CN1997663A - 不可分型的流感嗜血杆菌的多肽 - Google Patents

Abstract

含有不可分型的流感嗜血杆菌(NTHi)氨基酸序列的多肽。公开了2500种以上的具体NTHi多肽。本发明也提供相关的多肽、核酸、抗体和方法。这些物质可用在治疗和/或预防流感嗜血杆菌所致感染例如中耳炎的药物中。

Description

不可分型的流感嗜血杆菌的多肽

本文引用的所有文献全文纳入本文作为参考。

技术领域

本发明涉及流感嗜血杆菌(Haemophilus influenzae)免疫学和疫苗学。

背景技术

流感嗜血杆菌是小的、非运动性、革兰阴性球杆菌。它是导致多种人类感染的呼吸道病原体，所述感染包括：在上呼吸道中无症状的寄居(即，携带(carriage))；从寄居的粘膜表面扩展从而导致中耳炎(中耳感染)、支气管炎、结膜炎、鼻窦炎、尿路感染和肺炎等感染；和侵袭性感染，例如菌血症、脓毒性关节炎、会厌炎、肺炎、脓胸、心包炎、蜂窝织炎、骨髓炎和脑膜炎。流感嗜血杆菌是完全公布基因组序列的第一个细菌[1]。

流感嗜血杆菌可以有荚膜(可分型的)或无荚膜(不可分型的)，有荚膜的菌株主要有6种血清学类型(a型到f型)。95％的流感嗜血杆菌所致侵袭性疾病由b型流感嗜血杆菌(“Hib”)菌株导致。Hib疾病中最严重的表现是脑膜炎，但20世纪80年代开发的基于偶联Hib荚膜糖的疫苗极大降低了该疾病的发病率。

虽然目前可以通过接种疫苗控制Hib感染，但其它病原性流感嗜血杆菌菌株仍然危险。例如，不可分型的流感嗜血菌(NTHi)导致中耳炎(OM)，特别是慢性中耳炎。虽然OM极少致死，但它有较高的发病率。听力丧失是OM最常见的并发症，行为、教育和语言开发延迟是早期发作的伴有积液的OM的其它后果。在美国，急性OM是儿童中最常见的细菌感染。不可分型的流感嗜血杆菌埃及(aegyptius)生物群导致流行性结膜炎和巴西紫癜热(BPF)[2]，BPF的死亡率高达70％。

目前，抗生素是对付总称为OM的各种临床实体的主要工具，但由于出现了多抗生素耐受微生物，为OM而广泛使用抗生素引起了争议。由于不完全了解OM的发病机理和对OM的免疫应答，疫苗进展缓慢。

血清型d菌株KW20的基因组序列[1，3]可用于了解流感嗜血杆菌的基础生物学(特性)，但在对抗致病性流感嗜血杆菌菌株时用处不大，因为血清型d菌株一般是非致病性的。

本发明的目的之一是提供多肽，其用于开发预防和/或治疗不可分型流感嗜血杆菌菌株所致感染的疫苗。具体地，本发明的目的之一是提供多肽，其用于预防和/或治疗中耳炎的改进的疫苗中。这些多肽也可用于诊断性目的并作为抗生素的靶点。

发明内容

多肽

本发明提供含有实施例中所公开的流感嗜血杆菌氨基酸序列的多肽。这些氨基酸序列是2到5080的偶数SEQ ID NO。因此，有2540个氨基酸序列，这些序列称为NTHnnnn，其中nnnn是0001到2832的数字(有292个NTHnnnn编号没有序列；参见表I)。本发明的其它NTHi序列从SEQ ID NO：5088向前(编号)。

本发明也提供了含有与实施例所公开的流感嗜血杆菌氨基酸序列具有序列相同性的氨基酸序列的多肽。取决于具体的序列，序列相同性程度优选大于50％(例如，60％、70％、75％、80％、85％、90％、91％、92％、93％、94％、95％、96％、97％、98％、99％以上)。这些多肽包括同系物、直向同源物、等位变体和功能性突变体。两条多肽序列之间有50％或50％以上的相同性一般可认为是功能等价的指标。优选通过在MPSRCH程序(OxfordMolecular)中执行的Smith-Waterman同源性检索算法来测定多肽之间的相同性，所用的仿射(affine)空格检索其参数是空格开放罚分＝12，空格延伸罚分＝1。

与实施例的NTHi序列相比，这些多肽可含有一个以上(例如，1、2、3、4、5、6、7、8、9、10个等)保守性氨基酸取代，即用另一个具有相关侧链的氨基酸取代某一氨基酸。遗传编码的氨基酸一般分为四类：(1)酸性氨基酸，即天冬氨酸、谷氨酸；(2)碱性氨基酸，即赖氨酸、精氨酸、组氨酸；(3)非极性氨基酸，即丙氨酸、缬氨酸、亮氨酸、异亮氨酸、脯氨酸、苯丙氨酸、甲硫氨酸、色氨酸；和(4)不带电荷的极性氨基酸，即甘氨酸、天冬酰胺、谷氨酰胺、半胱氨酸、丝氨酸、苏氨酸、酪氨酸。苯丙氨酸、色氨酸和酪氨酸有时也共同分为芳族氨基酸。这些类别内的单个氨基酸取代一般对生物学活性无很大影响。相对于实施例的NTHi序列，这些多肽也可含有一个或1个以上(例如，1、2、3、4、5、6、7、8、9、10等)单氨基酸缺失。相对于实施例的NTHi序列，这些多肽也可含有一个或1个以上(例如，1、2、3、4、5、6、7、8、9、10等)插入(例如，各1、2、3、4或5个氨基酸)。

本发明的优选多肽见表II，包括脂质化的、位于外膜的、位于内膜的、位于周质的或者未在非致病性流感嗜血杆菌菌株中发现的多肽。特别优选的多肽是处于一个以上这些分类中的多肽，例如位于外膜同时未在非致病性流感嗜血杆菌中发现的多肽。

特别优选的多肽是NTH0867。也优选NTH0861、NTH0863和NTH0865。如下所述，这四种蛋白由SEQ ID NO：1566、5095、1570、5094、1574、5903、1578和5092表示。在这八种SEQ ID NO中，优选1566-1578。

本发明还提供含有实施例所公开的流感嗜血杆菌氨基酸序列片段的多肽。这些片段应包含来自这些序列的至少n个连续氨基酸，取决于具体的序列，n可以是7或以上(例如，8、10、12、14、16、18、20、22、24、26、28、30、35、40、45、50、60、70、80、90、100个或以上)。

所述片段可含有所述序列的至少一个T-细胞或优选B-细胞表位。可凭经验鉴定T-和B-细胞表位(例如，采用PEPSCAN[4，5]或类似的方法)，或者可预测它们(例如，采用Jameson-Wolf抗原性指数[6]、基于基质的方法[7]、TEPITOPE[8]、神经网络[9]、OptiMer & EpiMer[10，11]、ADEPT[12]、Tsites[13]、亲水性[14]、抗原性指数[15]或参考文献16公开的方法等)。其它优选的片段是(a)本发明NTHi多肽的N-末端信号肽；(b)NTHi多肽，但不具有其N-末端信号肽；(c)NTHi多肽，但不具有其N-末端氨基酸残基。

可以许多方式制备本发明的多肽，例如通过化学合成(全合成或部分合成)、利用蛋白酶消化较长的多肽、从RNA翻译、从细胞培养物(例如，重组表达)或生物本身(例如，在细菌培养后或直接从患者)纯化等。制备长度小于40个氨基酸的肽的优选方法是体外化学合成[17，18]。特别优选固相肽合成，例如基于tBoc或Fmoc化学的方法[19]。也可部分或全部使用酶合成[20]。作为化学合成的备选方法，可采用生物学合成，例如可通过翻译制备多肽。这可在体外或体内进行。生物学方法一般只限于产生基于L-氨基酸的多肽，但可利用对翻译机制的操作(例如，对氨酰基tRNA分子的操作)使得可引入D-氨基酸(或其它非天然氨基酸，例如碘代酪氨酸或甲基苯丙氨酸或叠氮高丙氨酸(azidohomoalanine)等)[21]。然而，当包括D-氨基酸时，优选采用化学合成。本发明多肽可在C-末端和/或N-末端具有共价修饰。

本发明多肽可采取各种形式(例如，天然的、融合的、糖基化的、非糖基化的、脂质化的、非脂质化的、磷酸化的、非磷酸化的、豆蔻酰化、非豆蔻酰化、单体的、多聚的、颗粒状的、变性的，等)。

本发明多肽优选以纯化或基本上纯化的形式提供，即基本上不含其它多肽(例如，不含天然产生的多肽)，特别是不含其它流感嗜血杆菌或宿主细胞的多肽，本发明多肽一般是至少约50％纯(以重量计)，通常是至少约90％纯，即组合物中小于约50％，更优选小于约10％(例如，5％)的部分由其它表达的多肽构成。本发明多肽优选流感嗜血杆菌多肽。本发明多肽优选具有表III的相关序列所示的功能。

本发明多肽可与固体支持物相连。本发明多肽可含有可检测标记(例如，放射性或荧光标记，或生物素标记)。

术语“多肽”指任何长度的氨基酸聚合物。该聚合物可以是线形或分支的，它可含有修饰的氨基酸。它可被非氨基酸打断。这些术语也可包括天然修饰或通过干预而修饰的氨基酸聚合物；例如形成二硫键、糖基化、脂质化、乙酰化、磷酸化或任何其它操作或修饰，如与标记组分偶联。此定义也包括，例如含有一个或多个氨基酸类似物(包括，如非天然氨基酸等)以及本领域已知的其它修饰的多肽。这些多肽可以单链或缔合链存在。本发明多肽可天然或非天然(即，该多肽所具有的糖基化模式不同于相应的天然产生多肽中发现的糖基化模式)糖基化。

本发明提供含有序列-X-Y-或-Y-X-的多肽：其中-X-是如上定义的氨基酸序列，-Y-不是如上定义的序列，即本发明提供融合蛋白。当多肽编码序列的N-末端密码子不是ATG时，该密码子将翻译为该密码子的标准氨基酸而不是当密码子是起始密码子时产生的Met。

本发明提供制备本发明多肽的方法，包括在可诱导多肽表达的条件下培养本发明的宿主细胞的步骤。

本发明提供制备本发明多肽的方法，其中所述多肽是利用化学方法部分或完全合成的。

本发明提供一种含有两种或两种以上本发明多肽的组合物。

本发明也提供式NH₂-A-[-X-L-]_n-B-COOH所示的杂合多肽，其中X是如上定义的本发明多肽，L是任选的接头氨基酸序列，A是任选的N-末端氨基酸序列，B是任选的C-末端氨基酸序列，n是大于1的整数。n的值在2和x之间，而x的值一般是3、4、5、6、7、8、9或10。n优选是2、3或4；更优选2或3；最优选n＝2。在各种n的例子中，-X-可以相同或不同。就[-X-L-]的各种n的例子而言，接头氨基酸序列-L-可以存在或不存在。例如，当n＝2时，杂合(多肽)可以是NH₂-X₁-L₁-X₂-L₂-COOH、NH₂-X₁-X₂-COOH、NH₂-X₁-L₁-X₂-COOH、NH₂-X₁-X₂-L₂-COOH等。接头氨基酸序列-L-一般是短的(例如，20或少于20个氨基酸，即19、18、17、16、15、14、13、12、11、10、9、8、7、6、5、4、3、2、1)。例子包括有助于克隆的短肽序列、多甘氨酸接头(即，Gly_n，其中n＝2、3、4、5、6、7、8、9、10或以上)和组氨酸标签(即，His_n，其中n＝3、4、5、6、7、8、9、10或以上)。本领域技术人员明显可知其它合适的接头氨基酸序列。-A-和-B-一般任选是短的氨基酸序列(例如，40或少于40个氨基酸，即39、38、37、36、35、34、33、32、31、30、29、28、27、26、25、24、23、22、21、20、19、18、17、16、15、14、13、12、11、10、9、8、7、6、5、4、3、2、1)。例子包括指导多肽运输的前导序列，或有助于克隆或纯化的短肽序列(例如，组氨酸标签即，His_n，其中n＝3、4、5、6、7、8、9、10或以上)。本领域技术人员明显可知其它合适的N-末端和C-末端氨基酸序列。

可采用各种检验来评估本发明多肽的体内免疫原性。例如，可重组表达这些多肽并通过免疫印迹将其用于筛选患者血清。多肽和患者血清之间的阳性反应表明该患者以前对所述蛋白质产生过免疫应答，即该蛋白质是免疫原。此方法也可用于鉴定免疫优势蛋白。

抗体

本发明提供与本发明多肽相结合的抗体。这些抗体可以是多克隆或单克隆的，可通过任何合适的方法制备(例如，通过重组表达)。为增加与人免疫系统的相容性，这些抗体可以是嵌合或人源化的[例如，参考文献22和23]，或者可利用完全的人抗体。这些抗体可包含可检测标记(例如，用于诊断试验)。本发明的抗体可以与固体支持物相连。本发明的抗体优选中和抗体。

单克隆抗体可特别用于鉴定和纯化它们所靶向的各多肽。本发明的单克隆抗体也可在免疫测定、放射性免疫测定(RIA)或酶联免疫吸附测定(ELISA)等中用作试剂。在这些应用中，可用分析上可检测的试剂，例如放射性同位素、荧光分子或酶标记这些抗体。以上方法所产生的单克隆抗体也可用于本发明多肽的分子鉴别和特征鉴定(表位作图)。

本发明抗体优选以纯化或基本上纯化的形式提供。抗体一般存在于基本上不含其它多肽的组合物中，例如组合物的小于90％(以重量计)，通常小于60％和更常见小于50％(的部分)由其它多肽构成。

本发明抗体可以是任何同种型(例如，IgA、IgG、IgM，即α、γ或μ重链)，但通常是IgG。在IgG同种型中，这些抗体可以是IgG1、IgG2、IgG3或IgG4亚类。本发明抗体可具有κ或γ轻链。

本发明抗体可采用各种形式，包括全抗体，抗体片段，例如F(ab′)₂和F(ab)片段、Fv片段(非共价异源二体)，单链抗体，例如单链Fv分子(scFv)，小体(minibody)、寡体(oligobody)等。术语“抗体”不暗示任何具体来源，包括经非常规方法，例如噬菌体展示获得的抗体。

本发明提供检测本发明多肽的方法，包括以下步骤：(a)使本发明抗体在适于形成抗体-抗原复合物的条件下与生物学样品相接触；和(b)检测所述复合物。

本发明提供检测本发明抗体的方法，包括以下步骤：(a)使本发明多肽在适于形成抗体-抗原复合物的条件下与生物学样品(例如，血液或血清样品)相接触；和(b)检测所述复合物。

核酸

本发明提供含有实施例所公开的流感嗜血杆菌核苷酸序列的核酸。这些核酸序列是1和5080之间的奇数SEQ ID NO。

本发明也提供含有与实施例所公开的流感嗜血杆菌核苷酸序列具有序列相同性的核苷酸序列的核酸。序列之间的相同性优选通过上述Smith-Waterman同源性检索算法测定。

本发明也提供能与实施例所公开的流感嗜血杆菌核酸杂交的核酸。可在不同“严谨性”条件下进行杂交反应。使杂交反应的严谨性增加的条件是本领域广为知晓且公开的[例如，参考文献24的第7.52页24]。有关条件的例子包括(为增加严谨性)：温育温度为25℃、37℃、50℃、55℃、和68℃；缓冲液浓度为10×SSC、6×SSC、1×SSC、0.1×SSC (其中SSC是0.15M NaCl和15mM柠檬酸缓冲液)，和使用其它缓冲系统的等价物；甲酰胺浓度为0％、25％、50％和75％；温育时间从5分钟到24小时；洗涤1、2或更多次；洗涤温育时间是1、2或15分钟；洗涤溶液是6×SSC、1×SSC、0.1×SSC或去离子水。杂交技术及其优化是本领域熟知的[例如，参见参考文献24-27等]。

在一些实施方案中，本发明核酸在低严谨条件下与本发明靶子杂交；在其它实施方案中，其在中等严谨条件下杂交；在优选的实施方案中，其在高严谨条件下杂交。示范性的一组低严谨杂交条件是50℃和10×SSC。示范性的一组中等严谨杂交条件是55℃和1×SSC。示范性的一组高严谨杂交条件是68℃和0.1×SSC。

也提供了含有这些序列的片段的核酸。这些核酸应含有来自流感嗜血杆菌序列的至少n个连续核苷酸，取决于具体的序列，n是10或10以上(例如，12、14、15、18、20、25、30、35、40、50、60、70、80、90、100、150、200以上)。

本发明提供式5′-X-Y-Z-3′所示的核酸，其中：-X-是由x个核苷酸组成的核苷酸序列；-Z-是由z个核苷酸组成的核苷酸序列；-Y-是由以下成分组成的核苷酸序列：(a)奇数编号的SEQ ID NO：1-5079之一的片段，或(b)(a)的互补序列；所述核酸5′-X-Y-Z-3′既不是(i)奇数编号的SEQ ID NO：1-5079之一的片段，也不是(ii)(i)的互补序列。-X-和/或-Z-部分可包含启动子序列(或其互补序列)。

本发明也提供编码本发明多肽和多肽片段的核酸。

本发明包括含有序列表所公开序列的互补序列(例如，用作反义序列或用于探测，或用作引物)以及按实际所示取向的序列的核酸。

本发明核酸可用于杂交反应(例如，Northern或Southern印迹，或用于核酸微阵列或“基因芯片”)和扩增反应(例如，PCR、SDA、SSSR、LCR、TMA、NASBA等)和其它核酸技术。

本发明核酸可采取各种形式(例如，单链、双链、载体、引物、探针、标记的等)。本发明核酸可以是环状或分支的，但是通常是线形的。除非另有指出或需要，利用核酸的任何本发明实施方案可利用双链形式和构成双链形式的两条互补单链形式的各条，反义核酸也一样。

本发明核酸优选以纯化或基本上纯化的形式提供，即基本上不含其它核酸(例如，不含天然产生的核酸)，特别是不含其它嗜血杆菌或宿主细胞的核酸，一般至少约50％纯(以重量计)，通常至少约90％纯。本发明核酸优选流感嗜血杆菌核酸。

可以多种方式制备本发明核酸，例如全部或部分通过化学合成(如，DNA的亚磷酰胺合成)、利用核酸酶(如，限制性内切酶)消化基因组或cDNA文库中较长的核酸、连接基因组或cDNA文库中较短的核酸或核苷酸(如利用连接酶或聚合酶)等。

可将本发明核酸连接于固体支持物(例如，珠、板、过滤器、膜、载玻片、微阵列支持物、树脂等)。可用，例如放射性或荧光标记或生物素标记来标记本发明核酸。当核酸要用于检测技术，例如核酸是引物或作为探针时，标记特别有用。

术语“核酸”一般指任何长度的含有脱氧核糖核苷酸、核糖核苷酸和/或它们的类似物的核苷酸聚合形式。其包括DNA、RNA、DNA/RNA杂合体。其也包括DNA或RNA类似物，例如含有修饰的骨架(如，肽核酸(PNA)或硫代磷酸酯)或修饰的碱基的核酸。因此，本发明包括mRNA、tRNA、rRNA、核酶、DNA、cDNA、重组核酸、分支核酸、质粒、载体、探针、引物等。当本发明核酸采取RNA形式时，其可具有或不具有5’帽子。

本发明核酸含有NTHi序列，但它们也可含有非-NTHi序列(例如，如上定义，式5′-X-Y-Z-3′所示核酸中)。这对引物而言特别有用，从而引物可含有与PCAV靶核酸互补的第一序列和不与该靶核酸互补的第二序列。引物中任何这种非互补序列优选在互补序列的5’(端)。典型的非互补序列包含限制性位点或启动子序列。

可以多种方式制备本发明核酸，例如通过化学合成(如，至少一部分)、利用核酸酶(如，限制性内切酶)消化基因组或cDNA文库中较长的核酸、连接(如利用连接酶或聚合酶)基因组或cDNA文库中较短的核酸等。

本发明核酸可以是载体的一部分，即设计用于转导/转染一种或多种细胞类型的核酸构建物的一部分。载体可以是，例如设计用于分离、扩增和复制插入的核苷酸的“克隆载体”，设计用于在宿主细胞中表达核苷酸序列的“表达载体”，设计用于产生重组病毒或病毒样颗粒的“病毒载体”，或具有一种以上类型载体的性质的“穿梭载体”。优选的载体是质粒。“宿主细胞”包括可以作为或已是外源性核酸接受者的单个细胞或细胞培养物。宿主细胞包括单个宿主细胞的后代，由于天然、偶发或有意的突变和/改变，该后代不一定与原始母代细胞完全一致(在形态学或总的DNA互补性上)。宿主细胞包括用本发明核酸在体内或体外转染或感染的细胞。

当核酸是DNA时，应该理解RNA序列中的“U”被DNA中的“T”所取代。类似地，当核酸是RNA时，应该理解DNA序列中的“T”被RNA中的“U”所取代。

当所用的术语“互补”或“互补的”涉及核酸时，指沃森-克里克碱基配对。因此，与C互补的是G、与G互补的是C、与A互补的是T(或U)、与T(或U)互补的是A。也能利用与例如嘧啶(C或T)互补的碱基，例如I(嘌呤肌苷)。这些术语也暗示了方向，与5′-ACAGT-3′互补的是5′-ACTGT-3′而非5′-TGTCA-3′。

本发明核酸可用于，例如：产生多肽；作为杂交探针检测生物学样品中的核酸；产生核酸的其它拷贝；产生核酶或反义寡核苷酸；作为单链DNA引物或探针；或作为形成三链的寡核苷酸。

本发明提供了产生本发明核酸的方法，其中该核酸全部或部分利用化学方法合成。

本发明提供含有本发明核苷酸序列的载体(例如，克隆或表达载体)和用这种载体转化的宿主细胞。

本发明也提供包含引物(例如，PCR引物)的试剂盒，所述引物用于扩增包含在嗜血杆菌细菌(例如，流感嗜血杆菌)核酸序列中的模板序列，该试剂盒包含第一引物和第二引物，其中该第一引物基本上与所述模板序列互补，该第二引物基本上与所述模板序列的互补序列互补，其中具有基本互补性的所述引物的各部分确定了待扩增模板序列的末端。该第一引物和/或第二引物可包含可检测标记(例如，荧光标记)。

本发明也提供包含第一和第二单链寡核苷酸的试剂盒，可扩增包含在某单链或双链核酸(或其混合物)中的嗜血杆菌模板核酸序列，其中：(a)该第一寡核苷酸包含与所述模板核酸序列基本上互补的引物序列；(b)该第二寡核苷酸包含与所述模板核酸序列的互补序列基本上互补的引物序列；(c)该第一寡核苷酸和/或该第二寡核苷酸包含与所述模板核酸不互补的序列；和(d)所述引物序列确定了待扩增模板序列的末端。特征(c)中的非互补序列优选是引物序列的上游(即，其5’端)。一条或两条这些(c)所述序列可包含限制性位点[例如，参考文献28]或启动子序列[例如，29]。该第一寡核苷酸和/或第二寡核苷酸可包含可检测标记(例如，荧光标记)。

模板序列可以是基因组序列的任一部分。

本发明提供检测本发明核酸的方法，包括以下步骤：(a)使本发明的核酸探针在适于形成双螺旋的杂交条件下与生物学样品相接触；和(b)检测所述双螺旋。

本发明提供检测生物学样品(例如，血液)中的流感嗜血杆菌的方法，包括在杂交条件下使本发明核酸与生物学样品相接触的步骤。该方法涉及核酸扩增(例如，PCR、SDA、SSSR、LCR、TMA、NASBA等)或杂交(例如，微阵列、印迹、在溶液中与探针杂交)。PCR检测临床样品中的流感嗜血杆菌已有报导[例如，参见参考文献30和31]。基于核酸的临床试验总体上描述于参考文献32。

本发明提供制备靶序列的片段的方法，其中所述片段通过延伸核酸引物来制备。所述靶序列和/或引物是本发明的核酸。引物延伸反应可涉及核酸扩增(例如，PCR、SDA、SSSR、LCR、TMA、NASBA等)。

本发明的核酸扩增可以是定量和/或实时的。

就本发明的某些实施方案而言，这些核酸的长度优选为至少7个核苷酸(例如，8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、31、32、33、34、35、36、37、38、39、40、45、50、55、60、65、70、75、80、90、100、110、120、130、140、150、160、170、180、190、200、225、250、275、300个核苷酸或更长)。

就本发明的某些实施方案而言，这些核酸的长度优选为最多500个核苷酸(例如，450、400、350、300、250、200、150、140、130、120、110、100、90、80、75、70、65、60、55、50、45、40、39、38、37、36、35、34、33、32、31、30、29、28、27、26、25、24、23、22、21、20、19、18、17、16、15个核苷酸或更短)。

用于杂交的本发明引物和探针以及其它核酸优选长10到30个核苷酸(例如，10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29或30个核苷酸)。

药物组合物

本发明提供含有以下组分的组合物：(a)本发明的多肽、抗体和/或核酸；和(b)药学上可接受的运载体。这些组合物可适于用作免疫原性组合物，例如作为诊断试剂或疫苗。本发明的疫苗可以是预防性(即，防止感染)或治疗性(即，治疗感染)，但一般是预防性的。

“药学上可接受的运载体”包括本身不诱导产生对接受组合物的个体有害的抗体的任何运载体。合适的运载体一般是大的、代谢缓慢的大分子，例如蛋白质、多糖、多乳酸、多乙醇酸、聚氨基酸、氨基酸共聚物、蔗糖、海藻糖、乳糖和脂质聚集体(例如油滴或脂质体)。这种运载体是本领域技术人员所熟知的。疫苗也可含有稀释剂，例如水、盐水、甘油等。此外，可存在辅助物质，例如润湿剂或乳化剂、pH缓冲物质等。无菌无热源的磷酸缓冲生理盐水是典型的运载体。药学上可接受的赋形剂的详尽讨论见参考文献138。

本发明组合物可含有抗菌剂，特别是如果以多剂量形式包装。

本发明组合物可含有去污剂，例如吐温(聚山梨酸酯)，如吐温80。去污剂一般以低水平存在，例如＜0.01％。

本发明组合物可含有钠盐(例如，氯化钠)以获得张力。NaCl的典型浓度是10±2mg/ml。

本发明组合物一般含有缓冲液。典型的是磷酸盐缓冲液。

本发明组合物可含有例如约15-30mg/ml(如25mg/ml)的糖醇(如甘露醇)或二糖(如蔗糖或海藻糖)，特别是如果要将组合物冻干或如果组合物含有从冻干物质重建的物质。冻干组合物的pH可在冻干之前调整为约6.1。

可联用其它免疫调节剂给予本发明多糖。具体地说，这些组合物通常包含疫苗佐剂。可用于本发明组合物的佐剂包括但不限于：

A.含有矿物质的组合物

适合用作本发明佐剂的含有矿物质的组合物包括矿物盐，例如铝盐和钙盐。本发明包括矿物盐，例如氢氧化物(如羟基氧化物(oxyhydroxides))、磷酸盐(如羟基磷酸盐、正磷酸盐)、硫酸盐等[如参见参考文献33的第8和9章]，或不同矿物质化合物的混合物，这些化合物可采取任何合适的形式(如凝胶、晶体、无定形等)，优选(具有)吸附性。含有矿物质的组合物也可配制为金属盐颗粒[34]。

特别优选磷酸铝，特别是在含有流感嗜血杆菌糖抗原的组合物中，典型的佐剂是PO₄/Al摩尔比为0.84到0.92、含有0.6mg Al³⁺/ml的无定形羟基磷酸铝。可采用低剂量的磷酸铝吸附，例如每剂中每种偶联物用50-100μg Al³⁺。当组合物中有多种偶联物时，无需吸附所有偶联物。

B.油乳剂

适合用作本发明佐剂的油乳剂组合物包括角鲨烯-水乳剂，例如MF59[参考文献33的第10章；也参见参考文献35](5％角鲨烯、0.5％吐温80和0.5％司盘(Span)85，利用微流化仪配制成亚微米颗粒)。也可用完全弗氏佐剂(CFA)和不完全弗氏佐剂(IFA)。

C.皂苷制剂[参考文献33的第22章]

皂苷制剂也可用作本发明的佐剂。皂苷是在许多植物种类的树皮、叶、茎、根、甚至花中发现的固醇糖苷和三萜系糖苷的异质混合物(heterologousgroup)。皂树(Quillaia saponaria Molina)树皮中的皂苷是广泛研究的佐剂。皂苷也可通过商业途径获自丽花菝葜(Smilax ornata)(墨西哥菝葜(sarsaprilla))、锥花丝石竹(Gypsophilla paniculata)(婚纱花(brides veil))和肥皂草(Saponaria officianalis)(皂根(soap root))。皂苷佐剂制剂包括纯化的制剂，例如QS21，以及脂质制剂，例如ISCOM。QS21的商品名为Stimulon^TM。

已利用HPLC和RP-HPLC纯化皂苷组合物。已经鉴定了用这些技术特别纯化的部分，包括QS7、QS17、QS18、QS21、QH-A、QH-B和QH-C。皂苷优选QS21。参考文献36公开了QS21的制备方法。皂苷制剂也可含有固醇，例如胆固醇[37]。

可联用皂苷和胆固醇来形成称为免疫刺激复合物(ISCOM)的独特颗粒[参考文献33的第23章]。ISCOM一般也含有磷脂，例如磷脂酰乙醇胺或磷脂酰胆碱。任何已知的皂苷可用在ISCOM中。ISCOM优选含有一种或多种QuilA、QHA和QHC。参考文献37-39进一步描述了ISCOM。ISCOM任选不含其它去污剂[40]。

皂苷佐剂开发的综述见参考文献41和42。

D.病毒体和病毒样颗粒

病毒体和病毒样颗粒(VLP)也可用作本发明的佐剂。这些结构通常含有一种或多种任选与磷脂联用或用磷脂配制的病毒蛋白质。它们通常是非病原性、非复制性，通常不含有任何天然病毒基因组。可重组产生或从完整病毒分离病毒蛋白。适用于病毒体或VLP中的病毒蛋白包括源自以下的蛋白质：流感病毒(例如HA或NA)、乙肝病毒(例如核心或衣壳蛋白)、戊肝病毒、麻疹病毒、辛德毕斯病毒、轮状病毒、口蹄疫病毒、逆转录病毒、诺瓦克病毒、人乳头瘤病毒、HIV、RNA-噬菌体、Qβ-噬菌体(例如外壳蛋白)、GA-噬菌体、fr-噬菌体、AP205噬菌体和Ty(例如逆转录转座子Ty蛋白pl)。参考文献43-48进一步讨论了VLP。例如，参考文献49进一步讨论了病毒体。

E.细菌或微生物衍生物

适用于本发明的佐剂包括细菌或微生物衍生物，例如肠细菌脂多糖(LPS)的无毒衍生物、脂质A衍生物、免疫刺激性寡核苷酸和ADP-核糖基化毒素和它们的解毒衍生物。

LPS的无毒衍生物包括单磷酰基脂质A(MPL)和3-O-脱酰基MPL(3dMPL)。3dMPL是具有4、5或6条酰化链的3脱-O-酰化单磷酰基脂质A的混合物。参考文献50公开了3脱-O-酰化单磷酰基脂质A的优选“小颗粒”形式。3dMPL的这种“小颗粒”足够小从而可经0.22μm膜无菌过滤[50]。其它无毒的LPS衍生物包括单磷酰基脂质A模拟物，例如氨基烷基氨基葡糖苷磷酸酯衍生物，如RC-529[51，52]。

脂质A衍生物包括大肠杆菌(Escherichia coli)的脂质A的衍生物，例如OM-174。例如，OM-174描述于参考文献53和54。

适合用作本发明佐剂的免疫刺激性寡核苷酸包括含有CpG基序(含有通过磷酸键与鸟苷相连的未甲基化胞嘧啶的二核苷酸序列)的核苷酸序列。含有回文或聚(dG)序列的双链RNA和寡核苷酸也显示具有免疫刺激性。

CpG可含有核苷酸修饰/类似物，例如硫代磷酸酯修饰并且可以是双链或单链的。参考文献55、56和57公开了可能的类似物取代，例如用2′-脱氧-7-脱氮鸟苷取代鸟苷。参考文献58-63进一步讨论了CpG寡核苷酸作为佐剂的作用。

CpG序列可涉及TLR9，例如基序GTCGTT或TTCGTT[64]。CpG序列，例如CpG-A ODN可特异地诱导Th1免疫应答，或者，例如CpG-B ODN更特异地诱导B细胞应答。参考文献65-67讨论了CpG-A和CpG-B ODN。CpG优选是CpG-A ODN。

优选将CpG寡核苷酸构建为5’端易于为受体识别。两条CpG寡核苷酸序列任选在它们的3’端相连以形成“免疫聚合物”(immunomer)。参见，例如参考文献64和68-70。

细菌ADP-核糖基化毒素及其解毒衍生物可用作本发明的佐剂。蛋白质优选源自大肠杆菌(大肠杆菌热不稳定肠毒素“LT”)、霍乱(病毒)(“CT”)或百日咳(病毒)(“PT”)。参考文献71描述了解毒的ADP-核糖基化毒素用作粘膜佐剂，参考文献72描述了其用作胃肠外佐剂。毒素或类毒素优选为含有A和B亚基的全毒素形式。A亚基优选含有解毒性突变；B亚基优选未突变。佐剂优选是解毒的LT突变体，例如LT-K63、LT-R72和LT-G192。ADP-核糖基化毒素及其解毒衍生物，特别是LT-K63和LT-R72作为佐剂的应用见参考文献73-80。氨基酸取代的数字基准优选以参考文献81所述的ADP-核糖基化毒素的A和B亚基比对为基础，该文献专门全文纳入本文作为参考。

F.人免疫调节剂

适合用作本发明佐剂的人免疫调节剂包括细胞因子，例如白介素(如，IL-1、IL-2、IL-4、IL-5、IL-6、IL-7、IL-12[82]等)[83]、干扰素(如，干扰素-γ)、巨噬细胞集落刺激因子和肿瘤坏死因子。

G.生物粘合剂和粘膜粘合剂

生物粘合剂(bioadhesive)和粘膜粘合剂(mucoadhesive)也可用作本发明的佐剂。合适的生物粘合剂包括酯化的透明质酸微球[84]，或者粘膜粘合剂，例如聚(丙烯酸)的交联衍生物、聚乙烯醇、聚乙烯吡咯烷酮、多糖和羧甲基纤维素。壳多糖及其衍生物也可用作本发明的佐剂[85]。

H.微粒

微粒也可用作本发明的佐剂。可从生物可降解和无毒的材料(例如，聚(α-羟酸)、聚羟基丁酸、聚原酸酯、聚酐、聚己酸内酯等)，优选聚(丙交酯-共-乙交酯)形成微粒(即，直径约100nm到150μm，优选约200nm到约30μm，最优选约500nm到约10μm的颗粒)，任选将这些微粒处理成带负电的表面(例如，用SDS)或带正电的表面(例如，用阳离子去污剂，如CTAB)。

I.脂质体(参考文献33的第13和14章)

适合用作佐剂的脂质体制剂的例子描述于参考文献86-88。

J.聚氧乙烯醚或聚氧乙烯酯制剂

适用于本发明的佐剂包括聚氧乙烯醚和聚氧乙烯酯[89]。这种制剂还包括联用辛苯聚醇的聚氧乙烯山梨糖醇酯表面活性剂[90]，以及联用至少一种其它非离子表面活性剂(例如辛苯聚醇)的聚氧乙烯烷基醚或酯表面活性剂[91]。优选的聚氧乙烯醚选自：聚氧乙烯-9-月桂基醚(laureth 9)、聚氧乙烯-9-硬脂酰基(steoryl)醚、聚氧乙烯-8-硬脂酰基(steoryl)醚、聚氧乙烯-4-月桂基醚、聚氧乙烯-35-月桂基醚和聚氧乙烯-23-月桂基醚。

