CN1626241A - 源自白斑综合征病毒的蛋白质及其应用 - Google Patents
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Abstract
本发明涉及源自白斑综合征病毒的四种估计大小为28kDa(VP28)、26kDa(VP26)、24kDa(VP24)和19kDa(VP19)的主要蛋白质的分离和特性鉴定,以及它们在疫苗的制备中的应用,这种疫苗是被用来保护甲壳动物抵抗白斑综合征病毒感染的。本发明进一步提供编码上述蛋白质的核酸序列以及它们在上述蛋白质的重组制备中的应用。另外,本发明还提供对抗上述蛋白质的抗体,和这些抗体在被动免疫接种中的应用,以及包含上述核酸或抗体的诊断试剂盒。
Description
技术领域
本发明涉及源自白斑综合征病毒的蛋白质,编码上述蛋白质的核酸序列,以及所述蛋白质在制备用于预防和/或治疗甲壳动物白斑综合征(White Spot Sydrone)的疫苗中的应用。
背景技术
白斑综合征病毒(WSSV)在东南亚大部分地区的虾中是一个主要的病毒性疾病。该病毒在甲壳动物中有很宽的宿主范围(Flegel,1997),而且在各个隔离群之间只有很小的遗传变异(Lo等,1999)。电子显微镜术(EM)研究显示病毒颗粒有包膜,呈杆状到弹头样外观,长度大约275nm,宽大约120nm,在一端有一个尾样附件。失去包膜的核壳呈交叉网格型外观,大小约300nm×70nm(Wongteerasupaya等,1995)。这个病毒颗粒的形态学,它的核定位和它的形态发生学令人想起昆虫中的杆状病毒(Durand等,1997)。本来白斑综合征病毒被分类作为杆状病毒科的一个未指定成员(Francki等,1991),因此该病毒曾经被称做系统性外中胚层杆状病毒(SEMBV)或白斑杆状病毒(WSBV)。目前由于缺乏分子数据,白斑综合征病毒不再被纳入这个科(Murphy等,1995)。限制性核酸内切酶分析显示其病毒的双链DNA大小超过200kb(Yang等,1997)。
白斑综合征病毒的暴发在东南亚的养殖虾中会引起虾群的大规模死亡。该疾病的特征是虾的甲壳、附肢和角皮出现白斑,肝胰腺呈淡红色。被感染的虾显示嗜睡、进食迅速减少等征候,在3到5天内这些虾就会死亡。白斑综合征病毒的暴发导致虾养殖工业的严重损失,因而强烈需要一种能对白斑综合征病毒的感染具有保护作用的疫苗。能在这样的疫苗中使用的白斑综合征病毒主要结构蛋白质的鉴定和表征能够为发展这种疫苗提供方法。
本发明的公开
四种主要白斑综合征病毒蛋白质VP28(28kDa)、VP26(26kDa)、VP24(24kDa)和VP19(19kDa)已经被鉴定出来,其分子量是根据它们在考马斯亮蓝染色的十二烷基磺酸钠-聚丙烯酰胺凝胶电泳(SDS-PAGE)中的迁移率来估计的。VP26和VP24是核壳蛋白质,而VP28和Vp19是包膜蛋白质。白斑综合征病毒蛋白质的氨基端(N端)氨基酸残基已通过蛋白质测序获得,并用来鉴定白斑综合征病毒基因组上的那些基因(分别是vp28,vp26,vp24,vp19)。如图2b所述,vp26的可读框(ORF)包含555个核苷酸(SEQ ID No:1),推导的VP26氨基酸序列含有184个氨基酸残基(SEQ ID No:3),也一同描述在图2b中。vp26的一个第二个可读框包含612个核苷酸,显示于SEQ ID No:9,推导出其氨基酸序列含有204个氨基酸残基,它被单独描述为SEQ IDNo:10。vp28的可读框包含615个核苷酸(SEQ ID No:2),在图2c中与被推导出的氨基酸序列(SEQ ID No:4)一起被描述。被推导出的VP28的氨基酸序列含有204个氨基酸。VP26和VP28都含有一个位于N端的假定的穿膜区和许多假定的N-和O-糖基化位点。vp26和vp28基因的可读框分别编码理论大小为20kDa和22kDa的蛋白质。VP26和VP28的理论上的氨基酸序列被直接的蛋白质测序确认。VP26和VP28理论上的大小与根据它们在考马斯亮蓝染色的十二烷基磺酸钠-聚丙烯酰胺凝胶电泳(SDS-PAGE)中的迁移率而测得的大小相差6kDa,这个大小差异可以被翻译后修饰作用:例如糖基化、磷酸化等来解释。VP24的N末端氨基酸序列和VP19的部分氨基酸序列分别被描述为SEQ ID No:5和6。vp24的完整可读框包含627个核苷酸,描述于SEQ ID No:11,与被推导出的VP24氨基酸序列一起被描述;推导出的VP24氨基酸序列有208个残基,单独描述于SEQ ID No:12。四个蛋白质和它们各自的核苷酸序列是白斑综合征病毒所特有的。
本发明首次提供了构建重组疫苗的方法,用于保护甲壳动物抵抗白斑综合征病毒的感染。已经被鉴定和定性描述过的四种白斑综合征病毒主要蛋白质VP28,VP26,VP24和VP19被发现很适合用来制备亚单位疫苗,用于保护甲壳动物抵抗白斑综合征病毒的感染。通过使用重组工艺技术,本发明的核苷酸序列的克隆和特异性可以用于生产白斑综合征病毒的这些结构蛋白质。这样,就能获得重组的白斑综合征病毒结构蛋白,并基本上去除其他的白斑综合征病毒蛋白质。这种分离的白斑综合征病毒结构蛋白质能用来制造亚单位疫苗,以保护甲壳动物抵抗白斑综合征病毒的感染。可供选择的是,将编码白斑综合征病毒结构蛋白的核苷酸序列用来制备载体疫苗,用于保护甲壳动物抵抗白斑综合征病毒感染。而且,本发明的核苷酸序列也能用于诊断目的,例如检测本地是否存在白斑综合征病毒。此外,本发明的白斑综合征病毒蛋白质还能用来制备白斑综合征病毒特异性抗体。这些抗体能用来制备白斑综合征病毒疫苗,为甲壳动物提供被动免疫。该抗体也能用于诊断目的,例如检测白斑综合征病毒在甲壳动物中或在本地是否存在。
因此,本发明的第一目的是提供白斑综合征病毒的结构蛋白质。更明确地说,本发明提供结构蛋白质VP24,VP26,VP28和VP19。本发明特别提供含有如图2b(SEQ ID No:3)所示氨基酸序列或其衍生序列(例如SEQ ID No:10)的VP26蛋白质,以及含有如图2c(SEQ ID No:4)所示的氨基酸序列或其衍生序列的VP28。本发明进一步提供含有如SEQ ID No:5所示的N末端氨基酸序列MHMWGVYAAILAGLTLILVVISIVVTNIELNKKLDKKDK或其衍生序列的VP24蛋白质,以及含有SEQ IDNo:6所示的部分氨基酸序列IVLISI(G/V)ILVLAVMNV(P/A/T)MGPKKDS或其衍生序列的VP19蛋白质。优选VP24蛋白质具有如SEQID No:12所示的氨基酸序列或由此衍生的序列。必须认识到,那些含有SEQ ID No:3,4,5,6,10或12中所述氨基酸序列的衍生序列的蛋白质也在本发明的范围之内。为了本发明的目的,蛋白质氨基酸序列的衍生物被理解为是与SEQ ID No:3,4,10或12所描述的氨基酸序列或SEQ ID No:5或6所描述的部分氨基酸序列相比,包含了变更的氨基酸序列,而上述的变更不影响该蛋白质的抗原性或免疫原性。为了本发明的目的,本发明所说的蛋白质抗原性应被理解为是该蛋白质诱发可以识别所述白斑综合征病毒蛋白质和/或与该蛋白质反应的抗体的能力。而免疫原性应被理解为是该蛋白质在甲壳动物中诱发保护反应,对抗白斑综合征病毒感染的能力。
依照本发明,可在序列中发生的变更可以是由于例如整个序列中一个或多个氨基酸的保守氨基酸替代,缺失,插入,倒位或添加所造成的。 被认为并不改变免疫特性的氨基酸替代已经被人描述过了。相关氨基酸之间的氨基酸置换或在进化过程中频繁发生的替代尤其是发生在:丝氨酸/丙氨酸,丝氨酸/甘氨酸,天冬氨酸/甘氨酸,天冬氨酸/天冬酰胺,异亮氨酸/缬氨酸之间(见Dayhof,M.D.,蛋白质序列与结构图谱(Atlas of protein sequence structure),Nat.Biomed.Res.Found.,Washington D.C.,1978,vol.5,suppl.3)。以此信息为基础,Lipman和Pearson发展出用于迅速和敏感的蛋白质比较(Science,1985,第227卷,1435-1441)以及判定具有序列同源性的蛋白质和多肽之间的功能相似性的方法。有几个计算机程序,例如FASTA,TFASTA,BLAST以及一些类似程序,可用于判定具有给定氨基酸序列的蛋白质或多肽和其衍生物之间的序列同源性。序列之间的最佳匹配区能自动地被这些程序确定。因此根据本发明的衍生蛋白质仍然有能力诱生可识别白斑综合征病毒结构蛋白质,并与之发生反应的抗体;或有能力在接受过接种的甲壳动物中诱发保护性反应,保护他们抵抗白斑综合征病毒的感染。依照本发明,可以被使用的其他衍生蛋白质是白斑综合征病毒蛋白质的片段,条件是所述片段仍然能诱生可识别白斑综合征病毒结构蛋白质并与之发生反应的抗体,或能在接受过接种的甲壳动物中诱发保护性反应,保护他们抵抗白斑综合征病毒的感染。
