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CN1273478C - 新型核苷及低聚核苷酸类似物 - Google Patents

新型核苷及低聚核苷酸类似物 Download PDF

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CN1273478C
CN1273478C CNB008056277A CN00805627A CN1273478C CN 1273478 C CN1273478 C CN 1273478C CN B008056277 A CNB008056277 A CN B008056277A CN 00805627 A CN00805627 A CN 00805627A CN 1273478 C CN1273478 C CN 1273478C
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SANKYO LIFE SCIENCE CO Ltd
Sankyo Co Ltd
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Abstract

下述通式(1)表示的化合物及其盐,以及以其作为中间体制得的具有稳定且优良的反义活性等新型低聚核苷酸类似物,式中,R1和R2相同或不同,表示氢原子、羟基的保护基、磷酸基、-P(R3)R4〔式中,R3和R4相同或不同,表示碳原子数1至5个的氰基烷氧基、被碳原子数1至4个的烷基取代的氨基〕,A表示碳原子数1至4个的亚烷基,B表示可以具有取代基的嘌呤-9-基或2-氧代-嘧啶-1-基。

Description

新型核苷及低聚核苷酸类似物
技术领域
本发明涉及具有稳定且优良的反义或抗基因活性,或者作为特定基因的检测剂(探测剂)或用于引发扩增的引物具有优良活性的新型低聚核苷酸类似物及其制备中间体的新型核苷类似物。
背景技术
具有优良的反义或抗基因(antigene)活性,而且在生物体内稳定的低聚核苷酸类似物被期待作为有用的药物,另外与DNA或mRNA形成稳定互补链的能力强的低聚核苷酸类似物,作为特定基因的检测剂或用于引发扩增的引物是有用的。
与此相比,已知天然型低聚核苷酸会被血液中或细胞内存在的各种核酸酶迅速分解。另外,天然型低聚核苷酸由于与互补碱基序列的亲和性造成的限制,有时作为特定基因的检测剂或作为引发扩增的引物,不具有充分的灵敏度。
为了克服这些缺点,制备了各种非天然型的低聚核苷酸类似物,并尝试以这些物质作为药物或特定基因的检测剂等进行了开发。即,已知例如将低聚核苷酸的磷酸二酯键内的磷原子结合的氧原子替换为硫原子得到的物质、将该氧原子替换为甲基得到的物质、将该氧原子替换为硼原子得到的物质、对低聚核苷酸的糖部分或碱基部分进行化学修饰得到的物质等。例如,ISIS公司开发了作为人巨细胞病毒性网膜炎的治疗剂的硫代酸酯(thioate)型低聚核苷酸ISIS2922(Vitravene),且已在美国销售。
但是,如果考虑上述非天然型低聚核苷酸类似物的反义或抗基因活性的强度,即与DNA或mRNA形成稳定互补链的能力、对各种核酸酶的稳定性、与生物体内的各种蛋白质非特异结合表现出的副作用等,则仍期望有更优良的在生物体内具有稳定性,表现出的副作用少,而且形成互补链的能力强的非天然型低聚核苷酸类似物。
发明内容
本发明人等对于具有优良的反义或抗基因活性,在生物体内稳定,表现出的副作用少的非天然型低聚核苷酸类似物,进行了常年的悉心研究。结果发现分子内具有醚键的低聚核苷酸类似物以及核苷类似物作为稳定且优良的反义或抗基因药物、特定基因的检测剂(探测剂)或用于引发扩增的引物以及其制备中间体是有用的,从而完成了本发明。
具体实施方式
以下详细地说明本发明。
本发明的新型核苷类似物是通式(1)表示的化合物及其盐,
Figure C0080562700071
式中,R1和R2相同或不同,表示氢原子、羟基的保护基、磷酸基、被保护的磷酸基或-P(R3)R4〔式中,R3和R4相同或不同,表示羟基、被保护的羟基、巯基、被保护的巯基、氨基、碳原子数1至4个的烷氧基、碳原子数1至4个的烷硫基、碳原子数1至5个的氰基烷氧基或被碳原子数1至4个的烷基取代的氨基
A表示碳原子数1至4个的亚烷基,
B表示嘌呤-9-基、2-氧代-嘧啶-1-基或者具有选自下述α组的取代基的取代嘌呤-9-基或取代2-氧代-嘧啶-1-基。
本发明的核苷酸类似物是具有1或2个以上下述通式(2)所示结构的低聚核苷酸类似物及其药理上允许的盐,
式中,A表示碳原子数1至4个的亚烷基,
B表示嘌呤-9-基、2-氧代-嘧啶-1-基或者具有选自下述α组的取代基的取代的嘌呤-9-基或取代的2-氧代-嘧啶-1-基,
(α组)
羟基、
被保护的羟基、
碳原子数1至4个的烷氧基、
巯基、
被保护的巯基、
碳原子数1至4个的烷硫基、
氨基、
被保护的氨基、
被碳原子数1至4个的烷基取代的氨基、
碳原子数1至4个的烷基、以及
卤素原子。
上述通式(1)或(2)中,A的“碳原子数1至4个的亚烷基”可以是例如亚甲基、亚乙基、三亚甲基、四亚甲基,优选亚甲基。
上述通式(1)或(2)中,R1和R2的“羟基保护基”以及R3和R4或α组的“被保护的羟基”中的保护基是指通过氢解、水解、电解和光解等化学方法或者人体内的水解等生物学方法可以开裂的保护基。这种保护基可以列举例如甲酰基、乙酰基、丙酰基、丁酰基、异丁酰基、戊酰基、新戊酰基、戊酰基、异戊酰基、辛酰基、壬酰基、癸酰基、3-甲基壬酰基、8-甲基壬酰基、3-乙基辛酰基、3,7-二甲基辛酰基、十一烷酰基、十二烷酰基、十三烷酰基、十四烷酰基、十五烷酰基、十六烷酰基、1-甲基十五烷酰基、14-甲基十五烷酰基、13,13-二甲基十四烷酰基、十七烷酰基、15-甲基十六烷酰基、十八烷酰基、1-甲基十七烷酰基、十九烷酰基、二十烷酰基以及二十一烷酰基等烷基羰基,丁二酸单酰基、戊二酸单酰基、己二酸单酰基等羧基化烷基羰基,氯乙酰基、二氯乙酰基、三氯乙酰基、三氟乙酰基等卤代低级烷基羰基,甲氧基乙酰基等低级烷氧基低级烷基羰基,(E)-2-甲基-2-丁烯酰基等不饱和烷基羰基等“脂肪族酰基”;
苯甲酰基、α-萘甲酰基、β-萘甲酰基等芳基羰基,2-溴苯甲酰基、4-氯苯甲酰基等卤代芳基羰基,2,4,6-三甲基苯甲酰基、4-甲基苯甲酰基等低级烷基化芳基羰基,4-甲氧基苯甲酰基等低级烷氧基化芳基羰基,2-羧基苯甲酰基、3-羧基苯甲酰基、4-羧基苯甲酰基等羧基化芳基羰基,4-硝基苯甲酰基、2-硝基苯甲酰基等硝基化芳基羰基,2-(甲氧基羰基)苯甲酰基等低级烷氧基羰基化芳基羰基,4-苯基苯甲酰基等芳基化芳基羰基等“芳香族酰基”;
四氢吡喃-2-基、3-溴四氢吡喃-2-基、4-甲氧基四氢吡喃-4-基、四氢噻喃-2-基、4-甲氧基四氢噻喃-4-基等“四氢吡喃基或四氢噻喃基”;四氢呋喃-2-基、四氢噻吩-2-基等“四氢呋喃基或四氢噻吩基”;三甲基甲硅烷基、三乙基甲硅烷基、异丙基二甲基甲硅烷基、叔丁基二甲基甲硅烷基、甲基二异丙基甲硅烷基、甲基二叔丁基甲硅烷基、三异丙基甲硅烷基等三低级烷基甲硅烷基,二苯基甲基甲硅烷基、二苯基丁基甲硅烷基、二苯基异丙基甲硅烷基、苯基二异丙基甲硅烷基等1至2个芳基取代的三低级烷基甲硅烷基等“甲硅烷基”;
甲氧基甲基、1,1-二甲基-1-甲氧基甲基、乙氧基甲基、丙氧基甲基、异丙氧基甲基、丁氧基甲基、叔丁氧基甲基等“低级烷氧基甲基”;
2-甲氧基乙氧基甲基等“低级烷氧基化低级烷氧基甲基”;
2,2,2-三氯乙氧基甲基、二(2-氯乙氧基)甲基等“卤代低级烷氧基甲基”;
1-乙氧基乙基、1-(异丙氧基)乙基等“低级烷氧基化乙基”;
2,2,2-三氯乙基等“卤代乙基”;
苯甲基、α-萘甲基、β-萘甲基、二苯基甲基、三苯基甲基、α-萘基二苯基甲基、9-蒽基甲基等“1至3个芳基取代的甲基”;
4-甲基苯甲基、2,4,6-三甲基苯甲基、3,4,5-三甲基苯甲基、4-甲氧基苯甲基、4-甲氧基苯基二苯基甲基、4,4’-二甲氧基三苯基甲基、2-硝基苯甲基、4-硝基苯甲基、4-氯苯甲基、4-溴苯甲基、4-氰基苯甲基等“芳环被低级烷基、低级烷氧基、卤素原子、氰基取代的1至3个芳基取代的甲基”;
甲氧羰基、乙氧羰基、叔丁氧羰基、异丁氧羰基等“低级烷氧羰基”;
2,2,2-三氯乙氧基羰基、2-三甲基甲硅烷基乙氧基羰基等“卤代或三低级烷基甲硅烷基取代的低级烷氧羰基”;
乙烯基氧羰基、烯丙基氧羰基等“链烯基氧羰基”;
苯甲氧基羰基、4-甲氧基苯甲氧基羰基、3,4-二甲氧基苯甲氧基羰基、2-硝基苯甲氧基羰基、4-硝基苯甲氧基羰基等“芳环可以被1至2个低级烷氧基或硝基取代的芳烷氧基羰基”。
R1和R2的“羟基保护基”中优选“脂肪族酰基”、“芳香族酰基”、“1至3个芳基取代的甲基”、“芳环被低级烷基、低级烷氧基、卤素原子、氰基取代的1至3个芳基取代的甲基”或“甲硅烷基”,更优选乙酰基、苯甲酰基、苯甲基、对甲氧基苯甲酰基、二甲氧基三苯甲基、一甲氧基三苯甲基或叔丁基二苯基甲硅烷基。
R3和R4或α组的“被保护的羟基”中优选“脂肪族酰基”或“芳香族酰基”,更优选苯甲酰基。
上述通式(1)中,R1和R2的“被保护的磷酸基”中的保护基是指通过氢解、水解、电解和光解等化学方法或者人体内的水解等生物学方法可以开裂的保护基,这种保护基可以列举,例如甲基、乙基、正丙基、异丙基、正丁基、异丁基、仲丁基、叔丁基、正戊基、异戊基、2-甲基丁基、新戊基、1-乙基丙基、正己基、异己基、4-甲基戊基、3-甲基戊基、2-甲基戊基、1-甲基戊基、3,3-二甲基丁基、2,2-二甲基丁基、1,1-二甲基丁基、1,2-二甲基丁基、1,3-二甲基丁基、2,3-二甲基丁基、2-乙基丁基等“低级烷基”;
2-氰基乙基、2-氰基-1,1-二甲基乙基等“氰基化低级烷基”;
2-甲基二苯基甲硅烷基乙基、2-三甲基甲硅烷基乙基、2-三苯基甲硅烷基乙基等“甲硅烷基取代的乙基”;
2,2,2-三氯乙基、2,2,2-三溴乙基、2,2,2-三氟乙基、2,2,2-三氯-1,1-二甲基乙基等“卤代低级烷基”;
乙烯基、1-丙烯基、2-丙烯基、1-甲基-2-丙烯基、1-甲基-1-丙烯基、2-甲基-1-丙烯基、2-甲基-2-丙烯基、2-乙基-2-丙烯基、1-丁烯基、2-丁烯基、1-甲基-2-丁烯基、1-甲基-1-丁烯基、3-甲基-2-丁烯基、1-乙基-2-丁烯基、3-丁烯基、1-甲基-3-丁烯基、2-甲基-3-丁烯基、1-乙基-3-丁烯基、1-戊烯基、2-戊烯基、1-甲基-2-戊烯基、2-甲基-2-戊烯基、3-戊烯基、1-甲基-3-戊烯基、2-甲基-3-戊烯基、4-戊烯基、1-甲基-4-戊烯基、2-甲基-4-戊烯基、1-己烯基、2-己烯基、3-己烯基、4-己烯基、5-己烯基等“低级链烯基”;
环丙基、环丁基、环戊基、环己基、环庚基、降冰片烷基、金刚烷基等“环烷基”;
2-氰基丁烯基等“氰基化低级链烯基”;
苯甲基、α-萘基甲基、β-萘基甲基、茚甲基、菲甲基、蒽甲基、二苯基甲基、三苯基甲基、1-苯基乙基、2-苯基乙基、1-萘基乙基、2-萘基乙基、1-苯基丙基、2-苯基丙基、3-苯基丙基、1-萘基丙基、2-萘基丙基、3-萘基丙基、1-苯基丁基、2-苯基丁基、3-苯基丁基、4-苯基丁基、1-萘基丁基、2-萘基丁基、3-萘基丁基、4-萘基丁基、1-苯基戊基、2-苯基戊基、3-苯基戊基、4-苯基戊基、5-苯基戊基、1-萘基戊基、2-萘基戊基、3-萘基戊基、4-萘基戊基、5-萘基戊基、1-苯基己基、2-苯基己基、3-苯基己基、4-苯基己基、5-苯基己基、6-苯基己基、1-萘基己基、2-萘基己基、3-萘基己基、4-萘基己基、5-萘基己基、6-萘基己基等“芳烷基”;
4-氯苯甲基、2-(4-硝基苯基)乙基、邻硝基苯甲基、4-硝基苯甲基、2,4-二硝基苯甲基、4-氯-2-硝基苯甲基等“芳环被硝基、卤素原子取代的芳烷基”;
苯基、茚基、萘基、菲基、蒽基等“芳基”;
2-甲基苯基、2,6-二甲基苯基、2-氯苯基、4-氯苯基、2,4-二氯苯基、2,5-二氯苯基、2-溴苯基、4-硝基苯基、4-氯-2-硝基苯基等“低级烷基、卤素原子、硝基取代的芳基”。
优选“低级烷基”、“氰基取代的低级烷基”、“芳烷基”或“芳环被硝基、卤素原子取代的芳烷基”。更优选2-氰基乙基、2,2,2-三氯乙基或苯甲基。
上述通式(1)或(2)中,R3和R4或α组的“碳原子数1至4个的烷氧基”可以列举,例如甲氧基、乙氧基、正丙氧基、异丙氧基、正丁氧基、异丁氧基、仲丁氧基或叔丁氧基,优选甲氧基或乙氧基。
上述通式(1)或(2)中,R3和R4或α组的“被保护的巯基”中的保护基除上述作为羟基的保护基列举的基团之外,还可以列举,例如甲硫基、乙硫基、叔丁硫基等烷硫基,苯甲硫基等芳烷硫基等“能形成二硫化物的基团”,优选“脂肪族酰基”或“芳香族酰基”,更优选苯甲酰基。
上述通式(1)或(2)中,α组的“碳原子数1至4个的烷硫基”可以列举,例如甲硫基、乙硫基、丙硫基、异丙硫基、丁硫基、异丁硫基、仲丁硫基、叔丁硫基,优选甲硫基或乙硫基。
上述通式(1)或(2)中,R3和R4或α组的“被保护的氨基”中的保护基可以列举,例如甲酰基、乙酰基、丙酰基、丁酰基、异丁酰基、戊酰基、新戊酰基、戊酰基、异戊酰基、辛酰基、壬酰基、癸酰基、3-甲基壬酰基、8-甲基壬酰基、3-乙基辛酰基、3,7-二甲基辛酰基、十一烷酰基、十二烷酰基、十三烷酰基、十四烷酰基、十五烷酰基、十六烷酰基、1-甲基十五烷酰基、14-甲基十五烷酰基、13,13-二甲基十四烷酰基、十七烷酰基、15-甲基十六烷酰基、十八烷酰基、1-甲基十七烷酰基、十九烷酰基、二十烷酰基以及二十一烷酰基等烷基羰基,丁二酸单酰基、戊二酸单酰基、己二酸单酰基等羧基化烷基羰基,氯乙酰基、二氯乙酰基、三氯乙酰基、三氟乙酰基等卤代低级烷基羰基,甲氧基乙酰基等低级烷氧基低级烷基羰基,(E)-2-甲基-2-丁烯酰基等不饱和烷基羰基等“脂肪族酰基”;苯甲酰基、α-萘甲酰基、β-萘甲酰基等芳基羰基,2-溴苯甲酰基、4-氯苯甲酰基等卤代芳基羰基,2,4,6-三甲基苯甲酰基、4-甲基苯甲酰基等低级烷基化芳基羰基,4-甲氧基苯甲酰基等低级烷氧基化芳基羰基,2-羧基苯甲酰基、3-羧基苯甲酰基、4-羧基苯甲酰基等羧基化芳基羰基,4-硝基苯甲酰基、2-硝基苯甲酰基等硝基化芳基羰基,2-(甲氧基羰基)苯甲酰基等低级烷氧基羰基化芳基羰基,4-苯基苯甲酰基等芳基化芳基羰基等“芳香族酰基”;
甲氧羰基、乙氧羰基、叔丁氧羰基、异丁氧羰基等“低级烷氧羰基”;
2,2,2-三氯乙氧基羰基、2-三甲基甲硅烷基乙氧基羰基等“卤素或三低级烷基甲硅烷基取代的低级烷氧羰基”;
乙烯氧羰基、烯丙氧羰基等“链烯氧羰基”;
苯甲氧基羰基、4-甲氧基苯甲氧基羰基、3,4-二甲氧基苯甲氧基羰基、2-硝基苯甲氧基羰基、4-硝基苯甲氧基羰基等“芳环可以被1至2个低级烷氧基或硝基取代的芳烷氧基羰基”,优选“脂肪族酰基”或“芳香族酰基”,更优选苯甲酰基。
上述通式(1)或(2)中,R3和R4或α组的“碳原子数1至4个的烷基取代的氨基”可以列举,例如甲氨基、乙氨基、丙氨基、异丙氨基、丁氨基、异丁氨基、仲丁氨基、叔丁氨基、二甲氨基、二乙氨基、二丙氨基、二异丙氨基、二丁氨基、二异丁氨基、二仲丁氨基、二叔丁氨基,优选甲氨基、乙氨基、二甲氨基、二乙氨基或二异丙氨基。
上述通式(1)中,R3和R4的“碳原子数1至5个的氰基烷氧基”是指在上述“碳原子数1至4个的烷氧基”上取代了氰基而得到的基团,这种基团可以列举,例如氰基甲氧基、2-氰基乙氧基、3-氰基丙氧基、4-氰基丁氧基、3-氰基-2-甲基丙氧基或1-氰基甲基-1,1-二甲基甲氧基,优选2-氰基乙氧基。
上述通式(1)或(2)中,α组的“碳原子数1至4个的烷基”可以列举,例如甲基、乙基、丙基、异丙基、丁基、异丁基、仲丁基、叔丁基,优选甲基或乙基。
上述通式(1)或(2)中,α组的“卤素原子”可以列举,例如氟原子、氯原子、溴原子或碘原子,优选氟原子或氯原子。
上述通式(1)或(2)中,B的“嘌呤-9-基”和“取代的嘌呤-9-基”全部优选的基团为6-氨基嘌呤-9-基(即腺嘌呤基)、氨基被保护的6-氨基嘌呤-9-基、2,6-二氨基嘌呤-9-基、2-氨基-6-氯嘌呤-9-基、氨基被保护的2-氨基-6-氯嘌呤-9-基、2-氨基-6-氟嘌呤-9-基、氨基被保护的2-氨基-6-氟嘌呤-9-基、2-氨基-6-溴嘌呤-9-基、氨基被保护的2-氨基-6-溴嘌呤-9-基、2-氨基-6-羟基嘌呤-9-基(即鸟嘌呤基)、氨基被保护的2-氨基-6-羟基嘌呤-9-基、氨基和羟基被保护的2-氨基-6-羟基嘌呤-9-基、6-氨基-2-甲氧基嘌呤-9-基、6-氨基-2-氯嘌呤-9-基、6-氨基-2-氟嘌呤-9-基、2,6-二甲氧基嘌呤-9-基、2,6-二氯嘌呤-9-基或6-巯基嘌呤-9-基,更优选6-苯甲酰氨基嘌呤-9-基、腺嘌呤基、2-异丁酰氨基-6-羟基嘌呤-9-基或鸟嘌呤基。
上述通式(1)或(2)中,B的“2-氧代-嘧啶-1-基”以及“取代的2-氧代-嘧啶-1-基”全部优选的基团为2-氧代-4-氨基-嘧啶-1-基(即胞嘧啶基)、氨基被保护的2-氧代-4-氨基-嘧啶-1-基、2-氧代-4-氨基-5-氟-嘧啶-1-基、氨基被保护的2-氧代-4-氨基-5-氟-嘧啶-1-基、4-氨基-2-氧代-5-氯-嘧啶-1-基、2-氧代-4-甲氧基-嘧啶-1-基、2-氧代-4-巯基-嘧啶-1-基、2-氧代-4-羟基-嘧啶-1-基(即尿嘧啶基)、2-氧代-4-羟基-5-甲基嘧啶-1-基(即胸腺嘧啶基)或4-氨基-5-甲基-2-氧代-嘧啶-1-基(即5-甲基胞嘧啶基),更优选2-氧代-4-苯甲酰氨基-嘧啶-1-基、胞嘧啶基、胸腺嘧啶基、尿嘧啶基、2-氧代-4-苯甲酰氨基-5-甲基-嘧啶-1-基或5-甲基胞嘧啶基。
“核苷类似物”是指嘌呤或嘧啶碱基与糖结合得到的“核苷”中非天然型的物质。
“低聚核苷酸类似物”是指2至50个相同或不同的上述“核苷”通过磷酸二酯键结合得到的“低聚核苷酸”的非天然型衍生物,这种类似物优选包括糖部分经改性的糖衍生物;磷酸二酯键部分是经硫代酸酯化(thioated)的硫代酸酯衍生物(thioate derivative);末端的磷酸部分是经酯化得到的酯体;嘌呤碱基上的氨基被酰胺化的酰胺体,更优选糖部分经改性的糖衍生物和磷酸二酯键部分是经硫代酸酯化的硫代酸酯衍生物。
由于本发明的化合物(1)可以成盐,“其盐”是指该化合物的盐,这种盐优选钠盐、钾盐、锂盐等碱金属盐,钙盐、镁盐等碱土金属盐,铝盐、铁盐、锌盐、铜盐、镍盐、钴盐等金属盐;铵盐等无机盐,叔辛基胺盐、二苯甲基胺盐、吗啉盐、葡糖胺盐、苯基甘氨酸烷基酯盐、乙二胺盐、N-甲基葡糖胺盐、胍盐、二乙胺盐、三乙胺盐、二环己基胺盐、N,N’-二苯甲基乙二胺盐、氯普鲁卡因盐、普鲁卡因盐、二乙醇胺盐、N-苯甲基-苯乙基胺盐、哌嗪盐、四甲基铵盐、三(羟甲基)氨基甲烷盐等有机盐等胺盐;氢氟酸盐、盐酸盐、氢溴酸盐、氢碘酸盐等氢卤酸盐,硝酸盐、高氯酸盐、硫酸盐、磷酸盐等无机酸盐;甲磺酸盐、三氟甲磺酸盐、乙磺酸盐等低级烷磺酸盐,苯磺酸盐、对甲苯磺酸盐等芳基磺酸盐,乙酸盐、苹果酸盐、富马酸盐、琥珀酸盐、枸橼酸盐、酒石酸盐、草酸盐、马来酸盐等有机酸盐;以及甘氨酸、赖氨酸、精氨酸、鸟氨酸、谷氨酸、天冬氨酸等氨基酸盐。
由于本发明改性的低聚核苷酸或多核苷酸类似物可以成盐,“其药理学上允许的盐”是指它们的盐,这种盐优选钠盐、钾盐、锂盐等碱金属盐,钙盐、镁盐等碱土金属盐,铝盐、铁盐、锌盐、铜盐、镍盐、钴盐等金属盐;铵盐等无机盐,叔辛基胺盐、二苯甲基胺盐、吗啉盐、葡糖胺盐、苯基甘氨酸烷基酯盐、乙二胺盐、N-甲基葡糖胺盐、胍盐、二乙胺盐、三乙胺盐、二环己基胺盐、N,N’-二苯甲基乙二胺盐、氯普鲁卡因盐、普鲁卡因盐、二乙醇胺盐、N-苯甲基-苯乙基胺盐、哌嗪盐、四甲基铵盐、三(羟甲基)氨基甲烷盐等有机盐等胺盐;氢氟酸盐、盐酸盐、氢溴酸盐、氢碘酸盐等氢卤酸盐,硝酸盐、高氯酸盐、硫酸盐、磷酸盐等无机酸盐;甲磺酸盐、三氟甲磺酸盐、乙磺酸盐等低级烷磺酸盐,苯磺酸盐、对甲苯磺酸盐等芳基磺酸盐,乙酸盐、苹果酸盐、富马酸盐、琥珀酸盐、枸橼酸盐、酒石酸盐、草酸盐、马来酸盐等有机酸盐;以及甘氨酸、赖氨酸、精氨酸、鸟氨酸、谷氨酸、天冬氨酸等氨基酸盐。
本发明的化合物(1)及其盐中,优选的化合物可以列举:
(1)R1为氢原子、脂肪族酰基、芳香族酰基、1至3个芳基取代的甲基、被1至3个芳环被低级烷基、低级烷氧基、卤素或氰基取代的芳基取代的甲基或甲硅烷基的化合物及其盐,
(2)R1为氢原子、乙酰基、苯甲酰基、苯甲基、对甲氧基苯甲基、二甲氧基三苯甲基、一甲氧基三苯甲基或叔丁基二苯基甲硅烷基的化合物及其盐,
(3)R2为氢原子、脂肪族酰基、芳香族酰基、被1至3个芳基取代的甲基、被1至3个芳环被低级烷基、低级烷氧基、卤素或氰基取代的芳基取代的甲基、甲硅烷基、亚磷酰胺(phosphoramidite)基、膦酰基、磷酸基或被保护的磷酸基的化合物及其盐,
(4)R2为氢原子、乙酰基、苯甲酰基、苯甲基、对甲氧基苯甲基、叔丁基二苯基甲硅烷基、-P(OC2H4CN)(NCH(CH3)2)、-P(OCH3)(NCH(CH3)2)、膦酰基或者2-氯苯基或4-氯苯基磷酸基的化合物及其盐,
(5)A为亚甲基的化合物及其盐,
(6)B为6-氨基嘌呤-9-基(即腺嘌呤基)、氨基被保护的6-氨基嘌呤-9-基、2,6-二氨基嘌呤-9-基、2-氨基-6-氯嘌呤-9-基、氨基被保护的2-氨基-6-氯嘌呤-9-基、2-氨基-6-氟嘌呤-9-基、氨基被保护的2-氨基-6-氟嘌呤-9-基、2-氨基-6-溴嘌呤-9-基、氨基被保护的2-氨基-6-溴嘌呤-9-基、2-氨基-6-羟基嘌呤-9-基(即鸟嘌呤基)、氨基被保护的2-氨基-6-羟基嘌呤-9-基、氨基和羟基被保护的2-氨基-6-羟基嘌呤-9-基、6-氨基-2-甲氧基嘌呤-9-基、6-氨基-2-氯嘌呤-9-基、6-氨基-2-氟嘌呤-9-基、2,6-二甲氧基嘌呤-9-基、2,6-二氯嘌呤-9-基、6-巯基嘌呤-9-基、2-氧代-4-氨基-嘧啶-1-基(即胞嘧啶基)、氨基被保护的2-氧代-4-氨基-嘧啶-1-基、2-氧代-4-氨基-5-氟-嘧啶-1-基、氨基被保护的2-氧代-4-氨基-5-氟-嘧啶-1-基、4-氨基-2-氧代-5-氯-嘧啶-1-基、2-氧代-4-甲氧基-嘧啶-1-基、2-氧代-4-巯基-嘧啶-1-基、2-氧代-4-羟基-嘧啶-1-基(即尿嘧啶基)、2-氧代-4-羟基-5-甲基嘧啶-1-基(即胸腺嘧啶基)、4-氨基-5-甲基-2-氧代-嘧啶-1-基(5-甲基胞嘧啶基)或氨基被保护的4-氨基-5-甲基-2-氧代-嘧啶-1-基的化合物及其盐,
(7)B为6-苯甲酰氨基嘌呤-9-基、腺嘌呤基、2-异丁酰氨基-6-羟基嘌呤-9-基、鸟嘌呤基、2-氧代-4-苯甲酰氨基-嘧啶-1-基、胞嘧啶基、2-氧代-5-甲基-4-苯甲酰氨基-嘧啶-1-基、5-甲基胞嘧啶基、尿嘧啶基或胸腺嘧啶基的化合物及其盐。
另外,上述(1)至(2)、(3)至(4)、或(6)至(7)随序号增大,表示更优选的化合物,通式(1)中R1从(1)至(2)中任意选择,R2从(3)至(4)中任意选择,A从(5)中任意选择,B从(6)至(7)中任意选择,以及将其任意组合得到的化合物及其盐也是优选的,特别优选由下述组中选择的化合物及其盐。
(化合物组)
2’-O,4’-C-亚乙基鸟嘌呤核苷、
2’-O,4’-C-亚乙基腺嘌呤核苷、
3’,5’-二-O-苯甲基-2’-O,4’-C-亚乙基-6-N-苯甲酰基腺嘌呤核苷、
3’,5’-二-O-苯甲基-2’-O,4’-C-亚乙基-2-N-异丁酰基鸟嘌呤核苷、
