JP5230234B2 - 還元酵素及びその利用 - Google Patents
還元酵素及びその利用 Download PDFInfo
- Publication number
- JP5230234B2 JP5230234B2 JP2008078602A JP2008078602A JP5230234B2 JP 5230234 B2 JP5230234 B2 JP 5230234B2 JP 2008078602 A JP2008078602 A JP 2008078602A JP 2008078602 A JP2008078602 A JP 2008078602A JP 5230234 B2 JP5230234 B2 JP 5230234B2
- Authority
- JP
- Japan
- Prior art keywords
- amino acid
- reductase
- seq
- transformant
- polynucleotide
- Prior art date
- Legal status (The legal status is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the status listed.)
- Expired - Fee Related
Links
Classifications
-
- Y—GENERAL TAGGING OF NEW TECHNOLOGICAL DEVELOPMENTS; GENERAL TAGGING OF CROSS-SECTIONAL TECHNOLOGIES SPANNING OVER SEVERAL SECTIONS OF THE IPC; TECHNICAL SUBJECTS COVERED BY FORMER USPC CROSS-REFERENCE ART COLLECTIONS [XRACs] AND DIGESTS
- Y02—TECHNOLOGIES OR APPLICATIONS FOR MITIGATION OR ADAPTATION AGAINST CLIMATE CHANGE
- Y02P—CLIMATE CHANGE MITIGATION TECHNOLOGIES IN THE PRODUCTION OR PROCESSING OF GOODS
- Y02P20/00—Technologies relating to chemical industry
- Y02P20/50—Improvements relating to the production of bulk chemicals
- Y02P20/52—Improvements relating to the production of bulk chemicals using catalysts, e.g. selective catalysts
Landscapes
- Enzymes And Modification Thereof (AREA)
- Preparation Of Compounds By Using Micro-Organisms (AREA)
- Micro-Organisms Or Cultivation Processes Thereof (AREA)
Description
本発明は、還元反応に利用可能な改変型還元酵素及びその利用に関するものである。
還元酵素は、基質を還元する触媒能を有し、医農薬の有効成分となる化合物やその中間体、特に光学活性化合物等を製造する為の有機合成反応に利用されている。
例えば、医農薬等の各種用途の化合物の製造中間体として有用な光学活性なアルコールの製造方法としては、種々の方法が知られており、特許文献１には、ライフソニア エスピー(Leifsonia sp.)Ｓ−７４９（ＦＥＲＭ ＢＰ−８２９１）から還元酵素遺伝子をクローニングし、当該還元酵素を発現する形質転換体を用いて光学活性アルコールを製造する方法が開示されている。また、種々の変異を導入して得られる改変型還元酵素も報告されている（特許文献２）。
例えば、医農薬等の各種用途の化合物の製造中間体として有用な光学活性なアルコールの製造方法としては、種々の方法が知られており、特許文献１には、ライフソニア エスピー(Leifsonia sp.)Ｓ−７４９（ＦＥＲＭ ＢＰ−８２９１）から還元酵素遺伝子をクローニングし、当該還元酵素を発現する形質転換体を用いて光学活性アルコールを製造する方法が開示されている。また、種々の変異を導入して得られる改変型還元酵素も報告されている（特許文献２）。
光学活性である化合物やその中間体等を製造する為に工業的に利用される還元酵素としては、還元反応における反応生成物の光学純度が高いこと又は基質の絶対立体配置に対する当該酵素の認識性が高いことや、温度・ｐＨ・溶媒・圧力等に対する安定性が高いことが望ましい。中でも有機溶媒に対する還元酵素の安定性、即ち有機溶媒耐性が高いと、基質又は生成物からの阻害を回避するために添加される有機溶媒による当該還元酵素の失活を軽減することが可能となる。そこで、反応時間の短縮及び反応効率の向上を図るうえで有機溶媒耐性に優れた還元酵素が切望されている。
特開２００４−２６１０４２
特開２００７−０６１０６５
本発明は、光学活性化合物の工業的製造に適した還元酵素及び当該酵素を用いた光学活性化合物の製造方法を提供することを目的とする。
本発明者らは、上記課題に鑑み、鋭意検討を行った結果、野生型還元酵素のアミノ酸配列においてある特定のアミノ酸が置換されているアミノ酸配列を有する改変型還元酵素が、優れた還元酵素活性を有し、且つ優れた有機溶媒耐性を示し光学的活性化合物の工業的製造に有用であることを見いだし、本発明を完成するに至った。すなわち本発明は以下の通りである。
〔１〕配列番号２で示される野生型還元酵素のアミノ酸配列において、少なくとも下記ａ）からｈ）の８箇所のアミノ酸置換を有することを特徴とするアミノ酸配列からなる改変型還元酵素；
ａ）３番目のアミノ酸がセリンに置換、
ｂ）４番目のアミノ酸がロイシンに置換、
ｃ）１２番目のアミノ酸がグリシンに置換、
ｄ）４２番目のアミノ酸がロイシンに置換、
ｅ）６７番目のアミノ酸がアルギニンに置換、
ｆ）１２５番目のアミノ酸がメチオニンに置換、
ｇ）１８０番目のアミノ酸がイソロイシンに置換、及び
ｈ）３２７番目のアミノ酸がバリンに置換。
〔２〕Ｃ末端にさらにオリゴペプチドＳｅｒ−Ｇｌｙ−Ｈｉｓ−Ｈｉｓ−Ｈｉｓ−Ｈｉｓ−Ｈｉｓ−Ｈｉｓ（配列番号３）が付加されている上記〔１〕に記載の改変型還元酵素。
〔３〕上記〔１〕又は〔２〕に記載の改変型還元酵素をコードする塩基配列を有するポリヌクレオチド。
〔４〕配列番号３３で示される塩基配列を有する上記〔３〕に記載のポリヌクレオチド。
〔５〕宿主細胞内において機能可能なプロモーターと上記〔３〕又は〔４〕に記載のポリヌクレオチドとが機能可能な形で接続されてなることを特徴とするポリヌクレオチド。
〔６〕上記〔３〕乃至〔５〕のいずれかに記載のポリヌクレオチドを有することを特徴とするベクター。
〔７〕配列番号３５で示される塩基配列を有することを特徴とするベクター。
〔８〕上記〔３〕乃至〔５〕のいずれかに記載のポリヌクレオチド又は上記〔６〕若しくは〔７〕に記載のベクターが宿主細胞に導入されてなることを特徴とする形質転換体。
〔９〕宿主細胞が微生物であることを特徴とする上記〔８〕に記載の形質転換体。
〔１０〕微生物が大腸菌であることを特徴とする上記〔９〕に記載の形質転換体。
〔１１〕上記〔３〕乃至〔５〕のいずれかに記載のポリヌクレオチド又は上記〔６〕若しくは〔７〕に記載のベクターを宿主細胞に導入する工程を含むことを特徴とする形質転換体の製造方法。
〔１２〕ケトン化合物又はアルデヒド化合物に、上記〔１〕若しくは〔２〕に記載の改変型還元酵素あるいはそれを産生する微生物、又は上記〔８〕乃至〔１０〕のいずれかに記載の形質転換体あるいはそれらの処理物を作用させることを特徴とするアルコール化合物の製造方法。
〔１３〕ケトン化合物がｍ−クロロフェナシルクロライドであり、アルコール化合物が１−（３−クロロフェニル）−２−クロロエタノールであることを特徴とする上記〔１２〕に記載のアルコール化合物の製造方法。
〔１４〕ケトン化合物が４−クロロ−３−オキソ酪酸エステルであり、アルコール化合物が４−クロロ−３−ヒドロキシ酪酸エステルであることを特徴とする上記〔１２〕に記載のアルコール化合物の製造方法。
ａ）３番目のアミノ酸がセリンに置換、
ｂ）４番目のアミノ酸がロイシンに置換、
ｃ）１２番目のアミノ酸がグリシンに置換、
ｄ）４２番目のアミノ酸がロイシンに置換、
ｅ）６７番目のアミノ酸がアルギニンに置換、
ｆ）１２５番目のアミノ酸がメチオニンに置換、
ｇ）１８０番目のアミノ酸がイソロイシンに置換、及び
ｈ）３２７番目のアミノ酸がバリンに置換。
〔２〕Ｃ末端にさらにオリゴペプチドＳｅｒ−Ｇｌｙ−Ｈｉｓ−Ｈｉｓ−Ｈｉｓ−Ｈｉｓ−Ｈｉｓ−Ｈｉｓ（配列番号３）が付加されている上記〔１〕に記載の改変型還元酵素。
〔３〕上記〔１〕又は〔２〕に記載の改変型還元酵素をコードする塩基配列を有するポリヌクレオチド。
〔４〕配列番号３３で示される塩基配列を有する上記〔３〕に記載のポリヌクレオチド。
〔５〕宿主細胞内において機能可能なプロモーターと上記〔３〕又は〔４〕に記載のポリヌクレオチドとが機能可能な形で接続されてなることを特徴とするポリヌクレオチド。
〔６〕上記〔３〕乃至〔５〕のいずれかに記載のポリヌクレオチドを有することを特徴とするベクター。
〔７〕配列番号３５で示される塩基配列を有することを特徴とするベクター。
〔８〕上記〔３〕乃至〔５〕のいずれかに記載のポリヌクレオチド又は上記〔６〕若しくは〔７〕に記載のベクターが宿主細胞に導入されてなることを特徴とする形質転換体。
〔９〕宿主細胞が微生物であることを特徴とする上記〔８〕に記載の形質転換体。
〔１０〕微生物が大腸菌であることを特徴とする上記〔９〕に記載の形質転換体。
〔１１〕上記〔３〕乃至〔５〕のいずれかに記載のポリヌクレオチド又は上記〔６〕若しくは〔７〕に記載のベクターを宿主細胞に導入する工程を含むことを特徴とする形質転換体の製造方法。
〔１２〕ケトン化合物又はアルデヒド化合物に、上記〔１〕若しくは〔２〕に記載の改変型還元酵素あるいはそれを産生する微生物、又は上記〔８〕乃至〔１０〕のいずれかに記載の形質転換体あるいはそれらの処理物を作用させることを特徴とするアルコール化合物の製造方法。
〔１３〕ケトン化合物がｍ−クロロフェナシルクロライドであり、アルコール化合物が１−（３−クロロフェニル）−２−クロロエタノールであることを特徴とする上記〔１２〕に記載のアルコール化合物の製造方法。
〔１４〕ケトン化合物が４−クロロ−３−オキソ酪酸エステルであり、アルコール化合物が４−クロロ−３−ヒドロキシ酪酸エステルであることを特徴とする上記〔１２〕に記載のアルコール化合物の製造方法。
本発明によれば、ケトン化合物又はアルデヒド化合物からアルコール化合物を製造するために優れた改変型還元酵素等が得られる。
文中で特に断らない限り、本明細書で用いるすべての技術用語及び科学用語は、本発明が属する技術分野の当業者に一般に理解されるのと同じ意味をもつ。本明細書に記載されたものと同様又は同等の任意の方法及び材料は、本発明の実施又は試験において使用することができるが、好ましい方法及び材料を以下に記載する。本明細書で言及したすべての刊行物及び特許は、例えば、記載された発明に関連して使用されうる刊行物に記載されている、構築物及び方法論を記載及び開示する目的で、参照として本明細書に組み入れられる。
まず、本発明における改変型還元酵素について説明する。
配列番号２で示される野生型還元酵素のアミノ酸配列とは、３４８個のアミノ酸残基からなるアミノ酸配列であり、ロドコッカス(Rhodococcus)属（好ましくは、ロドコッカス エリスロポリス(Rhodococcus erythropolis)）に属する微生物由来の還元酵素である。当該還元酵素及び本発明の改変型還元酵素の還元酵素活性（即ち、基質を還元する能力）は、これらのタンパク質を、例えば、ｍ−クロロフェナシルクロライド、ＮＡＤＨと混合して３０℃で保温し、遊離するＮＡＤ＋量を反応液の３４０ｎｍにおける吸光度を指標に定量することにより測定することができる。
配列番号２で示される野生型還元酵素のアミノ酸配列とは、３４８個のアミノ酸残基からなるアミノ酸配列であり、ロドコッカス(Rhodococcus)属（好ましくは、ロドコッカス エリスロポリス(Rhodococcus erythropolis)）に属する微生物由来の還元酵素である。当該還元酵素及び本発明の改変型還元酵素の還元酵素活性（即ち、基質を還元する能力）は、これらのタンパク質を、例えば、ｍ−クロロフェナシルクロライド、ＮＡＤＨと混合して３０℃で保温し、遊離するＮＡＤ＋量を反応液の３４０ｎｍにおける吸光度を指標に定量することにより測定することができる。
尚、ロドコッカス(Rhodococcus)属（好ましくは、ロドコッカス エリスロポリス(Rhodococcus erythropolis)）に属する微生物は、天然から分離してもよいし、菌株保存機関等から購入してもよい。
天然から分離する場合、まず、土壌を野外から採取する。採取された土壌を滅菌水で懸濁させた後、当該懸濁液を、例えば、ＰＹ培地（Bacto Peptoneを５ｇ／Ｌ、Yeast Extractを５ｇ／Ｌの割合で水に溶解した後、ｐＨを７．０に調整）等の微生物分離用固体培地上に塗布し、これを２５℃で培養し、数日後に生えてきた菌の独立したコロニーを切り取り、新しい、例えば、ＰＹ培地等の微生物分離用固体培地に移植し、これをさらに２５℃で培養する。生育してきた菌について、SNEATH, (P.H.A.), MAIR, (N.S.) SHARPE, (M.E.) and HOLT, (J.G.):Bergey’s manual of Systematic Bacteriorogy. Vol.2. 1984, Williams and Wilkins, Baltimore．等に記載される方法等に従って、ロドコッカス(Rhodococcus)属に属する微生物であるかを同定することにより、ロドコッカス(Rhodococcus)属に属する微生物を選抜すればよい。
つぎに、選抜されたロドコッカス(Rhodococcus)属に属する微生物から、当該微生物のｍ−クロロフェナシルクロライドを還元して１−（３−クロロフェニル）−２−クロロエタノールを生産する能力の有無を、例えば、後述の実施例に記載されるような方法に従って確認することにより、本発明に用いられるロドコッカス(Rhodococcus)属に属する微生物を選抜すればよい。
このように選抜されたロドコッカス(Rhodococcus)に属する微生物のうち、ロドコッカス エリスロポリス(Rhodococcus erythropolis)ＳＴ−１０株は、独立行政法人産業技術総合研究所特許生物寄託センター（〒３０５−８５６６ 茨城県つくば市東１−１−１ つくばセンター中央第６）に寄託され、ＦＥＲＭ ＢＰ−１３１５０の受託番号が付与されている（原寄託日：平成４年９月８日）。
本発明の改変型還元酵素としては、具体的には例えば、配列表の配列番号３３で示される塩基配列がコードするアミノ酸配列（配列番号３４）を有する還元酵素等を挙げることができる。その他に、配列番号２で示される野生型還元酵素のアミノ酸配列において、少なくとも下記ａ）からｈ）のアミノ酸置換を有する改変型還元酵素が例示される。
ａ）３番目のアミノ酸がセリンに置換、
ｂ）４番目のアミノ酸がロイシンに置換、
ｃ）１２番目のアミノ酸がグリシンに置換、
ｄ）４２番目のアミノ酸がロイシンに置換、
ｅ）６７番目のアミノ酸がアルギニンに置換、
ｆ）１２５番目のアミノ酸がメチオニンに置換、
ｇ）１８０番目のアミノ酸がイソロイシンに置換、及び
ｈ）３２７番目のアミノ酸がバリンに置換。
さらには、前記した改変型還元酵素のアミノ酸配列のＣ末端にさらにオリゴペプチドＳｅｒ−Ｇｌｙ−Ｈｉｓ−Ｈｉｓ−Ｈｉｓ−Ｈｉｓ−Ｈｉｓ−Ｈｉｓ（配列番号３）が付加されている改変型還元酵素も例示される。
ａ）３番目のアミノ酸がセリンに置換、
ｂ）４番目のアミノ酸がロイシンに置換、
ｃ）１２番目のアミノ酸がグリシンに置換、
ｄ）４２番目のアミノ酸がロイシンに置換、
ｅ）６７番目のアミノ酸がアルギニンに置換、
ｆ）１２５番目のアミノ酸がメチオニンに置換、
ｇ）１８０番目のアミノ酸がイソロイシンに置換、及び
ｈ）３２７番目のアミノ酸がバリンに置換。
さらには、前記した改変型還元酵素のアミノ酸配列のＣ末端にさらにオリゴペプチドＳｅｒ−Ｇｌｙ−Ｈｉｓ−Ｈｉｓ−Ｈｉｓ−Ｈｉｓ−Ｈｉｓ−Ｈｉｓ（配列番号３）が付加されている改変型還元酵素も例示される。
本発明の改変型還元酵素は、例えば、後述の本発明ポリヌクレオチド又は後述の本発明ベクター等が宿主細胞に導入されてなる形質転換体（即ち、本発明の形質転換体）を培養することにより製造することができる。
当該形質転換体を培養するための培地としては、例えば、微生物等の宿主細胞の培養に通常使用される炭素源や窒素源、有機塩や無機塩等を適宜含む各種の培地を用いることができる。
炭素源としては、例えば、グルコース、デキストリン、シュークロース等の糖類、グリセロール等の糖アルコール、フマル酸、クエン酸、ピルビン酸等の有機酸、動物油、植物油及び糖蜜が挙げられる。これらの炭素源の培地への添加量は培養液に対して通常０．１〜３０％（ｗ／ｖ）程度である。
窒素源としては、例えば、肉エキス、ペプトン、酵母エキス、麦芽エキス、大豆粉、コーン・スティープ・リカー(Corn Steep Liquor)、綿実粉、乾燥酵母、カザミノ酸等の天然有機窒素源、アミノ酸類、硝酸ナトリウム等の無機酸のアンモニウム塩、塩化アンモニウム、硫酸アンモニウム、リン酸アンモニウム等の無機酸のアンモニウム塩、フマル酸アンモニウム、クエン酸アンモニウム等の有機酸のアンモニウム塩及び尿素が挙げられる。これらのうち有機酸のアンモニウム塩、天然有機窒素源、アミノ酸類等は多くの場合には炭素源としても使用することができる。これらの窒素源の培地への添加量は培養液に対して通常０．１〜３０％（ｗ／ｖ）程度である。