第二方面,本发明提供编码一个或多个白斑综合征病毒结构蛋白质的核酸序列。更优选本发明提供分别编码主要结构蛋白质VP24、VP26、VP28和/或VP19的核酸序列。本发明特别提供SEQ ID No:1或9、SEQ ID No:2或SEQ ID No:11中描述的vp26,vp28和vp24的核酸序列,它们分别编码VP26,VP28和VP24。这些各自的核苷酸序列起始于编码推导出的氨基酸序列第一个甲硫氨酸残基的密码子ATG,直到编码羧基端(C末端)氨基酸残基的密码子为止。为了本发明的目的,必须认识到那些与SEQ ID No:1,2,9或11中描述的核苷酸序列具有序列同源性的核苷酸序列也在本发明的范围之内。就本发明而言,本发明所指的序列同源性可考虑为至少70%,优选75%,更优选80%,甚至更优选85%。高度优选的序列是那些与SEQ ID No:1,2,9或11所描述的序列的同源性为至少90%,更优选95%的核酸序列。
就本发明而言,序列同源性是通过把目的核苷酸序列与SEQ IDNo:1,SEQ ID No:2或SEQ ID No:11所述序列的相应部分进行比较而得出的。就本发明而言,这个序列同源性百分率被定义为被比较的序列之间的相同核苷酸的百分率。序列同源性可以由例如BLAST N等计算机程序确定,这些程序能自动地判定最佳的匹配区。
依照本发明具有序列同源性的核酸序列可以通过常规的克隆和杂交技术,使用SEQ ID No:1,2,11或9描述的核酸序列之一或该序列的片段,很容易地从密切相关的白斑综合征病毒株中分离出来。为此目的,杂交应在严格的条件下完成,优选在高度严格条件下完成。严格的杂交条件应被理解为指的是洗涤条件为1xSSC溶液,0.1%SDS,温度65℃;高度严格条件指的是洗涤条件中SSC浓度降低趋向0.3xSSC。这个具体信息不应该被如此狭隘地解释以致需要排除错误鉴定的碱基。本文公开的具体序列可以很容易地被用来分离来自其他毒株的同源核苷酸序列。
与SEQ ID No:1,2或11所描述的核酸序列之一具有同源性的核酸序列可编码如下蛋白质,该蛋白质的氨基酸序列与SEQ ID No:3,4,10,12所描述的氨基酸序列之一或SEQ ID No:5或6所描述的部分氨基酸序列之一相比,包含了变更,然而所说的变更并不影响上述蛋白质的抗原性和免疫原性。编码VP26蛋白质的一个同源核苷酸序列的例子就是SEQ ID No:9所描述的核苷酸序列,它所编码的VP26蛋白质与SEQ ID No:3所描述的氨基酸序列相比,包含有某些变更。
本发明的白斑综合征病毒蛋白质可以经由标准的生物化学分离和纯化方法获得,或者它们也可经由一般的重组技术而制备。本发明的核苷酸序列特别适合用于基本上没有其他白斑综合征病毒蛋白质的白斑综合征病毒结构蛋白质的重组生产。该核苷酸序列被整合进能够表达该蛋白质的合适表达载体之内,用上述表达载体转化合适的宿主细胞,在一种合适的培养基中培养该宿主细胞。所表达的蛋白质可以从细胞或培养基中分离和纯化。合适的表达载体是包含复制和表达必须的调控区的那些质粒、粘粒、病毒、YAC’s(酵母人工染色体)及其他载体。表达载体能被带到一种宿主细胞中进行表达。合适的宿主细胞有,例如细菌,酵母细胞,昆虫细胞和哺乳动物细胞。这种表达技术在本领域已经广为人知(Sambrooke等,分子克隆:实验室手册(Molecular Cloning:a laboratory Manual),冷泉港实验室出版社,冷泉港,1989;King和Possee,1992)。
第三方面,本发明提供疫苗,其含有白斑综合征病毒毒粒的结构蛋白质VP24、VP26、VP28或VP19中的一种或多种,以及药学上可接受的载体。更明确地说,本发明的这种疫苗包含白斑综合征病毒毒粒蛋白质VP24、VP26、VP28或VP19,或二者或更多种上述蛋白质的组合。优选地,本发明的这种疫苗含有VP24,而这种VP24蛋白质含有SEQ ID No:12中描述的氨基酸序列,或者SEQ ID No:5中描述的N末端氨基酸序列,或者上述两种序列的衍生序列;或者这种疫苗含有VP26,而这种VP26蛋白质含有SEQ ID No:3或者SEQ ID No:10中描述的氨基酸序列,或者上述任意一种序列的衍生序列;或者这种疫苗含有VP28,而这种VP28蛋白质含有SEQ ID No:4中描述的氨基酸序列或者该序列的衍生序列;或者这种疫苗含有VP19,而这种VP19蛋白质含有SEQ ID No:6中描述的N端氨基酸序列或者该序列的衍生序列;或者这种疫苗含有所述蛋白质中二种或更多种蛋白的组合。更优选的是本发明的这种疫苗包含白斑综合征病毒蛋白质VP26和VP28,以及任选的VP24。
除此之外,本发明的核酸序列可以被用来制造载体疫苗(vectorvaccine),对甲壳动物进行接种,以对抗白斑综合征病毒的感染。载体疫苗应被理解为是一种经过改造的、活的减毒细菌或病毒疫苗,以致它们的遗传物质中含有一个或多个插入的异源核苷酸序列。这些所谓的载体细菌或病毒能够共表达由被插入的核苷酸所编码的异源蛋白质。因此,第四方面,本发明提供一种含有活的减毒细菌或病毒,以及药学上可接受的载体的载体疫苗,其中所说的细菌或者病毒已经被改造过,以致它们的遗传物质中含有一个或多个本发明的核苷酸序列。
本发明的疫苗能用来保护甲壳动物,例如虾:包括但并不仅限于来自对虾科(Penaeidae)的成员,例如斑节对虾(P.monodon)、南美白对虾(P.vannamei),中国对虾(P.chinensis),墨吉对虾(P.merguensis)、或新对虾属的种(Metapeaeus spp.);对虾:包括但并不仅限于来自长臂虾科(Palaemonidae)的成员,例如沼虾属的种(Macrobrachium spp.),或长臂虾属的种(Palaemon spp.);龙虾:包括但不仅限于来自龙虾科(Palinuridae)和海螯虾科(Nephropidae)的成员,举例来说,如(Calinectes spp.)、Palinurusspp.,龙虾属的种(Panuliris spp.),或螯龙虾属的种(Homarusspp.);蝲蛄:包括但并不仅限于来自河虾科(Astacidae)的成员,例如Astacus spp.,Procambarus spp.,和Oronectes spp.;以及蟹:包括但并不仅限于来自黄道蟹科(Cancridae)和梭子蟹科(Portuidae)的成员,例如:黄道蟹属的种(Cancerspp.),Callinectes spp.,Carcinus spp.以及梭子蟹属的种(Portunus spp.)。
本发明的疫苗可以依照那些对本领域专业人员而言已经广为人知的技术来制备,例如在下文中被描述过的技术:Remington药物科学(Remingtong′s Pharmaceutical Sciences),第18版(1990),编者:A.R.Gennaro等,第72章,第1389-1404页,费城药剂学和科学学院。
本发明的疫苗含有有效量的一种或多种本发明蛋白质、载体细菌或病毒,和药学上可接受的载体。在此所使用的术语“有效”被定义为足以在甲壳动物中诱发保护性反应的量。载体或蛋白质的量将依赖于所使用载体或蛋白质的类型、给药途径、给药时间、接受接种的动物种类、以及年龄、一般健康状况、温度和饮食情况。
大体上,每只动物可以使用的剂量为0.01到1000μg蛋白质,优选0.5到500μg,更优选0.1到100μg。如果使用病毒载体疫苗,大体上每只动物可以使用的剂量为103到108pfu(噬斑形成单位)。
本发明所指的适合在本发明的疫苗中使用的药学上可接受的载体是无菌并且生理学上相容的,例如:无菌水、盐水、水性缓冲液例如碱金属磷酸盐(例如PBS)、醇、多元醇等。除此之外本发明的疫苗可能包含其它添加剂,例如佐剂,稳定剂,抗氧化剂,防腐剂和其他添加剂。
合适的佐剂包括但并不仅限于铝盐或凝胶,卡波姆(carbomers),非离子嵌段共聚物,维生素E,monophospheryllipid A,胞壁酰二肽,油乳剂,葡聚糖,细胞因子,皂角甙例如Quil A,以及其他类似物。佐剂的添加量依赖于该佐剂本身的性质。
适合在本发明的疫苗中使用的稳定剂包括但并不仅限于糖类:例如山梨醇、甘露醇、淀粉、蔗糖、糊精和葡萄糖;蛋白质类:例如白蛋白或酪蛋白;以及缓冲液如碱性磷酸盐。
合适的防腐剂包括,硫柳汞和乙汞硫代水杨酸及其他。
本发明的疫苗可经由注射,浸渍,浸浴,喷雾或气溶胶,或口服给药。对甲壳动物而言,优选的方式是疫苗经由浸渍或口服给药,尤其是在商业性水产养殖场。
就口服给药方式而言,疫苗优选和合适的载体混合后口服给药,例如,与纤维素、食物或可代谢的物质,如α纤维素或蔬菜或动物来源的不同的油类混合。本发明的疫苗特别优选的食物载体是活饲料生物,它们可以将疫苗装入自己体内,合适的活饲料生物包括但并不仅限于类似浮游生物的非选择性滤食动物,优选的是轮形动物、Artemia的成员等。高度优选盐水虾Artemia sp.。
