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DE60132290T2 - Elektrophoretische Vorrichtung und Kassette zur Detektion von Biopolymeren - Google Patents

Elektrophoretische Vorrichtung und Kassette zur Detektion von Biopolymeren Download PDF

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DE60132290T2
DE60132290T2 DE60132290T DE60132290T DE60132290T2 DE 60132290 T2 DE60132290 T2 DE 60132290T2 DE 60132290 T DE60132290 T DE 60132290T DE 60132290 T DE60132290 T DE 60132290T DE 60132290 T2 DE60132290 T2 DE 60132290T2
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DE
Germany
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unit
cartridge
light
biopolymers
dna
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DE60132290T
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Keiichi Yokohama-shi Sato
Mitsuhiro Yokohama-shi Tachibana
Toshiki Yokohama-shi Morita
Motonao Yokohama-shi Nakao
Current Assignee (The listed assignees may be inaccurate. Google has not performed a legal analysis and makes no representation or warranty as to the accuracy of the list.)
Hitachi Software Engineering Co Ltd
Original Assignee
Hitachi Software Engineering Co Ltd
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Publication date
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Description

  • HINTERGRUND DER ERFINDUNG
  • Die vorliegende Erfindung betrifft eine Vorrichtung zum Nachweis von Biopolymeren, die in der Lage ist, die Anwesenheit von Biopolymeren, wie etwa DNA, RNA und Protein in einer Probe nachzuweisen und eine existierende Menge oder eine Konzentration zu messen, sowie eine Kartusche, die für den Nachweis verwendet wird.
  • Als Technologien zum Nachweis von DNA sind im allgemeinen solche Technologien verwendet worden, bei denen DNA mit einem radioaktiven Material, einem Fluoreszenzfarbstoff oder ähnlichem modifiziert worden ist, unter Verwendung von RI-Technologien (radioaktive Isotope), Fluoreszenz oder ähnlichem, und mit einem Außenreiz zum Nachweis einer Lumineszenzantwort angeregt worden ist. Ebenso ist ein elektrisches Ladungsnachweisverfahren zum elektrochemischen Bestimmen von DNA entworfen worden, basierend auf einem Oxidations-Reduktionspotential unter Verwendung eines interkalierenden Mittels, das spezifisch an einen DNA-Duplex gebunden ist. Darüberhinaus gibt es ein Verfahren zum Verwenden von Oberflächenplasmon-Resonanz-Phänomenen als ein Verfahren ohne Modifikation und ähnliches. Im Hinblick auf ein Verfahren zum Fixieren von DNA an einer Elektrode gibt es ein Verfahren zum Verwenden eines Effektes, dahingehend, daß eine Monoschicht freie Thiolradikale, die sich an dem Ende von DNA befindet, sich auf der Goldoberfläche unter Verwendung einer Thiol-modifizierten DNA-Sonde selbst organisiert.
  • In herkömmlichen DNA-Nachweistechnologien gab es einen Bedarf an Verfahren zum Verwenden von RI oder Fluoreszenz, um DNA zu modifizieren.
  • EP 0457526 A2 beschreibt ein Elektrophoresesystem, bei dem die Temperatur des Systems überwacht und reguliert wird, und wobei darüberhinaus der elektrische Feldgradient im Gel überwacht werden kann. Darüberhinaus kann die Reaktion mit einem Spektrophotometer überwacht werden.
  • US-A-6,129,828 beschreibt ein Elektrophorese-Trennungssystem, umfassend eine Basiseinheit mit einer Elektrode und einer einführbaren Deckeleinheit, die ebenfalls eine Elektrode umfaßt.
  • JP 2000060554 A offenbart einen Polynukleotidsonden-Chip mit DNA, gebunden an die Elektroden, sowie DNA-Proben, die in einem Gel mittels Elektrophoreseverfahren bewegt werden.
