JP2001089496A - 新規ビシクロヌクレオシド類縁体 - Google Patents
新規ビシクロヌクレオシド類縁体Info
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Abstract
シド類縁体を見出すこと、及び、優れたアンチセンス又
はアンチジーン活性を有し、かつ、生体内で安定な、オ
リゴヌクレオチド類縁体を製造するための中間体を提供
することを目的とする。 【解決手段】下記の構造式(1)で示される化合物又は
その薬理上許容される塩。 【化1】 R1は、同一又は異なって、水素原子又は水酸基の保護
基を示し、R2は、アジド基、保護されていてもよいア
ミノ基等を示し、Bは、下記α群から選択される置換基
を有していてもよいプリン−9−イル又は2−オキソ−
1,2−ジヒドロピリミジン−1−イル基を示す。 (α群)ハロゲン原子、炭素数1乃至6個のアルキル
基、水酸基、メルカプト基、アミノ基等。
Description
ス又はアンチジーン活性を有し、かつ、生体内で安定な
非天然型のオリゴヌクレオチド類縁体を製造するための
新規なビシクロヌクレオシド類縁体に関する。
構造を1又は2以上含有する新規なオリゴヌクレオチド
類縁体に関する。
新規な修飾ビシクロヌクレオシド類縁体に関する。
性を有し、かつ、生体内で安定なオリゴヌクレオチド
は、有用な医薬として期待される。
は、血液中や細胞内に存在する各種ヌクレアーゼによ
り、速やかに分解されてしまうことが知られている。
型のオリゴヌクレオチド類縁体が製造され、それらを医
薬として、開発する試みがなされている。 例えば、オ
リゴヌクレオチドのホスホジエステル結合内のリン原子
と結合する酸素原子を硫黄原子に置換したもの、該酸素
原子をメチル基に置換したもの、該酸素原子をホウ素原
子に置換したもの、オリゴヌクレオチドの糖部分や塩基
部分を化学修飾したもの等が知られている。
トサイトメガロウイルス性網膜炎の治療薬として、チオ
エート型オリゴヌクレオチドであるISIS2922を開発し、
VitraveneTMとして米国で販売している。
クレオチド類縁体における、アンチセンス又はアンチジ
ーン活性の強さ、すなわち、m−RNA又はDNAとの
安定な相補鎖形成能や、各種ヌクレアーゼに対する安定
性、生体内の各種蛋白質と非特異的に結合することによ
る副作用の発現等を考慮すると、さらに優れたアンチセ
ンス又はアンチジーン活性を有し、生体内で安定で、か
つ、副作用の発現の少ない非天然型のオリゴヌクレオチ
ド類縁体が望まれる。
ち、下記のジオキサビシクロ[2,2,1]ヘプタン構造を
有するものが、WO98/39352号に記載されてい
るが、該化合物は、リボースの3’位における置換基に
おいて本願化合物と異なる。また、該化合物が抗エイズ
活性を有することは知られていない。
はそれらの類縁体であり、X及びYは同一又は異なっ
て、水素、アルキル基、アルケニル基、アルキニル基、
シクロアルキル基、アラルキル基、アリール基、アシル
基又はシリル基である。
たアンチセンス又はアンチジーン活性を有し、かつ、生
体内で安定な非天然型のオリゴヌクレオチド類縁体を製
造するための新規なビシクロヌクレオシド類縁体を提供
することにある。
オシド構造を1又は2以上含有する新規なオリゴヌクレ
オチド類縁体を提供することにある。
有する新規なビシクロヌクレオシド類縁体を提供するこ
とにある。
鋭意研究を続けた結果、2'-O,4'-C-メチレンを有する新
規なビシクロヌクレオシド類縁体が、優れたアンチセン
ス又はアンチジーン活性を有し、かつ、生体内で安定な
非天然型のオリゴヌクレオチド類縁体を製造するための
重要中間体であることを見出し、また、該ビシクロヌク
レオシド構造を1又は2以上含有する新規なオリゴヌク
レオチド類縁体が、優れたアンチセンス又はアンチジー
ン活性を有し、かつ、生体内で安定であることを見出
し、さらに、該ビシクロヌクレオシド類縁体が、優れた
抗エイズ活性を有することを見出し、本発明を完成し
た。
ヌクレオシド類縁体は、 1)一般式(1)
の核酸合成の保護基、リン酸基、核酸合成の保護基で保
護されたリン酸基又は式−P(R4a)R4b(式中、R4a
及びR4bは、同一又は異なって、水酸基、核酸合成の保
護基で保護された水酸基、メルカプト基、核酸合成の保
護基で保護されたメルカプト基、アミノ基、核酸合成の
保護基で保護されたアミノ基、炭素数1乃至6個のアル
コキシ基、炭素数1乃至6個のアルキルチオ基、炭素数
1乃至7個のシアノアルコキシ基又は炭素数1乃至6個
のアルキル基で置換されたアミノ基を示す)で表される
基を示し、R2は、アジド基、アミノ基又は式NH―R3
(R3は、同一又は異なって、アミノ基の核酸合成の保
護基、リン酸基、核酸合成の保護基で保護されたリン酸
基又は式−P(R4a)R4b(式中、R4a及びR4bは、同
一又は異なって、水酸基、核酸合成の保護基で保護され
た水酸基、メルカプト基、核酸合成の保護基で保護され
たメルカプト基、アミノ基、核酸合成の保護基で保護さ
れたアミノ基、炭素数1乃至6個のアルコキシ基、炭素
数1乃至6個のアルキルチオ基、炭素数1乃至7個のシ
アノアルコキシ基又は炭素数1乃至6個のアルキル基で
置換されたアミノ基を示す)で表される基を示す)で表
される基を示し、Bは、下記α群から選択される任意の
置換基を1以上有していてもよいプリン−9−イル又は
2−オキソ−1,2−ジヒドロピリミジン−1−イル基
を示す。]で表される化合物又はその薬理上許容される
塩である。 (α群)水酸基、核酸合成の保護基で保護された水酸
基、炭素数1乃至6個のアルコキシ基、メルカプト基、
核酸合成の保護基で保護されたメルカプト基、炭素数1
乃至6個のアルキルチオ基、アミノ基、核酸合成の保護
基で保護されたアミノ基、炭素数1乃至6個のアルキル
基で置換されたアミノ基、炭素数1乃至6個のアルキル
基、及び、ハロゲン原子。
基、シリル基、1乃至3個のアリール基で置換されたメ
チル基、又は、低級アルキル、低級アルコキシ、ハロゲ
ン若しくはシアノ基でアリール環が置換された1乃至3
個のアリール基で置換されたメチル基である、化合物、 3)R1が、水素原子、シリル基、1乃至3個のアリー
ル基で置換されたメチル基、又は、低級アルキル、低級
アルコキシ、ハロゲン若しくはシアノ基でアリール環が
置換された1乃至3個のアリール基で置換されたメチル
基である、化合物、 4)R1が、水素原子、トリメチルシリル基、t−ブチ
ルジメチルシリル基、t−ブチルジフェニルシリル基、
ベンジル基、トリフェニルメチル基、4−メトキシベン
ジル基、4−メトキシフェニルジフェニルメチル基、
4,4’−ジメトキシトリフェニルメチル基又は4,
4’,4”−トリメトキシトリフェニルメチル基であ
る、化合物、 5)R2が、アジド基、アミノ基、又は、式NH―R3基
(式中、R3は、脂肪族アシル基、芳香族アシル基、1
乃至3個のアリール基で置換されたメチル基、低級アル
キル、低級アルコキシ、ハロゲン若しくはシアノ基でア
リール環が置換された1乃至3個のアリール基で置換さ
れたメチル基、シリル基、ホスホロアミダイト基、ホス
ホニル基、リン酸基又は核酸合成の保護基で保護された
リン酸基である)である、化合物、 6)R2が、アジド基、アミノ基、式NH−R3基(式
中、R3が、アセチル基、トリフルオロアセチル基、ベ
ンゾイル基、ベンジル基、p−メトキシベンジル基、te
rt-ブチルジフェニルシリル基、式−P(OC2H4C
N)(NCH(CH3) 2)で表される基、式−P(OC
H3)(NCH(CH3)2)で表される基、ホスホニル
基、又は、2−クロロフェニル若しくは4−クロロフェ
ニルリン酸基である)である、化合物、 7)R2が、アジド基又はアミノ基である、化合物、 8)Bが、6−アミノプリン−9−イル(すなわち、ア
デニニル)、アミノ基が核酸合成の保護基で保護された
6−アミノプリン−9−イル、2,6−ジアミノプリン
−9−イル、アミノ基が核酸合成の保護基で保護された
2,6−ジアミノプリン−9−イル、2−アミノ−6−
クロロプリン−9−イル、アミノ基が核酸合成の保護基
で保護された2−アミノ−6−クロロプリン−9−イ
ル、2−アミノ−6−フルオロプリン−9−イル、アミ
ノ基が核酸合成の保護基で保護された2−アミノ−6−
フルオロプリン−9−イル、2−アミノ−6−ブロモプ
リン−9−イル、アミノ基が核酸合成の保護基で保護さ
れた2−アミノ−6−ブロモプリン−9−イル、2−ア
ミノ−6−ヒドロキシプリン−9−イル(すなわち、グ
アニニル)、アミノ基が核酸合成の保護基で保護された
2−アミノ−6−ヒドロキシプリン−9−イル、6−ア
ミノ−2−メトキシプリン−9−イル、アミノ基が核酸
合成の保護基で保護された6−アミノ−2−メトキシプ
リン−9−イル、6−アミノ−2−クロロプリン−9−
イル、アミノ基が核酸合成の保護基で保護された6−ア
ミノ−2−クロロプリン−9−イル、6−アミノ−2−
フルオロプリン−9−イル、アミノ基が核酸合成の保護
基で保護された6−アミノ−2−フルオロプリン−9−
イル、2,6−ジメトキシプリン−9−イル、2,6−
ジクロロプリン−9−イル、6−メルカプトプリン−9
−イル、メルカプト基が核酸合成の保護基で保護された
6−メルカプトプリン−9−イル、2−オキソ−4−ア
ミノ−1,2−ジヒドロピリミジン−1−イル(すなわ
ち、シトシニル)、アミノ基が核酸合成の保護基で保護
された2−オキソ−4−アミノ−1,2−ジヒドロピリ
ミジン−1−イル、4−アミノ−2−オキソ−5−フル
オロ−1,2−ジヒドロピリミジン−1−イル、アミノ
基が核酸合成の保護基で保護された4−アミノ−2−オ
キソ−5−フルオロ−1,2−ジヒドロピリミジン−1
−イル、4−アミノ−2−オキソ−5−クロロ−1,2
−ジヒドロピリミジン−1−イル、アミノ基が核酸合成
の保護基で保護された4−アミノ−2−オキソ−5−ク
ロロ−1,2−ジヒドロピリミジン−1−イル、2−オ
キソ−4−メトキシ−1,2−ジヒドロピリミジン−1
−イル、2−オキソ−4−メルカプト−1,2−ジヒド
ロピリミジン−1−イル、メルカプト基が核酸合成の保
護基で保護された2−オキソ−4−メルカプト−1,2
−ジヒドロピリミジン−1−イル、2,4−ジヒドロキ
シピリミジン−1−イル(すなわち、ウラシリル)、
2,4−ジヒドロキシ−5−メチルピリミジン−1−イ
ル(すなわち、チミニル)、4−アミノ−5−メチル−
2−オキソ−1,2−ジヒドロピリミジン−1−イル又
はアミノ基が核酸合成の保護基で保護された4−アミノ
−5−メチル−2−オキソ−1,2−ジヒドロピリミジ
ン−1−イル基である、化合物、 9)Bが、6−ベンゾイルアミノプリン−9−イル、ア
デニニル、2−ベンゾイルアミノ−6−ヒドロキシプリ
ン−9−イル、グアニニル、2−オキソ−4−ベンゾイ
ルアミノ−1,2−ジヒドロピリミジン−1−イル、シ
トシニル、ウラシリル又はチミニル基である、化合物、
である。
上記5)乃至7)から選択し、Bを上記8)乃至9)か
ら選択して得られる任意の組合せもまた好適であり、特
に好適には、2)、5)及び8)の組合せ、3)、6)
及び8)の組合せ及び4)、6)及び9)の組合せであ
る。
は、 1)一般式(1a)
いてもよいプリン−9−イル基又は2−オキソ−1,2
−ジヒドロピリミジン−1−イル基を示す。]で表わさ
れる構造を1又は2以上含有するオリゴヌクレオチド類
縁体及びその薬理学上許容される塩である。但し、上記
構造を2以上含有する場合には、当該構造間でBは同一
又は異なる。 (α群)水酸基、核酸合成の保護基で保護された水酸
基、炭素数1乃至6個のアルコキシ基、メルカプト基、
核酸合成の保護基で保護されたメルカプト基、炭素数1
乃至6個のアルキルチオ基、アミノ基、核酸合成の保護
基で保護されたアミノ基、炭素数1乃至6個のアルキル
基で置換されたアミノ基、炭素数1乃至6個のアルキル
基、及び、ハロゲン原子。
は、天然型のオリゴヌクレオチドにおけるヌクレオシド
単位が上記構造(1a)で1又は2以上置換された非天
然型のものをいい、そのような類縁体においては、例え
ば、糖部分が修飾された糖誘導体、リン酸ジエステル結
合部分がチオエート化されたチオエート誘導体、末端の
リン酸部分がエステル化されたエステル体、プリン塩基
上のアミノ基がアミド化されたアミド体を他のヌクレオ
シド又はヌクレオチド単位として含有することもでき
る。
のうち、好適なものは、 2)Bが、6−アミノプリン−9−イル基(すなわち、
アデニニル基)、アミノ基が核酸合成の保護基で保護さ
れた6−アミノプリン−9−イル基、2,6−ジアミノ
プリン−9−イル基、2−アミノ−6−クロロプリン−
9−イル基、アミノ基が核酸合成の保護基で保護された
2−アミノ−6−クロロプリン−9−イル基、2−アミ
ノ−6−フルオロプリン−9−イル基、アミノ基が核酸
合成の保護基で保護された2−アミノ−6−フルオロプ
リン−9−イル基、2−アミノ−6−ブロモプリン−9
−イル基、アミノ基が核酸合成の保護基で保護された2
−アミノ−6−ブロモプリン−9−イル基、2−アミノ
−6−ヒドロキシプリン−9−イル基(すなわち、グア
ニニル基)、アミノ基が核酸合成の保護基で保護された
2−アミノ−6−ヒドロキシプリン−9−イル基、アミ
ノ基及び水酸基が核酸合成の保護基で保護された2−ア
ミノ−6−ヒドロキシプリン−9−イル基、6−アミノ
−2−メトキシプリン−9−イル基、6−アミノ−2−
クロロプリン−9−イル基、6−アミノ−2−フルオロ
プリン−9−イル基、2,6−ジメトキシプリン−9−
イル基、2,6−ジクロロプリン−9−イル基、6−メ
ルカプトプリン−9−イル基、2−オキソ−4−アミノ
−1,2−ジヒドロピリミジン−1−イル基(すなわ
ち、シトシニル基)、アミノ基が核酸合成の保護基で保
護された2−オキソ−4−アミノ−1,2−ジヒドロピ
リミジン−1−イル基、2−オキソ−4−アミノ−5−
フルオロ−1,2−ジヒドロピリミジン−1−イル基、