5’-O-二甲氧基三苯甲基-2’-O,4’-C-亚乙基-6-N-苯甲酰基腺嘌呤核苷、
5’-O-二甲氧基三苯甲基-2’-O,4’-C-亚乙基-2-N-异丁酰基鸟嘌呤核苷、
2’-O,4’-C-亚乙基-2-N-异丁酰基鸟嘌呤核苷、
2’-O,4’-C-亚乙基-6-N-苯甲酰基腺嘌呤核苷、
5’-O-二甲氧基三苯甲基-2’-O,4’-C-亚乙基-6-N-苯甲酰基腺嘌呤核苷-3’-O-(2-氰基乙基N,N-二异丙基)亚磷酰胺(phosphoramidite)、
5’-O-二甲氧基三苯甲基-2’-O,4’-C-亚乙基-2-N-异丁酰基鸟嘌呤核苷-3’-O-(2-氰基乙基N,N-二异丙基)亚磷酰胺、
2’-O,4’-C-亚乙基尿嘧啶核苷、
2’-O,4’-C-亚乙基-5-甲基尿嘧啶核苷、
2’-O,4’-C-亚乙基胞嘧啶核苷、
2’-O,4’-C-亚乙基-5-甲基胞嘧啶核苷、
3’,5’-二-O-苯甲基-2’-O,4’-C-亚乙基尿嘧啶核苷、
5’-O-二甲氧基三苯甲基-2’-O,4’-C-亚乙基尿嘧啶核苷、
3’,5’-二-O-苯甲基-2’-O,4’-C-亚乙基-5-甲基尿嘧啶核苷、
5’-O-二甲氧基三苯甲基-2’-O,4’-C-亚乙基-5-甲基尿嘧啶核苷、
3’,5’-二-O-苯甲基-2’-O,4’-C-亚乙基-4-N-苯甲酰基胞嘧啶核苷、
5’-O-二甲氧基三苯甲基-2’-O,4’-C-亚乙基-4-N-苯甲酰基胞嘧啶核苷、
3’,5’-二-O-苯甲基-2’-O,4’-C-亚乙基-4-N-苯甲酰基-5-甲基胞嘧啶核苷、
5’-O-二甲氧基三苯甲基-2’-O,4’-C-亚乙基-4-N-苯甲酰基-5-甲基胞嘧啶核苷、
2’-O,4’-C-亚乙基-4-N-苯甲酰基胞嘧啶核苷、
2’-O,4’-C-亚乙基-4-N-苯甲酰基-5-甲基胞嘧啶核苷、
5’-O-二甲氧基三苯甲基-2’-O,4’-C-亚乙基-尿嘧啶核苷-3’-O-(2-氰基乙基N,N-二异丙基)亚磷酰胺、
5’-O-二甲氧基三苯甲基-2’-O,4’-C-亚乙基-5-甲基尿嘧啶核苷-3’-O-(2-氰基乙基N,N-二异丙基)亚磷酰胺、
5’-O-二甲氧基三苯甲基-2’-O,4’-C-亚乙基-4-N-苯甲酰基胞嘧啶核苷-3’-O-(2-氰基乙基N,N-二异丙基)亚磷酰胺、以及
5’-O-二甲氧基三苯甲基-2’-O,4’-C-亚乙基-4-N-苯甲酰基-5-甲基胞嘧啶核苷-3’-O-(2-氰基乙基N,N-二异丙基)亚磷酰胺。
本发明的含有1或2个以上通式(2)所示结构的低聚核苷酸类似物及其药理学上允许的盐中,优选的物质可以列举:
(8)A为亚甲基的低聚核苷酸类似物及其药理学上允许的盐、
(9)B为6-氨基嘌呤-9-基(即腺嘌呤基)、氨基被保护的6-氨基嘌呤-9-基、2,6-二氨基嘌呤-9-基、2-氨基-6-氯嘌呤-9-基、氨基被保护的2-氨基-6-氯嘌呤-9-基、2-氨基-6-氟嘌呤-9-基、氨基被保护的2-氨基-6-氟嘌呤-9-基、2-氨基-6-溴嘌呤-9-基、氨基被保护的2-氨基-6-溴嘌呤-9-基、2-氨基-6-羟基嘌呤-9-基(即鸟嘌呤基)、氨基被保护的2-氨基-6-羟基嘌呤-9-基、氨基和羟基被保护的2-氨基-6-羟基嘌呤-9-基、6-氨基-2-甲氧基嘌呤-9-基、6-氨基-2-氯嘌呤-9-基、6-氨基-2-氟嘌呤-9-基、2,6-二甲氧基嘌呤-9-基、2,6-二氯嘌呤-9-基、6-巯基嘌呤-9-基、2-氧代-4-氨基-嘧啶-1-基(即胞嘧啶基)、氨基被保护的2-氧代-4-氨基-嘧啶-1-基、2-氧代-4-氨基-5-氟-嘧啶-1-基、氨基被保护的2-氧代-4-氨基-5-氟-嘧啶-1-基、4-氨基-2-氧代-5-氯-嘧啶-1-基、2-氧代-4-甲氧基-嘧啶-1-基、2-氧代-4-巯基-嘧啶-1-基、2-氧代-4-羟基-嘧啶-1-基(即尿嘧啶基)、2-氧代-4-羟基-5-甲基嘧啶-1-基(即胸腺嘧啶基)、4-氨基-5-甲基-2-氧代-嘧啶-1-基(5-甲基胞嘧啶基)或氨基被保护的4-氨基-5-甲基-2-氧代-嘧啶-1-基的低聚核苷酸类似物及其药理学上允许的盐,
(10)B为6-苯甲酰氨基嘌呤-9-基、腺嘌呤基、2-异丁酰氨基-6-羟基嘌呤-9-基、鸟嘌呤基、2-氧代-4-苯甲酰氨基-嘧啶-1-基、胞嘧啶基、2-氧代-5-甲基-4-苯甲酰氨基-嘧啶-1-基、5-甲基胞嘧啶基、尿嘧啶基或胸腺嘧啶基的低聚核苷酸类似物及其药理学上允许的盐。
另外,上述(9)至(10)随序号增大,表示更优选的低聚核苷酸类似物,通式(2)中A从(8)中任意选择,B从(9)至(10)中任意选择,以及将其任意组合得到的低聚核苷酸类似物及其药理学上允许的盐也是优选的。
本发明的上述式(1)的化合物中包含的具体化合物如表1和表2所示。但是,本发明的化合物并不仅限于此。
表1和表2中,Me表示甲基,Bn表示苯甲基,Bz表示苯甲酰基,PMB表示对甲氧基苯甲基,Tr表示三苯基甲基、MMTr表示4-甲氧基三苯基甲基(一甲氧基三苯甲基),DMTr表示4,4’-二甲氧基三苯基甲基(二甲氧基三苯甲基),TMTr表示4,4’,4”-三甲氧基三苯基甲基(三甲氧基三苯甲基),TMS表示三甲基甲硅烷基,TBDMS表示叔丁基二甲基甲硅烷基,TBDPS表示叔丁基二苯基甲硅烷基,TIPS表示三异丙基甲硅烷基。
Figure C0080562700201
[表1]
  例示化合物序号 A R1 R2 R3a R4a
  1-1   CH2   H   H   H   H
  1-2   CH2   H   H   H   NH2
  1-3   CH2   H   H   H   OH
  1-4   CH2   H   H   OH   H
  1-5   CH2   H   H   OH   NH2
  1-6   CH2   H   H   OH   OH
  1-7   CH2   H   H   NH2   H
  1-8   CH2   H   H   NH2   NH2
  1-9   CH2   H   H   NH2   Cl
  1-10   CH2   H   H   NH2   F
  1-11   CH2   H   H   NH2   Br
  1-12   CH2   H   H   NH2   OH
  1-13   CH2   H   H   OMe   H
  1-14   CH2   H   H   OMe   OMe
  1-15   CH2   H   H   OMe   NH2
  1-16   CH2   H   H   Cl   H
  1-17   CH2   H   H   Br   H
  1-18   CH2   H   H   F   H
  1-19   CH2   H   H   Cl   Cl
  1-20   CH2   H   H   SH   H
  1-21   CH2   Bn   H   NHBz   H
  1-22   CH2   Bn   H   OH   NHCOCH(CH3)2
  1-23   CH2   Bn   Bn   NHBz   H
  1-24   CH2   Bn   Bn   OH   NHCOCH(CH3)2
  1-25   CH2   PMB   H   NHBz   H
  1-26   CH2   PMB   H   OH   NHCOCH(CH3)2
  1-27   CH2   PMB   PMB   NHBz   H
  1-28   CH2   PMB   PMB   OH   NHCOCH(CH3)2
  1-29   CH2   Tr   H   NHBz   H
  1-30   CH2   MMTr   H   NHBz   H
  1-31   CH2   DMTr   H   NHBz   H
  1-32   CH2   TMTr   H   NHBz   H
  1-33   CH2   Tr   H   OH   NHCOCH(CH3)2
  1-34   CH2   MMTr   H   OH   NHCOCH(CH3)2
  1-35   CH2   DMTr   H   OH   NHCOCH(CH3)2
  1-36   CH2   TMTr   H   OH   NHCOCH(CH3)2
  1-37   CH2   TMS   H   NHBz   H
  1-38   CH2   TBDMS   H   NHBz   H
  1-39   CH2   TBDFS   H   NHBz   H
  1-40   CH2   TIPS   H   NHBz   H
1-41 CH2 TMS H OH NHCOCH(CH3)2
  1-42   CH2   TBDMS   H   OH   NHCOCH(CH3)2
  1-43   CH2   TBDPS   H   OH   NHCOCH(CH3)2
  1-44   CH2   TIPS   H   OH   NHCOCH(CH3)2
  1-45   (CH2)2   H   H   H   H
  1-46   (CH2)2   H   H   H   NH2
  1-47   (CH2)2   H   H   H   OH
  1-48   (CH2)2   H   H   OH   H
  1-49   (CH2)2   H   H   OH   NH2
  1-50   (CH2)2   H   H   OH   OH
  1-51   (CH2)2   H   H   NH2   H
  1-52   (CH2)2   H   H   NH2   NH2
  1-53   (CH2)2   H   H   NH2   Cl
  1-54   (CH2)2   H   H   NH2   F
  1-55   (CH2)2   H   H   NH2   Br
  1-56   (CH2)2   H   H   NH2   OH
  1-57   (CH2)2   H   H   OMe   H
  1-58   (CH2)2   H   H   OMe   OMe
  1-59   (CH2)2   H   H   OMe   NH2
  1-60   (CH2)2   H   H   Cl   H
  1-61   (CH2)2   H   H   Br   H
  1-62   (CH2)2   H   H   F   H
  1-63   (CH2)2   H   H   Cl   Cl
  1-64   (CH2)2   H   H   SH   H
  1-65   (CH2)2   Bn   H   NHBz   H
  1-66   (CH2)2   Bn   H   OH   NHCOCH(CH3)2
  1-67   (CH2)2   Bn   Bn   NHBz   H
  1-68   (CH2)2   Bn   Bn   OH   NHCOCH(CH3)2
  1-69   (CH2)2   PMB   H   NHBz   H
  1-70   (CH2)2   PMB   H   OH   NHCOCH(CH3)2
  1-71   (CH2)2   PMB   PMB   NHBz   H
  1-72   (CH2)2   PMB   PMB   OH   NHCOCH(CH3)2
  1-73   (CH2)2   Tr   H   NHBz   H
  1-74   (CH2)2   MMTr   H   NHBz   H
  1-75   (CH2)2   DMTr   H   NHBz   H
  1-76   (CH2)2   TMTr   H   NHBz   H
  1-77   (CH2)2   Tr   H   OH   NHCOCH(CH3)2
  1-78   (CH2)2   MMTr   H   OH   NHCOCH(CH3)2
  1-79   (CH2)2   DMTr   H   OH   NHCOCH(CH3)2
  1-80   (CH2)2   TMTr   H   OH   NHCOCH(CH3)2
  1-81   (CH2)2   TMS   H   NHBz   H
  1-82   (CH2)2   TBDMS   H   NHBz   H
  1-83   (CH2)2   TBDPS   H   NHBz   H
  1-84   (CH2)2   TIPS   H   NHBz   H
  1-85   (CH2)2   TMS   H   OH   NHCOCH(CH3)2
  1-86   (CH2)2   TBDMS   H   OH   NHCOCH(CH3)2
  1-87   (CH2)2   TBDPS   H   OH   NHCOCH(CH3)2
  1-88   (CH2)2   TIPS   H   OH   NHCOCH(CH3)2
  1-89   (CH2)3   H   H   H   H
  1-90   (CH2)3   H   H   H   NH2
  1-91   (CH2)3   H   H   H   OH
  1-92   (CH2)3   H   H   OH   H
  1-93   (CH2)3   H   H   OH   NH2
  1-94   (CH2)3   H   H   OH   OH
  1-95   (CH2)3   H   H   NH2   H
  1-96   (CH2)3   H   H   NH2   NH2
1-97 (CH2)3 H H NH2 Cl
  1-98   (CH2)3   H   H   NH2   F
  1-99   (CH2)3   H   H   NH2   Br
  1-100   (CH2)3   H   H   NH2   OH
  1-101   (CH2)3   H   H   OMe   H
  1-102   (CH2)3   H   H   OMe   OMe
  1-103   (CH2)3   H   H   OMe   NH2
  1-104   (CH2)3   H   H   Cl   H
  1-105   (CH2)3   H   H   Br   H
  1-106   (CH2)3   H   H   F   H
  1-107   (CH2)3   H   H   Cl   Cl
  1-108   (CH2)3   H   H   SH   H
  1-109   (CH2)3   Bn   H   NHBz   H
  1-110   (CH2)3   Bn   H   OH   NHCOCH(CH3)2
  1-111   (CH2)3   Bn   Bn   NHBz   H
  1-112   (CH2)3   Bn   Bn   OH   NHCOCH(CH3)2
  1-113   (CH2)3   PMB   H   NHBz   H
  1-114   (CH2)3   PMB   H   OH   NHCOCH(CH3)2
  1-115   (CH2)3   PMB   PMB   NHBz   H
  1-116   (CH2)3   PMB   PMB   OH   NHCOCH(CH3)2
  1-117   (CH2)3   Tr   H   NHBz   H
  1-118   (CH2)3   MMTr   H   NHBz   H
  1-119   (CH2)3   DMTr   H   NHBz   H
  1-120   (CH2)3   TMTr   H   NHBz   H
  1-121   (CH2)3   Tr   H   OH   NHCOCH(CH3)2
  1-122   (CH2)3   MMTr   H   OH   NHCOCH(CH3)2
  1-123   (CH2)3   DMTr   H   OH   NHCOCH(CH3)2
  1-124   (CH2)3   TMTr   H   OH   NHCOCH(CH3)2
  1-125   (CH2)3   TMS   H   NHBz   H
  1-126   (CH2)3   TBDMS   H   NHBz   H
  1-127   (CH2)3   TBDPS   H   NHBz   H
  1-128   (CH2)3   TIPS   H   NHBz   H
  1-129   (CH2)3   TMS   H   OH   NHCOCH(CH3)2
  1-130   (CH2)3   TBDMS   H   OH   NHCOCH(CH3)2
  1-131   (CH2)3   TBDPS   H   OH   NHCOCH(CH3)2
  1-132   (CH2)3   TIPS   H   OH   NHCOCH(CH3)2
  1-133   (CH2)4   H   H   H   H
  1-134   (CH2)4   H   H   H   NH2
  1-135   (CH2)4   H   H   H   OH
  1-136   (CH2)4   H   H   OH   H
  1-137   (CH2)4   H   H   OH   NH2
  1-138   (CH2)4   H   H   OH   OH
  1-139   (CH2)4   H   H   NH2   H
  1-140   (CH2)4   H   H   NH2   NH2
  1-141   (CH2)4   H   H   NH2   Cl
  1-142   (CH2)4   H   H   NH2   F
  1-143   (CH2)4   H   H   NH2   Br
  1-144   (CH2)4   H   H   NH2   OH
  1-145   (CH2)4   H   H   OMe   H
  1-146   (CH2)4   H   H   OMe   OMe
  1-147   (CH2)4   H   H   OMe   NH2
  1-148   (CH2)4   H   H   Cl   H
  1-149   (CH2)4   H   H   Br   H
  1-150   (CH2)4   H   H   F   H
  1-151   (CH2)4   H   H   Cl   Cl
  1-152   (CH2)4   H   H   SH   H
  1-153   (CH2)4   Bn   H   NHBz   H
  1-154   (CH2)4   Bn   H   OH   NHCOCH(CH3)2
  1-155   (CH2)4   Bn   Bn   NHBz   H
  1-156   (CH2)4   Bn   Bn   OH   NHCOCH(CH3)2
  1-157   (CH2)4   PMB   H   NHBz   H
  1-158   (CH2)4   PMB   H   OH   NHCOCH(CH3)2
  1-159   (CH2)4   PMB   PMB   NHBz   H
  1-160   (CH2)4   PMB   PMB   OH   NHCOCH(CH3)2
  1-161   (CH2)4   Tr   H   NHBz   H
  1-162   (CH2)4   MMTr   H   NHBz   H
  1-163   (CH2)4   DMTr   H   NHBz   H
  1-164   (CH2)4   TMTr   H   NHBz   H
  1-165   (CH2)4   Tr   H   OH   NHCOCH(CH3)2
  1-166   (CH2)4   MMTr   H   OH   NHCOCH(CH3)2
  1-167   (CH2)4   DMTr   H   OH   NHCOCH(CH3)2
  1-168   (CH2)4   TMTr   H   OH   NHCOCH(CH3)2
  1-169   (CH2)4   TMS   H   NHBz   H
  1-170   (CH2)4   TBDMS   H   NHBz   H
  1-171   (CH2)4   TBDPS   H   NHBz   H
  1-172   (CH2)4   TIPS   H   NHBz   H
  1-173   (CH2)4   TMS   H   OH   NHCOCH(CH3)2
  1-174   (CH2)4   TBDMS   H   OH   NHCOCH(CH3)2
  1-175   (CH2)4   TBDPS   H   OH   NHCOCH(CH3)2
  1-176   (CH2)4   TIPS   H   OH   NHCOCH(CH3)2
  1-177   CH2   H   H   OH   NHCOCH(CH3)2
  1-178   CH2   H   H   NHBz   H
  1-179   (CH2)2   H   H   OH   NHCOCH(CH3)2
  1-180   (CH2)2   H   H   NHBz   H
  1-181   (CH2)3   H   H   OH   NHCOCH(CH3)2
  1-182   (CH2)3   H   H   NHBz   H
  1-183   (CH2)4   H   H   OH   NHCOCH(CH3)2
  1-184   (CH2)4   H   H   NHBz   H
  1-185   CH2   DMTr   P(N(iPr)2)(OC2H4CN)   OH   NHCOCH(CH3)2
  1-186   CH2   DMTr   P(N(iPr)2)(OC2H4CN)   NHBz   H
  1-187   (CH2)2   DMTr   P(N(iPr)2)(OC2H4CN)   OH   NHCOCH(CH3)2
  1-188   (CH2)2   DMTr   P(N(iFr)2)(OC2H4CN)   NHBz   H
  1-189   (CH2)3   DMTr   P(N(iPr)2)(OC2H4CN)   OH   NHCOCH(CH3)2
  1-190   (CH2)3   DMTr   P(N(iPr)2)(OC2H4CN)   NHBz   H
  1-191   (CH2)4   DMTr   P(N(iPr)2)(OC2H4CN)   OH   NHCOCH(CH3)2
  1-192   (CH2)4   DMTr   P(N(iPr)2)(OC2H4CN)   NHBz   H
  1-193   CH2   DMTr   P(N(iPr)2)(OCH3)   OH   NHCOCH(CH3)2
  1-194   CH2   DMTr   P(N(iPr)2)(OCH3)   NHBz   H
  1-195   (CH2)2   DMTr   P(N(iPr)2)(OCH3)   OH   NHCOCH(CH2)2