K.聚磷腈(PCPP)

PCPP制剂描述于，例如参考文献92和93中。

L.胞壁酰基肽

适合用作本发明佐剂的胞壁酰基肽的例子包括N-乙酰基-胞壁酰基-L-苏氨酰基-D-异谷氨酰胺(thr-MDP)、N-乙酰基-去甲胞壁酰基(normuramyl)-L-丙氨酰基-D-异谷氨酰胺(nor-MDP)和N-乙酰基胞壁酰基-L-丙氨酰基-D-异谷氨酰胺-L-丙氨酸-2-(1′-2′-二棕榈酰基-sn-甘油基-3-羟基磷酰氧基)-乙胺(MTP-PE)。

M.咪唑并喹诺酮化合物

适合用作本发明佐剂的咪唑并喹诺酮化合物包括参考文献94和95中进一步描述的咪喹莫特(Imiquamod)及其同系物(例如，“雷西喹莫特(Resiquimod)3M”)。

本发明也包括联用一种或多种以上所述的佐剂的各方面。例如，以下佐剂组合物可用于本发明：(1)皂苷和水包油乳剂[96]；(2)皂苷(例如QS21)+无毒的LPS衍生物(例如3dMPL)[97]；(3)皂苷(例如QS21)+无毒的LPS衍生物(例如3dMPL)+胆固醇；(4)皂苷(例如QS21)+3dMPL+IL-12(任选+固醇)[98]；(5)联用3dMPL与例如QS21和/或水包油乳剂[99]；(6)含有10％角鲨烯、0.4％吐温80^TM、5％普朗尼克嵌段聚合物L121和thr-MDP的SAF，微流化为亚微米乳剂或搅拌(vortex)产生较大粒度的乳剂；(7)Ribi^TM佐剂系统(RAS)，(Ribi Immunochem)，其中含有2％角鲨烯、0.2％吐温80和一种或多种选自单磷酸酰脂质A(monophosphorylipid A)(MPL)、海藻糖二分枝菌酸酯(TDM)和细胞壁骨架(CWS)，优选MPL+CWS(Detox^TM)的细菌细胞壁组分；和(8)一种或多种矿物盐(例如铝盐)+LPS的无毒衍生物(例如3dMPL)。

参考文献33的第7章公开了用作免疫刺激剂的其它物质。

特别优选用氢氧化铝或磷酸铝佐剂，抗原通常吸附到这些盐上。磷酸钙是另一种优选的佐剂。

本发明组合物的pH优选6到8，更优选约7。可用缓冲液维持稳定的pH。当组合物含有氢氧化铝盐时，优选用组氨酸缓冲液[100]。组合物可以是无菌和/或无热源的。组合物相对于人体可以是等渗的。

组合物可存在于小瓶中，或者它们可以存在于预填充注射器中。注射器可装有或不装有针头。注射器含有单剂量的组合物，而小瓶可以含有单剂量或多次剂量。可注射组合物通常可以是液体溶液或悬液。或者，它们可以固体形式(例如，冻干的)存放，在注射前用液体载体配制成溶液或悬液。

组合物可以包装为单位剂量或多剂量形式。就多剂量形式而言，小瓶优于预填充的注射器。可常规确定有效的剂量体积，但用于注射组合物的典型人用剂量体积是0.5ml。

当本发明组合物要在使用前临时配制(例如当组分以冻干形式存在时)并以试剂盒形式存在时，该试剂盒可含有两个小瓶，或者可以含有一个预填充注射器和一个小瓶，在注射前用注射器的内含物再活化小瓶的内含物。

用作疫苗的免疫原性组合物含有免疫有效量的抗原以及任何其它组分(如果需要)。“免疫有效量”表示给予个体的用量，其无论是单剂量或是一系列剂量的一部分均能有效地治疗或预防。该用量取决于待治疗个体的健康和身体状况、待治疗个体的年龄、分类学组(例如，非人灵长类、灵长类等)、个体的免疫系统合成抗体的能力、所需保护的程度、疫苗的配制、治疗医生对医学情况的评估和其它相关因素而不同。期望该用量有可通过常规试验确定的相对较宽的范围，每剂量中各脑膜炎球菌糖抗原的典型用量是每种抗原1μg到10mg。

药学应用

本发明也提供治疗患者的方法，包括给予患者治疗有效量的本发明组合物。患者自身可处于患病风险中或者可以是妊娠期的妇女(“母体免疫”)。

本发明提供用作药物(例如，作为免疫原性组合物或疫苗)或诊断试剂的本发明核酸、多肽或抗体。本发明也提供本发明核酸、多肽或抗体在制备以下物质中的应用：(i)用于治疗或预防流感嗜血杆菌所致的疾病和/或感染的药物；(ii)检测流感嗜血杆菌或流感嗜血杆菌所引起的抗体是否存在的诊断试剂；和/或(iii)可产生抗流感嗜血杆菌的抗体的试剂。但所述流感嗜血杆菌血清型或菌株优选是不可分型的流感嗜血杆菌。所述疾病可以是，例如中耳炎(包括急性中耳炎)、支气管炎、结膜炎、鼻窦炎、尿路感染、肺炎、菌血症、脓毒性关节炎、会厌炎、肺炎、脓胸、心包炎、蜂窝织炎、骨髓炎、下呼吸道感染或脑膜炎。本发明可特别用于预防中耳发炎，其通过引发免疫应答来阻止细菌从喉部经耳咽管向中耳转移然后在中耳寄居。

患者优选是人。当疫苗是预防性应用时，人优选儿童(例如，幼儿或婴儿)；当疫苗是治疗性应用时，人优选成年人。用于儿童的疫苗也可给予成年人，例如来评估安全性、剂量、免疫原性等。

检测治疗性治疗的疗效的一种方式包括给予本发明组合物后监测NTHi感染。检测预防性治疗的疗效的一种方式包括给药后监测针对所给予多肽的免疫应答。可通过将本发明组合物给予测试对象(例如，12-16个月大的儿童，或动物模型[例如，毛丝鼠模型[146]])，然后测定标准参数(包括IgG的ELISA滴度(GMT))来测定其免疫原性。一般可在给予组合物约4周后测定这些免疫应答，并将其与给予组合物之前测定的值相比较。当给予多剂量的组合物时，可作多次给药后测定。

给予多肽抗原是诱导免疫力的优选治疗方法。给予本发明抗体是另一优选治疗方法。此被动免疫方法特别可用于新生儿或妊娠期妇女。此方法一般使用人源化或完全是人的单克隆抗体。

本发明组合物一般直接给予患者。可通过胃肠外注射(例如，皮下、腹膜内、静脉内、肌肉内或注射到组织的胞间隙中)，或通过直肠、口服、阴道、局部、透皮、鼻内、眼部、耳部、肺部或其它粘膜给药来实现直接递送。优选通过肌肉内给予至大腿或上肢。可通过针头(例如，皮下注射针头)进行注射，但或者也可采用无针头注射。典型的肌肉内注射剂量是0.5ml。

本发明可用于引发全身性和/或粘膜免疫力。

剂量治疗可以是单剂量方案或多剂量方案。多剂量(方案)可用于初次免疫方案和/或加强免疫方案。初次剂量方案后可以是加强剂量方案。可常规测定引发剂量之间(例如，4-16周)与引发和加强之间合适的时间间隔。

细菌感染影响身体的各个区域，因此可将组合物制备为各种形式。例如，可将组合物制备为可注射的，如液体溶液或悬液。也可制备适合于在注射前溶解或悬浮在液体载体中的固体形式(例如，冻干组合物)。可将组合物制备为局部给药的，例如软膏、乳膏或粉末。可将组合物制备为用于口服给药的，例如片剂或胶囊，或糖浆(任选加入调味剂)。可将组合物制备为肺部给药的，例如利用细粉或喷雾的吸入剂。可将组合物制备为栓剂或阴道栓。可将组合物制备为鼻部、耳部或眼部给药的，例如喷剂、滴剂、凝胶或粉末[例如，参考文献101和102]。

组合

在实施例所述的＞2500种蛋白质中，NTH0861、NTH0863、NTH0865和NTH0867是本发明特别优选使用的(特别是用于疫苗中)，这四种蛋白质可联用。因此，本发明提供含有以下组分的组合物：(a)NTH0861蛋白；和(b)至少一种其它NTHi蛋白。本发明也提供含有以下组分的组合物：(a)NTH0863蛋白；和(b)至少一种其它NTHi蛋白。本发明也提供含有以下组分的组合物：(a)NTH0865蛋白；和(b)至少一种其它NTHi蛋白。本发明也提供含有以下组分的组合物：(a)NTH0867蛋白；和(b)至少一种其它NTHi蛋白。可从上述本发明蛋白质中选择其它NTHi蛋白。

宜在这四种蛋白内选择组合，因此本发明提供含有NTH0861、NTH0863、NTH0865和/或NTH0867中两种或两种以上(即，2、3或4)的组合物。优选的组合物含有：(1)NTH0861和NTH0863；(2)NTH0861和NTH0865；(3)NTH0861和NTH0867；(4)NTH0863和NTH0865；(5)NTH0863和NTH0867；(6)NTH0865和NTH0867；(7)NTH0861、NTH0863和NTH0865；(8)NTH0861、NTH0863和NTH0867；(9)NTH0863、NTH0865和NTH0867；(10)NTH0861、NTH0865和NTH0867；(11)NTH0861、NTH0863，NTH0865和NTH0867。

NTH0861蛋白优选含有SEQ ID NO：1566、SEQ ID NO：5095，或者与SEQ ID NO：1566和/或SEQ ID NO：5095具有序列相同性(如上所述)的氨基酸序列。NTH0863蛋白优选含有SEQ ID NO：1570、SEQ ID NO：5094，或者与SEQ ID NO：1570和/或SEQ ID NO：5094具有序列相同性(如上所述)的氨基酸序列。NTH0865蛋白优选含有SEQ ID NO：1574、SEQ ID NO：5093，或者与SEQ ID NO：1574和/或SEQ ID NO：5093具有序列相同性(如上所述)的氨基酸序列。NTH0867蛋白优选含有SEQ ID NO：1578、SEQ IDNO：5092，或者与SEQ ID NO：1578和/或SEQ ID NO：5092具有序列相同性(如上所述)的氨基酸序列。

本发明组合物的其它抗原性组分

本发明也提供含有本发明多肽和以下一种或多种其它抗原的组合物：

-脑膜炎奈瑟球菌(N.meningitidis)血清群A、C、W135和/或Y的糖抗原(优选所有四种)，例如参考文献103所公开的血清群C的寡糖[也参见参考文献104]或参考文献105(所述)的寡糖。

-肺炎链球菌(Streptococcus pneumoniae)的糖抗原[例如，106、107、108]。

-甲肝病毒的抗原，例如灭活的病毒[例如109、110]。

-乙肝病毒的抗原，例如表面抗原和/或核心抗原[例如，110、111]。

-白喉抗原，例如白喉类毒素[例如，参考文献112的第3章]，例如CRM₁₉₇突变体[例如113]。

-破伤风抗原，例如破伤风类毒素[例如，参考文献112的第4章]。

-百日咳博得特菌(Bordetella pertussis)的抗原，例如百日咳全毒素(PT)和百日咳博得特菌的丝状血细胞凝集素(FHA)，也任选与百日咳杆菌粘附素和/或凝集原2和3联用[例如，参考文献114和115]。

-流感嗜血杆菌B的糖抗原[例如104]。

-脊髓灰质炎抗原[例如，116、117]，例如IPV。

-麻疹、腮腺炎和/或风疹抗原[例如，参考文献112的第9、10和11章]。

-流感抗原[例如参考文献112的第19章]，例如血细胞凝集素和/或神经氨酸酶表面蛋白。

-粘膜炎莫拉菌(Moraxella catarrhalis)的抗原[例如118]。

-无乳链球菌(Streptococcus agalactiae)(B群链球菌)的蛋白质抗原[例如119、120]。

-无乳链球菌(B群链球菌)的糖抗原。

-酿脓链球菌(Streptococcus pyogenes)(A群链球菌)的抗原[例如120、121、122]。

-金黄色葡萄球菌(Staphylococcus aureus)的抗原[例如123]。

组合物可含有一种或多种这些其它抗原。

如果需要，可使毒性蛋白质抗原解毒(例如，通过化学和/或遗传学方法使百日咳病毒解毒[115])。

当组合物中含有白喉抗原时，其也优选含有破伤风抗原和百日咳抗原。类似地，当含有破伤风抗原时，其也优选含有白喉抗原和百日咳抗原。类似地，当含有百日咳抗原时，其也优选含有白喉抗原和破伤风抗原。因此优选DTP组合。

糖抗原优选偶联物形式。偶联物的运载体蛋白包括白喉毒素、破伤风毒素、脑膜炎奈瑟球菌外膜蛋白[124]、合成肽[125，126]、热激蛋白[127，128]、百日咳蛋白[129，130]、流感嗜血杆菌的D蛋白[131]、细胞因子[132]、淋巴因子[132]、链球菌蛋白、激素[132]、生长因子[132]、艰难梭菌(C.difficile)的毒素A或B[133]、铁摄取蛋白(iron-uptake protein)[134]等。优选的运载体蛋白是CRM197白喉类毒素[135]。

组合物中抗原的浓度一般至少是1μg/ml。任何给定抗原的浓度通常足以引发针对该抗原的免疫应答。

作为在本发明免疫原性组合物中使用蛋白质抗原的替代方式，也可用编码抗原的核酸(优选DNA，例如质粒形式)。

抗原优选吸附至铝盐。

筛选方法

本发明提供测定某检验化合物是否与本发明多肽相结合的方法。如果某检验化合物与本发明多肽相结合并且此结合抑制了流感嗜血杆菌细菌的生命周期，则该检验化合物能用作抗生素或用作前导化合物来设计抗生素。所述方法通常包括使某检验化合物与本发明多肽相接触，并测定该检验化合物是否与所述多肽相结合。用于这些方法的本发明优选多肽是酶(例如，tRNA合成酶)、膜转运蛋白与核糖体多肽。合适的检验化合物包括多肽、多肽、碳水化合物、脂质、核酸(例如，DNA、RNA及其修饰的形式)以及小的有机化合物(例如，分子量在200和2000Da之间)。这些检验化合物可以单独提供，但通常是作为文库的一部分(例如，组合文库)。监测结合相互作用的方法包括NMR、过滤器结合试验、凝胶延迟试验、取代试验、表面等离子共振、反向双杂交等。可通过使某化合物与GBS细菌相接触，然后监测对生长的抑制情况来检验与本发明多肽相结合的该化合物的抗生素活性。本发明也提供采用这些方法鉴定的化合物。

所述方法优选包括以下步骤：(a)使本发明多肽与一种或多种候选化合物相接触从而得到混合物；(b)温育该混合物以使多肽与候选化合物相互作用；和(c)评估候选化合物是否与所述多肽相结合或调节了其活性。

一旦候选化合物在体外鉴定为能与本发明多肽相结合，需要进行其它试验来证实该化合物在体内抑制细菌生长和/或存活的功能。因此所述方法包括使该化合物与NTHi细菌相接触并评估其效力的其它步骤。

用于筛选方法的多肽可以是溶液中游离的、固定于固体支持物的、位于细胞表面或位于胞内。优选通过直接或间接与候选化合物相连的标记来检测候选化合物与多肽的结合情况。标记可以是荧光团、放射性同位素或其它可检测标记。

概要

本发明提供含有序列表中的一条或多条序列的计算机可读介质(例如，软盘、硬盘、CD-ROM、DVD等)和/或计算机存储器和/或计算机数据库。

术语“含有”包括“包含”以及“组成”，例如“含有”X的组合物可仅由X组成或可包含其它的物质，例如X+Y。

与数值x相关的术语“约”表示，例如x±10％。

“基本上”不排除“完全”，例如“基本上无”Y的组合物可完全无Y。“基本上”可视需要从本发明定义中省去。

序列表中氨基酸序列的N-末端残基是相应核苷酸序列的第一密码子所编码的氨基酸。在第一密码子不是ATG的情况中，应该理解当该密码子是起始密码子时应翻译为甲硫氨酸，但当序列在融合伴侣的C-末端时翻译为所示的非Met。本发明具体公开并包括序列表中用N-末端甲硫氨酸残基(例如，甲酰基-甲硫氨酸残基)代替任何所示非Met残基的各条氨基酸序列。

生物学中可采用其它可选的起始密码子。序列表中的氨基酸残基序列基于具体的起始密码子，但或者可用下游起始密码子。因此，本发明具体公开并包括序列表中所示始于N-末端残基下游序列的任何甲硫氨酸残基的各条氨基酸序列(例如，SEQ ID NO：5088、5089和5090)。

如上所述，本发明的核酸与多肽可包括以下序列：

(a)与序列表所公开的序列相同的序列(即，100％相同)；

(b)与序列表所公开序列具有序列相同性的序列；

(c)与(a)或(b)所述序列相比，具有1、2、3、4、5、6、7、8、9或10个单核苷酸或氨基酸改变(缺失、插入、取代)的序列，这些改变可以位于分开的或是连续的位置；和

(d)当采用配对比对算法与序列表的具体序列进行比对时，x个单体(氨基酸或核苷酸)的移动窗(moving window)从起始端(N-末端或5’)向末端(C-末端或3’)移动，从而比对延伸至p个单体(当p＞x时)时，共有p-x+1个这样的窗，每个窗具有至少x·y个相同的比对单体，其中：x选自20、25、30、35、40、45、50、60、70、80、90、100、150、200；y选自0.50、0.60、0.70、0.75、0.80、0.85、0.90、0.91、0.92、0.93、0.94、0.95、0.96、0.97、0.98、0.99；和如果x·y不是整数则将其四舍五入为最接近的整数。优选的配对比对算法是Needleman-Wunsch球形比对算法(global alignment algorithm)[136]，其采用默认参数(例如，空格开放罚分＝10.0，空格延伸罚分＝0.5，采用EBLOSUM62评分矩阵)。此算法可采用EMBOSS软件包中的needle工具方便地执行[137]。

本发明核酸和多肽在(a)到(d)所述这些序列的N-末端/5’和/或C-末端/3’还可具有其它序列。

除非另有指出，实施本发明可采用本领域技术人员已知的常规化学、生物化学、分子生物学、免疫学和药学方法。参考文献中全面解释了这些技术。参见，例如参考文献138-145等。

实施本发明的方式

对低传代(low-passage)临床NTHi分离物(菌株86-028NP[146])进行了基因组测序。在基因组中总共鉴定了2540条编码序列，这些序列与它们推测的翻译产物一起示于序列表中。多肽序列中1489条序列的注释见表III。从测序材料中选择特别感兴趣的编码多肽的序列用于进一步研究，特别关注可用于疫苗开发的免疫原性蛋白质。

脂蛋白

在2540条编码序列中，以下39条鉴定为脂蛋白：NTH0094、NTH0163、NTH0167、NTH0255、NTH0289、NTH0838、NTH0909、NTH0997、NTH1000、NTH1016、NTH1174、NTH1298、NTH1313、NTH1413、NTH1416、NTH1552、NTH1623、NTH1675、NTH1680、NTH1739、NTH1873、NTH1922、NTH1942、NTH1974、NTH2142、NTH2169、NTH2251、NTH2349、NTH2356、NTH2358、NTH2524、NTH2588、NTH2595、NTH2641、NTH2673、NTH2715、NTH2754、NTH2758和NTH2769。脂蛋白暴露于表面，因此它们代表了可接近的免疫学靶位，例如用于诊断和免疫接种目的。此外，发现布氏疏螺旋体(B.burgdorferi)[147]中脂质化形式的OspA蛋白是免疫原性的，但非脂质化形式则无免疫原性，作者得出结论：翻译后的脂质连接是OspA免疫原性的关键决定因素。

外膜

因为流感嗜血杆菌是革兰阴性细菌，其细胞壁包含外膜。在2540条编码序列中，鉴定到以下48条位于此外膜中：NTH0017、NTH0193、NTH0227、NTH0241、NTH0252、NTH0270、NTH0283、NTH0432、NTH0498、NTH0502、NTH0504、NTH0512、NTH0539、NTH0638、NTH0647、NTH0648、NTH0788、NTH0839、NTH0867、NTH0914、NTH1054、NTH1075、NTH1082、NTH1200、NTH1203、NTH1214、NTH1290、NTH1390、NTH1582、NTH1652、NTH1666、NTH1744、NTH1819、NTH1845、NTH1900、NTH1953、NTH1956、NTH1958、NTH1962、NTH2039、NTH2232、NTH2234、NTH2235、NTH2269、NTH2448、NTH2484、NTH2493和NTH2727。外膜蛋白(OMP)暴露于表面，因此它们代表了可接近的免疫学靶位，例如用于诊断和免疫接种目的。OMP往往是侵染素、粘附素等，如果能阻断它则可提供一种防止细菌感染的方法。

NTH1845是Aida-样自我转运蛋白(“Lav”)，是本发明优选的蛋白。在NTHi各菌株(包括已知导致脑膜炎的一种菌株)之间该蛋白具有保守性，但在Rd序列或菌株R2846中无相应的基因。其位于tmk和holb基因中。NTH1845的优选形式始于Met-22(即，SEQ ID NO：5090)。

周质

因为流感嗜血杆菌是革兰阴性细菌，其在细胞质膜和外膜之间具有周质。在2540条编码序列中，鉴定到以下105条位于周质中：NTH0014、NTH0049、NTH0057、NTH0059、NTH0106、NTH0119、NTH0120、NTH0132、NTH0174、NTH0190、NTH0206、NTH0244、NTH0346、NTH0405、NTH0421、NTH0468、NTH0485、NTH0513、NTH0547、NTH0619、NTH0643、NTH0661、NTH0691、NTH0738、NTH0820、NTH0835、NTH0848、NTH0849、NTH0856、NTH0861、NTH0863、NTH0865、NTH0910、NTH0926、NTH0961、NTH1015、NTH1018、NTH1121、NTH1164、NTH1185、NTH1190、NTH1261、NTH1268、NTH1301、NTH1311、NTH1388、NTH1394、NTH1406、NTH1407、NTH1414、NTH1435、NTH1468、NTH1541、NTH1570、NTH1600、NTH1601、NTH1619、NTH1622、NTH1724、NTH1745、NTH1773、NTH1781、NTH1798、NTH1807、NTH1829、NTH1865、NTH1871、NTH1892、NTH1897、NTH1916、NTH1917、NTH1965、NTH1999、NTH2116、NTH2119、NTH2133、NTH2135、NTH2149、NTH2150、NTH2187、NTH2217、NTH2227、NTH2256、NTH2258、NTH2277、NTH2291、NTH2316、NTH2342、NTH2344、NTH2369、NTH2394、NTH2432、NTH2434、NTH2451、NTH2496、NTH2508、NTH2537、NTH2541、NTH2572、NTH2575、NTH2610、NTH2705、NTH2726、NTH2738和NTH2778。周质蛋白代表了有用的免疫学靶位，例如用于诊断和免疫接种目的。

内膜

因为流感嗜血杆菌是革兰阴性细菌，其具有内膜。在2540条编码序列中，鉴定到以下740条位于此内膜中：NTH0002、NTH0015、NTH0019、NTH0020、NTH0021、NTH0025、NTH0032、NTH0034、NTH0035、NTH0041、NTH0043、NTH0045、NTH0048、NTH0050、NTH0052、NTH0060、NTH0061、NTH0067、NTH0073、NTH0076、NTH0085、NTH0089、NTH0091、NTH0097、NTH0107、NTH0110、NTH0116、NTH0118、NTH0121、NTH0128、NTH0134、NTH0135、NTH0151、NTH0155、NTH0157、NTH0158、NTH0180、NTH0184、NTH0185、NTH0186、NTH0189、NTH0199、NTH0203、NTH0208、NTH0209、NTH0223、NTH0224、NTH0228、NTH0232、NTH0237、NTH0238、NTH0242、NTH0247、NTH0248、NTH0251、NTH0253、NTH0254、NTH0256、NTH0263、NTH0269、NTH0278、NTH0279、NTH0280、NTH0290、NTH0295、NTH0297、NTH0302、NTH0307、NTH0311、NTH0317、NTH0320、NTH0321、NTH0325、NTH0326、NTH0333、NTH0334、NTH0341、NTH0347、NTH0351、NTH0352、NTH0353、NTH0356、NTH0358、NTH0366、NTH0371、NTH0372、NTH0388、NTH0397、NTH0400、NTH0401、NTH0402、NTH0407、NTH0411、NTH0412、NTH0417、NTH0418、NTH0420、NTH0426、NTH0427、NTH0434、NTH0435、NTH0437、NTH0444、NTH0453、NTH0455、NTH0457、NTH0459、NTH0460、NTH0461、NTH0462、NTH0463、NTH0465、NTH0469、NTH0473、NTH0475、NTH0478、NTH0484、NTH0489、NTH0490、NTH0493、NTH0496、NTH0507、NTH0509、NTH0518、NTH0524、NTH0526、NTH0528、NTH0529、NTH0544、NTH0545、NTH0549、NTH0565、NTH0566、NTH0574、NTH0580、NTH0581、NTH0584、NTH0585、NTH0586、NTH0587、NTH0590、NTH0617、NTH0618、NTH0622、NTH0624、NTH0626、NTH0630、NTH0636、NTH0637、NTH0642、NTH0644、NTH0646、NTH0654、NTH0656、NTH0658、NTH0673、NTH0675、NTH0676、NTH0677、NTH0678、NTH0680、NTH0694、NTH0696、NTH0702、NTH0703、NTH0706、NTH0709、NTH0710、NTH0712、NTH0715、NTH0718、NTH0728、NTH0730、NTH0740、NTH0744、NTH0745、NTH0749、NTH0750、NTH0755、NTH0762、NTH0764、NTH0765、NTH0771、NTH0774、NTH0794、NTH0795、NTH0796、NTH0797、NTH0798、NTH0802、NTH0803、NTH0804、NTH0813、NTH0814、NTH0815、NTH0821、NTH0822、NTH0827、NTH0829、NTH0834、NTH0836、NTH0850、NTH0851、NTH0852、NTH0858、NTH0872、NTH0874、NTH0875、NTH0880、NTH0887、NTH0888、NTH0894、NTH0904、NTH0913、NTH0927、NTH0928、NTH0941、NTH0948、NTH0949、NTH0950、NTH0952、NTH0953、NTH0955、NTH0964、NTH0968、NTH0973、NTH0986、NTH0987、NTH0989、NTH0994、NTH0996、NTH1002、NTH1003、NTH1004、NTH1005、NTH1009、NTH1010、NTH1012、NTH1020、NTH1021、NTH1026、NTH1028、NTH1031、NTH1032、NTH1037、NTH1039、NTH1042、NTH1043、NTH1048、NTH1052、NTH1058、NTH1063、NTH1064、NTH1069、NTH1073、NTH1080、NTH1083、NTH1084、NTH1085、NTH1086、NTH1087、NTH1089、NTH1090、NTH1091、NTH1092、NTH1098、NTH1102、NTH1103、NTH1104、NTH1106、NTH1123、NTH1124、NTH1125、NTH1130、NTH1138、NTH1141、NTH1150、NTH1151、NTH1178、NTH1181、NTH1184、NTH1188、NTH1189、NTH1191、NTH1192、NTH1193、NTH1201、NTH1205、NTH1216、NTH1220、NTH1221、NTH1224、NTH1225、NTH1226、NTH1229、NTH1230、NTH1231、NTH1233、NTH1234、NTH1236、NTH1238、NTH1240、NTH1241、NTH1250、NTH1252、NTH1254、NTH1255、NTH1256、NTH1262、NTH1273、NTH1275、NTH1279、NTH1280、NTH1281、NTH1282、NTH1283、NTH1286、NTH1287、NTH1293、NTH1295、NTH1297、NTH1300、NTH1302、NTH1305、NTH1306、NTH1307、NTH1308、NTH1309、NTH1315、NTH1319、NTH1321、NTH1327、NTH1332、NTH1334、NTH1336、NTH1337、NTH1341、NTH1346、NTH1348、NTH1354、NTH1357、NTH1359、NTH1363、NTH1365、NTH1368、NTH1374、NTH1376、NTH1379、NTH1380、NTH1383、NTH1391、NTH1393、NTH1398、NTH1400、NTH1411、NTH1412、NTH1420、NTH1421、NTH1425、NTH1427、NTH1428、NTH1429、NTH1430、NTH1431、NTH1434、NTH1437、NTH1438、NTH1439、NTH1447、NTH1448、NTH1450、NTH1454、NTH1455、NTH1464、NTH1467、NTH1470、NTH1471、NTH1472、NTH1473、NTH1474、NTH1479、NTH1491、NTH1492、NTH1493、NTH1495、NTH1500、NTH1503、NTH1506、NTH1510、NTH1515、NTH1525、NTH1526、NTH1527、NTH1528、NTH1531、NTH1532、NTH1537、NTH1538、NTH1540、NTH1548、NTH1559、NTH1562、NTH1567、NTH1569、NTH1573、NTH1575、NTH1581、NTH1584、NTH1586、NTH1587、NTH1588、NTH1590、NTH1594、NTH1597、NTH1599、NTH1602、NTH1605、NTH1606、NTH1608、NTH1609、NTH1617、NTH1618、NTH1620、NTH1621、NTH1625、NTH1629、NTH1631、NTH1634、NTH1637、NTH1638、NTH1653、NTH1654、NTH1657、NTH1662、NTH1664、NTH1668、NTH1671、NTH1686、NTH1687、NTH1688、NTH1689、NTH1690、NTH1692、NTH1693、NTH1698、NTH1701、NTH1707、NTH1712、NTH1718、NTH1719、NTH1722、NTH1725、NTH1729、NTH1732、NTH1735、NTH1760、NTH1767、NTH1770、NTH1778、NTH1779、NTH1782、NTH1783、NTH1788、NTH1793、NTH1795、NTH1796、NTH1799、NTH1803、NTH1805、NTH1806、NTH1813、NTH1815、NTH1820、NTH1824、NTH1828、NTH1835、NTH1836、NTH1842、NTH1849、NTH1850、NTH1859、NTH1861、NTH1870、NTH1872、NTH1881、NTH1882、NTH1885、NTH1888、NTH1889、NTH1891、NTH1896、NTH1898、NTH1899、NTH1906、NTH1908、NTH1919、NTH1923、NTH1925、NTH1927、NTH1935、NTH1939、NTH1941、NTH1951、NTH1960、NTH1963、NTH1966、NTH1967、NTH1968、NTH1978、NTH1981、NTH1986、NTH1992、NTH1993、NTH1995、NTH1996、NTH1997、NTH1998、NTH2001、NTH2005、NTH2008、NTH2009、NTH2010、NTH2024、NTH2025、NTH2038、NTH2040、NTH2041、NTH2043、NTH2050、NTH2052、NTH2055、NTH2060、NTH2062、NTH2064、NTH2065、NTH2070、NTH2071、NTH2073、NTH2078、NTH2079、NTH2081、NTH2083、NTH2089、NTH2091、NTH2092、NTH2093、NTH2094、NTH2095、NTH2096、NTH2097、NTH2099、NTH2101、NTH2112、NTH2115、NTH2118、NTH2120、NTH2122、NTH2126、NTH2128、NTH2129、NTH2130、NTH2131、NTH2136、NTH2138、NTH2145、NTH2146、NTH2162、NTH2163、NTH2166、NTH2169、NTH2170、NTH2173、NTH2181、NTH2183、NTH2191、NTH2193、NTH2195、NTH2196、NTH2200、NTH2204、NTH2205、NTH2209、NTH2213、NTH2226、NTH2228、NTH2231、NTH2242、NTH2243、NTH2247、NTH2250、NTH2253、NTH2257、NTH2259、NTH2262、NTH2263、NTH2266、NTH2273、NTH2274、NTH2282、NTH2284、NTH2285、NTH2288、NTH2292、NTH2296、NTH2299、NTH2318、NTH2323、NTH2324、NTH2326、NTH2327、NTH2333、NTH2343、NTH2346、NTH2347、NTH2352、NTH2361、NTH2364、NTH2365、NTH2368、NTH2370、NTH2371、NTH2376、NTH2377、NTH2381、NTH2382、NTH2388、NTH2398、NTH2402、NTH2405、NTH2406、NTH2407、NTH2408、NTH2414、NTH2422、NTH2430、NTH2433、NTH2438、NTH2447、NTH2455、NTH2457、NTH2458、NTH2472、NTH2478、NTH2481、NTH2486、NTH2495、NTH2497、NTH2498、NTH2499、NTH2501、NTH2505、NTH2525、NTH2531、NTH2532、NTH2533、NTH2534、NTH2542、NTH2543、NTH2545、NTH2546、NTH2548、NTH2549、NTH2550、NTH2552、NTH2554、NTH2556、NTH2557、NTH2558、NTH2562、NTH2566、NTH2567、NTH2568、NTH2569、NTH2570、NTH2573、NTH2577、NTH2578、NTH2587、NTH2591、NTH2593、NTH2597、NTH2600、NTH2602、NTH2603、NTH2604、NTH2605、NTH2612、NTH2613、NTH2615、NTH2616、NTH2618、NTH2626、NTH2633、NTH2640、NTH2647、NTH2648、NTH2649、NTH2650、NTH2661、NTH2663、NTH2664、NTH2667、NTH2668、NTH2674、NTH2675、NTH2680、NTH2690、NTH2701、NTH2702、NTH2703、NTH2708、NTH2711、NTH2724、NTH2725、NTH2732、NTH2735、NTH2740、NTH2743、NTH2749、NTH2750、NTH2755、NTH2756、NTH2757、NTH2764、NTH2765、NTH2774、NTH2777、NTH2779、NTH2781、NTH2793、NTH2794、NTH2796、NTH2797、NTH2798、NTH2806、NTH2807、NTH2813、NTH2814、NTH2823和NTH2824。内膜蛋白代表了有用的免疫学靶位，例如用于诊断和免疫接种目的。

在这些蛋白质中，NTH1069特别鉴定为毒力相关蛋白。此蛋白的优选形式始于Met-27(即，SEQ ID NO：5088)。另一优选形式始于Met-19(SEQ ID NO：5089)。