アミノ基が核酸合成の保護基で保護された2−オキソ−
4−アミノ−5−フルオロ−1,2−ジヒドロピリミジ
ン−1−イル基、4−アミノ−2−オキソ−5−クロロ
−1,2−ジヒドロピリミジン−1−イル基、2−オキ
ソ−4−メトキシ−1,2−ジヒドロピリミジン−1−
イル基、2−オキソ−4−メルカプト−1,2−ジヒド
ロピリミジン−1−イル基、2−オキソ−4−ヒドロキ
シ−1,2−ジヒドロピリミジン−1−イル基(すなわ
ち、ウラシニル基)、2−オキソ−4−ヒドロキシ−5
−メチル−1,2−ジヒドロピリミジン−1−イル基
(すなわち、チミニル基)、4−アミノ−5−メチル−
2−オキソ−1,2−ジヒドロピリミジン−1−イル基
(すなわち、5−メチルシトシニル基)又はアミノ基が
核酸合成の保護基で保護された4−アミノ−5−メチル
−2−オキソ−1,2−ジヒドロピリミジン−1−イル
基である、オリゴヌクレオチド類縁体及びその薬理学上
許容される塩、 3)Bが、6−ベンゾイルアミノプリン−9−イル基、
アデニニル基、2−イソブチリルアミノ−6−ヒドロキ
シプリン−9−イル基、グアニニル基、2−オキソ−4
−ベンゾイルアミノ−1,2−ジヒドロピリミジン−1
−イル基、シトシニル基、2−オキソ−5−メチル−4
−ベンゾイルアミノ−1,2−ジヒドロピリミジン−1
−イル基、5−メチルシトシニル基、ウラシニル基又は
チミニル基である、オリゴヌクレオチド類縁体及びその
薬理学上許容される塩である。
成の保護基」は、核酸合成の際に安定に水酸基を保護し
得るものであれば、特に限定はないが、例えば、ホルミ
ル、アセチル、プロピオニル、ブチリル、イソブチリ
ル、ペンタノイル、ピバロイル、バレリル、イソバレリ
ル、オクタノイル、デカノイル、8−メチルノナノイ
ル、3−エチルオクタノイル、3,7−ジメチルオクタ
ノイル、ウンデカノイル、トリデカノイル、ヘキサデカ
ノイル、14−メチルペンタデカノイル、13,13−
ジメチルテトラデカノイル、1−メチルヘプタデカノイ
ル、ノナデカノイル、アイコサノイル及びヘナイコサノ
イルのようなアルキルカルボニル基、スクシノイル、グ
ルタロイル、アジポイルのようなカルボキシ化アルキル
カルボニル基、クロロアセチル、ジクロロアセチル、ト
リクロロアセチル、トリフルオロアセチルのようなハロ
ゲノ低級アルキルカルボニル基、メトキシアセチルのよ
うな低級アルコキシ低級アルキルカルボニル基、(E)
−2−メチル−2−ブテノイルのような不飽和アルキル
カルボニル基等の「脂肪族アシル基」;ベンゾイル、α
−ナフトイル、β−ナフトイルのようなアリールカルボ
ニル基、2−ブロモベンゾイル、4−クロロベンゾイル
のようなハロゲノアリールカルボニル基、2,4,6−
トリメチルベンゾイル、4−トルオイルのような低級ア
ルキル化アリールカルボニル基、4−アニソイルのよう
な低級アルコキシ化アリールカルボニル基、2−カルボ
キシベンゾイル、3−カルボキシベンゾイル、4−カル
ボキシベンゾイルのようなカルボキシ化アリールカルボ
ニル基、4−ニトロベンゾイル、2−ニトロベンゾイル
のようなニトロ化アリールカルボニル基;2−(メトキ
シカルボニル)ベンゾイルのような低級アルコキシカル
ボニル化アリールカルボニル基、4−フェニルベンゾイ
ルのようなアリール化アリールカルボニル基等の「芳香
族アシル基」;テトラヒドロピラン−2−イル、3−ブ
ロモテトラヒドロピラン−2−イル、4−メトキシテト
ラヒドロピラン−4−イル、テトラヒドロチオピラン−
2−イル、4−メトキシテトラヒドロチオピラン−4−
イルのような「テトラヒドロピラニル又はテトラヒドロ
チオピラニル基」;テトラヒドロフラン−2−イル、テ
トラヒドロチオフラン−2−イルのような「テトラヒド
ロフラニル又はテトラヒドロチオフラニル基」;トリメ
チルシリル、トリエチルシリル、イソプロピルジメチル
シリル、t−ブチルジメチルシリル、メチルジイソプロ
ピルシリル、メチルジ−t−ブチルシリル、トリイソプ
ロピルシリルのようなトリ低級アルキルシリル基、ジフ
ェニルメチルシリル、t−ブチルジフェニルシリル、ジ
フェニルイソプロピルシリル、フェニルジイソプロピル
シリルのような1乃至2個のアリール基で置換されたト
リ低級アルキルシリル基等の「シリル基」;メトキシメ
チル、1,1−ジメチル−1−メトキシメチル、エトキ
シメチル、プロポキシメチル、イソプロポキシメチル、
ブトキシメチル、t−ブトキシメチルのような「低級ア
ルコキシメチル基」;2−メトキシエトキシメチルのよ
うな「低級アルコキシ化低級アルコキシメチル基」;
2,2,2−トリクロロエトキシメチル、ビス(2−ク
ロロエトキシ)メチルのような「ハロゲノ低級アルコキ
シメチル」;1−エトキシエチル、1−(イソプロポキ
シ)エチルのような「低級アルコキシ化エチル基」;
2,2,2−トリクロロエチルのような「ハロゲン化エ
チル基」;ベンジル、α−ナフチルメチル、β−ナフチ
ルメチル、ジフェニルメチル、トリフェニルメチル、α
−ナフチルジフェニルメチル、9−アンスリルメチルの
ような「1乃至3個のアリール基で置換されたメチル
基」;4−メチルベンジル、2,4,6−トリメチルベ
ンジル、3,4,5−トリメチルベンジル、4−メトキ
シベンジル、4−メトキシフェニルジフェニルメチル、
4,4’−ジメトキシトリフェニルメチル、4,4’,
4”−トリメトキシトリフェニルメチル、2−ニトロベ
ンジル、4−ニトロベンジル、4−クロロベンジル、4
−ブロモベンジル、4−シアノベンジルのような「低級
アルキル、低級アルコキシ、ハロゲン又はシアノ基でア
リール環が置換された1乃至3個のアリール基で置換さ
れたメチル基」;メトキシカルボニル、エトキシカルボ
ニル、t−ブトキシカルボニル、イソブトキシカルボニ
ルのような「低級アルコキシカルボニル基」;2,2,
2−トリクロロエトキシカルボニル、2−トリメチルシ
リルエトキシカルボニルのような「ハロゲン又はトリ低
級アルキルシリル基で置換された低級アルコキシカルボ
ニル基」;ビニルオキシカルボニル、アリルオキシカル
ボニルのような「アルケニルオキシカルボニル基」;ベ
ンジルオキシカルボニル、4−メトキシベンジルオキシ
カルボニル、3,4−ジメトキシベンジルオキシカルボ
ニル、2−ニトロベンジルオキシカルボニル、4−ニト
ロベンジルオキシカルボニルのような「1乃至2個の低
級アルコキシ又はニトロ基でアリール環が置換されてい
てもよいアラルキルオキシカルボニル基」をあげること
ができ、好適には、脂肪族アシル基、芳香族アシル基、
1乃至3個のアリール基で置換されたメチル基、低級ア
ルキル、低級アルコキシ、ハロゲン若しくはシアノ基で
アリール環が置換された1乃至3個のアリール基で置換
されたメチル基、又は、シリル基であり、さらに好適に
は、アセチル基、ベンゾイル基、ベンジル基、p−メト
キシベンジル基、ジメトキシトリチル基、モノメトキシ
トリチル基又はtert-ブチルジフェニルシリル基であ
る。
の保護基で保護されたリン酸基」の核酸合成の保護基と
は、核酸合成の際に安定にリン酸基を保護し得るもので
あれば、特に限定はないが、例えば、メチル、エチル、
n−プロピル、イソプロピル、n−ブチル、イソブチ
ル、s−ブチル、tert−ブチル、n−ペンチル、イソペ
ンチル、2−メチルブチル、ネオペンチル、1−エチル
プロピル、n−ヘキシル、イソヘキシル、4−メチルペ
ンチル、3−メチルペンチル、2−メチルペンチル、1
−メチルペンチル、3,3−ジメチルブチル、2,2−
ジメチルブチル、1,1−ジメチルブチル、1,2−ジ
メチルブチル、1,3−ジメチルブチル、2,3−ジメ
チルブチル、2−エチルブチルのような「低級アルキル
基」;2−シアノエチル、2−シアノ−1,1−ジメチ
ルエチルのような「シアノ化低級アルキル基」;2−メ
チルジフェニルシリルエチル、2−トリメチルシリルエ
チル、2−トリフェニルシリルエチルのような「シリル
基で置換されたエチル基」;2,2,2−トリクロロエ
チル、2,2,2−トリブロモエチル、2,2,2−ト
リフルオロエチル、2,2,2−トリクロロ−1、1−
ジメチルエチルのような「ハロゲン化低級アルキル
基」;エテニル、1−プロペニル、2−プロペニル、1
−メチル−2−プロペニル、1−メチル−1−プロペニ
ル、2−メチル−1−プロペニル、2−メチル−2−プ
ロペニル、2−エチル−2−プロペニル、1−ブテニ
ル、2−ブテニル、1−メチル−2−ブテニル、1−メ
チル−1−ブテニル、3−メチル−2−ブテニル、1−
エチル−2−ブテニル、3−ブテニル、1−メチル−3
−ブテニル、2−メチル−3−ブテニル、1−エチル−
3−ブテニル、1−ペンテニル、2−ペンテニル、1−
メチル−2−ペンテニル、2−メチル−2−ペンテニ
ル、3−ペンテニル、1−メチル−3−ペンテニル、2
−メチル−3−ペンテニル、4−ペンテニル、1−メチ
ル−4−ペンテニル、2−メチル−4−ペンテニル、1
−ヘキセニル、2−ヘキセニル、3−ヘキセニル、4−
ヘキセニル、5−ヘキセニルのような「低級アルケニル
基」;シクロプロピル、シクロブチル、シクロペンチ
ル、シクロヘキシル、シクロヘプチル、ノルボルニル、
アダマンチルのような「シクロアルキル基」;2−シア
ノブテニルのような「シアノ化低級アルケニル基」;ベ
ンジル、α−ナフチルメチル、β−ナフチルメチル、イ
ンデニルメチル、フェナンスレニルメチル、アントラセ
ニルメチル、ジフェニルメチル、トリフェニルメチル、
1−フェネチル、2−フェネチル、1−ナフチルエチ
ル、2−ナフチルエチル、1−フェニルプロピル、2−
フェニルプロピル、3−フェニルプロピル、1−ナフチ
ルプロピル、2−ナフチルプロピル、3−ナフチルプロ
ピル、1−フェニルブチル、2−フェニルブチル、3−
フェニルブチル、4−フェニルブチル、1−ナフチルブ
チル、2−ナフチルブチル、3−ナフチルブチル、4−
ナフチルブチル、1−フェニルペンチル、2−フェニル
ペンチル、3−フェニルペンチル、4−フェニルペンチ
ル、5−フェニルペンチル、1−ナフチルペンチル、2
−ナフチルペンチル、3−ナフチルペンチル、4−ナフ
チルペンチル、5−ナフチルペンチル、1−フェニルヘ
キシル、2−フェニルヘキシル、3−フェニルヘキシ
ル、4−フェニルヘキシル、5−フェニルヘキシル、6
−フェニルヘキシル、1−ナフチルヘキシル、2−ナフ
チルヘキシル、3−ナフチルヘキシル、4−ナフチルヘ
キシル、5−ナフチルヘキシル、6−ナフチルヘキシル
のような「アラルキル基」;4−クロロベンジル、2−
(4−ニトロフェニル)エチル、o−ニトロベンジル、
4−ニトロベンジル、2、4−ジニトロベンジル、4−
クロロ−2−ニトロベンジルのような「ニトロ基、ハロ
ゲン原子でアリール環が置換されたアラルキル基」;フ
ェニル、インデニル、ナフチル、フェナンスレニル、ア
ントラセニルのような「アリール基」;2−メチルフェ
ニル、2,6−ジメチルフェニル、2−クロロフェニ
ル,4−クロロフェニル、2,4−ジクロロフェニル、
2,5−ジクロロフェニル、2−ブロモフェニル、4−
ニトロフェニル、4−クロロ−2−ニトロフェニルのよ
うな「低級アルキル基、ハロゲン原子、ニトロ基で置換
されたアリール基」をあげることができ、好適には、
「低級アルキル基」、「シアノ基で置換された低級アル
キル基」、「アラルキル基」、「ニトロ基、ハロゲン原
子でアリール環が置換されたアラルキル基」又は「低級
アルキル基、ハロゲン原子、ニトロ基で置換されたアリ
ール基」であり、さらに好適には、2−シアノエチル
基、2,2,2−トリクロロエチル基、ベンジル基、2
−クロロフェニル基又は4−クロロフェニル基である。
個のアルキル基」としては、例えば、メチル、エチル、
n−プロピル、イソプロピル、n−ブチル、イソブチ
ル、s−ブチル、tert−ブチル、ペンチル、ヘキシルの
ような炭素数1乃至6個の直鎖又は分枝鎖アルキル基を
あげることができ、好適には、炭素数1乃至4個のアル
キル基であり、さらに好適には、炭素数1又は2個のア
ルキル基であり、最も好適には、メチル基である。
合成の保護基」とは、核酸合成の際に安定にアミノ基を
保護し得るものであれば、特に限定はないが、例えば、
ホルミル、アセチル、プロピオニル、ブチリル、イソブ
チリル、ペンタノイル、ピバロイル、バレリル、イソバ
レリル、オクタノイル、デカノイル、8−メチルノナノ
イル、3−エチルオクタノイル、3,7−ジメチルオク
タノイル、ウンデカノイル、トリデカノイル、ヘキサデ
カノイル、14−メチルペンタデカノイル、13,13
−ジメチルテトラデカノイル、1−メチルヘプタデカノ
イル、ノナデカノイル、アイコサノイル及びヘナイコサ
ノイルのようなアルキルカルボニル基、スクシノイル、
グルタロイル、アジポイルのようなカルボキシ化アルキ
ルカルボニル基、クロロアセチル、ジクロロアセチル、
トリクロロアセチル、トリフルオロアセチルのようなハ
ロゲノ低級アルキルカルボニル基、メトキシアセチルの
ような低級アルコキシ低級アルキルカルボニル基、
(E)−2−メチル−2−ブテノイルのような不飽和ア
ルキルカルボニル基等の「脂肪族アシル基」;ベンゾイ
ル、α−ナフトイル、β−ナフトイルのようなアリール
カルボニル基、2−ブロモベンゾイル、4−クロロベン
ゾイルのようなハロゲノアリールカルボニル基、2,
4,6−トリメチルベンゾイル、4−トルオイルのよう
な低級アルキル化アリールカルボニル基、4−アニソイ
ルのような低級アルコキシ化アリールカルボニル基、2
−カルボキシベンゾイル、3−カルボキシベンゾイル、
4−カルボキシベンゾイルのようなカルボキシ化アリー
ルカルボニル基、4−ニトロベンゾイル、2−ニトロベ
ンゾイルのようなニトロ化アリールカルボニル基;2−
(メトキシカルボニル)ベンゾイルのような低級アルコ
キシカルボニル化アリールカルボニル基、4−フェニル
ベンゾイルのようなアリール化アリールカルボニル基等
の「芳香族アシル基」;メトキシカルボニル、エトキシ
カルボニル、t−ブトキシカルボニル、イソブトキシカ