通过使用本领域专业人员已知的一般技术,本发明的蛋白质可以用来制备抗体。优选这些蛋白质被用来生产特异性单克隆抗体。本发明抗体可以按照标准的技术制备。那些将蛋白质免疫动物,例如老鼠,以及选择产生该蛋白质特异性单克隆抗体的杂交瘤的操作步骤在本领域中已经广为人知(见:例如Cligan等(编辑),免疫学当前方法(current protocols in immunology),1992;Kohler和Milstein,Nature256,第495-497页,1975;Steenbakkers等,Mol.Biol.Rep.19,第125-134页,1994)。获得的抗体可以用于诊断学,在当地检测白斑综合征病毒,或在甲壳动物中检测白斑综合征病毒的存在。本发明的核苷酸序列也适合用于诊断。上述的序列或其片段能用于例如PCR技术方面,在当地或在甲壳动物中检测白斑综合征病毒的存在。因此,另一方面,本发明还提供诊断试剂盒,其中包含本发明的一种或多种核苷酸序列或抗体。
本发明所诱生的抗VP28,VP26,VP24和VP19蛋白质的抗体可以进一步用来为甲壳动物的被动免疫制造抗体疫苗。因此,在另一方面,本发明提供被动免疫疫苗以对抗白斑综合征病毒,上述的疫苗含有抗VP28,VP26,VP24或VP19,或上述任意二种或多种蛋白质的组合的抗体。这样的疫苗可以使用如上所述的标准技术进行制备。优选制备通过口服给药的抗体疫苗,其中,抗体和可食用的载体例如鱼饲料混合。更优选的是这种疫苗是由鸡蛋中制备的抗体(IgY抗体)制备的。
下列实施例是用来举例说明本发明而不应该被解释成是以任何方式限制本发明。
附图说明
图1
白斑综合征病毒蛋白质。(A)负染的完整病毒颗粒的透射电子显微镜(TEM)照片。(B)负染的白斑综合征病毒核壳的透射电子显微镜照片。(C)纯化的白斑综合征病毒15%考马斯染色的SDS-PAGE凝胶。泳道1:低分子量蛋白质标准。泳道2:来自未感染虾的纯化“白斑综合征病毒颗粒”。泳道3:纯化的白斑综合征病毒颗粒。泳道4:纯化的白斑综合征病毒核壳。
图2
白斑综合征病毒VP26和VP28的核苷酸序列。(A)VP26和VP28在白斑综合征病毒基因组片段上的定位。(B)VP26和(C)VP28的核苷酸和蛋白质序列。vp26和vp28各自的可读框,从编码推导出的氨基酸序列第一个甲硫氨酸残基的ATG密码子开始。N末端氨基酸序列用粗体字表示;推测的N-糖基化位点的位置被用下划线表示,推测的O-糖基化位点用双重的下划线表示。VP28的简并引物位置的核苷酸序列用斜体字表示。
图3
(A)VP26和(B)VP28的疏水图。
图4
白斑综合征病毒结构蛋白质在昆虫细胞中的杆状病毒表达,15%SDS-PAGE凝胶和蛋白质印迹法(Western印迹法)分析。(A)Sf21细胞提取物的考马斯染色凝胶。泳道1:低分子量蛋白质标准。泳道2:模拟感染。泳道3:AcMNPV-wt(野生型)感染。泳道4:AcMNPV-GFP感染。泳道5:AcMNPV-WSSVvp26感染。泳道6:AcMNPV-WSSVvp28感染。泳道7:白斑综合征病毒。(B)使用抗纯化的白斑综合征病毒的多克隆抗体的蛋白质印迹。
图5
抗结构蛋白VP28的抗血清对虾体内白斑综合征病毒的中和。阴性对照:接受NaCl溶液的虾。阳性对照:接受白斑综合征病毒但未接受抗血清的虾。免疫前血清:接受白斑综合征病毒和免疫前血清的虾。VP28抗血清:接受病毒和抗VP28抗血清的虾。
图6
给虾接种白斑综合征病毒蛋白质。阴性对照:只接受NaCl溶液的虾。阳性对照:接受NaCl溶液和白斑综合征病毒的虾。组3:用VP24进行接种的虾。组4:用VP26c进行接种的虾。组5:用VP28进行接种的虾。组6:用VP24,VP26c和VP28的混合物进行接种的虾。
实施例
方法
白斑综合征病毒的制备和纯化
在本研究中使用的病毒是从泰国的受感染的斑节对虾(Penaeusmonodon)中分离出来的。受感染组织在TN缓冲液(20mM Tris-HCl,400mM NaCl,PH值7.4)中被匀浆化,在以1,700xg离心沉淀10分钟之后,过滤上清液(0.45μM过滤器)。滤液被肌肉注射进健康的斑节对虾体内开始感染,注射部位在第四腹节外侧区。4天后,从垂死的虾体内提取血淋巴,与作为抗凝剂的改良Alsever溶液(Rodriguez等,1995)混合。在用TNE(20mM Tris-HCL,400mM NaCl,5mM EDTA,PH值7.4)溶液稀释之后,在4℃以1,700xg速度离心10分钟,将血淋巴与血细胞相互分离。将病毒颗粒在4℃以45,000xg离心沉淀1小时,沉淀物用TN溶液重新悬浮。
用Nonidet P40(NP40)处理病毒颗粒,去除病毒包膜。在病毒溶液中加入1%的NP40,室温下处理30分钟并轻微振荡。核壳在4℃以80,000xg离心沉淀30分钟,沉淀物用TE(10mM Tris-HCl,1mMEDTA,PH值7.5)溶液溶解。
病毒颗粒的十二烷基磺酸钠-聚丙烯酰胺凝胶电泳(SDS-PAGE)
为进行蛋白质分析,在15%SDS-PAGE凝胶中对白斑综合征病毒的病毒颗粒制品(有包膜的病毒颗粒,核壳和阴性对照)进行分析。使用考马斯亮蓝染色法使蛋白质在SDS-PAGE凝胶中显色。
电子显微镜检查
为进行透射电子显微镜检查(TEM),病毒悬液被负载在透明塑胶(Formvar)包被的,碳稳定的镍载网(400网孔)上,用磷钨酸做负染(2%PTA),样本用Philips CM12电子显微镜观察。
核酸纯化
将纯化的病毒颗粒在45℃用蛋白酶K(0.2mg/ml)和十二烷基肌氨酸钠(1%)处理3小时,分离病毒DNA。继而用酚/氯仿抽提,用TE溶液(10mM Tris-HCl,1mM EDTA,PH值7.5)进行透析。纯化和浓缩后的DNA用带有标准的琼脂糖凝胶电泳进行鉴定。
质粒构建
白斑综合征病毒亚基因组片段被克隆到pBluescript SK+(Stratagene公司)质粒之内,并被使用标准的技术(Sambrook等,1989)转化进大肠杆菌(E.coli)DH5α体内。DNA的分离,限制性内切酶消化,琼脂糖凝胶电泳和菌落转移是依照标准的程序进行的(Sambrook等,1989)。聚合酶链反应(PCR)是使用自设合成引物来进行的。编码VP28 N末端的DNA是从白斑综合征病毒总DNA中用PCR方法扩增出来的,使用的引物是以VP28的N末端氨基酸序列为基础的简并性引物。所使用的正向引物是5’CAGAATTCTCDATNGTYTTNGTNAC3’(SEQ ID No:7),反向引物是有EcoRI位点(斜体字)的5’CAGAATTCATGGAYYTNWSNTTYAC 3’(SEQ ID No:8)(D=A,T或G;N=A,C,G或T;Y=C或T;W=A或T;S=C或G)。VP24的N末端序列是从白斑综合征病毒总DNA中用PCR方法扩增出来的,使用的引物是一套以VP24的N末端氨基酸序列为基础的简并性引物。5’CAGAATTCATGCAYATGTGGGGNGT 3’(SEQ ID No:13)被用做正向引物,而5’CAGAATTCYTTRTCYTTYTTRTCIARYTT 3’(SEQ ID No:14)作为反向引物,两者均包含EcoRI位点(斜体字)。
DNA测序和计算机分析
要测序的质粒DNA经由QIAprep Miniprep系统或JETstar质粒纯化系统(Qiagen公司)被纯化。测序采用通用的pBluescript正向和反向核苷酸引物,以及订制合成的引物以两条链进行。使用AppliedBiosytems自动化DNA测序仪(Eurogentec,比利时)进行自动测序。
读出的序列用UWGCG计算机程序进行分析(版本10.0)。使用FASTA,TFASTA(Pearson &Lipman,1988)和BLAST(Altschul等,1997)程序将DNA和推导出的氨基酸序列与更新过的GenBank/EMBL,SWISSPORT和PIR数据库进行比较。
细胞和病毒
草地贪夜蛾(Spodoptera frugiperda)(Sf-AE-21)细胞(Vaughn等,1977)被培养在补充了10%胎牛血清(FCS)的Grace’s昆虫培养基(GIBCO BR公司)中。苜蓿银蚊夜蛾核型多角体病毒(AcMNPV)(Smith和Summers,1982)的E2-株被当作野生型(wt)病毒使用。常规的细胞维持培养和病毒感染步骤是依照已经出版的操作步骤进行的(Smith和Summers,1987;King和Possee,1992)。
重组体改造