  • ZUSAMMENFASSUNG DER ERFINDUNG
  • Eine Vorrichtung zum Nachweis von Biopolymeren in Übereinstimmung mit der vorliegenden Erfindung enthält: eine Spannungsquelleneinheit zum Anlegen einer elektrischen Spannung zwischen zwei Elektroden einer Kartusche, die Biopolymere zwischen den Elektroden enthält; eine Halteeinheit zum Halten der Kartusche; eine Bestrahlungseinheit zum Einstrahlen von Licht auf die durch die Halteeinheit gehaltene Kartusche; und eine Lichtempfangseinheit zum Empfangen des Lichts, das mittels der Bestrahlungseinheit auf die durch die Halteeinheit gehaltene Kartusche eingestrahlt worden ist, wobei die Spannungsquelleneinheit selektiv Wechselspannung und Gleichspannung liefern kann, so daß Biopolymere zu einer Elektrode oder beiden Elektroden angezogen werden können, und eine säulenförmige Basiseinheit, die eine Biopolymerlösung aufnehmen kann, wobei die Basiseinheit eine erste Elektrode auf dem Inneren einer Bodenseite, transparente Seiten in wenigstens einem Teil und eine geöffnete Oberseite hat, und eine Deckeleinheit, die eine zweite Elektrode an der Außenseite einer Bodenseite hat und in die Basiseinheit von der Oberseite zur Mitte der Basiseinheit eingeführt wird, um fixiert zu werden, wobei Biopolymersonden auf der ersten Elektrode oder der zweiten Elektrode fixiert sind. Ein Komplementärstrangbiopolymer und ein Nicht-Komplementärstrangbiopolymer können deshalb separat nachgewiesen werden.
  • Die Halteeinheit kann die Kartusche zweidimensional auf einer Ebene bewegen, die zu einer optischen Achse des durch die Bestrahlungseinheit eingestrahlten Lichts senkrecht ist, so daß die Anwesenheit eines Biopolymers an jedem Ort in der Kartusche nachgewiesen werden kann.
  • Da die Bestrahlungseinheit Licht einer spezifizierten einzelnen Wellenlänge einstrahlen kann, kann die Nachweisempfindlichkeit verbessert werden.
  • Die Vorrichtung zum Nachweis von Biopolymeren enthält weiterhin eine Recheneinheit zum Berechnen einer vorhandenen Menge, einer Basenlänge, einer Konzentration, eines Hybridi sierungsverhältnisses und einer Hybridisierungsmenge eines Biopolymers anhand einer Menge an Licht, die von der Lichtempfangseinheit empfangen wird, so daß verschiedene Arten von Mengen für das Biopolymer bestimmt werden können.
  • Die Vorrichtung zum Nachweis von Biopolymeren umfaßt weiterhin einen Heizer, der Wärme auf die Elektroden der Kartusche aufbringt zum Dissoziieren von Biopolymeren, die in der Kartusche hybridisiert sind, in Einzelstränge, so daß jede Anwesenheit eines Komplementärstrangbiopolymers und eines Nicht-Komplementärstrangbiopolymers nachgewiesen werden kann.
  • Darüberhinaus ist der Querschnitt der säulenförmigen Basiseinheit ein Viereck, und der Querschnitt der Deckeleinheit ist eine runde Form. Da die Lichteinstrahlungsebene eine ebene Oberfläche ist, ist es deshalb möglich, die Lichtstreuung zu unterdrücken und die Deckeleinheit in die Basiseinheit leicht einzuführen.
  • Ebenso umfaßt die Kartusche weiterhin ein Lösungsreservoir auf einem oberen Teil der Basiseinheit zum Aufnehmen einer Biopolymerlösung, die aus dem besagten säulenförmigen Teil ausgeflossen ist, um das Ausfließen der Lösung zu verhindern, so daß es möglich ist, ein Fließen der Lösung nach außen zu verhindern.
