KR20180133198A - T-조절 세포의 증식을 위한 인터류킨-2 뮤테인 - Google Patents
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Abstract
T 조절 세포를 우선적으로 증식시키고, 활성화시키고, 그리고 대규모 생산이 가능한 IL-2 뮤테인, IL-2 뮤테인 Fc-융합 분자, 항-IL-2 항체, 및 IL-2 사이토카인에 결합된 항 IL-2 항체를 포함하는 복합체가 본 명세서에 제공된다. 효과기 기능이 결여되거나 또는 상당히 감소된, 그리고 N297에서 글리코실화가 결여됨에도 불구하고 높은 안정성을 가지는, 변이체 인간 IgG1 Fc 분자가 또한 본 명세서에 제공된다. 포유동물 세포에서 발현될 때 글리코실화되는 링커 펩티드가 또한 본 명세서에 제공된다. 본 발명의 조성물을 제조하고 사용하는 방법들이 또한 본 명세서에 제공된다.
Description
관련
출원들에 대한 교차
-참조
본 출원은 2015년 4월 10일자로 제출된 U.S. 가특허 출원 번호 62/146,136의 우선권 혜택을 청구하며, 이의 전문은 참고자료에 편입된다.
IL-2는 다음 3 가지 막투과성(transmembrane) 수용체 소단위에 결합한다: IL-2Rβ 및 IL-2Rγ, 이들은 IL-2 결합 시 세포내 신호전달(signaling)을 활성화시키며; 그리고 CD25 (IL-2Rα), 이것은 IL-2와 IL-2Rβγ 사이의 상호작용을 안정화시키는 기능을 한다. IL-2Rβγ에 의해 전달되는 신호는 PI3-키나아제, Ras-MAP-키나아제, 및 STAT5 경로의 신호들을 포함한다.
T 세포는 조직 안에 전형적으로 존재하는 낮은 농도의 IL-2에 반응하기 위하여 CD25의 발현을 필요로 한다. CD25를 발현시키는 T 세포는 자가면역 염증 억제에 필수적인 FOXP3+ 조절 T 세포 (Treg 세포)와 CD25를 발현시키기 위하여 활성화된 FOXP3-T 세포를 모두 포함한다. FOXP3-CD25+ T 효과기 세포 (Teff)는 CD4+ 또는 CD8+ 세포일 수 있으며, 이들은 모두 염증, 자가면역, 장기이식편 거부반응, 또는 이식편 대 숙주 질환(graft-versus-host disease)에 기여할 수 있다. IL-2-자극된 STAT5 신호전달은 T-reg 세포의 정상적인 성장 및 생존, 그리고 FOXP3의 높은 발현에 중요하다.
공유출원건 WO 2010/085495에서 우리는 Treg 세포를 우선적으로 증식 또는 자극시키기 위하여 IL-2 뮤테인(muteins)의 사용을 설명한다. 대상체에게 투여될 때, Treg 세포에 대한 효과는 염증성 질환 및 자가면역 질환을 치료하는데 유용하다. 본 명세서에서 설명하는 IL-2 뮤테인이 생체 내에서 Teff 세포보다 Treg 세포를 증식시키는데 유용하지만, 인간 치료 용으로 최적의 속성을 갖는 IL-2 뮤테인을 생성하는 것이 바람직하였다.
요약
본원에는 고수율로 제조가능하며, 약학 활성을 갖는 IL-2 뮤테인, 항-IL-2 항체 및 항-IL-2 항체/IL-2 복합체가 기재되어 있다. 인간 치료제로 사용하기 위해 그러한 분자를 생산하려는 노력에서 예기치못한 그리고 예측불가능했던 많은 것들이 관찰되었다. 본원에 기재된 조성물 및 방법은 이러한 노력으로부터 비롯된 것이다.
본원에 기술된 IL-2 뮤테인은 IL-2 뮤테인 및/또는 내인성 IL-2에 대한 면역 반응을 만들 가능성이 상대적으로 낮고, 그리고 Treg 우선적인 증식(expansion) 및 활성화를 제공한다. 더욱이, 특정 구현예들에 있어서 상기 IL-2 뮤테인은 대상체에게 투여될 때, 혈청 반감기를 증가시키는 분자, 가령, 항체 Fc에 융합될 수 있다. IL-2 뮤테인은 짧은 혈청 반감기 (피하 주사의 경우 3 내지 5 시간)를 갖는다. 본원에서 설명된 예시적인 IL-2 뮤테인 Fc 융합체(fusions)는 인간의 경우 적어도 1 일, 적어도 3 일, 적어도 5 일, 적어도 10 일, 적어도 15 일, 적어도 20 일, 또는 적어도 25 일의 반감기를 갖는다. IL-2 뮤테인의 약물동력학(pharmacokinetics)에 대한 이러한 효과는 IL-2 뮤테인 치료제의 투여량(dosing)를 감소시키거나 또는 투여 빈도를 줄일 수 있게 한다.
더욱이, 의약용 거대 분자를 만들 때, 분자의 안정성을 최대화하고, 응집을 최소화하면서, 거대 분자를 대량 생산할 수 있는 능력이 고려되어야 한다. 상기 IL-2 뮤테인 Fc-융합 분자는 이러한 속성을 입증한다.
추가적으로, 특정 구현예들에 있어서 상기 IL-2 뮤테인 Fc-융합 단백질은 IgG1 Fc 영역을 함유한다. IgG1의 효과기 기능 (가령, ADCC 활성)을 제거하는 것이 바람직할 경우, 위치 297의 아스파라긴을 글리신으로 돌연변이 (N297G; EU 넘버링 체계)시키면 정제 효율은 상당히 개선되며, 탈글리코실화(aglycosylation) IgG1 Fc로 귀결되는 다른 돌연변이보다 생물물리학적 성질들이 상당히 개선되었다는 것을 알았다. 바람직한 구현예들에서, 이황화결합이 형성되도록 시스테인을 Fc 안으로 넣는 가공을 하였고, 이로써 탈글리코실화된 Fc-함유 분자의 안정성은 증가되었다. 탈글리코실화된 Fc는 상기 IL-2 뮤테인 Fc-융합체보다 유용성이 더 있다. 따라서, N297G 치환과 임의선택적으로 하나 이상의 추가 잔기들이 시스테인으로 치환된 것을 포함하는 Fc-함유 분자, Fc-융합체 및 항체가 본 명세서에서 제공된다.
한 측면에서, 본 발명은 서열번호:1에 제시된 아미노산 서열에 대하여 적어도 90% 동일한 아미노산 서열을 포함하는 인간 인터류킨-2 (IL-2) 뮤테인을 제공하며, 여기서 상기 IL-2 뮤테인은 L12G, L12K, L12Q, L12S, Q13G, E15A, E15G, E15S, H16A, H16D, H16G, H16K, H16M, H16N, H16R, H16S, H16T, H16V, H16Y, L19A, L19D, L19E, L19G, L19N, L19R, L19S, L19T, L19V, D20A, D20E, D20F, D20G, D20T, D20W, M23R, R81A, R81G, R81S, R81T, D84A, D84E, D84G, D84I, D84M, D84Q, D84R, D84S, D84T, S87R, N88A, N88D, N88E, N88F, N88G, N88M, N88R, N88S, N88V, N88W, V91D, V91E, V91G, V91S, I92K, I92R, 및 E95G로부터 선택된 적어도 하나의 돌연변이를 갖고, 그리고 시험관내 검정 및 인간화(humanized) 마우스(CD34+ 조혈 줄기 세포로 재구성된 NSG 마우스)에서 T 세포 또는 NK 세포와 비교하여 T 조절 세포를 우선적으로 자극한다. 한 구현예에서, 상기 뮤테인은 서열번호:1에 제시된 아미노산 서열에 대하여 적어도 95% 동일하다. 또 다른 구현예에서, 상기 뮤테인은 서열번호:1에 제시된 아미노산 서열에 대하여 적어도 97% 동일하다. 또 다른 구현예에서, 상기 뮤테인의 아미노산 서열은 서열번호:1에 제시된 아미노산 서열과 비교하여 오직 C125A에서, 그리고 L12G, L12K, L12Q, L12S, Q13G, E15A, E15G, E15S, H16A, H16D, H16G, H16K, H16M, H16N, H16R, H16S, H16T, H16V, H16Y, L19A, L19D, L19E, L19G, L19N, L19R, L19S, L19T, L19V, D20A, D20E, D20F, D20G, D20T, D20W, M23R, R81A, R81G, R81S, R81T, D84A, D84E, D84G, D84I, D84M, D84Q, D84R, D84S, D84T, S87R, N88A, N88D, N88E, N88F, N88G, N88M, N88R, N88S, N88V, N88W, V91D, V91E, V91G, V91S, I92K, I92R, 및 E95G로부터 선택된 하나의 위치에서 상이하다. 또 다른 구현예에서, 상기 뮤테인의 아미노산 서열은 서열번호:1에 제시된 아미노산 서열과 비교하여 오직 C125A와, 그리고 D20E, D20G, D20W, D84A, D84S, H16D, H16G, H16K, H16R, H16T, H16V, I92K, I92R, L12K, L19D, L19N, L19T, N88D, N88R, N88S, V91D, V91G, V91K, 및 V91S로부터 선택된 하나의 위치에서 상이하다.
또 다른 측면에서, 본 발명은 상기에서 설명된 바와 같이, Fc 및 인간 IL-2 뮤테인을 포함하는 Fc-융합 단백질을 제공한다. 한 구현예에서, 상기 Fc는 인간 IgG1 Fc이다. 또 다른 구현예에서, 상기 인간 IgG1 Fc는 상기 Fc의 효과기 기능을 변경시키는 하나 이상의 돌연변이를 포함한다. 또 다른 구현예에서, 상기 인간 IgG1은 N297에서 상기 치환을 포함한다. 또 다른 구현예에서, N297에서 상기 치환은 N297G이다. 또 다른 구현예에서, 상기 Fc-융합 단백질은 상기 인간 IgG Fc의 C-말단 리신의 치환 또는 결실을 포함한다. 또 다른 구현예에서, 상기 인간 IgG Fc의 C-말단 리신은 결실된다. 또 다른 구현예에서, 링커는 상기 단백질의 Fc와 인간 IL-2 뮤테인 부분을 연결한다. 또 다른 구현예에서, 상기 링커는 GGGGS (서열번호:5), GGNGT, 또는 (서열번호:6), 및 YGNGT (서열번호:7)이다. 또 다른 구현예에서, 상기 링커는 GGGGS (서열번호:5)이다. 또 다른 구현예에서, 상기 IL-2 뮤테인은 포유동물 세포에서 발현될 때, 상기 Fc-융합 단백질의 글리코실화를 변경시키는 아미노산 첨가, 치환, 또는 결실을 더 포함한다. 또 다른 구현예에서, 상기 IL-2 뮤테인은 T3 치환을 포함한다. 또 다른 구현예에서, 상기 IL-2 뮤테인은 T3N 또는 T3A 치환을 포함한다. 또 다른 구현예에서, 상기 IL-2 뮤테인은 T3N 치환을 포함한다. 또 다른 구현예에서, 상기 IL-2 뮤테인은 S5 돌연변이를 더 포함한다. 또 다른 구현예에서, 상기 IL-2 뮤테인은 S5T 돌연변이를 더 포함한다. 또 다른 구현예에서, 상기 Fc-융합 단백질은 Fc 이량체(dimer)를 포함한다. 또 다른 구현예에서, 상기 Fc-융합 단백질은 2개의 IL-2 뮤테인을 포함한다. 또 다른 구현예에서, 상기 Fc-융합 단백질은 단일 IL-2 뮤테인을 포함한다.
또 다른 측면에서, 본 발명은 상기에서 설명된 바와 같은 인간 IL-2 뮤테인을 암호화하는 단리된(isolated) 핵산을 제공한다.
또 다른 측면에서, 본 발명은 항체의 Fc 부분과 상기에서 설명된 바와 같은 인간 IL-2 뮤테인을 암호화하는 단리된 핵산을 제공한다. 한 구현예에서, 상기 항체의 Fc 부분과 상기 인간 IL-2 뮤테인은 단일 개방형 판독 프레임(open-reading frame) 안에 암호화된다. 또 다른 구현예에서, 상기 Fc는 인간 IgG1 Fc이다. 또 다른 구현예에서, 상기 인간 IgG1 Fc는 상기 Fc의 효과기 기능을 변경시키는 하나 이상의 돌연변이를 포함한다. 또 다른 구현예에서, 상기 인간 IgG1은 N297에서 상기 치환을 포함한다. 또 다른 구현예에서, N297에서 상기 치환은 N297G이다. 또 다른 구현예에서, 상기 핵산은 상기 인간 IgG Fc의 C-말단 리신의 치환 또는 결실을 암호화한다. 또 다른 구현예에서, 상기 인간 IgG Fc의 C-말단 리신은 결실된다. 또 다른 구현예에서, 상기 핵산은 상기 항체의 Fc 부분과 인간 IL-2 뮤테인을 연결시키는 링커를 더 암호화한다. 또 다른 구현예에서, 상기 링커는 GGGGS (서열번호:5), GGNGT, 또는 (서열번호:6), 및 YGNGT (서열번호:7)이다. 또 다른 구현예에서, 상기 링커는 GGGGS (서열번호:5)이다. 또 다른 구현예에서, 상기 IL-2 뮤테인은 포유동물 세포에서 발현될 때, 상기 IL-2 뮤테인의 글리코실화를 변경시키는 아미노산 첨가, 치환, 또는 결실을 더 포함한다. 또 다른 구현예에서, 상기 IL-2 뮤테인은 T3 치환을 포함한다. 또 다른 구현예에서, 상기 IL-2 뮤테인은 T3N 또는 T3A 치환을 포함한다. 또 다른 구현예에서, 상기 IL-2 뮤테인은 T3N 치환을 포함한다. 또 다른 구현예에서, 상기 IL-2 뮤테인은 S5 돌연변이를 더 포함한다. 또 다른 구현예에서, 상기 IL-2 뮤테인은 S5T 돌연변이를 더 포함한다.
또 다른 측면에서, 본 발명은 프로모터에 작동가능하게 연결된(operably linked) 상기에서 설명된 단리된 핵산을 포함하는 발현 벡터를 제공한다.
또 다른 측면에서, 본 발명은 상기에서 설명된 단리된 핵산을 포함하는 숙주 세포를 제공한다. 한 구현예에서, 상기 단리된 핵산은 프로모터에 작동가능하게 연결된다. 또 다른 구현예에서, 상기 숙주 세포는 원핵(prokaryotic) 세포이다. 또 다른 구현예에서, 상기 숙주 세포는 이.콜라이(E. coli )이다. 또 다른 구현예에서, 상기 숙주 세포는 진핵(eukaryotic) 세포이다. 또 다른 구현예에서, 상기 숙주 세포는 포유동물 세포이다. 또 다른 구현예에서, 상기 숙주 세포는 중국 햄스터 난소(CHO) 세포주이다.
또 다른 측면에서, 본 발명은 인간 IL-2 뮤테인을 제조하는 방법을 제공하는데, 이 방법은 상기 프로모터가 발현되는 조건하에 상기에서 설명된 숙주 세포를 배양하고, 그리고 상기 배양물로부터 상기 인간 IL-2 뮤테인을 수거하는 것을 포함한다.
또 다른 측면에서, 본 발명은 Fc-융합 단백질을 제조하는 방법을 제공하는데, 이 방법은 상기 프로모터가 발현되는 조건하에 상기에서 설명된 숙주 세포를 배양하고, 그리고 상기 배양물로부터 상기 Fc-융합 단백질을 수거하는 것을 포함한다.
또 다른 측면에서, 본 발명은 T 세포 집단에서 비-조절 T 세포에 대한 조절 T 세포(Tregs)의 비율을 증가시키는 방법을 제공하는데, 이 방법은 T 세포 집단에 상기에서 설명된 바와 같은 인간 IL-2 뮤테인의 유효량을 접촉시키는 것을 포함한다. 한 구현예에서, CD3+FoxP3-에 대한 CD3+FoxP3+ 세포 비율은 증가된다. 또 다른 구현예에서, 한 구현예에서, CD3+FoxP3-에 대한 CD3+FoxP3+ 세포 비율은 최소 50% 증가된다.
또 다른 측면에서, 본 발명은 T 세포 집단에서 비-조절 T 세포에 대한 조절 T 세포(Tregs)의 비율을 증가시키는 방법을 제공하는데, 이 방법은 T 세포 집단에 상기에서 설명된 바와 같은 Fc-융합 단백질의 유효량을 접촉시키는 것을 포함한다. 한 구현예에서, CD3+FoxP3-에 대한 CD3+FoxP3+ 세포 비율은 증가된다. 또 다른 구현예에서, 한 구현예에서, CD3+FoxP3-에 대한 CD3+FoxP3+ 세포 비율은 최소 50% 증가된다.
또 다른 측면에서, 본 발명은 대상체의 말초혈액에서 비-조절 T 세포에 대한 조절 T 세포(Tregs)의 비율을 증가시키는 방법을 제공하는데, 이 방법은 T 세포 집단에 상기에서 설명된 바와 같은 인간 IL-2 뮤테인의 유효량을 투여하는 것을 포함한다. 한 구현예에서, CD3+FoxP3-에 대한 CD3+FoxP3+ 세포 비율은 증가된다. 또 다른 구현예에서, 한 구현예에서, CD3+FoxP3-에 대한 CD3+FoxP3+ 세포 비율은 최소 50% 증가된다.
또 다른 측면에서, 본 발명은 대상체의 말초혈액에서 비-조절 T 세포에 대한 조절 T 세포(Tregs)의 비율을 증가시키는 방법을 제공하는데, 이 방법은 T 세포 집단에 상기에서 설명된 바와 같은 Fc-융합 단백질의 유효량을 투여하는 것을 포함한다. 한 구현예에서, CD3+FoxP3-에 대한 CD3+FoxP3+ 세포 비율은 증가된다. 또 다른 구현예에서, 한 구현예에서, CD3+FoxP3-에 대한 CD3+FoxP3+ 세포 비율은 최소 50% 증가된다.
또 다른 측면에서, 본 발명은 대상체의 말초혈액에서 자연 살해(NK) 세포에 대한 조절 T 세포(Tregs)의 비율을 증가시키는 방법을 제공하는데, 이 방법은 T 세포 집단에 상기에서 설명된 바와 같은 인간 IL-2 뮤테인의 유효량을 투여하는 것을 포함한다. 한 구현예에서, CD56 및/또는 CD16를 발현시키는 CD3-CD19-림프구에 대한 CD3+FoxP3+ 세포 비율은 증가된다. 또 다른 구현예에서, CD56 및/또는 CD16를 발현시키는 CD3-CD19-림프구에 대한 CD3+FoxP3+ 세포 비율은 최소 50% 증가된다.
또 다른 측면에서, 본 발명은 대상체의 말초혈액에서 자연 살해(NK) 세포에 대한 조절 T 세포(Tregs)의 비율을 증가시키는 방법을 제공하는데, 이 방법은 T 세포 집단에 상기에서 설명된 바와 같은 Fc-융합 단백질의 유효량을 투여하는 것을 포함한다. 한 구현예에서, CD56 및/또는 CD16를 발현시키는 CD3-CD19-림프구에 대한 CD3+FoxP3+ 세포 비율은 증가된다. 또 다른 구현예에서, CD56 및/또는 CD16를 발현시키는 CD3-CD19-림프구에 대한 CD3+FoxP3+ 세포 비율은 최소 50% 증가된다.
또 다른 측면에서, 본 발명은 염증성 질환 또는 자가면역 질환을 가진 대상체를 치료하는 방법을 제공하며, 상기 방법은 상기 대상체에게 상기에서 설명된 바와 같은 치료적 유효량의 IL-2 뮤테인 또는 상기에서 설명된 바와 같은 치료적 유효량의 Fc-융합 단백질을 투여하는 것을 포함한다. 한 구현예에서, 투여에 의해 상기 질환의 적어도 하나의 증상이 감소된다. 또 다른 구현예에서, 투여 후, 대상체의 말초혈액 안에 비-조절 T 세포에 대한 조절 T 세포(Tregs)의 비율은 증가된다. 또 다른 구현예에서, 투여 후 대상체의 말초혈액 안에 비-조절 T 세포에 대한 조절 T 세포(Tregs)의 비율은 본질적으로 동일하게 유지된다. 또 다른 구현예에서, 상기 염증성 질환 또는 자가면역 질환은 낭창, 이식편 대 숙주 질환, C 형 간염-유도된 맥관염, I 형 당뇨병, II 형 당뇨병, 다발성 경화증, 류마티스성 관절염, 탈모증, 죽상동맥경화증, 건선, 장기 이식 거부, 쇼그렌 증후군(Sjogren's Syndrome), 베체트 증후군 (Behget 's Syndrome), 자연유산, 아토피성 질환, 천식 또는 염증성 장 질환이다.
또 다른 측면에서, 본 발명은 인간 IgG1 항체의 Fc 영역을 포함하는 폴리펩티드를 제공하며, 여기서 상기 Fc 영역은 N297G 돌연변이를 포함하고, 인간 IgG1의 상기 Fc 영역은 서열번호:3에 제시된 아미노산 서열에 대하여 적어도 90% 동일성을 포함한다. 한 구현예에서, 인간 IgG1의 상기 Fc 영역은 서열번호:3에 제시된 아미노산 서열에 대하여 적어도 95% 동일성을 포함한다. 또 다른 구현예에서, 인간 IgG1의 상기 Fc 영역은 서열번호:3에 제시된 아미노산 서열을 포함한다. 또 다른 구현예에서, 인간 IgG1의 상기 Fc 영역은 이 폴리펩티드를 안정화시키기 위하여 하나 이상의 돌연변이를 더 포함한다. 또 다른 구현예에서, 서열번호:3에서 제시된 하나 이상의 아미노산은 시스테인으로 치환된다. 또 다른 구현예에서, 서열번호:3에 제시된 아미노산 서열의 V259, A287, R292, V302, L306, V323, 또는 I332은 시스테인으로 치환된다. 또 다른 구현예에서, 상기 Fc 영역은 서열번호:3에 제시된 아미노산 서열 안에 A287C 및 L306C 치환을 포함한다. 또 다른 구현예에서, 상기 Fc 영역은 서열번호:3에 제시된 아미노산 서열 안에 V259C 및 L306C 치환을 포함한다. 또 다른 구현예에서, 상기 Fc 영역은 서열번호:3에 제시된 아미노산 서열 안에 R292C 및 V302C 치환을 포함한다. 또 다른 구현예에서, 상기 Fc 영역은 서열번호:3에 제시된 아미노산 서열 안에 V323C 및 I332C 치환을 포함한다.
또 다른 측면에서, 본 발명은 상기에서 설명된 바와 같은 Fc 영역을 포함하는 항체를 제공한다.
또 다른 측면에서, 본 발명은 상기에서 설명된 바와 같은 Fc 영역을 포함하는 Fc-융합 단백질을 제공한다.
또 다른 측면에서, 본 발명은 링커를 포함하는 폴리펩티드를 제공하며, 여기서 상기 링커는 GGNGT (서열번호:6) 또는 YGNGT (서열번호:7)이다. 한 구현예에서, 상기 링커는 N-글리코실화를 포함한다. 또 다른 구현예에서, 상기 링커는 폴리펩티드 구조에 삽입되거나 또는 구조 내 루프(loop)를 대체한다.
또 다른 측면에서, 본 발명은 탈글리코실화된 IgG1 Fc-함유 분자를 제조하는 방법을 제공하는데, 상기 방법은 다음을 포함한다:
a)
포유동물 세포 배양물에서 상기에서 설명된 바와 같은 폴리펩티드를 암호화하는 핵산을 발현시키고; 그리고
b)
상기 배양물로부터 탈글리코실화된 IgG1 Fc-함유 분자를 수거한다.
또 다른 측면에서, 본 발명은 포유동물 세포에서 발현될 때 탈글리코실화된 IgG1 Fc-함유 분자를 제조하는 방법을 제공하며, 상기 방법은 상기 Fc 영역에서 N297에 대한 코돈을 글리신 코돈으로 돌연변이시키는 단계를 포함한다.
또 다른 측면에서, 본 발명은 Fc-융합 단백질을 제공하는데, 여기서 상기 Fc-융합 단백질의 아미노산 서열은 도 24에서 도시된 인간 IL-2 뮤테인 융합 단백질의 아미노산 서열에 적어도 90% 동일하다. 한 구현예에서, 상기 Fc-융합 단백질의 아미노산 서열은 도 24에서 도시된 인간 IL-2 뮤테인 융합 단백질의 아미노산 서열에 적어도 95% 동일하다. 또 다른 구현예에서, 상기 Fc-융합 단백질의 아미노산 서열은 도 24에서 도시된 인간 IL-2 뮤테인 융합 단백질의 아미노산 서열에 적어도 97% 동일하다. 또 다른 구현예에서, 상기 Fc-융합 단백질의 아미노산 서열은 도 24에서 도시된 인간 IL-2 뮤테인 융합 단백질의 아미노산 서열에 적어도 99% 동일하다. 또 다른 구현예에서, 상기 Fc-융합 단백질의 아미노산 서열은 도 24에서 도시된 인간 IL-2 뮤테인 융합 단백질의 아미노산 서열과 동일하다.
또 다른 측면에서, 본 발명은 상기에서 설명된 바와 같이 상기 Fc-융합체를 암호화하는 핵산을 제공한다.
또 다른 측면에서, 본 발명은 상기에서 설명된 바와 같이 상기 핵산을 포함하는 세포를 제공한다.
또 다른 측면에서, 본 발명은 Fc-융합 단백질을 제조하는 방법을 제공하는데, 이 방법은 상기 Fc-융합 단백질의 발현을 허용하는 조건하에 상기에서 설명된 세포를 배양하는 것을 포함한다.
또 다른 측면에서, 본 발명은 대상체의 염증성 또는 자가-면역 병태를 치료하는 방법을 제공하는데, 이 방법은 상기에서 설명된 상기 Fc-융합 단백질의 유효량을 상기 대상체에게 투여하는 것을 포함한다. 한 구현예에서, 상기 염증성 또는 자가-면역 병태는 낭창, 이식편 대 숙주 질환, C 형 간염-유도된 맥관염, I 형 당뇨병, II 형 당뇨병, 다발성 경화증, 류마티스성 관절염, 탈모증, 죽상동맥경화증, 건선, 장기 이식 거부, 쇼그렌 증후군, 베체트 증후군, 자연유산, 아토피성 질환, 천식 또는 염증성 장 질환이다.
또 다른 측면에서, 본 발명은 상기에서 설명된 상기 인간 인터류킨-2 (IL-2) 뮤테인, 상기에서 설명된 Fc-융합 단백질, 또는 상기에서 설명된 Fc-융합 단백질 치료에 대하여 대상체의 반응을 모니터링하는 방법을 제공하는데, 상기 대상체에서 변화를 탐지하는 것을 포함하며, 상기 변화는 체온의 증가, 상기 대상체의 말초혈액 안에 CRP의 증가, 상기 대상체의 말초혈액에서 혈소판의 감소, 상기 대상체의 말초혈액에서 호중구의 감소, 또는 상기 대상체의 말초혈액에서 알부민의 감소이며, 여기서 상기 변화가 탐지된 후, 상기 치료는 종료, 유예, 투여 빈도의 감소, 또는 투여량을 감소시킨다. 한 구현예에서, 상기 변화는 다음을 포함한다: 적어도 0.5℃의 체온 증가, 상기 대상체의 말초혈액에서 적어도 0.2 mg/mL의 CRP 증가, 상기 대상체의 말초혈액에서 혈소판이 적어도 0.8-배 감소, 상기 대상체의 말초혈액에서 호중구의 적어도 0.8-배 감소, 또는 상기 대상체의 말초혈액에서 알부민의 적어도 0.4-배 감소.
또 다른 측면에서, 본 발명은 단리된 항-인간 IL-2 항체를 제공하며, 여기서 상기 항체는 참조 항체의 중쇄 가변 도메인에 적어도 90% 동일한 중쇄 가변 도메인, 그리고 참조 항체의 경쇄 가변 도메인에 적어도 90% 동일한 경쇄 가변 도메인을 포함하며, 여기서 상기 참조 항체는 9D6, 2C3, 14C9, 8B12, 16A4, 16E1, 13A1, 8F10, 12C4, 9B12, 3H5, 18A6, 10A6, 10H7, 15A10, 12D2, 9B10, 17D3, 15G11, 14D7, 18F3, 17D9, 21F8, 22B9, 221D10, 14A6, 11D6, 10A9, 16E3, 14G7, 5H3, 2B12, 26H7, 26C12, 2H11, 또는 18H9이며, 그리고 여기서 상기 참조 항체의 중쇄 가변 도메인과 경쇄 가변 도메인은 각각 도 28 및 도 26에서 도시되며; 또는 참조 항체의 중쇄 가변 도메인의 CDR1, CDR2, 및 CDR3을 포함하는 중쇄 가변 도메인, 그리고 참조 항체의 경쇄 가변 도메인의 CDR1, CDR2, 및 CDR3을 포함하는 경쇄 가변 도메인을 포함하고, 여기서 상기 중쇄 CDRs 및 상기 경쇄 CDRs은 각각 도 28 및 도 26에서 도시되며; 또는 야생형 인간 IL-2 사이토카인에 대한 결합에 있어서 참조 항체과 교차-경쟁하고, 여기서 상기 참조 항체는 9D6, 2C3, 14C9, 8B12, 16A4, 16E1, 13A1, 8F10, 12C4, 9B12, 3H5, 18A6, 10A6, 10H7, 15A10, 12D2, 9B10, 17D3, 15G11, 14D7, 18F3, 17D9, 21F8, 22B9, 221D10, 14A6, 11D6, 10A9, 16E3, 14G7, 5H3, 2B12, 26H7, 26C12, 2H11, 또는 18H9이다. 한 구현예에서, 상기 항체는 참조 항체의 중쇄 가변 도메인 아미노산 서열에 적어도 90% 동일한 중쇄 가변 도메인 아미노산 서열, 그리고 참조 항체의 경쇄 가변 도메인 아미노산 서열에 적어도 90% 동일한 경쇄 가변 도메인 아미노산 서열을 포함하며, 여기서 상기 참조 항체는 9D6, 2C3, 14C9, 8B12, 16A4, 16E1, 13A1, 8F10, 12C4, 9B12, 3H5, 18A6, 10A6, 10H7, 15A10, 12D2, 9B10, 17D3, 15G11, 14D7, 18F3, 17D9, 21F8, 22B9, 221D10, 14A6, 11D6, 10A9, 16E3, 14G7, 5H3, 2B12, 26H7, 26C12, 2H11, 또는 18H9이며, 그리고 여기서 참조 항체의 중쇄 가변 도메인 아미노산 서열과 참조 항체의 경쇄 가변 도메인 아미노산 서열은 각각 도 28 및 도 26에 도시된다. 또 다른 구현예에서, 상기 항체는 참조 항체의 중쇄 가변 도메인 아미노산 서열에 적어도 95% 동일한 중쇄 가변 도메인 아미노산 서열, 그리고 참조 항체의 경쇄 가변 도메인 아미노산 서열에 적어도 95% 동일한 경쇄 가변 도메인 아미노산 서열을 포함하며, 여기서 상기 참조 항체는 9D6, 2C3, 14C9, 8B12, 16A4, 16E1, 13A1, 8F10, 12C4, 9B12, 3H5, 18A6, 10A6, 10H7, 15A10, 12D2, 9B10, 17D3, 15G11, 14D7, 18F3, 17D9, 21F8, 22B9, 221D10, 14A6, 11D6, 10A9, 16E3, 14G7, 5H3, 2B12, 26H7, 26C12, 2H11, 또는 18H9이며, 그리고 여기서 참조 항체의 중쇄 가변 도메인 아미노산 서열과 참조 항체의 경쇄 가변 도메인 아미노산 서열은 각각 도 28 및 도 26에 도시된다. 또 다른 구현예에서, 상기 항체는 참조 항체의 중쇄 가변 도메인 아미노산 서열에 적어도 97% 동일한 중쇄 가변 도메인 아미노산 서열, 그리고 참조 항체의 경쇄 가변 도메인 아미노산 서열에 적어도 97% 동일한 경쇄 가변 도메인 아미노산 서열을 포함하며, 여기서 상기 참조 항체는 9D6, 2C3, 14C9, 8B12, 16A4, 16E1, 13A1, 8F10, 12C4, 9B12, 3H5, 18A6, 10A6, 10H7, 15A10, 12D2, 9B10, 17D3, 15G11, 14D7, 18F3, 17D9, 21F8, 22B9, 221D10, 14A6, 11D6, 10A9, 16E3, 14G7, 5H3, 2B12, 26H7, 26C12, 2H11, 또는 18H9이며, 그리고 여기서 참조 항체의 중쇄 가변 도메인 아미노산 서열과 참조 항체의 경쇄 가변 도메인 아미노산 서열은 각각 도 28 및 도 26에 도시된다. 또 다른 구현예에서, 상기 항체는 참조 항체의 중쇄 가변 도메인 아미노산 서열에 적어도 99% 동일한 중쇄 가변 도메인 아미노산 서열, 그리고 참조 항체의 경쇄 가변 도메인 아미노산 서열에 적어도 99% 동일한 경쇄 가변 도메인 아미노산 서열을 포함하며, 여기서 상기 참조 항체는 9D6, 2C3, 14C9, 8B12, 16A4, 16E1, 13A1, 8F10, 12C4, 9B12, 3H5, 18A6, 10A6, 10H7, 15A10, 12D2, 9B10, 17D3, 15G11, 14D7, 18F3, 17D9, 21F8, 22B9, 221D10, 14A6, 11D6, 10A9, 16E3, 14G7, 5H3, 2B12, 26H7, 26C12, 2H11, 또는 18H9이며, 그리고 여기서 참조 항체의 중쇄 가변 도메인 아미노산 서열과 참조 항체의 경쇄 가변 도메인 아미노산 서열은 각각 도 28 및 도 26에 도시된다. 또 다른 구현예에서, 상기 항체는 참조 항체의 중쇄 가변 도메인 아미노산 서열과 참조 항체의 경쇄 가변 도메인 아미노산 서열을 포함하며, 여기서 상기 참조 항체는 9D6, 2C3, 14C9, 8B12, 16A4, 16E1, 13A1, 8F10, 12C4, 9B12, 3H5, 18A6, 10A6, 10H7, 15A10, 12D2, 9B10, 17D3, 15G11, 14D7, 18F3, 17D9, 21F8, 22B9, 221D10, 14A6, 11D6, 10A9, 16E3, 14G7, 5H3, 2B12, 26H7, 26C12, 2H11, 또는 18H9이고, 그리고 여기서 참조 항체의 중쇄 가변 도메인 아미노산 서열과 참조 항체의 경쇄 가변 도메인 아미노산 서열은 각각 도 28 및 도 26에 도시된다. 또 다른 구현예에서, 상기 단리된 항체는 다음과 같다: 인간 항체; 인간화 항체; 키메라 항체; 단클론 항체; 다클론 항체; 재조합 항체; 항원-결합 항체 단편; 단일 쇄 항체; 디아바디(diabody); 트리아바디(triabody); 테트라바디(tetrabody); Fab 단편; F(ab')2 단편; 도메인 항체; IgD 항체; IgE 항체; IgM 항체; IgG1 항체; IgG2 항체; IgG3 항체; IgG4 항체; 또는 H 쇄 안에 이황화결합을 형성하는 경향을 완화시키는 적어도 하나의 돌연변이를 힌지 영역 안에 보유한 IgG4 항체. 또 다른 구현예에서, 상기 단리된 항체는 인간 IgG1 Fc를 포함한다. 또 다른 구현예에서, 상기 인간 IgG1 Fc는 상기 Fc의 효과기 기능을 변경시키는 하나 이상의 돌연변이를 갖는다. 또 다른 구현예에서, 상기 인간 IgG1 Fc는 N297에서 상기 치환을 포함한다. 또 다른 구현예에서, N297에서 상기 치환은 N297G이다. 또 다른 구현예에서, 상기 항체는 상기 인간 IgG Fc의 C-말단 리신의 치환 또는 결실을 포함한다. 또 다른 구현예에서, 상기 인간 IgG Fc의 C-말단 리신은 결실된다. 또 다른 구현예에서, 상기 단리된 항체는 인간 IgG1 Fc를 포함한다. 또 다른 구현예에서, 상기 인간 IgG1 Fc는 상기 Fc의 효과기 기능을 변경시키는 하나 이상의 돌연변이를 갖는다. 또 다른 구현예에서, 상기 인간 IgG1 Fc는 N297에서 상기 치환을 포함한다. 또 다른 구현예에서, N297에서 상기 치환은 N297G이다. 또 다른 구현예에서, 상기 항체는 상기 인간 IgG Fc의 C-말단 리신의 치환 또는 결실을 포함한다. 또 다른 구현예에서, 상기 인간 IgG Fc의 C-말단 리신은 결실된다.
