KR102532832B1 - 플라비바이러스 바이러스 유사 입자 - Google Patents
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Abstract
본 출원은 하나 이상의 플라비바이러스 구조 단백질을 포함하는 바이러스 유사 입자, 및 이를 포함하는 조성물 또는 백신, 플라비바이러스 감염의 예방 또는 치료에서의 이의 용도를 제공한다. 플라비바이러스 구조 단백질은 외피 영역 중에 적어도 하나의 아미노산 변형을 함유한다. 플라비바이러스의 예는 뎅기 바이러스를 함유한다.
Description
본 발명은 하나 이상의 플라비바이러스 구조 단백질을 포함하는 바이러스 유사 입자, 및 이를 포함하는 조성물 또는 백신, 의약에서의, 특히 플라비바이러스 감염의 예방 또는 치료에서의 이의 용도에 관한 것이다.
플라비바이러스는 70 가지가 넘는 상이한 바이러스를 포함하며, 이들 중 다수는 절지동물-유래이고, 모기 또는 진드기에 의해 전염된다.
플라비바이러스는 플라비비리다에 (Flaviviridae) 과의 바이러스 속이다. 상기 속은 웨스트 나일 바이러스 (West Nile virus: WNV), 뎅기 바이러스 (DENV), 진드기-유래 뇌염 바이러스 (TBEV), 황열병 바이러스 (YFV), 일본 뇌염 (JEV), C 형 간염 바이러스 (HCV) 및 뇌염 또는 출혈성 질환을 일으킬 수 있는 여러 다른 바이러스를 포함한다.
뎅기열은 플라비바이러스에 의해 야기되는 모기-유래 질환이고, 대부분의 열대 및 많은 아열대 지역에 퍼져있다. 상기 질환은 다음과 같은 4 개의 가깝게 관련된 바이러스: 뎅기 바이러스 1 - 서브유형 I 내지 IV 포함, 뎅기 바이러스 2 - 서브유형 아시아 I 형 (Asian I), 아시아 II 형 (Asian II), 세계형 (Cosmopolitan), 미국형 (American) 및 미국/아시아형 (American/Asian) 포함, 뎅기 바이러스 3 - 서브유형 I 내지 IV 포함, 및 뎅기 바이러스 4 - 서브유형 I 내지 III 포함: 에 의해 야기된다. 뎅기가 전세계적인 질환 발병과 관련하여 가장 중요한 플라비바이러스임에도 불구하고, 상기 바이러스에 대항하는 백신의 개발 및 사용은 지금까지 백신-관련 부작용, 예컨대 감염의 면역 상승이라는 이론적인 위험 및 동시에 모든 4 개의 뎅기 혈청형에 대항하여 오래 지속되는 보호 면역 반응을 유도하는 필요조건에 의해 제한받았다.
효과적인 뎅기 치료법은 없고, 뎅기열에 대항하는 예방은 현재 벡터 통제 측정에만 제한된다. 그러므로 뎅기 백신이 질환의 통제에서 주요한 향상을 나타낼 것이다.
허가받은 뎅기 백신이 이용가능하지 않은 반면, 여러 개의 백신 후보가 현재 임상 연구에서 평가중이다. WHO 는 뎅기의 증가하는 전세계적인 유행에 대한 우려가 증가하며, 안전하고 효과적인 백신이 시급히 요구된다고 발표했다.
(http://www.who.int/immunization/research/development/dengue_vaccines/en/) and Vaccine 30 (2012) 4301-4306)
바이러스-유사 입자 (Virus-like particle: VLP) 는 진정한 고유의 바이러스의 조직 및 형태를 모방하나 임의의 바이러스 게놈을 함유하고 있지 않기 때문에 비-감염성인 다중단백질 구조이고, 잠재적으로 더욱 안전한 백신 후보를 산출한다. 몇몇의 예방적 VLP-기반 백신이 현재 세계적으로 시판된다: GlaxoSmithKline's EngerixR (B 형 간염 바이러스) 및 CervarixR (인간 파필로마바이러스), 및 Merck and Co., Inc.'s Recombivax HBR (B 형 간염 바이러스) 및 GardasilR (인간 파필로마바이러스) 가 몇몇 예이다. 기타 VLP-기반 백신 후보자는 임상 실험중이거나 전임상 평가 중이다 (예컨대 인플루엔자 바이러스, 파보바이러스, 노워크 (Norwalk) 및 다양한 키메라성 VLP). 많은 다른 것들이 전임상 실험에서의 성공에도 불구하고, 여전히 소규모 기본 연구에 제한된다. 대규모 VLP 제조의 영향은 공정 통제, 모니터링 및 최적화의 문맥에서 논의된다. 주요한 업-스트림 및 다운-스트림 기술적 도전이 확인되고 따라서 논의된다. 성공적인 VLP-기반 백신 블록버스터는 부수적으로 임상 실험으로부터의 최신 결과 및 치료적 또는 예방적 백신화를 위한 키메라성 VLP-기반 기술에서의 최근의 발달과 함께 간략하게 제시된다.
지금까지, VLP-기반 백신은 인간 및 다른 동물을 감염시키는 30 가지가 넘는 상이한 바이러스에 대해 제조되었다. 그 예에는 AAV (Adeno-associated virus: 아데노-연관 바이러스), H5N3 (Avian influenza: 조류 인플루엔자), BFDV (Budgerigar fledgling disease virus: 어린 잉꼬병 바이러스), BTV (Bluetongue virus: 청설병 바이러스), 에볼라 (Ebola), 엔테로바이러스 71 (Enterovirus 71), GHPV (Goose hemorrhagic polyoma virus: 거위 출혈 폴리오마 바이러스), HBV (B 형 간염 바이러스), HCV (C 형 간염 바이러스), HDV (δ 형 간염 바이러스), HEV (E 형 간염 바이러스), HIV, HPV (인간 파필로마바이러스), IBDV (Infectious bursal disease virus: 감염성 윤활낭병 바이러스), 인플루엔자 A (Influenza A), 인플루엔자 A H1N1, 인플루엔자 A H3N2, JC 폴리마바이러스, 마르구르그 (Margurg), MS2, IPCV (Indian peanut clump virus: 인도 땅콩 덤불 바이러스), NDV (Newcastle disease virus: 뉴캐슬 질환 바이러스), No (Norovirus: 노로바이러스) Nv (Norwalk virus: 노워크 바이러스), PhMV (Physalis mottle virus: 꽈리 반점 바이러스), 폴리마바이러스, PPV (Porcine parvovirus: 돼지 파보바이러스), RHDV (Rabbit hemorrhagic disease virus: 토끼 출혈병 바이러스), 로타바이러스 (Rotavirus), SARS, SIV (Simian immunodeficiency virus: 유인원 면역결핍 바이러스), SV40 (Simian virus 40: 유인원 바이러스 40), SVDV (Swine vesicular disease virus: 돼지 수포병 바이러스) 등이 포함된다. (Expert Rev. Vaccines 9(10), 1149-1176, 2010).
[비특허문헌]
[NPTL1]Vaccine 30 (2012) 4301-4306
[NPTL2] Expert Rev. Vaccines 9(10), 1149-1176, 2010
제 1 양상에서, 본 출원은 플라비바이러스 구조 단백질의 외피 영역이 아미노산 서열 중에 적어도 하나의 변형을 함유하는, 하나 이상의 플라비바이러스 구조 단백질을 포함하는 바이러스 유사 입자를 제공한다.
제 2 양상에서, 본 출원은 본 출원의 제 1 양상에서 제공되는 바이러스 유사 입자 내에 함유되는 플라비바이러스 구조 단백질을 엔코딩하는 뉴클레오티드 서열을 포함하는 또는 이것으로 이루어지는 핵산 분자를 제공한다.
제 3 양상에서, 본 출원은 제 1 양상에서 제공되는 바이러스 유사 입자 및/또는 제 2 양상에서 제공되는 핵산 분자를 포함하는 조성물 또는 백신을 제공한다.
제 4 양상에서, 본 출원은 본 출원의 제 1 양상에서 제공되는 바이러스 유사 입자 및/또는 본 출원의 제 2 양상에서 제공되는 핵산 분자를 포유류와 접촉시키는 것을 포함하는, 항체 또는 중화 항체를 포함하는 항-혈청의 제조 방법을 제공한다.
제 5 양상에서, 본 출원은 본 출원의 제 3 양상에서 제공되는 조성물을 포유류에게 투여하는 것을 포함하는, 플라비바이러스 감염을 치료 또는 예방하는 방법 또는 포유류에서 플라비바이러스에 대항하는 면역 반응을 유도 및/또는 향상시키는 방법을 제공한다.
제 6 양상에서, 본 출원은 바이러스 유사 입자 내에 함유된 적어도 하나의 플라비바이러스 구조 단백질을 엔코딩하는 유전자로 트랜스펙션된 세포를 배양하는 단계; 및 세포 배양물로부터 바이러스 유사 입자를 회수하는 단계를 포함하는, 본 출원의 제 1 양상에서 제공되는 바이러스 유사 입자의 제조 방법을 제공한다. 본 양상은 추가로 바이러스 유사 입자 내에 함유된 적어도 하나의 플라비바이러스 구조 단백질을 엔코딩하는 뉴클레오티드 서열을 포함하는 유전자의 제조 단계를 포함할 수 있다.
제 7 양상에서, 본 출원은 포유류에서 플라비바이러스 감염을 진단하는 방법 또는 키트에서 사용하기 위한 바이러스 유사 입자를 제공한다.
[도 1] 도 1 은 뎅기 바이러스 게놈의 구축 및 뎅기 VLP 구축물의 하나의 예를 보여준다.
[도 2] 도 2 는 웨스턴 블롯팅에 의해 측정되는 상청액 중의 외피 단백질을 보여준다. 뎅기 유형 2 바이러스 prM 및 외피 단백질을 포함하는 바이러스 구조 단백질, 또는 뎅기 유형 2 바이러스 prM 및 뎅기 유형 2 및 뎅기 유형 1 의 키메라를 포함하는 바이러스 구조 단백질 (이때 뎅기 바이러스 유형 2 외피 단백질의 C-말단 영역을 상응하는 뎅기 바이러스 유형 1 C-말단 영역 (SEQ ID NO: 8 의 199aa-676aa) 에 대해 대체하였음), 또는 키메라성 외피 영역을 함유하는 바이러스 구조 단백질 (이때 키메라성 외피 영역 중에 하나의 아미노산 변형 (F108K, SEQ ID NO: 10 의 289aa 에서) 을 도입하였음) 에 대한 발현 벡터, 및 뎅기 바이러스 유형 1 캡시드 단백질에 대한 발현 벡터를 293F 세포에 트랜스펙션하였다. 뎅기 외피 단백질에 대항하는 항체를 사용하는 웨스턴 블롯팅을 배양 상청액에 대항하여 수행하였다.
[도 3] 도 3 은 웨스턴 블롯팅의 결과를 보여준다. 뎅기 유형 1 캡시드 단백질에 대한 발현 벡터와 함께, 뎅기 유형 1 바이러스 prM 및 변형이 있는 또는 없는 외피 (야생형, F108A, K203M, K246M F108A +K246M 또는 F108+K203N) 를 포함하는 바이러스 구조 단백질에 대한 발현 벡터를 293F 세포에 트랜스펙션하였다. 뎅기 외피 단백질에 대항하는 항체를 사용하는 웨스턴 블롯팅을 배양 상청액에 대항하여 수행하였다.
[도 4] 도 4 는 웨스턴 블롯팅의 결과를 보여준다. 뎅기 유형 1 바이러스 prM 및 변형이 있는 또는 없는 외피 (야생형, F108A, K203M 또는 F108+K203N) 를 포함하는 바이러스 구조 단백질에 대한 발현 벡터를 293F 세포에 트랜스펙션하였다. 뎅기 외피 단백질에 대항하는 항체를 사용하는 웨스턴 블롯팅을 배양 상청액에 대항하여 수행하였다.
[도 5] 도 5 는 음성으로 염색된 VLP (F108+K203N) 의 전자 현미경 (EM) 시각화를 보여준다.
[도 2] 도 2 는 웨스턴 블롯팅에 의해 측정되는 상청액 중의 외피 단백질을 보여준다. 뎅기 유형 2 바이러스 prM 및 외피 단백질을 포함하는 바이러스 구조 단백질, 또는 뎅기 유형 2 바이러스 prM 및 뎅기 유형 2 및 뎅기 유형 1 의 키메라를 포함하는 바이러스 구조 단백질 (이때 뎅기 바이러스 유형 2 외피 단백질의 C-말단 영역을 상응하는 뎅기 바이러스 유형 1 C-말단 영역 (SEQ ID NO: 8 의 199aa-676aa) 에 대해 대체하였음), 또는 키메라성 외피 영역을 함유하는 바이러스 구조 단백질 (이때 키메라성 외피 영역 중에 하나의 아미노산 변형 (F108K, SEQ ID NO: 10 의 289aa 에서) 을 도입하였음) 에 대한 발현 벡터, 및 뎅기 바이러스 유형 1 캡시드 단백질에 대한 발현 벡터를 293F 세포에 트랜스펙션하였다. 뎅기 외피 단백질에 대항하는 항체를 사용하는 웨스턴 블롯팅을 배양 상청액에 대항하여 수행하였다.
[도 3] 도 3 은 웨스턴 블롯팅의 결과를 보여준다. 뎅기 유형 1 캡시드 단백질에 대한 발현 벡터와 함께, 뎅기 유형 1 바이러스 prM 및 변형이 있는 또는 없는 외피 (야생형, F108A, K203M, K246M F108A +K246M 또는 F108+K203N) 를 포함하는 바이러스 구조 단백질에 대한 발현 벡터를 293F 세포에 트랜스펙션하였다. 뎅기 외피 단백질에 대항하는 항체를 사용하는 웨스턴 블롯팅을 배양 상청액에 대항하여 수행하였다.
[도 4] 도 4 는 웨스턴 블롯팅의 결과를 보여준다. 뎅기 유형 1 바이러스 prM 및 변형이 있는 또는 없는 외피 (야생형, F108A, K203M 또는 F108+K203N) 를 포함하는 바이러스 구조 단백질에 대한 발현 벡터를 293F 세포에 트랜스펙션하였다. 뎅기 외피 단백질에 대항하는 항체를 사용하는 웨스턴 블롯팅을 배양 상청액에 대항하여 수행하였다.
[도 5] 도 5 는 음성으로 염색된 VLP (F108+K203N) 의 전자 현미경 (EM) 시각화를 보여준다.
(1) 하나 이상의 플라비바이러스 구조 단백질을 포함하는 바이러스 유사 입자
제 1 양상에서, 본 출원은 외피 영역 중의 적어도 하나의 아미노산이 이의 자연 발생된 구조로부터 변형된, 하나 이상의 플라비바이러스 구조 단백질를 포함하는 바이러스 유사 입자를 제공한다.
플라비바이러스는 웨스트 나일 바이러스, 뎅기 바이러스, 진드기-유래 뇌염 바이러스, 황열병 바이러스, 일본 뇌염, 및 C 형 간염 바이러스 (HCV) 일 수 있다. 바람직한 플라비바이러스는 뎅기 바이러스이다. 뎅기 바이러스는: 뎅기 바이러스 1 - 서브유형 I 내지 IV 포함, 뎅기 바이러스 2 - 서브유형 아시아 I 형 (Asian I), 아시아 II 형 (Asian II), 세계형 (Cosmopolitan), 미국형 (American) 및 미국/아시아형 (American/Asian) 포함, 뎅기 바이러스 3 - 서브유형 I 내지 IV 포함, 및 뎅기 바이러스 4 - 서브유형 I 내지 III 포함: 일 수 있다. 명세서 및 청구항에서, 용어 "플라비바이러스 구조 단백질 또는 이의 절편" 은, 대상에서 면역계에 의해 인지될 수 있는, 및/또는 대상에서 세포-매개 면역 반응을 촉진하는 및/또는 대상에서 항체의 생성을 촉진하는, 플라비바이러스 유래의 임의의 펩티드-기반 서열을 말한다.
도 1 에서 제시되는 바와 같이, 뎅기 바이러스 구조 단백질은 캡시드 단백질, 전구체 막 단백질 및 외피 단백질로 이루어진다. 본 구현예에서, VLP 는 이들 구조 단백질 중 적어도 하나, 및 바람직하게는, 전구체 막 단백질 (prM) 및 외피 단백질을 포함한다. 뎅기 바이러스 구조 단백질은 개시 코돈 및 prM 서열의 아미노 말단에 대한 신호 서열에 상응하는 아미노산을 추가로 포함할 수 있다.
적어도 하나의 아미노산 변형을 포함하는 영역은 바람직하게는 SEQ ID NO: 17 의 개시 코돈 M 및 신호 펩티드에 이어 뎅기 바이러스 1 의 prM 및 외피 영역을 포함하는 SEQ ID NO: 21 의 단백질 (WestPac 균주, GenBank Accsession No: U88535) 의 아미노산 위치 182 와 아미노산 위치 676 사이, 더욱 바람직하게는 아미노산 위치 271 과 아미노산 위치 302 사이, 특히 아미노산 위치 280 과 아미노산 위치 291 사이, 특히 289, 또는 개시 코돈 M, 신호 펩티드에 이어 플라비바이러스의 prM 및 외피 영역 또는 이의 절편을 포함하는 단백질의 아미노산 서열이 SEQ ID NO: 21 에 의해 나타내지는 아미노산 서열과 정렬된 경우 상기-확인된 위치로서 결정된 위치 사이에 있을 수 있다.
뎅기 바이러스 유형 1 아미노산 서열의 외피 영역은 SEQ ID NO: 20 에 의해 나타내진다. 따라서, 적어도 하나의 아미노산 변형을 포함하는 영역은 상기 서열 내에, 바람직하게는 SEQ ID NO: 20 의 단백질의 아미노산 위치 90 과 아미노산 위치 121 사이, 특히 아미노산 위치 99 와 아미노산 위치 110 사이, 특히 108, 또는 플라비바이러스의 외피 또는 이의 절편의 아미노산 서열이 SEQ ID NO: 20 과 정렬된 경우 상기-확인된 위치로서 결정된 위치 사이에 있을 수 있다.
본원에서 사용되는 바와 같은, "~ 에 상응하는 위치" 또는 뉴클레오티드 또는 아미노산 위치가 기재된 서열에서, 예컨대 서열목록에 언급된, 뉴클레오티드 또는 아미노산 위치 "에 상응한다" 라는 언급은, 표준 정렬 알고리즘을 사용하여 일치성을 최대화하기 위해 기재된 서열과 정렬시 확인된 뉴클레오티드 또는 아미노산 위치를 말한다. 서열을 정렬함으로써, 당업자는 상응하는 잔기를 확인할 수 있다.
뎅기 바이러스 유형 1-4 와 같은 다양한 플라비바이러스의 바이러스 구조 단백질은 GenBank 데이터베이스와 같은 다양한 공개 데이터베이스에서 확인 및 이용가능하다. 예를 들어, 뎅기 바이러스 유형 1 (WestPac 균주): Accession No. U88535, 뎅기 바이러스 유형 2 (S1 백신 균주): Accession No. M19197, 뎅기 바이러스 유형 3 (균주 Singapore 8120/95): Accession No. AY766104 및 뎅기 바이러스 유형 4 (균주 ThD4_0476_97): Accession No. Y618988. 본 출원에 따르면, 뎅기 바이러스와 같은 플라비바이러스의 외피 단백질은 데이터베이스로부터 입수하여, SEQ ID NO: 20 의 아미노산 위치 90 및 아미노산 위치 121 에 상응하는 위치, 예컨대 SEQ ID NO: 20 의 아미노산 위치 108 에 상응하는 위치 사이의 위치를 확인하기 위해 SEQ ID NO: 20 과 함께 정렬될 수 있다.
외피 영역 중에 적어도 하나의 아미노산 변형을 포함하는 것은 제외하고, 바이러스 유사 입자 내에 함유된 플라비바이러스 구조 단백질은 자연 발생 바이러스 구조 단백질 또는 이의 개질된 단백질일 수 있다. 하나의 구현예에서, 개질된 단백질은 prM 및 외피 단백질을 포함하는 자연 발생 바이러스 구조 단백질에 대해 적어도 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 95% 또는 98% 아미노산 서열 일치성을 갖는다. 하나의 구현예에서, 개질된 단백질은 아미노산의 최대 10% 가 prM 및 외피 영역을 포함하는 자연 발생 바이러스 구조 단백질에 대해 결실, 치환, 및/또는 부가된 돌연변이체이다. 서열 일치성은 통상의 방법에 의해 결정될 수 있다.
본 출원에 따르면, 상기 논의된 하나 이상의 플라비바이러스 구조 단백질 또는 이의 절편은 이들이 입자 구조로 자발적으로 조립되는 한, 사용될 수 있다. 예를 들어, 뎅기 바이러스의 prM 및 외피 단백질을 엔코딩하는 유전자를 발현하는 진핵 세포를 배양할 때, 단백질이 세포에 의해 생성되고 조립되어 VLP 를 산출하고, VLP 가 세포 배양 상청액으로부터 수집될 수 있다.
본 출원은 VLP, VLP 를 엔코딩하는 벡터, 및 항원에 특이적으로 결합하는 항체 (및 앱타머 및 펩티드를 포함하는 항체-유사 분자) 를 제공함으로써, 플라비바이러스 감염의 예방 또는 치료에서의 이의 사용 (단독 또는 조합으로) 과 함께, 상기 필요성 중 하나 이상을 해결한다.
명세서 및 청구항에서 사용되는 바와 같은, 용어 "항체" 는 에피토프 또는 항원 결정소에 결합할 수 있는 분자를 말한다. 상기 용어는 전체 항체 및 이의 항원-결합 절편 (단일-사슬 항체를 포함) 을 포괄한다. 이러한 항체는 인간 항원 결합 항체 절편을 포함할 수 있고, 제한 없이, Fab, Fab' 및 F(ab')2, Fd, 단일-사슬 Fvs (scFv), 단일-사슬 항체, 디술피드-연결 Fvs (sdFv) 및 VL 또는 VH 도메인을 포함하는 절편을 포함한다. 항체는 새 및 포유류를 포함하는 임의의 동물 기원일 수 있다. 바람직하게는, 항체는 포유류 예를 들어, 인간, 쥣과, 토끼, 염소, 기니아 피그, 낙타, 말 등, 또는 다른 적합한 동물 예를 들어 닭이다. 본원에서 사용되는 바와 같은, "인간" 항체는 인간 면역글로불린의 아미노산 서열을 갖는 항체를 포함하고, 인간 면역글로불린 라이브러리로부터 또는 하나 이상의 인간 면역글로불린에 대해 유전자도입되고 예를 들어, 그 설명이 본원에 전체가 참고로서 인용된 미국 특허 제 5,939,598 호에 기재된 바와 같은 내생 면역글로불린을 발현하지 않는 동물로부터 단리된 항체를 포함한다.