1-196 (CH2)2 DMTr P(N(iPr)2)(OCH3) NHBz H
  1-197   (CH2)3   DMTr   P(N(iPr)2)(OCH3)   OH   NHCOCH(CH3)2
  1-198   (CH2)3   DMTr   P(N(iPr)2)(OCH3)   NHBz   H
  1-199   (CH2)4   DMTr   P(N(iPr)2)(OCH3)   OH   NHCOCH(CH3)2
  1-200   (CH2)4   DMTr   P(N(iPr)2)(OCH3)   NHBz   H
  1-201   CH2   DMTr   P(O)(OH)H   OH   NHCOCH(CH2)2
  1-202   CH2   DMTr   P(O)(OH)H   NHBz   H
  1-203   (CH2)2   DMTr   P(O)(OH)H   OH   NHCOCH(CH3)2
  1-204   (CH2)2   DMTr   P(O)(OH)H   NHBz   H
  1-205   (CH2)3   DMTr   P(O)(OH)H   OH   NHCOCH(CH3)2
  1-206   (CH2)3   DMTr   P(O)(OH)H   NHBz   H
  1-207   (CH2)4   DMTr   P(O)(OH)H   OH   NHCOCH(CH3)2
  1-208   (CH2)4   DMTr   P(O)(OH)H   NHBz   H
[表2]
  例示化合物序号 A R1 R2 R5 R6
  2-1   CH2   H   H   OH   H
  2-2   CH2   H   H   OH   CH3
  2-3   CH2   H   H   NH2   H
  2-4   CH2   H   H   NH2   CH3
  2-5   CH2   H   H   NH2   F
  2-6   CH2   H   H   Cl   H
  2-7   CH2   H   H   OMe   H
  2-8   CH2   H   H   SH   H
  2-9   CH2   Bn   H   OH   H
  2-10   CH2   Bn   Bn   OH   H
  2-11   CH2   PMB   H   OH   H
  2-12   CH2   PMB   PMB   OH   H
  2-13   CH2   Tr   H   OH   H
  2-14   CH2   MMTr   H   OH   H
  2-15   CH2   DMTr   H   OH   H
  2-16   CH2   TMTr   H   OH   H
  2-17   CH2   TMS   H   OH   H
  2-18   CH2   TBDMS   H   OH   H
  2-19   CH2   TBDPS   H   OH   H
  2-20   CH2   TIPS   H   OH   H
  2-21   CH2   Bn   H   OH   CH3
  2-22   CH2   Bn   Bn   OH   CH3
  2-23   CH2   PMB   H   OH   CH2
  2-24   CH2   PMB   PMB   OH   CH3
  2-25   CH2   Tr   H   OH   CH3
  2-26   CH2   MMTr   H   OH   CH3
  2-27   CH2   DMTr   H   OH   CH3
  2-28   CH2   TMTr   H   OH   CH3
  2-29   CH2   TMS   H   OH   CH3
  2-30   CH2   TBDMS   H   OH   CH3
  2-31   CH2   TBDPS   H   OH   CH3
  2-32   CH2   TIPS   H   OH   CH3
2-33 CH2 Bn H NHBz H
  2-34   CH2   Bn   Bn   NHBz   H
  2-35   CH2   PMB   H   NHBz   H
  2-36   CH2   PMB   PMB   NHBz   H
  2-37   CH2   Tr   H   NHBz   H
  2-38   CH2   MMTr   H   NHBz   H
  2-39   CH2   DMTr   H   NHBz   H
  2-40   CH2   TMTr   H   NHBz   H
  2-41   CH2   TMS   H   NHBz   H
  2-42   CH2   TBDMS   H   NEBz   H
  2-43   CH2   TBDPS   H   NHBz   H
  2-44   CH2   TIPS   H   NHBz   H
  2-45   CH2   Bn   H   NHBz   CH3
  2-46   CH2   Bn   Bn   NHBz   CH3
  2-47   CH2   PMB   H   NHBz   CH3
  2-48   CH2   PMB   PMB   NHBz   CH3
  2-49   CH2   Tr   H   NHBz   CH3
  2-50   CH2   MMTr   H   NHBz   CH3
  2-51   CH2   DMTr   H   NHBz   CH3
  2-52   CH2   TMTr   H   NHBz   CH3
  2-53   CH2   TMS   H   NHBz   CH3
  2-54   CH2   TBDMS   H   NHBz   CH3
  2-55   CH2   TBDPS   H   NHBz   CH3
  2-56   CH2   TIPS   H   NHBz   CH3
  2-57   (CH2)2   H   H   OH   H
  2-58   (CH2)2   H   H   OH   CH3
  2-59   (CH2)2   H   H   NH2   H
  2-60   (CH2)2   H   H   NH2   CH3
  2-61   (CH2)2   H   H   NH2   F
  2-62   (CH2)2   H   H   Cl   H
  2-63   (CH2)2   H   H   OMe   H
  2-64   (CH2)2   H   H   SH   H
  2-65   (CH2)2   Bn   H   OH   H
  2-66   (CH2)2   Bn   Bn   OH   H
  2-67   (CH2)2   PMB   H   OH   H
  2-68   (CH2)2   PMB   PMB   OH   H
  2-69   (CH2)2   Tr   H   OH   H
  2-70   (CH2)2   MMTr   H   OH   H
  2-71   (CH2)2   DMTr   H   OH   H
  2-72   (CH2)2   TMTr   H   OH   H
  2-73   (CH2)2   TMS   H   OH   H
  2-74   (CH2)2   TBDMS   H   OH   H
  2-75   (CH2)2   TBDPS   H   OH   H
  2-76   (CH2)2   TIPS   H   OH   H
  2-77   (CH2)2   Bn   H   OH   CH3
2-78 (CH2)2 Bn Bn OH CH3
  2-79   (CH2)2   PMB   H   OH   CH3
  2-80   (CH2)2   PMB   PMB   OH   CH3
  2-81   (CH2)2   Tr   H   OH   CH3
  2-82   (CH2)2   MMTr   H   OH   CH3
  2-83   (CH2)2   DMTr   H   OH   CH3
  2-84   (CH2)2   TMTr   H   OH   CH3
  2-85   (CH2)2   TMS   H   OH   CH3
  2-86   (CH2)2   TBDMS   H   OH   CH3
  2-87   (CH2)2   TBDPS   H   OH   CH3
  2-88   (CH2)2   TIPS   H   OH   CH3
  2-89   (CH2)2   Bn   H   NHBz   H
  2-90   (CH2)2   Bn   Bn   NHBz   H
  2-91   (CH2)2   PMB   H   NHBz   H
  2-92   (CH2)2   PMB   PMB   NHBz   H
  2-93   (CH2)2   Tr   H   NHBz   H
  2-94   (CH2)2   MMTr   H   NHBz   H
  2-95   (CH2)2   DMTr   H   NHBz   H
  2-96   (CH2)2   TMTr   H   NHBz   H
  2-97   (CH2)2   TMS   H   NHBz   H
  2-98   (CH2)2   TBDMS   H   NHBz   H
  2-99   (CH2)2   TBDPS   H   NHBz   H
  2-100   (CH2)2   TIPS   H   NHBz   H
  2-101   (CH2)2   Bn   H   NHBz   CH3
  2-102   (CH2)2   Bn   Bn   NHBz   CH3
  2-103   (CH2)2   PMB   H   NHBz   CH3
  2-104   (CH2)2   PMB   PMB   NHBz   CH3
  2-105   (CH2)2   Tr   H   NHBz   CH3
  2-106   (CH2)2   MMTr   H   NHBz   CH3
  2-107   (CH2)2   DMTr   H   NHBz   CH3
  2-108   (CH2)2   TMTr   H   NHBz   CH3
  2-109   (CH2)2   TMS   H   NHBz   CH3
  2-110   (CH2)2   TBDMS   H   NHBz   CH3
  2-111   (CH2)2   TBDPS   H   NHBz   CH3
  2-112   (CH2)2   TIPS   H   NHBz   CH3
2-113 (CH2)3 H H OH H
  2-114   (CH2)3   H   H   OH   CH3
  2-115   (CH2)3   H   H   NH2   H
  2-116   (CH2)3   H   H   NH2   CH3
  2-117   (CH2)3   H   H   NH2   F
  2-118   (CH2)3   H   H   Cl   H
  2-119   (CH2)3   H   H   OMe   H
  2-120   (CH2)3   H   H   SH   H
  2-121   (CH2)3   Bn   H   OH   H
  2-122   (CH2)3   Bn   Bn   OH   H
  2-123   (CH2)3   PMB   H   OH   H
  2-124   (CH2)3   PMB   PMB   OH   H
  2-125   (CH2)3   Tr   H   OH   H
  2-126   (CH2)3   MMTr   H   OH   H
  2-127   (CH2)3   DMTr   H   OH   H
  2-128   (CH2)3   TMTr   H   OH   H
  2-129   (CH2)3   TMS   H   OH   H
  2-130   (CH2)3   TBDMS   H   OH   H
  2-131   (CH2)3   TBDPS   H   OH   H
  2-132   (CH2)3   TIPS   H   OH   H
  2-133   (CH2)3   Bn   H   OH   CH3
  2-134   (CH2)3   Bn   Bn   OH   CH3
  2-135   (CH2)3   PMB   H   OH   CH3
  2-136   (CH2)3   PMB   PMB   OH   CH3
  2-137   (CH2)3   Tr   H   OH   CH3
  2-138   (CH2)3   MMTr   H   OH   CH3
  2-139   (CH2)3   DMTr   H   OH   CH3
  2-140   (CH2)3   TMTr   H   OH   CH3
  2-141   (CH2)3   TMS   H   OH   CH3
  2-142   (CH2)3   TBDMS   H   OH   CH3
  2-143   (CH2)3   TBDPS   H   OH   CH3
  2-144   (CH2)3   TIPS   H   OH   CH3
  2-145   (CH2)3   Bn   H   NHBz   H
2-146 (CH2)3 Bn Bn NHBz H
  2-147   (CH2)3   PMB   H   NHBz   H
  2-148   (CH2)3   PMB   PMB   NHBz   H
  2-149   (CH2)3   Tr   H   NHBz   H
  2-150   (CH2)3   MMTr   H   NHBz   H
  2-151   (CH2)3   DMTr   H   NHBz   H
  2-152   (CH2)3   TMTr   H   NHBz   H
  2-153   (CH2)3   TMS   H   NHBz   H
  2-154   (CH2)3   TBDMS   H   NHBz   H
  2-155   (CH2)3   TBDPS   H   NHBz   H
  2-156   (CH2)3   TIPS   H   NHBz   H
  2-157   (CH2)3   Bn   H   NHBz   CH3
  2-158   (CH2)3   Bn   Bn   NHBz   CH3
  2-159   (CH2)3   PMB   H   NHBz   CH3
  2-160   (CH2)3   PMB   PMB   NHBz   CH3
  2-161   (CH2)3   Tr   H   NHBz   CH3
  2-162   (CH2)3   MMTr   H   NHBz   CH3
  2-163   (CH2)3   DMTr   H   NHBz   CH3
2-164 (CH2)3 TMTr H NHBz CH3
  2-165   (CH2)3   TMS   H   NHBz   CH3
  2-166   (CH2)3   TBDMS   H   NHBz   CH3
  2-167   (CH2)3   TBDPS   H   NHBz   CH3
  2-168   (CH2)3   TIPS   H   NHBz   CH3
  2-169   (CH2)4   H   H   OH   H
  2-170   (CH2)4   H   H   OH   CH3
  2-171   (CH2)4   H   H   NH2   H
  2-172   (CH2)4   H   H   NH2   CH3
  2-173   (CH2)4   H   H   NH2   F
  2-174   (CH2)4   H   H   Cl   H
  2-175   (CH2)4   H   H   OMe   H
  2-176   (CH2)4   H   H   SH   H
  2-177   (CH2)4   Bn   H   OH   H
  2-178   (CH2)4   Bn   Bn   OH   H
  2-179   (CH2)4   PMB   H   OH   H
  2-180   (CH2)4   PMB   PMB   OH   H
  2-181   (CH2)4   Tr   H   OH   H
  2-182   (CH2)4   MMTr   H   OH   H
  2-183   (CH2)4   DMTr   H   OH   H
  2-184   (CH2)4   TMTr   H   OH   H
  2-185   (CH2)4   TMS   H   OH   H
  2-186   (CH2)4   TBDMS   H   OH   H
  2-187   (CH2)4   TBDPS   H   OH   H
  2-188   (CH2)4   TIPS   H   OH   H
  2-189   (CH2)4   Bn   H   OH   CH3
  2-190   (CH2)4   Bn   Bn   OH   CH3
  2-191   (CH2)4   PMB   H   OH   CH3
  2-192   (CH2)4   PMB   PMB   OH   CH3
  2-193   (CH2)4   Tr   H   OH   CH3
  2-194   (CH2)4   MMTr   H   OH   CH3
  2-195   (CH2)4   DMTr   H   OH   CH3
2-196 (CH2)4 TMTr H OH CH3
  2-197   (CH2)4   TMS   H   OH   CH3
  2-198   (CH2)4   TBDMS   H   OH   CH3
  2-199   (CH2)4   TBDPS   H   OH   CH3
  2-200   (CH2)4   TIPS   H   OH   CH3
  2-201   (CH2)4   Bn   H   NHBz   H
  2-202   (CH2)4   Bn   Bn   NHBz   H
  2-203   (CH2)4   PMB   H   NHBz   H
  2-204   (CH2)4   PMB   PMB   NHBz   H
  2-205   (CH2)4   Tr   H   NHBz   H
2-206 (CH2)4 MMTr H NHBz H
  2-207   (CH2)4   DMTr   H   NHBz   H
  2-208   (CH2)4   TMTr   H   NHBz   H
  2-209   (CH2)4   TMS   H   NHBz   H
2-210 (CH2)4 TBDMS H NHBz H
  2-211   (CH2)4   TBDPS   H   NHBz   H
  2-212   (CH2)4   TIPS   H   NHBz   H
  2-213   (CH2)4   Bn   H   NHBz   CH3
  2-214   (CH2)4   Bn   Bn   NHBz   CH3
  2-215   (CH2)4   PMB   H   NHBz   CH3
  2-216   (CH2)4   PMB   PMB   NHBz   CH3
  2-217   (CH2)4   Tr   H   NHBz   CH3
  2-218   (CH2)4   MMTr   H   NHBz   CH3
  2-219   (CH2)4   DMTr   H   NHBz   CH3
  2-220   (CH2)4   TMTr   H   NHBz   CH3
  2-221   (CH2)4   TMS   H   NHBz   CH3
  2-222   (CH2)4   TBDMS   H   NHBz   CH3
  2-223   (CH2)4   TBDPS   H   NHBz   CH3
  2-224   (CH2)4   TIPS   H   NHBz   CH3
  2-225   CH2   H   H   NHBz   H
  2-226   CH2   H   H   NHBz   CH3
  2-227   (CH2)2   H   H   NHBz   H
  2-228   (CH2)2   H   H   NHBz   CH3
  2-229   (CH2)3   H   H   NHBz   H
  2-230   (CH2)3   H   H   NHBz   CH3
  2-231   (CH2)4   H   H   NHBz   H
  2-232   (CH2)4   H   H   NHBz   CH3
  2-233   CH2   DMTr   P(N(iPr)2)(OC2H4CN)   OH   H
  2-234   CH2   DMTr   P(N(iPr)2)(OC2H4CN)   OH   CH3
  2-235   CH2   DMTr   P(N(iPr)2)(OC2H4CN)   NHBz   H
  2-236   CH2   DMTr   P(N(iPr)2)(OC2H4CN)   NHBz   CH3
  2-237   (CH2)2   DMTr   P(N(iPr)2)(OC2H4CN)   OH   H
  2-238   (CH2)2   DMTr   P(N(iPr)2)(OC2H4CN)   OH   CH3
  2-239   (CH2)2   DMTr   P(N(iPr)2)(OC2H4CN)   NHBz   H
  2-240   (CH2)2   DMTr   P(N(iPr)2)(OC2H4CN)   NHBz   CH3
  2-241   (CH2)3   DMTr   P(N(iPr)2)(OC2H4CN)   OH   H
  2-242   (CH2)3   DMTr   P(N(iPr)2)(OC2H4CN)   OH   CH3
  2-243   (CH2)3   DMTr   P(N(iPr)2)(OC2H4CN)   NHBz   H
  2-244   (CH2)3   DMTr   P(N(iPr)2)(OC2H4CN)   NHBz   CH3
  2-245   (CH2)4   DMTr   P(N(iPr)2)(OC2H4CN)   OH   H
  2-246   (CH2)4   DMTr   P(N(iPr)2)(OC2H4CN)   OH   CH3
  2-247   (CH2)4   DMTr   P(N(iPr)2)(OC2H4CN)   NHBz   H
