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CN101622348A - 作为治疗性干预靶标的miR-20调节的基因和途径 - Google Patents

作为治疗性干预靶标的miR-20调节的基因和途径 Download PDF

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CN101622348A
CN101622348A CN200780048941A CN200780048941A CN101622348A CN 101622348 A CN101622348 A CN 101622348A CN 200780048941 A CN200780048941 A CN 200780048941A CN 200780048941 A CN200780048941 A CN 200780048941A CN 101622348 A CN101622348 A CN 101622348A
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CN
China
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mir
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cancer
seq
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Application number
CN200780048941A
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安德里斯·G·巴德
麦克·拜罗姆
查尔斯·D·约翰逊
大卫·布朗
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Asuragen Inc
Original Assignee
Asuragen Inc
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Abstract

本发明涉及用于鉴定被miR-20a调节的基因或者基因途径,使用miR-20a调节基因或者基因途径,使用该谱评估患者状况和/或用适当miRNA治疗患者的方法和组合物。

Description

作为治疗性干预靶标的miR-20调节的基因和途径
发明背景
I.技术领域
本发明涉及分子生物学和医学领域。更加具体而言,本发明涉及用于治疗受miR-20微RNA、微RNA表达以及通过它们直接和间接调节的基因和细胞途径影响的疾病或状况的方法。
II.背景技术
在2001年,几个小组使用克隆方法从线虫(C.elegans)、果蝇和人中分离和鉴定了一大群“微RNA”(miRNA)(Lagos-Quintana等,2001;Lau等,2001;Lee和Ambrmbros,2001)。已经在植物和包括人在内的动物中鉴定出几百种miRNA,它们似乎不具有内源siRNA。因此,虽然miRNA与siRNA类似,但是miRNA是不同的。
迄今观察到的miRNA长度有大约21-22个核苷酸,并且它们来源于从非蛋白编码基因转录的更长的前体。参见综述Carrington等(2003)。前体形成在自身互补区折回的结构;然后它们被核酸酶切酶(在动物中)或DCL1(在植物中)加工产生短的双链miRNA。miRNA链之一掺入到称作RNA诱导沉默复合体(RISC)的蛋白质和miRNA的复合体中。miRNA将RISC复合体导向至靶mRNA,然后依赖于miRNA与其靶mRNA的序列互补程度将其断裂或者发生翻译沉默。当前,据信完全或近乎完全的互补性导致mRNA降解,这如在植物中最普遍观察到的那样。相反,如主要在动物中发现的那样,不完全的碱基配对导致翻译沉默。然而,最近的资料表明了额外复杂性(Bagga等,2005;Lim等,2005),并且miRNA导致基因沉默的机制仍处于紧张研究中。
许多miRNA在不同生物体中是保守的,并且这表明miRNA参与有机体整个生存期必需的生物学过程(Esquela-Kerscher和Slack,2006)。具体而言,miRNA涉及调节细胞生长和细胞与组织分化,这是与癌症发展相关的细胞过程。例如,在线虫发育过程中,lin-4和let-7均调节从一个幼虫期到另一个幼虫期(Ambros,2001)的传代。Mir-14和bantam是调节细胞死亡的果蝇(Drosphila)miRNA,该调节似乎是通过调节细胞凋亡所涉及的基因的表达进行(Brennecke等,2003,Xu等,2003)。
关于微RNA的研究逐渐增加,因为科学家开始意识到这些分子在调节真核基因表达中起着广泛的作用。具体而言,几项最新研究已经表明,众多miRNA的表达水平与各种癌症相关(在Esquela-Kerscher和Slack,2006;Calin和Croce,2006中综述)。已经观察到了几乎所有miRNA在众多癌症类型中差异表达(Lu等,2005)。大多数此类研究仅仅通过间接证据将miRNA与癌症关联。然而,He等(2005a)已经提供了miRNA可直接致癌的更直接证据,即通过迫使包括miR-20a在内的六种miRNA在小鼠中过表达导致B细胞淋巴瘤明显增加。
发明人先前证明,hsa-miR-20a参与众多细胞活性的调节,这些细胞活性代表着癌症治疗和其他疾病和紊乱治疗的干预点(2005年5月31日提出的美国专利申请序列号11/141,707和2005年11月14日提出的序列号11/273,640,两个专利申请通过参考并入本文)。miR-20a过表达明显降低衍生自白血病外周血的人T细胞系Jurkat细胞的活力,而明显提高人正常原代T细胞的活力和增殖。提高正常细胞活力而降低癌细胞活力的细胞调节物代表着对癌症有用的治疗性治疗。Hsa-miR-20a增加A549肺癌细胞的细胞凋亡(诱导具有致癌潜能的细胞的死亡)并且增加BJ细胞的细胞周期S期细胞百分数(人包皮原代细胞)而同时降低这些细胞的细胞周期G1期细胞百分数。发明人观察到,hsa-miR-20a在来自慢性淋巴细胞白血病患者的白细胞中的表达高于来自正常患者的相同细胞中的表达。其他人已经表明,hsa-miR-20a调节转录因子E2F1的翻译产率(O’Donnell等,2005)并且表现出在结肠、胰腺和前列腺肿瘤中过表达的,而在乳癌癌中被下调(Volinia等,2006)。
生物信息学分析表明,任何特定miRNA可结合并改变多达几百个不同基因的表达。此外,一个基因可以被几个miRNA调节。因此,每一miRNA可调节基因、基因途径和基因网络间的复杂相互作用。这种牵涉miRNA的调节途径和网络的误调节或改变有可能促成紊乱和疾病,如癌症的发展。虽然生物信息学工具有助于预测miRNA结合靶,但它有局限性。因为miRNA与其靶结合位点的不完全互补性,仅使用生物信息学工具很难精确预测miRNA的mRNA靶。此外,miRNA与靶基因之间的复杂相互调节网路使得很难精确预测那些基因实际上响应特定miRNA而被误调节。
通过操纵miRNA表达或者通过修复miRNA误调节校正基因表达错误或调节基因表达代表着修复遗传病和治疗疾病,如癌症的有前景的方法。如上所述,当前该方法的缺陷是任何特定miRNA所影响的调节途径和网络的细节仍然普遍地未经鉴定。除了E2F1之外,癌细胞中被miR-20调节的基因、基因途径和基因网路仍然大部分未知。当前,这代表着对miR-20可能在其中起作用的癌症治疗的重要限制。需要鉴定hsa-miR-20表达所调节的或者调节hsa-miR-20表达的基因、基因途径和基因网络。
发明内容
本发明通过在miR-20介导改变另外的一个或多个基因表达之后鉴定miR-20调节的直接靶标基因或者调节的间接或下游靶标基因,提供额外的组合物和方法。此外,发明描述了被miR-20及其家族成员影响的基因、疾病和/或生理途径和网络。在某些方面,本发明组合物向患有、怀疑患有或者有危险发展成代谢性、免疫性、传染性、心血管、消化性、内分泌、眼、泌尿生殖、血液、肌肉骨骼、神经系统、先天性、呼吸、皮肤或癌性疾病或状况的受试者施用。
在特定方面,可以基于一个或一个以上miRNA或mRNA表达和/或异常表达选择用于治疗的受试者或者患者。在进一步的方面中,可以基于一个或一个以上生物或生理途径的异常,包括与途径相关的一个或一个以上基因的异常表达、或者与途径相关的一个或一个以上基因所编码一个或一个以上蛋白质的异常表达选择用于治疗的受试者或者患者。在仍进一步的方面中,可以基于miRNA表达或生物或生理途径异常两者选择受试者或者患者。可以基于对miRNA或mRNA表达或其缺乏的评定和/或分析,评估受试者对治疗或者治疗方案的敏感性、抗性和/或疗效。可以在向受试者或者患者施用一种治疗之前、之中或之后评估受试者对该治疗的可治疗性。有代表性地,评定或评估可以通过分析miRNA和/或mRNA,联合其他评估方法,包括但不限于组织学、免疫组织化学、血液学工作等开展。
在一些实施方案中,传染性疾病或状况包括细菌、病毒、寄生虫或真菌感染。这些基因和途径中许多与多种癌症和其他疾病相关。癌性状况包括,但不限于星形细胞瘤、急性髓性白血病、乳腺癌、膀胱癌、宫颈癌、结直肠癌、子宫内膜癌、食管鳞状细胞癌、神经胶质瘤、成胶质细胞瘤、胃癌、肝细胞癌、霍奇金淋巴瘤、白血病、脂肪瘤、黑素瘤、套细胞淋巴瘤、粘液纤维肉瘤、多发性骨髓瘤、神经母细胞瘤、非霍奇金淋巴瘤、肺癌、非小细胞肺癌、卵巢癌、食管癌、骨肉瘤、胰腺癌、前列腺癌、头颈部鳞状细胞癌、甲状腺癌、尿路上皮癌,其中对一个或一个以上基因的调节足以引起治疗反应。有代表性地,癌性状况是与不受控生长或不经历细胞死亡,包括细胞凋亡相关的异常高增生性状况。
细胞中miR-20表达或功能的改变将导致这些关键基因表达的改变并促成了疾病或其他状况的发展。向疾病细胞或者组织或受试者中引入miR-20(用于其中miRNA被下调的疾病)或miR-20抑制剂(用于其中miRNA被上调的疾病)将产生治疗反应。本文提供了对受miR-20直接或间接调节的关键基因和与其相关的疾病的鉴定。在某些方面,细胞可以是上皮细胞、基质细胞或黏膜细胞。细胞可以是,但不限于脑细胞、神经元细胞、血液细胞、食管细胞、肺细胞、心血管细胞、肝细胞、乳腺细胞、骨细胞、甲状腺细胞、腺细胞、肾上腺细胞、胰细胞、胃细胞、肠细胞、肾细胞、膀胱细胞、前列腺细胞、子宫细胞、卵巢细胞、睾丸细胞、脾细胞、皮肤细胞、平滑肌细胞、心肌或横纹肌细胞。在某些方面,细胞、组织或靶标不应是miRNA表达缺陷性的,然而可以仍然治疗性响应miRNA的表达或过表达。miR-20可以用作任何这些疾病的治疗靶标。
细胞、组织或者受试者可以是癌症细胞、癌性组织、潜伏癌性组织,或者可以是诊断患有或者有危险发展成疾病或状况的受试者或者患者。在某些方面,癌症细胞是神经元细胞、神经胶质细胞、肺细胞、肝细胞、脑细胞、乳腺细胞、膀胱细胞、血液细胞、白血病细胞、结肠细胞、子宫内膜细胞、胃细胞、皮肤细胞、卵巢细胞、脂肪细胞、骨细胞、宫颈细胞、食管细胞、胰细胞、前列腺细胞、肾细胞或甲状腺细胞。在仍进一步的方面中,癌症包括,但不限于星形细胞瘤、急性髓性白血病、乳腺癌、膀胱癌、宫颈癌、结直肠癌、子宫内膜癌、食管鳞状细胞癌、神经胶质瘤、成胶质细胞瘤、胃癌、肝细胞癌、霍奇金淋巴瘤、白血病、脂肪瘤、黑素瘤、套细胞淋巴瘤、粘液纤维肉瘤、多发性骨髓瘤、神经母细胞瘤、非霍奇金淋巴瘤、肺癌、非小细胞肺癌、卵巢癌、食管癌、骨肉瘤、胰腺癌、前列腺癌、头颈部鳞状细胞癌、甲状腺癌、尿路上皮癌。
本发明实施方案包括调节细胞、组织或受试者中基因表达或生物或生理途径的方法,包括向细胞、组织或者受试者施用一定量分离的核酸或其模拟物,所述一定量分离的核酸或其模拟物包含足以调节受miR-20miRNA调节的一个或多个基因表达的miR-20核酸序列。“miR-20核酸序列”包括miR-20和本文所述相关序列的全长前体或加工的(即成熟的)序列,以及前体miRNA或其加工序列的5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29或更多个核苷酸,包括所有范围和它们之间的整数。在某些实施方案中,miR-20核酸序列包含全长加工miRNA序列并且被称为“miR-20全长加工核酸序列”。在仍进一步的方面中,miR-20核酸包含与SEQID NO:1至SEQ ID NO:269具有至少75、80、85、90、95、98、99或100%同源性的miR-20的至少5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25或50个核苷酸(包括所有范围和它们之间的整数)片段。在某些方面,会使用包括一些但并非全部所列miR-20家族成员的miRNA亚组。可以预期到的是一个或一个以上miR-20家族成员或miR-20miRNA会明确排除在本发明某些实施方案之外例如,在一个实施方案,仅包含SEQ IDNO:269的共有序列的序列包含在内,而所有其他miRNA排除在外。通用术语miR-20包括miR-20家族所有成员。miR-20家族的成熟序列包括hsa-miR-20a(MIMAT0000075,SEQ ID NO:1)、hsa-miR-20b(MIMAT0001413,SEQ ID NO:2)、age-miR-20(MIMAT0002676,SEQ ID NO:3)、bta-miR-20a(MIMAT0003527,SEQ ID NO:4)、bta-miR-20b(MIMAT0003796,SEQ ID NO:5)、dre-miR-20a(MIMAT0001786,SEQ ID NO:6)、dre-miR-20a*(MIMAT0003400,SEQ ID NO:7)、dre-miR-20b(MIMAT0001778,SEQ ID NO:8)、fru-miR-20(MIMAT0003083,SEQID NO:9)、gga-miR-20a(MIMAT0001111,SEQ ID NO:10)、gga-miR-20b(MIMAT0001411,SEQ ID NO:11)、ggo-miR-20(MIMAT0002662,SEQ IDNO:12)、lca-miR-20(MIMAT0002669,SEQ ID NO:13)、lla-miR-20(MIMAT0002718,SEQ ID NO:14)、mdo-miR-20(MIMAT0004169,SEQ IDNO:15)、mml-miR-20(MIMAT0002704,SEQ ID NO:16)、mmu-miR-20a(MIMAT0000529,SEQ ID NO:17)、mmu-miR-20b(MIMAT0003187,SEQ IDNO:18)、mne-miR-20(MIMAT0002725,SEQ ID NO:19)、ppa-miR-20(MIMAT0002683,SEQ ID NO:20)、ppy-miR-20(MIMAT0002690,SEQ IDNO:21)、ptr-miR-20(MIMAT0002697,SEQ ID NO:22)、rno-miR-20a(MIMAT0000602,SEQ ID NO:23)、rno-miR-20a*(MIMAT0000603,SEQ IDNO:24)、rno-miR-20b(MIMAT0003211,SEQ ID NO:25)、rno-miR-20b*(MIMAT0003212,SEQ ID NO:26)、sla-miR-20(MIMAT0002711,SEQ ID NO:27)、ssc-miR-20(MIMAT0002129,SEQ ID NO:28)、tni-miR-20(MIMAT0003084,SEQID NO:29)、xla-miR-20(MIMAT0001348,SEQ ID NO:30)、xtr-miR-20a(MIMAT0003669,SEQ ID NO:31)、xtr-miR-20a*(MIMAT0003670,SEQ ID NO:32)和/或xtr-miR-20b(MIMAT0003707,SEQ ID NO:33)。
miR-20家族的其他成员,如Sanger数据库所指定,包括age-miR-106a(MIMAT0002796,SEQ ID NO:63)、age-miR-106b(MIMAT0002761 SEQ IDNO:64)、age-miR-17-3p(MIMAT0002673 SEQ ID NO:65)、age-miR-17-5p(MIMAT0002672 SEQ ID NO:66)、age-miR-18(MIMAT0002674 SEQ ID NO:67)、age-miR-93(MIMAT0002762 SEQ ID NO:68)、bta-miR-106(MIMAT0003784 SEQID NO:69)、bta-miR-17-3p(MIMAT0003816 SEQ ID NO:70)、bta-miR-17-5p(MIMAT0003815 SEQ ID NO:71)、bta-miR-18a(MIMAT0003526 SEQ ID NO:72)、bta-miR-18b(MIMAT0003517 SEQ ID NO:73)、bta-miR-93(MIMAT0003837 SEQID NO:74)、dre-miR-17a(MIMAT0001777 SEQ ID NO:75)、dre-miR-17a*(MIMAT0003396 SEQ ID NO:76)、dre-miR-18a(MIMAT0001779 SEQ ID NO:77)、dre-miR-18b(MIMAT0001780 SEQ ID NO:78)、dre-miR-18b*(MIMAT0003397SEQ ID NO:79)、dre-miR-18c(MIMAT0001781 SEQ ID NO:80)、dre-miR-93(MIMAT0001810 SEQ ID NO:81)、fru-miR-17(MIMAT0002916 SEQ ID NO:82)、fru-miR-18(MIMAT0002918 SEQ ID NO:83)、gga-miR-106(MIMAT0001142 SEQID NO:84)、gga-miR-17-3p(MIMAT0001115 SEQ ID NO:85)、gga-miR-17-5p(MIMAT0001114 SEQ ID NO:86)、gga-miR-18a(MIMAT0001113 SEQ IDNO:87)、gga-miR-18b(MIMAT0001141 SEQ ID NO:88)、ggo-miR-106a(MIMAT0002795 SEQ ID NO:89)、ggo-miR-106b(MIMAT0002758 SEQ IDNO:90)、ggo-miR-17-3p(MIMAT0002659 SEQ ID NO:91)、ggo-miR-17-5p(MIMAT0002658 SEQ ID NO:92)、ggo-miR-18(MIMAT0002660 SEQ ID NO:93)、ggo-miR-93(MIMAT0002759 SEQ ID NO:94)、hsa-miR-106a(MIMAT0000103SEQ ID NO:95)、hsa-miR-106b(MIMAT0000680 SEQ ID NO:96)、hsa-miR-17-3p(MIMAT0000071 SEQ ID NO:97)、hsa-miR-17-5p(MIMAT0000070 SEQ IDNO:98)、hsa-miR-18a(MIMAT0000072 SEQ ID NO:99)、hsa-miR-18a*(MIMAT0002891 SEQ ID NO:100)、hsa-miR-18b(MIMAT0001412 SEQ IDNO:101)、hsa-miR-93(MIMAT0000093 SEQ ID NO:102)、lca-miR-17-3p(MIMAT0002666 SEQ ID NO:103)、lca-miR-17-5p(MIMAT0002665 SEQ IDNO:104)、lca-miR-18(MIMAT0002667 SEQ ID NO:105)、lla-miR-106b(MIMAT0002777 SEQ ID NO:106)、lla-miR-17-3p(MIMAT0002715 SEQ IDNO:107)、lla-miR-17-5p(MIMAT0002714 SEQ ID NO:108)、lla-miR-18(MIMAT0002716 SEQ ID NO:109)、lla-miR-93(MIMAT0002778 SEQ IDNO:110)、mdo-miR-17-3p(MIMAT0004166 SEQ ID NO:111)、mdo-miR-17-5p(MIMAT0004165 SEQ ID NO:112)、mdo-miR-18(MIMAT0004167 SEQ IDNO:113)、mdo-miR-93(MIMAT0004178 SEQ ID NO:114)、mml-miR-106a(MIMAT0002798 SEQ ID NO:115)、mml-miR-106b(MIMAT0002772 SEQ IDNO:116)、mml-miR-17-3p(MIMAT0002701 SEQ ID NO:117)、mml-miR-17-5p(MIMAT0002700 SEQ ID NO:118)、mml-miR-18(MIMAT0002702 SEQ IDNO:119)、mml-miR-93(MIMAT0002773 SEQ ID NO:120)、mmu-miR-106a(MIMAT0000385 SEQ ID NO:121)、mmu-miR-106b(MIMAT0000386 SEQ IDNO:122)、mmu-miR-17-3p(MIMAT0000650 SEQ ID NO:123)、mmu-miR-17-5p(MIMAT0000649 SEQ ID NO:124)、mmu-miR-18(MIMAT0000528 SEQ IDNO:125)、mmu-miR-93(MIMAT0000540 SEQ ID NO:126)、mne-miR-106a(MIMAT0002802 SEQ ID NO:127)、mne-miR-106b(MIMAT0002780 SEQ IDNO:128)、mne-miR-17-3p(MIMAT0002722 SEQ ID NO:129)、mne-miR-17-5p(MIMAT0002721 SEQ ID NO:130)、mne-miR-18(MIMAT0002723 SEQ IDNO:131)、mne-miR-93(MIMAT0002781 SEQ ID NO:132)、ppa-miR-106a(MIMAT0002797 SEQ ID NO:133)、ppa-miR-106b(MIMAT0002763SEQ IDNO:134)、ppa-miR-17-3p(MIMAT0002680 SEQ ID NO:135)、ppa-miR-17-5p(MIMAT0002679 SEQ ID NO:136)、ppa-miR-18(MIMAT0002681 SEQ IDNO:137)、ppa-miR-93(MIMAT0002764 SEQ ID NO:138)、ppy-miR-106a(MIMAT0002799 SEQ ID NO:139)、ppy-miR-106b(MIMAT0002766 SEQ IDNO:140)、ppy-miR-17-3p(MIMAT0002687 SEQ ID NO:141)、ppy-miR-17-5p(MIMAT0002686 SEQ ID NO:142)、ppy-miR-18(MIMAT0002688 SEQ IDNO:143)、ppy-miR-93(MIMAT0002767 SEQ ID NO:144)、ptr-miR-106a(MIMAT0002800 SEQ ID NO:145)、ptr-miR-106b(MIMAT0002769 SEQ IDNO:146)、ptr-miR-17-3p(MIMAT0002694 SEQ ID NO:147)、ptr-miR-17-5p(MIMAT0002693 SEQ ID NO:148)、ptr-miR-18(MIMAT0002695 SEQ IDNO:149)、ptr-miR-93(MIMAT0002770 SEQ ID NO:150)、rno-miR-106b(MIMAT0000825 SEQ ID NO:151)、rno-miR-17(MIMAT0000786 SEQ IDNO:152)、rno-miR-18(MIMAT0000787 SEQ ID NO:153)、rno-miR-93(MIMAT0000817 SEQ ID NO:154)、sla-miR-106a(MIMAT0002801 SEQ IDNO:155)、sla-miR-106b(MIMAT0002775 SEQ ID NO:156)、sla-miR-17-3p(MIMAT0002708 SEQ ID NO:157)、sla-miR-17-5p(MIMAT0002707 SEQ IDNO:158)、sla-miR-18(MIMAT0002709 SEQ ID NO:159)、sla-miR-93(MIMAT0002776 SEQ ID NO:160)、ssc-miR-106a(MIMAT0002118 SEQ IDNO:161)、ssc-miR-18(MIMAT0002161 SEQ ID NO:162)、tni-miR-17(MIMAT0002917 SEQ ID NO:163)、tni-miR-18(MIMAT0002919 SEQ IDNO:164)、xla-miR-18(MIMAT0001349 SEQ ID NO:165)、xla-miR-20(MIMAT0001348 SEQ ID NO:166)、xtr-miR-106(MIMAT0003583 SEQ IDNO:167)、xtr-miR-17-3p(MIMAT0003565 SEQ ID NO:168)、xtr-miR-17-5p(MIMAT0003564 SEQ ID NO:169)、xtr-miR-18a(MIMAT0003652 SEQ IDNO:170)、xtr-miR-18b(MIMAT0003706 SEQ ID NO:171)、xtr-miR-93a(MIMAT0003659 SEQ ID NO:172)、xtr-miR-93b(MIMAT0003660 SEQ IDNO:173)。
miR-20家族成员的茎-环序列包括hsa-mir-20a(MI0000076,SEQ ID NO:34)、hsa-mir-20b(MI0001519,SEQ ID NO:35)、age-mir-20,(MI0002980 SEQ IDNO:36)、bta-mir-20a(MI0004741 SEQ ID NO:37)、bta-mir-20b,(MI0005015 SEQID NO:38)、dre-mir-20a(MI0001907 SEQ ID NO:39)、dre-mir-20b(MI0001899SEQ ID NO:40)、fru-mir-20(MI0003443 SEQ ID NO:41)、gga-mir-20a(MI0001181SEQ ID NO:42)、gga-mir-20b(MI0001517 SEQ ID NO:43)、ggo-mir-20(MI0002968SEQ ID NO:44)、lca-mir-20(MI0002974 SEQ ID NO:45)、lla-mir-20(MI0003016SEQ ID NO:46)、mdo-mir-20(MI0005357 SEQ ID NO:47)、mml-mir-20(MI0003004 SEQ ID NO:48)、mmu-mir-20a(MI0000568 SEQ ID NO:49)、mmu-mir-20b(MI0003536 SEQ ID NO:50)、mne-mir-20(MI0003022 SEQ IDNO:51)、ppa-mir-20(MI0002986 SEQ ID NO:52)、ppy-mir-20(MI0002992 SEQ IDNO:53)、ptr-mir-20(MI0002998 SEQ ID NO:54)、rno-mir-20a(MI0000638 SEQ IDNO:55)、rno-mir-20b(MI0003554 SEQ ID NO:56)、sla-mir-20(MI0003010 SEQ IDNO:57)、ssc-mir-20(MI0002423 SEQ ID NO:58)、tni-mir-20(MI0003444 SEQ IDNO:59)、xla-mir-20(MI0001453 SEQ ID NO:60)、xtr-mir-20a(MI0004911 SEQ IDNO:61)、和xtr-mir-20b(MI0004961 SEQ ID NO:62)。
在更多方面,miR-20家族包括的茎-环序列被称为age-mir-106a(MI0003099SEQ ID NO:174)、age-mir-106b(MI0003062 SEQ ID NO:175)、age-mir-17(MI0002977 SEQ ID NO:176)、age-mir-18(MI0002978 SEQ ID NO:177)、age-mir-93(MI0003063 SEQ ID NO:178)、bta-mir-106(MI0005005 SEQ IDNO:179)、bta-mir-17(MI0005031 SEQ ID NO:180)、bta-mir-18a(MI0004740 SEQID NO:181)、bta-mir-18b(MI0004732 SEQ ID NO:182)、bta-mir-93(MI0005050SEQ ID NO:183)、dre-mir-17a-1(MI0001897 SEQ ID NO:184)、dre-mir-17a-2(MI0001898 SEQ ID NO:185)、dre-mir-18a(MI0001900 SEQ ID NO:186)、dre-mir-18b(MI0001901 SEQ ID NO:187)、dre-mir-18c(MI0001902 SEQ IDNO:188)、dre-mir-93(MI0001954 SEQ ID NO:189)、fru-mir-17-1(MI0003231 SEQID NO:190)、fru-mir-17-2(MI0003441 SEQ ID NO:191)、fru-mir-18(MI0003233SEQ ID NO:192)、gga-mir-106(MI0001210 SEQ ID NO:193)、gga-mir-17(MI0001184 SEQ ID NO:194)、gga-mir-18a(MI0001183 SEQ ID NO:195)、gga-mir-18b(MI0001209 SEQ ID NO:196)、ggo-mir-106a(MI0003096 SEQ IDNO:197)、ggo-mir-106b(MI0003059 SEQ ID NO:198)、ggo-mir-17(MI0002965SEQ ID NO:199)、ggo-mir-18(MI0002966 SEQ ID NO:200)、ggo-mir-93(MI0003060 SEQ ID NO:201)、hsa-mir-106a(MI0000113 SEQ ID NO:202)、hsa-mir-106b(MI0000734 SEQ ID NO:203)、hsa-mir-17(MI0000071 SEQ IDNO:204)、hsa-mir-18a(MI0000072 SEQ ID NO:205)、hsa-mir-18b(MI0001518 SEQID NO:206)、hsa-mir-93(MI0000095 SEQ ID NO:207)、lca-mir-17(MI0002971SEQ ID NO:208)、lca-mir-18(MI0002972 SEQ ID NO:209)、lla-mir-106b(MI0003078 SEQ ID NO:210)、lla-mir-17(MI0003013 SEQ ID NO:211)、lla-mir-18(MI0003014 SEQ ID NO:212)、lla-mir-93(MI0003079 SEQ ID NO:213)、mdo-mir-17(MI0005354 SEQ ID NO:214)、mdo-mir-18(MI0005355 SEQ IDNO:215)、mdo-mir-93(MI0005369 SEQ ID NO:216)、mml-mir-106a(MI0003107SEQ ID NO:217)、mml-mir-106b(MI0003073 SEQ ID NO:218)、mml-mir-17(MI0003001 SEQ ID NO:219)、mml-mir-18(MI0003002 SEQ ID NO:220)、mml-mir-93(MI0003074 SEQ ID NO:221)、mmu-mir-106a(MI0000406 SEQ IDNO:222)、mmu-mir-106b(MI0000407 SEQ ID NO:223)、mmu-mir-17(MI0000687SEQ ID NO:224)、mmu-mir-18(MI0000567 SEQ ID NO:225)、mmu-mir-93(MI0000581 SEQ ID NO:226)、mne-mir-106a(MI0003120 SEQ ID NO:227)、mne-mir-106b(MI0003081 SEQ ID NO:228)、mne-mir-17(MI0003019 SEQ IDNO:229)、mne-mir-18(MI0003020 SEQ ID NO:230)、mne-mir-93(MI0003082 SEQID NO:231)、ppa-mir-106a(MI0003102 SEQ ID NO:232)、ppa-mir-106b(MI0003064 SEQ ID NO:233)、ppa-mir-17(MI0002983 SEQ ID NO:234)、ppa-mir-18(MI0002984 SEQ ID NO:235)、ppa-mir-93(MI0003065 SEQ IDNO:236)、ppy-mir-106a(MI0003109 SEQ ID NO:237)、ppy-mir-106b(MI0003067SEQ ID NO:238)、ppy-mir-17(MI0002989 SEQ ID NO:239)、ppy-mir-18(MI0002990 SEQ ID NO:240)、ppy-mir-93(MI0003068 SEQ ID NO:241)、ptr-mir-106a(MI0003112 SEQ ID NO:242)、ptr-mir-106b(MI0003070 SEQ IDNO:243)、ptr-mir-17(MI0002995 SEQ ID NO:244)、ptr-mir-18(MI0002996 SEQ IDNO:245)、ptr-mir-93(MI0003071 SEQ ID NO:246)、rno-mir-106b(MI0000889 SEQID NO:247)、rno-mir-17(MI0000845 SEQ ID NO:248)、rno-mir-18(MI0000846SEQ ID NO:249)、rno-mir-93(MI0000880 SEQ ID NO:250)、sla-mir-106a(MI0003115 SEQ ID NO:251)、sla-mir-106b(MI0003076 SEQ ID NO:252)、sla-mir-17(MI0003007 SEQ ID NO:253)、sla-mir-18(MI0003008 SEQ IDNO:254)、sla-mir-93(MI0003077 SEQ ID NO:255)、ssc-mir-106a(MI0002412 SEQID NO:256)、ssc-mir-18(MI0002455 SEQ ID NO:257)、tni-mir-17-1(MI0003232SEQ ID NO:258)、tni-mir-17-2(MI0003442 SEQ ID NO:259)、tni-mir-18(MI0003234 SEQ ID NO:260)、xla-mir-18(MI0001454 SEQ ID NO:261)、xtr-mir-106(MI0004822 SEQ ID NO:262)、xtr-mir-17(MI0004803 SEQ IDNO:263)、xtr-mir-18a(MI0004893 SEQ ID NO:264)、xtr-mir-18b(MI0004959 SEQID NO:265)、xtr-mir-93a(MI0004900 SEQ ID NO:266)、和xtr-mir-93b(MI0004901SEQ ID NO:267)。通常,miR-20家族具有共有序列(如使用核苷酸的WIPO标准命名所描述)SUGCWNHNNRKGYASNU SEQ ID NO:268,具体而言,命名为miR-20s的miR-20家族成员包含共有序列YAAAGUGCUYAYAGUGCAGGUSEQ ID NO:269。
在特别的实施方案中,包含miR-20的核酸或者miR-20核酸是hsa-miR-20a和/或hsa-miR-20b或其变体。在某些方面中,miR-20是miR-20a或miR-20b。miR-20可以是hsa-mir-20,包括hsa-miR-20a或hsa-miR20b。在进一步的方面中,miR-20核酸可以与1、2、3、4、5、6、7、8、9、10或更多个miRNA一起施用。miRNA可以并行施用、顺序施用或者以安排的进程施用。在某些方面,miR-20可以与let-7、miR-15a、miR-16、miR-21、miR-26a、miR-31、miR-34a、miR-126、miR-143、miR-145、miR-147、miR-188、miR-200b、miR-200c、miR-215、miR-216、miR-292-3p和/或miR-331中一个或一个以上联合施用。miRNA的全部或组合可以在单一制剂中施用。施用可以在第二治疗法之前、之中或之后。
miR-20核酸还可以包括多个异源核酸序列,即通常在自然界不能发现的有效连接miR-20的那些序列,例如启动子、增强子等。miR-20核酸可以是重组核酸,并且可以是核糖核酸或脱氧核糖核酸。重组核酸可包含miR-20表达盒,即当导入包含核酸合成成分的环境中时表达核酸的核酸片段。在进一步的方面中,表达盒包含在病毒载体、或质粒DNA载体或其他治疗性核酸载体或递送运载体,包括脂质体等等之中。在某些方面,病毒载体可以以1×102、1×103、1×104、1×105、1×106、1×107、1×108、1×109、1×1010、1×1011、1×1012、1×1013、1×1014pfu或病毒颗粒(vp)施用。
在特定方面中,miR-20核酸是合成的核酸。此外,本发明核酸可以是完全合成或部分合成。在仍进一步的方面中,本发明核酸或编码其的DNA可以以0.001、0.01、0.1、1、10、20、30、40、50、100、200、400、600、800、1000、2000至4000μg或mg施用,包括它们之间的所有数值和范围。在仍然进一步的方面中,本发明核酸,包括合成的核酸,可以以0.001、0.01、0.1、1、10、20、30、40、50、100至200μg或mg每千克(kg)体重施用。其中所述的每一种量可以在一段时间内施用,包括0.5、1、2、3、4、5、6、7、8、9、10分钟、小时、天、周、月或年,包括它们之间的所有数值和范围。
在某些实施方案中,组合物的施用可以是肠内的或肠胃外的。在某些方面,肠内施用是口服。在更多方面中,肠胃外施用是病损部位内、血管内、颅内、胸膜内、瘤内、腹膜内、肌内、淋巴内、腺内、皮下、局部、支气管内、气管内、鼻内、吸入或滴注。本发明组合物可区域施用或局部施用并且没必要直接施用入病损部位内。
在某些方面,受调节的一个基因或多个基因包含表1、3、4和5中鉴定的1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、20、25、30、35、40、45、50、100、150、200或更多个基因或基因组合。在仍进一步的方面中,受调节的一个基因或多个基因可排除表1、3、4和5中鉴定的1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、20、25、30、35、40、45、50、100、150、175或更多个基因或基因组合。调节包括调节细胞、组织或器官中的转录、mRNA水平、mRNA翻译和/或蛋白质水平。在某些方面,基因表达或基因产物水平,例如mRNA,被下调或上调。在特定方面中,被调节的基因包含或选自(并且可能甚至排除)表1、3、4和5中鉴定的1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28个或全部的基因或其任意组合。在某些实施方案中,被调节的或者被选择调节的基因来自表1。在进一步的实施方案中,被调节的或者被选择调节的基因来自表3。在仍进一步的实施方案中,被调节的或者被选择调节的基因来自表4。在仍然进一步的实施方案中,被调节的或者被选择调节的基因来自表5。本发明实施方案还可以包括,在选择治疗模式,例如施用miR-20核酸或模拟物之前,得到或评估靶细胞的基因表达谱或miRNA谱。与通过登录号或者数据库提交号所命名的核酸和基因有关的数据库内容,从本申请的提交日起通过参考并入本文。在本发明的某些方面,一个或一个以上miRNA可以调节单一基因。在进一步的方面中,在一个或一个以上遗传途径、细胞途径或生理途径中的一个或一个以上基因可以被一个或一个以上miRNA,包括与其他miRNA组合的miR-20核酸调节。
表1.用pre-miR hsa-miR-20a转染人癌症细胞后增加表达(正值)或降低表达(负值)的基因
  基因符号   RefSeq转录物ID(Pruitt等,2005)   log2
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本发明的进一步的实施方案涉及调节细胞途径的方法,包括向细胞施用一定量的分离的核酸,所述分离的核酸包含miR-20核酸序列,所述miR-20核酸序列的量足以调节细胞途径,特别是表2所述那些途径或者已知包括表1、3、4和/或5中一个或一个以上基因的途径的表达、功能、状况或状态。细胞途径的调节包括,但不限于调节一个或一个以上基因的表达。基因调节可包括抑制内源miRNA的功能或者向细胞、组织或者受试者提供功能性miRNA。调节指基因或其相关基因产物(例如mRNA)或蛋白质的表达水平或活性,例如mRNA水平可以被调节,或者mRNA翻译可以被调节。调节可以增加或者上调基因或基因产物,或者其可以降低或下调基因或基因产物(例如蛋白质水平或活性)。
仍然进一步的实施方案包括施用miRNA或其模拟物和/或治疗患有、怀疑患有或者有危险发展成病理状况的受试者或者患者的方法,包括下列一个或一个以上步骤(a)向患者或受试者施用一定量的分离的核酸,所述一定量的分离的核酸包含足以调节细胞途径表达的量的miR-20核酸序列;和(b)施用第二治疗法,其中细胞途径的调节使患者或受试者对第二治疗法敏感或者提高第二治疗法的疗效。疗效提高可以包括降低第二治疗法的毒性、剂量或持续时间,或者有加性效应或协同效应。细胞途径可包括,但不限于下表2中所述的一个或一个以上途径,或者已知包括表1、3、4和/或5中一个或一个以上基因的途径。第二治疗法可以在分离的核酸或miRNA施用之前、之中和/或之后施用。
第二治疗法可以包括施用第二miRNA或治疗性核酸,例如siRNA或反义寡核苷酸,或可以包括多种标准治疗法,例如药物、化学治疗、放射治疗、药物治疗、免疫治疗等。本发明实施方案还可以包括确定或评估基因表达或基因表达谱,用于选择适当治疗法。在特定方面中,第二治疗法是化学治疗。化学治疗可包括,但不限于紫杉醇、顺铂、碳铂、阿霉素、草酸铂、larotaxel、红豆杉醇、拉帕替尼、多西他塞(docetaxel)、甲氨蝶呤、卡培他滨(capecitabine)、长春瑞滨、环磷酰胺、吉西他滨、氨柔比星、阿糖胞苷、依托泊苷(etoposide)、喜树碱、地塞米松、达沙替尼、替吡法尼、贝伐单抗(bevacizumab)、西罗莫司、西罗莫司脂化物、依维莫司、洛那法尼、西妥昔单抗、埃罗替尼、吉非替尼、甲磺酸伊马替尼、利妥昔单抗、曲妥珠单抗、洛可达唑(nocodazole)、索拉非尼、舒尼替尼、硼替佐米、阿仑单抗、吉妥单抗、托西莫单抗或替伊莫单抗。
本发明实施方案包括治疗患有疾病或状况的受试者的方法,包括下列一个或一个以上步骤(a)确定选自表1、3、4和/或5的一个或一个以上基因的表达谱;(b)基于表达谱评估受试者对治疗法的敏感性;(c)基于所评估的敏感性选择治疗法;和(d)使用所选择的治疗法治疗受试者。有代表性地,疾病或状况将具有作为成分的指示物,或者出现表1、3、4和/或5的一个或一个以上基因的误调节。
在某些方面,2、3、4、5、6、7、8、9、10或更多个miRNA可以顺序使用或者组合使用。例如,可以基于观察两个给定miRNA是否共享在特定疾病或状况中被改变的、表1,2,4和5所列一组靶基因或途径,选择miR-20与另一miRNA的任意组合。该两个miRNA可以导致治疗改善(例如毒性降低、效果更大、延长缓解时间或者受试者状况的其他改善)、效果增强、出现提供额外或改良治疗反应的加性效应或协同效应。不希望被任何特定理论所束缚,两个miRNA的协同作用是更有效地调节同一些基因或相关基因(通过共同的途径或生物学最终结果)的结果(例如源于同一靶标或相关靶标上不同的结合位点)和/或调节不同基因的结果,但是在一些特定疾病或状况中已经涉及所有这些。
在某些方面,miR-20和let-7可以向患有以下疾病的患者施用:急性髓性白血病、乳腺癌、膀胱癌、宫颈癌、结直肠癌、子宫内膜癌、神经胶质瘤、成胶质细胞瘤、胃癌、肝细胞癌、霍奇金淋巴瘤、白血病、黑素瘤、粘液纤维肉瘤、多发性骨髓瘤、神经母细胞瘤、非霍奇金淋巴瘤、非小细胞肺癌、卵巢癌、食管癌、胰腺癌、前列腺癌、头颈部鳞状细胞癌、甲状腺癌或尿路上皮癌。
进一步的方面包括向患有以下疾病的患者施用miR-20和miR-15:星形细胞瘤、急性髓性白血病、乳腺癌、膀胱癌、宫颈癌、结直肠癌、子宫内膜癌、神经胶质瘤、成胶质细胞瘤、胃癌、肝细胞癌、霍奇金淋巴瘤、黑素瘤、套细胞淋巴瘤、粘液纤维肉瘤、多发性骨髓瘤、神经母细胞瘤、非霍奇金淋巴瘤、非小细胞肺癌、卵巢癌、食管癌、骨肉瘤、胰腺癌、前列腺癌、头颈部鳞状细胞癌或甲状腺癌。
在仍进一步的方面中,向患有以下疾病的患者施用miR-20和miR-16:星形细胞瘤、乳腺癌、膀胱癌、结直肠癌、子宫内膜癌、成胶质细胞瘤、胃癌、肝细胞癌、霍奇金淋巴瘤、黑素瘤、套细胞淋巴瘤、粘液纤维肉瘤、多发性骨髓瘤、非小细胞肺癌、卵巢癌、食管癌、胰腺癌、前列腺癌、头颈部鳞状细胞癌或甲状腺癌。
本发明方面包括向患有以下疾病的患者施用miR-20和miR-21的方法:星形细胞瘤、急性髓性白血病、乳腺癌、膀胱癌、结直肠癌、子宫内膜癌、神经胶质瘤、成胶质细胞瘤、胃癌、肝细胞癌、黑素瘤、套细胞淋巴瘤、神经母细胞瘤、非小细胞肺癌、卵巢癌、食管癌、胰腺癌、前列腺癌或头颈部鳞状细胞癌。
在仍进一步的方面中,向患有以下疾病的患者施用miR-20和miR-26a:急性髓性白血病、乳腺癌、膀胱癌、宫颈癌、结直肠癌、神经胶质瘤、成胶质细胞瘤、胃癌、肝细胞癌、白血病、黑素瘤、多发性骨髓瘤、神经母细胞瘤、非霍奇金淋巴瘤、非小细胞肺癌、卵巢癌、食管癌、骨肉瘤、胰腺癌或前列腺癌的患者。
在仍然进一步的方面中,向患有星形细胞瘤、急性髓性白血病、乳腺癌、膀胱癌、宫颈癌、结直肠癌、子宫内膜癌、神经胶质瘤、成胶质细胞瘤、胃癌、肝细胞癌、霍奇金淋巴瘤、白血病、黑素瘤、套细胞淋巴瘤、多发性骨髓瘤、非霍奇金淋巴瘤、非小细胞肺癌、卵巢癌、食管癌、骨肉瘤、胰腺癌、前列腺癌、头颈部鳞状细胞癌、甲状腺癌或尿路上皮癌的患者施用miR-20和miR-34a。
在某些方面,向患有星形细胞瘤、急性髓性白血病、乳腺癌、膀胱癌、宫颈癌、结直肠癌、子宫内膜癌、神经胶质瘤、成胶质细胞瘤、胃癌、肝细胞癌、霍奇金淋巴瘤、白血病、黑素瘤、套细胞淋巴瘤、非霍奇金淋巴瘤、非小细胞肺癌、卵巢癌、食管癌、骨肉瘤、胰腺癌、前列腺癌、头颈部鳞状细胞癌或甲状腺癌的患者施用miR-20和miR-126。
在进一步的方面中,向患有星形细胞瘤、急性髓性白血病、乳腺癌、膀胱癌、宫颈癌、结直肠癌、子宫内膜癌、神经胶质瘤、成胶质细胞瘤、胃癌、肝细胞癌、霍奇金淋巴瘤、白血病、黑素瘤、套细胞淋巴瘤、多发性骨髓瘤、非霍奇金淋巴瘤、非小细胞肺癌、卵巢癌、食管癌、骨肉瘤、胰腺癌、前列腺癌、头颈部鳞状细胞癌或甲状腺癌的患者施用miR-20和miR-143。
在仍进一步的方面中,向患有星形细胞瘤、乳腺癌、膀胱癌、宫颈癌、结直肠癌、子宫内膜癌、食管鳞状细胞癌、神经胶质瘤、成胶质细胞瘤、胃癌、肝细胞癌、霍奇金淋巴瘤、白血病、脂肪瘤、黑素瘤、套细胞淋巴瘤、粘液纤维肉瘤、多发性骨髓瘤、非霍奇金淋巴瘤、非小细胞肺癌、卵巢癌、食管癌、骨肉瘤、胰腺癌、前列腺癌、头颈部鳞状细胞癌或甲状腺癌的患者施用miR-20和miR-147。
仍然在另一方面,向患有星形细胞瘤、急性髓性白血病、乳腺癌、膀胱癌、宫颈癌、结直肠癌、子宫内膜癌、食管鳞状细胞癌、神经胶质瘤、成胶质细胞瘤、胃癌、肝细胞癌、白血病、黑素瘤、多发性骨髓瘤、非霍奇金淋巴瘤、非小细胞肺癌、卵巢癌、食管癌、胰腺癌、前列腺癌、头颈部鳞状细胞癌或甲状腺癌的患者施用miR-20和miR-188。
在更多方面,向患有星形细胞瘤、急性髓性白血病、乳腺癌、膀胱癌、宫颈癌、结直肠癌、子宫内膜癌、食管鳞状细胞癌、神经胶质瘤、成胶质细胞瘤、胃癌、肝细胞癌、霍奇金淋巴瘤、白血病、脂肪瘤、黑素瘤、套细胞淋巴瘤、粘液纤维肉瘤、多发性骨髓瘤、神经母细胞瘤、非霍奇金淋巴瘤、非小细胞肺癌、卵巢癌、食管癌、骨肉瘤、胰腺癌、前列腺癌、头颈部鳞状细胞癌、甲状腺癌或尿路上皮癌的患者施用miR-20和miR-215。
在某些方面,向患有星形细胞瘤、乳腺癌、宫颈癌、结直肠癌、子宫内膜癌、神经胶质瘤、成胶质细胞瘤、胃癌、肝细胞癌、霍奇金淋巴瘤、白血病、非霍奇金淋巴瘤、非小细胞肺癌、卵巢癌、食管癌、骨肉瘤、前列腺癌或头颈部鳞状细胞癌的患者施用miR-20和miR-216。
在进一步的方面中,向患有星形细胞瘤、急性髓性白血病、乳腺癌、膀胱癌、宫颈癌、结直肠癌、子宫内膜癌、神经胶质瘤、成胶质细胞瘤、胃癌、肝细胞癌、白血病、脂肪瘤、黑素瘤、粘液纤维肉瘤、多发性骨髓瘤、神经母细胞瘤、非霍奇金淋巴瘤、非小细胞肺癌、卵巢癌、食管癌、骨肉瘤、胰腺癌、前列腺癌、头颈部鳞状细胞癌、甲状腺癌或尿路上皮癌的患者施用miR-20和miR-292-3p。
在仍进一步的方面中,向患有星形细胞瘤、急性髓性白血病、乳腺癌、膀胱癌、宫颈癌、结直肠癌、子宫内膜癌、神经胶质瘤、成胶质细胞瘤、胃癌、肝细胞癌、白血病、黑素瘤、粘液纤维肉瘤、多发性骨髓瘤、神经母细胞瘤、非霍奇金淋巴瘤、卵巢癌、食管癌、骨肉瘤、胰腺癌、前列腺癌、头颈部鳞状细胞癌或甲状腺癌的患者施用miR-20和miR-331。
在仍然进一步的方面中,向患有乳腺癌、宫颈癌、结直肠癌、神经胶质瘤、成胶质细胞瘤、胃癌、肝细胞癌、白血病、脂肪瘤、多发性骨髓瘤、非小细胞肺癌、卵巢癌、食管癌、骨肉瘤、胰腺癌、前列腺癌、头颈部鳞状细胞癌或甲状腺癌的患者施用miR-20和miR-200b/c。
可以预期到的是当miR-20与一种或一种以上其他miRNA分子组合施用时,两种不同miRNA可以同时施用或者相继施用。在一些实施方案中,治疗以一种miRNA进行,并且在治疗1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、15、20、25、30、35、40、45、50、55分钟、1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24小时、1、2、3、4、5、6、7天、1、2、3、4、5周、或者1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11或12个月或者任意此类组合之后紧接着用其他miRNA治疗。
更多实施方案包括鉴定和评估指示细胞或组织中miR-20状态的表达谱,包括来自表1、3、4和/或5的一个或一个以上基因或者其任意组合的表达评估。
术语“miRNA”依照其普通的和显然的含义使用并且指在真核生物中存在的、涉及基于RNA的基因调节的微RNA分子。见,例如Carrington等,2003,其通过参考并入本文。术语可以指从前体加工而来的单链RNA分子或者在某些情况下指其前体本身或者其模拟物。
在一些实施方案中,知道细胞是否内源性表达特定miRNA或者此种表达是否在特定情况下受影响或者何时其处于特定疾病状态是有用的。因此,在本发明的一些实施方案中,方法包括测定细胞或者包含细胞的样品中指示目的基因表达水平的一个或一个以上miRNA标志基因或mRNA或其他分析物的存在。因此,在一些实施方案中,方法包括产生样品RNA谱的步骤。术语“RNA谱”或“基因表达谱”指关于样品中一个或一个以上基因或遗传标记表达模式的一组信息(例如鉴定来自表1、3、4和/或5的一个或一个以上标记或基因的多个核酸探针);可以预期到的是核酸谱可以使用一组RNA、使用例如本领域普通技术人员众所周知的核酸扩增或杂交技术得到。患者样品中的表达谱与参照表达谱,例如来自正常或者非病理样品的表达谱或者数字化参照之间的差异指示着病理、疾病或癌性状况。在某些方面,表达谱是发展成此种状况之倾向或可能性的指示物(即,疾病或状况的危险因素)。此种危险性或倾向性指示着进行治疗、增加监控、预防措施等等。核酸或探针组可以包含或鉴定相应mRNA的片段,并且可以包括表1、3、4和/或5所列的或者通过本文所述方法鉴定的基因或遗传标记或核酸、mRNA或其代表性探针的全部或者1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、31、32、33、34、35、36、37、38、39、40、41、42、43、44、45、46、47、48、49、50、51、52、53、54、55、56、57、58、59、60、61、62、100、200、500或更多个片段,包括可以从它们当中导出的任何整数或范围的部分。
本发明的某些实施方案涉及用于评估、预测或治疗患者中病理状况的组合物和方法,包括测量或确定患者样品中一个或一个以上miRNA或标记的表达谱,其中患者样品的表达谱与正常样品的表达谱或参照表达谱之间的差异指示着病理状态和特定癌症。在本发明的某些方面,miRNA、细胞途径、基因或遗传标记是或代表着表1、2、3、4和/或5中所述一个或一个以上途径或标记,包括它们的任意组合。
本发明的方面包括诊断、评估或治疗病理状况或者预防病理状况出现症状。例如,可以使用方法筛选病理状况;评估病理状况的预后;将病理状况分级;评估病理状况对治疗的反应;或作为第一治疗调节一个基因、多个基因或相关途径的表达或者使受试者对第二治疗法更敏感或更易反应。在特定方面,评估患者的病理状况可以评估患者的预后。预后可包括,但不限于估算存活时间或期望存活时间,评估对治疗法的反应等。在某些方面,一个或一个以上基因或标记的改变表达预示着患者具有病理状况的,其中标记是表1、3、4和/或5中的一个或一个以上,包括其任意组合。
表2.在人癌细胞中过表达hsa-miR-20a之后显著改变的功能性细胞途径
  基因数量   途径功能
  17   细胞运动,细胞生长和增殖,心血管系统发育和功能
14   细胞形态学,心血管系统发育和功能,细胞与细胞的信号转导和相互作用
  13   内分泌系统素乱,小分子生物化学,免疫应答
  13   心血管系统发育和功能,组织形态学,遗传病
  12   脂类代谢,分子转运,小分子生物化学
  9   发育障碍,肿瘤形态学,癌症
  1   细胞信号转导,分子转运,神经疾病
  1   癌症,细胞周期,骨骼和肌肉障碍
表3.预测的hsa-miR-20a靶基因
基因符号   RefSeq转录物ID 描述
  (Pruitt等,2005)
  76P   NM_014444  γ微管蛋白环复合体蛋白质(76p基因)
  A1BG   NM_130786   α1B-糖蛋白
  A2ML1   NM_144670   α-2-巨球蛋白样蛋白1
  AADAC   NM_001086   芳基乙酰胺脱乙酰酶
  AADACL1   NM_020792   芳基乙酰胺脱乙酰酶样蛋白1
  AADAT   NM_016228   α-氨基己二酸氨基转移酶
  AARSL   NM_020745   丙氨酰-tRNA合成酶样
  ABAT   NM_000663   4-氨基丁酸氨基转移酶前体
  ABCA1   NM_005502   ATP-结合盒,亚家族A成员1
  ABCA10   NM_080282   ATP-结合盒,亚家族A,成员10
  ABCB9   NM_019624   ATP-结合盒,亚家族B(MDR/TAP),
  ABCC13   NM_172024   ATP-结合盒蛋白质C13同种型b
  ABCC5   NM_005688   ATP-结合盒,亚家族C,成员5
  ABCD2   NM_005164   ATP-结合盒,亚家族D,成员2
  ABCE1   NM_002940   ATP-结合盒,亚家族E,成员1
  ABCG2   NM_004827   ATP-结合盒,亚家族G,成员2
  ABCG4   NM_022169   ATP-结合盒,亚家族G,成员4
  ABHD11   NM_031295   含自水解酶结构域11同种型4
  ABHD13   NM_032859   假定蛋白LOC84945
  ABHD2   NM_007011   含α/β水解酶结构域蛋白质
  ABHD4   NM_022060   含自水解酶结构域4
  ABI1   NM_001012750   abl结合因子1同种型b
  ABL1   NM_005157   v-abl埃布尔森鼠白血病病毒癌基因
  ABLIM1   NM_001003407   肌动蛋白结合LIM蛋白质1同种型b
  ABR   NM_001092   活性断裂点丛集区相关
  ABT1   NM_013375   基本转录激活物1
  ABTB1   NM_032548   锚蛋白重复和含BTB(POZ)结构域1
  ACAD8   NM_014384   酰基辅酶A脱氢酶家族,成员8
  ACADSB   NM_001609   酰基辅酶A脱氢酶,短/分枝的
  ACIN1   NM_014977   细胞凋亡染色体凝聚诱导物1
  ACPL2   NM_152282   酸性磷酸酶样蛋白2
  ACPP   NM_001099   前列腺酸性磷酸酶前体
  ACSL1   NM_001995   酰基辅酶合成酶长链家族成员1
  ACSL4   NM_004458   酰基辅酶合成酶长链家族成员4
  ACSM1   NM_052956   酰基辅酶合成酶中链家族成员
  ACTR2   NM_001005386   肌动蛋白相关蛋白2同种型a
  ACVR1B   NM_004302   激活素A类型IB受体同种型a前体
  ADAM19   NM_033274   ADAM金属肽酶结构域19同种型2
  ADAM21   NM_003813   ADAM金属肽酶结构域21前蛋白原
  ADAM33   NM_025220   ADAM金属肽酶结构域33同种型α
  ADAM9   NM_001005845   ADAM金属肽酶结构域9同种型2
ADAMTS3 NM_014243   具有血小板反应蛋白的ADAM金属肽酶类型1
ADAMTS5 NM_007038   具有血小板反应蛋白的ADAM金属肽酶类型1
  ADAMTSL2   NM_014694   ADAMTS样蛋白2
  ADAMTSL5   NM_213604   含血小板反应蛋白,类型I,结构域6
  ADAR   NM_001025107   腺苷脱氨酶,RNA-特异性同种型d
  ADARB1   NM_001033049   RNA-特异性腺苷脱氨酶B1同种型4
  ADAT1   NM_012091   腺苷脱氨酶,tRNA-特异性1
  ADCY1   NM_021116   脑腺苷酸环化酶1
  ADCY6   NM_015270   腺苷酸环化酶6同种型a
  ADCY9   NM_001116   腺苷酸环化酶9
  ADD1   NM_001119   内收蛋白1(α)同种型a
  ADHFE1   NM_144650   乙醇脱氢酶,含铁,1
  ADIPOR2   NM_024551   脂连蛋白受体2
  ADM2   NM_024866   肾上腺髓质素2前体
  ADORA2B   NM_000676   腺苷A2b受体
  ADPN   NM_025225   脂肪营养蛋白
  ADPRHL2   NM_017825   ADP-核糖基水解酶样蛋白2
  ADRA1B   NM_000679   α-1B-肾上腺素能受体
  ADRA2A   NM_000681   α-2A-肾上腺素能受体
  ADRA2B   NM_000682   α-2B-肾上腺素能受体
  ADRB3   NM_000025   肾上腺素能,β-3-,受体
  ADSL   NM_000026   腺苷琥珀酸裂解酶
  AEBP2   NM_153207   AE结合蛋白2
  AFAR3   NM_201252   黄曲霉毒素B1醛还原酶3
  AFF1   NM_005935   髓/淋巴或混合谱系白血病
  AFF2   NM_002025   脆性X智力低下2
  AFF4   NM_014423   来自5q31的ALL1融合基因
  AGA   NM_000027   天冬氨酰氨基葡糖苷酶前体
  AGBL2   NM_024783   ATP/GTP结合蛋白质样蛋白2
  AGGF1   NM_018046   血管生成因子VG5Q
  AGPAT4   NM_001012733   1-酰基甘油-3-磷酸O-酰基转移酶4
  AGPAT5   NM_018361   1-酰基甘油-3-磷酸O-酰基转移酶5
  AGTPBP1   NM_015239   ATP/GTP结合蛋白1
  AGTR2   NM_000686   血管紧张素II受体,类型2
  AGXT2L1   NM_031279   丙氨酸-乙醛酸氨基转移酶2样蛋白1
  AHCTF1   NM_015446   转录因子ELYS
  AHCY   NM_000687   S-腺苷高半胱氨酸水解酶
  AHI1   NM_017651   Jouberin
  AHNAK   NM_001620   AHNAK核蛋白同种型1
  AICDA   NM_020661   活化诱导胞苷脱氨酶
  AIM1   NM_001624   黑素瘤缺乏1
  AIPL1   NM_001033054   芳烃受体相互作用
  AJAP1   NM_018836   跨膜蛋白质SHREW1
  AK1   NM_000476   腺苷酸激酶1
  AK5   NM_012093   腺苷酸激酶5同种型2
  AKAP11   NM_016248   A-激酶锚定蛋白11同种型1
  AKAP13   NM_006738   A-激酶锚定蛋白13同种型1
  AKAP6   NM_004274   A-激酶锚定蛋白6
  AKAP9   NM_005751   A-激酶锚定蛋白9同种型2
  AKR1D1   NM_005989   醛-酮还原酶家族1,成员D1
  AKR7A2   NM_003689   醛-酮还原酶家族7,成员A2
  AKT3   NM_005465   v-akt鼠胸腺瘤病毒癌基因同系物3
  ALDH1A3   NM_000693   醛脱氢酶1A3
  ALDH3A2   NM_000382   醛脱氢酶3A2同种型2
  ALDH3B1   NM_000694   醛脱氢酶3B1同种型a
  ALDH8A1   NM_022568   醛脱氢酶8A1同种型1
  ALDH9A1   NM_000696   醛脱氢酶9A1
  ALDOC   NM_005165   果糖-二磷酸醛缩酶C
  ALKBH4   NM_017621   假定蛋白LOC54784
  ALKBH5   NM_017758   假定蛋白LOC54890
  ALOX15B   NM_001141   花生四烯酸15-脂氧合酶,第二型
  ALPK1   NM_025144   α-激酶1
  ALPP   NM_001632   胎盘碱性磷酸酶前体
  ALS2CL   NM_147129   ALS2C-末端样同种型1
  ALS2CR13   NM_173511   肌萎缩性侧索硬化2(幼年)
  ALS2CR15   NM_138468   Ica69相关蛋白质
  ALS2CR19   NM_057177   肌萎缩性侧索硬化2(幼年)
  ALX4   NM_021926   无芒样同源框4
  AMELX   NM_001142   釉质形成素(X染色体)同种型1前体
  AMELY   NM_001143   釉质形成素(Y染色体)前体
  AMID   NM_032797   细胞凋亡-诱导因子(AIF)样蛋白
  AMIGO2   NM_181847   两性霉素(amphoterin)诱导的基因2
  AMMECR1   NM_001025580   AMMECR1蛋白质同种型2
  AMOTL1   NM_130847   血管动蛋白样蛋白1
  AMPD2   NM_004037   腺苷酸一磷酸脱氨酶2(同种型L)
  AMPD3   NM_000480   红细胞腺苷一磷酸脱氨酶
  AMZ1   NM_133463   古梅斯蛋白-1
  ANAPC11   NM_001002244   APC11后期促进复合体亚基11
  ANGEL1   NM_015305   angel同系物1
  ANGEL2   NM_144567   LOC90806蛋白质
  ANGPTL7   NM_021146   血管生成素样蛋白7
  ANK2   NM_001148   锚蛋白2同种型1
  ANKFY1   NM_016376   含锚蛋白重复和FYVE结构域1
  ANKH   NM_054027   关节强硬,进行性同系物
  ANKK1   NM_178510   含锚蛋白重复和激酶结构域1
  ANKRA2   NM_023039   锚蛋白重复,家族A(RFXANK样蛋白),2
  ANKRD10   NM_017664   锚蛋白重复结构域10
  ANKRD11   NM_013275   锚蛋白重复结构域11
  ANKRD12   NM_015208   锚蛋白重复结构域12
  ANKRD13C   NM_030816   锚蛋白重复结构域13C
  ANKRD15   NM_015158   锚蛋白重复结构域蛋白质15同种型a
  ANKRD16   NM_019046   锚蛋白重复结构域16同种型a
  ANKRD25   NM_015493   锚蛋白重复结构域25
  ANKRD28   NM_015199   锚蛋白重复结构域28
  ANKRD29   NM_173505   锚蛋白重复结构域29
  ANKRD38   NM_181712  锚蛋白重复结构域38
  ANKRD42   NM_182603  锚蛋白重复结构域42
  ANKRD44   NM_153697  假定蛋白DKFZp434D2328
  ANKRD50   NM_020337  假定蛋白LOC57182
  ANKRD9   NM_152326  锚蛋白重复结构域9
  ANKS1A   NM_015245  锚蛋白重复和不育α模体结构域
  ANKS1B   NM_020140  cajalin2同种型c
  ANKS4B   NM_145865  含harmonin-相互作用锚蛋白重复
  ANTXR1   NM_018153  肿瘤内皮标志物8同种型3前体
  ANUBL1   NM_174890  AN1,遍在蛋白样蛋白,同系物
  ANXA13   NM_001003954  膜联蛋白A13同种型b
  ANXA7   NM_001156  膜联蛋白VII同种型1
  AOF1   NM_153042  胺氧化酶(含黄素)结构域1
  AP1G1   NM_001030007  衔接因子相关蛋白复合体1,γ1
  AP1S2   NM_003916  衔接因子相关蛋白复合体1σ2
  AP2B1   NM_001030006  衔接因子相关蛋白复合体2,β1
  AP3D1   NM_003938  衔接因子相关蛋白复合体3,δ1
  AP4S1   NM_007077  衔接因子相关蛋白复合体4,σ1
  APBB2   NM_173075  淀粉状蛋白βA4前体蛋白质结合,
  APBB3   NM_006051  淀粉状蛋白β前体蛋白质结合,家族
  APC   NM_000038  腺瘤性结肠息肉
  APCDD1   NM_153000  腺瘤性结肠息肉下调节的1
  APEX1   NM_001641  APEX核酸酶
  API5   NM_006595  细胞凋亡抑制剂5
  APOBEC3A   NM_145699  Phorbolin 1
  APOBEC3F   NM_001006666  载脂蛋白B mRNA编辑酶,催化
  APOBEC4   NM_203454  载脂蛋白B mRNA编辑酶,催化
  APOL1   NM_003661  载脂蛋白L1同种型a前体
  APOLD1   NM_030817  假定蛋白LOC81575
  APP   NM_000484  淀粉状蛋白βA4蛋白质前体,同种型a
  APPBP2   NM_006380  淀粉状蛋白β前体蛋白质结合蛋白质
  APPL   NM_012096  含pH结构域,PTB结构域衔接蛋白
  APXL2   NM_133456  顶端蛋白2
  AQP4   NM_001650  水通道蛋白4同种型a
  AQP9   NM_020980  水通道蛋白9
  ARCN1   NM_001655   古蛋白(Archain)
  ARFIP2   NM_012402   ADP-核糖基化因子相互作用蛋白质2
  ARGFX   NM_001012659   假定蛋白LOC503582
  ARHGAP1   NM_004308   Rho GTP酶激活蛋白1
  ARHGAP12   NM_018287   Rho GTP酶激活蛋白12
  ARHGAP18   NM_033515   Rho GTP酶激活蛋白18
  ARHGAP24   NM_031305   Rho GTP酶激活蛋白24
  ARHGAP26   NM_015071   与灶相关的GTP酶调节物
  ARHGAP5   NM_001030055   Rho GTP酶激活蛋白5同种型a
  ARHGAP6   NM_006125   Rho GTP酶激活蛋白6同种型3
  ARHGEF10   NM_014629   Rho乌苷酸交换因子10
  ARHGEF11   NM_014784   Rho乌苷酸交换因子(GEF)11
  ARHGEF18   NM_015318   Rho-特异性乌嘌呤核苷酸交换因子
  ARHGEF3   NM_019555   Rho鸟苷酸交换因子3
  ARHGEF6   NM_004840   Rac/Cdc42乌苷酸交换因子6
  ARHGEF7   NM_003899   Rho乌苷酸交换因子7同种型
  ARID4A   NM_002892   成视网膜细胞瘤-结合蛋白1同种型I
  ARID4B   NM_016374   AT丰富相互作用结构域4B同种型1
  ARL1   NM_001177   ADP-核糖基化因子样蛋白1
  ARL10   NM_173664   ADP-核糖基化因子样蛋白10
  ARL13B   NM_144996   ADP-核糖基化因子样蛋白2样蛋白1同种型2
  ARL4A   NM_005738   ADP-核糖基化因子样蛋白4A
  ARL4C   NM_005737   ADP-核糖基化因子样蛋白4C
  ARMC8   NM_014154   含armadillo重复单位8同种型1
  ARNT2   NM_014862   芳烃受体核易位蛋白
  ARPP-19   NM_006628   环AMP磷蛋白,19Kd
  ARPP-21   NM_001025068   环AMP调节的磷蛋白,21kD
  ARRDC1   NM_152285   含视紫红质抑制蛋白结构域1
  ARSB   NM_000046   芳基硫酸酯酶B同种型1前体
  ARSD   NM_001669   芳基硫酸酯酶D同种型a前体
  ARSJ   NM_024590   芳基硫酸酯酶J
  ARTS-1   NM_016442   1型肿瘤坏死因子受体脱落
  ASAH1   NM_004315   N-酰基鞘氨醇酰胺水解酶(酸性
  ASAH3L   NM_001010887   N-酰基鞘氨醇酰胺水解酶3样蛋白
  ASAHL   NM_014435   N-酰基鞘氨醇酰胺水解酶样蛋白蛋白质
  ASB1   NM_016114   含锚蛋白重复和SOCS盒蛋白质
  ASB13   NM_024701   含锚蛋白重复和SOCS盒蛋白质
  ASB5   NM_080874   含锚蛋白重复和SOCS盒蛋白质
  ASB6   NM_017873   含锚蛋白重复和SOCS盒6同种型
  ASB7   NM_198243   含锚蛋白重复和SOCS盒蛋白质7
  ASB9   NM_001031739   含锚蛋白重复和SOCS盒9同种型
  ASCIZ   NM_015251   ATM/ATR-底物Chk2-相互作用Zn2+-指
  ASF1A   NM_014034   ASF1抗沉默功能1同系物A
  ASL   NM_000048   精氨琥珀酸裂合酶同种型1
  ASTN   NM_004319   星触蛋白同种型1
  ATAD2   NM_014109   含双AAA结构域的蛋白质
  ATF5   NM_012068   转录激活因子5
  ATF7IP2   NM_024997   转录激活因子7相互作用
  ATG10   NM_031482   APG10自噬10样蛋白
  ATG12   NM_004707   APG12自噬12样蛋白
  ATG16L1   NM_017974   APG16自噬16样蛋白同种型2
  ATG4B   NM_013325   APG4自噬4同系物B同种型a
  ATG5   NM_004849   APG5自噬5样蛋白
  ATM   NM_000051   共济失调-毛细血管扩张突变蛋白质同种型1
  ATOH8   NM_032827   atonal同系物8
  ATP11A   NM_015205   ATP酶,VI类,11A型同种型a
  ATP12A   NM_001676   ATP酶,H+/K+转运,非胃的,α
  ATP1A2   NM_000702   Na+/K+-ATP酶α2亚基蛋白原
  ATP2B1   NM_001001323   质膜钙ATP酶1同种型1a
  ATP2B2   NM_001001331   质膜钙ATP酶2同种型a
  ATP6V0E   NM_003945   ATP酶,H+转运,溶酶体,V0亚基
  ATP6V1D   NM_015994   H(+)-转运二区室ATP酶
  ATP7B   NM_000053   ATP酶,Cu++转运,β多肽
  ATP8B4   NM_024837   ATP酶类I类型8B成员4
  ATP9A   NM_006045   ATP酶,类II,类型9A
  ATPAF1   NM_022745   ATP合酶线粒体F1复合体组装
  ATPBD1B   NM_018066   ATP结合结构域1家族,成员B
  ATPBD1C   NM_016301   ATP结合结构域1家族,成员C
  ATRNL1   NM_207303   引蛋白样蛋白1
  ATXN1   NM_000332   共济失调蛋白1
  ATXN3   NM_001024631   共济失调蛋白3同种型3
  B2M   NM_004048   β-2-微球蛋白前体
  B3GALNT2   NM_152490   UDP-GalNAc:βGlcNAcβ
  B3GALT2   NM_003783   UDP-Gal:βGlcNAcβ
  B3GALT5   NM_006057   UDP-Gal:βGlcNAcβ
  B3GNT5   NM_032047   β-1,3-N-乙酰葡糖胺转移酶bGnT-5
  B3Gn-T6   NM_138706   β-1,3-N-乙酰葡糖胺转移酶
  B4GALT2   NM_001005417   UDP-Gal:βGlcNAcβ1,4-
  B4GALT5   NM_004776   UDP-Gal:βGlcNAcβ1,4-
  B4GALT6   NM_004775   UDP-Gal:βGlcNAcβ1,4-
  BAALC   NM_001024372   脑和急性白血病,细胞质同种型2
  BACH2   NM_021813   BTB和CNC同源物1,碱性亮氨酸拉链
  BAG1   NM_004323   BCL2相关抗死亡基因同种型1L
  BAG5   NM_001015048   BCL2相关抗死亡基因5同种型b
  BAGE   NM_001187   B黑素瘤抗原
  BAGE4   NM_181704   B黑素瘤抗原家族,成员4
  BAHD1   NM_014952   含溴邻接同源物结构域1
  BAMBI   NM_012342   BMP和激活素膜结合抑制剂
  BAPX1   NM_001189   风笛同源框1
  BCAP29   NM_001008405   B细胞受体相关蛋白BAP29同种型
  BCAS1   NM_003657   乳腺癌扩增序列1
  BCAS2   NM_005872   乳腺癌扩增序列2
  BCL11B   NM_022898   B细胞CLL/淋巴瘤11B同种型2
  BCL2   NM_000633   B细胞淋巴瘤蛋白质2α同种型
  BCL2L11   NM_006538   BCL2样11同种型6
  BCL2L2   NM_004050   BCL2样2蛋白质
  BCL6   NM_001706   B细胞淋巴瘤6蛋白质
  BCL6B   NM_181844   B细胞CLL/淋巴瘤6,成员B(锌指
  BDH2   NM_020139   3-羟基丁酸脱氢酶,类型2
  BET1   NM_005868   转运早期阻断1
  BET1L   NM_016526   转运早期阻断1同系物(S.