플라비바이러스 구조 단백질은 자연 발생 단백질 또는 자연 발생 단백질의 개질된 단백질 또는 자연 발생 단백질 또는 개질된 펩티드의 절편일 수 있다. 개질된 단백질은 자연 발생 바이러스 구조 단백질의 절편일 수 있다.
하나의 구현예에서, 플라비바이러스 구조 단백질로부터 유래되는 개질된 단백질은 자연 발생 단백질에 대해 적어도 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 95% 또는 98% 아미노산 서열 일치성을 갖는다. 하나의 구현예에서, 플라비바이러스로부터 유래되는 개질된 단백질은 아미노산의 최대 10% 가 플라비바이러스로부터 유래되는 자연 발생 바이러스 구조 단백질에 대해 결실, 치환, 및/또는 부가되는 돌연변이체이다.
하나의 구현예에서, 본 출원은 SEQ ID Nos.2, 4, 8, 10, 14 및 16 중 임의의 하나에 의해 나타내지는 아미노산 서열을 갖는 플라비바이러스 구조 단백질을 포함하는 바이러스 유사 입자를 제공한다.
이들 서열 각각은 하기 영역을 함유하는 단백질을 나타낸다: 개시 코돈: M (1aa), 신호 서열 (2-15aa), pr 서열 (16-106aa), M 서열 (107-181aa), 및 외피 영역 (182-676aa). 하나의 구현예에서, SEQ ID Nos.2, 4, 8, 10, 14 및 16 의 prM 및 외피 영역의 영역을 갖는 바이러스 구조 단백질을 포함하는, 즉, 상기 단백질의 위치 16 에서 위치 676 까지의 아미노산 서열을 포함하는 바이러스 유사 입자가 제공될 수 있다.
개질된 플라비바이러스 구조 단백질은 SEQ ID Nos.2, 4, 8, 10, 14 및 16 중 임의의 하나에 의해 나타내지는 아미노산 서열, 또는 상기 서열 중 하나의 위치 16 에서 위치 676 까지의 아미노산 서열에 대해 적어도 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 95% 또는 98% 아미노산 서열 일치성을 가질 수 있다. 또한, 개질된 플라비바이러스 구조 단백질은 아미노산의 최대 10% 가 SEQ ID Nos. SEQ ID Nos.2, 4, 8, 10, 14 및 16 중 임의의 하나에 의해 나타내지는 아미노산 서열, 또는 상기 서열 중 임의의 하나의 위치 16 에서 위치 676 까지의 아미노산 서열을 갖는 플라비바이러스 구조 단백질에 대해 결실, 치환, 및/또는 부가되는 돌연변이체일 수 있다.
(2) 뉴클레오티드 및 벡터
제 2 양상에서, 본 출원은 본 발명의 제 1 양상에서 제공되는 바이러스 유사 입자를 엔코딩하는 뉴클레오티드 서열을 포함하는 또는 이것으로 이루어지는 핵산 분자를 제공한다.
하나의 구현예에서, 본 출원은 상기 기재된 바이러스 유사 입자를 제공하는 플라비바이러스 구조 단백질을 엔코딩하는 뉴클레오티드 서열을 포함하는 핵산 분자를 제공한다.
하나의 구현예에서, 본 출원은 상기 기재된 핵산 분자를 포함하는 발현 벡터를 제공하며, 상기 벡터는 핵산 분자에 작동가능하게 연결된 발현 조절 서열을 임의로 포함한다.
발현 조절 서열의 예는 제한 없이, 프로모터 예컨대 CMV 프로모터, 파지 람다 PL 프로모터, E. coli lac, phoA 및 tac 프로모터, SV40 초기 및 후기 프로모터, 및 레트로바이러스 LTR 의 프로모터를 포함한다.
하나의 구현예에서, 본 출원은 SEQ ID Nos.1, 3, 7, 9, 13 및 15 중 임의의 하나에 의해 나타내지는 뉴클레오티드 서열로 이루어지는, 플라비바이러스 구조 단백질에 대한 발현 벡터를 제공한다.
하나의 구현예에서, 본 출원은 SEQ ID Nos.1, 3, 7, 9, 13 및 15 중 임의의 하나에 의해 나타내지는 뉴클레오티드 서열을 갖는 핵산 분자로부터 개질된 핵산 분자를 제공한다. 개질된 핵산 분자는 SEQ ID Nos.1, 3, 7, 9, 13 및 15 중 임의의 하나에 의해 나타내지는 뉴클레오티드 서열을 갖는 핵산 분자에 대해 적어도 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 95% 또는 98% 뉴클레오티드 서열 일치성을 가질 수 있다. 또한, 개질된 핵산 분자는 아미노산의 최대 10% 가 SEQ ID Nos.1, 3, 7, 9, 13 및 15 중 임의의 하나에 의해 나타내지는 뉴클레오티드 서열을 갖는 핵산 분자에 대해 결실, 치환, 및/또는 부가되는 돌연변이체일 수 있다.
(3) 조성물 또는 백신
제 3 양상에서, 본 출원은 본 출원의 제 1 양상에서 제공되는 바이러스 유사 입자 및/또는 본 발명의 제 2 양상에서 제공되는 핵산 분자를 포함하는 조성물 또는 백신을 제공한다.
하나의 구현예에서, 본 출원은 상기 기재된 플라비바이러스 바이러스 유사 입자 또는 상기 기재된 핵산 분자를 포함하는 조성물을 제공한다.
조성물은 약학적으로 허용가능한 담체 및/또는 아쥬반트를 추가로 포함할 수 있다. 아쥬반트의 예는 제한 없이, Ribi 용액 (Sigma Adjuvant system, Sigma-Aldrich) 을 포함한다.
본 출원의 약학 조성물은 단일 활성 성분 또는 2 개 이상의 활성 성분의 조합을, 이들이 본 발명의 목적과 반대되지 않는 한, 함유할 수 있다. 예를 들어, 케모카인을 포함하는 사이토카인, 사이토카인에 대항하는 항체, 예컨대 항-TNF 항체 (예를 들어, 인플릭시맙, 아달리무밥), 항-VEGF 항체 (예를 들어, 베바시주맙 및 라니비주맙), 사이토카인 수용체 길항제 예컨대 항 HER2 항체 (예를 들어, 트라스투주맙), 항 EGF 수용체 항체 (예를 들어, 세툭시맙), 항 VEGF 앱타머 (예를 들어, 페갑타닙) 및 면역조절제 예컨대 시클로스포린, 타크롤리무스 및 우베니멕스가 조합 요법을 위해 사용될 수 있다.
다수의 활성 성분과 조합에서, 각 성분의 함량은 이들의 치료 효과 및 안전성을 고려하여 적합하게 증가 또는 감소될 수 있다.
본원에서 사용되는 용어 "조합" 은 2 가지 이상의 활성 성분이 환자에게 단일한 독립체 또는 투여량의 형태로 동시에 투여되는 것, 또는 이들 활성 성분이 환자에게 특정한 시간 제한 없이 동시에 또는 순차적으로 분리된 독립체로서 투여되는 것을 의미하며, 이러한 투여가 체내에서 2 개 성분의 치료학적으로 효과적인 수준을, 바람직하게는 동시에 제공한다.
하나의 구현예에서, 조성물은 DNA 백신을 포함하는 백신 조성물이다. 하나의 구현예에서, 본 발명에 의해 제공되는 DNA 백신은 CpG 함유 올리고뉴클레오티드를 포함한다.
(4) 항체의 제조 방법
제 4 양상에서, 본 출원은 본 출원의 제 1 양상에서 제공되는 바이러스 유사 입자 및/또는 본 발명의 제 2 양상에서 제공되는 핵산 분자를 포유류에게 접촉시키는 것을 포함하는, 플라비바이러스에 대항하는 항체 또는 플라비바이러스에 대항하는 중화 항체를 포함하는 항혈청의 제조 방법을 제공한다.
본 양상에서 제조되는 항체는 포유류에 플라비바이러스-야기 병원체를 투여함으로써 포유류에서 플라비바이러스-야기 병원체에 대항하는 수동 면역화를 위해 사용될 수 있고, 따라서 플라비바이러스 감염으로부터 포유류를 예방하거나 또는 포유류에서 플라비바이러스 감염에 의해 야기되는 질환 또는 상태를 치료한다.
본 출원의 제 4 양상에서 제조되는 항체는 통상의 기술을 사용하여 인간화될 수 있다. 따라서, 하나의 구현예에서, 본 발명의 제 4 양상에서 제공되는 방법은 비-인간 포유류 제조된 항체의 인간화 단계를 추가로 포함한다. 본 양상에 의해 제공되는 항체 또는 인간화된 항체는 플라비바이러스 감염으로부터 인간 대상을 예방하기 위해 또는 대상에서 플라비바이러스 감염에 의해 야기되는 질환 또는 상태를 치료하기 위해 사용될 수 있다.
본 양상에 따라 제조되는 항체는 환자로부터 유래된 면역 세포, 예컨대 B-세포 및 T-세포로부터의 하위집단을 선택하기 위해 시험관 내에서 사용될 수 있으며, 이후 이들은 환자에게 재투여된다.
항혈청은 통상의 방식에 의해 수득될 수 있다. 면역화된 비-인간 동물로부터 혈액 샘플을 취하고, 혈액을 가공하여 항혈청, 즉, 혈액의 항체-함유 액체 성분을 수득한다. 비-인간 포유류는 바람직하게는 래트, 마우스, 햄스터, 돼지, 토끼, 말, 당나귀, 염소, 양, 기니아 피그, 라마, 및 비-인간 영장류 (예를 들어, 침팬치) 로 이루어지는 군으로부터 선택된다.
(5) 대상에서 플라비바이러스 감염에 의해 야기되는 질환을 치료하는 또는 플라비바이러스 감염으로부터 대상을 예방하는 방법
제 5 양상에서, 제 1 양상에서 제공되는 바이러스 유사 입자, 제 2 양상에서 제공되는 뉴클레오티드 분자, 또는 제 3 양상에서 제공되는 조성물이 대상에게 투여되는, 대상에서 플라비바이러스 감염에 의해 야기되는 질환 또는 상태 예컨대 뎅기열을 치료하는 방법. 상기 나열된 VLP, 뉴클레오티드 분자 또는 조성물을 대상에게 투여함으로써, 플라비바이러스에 대항하는 면역 반응이 향상될 수 있고, 따라서, 플라비바이러스 감염에 의해 야기되는 질환 또는 상태가 효과적으로 치료될 수 있다. 본 양상에서, VLP, 뉴클레오티드 분자 또는 조성물은 환자에게 영향을 받는 기관에 국부적으로 또는 전신적으로 투여될 수 있다.
제 1 양상의 바이러스 유사 입자, 제 2 양상에서 제공되는 뉴클레오티드 분자 또는 제 3 양상의 조성물을 대상에게 투여하는 것을 포함하는, 플라비바이러스 감염으로부터 또는 플라비바이러스 감염에 의해 야기되는 질환으로부터 대상을 예방하는 방법. 플라비바이러스에 의해 야기되는 질환은 뎅기열일 수 있다.
본 출원에 따르면, 바이러스 유사 입자는 또한 면역 요법에 적용될 수 있다. VLP 는 환자에게 후속적으로 투여되는 인간 세포주 또는 환자로부터 유래되는 세포에 생체 외에서 적용될 수 있다.
(6) 바이러스 유사 입자의 제조 방법
제 6 양상에서, 본 출원은 바이러스 구조 단백질을 코딩하는 유전자를 발현하는 세포를 배양하는 단계; 및 세포 배양물로부터 바이러스 유사 입자를 회수하는 단계를 포함하는, 본 발명의 제 1 양상에서 제공되는 바이러스 유사 입자의 제조 방법을 제공한다.
다양한 숙주-벡터 시스템이 바이러스 유사 입자의 발현을 위해 사용될 수 있다. 진핵 세포는 본 출원의 제 4 양상에 의해 제공되는 방법을 위해 사용될 수 있다. 진핵 세포의 예는 제한 없이, 곤충 세포 (예를 들어, sf9 세포, H5 세포), 효모 세포 (예를 들어, S. cerevisiae) 및 포유류 세포 (예를 들어, CHO 세포, 인간 배아 신장 (HEK) 293F 세포) 를 포함한다. 본 출원의 제 2 양상에 의해 제공되는 방법에 사용되는 벡터는 발현하고자 하는 바이러스 유사 입자를 엔코딩하는 핵산 분자를 포함한다. 세포는 통상의 방법 (예를 들어, 리포펙션, 전기천공법) 을 사용하여 벡터와 함께 트랜스펙션될 수 있다. 당업자는 사용되는 세포에 따라, 배양 배지 또는 DNA 메틸 트랜스페라아제 억제제 및 히스톤 디아세틸라아제 억제제, 예컨대 나트륨 부티레이트의 여부를 선택할 수 있다. 트랜스펙션 후, 바이러스 유사 입자는 세포 및/또는 배양 상청액에서 제조될 수 있다. 바이러스 유사 입자는 배양 상청액으로부터 회수되고 초원심분리를 사용하여 정제될 수 있다.
본 출원의 바이러스 유사 입자는 복제되지 않고, 따라서 고도로 안정한 프로파일을 갖는다.
(7) 플라비바이러스 감염을 진단하는 키트 또는 방법
제 7 양상에서, 본 출원은 포유류에서 플라비바이러스 감염을 진단하는 방법 또는 키트에서 사용하기 위한 바이러스 유사 입자를 제공한다. 바이러스 유사 입자를 사용함으로써, 플라비바이러스에 특이적인 항체를 검출할 수 있는 효소-연결 면역-흡착 어세이 (ELISA) 진단 키트가 제조될 것이다.
본 출원은 하기 실시예를 참고로 더욱 상세히 기술될 것이며, 그러나 하기 실시예는 본 발명의 범주를 제한하는 것으로 의도되지 않는다.
[실시예 1]
뎅기 바이러스 유형 1-2 의 단백질 또는 절편을 포함하는 바이러스 유사 입자의 제조
뎅기 바이러스 유형 1 및 2 바이러스 구조 단백질을 야생형 바이러스 구조 단백질로서 사용하였다. 바이러스 구조 단백질의 외피 영역에, 적어도 하나의 변형을 도입하였다. 즉, 뎅기 바이러스 유형 1 외피 단백질 (SEQ ID NO: 20) 의 위치 108 에서의 아미노산 Phe 를 Ala (F108A) 로 변경하였고, 뎅기 바이러스 유형 1 외피 단백질의 위치 203 에서의 아미노산 Lys 를 Asn (K203N) (외피 영역: SEQ ID NO: 4 의 172-676aa) 로 변경하였고, 위치 246 에서의 아미노산 Asn 을 Met (K246M) 로 변경하였다. 본 실시예에서, 외피 영역은 SEQ ID NO: 2 의 172-676aa 에 상응하고, SEQ ID NO: 20 의 위치 108 은 SEQ ID NO: 2 의 위치 289 에 상응하고, SEQ ID NO: 20 의 위치 203 은 SEQ ID NO: 2 의 위치 384 에 상응하고, SEQ ID NO: 20 의 위치 246 은 SEQ ID NO: 2 의 위치 427 에 상응한다. 본 실시예에서, 외피 영역 중의 돌연변이는 외피 영역으로부터 시작하는 숫자를 사용하여 표현된다.
포유류 세포에서 바이러스 구조 단백질을 발현하기 위해, DENV2 prM E 발현 벡터 및 DENV2 캡시드 발현 벡터 20ug 각각을 혼합하고, 293F 세포로 트랜스펙션하였다. 캡시드 벡터는 더 나은 수율을 발현하기 위해 R85A 및 K86A 돌연변이시켰다 (SEQ ID NO: 11 및 12). DENV2 prM E 를 더 잘 발현하기 위해, C 말단 DENV2 Env 영역 (199aa-676aa) 을 상응하는 DENV1 Env 영역에 대체하여, 키메라 단백질 (SEQ ID NOs. 7 및 8) 을 산출하였다. VLP 를 안정화하기 위해, Env 융합 펩티드 영역 (F108A) 을 돌연변이시켰다 (SEQ ID NOs. 9 및 10).
트랜스펙션 4 일 후, 트랜스펙션된 세포 배양물로부터의 상청액을 수확하고, Env 발현을 1st 항체로서 외피 단백질에 특이적으로 결합하는 뎅기 바이러스 (9.F.10) 모노클로날 항체 (sc-70959, Santa Cruz Biotechnology) 및 2nd 항체로서 토끼 항-마우스 IgG-HRP (sc-358920, Santa Cruz Biotechnology) 를 사용하는 웨스턴 블롯팅에 의해 시험하였다. 결과는 도 2 에 제시한다.
도 2 로부터 제시되는 바와 같이, DENV2 prM 및 하나의 변형 (F108A) 을 가진 뎅기 바이러스 유형 2 및 유형 1 외피 단백질의 키메라로 트랜스펙션된 세포는 더 많은 양의 단백질을 산출하였다. 상청액 중의 상기 단백질은 자발적으로 조립되어 입자를 제공한다.
VLP 를 발현하기 위해, DENV1 prM E 발현 벡터 및 DENV1 캡시드 발현 벡터 20ug 각각을 혼합하고, 293F 세포로 트랜스펙션하였다. 캡시드 벡터는 더 나은 수율을 발현하기 위해 K85A 및 K86A 돌연변이시켰다 (SEQ ID NOs. 5 및 6). VLP 를 안정화하기 위해, Env 융합 펩티드 영역 (F108A) (SEQ ID NOs. 1 및 2) 또는 염기성 아미노산 (K203N) (SEQ ID NOs. 3 및 4) 또는 (K246M) 을 돌연변이시켰다. 추가로, 2 개의 아미노산 (F108A+K203N, SEQ ID NOs: 13 및 14) 및 (F108A+K246M, SEQ ID NOs. 15 및 16) 을 또한 돌연변이시켰다. 트랜스펙션 4 일 후, 트랜스펙션된 세포로부터의 상청액을 수확하고, Env 발현을 1st 항체로서 뎅기 바이러스 (9.F.10) 모노클로날 항체 (sc-70959, Santa Cruz Biotechnology) 및 2nd 항체로서 토끼 항-마우스 IgG-HRP (sc-358920, Santa Cruz Biotechnology) 를 사용하는 웨스턴 블롯팅에 의해 시험하였다. 결과는 도 3 에 제시한다.
도 3 으로부터 제시되는 바와 같이, DENV prM 및 적어도 하나의 변형을 가진 외피 단백질로 트랜스펙션된 세포는 더 많은 양의 외피 단백질을 산출하였다. 상청액 중의 상기 단백질은 자발적으로 조립되어 입자를 제공한다.
[실시예 2]
뎅기 바이러스 구조 단백질 prM 및 외피를 포함하는 바이러스 유사 입자의 제조.
실시예 1 에서 사용된 prM 및 개질된 외피 단백질 F108A, K203N, 또는 K203N+F108A (각각, SEQ ID NOs 1, 3, 13) 을 함유하는 뎅기 바이러스 구조 단백질에 대한 발현 벡터를 사용하였다. 실시예 1 과 동일한 방식으로, 20ug 의 벡터를 293F 세포에 트랜스펙션하고 배양하였다. 트랜스펙션 4 일 후에 트랜스펙션된 세포로부터의 상청액을 수확하였다. 1 차 항체로서 모노클로날 항체 (9.F. 10, Santa Cruz Biotech) 및 2 차 항체로서 토끼 항-마우스 IgG-HRP 콘쥬게이션된 항체를 사용하여 DENV VLP 를 검출하기 위해 웨스턴 블롯을 수행하였다. 결과는 도 4 에 제시한다. 도 4 로부터 제시되는 바와 같이, DENV1-prM 및 적어도 하나의 변형을 가진 외피 단백질로 트랜스펙션된 세포는 더 많은 양의 외피 단백질을 산출하였다.
바이러스 유사 입자를 수득하기 위해 상청액을 0.45μm 필터를 사용하여 여과하였다. 바이러스 유사 입자를 TFF 컬럼을 사용하여 농축하고 QXL 컬럼 (GE Healthcare) 을 사용하여 정제하여 정제된 바이러스 유사 입자를 수득하였다. 정제된 VLP 를 PBS 중의 4% 포름알데히드로 채웠다. 음성으로 염색된 VLP 의 전자 현미경 (EM) 시각화를 수행하였다. 간략히, 1.0μl 의 샘플을 탄소 코팅된 Formvar-필름 구리 격자 상에 두고, VLP 가 부착되도록 하였다. 이후, 2μl 1% PTA 용액을 격자에 첨가하고, 격자를 전자 현미경에 의해 시험하였다. 결과는 도 5 에 제시한다. 상청액에서, 바이러스 유사 입자가 관찰되었다.
[실시예 3]
뎅기 바이러스에 대항하는 항체
실시예 2 에서 수득된 정제된 VLP (K203N+F108A) 를 DEN1 VLP 로서 명명하였고, 본 실시예에서 사용하였다. 정제된 바이러스 유사 입자를 스핀 컬럼 (분자량 절삭: 100kDa) 을 사용하여 추가 농축하였고, 면역화를 위한 바이러스 유사 입자를 제조하였다. 이후, 4 마리의 마우스를 0 주 및 4 주에, 2 회 근육내 주사에 의해 알루미늄 아쥬반트 (alhydrogel 2%, Sergeant Aduvants) 를 함유하는 PBS 중의 DEN1 VLP 30 μg 으로 면역화하였다.
