岩波データサイエンス vol.1 のどこかのページに「初心者はJAGS（BUGS）」と書いてあったので*1、こつこつ学び始めています。世の中は Stan 大人気ですが、気にしない…。まず JAGS に慣れてから Stan をやります…。本エントリーは、前回のエントリーと多くがかぶっています。 今回は、次のページを参考にさせていただいています。 生態学のデータ解析 - R で JAGS (rjags 編) http://hosho.ees.hokudai.ac.jp/~kubo/ce/RtoJags.html 生態学のデータ解析 - JAGS 雑 http://hosho.ees.hokudai.ac.jp/~kubo/ce/JagsMisc.html 分析に使用したのは、JAGS 4.0.0 および rjags 4.4 です。 JAGS と rjags のインストール JAGS と rja
今更だけど，BESTっていうパッケージなんだって。 Bayesian Estimation Supersedes the T-testということでBESTパッケージ。うむうむ。 https://cran.r-project.org/web/packages/BEST/vignettes/BEST.pdf CRAN - Package BEST なるほどね。 基本はまずJAGSでMCMCするってことらしい。Rに通訳さんパッケージがいるのね。 なのでJAGSをインストールしないと使えない。 JAGS: Just Another Gibbs Sampler - Browse /JAGS/4.x at SourceForge.net まあ，要は2つのベクトルの母平均差や差得点の母標準偏差や効果量などの分布を求めたいってことね。 結局，例えば「標準化平均差のベイズ信用区間（credible inte
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