ルボニルのような「低級アルコキシカルボニル基」;
2,2,2−トリクロロエトキシカルボニル、2−トリ
メチルシリルエトキシカルボニルのような「ハロゲン又
はトリ低級アルキルシリル基で置換された低級アルコキ
シカルボニル基」;ビニルオキシカルボニル、アリルオ
キシカルボニルのような「アルケニルオキシカルボニル
基」;ベンジルオキシカルボニル、4−メトキシベンジ
ルオキシカルボニル、3,4−ジメトキシベンジルオキ
シカルボニル、2−ニトロベンジルオキシカルボニル、
4−ニトロベンジルオキシカルボニルのような「1乃至
2個の低級アルコキシ又はニトロ基でアリール環が置換
されていてもよいアラルキルオキシカルボニル基」をあ
げることができ、好適には、「脂肪族アシル基」、「芳
香族アシル基」又は「1乃至2個の低級アルコキシ又は
ニトロ基でアリール環が置換されていてもよいアラルキ
ルオキシカルボニル基」であり、さらに好適には、「脂
肪族アシル基」又は「1乃至2個の低級アルコキシ又は
ニトロ基でアリール環が置換されていてもよいアラルキ
ルオキシカルボニル基」であり、特に好適には、トリフ
ルオロアセチル基又はベンジルオキシカルボニル基であ
る。
−P(OR3a)(NR3b)で表される基(式中、R3aは
炭素数1乃至6個のアルキル基又は炭素数1乃至7個の
シアノアルキル基を示し、R3bは炭素数1乃至6個のア
ルキル基を示す)であり、好適には、式−P(OC2H4
CN)(NCH(CH3)2)で表される基又は式−P
(OCH3)(NCH(CH3)2)で表される基であ
る。
としては、弗素原子、塩素原子、臭素原子又は沃素原子
をあげることができ、好適には、弗素原子又は塩素原子
である。
る「炭素数1乃至6個のアルキル基」としては、例え
ば、メチル、エチル、n−プロピル、イソプロピル、n
−ブチル、イソブチル、s−ブチル、tert−ブチル、ペ
ンチル、ヘキシルのような炭素数1乃至6個の直鎖又は
分枝鎖アルキル基を挙げることができ、好適には、メチ
ル基又はエチル基である。
る「核酸合成の保護基で保護された水酸基」の核酸合成
の保護基としては、前記R1の定義における「水酸基の
核酸合成の保護基」で例示した基と同様の基をあげるこ
とができ、好適には、「脂肪族アシル基」又は「芳香族
アシル基」であり、さらに好適には、ベンゾイル基であ
る。
る「核酸合成の保護基で保護されたメルカプト基」の核
酸合成の保護基としては、例えば、前記R1の定義にお
ける「水酸基の核酸合成の保護基」としてあげたものの
他、メチルチオ、エチルチオ、tert−ブチルチオのよう
なアルキルチオ基、ベンジルチオのようなアリールチオ
基等の「ジスルフィドを形成する基」をあげることがで
き、好適には、「脂肪族アシル基」又は「芳香族アシル
基」であり、さらに好適には、ベンゾイル基である。
る「核酸合成の保護基で保護されたアミノ基」の核酸合
成の保護基としては、前記R2の定義における「アミノ
基の核酸合成の保護基」で例示した基と同様の基を挙げ
ることができ、好適には、「脂肪族アシル基」又は「芳
香族アシル基」であり、更に好適には、ベンゾイル基で
ある。
る「炭素数1乃至6個のアルコキシ基」としては、例え
ば、メトキシ、エトキシ、n−プロポキシ、イソプロポ
キシ、n−ブトキシ、イソブトキシ、s−ブトキシ、te
rt−ブトキシ、ペンチルオキシ、ヘキシルオキシのよう
な炭素数1乃至6個の直鎖若しくは分枝鎖アルコキシ基
を挙げることができ、好適には、メトキシ又はエトキシ
基である。
る「炭素数1乃至6個のアルキルチオ基」としては、例
えば、メチルチオ、エチルチオ、プロピルチオ、イソプ
ロピルチオ、ブチルチオ、イソブチルチオ、s−ブチル
チオ、tert−ブチルチオ、ペンチルチオ、ヘキシルチオ
基を挙げることができ、好適には、メチルチオ又はエチ
ルチオ基である。
る「炭素数1乃至6個のアルキル基で置換されたアルキ
ルアミノ基」としては、例えば、メチルアミノ、エチル
アミノ、プロピルアミノ、イソプロピルアミノ、ブチル
アミノ、イソブチルアミノ、s−ブチルアミノ、tert−
ブチルアミノ、ペンチルアミノ、ヘキシルアミノ、ジメ
チルアミノ、ジエチルアミノ、ジプロピルアミノ、ジイ
ソプロピルアミノ、ジブチルアミノ、ジイソブチルアミ
ノ、ジ(s−ブチル)アミノ、ジ(tert−ブチル)アミ
ノ、ジペンチルアミノ、ジヘキシルアミノ基を挙げるこ
とができ、好適には、メチルアミノ、エチルアミノ、ジ
メチルアミノ又はジエチルアミノ基である。
1乃至7個のシアノアルコキシ基」としては、例えば、
シアノメトキシ、シアノエトキシ、シアノプロピルオキ
シ、シアノブチルオキシ、シアノペンチルオキシ、シア
ノヘキシルオキシ基等を挙げることができ、好適には、
2−シアノエトキシ基である。
発明のヌクレオシド類縁体(1)並びに上記構造(1
a)を含有するオリゴヌクレオチド類縁体は、塩にする
ことができるので、その塩をいい、そのような塩として
は、好適には、ナトリウム塩、カリウム塩、リチウム塩
のようなアルカリ金属塩、カルシウム塩、マグネシウム
塩のようなアルカリ土類金属塩、アルミニウム塩、鉄
塩、亜鉛塩、銅塩、ニッケル塩、コバルト塩等の金属
塩;アンモニウム塩のような無機塩、t−オクチルアミ
ン塩、ジベンジルアミン塩、モルホリン塩、グルコサミ
ン塩、フェニルグリシンアルキルエステル塩、エチレン
ジアミン塩、N−メチルグルカミン塩、グアニジン塩、
ジエチルアミン塩、トリエチルアミン塩、ジシクロヘキ
シルアミン塩、N,N’−ジベンジルエチレンジアミン
塩、クロロプロカイン塩、プロカイン塩、ジエタノール
アミン塩、N−ベンジル−フェネチルアミン塩、ピペラ
ジン塩、テトラメチルアンモニウム塩、トリス(ヒドロ
キシメチル)アミノメタン塩のような有機塩等のアミン
塩;弗化水素酸塩、塩酸塩、臭化水素酸塩、沃化水素酸
塩のようなハロゲン化水素酸塩、硝酸塩、過塩素酸塩、
硫酸塩、燐酸塩等の無機酸塩;メタンスルホン酸塩、ト
リフルオロメタンスルホン酸塩、エタンスルホン酸塩の
ような低級アルカンスルホン酸塩、ベンゼンスルホン酸
塩、p−トルエンスルホン酸塩のようなアリールスルホ
ン酸塩、酢酸塩、りんご酸塩、フマール酸塩、コハク酸
塩、クエン酸塩、酒石酸塩、蓚酸塩、マレイン酸塩等の
有機酸塩;及び、グリシン塩、リジン塩、アルギニン
塩、オルニチン塩、グルタミン酸塩、アスパラギン酸塩
のようなアミノ酸塩を挙げることができ、ヌクレオシド
構造(1a)を含有するオリゴヌクレオチド類縁体の場
合には、ナトリウム塩、カリウム塩及びトリエチルアミ
ン塩が好適であり、ヌクレオシド類縁体(1)の場合に
は、フリー体が好適である。
並びに上記構造(1a)を含有するオリゴヌクレオチド
類縁体は、大気中に放置しておくことにより、水分を吸
収し、吸着水が付いたり、水和物となる場合があり、そ
のような塩も本発明に包含される。
(1)並びに上記構造(1a)を含有するオリゴヌクレ
オチド類縁体は、他のある種の溶媒を吸収し、溶媒和物
となる場合があるが、そのような塩も本発明に包含され
る。
例えば、下記表1及び表2に示すような化合物を挙げる
ことができる。
を、「Bz」は、ベンゾイル基を、「Me」は、メチル
基を、「PMBn」は、p−メトキシベンジル基を、
「MMTr」は、4−メトキシトリフェニルメチル基
を、「DMTr」は、4,4’−ジメトキシトリフェニ
ルメチル基を、「TMTr」は、4,4’,4”−トリ
メトキシトリフェニルメチル基を、「TMS」は、トリ
メチルシリル基を、「TBDMS」は、tert−ブチルジ
メチルシリル基を、「TBDPS」は、tert−ブチルジ
フェニルシリル基を、それぞれ示す。
3、1−4、1−7、1−9、1−10、1−16、1
−17、1−19、1−20、1−21、1−22、1
−23、1−27、1−28、1−31、1−33、1
−34、1−40、1−41、1−43、1−44、1
−45、1−46、1−47、1−49、1−50、1
−56、1−57、1−82、1−83、2−3、2−
4、2−5、2−6、2−7、2−8、2−9、2−1
0、2−13、2−14、2−15、2−16、2−1
7、2−18、2−19、2−20、2−21、2−2
2、2−48、2−59、2−60、及び2−61の化
合物が挙げられ、更に好ましい化合物としては、化合物
番号1−4、1−22、1−28、1−46、1−4
9、1−50、1−56、1−57、1−82、1−8
3、2−3、2−4、2−6、2−13、2−14、2
−16、2−21、2−22、2−48、2−59、2
−60、及び2−61の化合物が挙げられ、最も好まし
い化合物としては、化合物番号2−4 :3’−アミノ
−3’−デオキシ−2’−O,4’−C−メチレン−5
−メチルウリジン、化合物番号2−14:3’−アジド
−3’−デオキシ−2’−O,4’−C−メチレン−5
−メチルウリジン、化合物番号2−36:3’−アジド
−3’−デオキシ−5’−O−(4,4’−ジメトキシ
トリチル)−2’−O,4’−C−メチレン−5−メチ
ルウリジン、化合物番号2−48:3’−アジド−5’
−O−tert−ブチルジフェニルシリル−3’−デオ
キシ−2’−O,4’−C−メチレン−5−メチルウリ
ジン、及び、化合物番号2−60:3’−アミノ−3’
−デオキシ−5’−O−(4,4’−ジメトキシトリチ
ル)−2’−O,4’−C−メチレン−5−メチルウリ
ジンがあげられる。
記載するA法により、製造することができる。
る。
は、ベンゾイル、α−ナフトイル、β−ナフトイルのよ
うなアリールカルボニル基、2,4,6-トリメチルベンゾイ
ル、4−トルオイルのような低級アルキル化アリールカ
ルボニル基、4−フェニルベンゾイルのようなアリール
化アリールカルボニル基等の「芳香族アシル基」であ
り、更に好適には、ベンゾイル基である。
は、トリメチルシリル、トリエチルシリル、イソプロピ
ルジメチルシリル、t−ブチルジメチルシリル、メチル
ジイソプロピルシリル、メチルジ−t−ブチルシリル、
トリイソプロピルシリルのようなトリ低級アルキルシリ
ル基、ジフェニルメチルシリル、t−ブチルジフェニル
シリル、ジフェニルイソプロピルシリル、フェニルジイ
ソプロピルシリルのような1乃至2個のアリール基で置
換されたトリ低級アルキルシリル基等の「シリル基」;
ベンジル、α−ナフチルメチル、β−ナフチルメチル、
ジフェニルメチル、トリフェニルメチル、α−ナフチル
ジフェニルメチル、9−アンスリルメチルのような「1
乃至3個のアリール基で置換されたメチル基」;4−メ
チルベンジル、2,4,6−トリメチルベンジル、3,
4,5−トリメチルベンジル、4−メトキシベンジル、
4−メトキシフェニルジフェニルメチル、4,4’−ジ
メトキシトリフェニルメチル、4,4’,4”−トリメ
トキシトリフェニルメチル、2−ニトロベンジル、4−
ニトロベンジル、4−クロロベンジル、4−ブロモベン
ジル、4−シアノベンジルのような「低級アルキル、低
級アルコキシ、ハロゲン、シアノ基でアリール環が置換
された1乃至3個のアリール基で置換されたメチル基」
であり、更に好適には、トリメチルシリル基、t−ブチ
ルジメチルシリル基、t−ブチルジフェニルシリル基、
ベンジル基、トリフェニルメチル基、4−メトキシベン
ジル基、4−メトキシフェニルジフェニルメチル基、
4,4’−ジメトキシトリフェニルメチル基又は4,
4’,4”−トリメトキシトリフェニルメチル基であ
る。
スルホニル、エタンスルホニルのような低級アルキルス
ルホニル基、トリフルオロメタンスルホニルのような、
ハロゲン置換低級アルキルスルホニル基、p−トルエン
スルホニルのようなアリールスルホニル基であり、更に
好適には、メタンスルホニル又はp−トルエンスルホニ
ル基である。
は、ホルミル、アセチル、プロピオニル、ブチリル、イ
ソブチリル、ペンタノイル、ピバロイル、バレリル、イ
ソバレリル、オクタノイル、デカノイル、1−メチルヘ
プタデカノイル、ノナデカノイル、アイコサノイル及び
ヘナイコサノイルのようなアルキルカルボニル基、スク
シノイル、グルタロイル、アジポイルのようなカルボキ
シ化アルキルカルボニル基、クロロアセチル、ジクロロ
アセチル、トリクロロアセチル、トリフルオロアセチル
のようなハロゲノ低級アルキルカルボニル基、メトキシ
アセチルのような低級アルコキシ低級アルキルカルボニ
ル基、(E)−2−メチル−2−ブテノイルのような不
飽和アルキルカルボニル基等の「脂肪族アシル基」;ベ
ンゾイル、α−ナフトイル、β−ナフトイルのようなア
リールカルボニル基、2−ブロモベンゾイル、4−クロ
ロベンゾイルのようなハロゲノアリールカルボニル基、
2,4,6−トリメチルベンゾイル、4−トルオイルの
ような低級アルキル化アリールカルボニル基、4−アニ
ソイルのような低級アルコキシ化アリールカルボニル
基、2−カルボキシベンゾイル、3−カルボキシベンゾ
イル、4−カルボキシベンゾイルのようなカルボキシ化
アリールカルボニル基、4−ニトロベンゾイル、2−ニ
トロベンゾイルのようなニトロ化アリールカルボニル
基;2−(メトキシカルボニル)ベンゾイルのような低
級アルコキシカルボニル化アリールカルボニル基、4−
フェニルベンゾイルのようなアリール化アリールカルボ
ニル基等の「芳香族アシル基」であり、更に好適には、
「脂肪族アシル基」であり、特に好適には、アセチル基
である。
置換基を1以上有していてもよいプリン−9−イル又は
2−オキソ−1,2−ジヒドロピリミジン−1−イル基
を示す。 (α1群)水酸基、核酸合成の保護基で保護された水酸
基、炭素数1乃至6個のアルコキシ基、メルカプト基、
核酸合成の保護基で保護されたメルカプト基、炭素数1
乃至6個のアルキルチオ基、核酸合成の保護基で保護さ
れたアミノ基、炭素数1乃至6個のアルキル基で置換さ
れたアミノ基、炭素数1乃至6個のアルキル基、及び、
ハロゲン原子。
置換基Bを導入してから環化を行なって、目的化合物
(1a)、(1b)及び(1c)を得る方法である。
セトン−D−グルコースを出発原料にして、文献(O.
