JP2015212304A - リシルオキシダーゼ様2(loxl2)に結合する抗体及びその使用方法 - Google Patents
リシルオキシダーゼ様2(loxl2)に結合する抗体及びその使用方法 Download PDFInfo
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Abstract
Description
リシルオキシダーゼ型酵素は、ニワトリ、ラット、マウス、ウシ、及びヒトから精製されている。公知のリシルオキシダーゼ型酵素は、約205アミノ酸長であり、タンパク質のカルボキシ末端部分に位置し、酵素の活性部位を含む共通の触媒ドメインを含む。活性部位は、Cu(II)原子と配位する4つのヒスチジン残基を含む保存アミノ酸配列を含む銅結合部位を含む。活性部位はまた、リシン残基とチロシン残基(ラット リシルオキシダーゼでは、314番目のlys及び349番目のtyrに相当し、ヒト リシルオキシダーゼでは、320番目のlys及び355番目のtyrに相当する)の間の分子内共有結合により形成されるリシルチロシルキノン(LTQ)補因子も含む。LTQ補因子を形成するチロシン残基を取り巻く配列はまた、リシルオキシダーゼ型酵素の間でも保存される。触媒ドメインはまた、5つのジスルフィド結合の形成に関与する10個の保存システイン残基をも含む。触媒ドメインはまた、フィブロネクチン(fibronectin)結合ドメインをも含む。最終的に、成長因子及びサイトカインレセプタードメインに類似し、4つのシステイン残基を含むアミノ酸配列が、触媒ドメインに存在する。
製薬上許容できる担体又は賦形剤と
を含む、LOXL2に関連する状態を治療するためのキット。
参照サンプルとの比較においてサンプル中のLOXL2のレベルの変化が前記LOXL2に関連する状態の存在を示す、LOXL2に関連する状態を診断する方法。
[表1]
1 残基の番号付けは、Kabatら(前出)の命名方法に従う。
2 残基の番号付けは、Chothiaら(前出)の命名方法に従う。
3 残基の番号付けは、MacCallumら(前出)の命名方法に従う
(i)Glu及びAsp、Lys、Arg及びHisからなる、帯電している群;
(ii)Lys、Arg及びHisからなる、正に帯電している群;
(iii)Glu及びAspからなる、負に帯電している群;
(iv)Phe、Tyr及びTrpからなる、芳香族の群;
(v)His及びTrpからなる、窒素環の群;
(vi)Val、Leu及びIleからなる、大きな脂肪族非極性の群;
(vii)Met及びCysからなる、微極性の群;
(viii)Ser、Thr、Asp、Asn、Gly、Ala、Glu、Gln及びProからなる、小残基の群;
(ix)Val、Leu、Ile、Met及びCysからなる、脂肪族の群;並びに
(x)Ser及びThrからなる、小さいヒドロキシルの群
が挙げられる。
本願の開示は、一般に本書において「LOXL2ポリペプチド結合剤(LOXL2 polypeptide binding agents)」、「LOXL2結合剤(LOXL2 binding agents)」、又は「抗LOXL2結合剤(anti-LOXL2 binding agents)」と称される、LOXL2ポリペプチドの領域に結合する剤を提供する。抗LOXL2結合剤には、LOXL2の領域に結合する結合剤及びLOXL2酵素活性を阻害する結合剤が含まれる。そのような阻害性結合剤には、競合的阻害剤として又は非競合的阻害剤として作用する剤が含まれる。適当なLOXL2結合剤は、抗LOXL2結合剤(又はその抗原結合フラグメント)である。
いくつかの実施形態において、本発明に係る抗LOXL2抗体は、SRCR3−リンカーSRCR4領域内のエピトープに特異的に結合する。ここで、そのような領域は、「SRCR3−4」と称される。SRCR3−4領域は、配列番号1のアミノ酸325〜544、アミノ酸325〜547、アミノ酸303〜544、又はアミノ酸303〜547と少なくとも約90%、少なくとも約95%、少なくとも約98%、少なくとも約99%、又は100%アミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含むことができる。したがって、例えば、いくつかの実施形態において、本発明に係る抗LOXL2抗体は、配列番号1のアミノ酸325〜544、アミノ酸325〜547、アミノ酸303〜544、又はアミノ酸303〜547と少なくとも約90%、少なくとも約95%、少なくとも約98%、少なくとも約99%、又は100%アミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列内のエピトープに特異的に結合する。