면역화된 마우스로부터 유래하는 혈청의 뎅기 바이러스 특이적 IgG 역가를 ELISA 시스템에 의해 측정하였다. 혈청을 각각의 DENV-1, DENV-2, DENV-3, 및 DENV-4 바이러스에 대한 중화 항체에 대해 어세이하였다. 하기 뎅기 혈청형 1-4 를 사용하였다:
DENV-1, Philippine-99St12A 균주
DENV-2, Philippine-00St22A 균주
DENV-3, Philipine-SLMC50 균주
DENV-4, Philippine-SLMC318 균주
JEV- JaOAr S-982 균주
면역화된 마우스 혈청 중의 항-DENV 중화 항체를 1.25 x 108 FFU 의 Vero-적응된 DV 유형 1-4 를 사용하여 Vero 세포에 대해 이전에 기재된 초점 감소 중화 시험 (FRNT) 에 의해 검출하였다. 종료점 역가를 FFU 의 수가 적어도 50% 감소된 (FRNT50) 것을 시험된 최고 혈청 희석으로서 계산하였다. 96 웰 플레이트에서 100% 컨플루언스 (confluence) 로의 Vero 세포를 사용하였다.
인 하우스 (In house) 항-뎅기 토끼 IgG 를 1 차 항체로서 사용하였고, 항-토끼 IgG-HRPO 콘쥬게이트 (102-PD) 를 2 차 항체로서 사용하였다. 결과는 하기 표에 요약한다.
[표 1]
표 1 에서 제시되듯이, DENV1 VLP 는 뎅기 바이러스 유형 1, 2, 3 및 4 에 대해 우수한 중화 효과를 나타냈다. 뎅기 약화 생 백신으로 수득되는 중화 항체의 FRNT 50 값이 대략 1000 이라는 사실의 관점에서 (Tsai et al., Journal of Virology, 2015 89: 7348-7362.), DENV1 VLP 의 면역원성은 매우 강하였고, 약화 생 백신보다 뎅기 바이러스에 대항하여 약 10 배 더 높은 중화 항체를 제공하였다.
[실시예 4]
뎅기 바이러스 유사 입자를 포함하는 약학 조성물의 제조
뎅기 바이러스 유사 입자를 실시예 1 에 따라 제조하였다. 백신 조성물인 약학 조성물을 제조하기 위해, 80μg 의 각각의 제조된 입자를 1ml 의 수크로오스 포스페이트 용액, pH 7.2, 내독소 없음 (Teknova, SP 완충액) 과 혼합하였다.
[실시예 5]
뎅기 바이러스 유형 2-4 유래된 바이러스 유사 입자의 제조
외피 영역의 아미노산 위치 108 (SEQ ID NOs. 22-24 의 289aa 에 상응함) 이 F 에서 A 로 대체되고, 외피 단백질의 C-말단 영역 (478-676aa 또는 476-674aa) 이 뎅기 바이러스 유형 1 외피 단백질 (SEQ ID NO. 22 의 478-676aa) 에 상응하는 것으로 대체되는 뎅기 바이러스 유형 2-4 의 prM 및 외피 단백질에 대한 발현 벡터를 제조한다. 벡터에 의해 발현하고자 하는 단백질은 SEQ ID NOs. 22-24 에 의해 나타내지는 것들이다. 바이러스 유사 입자는 실시예 1 과 동일한 방식으로 수득된다.
SEQUENCE LISTING
<110> VLP THERAPEUTICS, LLP
<120> FLAVIVIRUS VIRUS LIKE PARTICLE
<130> 6725231
<150> 62/048,897
<151> 2014-09-11
<160> 24
<170> PatentIn version 3.5
<210> 1
<211> 5498
<212> DNA
<213> Dengue virus
<220>
<221> misc_feature
<223> DENV1 prM E (Env F108A)
<220>
<221> CDS
<222> (1046)..(3073)
<400> 1
tcgcgcgttt cggtgatgac ggtgaaaacc tctgacacat gcagctcccg gagacggtca 60
cagcttgtct gtaagcggat gccgggagca gacaagcccg tcagggcgcg tcagcgggtg 120
ttggcgggtg tcggggctgg cttaactatg cggcatcaga gcagattgta ctgagagtgc 180
accatatgcg gtgtgaaata ccgcacagat gcgtaaggag aaaataccgc atcaggcgcc 240
attcgccatt caggctgcgc aactgttggg aagggcgatc ggtgcgggcc tcttcgctat 300
tacgccagct ggcgaaaggg ggatgtgctg caaggcgatt aagttgggta acgccagggt 360
tttcccagtc acgacgttgt aaaacgacgg ccagtgaatt gacgcgtttg acattgatta 420
ttgactagtt attaatagta atcaattacg gggtcattag ttcatagccc atatatggag 480
ttccgcgtta cataacttac ggtaaatggc ccgcctggct gaccgcccaa cgacccccgc 540
ccattgacgt caataatgac gtatgttccc atagtaacgc caatagggac tttccattga 600
cgtcaatggg tggagtattt acggtaaact gcccacttgg cagtacatca agtgtatcat 660
atgccaagta cgccccctat tgacgtcaat gacggtaaat ggcccgcctg gcattatgcc 720
cagtacatga ccttatggga ctttcctact tggcagtaca tctacgtatt agtcatcgct 780
attaccatgg tgatgcggtt ttggcagtac atcaatgggc gtggatagcg gtttgactca 840
cggggatttc caagtctcca ccccattgac gtcaatggga gtttgttttg gcaccaaaat 900
caacgggact ttccaaaatg tcgtaacaac tccgccccat tgacgcaaat gggcggtagg 960
cgtgtacggt gggaggtcta tataagcaga gctcgtttag tgaaccgtca gataactgca 1020
ggtcgacgat atcgcggccg ccacc atg tcg gtg acc atg ctc ctc atg ctg 1072
Met Ser Val Thr Met Leu Leu Met Leu
1 5
ctg ccc aca gcc ctg gcg ttc cat ctg acc acc cga ggg gga gag ccg 1120
Leu Pro Thr Ala Leu Ala Phe His Leu Thr Thr Arg Gly Gly Glu Pro
10 15 20 25
cac atg ata gtt agc aag cag gaa aga gga aaa tca ctt ttg ttt aag 1168
His Met Ile Val Ser Lys Gln Glu Arg Gly Lys Ser Leu Leu Phe Lys
30 35 40
acc tct gca ggt gtc aac atg tgc acc ctt att gca atg gat ttg gga 1216
Thr Ser Ala Gly Val Asn Met Cys Thr Leu Ile Ala Met Asp Leu Gly
45 50 55
gag tta tgt gag gac aca atg acc tac aaa tgc ccc cgg atc act gag 1264
Glu Leu Cys Glu Asp Thr Met Thr Tyr Lys Cys Pro Arg Ile Thr Glu
60 65 70
acg gaa cca gat gac gtt gac tgt tgg tgc aat gcc acg gag aca tgg 1312
Thr Glu Pro Asp Asp Val Asp Cys Trp Cys Asn Ala Thr Glu Thr Trp
75 80 85
gtg acc tat gga aca tgt tct caa act ggt gaa cac cga cga gac aaa 1360
Val Thr Tyr Gly Thr Cys Ser Gln Thr Gly Glu His Arg Arg Asp Lys
90 95 100 105
cgt tcc gtc gca ctg gca cca cac gta ggg ctt ggt cta gaa aca aga 1408
Arg Ser Val Ala Leu Ala Pro His Val Gly Leu Gly Leu Glu Thr Arg
110 115 120
acc gaa acg tgg atg tcc tct gaa ggc gct tgg aaa caa ata caa aaa 1456
Thr Glu Thr Trp Met Ser Ser Glu Gly Ala Trp Lys Gln Ile Gln Lys
125 130 135
gtg gag acc tgg gct ctg aga cac cca gga ttc acg gtg ata gcc ctt 1504
Val Glu Thr Trp Ala Leu Arg His Pro Gly Phe Thr Val Ile Ala Leu
140 145 150
ttt cta gca cat gcc ata gga aca tcc atc acc cag aaa ggg atc att 1552
Phe Leu Ala His Ala Ile Gly Thr Ser Ile Thr Gln Lys Gly Ile Ile
155 160 165
ttt att ttg ctg atg ctg gta act cca tcc atg gcc atg cgg tgc gtg 1600
Phe Ile Leu Leu Met Leu Val Thr Pro Ser Met Ala Met Arg Cys Val
170 175 180 185
gga ata ggc aac aga gac ttc gtg gaa gga ctg tca gga gct acg tgg 1648
Gly Ile Gly Asn Arg Asp Phe Val Glu Gly Leu Ser Gly Ala Thr Trp
190 195 200
gtg gat gtg gta ctg gag cat gga agt tgc gtc act acc atg gca aaa 1696
Val Asp Val Val Leu Glu His Gly Ser Cys Val Thr Thr Met Ala Lys
205 210 215
gac aaa cca aca ctg gac att gaa ctc ttg aag acg gag gtc aca aac 1744
Asp Lys Pro Thr Leu Asp Ile Glu Leu Leu Lys Thr Glu Val Thr Asn
220 225 230
cct gcc gtc ctg cgc aaa ctg tgc att gaa gct aaa ata tca aac acc 1792
Pro Ala Val Leu Arg Lys Leu Cys Ile Glu Ala Lys Ile Ser Asn Thr
235 240 245
acc acc gat tcg aga tgt cca aca caa gga gaa gcc acg ctg gtg gaa 1840
Thr Thr Asp Ser Arg Cys Pro Thr Gln Gly Glu Ala Thr Leu Val Glu
250 255 260 265
gaa cag gac acg aac ttt gtg tgt cga cga acg ttc gtg gac aga ggc 1888
Glu Gln Asp Thr Asn Phe Val Cys Arg Arg Thr Phe Val Asp Arg Gly
270 275 280
tgg ggc aat ggt tgt ggg cta gcc gga aaa ggt agc tta ata acg tgt 1936
Trp Gly Asn Gly Cys Gly Leu Ala Gly Lys Gly Ser Leu Ile Thr Cys
285 290 295
gct aag ttt aag tgt gtg aca aaa ctg gaa gga aag ata gtc caa tat 1984
Ala Lys Phe Lys Cys Val Thr Lys Leu Glu Gly Lys Ile Val Gln Tyr
300 305 310
gaa aac tta aaa tat tca gtg ata gtc acc gta cac act gga gac cag 2032
Glu Asn Leu Lys Tyr Ser Val Ile Val Thr Val His Thr Gly Asp Gln
315 320 325
cac caa gtt gga aat gag acc aca gaa cat gga aca act gca acc ata 2080
His Gln Val Gly Asn Glu Thr Thr Glu His Gly Thr Thr Ala Thr Ile
330 335 340 345
aca cct caa gct ccc acg tcg gaa ata cag ctg aca gac tac gga gct 2128
Thr Pro Gln Ala Pro Thr Ser Glu Ile Gln Leu Thr Asp Tyr Gly Ala
350 355 360
cta aca ttg gat tgt tca cct aga aca ggg cta gac ttt aat gag atg 2176
Leu Thr Leu Asp Cys Ser Pro Arg Thr Gly Leu Asp Phe Asn Glu Met
365 370 375
gtg ttg ttg aca atg gaa aaa aaa tca tgg ctc gtc cac aaa caa tgg 2224
Val Leu Leu Thr Met Glu Lys Lys Ser Trp Leu Val His Lys Gln Trp
380 385 390
ttt cta gac tta cca ctg cct tgg acc tcg ggg gct tca aca tcc caa 2272
Phe Leu Asp Leu Pro Leu Pro Trp Thr Ser Gly Ala Ser Thr Ser Gln
395 400 405
gag act tgg aat aga caa gac ttg ctg gtc aca ttt aag aca gct cat 2320
Glu Thr Trp Asn Arg Gln Asp Leu Leu Val Thr Phe Lys Thr Ala His
410 415 420 425
gca aaa aag cag gaa gta gtc gta cta gga tca caa gaa gga gca atg 2368
Ala Lys Lys Gln Glu Val Val Val Leu Gly Ser Gln Glu Gly Ala Met
430 435 440
cac act gcg ttg act gga gcg aca gaa atc caa acg tct gga acg aca 2416
His Thr Ala Leu Thr Gly Ala Thr Glu Ile Gln Thr Ser Gly Thr Thr
445 450 455
aca att ttt gca gga cac ctg aaa tgc aga cta aaa atg gat aaa ctg 2464
Thr Ile Phe Ala Gly His Leu Lys Cys Arg Leu Lys Met Asp Lys Leu
460 465 470
act tta aaa ggg atg tca tat gta atg tgc aca ggg tca ttc aag tta 2512
Thr Leu Lys Gly Met Ser Tyr Val Met Cys Thr Gly Ser Phe Lys Leu
475 480 485
gag aag gaa gtg gct gag acc cag cat gga act gtt cta gtg cag gtt 2560
Glu Lys Glu Val Ala Glu Thr Gln His Gly Thr Val Leu Val Gln Val
490 495 500 505
aaa tac gaa gga aca gat gca cca tgc aag atc ccc ttc tcg tcc caa 2608
Lys Tyr Glu Gly Thr Asp Ala Pro Cys Lys Ile Pro Phe Ser Ser Gln
510 515 520
gat gag aag gga gta acc cag aat ggg aga ttg ata aca gcc aac ccc 2656
Asp Glu Lys Gly Val Thr Gln Asn Gly Arg Leu Ile Thr Ala Asn Pro
525 530 535
ata gtc act gac aaa gaa aaa cca gtc aac att gaa gcg gag cca cct 2704
Ile Val Thr Asp Lys Glu Lys Pro Val Asn Ile Glu Ala Glu Pro Pro
540 545 550
ttt ggt gag agc tac att gtg gta gga gca ggt gaa aaa gct ttg aaa 2752
Phe Gly Glu Ser Tyr Ile Val Val Gly Ala Gly Glu Lys Ala Leu Lys
555 560 565
cta agc tgg ttc aag aag gga agc agt ata ggg aaa atg ttt gaa gca 2800
Leu Ser Trp Phe Lys Lys Gly Ser Ser Ile Gly Lys Met Phe Glu Ala
570 575 580 585
act gcc cgt gga gca cga agg atg gcc atc ctg gga gac act gca tgg 2848
Thr Ala Arg Gly Ala Arg Arg Met Ala Ile Leu Gly Asp Thr Ala Trp
590 595 600
gac ttc ggt tct ata gga ggg gtg ttc acg tct gtg gga aaa ctg ata 2896
Asp Phe Gly Ser Ile Gly Gly Val Phe Thr Ser Val Gly Lys Leu Ile
605 610 615
cac cag att ttt ggg act gcg tat gga gtt ttg ttc agc ggt gtt tct 2944
His Gln Ile Phe Gly Thr Ala Tyr Gly Val Leu Phe Ser Gly Val Ser
620 625 630
tgg acc atg aag ata gga ata ggg att ctg ctg aca tgg cta gga tta 2992
Trp Thr Met Lys Ile Gly Ile Gly Ile Leu Leu Thr Trp Leu Gly Leu
635 640 645
aac tca agg agc acg tcc ctt tca atg acg tgt atc gca gtt ggc atg 3040
Asn Ser Arg Ser Thr Ser Leu Ser Met Thr Cys Ile Ala Val Gly Met
650 655 660 665
gtc acg ctg tac cta gga gtc atg gtt cag gcg taataaagat ctgctgtgcc 3093
Val Thr Leu Tyr Leu Gly Val Met Val Gln Ala
670 675
ttctagttgc cagccatctg ttgtttgccc ctcccccgtg ccttccttga ccctggaagg 3153
tgccactccc actgtccttt cctaataaaa tgaggaaatt gcatcgcatt gtctgagtag 3213
gtgtcattct attctggggg gtggggtggg gcaggacagc aagggggagg attgggaaga 3273
caatagcagg catgctgggg atgcggtggg ctctatggct cgagcatggt catagctgtt 3333
tcctgtgtga aattgttatc cgctcacaat tccacacaac atacgagccg gaagcataaa 3393
gtgtaaagcc tggggtgcct aatgagtgag ctaactcaca ttaattgcgt tgcgctcact 3453
gcccgctttc cagtcgggaa acctgtcgtg ccagctgcat taatgaatcg gccaacgcgc 3513
ggggagaggc ggtttgcgta ttgggcgctc ttccgcttcc tcgctcactg actcgctgcg 3573
ctcggtcgtt cggctgcggc gagcggtatc agctcactca aaggcggtaa tacggttatc 3633
cacagaatca ggggataacg caggaaagaa catgtgagca aaaggccagc aaaaggccag 3693
gaaccgtaaa aaggccgcgt tgctggcgtt tttccatagg ctccgccccc ctgacgagca 3753
tcacaaaaat cgacgctcaa gtcagaggtg gcgaaacccg acaggactat aaagatacca 3813
ggcgtttccc cctggaagct ccctcgtgcg ctctcctgtt ccgaccctgc cgcttaccgg 3873
atacctgtcc gcctttctcc cttcgggaag cgtggcgctt tctcatagct cacgctgtag 3933
gtatctcagt tcggtgtagg tcgttcgctc caagctgggc tgtgtgcacg aaccccccgt 3993
tcagcccgac cgctgcgcct tatccggtaa ctatcgtctt gagtccaacc cggtaagaca 4053
cgacttatcg ccactggcag cagccactgg taacaggatt agcagagcga ggtatgtagg 4113
cggtgctaca gagttcttga agtggtggcc taactacggc tacactagaa gaacagtatt 4173
tggtatctgc gctctgctga agccagttac cttcggaaaa agagttggta gctcttgatc 4233
cggcaaacaa accaccgctg gtagcggtgg tttttttgtt tgcaagcagc agattacgcg 4293
cagaaaaaaa ggatctcaag aagatccttt gatcttttct acggggtctg acgctcagtg 4353
gaacgaaaac tcacgttaag ggattttggt catgagatta tcaaaaagga tcttcaccta 4413
gatcctttta aattaaaaat gaagttttaa atcaatctaa agtatatatg agtaaacttg 4473
gtctgacagt tagaaaaact catcgagcat caaatgaaac tgcaatttat tcatatcagg 4533
attatcaata ccatattttt gaaaaagccg tttctgtaat gaaggagaaa actcaccgag 4593
gcagttccat aggatggcaa gatcctggta tcggtctgcg attccgactc gtccaacatc 4653
aatacaacct attaatttcc cctcgtcaaa aataaggtta tcaagtgaga aatcaccatg 4713
agtgacgact gaatccggtg agaatggcaa aagtttatgc atttctttcc agacttgttc 4773
aacaggccag ccattacgct cgtcatcaaa atcactcgca tcaaccaaac cgttattcat 4833
tcgtgattgc gcctgagcga gacgaaatac gcgatcgctg ttaaaaggac aattacaaac 4893
aggaatcgaa tgcaaccggc gcaggaacac tgccagcgca tcaacaatat tttcacctga 4953
atcaggatat tcttctaata cctggaatgc tgttttccca gggatcgcag tggtgagtaa 5013
ccatgcatca tcaggagtac ggataaaatg cttgatggtc ggaagaggca taaattccgt 5073
cagccagttt agtctgacca tctcatctgt aacatcattg gcaacgctac ctttgccatg 5133
tttcagaaac aactctggcg catcgggctt cccatacaat cgatagattg tcgcacctga 5193
ttgcccgaca ttatcgcgag cccatttata cccatataaa tcagcatcca tgttggaatt 5253
taatcgcggc ctagagcaag acgtttcccg ttgaatatgg ctcatactct tcctttttca 5313
atattattga agcatttatc agggttattg tctcatgagc ggatacatat ttgaatgtat 5373
ttagaaaaat aaacaaatag gggttccgcg cacatttccc cgaaaagtgc cacctgacgt 5433
ctaagaaacc attattatca tgacattaac ctataaaaat aggcgtatca cgaggccctt 5493
tcgtc 5498
<210> 2
<211> 676
<212> PRT
<213> Dengue virus
<400> 2
Met Ser Val Thr Met Leu Leu Met Leu Leu Pro Thr Ala Leu Ala Phe
1 5 10 15
His Leu Thr Thr Arg Gly Gly Glu Pro His Met Ile Val Ser Lys Gln
20 25 30
Glu Arg Gly Lys Ser Leu Leu Phe Lys Thr Ser Ala Gly Val Asn Met
35 40 45
Cys Thr Leu Ile Ala Met Asp Leu Gly Glu Leu Cys Glu Asp Thr Met
50 55 60
Thr Tyr Lys Cys Pro Arg Ile Thr Glu Thr Glu Pro Asp Asp Val Asp
65 70 75 80
Cys Trp Cys Asn Ala Thr Glu Thr Trp Val Thr Tyr Gly Thr Cys Ser
85 90 95
Gln Thr Gly Glu His Arg Arg Asp Lys Arg Ser Val Ala Leu Ala Pro
100 105 110
His Val Gly Leu Gly Leu Glu Thr Arg Thr Glu Thr Trp Met Ser Ser
115 120 125
Glu Gly Ala Trp Lys Gln Ile Gln Lys Val Glu Thr Trp Ala Leu Arg
130 135 140
His Pro Gly Phe Thr Val Ile Ala Leu Phe Leu Ala His Ala Ile Gly
145 150 155 160
Thr Ser Ile Thr Gln Lys Gly Ile Ile Phe Ile Leu Leu Met Leu Val
165 170 175
Thr Pro Ser Met Ala Met Arg Cys Val Gly Ile Gly Asn Arg Asp Phe
180 185 190
Val Glu Gly Leu Ser Gly Ala Thr Trp Val Asp Val Val Leu Glu His
195 200 205
Gly Ser Cys Val Thr Thr Met Ala Lys Asp Lys Pro Thr Leu Asp Ile
210 215 220
Glu Leu Leu Lys Thr Glu Val Thr Asn Pro Ala Val Leu Arg Lys Leu
225 230 235 240
Cys Ile Glu Ala Lys Ile Ser Asn Thr Thr Thr Asp Ser Arg Cys Pro
245 250 255
Thr Gln Gly Glu Ala Thr Leu Val Glu Glu Gln Asp Thr Asn Phe Val
260 265 270
Cys Arg Arg Thr Phe Val Asp Arg Gly Trp Gly Asn Gly Cys Gly Leu
275 280 285
Ala Gly Lys Gly Ser Leu Ile Thr Cys Ala Lys Phe Lys Cys Val Thr
290 295 300
Lys Leu Glu Gly Lys Ile Val Gln Tyr Glu Asn Leu Lys Tyr Ser Val
305 310 315 320
Ile Val Thr Val His Thr Gly Asp Gln His Gln Val Gly Asn Glu Thr
325 330 335
Thr Glu His Gly Thr Thr Ala Thr Ile Thr Pro Gln Ala Pro Thr Ser
340 345 350
Glu Ile Gln Leu Thr Asp Tyr Gly Ala Leu Thr Leu Asp Cys Ser Pro
355 360 365
Arg Thr Gly Leu Asp Phe Asn Glu Met Val Leu Leu Thr Met Glu Lys
370 375 380
Lys Ser Trp Leu Val His Lys Gln Trp Phe Leu Asp Leu Pro Leu Pro
385 390 395 400
Trp Thr Ser Gly Ala Ser Thr Ser Gln Glu Thr Trp Asn Arg Gln Asp
405 410 415
Leu Leu Val Thr Phe Lys Thr Ala His Ala Lys Lys Gln Glu Val Val
420 425 430
Val Leu Gly Ser Gln Glu Gly Ala Met His Thr Ala Leu Thr Gly Ala
435 440 445
Thr Glu Ile Gln Thr Ser Gly Thr Thr Thr Ile Phe Ala Gly His Leu
450 455 460
Lys Cys Arg Leu Lys Met Asp Lys Leu Thr Leu Lys Gly Met Ser Tyr
465 470 475 480
Val Met Cys Thr Gly Ser Phe Lys Leu Glu Lys Glu Val Ala Glu Thr
485 490 495
Gln His Gly Thr Val Leu Val Gln Val Lys Tyr Glu Gly Thr Asp Ala
500 505 510
Pro Cys Lys Ile Pro Phe Ser Ser Gln Asp Glu Lys Gly Val Thr Gln
515 520 525
Asn Gly Arg Leu Ile Thr Ala Asn Pro Ile Val Thr Asp Lys Glu Lys
530 535 540
Pro Val Asn Ile Glu Ala Glu Pro Pro Phe Gly Glu Ser Tyr Ile Val