또 다른 측면에서, 본 발명은 인간 IL-2 사이토카인에 결합된 상기에서 설명된 단리된 항-인간 IL-2 항체를 포함하는 단리된 복합체를 제공한다.
또 다른 측면에서, 본 발명은 상기에서 설명된 단리된 항-인간 IL-2 항체의 경쇄, 중쇄, 또는 경쇄와 중쇄 모두를 암호화하는 단리된 핵산을 제공한다.
또 다른 측면에서, 본 발명은 프로모터에 작동가능하게 연결된 상기에서 설명된 단리된 핵산을 포함하는 발현 벡터를 제공한다.
또 다른 측면에서, 본 발명은 상기에서 설명된 바와 같이 상기 단리된 핵산을 포함하는 세포를 제공한다. 한 구현예에서, 상기 단리된 핵산은 프로모터에 작동가능하게 연결된다. 또 다른 구현예에서, 상기 숙주 세포는 원핵(prokaryotic) 세포이다. 또 다른 구현예에서, 상기 숙주 세포는 이.콜라이(E. coli )이다. 또 다른 구현예에서, 상기 숙주 세포는 진핵(eukaryotic) 세포이다. 또 다른 구현예에서, 상기 숙주 세포는 포유동물 세포이다. 또 다른 구현예에서, 상기 숙주 세포는 중국 햄스터 난소(CHO) 세포주이다.
또 다른 측면에서, 본 발명은 항-인간 IL-2 항체를 제조하는 방법을 제공하는데, 이 방법은 상기 프로모터가 발현되는 조건하에 상기에서 설명된 숙주 세포를 배양하고, 그리고 상기 배양물로부터 상기 인간 IL-2 뮤테인을 수거하는 것을 포함한다.
또 다른 측면에서, 본 발명은 대상체의 염증성 또는 자가-면역 병태를 치료하는 방법을 제공하는데, 이 방법은 상기에서 설명된 바와 같이 항-인간 IL-2 항체 또는 단리된 항-인간 IL-2 항체를 포함하는 단리된 복합체의 유효량을 상기 대상체에게 투여하는 것을 포함한다. 한 구현예에서, 상기 염증성 또는 자가-면역 병태는 낭창, 이식편 대 숙주 질환, C 형 간염-유도된 맥관염, I 형 당뇨병, II 형 당뇨병, 다발성 경화증, 류마티스성 관절염, 탈모증, 죽상동맥경화증, 건선, 장기 이식 거부, 쇼그렌 증후군, 베체트 증후군, 자연유산, 아토피성 질환, 천식 또는 염증성 장 질환이다.
도 1 단기 자극 분석에서, IgG-Fc의 C-말단에 융합에 의한 동종이량체화(homodimerization)는 감소된 효능과 CD25에 대한 높은 친화력을 갖는 IL-2 뮤테인의 활성을 변경시키지 못한다.
도 2a 및 도 2b 표시된 돌연변이를 가지고, Fc-이종이량체의 한 측면 C-말단에 융합된 IL-2 뮤테인은 T 세포에서 STAT5 인산화(phosphorylation)를 촉진시키는 이의 능력에 대하여 테스트되었다. 이들 뮤테인은 또한 CD25에 대하여 높은 친화력을 부여하는 3가지 돌연변이 (V69A, N71R, Q74P)를 함유하였다. 이들의 활성은 Fc 융합체가 없는 3가지 형태의 IL-2 (개방형 기호): WT IL-2, HaWT (CD25에 대한 높은 친화력) (N29S, Y31H, K35R, T37A, K48E, V69A, N71R, Q74P), 그리고 HaD (CD25에 대한 높은 친화력 및 감소된 신호전달 활성) (N29S, Y31H, K35R, T37A, K48E, V69A, N71R, Q74P, N88D)과 비교되었다. 게이트(gated) FOXP3+CD4+ 및 FOXP3-CD4+ T 세포에 대한 포스포-STAT5 반응을 나타낸다.
도 3 Fc-이종이량체에 융합된 IL-2 뮤테인의 적정에 반응한 T 세포 하위집단(subsets)의 증식. 융합 단백질들의 활성은 Fc 융합체가 없는 3가지 형태의 IL-2 (개방형 기호): WT IL-2, HaWT (CD25에 대한 높은 친화력) (N29S, Y31H, K35R, T37A, K48E, V69A, N71R, Q74P), 그리고 HaD (CD25에 대한 높은 친화력 및 감소된 신호전달 활성) (N29S, Y31H, K35R, T37A, K48E, V69A, N71R, Q74P, N88D)와 비교되었다.
도 4 Fc-이종이량체에 융합된 IL-2 뮤테인의 적정에 반응한 NK 세포의 증식. 융합 단백질들의 활성은 Fc 융합체가 없는 3가지 형태의 IL-2 (개방형 기호): WT IL-2, HaWT (CD25에 대한 높은 친화력) (N29S, Y31H, K35R, T37A, K48E, V69A, N71R, Q74P), 그리고 HaD (CD25에 대한 높은 친화력 및 감소된 신호전달 활성) (N29S, Y31H, K35R, T37A, K48E, V69A, N71R, Q74P, N88D)와 비교되었다.
도 5 Fc-동종이량체 N297G에 융합된 IL-2 뮤테인의 적정에 반응한 T 세포 하위집단(subsets)의 증식. Fc.뮤테인의 활성은 WT IL-2 (흰 원)와 Fc.WT (검정 원)과 비교되었다. CD25에 대한 높은 친화력을 부여하는 돌연변이 (HaMut1)는 V69A 및 Q74P이었다.
도 6 Fc-동종이량체 N297G에 융합된 IL-2 뮤테인의 적정에 반응한 NK 세포의 증식. Fc.뮤테인의 활성은 WT IL-2 (흰 원)와 Fc.WT (검정 원)를 비교되었다.
도 7a 및 도 7b CD25에 대한 높은 친화력을 부여하는 돌연변이 없는 Fc.IL-2 뮤테인은 인간화 마우스에서 Treg 증식 및 FOXP3 상향조절을 촉진한다.
도 8 주당 낮은 투여분량 (동물당 0.5 ㎍)의 Fc.IL-2 뮤테인은 인간화 마우스에서 Treg 증식 및 FOXP3 상향조절을 촉진하고, Fc.N88D 및 Fc.WT과 비교하여 Fc.V91K 에서 더 나은 활성이 관찰되었다.
도 9a Fc.V91K 및 Fc.N88D는 CD25와 연합을 통하여 활성화된 T 세포의 표면 상에 지속된다.
도 9b Fc.WT와 비교하여 Fc.V91K 및 Fc.N88D에 의한 IL-2R 신호전달 지속.
도 10a 및 b 시노몰구스(cynomolgus) 원숭이에서 Fc.V91K의 2주 및 4주 투여 간격 비교, 그리고 IV 및 SC 투여 경로의 비교.
도 11a-f PROLEUKIN®, Fc.V91K, 및 Fc.N88D을 상이한 투약 레지멘(dosing regimens)으로 처리된 시노몰구스 원숭이에서 세포의 반응, 체온, 그리고 혈청 CRP의 역동학.
도 12a 시노몰구스 원숭이의 Treg 세포, NK 세포, CD4+FOXP3-T 세포, 및 CD8+FOXP3-T 세포 수준에 있어서 PROLEUKIN®, Fc.V91K, 또는 Fc.N88D의 투여량(dosages) 증가의 효과. 각 데이터 점은 4마리 동물의 평균 최고 반응을 나타낸다.
도 12b 시노몰구스 원숭이의 Treg 세포 및 호산구 수준에 있어서 PROLEUKIN®, Fc.V91K, 또는 Fc.N88D의 투여량 증가의 효과. 각 데이터 점은 4마리 동물의 평균 최고 반응을 나타낸다.
도 12c 시노몰구스 원숭이의 Treg 세포 및 CRP 수준 그리고 체온에 있어서 PROLEUKIN®, Fc.V91K, 또는 Fc.N88D의 투여량 증가의 효과. 각 데이터 점은 4마리 동물의 평균 최고 반응을 나타낸다.
도 12d 시노몰구스 원숭이의 Treg 세포, 혈소판, 호중구, 및 알부민 수준에 있어서 PROLEUKIN®, Fc.V91K, 또는 Fc.N88D의 투여량 증가의 효과. 각 데이터 점은 4마리 동물의 평균 최고 반응을 나타낸다. 오른쪽 y-축은 투여-전(pre-dose) 시료와 비교하여 반전되어 혈소판, 호중구 또는 알부민의 감소 배수 변화로 옮겨갔다.
도 13 Fc.V91K로 처리된 시노몰구스 원숭이에서 항-약물 항체 (ADA)의 발생 역동학(Kinetics of the development)
도 14 다양한 IL-2 뮤테인에 대한 IL-2:IL-2Rβ 상호작용의 Discovery Studio의 예측 △△Gbinding (kcal/mol). 양(positive)의 값 △△Gbinding 은 야생형 IL-2와 비교하여 뮤테인의 더 약한 결합을 나타낸다. N88 및 D20 돌연변이체의 △△Gbinding 값은 예상보다 아래에 있을 것이다. 상자 안에 나타낸 뮤테인들이 선택되었다.
도 15 다양한 IL-2 돌연변이체에 대한 IL-2:IL-2Rβ 상호작용의 Schrodinger의 예측 △△Gbinding (kcal/mol). 양(positive)의 값의 △△Gbinding은 WT와 비교하여 이 돌연변이체의 더 약한 결합을 나타낸다. 상자 안에 나타낸 뮤테인들이 선택되었다.
도 16a 및 도 16b 인간 일차(Primary) PBMCs는 2일 동안 100 ng/ml OKT3로 사전-활성화되었다. 그 다음 세포들은 OKT3 항체를 제거하기 위하여 3회 세척 후, 3일 동안 방치해두었다. Fc.IL-2 뮤테인 융합 단백질의 생물활성은 이들 휴지된(rested) 사전-활성화된 PBMCs를 37℃에서 10분 동안 IL-2 뮤테인 적정(1 nM, 100 pM, 33 pM, 11 pM)으로 자극한 후, 표준 PHOSFLOW™ (BD, Franklin Lakes, NJ) 분석에 의해 포스포-STAT5 수준을 탐지하였다. Fc.IL-2 뮤테인의 생물활성은 게이트(gated) CD4+ T 세포에서 포스포-STAT5 평균 형광 강도(MFI)로 나타낸다. 상기 뮤테인은 형질감염된(transfected) 293-6E 세포의 상청액으로 분석되었으며, Fc.IL-2 융합 단백질의 농도는 단백질 A 결합 (OCTET Q SYSTEM®, Pall forteBIO Co., Menlo Park, CA)에 의해 결정되었다. "pTT5" 시료는 비어있는(empty) DNA 발현 벡터에 의해 형질감염된 세포의 상청 분획을 나타낸다. A) 한 공여자의 T 세포에서 적정된(titrated) Fc.IL-2 뮤테인 융합 단백질에 대한 포스포-STAT5 반응. B) 두 공여자에 있어서 33 pM의 Fc.IL-2 뮤테인에 대한 pSTAT5 반응을 등급화함.
도 17 인간 일차(Primary) PBMCs는 2일 동안 100 ng/ml OKT3의 사전-활성화되었다. 그 다음 세포들은 OKT3 항체를 제거하기 위하여 3회 세척 후, 3일 동안 방치해두었다. IL-2 뮤테인의 생물활성은 이들 휴지된(rested) 사전-활성화된 PBMCs를 37℃에서 10분 동안 IL-2 뮤테인 적정으로 자극하고, 이어서 표준 PHOSFLOW™ (BD, Franklin Lakes, NJ) 분석을 통하여 포스포-STAT5 수준을 탐지함으로써, 테스트되었다. IL-2 뮤테인의 생물활성은 게이트(gated) CD25highCD4 T+ 세포에서 포스포-STAT5 평균 형광 강도(MFI)로 나타낸다. Fc.IL-2(D20W, C125A)는 pSTAT5를 활성화시키지 못하였고, 그리고 이 분자와 Fc.IL-2(WT, C125A)는 각 도표에서 양성 대조 및 음성 대조로 나타낸다. 두 가지 PBMC 공여자에 대해 일관된 결과가 얻어졌다.
도 18 전체 PBMCs는 100 ng의 OKT3으로 3 백만/ml에서 활성화되었다. 2일차 시점에, 세포는 3회 세척하고, 5일 동안 새로운 배지에서 방치해두었다. 그 다음, 세포에 CFSE로 표지하고, FACS 분석에 앞서 7일 동안 IL-2 함유 배지에서 웰당 0.5 백만 수준으로 24-개 웰 플레이트에서 추가 배양되었다. T 세포 하위집단의 증식은 FOXP3-CD4+ 세포 (A), FOXP3-CD8+ 세포 (B), 및 HELIOS+FOXP3+CD4+ (C)에 대하여 CFSE 희석 (정중 CFSE 형광)으로 나타낸다. HELIOS+FOXP3+CD4+ 세포에서 FOXP3을 상향조절하는 뮤테인의 능력 또한 나타낸다(D).
도 19 MACS 분류된 CD16+ NK 세포는 96-웰 플레이트 상에서 웰당 0.1백만 수준으로 3일 동안 표시된 Fc.IL-2 뮤테인 적정으로 배양되었다. 배양 최종 18 시간 동안 각 웰에 0.5 μCi 3H-티미딘이 추가되었다.
도 20 인간 일차(Primary) PBMCs는 2일 동안 100 ng/ml의 OKT3로 사전-자극되었다. 세포는 회수되고, 4회 세척되고, 배지에서 하룻밤 동안 방치되었다. 그 다음 세포에 400 pM의 Fc.IL-2를 30분 동안 37℃에서 펄스시켰다. 펄스(pulse) 후, 세포는 T0에서 한번 세척 후 회수되거나, 또는 12 ml의 따뜻한 배지에서 추가 3회 세척되고, 표시된 시간동안 배양되었다. 세포-연합된 Fc.IL-2를 탐지하기 위하여, 세포는 항-인간 IgG-FITC (Jackson Immunoresearch, West Grove, PA) 및 항-CD25-APC (A)으로 착색되었다. 세포 표면 유지(retention)에 대하여 상기 뮤테인을 등급화하기 위하여, 4, 6, 및 24 시간 시점 동안 hu IgG MFI 값의 합을 두 PBMC 공여자에 대하여 평균하였다 (B).
도 21 도 20에서와 같이, 펄스-세척 후 pSTAT5 신호 유지, 단 예외적으로 세포는 100 pM의 Fc.IL-2로 펄스되었다.
도 22 세포 표면 유지와 IL-2R 신호전달 유지의 상관관계. 등급화된 표면 유지와 pSTAT5 신호 유지 값은 6 및 24 시간 시점에서 hu-IgG MFI (표면) 또는 pSTAT5 MFI (신호전달) 값을 추가하고, 이 값을 0에서 1로 스케일링하고(scaling), 그리고 두 공여자의 등급화된 값을 평균냄으로써, 산출되었다.
도 23a 및 도 23b 0일 시점에 1 ㎍의 Fc.IL-2 뮤테인을 피하 투여 후, 4일차 시점에 인간화 마우스 (CD34+ 조혈 줄기 세포로 재구성된 NSG 마우스)의 혈액 안에 CD4 T세포에서 Treg의 백분율. (B) pSTAT5 신호 유지와 Treg 농축(enrichment)의 상관관계. 등급화된 pSTAT5 신호 유지 값은 6 및 24 시간 시점에서 pSTAT5 MFI를 추가하고, 이 값을 0에서 1로 스케일링하고(scaling), 그리고 두 공여자의 등급화된 값을 평균냄으로써, 산출되었다.
도 24 (a)-(p) 실시예 13 및 14에 따라 만들고, 테스트된 인간 IL-2 뮤테인 융합 단백질의 아미노산 서열. 굵은 체 = 리더 서열; 기울임체= Fc 도메인 (N297G 및 delK 돌연변이를 포함); 밑줄친 부분 = 링커 서열; 평문 = IL-2 (C125A 및 표시된 돌연변이를 포함). 이와 함께, 상기 Fc 도메인, 링커 서열, 및 IL-2는 상기 단백질의 성숙한 형태(mature form)를 포함한다.
도 25 (a)-(ll) 실시예 13 및 14에 따라 만들고, 테스트된 인간 IL-2 뮤테인 융합 단백질의 핵산 서열.
도 26 실시예 15에 따라 단리되고 시험된 항체의 경쇄 가변 도메인의 아미노산 서열. CDR 1, 2, 및 3 (Kabat에 따라 정의됨)은 굵고 밑줄로 표시되며; 틀(framework) 영역 1, 2, 3, 및 4는 평문으로 나타낸다.
도 27(a) -(i) 실시예 15에 따라 단리되고, 테스트된 항체의 경쇄 가변 도메인의 핵산 서열.
도 28 실시예 15에 따라 단리되고, 테스트된 항체의 중쇄 가변 도메인의 아미노산 서열 CDR 1, 2, 및 3 (Kabat에 따라 정의됨)은 굵고 밑줄로 표시되며; 틀(framework) 영역 1, 2, 3, 및 4는 평문으로 나타낸다.
도 29(a)-(i) 실시예 15에 따라 단리되고, 테스트된 항체의 중쇄 가변 도메인의 핵산 서열.
도 30 실시예 15에서 설명된 바와 같이, 1.5㎍의 야생형 인간 IL-2)와 복합된 8 ㎍의 항-IL-2 항체 복합체의 단일 주사에 의해 처리된 NSG SCID/Hu 마우스에서 NK 세포 증식에 대한 Treg 세포 증식의 활성화 비율.
도 2a 및 도 2b 표시된 돌연변이를 가지고, Fc-이종이량체의 한 측면 C-말단에 융합된 IL-2 뮤테인은 T 세포에서 STAT5 인산화(phosphorylation)를 촉진시키는 이의 능력에 대하여 테스트되었다. 이들 뮤테인은 또한 CD25에 대하여 높은 친화력을 부여하는 3가지 돌연변이 (V69A, N71R, Q74P)를 함유하였다. 이들의 활성은 Fc 융합체가 없는 3가지 형태의 IL-2 (개방형 기호): WT IL-2, HaWT (CD25에 대한 높은 친화력) (N29S, Y31H, K35R, T37A, K48E, V69A, N71R, Q74P), 그리고 HaD (CD25에 대한 높은 친화력 및 감소된 신호전달 활성) (N29S, Y31H, K35R, T37A, K48E, V69A, N71R, Q74P, N88D)과 비교되었다. 게이트(gated) FOXP3+CD4+ 및 FOXP3-CD4+ T 세포에 대한 포스포-STAT5 반응을 나타낸다.
도 3 Fc-이종이량체에 융합된 IL-2 뮤테인의 적정에 반응한 T 세포 하위집단(subsets)의 증식. 융합 단백질들의 활성은 Fc 융합체가 없는 3가지 형태의 IL-2 (개방형 기호): WT IL-2, HaWT (CD25에 대한 높은 친화력) (N29S, Y31H, K35R, T37A, K48E, V69A, N71R, Q74P), 그리고 HaD (CD25에 대한 높은 친화력 및 감소된 신호전달 활성) (N29S, Y31H, K35R, T37A, K48E, V69A, N71R, Q74P, N88D)와 비교되었다.
도 4 Fc-이종이량체에 융합된 IL-2 뮤테인의 적정에 반응한 NK 세포의 증식. 융합 단백질들의 활성은 Fc 융합체가 없는 3가지 형태의 IL-2 (개방형 기호): WT IL-2, HaWT (CD25에 대한 높은 친화력) (N29S, Y31H, K35R, T37A, K48E, V69A, N71R, Q74P), 그리고 HaD (CD25에 대한 높은 친화력 및 감소된 신호전달 활성) (N29S, Y31H, K35R, T37A, K48E, V69A, N71R, Q74P, N88D)와 비교되었다.
도 5 Fc-동종이량체 N297G에 융합된 IL-2 뮤테인의 적정에 반응한 T 세포 하위집단(subsets)의 증식. Fc.뮤테인의 활성은 WT IL-2 (흰 원)와 Fc.WT (검정 원)과 비교되었다. CD25에 대한 높은 친화력을 부여하는 돌연변이 (HaMut1)는 V69A 및 Q74P이었다.
도 6 Fc-동종이량체 N297G에 융합된 IL-2 뮤테인의 적정에 반응한 NK 세포의 증식. Fc.뮤테인의 활성은 WT IL-2 (흰 원)와 Fc.WT (검정 원)를 비교되었다.
도 7a 및 도 7b CD25에 대한 높은 친화력을 부여하는 돌연변이 없는 Fc.IL-2 뮤테인은 인간화 마우스에서 Treg 증식 및 FOXP3 상향조절을 촉진한다.
도 8 주당 낮은 투여분량 (동물당 0.5 ㎍)의 Fc.IL-2 뮤테인은 인간화 마우스에서 Treg 증식 및 FOXP3 상향조절을 촉진하고, Fc.N88D 및 Fc.WT과 비교하여 Fc.V91K 에서 더 나은 활성이 관찰되었다.
도 9a Fc.V91K 및 Fc.N88D는 CD25와 연합을 통하여 활성화된 T 세포의 표면 상에 지속된다.
도 9b Fc.WT와 비교하여 Fc.V91K 및 Fc.N88D에 의한 IL-2R 신호전달 지속.
도 10a 및 b 시노몰구스(cynomolgus) 원숭이에서 Fc.V91K의 2주 및 4주 투여 간격 비교, 그리고 IV 및 SC 투여 경로의 비교.
도 11a-f PROLEUKIN®, Fc.V91K, 및 Fc.N88D을 상이한 투약 레지멘(dosing regimens)으로 처리된 시노몰구스 원숭이에서 세포의 반응, 체온, 그리고 혈청 CRP의 역동학.
도 12a 시노몰구스 원숭이의 Treg 세포, NK 세포, CD4+FOXP3-T 세포, 및 CD8+FOXP3-T 세포 수준에 있어서 PROLEUKIN®, Fc.V91K, 또는 Fc.N88D의 투여량(dosages) 증가의 효과. 각 데이터 점은 4마리 동물의 평균 최고 반응을 나타낸다.
도 12b 시노몰구스 원숭이의 Treg 세포 및 호산구 수준에 있어서 PROLEUKIN®, Fc.V91K, 또는 Fc.N88D의 투여량 증가의 효과. 각 데이터 점은 4마리 동물의 평균 최고 반응을 나타낸다.
도 12c 시노몰구스 원숭이의 Treg 세포 및 CRP 수준 그리고 체온에 있어서 PROLEUKIN®, Fc.V91K, 또는 Fc.N88D의 투여량 증가의 효과. 각 데이터 점은 4마리 동물의 평균 최고 반응을 나타낸다.
도 12d 시노몰구스 원숭이의 Treg 세포, 혈소판, 호중구, 및 알부민 수준에 있어서 PROLEUKIN®, Fc.V91K, 또는 Fc.N88D의 투여량 증가의 효과. 각 데이터 점은 4마리 동물의 평균 최고 반응을 나타낸다. 오른쪽 y-축은 투여-전(pre-dose) 시료와 비교하여 반전되어 혈소판, 호중구 또는 알부민의 감소 배수 변화로 옮겨갔다.
도 13 Fc.V91K로 처리된 시노몰구스 원숭이에서 항-약물 항체 (ADA)의 발생 역동학(Kinetics of the development)
도 14 다양한 IL-2 뮤테인에 대한 IL-2:IL-2Rβ 상호작용의 Discovery Studio의 예측 △△Gbinding (kcal/mol). 양(positive)의 값 △△Gbinding 은 야생형 IL-2와 비교하여 뮤테인의 더 약한 결합을 나타낸다. N88 및 D20 돌연변이체의 △△Gbinding 값은 예상보다 아래에 있을 것이다. 상자 안에 나타낸 뮤테인들이 선택되었다.
도 15 다양한 IL-2 돌연변이체에 대한 IL-2:IL-2Rβ 상호작용의 Schrodinger의 예측 △△Gbinding (kcal/mol). 양(positive)의 값의 △△Gbinding은 WT와 비교하여 이 돌연변이체의 더 약한 결합을 나타낸다. 상자 안에 나타낸 뮤테인들이 선택되었다.
도 16a 및 도 16b 인간 일차(Primary) PBMCs는 2일 동안 100 ng/ml OKT3로 사전-활성화되었다. 그 다음 세포들은 OKT3 항체를 제거하기 위하여 3회 세척 후, 3일 동안 방치해두었다. Fc.IL-2 뮤테인 융합 단백질의 생물활성은 이들 휴지된(rested) 사전-활성화된 PBMCs를 37℃에서 10분 동안 IL-2 뮤테인 적정(1 nM, 100 pM, 33 pM, 11 pM)으로 자극한 후, 표준 PHOSFLOW™ (BD, Franklin Lakes, NJ) 분석에 의해 포스포-STAT5 수준을 탐지하였다. Fc.IL-2 뮤테인의 생물활성은 게이트(gated) CD4+ T 세포에서 포스포-STAT5 평균 형광 강도(MFI)로 나타낸다. 상기 뮤테인은 형질감염된(transfected) 293-6E 세포의 상청액으로 분석되었으며, Fc.IL-2 융합 단백질의 농도는 단백질 A 결합 (OCTET Q SYSTEM®, Pall forteBIO Co., Menlo Park, CA)에 의해 결정되었다. "pTT5" 시료는 비어있는(empty) DNA 발현 벡터에 의해 형질감염된 세포의 상청 분획을 나타낸다. A) 한 공여자의 T 세포에서 적정된(titrated) Fc.IL-2 뮤테인 융합 단백질에 대한 포스포-STAT5 반응. B) 두 공여자에 있어서 33 pM의 Fc.IL-2 뮤테인에 대한 pSTAT5 반응을 등급화함.
도 17 인간 일차(Primary) PBMCs는 2일 동안 100 ng/ml OKT3의 사전-활성화되었다. 그 다음 세포들은 OKT3 항체를 제거하기 위하여 3회 세척 후, 3일 동안 방치해두었다. IL-2 뮤테인의 생물활성은 이들 휴지된(rested) 사전-활성화된 PBMCs를 37℃에서 10분 동안 IL-2 뮤테인 적정으로 자극하고, 이어서 표준 PHOSFLOW™ (BD, Franklin Lakes, NJ) 분석을 통하여 포스포-STAT5 수준을 탐지함으로써, 테스트되었다. IL-2 뮤테인의 생물활성은 게이트(gated) CD25highCD4 T+ 세포에서 포스포-STAT5 평균 형광 강도(MFI)로 나타낸다. Fc.IL-2(D20W, C125A)는 pSTAT5를 활성화시키지 못하였고, 그리고 이 분자와 Fc.IL-2(WT, C125A)는 각 도표에서 양성 대조 및 음성 대조로 나타낸다. 두 가지 PBMC 공여자에 대해 일관된 결과가 얻어졌다.
도 18 전체 PBMCs는 100 ng의 OKT3으로 3 백만/ml에서 활성화되었다. 2일차 시점에, 세포는 3회 세척하고, 5일 동안 새로운 배지에서 방치해두었다. 그 다음, 세포에 CFSE로 표지하고, FACS 분석에 앞서 7일 동안 IL-2 함유 배지에서 웰당 0.5 백만 수준으로 24-개 웰 플레이트에서 추가 배양되었다. T 세포 하위집단의 증식은 FOXP3-CD4+ 세포 (A), FOXP3-CD8+ 세포 (B), 및 HELIOS+FOXP3+CD4+ (C)에 대하여 CFSE 희석 (정중 CFSE 형광)으로 나타낸다. HELIOS+FOXP3+CD4+ 세포에서 FOXP3을 상향조절하는 뮤테인의 능력 또한 나타낸다(D).
도 19 MACS 분류된 CD16+ NK 세포는 96-웰 플레이트 상에서 웰당 0.1백만 수준으로 3일 동안 표시된 Fc.IL-2 뮤테인 적정으로 배양되었다. 배양 최종 18 시간 동안 각 웰에 0.5 μCi 3H-티미딘이 추가되었다.
도 20 인간 일차(Primary) PBMCs는 2일 동안 100 ng/ml의 OKT3로 사전-자극되었다. 세포는 회수되고, 4회 세척되고, 배지에서 하룻밤 동안 방치되었다. 그 다음 세포에 400 pM의 Fc.IL-2를 30분 동안 37℃에서 펄스시켰다. 펄스(pulse) 후, 세포는 T0에서 한번 세척 후 회수되거나, 또는 12 ml의 따뜻한 배지에서 추가 3회 세척되고, 표시된 시간동안 배양되었다. 세포-연합된 Fc.IL-2를 탐지하기 위하여, 세포는 항-인간 IgG-FITC (Jackson Immunoresearch, West Grove, PA) 및 항-CD25-APC (A)으로 착색되었다. 세포 표면 유지(retention)에 대하여 상기 뮤테인을 등급화하기 위하여, 4, 6, 및 24 시간 시점 동안 hu IgG MFI 값의 합을 두 PBMC 공여자에 대하여 평균하였다 (B).
도 21 도 20에서와 같이, 펄스-세척 후 pSTAT5 신호 유지, 단 예외적으로 세포는 100 pM의 Fc.IL-2로 펄스되었다.
도 22 세포 표면 유지와 IL-2R 신호전달 유지의 상관관계. 등급화된 표면 유지와 pSTAT5 신호 유지 값은 6 및 24 시간 시점에서 hu-IgG MFI (표면) 또는 pSTAT5 MFI (신호전달) 값을 추가하고, 이 값을 0에서 1로 스케일링하고(scaling), 그리고 두 공여자의 등급화된 값을 평균냄으로써, 산출되었다.
도 23a 및 도 23b 0일 시점에 1 ㎍의 Fc.IL-2 뮤테인을 피하 투여 후, 4일차 시점에 인간화 마우스 (CD34+ 조혈 줄기 세포로 재구성된 NSG 마우스)의 혈액 안에 CD4 T세포에서 Treg의 백분율. (B) pSTAT5 신호 유지와 Treg 농축(enrichment)의 상관관계. 등급화된 pSTAT5 신호 유지 값은 6 및 24 시간 시점에서 pSTAT5 MFI를 추가하고, 이 값을 0에서 1로 스케일링하고(scaling), 그리고 두 공여자의 등급화된 값을 평균냄으로써, 산출되었다.
도 24 (a)-(p) 실시예 13 및 14에 따라 만들고, 테스트된 인간 IL-2 뮤테인 융합 단백질의 아미노산 서열. 굵은 체 = 리더 서열; 기울임체= Fc 도메인 (N297G 및 delK 돌연변이를 포함); 밑줄친 부분 = 링커 서열; 평문 = IL-2 (C125A 및 표시된 돌연변이를 포함). 이와 함께, 상기 Fc 도메인, 링커 서열, 및 IL-2는 상기 단백질의 성숙한 형태(mature form)를 포함한다.
도 25 (a)-(ll) 실시예 13 및 14에 따라 만들고, 테스트된 인간 IL-2 뮤테인 융합 단백질의 핵산 서열.
도 26 실시예 15에 따라 단리되고 시험된 항체의 경쇄 가변 도메인의 아미노산 서열. CDR 1, 2, 및 3 (Kabat에 따라 정의됨)은 굵고 밑줄로 표시되며; 틀(framework) 영역 1, 2, 3, 및 4는 평문으로 나타낸다.
도 27(a) -(i) 실시예 15에 따라 단리되고, 테스트된 항체의 경쇄 가변 도메인의 핵산 서열.
도 28 실시예 15에 따라 단리되고, 테스트된 항체의 중쇄 가변 도메인의 아미노산 서열 CDR 1, 2, 및 3 (Kabat에 따라 정의됨)은 굵고 밑줄로 표시되며; 틀(framework) 영역 1, 2, 3, 및 4는 평문으로 나타낸다.
도 29(a)-(i) 실시예 15에 따라 단리되고, 테스트된 항체의 중쇄 가변 도메인의 핵산 서열.
도 30 실시예 15에서 설명된 바와 같이, 1.5㎍의 야생형 인간 IL-2)와 복합된 8 ㎍의 항-IL-2 항체 복합체의 단일 주사에 의해 처리된 NSG SCID/Hu 마우스에서 NK 세포 증식에 대한 Treg 세포 증식의 활성화 비율.
여기에 사용된 구역별 제목은 단지 구성적 목적을 위한 것이며, 기술된 주제를 제한하는 것으로 해석되어서는 안된다. 이 명세서의 본문에 인용된 모든 참조 문헌은 그 전문이 참조로 편입된다.