  • In der Vorrichtung zum Nachweis gemäß der vorliegenden Erfindung wird eine Proben-DNA zwischen Elektroden injiziert, die einander gegenüberliegen. In dieser Technologie kann, da eine existierende Menge an DNA physisch gemessen werden kann, eine Konzentration davon und ähnliches ebenso bestimmt werden. Durch Anlegen einer externen Kraft mittels eines elektrischen Felds zwischen den einander gegenüberliegenden Elektroden zum Anziehen von Einzelstrangsonden-DNA, fixiert auf der Oberfläche der Elektrode, und nicht-hybridisierter Proben-DNA an die Elektrode, an der die Sonden-DNA nicht fixiert ist, wird es darüberhinaus möglich, ein Gen ohne Waschen nachzuweisen.
  • Darüberhinaus können unter Verwendung dieses Verfahrens deutlichere Ergebnisse erhalten werden, da sowohl umgesetzte als auch nicht umgesetzte in der Messung angezielt werden.
  • BESCHREIBUNG DER ZEICHNUNGEN
  • 1 ist eine schematische Ansicht, die eine Struktur einer Vorrichtung zum Nachweisen von Biopolymeren gemäß einer Ausführungsform in der vorliegenden Erfindung zeigt.
  • 2 ist eine Ansicht, die eine Struktur einer Kartusche gemäß einer Ausführungsform in der vorliegenden Erfindung zeigt.
  • 3 ist eine allgemeine Ansicht, die eine Vorrichtung zum Nachweis von Biopolymeren gemäß einer Ausführungsform in der vorliegenden Erfindung zeigt.
  • 4 ist eine schematische Ansicht, die eine Struktur einer Vorrichtung zum Nachweis von Biopolymeren unter Verwendung von plattenförmigen Kartuschen nicht gemäß der vorliegenden Erfindung, zeigt.
  • 5A und 5B sind Ansichten, die eine plattenförmige Kartusche im Detail zeigen, nicht gemäß der vorliegenden Erfindung.
  • 6 ist eine allgemeine Ansicht, die eine Vorrichtung zum Nachweis von Biopolymeren unter Verwendung der plattenförmigen Kartuschen, nicht gemäß der vorliegenden Erfindung, zeigt.
  • 7 ist eine Ansicht, die das Verhalten von DNA bei Anlegen einer Gleichspannung zeigt.
  • 8 ist eine Ansicht, die das Verhalten von DNA bei Anlegen einer Wechselspannung zeigt.
  • DETAILLIERTE BESCHREIBUNG
  • Hiernach werden unter Bezugnahme auf die Zeichnungen bevorzugte Ausführungsformen im Einzelnen beschrieben werden.
  • 1 ist eine schematische Ansicht, die eine Struktur einer Vorrichtung zum Nachweisen von Biopolymeren gemäß einer Ausführungsform der vorliegenden Erfindung zeigt. Die Vorrichtung enthält ein optisches System, um optische Energie und ähnliches zu messen, wie et wa Absorption, Transmission und Reflektion, sowie ein optisches System zum Nachweisen eines modifizierten Teils, wenn die DNA mit einem organischen Material oder einem anorganischen Material, wie etwa fluoreszierendem Material und einem radioaktiven Material modifiziert ist.