有機塩や無機塩としては、例えば、カリウム、ナトリウム、マグネシウム、鉄、マンガン、コバルト、亜鉛等の塩化物、硫酸塩、酢酸塩、炭酸塩及びリン酸塩を挙げることができる。具体的には、例えば、塩化ナトリウム、塩化カリウム、硫酸マグネシウム、硫酸第一鉄、硫酸マンガン、塩化コバルト、硫酸亜鉛、硫酸銅、酢酸ナトリウム、炭酸カルシウム、リン酸水素一カリウム及びリン酸水素二カリウムが挙げられる。これらの有機塩及び／又は無機塩の培地への添加量は培養液に対して通常０．０００１〜５％（ｗ／ｖ）程度である。
尚、あらかじめ培地中に原料となる基質を少量添加しておくと、本発明に関する形質転換体の能力を高めることができる。添加する基質の量は、通常０．００１％程度以上、好ましくは０．１〜１％程度がよい。
さらに、ｔａｃプロモーター、ｔｒｃプロモーター及びｌａｃプロモーター等のアロラクトースで誘導されるタイプのプロモーターと本発明ポリヌクレオチドとが機能可能な形で接続されてなる遺伝子が導入されてなる形質転換体の場合には、本発明の改変型還元酵素の生産を誘導するための誘導剤として、例えば、isopropyl thio-β-D-galactoside（ＩＰＴＧ）を培地中に少量加えることもできる。
後述の本発明ポリヌクレオチド又は後述の本発明ベクター等が宿主細胞に導入されてなる形質転換体（即ち、本発明形質転換体）の培養は、一般微生物における通常の方法に準じて行い、固体培養、液体培養（旋回式振とう培養、往復式振とう培養、ジャーファーメンター(JarFermenter)培養、タンク培養等）等が可能である。特に、ジャーファーメンターを用いる場合、無菌空気を導入する必要があり、通常、培養液量の約０．１〜約２倍／分の通気条件を用いる。培養温度及び培地のｐＨは、微生物が生育する範囲から適宜選ぶことができ、例えば、約１５℃〜約４０℃の培養温度にて、ｐＨが約６〜約８の培地で培養することが好ましい。培養時間は、種々の培養条件によって異なるが、通常約１日間〜約５日間が望ましい。温度シフト型やＩＰＴＧ誘導型等の誘導型のプロモーターを有する発現ベクターを用いた場合には、誘導時間は１日間以内が好ましく、通常数時間である。
後述の本発明ポリヌクレオチド又は後述の本発明ベクター等が宿主細胞に導入されてなる形質転換体（即ち、本発明形質転換体）の培養物から本発明の改変型還元酵素を精製する方法としては、通常のタンパク質の精製において使用される方法を適用することができ、例えば、次のような方法を挙げることができる。
まず、当該形質転換体の培養物から遠心分離等により細胞を集めた後、これを超音波処理、ダイノミル処理、フレンチプレス処理等の物理的破砕法又は界面活性剤若しくはリゾチーム等の溶菌酵素を用いる化学的破砕法等によって破砕する。得られた破砕液から遠心分離、メンブレンフィルター濾過等により不純物を除去することにより無細胞抽出液を調製し、これを陽イオン交換クロマトグラフィー、陰イオン交換クロマトグラフィー、疎水クロマトグラフィー、ゲルろ過クロマトグラフィー、金属キレートクロマトグラフィー等の分離精製方法を適宜用いて分画することによって、本発明の改変型還元酵素を精製することができる。
クロマトグラフィーに使用する担体としては、例えば、カルボキシメチル（ＣＭ）基、ジエチルアミノエチル（ＤＥＡＥ）基、フェニル基若しくはブチル基を導入したセルロース、デキストリン又はアガロース等の不溶性高分子担体が挙げられる。市販の担体充填済カラムを用いることもでき、かかる市販の担体充填済カラムとしては、例えば、Q-Sepharose FF、Phenyl-Sepharose HP（商品名、いずれもアマシャム ファルマシア バイオテク社製）、TSK-gel G3000SW（商品名、東ソー社製）等が挙げられる。
尚、本発明の改変型還元酵素を含む画分を選抜するには、例えば、ｍ−クロロフェナシルクロライドを還元して１−（３−クロロフェニル）−２−クロロエタノールを生産する能力を指標にして選抜すればよい。
次いで、本発明ポリヌクレオチドについて説明する。
本発明ポリヌクレオチドは、天然に存在する改変型遺伝子であってもよく、又は天然の野生型遺伝子に変異を導入（部位特異的変異導入法、突然変異処理等）することにより作出された改変型遺伝子であってもよい。また、特開２００７−０６１０６５に記載の還元酵素をコードするポリヌクレオチドを人工合成したものに変異を導入（部位特異的変異導入法、突然変異処理等）することにより作出された改変型遺伝子であってもよい。さらには、人工的に全ヌクレオチドを合成した人工合成ポリヌクレオチドであってもよい。上記のような改変型遺伝子及び野生型遺伝子を検索する場合には、例えば、ｍ−クロロフェナシルクロライドを還元して１−（３−クロロフェニル）−２−クロロエタノールを生産する能力を有する微生物を対象にすればよく、例えば、ロドコッカス(Rhodococcus)属（好ましくは、ロドコッカス エリスロポリス(Rhodococcus erythropolis)）に属する微生物をその対象として挙げることができる。
本発明ポリヌクレオチドは、天然に存在する改変型遺伝子であってもよく、又は天然の野生型遺伝子に変異を導入（部位特異的変異導入法、突然変異処理等）することにより作出された改変型遺伝子であってもよい。また、特開２００７−０６１０６５に記載の還元酵素をコードするポリヌクレオチドを人工合成したものに変異を導入（部位特異的変異導入法、突然変異処理等）することにより作出された改変型遺伝子であってもよい。さらには、人工的に全ヌクレオチドを合成した人工合成ポリヌクレオチドであってもよい。上記のような改変型遺伝子及び野生型遺伝子を検索する場合には、例えば、ｍ−クロロフェナシルクロライドを還元して１−（３−クロロフェニル）−２−クロロエタノールを生産する能力を有する微生物を対象にすればよく、例えば、ロドコッカス(Rhodococcus)属（好ましくは、ロドコッカス エリスロポリス(Rhodococcus erythropolis)）に属する微生物をその対象として挙げることができる。
本発明の改変型還元酵素をコードする塩基配列を有する遺伝子（即ち、本発明ポリヌクレオチド）を取得するには、まず、野生型還元酵素をコードする塩基配列を有する遺伝子（即ち、野生型遺伝子）を取得するとよい。ここで、野生型遺伝子とは、配列番号１に示される塩基配列を有する遺伝子であり、例えば、J.Sambrook、E.F.Fritsch、T.Maniatis著；モレキュラー クローニング 第２版(Molecular Cloning 2nd edition)、コールドスプリング ハーバー ラボラトリー(Cold Spring Harbor Laboratory)発行、１９８９年、等に記載される通常の遺伝子工学的手法に準じてロドコッカス エリスロポリス(Rhodococcus erythropolis)に属する微生物から取得することができる。即ち、ロドコッカス エリスロポリス(Rhodococcus erythropolis)に属する微生物から「新 細胞工学実験プロトコール」（東京大学医科学研究所制癌研究部編、秀潤社、１９９３年）に記載された方法に準じてＤＮＡライブラリーを調製し、調製されたＤＮＡライブラリーを鋳型として、かつ適切なプライマーを用いてＰＣＲを行うことにより、配列番号２で示されるアミノ酸配列をコードする塩基配列からなるＤＮＡ又は配列番号１で示される塩基配列を有するＤＮＡ等を増幅して本発明の改変型還元酵素の遺伝子を調製する。
野生型遺伝子に部位特異的変異を導入することによって、本発明ポリヌクレオチドを調製することができる。部位特異的変異導入法としては、例えば、Olfert Landt ら(Gene 96 125-128 1990)、Smithら(Genetic Engineering 3 1 Setlow,J.and Hollaender,A Plenum:New York)、Vlasukら(Experimental Manipulation of Gene Expression,Inouye,M.:Academic Press,New York)、Hos.N.Huntら(Gene 77 51 1989)の方法やMutan-Express Km（宝酒造社製）やTaKaRa La PCR in vitro Mutagenesis Kit（宝酒造社製）の市販キットの利用等が挙げられる。このようにして、例えば、配列番号２の野生型還元酵素のアミノ酸配列において、７つのアミノ酸の置換(3 Ser, 4 Leu, 12 Gly, 42 Leu, 67 Arg, 125 Met, 327 Val；置換対象となるアミノ酸の配列中の位置と置換後のアミノ酸の種類を示している)が導入されている配列番号３２で示されるアミノ酸配列を有する改変型還元酵素を得ることができる。
また、同様にして９つのアミノ酸の置換(3 Ser, 4 Leu, 12 Gly, 42 Leu, 67 Arg, 125 Met, 173 Pro, 180 Ile, 327 Val)が導入されている配列番号３７で示されるアミノ酸配列を有する改変型還元酵素を得ることができる。
また、同様にして９つのアミノ酸の置換(3 Ser, 4 Leu, 12 Gly, 42 Leu, 67 Arg, 125 Met, 173 Pro, 180 Ile, 327 Val)が導入されている配列番号３７で示されるアミノ酸配列を有する改変型還元酵素を得ることができる。
例えば、Olfert Landtら(Gene 96 125-128 1990)の方法を用いて、配列番号３２で示されるアミノ酸配列においてその１８０番目のアミノ酸（スレオニン）がイソロイシンで置換されているアミノ酸配列をコードする塩基配列からなるポリヌクレオチドを調製するには、まず、配列番号３２で示されるアミノ酸配列からなる改変型還元酵素の遺伝子が組み込まれたベクターＤＮＡを、例えばJ.Sambrook、E.F.Fritsch、T.Maniatis著；モレキュラー クローニング 第２版(Molecular Cloning 2nd edition)、コールドスプリング ハーバー ラボラトリー(Cold Spring Harbor Laboratory)発行、１９８９年、等に記載される方法に準じて調製する。次いで、得られたベクターＤＮＡを鋳型にして、例えば、配列番号３２で示されるアミノ酸配列における１８０番目のアミノ酸がイソロイシンに置換されているアミノ酸配列をコードする塩基配列を含むオリゴヌクレオチドを片側のプライマーとして用い、適切な塩基配列を有するオリゴヌクレオチドをもう一方の側のプライマーとして用いて、ＰＣＲ法によるＤＮＡ断片の増幅を行うとよい。ここで、ＰＣＲ反応の条件としては、例えば、９４℃にて５分間保温した後、９４℃にて１分間、次いで５０℃にて２分間、さらに７５℃にて３分間保温する処理を２０サイクル行い、最後に７５℃で８分間保温する。このようにして増幅されたＤＮＡ断片を、精製した後、改変型還元酵素の遺伝子が組み込まれたベクターＤＮＡと適切な塩基配列を有するオリゴヌクレオチドプライマーを加え、ＰＣＲ法により、ＤＮＡ断片の増幅を行うとよい。このようにして得られたＤＮＡ断片を、適切な制限酵素、例えば制限酵素ＥｃｏＲＩおよびＰｓｔＩで消化し、同様の制限酵素消化を行った改変型還元酵素の遺伝子を含むベクターＤＮＡとライゲーション反応を行うことにより、目的とするポリヌクレオチドを得ることができる。
尚、他のポジションが他のアミノ酸で置換されている場合も上記方法に準じた方法により、目的とする本発明ポリヌクレオチドを得ることができる。
また、本発明ポリヌクレオチドは、例えば、微生物又はファージ由来のベクターに挿入されたＤＮＡライブラリーに本発明ポリヌクレオチドが有する塩基配列から選ばれる部分塩基配列を有する約１５塩基程度以上の塩基配列からなるＤＮＡをプローブとして後述する条件にてハイブリダイズさせ、当該プローブが特異的に結合するＤＮＡを検出することによっても取得することができる。
染色体ＤＮＡ又はＤＮＡライブラリーにプローブをハイブリダイズさせる方法としては、例えば、コロニーハイブリダイゼーションやプラークハイブリダイゼーションを挙げることができ、ライブラリーの作製に用いられたベクターの種類に応じて方法を選択することができる。
使用されるライブラリーがプラスミドベクターを用いて作製されている場合にはコロニーハイブリダイゼーションを利用するとよい。具体的には、ライブラリーのＤＮＡを宿主微生物に導入することにより形質転換体を取得し、得られた形質転換体を希釈した後、当該希釈物を寒天培地上にまき、コロニーが現われるまで培養する。
使用されるライブラリーがファージベクターを用いて作製されている場合にはプラークハイブリダイゼーションを利用するとよい。具体的には、宿主微生物とライブラリーのファージとを感染可能な条件下で混合し、さらに軟寒天培地と混合した後、当該混合物を寒天培地上にまき、プラークが現われるまで培養する。
次いで、いずれのハイブリダイゼーションの場合にも、前記の培養を行った寒天培地上にメンブレンを置き、形質転換体又はファージを当該メンブレンに吸着・転写させる。このメンブレンをアルカリ処理した後、中和処理し、次いでＤＮＡを当該メンブレンに固定する処理を行う。より具体的には、例えば、プラークハイブリダイゼーションの場合には、前記寒天培地上にニトロセルロースメンブレン又はナイロンメンブレン（例えば、Hybond-N+（アマシャム社登録商標））を置き、約１分間静置してファージ粒子をメンブレンに吸着・転写させる。次に、当該メンブレンをアルカリ溶液（例えば１．５Ｍ塩化ナトリウム、０．５Ｍ水酸化ナトリウム）に約３分間浸してファージ粒子を溶解させることによりファージＤＮＡをメンブレン上に溶出させた後、中和溶液（例えば、１．５Ｍ塩化ナトリウム、０．５Ｍトリス−塩酸緩衝溶液ｐＨ７．５）に約５分間浸す。次いで当該メンブレンを洗浄液（例えば、０．３Ｍ塩化ナトリウム、３０ｍＭクエン酸、０．２Ｍトリス−塩酸緩衝液ｐＨ７．５）で約５分間洗った後、例えば、約８０℃で約９０分間加熱することによりファージＤＮＡをメンブレンに固定する。
このように調製されたメンブレンを用いて、上記ＤＮＡをプローブとしてハイブリダイゼーションを行う。ハイブリダイゼーションは、例えば、J.Sambrook, E.F.Frisch, T.Maniatis著「Molecular Cloning: A Laboratory Manual 2nd edition（1989）」 Cold Spring Harbor Laboratory Press等の記載に準じて行うことができる。
プローブに用いられるＤＮＡは、放射性同位元素により標識されたものや、蛍光色素で標識されたものであってもよい。
プローブに用いられるＤＮＡを放射性同位元素により標識する方法としては、例えば、Random Primer Labeling Kit（宝酒造社製）等を利用することにより、ＰＣＲ反応液中のｄＣＴＰを（α−３２Ｐ）ｄＣＴＰに替えて、プローブに用いられるＤＮＡを鋳型にしてＰＣＲを行う方法が挙げられる。
また、プローブに用いられるＤＮＡを蛍光色素で標識する場合には、例えば、アマシャム製のECL Direct Nucleic Acid Labeling and Detection System等を用いることができる。
ハイブリダイゼーションは、例えば、以下の通りに行うことができる。
４５０〜９００ｍＭの塩化ナトリウム及び４５〜９０ｍＭのクエン酸ナトリウムを含みドデシル硫酸ナトリウム（ＳＤＳ）を０．１〜１．０重量％の濃度で含み、変性した非特異的ＤＮＡを０〜２００μｌ／ｍｌの濃度で含み、場合によってはアルブミン、フィコール、ポリビニルピロリドン等をそれぞれ０〜０．２重量％の濃度で含んでいてもよいプレハイブリダイゼーション液（好ましくは９００ｍＭの塩化ナトリウム、９０ｍＭのクエン酸ナトリウム、１．０重量％のＳＤＳ及び１００μｌ／ｍｌの変性Calf-thymus DNAを含むプレハイブリダイゼーション液）を上記のようにして作製したメンブレン１ｃｍ２当たり５０〜２００μｌの割合で準備し、当該プレハイブリダイゼーション液に前記メンブレンを浸して４２〜６５℃で１〜４時間保温する。
４５０〜９００ｍＭの塩化ナトリウム及び４５〜９０ｍＭのクエン酸ナトリウムを含みドデシル硫酸ナトリウム（ＳＤＳ）を０．１〜１．０重量％の濃度で含み、変性した非特異的ＤＮＡを０〜２００μｌ／ｍｌの濃度で含み、場合によってはアルブミン、フィコール、ポリビニルピロリドン等をそれぞれ０〜０．２重量％の濃度で含んでいてもよいプレハイブリダイゼーション液（好ましくは９００ｍＭの塩化ナトリウム、９０ｍＭのクエン酸ナトリウム、１．０重量％のＳＤＳ及び１００μｌ／ｍｌの変性Calf-thymus DNAを含むプレハイブリダイゼーション液）を上記のようにして作製したメンブレン１ｃｍ２当たり５０〜２００μｌの割合で準備し、当該プレハイブリダイゼーション液に前記メンブレンを浸して４２〜６５℃で１〜４時間保温する。
次いで、例えば、４５０〜９００ｍＭの塩化ナトリウム及び４５〜９０ｍＭのクエン酸ナトリウムを含み、ＳＤＳを０．１〜１．０重量％の濃度で含み、変性した非特異的ＤＮＡを０〜２００μｇ／ｍｌの濃度で含み、場合によってはアルブミン、フィコール、ポロビニルピロリドン等をそれぞれ０〜０．２重量％の濃度で含んでいてもよいハイブリダイゼーション溶液（好ましくは、９００ｍＭの塩化ナトリウム、９０ｍＭのクエン酸ナトリウム、１．０重量％のＳＤＳ及び１００μｇ／ｍｌの変性Calf-thymus DNAを含むハイブリダイゼーション溶液）と前述の方法で調製して得られたプローブ（メンブレン１ｃｍ２当たり１．０×１０４〜２．０×１０６ｃｐｍ相当量）とを混合した溶液をメンブレン１ｃｍ２当たり５０〜２００μｌの割合で準備し、当該ハイブリダイゼーション溶液に浸し４２〜６５℃で１２〜２０時間保温する。
当該ハイブリダイゼーション後、メンブレンを取り出し、１５〜３００ｍＭの塩化ナトリウム１．５〜３０ｍＭクエン酸ナトリウム及び０．１〜１．０重量％のＳＤＳ等を含む４２〜６５℃の洗浄液（好ましくは１５ｍＭの塩化ナトリウム、１．５ｍＭのクエン酸ナトリウム及び１．０重量％のＳＤＳを含む６５℃の洗浄液）等を用いて洗浄する。洗浄したメンブレンを２ｘＳＳＣ（３００ｍＭ塩化ナトリウム、３０ｍＭクエン酸ナトリウム）で軽くすすいだ後、乾燥する。このメンブレンを例えばオートラジオグラフィー等に供してメンブレン上のプローブの位置を検出することにより、用いたプローブとハイブリダイズするＤＮＡのメンブレン上の位置に相当するクローンを元の寒天培地上で特定し、これを釣菌することにより、当該ＤＮＡを有するクローンを単離する。