재조합 DNA, 올리고뉴클레오티드 합성, 조직 배양 및 단백질 정제, 등에 표준 기술이 이용될 수 있다. 효소 반응 및 정제 기술은 제조자의 명세서에 따라, 또는 당해 기술 분야에서 통상적으로 실행되는, 또는 본원에 기술된 바와 같이 수행될 수 있다. 하기 절차 및 기술은 일반적으로 당업계에 잘 공지되어 있고, 본 명세서 전반에 걸쳐 인용되고 논의된 다양한 일반적인 문헌 및 보다 구체적인 참고 문헌에 기재된 바와 같은 종래의 방법에 따라 수행될 수 있다. 가령 , Sambrook 등, 2001, Molecular Cloning: A Laboratory Manuel, 3rd ed., Cold Spring Harbor Laboratory Press, cold Spring Harbor, N.Y.참고하며, 이는 임의의 목적을 위하여 본 명세서에 참고문헌에 편입된다. 특정 정의가 제공되지 않는 한, 본원에 기술된 분석 화학, 유기 화학 및 의약 및 약학 화학의 실험 절차 및 기술 그리고 이와 관련하여 사용된 명명법은 당업계에 널리 공지되어 있고, 통상적으로 사용되는 것들이다. 화학적 합성, 화학적 분석, 약학 제제(preparation), 제형(formulation) 및 환자의 전달 및 치료에 표준 기술이 사용될 수 있다.
IL-2
본 명세서에서 설명된 IL-2 뮤테인은 야생형 인간 IL-2의 변이체들이다. 본 명세서에서 이용된 바와 같이, "야생형 인간 IL-2", "야생형 IL-2", 또는 "WT IL-2"는 다음의 아미노산 서열을 갖는 폴리펩티드를 의미한다:
APTSSSTKKTQLQLEHLLLDLQMILNGINNYKNPKLTRMLTFKFYMPKKATELKHLQCLEEELKPLEEVLNLAQSKNFHLRPRDLISNINVIVLELKGSETTFMCEYADETATIVEFLNRWITFXQSIISTLT
여기서 X는 C, S, V, 또는 A이다 (서열번호:2).
변이체들은 상기 야생형 IL-2 아미노산 서열 안에 하나 이상의 치환, 결실, 또는 삽입을 함유한다. 잔기는 단일 문자 아미노산 코드와 이어서 이 IL-2 아미노산 위치로 표시되는데, 가령, K35는 서열번호:2의 위치 35에 있는 리신 잔기이다. 치환은 단일 문자 아미노산 코드와 이어서 이 IL-2 아미노산 위치, 그리고 치환되는 단일 문자 아미노산 코드로 표시되는데, 가령, K35A는 서열번호:2의 위치 35에 있는 리신 잔기가 알라닌으로 치환됨을 나타낸다.
IL-2
뮤테인
및 항-IL-2 항체
T 조절 (Treg) 세포를 우선적으로 자극하는 인간 IL-2 뮤테인 및 항-IL-2 항체를 본 명세서에서 제공한다. 본 명세서에서 이용된 바와 같이 "T 조절 세포를 우선적으로 자극한다"라는 것은, 항체 또는 뮤테인이 CD3+FoxP3-T 세포 보다는 CD3+FoxP3+ T 세포의 증식, 생존, 활성화 및/또는 기능을 촉진한다는 것을 의미한다. Tregs를 우선적으로 촉진시키는 능력을 측정하는 방법은 말초혈액 백혈구의 유동세포측정에 의해 측정될 수 있는데, 여기서 전체 CD4+ T 세포중에서 FOXP3+CD4+ T 세포의 백분율의 증가, 전체 CD8+ T 세포중에서 FOXP3+CD8+ T 세포의 백분율의 증가, NK 세포와 비교하여 FOXP3+ T 세포의 백분율의 증가, 및/또는 다른 T 세포 상에서 CD25의 발현 증가와 비교하여, FOXP3+ T 세포의 표면 상에서 CD25의 발현 수준의 더 큰 증가가 관찰된다. Treg 세포의 우선적 성장은 중아황산염-처리된 게놈 DNA의 중합효소 연쇄 반응(PCR)의 서열화에 의해 탐지될 때(J. Sehouli, 등, 2011. Epigenetics 6:2, 236-246) 전혈로부터 추출한 DNA에서 디메틸화된 CD3 유전자와 비교하여, 디메틸화된(demethylated) FOXP3 프로모터 DNA (가령, Treg-특이적 디메틸화된 영역, 또는 TSDR)의 증가로 탐지될 수 있다.
Treg 세포를 우선적으로 자극하는 IL-2 뮤테인 또는 항-IL-2 항체는 대상체에서 또는 말초 혈액 시료에서 CD3+FoxP3-T 세포에 대한 CD3+FoxP3+ T 세포의 비율을 적어도 30%, 적어도 40%, 적어도 50%, 적어도 60%, 적어도 70%, 적어도 80%, 적어도 90%, 적어도 100%, 적어도 150%, 적어도 200%, 적어도 300%, 적어도 400%, 적어도 500%, 적어도 600%, 적어도 700%, 적어도 800%, 적어도 900%, 또는 적어도 1000% 증가시킨다.
IL-2 뮤테인의 예로는 서열번호:2에 제시된 아미노산 서열에 H16T, H16K, H16R, L19N, L19D, D20E, D20G, D20T, N88D, N88R, N88S, V91D, V91G, V91K, 및/또는 V91S 치환(들)을 포함하는 IL-2 뮤테인을 포함하지만, 이에 국한되지는 않는다. 예시적인 IL-2 뮤테인은 도 24에서 제시된다. 본 발명의 IL-2 뮤테인은 임의선택적으로 C125A 치환을 포함한다. 야생형 IL-2 서열에 대한 돌연변이 수를 더 감소시키는 것이 유리할 수 있겠지만, 본 발명은 상기 뮤테인이 Tregs를 우선적으로 자극시키는 활성을 유지한다는 조건하에, H16T, H16K, H16R, L19N, L19D, D20E, D20G, D20T, N88D, N88R, N88S, V91D, V91G, V91K, 및/또는 V91S 치환에 추가적으로 절단 및/또는 추가 삽입, 결실, 및/또는 치환을 더 함유하는 IL-2 뮤테인을 포함한다. 따라서, 구현예들은 Tregs 세포를 우선적으로 자극시키고, 서열번호:2에 제시된 아미노산 서열에 대하여 적어도 90%, 적어도 91%, 적어도 92%, 적어도 93%, 적어도 94%, 적어도 95%, 적어도 96%, 적어도 97%, 적어도 98%, 또는 적어도 99% 동일하며, 그리고 H16T, H16K, H16R, L19N, L19D, D20E, D20G, D20T, N88D, N88R, N88S, V91D, V91G, V91K, 및/또는 V91S 치환을 갖는 아미노산을 포함하는 IL-2 뮤테인을 포함한다. 특별히 바람직한 구현예들에 있어서, 이러한 IL-2 뮤테인은 서열번호:2에 제시된 아미노산 서열에 대하여 적어도 90%, 적어도 91%, 적어도 92%, 적어도 93%, 적어도 94%, 적어도 95%, 적어도 96%, 적어도 97%, 적어도 98%, 또는 적어도 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다.
아미노산 서열의 경우, 서열 동일성 및/또는 유사성은 Smith and Waterman의 국소 서열 동일성 알고리즘, 1981, Adv . Appl . Math. 2:482, Needleman and Wunsch, 1970, J. Mol . Biol . 48:443의 서열 동일성 배열 알고리즘, Pearson and Lipman의 유사성 방법 조사, 1988, Proc . Nat. Acad . Sci . U.S.A . 85:2444, 이들 알고리즘의 자동화된 시행 (Wisconsin Genetics Software Package, Genetics Computer Group, 575 Science Drive, Madison, Wis.의 GAP, BESTFIT, FASTA, 및 TFASTA), 디폴트 세팅을 우선적으로 이용하거나, 또는 조사에 의해 Devereux 등, 1984, Nucl . Acid Res. 12:387-395에서 설명된 Best Fit 서열 프로그램을 포함하나, 이에 국한되지 않는 당업계에 공지된 표준 기술을 사용하여 결정된다. 바람직하게는, 다음의 매개변수에 근거하여 FastDB에 의해 동일성 백분율이 산출된다: 미스매치 패널피(mismatch penalty) 1; 갭 패널티(gap penalty) 1; 갭 크기 패널피(gap size penalty) 0.33; 그리고 결합 패널피(joining penalty) 30, "Current Methods in Sequence Comparison and Analysis," Macromolecule Sequencing and Synthesis, Selected Methods and Applications, pp 127-149 (1988), Alan R. Liss, Inc.
유용한 알고리즘의 예시는 PILEUP이다. PILEUP은 프로그래시브, 페어와이즈 정렬(progressive, pairwise alignments)을 사용하여 관련된 서열 그룹으로부터 다중 서열 정렬을 만든다. 또한 정렬을 작성하는데 사용된 클러스터링(clustering) 상관관계를 보여주는 트리를 플롯할 수 있다. PILEUP는 Feng & Doolittle, 1987, J. Mol . Evol . 35:351-360의 프로그래시브 정렬 방법의 단순화를 사용한다; 이 방법은 Higgins and Sharp, 1989, CABIOS 5:151-153에서 설명된 것과 유사하다. 유용한 PILEUP 매개변수들은 디폴트 갭 가중치(default gap weight) 3.00, 디폴트 갭 길이 가중치(default gap length weight) 0.10, 그리고 가중된 단부 갭(weighted end gaps)을 포함한다.
또 다른 유용한 알고리즘의 예는 Altschul 등, 1990, J. Mol . Biol . 215:403-410; Altschul 등, 1997, Nucleic Acids Res. 25:3389-3402; 및 Karin 등, 1993, Proc . Natl . Acad . Sci . U.S.A . 90:5873-5787에서 설명된 BLAST 알고리즘이다. 특히 유용한 BLAST 프로그램은 Altschul 등, 1996, Methods in Enzymology 266:460-480에서 얻을 수 있는 WU-BLAST-2 프로그램이다. WU-BLAST-2는 몇 가지 검색 매개 변수를 사용하고, 이들 대부분의 매개 변수는 기본값으로 설정된다. 조정 가능한 매개 변수는 다음 값으로 설정된다: 오버랩 스팬(overlap span)=1, 오버랩 프랙션(overlap fraction)=0.125, 단어 임계치(word threshold) (T)=II. HSP S 및 HSP S2 매개변수는 동적 값(dynamic values)이며, 특정 서열의 구성 및 관심 대상 서열이 검색되는 특정 데이터베이스의 구성에 따라 프로그램 자체에 의해 설정된다; 그러나, 민감도를 증가시키기 위하여 상기 값들은 조정될 수 있다.
추가적으로 유용한 알고리즘은 Altschul 등, 1993, Nucl . Acids Res. 25:3389-3402에 의해 보고된 갭삽입된(gapped) BLAST이다. 갭삽입된(Gapped) BLAST는 BLOSUM-62 치환 점수를 이용하고; 임계치 T 매개변수는 9로 설정되며; 갭이 없는(ungapped) 연장을 촉발시키기 위한 투-히트(two-hit) 방법을 이용하고, k의 갭 길이는 10+k의 값으로 부여하고; Xu 는 16으로 설정되며, 그리고 Xg 는 데이터베이스 조사 단계에서는 40으로, 그리고 알고리즘의 출력 단계에서는 67로 설정된다. 약 22 비트(bits)에 상응하는 점수에 의해 갭삽입된(Gapped) 정렬이 촉발된다.
아미노산 서열 변이를 도입하는 부위 또는 영역이 사전 결정될 수 있지만, 돌연변이 그 자체는 미리 결정할 필요는 없다. 예를 들어, 주어진 부위에서 돌연변이의 수행을 최적화하기 위해, 표적 코돈 또는 부위에서 무작위 돌연변이유발(random mutagenesis)이 수행될 수 있고, 발현된 IL-2 뮤테인은 원하는 활성의 최적 조합에 대해 스크리닝될 수 있다. 공지 서열을 갖는 DNA에서 미리 결정된 부위에 치환 돌연변이를 만드는 기술은 공지되어 있는데, 예를 들어, M13 프라이머 돌연변이 유발 및 PCR 돌연변이 유발 기술이 잘 알려져 있다. 돌연변이체의 스크리닝은 예를 들어, 본원에 기술된 분석법을 사용하여 수행될 수 있다.
아미노산 치환은 전형적으로 단일 잔기이다; 상당히 큰 삽입이 허용될 수는 있지만, 일반적으로 삽입은 약 1 내지 약 20개의 아미노산 잔기일 것이다. 결실은 약 1 개 내지 약 20 개의 아미노산 잔기의 범위이지만, 경우에 따라 결실이 훨씬 클 수도 있다.
치환, 결실, 삽입 또는 이의 임의의 조합을 이용하여 최종 유도체 또는 변이체에 이를 수 있다. 일반적으로, 이러한 변화는 분자의 변경, 특히 항원 결합 단백질의 면역원성 및 특이성을 최소화하기 위해 몇 가지 아미노산에서 이루어진다. 그러나 특정 상황에서는 큰 변화가 용인될 수 있다. 보수적 치환은 일반적으로 표 1에 표시된 다음 차트에 따라 만들어진다.
원래 잔기 | 예시적인 치환 |
Ala Arg Asn Asp Cys Gln Glu Gly His Ile Leu Lys Met Phe Ser Thr Trp Tyr Val |
Ser Lys Gln, His Glu Ser, Ala Asn Asp Pro Asn, Gln Leu, Val Ile, Val Arg, Gln, Glu Leu, Ile Met, Leu, Tyr, Trp Thr Ser Tyr, Phe Trp, Phe Ile, Leu |
기능 또는 면역학적 동일성에서 실질적인 변화는 표 1에 표시된 것보다 덜 보수적인 치환을 선택함으로써 이루어진다. 예를 들면, 변경 영역에서 폴리펩티드 기본틀 구조, 예를 들면 알파-나선 또는 베타-쉬트 구조; 표적 부위에서 분자의 하전 또는 소수성; 또는 측쇄의 크기(bulk)에 상당히 큰 영향을 주는 치환이 만들어질 수 있다. 폴리펩티드 성질을 최대로 변화시키는 것으로 일반적으로 예상되는 치환은 다음과 같다: (a) 친수성 잔기, 가령, 세릴 또는 트레오닐을 소수성 잔기, 가령, 루이실, 이소루이실, 페닐알라닐, 발일 또는 알라닐을 대체(또는 이로 치환); (b) 시스테인 또는 프롤린이 임의의 다른 잔기를 대체(또는 이로 치환); (c) 양전기 측쇄를 갖는 잔기, 가령, 리실, 아르기닐, 또는 히스티딜은 음전기 잔기, 가령, 글루타밀 또는 아스파르틸을 대체(또는 이로 치환); 또는 (d) 벌크 측쇄를 갖는 잔기, 가령, 페닐알라닌은 측쇄를 가지지 않는 것, 가령, 글리신을 대체(또는 이로 치환).
이들 변이체는 필요에 따라 IL-2 뮤테인의 특성을 변형시키는 변이체가 선택되기는 하지만, 이 변이체들은 전형적으로 동일한 질의 생물학적 활성을 나타내며, 자연 발생 유사체(analogue)와 동일한 면역 반응을 유도할 것이다. 대안적으로, 변이체는 IL-2 뮤테인의 생물학적 활성이 변경되도록 설계될 수 있다. 예를 들면, 글리코실화 부위는 본원에서 논의된 바와 같이 변경되거나 제거될 수 있다.
또 다른 구현예에서, 본 발명은 9D6, 2C3, 14C9, 8B12, 16A4, 16E1, 13A1, 8F10, 12C4, 9B12, 3H5, 18A6, 10A6, 10H7, 15A10, 12D2, 9B10, 17D3, 15G11, 14D7, 18F3, 17D9, 21F8, 22B9, 21D10, 14A6, 11D6, 10A9, 16E3, 14G7, 5H3, 2B12, 26H7, 26C12, 2H11, 및 18H9와 같이 본 명세서에서 명시된 항체중 하나의 중쇄 및 경쇄 가변 도메인을 포함하는 항체를 제공한다..
또 다른 구현예에서, 본 발명은 9D6, 2C3, 14C9, 8B12, 16A4, 16E1, 13A1, 8F10, 12C4, 9B12, 3H5, 18A6, 10A6, 10H7, 15A10, 12D2, 9B10, 17D3, 15G11, 14D7, 18F3, 17D9, 21F8, 22B9, 21D10, 14A6, 11D6, 10A9, 16E3, 14G7, 5H3, 2B12, 26H7, 26C12, 2H11, 또는 18H9의 경쇄 가변 도메인 서열에서 오직 15, 14, 13, 12, 11, 10, 9, 8, 7, 6, 5, 4, 3, 2, 또는 1개 잔기만 상이한 아미노산 서열이 포함된 경쇄 가변 도메인을 포함하는 항-IL-2 항체를 제공하며, 여기서 이러한 각 서열 차이는 독립적으로 한 개 아미노산의 결실, 삽입, 또는 치환일 수 있다. 또 다른 구현예에서, 상기 경쇄 가변 도메인은 9D6, 2C3, 14C9, 8B12, 16A4, 16E1, 13A1, 8F10, 12C4, 9B12, 3H5, 18A6, 10A6, 10H7, 15A10, 12D2, 9B10, 17D3, 15G11, 14D7, 18F3, 17D9, 21F8, 22B9, 21D10, 14A6, 11D6, 10A9, 16E3, 14G7, 5H3, 2B12, 26H7, 26C12, 2H11, 또는 18H9의 경쇄 가변 도메인 서열에 대하여 적어도 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 95%, 97%, 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다. 또 다른 구현예에서, 상기 경쇄 가변 도메인은 중간 수준의 엄격한 조건(stringent conditions) 하에서 도 27의 뉴클레오티드 서열의 보체에 혼성화되는 폴리뉴클레오티드에 의해 암호화되는 아미노산 서열을 포함한다.
또 다른 구현예에서, 본 발명은 9D6, 2C3, 14C9, 8B12, 16A4, 16E1, 13A1, 8F10, 12C4, 9B12, 3H5, 18A6, 10A6, 10H7, 15A10, 12D2, 9B10, 17D3, 15G11, 14D7, 18F3, 17D9, 21F8, 22B9, 21D10, 14A6, 11D6, 10A9, 16E3, 14G7, 5H3, 2B12, 26H7, 26C12, 2H11, 또는 18H9의 중쇄 가변 도메인 서열에서 오직 15, 14, 13, 12, 11, 10, 9, 8, 7, 6, 5, 4, 3, 2, 또는 1개 잔기만 상이한 아미노산 서열이 포함된 중쇄 가변 도메인을 포함하는 항-IL-2 항체를 제공하며, 여기서 이러한 각 서열 차이는 독립적으로 한 개 아미노산의 결실, 삽입, 또는 치환일 수 있다. 또 다른 구현예에서, 상기 중쇄 가변 도메인은 9D6, 2C3, 14C9, 8B12, 16A4, 16E1, 13A1, 8F10, 12C4, 9B12, 3H5, 18A6, 10A6, 10H7, 15A10, 12D2, 9B10, 17D3, 15G11, 14D7, 18F3, 17D9, 21F8, 22B9, 21D10, 14A6, 11D6, 10A9, 16E3, 14G7, 5H3, 2B12, 26H7, 26C12, 2H11, 또는 18H9의 중쇄 가변 도메인 서열에 대하여 적어도 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 95%, 97%, 또는 99% 동일한 아미노산 서열을 포함한다. 또 다른 구현예에서, 상기 중쇄 가변 도메인은 중간 수준의 엄격한 조건하에 도 29의 뉴클레오티드 서열의 보체에 혼성화되는 폴리뉴클레오티드에 의해 암호화되는 아미노산 서열을 포함한다.
또 다른 구현예에서, 본 발명은 항체 9D6, 2C3, 14C9, 8B12, 16A4, 16E1, 13A1, 8F10, 12C4, 9B12, 3H5, 18A6, 10A6, 10H7, 15A10, 12D2, 9B10, 17D3, 15G11, 14D7, 18F3, 17D9, 21F8, 22B9, 21D10, 14A6, 11D6, 10A9, 16E3, 14G7, 5H3, 2B12, 26H7, 26C12, 2H11, 또는 18H9의 3개 경쇄 CDR 서열 모두와 3개 중쇄 CDR 서열 모두를 포함하는 항-IL-2 항체를 제공한다.
또 다른 구현예에서, 본 발명은 실시예 15에서 설명된 것과 같이, IL-2에 대한 결합을 교차-억제하는 항-IL-2 항체를 제공한다.
연장된 혈청 반감기를 갖는 IL-2
뮤테인
및 항-IL-2 항체
본원에서 제공된 IL-2 뮤테인은 예를 들어, Teff 또는 NK 세포보다 Tregs를 우선적으로 증식시키기 때문에, 환자에게 투여될 때 안전성 프로파일은 야생형 IL-2 또는 PROLEUKIN®(알데스루킨(aldesleukin); Novartis, Basel, Switzerland)의 프로파일과는 다를 것이다. 야생형 IL-2 또는 PROLEUKIN®과 관련된 부작용으로는 독감-유사 증상, 오한/경직, 관절통, 발열, 발진, 가려움증, 주사 부위 반응, 저혈압, 설사, 메스꺼움, 불안, 정신혼란(confusion), 우울증 등이 있다. 본원에서 제공된 IL-2 뮤테인은 반감기 연장으로 인하여 환자에서 부작용 또는 유해 반응의 가능성 또는 그 강도를 증가시키는 위험의 증가 없이, 상기 뮤테인의 혈청 반감기를 연장시키는 분자를 함유하거나 또는 이러한 분자에 융합되도록 변경될 수 있다. 그러한 혈청 반감기 연장된 뮤테인의 피하 투여로 전신 최대 노출 (Cmax)을 더 낮추면서, 지속된 표적 범위를 허용할 수 있다. 혈청 반감기 연장으로 더 낮은 용량의, 또는 덜 빈번한 뮤테인의 투약이 허용될 수 있다.
본 명세서에서 제공되는 IL-2 뮤테인의 혈청 반감기는 당분야에 기본적으로 공지된 임의의 방법에 의해 연장될 수 있다. 이러한 방법은 신생아 Fcγ 수용체에 결합하거나, 또는 혈청 반감기 연장된, 가령, IgG 또는 인간 혈청 알부민을 갖는 단백질에 결합하는 펩티드를 포함하도록 상기 IL-2 뮤테인의 서열을 변경시키는 것을 포함한다. 다른 구현예들에 있어서, 상기 IL-2 뮤테인은 융합체 분자에게 연장된 반감기를 부여하는 폴리펩티드에 융합된다. 이러한 폴리펩티드는 신생아 Fcγ 수용체, 또는 인간 혈청 알부민에 결합하는 IgG Fc 또는 다른 폴리펩티드, 또는 연장된 혈청 반감기를 갖는 단백질에 결합하는 폴리펩티드를 포함한다. 바람직한 구현예들에서, 상기 IL-2 뮤테인은 IgG Fc 분자에 융합된다.
상기 IL-2 뮤테인은 IgG Fc 영역의 N-말단 또는 C-말단에 융합될 수 있다. 실시예에서 나타낸 바와 같이, IgG Fc 영역의 C-말단에 융합은 IgG Fc의 N-말단에 융합된 경우와 비교하여 상기 IL-2 뮤테인 활성을 더 큰 수준으로 유지시킨다.
본 발명의 한 구현예는 항체의 Fc 영역에 IL-2 뮤테인을 융합시켜 만든 2개의 Fc-융합 폴리펩티드를 포함하는 이량체에 관계한다. 상기 이량체는 예를 들면, 다음과 같이 만들어진다: 상기 융합 단백질을 암호화하는 유전자 융합체를 적절한 발현 벡터 안에 삽입하고, 상기 재조합 발현 벡터에 의해 형질변환된 숙주 세포 안에서 유전자 융합체를 발현시키고, 그리고 이 발현된 융합 단백질은 항체 분자와 매우 유사하게 어셈블리되도록 하고, 그 결과 상기 Fc 모이어티 사이에 쇄간 결합이 형성되어 이량체가 만들어질 수 있다.
본 명세서에서 이용된 바와 같이, 용어 "Fc 폴리펩티드" 또는 "Fc 영역"은 항체의 Fc 영역으로부터 유도된 폴리펩티드의 고유한 그리고 뮤테인 형태를 포함하고, 본 발명의 IL-2 뮤테인 융합 단백질 또는 항-IL-2 항체의 일부분일 수 있다. 이량체화를 촉진시키는 힌지 영역을 함유하는 이러한 폴리펩티드의 절단된 형태 또한 포함된다. 특정 구현예들에 있어서, 상기 Fc 영역은 항체 CH2 및 CH3 도메인을 포함한다. 연장된 혈청 반감기와 함께, Fc 모이어티 (및 이로부터 형성된 올리고머)를 포함하는 융합 단백질들은 단백질 A 또는 단백질 G 컬럼에서 친화력 크로마토그래피에 의해 용이하게 정제되는 장점을 제공한다. 바람직한 Fc 영역은 IgG1, IgG2, IgG3, 및 IgG4를 포함하는 인간 IgG로부터 유도된다. 여기서, 상기 Fc 안에 특이 잔기는 위치에 의해 확인된다. 모든 Fc 위치는 EU 넘버링 체계에 기반을 둔다.
항체의 Fc 영역의 기능중 하나는 이 항체가 이의 표적에 결합될 때, 면역계와 소통하는 것이다. 이것은 "효과기 기능(effector function)"으로 간주된다. 소통은 항체-의존성 세포 세포 독성 (ADCC), 항체-의존성 세포 식작용 (ADCP) 및/또는 보체 의존성 세포독성 (CDC)을 유도한다. ADCC 및 ADCP는 면역계의 세포 표면 상의 Fc 수용체에 대한 Fc의 결합을 통해 매개된다. CDC는 보체 시스템의 단백질, 예를 들어, C1q와의 Fc의 결합을 통해 매개된다.
IgG 하위 클래스는 효과기 기능을 중재하는 상이한 능력을 갖는다. 예를 들면, IgG1는 ADCC 및 CDC의 중재에 있어서, IgG2 및 IgG4보다 훨씬 우위에 있다. 따라서, 효과기 기능이 바람직하지 않는 구현예들에 있어서, IgG2 Fc가 선호될 것이다. 그러나, IgG2 Fc-함유 분자는 만들기가 훨씬 더 어렵고, 매력적인 생물물리적 성질, 이를 테면, IgG1 Fc-함유 분자와 비교하였을 때, 더 짧은 반감기를 가지는 것으로 알려져 있다.
상기 Fc 안에 하나 이상의 돌연변이를 도입시킴으로써, 항체의 효과기 기능이 증가 또는 감소될 수 있다. 본 발명의 구현예들은 효과기 기능을 증가시키도록 가공된 Fc를 갖는 IL-2 뮤테인 Fc 융합 단백질을 포함한다 (U.S. 7,317,091 및 Strohl, Curr . Opin . Biotech., 20:685-691, 2009; 이들 모두는 전문이 본 명세서의 참고자료에 편입된다). 증가된 효과기 기능을 갖는 예시적인 IgG1 Fc 분자는 다음의 치환을 갖는 것들을 포함한다:
S239D/I332E
S239D/A330S/I332E
S239D/A330L/I332E
S298A/D333A/K334A
P247I/A339D
P247I/A339Q
D280H/K290S
D280H/K290S/S298D
D280H/K290S/S298V
F243L/R292P/Y300L
F243L/R292P/Y300L/P396L
F243L/R292P/Y300L/V305I/P396L
G236A/S239D/I332E
K326A/E333A
K326W/E333S
K290E/S298G/T299A
K290N/S298G/T299A
K290E/S298G/T299A/K326E
K290N/S298G/T299A/K326E
IgG Fc-함유 단백질의 효과기 기능을 증가시키는 또 다른 방법은 Fc의 푸코실화(fucosylation)를 감소시키는 것이다. Fc에 부착된 2분지형 복합체-유형 올리고사카라이드로부터 코어 푸코스를 제거하면, 항원 결합 또는 CDC 효과기 기능을 변화시키지 않으면서, ADCC 효과기 기능은 크게 증가되었다. Fc-함유 분자, 예를 들어 항체의 푸코실화를 감소 또는 없애는 여러 가지 방법이 알려져 있다. 이들 방법은 FUT8 녹아웃(knockout) 세포주, 변이체 CHO 계통 Lec13, 래트(rat) 하이브리도마 세포주 YB2/0, FUT8 유전자에 특이적으로 대항하는 작은 간섭 RNA를 포함하는 세포주, 그리고 β-1,4-N-아세틀글루코사미닐전이효소 III 및 골지 α-만노시다제 II를 공동발현시키는 세포주을 포함하는 특정 포유동물 세포주에서 재조합 발현을 포함한다. 대안으로, 상기 Fc-함유 분자는 식물 세포, 효모, 또는 원핵 세포, 가령, 이.콜라이(E. coli)와 같은 비-포유동물 세포에서 발현될 수 있다.
특정 구현예들에 있어서, 본 발명의 상기 IL-2 뮤테인 Fc-융합 단백질 또는 항-IL-2 항체는 효과기 기능을 감소시키도록 가공된 Fc를 포함한다. 감소된 효과기 기능을 갖는 예시적인 Fc 분자는 다음의 치환을 갖는 것들을 포함한다:
N297A 또는 N297Q (IgG1)
L234A/L235A (IgG1)
V234A/G237A (IgG2)
L235A/G237A/E318A (IgG4)
H268Q/V309L/A330S/A331S (IgG2)
C220S/C226S/C229S/P238S (IgG1)
C226S/C229S/E233P/L234V/L235A (IgG1)
L234F/L235E/P331S (IgG1)
S267E/L328F (IgG1)
인간 IgG1은 N297 (EU 넘버링 체계)에서 글리코실화 부위를 갖고, 글리코실화는 IgG1 항체의 효과기 기능에 기여하는 것으로 알려져 있다. 예시적인 IgG1 서열은 서열번호:3에서 제공된다:
Asp Lys Thr His Thr Cys Pro Pro Cys Pro Ala Pro Glu Leu Leu Gly
1 5 10 15
Gly Pro Ser Val Phe Leu Phe Pro Pro Lys Pro Lys Asp Thr Leu Met
20 25 30
Ile Ser Arg Thr Pro Glu Val Thr Cys Val Val Val Asp Val Ser His
35 40 45
Glu Asp Pro Glu Val Lys Phe Asn Trp Tyr Val Asp Gly Val Glu Val
50 55 60
His Asn Ala Lys Thr Lys Pro Arg Glu Glu Gln Tyr Asn Ser Thr Tyr
65 70 75 80
Arg Val Val Ser Val Leu Thr Val Leu His Gln Asp Trp Leu Asn Gly
85 90 95
Lys Glu Tyr Lys Cys Lys Val Ser Asn Lys Ala Leu Pro Ala Pro Ile
100 105 110
Glu Lys Thr Ile Ser Lys Ala Lys Gly Gln Pro Arg Glu Pro Gln Val
115 120 125
Tyr Thr Leu Pro Pro Ser Arg Glu Glu Met Thr Lys Asn Gln Val Ser
130 135 140
Leu Thr Cys Leu Val Lys Gly Phe Tyr Pro Ser Asp Ile Ala Val Glu
145 150 155 160
Trp Glu Ser Asn Gly Gln Pro Glu Asn Asn Tyr Lys Thr Thr Pro Pro
165 170 175
Val Leu Asp Ser Asp Gly Ser Phe Phe Leu Tyr Ser Lys Leu Thr Val
180 185 190
Asp Lys Ser Arg Trp Gln Gln Gly Asn Val Phe Ser Cys Ser Val Met
195 200 205
His Glu Ala Leu His Asn His Tyr Thr Gln Lys Ser Leu Ser Leu Ser
210 215 220
Pro Gly Lys
225
글리코실화된 항체를 만드는 노력의 일환으로 N297을 돌연변이시켰다. 상기 돌연변이는 N297을 글루타민 (N297Q) 또는 극성 그룹이 없는 아스파라긴을 모방한 알라닌 (N297A)과 같은 물리화학적 성질에서 아스파라긴과 유사한 아미노산으로 대체하는 것에 초점을 두고 있다.
본 명세서에서 이용된 바와 같이, "탈글리코실화된 항체" 또는 "비글리코실화된 fc"는 상기 Fc의 297 위치에 있는 잔기의 글리코실화 상태를 나타낸다. 항체 또는 다른 분자는 하나 이상의 다른 위치에서 글리코실화를 함유할 수 있지만, 여전히 탈글리코실화된 항체 또는 탈글리코실화된 Fc-융합 단백질로 간주될 수 있다.
효과기 기능이 없는 IgG1 Fc를 제조하려는 시도에서, 인간 IgG1의 아미노산 N297이 글리신으로 돌연변이, 즉 N297G는 해당 잔기에서 다른 아미노산 치환보다 훨씬 우수한 정제 효율 및 생물물리학적 특성을 제공한다는 것이 발견되었다. 실시예 8 참고. 따라서, 바람직한 구현예들에서, 상기 IL-2 뮤테인 Fc-융합 단백질은 N297G 치환을 갖는 인간 IgG1을 포함한다. N297G 치환을 포함하는 Fc는 분자가 인간 IgG1 Fc를 포함하는 임의의 상황에서 유용하며, IL-2 뮤테인 Fc-융합과 관련하여 사용되는 것에 한정되지 않는다. 특정 구현예들에 있어서, 항체는 N297G 치환을 갖는 Fc를 포함한다.
N297G 돌연변이를 갖는 인간 IgG1 Fc를 포함하는 Fc는 추가 삽입, 결실, 및 치환을 또한 포함할 수 있다. 특정 구현예들에 있어서, 상기 인간 IgG1 Fc는 N297G 치환을 포함하며, 서열번호:3에 제시된 아미노산 서열에 대하여 적어도 90% 동일한, 적어도 91% 동일한, 적어도 92% 동일한, 적어도 93% 동일한, 적어도 94% 동일한, 적어도 95% 동일한, 적어도 96% 동일한, 적어도 97% 동일한, 적어도 98% 동일한, 또는 적어도 99% 동일하다. 특별히 바람직한 구현예에서, C-말단 리신 잔기는 치환되거나 또는 결실된다. N297G 치환 및, C-말단 리신의 결실을 포함하는 인간 IgG1의 아미노산 서열은 서열번호:4에서 제시된다.
글리코실화된 IgG1 Fc-함유 분자는 글리코실화된 IgG1 Fc-함유 분자보다 덜 무변성 것으로 보인다. 탈글리코실화된 분자의 안정성을 증가시키기 위하여 상기 Fc 영역은 추가 가공될 수 있다. 일부 구현예들에서, 하나 이상의 아미노산은 이량체 상태에서 이황화결합을 만들기 위하여 시스테인으로 치환된다. 서열번호:3에 제시된 아미노산 서열의 V259, A287, R292, V302, L306, V323, 또는 I332은 시스테인으로 치환된다. 바람직한 구현예들에서, 잔기의 특정 쌍은 이들이 서로간의 우선적인 이황화결합을 형성하고, 따라서 이황화결합의 스크램블링이 제한 또는 방지되도록 하는 치환이다. 바람직한 쌍은 A287C와 L306C, V259C와 L306C, R292C와 V302C, 그리고 V323C와 I332C를 포함하나, 이에 국한되지 않는다.
Fc-함유 분자를 본 명세서에서 제공하며, 여기서 하나 이상의 잔기 V259, A287, R292, V302, L306, V323, 또는 I332는 시스테인으로 치환되며, 이들의 예로는 A287C와 L306C, V259C와 L306C, R292C와 V302C, 또는 V323C와 I332C 치환을 포함하는 것들이다.