T. Schmidt, Methods in Carbohydr. Chem., 4, 318 (1
964);J. S. Brimacombe and O. A. Ching, Carbhyd. R
es., 8, 82 (1968);T. F. Tam and B. Fraser-Reid, C
an. J. Chem., 57, 2818 (1979);S. A. Suzhkov, Nucl
eosides & Nucleotides, 13, 2283 (1994))の方法に
準じて製造することができる。
る。 <A法> (A−1工程)本工程は、不活性溶剤中、塩基の存在
下、原料化合物(2)の一級水酸基の保護基を脱保護し
て、化合物(3)を製造する工程である。
反応に使用されるものであれば特に限定はなく、例え
ば、水;メタノール、エタノール、n−プロパノールの
ようなアルコール類、テトラヒドロフラン、ジオキサン
のようなエーテル類等の有機溶媒又は水と上記有機溶媒
との混合溶媒が用いられ、好適には、アルコール類であ
る。
分に影響を与えないものであれば特に限定はないが、好
適には、ナトリウムメトキシドのような金属アルコキシ
ド類;炭酸ナトリウム、炭酸カリウム、炭酸リチウムの
ようなアルカリ金属炭酸塩;水酸化ナトリウム、水酸化
カリウム、水酸化リチウム、水酸化バリウムのようなア
ルカリ金属水酸化物又はアンモニア水、濃アンモニア−
メタノールのようなアンモニア類が用いられ、好適に
は、アルカリ金属炭酸塩である。
及び使用される塩基等により異なり特に限定はないが、
副反応を抑制するために、通常は0℃乃至150℃で、
1乃至10時間実施される。
常法に従って、反応混合物から採取される。例えば、反
応液を中和し、反応混合物を濃縮し、水と酢酸エチルの
ような混和しない有機溶剤を加え、水洗後、目的化合物
を含む有機層を分離し、無水硫酸ナトリウム等で乾燥
後、溶剤を留去することで得られる。
えば、再結晶、シリカゲルカラムクロマトグラフィー等
によって更に精製できる。
塩基の存在下、A−1工程で得られる化合物(3)に水
酸基の保護化剤を反応させて、化合物(4)を製造する
工程である。
ず、出発物質をある程度溶解するものであれば特に限定
はないが、例えば、ヘキサン、ヘプタンのような脂肪族
炭化水素類;ベンゼン、トルエン、キシレンのような芳
香族炭化水素類;メチレンクロリド、クロロホルム、四
塩化炭素、ジクロロエタン、クロロベンゼン、ジクロロ
ベンゼンのようなハロゲン化炭化水素類;蟻酸エチル、
酢酸エチル、酢酸プロピル、酢酸ブチル、炭酸ジエチル
のようなエステル類;ジエチルエーテル、ジイソプロピ
ルエーテル、テトラヒドロフラン、ジオキサン、ジメト
キシエタン、ジエチレングリコールジメチルエーテルの
ようなエーテル類;アセトニトリル、イソブチロニトリ
ルのようなニトリル類;ホルムアミド、N,N−ジメチ
ルホルムアミド、N,N−ジメチルアセトアミド、N−
メチル−2−ピロリドン、N−メチルピロリジノン、ヘ
キサメチルホスホロトリアミドのようなアミド類を挙げ
ることができるが、好適には、メチレンクロリドであ
る。
いて塩基として使用されるものであれば、特に限定はな
いが、例えば、N−メチルモルホリン、トリエチルアミ
ン、トリブチルアミン、ジイソプロピルエチルアミン、
ジシクロヘキシルアミン、N−メチルピペリジン、ピリ
ジン、4−ピロリジノピリジン、ピコリン、4−(N,
N−ジメチルアミノ)ピリジン、2,6−ジ(tert−ブ
チル)−4−メチルピリジン、キノリン、N,N−ジメ
チルアニリン、N,N−ジエチルアニリンのような有機
塩基類を挙げることができるが、好適には、トリエチル
アミンである。
−ブチルジメチルシリルクロリド、トリメチルシリルク
ロリド、トリエチルシリルクロリド、トリエチルシリル
ブロミド、トリイソプロピルシリルクロリド、ジメチル
イソプロピルシリルクロリド、ジエチルイソプロピルシ
リルクロリド、t−ブチルジフェニルシリルクロリド、
ジフェニルメチルシリルクロリド、トリフェニルシリル
クロリドのようなシリルハライド類、4−メトキシトリ
フェニルメチルクロリド、4,4'-ジメトキシトリフェニ
ルメチルクロリド、4,4',4''-トリメトキシトリフェニ
ルメチルクロリドのようなトリチルハライド類、ベンジ
ルクロリド、ベンジルブロミド、p−メトキシベンジル
ブロミドのようなアラルキルハライド類を挙げることが
でき、好適には、t−ブチルジフェニルシリルクロリド
である。
溶媒の還流温度で行なわれるが、好適には、0℃乃至使
用する溶媒の還流温度である。
使用される塩基又は使用される溶媒の種類によって異な
るが、通常、10分間乃至3日間であり、好適には、1
時間乃至24時間である。
常法に従って、反応混合物から採取される。例えば、反
応液を中和し、水と酢酸エチルのような混和しない有機
溶剤を加え、水洗後、目的化合物を含む有機層を分離
し、無水硫酸ナトリウム等で乾燥後、溶剤を留去するこ
とで得られる。
ましくない水酸基にR8が導入された化合物が生じた場
合には、常法、例えば、再結晶、シリカゲルカラムクロ
マトグラフィー等によって更に精製できる。
塩基触媒の存在下、A−2工程で得られる化合物(4)
に脱離基導入試薬を反応させて、化合物(5)を製造す
る工程である。
ン、ヘプタン、リグロイン、石油エーテルのような脂肪
族炭化水素類;ベンゼン、トルエン、キシレンのような
芳香族炭化水素類;メチレンクロリド、クロロホルム、
四塩化炭素、ジクロロエタン、クロロベンゼン、ジクロ
ロベンゼンのようなハロゲン化炭化水素類;蟻酸エチ
ル、酢酸エチル、酢酸プロピル、酢酸ブチル、炭酸ジエ
チルのようなエステル類;ジエチルエーテル、ジイソプ
ロピルエーテル、テトラヒドロフラン、ジオキサン、ジ
メトキシエタン、ジエチレングリコールジメチルエーテ
ルのようなエーテル類;アセトン、メチルエチルケト
ン、メチルイソブチルケトン、イソホロン、シクロヘキ
サノンのようなケトン類;ニトロエタン、ニトロベンゼ
ンのようなニトロ化合物類;アセトニトリル、イソブチ
ロニトリルのようなニトリル類;ホルムアミド、N,N
−ジメチルホルムアミド、N,N−ジメチルアセトアミ
ド、N−メチル−2−ピロリドン、N−メチルピロリジ
ノン、ヘキサメチルホスホロトリアミドのようなアミド
類;スルホランのようなスルホキシド類;ピリジン類を
挙げることができるが、好適には、メチレンクロリドで
ある。
トリエチルアミン、ピリジン、ジメチルアミノピリジン
のような塩基である。
ば、メタンスルホニルクロリド、エタンスルホニルブロ
ミドのようなアルキルスルホニルハライド類;p-トルエ
ンスルホニルクロリドのようなアリールスルホニルハラ
イド類を挙げることができ、好適には、メタンスルホニ
ルクロリド及びp-トルエンスルホニルクロリドである。
剤、脱離基導入試薬、塩基触媒により異なるが、通常、
0℃乃至50℃であり、好適には、10℃乃至40℃で
ある。
剤、脱離基導入試薬、塩基触媒、反応温度により異なる
が、通常、10分乃至24時間であり、好適には、1乃
至15時間である。
は、常法に従って、反応混合物から採取される。例え
ば、反応液を中和し、反応混合物を濃縮し、水と酢酸エ
チルのような混和しない有機溶剤を加え、水洗後、目的
化合物を含む有機層を分離し、無水硫酸ナトリウム等で
乾燥後、溶剤を留去することで得られる。
えば、再結晶、シリカゲルカラムクロマトグラフィー等
によって更に精製できる。
の存在下、A−3工程で得られる化合物(5)に酸無水
物を反応させて、化合物(6)を製造する工程である。
ルエーテル、ジオキサン、テトラヒドロフランのような
エーテル類;アセトニトリル、イソブチロニトリルのよ
うなニトリル類;ホルムアミド、N,N−ジメチルホル
ムアミド、N,N−ジメチルアセトアミド、N−メチル
−2−ピロリドン、N−メチルピロリジノン、ヘキサメ
チルホスホロトリアミドのようなアミド類;酢酸のよう
な有機酸等を挙げることができるが、好適には、酢酸で
ある。
酸、硫酸、硝酸等の無機酸をあげることができるが、好
適には、硫酸(特に、濃硫酸)である。
水酢酸、無水プロピオン酸等の低級脂肪族カルボン酸の
無水物を挙げることができるが、好適には、無水酢酸で
ある。
剤、酸触媒、酸無水物により異なるが、通常、0℃乃至
50℃であり、好適には、10乃至40℃である。
剤、酸触媒、酸無水物、反応温度により異なるが、通
常、10分乃至12時間であり、好適には、30分乃至
6時間である。
常法に従って、反応混合物から採取される。例えば、水
と酢酸エチルのような混和しない有機溶剤を加え、水洗
後、目的化合物を含む有機層を分離し、無水硫酸ナトリ
ウム等で乾燥後、溶剤を留去することで得られる。
えば、再結晶、シリカゲルカラムクロマトグラフィー等
によって更に精製できる。
酸触媒の存在下、A−4工程で得られる化合物(6)
に、文献(H. Vorbrueggen, K. Krolikiewicz and B, B
ennua, Chem. Ber., 114, 1234-1255 (1981))に従って
調製した、所望の置換基を有していてもよいプリン又は
ピリミジンに対応するトリメチルシリル化体を反応させ
て、化合物(7)を製造する工程である。
エン、キシレンのような芳香族炭化水素類;メチレンク
ロリド、クロロホルム、四塩化炭素、1,2−ジクロロ
エタン、クロロベンゼン、ジクロロベンゼンのようなハ
ロゲン化炭化水素類;アセトニトリル、イソブチロニト
リルのようなニトリル類;ホルムアミド、N,N−ジメ
チルホルムアミド、N,N−ジメチルアセトアミド、N
−メチル−2−ピロリドン、N−メチルピロリジノン、
ヘキサメチルホスホロトリアミドのようなアミド類;硫
化炭素等を挙げることができるが、好適には、1,2-ジク
ロロエタンである。
3、SnCl4、TiCl4、ZnCl2、BF3、トリフルオロメタンス
ルホン酸トリメチルシリルのようなルイス酸触媒等をあ
げることができ、好適には、四塩化スズ(SnCl4)であ
る。
剤、酸触媒により異なるが、通常、0乃至100℃であ
り、好適には、30℃乃至80℃である。
剤、酸触媒、反応温度により異なるが、通常、1時間乃
至3日間であり、好適には、1時間乃至2日間である。
常法に従って、反応混合物から採取される。例えば、反
応液を中和し、水と酢酸エチル若しくは塩化メチレンの
ような混和しない有機溶剤を加え、水洗後、目的化合物
を含む有機層を分離し、無水硫酸ナトリウム等で乾燥
後、溶剤を留去することで得られる。
えば、再結晶、シリカゲルカラムクロマトグラフィー等
によって更に精製できる。
塩基触媒の存在下、A−5工程で得られる化合物(7)
を環化して、化合物(1a)を製造する工程である。
ず、出発物質をある程度溶解するものであれば特に限定
はないが、好適には、メタノール、エタノール、n−プ
ロパノール、イソプロパノール、n−ブタノール、イソ
ブタノール、t−ブタノール、イソアミルアルコール、
ジエチレングリコール、グリセリン、オクタノール、シ
クロヘキサノール、メチルセロソルブのようなアルコー
ル類を挙げることができるが、更に好適には、メタノー
ルである。
酸化ナトリウム、水酸化カリウムのようなアルカリ金属
水酸化物;炭酸ナトリウム、炭酸カリウムのようなアル
カリ金属炭酸塩;ナトリウムメトキシド、ナトリウムエ
トキシドのようなアルカリ金属アルコキシド;アンモニ
ア水等をあげることができ、好適には、アルカリ金属炭
酸塩であり、更に好適には炭酸カリウムである。
剤、塩基触媒により異なるが、通常、0℃乃至50℃で
あり、好適には、10℃乃至30℃である。
剤、塩基触媒、反応温度により異なるが、通常、1時間
乃至3日間であり、好適には、3時間乃至2日間であ
る。
は、常法に従って、反応混合物から採取される。例え
ば、反応混合物を濃縮し、水と酢酸エチルのような混和
しない有機溶剤を加え、水洗後、目的化合物を含む有機
層を分離し、無水硫酸ナトリウム等で乾燥後、溶剤を留
去することで得られる。
えば、再結晶、シリカゲルカラムクロマトグラフィー等
によって更に精製できる。
A−6工程で得られる化合物(1a)に脱保護試薬を反
応させて、化合物(1b)を製造する工程である。但
し、脱保護が不要な場合は、本工程を行わないで次の工
程に進むこともできる。
なるが、他の副反応を生じない方法であれば、特に限定
はなく、例えば、”Protective Groups in Organic Syn
thesis” (Theodora W. Greene 著、 1981年、A Wiley-
Interscience Publication発行)に記載の方法によっ
て、行うことができる。
ている場合は、これらの方法を適宜組み合わせて、順次
脱保護を行なうことができる。
又は芳香族アシル基」、(2)「1乃至3個のアリール
基で置換されたメチル基」又は「低級アルキル、低級ア
ルコキシ、ハロゲン、シアノ基でアリール環が置換され
た1乃至3個のアリール基で置換されたメチル基」、
(3)「シリル基」の場合には、以下の方法により行う
ことができる。 (1)脂肪族アシル基及び芳香族アシル基の場合は、通
常、不活性溶剤中、塩基を反応して行う。
反応に使用されるものであれば特に限定はなく、例え
ば、水;メタノール、エタノール、n−プロパノールの
ようなアルコール類、テトラヒドロフラン、ジオキサン
のようなエーテル類等の有機溶媒又は水と上記有機溶媒
との混合溶媒が用いられ、好適には、アルコール類であ
る。
分に影響を与えないものであれば特に限定はないが、好