  2-248   (CH2)4   DMTr   P(N(iPr)2)(OC2H4CN)   NHBz   CH3
  2-249   CH2   DMTr   P(N(iPr)2)(OCH3)   OH   H
  2-250   CH2   DMTr   P(N(iPr)2)(OCH3)   OH   CH3
  2-251   CH2   DMTr   P(N(iPr)2)(OCH3)   NHBz   H
  2-252   CH2   DMTr   P(N(iPr)2)(OCH3)   NHBz   CH3
  2-253   (CH2)2   DMTr   P(N(iPr)2)(OCH3)   OH   H
  2-254   (CH2)2   DMTr   P(N(iPr)2)(OCH3)   OH   CH3
  2-255   (CH2)2   DMTr   P(N(iPr)2)(OCH3)   NHBz   H
  2-256   (CH2)2   DMTr   P(N(iPr)2)(OCH3)   NHBz   CH3
  2-257   (CH2)3   DMTr   P(N(iPr)2)(OCH3)   OH   H
  2-258   (CH2)3   DMTr   P(N(iPr)2)(OCH3)   OH   CH3
  2-259   (CH2)3   DMTr   P(N(iPr)2)(OCH3)   NHBz   H
  2-260   (CH2)3   DMTr   P(N(iPr)2)(OCH3)   NHBz   CH3
  2-261   (CH2)4   DMTr   P(N(iPr)2)(OCH3)   OH   H
  2-262   (CH2)4   DMTr   P(N(iPr)2)(OCH3)   OH   CH3
  2-263   (CH2)4   DMTr   P(N(iPr)2)(OCH3)   NHBz   H
  2-264   (CH2)4   DMTr   P(N(iPr)2)(OCH3)   NHBz   CH3
上述表1至2中,优选的化合物为(1-5)、(1-7)、(1-23)、(1-24)、(1-31)、(1-35)、(1-39)、(1-43)、(1-49)、(1-51)、(1-67)、(1-68)、(1-75)、(1-79)、(1-83)、(1-87)、(1-93)、(1-95)、(1-111)、(1-112)、(1-119)、(1-123)、(1-127)、(1-131)、(1-137)、(1-139)、(1-155)、(1-156)、(1-163)、(1-167)、(1-171)、(1-175)、(1-177)、(1-178)、(1-185)、(1-186)、(1-193)、(1-194)、(1-201)、(1-202)、(2-1)、(2-2)、(2-3)、(2-4)、(2-10)、(2-15)、(2-19)、(2-22)、(2-27)、(2-31)、(2-34)、(2-39)、(2-43)、(2-46)、(2-51)、(2-55)、(2-57)、(2-58)、(2-59)、(2-60)、(2-66)、(2-71)、(2-75)、(2-78)、(2-83)、(2-87)、(2-90)、(2-95)、(2-99)、(2-102)、(2-107)、(2-111)、(2-113)、(2-114)、(2-115)、(2-116)、(2-122)、(2-127)、(2-131)、(2-134)、(2-139)、(2-143)、(2-146)、(2-151)、(2-155)、(2-158)、(2-163)、(2-167)、(2-169)、(2-170)、(2-171)、(2-172)、(2-178)、(2-183)、(2-187)、(2-190)、(2-195)、(2-199)、(2-202)、(2-207)、(2-211)、(2-214)、(2-219)、(2-223)、(2-225)、(2-226)、(2-233)、(2-234)、(2-235)或(2-236),更优选
2’-O,4’-C-亚乙基鸟嘌呤核苷(1-5)、
2’-O,4’-C-亚乙基腺嘌呤核苷(1-7)、
3’,5’-二-O-苯甲基-2’-O,4’-C-亚乙基-6-N-苯甲酰基腺嘌呤核苷(1-23)、
3’,5’-二-O-苯甲基-2’-O,4’-C-亚乙基-2-N-异丁酰基鸟嘌呤核苷(1-24)、
5’-O-二甲氧基三苯甲基-2’-O,4’-C-亚乙基-6-N-苯甲酰基腺嘌呤核苷(1-31)、
5’-O-二甲氧基三苯甲基-2’-O,4’-C-亚乙基-2-N-异丁酰基鸟嘌呤核苷(1-35)、
2’-O,4’-C-亚乙基-2-N-异丁酰基鸟嘌呤核苷(1-177)、
2’-O,4’-C-亚乙基-6-N-苯甲酰基腺嘌呤核苷(1-178)、
5’-O-二甲氧基三苯甲基-2’-O,4’-C-亚乙基-2-N-异丁酰基鸟嘌呤核苷-3’-O-(2-氰基乙基N,N-二异丙基)亚磷酰胺(1-185)、
5’-O-二甲氧基三苯甲基-2’-O,4’-C-亚乙基-6-N-苯甲酰基腺嘌呤核苷-3’-O-(2-氰基乙基N,N-二异丙基)亚磷酰胺(1-186)、
2’-O,4’-C-亚乙基尿嘧啶核苷(2-1)、
2’-O,4’-C-亚乙基-5-甲基尿嘧啶核苷(2-2)、
2’-O,4’-C-亚乙基胞嘧啶核苷(2-3)、
2’-O,4’-C-亚乙基-5-甲基胞嘧啶核苷(2-4)、
3’,5’-二-O-苯甲基-2’-O,4’-C-亚乙基尿嘧啶核苷(2-10)、
5’-O-二甲氧基三苯甲基-2’-O,4’-C-亚乙基尿嘧啶核苷(2-15)、
3’,5’-二-O-苯甲基-2’-O,4’-C-亚乙基-5-甲基尿嘧啶核苷(2-22)、
5’-O-二甲氧基三苯甲基-2’-O,4’-C-亚乙基-5-甲基尿嘧啶核苷(2-27)、
3’,5’-二-O-苯甲基-2’-O,4’-C-亚乙基-4-N-苯甲酰基胞嘧啶核苷(2-34)、
5’-O-二甲氧基三苯甲基-2’-O,4’-C-亚乙基-4-N-苯甲酰基胞嘧啶核苷(2-39)、
3’,5’-二-O-苯甲基-2’-O,4’-C-亚乙基-4-N-苯甲酰基-5-甲基胞嘧啶核苷(2-46)、
5’-O-二甲氧基三苯甲基-2’-O,4’-C-亚乙基-4-N-苯甲酰基-5-甲基胞嘧啶核苷(2-51)、
2’-O,4’-C-亚乙基-4-N-苯甲酰基胞嘧啶核苷(2-225)、
2’-O,4’-C-亚乙基-4-N-苯甲酰基-5-甲基胞嘧啶核苷(2-226)、
5’-O-二甲氧基三苯甲基-2’-O,4’-C-亚乙基-尿嘧啶核苷-3’-O-(2-氰基乙基N,N-二异丙基)亚磷酰胺(2-233)、
5’-O-二甲氧基三苯甲基-2’-O,4’-C-亚乙基-5-甲基尿嘧啶核苷-3’-O-(2-氰基乙基N,N-二异丙基)亚磷酰胺(2-234)、
5’-O-二甲氧基三苯甲基-2’-O,4’-C-亚乙基-4-N-苯甲酰基胞嘧啶核苷-3’-O-(2-氰基乙基N,N-二异丙基)亚磷酰胺(2-235)、或
5’-O-二甲氧基三苯甲基-2’-O,4’-C-亚乙基-4-N-苯甲酰基-5-甲基胞嘧啶核苷-3’-O-(2-氰基乙基N,N-二异丙基)亚磷酰胺(2-236)。
本发明的化合物(1)可以按照以下叙述的A法制备。
A法
A法中,X表示保护基,Y表示保护基,A表示与上述相同的含义,B1表示嘌呤-9-基、具有选自上述取代基α的取代嘌呤-9-基或取代2-氧代-嘧啶-1-基,但“可以被保护的氨基”中,无保护的氨基除外,B2表示嘌呤-9-基、具有选自上述取代基α的取代嘌呤-9-基或取代2-氧代-嘧啶-1-基,但“可以被保护的氨基”中,被保护的氨基除外,R7为形成离去基团的基团。R8为碳原子数1至4个的脂肪族酰基。
X的保护基与上述R1中“羟基的保护基”相同。
Y的保护基与上述R2中“羟基的保护基”相同。
R7的“形成离去基团的基团”可以列举例如甲磺酰基、乙磺酰基等低级烷基磺酰基,三氟甲磺酰基等卤代低级烷基磺酰基,对甲苯磺酰基等芳基磺酰基,优选甲磺酰基或对甲苯磺酰基。
R8的“碳原子数2至4个的脂肪族酰基”可以列举例如乙酰基、丙酰基、丁酰基等,优选乙酰基。
以下详细说明A法的各步骤。
(A-1步骤)
该步骤是在惰性溶剂中,在碱催化剂的存在下,使用于引入离去基团的试剂与可以按照下述B至D法制备的化合物(3)反应,制备化合物(4)的步骤。
可以使用的溶剂可以列举例如己烷、庚烷、轻石油、石油醚等脂肪族烃类;苯、甲苯、二甲苯等芳香族烃类;二氯甲烷、氯仿、四氯化碳、二氯乙烷、氯苯、二氯苯等卤代烃类;甲酸乙酯、乙酸乙酯、乙酸丙酯、乙酸丁酯、碳酸二乙酯等酯类;乙醚、二异丙基醚、四氢呋喃、二氧六环、二甲氧基乙烷、二甘醇二甲醚等醚类;丙酮、甲基乙基酮、甲基异丁基酮、异佛尔酮、环己酮等酮类;硝基乙烷、硝基苯等硝基化合物类;乙腈、异丁腈等腈类;甲酰胺、N,N-二甲基甲酰胺、N,N-二甲基乙酰胺、N-甲基-2-吡咯烷酮、N-甲基吡咯烷酮、六甲基磷酰三胺等酰胺类;环丁砜等亚砜类;吡啶类,优选吡啶。
可以使用的碱催化剂优选三乙胺、吡啶、二甲氨基吡啶等碱。
可以使用的离去基团引入用试剂可以列举例如甲磺酰氯、乙磺酰溴等烷基磺酰卤类;对甲苯磺酰氯等芳基磺酰卤类,优选甲磺酰氯和对甲苯磺酰氯。
反应温度根据使用的原料化合物、溶剂、离去基团引入试剂、碱催化剂的不同而有所不同,通常为0℃至50℃,优选10℃至40℃。
反应时间根据使用的原料化合物、溶剂、离去基团引入试剂、碱催化剂、反应温度的不同而有所不同,通常为10分钟至24小时,优选1至10小时。
反应结束后,本反应的目的化合物(4)可以通过例如中和反应液,浓缩反应混合物,加入乙酸乙酯之类与水不混溶的有机溶剂,用水洗涤后,分离含有目的化合物的有机层,用无水硫酸镁等干燥后,蒸馏除去溶剂得到。
如果需要,得到的化合物可以通过常规方法,例如重结晶、硅胶柱色谱法等进一步进行精制。
(A-2步骤)
该步骤是在溶剂中,在酸催化剂的存在下,使酸酐与A-1步骤中制备的化合物(4)反应,制备化合物(5)的步骤。
可以使用的溶剂是例如乙醚、二氧六环、四氢呋喃等醚类;乙腈、异丁腈等腈类;甲酰胺、N,N-二甲基甲酰胺、N,N-二甲基乙酰胺、N-甲基-2-吡咯烷酮、N-甲基吡咯烷酮、六甲基磷酰三胺等酰胺类;乙酸等有机酸等,优选乙酸。
可以使用的酸催化剂是例如盐酸、硫酸、硝酸等无机酸,优选硫酸(特别是浓硫酸)。
可以使用的酸酐是例如乙酸酐、丙酸酐等低级脂肪族羧酸的酸酐,优选乙酸酐。
反应温度根据使用的原料化合物、溶剂、酸催化剂、酸酐而有所不同,通常为0℃至50℃,优选10℃至40℃。
反应时间根据使用的原料化合物、溶剂、酸催化剂、酸酐、反应温度而有所不同,通常为10分钟至12小时,优选30分钟至3小时。
反应结束后,本反应的目的化合物(5)可以通过例如浓缩反应混合物,加入乙酸乙酯之类与水不混溶的有机溶剂,用水洗涤后,分离含有目的化合物的有机层,用无水硫酸镁等干燥后,蒸馏除去溶剂得到。
如果需要,得到的化合物可以通过常规方法,例如重结晶、硅胶柱色谱法等进一步进行精制。
(A-3步骤)
该步骤是在惰性溶剂中,在酸催化剂的存在下,使与按照文献(H.Vorbrggen,K.Krolikiewicz and B,Bennua,Chem.Ber.,114,1234-1255(1981))制备的可以具有所需取代基的嘌呤或嘧啶相应的三甲基甲硅烷基化体与A-2步骤中制备的化合物(5)反应,制备化合物(6)的步骤。
可以使用的溶剂是例如苯、甲苯、二甲苯等芳香族烃类;二氯甲烷、氯仿、四氯化碳、1,2-二氯乙烷、氯苯、二氯苯等卤代烃类;乙腈、异丁腈等腈类;甲酰胺、N,N-二甲基甲酰胺、N,N-二甲基乙酰胺、N-甲基-2-吡咯烷酮、N-甲基吡咯烷酮、六甲基磷酰三胺等酰胺类;二硫化碳等,优选1,2-二氯乙烷。
可以使用的酸催化剂是例如AlCl3、SnCl4、TiCl4、ZnCl2、BF3、三氟甲磺酸三甲基甲硅烷基酯等路易斯酸催化剂等,优选三氟甲磺酸三甲基甲硅烷基酯。
反应温度根据使用的原料化合物、溶剂、酸催化剂而有所不同,通常为0℃至100℃,优选50℃至80℃。
反应时间根据使用的原料化合物、溶剂、酸催化剂、反应温度而有所不同,通常为1小时至24小时,优选1小时至8小时。
反应结束后,本反应的目的化合物(6)可以通过例如浓缩反应混合物,加入乙酸乙酯之类与水不混溶的有机溶剂,用水洗涤后,分离含有目的化合物的有机层,用无水硫酸镁等干燥后,蒸馏除去溶剂得到。
如果需要,得到的化合物可以通过常规方法,例如重结晶、硅胶柱色谱法等进一步进行精制。
(A-4步骤)
该步骤是在惰性溶剂中、在碱催化剂的存在下,使A-3步骤中制备的化合物(6)环化,制备本发明化合物(1a)的步骤。
可以使用的溶剂是例如水;吡啶类;乙腈、异丁腈等腈类;甲酰胺、N,N-二甲基甲酰胺、N,N-二甲基乙酰胺、N-甲基-2-吡咯烷酮、N-甲基吡咯烷酮、六甲基磷酰三胺等酰胺类;或它们的混合溶剂,优选水和吡啶的混合溶剂。
可以使用的碱催化剂是例如氢氧化钠、氢氧化钾等碱金属氢氧化物;碳酸钠、碳酸钾等碱金属碳酸盐;甲醇钠、乙醇钠等碱金属醇化物;氨水等,优选碱金属氢氧化物(特别是氢氧化钠)。
反应温度根据使用的原料化合物、溶剂、碱催化剂而有所不同,通常为0℃至50℃,优选10℃至30℃。
反应时间根据使用的原料化合物、溶剂、碱催化剂、反应温度而有所不同,通常为1分钟至5小时,优选1分钟至30分钟。
反应结束后,本反应的目的化合物(1a)可以通过例如浓缩反应混合物,加入乙酸乙酯之类与水不混溶的有机溶剂,用水洗涤后,分离含有目的化合物的有机层,用无水硫酸镁等干燥后,蒸馏除去溶剂得到。
如果需要,得到的化合物可以通过常规方法,例如重结晶、硅胶柱色谱法等进一步进行精制。
(A-5步骤)
该步骤是在惰性溶剂中使脱保护试剂与A-4步骤中得到的化合物(1a)反应,制备化合物(1b)的步骤。
脱保护的方法根据保护基的种类而有所不同,只要是不发生其它副反应的方法,就没有特别的限定,例如可以按照“Protective Groupsin Organic Synthesis”(Theodora W.Greene、Peter G.M.Wuts著,1999年,A Wiley-Interscience Publication发行)记载的方法进行。
特别是在保护基为(1)“脂肪族酰基”或“芳香族酰基”、(2)“被1至3个芳基取代的甲基”或“被1至3个芳环被低级烷基、低级烷氧基、卤素原子、氰基取代的芳基取代的甲基”、(3)“甲硅烷基”的场合下,可以按照以下方法进行。
(1)脂肪族酰基和芳香族酰基的场合,通常在惰性溶剂中与碱反应进行。
可以使用的溶剂没有特别的限定,只要是容易与水混合,不阻碍反应,在某种程度上能溶解原料物质的溶剂即可,例如可以列举含水或无水的二甲基甲酰胺、二甲基乙酰胺等酰胺类;二氯甲烷、氯仿、1,2-二氯乙烷或四氯化碳等卤代烃类;四氢呋喃、乙醚、二氧六环等醚类,优选醚类,更优选四氢呋喃。
可以使用的碱是例如氢氧化锂、氢氧化钾、氢氧化钠等碱金属氢氧化物;碳酸钠、碳酸钾等碱金属碳酸盐;甲醇钠、乙醇钠等碱金属醇化物;氨水、氨/甲醇溶液等氨溶液。
反应温度为0℃至60℃,优选20℃至40℃。
反应时间为10分钟至24小时,优选1至3小时。
反应结束后,本反应的目的化合物(1b)可以通过例如浓缩反应混合物,加入乙酸乙酯之类与水不混溶的有机溶剂,用水洗涤后,分离含有目的化合物的有机层,用无水硫酸镁等干燥后,蒸馏除去溶剂得到。
如果需要,得到的化合物可以通过常规方法,例如重结晶或硅胶柱色谱法等进一步进行精制。
(2)保护基为“被1至3个芳基取代的甲基”或“被1至3个芳环被低级烷基、低级烷氧基、卤素原子、氰基取代的芳基取代的甲基”时,在惰性溶剂中使用还原剂进行。
作为可以使用的溶剂,优选甲醇、乙醇、异丙醇等醇类;乙醚、四氢呋喃、二氧六环等醚类;甲苯、苯、二甲苯等芳香族烃类;己烷、环己烷等脂肪族烃类;乙酸乙酯、乙酸丙酯等酯类,乙酸等有机酸类或这些有机溶剂与水的混合溶剂。
可以使用的还原剂没有特别的限定,只要是通常催化还原反应中能使用的物质即可,优选使用钯碳、兰尼镍、氧化铂、铂黑、铑-氧化铝、三苯基膦-氯化铑、钯-硫酸钡。
压力没有特别的限定,通常在1至10个大气压下进行。
反应温度为0℃至60℃,优选20℃至40℃。
反应时间为10分钟至24小时,优选1至3小时。
反应结束后,本反应的目的化合物(1b)可以通过例如从反应混合物中除去还原剂,加入乙酸乙酯之类与水不混溶的有机溶剂,用水洗涤后,分离含有目的化合物的有机层,用无水硫酸镁等干燥后,蒸馏除去溶剂得到。
如果需要,得到的化合物可以通过常规方法,例如重结晶、硅胶柱色谱法等进一步进行精制。
“被3个芳基取代的甲基”,即三苯甲基的场合,也可以使用酸进行。
这时,可以使用的溶剂是例如苯、甲苯、二甲苯等芳香族烃类;二氯甲烷、氯仿、四氯化碳、1,2-二氯乙烷、氯苯、二氯苯等卤代烃类;甲醇、乙醇、异丙醇、叔丁醇等醇类;乙腈、异丁腈等腈类;甲酰胺、N,N-二甲基甲酰胺、N,N-二甲基乙酰胺、N-甲基-2-吡咯烷酮、N-甲基吡咯烷酮、六甲基磷酰三胺等酰胺类;乙酸等有机酸类,优选有机酸(特别是乙酸)或醇类(特别是叔丁醇)。
使用的酸优选乙酸或三氟乙酸。
反应温度为0℃至60℃,优选20℃至40℃。
反应时间为10分钟至24小时,优选1至3小时。
反应结束后,本反应的目的化合物(1b)可以通过例如中和反应混合物,加入乙酸乙酯之类与水不混溶的有机溶剂,用水洗涤后,分离含有目的化合物的有机层,用无水硫酸镁等干燥后,蒸馏除去溶剂得到。如果需要,得到的化合物可以通过常规方法,例如重结晶、硅胶柱色谱法等进一步进行精制。
(3)保护基为“甲硅烷基”的场合,通常可以通过用氟化四丁基铵、氢氟酸、氢氟酸-吡啶、氟化钾等生成氟阴离子的化合物处理,或用乙酸、甲磺酸、对甲苯磺酸、三氟乙酸、三氟甲磺酸等有机酸或盐酸等无机酸处理将其除去。
另外,在通过氟阴离子除去的场合下,有时通过加入甲酸、乙酸、丙酸等有机酸促进反应进行。
可以使用的溶剂没有特别的限定,只要是不阻碍反应,在某种程度上能溶解原料物质的溶剂即可,优选乙醚、二异丙基醚、四氢呋喃、二氧六环、二甲氧基乙烷、二甘醇二甲醚等醚类;乙腈、异丁腈等腈类;水;乙酸等有机酸及它们的混合溶剂。
反应温度为0℃至100℃,优选20℃至70℃。
反应时间为5分钟至48小时,优选1至24小时。
反应结束后,本反应的目的化合物(1b)可以通过例如浓缩反应混合物,加入乙酸乙酯之类与水不混溶的有机溶剂,用水洗涤后,分离含有目的化合物的有机层,用无水硫酸镁等干燥后,蒸馏除去溶剂得到。如果需要,得到的化合物可以通过常规方法,例如重结晶或硅胶柱色谱法等进一步进行精制。
(A-6步骤)
该步骤是使脱保护试剂与A-5步骤中得到的化合物(1b)反应,制备本发明的化合物(1c)的步骤。
脱保护的方法根据保护基的种类而有所不同,只要是不发生其它副反应的方法,没有特别的限定,例如可以按照“Protective Groupsin Organic Synthesis”(Theodora W.Greene著,1981年,AWiley-Interscience Publication发行)记载的方法进行。
特别是在保护基为脂肪族酰基或芳香族酰基的场合下,可以按照以下方法进行。
即在保护基为脂肪族酰基和芳香族酰基的场合下,通常在惰性溶剂中与碱反应进行。
可以使用的溶剂没有特别的限定,只要是容易与水混合,不阻碍反应,在某种程度上能溶解原料物质的溶剂即可,例如可以列举含水或无水的甲醇、乙醇等醇类;二甲基甲酰胺、二甲基乙酰胺等酰胺类;二氯甲烷、氯仿、1,2-二氯乙烷或四氯化碳等卤代烃类;四氢呋喃、乙醚、二氧六环等醚类,优选醇类,更优选甲醇。
可以使用的碱是例如氢氧化锂、氢氧化钾、氢氧化钠等碱金属氢氧化物;碳酸钠、碳酸钾等碱金属碳酸盐;甲醇钠、乙醇钠等碱金属醇化物;氨,优选氨。
反应温度为0℃至50℃,优选10℃至40℃。
反应时间为10分钟至24小时,优选10至15小时。反应结束后,可以通过例如浓缩反应混合物,加入乙酸乙酯之类与水不混溶的有机溶剂,用水洗涤后,分离含有目的化合物的有机层,用无水硫酸镁等干燥后,蒸馏除去溶剂得到。
如果需要,得到的化合物可以通过常规方法,例如重结晶、硅胶柱色谱法等进一步进行精制。
上述中间体(3)可以按照以下叙述的B至D法制备。
B法
C法
Figure C0080562700482
D法
Figure C0080562700491
B至D法中,X和Y表示与上述相同的含义,R9表示形成离去基团的基团,E表示亚乙基、三亚甲基或四亚甲基,Z表示单键、亚甲基或亚乙基。
R9的形成离去基团的基团可以列举例如与上述R7中所列基团同样的基团,优选三氟甲磺酰基。
R11和R12相同,表示氢原子,或连成一体表示氧原子。
R10在R11和R12连成一体表示氧原子时,为甲基、乙基、丙基、异丙基、丁基、异丁基、仲丁基、叔丁基等碳原子数为1至4个的烷基,优选甲基。在R11和R12相同并表示氢原子时,R10为苯甲基等芳烷基;甲氧基甲基等烷氧基烷基;苯甲酰氧基甲基等芳基羰氧基甲基;苯甲氧基甲基等芳烷氧基甲基;甲氧基乙氧基甲基等烷氧基烷氧基烷基;三甲基甲硅烷基、叔丁基二甲基甲硅烷基、二苯基甲基甲硅烷基、二苯基丁基甲硅烷基、二苯基异丙基甲硅烷基、苯基二异丙基甲硅烷基等甲硅烷基。
B或C法中使用的原料化合物——化合物(7)可以按照以下的方法制备。
即,能够以市售的1,2,5,6-二异亚丙基D-葡萄糖为原料,按照文献(R.D.Youssefyeh,J.P.H.Verheyden,J.G.Moffatt.J.Org.Chem.,44,1301-1309(1979))的方法,制备化合物(6)的“X”部分相当于氢原子的化合物,其次按照文献(T.Waga,T.Nishizaki,I.Miyakawa,H.Ohrui,H.Meguro,Biosci.Biotechnol.Biochem.,57,1433-1438(1993))(X=Bn的场合)的方法,制备化合物(6)。
以下详细说明B至D法的各步骤。
(B法)
(B-1步骤)
该步骤是在惰性溶剂中,在碱催化剂的存在下,使离去基团引入试剂与按照上述方法制备的化合物(7)反应,制备化合物(8)的步骤。
可以使用的溶剂是例如二甲基甲酰胺、二甲基乙酰胺等酰胺类;二氯甲烷、氯仿、1,2-二氯乙烷或四氯化碳等卤代烃类;四氢呋喃、乙醚、二氧六环等醚类,优选二氯甲烷。
可以使用的碱催化剂优选三乙胺、吡啶、二甲氨基吡啶等碱。
可以使用的离去基团引入试剂优选三氟甲磺酰氯和三氟甲磺酸酐。
反应温度根据使用的原料化合物、溶剂、碱催化剂而有所不同,通常为-100℃至-50℃,优选-100℃至-70℃。
反应时间根据使用的原料化合物、溶剂、碱催化剂、反应温度而有所不同,通常为30分钟至12小时,优选30分钟至3小时。
反应结束后,本反应的目的化合物(8)可以通过例如浓缩反应混合物,加入乙酸乙酯之类与水不混溶的有机溶剂,用水洗涤后,分离含有目的化合物的有机层,用无水硫酸镁等干燥后,蒸馏除去溶剂得到。
如果需要,得到的化合物可以通过常规方法,例如重结晶、硅胶柱色谱法等进一步进行精制。
(B-2步骤)
该步骤是在惰性溶剂中,使氰化试剂与B-1步骤中制备的化合物(8)反应,制备化合物(9)的步骤。
可以使用的溶剂是例如二甲基甲酰胺、二甲基乙酰胺等酰胺类;二氯甲烷、氯仿、1,2-二氯乙烷或四氯化碳等卤代烃类;四氢呋喃、乙醚、二氧六环等醚类;乙腈;二甲基亚砜等,优选酰胺类(二甲基甲酰胺)。