  • Das optische System zum Messen von optischer Energie und ähnlichem, wie etwa Absorption, Transmission und Reflektion, schließt einen Laser, eine optische Quelle, einen Spalt, einen Filter, ein Beugungsgitter, eine Lichtempfangseinheit und ähnliches ein. Ein Steuergerät 3 ist mit einem Computer 1 mit einer Anzeige 2 verbunden. Licht, erzeugt durch einen Laser und eine optische Quelle 4, gesteuert durch die Steuereinheit 3 wird durch einen Spalt 6 der optischen Quelle nach Wellenlängenauswahl mit einem Filter 5 geleitet. Das Licht wird durch einen Einstrahlungsspalt 7 geleitet und an einem Beugungsgitter dahingehend umgewandelt, daß es Wellenlängen von 260 nm und 280 nm hat. Darüberhinaus wird das Licht durch einen Austrittsfilter 10 geleitet, der sich genau vor einer Kartusche 11 befindet, deren Einzelheiten in 2 gezeigt sind. Die optische Energie wird in der Kartusche 11 verringert, abhängig von einer existierenden Menge an DNA, da DNA das Licht absorbiert. Das heißt, die optische Energie nach der Verringerung wird an einer Lichtempfangseinheit 12 erhalten. Die Analyse des Ergebnisses wird mit dem Computer 1 durchgeführt, und eine Verteilung der existierenden DNA-Menge kann bestimmt werden, indem gemessen wird, in welchem Ausmaß die Menge an optischer Energie, die an der Lichtempfangseinheit empfangen wird, im Verhältnis zum eingestrahlten Licht an einer Position verringert worden ist. Die Transmission wird als Verhältnis der Menge an Licht zu derjenigen im Falle der Abwesenheit von DNA unter vollständiger Befüllung der Kartusche 11 mit Lösung erhalten. Die Reflektion wird auf dieselbe Weise als ein Verhältnis einer Menge an reflektiertem Licht zu derjenigen im Falle der Abwesenheit von DNA erhalten. Um diese Reflektion zu messen, wird ein optisches System zum Empfangen des reflektierten Lichts benötigt. Die Absorption wird durch Subtrahieren der Transmission von der Reflektion erhalten.
  • Das optische System zum Nachweisen eines modifizierten Teils an DNA, wenn die DNA mit einem organischen Material oder einem anorganischen Material modifiziert ist, wie etwa fluoreszierendem Material oder radioaktivem Material, schließt einen Laser, eine Lichtquelle, ein Loch, eine Linse und ähnliches ein. Das Licht, das von einem Laser und einer Lichtquelle 16 erzeugt wird, wird mit einer Linse 22 nach Passieren durch einen Filter 21 zur Wellenlängenauswahl kondensiert und wird durch ein Loch 23 im Brennpunkt geleitet. Das durch das Loch 23 geleitete Licht wird wiederum mit der Linse 24 kondensiert, die den Brennpunkt in einem Meßteil hat. Das Licht, das darauf hinweist, daß ein Material durch das kondensierte Licht angeregt worden ist, wird zu der Linse 24 geleitet und wird durch einen polarisierten Strahlspalter 17 zu der Seite einer Lichtempfangseinheit 18 geleitet. Das Licht, das eine ausgewählte Wellenlänge hat, in dem es durch einen Filter 20 geleitet wird, wird durch ein Loch 19 am Brennpunkt geleitet, um die Lichtempfangseinheit 18 zu erreichen. Die Verteilung der modifizierten Teile wird analysiert, basierend auf Signalen von der Lichtempfangseinheit 18.
  • 2 ist eine Ansicht, die die Struktur einer Kartusche gemäß einer Ausführungsform der vorliegenden Erfindung zeigt. Eine Kartusche 11 enthält eine Deckeleinheit 25 und eine Basiseinheit 27. In der Deckeleinheit 25 ist an einer oberen Seite davon ein innerer Zylinder 25b, der eine geöffnete Unterseite und einen kleineren Querschnitt hat, koaxial mit einer äußeren Säule 25a mit einem größeren Querschnitt verbunden. Eine Elektrode 26 wird an der Außenseite der gesamten Bodenseite des inneren Zylinders 25b bereitgestellt. Die Basiseinheit 27 hat eine rundförmige Elektrode 28 auf der Innenseite der Bodenseite einer hohlen viereckigen Säule 27a mit einem viereckigen Querschnitt. Eine obere Seite der viereckigen Säule 27a ist geöffnet, so daß eine DNA-Lösung injiziert wird und die Deckeleinheit 25 eingeführt werden kann. Darüberhinaus wird ein Lösungsreservoir 27b auf einem oberen Teil der viereckigen Säule 27a bereitgestellt, um zu verhindern, daß die DNA-Lösung nach außen fließt, wenn ein Teil der DNA-Lösung aus der viereckigen Säule 27a überfließt. Im Hinblick auf die Kartusche 11 werden die DNA-Sonden an einer der Elektroden fixiert. Die Kartusche 11 wird in einen Kartuschen-Einführungsteil der Vorrichtung eingeführt. Die Vorrichtung hat Elektroden zum Erzeugen eines elektrischen Felds in der Kartusche 11, so daß Gleichspannung und/oder Wechselspannung, die von einer Spannungsquelle geliefert werden, zwischen den Elektroden in der Kartusche 11 angelegt werden können.