Bac-to-Bac系统(GIBCO BRL公司)在昆虫细胞中被用来过量表达白斑综合征病毒VP24(SEQ ID No:12)、VP26(SEQ ID No:3)、VP26c(SEQID No:10)和VP28(SEQ ID No:4)。为了在昆虫细胞感染后容易检测和滴定Bac-to-Bac重组体,绿色荧光蛋白(GFP)基因被引入pFastBac-DUAL载体p10启动子的下游。GFP基因来自pVL92GFP质粒(Reilander等,1996),是将该质粒用Xba I和Kpn I消化之后得到的。700bp包含GFP的片段被琼脂糖凝胶电泳和GlassMAX纯化方法(GIBCOBRL)分离,使用DNA聚合酶钝化其末端,插入pFastBac-DUAL质粒p10启动子的下游多克隆区II的Sma l位点。所得到的质粒被命名为pFastBac-D/GFP,在它的多角体蛋白启动子的下游有一个供外源基因插入的I区。只表达受p10启动子调控的GFP的重组病毒依照Bac-to-Bac系统程序(GIBCO BRL)构建完成,该病毒被称为AcMNPV-GFP。
对含有据推测是完整的vp26(SEQ ID No:1)和vp28(SEQ ID No:2)可读框(ORFs)的白斑综合征病毒质粒进行PCR扩增反应,在ORFs的3’端引进一个BamH I位点,在ORFs的5’端引入一个Hind III位点。vp26(SEQ ID No:1)和vp28(SEQ ID No:2)首先被克隆到pET28a载体(Novagen公司)之内,用BamHI和Not I酶切割,将其插入质粒pFastBac-D/GFP的多角体蛋白启动子的下游。获得的质粒被分别命名为pFastBac-D/G-vp26和pFastBac-D/G-vp28。vp26c(SEQ ID No:9)和vp24(SEQ ID No:11)也从含有推测的可读框(ORFs)的质粒中经由PCR扩增出来,并通过引物在ORFs的5’端引进一个BamH I位点,在ORFs的3’端引入一个EcoR I位点。经消化后,vp26c(SEQ ID No:9)和vp24(SEQ ID No:11)的可读框被插入pFastBac-D/GFP质粒多角体蛋白启动子的下游,获得质粒pFastBac-D/G-vp26c和pFastBac-D/G-vp24。能从p10启动子表达GFP和从多角体蛋白启动子表达VP24(SEQ ID No:12),VP26(SEQ ID No:3),vp26c(SEQ ID No:10)或VP28(SEQ ID No:4)的重组病毒依照Bac-to-Bac系统程序(GIBCOBRL)构建完成,分别被命名为AcMNPV-WSSVvp24,AcMNPV-WSSVvp26,AcMNPV-WSSVvp26c和AcMNPV-WSSVvp28。
SDS-PAGE,蛋白质序列分析和免疫印迹法
将受野生型苜蓿银蚊夜蛾核型多角体病毒(AcMNPV)以及重组的表达异源性蛋白质(GFP,VP26,VP28)的AcMNPV感染的昆虫细胞在15%SDS-PAGE凝胶中分析。使用考马斯亮蓝染色法使蛋白质着色而可见。半干印迹可以在聚偏二氟乙烯(polyvinylidene difluoride)(PVDF)膜(Bio-Rad公司)上进行,使用的是CAPS缓冲液(10mM CAPS在10%甲醇中);或在ImmobilonTM-P(Millipore公司)膜上进行,使用Tris-甘氨酸缓冲液(25mM Tris碱,192mM甘氨酸,10%(v/v)甲醇,PH值8.3)。使用考马斯亮蓝染色法使蛋白质在PVDF膜上显色。来自白斑综合征病毒病毒颗粒标本的主要蛋白质带从滤膜上被切下并进行N末端序列测定(ProSeq公司,麻萨诸塞州)。
Immobulon-P膜在TBS溶液(0.2M NaCl,50mM Tris-HCL,PH值7.4)中用2%低脂奶粉(Campina公司,荷兰)封闭。免疫检测是通过下面的步骤来进行的:室温下,在含有0.2%低脂奶粉的TBS中将印迹与1∶2000稀释的多克隆兔抗白斑综合征病毒血清(来自P.C.Loh教授的惠赠,檀香山大学,夏威夷)一起孵育1小时。然后,用1∶2000稀释的,结合了辣根过氧化物酶(Amersham公司)的抗兔抗体与之结合,使用“增强的化学发光-光检测试剂盒”(Amersham公司)进行检测。
VP28多克隆抗体
白斑综合征病毒主要的包膜结构蛋白VP28在昆虫细胞中被杆状病毒AcMNPV-WSSVvp28所表达,使用Prepcell(Biorad公司)和分段收集器进行纯化。包含VP28的部份被收集和浓缩。将纯化的VP28蛋白质注射进兔子以制备多克隆抗体。用纯化的白斑综合征病毒颗粒对抗体进行蛋白质印迹法测试,抗体对来自白斑综合征病毒毒粒的VP28反应良好。将这个VP28抗毒血清用于白斑综合征病毒中和实验中。
白斑综合征病毒原种
白斑综合征病毒(WSSV)病毒原种是从蝲蛄Procambarus clarkii的血淋巴中提纯出来的,它在一周以前被肌肉注射了低浓度的白斑综合征病毒。血淋巴经由连续蔗糖梯度离心而纯化,吸出病毒条带。病毒在被沉淀后,又在TE溶液(PH值7.5)中被重新溶解。病毒原种被保存在-70℃直到在实验中使用。
蛋白质接种
白斑综合征病毒主要的包膜结构蛋白质VP28(SEQ ID No:4)和核壳蛋白质VP26c(SEQ ID No:10)和VP24(SEQ ID No:12)在昆虫细胞中用杆状病毒AcMNPV-WSSVvp28、AcMNPV-WSSVvp26c和AcMNPV-WSSVvp24表达,这些病毒从P10启动子表达GFP,从多角体蛋白启动子表达白斑综合征病毒结构蛋白。感染3天后,收获受感染的昆虫细胞,并用超声波打碎细胞。上清液用来接种斑节对虾(P.monodon)。
实验中使用6组虾:
组别 | 组名 | 接种 | 加强免疫 | 攻击 | 各组虾的个数 |
1 | 阴性对照 | 330mM NaCl | 330mM NaCl | 330mM NaCl | 10 |
2 | 阳性对照 | 330mM NaCl | 330mM NaCl | WSSV | 10 |
3 | VP28 | VP28 | VP28 | WSSV | 15 |
4 | VP26c | VP26c | VP26c | WSSV | 15 |
5 | VP24 | VP24 | VP24 | WSSV | 15 |
6 | 混合物(MIX) | 混合物 | 混合物 | WSSV | 15 |
在“混合物”中,等体积的VP28,VP26c和VP24溶液在注射之前混合。接种疫苗后5天,对这些虾进行加强注射。二天之后用白斑综合征病毒(病毒原种,见中和实验)注射攻击。注射后,对这些虾进行6天的监测,死虾经电子显微镜检查白斑综合征病毒是否存在。
结果
分离白斑综合征病毒蛋白质用于测序
使用纯化的病毒制剂并以肌内注射的方式感染斑节对虾。在感染后四天,从受白斑综合征病毒感染的动物的血淋巴中分离病毒。从未受感染的虾体内提取血淋巴作为阴性对照。这些标本被用来进行电子显微镜检查,分析白斑综合征病毒毒粒的存在和纯度。在未受感染动物的样品中,没有观察到病毒颗粒,但是在受感染动物的样品中,观察到许多主要包膜的病毒颗粒(图1a)。用NP40处理后,病毒的包膜被从病毒颗粒上去除,剩下纯的核壳(图1b)。该核壳具有白斑综合征病毒核壳所特有的表面分节的外观特性(Durand等,1997)。有包膜的病毒颗粒的蛋白质和核壳蛋白质可以被SDS-PAGE分开(图1c)。病毒颗粒中的四个主要的多肽可以根据它们的表观分子量而识别出来,它们的表观分子量分别是28(VP28),26(VP26),24(VP24),和19kDa(VP19)。数个较不明显的带也被观察到,其中大约六个带位于30到65kDa之间,至少七个弱的蛋白质带位于86kDa到130kDa的范围之内。来自血淋巴的三个主要的蛋白质带也与病毒颗粒一起被纯化,位于67kDa到78kDa之间。在这个区域中的较小的蛋白质带不能在这个凝胶中被观察到(图1)。其大小代表着主要的白斑综合征病毒蛋白质VP28和VP19的蛋白条带在包含纯化核壳的泳道(图1c)中并不存在,如此看来它们像是起源于病毒的包膜或间层。VP26和VP24在核壳和病毒颗粒的泳道上都存在,表示它们起源于核壳。
SDS-PAGE凝胶上的内容物通过半干印迹的方法被转移到一个聚偏二氟乙烯(PVDF)膜上,主要的病毒蛋白质带被切下和测序。VP28和VP26中有超过40个氨基酸被从N端测序(分别显示在图2b和2c中,用粗体字显示)。VP26的N末端序列包含了MEFGNLTNLDVAIIAILSIAIIALIVIMVIMIVFNTRVGRSVVAN。VP28 N末端测序得出的氨基酸序列是MDLSFTLSVVSAILAITAVIAVFIVIFRYHNTVTKTIEtHsD,其中39位的苏氨酸和41位的丝氨酸是不确定的。这两个N末端序列都是疏水的(图3)。经由N末端肽测序所获得的VP24 N末端氨基酸序列是MHMWGVYAAILAGLTLILVVISIVVTNIELNKKLDKKDK(SEQ ID No:5)。VP19的N末端被发现是封闭的,由CNBr消化N末端封闭肽所获得的VP19的部分内部序列是IVLISI(G/V)ILVLAVMNV(P/A/T)MGPKKDS(SEQ ID No:6)。在VP19不完全的序列中,第7位氨基酸残基可能是G或V,第17位可能是P,A或T残基。