  BFAR   NM_016561   细胞凋亡调节物
  BHLHB3   NM_030762   含碱性螺旋-环-螺旋结构域,类
  BHMT2   NM_017614   甜菜碱高半胱氨酸转甲基酶2
  BICD2   NM_001003800   二尾D同系物2同种型1
  BIRC1   NM_004536   含杆状病毒IAP重复1
  BIRC4   NM_001167   含杆状病毒IAP重复蛋白质4
  BIRC4BP   NM_017523   XIAP相关因子-1同种型1
  BIRC5   NM_001012270   含杆状病毒IAP重复蛋白质5
  BLZF1   NM_003666   碱性亮氨酸拉链核因子1
  BMP8B   NM_001720   骨形态发生蛋白8B前蛋白原
BMPR2 NM_001204 骨形态发生蛋白受体类型II
  BMX   NM_001721   BMX非受体酪氨酸激酶
  BNC2   NM_017637   碱核蛋白2
  BNIP2   NM_004330   BCL2/腺病毒E1B 19kD相互作用蛋白质2
  BNIP3L   NM_004331   BCL2/腺病毒E1B 19kD-相互作用蛋白质
  BNIPL   NM_138279   BCL2/腺病毒E1B 19kD相互作用蛋白质
  BPGM   NM_001724   2,3-二磷酸甘油酸变位酶
  BPHL   NM_004332   联苯水解酶样蛋白
  BPNT1   NM_006085   3′(2′),5′-二磷酸核苷酸酶1
  BRCA1   NM_007294   乳癌1,早发同种型1
  BRCA2   NM_000059   乳癌2,早发
  BRD1   NM_014577   含布罗莫结构域(bromodomain)蛋白质1
  BRMS1L   NM_032352   乳癌转移抑制蛋白1样蛋白
  BRWD1   NM_001007246   含布罗莫结构域和WD重复结构域1
  BSCL2   NM_032667   Seipin
  BSDC1   NM_018045   含BSD结构域1
  BTBD10   NM_032320   K+通道四聚化蛋白质
  BTBD15   NM_014155   含BTB(POZ)结构域15
  BTBD7   NM_001002860   含BTB(P0Z)结构域7同种型1
  BTG1   NM_001731   B细胞易位蛋白质1
  BTG3   NM_006806   B细胞易位基因3
  BTN1A1   NM_001732   嗜乳脂蛋白,亚家族1,成员A1
  BTN3A1   NM_007048   嗜乳脂蛋白,亚家族3,成员A1
  BTN3A2   NM_007047   嗜乳脂蛋白,亚家族3,成员A2前体
  BUB1   NM_004336   不被苯并吡唑抑制的BUB1出芽1
  BVES   NM_007073   血管心外膜物
  C10orf104   NM_173473   假定蛋白LOC119504
  C10orf114   NM_001010911   假定蛋白LOC399726
  C10orf118   NM_018017   CTCL肿瘤抗原L14-2
  C10orf129   NM_207321   假定蛋白LOC142827
  C10orf137   NM_015608   红细胞分化相关因子1
  C10orf22   NM_032804   假定蛋白LOC84890
  C10orf42   NM_138357   假定蛋白LOC90550
  C10orf46   NM_153810   假定蛋白LOC143384
  C10orf54   NM_022153   假定蛋白LOC64115
  C10orf57   NM_025125   假定蛋白LOC80195
  C10orf58   NM_032333   假定蛋白LOC84293
  C10orf72   NM_144984   假定蛋白LOC196740同种型2
  C10orf76   NM_024541   假定蛋白LOC79591
  C10orf78   NM_001002759   假定蛋白LOC119392同种型a
  C10orf85   NM_001012711   假定蛋白LOC404216
  C10orf96   NM_198515   假定蛋白LOC374355
  C10orf97   NM_024948   10号染色体开放阅读框97
  C11orf1   NM_022761   假定蛋白LOC64776
  C11orf30   NM_020193   EMSY蛋白质
  C11orf38   NM_212555   假定蛋白LOC399967
  C11orf49   NM_001003678   假定蛋白LOC79096同种型4
  C11orf54   NM_014039   假定蛋白LOC28970
  C11orf55   NM_207428   假定蛋白LOC399879
  C11orf63   NM_199124   假定蛋白LOC79864同种型2
  C11orf69   NM_152314   假定蛋白LOC120196
  C12orf31   NM_032338   假定蛋白LOC84298
  C12orf36   NM_182558   假定蛋白LOC283422
  C12orf44   NM_021934   假定蛋白LOC60673
  C12orf49   NM_024738   假定蛋白LOC79794
  C12orf53   NM_153685   假定蛋白LOC196500
  C13orf1   NM_020456   假定蛋白LOC57213
  C14orf101   NM_017799   假定蛋白LOC54916
  C14orf103   NM_018036   假定蛋白LOC55102
  C14orf105   NM_018168   假定蛋白LOC55195
  C14orf108   NM_018229   假定蛋白LOC55745
  C14orf111   NM_015962   假定蛋白LOC51077
  C14orf119   NM_017924   14号染色体开放阅读框119
  C14orf126   NM_080664   假定蛋白LOC112487
  C14orf129   NM_016472   假定蛋白LOC51527
  C14orf133   NM_022067   假定蛋白LOC63894
  C14orf138   NM_024558   假定蛋白LOC79609
  C14orf143   NM_145231   假定蛋白LOC90141
  C 14orf145   NM_152446   14号染色体开放阅读框145
  C14orf150   NM_001008726   假定蛋白LOC112840
  C14orf153   NM_032374   假定蛋白LOC84334
  C14orf24   NM_173607   假定蛋白LOC283635
  C14orf28   NM_001017923   假定蛋白LOC122525
  C14orf32   NM_144578   MAPK-相互作用和纺锤体稳定性
  C14orf43   NM_194278   假定蛋白LOC91748
  C14orf44   NM_152445   假定蛋白LOC145483
  C15orf17   NM_020447   假定蛋白LOC57184
  C15orf20   NM_025049   DNA解旋酶同系物PIF1
  C15orf32   NM_153040   假定蛋白LOC145858
  C15orf40   NM_144597   假定蛋白LOC123207
  C15orf41   NM_032499   假定蛋白LOC84529
  C16orf28   NM_023076   假定蛋白LOC65259
  C16orf34   NM_144570   染色体16开放阅读框34
  C16orf45   NM_033201   假定蛋白LOC89927
  C16orf54   NM_175900   假定蛋白LOC283897
  C16orf58   NM_022744   假定蛋白LOC64755
  C16orf59   NM_025108   假定蛋白LOC80178
  C17orf27   NM_020914   染色体17开放阅读框27
  C17orf37   NM_032339   染色体17开放阅读框37
  C17orf39   NM_024052   假定蛋白LOC79018
  C17orf40   NM_018428   肝细胞癌相关抗原66
  C17orf53   NM_024032   假定蛋白LOC78995
  C17orf62   NM_001033046   假定蛋白LOC79415
  C17orf69   NM_152466   假定蛋白LOC147081
  C17orf73   NM_017928   假定蛋白LOC55018
  C17orf77   NM_152460   假定蛋白LOC146723
  C18orf1   NM_001003674   假定蛋白LOC753同种型γ1
  C18orf16   NM_153010   假定蛋白LOC147429
  C18orf17   NM_153211   假定蛋白LOC125488
  C18orf19   NM_152352   假定蛋白LOC125228
  C18orf25   NM_001008239   染色体18开放阅读框25同种型b
  C18orf26   NM_173629   假定蛋白LOC284254
  C18orf45   NM_032933   假定蛋白LOC85019
  C19orf12   NM_031448   假定蛋白LOC83636同种型2
  C19orf2   NM_003796   RPB5-介导蛋白质同种型a
  C19orf20   NM_033513   基因陷阱ROSA b-geo 22
  C19orf31   NM_001014373   假定蛋白LOC404664
  C1GALT1   NM_020156   核心1合酶,
  C1orf107   NM_014388   假定蛋白LOC27042
  C1orf108   NM_024595   假定蛋白LOC79647
  C1orf110   NM_178550   假定蛋白LOC339512
  C1orf116   NM_023938   雄激素特异性调节的蛋白质
  C1orf130   NM_001010980   假定蛋白LOC400746
  C1orf135   NM_024037   假定蛋白LOC79000
  C1orf138   NM_001025493   假定蛋白LOC574406
  C1orf150   NM_145278   假定蛋白LOC148823
  C1orf151   NM_001032363   染色体1开放阅读框151蛋白质
  C1orf155   NM_033319   假定蛋白LOC91687
  C1orf171   NM_138467   假定蛋白LOC127253
  C1orf173   NM_001002912   假定蛋白LOC127254
  C1orf176   NM_022774   假定蛋白LOC64789
  C1orf178   NM_001010922   促凋亡Bcl-2蛋白质同种型a
  C1orf183   NM_019099   假定蛋白LOC55924同种型1
  C1orf19   NM_052965   假定蛋白LOC116461
  C1orf21   NM_030806   染色体1开放阅读框21
  C1orf24   NM_022083   niban蛋白质同种型1
  C1orf26   NM_017673   假定蛋白LOC54823
  C1orf32   NM_199351   假定蛋白LOC387597
  C1orf33   NM_016183   核糖体蛋白质P0样蛋白质
  C1orf42   NM_019060   染色体1开放阅读框42
  C1orf63   NM_020317   假定蛋白LOC57035同种型2
  C1orf69   NM_001010867   假定蛋白LOC200205
  C1orf76   NM_173509   假定蛋白MGC16664
  C1orf83   NM_153035   假定蛋白LOC127428
  C1orf84   NM_182518   RP11-506B15.1蛋白质同种型3
  C1orf9   NM_014283   染色体1开放阅读框9蛋白质
  C1orf96   NM_145257   假定蛋白LOC126731
  C1QDC1   NM_001002259   含C1q结构域1同种型1
  C1QTNF7   NM_031911   C1q和肿瘤坏死因子相关蛋白7
  C20orf103   NM_012261   20号染色体开放阅读框103前体
  C20orf108   NM_080821   假定蛋白LOC116151
  C20orf112   NM_080616   假定蛋白LOC140688
  C20orf117   NM_080627   假定蛋白LOC140710同种型1
  C20orf12   NM_018152   假定蛋白LOC55184
  C20orf121   NM_024331   假定蛋白LOC79183
  C20orf133   NM_001033086   假定蛋白LOC140733同种型1
  C20orf161   NM_033421   分选微管连接蛋白21同种型a
  C20orf172   NM_024918   假定蛋白LOC79980
  C20orf175   NM_080829   假定蛋白LOC140876
  C20orf177   NM_022106   假定蛋白LOC63939
  C20orf29   NM_018347   假定蛋白LOC55317
  C20orf43   NM_016407   假定蛋白LOC51507
  C20orf51   NM_022099   假定蛋白LOC63930
  C21orf25   NM_199050   假定蛋白LOC25966
  C21orf49   NM_001006116   假定蛋白LOC54067
  C21orf55   NM_017833   假定蛋白LOC54943
  C21orf58   NM_058180   假定蛋白LOC54058同种型1
  C21orf62   NM_019596   假定蛋白LOC56245
  C21orf63   NM_058187   21号染色体开放阅读框63
  C21orf66   NM_145328   GC丰富序列DNA结合因子候选物
  C21orf77   NM_018277   假定蛋白LOC55264
  C22of9   NM_001009880   假定蛋白LOC23313同种型b
  C2orf13   NM_173545   假定蛋白LOC200558
  C2orf15   NM_144706   假定蛋白LOC150590
  C2orf17   NM_024293   假定蛋白LOC79137
  C2orf19   NM_001024676   2号染色体开放阅读框19
  C2orf26   NM_023016   假定蛋白LOC65124
  C2orf28   NM_016085   细胞凋亡相关蛋白3同种型a
  C2orf3   NM_003203   假定蛋白LOC6936
  C3orf1   NM_016589   假定蛋白LOC51300
  C3orf21   NM_152531  假定蛋白LOC152002
  C3orf27   NM_007354  假定的GR6蛋白质
  C3orf34   NM_032898  假定蛋白LOC84984
  C3orf35   NM_178342  AP20区蛋白质同种型E
  C3orf38   NM_173824  假定蛋白LOC285237
  C3orf52   NM_024616  TPA-诱导的跨膜蛋白质
  C3orf56   NM_001007534  假定蛋白LOC285311
  C3orf62   NM_198562  假定蛋白LOC375341
  C3orf63   NM_015224  成视网膜细胞瘤相关蛋白140
  C3orf64   NM_173654  AER61糖基转移酶
  C3orf9   NM_020231  假定蛋白LOC56983
  C4orf12   NM_205857  FBI4蛋白质
  C4orf13   NM_001029998  假定蛋白LOC84068同种型b
  C4orf15   NM_024511  假定蛋白LOC79441
  C5   NM_001735  补体成分5
  C5orf22   NM_018356  假定蛋白LOC55322
  C6orf120   NM_001029863  假定蛋白LOC387263
  C6orf128   NM_145316  假定蛋白LOC221468
  C6orf134   NM_024909  假定蛋白LOC79969同种型2
  C6orf139   NM_018132  假定蛋白LOC55166
  C6orf15   NM_014070  STG蛋白质
  C6orf151   NM_152551  U11/U12snRNP 48K
  C6orf201   NM_206834  假定蛋白LOC404220
  C6orf208   NM_025002  假定蛋白LOC80069
  C6orf35   NM_018452  假定蛋白LOC55836
  C6orf49   NM_013397  过表达的乳腺肿瘤蛋白质
  C6orf59   NM_024929  假定蛋白LOC79992
  C6orf69   NM_173562  假定蛋白LOC222658
  C6orf71   NM_203395  6号染色体开放阅读框71
  C6orf85   NM_021945  离子转运蛋白质
  C6orf96   NM_017909  假定蛋白LOC55005
  C6orf97   NM_025059  假定蛋白LOC80129
  C7   NM_000587  补体成分7前体
  C7orf19   NM_032831  假定蛋白LOC80228
  C7orf29   NM_138434  假定蛋白LOC113763
  C8A   NM_000562   补体成分8,α多肽
  C8orf1   NM_004337   假定蛋白LOC734
  C8orf30A   NM_016458   脑蛋白质16
  C8orf37   NM_177965   假定蛋白LOC157657
  C8orf38   NM_152416   假定蛋白LOC137682
  C8orf44   NM_019607   假定蛋白LOC56260
  C8orf45   NM_173518   假定蛋白LOC157777
  C8orf49   NM_001031839   假定蛋白LOC606553
  C9orf100   NM_001031728   假定蛋白LOC84904同种型1
  C9orf102   NM_020207   牵张应答蛋白质278同种型a
  C9orf140   NM_178448   假定蛋白LOC89958
  C9orf40   NM_017998   假定蛋白LOC55071
  C9orf5   NM_032012   假定蛋白LOC23731
  C9orf64   NM_032307   假定蛋白LOC84267
  C9orf66   NM_152569   假定蛋白LOC157983
  C9orf72   NM_145005   假定蛋白LOC203228同种型b
  C9orf77   NM_001025780   9号染色体开放阅读框77同种型2
  C9orf78   NM_016482   9号染色体开放阅读框78同种型1
  C9orf80   NM_021218   假定蛋白LOC58493
  C9orf82   NM_024828   假定蛋白LOC79886
  C9orf85   NM_182505   假定蛋白LOC138241同种型a
  C9orf88   NM_022833   假定蛋白LOC64855
  CA10   NM_020178   碳酸酐酶X
  CA8   NM_004056   碳酸酐酶VIII
  CABLES1   NM_138375   Cdk5和Ab1酶底物1
  CABP2   NM_016366   钙结合蛋白2同种型1
  CACNG4   NM_014405   电压依赖性钙通道γ-4
  CALCOCO2   NM_005831   钙结合和卷曲螺旋结构域2
  CALD1   NM_004342   钙调结合蛋白1同种型2
  CALN1   NM_001017440   calneuronl
  CAMK1D   NM_020397   钙/钙调蛋白依赖的蛋白质激酶ID
  CAMK2D   NM_172127   钙/钙调蛋白依赖的蛋白质激酶II
  CAMK2G   NM_001222   钙/钙调蛋白依赖的蛋白质激酶II
  CAMK2N1   NM_018584   钙/钙调蛋白依赖的蛋白质激酶II
  CAMK2N2   NM_033259   CaM-KIl抑制剂y蛋白质
  CAMKK1   NM_032294   钙/钙调蛋白依赖的蛋白质激酶1
  CAMSAP1   NM_015447   钙调蛋白调节的血影蛋白相关蛋白
  CAMSAP1L1   NM_203459   钙调蛋白调节的血影蛋白相关蛋白
  CAMTA1   NM_015215   钙调蛋白结合转录激活物1
  CAMTA2   NM_015099   钙调蛋白结合转录激活物2
  CANX   NM_001024649   钙联接蛋白前体
  CAPN13   NM_144575   钙蛋白酶13
  CAPN3   NM_212464   钙蛋白酶3同种型g
  CAPN7   NM_014296   钙蛋白酶7
  CAPS2   NM_032606   钙磷蛋白2
  CARD10   NM_014550   胱天蛋白酶募集域蛋白质10
  CARD14   NM_052819   胱天蛋白酶募集域蛋白质14同种型2
  CARD4   NM_006092   胱天蛋白酶募集域家族,成员4
  CARD8   NM_014959   胱天蛋白酶募集域家族,成员8
  CARKL   NM_013276   碳水化合物激酶样蛋白
  CASC3   NM_007359   癌症易感性候选物3
  CASC4   NM_138423   癌症易感性候选物4同种型a
  CASP2   NM_032982   胱天蛋白酶2同种型1前蛋白原
  CASP6   NM_001226   胱天蛋白酶6同种型α前蛋白原
  CASP7   NM_001227   胱天蛋白酶7同种型α前体
  CASP8   NM_001228   胱天蛋白酶8同种型A
  CATSPER2   NM_172097   精子相关阳离子通道2同种型4
  CAV1   NM_001753   小窝蛋白1
  CAV2   NM_001233   小窝蛋白2同种型a和b
  CBX1   NM_006807   色素框同系物1(HP1β同系物,果蝇)
  CBX2   NM_005189   色素框同系物2同种型1
  CBX7   NM_175709   色素框同系物7
  CC2D1A   NM_017721   假定的NFkB活化蛋白质
  CC2D1B   NM_032449   含卷曲螺旋和C2结构域1B
  CCBE1   NM_133459   胶原和钙结合EGF结构域1
  CCBL1   NM_004059   细胞质半胱氨酸缀合-β裂合酶
  CCDC14   NM_022757   含卷曲螺旋结构域14
  CCDC15   NM_025004   含卷曲螺旋结构域15
  CCDC16   NM_052857   含卷曲螺旋结构域16
  CCDC25   NM_001031708   含卷曲螺旋结构域25同种型1
  CCDC43   NM_144609   假定蛋白LOC124808
  CCDC52   NM_144718   假定蛋白LOC152185
  CCDC6   NM_005436   含卷曲螺旋结构域6
  CCDC68   NM_025214   CTCL肿瘤抗原se57-1
  CCDC69   NM_015621   假定蛋白LOC26112
  CCL1   NM_002981   小可诱导细胞因子A1前体
  CCL28   NM_019846   小可诱导细胞因子A28前体
  CCL5   NM_002985   小可诱导细胞因子A5前体
  CCND1   NM_053056   细胞周期蛋白D1
  CCND2   NM_001759   细胞周期蛋白D2
  CCNE2   NM_057735   细胞周期蛋白E2同种型2
  CCNF   NM_001761   细胞周期蛋白F
  CCNG2   NM_004354   细胞周期蛋白G2
  CCNJ   NM_019084   细胞周期蛋白J
  CCNT2   NM_001241   细胞周期蛋白T2同种型a
  CCR6   NM_004367   趋化因子(C-C模体)受体6
  CCRL1   NM_016557   趋化因子(C-C模体)受体样蛋白1
  CCS   NM_005125   用于超氧化物歧化酶的铜伴侣蛋白
  CD200   NM_001004196   CD200抗原同种型b
  CD28   NM_006139   CD28抗原
  CD300LG   NM_145273   触发髓样细胞上表达受体
  CD36   NM_000072   CD36抗原
  CD38   NM_001775   CD38抗原
  CD46   NM_002389   CD46抗原,补体调节蛋白质
  CD47   NM_001025079   CD47分子同种型3前体
  CD59   NM_000611   CD59抗原p18-20
  CD68   NM_001251   CD68抗原
  CD69   NM_001781   CD69抗原(p60,早期T细胞活化
  CD82   NM_001024844   CD82抗原同种型2
  CD84   NM_003874   CD84抗原(白细胞抗原)
  CD96   NM_005816   CD96抗原同种型2前体
  CD99L2   NM_031462   CD99抗原样蛋白2同种型E3′-E4′-E3-E4
  CDAN1   NM_138477   codanin 1
  CDC23   NM_004661   细胞分裂周期蛋白质23
  CDC37L1   NM_017913   细胞分裂周期37同系物(S
  CDC40   NM_015891   前mRNA剪接因子17
  CDC42SE1   NM_020239   CDC42小效应蛋白1
  CDCA4   NM_017955   细胞分裂周期相关4
  CDCA7   NM_031942   细胞分裂周期相关蛋白7同种型
  CDH20   NM_031891   钙黏着蛋白20,类型2前蛋白原
  CDK2AP2   NM_005851   CDK2相关蛋白2
  CDK5R1   NM_003885   细胞周期蛋白依赖的激酶5,调节亚基1
  CDK6   NM_001259   细胞周期蛋白依赖的激酶6
  CDKN1A   NM_000389   细胞周期蛋白依赖的激酶抑制剂1A
  CDT1   NM_030928   DNA复制因子
  CECR6   NM_031890   猫眼综合征染色体区域,候选物6
  CEECAM1   NM_016174   脑内皮细胞黏着分子1
  CELSR2   NM_001408   钙黏着蛋白EGF LAG 7次跨膜G-类型受体2
  CENPF   NM_016343   着丝粒蛋白质F(350/400kD)
  CENTA2   NM_018404   半人马蛋白-α2蛋白质
  CENTB2   NM_012287   半人马蛋白,β2
  CENTD1   NM_015230   半人马蛋白δ1同种型a
  CEP135   NM_025009   中心体蛋白质4
  CEP152   NM_014985   假定蛋白LOC22995
  CEP170   NM_014812   中心体蛋白质170kDa
  CEP27   NM_018097   假定蛋白LOC55142
  CEP57   NM_014679   Translokin
  CEP70   NM_024491   中心体蛋白质70kDa
  CERK   NM_022766   神经酰胺激酶同种型a
  CES2   NM_003869   羧酸酯酶2同种型1
  CETN2   NM_004344   钙牵蛋白
  CFL2   NM_021914   丝切蛋白2
  CFLAR   NM_003879   CASP8和FADD样蛋白细胞凋亡调节物
  CGNL1   NM_032866   带蛋白样蛋白1
  CHAF1A   NM_005483   染色质组装因子1,亚基A(p150)
  CHD5   NM_015557   克罗莫结构域解旋酶DNA结合蛋白5
  CHD6   NM_032221   克罗莫结构域解旋酶DNA结合蛋白6
  CHD9   NM_025134   克罗莫结构域解旋酶DNA结合蛋白9
  CHES1   NM_005197   检验点抑制蛋白1
  ChGn   NM_018371   软骨素β1,4
  CHML   NM_001821   无脉络膜样Rab护卫蛋白2
  CHMP4C   NM_152284   染色质修饰蛋白4C
  CHRFAM7A   NM_139320   CHRNA7-FAM7A融合同种型1
  CHRM2   NM_000739   胆碱能受体,毒蕈碱性2
  CHRNA5   NM_000745   胆碱能受体,烟碱性,α
  CHRNA7   NM_000746   胆碱能受体,烟碱性,α7
  CHRNB1   NM_000747   烟碱性乙酰胆碱受体β1亚基
  CHRNB4   NM_000750   胆碱能受体,烟碱性,β
  CHST6   NM_021615   碳水化合物(N-乙酰葡糖胺6-O)
  CHSY1   NM_014918   碳水化合物(软骨素)合酶1
  CHURC1   NM_145165   含churchill结构域1
  CIAPIN1   NM_020313   细胞因子诱导的细胞凋亡抑制剂1
  CIAS1   NM_004895   隐热蛋白(cryopyrin)同种型a
  CIC   NM_015125   capicua同系物
  CIT   NM_007174   Citron
  CITED4   NM_133467   Cbp/p300-相互作用反式激活素,具有
  CKAP2   NM_018204   细胞骨架相关蛋白2
  CLASP1   NM_015282   CLIP相关蛋白1
  CLCN6   NM_001286   氯化物通道6同种型C1C-6a
  CLDN11   NM_005602   紧密连接蛋白11
  CLDN12   NM_012129   紧密连接蛋白12
  CLDN15   NM_138429   紧密连接蛋白15同种型2
  CLDN18   NM_001002026   紧密连接蛋白18同种型2
  CLDN19   NM_148960   紧密连接蛋白19
  CLDN2   NM_020384   紧密连接蛋白2
  CLDND1   NM_019895   假定蛋白LOC56650
  CLEC12B   NM_205852   巨噬细胞抗原h
  CLEC2D   NM_001004419   破骨细胞抑制性凝集素同种型2
  CLEC4D   NM_080387   C-类型凝集素结构域家族4,成员D
  CLIC4   NM_013943   氯化物细胞内通道4
  CLIC5   NM_016929   氯化物细胞内通道5
  CLN5   NM_006493   蜡样脂-脂褐素病,神经元5
  CLN8   NM_018941   CLN8蛋白质
  CLOCK   NM_004898   Clock
  CLSTN1   NM_001009566   钙同线蛋白1同种型1
  CLSTN2   NM_022131   钙同线蛋白2
  CMPK   NM_016308   胞苷酸激酶
  CMTM4   NM_178818   趋化因子样因子超家族4同种型1
  CMTM6   NM_017801   含CKLF样MARVEL跨膜结构域
  CNAP1   NM_014865   染色体凝聚相关SMC-相关
  CNDP2   NM_018235   CNDP二肽酶2(金属肽酶M20
  CNGB3   NM_019098   环核苷酸门控通道β3
  CNN1   NM_001299   钙调理蛋白1,碱性的,平滑肌
  CNNM2   NM_199077   细胞周期蛋白M2同种型3
  CNNM3   NM_017623   细胞周期蛋白M3同种型1
  CNOT4   NM_001008225   CCR4-NOT转录复合物,亚基4
  CNOT6   NM_015455   CCR4-NOT转录复合物,亚基6
  CNOT7   NM_013354   CCR4-NOT转录复合物,亚基7
  CNR1   NM_016083   中枢大麻素受体同种型a
  CNTF   NM_000614   睫状神经营养因子
  CNTN3   NM_020872   接触蛋白3
  CNTNAP2   NM_014141   细胞识别分子Caspr2前体
  CNTNAP3   NM_033655   细胞识别分子CASPR3
  COBL   NM_015198   cordon-bleu同系物
  COG3   NM_031431   高尔基体转运复合体成分3
  COG7   NM_153603   寡聚高尔基复合体成分7
  COIL   NM_004645   环形体蛋白
  COL11A2   NM_080679   胶原,类型XI,α2同种型3
  COL19A1   NM_001858   α1类型XIX胶原前体
  COL4A1   NM_001845   α1类型IV胶原前蛋白原
  COL4A2   NM_001846   α2类型IV胶原前蛋白原
  COL4A3   NM_000091   α3类型IV胶原同种型1前体
  COL4A4   NM_000092   α4类型IV胶原前体
  COL8A2   NM_005202   胶原,类型VIII,α2
  COLEC12   NM_030781   胶原凝素亚家族成员12同种型II
  COLQ   NM_005677   乙酰胆碱酯酶胶原样尾部亚基
  COMMD10   NM_016144   含COMM结构域10
  COMMD2   NM_016094   含COMM结构域2
  C0MMD4   NM_017828   含COMM结构域4
  COMMD5   NM_014066   高血压相关钙-调节基因
 COPA   NM_004371  外被体蛋白质复合体,亚基α
 COPS6   NM_006833  COP9信号体亚基6
 COQ2   NM_015697  对羟基苯甲酸聚戊烯转移酶,
 COQ7   NM_016138  COQ7蛋白质
 CORIN   NM_006587  心钠素
 CORO1C   NM_014325  冠蛋白,肌动蛋白结合蛋白质,1C
 CORO2B   NM_006091  冠蛋白,肌动蛋白结合蛋白质,2B
 COX6B2   NM_144613  细胞色素c氧化酶亚基VIb,
 COX7A2L   NM_004718  细胞色素c氧化酶亚基VIIa多肽2
 COX8C   NM_182971  细胞色素c氧化酶亚基8C
 CP110   NM_014711  CP110蛋白质
 CPEB3   NM_014912  细胞质多腺苷化元件结合
 CPM   NM_001005502  羧基肽酶M前体
 CPNE1   NM_003915  copine I
 CPOX   NM_000097  粪卟啉原氧化酶
 CPS1   NM_001875  氨基甲酰-磷酸合成酶1,线粒体
 CPSF6   NM_007007  剪切和多聚腺苷酸化特异性因子6,
 CR1   NM_000573  补体受体1同种型F前体
 CRAMP1L   NM_020825  Crm,cramped样
 CREB1   NM_004379  cAMP应答元件结合蛋白1
 CREB5   NM_001011666  cAMP应答元件结合蛋白5
 CREBL2   NM_001310  cAMP应答元件结合蛋白质样2
 CREM   NM_181571  cAMP应答元件调节剂同种型a
 CRIM1   NM_016441  半胱氨酸丰富运动神经元1
 CRIPT   NM_014171  突触后蛋白质CRIPT
 CRK   NM_005206  v-crk肉瘤病毒CT10癌基因同系物
 CRMP1   NM_001014809  瓦解蛋白反应调节蛋白质1同种型1
 CROT   NM_021151  肉碱O-辛酰转移酶
 CRP   NM_000567  C-反应蛋白质,五聚环蛋白相关
 CRSP3   NM_004830  Sp1转录所需辅因子
 CRSP6   NM_004268  Sp1转录所需辅因子
 CRSP7   NM_004831  Sp1转录所需辅因子
 CRSP9   NM_004270  Sp1转录所需辅因子
 CRTAM   NM_019604  I类MHC-限制T细胞相关的
 CRY2   NM_021117  隐色素2(光裂合酶样)
 CS   NM_004077   柠檬酸合酶前体,同种型a
 CSAD   NM_015989   半胱氨酸亚磺酸脱羧酶相关
 CSDE1   NM_001007553   NRAS上游同种型1
 CSF2RA   NM_006140   集落刺激因子2受体α链
 CSMD2   NM_052896   CUB和Sushi多结构域2
 CSNK1G1   NM_001011664   酪蛋白激酶1,γ1同种型L
 CSNK2A1   NM_001895   酪蛋白激酶IIα1亚基同种型a
 CSTF2T   NM_015235   剪切刺激因子,3′pre-RNA,亚基
 CTAGE1   NM_022663   皮肤的T细胞淋巴瘤相关抗原1
 CTDSPL   NM_001008392   小的CTD磷酸酶3同种型1
 CTDSPL2   NM_016396   CTD(羧基末端结构域,RNA聚合酶II,
 CTF1   NM_001330   心肌营养蛋白1
 CTNND1   NM_001331   联蛋白(钙黏着蛋白相关蛋白),δ1
 CTNS   NM_001031681   胱氨酸病,肾同种型1
 CTSB   NM_001908   组织蛋白酶B前蛋白原
 CTSC   NM_148170   组织蛋白酶C同种型b前体
 CTSK   NM_000396   组织蛋白酶K前蛋白原
 CTSS   NM_004079   组织蛋白酶S前蛋白原
 CTTNBP2NL   NM_018704   假定蛋白LOC55917
 CUBN   NM_001081   Cubilin
 CUGBP2   NM_001025076   CUG三联体重复,RNA结合蛋白2
 CUL1   NM_003592   滞蛋白1
 CUL3   NM_003590   滞蛋白3
 CUTL2   NM_015267   cut样2
 CX3CL1   NM_002996   趋化因子(C-X3-C模体)配体1
 CX40.1   NM_153368   间隙连接连接蛋白40.1
 CXCL14   NM_004887   小可诱导细胞因子B14前体
 CXCL5   NM_002994   趋化因子(C-X-C模体)配体5前体
 CXCL6   NM_002993   趋化因子(C-X-C模体)配体6(粒细胞
 CXCL9   NM_002416   小可诱导细胞因子B9前体
 CXorf20   NM_153346   假定蛋白LOC139105
 CXorf21   NM_025159   假定蛋白LOC80231
 CXorf38   NM_144970   假定蛋白LOC159013
 CXorf41   NM_173494   假定蛋白LOC139212
 CXorf53   NM_001018055   含BRCA1/BRCA2复合体亚基36
  CXorf6   NM_005491   假定蛋白LOC10046
  CXXC6   NM_030625   CXXC指6
  CYB561D1   NM_182580   含细胞色素b-561结构域1
  CYB5B   NM_030579   细胞色素b5线粒体外膜
  CYB5D1   NM_144607   假定蛋白LOC124637
  CYBB   NM_000397   细胞色素b-245,β多肽(慢性
  CYBRD1   NM_024843   细胞色素b还原酶1
  CYCS   NM_018947   细胞色素c
  CYLD   NM_015247   遍在蛋白羧基1末端水解酶CYLD
  CYLN2   NM_003388   细胞质接头2同种型1
  CYP19A1   NM_000103   细胞色素P450,家族19
  CYP26B1   NM_019885   细胞色素P450,家族26,亚家族b,
  CYP2U1   NM_183075   细胞色素P450,家族2,亚家族U,
  CYP2W1   NM_017781   细胞色素P450,家族2,亚家族W,
  CYP4F3   NM_000896   细胞色素P450,家族4,亚家族F,
  CYSLTR2   NM_020377   半胱氨酰白三烯受体2
  D21S2056E   NM_003683   核仁蛋白质NOP52
  DAPK2   NM_014326   死亡相关蛋白激酶2
  DAZAP2   NM_014764   DAZ相关蛋白2
  DBF4   NM_006716   S期激酶激活物
  DBF4B   NM_025104   DBF4同系物B同种型2
  DBT   NM_001918   二氢硫辛酰胺支链酰基转移酶
  DCBLD2   NM_080927   网柄菌素,含CUB和LCCL结构域2
  DCLRE1C   NM_001033855   artemis蛋白质同种型a
  DCTN4   NM_016221   动力蛋白激活蛋白4(p62)
  DCTN5   NM_032486   动力蛋白激活蛋白4
  DCUN1D3   NM_173475   假定蛋白LOC123879
  DCUN1D4   NM_015115   DCN1,滞蛋白neddylation缺陷1,结构域
  DDAH1   NM_012137   二甲基精氨酸二甲氨基水解酶1
  DDB2   NM_000107   损伤特异性DNA结合蛋白2(48kD)
  DDHD1   NM_030637   DD含HD结构域1
  DDHD2   NM_015214   DD含HD结构域2
  DDOST   NM_005216   多萜醇二磷酸寡糖蛋白质
  DDX11   NM_030655   DEAD/H(Asp-Glu-Ala-Asp/His)盒多肽11
  DDX21   NM_004728   DEAD(Asp-Glu-Ala-Asp)盒多肽21
  DDX26B   NM_182540   假定蛋白LOC203522
  DDX46   NM_014829   DEAD(Asp-Glu-Ala-Asp)盒多肽46
  DDX5   NM_004396   DEAD(Asp-Glu-Ala-Asp)盒多肽5
  DDX51   NM_175066   DEAD(Asp-Glu-Ala-Asp)盒多肽51
  DDX55   NM_020936   DEAD(Asp-Glu-Ala-Asp)盒多肽55
  DDX59   NM_031306   DEAD(Asp-Glu-Ala-Asp)盒多肽59
  DEADC1   NM_182503   含脱氨酶结构域1
  DEAF1   NM_021008   抑制素
  DECR2   NM_020664   2,4-二烯酰辅酶A还原酶2,过氧化物酶体
  DEDD   NM_032998   含死亡效应物结构域蛋白质
  DEFB106A   NM_152251   防卫素,β106A
  DEGS1   NM_003676   退化精母细胞同系物1,脂质
  DENND1A   NM_024820   假定蛋白LOC57706同种型2
  DENND2C   NM_198459   含DENN/MADD结构域2C
  DENND3   NM_014957   假定蛋白LOC22898
  DENND4C   NM_017925   假定蛋白LOC55667
  DEPDC4   NM_152317   含DEP结构域4
  DERL2   NM_016041   Der1样结构域家族,成员2
  DFFA   NM_004401   DNA断裂因子,45kDa,α
  DFNA5   NM_004403   耳聋,常染色体显性5蛋白质
  DGAT2L4   NM_001002254   二酰基甘油O-酰基转移酶2样4
  DGCR13   NM_001024733   DiGeorge综合征基因H
  DGKQ   NM_001347   二酰基甘油激酶,θ
  DHDDS   NM_024887   脱氢长醇二磷酸合酶同种型a
  DHFRL1   NM_176815   假定蛋白LOC200895
  DHODH   NM_001025193   二氢乳清酸脱氢酶同种型2
  DHTKD1   NM_018706   脱氢酶E1和转酮醇酶结构域
  DHX34   NM_014681   DEAH(Asp-Glu-Ala-His)盒多肽34
  DICER1   NM_030621   切酶1
  DIDO1   NM_033081   诱导死亡泯灭因子1同种型c
  DIO1   NM_000792   去碘酶,碘化甲状腺原氨酸,类型I同种型a
  DIP2A   NM_015151   DIP2样蛋白质同种型a
  DIP2B   NM_173602   假定蛋白LOC57609
  DIRC1   NM_052952   假定蛋白LOC116093
  DISC1   NM_001012957   精神分裂症中断裂1同种型Lv
  DIXDC1   NM_033425   含DIX结构域1同种型b
  DKFZP434B0335   NM_015395   假定蛋白LOC25851
  DKFZp434I1020   NM_194295   假定蛋白LOC196968
  DKFZp451A211   NM_001003399   假定蛋白LOC400169
  DKFZP564J0863   NM_015459   假定蛋白LOC25923
  DKFZp564K142   NM_032121   移植相关蛋白
  DKFZp667M2411   NM_207323   假定蛋白LOC147172
  DKFZP686A10121   NM_033107   紧密连接蛋白12
  DKFZp686L1814   NM_194282   假定蛋白LOC132660
  DKFZp686O24166   NM_001009913   假定蛋白LOC374383
  DKFZp761E198   NM_138368   假定蛋白LOC91056
  DKFZp762I137   NM_152411   假定蛋白LOC136051
  DKFZP781I1119   NM_152622   假定蛋白LOC166968
  DLC1   NM_006094   肝癌中缺失1同种型2
  DLEC1   NM_005106   肺癌和食管癌中缺失1同种型
  DLGAP2   NM_004745   大成虫盘(discs large)相关蛋白2
  DLX5   NM_005221   末端缺失同源框5
  DMBX1   NM_147192   间脑/中脑同源框1同种型b
  DMC1   NM_007068   mck1同系物的DMC1剂量抑制蛋白
  DMN   NM_015286   desmuslin同种型B
  DMP1   NM_004407   牙本质基质酸性磷蛋白
  DMRT2   NM_006557   两性和mab-3相关转录因子
  DMTF1   NM_021145   细胞周期蛋白D结合myb样转录因子
  DNAJA4   NM_018602   DnaJ(Hsp40)同系物,亚家族A,成员4
  DNAJA5   NM_001012339   DnaJ同源物亚家族A成员5同种型2
  DNAJB6   NM_005494   DnaJ(Hsp40)同系物,亚家族B,成员6
  DNAJB9   NM_012328   DnaJ(Hsp40)同系物,亚家族B,成员9
  DNAJC15   NM_013238   含DNAJ结构域
  DNAJC18   NM_152686   DnaJ(Hsp40)同系物,亚家族C,成员18
  DNAJC19   NM_145261   线粒体内膜易位酶
  DNAJC5   NM_025219   DnaJ(Hsp40)同系物,亚家族C,成员5
  DNASE2   NM_001375   脱氧核糖核酸酶II,溶酶体前体
  DNM2   NM_001005360   发动蛋白2同种型1
  DNM3   NM_015569   发动蛋白3
  DOCK9   NM_015296   胞质分裂提呈9
  DOPEY2   NM_005128   pad-1样
  DPP10   NM_001004360   二肽基肽酶10短同种型
  DPP3   NM_005700   二肽基肽酶III
  DPP9   NM_139159   二肽基肽酶9
  DPY19L3   NM_207325   dpy-19样3
  DPYD   NM_000110   二氢嘧啶脱氢酶
  DPYSL5   NM_020134   二氢嘧啶酶样5
  DRD1   NM_000794   多巴胺受体D1
  DSC3   NM_024423   桥粒胶蛋白3同种型Dsc3b前蛋白原
  DSG4   NM_177986   桥粒芯糖蛋白4
  DSPG3   NM_004950   硫酸皮肤素蛋白聚糖3前体
  DTWD2   NM_173666   含DTW结构域2
  DUSP10   NM_007207   双特异性磷酸酶10同种型a
  DUSP13   NM_001007271   肌肉限制性双特异性磷酸酶
  DUSP18   NM_152511   双特异性磷酸酶18
  DUSP2   NM_004418   双特异性磷酸酶2
  DUSP6   NM_001946   双特异性磷酸酶6同种型a
  DUSP8   NM_004420   双特异性磷酸酶8
  DUXA   NM_001012729   假定蛋白LOC503835
  DVL3   NM_004423   dishevelled 3
  DXS9879E   NM_006014   ESO3蛋白质
  DYNC1LI2   NM_006141   动力蛋白,细胞质,轻链中间体
  DYNLT1   NM_006519   t-复合体相关-睾丸表达1样1
  DYRK1A   NM_001396   双特异性酪氨酸-(Y)-磷酸化
  DYRK2   NM_003583   双特异性酪氨酸-(Y)-磷酸化
  DZIP1   NM_014934   DAZ相互作用蛋白质1同种型1
  E2F1   NM_005225   E2F转录因子1
  E2F2   NM_004091   E2F转录因子2
  E2F3   NM_001949   E2F转录因子3
  E2F5   NM_001951   E2F转录因子5
  EAF1   NM_033083   ELL相关因子1
  EBF3   NM_001005463   早期B细胞因子3
  EBI2   NM_004951   EBV-诱导的G蛋白偶联受体2
  EDA   NM_001005610   外胚层发育异常蛋白A同种型EDA-B
  EDA2R   NM_021783   X-连锁外胚层发育异常蛋白受体
  EDD1   NM_015902   E3遍在蛋白蛋白质连接酶,HECT结构域
  EDEM1   NM_014674   ER退化增强子,甘露糖苷酶α样
  EDG1   NM_001400   内皮分化,鞘脂
  EDG3   NM_005226   内皮分化,鞘脂
  EFHA2   NM_181723   EF手型结构域家族,成员A2
  EFNA1   NM_004428   肝配蛋白(ephrin)A1同种型a前体
  EFNB1   NM_004429   肝配蛋白-B1前体
  EFNB2   NM_004093   肝配蛋白B2
  EFTUD1   NM_024580   延伸因子Tu GTP结合结构域
  EGFL4   NM_001410   EGF样-结构域,多样的4
  EGLN1   NM_022051   egl 9同系物1
  EGLN3   NM_022073   egl 9同系物3
  EGR2   NM_000399   早期生长反应因子2蛋白质
  EGR3   NM_004430   早期生长反应因子3
  EHD3   NM_014600   含EH-结构域3
  EHHADH   NM_001966   烯酰辅酶A,水合酶/3-羟酰
  EHMT1   NM_024757   常染色质组蛋白甲基转移酶1
  EI24   NM_001007277   依托泊苷诱导的24同种型2
  EID-3   NM_152361   EID-2样分化抑制剂-3
  EIF2AK4   NM_001013703   真核翻译起始因子2α
  EIF2C1   NM_012199   真核翻译起始因子2C,1
  EIF2S1   NM_004094   真核翻译起始因子2,
  EIF3S2   NM_003757   真核翻译起始因子3,
  EIF4EBP2   NM_004096   真核翻译起始因子4E
  EIF4G2   NM_001418   真核翻译起始因子4
  EIF5   NM_001969   真核翻译起始因子5
  EIF5A2   NM_020390   eIF-5A2蛋白质
  ELK3   NM_005230   ELK3蛋白质
  Ells1   NM_152793   假定蛋白LOC222166
  ELMO1   NM_014800   吞入和细胞运动1同种型1
  ELMOD1   NM_018712   含ELMO结构域1
  EMR2   NM_013447   含egf样组件,黏蛋白样,激素
  EMX2   NM_004098   空气孔同系物2
  EN2   NM_001427   engrailed同系物2
  ENAH   NM_001008493   enabled同系物同种型a
  ENAM   NM_031889   Enamelin
  ENO2   NM_001975   烯醇化酶2
  ENPP4   NM_014936   胞外核苷酸焦磷酸酶/磷酸二酯酶
  ENPP5   NM_021572   胞外核苷酸焦磷酸酶/磷酸二酯酶
  ENSA   NM_207168   内磺肽α同种型8
  ENTPD4   NM_004901   外核苷三磷酸二磷酸水解酶
  ENTPD6   NM_001247   外核苷三磷酸二磷酸水解酶
  EPAS1   NM_001430   内皮PAS结构域蛋白质1
  EPB41   NM_004437   红细胞膜蛋白带4.1
  EPB41L1   NM_012156   红细胞膜蛋白带4.1样1
  EPB41L2   NM_001431   红细胞膜蛋白带4.1样2
  EPB41L4B   NM_019114   红细胞膜蛋白带4.1样4B
  EPB41L5   NM_020909   红细胞膜蛋白带4.1样5
  EPDR1   NM_017549   结直肠癌中上调基因1蛋白质
  EPHA4   NM_004438   肝配蛋白受体EphA4
  EPHA5   NM_004439   肝配蛋白受体EphA5同种型a
  EPHA7   NM_004440   肝配蛋白受体EphA7
  EPHB1   NM_004441   肝配蛋白受体EphB1前体
  EPHB4   NM_004444   肝配蛋白受体EphB4前体
  EPM2A   NM_005670   痫蛋白同种型a
  EPM2AIP1   NM_014805   EPM2A相互作用蛋白质1
  ERBB2IP   NM_001006600   ERBB2相互作用蛋白质同种型7
  ERBB3   NM_001982   erbB-3同种型1前体
  EREG   NM_001432   表皮调节素前体
  ERG   NM_004449   v-ets成红细胞增多症病毒E26癌基因样
  ERGIC1   NM_020462   内质网-高尔基体中间体
  ERN1   NM_152461   内质网至核信号转导1
  ERO1LB   NM_019891   内质网氧化还原酶1-Lβ
  ESR1   NM_000125   雌激素受体1
  ET   NM_024311   假定蛋白LOC79157
  ETF1   NM_004730   真核翻译终止因子1
  ETV1   NM_004956   ets变体基因1
  ETV5   NM_004454   ets变体基因5(ets相关分子)
  EVA1   NM_005797   上皮V样抗原1前体
  EXOSC1   NM_016046   外体核心蛋白质CSL4
  EYA1   NM_000503   缺眼1同种型b
  EYA4   NM_004100   缺眼4同种型a
  EZH1   NM_001991   zeste增强子同系物1
  F11R   NM_016946   F11受体同种型a前体
  F2R   NM_001992   凝血因子II受体前体
  F2RL1   NM_005242   凝血因子II(凝血酶)受体样1
  F2RL2   NM_004101   凝血因子II(凝血酶)受体样2
  F2RL3   NM_003950   凝血因子II(凝血酶)受体样3
  F3   NM_001993   凝血因子III前体
F9 NM_000133 凝血因子IX
  FADS1   NM_013402   脂肪酸去饱和酶1
  FADS6   NM_178128   脂肪酸去饱和酶结构域家族,成员6
  FAHD1   NM_031208   含延胡索酰乙酰乙酸水解酶结构域
  FAIM2   NM_012306   Fas细胞凋亡抑制分子2
  FAM102A   NM_203305   早期雌激素-诱导的基因1蛋白质同种型b
  FAM106A   NM_024974   假定蛋白LOC80039
  FAM107A   NM_007177   肾细胞癌中下调
  FAM107B   NM_031453   假定蛋白LOC83641
  FAM13A1   NM_001015045   具有序列相似性的家族13,成员A1
  FAM13C1   NM_001001971   假定蛋白LOC220965同种型2
  FAM18B   NM_016078   假定蛋白LOC51030
  FAM19A1   NM_213609   具有序列相似性的家族19(趋化因子
  FAM36A   NM_198076   具有序列相似性的家族36,成员A
  FAM3A   NM_021806   家族3,成员A蛋白质
  FAM3C   NM_014888   预测的成骨细胞蛋白质
  FAM40A   NM_033088   假定蛋白LOC85369
  FAM40B   NM_020704   假定蛋白LOC57464
  FAM43A   NM_153690   假定蛋白LOC131583
  FAM45A   NM_207009   假定蛋白LOC404636
  FAM45B   NM_018472   假定蛋白LOC55855
  FAM46C   NM_017709   假定蛋白LOC54855
  FAM46D   NM_152630   假定蛋白LOC169966
  FAM53B   NM_014661   假定蛋白LOC9679
  FAM53C   NM_016605   家族53,成员C蛋白质
  FAM54B   NM_019557   假定蛋白LOC56181
  FAM55C   NM_145037   假定蛋白LOC91775
  FAM57A   NM_024792   具有序列相似性的家族57,成员A
  FAM60A   NM_021238   具有序列相似性的家族60,成员A
  FAM62B   NM_020728   具有序列相似性的家族62(C2结构域
  FAM65A   NM_024519   假定蛋白LOC79567
  FAM70A   NM_017938   假定蛋白LOC55026
  FAM73A   NM_198549   假定蛋白LOC374986
  FAM73B   NM_032809   假定蛋白LOC84895
  FAM79A   NM_182752   假定蛋白LOC127262
  FAM79B   NM_198485   假定蛋白LOC285386
  FAM82C   NM_018145   具有序列相似性的家族82,成员C
  FAM83D   NM_030919   假定蛋白LOC81610
  FAM83E   NM_017708   假定蛋白LOC54854
  FAM83H   NM_198488   假定蛋白LOC286077
  FAM84B   NM_174911   乳癌膜蛋白质101
  FAM86C   NM_018172   假定蛋白LOC55199同种型1
  FAM8A1   NM_016255   常染色体高保守蛋白质
  FAM98B   NM_173611   假定蛋白LOC283742
  FANCC   NM_000136   范科尼贫血,互补群C
  FANCD2   NM_033084   范科尼贫血互补群D2同种型
  FARSLB   NM_005687   苯丙氨酸-tRNA合成酶样,β
  FASLG   NM_000639   fas配体
  FASTK   NM_006712   Fas-激活的丝氨酸/苏氨酸激酶同种型1
  FAT2   NM_001447   FAT肿瘤抑制物2前体
  FBLIM1   NM_001024216   细丝蛋白结合LIM蛋白质-1同种型c
  FBLN1   NM_006486   纤蛋白1同种型D
  FBN2   NM_001999   原纤蛋白2前体
  FBXL11   NM_012308   F-盒和亮氨酸丰富重复蛋白质11
  FBXL18   NM_024963   F-盒和亮氨酸丰富重复蛋白质18
  FBXL22   NM_203373   假定蛋白LOC283807
  FBXL3   NM_012158   F-盒和亮氨酸丰富重复蛋白质3
  FBXL5   NM_012161   F-盒和亮氨酸丰富重复蛋白质5同种型
  FBXL7   NM_012304   F-盒和亮氨酸丰富重复蛋白质7
  FBXO11   NM_025133   只有F-盒蛋白质11同种型1
  FBXO18   NM_032807   只有F-盒蛋白质,解旋酶,18同种型1
  FBXO21   NM_015002   只有F-盒蛋白质21同种型2
  FBXO27   NM_178820   F-盒蛋白质27
  FBXO31   NM_024735   F-盒蛋白质31
  FBXO39   NM_153230   F-盒蛋白质39
  FBXO40   NM_016298   F-盒蛋白质40
  FBXO6   NM_018438   F-盒only蛋白质6
  FBXO9   NM_012347   F-盒only蛋白质9同种型1
  FBXW11   NM_012300   F-盒和WD-40结构域蛋白质1B同种型C
  FCHO2   NM_138782   FCH结构域only 2
  FCMD   NM_006731   Fukutin
  FEM1C   NM_020177   雌性化1同系物a
  FEZ2   NM_005102   zygin 2
  FGD1   NM_004463   颜面生殖器发育不良蛋白质
  FGD4   NM_139241   FYVE,含RhoGEF和PH结构域4
  FGD5   NM_152536   FYVE,含RhoGEF和PH结构域5
  FGF2   NM_002006   成纤维细胞生长因子2
  FGF4   NM_002007   成纤维细胞生长因子4前体
  FGF5   NM_004464   成纤维细胞生长因子5同种型1前体
  FGF7   NM_002009   成纤维细胞生长因子7前体
  FGFR1   NM_023107   成纤维细胞生长因子受体1同种型5
  FGFR2   NM_022973   成纤维细胞生长因子受体2同种型6
  FGL2   NM_006682   血纤蛋白原样2
  FIGNL1   NM_022116   fidgetin样1
  FJX1   NM_014344   四连接盒1
  FKBP14   NM_017946   FK506结合蛋白14,22kDa
  FKBP1B   NM_004116   FK506-结合蛋白1B同种型a
  FKBP5   NM_004117   FK506结合蛋白5
  FKRP   NM_024301   fukutin相关蛋白质
  FLG2   NM_001014342   聚丝蛋白2
  FLJ10159   NM_018013   假定蛋白LOC55084
  FLJ10241   NM_018035   假定蛋白LOC55101
  FLJ10357   NM_018071   假定蛋白LOC55701
  FLJ10781   NM_018215   假定蛋白LOC55228
  FLJ10803   NM_018224   假定蛋白LOC55744
  FLJ10925   NM_018275   假定蛋白LOC55262
  FLJ11021   NM_023012   假定蛋白LOC65117同种型a
  FLJ11151   NM_018340   假定蛋白LOC55313
  FLJ11171   NM_018348   假定蛋白LOC55783
  FLJ11259   NM_018370   假定蛋白LOC55332
  FLJ11292   NM_018382   假定蛋白LOC55338
  FLJ11806   NM_024824   核蛋白质UKp68同种型1
  FLJ12331   NM_024986   假定蛋白LOC80052
  FLJ12505   NM_024749   假定蛋白LOC79805
  FLJ12949   NM_023008   假定蛋白LOC65095同种型1
  FLJ13236   NM_024902   假定蛋白FLJ13236
  FLJ13576   NM_022484   假定蛋白LOC64418
  FLJ13639   NM_024705   假定蛋白FLJ13639同种型2
  FLJ13646   NM_024584   假定蛋白LOC79635
  FLJ13841   NM_024702   假定蛋白LOC79755
  FLJ13946   NM_152275   假定蛋白LOC92104
  FLJ13984   NM_024770   假定蛋白LOC79828
  FLJ14107   NM_025026   假定蛋白LOC80094
  FLJ14213   NM_024841   假定蛋白LOC79899
  FLJ14397   NM_032779   假定蛋白LOC84865
  FLJ14437   NM_032578   肌钯蛋白
  FLJ14466   NM_032790   假定蛋白LOC84876
  FLJ14503   NM_152780   假定蛋白LOC256714
  FLJ16008   NM_001001665   假定蛋白LOC339761
  FLJ16237   NM_001004320   假定蛋白LOC392636
  FLJ16542   NM_001004301   假定蛋白LOC126017
  FLJ20032   NM_017628   假定蛋白LOC54790
  FLJ20186   NM_207514   FDCP中差异表达8同种型1
  FLJ20294   NM_017749   假定蛋白LOC55626
  FLJ20298   NM_017752   假定蛋白LOC54885同种型a
  FLJ20366   NM_017786   假定蛋白FLJ20366
  FLJ20487   NM_017841   假定蛋白LOC54949
  FLJ20489   NM_017842   假定蛋白LOC55652
  FLJ20758   NM_017952   假定蛋白LOC55037
  FLJ20972   NM_025030   假定蛋白LOC80098
  FLJ21125   NM_024627   假定蛋白LOC79680
  FLJ21657   NM_022483   假定蛋白LOC64417
  FLJ21687   NM_024859   含PDZ结构域,X染色体
  FLJ21736   NM_024922   酯酶31
  FLJ21945   NM_025203   假定蛋白LOC80304
  FLJ21963   NM_024560   假定蛋白LOC79611
  FLJ23235   NM_024943   假定蛋白LOC80008
  FLJ23322   NM_024955   假定蛋白LOC80020
  FLJ23447   NM_024825   假定蛋白LOC79883
  FLJ23834   NM_152750   假定蛋白LOC222256
  FLJ23861   NM_152519   假定蛋白LOC151050
  FLJ25102   NM_182626   假定蛋白LOC348738
  FLJ25328   NM_152483   假定蛋白LOC148231
  FLJ25416   NM_145018   假定蛋白LOC220042
  FLJ25476   NM_152493   假定蛋白LOC149076
  FLJ25477   NM_152704   假定蛋白LOC219287同种型1
  FLJ25530   NM_152722   肝细胞细胞黏着分子
  FLJ25773   NM_182560   假定蛋白LOC283598
  FLJ27365   NM_207477   假定蛋白LOC400931
  FLJ30294   NM_144632   假定蛋白LOC130827
  FLJ31132   NM_001004355   假定蛋白LOC441522
  FLJ31568   NM_152509   假定蛋白LOC150244
  FLJ31659   NM_153027   假定蛋白LOC152756
  FLJ31818   NM_152556   假定蛋白LOC154743
  FLJ31951   NM_144726   假定蛋白LOC153830
  FLJ32028   NM_152680   假定蛋白LOC201799
  FLJ32214   NM_152473   假定蛋白LOC147664
  FLJ32549   NM_152440   假定蛋白LOC144577
  FLJ32675   NM_173811   假定蛋白LOC283254
  FLJ33860   NM_173644   假定蛋白LOC284756
  FLJ34969   NM_152678   假定蛋白LOC201627
  FLJ35119   NM_175871   假定蛋白LOC126074
  FLJ35429   NM_001003807   假定蛋白LOC285830
  FLJ35530   NM_207467   假定蛋白LOC400798
  FLJ35695   NM_207444   假定蛋白LOC400359
  FLJ35848   NM_001033659   假定蛋白LOC284071
  FLJ35934   NM_207453   假定蛋白LOC400579
  FLJ36031   NM_175884   假定蛋白LOC168455
  FLJ36090   NM_153223   假定蛋白LOC153241
  FLJ36268   NM_207511   假定蛋白LOC401563
  FLJ37543   NM_173667   假定蛋白LOC285668
  FLJ37562   NM_152409   假定蛋白LOC134553
  FLJ38101   NM_153261   假定蛋白LOC255919
  FLJ38288   NM_173632   假定蛋白LOC284309
  FLJ38663   NM_152269   假定蛋白LOC91574
  FLJ38717   NM_001004322   假定蛋白LOC401261
  FLJ38973   NM_153689   假定蛋白LOC205327
  FLJ38991   NM_173827   线粒体COX18同种型6
  FLJ39237   NM_198571   假定蛋白LOC375607
  FLJ39502   NM_173648   假定蛋白LOC285025
  FLJ39653   NM_152684   假定蛋白LOC202020
  FLJ40172   NM_173649   假定蛋白LOC285051
  FLJ40194   NM_001007529   假定蛋白LOC124871
  FLJ40453   NM_001007542   假定蛋白LOC401217
  FLJ40919   NM_182508   假定蛋白LOC144809
  FLJ41170   NM_001004332   假定蛋白LOC440200
  FLJ41821   NM_001001697   假定蛋白LOC401011
  FLJ42102   NM_001001680   假定蛋白LOC399923
  FLJ42133   NM_001001690   假定蛋白LOC400844
  FLJ42289   NM_207383   假定蛋白LOC388182
  FLJ42842   NM_001004335   假定蛋白LOC440446
  FLJ42957   NM_207436   假定蛋白LOC400077
  FLJ43582   NM_207412   假定蛋白LOC389649
  FLJ44006   NM_001001696   假定蛋白LOC400997
  FLJ44060   NM_207366   假定蛋白LOC346288
  FLJ44290   NM_198564   假定蛋白LOC375347
  FLJ44385   NM_207478   假定蛋白LOC400934
  FLJ44790   NM_001001691   假定蛋白LOC400850
