大丈夫、という方向で収束しつつあるようで、蛇足になりますが お尋ねの列車に乗ったことはありませんが、 福知山駅の跨線橋は幡生方、というか豊岡寄りにあります。 福知山線は２両～６両で、下り電車の場合、 先頭車両がもっとも跨線橋に近いはずです。 （６両の場合は、ちょっと自信ありません） 到着番線が変更になった場合のご参考まで。

実際に該当する列車に乗ったことはありませんが、福知山駅は何度か行ったことがあります。 よっぽどのアクシデントがない限り、乗り換えできると思います。 日本の鉄道、とりわけJRはそう言う所は確実です。 会社が違っても待っています。まして、同じ会社ですから、間違いなく乗り換えられると思います。 不安なら、福知山駅に聞いてみてください。

２分という接続時間はきわどいですね。リレーつばめとつばめの乗り換えみたいに同一ホームでの乗換えが保証されているわけではないので。跨線橋を使っての乗り換えも考えた方がいいと思いますが、万が一２５２５Ｍが多少遅れたとしても、待ってくれるんじゃないかと思います。４２５Ｍを逃すと１時間半以上も待たないといけないので、２分や３分遅れようが待ってくれるはずです。 どうしても気になるようでしたが、福知山駅に問い合わせてみてはいかがでしょうか？このような問い合わせなら問題ないでしょうし、当日２５２５Ｍの車掌さんに聞いてみるのもいいでしょう。