ある実施形態において、本発明に係る抗LOXL2抗体(subject anti-LOXL2 antibody)は、配列番号1のアミノ酸303〜544、アミノ酸303〜545、アミノ酸303〜546、又はアミノ酸303〜547と少なくとも約90%、少なくとも約95%、少なくとも約98%、少なくとも約99%、又は100%のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列内のエピトープに特異的に結合する。
ある実施形態において、本発明に係る抗LOXL2抗体は、配列番号1のアミノ酸325〜544、アミノ酸325〜545、アミノ酸325〜546、又はアミノ酸325〜547と少なくとも約90%、少なくとも約95%、少なくとも約98%、少なくとも約99%、又は100%のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列内のエピトープに特異的に結合する。
ある実施形態において、本発明に係る抗LOXL2抗体は、SRCR3領域内のエピトープ(SRCR4内ではない)に特異的に結合する。SRCR3領域は、配列番号1のアミノ酸325〜425と、アミノ酸303〜425と、アミノ酸303〜434と、又はアミノ酸325〜434と少なくとも約90%、少なくとも約95%、少なくとも約98%、少なくとも約99%、又は100%のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含むことができる。したがって、例えば、いくつかの実施形態において、本発明に係る抗LOXL2抗体は、配列番号1のアミノ酸325〜425と、アミノ酸303〜425と、アミノ酸303〜434と、又はアミノ酸325〜434と少なくとも約90%、少なくとも約95%、少なくとも約98%、少なくとも約99%、又は100%のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列内のエピトープに特異的に結合する。
ある実施形態において、本発明に係る抗LOXL2抗体は、配列番号1のアミノ酸303〜425と少なくとも約90%、少なくとも約95%、少なくとも約98%、少なくとも約99%、又は100%のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列内のエピトープに特異的に結合する。
ある実施形態において、本発明に係る抗LOXL2抗体は、配列番号1のアミノ酸325〜434と少なくとも約90%、少なくとも約95%、少なくとも約98%、少なくとも約99%、又は100%のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列内のエピトープに特異的に結合する。
ある実施形態において、本発明に係る抗LOXL2抗体は、配列番号1のアミノ酸303〜434と少なくとも約90%、少なくとも約95%、少なくとも約98%、少なくとも約99%、又は100%のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列内のエピトープに特異的に結合する。
ある実施形態において、本発明に係る抗LOXL2抗体は、配列番号1のアミノ酸426〜544と、アミノ酸426〜545と、アミノ酸426〜546と、又はアミノ酸426〜547と少なくとも約90%、少なくとも約95%、少なくとも約98%、少なくとも約99%、又は100%のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列内のエピトープに特異的に結合する。
ある実施形態において、本発明に係る抗LOXL2抗体は、SRCR4領域内(SRCR3内ではない)のエピトープに特異的に結合する。SRCR4領域は、配列番号1のアミノ酸435〜544、アミノ酸435〜545、アミノ酸435〜546、又はアミノ酸435〜547と少なくとも約90%、少なくとも約95%、少なくとも約98%、少なくとも約99%、又は100%のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含むことができる。したがって、例えば、いくつかの実施形態において、本発明に係る抗LOXL2抗体は、配列番号1のアミノ酸435〜544、アミノ酸435〜545、アミノ酸435〜546、又はアミノ酸435〜547と少なくとも約90%、少なくとも約95%、少なくとも約98%、少なくとも約99%、又は100%のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列内のエピトープに特異的に結合する。