545 550 555 560
Val Gly Ala Gly Glu Lys Ala Leu Lys Leu Ser Trp Phe Lys Lys Gly
565 570 575
Ser Ser Ile Gly Lys Met Phe Glu Ala Thr Ala Arg Gly Ala Arg Arg
580 585 590
Met Ala Ile Leu Gly Asp Thr Ala Trp Asp Phe Gly Ser Ile Gly Gly
595 600 605
Val Phe Thr Ser Val Gly Lys Leu Ile His Gln Ile Phe Gly Thr Ala
610 615 620
Tyr Gly Val Leu Phe Ser Gly Val Ser Trp Thr Met Lys Ile Gly Ile
625 630 635 640
Gly Ile Leu Leu Thr Trp Leu Gly Leu Asn Ser Arg Ser Thr Ser Leu
645 650 655
Ser Met Thr Cys Ile Ala Val Gly Met Val Thr Leu Tyr Leu Gly Val
660 665 670
Met Val Gln Ala
675
<210> 3
<211> 5498
<212> DNA
<213> Dengue virus
<220>
<221> misc_feature
<223> DENV1 prM E (Env K203N)
<220>
<221> CDS
<222> (1046)..(3073)
<400> 3
tcgcgcgttt cggtgatgac ggtgaaaacc tctgacacat gcagctcccg gagacggtca 60
cagcttgtct gtaagcggat gccgggagca gacaagcccg tcagggcgcg tcagcgggtg 120
ttggcgggtg tcggggctgg cttaactatg cggcatcaga gcagattgta ctgagagtgc 180
accatatgcg gtgtgaaata ccgcacagat gcgtaaggag aaaataccgc atcaggcgcc 240
attcgccatt caggctgcgc aactgttggg aagggcgatc ggtgcgggcc tcttcgctat 300
tacgccagct ggcgaaaggg ggatgtgctg caaggcgatt aagttgggta acgccagggt 360
tttcccagtc acgacgttgt aaaacgacgg ccagtgaatt gacgcgtttg acattgatta 420
ttgactagtt attaatagta atcaattacg gggtcattag ttcatagccc atatatggag 480
ttccgcgtta cataacttac ggtaaatggc ccgcctggct gaccgcccaa cgacccccgc 540
ccattgacgt caataatgac gtatgttccc atagtaacgc caatagggac tttccattga 600
cgtcaatggg tggagtattt acggtaaact gcccacttgg cagtacatca agtgtatcat 660
atgccaagta cgccccctat tgacgtcaat gacggtaaat ggcccgcctg gcattatgcc 720
cagtacatga ccttatggga ctttcctact tggcagtaca tctacgtatt agtcatcgct 780
attaccatgg tgatgcggtt ttggcagtac atcaatgggc gtggatagcg gtttgactca 840
cggggatttc caagtctcca ccccattgac gtcaatggga gtttgttttg gcaccaaaat 900
caacgggact ttccaaaatg tcgtaacaac tccgccccat tgacgcaaat gggcggtagg 960
cgtgtacggt gggaggtcta tataagcaga gctcgtttag tgaaccgtca gataactgca 1020
ggtcgacgat atcgcggccg ccacc atg tcg gtg acc atg ctc ctc atg ctg 1072
Met Ser Val Thr Met Leu Leu Met Leu
1 5
ctg ccc aca gcc ctg gcg ttc cat ctg acc acc cga ggg gga gag ccg 1120
Leu Pro Thr Ala Leu Ala Phe His Leu Thr Thr Arg Gly Gly Glu Pro
10 15 20 25
cac atg ata gtt agc aag cag gaa aga gga aaa tca ctt ttg ttt aag 1168
His Met Ile Val Ser Lys Gln Glu Arg Gly Lys Ser Leu Leu Phe Lys
30 35 40
acc tct gca ggt gtc aac atg tgc acc ctt att gca atg gat ttg gga 1216
Thr Ser Ala Gly Val Asn Met Cys Thr Leu Ile Ala Met Asp Leu Gly
45 50 55
gag tta tgt gag gac aca atg acc tac aaa tgc ccc cgg atc act gag 1264
Glu Leu Cys Glu Asp Thr Met Thr Tyr Lys Cys Pro Arg Ile Thr Glu
60 65 70
acg gaa cca gat gac gtt gac tgt tgg tgc aat gcc acg gag aca tgg 1312
Thr Glu Pro Asp Asp Val Asp Cys Trp Cys Asn Ala Thr Glu Thr Trp
75 80 85
gtg acc tat gga aca tgt tct caa act ggt gaa cac cga cga gac aaa 1360
Val Thr Tyr Gly Thr Cys Ser Gln Thr Gly Glu His Arg Arg Asp Lys
90 95 100 105
cgt tcc gtc gca ctg gca cca cac gta ggg ctt ggt cta gaa aca aga 1408
Arg Ser Val Ala Leu Ala Pro His Val Gly Leu Gly Leu Glu Thr Arg
110 115 120
acc gaa acg tgg atg tcc tct gaa ggc gct tgg aaa caa ata caa aaa 1456
Thr Glu Thr Trp Met Ser Ser Glu Gly Ala Trp Lys Gln Ile Gln Lys
125 130 135
gtg gag acc tgg gct ctg aga cac cca gga ttc acg gtg ata gcc ctt 1504
Val Glu Thr Trp Ala Leu Arg His Pro Gly Phe Thr Val Ile Ala Leu
140 145 150
ttt cta gca cat gcc ata gga aca tcc atc acc cag aaa ggg atc att 1552
Phe Leu Ala His Ala Ile Gly Thr Ser Ile Thr Gln Lys Gly Ile Ile
155 160 165
ttt att ttg ctg atg ctg gta act cca tcc atg gcc atg cgg tgc gtg 1600
Phe Ile Leu Leu Met Leu Val Thr Pro Ser Met Ala Met Arg Cys Val
170 175 180 185
gga ata ggc aac aga gac ttc gtg gaa gga ctg tca gga gct acg tgg 1648
Gly Ile Gly Asn Arg Asp Phe Val Glu Gly Leu Ser Gly Ala Thr Trp
190 195 200
gtg gat gtg gta ctg gag cat gga agt tgc gtc act acc atg gca aaa 1696
Val Asp Val Val Leu Glu His Gly Ser Cys Val Thr Thr Met Ala Lys
205 210 215
gac aaa cca aca ctg gac att gaa ctc ttg aag acg gag gtc aca aac 1744
Asp Lys Pro Thr Leu Asp Ile Glu Leu Leu Lys Thr Glu Val Thr Asn
220 225 230
cct gcc gtc ctg cgc aaa ctg tgc att gaa gct aaa ata tca aac acc 1792
Pro Ala Val Leu Arg Lys Leu Cys Ile Glu Ala Lys Ile Ser Asn Thr
235 240 245
acc acc gat tcg aga tgt cca aca caa gga gaa gcc acg ctg gtg gaa 1840
Thr Thr Asp Ser Arg Cys Pro Thr Gln Gly Glu Ala Thr Leu Val Glu
250 255 260 265
gaa cag gac acg aac ttt gtg tgt cga cga acg ttc gtg gac aga ggc 1888
Glu Gln Asp Thr Asn Phe Val Cys Arg Arg Thr Phe Val Asp Arg Gly
270 275 280
tgg ggc aat ggt tgt ggg cta ttc gga aaa ggt agc tta ata acg tgt 1936
Trp Gly Asn Gly Cys Gly Leu Phe Gly Lys Gly Ser Leu Ile Thr Cys
285 290 295
gct aag ttt aag tgt gtg aca aaa ctg gaa gga aag ata gtc caa tat 1984
Ala Lys Phe Lys Cys Val Thr Lys Leu Glu Gly Lys Ile Val Gln Tyr
300 305 310
gaa aac tta aaa tat tca gtg ata gtc acc gta cac act gga gac cag 2032
Glu Asn Leu Lys Tyr Ser Val Ile Val Thr Val His Thr Gly Asp Gln
315 320 325
cac caa gtt gga aat gag acc aca gaa cat gga aca act gca acc ata 2080
His Gln Val Gly Asn Glu Thr Thr Glu His Gly Thr Thr Ala Thr Ile
330 335 340 345
aca cct caa gct ccc acg tcg gaa ata cag ctg aca gac tac gga gct 2128
Thr Pro Gln Ala Pro Thr Ser Glu Ile Gln Leu Thr Asp Tyr Gly Ala
350 355 360
cta aca ttg gat tgt tca cct aga aca ggg cta gac ttt aat gag atg 2176
Leu Thr Leu Asp Cys Ser Pro Arg Thr Gly Leu Asp Phe Asn Glu Met
365 370 375
gtg ttg ttg aca atg gaa aat aaa tca tgg ctc gtc cac aaa caa tgg 2224
Val Leu Leu Thr Met Glu Asn Lys Ser Trp Leu Val His Lys Gln Trp
380 385 390
ttt cta gac tta cca ctg cct tgg acc tcg ggg gct tca aca tcc caa 2272
Phe Leu Asp Leu Pro Leu Pro Trp Thr Ser Gly Ala Ser Thr Ser Gln
395 400 405
gag act tgg aat aga caa gac ttg ctg gtc aca ttt aag aca gct cat 2320
Glu Thr Trp Asn Arg Gln Asp Leu Leu Val Thr Phe Lys Thr Ala His
410 415 420 425
gca aaa aag cag gaa gta gtc gta cta gga tca caa gaa gga gca atg 2368
Ala Lys Lys Gln Glu Val Val Val Leu Gly Ser Gln Glu Gly Ala Met
430 435 440
cac act gcg ttg act gga gcg aca gaa atc caa acg tct gga acg aca 2416
His Thr Ala Leu Thr Gly Ala Thr Glu Ile Gln Thr Ser Gly Thr Thr
445 450 455
aca att ttt gca gga cac ctg aaa tgc aga cta aaa atg gat aaa ctg 2464
Thr Ile Phe Ala Gly His Leu Lys Cys Arg Leu Lys Met Asp Lys Leu
460 465 470
act tta aaa ggg atg tca tat gta atg tgc aca ggg tca ttc aag tta 2512
Thr Leu Lys Gly Met Ser Tyr Val Met Cys Thr Gly Ser Phe Lys Leu
475 480 485
gag aag gaa gtg gct gag acc cag cat gga act gtt cta gtg cag gtt 2560
Glu Lys Glu Val Ala Glu Thr Gln His Gly Thr Val Leu Val Gln Val
490 495 500 505
aaa tac gaa gga aca gat gca cca tgc aag atc ccc ttc tcg tcc caa 2608
Lys Tyr Glu Gly Thr Asp Ala Pro Cys Lys Ile Pro Phe Ser Ser Gln
510 515 520
gat gag aag gga gta acc cag aat ggg aga ttg ata aca gcc aac ccc 2656
Asp Glu Lys Gly Val Thr Gln Asn Gly Arg Leu Ile Thr Ala Asn Pro
525 530 535
ata gtc act gac aaa gaa aaa cca gtc aac att gaa gcg gag cca cct 2704
Ile Val Thr Asp Lys Glu Lys Pro Val Asn Ile Glu Ala Glu Pro Pro
540 545 550
ttt ggt gag agc tac att gtg gta gga gca ggt gaa aaa gct ttg aaa 2752
Phe Gly Glu Ser Tyr Ile Val Val Gly Ala Gly Glu Lys Ala Leu Lys
555 560 565
cta agc tgg ttc aag aag gga agc agt ata ggg aaa atg ttt gaa gca 2800
Leu Ser Trp Phe Lys Lys Gly Ser Ser Ile Gly Lys Met Phe Glu Ala
570 575 580 585
act gcc cgt gga gca cga agg atg gcc atc ctg gga gac act gca tgg 2848
Thr Ala Arg Gly Ala Arg Arg Met Ala Ile Leu Gly Asp Thr Ala Trp
590 595 600
gac ttc ggt tct ata gga ggg gtg ttc acg tct gtg gga aaa ctg ata 2896
Asp Phe Gly Ser Ile Gly Gly Val Phe Thr Ser Val Gly Lys Leu Ile
605 610 615
cac cag att ttt ggg act gcg tat gga gtt ttg ttc agc ggt gtt tct 2944
His Gln Ile Phe Gly Thr Ala Tyr Gly Val Leu Phe Ser Gly Val Ser
620 625 630
tgg acc atg aag ata gga ata ggg att ctg ctg aca tgg cta gga tta 2992
Trp Thr Met Lys Ile Gly Ile Gly Ile Leu Leu Thr Trp Leu Gly Leu
635 640 645
aac tca agg agc acg tcc ctt tca atg acg tgt atc gca gtt ggc atg 3040
Asn Ser Arg Ser Thr Ser Leu Ser Met Thr Cys Ile Ala Val Gly Met
650 655 660 665
gtc acg ctg tac cta gga gtc atg gtt cag gcg taataaagat ctgctgtgcc 3093
Val Thr Leu Tyr Leu Gly Val Met Val Gln Ala
670 675
ttctagttgc cagccatctg ttgtttgccc ctcccccgtg ccttccttga ccctggaagg 3153
tgccactccc actgtccttt cctaataaaa tgaggaaatt gcatcgcatt gtctgagtag 3213
gtgtcattct attctggggg gtggggtggg gcaggacagc aagggggagg attgggaaga 3273
caatagcagg catgctgggg atgcggtggg ctctatggct cgagcatggt catagctgtt 3333
tcctgtgtga aattgttatc cgctcacaat tccacacaac atacgagccg gaagcataaa 3393
gtgtaaagcc tggggtgcct aatgagtgag ctaactcaca ttaattgcgt tgcgctcact 3453
gcccgctttc cagtcgggaa acctgtcgtg ccagctgcat taatgaatcg gccaacgcgc 3513
ggggagaggc ggtttgcgta ttgggcgctc ttccgcttcc tcgctcactg actcgctgcg 3573
ctcggtcgtt cggctgcggc gagcggtatc agctcactca aaggcggtaa tacggttatc 3633
cacagaatca ggggataacg caggaaagaa catgtgagca aaaggccagc aaaaggccag 3693
gaaccgtaaa aaggccgcgt tgctggcgtt tttccatagg ctccgccccc ctgacgagca 3753
tcacaaaaat cgacgctcaa gtcagaggtg gcgaaacccg acaggactat aaagatacca 3813
ggcgtttccc cctggaagct ccctcgtgcg ctctcctgtt ccgaccctgc cgcttaccgg 3873
atacctgtcc gcctttctcc cttcgggaag cgtggcgctt tctcatagct cacgctgtag 3933
gtatctcagt tcggtgtagg tcgttcgctc caagctgggc tgtgtgcacg aaccccccgt 3993
tcagcccgac cgctgcgcct tatccggtaa ctatcgtctt gagtccaacc cggtaagaca 4053
cgacttatcg ccactggcag cagccactgg taacaggatt agcagagcga ggtatgtagg 4113
cggtgctaca gagttcttga agtggtggcc taactacggc tacactagaa gaacagtatt 4173
tggtatctgc gctctgctga agccagttac cttcggaaaa agagttggta gctcttgatc 4233
cggcaaacaa accaccgctg gtagcggtgg tttttttgtt tgcaagcagc agattacgcg 4293
cagaaaaaaa ggatctcaag aagatccttt gatcttttct acggggtctg acgctcagtg 4353
gaacgaaaac tcacgttaag ggattttggt catgagatta tcaaaaagga tcttcaccta 4413
gatcctttta aattaaaaat gaagttttaa atcaatctaa agtatatatg agtaaacttg 4473
gtctgacagt tagaaaaact catcgagcat caaatgaaac tgcaatttat tcatatcagg 4533
attatcaata ccatattttt gaaaaagccg tttctgtaat gaaggagaaa actcaccgag 4593
gcagttccat aggatggcaa gatcctggta tcggtctgcg attccgactc gtccaacatc 4653
aatacaacct attaatttcc cctcgtcaaa aataaggtta tcaagtgaga aatcaccatg 4713
agtgacgact gaatccggtg agaatggcaa aagtttatgc atttctttcc agacttgttc 4773
aacaggccag ccattacgct cgtcatcaaa atcactcgca tcaaccaaac cgttattcat 4833
tcgtgattgc gcctgagcga gacgaaatac gcgatcgctg ttaaaaggac aattacaaac 4893
aggaatcgaa tgcaaccggc gcaggaacac tgccagcgca tcaacaatat tttcacctga 4953
atcaggatat tcttctaata cctggaatgc tgttttccca gggatcgcag tggtgagtaa 5013
ccatgcatca tcaggagtac ggataaaatg cttgatggtc ggaagaggca taaattccgt 5073
cagccagttt agtctgacca tctcatctgt aacatcattg gcaacgctac ctttgccatg 5133
tttcagaaac aactctggcg catcgggctt cccatacaat cgatagattg tcgcacctga 5193
ttgcccgaca ttatcgcgag cccatttata cccatataaa tcagcatcca tgttggaatt 5253
taatcgcggc ctagagcaag acgtttcccg ttgaatatgg ctcatactct tcctttttca 5313
atattattga agcatttatc agggttattg tctcatgagc ggatacatat ttgaatgtat 5373
ttagaaaaat aaacaaatag gggttccgcg cacatttccc cgaaaagtgc cacctgacgt 5433
ctaagaaacc attattatca tgacattaac ctataaaaat aggcgtatca cgaggccctt 5493
tcgtc 5498
<210> 4
<211> 676
<212> PRT
<213> Dengue virus
<400> 4
Met Ser Val Thr Met Leu Leu Met Leu Leu Pro Thr Ala Leu Ala Phe
1 5 10 15
His Leu Thr Thr Arg Gly Gly Glu Pro His Met Ile Val Ser Lys Gln
20 25 30
Glu Arg Gly Lys Ser Leu Leu Phe Lys Thr Ser Ala Gly Val Asn Met
35 40 45
Cys Thr Leu Ile Ala Met Asp Leu Gly Glu Leu Cys Glu Asp Thr Met
50 55 60
Thr Tyr Lys Cys Pro Arg Ile Thr Glu Thr Glu Pro Asp Asp Val Asp
65 70 75 80
Cys Trp Cys Asn Ala Thr Glu Thr Trp Val Thr Tyr Gly Thr Cys Ser
85 90 95
Gln Thr Gly Glu His Arg Arg Asp Lys Arg Ser Val Ala Leu Ala Pro
100 105 110
His Val Gly Leu Gly Leu Glu Thr Arg Thr Glu Thr Trp Met Ser Ser
115 120 125
Glu Gly Ala Trp Lys Gln Ile Gln Lys Val Glu Thr Trp Ala Leu Arg
130 135 140
His Pro Gly Phe Thr Val Ile Ala Leu Phe Leu Ala His Ala Ile Gly
145 150 155 160
Thr Ser Ile Thr Gln Lys Gly Ile Ile Phe Ile Leu Leu Met Leu Val
165 170 175
Thr Pro Ser Met Ala Met Arg Cys Val Gly Ile Gly Asn Arg Asp Phe
180 185 190
Val Glu Gly Leu Ser Gly Ala Thr Trp Val Asp Val Val Leu Glu His
195 200 205
Gly Ser Cys Val Thr Thr Met Ala Lys Asp Lys Pro Thr Leu Asp Ile
210 215 220
Glu Leu Leu Lys Thr Glu Val Thr Asn Pro Ala Val Leu Arg Lys Leu
225 230 235 240
Cys Ile Glu Ala Lys Ile Ser Asn Thr Thr Thr Asp Ser Arg Cys Pro
245 250 255
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260 265 270
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Ile Val Thr Val His Thr Gly Asp Gln His Gln Val Gly Asn Glu Thr
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340 345 350
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Arg Thr Gly Leu Asp Phe Asn Glu Met Val Leu Leu Thr Met Glu Asn
370 375 380
Lys Ser Trp Leu Val His Lys Gln Trp Phe Leu Asp Leu Pro Leu Pro
385 390 395 400
Trp Thr Ser Gly Ala Ser Thr Ser Gln Glu Thr Trp Asn Arg Gln Asp
405 410 415
Leu Leu Val Thr Phe Lys Thr Ala His Ala Lys Lys Gln Glu Val Val
420 425 430
Val Leu Gly Ser Gln Glu Gly Ala Met His Thr Ala Leu Thr Gly Ala
435 440 445
Thr Glu Ile Gln Thr Ser Gly Thr Thr Thr Ile Phe Ala Gly His Leu
450 455 460
Lys Cys Arg Leu Lys Met Asp Lys Leu Thr Leu Lys Gly Met Ser Tyr
465 470 475 480
Val Met Cys Thr Gly Ser Phe Lys Leu Glu Lys Glu Val Ala Glu Thr
485 490 495
Gln His Gly Thr Val Leu Val Gln Val Lys Tyr Glu Gly Thr Asp Ala
500 505 510
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545 550 555 560
Val Gly Ala Gly Glu Lys Ala Leu Lys Leu Ser Trp Phe Lys Lys Gly
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Ser Ser Ile Gly Lys Met Phe Glu Ala Thr Ala Arg Gly Ala Arg Arg
580 585 590
Met Ala Ile Leu Gly Asp Thr Ala Trp Asp Phe Gly Ser Ile Gly Gly
595 600 605
Val Phe Thr Ser Val Gly Lys Leu Ile His Gln Ile Phe Gly Thr Ala
610 615 620
Tyr Gly Val Leu Phe Ser Gly Val Ser Trp Thr Met Lys Ile Gly Ile
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Gly Ile Leu Leu Thr Trp Leu Gly Leu Asn Ser Arg Ser Thr Ser Leu
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Met Val Gln Ala
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<212> DNA
<213> Dengue virus
<220>
<221> misc_feature
<223> DENV1 capsid K85A_K86A mutant
<220>
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attcgccatt caggctgcgc aactgttggg aagggcgatc ggtgcgggcc tcttcgctat 300
tacgccagct ggcgaaaggg ggatgtgctg caaggcgatt aagttgggta acgccagggt 360
tttcccagtc acgacgttgt aaaacgacgg ccagtgaatt gacgcgtttg acattgatta 420
ttgactagtt attaatagta atcaattacg gggtcattag ttcatagccc atatatggag 480
ttccgcgtta cataacttac ggtaaatggc ccgcctggct gaccgcccaa cgacccccgc 540
ccattgacgt caataatgac gtatgttccc atagtaacgc caatagggac tttccattga 600
cgtcaatggg tggagtattt acggtaaact gcccacttgg cagtacatca agtgtatcat 660
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cagtacatga ccttatggga ctttcctact tggcagtaca tctacgtatt agtcatcgct 780
