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RjpWiki はオープンソースの統計解析システム R に関する情報交換を目的とした Wiki ですRの日本語化に関する、質問、コメント、雑談用の掲示板です 注意：新規記事用の入力欄は以下の目次の直後にあります。各記事への追加コメントの入力欄は、各記事の後にあります。 Rの日本語化は岡田さんとなかま達(沢山居るように見える?)によって2003/7頃から始まりました. R日本語版の配布場所は http://r.nakama.ne.jp/ です. ライセンスは,R御本家と同じです(横着してます). R-2.8.0向けメッセージ日本語化 † 岡田 (2008-09-29 (月) 22:40:24) 2.8.0向けのメッセージテンプレートもFixしたようですので、2.8.0向けの翻訳作業を開始したいと思います。今回は10月6日あたりにフィーチャーフリーズとなるようですので、そのあたりを目処に進
[This article was first published on Digithead's Lab Notebook, and kindly contributed to R-bloggers]. (You can report issue about the content on this page here) Want to share your content on R-bloggers? click here if you have a blog, or here if you don't. “Is there a package for obfuscating code in #rstats?”, someone asked. “The S4 object system?!” came the snarky reply. If you’re smiling right no
How to Get a Microarray Data From NCBI GEO Aug 24th, 2012 GEOquery を使って公共データベースから発現データを入手する 例としてこのデータを取り出します。 GSE20349 準備
RStudio のキーバインドを変える。ただし、Mac で。 ほぼ emacs like な key binding にはなっているが、console でのコマンド履歴がカーソルの上下に設定されている。これだとホームポジションから手が離れるし、HHK Pro2 とかだとしんどい。これを Control + P, Control + N にそれぞれ割り当てたい。 そこで、KeyRemap4Mac でキーバインドを設定してみた。やりかたは、KeyRemap4Mac をインストールして、メニューバーから設定画面に入る。”Misc & Uninstall” を選び、”Custom Setting” の “Open private.xml” を開く。これを適当なエディタで開いて、以下のようにする。 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20
RとBioconductorでNGS解析: 第1時限 Rの基礎 はじめに この文章は統合データベース講習会：AJACSみちのく2「RとBioconductorを使ったNGS解析」の講義資料です。 この文章の著作権は二階堂愛にあります。ファイルのダウンロード、印刷、複製、大量の印刷は自由におこなってよいです。企業、アカデミアに関わらず講義や勉強会で配布してもよいです。ただし販売したり営利目的の集まりで使用してはいけません。ここで許可した行為について二階堂愛に連絡や報告する必要はありません。常に最新版を配布したいのでネット上での再配布や転載は禁止します。ネット上でのリンクはご自由にどうぞ。内容についての問い合わせはお気軽にメールしてください。 対象 ここでは、本講義を理解する上で知っておきたい、Rの基本的な使いかたについて解説する。対象とするのはプログラミング初心者でRを利用したことがない人が
Using R Markdown with RStudio R includes a powerful and flexible system (Sweave) for creating dynamic reports and reproducible research using LaTeX. Sweave enables the embedding of R code within LaTeX documents to generate a PDF file that includes narrative and analysis, graphics, code, and the results of computations. However, in some cases the preferred output format for a report is a web page r
Short courses Effective visualisation. September 2012. Applied Statistics 2012, Rigno, Slovenia. Data science in R. July 2012. OSCON, Portland, OR. R development master class. June 2012. Bay Area/New York City. Big data summer institute @ Rice University, Houston, TX. June 2012. Package development @ CSIRO, Canberra. October 2011. Data visualisation in R with ggplot2 and plyr @ Rice University. Se
統合データベース講習会は、生命科学系のデータベースやツールの使い方、データベースを統合する活動を紹介する講習会です。 今回の講習会では、1日目は生命科学系データベースのカタログ、横断検索、アーカイブの使い方や生命科学系の主要なデータベース（DDBJ：DNA Data Bank of Japan、PDBj：Protein Data Bank Japan、KEGG： Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes）の使い方について、また、Cytoscapeの使い方を紹介します。2日目はRおよびBioconductorを使った次世代シークエンサデータの解析のほか、遺伝子発現データベースや解析ツールをご紹介します。参加者全員がハンズオンでコンピュータを使いながらの講習です。 対象： 生命科学分野のデータベースを利用したい、研究に役立てたい方。 日時： 2012年8月
Rクックブック 作者: Paul Teetor,大橋真也,木下哲也出版社/メーカー: オライリージャパン発売日: 2011/12/22メディア: 大型本購入: 9人 クリック: 61回この商品を含むブログ (13件) を見る はじめに 統計的処理と結果のグラフ化をするために学生時代はmatlabを利用していました。matlabは行列演算に優れ使い易い言語だったのですが、一番の難点はMathWorks社の商用製品である事です。しかも高い。MathWorks 日本 - MATLAB / Simulinkによる数値計算 - マスワークス公式日本語サイト matlabと同様の機能をもつ(互換性は無い)scilabというFreeの言語もありますが、イマイチ流行っている感はありません。Home - Scilab WebSite Freeの言語で統計処理をやるのはR言語が主流のようなので、それに習ってR
Problem You want to use colors in a graph with ggplot2. Solution The default colors in ggplot2 can be difficult to distinguish from one another because they have equal luminance. They are also not friendly for colorblind viewers. A good general-purpose solution is to just use the colorblind-friendly palette below. Sample data These two data sets will be used to generate the graphs below. # Two va
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