ある例において、本発明に係る抗LOXL2抗体は、SRCR3及びSRCR4の間のリンカー領域におけるアミノ酸を含むエピトープに特異的に結合する。SRCR3及びSRCR4の間のリンカー領域は、以下のアミノ酸配列:TPAMGLQKK(配列番号2)と少なくとも約90%、少なくとも約95%、少なくとも約98%、少なくとも約99%、又は100%のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含むことができる。したがって、例えば、いくつかの実施形態において、本発明に係る抗LOXL2抗体は、配列番号2と少なくとも約90%、少なくとも約95%、少なくとも約98%、少なくとも約99%、又は100%のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列内のエピトープに特異的に結合する。
ある例において、本発明に係る抗LOXL2抗体は、SRCR4のアミノ酸459〜497内のエピトープに特異的に結合する。したがって、例えば、いくつかの実施形態において、本発明に係る抗LOXL2抗体は、アミノ酸配列:VWGMVCGQNWGIVEAMVVCRQLGLGFASNAFQETWYWHG(配列番号3)と、少なくとも約90%、少なくとも約95%、少なくとも約98%、少なくとも約99%、又は100%のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列内のエピトープに特異的に結合する。
いくつかの実施形態において、本発明に係る抗LOXL2抗体等のLOXL2結合剤は、SRCR1−リンカー−SRCR2領域(そのような領域は、「SRCR1−2」と称する)内のエピトープに特異的に結合する。SRCR1−2領域は、図1に示されるアミノ酸配列のアミノ酸58〜302、又は58〜324と、少なくとも約90%、少なくとも約95%、少なくとも約98%、少なくとも約99%、又は100%のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含むことができる。したがって、例えば、いくつかの実施形態において、本発明に係る抗LOXL2抗体は、図1に示されるアミノ酸配列のアミノ酸58〜302、又は58〜324と、少なくとも約90%、少なくとも約95%、少なくとも約98%、少なくとも約99%、又は100%のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列内のエピトープに特異的に結合する。
ある実施形態において、本発明に係る抗LOXL2抗体は、図1に示されるアミノ酸配列のアミノ酸58〜324と少なくとも約90%、少なくとも約95%、少なくとも約98%、少なくとも約99%、又は100%のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列内のエピトープに特異的に結合する。
ある実施形態において、本発明に係る抗LOXL2抗体は、SRCR1領域内(SRCR2内ではない)のエピトープに特異的に結合する。SRCR1領域は、図1に示されるアミノ酸配列のアミノ酸58〜159と、少なくとも約90%、少なくとも約95%、少なくとも約98%、少なくとも約99%、又は100%のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含み得る。したがって、例えば、ある実施形態において、本発明に係る抗LOXL2抗体は、図1に示されるアミノ酸配列のアミノ酸58〜159と少なくとも約90%、少なくとも約95%、少なくとも約98%、少なくとも約99%、又は100%のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列内のエピトープに特異的に結合する。
ある実施形態において、本発明に係る抗LOXL2抗体は、SRCR1−リンカー領域内のエピトープに特異的に結合する。SRCR1−リンカー領域は、図1に示されるアミノ酸配列のアミノ酸58〜187と少なくとも約90%、少なくとも約95%、少なくとも約98%、少なくとも約99%、又は100%のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含み得る。したがって、例えば、ある実施形態において、本発明に係る抗LOXL2抗体は、図1に示されるアミノ酸配列のアミノ酸58〜187と少なくとも約90%、少なくとも約95%、少なくとも約98%、少なくとも約99%、又は100%のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列内のエピトープに特異的に結合する。
ある実施形態において、本発明に係る抗LOXL2抗体は、SRCR1領域内(SRCR2内ではない)のエピトープに特異的に結合する。SRCR2領域は、図1に示されるアミノ酸配列のアミノ酸188〜302と少なくとも約90%、少なくとも約95%、少なくとも約98%、少なくとも約99%、又は100%のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含み得る。したがって、例えば、ある実施形態において、本発明に係る抗LOXL2抗体は、図1に示されるアミノ酸配列のアミノ酸188〜302と少なくとも約90%、少なくとも約95%、少なくとも約98%、少なくとも約99%、又は100%のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列内のエピトープに特異的に結合する。