24kDa蛋白质基因的定位和序列
根据VP24 N末端蛋白质序列,发展出了一组简并的PCR引物,正向引物是5’CAGAATTCATGCAYATGTGGGGNGT 3’(SEQ ID No:13),而反向引物则是5’CAGAATTCYTTRTCYTTYTTRTCIARYTT 3’(SEQ ID No:14),两者都包含EcoRI位点(斜体字)。使用白斑综合征病毒基因组DNA为模板进行PCR扩增。获得了一个133bp长的片段,并经由2%琼脂糖凝胶纯化之后,插入pBluescript SK+质粒中并测序。这种PCR产品的序列与白斑综合征病毒VP24的N末端蛋白质序列(SEQ ID No:5)相吻合,从而在白斑综合征病毒质粒文库筛选实验中被作为探针使用(Sambrook等,1989),用来识别VP24完整的可读框。一个能与这个片段进行杂交的18kbp BamHI片段被挑选出来进行进一步的分析。
包含627个核苷酸的完整vp24可读框和这个基因的启动子区域在18kbp BamHI片段上被发现。翻译的起始密码子处于有利的区域(AAAATGC)中,可以有效地起始真核翻译(Kozak,1989)。在启动子区域中,排列着一段A/T富集序列,但是没有发现共有序列TATA盒。polyA信号与翻译中止密码子重叠。vp24可读框(SEQ ID No:11)编码一段208个氨基酸(SEQ ID No:12)的推导出的蛋白质,其中氨基酸序列包含经实验证实的VP24 N末端序列(SEQ ID No:5)。VP24的理论大小有23kDa,等电点8.7。在VP24里面发现有四个可能的N-糖基化位点(N-{P}-[ST]-{P}),一个O-糖基化位点(Hansen等,1998)和9个可能的磷酸化位点([ST]-X-X-[DE]或[ST-X-[RK])。但是不知道是否其中任何一个修饰确实发生过。在VP24中没有发现其他存在于PROSITE据库中的基序。208个氨基酸的计算机分析显示在VP24的N末端存在一个强疏水区,包括一段推测的由第6到第25个氨基酸形成的跨膜α-螺旋。Gamier等人(1978)的算法还预测在该蛋白质中存在数个其他的α-螺旋和β-片层。
26kDa蛋白质基因的定位和序列
部分Hind III和BamH I白斑综合征病毒基因组文库被构建于pBluescript-SK+质粒中(van Hulten等,2000),从许多白斑综合征病毒片段中获得末端的核苷酸序列。编码VP26的N末端序列的核苷酸序列存在于6kb BamHI片段的近末端(图2a)。围绕甲硫氨酸起始密码子的序列(AAAATGG)与Kozak规则中有关真核翻译的有效起始的描述相吻合(Kozak,1989)。VP26的非翻译引导序列只有49个核苷酸可以被判定,一直伸展到末端BamH I位点(图2a)。
6kb BamHI片段包含了一个555nt的可读框,包括那些编码VP26N末端氨基酸的序列(图2b),polyA信号存在于VP26的翻译终止密码子下游94个核苷酸(nt)处。此可读框(VP26)编码一个含有184个氨基酸的蛋白质,理论大小为20kDa。这个推导出的蛋白质是碱性的,等电点为9.4。存在三个可能的N-糖基化位点(N-{P}-[ST]-{P}),以及三个使用NetOglyc程序推测出的O-糖基化位点(图2b)(Hansen等,1998)。发现了十三个可能的磷酸化位点([ST]-X-X-[DE]或[ST]-X-[RK]),但是没有发现其他存在于PROSITE数据库中的基序。VP26的184氨基酸的疏水性分析显示一个强的疏水区域存在于该蛋白质的N端(图3a)。这个区域包含了一个推测的、由第12到第34位氨基酸构成的、呈α-螺旋形式的跨膜锚钩。锚钩的后面是一个含有两个精氨酸的带正电荷区,这暗示其羧基端是朝向细胞质一侧的(Sonnhammer等,1998)。除α-螺旋外,在这个跨膜区内,根据Gamier等(1978)发现的法则,发现从第127位到第141位有一个潜在的β-片层。在该蛋白质中只有一个半胱氨酸,显示其不能在内部蛋白质之间形成二硫键交联。这个半胱氨酸位于蛋白质的C末端部分,在VP28中也是如此。
28kDa蛋白质基因的定位和序列
从白斑综合征病毒末端片段序列翻译得不到VP28的氨基酸序列。根据这个多肽的N末端序列发展出一套简并引物。正向引物是5’CAGAATTCTCDATNGTYTTNGTNAC 3’(SEQ ID No:7),而反向引物是有EcoRI位点(斜体字)的5’CAGAATTCATGGAYYTNWSNTTYAC 3’(SEQ IDNo:8)。序列上的引物定位如图2c所示。使用白斑综合征病毒DNA作为模板进行PCR扩增。获得一个128bp长的片段,并且该序列经过2.5%琼脂糖凝胶纯化以后,被克隆到pBluescript SK+质粒之内并进行测序。该核苷酸序列编码白斑综合征病毒VP28的N末端蛋白质序列,这个128bp片段还被用在菌落筛选实验中,作为探针来对数个白斑综合征病毒质粒文库进行鉴定(Sambrook等,1989)。一个3kb Hind III片段由于能与这个片段进行杂交而被留做进一步分析。
612nt的完整可读框(vp28)和这个基因的启动子区域在这个3kb Hind III片段上被发现(图2c)。甲硫氨酸起始密码子(GTCATGG)处于有利的环境中,可以有效地起始真核翻译(Kozak,1989)。在启动子区域中,排列着一段A/T富集序列,但是没有发现共有的TATA盒。polyA信号位于翻译终止密码子下游55核苷酸处。这个可读框编码一个含有204个氨基酸的推测蛋白质,包括N末端测序的氨基酸在内。这个酸性的蛋白质的理论上的大小是22kDa,等电点4.6。发现有五个潜在的N-糖基化位点(N-{P}-[ST]-{P}),二个O-糖基化位点(Hansen等,1998)(图2c)和9个潜在的磷酸化位点([ST]-X-X-[Pe]或[ST]-X-[RK])。(在VP28中没有发现其他存在于PROSITE数据库中的基序。
计算机分析显示这个204个氨基酸的蛋白质在其N端有一个强疏水区(图3b),包括一个推测的、由第9到第27位氨基酸形成的穿膜α-螺旋序列。和VP26一样,穿膜锚钩的后面是一个带正电荷区,这暗示该蛋白质可能具有由外向内的方向。在序列的C末端部分发现了另外的一个疏水区,它可能组成一个穿膜序列。然而,Gamier等的算法(1978)没有预测出在VP28的这个位置存在α-螺旋。该算法预测在89到99位氨基酸处存在另一个α-螺旋,但是该蛋白没有β-片层。和VP26一样,在VP28中也只有一个半胱氨酸,这个半胱氨酸位于蛋白质的C末端部分。
重组的vp24,vp26和vp28的表达和分析。
采用Bac-to-Bac系统(GIBCO BRL)在昆虫的细胞中制备能够表达推导的白斑综合征病毒颗粒蛋白质VP24,VP26,VP26c和VP28的重组杆状病毒。vp24,vp26,vp26c和vp28基因(分别是SEQ ID No:11,SEQ ID No:1,SEQ ID No:9和SEQ ID No:2)被克隆到pFastBac-D/GFP质粒的多角体蛋白启动子的下游,该质粒包含一个位于p10启动子的下游的GFP基因。从pFastBac-D/GFP(对照)质粒以及分别带有vp24,vp26,vp26c和vp28基因的质粒中产生重组病毒,这些重组病毒分别被命名为AcMNPV-GFP,AcMNPV-WSSVvp24,AcMNPV-WSSVvp26,AcMNPV-WSSVvp26c和AcMNPV-WSSVvp28。所有的重组病毒都受p10启动子调控表达GFP;后四者还在多角体蛋白启动子的调控下分别表达VP24(SEQ ID No:12),VP26(SEQ ID No:3),VP26c(SEQ ID No:10)和VP28(SEQ ID No:4)。
受AcMNPV-wt,AcMNPV-GFP,AcMNPV-WSSVvp26和AcMNPV-WSSVvp28感染的Sf21细胞的提取物在15%SDS-PAGE凝胶中进行分析。在受野生型AcMNPV感染的细胞中(图4a,泳道3)可见一条32kDa的带,它代表多角体蛋白。在那些含有被AcMNPV-GFP感染的细胞的提取物(泳道4),以及被表达白斑综合征病毒蛋白质的重组病毒感染的细胞的提取物(泳道5和6)的泳道中,可以观察到一个大约29kDa的GFP蛋白质带。受AcMNPV-GFP感染的细胞中的GFP的表达,比那些受同时从多角体蛋白启动子表达白斑综合征病毒蛋白质(泳道5和6)的杆状病毒感染的细胞中的GFP表达要高。用紫外线照射那些受不同的AcMNPV重组病毒感染的细胞后,这很容易观察到,其中:受AcMNPV-GFP感染的细胞的GFP萤光是最强的(资料未显示)。由多角体蛋白启动子调控的白斑综合征病毒蛋白质的表达与由p10启动子调控的GFP的表达相比,前者明要高(泳道5和6)。在受AcMNPV-WSSVvp26感染的细胞提取物中,可以观察到一个21kDa蛋白质的强表达,它很有可能代表白斑综合征病毒的VP26(泳道5)。在受AcMNPV-WSSVvp28感染的细胞中可观察到28kDa蛋白质的强表达(泳道6)。在这些凝胶中,通过使用抗GFP抗血清,GFP的位置被蛋白质印迹分析所确认(数据未显示)。