  FLJ44815   NM_207454   假定蛋白LOC400591
  FLJ45187   NM_207371   假定蛋白LOC387640
  FLJ45202   NM_207507   假定蛋白LOC401508
  FLJ45224   NM_207510   假定蛋白LOC401562
  FLJ45248   NM_207505   假定蛋白LOC401472
  FLJ45256   NM_207448   假定蛋白LOC400511
  FLJ45337   NM_207465   假定蛋白LOC400754
  FLJ45422   NM_001004349   假定蛋白LOC441140
  FLJ45645   NM_198557   假定蛋白LOC375287
  FLJ45909   NM_198445   假定蛋白LOC126432
  FLJ46247   NM_198529   假定蛋白LOC374786同种型1
  FLJ46363   NM_207434   假定蛋白LOC400002
  FLJ46385   NM_001001675   假定蛋白LOC390963
  FLJ90013   NM_153365   假定蛋白LOC202018
  FLJ90396   NM_153358   假定蛋白LOC163049
  FLJ90579   NM_173591   假定蛋白LOC28331O
  FLJ90757   NM_001004336   假定蛋白LOC440465
  FLRT2   NM_013231   纤连蛋白亮氨酸丰富跨膜蛋白质
  FLT1   NM_002019   fms相关酪氨酸激酶1(血管的
  FLYWCH1   NM_032296   FLYWCH-类型锌指1同种型a
  FMNL2   NM_001004417   成蛋白样2同种型D
  FMNL3   NM_175736   成蛋白样3同种型1
  FMO3   NM_001002294   含黄素单加氧酶3同种型2
  FMOD   NM_002023   纤调蛋白前体
  FNBP1   NM_015033   成蛋白结合蛋白1
  FNBP1L   NM_001024948   成蛋白结合蛋白1样同种型1
  FNBP4   NM_015308   成蛋白结合蛋白4
  FNDC3A   NM_014923   含纤连蛋白类型III结构域3A
  FNDC3B   NM_022763   含纤连蛋白类型III结构域3B
  FNDC5   NM_153756   含纤连蛋白类型III结构域5
  FOSL1   NM_005438   FOS样抗原1
  FOXA1   NM_004496   叉头盒A1
  FOXF1   NM_001451   叉头盒F1
  FOXJ2   NM_018416   叉头盒J2
  FOXJ3   NM_014947   叉头盒J3
  FOXL2   NM_023067   叉头盒L2
  FOXQ1   NM_033260   叉头盒Q1
  FPGT   NM_003838   岩藻糖1磷酸乌苷转移酶
  FRAT2   NM_012083   GSK-3结合蛋白FRAT2
  FREQ   NM_014286   频蛋白同系物
  FRMD4A   NM_018027   含FERM结构域4A
  FRMD6   NM_152330   含FERM结构域6
  FTS   NM_001012398   融合的toes同系物
  FUBP1   NM_003902   远端上游元件结合蛋白质
  FUCA2   NM_032020   岩藻糖苷酶,α-L-2,原生质
  FUNDC2   NM_023934   含FUN14结构域2
  FURIN   NM_002569   弗林蛋白酶前蛋白原
  FUSIP1   NM_054016   FUS相互作用蛋白质(丝氨酸-精氨酸丰富)1
  FUT2   NM_000511   岩藻糖基转移酶2(含分泌状态)
  FUT3   NM_000149   岩藻糖基转移酶3(半乳糖苷
  FUT4   NM_002033   岩藻糖基转移酶4
  FUT5   NM_002034   岩藻糖基转移酶5
  FUT6   NM_000150   岩藻糖基转移酶6(α(1,3)
  FXN   NM_000144   弗氏共济失调蛋白同种型1前蛋白原
  FXR1   NM_001013438   脆性X智力低下相关蛋白1
  FXYD6   NM_022003   含FXYD结构域离子转运调节物
  FYCO1   NM_024513   含FYVE和卷曲螺旋结构域1
  FZD10   NM_007197   frizzled 10
  FZD4   NM_012193   frizzled 4
  FZD6   NM_003506   frizzled 6
  FZD7   NM_003507   frizzled 7
  GAB1   NM_002039   GRB2相关结合蛋白1同种型b
  GAB2   NM_012296   GRB2相关结合蛋白2同种型b
  GAB3   NM_080612   Gab3蛋白质
  GABBR1   NM_001470   γ-氨基丁酸(GABA)B受体1
  GABBR2   NM_005458   G蛋白偶联受体51
  GABPB2   NM_005254   GA结合蛋白转录因子,β
  GABRE   NM_004961   γ-氨基丁酸(GABA)A受体,
  GABRG1   NM_173536   γ-氨基丁酸A受体,γ1
  GABRG2   NM_198904   γ-氨基丁酸A受体,γ2
  GAK   NM_005255   细胞周期蛋白G相关的激酶
  GALIG   NM_194327   半乳凝素-3内部基因
  GALK2   NM_001001556   半乳糖激酶2同种型2
  GALM   NM_138801   半乳糖变旋酶(醛糖1-表异构酶)
  GALNT3   NM_004482   多肽N-乙酰氨基半乳糖转移酶3
  GALNT4   NM_003774   多肽N-乙酰氨基半乳糖转移酶4
  GALNT6   NM_007210   多肽N-乙酰氨基半乳糖转移酶6
  GALNTL2   NM_054110   UDP-N-乙酰基-α-D-半乳糖胺:多肽
  GAN   NM_022041   巨轴突蛋白
  GARS   NM_002047   甘氨酰-tRNA合成酶
  GAS7   NM_003644   生长停滞-特异性7同种型a
  GAS8   NM_001481   生长停滞-特异性8
  GATA6   NM_005257   GATA结合蛋白6
  GATAD1   NM_021167   含GATA锌指结构域1
  GATS   NM_178831   STAG的反链转录单位3
  GBF1   NM_004193   高尔基体-特异性布雷菲德菌素A抗性因子1
  GBP1   NM_002053   乌苷酸结合蛋白1,
  GBP3   NM_018284   乌苷酸结合蛋白3
  GBP4   NM_052941   乌苷酸结合蛋白4
  GCC2   NM_014635   含GRIP和卷曲螺旋结构域2同种型
  GCET2   NM_001008756   生发中心表达的转录物2同种型
  GCLM   NM_002061   谷氨酸-半胱氨酸连接酶调节蛋白质
  GCNT2   NM_001491   葡糖胺(N-乙酰)转移酶2,
  GCNT4   NM_016591   核心2β-1,6-N-乙酰葡糖胺转移酶
  Gcom1   NM_001018100   GRINL1A上游蛋白质同种型7
  GDA   NM_004293   乌嘌呤脱氨酶
  GDPD1   NM_182569   甘油磷酸二酯磷酸二酯酶结构域
  GEMIN7   NM_001007269   gemin 7
  GENX-3414   NM_003943   genethonin 1
  GFER   NM_005262   erv1样生长因子
  GGA1   NM_001001561   高尔基体相关的,含γ衔接蛋白耳,
  GGT6   NM_153338   γ-谷氨酰基转移酶6同系物
  GIMAP8   NM_175571   GTP酶,IMAP家族成员8
  GIOT-1   NM_153257   促性腺激素可诱导的转录阻抑物
  GIPC2   NM_017655   PDZ结构域蛋白质GIPC2
  GIT2   NM_014776   G蛋白偶联受体激酶-相互作用分子2
  GJA1   NM_000165   间隙连接连接蛋白43
  GJB7   NM_198568   假定蛋白LOC375519
  GKAP1   NM_025211   G激酶锚定蛋白质1
  GLB1L   NM_024506   半乳糖苷酶,β1样
  GLDN   NM_181789   Collomin
  GLO1   NM_006708   乙二醛酶I
  GLT25D2   NM_015101   含糖基转移酶25结构域2
  GLTP   NM_016433   糖脂转运蛋白质
  GM632   NM_020713   假定蛋白LOC57473
  GMCL1   NM_178439   生殖细胞更少
  GMCL1L   NM_022471   生殖细胞更少同系物1(果蝇)样
  GMFB   NM_004124   胶质成熟因子,β
  GNAI1   NM_002069   乌嘌呤核苷酸结合蛋白(G蛋白质),
  GNAZ   NM_002073   乌嘌呤核苷酸结合蛋白质,αz
  GNB5   NM_006578   鸟嘌呤核苷酸结合蛋白质,β-5
  GNE   NM_005476   UDP-N-乙酰葡糖胺-2-表异构酶/N-
  GNPDA2   NM_138335   葡糖胺-6-磷酸脱氨酶2
  GNPNAT1   NM_198066   葡糖胺-磷酸N-乙酰转移酶1
  GNPTAB   NM_024312   N-乙酰葡糖胺-1-磷酸转移酶
  GNS   NM_002076   葡糖胺(N-乙酰)-6-硫酸酯酶前体
  GOLGA1   NM_002077   高尔基体蛋白97
  GOLGA2   NM_004486   高尔基体自身抗原,高尔基体蛋白亚家族a,2
  GOLPH2   NM_016548   高尔基体磷蛋白2
  GOLPH3   NM_022130   高尔基体磷蛋白3
  GORASP1   NM_031899   高尔基体再组装堆叠蛋白质1
  GOSR1   NM_001007024   高尔基体SNAP受体复合体成员1同种型3
  GP5   NM_004488   糖蛋白V(血小板)
  GPAM   NM_020918   线粒体甘油3-磷酸
  GPATC2   NM_018040   含G patch结构域2
  GPD1   NM_005276   甘油-3-磷酸脱氢酶1(可溶的)
  GPIAP1   NM_005898   膜组分10号染色体表面标志物
  GPR1   NM_005279   G蛋白偶联受体1
  GPR114   NM_153837   G-蛋白偶联受体114
  GPR126   NM_001032394   G蛋白偶联受体126α2
  GPR132   NM_013345   G蛋白偶联受体132
  GPR135   NM_022571   G蛋白偶联受体135
  GPR137B   NM_003272   跨膜7超家族成员1
  GPR155   NM_001033045   G蛋白偶联受体155
  GPR176   NM_007223   假定的G蛋白偶联受体
  GPR180   NM_180989   G蛋白偶联受体180前体
  GPR26   NM_153442   G蛋白偶联受体26
  GPR3   NM_005281   G蛋白偶联受体3
  GPR37   NM_005302   G蛋白偶联受体37
  GPR45   NM_007227   G蛋白偶联受体45
  GPR6   NM_005284   G蛋白偶联受体6
  GPR81   NM_032554   G蛋白偶联受体81
  GPR83   NM_016540   G蛋白偶联受体83
  GPR85   NM_018970   G蛋白偶联受体85
  GRAMD1A   NM_020895   假定蛋白LOC57655
  GRB2   NM_002086   生长因子受体结合蛋白质2同种型
  GREB1   NM_148903   GREB1蛋白质同种型c
  GRHL2   NM_024915   转录因子CP2样3
  GRIN3A   NM_133445   谷氨酸受体,离子型,
  GRIPAP1   NM_207672   GRIP1相关蛋白1同种型2
  GRM1   NM_000838   谷氨酸受体,代谢型1
  GRM6   NM_000843   谷氨酸受体,代谢型6前体
  GRM7   NM_000844   谷氨酸受体,代谢型7同种型a
  GRPEL2   NM_152407   GrpE样2,线粒体
  GRTP1   NM_024719   生长激素调节的TBC蛋白质1
  GSTM3   NM_000849   谷胱甘肽S-转移酶M3
  GTDC1   NM_001006636   含糖基转移酶样结构域1
  GTF2H2   NM_001515   通用转录因子IIH,多肽2,
  GTPBP5   NM_015666   GTP结合蛋白5
  GUCA1B   NM_002098   乌苷酸环化酶激活因子1B(视网膜)
  GUCY1A3   NM_000856   鸟苷酸环化酶1,可溶的,α3
  GUCY1B2   NM_004129   乌苷酸环化酶1,可溶的,β2
  GYS1   NM_002103   糖原合酶1(肌肉)
  H2AFJ   NM_018267   H2A组蛋白家族,成员J同种型1
  H2AFY2   NM_018649   核心组蛋白macroH2A2.2
  H6PD   NM_004285   己糖-6-磷酸脱氢酶前体
  HARS   NM_002109   组氨酰-tRNA合成酶
  HBP1   NM_012257   HMG-盒转录因子1
  HBS1L   NM_006620   HBS1样
  HBXIP   NM_006402   乙型肝炎病毒x-相互作用蛋白质
  HCCS   NM_005333   全细胞色素c合酶(细胞色素c
  HCLS1   NM_005335   造血细胞-特异性Lyn底物1
  HCP5   NM_006674   HLA复合体P5
  HDAC4   NM_006037   组蛋白脱乙酰基酶4
  HDCMA18P   NM_016648   假定蛋白LOC51574
  HDHD1A   NM_012080   卤酸脱卤酶样水解酶结构域
  HECA   NM_016217   头套(headcase)
  HECTD2   NM_182765   含HECT结构域2同种型a
  HEMK1   NM_016173   HemK甲基转移酶家族成员1
  HERPUD2   NM_022373   假定蛋白LOC64224
  HERV-FRD   NM_207582   HERV-FRD原病毒祖先Env多蛋白
  HES2   NM_019089   发状分裂相关增强子同系物2
  HEY2   NM_012259   具YRPW模体的发状分裂相关增强子
  HIAT1   NM_033055   海马丰富转录物1
  HIC2   NM_015094   癌症中高甲基化2
  HIF1A   NM_001530   缺氧-可诱导因子1,α亚基
  HIG2   NM_013332   缺氧-可诱导蛋白质2
  HIP1   NM_005338   亨廷顿蛋白相互作用蛋白质1
  HIP1R   NM_003959   亨廷顿蛋白相互作用蛋白质-1相关
  HIST1H2AG   NM_021064   H2A组蛋白家族,成员P
  HK1   NM_000188   己糖激酶1同种型HKI
  HLA-DOA   NM_002119   主要组织相容性复合体,类II,DO
  HLCS   NM_000411   羧化全酶合成酶
  HLF   NM_002126   肝白血病因子
  HM13   NM_178582   次要组织相容性抗原13同种型4
  HMGA2   NM_001015886   高迁移率族AT钩2同种型c
  HMGB3   NM_005342   高迁移率族蛋白3
  HMGCLL1   NM_019036   3-羟甲基-3-甲基戊二酰辅酶A
  HMGN4   NM_006353   高迁移率族核小体结合结构域
  HMOX1   NM_002133   血红素氧化酶(脱环)1
  HN1   NM_001002032   血液和神经表达1
  HNF4G   NM_004133   肝细胞核因子4,γ
  HNMT   NM_006895   组胺N-甲基转移酶同种型1
  HNRPH2   NM_001032393   核不均一核糖核蛋白H2
  HNRPU   NM_004501   核不均一核糖核蛋白U
  HNT   NM_016522   Neurotrimin
  HOOK3   NM_032410   高尔基体相关微管结合蛋白质
  HOXA3   NM_030661   同源框A3同种型a
  HOXB13   NM_006361   同源框B13
  HOXB4   NM_024015   同源框B4
  HP1BP3   NM_016287   HP1-BP74
  HPCAL4   NM_016257   海马钙蛋白样蛋白质4
  HPGD   NM_000860   羟基前列腺素脱氢酶15-(NAD)
  HPS5   NM_007216   Hermansky-Pudlak综合征5同种型b
  HRB   NM_004504   HIV-1Rev结合蛋白质
  HRB2   NM_007043   HIV-1rev结合蛋白2
  HRBL   NM_006076   HIV-1Rev结合蛋白质样蛋白质
  HRH2   NM_022304   组胺受体H2
  HRH4   NM_021624   组胺H4受体
  HS2ST1   NM_012262   硫酸乙酰肝素2-O-磺基转移酶1
  HS3ST4   NM_006040   硫酸乙酰肝素D-葡糖胺
  HSC20   NM_172002   J-类型共-蛋白伴侣HSC20
  HSD17B7   NM_016371   羟基类固醇(17-β)脱氢酶7
  HSPA5   NM_005347   热应激70kDa蛋白质5(葡萄糖调节的
  HSPA6   NM_002155   热应激70kDa蛋白质6(HSP70B′)
  HSPA8   NM_006597   热应激70kDa蛋白质8同种型1
  HSPC047   NM_014147   假定蛋白LOC29060
  HSPC065   NM_014157   假定蛋白LOC29070
  HSPC268   NM_197964   假定蛋白LOC154791
  HSPH1   NM_006644   热应激105kD
  HTR2A   NM_000621   5-羟色胺受体2A
  HUNK   NM_014586   激素上调Neu相关激酶
  HYAL3   NM_003549   透明质酸葡糖胺酶3
  HYPK   NM_016400   亨廷顿蛋白相互作用蛋白质K
  IAPP   NM_000415   胰岛淀粉状蛋白多肽前体
  ICAM4   NM_001544   细胞间黏附分子4同种型1
  ICMT   NM_012405   异戊二烯半胱氨酸羧基1甲基转移酶
  IFIT1   NM_001548   干扰素-诱导的蛋白质含
  IFIT3   NM_001549  干扰素-诱导的蛋白质含
  IFIT5   NM_012420  干扰素-诱导的蛋白质含
  IFNAR1   NM_000629  干扰素-α受体1前体
  IFNAR2   NM_207585  干扰素α/β受体2同种型a
  IFRD2   NM_006764  干扰素相关发育调节物2
  IFT80   NM_020800  WD重复结构域56
  IGF2BP1   NM_006546  胰岛素样生长因子2mRNA结合
  IGFBP5   NM_000599  胰岛素样生长因子结合蛋白5
  IGFBP7   NM_001553  胰岛素样生长因子结合蛋白7
  IGFL3   NM_207393  胰岛素生长因子样家族成员3
  IHPK1   NM_001006115  肌醇六磷酸激酶1同种型2
  IKBKB   NM_001556  κ轻链多肽基因抑制剂
  IKIP   NM_153687  IKK相互作用蛋白质同种型1
  IL10   NM_000572  白细胞介素10前体
  IL10RA   NM_001558  白细胞介素10受体,α前体
  IL11   NM_000641  白细胞介素11前体
  IL12RB2   NM_001559  白细胞介素12受体,β2前体
  IL17E   NM_022789  白细胞介素17E同种型1前体
  IL17F   NM_052872  白细胞介素17F前体
  IL17RB   NM_172234  白细胞介素17B受体同种型2前体
  IL17RD   NM_017563  白细胞介素17受体D
  IL1F5   NM_012275  白细胞介素1家族,成员5
  IL1R1   NM_000877  白细胞介素1受体,类型I前体
  IL1RAP   NM_002182  白细胞介素1受体辅助蛋白同种型
  IL1RL1   NM_003856  白细胞介素1受体样1同种型2
  IL23R   NM_144701  白细胞介素23受体前体
  IL27RA   NM_004843  I类细胞因子受体
  IL28RA   NM_173065  白细胞介素28受体,α同种型3
  IL6R   NM_000565  白细胞介素6受体同种型1前体
  IL8   NM_000584  白细胞介素8前体
  ILDR1   NM_175924  含免疫球蛋白样结构域受体
  ILKAP   NM_176799  整联蛋白相连的激酶相关蛋白
  IMPAD1   NM_017813  肌醇一磷酸酶A3
  INHBA   NM_002192  抑制素βA前体
  INHBE   NM_031479  激活素βE
  INOC1   NM_017553   INO80复合体同系物1
  INPP5B   NM_005540   肌醇多磷酸-5-磷酸酶,75kDa
  INPP5F   NM_014937   肌醇多磷酸-5-磷酸酶F同种型
  INTS5   NM_030628   整合子复合体亚基5
  INTS7   NM_015434   整合子复合体亚基7
  IPO8   NM_006390   输入蛋白8
  IPP   NM_005897   脑池内A颗粒促多肽
  IPPK   NM_022755   肌醇1,3,4,5,6-五磷酸2-激酶
  IQCC   NM_018134   含IQ模体C
  IQSEC1   NM_014869   IQ模体和Sec7结构域1
  IQSEC2   NM_015075   IQ模体和Sec7结构域2
  IRAK1   NM_001025242   白细胞介素-1受体相关激酶1
  IRAK4   NM_016123   白细胞介素-1受体相关激酶4
  IRF1   NM_002198   干扰素调节因子1
  IRXL1   NM_173576   假定蛋白LOC283078
  ISG20L1   NM_022767   干扰素刺激的外切核酸酶基因
  ISGF3G   NM_006084   干扰素-刺激的转录因子3,
  ITCH   NM_031483   痒同系物E3遍在蛋白蛋白质连接酶
  ITFG1   NM_030790   T细胞免疫调节蛋白质
  ITGA10   NM_003637   整联蛋白,α10前体
  ITGA4   NM_000885   整联蛋白α4前体
  ITGAL   NM_002209   整联蛋白αL前体
  ITGB1   NM_002211   整联蛋白β1同种型1A前体
  ITGB8   NM_002214   整联蛋白,β8
  ITGBL1   NM_004791   整联蛋白,β样1(具有EGF样重复
  ITIH5   NM_001001851   间α胰蛋白酶抑制剂重链
  ITIH5L   NM_198510   假定蛋白LOC347365
  ITPK1   NM_014216   肌醇1,3,4-三磷酸5/6激酶
  ITPKB   NM_002221   1D-肌醇-三磷酸3-激酶B
  ITSN2   NM_147152   交叉蛋白2同种型2
  IVNS1ABP   NM_006469   流感病毒NS1A结合蛋白同种型a
  IXL   NM_017592   雌雄间性样
  JAZF1   NM_175061   并列锌指基因1
  JOSD1   NM_014876   假定蛋白LOC9929
  JRKL   NM_003772   jerky同系物样
  JUB   NM_032876   jub,ajuba同系物同种型1
  KAL1   NM_000216   Kallmann综合征1蛋白质
  KATNAL1   NM_001014380   剑蛋白p60亚基A样1
  KBTBD6   NM_152903   含kelch重复和BTB(POZ)结构域6
  KBTBD8   NM_032505   T细胞激活kelch重复蛋白质
  KCNA7   NM_031886   钾电压门控通道,shaker相关
  KCNB1   NM_004975   钾电压门控通道,Shab相关
  KCNH5   NM_139318   钾电压门控通道,亚家族H,
  KCNH6   NM_030779   钾电压门控通道,亚家族H,
  KCNH8   NM_144633   钾电压门控通道,亚家族H,
  KCNJ10   NM_002241   钾内向整流通道,亚家族
  KCNJ16   NM_018658   钾内向整流通道J16
  KCNJ8   NM_004982   钾内向整流通道J8
  KCNJ9   NM_004983   钾内向整流通道亚家族
  KCNK1   NM_002245   钾通道,亚家族K,成员1
  KCNK2   NM_001017424   钾通道,亚家族K,成员2同种型
  KCNK3   NM_002246   钾通道,亚家族K,成员3
  KCNK6   NM_004823   钾通道,亚家族K,成员6
  KCNMA1   NM_001014797   大电导钙激活钾
  KCNQ2   NM_004518   钾电压门控通道KQT样蛋白质
  KCNRG   NM_199464   钾通道调节物同种型2
  KCNT2   NM_198503   钾通道,亚家族T,成员2
  KCTD18   NM_152387   钾通道四聚体化结构域
  KDELC2   NM_153705   含KDEL(Lys-Asp-Glu-Leu)2
  KEAP1   NM_012289   kelch样ECH相关蛋白1
  KIAA0082   NM_015050   假定蛋白LOC23070
  KIAA0143   NM_015137   假定蛋白LOC23167
  KIAA0157   NM_032182   假定蛋白LOC23172
  KIAA0240   NM_015349   假定蛋白LOC23506
  KIAA0247   NM_014734   假定蛋白LOC9766
  KIAA0319   NM_014809   KIAA0319
  KIAA0319L   NM_024874   多囊肾病1样同种型a
  KIAA0355   NM_014686   假定蛋白LOC9710
  KIAA0367   NM_015225   在羧基端包含BNIP2模体的分子
  KIAA0404   NM_015104   假定蛋白LOC23130
  KIAA0427   NM_014772   假定蛋白LOC9811
  KIAA0446   NM_014655   假定蛋白LOC9673
  KIAA0467   NM_015284   KIAA0467蛋白质
  KIAA0494   NM_014774   假定蛋白LOC9813
  KIAA0495   NM_207306   KIAA0495
  KIAA0513   NM_014732   假定蛋白LOC9764
  KIAA0562   NM_014704   甘氨酸-,谷氨酸-,
  KIAA0564   NM_015058   假定蛋白LOC23078同种型a
  KIAA0649   NM_014811   1A6/DRIM(在转移中下调)
  KIAA0664   NM_015229   假定蛋白LOC23277
  KIAA0773   NM_001031690   假定蛋白LOC9715
  KIAA0828   NM_015328   KIAA0828蛋白质
  KIAA0831   NM_014924   假定蛋白LOC22863
  KIAA0889   NM_152257   假定蛋白LOC25781
  KIAA0892   NM_015329   假定蛋白LOC23383
  KIAA0895   NM_015314   假定蛋白LOC23366
  KIAA0922   NM_015196   KIAA0922蛋白质
  KIAA0980   NM_025176   假定蛋白LOC22981
  KIAA0999   NM_025164   KIAA0999蛋白质
  KIAA1128   NM_018999   颗粒细胞抗血清阳性14
  KIAA1160   NM_020701   假定蛋白LOC57461
  KIAA1191   NM_020444   假定蛋白LOC57179
  KIAA1193   NM_017550   假定蛋白LOC54531
  KIAA1199   NM_018689   KIAA1199
  KIAA1202   NM_020717   假定蛋白LOC57477
  KIAA1324   NM_020775   假定蛋白LOC57535
  KIAA1377   NM_020802   假定蛋白LOC57562
  KIAA1434   NM_019593   假定蛋白LOC56261
  KIAA1456   NM_020844   假定蛋白LOC57604
  KIAA1522   NM_020888   假定蛋白LOC57648
  KIAA1530   NM_020894   假定蛋白LOC57654
  KIAA1559   NM_020917   锌指蛋白14样
  KIAA1598   NM_018330   假定蛋白LOC57698
  KIAA1600   NM_020940   假定蛋白LOC57700
  KIAA1609   NM_020947   假定蛋白LOC57707
  KIAA1618   NM_020954   假定蛋白LOC57714
  KIAA1627   NM_020961   假定蛋白LOC57721
  KIAA1641   NM_020970   假定蛋白LOC57730
  KIAA1706   NM_030636   假定蛋白LOC80820
  KIAA1727   NM_033393   假定蛋白LOC85462
  KIAA1826   NM_032424   KIAA1826蛋白质
  KIAA1909   NM_052909   假定蛋白LOC153478
  KIF11   NM_004523   驱动蛋白家族成员11
  KIF13B   NM_015254   驱动蛋白家族成员13B
  KIF14   NM_014875   驱动蛋白家族成员14
  KIF1A   NM_004321   突触小泡的轴突转运
  KIF1B   NM_015074   驱动蛋白家族成员1B同种型b
  KIF23   NM_004856   驱动蛋白家族成员23同种型2
  KIF3B   NM_004798   驱动蛋白家族成员3B
  KIF3C   NM_002254   驱动蛋白家族成员3C
  KIF5A   NM_004984   驱动蛋白家族成员5A
  KIF9   NM-022342   驱动蛋白家族成员9同种型1
  KIRREL   NM_018240   IRRE同族样
  KIT   NM_000222   v-kit Hardy-Zuckerman 4猫肉瘤病毒
  KLC3   NM_145275   驱动蛋白轻链2样同种型b
  KLF10   NM_001032282   Kruppel样因子10同种型b
  KLF11   NM_003597   Kruppel样因子11
  KLF12   NM_007249   Kruppel样因子12同种型a
  KLF13   NM_015995   Kruppel样因子13
  KLF17   NM_173484   锌指蛋白393
  KLF9   NM_001206   Kruppel样因子9
  KLHDC5   NM_020782   含kelch结构域5
  KLHDC6   NM_207335   假定蛋白LOC166348
  KLHL12   NM_021633   kelch样12
  KLHL2   NM_007246   kelch样2,Mayven
  KLHL20   NM_014458   kelch样20
  KLHL21   NM_014851   kelch样21
  KLHL22   NM_032775   kelch样
  KLHL23   NM_144711   kelch样23
  KLHL3   NM_017415   kelch样3(果蝇)
  KLHL8   NM_020803   kelch样8
  KLK5   NM_012427   激肽释放酶5前蛋白原
  KLK7   NM_005046   角化层糜蛋白酶
  KLRK1   NM_007360   NKG2-D类型II整合膜蛋白质
  KMO   NM_003679   犬尿氨酸3-单加氧酶
  KPNA2   NM_002266   核周蛋白(karyopherin)α2
  KPNA3   NM_002267   核周蛋白α3
  KPNA4   NM_002268   核周蛋白α4
  KRIT1   NM_001013406   krev相互作用捕获的1同种型2
  KRT10   NM_000421   角蛋白10
  KRT23   NM_015515   角蛋白23
  KRT2A   NM_000423   角蛋白2a
  KRT2B   NM_015848   细胞角蛋白2
  KRT6IRS   NM_033448   角蛋白6irs
  KRTAP10-4   NM_198687   角蛋白相关蛋白10-4
  KRTHB1   NM_002281   角蛋白,毛发,碱性的,1
  KRTHB5   NM_002283   角蛋白,毛发,碱性的,5
  KTI12   NM_138417   KTI12同系物,染色质相关的
  L2HGDH   NM_024884   假定蛋白LOC79944
  L3MBTL2   NM_001003689   1(3)mbt样2同种型b
  L3MBTL3   NM_001007102   1(3)mbt样3同种型b
  L3MBTL4   NM_173464   假定蛋白LOC91133
  LACE1   NM_145315   促泌乳1
  LALBA   NM_002289   乳清蛋白,α-前体
  LAMA3   NM_000227   层粘连蛋白α3亚基同种型2
  LAMC1   NM_002293   层粘连蛋白,γ1前体
  LAMC2   NM_018891   层粘连蛋白,γ2同种型b前体
  LAMP1   NM_005561   溶酶体相关膜蛋白质1
  LAMP2   NM_013995   溶酶体相关膜蛋白质2
  LAMP3   NM_014398   溶酶体相关膜蛋白质3
  LAPTM4A   NM_014713   溶酶体相关蛋白跨膜4
  LARP2   NM_018078   La核糖核蛋白结构域家族成员2
  LARP5   NM_015155   La核糖核蛋白结构域家族,成员5
  LASP1   NM_006148   LIM和SH3蛋白质1
  LASS2   NM_013384   LAG1确保长寿同系物2同种型2
  LASS3   NM_178842   假定蛋白LOC204219
  LASS6   NM_203463   确保长寿同系物6
  LAX1   NM_017773   淋巴细胞跨膜衔接因子1
  LBH   NM_030915   假定蛋白DKFZp566J091
  LDLR   NM_000527   低密度脂蛋白质受体前体
  LDLRAD3   NM_174902   假定蛋白LOC143458
  LDLRAP1   NM_015627   低密度脂蛋白质受体衔接蛋白
  LDOC1L   NM_032287   假定蛋白LOC84247
  LEP   NM_000230   瘦蛋白前体
  LEPREL1   NM_018192   leprecan样1
  LEPROT   NM_017526   瘦蛋白受体基因相关蛋白质
  LEPROTL1   NM_015344   瘦蛋白受体重叠转录物样1
  LETM1   NM_012318   含亮氨酸拉链-EF-手跨膜
  LGALS8   NM_006499   半乳凝素8同种型a
  LHFP   NM_005780   脂肪瘤HMGIC融合伴侣
  LHFPL2   NM_005779   脂肪瘤HMGIC融合伴侣样2
  LHFPL3   NM_199000   脂肪瘤HMGIC融合伴侣样3
  LHX6   NM_014368   LIM同源框蛋白质6同种型1
  LHX8   NM_001001933   LIM同源框8
  LIAS   NM_006859   硫辛酸合成酶同种型1前体
  LIF   NM_002309   白血病抑制因子(胆碱能
  LILRA5   NM_181986   白细胞免疫球蛋白样受体亚家族
  LILRB1   NM_006669   白细胞免疫球蛋白样受体,
  LIMA1   NM_016357   肿瘤中丧失的上皮蛋白质β
  LIMK1   NM_002314   LIM结构域激酶1同种型1
  LIN10   NM_025187   lin-10
  LIN28   NM_024674   lin-28同系物
  LIN7B   NM_022165   lin-7同系物B
  LINS1   NM_181740   种系同系物1同种型3
  LIPH   NM_139248   脂肪酶,成员H前体
  LITAF   NM_004862   LPS-诱导的TNF-α因子
  LMO2   NM_005574   只有LIM结构域2
  LMO3   NM_001001395   只有LIM结构域3
  LMOD3   NM_198271   平滑肌蛋白3(胎儿)
  LNK   NM_005475   淋巴细胞衔接蛋白
  LOC116143   NM_138458   单分体
  LOC116236   NM_198147   假定蛋白LOC116236
  LOC123688   NM_001013619   假定蛋白LOC123688
  LOC124751   NM_213597   假定蛋白LOC124751
  LOC126248   NM_173479   假定蛋白LOC126248
  LOC128439   NM_139016   假定蛋白LOC128439
  LOC129285   NM_152994   平滑肌肌球蛋白重链11同种型
  LOC130951   NM_138804   假定蛋白LOC130951
  LOC133619   NM_130809   假定蛋白LOC133619
  LOC134147   NM_138809   假定蛋白LOC134147
  LOC136263   NM_145268   假定蛋白LOC136263
  LOC148137   NM_144692   假定蛋白LOC148137
  LOC149620   NM_001013621   假定蛋白LOC149620
  LOC151194   NM_145280   假定蛋白LOC151194
  LOC153222   NM_153607   假定蛋白LOC153222
  LOC153561   NM_207331   假定蛋白LOC153561
  LOC158160   NM_001031744   17-β-羟基类固醇脱氢酶型
  LOC162427   NM_178126   假定蛋白LOC162427
  LOC168850   NM_176814   假定蛋白LOC168850
  LOC201895   NM_174921   假定蛋白LOC201895
  LOC203427   NM_145305   线粒体溶质运载体蛋白质
  LOC203547   NM_001017980   假定蛋白LOC203547
  LOC220594   NM_145809   TL132蛋白质
  LOC221091   NM_203422   假定蛋白LOC221091
  LOC222171   NM_175887   假定蛋白LOC222171
  LOC223075   NM_194300   假定蛋白LOC223075
  LOC283537   NM_181785   假定蛋白LOC283537
  LOC283551   NM_001012706   假定蛋白LOC283551
  LOC283849   NM_178516   假定蛋白LOC283849
  LOC284434   NM_001007525   假定蛋白LOC284434
  LOC284912   NM_203375   假定蛋白LOC284912
  LOC285382   NM_001025266   假定蛋白LOC285382
  LOC285636   NM_175921   假定蛋白LOC285636
  LOC338328   NM_178172   高密度脂蛋白质结合蛋白质
  LOC339745   NM_001001664   假定蛋白LOC339745
  LOC340843   NM_001013629   假定蛋白LOC340843
  LOC347273   NM_001018116   假定蛋白LOC347273
  LOC348262   NM_207368   假定蛋白LOC348262
  LOC387758   NM_203371   假定蛋白LOC387758
  LOC387790   NM_001013634   假定蛋白LOC387790
  LOC387873   NM_001013636   假定蛋白LOC387873
  LOC387882   NM_207376   假定蛋白LOC387882
  LOC387921   NM_001012754   假定蛋白LOC387921同种型a
  LOC388335   NM_001004313   假定蛋白LOC388335
  LOC388610   NM_001013642   假定蛋白LOC388610
  LOC388969   NM_001013649   假定蛋白LOC388969
  LOC389432   NM_001030060   假定蛋白LOC389432
  LOC389634   NM_001012988   假定蛋白LOC389634
  LOC389936   NM_001013656   假定蛋白LOC389936
  LOC390980   NM_001023563   类似于锌指蛋白264
  LOC399706   NM_001010910   假定蛋白LOC399706
  LOC400464   NM_001013670   假定蛋白LOC400464
  LOC400499   NM_001013671   假定蛋白LOC400499
  LOC401137   NM_214711   假定蛋白LOC401137
  LOC401152   NM_001001701   假定蛋白LOC401152
  LOC401410   NM_001008742   假定蛋白LOC401410
  LOC401431   NM_001008745   假定蛋白LOC401431
  LOC401507   NM_001012278   假定蛋白LOC401507
  LOC401589   NM_001013687   假定蛋白LOC401589
  LOC401620   NM_001013688   假定蛋白LOC401620
  LOC402176   NM_001011538   假定蛋白LOC402176
  LOC440248   NM_199045   假定蛋白LOC440248
  LOC440742   NM_001013710   假定蛋白LOC440742
  LOC441136   NM_001013719   假定蛋白LOC441136
  LOC441208   NM-001013723   假定蛋白LOC441208
  LOC441268   NM_001013725   假定蛋白LOC441268
  LOC441376   NM_001025357   假定蛋白LOC441376
  LOC442578   NM_001013739   假定蛋白LOC442578
  LOC493829   NM_001008274   假定蛋白LOC493829
  LOC51149   NM_001017987   假定蛋白LOC51149同种型2
  LOC51333   NM_016643  间充质干细胞蛋白质DSC43
  LOC51334   NM_016644  间充质干细胞蛋白质DSC54
  LOC554251   NM_001024680  假定蛋白LOC554251
  LOC57149   NM_020424  假定蛋白LOC57149
  LOC613206   NM_001033016  骨髓增生性疾病相关肿瘤
  LOC613266   NM_001033516  假定蛋白LOC613266
  LOC619208   NM_001033564  假定蛋白LOC619208
  LOC63928   NM_022097  肝细胞癌抗原基因520
  LOC63929   NM_022098  假定蛋白LOC63929
  LOC81558   NM_030802  C/EBP-诱导的蛋白质
  LOC90321   NM_001010851  假定蛋白LOC90321
  LOC90624   NM_181705  假定蛋白LOC90624
  LOC90639   NM_001031617  假定蛋白LOC90639
  LOC94431   NM_145237  假定蛋白LOC94431
  LONPL   NM_031490  过氧化物酶体LON蛋白酶样
  LPGAT1   NM_014873  溶血磷脂酰甘油酰基转移酶1
  LPHN3   NM_015236  蛛毒素受体3前体
  LPIN1   NM_145693  脂质1
  LPIN3   NM_022896  脂质3
  LRAP   NM_022350  白细胞源性精氨酸氨基肽酶
  LRAT   NM_004744  卵磷脂视黄醇酰基转移酶
  LRFN5   NM_152447  亮氨酸丰富重复和纤连蛋白类型III
  LRG1   NM_052972  亮氨酸丰富α-2-糖蛋白1
  LRIG1   NM_015541  亮氨酸丰富重复和免疫球蛋白样
  LRP1   NM_002332  低密度脂蛋白质相关蛋白1
  LRP12   NM_013437  阻抑致瘤性
  LRP1B   NM_018557  低密度脂蛋白质相关蛋白1B
  LRP2BP   NM_018409  LRP2结合蛋白质
  LRP4   NM_002334  低密度脂蛋白质受体相关蛋白质
  LRRC10   NM_201550  含亮氨酸丰富重复10
  LRRC15   NM_130830  含亮氨酸丰富重复15
  LRRC2   NM_024512  含亮氨酸丰富重复2
  LRRC20   NM_018205  含亮氨酸丰富重复20同种型3
  LRRC27   NM_030626  含亮氨酸丰富重复27
  LRRC32   NM_005512  含亮氨酸丰富重复32前体
  LRRC44   NM_145258  含亮氨酸丰富重复44
  LRRC45   NM_144999  含亮氨酸丰富重复45
  LRRC54   NM_015516  Tsukushi
  LRRC55   NM_001005210  假定蛋白LOC219527
  LRRC57   NM_153260  假定蛋白LOC255252
  LRRC8A   NM_019594  含亮氨酸丰富重复8
  LRRC8B   NM_015350  T细胞活化亮氨酸重复丰富蛋白质
  LRRIQ2   NM_024548  含亮氨酸丰富重复和IQ模体2
  LRRN6A   NM_032808  亮氨酸丰富重复神经元6A
  LSM11   NM_173491  LSM11,U7小的核RNA相关的
  LSM12   NM_152344  假定蛋白LOC124801
  LTB4R   NM_181657  白三烯B4受体
  LTBP2   NM_000428  潜伏转化生长因子β结合
  LTBR   NM_002342  淋巴毒素β受体
  LTV1   NM_032860  假定蛋白LOC84946
  LUZP1   NM_033631  亮氨酸拉链蛋白质1
  LY75   NM_002349  淋巴细胞抗原75
  LYCAT   NM_001002257  溶血心磷脂酰基转移酶同种型2
  LYST   NM_000081  溶酶体转运调解物同种型1
  M6PR   NM_002355  阳离子依赖性甘露糖-6-磷酸受体
  M6PRBP1   NM_005817  甘露糖6磷酸受体结合蛋白1
  MAF1   NM_032272  MAF1蛋白质
  MAFF   NM_012323  转录因子MAFF
  MAGI2   NM_012301  膜结合的乌苷酸激酶,WW和PDZ
  MAK   NM_005906  雄性生殖细胞相关激酶
  MAL2   NM_052886  mal,T细胞分化蛋白质2
  MAN1A2   NM_006699  甘露糖苷酶,α,类1A,成员2
  MAN2A2   NM_006122  甘露糖苷酶,α,类2A,成员2
  MANEAL   NM_152496  假定蛋白LOC149175同种型2
  MAP1LC3B   NM_022818  微管相关蛋白1A/1B轻链
  MAP3K11   NM_002419  促分裂原活化蛋白质激酶激酶激酶
  MAP3K12   NM_006301  促分裂原活化蛋白质激酶激酶激酶
  MAP3K14   NM_003954  促分裂原活化蛋白质激酶激酶激酶
  MAP3K2   NM_006609  促分裂原活化蛋白质激酶激酶激酶
  MAP3K3   NM_002401  促分裂原活化蛋白质激酶激酶激酶3
  MAP3K5   NM_005923   促分裂原活化蛋白质激酶激酶激酶
  MAP3K7   NM_003188   促分裂原活化蛋白质激酶激酶激酶7
  MAP3K8   NM_005204   促分裂原活化蛋白质激酶激酶激酶
  MAP3K9   NM_033141   促分裂原活化蛋白质激酶激酶激酶
  MAP6   NM_207577   微管相关蛋白6同种型2
  MAP7   NM_003980   微管相关蛋白7
  MAPK1   NM_002745   促分裂原活化蛋白质激酶1
  MAPK4   NM_002747   促分裂原活化蛋白质激酶4
  MAPK9   NM_002752   促分裂原活化蛋白质激酶9同种型1
  MAPKBP1   NM_014994   促分裂原活化蛋白质激酶结合蛋白质
  MAPRE1   NM_012325   微管相关蛋白,RP/EB家族,
  MAPRE3   NM_012326   微管相关蛋白,RP/EB家族,
  MARCH2   NM_001005415   膜相关环指(C3HC4)2
  MARCH5   NM_017824   环指蛋白153
  MARCH6   NM_005885   膜相关环指(C3HC4)6
  MARCH7   NM_022826   Axotrophin
  MARCH8   NM_001002265   免疫识别细胞调节剂
  MARK1   NM_018650   MAP/微管亲和力调节激酶1
  MARK4   NM_031417   MAP/微管亲和力调节激酶4
  MARS   NM_004990   甲硫氨酸-tRNA合成酶
  MARVELD3   NM_001017967   含MARVEL结构域3同种型1
  MASTL   NM_032844   微管相关的丝氨酸/苏氨酸
  MAT2B   NM_013283   甲硫氨酸腺苷转移酶II,β同种型
  MAWBP   NM_022129   MAWD结合蛋白同种型a
  MBD5   NM_018328   甲基-CpG结合结构域蛋白质5
  MBNL1   NM_021038   盲肌样1同种型a
  MBNL3   NM_018388   盲肌样3同种型G
  MBP   NM_001025100   Golli-mbp同种型2
  MBTD1   NM_017643   含mbt结构域1
  MBTPS1   NM_003791   膜结合转录因子位点-1
  MCAM   NM_006500   黑素瘤细胞黏着分子
  MCF2L2   NM_015078   Rho家族鸟嘌呤-核苷酸交换因子
  MCFD2   NM_139279   多种凝血因子缺乏2
  MCL1   NM_021960   髓样细胞白血病序列1同种型1
  MCM3   NM_002388   微小染色体维持蛋白质3
  MCM4   NM_005914   微小染色体维持蛋白质4
  MCMDC1   NM_153255   微小染色体维持蛋白质结构域
  MCOLN2   NM_153259   粘脂蛋白2
  MDFIC   NM_199072   含MyoD家族抑制剂结构域同种型
  MDM4   NM_002393   鼠双微体4同系物
  MECP2   NM_004992   甲基CpG结合蛋白2
  MECR   NM_001024732   核受体结合因子1同种型b
  MED12L   NM_053002   假定蛋白LOC116931
  MED18   NM_017638   RNA聚合酶II转录介导物,
  MED6   NM_005466   RNA聚合酶II转录介导物,
  METAP1   NM_015143   甲硫氨酰氨基肽酶1
  METT5D1   NM_152636   含甲基转移酶5结构域1
  METTL2A   NM_001005372   假定蛋白LOC339175
  METTL4   NM_022840   甲基转移酶样4
  MFAP3L   NM_001009554   微原纤维相关蛋白3样同种型
  MFAP5   NM_003480   微原纤维相关蛋白5
  MFN2   NM_014874   线粒体融合蛋白2
  MFSD4   NM_181644   假定蛋白DKFZp761N1114
  MGC11266   NM_024322   假定蛋白LOC79172
  MGC11332   NM_032718   假定蛋白LOC84804
  MGC13017   NM_080656   假定蛋白LOC91368
  MGC15476   NM_145056   胸腺表达基因3样
  MGC15619   NM_032369   假定蛋白LOC84329
  MGC16291   NM_032770   假定蛋白LOC84856
  MGC16385   NM_145039   假定蛋白LOC92806
  MGC16703   NM_145042   假定蛋白LOC113691
  MGC19604   NM_001031734   假定蛋白LOC112812同种型1
  MGC22001   NM_153238   假定蛋白LOC197196
  MGC24039   NM_144973   假定蛋白LOC160518
  MGC26718   NM_001029999   假定蛋白LOC440482
  MGC26733   NM_144992   假定蛋白LOC200403
  MGC26816   NM_152613   假定蛋白LOC164684
  MGC2752   NM_023939   假定蛋白LOC65996
  MGC29891   NM_144618   GA重复结合蛋白质,β2
  MGC3123   NM_024107   假定蛋白LOC79089同种型1
  MGC32020   NM_152266   假定蛋白LOC91442
  MGC3207   NM_001031727   假定蛋白LOC84245同种型1
  MGC34646   NM_173519   假定蛋白LOC157807
  MGC34821   NM_173586   假定蛋白LOC283238
  MGC35048   NM_153208   假定蛋白LOC124152
  MGC35440   NM_153220   假定蛋白LOC147990
  MGC39518   NM_173822   假定蛋白LOC285172
  MGC40069   NM_182615   假定蛋白LOC348035
  MGC40405   NM_152789   假定蛋白LOC257415
  MGC42090   NM_152774   假定蛋白LOC256130
  MGC4268   NM_031445   假定蛋白LOC83607
  MGC45438   NM_152459   假定蛋白LOC146556
  MGC4562   NM_133375   假定蛋白LOC115752
  MGC4655   NM_033309   假定蛋白LOC84752
  MGC48628   NM_207491   假定蛋白LOC401145
  MGC50372   NM_173566   假定蛋白LOC253143
  MGC52057   NM_194317   假定蛋白LOC130574
  MGC52110   NM_001008215   假定蛋白LOC493753
  MGC52498   NM_182621   假定蛋白LOC348378
  MGC70857   NM_001001795   假定蛋白LOC414919
  MGC87631   NM_001004306   假定蛋白LOC339184
  MGC9712   NM_152689   假定蛋白LOC202915
  MGEA5   NM_012215   脑膜瘤表达的抗原5(透明质酸酶)
  MGLL   NM_001003794   单甘油酯脂肪酶同种型2
  MICA   NM_000247   MHC I类链相关基因A蛋白质
  MICB   NM_005931   MHC I类多肽相关序列B
  MIDN   NM_177401   中脑核仁蛋白
  MINK1   NM_001024937   畸形/NIK相关激酶同种型4
  MKI67   NM_002417   通过单克隆抗体Ki-67鉴定的抗原
  MKL2   NM_014048   成巨核细胞白血病2蛋白质
  MKLN1   NM_013255   muskelin1,含细胞内介导物
  MKNK2   NM_017572   MAP激酶-相互作用丝氨酸/苏氨酸激酶2
  MKRN1   NM_013446   makorin,环指蛋白,1
  MLC1   NM_015166   巨脑白质脑病含
  MLL3   NM_021230   髓/淋巴或混合谱系白血病3
  MLL4   NM_014727   髓/淋巴或混合谱系白血病4
  MLLT10   NM_001009569   髓/淋巴或混合谱系白血病
  MLLT11   NM_006818   MLLT11蛋白质
  MLLT6   NM_005937   髓/淋巴或混合谱系白血病
  MLR1   NM_153686   转录因子MLR1
  MMACHC   NM_015506   假定蛋白LOC25974
  MME   NM_000902   膜金属内肽酶
  MMP19   NM_001032360   基质金属蛋白酶19同种型2前体
  MMP2   NM_004530   基质金属蛋白酶2前蛋白原
  MMP23A   NM_004659   基质金属蛋白酶23A前体
  MMP23B   NM_006983   基质金属蛋白酶23B前体
  MMP24   NM_006690   基质金属蛋白酶24前蛋白原
  MMP3   NM_002422   基质金属蛋白酶3前蛋白原
  MMRN2   NM_024756   多聚素2
  MOBKL1A   NM_173468   MOB1,Mps One Binder激酶激活物样1A
  MOCS1   NM_005943   钼辅因子合成-步骤1蛋白质
  MOG   NM_001008228   髓鞘少突胶质细胞糖蛋白同种型
  MOGAT3   NM_178176   单酰基甘油O-酰基转移酶3
  MORF4L1   NM_006791   MORF相关基因15同种型1
  MORF4L2   NM_012286   MORF相关基因X
  MPPE1   NM_023075   金属磷酯酶1同种型a前体
  MPZ   NM_000530   髓鞘蛋白零
  MRAS   NM_012219   肌肉RAS癌基因同系物
  MRCL3   NM_006471   肌球蛋白调节性轻链MRCL3
  MRE11A   NM_005590   减数分裂重组11同系物A同种型2
  MRGPRX3   NM_054031   G蛋白偶联受体MRGX3
  MRP63   NM_024026   线粒体核糖体蛋白质63
  MRPL17   NM_022061   线粒体核糖体蛋白质L17
  MRPL24   NM_024540   线粒体核糖体蛋白质L24
  MRPL30   NM_145212   线粒体核糖体蛋白质L30
  MRPL43   NM_032112   线粒体核糖体蛋白质L43同种型a
  MRPL47   NM_020409   线粒体核糖体蛋白质L47同种型a
  MRPL49   NM_004927   线粒体核糖体蛋白质L49
  MRPL52   NM_178336   线粒体核糖体蛋白质L52同种型a
  MRPS10   NM_018141   线粒体核糖体蛋白质S10
  MRPS16   NM_016065   线粒体核糖体蛋白质S16
  MRPS18B   NM_014046   线粒体核糖体蛋白质S18B
  MRPS25   NM_022497   线粒体核糖体蛋白质S25
  MRPS36   NM_033281   线粒体核糖体蛋白质S36
  MRRF   NM_138777   线粒体核糖体再循环因子同种型
  MS4A10   NM_206893   跨膜4结构域,亚家族A,成员
  MS4A7   NM_021201   跨膜4结构域,亚家族A,成员
  MSH3   NM_002439   mutS同系物3
  MSL2L1   NM_018133   环指蛋白184
  MSR1   NM_138715   巨噬细胞清除剂受体1同种型类型1
  MSRB3   NM_001031679   甲硫氨酸亚砜还原酶B3同种型2
  MST150   NM_032947   假定的小的膜蛋白质NID67
  MSTO1   NM_018116   Misato
  MTAC2D1   NM_152332   含膜靶向(串联)C2结构域
  MTCH2   NM_014342   线粒体运载体同系物2
  MTERFD2   NM_182501   含MTERF结构域2
  MTF1   NM_005955   金属-调节转录因子1
  MTFMT   NM_139242   甲硫氨酰-tRNA甲酸基转移酶,线粒体
  MTHFD1L   NM_015440   亚甲基四氢叶酸脱氢酶(NADP+
  MTHFD2   NM_006636   亚甲基四氢叶酸脱氢酶脱氢酶2
  MTMR12   NM_019061   肌管素相关蛋白12
  MTMR3   NM_021090   肌管素相关蛋白3同种型c
  MTMR7   NM_004686   肌管素相关蛋白7
  MTMR9   NM_015458   肌管素相关蛋白9
  MUC17   NM_001004430   黏蛋白17
  MUCDHL   NM_017717   mu-原钙黏着蛋白同种型2
  MULK   NM_018238   多底物脂质激酶
  MUM1L1   NM_152423   黑素瘤相关的抗原(突变的)1样1
  MUTED   NM_201280   Muted
  MVK   NM_000431   甲羟戊酸激酶
  MXD1   NM_002357   MAX二聚化蛋白质1
  MXI1   NM_001008541   MAX相互作用分子1同种型c
  MXRA7   NM_001008529   跨膜锚定蛋白质1同种型2
  MYADM   NM_001020818   髓相关分化标志物
  MYCL1   NM_001033081   1-myc-1原癌基因同种型1
  MYCN   NM_005378   v-myc髓细胞瘤病病毒相关癌基因,
  MYF5   NM_005593   生肌因子5
  MYF6   NM_002469   生肌因子6(力蛋白)
  MYLIP   NM_013262   肌球蛋白调节性轻链相互作用
  MYLK   NM_005965   肌球蛋白轻链激酶同种型6
  MYNN   NM_018657   肌神经蛋白
  MYO10   NM_012334   肌球蛋白X
  MYO18A   NM_078471   肌球蛋白18A同种型a
  MYO1C   NM_033375   肌球蛋白IC
  MYO1D   NM_015194   肌球蛋白ID
  MYO3B   NM_138995   肌球蛋白IIIB
  MYOHD1   NM_001033579   含肌球蛋白头结构域1同种型2
  MYOM1   NM_003803   肌中线蛋白1
  MYOZ2   NM_016599   myozenin2
  MYOZ3   NM_133371   myozenin3
  MYT1L   NM_015025   髓鞘转录因子1样
  N4BP1   NM_153029   Nedd4结合蛋白1
  N4BP2   NM_018177   Nedd4结合蛋白2
  NAGK   NM_017567   N-乙酰葡糖胺激酶
  NANOS1   NM_001009553   纳米同系物1同种型2
  NAPB   NM_022080   N-乙基马来酰亚胺敏感因子附着
  NAPE-PLD   NM_198990   N-酰基-磷脂酰乙醇胺-水解性
  NARG1L   NM_018527   NMDA受体调节的1样蛋白质同种型
  NARS   NM_004539   天冬酰胺酰-tRNA合成酶
  NAT11   NM_024771   假定蛋白LOC79829
  NAT12   NM_001011713   假定蛋白LOC122830
  NAV2   NM_145117   神经元导向2同种型2
  NBEA   NM_015678   激酶固定蛋白(neurobeachin)
  NBEAL1   NM_198945   激酶固定蛋白样1
  NBL1   NM_005380   神经母细胞瘤,阻抑致瘤性1
  NBPF4   NM_152488   假定蛋白LOC148545
  NBR1   NM_005899   BRCA1近邻基因1
  NBR2   NM_005821   假定蛋白LOC10230
  NCF2   NM_000433   嗜中性粒细胞胞质因子2
  NCK2   NM_001004720   NCK衔接蛋白2同种型A
  NCKAP1L   NM_005337   造血蛋白质1
  NCOA3   NM_006534   核受体辅激活物3同种型b
  NCOA7   NM_181782   核受体辅激活物7
  NCR1   NM_004829   天然细胞毒性触发受体1
  NDEL1   NM_001025579   nudE核分布基因E同系物样1
  NDN   NM_002487   抑蛋白
  NDUFA6   NM_002490   NADH脱氢酶(泛醌)1α
  NDUFC2   NM_004549   NADH脱氢酶(泛醌)1,亚复合体
  NDUFV3   NM_001001503   NADH-泛醌氧化还原酶黄素蛋白3
  NEB   NM_004543   伴肌动蛋白
  NEBL   NM_006393   nebulette肌节同种型
  NEDD4L   NM_015277   遍在蛋白-蛋白质连接酶NEDD4样
  NEFH   NM_021076   神经丝,重链多肽200kDa
  NEK8   NM_178170   NIMA相关激酶8
  NEK9   NM_033116   NIMA相关激酶9
  NENF   NM_013349   SCIRP10相关蛋白质
  NEO1   NM_002499   再生蛋白同系物1
  NETO2   NM_018092   神经毡蛋白和tolloid样蛋白质2
  NEUROG1   NM_006161   神经元素1
  NEUROG2   NM_024019   神经元素2
  NF2   NM_000268   神经纤维瘤蛋白2同种型1
  NFASC   NM_015090   神经束蛋白前体
  NFAT5   NM_006599   活化T细胞核因子5同种型c
  NFATC1   NM_172387   活化T细胞核因子,胞质的
  NFATC2IP   NM_032815   活化T细胞核因子,
  NFATC3   NM_173164   细胞质活化T细胞核因子
  NFATC4   NM_004554   细胞质活化T细胞核因子
  NFE2L2   NM_006164   核因子(红细胞派生2)样2
  NFIA   NM_005595   核因子I/A
  NFKBIB   NM_001001716   κ轻链多肽基因核因子
  NFKBIL2   NM_013432   I-κ-B相关蛋白质
  NFX1   NM_147134   核转录因子,X-盒结合1
  NFYB   NM_006166   核转录因子Y,β
  NGEF   NM_019850   神经元鸟嘌呤核苷酸交换因子
  NHLH1   NM_005598   无义螺旋环螺旋1
  NHS   NM_198270   Nance-Horan综合征蛋白质
  NIN   NM_020921   ninein同种型2
  NINJ2   NM_016533   ninjurin2
  NIP30   NM_024946   假定蛋白LOC80011
  NIP7   NM_016101   60S核糖体亚基生物发生蛋白质NIP7
  NIPA1   NM_144599   Prader-Willi/Angelman综合征非印记
  NKIRAS1   NM_020345   κB-ras 1
  NKIRAS2   NM_001001349   NFKB抑制剂相互作用Ras样2
  NKX2-2   NM_002509   NK2转录因子相关,基因座2
  NKX3-1   NM_006167   NK3转录因子相关,基因座1
  NLK   NM_016231   nemo样激酶
  NMD3   NM_015938   NMD3同系物
  NME6   NM_005793   核苷二磷酸激酶类型6
  NMNAT1   NM_022787   烟酰胺核苷酸腺苷酰转移酶1
  NMT1   NM_021079   N-豆蔻酰转移酶1
  NMT2   NM_004808   甘氨酰肽N-十四酰转移酶2
  NMUR1   NM_006056   神经调节肽U受体1
  NMUR2   NM_020167   神经调节肽U受体2
  NOL9   NM_024654   假定蛋白LOC79707
  NOM1   NM_138400   具MIF4G结构域核仁蛋白质1
  NOS1AP   NM_014697   一氧化氮合酶1(神经元)衔接子
  NOTCH2NL   NM_203458   缺刻翅同系物2N-末端样蛋白质
  NPAL2   NM_024759   含NIPA样结构域2
  NPAL3   NM_020448   含NIPA样结构域3
  NPAS2   NM_002518   神经元PAS结构域蛋白质2
  NPAS3   NM_022123   神经元PAS结构域蛋白质3同种型1
  NPAT   NM_002519   核蛋白质,共济失调-毛细血管扩张症基因座
  NPC1   NM_000271   尼曼病,类型C1
  NPEPL1   NM_024663   氨基肽酶样1
  NPHP1   NM_000272   肾胱素(nephrocytin)同种型1
  NPHP3   NM_153240   肾消耗病3
  NPHS1   NM_004646   肾病蛋白(nephrin)
  NPL   NM_030769   N-乙酰神经氨酸丙酮酸裂合酶
  NPLOC4   NM_017921   核蛋白质定位4
  NPNT   NM_001033047   肾连蛋白
  NPTX1   NM_002522   神经元五聚环蛋白I前体
  NPTXR   NM_014293   神经元五聚环蛋白受体同种型1
  NPY5R   NM_006174   神经肽Y受体Y5
  NR2E1   NM_003269   核受体亚家族2,组E,成员1
  NR2E3   NM_014249   光受体-特异性核受体同种型
  NR3C1   NM_000176   核受体亚家族3,组C,成员1
  NR4A2   NM_006186   核受体亚家族4,组A,成员2
  NR4A3   NM_006981   核受体亚家族4,组A,成员3
  NRBF2   NM_030759   核受体结合因子2
  NRBP1   NM_013392   核受体结合蛋白质
  NRIP2   NM_031474   核受体相互作用蛋白质2
  NRP2   NM_018534   神经毡蛋白2同种型4前体
  NSUN4   NM_199044   NOL1/NOP2/Sun结构域家族4蛋白质
  NT5C2   NM_012229   5′-核苷酸酶,胞质的II
  NT5DC3   NM_016575   假定蛋白LOC51559同种型2
  NT5E   NM_002526   5′外核苷酸酶
  NTN4   NM_021229   neutrin 4
  NTRK2   NM_001007097   神经营养酪氨酸激酶,受体,类型2
  NTSR1   NM_002531   神经降压肽受体1
  NUAK1   NM_014840   AMPK相关蛋白激酶5
  NUBP1   NM_002484   核苷酸结合蛋白1(MinD同系物,E.
