NMFを追っかけてたらMetagenes and molecular pattern discovery using matrix factorizationという論文を見つけたので、週末はこの論文を読みながら色々やってみた。NMFの便利なところは元の特徴(この論文の場合は遺伝子発現量)からより少ない任意の特徴量(論文中ではmetagene)に変換できるところであり、さらにそのままクラスターの分割に利用できる。 たとえば2つのmetageneで表現した場合、より発現量の大きいmetageneで分割すれば2つのクラスに分けられる。(QSARだったらdescriptorからmeta discriptorが導かれてそれに基づいてクラス分類ができるでしょう) 続いて、重要なのがクラスの安定性である。要するに最適なクラスタの数はいくつなのかということである。これに対して、この論文ではConsensu
Robert Plemmons Emeritus Z. Smith Reynolds Professor of Mathematics and Computer Science, Wake Forest University (Last updated September 23, 2023) Robert J. Plemmons, Emeritus Z. Smith Reynolds Professor of Mathematics and Computer Science, joined the Wake Forest University faculty in 1990, and retired from teaching, but not research, in 2013. He is a Fellow of the Society for Industrial and Appli
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