ある実施形態において、本発明に係る抗LOXL2抗体は、リンカー‐SRCR2領域内のエピトープに特異的に結合する。リンカー−SRCR2領域は、図1に示されるアミノ酸配列のアミノ酸160〜302と少なくとも約90%、少なくとも約95%、少なくとも約98%、少なくとも約99%、又は100%のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含み得る。したがって、例えば、ある実施形態において、本発明に係る抗LOXL2抗体は、図1に示されるアミノ酸配列のアミノ酸160〜302と少なくとも約90%、少なくとも約95%、少なくとも約98%、少なくとも約99%、又は100%のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列内のエピトープに特異的に結合する。
ある実施形態において、本発明に係る抗LOXL2抗体は、SRCR2−リンカー領域内のエピトープに特異的に結合する。SRCR2−リンカー領域は、図1に示されるアミノ酸配列のアミノ酸188〜324と少なくとも約90%、少なくとも約95%、少なくとも約98%、少なくとも約99%、又は100%のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含み得る。したがって、例えば、ある実施形態において、本発明に係る抗LOXL2抗体は、図1に示されるアミノ酸配列のアミノ酸188〜324の少なくとも約90%、少なくとも約95%、少なくとも約98%、少なくとも約99%、又は100%のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列内のエピトープと特異的に結合する。
ある実施形態において、本発明に係る抗LOXL2抗体は、リンカー−SRCR2−リンカー領域内のエピトープに特異的に結合する。リンカー−SRCR2−リンカー領域は、図1に示されるアミノ酸配列のアミノ酸160〜324と少なくとも約90%、少なくとも約95%、少なくとも約98%、少なくとも約99%、又は100%のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含み得る。したがって、例えば、ある実施形態において、本発明に係る抗LOXL2抗体は、図1に示されるアミノ酸配列のアミノ酸160〜324と少なくとも約90%、少なくとも約95%、少なくとも約98%、少なくとも約99%、又は100%のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列内のエピトープに特異的に結合する。
ある実施形態において、本発明に係る抗LOXL2抗体は、SRCR1−リンカー−SRCR2領域内のエピトープに特異的に結合する。SRCR1−リンカー−SRCR2領域は、図1に示されるアミノ酸配列のアミノ酸58〜302と少なくとも約90%、少なくとも約95%、少なくとも約98%、少なくとも約99%、又は100%のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含み得る。したがって、例えば、ある実施形態において、本発明に係る抗LOXL2抗体は、図1に示されるアミノ酸配列のアミノ酸58〜302と少なくとも約90%、少なくとも約95%、少なくとも約98%、少なくとも約99%、又は100%のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列内のエピトープに特異的に結合する。
いくつかの実施形態において、本発明に係る抗LOXL2抗体は、LOXL2ポリペプチドの触媒ドメイン内のエピトープに結合する。LOXL2ポリペプチドの触媒ドメインは、配列番号1のアミノ酸546〜774と少なくとも約90%、少なくとも約95%、少なくとも約98%、少なくとも約99%、又は100%のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含み得る。したがって、例えば、ある実施形態において、本発明に係る抗LOXL2抗体は、配列番号1のアミノ酸546〜774と少なくとも約90%、少なくとも約95%、少なくとも約98%、少なくとも約99%、又は100%のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列内のエピトープに特異的に結合する。
本発明に係る抗LOXL2抗体は、以下に記載のように、1つ以上の修飾を含むことができる。
本発明に係る抗体は、任意の既知の方法、例えば、タンパク質合成のための従来の合成方法;遺伝子組み換えDNA法等により製造することができる。