  NUBPL   NM_025152   核苷酸结合蛋白质样
  NUDT4   NM_019094   nudix-类型模体4同种型α
  NUFIP2   NM_020772   82-kD FMRP相互作用蛋白质
  NUP160   NM_015231   核孔蛋白160kDa
  NUP35   NM_001008544   核孔蛋白35kDa同种型b
  NUP43   NM_198887   核孔蛋白43kDa
  NUP62   NM_012346   核孔蛋白62kDa
  NUP98   NM_016320   核孔蛋白98kD同种型1
  NUPL1   NM_001008564   核孔蛋白样1同种型b
  NUSAP1   NM_016359   核仁和纺锤体相关蛋白1
  NY-SAR-48   NM_001011699   肉瘤抗原NY-SAR-48同种型b
  OACT2   NM_138799   O-酰基转移酶(膜结合的)结构域
  OACT5   NM_005768   基因丰富簇,C3f基因
  OAS2   NM_016817   2′-5′-寡腺苷酸合成酶2同种型1
  OATL1   NM_001006113   乌氨酸氨基转移酶样1同种型1
  OBFC2A   NM_001031716   假定蛋白LOC64859
  OBFC2B   NM_024068   假定蛋白LOC79035
  OCLN   NM_002538   闭合蛋白
  OCRL   NM_000276   磷脂酰肌醇多磷酸5-磷酸酶
  OGDH   NM_001003941   酮戊二酸(α-酮戊二酸)脱氢酶
  OGG1   NM_016827   8-氧鸟嘌呤DNA糖基化酶同种型2c
  OGT   NM_003605   O连锁的GlcNAc转移酶同种型3
  OLIG1   NM_138983   少突胶质细胞转录因子1
  OPA3   NM_001017989   OPA3蛋白质同种型a
  OPHN1   NM_002547   寡膈蛋白1
  OPTN   NM_001008211   视神经蛋白
  OR7D2   NM_175883   假定蛋白LOC162998
  ORC6L   NM_014321   起点识别复合体亚基6
  ORMDL3   NM_139280   ORM1样3
  OSBPL2   NM_014835   氧固醇结合蛋白质样蛋白质2同种型
  OSBPL5   NM_020896   氧固醇结合蛋白质样蛋白质5同种型
  OSCAR   NM_206817   破骨细胞-相关受体同种型2
  OSM   NM_020530   制癌蛋白M前体
  OSR1   NM_145260   odd-skipped相关1
  OSTM1   NM_014028   骨硬化病相关的跨膜蛋白质
  OTUD4   NM_199324   含OTU结构域4蛋白质同种型1
  OTUD6A   NM_207320   HIN-6蛋白酶
  OTX1   NM_014562   正小齿1
  OXR1   NM_181354   氧化抗性1
  P2RX4   NM_002560   嘌呤能受体P2X4同种型a
  P2RX7   NM_002562   嘌呤能受体P2X7同种型a
  P2RY13   NM_023914   嘌呤能受体P2Y,G-蛋白偶联的,13
  P2RY14   NM_014879   嘌呤能受体P2Y,G-蛋白偶联的,14
  P2RY6   NM_004154   嘧啶能受体P2Y6
  P2RY8   NM_178129   G-蛋白偶联的嘌呤能受体P2Y8
  P4HA3   NM_182904   脯氨酰4-羟化酶,αIII亚基
  PABPC5   NM_080832   聚(A)结合蛋白质,细胞质5
  PACSIN1   NM_020804   蛋白质激酶C和酪蛋白激酶底物
  PADI1   NM_013358   肽基精氨酸脱亚胺酶类型I
  PAF1   NM_019088   Paf1,RNA聚合酶II相关因子,
  PAFAH1B1   NM_000430   血小板活化因子乙酰水解酶,
  PAFAH1B2   NM_002572   血小板活化因子乙酰水解酶,
  PAFAH2   NM_000437   血小板活化因子乙酰水解酶2
  PAG1   NM_018440   与鞘糖脂相关的磷蛋白
  PAICS   NM_006452   磷酸核糖氨基咪唑羧化酶
  PAK2   NM_002577   p21-激活的激酶2
  PALLD   NM_016081   钯蛋白
  PALM2-AKAP2   NM_007203   PALM2-AKAP2蛋白质同种型1
  PAM   NM_000919   肽基甘氨酸α-酰胺化单加氧酶
  PANK1   NM_138316   泛酸激酶1同种型γ
  PANK3   NM_024594   泛酸激酶3
  PANX1   NM_015368   pannexin1
  PANX2   NM_052839   pannexin2
  PAPD1   NM_018109   含PAP相关的结构域1
  PAPOLA   NM_032632   poly(A)聚合酶α
  PAPOLB   NM_020144   poly(A)聚合酶β(睾丸特异性)
  PAPOLG   NM_022894   poly(A)聚合酶γ
  PAPPA   NM_002581   怀孕相关血浆蛋白质A
  PAQR5   NM_017705   膜孕酮受体γ
  PARD6B   NM_032521   PAR-6β
  PARD6G   NM_032510   PAR-6γ蛋白质
  PARN   NM_002582   聚(A)-特异性核糖核酸酶(脱腺苷化
  PARP14   NM_017554   聚(ADP-核糖)聚合酶家族,成员14
  PARP6   NM_020213   聚(ADP-核糖)聚合酶家族,成员6
  PBK   NM_018492   T-LAK细胞来源蛋白质激酶
  PBOV1   NM_021635   前列腺和乳癌过表达的1
  PBX3   NM_006195   前B细胞白血病转录因子3
  PBXIP1   NM_020524   前B细胞白血病转录因子
  PCAF   NM_003884   p300/CBP相关因子
  PCDH11X   NM_032967   原钙黏着蛋白11X-连锁同种型b前体
  PCDH11Y   NM_032971   原钙黏着蛋白11Y连锁的同种型a
  PCDH20   NM_022843   原钙黏着蛋白20
  PCDHA1   NM_018900   原钙黏着蛋白α1同种型1前体
  PCDHA10   NM_018901   原钙黏着蛋白α10同种型1前体
  PCDHA11   NM_018902   原钙黏着蛋白α11同种型1前体
  PCDHA12   NM_018903   原钙黏着蛋白α12同种型1前体
  PCDHA13   NM_018904   原钙黏着蛋白α13同种型1前体
  PCDHA2   NM_018905   原钙黏着蛋白α2同种型1前体
  PCDHA3   NM_018906   原钙黏着蛋白α3同种型1前体
  PCDHA4   NM_018907   原钙黏着蛋白α4同种型1前体
  PCDHA5   NM_018908   原钙黏着蛋白α5同种型1前体
  PCDHA6   NM_018909   原钙黏着蛋白α6同种型1前体
  PCDHA7   NM_018910   原钙黏着蛋白α7同种型1前体
  PCDHA8   NM_018911   原钙黏着蛋白α8同种型1前体
  PCDHA9   NM_031857   原钙黏着蛋白α9同种型1前体
  PCDHAC1   NM_018898   原钙黏着蛋白α亚家族C,1同种型1
  PCDHAC2   NM_018899   原钙黏着蛋白α亚家族C,2同种型1
  PCDHB9   NM_019119   原钙黏着蛋白β9前体
  PCDHGA7   NM_032087   原钙黏着蛋白γ亚家族A,7同种型2
  PCGF6   NM_001011663   polycomb组环指6同种型a
  PCK1   NM_002591   胞质的磷酸烯醇丙酮酸羧基激酶1
  PCMTD1   NM_052937   假定蛋白LOC115294
  PCNP   NM_020357   含PEST核蛋白质
  PCNX   NM_014982   山核桃素同系物
  PCNXL2   NM_014801   山核桃素样2
  PCSK2   NM_002594   蛋白原转变酶枯草蛋白酶/kexin类型2
  PCSK6   NM_138323   成对碱性氨基酸断裂系统4
  PCYOX1   NM_016297   异戊二烯基半胱氨酸氧化酶1
  PCYT1B   NM_004845   磷酸胞苷酰转移酶1,胆碱,β
  PDAP1   NM_014891   PDGFA相关蛋白1
  PDCD1LG2   NM_025239   程序性细胞死亡1配体2
  PDCD4   NM_014456   程序性细胞死亡4同种型1
  PDCD7   NM_005707   程序性细胞死亡7
  PDDC1   NM_182612   假定蛋白LOC347862
  PDE1B   NM_000924   磷酸二酯酶1B,钙调蛋白依赖的
  PDE3B   NM_000922   磷酸二酯酶3B,cGMP-抑制的
  PDE4A   NM_006202   磷酸二酯酶4A,cAMP-特异性
  PDE4B   NM_002600   磷酸二酯酶4B,cAMP-特异性同种型1
  PDE4C   NM_000923   磷酸二酯酶4C,cAMP-特异性
  PDE4DIP   NM_001002811   磷酸二酯酶4D相互作用蛋白质同种型
  PDE5A   NM_001083   磷酸二酯酶5A同种型1
  PDE7A   NM_002604   磷酸二酯酶7A同种型b
  PDE7B   NM_018945   磷酸二酯酶7B
  PDE8A   NM_002605   磷酸二酯酶8A同种型1
  PDGFB   NM_002608   血小板衍生生长因子β同种型1,
  PDGFC   NM_016205   血小板衍生生长因子C前体
  PDGFD   NM_025208   血小板衍生生长因子D同种型1
  PDGFRA   NM_006206   血小板衍生生长因子受体α
  PDGFRB   NM_002609   血小板衍生生长因子受体β
  PDHX   NM_003477   丙酮酸脱氢酶复合体,组分X
  PDIK1L   NM_152835   PDLIM1相互作用激酶1样
  PDK1   NM_002610   丙酮酸脱氢酶激酶,同工酶1
  PDK4   NM_002612   丙酮酸脱氢酶激酶,同工酶4
  PDLIM4   NM_003687   PDZ和L1M结构域4
  PDLIM5   NM_001011513   PDZ和LIM结构域5同种型b
  PDPK1   NM_002613   3-磷酸肌醇依赖性蛋白质激酶-1
  PDPN   NM_001006624   肺I型细胞膜-相关
  PDPR   NM_017990   丙酮酸脱氢酶磷酸酶调节
  PDRG1   NM_030815   p53和DNA损伤调节的蛋白质
  PDZD11   NM_016484   含PDZ结构域11
  PECR   NM_018441   过氧化物酶体反-2-烯酰辅酶A还原酶
  PEG3   NM_006210   父本表达的3
  PELI2   NM_021255   pellino 2
  PELO   NM_015946   pelota同系物
  PER2   NM_022817   period 2同种型1
  PERP   NM_022121   PERP,TP53细胞凋亡效应蛋白
  PERQ1   NM_022574   PERQ氨基酸丰富,具GYF结构域1
  PEX16   NM_057174   过氧化物酶体生物发生因子16同种型2
  PEX19   NM_002857   过氧化物酶体生物发生因子19
  PEX26   NM_017929   过氧化物酶体生物发生因子26
  PEX5L   NM_016559   PXR2b蛋白质
  PF4V1   NM_002620   血小板因子4变体1
  PFKFB2   NM_006212   6-磷酸果糖-2-激酶/果糖-2,
  PFKFB3   NM_004566   6-磷酸果糖-2-激酶/果糖-2,
  PFKP   NM_002627  磷酸果糖激酶,血小板
  PFN2   NM_002628  肌动蛋白抑制蛋白2同种型b
  PGA5   NM_014224  胃蛋白酶原5,组I(胃蛋白酶原A)
  PGAP1   NM_024989  GPI脱酰酶
  PGBD4   NM_152595  piggyBac可转座元件衍生4
  PGBD5   NM_024554  piggyBac可转座元件衍生5
  PGDS   NM_014485  前列腺素-D合酶
  PGF   NM_002632  胎盘生长因子,血管内皮
  PGM2L1   NM_173582  葡萄糖磷酸变位酶2样1
  PGM5   NM_021965  葡萄糖磷酸变位酶5
  PHACTR4   NM_023923  磷酸酶和肌动蛋白调节物4
  PHF1   NM_002636  PHD指蛋白质1同种型a
  PHF11   NM_016119  PHD指蛋白质11
  PHF15   NM_015288  PHD指蛋白质15
  PHF17   NM_024900  Jade1蛋白质短同种型
  PHF2   NM_005392  PHD指蛋白质2同种型a
  PHF20   NM_016436  PHD指蛋白质20
  PHF23   NM_024297  PHD指蛋白质23
  PHF6   NM_001015877  PHD指蛋白质6同种型1
  PHF8   NM_015107  PHD指蛋白质8
  PHKG1   NM_006213  磷酸化酶激酶,γ1(肌肉)
PHLDB3 NM_198850  血小板白细胞C激酶底物同系物样结构域,家族B,
  PHLPPL   NM_015020  PH结构域和亮氨酸丰富重复蛋白质
  PHTF2   NM_020432  假定的同源异型域转录因子2
  PHYHIP   NM_014759  植烷酰辅酶A羟化酶相互作用蛋白质
  PI15   NM_015886  蛋白酶抑制剂15前蛋白原
  PIGK   NM_005482  磷脂酰肌醇聚糖,类K前体
  PIGM   NM_145167  PIG-M甘露糖基转移酶
  PIGO   NM_032634  磷脂酰肌醇聚糖,类O同种型1
  PIGX   NM_017861  GPI-甘露糖基转移酶亚基
  PIK3CD   NM_005026  磷酸肌醇-3-激酶,催化,δ
  PIK3R1   NM_181504  磷酸肌醇-3-激酶,调节亚基,
  PIK3R2   NM_005027  磷酸肌醇-3-激酶,调节亚基2
  PIP3-E   NM_015553  磷酸肌醇-结合蛋白PIP3-E
  PIP5K1B   NM_001031687  磷脂酰肌醇-4-磷酸5-激酶,类型
  PIP5K2C   NM_024779  磷脂酰肌醇-4-磷酸5-激酶,类型
  PIP5K3   NM_001002881  磷脂酰肌醇-3-
  PIPOX   NM_016518  L-六氢吡啶羧酸氧化酶
  PITPNA   NM_006224  磷脂酰肌醇转运蛋白质,α
  PITX1   NM_002653  成对同源异型结构域转录因子1
  PIWIL2   NM_018068  piwi样2
  PKD1   NM_000296  多囊蛋白1同种型2前体
  PKD2   NM_000297  多囊蛋白2
  PKDREJ   NM_006071  卵胶样蛋白质前体受体
  PKHD1   NM_138694  polyductin同种型1
  PKIA   NM_006823  cAMP依赖的蛋白质激酶抑制剂α
  PKIG   NM_007066  cAMP依赖的蛋白质激酶抑制剂γ
  PKMYT1   NM_004203  蛋白质激酶Myt1同种型1
  PKNOX1   NM_004571  PBX/有节1同源框1同种型1
  PKP1   NM_000299  亲斑蛋白1同种型1b
  PLA2G6   NM_001004426  磷脂酶A2,组VI同种型b
  PLAC1   NM_021796  胎盘-特异性1
  PLAC2   NM_153375  胎盘-特异性2
  PLAC4   NM_182832  胎盘-特异性4
  PLAG1   NM_002655  多形性腺瘤基因1
  PLAGL2   NM_002657  多形性腺瘤基因样2
  PLAU   NM_002658  尿激酶纤维蛋白溶酶原激活物前蛋白原
  PLAUR   NM_001005376  纤维蛋白溶酶原激活物,尿激酶受体
  PLB1   NM_153021  磷脂酶B1
  PLCB1   NM_015192  磷酸肌醇-特异性磷脂酶Cβ1
  PLCH1   NM_014996  磷脂酶C样3
  PLCXD3   NM_001005473  磷脂酰肌醇-特异性磷脂酶C,X
  PLD1   NM_002662  磷脂酶D1,磷脂酰胆碱-特异性
  PLDN   NM_012388  梅毒螺旋体素
PLEKHA1 NM_001001974  含血小板白细胞C激酶底物同源物结构域,家族A
PLEKHA3 NM_019091  含血小板白细胞C激酶底物同源物结构域,家族A
  PLEKHA6   NM_014935  磷酸肌醇3-磷酸结合蛋白质-3
PLEKHB2 NM_017958  含血小板白细胞C激酶底物同源物结构域,家族B
  PLEKHF2   NM_024613  phafin 2
PLEKHG1 NM_001029884  含血小板白细胞C激酶底物同源物结构域,家族G
PLEKHG6 NM_018173  含血小板白细胞C激酶底物同源物结构域,家族G
PLEKHM1 NM_014798  含血小板白细胞C激酶底物同源物结构域,家族M
  PLEKHQ1   NM_025201  含PH结构域蛋白质
  PLIN   NM_002666  围脂滴蛋白
  PLS1   NM_002670  丝束蛋白1
  PLSCR3   NM_020360  磷脂爬行酶3
  PLSCR4   NM_020353  磷脂爬行酶4
  PLXDC1   NM_020405  含丛蛋白结构域1前体
  PLXNA1   NM_032242  丛蛋白A1
  PLXNA4B   NM_181775  假定蛋白LOC91584
  PLXNC1   NM_005761  丛蛋白C1
  PMAIP1   NM_021127  佛波醇12肉豆蔻酸13醋酸酯-诱导的蛋白质
  PNKD   NM_015488  肌原纤维形成调节物1同种型1
  PNPLA1   NM_173676  含马铃薯块茎特异蛋白样磷脂酶结构域1
  PNPLA4   NM_004650  GS2基因
  PODN   NM_153703  Podocan
  POFUT1   NM_015352  蛋白质O-岩藻糖基转移酶1同种型1
  POLDIP2   NM_015584  DNA聚合酶δ相互作用蛋白质2
  POLH   NM_006502  聚合酶(DNA指导的),eta
  POLQ   NM_199420  DNA聚合酶θ
  POLR1E   NM_022490  RNA聚合酶I相关因子53
  POLR3A   NM_007055  聚合酶(RNA)III(DNA指导的)多肽
  POLR3K   NM_016310  DNA指导的RNA聚合酶III多肽K
  PON2   NM_000305  对氧磷酶2同种型1
  POU3F2   NM_005604  POU结构域,类3,转录因子2
  POU4F2   NM_004575  POU结构域,类4,转录因子2
  POU6F1   NM_002702  POU结构域,类6,转录因子1
  PPAPDC3   NM_032728  磷脂酸磷酸酶类型2结构域
  PPARA   NM_001001928   过氧化物酶增殖激活受体,
  PPARD   NM_006238   过氧化物酶增殖激活受体,
  PPGB   NM_000308   β-半乳糖苷酶保护蛋白
  PPM1A   NM_177951   蛋白质磷酸酶1A同种型2
  PPM1B   NM_001033556   蛋白质磷酸酶1B同种型4
  PPM1E   NM_014906   蛋白质磷酸酶1E
  PPM1K   NM_152542   蛋白质磷酸酶1K(含PP2C结构域)
  PPP1R12B   NM_002481   蛋白质磷酸酶1,调节性(抑制剂)
  PPP1R13B   NM_015316   蛋白质磷酸酶1,调节性(抑制剂)
  PPP1R14C   NM_030949   蛋白质磷酸酶1,调节性(抑制剂)
  PPP1R15B   NM_032833   蛋白质磷酸酶1,调节亚基15B
  PPP1R1A   NM_006741   蛋白质磷酸酶1,调节性(抑制剂)
  PPP1R3B   NM_024607   蛋白质磷酸酶1,调节性(抑制剂)
  PPP1R3C   NM_005398   蛋白质磷酸酶1,调节性(抑制剂)
  PPP2CA   NM_002715   蛋白质磷酸酶2,催化亚基,α
  PPP2R1B   NM_002716   调节亚基A的β同种型,蛋白质
  PPP2R2A   NM_002717   调节亚基B55的α同种型,蛋白质
  PPP2R3A   NM_002718   蛋白质磷酸酶2,调节亚基B″,
  PPP3CA   NM_000944   蛋白质磷酸酶3(以前称作2B),催化
  PPP3R1   NM_000945   蛋白质磷酸酶3,调节亚基B,
  PPP6C   NM_002721   蛋白质磷酸酶6,催化亚基
  PPTC7   NM_139283   T细胞活化蛋白质磷酸酶2C
  PQLC2   NM_017765   含PQ环重复2
  PRAP1   NM_145202   脯氨酸丰富酸性蛋白质1
  PRDM10   NM_020228   含PR结构域10同种型1
  PRDM12   NM_021619   含PR结构域12
  PRDM14   NM_024504   含PR结构域14
  PRDM2   NM_001007257   成视网膜细胞瘤蛋白质结合锌指
  PRELP   NM_002725   脯氨酸精氨酸丰富末端亮氨酸丰富重复
  PREPL   NM_006036   脯氨酰内肽酶样
  PREX1   NM_020820   PREX1蛋白质
  PRH2   NM_005042   脯氨酸丰富蛋白质HaeIII亚家族2
  PRIC285   NM_033405   PPAR-α相互作用复合体蛋白质285
  PRICKLE2   NM_198859   棘样2
  PRKAB2   NM_005399   AMP活化的蛋白质激酶β2
 PRKACB   NM_002731  cAMP依赖的蛋白质激酶催化亚基
 PRKAR1A   NM_002734  cAMP依赖的蛋白质激酶,调节
 PRKCH   NM_006255  蛋白质激酶C,eta
 PRKD3   NM_005813  蛋白质激酶D3
 PRKX   NM_005044  蛋白质激酶,X-连锁
 PRKY   NM_002760  蛋白质激酶,Y连锁的
 PRND   NM_012409  朊病毒样蛋白质叠朊蛋白前蛋白原
 PRNP   NM_000311  朊病毒蛋白质前蛋白原
 PRO0149   NM_014117  假定蛋白LOC29035
 PRO1853   NM_018607  假定蛋白LOC55471同种型2
 PROK1   NM_032414  激动素原1
 PROSC   NM_007198  脯氨酸合成酶共转录同系物
 PRPF4   NM_004697  PRP4前mRNA加工因子4同系物
 PRPF40B   NM_001031698  亨廷顿蛋白相互作用蛋白质C同种型1
 PRPF4B   NM_003913  丝氨酸/苏氨酸-蛋白质激酶PRP4K
 PRR11   NM_018304  假定蛋白LOC55771
 PRR5   NM_001017528  脯氨酸丰富5(′肾)同种型2
 PRRG1   NM_000950  脯氨酸丰富Gla(G-羧基谷氨酸)1
 PRRG4   NM_024081  脯氨酸丰富Gla(G-羧基谷氨酸)4
 PRRT3   NM_207351  假定蛋白LOC285368
 PRRX1   NM_006902  成对中胚层同源框1同种型pmx-1a
 PRSS35   NM_153362  蛋白酶,丝氨酸,35
PSCD1 NM_004762  血小板白细胞C激酶底物同源物,Sec7和卷曲螺旋
 PSD   NM_002779  含血小板白细胞C激酶底物和Sec7结构域
 PSD3   NM_015310  ADP-核糖基化因子乌嘌呤核苷酸
 PSG3   NM_021016  怀孕特异性β-1-糖蛋白3
 PSMC3IP   NM_016556  TBP-1相互作用蛋白质同种型2
 PSMD12   NM_002816  蛋白酶体26S非ATP酶亚基12同种型1
 PSMD5   NM_005047  蛋白酶体26S非ATP酶亚基5
 PSTPIP2   NM_024430  脯氨酸-丝氨酸-苏氨酸磷酸酶相互作用
 PTAFR   NM_000952  血小板活化因子受体
 PTDSS1   NM_014754  磷脂酰丝氨酸合酶1
 PTGDR   NM_000953  前列腺素D2受体
 PTGER3   NM_198718  前列腺素E受体3,亚类型EP3同种型
  PTGER4   NM_000958   前列腺素E受体4,亚类型EP4
  PTGFRN   NM_020440   前列腺素F2受体负调节物
  PTGIS   NM_000961   前列腺素I2(前列环素)合酶
  PTGS1   NM_000962   前列腺素-内过氧化物合酶1同种型1
  PTHLH   NM_198965   甲状旁腺激素样激素同种型1
  PTK2   NM_005607   PTK2蛋白质酪氨酸激酶2同种型b
  PTK6   NM_005975   PTK6蛋白质酪氨酸激酶6
  PTK9   NM_002822   双丝蛋白同种型1
  PTP4A1   NM_003463   蛋白质酪氨酸磷酸酶类型IVA,成员1
  PTPDC1   NM_152422   含蛋白质酪氨酸磷酸酶结构域1
  PTPN1   NM_002827   蛋白质酪氨酸磷酸酶,非受体型
  PTPN12   NM_002835   蛋白质酪氨酸磷酸酶,非受体型
  PTPN3   NM_002829   蛋白质酪氨酸磷酸酶,非受体型
  PTPN4   NM_002830   蛋白质酪氨酸磷酸酶,非受体型
  PTPNS1   NM_080792   蛋白质酪氨酸磷酸酶,非受体型
  PTPRO   NM_002848   受体-类型蛋白质酪氨酸磷酸酶O
  PTPRT   NM_007050   蛋白质酪氨酸磷酸酶,受体型,T
  PTRF   NM_012232   聚合酶I和转录物释放因子
  PURA   NM_005859   嘌呤丰富元件结合蛋白A
  PURB   NM_033224   嘌呤丰富元件结合蛋白B
  PVR   NM_006505   脊髓灰质炎病毒受体
  PVRL2   NM_002856   脊髓灰质炎病毒受体相关2(泡疹病毒进入
  PYGB   NM_002862   脑糖原磷酸化酶
  QKI   NM_206853   quaking同系物,KH结构域RNA结合同种型
  QPRT   NM_014298   喹啉酸磷酸核糖转移酶
  QRSL1   NM_018292   谷氨酰胺酰-tRNA合酶
  R7BP   NM_001029875   R7结合蛋白质
  RAB10   NM_016131   ras相关GTP-结合蛋白RAB10
  RAB11A   NM_004663   Ras相关蛋白Rab-11A
  RAB11FIP1   NM_001002233   Rab偶联蛋白质同种型2
  RAB11FIP4   NM_032932   RAB11家族相互作用蛋白质4(I类I)
  RAB11FIP5   NM_015470   RAB11家族相互作用蛋白质5(I类)
  RAB21   NM_014999   RAB21,成员RAS癌基因家族
  RAB22A   NM_020673   RAS相关蛋白RAB-22A
  RAB23   NM_016277   Ras相关蛋白Rab-23
 RAB27A   NM_004580   Ras相关蛋白Rab-27A
 RAB28   NM_001017979   RAB28,成员RAS癌基因家族同种型1
 RAB30   NM_014488   RAB30,成员RAS癌基因家族
 RAB31   NM_006868   RAB31,成员RAS癌基因家族
 RAB35   NM_006861   RAB35,成员RAS癌基因家族
 RAB37   NM_001006638   RAB37,成员RAS癌基因家族同种型2
 RAB3B   NM_002867   RAB3B,成员RAS癌基因家族
 RAB3IL1   NM_013401   RAB3A相互作用蛋白质(Rab结合蛋白3)样1
 RAB43   NM_198490   RAB43蛋白质
 RAB5B   NM_002868   RAB5B,成员RAS癌基因家族
 RAB7L1   NM_003929   RAB7,成员RAS癌基因家族样1
 RAB8B   NM_016530   RAB8B,成员RAS癌基因家族
RABEP1 NM_004703   Rab接触蛋白,RAB GTP酶结合效应蛋白蛋白质1
 RABGAP1   NM_012197   RAB GTP酶激活素1
 RABL2A   NM_013412   RAB,RAS癌基因家族成员样2A
 RABL2B   NM_001003789   RAB,RAS癌基因家族成员样2B
 RABL5   NM_022777   RAB,成员RAS癌基因家族样5
 RACGAP1   NM_013277   Rac GTP酶激活素1
 RAD1   NM_002853   RAD1同系物同种型1
 RAD17   NM_002873   RAD17同系物同种型1
 RAD18   NM_020165   复制后修复蛋白质hRAD18p
 RAD23B   NM_002874   UV切除修复蛋白质RAD23同系物B
 RAD51   NM_002875   RAD51同源蛋白同种型1
 RAD52   NM_002879   RAD52同系物同种型α
 RAG1AP1   NM_018845   基质细胞蛋白质
 RAI16   NM_022749   视黄酸诱导的16
 RAI17   NM_020338   视黄酸诱导的17
 RALBP1   NM_006788   ralA结合蛋白1
 RALGPS1   NM_014636   含PH结构域和SH3结合模体Ral GEF 1
 RALGPS2   NM_018037   含PH结构域和SH3结合模体Ral GEF 2
 RAN   NM_006325   ras相关核蛋白质
 RANBP5   NM_002271   RAN结合蛋白5
 RAP1A   NM_001010935   RAP1A,RAS癌基因家族成员
 RAP2B   NM_002886   RAP2B,RAS癌基因家族成员
  RAP2C   NM_021183   RAP2C,RAS癌基因家族成员
  RAPGEF1   NM_005312   乌嘌呤核苷酸释放因子2同种型a
  RAPGEF4   NM_007023   Rap乌苷酸交换因子(GEF)4
  RAPGEFL1   NM_016339   Rap乌嘌呤核苷酸交换因子
RAPH1 NM_213589   Ras相关和血小板白细胞C激酶底物同源物结构域
  Raptor   NM_020761   Raptor
  RARB   NM_000965   视黄酸受体,β同种型1
  RASD1   NM_016084   RAS,地塞米松-诱导的1
  RASGEF1A   NM_145313   RasGEF结构域家族,成员1A
  RASL11B   NM_023940   RAS样家族11成员B
  RASL12   NM_016563   RAS样,家族12蛋白质
  RASSF2   NM_014737   Ras关联结构域家族2
  RASSF6   NM_177532   Ras关联(RalGDS/AF-6)结构域家族6
  RASSF8   NM_007211   Ras关联(RalGDS/AF-6)结构域家族8
  RAVER2   NM_018211   核糖核蛋白,PTB结合2
  RB1   NM_000321   成视网膜细胞瘤1
  RB1CC1   NM_014781   Rb1-可诱导的卷曲螺旋蛋白质1
  RBBP5   NM_005057   成视网膜细胞瘤结合蛋白5
  RBBP7   NM_002893   成视网膜细胞瘤结合蛋白7
  RBJ   NM_016544   Ras相关蛋白Rap1
  RBL1   NM_002895   成视网膜细胞瘤样蛋白质1同种型a
  RBL2   NM_005611   成视网膜细胞瘤样2(p130)
  RBM12   NM_006047   RNA结合模体蛋白质12
  RBM12B   NM_203390   假定蛋白LOC389677
  RBM13   NM_032509   RNA结合模体蛋白质13
  RBM15B   NM_013286   RNA结合模体蛋白质15B
  RBM7   NM_016090   RNA结合模体蛋白质7
  RBPMS   NM_006867   具有多种剪接形式的RNA-结合蛋白
  RCCD1   NM_001017919   假定蛋白LOC91433
  RCOR2   NM_173587   REST辅阻遏物2
  RECQL5   NM_001003715   RecQ蛋白质样5同种型2
  REEP1   NM_022912   受体表达增强蛋白质1
  REEP3   NM_001001330   受体表达增强蛋白质3
  REEP5   NM_005669   受体辅助蛋白5
  REL   NM_002908   v-rel网状内皮组织增殖病毒癌基因
  RERE   NM_012102   萎缩蛋白-1样蛋白质
  RET   NM_020975   ret原癌基因同种型a
  REXO1L1   NM_172239   外切核酸酶GOR
  RFC2   NM_002914   复制因子C2(40kD)同种型2
  RFK   NM_018339   核黄素激酶
  RFX2   NM_000635   调节因子X2同种型a
  RFX5   NM_000449   调节因子X,5
  RFXAP   NM_000538   调节因子X相关蛋白
  RG9MTD3   NM_144964   RNA(鸟嘌呤-9-)甲基转移酶结构域
  RGL1   NM_015149   ral乌嘌呤核苷酸解离
  RGMA   NM_020211   RGM结构域家族,成员A
  RGMB   NM_001012761   RGM结构域家族,成员B同种型1前体
  RGPD5   NM_005054   含RANBP2样和GRIP结构域5同种型
  RGS3   NM_021106   G-蛋白质信号转导调节物3同种型2
  RGS4   NM_005613   G-蛋白信号的调节物4
  RGS5   NM_003617   G-蛋白质信号转导调节物5
  RGS9BP   NM_207391   RGS9锚定蛋白质
  RHBDL2   NM_017821   菱形相关蛋白2
  RHO   NM_000539   视紫红质
  RHOA   NM_001664   ras同系物基因家族,成员A
  RHOBTB1   NM_001032380   含Rho相关BTB结构域1
  RHOBTB3   NM_014899   含rho相关BTB结构域3
  RHOC   NM_175744   ras同系物基因家族,成员C
  RHOT1   NM_001033566   ras同系物基因家族,成员T1同种型2
  RHOV   NM_133639   ras同系物基因家族,成员V
  RIC3   NM_024557   胆碱酯酶抑制剂抗性3
  RIMBP2   NM_015347   RIM-结合蛋白2
  RIMS4   NM_182970   调节突触膜胞吐4
  RIOK3   NM_003831   bimD6同系物的sudD抑制蛋白同种型1
  RIPK5   NM_015375   受体相互作用蛋白质激酶5同种型1
  RKHD1   NM_203304   含环指和KH结构域1
  RKHD2   NM_016626   含环指和KH结构域2
  RNASEL   NM_021133   核糖核酸酶L
  RND3   NM_005168   ras同系物基因家族,成员E
  RNF11   NM_014372   环指蛋白11
  RNF12   NM_016120   环指蛋白12
  RNF125   NM_017831   环指蛋白125
  RNF128   NM_024539   环指蛋白128同种型2
  RNF141   NM_016422   环指蛋白141
  RNF144   NM_014746   环指蛋白144
  RNF149   NM_173647   环指蛋白149
  RNF157   NM_052916   环指蛋白157
  RNF170   NM_030954   环指蛋白170
  RNF180   NM_178532   环指蛋白180
  RNF19   NM_015435   环指蛋白19
  RNF2   NM_007212   环指蛋白2
  RNF24   NM_007219   环指蛋白24
  RNF31   NM_017999   环指蛋白31
  RNF38   NM_022781   环指蛋白38同种型1
  RNF4   NM_002938   环指蛋白4
  RNF6   NM_005977   环指蛋白6同种型1
  RNF8   NM_003958   环指蛋白8同种型1
  RNH1   NM_002939   核糖核酸酶/血管生成素抑制剂
  RNMT   NM_003799   RNA(乌嘌呤-7-)甲基转移酶
  RNMTL1   NM_018146   RNA甲基转移酶样1
  RNPC1   NM_183425   含RNA结合区蛋白质1同种型
  RNPS1   NM_006711   RNA-结合蛋白S1,丝氨酸丰富结构域
  RNUXA   NM_032177   RNA U,小的核RNA输出衔接子
  ROCK2   NM_004850   Rho-相关,含卷曲螺旋蛋白质
  RORA   NM_002943   RAR相关孤儿受体A同种型c
  RORC   NM_001001523   RAR相关孤儿受体C同种型b
  RPA2   NM_002946   复制蛋白质A2,32kDa
  RPIP8   NM_006695   RaP2相互作用蛋白质8
  RPL13   NM_000977   核糖体蛋白质L13
  RPL15   NM_002948   核糖体蛋白质L15
  RPL32   NM_000994   核糖体蛋白质L32
  RPL37   NM_000997   核糖体蛋白质L37
  RPL37A   NM_000998   核糖体蛋白质L37a
  RPL7L1   NM_198486   核糖体蛋白质L7样1
  RPN1   NM_002950   核糖体结合糖蛋白I前体
  RPP14   NM_007042   核糖核酸酶P 14kDa亚基
  RPRM   NM_019845   reprimo,TP53依赖性G2阻滞调节物
  RPS23   NM_001025   核糖体蛋白质S23
  RPS6KA1   NM_001006665   核糖体蛋白质S6激酶,90kDa,多肽
  RPS6KA2   NM_001006932   核糖体蛋白质S6激酶,90kDa,多肽
  RPS6KA3   NM_004586   核糖体蛋白质S6激酶,90kDa,多肽
  RPS6KA4   NM_001006944   核糖体蛋白质S6激酶,90kDa,多肽
  RPS6KA5   NM_004755   核糖体蛋白质S6激酶,90kDa,多肽
  RRH   NM_006583   周视蛋白(peropsin)
  RRM2   NM_001034   核糖核苷酸还原酶M2多肽
  RRN3   NM_018427   RRN3RNA聚合酶I转录因子
  RSAD2   NM_080657   含根本的S-腺苷甲硫氨酸结构域
  RSBN1   NM_018364   圆形精子碱性蛋白质1
  RSL1D1   NM_015659   含核糖体L1结构域1
  RSNL2   NM_024692   列斯蛋白样2
  RSPO2   NM_178565   R-脊椎蛋白家族,成员2
  RSPO4   NM_001029871   R-脊椎蛋白家族,成员4同种型1前体
  RSU1   NM_012425   ras阻抑制因子蛋白质1同种型1
  RTF1   NM_015138   Paf1/RNA聚合酶II复合体成分
  RTN2   NM_206902   浆膜蛋白2同种型D
  RTP1   NM_153708   受体转运蛋白质1
  RTP4   NM_022147   28kD干扰素应答蛋白质
  RUNDC1   NM_173079   含RUN结构域1
  RUNDC2A   NM_032167   含RUN结构域2A
  RUNX1   NM_001001890   runt相关转录因子1同种型b
  RUNX2   NM_001015051   runt相关转录因子2同种型b
  RUNX3   NM_001031680   runt相关转录因子3同种型1
  RXRG   NM_006917   类视黄醇X受体,γ同种型a
  S100A16   NM_080388   S100钙结合蛋白A16
  S100A4   NM_002961   S100钙-结合蛋白A4
  S100PBP   NM_001017406   S100P结合蛋白Riken同种型b
  SACS   NM_014363   Sacsin
  SAMD10   NM_080621   含不育α模体结构域10
  SAMD12   NM_207506   含不育α模体结构域12
  SAMD8   NM_144660   含不育α模体结构域8
  SAMD9L   NM_152703   含不育α模体结构域9样
  SAPS1   NM_014931   假定蛋白LOC22870
  SAPS2   NM_014678   假定蛋白LOC9701
  SAPS3   NM_018312   SAPS结构域家族,成员3
  SAR1B   NM_001033503   SAR1a基因同系物2
  SART1   NM_005146   T细胞识别的鳞状细胞癌抗原
  SASH1   NM_015278   含SAM和SH3结构域1
  SATB2   NM_015265   SATB家族成员2
  SATL1   NM_001012980   精脒/精胺N1-乙酰基转移酶样
  SBK1   NM_001024401   SH3结合结构域激酶1
  SC4MOL   NM_001017369   固醇-C4-甲基氧化酶样同种型2
  SCAMP1   NM_052822   分泌的运载体膜蛋白质1同种型2
  SCAMP2   NM_005697   分泌的运载体膜蛋白质2
  SCAMP5   NM_138967   分泌的运载体膜蛋白质5
  SCAND2   NM_022050   含SCAN结构域蛋白质2同种型1
  SCARA5   NM_173833   假定蛋白LOC286133
  SCC-112   NM_015200   SCC-112蛋白质
  SCCPDH   NM_016002   酵母氨酸脱氢酶(假定的)
  SCIN   NM_033128   肌切蛋白
  SCMH1   NM_001031694   中足性梳同系物1同种型1
  SCML2   NM_006089   中足性梳样2
  SCN11A   NM_014139   钠通道,电压门控,类型XI,α
  SCN2B   NM_004588   钠通道,电压门控,类型II,β
  SCN3A   NM_006922   钠通道,电压门控,类型III,α
  SCRN3   NM_024583   分离蛋白3
  SCRT2   NM_033129   scratch 2蛋白质
  SDC2   NM_002998   黏结蛋白聚糖2前体
  SDPR   NM_004657   血清除尽效应蛋白
  SEC14L2   NM_012429   SEC14样2
  SEC31L2   NM_198138   酿酒酵母(S.cerevisiae)SEC31样2同种型b
  SEL1L   NM_005065   lin-12样sel-1抑制蛋白
  SELE   NM_000450   选择蛋白E前体
  SELI   NM_033505   硒蛋白I
  SELPLG   NM_003006   选择蛋白P配体
  SEMA3E   NM_012431   脑信号蛋白3E
  SEMA4B   NM_020210   脑信号蛋白4B前体
  SEMA4G   NM_017893   脑信号蛋白4G
  SEMA5A   NM_003966   脑信号蛋白5A
  SENP1   NM_014554   sentrin/SUMO-特异性蛋白酶1
  SENP8   NM_145204   SUMO/sentrin特异性蛋白酶家族成员8
  SEPT11   NM_018243   隔蛋白11
  SEPT2   NM_001008491   隔蛋白2
  SEPT6   NM_015129   隔蛋白6同种型B
  SERF1A   NM_021967   小的EDRK丰富因子1A,端粒
  SERF1B   NM_022978   小的EDRK丰富因子1B,着丝粒
  SERINC1   NM_020755   肿瘤差异表达的2
  SERP1   NM_014445   应激相关内质网蛋白质
  SERPINB8   NM_002640   丝氨酸(或半胱氨酸)蛋白酶抑制剂,进化枝
  SERPINE1   NM_000602   纤溶酶原激活物抑制剂-1
  SERTAD2   NM_014755   含SERTA结构域2
  SESN1   NM_014454   sestrin1
  SESN2   NM_031459   sestrin2
  SET   NM_003011   SET易位(髓性白血病-相关)
  SETD2   NM_014159   亨廷顿蛋白相互作用蛋白质B
  SETD4   NM_001007258   假定蛋白LOC54093同种型b
  SEZ6   NM_178860   癫痫发作相关6同系物
  SF4   NM_182812   剪接因子4同种型c
  SFMBT1   NM_001005158   具4个mbt结构域的Scm样1
  SFRP1   NM_003012   分泌的frizzled相关蛋白1
  SFRP2   NM_003013   分泌的frzzled相关蛋白2前体
  SFRS14   NM_001017392   剪接因子,精氨酸/丝氨酸丰富14
  SFRS2   NM_003016   剪接因子,精氨酸/丝氨酸丰富2
  SFT2D2   NM_199344   含SFT2结构域2
  SFXN2   NM_178858   sideroflexin2
  SFXN5   NM_144579   sideroflexin5
  SGCD   NM_000337   δ-肌聚糖同种型1
  SGK3   NM_001033578   血清/糖皮质激素调节的激酶3同种型
  SGPL1   NM_003901   鞘氨醇-1-磷酸裂合酶1
  SH2D3A   NM_005490   含SH2结构域3A
  SH3BGRL2   NM_031469   SH3结构域结合谷氨酸丰富蛋白质
  SH3BP5   NM_001018009   SH3-结构域结合蛋白5(BTK-相关)
  SH3GL3   NM_003027   SH3-结构域GRB2样3
  SH3PX3   NM_153271   含SH3和PX结构域3
  SH3PXD2A   NM_014631   SH3多结构域1
  SH3RF2   NM_152550   含SH3结构域环指2
  SHANK2   NM_012309   SH3和多锚蛋白重复结构域2
  SHCBP1   NM_024745   SHC SH2-结构域结合蛋白1
  SHE   NM_001010846   含Src同源物2结构域E
  SHF   NM_138356   假定蛋白LOC90525
  SHMT2   NM_005412   丝氨酸羟甲基转移酶2
  SHOC2   NM_007373   清晰化基因同系物soc-2抑制蛋白
  SIAE   NM_170601   胞质的唾液酸9-O-乙酰酯酶
  SIDT1   NM_017699   SID1跨膜家族,成员1
  SIGLEC10   NM_033130   唾液酸结合Ig样凝集素10
  SIGLEC11   NM_052884   唾液酸结合Ig样凝集素11
  SIKE   NM_025073   IKKε抑制蛋白
  SIM2   NM_009586   single-minded同系物2短同种型
  SIN3B   NM_015260   SIN3同系物B,转录调节物
  SIPA1L3   NM_015073   信号诱导增殖相关1样
  SIRT3   NM_001017524   sirtuin3同种型b
  SIRT7   NM_016538   sirtuin7
  SKI   NM_003036   v-ski肉瘤病毒癌基因同系物
  SLAMF7   NM_021181   SLAM家族成员7
  SLC11A1   NM_000578   溶质运载体家族11(质子偶联的
  SLC12A7   NM_006598   溶质运载体家族12(钾/氯化物
  SLC13A1   NM_022444   溶质运载体家族13(钠/硫酸盐
  SLC14A1   NM_015865   RACH1
  SLC14A2   NM_007163   溶质运载体家族14(尿素转运蛋白),
  SLC16A12   NM_213606   溶质运载体家族16(一元羧酸
  SLC16A14   NM_152527   溶质运载体家族16(一元羧酸
  SLC16A2   NM_006517   溶质运载体家族16,成员2
  SLC16A7   NM_004731   溶质运载体家族16,成员7
  SLC16A9   NM_194298   溶质运载体家族16(一元羧酸
  SLC17A5   NM_012434   溶质运载体家族17(阴离子/糖
  SLC17A7   NM_020309   溶质运载体家族17,成员7
  SLC17A8   NM_139319   溶质运载体家族17(钠依赖的
  SLC19A3   NM_025243   溶质运载体家族19,成员3
  SLC1A2   NM_004171   溶质运载体家族1,成员2
  SLC1A4   NM_003038   溶质运载体家族1,成员4
  SLC22A15   NM_018420   溶质运载体家族22(有机阳离子
  SLC22A2   NM_003058   溶质运载体家族22成员2同种型a
  SLC22A3   NM_021977   溶质运载体家族22成员3
  SLC22A5   NM_003060   溶质运载体家族22成员5
  SLC23A3   NM_144712   溶质运载体家族23(核碱基
  SLC24A3   NM_020689   溶质运载体家族24
  SLC24A4   NM_153646   溶质运载体家族24成员4同种型1
  SLC25A10   NM_012140   溶质运载体家族25(线粒体运载体,
  SLC25A13   NM_014251   溶质运载体家族25,成员13(citrin)
  SLC25A24   NM_013386   溶质运载体家族25成员24同种型1
  SLC25A27   NM_004277   溶质运载体家族25,成员27
  SLC25A34   NM_207348   溶质运载体家族25,成员34
  SLC26A4   NM_000441   潘蛋白
  SLC26A7   NM_052832   溶质运载体家族26,成员7同种型a
  SLC29A2   NM_001532   溶质运载体家族29(核苷
  SLC2A11   NM_030807   葡萄糖转运蛋白质10同种型a
  SLC2A2   NM_000340   溶质运载体家族2(易化葡萄糖
  SLC2A3   NM_006931   溶质运载体家族2(易化葡萄糖
  SLC2A4   NM_001042   葡萄糖转运蛋白4
  SLC2A4RG   NM_020062   SLC2A4调节物
  SLC2A5   NM_003039   溶质运载体家族2(易化
  SLC2A6   NM_017585   溶质运载体家族2(易化葡萄糖
  SLC30A10   NM_001004433   溶质运载体家族30(锌转运蛋白),
  SLC30A3   NM_003459   溶质运载体家族30(锌转运蛋白),
  SLC30A7   NM_133496   锌转运蛋白样2
  SLC31A1   NM_001859   溶质运载体家族31(铜转运蛋白),
  SLC35A5   NM_017945   溶质运载体家族35,成员A5
  SLC35B4   NM_032826   溶质运载体家族35,成员B4
  SLC35E1   NM_024881   溶质运载体家族35,成员E1
  SLC35E3   NM_018656   溶质运载体家族35,成员E2
  SLC35F3   NM_173508   溶质运载体家族35,成员F3
  SLC35F5   NM_025181   溶质运载体家族35,成员F5
  SLC36A1   NM_078483   溶质运载体家族36成员1
  SLC36A2   NM_181776   溶质运载体家族36(质子/氨基酸
  SLC37A4   NM_001467   溶质运载体家族37(甘油-6-磷酸
  SLC40A1   NM_014585   溶质运载体家族40(铁调节的
  SLC41A1   NM_173854   溶质运载体家族41成员1
  SLC44A4   NM_025257   NG22蛋白质同种型1
  SLC45A2   NM_001012509   膜相关转运蛋白质同种型
  SLC4A7   NM_003615   溶质运载体家族4,碳酸氢钠
  SLC5A12   NM_178498   溶质运载体家族5(钠/葡萄糖
  SLC5A7   NM_021815   溶质运载体家族5(胆碱转运蛋白),
  SLC6A8   NM_005629   溶质运载体家族6(神经递质
  SLC6A9   NM_001024845   溶质运载体家族6成员9同种型3
  SLC7A11   NM_014331   溶质运载体家族7,(阳离子氨基酸
  SLC7A2   NM_001008539   溶质运载体家族7,成员2同种型1
  SLC7A6   NM_003983   溶质运载体家族7(阳离子氨基酸
  SLC9A2   NM_003048   溶质运载体家族9(钠/氢
  SLC9A3R1   NM_004252   溶质运载体家族9(钠/氢
  SLC9A6   NM_006359   溶质运载体家族9(钠/氢
  SLC9A8   NM_015266   Na+/H+交换剂同种型8
  SLC9A9   NM_173653   溶质运载体家族9(钠/氢
  SLCO1C1   NM_017435   溶质运载体有机阴离子转运蛋白家族,
  SLCO4C1   NM_180991   溶质运载体有机阴离子转运蛋白家族,
  SLD5   NM_032336   SLD5
  SLITRK2   NM_032539   SLIT和NTRK样家族,成员2
  SLITRK3   NM_014926   slit和trk样3蛋白质
  SLK   NM_014720   丝氨酸/苏氨酸激酶2
  SLTM   NM_001013843   雌激素诱导转录调节物
  SMA4   NM_021652   SMA4
  SMA5   NM_021036   SMA5
  SMAD1   NM_001003688   Sma和Mad相关蛋白1
  SMAD2   NM_001003652   Sma和Mad相关蛋白2
  SMAD5   NM_001001419   SMAD(mothers against DPP)同系物5
  SMAD6   NM_005585   MAD(mothers against decapentaplegic)同系物6
  SMAD7   NM_005904   MAD(mothers against decapentaplegic)同系物7
  SMC1L1   NM_006306   SMC1染色体结构维持蛋白
  SMC1L2   NM_148674   SMC1染色体结构维持蛋白
  SMC4L1   NM_001002799   SMC4染色体结构维持蛋白
  SMEK2   NM_020463   假定蛋白LOC57223
  SMG1   NM_015092   PI-3-激酶相关激酶SMG-1
  SMOC1   NM_022137   分泌的模块钙-结合蛋白1
  SMOC2   NM_022138   分泌的模块钙-结合蛋白2
  SMYD1   NM_198274   含SET和MYND结构域1
  SMYD4   NM_052928   含SET和MYND结构域4
  SNAP23   NM_003825   突触小体相关蛋白23同种型
  SNAPC4   NM_003086   小的核RNA激活复合体,
  SNF1LK   NM_173354   SNF1样激酶
  SNPH   NM_014723   伸展蛋白
  SNRK   NM_017719   SNF相关激酶
  SNRPD3   NM_004175   小的核核糖核蛋白多肽D3
  SNX11   NM_013323   分拣微管连接蛋白11
  SNX16   NM_022133   分拣微管连接蛋白16同种型a
  SNX19   NM_014758   分拣微管连接蛋白19
  SNX22   NM_024798   分拣微管连接蛋白22
  SNX27   NM_030918   分拣微管连接蛋白家族成员27
  SNX9   NM_016224   分拣微管连接蛋白9
  SOCS6   NM_004232   细胞因子信号抑制蛋白6
  SOD2   NM_000636   锰超氧化物歧化酶同种型A
  SOLH   NM_005632   小的视叶
  SORBS2   NM_003603   含山梨糖和SH3结构域2同种型1
  SORL1   NM_003105   含选蛋白相关受体LDLR类
  SORT1   NM 002959   选蛋白1前蛋白原
  SOX1   NM_005986   SRY(性别决定区Y)-盒1
  SOX12   NM_006943   SRY(性别决定区Y)-盒12
  SOX4   NM_003107   SRY(性别决定区Y)-盒4
  SOX7   NM_031439   SRY-盒7
  SP140   NM_007237   SP140核体蛋白质同种型1
  SP4   NM_003112   Sp4转录因子
  SP6   NM_199262   Sp6转录因子
  SP8   NM_182700   Sp8转录因子同种型1
  SPACA1   NM_030960   精子顶体相关的1
  SPACA4   NM_133498   精子顶体膜蛋白质14
  SPARC   NM_003118   分泌的蛋白质,酸性,半胱氨酸丰富
  SPATA13   NM_153023   精子发生相关的13
  SPATA3   NM_139073   睾丸和精子发生细胞细胞凋亡
  SPATS2   NM_023071   精子发生相关的,丝氨酸丰富2
  SPBC24   NM_182513   纺锤体极体成分24同系物
  SPECC1   NM_001033553   具卷曲螺旋的血影蛋白结构域1NSP5b3b
  SPFH1   NM_006459   SPFH结构域家族,成员1
  SPFH2   NM_007175   SPFH结构域家族,成员2同种型1
  SPG20   NM_015087   Spartin
  SPIRE2   NM_032451   spire同系物2
  SPN   NM_001030288   诞福林
  SPOCK1   NM_004598   sparc/骨粘连蛋白,cwcv和kazal样结构域
  SPOCK2   NM_014767   sparc/骨粘连蛋白,cwcv和kazal样结构域
  SPRN   NM_001012508   朊病毒蛋白质阴影
  SPRR2B   NM_001017418   小的脯氨酸丰富蛋白质2B
  SPRR2E   NM_001024209   小的脯氨酸丰富蛋白质2E
  SPRR2F   NM_001014450   小的脯氨酸丰富蛋白质2F
  SPRY4   NM_030964   sprouty同系物4
  SPSB4   NM_080862   含SPRY结构域SOCS盒蛋白质SSB-4
  SPTBN4   NM_020971   血影蛋白,β,非红细胞4同种型1
  SPTLC1   NM_178324   丝氨酸棕榈酰转移酶亚基1同种型b
  SPTLC2   NM_004863   丝氨酸棕榈酰转移酶,长链碱基
  SPTY2D1   NM_194285   假定蛋白LOC144108
  SQSTM1   NM_003900   死骨片1
  SRD5A2L2   NM_001010874   类固醇5α-还原酶2样2
  SRGAP3   NM_001033116   SLIT-ROBO Rho GTP酶激活素3
  SRI   NM_003130   抗药蛋白同种型a
  SRP72   NM_006947   信号识别颗粒72kDa
  SRPK1   NM_003137   SFRS蛋白质激酶1
  SRPK2   NM_182691   SFRS蛋白质激酶2同种型b
  SRXN1   NM_080725   硫氧还蛋白1同系物
  SS18L1   NM_015558   SS18样蛋白质1
  SSBP3   NM_001009955   单链DNA结合蛋白3同种型c
  SSFA2   NM_006751   精子特异性抗原2
  SSH2   NM_033389   slingshot(丝切肌动蛋白)2
  SSPN   NM_005086   Sarcospan
  SSR3   NM_007107   信号序列受体γ亚基
  SSTR2   NM_001050   促生长素抑制素受体2
  SSX2IP   NM_014021   滑膜肉瘤,X断裂点2相互作用
  ST3GAL1   NM_003033   唾液酰基转移酶4A
  ST6GAL1   NM_003032   唾液酰基转移酶1同种型a
  ST6GALNAC3   NM_152996   ST6
  ST6GALNAC6   NM_013443   ST6
  ST8SIA2   NM_006011   ST8α-N-乙酰基-神经氨酸苷
  ST8SIA4   NM_005668   ST8α-N-乙酰基-神经氨酸苷
  STAC   NM_003149   SH3和半胱氨酸丰富结构域
  STAC2   NM_198993   SH3和半胱氨酸丰富结构域2
  STAM2   NM_005843   信号转导衔接子分子2
  STAR   NM_000349   类固醇生成急性调节物同种型1
  STARD8   NM_014725   含START结构域8
  STAT1   NM_007315   信号传导子及转录激活子
  STAT3   NM_003150   信号传导子及转录激活子
  STAT5B   NM_012448   信号传导子及转录激活子
  STC1   NM_003155   司腺钙蛋白1前体
  STIM1   NM_003156   基质相互作用分子1前体
  STIM2   NM_020860   基质相互作用分子2
  STK11   NM_000455   丝氨酸/苏氨酸蛋白质激酶11
  STK11IP   NM_052902   LKB1相互作用蛋白质
  STK17B   NM_004226   丝氨酸/苏氨酸激酶17b
  STK33   NM_030906   丝氨酸/苏氨酸激酶33
  STK38   NM_007271   丝氨酸/苏氨酸激酶38
  STK4   NM_006282   丝氨酸/苏氨酸激酶4
  STOM   NM_004099   stomatin同种型a
  STRBP   NM_018387   精子细胞核周RNA结合蛋白质
  STRN3   NM_014574   核自身抗原
  STS-1   NM_032873   Cbl-相互作用蛋白质Sts-1
  STX6   NM_005819   突触融合蛋白6
  STYX   NM_145251   丝氨酸/苏氨酸/酪氨酸相互作用蛋白质
  SUDS3   NM_022491   缺陷沉默抑制蛋白3
  SUHW2   NM_080764   毛翅同系物2抑制蛋白
  SUHW3   NM_017666   毛翅同系物3抑制蛋白
  SUHW4   NM_001002843   毛翅同系物4抑制蛋白同种型2
  SULF1   NM_015170   硫酸酯酶1
  SULT2A1   NM_003167   磺基转移酶家族,胞质的,2A,
  SUMF1   NM_182760   硫酸酯酶修饰因子1
  SUPT7L   NM_014860   SPTF相关因子65γ
  SUSD1   NM_022486   含sushi结构域1
  SUV39H2   NM_024670   花斑抑制蛋白3-9同系物2
  SUV420H1   NM_017635   花斑抑制蛋白4-20同系物1同种型
  SVH   NM_031905   SVH蛋白质
  SWAP70   NM_015055   SWAP-70蛋白质
  SYAP1   NM_032796   SYAP1蛋白质
  SYNE1   NM_015293   nesprin 1同种型β
  SYNE2   NM_015180   含血影蛋白重复,核膜2
  SYNGR2   NM_004710   突触循环蛋白2
  SYNJ2BP   NM_018373   突触小泡磷酸酶2结合蛋白质
  SYNPO2   NM_133477   突触足蛋白2
  SYNPO2L   NM_024875   突触足蛋白2样
  SYT10   NM_198992   突触结合蛋白10
  SYT13   NM_020826   突触结合蛋白XIII
  SYT15   NM_031912   突触结合蛋白XV同种型a
  SYT7   NM_004200   突触结合蛋白VII
  SYTL4   NM_080737   突触结合蛋白样4(粒亲蛋白(granuphilin)-a)
  TACC1   NM_006283   转化,含酸性卷曲螺旋
  TAF7   NM_005642   TATA盒结合蛋白质相关因子2F
  TAF9B   NM_015975   转录相关因子9B
  TAGAP   NM_054114   T细胞活化Rho GTP酶活化蛋白
  TAIP-2   NM_024969   TGF-β诱导的细胞凋亡蛋白质2
  TAL1   NM_003189   T细胞急性淋巴细胞白血病1
  TANC1   NM_033394   TPR结构域,锚蛋白重复和
  TAOK2   NM_016151   TAO激酶2同种型2
  TAOK3   NM_016281   TAO激酶3
  TAPBP   NM_172208   甲巯蛋白同种型2前体
  TAT   NM_000353   酪氨酸氨基转移酶
  TAX1BP1   NM_006024   Tax1(人T细胞白血病病毒类型I)
  TBC1D1   NM_015173   TBC1(tre-2/USP6,BUB2,cdc16)结构域家族,
  TBC1D10C   NM_198517   TBC1结构域家族,成员10C
  TBC1D15   NM_022771   TBC1结构域家族,成员15
  TBC1D17   NM_024682   TBC1结构域家族,成员17
  TBC1D2   NM_018421   TBC1结构域家族,成员2
  TBC1D4   NM_014832   TBC1结构域家族,成员4
  TBC1D8   NM_007063   TBC1结构域家族,成员8
  TBC1D9   NM_015130   假定蛋白LOC23158
  TBL1X   NM_005647   转导蛋白β样1X
  TBRG1   NM_032811   转化生长因子β调节物1
  TBX19   NM_005149   T-盒19
  TBX3   NM_005996   T-盒3蛋白质同种型1
  TCEAL7   NM_152278   假定蛋白LOC56849
  TCEB3   NM_003198   延伸蛋白A
  TCF21   NM_003206   转录因子21
  TCF7   NM_003202   转录因子7(T细胞特异性,
  TCF7L1   NM_031283   HMG-盒转录因子TCF-3
  TCL6   NM_014418   T细胞白血病/淋巴瘤6同种型TCL6a2
  TCN2   NM_000355   钴胺传递蛋白II前体
  TCOF1   NM_001008657   Treacher Collins-Franceschetti综合征1
  TCTA   NM_022171   T细胞白血病易位改变基因
  TCTEX1D1   NM_152665   假定蛋白LOC200132
  TDRD1   NM_198795   含tudor结构域1
  TEGT   NM_003217   睾丸增强的基因转录物(BAX抑制剂
  TEK   NM_000459   TEK酪氨酸激酶,内皮前体
  TEP1   NM_007110   端粒酶相关蛋白1
  TESC   NM_017899   Tescalcin
  TEX14   NM_031272   睾丸表达的序列14同种型b
  TEX15   NM_031271   睾丸表达的序列15
  TEX261   NM_144582   睾丸表达的序列261
  TFEC   NM_001018058   转录因子EC同种型b
  TGFB1I1   NM_015927   雄激素受体辅激活物ARA55
 TGFB2   NM_003238   转化生长因子,β2
 TGFBI   NM_000358   转化生长因子,β-诱导的,68kDa
 TGFBR2   NM_001024847   TGF-β类型II受体同种型A前体
 TGM2   NM_198951   转谷氨酰胺酶2同种型b
 TGM3   NM_003245   转谷氨酰胺酶3前体
 TGOLN2   NM_006464   高尔基体反面网络结构蛋白质2
 THADA   NM_198554   甲状腺腺瘤相关的同种型2
 THAP2   NM_031435   含THAP结构域,细胞凋亡相关的
 THAP6   NM_144721   含THAP结构域6
 THBD   NM_000361   凝血调节蛋白前体
 THBS2   NM_003247   血小板反应蛋白2前体
 THEDC1   NM_018324   含硫酯酶结构域1同种型1
 THEM4   NM_053055   硫酯酶超家族成员4同种型a
 THEM5   NM_182578   硫酯酶超家族成员5
 THEX1   NM_153332   组蛋白mRNA 3′末端-特异性外切核酸酶
 THRA   NM_199334   甲状腺激素受体,α同种型1
 THSD3   NM_182509   血小板反应蛋白,含类型I结构域3
 THUMPD1   NM_017736   含THUMP结构域1
 TIFA   NM_052864   TRAF-相互作用蛋白质具有
 TIMM10   NM_012456   线粒体内膜移位酶10
 TIMM17A   NM_006335   线粒体内膜移位酶17
 TIMM44   NM_006351   线粒体内膜移位酶44
 TIMM50   NM_001001563   线粒体内膜移位酶50
 TIMP2   NM_003255   金属蛋白酶组织抑制剂2
 TIMP3   NM_000362   金属蛋白酶组织抑制剂3
 TIPARP   NM_015508   TCDD-可诱导的聚(ADP-核糖)聚合酶
 TJP1   NM_003257   紧密连接蛋白质1同种型a
 TLE4   NM_007005   转导蛋白样增强子蛋白质4
 TLL1   NM_012464   tolloid样1
 TLOC1   NM_003262   易位蛋白质1
 TLR7   NM_016562   toll样受体7
 TM2D2   NM_001024380   含TM2结构域2同种型b
 TMBIM4   NM_016056   含跨膜BAX抑制剂模体4
 TMC7   NM_024847   跨膜通道样7
 TMCC1   NM_001017395   跨膜和卷曲螺旋结构域1同种型
  TMCC3   NM_020698  跨膜和卷曲螺旋结构域3
  TMED5   NM_016040  跨膜emp24蛋白质转运结构域
  TMEM1   NM_001001723  跨膜蛋白质1同种型b
  TMEM105   NM_178520  假定蛋白LOC284186
  TMEM113   NM_025222  假定蛋白PRO2730
  TMEM123   NM_052932  前细胞胀亡受体诱导膜损伤
  TMEM127   NM_017849  假定蛋白LOC55654
  TMEM130   NM_152913  假定蛋白LOC222865
  TMEM133   NM_032021  假定蛋白LOC83935
  TMEM135   NM_022918  假定蛋白LOC65084
  TMEM138   NM_016464  假定蛋白LOC51524
  TMEM16E   NM_213599  跨膜蛋白质16E
  TMEM16F   NM_001025356  跨膜蛋白质16F
  TMEM17   NM_198276  跨膜蛋白质17
  TMEM18   NM_152834  跨膜蛋白质18
  TMEM23   NM_147156  磷脂酰胆碱:神经酰胺
  TMEM25   NM_032780  跨膜蛋白质25
  TMEM26   NM_178505  跨膜蛋白质26
  TMEM28   NM_015686  跨膜蛋白质28
  TMEM30A   NM_018247  跨膜蛋白质30A
  TMEM38A   NM_024074  跨膜蛋白质38A
  TMEM40   NM_018306  跨膜蛋白质40
  TMEM41A   NM_080652  跨膜蛋白质41A
  TMEM45B   NM_138788  跨膜蛋白质45B
  TMEM50B   NM_006134  跨膜蛋白质50B
  TMEM56   NM_152487  跨膜蛋白质56
  TMEM64   NM_001008495  跨膜蛋白质64
  TMEM71   NM_144649  假定蛋白LOC137835
  TMEM77   NM_178454  假定蛋白LOC128338
  TMEM80   NM_174940  假定蛋白LOC283232
  TMEM83   NM_152454  假定蛋白LOC145978
  TMOD1   NM_003275  原肌球调节蛋白1
  TMOD2   NM_014548  原肌球调节蛋白2(神经元)
  TMPO   NM_001032283  胸腺生成素同种型β
  TMPRSS11B   NM_182502  跨膜蛋白酶,丝氨酸11B