  • Der Nachweis wird durchgeführt durch Messen der optischen Energie, wie etwa Absorption, Transmission und Reflektion von Licht mit einer Wellenlänge von 260 nm. Die Messung wird durchgeführt durch Vergleich in einer Vielzahl von Bereichen oder durch Abtasten („Scanning") in einem kleinen Bereich. Basierend auf einer Verteilung der erhaltenen optischen Energie, wie etwa Absorption, Transmission oder Reflektion, kann eine Verteilung der DNA, die sich zwischen den Elektroden befindet, erhalten werden, um eine vorhandene Menge, eine Konzentration, ein Hybridisierungsverhältnis, eine Hybridisierungseffizienz von DNA und ähnliches zu bestimmen.
  • 7 ist eine Ansicht, die das DNA-Verhalten bei Anlegen einer Gleichspannung zeigt. Wenn eine Gleichspannung zwischen einer Elektrode 71 und einer Elektrode 72 angelegt wird, wird die DNA in eine Richtung des elektrischen Felds gezogen und zu einer der Elektroden hingezogen, in diesem Fall Elektrode 72. Wenn die Sonden-DNA 73 an der Elektrode 71 fixiert ist und eine Gleichspannung zwischen den Elektroden nach der Hybridisierungsreaktion angelegt wird, wird aus diesem Grund Komplementärstrang-Proben-DNA 75, die hybridisiert war, an die Elektrode 71 fixiert und gestreckt, während Nicht-Komplementärstrang-Proben-DNA 76, die nicht hybridisiert war, auf die Seite von Elektrode 72 gezogen wird, und einen geschrumpften Zustand annimmt. Durch Messen der DNA-Menge an jedem Ort in diesem Zustand kann die Menge und die Basenlänge der hybridisierten Komplementärstrang-Proben-DNA 75 und die Menge der Nicht-Komplementärstrang-Proben-DNA 76, die nicht hybridisiert war, bestimmt werden. Insbesondere kann die Basenlänge bestimmt werden durch Messen, wo das Ende der DNA gestreckt und vorhanden ist.
  • 8 ist eine Ansicht, die DNA-Verhalten bei Anlegen von Wechselspannung zeigt. Wenn eine Wechselspannung zwischen einer Elektrode 77 und einer Elektrode 78 angelegt wird, wird die DNA in einem gestreckten Zustand vom Ort vor dem Anlegen der Spannung zu der näherliegenden Elektrode in einem gewissen Frequenz- und Spannungsbereich gezogen, 1 MHz und 106 V/m in der vorliegenden Vorrichtung. Durch separates und wiederholtes Verwenden von Gleich- und Wechselspannung als Spannung, die an die Kartusche 11 angelegt wird, ist es möglich, den Ort der DNA zu kontrollieren. In der vorliegenden Vorrichtung wird die Gleichspannung zwischen den Elektroden im jeweiligen Stadium des Anziehens von DNA zwischen den Elektroden zum Zeitpunkt der Probeninjektion, im jeweiligen Stadium des Anziehens der Proben-DNA auf die Sonden-Seite vor der Hybridisierungsreaktion und dem jeweiligen Stadium der Trennung von Proben-DNA, die ein Duplex mit den Sonden und nicht-umgesetzter Proben-DNA nach der Hybridisierungsreaktion bildet, angelegt. Wechselspannung wird angelegt, wenn die DNA in einem getrennten Zustand ausgestreckt ist, zum Zeitpunkt der Messung der Basenlänge und ähnliches.