本願の開示は、本発明に係る抗体を含む組成物を提供する。本発明に係る抗体組成物は、本発明に係る抗体に加えて、1つ以上の、例えば、NaCl、MgCl、KCl、MgSO4等の塩;例えば、トリス緩衝液、N−(2−ヒドロキシエチル)ピペラジン−N’−(2−エタンスルホン酸)(HEPES)、2−(N−モルフォリノ)エタンスルホン酸(MES)、2−(N−モルフォリノ)エタンスルホン酸ナトリウム塩(MES)、3−(N−モルフォリノ)プロパンスルホン酸(MOPS)、N−トリス[ヒドロキシメチル]メチル−3−アミノプロパンスルホン酸(TAPS)等の緩衝剤;可溶化剤;例えば、Tween−20等の非イオン性界面活性剤等の界面活性剤;プロテアーゼ阻害剤;グリセロール等を含むことができる。
本発明に係る方法において、本発明に係る抗体は、所望の治療効果又は診断効果をもたらすことが可能となる任意の簡便な手段を使用して、宿主に投与することができる。したがって、前記剤は、治療的な投与のための様々な製剤に組み込むことができる。さらに詳細には、本発明に係る抗体は、適切な製薬上許容できる担体又は希釈剤と組み合わされて医薬組成物に製剤化することができ、そして、タブレット、カプセル、粉末、顆粒、軟膏、溶液、座剤、注射剤、吸入剤(inhalants)及びエアロゾル等の、固体、半固体、液体又はガス状の形態の製剤(preparation)に製剤化され得る。
適当な投与量は、世話をする医師又は他の資格のある医療関係者により、様々な臨床学的因子に基づいて決定できる。薬学分野に良く知られるように、投与量は、どの患者に対しても、患者の背格好(size)、身体の表面積、年齢、投与される特定の化合物、患者の性別、時間、及び投与経路、健康全般(general health)、及び同時に投与されている他の薬剤を含む多くの因子に依存する。本発明に係る抗体は、1投与当たり、1ng/kg体重と20mg/kg体重の間の量、例えば、0.1mg/kg体重と10mg/kg体重の間、例えば、0.5mg/kg体重と5mg/kg体重の間の量で投与され得るが、下記又は上記の典型的な範囲の投与量は、特に前述の因子を考慮して想定される。投与計画(regimen)が持続注入である場合、投与量は、1分間に、体重1キログラム当たり1μgから10mgの範囲であり得る。
本発明に係る抗体は、インビボ及びエクスビボ法、並びに全身性及び局所的な投与経路を含む、薬剤輸送に適した任意の利用可能な方法及び経路を使用して個体に投与される。
本願の開示は、血管新生、線維症、腫瘍及び転移に関する疾患を予防し、及び治療するための組成物、キット、方法を更に提供する。
本発明に係る抗体は、投与を必要とする個体に単独で投与できる(例えば、単剤療法)。しかしながら、本発明に係る抗体はまた、1つ以上の追加の治療的薬剤を使用する併用療法においても投与できる。これらの疾患又は状態を予防又は治療するために、適切な治療薬剤は、例えば、化学療法剤、抗―腫瘍性生物製剤、抗−血管新生剤、及び抗−繊維化剤を含む。
本発明に係る抗体は、前癌性細胞(pre-cancerous cell)又は癌細胞を検出するのに使用される。したがって、本願の開示は、テストされる個体から得た生物学的サンプルを本発明に係る抗−LOXL2抗体と接触させ;そして抗LOXL2抗体の、生物学的サンプルのエピトープへの結合を検出することを含む診断方法を提供する。生物学的サンプルは、組織;細胞を含む液体サンプル;又は無(非)細胞サンプルであり得る。本発明に係る検出方法は、生物学的サンプルにおける、LOXL2の存在及び/又はLOXL2のレベルを検出する。正常の対照値よりもLOXL2ポリペプチドの検出されるレベルが高いことは、癌性又は癌性になる前の状態を示す(例えば、細胞を含む生物学的サンプルにおける、癌性又は前癌性細胞の存在を示す)。いくつかの実施形態において、抗LOXL2抗体は、検出可能に標識される。いくつかの実施形態において、抗LOXL2抗体は、不溶性の支持体上に固定される(例えば、試験紙(test strip)、ビーズ、多ウェルプレートのウェル等)。
癌を治療する本発明に係る方法(例えば、腫瘍増殖及び/又は転移を低減させる本発明に係る方法)での治療に適した対象は、癌を有すると診断されている個体;本発明に係る治療レジメン以外の治療レジメンで癌の治療を行なっているが、再発している個体;及び本発明に係る治療レジメン以外の治療レジメンで癌の治療ができない個体、例えば、本発明に係る治療レジメン以外の治療レジメンでの治療に応答できない個体を含む。
本願の開示は、本発明に係る治療又は本発明に係る診断方法を行なうためのキットを提供する。