このようにして得られるクローンを培養して得られる培養菌体から本発明ポリヌクレオチドを調製することができる。
さらに、本発明のポリヌクレオチドは、細胞工学別冊、植物細胞工学シリーズ７「植物のＰＣＲ実験プロトコール」、９５〜１００頁、島本巧・佐々木卓治監修秀潤社、１９９７年７月１日刊行に記載の方法などを参考に合成することもできる。この方法では、長い合成オリゴヌクレオチドプライマーのみを使用してＤＮＡを合成する。プライマーの対は、プライマーの各々の３’末端に約１０〜１２ｂｐの相補鎖またはオーバーラップをもつように合成され、お互いのプライマーを鋳型としてＤＮＡ合成を行う。プライマーの全長は、約６０〜１００ｍｅｒ、好ましくは約８０〜１００ｍｅｒである。
具体的には、まず、設計された塩基配列をもとに例えば約９０塩基ごとにプライマーとするＤＮＡオリゴマーを設計し、合成する。ＤＮＡオリゴマーの合成は、β−シアノエチルホスホアミダイド法によりＤＮＡ合成機を用いて行うことができる。
設計した塩基配列の中央部付近から５’側約９０残基上流までの配列を用いて第１のＤＮＡオリゴマーを設計し、合成する。次にこの第１のＤＮＡオリゴマーの３’側１２残基の配列を含み、この部分より遺伝子の３’下流側に９０残基程度の長さの相補鎖オリゴマーを合成し、これを第２のＤＮＡオリゴマーとする。また、第１のＤＮＡオリゴマーの５’側１２残基を含み、この部分より遺伝子の５’上流側に９０残基程度の長さの相補鎖オリゴマーを合成し、これを第３のＤＮＡオリゴマーとする。さらに、第２のＤＮＡオリゴマーの５’側（遺伝子側からみると３’側）の１２残基の配列を含み、この部分より遺伝子の３’下流側に第２のＤＮＡオリゴマーの相補鎖を合成し、これを第４のＤＮＡオリゴマーとする。以下同様に第５、第６とＤＮＡオリゴマーを合成し、全部の領域をカバーできるまでさらにオリゴマーを合成する。
設計した塩基配列の中央部付近から５’側約９０残基上流までの配列を用いて第１のＤＮＡオリゴマーを設計し、合成する。次にこの第１のＤＮＡオリゴマーの３’側１２残基の配列を含み、この部分より遺伝子の３’下流側に９０残基程度の長さの相補鎖オリゴマーを合成し、これを第２のＤＮＡオリゴマーとする。また、第１のＤＮＡオリゴマーの５’側１２残基を含み、この部分より遺伝子の５’上流側に９０残基程度の長さの相補鎖オリゴマーを合成し、これを第３のＤＮＡオリゴマーとする。さらに、第２のＤＮＡオリゴマーの５’側（遺伝子側からみると３’側）の１２残基の配列を含み、この部分より遺伝子の３’下流側に第２のＤＮＡオリゴマーの相補鎖を合成し、これを第４のＤＮＡオリゴマーとする。以下同様に第５、第６とＤＮＡオリゴマーを合成し、全部の領域をカバーできるまでさらにオリゴマーを合成する。
次に、これらオリゴマーを順番にＰＣＲ反応により結合する。まず第１と第２のＤＮＡオリゴマーをプライマーとして用いてＰＣＲ反応を行う。次にこのＰＣＲ産物を鋳型として、第３、第４のＤＮＡオリゴマーをプライマーとして用いてＰＣＲ反応を行う。ＰＣＲ反応は、例えば、変性温度９４℃１分、アニール温度５１℃１分、伸長温度７２℃２分を１セットとして５サイクル反応させた後、変性温度９４℃１分、アニール温度６０℃１分、伸長温度７２℃２分を１セットして２０サイクル反応を行う。反応に使用するＤＮＡポリメラーゼは塩基の取り込みエラー率の低い酵素を使用することが好ましい。以下この操作を繰り返し、塩基配列を伸長し、目的の塩基配列を得る。目的の塩基配列の両端には、必要に応じて制限酵素部位を設け、常法に従いクローニングベクターに導入し、サブクローニングしたり、セルフライゲーションによってプラスミドを構築する。得られたポリヌクレオチドの塩基配列をＤＮＡシークエンサーで確認し、目的の塩基配列が得られたことを確認する。
上記のようにして調製された本発明ポリヌクレオチドを「Molecular Cloning: A Laboratory Manual 2nd edition」(1989), Cold Spring Harbor Laboratory Press、「Current Protocols in Molecular Biology」(1987), John Wiley & Sons, Inc. ISBNO-471-50338-X等に記載されている方法に準じてベクターにクローニングして本発明ベクターを得ることができる。用いられるベクターとしては、具体的には、例えば、ｐＵＣ１１９（宝酒造社製）、ｐＴＶ１１８Ｎ（宝酒造社製）、ｐＢｌｕｅｓｃｒｉｐｔＩＩ（東洋紡社製）、ｐＣＲ２．１−ＴＯＰＯ (Invitrogen社製)、ｐＴｒｃ９９Ａ (Pharmacia社製)、ｐＫＫ２２３−３ (Pharmacia社製)等が挙げられる。
また、前述のＤＮＡの塩基配列は、F.Sanger, S.Nicklen, A.R.Coulson著、Proceeding of Natural Academy of Science U.S.A.(1977) 74: 5463-5467頁等に記載されているダイデオキシターミネーター法等により解析することができる。塩基配列分析用の試料調製には、例えば、パーキンエルマー社のABI PRISM Dye Terminator Cycle Sequencing Ready Reaction Kit等の市販の試薬を用いてもよい。
上述のようにして得られるＤＮＡが、ｍ−クロロフェナシルクロライドを還元して１−（３−クロロフェニル）−２−クロロエタノールを優先して生産する能力を有するタンパク質のアミノ酸配列をコードしていることの確認は、例えば、以下のようにして行うことができる。
まず上述のようにして得られるＤＮＡを後述のように、宿主細胞において機能可能なプロモーターの下流に接続されるようにベクターに挿入し、このベクターを宿主細胞に導入して形質転換体を取得する。次いで当該形質転換体の培養物をｍ−クロロフェナシルクロライドに作用させる。反応生成物中の１−（３−クロロフェニル）−２−クロロエタノールの量を分析することにより、得られたＤＮＡがかかる能力を有するタンパク質のアミノ酸配列をコードすることが確認できる。
本発明ポリヌクレオチドを宿主細胞で発現させるには、例えば、宿主細胞で機能可能なプロモーターと本発明ポリヌクレオチドとが機能可能な形で接続されてなるポリヌクレオチドを宿主細胞に導入する。
ここで、「機能可能な形で」とは、当該ポリヌクレオチドを宿主細胞に導入することにより宿主細胞を形質転換させた際に、本発明ポリヌクレオチドが、プロモーターの制御下に発現するようにプロモーターと結合された状態にあることを意味する。プロモーターとしては、大腸菌のラクトースオペロンのプロモーター、大腸菌のトリプトファンオペロンのプロモーター、または、ｔａｃプロモーターもしくはｔｒｃプロモーター等の大腸菌内で機能可能な合成プロモーター等を挙げることができる。
一般的には、宿主細胞において機能可能なプロモーターと機能可能な形で接続されてなる遺伝子を下記のような基本ベクターに組み込んでなるベクターを宿主細胞に導入する。ここで「基本ベクター」としては、具体的には大腸菌を宿主細胞とする場合には、例えば、ベクターｐＵＣ１１９（宝酒造社製）やファージミドｐＢｌｕｅｓｃｒｉｐｔＩＩ (Stratagene社製)等を挙げることができる。出芽酵母を宿主細胞とする場合には、ベクターｐＧＢＴ９、ｐＧＡＤ４２４、ｐＡＣＴ２ (Clontech社製)等を挙げることができる。また、哺乳類動物細胞を宿主細胞とする場合には、ｐＲｃ／ＲＳＶ、ｐＲｃ／ＣＭＶ (Invitrogen社製)等のベクター、ウシパピローマウイルスベクターｐＢＰＶ（アマシャム ファルマシア バイオテク社製）もしくはＥＢウイルスベクターｐＣＥＰ４ (Invitrogen社製)等のウイルス由来の自律複製起点を含むベクター、ワクシニアウイルス等のウイルス等を挙げることができる。さらに、昆虫類動物細胞を宿主細胞とする場合には、バキュロウイルス等の昆虫ウイルスを挙げることができる。
自律複製起点を含むベクター、例えば、上記の酵母用ベクターｐＡＣＴ２や、ウシパピローマウイルスベクターｐＢＰＶ、ＥＢウイルスベクターｐＣＥＰ４等を用いて本発明ベクターを構築すると、当該ベクターは宿主細胞に導入された際にエピソームとして細胞内に保持される。
尚、基本ベクターとして選択マーカー遺伝子（例えば、カナマイシン耐性遺伝子、ネオマイシン耐性遺伝子等の抗生物質耐性付与遺伝子等）を含むベクターを用いると、当該ベクターが導入された形質転換体を当該選択マーカー遺伝子の表現型等を指標にして選択することができる。
尚、基本ベクターとして選択マーカー遺伝子（例えば、カナマイシン耐性遺伝子、ネオマイシン耐性遺伝子等の抗生物質耐性付与遺伝子等）を含むベクターを用いると、当該ベクターが導入された形質転換体を当該選択マーカー遺伝子の表現型等を指標にして選択することができる。
また本発明ベクターは、酸化型β−ニコチンアミドアデニンジヌクレオチドリン酸又は酸化型β−ニコチンアミドアデニンジヌクレオチドを還元型に変換する能力を有するタンパク質のアミノ酸配列をコードする塩基配列を有するポリヌクレオチドをさらに含有してもよい。このような本発明ベクターを用いることにより、酸化型β−ニコチンアミドアデニンジヌクレオチドリン酸又は酸化型β−ニコチンアミドアデニンジヌクレオチドを還元型に変換する能力を有するタンパク質のアミノ酸配列をコードする塩基配列を有するポリヌクレオチドをさらに保有する本発明形質転換体を作製することもできる。
さらには、上記、本発明ポリヌクレオチドと基本ベクターを含み、さらには酸化型β−ニコチンアミドアデニンジヌクレオチドリン酸又は酸化型β−ニコチンアミドアデニンジヌクレオチドを還元型に変換する能力を有するタンパク質のアミノ酸配列をコードする塩基配列を有するポリヌクレオチドをさらに含有していてもよいポリヌクレオチドを人工合成したポリヌクレオチドとして、本発明ベクターを合成し、宿主細胞に導入してなる本発明形質転換体を作製することもできる。また、特開２００７−０６１０６５に記載のベクターｐＨＡＲ１のポリヌクレオチドを人工合成したものに（部位特異的変異導入法、突然変異処理等）することにより作出された本発明ベクターを構築し、宿主細胞に導入してなる本発明形質転換体を作製することもできる。
宿主細胞において機能可能なプロモーターと機能可能な形で接続されてなる本発明ポリヌクレオチド又は本発明ベクター等を導入する宿主細胞としては、例えば、Escherichia属、Bacillus属、Corynebacterium属、Staphylococcus属、Streptomyces属、Saccharomyces属、Kluyveromyces属及びAspergillus属に属する微生物等が挙げられる。
宿主細胞において機能可能なプロモーターと機能可能な形で接続されてなる本発明ポリヌクレオチド又は本発明ベクター等を宿主細胞へ導入する方法は、用いられる宿主細胞に応じて通常使われる導入方法であればよく、例えば、「Molecular Cloning: A Laboratory Manual 2nd edition」(1989), Cold Spring Harbor Laboratory Press、「Current Protocols in Molecular Biology」(1987), John Wiley & Sons, Inc. ISBNO-471-50338-X等に記載される塩化カルシウム法や、「Methods in Electroporation:Gene Pulser /E.coli Pulser System」 Bio-Rad Laboratories, (1993)等に記載されるエレクトロポレーション法等を挙げることができる。
宿主細胞において機能可能なプロモーターと機能可能な形で接続されてなる本発明ポリヌクレオチド又は本発明ベクター等が導入された形質転換体を選抜するには、例えば、前述のようなベクターに含まれる選択マーカー遺伝子の表現型を指標にして選抜すればよい。
当該形質転換体が本発明ポリヌクレオチドを保有していることは、例えば、「Molecular Cloning: A Laboratory Manual 2nd edition」(1989), Cold Spring Harbor Laboratory Press等に記載される通常の方法に準じて、制限酵素部位の確認、塩基配列の解析、サザンハイブリダイゼーション、ウエスタンハイブリダイゼーション等を行うことにより、確認することができる。
このようにして調製された本発明ポリヌクレオチドを用いて、前述の如く、通常の遺伝子工学的方法及び微生物培養方法等に準じ、本発明の改変型還元酵素を大量に製造し、取得することができる。
このようにして調製された本発明の改変型還元酵素を産生する本発明形質転換体又はその処理物は、基質を還元するバイオリアクターとして、例えば医農薬の有効成分となる化合物やその中間体、特に光学活性である化合物やその中間体等を製造する為の有機合成反応に利用することが可能である。
次に、本発明におけるアルコール化合物の製造方法について説明する。
ケトン化合物又はアルデヒド化合物としては、例えば、プロピオンアルデヒド、ｎ−ブチルアルデヒド、ｎ−バレルアルデヒド、ｎ−ヘキシルアルデヒド、ｎ−ペプチルアルデヒド、ｎ−デシルアルデヒド、２−オキソプロピオンアルデヒド、トランス−シンナムアルデヒド、４−ブロモベンズアルデヒド、２−ニトロベンズアルデヒド、３−ニトロベンズアルデヒド、フェニルアセトアルデヒド、４−クロロベンズアルデヒド、２−ペンタノン、２−ヘキサノン、２−ヘプタノン、２−オクタノン、２−ノナノン、３−ペンタノン、３−クロロ−２−ブタノン、ｔｅｒｔ−ブチルアセトアセテート、４−ヒドロキシ−２−ブタノン、ヒドロキシアセトン、１，１−ジクロロアセトン、クロロアセトン、ジヒドロキシアセトン、１，１−ジクロロアセトン、メチル ３−オキソブタノエート、エチル ３−オキサブタノネート、エチル ４−クロロアセトアセテート、メチル ４−ブロモ−３−オキサブタノエート、エチル ４−ブロモ−３−オキサブタノエート、Ｎ−ｔｅｒｔ−ブトキシカルボニル−３−ピロリジノン、イソプロピル ４−シアノ−３−オキソブタノエート、エチル ４−シアノ−３−オキソブタノエート、メチル ４−シアノ−３−オキソブタノエート、メチル ３−オキソペンタノエート、ｍ−クロロフェナシルクロライド、アセトフェノン、２’−ブロモアセトフェノン、３’−ブロモアセトフェノン、４’−ブロモアセトフェノン、２−クロロアセトフェノン、３’−クロロアセトフェノン、４’−クロロアセトフェノン、ベンジルアセトン、１−フェニル−２−ブタノン、ｍ−メトキシアセトフェノン、３，４−ジメトキシアセトフェノン、４’−メトキシアセトフェノン、２，３’−ジクロロアセトフェノン、３，４−ジメトキシフェニルアセトン、シクロペンタノン、Ｎ−ベンジルピロリジノン、Ｎ−Ｂｏｃ−ピロリジノン、４−アセチル安息香酸、Ｄ−（＋）−グルコース等が挙げられる。
ケトン化合物又はアルデヒド化合物としては、例えば、プロピオンアルデヒド、ｎ−ブチルアルデヒド、ｎ−バレルアルデヒド、ｎ−ヘキシルアルデヒド、ｎ−ペプチルアルデヒド、ｎ−デシルアルデヒド、２−オキソプロピオンアルデヒド、トランス−シンナムアルデヒド、４−ブロモベンズアルデヒド、２−ニトロベンズアルデヒド、３−ニトロベンズアルデヒド、フェニルアセトアルデヒド、４−クロロベンズアルデヒド、２−ペンタノン、２−ヘキサノン、２−ヘプタノン、２−オクタノン、２−ノナノン、３−ペンタノン、３−クロロ−２−ブタノン、ｔｅｒｔ−ブチルアセトアセテート、４−ヒドロキシ−２−ブタノン、ヒドロキシアセトン、１，１−ジクロロアセトン、クロロアセトン、ジヒドロキシアセトン、１，１−ジクロロアセトン、メチル ３−オキソブタノエート、エチル ３−オキサブタノネート、エチル ４−クロロアセトアセテート、メチル ４−ブロモ−３−オキサブタノエート、エチル ４−ブロモ−３−オキサブタノエート、Ｎ−ｔｅｒｔ−ブトキシカルボニル−３−ピロリジノン、イソプロピル ４−シアノ−３−オキソブタノエート、エチル ４−シアノ−３−オキソブタノエート、メチル ４−シアノ−３−オキソブタノエート、メチル ３−オキソペンタノエート、ｍ−クロロフェナシルクロライド、アセトフェノン、２’−ブロモアセトフェノン、３’−ブロモアセトフェノン、４’−ブロモアセトフェノン、２−クロロアセトフェノン、３’−クロロアセトフェノン、４’−クロロアセトフェノン、ベンジルアセトン、１−フェニル−２−ブタノン、ｍ−メトキシアセトフェノン、３，４−ジメトキシアセトフェノン、４’−メトキシアセトフェノン、２，３’−ジクロロアセトフェノン、３，４−ジメトキシフェニルアセトン、シクロペンタノン、Ｎ−ベンジルピロリジノン、Ｎ−Ｂｏｃ−ピロリジノン、４−アセチル安息香酸、Ｄ−（＋）−グルコース等が挙げられる。
上記方法は、通常、水及び還元型ニコチンアミドアデニンジヌクレオチド（以下、ＮＡＤＨと記す。）の存在下に行うとよい。この際に用いられる水は、緩衝水溶液であってもよい。当該緩衝水溶液に用いられる緩衝剤としては、例えば、リン酸ナトリウム、リン酸カリウム等のリン酸アルカリ金属塩、酢酸ナトリウム水溶液、酢酸カリウム等の酢酸アルカリ金属塩及びこれらの混合物が挙げられる。
上記方法においては、水に加えて有機溶媒を共存させることもできる。共存させることができる有機溶媒としては、例えば、ｔ−ブチルメチルエーテル、ジイソプロプルエーテル、テトラヒドロフラン等のエーテル類、ギ酸エチル、酢酸エチル、酢酸プロピル、酢酸ブチル、プロピオン酸エチル、プロピオン酸ブチル等のエステル類、トルエン、ヘキサン、シクロへヘキサン、ヘプタン、イソオクタン等の炭化水素類、メタノール、エタノール、２−プロパノール、ブタノール、ｔ−ブチルアルコール等のアルコール類、ジメチルスルホキシド等の有機硫黄化合物、アセトン等のケトン類、アセトニトリル等のニトリル類及びこれらの混合物が挙げられる。