  • 3 ist eine allgemeine Ansicht der Vorrichtung zum Nachweis von Biopolymeren gemäß einer Ausführungsform der vorliegenden Erfindung. Ein Rotationskartuscheneinführungsteil 30 wird in der Haupteinheit 29 der Vorrichtung bereitgestellt. Die Mehrzahl an Kartuschen 11 werden darauf geladen und eine Deckeleinheit 31 der Vorrichtung wird geschlossen. Deshalb kann der DNA-Nachweis durch automatisches Wechseln der einer Messung zu unterziehenden Kartuschen 11 kontinuierlich durchgeführt werden.
  • 4 ist eine schematische Ansicht, die eine Struktur der Vorrichtung zum Nachweis von Biopolymeren unter Verwendung einer plattenförmigen Kartusche zeigt, deren Einzelheiten in 5 gezeigt werden und die nicht erfindungsgemäß ist. Ein optisches System zum Messen von optischer Energie und ähnlichem, wie etwa Absorption, Transmission und Reflektion schließt einen Laser und eine Lichtquelle, einen Spalt, einen Filter, ein Beugungsgitter, eine Lichtempfangseinheit und ähnliches ein. Licht, das von einem Laser und einer Lichtquelle 35 erzeugt worden ist, wird nach Wellenlängenselektion mit einem Filter 36 durch einen Lichtquellenspalt 37 geleitet. Das Licht wird durch einen Eingangsspalt 38 geleitet und mit einem Beugungsgitter 39 so umgewandelt, das es Wellenlängen von 260 nm und 280 nm hat. Darüberhinaus wird das Licht durch einen Austrittsspalt 41 geleitet, der genau vor die Kartusche gebracht ist. Optische Energie wird in einer plattenförmigen Kartusche 42, abhängig von einer existierenden Menge an DNA, verringert, da DNA das Licht absorbiert. Das heißt, die optische Energie nach der Verringerung wird an eine Lichtempfangseinheit 45 erhalten. Die Analyse des Ergebnisses wird mit einem Computer 32 durchgeführt, und eine Verteilung der existieren DNA-Menge kann bestimmt werden durch Messen, wieviel optische Energie, die an der Lichtempfangseinheit 45 empfangen worden ist, im Verhältnis zum einfallenden Licht an einem Ort verringert worden ist.
  • Ein optisches System zum Nachweis eines modifizierten Teils, wenn die DNA mit einem organischen Material oder einem anorganischen Material modifiziert worden ist, wie etwa fluoreszierendem Material oder radioaktivem Material schließt einen Laser und eine Lichtquelle, ein Loch, eine Linse und ähnliches ein. Licht, das von einem Laser und einer Lichtquelle 47 erzeugt worden ist, wird mit einer Linse 49 kondensiert, nachdem es durch einen Filter 48 zur Wellenlängenselektion geleitet worden ist und wird durch ein Loch 50 im Brennpunkt geleitet. Das Licht wird zu der plattenförmigen Kartusche 42 mit einem reflektierenden Spiegel 51 geleitet und wird wieder mit der Linse 53 kondensiert, die den Brennpunkt in einem Meßteil hat. Das Licht, das einen Hinweis darauf gibt, daß das Material durch das kondensierte Licht angeregt worden ist, wird zu der Linse 53 geleitet und wird durch einen polarisierten Strahlspalter 52 zu einer Lichtempfangseinheit 56 geleitet. Das Licht, das eine ausgewählte Wellenlänge hat, indem es durch einen Filter 54 geleitet worden ist, wird durch ein Loch 55 am Brennpunkt geleitet, um die Lichtempfangseinheit 56 zu erreichen. Die Analyse der Vertei lung der modifizierten Teile wird durch einen Computer 32 durchgeführt, basierend auf Signalen von der Lichtempfangseinheit 56.