粘附素

在分离自脑膜炎患者的NTHi菌株中鉴定到具有SEQ ID NO：5091所示氨基酸序列的粘附素。其与脑膜炎奈瑟球菌的Hia粘附素同源。

流感嗜血杆菌Rd

1995年公开了血清型d菌株KW20的基因组序列[1，3]。因为血清型d菌株通常不是病原菌，但测序的NTHi菌株来自临床感染，所表达的、未在血清型d中观察到的NTHi序列可能是参与发病机理的蛋白质。因此，通过抗生素治疗或抗体结合来阻断这些蛋白质具有用于治疗的可能性。在这2540条序列中，以下613条未在Rd基因组中观察到：NTH0001、NTH0002、NTH0004、NTH0005、NTH0012、NTH0016、NTH0021、NTH0022、NTH0024、NTH0032、NTH0033、NTH0034、NTH0035、NTH0036、NTH0037、NTH0038、NTH0040、NTH0045、NTH0050、NTH0051、NTH0052、NTH0053、NTH0064、NTH0089、NTH0092、NTH0097、NTH0101、NTH0104、NTH0110、NTH0114、NTH0122、NTH0123、NTH0124、NTH0125、NTH0129、NTH0135、NTH0136、NTH0138、NTH0140、NTH0146、NTH0148、NTH0151、NTH0153、NTH0154、NTH0159、NTH0161、NTH0164、NTH0169、NTH0173、NTH0176、NTH0177、NTH0187、NTH0191、NTH0192、NTH0193、NTH0194、NTH0195、NTH0197、NTH0198、NTH0199、NTH0226、NTH0235、NTH0236、NTH0238、NTH0250、NTH0251、NTH0254、NTH0255、NTH0256、NTH0264、NTH0265、NTH0278、NTH0279、NTH0280、NTH0282、NTH0283、NTH0284、NTH0285、NTH0289、NTH0297、NTH0298、NTH0299、NTH0300、NTH0302、NTH0307、NTH0308、NTH0310、NTH0312、NTH0313、NTH0319、NTH0327、NTH0328、NTH0331、NTH0334、NTH0335、NTH0339、NTH0341、NTH0348、NTH0363、NTH0371、NTH0375、NTH0378、NTH0379、NTH0384、NTH0385、NTH0396、NTH0407、NTH0408、NTH0411、NTH0417、NTH0419、NTH0420、NTH0424、NTH0429、NTH0430、NTH0431、NTH0432、NTH0433、NTH0434、NTH0435、NTH0438、NTH0455、NTH0478、NTH0484、NTH0485、NTH0486、NTH0487、NTH0488、NTH0489、NTH0498、NTH0500、NTH0501、NTH0506、NTH0509、NTH0510、NTH0511、NTH0520、NTH0523、NTH0526、NTH0527、NTH0531、NTH0534、NTH0536、NTH0539、NTH0559、NTH0561、NTH0573、NTH0577、NTH0579、NTH0580、NTH0581、NTH0582、NTH0583、NTH0584、NTH0585、NTH0586、NTH0588、NTH0599、NTH0603、NTH0604、NTH0606、NTH0615、NTH0617、NTH0631、NTH0637、NTH0644、NTH0645、NTH0653、NTH0662、NTH0663、NTH0664、NTH0667、NTH0668、NTH0673、NTH0677、NTH0680、NTH0681、NTH0683、NTH0687、NTH0690、NTH0691、NTH0692、NTH0694、NTH0695、NTH0696、NTH0706、NTH0707、NTH0711、NTH0715、NTH0716、NTH0717、NTH0721、NTH0724、NTH0725、NTH0726、NTH0728、NTH0729、NTH0730、NTH0749、NTH0752、NTH0756、NTH0768、NTH0776、NTH0792、NTH0797、NTH0818、NTH0827、NTH0832、NTH0839、NTH0841、NTH0843、NTH0844、NTH0862、NTH0864、NTH0866、NTH0867、NTH0877、NTH0879、NTH0885、NTH0886、NTH0892、NTH0895、NTH0896、NTH0900、NTH0901、NTH0904、NTH0906、NTH0921、NTH0924、NTH0928、NTH0929、NTH0930、NTH0931、NTH0932、NTH0933、NTH0937、NTH0938、NTH0942、NTH0949、NTH0953、NTH0955、NTH0961、NTH0964、NTH0970、NTH0971、NTH0972、NTH0973、NTH0985、NTH0987、NTH0991、NTH0992、NTH0993、NTH0994、NTH0995、NTH0996、NTH1007、NTH1016、NTH1017、NTH1020、NTH1025、NTH1026、NTH1027、NTH1028、NTH1029、NTH1037、NTH1040、NTH1049、NTH1067、NTH1069、NTH1070、NTH1073、NTH1082、NTH1086、NTH1089、NTH1090、NTH1108、NTH1111、NTH1112、NTH1114、NTH1115、NTH1116、NTH1122、NTH1129、NTH1131、NTH1142、NTH1149、NTH1150、NTH1153、NTH1157、NTH1159、NTH1161、NTH1162、NTH1176、NTH1178、NTH1179、NTH1193、NTH1195、NTH1196、NTH1204、NTH1205、NTH1207、NTH1208、NTH1209、NTH1210、NTH1211、NTH1214、NTH1216、NTH1220、NTH1225、NTH1234、NTH1235、NTH1237、NTH1241、NTH1244、NTH1245、NTH1246、NTH1247、NTH1248、NTH1249、NTH1250、NTH1251、NTH1252、NTH1253、NTH1270、NTH1271、NTH1294、NTH1299、NTH1313、NTH1315、NTH1316、NTH1325、NTH1330、NTH1333、NTH1337、NTH1339、NTH1342、NTH1353、NTH1361、NTH1367、NTH1374、NTH1375、NTH1381、NTH1382、NTH1390、NTH1391、NTH1395、NTH1396、NTH1399、NTH1414、NTH1415、NTH1418、NTH1419、NTH1437、NTH1441、NTH1454、NTH1456、NTH1471、NTH1474、NTH1487、NTH1489、NTH1490、NTH1491、NTH1492、NTH1493、NTH1494、NTH1495、NTH1496、NTH1497、NTH1504、NTH1516、NTH1540、NTH1543、NTH1555、NTH1563、NTH1564、NTH1567、NTH1571、NTH1573、NTH1574、NTH1580、NTH1587、NTH1598、NTH1599、NTH1600、NTH1601、NTH1602、NTH1603、NTH1605、NTH1606、NTH1607、NTH1611、NTH1612、NTH1615、NTH1616、NTH1626、NTH1627、NTH1628、NTH1647、NTH1656、NTH1657、NTH1658、NTH1676、NTH1677、NTH1687、NTH1697、NTH1702、NTH1703、NTH1713、NTH1734、NTH1740、NTH1742、NTH1744、NTH1745、NTH1748、NTH1749、NTH1751、NTH1752、NTH1753、NTH1754、NTH1755、NTH1756、NTH1757、NTH1758、NTH1759、NTH1760、NTH1765、NTH1769、NTH1770、NTH1778、NTH1798、NTH1804、NTH1811、NTH1812、NTH1815、NTH1816、NTH1817、NTH1818、NTH1820、NTH1821、NTH1822、NTH1829、NTH1832、NTH1833、NTH1837、NTH1842、NTH1845、NTH1854、NTH1857、NTH1904、NTH1910、NTH1914、NTH1916、NTH1920、NTH1921、NTH1922、NTH1945、NTH1946、NTH1947、NTH1948、NTH1956、NTH1962、NTH1964、NTH1968、NTH1989、NTH1994、NTH2019、NTH2031、NTH2035、NTH2043、NTH2056、NTH2060、NTH2069、NTH2075、NTH2093、NTH2096、NTH2109、NTH2110、NTH2112、NTH2113、NTH2114、NTH2117、NTH2156、NTH2159、NTH2170、NTH2197、NTH2198、NTH2199、NTH2206、NTH2207、NTH2215、NTH2217、NTH2219、NTH2220、NTH2221、NTH2222、NTH2223、NTH2226、NTH2229、NTH2245、NTH2273、NTH2284、NTH2287、NTH2305、NTH2309、NTH2315、NTH2316、NTH2323、NTH2326、NTH2330、NTH2332、NTH2343、NTH2349、NTH2353、NTH2362、NTH2363、NTH2364、NTH2386、NTH2414、NTH2442、NTH2451、NTH2455、NTH2456、NTH2457、NTH2458、NTH2460、NTH2461、NTH2463、NTH2464、NTH2466、NTH2467、NTH2468、NTH2471、NTH2480、NTH2481、NTH2482、NTH2483、NTH2484、NTH2485、NTH2486、NTH2487、NTH2488、NTH2500、NTH2510、NTH2524、NTH2525、NTH2527、NTH2528、NTH2536、NTH2537、NTH2549、NTH2562、NTH2563、NTH2572、NTH2573、NTH2575、NTH2584、NTH2585、NTH2590、NTH2604、NTH2607、NTH2608、NTH2609、NTH2635、NTH2647、NTH2648、NTH2650、NTH2655、NTH2664、NTH2668、NTH2679、NTH2684、NTH2693、NTH2694、NTH2696、NTH2697、NTH2703、NTH2704、NTH2706、NTH2707、NTH2708、NTH2709、NTH2710、NTH2711、NTH2712、NTH2713、NTH2715、NTH2716、NTH2718、NTH2719、NTH2720、NTH2721、NTH2723、NTH2724、NTH2725、NTH2726、NTH2727、NTH2729、NTH2730、NTH2731、NTH2737、NTH2744、NTH2753、NTH2778、NTH2781、NTH2783、NTH2784、NTH2785、NTH2791、NTH2804、NTH2806、NTH2809、NTH2810和NTH2816。

NTH0861到NTH0867

发现脑膜炎奈瑟球菌的NMB0419蛋白参与脑膜炎球菌侵入机制[2]。

该蛋白质显示能调节细菌与人呼吸道上皮细胞单层相互作用，从而促进侵入。在流感嗜血杆菌埃及生物群中观察到同源性蛋白BPF001，但未能对此蛋白进行研究。

NTHi基因组包括编码与NMB0419极其相似的四种多肽(NTH0861、NTH0863、NTH0865和NTH0867)的链的区域(SEQ ID NO：5081)。此区域和四种多肽如下所示：

    GCCAGCTTGCTGCCTGCGGTCGACTCTANGAGACCCCTACAACAAAACATAATGCTAAAC

    AAAAAATGTTTGGTTGTTTCAATTGTTGATTAATAAA TGGACGATTTCTATGCGATTCAC

                      (SEQ ID NO：1578) NTH0867       M  R  F T

    AAAAACACTTTTTACCACCGCACTTTTAGGTGCTTCTATCTTTTCTTTTCAATCCACCGC

      K  T L  F  T  T A  L L  G A  S  I F  S  F  Q S  T A

    TTGGGCGGATACGCTGGAACAGCAATTCCAACAAGGTTCTGAAGCCACTACGAGAGGCGA

      W  A D  T  L  E Q  Q F  Q Q  G  S E  A  T  T R  G  D

    TTATCAAACCACCTTTAAATTTTTGTTACCTCTGGCGGAGCAGGGAAATGCAGAGGCTCA

     Y Q  T T  F K  F  L L  P  L  A E  Q G  N  A E  A  Q

     ATTGATGTTGGGCGTGATGTATGCAAGAGGAATAGGCGTCAAACAAGATGATTTTGAAGC

      L  M L  G  V M  Y  A  R G  I G  V  K Q  D  D F  E A

    GGTGAAGTGGTATCGCCAAGCGGCGGAGCAGGGATATGCAAATGCTCAAGCTATATTGGG

     V  K W  Y  R  Q  A  A E  Q  G Y  A  N A  Q  A I  L G

    ATTCTCATATCTTTTAGGACAAAGCGGTGTTCAAGTAAATAAATCTTTAGCCAAAGAATG

     F  S Y  L L  G  Q  S G  V  Q  V N  K S  L  A K  E  W

    GTTTGGTAAGGCTTGTGATAATGGTGATCAAAATGGTTGCGAATATTATGGCAAGTTAAA

     F  G K  A    D  N  G D  Q  N G    E  Y  Y G  K  L N

    TAGAGGGGAGCTCTAATGCCAACTTTACAATGCGAATTTTGGAATGTAGGGCAAGGGTTA

     R  G  E L  *

    TTTTCAAGTGGGCGTATTCAAATGGGAGACGCCCCAGCCTTTCATTGGGTTTATGGTTTG

    CAAGTTCCTCATCATGGTTCAAAGCCAATTTTAGTGAATAAAAATAAAAGATTATCCATT

    CATTCAATTTAAT AGGAAAACAAATGAAACTCACAAAAACACTTCTTACCACCGCACTTT

(SEQ ID NO：1574)NTH0865    M  K  L  T K  T  L L  T T  A  L F

    TCGGTGCTTCTATTTTTTCTTTTCAATCCACCGCTTGGGCGGATACGCCGGAACAGCAAT

       G  A S  I F  S  F Q  S  T A  W  A D  T  P  E Q  Q  F

    TCCAACAAGGTTTAACCGCTTATGAGCAAAGCAACTATCAAACCGCCTTTAAACTTTGGT

      Q  Q G  L  T  A Y  E Q  S  N Y  Q  T A  F K  L  W  L

    TACCTCTGGCGGAGCAGGGAGATGCACAGGCTCAAGGTGGTTTGGGCATGATGTATGAAA

      P L  A  E Q  G  D  A Q  A  Q G  G  L G  M  M Y  E  R

    GAGGACTTGGCGTAAAACAAGATGATTTCAAAGCAGTGAACTGGTATCGC AAAGCGGCG G

      G L  G  V  K Q  D  D F  K  A V  N  W Y  R   K A  A  E

AGCAGGGGGATGCAGATGCTCAATTAAATTTGGGTGCGATGTATGCAATCGGACGTGGCG

   Q  G D  A  D A  Q  L N  L G  A  M  Y A  I  G R  G  V

TAAAACAAGATGGTGTTGAAGCGGTGAAGTGGTTTCGC AAAGCGGCAGAGCAGGGAAATG

  K  Q D  G  V E  A  V K  W  F R   K A  A  E Q  G  N A

CAAAGGCTCAAAATGGTTTGGGCATGATGTATGACGGAGGACTTGGCATAAAACAAGATT

  K A  Q  N  G L  G  M M  Y  D G  G L  G  I K  Q  D  Y

ATTTCAAAGCGGTGAAATGGCATCGCAAAGCGGCGGAGCAGGGATATGGAGGTGCTCAAG

  F  K A  V  K W  H  R K  A  A E  Q  G Y  G  G A  Q  V

TTATGTTGGGATTCTCATATCTTTCGGGAAAAGGTGTTCAAGTAAATAAATCTTTAGCCA

  M  L G  F  S Y  L  S G  K  G V  Q  V N  K  S L  A K

AAGAATGGTTTGGTAAGGCTTGTGATAATGGTGAACAAGTGGGTTGTGAATATTATGGCA

  E  W F  G  K A    D  N  G E  Q  V G    E  Y  Y  G K

AGCTAAATAGAGGGGAACGCTAATGCCAACTTTACAATGCGAATTTTGGAATGTAGGGCA

  L  N R  G  E R  *

AGGGTTATTTTCAAGTGGGCGTATTCAAATGGGAGACGCCCAAGCCTTTCATTGGGTTTA

TGGTTTGCAAGTTCCTCATCATGGTTCAAAGCCAATTTTAGTGAATAAAAATAAAAGATT

ATCCATTCATTCAATTTAAT AGGAAAACAAAATGAAACTCACAAAAACACTTCTTACCAC

  (SEQ ID NO：1570) NTH0863    M  K L  T  K  T L  L T  T

CGCACTTTTCGGTGCTTCTGTATTTTCTTTTCAATCCACCGCTTGGGCGGATACGCTGGA

  A  L F  G  A S  V  F S  F  Q S  T  A W  A  D T  L  E

ACAGCAATTCCAACAAGGTTTAACCGCTTATGAGCAAAGCAACTATCAAACCGCCTTTAA

 Q  Q F  Q  Q G  L  T A  Y  E Q  S  N Y  Q  T A  F  K

ACTTTGGTTACCTATGGCAGAGCAGGGATATGCAAAGGCTCAATTTAATTTGGGCGTGAT

 L  W L  P  M A  E  Q G  Y  A K  A  Q F  N  L G  V  M

GTATGCTAAGGGGCAAGGCGTCAAACAAGATGATTTTGAAGCGGTGAAGTGGTTTCGCAA

 Y  A K  G  Q G  V  K Q  D  D F  E  A V  K  W  F R  K

AGCGGCGGAGCAGGGATATGCAGAGGCTAAATTTAATTTGGGCCATATGTATTCTAAGGG

 A  A E  Q  G Y  A  E A  K  F N  L  G H  M  Y S  K  G

ACGAGGCGTCAAACAAGATGATTTTGAAGCAGTGAACTGGTATCGCAAAGCGGCGGAGCA

 R  G V  K  Q D  D  F E  A V  N  W  Y R   K  A A  E  Q

GGGAGATGCAGATGCTCAAGCTATATTGGGATTCTTATATCTTTTAGGAGAAAGAGGTGT

 G  D A  D  A Q  A  I L  G  F L  Y  L L  G  E R  G  V

CAAGTAAATAATTCTTTAGCCAAGNAATGGTNTGGTAAGGCTTGTGATAATGGTAATCAA

 K  *

AATGGCTGCGAATATTATGGCAAGCTAAATAGAGGGGAGCTCTAATGCCCACTTTTACAA

TGCGAATTNTGGAATGTAGGGCAAGGGTTATTTTCAAGTGGGCGTATTCAAGTGGAGACG

CNNCCAAGCCTTTCATTGGGTTTATGGTTTGCAAGTTCCTCATCATGGTTCANAGCCCAA

TTTAGTGNAATAAAAATAAAAGATTATCCATTCATTCAATTTAAT AGGAAAACAAAATGA

                         (SEQ ID NO：1566) NTH0861  M  K

AACTCACAAAAACACTTCTTACCACCGCACTTTTAGGTGCTTCTGTATTATCTTTTCAAT

   L  T K  T L  L  T  T A  L  L G  A  S V  L  S F  Q S

CCACCGCTTGGGCGGATACGCTGGAACAGCAATTCCAACAAGGTTTAACCGCTTATGAGC

   T  A W  A  D T  L  E Q  Q  F Q  Q  G L  T  A Y  E Q

AAAGCAACTATCAAACCGCCTTTAAACTTTGGTTACCTCTGGCGGAGCAGGGAGATGCAA

  S  N Y  Q  T A  F  K L  W L  P  L  A E  Q  G D  A  N

ATGTTCAATTTAATTTGGGCGTGATGTATGCTGAGGGGCAAGGCGTCAAACAAGATGATT

  V  Q F  N  L G  V  M Y  A  E G  Q G  V  K  Q D  D F

TTGAAGCGGTGAAATGGTATCGCAAAGCGGCGGAGCAGGGAGATGCAAATGCTCAGGCTT

  E  A V  K  W Y  R  K A  A  E Q  G  D A  N A  Q  A  Y

ATTTAGGTTTGGCTTATACTGAAGGGCGTGGTGTAAGACAAGATTATACCGAAGCGGTGA

  L  G L  A  Y T  E  G R  G  V R  Q  D Y  T  E A  V  K

AGTGGTTTCGCAAAGCGGCGGAGCAGGGACATGCAAATGCTCAAGCTATATGGGATCTCT

  W  F R   K A  A  E  Q G  H  A N  A  Q A  I  W D  L  F

TTCTTTAGGGTACCGAGCCGAATCGATCCA

      L  *

这四种编码序列进行以下比对(ClustalW)：

NTH0863    ATGAAACTCACAAAAACACTTCTTACCACCGCACTTTTCGGTGCTTCTGTATTTTCTTTT

NTH0867    ATGCGATTCACAAAAACACTTTTTACCACCGCACTTTTAGGTGCTTCTATCTTTTCTTTT

NTH0865    ATGAAACTCACAAAAACACTTCTTACCACCGCACTTTTCGGTGCTTCTATTTTTTCTTTT

NTH0861    ATGAAACTCACAAAAACACTTCTTACCACCGCACTTTTAGGTGCTTCTGTATTATCTTTT

           ***  * ************** **************** ********* * ** ******

NTH0863    CAATCCACCGCTTGGGCGGATACGCTGGAACAGCAATTCCAACAAGGTTTAACCGCTTAT

NTH0867    CAATCCACCGCTTGGGCGGATACGCTGGAACAGCAATTCCAACAAGGTTCTGAAGCCACT

NTH0865    CAATCCACCGCTTGGGCGGATACGCCGGAACAGCAATTCCAACAAGGTTTAACCGCTTAT

NTH0861    CAATCCACCGCTTGGGCGGATACGCTGGAACAGCAATTCCAACAAGGTTTAACCGCTTAT

           ************************* ***********************     **   *

NTH0863    GAGCAAAGCAACTATCAAACCGCCTTTAAACTTTGGTTACCTATGGCAGAGCAGGGATAT

NTH0867    ACGAGAGGCGATTATCAAACCACCTTTAAATTTTTGTTACCTCTGGCGGAGCAGGGAAAT

NTH0865    GAGCAAAGCAACTATCAAACCGCCTTTAAACTTTGGTTACCTCTGGCGGAGCAGGGAGAT

NTH0861    GAGCAAAGCAACTATCAAACCGCCTTTAAACTTTGGTTACCTCTGGCGGAGCAGGGAGAT

             *  * ** * ********* ******** *** ******* **** ********* **

NTH0863    GCAAAGGCTCAATTTAATTTGGGCGTGATGTATGCTAAGGGGCAAGGCGTCAAACAAGAT

NTH0867    GCAGAGGCTCAATTGATGTTGGGCGTGATGTATGCAAGAGGAATAGGCGTCAAACAAGAT

NTH0865    GCACAGGCTCAAGGTGGTTTGGGCATGATGTATGAAAGAGGACTTGGCGTAAAACAAGAT

NTH0861    GCAAATGTTCAATTTAATTTGGGCGTGATGTATGCTGAGGGGCAAGGCGTCAAACAAGAT

           *** * * ****      ****** *********     **    ***** *********

NTH0863    GATTT-------------------------------------------------------

NTH0867    GATTT-------------------------------------------------------

NTH0865    GATTTCAAAGCAGTGAACTGGTATCGCAAAGCGGCGGAGCAGGGGGATGCAGATGCTCAA

NTH0861    GATTT-------------------------------------------------------

           *****

NTH0863    -----------------------------------------------------TGAAGCG

NTH0867    -----------------------------------------------------TGAAGCG

NTH0865    TTAAATTTGGGTGCGATGTATGCAATCGGACGTGGCGTAAAACAAGATGGTGTTGAAGCG

NTH0861    -----------------------------------------------------TGAAGCG

                                                                *******

NTH0863    GTGAAGTGGTTTCGCAAAGCGGCGGAGCAGGGATATGCAGAGGCTAAATTTAATTTGGGC

NTH0867    GTGAAGTGGTATCGCCAAGCGGCGGAGCAGGGATATGCAAA-------------------

NTH0865    GTGAAGTGGTTTCGCAAAGCGGCAGAGCAGGGAAATGCAAAGGCTCAAAATGGTTTGGGC

NTH0861    GTGAAATGGTATCGCAAAGCGGCGGAGCAGGGAGATGCAAA-------------------

           ***** **** **** ******* ********* ***** *

NTH0863    CATATGTATTCTAAGGGACGAGGCGTCAAACAAGATGATTTTGAAGCAGTGAACTGGTAT

NTH0867    ------------------------------------------------------------

NTH0865    ATGATGTATGACGGAGGACTTGGCATAAAACAAGATTATTTCAAAGCGGTGAAATGGCAT

NTH0861    ------------------------------------------------------------

NTH0863    CGCAAAGCGGCGGAGCAGGGAGATGCAGATGCTCAAGCTATATTGGGATTCTTATATCTT

NTH0867    -----------------------------TGCTCAAGCTATATTGGGATTCTCATATCTT

NTH0865    CGCAAAGCGGCGGAGCAGGGATATGGAGGTGCTCAAGTTATGTTGGGATTCTCATATCTT

NTH0861    -----------------------------TGCTCAGGCTTATTTAGGTTTGGCTTATACT

                                        ****** * *   ** ** **    ***  *

NTH0863    TTAGGAGAAAGAGGTGT-CAAGTAAATAATTCTTTAGCCAAGNAATGGTNTGGTAAGGCT

NTH0867    TTAGGACAAAGCGGTGTTCAAGTAAATAAATCTTTAGCCAAAGAATGGTTTGGTAAGGCT

NTH0865    TCGGGAAAA---GGTGTTCAAGTAAATAAATCTTTAGCCAAAGAATGGTTTGGTAAGGCT

NTH0861    GAAGGGCGT---GGTGTAAGACAAGATTATACCGAAGCGGTGAAGTGGTTTCGCAAAGC-

              **       *****   *  * ** *  *   ***     * **** * * ** **

NTH0863    TGTGATAATGGTAATCAAAATGGCTGCGAATATTATGGCAAGCTAAATAGAGGGGAGCTC

NTH0867    TGTGATAATGGTGATCAAAATGGTTGCGAATATTATGGCAAGTTAAATAGAGGGGAGCTC

NTH0865    TGTGATAATGGTGAACAAGTGGGTTGTGAATATTATGGCAAGCTAAATAGAGGGGAACGC

NTH0861    ---------GGCGGAGCAGGGACATGCAAATGCT----CAAGCTATAT----GGGATCTC

                    **      *      **  ***  *    **** ** **    **** * *

NTH0863    TAATGCCCACTTTTACAATGCGAATTNTGGAATGTAGGGCAAGGGTTATTTTCAAGTGGG

NTH0867    TAATGCCAACTTT-ACAATGCGAATTTTGGAATGTAGGGCAAGGGTTATTTTCAAGTGGG

NTH0865    TAATGCCAACTTT-ACAATGCGAATTTTGGAATGTAGGGCAAGGGTTATTTTCAAGTGGG

NTH0861    TTTCTTTAGGGTA-CCGAGCCGAATC----GATCCA------------------------

           *          *   * *  *****      **  *

NTH0863    CGTATTCAAGTGGAGACGCNNCCAAGCCTTTCATTGGGTTTATGGTTTGCAAGTTCCTCA

NTH0867    CGTATTCAAATGG-GAGACGCCCCAGCCTTTCATTGGGTTTATGGTTTGCAAGTTCCTCA

NTH0865    CGTATTCAAATGG-GAGACGCCCAAGCCTTTCATTGGGTTTATGGTTTGCAAGTTCCTCA

NTH0861    ------------------------------------------------------------

NTH0863    TCATGGTTCANAGCCCAATTTAGTGNAATAAAAATAAAAGATTATCCATTCATTCAATTT

NTH0867    TCATGGTTCAAAGCCAATTTTAGTGAA-TAAAAATAAAAGATTATCCATTCATTCAATTT

NTH0865    TCATGGTTCAAAGCCAATTTTAGTGAA-TAAAAATAAAAGATTATCCATTCATTCAATTT

NTH0861    ------------------------------------------------------------------

NTH0863    AATAGGAAAACAAA  SEQ ID NO：5083

NTH0867    AATAGGAAAACAA-  SEQ ID NO：5085

NTH0865    AATAGGAAAACAAA  SEQ ID NO：5084

NTH0861    --------------  SEQ ID NO：5082

  所编码的多肽与bpf001和NMB0419序列如下比对：

NTH0861    ------------MKLTKTLLTTALLG--------ASVLSFQS---TAWADTLEQQFQQG

NTH0863    ------------MKLTKTLLTTALFG--------ASVFSFQS---TAWADTLEQQFQQG

NTH0865    ------------MKLTKTLLTTALFG--------ASIFSFQS---TAWADTPEQQFQQG

NTH0867    ------------MRFTKTLFTTALLG--------ASIFSFQS---TAWADTLEQQFQQG

BPF001     ------------MKLTKTLFTSALLG--------ASILSFHP---TVAAMDFGT--QVG

NMB0419    ------------MKQTVKWLAAALIALGLNRAVWADDVSDFRENLQAAAQGNAAAQYNLG

                       *: * . :::**:.          .: .*:    :.         : *

NTH0861    LTAYE----QSNYQTAFKLWLPLAEQ-GDANVQFNLGVMYAEGQGVKQDDFEAVKWYRKA

NTH0863    LTAYE----QSNYQTAFKLWLPMAEQ-GYAKAQFNLGVMYAKGQGVKQDDFEAVKWFRKA

NTH0865    LTAYE----QSNYQTAFKLWLPLAEQ-GDAQAQGGLGMMYERGLGVKQDDFKAVNWYRKA

NTH0867    SEATT----RGDYQTTFKFLLPLAEQ-GNAEAQLMLGVMYARGIGVKQDDFEAVKWYRQA

BPF001     IDAYR----KNDFAQAAEQFKDAGIVRGDPTAQLFLGRMYYNGEFFKQDYVEAAKWYRKA

NMB0419    AMYYKGRGVRRDDAEAVRWYRQAAEQ-GLAQAQYNLGWMYANGRGVRQDDTEAVRWYRQA

                    : :   : .     .   * . .*  ** ** .*  .:**  :*..*:*:*

NTH0861    AEQG--------------------------------------------------------

NTH0863    AEQG--------------------------------------------------------

NTH0865    AEQGDADAQLNLGAMYAIGRGVKQDGVEAVKWFRKAAEQGNAKAQNGLGMMYDGGLGIKQ

NTH0867    AEQG--------------------------------------------------------

BPF001     AEQGEEFGLLFLG------------------------------------ETYEDGEGVEK

NMB0419    AAQGVVQAQYNLG------------------------------------VIYAEGRGVRQ

           * **

NTH0861    ----------------DANAQAYLGLAYTEGR-GVRQDYTEAVKWFRKAAEQGHANAQAI

NTH0863    ----------------YAEAKFNLGHMYSKGR-GVKQDDFEAVNWYRKAAEQGDADAQAI

NTH0865    DYFKAVKWHRKAAEQGYGGAQVMLGFSYLSGK-GVQVNKSLAKEWFGKACDNGEQVGCEY

NTH0867    ----------------YANAQAILGFSYLLGQSGVQVNKSLAKEWFGKACDNGDQNGCEY

BPF001     DYAEAAKLYRKAAEQGSAEGQMALGKMYRFGN-GVEKDYAEAIKLYRKSAEQGNFTALFF

NMB0419    DDVEAVRWFRQAAAQGVAQAQNNLGVMYAERR-GVRQDRALAQEWFGKACQNGDQDGCDN

                            . .:  **  *   . **. :   * : : *:.::*.  .

NTH0861    WDLFL-----------------  SEQ ID N0：1566

NTH0863    LGFLYLLGERGVK---------  SEQ ID NO：1570

NTH0865    YGKLNR-GER------------  SEQ ID NO：1574

NTH0867    YGKLNR-GEL------------  SEQ ID NO：1578

BPF001     LGEMYDNGVGVKQNKAESQRII  SEQ ID NO：5086

NMB0419    DQRLKAGY--------------  SEQ ID NO：5087

值得关注的是四种密切相关基因的串联重复，所述基因还与参与细菌侵袭的基因有关，并且NTH0861、NTH0863、NTH0865和NTH0867是为免疫接种目的而特别感兴趣的多肽。特别是NTH0867是未在Rd基因组中观察到的外膜蛋白，尤其令人感兴趣。

此外，除了NTHi外，粘膜炎莫拉菌(Moraxella catarrhalis)和肺炎链球菌(Streptococcus pneumoniae)也往往导致急性中耳炎。在NTHi基因组中鉴定了在粘膜炎莫拉菌基因组中有同源物的四种蛋白质，即NTH0861(SEQ ID NO：1566)、NTH0863(SEQ ID NO：1570)、NTH0865(SEQ ID NO：1574)和NTH0867(SEQ ID NO：1578)。

因此，这些蛋白质可用作通用AOM疫苗的抗原。也可单独利用相应的粘膜炎莫拉菌抗原或与NTHi抗原联用。

    SEQ ID NO：1566的变体见SEQ ID NO：5059：

                10        20        30        40        50        60        70        80

                 |         |         |         |         |         |         |         |     |

1566    MKLTKTLLTTALLGASVLSFQSTAWADTLEQQFQQGLTAYEQSNYQTAFKLWLPLAEQGDANVQFNLGVMYAEGQGVKQD

5095    MKLTKTLLTTALLGASVFSFQSTAWADTPEQQFQQGSTAYEQSDYQTAFKLWLPMAEQGDANVQFNLGVMYAKGQGVKQD

        *****************:********** ******* ******:**********:*****************:*******

                90       100       110       120       130       140       150       160

                 |         |         |         |         |         |         |         |

1566    DFEAVKWYRKAAEQ------------------------------------GDANAQAYLGLAYTEGRGVRQDYTEAVKWF

5095    DFEAVKWYRKAAEQGHAKAQFNLGVMYAKGQGVKQDDFKAVKWYRKAAEQGYADAQANLGSAYSAGRGVRQDYIEAVKWF

        **************                                    * *:*** ** **: ******** ******

               170       180       190       200       210

                 |         |         |         |         |

1566    RKAAEQGHANAQAIWDLFL----------------------------------------

5095    KKAAENGSADGQFKLGLVYLIGQSIQKDRTLAKEWFGKACDNGEQRGCEYYGKLNRGEL

             :****:*  *:.*   .*.