本発明の還元酵素は、有機溶媒、特に２−プロパノール存在下（例えば、２０％（ｖ／ｖ）、３０℃、２２時間反応）での活性が向上した改変型還元酵素である。当該還元酵素は、基質であるケトン化合物又はアルデヒド化合物の存在下であっても活性を高く保持でき、及び／または、高い基質濃度下で変換反応が可能であることから、工業的なアルコール化合物の製造において有利である。補酵素をリサイクルするための基質となりうる２−プロパノール等の有機溶媒から、当該還元酵素の失活を軽減することが可能となるために、２−プロパノール等の有機溶媒の存在下で優れた活性を示す。
本発明の改変型還元酵素は、例えば、２０％（ｖ／ｖ）の２−プロパノールの存在下において３０℃で２２時間での還元反応を行った場合の還元酵素活性が、同様に還元反応を行った場合の野生型還元酵素や、特開２００７−０６１０６５に記載の改変型還元酵素の還元酵素活性よりも高く、有機溶媒耐性に優れる。
本発明の改変型還元酵素は、例えば、２０％（ｖ／ｖ）の２−プロパノールの存在下において３０℃で２２時間での還元反応を行った場合の還元酵素活性が、同様に還元反応を行った場合の野生型還元酵素や、特開２００７−０６１０６５に記載の改変型還元酵素の還元酵素活性よりも高く、有機溶媒耐性に優れる。
上記方法における反応は、例えば、水、ＮＡＤＨ、及びケトン化合物又はアルデヒド化合物を、本発明の改変型還元酵素あるいはそれを産生する形質転換体又はその処理物とともに、必要によりさらに有機溶媒等を含有した状態で、攪拌、振盪等により混合することにより行われる。
上記方法における反応時のｐＨは適宜選択することができるが、通常ｐＨ３〜１０の範囲である。また反応温度は適宜選択することができるが、原料及び生成物の安定性、反応速度の点から通常０〜６０℃の範囲である。
反応の終点は、例えば、反応液中のケトン化合物又はアルデヒド化合物の量を液体クロマトグラフィー等により追跡することにより決めることができる。
反応時間は適宜選択することができるが、通常、０．５時間から１０日間の範囲である。
反応時間は適宜選択することができるが、通常、０．５時間から１０日間の範囲である。
反応液からのアルコールの回収は、一般に知られている方法を適宜選んで行えばよい。
例えば、反応液の有機溶媒抽出操作、濃縮操作等の後処理を、必要によりカラムクロマトグラフィー、蒸留等を組み合わせて、行うことにより精製する方法が挙げられる。
例えば、反応液の有機溶媒抽出操作、濃縮操作等の後処理を、必要によりカラムクロマトグラフィー、蒸留等を組み合わせて、行うことにより精製する方法が挙げられる。
本発明の改変型還元酵素、それを産生する形質転換体又はその処理物は種々の形態で上記方法に用いることができる。
具体的な形態としては、例えば、本発明ポリヌクレオチドを保有する形質転換体の培養物、かかる形質転換体の処理物としては、無細胞抽出液、粗精製タンパク質、精製タンパク質等及びこれらの固定化物が挙げられる。ここで、形質転換体の処理物としては、例えば、凍結乾燥形質転換体、有機溶媒処理形質転換体、乾燥形質転換体、形質転換体摩砕物、形質転換体の自己消化物、形質転換体の超音波処理物、形質転換体抽出物、形質転換体のアルカリ処理物が挙げられる。また、固定化物を得る方法としては、例えば、担体結合法（シリカゲルやセラミック等の無機担体、セルロース、イオン交換樹脂等に本発明の改変型還元酵素等を吸着させる方法）及び包括法（ポリアクリルアミド、含硫多糖ゲル（例えばカラギーナンゲル）、アルギン酸ゲル、寒天ゲル等の高分子の網目構造の中に本発明の改変型還元酵素等を閉じ込める方法）が挙げられる。
尚、本発明ポリヌクレオチドを保有する形質転換体を用いた工業的な生産を考慮すれば、生形質転換体を用いるよりも当該形質転換体を死滅化させた処理物を用いる方法が製造設備の制限が少ないという点では好ましい。そのための死菌化処理方法としては、例えば、物理的殺菌法（加熱、乾燥、冷凍、光線、超音波、濾過、通電）や、化学薬品を用いる殺菌法（アルカリ、酸、ハロゲン、酸化剤、硫黄、ホウ素、砒素、金属、アルコール、フェノール、アミン、サルファイド、エーテル、アルデヒド、ケトン、シアン及び抗生物質）が挙げられる。一般的には、これらの殺菌法のうちできるだけ本発明の改変型還元酵素の酵素活性を失活させず、かつ反応系への残留、汚染などの影響が少ない処理方法を選択することが望ましい。
また、本発明のアルコール化合物の製造方法はＮＡＤＨの存在下に行われ、ケトン化合物又はアルデヒド化合物の還元反応の進行に伴い、当該ＮＡＤＨは酸化型β−ニコチンアミドアデニンジヌクレオチド（以下、ＮＡＤ＋と記す）に変換される。変換により生じたＮＡＤ＋は、ＮＡＤ＋を還元型（ＮＡＤＨ）に変換する能力を有するタンパク質により元のＮＡＤＨに戻すことができるので、上記方法の反応系内には、ＮＡＤ＋をＮＡＤＨに変換する能力を有するタンパク質を共存させることもできる。
ＮＡＤ＋をＮＡＤＨに変換する能力を有するタンパク質としては、例えば、グルコース脱水素酵素、アルコール脱水素酵素、アルデヒド脱水素酵素、アミノ酸脱水素酵素及び有機酸脱水素酵素（リンゴ酸脱水素酵素等）等が挙げられる。
また、ＮＡＤ＋をＮＡＤＨに変換する能力を有するタンパク質がグルコース脱水素酵素である場合には、反応系内にグルコース等を共存させることにより当該タンパク質の活性が増強される場合もあり、例えば、反応液にこれらを加えてもよい。
また、当該タンパク質は、酵素そのものであってもよいし、また当該酵素をもつ微生物又は当該微生物の処理物の形態で反応系内に共存していてもよい。さらにまた、ＮＡＤ＋をＮＡＤＨに変換する能力を有するタンパク質のアミノ酸配列をコードする塩基配列を有する遺伝子を含む形質転換体又はその処理物であってもよい。ここで処理物とは、前述にある「形質転換体の処理物」と同等なものを意味する。
さらに、本発明のアルコール化合物の製造方法では、グルコース脱水素酵素、アルコール脱水素酵素、アルデヒド脱水素酵素、アミノ酸脱水素酵素及び有機酸脱水素酵素（リンゴ酸脱水素酵素等）等のようなＮＡＤ＋をＮＡＤＨに変換する能力を有するタンパク質のアミノ酸配列をコードする塩基配列を有する遺伝子を同時に保有する形質転換体を用いて行うこともできる。
この形質転換体において、両者遺伝子を宿主細胞へ導入する方法としては、例えば、単一である、両者遺伝子を含むベクターを宿主細胞に導入する方法、複製起源の異なる複数のベクターに両者遺伝子を別々に導入した組換ベクターにより宿主細胞を形質転換する方法等があげられる。さらに、一方の遺伝子または両者遺伝子を宿主細胞の染色体中に導入してもよい。
尚、単一である、両者遺伝子を含むベクターを宿主細胞に導入する方法としては、例えば、プロモーター、ターミネーター等の発現制御に関わる領域をそれぞれの両者遺伝子に連結して組換ベクターを構築したり、ラクトースオペロンのような複数のシストロンを含むオペロンとして発現させるような組換ベクターを構築したりしてもよい。
以下、実施例等により本発明を更に詳細に説明するが、本発明はそれらの実施例によって何ら限定されるものではない。また、本発明において使用する試薬や装置、材料は特に言及されない限り、商業的に入手可能である。
実施例１ （スクリーニング用プラスミドＤＮＡの調製）
（１−１）プラスミドｐＥＡＲ１の調製
配列番号４（ＰＡＲ２０７Ｆ：5’-AAGAATTCAAGGAGATAAGGCCATGAAGGCCATCCAGTAC-3’)で示される塩基配列を有するオリゴヌクレオチドと配列番号５（ＰＡＲ２０７Ｒ：5’-TTTCTGCAGGCCTCACAGGCCAGGGACCACAACCGC-3’）で示されるオリゴヌクレオチドとをプライマーに用いて、例えば、Appl. Microbiol. Biotechnol. (1999) 52:386-392等に記載される公知のプラスミドであるｐＵＡＲ（野生型還元酵素の遺伝子を保有するプラスミド、受託番号ＦＥＲＭ Ｐ−１８１２７）を鋳型にして下記の反応液組成及び反応条件でＰＣＲを行った。
（１−１）プラスミドｐＥＡＲ１の調製
配列番号４（ＰＡＲ２０７Ｆ：5’-AAGAATTCAAGGAGATAAGGCCATGAAGGCCATCCAGTAC-3’)で示される塩基配列を有するオリゴヌクレオチドと配列番号５（ＰＡＲ２０７Ｒ：5’-TTTCTGCAGGCCTCACAGGCCAGGGACCACAACCGC-3’）で示されるオリゴヌクレオチドとをプライマーに用いて、例えば、Appl. Microbiol. Biotechnol. (1999) 52:386-392等に記載される公知のプラスミドであるｐＵＡＲ（野生型還元酵素の遺伝子を保有するプラスミド、受託番号ＦＥＲＭ Ｐ−１８１２７）を鋳型にして下記の反応液組成及び反応条件でＰＣＲを行った。
［反応液組成］
ｐＵＡＲ：５ｎｇ
ｄＮＴＰ：各０．２ｍＭ−ｍｉｘ
プライマー：各３００ｎＭ
KOD-Plus-buffer：５μｌ
ＭｇＳＯ４：１ｍＭ
KOD-Plus-DNAポリメラーゼ：１Ｕ
計５０μｌ
ｐＵＡＲ：５ｎｇ
ｄＮＴＰ：各０．２ｍＭ−ｍｉｘ
プライマー：各３００ｎＭ
KOD-Plus-buffer：５μｌ
ＭｇＳＯ４：１ｍＭ
KOD-Plus-DNAポリメラーゼ：１Ｕ
計５０μｌ
［反応条件］
上記組成の反応液が入った容器をPTC-200 Thermal Cycler（ＭＪリサーチ）にセットし、９４℃（２分間）に加熱した後、９４℃（０．２５分間）−５５℃（０．５分間）−６８℃（２分間）のサイクルを３０回行なった。
上記組成の反応液が入った容器をPTC-200 Thermal Cycler（ＭＪリサーチ）にセットし、９４℃（２分間）に加熱した後、９４℃（０．２５分間）−５５℃（０．５分間）−６８℃（２分間）のサイクルを３０回行なった。
ＰＣＲ反応液を精製して得られたＰＣＲ増幅ＤＮＡ断片に２種類の制限酵素（ＥｃｏＲＩ及びＰｓｔＩ）を加えることにより、当該ＤＮＡ断片を２重消化させた。次いで得られたＤＮＡ断片を精製した。
一方、ベクターｐＵＣ１１８ (Pharmacia製)を２種類の制限酵素（ＥｃｏＲＩ及びＰｓｔＩ）を加えることにより、当該ベクターを２重消化させた。次いで消化されたＤＮＡ断片を精製した。
このようにして精製して得られた２種類のＤＮＡ断片を混合し、Ｔ４ ＤＮＡリガーゼ（宝酒造社製）でライゲーションした。得られたライゲーション液でＥ．ｃｏｌｉ ＪＭ１０９株を形質転換した。得られた形質転換体からQIAprep Spin Miniprep Kit (Qiagen社製)を用いて野生型還元酵素の遺伝子を含有するプラスミド（以下、プラスミドｐＥＡＲ１と記すこともある。）を取り出した。
（１−２）プラスミドｐＥＡＲ２の調製
配列番号４（ＰＡＲ２０７Ｆ：5’-AAGAATTCAAGGAGATAAGGCCATGAAGGCCATCCAGTAC-3’）で示される塩基配列を有するオリゴヌクレオチドと配列番号６（ＰＡＲ２０７ＲＨ：3’-TTTCTGCAGTCAGTGGTGGTGGTGGTGGTGGCCGGACAGGCCAGGGACCACAACCGC-5’）で示されるオリゴヌクレオチドとをプライマーに用いて、ｐＵＡＲ（受託番号ＦＥＲＭ Ｐ−１８１２７）を鋳型にして下記の反応液組成及び反応条件でＰＣＲを行った。
配列番号４（ＰＡＲ２０７Ｆ：5’-AAGAATTCAAGGAGATAAGGCCATGAAGGCCATCCAGTAC-3’）で示される塩基配列を有するオリゴヌクレオチドと配列番号６（ＰＡＲ２０７ＲＨ：3’-TTTCTGCAGTCAGTGGTGGTGGTGGTGGTGGCCGGACAGGCCAGGGACCACAACCGC-5’）で示されるオリゴヌクレオチドとをプライマーに用いて、ｐＵＡＲ（受託番号ＦＥＲＭ Ｐ−１８１２７）を鋳型にして下記の反応液組成及び反応条件でＰＣＲを行った。
［反応液組成］
ｐＵＡＲ１：１ｎｇ
ｄＮＴＰ：各０．２ｍＭ−ｍｉｘ
プライマー：各５００ｎＭ
ExTaq-buffer：５μｌ
ExTaq-DNAポリメラーゼ（宝酒造社製）：５Ｕ
計１００μｌ
ｐＵＡＲ１：１ｎｇ
ｄＮＴＰ：各０．２ｍＭ−ｍｉｘ
プライマー：各５００ｎＭ
ExTaq-buffer：５μｌ
ExTaq-DNAポリメラーゼ（宝酒造社製）：５Ｕ
計１００μｌ
［反応条件］
上記組成の反応液が入った容器をPTC-200 Thermal Cycler（ＭＪリサーチ）にセットし、９４℃（５分間）に加熱した後、９４℃（０．５分間）−５５℃（０．５分間）−７２℃（１分間）のサイクルを３０回行った。
上記組成の反応液が入った容器をPTC-200 Thermal Cycler（ＭＪリサーチ）にセットし、９４℃（５分間）に加熱した後、９４℃（０．５分間）−５５℃（０．５分間）−７２℃（１分間）のサイクルを３０回行った。
ＰＣＲ反応液を精製して得られたＰＣＲ増幅ＤＮＡ断片に２種類の制限酵素（ＫｐｎＩ及びＰｓｔＩ）を加えることにより、当該ＤＮＡ断片を２重消化させた。次いで得られたＤＮＡ断片を精製した。
一方、プラスミドｐＥＡＲ１を２種類の制限酵素（ＫｐｎＩ及びＰｓｔＩ）を加えることにより、当該ベクターを２重消化させた。次いで消化されたＤＮＡ断片を精製した。
このようにして精製して得られた２種類のＤＮＡ断片を混合し、Ｔ４ ＤＮＡリガーゼでライゲーションした。得られたライゲーション液でＥ．ｃｏｌｉ ＪＭ１０９株を形質転換した。得られた形質転換体からQIAprep Spin Miniprep Kit (Qiagen社製)を用いて野生型還元酵素の遺伝子を含有するプラスミド（以下、プラスミドｐＥＡＲ２と記すこともある。）を取り出した。
（１−３）プラスミドｐＥＡＲ２ｓの調製
プラスミドｐＥＡＲ２に制限酵素（ＥｃｏＴ１４Ｉ）を加えることにより、当該ＤＮＡ断片を消化させた。次いで得られたＤＮＡ断片を精製した。
プラスミドｐＥＡＲ２に制限酵素（ＥｃｏＴ１４Ｉ）を加えることにより、当該ＤＮＡ断片を消化させた。次いで得られたＤＮＡ断片を精製した。
このようにして精製して得られたＤＮＡ断片を、Ｔ４ ＤＮＡポリメラーゼ（New England Biolabs社製）で平滑化した後、Ｔ４ ＤＮＡリガーゼでセルフライゲーションした。得られたライゲーション液でＥ．ｃｏｌｉ ＪＭ１０９株を形質転換した。得られた形質転換体からQIAprep Spin Miniprep Kit (Qiagen社製)を用い、野生型還元酵素の遺伝子の一部欠如した遺伝子を含有するプラスミド（以下、プラスミドｐＥＡＲ２ｓと記すこともある。）を取り出した。
実施例２ （プラスミドｐＥＡＲ２のランダム変異導入ライブラリーの調製）
配列番号７（ＲＶ−Ｍ：5’-GAGCGGATAACAATTTCACACAGG-3’）（宝酒造社製）で示される塩基配列を有するオリゴヌクレオチドと配列番号８（Ｍ１３−４７：5’-CGCCAGGGTTTTCCCAGTCACGAC-3’）（宝酒造社製）で示されるオリゴヌクレオチドとをプライマーに用いて、ｐＥＡＲ２を鋳型にして下記の反応液組成及び反応条件でＰＣＲを行った。
配列番号７（ＲＶ−Ｍ：5’-GAGCGGATAACAATTTCACACAGG-3’）（宝酒造社製）で示される塩基配列を有するオリゴヌクレオチドと配列番号８（Ｍ１３−４７：5’-CGCCAGGGTTTTCCCAGTCACGAC-3’）（宝酒造社製）で示されるオリゴヌクレオチドとをプライマーに用いて、ｐＥＡＲ２を鋳型にして下記の反応液組成及び反応条件でＰＣＲを行った。
［反応液組成］
ｐＥＡＲ２：１ｎｇ
ｄＡＴＰ：０．２ｍＭ
ｄＴＴＰ：１ｍＭ
ｄＧＴＰ：０．２ｍＭ
ｄＣＴＰ：１ｍＭ
プライマー：各３０ｐｍｏｌ
ＭｇＣｌ２：７ｍＭ
ＭｎＣｌ２：０．５ｍＭ
ＫＣｌ：５０ｍＭ
Tris-HCl buffer (pH8.3)：１０ｍＭ
Ｇｅｌａｔｉｎ：０．０１％（ｗ／ｖ）
Taq-DNAポリメラーゼ（ロシュ・ダイアグノスティックス）：５Ｕ
計１００μｌ
ｐＥＡＲ２：１ｎｇ
ｄＡＴＰ：０．２ｍＭ
ｄＴＴＰ：１ｍＭ
ｄＧＴＰ：０．２ｍＭ
ｄＣＴＰ：１ｍＭ
プライマー：各３０ｐｍｏｌ
ＭｇＣｌ２：７ｍＭ
ＭｎＣｌ２：０．５ｍＭ
ＫＣｌ：５０ｍＭ
Tris-HCl buffer (pH8.3)：１０ｍＭ
Ｇｅｌａｔｉｎ：０．０１％（ｗ／ｖ）
Taq-DNAポリメラーゼ（ロシュ・ダイアグノスティックス）：５Ｕ
計１００μｌ
［反応条件］
上記組成の反応液が入った容器をPTC-200 Thermal Cycler（ＭＪリサーチ）にセットし、９４℃（１分間）−４５℃（１分間）−７２℃（１分間）のサイクルを３０回行なった。
上記組成の反応液が入った容器をPTC-200 Thermal Cycler（ＭＪリサーチ）にセットし、９４℃（１分間）−４５℃（１分間）−７２℃（１分間）のサイクルを３０回行なった。
ＰＣＲ反応液を精製して得られたＰＣＲ増幅ＤＮＡ断片に制限酵素（ＳｆｉＩ）を加えることにより、当該ＤＮＡ断片を消化させた。次いで得られたＤＮＡ断片を精製した。
一方、プラスミドｐＥＡＲ２ｓを制限酵素（ＳｆｉＩ）を加えることにより、当該ベクターを消化させた。次いで消化されたＤＮＡ断片を精製した。
このようにして精製して得られた２種類のＤＮＡ断片を混合し、Ｔ４ ＤＮＡリガーゼでライゲーションした。得られたライゲーション液でＥ．ｃｏｌｉ ＪＭ１０９株を形質転換した。得られた形質転換体からQIAprep Spin Miniprep Kit (Qiagen社製)を用いてランダム変異の導入された野生型還元酵素の遺伝子を含有するランダム変異導入ライブラリーを取り出した。
実施例３ （有機溶媒耐性を有する形質転換大腸菌の選抜）
（３−１）有機溶媒耐性（２０％イソプロパノール中で活性を示す）を有する形質転換大腸菌の一次選抜
実施例２で得られた形質転換体を０．４ｍＭのisopropyl-β-D-thiogalactopyranoside (IPTG)、１００μｇ／ｍｌのアンピシリン、０．０１％（ｗ／ｖ）のＺｎＣｌ２、１０ｇ／ＬのBacto-tryptone (Difco)、５ｇ／ＬのBacto-yeast extract (Difco)、１０ｇ／ＬのＮａＣｌ及び１５ｇ／Ｌのアガロースを含有する滅菌寒天培地に接種し、これを３０℃で２４時間培養した。培養後、得られたコロニーをナイロン膜（BiodyneA，日本ポール社製）に転写した後、そのナイロン膜を１ｍＭのＮＡＤ＋、２００μＭのnitroblue tetrazolium、１０μＭの1-methoxy-5-methylphenazinium methylsulfate（同仁化学研究所社製）及び２０％（ｖ／ｖ）の２−プロパノールを含む５０ｍＭの3-(N-morpholino)propanesulfonic acid（ＭＯＰＳ）バッファー中に室温で３０分間浸した。その後、ナイロン膜を蒸留水で洗浄し、染色されたコロニー３２０種を選抜した。選抜された３２０のコロニー、プラスミドｐＥＡＲ２にて形質転換されたＪＭ１０９形質転換大腸菌（ＪＭ１０９（ｐＥＡＲ２））、そして、プラスミドｐＥＡＲ２ｓにて形質転換されたＪＭ１０９形質転換大腸菌（ＪＭ１０９（ｐＥＡＲ２ｓ））を、１００μｇ／ｍｌのアンピシリンを含有する滅菌ＬＢ培地（１％トリプトン、０．５％酵母エキス、１％塩化ナトリウム）（１００μｌ）に接種し、これを３７℃で１８時間振盪培養した。