可以使用的氰化试剂是例如KCN、NaCN、氰化三甲基硅烷等,优选NaCN。
反应温度根据使用的原料化合物、溶剂、氰化试剂而有所不同,通常为0℃至100℃,优选30℃至70℃。
反应时间根据使用的原料化合物、溶剂、氰化试剂、反应温度而有所不同,通常为30分钟至12小时,优选1至3小时。
反应结束后,本反应的目的化合物(9)可以通过例如浓缩反应混合物,加入乙酸乙酯之类与水不混溶的有机溶剂,用水洗涤后,分离含有目的化合物的有机层,用无水硫酸镁等干燥后,蒸馏除去溶剂得到。
如果需要,得到的化合物可以通过常规方法,例如重结晶、硅胶柱色谱法等进一步进行精制。
(B-3步骤)
该步骤是在惰性溶剂中,使还原剂与B-2步骤中制备的化合物(9)反应,制备化合物(10)的步骤。
可以使用的溶剂是例如二氯甲烷、氯仿、1,2-二氯乙烷或四氯化碳等卤代烃类;己烷、庚烷、轻石油、石油醚等脂肪族烃类;苯、甲苯、二甲苯等芳香族烃类;乙醚、二异丙基醚、四氢呋喃、二氧六环、二甲氧基乙烷、二甘醇二甲醚等醚类;丙酮、甲基乙基酮、甲基异丁基酮、异佛尔酮、环己酮等酮类,优选卤代烃类(特别是二氯甲烷)。
可以使用的还原剂可以列举氢化二异丁基铝和氢化三乙氧基铝等,优选氢化二异丁基铝。
反应温度根据使用的原料化合物、溶剂、还原剂而有所不同,通常为-100℃至-50℃,优选-90℃至-70℃。
反应时间根据使用的原料化合物、溶剂、还原剂、反应温度而有所不同,通常为30分钟至12小时,优选1至5小时。
反应结束后,本反应的目的化合物(10)可以通过例如浓缩反应混合物,加入乙酸乙酯之类与水不混溶的有机溶剂,用水洗涤后,分离含有目的化合物的有机层,用无水硫酸镁等干燥后,蒸馏除去溶剂得到。
如果需要,得到的化合物可以通过常规方法,例如重结晶、硅胶柱色谱法等进一步进行精制。
(B-4步骤)
该步骤是在惰性溶剂中使还原剂与B-3步骤中制备的化合物(10)反应,制备A法中的原料化合物之一,即化合物(3a)的步骤。
可以使用的溶剂是例如甲醇、乙醇、正丙醇、异丙醇、正丁醇、异丁醇、叔丁醇、异戊醇、二甘醇、甘油、辛醇、环己醇、甲基溶纤剂等醇类;乙酸等,优选醇类(特别是乙醇)。
可以使用的还原剂是例如硼氢化钠、硼氢化锂等碱金属硼氢化物;氢化铝锂、氢化锂三乙醇铝(lithium triethoxide aluminiumhydride)等氢化铝化合物;硼烷等,优选硼氢化钠。
反应温度根据使用的原料化合物、溶剂、还原剂而有所不同,通常为0℃至50℃,优选10℃至40℃。
反应时间根据使用的原料化合物、溶剂、还原剂、反应温度而有所不同,通常为10分钟至12小时,优选30分钟至5小时。
反应结束后,本反应的目的化合物(3a)可以通过例如分解还原剂,浓缩反应混合物,加入乙酸乙酯之类与水不混溶的有机溶剂,用水洗涤后,分离含有目的化合物的有机层,用无水硫酸镁等干燥后,蒸馏除去溶剂得到。
如果需要,得到的化合物可以通过常规方法,例如重结晶、硅胶柱色谱法等进一步进行精制。
(C法)
(C-1步骤)
该步骤是在惰性溶剂中,使氧化剂与按照上述方法制备的化合物(7)反应,制备化合物(11)的步骤。
可以使用的溶剂是例如己烷、庚烷、轻石油、石油醚等脂肪族烃类;苯、甲苯、二甲苯等芳香族烃类;二氯甲烷、氯仿、四氯化碳、二氯乙烷、氯苯、二氯苯等卤代烃类;甲酸乙酯、乙酸乙酯、乙酸丙酯、乙酸丁酯、碳酸二乙酯等酯类;乙醚、二异丙基醚、四氢呋喃、二氧六环、二甲氧基乙烷、二甘醇二甲醚等醚类;丙酮、甲基乙基酮、甲基异丁基酮、异佛尔酮、环己酮等酮类,优选卤代烃类(特别是二氯甲烷)。
可以使用的氧化剂是例如Swern氧化用试剂、Dess-Martin氧化用试剂、吡啶盐酸盐·三氧化铬络合物(氯铬酸吡啶翁、重铬酸吡啶翁)等三氧化铬络合物等,优选的试剂为Swern氧化用试剂(即二甲基亚砜-草酰氯)。
反应温度根据使用的原料化合物、溶剂、氧化剂而有所不同,通常为-100℃至-50℃,优选-100℃至-70℃。
反应时间根据使用的原料化合物、溶剂、氧化剂、反应温度而有所不同,通常为30分钟至12小时,优选1至5小时。
反应结束后,本反应的目的化合物(11)可以通过例如分解氧化剂,浓缩反应混合物,加入乙酸乙酯之类与水不混溶的有机溶剂,用水洗涤后,分离含有目的化合物的有机层,用无水硫酸镁等干燥后,蒸馏除去溶剂得到。
如果需要,得到的化合物可以通过常规方法,例如重结晶、硅胶柱色谱法等进一步进行精制。
(C-2步骤)
该步骤是在惰性溶剂中,使增碳试剂与C-1步骤中制备的化合物(11)反应,制备化合物(12)的步骤。
可以使用的溶剂是例如己烷、庚烷、轻石油、石油醚等脂肪族烃类;苯、甲苯、二甲苯等芳香族烃类;二氯甲烷、氯仿、四氯化碳、二氯乙烷、氯苯、二氯苯等卤代烃类;甲酸乙酯、乙酸乙酯、乙酸丙酯、乙酸丁酯、碳酸二乙酯等酯类;乙醚、二异丙基醚、四氢呋喃、二氧六环、二甲氧基乙烷、二甘醇二甲醚等醚类;丙酮、甲基乙基酮、甲基异丁基酮、异佛尔酮、环己酮等酮类,优选卤代烃类(特别是二氯甲烷)。
可以使用的试剂例如Wittig试剂、Horner-Emmons试剂、Peterson反应试剂、TiCl4-CH2Cl2-Zn系反应剂、Tebbe试剂等,优选Wittig试剂、Horner-Emmons试剂和Tebbe试剂。
反应温度根据使用的原料化合物、溶剂、增碳试剂而有所不同,通常为-20℃至20℃,优选0℃。
反应时间根据使用的原料化合物、溶剂、增碳试剂、反应温度而有所不同,通常为30分钟至12小时,优选1至5小时。
反应结束后,本反应的目的化合物(12)可以通过例如浓缩反应混合物,加入乙酸乙酯之类与水不混溶的有机溶剂,用水洗涤后,分离含有目的化合物的有机层,用无水硫酸镁等干燥后,蒸馏除去溶剂得到。
如果需要,得到的化合物可以通过常规方法,例如重结晶、硅胶柱色谱法等进一步进行精制。
(C-3步骤)
该步骤是在惰性溶剂中,在C-2步骤中制备的化合物(12)的烯烃末端碳原子上选择性地引入羟基,制备化合物(3a)的步骤。
可以使用的溶剂是例如己烷、庚烷、轻石油、石油醚等脂肪族烃类;苯、甲苯、二甲苯等芳香族烃类;二氯甲烷、氯仿、四氯化碳、二氯乙烷、氯苯、二氯苯等卤代烃类;甲酸乙酯、乙酸乙酯、乙酸丙酯、乙酸丁酯、碳酸二乙酯等酯类;乙醚、二异丙基醚、四氢呋喃、二氧六环、二甲氧基乙烷、二甘醇二甲醚等醚类;丙酮、甲基乙基酮、甲基异丁基酮、异佛尔酮、环己酮等酮类,优选醚类(特别是四氢呋喃)。
可以使用的反应试剂是例如硼烷、二(1,2-二甲基丙基)硼烷、1,1,2-三甲基丙基硼烷、9-BBN(9-硼二环〔3.3.1〕壬烷)等,优选9-BBN。
反应温度根据使用的原料化合物、溶剂、试剂而有所不同,通常为0℃至50℃,优选10℃至40℃。
反应时间根据使用的原料化合物、溶剂、试剂、反应温度而有所不同,通常为6至48小时,优选12至24小时。
反应结束后,本反应的目的化合物(3a)可以通过例如浓缩反应混合物,加入乙酸乙酯之类与水不混溶的有机溶剂,用水洗涤后,分离含有目的化合物的有机层,用无水硫酸镁等干燥后,蒸馏除去溶剂得到。
如果需要,得到的化合物可以通过常规方法,例如重结晶、硅胶柱色谱法等进一步进行精制。
(D法)
(D-1步骤)
该步骤是在惰性溶剂中,使增碳试剂与C-1步骤中制备的化合物(11)反应,制备化合物(13)的步骤。
可以使用的溶剂是例如己烷、庚烷、轻石油、石油醚等脂肪族烃类;苯、甲苯、二甲苯等芳香族烃类;二氯甲烷、氯仿、四氯化碳、二氯乙烷、氯苯、二氯苯等卤代烃类;甲酸乙酯、乙酸乙酯、乙酸丙酯、乙酸丁酯、碳酸二乙酯等酯类;乙醚、二异丙基醚、四氢呋喃、二氧六环、二甲氧基乙烷、二甘醇二甲醚等醚类;丙酮、甲基乙基酮、甲基异丁基酮、异佛尔酮、环己酮等酮类,优选醚类(特别是四氢呋喃)等,更优选卤代烃类(特别是二氯甲烷)。
可以使用的增碳试剂是例如Wittig试剂、Horner-Emmons试剂等。
反应温度根据使用的原料化合物、溶剂、试剂而有所不同,通常为-20℃至40℃,优选0℃至20℃。
反应时间根据使用的原料化合物、溶剂、试剂、反应温度而有所不同,通常为30分钟至12小时,优选1至5小时。
反应结束后,本反应的目的化合物(13)可以通过例如浓缩反应混合物,加入乙酸乙酯之类与水不混溶的有机溶剂,用水洗涤后,分离含有目的化合物的有机层,用无水硫酸镁等干燥后,蒸馏除去溶剂得到。
如果需要,得到的化合物可以通过常规方法,例如重结晶或硅胶柱色谱法等进一步进行精制。
(D-2步骤)
该步骤是在惰性溶剂中,使还原剂与D-1步骤中制备的化合物(13)反应,制备化合物(14)的步骤。
该步骤可以按照A-5步骤的(2)实施。其中,当R10是可以具有取代基的苯甲基,而且R11和R12为氢原子时,按照这一步骤可以直接制备化合物(3b)。
(D-3步骤)
该步骤是在惰性溶剂中,使还原剂与D-2步骤中制备的化合物(14)反应,制备A法中的原料化合物之一,即化合物(3b)的步骤。
(a)R11和R12连成一体为氧原子的场合
可以使用的溶剂是例如甲醇、乙醇、正丙醇、异丙醇、正丁醇、异丁醇、叔丁醇、异戊醇、二甘醇、甘油、辛醇、环己醇、甲基溶纤剂等醇类,乙酸等,优选醇类(特别是乙醇)。
可以使用的还原剂是例如硼氢化锂等碱金属硼氢化物;氢化铝锂、氢化锂三乙醇铝(lithium triethoxide aluminum hydride)等氢化铝化合物;硼烷等,优选硼烷或氢化铝锂。
反应温度根据使用的原料化合物、溶剂、还原剂而有所不同,通常为0℃至50℃,优选10℃至40℃。
反应时间根据使用的原料化合物、溶剂、还原剂、反应温度而有所不同,通常为10分钟至12小时,优选30分钟至5小时。
反应结束后,本反应的目的化合物(3b)可以通过例如分解还原剂,浓缩反应混合物,加入乙酸乙酯之类与水不混溶的有机溶剂,用水洗涤后,分离含有目的化合物的有机层,用无水硫酸镁等干燥后,蒸馏除去溶剂得到。
如果需要,得到的化合物可以通过常规方法,例如重结晶、硅胶柱色谱法等进一步进行精制。
(b)R11和R12为氢且R10为苯甲基以外的基团的场合
R10为甲硅烷基的场合,可以按照A-5步骤中(3)的方法实施。
R10为苯甲基等芳烷基;甲氧基甲基等烷氧基烷基;苯甲酰氧基甲基等芳基羰氧基甲基或苯甲氧基甲基等芳烷氧基甲基;甲氧基乙氧基甲基等烷氧基烷氧基烷基等的场合,使用酸催化剂,这时使用的酸催化剂可以是例如对甲苯磺酸、三氟乙酸、二氯乙酸等有机酸,BF3、AlCl3等路易斯酸。
可以使用的溶剂是例如苯、甲苯、二甲苯等芳香族烃类;二氯甲烷、氯仿、四氯化碳、1,2-二氯乙烷、氯苯、二氯苯等卤代烃类;乙腈、异丁腈等腈类;甲酰胺、N,N-二甲基甲酰胺、N,N-二甲基乙酰胺、N-甲基-2-吡咯烷酮、N-甲基吡咯烷酮、六甲基磷酰三胺等酰胺类;二硫化碳等。
反应温度根据使用的原料化合物、溶剂、酸催化剂而有所不同,通常为0℃至50℃,优选10℃至40℃。
反应时间根据使用的原料化合物、溶剂、酸催化剂、反应温度而有所不同,通常为10分钟至12小时,优选30分钟至5小时。
反应结束后,本反应的目的化合物(3b)可以通过例如中和反应混合物,加入乙酸乙酯之类与水不混溶的有机溶剂,用水洗涤后,分离含有目的化合物的有机层,用无水硫酸镁等干燥后,蒸馏除去溶剂得到。
如果需要,得到的化合物可以通过常规方法,例如重结晶、硅胶柱色谱法等进一步进行精制。
使用本发明的化合物(1),按照以下叙述的E法,可以制备含有改性核苷的低聚核苷酸或其硫代酸酯衍生物。
E法
E法中,A和B表示与上述相同的含义,R13表示羟基的保护基(特别是可以被甲氧基取代的三苯甲基),R14表示磺酰基或通过使后述的一取代-氯(烷氧基)膦类或二取代-烷氧基膦类反应形成的基团。
(E法)
(E-1步骤)
该步骤是在惰性溶剂中,使保护试剂与A法中制备的化合物(1)反应,制备化合物(15)的步骤。
可以使用的溶剂是例如苯、甲苯、二甲苯等芳香族烃类;二氯甲烷、氯仿、四氯化碳、二氯乙烷、氯苯、二氯苯等卤代烃类;甲酸乙酯、乙酸乙酯、乙酸丙酯、乙酸丁酯、碳酸二乙酯等酯类;乙醚、二异丙基醚、四氢呋喃、二氧六环、二甲氧基乙烷、二甘醇二甲醚等醚类;丙酮、甲基乙基酮、甲基异丁基酮、异佛尔酮、环己酮等酮类;硝基乙烷、硝基苯等硝基化合物类;乙腈、异丁腈等腈类;甲酰胺、二甲基甲酰胺(DMF)、二甲基乙酰胺、六甲基磷酰三胺等酰胺类;二甲基亚砜、环丁砜等亚砜类;三甲胺、三乙胺、N-甲基吗啉等脂肪族叔胺类;吡啶、甲基吡啶等芳香族胺等,更优选卤代烃类(特别是二氯甲烷)、芳香族胺(特别是吡啶)。
可以使用的保护试剂没有特别的限定,只要是能够仅选择性地保护5’位,在酸性、中性条件下可以除去的物质即可,优选的保护试剂是三苯甲基氯、一甲氧基三苯甲基氯、二甲氧基三苯甲基氯等三芳基甲基卤类。
使用三芳基甲基卤类作为保护试剂时,通常使用碱。
这时,可以使用的碱是例如吡啶、二甲氨基吡啶、吡咯烷基吡啶等杂环胺类;三甲胺、三乙胺等脂肪族叔胺类,优选吡啶、二甲氨基吡啶、吡咯烷基吡啶。
使用液态的碱作为溶剂时,该碱本身起着脱酸剂的作用,因此没有必要加入另外的碱。
反应温度根据使用的原料、试剂、溶剂等而定,通常为0℃至150℃,优选20℃至100℃。另外,反应时间根据使用的原料、溶剂、反应温度而有所不同,通常为1至100小时,优选2至24小时。
反应结束后,本反应的目的化合物(15)可以通过例如浓缩反应混合物,加入乙酸乙酯之类与水不混溶的有机溶剂,用水洗涤后,分离含有目的化合物的有机层,用无水硫酸镁等干燥后,蒸馏除去溶剂得到。
如果需要,得到的化合物可以通过常规方法,例如重结晶、硅胶柱色谱法等进一步进行精制。
(E-2步骤)
该步骤是在惰性溶剂中,使酰胺化(amiditation)中通常使用的一取代-氯(烷氧基)膦类或二取代-烷氧基膦类与E-1步骤中制备的化合物(15)反应,制备化合物(16)的步骤。
可以使用的溶剂没有特别的限定,只要是对反应没有影响的溶剂即可,优选的溶剂是例如四氢呋喃、乙醚、二氧六环等醚类;二氯甲烷、氯仿、四氯化碳、二氯乙烷、氯苯、二氯苯等卤代烃类。
可以使用的一取代-氯(烷氧基)膦类是例如氯(吗啉代基)甲氧基膦、氯(吗啉代基)氰基乙氧基膦、氯(二甲氨基)甲氧基膦、氯(二甲氨基)氰基乙氧基膦、氯(二异丙氨基)甲氧基膦、氯(二异丙氨基)氰基乙氧基膦等膦类,优选氯(吗啉基)甲氧基膦、氯(吗啉基)氰基乙氧基膦、氯(二异丙氨基)甲氧基膦、氯(二异丙氨基)氰基乙氧基膦。
在使用一取代-氯(烷氧基)膦类的场合下,使用脱酸剂,这时可以使用的脱酸剂是例如吡啶、二甲氨基吡啶等杂环胺类;三甲胺、三乙胺、二异丙胺等脂肪族胺类,优选脂肪族胺类(特别是二异丙胺)。
可以使用的二取代-烷氧基膦类是例如二(二异丙氨基)氰基乙氧基膦、二(二乙氨基)甲磺酰基乙氧基膦、二(二异丙氨基)(2,2,2-三氯乙氧基)膦、二(二异丙氨基)(4-氯苯基甲氧基)膦等膦类,优选二(二异丙氨基)氰基乙氧基膦。
在使用二取代-烷氧基膦类的场合下,使用酸,这时可以使用的酸优选四唑、乙酸或对甲苯磺酸。
反应温度没有特别的限定,通常为0℃至80℃,优选室温。
反应时间根据使用的原料、试剂、温度等而有所不同,通常为5分钟至30小时,在室温下反应的场合优选30分钟至10小时。
反应结束后,本反应的目的化合物(16)可以通过例如适当中和反应混合物,另外,存在不溶物的场合,过滤除去后,加入乙酸乙酯之类与水不混溶的有机溶剂,用水洗涤后,分离含有目的化合物的有机层,用无水硫酸镁等干燥后,蒸馏除去溶剂得到。如果需要,得到的化合物可以通过常规方法,例如重结晶、硅胶柱色谱法等进一步进行精制。
或者,该步骤是在惰性溶剂中(优选二氯甲烷等卤代烃类),使三(1,2,4-三唑基)亚磷酸盐与E-1中制备的化合物(15)反应后,加入水,进行H-磷酸化,制备化合物(16)的步骤。
反应温度没有特别的限定,通常为-20℃至100℃,优选10℃至40℃。
反应时间根据使用的原料、试剂、温度等而有所不同,通常为5分钟至30小时,在室温下反应的场合优选30分钟。
反应结束后,本反应的目的化合物(16)可以通过例如适当中和反应混合物,另外,存在不溶物的场合,过滤除去后,加入乙酸乙酯之类与水不混溶的有机溶剂,用水洗涤后,分离含有目的化合物的有机层,用无水硫酸镁等干燥后,蒸馏除去溶剂得到。如果需要,得到的化合物可以通过常规方法,例如重结晶、硅胶柱色谱法等进一步进行精制。
(E-3步骤)
该步骤是使用至少1种以上E-2中制备的化合物(16)、以及制备所需核苷酸序列的低聚核苷酸类似物所必须的市售亚磷酰胺试剂等,按照常规的方法,在DNA自动合成机上制备目的低聚核苷酸类似物的步骤。
具有所需核苷酸序列的低聚核苷酸类似物可以使用DNA合成机,例如Perkin-Elmer公司的采用亚磷酰胺法的Model 392等,按照文献(Nucleic AcidsResearch,12,4539(1984))记载的方法合成。
另外,根据需要进行硫代酸酯化时,除硫以外,可以使用二硫化四乙基秋兰姆(TETD,Applied Biosystems公司)、Beaucage试剂(millipore公司)等与3价磷酸反应形成硫代酸酯的试剂,按照文献(Tetrahedron Letters,32,3005(1991);J.Am.Chem.Soc., 112,1253(1990))记载的方法,得到硫代酸酯衍生物。
得到的粗制低聚核苷酸类似物可以使用OligoPak(反相色谱柱)精制,通过用HPLC进行分析,确认精制物的纯度。
得到的低聚核苷酸类似物的链长以核苷为单位,通常为2至50个,优选10至30个。
得到的低聚核苷酸类似物形成互补链的能力以及核酸酶耐受性可以按照以下的方法确定。
(试验方法1)
通过对得到的各种低聚核苷酸类似物以及具有互补序列的天然DNA或RNA构成的低聚核苷酸进行退火处理,测定熔化温度(Tm值),确定本发明的低聚核苷酸类似物对互补DNA和RNA的杂交体形成能力。
向磷酸钠缓冲液加入相同量的低聚核苷酸类似物和天然型互补低聚核苷酸得到试样溶液,将其置于沸水浴中,一定时间内缓慢冷却至室温(退火)。在分光光度计(例如岛津UV-2100PC)的比色杯内,使试样溶液由20℃分多次上升至90℃,测定260nm处的紫外吸收。
(试验方法2)核酸酶耐受性的测定
将低聚核苷酸置于缓冲液中,加入核酸酶后加温。作为核酸酶,使用蛇毒磷酸二酯酶、核酸内切酶P1、核酸内切酶S1等。作为缓冲液,只要是适合酶的缓冲液即可,没有特别的限定,蛇毒磷酸二酯酶的场合使用Tris-盐酸缓冲液,核酸内切酶P1的场合使用乙酸钠缓冲液。另外,必要时在缓冲液中加入金属离子。作为金属离子,蛇毒磷酸二酯酶的场合使用Mg2+,核酸内切酶的场合使用Zn2+等。反应温度优选0~100℃,更优选30~50℃。
一定时间后,加入乙二胺四乙酸(EDTA),在100℃下加热2分钟,使反应停止。
低聚核苷酸的残余量的定量可以采用下述方法进行:用放射性同位素等标记低聚核苷酸,用图象分析仪定量分裂反应产物的方法;用反相高效液相色谱法(HPLC)定量分裂反应产物的方法;用色素(溴化乙锭等)对分裂反应产物染色,通过利用计算机的图象处理进行定量的方法等。
作为本发明的含有1或2个以上通式(2)所示结构的低聚核苷酸类似物的给药方式,可以采用例如片剂、胶囊剂、颗粒剂、散剂或糖浆剂等的口服给药或者采用注射剂或栓剂等的非口服给药,这些制剂可以使用赋形剂(例如乳糖、白糖、葡萄糖、甘露醇、山梨醇等糖衍生物;玉米淀粉、马铃薯淀粉、α淀粉、糊精等淀粉衍生物;结晶纤维素等纤维素衍生物;阿拉伯胶;葡聚糖;茁酶多糖等有机赋形剂;以及轻质硅酸酐、合成硅酸铝、硅酸钙、偏硅酸铝酸镁等硅酸盐衍生物;磷酸氢钙等磷酸盐;碳酸钙等碳酸盐;硫酸钙等硫酸盐等无机赋形剂)、润滑剂(例如硬脂酸、硬脂酸钙、硬脂酸镁等硬脂酸金属盐;滑石;胶态二氧化硅;蜂胶、鲸蜡等蜡类;硼酸;己二酸;硫酸钠等硫酸盐;乙二醇;富马酸;苯甲酸钠;DL亮氨酸;脂肪酸钠盐;月桂基硫酸钠、月桂基硫酸镁等月桂基硫酸盐;硅酸酐、硅酸水合物等硅酸类;以及上述淀粉衍生物)、粘合剂(例如羟丙基纤维素、羟丙基甲基纤维素、聚乙烯吡咯烷酮、聚乙二醇以及与上述赋形剂相同的化合物)、崩解剂(例如低取代度羟丙基纤维素、羧甲基纤维素、羧甲基纤维素钙、内部交联羧甲基纤维素钠等纤维素衍生物;羧甲基淀粉、羧甲基淀粉钠、交联聚乙烯吡咯烷酮等化学改性的淀粉·纤维素类)、稳定剂(例如对羟基苯甲酸甲酯、对羟基苯甲酸丙酯等对羟基苯甲酸酯类;氯丁醇、苯甲醇、苯乙醇等醇类;苯扎氯铵;苯酚、甲酚等酚类;硫汞撒;脱氢乙酸;以及山梨酸)、矫味剂(例如通常使用的甜味剂、酸味剂、香料等)、稀释剂等添加剂,按照公知的方法制备。
其用量根据症状、年龄、给药方法等而有所不同,例如口服给药的场合,每次下限为0.01mg/kg体重(优选0.1mg/kg体重),上限为1000mg/kg(优选100mg/kg),静脉给药的场合,每次下限为0.001mg/kg体重(优选0.01mg/kg体重),上限为100mg/kg(优选10mg/kg),优选根据症状1日1次至数次给药。
以下,结合实施例、参考例和试验例,更详细地说明本发明。
〔实施例〕
(实施例1)
3’,5’-二-O-苯甲基-2’-O,4’-C-亚乙基-4-N-苯甲酰基胞嘧啶核苷
(示例化合物编号2-34)
将参考例11中得到的化合物(6.80g,8.86mmol)溶解在吡啶(136ml)中,冷却至0℃后,加入2N氢氧化钠水溶液(68ml),然后在室温下搅拌1小时。
反应结束后,向反应液中滴加20%乙酸水溶液,中和反应液后,用氯仿萃取,用饱和食盐水洗涤。减压蒸馏除去溶剂后,将残渣用硅胶色谱法精制(二氯甲烷∶甲醇=100∶3),得到目的化合物(3.33g,6.02mmol,68%)。
1H-NMR(400MHz,CDCl3):8.64(2H,brs),7.89(2H,d,7.6Hz),7.64-7.60(1H,m),7.54-7.51(2H,m),7.48-7.37(3H,m),7.36-7.26(8H,m),6.18(1H,s),4.70(1H,d,11Hz),4.60(1H,d,11Hz),4.55(1H,d,11Hz),4.46(1H,d,2.9Hz),4.42(1H,d,11Hz),4.10-4.02(2H,m),3.89(1H,d,2.9Hz),3.75(1H,d,11Hz),3.62(1H,d,11Hz),2.34-2.26(1H,m),1.39-1.36(1H,m).FAB-MAS(mNBA):554(M+H)+
(实施例2)
2’-O,4’-C-亚乙基-4-N-苯甲酰基胞嘧啶核苷
(示例化合物编号2-225)
将实施例1中得到的化合物(2.06g,3.72mmol)溶解在无水二氯甲烷(317ml)中,冷却至-78℃后滴加三氯硼烷(1.0M二氯甲烷中)(31.7ml)。-78℃下搅拌1小时后,缓慢升温至-20℃,将反应容器置于冰-食盐浴中,在-20℃至-10℃之间搅拌2小时。缓慢滴加甲醇(12ml),搅拌10分钟后,少量多次加入碳酸氢钠饱和水溶液,调节至pH7~8,恢复到室温。减压浓缩该混合溶液,将得到的残渣用硅胶色谱法精制(二氯甲烷∶甲醇=100∶5),得到白色固体状目的产物(1.21g,3.24mmol,87%)。
1H-NMR(500MHz,DMSO-d6):11.23(1H,brs),8.70(1H,d,7.2Hz),8.00(2H,d,7.5Hz),7.3-6(4H,m),5.97(1H,s),5.35(1H,dd,5和10Hz),4.10(1H,dd,5和10Hz),4.03(1H,d,3.2Hz),3.95-3.85(2H,m)3.83(1H,d,3.2Hz),3.65-3.51(2H,m),2.06-1.98(1H,m),1.26(1).