  • 5A und 5B sind Ansichten, die eine plattenförmige Kartusche, nicht gemäß der vorliegenden Erfindung, in Einzelheiten zeigt. Eine plattenförmige Kartusche, die in 5A gezeigt wird, hat eine Struktur, in der Speichergräben 59 mit Mikroweiten und -tiefen auf einer Platte bereitgestellt sind, und Elektroden 57 und 58 werden auf beiden Seiten von jedem der Speichergräben 59 bereitgestellt. Wenn die Absorption, die Transmission und ähnliches gemessen werden, wird eine transparente Bodenseite benötigt. Was die Messung betrifft, wird optische Energie wie etwa Absorption, Transmission, Reflektion und ähnliches gemessen. Der herkömmliche Nachweis mittels Fluoreszenz kann nachgewiesen werden.
  • 5B ist eine Ansicht, die plattenförmige Kartuschen mit Gel zeigt. Indem Gel 65 in die Mitte der Speichergräben und Heizelektroden 61 und 62 gebracht wird, ist es möglich eine Zeitverzögerungsmessung durchzuführen. Einzelstrang-DNA-Sonden werden vorher an eine Elektrode 61 fixiert, und eine Proben-DNA wird in jede der Vertiefungen 63 injiziert, die sich auf der Seite der Elektrode 61 befinden, an die die Sonden fixiert sind, für eine Hybridisierungsreaktion. Die Messung wird für nicht-umgesetzte Proben-DNA mittels herkömmlicher Elektrophorese durchgeführt. Wenn die DNA und die modifizierten Materialien in dem Gelteil 65 vollständig heraus in die Vertiefung 64 geflossen sind, die sich auf der Seite der Elektrode 62 gegenüber der Elektrode 61 befindet, wird die Elektrode 61 erhitzt, um die sich um die Elektrode 61 befindende DNA in Einzelstränge zu dissoziieren, und die Messung wird wieder mittels herkömmlicher Elektrophorese durchgeführt. Auf diese Weise ist es möglich, eine Basenlängenverteilung und eine vorhandene Menge an Komplementärstrang-DNA und eine Basenlängenverteilung und eine vorhandene Menge an Nicht-Komplementärstrang-DNA in der Proben-DNA zu bestimmen.
  • In der Messung und dem Nachweis ist es möglich, nicht-modifizierte Proben-DNA zu verwenden, aber es ist möglich, eine höhere Empfindlichkeit durch Modifizierung von DNA mit einem organischen Material oder einem anorganischen Material zu erhalten, wie etwa einem fluoreszierenden Farbstoff zur Anregung mit einem externen Reiz.
  • 6 ist eine allgemeine Ansicht der nicht erfindungsgemäßen Vorrichtung mit plattenförmigen Kartuschen zum Nachweis von Biopolymeren. Eine Vielzahl von plattenförmigen Kartu schen 42 werden in einer Haupteinheit 66 der Vorrichtung geladen, so daß die Elektroden der Kartusche so verbunden werden, daß sie mit einer Elektrode 67 und der anderen Elektrode 68 in Kontakt sind. Die Kartuschen werden in einem Durchgang mit einem Scannerteil 69 abgetastet („scanned"). Gewöhnlich wird die Hybridisierung oder Elektrophorese durchgeführt, während ein Deckel 70 geschlossen ist.
  • In der oben erwähnten Ausführungsform ist der Querschnitt der Kartusche viereckig, aber andere Formen, wie etwa hexagonal können ebenfalls akzeptabel sein. Es ist wünschenswert, daß die Kartusche transparente und parallele Ebenen hat, um eine Streuung des durchgehenden Lichts zu vermeiden.
  • Darüberhinaus kann die Dissoziierungstemperatur für Einzelstränge von DNA bestimmt werden, in dem die Temperatur der Elektroden variiert wird und indem eine Menge an hybridisierter DNA oder nicht-hybridisierter DNA bei jeder Temperatur gemessen wird.
  • In Übereinstimmung mit der vorliegenden Erfindung können die Anwesenheit und eine vorhandene Menge oder eine Konzentration eines Biopolymers wie etwa DNA, RNA und Protein und ähnliches in einer Probe in einfacher Weise bestimmt werden.