（３−１）有機溶媒耐性（２０％イソプロパノール中で活性を示す）を有する形質転換大腸菌の一次選抜
実施例２で得られた形質転換体を０．４ｍＭのisopropyl-β-D-thiogalactopyranoside (IPTG)、１００μｇ／ｍｌのアンピシリン、０．０１％（ｗ／ｖ）のＺｎＣｌ２、１０ｇ／ＬのBacto-tryptone (Difco)、５ｇ／ＬのBacto-yeast extract (Difco)、１０ｇ／ＬのＮａＣｌ及び１５ｇ／Ｌのアガロースを含有する滅菌寒天培地に接種し、これを３０℃で２４時間培養した。培養後、得られたコロニーをナイロン膜（BiodyneA，日本ポール社製）に転写した後、そのナイロン膜を１ｍＭのＮＡＤ＋、２００μＭのnitroblue tetrazolium、１０μＭの1-methoxy-5-methylphenazinium methylsulfate（同仁化学研究所社製）及び２０％（ｖ／ｖ）の２−プロパノールを含む５０ｍＭの3-(N-morpholino)propanesulfonic acid（ＭＯＰＳ）バッファー中に室温で３０分間浸した。その後、ナイロン膜を蒸留水で洗浄し、染色されたコロニー３２０種を選抜した。選抜された３２０のコロニー、プラスミドｐＥＡＲ２にて形質転換されたＪＭ１０９形質転換大腸菌（ＪＭ１０９（ｐＥＡＲ２））、そして、プラスミドｐＥＡＲ２ｓにて形質転換されたＪＭ１０９形質転換大腸菌（ＪＭ１０９（ｐＥＡＲ２ｓ））を、１００μｇ／ｍｌのアンピシリンを含有する滅菌ＬＢ培地（１％トリプトン、０．５％酵母エキス、１％塩化ナトリウム）（１００μｌ）に接種し、これを３７℃で１８時間振盪培養した。
（３−２）有機溶媒耐性（２０％イソプロパノール中で活性を示す）を有する形質転換大腸菌の二次選抜
（３−１）で一次選抜された３２０種の選抜コロニーのうち、４０コロニーを０．４ｍＭのＩＰＴＧ）、１００μｇ／ｍｌのアンピシリン、０．０１％（ｗ／ｖ）のＺｎＣｌ２、１０ｇ／ＬのBacto‐tryptone (Difco)、５ｇ／ＬのBacto-yeast extract (Difco)、１０ｇ／ＬのＮａＣｌを含有する滅菌培地（１ｍｌ）に接種し、これを３７℃で２２時間培養した。培養後、得られた培養液を遠心分離（２００００×ｇ、５分、４℃）することにより、沈殿として湿菌体を回収した。回収された湿菌体に、最終濃度１ｍＭとなるＮＡＤ＋を含む最終濃度５０ｍＭとなるＭＯＰＳバッファー０．４ｍｌを加えた。次に、５％（ｗ／ｖ）のｍ−クロロフェナシルクロライドを含む２−プロパノール０．１ｍｌを加えた。これを３０℃で２２時間反応させた。反応終了後、酢酸エチルを１ｍｌ添加し、有機層を分取した。有機層はＮａ２ＳＯ４にて脱水処理を行った。当該有機層を下記条件で液体クロマトグラフィーによる含量分析に供試した。このような分析を１６０種の一次選抜された全てのコロニーについて行った結果、クローンＣ３８、Ｃ１２、Ｈ２３、Ｅ９を見出した。
（３−１）で一次選抜された３２０種の選抜コロニーのうち、４０コロニーを０．４ｍＭのＩＰＴＧ）、１００μｇ／ｍｌのアンピシリン、０．０１％（ｗ／ｖ）のＺｎＣｌ２、１０ｇ／ＬのBacto‐tryptone (Difco)、５ｇ／ＬのBacto-yeast extract (Difco)、１０ｇ／ＬのＮａＣｌを含有する滅菌培地（１ｍｌ）に接種し、これを３７℃で２２時間培養した。培養後、得られた培養液を遠心分離（２００００×ｇ、５分、４℃）することにより、沈殿として湿菌体を回収した。回収された湿菌体に、最終濃度１ｍＭとなるＮＡＤ＋を含む最終濃度５０ｍＭとなるＭＯＰＳバッファー０．４ｍｌを加えた。次に、５％（ｗ／ｖ）のｍ−クロロフェナシルクロライドを含む２−プロパノール０．１ｍｌを加えた。これを３０℃で２２時間反応させた。反応終了後、酢酸エチルを１ｍｌ添加し、有機層を分取した。有機層はＮａ２ＳＯ４にて脱水処理を行った。当該有機層を下記条件で液体クロマトグラフィーによる含量分析に供試した。このような分析を１６０種の一次選抜された全てのコロニーについて行った結果、クローンＣ３８、Ｃ１２、Ｈ２３、Ｅ９を見出した。
（含量分析条件）
カラム：Chiralcel OB-H（ダイセル化学工業社製）
キャリアー溶媒：ｎ−ヘキサン／２−プロパノール＝９：１（ｖ／ｖ）
流速：０．８ｍｌ／分
検出器：ＵＶ２６８ｎｍ
カラム：Chiralcel OB-H（ダイセル化学工業社製）
キャリアー溶媒：ｎ−ヘキサン／２−プロパノール＝９：１（ｖ／ｖ）
流速：０．８ｍｌ／分
検出器：ＵＶ２６８ｎｍ
実施例４ （多重改変型ポリヌクレオチドの作製）
（４−１）ライゲーションによる改変型遺伝子の作製
実施例３（３−２）で二次選抜されたクローンＣ３８、Ｃ１２、Ｈ２３、Ｅ９をそれぞれ１００μｇ／ｍｌのアンピシリンを含有する滅菌ＬＢ培地（４ｍｌ）に接種し、これを３７℃で２２時間振盪培養した。培養後、得られたクローンＣ３８、Ｃ１２、Ｈ２３、Ｅ９からそれぞれQIAprep Spin Miniprep Kit (Qiagen社製)を用いてプラスミドを取り出した。クローンＨ２３のプラスミドを精製した後、２種類の制限酵素（ＡｃｃＩとＨｉｎｄＩＩＩ）を加えることにより、当該プラスミドを２重消化させた。次いで消化されたＤＮＡ断片を精製し３３８４ｂｐのＤＮＡ断片を得た。クローンＣ３８のプラスミドを精製した後、２種類の制限酵素（ＡｃｃＩとＫｐｎＩ）を加えることにより、当該プラスミドを２重消化させた。次いで消化されたＤＮＡ断片を精製し２８０ｂｐのＤＮＡ断片を得た。クローンＥ９のプラスミドを精製した後、２種類の制限酵素（ＫｐｎＩとＨｉｎｄＩＩＩ）を加えることにより、当該プラスミドを２重消化させた。次いで消化されたＤＮＡ断片を精製し５５０ｂｐのＤＮＡ断片を得た。このようにして精製して得られた３種類のＤＮＡ断片を混合し、Ｔ４ ＤＮＡリガーゼでライゲーションした。得られたライゲーション液でＥ．ｃｏｌｉＪＭ１０９株を形質転換した。得られた形質転換体からQIAprep Spin Miniprep Kit (Qiagen社製)を用い、野生型還元酵素の遺伝子に変異が導入されたプラスミド（以下、プラスミドｐＳａｒＰと記すこともある。）を取り出した。
（４−１）ライゲーションによる改変型遺伝子の作製
実施例３（３−２）で二次選抜されたクローンＣ３８、Ｃ１２、Ｈ２３、Ｅ９をそれぞれ１００μｇ／ｍｌのアンピシリンを含有する滅菌ＬＢ培地（４ｍｌ）に接種し、これを３７℃で２２時間振盪培養した。培養後、得られたクローンＣ３８、Ｃ１２、Ｈ２３、Ｅ９からそれぞれQIAprep Spin Miniprep Kit (Qiagen社製)を用いてプラスミドを取り出した。クローンＨ２３のプラスミドを精製した後、２種類の制限酵素（ＡｃｃＩとＨｉｎｄＩＩＩ）を加えることにより、当該プラスミドを２重消化させた。次いで消化されたＤＮＡ断片を精製し３３８４ｂｐのＤＮＡ断片を得た。クローンＣ３８のプラスミドを精製した後、２種類の制限酵素（ＡｃｃＩとＫｐｎＩ）を加えることにより、当該プラスミドを２重消化させた。次いで消化されたＤＮＡ断片を精製し２８０ｂｐのＤＮＡ断片を得た。クローンＥ９のプラスミドを精製した後、２種類の制限酵素（ＫｐｎＩとＨｉｎｄＩＩＩ）を加えることにより、当該プラスミドを２重消化させた。次いで消化されたＤＮＡ断片を精製し５５０ｂｐのＤＮＡ断片を得た。このようにして精製して得られた３種類のＤＮＡ断片を混合し、Ｔ４ ＤＮＡリガーゼでライゲーションした。得られたライゲーション液でＥ．ｃｏｌｉＪＭ１０９株を形質転換した。得られた形質転換体からQIAprep Spin Miniprep Kit (Qiagen社製)を用い、野生型還元酵素の遺伝子に変異が導入されたプラスミド（以下、プラスミドｐＳａｒＰと記すこともある。）を取り出した。
（４−２）部位特異的変異導入操作
配列番号９（ＰＡＲＳＱ−Ｒ１：5’-CATTAGGCACCCCAGGCTTTACAC-3’）で示される塩基配列を有するオリゴヌクレオチドと配列番号１４（ＰＡＲ−Ａ１２５Ｔ−ｃｏｍｐ：5’-CTCATGATGAAGACGTCCGAGTGGC-3’）で示されるオリゴヌクレオチドとをプライマーに用いて、ｐＳａｒＰを鋳型にして下記の反応液組成及び反応条件でＰＣＲを行った結果、２６２ｂｐのＤＮＡ断片が得られた。また、配列番号１５（ＰＡＲ−Ｔ３７３Ａ−ｓｅｎｓ：5’-GCACCCGGCGCGATGGCCGAGTTCA-3’）で示される塩基配列を有するオリゴヌクレオチドと配列番号１６（ＰＡＲ−Ｔ５１７Ｃ−ｃｏｍｐ：5’-CAACCGCGTACGGGCCTCCGCGAAG-3’）で示されるオリゴヌクレオチドとをプライマーに用いて、ｐＳａｒＰを鋳型にして下記の反応液組成及び反応条件でＰＣＲを行った結果、１６９ｂｐのＤＮＡ断片が得られた。このようにして精製して得られた２種類のＤＮＡ断片をプライマーに用いて、ｐＳａｒＰを鋳型にして下記の反応液組成及び反応条件でＰＣＲを行った。
配列番号９（ＰＡＲＳＱ−Ｒ１：5’-CATTAGGCACCCCAGGCTTTACAC-3’）で示される塩基配列を有するオリゴヌクレオチドと配列番号１４（ＰＡＲ−Ａ１２５Ｔ−ｃｏｍｐ：5’-CTCATGATGAAGACGTCCGAGTGGC-3’）で示されるオリゴヌクレオチドとをプライマーに用いて、ｐＳａｒＰを鋳型にして下記の反応液組成及び反応条件でＰＣＲを行った結果、２６２ｂｐのＤＮＡ断片が得られた。また、配列番号１５（ＰＡＲ−Ｔ３７３Ａ−ｓｅｎｓ：5’-GCACCCGGCGCGATGGCCGAGTTCA-3’）で示される塩基配列を有するオリゴヌクレオチドと配列番号１６（ＰＡＲ−Ｔ５１７Ｃ−ｃｏｍｐ：5’-CAACCGCGTACGGGCCTCCGCGAAG-3’）で示されるオリゴヌクレオチドとをプライマーに用いて、ｐＳａｒＰを鋳型にして下記の反応液組成及び反応条件でＰＣＲを行った結果、１６９ｂｐのＤＮＡ断片が得られた。このようにして精製して得られた２種類のＤＮＡ断片をプライマーに用いて、ｐＳａｒＰを鋳型にして下記の反応液組成及び反応条件でＰＣＲを行った。
［反応液組成］
ｐＳａｒＰ：５ｎｇ
ｄＮＴＰ：各０．２ｍＭ−ｍｉｘ
プライマー：各３００ｎＭ
ＫＯＤ−Ｐｌｕｓ−ｂｕｆｆｅｒ：５μｌ
ＭｇＳＯ４：１ｍＭ
ＫＯＤ−Ｐｌｕｓ−ＤＮＡポリメラーゼ：１Ｕ
計５０μｌ
ｐＳａｒＰ：５ｎｇ
ｄＮＴＰ：各０．２ｍＭ−ｍｉｘ
プライマー：各３００ｎＭ
ＫＯＤ−Ｐｌｕｓ−ｂｕｆｆｅｒ：５μｌ
ＭｇＳＯ４：１ｍＭ
ＫＯＤ−Ｐｌｕｓ−ＤＮＡポリメラーゼ：１Ｕ
計５０μｌ
［反応条件］
上記組成の反応液が入った容器をPTC-200 Thermal Cycler（ＭＪリサーチ）にセットし、９４℃（２分間）に加熱した後、９４℃（０．２５分間）−５５℃（０．５分間）−６８℃（２分間）のサイクルを３０回行なった。
上記組成の反応液が入った容器をPTC-200 Thermal Cycler（ＭＪリサーチ）にセットし、９４℃（２分間）に加熱した後、９４℃（０．２５分間）−５５℃（０．５分間）−６８℃（２分間）のサイクルを３０回行なった。
ＰＣＲ反応液を精製して得られたＰＣＲ増幅ＤＮＡ断片に２種類の制限酵素（ＥｃｏＲＩ及びＢｓｉＷＩ）を加えることにより、当該ＤＮＡ断片を２重消化させた。次いで得られた５３７ｂｐのＤＮＡ断片を精製した。
一方、プラスミドｐＳａｒＰを２種類の制限酵素（ＥｃｏＲＩ及びＢｓｉＷＩ）を加えることにより、当該ベクターを２重消化させた。次いで消化されたＤＮＡ断片を精製した。
このようにして精製して得られた２種類のＤＮＡ断片を混合し、Ｔ４ ＤＮＡリガーゼ（宝酒造社製）でライゲーションした。得られたライゲーション液でＥ．ｃｏｌｉ ＪＭ１０９株を形質転換した。得られた形質転換体からQIAprep Spin Miniprep Kit (Qiagen社製)を用いて改変型還元酵素の遺伝子を含有するプラスミド（以下、プラスミドｐＳａｒＡと記すこともある。）を取り出した。
（４−２）で得られたプラスミドｐＳａｒＡをダイデオキシ法により変異箇所の塩基配列を決定し、９つのアミノ酸変異(12 Gly, 20 Arg, 42 Val, 67 Arg, 125 Met, 163 Arg, 173 Pro, 275 Leu, 327 Val)が導入されていることを確認した。
実施例５（変異型ポリヌクレオチドの作製：プラスミドｐＳａｒ２、ｐＳａｒ６、ｐＳａｒ８の構築）
表１で示される塩基配列を有する組合せのオリゴヌクレオチドをプライマーに用いて、プラスミドｐＳａｒＡを鋳型にして以下の反応液組成及び反応条件で第１ＰＣＲを行った。
［反応液組成］
ｐＳａｒＡ：５ｎｇ
ｄＮＴＰ：各０．２ｍＭ−ｍｉｘ
プライマー：各３００ｎＭ
ＫＯＤ−Ｐｌｕｓ−ｂｕｆｆｅｒ：５μｌ
ＭｇＳＯ４：１ｍＭ
ＫＯＤ−Ｐｌｕｓ−ＤＮＡポリメラーゼ：１Ｕ
計５０μｌ
ｐＳａｒＡ：５ｎｇ
ｄＮＴＰ：各０．２ｍＭ−ｍｉｘ
プライマー：各３００ｎＭ
ＫＯＤ−Ｐｌｕｓ−ｂｕｆｆｅｒ：５μｌ
ＭｇＳＯ４：１ｍＭ
ＫＯＤ−Ｐｌｕｓ−ＤＮＡポリメラーゼ：１Ｕ
計５０μｌ
［反応条件］
上記組成の反応液が入った容器をPTC-200 Thermal Cycler（ＭＪリサーチ）にセットし、９４℃（２分間）に加熱した後、９４℃（０．２５分間）−５５℃（０．５分間）−６８℃（２分間）のサイクルを３０回行った。
上記組成の反応液が入った容器をPTC-200 Thermal Cycler（ＭＪリサーチ）にセットし、９４℃（２分間）に加熱した後、９４℃（０．２５分間）−５５℃（０．５分間）−６８℃（２分間）のサイクルを３０回行った。
ＰＣＲ反応液を精製して得られたＰＣＲ増幅ＤＮＡ断片と表２に示す塩基配列を有するオリゴヌクレオチドをプライマーに用いて、プラスミドｐＳａｒＡを鋳型にして以下の反応液組成及び反応条件で第２ＰＣＲを行った。
［反応液組成］
ｐＳａｒＡ：５ｎｇ
ｄＮＴＰ：各０．２ｍＭ−ｍｉｘ
プライマー：各３００ｎＭ
ＫＯＤ−Ｐｌｕｓ−ｂｕｆｆｅｒ：５μｌ
ＭｇＳＯ４：１ｍＭ
ＫＯＤ−Ｐｌｕｓ−ＤＮＡポリメラーゼ：１Ｕ
計５０μｌ
ｐＳａｒＡ：５ｎｇ
ｄＮＴＰ：各０．２ｍＭ−ｍｉｘ
プライマー：各３００ｎＭ
ＫＯＤ−Ｐｌｕｓ−ｂｕｆｆｅｒ：５μｌ
ＭｇＳＯ４：１ｍＭ
ＫＯＤ−Ｐｌｕｓ−ＤＮＡポリメラーゼ：１Ｕ
計５０μｌ
［反応条件］
上記組成の反応液が入った容器をPTC-200 Thermal Cycler （ＭＪリサーチ）にセットし、９４℃（２分間）に加熱した後、９４℃（０．２５分間）−５５℃（０．５分間）−６８℃（２分間）のサイクルを３０回行なった。
上記組成の反応液が入った容器をPTC-200 Thermal Cycler （ＭＪリサーチ）にセットし、９４℃（２分間）に加熱した後、９４℃（０．２５分間）−５５℃（０．５分間）−６８℃（２分間）のサイクルを３０回行なった。
ＰＣＲ反応液を精製して得られたＰＣＲ増幅ＤＮＡ断片に表３に示す２種類の制限酵素を加えることにより、当該ＤＮＡ断片を２重消化させた。次いで得られたＤＮＡ断片を精製した。
一方、プラスミドｐＳａｒＡを表３に示す２種類の制限酵素を加えることにより、当該ベクターを２重消化させた。次いで消化されたＤＮＡ断片を精製した。
このようにして精製して得られたそれぞれのプラスミドに対応する２種類のＤＮＡ断片を混合し、Ｔ４ ＤＮＡリガーゼでライゲーションした。得られたライゲーション液でＥ．ｃｏｌｉ ＪＭ１０９株を形質転換した。得られた形質転換体からQIAprep Spin Miniprep Kit (Qiagen社製)を用いて改変型還元酵素の遺伝子を含有するそれぞれのプラスミドを取り出した。
実施例６ （プラスミドｐＳａｒ２６８の構築、および、当該プラスミドを保有する形質転換体の調製）
プラスミドｐＳａｒ２を２種類の制限酵素（ＸｈｏＩ及びＨｉｎｄＩＩＩ）を加えることにより、当該プラスミドを２重消化させた。次いで得られたベクター部分のＤＮＡ断片を精製した。
プラスミドｐＳａｒ２を２種類の制限酵素（ＸｈｏＩ及びＨｉｎｄＩＩＩ）を加えることにより、当該プラスミドを２重消化させた。次いで得られたベクター部分のＤＮＡ断片を精製した。
また、プラスミドｐＳａｒ６を２種類の制限酵素（ＸｈｏＩ及びＫｐｎＩ）を加えることにより、当該プラスミドを２重消化させた。次いで消化されたインサート部分のＤＮＡ断片を精製した。
一方、プラスミドｐＳａｒ８を２種類の制限酵素（ＫｐｎＩ及びＨｉｎｄＩＩＩ）を加えることにより、当該プラスミドを２重消化させた。次いで消化されたインサート部分のＤＮＡ断片を精製した。
このようにして精製して得られた３種類のＤＮＡ断片を混合し、Ｔ４ ＤＮＡリガーゼでライゲーションした。得られたライゲーション液でＥ．ｃｏｌｉ ＪＭ１０９株を形質転換した。得られた形質転換体からQIAprep Spin Miniprep Kit (Qiagen社製)を用いて改変型還元酵素の遺伝子を含有するプラスミドを取り出した（以下、プラスミドｐＳａｒ２６８と記すこともある。）。
実施例７ （プラスミドｐＳａｒ２６８の４２番目のアミノ酸（Ｖａｌ）を別のアミノ酸に置換したプラスミドの構築）
配列番号２０（ＳａｔＳａｒ３：5’-CTGCCACTCGGACNNKTTCATCATGAGC-3’）もしくは配列番号２１（ＳａｔＳａｒ３−２：5’-CTGCCACTCGGACMHYTTCATCATGAGC-3’）で示される塩基配列を有するオリゴヌクレオチドと、配列番号１３（ＰＡＲＳＱ−Ｆ３：5’-GCACCGAGACCGGGAGGATTG-3’）で示される塩基配列を有するオリゴヌクレオチドをプライマーに用いて、プラスミドｐＳａｒ２６８を鋳型にして以下の反応液組成及び反応条件で第１ＰＣＲを行った。