IgG1 Fc에 가해질 수 있는 부가적인 돌연변이는 Fc 함유 폴리펩티드들 사이에서 이종이량체 형성을 촉진시키는 것들을 포함한다. 일부 구현예들에서, 세포에서 공동-발현될 때, 2 개의 상이한 Fc-함유 폴리펩티드 쇄의 이종이량체 형성을 촉진시키는 "손잡이(knobs)"및 "구멍(holes)"이 형성되도록 Fc 영역이 가공된다. U.S. 7,695,963. 다른 구현예들에 있어서, 세포에서 공동-발현될 때, 두 개의 상이한 Fc-함유 폴리펩티드의 동종이량체 형성을 방해하면서, 이종이량체 형성을 촉진시키도록 정전기 스티어링(electrostatic steering)을 사용하여 Fc 영역이 변경된다. WO 09/089,004, 이의 전문은 참고자료에 편입된다. 바람직한 이종이량체 Fc는 상기 Fc의 한 쇄는 D399K 및 E356K 치환을 포함하고, 상기 Fc의 다른 쇄는 K409D 및 K392D 치환을 포함하는 것들이다. 다른 구현예들에 있어서, 상기 Fc의 한 쇄는 D399K, E356K, 및 E357K 치환을 포함하며, 상기 Fc의 다른 쇄는 K409D, K392D, 및 K370D 치환을 포함한다.
특정 구현예들에 있어서 IL-2 뮤테인 Fc-융합 단백질이 단량체, 즉 오직 하나의 IL-2 뮤테인 분자만을 함유하는 것이 유리할 수 있다. 유사하게, 하나 이상의 추가 표적에 특이적으로 결합할 수 있는 2중 특이적, 3중 특이적 또는 4중 특이적 항체가 요구될 수 있다. 이러한 구현예들에 있어서, 상기 융합 단백질 또는 항체의 Fc-영역은 이종이량체 형성을 촉진시키는 하나 이상의 돌연변이를 함유할 수 있다. 상기 융합 단백질 또는 항체는 상기 IL-2 뮤테인 Fc-융합 폴리펩티드에서 레시프로컬(reciprocal) 돌연변이를 갖지만, IL-2 뮤테인 또는 항-IL-2 중쇄 가변 도메인 없는 Fc-영역과 함께 공동-발현된다. 2개의 Fc-함유 폴리펩티드의 이종이량체가 형성될 때, 생성된 단백질은 오직 단일 IL-2 뮤테인 또는 항-IL-2 결합 도메인을 포함한다.
단량체 IL-2 뮤테인 Fc-융합 단백질을 만드는 또 다른 방법은 단량체 Fc, 즉, 이량체화되지 않는 Fc 영역에 상기 IL-2 뮤테인을 융합시키는 것이다. 무변성 단량체 Fc는 이량체화를 억제하고, 단량체 형태에서 분자를 안정화시키는 돌연변이를 포함한다. 바람직한 단량체 Fc는 WO 2011/063348에서 공개되며, 이의 전문은 전체가 참고자료에 편입된다. 특정 구현예들에 있어서, IL-2 뮤테인 Fc 융합 단백질은 위치 392 및 409에서 음으로 하전된 아미노산을 포함하고, Y349, L351, L368, V397, L398, F405, 또는 Y407에서 트레오닌 치환을 갖는 Fc를 포함한다.
특정 구현예들에 있어서, 상기 IL-2 뮤테인 Fc-융합 단백질은 상기 Fc와 상기 IL-2 뮤테인 사이에 링커를 포함한다. 상이한 많은 링커 폴리펩티드들이 당분야에 공지되어 있으며, IL-2 뮤테인 Fc-융합 단백질에서 이용될 수 있다. 바람직한 구현예들에서, 상기 IL-2 뮤테인 Fc-융합 단백질은 상기 Fc와 상기 IL-2 뮤테인 사이에 GGGGS (서열번호:5), GGNGT (서열번호:6), 또는 YGNGT (서열번호:7)로 구성된 펩티드의 하나 이상의 복사체를 포함한다. 일부 구현예들에서, 상기 Fc 영역과 상기 IL-2 뮤테인 영역 사이의 폴리펩티드 영역은 GGGGS (서열번호:5), GGNGT (서열번호:6), 또는 YGNGT (서열번호:7)의 단일 복사체를 포함한다. 본 명세서에서 나타낸 바와 같이, 상기 링커 GGNGT (서열번호:6) 또는 YGNGT (서열번호:7)는 적절한 세포에서 발현될 때 글리코실화되고, 이러한 글리코실화는 용액 안에서 또는 생체내 투여될 때 상기 단백질을 안정화시키는데 도움을 줄 수 있다. 따라서, 특정 구현예들에 있어서 IL-2 뮤테인 융합 단백질은 상기 Fc 영역과 상기 IL-2 뮤테인 영역 사이에 글리코실화된 링커를 포함한다.
글리코실화된 링커는 폴리펩티드에 배치될 때 유용한 것으로 간주된다. 본 명세서에서 폴리펩티드의 아미노산 서열 안에 삽입된, 또는 이 폴리펩티드의 아미노산 서열 내 하나 이상의 아미노산을 대체하는 GGNGT (서열번호:6) 또는 YGNGT (서열번호:7)을 포함하는 폴리펩티드를 제공한다. 바람직한 구현예들에서, GGNGT (서열번호:6) 또는 YGNGT (서열번호:7)는 폴리펩티드 삼차 구조의 루프 안에 삽입된다. 다른 구현예들에 있어서, 루프의 하나 이상의 아미노산은 GGNGT (서열번호:6) 또는 YGNGT (서열번호:7)로 대체된다.
상기 Fc의 C-말단 부분 및/또는 상기 IL-2 뮤테인의 아미노 말단 부분은 상기 IL-2 뮤테인 Fc-융합 단백질이 포유동물 세포에서 발현될 때 글리코실화 프로파일을 변경시키는 하나 이상의 돌연변이를 함유할 수 있다. 특정 구현예들에 있어서, 상기 IL-2 뮤테인은 T3 치환, 가령, T3N 또는 T3A를 더 포함할 수 있다. 상기 IL-2 뮤테인은 S5 치환, 이를 테면 S5T를 더 포함할 수 있다.
IL-2 뮤테인 및 IL-2 뮤테인 Fc-융합 단백질 그리고 항-IL-2 항체의 공유적 변형이 본 발명의 범위안에 포함되며, 일반적으로 해독후 변형되지만, 반드시 그런 것은 아니다. 예를 들면, 특정 아미노산 잔기를 선택된 측쇄 또는 N-또는 C-말단 잔기와 반응할 수 있는 유기 유도화 물질과 반응시킴으로써, 이 분자 안에 몇 가지 유형의 공유적 변형이 도입된다.
시스테닐 잔기는 가장 일반적으로 클로로아세트산 또는 클로로아세트아미드와 같은 α-할로아세테이트 (및 상응하는 아민)와 반응하여 카르복시메틸 또는 카르복시아미도메틸 유도체를 생성한다. 시스테인 잔기는 또한 브로모트리플루오로아세톤, α-브로모-β-(5-이미도조일)프로피온산, 클로로아세틸 포스페이트, N-알킬 말레이미드, 3-니트로-2-피리딜 디술피드, 메틸 2-피리딜 디술피드, p-클로로머큐리벤조에이트, 2-클로로머큐리-4-니트로페놀, 또는 클로로-7-니이트로벤조-2-옥사-1,3-디아졸과의 반응에 의해 유도된다.
히스티딜 잔기는 디에틸피로카보네이트가 히스티딜 측쇄에 비교적 특이적이기 때문에 pH 5.5-7.0에서 이 물질과의 반응에 의해 유도체화된다. 파라-브로모페나실브로마이드 또한 유용한데; 바람직하게는 pH 6.0에서 0.1M의 나트륨 카코딜레이트에서 반응이 수행된다.
리실 및 아미노 말단 잔기는 숙신산 또는 다른 카르복실산 무수물과 반응한다. 이러한 제제로 유도화하는 것은 리신 잔기의 전하를 역전시키는 효과를 갖는다. 알파-아미노-함유 잔기를 유도화하는데 적합한 다른 시약은 메틸 피콜린이미데이트와 같은 이미도에스테르; 피리독살 포스페이트; 피리독살; 클로로보로하이드리드; 트리니트로벤젠술폰산; O-메틸이소우레아; 2,4-펜탄디온; 및 글리옥실레이트와의 트랜스 아미나제-촉매 반응을 포함한다.
아르기닌 잔기는 페닐글리옥살, 2,3-부탄디온, 1,2-사이클로 헥산디온 및 닌히드린 중 하나 또는 몇 가지 통상적인 시약과의 반응에 의해 변형된다. 아르기닌 잔기의 유도화는 구아니딘 작용기의 높은 pKa 때문에 알칼리 조건에서 반응이 수행되어야 한다. 또한, 이들 시약은 아르기닌 엡실론-아미노기 뿐만 아니라 리신 그룹과 반응할 수 있다.
티로실 잔기의 특정 변형이 만들어질 수 있는데, 특히 관심이 가는 것은 방향족 디아조늄 화합물 또는 테트라니트로메탄과의 반응에 의해 티로실 잔기로 스펙트럼 라벨을 도입하는 것이다. 가장 일반적으로, N-아세틸이미다졸 및 테트라니트로메탄은 각각 O-아세틸 티로실 종과 3-니트로 유도체를 만드는데 이용된다. 티로실 잔기는 방사능 면역 측정법에 사용하기 위하여 표지된 단백질을 준비하는데 125I 또는 131I를 사용하여 요오드화되며, 상기 기술된 클로라민 T 방법이 적합하다.
카르복실 측쇄 기 (아스파르틸 또는 글루타밀)은 카르보디이미드(R'―N=C=N--R')와의 반응에 의해 선택적으로 변형되며, 여기서 R 및 R'는 임의선택적으로 상이한 알킬기, 이를 테면 1-시클로헥실-3-(2-몰포리닐-4-에틸) 카르보디이미드 또는 1-에틸-3-(4-아조니아-4,4-디메틸펜틸) 카르보디이미드이다. 더욱이, 아스파르틸 및 글루타밀 잔기는 암모니움 이온과의 반응에 의해 아스파라기닐과 글루타미닐 잔기로 전환된다.
이기능성 작용제와의 유도화는 다양한 방법에 사용하기 위하여 물-불용성 지지 매트릭스 또는 표면에 항원 결합 단백질을 가교하는데 유용하다. 통상적으로 사용되는 가교 결합제는 예를 들어 1,1-비스(디아조아세틸)-2-페닐에탄, 글루타르알데히드, N-히드록시숙신이 미드 에스테르, 예를 들어 4-아지도살리실산을 갖는 에스테르, 3,3'-디티오비스(숙시니미딜프로피오네이트)를 포함하는 동종이기능성 이미도에스테르, 그리고 비스-N-말레이미도-1,8-옥탄과 같은 이기능성 말레이미드를 포함한다. 유도화 물질, 이를 테면 메틸-3-[(p-아지도페닐)디티오]프로피오이미데이트는 광-존재 하에 가교결합을 형성할 수 있는 광활성화 가능한 중간체를 생성한다. 대안으로, U.S. 특허 3,969,287; 3,691,016; 4,195,128; 4,247,642; 4,229,537; 및 4,330,440에서 기술된 반응성 물-불용성 매트릭스, 이를 테면 시아노겐 브로마이드-활성화된 탄수화물 및 반응성 기질이 단백질 부동화(immobilization)에 이용된다.
글루타미닐 및 아스파라기닐 잔기는 각각 상응하는 글루타밀과 아스파르틸 잔기로 흔히 탈아미드화된다. 대안으로, 이들 잔기는 약-산성 조건하에 탈아미드화된다. 어느 형태이건 이들 잔기의 형성은 본 발명의 범위에 속한다.
기타 변형에는 프롤린과 리신의 수화, 세릴 또는 트레오틸 잔기의 히드록실기의 인산화, 리신, 아르기닌 및 히스트딘의 α-아미노기의 메틸화 (T. E. Creighton, Proteins: Structure and Molecular Properties, W. H. Freeman & Co., San Francisco, 1983, pp. 79-86), N-말단 아민의 아세틸화, 그리고 임의의 C-말단 카르복실 기의 아미드화를 포함한다.
본 발명의 범위에 포함된 IL-2 뮤테인, IL-2 뮤테인 Fc-융합체, 또는 항-IL-2 항체의 또 다른 유형의 공유적 변형은 상기 단백질의 글리코실화 패턴을 변경시키는 것을 포함한다. 당분야에 공지된 바와 같이, 글리코실화 패턴은 이 단백질의 서열 (가령, 하기에서 논의된 바와 같이 특정 글리코실화 아미노산 잔기의 존부), 또는 상기 단백질이 생산되는 숙주 세포 또는 유기체에 따라 달라질 수 있다. 특정 발현 시스템은 하기에서 논의된다.
폴리펩티드의 글리코실화는 전형적으로 N-연결되거나 또는 O-연결된다. N-연결된(linked)이란 아스파라긴 잔기의 측쇄에 탄수화물 모이어티의 부착을 말한다. 아스파라긴-X-세린 및 아스파라긴-X-트레오닌 (여기에서 X는 프롤린을 제외한 임의의 아미노산임)의 트리-펩티드 서열은 아스파라긴 측쇄에 탄수화물 모이어티의 효소 부착을 위한 인지 서열이다. 따라서, 폴리펩티드에서 이들중 하나의 트리-펩티드 서열의 존재는 잠재적 글리코실화 부위를 만든다. O-연결된 글리코실화는 당 N-아세틸갈락토사민, 갈락토스, 또는 자일로스중 하나를 히드록시아미노산, 가장 흔하게는 세린 또는 트레오닌에 부착되는 것을 말하며, 5-히드록시프롤린 또는 5-히드록시리신이 또한 이용될 수 있다.
상기 IL-2 뮤테인, IL-2 뮤테인 Fc-융합체, 또는 항-IL-2 항체에 글리코실화 부위의 추가는 상기에서 설명된 트리-펩티드 서열 (N-연결된 글리코실화 부위를 위한)중 하나 이상을 포함하도록 아미노산 서열을 변경시키면 통상적으로 이루어질 수 있다. 이러한 변경은 하나 이상의 세린 또는 트레오닌 잔기를 출발 서열 (O-연결된 글리코실화 부위의 경우)에 추가 또는 치환시켜 만들 수도 있다. 편리하게 하자면, 상기 IL-2 뮤테인, IL-2 뮤테인 Fc-융합체, 또는 항-IL-2 항체 아미노산 서열은 DNA 수준에서 변화, 구체적으로 사전 선택된 염기에서 표적 폴리펩티드를 암호화하는 DNA를 돌연변이시킴으로써, 원하는 아미노산으로 해독되도록 코돈을 만들어 변경시키는 것이 바람직하다.
상기 IL-2 뮤테인, IL-2 뮤테인 Fc-융합체, 또는 항-IL-2 항체의 탄소화물 모이어티의 수를 증가시키는 다른 수단은 상기 단백질에 화학 또는 효소적으로 글리코시드를 결합시키는 것이다. 이 과정은 N-및 O-연결된 글리코실화에 대한 글리코실화 능력을 갖는 숙주 세포에서 이 단백질의 생산을 요구하지 않는다는 점에서 유리하다. 이용되는 결합 방식에 따라, 이 당(들)은 (a) 아르기닌 및 히스티딘, (b) 자유 카르복실기, (c) 자유 술포히드릴기, 이를 테면 시스테인의 기, (d) 자유 히드록실 기, 이를 테면 세린, 트레오닌, 또는 히드록시프롤린, (e) 방향족 잔기, 이를 테면 페닐알라닌, 티로신, 또는 트립토탄의 기, 또는 (f) 글루타민의 아미드 기에 부착될 수 있다. 이들 방법은 WO 87/05330 (Sep. 11, 1987), 및 Aplin and Wriston, 1981, CRC Crit . Rev. Biochem ., pp. 259-306에서 설명된다.
출발 IL-2 뮤테인, IL-2 뮤테인 Fc-융합체, 또는 항-IL-2 항체에 존재하는 탄수화물 모이어티는 화학적으로 또는 효소적으로 제거될 수 있다. 화학적 탈글리코실화는 단백질 트리플루오로메탄설폰산 또는 이에 등가의 화합물에 대한 단백질의 노출을 필요로 한다. 이 처리는 폴리펩티드를 손상시키지 않으면서, 연결당 (N-아세틸 글루코사민 또는 N-아세틸 갈락토사민)을 제외한 대부분 또는 모든 당을 절단하게 된다. 화학적 탈글리코실화는 Hakimuddin 등., 1987, Arch. Biochem . Biophys. 259:52 및 Edge 등, 1981, Anal. Biochem. 118:131에서 설명된다. 폴리펩티드상의 탄수화물 모이어티는 Thotakura 등, 1987, Meth . Enzymol. 138:350에서 설명된 다양한 엔도-및 엑소-글리코시다제의 사용에 의해 효소적으로 제거될 수 있다. 잠재적 글리코실화 부위에서 글리코실화는 Duskin 등, 1982, J. Biol . Chem. 257:3105에서 설명된 화합물 투니카마이신의 사용에 의해 저지될 수 있다. 투니카마이신(Tunicamycin)은 단백질-N-글리코시드 연쇄(linkages) 형성을 차단시킨다.
상기 IL-2 뮤테인, IL-2 뮤테인 Fc-융합체, 또는 항-IL-2 항체의 또 다른 유형의 공유적 변형은 U.S. 특허 번호 4,640,835; 4,496,689; 4,301,144; 4,670,417; 4,791,192 또는 4,179,337에서 제시한 방식으로 다양한 폴리올, 이를 테면 폴리에틸렌 글리콜, 폴리프로필렌 글리콜 또는 폴리옥시알킬렌을 포함하나, 이에 국한되지 않는 다양한 비-단백질성 폴리머에 상기 단백질을 연결시키는 것을 포함한다. 또한, 폴리머, 이를 테면 PEG의 추가를 용이하게 하기 위하여, 상기 IL-2 뮤테인, IL-2 뮤테인 Fc-융합체, 또는 항-IL-2 항체안 다양한 위치에서 아미노산 치환이 만들어질 수 있다. 따라서, 본 발명의 구현예는 페길화된(PEGylated) IL-2 뮤테인, IL-2 뮤테인 Fc-융합체, 또는 항-IL-2 항체를 포함한다. 이러한 페길화된 단백질은 비-페길화된 형태보다 증가된 반감기 및/또는 감소된 면역원성을 가질 수 있다.
IL-2
뮤테인
및 IL-2
뮤테인
Fc
-융합 단백질을 암호화하는 폴리뉴클레오티드
본 발명에는 IL-2 뮤테인, IL-2 뮤테인 Fc-융합체, 또는 항-IL-2 항체를 암호화하는 핵산을 포함한다. 본 발명의 측면은 본 명세서에서 설명된 아미노산 서열을 암호화하는 폴리뉴클레오티드 변이체들 (가령, 축중성(degeneracy)으로 인한)을 포함한다.
핵산의 단리 또는 데이터베이스 검색을 위한 질의(query) 서열로서의 프로브 또는 프라이머로서 사용하기 위한, 본원에 기술된 아미노산 서열에 상응하는 뉴클레오티드 서열은 이 아미노산 서열로부터 역-해독 (back-translation)에 의해 수득될 수 있다. 잘 알려진 중합효소 연쇄 반응 (PCR) 과정은 IL-2 뮤테인 및 IL-2 뮤테인 Fc-융합 단백질을 암호화하는 DNA 서열을 분리 및 증폭하는데 사용될 수 있다. DNA 단편들의 조합의 의도된 말단을 한정하는 올리고 뉴클레오타이드는 5' 및 3' 프라이머로 사용된다. 올리고뉴클레오티드는 발현 벡터 내로 증폭된 DNA 단편들의 조합의 삽입이 용이하도록 제한 엔도뉴클레아제의 인지 부위를 부가적으로 포함할 수 있다. PCR 기술은 Saiki 등, Science 239:487 (1988); Recombinant DNA Methodology, Wu 등, eds., Academic Press, Inc., San Diego (1989), pp. 189-196; 및 PCR Protocols: A Guide to Methods and Applications, Innis et. al., eds., Academic Press, Inc. (1990)에서 설명하고 있다.
본 발명의 핵산 분자는 단일 가닥 및 이중 가닥 형태의 DNA 및 RNA를 포함하고, 이뿐만 아니라 상응하는 상보적 서열을 포함한다. "단리된 핵산"은 자연 발생 원천으로부터 단리된 핵산의 경우, 핵산이 분리된 유기체의 게놈에 존재하는 인접한 유전자 서열로부터 분리된 핵산이다. 예를 들어, PCR 산물, cDNA 분자 또는 올리고뉴클레오티드와 같은 주형으로부터 화학적으로 합성된 핵산의 경우, 그러한 공정으로부터 생성된 핵산은 단리된 핵산으로 간주된다. 단리된 핵산 분자는 별도의 단편 형태, 또는 보다 큰 핵산 작제물의 성분으로서의 핵산 분자를 지칭한다. 하나의 바람직한 구현예에서, 핵산은 실질적으로 내인성 물질로부터 오염되지 않는다. 핵산 분자는 바람직하게는 표준 생화학적 방법(이를 테면 Sambrook 등, Molecular Cloning: A Laboratory Manual, 2nd ed., Cold Spring Harbor Laboratory, Cold Spring Harbor, NY (1989)에서 제시된 방법들)에 의해 그의 성분 뉴클레오티드 서열의 동정, 가공 및 회수를 가능하게 하는 양 또는 농도로, 실질적으로 순수한 형태로 1 회 이상 단리된 DNA 또는 RNA로부터 유도된 것이다. 이러한 서열은 바람직하게는 진핵 생물 유전자 내에 전형적으로 존재하는 내부 비-해독 서열, 또는 인트론에 의해 중단되지 않는 개방형 판독 프레임(open reading frame)의 형태로 제공 및/또는 구성된다. 해독되지 않은 DNA의 서열은 개방형 판독 프레임에서 5 '또는 3'에 존재할 수 있으며, 여기서 암호화 영역의 가공 또는 발현에 간섭을 받지 않는다.
본 발명에 따른 IL-2 뮤테인은 이 변이체를 암호화하는 DNA를 만들고, 그 다음 본 명세서에서 제시된 세포 배양에서 재조합 DNA를 발현시키기 위하여, 당분야에 공지된 카세트 또는 PCR 돌연변이유발 또는 다른 기술을 이용하여 상기 IL-2 뮤테인 또는 IL-2 뮤테인 Fc-융합 단백질을 암호화하는 DNA에서 뉴클레오티드의 부위 특이적 돌연변이유발에 의해 보통 준비된다. 그러나, IL-2 뮤테인 및 IL-2 뮤테인 Fc-융합체는 확립된 기술을 사용하여 시험관내 합성에 의해 제조될 수 있다. 이 변이체들은 자연적으로 발생하는 유사체와 동일한 질적 생물학적 활성, 예를 들어, Treg 증식을 나타내지만, 변형된 특성을 갖는 변이체도 또한 선택할 수 있고, 이러한 것들은 아래에서 더 상세하게 설명된다.
당업자가 인지할 수 있는 바와 같이, 유전자 코드의 축중성으로 인하여, 본 발명의 각 IL-2 뮤테인, IL-2 뮤테인 Fc-융합체, 및 항-IL-2 항체는 예외적으로 많은 수의 핵산에 의해 암호화되며, 이들 각각은 본 발명의 범위에 속하며, 표준 기술에 의해 만들 수 있다. 따라서, 특정한 아미노산 서열을 동정한 당업자라면, 암호화된 단백질의 아미노산 서열을 변화시키지 않는 방식으로 하나 이상의 코돈의 서열을 간단히 변형시킴으로써 임의의 수의 상이한 핵산을 제조할 수 있다.
본 발명은 상기 적어도 하나의 폴리뉴클레오티드를 포함하는 플라스미드, 발현 벡터, 전사 또는 발현 카세트의 형태의 발현 시스템 및 작제물을 또한 제공한다. 또한, 본 발명은 이러한 발현 시스템 또는 작제물을 포함하는 숙주 세포를 제공한다.
전형적으로, 임의의 숙주 세포에서 사용되는 발현 벡터는 플라스미드 유지 및 외래 뉴클레오티드 서열의 클로닝 및 발현을 위한 서열을 함유할 것이다. 특정 구현예들에 있어서, 집합적으로 "인접(flanking) 서열"로 지칭되는 이러한 서열은 다음의 뉴클레오티드 서열중 하나 이상을 포함한다: 프로모터, 하나 이상의 인핸서(enhancer) 서열, 복제 원점, 전사 종료 서열, 완전한 인트론 서열 함유하는 공여자 및 수용자 접합 부위, 폴리펩티드 분비를 위한 리더 서열을 암호화하는 서열, 리보좀 결합 부위, 폴리아데닐화 서열, 발현되는 폴리펩티드를 암호화하는 핵산을 삽입하기 위한 폴리링커 영역, 그리고 선택가능한 표지 요소. 이들 각 서열은 하기에서 논의된다.
임의선택적으로, 상기 벡터는 "태그(tag)"-암호화 서열을 함유할 수 있는데, 가령, 상기 IL-2 뮤테인, IL-2 뮤테인 Fc-융합체, 또는 항-IL-2 항체-암호화 서열의 5' 또는 3' 단부에 위치한 올리고뉴클레오티드 분자; polyHis (이를 테면 hexaHis (서열번호:21))를 암호화하는 올리고뉴클레오티드 서열, 또는 상업적으로 이용가능한 항체가 존재하는 또 다른 "태그", 이를 테면 FLAG, HA (헤마글루티닌 인플루엔자 바이러스, 또는 myc를 포함할 수 있다. 이 태그는 전형적으로 폴리펩티드의 발현 시에 폴리펩티드에 융합되며, 숙주 세포로부터 친화력 정제 또는 검출을 위한 수단으로서의 역할을 할 수 있다. 친화력 정제는 예를 들어, 친화성 매트릭스로서 상기 태그에 대한 항체를 사용하는 컬럼 크로마토그래피에 의해 이루어질 수 있다. 임의선택적으로, 상기 태그는 절단을 위한 특정 펩티다아제를 사용하는 것과 같은 다양한 수단에 의해 후속적으로 제거될 수 있다.
인접 서열은 상동성(가령, 숙주 세포와 동일한 종 및/또는 균주), 이종(가령, 숙주 세포종 또는 균주가 아닌 종), 하이브리드(가령, 하나 이상의 원천에서 온 인접 서열의 조합)성이며, 합성 또는 고유한 것일 수 있다. 이와 같이, 인접 서열은 이 인접 서열이 숙주 세포 기전에서 기능을 하며, 숙주 세포 기전에 의해 활성화될 수 있다는 전제 조건하에, 임의의 원핵 또는 진핵 생물, 임의의 척추 또는 무척추 유기체 또는 임의의 식물이 원천이 될 수 있다.
본 발명의 벡터에서 유용한 인접 서열은 당업계에 공지된 몇 가지 방법 중 임의의 방법에 의해 수득될 수 있다. 전형적으로, 본원에서 유용한 인접 서열은 매핑 및/또는 제한 엔도뉴클레아제 분해에 의해 이전에 확인될 것이며, 따라서 적절한 제한 엔도뉴클레아제를 사용하여 적절한 조직 공급원으로부터 분리될 수 있다. 일부 경우, 인접 서열의 전체 뉴클레오티드 서열이 공지될 수 있다. 여기에서, 인접 서열은 핵산 합성 또는 클로닝을 위하여 본원에 기술된 방법을 사용하여 합성될 수 있다.
인접 서열의 전부 또는 일부만이 알려졌을 때, 인접 서열은 중합 효소 연쇄 반응(PCR)을 이용하여 얻거나, 및/또는 동일하거나 유사한 종으로부터 올리고뉴클레오티드 및/또는 인접 서열 단편과 같은 적합한 프로브를 이용하여 게놈 라이브러리를 스크리닝함으로써 수득될 수 있다. 인접 서열이 알려지지 않은 경우, 인접 서열을 함유하는 DNA의 단편은 예를 들어, 암호화 서열 또는 심지어 다른 유전자 또는 유전자들을 함유할 수 있는 더 큰 DNA 조각으로부터 단리될 수 있다. 분리는 적절한 DNA 단편을 만들기 위하여 제한 엔도뉴클레아제 분해하고, 이어서 아가로스 겔 정제, Qiagen® 컬럼 크로마토그래피 (Chatsworth, CA) 또는 당업자에게 공지된 다른 방법을 사용하여 단리함으로써, 달성될 수 있다. 이러한 목적을 달성하는데 적합한 효소의 선택은 당업자에게 자명할 것이다.
복제의 원점은 일반적으로 상업적으로 구입한 원핵 생물 발현 벡터의 일부이며, 이 원점은 숙주 세포에서 벡터의 증폭을 돕는다. 선택 벡터가 복제 원점 부위를 함유하지 않으면, 공지된 서열을 기초로 하여 화학적으로 합성한 후, 벡터에 연결시킬 수 있다. 예를 들면, 플라스미드 pBR322 (New England Biolabs, Beverly, MA)의 복제 원점은 대부분의 그램-음성 박테리아에 적합하며, 다양한 바이러스 원점 (가령, SV40, 폴리오마, 아데노바이러스, 수포성 구내염 바이러스(VSV), 또는 유두종바이러스, 이를 테면 HPV 또는 BPV)이 포유동물 세포에서 벡터 클로닝에 유용하다. 일반적으로, 복제 성분의 원점은 포유동물 발현 벡터에 필요하지 않다 (예를 들어, SV40 원점은 바이러스 조기 프로모터를 또한 포함하기 때문에 종종 사용된다).
전사 종료 서열은 전사를 종료시키는 역할을 하며, 폴리펩티드 암호화 영역의 단부 3'에 전형적으로 위치한다. 보통, 원핵 세포의 전사 종료 서열은 G-C가 많은 단편에 이어서 폴리-T 서열이다. 이 서열은 라이브러리로부터 용이하게 복제되거나 심지어 벡터의 일부로서 상업적으로 구입할 수 있지만, 여기에 기재된 것과 같은 핵산 합성 방법을 사용하여 용이하게 합성할 수도 있다.
선택 마커 유전자는 선택 배양 배지에서 성장한 숙주 세포의 생존 및 성장에 필요한 단백질을 암호화한다. 전형적인 선택 마커 유전자는 (a) 원핵 숙주 세포에 대해 항생제 또는 다른 독소, 예컨대 암피실린, 테트라사이클린 또는 카나마이신에 대한 내성을 부여하는 단백질; (b) 세포의 영양 요구성 결핍을 보완하는 단백질; 또는 (c) 복잡 또는 한정 배지에서 이용할 수 없는 중요한 영양소를 공급하는 단백질을 암호화한다. 특이적 선택가능한 마커는 카나마이신 내성 유전자, 암피실린 내성 유전자 및 테트라사이클린 내성 유전자이다. 유리하게는, 네오마이신 내성 유전자는 원핵 및 진핵 숙주 세포 모두에서 선별에 또한 사용될 수 있다.
다른 선택성 유전자는 발현될 유전자를 증폭시키는데 사용될 수 있다. 증폭이란 성장 또는 세포 생존에 중요한 단백질의 생산에 필요한 유전자가 연속 생성된 재조합 세포의 염색체 내에서 직렬로 반복되는 과정이다. 포유동물 세포에 적합한 선택가능한 마커의 예로는 디하이드로폴레이트 환원효소(DHFR) 및 무촉진성(promoterless) 티르니딘(thyrnidine) 키나아제 유전자를 포함한다. 포유동물 세포 형질전환체는 선별 압력하에 놓여지고, 벡터에 존재하는 선택 가능한 유전자에 의해 생존할 수 있는 형질전환체만이 적응하게 된다. 배지 중의 선택 물질의 농도가 연속적으로 증가하는 조건하에 형질전환된 세포를 배양함으로써, 선별 압력이 부과되고, 이에 따라 선택가능한 유전자와 결과적으로 원하는 폴리펩티드, 예컨대 IL-2 뮤테인, IL-2 뮤테인 Fc-융합, 또는 항 IL-2 항체의 중쇄 및/또는 경쇄를 암호화하는 유전자 모두가 증폭하게 된다. 결과적으로, 증폭된 DNA로부터 증가된 양의 폴리펩티드가 합성된다.
mRNA의 해독 개시에는 보통 리보솜 결합 부위가 필요하며, Shine-Dalgarno 서열 (원핵 생물) 또는 Kozak 서열 (진핵 생물)로 특징화되어 있다. 상기 요소는 전형적으로 프로모터의 3'에 그리고 발현되는 폴리펩티드의 암호화 서열의 5'에 위치한다. 특정 구현예들에 있어서, 하나 이상의 암호화 영역은 내부 리보좀 결합 부위 (IRES)에 작동가능하게 연결될 수 있고, 이로 인하여 단일 RNA 전사체로부터 2개의 개방형 판독 프레임의 해독이 가능하다.
일부 경우에 있어서, 이를 테면 진핵 숙주 세포 발현계에서 글리코실화가 바람직한 경우, 글리코실화 또는 수율을 개선시키기 위하여 다양한 프레(pre)-서열 또는 프로(pro)-서열을 가공할 수 있다. 예를 들면, 특정 신호 펩티드의 펩티다제 절단 부위를 변경시키거나, 또는 프로서열을 추가할 수 있는데, 이 또한 글리코실화에 영향을 줄 수 있다. 최종 단백질 산물은 -1 위치 (성숙 단백질의 첫번째 아미노산에 대하여)에서 발현에 부수적인 하나 이상의 추가 아미노산을 가질 수 있으며, 이는 완전히 제거되지 않을 수 있다. 예를 들면, 최종 단백질 산물은 아미노-말단에 부착된 펩티다제 절단 부위에서 발견되는 하나 또는 두 개의 아미노산 잔기를 가질 수 있다. 대안으로, 성숙 폴리펩티드 안에 있는 일부 효소 절단 부위가 있고, 효소가 이 부위를 절단한다면, 이러한 효소 절단 부위의 사용은 원하는 폴리펩티드의 일부에서 약간 절단된 형태를 만들 수 있다.
본 발명의 발현 벡터 및 클로닝 벡터는 상기 숙주 유기체가 인지하고, IL-2 뮤테인, IL-2 뮤테인 Fc-융합체, 또는 항-IL-2 항체의 중쇄 및/또는 경쇄를 암호화하는 분자에 작동가능하게 연결된 프로모터를 전형적으로 포함할 것이다. 프로모터는 구조 유전자의 전사를 제어하는 구조 유전자의 시작 코돈 (일반적으로 약 100 내지 1000bp 안에)의 상류 (즉, 5')에 위치하는 전사되지 않은 서열이다. 프로모터는 통상적으로 유도성(inducible) 프로모터 및 구성(constitutive) 프로모터의 2 가지 분류중 하나로 분류된다. 유도성 프로모터는 영양분의 존재 또는 부재, 또는 온도 변화와 같은 배양 조건의 변화에 반응하여 DNA로부터 증가된 수준의 전사를 개시한다. 한편, 구성 프로모터는 유전자 발현의 제어 없이 또는 거의 없이, 이에 작동가능하게 연결된 유전자를 균일하게 전사한다. 다양한 잠재적인 숙주 세포에 의해 인지되는 다수의 프로모터가 잘 알려져 있다.