attaccatgg tgatgcggtt ttggcagtac atcaatgggc gtggatagcg gtttgactca 840
cggggatttc caagtctcca ccccattgac gtcaatggga gtttgttttg gcaccaaaat 900
caacgggact ttccaaaatg tcgtaacaac tccgccccat tgacgcaaat gggcggtagg 960
cgtgtacggt gggaggtcta tataagcaga gctcgtttag tgaaccgtca gataactgca 1020
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cga ccg tct ttc aat atg ctg aaa cgc gcg aga aac cgc gtg tca act 1120
Arg Pro Ser Phe Asn Met Leu Lys Arg Ala Arg Asn Arg Val Ser Thr
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gtt tca cag ttg gcg aag aga ttc tca aaa gga ttg ctt tca ggc caa 1168
Val Ser Gln Leu Ala Lys Arg Phe Ser Lys Gly Leu Leu Ser Gly Gln
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gga ccc atg aaa ttg gtg atg gct ttt ata gca ttc cta aga ttt cta 1216
Gly Pro Met Lys Leu Val Met Ala Phe Ile Ala Phe Leu Arg Phe Leu
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gcc ata cct cca aca gca gga att ttg gct aga tgg ggc tca ttc aag 1264
Ala Ile Pro Pro Thr Ala Gly Ile Leu Ala Arg Trp Gly Ser Phe Lys
60 65 70
aag aat gga gcg atc aaa gtg tta cgg ggt ttc gcg gca gaa atc tca 1312
Lys Asn Gly Ala Ile Lys Val Leu Arg Gly Phe Ala Ala Glu Ile Ser
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aac atg ttg aac ata atg aac agg agg aaa aga taataaagat ctgctgtgcc 1365
Asn Met Leu Asn Ile Met Asn Arg Arg Lys Arg
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ttctagttgc cagccatctg ttgtttgccc ctcccccgtg ccttccttga ccctggaagg 1425
tgccactccc actgtccttt cctaataaaa tgaggaaatt gcatcgcatt gtctgagtag 1485
gtgtcattct attctggggg gtggggtggg gcaggacagc aagggggagg attgggaaga 1545
caatagcagg catgctgggg atgcggtggg ctctatggct cgagcatggt catagctgtt 1605
tcctgtgtga aattgttatc cgctcacaat tccacacaac atacgagccg gaagcataaa 1665
gtgtaaagcc tggggtgcct aatgagtgag ctaactcaca ttaattgcgt tgcgctcact 1725
gcccgctttc cagtcgggaa acctgtcgtg ccagctgcat taatgaatcg gccaacgcgc 1785
ggggagaggc ggtttgcgta ttgggcgctc ttccgcttcc tcgctcactg actcgctgcg 1845
ctcggtcgtt cggctgcggc gagcggtatc agctcactca aaggcggtaa tacggttatc 1905
cacagaatca ggggataacg caggaaagaa catgtgagca aaaggccagc aaaaggccag 1965
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tcacaaaaat cgacgctcaa gtcagaggtg gcgaaacccg acaggactat aaagatacca 2085
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tcgtgattgc gcctgagcga gacgaaatac gcgatcgctg ttaaaaggac aattacaaac 3165
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ccatgcatca tcaggagtac ggataaaatg cttgatggtc ggaagaggca taaattccgt 3345
cagccagttt agtctgacca tctcatctgt aacatcattg gcaacgctac ctttgccatg 3405
tttcagaaac aactctggcg catcgggctt cccatacaat cgatagattg tcgcacctga 3465
ttgcccgaca ttatcgcgag cccatttata cccatataaa tcagcatcca tgttggaatt 3525
taatcgcggc ctagagcaag acgtttcccg ttgaatatgg ctcatactct tcctttttca 3585
atattattga agcatttatc agggttattg tctcatgagc ggatacatat ttgaatgtat 3645
ttagaaaaat aaacaaatag gggttccgcg cacatttccc cgaaaagtgc cacctgacgt 3705
ctaagaaacc attattatca tgacattaac ctataaaaat aggcgtatca cgaggccctt 3765
tcgtc 3770
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<211> 100
<212> PRT
<213> Dengue virus
<400> 6
Met Asn Asn Gln Arg Lys Lys Thr Gly Arg Pro Ser Phe Asn Met Leu
1 5 10 15
Lys Arg Ala Arg Asn Arg Val Ser Thr Val Ser Gln Leu Ala Lys Arg
20 25 30
Phe Ser Lys Gly Leu Leu Ser Gly Gln Gly Pro Met Lys Leu Val Met
35 40 45
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85 90 95
Arg Arg Lys Arg
100
<210> 7
<211> 6679
<212> DNA
<213> Dengue virus
<220>
<221> misc_feature
<223> Chimera DENV2 prM E_chimeric DENV1 E
<220>
<221> CDS
<222> (906)..(2933)
<220>
<221> misc_feature
<222> (906)..(2336)
<223> DENV2 prM E region
<220>
<221> misc_feature
<222> (2337)..(2933)
<223> DENV1 E region
<400> 7
gaattcccat tgcatacgtt gtatccatat cataatatgt acatttatat tggctcatgt 60
ccaacattac cgccatgttg acattgatta ttgactagtt attaatagta atcaattacg 120
gggtcattag ttcatagccc atatatggag ttccgcgtta cataacttac ggtaaatggc 180
ccgcctggct gaccgcccaa cgacccccgc ccattgacgt caataatgac gtatgttccc 240
atagtaacgc caatagggac tttccattga cgtcaatggg tggagtattt acggtaaact 300
gcccacttgg cagtacatca agtgtatcat atgccaagta cgccccctat tgacgtcaat 360
gacggtaaat ggcccgcctg gcattatgcc cagtacatga ccttatggga ctttcctact 420
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gtcaatggga gtttgttttg gcaccaaaat caacgggact ttccaaaatg tcgtaacaac 600
tccgccccat tgacgcaaat gggcggtagg cgtgtacggt gggaggtcta tataagcaga 660
gctcgtttag tgaaccgtca gatcgcctgg agacgccatc cacgctgttt tgacctccat 720
agaagacacc gggaccgatc cagcctccgt taacggtgga gggcagtgta gtctgagcag 780
tactcgttgc tgccgcgcgc gccaccagac ataatagctg acagactaac agactgttcc 840
tttccatggg tcttttctgc agtcaccgtc gtcgacacgt gtgatcagat atcgcggccg 900
ccacc atg act gca ggc atg atc atc atg ctg att cca aca gtg atg gcg 950
Met Thr Ala Gly Met Ile Ile Met Leu Ile Pro Thr Val Met Ala
1 5 10 15
ttt cat ctg acc aca cgc aac gga gaa cca cac atg atc gtc agt aga 998
Phe His Leu Thr Thr Arg Asn Gly Glu Pro His Met Ile Val Ser Arg
20 25 30
caa gaa aaa ggg aaa agc ctt ctg ttt aag aca aag gac ggc acg aac 1046
Gln Glu Lys Gly Lys Ser Leu Leu Phe Lys Thr Lys Asp Gly Thr Asn
35 40 45
atg tgt acc ctc atg gcc atg gac ctt ggt gag ttg tgt gaa gac aca 1094
Met Cys Thr Leu Met Ala Met Asp Leu Gly Glu Leu Cys Glu Asp Thr
50 55 60
atc acg tat aaa tgt ccc ttt ctc aag cag aac gaa cca gaa gac ata 1142
Ile Thr Tyr Lys Cys Pro Phe Leu Lys Gln Asn Glu Pro Glu Asp Ile
65 70 75
gat tgt tgg tgc aac tcc acg tcc aca tgg gta act tat ggg aca tgt 1190
Asp Cys Trp Cys Asn Ser Thr Ser Thr Trp Val Thr Tyr Gly Thr Cys
80 85 90 95
acc acc aca gga gag cac aga aga gaa aaa aga tca gtg gcg ctt gtt 1238
Thr Thr Thr Gly Glu His Arg Arg Glu Lys Arg Ser Val Ala Leu Val
100 105 110
cca cac gtg gga atg gga ttg gag aca cga act gaa aca tgg atg tca 1286
Pro His Val Gly Met Gly Leu Glu Thr Arg Thr Glu Thr Trp Met Ser
115 120 125
tca gaa ggg gcc tgg aaa cat gcc cag aga att gaa act tgg att ctg 1334
Ser Glu Gly Ala Trp Lys His Ala Gln Arg Ile Glu Thr Trp Ile Leu
130 135 140
aga cat cca ggc ttt acc ata atg gcc gca atc ctg gca tac acc ata 1382
Arg His Pro Gly Phe Thr Ile Met Ala Ala Ile Leu Ala Tyr Thr Ile
145 150 155
gga acg acg cat ttc caa aga gtc ctg ata ttc atc cta ctg aca gcc 1430
Gly Thr Thr His Phe Gln Arg Val Leu Ile Phe Ile Leu Leu Thr Ala
160 165 170 175
atc gct cct tca atg aca atg cgc tgc ata gga ata tca aat agg gac 1478
Ile Ala Pro Ser Met Thr Met Arg Cys Ile Gly Ile Ser Asn Arg Asp
180 185 190
ttt gtg gaa gga gtg tca gga ggg agt tgg gtt gac ata gtt tta gaa 1526
Phe Val Glu Gly Val Ser Gly Gly Ser Trp Val Asp Ile Val Leu Glu
195 200 205
cat gga agt tgt gtg acg acg atg gca aaa aat aaa cca aca ctg gac 1574
His Gly Ser Cys Val Thr Thr Met Ala Lys Asn Lys Pro Thr Leu Asp
210 215 220
ttt gaa ctg ata aaa aca gaa gcc aaa caa ccc gcc acc tta agg aag 1622
Phe Glu Leu Ile Lys Thr Glu Ala Lys Gln Pro Ala Thr Leu Arg Lys
225 230 235
tac tgt ata gag gct aaa ctg acc aac acg aca aca gac tcg cgc tgc 1670
Tyr Cys Ile Glu Ala Lys Leu Thr Asn Thr Thr Thr Asp Ser Arg Cys
240 245 250 255
cca aca caa ggg gaa ccc acc ctg aat gaa gag cag gac aaa agg ttt 1718
Pro Thr Gln Gly Glu Pro Thr Leu Asn Glu Glu Gln Asp Lys Arg Phe
260 265 270
gtc tgc aaa cat tcc atg gta gac aga gga tgg gga aat gga tgt gga 1766
Val Cys Lys His Ser Met Val Asp Arg Gly Trp Gly Asn Gly Cys Gly
275 280 285
tta ttt gga aaa gga ggc atc gtg acc tgt gcc atg ttc aca tgc aaa 1814
Leu Phe Gly Lys Gly Gly Ile Val Thr Cys Ala Met Phe Thr Cys Lys
290 295 300
aag aac atg gag gga aaa att gtg cag cca gaa aac ctg gaa tac act 1862
Lys Asn Met Glu Gly Lys Ile Val Gln Pro Glu Asn Leu Glu Tyr Thr
305 310 315
gtc gtt ata aca cct cat tca ggg gaa gaa cat gca gtc gga aat gac 1910
Val Val Ile Thr Pro His Ser Gly Glu Glu His Ala Val Gly Asn Asp
320 325 330 335
aca gga aaa cat ggt aaa gaa gtc aag ata aca cca cag agc tcc atc 1958
Thr Gly Lys His Gly Lys Glu Val Lys Ile Thr Pro Gln Ser Ser Ile
340 345 350
aca gag gcg gaa ctg aca ggc tat ggc act gtt acg atg gag tgc tct 2006
Thr Glu Ala Glu Leu Thr Gly Tyr Gly Thr Val Thr Met Glu Cys Ser
355 360 365
cca aga acg ggc ctc gac ttc aat gag atg gtg ttg ctg caa atg aaa 2054
Pro Arg Thr Gly Leu Asp Phe Asn Glu Met Val Leu Leu Gln Met Lys
370 375 380
gac aaa gct tgg ctg gtg cac aga caa tgg ttc cta gac cta ccg ttg 2102
Asp Lys Ala Trp Leu Val His Arg Gln Trp Phe Leu Asp Leu Pro Leu
385 390 395
cca tgg ctg ccc gga gca gac aca caa gga tca aat tgg ata cag aaa 2150
Pro Trp Leu Pro Gly Ala Asp Thr Gln Gly Ser Asn Trp Ile Gln Lys
400 405 410 415
gag aca ctg gtc acc ttc aaa aat ccc cat gcg aaa aaa cag gat gtt 2198
Glu Thr Leu Val Thr Phe Lys Asn Pro His Ala Lys Lys Gln Asp Val
420 425 430
gtt gtc tta ggc tcc caa gag ggg gcc atg cat aca gca ctc aca ggg 2246
Val Val Leu Gly Ser Gln Glu Gly Ala Met His Thr Ala Leu Thr Gly
435 440 445
gct acg gaa atc cag atg tca tca gga aac ctg ctg ttc aca gga cat 2294
Ala Thr Glu Ile Gln Met Ser Ser Gly Asn Leu Leu Phe Thr Gly His
450 455 460
ctt aag tgc agg ctg aga atg gac aaa tta caa ctt aaa ggg atg tca 2342
Leu Lys Cys Arg Leu Arg Met Asp Lys Leu Gln Leu Lys Gly Met Ser
465 470 475
tat gta atg tgc aca ggg tca ttc aag tta gag aag gaa gtg gct gag 2390
Tyr Val Met Cys Thr Gly Ser Phe Lys Leu Glu Lys Glu Val Ala Glu
480 485 490 495
acc cag cat gga act gtt cta gtg cag gtt aaa tac gaa gga aca gat 2438
Thr Gln His Gly Thr Val Leu Val Gln Val Lys Tyr Glu Gly Thr Asp
500 505 510
gca cca tgc aag atc ccc ttc tcg tcc caa gat gag aag gga gta acc 2486
Ala Pro Cys Lys Ile Pro Phe Ser Ser Gln Asp Glu Lys Gly Val Thr
515 520 525
cag aat ggg aga ttg ata aca gcc aac ccc ata gtc act gac aaa gaa 2534
Gln Asn Gly Arg Leu Ile Thr Ala Asn Pro Ile Val Thr Asp Lys Glu
530 535 540
aaa cca gtc aac att gaa gcg gag cca cct ttt ggt gag agc tac att 2582
Lys Pro Val Asn Ile Glu Ala Glu Pro Pro Phe Gly Glu Ser Tyr Ile
545 550 555
gtg gta gga gca ggt gaa aaa gct ttg aaa cta agc tgg ttc aag aag 2630
Val Val Gly Ala Gly Glu Lys Ala Leu Lys Leu Ser Trp Phe Lys Lys
560 565 570 575
gga agc agt ata ggg aaa atg ttt gaa gca act gcc cgt gga gca cga 2678
Gly Ser Ser Ile Gly Lys Met Phe Glu Ala Thr Ala Arg Gly Ala Arg
580 585 590
agg atg gcc atc ctg gga gac act gca tgg gac ttc ggt tct ata gga 2726
Arg Met Ala Ile Leu Gly Asp Thr Ala Trp Asp Phe Gly Ser Ile Gly
595 600 605
ggg gtg ttc acg tct gtg gga aaa ctg ata cac cag att ttt ggg act 2774
Gly Val Phe Thr Ser Val Gly Lys Leu Ile His Gln Ile Phe Gly Thr
610 615 620
gcg tat gga gtt ttg ttc agc ggt gtt tct tgg acc atg aag ata gga 2822
Ala Tyr Gly Val Leu Phe Ser Gly Val Ser Trp Thr Met Lys Ile Gly
625 630 635
ata ggg att ctg ctg aca tgg cta gga tta aac tca agg agc acg tcc 2870
Ile Gly Ile Leu Leu Thr Trp Leu Gly Leu Asn Ser Arg Ser Thr Ser
640 645 650 655
ctt tca atg acg tgt atc gca gtt ggc atg gtc acg ctg tac cta gga 2918
Leu Ser Met Thr Cys Ile Ala Val Gly Met Val Thr Leu Tyr Leu Gly
660 665 670
gtc atg gtt cag gcg taataaagat ctgctgtgcc ttctagttgc cagccatctg 2973
Val Met Val Gln Ala
675
ttgtttgccc ctcccccgtg ccttccttga ccctggaagg tgccactccc actgtccttt 3033
cctaataaaa tgaggaaatt gcatcgcatt gtctgagtag gtgtcattct attctggggg 3093
gtggggtggg gcaggacagc aagggggagg attgggaaga caatagcagg catgctgggg 3153
atgcggtggg ctctatgggt acccaggtgc tgaagaattg acccggttcc tcctgggcca 3213
gaaagaagca ggcacatccc cttctctgtg acacaccctg tccacgcccc tggttcttag 3273
ttccagcccc actcatagga cactcatagc tcaggagggc tccgccttca atcccacccg 3333
ctaaagtact tggagcggtc tctccctccc tcatcagccc accaaaccaa acctagcctc 3393
caagagtggg aagaaattaa agcaagatag gctattaagt gcagagggag agaaaatgcc 3453
tccaacatgt gaggaagtaa tgagagaaat catagaattt taaggccatg atttaaggcc 3513
atcatggcct aagcttgaaa ggagatagga tcaaagcttg gcgtaatcat ggtcatagct 3573
gtttcctgtg tgaaattgtt atccgctcac aattccacac aacatacgag ccggaagcat 3633
aaagtgtaaa gcctggggtg cctaatgagt gagctaactc acattaattg cgttgcgctc 3693
actgcccgct ttccagtcgg gaaacctgtc gtgccagctg cattaatgaa tcggccaacg 3753
cgcggggaga ggcggtttgc gtattgggcg ctcttccgct tcctcgctca ctgactcgct 3813
gcgctcggtc gttcggctgc ggcgagcggt atcagctcac tcaaaggcgg taatacggtt 3873
atccacagaa tcaggggata acgcaggaaa gaacatgtga gcaaaaggcc agcaaaaggc 3933
caggaaccgt aaaaaggccg cgttgctggc gtttttccat aggctccgcc cccctgacga 3993
gcatcacaaa aatcgacgct caagtcagag gtggcgaaac ccgacaggac tataaagata 4053
ccaggcgttt ccccctggaa gctccctcgt gcgctctcct gttccgaccc tgccgcttac 4113
cggatacctg tccgcctttc tcccttcggg aagcgtggcg ctttctcata gctcacgctg 4173
taggtatctc agttcggtgt aggtcgttcg ctccaagctg ggctgtgtgc acgaaccccc 4233
cgttcagccc gaccgctgcg ccttatccgg taactatcgt cttgagtcca acccggtaag 4293
acacgactta tcgccactgg cagcagccac tggtaacagg attagcagag cgaggtatgt 4353
aggcggtgct acagagttct tgaagtggtg gcctaactac ggctacacta gaagaacagt 4413
atttggtatc tgcgctctgc tgaagccagt taccttcgga aaaagagttg gtagctcttg 4473
atccggcaaa caaaccaccg ctggtagcgg tggttttttt gtttgcaagc agcagattac 4533
gcgcagaaaa aaaggatctc aagaagatcc tttgatcttt tctacggggt ctgacgctca 4593
gtggaacgaa aactcacgtt aagggatttt ggtcatgaga ttatcaaaaa ggatcttcac 4653
ctagatcctt ttaaattaaa aatgaagttt taaatcaatc taaagtatat atgagtaaac 4713
ttggtctgac agttaccaat gcttaatcag tgaggcacct atctcagcga tctgtctatt 4773
tcgttcatcc atagttgcct gactccccgt cgtgtagata actacgatac gggagggctt 4833
accatctggc cccagtgctg caatgatacc gcgagaacca cgctcaccgg ctccagattt 4893
atcagcaata aaccagccag ccggaagggc cgagcgcaga agtggtcctg caactttatc 4953
cgcctccatc cagtctatta attgttgccg ggaagctaga gtaagtagtt cgccagttaa 5013
tagtttgcgc aacgttgttg ccattgctac aggcatcgtg gtgtcacgct cgtcgtttgg 5073
tatggcttca ttcagctccg gttcccaacg atcaaggcga gttacatgat cccccatgtt 5133
gtgcaaaaaa gcggttagct ccttcggtcc tccgatcgtt gtcagaagta agttggccgc 5193
agtgttatca ctcatggtta tggcagcact gcataattct cttactgtca tgccatccgt 5253
aagatgcttt tctgtgactg gtgagtactc aaccaagtca ttctgagaat agtgtatgcg 5313
gcgaccgagt tgctcttgcc cggcgtcaat acgggataat accgcgccac atagcagaac 5373
tttaaaagtg ctcatcattg gaaaacgttc ttcggggcga aaactctcaa ggatcttacc 5433
gctgttgaga tccagttcga tgtaacccac tcgtgcaccc aactgatctt cagcatcttt 5493
tactttcacc agcgtttctg ggtgagcaaa aacaggaagg caaaatgccg caaaaaaggg 5553
aataagggcg acacggaaat gttgaatact catactcttc ctttttcaat attattgaag 5613
catttatcag ggttattgtc tcatgagcgg atacatattt gaatgtattt agaaaaataa 5673
acaaataggg gttccgcgca catttccccg aaaagtgcca cctgacgtct aagaaaccat 5733
tattatcatg acattaacct ataaaaatag gcgtatcacg aggccctttc gggtcgcgcg 5793
tttcggtgat gacggtgaaa acctctgaca catgcagctc ccgttgacgg tcacagcttg 5853
tctgtaagcg gatgccggga gcagacaagc ccgtcagggc gcgtcagcgg gtgttggcgg 5913
gtgtcggggc tggcttaact atgcggcatc agagcagatt gtactgagag tgcaccataa 5973
aattgtaaac gttaatattt tgttaaaatt cgcgttaaat ttttgttaaa tcagctcatt 6033
ttttaaccaa taggccgaaa tcggcaaaat cccttataaa tcaaaagaat agcccgagat 6093
agggttgagt gttgttccag tttggaacaa gagtccacta ttaaagaacg tggactccaa 6153
cgtcaaaggg cgaaaaaccg tctatcaggg cgatggccca ctacgtgaac catcacccaa 6213
atcaagtttt ttggggtcga ggtgccgtaa agcactaaat cggaacccta aagggagccc 6273