適には、ナトリウムメトキシドのような金属アルコキシ
ド類;炭酸ナトリウム、炭酸カリウム、炭酸リチウムの
ようなアルカリ金属炭酸塩;水酸化ナトリウム、水酸化
カリウム、水酸化リチウム、水酸化バリウムのようなア
ルカリ金属水酸化物又はアンモニア水、濃アンモニア−
メタノールのようなアンモニア類が用いられ、好適に
は、アルカリ金属炭酸塩である。
及び使用される塩基等により異なり特に限定はないが、
副反応を抑制するために、通常は0℃乃至150℃で、
1乃至10時間実施される。
は常法に従って、反応混合物から採取される。例えば、
反応混合物を濃縮し、水と酢酸エチルのような混和しな
い有機溶媒を加え、水洗後、目的化合物を含む有機層を
分離し、無水硫酸ナトリウム等で乾燥後、溶剤を留去す
ることで得られる。
ば、再結晶またはシリカゲルカラムクロマトグラフィー
等によって更に精製できる。 (2)保護基が「1乃至3個のアリール基で置換された
メチル基」又は「低級アルキル、低級アルコキシ、ハロ
ゲン、シアノ基でアリール環が置換された1乃至3個の
アリール基で置換されたメチル基」の場合には、不活性
溶剤中、還元剤を用いて行う。
ノール、エタノール、イソプロパノールのようなアルコ
ール類;ジエチルエーテル、テトラヒドロフラン、ジオ
キサンのようなエーテル類;トルエン、ベンゼン、キシ
レンのような芳香族炭化水素類;ヘキサン、シクロヘキ
サンのような脂肪族炭化水素類;酢酸エチル、酢酸プロ
ピルのようなエステル類;酢酸のような有機酸類又はこ
れらの有機溶媒と水との混合溶媒を挙げることができ
る。
元反応に使用されるものであれば特に限定はないが、好
適には、パラジウム炭素、ラネーニッケル、酸化白金、
白金黒、ロジウム−酸化アルミニウム、トリフェニルホ
スフィン−塩化ロジウム、パラジウム−硫酸バリウムを
挙げることができる。
0気圧で行なわれる。
には、20乃至40℃である。
好適には、1乃至3時間である。
は常法に従って、反応混合物から採取される。例えば、
反応混合物から、還元剤を除去し、水と酢酸エチルのよ
うな混和しない有機溶媒を加え、水洗後、目的化合物を
含む有機層を分離し、無水硫酸ナトリウム等で乾燥後、
溶剤を留去することで得られる。
えば、再結晶、シリカゲルカラムクロマトグラフィー等
によって更に精製できる。
基」、すなわち、トリチル基の場合は酸を用いて行うこ
ともできる。
ば、ベンゼン、トルエン、キシレンのような芳香族炭化
水素類;メチレンクロリド、クロロホルム、四塩化炭
素、1,2−ジクロロエタン、クロロベンゼン、ジクロ
ロベンゼンのようなハロゲン化炭化水素類;メタノー
ル、エタノール、イソプロパノール、tert-ブタノール
のようなアルコ−ル類;アセトニトリル、イソブチロニ
トリルのようなニトリル類;ホルムアミド、N,N−ジ
メチルホルムアミド、N,N−ジメチルアセトアミド、
N−メチル−2−ピロリドン、N−メチルピロリジノ
ン、ヘキサメチルホスホロトリアミドのようなアミド
類;酢酸のような有機酸類を挙げることができ、好適に
は、有機酸(特に、酢酸)又はアルコール類(特に、te
rt-ブタノール)である。
トリフルオロ酢酸である。
には、20乃至40℃である。
好適には、1乃至3時間である。
は常法に従って、反応混合物から採取される。例えば、
反応混合物を中和し、水と酢酸エチルのような混和しな
い有機溶剤を加え、水洗後、目的化合物を含む有機層を
分離し、無水硫酸ナトリウム等で乾燥後、溶剤を留去す
ることで得られる。
えば、再結晶、シリカゲルカラムクロマトグラフィー等
によって更に精製できる。 (3)保護基が、「シリル基」の場合は、通常、弗化テ
トラブチルアンモニウム、弗化水素酸、弗化水素酸−ピ
リジン、弗化カリウムのような弗素アニオンを生成する
化合物で処理するか、又は、酢酸、メタンスルホン酸、
パラトルエンスルホン酸、トリフルオロ酢酸、トリフル
オロメタンスルホン酸のような有機酸又は塩酸のような
無機酸で処理することにより除去できる。
蟻酸、酢酸、プロピオン酸のような有機酸を加えること
によって、反応が促進することがある。
ず、出発物質をある程度溶解するものであれば特に限定
はないが、好適には、ジエチルエーテル、ジイソプロピ
ルエーテル、テトラヒドロフラン、ジオキサン、ジメト
キシエタン、ジエチレングリコールジメチルエーテルの
ようなエーテル類;アセトニトリル、イソブチロニトリ
ルのようなニトリル類;水;酢酸のような有機酸及びこ
れらの混合溶媒を挙げることができる。
適には、20乃至70℃である。
適には、1乃至24時間である。
は常法に従って、反応混合物から採取される。例えば、
溶剤を留去し、シリカゲルカラムクロマトグラフィーに
よって精製することで得られる。
水素及び触媒の存在下、A−7工程で得られる化合物
(1b)のアジド基をアミノ基に還元して、また、所望
により、そのアミノ基を保護して、化合物(1c)を製
造する工程である。
ないものであれば特に限定はないが、好適には、メタノ
ール、エタノール、イソプロパノールのようなアルコー
ル類、ジエチルエーテル、テトラヒドロフラン、ジオキ
サンのようなエーテル類、トルエン、ベンゼン、キシレ
ンのような芳香族炭化水素類、ヘキサン、シクロヘキサ
ンのような脂肪族炭化水素類、酢酸エチル、酢酸プロピ
ルのようなエステル類、ホルムアミド、ジメチルホルム
アミド、ジメチルアセトアミド、N−メチル−2−ピロ
リドン、ヘキサメチルホスホロトリアミドのようなアミ
ド類、蟻酸、酢酸のような脂肪酸類、水、又はこれらの
混合溶剤が用いられる。
反応に使用されるものであれば、特に限定はないが、好
適には、パラジウム炭素、パラジウム黒、ラネーニッケ
ル、酸化白金、白金黒、ロジウム−酸化アルミニウム、
トリフェニルホスフィン−塩化ロジウム、パラジウム−
硫酸バリウムが用いられる。
0気圧で行なわれる。
及び触媒の種類等により異なるが、通常、0℃乃至10
0℃(好適には、20℃乃至40℃)、5分乃至48時
間(好適には、30分間乃至10時間)である。
は、常法に従って、反応混合物から採取される。例え
ば、ろ過により触媒を除去し、溶剤を留去することによ
って得られる。
tive Groups in Organic Synthesis)に記載の方法に従
って、アミノ基を保護することもできる。
べるB法により、3'位の窒素原子と5'位の酸素原子を
リン酸で結合させたN3'−P5'型の本発明のオリゴヌ
クレオチド類縁体を合成することができる。
式(1d)B1と式(8)のB1とは、同一又は異なって
いてもよい。
olled Pore Glass)又はテンタゲル(Tentagel)のよう
な、オリゴヌクレオチドの合成に通常用いられる樹脂を
示す。
る。 (B−1工程)本工程は、化合物(1d)に化合物
(8)を反応させて、化合物(9)を製造する、酸化的
リン酸化反応(oxidative phosphorylation coupling)
であり、文献(1)(Nucleic Acids Research, Vol. 2
3, No. 14, pp. 2661-2668, 1995)と同様に行うことが
できる。
られる化合物(1c)において、5’位の水酸基が保護
されており、かつ、塩基Bにアミノ基が存在する場合に
はアミノ基が保護されている化合物である。
れる化合物(1c)から文献(1)と同様にして合成で
きる化合物である。 (B−2工程)本工程は、B−1工程で得られる化合物
(9)からオリゴヌクレオチドを合成する工程である。
合物(9)の水酸基の保護基R8を脱保護し、続いて、
文献(1)と同様にしてリン酸化を行ない、さらに、上
記B−1工程と同様にして化合物(1d)を反応させ、
このサイクルを繰り返すことによってオリゴヌクレオチ
ドを合成することができる。
は、ヌクレオシド単位として、通常、2乃至50個であ
り、好適には、10乃至30個である。
種ヌクレアーゼに対して分解されにくく、生体への投与
後、長時間生体内に存在することができる。また、例え
ば、mRNAと安定な二重鎖を形成して、病因となるタ
ンパク質の生合成を阻害したり、ゲノム中の二重鎖DN
Aとの間で三重鎖を形成して、mRNAへの転写を阻害
したり、細胞に感染したウイルスの増殖を抑えることも
できる。
体は、抗腫瘍剤、抗ウイルス剤をはじめ、特定遺伝子の
働きを阻害し、疾病を治療する医薬品として期待され
る。
えば、緩衝剤および/または安定剤等の慣用の助剤を配
合して非経口投与製剤としたり、リポソーム製剤とする
ことができる。また、局所用の製剤としては、慣用の医
薬用担体を配合して軟膏、クリーム、液剤または膏薬等
に調剤できる。
り異なるが、例えば、1回当り、下限として、0.001mg/
kg 体重(好ましくは、0.01mg/kg 体重)、上限とし
て、100mg/kg 体重(好ましくは、10mg/kg 体重)を1
日当り1乃至数回症状に応じて使用することが望まし
い。
をさらに詳細に説明するが、本発明の範囲は、これらに
限定されるものではない。
キシ-2'-O,4'-C-メチレン-5-メチルウリジン (例示化合
物番号2-48) 参考例5の化合物 (200 mg, 0.27 mmol)のメタノール
溶液(7 ml)に 0 ℃で炭酸カリウム(41 mg, 0.29 mmo
l)を加え、室温で 4.5 時間撹拌した後、さらに、炭酸
カリウム(34 mg, 0.25 mmol)を加え 23 時間撹拌し
た。メタノールを留去後、残渣に水を加え、酢酸エチル
で抽出し、飽和食塩水で洗浄した。有機層を無水硫酸ナ
トリウムで乾燥し、溶媒留去後、シリカゲルカラムクロ
マトグラフィー(酢酸エチル:n-ヘキサン = 2:1)に
より精製し、目的物を無色結晶 (142 mg, 0.27 mmol,
100%)として得た。 mp 93-95 ℃. IR νmax (KBr): 3169, 3047, 2956, 2888, 2859, 211
7, 1696, 1275, 1109 cm- 1.1 H-NMR(CDCl3)δ: 1.12 (9H, s), 1.65 (3H, s), 3.7
8, 3.84 (2H, AB, J = 8Hz), 3.90, 4.08 (2H, AB, J =
12.5 Hz), 4.02 (1H, s), 4.67 (1H, s), 5.67(1H,
s), 7.54 (1H, s), 7.39-7.48 (6H, m), 7.67-7.71 (4
H, m), 8.46 (1H,br s).13 C-NMR(CDCl3)δ: 12.3, 19.5, 27.0, 58.7, 60.3,
71.4, 77.2, 78.6, 87.2, 90.1, 110.8, 128.0, 130.1,
130.2, 131.7, 132.3, 133.7, 135.1, 135.4, 149.6,
163.6. (実施例2)3'-アジド-3'-デオキシ-2'-O,4'-C-メチレン-5-メチル
ウリジン (例示化合物番号2-14) 窒素気流下、実施例1の化合物 (140 mg, 0.26 mmol)
の無水テトラヒドロフラン溶液(5 ml)に、テトラブチ
ルアンモニウムフルオライド(1.0 M in THF,290 μl,
0.29 mmol)を加え、室温で 1 時間撹拌した。溶媒留去
後、シリカゲルカラムクロマトグラフィー(酢酸エチ
ル:n-ヘキサン = 25:1)により精製し、目的物を白色
粉末 (65.7 mg, 0.22 mmol, 85%)として得た。 mp 94-96 ℃. IR νmax (KBr): 3163, 3046, 2118, 1692, 1468, 127
3, 1062 cm-1.1 H-NMR(CD3OD)δ: 1.89 (3H, s), 3.76, 3.86 (2H, A
B, J = 8 Hz), 3.85, 3.95 (2H, AB, J = 13 Hz), 4.03
(1H, s), 4.58 (1H, s), 5.58 (1H, s), 7.70 (1H,
s).13 C-NMR(CD3OD)δ: 12.8, 57.3, 61.2, 72.4, 79.8,
88.3, 91.0, 110.8, 136.3, 151.5, 166.1. (実施例3)3'-アミノ-3'-デオキシ-2'-O,4'-C-メチレン-5-メチル
ウリジン (例示化合物番号2-4) 水素気流下、10% パラジウム炭素(28 mg)の無水テト
ラヒドロフラン溶液(5ml)に、実施例2の化合物 (64
mg, 0.22 mmol)のエタノ−ル溶液(3 ml)を加え、室
温で 0.5 時間撹拌した。反応溶液を濾過後、溶媒留去
して、目的物を白色粉末 (59 mg, 0.22 mmol, 100%)
として得た。 mp 243-246 ℃. IR νmax (KBr): 3459, 3365, 1699, 1447, 1273, 1054
cm-1.1 H-NMR(C5D5N)δ: 1.83 (3H, s), 3.62 (1H, s), 3.9
2, 4.14 (2H, AB, J = 8Hz), 4.24 (2H, s), 4.54 (1H,
s), 5.97 (1H, s), 7.90 (1H, s).13 C-NMR(C5D5N)δ: 12.8, 54.2, 57.2, 71.6, 81.4,
91.1, 109.5, 150.8, 164.3. (実施例4)3'-アジド-3'-デオキシ-5'-O-(4,4'−ジメトキシトリチ
ル)-2'-O,4'-C-メチレン-5-メチルウリジン (例示化合
物番号2-36) 窒素気流下、実施例2の化合物(300mg, 1.02 mmol)の