FAB-MAS(mNBA):374(M+H)+
(实施例3)
2’-O,4’-C-亚乙基-胞嘧啶核苷
(示例化合物编号2-3)
将实施例2中得到的化合物(0.1g,0.268mmol)溶解在饱和氨-甲醇溶液(12ml)中,放置过夜。蒸馏除去溶剂,得到白色固体状目的产物(0.054g,75%)。
1H-NMR(500MHz,DMSO-d6):8.18(1H,d,7.4Hz),7.10(2H,br),5.84(1H,s),5.69(1H,d,7.6Hz),5.27-5.24(2H,m),3.86(1H,d,3.2Hz),3.90-3.78(2H,m),3.76(1H,d,3.2Hz),3.56(1H,dd,5.5和12Hz),3.49(1H,dd,5.5和12Hz),2.01-1.93(1H,dt,7.5和12Hz),1.22(1H,dd,3.6 and 13Hz).FAB-MAS(mNBA):270(M+H)+
(实施例4)
5’-O-二甲氧基三苯甲基-2’-O,4’-C-亚乙基-4-N-苯甲酰基胞嘧啶核苷
(示例化合物编号2-39)
将实施例2中得到的化合物(1.29g,3.46mmol)用无水吡啶共沸脱水后,在氮气流下,溶解在无水吡啶(26ml)中。向其中添加4,4’-二甲氧基三苯甲基氯(1.76g,5.18mmol),然后在室温下搅拌过夜。
向反应溶液中加入少量甲醇后,减压浓缩溶剂,加入水,用氯仿萃取。用碳酸氢钠饱和水溶液、饱和食盐水洗涤有机层后,减压浓缩溶剂,将得到的残渣用硅胶色谱法精制(二氯甲烷∶甲醇=100∶5),得到无色无定形的目的产物(2.10g,3.11mmol,90%)。
1H-NMR(270MHz,DMSO-d6):11.27(1H,brs),8.59(1H,m),6.92-8.01(19H,m),6.03(1H,s),5.56(1H,m),4.17(1H,m),4.08(1H,m),3.86(2H,m),3.77(6H,s),3.24(2H,m),1.98(1H,m),1.24(1H,m).FAB-MAS(mNBA):676(M+H)+
(实施例5)
5’-O-二甲氧基三苯甲基-2’-O,4’-C-亚乙基-4-N-苯甲酰基胞嘧啶核苷-3’-O-(2-氰基乙基N,N-二异丙基)亚磷酰胺
(示例化合物编号2-235)
将实施例4中得到的化合物(6.53g,9.66mmol)用无水吡啶共沸脱水后,在氮气流下,溶解在无水二氯甲烷(142ml)中,加入N,N-二异丙基胺(2.80g,16.1mmol)。在冰冷条件下滴加2-氰基乙基N,N-二异丙基氯亚磷酰胺(2.16ml,9.66mmol),然后在室温下搅拌6小时。用碳酸氢钠饱和水溶液、饱和食盐水洗涤反应溶液后,减压浓缩溶剂,将得到的残渣用硅胶色谱法精制(二氯甲烷∶三乙胺=50∶1~二氯甲烷∶乙酸乙酯∶三乙胺=60∶30∶1),得到苍白色目的产物(7.10g,8.11mmol,84%)。
1H-NMR(400MHz,CDCl3):1.1-1.2(12H,m),1.35(1H,m),2.11(1H,m),2.3(2H,m),3.35-3.7(6H,m),3.8(6H,m),3.9-4.1(2H,m),4.33(1H,m),4.45(1H,m),6.23(1H,s),6.9(4H,m),7.3-7.9(15H,m),8.7-8.8(1H,m).
(实施例6)
3’,5’-二-O-苯甲基-2’-O,4’-C-亚乙基-5-甲基尿嘧啶核苷
(示例化合物编号2-22)
将参考例10中得到的化合物(418mg,0.62mmol)溶解在吡啶∶甲醇∶水=65∶30∶5的混合溶液(5ml)中。在0℃下向其中加入2N氢氧化钠/同一混合溶液(5ml),室温下搅拌15分钟。
反应结束后,用1N盐酸中和反应液,加入乙酸乙酯(约30ml),分离,用碳酸氢钠饱和水溶液(约30ml)、饱和食盐水(约30ml)洗涤有机层后,用无水硫酸镁干燥。
减压蒸馏除去溶剂后,将得到的残渣用硅胶色谱法精制(己烷∶乙酸乙酯=1∶1),得到无定形的无色物质(228mg,0.49mmol,79%)。
1H-NMR(400MHz,CDCl3):1.35(1H,d,13Hz),1.41(3H,s),2.28(1H,dt,9.4and 13Hz),3.60(1H,d,11Hz),3.76(1H,d,11Hz),3.94(1H,d,3.0Hz),4.10(1H,d,7.0Hz),4.14(1H,d,7.0Hz),4.31(1H,d,3.0Hz),4.51(1H,d,12Hz),4.54(1H,d,12Hz),4.58(1H,d,12Hz),4.75(1H,d,12Hz),6.06(1H,s),7.3(10H,m),7.91(1H,s),8.42(1H,brs).FAB-MAS(mNBA):465(M+H)+
(实施例7)
2’-O,4’-C-亚乙基-5-甲基尿嘧啶核苷
(示例化合物编号2-2)
将实施例6中得到的化合物(195mg,0.42mmol)溶解在甲醇(10ml)中,将得到的反应液在加氢催化剂的存在下、在氢气流、常压下搅拌5小时。
反应结束后,过滤催化剂,减压蒸馏除去滤液中的溶剂后,将得到的残渣用硅胶色谱法精制(二氯甲烷∶甲醇=10∶1),得到白色粉末(76mg,0.268mmol,64%)。
1H-NMR(400MHz,CD3OD):1.33(1H,dd,3.8 and 13Hz),1.86(3H,d,0.9Hz),1.94(1H,ddd,7.5,11.7 and 13Hz),3.68(1H,d,12Hz),3.75(1H,d,12Hz),3.9-4.0(2H,m),4.05(1H,d,3.2Hz),4.09(1H,d,3.2Hz),6.00(1H,s),8.28(1H,d,1.1Hz).
FAB-MAS(mNBA):285(M+H)+
(实施例8)
5’-O-二甲氧基三苯甲基-2’-O,4’-C-亚乙基-5-甲基尿嘧啶核苷
(示例化合物编号2-27)
将实施例7中得到的化合物(1.45g,5.10mmol)用无水吡啶共沸脱水后,在氮气流下,溶解在无水吡啶(44ml)中。向其中添加4,4’-二甲氧基三苯甲基氯(2.59g,7.65mmol),然后在室温下搅拌过夜。
向反应溶液中加入少量甲醇后,减压浓缩溶剂,加入水,用氯仿萃取。用碳酸氢钠饱和水溶液、饱和食盐水洗涤有机层后,减压浓缩溶剂,将得到的残渣用硅胶色谱法精制(二氯甲烷∶甲醇=100∶10),得到无色无定形的目的产物(2.42g,4.13mmol,81%)。
1H-NMR(270MHz,DMSO-d6):11.36(1H,s),7.68(1H,s),6.90-7.44(13H,m),5.89(1H,s),5.55(1H,d),4.09(1H,m),4.04(1H,d),3.82(2H,m),3.74(6H,s),3.19(2H,m),1.99(1H,m),1.36(1H,m),1.17(3H,s).FAB-MAS(mNBA):587(M+H)+
(实施例9)
5’-O-二甲氧基三苯甲基-2’-O,4’-C-亚乙基-5-甲基尿嘧啶核苷-3’-O-(2-氰基乙基N,N-二异丙基)亚磷酰胺
(示例化合物编号2-234)
将实施例8中得到的化合物(4.72g’8.05mmol)用无水吡啶共沸脱水后,在氮气流下,溶解在无水二氯甲烷(142ml)中,加入N,N-二异丙胺(2.80g,16.1mmol)。在冰冷条件下,滴加2-氰基乙基N,N-二异丙基氯亚磷酰胺(2.16ml,9.66mmol),然后在室温下搅拌6小时。用碳酸氢钠饱和水溶液、饱和食盐水洗涤反应溶液后,减压浓缩溶剂,将得到的残渣用硅胶色谱法精制(己烷∶乙酸乙酯∶三乙胺=50∶50∶1~己烷∶乙酸乙酯∶三乙胺=30∶60∶1),得到无色无定形的目的产物(5.64g,7.17mmol,89%)。
1H-NMR(400MHz,CDCl3):1.1-1.2(15H,m),1.4(1H,m),2.08(1H,m),2.4(2H,m),3.2-4.0(14H,m),4.38(2H,m),4.47(1H,m),6.06(1H,s),6.8-6.9(4H,m),7.2-7.5(9H,m),7.91(1H,m).FAB-MAS(mNBA):787(M+H)+
(实施例10)
3’,5’-二-O-苯甲基-2’-O,4’-C-亚乙基-6-N-苯甲酰基腺嘌呤核苷
(示例化合物编号1-23)
将参考例12中得到的化合物(238mg,0.30mmol)溶解在吡啶∶甲醇∶水=65∶30∶5的混合溶液(5ml)中。在0℃下向其中加入2N氢氧化钠/同一混合溶液(5ml),然后在室温下搅拌15分钟。
反应结束后,用1N盐酸中和反应液,用乙酸乙酯(约30ml)萃取,用碳酸氢钠饱和水溶液(约30ml)、饱和食盐水(约30ml)洗涤后,用无水硫酸镁干燥。减压蒸馏除去溶剂后,将得到的残渣用硅胶色谱法精制(二氯甲烷∶甲醇=50∶1),得到无定形的无色物质(133mg,0.23mmol,78%)。
1H-NMR(400MHz,CDCl3):1.44(1H,d,13Hz),2.31(1H,dd,13和19Hz),3.56(1H,d,11Hz),3.70(1H,d,11Hz),4.10(2H,m),4.24(1H,s),4.45(1H,d,12Hz),4.53-4.67(4H,m),6.52(1H,s),7.3(10H,m),7.53(2H,m),7.62(1H,m),8.03(2H,d,7.6Hz),8.66(1H,s),8.78(1H,s),9.00(1H,brs).FAB-MAS(mNBA):578(M+H)+
(实施例11)
2’-O,4’-C-亚乙基-6-N-苯甲酰基腺嘌呤核苷
(示例化合物编号1-178)
在氮气流下,将实施例10中得到的化合物(116mg,0.20mmol)溶解在无水二氯甲烷5ml中,冷却至-78℃。向其中缓慢滴加1M-三氯化硼/二氯甲烷溶液(1.5ml,1.5mmol),然后在-78℃下搅拌3小时。再加入1M-三氯化硼/二氯甲烷溶液(1.5ml,1.5mmol),搅拌2小时。接着,缓慢升温至室温,再骤冷至-78℃后,加入甲醇(5ml),再次缓慢升温至室温。
反应结束后,减压蒸馏除去溶剂,将得到的残渣用硅胶色谱法精制(二氯甲烷∶甲醇=9∶1),得到白色粉末(49mg,0.17mmol,84%)。
1H-NMR(400MHz,CD3OD):1.45(1H,dd,4.3和13Hz),2.12(1H,m),3.72(1H,d,12Hz),3.79(1H,d,12Hz),4.04(1H,dd,7.3和12Hz),4.15(1H,dt,4.3和9.4Hz),4.36(1H,d,3.2Hz),4.43(1H,d,3.2Hz),6.57(1H,s),7.57(2H,m),7.66(1H,m),8.09(2H,d,8.0Hz),8.72(1H,s),8.85(1H,s).FAB-MAS(mNBA):398(M+H)+
(实施例12)
2’-O,4’-C-亚乙基腺嘌呤核苷
(示例化合物编号1-7)
将实施例11中得到的化合物(14mg,0.035mmol)溶解在饱和氨/甲醇溶液(1ml)中,放置过夜。
反应结束后,减压蒸馏除去溶剂,将得到的残渣用硅胶色谱法精制(二氯甲烷∶甲醇=10∶1),得到白色粉末(10mg,0.034mmol,98%)。
1H-NMR(400MHz,CD3OD):1.32(1H,dd,4和13Hz),2.04(1H,dt,7.4和12Hz),3.53(1H,dd,5和12Hz),3.61(1H,dd,5.2 and 12Hz),3.90(1H,dd,7.4and 12Hz),3.97(1H,dt,4和12Hz),4.15(1H,d,3.1Hz),4.21(1H,d,3.1Hz),5.27(1H,t,5.2Hz),5.39(1H,d,3.1Hz),6.33(1H,s),7.29(2H,s),7.66(1H,m),8.14(1H,s),8.42(1H,s).FAB-MAS(mNBA):294(M+H)+UV(λmax):260(pH7),260(pH1),258(pH13)
(实施例13)
5’-O-二甲氧基三苯甲基-2’-O,4’-C-亚乙基-6-N-苯甲酰基腺嘌呤核苷
(示例化合物编号1-31)
将实施例11中得到的化合物(14mg,0.035mmol)用无水吡啶共沸脱水后,在氮气流下,溶解在无水吡啶(1ml)中。向其中添加4,4’-二甲氧基三苯甲基氯(18mg,0.053mmol),然后在40℃下搅拌5小时。
向反应溶液中加入少量甲醇后,减压浓缩溶剂,加入水,用氯仿萃取。用碳酸氢钠饱和水溶液、饱和食盐水洗涤有机层后,减压浓缩溶剂,将得到的残渣用硅胶色谱法精制(二氯甲烷∶甲醇=100∶5),得到无色无定形的目的产物(18mg,0.026mmol,73%)。
1H-NMR(400MHz,CDCl3):1.63(1H,m),2.14(1H,7.5,12,和13Hz),3.37(1H,d,11Hz),3.41(1H,d,11Hz),3.79(6H,s),4.10(2H,m),4.48(1H,d,3.3Hz),4.59(1H,d,3.3Hz),6.54(1H,s),6.85(4H,m),7.2-7.6(12H,m),8.02(2H,m),8.45(1H,s),8.82(1H,s),9.02(1H,brs).FAB-MAS(mNBA):700(M+H)+
(实施例14)
5’-O-二甲氧基三苯甲基-2’-O,4’-C-亚乙基-6-N-苯甲酰基腺嘌呤核苷-3’-O-(2-氰基乙基N,N-二异丙基)亚磷酰胺
(示例化合物编号1-186)
将实施例13中得到的化合物(16mg,0.023mmol)用无水吡啶共沸脱水后,在氮气流下,溶解在无水二氯甲烷(0.5ml)中,加入四唑N,N-二异丙基胺盐(10mg)。在冰冷条件下,滴加2-氰基乙基N,N,’N,’N-四异丙基亚磷酰胺(约20μl),然后在室温下搅拌过夜。用碳酸氢钠饱和水溶液、饱和食盐水洗涤反应溶液后,减压浓缩溶剂,将得到的残渣用硅胶色谱法精制(二氯甲烷∶乙酸乙酯=2∶1),得到白色固体状目的产物(20mg,0.022mmol,97%)。
1H-NMR(400MHz,CDCl3):1.0-1.2(12H,m),1.54(1H,m),2.15(1H,m),2.33(2H,m),3.3-3.6(6H,m),3.80(6H,s),4.08(2H,m),4.65(1H,m),4.75(1H,m),6.53(1H,s),6.84(4H,m),7.2-7.6(12H,m),8.01(2H,m),8.53(1H,s),8.83(1H,s),9.01(1H,brs).FAB-MAS(mNBA):900(M+H)+
(实施例15)
3’,5’-二-O-苯甲基-2’-O,4’-C-亚乙基尿嘧啶核苷
(示例化合物编号2-10)
将参考例13中得到的化合物(194mg,0.292mmol)溶解在吡啶(3ml)中。在0℃下向其中加入1N氢氧化钠(2ml),然后在室温下搅拌30分钟。
反应结束后,用1N盐酸中和反应液,加入乙酸乙酯(10ml),分离各层,用碳酸氢钠饱和水溶液、饱和食盐水洗涤有机层后,用无水硫酸镁干燥。减压蒸馏除去溶剂后,将得到的残渣用硅胶色谱法精制(二氯甲烷∶甲醇=100∶3),得到油状无色物质(105mg,0.233mmol,80%)。
1H-NMR(400MHz,CDCl3):1.36(1H,m),2.29(1H,m),3.63(1H.d,11Hz),3.74(1H,d,11Hz),3.87(1H,d,2.9Hz),4.03(2H,m),4.29(1H,d,2.9Hz),4.49(1H,d,12Hz),4.50(1H,d,11Hz),4.53(1H,d,11Hz),4.73(1H,d,12Hz),5.20(1H,dd,2和8Hz),6.04(1H,s),7.2-7.4(10H,m),8.13(1H,d,8.2Hz),8.57(1H,brs).
FAB-MAS(mNBA):451(M+H)+
(实施例16)
2’-O,4’-C-亚乙基尿嘧啶核苷
(示例化合物编号2-1)
将实施例15中得到的化合物(100mg,0.222mmol)溶解在甲醇(4ml)中,将得到的反应液在加氢催化剂的存在下、在氢气流、常压下搅拌5小时。
反应结束后,过滤催化剂,减压蒸馏除去滤液中的溶剂后,将得到的残渣用硅胶色谱法精制(二氯甲烷∶甲醇=10∶1),得到无色油状物质(45mg,0.167mmol,75%).
1H-NMR(400MHz,CD3OD):1.35(1H,dd,4和13Hz),2.13(1H,ddd,7,11和13Hz),3.66(1H,d,12Hz),3.73(1H,d,12Hz),3.91-4.08(2H,m),4.01(1H,d,3.2Hz),4.12(1H,d,3.2Hz),5.66(1H,d,8.2Hz),6.00(1H,s),8.37(1H,d,8.2Hz).
FAB-MAS(mNBA):271(M+H)+
(实施例17)
5’-O-二甲氧基三苯甲基-2’-O,4’-C-亚乙基尿嘧啶核苷
(示例化合物编号2-15)
将实施例16中得到的化合物(28mg,0.104mmol)用无水吡啶共沸脱水后,在氮气流下,溶解在无水吡啶(3ml)中。向其中添加4,4’-二甲氧基三苯甲基氯(50mg,0.15mmol),然后在室温下搅拌过夜。
向反应溶液中加入少量甲醇后,减压浓缩溶剂,加入水,用氯仿萃取。用碳酸氢钠饱和水溶液、饱和食盐水洗涤有机层后,减压浓缩溶剂,将得到的残渣用硅胶色谱法精制(二氯甲烷∶甲醇=100∶3),得到无色油状目的产物(25mg,0.044mmol,42%)。
1H-NMR(400MHz,CD3OD):1.35(1H,dd,3和14Hz),2.03(1H,ddd,8,11和14Hz),2.46(1H,d,8Hz),3.36(1H,d,11Hz),3.41(1H,d,11Hz),3.80(3H,s),3.81(3H,s),3.97(2H,m),4.21(1),4.33(1H,brm),5.31(1H,m),6.10(1H,s),6.86(4H,m),7.2-7.5(9H,m),8.27(1H,d,8.2Hz),8.43(1H,brs).FAB-MAS(mNBA):573(M+H)+
(实施例18)
5’-O-二甲氧基三苯甲基-2’-O,4’-C-亚乙基尿嘧啶核苷-3’-O-(2-氰基乙基N,N-二异丙基)亚磷酰胺
(示例化合物编号2-233)
将实施例17中得到的化合物(6mg,0.0105mmol)用无水吡啶共沸脱水后,在氮气流下,溶解在无水二氯甲烷(0.5ml)中,加入四唑N,N-二异丙基胺盐(3mg)。在冰冷条件下,滴加2-氰基乙基N,N,’N,’N-四异丙基亚磷酰胺(约5μl),然后在室温下搅拌过夜。用碳酸氢钠饱和水溶液、饱和食盐水洗涤反应溶液后,减压浓缩溶剂,将得到的残渣用硅胶色谱法精制(二氯甲烷∶乙酸乙酯=2∶1),得到白色固体状目的产物(8mg)。
1H-NMR(400MHz,CDCl3):1.1-1.2(13H,m),2.09(1H,m),2.4(2H,m),3.3-3.6(6H,m),3.81(6H,m),3.94(2H,m),4.35(1H,m),4.47(1H,m),5.18(1H,d,8.2Hz),6.08(1H,s),6.86(4H,m),7.2-7.4(9H,m),8.31(1H,d,8.2Hz).FAB-MAS(mNBA):773(M+H)+
(实施例19)
3’,5’-二-O-苯甲基-2’-O,4’-C-亚乙基-4-N-苯甲酰基-5-甲基胞嘧啶核苷
(示例化合物编号2-46)
将参考例14中得到的化合物(310mg,0.396mmol)溶解在吡啶(5ml)中,冷却至0℃后,加入1N氢氧化钠水溶液(5ml),然后在室温下搅拌20分钟。
反应后,向反应液中滴加20%乙酸水溶液,中和反应液后,用二氯甲烷萃取,用饱和食盐水洗涤。减压蒸馏除去溶剂后,将残渣用硅胶色谱法精制(二氯甲烷∶甲醇=100∶2),得到目的产物(190mg,0.334mmol,84%)。
1H-NMR(400MHz,CDCl3):1.37(1H,m),1.58(3H,s),2.30(1H,dt,10和13Hz),3.64(1H,d,11Hz),3.79(1H,d,11Hz),3.95(1H,d,3.0Hz),4.04(2H,dd,2.3和10Hz),4.37(1H,d,3.0Hz),4.50(1H,d,12Hz),4.56(1H,d,11Hz),4.61(1H,d,11Hz),4.76(1H,d,12Hz),6.11(1H,s),7.2-7.5(13H,m),8.09(1H,s),8.29(2H,m).