用野生型和重组的AcMNPV感染Sf21细胞,取样在SDS-PAGE凝胶中电泳,然后进行蛋白质印迹分析。一种抗白斑综合征病毒毒粒的多克隆抗体被用来检测重组的VP26和VP28(图4b)。VP26和VP28都在这些细胞提取物中被很好地检测到。VP26在分子量为21kDa的位置处被检测到,这与考马斯亮蓝染色凝胶结果相符(图4a,泳道5;图4b,泳道5)。重组VP28与来自白斑综合征病毒颗粒的VP28在凝胶上移动到同一位置,该位置所代表的分子量明显高于这个蛋白质的理论大小22kDa。就象从这些样品的非常低的本底反应所能观察出来的那样,该多克隆抗体没有与昆虫细胞(泳道2)或杆状病毒(泳道3和4)的蛋白质发生较多的交叉反应。
将受AcMNPV-WSSVvp26c以及AcMNPV-WSSVvp24感染的Sf21细胞的提取物在15%SDS-PAGE凝胶中进行分析。一个低分子量标准和纯化的白斑综合征病毒颗粒也在相同的凝胶中分析。在含有受AcMNPV-WSSVvp26c以及AcMNPV-WSSVvp24感染的细胞的泳道中,可以观察到一个29kDa的弱带,它代表GFP,在受感染的细胞经紫外线照射之后可以很清楚地被观察到。此外在含有受AcMNPV-WSSVvp26c感染的细胞的泳道中,可以观察到一个26kDa的强表达带,与在白斑综合征病毒颗粒中的26kDa带出现在凝胶中的相同位置。在包含受AcMNPV-WSSVvp24感染的细胞的泳道,可以观察到一个清晰的24kDa带,与白斑综合征病毒颗粒所具有的24kDa蛋白质的位置相一致。为了证明在受AcMNPV-WSSVvp26c感染的细胞中的26kDa带,和在受AcMNPV-WSSVvp24感染的细胞中的24kDa带,与在白斑综合征病毒颗粒中的26kDa和24kDa蛋白质相一致,使用抗白斑综合征病毒颗粒的一个多克隆抗体对这个凝胶进行蛋白印迹分析。在受AcMNPV-WSSVvp26c感染的细胞中的26kDa带,以及在受AcMNPV-WSSVvp24感染的细胞中的24kDa带都被很好地检测到了。
VP26和VP28的相关性
以GenBank/EMBL,SWISSPORT和PIR数据库为基础,使用FASTA,TFASTA和BLAST程序,对白斑综合征病毒的VP24,VP26,VP26c和VP28进行了同源性搜索。没有发现它们与存储在GenBank中的序列有明显的同源关系,它们既不与杆状病毒包膜或衣壳蛋白质有同源关系,也不与来自其他的大的DNA病毒的结构蛋白质有同源关系。
中和实验
病毒原种的滴度从滴定实验中获得。病毒原种被稀释1×107到5×1011倍,在每个稀释度,都要取该稀释度的病毒液给10只虾(斑节对虾,3-4个月大)进行肌内注射,每只注射10μl。白斑综合征病毒原种的1×108倍稀释液在7到12天后可引起50%的虾死亡。在进一步的实验中将会用到这个稀释度。
4群虾用于中和实验:
组别 | 组名 | 注射 | 每组中虾的个数 |
1 | 阴性对照 | 330mM NaCl | 10 |
2 | 阳性对照 | WSSV | 10 |
3 | 免疫前血清 | WSSV+免疫前血清 | 15 |
4 | VP28抗血清 | WSSV+VP28抗血清 | 15 |
给每只虾注射的病毒的总量在所有的组中都是恒定不变的,都等于10μl的病毒原种的1×108倍稀释液。组3中的血清浓度和组4是相同的(每次注射都含有1ul的白斑综合征病毒和9ul血清)。在注射之后,虾被监视4个星期,死虾要经过电子显微镜检查以确定白斑综合征病毒的存在。结果如图5所示。
在组1,即阴性对照组中,没有一只虾因感染白斑综合征病毒而死亡,因此死亡率是0%。在阳性对照(组2)中,在23天之后,死亡率达到100%。免疫前血清(在兔子被注射VP28蛋白质之前采集的血清)加入白斑综合征病毒的组(组3),在25天内死亡率达到100%。VP28抗毒血清加入白斑综合征病毒的组(组4),所有的虾都活着,死亡率为0%。这些结果显示VP28抗毒血清在斑节对虾中能够中和白斑综合征病毒的感染。
蛋白质免疫接种
用5μl(初次接种)和10ul(加强免疫)不同的蛋白质溶液对组3-6进行免疫接种。免疫接种时,组3接受了2.5μg VP28蛋白质,组4接受了3.6μg VP26c蛋白质,组5接受了0.7μg VP24蛋白质。组6接受了由等体积的VP28,VP26c以及VP24溶液所组成的混合物,总共2.7ug蛋白质。加强免疫时,这些虾所接受的蛋白质的量就更高了:组3为9.6ug VP28蛋白质,组4为5.7ug VP26c蛋白质,组5为5.9ug VP24蛋白质,组6为合计7.1ug的混合蛋白质。所有这些组里的虾都被注射了10ul 1×108倍稀释的白斑综合征病毒原种溶液。
免疫接种的结果如图6所示。在组1,即阴性对照组中,没有一只虾因感染白斑综合征病毒而死亡,因此死亡率是0%。在组2中,在注射后1天,虾就因为感染白斑综合征病毒而开始死亡,并且死亡率在不断增加。虽然这些虾所接受的白斑综合征病毒的剂量与中和实验中的虾所接受的剂量完全相同,但是组2中的虾更早地开始死亡。这或许是由于本实验进行多次注射而引起对虾的压力所造成的结果。在组3-5(虾分别被接种了VP24,VP26c和VP28)中的死亡率被延迟,在组6(虾被接种了VP24,VP26c和VP28的混合物)中,没有一只虾因为感染白斑综合征病毒而死亡,因此死亡率是0%。对在接种中使用的各蛋白质的剂量进行优化也会增强抗白斑综合征病毒感染的保护效果。
参考文献
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<140>
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<151>1999-08-03
<150>EP 00200248.3
<151>2000-01-24
<160>14
<170>PatentIn Ver.2.1
<210>1
<211>555
<212>DNA
<213>白斑综合征病毒
<400>1
atggaatttg gcaacctaac aaacctggac gttgcaatta ttgcaatctt gtccattgca 60
atcattgctc taatcgttat catggttata atgattgtat tcaacacacg tgttggaaga 120
agcgtcgtcg ctaattatga tcagatgatg cgagtcccaa ttcaaagaag ggcaaaggta 180
atgtcaattc gtggagagag gtcctacaat actcctcttg gaaaggtggc catgaagaat 240
ggtctctccg ataaggacat gaaggatgtt tctgctgatc ttgtcatctc taccgtcaca 300
gccccaagga ctgatcccgc tggcactggg gccgagaact ctaacatgac tttgaagatc 360
ctcaacaaca ctggcgtcga tctcttgatc aacgacatta ctgttcggcc aactgttatt 420
gcaggaaaca ttaagggaaa tactatgtcg aacacttact tctcgagcaa ggacattaaa 480
tcttcatctt caaaaattac cctcattgac gtgtgcagca aatttgaaga cgcgcagcct 540
tcgaagctac aatga 555
<210>2
<211>615
<212>DNA
<213>白斑综合征病毒
<400>2
atggatcttt ctttcactct ttcggtcgtg tcggccatcc tcgccatcac tgctgtgatt 60
gctgtattta ttgtgatttt taggtatcac aacactgtga ccaagaccat cgaaacccac 120
acagacaata tcgagacaaa catggatgaa aacctccgca ttcctgtgac tgctgaggtt 180
ggatcaggct acttcaagat gactgatgtg tcctttgaca gcgacacctt gggcaaaatc 240