효모 숙주와 함께 사용하기에 적합한 프로모터는 당업계에 잘 공지되어 있다. 효모 인핸서는 효모 프로모터와 함께 유리하게 사용된다. 포유동물 숙주 세포와 함께 사용하기에 적합한 프로모터는 잘 알려져 있으며, 그리고 폴리오마 바이러스, 계두(fowlpox) 바이러스, 아데노바이러스 (가령, 아데노바이러스 2), 소 유두종 바이러스, 조류 육종 바이러스, 사이토메갈로바이러스, 레트로바이러스, B 형 간염 바이러스 및 가장 바람직하게는 시미안(Simian) 바이러스 40 (SV40)를 포함하나, 이에 국한되지 않는다. 다른 적합한 포유동물 프로모터는 이종 포유동물 프로모터, 예를 들어, 열-충격 프로모터 및 액틴 프로모터를 포함한다.
관심대상이 될 수 있는 추가 프로모터에는 다음을 포함하나, 이에 국한되지 않는다: SV40 초기 프로모터 (Benoist and Chambon, 1981, Nature 290:304-310); CMV 프로모터 (Thornsen 등, 1984, Proc . Natl . Acad . U.S.A . 81:659-663); 라우스 육종 바이러스의 3' 긴 말단 반복부 안에 포함된 프로모터 (Yamamoto 등, 1980, Cell 22:787-797); 헤르페스 티미딘 키나아제 프로모터 (Wagner 등, 1981, Proc. Natl. Acad . Sci . U.S.A . 78:1444-1445); 메탈로티오닌 유전자의 프로모터 및 조절 서열 Prinster 등, 1982, Nature 296:39-42); 그리고 원핵 프로모터, 이를 테면 베타-락타마제 프로모터 (Villa-Kamaroff 등, 1978, Proc . Natl . Acad . Sci . U.S.A . 75:3727-3731); 또는 tac 프로모터 (DeBoer 등, 1983, Proc . Natl . Acad . Sci . U.S.A . 80:21-25). 유전자 삽입 동물에서 이용되었으며, 조직 특이성을 나타내는 다음의 동물 전사 조절 영역이 또한 관심 대상이다: 췌장 선포 세포에서 활성이 있는 엘라스타제 I 유전자 조절 영역 (Swift 등, 1984, Cell 38:639-646; Ornitz 등, 1986, Cold Spring Harbor Symp . Quant . Biol . 50:399-409; MacDonald, 1987, Hepatology 7:425-515); 췌장 베타 세포에서 활성이 있는 인슐린 유전자 조절 영역 (Hanahan, 1985, Nature 315:115-122); 림프 세포에서 활성이 있는 면역글로불린 유전자 조절 영역 (Grosschedl 등, 1984, Cell 38:647-658; Adames 등, 1985, Nature 318:533-538; Alexander 등, 1987, Mol . Cell. Biol . 7:1436-1444); 고환, 유방, 림프 및 비만 세포에서 활성이 있는 마우스 유방 종양 바이러스 조절 영역 (Leder 등, 1986, 세포 45:485-495); 간에서 활성이 있는 알부민 유전자 조절 영역 (Pinkert 등, 1987, Genes and Devel . 1 :268-276); 간에서 활성이 있는 알파-페토-단백질 유전자 조절 영역(Krumlauf 등, 1985, Mol . Cell . Biol . 5:1639-1648; Hammer 등, 1987, Science 253:53-58); 간에서 활성이 있는 알파 1-항트립신 유전자 조절 영역(Kelsey 등, 1987, Genes and Devel . 1:161-171); 골수 세포에서 활성이 있는 베타-글로빈 유전자 조절 영역(Mogram 등, 1985, Nature 315:338-340; Kollias 등, 1986, Cell 46:89-94); 뇌에서 희돌기교 세포에서 활성이 있는 미엘린 염기성 단백질 유전자 조절 영역(Readhead 등, 1987, Cell 48:703-712); 골근에서 활성이 있는 미오신 경쇄-2 유전자 조절 영역(Sani, 1985, Nature 314:283-286); 그리고 해마에서 활성이 있는 성선자극 방출 호르몬 유전자 조절 영역(Mason 등, 1986, Science 234:1372-1378).
고등 진핵 생물에 의한 전사를 증가시키기 위해 인핸서 서열을 벡터에 삽입할 수 있다. 인핸서는 전사를 증가시키는 프로모터에 작용하는 약 10-300 bp 길이의 DNA의 시스(cis)-작용 요소이다. 인핸서는 상대적으로 배향 및 위치 독립적이며, 전사 단위의 5 '및 3' 위치에서 발견되었다. 포유동물 유전자로부터 이용가능한 몇 가지 인핸서 서열 (예를 들어, 글로빈, 엘라스타제, 알부민, 알파-페토-단백질 및 인슐린)이 공지되어 있다. 그러나, 전형적으로, 바이러스의 인핸서가 이용된다. 당분야에 공지된 SV40 인핸서, 사이토메갈로바이러스 초기 프로모터 인핸서, 폴리오마 인핸서, 및 아데노바이러스 인핸서는 진핵 프로모터의 활성화를 위한 예시적인 강화 요소이다. 인핸서는 암호화 서열에 대해 5' 또는 3' 벡터 중 어느 하나에 위치할 수 있지만, 전형적으로 프로모터로부터 5' 부위에 위치한다. IL-2 뮤테인, IL-2 뮤테인 Fc-융합체, 또는 중쇄 및/또는 경쇄의 세포외 분비를 촉진하기 위하여, 적절한 천연 또는 이종 신호 서열 (리더 서열 또는 신호 펩티드)을 암호화하는 서열이 발현 벡터에 혼입될 수 있다. 신호 펩티드 또는 리더의 선택은 단백질이 생산되는 숙주 세포의 유형에 의존하고, 이종 신호 서열은 천연 신호 서열을 대체할 수 있다. 포유동물 숙주 세포에서 기능을 하는 신호 펩티드의 예는 다음을 포함한다: US 특허 번호 4,965,195에서 설명된 인터류킨-7 (IL-7)에 대한 신호 서열; Cosman 등, 1984, Nature 312:768에서 설명된 인터류킨-2 수용체에 대한 신호 서열; EP 특허 번호 0367 566에서 설명된 인터류킨-4 수용체 신호서열; U.S. 특허 번호 4,968,607에서 설명된 유형 I 인터류킨-1 수용체 신호 펩티드; EP 특허번호 0 460 846에서 설명된 유형 II 인터류킨-1 수용체 신호 펩티드. 한 구현예에서, 본 발명의 IL-2 뮤테인 Fc-융합체는 도 24에서 설명된 바와 같은 리더 서열을 포함한다.
상기 벡터는 이 벡터가 숙주 세포 게놈에 통합될 때 발현을 촉진시키는 하나 이상의 요소를 포함할 수 있다. 실시예는 EASE 요소 (Aldrich 등, 2003 Biotechnol Prog . 19:1433-38) 및 매트릭스 부착 영역 (MAR)을 포함한다. MARs는 염색질의 구조적 구성을 매개하고, 통합된 벡터를 "위치(position)"효과로부터 격리시킬 수 있다. 따라서, 벡터가 무변성 형질전환체를 만드는데 사용될 때, MAR은 특히 유용하다. 천연 및 합성 MAR-함유 핵산은 당분야에 공지되어 있는데, 가령, U.S. 특허 번호 6,239,328; 7,326,567; 6,177,612; 6,388,066; 6,245,974; 7,259,010; 6,037,525; 7,422,874; 7,129,062 참고.
본 발명의 발현 벡터는 시판중인 벡터와 같은 출발 벡터로부터 작제될 수 있다. 이러한 벡터는 원하는 모든 인접 서열을 함유하거나, 또는 함유하지 않을 수 있다. 본원에 기재된 하나 이상의 인접 서열이 벡터 내에 이미 존재하지 않는 경우, 이들은 개별적으로 수득되고, 벡터 내로 연결될 수 있다. 인접 서열의 각각을 수득하기 위해 사용되는 방법은 당업자에게 잘 알려져 있다.
벡터가 작제된 후, IL-2 뮤테인, IL-2 뮤테인 Fc-융합체, 또는 항-IL-2 항체의 중쇄 및/또는 경쇄를 암호화하는 핵산 분자는 벡터의 적합한 위치로 삽입되고, 완성된 벡터는 증폭 및/또는 폴리펩티드 발현을 위해 적합한 숙주 세포에 삽입될 수 있다. 선택된 숙주 세포 안으로 발현 벡터의 형질변환은 형질감염, 감염, 칼슘 포스페이트 공-침전, 전기천공법, 마이크로인젝션, 리포펙션, DEAE-덱스트란 매개된 형질감염 또는 다른 공지된 기술을 포함하는 잘 알려진 방법에 의해 수행될 수 있다. 선택된 방법은 부분적으로는 사용될 숙주 세포 유형에 대한 함수일 것이다. 이들 방법 및 다른 적합한 방법은 당업자에게 잘 알려져 있으며, 예를 들어, Sambrook 등, 2001, 상기에 기재되어 있다.
숙주 세포가 적절한 조건하에 배양될 때, IL-2 뮤테인, IL-2 뮤테인 Fc-융합체, 또는 항-IL-2 항체의 중쇄 및/또는 경쇄를 합성하고, 이는 추후 배양 배지로부터(숙주 세포가 이를 배지로 분비하는 경우) 수집하거나, 또는 그것을 생산하는 숙주 세포로부터 직접 (분비되지 않은 경우) 수집할 수 있다. 적절한 숙주 세포의 선택은 원하는 발현 수준, 활성 (예를 들어, 글리코실화 또는 인산화)에 바람직하거나 필요한 폴리펩티드 변형 및 생물학적 활성 분자로 용이한 폴딩(folding)과 같은 다양한 인자에 좌우될 것이다. 숙주 세포는 진핵 또는 원핵 세포일 수 있다.
발현을 위한 숙주로서 이용가능한 포유 동물 세포주는 당업계에 공지되어 있고, American Type Culture Collection(ATCC)으로부터 입수할 수 있는 불멸화된 세포주 및 당업계에 공지된 발현 시스템에서 사용되는 임의의 세포주들이 본 발명의 재조합 폴리펩티드를 제조하는데 사용될 수 있다. 일반적으로, 숙주 세포는 원하는 IL-2 뮤테인, IL-2 뮤테인 Fc-융합체 또는 항-IL-2 항체를 암호화하는 DNA를 포함하는 재조합 발현 벡터에 의해 형질변환된다. 사용될 수 있는 숙주 세포는 원핵 생물, 효모 또는 고등 진핵 세포이다. 원핵 생물은 그람 음성균 또는 그람 양성균, 예를 들면 이.콜라이(E. coli) 또는 간균(bacilli)을 포함한다. 고등 진핵 세포는 곤충 세포 및 포유 동물 기원의 확립된 세포주를 포함한다. 적합한 포유동물 숙주 세포주의 예로는 원숭이 신장 세포의 COS-7 계통(ATCC CRL 1651) (Gluzman 등, 1981, Cell 23:175), L 세포, 293 세포, C127 세포, 3T3 세포 (ATCC CCL 163), 중국 햄스터 난소 (CHO) 세포, 또는 이들의 유도체, 가령, 무혈청-배지에서 성장된 이를 테면 Veggie CHO 및 관련된 세포주 (Rasmussen 등, 1998, Cytotechnology 28: 31), HeLa 세포, BHK (ATCC CRL 10) 세포주, 그리고 McMahan 등, 1991, EMBO J. 10: 2821에서 설명된 아프리카 녹색 원숭이 신장 세포주 CVI (ATCC CCL 70)으로부터 유도된 CVI/EBNA 세포주, 인간 배아 신장 세포, 이를 테면 293, 293 EBNA 또는 MSR 293, 인간 상피 A431 세포, 인간 Colo205 세포, 다른 형질변환된 영장류 세포주, 정상적인 이배체 세포, 일차 조직, 일차 이식물, HL-60, U937, HaK 또는 Jurkat 세포의 시험관 배양으로부터 유도된 세포 균주를 포함한다. 임의선택적으로, 포유동물 세포주, 이를 테면 HepG2/3B, KB, NIH 3T3 또는 S49는 다양한 신호전달 또는 리포터 분석에서 폴리펩티드를 이용할 때, 이 폴리펩티드의 발현을 위하여 이용될 수 있다.
대안으로, 효모와 같은 하등 진핵 생물, 또는 박테리아와 같은 원핵 생물에서 폴리펩티드를 생산하는 것이 가능하다. 적절한 효모는 사카로미세스 세레비시에(Saccharomyces cerevisiae), 쉬코사카로미세스 폼베(Schizosaccharomyces pombe), 클루베르미세스 균주(Kluyveromyces strains), 칸디다(Candida), 또는 이종 폴리펩티드를 발현시킬 수 있는 임의의 효모 균주를 포함한다. 적합한 박테리아 균주는 이.콜라이, 바실러스 서브틸리스(Bacillus subtilis), 살모넬라 티피뮤리움(Salmonella typhimurium) 또는 이종 폴리펩티드를 발현시킬 수 있는 임의의 박테리아 균주를 포함한다. 폴리펩티드가 효모 또는 박테리아에서 제조되는 경우, 기능을 하는 폴리펩티드를 수득하기 위해, 예를 들어 적절한 부위의 인산화 또는 글리코실화에 의해 그 내부에서 생성된 폴리펩티드를 변형시키는 것이 바람직할 수 있다. 이러한 공유 결합은 공지된 화학적 또는 효소적 방법을 사용하여 수행될 수 있다.
폴리펩티드는 또한 본 발명의 단리된 핵산을 하나 이상의 곤충 발현 벡터에서 적절한 제어 서열에 작동 가능하게 연결시키고, 곤충 발현 시스템을 사용하여 제조할 수 있다. 베큘로바이러스/곤충 세포 발현 시스템을 위한 재료 및 방법은 키트 형태로 시판되는 것을 이용할 수 있는데, 가령, Invitrogen, San Diego, Calif., U.S.A. (MaxBac® 키트), 그리고 이러한 방법은 Summers and Smith, Texas Agricultural Experiment Station Bulletin No. 1555 (1987), 및 Luckow and Summers, Bio/Technology 6:47 (1988)에서 설명된 바와 같이 당분야에 잘 공지되어 있다. 무-세포(cell-free) 해독 시스템은 또한 본원에 개시된 핵산 작제물로부터 유도된 RNA를 사용하여 폴리펩티드를 생산하는데 사용될 수 있다. 세균, 진균, 효모 및 포유동물 세포 숙주와 함께 사용하는데 적절한 클로닝 및 발현 벡터가 Pouwels 등, (Cloning Vectors: A Laboratory Manual, Elsevier, New York, 1985)에 기재되어 있다. 적어도 하나의 발현 조절 서열에 바람직하게는 작동가능하게 연결된 본 발명의 단리된 핵산을 포함하는 숙주 세포는 "재조합 숙주 세포"이다.
특정 측면에 있어서, 본 발명은 T 조절 세포를 우선적으로 자극하고, D20E, D20G, D20W, D84A, D84S, H16D, H16G, H16K, H16R, H16T, H16V, I92K, I92R, L12K, L19D, L19N, L19T, N88D, N88R, N88S, V91D, V91G, V91K, 및/또는 V91S 치환을 포함하며, 그리고 서열번호:1에 제시된 아미노산 서열에 대하여 적어도 90%, 적어도 91%, 적어도 92%, 적어도 93%, 적어도 94%, 적어도 95%, 적어도 96%, 적어도 97%, 적어도 98%, 적어도 99%, 또는 100% 동일한 아미노산 서열을 포함하는 인간 IL-2 뮤테인을 암호화하는 단리된 핵산을 포함한다.
또한, 본원에 기재된 임의의 예시적인 IL-2 뮤테인 Fc-융합 단백질을 암호화하는 단리된 핵산이 또한 포함된다. 바람직한 구현예들에서, 상기 항체의 Fc 부분과 상기 인간 IL-2 뮤테인은 상기 Fc 영역과 상기 IL-2 뮤테인 사이에 암호화된 링커를 임의선택적으로 가진, 단일 개방형 판독 프레임 안에 암호화된다.
또 다른 측면에서, 프로모터에 작동가능하게 연결된 IL-2 뮤테인-또는 IL-2 뮤테인 Fc-융합 단백질-암호화 핵산을 포함하는 발현 벡터를 본 명세서에서 제공한다.
또 다른 측면에서, IL-2 뮤테인, IL-2 뮤테인 Fc-융합 단백질, 또는 항-IL-2 항체를 암호화하는 단리된 핵산을 포함하는 숙주 세포를 본 명세서에서 제공한다. 상기 숙주 세포은 원핵 세포, 이를 테면 이.콜라이(E. coli )이거나 또는 진핵 세포, 이를 테면 포유동물 세포일 수 있다. 특정 구현예들에 있어서 상기 숙주 세포는 중국 햄스터 난소(CHO) 세포주이다.
또 다른 측면에서, 인간 IL-2 뮤테인을 제조하는 방법들을 본 명세서에서 제공한다. 이 방법은 프로모터에 작동가능하게 연결된 인간 IL-2 뮤테인이 발현되는 조건하에 숙주 세포를 배양하는 것을 포함한다. 후속적으로, 상기 인간 IL-2 뮤테인은 상기 배양물로부터 수거된다. 상기 IL-2 뮤테인은 배양 배지 및/또는 숙주 세포 용해물로부터 수거될 수 있다.
또 다른 측면에서, 인간 IL-2 뮤테인 Fc-융합 단백질을 제조하는 방법을 본 명세서에서 제공한다. 이 방법은 프로모터에 작동가능하게 연결된 인간 IL-2 뮤테인 Fc-융합 단백질이 발현되는 조건하에 숙주 세포를 배양하는 것을 포함한다. 후속적으로, 상기 인간 IL-2 뮤테인 Fc-융합 단백질은 상기 배양물로부터 수거된다. 상기 인간 IL-2 뮤테인 Fc-융합 단백질은 배양 배지 및/또는 숙주 세포 용해물로부터 수거될 수 있다
또 다른 측면에서, 항-IL-2 항체를 제조하는 방법들을 본 명세서에서 제공한다. 이 방법은 프로모터에 작동가능하게 연결된 항-IL-2 항체의 중쇄 및 경쇄가 발현되는 조건하에 숙주 세포를 배양하는 것을 포함한다. 후속적으로, 상기 항-IL-2 항체는 상기 배양물로부터 수거된다. 상기 항-IL-2 항체는 배양 배지 및/또는 숙주 세포 용해물로부터 수거될 수 있다.
약학 조성물
일부 구현예들에서, 본 발명은 약학적으로 효과적인 희석제, 운반체, 가용화제, 유화제, 보존제, 및/또는 어쥬번트와 함께, 치료적 유효량의 IL-2 뮤테인 또는 항-IL-2 항체를 포함하는 약학 조성물을 제공한다. 특정 구현예들에 있어서 상기 IL-2 뮤테인은 IL-2 뮤테인 Fc-융합 단백질 안에 속한다. 본 발명의 약학 조성물은 액체, 동결 및 동결 건조 조성물을 포함하나, 이에 한정되지 않는다.
바람직하게는, 제형 물질은 사용되는 투여량 및 농도에서 수령자에게 무독성이다. 특이적 구현예들에 있어서, 치료적 유효량의 IL-2 뮤테인 함유 치료요법적 분자, 이를 테면, IL-2 뮤테인 Fc-융합체를 포함하는 약학 조성물이 제공된다.
특정 구현예들에 있어서, 상기 약학 조성물은 예를 들어 pH, 삼투압, 점도, 투명도, 색, 등장성, 냄새, 무균성, 안정성, 용해 또는 방출 속도, 조성물의 흡착 또는 침투를 변경, 유지 또는 보존하기 위한 제형 물질을 함유할 수 있다. 이러한 구현예들에 있어서, 적합한 제형 물질은 다음을 포함하나, 이에 국한되지 않는다: 아미노산 (이를 테면 글리신, 글루타민, 아스파라긴, 아르기닌, 프롤린, 또는 리신); 항미생물제; 항산화제 (이를 테면 아스코르브산, 아황산나트륨 또는 아황산 수소나트륨); 완충액 (이를 테면, 붕산염, 중탄산염, Tris-HCl, 구연산염, 인산염 또는 다른 유기산); 벌킹제(bulking agents) (이를 테면, 만니톨 또는 글리신); 킬레이트제 (이를 테면, 에틸렌디아민 테트라아세트산 (EDTA)); 복합체형성 물질 (이를 테면, 카페인, 폴리비닐피롤리돈, 베타-시클로덱스트린 또는 히드록시프로필-베타-시클로덱스트린); 충전제; 모노사카라이드; 디사카라이드; 및 기타 탄수화물 (이를 테면, 포도당, 만노스 또는 덱스트린); 단백질 (이를 테면, 혈청 알부민, 젤라틴 또는 면역글로불린); 발색제, 풍미제 및 희석제; 친수성 폴리머 (이를 테면 폴리비닐피롤리돈); 저분자량 폴리펩티드; 염-형성 반대이온 (이를 테면, 나트륨); 보존제 (이를 테면, 벤잘코늄 클로라이드, 벤조산, 살리실산, 티메르솔, 펜에틸알코올, 메틸파라벤, 프로필파라벤, 클로르헥시딘, 소르브산 또는 과산화수소); 용매(이를 테면, 글리세린, 프로필렌 글리콜 또는 폴리에틸렌 글리콜); 당 알코올 (이를 테면, 만니톨 또는 솔비톨); 현탁제; 계면활성제 또는 습윤제(이를 테면, 플로닉스, PEG, 소르비탄 에스테르, 폴리소르베이트, 이를 테면 폴리소르베이트 20, 폴리소르베이트, 트리톤, 트로메타민, 레시틴, 콜레스테롤, 틸옥사팔); 안정성 강화제(이를 테면, 슈크로스 또는 솔비톨); 강장성 강화제 (이를 테면, 알칼리 금속할로겐화물, 바람직하게는 염화나트륨 또는 염화 칼륨, 만니톨 솔비톨); 운반 비히클; 희석제; 부형제 및/또는 약학 어쥬번트. REMINGTON'S PHARMACEUTICAL SCIENCES, 18" Edition, (A. R. Genrmo, ed.), 1990, Mack Publishing Company 참고.
특정 구현예들에 있어서, 최적의 약학 조성물은 예를 들어 의도된 투여 경로, 전달 형식 및 목적하는 투여량에 따라 당업자에 의해 결정될 것이다. 예를 들면, 상기 REMINGTON'S PHARMACEUTICAL SCIENCES 참고. 특정 구현예들에 있어서, 이러한 조성물은 본 발명의 항원 결합 단백질의 물리적 상태, 안정성, 생체내 방출 속도 및 생체 내 제거율에 영향을 줄 수 있다. 특정 구현예들에 있어서, 약학 조성물 중 1 차 비히클 또는 운반체는 수성 또는 비-수성일 수 있다. 예를 들면, 적합한 비히클 또는 운반체는 주사용 물, 생리 식염수 용액 또는 인공 뇌척수액 일 수 있으며, 비경구(parenteral) 투여용 조성물에서 흔히 보충되는 다른 물질이 보충될 수 있다. 중성 완충 식염수 또는 혈청 알부민과 혼합된 염수는 추가의 예시적인 비히클이다. 특이적 구현예들에 있어서, 약학 조성물은 약 pH 7.0-8.5의 트리스 완충액, 또는 약 pH 4.0-5.5의 아세테이트 완충액을 포함하고, 그리고 솔비톨 또는 이의 적절한 대체물을 추가로 포함할 수 있다. 본 발명의 특정 구현예들에 있어서, Il-2 뮤테인 또는 항-IL-2 항체 조성물은 원하는 정도의 순도를 갖는 선택된 조성물을 동결 건조 케이크 또는 수용액 형태의 임의의 제형 제제 (REMINGTON 'S PHARMACEUTICAL SCIENCES, 상기 참조)와 혼합함으로써 저장용으로 제조될 수 있다 . 더욱이, 특정 구현예들에 있어서 상기 IL-2 뮤테인 또는 항-IL-2 항체 산물은 슈크로스와 같은 적절한 부형제를 사용하여 동결 건조물로서 제형화될 수 있다.
본 발명의 약학 조성물은 비경구 운반용으로 선택될 수 있다. 대안으로, 상기 조성물은 흡입용으로 또는 소화관을 통한 전달용으로, 예를 들어 경구로 선택될 수 있다. 이러한 약학적으로 허용 가능한 조성물의 제조는 당업계의 기술 범위 내에 있다. 제형 성분은 바람직하게는 투여 부위에서 수용 가능한 농도로 존재한다. 특정 구현예들에 있어서, 완충액은 조성물을 생리학적 pH 또는 약간 낮은 pH, 전형적으로 약 5 내지 약 8의 pH 범위 내에서 유지시키는데 사용된다.
비경구 투여가 고려되는 경우, 본 발명에서 사용하기 위한 치료학적 조성물은 약학적으로 허용가능한 비히클 안에 원하는 IL-2 뮤테인 또는 항-IL-2 항체 조성물을 포함하는 비-발열성, 비경구로 허용되는 수용액의 형태로 제공될 수 있다. 비경구 주사에 특히 적합한 비히클은 멸균 증류수로써, 이 안에서 뮤테인 또는 항-IL-2 항체 조성물이 적절히 보존된 멸균, 등장액으로서 제제화된다. 특정 구현예들에 있어서, 제조는 산물의 제어된 또는 지속적인 방출을 제공할 수 있는 주사가능한 미소구, 생체-침식성 입자, 폴리머 화합물 (예: 폴리락트산 또는 폴리글리콜 산), 비드 또는 리포솜과 같은 제제로 원하는 분자를 제형화하는 것을 포함하고, 이것은 데포우(depot) 주사를 통해 전달될 수 있다. 특정 구현예들에 있어서, 히알루론산은 순환계에서 지속 시간을 촉진시키는 효과를 갖고 있어, 또한 사용될 수 있다. 특정 구현예들에 있어서, 이식가능한 약물 운반 장치를 이용하여 IL-2 뮤테인 또는 항-IL-2 항체 조성물을 도입시킬 수 있다.
서방형 제형 또는 제어된 제형에 IL-2 뮤테인 또는 항-IL-2 항체 조성물을 포함하는 제제를 포함하는 추가의 약학 조성물은 당업자에게 명백할 것이다. 리포좀 운반체, 생체-침식성 미립자 또는 다공성 비드 및 데포우 주사과 같은 다양한 다른 지속적-전달 또는 제어된-전달 수단을 제형 화하기 위한 기술 또한 당업자에게 공지되어 있다. 예를 들면, 약학 조성물의 운반을 위한 다공성 폴리머 미소입자의 제어 방출을 기술하는 국제 특허 출원 번호 PCT/US93/00829를 참고하며, 이는 참고자료에 편입된다. 서방성 제제는 필름 또는 마이크로캡슐과 같은 성형 제품의 형태로 반투과성 폴리머 매트릭스를 포함할 수 있다. 지속적 방출 매트릭스는 폴리에스테르, 하이드로겔, 폴리락티드 (U.S. 특허 3,773,919 및 EP 출원 공개 번호 EP 058481에서 기술됨, 이들 각각은 참고자료에 편입됨), L-글루타민산 및 감마 에틸-L-글루탐산염의 코폴리머 (Sidman 등, 1983, Biopolymers 2:547-556), 폴리 (2-히드록시에틸-메타크릴레이트) (Langer 등, 1981, J. Biomed. Mater. Res. 15:167-277 및 Langer, 1982, Chem. Tech. 12:98-105), 에틸렌 비닐 아세테이트 (Langer 등, 1981, 상기) 또는 폴리-D(-)-3-히드록시부틸산 (EP 출원 공개 번호 EP 133,988)를 포함할 수 있다. 지속형 방출 조성물은 당분야에 공지된 임의의 몇 가지 방법에 의해 만들어질 수 있는 리포좀을 또한 포함할 수 있다. 가령, Eppstein 등, 1985, Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 82:3688-3692; EP 출원 공개 번호 EP 036,676; EP 088,046 및 EP 143,949 참고하며, 이들은 참고자료에 편입된다.
생체 내 투여용 약학 조성물은 전형적으로 멸균 제제로서 제공된다. 멸균 여과막을 통한 여과에 의해 살균될 수 있다. 조성물이 동결 건조될 때, 이 방법을 사용하는 멸균은 동결 건조 및 재구성 전 또는 후에 수행될 수 있다. 비경구 투여용 조성물은 동결 건조 된 형태 또는 용액으로 저장될 수있다. 비경구 조성물은 일반적으로 멸균된 접촉 포트, 예를 들어 피하 주사 바늘에 의해 관통할 수 있는 마개를 갖는 정맥내 용액 주머니 또는 바이알을 갖는 용기 안에 배치된다.
본 발명의 한 측면은 약학 조성물로서 사용될 수 있는 자가-완충 IL-2 뮤테인 또는 항-IL-2 항체 제제를 포함하며, 이는 국제 특허 출원 WO 06138181A2 (PCT/US2006/022599)에서 설명되며, 이 출원은 전문이 참고자료에 편입된다.
논의된 바와 같이, 특정 구현예들은 IL-2 뮤테인 또는 항-IL-2 항체 조성물, 특히, 상기 IL-2 뮤테인 또는 항-IL-2 항체 조성물에 추가하여, 하나 이상의 부형제, 이를 테면 본 명세서의 이 단락 또는 도처에서 설명된 것들을 포함하는 약학 Il-2 뮤테인 Fc-융합 단백질을 제공한다. 부형제는 점도의 조절과 같은 제제의 물리적, 화학적 또는 생물학적 성질을 조절하는 것과 이러한 제제의 유효성을 개선시키고, 예를 들어 제조, 선적, 보관, 사용 전 준비, 투여 및 그 이후에 발생하는 스트레스로 인한 분해 및 부패에 대항하여 이러한 제제 및 공정을 안정화시키는 본 발명의 공정과 같은 다양한 목적으로 본 발명에서 이용될 수 있다.
이와 관련하여 유용한 단백질 안정화 및 제제 물질 및 방법에 대한 다양한 설명이 제공되며, 이를테면 Arakawa 등, "Solvent interactions in pharmaceutical formulations," Pharm Res. 8(3): 285-91 (1991); Kendrick et al., "Physical stabilization of proteins in aqueous solution," in: RATIONAL DESIGN OF STABLE PROTEIN FORMULATIONS: THEORY AND PRACTICE, Carpenter and Manning, eds. Pharmaceutical Biotechnology. 13: 61-84 (2002), and Randolph et al., "Surfactant-protein interactions," Pharm Biotechnol. 13: 159-75 (2002)," Pharm Biotechnol. 13: 159-75 (2002), 이들 각각은 본원에 전문이 참고자료에 편입되며, 구체적으로, 본 발명에 따른 자가-완충 단백질 제형에 대한 동일한 부형제 및 그의 공정에 관련된 부분, 구체적으로 동물 및/또는 인간의 의학용도로써 단백질 의약품에 관련된 부분이 참고자료에 편입된다.
본 발명의 특정 구현예에 따르면, 염은 예를 들면, 제제의 이온 강도 및/또는 등장성을 조절하기 위해, 및/또는 조성물의 단백질 또는 다른 성분의 용해도 및/또는 물리적 안정성을 개선시키기 위해 사용될 수 있다.
잘 알려진 바와 같이, 이온은 단백질 표면의 하전된 잔기에 결합하고, 단백질의 하전된 극성기들을 차폐하고, 그리고 정전기 상호 작용의 강도, 인력 및 척력 상호 작용을 줄임으로써 단백질의 원래 상태를 안정화시킬 수 있다. 이온은 또한 단백질의 변성된 펩티드 결합 (-CONH)에 특히 결합함으로써, 단백질의 변성된 상태를 안정화시킬 수 있다. 더욱이, 단백질에서 하전된 그리고 극성기들과의 이온 상호 작용은 또한 분자간 정전기 상호작용을 감소시킬 수 있으며, 이로써 단백질 응집 및 불용성을 예방 또는 감소시킬 수 있다.
이온 종은 단백질에 미치는 영향은 상당히 상이하다. 본 발명에 따른 약학 조성물을 제제화하는데 사용될 수 있는 단백질에 대한 다수의 범주별 순위 및 이온 효과가 개발되었다. 한 예로 Hofmeister 시리즈가 있는데, 이 시리즈는 이온성 및 극성 비-이온성 용질이 용액 내 단백질의 구조 안정성에 미치는 영향으로 평가한다. 안정화 용질은 "코스모트로피 (kosmotropic)"라고 부른다. 불안정한 용질은 "카오트로픽 (chaotropic)"이라고 부른다. 코스모트로피는 일반적으로 용액으로부터 단백질을 침전시키기 위해("솔팅-아웃") 고농도 (예를 들어, > 1 몰 암모늄 설페이트)로 사용된다. 카오트로픽은 일반적으로 단백질을 변성 및/또는 용해시키기 위해("솔팅-인") 사용된다. "솔트-인" 및 "솔트-아웃"에 대한 이온의 상대적인 효과는 Hofmeister 시리즈에서 이들 이온의 위치로 정의된다.
유리(free) 아미노산은 벌크화제, 안정화제 및 항산화제 뿐만 아니라, 기타 표준 용도로서 본 발명의 다양한 구현예에 따라 IL-2 뮤테인 또는 항-IL-2 항체 제제에 사용될 수 있다. 리신, 프롤린, 세린, 및 알라닌이 제형에서 단백질을 안정화시키는데 이용될 수 있다. 글리신은 정확한 케이크(cake) 구조 및 특성을 확보하기 위해 동결 건조에 유용하다. 아르기닌은 액체 및 동결 건조 제형 모두에서 단백질 응집을 억제하는데 유용할 수 있다. 메티오닌은 항산화제로서 유용하다.
폴리올은 당, 예를 들어 만니톨, 슈크로스 및 솔비톨 및 글리세롤 및 프로필렌 글리콜과 같은 다가 알코올 및 본원에서의 논의를 위해 폴리에틸렌 글리콜 (PEG) 및 관련 물질을 포함한다. 폴리올은 코스모트로피성이다. 이들 폴리올은 물리적 및 화학적 분해 과정에서 단백질을 보호하기 위해 액체 및 동결 건조 제제 모두에서 유용한 안정화제이다. 폴리올은 또한 제형의 긴장도를 조절하는데 유용하다.