Claims (8)

  1. Vorrichtung zum Nachweis von Biopolymeren, umfassend: eine Spannungsquelleneinheit zum Anlegen einer elektrischen Spannung zwischen zwei Elektroden (26, 28) einer Kartusche (11), die Biopolymere zwischen den Elektroden (26, 28) enthält, eine Halteeinheit zum Halten der Kartusche (11), eine Bestrahlungseinheit zum Einstrahlen von Licht auf die durch die Halteeinheit gehaltene Kartusche, und eine Lichtempfangseinheit (12) zum Empfangen des Lichts, das mittels der Bestrahlungseinheit auf die durch die Halteeinheit gehaltene Kartusche eingestrahlt worden ist, wobei die Spannungsquelleneinheit selektiv Wechselspannung und Gleichspannung liefern kann, wobei die Kartusche (11) umfaßt: eine säulenförmige Basiseinheit (27), die eine Biopolymerlösung aufnehmen kann, wobei die Basiseinheit eine erste Elektrode (28) auf dem Inneren einer Bodenseite, transparente Seiten in wenigstens einem Teil und eine geöffnete Oberseite hat, und eine Deckeleinheit (25), die eine zweite Elektrode (26) an der Außenseite einer Bodenseite hat und eingeführt wird, um in der Basiseinheit von der Oberseite zur Mitte der Basiseinheit fixiert zu werden, und wobei in der Kartusche (11) eine Biopolymersonde (73) auf besagter erster Elektrode oder besagter zweiter Elektrode fixiert ist.
  2. Vorrichtung zum Nachweis von Biopolymeren nach Anspruch 1, wobei die Halteeinheit die Kartusche zweidimensional auf einer Ebene bewegen kann, die zu einer optischen Achse des durch die Bestrahlungseinheit eingestrahlten Lichts senkrecht ist.
  3. Vorrichtung zum Nachweis von Biopolymeren nach einem der vorangehenden Ansprüche, wobei die Bestrahlungseinheit Licht mit einer spezifizierten einzelnen Wellenlänge einstrahlen kann.
  4. Vorrichtung zum Nachweis von Biopolymeren nach einem der vorangehenden Ansprüche, wobei die Spannungsquelleneinheit selektiv Wechselspannung und Gleichspannung liefern kann, und die Bestrahlungseinheit Licht mit einer spezifizierten einzelnen Wellenlänge einstrahlen kann.
  5. Vorrichtung zum Nachweis von Biopolymeren nach einem der vorangehenden Ansprüche, weiterhin umfassend eine Recheneinheit zum Berechnen einer vorhandenen Menge, einer Basenlänge, einer Konzentration, eines Hybridisierungsverhältnisses und einer Hybridisierungsmenge eines Biopolymers anhand einer Menge an Licht, die von der Lichtempfangseinheit empfangen wird.
  6. Vorrichtung zum Nachweis von Biopolymeren nach einem der vorangehenden Ansprüche, weiterhin umfassend einen Heizer, der Wärme auf die Elektroden der Kartusche aufbringt zum Dissoziieren von Biopolymeren, die in der Kartusche hybridisiert sind, in Einzelstränge.
  7. Vorrichtung nach einem der vorangehenden Ansprüche, wobei ein Querschnitt besagter säulenförmiger Basiseinheit ein Viereck und ein Querschnitt besagter Deckeleinheit eine runde Form ist.
  8. Vorrichtung nach einem der vorangehenden Ansprüche, wobei die Kartusche weiterhin ein Lösungsreservoir auf einem oberen Teil besagter Basiseinheit zum Aufnehmen einer Biopolymerlösung umfaßt, die aus dem besagten säulenförmigen Teil ausgeflossen ist, um zu verhindern, daß die Lösung nach außen fließt.
DE60132290T 2000-11-30 2001-11-30 Elektrophoretische Vorrichtung und Kassette zur Detektion von Biopolymeren Expired - Lifetime DE60132290T2 (de)

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JP2000364370 2000-11-30
JP2000364370A JP3729729B2 (ja) 2000-11-30 2000-11-30 生体高分子検出装置及びカートリッジ

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