配列番号２０（ＳａｔＳａｒ３：5’-CTGCCACTCGGACNNKTTCATCATGAGC-3’）もしくは配列番号２１（ＳａｔＳａｒ３−２：5’-CTGCCACTCGGACMHYTTCATCATGAGC-3’）で示される塩基配列を有するオリゴヌクレオチドと、配列番号１３（ＰＡＲＳＱ−Ｆ３：5’-GCACCGAGACCGGGAGGATTG-3’）で示される塩基配列を有するオリゴヌクレオチドをプライマーに用いて、プラスミドｐＳａｒ２６８を鋳型にして以下の反応液組成及び反応条件で第１ＰＣＲを行った。
［反応液組成］
ｐＳａｒ２６８：５ｎｇ
ｄＮＴＰ：各０．２ｍＭ−ｍｉｘ
プライマー：各３００ｎＭ
ＫＯＤ−Ｐｌｕｓ−ｂｕｆｆｅｒ：５μｌ
ＭｇＳＯ４：１ｍＭ
ＫＯＤ−Ｐｌｕｓ−ＤＮＡポリメラーゼ：１Ｕ
計５０μｌ
ｐＳａｒ２６８：５ｎｇ
ｄＮＴＰ：各０．２ｍＭ−ｍｉｘ
プライマー：各３００ｎＭ
ＫＯＤ−Ｐｌｕｓ−ｂｕｆｆｅｒ：５μｌ
ＭｇＳＯ４：１ｍＭ
ＫＯＤ−Ｐｌｕｓ−ＤＮＡポリメラーゼ：１Ｕ
計５０μｌ
［反応条件］
上記組成の反応液が入った容器をPTC-200 Thermal Cycler （ＭＪリサーチ）にセットし、９４℃（２分間）に加熱した後、９４℃（０．２５分間）−５８℃（０．５分間）−６８℃（０．５分間）のサイクルを３０回繰り返し、６５℃（５分間）ののち、４℃で保温した。
上記組成の反応液が入った容器をPTC-200 Thermal Cycler （ＭＪリサーチ）にセットし、９４℃（２分間）に加熱した後、９４℃（０．２５分間）−５８℃（０．５分間）−６８℃（０．５分間）のサイクルを３０回繰り返し、６５℃（５分間）ののち、４℃で保温した。
ＰＣＲ反応液を精製して得られたＰＣＲ増幅ＤＮＡ断片と配列番号９（ＰＡＲＳＱ−Ｒ１：5’-CATTAGGCACCCCAGGCTTTACAC-3’）に示す塩基配列を有するオリゴヌクレオチドをプライマーに用いて、プラスミドｐＳａｒ２６８を鋳型にして以下の反応液組成及び反応条件で第２ＰＣＲを行った。
［反応液組成］
ｐＳａｒ２６８：５ｎｇ
ｄＮＴＰ：各０．２ｍＭ−ｍｉｘ
プライマー：各３００ｎＭ
ＫＯＤ−Ｐｌｕｓ−ｂｕｆｆｅｒ：５μｌ
ＭｇＳＯ４：１ｍＭ
ＫＯＤ−Ｐｌｕｓ−ＤＮＡポリメラーゼ：１Ｕ
計５０μｌ
ｐＳａｒ２６８：５ｎｇ
ｄＮＴＰ：各０．２ｍＭ−ｍｉｘ
プライマー：各３００ｎＭ
ＫＯＤ−Ｐｌｕｓ−ｂｕｆｆｅｒ：５μｌ
ＭｇＳＯ４：１ｍＭ
ＫＯＤ−Ｐｌｕｓ−ＤＮＡポリメラーゼ：１Ｕ
計５０μｌ
［反応条件］
上記組成の反応液が入った容器をPTC-200 Thermal Cycler （ＭＪリサーチ）にセットし、９４℃（２分間）に加熱した後、９４℃（０．２５分間）−５８℃（０．５分間）−６８℃（０．５分間）のサイクルを３０回繰り返し、６５℃（５分間）ののち、４℃で保温した。
上記組成の反応液が入った容器をPTC-200 Thermal Cycler （ＭＪリサーチ）にセットし、９４℃（２分間）に加熱した後、９４℃（０．２５分間）−５８℃（０．５分間）−６８℃（０．５分間）のサイクルを３０回繰り返し、６５℃（５分間）ののち、４℃で保温した。
ＰＣＲ反応液を精製して得られたＰＣＲ増幅ＤＮＡ断片に２種類の制限酵素（ＥｃｏＲＩ及びＸｈｏＩ）を加えることにより、当該ＤＮＡ断片を２重消化させた。次いで得られたＤＮＡ断片を精製した。
一方、プラスミドｐＳａｒ２６８を２種類の制限酵素（ＥｃｏＲＩ及びＸｈｏＩ）を加えることにより、当該ベクターを２重消化させた後、carf intestineアルカリフォスファターゼ処理した。次いで消化されたＤＮＡ断片を精製した。
このようにして精製して得られた２種類のＤＮＡ断片を混合し、Ligation Convenience Kit（ニッポンジーン社製）でライゲーションした。得られたライゲーション液でＥ．ｃｏｌｉ ＪＭ１０９株を形質転換した。出現したシングルコロニーから、配列番号２０（ＳａｔＳａｒ３）を使用した反応については８０個、配列番号２１（ＳａｔＳａｒ３−２）を使用した反応については２４個それぞれランダムに選び、培養の後プラスミドを調製した。
得られたプラスミドに挿入されたＤＮＡ断片の塩基配列を確認し、４２番目のアミノ酸置換を調べたところ、４２番目のＶａｌがＬｅｕ、Ｉｌｅ、Ｔｒｐ、Ａｌａ、Ｍｅｔ、Ｈｉｓ、Ｃｙｓ、Ｔｈｒ、Ａｓｎ、Ｇｌｎ、Ｔｙｒ、Ｌｙｓ、Ｇｌｙ、Ｇｌｕ、Ａｓｐ、Ｓｅｒ、Ａｒｇ、Ｐｈｅ、Ｐｒｏに置換された置換体が得られたことを確認した。
なお、プラスミドに挿入されたＤＮＡ断片の塩基配列の解析は、BigDye Terminator v3.1 Cycle Sequencing Kit (Applied Biosystems)を用いて各プラスミドを鋳型としてシークエンス反応を行い、得られたＤＮＡの塩基配列をABI PRISM 310 Genetic Analyserで解析することにより行った。
なお、プラスミドに挿入されたＤＮＡ断片の塩基配列の解析は、BigDye Terminator v3.1 Cycle Sequencing Kit (Applied Biosystems)を用いて各プラスミドを鋳型としてシークエンス反応を行い、得られたＤＮＡの塩基配列をABI PRISM 310 Genetic Analyserで解析することにより行った。
実施例８ （プラスミドｐＳａｒ２６８Ｖ４２Ｌの選抜）
実施例７で得られた形質転換体の中から５０クローンを選抜し、さらに、プラスミドｐＳａｒ２６８またはｐＲＡＥ２ｓでＥ．ｃｏｌｉ ＪＭ１０９株を形質転換したおのおの８クローンずつの形質転換体、合計６６クローンを０．４ｍＭのＩＰＴＧ、１００μｇ／ｍｌのアンピシリン、０．０１％（ｗ／ｖ）のＺｎＣｌ２、１０ｇ／ＬのBacto-tryptone (Difco)、５ｇ／ＬのBacto-yeast extract (Difco)、１０ｇ／ＬのＮａＣｌを含有する滅菌培地（１ｍｌ）に接種し、これを３７℃で２２時間培養した。培養後、得られた培養液を遠心分離（２００００×ｇ、５分、４℃）することにより、沈澱として湿菌体を回収した。回収された湿菌体約１０ｍｇに、１７．４％（ｖ／ｖ）の２−プロパノール、４％（ｗ／ｖ）のｍ−クロロフェナシルクロライド、１ｍＭのＮＡＤ＋を含む５０ｍＭ ＭＯＰＳ緩衝液（ｐＨ７．０）０．５ｍｌを添加した。これを３０℃で２２時間反応させた。反応終了後、酢酸エチルを１ｍｌ添加し、有機層を分取した。有機層はＮａ２ＳＯ４にて脱水処理を行なった。当該有機層を下記条件でガスクロマトグラフィーによる含量分析に供試した。（Ｒ）−１−（３−クロロフェニル）−２−クロロエタノールとｍ−クロロフェナシルクロライドの合計ピーク面積に対する（Ｒ）−１−（３−クロロフェニル）−２−クロロエタノールのピーク面積の割合を変換率として算出した。結果を表４に示す。このような分析を６６種のクローンについて行った結果、４２番目のアミノ酸がロイシンに置換された変異体が有意に高い変換能を持つことを見出した。得られた４２番目のアミノ酸がロイシンに置換された変異型Ｓａｒ２６８を有する形質転換体からQIAprep Spin Miniprep Kit (Qiagen社製)を用いて改変型還元酵素の遺伝子を含有するプラスミドを取り出した（以下、プラスミドｐＳａｒ２６８Ｖ４２Ｌと記すこともある。）。
実施例７で得られた形質転換体の中から５０クローンを選抜し、さらに、プラスミドｐＳａｒ２６８またはｐＲＡＥ２ｓでＥ．ｃｏｌｉ ＪＭ１０９株を形質転換したおのおの８クローンずつの形質転換体、合計６６クローンを０．４ｍＭのＩＰＴＧ、１００μｇ／ｍｌのアンピシリン、０．０１％（ｗ／ｖ）のＺｎＣｌ２、１０ｇ／ＬのBacto-tryptone (Difco)、５ｇ／ＬのBacto-yeast extract (Difco)、１０ｇ／ＬのＮａＣｌを含有する滅菌培地（１ｍｌ）に接種し、これを３７℃で２２時間培養した。培養後、得られた培養液を遠心分離（２００００×ｇ、５分、４℃）することにより、沈澱として湿菌体を回収した。回収された湿菌体約１０ｍｇに、１７．４％（ｖ／ｖ）の２−プロパノール、４％（ｗ／ｖ）のｍ−クロロフェナシルクロライド、１ｍＭのＮＡＤ＋を含む５０ｍＭ ＭＯＰＳ緩衝液（ｐＨ７．０）０．５ｍｌを添加した。これを３０℃で２２時間反応させた。反応終了後、酢酸エチルを１ｍｌ添加し、有機層を分取した。有機層はＮａ２ＳＯ４にて脱水処理を行なった。当該有機層を下記条件でガスクロマトグラフィーによる含量分析に供試した。（Ｒ）−１−（３−クロロフェニル）−２−クロロエタノールとｍ−クロロフェナシルクロライドの合計ピーク面積に対する（Ｒ）−１−（３−クロロフェニル）−２−クロロエタノールのピーク面積の割合を変換率として算出した。結果を表４に示す。このような分析を６６種のクローンについて行った結果、４２番目のアミノ酸がロイシンに置換された変異体が有意に高い変換能を持つことを見出した。得られた４２番目のアミノ酸がロイシンに置換された変異型Ｓａｒ２６８を有する形質転換体からQIAprep Spin Miniprep Kit (Qiagen社製)を用いて改変型還元酵素の遺伝子を含有するプラスミドを取り出した（以下、プラスミドｐＳａｒ２６８Ｖ４２Ｌと記すこともある。）。
（含量分析条件）
カラム：CP-cyclodextrine-β-236 M-19, 0.25mm by 25m
カラム温度：１６０℃
インジェクション温度：２４０℃
ディテクション温度：２５０℃
キャリアーガス：ヘリウム（流量：０．４ｍｌ／ｍｉｎ）
検出器：ＦＩＤ
カラム：CP-cyclodextrine-β-236 M-19, 0.25mm by 25m
カラム温度：１６０℃
インジェクション温度：２４０℃
ディテクション温度：２５０℃
キャリアーガス：ヘリウム（流量：０．４ｍｌ／ｍｉｎ）
検出器：ＦＩＤ
実施例９ （改変型還元酵素をコードする遺伝子の５’末端配列と開始コドン前の１６残基を特定の遺伝子配列に置換したベクターの構築、および、当該ベクターを保有する形質転換体の調製）（ｐＨＡＲ１の構築）
改変型還元酵素をコードする遺伝子の５’末端配列と開始コドン前の１６残基を特定の遺伝子配列に置換したベクターを構築するため、配列番号２２（ＰＡＲＨＥ−Ｓ：5’-ATGAAATCATTACAATATACGAGAATCGGCGCG-3’）で示される塩基配列を有するオリゴヌクレオチドと、配列番号２３（ＰＡＲＨＥ−Ａ：5’-ATGAGACTCTCCAGTCAAATTGTTATCCGCTCAC-3’）で示される塩基配列を有するオリゴヌクレオチドをT4 polynucleotide kinase(New England Biolabs)にてリン酸化した後、これらのオリゴヌクレオチドをプライマーに用いて、ｐＳａｒ２６８Ｖ４２Ｌを鋳型にして以下の反応液組成及び反応条件でＰＣＲを行った。
改変型還元酵素をコードする遺伝子の５’末端配列と開始コドン前の１６残基を特定の遺伝子配列に置換したベクターを構築するため、配列番号２２（ＰＡＲＨＥ−Ｓ：5’-ATGAAATCATTACAATATACGAGAATCGGCGCG-3’）で示される塩基配列を有するオリゴヌクレオチドと、配列番号２３（ＰＡＲＨＥ−Ａ：5’-ATGAGACTCTCCAGTCAAATTGTTATCCGCTCAC-3’）で示される塩基配列を有するオリゴヌクレオチドをT4 polynucleotide kinase(New England Biolabs)にてリン酸化した後、これらのオリゴヌクレオチドをプライマーに用いて、ｐＳａｒ２６８Ｖ４２Ｌを鋳型にして以下の反応液組成及び反応条件でＰＣＲを行った。
［反応液組成］
テンプレートＤＮＡ：５ｎｇ
ｄＮＴＰ：各０．２ｍＭ−ｍｉｘ
プライマー：各３００ｎＭ
ＫＯＤ−Ｐｌｕｓ−ｂｕｆｆｅｒ：５μｌ
ＭｇＳＯ４：１ｍＭ
ＫＯＤ−Ｐｌｕｓ−ＤＮＡポリメラーゼ：１Ｕ
計５０μｌ
テンプレートＤＮＡ：５ｎｇ
ｄＮＴＰ：各０．２ｍＭ−ｍｉｘ
プライマー：各３００ｎＭ
ＫＯＤ−Ｐｌｕｓ−ｂｕｆｆｅｒ：５μｌ
ＭｇＳＯ４：１ｍＭ
ＫＯＤ−Ｐｌｕｓ−ＤＮＡポリメラーゼ：１Ｕ
計５０μｌ
［反応条件］
上記組成の反応液が入った容器をPTC-200 Thermal Cycler （ＭＪリサーチ）にセットし、９４℃（２分間）に加熱した後、９４℃（０．２５分間）−５８℃（０．５分間）−６８℃（４分間）のサイクルを３０回繰り返し、６５℃（５分間）ののち、４℃で保温した。
上記組成の反応液が入った容器をPTC-200 Thermal Cycler （ＭＪリサーチ）にセットし、９４℃（２分間）に加熱した後、９４℃（０．２５分間）−５８℃（０．５分間）−６８℃（４分間）のサイクルを３０回繰り返し、６５℃（５分間）ののち、４℃で保温した。
ＰＣＲ反応液を用いて、Ligation Convenience Kit（ニッポンジーン社製）でそれぞれライゲーションした後、制限酵素ＤｐｎＩ(Fermentas社製)にて制限酵素処理した。得られた処理液でＥ．ｃｏｌｉ ＪＭ１０９株を形質転換した（ＪＭ１０９（ｐＨＡＲ１））。プレート上に出現したシングルコロニーをかき取り、このコロニーを１００μｇ／ｍｌのアンピシリン、０．０１％（ｗ／ｖ）のＺｎＣｌ２、１０ｇ／ＬのBacto-tryptone(Difco)、５ｇ／ＬのBacto-yeast extract (Difco)、１０ｇ／ＬのＮａＣｌを含有する滅菌培地（２ｍｌ）に接種し、これを３７℃で２２時間培養した。培養菌体からQIAprep Spin Miniprep Kit (Qiagen社製)を用いてプラスミドを取り出した。
得られた３種類のプラスミドの塩基配列を確認し、−１６番目から−１番目の塩基配列がGACTGGAGAGTCTCAT（配列番号２４）であり、また、１番目から１８番目の塩基配列がATGAAATCATTACAATAT（配列番号２５）であることを確認した。また、４２番目のアミノ酸置換を調べたところ、４２番目のＶａｌがＬｅｕに置換される変異が導入されたプラスミドが得られたことを確認した（以下、プラスミドｐＨＡＲ１と記すこともある。）。
なお、プラスミドに挿入されたＤＮＡ断片の塩基配列の解析は、BigDye Terminator v3.1 Cycle Sequencing Kit (Applied Biosystems)を用いて各プラスミドを鋳型としてシークエンス反応を行い、得られたＤＮＡの塩基配列をABI PRISM 310 Genetic Analyserで解析することにより行った。
なお、プラスミドに挿入されたＤＮＡ断片の塩基配列の解析は、BigDye Terminator v3.1 Cycle Sequencing Kit (Applied Biosystems)を用いて各プラスミドを鋳型としてシークエンス反応を行い、得られたＤＮＡの塩基配列をABI PRISM 310 Genetic Analyserで解析することにより行った。
実施例１０ （本発明ベクターの構築：プラスミドｐＨＡＲ１１）
（１０−１）プラスミドｐＨＡＲ１へのＣ５１７Ｔ変異の導入（１７３番目のアミノ酸のプロリンからセリンへの置換の導入）
配列番号２６（ＨＡ７Ｄ１４−Ｃ５１７Ｔ：5’-GAAACTTCGCGGAGGCTCGTACGCGGTTGTC-3’）で示される塩基配列を有するオリゴヌクレオチドと配列番号２７（ＨＡ７Ｄ１４−Ｃ５１７ＴＲ：5’-GACAACCGCGTACGAGCCTCCGCGAAGTTTC-3’）で示されるオリゴヌクレオチドとをプライマーに用いて、プラスミドｐＨＡＲ１を鋳型にして下記の反応液組成及び反応条件でＰＣＲを行った。なお、Ｃ５１７Ｔ変異導入にはStratagene社製のQuickChange（登録商標）II XL Site-Directed Mutagenesis Kitを使用した。
（１０−１）プラスミドｐＨＡＲ１へのＣ５１７Ｔ変異の導入（１７３番目のアミノ酸のプロリンからセリンへの置換の導入）
配列番号２６（ＨＡ７Ｄ１４−Ｃ５１７Ｔ：5’-GAAACTTCGCGGAGGCTCGTACGCGGTTGTC-3’）で示される塩基配列を有するオリゴヌクレオチドと配列番号２７（ＨＡ７Ｄ１４−Ｃ５１７ＴＲ：5’-GACAACCGCGTACGAGCCTCCGCGAAGTTTC-3’）で示されるオリゴヌクレオチドとをプライマーに用いて、プラスミドｐＨＡＲ１を鋳型にして下記の反応液組成及び反応条件でＰＣＲを行った。なお、Ｃ５１７Ｔ変異導入にはStratagene社製のQuickChange（登録商標）II XL Site-Directed Mutagenesis Kitを使用した。
［反応液組成］
ｐＨＡＲ１：２μｌ（５ｎｇ）
ｄＮＴＰ ｍｉｘ：１μｌ
プライマー：各０．４μｌ（２ｐｍｐｌ）
Ｑｕｉｃｋ Ｓｏｌｕｔｉｏｎ Ｒｅａｇｅｎｔ：３μｌ
１０×ｒｅａｃｔｉｏｎ ｂｕｆｆｅｒ：５μｌ
滅菌水：３８．２μｌ
ＰｆｕＵｌｔｒａ ＨＦ ＤＮＡポリメラーゼ：１μｌ（２．５Ｕ）
計５１μｌ
ｐＨＡＲ１：２μｌ（５ｎｇ）
ｄＮＴＰ ｍｉｘ：１μｌ
プライマー：各０．４μｌ（２ｐｍｐｌ）
Ｑｕｉｃｋ Ｓｏｌｕｔｉｏｎ Ｒｅａｇｅｎｔ：３μｌ
１０×ｒｅａｃｔｉｏｎ ｂｕｆｆｅｒ：５μｌ
滅菌水：３８．２μｌ
ＰｆｕＵｌｔｒａ ＨＦ ＤＮＡポリメラーゼ：１μｌ（２．５Ｕ）
計５１μｌ
［反応条件］
上記組成の反応液が入った容器をGene Amp PCR System 9700(Applied Biosystems社製)にセットし、９５℃（１分間）に加熱した後、９５℃（５０秒間）−６０℃（５０秒間）−６８℃（４．５分間）のサイクルを１８回行った。その後、６８℃で７分間保温し、４℃保存した。
ＰＣＲ反応液にＤｐｎＩ（１０Ｕ／μｌ）を１μｌ添加し、３７℃で１時間保温した。
上記組成の反応液が入った容器をGene Amp PCR System 9700(Applied Biosystems社製)にセットし、９５℃（１分間）に加熱した後、９５℃（５０秒間）−６０℃（５０秒間）−６８℃（４．５分間）のサイクルを１８回行った。その後、６８℃で７分間保温し、４℃保存した。
ＰＣＲ反応液にＤｐｎＩ（１０Ｕ／μｌ）を１μｌ添加し、３７℃で１時間保温した。