  TMTC2   NM_152588   假定蛋白LOC160335
  TNFAIP1   NM_021137   肿瘤坏死因子,α-诱导的蛋白质1
  TNFAIP3   NM_006290   肿瘤坏死因子,α-诱导的蛋白质3
  TNFAIP8L1   NM_152362   肿瘤坏死因子,α-诱导的蛋白质
  TNFAIP8L2   NM_024575   肿瘤坏死因子,α-诱导的蛋白质
  TNFAIP8L3   NM_207381   肿瘤坏死因子,α-诱导的蛋白质
  TNFRSF10A   NM_003844   肿瘤坏死因子受体超家族,
  TNFRSF10B   NM_003842   肿瘤坏死因子受体超家族,
  TNFRSF10D   NM_003840   肿瘤坏死因子受体超家族,
  TNFRSF17   NM_001192   肿瘤坏死因子受体超家族,
  TNFRSF19   NM_148957   肿瘤坏死因子受体超家族,
  TNFRSF1B   NM_001066   肿瘤坏死因子受体2前体
  TNFRSF21   NM_014452   肿瘤坏死因子受体超家族,
  TNFSF11   NM_003701   肿瘤坏死因子配体超家族,成员
  TNFSF14   NM_003807   肿瘤坏死因子配体超家族,成员
  TNFSF15   NM_005118   肿瘤坏死因子(配体)超家族,
  TNIP3   NM_024873   假定蛋白LOC79931
  TNK2   NM_001010938   酪氨酸激酶,非受体,2同种型2
  TNKS1BP1   NM_033396   182kDa的端锚聚合酶1-结合蛋白
  TNKS2   NM_025235   端锚聚合酶,TRF1-相互作用锚蛋白相关
  TNNI1   NM_003281   肌钙蛋白I,骨骼的,慢的
  TNRC6A   NM_014494   含三核苷酸重复6A同种型1
  TNRC6B   NM_001024843   含三核苷酸重复6B同种型2
  TOLLIP   NM_019009   toll相互作用蛋白质
  TOMM40L   NM_032174   线粒体外膜易位酶40
  TOMM7   NM_019059   6.2kd蛋白质
  TOMM70A   NM_014820   线粒体外膜易位酶70
  top3A   NM_004618   拓扑异构酶(DNA)IIIα
  拓扑RS   NM_005802   拓扑异构酶I结合,精氨酸/丝氨酸丰富
  TOR1B   NM_014506   扭蛋白(torsin)家族1,成员B(扭蛋白B)
  TP53INP1   NM_033285   肿瘤蛋白质p53可诱导的核蛋白质1
  TP53INP2   NM_021202   肿瘤蛋白质p53可诱导的核蛋白质2
  TPD52   NM_001025252   肿瘤蛋白质D52同种型1
  TPK1   NM_022445   硫胺素焦磷酸激酶1
  TPM4   NM_003290   原肌球蛋白4
  TRA16   NM_176880   TR4孤儿受体相关蛋白TRA16
  TRAK1   NM_014965   OGT(O-Glc-NAc转移酶)-相互作用蛋白质
  TRAM1   NM_014294   易位链相关膜
  TRAM2   NM_012288   易位相关膜蛋白质2
  TRAPPC2   NM_001011658   转运蛋白质复合粒子2
  TRIAD3   NM_019011   TRIAD3蛋白质同种型c
  TRIAP1   NM_016399   p53-可诱导的细胞存活因子
  TRIB3   NM_021158   tribbles 3
  TRIM10   NM_052828   含三分模体10同种型2
  TRIM2   NM_015271   含三分模体2
  TRIM22   NM_006074   含三分模体22
  TRIM26   NM_003449   含三分模体26
  TRIM3   NM_006458   含三分模体3
  TRIM31   NM_052816   三分模体蛋白质31同种型β
  TRIM32   NM_012210   TAT-相互作用蛋白,72-KD
  TRIM33   NM_015906   含三分模体33蛋白质同种型
  TRIM36   NM_018700   含三分模体36同种型1
  TRIM37   NM_015294   含三分模体37蛋白质
  TRIM4   NM_033017   三分模体蛋白质TRIM4同种型α
  TRIM55   NM_033058   环指蛋白29同种型2
  TRIM56   NM_030961   含三分模体56
  TRIM58   NM_015431   含三分模体58
  TRIM65   NM_173547   含三分模体65
  TRIM68   NM_018073   环指蛋白137
  TRIM7   NM_203293   含三分模体7同种型1
  TRIM8   NM_030912   含三分模体8
  TRIM9   NM_052978   三分模体蛋白质9同种型2
  TRIP10   NM_004240   甲状腺激素受体结合因子10
  TRIP11   NM_004239   甲状腺激素受体结合因子11
  TRMU   NM_001008568   tRNA 5-甲基氨甲基-2-硫尿苷酸
  TRPA1   NM_007332   锚蛋白样蛋白质1
  TRPC1   NM_003304   瞬时受体电位阳离子通道,
  TRPC4   NM_016179   瞬时受体电位4
  TRPM1   NM_002420   瞬时受体电位阳离子通道,
  TRPM6   NM_017662   瞬时受体电位阳离子通道,
  TRPS1   NM_014112   锌指转录因子TRPS1
  TRPV6   NM_018646   瞬时受体电位阳离子通道,
  TRSPAP1   NM_017846   tRNA硒代半胱氨酸相关蛋白
  TRUB1   NM_139169   TruB假尿苷(psi)合酶同系物1
  TSC22D2   NM_014779   TSC22结构域家族2
  TSCOT   NM_033051   胸腺基质共-转运蛋白
  TSEN2   NM_025265   tRNA剪接内切核酸酶2同系物
  TSG101   NM_006292   肿瘤易感性基因101
  TSHZ3   NM_020856   锌指蛋白537
  TSNAX   NM_005999   易位蛋白相关因子X
  TSPAN14   NM_030927   四跨膜蛋白(tetraspanin)14
  TSPAN17   NM_001006616   4次跨膜超家族成员17同种型c
  TSPAN4   NM_001025234   四跨膜蛋白4同种型a
  TSPAN9   NM_006675   四跨膜蛋白9
  TSPYL1   NM_003309   TSPY样1
  TSR1   NM_018128   假定蛋白LOC55720
  TTF2   NM_003594   转录终止因子,RNA聚合酶
  TTL   NM_153712   微管蛋白酪氨酸连接酶
  TTLL6   NM_173623   假定蛋白LOC284076
  TTN   NM_003319   肌联蛋白同种型N2-B
  TULP3   NM_003324   Tubby样蛋白质3
  TUSC2   NM_007275   肿瘤抑制物候选物2
  TWIST1   NM_000474   扭转
  TXLNA   NM_175852   滑行蛋白
  TXNDC10   NM_019022   含硫氧还蛋白结构域10
  TXNDC4   NM_015051   含硫氧还蛋白结构域4(内质
  TXNIP   NM_006472   硫氧还蛋白相互作用蛋白质
  TXNL2   NM_006541   硫氧还蛋白样
  TYRP1   NM_000550   酪氨酸酶相关蛋白1
  UACA   NM_001008224   具有卷曲螺旋结构域的眼球血管膜自身抗原
  UBAP1   NM_016525   遍在蛋白相关蛋白1
  UBASH3A   NM_001001895   遍在蛋白相关的和含SH3结构域
  UBC   NM_021009   遍在蛋白C
  UBE2B   NM_003337   遍在蛋白缀合酶E2B
  UBE2G1   NM_003342   遍在蛋白缀合酶E2G1同种型1
  UBE2G2   NM_003343   遍在蛋白缀合酶E2G2同种型1
  UBE2J1   NM_016021   遍在蛋白缀合酶E2,J1
  UBE2Q2   NM_173469   遍在蛋白缀合酶E2Q(假定的)2
  UBE2W   NM_001001481   假定蛋白LOC55284同种型1
  UBE3A   NM_000462   遍在蛋白蛋白质连接酶E3A同种型2
  UBE3C   NM_014671   遍在蛋白蛋白质连接酶E3C
  UBE4A   NM_004788   遍在蛋白化因子E4A
  UBL4A   NM_014235   遍在蛋白样4
  UBOX5   NM_014948   含U-盒结构域5同种型a
  UBQLN1   NM_013438   遍在蛋白相关性早老作用蛋白1同种型1
  UBQLN4   NM_020131   共济失调蛋白-1遍在蛋白样相互作用蛋白质
  UBXD4   NM_181713   含UBX结构域4
  UBXD8   NM_014613   含UBX结构域8
  UCP3   NM_003356   解偶联蛋白质3同种型UCP3L
  UEV3   NM_018314   遍在蛋白缀合酶E2样
  UGDH   NM_003359   UDP-葡萄糖脱氢酶
  UGP2   NM_001001521   UDP-葡萄糖焦磷酸化酶2同种型b
  ULK1   NM_003565   unc-51样激酶1
  UNC5C   NM_003728   unc5C
  UNC5CL   NM_173561   unc-5同系物C样
  UNC93B1   NM_030930   unc-93同系物B1
  UNQ9370   NM_207447   假定蛋白LOC400454
  UPF3A   NM_023011   无义转录物UPF3调节物同系物A
  UPK1A   NM_007000   尿斑蛋白(uroplakin)1A
  UPK1B   NM_006952   尿斑蛋白1B
  UPP1   NM_003364   尿苷磷酸化酶1
  UQCRB   NM_006294   泛醇-细胞色素c还原酶结合
  URB   NM_199511   类固醇敏感蛋白质1
  URG4   NM_017920   假定蛋白LOC55665
  USP14   NM_005151   遍在蛋白特异性蛋白酶14同种型a
  USP25   NM_013396   遍在蛋白特异性蛋白酶25
  USP28   NM_020886   遍在蛋白特异性蛋白酶28
  USP3   NM_006537   遍在蛋白特异性蛋白酶3
  USP32   NM_032582   遍在蛋白特异性蛋白酶32
  USP33   NM_015017   遍在蛋白特异性蛋白酶33同种型1
  USP37   NM_020935   遍在蛋白特异性蛋白酶37
  USP46   NM_022832   遍在蛋白特异性蛋白酶46
  USP47   NM_017944   遍在蛋白特异性蛋白酶47
  USP49   NM_018561   遍在蛋白特异性蛋白酶49
  USP9Y   NM_004654   遍在蛋白特异性蛋白酶9,Y连锁的
  UST   NM_005715   糖醛基-2-磺基转移酶
  UTP14C   NM_021645   UTP14,U3小的核仁核糖核蛋白,
  UXS1   NM_025076   UDP-葡糖醛酸脱羧酶1
  VANGL1   NM_138959   vang样1
  VAPA   NM_003574   小泡相关膜蛋白质-相关
  VASP   NM_001008736   血管舒张剂-刺激的磷蛋白同种型2
  VAV2   NM_003371   vav 2癌基因
  VAX1   NM_199131   前腹同源框1
  VCL   NM_003373   黏着斑蛋白同种型VCL
  VDAC1   NM_003374   电压依赖性阴离子通道1
  VEGF   NM_001025366   血管内皮生长因子同种型a
  VEZT   NM_017599   跨膜蛋白质vezatin
  VGLL2   NM_153453   残翅样2同种型2
  VGLL3   NM_016206   结肠癌相关蛋白质
  VGLL4   NM_014667   残翅样4
  VHL   NM_000551   von Hippel-Lindau肿瘤抑制物同种型1
  VLDLR   NM_001018056   极低密度脂蛋白质受体同种型b
  VMP   NM_080723   小泡膜蛋白质p24
  VPS13C   NM_017684   空泡蛋白质分选13C蛋白质同种型1A
  VPS13D   NM_015378   空泡蛋白质分选13D同种型1
  VPS24   NM_001005753   空泡蛋白质分选24同种型2
  VPS25   NM_032353   空泡蛋白质分选25
  VPS26A   NM_004896   空泡蛋白质分选26同系物A同种型1
  VPS36   NM_016075   空泡蛋白质分选36
  VPS37C   NM_017966   空泡蛋白质分选37C
  VPS4B   NM_004869   空泡蛋白质分选因子4B
  VRK1   NM_003384   痘苗相关激酶1
  VSIG1   NM_182607   含V-set和免疫球蛋白结构域1
  VSX1   NM_014588   视觉系统同源框1蛋白质同种型a
  WAC   NM_016628   具卷曲螺旋的含WW结构域衔接蛋白
 WASF2   NM_006990   WAS蛋白质家族,成员2
 WASF3   NM_006646   WAS蛋白质家族,成员3
 WASL   NM_003941   Wiskott-Aldrich综合征基因样蛋白质
 WBSCR1   NM_022170   真核翻译起始因子4H
 WBSCR22   NM_017528   Williams Beuren综合征染色体区域22
 WDFY3   NM_014991   WD重复和含FYVE结构域3同种型
 WDR1   NM_005112   含WD重复蛋白质1同种型2
 WDR17   NM_170710   WD重复结构域17同种型1
 WDR19   NM_025132   WD重复结构域19
 WDR21C   NM_152418   假定蛋白LOC138009
 WDR23   NM_025230   WD重复结构域23同种型1
 WDR26   NM_025160   WD重复结构域26
 WDR32   NM_024345   WD重复结构域32
 WDR33   NM_001006623   WD重复结构域33同种型3
 WDR35   NM_001006657   WD重复结构域35同种型1
 WDR36   NM_139281   WD重复结构域36
 WDR37   NM_014023   WD重复结构域37
 WDR39   NM_004804   WD重复结构域39
 WDR4   NM_018669   WD重复结构域4蛋白质
 WDR40B   NM_178470   WD重复结构域40B
 WDR42A   NM_015726   H326
 WDR48   NM_020839   WD重复结构域48
 WDR5B   NM_019069   WD重复结构域5B
 WDR73   NM_032856   WD重复结构域73
 WEE1   NM_003390   weel酪氨酸激酶
 WFS1   NM_006005   Wolframin
 WHSC1   NM_007331   Wolf-Hirschhorn综合征候选物1蛋白质
 WIG1   NM_022470   p53靶锌指蛋白同种型1
 WIRE   NM_133264   WIRE蛋白质
 WISP2   NM_003881   WNT1可诱导的信号转导途径蛋白质2
 WNK2   NM_006648   WNK赖氨酸缺陷型蛋白质激酶2
 WNK3   NM_001002838   WNK赖氨酸缺陷型蛋白质激酶3同种型2
 WNT5A   NM_003392   无翅型MMTV整合位点家族,
 WNT7B   NM_058238   无翅型MMTV整合位点家族,
 WSB2   NM_018639   WD SOCS-盒蛋白质2
  WT1   NM_000378   Wilms肿瘤1同种型A
  WWP2   NM_199423   含WW结构域的E3遍在蛋白蛋白质连接酶
  XCL1   NM_002995   趋化因子(C模体)配体1
  XCL2   NM_003175   趋化因子(C模体)配体2
  XKR5   NM_207411   XK相关蛋白5a
  XKRX   NM_212559   X Kell血型前体相关,X-连锁
  XPO5   NM_020750   输出蛋白5
  XRCC2   NM_005431   X射线修复交叉互补蛋白质2
  XRN1   NM_019001   5′-3′外切核糖核酸酶1
  XTP7   NM_138568   由乙型肝炎病毒X反式激活的蛋白质7
  YAF2   NM_001012424   YY1相关因子2同种型b
  YARS2   NM_015936   酪氨酰-tRNA合成酶2(线粒体)
  YES1   NM_005433   病毒癌基因yes-1同系物1
  YIPF5   NM_001024947   平滑肌细胞相关蛋白5
  YME1L1   NM_014263   YME1样1同种型3
  YOD1   NM_018566   假定蛋白LOC55432
  YPEL1   NM_013313   开心果样1
  YPEL2   NM_001005404   开心果样2
  YPEL4   NM_145008   开心果样4
  YTHDF3   NM_152758   YTH结构域家族,成员3
  YWHAQ   NM_006826   酪氨酸3/色氨酸5-单加氧酶
  YWHAZ   NM_003406   酪氨酸3/色氨酸5-单加氧酶
  ZADH1   NM_152444   锌结合乙醇脱氢酶,结构域
  ZADH2   NM_175907   锌结合乙醇脱氢酶,结构域
  ZAK   NM_133646   MLK相关激酶同种型2
  ZBED1   NM_004729   Ac样可转座元件
  ZBP1   NM_030776   肿瘤间质和激活的巨噬细胞蛋白质
  ZBTB24   NM_014797   含锌指和BTB结构域24
  ZBTB33   NM_006777   Kaiso
  ZBTB39   NM_014830   含锌指和BTB结构域39
  ZBTB4   NM_020899   含锌指和BTB结构域4
  ZBTB41   NM_194314   含锌指和BTB结构域41
  ZBTB5   NM_014872   含锌指和BTB结构域5
  ZBTB7A   NM_015898   含锌指和BTB结构域7A
  ZBTB9   NM_152735   含锌指和BTB结构域9
  ZC3H12B   NM_001010888  假定蛋白LOC340554
  ZCCHC16   NM_001004308  假定蛋白LOC340595
  ZDHHC1   NM_013304  锌指,含DHHC结构域1
  ZDHHC23   NM_173570  锌指,含DHHC结构域23
  ZDHHC9   NM_001008222  锌指,含DHHC结构域9
  ZFP106   NM_022473  锌指蛋白106同系物
  ZFP161   NM_003409  锌指蛋白161同系物
  ZFP30   NM_014898  锌指蛋白30同系物
  ZFP42   NM_174900  锌指蛋白42
  ZFP90   NM_133458  锌指蛋白90同系物
  ZFP91   NM_053023  锌指蛋白91同种型1
  ZFP95   NM_014569  锌指蛋白95同系物
  ZFPM2   NM_012082  锌指蛋白,多向型2
  ZFYVE20   NM_022340  含FYVE-指Rab5效应蛋白蛋白质
  ZFYVE21   NM_024071  锌指,含FYVE结构域21
  ZFYVE26   NM_015346  锌指,含FYVE结构域26
  ZFYVE9   NM_004799  锌指,含FYVE结构域9同种型3
  ZHX2   NM_014943  锌指和同源框2
  ZHX3   NM_015035  锌指和同源框3
  ZIC1   NM_003412  小脑锌指蛋白1
  ZIC4   NM_032153  小脑锌指蛋白4
  ZIM3   NM_052882  锌指,印记的3
  ZKSCAN1   NM_003439  锌指蛋白36
  ZMYM6   NM_007167  锌指蛋白258
  ZNF114   NM_153608  锌指蛋白114
  ZNF134   NM_003435  锌指蛋白134
  ZNF136   NM_003437  锌指蛋白136(克隆pHZ-20)
  ZNF137   NM_003438  锌指蛋白137(克隆pHZ-30)
  ZNF14   NM_021030  锌指蛋白14
  ZNF140   NM_003440  锌指蛋白140(克隆pHZ-39)
  ZNF148   NM_021964  锌指蛋白148(pHZ-52)
  ZNF155   NM_003445  锌指蛋白155
  ZNF160   NM_033288  锌指蛋白160
  ZNF161   NM_007146  锌指蛋白161
  ZNF177   NM_003451  锌指蛋白177
  ZNF180   NM_013256  锌指蛋白180(HHZ168)
  ZNF187   NM_001023560  锌指蛋白187
  ZNF192   NM_006298  锌指蛋白192
  ZNF195   NM_007152  锌指蛋白195
  ZNF197   NM_006991  锌指蛋白197同种型1
  ZNF2   NM_001017396  锌指蛋白2同种型b
  ZNF202   NM_003455  锌指蛋白202
  ZNF213   NM_004220  锌指蛋白213
  ZNF217   NM_006526  锌指蛋白217
  ZNF23   NM_145911  锌指蛋白23
  ZNF236   NM_007345  锌指蛋白236
  ZNF238   NM_006352  锌指蛋白238同种型2
  ZNF239   NM_005674  锌指蛋白239
  ZNF25   NM_145011  锌指蛋白25
  ZNF264   NM_003417  锌指蛋白264
  ZNF271   NM_006629  锌指蛋白271
  ZNF28   NM_006969  锌指蛋白28(KOX24)
  ZNF282   NM_003575  锌指蛋白282
  ZNF295   NM_020727  锌指蛋白295
  ZNF304   NM_020657  锌指蛋白304
  ZNF307   NM_019110  锌指蛋白307
  ZNF31   NM_145238  锌指蛋白31
  ZNF320   NM_207333  锌指蛋白320
  ZNF329   NM_024620  锌指蛋白329
  ZNF331   NM_018555  锌指蛋白331
  ZNF333   NM_032433  锌指蛋白333
  ZNF336   NM_022482  锌指蛋白336
  ZNF337   NM_015655  锌指蛋白337
  ZNF33A   NM_006974  锌指蛋白33a
  ZNF346   NM_012279  锌指蛋白346
  ZNF347   NM_032584  锌指蛋白347
  ZNF367   NM_153695  锌指蛋白367
  ZNF385   NM_015481  锌指蛋白385
  ZNF394   NM_032164  锌指蛋白99
  ZNF398   NM_020781  锌指398同种型b
  ZNF417   NM_152475  锌指蛋白417
  ZNF43   NM_003423  锌指蛋白43(HTF6)
  ZNF430   NM_025189  锌指蛋白430
  ZNF431   NM_133473  锌指蛋白431
  ZNF440   NM_152357  锌指蛋白440
  ZNF445   NM_181489  锌指蛋白445
  ZNF452   NM_052923  锌指蛋白452
  ZNF454   NM_182594  锌指蛋白454
  ZNF468   NM_001008801  锌指蛋白ZNF468同种型2
  ZNF473   NM_001006656  锌指蛋白473
  ZNF482   NM_006626  锌指蛋白482
  ZNF483   NM_001007169  锌指蛋白483同种型b
  ZNF490   NM_020714  锌指蛋白490
  ZNF498   NM_145115  锌指蛋白498
  ZNF500   NM_021646  锌指蛋白500
  ZNF502   NM_033210  锌指蛋白502
  ZNF510   NM_014930  锌指蛋白510
  ZNF512   NM_032434  锌指蛋白512
  ZNF514   NM_032788  锌指蛋白514
  ZNF518   NM_014803  锌指蛋白518
  ZNF526   NM_133444  锌指蛋白526
  ZNF528   NM_032423  锌指蛋白528
  ZNF532   NM_018181  锌指蛋白532
  ZNF536   NM_014717  锌指蛋白536
  ZNF542   NM_194319  锌指蛋白542
  ZNF546   NM_178544  锌指蛋白546
  ZNF549   NM_153263  锌指蛋白549
  ZNF551   NM_138347  锌指蛋白551
  ZNF554   NM_152303  锌指蛋白554
  ZNF556   NM_024967  锌指蛋白556
  ZNF561   NM_152289  锌指蛋白561
  ZNF562   NM_017656  锌指蛋白562
  ZNF565   NM_152477  锌指蛋白565
  ZNF566   NM_032838  锌指蛋白566
  ZNF577   NM_032679  锌指蛋白577
 ZNF585A   NM_152655  锌指蛋白585A
 ZNF587   NM_032828  锌指蛋白587
 ZNF588   NM_001013746  锌指蛋白588
 ZNF595   NM_182524  锌指蛋白595
 ZNF597   NM_152457  锌指蛋白597
 ZNF599   NM_001007247  锌指蛋白599同种型b
 ZNF600   NM_198457  锌指蛋白600
 ZNF620   NM_175888  锌指蛋白620
 ZNF621   NM_198484  锌指蛋白621
 ZNF623   NM_014789  锌指蛋白623
 ZNF627   NM_145295  锌指蛋白627
 ZNF651   NM_145166  锌指蛋白651
 ZNF652   NM_014897  锌指蛋白652
 ZNF655   NM_001009956  锌指蛋白655同种型e
 ZNF662   NM_207404  锌指蛋白662
 ZNF665   NM_024733  锌指蛋白665
 ZNF667   NM_022103  锌指蛋白667
 ZNF669   NM_024804  锌指蛋白669
 ZNF671   NM_024833  锌指蛋白671
 ZNF680   NM_178558  锌指蛋白680
 ZNF684   NM_152373  锌指蛋白684
 ZNF69   NM_021915  锌指蛋白69(Cos5)
 ZNF696   NM_030895  锌指蛋白696
 ZNF70   NM_021916  锌指蛋白70
 ZNF701   NM_018260  锌指蛋白701
 ZNF702   NM_024924  锌指蛋白702
 ZNF704   NM_001033723  锌指蛋白704
 ZNF708   NM_021269  锌指蛋白15样1(KOX 8)
 ZNF71   NM_021216  锌指蛋白71
 ZNF721   NM_133474  锌指蛋白721
 ZNF81   NM_007137  锌指蛋白81(HFZ20)
 ZNFN1A4   NM_022465  锌指蛋白,亚家族1A,4
 ZNFX1   NM_021035  锌指,含NFX1-类型1
 ZSWIM3   NM_080752  锌指,含SWIM结构域3
 ZSWIM4   NM_023072  锌指,含SWIM结构域4
  ZXDB   NM_007157  锌指,X-连锁,复制的B
  ZYG11A   NM_001004339  假定蛋白LOC440590
  ZYG11B   NM_024646  假定蛋白LOC79699
  ZZEF1   NM_015113  锌指,具EF手型结构域ZZ类型1
  ZZZ3   NM_015534  锌指,含ZZ结构域3
表4.在转染pre-miR hsa-miR-20a的人癌细胞中表现出mRNA表达水平改变的hsa-miR-20a靶
基因符号   RefSeq转录物ID(Pruitt等,2005) 描述
  ABCA1   NM_005502   ATP-结合盒,亚家族A成员1
  ANTXR1   NM_018153   肿瘤内皮标志物8同种型3前体
  ARTS-1   NM_016442   脱落的1型肿瘤坏死因子受体
  ATP6V0E   NM_003945   ATP酶,H+转运,溶酶体,V0亚基
  ATP9A   NM_006045   ATP酶,类II,类型9A
  BICD2   NM_001003800   二尾D同系物2同种型1
  BTG3   NM_006806   B细胞易位基因3
  BTN3A2   NM_007047   嗜乳脂蛋白,亚家族3,成员A2前体
  C19orf2   NM_003796   RPB5-介导蛋白质同种型a
  C21orf25   NM_199050   假定蛋白LOC25966
  C6orf120   NM_001029863   假定蛋白LOC387263
  CCND1   NM_053056   细胞周期蛋白D1
  CDC37L1   NM_017913   细胞分裂周期37同系物(S
  CLIC4   NM_013943   氯化物细胞内通道4
  COL4A1   NM_001845   α1类型IV胶原前蛋白原
  COL4A2   NM_001846   α2类型IV胶原前蛋白原
  CPM   NM_001005502   羧基肽酶M前体
  CRIPT   NM_014171   突触后蛋白质CRIPT
  CXCL5   NM_002994   趋化因子(C-X-C模体)配体5前体
  DAZAP2   NM_014764   DAZ相关蛋白2
  DCBLD2   NM_080927   网柄菌素,含CUB和LCCL结构域2
  DDAH1   NM_012137   二甲基精氨酸二甲氨基水解酶1
  DNAJB6   NM_005494   DnaJ(Hsp40)同系物,亚家族B,成员6
  DNAJC15   NM_013238   含DNAJ结构域
  EIF2C1   NM_012199   真核翻译起始因子2C,1
  EIF2S1   NM_004094   真核翻译起始因子2,
  EREG   NM_001432   表皮调节素前体
  F2RL1   NM_005242   凝血因子II(凝血酶)受体样1
  FAM18B   NM_016078   假定蛋白LOC51030
  FJX1   NM_014344   四连接盒1
  FLJ31568   NM_152509   假定蛋白LOC150244
  FTS   NM_001012398   融合的toes同系物
  FYCO1   NM_024513   含FYVE和卷曲螺旋结构域1
  FZD7   NM_003507   frizzled 7
  GATA6   NM_005257   GATA结合蛋白6
  GNS   NM_002076   葡糖胺(N-乙酰)-6-硫酸酯酶前体
  GOLPH2   NM_016548   高尔基体磷蛋白2
  HCCS   NM_005333   全细胞色素c合酶(细胞色素c
  HIC2   NM_015094   癌症中高甲基化2
  HMGA2   NM_001015886   高移动族AT钩2同种型c
  HN1   NM_001002032   血液和神经表达1
  IL11   NM_000641   白细胞介素11前体
  IL8   NM_000584   白细胞介素8前体
  KCNMA1   NM_001014797   大电导钙激活钾
  KIAA0494   NM_014774   假定蛋白LOC9813
  KLF10   NM_001032282   Kruppel样因子10同种型b
  LEPROT   NM_017526   瘦蛋白受体基因相关蛋白质
  LHFP   NM_005780   脂肪瘤HMGIC融合伴侣
  LIMK1   NM_002314   LIM结构域激酶1同种型1
  LRRC54   NM_015516   Tsukushi
  M6PR   NM_002355   阳离子依赖性甘露糖-6-磷酸受体
  MAP3K2   NM_006609   促分裂原活化蛋白质激酶激酶激酶
  MGC11332   NM_032718   假定蛋白LOC84804
  MICA   NM_000247   MHC I类链相关基因A蛋白质
  NAGK   NM_017567   N-乙酰葡糖胺激酶
  NPAS2   NM_002518   神经元PAS结构域蛋白质2
  NPTX1   NM_002522   神经元五聚环蛋白I前体
  NRP2   NM_018534   神经毡蛋白2同种型4前体
 NUPL1   NM_001008564   核孔蛋白样1同种型b
 OSTM1   NM_014028   骨硬化病相关的跨膜蛋白质
 PDCD4   NM_014456   程序性细胞死亡4同种型1
 PELI2   NM_021255   pellino 2
 PFKP   NM_002627   磷酸果糖激酶,血小板
 PLAU   NM_002658   尿激酶纤维蛋白溶酶原激活物前蛋白原
 PLCB1   NM_015192   磷酸肌醇-特异性磷脂酶Cβ1
 PON2   NM_000305   对氧磷酶2同种型1
 PTHLH   NM_198965   甲状旁腺激素样激素同种型1
 QKI   NM_206853   quaking同系物,KH结构域RNA结合同种型
 RAB22A   NM_020673   RAS相关蛋白RAB-22A
 RHOC   NM_175744   ras同系物基因家族,成员C
 RNH1   NM_002939   核糖核酸酶/血管生成素抑制剂
 RRM2   NM_001034   核糖核苷酸还原酶M2多肽
 SERPINE1   NM_000602   纤溶酶原激活物抑制剂-1
 SESN1   NM_014454   sestrin 1
 SGPL1   NM_003901   鞘氨醇-1-磷酸裂合酶1
 SLC1A4   NM_003038   溶质运载体家族1,成员4
 SLC2A3   NM_006931   溶质运载体家族2(易化葡萄糖
 SNAP23   NM_003825   突触小体相关蛋白23同种型
 SPARC   NM_003118   分泌的蛋白质,酸性,半胱氨酸丰富
 SPFH2   NM_007175   SPFH结构域家族,成员2同种型1
 STC1   NM_003155   司腺钙蛋白1前体
 SYNE1   NM_015293   nesprin 1同种型β
 TBC1D2   NM_018421   TBC1结构域家族,成员2
 TGFBR2   NM_001024847   TGF-β类型II受体同种型A前体
 TNFRSF10B   NM_003842   肿瘤坏死因子受体超家族,
 TXLNA   NM_175852   滑行蛋白
 UEV3   NM_018314   遍在蛋白缀合酶E2样
 USP46   NM_022832   遍在蛋白特异性蛋白酶46
 VANGL1   NM_138959   vang样1
 VLDLR   NM_001018056   极低密度脂蛋白质受体同种型b
 WNT5A   NM_003392   无翅型MMTV整合位点家族,
 ZNF331   NM_018555   锌指蛋白331
本发明某些实施方案包括通过扩增分析、杂交分析或蛋白质分析确定一个或一个以上标记、基因或代表一个或一个以上基因的核酸片段的表达,上述种种方法为本领域普通技术人员众所周知。在某些方面,扩增分析可以是定量扩增分析,例如定量RT-PCR等。在仍进一步的方面中,杂交分析可以包括阵列杂交分析或溶液杂交分析。来自样品的核酸可以从样品中标记和/或将标记核酸与一个或一个以上核酸探针杂交。核酸、mRNA和/或核酸探针可以偶联至支持物。此类支持物是本领域普通技术人员众所周知的并且包括,但不限于玻璃、塑料、金属或乳胶。在本发明的特定方面,支持物可以是平面的或者是珠的形式或者本领域已知的其他几何形状或构型。蛋白质通常通过免疫印迹、层析或质谱分析法或本领域普通技术人员已知的其他方法分析。
本发明还涉及包含本发明组合物或者借以实现本发明方法的组合物的试剂盒。在一些实施方案中,试剂盒可以用于评估一个或一个以上标记分子和/或表达一个或一个以上miRNA。在某些实施方案中,试剂盒包含、至少包含或至多包含1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、31、32、33、34、35、36、37、38、39、40、41、42、43、44、45、46、47、48、49、50、51、52、53、54、55、56、57、58、59、60、61、100、150、200或更多个与待评估标记相关的探针、重组核酸或合成核酸分子或者待表达或调节的miRNA,并且可以包括从它们导出的任何范围或组合。试剂盒可以包含可以单独包装的或者置于一个容器,例如管、瓶、小瓶、注射器或其他适宜容器装置内的成分。单独成分还可以浓缩量形式在试剂盒中提供;在一些实施方案中,成分以与它在含其他成分的溶液中的浓度相同的浓度单独提供。成分的浓度可以以1×、2×、5×、10×、20×或更高倍数提供。可以作为本发明的部分包含使用本发明探针、合成核酸、重组核酸或非合成核酸开展治疗应用、预后应用或诊断应用的试剂盒。特别考虑的是对应于据报导影响本文所述一个或一个以上标志基因或基因途径的生物学活性或表达的任何miRNA的任何此类分子。在某些方面,阴性和/或阳性对照包括在一些试剂盒实施方案中。对照分子可以用于证实转染效率和/或对细胞中转染诱导变化的控制。
某些实施方案涉及用于通过样品核酸谱分析评估患者病理状况或者发展成病理状况危险的试剂盒,包含在适宜容器装置中的两种或者两种以上核酸杂交或扩增试剂。试剂盒可以包含用于标记样品中核酸的试剂和/或核酸杂交试剂。杂交试剂有代表性地包含杂交探针。扩增试剂包括,但不限于扩增引物、试剂和酶。
在本发明的一些实施方案中,表达谱通过包括下列的步骤产生:(a)标记样品中的核酸;(b)将核酸与诸多探针杂交或扩增诸多核酸,和(c)确定和/或定量与探针杂交的核酸或者探测和定量表达谱产生的扩增产物。见美国临时专利申请60/575,743和美国临时专利申请60/649,584和美国专利申请序列号11/141,707和美国专利申请序列号11/273,640,所有这些专利申请通过参考并入本文。
本发明方法包括基于miRNA和/或标记核酸表达谱诊断和/或评估患者预后。在某些实施方案中,细胞中特定基因或遗传途径或核酸组表达水平较之正常或非病理细胞或组织样品中它们的表达水平提高或降低与疾病状态或病理状况关联。在测量被评估生物学样品中一个或一个以上核酸表达水平并与正常或者非病理细胞或组织样品中的表达水平相比较时,该关联使得可以开展诊断和/或预后方法。特别考虑的是,患者特别是怀疑患有或倾向具有特定疾病或状况例如癌症的那些患者的表达谱可以通过评估本申请所述任何的或多组的miRNA和/或核酸产生。从患者产生的表达谱将是提供关于特定疾病或状况信息的表达谱。在许多实施方案中,使用核酸杂交或扩增(例如阵列杂交或RT-PCR)产生表达谱。在某些方面,表达谱可以与其他诊断和/或预后试验,例如组织学、血清中蛋白质谱和/或细胞遗传评估联合使用。
方法可以进一步地包括一个或一个以上步骤,包括:(a)从患者得到样品,(b)从样品分离核酸,(c)标记从样品分离的核酸,和(d)将标记的核酸与一个或一个以上探针杂交。本发明核酸包括一个或一个以上核酸,所述核酸包含至少一个具有表1、3、4和/或5中一个或一个以上基因或标记所代表核酸序列或互补序列的片段。
Figure A20078004894101331
Figure A20078004894101341
可以预期到的是,本文所述的任何方法或组合物可以使用本文所述的任何其他方法或组合物实现,并且不同的实施方案可以组合。特别考虑的是,本文所述的对于miRNA分子、miRNA、基因和代表基因的核酸的任何方法和组合物可以使用合成核酸实现。在一些实施方案中,合成核酸处于适当条件下,以便使其变成加工的或者成熟的核酸,例如生理条件下的miRNA。最初提交的权利要求考虑涵盖多次从属于任何所提交权利要求或所提交权利要求组合的权利要求。
同样,涉及特异基因(包括其代表性片段)、mRNA或名称叫作miRNA的本发明的任何实施方案还考虑涵盖涉及其序列与特定miRNA的成熟序列具有至少80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、99%同源性的miRNA的实施方案。
应当进一步理解,除非另外指出,采用缩写符号时,对基因或其标记或miRNA的一般描述指任何其基因家族成员(通过数字区分)或其代表性片段。本领域技术人员应理解,“基因家族”指具有相同编码序列或miRNA编码序列的一组基因。有代表性地,miRNA基因家族的成员通过最初指定名后的数字鉴别。例如,miR-16-1和miR-16-2是miR-16基因家族成员,“mir-7”指miR-7-1、miR-7-2和miR-7-3。此外,除非另外指出,缩写符号指相关miRNA(通过字母区分)。该缩写符号的例外将另外鉴别。
在本申请的各处讨论本发明的另外实施方案。对于本发明的一个方面所讨论的任何实施方案也适用于本发明的其他方面并且反之亦然。实施例和详述部分中的实施方案理解为可适用于本发明所有方面的本发明实施方案。
术语“抑制”、“降低”或“预防”或者这些术语的任何变化形式,当用于权利要求书和/或说明书中时包括达到期望结果的任何可测量的降低或完全抑制。
当词“一”或“一”在权利要求书和/或说明书中与术语“包含”联合使用时,可能意思是“一个”,但其还有“一个或多个”、“至少一个”和“一个或一个以上”的意思。
在该申请的通篇中,术语“大约”用于指数值包括对于用来确定数值的设备或方法的误差标准差。
虽然此公开支持术语“或者”指仅备选物和“和/或”,但是在权利要求书中术语“或者”用于指“和/或”,除非明确指出是指仅备选物或者备选物相互排斥。
如在该说明书和权利要求书中所使用,词“包含”(和包含的任何形式,例如“包含”和“包含”)、“具有”(和具有的任何形式,例如“具有”和“具有”)、“包括”(和包括的任何形式,例如“包括”和“包括”)或者“含有”(和含有的任何形式,例如“含有”和“含有”)是包含性的或者开放性的,并且不排除额外的、非描述的元件或方法步骤。
本发明的其他目的、特征和优点在详细描述之后会变得明显。然而,应当理解的是,详细描述和特定实施例仅以例证的方式给出以显示本发明特定实施方案,因为从该详细描述可以看出,处于本发明精神和范围内的多种改变和修饰对本领域技术人员是显而易见的。
具体实施方式
本发明涉及组合物和方法,所述组合物和方法通过所鉴定基因的表达显示,以鉴定和表征基因和与这些基因相关的生物学途径,,并且涉及使用与此相关的miRNA,以用于治疗、预后和诊断应用的用途,特别是与评估和/或鉴定miR-20a表达或其异常表达直接或间接相关的病理状况相关的那些方法和组合物。
在某些方面,本发明涉及用于对细胞或受试者评估、分析和/或治疗的方法,在所述的细胞或受试者中,因为任何一个或者组合的miR-20家族成员表达增加或降低,使得某些基因表达降低或增加(相对于正常)。在某些情况下,针对miR-20表达或抑制的表达谱和/或反应可以指示疾病或病理状况,例如癌症。
表征任何一个或组合的所列miRNA或所列标记(包括其代表性核酸)的预后分析可以用于患者评估中,以确定如果有治疗方案的话,什么治疗方案是对的。与上述的诊断分析一样,限定低表达的绝对值会依赖于用于测量miRNA的平台。对于诊断分析所描述的方法同样可用于预后分析。
I.治疗方法
本发明实施方案涉及当导入细胞内后执行内源miRNA活性或者抑制内源miRNA的核酸。在某些方面,核酸是合成的或非合成的miRNA。序列特异性的miRNA抑制剂可以用于连续性或组合抑制细胞内一个或一个以上内源miRNA活性,以及受内源miRNA调节的那些基因和相关途径的活性。
本发明在一些实施方案中涉及在细胞中作为miRNA或者miRNA抑制剂起作用的短核酸分子。术语“短”指15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、50、100、150个核苷酸或更少的单一多核苷酸长度,包括可从它们当中导出的所有整数或范围。核酸分子有代表性地是合成的。术语“合成的”指非细胞内天然产生的核酸分子。在某些方面,化学结构偏离天然存在的核酸分子,例如内源前体miRNA或miRNA分子。然而在一些实施方案中,本发明核酸不具有与天然存在核酸序列相同的全部序列,此类分子可以包含全部或部分的天然存在序列。然而,可以预期到的是施用至细胞的合成的核酸可以随后在细胞内被修饰或改变,以致于其结构或序列与非合成的或天然存在的核酸,例如成熟miRNA序列相同。例如,合成的核酸可以具有与前体miRNA序列不同的序列,但是该序列一旦进入细胞可以被改变成与内源性的、加工了的miRNA相同的序列。术语“分离的”意思是指,本发明核酸分子最初从不同的(依据序列或结构)和不需要的核酸分子分离而来,以致于所分离核酸的群体就其他多核苷酸分子而言是至少大约90%同源的,并且可以是至少大约95、96、97、98、99或100%同源的。在许多本发明实施方案中,核酸是分离的,因为它已经被体外合成,与细胞内源核酸分离开来。然而,应当理解的是,分离的核酸可以随后混合或集合在一起。在某些方面,本发明的合成miRNA是RNA或RNA类似物。miRNA抑制剂可以是DNA或RNA或其类似物。本发明的miRNA和miRNA抑制剂总称为“合成核酸”。
在一些实施方案中,存在具有17和130个残基长度的miRNA或合成的miRNA。本发明的miRNA或合成的miRNA长度是、至少或者至多15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、31、32、33、34、35、36、37、38、39、40、41、42、43、44、45、46、47、48、49、50、51、52、53、54、55、56、57、58、59、60、61、62、63、64、65、66、67、68、69、70、71、72、73、74、75、76、77、78、79、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、99、100、101、102、103、104、105、106、107、108、109、110、111、112、113、114、115、116、117、118、119、120、121、122、123、124、125、126、127、128、129、130、140、145、150、160、170、180、190、200或更多个残基的miRNA或合成miRNA分子,包括它们之间的任何整数或范围。
在某些实施方案中,合成miRNA具有(a)“miRNA区域”,其序列或结合区从5’至3’与全部或部分成熟miRNA序列相同,和(b)“互补区域”,其序列从5’至3’与miRNA序列具有60%和100%之间的互补性。在某些实施方案中,这些合成miRNA也是分离的,如上面所定义。术语“miRNA区域”指合成miRNA上与成熟的天然存在miRNA序列的全部序列具有至少75、80、85、90、95或100%包括它们之间的全部整数同源性的区域。在某些实施方案中,miRNA区域与天然存在miRNA的序列具有或具有至少90、91、92、93、94、95、96、97、98、99、99.1、99.2、99.3、99.4、99.5、99.6、99.7、99.8、99.9或100%同源性。
术语“互补区域”指与成熟的天然存在miRNA序列具有或具有至少60%互补性的合成miRNA的区域。互补区域具有或具有至少60、61、62、63、64、65、66、67、68、69、70、71、72、73、74、75、76、77、78、79、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、99、99.1、99.2、99.3、99.4、99.5、99.6、99.7、99.8、99.9或100%互补性或者从其中可导出的任何范围。在单个多核苷酸序列内,可以具有发夹环结构,这是miRNA区域和互补区域之间化学键合的结果。在其他实施方案中,互补区域在与miRNA区域不同的核酸分子上,在该情况下,互补区域在互补链上而miRNA区域在活性链上。
在本发明另外的实施方案中,存在为miRNA抑制剂的合成核酸。miRNA抑制剂长度在大约17至25个核苷酸之间,并且包含与成熟miRNA的5’至3’序列具有至少90%互补性的5’至3’序列。在某些实施方案中,miRNA抑制剂分子长度是17、18、19、20、21、22、23、24或25个核苷酸或者可从它们导出的任何范围。然而,miRNA抑制剂可以具有与成熟miRNA、特别是成熟的天然存在miRNA的5’至3’序列具有或具有至少70、75、80、85、90、91、92、93、94、95、96、97、98、99、99.1、99.2、99.3、99.4、99.5、99.6、99.7、99.8、99.9或100%或可从其导出的任何范围的互补性的序列(从5’至3’)。本领域技术人员可以使用与成熟miRNA序列互补的部分miRNA序列作为miRNA抑制剂序列。然而,该部分核酸序列可以被改变,以致于其与成熟miRNA序列仍然具有适当百分数的互补性。
在本发明的一些实施方案中,合成的miRNA包含一个或一个以上设计元件。这些设计元件包括,但不限于:(i)对于互补区域5’末端核苷酸的磷酸或羟基的取代基;(ii)互补区域开始或最后1-6个残基中一个或一个以上糖修饰;或(iii)互补区域3’端最后1-5个残基内的一个或一个以上核苷酸与miRNA区域相应核苷酸的非互补性。多种设计修饰是本领域众所周知的,见下文。
在某些实施方案中,合成的miRNA在其互补区域5’端具有其磷酸和/或羟基已经被另一化学基取代的核苷酸(被称为“取代设计”)。在一些情况下,磷酸基被取代,而在另外一些情况下,羟基已经被取代。虽然其他取代基为本领域技术人员众所周知并且同样可以使用,但是在特定实施方案中,取代基是生物素、胺基、低碳烷基胺基、乙酰基、2’O-Me(2’氧-甲基)、DMTO(带氧的4,4’-二甲氧基三苯甲基)、荧光素、巯基或吖啶。该设计元件还可以在miRNA抑制剂中使用。
另外的实施方案涉及在互补区域开始或最后1-6个残基中具有一个或一个以上糖修饰的合成miRNA(被称为“糖取代设计”)。在某些情况下,在互补区域的开始1、2、3、4、5、6或更多个残基或可从其中导出的任何范围的残基中存在一个或一个以上糖修饰。在另外的情况下,在互补区域的最后1、2、3、4、5、6或更多个残基或可从其中导出的任何范围残基内存在一个或一个以上糖修饰。应当理解的是,术语“开始”和“最后”是对于区域的从5’端至3’端的残基次序而言的。在特定实施方案中,糖修饰是2’O-Me修饰。在进一步的实施方案中,在互补区域的开始或最后2-4个残基内或者互补区域的开始或最后4-6个残基内存在一个或一个以上糖修饰。该设计元件还可以在miRNA抑制剂中使用。因此,miRNA抑制剂可以在5’末端核苷酸上具有该设计元件和/或取代基。
本发明另外的实施方案,存在其中互补区域3’端最后1-5个残基中一个或一个以上核苷酸与miRNA区域相应核苷酸不互补的合成miRNA(“非互补性”)(被称为“非互补性设计”)。非互补性可以存在于互补miRNA的最后1、2、3、4和/或5个残基中。在某些实施方案中,在互补区域的至少2个核苷酸内存在非互补性。
可以预期到的是本发明的合成miRNA具有一个或一个以上取代、糖修饰或非互补性设计。在某些情况下,合成RNA分子具有它们当中的两种,而在另外一些情况下,这些分子在适当位置具有全部三种设计。
miRNA区域和互补区域可以在同一或者分开的多核苷酸上。在miRNA区域和互补区域包含在同一多核苷酸之上或之内的情况下,miRNA分子将考虑为单一多核苷酸。在不同的区域位于分开的多核苷酸之上的实施方案中,合成miRNA将考虑包含在两个多核苷酸内。
当RNA分子为单一多核苷酸时,在miRNA区域和互补区域之间可存在接头区。在一些实施方案中,单一多核苷酸是能够形成发夹环结构,这是miRNA区域和互补区域结合的结果。接头构成了发夹环。在一些实施方案中,可以预期到的是接头区长度为、为至少或为至多2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、31、32、33、34、35、36、37、38、39或40个残基或者可从其中导出的任何范围。在某些实施方案中,接头长度为3和30个残基(包含在内)之间。
除了具有miRNA区和互补区域之外,还可以在区域的5’端或3’端具有侧翼序列。在一些实施方案中,在这些区域的一侧或两侧存在或存在至少1、2、3、4、5、6、7、8、9、10个核苷酸或更多个核苷酸,或者可从其中导出的任何范围。
本发明方法包括降低或消除细胞内一个或一个以上miRNA活性,包括向细胞内引入miRNA抑制剂;或者提供或增强细胞内一个或一个以上miRNA活性。本发明还涉及通过向细胞特定核酸,例如特异性合成miRNA分子或合成miRNA抑制剂分子诱导某些细胞特性。然而,在本发明方法中,miRNA分子或miRNA抑制剂不必须是合成的。它们可以具有与天然存在miRNA具有相同的序列或者它们可以不具有任何设计修饰。在某些实施方案中,miRNA分子和/或miRNA抑制剂是合成的,如上所述。
向细胞提供的特定核酸分子理解为对应于细胞内的特定miRNA,因此细胞内的miRNA被称为“对应miRNA”。在指定miRNA分子引入细胞内的情况下,对应miRNA将被理解为被诱导或抑制的miRNA或者miRNA功能。然而,可以预期到的是被引入细胞内的miRNA分子不是成熟miRNA,而是能够在适当生理条件下变成成熟miRNA。在特定的对应miRNA被miRNA抑制剂抑制的情况下,特定miRNA将被称为靶向的miRNA。可以预期到的是可以涉及多个对应miRNA。在特定实施方案中,一种以上miRNA分子被引入细胞内。然而,在其他实施方案中,一种以上miRNA抑制剂被引入细胞内。此外,miRNA分子和miRNA抑制剂的组合可以被引入细胞内。发明人可以预期到的是,miRNA组合可以在异常表型细胞内细胞途径中一个或一个以上点处起作用,并且此种组合对靶细胞的功效增加,而与此同时对正常细胞没有不利影响。因此,miRNA组合可以对受试者或者患者具有最低限度的不利影响,而同时提供充足的治疗作用,例如状况改善、细胞的生长抑制、所靶向细胞的死亡、细胞表型或生理学改变、细胞生长放缓、对第二治疗法的敏化、对特定治疗法的敏化等等。
方法包括鉴定需要诱导这些细胞特性的细胞或患者。同样,应当理解的是,向细胞或有机体提供的合成核酸量是“有效量”,其指达到期望的目标,诸如诱导特定细胞特性所需要的量(或足够量)。在方法的某些实施方案中包括向细胞提供或引入有效达到期望的生理学结果数量的对应于细胞内miRNA的核酸分子。
此外,方法可以包括提供合成或非合成miRNA分子。在这些实施方案中可以预期到的是,方法可限于或可不限于提供仅仅一个或一个以上合成miRNA分子或者仅仅一个或一个以上非合成miRNA分子。因此,在某些实施方案中,方法可以涉及提供合成miRNA分子和非合成miRNA分子。在该情况下,最有可能向一个细胞或多个细胞提供对应于特定miRNA的合成miRNA分子和对应于不同miRNA的非合成miRNA分子。此外,使用一列miRNA用马库什组语言限定的任何方法可以不用马库什组语言而用分离性的词(即,或者)限定,反之亦然。
有代表性地,细胞内的内源基因、miRNA或mRNA被调节。在特定实施方案中,核酸序列包含至少一个在核酸序列上与一个或一个以上miRNA或基因序列具有至少70、75、80、85、90、95或100%同一性的片段。内源基因、miRNA或mRNA的表达或加工的调节可以贯穿于mRNA加工的调节中,此类加工包括细胞内的转录、转运和/或翻译。调节还可以通过细胞、组织或器官内miRNA活性的抑制或增强而实现。此类加工可影响所编码产物的表达或者mRNA的稳定性。仍然在其他实施方案中,核酸序列可包含修饰核酸序列。在某些方面,一个或一个以上miRNA序列可包括或包含修饰核碱基或核酸序列。
应当理解,在本发明方法中,可通过向细胞或有机体施用其一旦进入细胞即充当对应miRNA的核酸分子,向细胞或其他生物物质例如有机体(包括患者)提供对应于特定miRNA的miRNA或miRNA分子。向细胞提供的分子的形式可以不是一旦进入细胞即充当miRNA的形式。因此,在一些实施方案中可以预期到的是提供合成miRNA或非合成miRNA,以致于其一旦进入细胞的miRNA加工机构即被加工成成熟的和活化的miRNA。在某些实施方案中,特别考虑的是,提供的miRNA分子不是成熟miRNA分子,而是其一旦进入miRNA加工机构即被加工成成熟miRNA的核酸分子。miRNA背景下的术语“非合成”意思是指miRNA不是“合成的”,如本文所定义。此外,可以预期到的是在涉及使用合成miRNA的本发明实施方案中,在本发明的一个方面也考虑使用相应的非合成,反之亦然。应当理解的是,术语“提供”试剂用于包括向患者“施用”试剂。
在某些实施方案中,方法还包括靶向miRNA以在细胞或有机体内调节。术语“靶向miRNA以调节”意思是指将采用本发明核酸以调节所选择的miRNA。在一些实施方案中,调节用对应于所靶向miRNA的合成或非合成miRNA实现,其有效地向细胞或有机体提供所靶向的miRNA(正向调节)。在其他实施方案中,调节用miRNA抑制剂实现,其有效地抑制细胞或有机体中的所靶向的miRNA(负向调节)。
在一些实施方案中,被靶向调节的miRNA是影响疾病、状况或途径的miRNA。在某些实施方案中,miRNA被靶向,因为治疗可以通过负向调节所靶向miRNA而提供。在其他实施方案中,miRNA被靶向,因为治疗可以通过正向调节所靶向miRNA或其靶标而提供。
在本发明的某些方法中,存在向需要与靶向miRNA调节相关的治疗的或需要本文所述生理学或生物学结果(例如对于特定细胞途径或结果,如细胞活力下降)的细胞、组织、器官或有机体(总称为“生物物质”)施用所选择的miRNA调节剂的更多步骤。因此,在本发明的一些方法中,存在鉴定需要通过提供miRNA调节剂治疗的患者的步骤。可以预期到的是,在一些实施方案中施用有效量的miRNA调节剂。在特定实施方案中,赋予生物物质治疗益处,其中“治疗益处”指一种或一种以上状况或与疾病或状况相关症状的改善,或者就疾病而言预后、持续时间或状况的改善。可以预期到的是治疗益处包括,但不限于疼痛降低、发病率降低和/或症状减少。例如,就癌症而言,可以预期到的是治疗益处可以是肿瘤生长的抑制、转移的阻止、转移灶数量的减少、癌细胞增殖的抑制、癌细胞中细胞死亡的诱导、癌细胞附近血管发生的抑制、癌细胞细胞凋亡的诱导、疼痛的减轻、复发危险的降低、癌细胞中化学敏感性或辐射敏感性的诱导、生命的延长和/或癌症直接或间接相关的死亡的延迟。
此外,可以预期到的是,miRNA组合物可以作为治疗的一部分与传统治疗法或预防试剂联合向患者提供。此外,可以预期到的是在治疗背景下讨论的任何方法,可以预防性地特别应用于经鉴定潜在需要治疗或者处于需要治疗的状况或疾病风险之中的患者。
此外,本发明方法涉及使用一种或一种以上对应于miRNA的核酸和治疗药物。核酸可以增强药物的作用或疗效、降低任何副作用或毒性、改变其生物利用率和/或降低所需要的剂量或频率。在某些实施方案中,治疗药物是癌症治疗剂。因此,在一些实施方案中,存在治疗患者中癌症的方法,包括向患者施用癌症治疗剂和有效量的至少一种改善癌症治疗剂疗效或保护非癌细胞的miRNA分子。癌症治疗法还包括与基于化学和辐射的治疗的多种联合治疗。联合化学治疗包括但不限于,例如,5-氟尿嘧啶、阿仑单抗、氨柔比星、贝伐单抗、博来霉素、硼替佐米、白消安、喜树碱、卡培他滨、碳铂、西妥昔单抗、苯丁酸氮芥、顺铂(CDDP)、COX-2抑制剂(例如塞来昔布)、环磷酰胺、阿糖胞苷、更生霉素、达沙替尼、柔红霉素、地塞米松、多西他塞、阿霉素(亚德里亚霉素)、EGFR抑制剂(吉非替尼和西妥昔单抗)、埃罗替尼、雌激素受体结合剂、依托泊苷(VP16)、依维莫司、法呢基-蛋白质转移酶抑制剂、吉非替尼、吉西他滨、吉妥单抗、替伊莫单抗、异环磷酰胺、甲磺酸伊马替尼、larotaxel、拉帕替尼、洛那法尼、氮芥、美法仑、甲氨蝶呤、丝裂霉素、诺维本、亚硝基脲、洛可达唑、草酸铂、紫杉醇、plicomycin、丙卡巴肼、雷洛昔芬、利妥昔单抗、西罗莫司、索拉非尼、舒尼替尼、他莫昔芬、红豆杉醇、多西他赛、西罗莫司脂化物、替吡法尼、托西莫单抗、transplatinum、曲妥珠单抗、长春碱、长春新碱、或长春瑞滨或者上述药物的任何类似物或衍生变体。
通常,可给与miRNA抑制剂以降低内源miRNA的活性。例如,增加细胞增殖的miRNA分子的抑制剂可以向细胞提供以降低细胞增殖。本发明可以预期到的是针对本文所公开的不同miRNA分子和miRNA抑制剂观察到不同生理效应的这些实施方案。这包括,但不限于下列生理效应:增加和降低细胞增殖、增加或降低细胞凋亡、增加转化、增加或降低细胞活力、激活或抑制激酶(例如Erk)、激活/诱导或抑制hTert、抑制促进生长途径(例如Stat 3信号途径)的兴奋、减少或增加活细胞数、和增加或降低细胞周期中特定期细胞数。本发明方法一般考虑包括提供或引入对应于一种或一种以上不同miRNA分子的一种或一种以上不同核酸分子。可以预期到的是下列数量、至少下列数量或至多下列数量的不同核酸或miRNA分子可以被提供或引入:1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、31、32、33、34、35、36、37、38、39、40、41、42、43、44、45、46、47、48、49、50、51、52、53、54、55、56、57、58、59、60、61、62、63、64、65、66、67、68、69、70、71、72、73、74、75、76、77、78、79、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、99、100或从其中导出的任何范围。这也适用于可以提供或引入细胞内的不同miRNA分子的数量。
II.药物制剂和递送
本发明方法包括递送有效量的miRNA或编码其的表达构建体。“有效量”药物组合物通常定义为足以可检测地和可重复地达到所述期望的结果,例如改善、降低、最小化或限制疾病或其症状程度的数量。可采用其他更严格的定义,包括消除、消灭或治愈疾病。
A.施用
在某些实施方案中,期望杀死细胞、抑制细胞生长、抑制转移、降低肿瘤或组织大小和/或逆转或降低细胞的恶性或疾病表型。施用途径自然地随着待靶向的病变或部位的位置和性质而变化,并且包括例如真皮内、皮下、区域、肠胃外、静脉内、肌内、鼻内、全身和口服施用和制剂。直接注射、瘤内注射或肿瘤脉管系统内注射特别考虑用于分散的、实体的、可接近的肿瘤或其他可接近的靶区域。局部、区域或全身施用也是适当的。对于>4cm的肿瘤,待施用的体积将会是大约4-10ml(优选10ml),而对于<4cm的肿瘤,将使用大约1-3ml的体节(优选3ml)。
作为单次剂量递送的多次注射包含大约0.1至大约0.5ml的体积。本发明组合物可以在多次注射中施用至肿瘤所所靶向部位。在某些方面,注射可以以大约1cm的间隔间隔开。
在手术介入的情况下,本发明可在手术前使用,以使得不宜手术的肿瘤受试者能够行切除术。备选地,本发明可以在手术的同时使用,和/或手术之后使用以治疗残留的或转移的疾病。例如,可向将切除的瘤床注射或者灌注包含miRNA或其组合的制剂。在切除术后可连续施用,例如通过在手术部位植入导管。还构想了定期术后治疗。还考虑连续灌注表达构建体或病毒构建体。
在适当的地方也可以采用连续施用,例如,当肿瘤或其他不希望的受累区域被切除和瘤床或靶向部位被处理以消除残留的微小疾病(microscopic disease)时。考虑通过注射器或导管递送。此类连续灌注可在最初治疗之后持续从大约1-2小时至大约2-6小时、至大约6-12小时、至大约12-24小时、至大约1-2天、至大约1-2周或者更长时间。通常,通过连续灌注的治疗组合物的剂量等同于随着灌注持续阶段调整的单次或多次注射的剂量。
治疗方案同样也可变化,并且常常依赖于肿瘤类型、肿瘤部位、免疫状况、靶位点、疾病进程和患者的健康和年龄。某些肿瘤类型将需要更积极治疗。临床医生将最适合基于治疗制剂的已知疗效和毒性(如果存在的话)做出此类决定。
在某些实施方案中,被治疗的肿瘤或患病区域可能是,至少最初是不可切除的。用本发明组合物治疗可以因为边界收缩或者消除了某些特别的侵袭部分而增加肿瘤的可切除性。在治疗后,行切除术是可能的。在切除术后的额外的治疗可用作消除肿瘤或靶向部位的微小残留疾病。
治疗可以包括多种“单位剂量”。单位剂量定义为包含预定量的治疗组合物。待施用的量和特定途径和制剂处于临床领域技术人员的技能范围内。单位剂量不需要以单次注射施用,但是可以包含在设定的时间阶段内连续灌注。对于本发明的病毒成分,单位剂量可以方便地以μg或mg miRNA或miRNA模拟物的方式描述。备选地,指定量可以是作为每日平均剂量、每周平均剂量或每月平均剂量施用的量。
miRNA可以以大约或至少大约0.5、1、5、10、15、20、25、30、35、40、45、50、60、70、80、90、100、110、120、130、140、150、160、170、180、190、200、210、220、230、240、250、260、270、280、290、300、310、320、330、340、350、360、370、380、390、400、410、420、430、440、450、460、470、480、490、500、510、520、530、540、550、560、570、580、590、600、610、620、630、640、650、660、670、680、690、700、710、720、730、740、750、760、770、780、790、800、810、820、830、840、850、860、870、880、890、900、910、920、930、940、950、960、970、980、990、1000μg或mg或更多或从其中导出的任何范围的剂量向患者施用。备选地,指定量可以是作为每日平均剂量、每周平均剂量或每月平均剂量施用的量或者其可以以mg/kg方式表示,其中kg指患者重量,mg在上文说明。在其他实施方案中,指定量是上述的任何数但是表示为mg/m2(对于肿瘤大小或者患者表面积)。
B.注射组合物和制剂
在一些实施方案中,用于递送miRNA或编码其的表达构建体或其组合的方法是经由全身施用。然而,本文所公开的药物组合物也可以肠胃外、皮下、直接、气管内、静脉内、真皮内、肌内或甚至腹膜内施用,如美国专利5,543,158;5,641,515和5,399,363(每一专利全文明确地通过参考并入本文)中所述。
核酸注射可以通过注射器或者用于注射溶液的任何其他方法递送,只要核酸和任何相关成分可以通过注射所需的特定的针规即可。注射器系统也已经描述用于基因治疗,允许精确地在任何深度多次注射预定量的溶液(美国专利5,846,225)。
作为游离碱或可药用盐的活性化合物溶液在适当混合有表面活性剂,例如羟基丙基纤维素的水中制备。也可以在甘油、液体聚乙二醇、其混合物中和在油类中制备分散液。在储存和使用的常规条件下,这些制剂包含防腐剂以防止微生物生长。适宜注射使用的药物形式包括无菌水溶液或分散液和用于临时制备无菌注射溶液或分散液的无菌粉剂(美国专利5,466,468,其全文明确地通过参考并入本文)。在所有情况下,剂型必须是无菌的并且必须是易注射程度的流体。其必须是于制造和储存条件下稳定的并且必须防止微生物,例如细菌和真菌的污染作用。载体可以是溶剂或分散介质,包含例如水、乙醇、多元醇(例如甘油、丙二醇和液体聚乙二醇等等)、其适宜混合物和/或植物油。例如可以通过使用包衣,例如卵磷脂、通过维持分散液所需要的颗粒大小和通过使用表面活性剂维持适当的流动性。对微生物作用的抑制可以通过多种抗菌剂和抗真菌剂,例如对羟基苯甲酸酯类、三氯叔丁醇,苯酚,山梨酸,硫柳汞等实现。在许多情况下,将优选包括等渗剂,例如糖或氯化钠。注射组合物的延长吸收可以通过在组合物中使用延迟吸收试剂,例如,单硬脂酸铝和明胶实现。
在某些制剂中,采用基于水的制剂,而在另外一些情况下,可以是基于脂质的制剂。在本发明的特定实施方案中,包含肿瘤抑制蛋白或者编码其的核酸的组合物是基于水的制剂。在其他实施方案中,制剂是基于脂质的。
例如对于水溶液的肠胃外施用,必要时溶液应当被适宜缓冲并且首先使用足够的盐或葡萄糖使液体稀释液具有等渗性。这些特定水溶液特别适宜静脉内、肌内、皮下、瘤内、病损部位内和腹膜内施用。在这一点上,可以采用的无菌水介质依据本公开将会是本领域技术人员已知的。例如,一次剂量可以溶解于1ml等渗NaCl溶液中,并且,或者加入到1000ml皮下灌注流体中,或者在计划灌注部位注射(见例如,“Remington′s Pharmaceutical Sciences”第15版,第1035-1038和1570-1580页)。取决于被治疗受试者的状况,必定发生剂量的一些改变。负责施用的人员无论如何将针对个体受试者确定适当剂量。此外,对于人类施用,制剂应该满足FDA生物制剂标准办公室所要求的无菌性、致热原性、一般安全性和纯度标准。
如本文所使用,“载体”包括任何和全部的溶剂、分散介质、运载体、包衣、稀释剂、抗细菌剂和抗真菌剂、等渗剂和吸收延迟剂、缓冲剂、载体溶液、悬液、胶体等。此类介质和试剂用于药物活性物质的用途是本领域众所周知的。其在治疗组合物中的用途可以考虑,除非任何常规介质或试剂与活性成分不相容。补充的活性成分也可加入到组合物中。
短语“可药用”指施用至人时不产生变态反应或类似不良反应的分子实体和组合物。
核酸以与剂量制剂相容的方式并且以治疗有效量施用。待施用的量取决于待治疗的受试者,包括例如疾病或癌症的侵袭性、任何肿瘤或损害的大小、先前治疗或其他疗程治疗。需要施用的活性成分的精确的量依赖于医师的判断。最初施用和后续施用的适宜方案也是可变的,但典型的是先最初施用,然后是其他施用。此类施用可以作为一次剂量、在跨越10、20、30、40、50、60分钟和/或1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24或更多个小时和/或1、2、3、4、5、6、7天或更长的时间内连续地全身施用。此外,可通过由制剂和/或施用模式实现的定时释放或持续释放机制施用。
C.组合治疗
在某些实施方案中,本发明组合物和方法涉及miRNA或编码其的表达构建体。这些miRNA组合物可以与第二治疗法组合使用以增强miRNA治疗的效果或者提高所采用的另一治疗法的治疗效果。这些组合物将以有效实现预期效果,例如杀死癌细胞和/或抑制细胞过度增殖的组合量提供。该过程可涉及细胞与miRNA或第二治疗法同时或不同时间接触。这可以如下实现:通过细胞与一种或一种以上组合物或包含一种或一种以上试剂的药物制剂接触,或者通过细胞与两种或两种以上不同组合物或制剂接触,其中一种组合物提供(1)miRNA;和/或(2)第二治疗剂。可以施用包括化学治疗、放射治疗、手术治疗、免疫治疗或基因治疗的第二组合物或方法。
可以预期到的是可以在相互大约12-24小时内、并且优选地在相互大约6-12小时内向患者提供miRNA治疗和第二治疗法。然而,在一些情况下,希望明显延长治疗时间期限,时间期限为从几天(2、3、4、5、6或7)至几周(1、2、3、4、5、6、7或8)的分别施用间隔。
在某些实施方案中,疗程将持续1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、31、32、33、34、35、36、37、38、39、40、41、42、43、44、45、46、47、48、49、50、51、52、53、54、55、56、57、58、59、60、61、62、63、64、65、66、67、68、69、70、71、72、73、74、75、76、77、78、79、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90天或更长。可以预期到的是,在第1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、31、32、33、34、35、36、37、38、39、40、41、42、43、44、45、46、47、48、49、50、51、52、53、54、55、56、57、58、59、60、61、62、63、64、65、66、67、68、69、70、71、72、73、74、75、76、77、78、79、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89和/或90天或其任意组合,给于第一试剂,并且在第1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、31、32、33、34、35、36、37、38、39、40、41、42、43、44、45、46、47、48、49、50、51、52、53、54、55、56、57、58、59、60、61、62、63、64、65、66、67、68、69、70、71、72、73、74、75、76、77、78、79、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89和/或90天或其任意组合,给于另一试剂。在一天内(24小时的时间内),可以向患者一次施用或者多次施用试剂。此外,可以预期到的是在一个疗程之后有一个不进行治疗的时间段。该时间段可持续1、2、3、4、5、6、7天和/或1、2、3、4、5周和/或1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12月或更长,取决于患者状况,例如其预后、强度、健康等。
可采用多种组合,例如miRNA治疗法是“A”并且第二治疗法是“B”:
A/B/A  B/A/B  B/B/A  A/A/B  A/B/B  B/A/A  A/B/B/B  B/A/B/B
B/B/B/A    B/B/A/B    A/A/B/B    A/B/A/B    A/B/B/A    B/B/A/A
B/A/B/A    B/A/A/B   A/A/A/B  B/A/A/A  A/B/A/A  A/A/B/A
任何本发明化合物或治疗向患者的施用将遵循施用此类化合物的一般方案,如果存在的话,要考虑载体或任何蛋白质或其他试剂的毒性。因此,在一些实施方案中,存在检测归因于组合治疗的毒性的步骤。预计在需要时将重复治疗周期。也可以预期到的是,多种标准治疗法以及手术介入可与所述治疗法组合应用。
在特定方面,可以预期到的是第二治疗法,例如化学治疗、放射治疗、免疫治疗、手术治疗或其他基因治疗被用来与如本文所述的miRNA治疗相组合。
1.化学治疗
根据本发明可使用广泛多种的化学治疗剂。术语“化学治疗”指使用药物治疗癌症。“化学治疗剂”用于指在治疗癌症中施用的化合物或组合物。这些试剂或药物通过它们在细胞内的活性模式分类,例如它们是否或者在什么阶段影响细胞周期。备选地,试剂可基于其直接交联DNA、嵌入DNA或者通过影响核酸合成引起染色体和有丝分裂异常的能力来表征。大部分化学治疗剂归于下列几类:烷化剂、抗代谢药、抗肿瘤抗生素、有丝分裂抑制剂和亚硝基脲。
a.烷化剂
烷化剂是直接与基因组DNA相互作用以防止癌细胞增殖的药物。该类化学治疗药物代表着影响细胞周期所有阶段的试剂,即它们不是阶段特异性的。可应用烷化剂治疗慢性白血病、非霍奇金淋巴瘤、霍奇金病、多发性骨髓瘤、和乳腺、肺和卵巢的特定癌症。它们包括:白消安、苯丁酸氮芥、顺铂、环磷酰胺(环磷氮芥)、达卡巴嗪、异环磷酰胺、氮芥(氮芥)和美法仑。曲格列酮可以用于与任何一个或一个以上的这些烷化剂相组合治疗癌症。
b.抗代谢药
抗代谢药破坏DNA和RNA合成。与烷化剂不同,它们特异性地影响细胞周期的S期。它们除了用于治疗乳腺、卵巢和胃肠道肿瘤之外,还已经用于治疗慢性白血病。抗代谢药包括5-氟尿嘧啶(5-FU)、阿糖胞苷(Ara-C)、氟达拉滨、吉西他滨和甲氨蝶呤。