    SEQ ID NO：1570的变体见SEQ ID NO：5094：

                10        20        30        40        50        60        70        80

                 |         |         |         |         |         |         |         |

1570    MKLTKTLLTTALFGASVFSFQSTAWADTLEQQFQQGLTAYEQSNYQTAFKLWLPMAEQGYAKAQFNLGVMYAKGQGVKQD

5094    MKLTKTLLTTALLGASVFSFQSTAWADTPEQQFQQGSTAYEQSDYQTAFKLWLPMAEQGDANVQFNLGVMYAKGQGVKQD

        ************:*************** ******* ******:*************** *:.*****************

                90       100       110       120       130       140       150

                 |         |         |         |         |         |         |

1570    DFEAVKWFRKAAEQGYAEAKFNLGHMYSKG-RGVKQDDFEAVNWYRKAAEQGDADAQAILGFLYLLGERGVK

5094    DFEAVKWFRKAAEQGHAKAQAILGFSYLLGERGVQVNKSLAKEWFGKACDNGNQDGCEYYG---KLNRGGF-

           *************** :*:*  **. *  * ***::. * :*:**.::*:*.    *    *..*.

    SEQ ID NO：1574的变体见SEQ ID NO：5093：

                10        20        30        40        50        60        70        80

                 |         |         |         |         |         |         |         |

1574    MKLTKTLLTTALFGASIFSFQSTAWADTPEQQFQQGLTAYEQSNYQTAFKLWLPLAEQGDAQAQGGLGMMYERGLGVKQD

5093    MKLTKTLLTTALFGASIFSFQSTAWADTPEQQFQQGLTAYEQSDYQTAFKLWLPMAEQGYAQAQGGLGMMYERGLGVKQD

        *******************************************:**********:**** ********************

                90       100       110       120       130       140       150       160

                 |         |         |         |         |         |         |         |

1574    DFKAVNWYRKAAEQGDADAQLNLGAMYAIGRGVKQDGVEAVKWFRKAAEQGNAKAQNGLGMMYDGGLGIKQDYFKAVKWH

5093    DFKAVNWYRKAAEQGDADAQLNLGAMYAIGHGVKQDGVEAVKWFRKAAEQGNAKAQNGLGMMYRGRLGIKQDYFKAVKWY

        ******************************:******************************** * *************:

               170       180       190       200       210

                 |         |         |         |         |

1574    RKAAEQGYGGAQVMLGFSYLSGKGVQVNKSLAKEWFGKACDNGEQVGCEYYGKLNRGER

5093    RKAAEQGYGGAQVMLGFSYLSGKGVQVNKSLAKEWFGKACDNGEQVGCEYYSKLNRGER

        ***************************************************.*******

    SEQ ID NO：1578的变体见SEQ ID NO：5092：

                10        20        30        40        50        60        70        80

                 |         |         |         |         |         |         |         |

5092    MRFTKTLFTTALLGASVFSFQSTAWADTLEQQFQQGSEATTRGDYQTTFKFLLPLAEQGNALAQMMLGVMYAKGQGVKQD

1578    MRFTKTLFTTALLGASIFSFQSTAWADTLEQQFQQGSEATTRGDYQTTFKFLLPLAEQGNAEAQLML6VMYARGIGVKQD

        ****************:******************************************** **:*******:* *****

                90       100       110       120       130       140

                 |         |         |         |         |         |

5092    DVEAVKWYRKAAEQGYADAQAMLGFSYLLGQSGVQVNKSLAKEWFGKACDNGDQNGCEYYGKLNRGEL

1578    DFEAVKWYRQAAEQGYANAQAILGFSYLLGQSGVQVNKSLAKEWFGKACDNGDQNGCEYYGKLNRGEL

        *.*******:*******:***:**********************************************

优选的NTH0861蛋白与SEQ ID NO：1566和5095均具有相同性。优选的NTH0863蛋白与SEQ ID NO：1570和5094均具有相同性。优选的NTH0865蛋白与SEQ ID NO：1574和5093均具有相同性。优选的NTH0867蛋白与SEQID NO：1578和5092均具有相同性。

应该理解本发明只是通过实施例得以描述，可作出改进而仍处于本发明的范围和构思内。

表I-NTH0001和NTH2832之间的缺少(序列)的NTHnnnn值

0008	0031	0042	0054	0056	0066	0074	0077	0093	0111	0160	0162
												0166	0171	0179	0210	0213	0214	0219	0229	0231	0276	0281	0288
0293	0322	0332	0357	0362	0381	0395	0398	0404	0406	0409	0410
												0415	0439	0445	0446	0452	0466	0471	0491	0497	0516	0533	0538
0541	0546	0551	0553	0556	0569	0578	0598	0600	0610	0623	0639
												0649	0666	0693	0713	0722	0727	0742	0746	0757	0763	0780	0789
0791	0793	0800	0809	0816	0855	0883	0891	0902	0911	0915	0916
												0922	0943	0944	0957	0975	0978	0980	0998	0999	1013	1034	1044
1047	1055	1056	1065	1072	1076	1079	1099	1113	1118	1119	1128
												1133	1134	1136	1146	1147	1158	1160	1170	1194	1199	1213	1219
1223	1232	1243	1257	1260	1288	1289	1296	1312	1317	1329	1335
												1347	1350	1356	1358	1362	1364	1372	1377	1385	1452	1458	1469
1478	1481	1486	1488	1502	1517	1518	1529	1536	1547	1553	1557
												1560	1566	1592	1595	1596	1604	1642	1649	1667	1669	1674	1691
1699	1711	1715	1721	1723	1727	1728	1731	1737	1741	1743	1746
												1750	1761	1772	1784	1797	1810	1814	1823	1843	1844	1856	1864
1866	1878	1902	1909	1918	1957	1961	1979	1985	1987	1990	2004
												2006	2015	2017	2023	2033	2037	2042	2054	2077	2080	2098	2104
2107	2125	2154	2167	2171	2174	2179	2194	2203	2210	2218	2237
												2239	2240	2244	2254	2255	2267	2268	2270	2275	2278	2286	2290
2295	2300	2302	2312	2320	2334	2340	2355	2357	2366	2367	2374
												2380	2400	2409	2431	2444	2459	2523	2540	2547	2551	2574	2580

2589	2601	2611	2614	2624	2628	2637	2639	2645	2652	2658	2662
												2677	2692	2699	2700	2728	2734	2746	2760	2767	2773	2787	2799
2805	2808	2819	2822

表II-优选的多肽

NTH0001  NTH0002  NTH0004  NTH0005  NTH0012  NTH0014  NTH0015  NTH0016

NTH0017  NTH0019  NTH0020  NTH0021  NTH0022  NTH0024  NTH0025  NTH0032

NTH0033  NTH0034  NTH0035  NTH0036  NTH0037  NTH0038  NTH0040  NTH0041

NTH0043  NTH0045  NTH0048  NTH0049  NTH0050  NTH0051  NTH0052  NTH0053

NTH0057  NTH0059  NTH0060  NTH0061  NTH0064  NTH0067  NTH0073  NTH0076

NTH0085  NTH0089  NTH0091  NTH0092  NTH0094  NTH0097  NTH0101  NTH0104

NTH0106  NTH0107  NTH0110  NTH0114  NTH0116  NTH0118  NTH0119  NTH0120

NTH0121  NTH0122  NTH0123  NTH0124  NTH0125  NTH0128  NTH0129  NTH0132

NTH0134  NTH0135  NTH0136  NTH0138  NTH0140  NTH0146  NTH0148  NTH0151

NTH0153  NTH0154  NTH0155  NTH0157  NTH0158  NTH0159  NTH0161  NTH0163

NTH0164  NTH0167  NTH0169  NTH0173  NTH0174  NTH0176  NTH0177  NTH0180

NTH0184  NTH0185  NTH0186  NTH0187  NTH0189  NTH0190  NTH0191  NTH0192

NTH0193  NTH0194  NTH0195  NTH0197  NTH0198  NTH0199  NTH0203  NTH0206

NTH0208  NTH0209  NTH0223  NTH0224  NTH0226  NTH0227  NTH0228  NTH0232

NTH0235  NTH0236  NTH0237  NTH0238  NTH0241  NTH0242  NTH0244  NTH0247

NTH0248  NTH0250  NTH0251  NTH0252  NTH0253  NTH0254  NTH0255  NTH0256

NTH0263  NTH0264  NTH0265  NTH0269  NTH0270  NTH0278  NTH0279  NTH0280

NTH0282  NTH0283  NTH0284  NTH0285  NTH0289  NTH0290  NTH0295  NTH0297

NTH0298  NTH0299  NTH0300  NTH0302  NTH0307  NTH0308  NTH0310  NTH0311

NTH0312  NTH0313  NTH0317  NTH0319  NTH0320  NTH0321  NTH0325  NTH0326

NTH0327  NTH0328  NTH0331  NTH0333  NTH0334  NTH0335  NTH0339  NTH0341

NTH0346  NTH0347  NTH0348  NTH0351  NTH0352  NTH0353  NTH0356  NTH0358

NTH0363  NTH0366  NTH0371  NTH0372  NTH0375  NTH0378  NTH0379  NTH0384

NTH0385  NTH0388  NTH0396  NTH0397  NTH0400  NTH0401  NTH0402  NTH0405

NTH0407  NTH0408  NTH0411  NTH0412  NTH0417  NTH0418  NTH0419  NTH0420

NTH0421  NTH0424  NTH0426  NTH0427  NTH0429  NTH0430  NTH0431  NTH0432

NTH0433  NTH0434  NTH0435  NTH0437  NTH0438  NTH0444  NTH0453  NTH0455

NTH0457  NTH0459  NTH0460  NTH0461  NTH0462  NTH0463  NTH0465  NTH0468

NTH0469  NTH0473  NTH0475  NTH0478  NTH0484  NTH0485  NTH0486  NTH0487

NTH0488  NTH0489  NTH0490  NTH0493  NTH0496  NTH0498  NTH0500  NTH0501

NTH0502  NTH0504  NTH0506  NTH0507  NTH0509  NTH0510  NTH0511  NTH0512

NTH0513  NTH0518  NTH0520  NTH0523  NTH0524  NTH0526  NTH0527  NTH0528

NTH0529  NTH0531  NTH0534  NTH0536  NTH0539  NTH0544  NTH0545  NTH0547

NTH0549  NTH0559  NTH0561  NTH0565  NTH0566  NTH0573  NTH0574  NTH0577

NTH0579  NTH0580  NTH0581  NTH0582  NTH0583  NTH0584  NTH0585  NTH0586

NTH0587  NTH0588  NTH0590  NTH0599  NTH0603  NTH0604  NTH0606  NTH0615

NTH0617  NTH0618  NTH0619  NTH0622  NTH0624  NTH0626  NTH0630  NTH0631

NTH0636  NTH0637  NTH0638  NTH0642  NTH0643  NTH0644  NTH0645  NTH0646

NTH0647  NTH0648  NTH0653  NTH0654  NTH0656  NTH0658  NTH0661  NTH0662

NTH0663  NTH0664  NTH0667  NTH0668  NTH0673  NTH0675  NTH0676  NTH0677

NTH0678  NTH0680  NTH0681  NTH0683  NTH0687  NTH0690  NTH0691  NTH0692

NTH0694  NTH0695  NTH0696  NTH0702  NTH0703  NTH0706  NTH0707  NTH0709

NTH0710  NTH0711  NTH0712  NTH0715  NTH0716  NTH0717  NTH0718  NTH0721

NTH0724  NTH0725  NTH0726  NTH0728  NTH0729  NTH0730  NTH0738  NTH0740

NTH0744  NTH0745  NTH0749  NTH0750  NTH0752  NTH0755  NTH0756  NTH0762

NTH0764  NTH0765  NTH0768  NTH0771  NTH0774  NTH0776  NTH0788  NTH0792

NTH0794  NTH0795  NTH0796  NTH0797  NTH0798  NTH0802  NTH0803  NTH0804

NTH0813  NTH0814  NTH0815  NTH0818  NTH0820  NTH0821  NTH0822  NTH0827

NTH0829  NTH0832  NTH0834  NTH0835  NTH0836  NTH0838  NTH0839  NTH0841

NTH0843  NTH0844  NTH0848  NTH0849  NTH0850  NTH0851  NTH0852  NTH0856

NTH0858  NTH0861  NTH0862  NTH0863  NTH0864  NTH0865  NTH0866  NTH0867

NTH0872  NTH0874  NTH0875  NTH0877  NTH0879  NTH0880  NTH0885  NTH0886

NTH0887  NTH0888  NTH0892  NTH0894  NTH0895  NTH0896  NTH0900  NTH0901

NTH0904  NTH0906  NTH0909  NTH0910  NTH0913  NTH0914  NTH0921  NTH0924

NTH0926  NTH0927  NTH0928  NTH0929  NTH0930  NTH0931  NTH0932  NTH0933

NTH0937  NTH0938  NTH0941  NTH0942  NTH0948  NTH0949  NTH0950  NTH0952

NTH0953  NTH0955  NTH0961  NTH0964  NTH0968  NTH0970  NTH0971  NTH0972

NTH0973  NTH0985  NTH0986  NTH0987  NTH0989  NTH0991  NTH0992  NTH0993

NTH0994  NTH0995  NTH0996  NTH0997  NTH1000  NTH1002  NTH1003  NTH1004

NTH1005  NTH1007  NTH1009  NTH1010  NTH1012  NTH1015  NTH1016  NTH1017

NTH1018  NTH1020  NTH1021  NTH1025  NTH1026  NTH1027  NTH1028  NTH1029

NTH1031  NTH1032  NTH1037  NTH1039  NTH1040  NTH1042  NTH1043  NTH1048

NTH1049  NTH1052  NTH1054  NTH1058  NTH1063  NTH1064  NTH1067  NTH1069

NTH1070  NTH1073  NTH1075  NTH1080  NTH1082  NTH1083  NTH1084  NTH1085

NTH1086  NTH1087  NTH1089  NTH1090  NTH1091  NTH1092  NTH1098  NTH1102

NTH1103  NTH1104  NTH1106  NTH1108  NTH1111  NTH1112  NTH1114  NTH1115

NTH1116  NTH1121  NTH1122  NTH1123  NTH1124  NTH1125  NTH1129  NTH1130

NTH1131  NTH1138  NTH1141  NTH1142  NTH1149  NTH1150  NTH1151  NTH1153

NTH1157  NTH1159  NTH1161  NTH1162  NTH1164  NTH1174  NTH1176  NTH1178

NTH1179  NTH1181  NTH1184  NTH1185  NTH1188  NTH1189  NTH1190  NTH1191

NTH1192  NTH1193  NTH1195  NTH1196  NTH1200  NTH1201  NTH1203  NTH1204

NTH1205  NTH1207  NTH1208  NTH1209  NTH1210  NTH1211  NTH1214  NTH1216

NTH1220  NTH1221  NTH1224  NTH1225  NTH1226  NTH1229  NTH1230  NTH1231

NTH1233  NTH1234  NTH1235  NTH1236  NTH1237  NTH1238  NTH1240  NTH1241

NTH1244  NTH1245  NTH1246  NTH1247  NTH1248  NTH1249  NTH1250  NTH1251

NTH1252  NTH1253  NTH1254  NTH1255  NTH1256  NTH1261  NTH1262  NTH1268

NTH1270  NTH1271  NTH1273  NTH1275  NTH1279  NTH1280  NTH1281  NTH1282

NTH1283  NTH1286  NTH1287  NTH1290  NTH1293  NTH1294  NTH1295  NTH1297

NTH1298  NTH1299  NTH1300  NTH1301  NTH1302  NTH1305  NTH1306  NTH1307

NTH1308  NTH1309  NTH1311  NTH1313  NTH1315  NTH1316  NTH1319  NTH1321

NTH1325  NTH1327  NTH1330  NTH1332  NTH1333  NTH1334  NTH1336  NTH1337

NTH1339  NTH1341  NTH1342  NTH1346  NTH1348  NTH1353  NTH1354  NTH1357

NTH1359  NTH1361  NTH1363  NTH1365  NTH1367  NTH1368  NTH1374  NTH1375

NTH1376  NTH1379  NTH1380  NTH1381  NTH1382  NTH1383  NTH1388  NTH1390

NTH1391  NTH1393  NTH1394  NTH1395  NTH1396  NTH1398  NTH1399  NTH1400

NTH1406  NTH1407  NTH1411  NTH1412  NTH1413  NTH1414  NTH1415  NTH1416

NTH1418  NTH1419  NTH1420  NTH1421  NTH1425  NTH1427  NTH1428  NTH1429

NTH1430  NTH1431  NTH1434  NTH1435  NTH1437  NTH1438  NTH1439  NTH1441

NTH1447  NTH1448  NTH1450  NTH1454  NTH1455  NTH1456  NTH1464  NTH1467

NTH1468  NTH1470  NTH1471  NTH1472  NTH1473  NTH1474  NTH1479  NTH1487

NTH1489  NTH1490  NTH1491  NTH1492  NTH1493  NTH1494  NTH1495  NTH1496

NTH1497  NTH1500  NTH1503  NTH1504  NTH1506  NTH1510  NTH1515  NTH1516

NTH1525  NTH1526  NTH1527  NTH1528  NTH1531  NTH1532  NTH1537  NTH1538

NTH1540  NTH1541  NTH1543  NTH1548  NTH1552  NTH1555  NTH1559  NTH1562

NTH1563  NTH1564  NTH1567  NTH1569  NTH1570  NTH1571  NTH1573  NTH1574

NTH1575  NTH1580  NTH1581  NTH1582  NTH1584  NTH1586  NTH1587  NTH1588

NTH1590  NTH1594  NTH1597  NTH1598  NTH1599  NTH1600  NTH1601  NTH1602

NTH1603  NTH1605  NTH1606  NTH1607  NTH1608  NTH1609  NTH1611  NTH1612

NTH1615  NTH1616  NTH1617  NTH1618  NTH1619  NTH1620  NTH1621  NTH1622

NTH1623  NTH1625  NTH1626  NTH1627  NTH1628  NTH1629  NTH1631  NTH1634

NTH1637  NTH1638  NTH1647  NTH1652  NTH1653  NTH1654  NTH1656  NTH1657

NTH1658  NTH1662  NTH1664  NTH1666  NTH1668  NTH1671  NTH1675  NTH1676

NTH1677  NTH1680  NTH1686  NTH1687  NTH1688  NTH1689  NTH1690  NTH1692

NTH1693  NTH1697  NTH1698  NTH1701  NTH1702  NTH1703  NTH1707  NTH1712

NTH1713  NTH1718  NTH1719  NTH1722  NTH1724  NTH1725  NTH1729  NTH1732

NTH1734  NTH1735  NTH1739  NTH1740  NTH1742  NTH1744  NTH1745  NTH1748

NTH1749  NTH1751  NTH1752  NTH1753  NTH1754  NTH1755  NTH1756  NTH1757

NTH1758  NTH1759  NTH1760  NTH1765  NTH1767  NTH1769  NTH1770  NTH1773

NTH1778  NTH1779  NTH1781  NTH1782  NTH1783  NTH1788  NTH1793  NTH1795

NTH1796  NTH1798  NTH1799  NTH1803  NTH1804  NTH1805  NTH1806  NTH1807

NTH1811  NTH1812  NTH1813  NTH1815  NTH1816  NTH1817  NTH1818  NTH1819

NTH1820  NTH1821  NTH1822  NTH1824  NTH1828  NTH1829  NTH1832  NTH1833

NTH1835  NTH1836  NTH1837  NTH1842  NTH1845  NTH1849  NTH1850  NTH1854

NTH1857  NTH1859  NTH1861  NTH1865  NTH1870  NTH1871  NTH1872  NTH1873

NTH1881  NTH1882  NTH1885  NTH1888  NTH1889  NTH1891  NTH1892  NTH1896

NTH1897  NTH1898  NTH1899  NTH1900  NTH1904  NTH1906  NTH1908  NTH1910

NTH1914  NTH1916  NTH1917  NTH1919  NTH1920  NTH1921  NTH1922  NTH1923

NTH1925  NTH1927  NTH1935  NTH1939  NTH1941  NTH1942  NTH1945  NTH1946

NTH1947  NTH1948  NTH1951  NTH1953  NTH1956  NTH1958  NTH1960  NTH1962

NTH1963  NTH1964  NTH1965  NTH1966  NTH1967  NTH1968  NTH1974  NTH1978

NTH1981  NTH1986  NTH1989  NTH1992  NTH1993  NTH1994  NTH1995  NTH1996

NTH1997  NTH1998  NTH1999  NTH2001  NTH2005  NTH2008  NTH2009  NTH2010

NTH2019  NTH2024  NTH2025  NTH2031  NTH2035  NTH2038  NTH2039  NTH2040

NTH2041  NTH2043  NTH2050  NTH2052  NTH2055  NTH2056  NTH2060  NTH2062

NTH2064  NTH2065  NTH2069  NTH2070  NTH2071  NTH2073  NTH2075  NTH2078

NTH2079  NTH2081  NTH2083  NTH2089  NTH2091  NTH2092  NTH2093  NTH2094

NTH2095  NTH2096  NTH2097  NTH2099  NTH2101  NTH2109  NTH2110  NTH2112

NTH2113  NTH2114  NTH2115  NTH2116  NTH2117  NTH2118  NTH2119  NTH2120

NTH2122  NTH2126  NTH2128  NTH2129  NTH2130  NTH2131  NTH2133  NTH2135

NTH2136  NTH2138  NTH2142  NTH2145  NTH2146  NTH2149  NTH2150  NTH2156

NTH2159  NTH2162  NTH2163  NTH2166  NTH2169  NTH2170  NTH2173  NTH2181

NTH2183  NTH2187  NTH2191  NTH2193  NTH2195  NTH2196  NTH2197  NTH2198

NTH2199  NTH2200  NTH2204  NTH2205  NTH2206  NTH2207  NTH2209  NTH2213

NTH2216  NTH2217  NTH2219  NTH2220  NTH2221  NTH2222  NTH2223  NTH2226

NTH2227  NTH2228  NTH2229  NTH2231  NTH2232  NTH2234  NTH2235  NTH2242

NTH2243  NTH2245  NTH2247  NTH2250  NTH2251  NTH2253  NTH2256  NTH2257

NTH2258  NTH2259  NTH2262  NTH2263  NTH2266  NTH2269  NTH2273  NTH2274

NTH2277  NTH2282  NTH2284  NTH2285  NTH2287  NTH2288  NTH2291  NTH2292

NTH2296  NTH2299  NTH2305  NTH2309  NTH2315  NTH2316  NTH2318  NTH2323

NTH2324  NTH2326  NTH2327  NTH2330  NTH2332  NTH2333  NTH2342  NTH2343

NTH2344  NTH2346  NTH2347  NTH2349  NTH2352  NTH2353  NTH2356  NTH2358

NTH2361  NTH2362  NTH2363  NTH2364  NTH2365  NTH2368  NTH2369  NTH2370

NTH2371  NTH2376  NTH2377  NTH2381  NTH2382  NTH2386  NTH2388  NTH2394

NTH2398  NTH2402  NTH2405  NTH2406  NTH2407  NTH2408  NTH2414  NTH2414

NTH2422  NTH2430  NTH2432  NTH2433  NTH2434  NTH2438  NTH2442  NTH2447

NTH2448  NTH2451  NTH2455  NTH2456  NTH2457  NTH2458  NTH2460  NTH2461

NTH2463  NTH2464  NTH2466  NTH2467  NTH2468  NTH2471  NTH2472  NTH2478

NTH2480  NTH2481  NTH2482  NTH2483  NTH2484  NTH2485  NTH2486  NTH2487

NTH2488  NTH2493  NTH2495  NTH2496  NTH2497  NTH2498  NTH2499  NTH2500

NTH2501  NTH2505  NTH2508  NTH2510  NTH2524  NTH2525  NTH2527  NTH2528

NTH2531  NTH2532  NTH2533  NTH2534  NTH2536  NTH2537  NTH2541  NTH2542

NTH2543  NTH2545  NTH2546  NTH2548  NTH2549  NTH2550  NTH2552  NTH2554

NTH2556  NTH2557  NTH2558  NTH2562  NTH2563  NTH2566  NTH2567  NTH2568

NTH2569  NTH2570  NTH2572  NTH2573  NTH2575  NTH2577  NTH2578  NTH2584

NTH2585  NTH2587  NTH2588  NTH2590  NTH2591  NTH2593  NTH2595  NTH2597

NTH2600  NTH2602  NTH2603  NTH2604  NTH2605  NTH2607  NTH2608  NTH2609

NTH2610  NTH2612  NTH2613  NTH2615  NTH2616  NTH2618  NTH2626  NTH2633

NTH2635  NTH2640  NTH2641  NTH2647  NTH2648  NTH2649  NTH2650  NTH2655

NTH2661  NTH2663  NTH2664  NTH2667  NTH2668  NTH2673  NTH2674  NTH2675

NTH2679  NTH2680  NTH2684  NTH2690  NTH2693  NTH2694  NTH2696  NTH2697

NTH2701  NTH2702  NTH2703  NTH2704  NTH2705  NTH2706  NTH2707  NTH2708

NTH2709  NTH2710  NTH2711  NTH2712  NTH2713  NTH2715  NTH2716  NTH2718

NTH2719  NTH2720  NTH2721  NTH2723  NTH2724  NTH2725  NTH2726  NTH2727

NTH2729  NTH2730  NTH2731  NTH2732  NTH2735  NTH2737  NTH2738  NTH2740

NTH2743  NTH2744  NTH2749  NTH2750  NTH2753  NTH2754  NTH2755  NTH2756

NTH2757  NTH2758  NTH2764  NTH2765  NTH2769  NTH2774  NTH2777  NTH2778

NTH2779  NTH2781  NTH2783  NTH2784  NTH2785  NTH2791  NTH2793  NTH2794

NTH2796  NTH2797  NTH2798  NTH2804  NTH2806  NTH2807  NTH2809  NTH2810

NTH2813  NTH2814  NTH2816  NTH2823

表III-注释

aa＝多肽的长度

PSORT＝多肽的细胞定位，根据PSORT算法

NTH	aa	PSORT	注释
				0003	274	细胞质	二氨基庚二酸差向异构酶(dapF)
0007	61	细胞质	tldD蛋白tldD
				0010	158	细胞质	转录调节物
0011	93	细胞质	usg-1蛋白(usg1)
				0013	274	细胞质	核酸切除酶ABC，亚基C(uvrC)
0014	64	周质	核酸切除酶ABC，亚基C(uvrC)
				0017	161	外膜	2′，3′-环-核苷酸2′-磷酸二酯酶(cpdB)
0018	130	细胞质	16s假尿苷516合成酶(rsuA)
				0019	98	内膜1	双环霉素抗性蛋白(bcr)
0020	181	内膜4	Na(+)-转运NADH-醌还原酶，亚基
				0023	110	细胞质	σ-E因子调节蛋白(rseB)
0025	195	内膜1	σ-E因子负调节蛋白(mclA)
				0026	157	细胞质	RNA聚合酶σ-E因子(rpoE)
0027	100	细胞质	细胞分裂蛋白(ftsQ)
				0028	37	细胞质	细胞分裂蛋白(ftsA)
0029	34	细胞质	细胞分裂蛋白(ftsA)
				0030	268	细胞质	天冬氨酸-氨连接酶(asnA)
0039	311	细胞质	ADP-庚糖-LPS庚糖基转移酶II(rfaF)
				0043	194	内膜3	钠：二羧酸盐协同转运蛋白
0044	79	细胞质	铁蛋白(rsgA)
				0047	219	细胞质	热激蛋白(hsIU)/ATP-依赖性CIp蛋白酶，ATP-结合亚基
0048	55	内膜2	L-乳酸通透酶(1ctP)
				0049	90	周质	转铁蛋白结合蛋白或TonB-依赖性受体
0055	92	细胞质	热激蛋白(hslV)
				0057	235	周质	酸性磷酸酶

0058	206	细胞质	杆状决定蛋白(rod shape-determining protein)(mreB)或细胞分裂蛋白FtsA ftsA
				0059	54	周质	杆状决定蛋白(mreC)
0060	104	内膜0	核糖体蛋白S8(rpS8)
				0061	313	内膜2	核糖体蛋白L6(rpL6)
0063	257	细胞质	延胡索酸盐(和硝酸盐)还原调节蛋白(fnr)
				0065	266	细胞质	硫胺素ABC转运蛋白，周质-结合蛋白(tbpA)
0067	86	内膜1	硫胺素ABC转运蛋白，通透酶蛋白
				0068	52	细胞质	UDP-N-乙酰基烯醇式丙酮酰葡糖胺还原酶(murB)
0069	149	细胞质	RNA聚合酶σ-32因子(rpoH)
				0070	127	细胞质	RNA聚合酶σ-32因子(rpoH)
0071	64	细胞质	NifR3/SMM1家族蛋白
				0072	201	细胞质	乙酰乳酸合成酶III大亚基(ilvI)
0073	142	内膜1	乙酰乳酸合成酶III大亚基(ilvI)
				0075	166	细胞质	乙酰乳酸合成酶III小亚基(ilvH)
0078	119	细胞质	乳清磷酸核糖基转移酶(pyrE)
				0079	36	细胞质	乳清磷酸核糖基转移酶(pyrE)
0082	144	细胞质	DNA聚合酶III，chi亚基(holC)
				0083	85	细胞质	甲基乙二醛合成酶(mgsA)
0085	340	内膜7	细胞色素C-型生物发生蛋白(ccmF)
				0086	45	细胞质	细胞色素C-型生物发生蛋白(ccmE)
0087	312	细胞质	组氨酰-tRNA合成酶(hisS)
				0088	214	细胞质	拓扑异构酶IV，亚基A(parC)
0091	212	内膜1	4-羟基-2-酮戊二酸
				0094	338	脂蛋白	锌蛋白酶
0098	358	细胞质	高丝氨酸O-乙酰基转移酶(met2)
				0099	60	细胞质	DNA回旋酶，亚基A(gyrA)
0100	56	细胞质	DNA回旋酶，亚基A(gyrA)
				0102	102	细胞质	通用应力蛋白A(uspA)
0103	290	细胞质	丙氨酰-tRNA合成酶(alaS)
				0104	81	细胞质	丙氨酰-tRNA合成酶(alaS)
0105	557	细胞质	保护性表面抗原D15(Omp85)
				0106	110	周质	外膜蛋白
0107	257	内膜1	细胞分裂蛋白(ftsZ)

0108	352	细胞质	细胞分裂蛋白(ftsA)
				0109	496	细胞质	DNA拓扑异构酶I(topA)
0112	259	细胞质	青霉素-结合蛋白1B(ponB)
				0113	35	细胞质	青霉素-结合蛋白1B(ponB)
0115	279	细胞质	青霉素-结合蛋白1A(ponA)
				0116	310	内膜1	GTP-结合蛋白
0117	243	细胞质	磷酸甘露糖变位酶(yhxB)
				0118	84	内膜0	磷酸甘露糖变位酶(yhxB)
0119	89	周质	tonB蛋白
				0120	147	周质	生物高分子转运蛋白(exbD)
0121	49	内膜1	生物高分子转运蛋白(exbB)
				0126	77	细胞质	整合酶/重组酶
0128	111	内膜1	黄嘌呤-鸟嘌呤磷酸核糖基转移酶(gptB)
				0130	184	细胞质	氨酰基-组氨酸二肽酶(pepD)
0131	35	细胞质	氨酰基-组氨酸二肽酶(pepD)
				0134	182	内膜1	磷酸核糖基甘氨酰胺甲酰基转移酶(purN)
0137	58	细胞质	GTP-结合膜蛋白(lepA)
				0141	78	细胞质	尿嘧啶DNA糖基化酶(ung)
0142	76	细胞质	醛糖1-差向异构酶(galM)
				0143	129	细胞质	半乳糖激酶(galK)
0144	197	细胞质	半乳糖激酶(galK)
				0145	346	细胞质	GTP-结合蛋白TypA
0147	179	细胞质	辫苷(queuine)tRNA-核糖基转移酶(tgt)
				0150	239	细胞质	核糖体大亚基假尿苷合成酶C
0152	463	细胞质	半乳糖苷ABC转运蛋白，ATP-结合蛋白(mglA)
				0153	247	细胞质	血凝素/溶血素-相关蛋白
0154	240	细胞质	血凝素/溶血素-相关蛋白
				0155	302	内膜7	磷酸通透酶
0157	124	内膜2	细胞色素D泛醇(ubiquinol)氧化酶，亚基I(cydA)或铁(III)ABC转运蛋白，通透酶蛋白fbpB
				0158	103	内膜2	细胞色素D泛醇氧化酶，亚基II(cydB)
0163	154	脂蛋白	15kDa肽聚糖相关脂蛋白(lpp)
				0165	165	细胞质	膜结合的溶胞壁质糖基转移酶C(mltC)

0167	194	脂蛋白	膜结合的溶胞壁质糖基转移酶C(mltC)
				0170	51	细胞质	HflK蛋白(hflK)
0174	40	周质	尾部特异蛋白酶(prc)
				0178	116	细胞质	重组蛋白(rec2)或竞争性蛋白ComA comA
0180	147	内膜2	ABC转运蛋白，ATP-结合蛋白(msbA)
				0185	220	内膜0	分支酸合成酶(aroC)
0186	156	内膜2	ATP-结合转运蛋白(cydD)
				0189	162	内膜2	杆状决定蛋白(mreD)
0190	188	周质	杆状决定蛋白(mreC)
				0196	68	细胞质	σ因子
0200	68	细胞质	汞离子捕获蛋白(merP)
				0201	68	细胞质	汞离子捕获蛋白(merP)
0202	68	细胞质	汞离子捕获蛋白(merP)
				0203	63	内膜0	OrfJ蛋白
0204	306	细胞质	青霉素-结合蛋白1A(ponA)
				0205	38	细胞质	青霉素-结合蛋白1A(ponA)
0207	175	细胞质	基因外抑制子(suhB)
				0208	64	内膜1	细胞色素C-型生物发生
0209	117	内膜2	1，4-二羟基-2-萘甲酸八异戊二烯基转移酶(menA)
				0212	203	细胞质	赖氨酰基-tRNA合成酶类似物(genX)
0215	204	细胞质	延胡索酸还原酶，黄素蛋白亚基(frdA)或琥珀酸脱氢酶，黄素蛋白亚基sdhA
				0216	48	细胞质	延胡索酸还原酶，黄素蛋白亚基(frdA)
0217	40	细胞质	延胡索酸还原酶，黄素蛋白亚基(frdA)
				0218	310	细胞质	固氮蛋白(nifR3)
0220	99	细胞质	HindIII重组增强子结合蛋白(fis)或逆转因子刺激蛋白Fis，
				0221	48	细胞质	小蛋白B(smpB)
0222	222	细胞质	镁和钴转运蛋白(corA)
				0223	91	内膜1	镁和钴转运蛋白(corA)
0225	426	细胞质	外切核糖核酸酶II(rnb)或核糖核酸酶II家族蛋白vacB
				0233	114	细胞质	尿苷酸激酶(pyrH)
0234	41	细胞质	尿苷酸激酶(pyrH)

0236	35	细胞质	磷酸-2-脱氢-3-脱氧庚酸醛缩酶(苯丙氨酸)
				0239	322	细胞质	热激(蛋白伴侣)蛋白(hscA)
0240	44	细胞质	热激(蛋白伴侣)蛋白(hscA)
				0241	193	外膜	usg-1蛋白(usg1)
0242	268	内膜2	色氨酸合成酶α亚基(trpA)
				0243	58	细胞质	色氨酸合成酶β亚基(trpB)
0244	245	周质	稳定期存活蛋白SurA或肽酰基-脯氨酰基顺-反异构酶
				0245	191	细胞质	嘧啶操纵子调节蛋白(pyrR)或次黄嘌呤-鸟嘌呤磷酸核糖基转移酶
0246	153	细胞质	MazG蛋白(mazG)
				0247	159	内膜3	ATP合成酶F0，亚基a(atpB)
0249	203	细胞质	葡萄糖抑制性分裂蛋白(gidB)
				0257	289	细胞质	硒代半胱氨酸-特异性延长因子(selB)
0258	212	细胞质	丙酮酸脱氢酶，E1组分(aceE)
				0259	61	细胞质	丙酮酸脱氢酶，E1组分(aceE)
0260	505	细胞质	核糖核酸酶E(rne)
				0262	303	细胞质	ATP-依赖性解旋酶(dinG)
0263	276	内膜7	硫胺素ABC转运蛋白，通透酶蛋白
				0266	121	细胞质	N利用底物蛋白B(nusB)
0267	160	细胞质	硫胺素-单磷酸激酶(thiL)
				0268	144	细胞质	硫胺素-单磷酸激酶(thiL)
0269	163	内膜3	磷脂酰甘油磷酸酶A(pgpA)
				0272	44	细胞质	核糖体蛋白L34(rpL34)
0273	119	细胞质	核糖核酸酶P(rnpA)
				0275	146	细胞质	impA蛋白
0277	218	细胞质	磷酸-2-脱氢-3-脱氧庚酸醛缩酶(苯丙氨酸)
				0286	288	细胞质	GTP-结合蛋白
0287	422	细胞质	甲酸脱氢酶，β亚基(fdxH)或铁氧还蛋白，4Fe-4S细菌型
				0291	109	细胞质	甘露糖酸脱水酶(uxuA)
0292	46	细胞质	甘露糖酸脱水酶(uxuA)
				0294	171	细胞质	二羟基酸脱水酶(ilvD)
0295	308	内膜1	苏氨酸脱氨酶(ilvA)
				0296	239	细胞质	半乳糖-1-磷酸尿苷酰转移酶(galT)

0303	283	细胞质	血红蛋白-结合蛋白
				0304	68	细胞质	核糖体蛋白L24(rpL24)
0305	123	细胞质	核糖体蛋白L14(rpL14)
				0309	82	细胞质	无机焦磷酸酶(ppa)
0311	185	内膜4	磷脂酰磷酸甘油合成酶(pgsA)或CDP-二酰基甘油-甘油-3-磷酸
				0314	274	细胞质	二氢硫辛酰胺脱氢酶(1pdA)或丙酮酸脱氢酶，E3组分，硫辛酰胺
0315	38	细胞质	二氢硫辛酰胺脱氢酶(lpdA)
				0318	358	细胞质	DNA拓扑异构酶III(topB)或DNA拓扑异构酶I topA
0320	411	内膜1	Na-转运NADH-醌还原酶的Nqr6亚基
				0321	191	内膜1	单链DNA结合蛋白(ssb)
0323	141	细胞质	核酸切除酶ABC，亚基A(uvrA)
				0324	319	细胞质	IV型纤毛组装蛋白pilF
0325	200	内膜1	纤毛组装蛋白PilG pilG
				0326	386	内膜8	支链氨基酸转运系统II载体
0329	395	细胞质	胱硫醚β-裂合酶(metC)或反式-硫化酶家族蛋白
				0330	109	细胞质	sanA蛋白(sanA)
0333	96	内膜1	叶酰多谷氨酸合成酶/二氢叶酸合成酶(folC)
				0336	133	细胞质	短链脱氢酶/还原酶或氧化还原酶，短链脱氢酶/还原酶
0337	391	cytoplam	色氨酸合成酶β亚基(trpB)
				0340	151	细胞质	细胞分裂蛋白(ftsH)
0342	147	细胞质	肽甲硫氨酸亚砜还原酶pilB
				0346	46	周质	小蛋白A
0347	273	内膜7	转运蛋白
				0349	66	细胞质	蛋白酶
0351	412	内膜1	青霉素-结合蛋白1B(ponB)
				0352	291	内膜5	碳饥饿蛋白A cstA
0354	227	细胞质	GTP焦磷酸激酶(relA)
				0355	367	细胞质	GTP焦磷酸激酶(relA)
0356	65	内膜1	二酰基甘油激酶(dgkA)
				0358	56	内膜1	二酰基甘油激酶(dgkA)