본 발명의 선택된 구현예에서 유용한 폴리올 중에 만니톨이 있는데, 이는 동결 건조 제형에서 케이크의 구조적 안정성을 보장하는데 일반적으로 사용된다. 이것은 케이크에 대한 구조적 안정성을 보장한다. 그것은 일반적으로 동결건조보호제(lyoprotectant), 예를 들어 슈크로즈와 함께 사용된다. 솔비톨과 슈크로즈는 제조 과정에서 운반 중 또는 벌크 제조 중에 동결-해동 응력을 방지하기 위해 장력을 조절하고, 안정제로 선호하는 물질중 하나이다. 포도당 및 락토오스와 같은 환원당 (유리 알데히드 또는 케톤기를 포함)은 표면 리신 및 아르기닌 잔기를 글리코실화할 수 있다. 따라서, 이들은 일반적으로 본 발명에 사용하기에 바람직한 폴리올은 아니다. 또한, 이러한 반응을 형성하는 당, 예컨대 산성 조건하에 프락토스와 포도당으로 가수 분해되고, 결과적으로 글리코실화를 일으키는 슈크로즈는 또한 이와 관련하여 본 발명의 바람직한 폴리올은 아니다. PEG는 단백질을 안정화시키고, 동결 방지제로서 유용하며, 이와 관련하여 본 발명에서 사용될 수 있다.
IL-2 뮤테인 및/또는 항-IL-2 항체 제형의 구현예들은 계면활성제를 더 포함한다. 단백질 분자는 공기-액체, 고체-액체 및 액체-액체 계면에서 표면에서의 흡착 및 변성 및 그에 따른 응집에 민감할 수 있다. 이러한 효과는 일반적으로 단백질 농도에 반비례한다. 이러한 유해한 상호작용은 일반적으로 단백질 농도와 반비례하며, 일반적으로 제품의 선적 및 취급 과정에서 발생하는 물리적 흔들림에 의해 악화된다.
계면 활성제는 일상적으로 표면 흡착을 방지, 최소화 또는 감소시키는데 사용된다. 이와 관련하여 본 발명의 유용한 계면활성제는 폴리소르베이트 20, 폴리소르베이트 80, 소르비탄 폴리에톡실레이트의 다른 지방산 에스테르 및 폴옥사머 188을 포함한다.
계면 활성제는 또한 단백질 구조 안정성을 제어하는데 일반적으로 사용된다. 이 점에서 계면활성제의 사용은 특정 계면활성제가 전형적으로 일부 단백질을 안정화시키고, 다른 단백질을 불안정하게할 것이기 때문에 단백질-특이적이다.
폴리소르베이트는 산화 분해가 일어나기 쉽고, 대개 공급될 때 단백질 잔기의 측쇄, 특히 메티오닌의 산화를 일으키는 충분한 양의 과산화물을 함유하고 있다. 결과적으로, 폴리소르베이트는 신중하게 사용해야 하며, 사용하는 경우 최저 유효 농도로 사용해야 한다. 이와 관련하여, 폴리소르베이트는 부형제의 경우 최저 유효 농도로 사용되어야 한다는 일반적인 규칙을 예시한다.
IL-2 뮤테인 또는 항-IL-2 항체 제형의 구현예들은 하나 이상의 항산화제를 더 포함한다. 대기 산소 및 온도를 적절한 수준으로 유지하고, 빛에 노출되는 것을 피함으로써 약학 제제에서 단백질의 유해한 산화는 어느 정도 예방할 수 있다. 산화방지제 부형제는 단백질의 산화 분해를 방지하기 위해 사용될 수 있다. 이와 관련하여 유용한 항산화제 중에는 환원제, 산소/자유-라디칼 소거제 및 킬레이트제가 있다. 본 발명에 따른 치료용 단백질 제제에 사용하기 위한 항산화제는 바람직하게는 수용성이고, 제품의 유효 기간 내내 그 활성을 유지한다. EDTA는 이와 관련하여 본 발명에 따라 바람직한 항산화제이다.
항산화제는 단백질을 분해할 수 있다. 예를 들어, 특히 글루타티온과 같은 환원제는 분자 내 이황화 연쇄를 파괴시킬 수 있다. 따라서, 본 발명에서 사용하기 위하여 무엇보다도 제제 내에서 단백질을 손상시킬 가능성을 제거하거나 충분히 감소시키는 항산화제가 선택된다.
본 발명에 따른 제제는 단백질 배위 착물을 형성하는데 필요한 단백질 공-인자(co-factor)인 금속 이온을 포함할 수 있는데, 이를 테면, 특정 인슐린 현탁액을 형성시키는데 필요한 아연을 포함할 수 있다. 금속 이온은 단백질을 분해하는 일부 과정을 또한 억제할 수 있다. 그러나, 금속 이온은 단백질을 분해하는 물리적 및 화학적 과정을 또한 촉매한다.
마그네슘 이온 (10-120 mM)은 아스파르트산이 이소아스파르트 산으로 되는 이성질화를 억제하는데 사용될 수 있다. Ca+ 2 이온 (최대 100 mM)은 인간 데옥시리보뉴클레아제의 안정성을 증가시킬 수 있다. 그러나, Mg+2, Mn+2, 및 Zn+ 2은 rhDNase를 탈안정화시킬 수 있다. 유사하게, Ca+2 및 Sr+ 2은 Factor VIII를 안정화시킬 수 있고, 이것은 Mg+2, Mn+2와 Zn+2, Cu+2와 Fe+2에 의해 탈안정화될 수 있으며, 이의 응집은 Al+3 이온에 의해 증가될 수 있다.
IL-2 뮤테인 또는 항-IL-2 항체 제형의 구현예들은 하나 이상의 보존제를 더 포함할 수 있다. 보존제는 동일한 용기에서 1 회 이상의 추출이 필요한 다중-용량의 비경구 제형을 개발할 때 필요하다. 이들의 주요 기능은 미생물 성장을 억제시키고, 의약품의 유효 기간 또는 사용 기간 동안 제품의 무균 상태를 보장하는 것이다. 일반적으로 사용되는 보존제는 벤질알코올, 페놀 및 m-크레졸을 포함한다. 보존제는 소-분자 비경구용으로 오랫동안 사용되어 왔지만, 보존제가 포함된 단백질 제형의 개발은 어려울 수 있다. 보존제는 단백질에 대하여 불안정한 효과 (응집)를 거의 항상 가지고 있고, 이것이 다중-용량 단백질 제형에서의 사용을 제한하는 주요 요인이 되었다. 지금까지 대부분의 단백질 약물은 일회용으로만 만들어졌다. 그러나, 다중 투여 제형이 가능할 경우, 환자 편의성을 높이고, 그리고 시장성을 높일 수 있다는 장점이 있다. 인간 성장 호르몬 (hGH)이 좋은 예가 되는데, 보존된 제형의 개발로 인해 보다 편리하고 다중-사용 주사 펜 제시방식이 상용화되었다. hGH의 보존된 제형을 함유하는 최소 4가지 펜 장치가 현재 시장에서 사용 가능하다. Norditropin (액체, Novo Nordisk), Nutropin AQ (액체, Genentech) & Genotropin (동결건조된--이중 챔버 카트리지, Pharmacia & Upjohn)은 페놀을 함유하며, Somatrope (Eli Lilly)은 m-크레졸로 제형화된다.
한 구현예에서, IL-2 뮤테인 또는 IL-2 뮤테인의 Fc-융합체, 이를 테면, 예를 들면, Fc.IL-2(H16T), Fc.IL-2(H16K), Fc.IL-2(H16R), Fc.IL-2(L19N), Fc.IL-2(L19D), Fc.IL-2(D20E), Fc.IL-2(D20G), Fc.IL-2(D20T), Fc.IL-2(N88D), Fc.IL-2(N88R), Fc.IL-2(N88S), Fc.IL-2(V91D), Fc.IL-2(V91G), Fc.IL-2(V91K), 또는 Fc.IL-2(V91S)은 10 mM L-글루탐산, 3.0% (w/v) L-프롤린, pH 5.2에서 10 mg/mL로 제형화된다. 또 다른 구현예에서, IL-2 뮤테인 또는 IL-2 뮤테인의 Fc-융합체, 이를 테면, 예를 들면, Fc.IL-2(H16T), Fc.IL-2(H16K), Fc.IL-2(H16R), Fc.IL-2(L19N), Fc.IL-2(L19D), Fc.IL-2(D20E), Fc.IL-2(D20G), Fc.IL-2(D20T), Fc.IL-2(N88D), Fc.IL-2(N88R), Fc.IL-2(N88S), Fc.IL-2(V91D), Fc.IL-2(V91G), Fc.IL-2(V91K), 또는 Fc.IL-2(V91S)는 10 mM KPi, 161 mM L-아르기닌, pH 7.6에서 제형화된다.
보존된 제형의 제조 및 개발시 여러 측면을 고려할 필요가 있다. 약물 제품에서 효과적인 보존제 농도는 최적화되어야 한다. 단백질 안정성을 손상시키지 않으면서, 항-미생물 유효성을 부여하는 농도 범위를 갖는 투약 형태에서 주어진 방부제를 시험해야 한다.
또 다른 측면에서, 본 발명은 동결건조된 제형 안에 IL-2 뮤테인, 항-IL-2 항체, 또는 IL-2 뮤테인의 Fc-융합체를 제공한다. 동결-건조 제품은 방부제없이 동결 건조되고, 사용시 보존제가 포함된 희석제로 재구성할 수 있다. 이렇게 함으로써, 보존제가 단백질과 접촉하는 시간을 단축시켜고, 관련된 안정성 위험을 현저히 최소화한다. 액체 제형의 경우, 보존 기간의 유효성과 안정성은 전체 제품 유효 기간 (약 18 개월에서 24 개월) 동안 유지되어야 한다. 주목해야할 중요한 점은 활성 약물 및 모든 부형제 성분을 포함하는 최종 제제에서 보존 효과가 입증되어야 한다는 것이다.
IL-2 뮤테인 또는 항-IL-2 항체 제형은 일반적으로 다른 무엇보다도 생물-이용성 및 지속성 범위와 함께, 투여를 위한 특정 경로 및 방법, 특이적 투여 투약형 및 투여 빈도, 특정 질환에 대한 특정 치료에 맞게 기획될 수 있다. 따라서, 제형은 구강으로, 귀로, 눈으로, 직장 및 질 내, 그리고 정맥 내 및 동맥 내 주사, 근육 내 주사 및 피하 주사를 포함하는 비경구 경로를 포함하나, 이에 국한되지 않는 임의의 적합한 경로에 의한 전달되도록 본 발명에 따라 설계될 수 있다.
일단 약학 조성물이 제형화되면, 용액, 현탁액, 겔, 에멀젼, 고체, 결정 또는 탈수된 분말 또는 동결건조된 분말로서 멸균 바이알에 저장될 수 있다. 이러한 제형은 즉시 사용하는 형태, 또는 투여 전, 재구성되는 형태 (예를 들어, 동결건조된)로 저장될 수 있다. 본 발명은 단일-용량 투여 단위를 만들기 위한 키트를 제공한다. 본 발명의 키트는 건조된 단백질을 갖는 제 1 용기와 수성 제형을 갖는 제 2 용기를 각각 포함할 수 있다. 본 발명의 특정 구현예들에 있어서, 단일 및 다중-챔버를 갖는 사전-충전된 주사기 (예를 들어, 액체 주사기 및 라이오주사기(lyosyringes))를 포함하는 키트가 제공된다.
사용되는 IL-2 뮤테인-또는 항-IL-2 항체-함유하는 약학 조성물의 치료 유효량은 예를 들어, 치료적 배경 및 목적에 따라 달라질 것이다. 당업자는 치료를 위한 적절한 투여량 수준은 전달되는 분자, IL-2 뮤테인 또는 항-IL-2 항체가 사용되는 증상, 투여 경로, 그리고 환자의 체격 (체중, 신체 표면 또는 장기 크기) 및/또는 환자의 상태 (연령 및 전반적인 건강 상태)에 따라 달라질 수 있다는 것을 인지할 것이다. 특정 구현예들에 있어서, 임상의는 투여량을 적정하고, 최적의 치료 효과를 얻기 위해 투여 경로를 변경할 수 있다. 일반적인 투여량은 위에서 언급한 요인에 따라, 약 0.1 ㎍/kg 내지 최대 약 1 mg/kg의 범위에 있을 수 있다. 특이적 구현예들에 있어서, 투여량은 0.5 ㎍/kg 내지 최대 약 100 ㎍/kg 범위가 될 수 있으며, 임의선택적으로 2.5 ㎍/kg 내지 약 50 ㎍/kg 범위가 될 수 있다.
치료요법적 유효량의 IL-2 뮤테인 또는 항-IL-2 항체는 바람직하게는 질병 증상의 중증도의 감소, 질병 증상이 없는 기간의 빈도 또는 기간의 증가, 또는 질병으로 인한 손상 또는 장애를 예방한다.
약학 조성물은 의료 기구를 이용하여 투여될 수 있다. 약학 조성물을 투여하기 위한 의료 기구의 예는 U.S. 특허 번호 4,475,196; 4,439,196; 4,447,224; 4,447, 233; 4,486,194; 4,487,603; 4,596,556; 4,790,824; 4,941,880; 5,064,413; 5,312,335; 5,312,335; 5,383,851; 및 5,399,163에서 공개되며, 이들 모두는 본 명세서의 참고자료에 편입된다.
한 구현예에서, 포함하는 약학 조성물이 제공된다.
자가면역 또는 염증성 장애의 치료 방법
특정 구현예들에 있어서, 본 발명의 IL-2 뮤테인 또는 항-IL-2 항체는 자가면역 또는 염증성 장애를 치료하는데 이용된다. 바람직한 구현예들에서, IL-2 뮤테인 Fc-융합 단백질이 이용된다.
본 명세서에서 공개된 IL-2 뮤테인 또는 항-IL-2 항체로 특별히 치료가능한 장애는 다음을 포함하나, 이에 국한되지 않는다: 염증, 자가면역 질환, 아토피 질환, 부신생물 자가면역 질환, 연골 염증, 관절염, 류마티스성 관절염, 소아 관절염, 소아 류마티스성 관절염, 소아 소수관절(pauciarticular) 류마티스 관절염, 소아 다수관절(polyarticular) 류마티스 관절염, 전신성 소아 류마티스성 관절염, 소아 강직성 척추염, 소아 장병성(enteropathic) 관절염, 소아 반응성 관절염, 소아 라이타 증후군(Reiter's Syndrome), SEA 증후군 (혈청 반응 음성, 골근부착부질환(Enthesopathy), 관절증 증후군), 소아 피부근염, 소아 건선성 관절염, 소아 경피증, 소아 전신 홍반 루푸스, 소아 혈관염, 소수관절 류마티스 관절염, 다수관절 류마티스 관절염, 전신성 개시 류마티스성 관절염, 강직성 척추염, 장병성 관절염, 반응성 관절염, 라이타 증후군, SEA 증후군 (혈청반응 음성, 골근부착부질환, 관절증 증후군), 피부근염, 건선성 관절염, 경피증, 혈관염, 척수염, 다척수염(polymyolitis), 피부근염, 다발동맥염, 웨그너(Wegener) 육아종증, 동맥염, 류마티스성 다발근통, 사르코이드증, 경화증, 원발담즙간경변증, 경화쓸개관염, 쇼그렌 증후군(Sjogren's syndrome), 건선, 판상 건선(plaque psoriasis), 반점성 건성(guttate psoriasis), 간찰부 건선(inverse psoriasis), 농포 건선(pustular psoriasis), 홍피선 건선(erythrodermic psoriasis), 피부염, 아토피성 피부염, 죽상경화증, 루프스, 스틸 질환(Still's disease), 전신 홍반성 루프스(SLE), 중증근무력증, 염증성 장 질환(IBD), 크론병, 궤양성 대장염, 실리악병(celiac disease), 다발성 경화증 (MS), 천식, COPD, 부비동염, 폴립을 가진 부비동염, 호산구성 식도염, 호산구성 기관지염, 길랑-바레병(Guillain-Barre disease), I 형 진성 당뇨병, 갑상선염 (예컨대, 그레이브스병(Graves' disease)), 애디슨병(Addison's disease), 레이노 현상(Raynaud's phenomenon),자가면역 간염, GVHD, 이식 거부, 신장 손상, C 형 간염-유발된 혈관염, 자연유산 및 이와 유사한 것들.
바람직한 구현예들에서, 자가 면역 질환 또는 염증성 질환은 루푸스, 이식편-대-숙주 질환, C 형 간염 유발성 혈관염, I 형 진성 당뇨병, 다발성 경화증, 자연 유산, 아토피성 질환 및 염증성 장 질환이다.
또 다른 구현예에서, 자가 면역 또는 염증성 장애를 가지고 있거나 발병 위험이 있는 환자는 IL-2 뮤테인 또는 항-IL-2 항체 (예를 들어, 본원에서 설명된 IL-2 뮤테인 Fc-융합체와 같은 본원에 개시된 IL-2 뮤테인 또는 임의선택적으로 본원에서 설명된 유형의 Fc-융합 분자의 일부로써 당업계에 공지된 다른 IL-2 뮤테인 또는 야생형 IL-2)로 치료받고, 그리고 이 치료에 대한 환자의 반응을 모니터링한다. 모니터되는 환자의 반응은 치료에 대한 환자의 탐지가능하거나 측정가능한 반응, 그러한 반응의 조합일 수도 있다. 예를 들면, 반응은 환자의 생리 상태에서 변화, 예를 들면, 체온 또는 발열, 식욕, 발한, 두통, 메스꺼움, 피로, 허기, 갈증, 예민함 또는 이와 유사한 것일 수 있다. 대안으로, 반응은 환자로부터 취한 말초 혈액의 샘플에서 세포 유형 또는 유전자 산물 (예를 들어, 단백질, 펩티드 또는 핵산)의 양의 변화일 수 있다. 한 구현예에서, 환자가 치료에 대해 감지가능하거나 또는 측정가능한 반응을 나타내거나 또는 그러한 반응이 특정 임계 값을 초과하는 경우 환자의 치료 레지멘은 변경된다. 상기 변화는 투여 빈도의 감소 또는 증가, 또는 투여 당 투여되는 IL-2 뮤테인 또는 항-IL-2 항체의 양의 감소 또는 증가, 또는 투여가 없는 "쉬는 날"(즉, 명시된 기간 동안, 또는 치료 의사가 치료를 계속하기로 결정할 때까지, 또는 환자의 모니터링된 반응이 치료가 필요하다고 표시하거나 치료를 재개할 때까지 치료의 일시적 중단) 또는 치료를 종료할 수 있다. 한 구현예에서, 상기 반응은 환자의 체온이나 CRP 수준의 변화이다. 예를 들면, 상기 반응은 환자의 체온이 증가하거나 말초 혈액 샘플에서 CRP 수준의 증가, 또는 이 둘 모두가될 수 있다. 한 특정 구현예에서, 치료 과정 동안 환자의 체온이 적어도 0.1°, 0.2°, 0.3°, 0.4°, 0.5°, 0.7°, 1°, 1.5°, 2°, 또는 2.5℃로 상승된다면, 환자의 치료를 줄이거나, 유예하거나, 또는 종료한다. 또 다른 특정 구현예에서, 치료 과정 동안 환자의 말초혈액 시료 안에 CRP의 농도가 적어도 0.1, 0.2, 0.3, 0.4, 0.5, 0.7, 1, 1.5, 또는 2 mg/mL로 증가된다면, 환자의 치료를 줄이거나, 중단하거나, 또는 종료된다. 치료를 수정, 감소, 중단 또는 종료할지 여부를 결정할 때 모니터링되고, 이용될 수 있는 환자의 기타 반응은 모세혈관 누출 증후군 (저혈압 및 심혈관 불안정성)의 발달 또는 악화, 호중구 기능의 손상 (예를 들면, 감염이 발달되거나 또는 악화되거나 또는 탐지되는 경우), 혈소판 감소증, 혈전성 혈관병증, 주사 부위 반응, 혈관염 (C 형 간염 바이러스 혈관염과 같은), 또는 염증성 증상 또는 질환의 발달 또는 악화를 포함한다. 치료를 수정, 감소, 중단 또는 종료할지 여부를 결정할 때 모니터링되고, 이용될 수 있는 환자의 추가적인 반응으로는 NK 세포, Treg 세포, FOXP3-CD4 T 세포, FOXP3+ CD4 T 세포, FOXP3-CD8 T 세포, 또는 호산구 수의 증가가 포함된다. 이러한 세포 유형의 증가는 예를 들어, 다른 유형의 세포 또는 혈액 샘플의 세포와 비교하여, 말초 혈액 단위 당 세포 수의 증가 (예를 들어, 혈액 1 ml 당 세포의 증가로 표시됨) 또는 백분율의 증가로 탐지될 수 있다. 모니터링할 수 있는 또 다른 환자 반응은 환자의 말초 혈액 샘플에서 CD25+ 세포에서 세포 표면-결합된 IL-2 뮤테인 또는 항IL-2 항체 양의 증가이다.
Treg
세포를 증식시키는 방법
상기 IL-2 뮤테인, 항-IL-2 항체, 또는 IL-2 뮤테인 Fc-융합 단백질은 대상체 또는 시료 안 Treg 세포를 증식시키는데 이용될 수 있다. 비(non)-조절 T 세포에 대하여 Tregs 비율을 증가시키는 방법이 본 명세서에서 제공된다. 상기 방법은 T 세포의 집단을 유효량의 인간 IL-2 뮤테인, 항-IL-2 항체 또는 IL-2 뮤테인 Fc-융합체에 접촉시키는 것을 포함한다. T 세포 집단 내의 CD3+FOXP3-세포 대 CD3+FOXP3-세포의 비율을 측정함으로써 상기 비율은 측정될 수 있다. 인간 혈액 내 전형적인 Treg 빈도는 전체 CD4+CD3+T 세포의 5-10 %이지만, 그러나, 상기 언급된 질병에서 이 비율은 더 낮거나 높을 수 있다. 바람직한 구현예들에서, Treg의 백분율은 적어도 10%, 적어도 20%, 적어도 30%, 적어도 40%, 적어도 50%, 적어도 60%, 적어도 70%, 적어도 80%, 적어도 90%, 적어도 100%, 적어도 200%, 적어도 300%, 적어도 400%, 적어도 500%, 적어도 600%, 적어도 700%, 적어도 800%, 적어도 900%, 또는 적어도 1000% 증가된다. Treg의 최대 증가 배수는 특정 질병에 따라 다를 수 있지만; 그러나 IL-2 뮤테인 치료를 통해 얻을 수 있는 최대 Treg 빈도는 전체 CD4+CD3+T 세포의 50 % 또는 60 %일 것이다. 특정 구현예들에 있어서 상기 IL-2 뮤테인, 항-IL-2 항체, 또는 IL-2 뮤테인 Fc-융합 단백질이 대상체에게 투여되고, 대상체의 말초혈액 안에 비-조절 T 세포에 대한 조절 T 세포(Tregs)의 비율은 증가된다.
상기 IL-2 뮤테인, 항-IL-2 항체, 및 IL-2 뮤테인 Fc-융합 단백질은 다른 세포 유형과 비교하여 Tregs를 우선적으로 증식시키기 때문에, 이들 단백질은 대상체의 말초혈액 안에 자연살해(NK) 세포에 대한 조절 T 세포(Tregs)의 비율은 증가시키는데 또한 유용하다. CD19-및 CD3-인 CD16+및/또는 CD56+림프구에 대한 CD3+FOXP3+ 세포의 비율을 결정함으로써, 상기 비율이 측정될 수 있다.
상기 IL-2 뮤테인, 항-IL-2 항체, 또는 IL-2 뮤테인 Fc-융합 단백질은 환자의 말초 혈액 안에 비-조절 T 세포 또는 NK 세포에 대한 Tregs의 비율을 유의적으로 증식시키지 않고, 환자의 질환 또는 장애에 대하여 치료요법적 효과를 가질 수 있는 것으로 간주된다. 상기 치료요법적 효과는 염증 또는 자가면역 부위에서 상기 IL-2 뮤테인, 항-IL-2 항체, 또는 IL-2 뮤테인 Fc-융합 단백질의 활성의 국소화로 인한 것일 수 있다.
실시예
다음의 실질적, 그리고 예측적 측면의 실시예는 모두 본 발명의 특정 구현예 또는 특징을 설명하기 위한 목적으로 제공되며, 본 발명의 범위를 제한하고자 하는 의도는 없다.
실시예
1 --CD25에 대한 높은 친화력을 부여하는 돌연변이 수의 감소
CD25에 대한 증가된 친화력과 IL-2Rβγ를 통한 감소된 신호전달 강도를 가지는 IL-2 뮤테인은 Treg 성장 및 기능을 우선적으로 촉진한다. 잠재적인 면역원성을 줄이기 위해, CD25에 대한 높은 친화력성을 얻기 위해 필요한 적어도의 돌연변이가 요구되었다. IL-2와 이의 3개 수용체와 복합된 결정 구조 (PDB 코드 -2B5I)에서 V69A와 Q74P는 CD25와 상호작용하는 나선 구조에 위치한다. 이는 왜 V69A와 Q74P가 CD25 높은 결합 친화력에 대한 2가지 별개 IL-2 돌연변이유발 스크린에서 빈번하게 단리되는지를 설명할 수 있다(Rao 등, 2005; Thanos 등, 2006). 본 실시예는 Rao 등의 스크린에서 확인된 IL-2 뮤테인 "2-4"의 다른 돌연변이가 V69A 및 Q74P 단독에서 관찰된 것 이상으로 친화력을 증가시키는데 중요한 지를 탐색한다. 활성화된 T 세포 표면의 CD25와의 결합에 대해 다음의 단백질들이 유동세포 분석기로 스크리닝되었다. 모든 작제물들은 정제 및 탐지를 위한 C-말단 FLAG 및 폴리-His 태그를 모두 함유한다. 특이적 돌연변이는 괄호로 제시된다.
HaMut1D (V69A,Q74P,N88D,C125A) (서열번호:8) APTSSSTKKTQLQLEHLLLDLQMILNGINNYKNPKLTRMLTFKFYMPKKATELKHLQCLEEELKPLEEALNLAPSKNFHLRPRDLISDINVIVLELKGSETTFMCEYADETATIVEFLNRWITFAQSIISTLT
HaMut2D (N30S,V69A,Q74P,N88D,C125A) (서열번호:9) APTSSSTKKTQLQLEHLLLDLQMILNGINSYKNPKLTRMLTFKFYMPKKATELKHLQCLEEELKPLEEALNLAPSKNFHLRPRDLISDINVIVLELKGSETTFMCEYADETATIVEFLNRWITFAQSIISTLT
HaMut3D (K35R,V69A,Q74P,N88D,C125A) (서열번호:10) APTSSSTKKTQLQLEHLLLDLQMILNGINNYKNPRLTRMLTFKFYMPKKATELKHLQCLEEELKPLEEALNLAPSKNFHLRPRDLISDINVIVLELKGSETTFMCEYADETATIVEFLNRWITFAQSIISTLT
HaMut4D (T37A,V69A,Q74P,N88D,C125A) (서열번호:11) APTSSSTKKTQLQLEHLLLDLQMILNGINNYKNPKLARMLTFKFYMPKKATELKHLQCLEEELKPLEEALNLAPSKNFHLRPRDLISDINVIVLELKGSETTFMCEYADETATIVEFLNRWITFAQSIISTLT
HaMut5D (K48E,V69A,Q74P,N88D,C125A) (서열번호:12) APTSSSTKKTQLQLEHLLLDLQMILNGINNYKNPKLTRMLTFKFYMPEKATELKHLQCLEEELKPLEEALNLAPSKNFHLRPRDLISDINVIVLELKGSETTFMCEYADETATIVEFLNRWITFAQSIISTLT
HaMut6D (E68D,V69A,Q74P,N88D,C125A) (서열번호:13) APTSSSTKKTQLQLEHLLLDLQMILNGINNYKNPKLTRMLTFKFYMPKKATELKHLQCLEEELKPLEDALNLAPSKNFHLRPRDLISDINVIVLELKGSETTFMCEYADETATIVEFLNRWITFAQSIISTLT
HaMut7D (N71R,V69A,Q74P,N88D,C125A) (서열번호:14) APTSSSTKKTQLQLEHLLLDLQMILNGINNYKNPKLTRMLTFKFYMPKKATELKHLQCLEEELKPLEEALRLAPSKNFHLRPRDLISDINVIVLELKGSETTFMCEYADETATIVEFLNRWITFAQSIISTLT
HaMut8D (K35R,K48E,E68D,N88D,C125A) (서열번호:15) APTSSSTKKTQLQLEHLLLDLQMILNGINNYKNPRLTRMLTFKFYMPEKATELKHLQCLEEELKPLEDVLNLAQSKNFHLRPRDLISDINVIVLELKGSETTFMCEYADETATIVEFLNRWITFAQSIISTLT
HaMut7D는 고유의 분리체 "2-4"(~ 200pM)와 거의 동일한 친화력으로 CD25에 결합하였고, 이것은 돌연변이 N71R이 V69A, Q74P 단독 (HaMut1D, ~ 2nM)에서 관찰된 것보다 훨씬 높게 친화력을 증가시킬 수 있음을 나타낸다. 다른 작제물들은 HaMut1D와 유사하거나, 또는 약간 더 높은 친화력을 보였으나, 예외적으로 HaMut8D의 친화력은 WT IL-2의 것보다 겨우 약간 높았다.
실시예
2 --반감기 개선을 위하여
IgG1
-
Fc
도메인에 융합된 IL-2
뮤테인
IL-2 뮤테인으로 Treg 농축을 달성하는데 요구되는 투약 빈도를 감소시키기 위해, IL-2 및 IgG1-Fc 도메인 사이의 다양한 융합이 평가되었다. 상기 Fc 도메인은 표적 세포 용해와 같은 IgG1에 의해 매개되는 효과기 기능을 없애기 위한 점 돌연변이를 함유하고 있다. 이용된 Fc 효과기 기능 돌연변이는 A327Q, Ala Ala (L234A+L235A) 또는 N297G이다. Treg-선택적 IL-2 뮤테인은 IL-2 효능의 부분적인 감소를 갖기 때문에, IL-2R 신호 전달에 유의적인 영향을 미치지 않는 방식으로 IL-2를 Fc에 융합시키는 것이 중요하였다. 따라서, IL-2 뮤테인은 Fc 융합 유무에 관계없이, IL-2R 활성화에 대해 시험하였다.
Fc 융합체에 의한 IL-2 이량체화가 IL-2R에 대한 결합력(avidity) 증가로 인하여 IL-2R 신호전달 강도를 증가시킬 수 있는 지를 판단하기 위하여, GGGGS (서열번호:5) 링커 서열에 의해 분리된 Fc의 아미노 말단에 더 약한 IL-2 뮤테인 (haD5) (US20110274650)을 융합시켰다. 상기 뮤테인은 IL-2R 신호전달 (E15Q, H16N, N88D)에 영향을 주는 3개 돌연변이, CD25에 대한 높은 친화력을 부여하는 8개 돌연변이 (N29S, Y31H, K35R, T37A, K48E, V69A, N71R, Q74P) (Rao 등, 2005), 그리고 시스테인 미스페어링과 응집을 방지하는 C125S를 보유한다. 이러한 방식으로 Fc와의 융합은 haD5의 생물학적 활성을 완전히 없애고, 이량체화로 인한 결합력의 증가때문에 세포 표면 CD25에 대한 높은 친화력 결합은 강화되었다.
IL-2 뮤테인은 Fc 이량체중 단 하나의 쇄만 IL-2 도메인을 보유하도록, Fc 이종이량체의 N-또는 C-말단 중 어느 하나에 또한 융합되었다. 2 개의 비대칭 Fc 쇄 간의 이종이량체 페어링(pairing)은 하나의 Fc 쇄상의 도입된 리신과 다른 Fc 쇄상의 도입된 아스파르트산 사이의 정전기적 상호 작용에 의해 촉진되었다. 하나의 배열이 바람직한 경우 IL-2 뮤테인 (haute)-hD6을 하나의 Fc 쇄 또는 다른 Fc 단편의 N-말단에 융합시켜 haD6.FcDD 및 haD6.FcKK로 명명되는 두 개의 단백질 구조물을 만들었다. 뮤테인 haMut7D는 하나 또는 두개의 GGGGS (서열번호:5) 링커 (FcKK(G4S)haMut7D, FcKK(G4S)2haMut7D)를 갖는 상기 Fc 이종이량체의 C-말단에 또한 융합되었다. 상기 Fc 이종이량체의 N-말단에 상기 IL-2 뮤테인 haD6의 융합으로 pSTAT5 및 T 세포 증식 실험 모두에서 자유 haD6와 비교하여 부분적으로 활성이 상실되었다. 대조적으로, 하나 또는 두개의 GGGGS (서열번호:5) 링커를 갖는 상기 Fc 이종이량체의 C-말단에 haMut7D를 융합시켜도 haMut7D의 효능은 변화되지 않았다.
Fc 동종이량체의 C-말단에 IL-2 뮤테인의 융합 또한 조사되었다. 전체 PBMC는 100 ng/ml의 항-CD3 (OKT3)와 함께 100ml 당 300백만 세포로 T75 조직 배양 플라스크에서 활성화되었다. 배양 3일차 시점에, 세포는 3회 세척하고, 3일 동안 새로운 배지에서 방치해두었다. 그 후 IL-2 변이체로 50㎕의 최종 부피에서 1pM 내지 10nM 범위의 10x 용량 적정으로 세포를 자극시켰다. STAT5 인산화 수준은 BD 포스플로우 버퍼(phosflow buffer) 키트를 사용하여 측정하였다. 간략하게, 1 ml의 BD 용해/고정 포스플로우 버퍼가 추가되어 자극을 중단시켰다. 세포를 37℃에서 20 분간 고정시키고, CD4, CD25, FOXP3 및 pSTAT5를 염색하기 전, 얼음에서 1x BD 포스플로우 퍼머(perm) 완충액으로 투과화되었다(permeabilized).
도 1에서 볼 수 있는 바와 같이, 뮤테인 haMut1D 및 haMut7D의 생물활성은 Fc 동종이량체의 C-말단으로의 융합에 의해 변경되지 않았다. 따라서, IL-2의 N-말단과 Fc의 C-말단 사이의 융합은 Fc.IL-2 동종이량체의 경우에서도 IL-2 뮤테인의 항진 활성을 손상시키지 않았다. 이러한 작제물에서 제작 개선을 위하여 C125A 돌연변이는 C125S 대신하여 사용되었다.