5-氟尿嘧啶(5-FU)具有化学名5-氟-2,4(1H,3H)-嘧啶二酮。其作用机制被认为是通过阻断脱氧尿苷酸至胸苷酸的甲基化反应。因此,5-FU干扰脱氧核糖核酸(DNA)的合成并且较小程度地抑制核糖核酸(RNA)的形成。由于DNA和RNA是细胞分裂和增殖所必需的,据认为5-FU的效应是产生胸苷缺乏,导致细胞死亡。因此,5-FU的效应存在于快速分裂的细胞内,快速分裂是转移癌的特征。
c.抗肿瘤抗生素
抗肿瘤抗生素具有抗微生物活性和细胞毒性活性。这些药物也通过化学性抑制酶和有丝分裂或者改变细胞膜而干扰DNA。这些试剂不是阶段特异性的,以致于它们在细胞周期的所有阶段起作用。因此,它们广泛用于多种癌症。抗肿瘤抗生素实例包括博来霉素、更生霉素、柔红霉素、阿霉素和伊达比星,其中一些在下文更详细描述。广泛用于肿瘤临床治疗环境的这些化合物以从25-75mg/m2的剂量21天的间隔静脉大丸剂注射阿霉素至35-100mg/m2静脉或口服依托泊苷施用。
d.有丝分裂抑制剂
有丝分裂抑制剂包括可以抑制细胞分裂或有丝分裂所需蛋白质合成的植物生物碱和其他天然试剂。它们在细胞周期的特定阶段起作用。有丝分裂抑制剂包括多西他塞、依托泊苷(VP16)、紫杉醇、红豆杉醇、多西他赛、长春碱、长春新碱和长春瑞滨。
e.亚硝基脲
像烷化剂一样,亚硝基脲抑制DNA修复蛋白。它们除了用于治疗脑肿瘤外,还用于治疗非霍奇金淋巴瘤、多发性骨髓瘤、恶性黑素瘤。实例包括卡氮芥和洛莫司汀。
2.放射治疗
放射治疗也称作辐射治疗,是用电离辐射治疗癌症和其他疾病。电离辐射储存能量,通过损伤遗传物质使得这些细胞不能够继续生长,以损伤或破坏所治疗区域的细胞。虽然辐射损伤癌细胞和正常细胞,但是正常细胞能够自我修复并正确地起作用。放射治疗可用于治疗局限性实体肿瘤,例如皮肤、舌、喉、脑、乳腺或宫颈癌症。其还可用于治疗白血病和淋巴瘤(分别是血液形成细胞和淋巴系统癌症)。
根据本发明使用的放射治疗可包括,但不限于,使用γ-射线、X-射线和/或向肿瘤细胞直接递送放射性同位素。也考虑其他形式的DNA损伤因素,例如微波、质子束照射(美国专利5,760,395和4,870,287)和UV-照射。最有可能所有这些因素对DNA、DNA前体、DNA复制和修复以及染色体的组装和维持造成广泛损伤。对于X-射线的剂量范围从长时间段的每日50至200伦琴的剂量(3至4周),至2000至6000伦琴的单次剂量。放射性同位素的剂量范围变化极大,并且依赖于同位素的半衰期、所释放放射线的强度和类型以及被肿瘤细胞的摄取。放射治疗可包括使用放射标记的抗体以直接向癌症部位递送剂量辐射(放射免疫治疗)。一旦抗体被注射入体内,其积极地搜寻出癌细胞,通过辐射的细胞杀伤(细胞毒性)作用摧毁癌细胞。该方法可使辐射损伤健康细胞的危险降到最低。
对于脑和其他肿瘤的立体定位放射手术(γ刀)不使用刀,而是来自γ放射治疗的数百个不同角的极精确靶向束。仅需要一期放射治疗,大约4至5小时。为了该种治疗,将特制金属框附在头上。然后,开展几次x-射线扫描以找到需要治疗的精确区域。在脑肿瘤的放射治疗期间,患者躺卧,其头位于巨大头盔中,头盔具有数百个孔允许放射治疗束穿过。相关方法允许定位身体其他区域的肿瘤以便治疗。
3.免疫治疗
在癌症治疗的情况下,免疫治疗通常依赖于使用免疫效应细胞和分子以靶向和摧毁癌细胞。曲妥珠单抗(赫赛汀TM)即为此类实例。免疫效应器可以是例如对肿瘤细胞表面的一些标记特异的抗体。抗体可以单独充当治疗的效应器或者其可以招募其他细胞实际行使细胞杀伤。抗体也可以缀合至药物或毒素(化学治疗剂、放射性核素、蓖麻毒蛋白A链、霍乱毒素、百日咳毒素等)并且仅充当靶向剂。备选地,效应器可以是携带有直接或间接与肿瘤细胞靶相互作用的表面分子的淋巴细胞。多种效应器细胞包括细胞毒性T细胞和NK细胞。治疗方式的组合,即直接的细胞毒性活性和抑制或降低ErbB2将会在ErbB2过表达的癌症治疗中提供治疗益处。
在免疫治疗的一个方面,肿瘤或疾病细胞必须带有适宜靶向,即在大多数细胞上不存在的一些标记。存在许多肿瘤标记并且任何这些肿瘤标记在本发明中适宜靶向。共有的肿瘤标记包括癌胚抗原、前列腺特异性抗原、泌尿肿瘤相关的抗原、胎儿抗原、酪氨酸酶(p97)、gp68、TAG-72、HMFG、唾液酸Lewis抗原、MucA、MucB、PLAP、雌激素受体、层粘连蛋白受体、erb B和p155。免疫治疗的一个备选方面是组合抗癌效果与免疫刺激效果。也存在免疫刺激分子,包括:细胞因子例如IL-2、IL-4、IL-12、GM-CSF、γ-IFN、趋化因子例如MIP-1、MCP-1、IL-8和生长因子例如FLT3配体。免疫刺激分子,或者作为蛋白质或者用于基因递送,与肿瘤抑制物例如MDA-7的组合已经显示出增强抗肿瘤效果(Ju等,2000)。此外,抗任何这些化合物的抗体可用于本文所述抗癌试剂的靶向。
当前研究中的或者使用中的免疫治疗剂实例为免疫佐剂,例如牛分枝杆菌(Mycobacterium bovis)、恶性疟原虫(Plasmodium falciparum)、二硝基氯苯和芳香族化合物(美国专利5,801,005和5,739,169;Hui和Hashimoto,1998;Christodoulides等,1998)、细胞因子治疗剂例如干扰素α、干扰素β和干扰素γ、IL-1、GM-CSF和TNF(Bukowski等,1998;Davidson等,1998;Hellstrand等,1998)基因治疗剂例如TNF、IL-1、IL-2、p53(Qin等,1998;Austin-Ward和Villaseca,1998;美国专利5,830,880和5,846,945)以及单克隆抗体,例如抗神经节苷脂GM2抗体、抗HER-2抗体、抗p185抗体;Pietras等,1998;Hanibuchi等,1998;美国专利5,824,311)。赫赛汀(曲妥珠单抗)是阻断HER2-neu受体的嵌合(小鼠-人)单克隆抗体。其拥有抗肿瘤活性并且批准用于恶性肿瘤的治疗(Dillman,1999)。表6是几种已知抗癌免疫治疗剂及其靶的非限定性列表。可以预期到的是一个或一个以上这些治疗剂可以与本文所述miRNA治疗剂一起使用。
表6
  通用名称   靶
  西妥昔单抗   EGFR
  帕尼单抗   EGFR
  曲妥珠单抗   erbB2受体
  贝伐单抗   VEGF
  阿仑单抗   CD52
  吉妥单抗奥唑米星   CD33
  利妥昔单抗   CD20
  托西莫单抗   CD20
  马妥珠单抗   EGFR
  替伊莫单抗   CD20
  托西莫单抗   CD20
  HuPAM4   MUC1
  MORAb-009   间皮素
  G250   碳酸酐酶IX
  mAb 8H9   8H9抗原
  M195   CD33
  ipilimumab   CTLA4
  HuLuc63   CS1
  阿仑单抗   CD53
  依帕珠单抗   CD22
  BC8   CD45
  HuJ591   前列腺特异性膜抗原
  hA20   CD20
  来沙木单抗   TRAIL受体-2
  帕妥珠单抗   HER-2受体
  Mik-β-1   IL-2R
  RAV12   RAAG12
  SGN-30   CD30
  AME-133v   CD20
  HeFi-1   CD30
  BMS-663513   CD137
  Volociximab   抗-α5β1整联蛋白
  GC1008   TGFβ
  HCD122   CD40
  希普利珠单抗   CD2
  MORAb-003   叶酸受体α
  CNTO 328   IL-6
  MDX-060   CD30
  Ofatumumab   CD20
  SGN-33   CD33
存在诸多用于癌症被动免疫治疗的不同方法。它们大概分成如下几类:抗体单独注射;偶联至毒素或化学治疗剂的抗体的注射;偶联至放射性同位素的抗体的注射;抗独特型抗体的注射;和骨髓中肿瘤细胞的清除。
4.基因治疗
仍然在另一个实施方案中,组合治疗包括基因治疗,其中治疗性多核苷酸在一个或一个以上治疗miRNA施用之前、之后或同时施用。治疗性多肽或者编码核酸与miRNA组合递送可对靶组织具有组合的治疗效果。本发明包含多种蛋白质,其中一些在下文描述。可以与本发明组合用于多种形式基因治疗靶向的多种基因包括,但不限于细胞增殖诱导物、细胞增殖抑制剂、程序性细胞死亡调节物、细胞因子和其他治疗核酸或者编码治疗蛋白质的核酸。
肿瘤抑制物癌基因的作用是抑制细胞过度增殖。这些基因的失活破坏了其抑制活性,导致增殖不受调节。肿瘤抑制物(例如治疗多肽)p53、FHIT、p16和C-CAM可以采用。
除了p53之外,另一个细胞增殖抑制剂是p16。真核细胞周期的多数转换由细胞周期蛋白依赖的激酶或CDK激发。细胞周期蛋白依赖的激酶4(CDK4)是一种CDK,其调节进展通过G1。该酶的活性可以在晚G1期磷酸化Rb。CDK4的活性通过激活亚基D型细胞周期蛋白和通过抑制亚基p16INK4控制,p16INK4已经被表征为特异性结合并抑制CDK4并且因此可以调节Rb磷酸化的蛋白质(Serrano等,1993;Serrano等,1995)。由于p16INK4蛋白质是CDK4抑制剂(Serrano,1993),该基因的缺失可以增加CDK4的活性,导致Rb蛋白质的过度磷酸化。还已知p16调节CDK6的功能。
p16INK4属于新近描述的一类CDK-抑制蛋白,该类蛋白还包括p16B、p19、p21WAF1和p27KIP1。p16INK4基因位于9p21,该区是许多肿瘤类型中频繁缺失的染色体区域。p16INK4基因的纯合缺失和突变在人肿瘤细胞系中常见。该证据表明p16INK4基因是肿瘤抑制基因。然而,该解释受到如下观察结果的挑战,即在原代未培养的肿瘤中p16INK4基因改变的频率远远低于培养的细胞系中(Caldas等,1994;Cheng等,1994;Hussussian等,1994;Kamb等,1994;Mori等,1994;Okamoto等,1994;Nobori等,1995;Orlow等,1994;Arap等,1995)。通过转染质粒表达载体对野生型p16INK4功能的恢复降低了一些人癌症细胞系的集落形成(Okamoto,1994;Arap,1995)。
根据本发明可以使用的其他基因包括Rb、APC、DCC、NF-1、NF-2、WT-1、MEN-I、MEN-II、zac1、p73、VHL、MMAC1/PTEN、DBCCR-1、FCC、rsk-3、p27、p27/p16融合基因、p21/p27融合基因、抗凝基因(例如COX-1、TFPI)、PGS、Dp、E2F、ras、myc、neu、raf、erb、fms、trk、ret、gsp、hst、abl、E1A、p300、血管发生中涉及的基因(例如VEGF、FGF、血小板反应蛋白、BAI-1、GDAIF或它们的受体)和MCC。
5.外科手术
大约60%的癌症患者将经历一些类型的外科手术,其包括预防性手术、诊断性或分期手术、治疗性手术和姑息性手术。治疗性手术是可以与其他治疗法,如本发明治疗法、化学治疗法、放射治疗法、激素治疗法、基因治疗法、免疫治疗法和/或备选治疗法联合的癌症治疗。
治疗性手术包括切除术,其中物理性去除、切除和/或破坏全部或部分癌组织。肿瘤切除术指物理性去除至少部分肿瘤。除了肿瘤切除术之外,外科手术治疗还包括激光外科手术、冷冻外科手术、电外科手术和显微控制手术(Mohs外科手术)。还进一步可以预期到的是,本发明可用于与浅表癌、前期癌或附带量的正常组织去除联合。
在切除部分或全部癌细胞、组织或肿瘤时,会在身体内形成空洞。可通过灌注、直接注射或区域局部应用另外的抗癌治疗实现治疗。此类治疗可以重复,例如每1、2、3、4、5、6或7天、或每1、2、3、4和5周或者每1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11或12个月。这些治疗同样可以改变剂量。
6.其他试剂
可以预期到的是其他试剂可用于与本发明相组合以改善治疗的治疗性效果。这些额外的试剂包括免疫调节剂、上调细胞表面受体和缝隙连接的试剂、细胞抑制剂和分化试剂、细胞黏着抑制剂、提高高增生性细胞对细胞凋亡诱导剂敏感性的试剂或其他生物学试剂。免疫调节剂包括肿瘤坏死因子;干扰素α,β和γ;IL-2和其他细胞因子;F42K和其他细胞因子类似物;或者MIP-1,MIP-1β,MCP-1,RANTES,和其他趋化因子。还可以预期到的是,细胞表面受体或其配体,如Fas/Fas配体、DR4或DR5/TRAIL(Apo-2配体)的上调通过确立对高增生性细胞的自分泌或旁分泌效应将使本发明具有诱导细胞凋亡的能力。通过提高缝隙连接数增加细胞间信号传导将增加对临近高增生性细胞群体的抗高增生性作用。在其他实施方案中,细胞抑制剂或分化试剂可用于与本发明相组合以改善治疗的抗高增生效果。考虑的了细胞黏着抑制剂以改善本发明的疗效。细胞黏着抑制剂实例是黏着斑激酶(FAK)抑制剂和洛伐他汀。还可以预期到的是,增加高增生性细胞对细胞凋亡敏感性的其他试剂,例如抗体c225,可用于与本发明相组合以改善治疗疗效。
Apo2配体(Apo2L,也称作TRAIL)是肿瘤坏死因子(TNF)细胞因子家族成员。TRAIL在许多类型癌细胞中激活快速的细胞凋亡,然而对正常细胞不具有毒性。TRAIL mRNA广泛存在于多种组织中。大多数正常细胞表现出对TRAIL的细胞毒性作用具有抵抗,表明存在保护细胞不被TRAIL诱导细胞凋亡的机制。描述的TRAIL的第一个受体称作死亡受体4(DR4),包含胞质“死亡结构域”;DR4传递由TRAIL携带的细胞凋亡信号。已经鉴定出结合TRAIL的额外的受体。一个受体称作DR5,包含胞质死亡结构域并且与DR4非常相似传递细胞凋亡信号。DR4和DR5mRNA在多种正常组织和肿瘤细胞系中表达。最近,已经鉴定出诱杀受体例如DcR1和DcR2,其阻止TRAIL通过DR4和DR5诱导细胞凋亡。因此,这些诱杀受体代表着直接在细胞表面调节对促细胞凋亡细胞因子敏感性的新机制。这些抑制性受体在正常组织内的优先表达表明,TRAIL可以用作诱导癌细胞细胞凋亡的同时保护正常细胞的抗癌剂(Marsters等,1999)。
在引入细胞毒性化学治疗药物之后开展癌症治疗中存在许多进步。然而,化学治疗的后果之一是药物抗性表型的产生/获得和多药耐药的产生。药物抗性的产生仍然是此类肿瘤治疗的主要障碍,并且因此明显需要替代方法,例如基因治疗。
用于与化学治疗、放射治疗或生物治疗联合的另一种形式的治疗包括过热治疗,其为将患者组织暴露于高温(一直到106°F)下的方法。外部或内部加热装置可用于局部、区域或全身过热治疗应用中。局部过热治疗包括向小的区域例如肿瘤应用热治疗。加热可以用来自体外设备的靶向肿瘤的高频波在外部产生。内部加热可涉及无菌探针,包括细的经加热的导线或者充满热水的中空管、植入的微波天线或射频电极。
对于区域治疗,将患者器官或者肢体加热,这使用产生高能量的装置如磁体实现。备选地,患者的一些血液被取出,并且在灌注入将被内部加热的区域之前加热。在癌症扩散至全身的情况下,也可以进行全身加热。热水毯、热蜡、感应线圈和热室可用于此目的。
激素治疗也可以用于与本发明联合,或者与先前所述的其他癌症治疗相组合。激素可用于治疗某些癌症,例如乳腺癌、前列腺癌、卵巢癌或宫颈癌,以降低某些激素的水平或者阻断某些激素的效应,例如睾酮或雌激素。该种治疗常常用于与至少一种其他癌症治疗向组合作为一种治疗选择或者降低转移风险。
于2006年2月8日提出的、要求2005年2月8日所提出美国临时申请序列号60/650,807的优先权的美国申请序列号11/349,727在此通过参考全部并入本申请。
III.miRNA分子
关于微RNA分子(“miRNA”)虽然已经有19个核苷酸和一直到23个核苷酸长度的报道,但是其长度通常为21至22个核苷酸。miRNA各自从更长的前体RNA分子(“前体miRNA”)加工而来。前体miRNA从非蛋白质编码基因转录而来。前体miRNA具有两个互补区域,使得其能够形成茎-环样结构或者折回样结构,该结构在动物中由称作切酶的核糖核酸酶III样核酸酶切开。所加工的miRNA有代表性地是部分茎。
所加工miRNA(也被称为“成熟miRNA”)变成大复合体的一部分以下调特定靶基因或其基因产物。动物miRNA实例包括与靶不完全碱基配对的那些,其使翻译停止(Olsen等,1999;Seggerson等,2002)。siRNA分子也是由切酶加工,但是是从长的双链RNA分子加工而来。siRNA非天然存在于动物细胞中,但是它可以通过RNA诱导的沉默复合体(RISC)指导mRNA靶的序列特异性切割(Denli等,2003)。
A.阵列制备
本发明某些实施方案涉及mRNA或核酸阵列、miRNA或核酸阵列和/或miRNA或核酸探针阵列的制备和用途,其是核酸分子(探针)的巨阵列或微阵列,所述核酸分子(探针)与衍生自由miR-20miRNA所调节多种基因和基因途径的多个核酸、mRNA或miRNA分子、前体miRNA分子或核酸具有完全或几乎完全的互补性(在探针的整个长度上)或同一性(在探针的整个长度上),并且以空间分开的组织结构置于支持物或支持材料上。巨阵列有代表性地是其上已经点有探针的硝酸纤维素或尼龙板。微阵列更紧密地放置核酸探针,以致于在典型的1-4平方厘米的区域内可以固定至多10,000种核酸分子。微阵列可以通过将核酸分子例如基因、寡核苷酸等点在基质上或者通过在基质上原位构建寡核苷酸序列来制造。所点的或者所构建的核酸分子可以以每平方厘米至多大约30种非相同核酸分子的高密度基质模式或者更高密度的基质模式,例如每平方厘米至多大约100或者甚至1000种的基质模式应用。与滤膜阵列的基于硝酸纤维素的材料不同,微阵列有代表性地使用包被玻璃作为固体支持物。因具有标记RNA和/或miRNA-互补核酸样品的有序阵列,每一样品的位置可以被追踪并且可以与原始样品联系起来。
在其中多个不同核酸探针稳定结合在固体支持物表面的多种不同的阵列装置是本领域技术人员已知的。对于阵列有用的基质包括尼龙、玻璃、金属、塑料、乳胶和硅。此类阵列可以多种不同方式变化,包括平均探针长度、探针序列或类型、探针和阵列表面结合的性质,例如共价或非共价等。在对于除了探针之外的任何参数的疗效上,本发明的标记和筛选方法和阵列不限于检测miRNA或基因或者代表基因的核酸;因此,方法和组合物可以用于多种不同类型的核酸阵列。
用于制备微阵列的代表性方法和仪器已经描述于例如美国专利5,143,854、5,202,231、5,242,974、5,288,644、5,324,633、5,384,261、5,405,783、5,412,087、5,424,186、5,429,807、5,432,049、5,436,327、5,445,934、5,468,613、5,470,710、5,472,672、5,492,806、5,525,464、5,503,980、5,510,270、5,525,464、5,527,681、5,529,756、5,532,128、5,545,531、5,547,839、5,554,501、5,556,752、5,561,071、5,571,639、5,580,726、5,580,732、5,593,839、5,599,695、5,599,672、5,610;287、5,624,711、5,631,134、5,639,603、5,654,413、5,658,734、5,661,028、5,665,547、5,667,972、5,695,940、5,700,637、5,744,305、5,800,992、5,807,522、5,830,645、5,837,196、5,871,928、5,847,219、5,876,932、5,919,626、6,004,755、6,087,102、6,368,799、6,383,749、6,617,112、6,638,717、6,720,138,以及WO 93/17126、WO 95/11995、WO 95/21265、WO 95/21944、WO 95/35505、WO 96/31622、WO97/10365、WO 97/27317、WO 99/35505、WO 09923256、WO 09936760、WO0138580、WO 0168255、WO 03020898、WO 03040410、WO 03053586、WO03087297、WO 03091426、WO03100012、WO 04020085、WO 04027093、EP 373203、EP 785 280、EP 799 897和UK 8 803 000中;其公开全部通过参考并入本文。
可以预期到的是阵列可以是高密度阵列,抑制它们包含2、20、25、50、80、100或更多种不同探针。可以预期到的是它们可以包含1000、16,000、65,000、250,000或1,000,000或更多种不同探针。探针可以针对一个或一个以上不同生物体或者细胞类型中的mRNA和/或miRNA靶。在一些实施方案中,寡核苷酸探针长度范围从5至50、5至45、10至40、9至34或10至40个核苷酸。在某些实施方案中,寡核苷酸探针长度为5、10、15、20至20、25、30、35、40个核苷酸,包括它们之间的所有整数和范围。
通常已知阵列中每一不同探针序列的位置和序列。然而,大数量的不同探针可以占用相对小的面积,提供了高密度阵列,其具有通常大于每平方厘米60、100、600、1000、5,000、10,000、40,000、100,000或400,000种不同寡核苷酸探针的探针密度。阵列的表面积可以是大约或者小于大约1、1.6、2、3、4、5、6、7、8、9或10cm2
然而,本领域普通技术人员可以容易地分析使用阵列产生的数据。此类方法描述于上文并且包括在WO 9743450、WO 03023058、WO 03022421、WO03029485、WO 03067217、WO 03066906、WO 03076928、WO 03093810、WO03100448A1中找到的信息,所有这些明确地通过参考并入本文。
B.样品制备
可以预期到的是广泛多种样品的RNA和/或miRNA可以使用本发明的阵列、探针索引(index of probe)或阵列技术分析。虽然可以预期到的是内源miRNA与本发明组合物和方法,重组一起使用,但是miRNA,包括与内源miRNA或前体miRNA互补或相同的核酸也可以如本文所述处理和分析。样品可以是生物学样品,在此情况下,它们可以来自活组织检查、细针抽取物、表皮脱落物、血液、组织、器官、精液、唾液、眼泪、其他体液、毛囊、皮肤或包含生物细胞,特别是癌细胞或高增生性细胞或由其组成的任何样品。在某些实施方案中,样品可以是,但不限于,活组织检查或从活组织检查或其他体液或组织纯化或富集一定程度的细胞。备选地,样品可以不是生物学样品,而是化学混合物,例如无细胞的反应混合物(其可以包含一种或一种以上的生物酶)。
C.杂交
当制备阵列或一组探针和/或标记样品中的核酸或探针之后,靶核酸群体在杂交条件下与阵列或探针接触,其中此种条件可以按所期望那样调整,以针对待开展的特定分析提供最佳特异性水平。适宜杂交条件是本领域技术人员众所周知的综述于Sambrook等(2001)和WO 95/21944中。在许多实施方案中特别感兴趣的是在杂交过程中使用严格条件。严格条件是本领域技术人员已知的。
特别考虑的是单个阵列或探针组可以与多个样品接触。样品可以用不同的标记物标记以区别样品。例如,单个阵列可以与用Cy3标记的肿瘤组织样品和用Cy5标记的正常组织样品接触。对于样品中对应于阵列上探针的特定miRNA之间的差异可以容易地确定和定量。
小的阵列表面积使得杂交条件一致,例如温度调节和盐含量。此外,由于高密度阵列占用的面积小,杂交可以在非常小的流体体积(例如大约250μl或更少,包括大约或少于大约5、10、25、50、60、70、80、90、100μl的体积或从其中导出的任何范围)中开展。在小的体积中,杂交可以非常快速地进行。
D.差异表达分析
本发明的阵列可以用于检测两个样品之间的差异。特别考虑的应用包括鉴定和/或定量正常样品与非正常样品之间、疾病或状况与未表现出此种疾病或状况的细胞之间、或者两个不同处理样品之间的miRNA或基因表达差异。同样,可以比较据信易患特定疾病或状况的样品与据信不易患或者抵抗该疾病或状况的样品之间的miRNA或基因表达。非正常的样品是表现出疾病或状况表型或遗传型性状的样品或者据信就该疾病或状况而言为非正常的样品。其可以与就该疾病或状况而言为正常的细胞比较。表型性状包括疾病或状况的症状或易感性,其中一项是、或者可以是、或者可以不是遗传的或者由一个或多个高增生性或肿瘤细胞引起。
阵列包含带有连接至支持物上的核酸探针的固体支持物。阵列有代表性地包含多种不同的核酸探针,其以不同的、已知的位置偶联至基质表面。这些阵列,也描述为“微阵列”或通俗语“芯片”,也已经在本领域中广泛描述,例如美国专利5,143,854、5,445,934、5,744,305、5,677,195、6,040,193、5,424,186和Fodor等(1991),为了所有目的其中每一篇文献的全文通过参考并入本文。使用机械合成方法合成这些阵列的技术描述于,例如美国专利5,384,261,为了所有目的其全文通过参考并入本文。虽然在某些方面使用平面阵列表面,阵列可以在实际上任何形状的表面或者甚至复杂表面上制造。阵列可以是珠、凝胶、多聚体表面、纤维如光纤、玻璃或任何其他适宜基质上的核酸,见美国专利5,770,358、5,789,162、5,708,153、6,040,193和5,800,992,为了所有目的其全文通过参考并入本文。阵列可如此方式包装,以便于诊断和所有内含装置的其他操作,见例如美国专利5,856,174和5,922,591,为了所有目的其全文通过参考并入本文。对于阵列、其制造和其特性有关的额外信息,还可见于2000年4月7日提出的美国专利申请序列号09/545,207,为了所有目的其全文通过参考并入本文。
特别地,阵列可以用于评估样品的病理状况,例如癌症和相关状况。特别考虑的是,本发明可以用于评估疾病各期或亚分类之间的差异,例如良性、癌性和转移组织或肿瘤之间。
待评估的表型性状包括特征,例如寿命、发病率、期望存活率、对特定药物或治疗性治疗的易感性或感受性(药物疗效)和药物毒性危险。其表型性状不同的样品也可以使用所述的组合物和方法评估。
在某些实施方案中,可产生miRNA和/或表达谱,以评估并将这些表达谱与药代动力学或治疗关联。例如,可以产生并评估患者被治疗前的或者治疗过程当中的患者肿瘤和血液样品的这些表达谱,以确定是否存在其表达与患者治疗结果关联的miRNA或基因。差异miRNA或基因的鉴定可用于诊断分析,以评定肿瘤和/或血液样品以确定将向患者提供什么样的药物方案。此外,其可以用于鉴定或者选择适宜特定临床试验的患者。如果经确定表达谱与药物疗效或药物毒性相关,则该表达谱与患者是否是接受药物、接受药物组合或者药物特定剂量的适宜患者相关。
除了上述预后分析之外,来自患有多种疾病的患者的样品可评估以确定不同的疾病是否可以基于miRNA和/或相关基因表达水平鉴定。可以基于谱进行诊断分析,医生可以使用该谱鉴定患有疾病的个体或者鉴定谁处于发展成疾病的危险之中。备选地,可以基于miRNA谱分析设计治疗方案。此类方法和组合物的实例描述于2005年5月23日提出的、题目为“包括miRNA和miRNA抑制剂分子的方法和组合物”的美国临时专利申请中,其全文通过参考并入本文。
E.其他分析法
除了使用阵列和微阵列之外,可以预期到的是许多不同的分析法可用于分析miRNA或相关基因、它们的活性和它们的作用。此类分析法包括,但不限于,核酸扩增、聚合酶链反应、定量PCR、RT-PCR、原位杂交、Northern杂交、杂交保护分析法(HPA)(GenProbe)、分支DNA(bDNA)分析法(Chiron)、滚环扩增(RCA)、单分子杂交检测(US Genomics)、侵染检测(ThirdWave Technologies)和/或Bridge Litigation分析法(Genaco)。
IV.核酸
本发明涉及可标记、用于阵列分析或者用于诊断、治疗或预后应用中的核酸、修饰或模拟核酸、miRNA、mRNA、基因和其代表性片段,特别是与病理状况如癌症相关的那些。分子可以是细胞内源产生的或者是化学或重组合成的或产生的。它们可以是分离的和/或纯化的。每一miRNA在本文描述并且包括这些miRNA序列相应的序列标识号SEQ ID NO和登录号。miRNA名称常以无“hsa-”前缀的形式缩写或提到,并且将依赖于上下文语境作如此理解。除非另外指出,在本申请中miRNA指鉴定为miR-X或let-X的人序列,其中X是数字和/或字母。
在某些方面,可以使用通过后缀“5P”或“3P”指定的miRNA探针。如在万维网sanger.ac.uk上描述的那样,“5P”指成熟miRNA衍生自前体的5’端,并且对应的“3P”指其衍生自前体的3’端,如在万维网sanger.ac.uk所述。此外,在一些实施方案中,使用了与已知人miRNA不对应的miRNA探针。可以预期到的是这些非人miRNA探针可以用于本发明实施方案中或者存在与非人miRNA同源的人miRNA。在其他实施方案中,可以采用任何哺乳动物细胞、生物学样品或其制备物。
在本发明的一些实施方案中,包含miRNA的方法和组合物可以涉及miRNA、标记物(mRNA)和/或其他核酸。核酸长度可以是、是至少或是至多3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、31、32、33、34、35、36、37、38、39、40、41、42、43、44、45、46、47、48、49、50、51、52、53、54、55、56、57、58、59、60、61、62、63、64、65、66、67、68、69、70、71、72、73、74、75、76、77、78、79、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、99、100、101、102、103、104、105、106、107、108、109、110、120、130、140、150、160、170、180、190、200、210、220、230、240、250、260、270、280、290、300、310、320、330、340、350、360、370、380、390、400、410、420、430、440、450、460、470、480、490、500、510、520、530、540、550、560、570、580、590、600、610、620、630、640、650、660、670、680、690、700、710、720、730、740、750、760、770、780、790、800、810、820、830、840、850、860、870、880、890、900、910、920、930、940、950、960、970、980、990、或1000个核苷酸或从其中导出的任何范围。此长度涵盖了加工miRNA、miRNA探针、前体miRNA、包含miRNA的载体、mRNA、mRNA探针、对照核酸和其他探针和引物的长度。
在许多实施方案中,miRNA长度为19-24个核苷酸,而miRNA探针长度为19-35个核苷酸,这取决于加工miRNA和所加入的任何侧翼区域的长度。在人中,miRNA前体通常在62和110个核苷酸之间。
本发明核酸可以具有与另一核酸相同或互补的区域。可以预期到的是互补性或同源性区域可以是至少5个连续残基,可是特别考虑的是该区域是、是至少或是至多6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、31、32、33、34、35、36、37、38、39、40、41、42、43、44、45、46、47、48、49、50、51、52、53、54、55、56、57、58、59、60、61、62、63、64、65、66、67、68、69、70、71、72、73、74、75、76、77、78、79、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、99、100、110、120、130、140、150、160、170、180、190、200、210、220、230、240、250、260、270、280、290、300、310、320、330、340、350、360、370、380、390、400、410、420、430、440、441、450、460、470、480、490、500、510、520、530、540、550、560、570、580、590、600、610、620、630、640、650、660、670、680、690、700、710、720、730、740、750、760、770、780、790、800、810、820、830、840、850、860、870、880、890、900、910、920、930、940、950、960、970、980、990、或1000个连续核苷酸。应当进一步理解的是,前体miRNA或其他核酸内的互补性长度或者miRNA探针与miRNA或miRNA基因之间的互补性长度是如此长度。而且,互补性可以表示为百分数,意思是在整个探针长度上探针与其靶之间的互补性是90%或者更高。在一些实施方案中,互补性是或者是至少90%、95%或100%。具体而言,如此长度可以适用于包含SEQ ID NO:1至SEQID NO:269中任何序列、登录号或本文所公开的任何其他序列所确定核酸序列的核酸。有代表性地,提供miRNA的通用名称(在前缀中带有其鉴定来源,例如,对于人序列为“hsa”)和加工miRNA序列。除非另外指出,不带前缀的miRNA将理解为指人miRNA。此外,miRNA名称中的小写字母可以小写也可以不小写;例如,hsa-mir-130b也可以被称为miR-130B。术语“miRNA探针”指可鉴定特定miRNA或结构相关miRNA的核酸探针。
应当理解,一些核酸衍生自基因组序列或基因。在该方面,对于特定miRNA或基因,术语“基因”为简单起见用于指编码前体核酸或miRNA的基因组序列。然而,本发明实施方案可以包含在其表达中涉及的miRNA基因组序列,例如启动子或其他调节序列。
术语“重组体”可以使用,并且该术语通常指已被体外操作的分子或者此种分子的复制或表达产物。
术语“核酸”是本领域众所周知的。如本文所使用,“核酸”通常指DNA、RNA分子(一个或一个以上的链)或包含核碱基的其衍生物或类似物。核碱基包括,例如在DNA(例如腺嘌呤“A”、鸟嘌呤“G”、胸腺嘧啶“T”或胞嘧啶“C”)或RNA(例如A、G、尿嘧啶“U”或C)中天然存在的嘌呤或嘧啶碱基。术语“核酸”包含术语“寡核苷酸”和“多核苷酸”,术语“寡核苷酸”和“多核苷酸”每一个都是术语“核酸”的亚属。
术语“miRNA”通常指单链分子,但是在特别的实施方案中,在本发明中应用的分子还将包含一个与同一单链分子的另一个区域或者另一个核酸部分互补(在整个链长度上具有10和50%之间的互补性)、基本互补(在整个链长度上具有大于50%但小于100%的互补性)或完全互补的区域或额外链。因此,miRNA可包含含有特定序列的一个或一个以上互补链或自身互补链或“互补物”的分子。例如,前体miRNA可具有自身互补区域,其一直到100%的补体性。本发明的miRNA探针或核酸与其靶的互补性可以包括、可以是、可以是至少60、65、70、75、80、85、90、95、96、97、98、99或100%互补性。
应当理解,本发明的“合成核酸”意思是指核酸不具有天然存在核酸的全部或部分化学结构或序列。因此,应当理解的是,术语“合成miRNA”指在细胞中或者在生理条件下作为天然存在miRNA起作用的“合成核酸”。
虽然本发明实施方案可包括合成miRNA或合成核酸,但是在本发明的一些实施方案中,核酸分子无需是“合成”的。在某些实施方案中,在本发明方法和组合物中采用的非合成核酸或miRNA可以具有天然存在mRNA或miRNA前体或成熟mRNA或miRNA的全部序列和结构。例如,在本发明方法和组合物中使用的非合成miRNA可以不具有一个或一个以上修饰核苷酸或核苷酸类似物。在这些实施方案中,非合成miRNA可以是或可以不是重组产生的。在特定实施方案中,在本发明方法和/或组合物中的核酸特别是合成miRNA,而不是非合成miRNA(即不是“合成”的miRNA);可以在其他实施方案中,本发明特别包含非合成miRNA,而不包含合成miRNA。就合成miRNA的使用而言讨论的任何实施方案可以适用于非合成miRNA,反之亦然。
应当理解的是,术语“天然存在”指在没有任何人介入的有机体中存在的事物;它可以指天然存在的野生型或突变体分子。在一些实施方案中,合成miRNA分子不具有天然存在miRNA分子的序列。在其他实施方案中,合成miRNA分子可以具有天然存在miRNA分子的序列,但是分子的化学结构,特别是与精确序列特别不相关的部分中的化学结构(非序列化学结构)不同于具有该序列的天然存在miRNA分子的化学结构。在一些情况下,合成miRNA具有序列化学结构和天然存在miRNA中不存在的非序列化学结构。然而,合成分子的序列能鉴别哪一个miRNA将被有效提供或被抑制;内源miRNA被称为“对应miRNA”。可以在本发明情况下使用的相应miRNA序列包括,但不限于,SEQ ID NO:1-269中那些序列的全部或部分以及任何其他miRNA序列、miRNA前体序列或其任何互补序列。在一些实施方案中,序列是、或衍生自、或包含本文所鉴定靶向特定miRNA(或一组miRNA)的序列的全部或部分,所述特定miRNA(或一组miRNA)可以与序列一起使用。可以选择任意1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、30、40、50、60、70、80、90、100、110、120、130、140、150、160、170、180、190、200、210、220、230、240、250、260种或它们之间任意数量或范围的序列,而排除所有非选择序列。
如本文所使用,“杂交作用”、“杂交”或“能够杂交”理解为意思是指形成双链或三链分子或者具有部分双链或三链性质的分子。如本文所使用的术语“退火”是“杂交”的同义词。术语“杂交作用”、“杂交”或“能够杂交”包括术语“严格条件”或“高严格性”和术语“低严格性”或“低严格条件”。
如本文所使用的“严格条件”或“高严格性”是允许包含互补序列的一个或一个以上核酸链之间或之内杂交但排除随机序列杂交的那些条件。严格条件允许核酸与靶链之间有少量错配,如果存在的话。此类条件是本领域普通技术人员众所周知的,并且对于需要高选择性的应用是优选的。非限定性的应用包括分离核酸,例如基因或其核酸片段或者检测至少一个特异性mRNA转录物或其核酸片段,等等。
严格条件可以包括低盐和/或高温度条件,例如在大约42℃至大约70℃温度下大约0.02M至大约0.5M NaCl所提供的条件。应当理解,期望的严格性的温度和离子强度部分地通过特定核酸的长度、靶序列的长度和核碱基内容、核酸的电荷组成以及杂交混合物中甲酰胺、四甲基氯化铵或其他溶剂的存在或浓度决定。
还应当理解,对于杂交的这些范围、组成和条件仅仅是以非限定性实例的方式描述,并且对于特定杂交反应的预期严格性常常通过比较一个或一个以上阳性或阴性对照经验性确定。取决于所拟想的应用,优选采用变化的杂交条件以实现核酸对靶序列的不同程度的选择性。在非限定性实例中,对在严格条件下不与核酸杂交的相关靶核酸的鉴定可以通过在低温度和/或高离子强度下杂交完成。此类条件称作“低严格性”或“低严格条件”,并且低严格性的非限定性实例包括在大约20℃至大约50℃的温度范围内在大约0.15M至大约0.9M NaCl情况下进行杂交。当然,进一步修改低或高严格条件以适合特定应用处于本领域技术人员的能力范围内。
A.核碱基、核苷、核苷酸和修饰核苷酸
如本文所使用的“核碱基”指杂环碱基,例如诸如在至少一种天然存在核酸(即DNA和RNA)中存在的天然存在核碱基(即A、T、G、C或U),和此类核碱基的天然或非天然存在衍生物和类似物。核碱基通常可以与至少一个天然存在核碱基以这样一种方式形成一个或一个以上氢键(“退火”或“杂交”),即其可以代替天然存在的核碱基配对(例如A和T、G和C以及A和U之间的氢键)。
“嘌呤”和/或“嘧啶”核碱基包含天然存在嘌呤和/或嘧啶核碱基以及其衍生物和类似物,包括但不限于,嘌呤或嘧啶被一个或一个以上烷基、羧烷基、氨基、羟基、卤素(即氟、氯、溴或碘)、巯基或烷硫基部分取代的那些。优选的烷基(例如烷基、羧烷基等)部分包含大约1、大约2、大约3、大约4、大约5、至大约6个碳原子。嘌呤或嘧啶的其他非限定性实例包括脱氮嘌呤、2,6-二氨基嘌呤、5-氟尿嘧啶、黄嘌呤、次黄嘌呤、8-溴鸟嘌呤、8-氯鸟嘌呤、溴胸腺嘧啶、8-氨基鸟嘌呤、8-羟基鸟嘌呤、8-甲基乌嘌呤、8-硫乌嘌呤、氮乌嘌呤、2-氨基嘌呤、5-乙基胞嘧啶、5-甲基胞嘧啶、5-溴尿嘧啶、5-乙基尿嘧啶、5-碘尿嘧啶、5-氯尿嘧啶、5-丙基尿嘧啶、硫尿嘧啶、2-甲基腺嘌呤、甲基硫腺嘌呤、N,N-二甲腺嘌呤、氮杂腺嘌呤、8-溴腺嘌呤、8-羟基腺嘌呤、6-羟基氨基嘌呤、6-硫嘌呤、4-(6-氨基己基/胞嘧啶)等。其他实例是本领域技术人员众所周知的。
如本文所使用,“核苷”指包含共价连接至核碱基接头部分的核碱基的单个化学单位。“核碱基接头部分”的非限定性实例是包含5-碳原子的糖(即“5-碳糖”),包括但不限于脱氧核糖、核糖、阿拉伯糖或5-碳糖的衍生物或类似物。5-碳糖衍生物或类似物的非限定性实例包括2′-氟-2′-脱氧核糖或者其中糖环中的氧原子被碳取代的碳环糖。核碱基与核碱基接头部分的不同类型共价连接是本领域已知的(Kornberg和Baker,1992)。
如本文所使用,“核苷酸”指还包含“骨架部分”的核苷。骨架部分通常共价连接核苷酸至包含核苷酸的另一分子或者共价连接至另一核苷酸以形成核酸。天然存在核苷酸中的“骨架部分”有代表性地包含共价连接至5-碳糖的磷部分。骨架部分的连接有代表性地发生在5-碳糖的3′-位或者5′-位。然而,其他类型的连接是本领域已知的,特别是当核苷酸包含天然存在5-碳糖或磷部分的衍生物或类似物时。
核酸可以包含天然存在核酸中存在的核碱基、核碱基接头部分和/或骨架部分的衍生物或类似物,或完全由其组成。带有核酸类似物的RNA也可以根据本发明方法标记。如本文所使用的“衍生物”指化学修饰或改变形式的天然存在分子,而术语“模拟物”或“类似物”指结构上类似或者不类似于天然存在分子或部分,但具有相似功能的分子。如本文所使用,“部分”通常指较大化学或分子结构的较小化学或分子成分。核碱基、核苷和核苷酸类似物或衍生物是本领域众所周知的,并且已经描述(见例如,Scheit,1980,通过参考并入本文)。
核苷、核苷酸或核酸的另外非限定性实例包括美国专利5,681,947、5,652,099和5,763,167、5,614,617、5,670,663、5,872,232、5,859,221、5,446,137、5,886,165、5,714,606、5,672,697、5,466,786、5,792,847、5,223,618、5,470,967、5,378,825、5,777,092、5,623,070、5,610,289、5,602,240、5,858,988、5,214,136、5,700,922、5,708,154、5,728,525、5,637,683、6,251,666、5,480,980和5,728,525中的那些,每一篇的全文通过参考并入本文。
本发明的标记方法和实际盒特别可以预期到的是核苷酸的使用,核苷酸被修饰以连接标记并且可以掺入到miRNA分子中。此类核苷酸包括可以用染料,包括荧光染料或者用分子,例如生物素标记的那些核苷酸。可容易地得到标记的核苷酸;它们可以商业性获得或者它们可以通过本领域技术人员已知的反应合成。
用于本发明的修饰核苷酸不是天然存在核苷酸,而是在其上具有反应部分的制备的核苷酸。感兴趣的特异性反应官能团包括:氨基、巯基、烷基磺酰氧基(sulfoxyl)、氨基巯基、叠氮基、环氧化物、异硫氰酸酯、异氰酸酯、酐、一氯三嗪、二氯三嗪、一卤或二卤取代吡啶、一取代或二取代二嗪、马来酰亚胺、环氧化物、氮丙啶、磺酰卤、卤酸、烷基卤、芳基卤、烷基磺酸盐、N-羟基琥珀酰亚胺酯、亚氨酸酯、肼、叠氮基硝基苯基、叠氮化物、3-(2-吡啶基二硫代)-丙酰胺、乙二醛、醛、碘乙酰、氰甲基酯、p-硝基苯基酯、o-硝基苯基酯、羟基吡啶酯、羰基咪唑和其他此类化学基团。在一些实施方案中,反应官能团可以与核苷酸直接键合或其可以通过连接基团与核苷酸连接。功能性部分和任何接头基本上不损伤核苷酸被添加至miRNA或者被标记的能力。代表性的连接基团包括含碳连接基团,有代表性地从大约2至18、通常从大约2至8个碳原子,其中含碳连接基团可以包括或者可以不包括一个或一个以上杂原子,如S、O、N等,并且可以包括或者可以不包括一个或一个以上不饱和位点。在许多实施方案中特别感兴趣的是烷基连接基团,有代表性的是1至16个、通常1至4个碳原子的低碳烷基胺连接基团,其中连接基团可以包括一个或一个以上不饱和位点。在上述官能化靶产生的方法中使用的官能化核苷酸(或引物)可以使用已知方法制造或者从供货商,例如Sigma、Roche、Ambion、Biosearch Technologies和NEN购买。官能团可以根据本领域技术人员已知的方式制备,包括美国专利4,404,289;4,405,711;4,337,063和5,268,486以及英国专利1,529,202中的代表性信息,每一专利通过参考并入本文。
在本发明的几个实施方案中使用胺修饰的核苷酸。胺修饰的核苷酸是带有用于连接标记的活性胺基的核苷酸。可以预期到的是任何核糖核苷酸(G、A、U或C)或脱氧核糖核苷酸(G、A、T或C)可以被修饰以便标记。实例包括,但不限于,下列修饰核糖核苷酸和脱氧核糖核苷酸:5-(3-氨基烯丙基)-UTP;8-[(4-氨基)丁基]-氨基-ATP和8-[(6-氨基)丁基]-氨基-ATP;N6-(4-氨基)丁基-ATP、N6-(6-氨基)丁基-ATP、N4-[2,2-氧-双-(乙基胺)]-CTP;N6-(6-氨基)己基-ATP;8-[(6-氨基)己基]-氨基-ATP;5-炔丙基氨基-CTP、5-炔丙基氨基-UTP;5-(3-氨基烯丙基)-dUTP;8-[(4-氨基)丁基]-氨基-dATP和8-[(6-氨基)丁基]-氨基-dATP;N6-(4-氨基)丁基-dATP、N6-(6-氨基)丁基-dATP、N4-[2,2-氧-双-(乙基胺)]-dCTP;N6-(6-氨基)己基-dATP;8-[(6-氨基)己基]-氨基-dATP;5-炔丙基氨基-dCTP和5-炔丙基氨基-dUTP。此类核苷酸可以根据本领域技术人员已知的方法制备。然而,本领域普通技术人员可以制备具有同样胺修饰的其他核苷酸部分,例如5-(3-氨基烯丙基)-CTP、5-(3-氨基烯丙基)-GTP、5-(3-氨基烯丙基)-ATP、5-(3-氨基烯丙基)-dCTP、5-(3-氨基烯丙基)-dGTP、5-(3-氨基烯丙基)-dTTP或代替5-(3-氨基烯丙基)-UTP的5-(3-氨基烯丙基)-dUTP。
B.核酸制备
核酸可以通过本领域普通技术人员已知的任何技术制备,例如化学合成、酶促生产或生物学生产。特别考虑的是,化学合成本发明的miRNA探针。
在本发明的一些实施方案中,miRNA从生物学样品中回收或分离。miRNA可以是重组体或者其可以细胞天然的或内源的(从细胞基因组产生)。可以预期到的是,生物学样品可以以增强小的RNA分子例如miRNA回收的方式处理。美国专利申请序列号10/667,126描述了此类方法并且该文献明确地通过参考并入本文。通常,方法包括以含有胍和去污剂的溶液裂解细胞。
备选地,核酸合成根据标准方法开展。见例如,Itakura和Riggs(1980)以及美国专利4,704,362、5,221,619和5,583,013,每一文献通过参考并入本文。合成核酸(例如合成寡核苷酸)的非限定性实例包括使用例如描述于EP 266,032(通过参考并入本文)中的磷酸三酯、亚磷酸盐或亚磷酰胺化学和固相技术,或者如Froehler等,1986和美国专利5,705,629(每一文献通过参考并入本文)中所述经由脱氧核苷H-膦酸酯中间体通过体外化学合成制造的核酸。寡核苷酸合成的多种不同机制已经描述于例如美国专利4,659,774、4,816,571、5,141,813、5,264,566、4,959,463、5,428,148、5,554,744、5,574,146、5,602,244中,每一专利通过参考并入本文。
酶促生产核酸的非限定性实例包括在扩增反应如PCRTM中通过酶产生的核酸(见例如美国专利4,683,202和4,682,195,每一专利通过参考并入本文)或者描述于美国专利5,645,897(通过参考并入本文)中的寡核苷酸的合成。还可见Sambrook等,2001,其通过参考并入本文。
寡核苷酸合成是本领域技术人员众所周知的。寡核苷酸合成的多种不同机制已经描述于例如美国专利4,659,774、4,816,571、5,141,813、5,264,566、4,959,463、5,428,148、5,554,744、5,574,146、5,602,244中,每一专利通过参考并入本文。
用于在细胞中产生核酸的重组方法是本领域技术人员众所周知的。这些方法包括使用载体(病毒和非病毒载体)、质粒、粘粒和其他载体递送核酸至细胞,细胞可以是靶细胞(例如癌细胞)或者只是宿主细胞(以生产大量的目的RNA分子)。备选地,此类载体可以用于无细胞系统情况下,只要存在用于产生RNA分子的试剂即可。此类方法包括描述于Sambrook,2003,Sambrook,2001和Sambrook,1989中的那些,每一文献通过参考并入本文。
C.核酸分离
核酸可以使用本领域技术人员众所周知的技术分离,但是在特定实施方案中,可以采用用于分离小的核酸分子和/或分离RNA分子的方法。层析是常常使用从蛋白质或从其他核酸中分开或分离核酸的方法。此类方法可以包括胶基质电泳、过滤柱、乙醇沉淀和/或其他层析。如果打算使用或评估来自细胞的miRNA,方法通常包括在开展分离特定群体RNA的方法之前,用离液剂(例如异硫氰酸胍)和/或去污剂(例如N-月桂酰基肌氨酸盐)裂解细胞。
在用于从其他核酸中分离miRNA的特定方法中,虽然也可以使用琼脂糖制备凝胶基质,但是凝胶基质用聚丙烯酰胺制备。凝胶可以是浓度梯度的或者是浓度均匀的。板或管可用于容纳用于电泳的凝胶基质。对于核酸分离通常采用一维电泳。板用于制备平板凝胶,而管(代表性的是玻璃或橡胶管)可以用于制备管凝胶。短语“管电泳”指使用管而不是平板形成凝胶。开展管电泳的材料可以由本领域技术人员容易地制备或者从例如C.B.S.Scientific Co.,Inc.或Scie-Plas购买。
方法可以包括使用有机溶剂和/或乙醇以分离核酸,特别是本发明方法和组合物中使用的miRNA。一些实施方案描述于美国专利申请序列号10/667,126中,其通过参考并入本文。通常,该公开提供了从细胞中有效分离小RNA分子的方法,包括:向细胞裂解物中加入乙醇溶液和将醇/裂解物混合物应用在固体支持物上,然后从固体支持物上洗脱RNA分子。在一些实施方案中,加至细胞裂解物的醇的量达到了大约55%至60%的乙醇浓度。虽然可以使用不同的醇类,但是乙醇效果良好。固体支持物可以是任何结构,并且它包括珠、滤纸和柱,其可以包括带有负电基团的矿物支持物或多聚体支持物。玻璃纤维滤膜或柱对于此种分离过程效果特别好。
在特别的实施方案中,miRNA分离方法包括:a)用含胍的裂解溶液裂解细胞样品,其中产生胍浓度至少大约1M的裂解物;b)用含苯酚的提取溶液从裂解物中提取miRNA分子;c)向裂解物加入醇溶液,形成裂解物/醇混合物,其中混合物中乙醇浓度在大约35%至大约70%之间;d)将裂解物/醇混合物加至固体支持物;e)用离子溶液从固体支持物洗脱miRNA分子;和f)收集miRNA分子。有代表性地,样品被干燥并且重悬于适宜后续操作的液体和体积中。
V.标记和标记技术
在一些实施方案中,本发明涉及标记的miRNA。可以预期到的是miRNA可以在标记之前首先被分离和/或纯化。与样品中的其他RNA在标记之前miRNA未分离或纯化相比,这可以完成更有效标记miRNA的反应。在许多本发明实施方案中,标记是非放射性的。通常,通过加入标记核苷酸(一步法)或者加入核苷酸并标记所加入核苷酸(两步法)可以标记核酸。
A.标记技术
在一些实施方案中,通过向核酸催化性添加已经标记的一种或多种核苷酸,将核酸标记。一种或一种以上标记核苷酸可以添加至miRNA分子。见美国专利6,723,509,其通过参考并入本文。
在其他实施方案中,未标记的一种或多种核苷酸催化性添加至miRNA,并且未标记核苷酸用化学部分修饰,化学部分能够使它在以后被标记。在本发明实施方案中,化学部分是活性胺,从而核苷酸是胺修饰核苷酸。胺修饰核苷酸的实例是本领域技术人员众所周知的,许多可以商业获得,例如从Ambion、Sigma、Jena Bioscience和TriLink获得。
与在cDNA合成过程中标记cDNA不同,标记miRNA的问题是如何标记已经存在的分子。本发明涉及能够使用二-或三-磷酸核糖核苷酸或脱氧核糖核苷酸作为底物的酶用于将底物添加至miRNA的用途。此外,在特别的实施方案中,它包括使用修饰的二-或三-磷酸核糖核苷酸,其被添加至miRNA的3’端。能够添加此类核苷酸的酶包括,但不限于,poly(A)聚合酶、末端转移酶和多核苷酸磷酸化酶。在本发明特别的实施方案中,连接酶不是作为用于添加标记的酶考虑的,并且改为采用非连接酶的酶。末端转移酶催化核苷酸添加至核酸3′末端。多核苷酸磷酸化酶可将核苷酸二磷酸聚合,而无需引物。
B.标记
miRNA或miRNA探针上的标记可以是比色的(包括可见光谱和紫外光谱,包括荧光)、发光的、酶的或发射正电子(包括放射性的)的标记。标记可以直接或间接检测。放射性标记包括125I、32P、33P和35S。酶标记实例包括碱性磷酸酶、萤光素酶、辣根过氧化物酶和β半乳糖苷酶。标记也可以是具有发光特性的蛋白质,例如绿色荧光蛋白和藻红蛋白。
考虑用作缀合物的比色和荧光标记包括,但不限于,Alexa Fluor染料,BODIPY染料,例如BODIPY FL;Cascade Blue;Cascade Yellow;香豆素及其衍生物,例如7-氨基-4-甲基香豆素,氨基香豆素和羟基香豆素;花青染料,例如Cy3和Cy5;曙红和赤藓红;荧光素及其衍生物,例如荧光素异硫氰酸酯;镧系离子大环螯合物,例如Quantum DyeTM;Marina Blue;俄勒冈绿;罗丹明染料,例如罗丹明红,四甲基罗丹明红和罗丹明6G;德克萨斯红;荧光能量转移染料,例如噻唑橙-乙啶异二聚体;和TOTAB。
染料的特定实例包括,但不限于,上面鉴定的那些和下列的那些:Alexa Fluor350、Alexa Fluor 405、Alexa Fluor 430、Alexa Fluor 488、Alexa Fluor 500.AlexaFluor 514、Alexa Fluor 532、Alexa Fluor 546、Alexa Fluor 555、Alexa Fluor 568、Alexa Fluor 594、Alexa Fluor 610、Alexa Fluor 633、Alexa Fluor 647、Alexa Fluor660、Alexa Fluor 680、Alexa Fluor 700、和Alexa Fluor 750;活性胺BODIPY染料、例如BODIPY 493/503、BODIPY 530/550、BODIPY 558/568、BODIPY564/570、BODIPY 576/589、BODIPY 581/591、BODIPY 630/650、BODIPY650/655、BODIPY FL、BODIPY R6G、BODIPY TMR、和BODIPY-TR;Cy3、Cy5、6-FAM、荧光素异硫氰酸酯、HEX、6-JOE、俄勒冈绿488、俄勒冈绿500、俄勒冈绿514、太平洋蓝、REG、罗丹明绿、罗丹明红、Renographin、ROX、SYPRO、TAMRA、2′,4′,5′,7′-(四溴砜荧光素)Tetrabromosulfonefluorescein和TET。
荧光标记的核糖核苷酸的特定实例可以从Molecular Probes获得,并且它们包括Alexa Fluor 488-5-UTP、荧光素-12-UTP、BODIPY FL-14-UTP、BODIPYTMR-14-UTP、四甲基罗丹明红-6-UTP、Alexa Fluor 546-14-UTP、德克萨斯红-5-UTP、和BODIPY TR-14-UTP。其他荧光核糖核苷酸可从AmershamBiosciences获得,例如Cy3-UTP和Cy5-UTP。
荧光标记的脱氧核糖核苷酸实例包括二硝基苯基(DNP)-11-dUTP、CascadeBlue-7-dUTP、Alexa Fluor 488-5-dUTP、荧光素-12-dUTP、俄勒冈绿488-5-dUTP、BODIPY FL-14-dUTP、罗丹明绿-5-dUTP、Alexa Fluor 532-5-dUTP、BODIPYTMR-14-dUTP、四甲基罗丹明红-6-dUTP、Alexa Fluor 546-14-dUTP、Alexa Fluor568-5-dUTP、德克萨斯红-12-dUTP、德克萨斯红-5-dUTP、BODIPY TR-14-dUTP、Alexa Fluor 594-5-dUTP、BODIPY 630/650-14-dUTP、BODIPY 650/665-14-dUTP;Alexa Fluor 488-7-OBEA-dCTP、Alexa Fluor 546-16-OBEA-dCTP、Alexa Fluor594-7-OBEA-dCTP、Alexa Fluor 647-12-OBEA-dCTP。
可以预期到的是核酸可以用两种不同标记标记。此外,荧光共振能量转移(FRET)可以在本发明方法中采用(例如Klostermeier等,2002;Emptage,2001;Didenko,2001,每一文献通过参考并入本文)。
备选地,标记可以不是本身可检测性的,而是可间接检测性的或者允许靶向核酸的分离或分选。例如,标记可以是生物素、地高辛配基、多价阳离子、螯合基和其他配体,包括抗体的配体。
C.可视化技术
容易得到用于可视化或者检测所标记核酸的诸多技术。此类技术包括,但不限于,显微术、阵列、荧光分析法、Light cyclers或其他实时PCR仪器、FACS分析、闪烁计数器、磷像仪、盖革计数器、MRI、CAT、基于抗体的检测方法(Western、免疫荧光、免疫组织化学)、组织化学技术、HPLC(Griffey等,1997)、光谱学、毛细管凝胶电泳(Cummins等,1996)、光谱学、质谱、放射性技术和质量平衡技术。
当采用两个或更多个不同颜色的标记时,可采用荧光共振能量转移(FRET)技术以表征一个或一个以上核酸的结合。此外,本领域普通技术人员完全知道可视化、鉴定和表征所标记核酸的方法,因此此类方法可以用作本发明的部分。还可以使用的工具的实例包括荧光显微术、BioAnalyzer、板阅读器、Storm(Molecular Dynamics)、阵列扫描仪、FACS(荧光激活细胞分选)或具有激发和检测荧光分子能力的任何仪器。
VI.试剂盒
本文所述的任何组合物可以包含在试剂盒中。在非限定性实例中,用于分离miRNA、标记miRNA和/或使用阵列、核酸扩增和/或杂交评估miRNA群体的试剂以及用于从血液样品中制备样品的试剂可以包括在试剂盒内。试剂盒可以进一步包括用于产生或合成miRNA探针的试剂。因此,试剂盒将在适宜容器装置中包含用于通过掺入标记核苷酸或未标记核苷酸(随后标记)标记miRNA的酶。在某些方面,试剂盒可包括扩增试剂。在更多方面,试剂盒可包括不同的支持物,例如玻璃、尼龙、多聚体珠等等,和/或用于偶联任何探针和/或靶核酸的试剂。其还可以包括一种或一种以上的缓冲液,例如反应缓冲液、标记缓冲液、洗涤缓冲液或杂交缓冲液,用于制备miRNA探针的化合物,和用于分离miRNA的成分。本发明的其他试剂盒可包括制造包含miRNA的核酸阵列的成分,并且因此可以包括例如固体支持物。
特别考虑了用于开展本文所述本发明方法的试剂盒。在一些实施方案中,为用于制备多重标记miRNA的试剂盒和用于制备miRNA探针和/或miRNA阵列的试剂盒。在这些实施方案中,试剂盒在适宜容器装置包含下列1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12或更多种:(1)poly(A)聚合酶;(2)未修饰核苷酸(G、A、T、C、和/或U);(3)修饰核苷酸(标记或未标记);(4)poly(A)聚合酶缓冲液;和,(5)至少一个微滤膜;(6)可连接至核苷酸的标记;(7)至少一种miRNA探针;(8)反应缓冲液;(9)miRNA阵列或用于制造此阵列的成分;(10)乙酸;(11)醇;(12)用于制备、分离、富集和纯化miRNA或miRNA探针或阵列的溶液。其他试剂包括通常用于处理RNA的那些试剂,例如甲酰胺、上样染料、核糖核酸酶抑制剂和DNA酶。
在特别的实施方案中,本发明的试剂盒包括包含miRNA探针的阵列,如本申请中所描述。阵列可以具有探针,所述探针对应于特定状况下有机体或特定组织或器官的所有已知miRNA或者对应于此类探针的亚组。本发明阵列上的探针亚组可以是或包括经鉴定与特定诊断、治疗或预后应用关联的那些。例如,阵列可包含一种或一种以上探针,所述探针指示或暗示(1)疾病或状况(急性髓性白血病),(2)对特定药物或治疗的易感性或抗性;(3)对药物或物质毒性的易感性;(4)疾病或状况进展或严重性的分级(预后);和(5)对疾病或状况的遗传易感性。
对于包括阵列的任何试剂盒实施方案,可以存在包含或可用于扩增下述序列的核酸分子,所述序列是任何SEQ ID NO:1-267的全部或部分序列的变体、或与之相同或互补。在某些实施方案中,本发明的试剂盒或阵列可包含用于SEQID NO:1-267所确定miRNA的一种或一种以上探针。上述的任何核酸可作为试剂盒的部分应用。
试剂盒的成分可以在水介质中包装或者以冻干形式包装。试剂盒的容器装置通常包括至少一个小瓶、试管、烧瓶、瓶、注射器或其他容器装置,成分可以包装在这些容器中并且优选地适当等分包装在这些容器中。在试剂盒中包含一种以上成分的情况下(标记试剂和标记可以包装在一起),试剂盒还通常包含第二、第三或者其他额外容器,额外的成分可以分开置于这些容器中。然而,可以在小瓶中包含成分的多种组合。本发明试剂盒还代表性地包括包含核酸的装置和商业销售的任何其他密闭的试剂容器。此类容器可包括注塑或吹塑容器,在所述容器中放置期望的小瓶。
当试剂盒的成分以一种和/或更多种液体溶液提供时,液体溶液是水溶液,特别优选无菌水溶液。
然而,试剂和成分可以作为干粉提供。当试剂和/或成分作为干粉提供时,可以通过加入适宜溶剂将粉末重构。可以预期到的是,溶剂还可在另一容器装置中提供。在一些实施方案中,标记染料作为干的粉末提供。可以预期到的是在本发明试剂盒中提供10、20、30、40、50、60、70、80、90、100、120、120、130、140、150、160、170、180、190、200、300、400、500、600、700、800、900、1000μg或者至少或至多这些量的干的染料。然后,染料可以重悬于任何适宜溶剂中,例如DMSO。
此类试剂盒还可以包括帮助分离标记miRNA的成分。其还可以包括保存或维持miRNA或保护免受降解的成分。此类成分可以是无RNA酶的或者免受RNA酶污染。此类试剂盒通常会在适宜装置中包含不同的容器,用于每一个别试剂或溶液。
试剂盒还可以包括说明书,说明试剂盒成分的使用以及试剂盒中未包括的任何其他试剂的使用。说明书可包括可以实现的变动。
本发明的试剂盒还可以包括下列的一种或一种以上:对照RNA;无核酸酶水;无RNA酶容器,例如1.5ml管;无RNA酶洗脱管;PEG或葡聚糖;乙醇;乙酸;乙酸钠;乙酸胺;胍;去污剂;核酸分子量标记物;无RNA酶管尖;和RNA酶或DNA酶抑制剂。
可以预期到的是此类试剂是本发明试剂盒的实施方案。然而,此类试剂盒不限于上面确定的特定事项,并且可以包括用于操作或表征miRNA的任何试剂。
VII.实施例
所附的下列实施例旨在证明本发明的优选实施方案。本领域技术人员应当认识到,以下发明人所发明的代表性技术的实施例中公开的技术良好地实施本发明,并且因此可以考虑构成其优选的实施模式。然而,依据本公开,本领域技术人员应当意识到,对已经公开的特定的实施方案中可以做诸多改变,并且仍然得到同样的或相似的结果,并未脱离本发明的精神和范围。
实施例1:HSA-MIR-20a转染后的基因表达分析
据信miRNA通过结合至靶mRNA转录物并且(1)启动转录物降解或者(2)改变蛋白质从转录物的翻译调节基因表达。导致蛋白质表达上调或下调的翻译调节可产生下游基因产物和基因活性和表达的改变,翻译调节反过来被这些蛋白质调节。这些众多的调节效应显示为整体mRNA表达谱的变化。开展微阵列基因表达分析以鉴定由hsa-miR-20a表达误调节的基因。
合成Pre-miR-20a(Ambion)反向感染进入一式四份的A549细胞样品中,每一份为三个时间点。使用siPORT NeoFX(Ambion)根据厂商的推荐以下列参数转染细胞:在六孔板中每孔200,000个细胞,5.0μl NeoFX,2.5ml中的30nM终浓度的miRNA。细胞在转染后4小时、24小时和72小时收获。使用RNAqueous-4PCR(Ambion)根据厂商推荐的方法提取总RNA。
mRNA阵列分析由Asuragen Services(Austin,TX)根据公司标准操作方法开展。使用MessageAmpTM II-96aRNA扩增试剂盒(Ambion,目录号1819)2μg总RNA用作靶制备和生物素标记。使用Agilent Bioanalyzer 2100毛细管电泳法定量cRNA产量。使用厂商的推荐和下列参数将标记的靶与Affymetrix mRNA阵列(人HG-U133A 2.0阵列)杂交。杂交在Affymetrix Model 640杂交箱于45℃开展16小时。在Affymetrix FS450 Fluidics站上洗涤阵列并着色,运行洗涤脚本Midi_euk2v3_450。阵列在Affymetrix GeneChip扫描仪3000上扫描。图像信号资料的概括信息、组平均值、带有显著性标志的p值、log比值和阵列上每一基因的基因注释使用Affymetrix统计学算法MAS 5.0(GCOS v1.3)产生。数据报道于包含Affymetrix数据和结果的文件(cabinet)和包含阵列最初图像和处理后单元强度的文件(.cel)中。数据针对两种阴性对照微RNA序列的平均观察效果标准化,然后一起平均后给出结果。其表达水平比平均阴性对照变化至少0.7log2的一列基因组合在一起。微阵列基因表达分析结果示于上表1。
对表1所列基因的表达水平的的操纵代表着对癌症和其他疾病(其中hsa-miR-20a的表达增加或降低在疾病中发挥作用)的潜在有用的治疗法。
实施例2:HSA-MiR-20a影响的细胞途径
hsa-miR-20a对基因表达的误调节(表1)影响许多细胞途径,这些细胞途径代表着控制癌症和其他疾病和紊乱的潜在治疗靶。发明人确定了被hsa-miR-20a表达诱导的调节性级联所影响的细胞遗传途径的身份和性质。细胞途径分析使用Ingenuity Pathways Analysis(
Figure A20078004894101751
Systems,Redwood City,CA)开展。在A549细胞中受hsa-miR-20a过表达影响最显著的途径示于上表2。
这些数据证明,hsa-miR-20a直接或间接影响众多细胞生长、细胞增殖、细胞信号转导和细胞发育相关基因的表达,并且因此主要影响与细胞生长、细胞发育和细胞增殖相关的功能途径。这些细胞过程在多种癌症的发展和进展中全部具有整合作用。对表2所示细胞途径中的基因表达水平的操纵代表着对癌症和其他疾病(其中hsa-miR-20a的表达增加或降低在疾病中发挥作用)的潜在有用的治疗法。
实施例3:预测的HSA-MIR-20a基因靶标
结合hsa-miR-20a并被hsa-miR-20a调节的基因靶使用专有算法miRNATargetTM(Asuragen)预测并示于上表3。
表现出在转染pre-miR hsa-miR-20a后的人癌细胞中mRNA表达水平改变的预测的基因靶示于上表4。
预测的其mRNA表达水平受hsa-miR-20a影响的hsa-miR-20a的基因靶,代表着用于通过控制它们的表达水平进行癌症治疗和其他疾病治疗的特别有用的候选物。
实施例4:HSA-MIR-20a改变的癌症相关基因表达
细胞增殖和存活途径通常在肿瘤中改变(Hanahan和Weinberg,2000)。发明人已经显示,hsa-miR-20a直接或间接调节在这些途径的调节中至关重要的蛋白质的转录物。这些靶中多数具有先天的致癌活性或肿瘤抑制活性。与多种癌症关联的Hsa-miR-20a靶示于表5。
特别感兴趣的Hsa-miR-20a靶是在调节细胞内信号转导中起作用的基因以及它们的产物。当去调节之后,这些蛋白质中的许多蛋白质促成了体外和体内恶性表型。Hsa-miR-20a在多个层面影响细胞内信号转导并且控制着分泌的生长因子、跨膜生长因子受体和细胞质信号传导分子的表达。受hsa-miR-20a调节的分泌蛋白质的实例是Eregulin(EREG)、Wnt5a和炎性趋化因子IL-8。Eregulin(EREG)属于表皮生长因子(EGF)家族并且结合EGF受体,如ErbB(Shelly等,1998)。Eregulin在成年组织中罕见表达但是在多种癌症类型中表达提高(Toyoda等,1997)。Eregulin还在肿瘤发生中起直接作用,因为其促进结肠癌症细胞的肿瘤形成(Baba等,2000)。由于转染hsa-miR-20a降低EREG转录物水平,hsa-miR-20a可能干涉Eregulin的致癌活性。Wnt家族成员是作为生长因子起作用的半胱氨酸丰富蛋白质。在发育过程中,Wnt5a在胚胎神经系统的模式决定中起作用,并且Wnt5a与黑素瘤的进展和乳腺导管癌相联系(Jonsson等,2002;Weeraratna等,2002)。hsa-miR-20a靶向的跨膜受体包括血小板衍生生长因子受体样(PDGFR-L,也称作PDGF-受体β样肿瘤抑制物,PRLTS)、转化生长因子β(TGF-β)受体2(TGFBR2)、肿瘤坏死因子相关细胞凋亡诱导物配体(TRAIL)受体2(TRAIL-R2;也称作肿瘤坏死因子受体超家族成员B10;TNFSFB10)、视黄酸受体效应器1(RARRES1)、肝配蛋白B2受体(EphB2)和成纤维细胞生长因子受体(FGFR)3和4。FGFR-3和FGFR-4通常在多种癌症类型中过表达并且表现出具有生血管活性(Chandler等,1999)。与之相反,PDGFR-L、TRAIL-R2、RARRES1和TGFBR-2是假定的肿瘤抑制物。PDGFR-L表现出在广泛多种癌症中功能缺失,这或者是通过杂合性缺失(LOH)或者是通过错义和移码突变(Fujiwara等,1995;Komiya等,1997)。TRAIL-R2与TRAIL相互作用并且刺激多种细胞类型中的促凋亡途径(Fesik,2005)。对应基因位于在多种人肿瘤中LOH频繁部位的染色体区域(8p22-23)(Adams等,2005)。因此,TRAIL-R2缺失可促成这些癌症的恶性表型。RARRES1是跨膜蛋白质,其在几种类型癌症中缺失或者表达水平降低(Wu等,2006a及其中的参考文献)。TGFBR-2与TGFBR-1形成功能性复合体并且是TGF-β的主要受体(Massague等,2000)。TGF-β的中心作用是抑制众多细胞类型,例如上皮细胞、内皮细胞、造血细胞、神经细胞和间充质细胞的细胞生长。许多带有微卫星不稳性的乳腺癌和结直肠癌具有TGFBR-2失活突变,并且因此没有TGF-β的生长抑制性功能(Markowitz等,1995;Lucke等,2001)。肝配蛋白B2受体在前列腺和结直肠癌中具有抑制蛋白阻抑制因子作用,因为EphB2的失活加速了肿瘤形成(Guo等,2006)。受hsa-miR-20a调节的细胞质信号传导分子包括RhoC和磷脂酶Cβ-1(PLCβ-1)。RhoC是小GTP酶,其调节正常细胞的细胞运动并且在肿瘤发生过程中促进转移(Wheeler和Ridley,2004;Wu等,2004b)。因此,随着肿瘤变成更强力转移性的,RhoC水平进行性提高。PLCβ-1催化由磷脂酰肌醇二磷酸(PIP2)产生肌醇-1,4,5-三磷酸(IP3)和二酰基甘油(DAG),调节增殖性信号和细胞周期检验点(Lo Vasco等,2004)。
受hsa-miR-20a调节的另一类基因编码转录因子。在这些转录因子中有碱性区域/亮氨酸拉链蛋白质(bZIP)Jun和CCAAT/增强子结合蛋白δ(C/EBPδ),前者是禽癌蛋白质v-Jun的细胞同系物(Maki等,1987)。Hsa-miR-20a还调节转录因子ETS2,其是最初从转化成红细胞增多症病毒E26分离的癌蛋白质v-Ets的哺乳动物同系物(Leprince等,1983)。相应ETS2基因在急性髓性白血病(AML)中频繁遭受染色体易位并且在疾病进展中至关重要(Sacchi等,1986)。外源引入hsa-miR-20a诱导ID4表达增加(DNA结合抑制剂4),ID4是一种潜在的肿瘤抑制物,其在白血病中通过甲基化被选择性沉默(Yu等,2005)。ID4带有螺旋-环-螺旋结构域但是缺乏完整的DNA结合结构域。因此,ID4作为对其他HLH转录因子,例如在绝大多数人癌症中被去调节的c-Myc的显性负调控起作用(Grandori等,2000;Nesbit等,1999)。
被hsa-miR-20a调节的更多的生长相关基因是细胞周期蛋白D1和G1,以及S期激酶相关蛋白2(Skp2)。细胞周期蛋白是细胞周期蛋白依赖性激酶(CDK)的辅因子,并且在细胞周期进程中起作用。细胞周期蛋白D1是从G1期过渡到S期所必需的并且在众多癌症类型中过表达(Donnellan和Chetty,1998)。Hsa-miR-20a负向调节细胞周期蛋白D1表达并且因此可以干扰依赖于高水平细胞周期蛋白D1的异常细胞生长。与之相反,细胞周期蛋白G1具有生长抑制性活性并且被hsa-miR-20a上调(Zhao等,2003)。Skp2是多亚基E3遍在蛋白连接酶复合体的成分,该复合体将蛋白质标记以便通过蛋白酶体降解。充分表征的靶是CDK抑制剂p27,其为Skp2的细胞周期促进活性提供了解释(Carrano等,1999)。Skp2是固有致癌性的并且在多种癌症类型中表现出水平增加(Gstaiger等,2001;Kamata等,2005;Saigusa等,2005;Einama等,2006)。
总之,hsa-miR-20a控制着本身为细胞增殖和存活的关键调节物的蛋白质的活性。这些靶常常在人癌症中去调节。基于受miR-20a调节的基因和相关途径的这种评论,向多种癌症细胞类型中引入hsa-miR-20a或anti-hsa-miR-20a将会产生治疗反应。
参考文献
下列参考文献,以它们向本文所述的那些补充提供可示范程序或其他细节的程度明确地通过参考并入本文。
美国专利4,337,063
美国专利4,404,289
美国专利4,405,711
美国专利4,659,774
美国专利4,682,195
美国专利4,683,202
美国专利4,704,362
美国专利4,816,571
美国专利4,870,287
美国专利4,959,463
美国专利5,141,813
美国专利5,143,854
美国专利5,202,231
美国专利5,214,136
美国专利5,221,619
美国专利5,223,618
美国专利5,242,974
美国专利5,264,566
美国专利5,268,486
美国专利5,288,644
美国专利5,324,633
美国专利5,378,825
美国专利5,384,261
美国专利5,399,363
美国专利5,405,783
美国专利5,412,087
美国专利5,424,186
美国专利5,428,148
美国专利5,429,807
美国专利5,432,049
美国专利5,436,327
美国专利5,445,934
美国专利5,446,137
美国专利5,466,468
美国专利5,466,786
美国专利5,468,613
美国专利5,470,710
美国专利5,470,967
美国专利5,472,672
美国专利5,480,980
美国专利5,492,806
美国专利5,503,980
美国专利5,510,270
美国专利5,525,464
美国专利5,527,681
美国专利5,529,756
美国专利5,532,128
美国专利5,543,158
美国专利5,545,531
美国专利5,547,839
美国专利5,554,501
美国专利5,554,744
美国专利5,556,752
美国专利5,561,071
美国专利5,571,639
美国专利5,574,146
美国专利5,580,726
美国专利5,580,732
美国专利5,583,013
美国专利5,593,839
美国专利5,599,672
美国专利5,599,695
美国专利5,602,240
美国专利5,602,244
美国专利5,610,289
美国专利5,610,287
美国专利5,614,617
美国专利5,623,070
美国专利5,624,711
美国专利5,631,134
美国专利5,637,683
美国专利5,639,603
美国专利5,641,515
美国专利5,645,897
美国专利5,652,099
美国专利5,654,413
美国专利5,658,734
美国专利5,661,028
美国专利5,665,547
美国专利5,667,972
美国专利5,670,663
美国专利5,672,697
美国专利5,677,195
美国专利5,681,947
美国专利5,695,940
美国专利5,700,637
美国专利5,700,922
美国专利5,705,629
美国专利5,708,153
美国专利5,708,154
美国专利5,714,606
美国专利5,728,525
美国专利5,739,169
美国专利5,744,305
美国专利5,760,395
美国专利5,763,167
美国专利5,770,358
美国专利5,777,092
美国专利5,789,162
美国专利5,792,847
美国专利5,800,992
美国专利5,801,005
美国专利5,807,522
美国专利5,824,311
美国专利5,830,645
美国专利5,830,880
美国专利5,837,196
美国专利5,846,225
美国专利5,846,945
美国专利5,847,219
美国专利5,856,174
美国专利5,858,988
美国专利5,859,221
美国专利5,871,928
美国专利5,872,232
美国专利5,876,932
美国专利5,886,165
美国专利5,919,626
美国专利5,922,591
美国专利6,004,755
美国专利6,040,193
美国专利6,040,193
美国专利6,087,102
美国专利6,251,666
美国专利6,368,799
美国专利6,383,749
美国专利6,617,112
美国专利6,638,717
美国专利6,720,138
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美国专利序列号09/545,207
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美国专利序列号11/349,727
美国专利序列号60/575,743
美国专利序列号60/649,584
美国专利序列号60/650,807
Aaboe等,Biochim Biophys Acta,1638(1):72-82,2003.