0359	275	细胞质	酯酶
				0360	216	细胞质	UDP-3-O-(3-羟基肉豆蔻酰基)-葡糖胺N-酰基转移酶
0361	141	细胞质	翻译延伸因子Ts(tsf)(EF-TS)
				0365	91	细胞质	外切脱氧核糖核酸酶III(xthA)
0366	432	内膜1	血红素-血色素结合蛋白利用蛋白A(hxuA)
				0367	184	细胞质	羧基末端尾部特异性蛋白酶(prc)
0368	204	细胞质	羧基末端尾部特异性蛋白酶(prc)
				0369	163	细胞质	二羟基酸脱水酶(ilvD)
0370	201	细胞质	乙酰羟酸合成酶II或乙酰乳酸合成酶III，大亚基ilvI
				0372	306	内膜7	钠-依赖性转运蛋白或钠-和氯-依赖性转运蛋白
0373	42	细胞质	转氨酶
				0374	307	细胞质	转氨酶
0376	128	细胞质	核糖体蛋白L17(rplQ)
				0377	193	细胞质	DNA-指导的RNA聚合酶，α链(rpoA)
0380	33	细胞质	酰基神经氨酸胞苷酰基转移酶(neuA)
				0382	359	细胞质	肽酰基-脯氨酰基顺-反异构酶
0386	111	细胞质	DNA回旋酶，亚基A(gyrA)
				0387	52	细胞质	DNA回旋酶，亚基A(gyrA)
0388	242	内膜3	钠/脯氨酸同向转运蛋白(脯氨酸通透酶)(putP)
				0391	256	细胞质	厌氧核糖核酸酶-三磷酸还原酶(nrdD)
0392	87	细胞质	厌氧核糖核酸酶-三磷酸还原酶(nrdD)
				0393	211	细胞质	转氨酶
0394	117	细胞质	需氧呼吸控制蛋白ARCA(arcA)或DNA-结合效应调节物
				0397	444	内膜8	硫醇：二硫化物交换蛋白(dsbD)
0399	362	细胞质	GTP-结合膜蛋白(lepA)
				0400	437	内膜9	钠-依赖性转运蛋白
0401	206	内膜5	亚硝酸还原酶，跨膜蛋白(nrfD)
				0402	138	内膜3	细胞色素C-型生物发生蛋白或硫醇：二硫化物交换蛋白DsbD dsbD
0403	84	细胞质	肽甲硫氨酸亚砜还原酶(msrA)
				0405	299	周质	肽甲硫氨酸亚砜还原酶(msrA)

0418	297	内膜3	细胞色素D泛醇氧化酶，亚基I(cydA)
				0421	287	周质	CTP合成酶(pyrG)
0423	385	细胞质	外切脱氧核糖核酸酶VII，大亚基(xseA)
				0425	92	细胞质	寡肽ABC转运蛋白，ATP-结合蛋白(oppD)
0426	311	内膜6	寡肽ABC转运蛋白，通透酶蛋白(oppC)
				0427	232	内膜6	寡肽ABC转运蛋白，通透酶蛋白(oppB)或铁(III)ABC转运蛋白，通透酶蛋白
0428	316	细胞质	半胱氨酸合成酶(cysK)
				0431	116	细胞质	C-5胞嘧啶-特异性DNA-甲基化酶
0436	341	细胞质	肽链释放因子3(prfC)
				0437	295	内膜1	烯酰-(酰基-载体-蛋白)还原酶(fabI)
0441	66	细胞质	L-2，4-二氨基丁酸脱羧酶
				0442	222	细胞质	甲酰胺基嘧啶-DNA糖基化酶(fpg)
0443	160	细胞质	肽酶T(pepT)
				0444	178	内膜0	岩藻酮糖激酶(fucK)
0447	323	细胞质	L-岩藻糖异构酶(fucI)
				0448	119	细胞质	L-岩藻糖异构酶(fucI)
0449	193	细胞质	脱硫生物素(dethiobiotin)合成酶(bioD-1)
				0451	88	细胞质	GTP环水解酶I(folE)
0453	113	内膜1	GTP环水解酶I(folE)
				0454	78	细胞质	GTP环水解酶I(folE)
0456	212	细胞质	蛋白-PII尿苷酰转移酶(glnD)
				0457	288	内膜9	十一异戊二烯基-磷酸α-N-乙酰葡糖胺基转移酶或磷酸-N-乙酰基胞壁酰基-五肽-转移酶
0458	293	细胞质	青霉素耐受蛋白(lytB)
				0459	57	内膜1	脂蛋白信号肽酶(lspA)
0460	122	内膜1	脂蛋白信号肽酶(lspA)
				0461	433	内膜2	YhbX/YhjW/YijP/YjdB家族蛋白
0462	107	内膜2	转运蛋白
				0463	159	内膜3	转运蛋白
0464	349	细胞质	2′，3′-环-核苷酸2′-磷酸二酯酶(cpdB)
				0465	73	内膜1	铁(螯合的)ABC转运蛋白，通透酶蛋白(yfeD)
0467	215	细胞质	转录激活物
				0468	314	周质	硫胺素生物合成蛋白
0469	76	内膜1	ABC转运蛋白，通透酶蛋白

0470	328	细胞质	丙氨酰-tRNA合成酶(alaS)
				0472	122	细胞质	丙氨酰-tRNA合成酶(alaS)
0473	89	内膜0	磷脂酰丝氨酸脱羧酶酶原(psd)
				0474	261	细胞质	谷胱甘肽还原酶(gor)或2-酮戊二酸脱氢酶，E3组分
0475	241	内膜5	磷脂酰甘油磷酸酶B(pgpB)
				0476	119	细胞质	GTP环水解酶II(ribA)
0477	153	细胞质	DNA聚合酶III，δ亚基(holA)
				0479	369	细胞质	甘氨酰-tRNA合成酶，β链(glyS)
0480	305	细胞质	UDP-3-0-(3-羟基肉豆蔻酰基)N-乙酰葡糖胺脱乙酰基酶
				0481	116	细胞质	分支酸变位酶/预苯酸脱水酶(pheA)
0483	271	细胞质	脲酶辅助蛋白(ureH)
				0490	179	内膜4	谷氨酸通透酶(gltS)钠/谷氨酸同向转运蛋白
0492	95	细胞质	核糖体蛋白S6修饰蛋白(rimK)或谷胱甘肽合成酶gshB
				0493	123	内膜2	Na+/H+反向转运蛋白(nhaC)
0494	326	细胞质	木糖操纵子调节蛋白(xylR)
				0495	144	细胞质	脂多糖生物合成蛋白或乳糖-N-新丁糖生物合成糖基
0496	257	内膜1	脂多糖生物合成蛋白
				0502	46	外膜	青霉素-结合蛋白7
0503	138	细胞质	转录延伸因子(greA)
				0504	115	外膜	D-丙氨酰-D-丙氨酸
0505	370	细胞质	D-丙氨酰-D-丙氨酸或青霉素-结合蛋白3
				0506	38	细胞质	IS1016家族转座酶
0507	158	内膜1	IS1016-V6蛋白(IS1016-V6)
				0508	111	细胞质	IS1016C2转座酶
0514	296	细胞质	氨肽酶A/I(pepA)
				0515	113	细胞质	严格饥饿蛋白B(sspB)
0517	312	细胞质	1-脱氧木酮糖-5-磷酸合成酶(dxs)
				0518	150	内膜0	短链脱氢酶/还原酶
0519	348	细胞质	磷酸核糖基氨基咪唑合成酶(purM)
				0521	40	细胞质	磷酸甘油酸变位酶(gpmA)
0522	70	细胞质	核糖体蛋白L31(rpL31)

0524	158	内膜0	A/G-特异性腺嘌呤糖基化酶(mutY)
				0525	86	细胞质	A/G-特异性腺嘌呤糖基化酶(mutY)
0528	170	内膜2	甲酸脱氢酶，γ亚基(fdxI)
				0529	319	内膜2	fdhE蛋白(fdhE)
0530	137	细胞质	DNA转化蛋白(sxy)
				0532	571	细胞质	免疫球蛋白A1蛋白酶(iga1)或血凝素/溶血素-相关蛋白
0535	289	细胞质	苏氨酰-tRNA合成酶(thrS)
				0540	184	细胞质	感受态蛋白E(comE)
0542	213	细胞质	感受态蛋白F(comF)
				0543	220	细胞质	hflK蛋白(hflK)或stomatin/Mec-2家族蛋白
0544	295	内膜1	hflC蛋白(hflC)或stomatin/Mec-2家族蛋白
				0547	74	周质	钠/脯氨酸同向转运蛋白(脯氨酸通透酶)(putP)
0548	304	细胞质	胞质轴向丝状蛋白(cafA)
				0549	108	内膜1	胞质轴向丝状蛋白(cafA)
0550	93	细胞质	胞质轴向丝状蛋白(cafA)
				0552	217	细胞质	细胞分裂蛋白(mukB)
0554	248	细胞质	杀伤蛋白抑制物(kicA)
				0557	245	细胞质	FdhD蛋白(fdhD)
0558	38	细胞质	FdhD蛋白(fdhD)
				0560	30	细胞质	磷脂酰丝氨酸脱羧酶酶原(psd)
0563	56	细胞质	核糖体蛋白L32(rpL32)
				0564	225	细胞质	β-酮脂酰基-ACP合成酶III(fabH)或3-酮酰基(oxoacyl)-(酰基-载体-蛋白)合成酶III fabH
0565	368	内膜7	色氨酸-特异性转运蛋白(mtr)
				0566	409	内膜1	L-丝氨酸脱氨酶(sdaA)
0571	292	细胞质	胞苷脱氨酶(cdd)
				0574	212	内膜2	脂蛋白
0575	65	细胞质	转录调节物(bolA)
				0576	158	细胞质	NADH：泛醌氧化还原酶亚基A，Na转运或Na(+)-转运NADH-醌还原酶，亚基
0580	160	内膜0	翻译起始因子2(infB)
				0591	200	细胞质	β-磷酸葡萄糖变位酶pgmB
0592	462	细胞质	细胞分裂蛋白(mukB)

0594	393	细胞质	traN-相关蛋白
				0595	31	细胞质	GTP环水解酶II(ribA)
0596	57	细胞质	GTP环水解酶II(ribA)
				0597	345	细胞质	寡肽转运蛋白，周质-结合蛋白，
0599	32	细胞质	寡肽转运蛋白，周质-结合蛋白，
				0601	240	细胞质	氨肽酶P(pepP)
0604	37	细胞质	醛糖1-差向异构酶(galM)
				0605	195	细胞质	醛糖1-差向异构酶(galM)
0607	318	细胞质	C-5胞嘧啶-特异性DNA-甲基化酶
				0608	104	细胞质	杀伤蛋白(kicB)
0609	144	细胞质	DNA聚合酶III，δ亚基(holA)
				0611	69	细胞质	罕见脂蛋白B
0613	75	细胞质	转录调节物(nadR)
				0614	310	细胞质	转录调节物(nadR)
0616	69	细胞质	需氧呼吸控制蛋白ARCA(arcA)
				0618	368	内膜7	钠/丙氨酸同向转运蛋白
0619	303	周质	延伸因子Tu(tufB)
				0622	218	内膜4	dedA蛋白
0626	164	内膜5	lic-1操纵子蛋白(licB)
				0627	321	细胞质	lic-1操纵子蛋白(licA)
0628	235	细胞质	UDP-N-乙酰基烯醇式丙酮酰葡糖胺还原酶(murB)
				0629	179	细胞质	硝酸/亚硝酸感应蛋白(narQ)
0630	151	内膜1	小主要蛋白B(smpB)
				0632	53	细胞质	6-磷酸果糖激酶(pfkA)
0633	290	细胞质	6-磷酸果糖激酶(pfkA)
				0635	355	细胞质	I型修饰性酶(hsdM)
0636	158	内膜2	半胱氨酸合成酶(cysZ)
				0638	328	外膜	细胞分裂蛋白ZipA
0640	122	细胞质	核糖体蛋白S12(rps12)
				0641	346	细胞质	葡萄糖抑制分裂蛋白(gidA)
0646	257	内膜5	Na+/H+反向运输蛋白(nhaC)
				0647	37	外膜	Na+/H+反向运输蛋白(nhaC)
0648	362	外膜	大肠杆菌素耐受蛋白(tolB)
				0650	497	细胞质	细胞分裂蛋白(mukB)

0651	391	细胞质	血红素-结合脂蛋白(dppA)
				0652	78	细胞质	八异戊二烯基-二磷酸合成酶(ispB)
0654	103	内膜1	核糖体蛋白L21(rpL21)
				0655	85	细胞质	核糖体蛋白L27(rpL27)
0657	83	细胞质	GTP-结合蛋白(yhbZ)
				0658	75	内膜1	脂多糖生物合成蛋白
0659	55	细胞质	脂多糖生物合成蛋白
				0660	255	细胞质	钼转运蛋白(modE)
0661	34	周质	钼ABC转运蛋白，周质-结合蛋白
				0665	144	细胞质	单链DNA结合蛋白(ssb)
0670	366	细胞质	组氨醇-磷酸转氨酶(hisH)
				0671	31	细胞质	磷酸丝氨酸转氨酶(serC)
0672	31	细胞质	磷酸丝氨酸转氨酶(serC)
				0674	140	细胞质	核糖体蛋白L3(rpL3)
0675	200	内膜1	核糖体蛋白L4(rpL4)
				0676	139	内膜1	核糖体蛋白L23(rpL23)
0679	51	细胞质	ampD信号转导蛋白(ampD)
				0682	96	细胞质	溶血素
0684	208	细胞质	亚精胺/腐胺ABC转运蛋白，ATP-结合蛋白
				0685	52	细胞质	赖氨酰-tRNA合成酶类似物(genX)
0686	227	细胞质	DNA-结合效应调节物(cpxR)
				0688	256	细胞质	氨酰基-组氨酸二肽酶(pepD)
0689	185	细胞质	整合酶/重组酶(xerC)
				0698	399	细胞质	nifS蛋白
0699	51	细胞质	核酸酶
				0701	153	细胞质	DnaA-相关蛋白
0702	279	内膜7	尿嘧啶通透酶(uraA)
				0703	129	内膜3	尿嘧啶通透酶(uraA)
0704	135	细胞质	尿嘧啶磷酸核糖基转移酶(upp)
				0705	341	细胞质	谷氨酰胺酰-tRNA合成酶(glnS)
0708	78	细胞质	胞质轴向丝状蛋白(cafA)
				0709	258	内膜5	厌氧C4-二羧酸膜转运蛋白
0710	43	内膜1	厌氧C4-二羧酸膜转运蛋白
				0714	169	细胞质	蛋白-输出蛋白(secB)

0718	175	内膜1	葡萄糖抑制分裂蛋白(gidA)
				0719	224	细胞质	苏氨酰-tRNA合成酶(thrS)
0720	194	细胞质	酰基载体蛋白磷酸二酯酶(acpD)
				0723	146	细胞质	DNA拓扑异构酶I(topA)
0732	200	细胞质	重组蛋白RecR(recR)
				0733	202	细胞质	DNA拓扑异构酶III(topB)
0734	322	细胞质	S-腺苷甲硫氨酸合成酶(metX)
				0735	193	细胞质	邻氨基苯甲酸合成酶组分II(trpG)或对-氨基苯甲酸合成酶谷氨酰胺
0736	210	细胞质	对氨基苯甲酸合成酶组分
				0737	118	细胞质	叶酰多谷氨酸合成酶/二氢叶酸合成酶(folC)
0738	184	周质	乙酰-CoA羧化酶，羧基转移酶亚基β
				0739	93	细胞质	乙酰-CoA羧化酶，羧基转移酶亚基β
0740	177	内膜1	周质丝氨酸蛋白酶
				0741	321	细胞质	周质丝氨酸蛋白酶
0743	269	细胞质	tRNA假尿苷酸合成酶I(truA)
				0745	235	内膜2	肽ABC转运蛋白，ATP-结合蛋白(sapF)
0747	37	细胞质	肽ABC转运蛋白，ATP-结合蛋白(sapF)
				0748	44	细胞质	肽ABC转运蛋白，ATP-结合蛋白(sapD)
0751	86	细胞质	假尿苷合成酶RluD(rluD)
				0753	198	细胞质	tRNA(鸟嘌呤-N1)-甲基转移酶(trmD)
0754	116	细胞质	核糖体蛋白L19(rpL19)
				0758	235	细胞质	核糖体蛋白S3(rpS3)
0759	110	细胞质	核糖体蛋白L22(rpL22)
				0760	91	细胞质	核糖体蛋白S19(rpS19)
0761	180	细胞质	核糖体蛋白L2(rpL2)
				0762	221	内膜5	蛋白-输出膜蛋白(secD)
0764	406	内膜1	蛋白-输出膜蛋白(secD)
				0765	97	内膜1	前蛋白转运酶，YajC亚基(yajC)
0769	37	细胞质	辫苷(queuine)tRNA-核糖基转移酶(tgt)
				0770	371	细胞质	tRNA
0772	55	细胞质	硫胺素生物合成脂蛋白ApbE脂蛋白
				0773	35	细胞质	脂蛋白
0774	299	内膜1	硫胺素生物合成脂蛋白ApbE脂蛋白
				0777	63	细胞质	核糖体蛋白L29(rpL29)

0778	74	细胞质	核糖体蛋白L16(rpL16)
				0779	335	细胞质	二氢硫辛酰胺乙酰基转移酶(aceF)或丙酮酸脱氢酶，E2组分
0781	35	细胞质	二氢硫辛酰胺乙酰基转移酶(aceF)
				0782	549	细胞质	丙酮酸脱氢酶，E1组分(aceE)
0787	297	细胞质	甘氨酸切割系统转录激活物(gcvA)或转录调节物，LysR家族
				0788	159	外膜(outer-hand)	青霉素-结合蛋白1A(ponA)
0790	164	细胞质	感受态蛋白A(comA)
				0794	168	内膜1	感受态蛋白B(comB)
0795	134	内膜1	感受态蛋白C(comC)
				0796	172	内膜1	感受态蛋白D(comD)
0798	166	内膜1	感受态蛋白E(comE)
				0801	583	细胞质	精氨酰-tRNA合成酶(argS)
0802	100	内膜1	谷氧还蛋白(grx)
				0803	406	内膜0	β-酮脂酰基-ACP合成酶I(fabB)
0804	137	内膜1	单功能生物合成肽聚糖转糖基酶
				0805	101	细胞质	trp操纵子阻遏物(trpR)
0806	305	细胞质	可溶性溶胞壁质转糖基酶
				0807	267	细胞质	2-羟酸(甘油酸)脱氢酶
0808	30	细胞质	2-脱氢-3-脱氧磷酸辛酸醛缩酶(kdsA)
				0810	249	细胞质	2-脱氢-3-脱氧磷酸辛酸醛缩酶(kdsA)
0812	84	细胞质	hemK蛋白(hemK)
				0813	202	内膜1	hemK蛋白(hemK)
0817	411	细胞质	水解酶
				0821	240	内膜1	转录调节蛋白(ygiX)
0822	154	内膜1	感应蛋白(ygiY)
				0823	66	细胞质	感应蛋白(ygiY)
0824	316	细胞质	谷氨酰-tRNA合成酶(gltX)
				0825	80	细胞质	谷氨酰-tRNA合成酶(gltX)
0826	79	细胞质	谷氨酰-tRNA合成酶(gltX)
				0828	45	细胞质	核糖核酸酶PH(rph)
0829	278	内膜1	酰氨基磷酸核糖基转移酶(purF)
				0830	484	细胞质	DNA回旋酶，亚基A(gyrA)

0831	54	细胞质	DNA回旋酶，亚基A(gyrA)
				0833	583	细胞质	氯高铁血红素受体(hemR)或铁调节的外膜蛋白FrpB frpB
0834	143	内膜2	大肠杆菌素转运蛋白(tolQ)或生物高分子转运蛋白ExbB exbB
				0835	139	周质	大肠杆菌素转运蛋白(tolR)或生物高分子转运蛋白ExbD exbD
0836	337	内膜1	外膜整合蛋白(tolA)或IgA-特异性丝氨酸内肽酶iga
				0840	76	细胞质	ABC转运蛋白，ATP-结合蛋白
0842	31	细胞质	I型限制性酶(hsdR)
				0844	53	细胞质	修饰性甲基化酶
0845	184	细胞质	ADP-庚糖合成酶(rfaE)或aut蛋白aut
				0847	389	细胞质	精氨琥珀酸裂合酶(argH)
0848	295	周质	葡萄糖磷酸尿苷酰转移酶(galU)或UTP-葡萄糖-1-磷酸尿苷酰转移酶galU
				0849	63	周质	碳储存调节物(csrA)
0850	461	内膜4	ATP-结合蛋白(cydD)
				0851	94	内膜2	ATP-结合蛋白(cydD)
0852	160	内膜1	NAD(P)H氧化还原酶
				0856	133	周质	蛋白酶IV(sppA)
0857	152	细胞质	钼ABC转运蛋白，周质-结合蛋白
				0858	242	内膜5	钼ABC转运蛋白，通透酶蛋白(modB)或硫酸ABC转运蛋白，通透酶蛋白cysT
0859	40	细胞质	钼ABC转运蛋白，ATP-结合蛋白(modC)
				0860	245	细胞质	钼ABC转运蛋白，ATP-结合蛋白(modC)或硫酸ABC转运蛋白，ATP-结合蛋白cysA
0868	119	细胞质	I型限制性/修饰性特异性蛋白(hsdS)
				0869	90	细胞质	邻氨基苯甲酸合成酶组分I trpE
0873	145	细胞质	磷酸丝氨酸转氨酶(serC)
				0874	234	内膜2	琥珀酰-CoA合成酶，β亚基(sucC)
0875	293	内膜1	琥珀酰-CoA合成酶，α亚基(sucD)
				0882	93	细胞质	mazG蛋白(mazG)
0887	285	内膜1	3-酮酰基-(酰基-载体-蛋白)还原酶fabG-2
				0890	153	细胞质	DNA聚合酶III，δ亚基(holB)

0892	41	细胞质	硫醇：二硫化物交换蛋白(dsbD)
				0893	60	细胞质	硫醇：二硫化物交换蛋白(dsbD)
0897	234	细胞质	氨基咪唑氨甲酰核苷酸甲酰基转移酶
				0898	552	细胞质	ATP-依赖性RNA解旋酶DeaD(deaD)
0900	64	细胞质	I型限制性/修饰性特异性蛋白(hsdS)
				0903	248	细胞质	I型限制性酶(hsdR)
0905	106	细胞质	2-异丙基苹果酸合成酶(leuA)
				0907	373	细胞质	DNA加工链A(dprA)
0910	106	周质	亚硝酸还原酶，Fe-S蛋白(nrfC)
				0912	98	细胞质	亚硝酸还原酶，细胞色素C-型蛋白(nrfB)
0913	277	内膜1	细胞分裂蛋白FtsK-相关蛋白
				0914	205	外膜	外膜脂蛋白载体蛋白(lolA)
0918	286	细胞质	糖原磷酸化酶(glgP)
				0919	323	细胞质	糖原磷酸化酶(glgP)
0920	117	细胞质	糖原磷酸化酶(glgP)
				0923	253	细胞质	糖原合成酶(glgA)
0925	105	细胞质	磷酸甘油酸变位酶(gpmA)
				0934	242	细胞质	3-酮脂酰基-酰基载体蛋白还原酶(fabG)
0935	48	细胞质	丙二酰CoA-酰基载体蛋白转酰酶(fabD)
				0936	222	细胞质	丙二酰CoA-酰基载体蛋白转酰酶(fabD)
0939	111	细胞质	3-酮酰基-(酰基-载体-蛋白)合成酶III fabH
				0945	125	细胞质	钼蝶呤生物合成蛋白(moeB)或thiF蛋白thiF
0946	404	细胞质	钼蝶呤生物合成蛋白(moeA)
				0947	55	细胞质	GTP环水解酶I(folE)
0950	353	内膜2	蛋白酶(sohB)
				0954	274	细胞质	重组相关蛋白RdgC rdgC
0956	354	细胞质	腺苷甲硫氨酸-8-氨基-7-氧代壬酸转氨酶
				0958	379	细胞质	8-氨基-7-氧代壬酸合成酶(bioF)
0960	80	细胞质	ABC转运蛋白，ATP-结合蛋白
				0962	66	细胞质	ABC转运蛋白，ATP-结合蛋白
0963	317	细胞质	ABC转运蛋白，ATP-结合蛋白(msbA)
				0965	313	细胞质	四酰基二糖4-激酶lpxK
0966	254	细胞质	3-脱氧-D-甘露-辛酮糖酸胞苷酰基转移酶(kdsB)
				0967	77	细胞质	核酸切除酶ABC，亚基C(uvrC)

0969	204	细胞质	ABC转运蛋白，ATP-结合蛋白
				0974	90	细胞质	脱硫生物素合成酶(bioD-2)
0976	223	细胞质	生物素合成蛋白BioC
				0977	549	细胞质	长链脂肪酸coA连接酶
0983	574	细胞质	磷酸烯醇式丙酮酸羧化酶(ppc)
				0984	303	细胞质	gcpE蛋白(gcpE)
0988	226	细胞质	Rbs阻遏物(rbsR)
				0989	322	内膜1	核糖激酶(rbsK)或ADP-庚糖合成酶
0990	156	细胞质	D-核糖ABC转运蛋白，周质-结合蛋白(rbsB)
				0992	223	细胞质	基板组装蛋白V
0994	52	内膜0	粘连蛋白/侵染素
				0997	454	脂蛋白	多药运出泵通道蛋白mtrE
1001	273	细胞质	转录终止因子(rho)
				1002	230	内膜5	4型前菌毛蛋白样蛋白特异性前导肽酶
1003	143	内膜1	纤毛组装蛋白PilG pilG
				1007	39	细胞质	甘油-3-磷酸调节子阻遏物(glpR)
1008	306	细胞质	果糖-1，6-二磷酸酶(fbp)
				1012	233	内膜8	羟基酰基谷胱甘肽水解酶
1014	182	细胞质	亚碲酸盐抗性蛋白(tehB)
				1015	541	周质	寡肽ABC转运蛋白，周质-结合蛋白
1018	45	周质	寡肽ABC转运蛋白，通透酶蛋白(oppB)
				1019	256	细胞质	亚甲基四氢叶酸
1021	428	内膜0	L-岩藻糖通透酶(fucP)或葡萄糖/半乳糖转运蛋白gluP
				1022	216	细胞质	L-岩藻酮糖磷酸醛缩酶(fucA)
1023	144	细胞质	岩藻糖操纵子蛋白(fucU)
				1024	30	细胞质	岩藻酮糖激酶(fucK)
1030	492	细胞质	厌氧甘油-3-磷酸脱氢酶，亚基A
				1031	320	内膜1	厌氧甘油-3-磷酸脱氢酶，亚基B
1032	242	内膜5	转运蛋白
				1033	116	细胞质	砷酸还原酶
1041	70	细胞质	次黄嘌呤磷酸核糖基转移酶(hpt)
				1043	460	内膜9	质子谷氨酸同向转运蛋白或钠/二羧酸同向转运蛋白家族蛋白
1045	155	细胞质	厌氧核糖核酸酶-三磷酸还原酶激活

1046	242	细胞质	转运ATP-结合蛋白(cydC)ABC转运蛋白
				1048	212	内膜4	转运ATP-结合蛋白(cydC)
1050	359	细胞质	果糖-二磷酸醛缩酶(fba)
				1051	346	细胞质	ADP-庚糖-LPS庚糖基转移酶II rfaF
1053	56	细胞质	肽酰基-脯氨酰基顺-反异构酶
				1054	201	外膜	肽酰基-脯氨酰基顺-反异构酶
1057	452	细胞质	噻吩和呋喃氧化蛋白(thdF)
				1058	224	内膜2	内膜蛋白，60kDa(yidC)
1059	58	细胞质	核糖体蛋白S18(rpS18)
				1060	149	细胞质	核糖体蛋白L9(rpL9)
1061	577	细胞质	热激蛋白(groEL)
				1062	102	细胞质	伴侣蛋白(groES)
1063	190	内膜4	脲酶，γ亚基(ureA)
				1064	216	内膜5	杆状决定蛋白(rodA)或细胞分裂蛋白FtsWftsW
1066	66	细胞质	青霉素-结合蛋白2(pbp2)
				1068	66	细胞质	细胞分裂蛋白FtsK-相关蛋白
1071	447	细胞质	蛋白酶IV(sppA)
				1074	286	细胞质	lic-1操纵子蛋白(licD)
1075	213	外膜	氨肽酶A/I(pepA)
				1077	141	细胞质	核苷二磷酸激酶(ndk)
1078	227	细胞质	GTP-结合蛋白(yhbZ)
				1080	317	内膜1	磷酸核糖胺-甘氨酸连接酶(purD)
1081	198	细胞质	氨基咪唑氨甲酰核苷酸甲酰基转移酶
				1082	31	外膜	氨基咪唑氨甲酰核苷酸甲酰基转移酶
1083	45	内膜0	氨基咪唑氨甲酰核苷酸甲酰基转移酶
				1084	199	内膜0	sufI蛋白(sufI)
1085	125	内膜1	1-酰基-甘油-3-磷酸酰基转移酶(plsC)
				1087	75	内膜1	1-酰基-甘油-3-磷酸酰基转移酶(plsC)
1091	199	内膜4	钠-和氯-依赖性转运蛋白
				1092	217	内膜2	钾/铜-转运ATP酶
1093	68	细胞质	汞离子捕获蛋白(merP)
				1094	68	细胞质	汞离子捕获蛋白(merP)
1095	68	细胞质	汞离子捕获蛋白(merP)
				1096	144	细胞质	转录调节物，merR家族

1097	105	细胞质	met阻遏物(metJ)
				1098	109	内膜1	转录终止因子(rho)
1100	317	细胞质	延胡索酸还原酶，黄素蛋白亚基(frdA)或琥珀酸脱氢酶，黄素蛋白亚基sdhA
				1101	276	细胞质	延胡索酸还原酶，铁-硫蛋白(frdB)或琥珀酸脱氢酶，铁-硫蛋白sdhB
1102	132	内膜3	延胡索酸还原酶，15kDa疏水性蛋白(frdC)
				1103	114	内膜1	延胡索酸还原酶，13kDa疏水性蛋白(frdD)
1109	170	细胞质	末端酶，小亚基
				1116	51	细胞质	血红素-血色素结合蛋白利用蛋白A(hxuA)
1117	165	细胞质	血红素-血色素结合蛋白利用蛋白A(hxuA)
				1120	118	细胞质	二氢新蝶啶醛缩酶(folB)
1124	338	内膜1	硝酸/亚硝酸感应蛋白(narQ)
				1125	225	内膜1	拓扑异构酶IV，亚基A(parC)
1127	139	细胞质	葡萄糖激酶
				1132	202	细胞质	I型修饰性酶(hsdM)
1135	260	细胞质	I型修饰性酶(hsdM)
				1137	362	细胞质	I型限制性/修饰性特异性蛋白(hsdS)
1138	226	内膜0	硫胺素-磷酸焦磷酸化酶
				1139	254	细胞质	磷酸甲基嘧啶激酶(thiD)
1140	32	细胞质	磷酸甲基嘧啶激酶(thiD)
				1141	263	内膜1	羟乙基噻唑激酶
1143	70	细胞质	外膜蛋白NsgA
				1144	51	细胞质	核糖核酸酶E(rne)
1145	75	细胞质	核糖核酸酶E(rne)
				1148	42	细胞质	核糖核酸酶E(rne)
1151	180	内膜1	腺嘌呤磷酸核糖基转移酶(apt)
				1152	311	细胞质	DNA聚合酶III，亚基γ和τ(dnaX)
1154	221	细胞质	DNA聚合酶III，亚基γ和τ(dnaX)
				1155	173	细胞质	DNA聚合酶III，亚基γ和τ(dnaX)
1156	60	细胞质	尿嘧啶磷酸核糖基转移酶(upp)
				1165	406	细胞质	nifS蛋白(nifS)
1166	151	细胞质	iscU蛋白(iscU)
				1167	107	细胞质	HesB/YadR/YfhF家族蛋白
1168	174	细胞质	辅助陪伴(co-chaperone)蛋白Hsc20(hscB)

1171	151	细胞质	热激蛋白(hscA)
				1172	53	细胞质	D-乳酸脱氢酶(dld)
1173	36	细胞质	I型限制性酶EcoR124II R蛋白，
				1174	183	脂蛋白	脂蛋白(spr)
1175	194	细胞质	tldD蛋白tldD
				1177	44	细胞质	血红蛋白-结合蛋白
1180	234	细胞质	肽酶E(pepE)
				1182	386	细胞质	核糖体蛋白S1(rpS1)
1183	94	细胞质	整合宿主因子，β-亚基(himD)
				1186	194	细胞质	乳清苷5′-磷酸脱羧酶(pyrF)
1188	181	内膜1	脂多糖生物合成蛋白
				1189	264	内膜1	α-1，2-N-乙酰葡糖胺转移酶rfaK
1190	57	周质	脂多糖生物合成蛋白
				1191	304	内膜2	α-2，3-唾液酸转移酶
1192	160	内膜4	脂多糖生物合成蛋白
				1197	124	细胞质	尿苷激酶(udk)
1198	195	细胞质	脱氧胞苷三磷酸脱氨酶(dcd)
				1201	402	内膜10	药物抗性转运酶家族蛋白
1202	158	细胞质	GTP-结合蛋白
				1203	55	外膜	血红蛋白-结合蛋白
1206	736	细胞质	TonB-依赖性受体或血红蛋白受体hmbR
				1207	91	细胞质	转录调节物，HTH_3家族
1212	230	细胞质	甘氨酰-tRNA合成酶，β链(glyS)
				1218	244	细胞质	甘氨酰-tRNA合成酶，α链(glyQ)
1228	198	细胞质	丝氨酰-tRNA合成酶(serS)
				1229	282	内膜2	细胞色素C-型生物发生蛋白(nrfF)
1230	176	内膜1	硫醇：二硫化物交换蛋白(dsbE)
				1231	507	内膜9	细胞色素C-型生物发生
1233	380	内膜1	谷氨酸脱氢酶(gdhA)
				1242	135	细胞质	转录调节物
1253	266	细胞质	转录调节物蛋白
				1254	101	内膜3	半乳糖苷ABC转运蛋白，通透酶蛋白(mglC)
1256	185	内膜6	内膜分隔蛋白A ispA
				1258	154	细胞质	酰基CoA硫酯水解酶家族蛋白