ccgatttaga gcttgacggg gaaagccggc gaacgtggcg agaaaggaag ggaagaaagc 6333
gaaaggagcg ggcgctaggg cgctggcaag tgtagcggtc acgctgcgcg taaccaccac 6393
acccgccgcg cttaatgcgc cgctacaggg cgcgtactat ggttgctttg acgtatgcgg 6453
tgtgaaatac cgcacagatg cgtaaggaga aaataccgca tcaggcgcca ttcgccattc 6513
aggctgcgca actgttggga agggcgatcg gtgcgggcct cttcgctatt acgccagctg 6573
gcgaaagggg gatgtgctgc aaggcgatta agttgggtaa cgccagggtt ttcccagtca 6633
cgacgttgta aaacgacggc cagtgaattc catggtctca actttc 6679
<210> 8
<211> 676
<212> PRT
<213> Dengue virus
<400> 8
Met Thr Ala Gly Met Ile Ile Met Leu Ile Pro Thr Val Met Ala Phe
1 5 10 15
His Leu Thr Thr Arg Asn Gly Glu Pro His Met Ile Val Ser Arg Gln
20 25 30
Glu Lys Gly Lys Ser Leu Leu Phe Lys Thr Lys Asp Gly Thr Asn Met
35 40 45
Cys Thr Leu Met Ala Met Asp Leu Gly Glu Leu Cys Glu Asp Thr Ile
50 55 60
Thr Tyr Lys Cys Pro Phe Leu Lys Gln Asn Glu Pro Glu Asp Ile Asp
65 70 75 80
Cys Trp Cys Asn Ser Thr Ser Thr Trp Val Thr Tyr Gly Thr Cys Thr
85 90 95
Thr Thr Gly Glu His Arg Arg Glu Lys Arg Ser Val Ala Leu Val Pro
100 105 110
His Val Gly Met Gly Leu Glu Thr Arg Thr Glu Thr Trp Met Ser Ser
115 120 125
Glu Gly Ala Trp Lys His Ala Gln Arg Ile Glu Thr Trp Ile Leu Arg
130 135 140
His Pro Gly Phe Thr Ile Met Ala Ala Ile Leu Ala Tyr Thr Ile Gly
145 150 155 160
Thr Thr His Phe Gln Arg Val Leu Ile Phe Ile Leu Leu Thr Ala Ile
165 170 175
Ala Pro Ser Met Thr Met Arg Cys Ile Gly Ile Ser Asn Arg Asp Phe
180 185 190
Val Glu Gly Val Ser Gly Gly Ser Trp Val Asp Ile Val Leu Glu His
195 200 205
Gly Ser Cys Val Thr Thr Met Ala Lys Asn Lys Pro Thr Leu Asp Phe
210 215 220
Glu Leu Ile Lys Thr Glu Ala Lys Gln Pro Ala Thr Leu Arg Lys Tyr
225 230 235 240
Cys Ile Glu Ala Lys Leu Thr Asn Thr Thr Thr Asp Ser Arg Cys Pro
245 250 255
Thr Gln Gly Glu Pro Thr Leu Asn Glu Glu Gln Asp Lys Arg Phe Val
260 265 270
Cys Lys His Ser Met Val Asp Arg Gly Trp Gly Asn Gly Cys Gly Leu
275 280 285
Phe Gly Lys Gly Gly Ile Val Thr Cys Ala Met Phe Thr Cys Lys Lys
290 295 300
Asn Met Glu Gly Lys Ile Val Gln Pro Glu Asn Leu Glu Tyr Thr Val
305 310 315 320
Val Ile Thr Pro His Ser Gly Glu Glu His Ala Val Gly Asn Asp Thr
325 330 335
Gly Lys His Gly Lys Glu Val Lys Ile Thr Pro Gln Ser Ser Ile Thr
340 345 350
Glu Ala Glu Leu Thr Gly Tyr Gly Thr Val Thr Met Glu Cys Ser Pro
355 360 365
Arg Thr Gly Leu Asp Phe Asn Glu Met Val Leu Leu Gln Met Lys Asp
370 375 380
Lys Ala Trp Leu Val His Arg Gln Trp Phe Leu Asp Leu Pro Leu Pro
385 390 395 400
Trp Leu Pro Gly Ala Asp Thr Gln Gly Ser Asn Trp Ile Gln Lys Glu
405 410 415
Thr Leu Val Thr Phe Lys Asn Pro His Ala Lys Lys Gln Asp Val Val
420 425 430
Val Leu Gly Ser Gln Glu Gly Ala Met His Thr Ala Leu Thr Gly Ala
435 440 445
Thr Glu Ile Gln Met Ser Ser Gly Asn Leu Leu Phe Thr Gly His Leu
450 455 460
Lys Cys Arg Leu Arg Met Asp Lys Leu Gln Leu Lys Gly Met Ser Tyr
465 470 475 480
Val Met Cys Thr Gly Ser Phe Lys Leu Glu Lys Glu Val Ala Glu Thr
485 490 495
Gln His Gly Thr Val Leu Val Gln Val Lys Tyr Glu Gly Thr Asp Ala
500 505 510
Pro Cys Lys Ile Pro Phe Ser Ser Gln Asp Glu Lys Gly Val Thr Gln
515 520 525
Asn Gly Arg Leu Ile Thr Ala Asn Pro Ile Val Thr Asp Lys Glu Lys
530 535 540
Pro Val Asn Ile Glu Ala Glu Pro Pro Phe Gly Glu Ser Tyr Ile Val
545 550 555 560
Val Gly Ala Gly Glu Lys Ala Leu Lys Leu Ser Trp Phe Lys Lys Gly
565 570 575
Ser Ser Ile Gly Lys Met Phe Glu Ala Thr Ala Arg Gly Ala Arg Arg
580 585 590
Met Ala Ile Leu Gly Asp Thr Ala Trp Asp Phe Gly Ser Ile Gly Gly
595 600 605
Val Phe Thr Ser Val Gly Lys Leu Ile His Gln Ile Phe Gly Thr Ala
610 615 620
Tyr Gly Val Leu Phe Ser Gly Val Ser Trp Thr Met Lys Ile Gly Ile
625 630 635 640
Gly Ile Leu Leu Thr Trp Leu Gly Leu Asn Ser Arg Ser Thr Ser Leu
645 650 655
Ser Met Thr Cys Ile Ala Val Gly Met Val Thr Leu Tyr Leu Gly Val
660 665 670
Met Val Gln Ala
675
<210> 9
<211> 6679
<212> DNA
<213> Dengue virus
<220>
<221> misc_feature
<223> Chimera DENV2 prM E (Env F108A)_chimeric DENV1 E
<220>
<221> CDS
<222> (906)..(2933)
<220>
<221> misc_feature
<222> (906)..(2336)
<223> DENV2 prM E region
<220>
<221> misc_feature
<222> (2337)..(2933)
<223> DENV1 region (F108A)
<400> 9
gaattcccat tgcatacgtt gtatccatat cataatatgt acatttatat tggctcatgt 60
ccaacattac cgccatgttg acattgatta ttgactagtt attaatagta atcaattacg 120
gggtcattag ttcatagccc atatatggag ttccgcgtta cataacttac ggtaaatggc 180
ccgcctggct gaccgcccaa cgacccccgc ccattgacgt caataatgac gtatgttccc 240
atagtaacgc caatagggac tttccattga cgtcaatggg tggagtattt acggtaaact 300
gcccacttgg cagtacatca agtgtatcat atgccaagta cgccccctat tgacgtcaat 360
gacggtaaat ggcccgcctg gcattatgcc cagtacatga ccttatggga ctttcctact 420
tggcagtaca tctacgtatt agtcatcgct attaccatgg tgatgcggtt ttggcagtac 480
atcaatgggc gtggatagcg gtttgactca cggggatttc caagtctcca ccccattgac 540
gtcaatggga gtttgttttg gcaccaaaat caacgggact ttccaaaatg tcgtaacaac 600
tccgccccat tgacgcaaat gggcggtagg cgtgtacggt gggaggtcta tataagcaga 660
gctcgtttag tgaaccgtca gatcgcctgg agacgccatc cacgctgttt tgacctccat 720
agaagacacc gggaccgatc cagcctccgt taacggtgga gggcagtgta gtctgagcag 780
tactcgttgc tgccgcgcgc gccaccagac ataatagctg acagactaac agactgttcc 840
tttccatggg tcttttctgc agtcaccgtc gtcgacacgt gtgatcagat atcgcggccg 900
ccacc atg act gca ggc atg atc atc atg ctg att cca aca gtg atg gcg 950
Met Thr Ala Gly Met Ile Ile Met Leu Ile Pro Thr Val Met Ala
1 5 10 15
ttt cat ctg acc aca cgc aac gga gaa cca cac atg atc gtc agt aga 998
Phe His Leu Thr Thr Arg Asn Gly Glu Pro His Met Ile Val Ser Arg
20 25 30
caa gaa aaa ggg aaa agc ctt ctg ttt aag aca aag gac ggc acg aac 1046
Gln Glu Lys Gly Lys Ser Leu Leu Phe Lys Thr Lys Asp Gly Thr Asn
35 40 45
atg tgt acc ctc atg gcc atg gac ctt ggt gag ttg tgt gaa gac aca 1094
Met Cys Thr Leu Met Ala Met Asp Leu Gly Glu Leu Cys Glu Asp Thr
50 55 60
atc acg tat aaa tgt ccc ttt ctc aag cag aac gaa cca gaa gac ata 1142
Ile Thr Tyr Lys Cys Pro Phe Leu Lys Gln Asn Glu Pro Glu Asp Ile
65 70 75
gat tgt tgg tgc aac tcc acg tcc aca tgg gta act tat ggg aca tgt 1190
Asp Cys Trp Cys Asn Ser Thr Ser Thr Trp Val Thr Tyr Gly Thr Cys
80 85 90 95
acc acc aca gga gag cac aga aga gaa aaa aga tca gtg gcg ctt gtt 1238
Thr Thr Thr Gly Glu His Arg Arg Glu Lys Arg Ser Val Ala Leu Val
100 105 110
cca cac gtg gga atg gga ttg gag aca cga act gaa aca tgg atg tca 1286
Pro His Val Gly Met Gly Leu Glu Thr Arg Thr Glu Thr Trp Met Ser
115 120 125
tca gaa ggg gcc tgg aaa cat gcc cag aga att gaa act tgg att ctg 1334
Ser Glu Gly Ala Trp Lys His Ala Gln Arg Ile Glu Thr Trp Ile Leu
130 135 140
aga cat cca ggc ttt acc ata atg gcc gca atc ctg gca tac acc ata 1382
Arg His Pro Gly Phe Thr Ile Met Ala Ala Ile Leu Ala Tyr Thr Ile
145 150 155
gga acg acg cat ttc caa aga gtc ctg ata ttc atc cta ctg aca gcc 1430
Gly Thr Thr His Phe Gln Arg Val Leu Ile Phe Ile Leu Leu Thr Ala
160 165 170 175
atc gct cct tca atg aca atg cgc tgc ata gga ata tca aat agg gac 1478
Ile Ala Pro Ser Met Thr Met Arg Cys Ile Gly Ile Ser Asn Arg Asp
180 185 190
ttt gtg gaa gga gtg tca gga ggg agt tgg gtt gac ata gtt tta gaa 1526
Phe Val Glu Gly Val Ser Gly Gly Ser Trp Val Asp Ile Val Leu Glu
195 200 205
cat gga agt tgt gtg acg acg atg gca aaa aat aaa cca aca ctg gac 1574
His Gly Ser Cys Val Thr Thr Met Ala Lys Asn Lys Pro Thr Leu Asp
210 215 220
ttt gaa ctg ata aaa aca gaa gcc aaa caa ccc gcc acc tta agg aag 1622
Phe Glu Leu Ile Lys Thr Glu Ala Lys Gln Pro Ala Thr Leu Arg Lys
225 230 235
tac tgt ata gag gct aaa ctg acc aac acg aca aca gac tcg cgc tgc 1670
Tyr Cys Ile Glu Ala Lys Leu Thr Asn Thr Thr Thr Asp Ser Arg Cys
240 245 250 255
cca aca caa ggg gaa ccc acc ctg aat gaa gag cag gac aaa agg ttt 1718
Pro Thr Gln Gly Glu Pro Thr Leu Asn Glu Glu Gln Asp Lys Arg Phe
260 265 270
gtc tgc aaa cat tcc atg gta gac aga gga tgg gga aat gga tgt gga 1766
Val Cys Lys His Ser Met Val Asp Arg Gly Trp Gly Asn Gly Cys Gly
275 280 285
tta gct gga aaa gga ggc atc gtg acc tgt gcc atg ttc aca tgc aaa 1814
Leu Ala Gly Lys Gly Gly Ile Val Thr Cys Ala Met Phe Thr Cys Lys
290 295 300
aag aac atg gag gga aaa att gtg cag cca gaa aac ctg gaa tac act 1862
Lys Asn Met Glu Gly Lys Ile Val Gln Pro Glu Asn Leu Glu Tyr Thr
305 310 315
gtc gtt ata aca cct cat tca ggg gaa gaa cat gca gtc gga aat gac 1910
Val Val Ile Thr Pro His Ser Gly Glu Glu His Ala Val Gly Asn Asp
320 325 330 335
aca gga aaa cat ggt aaa gaa gtc aag ata aca cca cag agc tcc atc 1958
Thr Gly Lys His Gly Lys Glu Val Lys Ile Thr Pro Gln Ser Ser Ile
340 345 350
aca gag gcg gaa ctg aca ggc tat ggc act gtt acg atg gag tgc tct 2006
Thr Glu Ala Glu Leu Thr Gly Tyr Gly Thr Val Thr Met Glu Cys Ser
355 360 365
cca aga acg ggc ctc gac ttc aat gag atg gtg ttg ctg caa atg aaa 2054
Pro Arg Thr Gly Leu Asp Phe Asn Glu Met Val Leu Leu Gln Met Lys
370 375 380
gac aaa gct tgg ctg gtg cac aga caa tgg ttc cta gac cta ccg ttg 2102
Asp Lys Ala Trp Leu Val His Arg Gln Trp Phe Leu Asp Leu Pro Leu
385 390 395
cca tgg ctg ccc gga gca gac aca caa gga tca aat tgg ata cag aaa 2150
Pro Trp Leu Pro Gly Ala Asp Thr Gln Gly Ser Asn Trp Ile Gln Lys
400 405 410 415
gag aca ctg gtc acc ttc aaa aat ccc cat gcg aaa aaa cag gat gtt 2198
Glu Thr Leu Val Thr Phe Lys Asn Pro His Ala Lys Lys Gln Asp Val
420 425 430
gtt gtc tta ggc tcc caa gag ggg gcc atg cat aca gca ctc aca ggg 2246
Val Val Leu Gly Ser Gln Glu Gly Ala Met His Thr Ala Leu Thr Gly
435 440 445
gct acg gaa atc cag atg tca tca gga aac ctg ctg ttc aca gga cat 2294
Ala Thr Glu Ile Gln Met Ser Ser Gly Asn Leu Leu Phe Thr Gly His
450 455 460
ctt aag tgc agg ctg aga atg gac aaa tta caa ctt aaa ggg atg tca 2342
Leu Lys Cys Arg Leu Arg Met Asp Lys Leu Gln Leu Lys Gly Met Ser
465 470 475
tat gta atg tgc aca ggg tca ttc aag tta gag aag gaa gtg gct gag 2390
Tyr Val Met Cys Thr Gly Ser Phe Lys Leu Glu Lys Glu Val Ala Glu
480 485 490 495
acc cag cat gga act gtt cta gtg cag gtt aaa tac gaa gga aca gat 2438
Thr Gln His Gly Thr Val Leu Val Gln Val Lys Tyr Glu Gly Thr Asp
500 505 510
gca cca tgc aag atc ccc ttc tcg tcc caa gat gag aag gga gta acc 2486
Ala Pro Cys Lys Ile Pro Phe Ser Ser Gln Asp Glu Lys Gly Val Thr
515 520 525
cag aat ggg aga ttg ata aca gcc aac ccc ata gtc act gac aaa gaa 2534
Gln Asn Gly Arg Leu Ile Thr Ala Asn Pro Ile Val Thr Asp Lys Glu
530 535 540
aaa cca gtc aac att gaa gcg gag cca cct ttt ggt gag agc tac att 2582
Lys Pro Val Asn Ile Glu Ala Glu Pro Pro Phe Gly Glu Ser Tyr Ile
545 550 555
gtg gta gga gca ggt gaa aaa gct ttg aaa cta agc tgg ttc aag aag 2630
Val Val Gly Ala Gly Glu Lys Ala Leu Lys Leu Ser Trp Phe Lys Lys
560 565 570 575
gga agc agt ata ggg aaa atg ttt gaa gca act gcc cgt gga gca cga 2678
Gly Ser Ser Ile Gly Lys Met Phe Glu Ala Thr Ala Arg Gly Ala Arg
580 585 590
agg atg gcc atc ctg gga gac act gca tgg gac ttc ggt tct ata gga 2726
Arg Met Ala Ile Leu Gly Asp Thr Ala Trp Asp Phe Gly Ser Ile Gly
595 600 605
ggg gtg ttc acg tct gtg gga aaa ctg ata cac cag att ttt ggg act 2774
Gly Val Phe Thr Ser Val Gly Lys Leu Ile His Gln Ile Phe Gly Thr
610 615 620
gcg tat gga gtt ttg ttc agc ggt gtt tct tgg acc atg aag ata gga 2822
Ala Tyr Gly Val Leu Phe Ser Gly Val Ser Trp Thr Met Lys Ile Gly
625 630 635
ata ggg att ctg ctg aca tgg cta gga tta aac tca agg agc acg tcc 2870
Ile Gly Ile Leu Leu Thr Trp Leu Gly Leu Asn Ser Arg Ser Thr Ser
640 645 650 655
ctt tca atg acg tgt atc gca gtt ggc atg gtc acg ctg tac cta gga 2918
Leu Ser Met Thr Cys Ile Ala Val Gly Met Val Thr Leu Tyr Leu Gly
660 665 670
gtc atg gtt cag gcg taataaagat ctgctgtgcc ttctagttgc cagccatctg 2973
Val Met Val Gln Ala
675
ttgtttgccc ctcccccgtg ccttccttga ccctggaagg tgccactccc actgtccttt 3033
cctaataaaa tgaggaaatt gcatcgcatt gtctgagtag gtgtcattct attctggggg 3093
gtggggtggg gcaggacagc aagggggagg attgggaaga caatagcagg catgctgggg 3153
atgcggtggg ctctatgggt acccaggtgc tgaagaattg acccggttcc tcctgggcca 3213
gaaagaagca ggcacatccc cttctctgtg acacaccctg tccacgcccc tggttcttag 3273
ttccagcccc actcatagga cactcatagc tcaggagggc tccgccttca atcccacccg 3333
ctaaagtact tggagcggtc tctccctccc tcatcagccc accaaaccaa acctagcctc 3393
caagagtggg aagaaattaa agcaagatag gctattaagt gcagagggag agaaaatgcc 3453
tccaacatgt gaggaagtaa tgagagaaat catagaattt taaggccatg atttaaggcc 3513
atcatggcct aagcttgaaa ggagatagga tcaaagcttg gcgtaatcat ggtcatagct 3573
gtttcctgtg tgaaattgtt atccgctcac aattccacac aacatacgag ccggaagcat 3633
aaagtgtaaa gcctggggtg cctaatgagt gagctaactc acattaattg cgttgcgctc 3693
actgcccgct ttccagtcgg gaaacctgtc gtgccagctg cattaatgaa tcggccaacg 3753
cgcggggaga ggcggtttgc gtattgggcg ctcttccgct tcctcgctca ctgactcgct 3813
gcgctcggtc gttcggctgc ggcgagcggt atcagctcac tcaaaggcgg taatacggtt 3873
atccacagaa tcaggggata acgcaggaaa gaacatgtga gcaaaaggcc agcaaaaggc 3933
caggaaccgt aaaaaggccg cgttgctggc gtttttccat aggctccgcc cccctgacga 3993
gcatcacaaa aatcgacgct caagtcagag gtggcgaaac ccgacaggac tataaagata 4053
ccaggcgttt ccccctggaa gctccctcgt gcgctctcct gttccgaccc tgccgcttac 4113
cggatacctg tccgcctttc tcccttcggg aagcgtggcg ctttctcata gctcacgctg 4173
taggtatctc agttcggtgt aggtcgttcg ctccaagctg ggctgtgtgc acgaaccccc 4233
cgttcagccc gaccgctgcg ccttatccgg taactatcgt cttgagtcca acccggtaag 4293
acacgactta tcgccactgg cagcagccac tggtaacagg attagcagag cgaggtatgt 4353
aggcggtgct acagagttct tgaagtggtg gcctaactac ggctacacta gaagaacagt 4413
atttggtatc tgcgctctgc tgaagccagt taccttcgga aaaagagttg gtagctcttg 4473
atccggcaaa caaaccaccg ctggtagcgg tggttttttt gtttgcaagc agcagattac 4533
gcgcagaaaa aaaggatctc aagaagatcc tttgatcttt tctacggggt ctgacgctca 4593
gtggaacgaa aactcacgtt aagggatttt ggtcatgaga ttatcaaaaa ggatcttcac 4653
ctagatcctt ttaaattaaa aatgaagttt taaatcaatc taaagtatat atgagtaaac 4713
ttggtctgac agttaccaat gcttaatcag tgaggcacct atctcagcga tctgtctatt 4773
tcgttcatcc atagttgcct gactccccgt cgtgtagata actacgatac gggagggctt 4833
accatctggc cccagtgctg caatgatacc gcgagaacca cgctcaccgg ctccagattt 4893
atcagcaata aaccagccag ccggaagggc cgagcgcaga agtggtcctg caactttatc 4953
cgcctccatc cagtctatta attgttgccg ggaagctaga gtaagtagtt cgccagttaa 5013
tagtttgcgc aacgttgttg ccattgctac aggcatcgtg gtgtcacgct cgtcgtttgg 5073
tatggcttca ttcagctccg gttcccaacg atcaaggcga gttacatgat cccccatgtt 5133
gtgcaaaaaa gcggttagct ccttcggtcc tccgatcgtt gtcagaagta agttggccgc 5193
agtgttatca ctcatggtta tggcagcact gcataattct cttactgtca tgccatccgt 5253
aagatgcttt tctgtgactg gtgagtactc aaccaagtca ttctgagaat agtgtatgcg 5313
gcgaccgagt tgctcttgcc cggcgtcaat acgggataat accgcgccac atagcagaac 5373
tttaaaagtg ctcatcattg gaaaacgttc ttcggggcga aaactctcaa ggatcttacc 5433
gctgttgaga tccagttcga tgtaacccac tcgtgcaccc aactgatctt cagcatcttt 5493
tactttcacc agcgtttctg ggtgagcaaa aacaggaagg caaaatgccg caaaaaaggg 5553
aataagggcg acacggaaat gttgaatact catactcttc ctttttcaat attattgaag 5613
catttatcag ggttattgtc tcatgagcgg atacatattt gaatgtattt agaaaaataa 5673
acaaataggg gttccgcgca catttccccg aaaagtgcca cctgacgtct aagaaaccat 5733
tattatcatg acattaacct ataaaaatag gcgtatcacg aggccctttc gggtcgcgcg 5793