全長ヒトLOXL2タンパク質(図1に示されるアミノ酸配列)、SRCR2とSRCR3ドメインの間のインビボ開裂によって生じた、プロセスされたLOXL2のフラグメント、及びLOXL2触媒ドメインを、一連のマウス免疫付加(mouse immunizations)において抗原として使用した。His6精製タグをタンパク質のカルボキシ末端に付加した。抗原(3mgの総タンパク質)として、全長LOXL2を50%及びプロセスされたLOXL2を50%含み、及び、アジュバントとして、アルヒドロゲル(alhydrogel)(Al(OH)3)を含む混合液を使用して、皮下免疫を行なった(proB免疫)。抗原(0.3mgの総タンパク質)として、全長LOXL2を90%及びプロセスされたLOXL2を10%含み、及び、アジュバントとして、TiterMax(登録商標)(TiterMax(登録商標)、Norcross, GA製)を含む混合液を使用して、足蹠免疫(footpad immunization)を行なった(RPDS-1免疫)。二次足蹠免疫には、LOXL2触媒ドメイン(0.3mgの総タンパク質、図1のアミノ酸の546−774部分)を抗原として、TiterMax(登録商標)をアジュバンドとして使用した(RPDS-2免疫)。ELISAにより抗LOXL2抗体に対して陽性を示すマウスからの血清を、単一クローンを得るためのハイブリドーマライブラリの作成に使用した。抗体をクローンから精製し、そして、実施例2に記載されるように、ELISAアッセイを使用して、LOXL2に対する結合をスクリーニングした。
Nunc Maxisorp(登録商標)プレート(Thermo Fisher Scientific, Rochester, NY製)を、ホウ酸塩緩衝液中で、4℃で、1μg/mLのLOXL2で終夜コートした(1ウェル当たり100μl)。次の日、プレートをPBST(50mMのリン酸ナトリウム、140mMの塩化ナトリウム、0.05%のTween−20、pH7.4)で3回洗浄し、ウシ血清アルブミン溶液(50mMリン酸ナトリウム中に5%のBSA、pH7.4の140mMの塩化ナトリウム、1ウェル当たり200μL)で1時間、周囲温度でブロックした。プレートを、次に、300μLのPBSTで3回洗浄し、100μl容量の実施例1に記載されたハイブリドーマクローンからの精製抗体の2倍希釈液を、ブロックされたプレートに添加し、そして、周囲温度で1時間インキュベートした。プレートを300μLのPBSTで3回洗浄し、0.5%BSA溶液(50mMリン酸ナトリウム中に0.5%のBSA、pH7.4の140mMの塩化ナトリウム)で1:10000の割合で希釈された、西洋ワサビペルオキシダーゼーコンジュゲートヤギ抗マウス二次抗体(Pierce, Rockford, IL製)、100μLを加え、次に、周囲温度で1時間インキュベートした。
解離定数を、吸光度値に対応する抗体の濃度をプロットし、以下に示す方程式:
(ここで、PLは、吸光度値に等しく(これは、結合抗体の濃度に比例する)、Lは、抗体の濃度(mM)、Bmaxは、最大結合(nM)及び、KDは、解離定数(nM)である)にデータを当てはめることにより決定した。
実施例2において特定された72のLOXL2−結合抗体を、更に、LOXL2の酵素活性を阻害する能力についてスクリーニングした。2つの阻害アッセイを採用した。一方は、ジアミノペンタン(DAP)を基質として使用し、他方は、コラーゲンを基質として使用するものである。両アッセイにおいて、LOXL2の酵素活性は、過酸化水素の生成(基質のジアミネーション(deamination)の際にLOXL2により遊離する)を、レゾルフィン(蛍光産物)へのAmplex(登録商標)レッド(Invitrogen, Carlsbad, CA製)の西洋ワサビペルオキシダーゼ触媒変換とカップルさせたアッセイを使用して測定した。
[表2]阻害性抗体
[表3]
全長LOXL2に結合するが、LOXL2触媒ドメインを含むフラグメントには結合しない抗体は、それらのエピトープが触媒ドメインの外側に位置するかどうかを決定し、更に特徴付けを行なった。この目的を達成するために、LOXL2の異なったSRCRドメイン及びそれらの介在リンカー配列に相当するポリペプチドを標的として使用し、ELISAアッセイを行なった。各ポリペプチドに含まれるLOXL2アミノ酸配列の部位(図1に示されている)及びポリペプチドの名前は、表4の2番目及び1番目のカラムにそれぞれ示されている。ポリペプチドのアミノ酸配列は、図2に示されている。
[表4]
LOXL2由来のSRCR3及びSRCR4の15アミノ酸の長さのオーバーラップと一致するペプチドを合成し(Elim Biopharmaceuticals, Hayward, CA製)、AB0023及びそのヒト化誘導体AB0024に結合する能力をアッセイした。これらペプチドのアミノ酸配列を表5に示す。凍結乾燥されたペプチドを溶解し、PBS+5%アセトニトリルで、10mMの終濃度とした。2mg/mlの抗体の保存溶液をPBS(AB0023)又は、10mMのリン酸ナトリウム、140mMのNaCl(AB0024)で作成した。6マイクロリットルのペプチド溶液を、496μlの抗体溶液に添加し、そして、(AB0023にはPBSを使用して、又はAB0024には10mMのリン酸ナトリウムを使用して)最終容量を1mlとし、60μMのペプチド及び6.6μMの抗体の所要の最終濃度とし、25℃で1時間、室温でインキュベートした。