ピリジン溶液 (6 ml)にジメトキシトリチルクロリド(4
15 mg,1.22 mmol)及びジメチルアミノピリジン(12.5
mg,0.10 mmol)を加え、室温で20.5時間撹拌した。反
応溶液に飽和重曹水を加え、ジクロロメタンで抽出し
た。有機層を水、飽和食塩水で洗浄後、無水硫酸ナトリ
ウムにて乾燥した。溶媒を減圧留去し、得られた粗成績
体をシリカゲルカラムクロマトグラフィー (n-ヘキサ
ン:酢酸エチル=2:1→1:1) により精製し、淡黄色泡状物
質として標記化合物 (462 mg, 0.78 mmol, 76%) を得
た。
H, s) , 3.32, 3.65 (2H, ABq, J=11Hz), 3.78 (2H,
s), 3.80 (6H, s), 4.13 (1H, s), 4.63 (1H, s), 5.67
(1H,s), 6.86 (4H, dd, J=2 Hz, 9 Hz), 7.23-7.45 (9
H, m), 7.73 (1H, s), 8.04 (1H, brs). (実施例5)3'-アミノ-3'-デオキシ-5'-O-(4,4'-ジメトキシトリチ
ル)-2'-O,4'-C-メチレン-5-メチルウリジン (例示化
合物番号2-60) 窒素気流下、実施例4の化合物 (110 mg, 0.18 mmol)
のピリジン溶液 (2.5 ml)にトリフェニルホスフィン (9
4.0 ml, 0.36 mmol) を加え、室温で3.5時間攪拌した。
引き続き、28%アンモニア水溶液(5.5 ml)を加え、室
温で24時間撹拌した。溶媒を減圧留去し、得られた粗成
績体をシリカゲルカラムクロマトグラフィー (クロロホ
ルム:エタノール=20:1) により精製し、淡黄色泡状
物質として標記化合物 (103 mg, 0.18 mmol, 97%) を得
た。
1.89 (3H, s), 3.71 (6H, s), 3.77(1H, s), 3.84 (2H,
s), 3.99, 4.10 (2H, ABq, J = 8 Hz), 4.69 (1H,
s), 6.04 (1H, s), 7.03-7.87 (13H, m), 8.58 (1H,
s). (実施例6)3'-アミノ-3'-デオキシ-5'-O-(4,4'-ジメトキシトリチ
ル)-2'-O,4'-C-メチレン-5-メチルウリジニル-(3'→5')
-3'-O-(tert-ブチルジメチルシリル)チミジン 2-シアノ
エチル エステル 窒素気流下、参考例6の化合物(14.5 mg, 0.28 μmo
l)のアセトニトリル溶液(0.3 ml)に実施例5の化合
物(10.0 mg, 18μmol)の四塩化炭素(0.3 ml)、トリ
エチルアミン(0.05 ml, 0.36 mmol)、アセトニトリル
溶液(0.2 ml)を加え、室温で14.5時間攪拌した。溶媒
を減圧留去し、得られた粗成績体をシリカゲルカラムク
ロマトグラフィー (n-ヘキサン:酢酸エチル=1:1→0:1)
により精製し、白色粉末として標記化合物 (13.0 mg, 1
2.5 μmol, 71%) を得た。
8.24. Mass(FAB): m/z 1043(M++H). (実施例7)3'-アミノ-3'-デオキシ-5'-O-(4,4'-ジメトキシトリチ
ル)-2'-O,4'-C-メチレン-5-メチルウリジニル-(3'→5')
-3'-O-(tert-ブチルジメチルシリル)チミジン メチル
エステル 窒素気流下、参考例7の化合物(22.1 mg, 51 μmol)
のアセトニトリル溶液(0.3 ml)に実施例5の化合物
(10.0 mg, 18μmol)の四塩化炭素(0.3 ml)、トリエ
チルアミン(0.05 ml, 0.36 mmol)、アセトニトリル溶
液(0.2 ml)を加え、室温で18時間攪拌した。反応溶液
に水加えた後、酢酸エチルにて抽出した。有機層を飽和
食塩水で洗浄後、無水硫酸ナトリウムにて乾燥した。溶
媒を減圧留去し、得られた粗成績体をシリカゲルカラム
クロマトグラフィー (ジクロロメタン:メタノール=20:
1,30:1) により精製し、白色粉末として標記化合物
(6.9 mg, 6.87 μmol, 39%) を得た。
0, 11.30. Mass(FAB): m/z 1026(M++Na). (実施例8)3'-アミノ-3'-デオキシ-5'-O-(4,4'-ジメトキシトリチ
ル)-2'-O,4'-C-メチレン-5-メチルウリジニル-(3'→5')
-チミジン メチル エステル 窒素気流下、実施例7の化合物(13.9 mg, 14 μmol)
のテトラヒドロフラン溶液(1 ml)にテトラブチルア
ンモニウムフロリドのテトラヒドロフラン溶液(1.0 M,
15μl, 15μmol)を加え、室温で3時間攪拌した。溶媒
を減圧留去し、得られた粗成績体をシリカゲルカラムク
ロマトグラフィー (酢酸エチル:エタノール=5:1) によ
り精製し、無色結晶として標記化合物 (9.7 mg, 10.9
μmol, 78%) を得た。
5, 11.23. Mass(FAB): m/z 912(M++Na). (実施例9)3'-アミノ-3'-デオキシ-5'-O-(4,4'-ジメトキシトリチ
ル)-2'-O,4'-C-メチレン-5-メチルウリジニル-(3'→5')
?2'-[シアノエトキシ(ジイソプロピルアミノ)ホスフィ
ノ]チミジン メチル エステル 窒素気流下、実施例8の化合物(10.0 mg, 11 μmo
l)、とジイソプロピルアンモニウムテトラゾリド(15.5
mg, 77 μmol)のアセトニトリル溶液(0.6 ml)にテト
ラヒドロフラン(0.2 ml)を加え、2-シアノエチルジイ
ソプロピルクロロホスホロアミダイト(39.8 mg, 132 μ
mol)を加えて、室温で25時間攪拌した。溶媒を減圧留去
し、得られた粗成績体をシリカゲルカラムクロマトグラ
フィー (酢酸エチル:トリエチルアミン=99:1→酢酸エチ
ル:エタノール:トリエチルアミン=100:10:1) により精
製した後、ジクロロメタン、n-ヘキサンにより再沈殿を
行い、白色粉末として標記化合物 (3.8 mg, 3.5 μmol,
31%) を得た。
148.93, 148.99, 149.03. (実施例10)オリゴヌクレオチド類縁体の合成 核酸合成機(Pharmacia 社製 Gene Assembler Plus)
を用い、0.2μmolスケールで行った。各合成サイクルに
おける溶媒、試薬、ホスホロアミダイトの濃度は天然型
オリゴヌクレオチド合成の場合と同じであり、溶媒、試
薬、天然型ヌクレオシドのホスホロアミダイトは全てPh
armacia社製のものを用いた。UniversalQ CPG(0.2μmo
l、Glen Research製)のDMTr基をトリクロロ酢酸に
よって脱保護し、その生成した水酸基に実施例9の化合
物及び天然ヌクレオチド合成用のアミダイトを用いて縮
合反応を繰り返し行い、それぞれの配列の修飾オリゴヌ
クレオチド類縁体を合成した。合成サイクルは以下の通
りである。
sec 2) coupling ホスホロアミダイト(25eq)、テトラゾール
/アセトニトリル;2 minor 30 min 3) capping 1-メチルイミダゾール/アセトニトリル、無
水酢酸/2,4,6-コリジン/アセトニトリル;36sec 4) oxidation ヨウ素/水/ピリジン/アセトニトリル;6s
ec 上記において、サイクル2)で実施例10の化合物を用い
て反応を行う場合は、30分間反応を行い、その他のホス
ホロアミダイトを用いる場合は2分間反応を行った。
し、合成サイクルの1)まで行い5'−位のジメトキシト
リチル基を脱保護した後は、常法に従い、濃アンモニア
水処理によってオリゴマーを支持体から切り出すととも
に、リン原子上の保護基シアノエチル基をはずし、さら
に核酸塩基上の保護基をはずした。
レオチドを得た。
3'-デオキシ-2'-O,4'-C-メチレン-5-メチルウリジンで
あるオリゴヌクレオチド類縁体(以下「オリゴヌクレオ
チド(1)」とする。)を得た。 (収量 8.5 nmol( 4.3% yield)) 得られた修飾オリゴヌクレオチド類縁体の精製は、逆相
HPLC(HPLC:GILSON社;Model 302、カラム: CHEMCO C
HEMCOBOND 5-ODS-H (7.8×300mm);0.1M酢酸トリエチル
アミン水溶液(TEAA), pH7;10→12.5%CH3CN / 40min, l
inear gradient;50℃;2.5ml/min;254nm)にて行い、
25.4分に溶出する分画を集めた。 (実施例11) オリゴヌクレオチド類縁体の合成 5’-O-ジメトキシトリチル-N-4-ベンゾイル-5-メチル-
2’-デオキシシチジン-3’-O-(2‐シアノエチル)N,
N−ジイソプロピルホスホロアミダイト(ファルマシア
製)を用い、実施例11と同様に、以下の配列: 5'−tttttmtntmtmtmt−3'(配列表の配列番号2)で
示される配列を有し、mが5-メチル2’-デオキシシチジ
ンで、nが3'-アミノ-3'-デオキシ-2'-O,4'-C-メチレン
-5-メチルウリジンであるオリゴヌクレオチド類縁体
(以下「オリゴヌクレオチド(2)」とする。)を得
た。 (収量 7.1 nmol( 3.5% yield)) 得られた修飾オリゴヌクレオチド類縁体の精製は、逆相
HPLC(HPLC:GILSON社;Model 302、カラム: CHEMCO C
HEMCOBOND 5-ODS-H (7.8×300mm);0.1M酢酸トリエチル
アミン水溶液(TEAA), pH7;10→12%CH3CN / 40min, lin
ear gradient;50℃;2.5ml/min;254nm)にて行い、2
2.5分に溶出する分画を集めた。 (参考例1)3-アジド-3-デオキシ-4-ヒドロキシメチル-1,2-O-イソ
プロピリデン-α-D-リボフラノース 文献(Surzhykov S.A., Krayevsky A.A, Nucleosides N
ucleotides, 13, 2283-2305 (1994))に従い調製した3-
アジド-4-ベンゾイルオキシメチル-5-O-ベンゾイル-3-
デオキシ-1,2-O-イソプロピリデン-α-D-リボフラノー
ス (4.13 g, 9.15 mmol)のメタノール溶液(85 ml)
に 0 ℃で炭酸カリウム(380 mg, 2.75 mmol)、水(15
ml)を加え、同温で 4.5 時間撹拌した。0 ℃下、10%
塩酸で中和し、メタノールを留去した。残渣に水を加
え、酢酸エチルで抽出し、飽和食塩水で洗浄した。有機
層を無水硫酸ナトリウムで乾燥後、溶媒留去し、得られ
た白色固体を、冷n-ヘキサンで洗浄して、目的物を白色
粉末 (1.93 g, 7.87 mmol, 86%) として得た。 mp 113-115 ℃ (トルエン). IR νmax (KBr): 3460, 3417, 2989, 2951, 2907, 2111
cm-1.1 H-NMR(CDCl3)δ: 1.62 (3H, s), 1.35 (3H, s) 2.65
(2H, br s), 3.81, 3.65 (2H, AB, J = 12 Hz), 3.59,
4.00 (2H, AB, J = 12.5 Hz), 4.28 (1H, d, J= 5.5 H
z), 4.82 (1H, dd, J = 4 Hz, 5.5 Hz), 5.85 (1H, d,
J = 4 Hz).13 C-NMR(CDCl3)δ: 25.7, 26.2, 61.9, 62.1, 63.2,
79.9, 87.3, 104.4, 113.6. (参考例2)3-アジド-5-O-tert-ブチルジフェニルシリル-3-デオキ
シ-4-ヒドロキシメチル-1,2-O-イソプロピリデン-α-D-
リボフラノース 窒素気流下、参考例1の化合物 (2.56 g, 10.5 mmol)
の無水塩化メチレン溶液(73 ml)に、0 ℃で、トリエ
チルアミン(3.5g, 4.82 ml, 34.6 mmol)、塩化t-ブチ
ルジフェニルシラン(9.75g, 9.22 ml, 35.46 mmol)を
加え、室温で 24 時間撹拌した。反応溶液に飽和重曹水
を加え、酢酸エチルで抽出し、飽和食塩水で洗浄した。
有機層を無水硫酸ナトリウムで乾燥し、溶媒留去後、シ
リカゲルカラムクロマトグラフィー(酢酸エチル:n-ヘ
キサン = 1:6)により精製し、目的物を白色粉末 (3.
13 g, 6.47 mmol, 62%)として得た。 mp 99.5-100.5 ℃ (n-ヘキサン). IR νmax (KBr): 3504, 2936, 2852, 2111 cm-1.1 H-NMR(CDCl3)δ: 1.07 (9H, s), 1.36 (3H, s), 1.6
2 (3H, s), 3.62, 3.92(2H, AB, J = 12 Hz), 4.38 (1
H, d, J = 6 Hz), 4.84 (1H, dd, J = 4 Hz, 5.5Hz),
3.82, 3.70 (2H, AB, J = 11 Hz), 4.84 (1H, dd, J =
4 Hz, 5.5 Hz), 5.86 (1H, d, J = 4 Hz), 7.36-7.44
(6H, m), 7.64-7.67 (4H, m).13 C-NMR(CDCl3)δ: 19.2, 26.1, 26.3, 26.8, 62.2,
62.3, 65.2, 80.4, 88.0, 104.5, 113.7, 127.7, 127.