一方、ＸＬ１０−ＧＯＬＤコンピテントセル(Stratagene社製)にβ−メルカプトエタノールを２μｌ添加後、２分毎に攪拌しながら、１０分間氷冷した。ＤｐｎＩ処理液から２μｌ分取し、氷冷中のコンピテントセル液に添加し、３０分間さらに氷冷した。その後、４２℃で３０秒間保温した後、２分間氷冷し、１００μｇ／ｍｌのアンピシリンを含有するＬＢ（１％バクト−トリプトン、０．５％バクト−酵母エキス、１％塩化ナトリウム）培地に、得られた形質転換体を接種し培養した。培養菌体からQIAprep Spin Miniprep Kit (Qiagen社製)を用いてプラスミド（以下、プラスミドｐＨＡＲ１−Ｃ５１７Ｔと記すこともある。）を取り出した。
（１０−２）プラスミドｐＨＡＲ１−Ｃ５１７ＴへのＣ３５１Ｔ変異の導入
配列番号２８（ＨＡ７Ｄ１４−Ｃ３５１Ｔ：5’-GAACTCGGAATCAATCCTCCTGGTCTCGGTG-3’）で示される塩基配列を有するオリゴヌクレオチドと配列番号２９（ＨＡ７Ｄ１４−Ｃ３５１ＴＲ：5’-CACCGAGACCAGGAGGATTGATTCCGAGTTC-3’）で示されるオリゴヌクレオチドとをプライマーに用いて、プラスミドｐＨＡＲ１−Ｃ５１７Ｔを鋳型にして下記の反応液組成及び反応条件でＰＣＲを行う。なお、Ｃ３５１Ｔ変異導入にもStratagene社製のQuickChange（登録商標）II XL Site-Directed Mutagenesis Kitを使用する。
配列番号２８（ＨＡ７Ｄ１４−Ｃ３５１Ｔ：5’-GAACTCGGAATCAATCCTCCTGGTCTCGGTG-3’）で示される塩基配列を有するオリゴヌクレオチドと配列番号２９（ＨＡ７Ｄ１４−Ｃ３５１ＴＲ：5’-CACCGAGACCAGGAGGATTGATTCCGAGTTC-3’）で示されるオリゴヌクレオチドとをプライマーに用いて、プラスミドｐＨＡＲ１−Ｃ５１７Ｔを鋳型にして下記の反応液組成及び反応条件でＰＣＲを行う。なお、Ｃ３５１Ｔ変異導入にもStratagene社製のQuickChange（登録商標）II XL Site-Directed Mutagenesis Kitを使用する。
［反応液組成］
ｐＨＡＲ１−Ｃ５１７Ｔ：２μｌ（５ｎｇ）
ｄＮＴＰ ｍｉｘ：１μｌ
プライマー：各０．４μｌ（２ｐｍｐｌ）
Ｑｕｉｃｋ Ｓｏｌｕｔｉｏｎ Ｒｅａｇｅｎｔ：３μｌ
１０×ｒｅａｃｔｉｏｎ ｂｕｆｆｅｒ：５μｌ
滅菌水：３８．２μｌ
ＰｆｕＵｌｔｒａ ＨＦ ＤＮＡポリメラーゼ：１μｌ（２．５Ｕ）
計５１μｌ
ｐＨＡＲ１−Ｃ５１７Ｔ：２μｌ（５ｎｇ）
ｄＮＴＰ ｍｉｘ：１μｌ
プライマー：各０．４μｌ（２ｐｍｐｌ）
Ｑｕｉｃｋ Ｓｏｌｕｔｉｏｎ Ｒｅａｇｅｎｔ：３μｌ
１０×ｒｅａｃｔｉｏｎ ｂｕｆｆｅｒ：５μｌ
滅菌水：３８．２μｌ
ＰｆｕＵｌｔｒａ ＨＦ ＤＮＡポリメラーゼ：１μｌ（２．５Ｕ）
計５１μｌ
［反応条件］
上記組成の反応液が入った容器をGene Amp PCR System 9700(Applied Biosystems社製)にセットし、９５℃（１分間）に加熱した後、９５℃（５０秒間）−６０℃（５０秒間）−６８℃（４．５分間）のサイクルを１８回行う。その後、６８℃で７分間保温し、４℃保存する。
ＰＣＲ反応液にＤｐｎＩ（１０Ｕ／μｌ）を１μｌ添加し、３７℃で１時間保温する。
上記組成の反応液が入った容器をGene Amp PCR System 9700(Applied Biosystems社製)にセットし、９５℃（１分間）に加熱した後、９５℃（５０秒間）−６０℃（５０秒間）−６８℃（４．５分間）のサイクルを１８回行う。その後、６８℃で７分間保温し、４℃保存する。
ＰＣＲ反応液にＤｐｎＩ（１０Ｕ／μｌ）を１μｌ添加し、３７℃で１時間保温する。
一方、ＸＬ１０−ＧＯＬＤコンピテントセル(Stratagene社製)にβ−メルカプトエタノールを２μｌ添加後、２分毎に攪拌しながら、１０分間氷冷する。ＤｐｎＩ処理液から２μｌ分取し、氷冷中のコンピテントセル液に添加し、３０分間さらに氷冷する。その後、４２℃で３０秒間保温した後、２分間氷冷し、１００μｇ／ｍｌのアンピシリンを含有するＬＢ（１％バクト−トリプトン、０．５％バクト−酵母エキス、１％塩化ナトリウム）培地に、得られた形質転換体を接種し培養する。培養菌体からQIAprep Spin Miniprep Kit (Qiagen社製)を用いてプラスミド（以下、プラスミドｐＨＡＲ１＿１Ｄ５と記すこともある。）を取り出す。
（１０−３）プラスミドｐＨＡＲ１＿１Ｄ５へのＣ５３９Ｔ変異の導入（１８０番目のアミノ酸のスレオニンからイソロイシンへの置換の導入）
配列番号３０（ＰＡＲ＿Ｃ５３９Ｔ＿ｓ：5’-GCCACGTCGCTATTCAGCTC-3’）で示される塩基配列を有するオリゴヌクレオチドと配列番号３１（ＰＡＲ＿Ｃ５３９Ｔ＿ａｓ：5’-CGAGACCGCCGATACCAATG-3’）で示されるオリゴヌクレオチドとを、T4 Polynucleotide Kinase (New England Biolabs社製)にてリン酸化し、続いてリン酸化されたオリゴヌクレオチドをプライマーに用いて、プラスミドｐＨＡＲ１＿１Ｄ５を鋳型にして下記の反応液組成及び反応条件でＰＣＲを行った。
配列番号３０（ＰＡＲ＿Ｃ５３９Ｔ＿ｓ：5’-GCCACGTCGCTATTCAGCTC-3’）で示される塩基配列を有するオリゴヌクレオチドと配列番号３１（ＰＡＲ＿Ｃ５３９Ｔ＿ａｓ：5’-CGAGACCGCCGATACCAATG-3’）で示されるオリゴヌクレオチドとを、T4 Polynucleotide Kinase (New England Biolabs社製)にてリン酸化し、続いてリン酸化されたオリゴヌクレオチドをプライマーに用いて、プラスミドｐＨＡＲ１＿１Ｄ５を鋳型にして下記の反応液組成及び反応条件でＰＣＲを行った。
［反応液組成］
ｐＨＡＲ１＿１Ｄ５：１０ｎｇ
ｄＮＴＰ：各０．２ｍＭ−ｍｉｘ
プライマー：各３００ｎＭ
ＫＯＤ−Ｐｌｕｓ−ｂｕｆｆｅｒ：５μｌ
ＭｇＳＯ４：１ｍＭ
ＫＯＤ−Ｐｌｕｓ−ＤＮＡポリメラーゼ（ＴＯＹＯＢＯ社製）：１Ｕ
計５０μｌ
ｐＨＡＲ１＿１Ｄ５：１０ｎｇ
ｄＮＴＰ：各０．２ｍＭ−ｍｉｘ
プライマー：各３００ｎＭ
ＫＯＤ−Ｐｌｕｓ−ｂｕｆｆｅｒ：５μｌ
ＭｇＳＯ４：１ｍＭ
ＫＯＤ−Ｐｌｕｓ−ＤＮＡポリメラーゼ（ＴＯＹＯＢＯ社製）：１Ｕ
計５０μｌ
［反応条件］
上記組成の反応液が入った容器をPTC-200 Thermal Cycler （ＭＪリサーチ）にセットし、９４℃（４分間）に加熱した後、９４℃（０．２５分間）−５５℃（０．５分間）−６８℃（２分間）のサイクルを３０回行なった。
ＰＣＲ増幅断片をDNA Ligation Kit v2.1(宝酒造社製）を用いて、セルフライゲーションし、その後、ＤｐｎＩ(Fermentas社製)を用いてテンプレートを分解した。
ＤｐｎＩ処理液をエタノール沈殿させた後、得られたＤＮＡを用いて、大腸菌ＪＭ１０９株を形質転換した（ＪＭ１０９（ｐＨＡＲ１１））。得られた形質転換体を１００μｇ／ｍｌのアンピシリンを含有するＬＢ（１％バクト−トリプトン、０．５％バクト−酵母エキス、１％塩化ナトリウム）培地に接種し培養した。培養菌体からQIAprep Spin Miniprep Kit (Qiagen社製)を用いてプラスミド（以下、プラスミドｐＨＡＲ１１と記すこともある。）を取り出した。
上記組成の反応液が入った容器をPTC-200 Thermal Cycler （ＭＪリサーチ）にセットし、９４℃（４分間）に加熱した後、９４℃（０．２５分間）−５５℃（０．５分間）−６８℃（２分間）のサイクルを３０回行なった。
ＰＣＲ増幅断片をDNA Ligation Kit v2.1(宝酒造社製）を用いて、セルフライゲーションし、その後、ＤｐｎＩ(Fermentas社製)を用いてテンプレートを分解した。
ＤｐｎＩ処理液をエタノール沈殿させた後、得られたＤＮＡを用いて、大腸菌ＪＭ１０９株を形質転換した（ＪＭ１０９（ｐＨＡＲ１１））。得られた形質転換体を１００μｇ／ｍｌのアンピシリンを含有するＬＢ（１％バクト−トリプトン、０．５％バクト−酵母エキス、１％塩化ナトリウム）培地に接種し培養した。培養菌体からQIAprep Spin Miniprep Kit (Qiagen社製)を用いてプラスミド（以下、プラスミドｐＨＡＲ１１と記すこともある。）を取り出した。
実施例１１ （本発明還元酵素を用いた反応（その１））（ｍ−クロロフェナシルクロライドを用いた反応）
実施例９、１０で得られた２種類の形質転換体（ＪＭ１０９（ｐＨＡＲ１）またはＪＭ１０９（ｐＨＡＲ１１）を０．４ｍＭのＩＰＴＧ、１００μｇ／ｍｌのアンピシリン、０．０１％（ｗ／ｖ）のＺｎＣｌ２、１０ｇ／ＬのBacto-tryptone(Difco)、５ｇ／ＬのBacto-yeast extract (Difco)、１０ｇ／ＬのＮａＣｌを含有する滅菌培地（１００ｍｌ）に接種し、これを３７℃で２２時間培養した。培養後、得られた培養液を遠心分離（８０００×ｇ、５分、４℃）することにより、沈澱として湿菌体を回収した。回収された湿菌体約２０ｍｇに、ｍ−クロロフェナシルクロライドを２００ｍｇ、２０％（ｖ／ｖ）の２−プロパノールと、１ｍＭのＮＡＤ＋を含む５０ｍＭ ＭＯＰＳ緩衝液（ｐＨ７．０）０．５ｍｌを添加した。これを３０℃で２２時間反応させた。反応終了後、酢酸エチルを１ｍｌ添加し、有機層を分取した。有機層はＮａ２ＳＯ４にて脱水処理を行なった。当該有機層を下記条件でガスクロマトグラフィーによる含量分析に供試した。（Ｒ）−１−（３−クロロフェニル）−２−クロロエタノールとｍ−クロロフェナシルクロライドの合計ピーク面積に対する（Ｒ）−１−（３−クロロフェニル）−２−クロロエタノールのピーク面積の割合を変換率として算出した。結果を表５に示す。
実施例９、１０で得られた２種類の形質転換体（ＪＭ１０９（ｐＨＡＲ１）またはＪＭ１０９（ｐＨＡＲ１１）を０．４ｍＭのＩＰＴＧ、１００μｇ／ｍｌのアンピシリン、０．０１％（ｗ／ｖ）のＺｎＣｌ２、１０ｇ／ＬのBacto-tryptone(Difco)、５ｇ／ＬのBacto-yeast extract (Difco)、１０ｇ／ＬのＮａＣｌを含有する滅菌培地（１００ｍｌ）に接種し、これを３７℃で２２時間培養した。培養後、得られた培養液を遠心分離（８０００×ｇ、５分、４℃）することにより、沈澱として湿菌体を回収した。回収された湿菌体約２０ｍｇに、ｍ−クロロフェナシルクロライドを２００ｍｇ、２０％（ｖ／ｖ）の２−プロパノールと、１ｍＭのＮＡＤ＋を含む５０ｍＭ ＭＯＰＳ緩衝液（ｐＨ７．０）０．５ｍｌを添加した。これを３０℃で２２時間反応させた。反応終了後、酢酸エチルを１ｍｌ添加し、有機層を分取した。有機層はＮａ２ＳＯ４にて脱水処理を行なった。当該有機層を下記条件でガスクロマトグラフィーによる含量分析に供試した。（Ｒ）−１−（３−クロロフェニル）−２−クロロエタノールとｍ−クロロフェナシルクロライドの合計ピーク面積に対する（Ｒ）−１−（３−クロロフェニル）−２−クロロエタノールのピーク面積の割合を変換率として算出した。結果を表５に示す。
（含量分析条件）
カラム：CP-cyclodextrine-β-236 M-19, 0.25mm by 25m
カラム温度：１６０℃
インジェクション温度：２４０℃
ディテクション温度：２５０℃
キャリアーガス：ヘリウム（流量：０．４ｍｌ／ｍｉｎ）
検出器：ＦＩＤ
カラム：CP-cyclodextrine-β-236 M-19, 0.25mm by 25m
カラム温度：１６０℃
インジェクション温度：２４０℃
ディテクション温度：２５０℃
キャリアーガス：ヘリウム（流量：０．４ｍｌ／ｍｉｎ）
検出器：ＦＩＤ
実施例１２ （本発明還元酵素を用いた反応（その２））（４−クロロ−３−オキソ酪酸エチルを用いた反応）
実施例９、１０で得られた２種類の形質転換体（ＪＭ１０９（ｐＨＡＲ１）、ＪＭ１０９（ｐＨＡＲ１１））を０．４ｍＭのＩＰＴＧ、１００μｇ／ｍｌのアンピシリン、１％（ｗ／ｖ）のＺｎＣｌ２、１０ｇ／ＬのBacto-tryptone (Difco)、５ｇ／ＬのBacto-yeast extract (Difco)、１０ｇ／ＬのＮａＣｌを含有する滅菌培地（１００ｍｌ）に接種し、これを３７℃で２２時間培養した。培養後、得られた培養液を遠心分離（８０００×ｇ、５分、４℃）することにより、沈澱として湿菌体を回収した。回収された湿菌体２０ｍｇに、２０％（ｖ／ｖ）の２−プロパノール、１ｍＭのＮＡＤ＋を含む５０ｍＭ ＭＯＰＳ緩衝液（ｐＨ７．０）と、所定量の４−クロロ−３−オキソ酪酸エチルを加え、合計０．５ｍｌとなるよう添加した。これを３０℃で２２時間反応させた。反応終了後、酢酸エチルを１ｍｌ添加し、有機層を分取した。有機層はＮａ２ＳＯ４にて脱水処理を行なった。当該有機層を下記条件でガスクロマトグラフィーによる含量分析に、液体クロマトグラフィーによる光学異性体分析に供試した。各形質転換体を用いて反応を行なった時のガスクロマトグラフィーによる結果から４−クロロ−３−オキソ酪酸エチルのモル変換率を算出した。結果を表６に示す。また、いずれの反応条件でも４−クロロ−３−ヒドロキシ酪酸エチルの光学純度は９９％ｅ．ｅ．（Ｒ）以上であった。
実施例９、１０で得られた２種類の形質転換体（ＪＭ１０９（ｐＨＡＲ１）、ＪＭ１０９（ｐＨＡＲ１１））を０．４ｍＭのＩＰＴＧ、１００μｇ／ｍｌのアンピシリン、１％（ｗ／ｖ）のＺｎＣｌ２、１０ｇ／ＬのBacto-tryptone (Difco)、５ｇ／ＬのBacto-yeast extract (Difco)、１０ｇ／ＬのＮａＣｌを含有する滅菌培地（１００ｍｌ）に接種し、これを３７℃で２２時間培養した。培養後、得られた培養液を遠心分離（８０００×ｇ、５分、４℃）することにより、沈澱として湿菌体を回収した。回収された湿菌体２０ｍｇに、２０％（ｖ／ｖ）の２−プロパノール、１ｍＭのＮＡＤ＋を含む５０ｍＭ ＭＯＰＳ緩衝液（ｐＨ７．０）と、所定量の４−クロロ−３−オキソ酪酸エチルを加え、合計０．５ｍｌとなるよう添加した。これを３０℃で２２時間反応させた。反応終了後、酢酸エチルを１ｍｌ添加し、有機層を分取した。有機層はＮａ２ＳＯ４にて脱水処理を行なった。当該有機層を下記条件でガスクロマトグラフィーによる含量分析に、液体クロマトグラフィーによる光学異性体分析に供試した。各形質転換体を用いて反応を行なった時のガスクロマトグラフィーによる結果から４−クロロ−３−オキソ酪酸エチルのモル変換率を算出した。結果を表６に示す。また、いずれの反応条件でも４−クロロ−３−ヒドロキシ酪酸エチルの光学純度は９９％ｅ．ｅ．（Ｒ）以上であった。
（含量分析条件）
カラム：CP-cyclodextrine-β-236 M-19, 0.25mm by 25m
カラム温度：１２０℃
インジェクション温度：２４０℃
ディテクション温度：２５０℃
キャリアーガス：ヘリウム（流量：０．４ｍｌ／ｍｉｎ）
検出器：ＦＩＤ
保持時間：４−クロロ−３−オキソ酪酸エチル；７．７分
４−クロロ−３−ヒドロキシ酪酸エチル；１０．８分
カラム：CP-cyclodextrine-β-236 M-19, 0.25mm by 25m
カラム温度：１２０℃
インジェクション温度：２４０℃
ディテクション温度：２５０℃
キャリアーガス：ヘリウム（流量：０．４ｍｌ／ｍｉｎ）
検出器：ＦＩＤ
保持時間：４−クロロ−３−オキソ酪酸エチル；７．７分
４−クロロ−３−ヒドロキシ酪酸エチル；１０．８分
（光学異性体分析条件）
カラム：Ｃｈｉｒａｌｃｅｌ ＯＢ−Ｈ（ダイセル化学工業社製）
キャリアー溶媒：ｎ−ヘキサン／２−プロパノール＝９：１（ｖ／ｖ）
流速：１．０ｍｌ／分
カラム温度：３０℃
検出器：ＵＶ２２０ｎｍ
保持時間：４−クロロ−３−オキソ酪酸エチル；１２．３分
（Ｒ）− ４−クロロ−３−ヒドロキシ酪酸エチル；８．２分
（Ｓ）− ４−クロロ−３−ヒドロキシ酪酸エチル；８．７分
カラム：Ｃｈｉｒａｌｃｅｌ ＯＢ−Ｈ（ダイセル化学工業社製）
キャリアー溶媒：ｎ−ヘキサン／２−プロパノール＝９：１（ｖ／ｖ）
流速：１．０ｍｌ／分
カラム温度：３０℃
検出器：ＵＶ２２０ｎｍ
保持時間：４−クロロ−３−オキソ酪酸エチル；１２．３分
（Ｒ）− ４−クロロ−３−ヒドロキシ酪酸エチル；８．２分
（Ｓ）− ４−クロロ−３−ヒドロキシ酪酸エチル；８．７分
実施例１３ （本発明の改変型還元酵素の精製）
実施例１１に記載された方法で培養した形質転換体（ＪＭ１０９（ｐＨＡＲ１１））を超音波破砕（２０ＫＨｚ、１５分、４℃）した後、遠心分離（１０００００ｘｇ、６０分、４℃）を行い、その上清を得る。得られた超遠心上清をイオン交換クロマトグラフィーカラム［DEAE-Sepharose CL-6B（アマシャム ファルマシア バイオテク社製）］［カリウム−リン酸バッファー（２０ｍＭ、ｐＨ７．５）で平衡化したもの］に展着し、ＮａＣｌを溶解したカリウム−リン酸バッファー（ＮａＣｌ濃度０Ｍ→０．８Ｍの濃度勾配）を移動層として目的酵素を溶出する。溶出画分の酵素活性の測定はアセトフェノンを用いて行う。
実施例１１に記載された方法で培養した形質転換体（ＪＭ１０９（ｐＨＡＲ１１））を超音波破砕（２０ＫＨｚ、１５分、４℃）した後、遠心分離（１０００００ｘｇ、６０分、４℃）を行い、その上清を得る。得られた超遠心上清をイオン交換クロマトグラフィーカラム［DEAE-Sepharose CL-6B（アマシャム ファルマシア バイオテク社製）］［カリウム−リン酸バッファー（２０ｍＭ、ｐＨ７．５）で平衡化したもの］に展着し、ＮａＣｌを溶解したカリウム−リン酸バッファー（ＮａＣｌ濃度０Ｍ→０．８Ｍの濃度勾配）を移動層として目的酵素を溶出する。溶出画分の酵素活性の測定はアセトフェノンを用いて行う。