サンプルを、次に、Agilent 1100 SEC−HPLCカラム(Tosoh TSKgel G3000SWx resin)上に注入した。カラムに、PBS+250mMのNaCl、pH7.4(AB0023)又は、10mMのリン酸ナトリウム、250mMのNaCl、pH5.8(AB0024)を、0.5ml/分の速度で注入し(develop)、UV吸収材料のピーク領域(210nm)を測定した。15merのペプチドの分子量は、抗体の分子量と比較して小さいため、抗体−ペプチド複合体の形成によって、どちらの分子の保持時間(retention time)のシフトも生じなかった。それ故、抗体−ペプチド複合体の形成は、自由な(複合体を形成していない)抗体と一致するピーク領域の増加に加え、自由なペプチドと一致するピークの領域に同時に生じる減少によって示された。ケミステーションソフトウェア(Agilent, Palo Alto, CA製)を、ピーク領域の積分に使用した。
VWGMVCGQNWGIVEAMVVCRQLGLGFASNAFQETWYWHG
(配列番号3)
[表5]ペプチドマッピング
ペプチドのアミノ酸配列(一文字コード)は、2番目のカラムに示される。4番目のカラムにおいて、「+」は、ペプチドにAB0023が結合したことを示し、「−」は、結合が観察されなかったことを示す。
LOXL2のSRCR4ドメインのアラニンスキャニング突然変異を行い、AB0023、AB0024及びM14抗体の結合に関与するLOXL2 SRCR4ドメイン内のアミノ酸残基を特定した。この目的を達成するために、LOXL2のSRCR4ドメイン(配列番号1のアミノ酸435-547部分)をエンコードする配列を含むDNAフラグメントを構成した;シグナル配列、リンカー配列、mycエピトープタグ、及び(His)6精製タグを加え、コンストラクトをクローン化した。SRCR4ドメインにおける、ある特定のアミノ酸が、アラニンに変換されるように、追加のコンストラクトを作成した。AB0023、AB0024及びM14の様々な変異アミノ酸配列に結合する能力をELISA、表面プラズモン共鳴(SPR)及び、AB0023及びAB0024についてのSEC−HPLC;及び、M14についてのELISAによって決定した。ELISAアッセイを、異なったアラニンスキャニング変異体を標的として使用し、正解に実施例2に記載のとおり行なった。
第1のカラムにある数は、図1に示されるLOXL2アミノ酸配列内のアミノ酸残基を参照する。番号の前にある文字は、野生型のタンパク質において、その(番号の)位置にあるアミノ酸(1文字アミノ酸コードで示される)を示す。番号に続く文字は、ある特定の変異における、野生型の残基のアラニンへの変換を示す。残りのカラムは、ある特定の変異ポリペプチドに、AB0023(2番目のカラム)、AB0024(3番目のカラム)又はM14(4番目のカラム)が結合するかどうかを示す。M14は、RPDS−1M14抗体を意味する。「+」は、結合を示し、「+/−」は、弱い結合を示し、「0」は、検出不可能な結合を示し、「ND」は、試験を行っていない(not done)ことを示す。
リシルオキシダーゼ様タンパク質LOXL3及びLOXL4はまた、4つのSRCRドメインを含み、これらは、LOXL2の4つのSRCRドメインと同一ではないが、いくらかのホモロジーを有する。これらの特異性を評価し、そのエピトープの性質の更なる情報を得るために、AB0023の、LOXL3及びLOXL4のSRCR配列に対する結合をテストした。ELISAアッセイをヒトLOX、LOXL1、LOXL2、LOXL3及びLOXL4を標的として使用して、正確に実施例2に記載のとおり行なった。図3に示される結果は、AB0023が、他の既知のヒトリシルオキシダーゼ型酵素のいずれにも結合しないことを示す。したがって、AB0023は、他のリシルオキシダーゼ型酵素と比較して、LOXL2に対して特異的であり、そして、特に、AB0023は、LOXL3又はLOXL4のどちらのSRCR4ドメインにも結合しない。
上記の表6は、LOXL2のSRCR4ドメインのアミノ酸(位置)478の、アルギニンからアラニンへの変換によって、AB0023及びAB0024抗体と結合する能力が失われたが、M14抗体と結合する能力は、影響を受けなかったことを示す。これは、M14は、AB0023及びAB0024によって認識されるエピトープと異なるエピトープを認識することを示す。別の試験において、実施例6に記載されるような表面プラズモン共鳴解析によって、AB0023が結合しないF484A変異体に、M14抗体が結合することを決定した。したがって、M14抗体は、SRCR4ドメインにおける第二のエピトープ(これは、AB0023及びAB0024によって認識されるエピトープと異なる)を定義する。