aagatccgca atggaaagtc tgatgcacag atgaaggaag aagatgcgga tcttgtcatc 300
actcccgtgg agggccgagc actcgaagtg actgtggggc agaatctcac ctttgaggga 360
acattcaagg tgtggaacaa cacatcaaga aagatcaaca tcactggtat gcagatggtg 420
ccaaagatta acccatcaaa ggcctttgtc ggtagctcca acacctcctc cttcaccccc 480
gtctctattg atgaggatga agttggcacc tttgtgtgtg gtaccacctt tggcgcacca 540
attgcagcta ccgccggtgg aaatcttttc gacatgtacg tgcacgtcac ctactctggc 600
actgagaccg agtaa 615
<210>3
<211>184
<212>PRT
<213>白斑综合征病毒
<400>3
Met Glu Phe Gly Asn Leu Thr Asn Leu Asp Val Ala Ile Ile Ala Ile
1 5 10 15
Leu Ser Ile Ala Ile Ile Ala Leu Ile Val Ile Met Val Ile Met Ile
20 25 30
Val Phe Asn Thr Arg Val Gly Arg Ser Val Val Ala Asn Tyr Asp Gln
35 40 45
Met Met Arg Val Pro Ile Gln Arg Arg Ala Lys Val Met Ser Ile Arg
50 55 60
Gly Glu Arg Ser Tyr Asn Thr Pro Leu Gly Lys Val Ala Met Lys Asn
65 70 75 80
Gly Leu Ser Asp Lys Asp Met Lys Asp Val Ser Ala Asp Leu Val Ile
85 90 95
Ser Thr Val Thr Ala Pro Arg Thr Asp Pro Ala Gly Thr Gly Ala Glu
100 105 110
Asn Ser Asn Met Thr Leu Lys Ile Leu Asn Asn Thr Gly Val Asp Leu
115 120 125
Leu Ile Asn Asp Ile Thr Val Arg Pro Thr Val Ile Ala Gly Asn Ile
130 135 140
Lys Gly Asn Thr Met Ser Asn Thr Tyr Phe Ser Ser Lys Asp Ile Lys
145 150 155 160
Ser Ser Ser Ser Lys Ile Thr Leu Ile Asp Val Cys Ser Lys Phe Glu
165 170 175
Asp Ala Gln Pro Ser Lys Leu Gln
180
<210>4
<211>204
<212>PRT
<213>白斑综合征病毒
<400>4
Met Asp Leu Ser Phe Thr Leu Ser Val Val Ser Ala Ile Leu Ala Ile
1 5 10 15
Thr Ala Val Ile Ala Val Phe Ile Val Ile Phe Arg Tyr His Asn Thr
20 25 30
Val Thr Lys Thr Ile Glu Thr His Thr Asp Asn Ile Glu Thr Asn Met
35 40 45
Asp Glu Asn Leu Arg Ile Pro Val Thr Ala Glu Val Gly Ser Gly Tyr
50 55 60
Phe Lys Met Thr Asp Val Ser Phe Asp Ser Asp Thr Leu Gly Lys Ile
65 70 75 80
Lys Ile Arg Asn Gly Lys Ser Asp Ala Gln Met Lys Glu Glu Asp Ala
85 90 95
Asp Leu Val Ile Thr Pro Val Glu Gly Arg Ala Leu Glu Val Thr Val
100 105 110
Gly Gln Asn Leu Thr Phe Glu Gly Thr Phe Lys Val Trp Asn Asn Thr
115 120 125
Ser Arg Lys Ile Asn Ile Thr Gly Met Gln Met Val Pro Lys Ile Asn
130 135 140
Pro Ser Lys Ala Phe Val Gly Ser Ser Asn Thr Ser Ser Phe Thr Pro
145 150 155 160
Val Ser Ile Asp Glu Asp Glu Val Gly Thr Phe Val Cys Gly Thr Thr
165 170 175
Phe Gly Ala Pro Ile Ala Ala Thr Ala Gly Gly Asn Leu Phe Asp Met
180 185 190
Tyr Val His Val Thr Tyr Ser Gly Thr Glu Thr Glu
195 200
<210>5
<211>39
<212>PRT
<213>白斑综合征病毒
<400>5
Met His Met Trp Gly Val Tyr Ala Ala Ile Leu Ala Gly Leu Thr Leu
1 5 10 15
Ile Leu Val Val Ile Ser Ile Val Val Thr Asn Ile Glu Leu Asn Lys
20 25 30
Lys Leu Asp Lys Lys Asp Lys
35
<210>6
<211>24
<212>PRT
<213>白斑综合征病毒
<220>
<221>UNSURE
<222>(7)
<223>Xaa=Gly或Val
<220>
<221>UNSURE
<222>(17)
<223>Xaa=Pro或Ala或Thr
<400>6
Ile Val Leu Ile Ser Ile Xaa Ile Leu Val Leu Ala Val Met Asn Val
1 5 10 15
Xaa Met Gly Pro Lys Lys Asp Ser
20
<210>7
<211>25
<212>DNA
<213>人工序列
<220>
<223>人工序列描述:引物序列
<400>7
cagaattctc datngtyttn gtnac 25
<210>8
<211>25
<212>DNA
<213>人工序列
<220>
<223>人工序列描述:引物序列
<400>8
cagaattcat ggayytnwsn ttyac 25
<210>9
<211>615
<212>DNA
<213>白斑综合征病毒
<400>9
atggaatttg gcaacctaac aaacctggac gttgcaatta ttgcaatctt gtccattgca 60
atcattgctc taatcgttat catggttata atgattgtat tcaacacacg tgttggaaga 120
agcgtcgtcg ctaattatga tcagatgatg cgagtcccaa ttcaaagaag ggcaaaggta 180
atgtcaattc gtggagagag gtcctacaat actcctcttg gaaaggtggc catgaagaat 240
ggtctctccg ataaggacat gaaggatgtt tctgctgatc ttgtcatctc taccgtcaca 300
gccccaagga ctgatcccgc tggcactggg gccgagaact ctaacatgac tttgaagatc 360
ctcaacaaca ctggcgtcga tctcttgatc aacgacatta ctgttcggcc aactgttatt 420
gcaggaaaca ttaagggaaa tactatgtcg aacacttact tctcgagcaa ggacattaaa 480
tcttcatctt caaaaattac cctcattgac gtgtgcagca aatttgaaga cggcgcagcc 540
ttcgaagcta caatgaacat tggattcacc tccaagaatg tgatcgatat caaggacgaa 600