1261	158	周质	可溶性溶胞壁质转糖基酶
				1263	229	细胞质	吡哆胺磷酸氧化酶(pdxH)
1264	162	细胞质	GTP-结合蛋白
				1266	69	细胞质	NAD(P)H-黄素氧化还原酶
1267	386	细胞质	ATP-结合蛋白(mrp)
				1268	460	周质	甲硫氨酰-tRNA合成酶(metG)
1269	70	细胞质	磷酸核糖基氨基咪唑羧化酶，催化性
				1272	596	细胞质	氨肽酶N(pepN)
1273	175	内膜1	二氢吡啶二羧酸还原酶(dapB)
				1274	82	细胞质	铁氧还蛋白
1276	329	细胞质	苯基丙氨酰-tRNA合成酶，α亚基(pheS)
				1277	373	细胞质	苯基丙氨酰-tRNA合成酶，β亚基(pheT)
1278	286	细胞质	DNA腺嘌呤甲基化酶(dam)
				1279	298	内膜1	3-脱氢奎尼酸合成酶(aroB)
1280	74	内膜2	NADH：泛醌氧化还原酶，Na转运性
				1281	208	内膜6	NADH：泛醌氧化还原酶，Na转运性
1282	269	内膜1	NADH：泛醌氧化还原酶，Na转运性
				1283	411	内膜7	NADH：泛醌氧化还原酶，亚基B(nqrB)
1284	48	细胞质	NADH：泛醌氧化还原酶亚基A，Na转运性
				1285	254	细胞质	NADH：泛醌氧化还原酶亚基A，Na转运性
1286	85	内膜1	氮固定蛋白(rnfG)
				1287	358	内膜9	Na(+)-转运NADH-醌还原酶，亚基
1290	679	外膜	铁氧还蛋白，4Fe-4S细菌型
				1291	58	细胞质	铁氧还蛋白，4Fe-4S细菌型
1295	406	内膜1	多核糖核苷酸核苷酸转移酶pnp
				1297	296	内膜1	多核糖核苷酸核苷酸转移酶pnp
1302	452	内膜1	O-琥珀酰基苯甲酸-CoA连接酶(menE)或长链脂肪酸-CoA连接酶fadD-2
				1303	201	细胞质	seqA蛋白(seqA)
1304	85	细胞质	酯酶/脂酶
				1305	65	内膜1	酯酶/脂酶
1306	144	内膜0	酯酶/脂酶
				1307	41	内膜1	铁(螯合的)ABC转运蛋白，通透酶蛋白(yfeD)
1308	147	内膜2	铁(螯合的)ABC转运蛋白，通透酶蛋白(yfeD)

1309	282	内膜8	铁(螯合的)ABC转运蛋白，通透酶蛋白(yfeC)
				1310	306	细胞质	铁(螯合的)转运蛋白，ATP-结合蛋白(yfeB)
1311	293	周质	铁(螯合的)ABC转运蛋白，周质-结合蛋白
				1313	154	脂蛋白	外膜整合蛋白(tolA)或IgA-特异性丝氨酸内肽酶iga
1314	253	细胞质	青霉素-结合蛋白7
				1318	41	细胞质	转录激活物(ilvY)
1319	292	内膜9	rarD蛋白
				1320	105	细胞质	glpE蛋白(glpE)
1321	263	内膜1	丙糖磷酸异构酶(tpiA)
				1323	107	细胞质	整合酶/重组酶(xerC)
1324	100	细胞质	dnaK阻遏物蛋白(dksA)
				1326	58	细胞质	poly(A)聚合酶(pcnB)
1327	450	内膜10	C4-二羧酸转运蛋白
				1331	131	细胞质	尿嘧啶DNA糖基化酶(ung)
1332	124	内膜2	双环霉素抗性蛋白(bcr)
				1338	50	细胞质	γ-谷氨酰磷酸还原酶(proA)
1339	47	细胞质	γ-谷氨酰磷酸还原酶(proA)
				1340	39	细胞质	γ-谷氨酰磷酸还原酶(proA)
1341	319	内膜1	γ-谷氨酰磷酸还原酶(proA)
				1343	98	细胞质	热激蛋白(dnaJ)
1344	133	细胞质	乙酰-CoA羧化酶，生物素羧基载体蛋白
				1345	443	细胞质	乙酰-CoA羧化酶，生物素羧化酶(accC)
1348	320	内膜7	钠/泛酸同向转运蛋白(panF)
				1349	493	细胞质	细胞分裂蛋白(ftsH)
1351	201	细胞质	二氢蝶酸合成酶(folP-2)
				1352	445	细胞质	mrsA蛋白(mrsA)或磷酸葡萄糖变位酶/磷酸甘露糖变位酶家族
1355	438	细胞质	DNA-指导的RNA聚合酶，β′链(rpoC)
				1357	172	内膜2	杆状决定蛋白(rodA)
1359	621	内膜1	青霉素-结合蛋白2(pbp2)
				1361	193	细胞质	修饰性甲基化酶NlaIV
1363	432	内膜1	3-磷酸莽草酸-1-羧基乙烯基转移酶(aroA)或3-

1365	298	内膜1	甲酰基四氢叶酸脱甲酰基酶(purU)或磷酸核糖基甘氨酰胺甲酰基转移酶purN
				1366	138	细胞质	DNA-结合蛋白H-NS(hns)
1369	66	细胞质	DNA聚合酶III，α亚基(dnaE)
				1370	35	细胞质	DNA聚合酶III，α亚基(dnaE)
1371	847	细胞质	DNA聚合酶III，α亚基(dnaE)
				1373	118	细胞质	苏氨酸脱氨酶(ilvA)
1378	196	细胞质	MutT/nudix家族蛋白
				1379	382	内膜1	谷氨酸5-激酶(γ-谷氨酰激酶)(proB)
1380	128	内膜0	二氢叶酸还原酶(folA)
				1381	46	细胞质	二氢叶酸还原酶(folA)
1383	392	内膜2	多药抗性蛋白A(emrA)或脂肪酸运出系统蛋白farA
				1384	343	细胞质	poly(A)聚合酶(pcnB)
1386	106	细胞质	2-氨基-4-羟基-6-羟甲基二氢蝶啶-
				1388	432	周质	N-乙酰胞壁酰(muramoyl)-L-丙氨酸酰胺酶
1389	227	细胞质	DNA错配修复蛋白(mutL)
				1392	247	细胞质	hemY蛋白(hemY)
1393	175	内膜1	hemY蛋白(hemY)
				1394	377	周质	尿卟啉-III C-甲基转移酶(hemX)
1398	194	内膜0	转录激活物(ilvY)
				1400	492	内膜1	酮醇酸还原异构酶(ilvC)
1401	426	细胞质	厌氧甘油-3-磷酸脱氢酶，亚基C
				1402	30	细胞质	tRNA(鸟嘌呤-N1)-甲基转移酶(trmD)
1403	59	细胞质	16S rRNA加工蛋白RimM rimM
				1404	81	细胞质	16S rRNA加工蛋白RimM rimM
1405	82	细胞质	核糖体蛋白S16(rpS16)
				1407	603	周质	5′-核苷酸酶
1408	128	细胞质	莽草酸激酶I(aroK)
				1410	249	细胞质	稳定期存活蛋白(surE)
1411	128	内膜2	脂蛋白B(lppB)
				1412	74	内膜1	脂蛋白B(lppB)
1416	354	脂蛋白	脂蛋白NlpD
				1417	56	细胞质	脂蛋白NlpD
1420	62	内膜1	磷酸ABC转运蛋白，通透酶蛋白(pstC)

1421	282	内膜5	磷酸ABC转运蛋白，通透酶蛋白(pstA)或硫酸ABC转运蛋白，通透酶蛋白cysT
				1422	255	细胞质	氨基酸ABC转运蛋白，ATP-结合蛋白或硫酸ABC转运蛋白，ATP-结合蛋白cysA
1423	154	细胞质	磷酸调节子转录调节蛋白(phoB)或DNA-结合效应调节物NULL
				1424	72	细胞质	磷酸调节子转录调节蛋白(phoB)
1425	425	内膜1	磷酸调节子感应蛋白(phoR)或感应组氨酸激酶NULL
				1426	44	细胞质	外切脱氧核糖核酸酶I(sbcB)
1427	474	内膜1	外切脱氧核糖核酸酶I(sbcB)
				1428	158	内膜1	氨肽酶A/I(pepA)
1429	480	内膜5	高亲和力胆碱转运蛋白(betT)
				1430	132	内膜2	高亲和力胆碱转运蛋白(betT)
1431	57	内膜0	感应蛋白(ygiY)
				1432	139	细胞质	高亲和力核糖转运蛋白(rbsD)
1433	493	细胞质	D-核糖ABC转运蛋白，ATP-结合蛋白(rbsA)
				1434	323	内膜9	D-核糖ABC转运蛋白，通透酶蛋白(rbsC)
1435	53	周质	D-核糖ABC转运蛋白，周质-结合蛋白
				1436	88	细胞质	D-核糖ABC转运蛋白，周质-结合蛋白(rbsB)
1438	246	内膜6	血红素运出蛋白C(ccmC)或细胞色素c-型生物发生蛋白
				1439	221	内膜6	血红素运出蛋白B(ccmB)
1440	212	细胞质	血红素运出ATP-结合蛋白A(ccmA)或氨基酸ABC转运蛋白，ATP-结合蛋白
				1442	215	细胞质	过氧化物岐化酶(sodA)
1443	231	细胞质	ABC转运蛋白，ATP-结合蛋白
				1445	105	细胞质	抗-σ因子B拮抗剂
1446	99	细胞质	BolA/YrbA家族蛋白
				1447	424	内膜3	UDP-N-乙酰葡糖胺1-羧基乙烯基转移酶(murZ)
1448	110	内膜1	氨基酸ABC转运蛋白，周质-结合蛋白
				1449	135	细胞质	氨基酸ABC转运蛋白，周质-结合蛋白
1450	234	内膜3	氨基酸ABC转运蛋白，通透酶蛋白
				1456	51	细胞质	ATP-依赖性Clp蛋白酶，ATP酶亚基(clpB)

1457	246	细胞质	RNA甲基转移酶，TrmH家族
				1459	782	细胞质	毒力相关蛋白(vacB)或核糖核酸酶II家族蛋白vacB
1460	83	细胞质	肽酰基-脯氨酰基顺-反异构酶，FkbP-型(slyD)或FKBP-型肽酰基-脯氨酰基顺-反异构酶
				1462	128	细胞质	核糖体结合因子A(rbfA)
1463	306	细胞质	tRNA假尿苷55合成酶(truB)
				1464	379	内膜1	分支酸变位酶/预苯酸脱氢酶(tyrA)
1467	38	内膜1	分支酸合成酶(aroC)
				1468	286	周质	青霉素-不敏感胞壁质内肽酶(mepA)
1472	318	内膜2	脂蛋白A生物合成(kdo)2-(月桂酰基)-脂蛋白IVA或HtrB/MsbB家族蛋白
				1473	126	内膜1	寡肽转运蛋白，周质-结合蛋白，
1475	696	细胞质	寡肽酶A(prlC)
				1476	292	细胞质	I型修饰性酶(hsdM)
1477	196	细胞质	I型修饰性酶(hsdM)
				1480	204	细胞质	核黄素合成酶，α链(ribE)
1482	212	细胞质	氨肽酶N(pepN)
				1483	140	细胞质	谷氨酰胺酰-tRNA合成酶(glnS)
1485	699	细胞质	4-α-葡聚糖转移酶(malQ)
				1499	273	细胞质	谷氨酰胺合成酶(glnA)
1500	96	内膜1	谷氨酰胺合成酶(glnA)
				1501	50	细胞质	谷氨酰胺合成酶(glnA)
1503	347	内膜0	DTDP-葡萄糖4，6-脱水酶(rffG)
				1505	527	细胞质	拓扑异构酶IV，亚基B(parE)
1506	315	内膜1	脂蛋白A生物合成月桂酰基氨酰基转移酶(htrB)
				1507	308	细胞质	ADP-庚糖合成酶(rfaE)
1508	83	细胞质	DNA-指导的RNA聚合酶，β′链(rpoC)
				1509	829	细胞质	DNA-指导的RNA聚合酶，β′链(rpoC)
1510	332	内膜8	亚碲酸盐抗性蛋白(tehA)
				1511	81	细胞质	核糖体蛋白L13(rpL13)
1512	153	细胞质	核糖体蛋白S9(rpS9)
				1513	101	细胞质	脲酶，β亚基(ureB)
1514	572	细胞质	脲酶，α亚基(ureC)

1515	185	内膜1	脲酶辅助蛋白(ureE)
				1519	183	细胞质	脲酶辅助蛋白(ureF)
1520	107	细胞质	脲酶辅助蛋白(ureG)
				1523	334	细胞质	鸟氨酸氨甲酰基转移酶(arcB)
1524	310	细胞质	氨基甲酸激酶(arcC)
				1526	193	内膜3	运出泵组分MtrF mtrF
1527	113	内膜2	厌氧C4-二羧酸膜转运蛋白
				1528	136	内膜1	NADH脱氢酶(ndh)
1530	315	细胞质	NADH脱氢酶(ndh)
				1531	410	内膜1	甘油-3-磷酸酰基转移酶(plsB)
1532	367	内膜0	甘油-3-磷酸酰基转移酶(plsB)
				1533	75	细胞质	lexA阻遏物(lexA)
1534	121	细胞质	混浊蛋白或外膜蛋白NsgA nsgA
				1537	227	内膜4	精氨酸ABC转运蛋白，通透酶蛋白(artM)
1538	221	内膜4	精氨酸ABC转运蛋白，通透酶蛋白(artQ)
				1539	72	细胞质	精氨酸ABC转运蛋白，周质-结合蛋白(artI)
1541	99	周质	精氨酸ABC转运蛋白，周质-结合蛋白
				1542	243	细胞质	精氨酸ABC转运蛋白，ATP-结合蛋白(artP)
1544	69	细胞质	磷酸庚糖异构酶(gmhA)
				1545	73	细胞质	莽草酸5-脱氢酶-相关蛋白
1546	267	细胞质	丝氨酸乙烯基转移酶(cysE)
				1548	332	内膜1	甘油-3-磷酸脱氢酶(NAD+)(gpsA)
1549	567	细胞质	腺苷酸环化酶(cyaA)
				1550	42	细胞质	腺苷酸环化酶(cyaA)
1551	228	细胞质	腺苷酸环化酶(cyaA)
				1552	110	脂蛋白	核糖体-蛋白-丙氨酸乙酰基转移酶(rimI)
1554	134	细胞质	DNA聚合酶III，psi亚基(holD)
				1556	222	细胞质	hemK蛋白hemK
1558	181	细胞质	GTP-结合蛋白(era)
				1559	125	内膜0	GTP-结合蛋白(era)
1561	227	细胞质	核糖核酸酶III(rnc)
				1562	349	内膜3	信号肽酶I(lepB)
1565	345	细胞质	尾部纤维蛋白
				1568	395	细胞质	酪氨酰tRNA合成酶(tyrS)

1569	315	内膜1	磷酸核糖基焦磷酸合成酶(prsA)
				1575	72	内膜1	IS1016-V6蛋白
1576	563	细胞质	葡萄糖-6-磷酸异构酶(pgi)
				1577	360	细胞质	丙氨酸消旋酶，生物合成的(alr)
1578	126	细胞质	复制型DNA解旋酶(dnaB)
				1579	303	细胞质	复制型DNA解旋酶(dnaB)
1582	991	外膜(outer-hand)	血红蛋白-结合蛋白
				1583	237	细胞质	锌蛋白酶
1584	276	内膜1	腺苷酸基琥珀酸合成酶(purA)
				1585	41	细胞质	腺苷酸基琥珀酸合成酶(purA)
1586	297	内膜1	2，3，4，5-四氢吡啶-2-羧酸酯
				1588	336	内膜1	嘌呤核苷酸合成阻遏物(purR)
1589	78	细胞质	磷酸烯醇式丙酮酸羧化酶(ppc)
				1590	45	内膜1	核糖体蛋白S1(rpS1)
1591	244	细胞质	胞苷酸激酶2(cmkB)
				1593	291	细胞质	单线态氧抗性蛋白
1597	549	内膜1	D-乳酸脱氢酶(dld)
				1609	462	内膜1	氧化还原酶
1610	199	细胞质	亚精胺/腐胺ABC转运蛋白，周质-结合
				1613	41	细胞质	碳酸酐酶
1614	647	细胞质	ABC转运蛋白，ATP-结合蛋白
				1618	289	内膜6	细胞色素C-型生物发生蛋白(ccmF)
1619	181	周质	硫醇：二硫化物交换蛋白(dsbE)
				1624	152	细胞质	DNA连接酶(lig)
1625	1027	内膜1	I型限制性酶(hsdR)
				1627	123	细胞质	反密码子核酸酶prrC
1629	177	内膜1	寡肽ABC转运蛋白，ATP-结合蛋白(oppD)或硫酸ABC转运蛋白，ATP-结合蛋白cysA
				1630	356	细胞质	寡肽ABC转运蛋白，ATP-结合蛋白(oppF)或硫酸ABC转运蛋白，ATP-结合蛋白cysA
1631	292	内膜1	膜蛋白(lapB)
				1635	683	细胞质	5-甲基四氢蝶酰基三谷氨酸-高半胱氨酸
1636	73	细胞质	5-甲基四氢蝶酰基三谷氨酸-高半胱氨酸
				1639	363	细胞质	GTP-结合蛋白

1640	194	细胞质	肽酰基-tRNA水解酶(pth)
				1645	163	细胞质	外切脱氧核糖核酸酶VII，大亚基(xseA)
1646	183	细胞质	YhbX/YhjW/YijP/YjdB家族蛋白
				1648	242	细胞质	热激蛋白(dnaJ)
1650	320	细胞质	热激蛋白70(dnaK)
				1651	327	细胞质	热激蛋白70(dnaK)
1653	411	内膜8	葡糖酸通透酶gntP
				1659	269	细胞质	钼辅助因子生物合成蛋白A(moaA)
1662	337	内膜2	糖异构酶，KpsF/GutQ家族
				1664	531	内膜1	单链DNA-特异性核酸外切酶(recJ)
1665	39	细胞质	单链DNA-特异性核酸外切酶(recJ)
				1666	235	外膜	硫醇：二硫化物交换蛋白(dsbA)
1668	230	内膜1	pfs蛋白(pfs)或5-甲基硫代腺苷
				1670	565	细胞质	转铁蛋白-结合蛋白或TonB-依赖性受体
1671	568	内膜1	Ion蛋白酶或ATP-依赖性蛋白酶La Ion
				1672	139	细胞质	3-羟基癸酰基-(酰基载体-蛋白)脱水酶(fabA)
1678	155	细胞质	细菌铁蛋白共迁移蛋白(bcp)
				1679	286	细胞质	二氢吡啶二羧酸合成酶(dapA)
1680	209	脂蛋白	脂蛋白
				1681	107	细胞质	σ(54)调制蛋白
1682	312	细胞质	糖基转移酶
				1688	613	内膜2	感应组氨酸激酶
1690	145	内膜1	UDP-N-乙酰葡糖胺乙酰基转移酶(lpxA)
				1692	403	内膜0	脂蛋白-A-二糖合成酶(lpxB)
1693	197	内膜1	核糖核酸酶HII(rnhB)
				1694	146	细胞质	修饰性甲基化酶
1696	185	细胞质	核糖体释放因子(rrf)
				1698	226	内膜1	1-脱氧-D-木酮糖5-磷酸还原异构酶(dxr)
1700	171	细胞质	1-脱氧-D-木酮糖5-磷酸还原异构酶(dxr)
				1704	370	细胞质	核糖核苷二磷酸还原酶，α链(nrdA)
1705	39	细胞质	核糖核苷二磷酸还原酶，β链(nrdB)
				1706	311	细胞质	核糖核苷二磷酸还原酶，β链(nrdB)
1707	409	内膜1	2-酮戊二酸脱氢酶E2组分，二氢硫辛酰胺
				1708	222	细胞质	2-酮戊二酸脱氢酶E1组分(sucA)

1709	184	细胞质	核糖体蛋白S4(rpS4)
				1712	314	内膜2	磷酸丝氨酸磷酸酶(serB)
1714	680	细胞质	转酮酶1(tktA)
				1716	333	细胞质	生物素合成酶(bioB)
1717	217	细胞质	硫胺素ABC转运蛋白，ATP-结合蛋白或亚精胺/腐胺ABC转运蛋白，ATP-结合
				1718	84	内膜1	硫胺素ABC转运蛋白，通透酶蛋白
1719	77	内膜1	钼蝶呤生物合成蛋白(mog)
				1720	112	细胞质	氮调节蛋白P-II(glnB)
1722	348	内膜6	转运蛋白
				1724	264	周质	引发体蛋白N′(priA)
1725	487	内膜1	引发体蛋白N′(priA)
				1726	102	细胞质	PTS系统，葡萄糖-特异性IIA组分(crr)
1729	581	内膜1	磷酸烯醇式丙酮酸-蛋白磷酸转移酶(ptsI)
				1730	92	细胞质	磷酸载体蛋白HPr(ptsH)
1733	189	细胞质	寡核糖核酸酶orn
				1735	294	内膜2	苯基丙氨酰-tRNA合成酶，β亚基(pheT)
1736	53	细胞质	整合宿主因子，α-亚基(himA)
				1738	47	细胞质	整合宿主因子，α-亚基(himA)
1739	161	脂蛋白	脂蛋白(nlpC)
				1747	87	细胞质	丙酮酸激酶，II型(pykA)
1758	387	细胞质	修饰性甲基化酶NIaIV
				1766	90	细胞质	外切脱氧核糖核酸酶，小亚基(xseB)
1767	296	内膜1	牻牛儿基转移酶(geranyltranstransferase)(ispA)
				1768	316	细胞质	1-脱氧木酮糖-5-磷酸合成酶(dxs)
1770	99	内膜1	糖基转移酶
				1771	464	细胞质	延胡索酸水合酶，II类(fumC)
1776	315	细胞质	二氢乳清酸脱氢酶(pyrD)
				1780	669	细胞质	转铁蛋白-结合蛋白2前体(tbp2)
1781	560	周质	转铁蛋白-结合蛋白1前体(tbp1)
				1782	152	内膜1	脱氧尿苷三磷酸酶(dut)
1783	400	内膜1	DNA/泛酸代谢黄素蛋白(dfp)
				1785	234	细胞质	DNA修复蛋白(radC)
1786	82	细胞质	核糖体蛋白L28(rpL28)
				1787	56	细胞质	核糖体蛋白L33(rpL33)

1788	454	内膜1	L-2，4-二氨基丁酸：2-酮戊二酸4-转氨酶或乙酰基鸟氨酸转氨酶argD
				1790	132	细胞质	毒力相关蛋白C(vapC)
1791	443	细胞质	L-2，4-二氨基丁酸脱羧酶
				1792	434	细胞质	ATP-依赖性RNA解旋酶(hrpa)
1793	780	内膜1	ATP-依赖性RNA解旋酶(hrpa)
				1794	122	细胞质	ATP-依赖性解旋酶(hrpa)
1799	243	内膜5	细胞色素D泛醇氧化酶，亚基II(cydB)
				1800	198	细胞质	uxu操纵子调节物(uxuR)
1801	51	细胞质	甘露糖酸脱水酶(uxuA)
				1802	33	细胞质	酰基载体蛋白(acpP)
1803	220	内膜5	厌氧C4-二羧酸膜转运蛋白
				1805	486	内膜5	NAD(P)转氢酶，亚基α(pntA)
1806	474	内膜7	NAD(P)转氢酶，亚基β(pntB)
				1807	305	周质	转录调节物
1808	70	细胞质	DNA拓扑异构酶I(topA)
				1809	50	细胞质	信号识别颗粒蛋白(ffh)
1812	88	细胞质	I型限制性酶(hsdR)
				1813	646	内膜1	I型限制性酶(hsdR)
1815	418	内膜1	I型限制性/修饰性特异性蛋白(hsdS)
				1819	545	外膜	血红素-血色素结合蛋白利用蛋白B(hxuB)
1825	402	细胞质	木糖异构酶(xylA)
				1826	493	细胞质	木酮糖激酶
1827	308	细胞质	ADP-L-甘油基-D-甘露庚糖-6-差向异构酶(rfaD)
				1828	167	内膜1	硫氧还蛋白
1830	223	细胞质	脱氧核糖-磷酸醛缩酶(deoC)
				1831	509	细胞质	感受态蛋白(comM)
1834	72	细胞质	葡萄糖激酶
				1835	288	内膜1	RpiR/YebK/YfhH家族蛋白
1836	293	内膜0	N-乙酰基神经氨酸裂合酶(nanA)或二氢吡啶二羧酸合成酶dapA
				1838	270	细胞质	葡糖胺-6-磷酸异构酶(nagB)
1839	381	细胞质	N-乙酰葡糖胺-6-磷酸脱乙酰基酶(nagA)
				1840	107	细胞质	外膜蛋白P2(ompP2)

1841	38	细胞质	DNA聚合酶III，δ亚基(holB)
				1845	716	外膜(outer-hand)	LavA毒力蛋白
1846	237	细胞质	胸苷酸激酶
				1848	265	细胞质	精氨琥珀酸合成酶(argG)
1855	97	细胞质	外切核糖核酸酶II(rnb)
				1858	188	细胞质	L-乳酸脱氢酶(lctD)
1859	269	内膜1	谷氨酸消旋酶(murI)
				1860	693	细胞质	ATP-依赖性DNA解旋酶(recG)
1861	515	内膜1	鸟苷-3′，5′-双(二磷酸)3′-焦磷酸水解酶
				1867	69	细胞质	钼蝶呤结合蛋白(mopI)
1868	109	细胞质	脱硫绿胶霉素γ亚基
				1870	393	内膜1	杀伤蛋白(kicB)
1871	343	周质	烯醇酶(eno)
				1875	508	细胞质	过氧化氢酶(hktE)
1876	50	细胞质	葡糖胺-果糖-6-磷酸转氨酶(glmS)
				1877	232	细胞质	糖原合成酶(glgA)
1879	174	细胞质	葡萄糖-1-磷酸腺苷酰转移酶(glgC)
				1880	283	细胞质	葡萄糖-1-磷酸腺苷酰转移酶(glgC)
1881	435	内膜1	糖原操纵子蛋白(glgX)
				1882	229	内膜1	糖原操纵子蛋白(glgX)
1883	685	细胞质	1，4-α-葡聚糖分支酶(glgB)
				1884	119	细胞质	核糖体蛋白S10(rpS10)
1885	315	内膜1	Cys调节子转录激活物cysB
				1886	217	细胞质	乙酸CoA-转移酶，α亚基
1887	233	细胞质	乙酸CoA-转移酶，β亚基(atoA)
				1888	344	内膜5	短链脂肪酸转运蛋白(atoE)
1889	84	内膜1	短链脂肪酸转运蛋白(atoE)
				1890	393	细胞质	乙酰-CoA乙酰基转移酶(atoB)
1891	310	内膜4	细胞分裂蛋白(ftsX)
				1892	119	周质	细胞分裂ATP-结合蛋白(ftsE)
1893	129	细胞质	细胞分裂ATP-结合蛋白(ftsE)
				1894	175	细胞质	信号识别颗粒-停靠蛋白FtsY(ftsY)
1895	243	细胞质	肽ABC转运蛋白，ATP-结合蛋白(sapD)
				1896	105	内膜2	肽ABC转运蛋白，通透酶蛋白(sapC)

1897	50	周质	肽ABC转运蛋白，通透酶蛋白(sapC)
				1898	184	内膜4	肽ABC转运蛋白，通透酶蛋白(sapC)
1899	321	内膜6	肽ABC转运蛋白，通透酶蛋白(sapB)
				1900	564	外膜	肽ABC转运蛋白，周质-结合蛋白(sapA)
1903	72	细胞质	磷酸烯醇式丙酮酸羧化酶(ppc)
				1905	337	细胞质	氧化还原酶
1906	624	内膜1	氧化还原酶
				1908	323	内膜0	亚铁螯合酶(hemH)
1913	321	细胞质	硫氧还蛋白还原酶(trxB)
				1915	127	细胞质	巯基过氧化物酶(tpx)
1917	286	周质	磷酸核糖基甲酰基甘氨脒合成酶(purL)
				1919	960	内膜1	磷酸核糖基甲酰基甘氨脒合成酶(purL)
1923	247	内膜0	脂寡糖生物合成蛋白
				1925	172	内膜5	glp蛋白
1926	235	细胞质	核糖体大亚基假尿苷合成酶D
				1927	923	内膜1	ATP-依赖性解旋酶(hepA)
1928	249	细胞质	L-岩藻糖操纵子激活物(fucR)或转录调节物，DeoR家族
				1929	568	细胞质	ABC转运蛋白，ATP-结合蛋白
1932	440	细胞质	血红蛋白-结合蛋白
				1933	158	细胞质	血红蛋白-结合蛋白
1934	140	细胞质	3，4-二羟基-2-丁酮4-磷酸合成酶(ribB)或GTP环水解酶
				1935	282	内膜1	脂寡糖生物合成蛋白或乳-N-新丁糖生物合成糖基
1936	160	细胞质	rRNA甲基化酶
				1938	355	细胞质	信号识别颗粒-停靠蛋白FtsY(ftsY)
1939	622	内膜9	O-抗原乙酰基转移酶
				1940	380	细胞质	核糖核酸酶D(rnd)
1941	562	内膜2	长链脂肪酸辅酶A连接酶(fadD)
				1942	183	脂蛋白	外膜蛋白
1944	158	细胞质	ATP-依赖性解旋酶(dinG)
				1949	357	细胞质	血凝素/溶血素-相关蛋白
1950	270	细胞质	traN-相关蛋白
				1953	232	外膜	外膜蛋白P2(ompP2)

1954	366	细胞质	辫苷生物合成蛋白(queA)或S-腺苷甲硫氨酸：tRNA
				1958	1392	外膜	黏附和穿透蛋白
1959	504	细胞质	核酸切除酶ABC，亚基A(uvrA)
				1960	220	内膜1	核酸切除酶ABC，亚基A(uvrA)
1962	384	外膜	膜结合的溶胞壁质糖基转移酶A
				1963	261	内膜1	HesA/MoeB/ThiF家族蛋白
1965	333	周质	粘连蛋白
				1967	467	内膜1	NMB1183
1969	156	细胞质	转录调节物(ttk)
				1971	224	细胞质	分解代谢基因激活物(crp)
1972	392	细胞质	tRNA(尿嘧啶-5-)-甲基转移酶trmA
				1973	351	细胞质	β-氨基己糖苷酶(exoII)或糖基水解酶，家族3
1975	299	细胞质	长链脂肪酸转运蛋白(fadL)或外膜蛋白P1
				1976	189	细胞质	甲基化-DNA-蛋白-半胱氨酸甲基转移酶(dat1)
1977	87	细胞质	DNA错配修复蛋白(mutH)
				1978	53	内膜0	DNA错配修复蛋白(mutH)
1980	71	细胞质	DNA错配修复蛋白(mutH)
				1981	430	内膜1	细胞周期蛋白(mesJ)
1982	34	细胞质	吡哆醇激酶
				1983	186	细胞质	乙酰-CoA羧化酶，羧基转移酶亚基α
1984	141	细胞质	乙酰-CoA羧化酶，羧基转移酶亚基α
				1986	261	内膜9	膜蛋白
1988	212	细胞质	ABC转运蛋白，ATP-结合蛋白(yebM)
				1989	127	细胞质	硒代半胱氨酸-特异性延伸因子(selB)
1991	55	细胞质	硒代半胱氨酸-特异性延伸因子(selB)或翻译延伸因子Tu tufA
				1992	461	内膜1	L-丝氨酰-tRNA硒转移酶(selA)
1993	861	内膜1	DNA错配修复蛋白(mutS)
				1995	74	内膜2	色氨酸-特异性转运蛋白(mtr)
1996	339	内膜5	色氨酸-特异性转运蛋白(mtr)
				1997	81	内膜2	ATP合成酶F0，亚基a(atpB)
1998	88	内膜1	ATP合成酶F0，亚基c(atpE)
				1999	156	周质	ATP合成酶F0，亚基b(atpF)

2000	144	细胞质	ATP合成酶F1，亚基δ(atpH)
				2001	41	内膜0	ATP合成酶F1，亚基δ(atpH)
2002	513	细胞质	ATP合成酶F1，亚基α(atpA)
				2003	289	细胞质	ATP合成酶F1，亚基γ(atpG)
2005	76	内膜1	ATP合成酶F1，亚基β(atpD)
				2007	372	细胞质	ATP合成酶F1，亚基β(atpD)
2008	147	内膜1	ATP合成酶F1，亚基ε(atpC)
				2009	54	内膜1	酪氨酸-特异性转运蛋白(tyrP)
2010	117	内膜1	核糖体蛋白L20(rpL20)
				2011	77	细胞质	外切脱氧核糖核酸酶V，β链(recB)
2012	1086	细胞质	外切脱氧核糖核酸酶V，β链(recB)
				2013	288	细胞质	外切脱氧核糖核酸酶V，α链(recD)
2014	47	细胞质	外切脱氧核糖核酸酶V，α链(recD)
				2016	194	细胞质	外切脱氧核糖核酸酶V，α链(recD)
2021	107	细胞质	毒力相关蛋白A(vapA)
				2022	556	细胞质	ABC转运蛋白，ATP-结合蛋白
2028	435	细胞质	转录-修复偶连因子(mfd)
				2029	228	细胞质	转录-修复偶连因子(mfd)
2030	392	细胞质	转录-修复偶连因子(mfd)
				2031	36	细胞质	转录-修复偶连因子(mfd)
2032	86	细胞质	亮氨酰-tRNA合成酶(1euS)
				2034	688	细胞质	亮氨酰-tRNA合成酶(leuS)
2036	281	细胞质	十一异戊二烯基二磷酸合成酶
				2038	288	内膜7	CDP-甘油二酯合成酶(cdsA)
2041	283	内膜2	保护性表面抗原D15 Omp85
				2044	256	细胞质	RNA聚合酶σ-70因子(rpoD)
2045	300	细胞质	RNA聚合酶σ-7因子(rpoD)
				2046	347	细胞质	DNA引发酶(dnaG)
2047	191	细胞质	DNA引发酶(dnaG)
				2048	52	细胞质	DNA引发酶(dnaG)
2049	71	细胞质	核糖体蛋白S21(rpS21)
				2050	342	内膜1	O-唾液酸糖蛋白内肽酶(gcp)
2051	206	细胞质	胸苷激酶(tdk)
				2052	406	内膜10	酪氨酸-特异性转运蛋白(tyrP)或色氨酸转运蛋白mtr

2053	86	细胞质	铁氧还蛋白，4Fe-4S细菌型(fdx-2)
				2058	263	细胞质	磷酸甘油酸激酶(pgk)
2059	81	细胞质	磷酸甘油酸激酶(pgk)
				2061	207	细胞质	氨基酸ABC转运蛋白，ATP-结合蛋白
2062	79	内膜0	氨基酸ABC转运蛋白，ATP-结合蛋白
				2065	230	内膜4	核糖核酸酶BN(rbn)
2066	53	细胞质	核糖核酸酶BN(rbn)
				2070	273	内膜1	尿苷磷酸化酶(udp)
2071	438	内膜9	转运蛋白
				2073	568	内膜1	2-琥珀酰基-6-羟基-2，4-环己二烯-1-羧酸酯
2074	185	细胞质	甲基萘醌-特异性异分支酸合成酶(menF)或邻氨基苯甲酸合成酶组分I trpE
				2076	679	细胞质	核酸切除酶ABC，亚基B(uvrB)
2079	756	内膜4	苹果酸氧化还原酶
				2081	238	内膜5	酪氨酸-特异性转运蛋白(tyrP)或色氨酸转运蛋白mtr
2083	228	内膜0	磷酸核糖基-AMP环水解酶/磷酸核糖基-ATP
				2084	258	细胞质	hisF环化酶(hisF)
2085	249	细胞质	磷酸核糖基亚胺甲基-5-氨基咪唑羧酰胺
				2086	199	细胞质	酰胺转移酶(hisH)
2087	381	细胞质	咪唑甘油-磷酸脱水酶/
				2088	367	细胞质	组氨醇-磷酸转氨酶(hisC)
2089	427	内膜1	组氨醇脱氢酶(hisD)
				2090	35	细胞质	ATP磷酸核糖基转移酶(hisG)
2091	199	内膜1	生物素操纵子阻遏物/生物素乙酰基辅酶A或BirA蛋白/Bvg辅助因子
				2092	488	内膜1	肌苷-5′-一磷酸脱氢酶(guaB)
2094	523	内膜1	GMP合成酶(guaA)
				2095	296	内膜7	rarD蛋白
2097	168	内膜0	转录调节物
				2099	321	内膜10	Na+/H+反向运输蛋白(nhaA)
2100	32	细胞质	溶血素
				2101	522	内膜7	载脂蛋白N-酰基转移酶(cutE)
2106	193	细胞质	重组相关蛋白RdgC rdgC
				2108	105	细胞质	重组相关蛋白RdgC rdgC