tttcggtgat gacggtgaaa acctctgaca catgcagctc ccgttgacgg tcacagcttg 5853
tctgtaagcg gatgccggga gcagacaagc ccgtcagggc gcgtcagcgg gtgttggcgg 5913
gtgtcggggc tggcttaact atgcggcatc agagcagatt gtactgagag tgcaccataa 5973
aattgtaaac gttaatattt tgttaaaatt cgcgttaaat ttttgttaaa tcagctcatt 6033
ttttaaccaa taggccgaaa tcggcaaaat cccttataaa tcaaaagaat agcccgagat 6093
agggttgagt gttgttccag tttggaacaa gagtccacta ttaaagaacg tggactccaa 6153
cgtcaaaggg cgaaaaaccg tctatcaggg cgatggccca ctacgtgaac catcacccaa 6213
atcaagtttt ttggggtcga ggtgccgtaa agcactaaat cggaacccta aagggagccc 6273
ccgatttaga gcttgacggg gaaagccggc gaacgtggcg agaaaggaag ggaagaaagc 6333
gaaaggagcg ggcgctaggg cgctggcaag tgtagcggtc acgctgcgcg taaccaccac 6393
acccgccgcg cttaatgcgc cgctacaggg cgcgtactat ggttgctttg acgtatgcgg 6453
tgtgaaatac cgcacagatg cgtaaggaga aaataccgca tcaggcgcca ttcgccattc 6513
aggctgcgca actgttggga agggcgatcg gtgcgggcct cttcgctatt acgccagctg 6573
gcgaaagggg gatgtgctgc aaggcgatta agttgggtaa cgccagggtt ttcccagtca 6633
cgacgttgta aaacgacggc cagtgaattc catggtctca actttc 6679
<210> 10
<211> 676
<212> PRT
<213> Dengue virus
<400> 10
Met Thr Ala Gly Met Ile Ile Met Leu Ile Pro Thr Val Met Ala Phe
1 5 10 15
His Leu Thr Thr Arg Asn Gly Glu Pro His Met Ile Val Ser Arg Gln
20 25 30
Glu Lys Gly Lys Ser Leu Leu Phe Lys Thr Lys Asp Gly Thr Asn Met
35 40 45
Cys Thr Leu Met Ala Met Asp Leu Gly Glu Leu Cys Glu Asp Thr Ile
50 55 60
Thr Tyr Lys Cys Pro Phe Leu Lys Gln Asn Glu Pro Glu Asp Ile Asp
65 70 75 80
Cys Trp Cys Asn Ser Thr Ser Thr Trp Val Thr Tyr Gly Thr Cys Thr
85 90 95
Thr Thr Gly Glu His Arg Arg Glu Lys Arg Ser Val Ala Leu Val Pro
100 105 110
His Val Gly Met Gly Leu Glu Thr Arg Thr Glu Thr Trp Met Ser Ser
115 120 125
Glu Gly Ala Trp Lys His Ala Gln Arg Ile Glu Thr Trp Ile Leu Arg
130 135 140
His Pro Gly Phe Thr Ile Met Ala Ala Ile Leu Ala Tyr Thr Ile Gly
145 150 155 160
Thr Thr His Phe Gln Arg Val Leu Ile Phe Ile Leu Leu Thr Ala Ile
165 170 175
Ala Pro Ser Met Thr Met Arg Cys Ile Gly Ile Ser Asn Arg Asp Phe
180 185 190
Val Glu Gly Val Ser Gly Gly Ser Trp Val Asp Ile Val Leu Glu His
195 200 205
Gly Ser Cys Val Thr Thr Met Ala Lys Asn Lys Pro Thr Leu Asp Phe
210 215 220
Glu Leu Ile Lys Thr Glu Ala Lys Gln Pro Ala Thr Leu Arg Lys Tyr
225 230 235 240
Cys Ile Glu Ala Lys Leu Thr Asn Thr Thr Thr Asp Ser Arg Cys Pro
245 250 255
Thr Gln Gly Glu Pro Thr Leu Asn Glu Glu Gln Asp Lys Arg Phe Val
260 265 270
Cys Lys His Ser Met Val Asp Arg Gly Trp Gly Asn Gly Cys Gly Leu
275 280 285
Ala Gly Lys Gly Gly Ile Val Thr Cys Ala Met Phe Thr Cys Lys Lys
290 295 300
Asn Met Glu Gly Lys Ile Val Gln Pro Glu Asn Leu Glu Tyr Thr Val
305 310 315 320
Val Ile Thr Pro His Ser Gly Glu Glu His Ala Val Gly Asn Asp Thr
325 330 335
Gly Lys His Gly Lys Glu Val Lys Ile Thr Pro Gln Ser Ser Ile Thr
340 345 350
Glu Ala Glu Leu Thr Gly Tyr Gly Thr Val Thr Met Glu Cys Ser Pro
355 360 365
Arg Thr Gly Leu Asp Phe Asn Glu Met Val Leu Leu Gln Met Lys Asp
370 375 380
Lys Ala Trp Leu Val His Arg Gln Trp Phe Leu Asp Leu Pro Leu Pro
385 390 395 400
Trp Leu Pro Gly Ala Asp Thr Gln Gly Ser Asn Trp Ile Gln Lys Glu
405 410 415
Thr Leu Val Thr Phe Lys Asn Pro His Ala Lys Lys Gln Asp Val Val
420 425 430
Val Leu Gly Ser Gln Glu Gly Ala Met His Thr Ala Leu Thr Gly Ala
435 440 445
Thr Glu Ile Gln Met Ser Ser Gly Asn Leu Leu Phe Thr Gly His Leu
450 455 460
Lys Cys Arg Leu Arg Met Asp Lys Leu Gln Leu Lys Gly Met Ser Tyr
465 470 475 480
Val Met Cys Thr Gly Ser Phe Lys Leu Glu Lys Glu Val Ala Glu Thr
485 490 495
Gln His Gly Thr Val Leu Val Gln Val Lys Tyr Glu Gly Thr Asp Ala
500 505 510
Pro Cys Lys Ile Pro Phe Ser Ser Gln Asp Glu Lys Gly Val Thr Gln
515 520 525
Asn Gly Arg Leu Ile Thr Ala Asn Pro Ile Val Thr Asp Lys Glu Lys
530 535 540
Pro Val Asn Ile Glu Ala Glu Pro Pro Phe Gly Glu Ser Tyr Ile Val
545 550 555 560
Val Gly Ala Gly Glu Lys Ala Leu Lys Leu Ser Trp Phe Lys Lys Gly
565 570 575
Ser Ser Ile Gly Lys Met Phe Glu Ala Thr Ala Arg Gly Ala Arg Arg
580 585 590
Met Ala Ile Leu Gly Asp Thr Ala Trp Asp Phe Gly Ser Ile Gly Gly
595 600 605
Val Phe Thr Ser Val Gly Lys Leu Ile His Gln Ile Phe Gly Thr Ala
610 615 620
Tyr Gly Val Leu Phe Ser Gly Val Ser Trp Thr Met Lys Ile Gly Ile
625 630 635 640
Gly Ile Leu Leu Thr Trp Leu Gly Leu Asn Ser Arg Ser Thr Ser Leu
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Ser Met Thr Cys Ile Ala Val Gly Met Val Thr Leu Tyr Leu Gly Val
660 665 670
Met Val Gln Ala
675
<210> 11
<211> 3770
<212> DNA
<213> Dengue virus
<220>
<221> misc_feature
<223> DENV2 capsid R85A K86A mutant
<220>
<221> CDS
<222> (1046)..(1345)
<400> 11
tcgcgcgttt cggtgatgac ggtgaaaacc tctgacacat gcagctcccg gagacggtca 60
cagcttgtct gtaagcggat gccgggagca gacaagcccg tcagggcgcg tcagcgggtg 120
ttggcgggtg tcggggctgg cttaactatg cggcatcaga gcagattgta ctgagagtgc 180
accatatgcg gtgtgaaata ccgcacagat gcgtaaggag aaaataccgc atcaggcgcc 240
attcgccatt caggctgcgc aactgttggg aagggcgatc ggtgcgggcc tcttcgctat 300
tacgccagct ggcgaaaggg ggatgtgctg caaggcgatt aagttgggta acgccagggt 360
tttcccagtc acgacgttgt aaaacgacgg ccagtgaatt gacgcgtttg acattgatta 420
ttgactagtt attaatagta atcaattacg gggtcattag ttcatagccc atatatggag 480
ttccgcgtta cataacttac ggtaaatggc ccgcctggct gaccgcccaa cgacccccgc 540
ccattgacgt caataatgac gtatgttccc atagtaacgc caatagggac tttccattga 600
cgtcaatggg tggagtattt acggtaaact gcccacttgg cagtacatca agtgtatcat 660
atgccaagta cgccccctat tgacgtcaat gacggtaaat ggcccgcctg gcattatgcc 720
cagtacatga ccttatggga ctttcctact tggcagtaca tctacgtatt agtcatcgct 780
attaccatgg tgatgcggtt ttggcagtac atcaatgggc gtggatagcg gtttgactca 840
cggggatttc caagtctcca ccccattgac gtcaatggga gtttgttttg gcaccaaaat 900
caacgggact ttccaaaatg tcgtaacaac tccgccccat tgacgcaaat gggcggtagg 960
cgtgtacggt gggaggtcta tataagcaga gctcgtttag tgaaccgtca gataactgca 1020
ggtcgacgat atcgcggccg ccacc atg aat gac caa cgg aaa aag gcg aga 1072
Met Asn Asp Gln Arg Lys Lys Ala Arg
1 5
aac acg cct ttc aat atg ctg aaa cgc gag aga aac cgc gtg tca act 1120
Asn Thr Pro Phe Asn Met Leu Lys Arg Glu Arg Asn Arg Val Ser Thr
10 15 20 25
gta caa cag ttg aca aag aga ttc tca ctt gga atg ctg cag gga cga 1168
Val Gln Gln Leu Thr Lys Arg Phe Ser Leu Gly Met Leu Gln Gly Arg
30 35 40
gga cca cta aaa ttg ttc atg gcc ctg gtg gca ttc ctt cgt ttc cta 1216
Gly Pro Leu Lys Leu Phe Met Ala Leu Val Ala Phe Leu Arg Phe Leu
45 50 55
aca atc cca cca aca gca ggg ata tta aaa aga tgg gga aca att aaa 1264
Thr Ile Pro Pro Thr Ala Gly Ile Leu Lys Arg Trp Gly Thr Ile Lys
60 65 70
aaa tca aag gct att aat gtt ctg aga ggc ttc gcg gca gag att gga 1312
Lys Ser Lys Ala Ile Asn Val Leu Arg Gly Phe Ala Ala Glu Ile Gly
75 80 85
agg atg ctg aat atc tta aac agg aga cgt aga taataaagat ctgctgtgcc 1365
Arg Met Leu Asn Ile Leu Asn Arg Arg Arg Arg
90 95 100
ttctagttgc cagccatctg ttgtttgccc ctcccccgtg ccttccttga ccctggaagg 1425
tgccactccc actgtccttt cctaataaaa tgaggaaatt gcatcgcatt gtctgagtag 1485
gtgtcattct attctggggg gtggggtggg gcaggacagc aagggggagg attgggaaga 1545
caatagcagg catgctgggg atgcggtggg ctctatggct cgagcatggt catagctgtt 1605
tcctgtgtga aattgttatc cgctcacaat tccacacaac atacgagccg gaagcataaa 1665
gtgtaaagcc tggggtgcct aatgagtgag ctaactcaca ttaattgcgt tgcgctcact 1725
gcccgctttc cagtcgggaa acctgtcgtg ccagctgcat taatgaatcg gccaacgcgc 1785
ggggagaggc ggtttgcgta ttgggcgctc ttccgcttcc tcgctcactg actcgctgcg 1845
ctcggtcgtt cggctgcggc gagcggtatc agctcactca aaggcggtaa tacggttatc 1905
cacagaatca ggggataacg caggaaagaa catgtgagca aaaggccagc aaaaggccag 1965
gaaccgtaaa aaggccgcgt tgctggcgtt tttccatagg ctccgccccc ctgacgagca 2025
tcacaaaaat cgacgctcaa gtcagaggtg gcgaaacccg acaggactat aaagatacca 2085
ggcgtttccc cctggaagct ccctcgtgcg ctctcctgtt ccgaccctgc cgcttaccgg 2145
atacctgtcc gcctttctcc cttcgggaag cgtggcgctt tctcatagct cacgctgtag 2205
gtatctcagt tcggtgtagg tcgttcgctc caagctgggc tgtgtgcacg aaccccccgt 2265
tcagcccgac cgctgcgcct tatccggtaa ctatcgtctt gagtccaacc cggtaagaca 2325
cgacttatcg ccactggcag cagccactgg taacaggatt agcagagcga ggtatgtagg 2385
cggtgctaca gagttcttga agtggtggcc taactacggc tacactagaa gaacagtatt 2445
tggtatctgc gctctgctga agccagttac cttcggaaaa agagttggta gctcttgatc 2505
cggcaaacaa accaccgctg gtagcggtgg tttttttgtt tgcaagcagc agattacgcg 2565
cagaaaaaaa ggatctcaag aagatccttt gatcttttct acggggtctg acgctcagtg 2625
gaacgaaaac tcacgttaag ggattttggt catgagatta tcaaaaagga tcttcaccta 2685
gatcctttta aattaaaaat gaagttttaa atcaatctaa agtatatatg agtaaacttg 2745
gtctgacagt tagaaaaact catcgagcat caaatgaaac tgcaatttat tcatatcagg 2805
attatcaata ccatattttt gaaaaagccg tttctgtaat gaaggagaaa actcaccgag 2865
gcagttccat aggatggcaa gatcctggta tcggtctgcg attccgactc gtccaacatc 2925
aatacaacct attaatttcc cctcgtcaaa aataaggtta tcaagtgaga aatcaccatg 2985
agtgacgact gaatccggtg agaatggcaa aagtttatgc atttctttcc agacttgttc 3045
aacaggccag ccattacgct cgtcatcaaa atcactcgca tcaaccaaac cgttattcat 3105
tcgtgattgc gcctgagcga gacgaaatac gcgatcgctg ttaaaaggac aattacaaac 3165
aggaatcgaa tgcaaccggc gcaggaacac tgccagcgca tcaacaatat tttcacctga 3225
atcaggatat tcttctaata cctggaatgc tgttttccca gggatcgcag tggtgagtaa 3285
ccatgcatca tcaggagtac ggataaaatg cttgatggtc ggaagaggca taaattccgt 3345
cagccagttt agtctgacca tctcatctgt aacatcattg gcaacgctac ctttgccatg 3405
tttcagaaac aactctggcg catcgggctt cccatacaat cgatagattg tcgcacctga 3465
ttgcccgaca ttatcgcgag cccatttata cccatataaa tcagcatcca tgttggaatt 3525
taatcgcggc ctagagcaag acgtttcccg ttgaatatgg ctcatactct tcctttttca 3585
atattattga agcatttatc agggttattg tctcatgagc ggatacatat ttgaatgtat 3645
ttagaaaaat aaacaaatag gggttccgcg cacatttccc cgaaaagtgc cacctgacgt 3705
ctaagaaacc attattatca tgacattaac ctataaaaat aggcgtatca cgaggccctt 3765
tcgtc 3770
<210> 12
<211> 100
<212> PRT
<213> Dengue virus
<400> 12
Met Asn Asp Gln Arg Lys Lys Ala Arg Asn Thr Pro Phe Asn Met Leu
1 5 10 15
Lys Arg Glu Arg Asn Arg Val Ser Thr Val Gln Gln Leu Thr Lys Arg
20 25 30
Phe Ser Leu Gly Met Leu Gln Gly Arg Gly Pro Leu Lys Leu Phe Met
35 40 45
Ala Leu Val Ala Phe Leu Arg Phe Leu Thr Ile Pro Pro Thr Ala Gly
50 55 60
Ile Leu Lys Arg Trp Gly Thr Ile Lys Lys Ser Lys Ala Ile Asn Val
65 70 75 80
Leu Arg Gly Phe Ala Ala Glu Ile Gly Arg Met Leu Asn Ile Leu Asn
85 90 95
Arg Arg Arg Arg
100
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<213> Dengue virus
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<220>
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gacggtaaat ggcccgcctg gcattatgcc cagtacatga ccttatggga ctttcctact 420
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tccgccccat tgacgcaaat gggcggtagg cgtgtacggt gggaggtcta tataagcaga 660
gctcgtttag tgaaccgtca gatcgcctgg agacgccatc cacgctgttt tgacctccat 720
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Met
1
tcg gtg acc atg ctc ctc atg ctg ctg ccc aca gcc ctg gcg ttc cat 1187
Ser Val Thr Met Leu Leu Met Leu Leu Pro Thr Ala Leu Ala Phe His
5 10 15
ctg acc acc cga ggg gga gag ccg cac atg ata gtt agc aag cag gaa 1235
Leu Thr Thr Arg Gly Gly Glu Pro His Met Ile Val Ser Lys Gln Glu
20 25 30
aga gga aaa tca ctt ttg ttt aag acc tct gca ggt gtc aac atg tgc 1283
Arg Gly Lys Ser Leu Leu Phe Lys Thr Ser Ala Gly Val Asn Met Cys
35 40 45
acc ctt att gca atg gat ttg gga gag tta tgt gag gac aca atg acc 1331
Thr Leu Ile Ala Met Asp Leu Gly Glu Leu Cys Glu Asp Thr Met Thr
50 55 60 65
tac aaa tgc ccc cgg atc act gag acg gaa cca gat gac gtt gac tgt 1379
Tyr Lys Cys Pro Arg Ile Thr Glu Thr Glu Pro Asp Asp Val Asp Cys
70 75 80
tgg tgc aat gcc acg gag aca tgg gtg acc tat gga aca tgt tct caa 1427
Trp Cys Asn Ala Thr Glu Thr Trp Val Thr Tyr Gly Thr Cys Ser Gln
85 90 95
act ggt gaa cac cga cga gac aaa cgt tcc gtc gca ctg gca cca cac 1475
Thr Gly Glu His Arg Arg Asp Lys Arg Ser Val Ala Leu Ala Pro His
100 105 110
gta ggg ctt ggt cta gaa aca aga acc gaa acg tgg atg tcc tct gaa 1523
Val Gly Leu Gly Leu Glu Thr Arg Thr Glu Thr Trp Met Ser Ser Glu
115 120 125
ggc gct tgg aaa caa ata caa aaa gtg gag acc tgg gct ctg aga cac 1571
Gly Ala Trp Lys Gln Ile Gln Lys Val Glu Thr Trp Ala Leu Arg His
130 135 140 145
cca gga ttc acg gtg ata gcc ctt ttt cta gca cat gcc ata gga aca 1619
Pro Gly Phe Thr Val Ile Ala Leu Phe Leu Ala His Ala Ile Gly Thr
150 155 160
tcc atc acc cag aaa ggg atc att ttt att ttg ctg atg ctg gta act 1667
Ser Ile Thr Gln Lys Gly Ile Ile Phe Ile Leu Leu Met Leu Val Thr
165 170 175
cca tcc atg gcc atg cgg tgc gtg gga ata ggc aac aga gac ttc gtg 1715
Pro Ser Met Ala Met Arg Cys Val Gly Ile Gly Asn Arg Asp Phe Val
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Glu Gly Leu Ser Gly Ala Thr Trp Val Asp Val Val Leu Glu His Gly
195 200 205
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Ser Cys Val Thr Thr Met Ala Lys Asp Lys Pro Thr Leu Asp Ile Glu
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Leu Leu Lys Thr Glu Val Thr Asn Pro Ala Val Leu Arg Lys Leu Cys
230 235 240
att gaa gct aaa ata tca aac acc acc acc gat tcg aga tgt cca aca 1907
Ile Glu Ala Lys Ile Ser Asn Thr Thr Thr Asp Ser Arg Cys Pro Thr
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caa gga gaa gcc acg ctg gtg gaa gaa cag gac acg aac ttt gtg tgt 1955
Gln Gly Glu Ala Thr Leu Val Glu Glu Gln Asp Thr Asn Phe Val Cys
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Arg Arg Thr Phe Val Asp Arg Gly Trp Gly Asn Gly Cys Gly Leu Ala
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Gly Lys Gly Ser Leu Ile Thr Cys Ala Lys Phe Lys Cys Val Thr Lys
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ctg gaa gga aag ata gtc caa tat gaa aac tta aaa tat tca gtg ata 2099
Leu Glu Gly Lys Ile Val Gln Tyr Glu Asn Leu Lys Tyr Ser Val Ile
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gtc acc gta cac act gga gac cag cac caa gtt gga aat gag acc aca 2147
Val Thr Val His Thr Gly Asp Gln His Gln Val Gly Asn Glu Thr Thr
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Glu His Gly Thr Thr Ala Thr Ile Thr Pro Gln Ala Pro Thr Ser Glu
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aca ggg cta gac ttt aat gag atg gtg ttg ttg aca atg gaa aat aaa 2291
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ctg gtc aca ttt aag aca gct cat gca aaa aag cag gaa gta gtc gta 2435
Leu Val Thr Phe Lys Thr Ala His Ala Lys Lys Gln Glu Val Val Val
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Leu Gly Ser Gln Glu Gly Ala Met His Thr Ala Leu Thr Gly Ala Thr
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Glu Ile Gln Thr Ser Gly Thr Thr Thr Ile Phe Ala Gly His Leu Lys
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tgc aga cta aaa atg gat aaa ctg act tta aaa ggg atg tca tat gta 2579
Cys Arg Leu Lys Met Asp Lys Leu Thr Leu Lys Gly Met Ser Tyr Val
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Met Cys Thr Gly Ser Phe Lys Leu Glu Lys Glu Val Ala Glu Thr Gln
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His Gly Thr Val Leu Val Gln Val Lys Tyr Glu Gly Thr Asp Ala Pro
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Ala Ile Leu Gly Asp Thr Ala Trp Asp Phe Gly Ser Ile Gly Gly Val
