまたはAlaであり、そして/あるい は 32位におけるアミノ酸がLeu,Ile,Gln,ValまたはThrである 。
- 4.糖バインディングドメインが下記アミノ酸配列から構成された請求の範囲第 3項の酵素: 【配列があります】; 【配列があります】; 【配列があります】; 【配列があります】; 【配列があります】; 【配列があります】; 【配列があります】; 【配列があります】; 【配列があります】;または 【配列があります】。
- 5.前記酵素の触媒活性ドメインに前記糖バインディングドメインを結合する連 結B領域を特定するアミノ酸配列を、さらに含んでなる請求の範囲第1〜4項の いずれかの酵素。
- 6.前記連結B領域がアミノ酸類グリシンおよび/またはアスパラギンおよび/ またはプロリンおよび/またはセリンおよび/またはスレオニンおよび/または グルタミンに富んだものである請求の範囲第5項の酵素。
- 7.前記アミノ酸の1種以上が短い反復性単位を表す請求の範囲第6項の酵素。
- 8.一の天然のセルラーゼまたはヘミセルラーゼ分解性酵素から誘導される糖バ インディングドメイン、もう一つの天然のセルラーゼまたはヘミセルラーゼ分解 性酵素から誘導されるアミノ酸配列であって、連結B領域を特定するアミノ酸配 列、ならびに前記糖バインディングドメインもくしは前記B領域のいずれかを提 供する酵素または第三の酵素から誘導される触媒活性ドメインを含んでなる請求 の範囲第1〜7項のいずれかの酵素。
- 9.前記触媒活性ドメインが、事実上、糖バインディングドメインまたはB領域 を含まない酵素から誘導される請求の範囲第8項の酵素。
- 10.セルラーゼ、例えばエンドグルカナーゼ、セロビオヒドロラーゼまたはβ −グルコシダーゼである請求の範囲第1〜9項のいずれかの酵素。
- 11.請求の範囲第1〜10項のいずれかの酵素をコードするDNA配列を含ん でなるDNA構成物。
- 12.請求の範囲第11項の押入されたDNA構成物を担持する発現ベクター。
- 13.請求の範囲第11項のDNA構成物または請求の範囲第12項の発現ベク ターで形質転換された細胞。
- 14.糸状菌、例えば、アスペルギルス(aspergillus)の−菌株に 属する、例えばアスペルギルスニガー(Aspergillus niger) もしくはアスペルギルスオリーゼ(Aspergillus oryzae)、 あるいは、例えばサッカロミセスセレビシエ(Saccharomyces c erevisiae)のようなサッカロミセス(Saccharomyces) の−菌株に属する酵母細胞である請求の範囲第13項の細胞。
- 15.請求の範囲第1〜10項のいずれかの酵素の生産方法であって、請求の範 囲第13項または第14項の細胞を前記酵素の生産を行うことのできる条件下で 培養し、次いで培養物から前記酵素を回収する方法。
- 16.セルロースまたはヘミセルロースの分解剤であって、請求の範囲第1〜1 0項のいずれかの酵素を含んでなる分解剤。
- 17.請求の範囲第1〜10項のいずれかの酸素2種以上の組み合わせ、または 請求の範囲第1〜10項のいずれかの酵素1種以上とセルロースもしくはヘミセ ルロース分解活性を有する他の酵素1種以上との組み合わせを含んでなる請求の 範囲第16項の分解剤。
- 18.トリコデルマレーセイ(Trichoderma reesel)セルラ ーゼのターミナルA領域に相同的な糖バインディングドメインであって、アミノ 酸配列 【配列があります】 または不溶性のセルロース性基質もしくはヘミセルロース性基質にタンパク質を バインディングさせうる前記配列の副配列を含んでなる糖バインディングドメイ ン。
- 19.請求の範囲第18項に示されるアミノ酸配列の変化が次のものから選ばれ る請求の範囲第18項の糖バインディングドメイン:1位におけるアミノ酸がT rpまたはTyrであり、2位におけるアミノ酸がGlyまたはAlaであり、 7位におけるアミノ酸がGln,IleまたはAsnであり、8位におけるアミ ノ酸がGlyまたはAsnであり、9位におけるアミノ酸がTrp,Pheまた はTryであり、10位におけるアミノ酸がSer,Asn,ThrまたはGl nであり、12位におけるアミノ酸がPro,AlaまたはCysであり、13 位におけるアミノ酸がThr,ArgまたはLysであり、14位におけるアミ ノ酸がThr,CysまたはAsnであり、18位におけるアミノ酸がGlyま たはProであり、19位におけるアミノ酸(存在するとしたら)かSer,T hr,Phe,LeuまたはAlaであり、 20位におけるアミノ酸がThrまたはLysであり、24位におけるアミノ酸 がGlnまたはIleであり、26位におけるアミノ酸がGln,Aspまたは Alaであり、27位におけるアミノ酸がTrp,PheまたはTyrであり、 29位におけるアミノ酸がSer,HisまたはAyrであり、そして/または 32位におけるアミノ酸がLeu,Ile,Gln,ValまたはThrである 。
- 20.糖バインディングドメインが下記アミノ酸配列から構成された請求の範囲 第19項の糖バインディングドメイン:【配列があります】; 【配列があります】; 【配列があります】; 【配列があります】; 【配列があります】; 【配列があります】; 【配列があります】; 【配列があります】; 【配列があります】;または 【配列があります】。
- 21.セルロースまたはヘミセルロース分解性酵素から誘導される連結B領域で あって、アミノ酸類グリシンおよび/またはアスパラギンおよび/またはプロリ ンおよび/またはセリンおよび/またはスレオニンおよび/またはグルタミンに 富んだアミノ酸配列を含んでなる前記領域。
- 22.前記アミノ酸類の1種以上が短い反復単位を表す請求の範囲第21項のB 領域。
- 23.下記アミノ酸配列を含んでなる請求の範囲第21項または第22項のB領 域: 【配列があります】; 【配列があります】; 【配列があります】; 【配列があります】; 【配列があります】; 【配列があります】; 【配列があります】;または 【配列があります】。
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