실시예
3 --
우선적인
Treg
성장을 이루기 위하여 IL-2
뮤테인의
효능을 조율
IL-2 뮤테인의 최초 패널은 N88D 단독으로, 또는 IL-2R 신호 전달에 영향을 미치는 1개 또는 2 개의 추가 돌연변이를 갖는 N88D를 함유하였다. 두 번째 뮤테인 패널은 N88D 시리즈와 유사하거나 이보다 약간 더 강력한 효능을 가진 뮤테인을 확인하는 목표로 하여, 모두 단일 점 돌연변이를 가지도록 기획되었다. 예측 된 IL-2Rβ 상호작용 아미노산 (결정 구조, PDB 코드 -2B5I)에 기초하여 24 가지 신호전달 돌연변이 패널이 확인되었다. 특정 치환은 뮤테인과 IL-2Rβ 사이의 결합 자유 에너지의 예측된 감소에 기초하여 선택되었다. 결합 자유 에너지는 EGAD 계산 알고리즘을 사용하여 계산되었다(Handel's Laboratory, University of California at San Diego, USA). 돌연변이체의 결합 자유 에너지는 다음과 같이 정의된다: △△Gmut = μ (△Gmut - △Gwt). 여기서, μ(= 0.1, 일반적으로)는 실험 에너지와 비교하여, 결합 친화력의 예측된 변화 기울기는 1을 갖도록 표준화하는데 사용되는 스케일링 계수이다(Pokala and Handel 2005). 해리 자유 에너지(△G)는 복합체 (△Gbound)와 자유 상태 (△Gfree)간의 에너지 차이로 정의되었다. 각 치환에 있어서 해리 에너지 △Gmut가 산출되었다.
다음의 치환을 갖는 IL-2 뮤테인 패널(H16E, H16Q, L19K, D20R, D20K, D20H, D20Y, M23H, D84K, D84H, S87Y, N88D, N88K, N88I, N88H, N88Y, V91N, V91K, V91H, V91R, I92H, E95K, E95R, 또는 E95I)은 상기 Fc 이종이량체의 C-말단 융합체로 발현되었다. 이들 작제물은 높은 CD25 결합 친화력을 위한 haMut7 돌연변이 (V69A, N71R, Q74P)와 효과적인 폴딩을 위하여 C125A를 또한 함유하였다.
실시예 2의 T 세포 STAT5 인산화 분석에서 효능에 대하여 이들 패널을 스크리닝하였으며, H16E, D84K, V91N, V91K, 및 V91R는 야생형 IL-2보다 적고, N88D보다는 많은 활성을 보유하는 것으로 밝혀졌다 (도 2).
H16E, D84K, V91N, V91K, 및 V91R는 야생형 IL-2보다 적고, N88D보다는 많은 활성을 보유하였다.
선택된 뮤테인은 T 세포 및 NK 성장 분석에서 또한 시험되었다.
T-세포 분석을 위하여, 전체 PBMCs는 100 ng OKT3으로 3 백만/ml에서 활성화되었다. 2일차 시점에, 세포는 3회 세척하고, 5일 동안 새로운 배지에서 방치해두었다. 그 다음, 세포에 CFSE로 표지하고, FACS 분석에 앞서 7일 동안 IL-2 함유 배지에서 웰당 0.5 백만 수준으로 24-개 웰 플레이트에서 추가 배양되었다. T 세포 하위집단의 증식은 도 3에서 CFSE 희석 (정중 CFSE 형광)으로 나타낸다.
NK-세포 분석을 위하여, MACS 분류된 CD16+ NK 세포는 96웰 플레이트에서 웰당 0.1 백만 세포로 3일간 IL-2 함유 배지에서 배양되었다. 배양 최종 18 시간 동안 각 웰에 0.5 μCi 3H-티미딘이 추가되었다. 이들 결과는 도 4에 나타낸다.
돌연변이체 H16E, D84K, V91N, V91K, 및 V91R 돌연변이체는 WT IL-2와 유사하게 Treg 성장을 촉진시킬 수 있었지만, 그러나 다른 T 세포보다는 10x 효능이 적고 (도 3), NK 세포에서는 대략 100x 효능이 적다 (도 4).
Fc 이종이량체와 뮤테인 haMut7 (V69A, N71R, Q74P, C125A) 사이의 거리가 일련의 개별 아미노산 절단에 의해 감소되도록, Fc.IL-2 융합 단백질의 별도 패널이 설계되었다.
Trunc1-Trunc4는 도 2, 3 및 4에서 나타낸 바와 같이, STAT5 인산화 및 T 세포 및 NK 세포 증식에 의해 측정되었을 때, 전장의 부모 작제물 Fc.haMut7와 대등한 효능을 가지고 있었다. Trunc5 및 Trunc6은 반응을 더 약하게 자극하였지만, 여전히 N88D 돌연변이 (haD 및 haMut7D)에 의해 자극된 것보다는 더 강하고, V91K에 의해 자극된 것과 매우 유사하였다. Trunc7은 N88D 뮤테인보다 더 약하였으며, Trunc8은 활성이 거의 없었다. 그러나, NK 세포에서 시험하였을 때, Trunc5와 Trunc6은 V91K보다 더 강한 항진제였고, 이것은 Treg 선택성이 근위 Fc 도메인에 의한 입체 장애보다는 신호전달 돌연변이로 보다 더 용이하게 달성되었음을 나타낸다.
실시예
4 -- Fc
동종이량체에서
높은 CD25 친화력 돌연변이
높은 CD25 결합 친화력을 부여하는 돌연변이는 CD25-높은 T 세포로의 향성(tropism)을 증가시키고, 장기간 CD25::IL-2 뮤테인 연합과 연장된 신호전달을 촉진했기 때문에, 유리한 것으로 간주되었다. 그러나, 돌연변이 수를 줄이면 면역원성이 감소될 수 있다. haMut1 높은 친화력 돌연변이 V69A 및 Q74P를 갖는, 또는 가지지 않는 N88D 또는 V91K 뮤테인은 Fc 동종이량체의 C-말단 융합체로 발현되었으며, 생물활성이 비교되었다. pSTAT5 자극 분석, 상기 동종이량체화는 단량체 뮤테인과 비교하여 신호 강도에서 효과가 없었다. 높은 친화력 돌연변이 V69A 및 Q74P의 복귀 또한 pSTAT5 신호전달에 영향을 주지 못하였다. T 세포 성장 분석에서, 높은 친화력 돌연변이는 통상적인 CD4 T 세포 및 CD8 T 세포에서의 활성은 감소시켰지만, 조절 T 세포에서는 감소가 없었다 (도 5). 높은 친화력 돌연변이는 NK 세포에서 증식 반응 또한 변경시키지 못하였다(도 6).
고친화성 돌연변이가 생체 내에서 T 세포 반응에 영향을 미치는지를 결정하기 위해, 인간화된 마우스 (인간 CD34+조혈 줄기 세포로 재구성된 NOD.SCID.Il2rg-null 마우스)에게 상기 Fc.IL-2 뮤테인 융합 단백질을 투여하고, Treg 증식을 모니터링 하였다. 7주령의 NOD. SCID . Il2rg -null (NSG) 마우스 (Jackson Labs, Bar Harbor, ME) 에게 조사하였고(180 rad), 94,000개의 인간 태아 간 CD34+ 조혈 줄기 세포로 재구성되었다. 21주 시점에, 마우스를 키메라현상(chimerism) (PBL의 유동 세포 측정법에 의해 결정)의 균등 분배에 기초하여 6 개의 군으로 나누고, 0 일차 및 7 일차에 표시된 Fc.뮤테인 융합 단백질 또는 PBS 1㎍을 피하주사를 통하여 투여하였다. 11 일차에, 혈액내 T 세포 하위집단 빈도는 유동 세포 측정법에 의해 측정되었다. 동물 당 1 ㎍의 낮은 용량에서, 고친화성 돌연변이는 N88D 또는 V91K 돌연변이 단독에서 관찰된 것보다 Treg 증식을 개선시키지 못했다(도 7).
FOXP3-CD4+ T 세포가 인간 B 및 T 세포 및 마우스 골수 세포의 혼합물을 포함하는 전체 말초 혈액 백혈구 (PBL)에 비해 풍도를 증가시키지 못하였고, 이점에서 Treg 증식은 선택적이었다. 더욱이, 높은 투여량에서, 높은 친화도 돌연변이는 CD25+FOXP3-T 세포의 증가를 촉진하였으며, 따라서 Treg 선택성은 감소되었다. 따라서, 상기 Fc 동종이량체 관련하여, 높은 친화도 돌연변이는 특이적 Treg 성장을 촉진시키는데 필요하지 않는 것으로 간주되었다.
Fc.WT IgG1Fc(N297G_delK)::G4S::huIL-2(C125A) (서열번호:16)
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Fc . haMut1V91K IgG1Fc(N297G_delK)::G4S::huIL-2(V69A, Q74P, V91K, C125A) (서열번호:17)
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Fc . V91K (또는 Fc .IL-2( V91K )) IgG1Fc(N297G_delK)::G4S::huIL-2(V91K, C125A) (서열번호:18)
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Fc . haMut1N88D IgG1Fc(N297G_delK)::G4S::huIL-2(V69A, Q74P, N88D, C125A) (서열번호:19)
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Fc . N88D (또는 Fc .IL-2( N88D )) IgG1Fc(N297G_delK)::G4S::huIL-2(N88D, C125A) (서열번호:20)
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실시예
5 --
Fc
.IL-2
뮤테인의
연장된 세포 표면 CD25 연합
인간화된 마우스 연구에서 예기치 않은 결과는 신호 전달 능력이 감소되었음에도 불구하고, 뮤테인은 Fc.WT IL-2에 비해 더 강한 Treg 농축을 유도한다는 것이었다. 마우스당 1 ㎍의 투여량 (도 7)과 마우스당 더 낮은 투여량 0.5 ㎍에서 (도 8) Fc.WT에서 볼 수 있는 것과 관련하여 더 큰 Treg 농축과 FOXP3 상향조절이 관찰되었다. 이와 같은 생체 내에서 증가된 효능은 T 세포에 의한 소비 감소로 인한 결과일 수 있으며, 이로써 FMC-2 뮤테인을 장시간 신호 전달에 사용할 수 있다.
그러나, 시험관내 및 생체 내 PK 연구는 투여를 받은 마우스의 혈청 또는 활성화된 T 세포 배양물의 상청액에서 Fc.WT에 비교하여, Fc.V91K 또는 Fc.N88D의 현저하게 증가된 지속성을 입증하지 못하였다. Fc 융합체가 2 개의 IL-2 뮤테인 도메인을 보유하기 때문에, 증가된 엔도좀 재활용은 CD25에 대한 증가된 결합력으로 인하여 세포 표면의 연장된 결합을 초래할 수 있다. 실제로, Fc.V91K 및 Fc.N88D는 융합 단백질의 짧은 노출 후, 이미 활성화된 T 세포의 표면에서 Fc.WT보다 더 효율적으로 지속되는 것으로 밝혀졌다 (도 9a 및 b).
일차(Primary) PBMCs는 2일 동안 100 ng/ml의 OKT3으로 사전-자극되었다. 세포는 회수되고, 4회 세척되고, 배지에서 하룻밤 동안 방치되었다. 그 다음 세포에 400 pM Fc.IL-2를 30분 동안 37℃에서 펄스시켰다. 펄스 후, 세포는 T0에서 한번 세척 후 회수되거나, 또는 12 ml의 따뜻한 배지에서 추가 3회 세척되고, 4 시간동안 배양되었다. 세포-연합된 Fc.IL-2를 탐지하기 위하여, 세포는 항-인간 IgG-FITC (Jackson Immunoresearch, West Grove, PA) 및 항-CD25-APC (도 9a)으로 착색되었다.
Fc.WT와 비교하여 Fc.V91K 및 Fc.N88D의 IL-2R 신호 전달의 지속성은 동일한 시점에서 포스포-STAT5의 세포 내 면역검출에 의해 관찰되었다. FOXP3+CD4+ T 세포에 대한 포스포-STAT5 MFI를 나타낸다 (도 9b).
실시예
6 --
융합체
서열 최적화
마우스의 전임상 연구에서, 고유 분자의 혈청 농도를 순환하는 인간 Fc 이화생성물을 나타내는 인간 Fc 부분만의 혈청 농도와 비교할 때, Fc.IL-2 뮤테인은 차등 노출을 나타내었다. Fc.IL-2 뮤테인의 생체 내 안정성 및 약물동력학을 최적화하기 위하여, 전신 순환 및 세망 내피 시스템을 통한 재순환 동안의 Fc.IL-2 뮤테인의 단백질분해에 미치는 영향에 대하여 융합체 서열 변형이 특징화되었다. 다음 작제물을 시험관내 및 생체 내에서의 단백질 분해에 대해 평가하였다.
시간 경과에 따른 농도를 고유의 Fc.IL-2 뮤테인의 농도와 비교하여 인간 Fc의 농도를 비교함으로써, 정량적 면역분석에 의해 안정성이 측정되었다. Fc.IL-2 뮤테인의 단백질분해는 항-IL-2 및 항-인간 Fc 항체를 사용하는 웨스턴 블롯 분석,이어서 이화생성물의 면역포획 및 질량 분광법에 의한 특성화에 의해 입증되었다. 생체내및 시험관 시료의 (Ala_Ala)_G4S 이화생성물의 질량 분석에 의한 특성 분석에서 단백질 분해 절단 부위로서 Fc 도메인의 C 말단 Lys를 확인했다. 상기 Fc 도메인 ((N297G_delK)_G4S 및 (N297G_KtoA)_AAPT)의 C-말단 리신의 결실 또는 돌연변이로 인하여 C-말단 리신을 갖는 Fc 작제물 ((Ala_Ala)_G4S)와 비교하였을 때, 37℃에서 마우스 혈청의 시험관 안정성이 연장되었다. 이 연장된 시험관 혈청 안정성은 시간에 대한 Fc.IL-2 뮤테인 혈청 농도 곡선 아래 면적(AUC)으로 측정된 바와 같이, 마우스에서 더 큰 노출로 해석되었다. Fc의 C-말단 리신이 결여된 Fc.IL-2 뮤테인의 이와같은 연장된 안정성은 또한 시험관내 시노몰구스 원숭이 및 인간의 혈청에서 또한 관찰되었다. IL-2의 Thr-3가 Ala ((N297G_KtoA)_AAPA)로의 돌연변이로 인하여 마우스 혈청에서 그리고 재조합 인간 카텝신 D 및 L과 별도 배양에서 37℃에서 시험관 안정성이 감소되었다((N297G_KtoA)_AAPT와 비교하여). 이와 같은 시험관 혈청 안정성 감소는 마우스에서 (N297G_KtoA)_AAPT와 비교하여 (N297G_KtoA)_AAPA에 대하여 더 낮은 노출로 해석되었다(AUC). 질량 분광분석에 의해 시험관 및 생체 시료에서 (N297G_KtoA)_AAPA의 이화생성물의 특성분석에서 (N297G_KtoA)_AAPT의 등가 시료에서는 관찰되지 않은 단백질분해에 민감한 잔기로써 IL-2 뮤테인 도메인의 Lys8 및 Lys9를 확인하였다. (N297G_KtoA)_AAPT와 비교하여 (N297G_KtoA)_AAPA의 37°C에서의 안정성 감소는 시험관내 시노몰구스 원숭이 및 인간의 혈청에서 또한 관찰되었다.
이 영역에서 글리코실화의 중요성 및 융합 단백질의 제조 가능성을 잠재적으로 개선하기 위해, 융합체 서열을 다음과 같이 변경하여 O-연결된 글리코실화보다는 N-연결된 글리코실화를 촉진시켰다.
원래
IgG1Fc(N297G_delK)::G4S::huIL-2(V91K,C125A)
(서열번호:32)
변경된 상태
IgG1Fc(N297G_delK)::G4S::huIL-2(T3N,V91K,C125A)
IgG1Fc(N297G_delK)::G4S::huIL-2(T3N,S5T,V91K,C125A)
IgG1Fc(N297G_delK)::GGNGT::huIL-2(T3A,V91K,C125A)
IgG1Fc(N297G_delK)::YGNGT::huIL-2(T3A,V91K,C125A)
실시예
7 -
시노몰구스
원숭이 PK/PD 측정
표준 IL-2 면역 자극 요법은 바람직하지 않은 부작용을 피하기 위해, 투여 주기 사이에 약물이 없는 쉬는 날(노출 없음)이 필요하다. 대조적으로, Treg 증식 또는 자극 요법은 Treg 자극에는 충분한 지속적인 저점(trough) 약물 수준(혈청 Cmin)으로, 그러나 면역 활성화를 유도하는 약물 수준 이하에서 최대 노출 (혈청 Cmax)로 장기간 노출이 필요할 수 있다. 본 실시예는 시노몰구스 원숭이에서 사전염증성 면역 활성화에 필수적인 것으로 간주되는 약물 수준 이하의 최대 노출 (혈청 Cmax)을 유지하면서, 연장된 표적 적용범위(혈청 Cmin)를 위한 반감기-연장된 뮤테인의 투여 전략을 실증한다.
시노몰구스 원숭이의 4개 집단(A-D)에는 Fc.V91K (IgG1Fc(N297G_delK)::G4S::huIL-2(V91K, C125A)를 투여하고, 여기서 세 개 집단(A-C)은 피하로 투여되며, 한 개 집단(D)은 정맥으로 투여된다. 각 집단의 경우, 하기에서 제시된 투여 전략에 따라 4마리의 생물학적으로 순수한 수컷 시노몰구스 원숭이에게 투여된다. 반감기 연장된 뮤테인의 피하 투여는 더 많은 림프 흡수를 허용하여, 더 낮은 최대 노출 (혈청 Cmax) 및/또는 더 강력한 약학적 반응 (Treg 증식)을 초래할 수 있다. 집단 A에 대한 투여 전략은 주기 1에서 0일, 2일 및 4일 차에 3회 연속 10㎍/kg의 투여 분량과 14일차에 10 ㎍/kg을 투여하는 것으로 구성되며, 이로써 더 낮은 최대 노출(Cmax)을 유지하면서, 50 ㎍/kg의 더 높은 초기 투여 분량의 경우와 유사한 연장된 표적 범위가 허용된다. 집단 B의 투여 전략은 집단 A와 비교하였을 때, 0일과 14일 시점에 50 ㎍/kg이 투여된다. 집단 C의 경우 0일과 28일 시점에 투여되는 양은 50 ㎍/kg이다. Treg 농축을 유지하기 위해 저점 범위가 필요한지, 또는 약물 없는 휴일이 투약 주기 간에 유익한 지의 여부를 결정할 수 있다. 정맥내 투여 집단 D의 투여 전략은 0일 시점에 50 ㎍/kg을 투여하고, 이로써 피하 투여군과 최대 노출 (Cmax) 및 Treg 농축 차이의 비교가 가능하다.
다음의 명시된 각 투여 집단에 대하여 다음의 시간대에서 약물동력학 (고유(intact) 분자 및 전체 인간 Fc에 대한 정략적 면역분석), 항-약물 항체, 방출된(shed) 가용성 CD25, 및 혈청 사이토카인 (IL-1β, TNF-α, IFN-γ, IL-10, IL-5, IL-4, 및 IL-13)이 측정되었다:
집단 A: 투여-전 (제1 주기; 투여 1), 48 (투여-전 제1 주기; 투여 2), 96 (투여-전 제1 주기; 투여 3), 100, 104, 120, 168, 216, 264, 336 (투여-전 제2 주기), 340, 344, 360, 408, 456, 504, 576, 672, 744, 840, 및 1008 시간.
집단 B: 투여-전 (제1 주기), 4, 8, 24, 72, 120, 168, 240, 336 (투여-전 제2 주기), 340, 344, 360, 408, 456, 504, 576, 672, 744, 840, 및 1008 시간.
집단 C: 투여-전 (제1 주기), 4, 8, 24, 72, 120, 168, 240, 336, 408, 504, 672 (투여-전 제2 주기), 676, 680, 696, 744, 792, 840, 912, 1008, 1080, 및 1176 시간.
집단 D: 투여-전 (제1 주기), 0.25, 1, 4, 8, 24, 72, 120, 168, 240, 336, 408, 504, 및 672 시간.
다음의 명시된 각 투여 집단에 대하여 다음의 시간대에서 약물력학 (면역표현형확인(immunopheotyping) 및 말초혈액 Tregs, 비-조절 CD4 및 CD8 T 세포, 그리고 NK 세포의 열거)이 측정되었다:
집단 A: 투여-전 (제1 주기; 투여 1), 96 (투여-전 제1 주기; 투여 3), 168, 336 (투여-전 제2 주기), 456, 및 576 시간.
집단 B: 투여-전 (제1 주기), 120, 240, 336 (투여-전 제2 주기), 456, 및 576 시간.
집단 C: 투여-전 (제1 주기), 120, 240, 672 (투여-전 제2 주기), 792, 및 912 시간.
집단 D: 투여-전 (제1 주기), 120 및 240 시간.
투여 집단에서 투여 전, 최초 투여 후 24 시간에 모든 동물 및 투여 군에 대해 혈액학 및 임상 화학을 평가한다. 다음의 매개변수들이 평가된다.
혈액학(Hematology):
*
백혈구 계수 (전체 및 무수(absolute) 차등)
*
적혈구 계수
*
헤모글로빈
*
헤마토크릿
*
평균 미립자(corpuscular) 헤모글로빈, 평균 미립자 체적, 평균 미립자 헤모글로빈 농도(산출된)
*
무수(absolute) 망상적혈구
*
혈소판 계수
*
혈액 세포 형태
*
적혈구 세포 분포 폭
*
평균 혈소판 용적
임상 화학(Clinical Chemistry):
*
알칼리 포스파타제
*
전체 빌리루빈 (전체 빌리루빈이 1 mg/dL을 초과한다면, 직접 빌리루빈)
*
아스파르테이트아미노전달효소
*
알라닌아미노전달효소
*
감마 글루타밀 전달효소
*
요소 질소
*
크레아티닌
*
전체 단백질
*
알부민
*
글로불린과 A/G (알부민/글로불린) 비율 (산출된)
*
글루코스
*
전체 콜레스테롤
*
트라이글리세리드
*
전해질(나트륨, 칼륨, 염화물)
*
칼슘
*
인
실시예
8 -
탈글리코실화된
(
Aglycosylated
)
IgG1
Fc
자연 발생적 IgG 항체는 중쇄 (CH2)의 불변 도메인 2에 글리코실화 부위를 소유한다. 예를 들면, 인간 IgG1 항체는 위치 Asn297 (EU 넘버링)에 위치한 글리코실화 부위를 갖는다. 지금까지, 글리코실화 항체를 제조하는 전략은 물리 화학적 성질에 있어서 Asn 잔기를 모방하는 아미노산 (예: Gln)으로 Asn 잔기를 대체하거나, 또는 극성 기가 없는 Asn 측쇄를 닮은 Ala 잔기로 대체하는 것을 포함한다. 본 실시예는 Asn을 글리신으로 대체할 때(N297G), 유리한 점을 실증하여 보여준다. N297G Fc는 생물물리학적 성질과, 제조가능성 속성(가령, 정제 동안 회수)된 더 개선된 탈글리코실화된 분자이다.
Fc 단편 및 IgG 항체의 다수의 공지된 결정 구조를 조사하면 글리코실화된 루프 세그먼트 주위, 특히, 글리코실화된 Asn297 위치에서 상당한 형태학적 유연성이 드러났다. 공지된 많은 결정 구조에서, Asn297은 양(positive)의 이면(dihedral) 각에 순응되었다. Gly는 측쇄 원자가 없기 때문에, 양(positive)의 기본 2 면각에 순응되는 성향이 크다. 따라서, 이와 같은 입체형태와 구조적 사유에 근거하여, Gly는 N297Q 또는 N297A보다 Asn의 더 유리한 대체물이 될 수 있다.
Asn297를 Gly로 돌연변이시키면 정제 과정 및 생물물리학적 성질에서 회수가 개선된(또는 효율을 갖는) 탈글리코실화된 분자가 된다. 예를 들면, 상기 단백질 A 푸울(pool)로부터 회수 백분율(최종 수율)은 N297Q의 경우 45.6%와 N297A의 경우 39.6%와 비교하여, N297G 돌연변이는 82.6%이었다. SPHP 컬럼 분석은 N297Q 및 N297A 돌연변이의 경우 낮은 회수율은 꼬리형 정점(tailing peak)때문인데, 이것은 고분자량 응집 및/또는 폴딩이 잘못된 종을 나타낸다. 이 결과는 더 큰 2L 규모 운영에서 재확인되었다.
생물 약제 산업에서, 대량 생산 가능성이 요구되는 분자, 예를 들어 약물로 판매될 수 있는 잠재력을 지닌 분자는 이러한 분자가 대규모 생산 및 정제되지 못할 위험을 줄이도록 여러 가지 특성에 대하여 평가된다. 제조 가능성 평가에서, N297G는 pH 변화에 대한 강건함을 보였다. N297G는 응집 문제가 없었고, 반면 N297Q와 N297A는 각각 각각 응집이 20 %와 10 % 증가를 보였다. 비록 N297G는 제조 가능성 특성이 더 우수했지만, 테스트한 모든 기능 분석에서 N297Q 및 N297A와 유사했다. 예를 들면, ADCC 검정에서 N297G는 N297Q 및 N297A와 유사한 세포독성은 없었다.
실시예
9 -안정화된
탈글리코실화
IgG1
Fc
본 실시예는 가공된 이황화결합(들)을 도입함으로써, IgG 항체 골격(scaffolds)의 안정성을 향상시키는 방법을 기술한다. 자연 발생적 IgG 항체는 무변성 분자이다. 그러나, 일부 치료요법적 적용의 경우, 돌연변이를 만들거나 또는 탈글리코실화된 분자로 만들 필요가 있을 수 있다. 예를 들면, 탈글리코실화된 IgG 분자는 ADCC를 피하고, Fc감마 수용체에 결합할 필요가 있는 치료 징후에 사용될 수 있다. 그러나, 상기 탈글리코실화된 IgG1은 글리코실화된 IgG1보다 훨씬 낮은 용융 온도를 갖는다 (CH2 도메인 융융 온도는 약 10℃ 감소하여; 70℃에서 60℃로 낮아짐). 관찰된 더 낮은 용융 온도는 글리코실화된 IgG1의 다양한 생물학적 특성에 부정적으로 영향을 미친다. 예를 들면, 탈글리코실화된 IgG1은 글리코실화된 IgG1과 비교하여 낮은 pH에서 응집 수준이 증가하였다.
이황화결합 결합을 가공하기 위해, C-알파 원자 간의 거리 산출을 포함하는 구조-기반 방법이 초기에 사용하여, Fc 영역에서 Cys으로 돌연변이될 54개 잔기 쌍을 확인하였다. 이들 54개 부위는 다음의 4개 잔기쌍으로 더욱 축소되었다(V259C-L306C, R292C-V302C, A287C-L306C, 및 V323C-I332C). 사용된 기준은 (i) CH2 도메인 내의 위치, (ii) 루프, 턴 및 탄수화물로부터의 떨어져 있고, (iii) Fc감마 수용체 및 FcRn 상호 작용 부위로부터의 떨어져 있고, (iv) 용매 접근성 (바람직한 매립 위치), 등을 포함한다.
탈글리코실화된 N297G Fc에서 쌍을 이룬 시스테인 치환이 생성되었다. 비-환원된 펩티드 맵핑 분석 결과, 4 개의 가공 부위 중 3 개가 이와 관련하여 기획되고, 예상된 바와 같은 이황화결합을 형성한 것으로 드러났다. V259C-L306C 돌연변이는 이황화결합을 정확하게 형성하지 못했고, 이로 인하여 CH2 도메인에 이미 존재하는 고유의 이황화물과의 잘못된 짝형성이 초래되었다. 나머지 세 가지 기획물인 R292C-V302C, A287C-L306C 및 V323C-I332C는 예측되고 설계된 바와 같이 정확하게 이황화결합을 형성하였다. N297G 돌연변이에 이황화결합을 추가하면 N297G 돌연변이 단독과 비교하여 열 안정성은 약 15 ℃ 향상되었다. R292C-V302C, A287C-L306C, 및 V323C-I332C 이황화물 변이체들중에서, R292C-V302C와 A287C-L306C는 래트에게 투여되었을 때, 양호한 약물동력학을 갖는다(각각 t1/2 11 일과 9일). 이것은 이전에 발표된 CH2 도메인 디설파이드 결합에 있어서 래트에서 관찰된 t1/ 2 5일의 약물동력학 프로파일과 대조적이다(Gong 등, J. Biol. Chem. 2009 284 : 14203 - 14210).
CH2 도메인에서 이황화결합을 가공하면, 글리코실화된 IgG1 분자와 동등한 수준으로 탈글리코실화된 분자의 안정성이 향상된다 (시차 주사 열량계로 측정하였을 때, 용융 온도에서 10℃ ~15℃ 향상). 본 명세서에 기재된 가공 부위는 이황화물 스크램블링(scrambling)을 유발하지 않으며, 집단의 약 100 %에서 예측된 바와 같이 이황화물이 형성된다. 더 중요한 것은, CH2 도메인의 공개된 이황화결합 부위와 달리, 본 원에 기재된 이황화결합은 래트의 PK에 영향을 미치지 않는다는 것이다.
실시예 10
시노몰구스 원숭이와 인간의 T 세포 및 NK 세포에서의 반응에 있어서 V91K 및 N88D 돌연변이의 영향을 시험 관내에서 비교하였다. CD25 (전혈 pSTAT5 반응에서 CD4+CD25+ 게이트 T 세포) 존재 하에, 시노몰구스 IL-2R 신호전달에 있어서 V91K 돌연변이의 효과는 인간 IL-2R에서 이의 감소된 활성화 비교하였을 때 무시할 수준이었다. 그러나, CD25 (전혈 pSTAT5 반응 및 NK 세포 증식에서 CD25-게이트 T 세포) 없는 경우, V91K 돌연변이는 시노몰구스 IL-2R 신호전달을 더 실질적으로 감소시켰다. 대조적으로, Fc.N88D는 시노몰구스 전혈의 CD25+ T 세포에서 감소된 신호전달을 보여주었는데, 이는 인간 전혈의 T 세포에서의 Fc.V91K의 신호전달 효과와 더욱 유사하다. 표 2에 요약된 시험관내 자료에 따르면, 시노몰구스 원숭이에서 약한 항진제인 Fc.N88D를 이용하여 관찰된 치료 창은 사람에서 Fc.V91K의 효과를 예측할 수 있다.
표 2. 인간 및
시노몰구스
세포의 시험관 반응에서
V91K
또는
N88D
돌연변이 효과 요약
실시예
-11
2가지 생체내 연구가 시노몰구스 원숭이에서 실행되었다. 첫번째 시노몰구스 원숭이 연구는 Fc.V91K의 2주 및 4주의 투약 간격을 비교하여, 완전한 또는 부분적인 약물동력학 (PK) 및 약물력학 (PD) 저점이 두 번째 투약에 대한 반응의 크기를 변경했는지 확인하기 위해 실시되었다 (도 10a 및 b). 강력한 Treg 반응을 제공하는 것으로 예측된 제 1 투여 (50 ㎍/kg)와 치료 창의 하한을 조사하기 위하여 제2 투여 (10 ㎍/kg)량이 이용되었다. 10 ㎍/kg이 너무 낮은 지 여부는 알려지지 않았기 때문에, 반응의 가능성을 높이기 위하여 1 일, 3 일 및 5 일 시점에 투여되었다. 이 투여 레지멘은 단일 50 ㎍/kg 피하 (SC) 투여로 달성된 것과 같이 5일차 후에 동일한 노출을 제공하지만, C-max는 더 낮았다. 림프 대 혈액 구획에서 더 높은 약물 노출에 따라 PD의 잠재적 차이를 조사하기 위해 50 ㎍/kg 정맥내 주사 (IV) 그룹도 포함되었다. 이 연구의 결과는 각 투여 수준이 부작용없이(AEs), 또는 Teff 또는 NK 성장없이, 강력한 Treg 성장 반응을 유도하고, 14 일 또는 28 일에 2 차 투여로의 반응이 동등하다는 것을 입증했다.
일차 시노몰구스 원숭이 연구를 위한 연구 설계 | |||
집단 | 동물의 수 (#) | 투여 (일) | 투여 Fc . V91K |
1 | 4 | 1, 3, 5, 15 | 10 μg/kg SC |
2 | 4 | 1, 15 | 50 μg/kg SC |
3 | 4 | 1, 29 | 50 μg/kg SC |
4 | 4 | 1 | 50 μg/kg IV |
2차 시노몰구스 원숭이 연구는 1, 3, 100, 200 ㎍/kg (SC)의 Fc.V91K 투여로 치료창의 폭(margins)을 조사하고, 그리고 더 약한 항진제인 Fc.N88D를 3, 10, 100, 200 ㎍/kg (SC) 투여와 PROLEUKIN® 를 3, 10, 30, 100 ㎍/kg (SC QDx5) 투여한 경우와 비교하도록 기획되었다. PROLEUKIN® 투여는 공개된 인간 및 비-인간 영장류 연구 (Hartemann 등, 2013, Lancet Diabetes Endocrin 1:295-305; Saadoun 등, 2011, NEJM 365:2067-77; Aoyama 등, 2012, Am J Transplantation 12:2532-37)에 근거하여 선택되었으며, HCV 혈관염 및 유형 1 당뇨병 (T1D)에서 낮은-투여량의 IL-2 임상 시험을 모방하여 QDx5로 투여되었다.
제2 시노몰구스 원숭이 연구를 위한 연구 설계 | ||||
집단 | 동물의 수 (#) | 테스트 물품 |
1 차
주기 치료
치료 일: 투여 (SC) |
2 차
주기 치료
치료 일: 투여 (SC) |
1 | 4 | PROLEUKIN® | 제1-5일: 3 μg/kg | 제 14-18일: 30 μg/kg |
2 | 4 | PROLEUKIN® | 제 1-5일: 10 μg/kg | 제 14-18일: 100 μg/kg |
3 | 4 | Fc.V91K | 제 1일: 1 μg/kg | 제 14일: 100 μg/kg |
4 | 4 | Fc.V91K | 제 1일: 3 μg/kg | 제 14일: 200 μg/kg |
5 | 4 | Fc.N88D | 제 1일: 3 μg/kg | 제 14일: 100 μg/kg |
6 | 4 | Fc.N88D | 제 1일: 10 μg/kg | 제 14일: 200 μg/kg |
도 11a-f에서 세포의 반응, 체온, 그리고 혈청 CRP의 역동학을 나타낸다. x 축의 타임 라인은 첫 번째 투여 날로 1일차가 아닌 0일차부터 시작한다.
두 개의 시노몰구스 원숭이 연구는 복합적으로 PROLEUKIN®을 사용했을 때 보다 IL-2 뮤테인은 넓은 치료 창을 통해 더 큰 Treg 농축을 유도함을 입증했다(도 12a 및 b). PROLEUKIN®에 의해, Treg 농축은 NK와 호산구 성장과 평행을 이뤘다. 특정 이론에 구속되지 않고, 호산구 성장은 IL-2 치료법에 대응하는 잘 알려진 반응이고, CD25+ 선천성 림프구 세포로부터의 IL-2-유도된 IL-5의 결과일 가능성이 있다. CD4와 CD8 Teff 성장은 Tregs를 CD4 T 세포의 25-35 %로 증가시키는 용량에서 발생했다. 대조적으로, Fc.V91K 및 Fc.N88D는 NK 세포 및 호산구보다 높은 선택성으로 Treg 성장을 유도하였고, Teff 성장을 촉진하였던 투여량은 Treg를 CD4 T 세포의 40 %이상(>)으로 농축시킨 투여양보다 더 높았다.