8, 129.8, 129.9, 132.7, 132.8, 135.5. (参考例3)3-アジド-5-O-tert-ブチルジフェニルシリル-3-デオキ
シ-4-(p-トルエンスルホニルオキシメチル)-1,2-O-イソ
プロピリデン-α-D-リボフラノース 窒素気流下、0 ℃で、参考例2の化合物 (100 mg, 0.2
1 mmol)の無水塩化メチレン溶液 (2 ml) に、トリエチ
ルアミン(137 mg, 180 μl, 1.29 mmol)、塩化p-トル
エンスルホニル(63.3 mg, 0.33 mmol)、4−ジメチル
アミノピリジン(4 mg, 0.03 mmol) を加え、室温で 14
時間撹拌した。反応溶液に飽和重曹水を加え、酢酸エチ
ルで抽出し、飽和食塩水で洗浄した。有機層を無水硫酸
ナトリウムで乾燥し、溶媒留去後、シリカゲルカラムク
ロマトグラフィー(酢酸エチル:n-ヘキサン = 1:6)
により精製し、目的物を白色粉末 (130 mg, 0.20 mmo
l, 98%)として得た。 mp 122-124 ℃ (酢酸エチル-n-ヘキサン). IR νmax (KBr): 3069, 2935, 2114, 1366, 1183, 1109
cm-1.1 H-NMR(CDCl3)δ: 1.03 (9H, s), 1.27 (3H, s), 1.3
1 (3H, s), 2.41 (3H, s), 3.60, 3.72 (2H, AB, J = 1
0.5 Hz), 4.33, 4.40 (2H, AB, J = 10 Hz), 4.55 (1H,
d, J = 5.5 Hz), 5.00 (1H, dd, J = 3.7 Hz, 5.5 H
z), 5.82 (1H, d, J= 3.7 Hz), 7.23 (2H, d, J = 8.5
Hz), 7.36-7.45 (6H, m), 7.61-7.63 (4H,m), 7.72 (2
H, d, J = 8.5 Hz). 13C-NMR(CDCl3)δ: 19.1, 21.5,
25.9, 26.0, 26.7, 63.1, 64.7, 68.9, 80.1, 85.6, 1
04.4, 113.8, 127.8, 128.0, 129.6,129.9, 132.4, 13
2.5, 135.4, 144.6. (参考例4)3-アジド-5-O-tert-ブチルジフェニルシリル-3-デオキ
シ-4-(p-トルエンスルホニルオキシメチル)-1,2-ジ-O-
アセチル-D-リボフラノース 窒素気流下、参考例3の化合物 (230 mg, 0.36 mmol)
の酢酸溶液(3.5 ml)に、無水酢酸(406 mg, 375 μl,
3.98 mmol)、濃硫酸(6.5 mg, 3.5 μl, 0.066 mmo
l)を加え、室温で 5 時間撹拌した。反応溶液を氷水に
加え、30 分間撹拌し、飽和食塩水を加え、酢酸エチル
で抽出した。有機層を無水硫酸ナトリウムで乾燥し、溶
媒留去後、シリカゲルカラムクロマトグラフィー(酢酸
エチル:n-ヘキサン = 4:1)により精製し、α:β=
約3:7の混合物である目的物を無色油状物質 (230 m
g, 0.34 mmol, 94%)として得た。 IR νmax (KBr): 3048, 2935, 2864, 2117, 1756.cm-1.1 H-NMR(CDCl3)[β体]δ: 1.06 (9H, s), 1.83 (3H,
s), 2.08 (3H, s), 2.40 (3H, s), 3.54, 3.80 (2H, A
B, J = 11 Hz), 4.12, 4.26 (2H, AB, J = 10 Hz), 4.3
7 (1H, d, J = 5.5 Hz), 5.32 (1H, d, J = 5.5 Hz),
5.98 (1H, s), 7.29 (2H, d, J = 8 Hz), 7.37-7.46 (6
H, m), 7.59-7.65 (4H, m), 7.76 (2H, d,J = 8 Hz). [α体]δ: 1.05 (9H, s), 2.02 (3H, s), 2.13(3H,
s), 2.39 (3H, s), 3.51,3.68 (2H, AB, J = 11 Hz),
4.12, 4.21 (2H, AB, J = 10.5 Hz), 4.40 (1H, d, J =
7 Hz), 5.32 (1H, m), 6.31 (1H, d, J = 4.5 Hz), 7.
25 (2H, d, J = 8.5 Hz), 7.37-7.46 (6H, m), 7.59-7.
65 (4H, m), 7.70 (2H, d, J = 8.5 Hz).13C-NMR(CDCl
3)δ: 19.0, 19.1, 20.0, 20.6, 20.9, 21.1, 21.5, 2
6.6, 61.0, 63.2, 65.1, 68.4, 68.8, 72.2, 75.5, 85.
4, 86.5, 93.6, 96.0, 97.3, 127.8, 127.9, 128.0, 12
9.6, 129.9, 130.0, 132.0, 132.3, 132.4, 135.4, 14
4.7,168.5, 169.2, 169.3, 169.4. (参考例5)2'-O-アセチル-3'-アジド-5'-O-tert-ブチルジフェニル
シリル-3'-デオキシ-4'-(p-トルエンスルホニルオキシ
メチル)-5-メチルウリジン 窒素気流下、0 ℃で参考例4の化合物 (300 mg, 0.44
mmol)の無水1,2−ジクロロエタン溶液(6 ml)に、O,
O'-ビス(トリメチルシリル)チミン(240 mg,0.93 mmo
l)、四塩化スズ(253 mg, 114 μl, 0.97 mmol)を加
え、室温で 43時間撹拌した。氷冷下、ジクロロメタン
で希釈後、反応溶液に飽和重曹水を加え、ジクロロメタ
ンで抽出した。飽和食塩水で洗浄後、有機層を無水硫酸
ナトリウムで乾燥し、溶媒留去後、シリカゲルカラムク
ロマトグラフィ−(酢酸エチル:n-ヘキサン = 1:2−
1:0)により精製し、目的物を白色粉末 (300 mg, 0.4
mmol, 91%)として得た。 mp 158.5-159.5 ℃ (酢酸エチル-n-ヘキサン). IR νmax (KBr): 3185, 3067, 2956, 2116, 1752, 169
5, 1369, 1100 cm-1.1H-NMR(CDCl3)δ: 1.11 (9H,
s), 1.59 (3H, s), 2.15 (3H, s), 2.41 (3H, s), 3.8
0, 3.84 (2H, AB, J = 11.5 Hz), 4.04, 4.10 (2H, AB,
J = 11 Hz), 4.47 (1H, d, J = 6 Hz), 5.53 (1H, t,
J = 6.5 Hz), 5.94 (1H, d, J = 7 Hz), 7.18 (1H, s),
7.28 (2H, d, J = 7.5 Hz), 7.37-7.47 (6H, m), 7.61
-7.65 (4H,m), 7.71 (2H, d, J = 7.5 Hz), 9.68 (1H,
br s).13 C-NMR(CDCl3)δ: 11.8, 19.2, 20.9, 21.5, 26.9,
62.3, 65.9, 68.3, 74.2, 84.8, 86.1, 118.9, 127.9,
128.0, 129.7, 130.1, 131.5, 132.2, 135.2, 135.3, 1
35.5, 145.0, 150.4, 163.6, 169.9. (参考例6)3’-O-(tert-ブチルジメチルシリル)チミジン 5’-(2-
シアノエチル)ホスホネート 窒素気流下、3’-O-(tert-ブチルジメチルシリル)チミ
ジン(K. M. Fries, C.Joswing and R. F. Borch, J. M
ed. Chem.,38, 2672 (1995)に記載されている) (100 m
g, 0.34 mmol) のアセトニトリル溶液 (4 ml) に2-シア
ノエチルテトライソプロピルホスホロジアミダイト (13
2 mg, 0.44 mmol) を5分かけて加え、室温で2.2時間攪
拌した。引き続き、テトラゾール(30.8 mg, 0.44 mmol)
のアセトニトリル溶液(0.88 ml)を加え、室温で1時間
撹拌した。反応溶液に水加えた後、ジクロロエタンにて
抽出した。有機層を飽和食塩水で洗浄後、無水硫酸ナト
リウムにて乾燥した。溶媒を減圧留去し、得られた粗成
績体をシリカゲルカラムクロマトグラフィー (クロロホ
ルム:メタノール=30:1,n-ヘキサン:酢酸エチル=1:5
→0:1) により精製し、無色油状物質として標記化合物
(98.4 mg, 0.21 mmol, 70%) を得た。1 H-NMR (CDCl3)δ:0.10 (6H, s), 0.90 (9H, s), 1.96
(3H, s), 2.16-2.28 (2H, m), 2.77-2.82 (2H, m),
4.09-4.41 (6H, m), 6.28 (1H, dd, J = 7 Hz, 11 Hz),
6.98 (1H, d, J = 720 Hz), 7.36 (1H, d, J = 8 Hz),
8.20(1H, brs). 31P-NMR (CDCl3)δ: 7.70, 8.94. (参考例7)3’-O-(tert-ブチルジメチルシリル)チミジン 5’-メチ
ルホスホネート 窒素気流下、3’-O-(tert-ブチルジメチルシリル)チミ
ジン (100 mg, 0.28 mmol) のジクロロメタン溶液 (2 m
l) にクロロジイソプロピルアミノメトキシホスフィン
(69.2 mg, 0.35 mmol) を5分かけて加え、室温で1時間
攪拌した。引き続き、テトラゾール(56.0 mg, 0.80 mmo
l)のアセトニトリル溶液(2.0 ml)を加え、室温で40分撹
拌した。反応溶液に水加えた後、ジクロロエタンにて抽
出した。有機層を飽和食塩水で洗浄後、無水硫酸ナトリ
ウムにて乾燥した。溶媒を減圧留去し、得られた粗成績
体をシリカゲルカラムクロマトグラフィー (n-ヘキサ
ン:酢酸エチル=1:1→0:1,n-ヘキサン:酢酸エチル=1:4)
により精製し、無色油状物質として標記化合物 (109 m
g, 0.25 mmol, 91%) を得た。31 P-NMR (CDCl3)δ: 9.13, 10.07. (試験例1) (三本鎖形成能測定のためのTm測定)140 mM KCl及び10
mM MgCl2を含む7 mM リン酸ナトリウム緩衝液(pH7.
0)(または、そのMgCl2非添加である溶液)に溶解した
3本鎖を形成するオリゴヌクレオチド(2)と天然型2本
鎖DNAオリゴヌクレオチドを同モル量(各オリゴヌクレ
オチドの終濃度は1.5マイクロM)加えたサンプル溶液
を、沸騰水中に浴し、12時間をかけてゆっくり室温まで
冷却し、さらに4℃下で1時間放置した。分光光度計(B
eckman社製 Du 650)のセル室内で、サンプル溶液を5
℃から85℃まで少しずつ昇温させ(0.5℃/min)、2
60nmにおける紫外線吸収を測定した。天然型2本鎖D
NAオリゴヌクレオチドは、 配列: 5'−gctaaaaagaaagagagatcg−3'(配列表の配列番号
3) 及びその相補鎖で 配列: 5'−cgatctctctttctttttagc−3'(配列表の配列番号
4) からなるものを用いた。 また、3本鎖を形成する天然型オリゴヌクレオチドとし
て、 配列: 5'−tttttmtttmtmtmt−3'(配列表の配列番号5) であって、mが5-メチル-2’-デオキシシチジンであるも
の(以下、「オリゴヌクレオチド(3)」とする)を用
いた。
(3)と2本鎖DNAとのTm測定結果を示す。
類縁体は、天然型オリゴヌクレオチドと比べて、3本鎖
におけるTm値が高く、きわめてよい3本鎖形成能を示し
た。 (試験例2) (ヌクレアーゼ酵素耐性の測定) 各種オリゴヌクレオチド(10μg)を含むバッファー溶液
320μl(50mM Tris(pH8.0) and 10mM MgCl2)に3’-エ
キソヌクレアーゼ(phosphodiesterase from Crotalus
durissus (Boehringer Mannheim))0.2μgを加え、混
合液を37℃に保ち反応を行った。一定時間後に混合液の
一部を取り、90℃で2分間加熱することにより、酵素
を失活させ反応を停止させた。各時間における混合液中
のオリゴヌクレオチドの残量を逆相高速液体カラムクロ
マトグラフィーで定量し、ヌクレアーゼ存在下でのオリ
ゴヌクレオチド量の経時的変化を測定し、結果を図1に
示した。 試験に用いたオリゴヌクレオチド 1. 実施例10で得られたオリゴヌクレオチド(1) 2. 配列: 5’−ttttttttttnt−3’(配列表の配列番号 1) で示される配列を有し、nが2’−O,4’−C−メチ
レン−5−メチルウリジンであるオリゴヌクレオチド
(以下、「オリゴヌクレオチド(4)」とする。) 3. 配列: 5’−tttttttttttt−3’(配列表の配列番号 6) で示される配列を有する天然型オリゴヌクレオチド(以
下、「オリゴヌクレオチド(5)」とする。) 本発明のオリゴヌクレオチド類縁体は天然型と比して顕
著なヌクレアーゼ耐性を示した。更に、既知の非天然型
オリゴヌクレオチド類縁体と比しても顕著なヌクレアー
ゼ耐性を示した。
ブリッド形成能及び抗HIV活性の測定は、以下の方法
に従い、調べることができる。
レオチド類縁体をアンチセンス鎖とし、天然のDNAあ
るいはRNAからなるセンス鎖とをアニーリング処理し
たものの融解温度(Tm値)を測定することにより、本
発明のオリゴヌクレオチド類縁体の相補DNAおよびR
NAに対するハイブリッド形成能を調べる。
M、リン酸ナトリウム緩衝液(pH7.2)10mM、
アンチセンス鎖4μM、センス鎖4μMとしたサンプル
溶液(500μL)を沸騰水中に浴し、10時間をかけ
てゆっくり室温まで冷却する。分光光度計(例えば、島
津 UV-2100PC)のセル室内に結露防止のために窒素気流
を通し、サンプル溶液を5℃まで徐々に冷却し、さら
に、20分間5℃に保った後、測定を開始する。サンプ
ル温度は90℃まで毎分0.2℃ずつ上昇させ、0.1℃
間隔で260nmにおける紫外線吸収を測定する。
化するのを防ぐため、セルは、蓋付きのものを用い、サ
ンプル溶液表面に鉱油を1滴添加して測定する。
方法(J. VirologicalMethod 20, p. 309-321(1988))
に準じて行なう。すなわち、MT−4細胞を遠心分離
(1000xg,5分)し得られる細胞沈査を、血清を含ま
ないRPMI−1640培地に懸濁した細胞浮遊液に、
HIVを接種して、37℃で1時間培養した後、10%
牛胎児血清添加RPMI−1640培地(以下、血清培
地という)に加えて洗浄、遠心分離(1000xg,5分)
する。このようにして得られるHIV感染細胞及びHI
V非感染細胞をそれぞれ4x105/mlになるように
血清培地に懸濁し、組織培養用の96穴マルチウェルの
各ウェルに100μlずつ分注する。これらの各ウェル
に100μlずつ分注した後、5%炭酸ガスの存在下
で、37℃で5日間静置培養する。同様に化合物無添加