atcaagaaga agtaa 615
<210>10
<211>204
<212>PRT
<213>白斑综合征病毒
<220>
<223>人工序列描述:引物;n是脱氧肌苷
<400>10
Met Glu Phe Gly Asn Leu Thr Asn Leu Asp Val Ala Ile Ile Ala Ile
1 5 10 15
Leu Ser Ile Ala Ile Ile Ala Leu Ile Val Ile Met Val Ile Met Ile
20 25 30
Val Phe Asn Thr Arg Val Gly Arg Ser Val Val Ala Asn Tyr Asp Gln
35 40 45
Met Met Arg Val Pro Ile Gln Arg Arg Ala Lys Val Met Ser Ile Arg
50 55 60
Gly Glu Arg Ser Tyr Asn Thr Pro Leu Gly Lys Val Ala Met Lys Asn
65 70 75 80
Gly Leu Ser Asp Lys Asp Met Lys Asp Val Ser Ala Asp Leu Val Ile
85 90 95
Ser Thr Val Thr Ala Pro Arg Thr Asp Pro Ala Gly Thr Gly Ala Glu
100 105 110
Asn Ser Asn Met Thr Leu Lys Ile Leu Asn Asn Thr Gly Val Asp Leu
115 120 125
Leu Ile Asn Asp Ile Thr Val Arg Pro Thr Val Ile Ala Gly Asn Ile
130 135 140
Lys Gly Asn Thr Met Ser Asn Thr Tyr Phe Ser Ser Lys Asp Ile Lys
145 150 155 160
Ser Ser Ser Ser Lys Ile Thr Leu Ile Asp Val Cys Ser Lys Phe Glu
165 170 175
Asp Gly Ala Ala Phe Glu Ala Thr Met Asn Ile Gly Phe Thr Ser Lys
180 185 190
Asn Val Ile Asp Ile Lys Asp Glu Ile Lys Lys Lvs
195 200
<210>11
<211>627
<212>DNA
<213>白斑综合征病毒
<220>
<223>人工序列描述:引物
<400>11
atgcacatgt ggggggttta cgccgctata ctggcgggtt tgacattgat actcgtggtt 60
atatctatag ttgtaaccaa catagaactt aacaagaaat tggacaagaa ggataaagac 120
gcctaccctg ttgaatctga aataataaac ttgaccatta acggtgttgc tagaggaaac 180
cactttaact ttgtaaacgg cacattacaa accaggaact atggaaaggt atatgtagct 240
ggccaaggaa cgtccgattc tgaactggta aaaaagaaag gagacataat cctcacatct 300
ttacttggag acggagacca cacactaaat gtaaacaaag ccgaatctaa agaattagaa 360
ttgtatgcaa gagtatacaa taatacaaag agggatataa cagtggactc tgtttcactg 420
tctccaggtc taaatgctac aggaagggaa ttttcagcta acaaatttgt attatatttc 480
aaaccaacag ttttgaagaa aaataggatc aacacacttg tgtttggagc aacgtttgac 540
gaagacatcg atgatacaaa taggcattat ctgttaagta tgcgattttc tcctggcaat 600
gatctgttta aggttgggga aaaataa 627
<210>12
<211>208
<212>PRT
<213>白斑综合征病毒
<400>12
Met His Met Trp Gly Val Tyr Ala Ala Ile Leu Ala Gly Leu Thr Leu
1 5 10 15
Ile Leu Val Val Ile Ser Ile Val Val Thr Asn Ile Glu Leu Asn Lys
20 25 30
Lys Leu Asp Lys Lys Asp Lys Asp Ala Tyr Pro Val Glu Ser Glu Ile
35 40 45
Ile Asn Leu Thr Ile Asn Gly Val Ala Arg Gly Asn His Phe Asn Phe
50 55 60
Val Asn Gly Thr Leu Gln Thr Arg Asn Tyr Gly Lys Val Tyr Val Ala
65 70 75 80
Gly Gln Gly Thr Ser Asp Ser Glu Leu Val Lys Lys Lys Gly Asp Ile
85 90 95
Ile Leu Thr Ser Leu Leu Gly Asp Gly Asp His Thr Leu Asn Val Asn
100 105 110
Lys Ala Glu Ser Lys Glu Leu Glu Leu Tyr Ala Arg Val Tyr Asn Asn
115 120 125
Thr Lys Arg Asp Ile Thr Val Asp Ser Val Ser Leu Ser Pro Gly Leu
130 135 140
Asn Ala Thr Gly Arg Glu Phe Ser Ala Asn Lys Phe Val Leu Tyr Phe
145 150 155 160
Lys Pro Thr Val Leu Lys Lys Asn Arg Ile Asn Thr Leu Val Phe Gly
165 170 175
Ala Thr Phe Asp Glu Asp Ile Asp Asp Thr Asn Arg His Tyr Leu Leu
180 185 190
Ser Met Arg Phe Ser Pro Gly Asn Asp Leu Phe Lys Val Gly Glu Lys
195 200 205
<210>13
<211>25
<212>DNA
<213>人工序列
<220>
<223>人工序列描述:引物
<400>13
cagaattcat gcayatgtgg ggngt 25
<210>14
<211>29
<212>DNA
<213>人工序列
<220>
<223>人工序列描述:引物;n是脱氧肌苷
<400>14
cagaattcyt trtcyttytt rtcnarytt 29
Claims (10)
1.用于在甲壳动物中预防和/或治疗白斑综合征的疫苗,其包含药学上可接受的载体和蛋白质,所说的蛋白质含有SEQ ID NO:6所示的氨基酸序列。
2.根据权利要求1的疫苗,其特征在于该疫苗包含具有SEQ ID NO:3或10所示氨基酸序列的蛋白质、具有SEQ ID NO:4所示氨基酸序列的蛋白质、和具有SEQ ID NO:12所示氨基酸序列的蛋白质的混合物。
3.用于在甲壳动物中预防或治疗白斑综合征的载体疫苗,其特征在于所述疫苗含有减毒的细菌或病毒,所述的细菌或病毒在它的基因组中包含编码白斑综合征病毒蛋白质的异源核酸序列,所说的白斑综合征病毒蛋白质包含SEQ ID NO:6所示的氨基酸序列。
4.来源于白斑综合征病毒的结构蛋白质,其特征在于所述蛋白质的氨基酸序列是SEQ ID NO:6中描述的氨基酸序列。
5.编码白斑综合征病毒的结构蛋白质的核酸序列,其特征在于所述结构蛋白质具有SEQ ID NO:6中所描述的氨基酸序列。
6.根据权利要求4的结构蛋白质用作药物的用途。
7.药物组合物,其含有药学上可接受的载体和至少一种根据权利要求4的结构蛋白质或至少一种根据权利要求5的核酸序列。
8.抗根据权利要求4的结构蛋白质的抗体。
9.疫苗或药物制剂,含有药学上可接受的载体或赋形剂以及至少一种根据权利要求8的抗体。
10.用于检测白斑综合征病毒的诊断试剂盒,其特征在于所述试剂盒包含根据权利要求5的核酸序列或根据权利要求8的抗体。
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