2110	290	细胞质	整合酶/重组酶
				2115	158	内膜4	大肠杆菌素V产生蛋白(cvpA)
2118	441	内膜2	乙酸激酶(ackA)
				2119	331	周质	磷酸乙酰基转移酶(pta)
2120	403	内膜1	磷酸乙酰基转移酶(pta)
				2122	314	内膜1	腺嘌呤特异性甲基化酶
2123	323	细胞质	Cys调节子转录激活物(cysB)
				2124	71	细胞质	磷酸核糖基氨基咪唑羧化酶，催化亚基
2126	362	内膜1	磷酸核糖基氨基咪唑羧化酶，ATP酶亚基
				2127	396	细胞质	天冬氨酸转氨酶(aspC)
2128	220	内膜1	亚精胺/腐胺ABC转运蛋白，ATP-结合
				2134	152	细胞质	汞耐受性操纵子调节蛋白(merR2)
2138	560	内膜10	PTS系统，果糖-特异性IIBC组分(fruA)
				2139	313	细胞质	1-磷酸果糖激酶(fruK)或ADP-庚糖合成酶
2140	499	细胞质	PTS系统，果糖-特异性IIA/FPr组分(fruB)
				2143	92	细胞质	毒力相关蛋白D(vapD)
2146	101	内膜1	次黄嘌呤磷酸核糖基转移酶(hpt)
				2147	451	细胞质	pmbA蛋白(pmbA)
2151	241	细胞质	ABC转运蛋白，ATP-结合蛋白
				2152	164	细胞质	氮调节IIA蛋白(ptsN)
2155	202	细胞质	分支酸变位酶/预苯酸脱水酶(pheA)
				2157	148	细胞质	ABC转运蛋白，ATP-结合蛋白
2158	192	细胞质	组氨醇-磷酸酶
				2160	221	细胞质	5，10亚甲基四氢叶酸还原酶(metF)
2161	89	细胞质	脱硫生物素合成酶(bioD-1)
				2162	313	内膜5	TRK系统钾摄取蛋白(trkH)或双(5-nucleosyl)-四磷酸酶，对称/Trk
2163	191	内膜3	TRK系统钾摄取蛋白(trkH)或双(5-nucleosyl)-四磷酸酶，对称/Trk
				2166	288	内膜4	热激蛋白(htpX)
2168	130	细胞质	核糖核酸酶
				2169	244	内膜0	脂蛋白(vacJ)
2172	185	细胞质	转录抗终止蛋白(nusG)
				2173	138	内膜3	前蛋白转运酶SecE亚基(secE)
2175	411	细胞质	ATP-依赖性Clp蛋白酶，ATP-结合亚基(clpX)

2176	211	细胞质	ATP-依赖性Clp蛋白酶，蛋白酶解亚基(clpP)
				2177	394	细胞质	触发因子(tig)
2178	52	细胞质	触发因子(tig)
				2180	89	细胞质	核糖体蛋白S20(rpS20)
2181	524	内膜11	毒力因子(mviN)
				2182	312	细胞质	核黄素激酶/FMN腺苷酰转移酶(ribF)
2183	484	内膜1	异亮氨酰-tRNA合成酶ileS
				2184	485	细胞质	异亮氨酰-tRNA合成酶ileS
2185	102	细胞质	hit-相关蛋白
				2186	184	细胞质	脂蛋白
2187	393	周质	青霉素-结合蛋白5(dacA)
				2189	212	细胞质	硫辛酸生物合成蛋白B(lipB)
2190	320	细胞质	硫辛酸生物合成蛋白A(lipA)
				2191	335	内膜1	柠檬酸裂合酶连接酶(citC)
2192	95	细胞质	柠檬酸裂合酶，γ链(citD)
				2193	291	内膜0	柠檬酸裂合酶，β链(citE)
2195	500	内膜1	柠檬酸裂合酶，α链(citF)
				2196	416	内膜1	citG蛋白(citG)
2200	256	内膜1	血红素-血色素结合蛋白利用蛋白A(hxuA)
				2202	458	细胞质	DNA修复蛋白(radA)
2204	166	内膜1	亮氨酸效应调节蛋白(Irp)
				2205	554	内膜5	细胞分裂蛋白FtsK ftsK-1
2208	169	细胞质	多肽脱甲酰基酶(def)
				2209	318	内膜1	甲硫氨酰-tRNA甲酰基转移酶(fmt)
2211	450	细胞质	sun蛋白(sun)或16S RNA甲基转移酶rsmB
				2212	458	细胞质	TRK系统钾摄取蛋白(trkA)
2213	134	内膜2	大传导力敏感通道(large conductancemechanosensitive channel)(mscL)
				2215	40	细胞质	RNA聚合酶σ-E因子(rpoE)
2231	347	内膜1	脂多糖生物合成蛋白或ADP-庚糖-LPS庚糖基转移酶II rfaF
				2232	539	外膜	血红素-血色素结合蛋白利用蛋白C或铁调节外膜蛋白FrpB frpB
2233	170	细胞质	血红素-血色素结合蛋白利用蛋白C
				2234	565	外膜	血红素-血色素结合蛋白利用蛋白B(hxuB)

2235	758	外膜(outer-hand)	血红素-血色素结合蛋白利用蛋白A(hxuA)
				2236	231	细胞质	DNA连接酶ligA-2
2238	327	细胞质	二肽ABC转运蛋白，ATP-结合蛋白(dppF)
				2241	330	细胞质	二肽ABC转运蛋白，ATP-结合蛋白(dppD)
2242	295	内膜6	二肽ABC转运蛋白，通透酶蛋白(dppC)或硫醇：二硫化物交换蛋白DsbD dsbD
				2243	333	内膜5	二肽ABC转运蛋白，通透酶蛋白(dppB)
2246	727	细胞质	DNA解旋酶II(uvrD)
				2249	141	细胞质	6-丙酮酸四氢蝶呤(biopterin)合成酶
2250	227	内膜0	铝抗性蛋白
				2252	184	细胞质	支链氨基酸转氨酶(ilyE)
2259	898	内膜1	外切脱氧核糖核酸酶V，γ链(recC)
				2260	163	细胞质	外切脱氧核糖核酸酶V，γ链(recC)
2262	372	内膜1	核黄素生物合成蛋白(ribD)
				2263	357	内膜1	蛋白酶(degS)
2274	192	内膜0	钼蝶呤-鸟嘌呤二核苷酸生物合成蛋白
				2277	216	周质	周质氧化还原酶(por)或硫醇：二硫化物交换蛋白DsbA dsbA-2
2280	363	细胞质	tRNA(尿嘧啶-5-)-甲基转移酶(trmA)
				2282	125	内膜1	σ-E因子调节蛋白
2283	33	细胞质	σ-E因子调节蛋白
				2285	178	内膜0	钼蝶呤-鸟嘌呤二核苷酸生物合成蛋白B
2289	652	细胞质	ATP-依赖性Clp蛋白酶，ATP酶亚基(clpB)
				2293	156	细胞质	DNA聚合酶I(polA)
2294	785	细胞质	DNA聚合酶I(polA)
				2299	507	内膜0	N利用物质蛋白A(nusA)
2301	855	细胞质	翻译起始因子2(infB)
				2303	466	细胞质	I型限制性酶(hsdR)
2304	285	细胞质	I型限制性酶(hsdR)
				2307	518	细胞质	邻氨基苯甲酸合成酶组分I(trpE)
2308	195	细胞质	邻氨基苯甲酸合成酶组分II(trpG)或对氨基苯甲酸合成酶谷氨酰胺
				2311	84	细胞质	邻氨基苯甲酸(anthanilate)磷酸核糖基转移酶(trpD)

2313	231	细胞质	邻氨基苯甲酸(anthanilate)磷酸核糖基转移酶(trpD)
				2314	477	细胞质	吲哚-3-甘油磷酸合成酶/
2317	239	细胞质	缬氨酰-tRNA合成酶(valS)
				2318	425	内膜1	缬氨酰-tRNA合成酶(valS)
2319	35	细胞质	缬氨酰-tRNA合成酶(valS)
				2321	150	细胞质	缬氨酰-tRNA合成酶(valS)
2322	102	细胞质	缬氨酰-tRNA合成酶(valS)
				2324	42	内膜1	转运蛋白
2325	238	细胞质	嘌呤-核苷磷酸化酶(deoD)或5-甲基硫代腺苷
				2327	142	内膜0	核糖体蛋白L11(rpL11)
2328	229	细胞质	核糖体蛋白L1(rpL1)
				2329	1298	细胞质	DNA-指导的RNA聚合酶，β链(rpoB)
2331	158	细胞质	铁(III)ABC转运蛋白，周质-结合蛋白
				2333	506	内膜11	铁(III)ABC转运蛋白，通透酶蛋白(hitB)
2335	356	细胞质	铁(III)ABC转运蛋白，ATP-结合蛋白(hitC)
				2338	377	细胞质	琥珀酰-二氨基庚二酸脱琥珀酰基酶(dapE)
2341	631	细胞质	热激蛋白(htpG)
				2344	106	周质	有机溶剂耐受性蛋白
2345	667	细胞质	有机溶剂耐受性蛋白
				2346	572	内膜1	脯氨酰基-tRNA合成酶(proS)
2347	630	内膜1	ATP-依赖性DNA解旋酶(recQ)
				2348	113	细胞质	cyaY蛋白(cyaY)
2350	415	细胞质	二氨基庚二酸脱羧酶(1ysA)
				2351	208	细胞质	硝酸/亚硝酸效应调节蛋白(narP)或转录调节物，LuxR家族
2354	203	细胞质	假尿苷合成酶RluD(rluD)或核糖体大亚基假尿苷合成酶D
				2356	272	脂蛋白	脂蛋白或感受态脂白ComL comL
2359	246	细胞质	丙酮酸甲酸-裂合酶激活酶(act)
				2360	772	细胞质	甲酸乙酰基转移酶(pfl)
2361	286	内膜6	甲酸转运蛋白
				2365	276	内膜2	糖激酶
2368	377	内膜5	氨基酸载体蛋白
				2371	158	内膜0	YgbB/YacN家族蛋白

2373	146	细胞质	mioC蛋白(mioC)或硫酸还原酶(NADPH)黄素蛋白，α
				2376	333	内膜1	glpX蛋白(glpX)
2381	551	内膜6	ABC转运蛋白，ATP-结合蛋白
				2382	360	内膜2	ATP-结合转运蛋白(cydD)
2383	228	细胞质	热激蛋白(grpE)
				2385	520	细胞质	DNA修复蛋白(recN)
2387	38	细胞质	DNA修复蛋白(recN)
				2388	981	内膜1	谷氨酸-氨-连接酶腺苷酰转移酶(glnE)
2389	311	细胞质	tRNAδ(2)-异戊烯焦磷酸转移酶(trpX)
				2390	390	细胞质	DNA错配修复蛋白(mutL)
2391	123	细胞质	胸苷酸合成酶(thyA)
				2392	173	细胞质	胞苷和脱氧胞苷酸脱氨酶家族
2395	545	细胞质	前蛋白转运酶SecA亚基(secA)
				2396	363	细胞质	前蛋白转运酶SecA亚基(secA)
2397	163	细胞质	增变物mutT蛋白(mutT)
				2398	618	内膜10	谷胱甘肽-调节的钾运出系统蛋白(kefC)
2399	254	细胞质	3-脱甲基泛醌-9 3-甲基转移酶ubiG
				2401	245	细胞质	核糖体蛋白S2(rpS2)
2402	71	内膜1	前蛋白转运酶SecY亚基(secY)
				2403	144	细胞质	核糖体蛋白L15(rpL15)
2404	59	细胞质	核糖体蛋白L30(rpL30)
				2405	267	内膜1	葡糖胺-果糖-6-磷酸转氨酶(glmS)
2406	177	内膜3	二硫键形成蛋白B(dsbB)
				2407	238	内膜5	Na+/H+反向运输蛋白(nhaB)
2408	292	内膜5	Na+/H+反向运输蛋白(nhaB)
				2410	241	细胞质	脂肪酸代谢调节蛋白(fadR)
2411	455	细胞质	磷脂酰丝氨酸合成酶(pssA)或心磷脂合成酶家族蛋白
				2412	201	细胞质	rRNA甲基化酶
2413	232	细胞质	腺嘌呤特异性甲基化酶
				2415	122	细胞质	ATP-依赖性RNA解旋酶SrmB(srmB)
2416	287	细胞质	ATP-依赖性RNA解旋酶SrmB(srmB)
				2417	231	细胞质	蛋白酶
2418	203	细胞质	ATP磷酸核糖基转移酶(hisG)

2421	410	细胞质	D-3-磷酸甘油酸脱氢酶(serA)
				2422	219	内膜1	核糖5-磷酸异构酶A(rpiA)
2423	383	细胞质	不依赖氧气的粪卟啉原III氧化酶
				2424	658	细胞质	ATP-依赖性蛋白酶(Ion)
2428	298	细胞质	转录调节物，araC家族
				2429	38	细胞质	ABC转运蛋白，ATP-结合蛋白
2430	576	内膜4	ABC转运蛋白，ATP-结合蛋白
				2432	92	周质	汞离子捕获蛋白(merP)
2433	120	内膜3	汞离子转运蛋白(merT)
				2435	472	细胞质	厌氧二甲基亚砜还原酶，链A(dmsA)
2436	352	细胞质	厌氧二甲基亚砜还原酶，链A(dmsA)
				2437	205	细胞质	厌氧二甲基亚砜还原酶，链B(dmsB)
2438	279	内膜7	厌氧二甲基亚砜还原酶，链C(dmsC)
				2440	166	细胞质	铁氧还蛋白型蛋白(napF)或NADH脱氢酶I，I亚基nuoI
2443	133	细胞质	2-异丙基苹果酸合成酶(leuA)
				2445	358	细胞质	3-异丙基苹果酸脱氢酶(beta-IPM脱氢酶)
2446	469	细胞质	3-异丙基苹果酸脱水酶，α亚基(leuC)
				2447	200	内膜0	3-异丙基苹果酸脱水酶小亚基(leuD)
2448	1794	外膜(outer-hand)	免疫球蛋白A1蛋白酶(iga1)或IgA-特异性丝氨酸内肽酶iga
				2449	378	细胞质	DNA/ATP结合蛋白(recF)
2450	366	细胞质	DNA聚合酶III，β亚基(dnaN)
				2452	454	细胞质	染色体复制起始蛋白(dnaA)
2453	118	细胞质	转铁蛋白-结合蛋白1前体(tbp1)
				2454	231	细胞质	转铁蛋白-结合蛋白1前体(tbp1)
2457	199	内膜1	基板组装蛋白V
				2462	861	细胞质	尾部纤维蛋白
2476	69	细胞质	天冬氨酸激酶I/高丝氨酸脱氢酶I(thrA)
				2477	307	细胞质	天冬氨酸激酶I/高丝氨酸脱氢酶I(thrA)
2478	314	内膜1	高丝氨酸激酶(thrB)
				2479	425	细胞质	苏氨酸合成酶(thrC)
2480	238	细胞质	整合酶/重组酶(xerC)
				2491	176	细胞质	铁氧还蛋白型4Fe-4S蛋白(napF)
2492	93	细胞质	napD蛋白(napD)

2493	832	外膜(outer-hand)	甲酸脱氢酶大亚基
				2494	279	细胞质	铁氧还蛋白型蛋白(napG)
2495	287	内膜4	铁氧还蛋白型4Fe-4S蛋白(napH)
				2496	150	周质	周质硝酸还原酶(napB)
2497	200	内膜1	细胞色素C-型蛋白(napC)
				2498	214	内膜0	腺苷酸激酶(adk)
2499	412	内膜10	通透酶或AmpG-相关蛋白
				2501	241	内膜0	UDP-葡萄糖4-差向异构酶(galE)
2502	82	细胞质	UDP-葡萄糖4-差向异构酶(galE)
				2504	244	细胞质	铁(III)ABC转运蛋白，ATP-结合蛋白fbpC
2505	176	内膜4	ABC转运蛋白，通透酶蛋白
				2508	241	周质	FkbP-型肽酰基-脯氨酰基顺-反异构酶(fkpA)或噬菌体感染力增效剂
2509	73	细胞质	slyX蛋白(slyX)
				2511	33	细胞质	过氧化物氧还蛋白2家族蛋白/谷氧还蛋白
2512	48	细胞质	过氧化物氧还蛋白2家族蛋白/谷氧还蛋白
				2513	117	细胞质	过氧化物氧还蛋白2家族蛋白/谷氧还蛋白
2514	301	细胞质	过氧化氢可诱导的基因激活物(oxyR)或转录调节物，LysR家族
				2517	158	细胞质	转录延伸因子(greB)
2518	770	细胞质	转录辅助蛋白(tex)
				2519	736	细胞质	DNA回旋酶，亚基B(gyrB)
2520	59	细胞质	DNA回旋酶，亚基B(gyrB)
				2521	234	细胞质	核酮糖-磷酸3-差向异构酶(dod)
2522	224	细胞质	磷酸乙醇酸磷酸酶(gph)
				2530	132	细胞质	转座酶
2531	369	内膜8	多抗药性蛋白B(emrB)或脂肪酸运出系统蛋白farB
				2532	256	内膜1	细胞分裂蛋白(ftsN)
2533	1032	内膜12	吖啶黄素抗性蛋白(acrB)或多重可转移耐受性系统(multiple transferable resistance system)蛋白MtrD
				2534	419	内膜1	脂蛋白或膜融合蛋白mtrC
2535	196	细胞质	转录阻遏物(Bm3R1)或转录调节物MtrR mtrR

2538	418	细胞质	ATP-依赖性RNA解旋酶(rhlB)
				2541	210	周质	激酶
2542	421	内膜1	丝氨酸羟甲基转移酶(丝氨酸甲基化酶)(glyA)
				2543	478	内膜3	YhbX/YhjW/YijP/YjdB家族蛋白
2544	85	细胞质	磷酸核糖胺-甘氨酸连接酶(purD)
				2545	101	内膜1	细胞分裂蛋白(ftsQ)
2546	306	内膜0	D-丙氨酸-D-丙氨酸连接酶(ddlB)
				2548	475	内膜2	UDP-N-乙酰胞壁酸-丙氨酸连接酶(murC)
2550	351	内膜1	UDP-N-乙酰葡糖胺-N-乙酰胞壁酰-(五肽)
				2552	394	内膜9	细胞分裂蛋白(ftsW)
2553	437	细胞质	UDP-N-乙酰胞壁酰(muramoyl)丙氨酸-D-谷氨酸连接酶(murD)
				2554	360	内膜10	磷酸-N-乙酰胞壁酰(muramoyl)-五肽-转移酶E(mraY)
2555	457	细胞质	UDP-MurNAc-五肽合成酶(murF)
				2556	488	内膜1	UDP-N-乙酰胞壁酰-三肽合成酶(murE)
2557	610	内膜1	青霉素-结合蛋白3(ftsI)
				2558	107	内膜1	细胞分裂蛋白(ftsL)
2561	208	细胞质	岩藻酮糖激酶(fucK)
				2564	68	细胞质	转录调节蛋白(asnC)
2569	269	内膜0	亚硫酸合成途径蛋白(cysQ)或肌醇一磷酸酶家族蛋白
				2570	474	内膜0	葡萄糖-6-磷酸1-脱氢酶(zwf)
2571	245	细胞质	氧化还原酶(devB)
				2577	392	内膜1	6-磷酸葡糖脱氢酶，脱羧基(gnd)
2578	76	内膜0	6-磷酸葡糖脱氢酶，脱羧基(gnd)
				2581	275	细胞质	二腺苷-四磷酸酶(apaH)或双(5-nucleosyl)-四磷酸酶，对称/Trk
2582	312	细胞质	脂寡糖生物合成蛋白或乳糖-N-新丁糖生物合成糖基
				2583	287	细胞质	二甲基腺苷转移酶(ksgA)
2584	253	细胞质	脂多糖糖基转移酶
				2585	65	细胞质	脂多糖糖基转移酶
2586	84	细胞质	翻译起始因子1(infA)

2587	480	内膜8	甘油-3-磷酸酶转运蛋白(glpT)
				2588	364	脂蛋白	甘油磷酰二酯磷酸二酯酶(glpQ)
2591	217	内膜4	甘油摄取辅助物蛋白(glpF)
				2592	503	细胞质	甘油激酶(glpK)
2593	155	内膜1	黄嘌呤-鸟嘌呤磷酸核糖基转移酶(gptB)
				2594	45	细胞质	甘油磷酰二酯磷酸二酯酶(glpQ)
2595	274	脂蛋白	脂蛋白E(hel)
				2597	132	内膜1	外(切)多磷酸酶(exopolyphosphatase)
2598	212	细胞质	外(切)多磷酸酶
				2600	133	内膜1	肽链释放因子3(prfC)
2606	309	细胞质	转录激活物(metR)
				2610	89	周质	吡咯啉-5-羧酸还原酶(proC)
2612	189	内膜0	吡咯啉-5-羧酸还原酶(proC)
				2617	297	细胞质	整合酶/重组酶(xerD)
2619	335	细胞质	霍利迪连接DNA解旋酶(ruvB)
				2620	204	细胞质	霍利迪连接DNA解旋酶(ruvA)
2621	190	细胞质	交换连接内切脱氧核糖核酸酶(ruvC)
				2623	156	细胞质	datP焦磷酸水解酶(ntpA)
2625	588	细胞质	天冬氨酰-tRNA合成酶(aspS)
				2629	78	细胞质	毒力相关蛋白B(vapB)
2630	134	细胞质	毒力相关蛋白C
				2631	135	细胞质	乳酰谷胱甘肽裂合酶(gloA)
2632	229	细胞质	核糖核酸酶T(rnt)
				2636	188	细胞质	翻译延伸因子P(efp)
2640	431	内膜1	混浊度相关蛋白(oapA)
				2641	134	脂蛋白	混浊度相关蛋白(oapB)
2642	236	细胞质	DNA修复蛋白(recO)
				2643	438	细胞质	tRNA(尿嘧啶-5-)-甲基转移酶trmA
2644	651	细胞质	延伸因子G(fusA)
				2646	394	细胞质	延伸因子Tu(tufB)
2647	75	内膜2	氯通道蛋白-相关蛋白
				2649	245	内膜3	氯通道蛋白-相关蛋白
2654	336	细胞质	色氨酰-tRNA合成酶(trpS)
				2657	92	细胞质	腺苷酸基琥珀酸裂合酶(purB)

2659	364	细胞质	腺苷酸基琥珀酸裂合酶(purB)
				2660	163	细胞质	核糖体蛋白L10(rpL10)
2661	126	内膜0	核糖体蛋白L7/L12(rpL7/L12)
				2663	456	内膜0	UDP-N-乙酰葡糖胺焦磷酸化酶(glmU)
2665	311	细胞质	溶血磷脂酶L2(pldB)
				2666	371	细胞质	天冬氨酸-半醛脱氢酶(asd)
2667	243	内膜4	转运蛋白
				2670	136	细胞质	药物活性的调节剂B(mdaB)
2671	42	细胞质	药物活性的调节剂B(mdaB)
				2672	676	细胞质	ATP-依赖性DNA解旋酶(rep)
2674	156	内膜1	脂多糖核心生物合成蛋白(kdtB)
				2675	427	内膜2	3-脱氧-d-甘露-辛酮糖酸转移酶(kdtA)
2676	254	细胞质	脂多糖生物合成蛋白或β-1，4-糖基转移酶IgtF
				2678	192	细胞质	DNA-3-甲基腺嘌呤糖苷酶I(tagI)
2680	268	内膜1	莽草酸5-脱氢酶(aroE)
				2682	178	细胞质	DNA拓扑异构酶I topA
2683	63	细胞质	ABC转运蛋白，ATP-结合蛋白
				2685	115	细胞质	厌氧核糖核酸酶-三磷酸还原酶(nrdD)
2686	272	细胞质	厌氧核糖核酸酶-三磷酸还原酶(nrdD)
				2687	286	细胞质	酰基-CoA硫酯酶II(tesB)
2688	469	细胞质	半胱氨酰-tRNA合成酶(cysS)
				2689	169	细胞质	肽酰基-脯氨酰基顺-反异构酶B(ppiB)
2698	107	细胞质	硫氧还蛋白(trxM)
				2701	335	内膜1	D-乳酸脱氢酶，发酵型(ldhA)
2702	393	内膜1	胱硫醚γ-合成酶(metB)
				2703	175	内膜1	ParA家族蛋白
2705	451	周质	复制型DNA解旋酶(dnaB)
				2714	140	细胞质	单链DNA结合蛋白(ssb)
2717	686	细胞质	DNA拓扑异构酶III(topB)
				2722	156	细胞质	DNA修复蛋白(radC)
2733	150	细胞质	mutT蛋白mutT
				2735	170	内膜3	转运蛋白
2736	280	细胞质	天冬氨酸氨-裂合酶(aspA)
				2738	236	周质	天冬氨酸激酶I/高丝氨酸脱氢酶I(thrA)

2739	317	细胞质	转醛酶B(talB)
				2740	217	内膜1	甘油醛-3-磷酸脱氢酶(gapdH)
2741	34	细胞质	内膜蛋白，60kDa(yidC)
				2742	204	细胞质	内膜蛋白，60kDa(yidC)
2745	229	细胞质	sufI蛋白(sufI)
				2747	167	细胞质	热激蛋白(hsIU)或ATP-依赖性CIp蛋白酶，ATP-结合亚基
2748	94	细胞质	亚精胺/腐胺ABC转运蛋白，周质-结合
				2749	287	内膜8	抗药性转运酶家族蛋白
2750	325	内膜2	钾/铜-转运ATP酶或阳离子转运ATP酶，E1-E2家族
				2751	349	细胞质	2-酮戊二酸脱氢酶E1组分(sucA)
2752	34	细胞质	2-酮戊二酸脱氢酶E1组分(sucA)
				2755	38	内膜1	丝氨酸转运蛋白(sdaC)
2756	217	内膜4	丝氨酸转运蛋白(sdaC)
				2758	75	脂蛋白	耐热核酸酶家族蛋白
2761	144	细胞质	orfG蛋白
				2762	51	细胞质	甲硫氨酸氨肽酶(map)
2763	343	细胞质	蛋白-PII尿苷酰转移酶glnD
				2764	107	内膜4	转运蛋白
2765	282	内膜5	蛋白-输出膜蛋白(secF)
				2766	96	细胞质	recA蛋白(recA)
2768	152	细胞质	调节蛋白(recX)
				2769	111	脂蛋白	crcB蛋白
2772	163	细胞质	转录调节蛋白(tyrR)或氮同化调节蛋白NtrXntrX
				2774	209	内膜1	谷胱甘肽转移酶(bphH)或严格饥饿蛋白AsspA
2780	43	细胞质	CTP合成酶(pyrG)
				2782	138	细胞质	CTP合成酶(pyrG)
2785	167	细胞质	转录调节物
				2786	93	细胞质	鸟苷酸激酶(gmk)
2788	88	细胞质	DNA-指导的RNA聚合酶，ω链(rpoZ)
				2789	84	细胞质	鸟苷-3′，5′-双(二磷酸)3′-焦磷酸水解酶
2790	38	细胞质	鸟苷-3′，5′-双(二磷酸)3′-焦磷酸水解酶

2792	90	细胞质	S-腺苷甲硫氨酸：2-脱甲基甲基萘醌甲基转移酶
				2795	120	细胞质	rbs阻遏物(rbsR)
2801	113	细胞质	铁氧还蛋白(fdx-1)或铁氧还蛋白，2Fe-2S型fdx-2
				2807	266	内膜1	修饰性甲基化酶(hindIIIM)
2811	350	细胞质	天冬酰胺酰-tRNA合成酶(asnS)或天冬氨酰-tRNA合成酶aspS
				2812	31	细胞质	核黄素合成酶，β链(ribH)
2813	228	内膜3	PqiA家族蛋白
				2814	282	内膜1	pqiB蛋白pqiB
2815	112	细胞质	天冬酰胺酰-tRNA合成酶(asnS)或天冬氨酰-tRNA合成酶aspS
				2817	128	细胞质	碳酸酐酶
2818	122	细胞质	转录调节蛋白(tyrR)
				2825	215	细胞质	pqiB蛋白pqiB
2827	194	细胞质	磷酸庚糖异构酶gmhA
				2831	233	细胞质	28kDa外膜蛋白(hlpA)
2832	33	细胞质	甘油-3-磷酸调节子阻遏物(glpR)

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[147]Erdile等，(1993)，Infect Immun，61：81-90。

Claims (17)