Adams等,Cancer Lett,220(2):137-144,2005.
Akiba等,Int J Oncol,18(2):257-264,2001.
Ambros,Cell,107(7):823-826,2001.
Arap等,Cancer Res.,55(6):1351-1354,1995.
Austin-Ward和Villaseca,Revista Medica de Chile,126(7):838-845,1998.
Baba等,Cancer Res,60(24):6886-6889,2000.
Bagga等,Cell,122(4):553-563,2005.
Barton等,Clin Cancer Res,3(9):1579-1586,1997.
Bellovin等,Oncogene,25(52):6959-6967,2006.
Biswas等,Cancer Res,64(14):4687-4692,2004.
Blanc等,Cancer Lett,228(1-2):117-123,2005.
Bodner-Adler等,Anticancer Res,21(1B):809-812,2001.
Brennecke等,Cell,113(1):25-36,2003.
Bukowski等,Clinical Cancer Res.,4(10):2337-2347,1998.
Caldas等,Cancer Res.,54:3568-3573,1994.
Caldas等,Nat.Genet.,8(1):27-32,1994.
Calin等,Proc.Natl.Acad.Sci.USA,99(24):15524-15529,2002.
Carrano等,Nat Cell Biol,1(4):193-199,1999.
Carreiras等,Gynecol Oncol,62(2):260-267,1996.
Carreiras等,Gynecol Oncol,72(3):312-322,1999.
Carrington和Ambros,Science,301(5631):336-338,2003.
Chan等,Oncogene,22(44):6946-6953,2003.
Chandler等,Int J Cancer,81(3):451-458,1999.
Cheng等,Cancer Res.,54(21):5547-5551,1994.
Christodoulides等,Microbiology,144(Pt 11):3027-3037,1998.
Cummins等,In:IRT:Nucleosides and nucleosides,La Jolla CA,72,1996.
Davalos等,Oncogene,26(2):308-311,2006.
Davidson等,J.Immunother.,21(5):389-398,1998.
de Candia等,Hum Pathol,37(8):1032-1041,2006.
de Nigris等,Cancer Res,61(5):2267-2275,2001.
Denli等,Trends Biochem.Sci.,28:196,2003.
Didenko,Biotechniques,31(5):1106-1116,1118,1120-1121,2001.
Dillman,Cancer Biother.Radiopharm.,14(1):5-10,1999.
Donnellan和Chetty,Mol Pathol,51(1):1-7,1998.
Eferl等,Cell,112(2):181-192,2003.
Einama等,Pancreas,32(4):376-381,2006.
Emptage等,Neuron,29(1):197-208,2001.
EP 266,032
EP 373 203
EP 785 280
EP 799 897
Esquela-Kerscher和Slack,Nat Rev Cancer,6(4):259-269,2006.
Ezzat等,Clin Cancer Res,11(3):1336-1341,2005.
Faried等,Eur J Cancer,42(10):1455-1465,2006.
Fesik,Nat Rev Cancer,5(11):876-885,2005.
Firth和Baxter,Endocr Rev,23(6):824-854,2002.
Fodor等,Science,251:767-777,1991.
Froehler等,Nucleic Acids Res.,14(13):5399-5407,1986.
Fujiwara等,Oncogene,10(5):891-895,1995.
Grandori等,Annu Rev Cell Dev Biol,16:653-699,2000.
Griffey等,J.Mass Spectrom,32(3):305-13,1997.
Gstaiger等,Proc Natl Acad Sci U S A,98(9):5043-5048,2001.
Guo等,Carcinogenesis,27(3):454-464,2006.
Hanahan和Weinberg,Cell,100(1):57-70,2000.
Hanibuchi等,Int.J.Cancer,78(4):480-485,1998.
Hartmann等,Cancer Res,59(7):1578-1583,1999.
He等,Nature,435(7043):828-833,2005a.
He等,Proc.Natl.Acad.Sci.USA,102(52):19075-19080,2005b.
Hellstrand等,Acta Oncologica,37(4):347-353,1998.
Huang等,Clin Cancer Res,12(2):487-498,2006.
Huang等,J Clin Oncol,23(34):8765-8773,2005.
Hui和Hashimoto,Infection Immun.,66(11):5329-5336,1998.
Hussussian等,Nat.Genet.,8(1):15-21,1994.
Huusko等,Nat Genet,36(9):979-983,2004.
Itakura和Riggs,Science,209:1401-1405,1980.
Ito等,Anticancer Res,22(3):1581-1584,2002.
Ito等,Anticancer Res,25(5):3419-3423,2005.
Jaakkola等,Int J Cancer,54(3):378-382,1993.
Jonsson等,Cancer Res,62(2):409-416,2002.
Ju等,Gene Ther.,7(19):1672-1679,2000.
Jubb等,Clin Cancer Res,11(14):5181-5187,2005.
Kamata等,J Cancer Res Clin Oncol,131(9):591-596,2005.
Kamb等,Nat.Genet.,8(1):23-26,1994.
Kamb等,Science,2674:436-440,1994.
Kirikoshi等,Int J Oncol,19(1):111-115,2001.
Kleer等,Clin Cancer Res,12(15):4485-4490,2006.
Klostermeier和Millar,Biopolymers,61(3):159-79,2002.
Kokko等,BMC Cancer,6:145,2006.
Komiya等,Jpn J Cancer Res,88(4):389-393,1997.
Lagos-Quintana等,Science,294(5543):853-858,2001.
Lau等,Science,294(5543):858-862,2001.
Lee和Ambros,Science,294(5543):862-864,2001.
Lee等,Cell Struct Funct,23(4):193-199,1998.
Leprince等,Nature,306(5941):395-397,1983.
Leris等,Anticancer Res,25(2A):731-734,2005.
L′Hote和Knowles,Exp Cell Res,304(2):417-431,2005.
Li等,World J Gastroenterol,9(2):205-208,2003.
Lim等,Nature,433(7027):769-773,2005
Lo Vasco等,Leukemia,18(6):1122-1126,2004.
Lu等,Nature,435(7043):834-838,2005.
Lucke等,Cancer Res,61(2):482-485,2001.
Maki等,Proc Natl Acad Sci U S A,84(9):2848-2852,1987.
Markowitz等,Science,268(5215):1336-1338,1995.
Markowitz,Biochim Biophys Acta,1470(1):M13-20,2000.
Marsters等,Recent Prog.Horm.Res.,54:225-234,1999.
Massague等,Cell,103(2):295-309,2000.
Merle等,Gastroenterology,127(4):1110-1122,2004.
Miyake等,Cancer,86(2):316-324,1999.
Montero等,Clin Cancer Res,4(9):2161-2168,1998.
Mori等,Cancer Res.,54(13):3396-3397,1994.
Nakada等,Cancer Res,64(9):3179-3185,2004.
Nesbit等,Oncogene,18(19):3004-3016,1999.
Nobri等,Nature(London),368:753-756,1995.
O’Donnell等,Nature,435:839-843,2005.
Okamoto等,Proc.Natl.Acad.Sci.USA,91(23):11045-11049,1994.
Olsen等,Dev.Biol.,216:671,1999.
Orlow等,Cancer Res,54(11):2848-2851,1994.
Orlow等,Int.J.Oncol.,15(1):17-24,1994.
PCT申请WO 0168255
PCT申请WO 03020898
PCT申请WO 03022421
PCT申请WO 03023058
PCT申请WO 03029485
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PCT申请WO 95/21944
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PCT申请WO 97/27317
PCT申请WO 9743450
PCT申请WO 99/35505
PCT申请WO 0138580
Petit等,Genomics,57(3):438-441,1999.
Pietras等,Oncogene,17(17):2235-2249,1998.
Pruitt等,Nucleic Acids Res,33(1):D501-D504,2005.
Qin等,Proc.Natl.Acad.Sci.USA,95(24):14411-14416,1998.
Ree等,Cancer Res,59(18):4675-4680,1999.
Reimer等,J Biol Chem,274(16):11022-11029,1999.
Reinhart等,Nature,403(6772):901-906,2000.
Remington’s Pharmaceutical Sciences,第15版,1035-1038和1570-1580页,Mack Publishing Company,Easton,PA,1980.
Rossi等,Cancer Genet Cytogenet,161(2):97-103,2005.
Ruth等,J Invest Dermatol,126(4):862-868,2006.
Sacchi等,Science,231(4736):379-382,1986.
Saigusa等,Cancer Sci,96(10):676-683,2005.
Saitoh等,Int J Mol Med,9(5):515-519,2002.
Sambrook和Russell,Molecular Cloning:A Laboratory Manual第3版,ColdSpring Harbor Laboratory Press,2001.
Sambrook等,In:DNA microaarays:a molecular cloning manual,ColdSpring Harbor Laboratory Press,Cold Spring Harbor,NY,2003.
Sambrook等,In:Molecular cloning:a laboratory manual,第2版,ColdSpring Harbor Laboratory Press,Cold Spring Harbor,NY,1989.
Seggerson等,Dev.Biol.,243:215,2002.
Sementchenko等,Oncogene,17(22):2883-2888,1998.
Serrano等,Nature,366:704-707,1993.
Serrano等,Science,267(5195):249-252,1995.
Shah等,Oncogene,21(54):8251-8261,2002.
Shelly等,J Biol Chem,273(17):10496-10505,1998.
Shibahara等,Anticancer Res,25(3B):1881-1888,2005.
Shimoyama等,Clin Cancer Res,5(5):1125-1130,1999.
Simpson等,Oncogene,14(18):2149-2157,1997.
Skotzko等,Cancer Res,55(23):5493-5498,1995.
Sparmann和Bar-Sagi,Cancer Cell,6(5):447-458,2004.
Su等,Clin Cancer Res,7(5):1320-1324,2001.
Sui等,Oncol Rep,15(4):765-771,2006.
Takanami,Oncol Rep,13(4):727-731,2005.
Tanaka等,Proc Natl Acad Sci U S A,95(17):10164-10169,1998.
Thogersen等,Cancer Res,61(16):6227-6233,2001.
Tomasini-Johansson等,Exp Cell Res,214(1):303-312,1994.
Torring等,Anticancer Res,20(1A):91-95,2000.
Toyoda等,Biochem J,326(Pt 1):69-75,1997.
Traub等,Breast Cancer Res Treat,99(2):185-191,2006.
Uhm等,Clin Cancer Res,5(6):1587-1594,1999.
UK 1,529,202
UK 8 803 000
Volinia等,Proc Natl Acad Sci U S A,103(7):2257-2261,2006.
Weeraratna等,Cancer Cell,1(3):279-288,2002.
Weiss和Bohmann,Cell Cycle,3(2):111-113,2004.
Wheeler和Ridley,Exp Cell Res,301(1):43-49,2004.
Wu等,Breast Cancer Res Treat,84(1):3-12,2004b.
Wu等,Eur J Cancer,42(4):557-565,2006a.
Wu等,Gynecol Oncol,102(1):15-21,2006b.
Wu等,Pathol Oncol Res,10(1):26-33,2004a.
Xu等,Curr.Biol.,13(9):790-795,2003.
Yang等,J Androl,22(3):471-480,2001.
Yao等,Oncogene,25(16):2285-2296,2006.
Yoshioka等,Proc Natl Acad Sci U S A,100(12):7247-7252,2003.
Yu等,Nat Genet,37(3):265-274,2005.
Zhang等,Oncogene,23(12):2241-2249,2004.
Zhao等,Mol Cancer Res,1(3):195-206,2003.
Zhu等,Biochem Biophys Res Commun,273(3):1019-1024,2000.
序列表
<110>安德里斯.G.巴德
     麦克.拜罗姆
     查尔斯.D.约翰逊
     大卫.布朗
<120>作为治疗性干预靶标的miR-20调节的基因和途径
<130>ASUR:024WO
<140>PCT/US2007/087029
<141>2007-12-10
<150>60/915,026
<151>2007-04-30
<150>60/869,295
<151>2006-12-08
<160>269
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<220>
<223>合成的引物
<400>28
uaaagugcuu auagugcagg ua     22
<210>29
<211>23
<212>RNA
<213>人工的
<220>
<223>合成的引物
<400>29
uaaagugcuu auagugcagg uag    23
<210>30
<211>23
<212>RNA
<213>人工的
<220>
<223>合成的引物
<400>30
caaagugcuc auagugcagg uag    23
<210>31
<211>23
<212>RNA
<213>人工的
<220>
<223>合成的引物
<400>31
uaaagugcuu auagugcagg uag    23
<210>32
<211>21
<212>RNA
<213>人工的
<220>
<223>合成的引物
<400>32
acugcauaau gagcacuuaa a                                              21
<210>33
<211>23
<212>RNA
<213>人工的
<220>
<223>合成的引物
<400>33
caaagugcuc auagugcagg uag                                            23
<210>34
<211>71
<212>RNA
<213>人工的
<220>
<223>合成的引物
<400>34
guagcacuaa agugcuuaua gugcagguag uguuuaguua ucuacugcau uaugagcacu    60
uaaaguacug c                                                         71
<210>35
<211>69
<212>RNA
<213>人工的
<220>
<223>合成的引物
<400>35
aguaccaaag ugcucauagu gcagguaguu uuggcaugac ucuacuguag uaugggcacu    60
uccaguacu                                                            69
<210>36
<211>71
<212>RNA
<213>人工的
<220>
<223>合成的引物
<400>36
guagcacuaa agugcuuaua gugcagguag uguuuaguua ucuacugcau uaugagcacu    60
uaaaguacug c                                                         71
<210>37
<211>71
<212>RNA
<213>人工的
<220>
<223>合成的引物
<400>37
guagcacuaa agugcuuaua gugcagguag uguuuaguua ucuacugcau uaugagcacu    60
uaaaguacug c                                                         71
<210>38
<211>69
<212>RNA
<213>人工的
<220>
<223>合成的引物
<400>38
aguaccaaag ugcucacagu gcagguaguu uuggcagcgc ucuacuguag ugugggcacu     60
uccaguacu                                                             69
<210>39
<211>153
<212>RNA
<213>人工的
<220>
<223>合成的引物
<400>39
ucuuaaauaa aucuccuaau guugcaguug uguuagaguu ucagcagugc uaaagugcuu    60
auagugcagg uaguauuucu gucaucuacu gcagugugag cacuugaagu acuucuagcu   120
uaaugcgucu gggauccgaa gauuucugcu aga                                153
<210>40
<211>94
<212>RNA
<213>人工的
<220>
<223>合成的引物
<400>40
gaguuugucc uggcaguucc aaagugcuca cagugcaggu agugccagug gaucuacugc    60
aaugucugca cuucaaguau ugccggacgc cuuc                                94
<210>41
<211>80
<212>RNA
<213>人工的
<220>
<223>合成的引物
<400>41
agcaguauua aagugcuuau agugcaggua guuacugaug gucuacugca gugugagcac    60
uucuaguacu ucuagaugca                                                80
<210>42
<211>98
<212>RNA
<213>人工的
<220>
<223>合成的引物
<400>42
ugacagcucu uguagcacua aagugcuuau agugcaggua guguucacua aucuacugca    60
uuauaagcac uuaaaguacu gcuagcugua gaacuaca                            98
<210>43
<211>85
<212>RNA
<213>人工的
<220>
<223>合成的引物
<400>43
cuagcaguau caaagugcuc auagugcagg uagcuuggca uuggaccuac uguaaugugg    60
gcacuuacag uacuguuaga uaaag                                          85
<210>44
<211>71
<212>RNA
<213>人工的
<220>
<223>合成的引物
<400>44
guagcacuaa agugcuuaua gugcagguag uguuuaguua ucuacugcau uaugagcacu    60
uaaaguacug c                                                        71
<210>45
<211>71
<212>RNA
<213>人工的
<220>
<223>合成的引物
<400>45
guagcacuaa agugcuuaua gugcagguag uguuuaguua ucuacugcau caugagcacu    60
uaaaguacug c                                                         71
<210>46
<211>71
<212>RNA
<213>人工的
<220>
<223>合成的引物
<400>46
guagcacuaa agugcuuaua gugcagguag uguuuaguua ucuacugcau uaugagcacu    60
uaaaguacug c                                                         71
<210>47
<211>102
<212>RNA
<213>人工的
<220>
<223>合成的引物
<400>47
ugaaaggaca gcuuuuguag cacuaaagug cuuauagugc agguaguguu uaguuaucua    60
cugcauuaug agcacuugaa guacugcuag cuguagaacu ac                      102
<210>48
<211>71
<212>RNA
<213>人工的
<220>
<223>合成的引物
<400>48
guagcacuaa agugcuuaua gugcagguag uguuuaguua ucuacugcau uaugagcacu    60
uaaaguacug c                                                         71
<210>49
<211>107
<212>RNA
<213>人工的
<220>
<223>合成的引物
<400>49
gugugaugug acagcuucug uagcacuaaa gugcuuauag ugcagguagu guguagccau    60
cuacugcauu acgagcacuu aaaguacugc cagcuguaga acuccag                 107
<210>50
<211>80
<212>RNA
<213>人工的
<220>
<223>合成的引物
<400>50
ccuaguagug ccaaagugcu cauagugcag guaguuuuua uaccacucua cugcagugug    60
agcacuucua guacuccugg                                                80
<210>51
<211>142
<212>RNA
<213>人工的
<220>
<223>合成的引物
<400>51
guagcacuaa agugcuuaua gugcagguag uguuuaguua ucuacugcau uaugagcacu    60
uaaaguacug cuguucuaag gugcaucuag ugcagauagu gaaguagauu agcaucuacu   120
gcccuaagug cuccuucugg ca                                            142
<210>52
<211>71
<212>RNA
<213>人工的
<220>
<223>合成的引物
<400>52
guagcacuaa agugcuuaua gugcagguag uguuuaguua ucuacugcau uaugagcacu    60
uaaaguacug c                                                         71
<210>53
<211>71
<212>RNA
<213>人工的
<220>
<223>合成的引物
<400>53
guagcacuaa agugcuuaua gugcagguag uguuuaguua ucuacugcau uaugagcacu    60
uaaaguacug c                                                         71
<210>54
<211>71
<212>RNA
<213>人工的
<220>
<223>合成的引物
<400>54
guagcacuaa agugcuuaua gugcagguag uguuuaguua ucuacugcau uaugagcacu    60
uaaaguacug c                                                         71
<210>55
<211>85
<212>RNA
<213>人工的
<220>
<223>合成的引物
<400>55
cagcuucugu agcacuaaag ugcuuauagu gcagguagug ugucgucauc uacugcauua    60
cgagcacuua caguacugcc agcug                                          85
<210>56
<211>72
<212>RNA
<213>人工的
<220>
<223>合成的引物
<400>56
guagugccaa agugcucaua gugcagguag guuuugcugc acucuacugc agugugagca    60
cuucugguac uc                                                        72
<210>57
<211>71
<212>RNA
<213>人工的
<220>
<223>合成的引物
<400>57
guagcacuaa agugcuuaua gugcagguag uguuuaguua ucuacugcau uaugagcacu    60
uaaaguacug c                                                         71
<210>58
<211>71
<212>RNA
<213>人工的
<220>
<223>合成的引物
<400>58
guagcacuaa agugcuuaua gugcagguag uguuuaguua ucuacugcau uaugagcacu    60
uaaaguacug c                                                         71
<210>59
<211>73
<212>RNA
<213>人工的
<220>
<223>合成的引物
<400>59
gcaguauuaa agugcuuaua gugcagguag uuuucucagg gucuacugca guaugagcac    60
uucuaguacu ucu                                                       73
<210>60
<211>74
<212>RNA
<213>人工的
<220>
<223>合成的引物
<400>60
gcaguuccaa agugcucaua gugcagguag uuguauucau guucuacugu aauaugggca    60
cuuacaguac ugcu                                                      74
<210>61
<211>84
<212>RNA
<213>人工的
<220>
<223>合成的引物
<400>61
gcuaaagugg ugcuaaagug cuuauagugc agguaguuuu ucuguauucu acugcauaau    60
gagcacuuaa aguacuccua gcug                                           84
<210>62
<211>74
<212>RNA
<213>人工的
<220>
<223>合成的引物
<400>62
gcaguuccaa agugcucaua gugcagguag uuguauugau guucuacugu aauaugggca    60
cuuacaguac ugcu                                                      74
<210>63
<211>24
<212>RNA
<213>人工的
<220>
<223>合成的引物
<400>63
aaaagugcuu acagugcagg uagc         24
<210>64
<211>21
<212>RNA
<213>人工的
<220>
<223>合成的引物
<400>64
uaaagugcug acagugcaga u            21
<210>65
<211>20
<212>RNA
<213>人工的
<220>
<223>合成的引物
<400>65
acugcaguga aggcacuugu              20
<210>66
<211>24
<212>RNA
<213>人工的
<220>
<223>合成的引物
<400>66
caaagugcuu acagugcagg uagu         24
<210>67
<211>22
<212>RNA
<213>人工的
<220>
<223>合成的引物
<400>67
uaaggugcau cuagugcaga ua     22
<210>68
<211>22
<212>RNA
<213>人工的
<220>
<223>合成的引物
<400>68
aaagugcugu ucgugcaggu ag     22
<210>69
<211>22
<212>RNA
<213>人工的
<220>
<223>合成的引物
<400>69
aaaagu gcuu acagugcagg ua    22
<210>70
<211>20
<212>RNA
<213>人工的
<220>
<223>合成的引物
<400>70
acugcaguga aggcacuugu        20
<210>71
<211>24
<212>RNA
<213>人工的
<220>
<223>合成的引物
<400>71
caaagugcuu acagugcagg uagu     24
<210>72
<211>22
<212>RNA
<213>人工的
<220>
<223>合成的引物
<400>72
uaaggugcau cuagugcaga ua       22
<210>73
<211>22
<212>RNA
<213>人工的
<220>
<223>合成的引物
<400>73
uaaggugcau cuagugcagu ua       22
<210>74
<211>22
<212>RNA
<213>人工的
<220>
<223>合成的引物
<400>74
caaagugcug uucgugcagg ua     22
<210>75
<211>22
<212>RNA
<213>人工的
<220>
<223>合成的引物
<400>75
caaagugcuu acagugcagg ua      22
<210>76
<211>22
<212>RNA
<213>人工的
<220>
<223>合成的引物
<400>76
acugcagugg aggcacuucu ag      22
<210>77
<211>22
<212>RNA
<213>人工的
<220>
<223>合成的引物
<400>77
uaaggugcau cuagugcaga ua      22
<210>78
<211>22
<212>RNA
<213>人工的
<220>
<223>合成的引物
<400>78
uaaggugcau uuagugcaga ua    22
<210>79
<211>22
<212>RNA
<213>人工的
<220>
<223>合成的引物
<400>79
cugcccuaag ugccccuucu gg    22
<210>80
<211>22
<212>RNA
<213>人工的
<220>
<223>合成的引物
<400>80
uaaggugcau cuuguguagu ua    22
<210>81
<211>22
<212>RNA
<213>人工的
<220>
<223>合成的引物
<400>81
aaaagugcug uuugugcagg ua    22
<210>82
<211>22
<212>RNA
<213>人工的
<220>
<223>合成的引物
<400>82
caaagugcuu acagugcagg ua       22
<210>83
<211>22
<212>RNA
<213>人工的
<220>
<223>合成的引物
<400>83
uaaggugcau cuagugcaga ua       22
<210>84
<211>22
<212>RNA
<213>人工的
<220>
<223>合成的引物
<400>84
aaaagugcuu acagugcagg ua       22
<210>85
<211>20
<212>RNA
<213>人工的
<220>
<223>合成的引物
<400>85
acugcaguga aggcacuugu         20
<210>86
<211>24
<212>RNA
<213>人工的
<220>
<223>合成的引物
<400>86
caaagugcuu acagugcagg uagu     24
<210>87
<211>22
<212>RNA
<213>人工的
<220>
<223>合成的引物
<400>87
uaaggugcau cuagugcaga ua       22
<210>88
<211>22
<212>RNA
<213>人工的
<220>
<223>合成的引物
<400>88
uaaggugcau cuagugcagu ua       22
<210>89
<211>24
<212>RNA
<213>人工的
<220>
<223>合成的引物
<400>89
aaaagugcuu acagugcagg uagc     24
<210>90
<211>21
<212>RNA
<213>人工的
<220>
<223>合成的引物
<400>90
uaaagugcug acagugcaga u        21
<210>91
<211>20
<212>RNA
<213>人工的
<220>
<223>合成的引物
<400>91
acugcaguga aggcacuugu          20
<210>92
<211>24
<212>RNA
<213>人工的
<220>
<223>合成的引物
<400>92
caaagugcuu acagugcagg uagu     24
<210>93
<211>22
<212>RNA
<213>人工的
<220>
<223>合成的引物
<400>93
uaaggugcau cuagugcaga ua     22
<210>94
<211>22
<212>RNA
<213>人工的
<220>
<223>合成的引物
<400>94
aaagugcugu ucgugcaggu ag      22
<210>95
<211>24
<212>RNA
<213>人工的
<220>
<223>合成的引物
<400>95
aaaagugcuu acagugcagg uagc    24
<210>96
<211>21
<212>RNA
<213>人工的
<220>
<223>合成的引物
<400>96
uaaagugcug acagugcaga u      21
<210>97
<211>20
<212>RNA
<213>人工的
<220>
<223>合成的引物
<400>97
acugcaguga aggcacuugu         20
<210>98
<211>24
<212>RNA
<213>人工的
<220>
<223>合成的引物
<400>98
caaagugcuu acagugcagg uagu    24
<210>99
<211>22
<212>RNA
<213>人工的
<220>
<223>合成的引物
<400>99
uaaggugcau cuagugcaga ua      22
<210>100
<211>21
<212>RNA
<213>人工的
<220>
<223>合成的引物
<400>100
acugcccuaa gugcuccuuc u    21
<210>101
<211>22
<212>RNA
<213>人工的
<220>
<223>合成的引物
<400>101
uaaggugcau cuagugcagu ua    22
<210>102
<211>22
<212>RNA
<213>人工的
<220>
<223>合成的引物
<400>102
aaagugcugu ucgugcaggu ag    22
<210>103
<211>20
<212>RNA
<213>人工的
<220>
<223>合成的引物
<400>103
acugcaguga aggcacuugu       20
<210>104
<211>24
<212>RNA
<213>人工的
<220>
<223>合成的引物
<400>104
caaagugcuu acagugcagg uagu    24
<210>105
<211>22
<212>RNA
<213>人工的
<220>
<223>合成的引物
<400>105
uaaggugcau cuagugcaga ua       22
<210>106
<211>21
<212>RNA
<213>人工的
<220>
<223>合成的引物
<400>106
uaaagugcug acagugcaga u        21
<210>107
<211>20
<212>RNA
<213>人工的
<220>
<223>合成的引物
<400>107
acugcaguga aggcacuugu         20
<210>108
<211>24
<212>RNA
<213>人工的
<220>
<223>合成的引物
<400>108
caaagugcuu acagugcagg uagu    24
<210>109
<211>22
<212>RNA
<213>人工的
<220>
<223>合成的引物
<400>109
uaaggugcau cuagugcaga ua       22
<210>110
<211>22
<212>RNA
<213>人工的
<220>
<223>合成的引物
<400>110
aaagugcugu ucgugcaggu ag       22
<210>111
<211>21
<212>RNA
<213>人工的
<220>
<223>合成的引物
<400>111
acugcaguga aggcacuugu a       21
<210>112
<211>24
<212>RNA
<213>人工的
<220>
<223>合成的引物
<400>112
caaagugcuu acagugcagg uagu    24
<210>113
<211>22
<212>RNA
<213>人工的
<220>
<223>合成的引物
<400>113
uaaggugcau cuagugcaga ua      22
<210>114
<211>22
<212>RNA
<213>人工的
<220>
<223>合成的引物
<400>114
aaagugcugu ucgugcaggu ag      22
<210>115
<211>24
<212>RNA
<213>人工的
<220>
<223>合成的引物
<400>115
aaaagu gcuu acagugcagg uagc    24
<210>116
<211>21
<212>RNA
<213>人工的
<220>
<223>合成的引物
<400>116
uaaagugcug acagugcaga u         21
<210>117
<211>20
<212>RNA
<213>人工的
<220>
<223>合成的引物
<400>117
acugcaguga aggcacuugu           20
<210>118
<211>24
<212>RNA
<213>人工的
<220>
<223>合成的引物
<400>118
caaagugcuu acagugcagg uagu    24
<210>119
<211>22
<212>RNA
<213>人工的
<220>
<223>合成的引物
<400>119
uaaggugcau cuagugcaga ua       22
<210>120
<211>22
<212>RNA
<213>人工的
<220>
<223>合成的引物
<400>120
aaagugcugu ucgugcaggu ag       22
<210>121
<211>22
<212>RNA
<213>人工的
<220>
<223>合成的引物
<400>121
caaagugcua acagugcagg ua       22
<210>122
<211>21
<212>RNA
<213>人工的
<220>
<223>合成的引物
<400>122
uaaagugcug acagugcaga u      21
<210>123
<211>21
<212>RNA
<213>人工的
<220>
<223>合成的引物
<400>123
acugcaguga gggcacuugu a       21
<210>124
<211>24
<212>RNA
<213>人工的
<220>
<223>合成的引物
<400>124
caaagugcuu acagugcagg uagu    24
<210>125
<211>22
<212>RNA
<213>人工的
<220>
<223>合成的引物
<400>125
uaaggugcau cuagugcaga ua      22
<210>126
<211>23
<212>RNA
<213>人工的
<220>
<223>合成的引物
<400>126
caaagugcug uucgugcagg uag     23
<210>127
<211>24
<212>RNA
<213>人工的
<220>
<223>合成的引物
<400>127
aaaagugcuu acagugcagg uagc    24
<210>128
<211>21
<212>RNA
<213>人工的
<220>
<223>合成的引物
<400>128
uaaagugcug acagugcaga u       21
<210>129
<211>20
<212>RNA
<213>人工的
<220>
<223>合成的引物
<400>129
acugcaguga aggcacuugu         20
<210>130
<211>24
<212>RNA
<213>人工的
<220>
<223>合成的引物
<400>130
caaagugcuu acagugcagg uagu     24
<210>131
<211>22
<212>RNA
<213>人工的
<220>
<223>合成的引物
<400>131
uaaggugcau cuagugcaga ua       22
<210>132
<211>22
<212>RNA
<213>人工的
<220>
<223>合成的引物
<400>132
aaagugcugu ucgugcaggu ag       22
<210>133
<211>24
<212>RNA
<213>人工的
<220>
<223>合成的引物
<400>133
aaaagugcuu acagugcagg uagc      24
<210>134
<211>21
<212>RNA
<213>人工的
<220>
<223>合成的引物
<400>134
uaaagugcug acagugcaga u         21
<210>135
<211>20
<212>RNA
<213>人工的
<220>
<223>合成的引物
<400>135
acugcaguga aggcacuugu           20
<210>136
<211>24
<212>RNA
<213>人工的
<220>
<223>合成的引物
<400>136
caaagugcuu acagugcagg uagu      24
<210>137
<211>22
<212>RNA
<213>人工的
<220>
<223>合成的引物
<400>137
uaaggugcau cuagugcaga ua       22
<210>138
<211>22
<212>RNA
<213>人工的
<220>
<223>合成的引物
<400>138
aaagugcugu ucgugcaggu ag       22
<210>139
<211>24
<212>RNA
<213>人工的
<220>
<223>合成的引物
<400>139
aaaagugcuu acagugcagg uagc     24
<210>140
<211>21
<212>RNA
<213>人工的
<220>
<223>合成的引物
<400>140
uaaagugcug acagugcaga u       21
<210>141
<211>20
<212>RNA
<213>人工的
<220>
<223>合成的引物
<400>141
acugcaguga aggcacuugu         20
<210>142
<211>24
<212>RNA
<213>人工的
<220>
<223>合成的引物
<400>142
caaagugcuu acagugcagg uagu    24
<210>143
<211>22
<212>RNA
<213>人工的
<220>
<223>合成的引物
<400>143
uaaggugcau cuagugcaga ua      22
<210>144
<211>22
<212>RNA
<213>人工的
<220>
<223>合成的引物
<400>144
aaagugcugu ucgugcaggu ag      22
<210>145
<211>24
<212>RNA
<213>人工的
<220>
<223>合成的引物
<400>145
aaaagugcuu acagugcagg uagc    24
<210>146
<211>21
<212>RNA
<213>人工的
<220>
<223>合成的引物
<400>146
uaaagugcug acagugcaga u       21
<210>147
<211>20
<212>RNA
<213>人工的
<220>
<223>合成的引物
<400>147
acugcaguga aggcacuugu         20
<210>148
<211>24
<212>RNA
<213>人工的
<220>
<223>合成的引物
<400>148
caaagugcuu acagugcagg uagu     24
<210>149
<211>22
<212>RNA
<213>人工的
<220>
<223>合成的引物
<400>149
uaaggugcau cuagugcaga ua       22
<210>150
<211>22
<212>RNA
<213>人工的
<220>
<223>合成的引物
<400>150
aaagugcugu ucgugcaggu ag       22
<210>151
<211>21
<212>RNA
<213>人工的
<220>
<223>合成的引物
<400>151
uaaagugcug acagugcaga u      21
<210>152
<211>24
<212>RNA
<213>人工的
<220>
<223>合成的引物
<400>152
caaagugcuu acagugcagg uagu    24
<210>153
<211>22
<212>RNA
<213>人工的
<220>
<223>合成的引物
<400>153
uaaggugcau cuagugcaga ua      22
<210>154
<211>23
<212>RNA
<213>人工的
<220>
<223>合成的引物
<400>154
caaagugcug uucgugcagg uag     23
<210>155
<211>24
<212>RNA
<213>人工的
<220>
<223>合成的引物
<400>155
aaaagugcuu acagugcagg uagc    24
<210>156
<211>21
<212>RNA
<213>人工的
<220>
<223>合成的引物
<400>156
uaaagugcug acagugcaga u       21
<210>157
<211>20
<212>RNA
<213>人工的
<220>
<223>合成的引物
<400>157
acugcaguga aggcacuugu         20
<210>158
<211>24
<212>RNA
<213>人工的
<220>
<223>合成的引物
<400>158
caaagugcuu acagugcagg uagu    24
<210>159
<211>22
<212>RNA
<213>人工的
<220>
<223>合成的引物
<400>159
uaaggugcau cuagugcaga ua      22
<210>160
<211>22
<212>RNA
<213>人工的
<220>
<223>合成的引物
<400>160
aaagugcugu ucgugcaggu ag      22
<210>161
<211>24
<212>RNA
<213>人工的
<220>
<223>合成的引物
<400>161
aaaagugcuu acagugcagg uagc    24
<210>162
<211>22
<212>RNA
<213>人工的
<220>
<223>合成的引物
<400>162
uaaggugcau cuagugcaga ua    22
<210>163
<211>22
<212>RNA
<213>人工的
<220>
<223>合成的引物
<400>163
caaagugcuu acagugcagg ua    22
<210>164
<211>22
<212>RNA
<213>人工的
<220>
<223>合成的引物
<400>164
uaaggugcau cuagugcaga ua     22
<210>165
<211>23
<212>RNA
<213>人工的
<220>
<223>合成的引物
<400>165
uaaggugcau cuagugcagu uag    23
<210>166
<211>23
<212>RNA
<213>人工的
<220>
<223>合成的引物
<400>166
caaagugcuc auagugcagg uag     23
<210>167
<211>24
<212>RNA
<213>人工的
<220>
<223>合成的引物
<400>167
aaaagugcuu auagugcagg uaga    24
<210>168
<211>20
<212>RNA
<213>人工的
<220>
<223>合成的引物
<400>168
acugcagu ga aggcacuugu        20
<210>169
<211>24
<212>RNA
<213>人工的
<220>
<223>合成的引物
<400>169
caaagugcuu acagugcagg uagu     24
<210>170
<211>22
<212>RNA
<213>人工的
<220>
<223>合成的引物
<400>170
uaaggugcau cuagugcaga ua    22
<210>171
<211>23
<212>RNA
<213>人工的
<220>
<223>合成的引物
<400>171
uaaggugcau cuagugcagu uag    23
<210>172
<211>23
<212>RNA
<213>人工的
<220>
<223>合成的引物
<400>172
caaagugcug uucgugcagg uag    23
<210>173
<211>23
<212>RNA
<213>人工的
<220>
<223>合成的引物
<400>173
ucaagugcug uucgugcagg uag                                            23
<210>174
<211>81
<212>RNA
<213>人工的
<220>
<223>合成的引物
<400>174
ccuuggccau guaaaagugc uuacagugca gguagcuuuu ugagaucuac ugcaaugcaa    60
gcacuucuua cauuaccaug g                                              81
<210>175
<211>82
<212>RNA
<213>人工的
<220>
<223>合成的引物
<400>175
ccugccgggg cuaaagugcu gacagugcag auaguggucc ucuccgugcu accgcacugu    60
ggguacuugc ugcuccagca gg                                             82
<210>176
<211>84
<212>RNA
<213>人工的
<220>
<223>合成的引物
<400>176
gucagaauaa ugucaaagug cuuacagugc agguagugau augugcaucu acugcaguga    60
aggcacuugu agcauuaugg ugac                                           84
<210>177
<211>71
<212>RNA
<213>人工的
<220>
<223>合成的引物
<400>177
uguucuaagg ugcaucuagu gcagauagug aaguagauua gcaucuacug cccuaagugc    60
uccuucuggc a                                                         71
<210>178
<211>80
<212>RNA
<213>人工的
<220>
<223>合成的引物
<400>178
cugggggcuc caaagugcug uucgugcagg uagugugauu accugaccua cugcugagcu    60
agcacuuccc gagcccccgg                                                80
<210>179
<211>81
<212>RNA
<213>人工的
<220>
<223>合成的引物
<400>179
ccuuggccau guaaaagugc uuacagugca gguagcuuuu ugagaucuac ugcaaugcaa    60
gcacuucuua cauuaccaug g                                              81
<210>180
<211>84
<212>RNA
<213>人工的
<220>
<223>合成的引物
<400>180
gucagaauaa ugucaaagug cuuacagugc agguagugau augugcaucu acugcaguga    60
aggcacuugu agcauuaugg ugac                                           84
<210>181
<211>71
<212>RNA
<213>人工的
<220>
<223>合成的引物
<400>181
uguucuaagg ugcaucuagu gcagauagug aaguagauua gcaucuacug cccuaagugc    60
uccuucuggc a                                                         71
<210>182
<211>43
<212>RNA
<213>人工的
<220>
<223>合成的引物
<400>182
cuuguguuaa ggugcaucua gugcaguuag ugaagcagcu cag                      43
<210>183
<211>77
<212>RNA
<213>人工的
<220>
<223>合成的引物
<400>183
cugggggcuc caaagugcug uucgugcagg uagugugauc accugaccua cugcugagcc    60
agcacuuccc gagcccc                                                   77
<210>184
<211>138
<212>RNA
<213>人工的
<220>
<223>合成的引物
<400>184
ggacuuucuu gaguggacuu gguugguguc aauguauugu caaagugcuu acagugcagg    60
uaguauuaug gaauaucuac ugcaguggag gcacuucuag caauacacuu gaccauuuua   120
accuuccucc aggcaucc                                                 138
<210>185
<211>83
<212>RNA
<213>人工的
<220>
<223>合成的引物
<400>185
gucacuguag ugucaaagug cuuacagugc agguaguuca auauaaucua cugcagugga    60
ggcacuucaa gcuuuaccgu gac                                            83
<210>186
<211>83
<212>RNA
<213>人工的
<220>
<223>合成的引物
<400>186
ggcuuugugc uaaggugcau cuagugcaga uagugaagua gacuagcacc uacugcccua    60
agugcuccuu cuggcacgag ggu                                            83
<210>187
<211>87
<212>RNA
<213>人工的
<220>
<223>合成的引物
<400>187
uacugcuuau gcuaaggugc auuuagugca gauagugaaa uagacuagca ccuacugccc    60
uaagugcccc uucuggcaua aggggcu                                        87
<210>188
<211>85
<212>RNA
<213>人工的
<220>
<223>合成的引物
<400>188
gccuuccugc uaaggugcau cuuguguagu uagugaagua gucuaguauc uacugcgcua    60
gauguuccuu uuggcaggag uagcu                                          85
<210>189
<211>74
<212>RNA
<213>人工的
<220>
<223>合成的引物
<400>189
guguguguua aaagugcugu uugugcaggu aguguguuuc cucuacugua ggagcagcac    60
uucacaacac acac                                                      74
<210>190
<211>86
<212>RNA
<213>人工的
<220>
<223>合成的引物
<400>190
gucuguguau ugccaaagug cuuacagugc agguaguucu augugacacc uacugcaaug   60
gaggcacuua cagcaguacu cuugac                                        86
<210>191
<211>82
<212>RNA
<213>人工的
<220>
<223>合成的引物
<400>191
gucaaaguag ugucaaagug cuuacagugc agguaguuug augacaucua cugcagugaa    60
ggcacuuuca gcgcuauucu ga                                             82
<210>192
<211>76
<212>RNA
<213>人工的
<220>
<223>合成的引物
<400>192
uugugcuaag gugcaucuag ugcagauagu gaaauagacu agcaccuacu gcccuaagug     60
cuccuucugg cauaag                                                     76
<210>193
<211>81
<212>RNA
<213>人工的
<220>
<223>合成的引物
<400>193
ccuugaguug ugcaaaagug cuuacagugc agguagagcu cagcaccuac ugcaguauaa    60
gcacuucugg caugaccgug g                                              81
<210>194
<211>85
<212>RNA
<213>人工的
<220>
<223>合成的引物
<400>194
gucagaguaa ugucaaagug cuuacagugc agguagugau auauagaacc uacugcagug    60
aaggcacuug uagcauuaug uugac                                          85
<210>195
<211>93
<212>RNA
<213>人工的
<220>
<223>合成的引物
<400>195
gugcuuuuug uacuaaggug caucuagugc agauagugaa guagauuagc aucuacugcc    60
cuaagugcuc cuucuggcau aagaaguuau guc                                 93
<210>196
<211>84
<212>RNA
<213>人工的
<220>
<223>合成的引物
<400>196
cgugguccuu guguuaaggu gcaucuagug caguuaguga cguagcguag aaucuacugc    60
ccuaaaugcu ccuucuggca caag                                           84
<210>197
<211>81
<212>RNA
<213>人工的
<220>
<223>合成的引物
<400>197
ccuuggccau guaaaagugc uuacagugca gguagcuuuu ugagaucuac ugcaaugcaa     60
gcacuucuua cauuaccaug g                                               81
<210>198
<211>82
<212>RNA
<213>人工的
<220>
<223>合成的引物
<400>198
ccugccgggg cuaaagugcu  gacagugcag auaguggucc ucuccgugcu accgcacugu    60
ggguacuugc ugcuccagca gg                                             82
<210>199
<211>84
<212>RNA
<213>人工的
<220>
<223>合成的引物
<400>199
gucagaauaa ugucaaagug cuuacagugc agguagugau augugcaucu acugcaguga    60
aggcacuugu agcauuaugg ugac                                           84
<210>200
<211>71
<212>RNA
<213>人工的
<220>
<223>合成的引物
<400>200
uguucuaagg ugcaucuagu gcagauagug aaguagauua gcaucuacug cccuaagugc    60
uccuucuggc a                                                         71
<210>201
<211>80
<212>RNA
<213>人工的
<220>
<223>合成的引物
<400>201
cugggggcuc caaagugcug uucgugcagg uagugugauu acccgaccua cugcugagcu    60
agcacuuccc gagcccccgg                                                80
<210>202
<211>81
<212>RNA
<213>人工的
<220>
<223>合成的引物
<400>202
ccuuggccau guaaaagugc uuacagugca gguagcuuuu ugagaucuac ugcaauguaa    60
gcacuucuua cauuaccaug g                                              81
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<211>82
<212>RNA
<213>人工的
<220>
<223>合成的引物
<400>203
ccugccgggg cuaaagugcu gacagugcag auaguggucc ucuccgugcu accgcacugu    60
ggguacuugc ugcuccagca gg                                             82
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<212>RNA
<213>人工的
<220>
<223>合成的引物
<400>204
gucagaauaa ugucaaagug cuuacagugc agguagugau augugcaucu acugcaguga    60
aggcacuugu agcauuaugg ugac                                           84
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<212>RNA
<213>人工的
<220>
<223>合成的引物
<400>205
uguucuaagg ugcaucuagu gcagauagug aaguagauua gcaucuacug cccuaagugc    60
uccuucuggc a                                                         71
<210>206
<211>71
<212>RNA
<213>人工的
<220>
<223>合成的引物
<400>206
uguguuaagg ugcaucuagu gcaguuagug aagcagcuua gaaucuacug cccuaaaugc    60
cccuucuggc a                                                         71
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<211>80
<212>RNA
<213>人工的
<220>
<223>合成的引物
<400>207
cugggggcuc caaagugcug uucgugcagg uagugugauu acccaaccua cugcugagcu    60
agcacuuccc gagcccccgg                                                80
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<211>84
<212>RNA
<213>人工的
<220>
<223>合成的引物
<400>208
gucagaauaa ugucaaagug cuuacagugc agguagugau augugcaucu acugcaguga    60
aggcacuugu agcauuaugg ugac                                           84
<210>209
<211>71
<212>RNA
<213>人工的
<220>
<223>合成的引物
<400>209
uguucuaagg ugcaucuagu gcagauagug aaguagauua gcaucuacug cccuaagugc    60
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<210>210
<211>81
<212>RNA
<213>人工的
<220>
<223>合成的引物
<400>210
ccugccgggg cuaaagugcu gacagugcag auaguguccu cuccgugcua ccgcacugug    60
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<210>211
<211>84
<212>RNA
<213>人工的
<220>
<223>合成的引物
<400>211
gucagaauaa ugucaaagug cuuacagugc agguagugau augugcaucu acugcaguga    60
aggcacuugu agcauuaugg ugac                                           84
<210>212
<211>71
<212>RNA
<213>人工的
<220>
<223>合成的引物
<400>212
uguucuaagg ugcaucuagu gcagauagug aaguagauua gcaucuacug cccuaagugc    60
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<211>80
<212>RNA
<213>人工的
<220>
<223>合成的引物
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cucggggcuc caaagugcug uucgugcagg uagugugauu accugaccua cugcugagcu    60
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<210>214
<211>85
<212>RNA
<213>人工的
<220>
<223>合成的引物
<400>214
gucagaauaa ugucaaagug cuuacagugc agguagugau auguagaauc uacugcagug    60
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<210>215
<211>72
<212>RNA
<213>人工的
<220>
<223>合成的引物
<400>215
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<210>216
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<213>人工的
<220>
<223>合成的引物
<400>216
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<212>RNA
<213>人工的
<220>
<223>合成的引物
<400>217
ccuuggccau guaaaagugc uuacagugca gguagcuuuu ugagaucuac ugcaaugcaa    60
gcacuucuua cauuaccaug g                                              81
<210>218
<211>82
<212>RNA
<213>人工的
<220>
<223>合成的引物
<400>218
ccugcugggg cuaaagugcu gacagugcag auaguggucc ucuccgugcu accgcacugu    60
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<210>219
<211>84
<212>RNA
<213>人工的
<220>
<223>合成的引物
<400>219
gucagaauaa ugucaaagug cuuacagugc agguagugau augugcaucu acugcaguga    60
aggcacuugu agcauuaugg ugac                                           84
<210>220
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<212>RNA
<213>人工的
<220>
<223>合成的引物
<400>220
uguucuaagg ugcaucuagu  gcagauagug aaguagauua gcaucuacug cccuaagugc    60
uccuucuggc a                                                         71
<210>221
<211>80
<212>RNA
<213>人工的
<220>
<223>合成的引物
<400>221
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<212>RNA
<213>人工的
<220>
<223>合成的引物
<400>222
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<211>82
<212>RNA
<213>人工的
<220>
<223>合成的引物
<400>223
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ggguacuugc ugcuccagca gg                                             82
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<212>RNA
<213>人工的
<220>
<223>合成的引物
<400>224
gucagaauaa ugucaaagug cuuacagugc agguagugau gugugcaucu acugcaguga    60
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<212>RNA
<213>人工的
<220>
<223>合成的引物
<400>225
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<210>226
<211>88
<212>RNA
<213>人工的
<220>
<223>合成的引物
<400>226
agucaugggg gcuccaaagu gcuguucgug cagguagugu aauuaccuga ccuacugcug    60
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<212>RNA
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<220>
<223>合成的引物
<400>227
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<220>
<223>合成的引物
<400>228
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<212>RNA
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<220>
<223>合成的引物
<400>229
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<220>
<223>合成的引物
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<220>
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ccuuggccau guaaaagugc uuacagugca gguagcuuuu ugagaucuac ugcaaugcaa    60
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<220>
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<212>RNA
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<220>
<223>合成的引物
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aggcacuugu agcauuaugg ugac                                           84
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<211>71
<212>RNA
<213>人工的
<220>
<223>合成的引物
<400>235
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<211>80
<212>RNA
<213>人工的
<220>
<223>合成的引物
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<220>
<223>合成的引物
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<220>
<223>合成的引物
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<220>
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<211>71
<212>RNA
<213>人工的
<220>
<223>合成的引物
<400>240
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<212>RNA
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<220>
<223>合成的引物
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cugggggcuc caaagugcug uucgugcagg uagugugauu acccgaccua cugcugagcu    60
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<211>81
<212>RNA
<213>人工的
<220>
<223>合成的引物
<400>242
ccuuggccau guaaaagugc uuacagugca gguagcuuuu ugagaucuac ugcaaugcaa    60
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<220>
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<220>
<223>合成的引物
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gucagaauaa ugucaaagug cuuacagugc agguagugau augugcaucu acugcaguga    60
aggcacuugu agcauuaugg ugac                                           84
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<212>RNA
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<220>
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<400>245
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<212>RNA
<213>人工的
<220>
<223>合成的引物
<400>246
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<212>RNA
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<220>
<223>合成的引物
<400>247
ccugcuggga cuaaagugcu gacagugcag auaguggucc ucucugugcu accgcacugu    60
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<220>
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<223>合成的引物
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<212>RNA
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<211>82
<212>RNA
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<223>合成的引物
<400>252
ccugccgggg cuaaagugcu gacagugcag auaguggucc ucuccgugcu accgcacugu    60
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<212>RNA
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<220>
<223>合成的引物
<400>253
gucagaauaa ugucaaagug cuuacagugc agguagugau augugcaucu acugcaguga    60
aggcacuugu agcauuaugg ugac                                           84
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<211>71
<212>RNA
<213>人工的
<220>
<223>合成的引物
<400>254
uguucuaagg ugcaucuagu gcagauagug aaguagauua gcaucuacug cccuaagugc    60
uccuucuggc a                                                         71
<210>255
<211>80
<212>RNA
<213>人工的
<220>
<223>合成的引物
<400>255
cugggggcuc caaagugcug uucgugcagg uagugugauu acccaaccua cugcugagcu    60
agcacuuccc gagcccccgg                                                80
<210>256
<211>81
<212>RNA
<213>人工的
<220>
<223>合成的引物
<400>256
ccuuggccgu guaaaagugc uuacagugca gguagcuuuu ugagaucuac ugcaaugcaa    60
gcacuucuua cauuaccaug g                                              81
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<211>92
<212>RNA
<213>人工的
<220>
<223>合成的引物
<400>257
gugcuuuuug uucuaaggug caucuagugc agauagugaa guagauuagc aucuacugcc    60
cuaagugcuc cuucuggcau aagaaguuau gu                                  92
<210>258
<211>86
<212>RNA
<213>人工的
<220>
<223>合成的引物
<400>258
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gaggcacuua cagcaguacu cuugac                                         86
<210>259
<211>82
<212>RNA
<213>人工的
<220>
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<400>259
gucaccguag ugucaaagug cuuacagugc agguaguuaa aagaaaucua cugcagugaa    60
ggcacuuuca gcacuauucu ga                                             82
<210>260
<211>76
<212>RNA
<213>人工的
<220>
<223>合成的引物
<400>260
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cuccuucugg cauaag                                                    76
<210>261
<211>79
<212>RNA
<213>人工的
<220>
<223>合成的引物
<400>261
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<210>262
<211>63
<212>RNA
<213>人工的
<220>
<223>合成的引物
<400>262
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<210>263
<211>87
<212>RNA
<213>人工的
<220>
<223>合成的引物
<400>263
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<210>264
<211>87
<212>RNA
<213>人工的
<220>
<223>合成的引物
<400>264
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<210>265
<211>78
<212>RNA
<213>人工的
<220>
<223>合成的引物
<400>265
ccuuguguua aggugcaucu agugcaguua gugacauagu guagcaucua cugcccuaaa    60
ugcuccuuuu ggcacagg                                                  78
<210>266
<211>73
<212>RNA
<213>人工的
<220>
<223>合成的引物
<400>266
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<210>267
<211>64
<212>RNA
<213>人工的
<220>
<223>合成的引物
<400>267
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<210>268
<211>17
<212>RNA
<213>人工的
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<223>合成的引物
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<400>268