のHIV感染細胞及びHIV非感染細胞を培養する。培
養終了後、MTT(3−(4,5−ジメチルチアゾール
−2−イル)−2,5−ジフェニルテトラゾリウムブロ
ミド)を用いて生細胞を測定し、化合物添加における細
胞傷害抑制活性(抗HIV活性)を求める。なお、細胞
液および接種ウイルス液にはマイコプラズマを含まない
ことを確認する。
害抑制活性を100%とし、化合物無添加のHIV感染
細胞の細胞傷害抑制活性を0%として、HIV感染細胞
に対して50%の細胞傷害抑制活性を示す化合物濃度
(EC50)を求める。
縁体は、優れたアンチセンス又はアンチジーン活性を有
し、かつ、生体内で安定なオリゴヌクレオチド類縁体を
製造するための中間体として有用である。
縁体は、生体内で安定であり、アンチセンス又はアンチ
ジーン薬として有用である。
シド類縁体は、抗エイズ活性を有し、AIDSの予防又
は治療薬として有用である。
チド量の経時的変化を示す。縦軸は、0(分)における
各オリゴヌクレオチド量に対する各オリゴヌクレオチド
の残存率(%)を示す。横軸は、反応開始からの経過時
間(分)を示す。
耐性をテストするための合成オリゴヌクレオチド <220> 配列の特徴 <221> 配列の種類:修飾塩基 <222> 特徴を表す位置:11 <223> 特徴の説明:修飾ウリジン
をテストするための合成オリゴヌクレオチド <220> 配列の特徴 <221> 配列の種類:修飾塩基 <222> 特徴を表す位置:6 <223> 特徴の説明:5-メチル 2'-デオキシシチジン <220> 配列の特徴 <221> 配列の種類:修飾塩基 <222> 特徴を表す位置:8 <223> 特徴の説明:3'-アミノ-3'-デオキシ-2'-O, 4'-C
-メチレン-5-メチルウリジン <220> 配列の特徴 <221> 配列の種類:修飾塩基 <222> 特徴を表す位置:10 <223> 特徴の説明:5-メチル 2'-デオキシシチジン <220> 配列の特徴 <221> 配列の種類:修飾塩基 <222> 特徴を表す位置:12 <223> 特徴の説明:5-メチル 2'-デオキシシチジン <220> 配列の特徴 <221> 配列の種類:修飾塩基 <222> 特徴を表す位置:14 <223> 特徴の説明:5-メチル 2'-デオキシシチジン
をテストするための合成オリゴヌクレオチド
をテストするための合成オリゴヌクレオチド
をテストするための合成オリゴヌクレオチド <220> 配列の特徴 <221> 配列の種類:修飾塩基 <222> 特徴を表す位置:6 <223> 特徴の説明:5-メチル 2'-デオキシシチジン <220> 配列の特徴 <221> 配列の種類:修飾塩基 <222> 特徴を表す位置:10 <223> 特徴の説明:5-メチル 2'-デオキシシチジン <220> 配列の特徴 <221> 配列の種類:修飾塩基 <222> 特徴を表す位置:12 <223> 特徴の説明:5-メチル 2'-デオキシシチジン <220> 配列の特徴 <221> 配列の種類:修飾塩基 <222> 特徴を表す位置:14 <223> 特徴の説明:5-メチル 2'-デオキシシチジン
耐性をテストするための合成オリゴヌクレオチド
Claims (13)
- 【請求項1】一般式(1) 【化1】 [式中、 R1は、同一又は異なって、水素原子、水酸基の核酸合
成の保護基、リン酸基、核酸合成の保護基で保護された
リン酸基又は式−P(R4a)R4b(式中、R4a及びR4b
は、同一又は異なって、水酸基、核酸合成の保護基で保
護された水酸基、メルカプト基、核酸合成の保護基で保
護されたメルカプト基、アミノ基、核酸合成の保護基で
保護されたアミノ基、炭素数1乃至6個のアルコキシ
基、炭素数1乃至6個のアルキルチオ基、炭素数1乃至
7個のシアノアルコキシ基又は炭素数1乃至6個のアル
キル基で置換されたアミノ基を示す)で表される基を示
し、 R2は、アジド基、アミノ基又は式NH―R3(R3は、
同一又は異なって、アミノ基の核酸合成の保護基、リン
酸基、核酸合成の保護基で保護されたリン酸基又は式−
P(R4a)R4b(式中、R4a及びR4bは、同一又は異な
って、水酸基、核酸合成の保護基で保護された水酸基、
メルカプト基、核酸合成の保護基で保護されたメルカプ
ト基、アミノ基、核酸合成の保護基で保護されたアミノ
基、炭素数1乃至6個のアルコキシ基、炭素数1乃至6
個のアルキルチオ基、炭素数1乃至7個のシアノアルコ
キシ基又は炭素数1乃至6個のアルキル基で置換された
アミノ基を示す)で表される基を示す)で表される基を
示し、 Bは、下記α群から選択される任意の置換基を1以上有
していてもよいプリン−9−イル又は2−オキソ−1,
2−ジヒドロピリミジン−1−イル基を示す。]で表さ
れる化合物又はその薬理上許容される塩。 (α群) 水酸基、 核酸合成の保護基で保護された水酸基、 炭素数1乃至6個のアルコキシ基、 メルカプト基、 核酸合成の保護基で保護されたメルカプト基、 炭素数1乃至6個のアルキルチオ基、 アミノ基、 核酸合成の保護基で保護されたアミノ基、 炭素数1乃至6個のアルキル基で置換されたアミノ基、 炭素数1乃至6個のアルキル基、及び、 ハロゲン原子。 - 【請求項2】請求項1において、R1が、水素原子、脂
肪族アシル基、芳香族アシル基、シリル基、1乃至3個
のアリール基で置換されたメチル基、又は、低級アルキ
ル、低級アルコキシ、ハロゲン若しくはシアノ基でアリ
ール環が置換された1乃至3個のアリール基で置換され
たメチル基である、化合物。 - 【請求項3】請求項1において、R1が、水素原子、シ
リル基、1乃至3個のアリール基で置換されたメチル
基、又は、低級アルキル、低級アルコキシ、ハロゲン若
しくはシアノ基でアリール環が置換された1乃至3個の
アリール基で置換されたメチル基である、化合物。 - 【請求項4】請求項1において、R1が、水素原子、ト
リメチルシリル基、t−ブチルジメチルシリル基、t−
ブチルジフェニルシリル基、ベンジル基、トリフェニル
メチル基、4−メトキシベンジル基、4−メトキシフェ
ニルジフェニルメチル基、4,4’−ジメトキシトリフ
ェニルメチル基又は4,4’,4”−トリメトキシトリ
フェニルメチル基である、化合物。 - 【請求項5】請求項1において、R2が、アジド基、ア
ミノ基、又は、式NH―R3基(式中、R3は、脂肪族ア
シル基、芳香族アシル基、1乃至3個のアリール基で置
換されたメチル基、低級アルキル、低級アルコキシ、ハ
ロゲン若しくはシアノ基でアリール環が置換された1乃
至3個のアリール基で置換されたメチル基、シリル基、
ホスホロアミダイト基、ホスホニル基、リン酸基又は核
酸合成の保護基で保護されたリン酸基である)である、
化合物。 - 【請求項6】請求項1において、R2が、アジド基、ア
ミノ基、式NH−R3基(式中、R3が、アセチル基、ト
リフルオロアセチル基、ベンゾイル基、ベンジル基、p
−メトキシベンジル基、tert-ブチルジフェニルシリル
基、式−P(OC2H4CN)(NCH(CH3)2)で表
される基、式−P(OCH3)(NCH(CH3)2)で
表される基、ホスホニル基、又は、2−クロロフェニル
若しくは4−クロロフェニルリン酸基である)である、
化合物。 - 【請求項7】請求項1において、R2が、アジド基又は
アミノ基である、化合物。 - 【請求項8】請求項1において、Bが、6−アミノプリ
ン−9−イル(すなわち、アデニニル)、アミノ基が核
酸合成の保護基で保護された6−アミノプリン−9−イ
ル、2,6−ジアミノプリン−9−イル、アミノ基が核
酸合成の保護基で保護された2,6−ジアミノプリン−
9−イル、2−アミノ−6−クロロプリン−9−イル、
アミノ基が核酸合成の保護基で保護された2−アミノ−
6−クロロプリン−9−イル、2−アミノ−6−フルオ
ロプリン−9−イル、アミノ基が核酸合成の保護基で保
護された2−アミノ−6−フルオロプリン−9−イル、
2−アミノ−6−ブロモプリン−9−イル、アミノ基が
核酸合成の保護基で保護された2−アミノ−6−ブロモ
プリン−9−イル、2−アミノ−6−ヒドロキシプリン
−9−イル(すなわち、グアニニル)、アミノ基が核酸
合成の保護基で保護された2−アミノ−6−ヒドロキシ
プリン−9−イル、6−アミノ−2−メトキシプリン−
9−イル、アミノ基が核酸合成の保護基で保護された6
−アミノ−2−メトキシプリン−9−イル、6−アミノ
−2−クロロプリン−9−イル、アミノ基が核酸合成の
保護基で保護された6−アミノ−2−クロロプリン−9
−イル、6−アミノ−2−フルオロプリン−9−イル、
アミノ基が核酸合成の保護基で保護された6−アミノ−
2−フルオロプリン−9−イル、2,6−ジメトキシプ
リン−9−イル、2,6−ジクロロプリン−9−イル、
6−メルカプトプリン−9−イル、メルカプト基が核酸
合成の保護基で保護された6−メルカプトプリン−9−
イル、2−オキソ−4−アミノ−1,2−ジヒドロピリ
ミジン−1−イル(すなわち、シトシニル)、アミノ基
が核酸合成の保護基で保護された2−オキソ−4−アミ
ノ−1,2−ジヒドロピリミジン−1−イル、4−アミ
ノ−2−オキソ−5−フルオロ−1,2−ジヒドロピリ
ミジン−1−イル、アミノ基が核酸合成の保護基で保護
された4−アミノ−2−オキソ−5−フルオロ−1,2
−ジヒドロピリミジン−1−イル、4−アミノ−2−オ
キソ−5−クロロ−1,2−ジヒドロピリミジン−1−
イル、アミノ基が核酸合成の保護基で保護された4−ア
ミノ−2−オキソ−5−クロロ−1,2−ジヒドロピリ
ミジン−1−イル、2−オキソ−4−メトキシ−1,2
−ジヒドロピリミジン−1−イル、2−オキソ−4−メ
ルカプト−1,2−ジヒドロピリミジン−1−イル、メ
ルカプト基が核酸合成の保護基で保護された2−オキソ
−4−メルカプト−1,2−ジヒドロピリミジン−1−
イル、2,4−ジヒドロキシピリミジン−1−イル(す
なわち、ウラシリル)、2,4−ジヒドロキシ−5−メ
チルピリミジン−1−イル(すなわち、チミニル)、4
−アミノ−5−メチル−2−オキソ−1,2−ジヒドロ
ピリミジン−1−イル又はアミノ基が核酸合成の保護基
で保護された4−アミノ−5−メチル−2−オキソ−
1,2−ジヒドロピリミジン−1−イル基である、化合
物。 - 【請求項9】請求項1において、Bが、6−ベンゾイル
アミノプリン−9−イル、アデニニル、2−ベンゾイル
アミノ−6−ヒドロキシプリン−9−イル、グアニニ
ル、2−オキソ−4−ベンゾイルアミノ−1,2−ジヒ
ドロピリミジン−1−イル、シトシニル、ウラシリル又
はチミニル基である、化合物。 - 【請求項10】下記化合物群から選択される1の化合
物: 3’−アミノ−3’−デオキシ−2’−O,4’−C−
メチレン−5−メチルウリジン、 3’−アジド−3’−デオキシ−2’−O,4’−C−
メチレン−5−メチルウリジン、 3’−アジド−5’−O−tert−ブチルジフェニル
シリル−3’−デオキシ−2’−O,4’−C−メチレ
ン−5−メチルウリジン、 3’−アジド−3’−デオキシ−5’−O−(4,4’
−ジメトキシトリチル)−2’−O,4’−C−メチレ
ン−5−メチルウリジン、及び、 3’−アミノ−3’−デオキシ−5’−O−(4,4’
−ジメトキシトリチル)−2’−O,4’−C−メチレ
ン−5−メチルウリジン。 - 【請求項11】一般式(1a) 【化2】 [式中、 Bは、下記α群から選択される置換基を有していてもよ
いプリン−9−イル基又は2−オキソ−1,2−ジヒド
ロピリミジン−1−イル基を示す。]で表わされる構造
を1又は2以上含有するオリゴヌクレオチド類縁体及び
その薬理学上許容される塩である。但し、上記構造を2
以上含有する場合には、当該構造間でBは同一又は異な
る。 (α群) 水酸基、 核酸合成の保護基で保護された水酸基、 炭素数1乃至6個のアルコキシ基、 メルカプト基、 核酸合成の保護基で保護されたメルカプト基、 炭素数1乃至6個のアルキルチオ基、 アミノ基、 核酸合成の保護基で保護されたアミノ基、 炭素数1乃至6個のアルキル基で置換されたアミノ基、 炭素数1乃至6個のアルキル基、及び、 ハロゲン原子。 - 【請求項12】請求項11において、Bが、6−アミノ
プリン−9−イル基(すなわち、アデニニル基)、アミ
ノ基が核酸合成の保護基で保護された6−アミノプリン
−9−イル基、2,6−ジアミノプリン−9−イル基、
2−アミノ−6−クロロプリン−9−イル基、アミノ基
が核酸合成の保護基で保護された2−アミノ−6−クロ
ロプリン−9−イル基、2−アミノ−6−フルオロプリ
ン−9−イル基、アミノ基が核酸合成の保護基で保護さ
れた2−アミノ−6−フルオロプリン−9−イル基、2
−アミノ−6−ブロモプリン−9−イル基、アミノ基が
核酸合成の保護基で保護された2−アミノ−6−ブロモ
プリン−9−イル基、2−アミノ−6−ヒドロキシプリ
ン−9−イル基(すなわち、グアニニル基)、アミノ基
が核酸合成の保護基で保護された2−アミノ−6−ヒド
ロキシプリン−9−イル基、アミノ基及び水酸基が核酸
合成の保護基で保護された2−アミノ−6−ヒドロキシ
プリン−9−イル基、6−アミノ−2−メトキシプリン
−9−イル基、6−アミノ−2−クロロプリン−9−イ
ル基、6−アミノ−2−フルオロプリン−9−イル基、
2,6−ジメトキシプリン−9−イル基、2,6−ジク
ロロプリン−9−イル基、6−メルカプトプリン−9−
イル基、2−オキソ−4−アミノ−1,2−ジヒドロピ
リミジン−1−イル基(すなわち、シトシニル基)、ア
ミノ基が核酸合成の保護基で保護された2−オキソ−4
−アミノ−1,2−ジヒドロピリミジン−1−イル基、
2−オキソ−4−アミノ−5−フルオロ−1,2−ジヒ
ドロピリミジン−1−イル基、アミノ基が核酸合成の保
護基で保護された2−オキソ−4−アミノ−5−フルオ
ロ−1,2−ジヒドロピリミジン−1−イル基、4−ア
ミノ−2−オキソ−5−クロロ−1,2−ジヒドロピリ
ミジン−1−イル基、2−オキソ−4−メトキシ−1,
2−ジヒドロピリミジン−1−イル基、2−オキソ−4
−メルカプト−1,2−ジヒドロピリミジン−1−イル
基、2−オキソ−4−ヒドロキシ−1,2−ジヒドロピ
リミジン−1−イル基(すなわち、ウラシニル基)、2
−オキソ−4−ヒドロキシ−5−メチル−1,2−ジヒ
ドロピリミジン−1−イル基(すなわち、チミニル
基)、4−アミノ−5−メチル−2−オキソ−1,2−
ジヒドロピリミジン−1−イル基(すなわち、5−メチ
ルシトシニル基)又はアミノ基が核酸合成の保護基で保
護された4−アミノ−5−メチル−2−オキソ−1,2
−ジヒドロピリミジン−1−イル基である、オリゴヌク
レオチド類縁体及びその薬理学上許容される塩。 - 【請求項13】請求項11において、Bが、6−ベンゾ
イルアミノプリン−9−イル基、アデニニル基、2−イ
ソブチリルアミノ−6−ヒドロキシプリン−9−イル
基、グアニニル基、2−オキソ−4−ベンゾイルアミノ
−1,2−ジヒドロピリミジン−1−イル基、シトシニ
ル基、2−オキソ−5−メチル−4−ベンゾイルアミノ
−1,2−ジヒドロピリミジン−1−イル基、5−メチ
ルシトシニル基、ウラシニル基又はチミニル基である、
オリゴヌクレオチド類縁体及びその薬理学上許容される
塩。
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