AB0030抗体は、ヒトLOXL2触媒ドメイン内に結合し、その酵素活性を阻害する。AB0030のヒト、カニクイザル、ラット及びマウスのLOXL2タンパク質への結合を比較したELISAアッセイは、AB0023が、カニクイザルLOXL2にも結合するが、ラット又はマウスLOXL2に結合しないことを示した。一方において、ヒト及びカニクイザルLOXL2及び、他方において、ラット及びマウスLOXL2の触媒ドメインのアミノ酸配列を比較した場合、配列中に21の残基が異なっていることが明らかになった。図5を参照する。したがって、これらの各アミノ酸が個々に、ヒト配列に対応するように変更されたラットタンパク質の変異体を、ELISA及びSPRによって、AB0030が結合する能力についてアッセイした。
Claims (32)
- 図1に示され、かつ配列番号1に示される配列のアミノ酸325から434によって規定されるエピトープに特異的に結合する、リシルオキシダーゼ様2(LOXL2)に対する単離された抗体。
- 前記エピトープがTPAMGLQKK(配列番号2)内のアミノ酸を含む、請求項1に記載の抗体。
- 前記抗体がLOXL2ポリペプチドの酵素活性を阻害する、請求項1に記載の単離された抗体。
- 前記抗体がLOXL2ポリペプチドの酵素活性を阻害しない、請求項1に記載の単離された抗体。
- 前記抗体が約107M−1〜約1012M−1の親和力でエピトープに結合する、請求項1に記載の単離された抗体。
- 前記抗体が重鎖を含み、前記抗体の重鎖がアイソタイプIgG1、IgG2、IgG3、又はIgG4のものである、請求項1に記載の単離された抗体。
- 結合剤が検出可能に標識される、請求項1に記載の単離された抗体。
- 前記抗体がFv、scFv、Fab、F(ab’)2、又はFab’である、請求項1に記載の単離された抗体。
- 前記抗体がヒト化されている、請求項1に記載の単離された抗体。
- 前記抗体がキメラである、請求項1に記載の単離された抗体。
- 前記抗体が非ペプチド合成ポリマー、脂質、脂肪酸、多糖、炭水化物、又は造影剤からなる群から選択される共有結合成分を含む、請求項1に記載の単離された抗体。
- 前記合成ポリマーがポリ(エチレングリコール)ポリマーである、請求項11に記載の単離された抗体。
- 前記抗体が固体支持体上に固定化される、請求項1に記載の単離された抗体。
- 前記抗体が前記抗体に共有又は非共有結合した癌化学療法剤を含む、請求項1に記載の単離された抗体。
- 請求項1に記載の単離されたLOXL2結合剤を含む組成物と
製薬上許容できる担体又は賦形剤と
を含む、LOXL2に関連する状態を治療するためのキット。 - 前記LOXL2に関連する状態が腫瘍、転移、血管新生、又は線維症である、請求項15に記載のキット。
- 前記LOXL2結合剤が検出可能な標識、治療剤又はこれらの両方を含む、請求項15に記載のキット。
- 対象のサンプル中のLOXL2のレベルを、前記サンプルを請求項1に記載の単離された抗体と接触させることによって、評価することを含み、
参照サンプルとの比較においてサンプル中のLOXL2のレベルの変化が前記LOXL2に関連する状態の存在を示す、LOXL2に関連する状態を診断する方法。 - 前記LOXL2に関連する状態が腫瘍、転移、血管新生、又は線維症である、請求項18に記載の方法。
- 参照サンプルとの比較においてサンプル中のLOXL2のレベルの増加が腫瘍又はその転移の存在、或いは腫瘍又は転移増殖の増加を示す、請求項19に記載の方法。
- 前記参照サンプルが初期の時点で対象から取得され又は同一タイプの健常な組織から取得されたサンプルであるか、或いは別の個体からのサンプルである、請求項20に記載の方法。
- 前記抗体が検出可能に標識される、請求項18に記載の方法。
- サンプル又は細胞組織を請求項1に記載の単離された抗体と接触させることによって、LOXL2活性を阻害する方法。
- 接触がインビトロ又はエクスビボで生ずる、請求項23に記載の方法。
- 接触がインビボで生ずる、請求項23に記載の方法。
- LOXL2の阻害が腫瘍増殖、血管新生、及び線維症からなる群から選択される対象における状態を低減する、請求項23に記載の方法。
- 請求項1に記載の抗体を対象に投与することを含む、対象における腫瘍の増殖を低減する方法。
- 前記腫瘍が原発性腫瘍又は転移性腫瘍である、請求項27に記載の方法。
- 前記腫瘍が固形腫瘍である、請求項27に記載の方法。
- 請求項1に記載の抗体を対象に投与することを含む、対象における血管新生を阻害する方法。
- 請求項1に記載の抗体を対象に投与することによって、対象における線維性疾患を阻害する方法。
- 請求項1に記載の抗体を用いてLOXL2レベル及び/又は活性を検出することによって、抗LOXL2療法に対する対象の応答をモニタリングする方法。
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