FAB-MAS(mNBA):568(M+H)+
(实施例20)
2’-O,4’-C-亚乙基-4-N-苯甲酰基-5-甲基胞嘧啶核苷
(示例化合物编号2-226)
将实施例19中得到的化合物(120mg,0.211mmol)溶解在无水二氯甲烷(5ml)中,在冷却至-78℃的条件下滴加三氯硼烷(1.0M二氯甲烷中)(1.6ml)。在-78℃下搅拌4小时后,缓慢滴加甲醇(1ml),搅拌10分钟后,少量多次加入碳酸氢钠饱和水溶液,调节至pH7~8,恢复到室温。减压浓缩该混合溶液,将得到的残渣用硅胶色谱法精制(二氯甲烷∶甲醇=100∶6),得到白色固体状目的产物(29mg,0.075mmol,36%)。
1H-NMR(400MHz,d-DMSO):1.24(1H,m),2.01(3H,s),2.0(1H,m),3.54(1H,dd,5.4和12Hz),3.64(1H,dd,5.4和12Hz),3.88(3H,m),4.10(1H,m),5.36(1H,d,5.4Hz),5.49(1H,t,5.0Hz),5.95(1H,s),7.4-7.6(3H,m),8.21(2H,m),8.49(1H,s),13.17(1H,brs).FAB-MAS(mNBA):388(M+H)+
(实施例21)
5’-O-二甲氧基三苯甲基-2’-O,4’-C-亚乙基-4-N-苯甲酰基-5-甲基胞嘧啶核苷
(示例化合物编号2-51)
将实施例20中得到的化合物(44mg,0.114mmol)用无水吡啶共沸脱水后,在氮气流下,溶解在无水吡啶(1ml)中。向其中添加4,4’-二甲氧基三苯甲基氯(60mg,0.177mmol),然后在室温下搅拌过夜。向反应溶液中加入少量甲醇后,减压浓缩溶剂,加入水,用氯仿萃取。用碳酸氢钠饱和水溶液、饱和食盐水洗涤有机层后,减压浓缩溶剂,将得到的残渣用硅胶色谱法精制(二氯甲烷∶甲醇=100∶4),得到无色油状目的产物(73mg,0.106mmol,93%)。
1H-NMR(400MHz,CDCl3):1.46(1H,m),1.49(3H,s),2.06(1H,m),2.59(1H,d,8.6Hz),3.36(1H,d,11Hz),3.39(1H,d,11Hz),3.80(3H,s),3.81(3H,s),3.99(2H,m),4.30(1H,d,3.3Hz),4.39(1H,m),6.12(1H,s),6.85(4H,m),7.2-7.5(12H,m),8.03(1H,s),8.28(2H,m).
FAB-MAS(mNBA):573(M+H)+
(实施例22)
5’-O-二甲氢基三苯甲基-2’-O,4’-C-亚乙基-4-N-苯甲酰基-5-甲基胞嘧啶核苷-3’-O-(2-氰基乙基N,N-二异丙基)亚磷酰胺
(示例化合物编号2-236)
将实施例21中得到的化合物(35mg,0.0507mmol)用无水吡啶共沸脱水后,在氮气流下,溶解于无水二氯甲烷(1ml)中,加入四唑N,N-二异丙基胺盐(17mg)。在冰冷条件下,滴加2-氰基乙基N,N,’N,’N-四异丙基亚磷酰胺(32μl,0.1mmol),然后在室温下搅拌过夜。用碳酸氢钠饱和水溶液、饱和食盐水洗涤反应溶液后,减压浓缩溶剂,将得到的残渣用硅胶色谱法精制(二氯甲烷∶乙酸乙酯=2∶1),得到白色固体状目的产物(40mg,0.0445mmol,89%)。
1H-NMR(400MHz,CDCl3):1.1-1.2(12H,m),1.36(3H,s),1.37(1H,m),2.10(1H,m),2.36(2H,m),3.3-3.6(6H,m),3.81(6H,m),3.98(2H,m),4.42(1H,m),4.49(1H,m),6.11(1H,s),6.88(4H,m),7.2-7.5(12H,m),8.14(1H,s),8.28(2H,m).
FAB-MAS(mNBA):890(M+H)+
(实施例23)
2’-O,4’-C-亚乙基-5-甲基胞嘧啶核苷
(示例化合物编号2-4)
将实施例20中得到的化合物(11.6mg,0.030mmol)溶解在饱和氨-甲醇溶液(2ml)中,放置过夜。蒸馏除去溶剂,得到白色固体状目的产物(8.5mg,0.03mmol)。
1H-NMR(400MHz,d-DMSO):1.20(1H,m),1.82(3H,s),1.97(1H,m),3.49(1H,dd,5和12Hz),3.58(1H,dd,5和12Hz),3.85(2H,m),5.23(1H,d,5Hz),5.32(1H,t,5Hz),5.84(1H,s),6.7(1H,brs),7.2(1H,brs),8.08(1H,s).
FAB-MAS(mNBA):284(M+H)+UV(λmax):279(pH7),289(pH1),279(pH13)
(实施例24)
3’,5’-二-O-苯甲基-2’-O,4’-C-亚乙基-2-N-异丁酰基鸟嘌呤核苷
(示例化合物编号1-24)
将参考例15中得到的化合物(约200mg)溶解在吡啶(2ml)中。向其中加入1N氢氧化钠(2ml),然后在室温下搅拌15分钟。
反应结束后,用1N盐酸中和反应液,用乙酸乙酯萃取,用碳酸氢钠饱和水溶液、饱和食盐水洗涤后,用无水硫酸镁干燥。减压蒸馏除去溶剂后,将得到的残渣用硅胶色谱法精制(二氯甲烷∶甲醇=50∶1),得到无定形的无色物质(20mg,0.036mmol,6%(2步))。
1H-NMR(400MHz,CDCl3):1.27(3H,s),1.29(3H,s),1.43(1H,dd,3和13Hz),2.28(1H,m),2.59(1H,qui,6.9Hz),3.54(1H,d,11Hz),3.68(1H,d,11Hz),4.03(2H,m),4.15(1H,d,3.0Hz),4.31(1H,d,3.0Hz),4.45(1H,d,12),4.56(1H,d,12Hz),4.61(1H,d,12Hz),4.63(1H,d,12Hz),6.18(1H,s),7.2-7.4(10H,m),8.19(1H,s),11.93(1H,brs).FAB-MAS(mNBA):560(M+H)+
(实施例25)
2’-O,4’-C-亚乙基-2-N-异丁酰基鸟嘌呤核苷
(示例化合物编号1-177)
将实施例24中得到的化合物(10mg,0.018mmol)溶解在甲醇(2ml)中,将得到的反应液在加氢催化剂的存在下、在氢气流、常压下搅拌5小时。
反应结束后,过滤催化剂,减压蒸馏除去滤液中的溶剂后,将得到的残渣用硅胶色谱法精制(二氯甲烷∶甲醇=10∶2),得到无色油状物质(5mg,0.013mmol,72%)。
1H-NMR(400MHz,CD3OD):1.21(3H,s),1.22(3H,s),1.41(1H,dd,4和13Hz),2.18(1H,m),2.69(1H,qui,6.9Hz),3.69(1H,d,12Hz),3.76(1H,d,12Hz),4.0(2H,m),4.26(1H,d,3.2Hz),4.30(1H,d,3.2Hz),6.30(1H,s),8.40(1H,s).
FAB-MAS(mNBA):380(M+H)+
(实施例26)
5’-O-二甲氧基三苯甲基-2’-O,4’-C-亚乙基-2-N-异丁酰基鸟嘌呤核苷
(示例化合物编号1-35)
将实施例25中得到的化合物(5mg,0.013mmol)用无水吡啶共沸脱水后,在氮气流下,溶解在无水吡啶(1ml)中。向其中添加4,4’-二甲氧基三苯甲基氯(14mg,0.04mmol),然后在40℃下搅拌3小时。
向反应溶液中加入少量甲醇后,减压浓缩溶剂,将得到的残渣用硅胶色谱法精制(二氯甲烷∶甲醇=100∶6),得到无色固体状目的产物(4mg,0.0059mmol,45%)。
1H-NMR(400MHz,CDCl3):1.26(3H,d,1.4Hz),1.28(3H,d,1.4Hz),1.66(1H,m),2.15(1H,m),2.59(1H,qui,6.9Hz),3.65(1H,m),3.78(1H,m),4.06(2H,m),4.35(1H,m),4.38(1H,d,3.2Hz),6.23(1H,s),6.8(4H,m),7.2-7.5(9H,m),8.01(1H,s),8.19(1H,brs).FAB-MAS(mNBA):682(M+H)+
(实施例27)
5’-O-二甲氧基三苯甲基-2’-O,4’-C-亚乙基-2-N-异丁酰基鸟嘌呤核苷-3’-O-(2-氰基乙基N,N-二异丙基)亚磷酰胺
(示例化合物编号1-185)
将实施例26中得到的化合物(4mg,0.0058mmol)用无水吡啶共沸脱水后,在氮气流下,溶解在无水二氯甲烷(0.5ml)中,加入四唑N,N-二异丙基胺盐(5mg)。在冰冷条件下,滴加2-氰基乙基N,N,’N,’N-四异丙基亚磷酰胺(9μl,0.03mmol),然后在室温下搅拌过夜。用碳酸氢钠饱和水溶液、饱和食盐水洗涤反应溶液后,减压浓缩溶剂,将得到的残渣用硅胶色谱法精制(二氯甲烷∶乙酸乙酯=2∶1),得到白色固体状目的产物(4mg)。
1H-NMR(400MHz,CDCl3):1.1-1.4(19H,m),2.1(1H,m),2.4(2H,m),2.6(1H,m),3.3-3.6(6H,m),3.8(6H,s),4.0-4.6(4H,m),6.2(1H,s),6.8(4H,m),7.2-7.5(9H,m),8.1(1H,s).
(实施例28)
2’-O,4’-C-亚乙基鸟嘌呤核苷
(示例化合物编号1-5)
将实施例25中得到的化合物(0.5mg)溶解在饱和氨/甲醇溶液(0.5ml)中,在60℃下使之反应5小时。
反应结束后,减压蒸馏除去溶剂,得到白色粉末(0.4mg)。
FAB-MAS(mNBA):310(M+H)+UV(λmax):255(pH7),256(pH1),258-266(pH13)
(实施例29)
(低聚核苷酸类似物的合成)
使用核酸合成机(Perkin Elmer公司制,ABI 392型DNA/RNA合成机),以1.0μmol的规模进行。各合成周期中的溶剂、试剂、亚磷酰胺的浓度与合成天然低聚核苷酸的情况相同,溶剂、试剂、天然型核苷的亚磷酰胺全部使用PE Biosystems公司生产的物质。通过三氯乙酸脱去3’-羟基结合在CPG支持体上的5’-O-DMTr-胸腺嘧啶核苷(1.0μmol)的保护基DMTr基团,使用天然核苷酸合成用的4种核酸碱基构成的酰亚胺(amidite)以及实施例9的化合物与其5’-羟基反复进行缩合反应,合成各种序列的改性低聚核苷酸类似物。合成周期如下所述。
合成周期
1)脱三苯甲基(detritylation)三氯乙酸/二氯甲烷;35秒
2)偶联(coupling)亚磷酰胺(约20eq)、四唑/乙腈;25秒或10分钟
3)封端(capping)1-甲基咪唑/四氢呋喃、乙酸酐/吡啶/四氢呋喃;15秒
4)氧化(oxidation)碘/水/吡啶/四氢呋喃;15秒
上述周期2)使用实施例9的化合物进行反应时,反应10分钟,使用其它亚磷酰胺时,反应25秒。
合成具有目的序列的低聚核苷酸类似物,进行到合成周期的1)脱去保护基5’-DMTr基后,按照常规方法,用浓氨水处理,使低聚物从支持体上脱离,同时使磷酸基上的保护基氰基乙基脱离,再脱去腺嘌呤、鸟嘌呤、胞嘧啶的氨基的保护基。
得到的低聚核苷酸类似物通过反相HPLC(HPLC:岛津制作所制LC-VP,柱:和光纯药制Wakopak WS-DNA)进行精制,得到目的低聚核苷酸。
按照本合成方法,得到具有以下序列,碱基编号4至9的胸腺嘧啶核苷的糖部分为2’-O,4’-C-亚乙基的低聚核苷酸类似物(以下,称为“低聚核苷酸(1)”)(收量0.23μmol(收率23%))
5’-gcgttttttgct-3’(序列表的序列号2)
(参考例1)
3,5-二-O-苯甲基-4-三氟甲磺酰氧基甲基-1,2-O-异亚丙基-α-D-赤型五呋喃糖
在氮气流下,将3,5-二-O-苯甲基-4-羟甲基-1,2-O-异亚丙基-α-D-赤型五呋喃糖(2000mg,5.0mmol)溶解在无水二氯甲烷50ml中,冷却至-78℃。向其中加入无水吡啶(0.60ml,7.5mmol)和三氟甲磺酸酐(1010mg,6.0mmol),然后搅拌40分钟。
反应结束后,向反应液中加入碳酸氢钠饱和水溶液(约100ml),分离各层,用碳酸氢钠饱和水溶液(约100ml)、饱和食盐水(约100ml)洗涤有机层,用无水硫酸镁干燥。减压蒸馏除去溶剂,得到白色粉末(2520mg,4.73mmol,95%),将其直接用于以下的反应。
1H-NMR(400MHz,CDCl3):1.34(3H,s),1.63(3H,s),3.48(1H,d,10Hz),3.53(1H,d,10Hz),4.21(1H,d,5.0Hz),4.5(4H,m),4.74(1H,d,12Hz),4.80(1H,d,12Hz),5.01(1H,d,12Hz),5.73(1H,d,4.6Hz),7.3(10H,m).
(参考例2)
3,5-二-O-苯甲基-4-氰基甲基-1,2-O-异亚丙基-α-D-赤型五呋喃糖
向参考例1中得到的化合物(2520mg,4.73mmol)中加入二甲基亚砜(50ml),在90℃下溶解。返回室温后,加入氰化钠(463mg,9.46mmol),在50℃下搅拌3小时。
反应结束后,向反应液中加入水(约100ml)和乙酸乙酯(约100ml),分离各层,用饱和食盐水(约100ml)洗涤有机层,用无水硫酸镁干燥。
减压蒸馏除去溶剂后,将得到的残渣用硅胶色谱法精制(己烷∶乙酸乙酯=4∶1),得到无色油状物质(1590mg,3.89mmol,82%)。
1H-NMR(400MHz,CDCl3):1.34(3H,s),1.62(3H,s),2.88(1H,d,17Hz),3.15(1H,d,17Hz),3.50(1H,d,10Hz),3.58(1H,d,10Hz),4.08(1H,d,5.1Hz),4.52(1H,d,12Hz),4.56(1H,d,12Hz),4.57(1H,m),4.58(1H,d,12Hz),4.76(1H,d,12Hz),5.73(1H,d,3.7Hz),7.3(10H,m).
(参考例3)
3,5-二-O-苯甲基-4-甲酰基甲基-1,2-O-异亚丙基-α-D-赤型五呋喃糖
在氮气流下,将参考例2中得到的化合物(610mg,1.49mmol)溶解在二氯甲烷(10ml)中,冷却至-78℃。向其中缓慢滴加1.5M氢化二异丁基铝/甲苯溶液(2ml,3.0mmol),在-78℃下搅拌1小时。然后返回至室温,向反应液中加入甲醇(5ml),再加入饱和氯化铵水溶液(约20ml),搅拌30分钟。
反应结束后,向反应液中加入乙酸乙酯(约30ml),分离各层,用碳酸氢钠饱和水溶液(约30ml)洗涤有机层,接着用饱和食盐水(约30ml)洗涤,用无水硫酸镁干燥。减压蒸馏除去溶剂后,将其直接用于以下的反应。
(参考例4)
3,5-二-O-苯甲基-4-羟乙基-1,2-O-异亚丙基-α-D-赤型五呋喃糖
将参考例3中得到的化合物(154mg,0.377mmol)溶解在乙醇5ml中,加入NaBH4(7.6mg,0.2mmol),然后在室温下搅拌1小时。
反应结束后,向反应液中加入乙酸乙酯(约10ml)和水(约10ml),分离各层,用饱和食盐水(约10ml)洗涤有机层,用无水硫酸镁干燥。
减压蒸馏除去溶剂后,将得到的残渣用硅胶色谱法精制(己烷∶乙酸乙酯=2∶1),得到无色油状物质(117mg,0.284mmol,75%)。
1H-NMR(400MHz,CDCl3):1.33(3H,s),1.66(3H,s),1.78(1H,ddd,4.0,8.5,15Hz),2.51(1H,ddd,3.4,6.4,15Hz),3.31(1H,d,10Hz),3.54(1H,d,10Hz),3.80(2H,m),4.13(1H,d,5.3Hz),4.43(1H,d,12Hz),4.52(1H,d,12Hz),4.55(1H,d,12Hz),4.65(1H,dd,4.0,5.3Hz),4.77(1H,d,12Hz),5.77(1H,d,4.0Hz),7.3(10H,m).
FABMS(mNBA):415(M+H)+,[α]D+57.4°(0.91,甲醇).
(参考例5)
3,5-二-O-苯甲基-4-甲酰基-1,2-O-异亚丙基-α-D-赤型五呋喃糖
在氮气流下,向冷却至-78℃的无水二氯甲烷(200ml)中加入草酰氯(6.02ml,69.0mmol),向其中滴加溶解在无水二氯甲烷(100ml)中的二甲基亚砜(7.87ml,110mmol)。搅拌20分钟后,向反应液中滴加溶解在无水二氯甲烷(100ml)中的3,5-二-O-苯甲基-1,2-O-异亚丙基-α-D-赤型五呋喃糖(9210mg,23.02mmol),再搅拌30分钟。另外再加入三乙胺(28ml,200mmol),缓慢恢复到室温。向反应液中加入水(约300ml),分离各层,用水(约300ml)、饱和食盐水(约300ml)洗涤有机层,用无水硫酸镁干燥。减压蒸馏除去溶剂后,用硅胶色谱法精制(己烷∶乙酸乙酯=5∶1),得到无色油状物质(8310mg,20.88mmol,91%)。
1H-NMR(400MHz,CDCl3):1.35(3H,s),1.60(3H,s),3.61(1H,d,11Hz),3.68(1H,d,11Hz),4.37(1H,d,4.4Hz),4.46(1H,d,12Hz),4.52(1H,d,12Hz),4.59(1H,d,12Hz),4.59(1H,dd,3.4,4.4Hz),4.71(1H,d,12Hz),5.84(1H,d,3.4Hz),7.3(10H,m),9.91(1H,s).FABMS(mNBA):397(M-H)+,421(M+Na)+,[α]D+27.4°(0.51,甲醇).
(参考例6)
3,5-二-O-苯甲基-4-乙烯基-1,2-O-异亚丙基-α-D-赤型五呋喃糖
在氮气流下,将参考例5中得到的化合物(8310mg,20.88mmol)溶解在无水四氢呋喃(300ml)中,冷却至0℃。向其中滴加0.5M Tebbe试剂/甲苯溶液(44ml,22mmol)后,在0℃下搅拌1小时。
反应结束后,加入乙醚(300ml)后,缓慢加入0.1N氢氧化钠水溶液(20ml)。用硅藻土过滤得到的析出物,用乙醚(约100ml)洗涤滤取物,分离各层,用无水硫酸镁干燥有机层。减压蒸馏除去溶剂后,将得到的残渣用氧化铝(碱性)色谱法粗精制(二氯甲烷),再将得到的粗精制产物用硅胶色谱法进一步精制(己烷∶乙酸乙酯=8∶1,其后5∶1),得到无色油状物质(5600mg,14.14mmol,68%)。
1H-NMR(400MHz,CDCl3):1.28(3H,s),1.52(3H,s),3.31(1H,d,11Hz),3.34(1H,d,11Hz),4.25(1H,d,4.9Hz),4.40(1H,d,12Hz),4.52(1H,d,12Hz),4.57(1H,dd,3.9,4.9Hz),4.59(1H,d,12Hz),4.76(1H,d,12Hz),5.25(1H,d d,1.8,11Hz),5.52(1H,dd,1.8,18Hz),5.76(1H,d,3.9Hz),6.20(1H,dd,11,18Hz),7.3(10H,m).FABMS(mNBA):419(M+Na)+.
(参考例7)
3,5-二-O-苯甲基-4-羟乙基-1,2-O-异亚丙基-α-D-赤型五呋喃糖
在氮气流下,将参考例6中得到的化合物(5500mg,13.89mmol)溶解在无水四氢呋喃(200ml)中,向其中滴加0.5M的9-BBN(9-硼二环[3.3.1]壬烷)/四氢呋喃溶液(80ml,40mmol),然后在室温下搅拌过夜。
加入水,直到反应液中没有气泡产生之后,加入3N氢氧化钠水溶液(30ml)。再缓慢加入30%过氧化氢水溶液(30ml),使反应液达到30至50℃,之后搅拌30分钟。
反应结束后,向反应混合物中加入饱和食盐水(约200ml)和乙酸乙酯(约200ml),分离各层,用中性磷酸缓冲液(约200ml)洗涤有机层,接着用饱和食盐水(约200ml)洗涤,用无水硫酸镁干燥。减压蒸馏除去溶剂后,将得到的残渣用硅胶色谱法精制(己烷∶乙酸乙酯=2∶1,然后1∶1),得到无色油状物质(5370mg,12.97mmol,93%)。
1H-NMR(400MHz,CDCl3):1.33(3H,s),1.66(3H,s),1.78(1H,ddd,4.0,8.5,15Hz),2.51(1H,ddd,3.4,6.4,15Hz),3.31(1H,d,10Hz),3.54(1H,d,10Hz),3.80(2H,m),4.13(1H,d,5.3Hz),4.43(1H,d,12Hz),4.52(1H,d,12Hz),4.55(1H,d,12Hz),4.65(1H,dd,4.0,5.3Hz),4.77(1H,d,12Hz),5.77(1H,d,4.0Hz),7.3(10H,m).FABMS(mNBA):415(M+H)+,[α]D+57.4(0.91,甲醇).