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Phe Thr Ser Val Gly Lys Leu Ile His Gln Ile Phe Gly Thr Ala Tyr
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Ile Leu Leu Thr Trp Leu Gly Leu Asn Ser Arg Ser Thr Ser Leu Ser
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Val Gln Ala
675
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Cys Thr Leu Ile Ala Met Asp Leu Gly Glu Leu Cys Glu Asp Thr Met
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Cys Trp Cys Asn Ala Thr Glu Thr Trp Val Thr Tyr Gly Thr Cys Ser
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His Val Gly Leu Gly Leu Glu Thr Arg Thr Glu Thr Trp Met Ser Ser
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Glu Gly Ala Trp Lys Gln Ile Gln Lys Val Glu Thr Trp Ala Leu Arg
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His Pro Gly Phe Thr Val Ile Ala Leu Phe Leu Ala His Ala Ile Gly
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Thr Pro Ser Met Ala Met Arg Cys Val Gly Ile Gly Asn Arg Asp Phe
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Val Glu Gly Leu Ser Gly Ala Thr Trp Val Asp Val Val Leu Glu His
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Gly Ser Cys Val Thr Thr Met Ala Lys Asp Lys Pro Thr Leu Asp Ile
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<212> DNA
<213> Dengue virus
<220>
<221> misc_feature
<223> DENV1 prM E (F108A K203N) VLP D01
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<222> (1137)..(3164)
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Thr Leu Ile Ala Met Asp Leu Gly Glu Leu Cys Glu Asp Thr Met Thr
50 55 60 65
tac aaa tgc ccc cgg atc act gag acg gaa cca gat gac gtt gac tgt 1379
Tyr Lys Cys Pro Arg Ile Thr Glu Thr Glu Pro Asp Asp Val Asp Cys
70 75 80
tgg tgc aat gcc acg gag aca tgg gtg acc tat gga aca tgt tct caa 1427
Trp Cys Asn Ala Thr Glu Thr Trp Val Thr Tyr Gly Thr Cys Ser Gln
85 90 95
act ggt gaa cac cga cga gac aaa cgt tcc gtc gca ctg gca cca cac 1475
Thr Gly Glu His Arg Arg Asp Lys Arg Ser Val Ala Leu Ala Pro His
100 105 110
gta ggg ctt ggt cta gaa aca aga acc gaa acg tgg atg tcc tct gaa 1523
Val Gly Leu Gly Leu Glu Thr Arg Thr Glu Thr Trp Met Ser Ser Glu
115 120 125
ggc gct tgg aaa caa ata caa aaa gtg gag acc tgg gct ctg aga cac 1571
Gly Ala Trp Lys Gln Ile Gln Lys Val Glu Thr Trp Ala Leu Arg His
130 135 140 145
cca gga ttc acg gtg ata gcc ctt ttt cta gca cat gcc ata gga aca 1619
Pro Gly Phe Thr Val Ile Ala Leu Phe Leu Ala His Ala Ile Gly Thr
150 155 160
tcc atc acc cag aaa ggg atc att ttt att ttg ctg atg ctg gta act 1667
Ser Ile Thr Gln Lys Gly Ile Ile Phe Ile Leu Leu Met Leu Val Thr
165 170 175
cca tcc atg gcc atg cgg tgc gtg gga ata ggc aac aga gac ttc gtg 1715
Pro Ser Met Ala Met Arg Cys Val Gly Ile Gly Asn Arg Asp Phe Val
180 185 190
gaa gga ctg tca gga gct acg tgg gtg gat gtg gta ctg gag cat gga 1763
Glu Gly Leu Ser Gly Ala Thr Trp Val Asp Val Val Leu Glu His Gly
195 200 205
agt tgc gtc act acc atg gca aaa gac aaa cca aca ctg gac att gaa 1811
Ser Cys Val Thr Thr Met Ala Lys Asp Lys Pro Thr Leu Asp Ile Glu
210 215 220 225
ctc ttg aag acg gag gtc aca aac cct gcc gtc ctg cgc aaa ctg tgc 1859
Leu Leu Lys Thr Glu Val Thr Asn Pro Ala Val Leu Arg Lys Leu Cys
230 235 240
att gaa gct aaa ata tca aac acc acc acc gat tcg aga tgt cca aca 1907
Ile Glu Ala Lys Ile Ser Asn Thr Thr Thr Asp Ser Arg Cys Pro Thr
245 250 255
caa gga gaa gcc acg ctg gtg gaa gaa cag gac acg aac ttt gtg tgt 1955
Gln Gly Glu Ala Thr Leu Val Glu Glu Gln Asp Thr Asn Phe Val Cys
260 265 270
cga cga acg ttc gtg gac aga ggc tgg ggc aat ggt tgt ggg cta gcc 2003
Arg Arg Thr Phe Val Asp Arg Gly Trp Gly Asn Gly Cys Gly Leu Ala
275 280 285
gga aaa ggt agc tta ata acg tgt gct aag ttt aag tgt gtg aca aaa 2051
Gly Lys Gly Ser Leu Ile Thr Cys Ala Lys Phe Lys Cys Val Thr Lys
290 295 300 305
ctg gaa gga aag ata gtc caa tat gaa aac tta aaa tat tca gtg ata 2099
Leu Glu Gly Lys Ile Val Gln Tyr Glu Asn Leu Lys Tyr Ser Val Ile
310 315 320
gtc acc gta cac act gga gac cag cac caa gtt gga aat gag acc aca 2147
Val Thr Val His Thr Gly Asp Gln His Gln Val Gly Asn Glu Thr Thr
325 330 335
gaa cat gga aca act gca acc ata aca cct caa gct ccc acg tcg gaa 2195
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Ile Gln Leu Thr Asp Tyr Gly Ala Leu Thr Leu Asp Cys Ser Pro Arg
355 360 365
aca ggg cta gac ttt aat gag atg gtg ttg ttg aca atg gaa aaa aaa 2291
Thr Gly Leu Asp Phe Asn Glu Met Val Leu Leu Thr Met Glu Lys Lys
370 375 380 385
tca tgg ctc gtc cac aaa caa tgg ttt cta gac tta cca ctg cct tgg 2339
Ser Trp Leu Val His Lys Gln Trp Phe Leu Asp Leu Pro Leu Pro Trp
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acc tcg ggg gct tca aca tcc caa gag act tgg aat aga caa gac ttg 2387
Thr Ser Gly Ala Ser Thr Ser Gln Glu Thr Trp Asn Arg Gln Asp Leu
405 410 415
ctg gtc aca ttt aag aca gct cat gca atg aag cag gaa gta gtc gta 2435
Leu Val Thr Phe Lys Thr Ala His Ala Met Lys Gln Glu Val Val Val
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cta gga tca caa gaa gga gca atg cac act gcg ttg act gga gcg aca 2483
Leu Gly Ser Gln Glu Gly Ala Met His Thr Ala Leu Thr Gly Ala Thr
435 440 445
gaa atc caa acg tct gga acg aca aca att ttt gca gga cac ctg aaa 2531
Glu Ile Gln Thr Ser Gly Thr Thr Thr Ile Phe Ala Gly His Leu Lys
450 455 460 465
tgc aga cta aaa atg gat aaa ctg act tta aaa ggg atg tca tat gta 2579
Cys Arg Leu Lys Met Asp Lys Leu Thr Leu Lys Gly Met Ser Tyr Val
470 475 480
atg tgc aca ggg tca ttc aag tta gag aag gaa gtg gct gag acc cag 2627
Met Cys Thr Gly Ser Phe Lys Leu Glu Lys Glu Val Ala Glu Thr Gln
485 490 495
cat gga act gtt cta gtg cag gtt aaa tac gaa gga aca gat gca cca 2675
His Gly Thr Val Leu Val Gln Val Lys Tyr Glu Gly Thr Asp Ala Pro
500 505 510
tgc aag atc ccc ttc tcg tcc caa gat gag aag gga gta acc cag aat 2723
Cys Lys Ile Pro Phe Ser Ser Gln Asp Glu Lys Gly Val Thr Gln Asn
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ggg aga ttg ata aca gcc aac ccc ata gtc act gac aaa gaa aaa cca 2771
Gly Arg Leu Ile Thr Ala Asn Pro Ile Val Thr Asp Lys Glu Lys Pro
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gtc aac att gaa gcg gag cca cct ttt ggt gag agc tac att gtg gta 2819
Val Asn Ile Glu Ala Glu Pro Pro Phe Gly Glu Ser Tyr Ile Val Val
550 555 560
gga gca ggt gaa aaa gct ttg aaa cta agc tgg ttc aag aag gga agc 2867
Gly Ala Gly Glu Lys Ala Leu Lys Leu Ser Trp Phe Lys Lys Gly Ser
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agt ata ggg aaa atg ttt gaa gca act gcc cgt gga gca cga agg atg 2915
Ser Ile Gly Lys Met Phe Glu Ala Thr Ala Arg Gly Ala Arg Arg Met
580 585 590
gcc atc ctg gga gac act gca tgg gac ttc ggt tct ata gga ggg gtg 2963
Ala Ile Leu Gly Asp Thr Ala Trp Asp Phe Gly Ser Ile Gly Gly Val
595 600 605
ttc acg tct gtg gga aaa ctg ata cac cag att ttt ggg act gcg tat 3011
Phe Thr Ser Val Gly Lys Leu Ile His Gln Ile Phe Gly Thr Ala Tyr
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gga gtt ttg ttc agc ggt gtt tct tgg acc atg aag ata gga ata ggg 3059
Gly Val Leu Phe Ser Gly Val Ser Trp Thr Met Lys Ile Gly Ile Gly
630 635 640
att ctg ctg aca tgg cta gga tta aac tca agg agc acg tcc ctt tca 3107
Ile Leu Leu Thr Trp Leu Gly Leu Asn Ser Arg Ser Thr Ser Leu Ser
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atg acg tgt atc gca gtt ggc atg gtc acg ctg tac cta gga gtc atg 3155
Met Thr Cys Ile Ala Val Gly Met Val Thr Leu Tyr Leu Gly Val Met
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gtt cag gcg taataaagat ctgctgtgcc ttctagttgc cagccatctg 3204
Val Gln Ala
675
ttgtttgccc ctcccccgtg ccttccttga ccctggaagg tgccactccc actgtccttt 3264
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gaaagaagca ggcacatccc cttctctgtg acacaccctg tccacgcccc tggttcttag 3504
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gtttcctgtg tgaaattgtt atccgctcac aattccacac aacatacgag ccggaagcat 3864
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actgcccgct ttccagtcgg gaaacctgtc gtgccagctg cattaatgaa tcggccaacg 3984
cgcggggaga ggcggtttgc gtattgggcg ctcttccgct tcctcgctca ctgactcgct 4044
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atccacagaa tcaggggata acgcaggaaa gaacatgtga gcaaaaggcc agcaaaaggc 4164
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cggatacctg tccgcctttc tcccttcggg aagcgtggcg ctttctcata gctcacgctg 4404
taggtatctc agttcggtgt aggtcgttcg ctccaagctg ggctgtgtgc acgaaccccc 4464
cgttcagccc gaccgctgcg ccttatccgg taactatcgt cttgagtcca acccggtaag 4524
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aggcggtgct acagagttct tgaagtggtg gcctaactac ggctacacta gaagaacagt 4644
atttggtatc tgcgctctgc tgaagccagt taccttcgga aaaagagttg gtagctcttg 4704
atccggcaaa caaaccaccg ctggtagcgg tggttttttt gtttgcaagc agcagattac 4764
gcgcagaaaa aaaggatctc aagaagatcc tttgatcttt tctacggggt ctgacgctca 4824
gtggaacgaa aactcacgtt aagggatttt ggtcatgaga ttatcaaaaa ggatcttcac 4884
ctagatcctt ttaaattaaa aatgaagttt taaatcaatc taaagtatat atgagtaaac 4944
ttggtctgac agttaccaat gcttaatcag tgaggcacct atctcagcga tctgtctatt 5004
tcgttcatcc atagttgcct gactccccgt cgtgtagata actacgatac gggagggctt 5064
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gtgcaaaaaa gcggttagct ccttcggtcc tccgatcgtt gtcagaagta agttggccgc 5424
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tactttcacc agcgtttctg ggtgagcaaa aacaggaagg caaaatgccg caaaaaaggg 5784
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tattatcatg acattaacct ataaaaatag gcgtatcacg aggccctttc gggtcgcgcg 6024
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<213> Dengue virus
<400> 16
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His Val Gly Leu Gly Leu Glu Thr Arg Thr Glu Thr Trp Met Ser Ser
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Thr Pro Ser Met Ala Met Arg Cys Val Gly Ile Gly Asn Arg Asp Phe
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Val Leu Gly Ser Gln Glu Gly Ala Met His Thr Ala Leu Thr Gly Ala
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<213> Dengue virus
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<212> PRT
<213> Dengue virus
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<220>
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<220>
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<223> DENV1 M sequence
<220>
<221> MISC_FEATURE
<222> (182)..(676)
<223> DENV1 Envelope sequence
<400> 21
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Thr Ser Ile Thr Gln Lys Gly Ile Ile Phe Ile Leu Leu Met Leu Val
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Thr Pro Ser Met Ala Met Arg Cys Val Gly Ile Gly Asn Arg Asp Phe
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Val Leu Gly Ser Gln Glu Gly Ala Met His Thr Ala Leu Thr Gly Ala
435 440 445
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545 550 555 560
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<221> MISC_FEATURE
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245 250 255
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260 265 270
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275 280 285
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485 490 495
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500 505 510
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515 520 525
Arg Leu Ile Thr Ala Asn Pro Ile Val Thr Asp Lys Glu Lys Pro Val
530 535 540
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565 570 575
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580 585 590
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595 600 605
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610 615 620
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660 665 670
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<211> 676
<212> PRT
<213> Dengue virus
<220>
<221> MISC_FEATURE
<223> DEV4 prM E (F108A)_3'DEV1
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<221> MISC_FEATURE
<222> (1)..(477)
<223> DEV4 prM E (F108A)
<220>
<221> MISC_FEATURE
<222> (478)..(676)
<223> 3' DEV1
<400> 24
Met Ser Thr Val Thr Leu Leu Cys Leu Ile Pro Thr Val Met Ala Phe
1 5 10 15
His Leu Ser Thr Arg Asp Gly Glu Pro Leu Met Ile Val Ala Lys His
20 25 30
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35 40 45
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50 55 60
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65 70 75 80
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100 105 110
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115 120 125
Glu Gly Ala Trp Lys His Ala Gln Arg Val Glu Ser Trp Ile Leu Arg
130 135 140
Asn Pro Gly Phe Ala Leu Leu Ala Gly Phe Met Ala Tyr Met Ile Gly
145 150 155 160
Gln Thr Gly Ile Gln Arg Thr Val Phe Phe Val Leu Met Met Leu Val
165 170 175
Ala Pro Ser Tyr Gly Met Arg Cys Ile Gly Val Gly Asn Arg Asp Phe
180 185 190
Val Glu Gly Val Ser Gly Gly Ala Trp Val Asp Leu Val Leu Glu His
195 200 205
Gly Gly Cys Val Thr Thr Met Ala Gln Gly Lys Pro Thr Leu Asp Phe
210 215 220
Glu Leu Ile Lys Thr Thr Ala Lys Glu Val Ala Leu Leu Arg Thr Tyr
225 230 235 240
Cys Ile Glu Ala Ser Ile Ser Asn Ile Thr Thr Ala Thr Arg Cys Pro
245 250 255
Thr Gln Gly Glu Pro Tyr Leu Lys Glu Glu Gln Asp Gln Gln Tyr Ile
260 265 270
Cys Arg Arg Asp Val Val Asp Arg Gly Trp Gly Asn Gly Cys Gly Leu
275 280 285
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645 650 655
Ser Met Thr Cys Ile Ala Val Gly Met Val Thr Leu Tyr Leu Gly Val
660 665 670
Met Val Gln Ala
675
Claims (22)
- 하나 이상의 플라비바이러스 구조 단백질을 포함하는 바이러스 유사 입자로서, 상기 플라비바이러스 구조 단백질이 SEQ ID Nos. 2, 10, 14, 16, 23 및 24 중 임의의 하나에 의해 나타내지는 아미노산 서열의 아미노산 위치 16 에서 C-말단 사이의 아미노산 서열을 포함하는 단백질인 바이러스 유사 입자.
- 제 1 항에 있어서, 상기 플라비바이러스 구조 단백질이 SEQ ID Nos. 2, 10, 14 및 16 중 임의의 하나에 의해 나타내지는 아미노산 서열로 이루어지는 단백질인 바이러스 유사 입자.
- 제 1 항 또는 제 2 항에 따른 바이러스 유사 입자 내에 함유되는 플라비바이러스 구조 단백질을 엔코딩하는 뉴클레오티드 서열을 포함하는 단리된 핵산 분자.
- 제 3 항에 있어서, SEQ ID Nos. 1, 9, 13 및 15 중 임의의 하나에 의해 나타내지는 뉴클레오티드 서열로 이루어지는 단리된 핵산 분자.
- 제 3 항에 따른 핵산 분자를 포함하는 벡터로서, 핵산 분자에 작동적으로 연결된 발현 조절 서열을 포함하는 벡터.
- 하기를 포함하는, 플라비바이러스 감염에 의해 야기되는 질환 또는 상태의 치료 또는 예방을 위한 약학 조성물:
(a) 제 1 항 또는 제 2 항에 따른 바이러스 유사 입자 및 제 1 항 또는 제 2 항에 따른 바이러스 유사 입자 내에 함유되는 플라비바이러스 구조 단백질을 엔코딩하는 뉴클레오티드 서열을 포함하는 단리된 핵산 분자로 이루어진 군에서 선택되는 하나 이상; 및
(b) 약학적으로 허용가능한 담체. - 제 1 항 또는 제 2 항에 따른 바이러스 유사 입자를 포함하는 백신 조성물.
- 제 3 항에 따른 핵산 분자를 포함하는 DNA 백신 조성물.
- 제 1 항 또는 제 2 항에 따른 바이러스 유사 입자 및 제 1 항 또는 제 2 항에 따른 바이러스 유사 입자 내에 함유되는 플라비바이러스 구조 단백질을 엔코딩하는 뉴클레오티드 서열을 포함하는 단리된 핵산 분자로 이루어진 군에서 선택되는 하나 이상을 인간을 제외한 포유류와 접촉시키는 것을 포함하는, 항체의 제조 방법.
- 제 1 항 또는 제 2 항에 따른 바이러스 유사 입자 내에 함유된 적어도 하나의 플라비바이러스 구조 단백질을 엔코딩하는 유전자로 트랜스펙션된 세포를 배양하는 단계; 및 세포 배양물로부터 바이러스 유사 입자를 회수하는 단계를 포함하는, 제 1 항 또는 제 2 항에 따른 바이러스 유사 입자의 제조 방법.
- 제 1 항 또는 제 2 항에 있어서, 포유류에서 플라비바이러스 감염을 진단하는 방법 또는 키트에서 사용하기 위한 바이러스 유사 입자.
- 삭제
- 삭제
- 삭제
- 삭제
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- 삭제
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- 삭제
- 삭제
- 삭제
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