具体的には、溶出画分を含む０．０１ｍｌの溶出液に、アセトフェノン（０．３６５ｍｇ／ｍｌ）及びＮＡＤＨ（０．５４３ｍｇ／ｍｌ）を溶解したリン酸緩衝液（５０ｍＭ，ｐＨ７．０）０．９９ｍｌを加え、２５℃で保温し、３４０ｎｍの吸光度の減少を測定する。還元酵素活性のある画分を集め、当該画分に硫酸アンモニウムをその濃度が１．８Ｍになるまで徐々に加える。これを疎水性相互作用クロマトグラフィーカラム［Butyl-Toyopearl 650（東ソー社製）］［１．８Ｍ硫酸アンモニウムを含むカリウム−リン酸バッファー（２０ｍＭ、ｐＨ７．０）で平衡化したもの］に展着し、硫酸アンモニウムを溶解したカリウム−リン酸バッファー（硫酸アンモニウム濃度１．８Ｍ→０Ｍの濃度勾配）を移動層として目的酵素を溶出する。還元酵素活性のある画分を集め、当該画分に硫酸アンモニウムをその濃度が１．８Ｍになるまで徐々に加える。これを疎水性相互作用クロマトグラフィーカラム［Phenyl-Toyopearl 650（東ソー社製）］［１．８Ｍ硫酸アンモニウムを含むカリウム−リン酸バッファー（２０ｍＭ、ｐＨ７．０）で平衡化したもの］に展着し、硫酸アンモニウムを溶解したカリウム−リン酸バッファー（硫酸アンモニウム濃度１．８Ｍ→０Ｍの濃度勾配）を移動層として目的酵素を溶出する。還元酵素活性のある画分を集め、当該画分をCellulofine GC-700mカラム（生化学工業社製）［０．１ＭＮａＣｌを含むカリウム−リン酸バッファー（２０ｍＭ、ｐＨ７．０）で平衡化したもの］に展着し、０．１ＭＮａＣｌを含むカリウム−リン酸バッファーを移動層として目的酵素を溶出する。還元酵素活性のある画分を集め、当該画分をCellulofine GC-2000sfカラム（生化学工業社製）［０．１ＭＮａＣｌを含むカリウム−リン酸バッファー（２０ｍＭ、ｐＨ７．０）で平衡化したもの］に展着し、０．１ＭＮａＣｌを含むカリウム−リン酸バッファーを移動層として目的酵素を溶出させる。還元酵素活性のある画分を集め、精製還元酵素を得る。
配列番号１
野生型還元酵素をコードするＤＮＡの塩基配列
配列番号２
野生型還元酵素のアミノ酸配列
配列番号３
還元酵素Ｃ末端への付加用オリゴペプチド
配列番号４
ＰＣＲのために設計されたオリゴヌクレオチドプライマー
配列番号５
ＰＣＲのために設計されたオリゴヌクレオチドプライマー
配列番号６
ＰＣＲのために設計されたオリゴヌクレオチドプライマー
配列番号７
ＰＣＲのために設計されたオリゴヌクレオチドプライマー
配列番号８
ＰＣＲのために設計されたオリゴヌクレオチドプライマー
配列番号９
ＰＣＲのために設計されたオリゴヌクレオチドプライマー
配列番号１０
ＰＣＲのために設計されたオリゴヌクレオチドプライマー
配列番号１１
ＰＣＲのために設計されたオリゴヌクレオチドプライマー
配列番号１２
ＰＣＲのために設計されたオリゴヌクレオチドプライマー
配列番号１３
ＰＣＲのために設計されたオリゴヌクレオチドプライマー
配列番号１４
ＰＣＲのために設計されたオリゴヌクレオチドプライマー
配列番号１５
ＰＣＲのために設計されたオリゴヌクレオチドプライマー
配列番号１６
ＰＣＲのために設計されたオリゴヌクレオチドプライマー
配列番号１７
ＰＣＲのために設計されたオリゴヌクレオチドプライマー
配列番号１８
ＰＣＲのために設計されたオリゴヌクレオチドプライマー
配列番号１９
ＰＣＲのために設計されたオリゴヌクレオチドプライマー
配列番号２０
ＰＣＲのために設計されたオリゴヌクレオチドプライマー
配列番号２１
ＰＣＲのために設計されたオリゴヌクレオチドプライマー
配列番号２２
ＰＣＲのために設計されたオリゴヌクレオチドプライマー
配列番号２３
ＰＣＲのために設計されたオリゴヌクレオチドプライマー
配列番号２４
改変型還元酵素遺伝子の塩基配列の一部（−１６〜−１）
配列番号２５
改変型還元酵素遺伝子の塩基配列の一部（１〜１８）
配列番号２６
ＰＣＲのために設計されたオリゴヌクレオチドプライマー
配列番号２７
ＰＣＲのために設計されたオリゴヌクレオチドプライマー
配列番号２８
ＰＣＲのために設計されたオリゴヌクレオチドプライマー
配列番号２９
ＰＣＲのために設計されたオリゴヌクレオチドプライマー
配列番号３０
ＰＣＲのために設計されたオリゴヌクレオチドプライマー
配列番号３１
ＰＣＲのために設計されたオリゴヌクレオチドプライマー
配列番号３２
改変型還元酵素のアミノ酸配列
配列番号３３
改変型還元酵素をコードする塩基配列
配列番号３４
改変型還元酵素のアミノ酸配列
配列番号３５
改変型還元酵素をコードする塩基配列
配列番号３６
改変型還元酵素のアミノ酸配列
配列番号３７
改変型酵素のアミノ酸配列
野生型還元酵素をコードするＤＮＡの塩基配列
配列番号２
野生型還元酵素のアミノ酸配列
配列番号３
還元酵素Ｃ末端への付加用オリゴペプチド
配列番号４
ＰＣＲのために設計されたオリゴヌクレオチドプライマー
配列番号５
ＰＣＲのために設計されたオリゴヌクレオチドプライマー
配列番号６
ＰＣＲのために設計されたオリゴヌクレオチドプライマー
配列番号７
ＰＣＲのために設計されたオリゴヌクレオチドプライマー
配列番号８
ＰＣＲのために設計されたオリゴヌクレオチドプライマー
配列番号９
ＰＣＲのために設計されたオリゴヌクレオチドプライマー
配列番号１０
ＰＣＲのために設計されたオリゴヌクレオチドプライマー
配列番号１１
ＰＣＲのために設計されたオリゴヌクレオチドプライマー
配列番号１２
ＰＣＲのために設計されたオリゴヌクレオチドプライマー
配列番号１３
ＰＣＲのために設計されたオリゴヌクレオチドプライマー
配列番号１４
ＰＣＲのために設計されたオリゴヌクレオチドプライマー
配列番号１５
ＰＣＲのために設計されたオリゴヌクレオチドプライマー
配列番号１６
ＰＣＲのために設計されたオリゴヌクレオチドプライマー
配列番号１７
ＰＣＲのために設計されたオリゴヌクレオチドプライマー
配列番号１８
ＰＣＲのために設計されたオリゴヌクレオチドプライマー
配列番号１９
ＰＣＲのために設計されたオリゴヌクレオチドプライマー
配列番号２０
ＰＣＲのために設計されたオリゴヌクレオチドプライマー
配列番号２１
ＰＣＲのために設計されたオリゴヌクレオチドプライマー
配列番号２２
ＰＣＲのために設計されたオリゴヌクレオチドプライマー
配列番号２３
ＰＣＲのために設計されたオリゴヌクレオチドプライマー
配列番号２４
改変型還元酵素遺伝子の塩基配列の一部（−１６〜−１）
配列番号２５
改変型還元酵素遺伝子の塩基配列の一部（１〜１８）
配列番号２６
ＰＣＲのために設計されたオリゴヌクレオチドプライマー
配列番号２７
ＰＣＲのために設計されたオリゴヌクレオチドプライマー
配列番号２８
ＰＣＲのために設計されたオリゴヌクレオチドプライマー
配列番号２９
ＰＣＲのために設計されたオリゴヌクレオチドプライマー
配列番号３０
ＰＣＲのために設計されたオリゴヌクレオチドプライマー
配列番号３１
ＰＣＲのために設計されたオリゴヌクレオチドプライマー
配列番号３２
改変型還元酵素のアミノ酸配列
配列番号３３
改変型還元酵素をコードする塩基配列
配列番号３４
改変型還元酵素のアミノ酸配列
配列番号３５
改変型還元酵素をコードする塩基配列
配列番号３６
改変型還元酵素のアミノ酸配列
配列番号３７
改変型酵素のアミノ酸配列
Claims (14)
- 配列番号２で示される野生型還元酵素のアミノ酸配列において、少なくとも下記ａ）からｈ）の８箇所のアミノ酸置換を有することを特徴とするアミノ酸配列からなる改変型還元酵素；
ａ）３番目のアミノ酸がセリンに置換、
ｂ）４番目のアミノ酸がロイシンに置換、
ｃ）１２番目のアミノ酸がグリシンに置換、
ｄ）４２番目のアミノ酸がロイシンに置換、
ｅ）６７番目のアミノ酸がアルギニンに置換、
ｆ）１２５番目のアミノ酸がメチオニンに置換、
ｇ）１８０番目のアミノ酸がイソロイシンに置換、及び
ｈ）３２７番目のアミノ酸がバリンに置換。 - Ｃ末端にさらにオリゴペプチドＳｅｒ−Ｇｌｙ−Ｈｉｓ−Ｈｉｓ−Ｈｉｓ−Ｈｉｓ−Ｈｉｓ−Ｈｉｓが付加されている請求項１に記載の改変型還元酵素。
- 請求項１又は２に記載の改変型還元酵素をコードする塩基配列を有するポリヌクレオチド。
- 配列番号３３で示される塩基配列を有する請求項３に記載のポリヌクレオチド。
- 宿主細胞内において機能可能なプロモーターと請求項３又は４に記載のポリヌクレオチドとが機能可能な形で接続されてなることを特徴とするポリヌクレオチド。
- 請求項３乃至５のいずれか１項に記載のポリヌクレオチドを有することを特徴とするベクター。
- 配列番号３５で示される塩基配列を有することを特徴とするベクター。
- 請求項３乃至５のいずれか１項に記載のポリヌクレオチド又は請求項６若しくは７に記載のベクターが宿主細胞に導入されてなることを特徴とする形質転換体。
- 宿主細胞が微生物であることを特徴とする請求項８に記載の形質転換体。
- 微生物が大腸菌であることを特徴とする請求項９に記載の形質転換体。
- 請求項３乃至５のいずれか１項に記載のポリヌクレオチド又は請求項６若しくは７に記載のベクターを宿主細胞に導入する工程を含むことを特徴とする形質転換体の製造方法。
- ケトン化合物又はアルデヒド化合物に、請求項１若しくは２に記載の改変型還元酵素あるいはそれを産生する微生物、又は請求項８乃至１０のいずれか１項に記載の形質転換体あるいはそれらの処理物を作用させることを特徴とするアルコール化合物の製造方法。
- ケトン化合物がｍ−クロロフェナシルクロライドであり、アルコール化合物が１−（３−クロロフェニル）−２−クロロエタノールであることを特徴とする請求項１２に記載のアルコール化合物の製造方法。
- ケトン化合物が４−クロロ−３−オキソ酪酸エステルであり、アルコール化合物が４−クロロ−３−ヒドロキシ酪酸エステルであることを特徴とする請求項１２に記載のアルコール化合物の製造方法。
Priority Applications (1)
| Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
|---|---|---|---|
| JP2008078602A JP5230234B2 (ja) | 2008-03-25 | 2008-03-25 | 還元酵素及びその利用 |
Applications Claiming Priority (1)
| Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
|---|---|---|---|
| JP2008078602A JP5230234B2 (ja) | 2008-03-25 | 2008-03-25 | 還元酵素及びその利用 |
Publications (2)
| Publication Number | Publication Date |
|---|---|
| JP2009225773A JP2009225773A (ja) | 2009-10-08 |
| JP5230234B2 true JP5230234B2 (ja) | 2013-07-10 |
Family
ID=41241932
Family Applications (1)
| Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
|---|---|---|---|
| JP2008078602A Expired - Fee Related JP5230234B2 (ja) | 2008-03-25 | 2008-03-25 | 還元酵素及びその利用 |
Country Status (1)
| Country | Link |
|---|---|
| JP (1) | JP5230234B2 (ja) |
Families Citing this family (3)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| KR20090083900A (ko) | 2006-10-02 | 2009-08-04 | 코덱시스, 인코포레이티드 | 입체이성질체적으로 순수한 스타틴 및 이의 합성 중간체 제조용 조성물 및 제조 방법 |
| US10294461B2 (en) | 2013-03-28 | 2019-05-21 | Kaneka Corporation | Modified carbonyl reducing enzyme and gene |
| CN115820700A (zh) * | 2021-09-15 | 2023-03-21 | 浙江正硕生物科技有限公司 | 一种包含rkred核苷酸序列的重组表达载体、重组工程菌及构建方法和酶及其应用 |
-
2008
- 2008-03-25 JP JP2008078602A patent/JP5230234B2/ja not_active Expired - Fee Related
Also Published As
| Publication number | Publication date |
|---|---|
| JP2009225773A (ja) | 2009-10-08 |
Similar Documents
| Publication | Publication Date | Title |
|---|---|---|
| JP3950196B2 (ja) | アルコールデヒドロゲナーゼ及びキラルヒドロキシ化合物の酵素的生産へのその使用 | |
| TWI275645B (en) | (R)-2-octanol dehydrogenases, methods for producing the enzymes, DNA encoding the enzymes, and methods for producing alcohols using the enzymes | |
| KR20090033864A (ko) | 광학 활성 알코올의 제조방법 | |
| CA2394140A1 (en) | Enzymes and genes used for producing vanillin | |
| WO1998040472A2 (en) | Carboxylic acid reductase, and methods of using same | |
| JP5230234B2 (ja) | 還元酵素及びその利用 | |
| WO2006085535A1 (ja) | テトラヒドロビオプテリン生合成酵素を用いたビオプテリン類の製造方法 | |
| US20070072278A1 (en) | Reductase gene and use thereof | |
| JP4366097B2 (ja) | 還元酵素遺伝子及びその利用 | |
| JP4745762B2 (ja) | 還元酵素及びその利用 | |
| JP4558414B2 (ja) | 還元酵素及びその利用 | |
| JP4228606B2 (ja) | 改変型還元酵素、その遺伝子及びそれらの利用 | |
| CN106795511B (zh) | 氧化酶、编码该酶的多核苷酸、以及它们的应用 | |
| US6200794B1 (en) | Guava (Psidium guajava) 13-hydroperoxide lyase and uses thereof | |
| JP4039037B2 (ja) | 還元酵素遺伝子及びその利用 | |
| JP2009089649A (ja) | クロストリジウム・クルベリのジアホラーゼ遺伝子およびその利用 | |
| JP4228605B2 (ja) | 改変型還元酵素、その遺伝子及びそれらの利用 | |
| JP5724194B2 (ja) | 変異型還元酵素 | |
| JP2013172682A (ja) | 変異型還元酵素及びその利用 | |
| JP6064183B2 (ja) | 還元酵素遺伝子増幅用プライマーセット、および還元酵素遺伝子取得方法 | |
| JP5724191B2 (ja) | 変異型還元酵素 | |
| JP2003339387A (ja) | 新規カルボニル還元酵素及びこれをコードする遺伝子、ならびにこれらを利用した光学活性アルコールの製造方法 | |
| JP5724193B2 (ja) | 変異型還元酵素 | |
| JP2004313033A (ja) | 新規なカルボニル還元酵素及びそれをコードする遺伝子並びにその用途 | |
| JP5724192B2 (ja) | 変異型還元酵素 |
Legal Events
| Date | Code | Title | Description |
|---|---|---|---|
| A621 | Written request for application examination |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A621 Effective date: 20101206 |
|
| A131 | Notification of reasons for refusal |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A131 Effective date: 20121204 |
|
| TRDD | Decision of grant or rejection written | ||
| A01 | Written decision to grant a patent or to grant a registration (utility model) |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A01 Effective date: 20130226 |
|
| A61 | First payment of annual fees (during grant procedure) |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A61 Effective date: 20130319 |
|
| FPAY | Renewal fee payment (event date is renewal date of database) |
Free format text: PAYMENT UNTIL: 20160329 Year of fee payment: 3 |
|
| R150 | Certificate of patent or registration of utility model |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: R150 |
|
| R250 | Receipt of annual fees |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: R250 |
|
| LAPS | Cancellation because of no payment of annual fees |