(参考例8)
3,5-二-O-苯甲基-4-(对甲苯磺酰氧基乙基)-1,2-O-异亚丙基-α-D-赤型五呋喃糖
在氮气流下,将与甲苯共沸了的参考例4中得到的化合物(1035mg,2.5mmol)溶解在无水二氯甲烷(35ml)中,冷却至0℃。向其中加入三乙胺(1.8ml,13mmol)、二甲氨基吡啶(30mg,0.25mmol)、对甲苯磺酰氯(858mg,4.5mmol),然后在室温下搅拌过夜。
反应结束后,向反应液中加入碳酸氢钠饱和水溶液(约100ml),分离各层,用碳酸氢钠饱和水溶液(约100ml)、饱和食盐水(约100ml)洗涤有机层,用无水硫酸镁干燥。
减压蒸馏除去溶剂后,将得到的残渣用硅胶色谱法精制(己烷∶乙酸乙酯=3∶1),得到无色油状物质(1340mg,2.6mmol,94%)。
1H-NMR(400MHz,CDCl3):1.33(3H,s),1.49(3H,s),1.99(1H,dt,7.6 and 15Hz),2.47(3H,s),2.60(1H,ddd,5.7,7.6,15Hz),3.28(1H,d,10Hz),3.45(1H,d,10Hz),4.11(1H,d,5.3Hz),4.32(2H,m),4.42(1H,d,12Hz),4.50(1H,d,12Hz),4.54(1H,d,12Hz),4.62(1H,dd,4.0,5.2Hz),4.76(1H,d,12Hz),5.74(1H,d,4.0Hz),7.3(12H,m),7.78(2H,d,8.3Hz).FAB-MAS(mNBA):569(M+H)+
(参考例9)
1,2-二-O-乙酰基-3,5-O-苯甲基-4-(对甲苯磺酰氧基乙基)-α-D-赤型五呋喃糖
将参考例8中得到的化合物1340mg(2.36mmol)溶解于乙酸15ml中,加入乙酸酐1.88ml(20mmol)、浓硫酸0.01ml,在室温下搅拌1小时。将反应液倒入冰水60ml中,再搅拌30分钟。加入饱和食盐水(约100ml)、乙酸乙酯(约100ml),用中性磷酸缓冲液、碳酸氢钠饱和水溶液、饱和食盐水洗涤有机层,用无水硫酸镁干燥。蒸馏除去溶剂后,将得到的残渣用硅胶柱色谱法精制(己烷∶乙酸乙酯=2∶1),得到无色油状物质1290mg(2.11mmol,89%,α∶β=1∶5)。
1H-NMR(400MHz,CDCl3):(β体)1.86(3H,s),2.05(3H,s),2.08(1H,m),2.18(1H,m),2.42(3H,s),3.30(1H,d,10Hz),3.33(1H,d,10Hz),4.23(1H,d,5.1Hz),4.24(2H,m),4.42(2H,s),4.45(1H,d,12Hz),4.55(1H,d,12Hz),5.28(1H,d,5.1Hz),6.01(1H,s),7.3(12H,m),7.73(2H,d,8.3Hz).FAB-MAS(mNBA):613(M+H)+
(参考例10)
2’-O-乙酰基-3’,5’-二-O-苯甲基-4’-对甲苯磺酰氧基乙基-5-甲基尿嘧啶核苷
在氮气流下,室温下将参考例9中得到的化合物(650mg,1.06mmol)溶解于无水1,2-二氯乙烷(15ml)中,向其中加入按照上述文献(H.Vorbrggen,K.Krolikiewicz and B,Bennua,Chem.Ber.,114,1234-1255(1981))制备的三甲基甲硅烷基化胸腺嘧啶(500mg,约2mmol),再向其中滴加三氟甲磺酸三甲基甲硅烷基酯(0.36ml,2mmol),然后在50℃下搅拌1小时。
反应结束后,向反应液中加入碳酸氢钠饱和水溶液(约50ml),用硅藻土过滤,在滤液中加入二氯甲烷(约50ml),用碳酸氢钠饱和水溶液(约50ml)、饱和食盐水(约50ml)洗涤有机层后,用无水硫酸镁干燥。减压蒸馏除去溶剂后,将得到的残渣用硅胶柱色谱法精制(己烷∶乙酸乙酯=1.2∶1),得到无定形的无色物质(432mg,0.46mmol,60%)。
1H-NMR(400MHz,CDCl3):1.52(3H,d,0.9Hz),1.94(1H,dt,7.5和15Hz),2.06(3H,s),2.23(1H,dt,6.0 and 15Hz),2.42(3H,s),3.38(1H,d,10Hz),3.67(1H,d,10Hz),4.17(2H,m),4.36(1H,d,6.0Hz),4.41(1H,d,12Hz),4.44(1H,d,12Hz),4.48(1H,d,12Hz),4.58(1H,d,12Hz),5.39(1H,dd,5.1 and 6.0Hz),6.04(1H,d,5.1Hz),7.3(12H,m),7.73(2H,dt,1.8 and 8.3Hz),8.18(1H,s).FAB-MAS(mNBA):679(M+H)+
(参考例11)
2’-O-乙酰基-3’,5’-二-O-苯甲基-4’-对甲苯磺酰氧基乙基-4-N-苯甲酰基胞嘧啶核苷
将参考例9中得到的化合物(383mg,0.626mmol)溶解于无水1,2-二氯乙烷(4ml)中。向其中加入按照上述文献(H.Vorbrggen,K.Krolikiewicz and B,Bennua,Chem.Ber.,114,1234-1255(1981))制备的三甲基甲硅烷基化苯甲酰基胞嘧啶(300mg,约1.0mmol),冷却至0℃,再加入三氟甲磺酸三甲基甲硅烷基酯(0.18ml,0.995mmol),之后,在50℃下搅拌1小时。使反应液恢复到室温,加入饱和碳酸氢钠水溶液(约10ml)。
反应结束后,在反应混合物中加入二氯甲烷(约20ml),搅拌,用硅藻土过滤析出的白色不溶物。从得到的滤液中分离有机层,用饱和食盐水(约20ml)洗涤有机层,用无水硫酸镁干燥。减压蒸馏除去溶剂,得到无色无定形的物质(397mg,83%)。
1H-NMR(400MHz,CDCl3):8.70(1H,br),8.18(1H,d,7.4Hz),7.87(2H,d,7.5Hz),7.72(2H,d,8.3Hz),7.61-7.57(1H,m),7.51-7.48(2H,m),7.43-7.21(13H,m),6.02(1H,d,2.9Hz),5.40(1H,dd,5.8,2.9Hz),4.57(1H,d,11Hz),4.39(1H,d,11Hz),4.32-4.28(3H,m),4.19-4.16(2H,m),3.69(1H,d,11Hz),3.31(1H,d,11Hz),2.40(3H,s),2.30-2.23(1H,m),2.06(3H,s),1.95-1.89(1H,m)
FAB-MAS(mNBA):768(M+H)+
(参考例12)
2’-O-乙酰基-3’,5’-二-O-苯甲基-4-对甲苯磺酰氧基乙基-6-N-苯甲酰基腺嘌呤核苷
在氮气流下,在室温下将参考例9中得到的化合物(600mg,0.98mmol)溶解于无水1,2-二氯乙烷(15ml)中,向其中加入按照上述文献(H.Vorbrggen,K.Krolikiewicz and B,Bennua,Chem.Ber.,114,1234-1255(1981))制备的三甲基甲硅烷基化苯甲酰基腺嘌呤(500mg,约2mmol)。向得到的反应液中滴加三氟甲磺酸三甲基甲硅烷基酯(0.36ml,2mmol)后,在50℃下搅拌4小时。
反应结束后,向反应液中加入碳酸氢钠饱和水溶液(约50ml),再加入二氯甲烷(约50ml),分离各层,用碳酸氢钠饱和水溶液(约50ml)洗涤有机层,接着用饱和食盐水(约50ml)洗涤后,用无水硫酸镁干燥。减压蒸馏除去溶剂后,将得到的残渣用硅胶柱色谱法精制(二氯甲烷∶甲醇=50∶1),得到无定形的无色物质(405mg,0.51mmol,52%)。
1H-NMR(400MHz,CDCl3):2.0(1H,m),2.06(3H,s),2.32(1H,dt,6.0和15Hz),2.40(3H,s),3.36(1H,d,10Hz),3.58(1H,d,10Hz),4.22(2H,m),4.39(1H,d,12Hz),4.45(1H,d,12Hz),4.47(1H,d,12Hz),4.59(1H,d,12Hz),4.62(1H,d,5.6Hz),5.94(1H,dd,4.5和5.6Hz),6.21(1H,d,4.5Hz),7.2-7.3(12H,m),7.54(2H,m),7.62(1H,dt,1.2和6.2Hz),7.72(2H,d,8.3Hz),8.02(2H,m),8.21(1H,s),8.75(1H,s),8.97(1H,brs).FAB-MAS(mNBA):792(M+H)+
(参考例13)
2’-O-乙酰基-3’,5’-二-O-苯甲基-4’-对甲苯磺酰氧基乙基-尿嘧啶核苷
在氮气流下,在室温下将参考例9中得到的化合物(200mg,0.327mmol)溶解于无水1,2-二氯乙烷(8ml)中,向其中加入按照上述文献(H.Vorbrggen,K.Krolikiewicz and B,Bennua,Chem.Ber.,114,1234-1255(1981))制备的三甲基甲硅烷基化尿嘧啶(200mg,约0.8mmol)。再向其中滴加三氟甲磺酸三甲基甲硅烷基酯(0.145ml,0.8mmol),然后在70℃下搅拌1小时。
反应结束后,向反应液中加入碳酸氢钠饱和水溶液(约10ml),用硅藻土过滤,在滤液中加入二氯甲烷(约10ml),用碳酸氢钠饱和水溶液、饱和食盐水洗涤有机层后,用无水硫酸镁干燥。减压蒸馏除去溶剂后,将得到的残渣用硅胶柱色谱法精制(二氯甲烷∶甲醇=100∶2),得到油状无色物质(199mg,0.299mmol,92%)。
1H-NMR(400MHz,CDCl3):1.94(1H,dt,7.4和15Hz),2.07(3H,s),2.23(1H,dt,5.9和15Hz),2.43(3H,s),3.36(1H,d,10Hz),3.65(1H,d,10Hz),4.17(2H,dd,6和7Hz),4.31(1H,d,5.9Hz),4.38(1H,d,11Hz),4.39(1H,d,11Hz),4.40(1H,d,11Hz),4.58(1H,d,11Hz),5.29(1H,dd,2.4和8.2Hz),5.33(1H,dd,4.5和6Hz),6.00(1H,d,4.5Hz),7.2-7.4(12H,m),7.61(1H,d,8.2Hz),7.74(1H,d,8.3Hz),8.14(1H,brs).
FAB-MAS(mNBA):665(M+H)+
(参考例14)
2’-O-乙酰基-3’,5’-二-O-苯甲基-4’-对甲苯磺酰氧基乙基-4-N-苯甲酰基-5-甲基胞嘧啶核苷
将参考例9中得到的化合物(400mg,0.653mmol)溶解于无水1,2-二氯乙烷(6ml)中,向其中加入按照上述文献(H.Vorbrggen,K.Krolikiewicz and B,Bennua,Chem.Ber.,114,1234-1255(1981))制备的三甲基甲硅烷基化苯甲酰基5-甲基胞嘧啶(约400mg,约1.2mmol),冷却至0℃,再滴加三氟甲磺酸三甲基甲硅烷基酯(180μl,1.0mmol),然后在50℃下搅拌1小时。使反应液恢复至室温,加入饱和碳酸氢钠水溶液(约5ml)。
反应结束后,向反应混合物中加入二氯甲烷(约10ml),搅拌,用硅藻土过滤析出的白色不溶物。由得到的滤液中分离出有机层,用饱和食盐水洗涤有机层,用无水硫酸镁干燥。减压蒸馏除去溶剂,得到无色的无定形物质(320mg,0.409mmol,63%)。
1H-NMR(400MHz,CDCl3):1.68(3H,s),1.95(1H,dt,7.3和15Hz),2.07(3H,s),2.25(1H,dt,6和15Hz),2.43(3H,s),3.40(1H,d,10Hz),3.71(1H,d,10Hz),4.18(2H,m),4.37(1H,d,5.8Hz),4.42(1H,d,12Hz),4.46(1H,d,12Hz),4.51(1H,d,12Hz),4.61(1H,d,12Hz),5.42(1H,dd,4.9和5.8Hz),6.07(1H,d,4.9Hz),7.2-7.6(17H,m),7.74(2H,d,8.3Hz),8.28(2H,d,7.0Hz).FAB-MAS(mNBA):782(M+H)+
(参考例15)
2’-O-乙酰基-3’,5’-二-O-苯甲基-4’-对甲苯磺酰氧基乙基-2-N-异丁酰基鸟嘌呤核苷
在氮气流下,在室温下将参考例9中得到的化合物(400mg,0.65mmol)溶解于无水1,2-二氯乙烷(10ml)中,向其中加入按照上述文献(H.Vorbrggen,K.Krolikiewicz and B,Bennua,Chem.Ber.,114,1234-1255(1981))制备的三甲基甲硅烷基化异丁酰基鸟嘌呤核苷(约650mg,约1.5mmol)。向得到的反应液中滴加三氟甲磺酸三甲基甲硅烷基酯(0.2ml,1.2mmol),然后在50℃下搅拌4小时。
反应结束后,向反应液中加入碳酸氢钠饱和水溶液(约5ml),分离各层,用碳酸氢钠饱和水溶液洗涤有机层,接着用饱和食盐水洗涤后,用无水硫酸镁干燥。减压蒸馏除去溶剂后,直接用于以下的反应。
(试验例1)
(Tm测定试验)
将最终浓度分别为NaCl 100mM、磷酸钠缓冲液(pH7.2)10mM、低聚核苷酸(1)4μM、其互补链(具有序列:5’-agcaaaaaacgc-3’(序列表的序列号1)所示序列的互补型DNA(以下称为“低聚核苷酸(2)”,或具有序列:5’-agcaaaaaacgc-3’(序列表的序列号1)所示序列的互补型RNA(以下称为“低聚核苷酸(3)”))4μM的试样溶液(1000ml)置于沸水浴中,用大约2小时缓慢冷却到室温。使用分光光度计(岛津UV-3100PC)加温测定试样溶液。试样在比色杯(比色杯厚1.0cm,圆筒套型)内通过用恒温箱(EKO公司制,Haake FE2)加温的循环水加温,使用数字温度计(SATOSK1250MC)监控温度。使温度由20℃上升至95℃,每隔1℃测定260nm附近的最大吸收波长处的紫外吸收强度。作为对照,使用与低聚核苷酸(1)(实施例29的化合物)具有相同序列:5’-gcgttttttgct-3’(序列表的序列号2)的天然型DNA(以下,称为“低聚核苷酸(4)”),进行同样的操作。
以每1℃的变化量达到最大的温度作为Tm(熔化温度),评价该温度下低聚核苷酸类似物形成互补链的能力。
以下,表示低聚核苷酸(4)(天然型DNA)和低聚核苷酸(1)(实施例29的化合物)对低聚核苷酸(2)(互补型DNA)和低聚核苷酸(3)(互补型RNA)的Tm测定结果。
〔表3〕
 化合物   Tm(℃)
  低聚核苷酸(2)   低聚核苷酸(3)
 低聚核苷酸(4)低聚核苷酸(1)   4861   4475
由上述可以得知,本发明的低聚核苷酸类似物与天然型DNA相比,Tm显著高,表明形成互补链的能力强。
(试验例2)
(核酸酶耐受性的测定)
向37℃下保存15分钟的低聚核苷酸的缓冲溶液中混入核酸外切酶或核酸内切酶。将混合液保持在37℃,一定时间后,取出一部分混合液,加入乙二胺四乙酸(EDTA),在100℃下加热2分钟,使反应停止。用反相高效液相柱色谱法定量测定混合液中低聚核苷酸的残余量,测定核酸酶存在下的低聚核苷酸量的经时变化。
本发明的低聚核苷酸类似物显示显著的核酸酶耐受性。
〔工业实用性〕
本发明的新型核苷酸类似物以及核苷类似物作为稳定且优良的反义或抗基因药物、特定基因的检测剂(探测剂)或用作引发扩增的引物及其制备中间体是有用的。
序列表
SEQUENCE LISTING
<110>Sankyo Company,Limited
<120>新型核苷及核苷酸衍生物
<130>FP200013
<140>
<141>
<150>JP HEI11-33863
<151>1999-02-12
<160>2
<170>PatentIn Ver.2.0
<210>1
<211>12
<212>DNA
<213>Artificial Sequence
<214>人工序列
<220>
<223>人工序列描述:用于测试Tm值的合成的低聚核苷酸
<400>1
agcaaaaaac gc                                            12
<210>2
<211>12
<212>DNA
<213>Artificial Sequence
<214>人工序列
<220>
<223>人工序列描述:用于测试Tm值的合成的低聚核苷酸
<400>2
gcgttttttg ct                                            12

Claims (11)

1、通式(1)表示的化合物或其盐,
Figure C008056270002C1
式中,R1和R2相同或不同,表示氢原子、苯甲基、二甲氧基三苯甲基或-P(R3)R4,其中,R3和R4相同或不同,表示2-氰基乙氧基或二异丙基氨基;
A表示亚甲基,
B表示具有至少1个选自羟基、氨基、苯甲酰基氨基、异丁酰基氨基和甲基的取代基的取代的嘌呤-9-基或2-氧代-嘧啶-1-基。
2、根据权利要求1所述的化合物或其盐,其中R1为氢原子、苯甲基或二甲氧基三苯甲基。
3、根据权利要求1或2所述的化合物或其盐,其中R2为氢原子、苯甲基或-P(OC2H4CN)(N(CH(CH3)2)2)。
4、根据权利要求1所述的化合物或其盐,其中B为6-苯甲酰基氨基嘌呤-9-基、腺嘌呤基、2-异丁酰基氨基-6-羟基嘌呤-9-基、鸟嘌呤基、2-氧代-4-苯甲酰基氨基-嘧啶-1-基、胞嘧啶基、2-氧代-5-甲基-4-苯甲酰基氨基-嘧啶-1-基、5-甲基胞嘧啶基、尿嘧啶基或胸腺嘧啶基。
5、由下述组中选择的化合物或其盐,
2’-O,4’-C-亚乙基鸟嘌呤核苷、
2’-O,4’-C-亚乙基腺嘌呤核苷、
3’,5’-二-O-苯甲基-2’-O,4’-C-亚乙基-6-N-苯甲酰基腺嘌呤核苷、
3’,5’-二-O-苯甲基-2’-O,4’-C-亚乙基-2-N-异丁酰基鸟嘌呤核苷、
5’-O-二甲氧基三苯甲基-2’-O,4’-C-亚乙基-6-N-苯甲酰基腺嘌呤核苷、
5’-O-二甲氧基三苯甲基-2’-O,4’-C-亚乙基-2-N-异丁酰基鸟嘌呤核苷、
2’-O,4’-C-亚乙基-2-N-异丁酰基鸟嘌呤核苷、
2’-O,4’-C-亚乙基-6-N-苯甲酰基腺嘌呤核苷、
5’-O-二甲氧基三苯甲基-2’-O,4’-C-亚乙基-6-N-苯甲酰基腺嘌呤核苷-3’-O-(2-氰基乙基N,N-二异丙基)亚磷酰胺、
5’-O-二甲氧基三苯甲基-2’-O,4’-C-亚乙基-2-N-异丁酰基鸟嘌呤核苷-3’-O-(2-氰基乙基N,N-二异丙基)亚磷酰胺、
2’-O,4’-C-亚乙基尿嘧啶核苷、
2’-O,4’-C-亚乙基-5-甲基尿嘧啶核苷、
2’-O,4’-C-亚乙基胞嘧啶核苷、
2’-O,4’-C-亚乙基-5-甲基胞嘧啶核苷、
3’,5’-二-O-苯甲基-2’-O,4’-C-亚乙基尿嘧啶核苷、
5’-O-二甲氧基三苯甲基-2’-O,4’-C-亚乙基尿嘧啶核苷、
3’,5’-二-O-苯甲基-2’-O,4’-C-亚乙基-5-甲基尿嘧啶核苷、
5’-O-二甲氧基三苯甲基-2’-O,4’-C-亚乙基-5-甲基尿嘧啶核苷、
3’,5’-二-O-苯甲基-2’-O,4’-C-亚乙基-4-N-苯甲酰基胞嘧啶核苷、
5’-O-二甲氧基三苯甲基-2’-O,4’-C-亚乙基-4-N-苯甲酰基胞嘧啶核苷、
3’,5’-二-O-苯甲基-2’-O,4’-C-亚乙基-4-N-苯甲酰基-5-甲基胞嘧啶核苷、
5’-O-二甲氧基三苯甲基-2’-O,4’-C-亚乙基-4-N-苯甲酰基-5-甲基胞嘧啶核苷、
2’-O,4’-C-亚乙基-4-N-苯甲酰基胞嘧啶核苷、
2’-O,4’-C-亚乙基-4-N-苯甲酰基-5-甲基胞嘧啶核苷、
5’-O-二甲氧基三苯甲基-2’-O,4’-C-亚乙基-尿嘧啶核苷-3’-O-(2-氰基乙基N,N-二异丙基)亚磷酰胺、
5’-O-二甲氧基三苯甲基-2’-O,4’-C-亚乙基-5-甲基尿嘧啶核苷-3’-O-(2-氰基乙基N,N-二异丙基)亚磷酰胺、
5’-O-二甲氧基三苯甲基-2’-O,4’-C-亚乙基-4-N-苯甲酰基胞嘧啶核苷-3’-O-(2-氰基乙基N,N-二异丙基)亚磷酰胺、以及
5’-O-二甲氧基三苯甲基-2’-0,4’-C-亚乙基-4-N-苯甲酰基-5-甲基胞嘧啶核苷-3’-O-(2-氰基乙基N,N-二异丙基)亚磷酰胺。
6、具有2-50个通过磷酸二酯键结合的核苷酸的低聚核苷酸类似物、或其磷酸二酯键部分被硫代酸酯化的硫代酸酯衍生物、或其药理上允许的盐,其中两个或两个以上的所述核苷酸具有下述通式(2)所示结构,
Figure C008056270004C1
式中,A表示亚甲基,
B表示具有至少1个选自羟基、氨基、苯甲酰基氨基、异丁酰基氨基和甲基的取代基的取代的嘌呤-9-基或2-氧代-嘧啶-1-基。
7、具有2-50个通过磷酸二酯键结合的核苷酸的低聚核苷酸类似物、或其磷酸二酯键部分被硫代酸酯化的硫代酸酯衍生物、或其药理上允许的盐,其中一个所述的核苷酸具有下述通式(2)所示结构,
Figure C008056270004C2
式中,A表示亚甲基,
B表示具有至少1个选自羟基、氨基、苯甲酰基氨基、异丁酰基氨基和甲基的取代基的取代的嘌呤-9-基或2-氧代-嘧啶-1-基。
8、根据权利要求6或7所述的低聚核苷酸类似物或其药理学上允许的盐,其中B为6-苯甲酰基氨基嘌呤-9-基、腺嘌呤基、2-异丁酰基氨基-6-羟基嘌呤-9-基、鸟嘌呤基、2-氧代-4-苯甲酰基氨基-嘧啶-1-基、胞嘧啶基、2-氧代-5-甲基-4-苯甲酰基氨基-嘧啶-1-基、5-甲基胞嘧啶基、尿嘧啶基或胸腺嘧啶基。
9、一种药物组合物,其中包含有效量的药物学上的活性化合物和载体或稀释剂,其中所述药物学上的活性化合物是按照权利要求6或7所述的低聚核苷酸类似物或其药物学上可接受的盐。
10、权利要求6或7所述的低聚核苷酸类似物或其药物学上可接受的盐用于制备预防或治疗下述疾病的药物的用途,该疾病可以通过所述低聚核苷酸类似物在给药后在患者体内显示药物学上有用的反义活性的能力来预防或治疗。
11、权利要求6或7所述的低聚核苷酸类似物或其药物学上可接受的盐用于制备预防或治疗下述疾病的药物的用途,该疾病可以通过所述低聚核苷酸类似物在给药后在患者体内显示药物学上有用的抗基因活性的能力来预防或治疗。
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