1.一种多肽，其含有与以下一种或多种SEQ ID NO具有至少75％序列相同性的氨基酸序列：1566、5095、1570、5094、1574、5903、1578、5092、2、4、6、8、10、12、14、16、18、20、22、24、26、28、30、32、34、36、38、40、42、44、46、48、50、52、54、56、58、60、62、64、66、68、70、72、74、76、78、80、82、84、86、88、90、92、94、96、98、100、102、104、106、108、110、112、114、116、118、120、122、124、126、128、130、132、134、136、138、140、142、144、146、148、150、152、154、156、158、160、162、164、166、168、170、172、174、176、178、180、182、184、186、188、190、192、194、196、198、200、202、204、206、208、210、212、214、216、218、220、222、224、226、228、230、232、234、236、238、240、242、244、246、248、250、252、254、256、258、260、262、264、266、268、270、272、274、276、278、280、282、284、286、288、290、292、294、296、298、300、302、304、306、308、310、312、314、316、318、320、322、324、326、328、330、332、334、336、338、340、342、344、346、348、350、352、354、356、358、360、362、364、366、368、370、372、374、376、378、380、382、384、386、388、390、392、394、396、398、400、402、404、406、408、410、412、414、416、418、420、422、424、426、428、430、432、434、436、438、440、442、444、446、448、450、452、454、456、458、460、462、464、466、468、470、472、474、476、478、480、482、484、486、488、490、492、494、496、498、500、502、504、506、508、510、512、514、516、518、520、522、524、526、528、530、532、534、536、538、540、542、544、546、548、550、552、554、556、558、560、562、564、566、568、570、572、574、576、578、580、582、584、586、588、590、592、594、596、598、600、602、604、606、608、610、612、614、616、618、620、622、624、626、628、630、632、634、636、638、640、642、644、646、648、650、652、654、656、658、660、662、664、666、668、670、672、674、676、678、680、682、684、686、688、690、692、694、696、698、700、702、704、706、708、710、712、714、716、718、720、722、724、726、728、730、732、734、736、738、740、742、744、746、748、750、752、754、756、758、760、762、764、766、768、770、772、774、776、778、780、782、784、786、788、790、792、794、796、798、800、802、804、806、808、810、812、814、816、818、820、822、824、826、828、830、832、834、836、838、840、842、844、846、848、850、852、854、856、858、860、862、864、866、868、870、872、874、876、878、880、882、884、886、888、890、892、894、896、898、900、902、904、906、908、910、912、914、916、918、920、922、924、926、928、930、932、934、936、938、940、942、944、946、948、950、952、954、956、958、960、962、964、966、968、970、972、974、976、978、980、982、984、986、988、990、992、994、996、998、1000、1002、1004、1006、1008、1010、1012、1014、1016、1018、1020、1022、1024、1026、1028、1030、1032、1034、1036、1038、1040、1042、1044、1046、1048、1050、1052、1054、1056、1058、1060、1062、1064、1066、1068、1070、1072、1074、1076、1078、1080、1082、1084、1086、1088、1090、1092、1094、1096、1098、1100、1102、1104、1106、1108、1110、1112、1114、1116、1118、1120、1122、1124、1126、1128、1130、1132、1134、1136、1138、1140、1142、1144、1146、1148、1150、1152、1154、1156、1158、1160、1162、1164、1166、1168、1170、1172、1174、1176、1178、1180、1182、1184、1186、1188、1190、1192、1194、1196、1198、1200、1202、1204、1206、1208、1210、1212、1214、1216、1218、1220、1222、1224、1226、1228、1230、1232、1234、1236、1238、1240、1242、1244、1246、1248、1250、1252、1254、1256、1258、1260、1262、1264、1266、1268、1270、1272、1274、1276、1278、1280、1282、1284、1286、1288、1290、1292、1294、1296、1298、1300、1302、1304、1306、1308、1310、1312、1314、1316、1318、1320、1322、1324、1326、1328、1330、1332、1334、1336、1338、1340、1342、1344、1346、1348、1350、1352、1354、1356、1358、1360、1362、1364、1366、1368、1370、1372、1374、1376、1378、1380、1382、1384、1386、1388、1390、1392、1394、1396、1398、1400、1402、1404、1406、1408、1410、1412、1414、1416、1418、1420、1422、1424、1426、1428、1430、1432、1434、1436、1438、1440、1442、1444、1446、1448、1450、1452、1454、1456、1458、1460、1462、1464、1466、1468、1470、1472、1474、1476、1478、1480、1482、1484、1486、1488、1490、1492、1494、1496、1498、1500、1502、1504、1506、1508、1510、1512、1514、1516、1518、1520、1522、1524、1526、1528、1530、1532、1534、1536、1538、1540、1542、1544、1546、1548、1550、1552、1554、1556、1558、1560、1562、1564、1566、1568、1570、1572、1574、1576、1578、1580、1582、1584、1586、1588、1590、1592、1594、1596、1598、1600、1602、1604、1606、1608、1610、1612、1614、1616、1618、1620、1622、1624、1626、1628、1630、1632、1634、1636、1638、1640、1642、1644、1646、1648、1650、1652、1654、1656、1658、1660、1662、1664、1666、1668、1670、1672、1674、1676、1678、1680、1682、1684、1686、1688、1690、1692、1694、1696、1698、1700、1702、1704、1706、1708、1710、1712、1714、1716、1718、1720、1722、1724、1726、1728、1730、1732、1734、1736、1738、1740、1742、1744、1746、1748、1750、1752、1754、1756、1758、1760、1762、1764、1766、1768、1770、1772、1774、1776、1778、1780、1782、1784、1786、1788、1790、1792、1794、1796、1798、1800、1802、1804、1806、1808、1810、1812、1814、1816、1818、1820、1822、1824、1826、1828、1830、1832、1834、1836、1838、1840、1842、1844、1846、1848、1850、1852、1854、1856、1858、1860、1862、1864、1866、1868、1870、1872、1874、1876、1878、1880、1882、1884、1886、1888、1890、1892、1894、1896、1898、1900、1902、1904、1906、1908、1910、1912、1914、1916、1918、1920、1922、1924、1926、1928、1930、1932、1934、1936、1938、1940、1942、1944、1946、1948、1950、1952、1954、1956、1958、1960、1962、1964、1966、1968、1970、1972、1974、1976、1978、1980、1982、1984、1986、1988、1990、1992、1994、1996、1998、2000、2002、2004、2006、2008、2010、2012、2014、2016、2018、2020、2022、2024、2026、2028、2030、2032、2034、2036、2038、2040、2042、2044、2046、2048、2050、2052、2054、2056、2058、2060、2062、2064、2066、2068、2070、2072、2074、2076、2078、2080、2082、2084、2086、2088、2090、2092、2094、2096、2098、2100、2102、2104、2106、2108、2110、2112、2114、2116、2118、2120、2122、2124、2126、2128、2130、2132、2134、2136、2138、2140、2142、2144、2146、2148、2150、2152、2154、2156、2158、2160、2162、2164、2166、2168、2170、2172、2174、2176、2178、2180、2182、2184、2186、2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2.如权利要求1所述的多肽，其特征在于，含有一种或多种以下SEQID NO所示的氨基酸序列：2、4、6、8、10、12、14、16、18、20、22、24、26、28、30、32、34、36、38、40、42、44、46、48、50、52、54、56、58、60、62、64、66、68、70、72、74、76、78、80、82、84、86、88、90、92、94、96、98、100、102、104、106、108、110、112、114、116、118、120、122、124、126、128、130、132、134、136、138、140、142、144、146、148、150、152、154、156、158、160、162、164、166、168、170、172、174、176、178、180、182、184、186、188、190、192、194、196、198、200、202、204、206、208、210、212、214、216、218、220、222、224、226、228、230、232、234、236、238、240、242、244、246、248、250、252、254、256、258、260、262、264、266、268、270、272、274、276、278、280、282、284、286、288、290、292、294、296、298、300、302、304、306、308、310、312、314、316、318、320、322、324、326、328、330、332、334、336、338、340、342、344、346、348、350、352、354、356、358、360、362、364、366、368、370、372、374、376、378、380、382、384、386、388、390、392、394、396、398、400、402、404、406、408、410、412、414、416、418、420、422、424、426、428、430、432、434、436、438、440、442、444、446、448、450、452、454、456、458、460、462、464、466、468、470、472、474、476、478、480、482、484、486、488、490、492、494、496、498、500、502、504、506、508、510、512、514、516、518、520、522、524、526、528、530、532、534、536、538、540、542、544、546、548、550、552、554、556、558、560、562、564、566、568、570、572、574、576、578、580、582、584、586、588、590、592、594、596、598、600、602、604、606、608、610、612、614、616、618、620、622、624、626、628、630、632、634、636、638、640、642、644、646、648、650、652、654、656、658、660、662、664、666、668、670、672、674、676、678、680、682、684、686、688、690、692、694、696、698、700、702、704、706、708、710、712、714、716、718、720、722、724、726、728、730、732、734、736、738、740、742、744、746、748、750、752、754、756、758、760、762、764、766、768、770、772、774、776、778、780、782、784、786、788、790、792、794、796、798、800、802、804、806、808、810、812、814、816、818、820、822、824、826、828、830、832、834、836、838、840、842、844、846、848、850、852、854、856、858、860、862、864、866、868、870、872、874、876、878、880、882、884、886、888、890、892、894、896、898、900、902、904、906、908、910、912、914、916、918、920、922、924、926、928、930、932、934、936、938、940、942、944、946、948、950、952、954、956、958、960、962、964、966、968、970、972、974、976、978、980、982、984、986、988、990、992、994、996、998、1000、1002、1004、1006、1008、1010、1012、1014、1016、1018、1020、1022、1024、1026、1028、1030、1032、1034、1036、1038、1040、1042、1044、1046、1048、1050、1052、1054、1056、1058、1060、1062、1064、1066、1068、1070、1072、1074、1076、1078、1080、1082、1084、1086、1088、1090、1092、1094、1096、1098、1100、1102、1104、1106、1108、1110、1112、1114、1116、1118、1120、1122、1124、1126、1128、1130、1132、1134、1136、1138、1140、1142、1144、1146、1148、1150、1152、1154、1156、1158、1160、1162、1164、1166、1168、1170、1172、1174、1176、1178、1180、1182、1184、1186、1188、1190、1192、1194、1196、1198、1200、1202、1204、1206、1208、1210、1212、1214、1216、1218、1220、1222、1224、1226、1228、1230、1232、1234、1236、1238、1240、1242、1244、1246、1248、1250、1252、1254、1256、1258、1260、1262、1264、1266、1268、1270、1272、1274、1276、1278、1280、1282、1284、1286、1288、1290、1292、1294、1296、1298、1300、1302、1304、1306、1308、1310、1312、1314、1316、1318、1320、1322、1324、1326、1328、1330、1332、1334、1336、1338、1340、1342、1344、1346、1348、1350、1352、1354、1356、1358、1360、1362、1364、1366、1368、1370、1372、1374、1376、1378、1380、1382、1384、1386、1388、1390、1392、1394、1396、1398、1400、1402、1404、1406、1408、1410、1412、1414、1416、1418、1420、1422、1424、1426、1428、1430、1432、1434、1436、1438、1440、1442、1444、1446、1448、1450、1452、1454、1456、1458、1460、1462、1464、1466、1468、1470、1472、1474、1476、1478、1480、1482、1484、1486、1488、1490、1492、1494、1496、1498、1500、1502、1504、1506、1508、1510、1512、1514、1516、1518、1520、1522、1524、1526、1528、1530、1532、1534、1536、1538、1540、1542、1544、1546、1548、1550、1552、1554、1556、1558、1560、1562、1564、1566、1568、1570、1572、1574、1576、1578、1580、1582、1584、1586、1588、1590、1592、1594、1596、1598、1600、1602、1604、1606、1608、1610、1612、1614、1616、1618、1620、1622、1624、1626、1628、1630、1632、1634、1636、1638、1640、1642、1644、1646、1648、1650、1652、1654、1656、1658、1660、1662、1664、1666、1668、1670、1672、1674、1676、1678、1680、1682、1684、1686、1688、1690、1692、1694、1696、1698、1700、1702、1704、1706、1708、1710、1712、1714、1716、1718、1720、1722、1724、1726、1728、1730、1732、1734、1736、1738、1740、1742、1744、1746、1748、1750、1752、1754、1756、1758、1760、1762、1764、1766、1768、1770、1772、1774、1776、1778、1780、1782、1784、1786、1788、1790、1792、1794、1796、1798、1800、1802、1804、1806、1808、1810、1812、1814、1816、1818、1820、1822、1824、1826、1828、1830、1832、1834、1836、1838、1840、1842、1844、1846、1848、1850、1852、1854、1856、1858、1860、1862、1864、1866、1868、1870、1872、1874、1876、1878、1880、1882、1884、1886、1888、1890、1892、1894、1896、1898、1900、1902、1904、1906、1908、1910、1912、1914、1916、1918、1920、1922、1924、1926、1928、1930、1932、1934、1936、1938、1940、1942、1944、1946、1948、1950、1952、1954、1956、1958、1960、1962、1964、1966、1968、1970、1972、1974、1976、1978、1980、1982、1984、1986、1988、1990、1992、1994、1996、1998、2000、2002、2004、2006、2008、2010、2012、2014、2016、2018、2020、2022、2024、2026、2028、2030、2032、2034、2036、2038、2040、2042、2044、2046、2048、2050、2052、2054、2056、2058、2060、2062、2064、2066、2068、2070、2072、2074、2076、2078、2080、2082、2084、2086、2088、2090、2092、2094、2096、2098、2100、2102、2104、2106、2108、2110、2112、2114、2116、2118、2120、2122、2124、2126、2128、2130、2132、2134、2136、2138、2140、2142、2144、2146、2148、2150、2152、2154、2156、2158、2160、2162、2164、2166、2168、2170、2172、2174、2176、2178、2180、2182、2184、2186、2188、2190、2192、2194、2196、2198、2200、2202、2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3.一种多肽，其含有来自以下一种或多种SEQ ID NO的至少7个连续氨基酸的片段：1566、5095、1570、5094、1574、5903、1578、5092、2、4、6、8、10、12、14、16、18、20、22、24、26、28、30、32、34、36、38、40、42、44、46、48、50、52、54、56、58、60、62、64、66、68、70、72、74、76、78、80、82、84、86、88、90、92、94、96、98、100、102、104、106、108、110、112、114、116、118、120、122、124、126、128、130、132、134、136、138、140、142、144、146、148、150、152、154、156、158、160、162、164、166、168、170、172、174、176、178、180、182、184、186、188、190、192、194、196、198、200、202、204、206、208、210、212、214、216、218、220、222、224、226、228、230、232、234、236、238、240、242、244、246、248、250、252、254、256、258、260、262、264、266、268、270、272、274、276、278、280、282、284、286、288、290、292、294、296、298、300、302、304、306、308、310、312、314、316、318、320、322、324、326、328、330、332、334、336、338、340、342、344、346、348、350、352、354、356、358、360、362、364、366、368、370、372、374、376、378、380、382、384、386、388、390、392、394、396、398、400、402、404、406、408、410、412、414、416、418、420、422、424、426、428、430、432、434、436、438、440、442、444、446、448、450、452、454、456、458、460、462、464、466、468、470、472、474、476、478、480、482、484、486、488、490、492、494、496、498、500、502、504、506、508、510、512、514、516、518、520、522、524、526、528、530、532、534、536、538、540、542、544、546、548、550、552、554、556、558、560、562、564、566、568、570、572、574、576、578、580、582、584、586、588、590、592、594、596、598、600、602、604、606、608、610、612、614、616、618、620、622、624、626、628、630、632、634、636、638、640、642、644、646、648、650、652、654、656、658、660、662、664、666、668、670、672、674、676、678、680、682、684、686、688、690、692、694、696、698、700、702、704、706、708、710、712、714、716、718、720、722、724、726、728、730、732、734、736、738、740、742、744、746、748、750、752、754、756、758、760、762、764、766、768、770、772、774、776、778、780、782、784、786、788、790、792、794、796、798、800、802、804、806、808、810、812、814、816、818、820、822、824、826、828、830、832、834、836、838、840、842、844、846、848、850、852、854、856、858、860、862、864、866、868、870、872、874、876、878、880、882、884、886、888、890、892、894、896、898、900、902、904、906、908、910、912、914、916、918、920、922、924、926、928、930、932、934、936、938、940、942、944、946、948、950、952、954、956、958、960、962、964、966、968、970、972、974、976、978、980、982、984、986、988、990、992、994、996、998、1000、1002、1004、1006、1008、1010、1012、1014、1016、1018、1020、1022、1024、1026、1028、1030、1032、1034、1036、1038、1040、1042、1044、1046、1048、1050、1052、1054、1056、1058、1060、1062、1064、1066、1068、1070、1072、1074、1076、1078、1080、1082、1084、1086、1088、1090、1092、1094、1096、1098、1100、1102、1104、1106、1108、1110、1112、1114、1116、1118、1120、1122、1124、1126、1128、1130、1132、1134、1136、1138、1140、1142、1144、1146、1148、1150、1152、1154、1156、1158、1160、1162、1164、1166、1168、1170、1172、1174、1176、1178、1180、1182、1184、1186、1188、1190、1192、1194、1196、1198、1200、1202、1204、1206、1208、1210、1212、1214、1216、1218、1220、1222、1224、1226、1228、1230、1232、1234、1236、1238、1240、1242、1244、1246、1248、1250、1252、1254、1256、1258、1260、1262、1264、1266、1268、1270、1272、1274、1276、1278、1280、1282、1284、1286、1288、1290、1292、1294、1296、1298、1300、1302、1364、1306、1308、1310、1312、1314、1316、1318、1320、1322、1324、1326、1328、1330、1332、1334、1336、1338、1340、1342、1344、1346、1348、1350、1352、1354、1356、1358、1360、1362、1364、1366、1368、1370、1372、1374、1376、1378、1380、1382、1384、1386、1388、1390、1392、1394、1396、1398、1400、1402、1404、1406、1408、1410、1412、1414、1416、1418、1420、1422、1424、1426、1428、1430、1432、1434、1436、1438、1440、1442、1444、1446、1448、1450、1452、1454、1456、1458、1460、1462、1464、1466、1468、1470、1472、1474、1476、1478、1480、1482、1484、1486、1488、1490、1492、1494、1496、1498、1500、1502、1504、1506、1508、1510、1512、1514、1516、1518、1520、1522、1524、1526、1528、1530、1532、1534、1536、1538、1540、1542、1544、1546、1548、1550、1552、1554、1556、1558、1560、1562、1564、1566、1568、1570、1572、1574、1576、1578、1580、1582、1584、1586、1588、1590、1592、1594、1596、1598、1600、1602、1604、1606、1608、1610、1612、1614、1616、1618、1620、1622、1624、1626、1628、1630、1632、1634、1636、1638、1640、1642、1644、1646、1648、1650、1652、1654、1656、1658、1660、1662、1664、1666、1668、1670、1672、1674、1676、1678、1680、1682、1684、1686、1688、1690、1692、1694、1696、1698、1700、1702、1704、1706、1708、1710、1712、1714、1716、1718、1720、1722、1724、1726、1728、1730、1732、1734、1736、1738、1740、1742、1744、1746、1748、1750、1752、1754、1756、1758、1760、1762、1764、1766、1768、1770、1772、1774、1776、1778、1780、1782、1784、1786、1788、1790、1792、1794、1796、1798、1800、1802、1804、1806、1808、1810、1812、1814、1816、1818、1820、1822、1824、1826、1828、1830、1832、1834、1836、1838、1840、1842、1844、1846、1848、1850、1852、1854、1856、1858、1860、1862、1864、1866、1868、1870、1872、1874、1876、1878、1880、1882、1884、1886、1888、1890、1892、1894、1896、1898、1900、1902、1904、1906、1908、1910、1912、1914、1916、1918、1920、1922、1924、1926、1928、1930、1932、1934、1936、1938、1940、1942、1944、1946、1948、1950、1952、1954、1956、1958、1960、1962、1964、1966、1968、1970、1972、1974、1976、1978、1980、1982、1984、1986、1988、1990、1992、1994、1996、1998、2000、2002、2004、2006、2008、2010、2012、2014、2016、2018、2020、2022、2024、2026、2028、2030、2032、2034、2036、2038、2040、2042、2044、2046、2048、2050、2052、2054、2056、2058、2060、2062、2064、2066、2068、2070、2072、2074、2076、2078、2080、2082、2084、2086、2088、2090、2092、2094、2096、2098、2100、2102、2104、2106、2108、2110、2112、2114、2116、2118、2120、2122、2124、2126、2128、2130、2132、2134、2136、2138、2140、2142、2144、2146、2148、2150、2152、2154、2156、2158、2160、2162、2164、2166、2168、2170、2172、2174、2176、2178、2180、2182、2184、2186、2188、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4.如权利要求3所述的多肽，其特征在于，所述片段含有SEQ ID NO：氨基酸序列的T-细胞或B-细胞表位。

5.与以上任一项权利要求所述的多肽相结合的抗体。

6.如权利要求5所述的抗体，其特征在于，所述抗体是单克隆抗体。

7.一种核酸，其含有与以下一种或多种SEQ ID NO具有至少75％序列相同性的核苷酸序列：1565、1569、1573、1577、1、3、5、7、9、11、13、15、17、19、21、23、25、27、29、31、33、35、37、39、41、43、45、47、49、51、53、55、57、59、61、63、65、67、69、71、73、75、77、79、81、83、85、87、89、91、93、95、97、99、101、103、105、107、109、111、113、115、117、119、121、123、125、127、129、131、133、135、137、139、141、143、145、147、149、151、153、155、157、159、161、163、165、167、169、171、173、175、177、179、181、183、185、187、189、191、193、195、197、199、201、203、205、207、209、211、213、215、217、219、221、223、225、227、229、231、233、235、237、239、241、243、245、247、249、251、253、255、257、259、261、263、265、267、269、271、273、275、277、279、281、283、285、287、289、291、293、295、297、299、301、303、305、307、309、311、313、315、317、319、321、323、325、327、329、331、333、335、337、339、341、343、345、347、349、351、353、355、357、359、361、363、365、367、369、371、373、375、377、379、381、383、385、387、389、391、393、395、397、399、401、403、405、407、409、411、413、415、417、419、421、423、425、427、429、431、433、435、437、439、441、443、445、447、449、451、453、455、457、459、461、463、465、467、469、471、473、475、477、479、481、483、485、487、489、491、493、495、497、499、501、503、505、507、509、511、513、515、517、519、521、523、525、527、529、531、533、535、537、539、541、543、545、547、549、551、553、555、557、559、561、563、565、567、569、571、573、575、577、579、581、583、585、587、589、591、593、595、597、599、601、603、605、607、609、611、613、615、617、619、621、623、625、627、629、631、633、635、637、639、641、643、645、647、649、651、653、655、657、659、661、663、665、667、669、671、673、675、677、679、681、683、685、687、689、691、693、695、697、699、701、703、705、707、709、711、713、715、717、719、721、723、725、727、729、731、733、735、737、739、741、743、745、747、749、751、753、755、757、759、761、763、765、767、769、771、773、775、777、779、781、783、785、787、789、791、793、795、797、799、801、803、805、807、809、811、813、815、817、819、821、823、825、827、829、831、833、835、837、839、841、843、845、847、849、851、853、855、857、859、861、863、865、867、869、871、873、875、877、879、881、883、885、887、889、891、893、895、897、899、901、903、905、907、909、911、913、915、917、919、921、923、925、927、929、931、933、935、937、939、941、943、945、947、949、951、953、955、957、959、961、963、965、967、969、971、973、975、977、979、981、983、985、987、989、991、993、995、997、999、1001、1003、1005、1007、1009、1011、1013、1015、1017、1019、1021、1023、1025、1027、1029、1031、1033、1035、1037、1039、1041、1043、1045、1047、1049、1051、1053、1055、1057、1059、1061、1063、1065、1067、1069、1071、1073、1075、1077、1079、1081、1083、1085、1087、1089、1091、1093、1095、1097、1099、1101、1103、1105、1107、1109、1111、1113、1115、1117、1119、1121、1123、1125、1127、1129、1131、1133、1135、1137、1139、1141、1143、1145、1147、1149、1151、1153、1155、1157、1159、1161、1163、1165、1167、1169、1171、1173、1175、1177、1179、1181、1183、1185、1187、1189、1191、1193、1195、1197、1199、1201、1203、1205、1207、1209、1211、1213、1215、1217、1219、1221、1223、1225、1227、1229、1231、1233、1235、1237、1239、1241、1243、1245、1247、1249、1251、1253、1255、1257、1259、1261、1263、1265、1267、1269、1271、1273、1275、1277、1279、1281、1283、1285、1287、1289、1291、1293、1295、1297、1299、1301、1303、1305、1307、1309、1311、1313、1315、1317、1319、1321、1323、1325、1327、1329、1331、1333、1335、1337、1339、1341、1343、1345、1347、1349、1351、1353、1355、1357、1359、1361、1363、1365、1367、1369、1371、1373、1375、1377、1379、1381、1383、1385、1387、1389、1391、1393、1395、1397、1399、1401、1403、1405、1407、1409、1411、1413、1415、1417、1419、1421、1423、1425、1427、1429、1431、1433、1435、1437、1439、1441、1443、1445、1447、1449、1451、1453、1455、1457、1459、1461、1463、1465、1467、1469、1471、1473、1475、1477、1479、1481、1483、1485、1487、1489、1491、1493、1495、1497、1499、1501、1503、1505、1507、1509、1511、1513、1515、1517、1519、1521、1523、1525、1527、1529、1531、1533、1535、1537、1539、1541、1543、1545、1547、1549、1551、1553、1555、1557、1559、1561、1563、1565、1567、1569、1571、1573、1575、1577、1579、1581、1583、1585、1587、1589、1591、1593、1595、1597、1599、1601、1603、1605、1607、1609、1611、1613、1615、1617、1619、1621、1623、1625、1627、1629、1631、1633、1635、1637、1639、1641、1643、1645、1647、1649、1651、1653、1655、1657、1659、1661、1663、1665、1667、1669、1671、1673、1675、1677、1679、1681、1683、1685、1687、1689、1691、1693、1695、1697、1699、1701、1703、1705、1707、1709、1711、1713、1715、1717、1719、1721、1723、1725、1727、1729、1731、1733、1735、1737、1739、1741、1743、1745、1747、1749、1751、1753、1755、1757、1759、1761、1763、1765、1767、1769、1771、1773、1775、1777、1779、1781、1783、1785、1787、1789、1791、1793、1795、1797、1799、1801、1803、1805、1807、1809、1811、1813、1815、1817、1819、1821、1823、1825、1827、1829、1831、1833、1835、1837、1839、1841、1843、1845、1847、1849、1851、1853、1855、1857、1859、1861、1863、1865、1867、1869、1871、1873、1875、1877、1879、1881、1883、1885、1887、1889、1891、1893、1895、1897、1899、1901、1903、1905、1907、1909、1911、1913、1915、1917、1919、1921、1923、1925、1927、1929、1931、1933、1935、1937、1939、1941、1943、1945、1947、1949、1951、1953、1955、1957、1959、1961、1963、1965、1967、1969、1971、1973、1975、1977、1979、1981、1983、1985、1987、1989、1991、1993、1995、1997、1999、2001、2003、2005、2007、2009、2011、2013、2015、2017、2019、2021、2023、2025、2027、2029、2031、2033、2035、2037、2039、2041、2043、2045、2047、2049、2051、2053、2055、2057、2059、2061、2063、2065、2067、2069、2071、2073、2075、2077、2079、2081、2083、2085、2087、2089、2091、2093、2095、2097、2099、2101、2103、2105、2107、2109、2111、2113、2115、2117、2119、2121、2123、2125、2127、2129、2131、2133、2135、2137、2139、2141、2143、2145、2147、2149、2151、2153、2155、2157、2159、2161、2163、2165、2167、2169、2171、2173、2175、2177、2179、2181、2183、2185、2187、2189、2191、2193、2195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8.如权利要求7所述的核酸，其特征在于，含有选自以下SEQ ID NO的核苷酸序列：1、3、5、7、9、11、13、15、17、19、21、23、25、27、29、31、33、35、37、39、41、43、45、47、49、51、53、55、57、59、61、63、65、67、69、71、73、75、77、79、81、83、85、87、89、91、93、95、97、99、101、103、105、107、109、111、113、115、117、119、121、123、125、127、129、131、133、135、137、139、141、143、145、147、149、151、153、155、157、159、161、163、165、167、169、171、173、175、177、179、181、183、185、187、189、191、193、195、197、199、201、203、205、207、209、211、213、215、217、219、221、223、225、227、229、231、233、235、237、239、241、243、245、247、249、251、253、255、257、259、261、263、265、267、269、271、273、275、277、279、281、283、285、287、289、291、293、295、297、299、301、303、305、307、309、311、313、315、317、319、321、323、325、327、329、331、333、335、337、339、341、343、345、347、349、351、353、355、357、359、361、363、365、367、369、371、373、375、377、379、381、383、385、387、389、391、393、395、397、399、401、403、405、407、409、411、413、415、417、419、421、423、425、427、429、431、433、435、437、439、441、443、445、447、449、451、453、455、457、459、461、463、465、467、469、471、473、475、477、479、481、483、485、487、489、491、493、495、497、499、501、503、505、507、509、511、513、515、517、519、521、523、525、527、529、531、533、535、537、539、541、543、545、547、549、551、553、555、557、559、561、563、565、567、569、571、573、575、577、579、581、583、585、587、589、591、593、595、597、599、601、603、605、607、609、611、613、615、617、619、621、623、625、627、629、631、633、635、637、639、641、643、645、647、649、651、653、655、657、659、661、663、665、667、669、671、673、675、677、679、681、683、685、687、689、691、693、695、697、699、701、703、705、707、709、711、713、715、717、719、721、723、725、727、729、731、733、735、737、739、741、743、745、747、749、751、753、755、757、759、761、763、765、767、769、771、773、775、777、779、781、783、785、787、789、791、793、795、797、799、801、803、805、807、809、811、813、815、817、819、821、823、825、827、829、831、833、835、837、839、841、843、845、847、849、851、853、855、857、859、861、863、865、867、869、871、873、875、877、879、881、883、885、887、889、891、893、895、897、899、901、903、905、907、909、911、913、915、917、919、921、923、925、927、929、931、933、935、937、939、941、943、945、947、949、951、953、955、957、959、961、963、965、967、969、971、973、975、977、979、981、983、985、987、989、991、993、995、997、999、1001、1003、1005、1007、1009、1011、1013、1015、1017、1019、1021、1023、1025、1027、1029、1031、1033、1035、1037、1039、1041、1043、1045、1047、1049、1051、1053、1055、1057、1059、1061、1063、1065、1067、1069、1071、1073、1075、1077、1079、1081、1083、1085、1087、1089、1091、1093、1095、1097、1099、1101、1103、1105、1107、1109、1111、1113、1115、1117、1119、1121、1123、1125、1127、1129、1131、1133、1135、1137、1139、1141、1143、1145、1147、1149、1151、1153、1155、1157、1159、1161、1163、1165、1167、1169、1171、1173、1175、1177、1179、1181、1183、1185、1187、1189、1191、1193、1195、1197、1199、1201、1203、1205、1207、1209、1211、1213、1215、1217、1219、1221、1223、1225、1227、1229、1231、1233、1235、1237、1239、1241、1243、1245、1247、1249、1251、1253、1255、1257、1259、1261、1263、1265、1267、1269、1271、1273、1275、1277、1279、1281、1283、1285、1287、1289、1291、1293、1295、1297、1299、1301、1303、1305、1307、1309、1311、1313、1315、1317、1319、1321、1323、1325、1327、1329、1331、1333、1335、1337、1339、1341、1343、1345、1347、1349、1351、1353、1355、1357、1359、1361、1363、1365、1367、1369、1371、1373、1375、1377、1379、1381、1383、1385、1387、1389、1391、1393、1395、1397、1399、1401、1403、1405、1407、1409、1411、1413、1415、1417、1419、1421、1423、1425、1427、1429、1431、1433、1435、1437、1439、1441、1443、1445、1447、1449、1451、1453、1455、1457、1459、1461、1463、1465、1467、1469、1471、1473、1475、1477、1479、1481、1483、1485、1487、1489、1491、1493、1495、1497、1499、1501、1503、1505、1507、1509、1511、1513、1515、1517、1519、1521、1523、1525、1527、1529、1531、1533、1535、1537、1539、1541、1543、1545、1547、1549、1551、1553、1555、1557、1559、1561、1563、1565、1567、1569、1571、1573、1575、1577、1579、1581、1583、1585、1587、1589、1591、1593、1595、1597、1599、1601、1603、1605、1607、1609、1611、1613、1615、1617、1619、1621、1623、1625、1627、1629、1631、1633、1635、1637、1639、1641、1643、1645、1647、1649、1651、1653、1655、1657、1659、1661、1663、1665、1667、1669、1671、1673、1675、1677、1679、1681、1683、1685、1687、1689、1691、1693、1695、1697、1699、1701、1703、1705、1707、1709、1711、1713、1715、1717、1719、1721、1723、1725、1727、1729、1731、1733、1735、1737、1739、1741、1743、1745、1747、1749、1751、1753、1755、1757、1759、1761、1763、1765、1767、1769、1771、1773、1775、1777、1779、1781、1783、1785、1787、1789、1791、1793、1795、1797、1799、1801、1803、1805、1807、1809、1811、1813、1815、1817、1819、1821、1823、1825、1827、1829、1831、1833、1835、1837、1839、1841、1843、1845、1847、1849、1851、1853、1855、1857、1859、1861、1863、1865、1867、1869、1871、1873、1875、1877、1879、1881、1883、1885、1887、1889、1891、1893、1895、1897、1899、1901、1903、1905、1907、1909、1911、1913、1915、1917、1919、1921、1923、1925、1927、1929、1931、1933、1935、1937、1939、1941、1943、1945、1947、1949、1951、1953、1955、1957、1959、1961、1963、1965、1967、1969、1971、1973、1975、1977、1979、1981、1983、1985、1987、1989、1991、1993、1995、1997、1999、2001、2003、2005、2007、2009、2011、2013、2015、2017、2019、2021、2023、2025、2027、2029、2031、2033、2035、2037、2039、2041、2043、2045、2047、2049、2051、2053、2055、2057、2059、2061、2063、2065、2067、2069、2071、2073、2075、2077、2079、2081、2083、2085、2087、2089、2091、2093、2095、2097、2099、2101、2103、2105、2107、2109、2111、2113、2115、2117、2119、2121、2123、2125、2127、2129、2131、2133、2135、2137、2139、2141、2143、2145、2147、2149、2151、2153、2155、2157、2159、2161、2163、2165、2167、2169、2171、2173、2175、2177、2179、2181、2183、2185、2187、2189、2191、2193、2195、2197、2199、2201、2203、220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9.能在高度严谨条件下与权利要求8所述核酸杂交的核酸。

10.一种核酸，其含有来自以下一种或多种SEQ ID NO的10个或10个以上连续氨基酸的片段：1565、1569、1573、1577、1、3、5、7、9、11、13、15、17、19、21、23、25、27、29、31、33、35、37、39、41、43、45、47、49、51、53、55、57、59、61、63、65、67、69、71、73、75、77、79、81、83、85、87、89、91、93、95、97、99、101、103、105、107、109、111、113、115、117、119、121、123、125、127、129、131、133、135、137、139、141、143、145、147、149、151、153、155、157、159、161、163、165、167、169、171、173、175、177、179、181、183、185、187、189、191、193、195、197、199、201、203、205、207、209、211、213、215、217、219、221、223、225、227、229、231、233、235、237、239、241、243、245、247、249、251、253、255、257、259、261、263、265、267、269、271、273、275、277、279、281、283、285、287、289、291、293、295、297、299、301、303、305、307、309、311、313、315、317、319、321、323、325、327、329、331、333、335、337、339、341、343、345、347、349、351、353、355、357、359、361、363、365、367、369、371、373、375、377、379、381、383、385、387、389、391、393、395、397、399、401、403、405、407、409、411、413、415、417、419、421、423、425、427、429、431、433、435、437、439、441、443、445、447、449、451、453、455、457、459、461、463、465、467、469、471、473、475、477、479、481、483、485、487、489、491、493、495、497、499、501、503、505、507、509、511、513、515、517、519、521、523、525、527、529、531、533、535、537、539、541、543、545、547、549、551、553、555、557、559、561、563、565、567、569、571、573、575、577、579、581、583、585、587、589、591、593、595、597、599、601、603、605、607、609、611、613、615、617、619、621、623、625、627、629、631、633、635、637、639、641、643、645、647、649、651、653、655、657、659、661、663、665、667、669、671、673、675、677、679、681、683、685、687、689、691、693、695、697、699、701、703、705、707、709、711、713、715、717、719、721、723、725、727、729、731、733、735、737、739、741、743、745、747、749、751、753、755、757、759、761、763、765、767、769、771、773、775、777、779、781、783、785、787、789、791、793、795、797、799、801、803、805、807、809、811、813、815、817、819、821、823、825、827、829、831、833、835、837、839、841、843、845、847、849、851、853、855、857、859、861、863、865、867、869、871、873、875、877、879、881、883、885、887、889、891、893、895、897、899、901、903、905、907、909、911、913、915、917、919、921、923、925、927、929、931、933、935、937、939、941、943、945、947、949、951、953、955、957、959、961、963、965、967、969、971、973、975、977、979、981、983、985、987、989、991、993、995、997、999、1001、1003、1005、1007、1009、1011、1013、1015、1017、1019、1021、1023、1025、1027、1029、1031、1033、1035、1037、1039、1041、1043、1045、1047、1049、1051、1053、1055、1057、1059、1061、1063、1065、1067、1069、1071、1073、1075、1077、1079、1081、1083、1085、1087、1089、1091、1093、1095、1097、1099、1101、1103、1105、1107、1109、1111、1113、1115、1117、1119、1121、1123、1125、1127、1129、1131、1133、1135、1137、1139、1141、1143、1145、1147、1149、1151、1153、1155、1157、1159、1161、1163、1165、1167、1169、1171、1173、1175、1177、1179、1181、1183、1185、1187、1189、1191、1193、1195、1197、1199、1201、1203、1205、1207、1209、1211、1213、1215、1217、1219、1221、1223、1225、1227、1229、1231、1233、1235、1237、1239、1241、1243、1245、1247、1249、1251、1253、1255、1257、1259、1261、1263、1265、1267、1269、1271、1273、1275、1277、1279、1281、1283、1285、1287、1289、1291、1293、1295、1297、1299、1301、1303、1305、1307、1309、1311、1313、1315、1317、1319、1321、1323、1325、1327、1329、1331、1333、1335、1337、1339、1341、1343、1345、1347、1349、1351、1353、1355、1357、1359、1361、1363、1365、1367、1369、1371、1373、1375、1377、1379、1381、1383、1385、1387、1389、1391、1393、1395、1397、1399、1401、1403、1405、1407、1409、1411、1413、1415、1417、1419、1421、1423、1425、1427、1429、1431、1433、1435、1437、1439、1441、1443、1445、1447、1449、1451、1453、1455、1457、1459、1461、1463、1465、1467、1469、1471、1473、1475、1477、1479、1481、1483、1485、1487、1489、1491、1493、1495、1497、1499、1501、1503、1505、1507、1509、1511、1513、1515、1517、1519、1521、1523、1525、1527、1529、1531、1533、1535、1537、1539、1541、1543、1545、1547、1549、1551、1553、1555、1557、1559、1561、1563、1565、1567、1569、1571、1573、1575、1577、1579、1581、1583、1585、1587、1589、1591、1593、1595、1597、1599、1601、1603、1605、1607、1609、1611、1613、1615、1617、1619、1621、1623、1625、1627、1629、1631、1633、1635、1637、1639、1641、1643、1645、1647、1649、1651、1653、1655、1657、1659、1661、1663、1665、1667、1669、1671、1673、1675、1677、1679、1681、1683、1685、1687、1689、1691、1693、1695、1697、1699、1701、1703、1705、1707、1709、1711、1713、1715、1717、1719、1721、1723、1725、1727、1729、1731、1733、1735、1737、1739、1741、1743、1745、1747、1749、1751、1753、1755、1757、1759、1761、1763、1765、1767、1769、1771、1773、1775、1777、1779、1781、1783、1785、1787、1789、1791、1793、1795、1797、1799、1801、1803、1805、1807、1809、1811、1813、1815、1817、1819、1821、1823、1825、1827、1829、1831、1833、1835、1837、1839、1841、1843、1845、1847、1849、1851、1853、1855、1857、1859、1861、1863、1865、1867、1869、1871、1873、1875、1877、1879、1881、1883、1885、1887、1889、1891、1893、1895、1897、1899、1901、1903、1905、1907、1909、1911、1913、1915、1917、1919、1921、1923、1925、1927、1929、1931、1933、1935、1937、1939、1941、1943、1945、1947、1949、1951、1953、1955、1957、1959、1961、1963、1965、1967、1969、1971、1973、1975、1977、1979、1981、1983、1985、1987、1989、1991、1993、1995、1997、1999、2001、2003、2005、2007、2009、2011、2013、2015、2017、2019、2021、2023、2025、2027、2029、2031、2033、2035、2037、2039、2041、2043、2045、2047、2049、2051、2053、2055、2057、2059、2061、2063、2065、2067、2069、2071、2073、2075、2077、2079、2081、2083、2085、2087、2089、2091、2093、2095、2097、2099、2101、2103、2105、2107、2109、2111、2113、2115、2117、2119、2121、2123、2125、2127、2129、2131、2133、2135、2137、2139、2141、2143、2145、2147、2149、2151、2153、2155、2157、2159、2161、2163、2165、2167、2169、2171、2173、2175、2177、2179、2181、2183、2185、2187、2189、2191、2193、21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11.编码权利要求1-4中任一项所述多肽的核酸。

12.一种组合物，其含有以下组分：

(a)以上任一项权利要求所述的多肽、抗体和/或核酸；和(b)药学上可接受的运载体。

13.如权利要求12所述的组合物，还含有疫苗佐剂。

14.如权利要求1-11中任一项所述的核酸、多肽或抗体作为药物的应用。

15.一种治疗患者的方法，包括给予患者治疗有效量的权利要求12所述的组合物。

16.如权利要求1-11中任一项所述的核酸、多肽或抗体在制备用于治疗或预防流感嗜血杆菌所致疾病和/或感染的药物中的应用。

17.如权利要求15所述的方法，或如权利要求16所述的应用，其特征在于，用于预防中耳炎、支气管炎、结膜炎、鼻窦炎、尿路感染、肺炎、菌血症、脓毒性关节炎、会厌炎、肺炎、脓胸、心包炎、蜂窝织炎、骨髓炎或脑膜炎。