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<210>269
<211>21
<212>RNA
<213>人工的
<220>
<223>合成的引物
<400>269
yaaagugcuy ayagugcagg u    21

Claims (46)

1.调节细胞中基因表达的方法,包括向细胞施用一定量分离的核酸,所述一定量分离的核酸包含足以调节表1、3、4或5中所鉴定一个或一个以上基因表达的量的miR-20核酸序列。
2.权利要求1的方法,其中细胞位于患有、怀疑患有或者有危险发展成代谢性、免疫性、传染性、心血管、消化性、内分泌、眼、泌尿生殖、血液、肌肉骨骼、神经系统、先天性、呼吸、皮肤或癌性疾病或状况的受试者内。
3.权利要求2的方法,其中传染性疾病或状况是寄生虫、细菌、病毒或真菌感染。
4.权利要求2的方法,其中癌性状况是其中调节一个或一个以上基因足以引起治疗反应的星形细胞瘤、急性髓性白血病、乳腺癌、膀胱癌、宫颈癌、结直肠癌、子宫内膜癌、食管鳞状细胞癌、神经胶质瘤、成胶质细胞瘤、胃癌、肝细胞癌、霍奇金淋巴瘤、白血病、脂肪瘤、黑素瘤、套细胞淋巴瘤、粘液纤维肉瘤、多发性骨髓瘤、神经母细胞瘤、非霍奇金淋巴瘤、肺癌、非小细胞肺癌、卵巢癌、食管癌、骨肉瘤、胰腺癌、前列腺癌、头颈部鳞状细胞癌、甲状腺癌、尿路上皮癌。
5.权利要求1的方法,其中基因表达被下调。
6.权利要求1的方法,其中细胞是上皮细胞、基质细胞或黏膜细胞。
7.权利要求1的方法,其中细胞是脑细胞、神经元细胞、血液细胞、食管细胞、肺细胞、心血管细胞、肝细胞、乳腺细胞、骨细胞、甲状腺细胞、腺细胞、肾上腺细胞、胰细胞、胃细胞、肠细胞、肾细胞、膀胱细胞、前列腺细胞、子宫细胞、卵巢细胞、睾丸细胞、脾细胞、皮肤细胞、平滑肌细胞、心肌细胞、横纹肌细胞。
8.权利要求1的方法,其中细胞是癌症细胞。
9.权利要求8的方法,其中癌症细胞是神经元细胞、神经胶质细胞、肺细胞、肝细胞、脑细胞、乳腺细胞、膀胱细胞、血液细胞、白血病细胞、结肠细胞、子宫内膜细胞、胃细胞、皮肤细胞、卵巢细胞、脂肪细胞、骨细胞、宫颈细胞、食管细胞、胰细胞、前列腺细胞、肾细胞或甲状腺细胞。
10.权利要求1的方法,其中分离的miR-20核酸是重组核酸。
11.权利要求10的方法,其中重组核酸是RNA。
12.权利要求10的方法,其中重组核酸是DNA。
13.权利要求12的方法,其中重组核酸包含miR-20表达盒。
14.权利要求13的方法,其中表达盒包含在病毒载体或质粒DNA载体中。
15.权利要求14的方法,其中病毒载体以每一剂量1×105至1×1014个病毒颗粒的剂量施用或者质粒DNA载体以每一患者100mg至每一患者4000mg的剂量施用。
16.权利要求1的方法,其中miR-20核酸是合成的核酸。
17.权利要求16的方法,其中核酸是以0.01mg/kg体重至10mg/kg体重的剂量施用。
18.权利要求1的方法,其中miR-20是hsa-miR-20。
19.权利要求1的方法,其中miR-20是miR-20a。
20.权利要求1的方法,其中核酸是肠内或肠胃外施用。
21.权利要求20的方法,其中肠内施用是口服。
22.权利要求20的方法,其中肠胃外施用是血管内施用、颅内施用、胸膜内施用、瘤内施用、腹膜内施用、肌内施用、淋巴内施用、腺内施用、皮下施用、局部施用、支气管内施用、气管内施用、鼻内施用、吸入施用或滴注施用。
23.权利要求1的方法,其中核酸是包含在药物制剂中。
24.权利要求23的方法,其中药物制剂是脂质组合物。
25.调节细胞途径或者生理途径的方法,包括向细胞施用一定量的分离的核酸,所述分离的核酸包含足以调节细胞途径或者生理途径量的miR-20核酸序列,细胞途径或者生理途径包含表1、3、4或5中所鉴定的一个或一个以上基因或者与表1、3、4或5中所鉴定的一个或一个以上基因相关的基因产物。
26.权利要求25的方法,还包括施用2、3、4、5、6或更多个miRNA。
27.权利要求26的方法,其中miRNA包含在单一组合物中。
28.权利要求23的方法,其中至少两个细胞途径或者生理途径被调节。
29.权利要求26的方法,其中至少一个基因被多个miRNA调节。
30.权利要求25的方法,其中基因表达或基因产物被下调。
31.权利要求25的方法,其中基因表达或基因产物被上调。
32.权利要求25的方法,其中细胞是癌症细胞。
33.权利要求32的方法,其中细胞活力降低,细胞增殖减少,细胞转移减少或者细胞对治疗的敏感性增加。
34.权利要求32的方法,其中癌症细胞是神经元细胞、神经胶质细胞、肺细胞、肝细胞、脑细胞、乳腺细胞、膀胱细胞、血液细胞、白血病细胞、结肠细胞、子宫内膜细胞、胃细胞、皮肤细胞、卵巢细胞、脂肪细胞、骨细胞、宫颈细胞、食管细胞、胰细胞、前列腺细胞、肾细胞或甲状腺细胞。
35.权利要求25的方法,其中分离的miR-20核酸是重组核酸。
36.权利要求35的方法,其中重组核酸是DNA。
37.权利要求36的方法,其中重组核酸是病毒载体或质粒DNA载体。
38.权利要求25的方法,其中miR-20a核酸是合成核酸。
39.治疗诊断患有或者怀疑患有或者怀疑发展成与miRNA所调节基因相关病理状况或疾病的患者的方法,包括步骤:
(a)向患者施用一定量分离的核酸,所述一定量分离的核酸包含足以调节细胞途径或者生理途径的量的miR-20核酸序列;和
(b)施用第二治疗法,其中细胞途径或者生理途径的调节使患者对第二治疗法敏感。
40.权利要求39的方法,其中一个或一个以上细胞途径或者生理途径包含表1、3、4或5中鉴定的一个或一个以上基因。
41.选择待向患有、怀疑患有或者倾向发展成病理状况或者疾病的受试者施用的miRNA的方法,包括:
(a)确定选自表1、3、4或5的一个或一个以上基因的表达谱;
(b)基于表达谱评估受试者对miRNA治疗的敏感性;和
(c)基于所评估的敏感性选择一个或一个以上miRNA。
42.权利要求41的方法,还包括用1、2、4、5、6、7、8、9、10或更多个miRNA治疗受试者。
43.权利要求42的方法,其中每一miRNA单独施用或者一种或一种以上组合施用。
44.权利要求43的方法,其中miRNA在单一组合物中。
45.评估细胞、组织或者受试者的方法,包括在至少一个样品中评估miR-20的表达与评估来自表1、3、4或5的一个或一个以上基因的表达相联合。
46.评估样品中miR-20状态的方法,包括步骤:
(a)评估样品中来自表1、3、4或5的一个或一个以上基因的表达;和
(b)基于样品中miR-20表达水平确定miR-20状态。
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Cited By (29)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
CN102296114A (zh) * 2011-08-12 2011-12-28 中国人民解放军第三军医大学第一附属医院 miRNA-20a及其抑制剂在制备胶质瘤干细胞侵袭调控剂中的应用
CN102776194A (zh) * 2012-07-20 2012-11-14 苏州大学 微小rna用于调控pten基因表达
CN102772803A (zh) * 2011-05-12 2012-11-14 北京大学 Unc5cl及其编码蛋白的应用
CN103397035A (zh) * 2013-08-14 2013-11-20 重庆大学 miRNA-20a作为哺乳动物宿主细胞凋亡调控靶标的应用
CN104013975A (zh) * 2014-06-16 2014-09-03 山东大学 Fbxo31基因及其相关产物在制备胃癌治疗药物中的应用
CN104611336A (zh) * 2015-02-09 2015-05-13 上海长海医院 融合基因ttty15-usp9y及其作为前列腺癌标志物的应用
CN106086178A (zh) * 2016-06-16 2016-11-09 朱伟 一种与胃癌辅助诊断相关的血清miRNA标志物及其应用
CN106119341A (zh) * 2016-04-14 2016-11-16 冯同保 miR‑20a抑制剂的用途、药物组合物和试剂盒
CN107144695A (zh) * 2017-04-19 2017-09-08 南昌大学 Arl13b蛋白在癌症诊断中的应用
CN107723366A (zh) * 2017-09-11 2018-02-23 朱伟 一种与贲门癌辅助诊断相关的血清miRNA标志物及其应用
CN108025016A (zh) * 2015-09-16 2018-05-11 国立大学法人东北大学 核酸分子
CN108132349A (zh) * 2016-11-30 2018-06-08 北京大学 一种用于癫痫预后评估的生物标志物
CN108872588A (zh) * 2018-06-14 2018-11-23 华南农业大学 一种与种公猪繁殖性能密切相关的精子蛋白标记spaca4及其应用
CN110055328A (zh) * 2019-03-28 2019-07-26 昆明医科大学第一附属医院 一种基于代谢基因谱的肺腺癌诊断标志物
CN110791566A (zh) * 2019-10-29 2020-02-14 徐州市中心医院 人shcbp1基因的用途及相关产品
CN110835648A (zh) * 2018-08-15 2020-02-25 复旦大学附属肿瘤医院 NSrp70基因在制备用于肿瘤转移相关药物制剂中的应用
CN110938630A (zh) * 2019-12-20 2020-03-31 中国人民解放军第四军医大学 人b3gnt5基因的用途及相关产品
CN110970087A (zh) * 2019-12-31 2020-04-07 华中科技大学 一种鉴定调控细胞自噬的功能激酶的方法
CN111440771A (zh) * 2020-03-17 2020-07-24 中山大学附属第三医院 一种含有clcn2纯合突变的白质脑病患者特异诱导多能干细胞系
CN111471683A (zh) * 2020-04-15 2020-07-31 湖南省科域生物医药科技有限公司 miR-93-5p作为诊断和治疗胃癌标志物的应用
CN112342295A (zh) * 2019-08-06 2021-02-09 中山大学孙逸仙纪念医院 一种检测人结直肠癌的肿瘤标志物及其应用
CN112680476A (zh) * 2020-12-23 2021-04-20 南京景瑞康分子医药科技有限公司 Klhl22-depdc5蛋白相互作用筛选系统
CN112725338A (zh) * 2020-12-31 2021-04-30 中国水产科学研究院南海水产研究所 一种靶向斑节对虾trim9基因的小干扰rna及其用途
CN112908470A (zh) * 2021-02-08 2021-06-04 深圳市人民医院 一种基于rna结合蛋白基因的肝细胞癌预后评分系统及其应用
CN113045651A (zh) * 2021-03-24 2021-06-29 吉林大学 靶向Palladin蛋白Pal-11-15区段的抗体及在制备神经再生药物中的应用
CN113249474A (zh) * 2021-04-29 2021-08-13 中山大学附属第一医院 Pcdh20在预测肝癌化疗敏感性中的应用
CN114317775A (zh) * 2022-01-12 2022-04-12 中国人民解放军军事科学院军事医学研究院 一种NCOA4的RNA m6A修饰作为γ射线辐射标志物的应用
CN114350805A (zh) * 2022-01-14 2022-04-15 中国人民解放军陆军军医大学第一附属医院 Ablim1作为胶质瘤分子标志物的应用
CN114667355A (zh) * 2019-11-07 2022-06-24 基因特力株式会社 检测结直肠癌的方法

Families Citing this family (173)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
EP2290076B1 (en) 2004-05-28 2015-03-25 Asuragen, Inc. Methods and compositions involving microRNA
ES2507544T3 (es) 2004-11-12 2014-10-15 Asuragen, Inc. Procedimientos y composiciones que implican miARN y moléculas inhibidoras de miARN
CN103866017B (zh) 2005-08-01 2016-05-25 俄亥俄州立大学研究基金会 用于乳腺癌的诊断、预后和治疗的基于MicroRNA的方法和组合物
EP1937280B1 (en) 2005-09-12 2014-08-27 The Ohio State University Research Foundation Compositions for the therapy of bcl2-associated cancers
JP2009511482A (ja) * 2005-10-05 2009-03-19 ジ・オハイオ・ステイト・ユニバーシティ・リサーチ・ファウンデイション Wwox遺伝子、同じものを含むベクター、および癌の治療における使用
ES2461189T3 (es) 2006-01-05 2014-05-19 The Ohio State University Research Foundation Métodos basados en microARN y composiciones para el diagnóstico y el tratamiento de cánceres sólidos de mama o pulmón
CN103361424A (zh) 2006-01-05 2013-10-23 俄亥俄州立大学研究基金会 胰腺内分泌和腺泡肿瘤中的微小rna表达异常
EP2514433B1 (en) 2006-01-05 2015-10-21 The Ohio State University Research Foundation MicroRNA-based methods for the diagnosis, prognosis and treatment of lung cancer
WO2007109236A2 (en) 2006-03-20 2007-09-27 The Ohio State University Research Foundation Microrna fingerprints during human megakaryocytopoiesis
ES2434075T3 (es) 2006-07-13 2013-12-13 The Ohio State University Research Foundation MIR-203 para el diagnóstico de adenocarcinoma de colon con mal pronóstico de supervivencia
EP2061907B1 (en) 2006-09-19 2011-11-23 The Ohio State University Research Foundation Tcl1 expression in chronic lymphocytic leukemia (cll) regulated by mir-29 and mir-181
EP2145001A2 (en) * 2006-09-19 2010-01-20 Asuragen, Inc. Mir-15, mir-26, mir -31,mir -145, mir-147, mir-188, mir-215, mir-216 mir-331, mmu-mir-292-3p regulated genes and pathways as targets for therapeutic intervention
CA2667617A1 (en) 2006-11-01 2008-05-08 The Ohio State University Research Foundation Microrna expression signature for predicting survival and metastases in hepatocellular carcinoma
US20080131878A1 (en) * 2006-12-05 2008-06-05 Asuragen, Inc. Compositions and Methods for the Detection of Small RNA
EP2104735A2 (en) * 2006-12-08 2009-09-30 Asuragen, INC. Mir-21 regulated genes and pathways as targets for therapeutic intervention
CA2671194A1 (en) * 2006-12-08 2008-06-19 Asuragen, Inc. Mir-20 regulated genes and pathways as targets for therapeutic intervention
DK2104737T3 (da) * 2006-12-08 2013-05-27 Asuragen Inc Funktioner og formål for let-7 mikro-RNAer
US20090175827A1 (en) * 2006-12-29 2009-07-09 Byrom Mike W miR-16 REGULATED GENES AND PATHWAYS AS TARGETS FOR THERAPEUTIC INTERVENTION
JP2010516291A (ja) * 2007-01-31 2010-05-20 ジ・オハイオ・ステイト・ユニバーシティ・リサーチ・ファウンデイション 急性骨髄性白血病(aml)の診断、予後及び治療のためのマイクロrnaに基づく方法及び組成物
US20100204309A1 (en) * 2007-04-19 2010-08-12 Vib Vzw Oligonucleotide compositions for the treatment of alzheimer's disease
EP2481806B1 (en) * 2007-04-30 2016-11-09 The Ohio State University Research Foundation Methods for pancreatic cancer prognosis
US20090232893A1 (en) * 2007-05-22 2009-09-17 Bader Andreas G miR-143 REGULATED GENES AND PATHWAYS AS TARGETS FOR THERAPEUTIC INTERVENTION
US8415096B2 (en) 2007-05-23 2013-04-09 University Of South Florida Micro-RNAs modulating immunity and inflammation
AU2008261951A1 (en) * 2007-06-08 2008-12-18 Asuragen, Inc. miR-34 regulated genes and pathways as targets for therapeutic intervention
JP5690588B2 (ja) * 2007-06-08 2015-03-25 アメリカ合衆国 肝細胞癌のサブタイプを決定し、肝癌幹細胞を検出するための方法
WO2008157319A1 (en) 2007-06-15 2008-12-24 The Ohio State University Research Foundation ONCOGENIC ALL-1 FUSION PROTEINS FOR TARGETING DROSHA-MEDIATED microRNA PROCESSING
WO2009018303A2 (en) 2007-07-31 2009-02-05 The Ohio State University Research Foundation Methods for reverting methylation by targeting dnmt3a and dnmt3b
AU2008283997B2 (en) * 2007-08-03 2014-04-10 The Ohio State University Research Foundation Ultraconserved regions encoding ncRNAs
ES2562078T3 (es) * 2007-08-22 2016-03-02 The Ohio State University Research Foundation Métodos y composiciones para inducir la desregulación de la fosforilación de EphA7 y ERK en leucemias agudas humanas
WO2009036332A1 (en) 2007-09-14 2009-03-19 Asuragen, Inc. Micrornas differentially expressed in cervical cancer and uses thereof
EP2212440A4 (en) * 2007-10-11 2011-04-06 Univ Ohio State Res Found METHOD AND COMPOSITIONS FOR DIAGNOSIS AND TREATMENT OF ADENOCARCINOMES OF DISHES
US20090186015A1 (en) * 2007-10-18 2009-07-23 Latham Gary J Micrornas differentially expressed in lung diseases and uses thereof
JP2011504093A (ja) 2007-10-26 2011-02-03 ジ・オハイオ・ステイト・ユニバーシティ・リサーチ・ファウンデイション 脆弱性ヒスチジン三連構造(fhit)相互作用を同定するための方法およびその使用
US20100323357A1 (en) * 2007-11-30 2010-12-23 The Ohio State University Research Foundation MicroRNA Expression Profiling and Targeting in Peripheral Blood in Lung Cancer
WO2009070805A2 (en) * 2007-12-01 2009-06-04 Asuragen, Inc. Mir-124 regulated genes and pathways as targets for therapeutic intervention
US20090192114A1 (en) * 2007-12-21 2009-07-30 Dmitriy Ovcharenko miR-10 Regulated Genes and Pathways as Targets for Therapeutic Intervention
US20090263803A1 (en) * 2008-02-08 2009-10-22 Sylvie Beaudenon Mirnas differentially expressed in lymph nodes from cancer patients
AU2009219203B2 (en) * 2008-02-28 2014-04-03 The Ohio State University Research Foundation MicroRNA signatures associated with cytogenetics and prognosis in acute myeloid leukemia (AML) and uses thereof
US20110054009A1 (en) * 2008-02-28 2011-03-03 The Ohio State University Research Foundation MicroRNA-Based Methods and Compositions for the Diagnosis, Prognosis and Treatment of Prostate Related Disorders
WO2009108856A2 (en) * 2008-02-28 2009-09-03 The Ohio State University Research Foundation Microrna signatures associated with human chronic lymphocytic leukemia (ccl) and uses thereof
WO2009154835A2 (en) * 2008-03-26 2009-12-23 Asuragen, Inc. Compositions and methods related to mir-16 and therapy of prostate cancer
US20090258928A1 (en) * 2008-04-08 2009-10-15 Asuragen, Inc. Methods and compositions for diagnosing and modulating human papillomavirus (hpv)
JP5750710B2 (ja) * 2008-04-30 2015-07-22 日本電気株式会社 癌マーカー、それを用いた癌の評価方法および評価試薬
EP2990487A1 (en) 2008-05-08 2016-03-02 Asuragen, INC. Compositions and methods related to mirna modulation of neovascularization or angiogenesis
JP5745401B2 (ja) 2008-06-11 2015-07-08 アメリカ合衆国 肝細胞癌についての予測マーカーとしてのMiR−26ファミリーの使用および療法に対する反応性
EP4219760A3 (en) * 2008-11-10 2023-09-06 Battelle Memorial Institute Methods, compositions, and devices utilizing microrna to determine physiological conditions
US20110294692A1 (en) * 2008-11-10 2011-12-01 John Dick Use of mir-126 for enhancing hematopoietic stem cell engraftment, for isolating hematopoietic stem cells, and for treating and monitoring the treatment of acute myeloid leukemia
WO2010056737A2 (en) * 2008-11-11 2010-05-20 Mirna Therapeutics, Inc. Methods and compositions involving mirnas in cancer stem cells
WO2011063382A1 (en) 2009-11-23 2011-05-26 The Ohio State University Materials and methods useful for affecting tumor cell growth, migration and invasion
JP2011149859A (ja) * 2010-01-22 2011-08-04 Igaku Seibutsugaku Kenkyusho:Kk 食道癌マーカー
EP2354246A1 (en) 2010-02-05 2011-08-10 febit holding GmbH miRNA in the diagnosis of ovarian cancer
JP6081798B2 (ja) * 2010-02-26 2017-02-15 メモリアル スローン−ケタリング キャンサー センター miRNAに関連する癌を検出および処置するための方法および組成物およびmiRNAインヒビターおよび標的
CN101899503B (zh) * 2010-04-21 2013-01-09 广州朗日生物技术有限公司 SYBR Green Ⅰ荧光定量PCR检测miR-126的方法
CN102140462B (zh) * 2010-04-29 2013-06-12 苏州吉玛基因股份有限公司 人miR-1260反义核酸及其应用
GB201014049D0 (en) * 2010-08-23 2010-10-06 Sistemic Uk Cell characterisation
CN102373204B (zh) * 2010-08-27 2013-02-20 复旦大学附属金山医院 一种转录水平基因表达调控的方法及应用
CN101921759B (zh) * 2010-09-08 2013-05-29 南京医科大学 一种与宫颈癌及其癌前病变相关的血清/血浆miRNA标志物及其应用
JP5931897B2 (ja) 2010-11-12 2016-06-08 ジ・オハイオ・ステイト・ユニバーシティ・リサーチ・ファウンデイションThe Ohio State University Research Foundation マイクロrna−21、ミスマッチ修復および結腸直腸癌に関連する物質および方法
CN103313706A (zh) 2010-11-15 2013-09-18 俄亥俄州立大学研究基金会 控制释放粘膜粘合系统
EP2772550B1 (en) 2010-11-17 2017-03-29 Interpace Diagnostics, LLC Mirnas as biomarkers for distinguishing benign from malignant thyroid neoplasms
GB2486424A (en) * 2010-12-13 2012-06-20 Univ Sussex Markers for plasma cell disorders
CA2828772A1 (en) 2011-03-07 2012-09-13 The Ohio State University Mutator activity induced by microrna-155 (mir-155) links inflammation and cancer
CN102286435B (zh) * 2011-06-23 2012-12-12 中国人民解放军第三军医大学 调控性ciapin1基因重组腺病毒及其制备方法和应用
EP3709022A1 (en) 2011-07-08 2020-09-16 Sloan-Kettering Institute for Cancer Research Uses of labeled hsp90 inhibitors
CA2844197A1 (en) * 2011-08-03 2013-02-07 The Charlotte-Mecklenburg Hospital Authority D/B/A Carolina Healthcare System Treatment of fibrosis using microrna-19b
US9644241B2 (en) 2011-09-13 2017-05-09 Interpace Diagnostics, Llc Methods and compositions involving miR-135B for distinguishing pancreatic cancer from benign pancreatic disease
AU2012323924A1 (en) 2011-10-14 2014-05-29 The Ohio State University Methods and materials related to ovarian cancer
US9745578B2 (en) 2011-11-30 2017-08-29 Cedars-Sinai Medical Center Targeting microRNA miR-409-3P to treat prostate cancer
JP2015504847A (ja) * 2011-11-30 2015-02-16 シーダーズ−サイナイ メディカル センター 前立腺癌骨転移および薬剤耐性肺癌を治療するためのマイクロrnamir−409−5p、mir−379、およびmir−154*の標的化
EP2790735A4 (en) 2011-12-13 2015-12-09 Ohio State Innovation Foundation METHODS AND COMPOSITIONS RELATING TO MIR-21 AND MIR-29A, EXOSOME INHIBITION, AND CANCER METASTASIS
CN102559876A (zh) * 2011-12-19 2012-07-11 苏州福英基因科技有限公司 癌症病理演变前期microrna-16-1水平原位杂交检测试剂盒及检测方法和应用
CN102443641A (zh) * 2011-12-19 2012-05-09 苏州福英基因科技有限公司 各种癌症病理演变前期microrna-16水平原位杂交检测试剂盒及检测方法和应用
CN104685065B (zh) 2012-01-20 2017-02-22 俄亥俄州立大学 浸润性和预后的乳腺癌生物标志物标签
WO2014093924A1 (en) 2012-12-13 2014-06-19 Moderna Therapeutics, Inc. Modified nucleic acid molecules and uses thereof
RS63237B1 (sr) 2012-11-26 2022-06-30 Modernatx Inc Terminalno modifikovana rnk
EP2749569A1 (en) 2012-12-28 2014-07-02 Annibale Alessandro Puca Variant of BPIFB4 protein
EP2946014A2 (en) 2013-01-17 2015-11-25 Moderna Therapeutics, Inc. Signal-sensor polynucleotides for the alteration of cellular phenotypes
KR20150133695A (ko) * 2013-02-05 2015-11-30 유니버시티 오브 조지아 리서치 파운데이션, 인코포레이티드 바이러스 제조를 위한 세포주 및 이의 사용 방법
CN103642928B (zh) * 2013-12-13 2015-06-10 山东大学 急性髓系白血病相关miRNA标志物组及其特异引物与应用
WO2015091902A2 (en) * 2013-12-19 2015-06-25 Comprehensive Biomarker Center Gmbh Determination of platelet-mirnas in alzheimer's disease
EP3041948B1 (en) 2014-11-10 2019-01-09 Modernatx, Inc. Alternative nucleic acid molecules containing reduced uracil content and uses thereof
CN104585160B (zh) * 2014-12-31 2016-07-06 上海师范大学 新型透明骨骼标本制作以及树脂保存方法
CN105203761B (zh) * 2015-09-22 2019-10-01 宁波中元生物科技有限公司 宫颈癌预后检测方法
EP3985116A1 (en) * 2015-10-15 2022-04-20 City of Hope Compounds and compositions including phosphorothioated oligodeoxynucleotide, and methods of use thereof
WO2017127750A1 (en) 2016-01-22 2017-07-27 Modernatx, Inc. Messenger ribonucleic acids for the production of intracellular binding polypeptides and methods of use thereof
CN117757795A (zh) 2016-03-07 2024-03-26 美国政府(由卫生和人类服务部的部长所代表) 微小rna及其使用方法
WO2017180587A2 (en) 2016-04-11 2017-10-19 Obsidian Therapeutics, Inc. Regulated biocircuit systems
CN105838804A (zh) * 2016-05-16 2016-08-10 苏州大学 MiR-17-5p恶性血液病辅助诊断试剂及应用
SI3458083T1 (sl) 2016-05-18 2023-03-31 Modernatx, Inc. Polinukleotidi, ki kodirajo interlevkin-12 (IL12) in njihova uporaba
CN105878264B (zh) * 2016-06-13 2018-11-09 山东大学 miR-21及其抑制剂在制备促进牙周组织再生药物中的应用
US20200069599A1 (en) 2016-06-14 2020-03-05 Modernatx, Inc. Stabilized formulations of lipid nanoparticles
US11174469B2 (en) 2016-06-29 2021-11-16 Crispr Therapeutics Ag Materials and methods for treatment of Amyotrophic Lateral Sclerosis (ALS) and other related disorders
US11564997B2 (en) 2016-06-29 2023-01-31 Crispr Therapeutics Ag Materials and methods for treatment of friedreich ataxia and other related disorders
WO2018002812A1 (en) 2016-06-29 2018-01-04 Crispr Therapeutics Ag Materials and methods for treatment of myotonic dystrophy type 1 (dm1) and other related disorders
CN110214149B (zh) 2016-07-06 2024-05-14 沃泰克斯药物股份有限公司 用于治疗疼痛相关病症的材料和方法
AU2017292173B2 (en) 2016-07-06 2022-01-13 Vertex Pharmaceuticals Incorporated Materials and methods for treatment of pain related disorders
RU2765874C2 (ru) 2016-10-26 2022-02-04 МОДЕРНАТиЭкс, ИНК. Матричные рибонуклеиновые кислоты для усиления иммунных ответов и способы их применения
EP3538067A1 (en) 2016-11-08 2019-09-18 Modernatx, Inc. Stabilized formulations of lipid nanoparticles
CN108070645A (zh) * 2016-11-11 2018-05-25 中国科学院上海生命科学研究院 Stx-t在预防和/或治疗贫血或其相关疾病的应用
WO2018102162A1 (en) * 2016-11-30 2018-06-07 Exosome Diagnostics, Inc. Methods and compositions to detect mutations in plasma using exosomal rna and cell free dna from non-small cell lung cancer patients
CN106636408A (zh) * 2016-12-27 2017-05-10 北京泱深生物信息技术有限公司 一种布加综合征诊断工具
US20190351039A1 (en) 2017-02-01 2019-11-21 Modernatx, Inc. Immunomodulatory therapeutic mrna compositions encoding activating oncogene mutation peptides
US11920148B2 (en) 2017-02-22 2024-03-05 Crispr Therapeutics Ag Compositions and methods for gene editing
EP3585898A1 (en) 2017-02-22 2020-01-01 CRISPR Therapeutics AG Materials and methods for treatment of spinocerebellar ataxia type 1 (sca1) and other spinocerebellar ataxia type 1 protein (atxn1) gene related conditions or disorders
EP3585807A1 (en) 2017-02-22 2020-01-01 CRISPR Therapeutics AG Materials and methods for treatment of early onset parkinson's disease (park1) and other synuclein, alpha (snca) gene related conditions or disorders
WO2018154459A1 (en) 2017-02-22 2018-08-30 Crispr Therapeutics Ag Materials and methods for treatment of primary hyperoxaluria type 1 (ph1) and other alanine-glyoxylate aminotransferase (agxt) gene related conditions or disorders
WO2018154462A2 (en) 2017-02-22 2018-08-30 Crispr Therapeutics Ag Materials and methods for treatment of spinocerebellar ataxia type 2 (sca2) and other spinocerebellar ataxia type 2 protein (atxn2) gene related conditions or disorders
CN108721646B (zh) * 2017-04-17 2021-10-01 中山大学 一种抑制病毒感染的方法及抗病毒药物
WO2018231990A2 (en) 2017-06-14 2018-12-20 Modernatx, Inc. Polynucleotides encoding methylmalonyl-coa mutase
CA3073211A1 (en) 2017-08-31 2019-03-07 Modernatx, Inc. Methods of making lipid nanoparticles
CN107385081B (zh) * 2017-08-31 2020-06-02 青岛泱深生物医药有限公司 一种与肾癌相关的基因及其应用
EP3714055A1 (en) 2017-11-21 2020-09-30 CRISPR Therapeutics AG Materials and methods for treatment of autosomal dominant retinitis pigmentosa
CN118773309A (zh) * 2017-11-30 2024-10-15 梅约医学教育与研究基金会 用于表征生物样品的方法
WO2019116234A1 (en) 2017-12-12 2019-06-20 Nestec S.A. Methods for determining microbiome ribosomal rna composition changes
CN111836892A (zh) 2017-12-21 2020-10-27 克里斯珀医疗股份公司 用于治疗2a型乌谢尔综合征的材料和方法
WO2019123430A1 (en) 2017-12-21 2019-06-27 Casebia Therapeutics Llp Materials and methods for treatment of usher syndrome type 2a and/or non-syndromic autosomal recessive retinitis pigmentosa (arrp)
WO2019129144A1 (zh) * 2017-12-27 2019-07-04 立森印迹诊断技术有限公司 一种用于检测食道肿瘤和/或胃肿瘤良恶性程度的分级模型及其应用
JP2021512090A (ja) 2018-01-30 2021-05-13 モデルナティーエックス, インコーポレイテッド 免疫細胞に薬剤を送達するための組成物及び方法
WO2019200171A1 (en) 2018-04-11 2019-10-17 Modernatx, Inc. Messenger rna comprising functional rna elements
CN109207429A (zh) * 2018-05-04 2019-01-15 窦科峰 永生化的α-1,3-半乳糖转移酶基因敲除猪肝细胞系及其制备方法和应用
CN108704135A (zh) * 2018-05-24 2018-10-26 江苏大学附属医院 Chaf1a抑制剂在制备胃癌治疗药物中的用途
WO2019241315A1 (en) 2018-06-12 2019-12-19 Obsidian Therapeutics, Inc. Pde5 derived regulatory constructs and methods of use in immunotherapy
CN109022587B (zh) * 2018-09-13 2022-02-22 南京求臻基因科技有限公司 一种急性髓系白血病的miRNA标志物及其应用
EP3852728B1 (en) 2018-09-20 2024-09-18 ModernaTX, Inc. Preparation of lipid nanoparticles and methods of administration thereof
WO2020086742A1 (en) 2018-10-24 2020-04-30 Obsidian Therapeutics, Inc. Er tunable protein regulation
CN109652540A (zh) * 2018-12-21 2019-04-19 思泰得精准(北京)医学检验实验室有限公司 一种甲状腺癌早期检测分子标志物及其应用
CN109674809B (zh) * 2018-12-27 2022-08-09 吉林大学 一种包括miR-124-3P的组合物及其在诱导神经元形成的药物中的应用
CN111467493A (zh) * 2019-01-23 2020-07-31 首都师范大学 人rev3l蛋白切割抑制剂及其应用
CN118697900A (zh) 2019-01-31 2024-09-27 摩登纳特斯有限公司 制备脂质纳米颗粒的方法
CN109652556B (zh) * 2019-02-28 2020-08-21 中南大学 circARHGAP12及其在制备鼻咽癌诊断制剂中的应用和诊断制剂
CN109762904A (zh) * 2019-03-05 2019-05-17 中国医学科学院北京协和医院 与胰腺神经内分泌肿瘤相关的分子标记物及其应用
CA3132840A1 (en) 2019-03-08 2020-09-17 Obsidian Therapeutics, Inc. Human carbonic anhydrase 2 compositions and methods for tunable regulation
CN110029161A (zh) * 2019-05-16 2019-07-19 中国人民解放军第四军医大学 Charge综合征致病基因chd7突变检测试剂盒
CN110184338B (zh) * 2019-05-31 2023-04-07 南方医科大学第三附属医院(广东省骨科研究院) 脑脊液外泌体miRNA在MMD诊断和治疗中的应用
EP3987027A1 (en) 2019-06-24 2022-04-27 ModernaTX, Inc. Endonuclease-resistant messenger rna and uses thereof
MA56517A (fr) 2019-06-24 2022-04-27 Modernatx Inc Arn messager comprenant des éléments d'arn fonctionnels et leurs utilisations
CN110305960A (zh) * 2019-07-03 2019-10-08 江苏医药职业学院 检测锌指蛋白622表达水平的试剂的应用和试剂盒
CN110358827A (zh) * 2019-07-09 2019-10-22 中国人民解放军第四军医大学 Vmp1基因在病理诊断胶质母细胞瘤中的应用及其试剂盒的制备
CN110420328B (zh) * 2019-07-19 2021-10-29 蚌埠医学院第一附属医院 Syt14抑制剂在制备肺癌治疗药物中的用途
US20220348937A1 (en) 2019-09-06 2022-11-03 Obsidian Therapeutics, Inc. Compositions and methods for dhfr tunable protein regulation
CN110456085A (zh) * 2019-09-20 2019-11-15 四川大学华西医院 Syt12自身抗体检测试剂在制备肺癌筛查试剂盒中的用途
EP4036222A4 (en) * 2019-09-26 2023-10-25 Oricell Therapeutics Co., Ltd. MODIFIED IMMUNE CELL AND USE THEREOF
IT201900025126A1 (it) * 2019-12-20 2021-06-20 Sildeha Swiss S A Uso di derivati dell’acido ialuronico nella rigenerazione dei tessuti ossei e cartilaginei
CN111141904B (zh) * 2020-01-07 2021-08-24 浙江大学 一种鉴定、分选、清除衰老细胞的方法和应用
WO2021155274A1 (en) 2020-01-31 2021-08-05 Modernatx, Inc. Methods of preparing lipid nanoparticles
CN111562395A (zh) * 2020-06-11 2020-08-21 青岛大学 一种胰腺癌肿瘤的标志物及其应用和试剂盒
JP2023535225A (ja) 2020-07-24 2023-08-16 ストランド セラピューティクス インコーポレイテッド 改変ヌクレオチドを含む脂質ナノ粒子
CN112760375A (zh) * 2020-08-04 2021-05-07 佛山科学技术学院 一种特征miRNA表达谱组合及子宫内膜癌早期预测方法
IL300404A (en) 2020-08-06 2023-04-01 Modernatx Inc Methods for preparing fat nanoparticles
CN111789965B (zh) * 2020-08-14 2023-05-23 福建医科大学附属协和医院 一种miR-522-3p吸附因子在制备治疗癌症的药物中的应用
CN112578116A (zh) * 2020-11-05 2021-03-30 南京师范大学 Clu和prkd3及其下调或抑制剂在三阴性乳腺癌检测分型和治疗及疗效评估中的应用
TW202241931A (zh) 2021-01-08 2022-11-01 美商斯特蘭德治療股份有限公司 表現構築體及其用途
CN112915196B (zh) * 2021-03-15 2024-01-09 中国人民解放军北部战区总医院 Creg1蛋白用于预防或治疗索拉非尼诱导的心肌损伤的医药用途
CN115212308B (zh) * 2021-04-15 2023-10-20 中国医学科学院基础医学研究所 Gasdermin e通路的靶向剂在治疗胰腺癌中的应用
CN113249472B (zh) * 2021-04-27 2023-02-21 首都医科大学附属北京妇产医院 一种zbtb5基因在宫颈癌紫杉醇耐药性检测和治疗中的应用
WO2022233880A1 (en) 2021-05-03 2022-11-10 Curevac Ag Improved nucleic acid sequence for cell type specific expression
CN113750219B (zh) * 2021-09-09 2023-01-17 中国人民解放军海军军医大学 Tmem184c在制备预防或治疗乙型脑炎病毒感染药物中的应用
CN113797219B (zh) * 2021-09-13 2023-03-31 温州医科大学附属第一医院 Xpr1抑制剂在制备抑制甲状腺癌细胞迁移和/或增殖的产品的应用
CN113789396B (zh) * 2021-09-15 2024-01-23 复旦大学附属中山医院 一种用于检测食管癌患者特定肠道菌群占比的基因组合物及其应用
CN114032236B (zh) * 2021-09-24 2023-04-07 南通市肿瘤医院 一种TMEM2的shRNA及其应用
CN114660284A (zh) * 2022-02-23 2022-06-24 上海市杨浦区市东医院 一种预测肝癌侵袭转移的生物标志物及其应用
WO2023166425A1 (en) 2022-03-01 2023-09-07 Crispr Therapeutics Ag Methods and compositions for treating angiopoietin-like 3 (angptl3) related conditions
AU2023262576A1 (en) 2022-04-26 2024-10-10 Strand Therapeutics Inc. Lipid nanoparticles comprising venezuelan equine encephalitis (vee) replicon and uses thereof
CN114752675B (zh) * 2022-05-06 2022-09-30 济南市中心医院 一种用于胃癌筛查、预后及免疫治疗评估的分子标记物及其应用
WO2024026487A1 (en) 2022-07-29 2024-02-01 Modernatx, Inc. Lipid nanoparticle compositions comprising phospholipid derivatives and related uses
WO2024026475A1 (en) 2022-07-29 2024-02-01 Modernatx, Inc. Compositions for delivery to hematopoietic stem and progenitor cells (hspcs) and related uses
WO2024026482A1 (en) 2022-07-29 2024-02-01 Modernatx, Inc. Lipid nanoparticle compositions comprising surface lipid derivatives and related uses
CN115820632B (zh) * 2022-08-15 2023-07-18 南通市肿瘤医院 抑制ascc3表达的小干扰rna及其在抑制膀胱癌转移中的应用
CN116732172B (zh) * 2023-01-10 2024-07-23 杭州师范大学 Mpped1在胶质母细胞瘤诊断及预后评估中的应用
CN116287254B (zh) * 2023-02-22 2024-04-30 中国人民解放军海军军医大学 Scrn1在制备肝细胞癌分型诊断或索拉非尼疗效预测试剂盒中的应用
CN116036280A (zh) * 2023-03-10 2023-05-02 华中科技大学同济医学院附属同济医院 Myo9b抑制剂在用于制备预防和/或治疗个体纤维化疾病药物中的应用
CN117604109B (zh) * 2024-01-23 2024-04-16 杭州华得森生物技术有限公司 用于膀胱癌诊断和预后判断的生物标志物及其应用
CN117907596B (zh) * 2024-03-20 2024-06-18 浙江百迪生物科技有限公司 一种乳腺癌早期诊断标志物、试剂盒及其应用

Family Cites Families (98)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
US5011769A (en) * 1985-12-05 1991-04-30 Meiogenics U.S. Limited Partnership Methods for detecting nucleic acid sequences
US4999290A (en) * 1988-03-31 1991-03-12 The Board Of Regents, The University Of Texas System Detection of genomic abnormalities with unique aberrant gene transcripts
DE68903482T2 (de) * 1988-12-23 1993-04-01 Nederlandse Cement Ind Zement, verfahren zur herstellung dieses zements und verfahren zur herstellung von produkten mit diesem zement.
US6040138A (en) * 1995-09-15 2000-03-21 Affymetrix, Inc. Expression monitoring by hybridization to high density oligonucleotide arrays
US5188934A (en) * 1989-11-14 1993-02-23 Applied Biosystems, Inc. 4,7-dichlorofluorescein dyes as molecular probes
US5486603A (en) * 1990-01-08 1996-01-23 Gilead Sciences, Inc. Oligonucleotide having enhanced binding affinity
US5859221A (en) * 1990-01-11 1999-01-12 Isis Pharmaceuticals, Inc. 2'-modified oligonucleotides
WO1992007095A1 (en) * 1990-10-15 1992-04-30 Stratagene Arbitrarily primed polymerase chain reaction method for fingerprinting genomes
AU662906B2 (en) * 1991-06-26 1995-09-21 F. Hoffmann-La Roche Ag Methods for detection of carcinoma metastases by nucleic acid amplification
US5538848A (en) * 1994-11-16 1996-07-23 Applied Biosystems Division, Perkin-Elmer Corp. Method for detecting nucleic acid amplification using self-quenching fluorescence probe
AU5310296A (en) * 1995-03-17 1996-10-08 John Wayne Cancer Institute Detection of melanoma or breast metastases with a multiple marker assay
US6998268B2 (en) * 1995-07-03 2006-02-14 Dainippon Sumitomo Pharma Co. Ltd. Gene preparations
US5871697A (en) * 1995-10-24 1999-02-16 Curagen Corporation Method and apparatus for identifying, classifying, or quantifying DNA sequences in a sample without sequencing
US6020481A (en) * 1996-04-01 2000-02-01 The Perkin-Elmer Corporation Asymmetric benzoxanthene dyes
US5863727A (en) * 1996-05-03 1999-01-26 The Perkin-Elmer Corporation Energy transfer dyes with enhanced fluorescence
US6184037B1 (en) * 1996-05-17 2001-02-06 Genemedicine, Inc. Chitosan related compositions and methods for delivery of nucleic acids and oligonucleotides into a cell
US5739169A (en) * 1996-05-31 1998-04-14 Procept, Incorporated Aromatic compounds for inhibiting immune response
ATE295427T1 (de) * 1996-06-04 2005-05-15 Univ Utah Res Found Überwachung der hybridisierung während pcr
US5898031A (en) * 1996-06-06 1999-04-27 Isis Pharmaceuticals, Inc. Oligoribonucleotides for cleaving RNA
AU6545898A (en) * 1997-03-07 1998-09-22 Reprogen, Inc. Method for identifying hormonally modulated genes
NO972006D0 (no) * 1997-04-30 1997-04-30 Forskningsparken I Aas As Ny metode for diagnose av sykdommer
DE69841002D1 (de) * 1997-05-14 2009-09-03 Univ British Columbia Hochwirksame verkapselung von nukleinsäuren in lipidvesikeln
EP1025120B1 (en) * 1997-10-27 2010-08-18 Boston Probes, Inc. Methods, kits and compositions pertaining to pna molecular beacons
US5936087A (en) * 1997-11-25 1999-08-10 The Perkin-Elmer Corporation Dibenzorhodamine dyes
US6238869B1 (en) * 1997-12-19 2001-05-29 High Throughput Genomics, Inc. High throughput assay system
US6232066B1 (en) * 1997-12-19 2001-05-15 Neogen, Inc. High throughput assay system
US6506559B1 (en) * 1997-12-23 2003-01-14 Carnegie Institute Of Washington Genetic inhibition by double-stranded RNA
AUPP249298A0 (en) * 1998-03-20 1998-04-23 Ag-Gene Australia Limited Synthetic genes and genetic constructs comprising same I
US6037129A (en) * 1998-05-28 2000-03-14 Medical University Of South Carolina Multi-marker RT-PCR panel for detecting metastatic breast cancer
US6730477B1 (en) * 1998-08-04 2004-05-04 Diadexus, Inc. Method of diagnosing, monitoring and staging breast cancer
GB9904991D0 (en) * 1999-03-05 1999-04-28 Univ Nottingham Genetic screening
US6383752B1 (en) * 1999-03-31 2002-05-07 Hybridon, Inc. Pseudo-cyclic oligonucleobases
WO2000074634A2 (en) * 1999-06-03 2000-12-14 Au Jessie L S Methods and compositions for modulating cell proliferation and cell death
US7005261B1 (en) * 1999-07-29 2006-02-28 British Biocell International Limited Method for detecting nucleic acid target sequences involving in vitro transcription from an RNA polymerase promoter
US6511832B1 (en) * 1999-10-06 2003-01-28 Texas A&M University System In vitro synthesis of capped and polyadenylated mRNAs using baculovirus RNA polymerase
US6528254B1 (en) * 1999-10-29 2003-03-04 Stratagene Methods for detection of a target nucleic acid sequence
US6191278B1 (en) * 1999-11-03 2001-02-20 Pe Corporation Water-soluble rhodamine dyes and conjugates thereof
GB9927444D0 (en) * 1999-11-19 2000-01-19 Cancer Res Campaign Tech Inhibiting gene expression
DE10100586C1 (de) * 2001-01-09 2002-04-11 Ribopharma Ag Verfahren zur Hemmung der Expression eines Ziegens
US7205105B2 (en) * 1999-12-08 2007-04-17 Epoch Biosciences, Inc. Real-time linear detection probes: sensitive 5′-minor groove binder-containing probes for PCR analysis
US20020065406A1 (en) * 2000-03-24 2002-05-30 Meyers Rachel A. 18221, a novel dual specificity phosphatase and uses thereof
US20020037540A1 (en) * 2000-03-23 2002-03-28 Shujath Ali Compositions and methods of diagnosing, monitoring, staging, imaging and treating prostate cancer
WO2001073030A2 (en) * 2000-03-28 2001-10-04 Diadexus, Inc. Compositions and methods of diagnosing, monitoring, staging, imaging and treating colon cancer
WO2001075169A2 (en) * 2000-03-30 2001-10-11 Diadexus, Inc. Compositions and methods for diagnosing, monitoring, staging, imaging and treating stomach cancer
US6573048B1 (en) * 2000-04-18 2003-06-03 Naxcor Degradable nucleic acid probes and nucleic acid detection methods
MXPA02011093A (es) * 2000-05-10 2004-08-19 David A Sirbasku Composiciones y metodos para el diagnostico, tratamiento y prevencion de canceres que responden a la hormona esteroidea.
US20030009295A1 (en) * 2001-03-14 2003-01-09 Victor Markowitz System and method for retrieving and using gene expression data from multiple sources
AU2001289617A1 (en) * 2000-06-30 2002-01-08 Epigenomics Ag Diagnosis of diseases associated with signal transduction
WO2002024718A1 (en) * 2000-09-19 2002-03-28 Diadexus, Inc. Compositions and methods relating to prostate specific genes and proteins
US7001724B1 (en) * 2000-11-28 2006-02-21 Applera Corporation Compositions, methods, and kits for isolating nucleic acids using surfactants and proteases
GB0029360D0 (en) * 2000-12-01 2001-01-17 Univ Nottingham Humanised antibodies and uses thereof
US20030099976A1 (en) * 2001-01-17 2003-05-29 Tai-Jay Chang Androgen receptor complex-associated protein
US7015047B2 (en) * 2001-01-26 2006-03-21 Aviva Biosciences Corporation Microdevices having a preferential axis of magnetization and uses thereof
US20040058373A1 (en) * 2001-01-31 2004-03-25 Winkler Matthew M. Competitive amplification of fractionated targets from multiple nucleic acid samples
US20040110191A1 (en) * 2001-01-31 2004-06-10 Winkler Matthew M. Comparative analysis of nucleic acids using population tagging
EP1399460A4 (en) * 2001-04-27 2005-04-13 Sunnybrook & Women S College H GENESIS ASSOCIATED WITH BREAST CANCER AND THEIR USE
US7171311B2 (en) * 2001-06-18 2007-01-30 Rosetta Inpharmatics Llc Methods of assigning treatment to breast cancer patients
US20040086504A1 (en) * 2001-06-21 2004-05-06 Deepak Sampath Cyr61 as a target for treatment and diagnosis of breast cancer
DE60234369D1 (de) * 2001-09-19 2009-12-24 Alexion Pharma Inc Manipulierte matrizen und ihre verwendung bei der single-primer-amplifikation
WO2003024388A2 (en) * 2001-09-20 2003-03-27 Cornell Research Foundation, Inc. Methods and compositions for treating and preventing skin disorders using binding agents specific for psma
US20040063654A1 (en) * 2001-11-02 2004-04-01 Davis Mark E. Methods and compositions for therapeutic use of RNA interference
WO2003043487A2 (en) * 2001-11-19 2003-05-30 Protometrix, Inc. Method of using a non-antibody protein to detect and measure an analyte
US7368098B2 (en) * 2001-12-27 2008-05-06 Medarex, Inc. Use of biomolecular targets in the treatment and visualization of tumors
JP2005521420A (ja) * 2002-04-03 2005-07-21 エージーワイ セラピューティクス インコーポレイティッド 脳腫瘍の処置及び可視化における生体分子標的の使用法
US20070025997A1 (en) * 2002-04-03 2007-02-01 Usha Nagavarapu Use of biomolecular targets in the treatment and visualization of brain tumors
ES2465574T3 (es) * 2002-05-03 2014-06-06 Duke University Un método para regular la expresión génica
RU2318197C2 (ru) * 2002-05-20 2008-02-27 Нортроп Грумман Корпорейшен Автоматическая система и способ обнаружения точечного источника биологического агента
US20040029121A1 (en) * 2002-08-08 2004-02-12 Susan Cottrell Methods and nucleic acids for the analysis of CpG dinucleotide methylation status associated with the calcitonin gene
US20040029128A1 (en) * 2002-08-08 2004-02-12 Epigenomics, Inc. Methods and nucleic acids for the analysis of CpG dinucleotide methylation status associated with the calcitonin gene
US20040114800A1 (en) * 2002-09-12 2004-06-17 Baylor College Of Medicine System and method for image segmentation
US7655785B1 (en) * 2002-11-14 2010-02-02 Rosetta Genomics Ltd. Bioinformatically detectable group of novel regulatory oligonucleotides and uses thereof
US7851150B2 (en) * 2002-12-18 2010-12-14 Third Wave Technologies, Inc. Detection of small nucleic acids
ES2310279T3 (es) * 2003-01-16 2009-01-01 North Carolina State University Disminucion de celulas germinales primordiales en especies aviares.
WO2004083816A2 (en) * 2003-03-14 2004-09-30 John Wayne Cancer Institute Loss of heterozygosity of the dna markers in the 12q22-23 region
US7718364B2 (en) * 2003-03-25 2010-05-18 John Wayne Cancer Institute DNA markers for management of cancer
US20050059024A1 (en) * 2003-07-25 2005-03-17 Ambion, Inc. Methods and compositions for isolating small RNA molecules
US20050037362A1 (en) * 2003-08-11 2005-02-17 Eppendorf Array Technologies, S.A. Detection and quantification of siRNA on microarrays
KR20060125743A (ko) * 2003-11-10 2006-12-06 녹손 파르마 아게 생체 활성형 그렐린에 특이적으로 결합하는 핵산
EP2295604B1 (en) * 2004-02-09 2015-04-08 Thomas Jefferson University Diagnosis and treatment of cancers with microRNA located in or near cancer-associated chromosomal features
EP1732650A4 (en) * 2004-03-27 2008-06-11 Univ Arizona COMPOSITION AND METHOD FOR CANCER TREATMENT
US7365058B2 (en) * 2004-04-13 2008-04-29 The Rockefeller University MicroRNA and methods for inhibiting same
IL179285A (en) * 2004-05-14 2011-04-28 Rosetta Genomics Ltd Micrornas and uses thereof
EP2290076B1 (en) * 2004-05-28 2015-03-25 Asuragen, Inc. Methods and compositions involving microRNA
US7642348B2 (en) * 2004-10-04 2010-01-05 Rosetta Genomics Ltd Prostate cancer-related nucleic acids
US20060078894A1 (en) * 2004-10-12 2006-04-13 Winkler Matthew M Methods and compositions for analyzing nucleic acids
FR2877350B1 (fr) * 2004-11-03 2010-08-27 Centre Nat Rech Scient IDENTIFICATION ET UTILISATION DE miRNAs IMPLIQUES DANS LA DIFFERENCIATION DE CELLULES ISSUES D'UNE LEUCEMIE MYELOIDE
ES2507544T3 (es) * 2004-11-12 2014-10-15 Asuragen, Inc. Procedimientos y composiciones que implican miARN y moléculas inhibidoras de miARN
EP1838870A2 (en) * 2004-12-29 2007-10-03 Exiqon A/S NOVEL OLIGONUCLEOTIDE COMPOSITIONS AND PROBE SEQUENCES USEFUL FOR DETECTION AND ANALYSIS OF MICRORNAS AND THEIR TARGET MRNAs
CN101166539B (zh) * 2005-02-08 2012-01-04 得克萨斯大学体系董事会 用于治疗癌症的涉及mda-7的组合物和方法
US7495073B2 (en) * 2005-03-24 2009-02-24 Asia Hepato Gene Company Short isoform of Annexin A10 at chromosome 4q, termed Annexin 10s (ANXA10s) and methods of use
GB0601102D0 (en) * 2006-01-19 2006-03-01 Nuclea Biomarkers Llc Kinase Peptides And Antibodies
US20070054287A1 (en) * 2005-05-31 2007-03-08 Applera Corporation Method for identifying medically important cell populations using micro rna as tissue specific biomarkers
US20070065844A1 (en) * 2005-06-08 2007-03-22 Massachusetts Institute Of Technology Solution-based methods for RNA expression profiling
CA2611507A1 (en) * 2005-06-09 2006-12-21 Epoch Biosciences, Inc. Improved primer-based amplification methods
IL177006A0 (en) * 2005-08-02 2006-12-10 Veridex Llc Predicting bone relapse of breast cancer
US20070041934A1 (en) * 2005-08-12 2007-02-22 Regents Of The University Of Michigan Dendrimer based compositions and methods of using the same
WO2007144985A1 (ja) * 2006-06-16 2007-12-21 Taisho Pharmaceutical Co., Ltd. Rpn2遺伝子発現抑制剤の用途
US20080076674A1 (en) * 2006-07-06 2008-03-27 Thomas Litman Novel oligonucleotide compositions and probe sequences useful for detection and analysis of non coding RNAs associated with cancer

Cited By (38)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
CN102772803A (zh) * 2011-05-12 2012-11-14 北京大学 Unc5cl及其编码蛋白的应用
CN102296114A (zh) * 2011-08-12 2011-12-28 中国人民解放军第三军医大学第一附属医院 miRNA-20a及其抑制剂在制备胶质瘤干细胞侵袭调控剂中的应用
CN102776194A (zh) * 2012-07-20 2012-11-14 苏州大学 微小rna用于调控pten基因表达
CN103397035A (zh) * 2013-08-14 2013-11-20 重庆大学 miRNA-20a作为哺乳动物宿主细胞凋亡调控靶标的应用
CN104013975A (zh) * 2014-06-16 2014-09-03 山东大学 Fbxo31基因及其相关产物在制备胃癌治疗药物中的应用
CN104611336B (zh) * 2015-02-09 2017-06-23 上海长海医院 融合基因ttty15‑usp9y及其作为前列腺癌标志物的应用
CN104611336A (zh) * 2015-02-09 2015-05-13 上海长海医院 融合基因ttty15-usp9y及其作为前列腺癌标志物的应用
CN108025016A (zh) * 2015-09-16 2018-05-11 国立大学法人东北大学 核酸分子
CN106119341A (zh) * 2016-04-14 2016-11-16 冯同保 miR‑20a抑制剂的用途、药物组合物和试剂盒
CN106086178A (zh) * 2016-06-16 2016-11-09 朱伟 一种与胃癌辅助诊断相关的血清miRNA标志物及其应用
CN108132349A (zh) * 2016-11-30 2018-06-08 北京大学 一种用于癫痫预后评估的生物标志物
CN107144695A (zh) * 2017-04-19 2017-09-08 南昌大学 Arl13b蛋白在癌症诊断中的应用
CN107144695B (zh) * 2017-04-19 2019-02-26 南昌大学 Arl13b蛋白在癌症诊断中的应用
CN107723366B (zh) * 2017-09-11 2019-10-01 朱伟 一种与贲门癌辅助诊断相关的血清miRNA标志物及其应用
CN107723366A (zh) * 2017-09-11 2018-02-23 朱伟 一种与贲门癌辅助诊断相关的血清miRNA标志物及其应用
CN108872588A (zh) * 2018-06-14 2018-11-23 华南农业大学 一种与种公猪繁殖性能密切相关的精子蛋白标记spaca4及其应用
CN110835648A (zh) * 2018-08-15 2020-02-25 复旦大学附属肿瘤医院 NSrp70基因在制备用于肿瘤转移相关药物制剂中的应用
CN110835648B (zh) * 2018-08-15 2023-12-15 复旦大学附属肿瘤医院 NSrp70基因在制备用于肿瘤转移相关药物制剂中的应用
CN110055328A (zh) * 2019-03-28 2019-07-26 昆明医科大学第一附属医院 一种基于代谢基因谱的肺腺癌诊断标志物
CN112342295A (zh) * 2019-08-06 2021-02-09 中山大学孙逸仙纪念医院 一种检测人结直肠癌的肿瘤标志物及其应用
CN110791566A (zh) * 2019-10-29 2020-02-14 徐州市中心医院 人shcbp1基因的用途及相关产品
CN110791566B (zh) * 2019-10-29 2023-06-27 徐州市中心医院 人shcbp1基因的用途及相关产品
CN114667355A (zh) * 2019-11-07 2022-06-24 基因特力株式会社 检测结直肠癌的方法
CN110938630A (zh) * 2019-12-20 2020-03-31 中国人民解放军第四军医大学 人b3gnt5基因的用途及相关产品
CN110938630B (zh) * 2019-12-20 2023-07-28 中国人民解放军第四军医大学 人b3gnt5基因的用途及相关产品
CN110970087A (zh) * 2019-12-31 2020-04-07 华中科技大学 一种鉴定调控细胞自噬的功能激酶的方法
CN111440771A (zh) * 2020-03-17 2020-07-24 中山大学附属第三医院 一种含有clcn2纯合突变的白质脑病患者特异诱导多能干细胞系
CN111471683A (zh) * 2020-04-15 2020-07-31 湖南省科域生物医药科技有限公司 miR-93-5p作为诊断和治疗胃癌标志物的应用
CN112680476A (zh) * 2020-12-23 2021-04-20 南京景瑞康分子医药科技有限公司 Klhl22-depdc5蛋白相互作用筛选系统
CN112725338B (zh) * 2020-12-31 2021-09-21 中国水产科学研究院南海水产研究所 一种靶向斑节对虾trim9基因的小干扰rna及其用途
CN112725338A (zh) * 2020-12-31 2021-04-30 中国水产科学研究院南海水产研究所 一种靶向斑节对虾trim9基因的小干扰rna及其用途
CN112908470A (zh) * 2021-02-08 2021-06-04 深圳市人民医院 一种基于rna结合蛋白基因的肝细胞癌预后评分系统及其应用
CN112908470B (zh) * 2021-02-08 2023-10-03 深圳市人民医院 一种基于rna结合蛋白基因的肝细胞癌预后评分系统及其应用
CN113045651A (zh) * 2021-03-24 2021-06-29 吉林大学 靶向Palladin蛋白Pal-11-15区段的抗体及在制备神经再生药物中的应用
CN113249474A (zh) * 2021-04-29 2021-08-13 中山大学附属第一医院 Pcdh20在预测肝癌化疗敏感性中的应用
CN114317775A (zh) * 2022-01-12 2022-04-12 中国人民解放军军事科学院军事医学研究院 一种NCOA4的RNA m6A修饰作为γ射线辐射标志物的应用
CN114317775B (zh) * 2022-01-12 2023-06-30 中国人民解放军军事科学院军事医学研究院 一种NCOA4的RNA m6A修饰作为γ射线辐射标志物的应用
CN114350805A (zh) * 2022-01-14 2022-04-15 中国人民解放军陆军军医大学第一附属医院 Ablim1作为胶质瘤分子标志物的应用

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