문헌에서 보고된 저용량 IL-2 임상 시험에서, 발생한 첫 번째 AEs 사례는 독감-유사 증상과 발열이었다. 따라서, 이 연구의 목적은 치료 창을 비교하는 것 외에도, 발열에 선행되는 생물표지자(biomarker)를 찾는 것이었다. 도 12c에 도시 된 바와 같이, 2가지 더 높은 투여량의 PROLEUKIN®로 CRP 수치가 체온과 평행을 이루는 것으로 나타났다. Fc.V91K의 경우, 가장 높은 투여량에서 체온의 적당한 상승이 검출되었고, 그 다음의 낮은 투여량에서는 CRP의 소규모 증가가 관찰되었다. 따라서 CRP는 본 발명의 분자로의 치료에 대한 환자의 반응을 모니터링하고 및/또는 환자에서 투여량 상한을 정의하는데 사용될 수 있다.
PROLUKIN® 처리된 동물에서 Fc.V91K-또는 Fc.N88D 처리된 동물에서는 덜 나타나거나 또는 존재하지 않았던 일부 독성이 또한 관찰되었다(도 12d). PROLEUKIN®으로 치료하였을 때, 혈소판, 호중구 및 알부민의 수준이 모두 감소하는 것으로 나타났고 한편, 유사하거나 더 큰 으로 이어진 Fc.V91K 또는 Fc.N88D의 투여는 유사하거나 더 큰 수준으로 Treg 농축시키지만, 이러한 변수들은 거의 감소되지 않았거나, 또는 전혀 감소되지 않았다. 종합하면, 이 데이터로부터 Fc.V91K-또는 Fc.N88D를 이용한 환자의 치료 창은 PROLEUKIN®보다 유의적으로 더 클 것으로 예상된다.
실시예
-12
선택된 시점에서, 실시예 11의 제1 시노몰구스 연구의 혈청을 항-약물 항체 (ADA)에 대하여 조사하였다 (도 13). 경쟁에 의해 Fc.V91K 특이성이 확인된 시료에 대한 ADA 신호/노이즈 데이터를 보여준다. ADA가 검사되는 시점은 x 축 위의 수직선으로 표시된다. 집단 1에서 한 동물은 마지막 투여 후 최소 15 일 후 ADA를 만들었고, 집단 2에서는 ADA에 대하여 양성인 동물이 없었고, 집단 3에서 ADA는 첫 번째 투여 후 15 일 또는 그 이후 3 마리의 동물에게 지속적으로 나타났다. 162 일째에 집단 1과 집단 2에 50㎍/kg을 반복 투여한 결과, 4 주 후(190일차)에 ADA 검사에서 양성으로 판정받은 동물은 없었다. 가장 강한 ADA 신호를 생성하는 집단 3의 두마리 동물 (210, 212)은 이들에서 두 번째 투여 후 관찰된 감소된 C-max와 일관하는 감소된 PD 반응을 나타냈다. 네 번째 집단 (50 ㎍/kg IV)의 동물에서 ADA 검사에서 양성인 동물은 없었다. ADA는 IL-2 및 Fc 영역 모두에 대하여 특이적이었는데, 이는 시노몰구스 IL-2와 인간 IL-2 (V91K, C125A) 사이의 8 개 아미노산 차이 때문인 것으로 예상된다. ADA의 중화 활성은 시험되지 않았다.
실시예
13
본 실시예는 본 발명의 원리가 IL-2R 신호전달을 원하는 수준으로 유도하는 IL-2 뮤테인을 설계하고, 이를 확인하는데 사용될 수 있음을 예증한다.
IL-2Rβ 결합과 IL-2R 신호 강도를 부분적으로 감쇠시키는 IL-2 돌연변이를 찾기 위하여, IL-2 돌연변이에 의해 IL-2와 IL-2Rβ 사이의 결합 에너지 감소 수준을 산출하는 컴퓨터 알고리즘을 적용하였다. IL-2:IL-2Rα:IL-2Rβ:γc (PDB ID: 2B5I (Wang 등, 2005, Science 310(5751):1159-63))의 구조를 이용하여 구조-유도된 전산 예너지 산출에 근거된 64가지 변이체를 추천하도록 전산 알고리즘의 입력값으로 사용되었다. 요약하면, 이들 단계는 (i) 에너지 산출을 위하여 IL-2와 이의 수용체 복합 구조를 만들고, (ii) 다른 19개 자연-생성 아미노산의 돌연변이를 위한 상기 IL-2:IL-2Rβ 경계에서 접촉면 잔기를 확인하고, (iii) 상이한 2가지 전산 알고리즘을 이용하여 돌연변이 에너지 산출을 실시하고, 그리고 (iv) 산출된 에너지 값, 아미노산의 형태 그리고 기존의 경험 및 지식을 이용하여 뮤테인을 선택하는 것들을 포함한다.
상기 IL-2:IL-2Rα:IL-2Rβ:γc 구조는 모든 물 분자의 결실, 누락된 원자의 좌표 생성, 및 CHARMm 역장(force field)을 이용하는 내재 (GBIM) 용매 모델에서 복잡체 구조의 에너지 최소화를 통하여 만들었다. 상기 단계들은 ACCELRYS® (BIOVIA, San Diego, CA)의 Discovery Studio 소프트웨어에서 실행되었다.
상기 복합체 구조로부터 상기 IL-2: IL-2Rβ 접촉면에 있는 다음의 IL-2 잔기들이 확인되었고, 인실리코(in silico) 돌연변이유발 산출에 선택되었다: L12, Q13, E15, H16, L19, D20, M23, R81, D84, S87, N88, V91, I92, L94, 및 E95. 인실리코(in silico) 돌연변이유발은 Discovery Studio 소프트웨어의 "Calculate Mutation Energy (Binding)" 프로토콜을 이용하여 실행되었다. 이 프로토콜은 결합 자유 에너지, △△Gbinding 에서의 변화(즉, [IL-2Rβ에 대한 돌연변이체 IL-2의 결합 자유 에너지] - [IL-2Rβ에 대한 야생형 IL-2의 결합 자유 에너지])를 산출한다. 상기 △△Gbinding 값은 내재 용매 모델 (Generalized Born with Implicit Membrane)에서 산출되었다. 각 뮤테인 안에 잔기의 넘버링은 야생형 인간 IL-2 (서열번호:1)의 서열에 관련된다:
Ala Pro Thr Ser Ser Ser Thr Lys Lys Thr Gln Leu Gln Leu Glu His
1 5 10 15
Leu Leu Leu Asp Leu Gln Met Ile Leu Asn Gly Ile Asn Asn Tyr Lys
20 25 30
Asn Pro Lys Leu Thr Arg Met Leu Thr Phe Lys Phe Tyr Met Pro Lys
35 40 45
Lys Ala Thr Glu Leu Lys His Leu Gln Cys Leu Glu Glu Glu Leu Lys
50 55 60
Pro Leu Glu Glu Val Leu Asn Leu Ala Gln Ser Lys Asn Phe His Leu
65 70 75 80
Arg Pro Arg Asp Leu Ile Ser Asn Ile Asn Val Ile Val Leu Glu Leu
85 90 95
Lys Gly Ser Glu Thr Thr Phe Met Cys Glu Tyr Ala Asp Glu Thr Ala
100 105 110
Thr Ile Val Glu Phe Leu Asn Arg Trp Ile Thr Phe Cys Gln Ser Ile
115 120 125
Ile Ser Thr Leu Thr
130
선택된 IL-2 잔기 모두는 19 개의 다른 아미노산으로 돌연변이되었고, 이로 인하여 299 개의 단일 아미노산 치환 변이체이 유도되었다. 각 변이체들에 대한 △△Gbinding 값은 상기에서 설명된 바와 같이 산출되었다. 산출된 △△Gbinding 값은 도 14에 보고된다. 선택된 돌연변이가 △△Gbinding 값 > 1.5 kcal/mol을 유도하고 프롤린 잔기를 도입하지 않는 변이체를 선택하였다. 다양성을 증가시키기 위해, 돌연변이가 △△Gbinding> 1.5 kcal/mol 로 유도되지 않은 위치(예 : L12)의 경우 △△Gbinding> 1.0 kcal/mol을 가진 돌연변이를 선택하였다.
상기 IL-2:IL-2Rα:IL-2Rβ:γc 구조는 모든 물 분자의 결실, 누락된 원자의 좌표 생성, 및 OPLS 2005 역장(force field) (Banks et al., 2005, J Comp Chem 26:1752)을 이용하는 구조의 에너지 최소화를 통하여 만들었다. 상기 단계들은 BIOLUMINATE® 소프트웨어 (Schrodinger, New York, NY)에서 실행되었다.
상기 복합체 구조로부터 상기 IL-2: IL-2Rβ 접촉면에 있는 다음의 IL-2 잔기들이 확인되었고, 인실리코(in silico) 돌연변이유발 산출에 선택되었다: L12, Q13, E15, H16, L19, D20, M23, R81, D84, S87, N88, V91, I92, L94, E95. 인실리코(in silico) 돌연변이유발은 BIOLUMINATE®의 "Residue Scanning" 특징을 이용하여 실행되었다. 산출된 △△Gbinding 값은 도 15에 보고된다.
예상 △△Gbinding 값을 이용하여, 다음의 기준에 따라 변이체들이 선택되었다: 선택된 돌연변이는 프롤린 잔기를 도입시키지 않으며; 선택된 돌연변이는 Discovery Studio 소프트웨어에 의해 이미 추천된 것이 아니며; 선택된 돌연변이는 △△Gbinding값 > 10 kcal/mol을 유도하며; 선택된 돌연변이는 히스티딘 잔기를 도입시키지 않는다 (BIOLUMINATE® 에 의해 히스티딘 잔기로의 돌연변이 경우에 산출된 △△Gbinding 값은 신뢰할 수 없다는 것이 밝혀졌다).
돌연변이 D20E, V91D, 및 I92W가 BIOLUMINATE®에서 추천한 새로운 변이체이며, Discovery Studio 소프트웨어에 의해 추천된 57개 변이체 목록에 추가되었다. 변이체들 L12K, L12Q, L19R 및 L19N들 또한 최종 분석에 포함되어, 다음과 같은 목록이 생성되었다: D20A, D20E, D20F, D20G, D20W, D84A, D84E, D84G, D84I, D84M, D84Q, D84R, D84S, D84T, E15A, E15G, E15S, E95G, H16A, H16D, H16G, H16K, H16M, H16N, H16R, H16S, H16T, H16V, H16Y, I92K, I92R, L12G, L12K, L12Q, L12S, L19A, L19D, L19E, L19G, L19N, L19R, L19S, L19T, L19V, M23R, N88A, N88D, N88E, N88F, N88G, N88M, N88R, N88S, N88V, N88W, Q13G, R81A, R81G, R81S, R81T, S87R, V91D, V91E, V91G, V91K, 및 V91S. 모든 IL-2 뮤테인은 또한 제조 가능성 향상을 위하여 C125A 돌연변이를 포함하고 있다.
IgG1 Fc (N297G)의 C-말단에 융합된(G4S 링커에 의해 분리된) 66 개의 IL-2 뮤테인의 패널은 사전활성화되고, 휴지된 인간 T 세포에 대한 IL-2R 자극에 대해 시험하였다(도 16). 도 16a에 나타낸 바와 같이, 33pM은 모든 뮤테인에 대해 최적 이하의 농도였고, 따라서 뮤테인의 활성은 이 농도에서 pSTAT5 MFI에 기초하여 평가되었다. 두 가지 PBMC 공여자에 대한 순위는 도 16b에 도시되어있다. 상기에서 나타낸 바와 같이, Treg는 감쇠된(attenuated) IL-2 뮤테인에 대하여 우선적으로 반응하기 때문에, 이 패널을 사용하여 최적의 Treg 선택성을 유도하는 IL-2R 신호전달의 상한 및 하한을 정의할 수 있다.
실시예
14
상청액 분획으로 얻은 초기 pSTAT5 신호전달 데이터로부터 발현, 정제 및 추가 평가를 위해 구조의 보다 작은 패널을 선택하였다. 이들 각각 분자는 Fc.IL-2-G4S 링커-IL-2 뮤테인을 포함하고, 여기서 각각의 뮤테인은 C125A와, 다음 돌연변이중 하나를 포함한다: D20E, D20G, D20W, D84A, D84S, H16D, H16G, H16K, H16R, H16T, H16V, I92K, I92R, L12K, L19D, L19N, L19T, N88D, N88R, N88S, V91D, V91G, V91K, V91S, 또는 추가 돌연변이 없음 ("WT"). 이러한 정제된 분자는 사전-자극되고 휴지된 인간 T 세포에서 STAT5 인산화를 활성화시키는 능력에 대해 시험하였다 (도 17). Fc.IL-2 뮤테인은 또한 T 세포 하위집단의 증식을 자극하고, FOXP3 발현을 증가시키는 능력(도 18) 및 NK 세포 증식을 자극하는 능력(도 19)에 대해 시험하였다.
Fc.IL-2 뮤테인은 T 세포의 표면상에서 CD25 (IL-2Rα)에 결합하는 능력 및 다양한 시점에서 세포 표면 CD25에 결합된 상태로 유지되는 능력에 대하여 시험되었다(도 20). Fc.IL-2 뮤테인이 T 세포에서 STAT5 인산화를 자극하는 정도 (도 17)는 세포 표면 유지에 대하여 높은 음의 상관 관계 (r = -0.87)를 나타내고, 이것은 IL-2Rβγ를 통한 신호 전달에 의한 내화(internalization) 속도와 밀접하게 연관되어 있음을 나타낸다.
병행 실험에서, pSTAT5 신호전달의 지속성은 상이한 시간 지점에서 포스포-STAT의 세포 내 면역검출에 의해 관찰되었다. FOXP3+CD25+CD4+ T 세포의 포스포-STATS MFI는 도 21에 나타낸다. 이러한 결과로부터 중간수준의 신호전달 강도를 갖는 특정 뮤테인(가령, H16T, H16K, H16R, L19N, L19D, D20T, N88D, N88R, N88S, V91D, V91G, V91K, V91S)이 나중 시점에 까지 pSTAT5 신호전달의 유지에 있어서 Fc.WT IL-2보다 더 효과적이라는 것이 입증되었다. 길항제 뮤테인 (D20W)을 제외하고, IL-2R 신호전달 유지는 세포 표면 유지와 연관되는 경향이 있었지만; 그러나, 높은 표면 유지를 나타내는 일부 약한 뮤테인(예를 들어, D20G 및 D20T)은 IL-2R 신호 전달을 유지하는데 가장 효과적인 것은 아니었다 (도 22).
생체 내에서 어떻게 상이한 Fc.IL-2 뮤테인들이 Treg 빈도를 증가시키는 지를 측정하기 위하여, 인간화 마우스 (CD34+ 조혈 줄기 세포로 4 개월 전에 재구성된 NSG 마우스)에 표시된 뮤테인을 투여하고, Treg 농축을 4 일째 혈액에서 측정하였다(도 23a). Treg 농축 정도는 증식된 pSTAT5 신호를 전달할 수 있는 능력과 가장 밀접한 상관 관계가 있는 것으로 나타났고(도 23b), 위치 V91에서의 치환은 생체 내에서 Treg 농축 및 시험관내에서 IL-2R 신호전달 유지를 증가시키는데 특히 효과적이었다.
실시예
15
XENOMOUSE® (Amgen Inc., Thousand Oaks, CA) 마우스에서 일련의 인간 항-인간 IL-2 항체가 생성되었고, ELISA 검정에서 인간 및 시노몰구스 원숭이 IL-2 모두에 결합하는 능력에 근거하여 선택되었다. 이들의 경쇄 및 중쇄 가변 도메인 아미노산 서열과 핵산 서열은 도 26-29에서 나타낸다.
DERL-2 세포 (IL-2 수용체 α/β/γ 양성) 및 NKL 세포 (IL-2 수용체 α/β/γ 양성)에 의한 IL-2 반응을 억제시키는 능력에 대하여 이들 항체를 스크리닝하였다. 추가 분석용으로 DERL2 세포에 대한 높은 억제 활성 및 NKL 세포에 대한 중등도 내지 낮은 활성을 나타내는 항체를 선택하였다. 만족스럽게 제작하는 것이 훨씬 더 어려운 자매 클론 및 mAb를 제거하기 위해 클론을 서열화하였다. 결합 교차 저해 연구가 수행되었고, 항체는 8 개의 빈(bin)으로 분류되었다. 시험된 모든 XENOMOUSE® 항체는 A, B, C, D, E, 및 E.1 빈(bin)에 속하였다. B, C, E 및 E.1 빈(bin)에 있는 항체들은 인간 IL-2가 인간 IL2Rα에 결합하는 것을 간섭하였고, 반면 A 및 D 빈(bin)의 항체들은 간섭하지 않았다. F 빈(bin)은 대조 항체로 규정되며, 대조 항체는 인간 IL-2에 결합하여도 상기 IL-2 수용체 α에 사이토카인이 결합하는 것을 방해하지 않으며, G 빈(bin)은 대조 항체 5344.111 (Cat. No. 555051, BD Biosciences, San Jose, CA)로 규정되었다. 시험된 XENOMOUSE® 항체중 F 또는 G(bin)에 속하는 것은 없다.
BIACORE® (GE Healthcare Bio-Sciences, Pittsburgh, PA) 분석을 이용하여 각 항체에 있어서 운동 매개변수 KD, kon 및 kdis 또한 규정되었다. 모든 빈(bin)의 대표물과 KD및 kdis값의 범위를 포함하여 클론의 다양성을 나타내는 36 개의 항체의 하위집합이 선택되었다. 이들 클론 모두 인간 전혈 림프구에서 비-Treg CD4 T 세포 (nTr), CD8 T 세포 (CD8) 또는 자연 살해 (NK ) 세포보다 조절 T 세포 (Treg)에서 더 높은 IC50 값으로 IL-2 신호전달을 저해하였다(여기에서 더 높은 IC50 값은 저해 효과가 적다는 것을 나타낸다).
인간 줄기 세포로 재구성된 NSG SCID/Hu 마우스에서 항-IL-2 항체/hIL-2 면역복합체 (1:2 몰 비율의 항체: hIL-2)의 일부분으로 36개 항체는 저용량 야생형 IL-2.Fc, 모델 IL-2 뮤테인 N88D.Fc, 5344.111 마우스 항-인간 IL-2/hIL-2 복합체 및 PBS-처리된 대조군 마우스와 비교하여, nTr, NK 및 CD8 세포보다 Treg를 증식시키는 능력에 대하여 시험하였다. Treg/NK 및 Tr/nTr 비율을 이용하여 효과기 세포와 비교하여 Treg를 선택적으로 증식시키는 XENOMOUSE® 항체의 상대적 능력을 평가하였다 (비율은 모든 항체를 분석하는데 필요한 여러 실행 사이의 비교 가능성을 허용하기 위해 PBS-처리된 마우스에 대하여 관찰된 값으로 표준화되었다). 항체 중 12 개가 5344.111/IL-2 대조와 대등하거나 더 우수하였다. 이들의 특성은 표 5에서 열거되어 있으며, 도 30에 나타낸다.
빈 | Hu WB pSTAT5 IC50 vs | ||||
항체 | Treg | 비Treg CD4 | CD8 | NK | |
9B10 | A | 200 | 38 | 23 | 79 |
14G7 | B | 61 | 64 | 44 | 54 |
26C12 | B | 302 | 224 | 283 | 370 |
26H7 | B | 25 | 22 | 16 | 259 |
2H11 | B | 106 | 42 | 49 | 18 |
9D6 | B | 29 | 21 | 16 | 23 |
18F3 | C | 42 | 25 | 21 | 181 |
2C3 | D | 184 | 132 | 79 | 152 |
8F10 | D | 158 | 30 | 20 | 24 |
14D7 | E | 668 | 244 | 144 | 293 |
21F8 | E | 61 | 64 | 44 | 54 |
22B9 | E.1 | 813 | 137 | 276 | - |
표 6: 항-IL-2 항체의 운동 성질
SEQUENCE LISTING
<110> AMGEN INC.
BUTZ, Eric Alan
THOMSON, Christy Ann
GAVIN, Marc Alain
FOLTZ, Ian Nevin
XIA, Dong
ALCORN, Dina N.
LIM, Ai Ching
KETCHEM, Randal Robert
MANCHULENKO, Kathy
SEKIROV, Laura
BERRY, Kelly Ann
DE IMUS, Cyr Clovis Chua
AGRAWAL, Neeraj Jagdish
KANNAN, Gunasekaran
LI, Li
<120> INTERLEUKIN-2 MUTEINS FOR THE EXPANSION OF T-REGULATORY CELLS
<130> A-1935-WO-PCT
<140> PCT/US16/30843
<141> 2016-05-04
<150> 62/146,136
<151> 2015-04-10
<160> 308
<170> PatentIn version 3.5
<210> 1
<211> 133
<212> PRT
<213> Homo sapiens
<400> 1
Ala Pro Thr Ser Ser Ser Thr Lys Lys Thr Gln Leu Gln Leu Glu His
1 5 10 15
Leu Leu Leu Asp Leu Gln Met Ile Leu Asn Gly Ile Asn Asn Tyr Lys
20 25 30
Asn Pro Lys Leu Thr Arg Met Leu Thr Phe Lys Phe Tyr Met Pro Lys
35 40 45
Lys Ala Thr Glu Leu Lys His Leu Gln Cys Leu Glu Glu Glu Leu Lys
50 55 60
Pro Leu Glu Glu Val Leu Asn Leu Ala Gln Ser Lys Asn Phe His Leu
65 70 75 80
Arg Pro Arg Asp Leu Ile Ser Asn Ile Asn Val Ile Val Leu Glu Leu
85 90 95
Lys Gly Ser Glu Thr Thr Phe Met Cys Glu Tyr Ala Asp Glu Thr Ala
100 105 110
Thr Ile Val Glu Phe Leu Asn Arg Trp Ile Thr Phe Cys Gln Ser Ile
115 120 125
Ile Ser Thr Leu Thr
130
<210> 2
<211> 133
<212> PRT
<213> Homo sapiens
<220>
<221> MISC_FEATURE
<222> (125)..(125)
<223> Wherein X is C, S, V, or A
<400> 2
Ala Pro Thr Ser Ser Ser Thr Lys Lys Thr Gln Leu Gln Leu Glu His
1 5 10 15
Leu Leu Leu Asp Leu Gln Met Ile Leu Asn Gly Ile Asn Asn Tyr Lys
20 25 30
Asn Pro Lys Leu Thr Arg Met Leu Thr Phe Lys Phe Tyr Met Pro Lys
35 40 45
Lys Ala Thr Glu Leu Lys His Leu Gln Cys Leu Glu Glu Glu Leu Lys
50 55 60
Pro Leu Glu Glu Val Leu Asn Leu Ala Gln Ser Lys Asn Phe His Leu
65 70 75 80
Arg Pro Arg Asp Leu Ile Ser Asn Ile Asn Val Ile Val Leu Glu Leu
85 90 95
Lys Gly Ser Glu Thr Thr Phe Met Cys Glu Tyr Ala Asp Glu Thr Ala
100 105 110
Thr Ile Val Glu Phe Leu Asn Arg Trp Ile Thr Phe Xaa Gln Ser Ile
115 120 125
Ile Ser Thr Leu Thr
130
<210> 3
<211> 227
<212> PRT
<213> Homo sapiens
<400> 3
Asp Lys Thr His Thr Cys Pro Pro Cys Pro Ala Pro Glu Leu Leu Gly
1 5 10 15
Gly Pro Ser Val Phe Leu Phe Pro Pro Lys Pro Lys Asp Thr Leu Met
20 25 30
Ile Ser Arg Thr Pro Glu Val Thr Cys Val Val Val Asp Val Ser His
35 40 45
Glu Asp Pro Glu Val Lys Phe Asn Trp Tyr Val Asp Gly Val Glu Val
50 55 60
His Asn Ala Lys Thr Lys Pro Arg Glu Glu Gln Tyr Asn Ser Thr Tyr
65 70 75 80
Arg Val Val Ser Val Leu Thr Val Leu His Gln Asp Trp Leu Asn Gly
85 90 95
Lys Glu Tyr Lys Cys Lys Val Ser Asn Lys Ala Leu Pro Ala Pro Ile
100 105 110
Glu Lys Thr Ile Ser Lys Ala Lys Gly Gln Pro Arg Glu Pro Gln Val
115 120 125
Tyr Thr Leu Pro Pro Ser Arg Glu Glu Met Thr Lys Asn Gln Val Ser
130 135 140
Leu Thr Cys Leu Val Lys Gly Phe Tyr Pro Ser Asp Ile Ala Val Glu
145 150 155 160
Trp Glu Ser Asn Gly Gln Pro Glu Asn Asn Tyr Lys Thr Thr Pro Pro
165 170 175
Val Leu Asp Ser Asp Gly Ser Phe Phe Leu Tyr Ser Lys Leu Thr Val
180 185 190
Asp Lys Ser Arg Trp Gln Gln Gly Asn Val Phe Ser Cys Ser Val Met
195 200 205
His Glu Ala Leu His Asn His Tyr Thr Gln Lys Ser Leu Ser Leu Ser
210 215 220
Pro Gly Lys
225
<210> 4
<211> 226
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic Polypeptide
<400> 4
Asp Lys Thr His Thr Cys Pro Pro Cys Pro Ala Pro Glu Leu Leu Gly
1 5 10 15
Gly Pro Ser Val Phe Leu Phe Pro Pro Lys Pro Lys Asp Thr Leu Met
20 25 30
Ile Ser Arg Thr Pro Glu Val Thr Cys Val Val Val Asp Val Ser His
35 40 45
Glu Asp Pro Glu Val Lys Phe Asn Trp Tyr Val Asp Gly Val Glu Val
50 55 60
His Asn Ala Lys Thr Lys Pro Arg Glu Glu Gln Tyr Asn Ser Thr Tyr
65 70 75 80
Arg Val Val Ser Val Leu Thr Val Leu His Gln Asp Trp Leu Asn Gly
85 90 95
Lys Glu Tyr Lys Cys Lys Val Ser Asn Lys Ala Leu Pro Ala Pro Ile
100 105 110
Glu Lys Thr Ile Ser Lys Ala Lys Gly Gln Pro Arg Glu Pro Gln Val
115 120 125
Tyr Thr Leu Pro Pro Ser Arg Glu Glu Met Thr Lys Asn Gln Val Ser
130 135 140
Leu Thr Cys Leu Val Lys Gly Phe Tyr Pro Ser Asp Ile Ala Val Glu
145 150 155 160
Trp Glu Ser Asn Gly Gln Pro Glu Asn Asn Tyr Lys Thr Thr Pro Pro
165 170 175
Val Leu Asp Ser Asp Gly Ser Phe Phe Leu Tyr Ser Lys Leu Thr Val
180 185 190
Asp Lys Ser Arg Trp Gln Gln Gly Asn Val Phe Ser Cys Ser Val Met
195 200 205
His Glu Ala Leu His Asn His Tyr Thr Gln Lys Ser Leu Ser Leu Ser
210 215 220
Pro Gly
225
<210> 5
<211> 5
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic Polypeptide
<400> 5
Gly Gly Gly Gly Ser
1 5
<210> 6
<211> 5
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic Polypeptide
<400> 6
Gly Gly Asn Gly Thr
1 5
<210> 7
<211> 5
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic Polypeptide
<400> 7
Tyr Gly Asn Gly Thr
1 5
<210> 8
<211> 133
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic Polypeptide
<400> 8
Ala Pro Thr Ser Ser Ser Thr Lys Lys Thr Gln Leu Gln Leu Glu His
1 5 10 15
Leu Leu Leu Asp Leu Gln Met Ile Leu Asn Gly Ile Asn Asn Tyr Lys
20 25 30
Asn Pro Lys Leu Thr Arg Met Leu Thr Phe Lys Phe Tyr Met Pro Lys
35 40 45
Lys Ala Thr Glu Leu Lys His Leu Gln Cys Leu Glu Glu Glu Leu Lys
50 55 60
Pro Leu Glu Glu Ala Leu Asn Leu Ala Pro Ser Lys Asn Phe His Leu
65 70 75 80
Arg Pro Arg Asp Leu Ile Ser Asp Ile Asn Val Ile Val Leu Glu Leu
85 90 95
Lys Gly Ser Glu Thr Thr Phe Met Cys Glu Tyr Ala Asp Glu Thr Ala
100 105 110
Thr Ile Val Glu Phe Leu Asn Arg Trp Ile Thr Phe Ala Gln Ser Ile
115 120 125
Ile Ser Thr Leu Thr
130
<210> 9
<211> 133
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic Polypeptide
<400> 9
Ala Pro Thr Ser Ser Ser Thr Lys Lys Thr Gln Leu Gln Leu Glu His
1 5 10 15
Leu Leu Leu Asp Leu Gln Met Ile Leu Asn Gly Ile Asn Ser Tyr Lys
20 25 30
Asn Pro Lys Leu Thr Arg Met Leu Thr Phe Lys Phe Tyr Met Pro Lys
35 40 45
Lys Ala Thr Glu Leu Lys His Leu Gln Cys Leu Glu Glu Glu Leu Lys
50 55 60
Pro Leu Glu Glu Ala Leu Asn Leu Ala Pro Ser Lys Asn Phe His Leu
65 70 75 80
Arg Pro Arg Asp Leu Ile Ser Asp Ile Asn Val Ile Val Leu Glu Leu
85 90 95
Lys Gly Ser Glu Thr Thr Phe Met Cys Glu Tyr Ala Asp Glu Thr Ala
100 105 110
Thr Ile Val Glu Phe Leu Asn Arg Trp Ile Thr Phe Ala Gln Ser Ile
115 120 125
Ile Ser Thr Leu Thr
130
<210> 10
<211> 133
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic Polypeptide
<400> 10
Ala Pro Thr Ser Ser Ser Thr Lys Lys Thr Gln Leu Gln Leu Glu His
1 5 10 15
Leu Leu Leu Asp Leu Gln Met Ile Leu Asn Gly Ile Asn Asn Tyr Lys
20 25 30
Asn Pro Arg Leu Thr Arg Met Leu Thr Phe Lys Phe Tyr Met Pro Lys
35 40 45
Lys Ala Thr Glu Leu Lys His Leu Gln Cys Leu Glu Glu Glu Leu Lys
50 55 60
Pro Leu Glu Glu Ala Leu Asn Leu Ala Pro Ser Lys Asn Phe His Leu
65 70 75 80
Arg Pro Arg Asp Leu Ile Ser Asp Ile Asn Val Ile Val Leu Glu Leu
85 90 95
Lys Gly Ser Glu Thr Thr Phe Met Cys Glu Tyr Ala Asp Glu Thr Ala
100 105 110
Thr Ile Val Glu Phe Leu Asn Arg Trp Ile Thr Phe Ala Gln Ser Ile
115 120 125
Ile Ser Thr Leu Thr
130
<210> 11
<211> 133
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic Polypeptide
<400> 11
Ala Pro Thr Ser Ser Ser Thr Lys Lys Thr Gln Leu Gln Leu Glu His
1 5 10 15
Leu Leu Leu Asp Leu Gln Met Ile Leu Asn Gly Ile Asn Asn Tyr Lys
20 25 30
Asn Pro Lys Leu Ala Arg Met Leu Thr Phe Lys Phe Tyr Met Pro Lys
35 40 45
Lys Ala Thr Glu Leu Lys His Leu Gln Cys Leu Glu Glu Glu Leu Lys
50 55 60
Pro Leu Glu Glu Ala Leu Asn Leu Ala Pro Ser Lys Asn Phe His Leu
65 70 75 80
Arg Pro Arg Asp Leu Ile Ser Asp Ile Asn Val Ile Val Leu Glu Leu
85 90 95
Lys Gly Ser Glu Thr Thr Phe Met Cys Glu Tyr Ala Asp Glu Thr Ala
100 105 110
Thr Ile Val Glu Phe Leu Asn Arg Trp Ile Thr Phe Ala Gln Ser Ile
115 120 125
Ile Ser Thr Leu Thr
130
<210> 12
<211> 133
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic Polypeptide
<400> 12
Ala Pro Thr Ser Ser Ser Thr Lys Lys Thr Gln Leu Gln Leu Glu His
1 5 10 15
Leu Leu Leu Asp Leu Gln Met Ile Leu Asn Gly Ile Asn Asn Tyr Lys
20 25 30
Asn Pro Lys Leu Thr Arg Met Leu Thr Phe Lys Phe Tyr Met Pro Glu
35 40 45
Lys Ala Thr Glu Leu Lys His Leu Gln Cys Leu Glu Glu Glu Leu Lys
50 55 60
Pro Leu Glu Glu Ala Leu Asn Leu Ala Pro Ser Lys Asn Phe His Leu
65 70 75 80
Arg Pro Arg Asp Leu Ile Ser Asp Ile Asn Val Ile Val Leu Glu Leu
85 90 95
Lys Gly Ser Glu Thr Thr Phe Met Cys Glu Tyr Ala Asp Glu Thr Ala
100 105 110
Thr Ile Val Glu Phe Leu Asn Arg Trp Ile Thr Phe Ala Gln Ser Ile
115 120 125
Ile Ser Thr Leu Thr
130
<210> 13
<211> 133
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic Polypeptide
<400> 13
Ala Pro Thr Ser Ser Ser Thr Lys Lys Thr Gln Leu Gln Leu Glu His
1 5 10 15
Leu Leu Leu Asp Leu Gln Met Ile Leu Asn Gly Ile Asn Asn Tyr Lys
20 25 30
Asn Pro Lys Leu Thr Arg Met Leu Thr Phe Lys Phe Tyr Met Pro Lys
35 40 45
Lys Ala Thr Glu Leu Lys His Leu Gln Cys Leu Glu Glu Glu Leu Lys
50 55 60
Pro Leu Glu Asp Ala Leu Asn Leu Ala Pro Ser Lys Asn Phe His Leu
65 70 75 80
Arg Pro Arg Asp Leu Ile Ser Asp Ile Asn Val Ile Val Leu Glu Leu
85 90 95
Lys Gly Ser Glu Thr Thr Phe Met Cys Glu Tyr Ala Asp Glu Thr Ala
100 105 110
Thr Ile Val Glu Phe Leu Asn Arg Trp Ile Thr Phe Ala Gln Ser Ile
115 120 125
Ile Ser Thr Leu Thr
130
<210> 14
<211> 133
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic Polypeptide
<400> 14
Ala Pro Thr Ser Ser Ser Thr Lys Lys Thr Gln Leu Gln Leu Glu His
1 5 10 15
Leu Leu Leu Asp Leu Gln Met Ile Leu Asn Gly Ile Asn Asn Tyr Lys
20 25 30
Asn Pro Lys Leu Thr Arg Met Leu Thr Phe Lys Phe Tyr Met Pro Lys
35 40 45
Lys Ala Thr Glu Leu Lys His Leu Gln Cys Leu Glu Glu Glu Leu Lys
50 55 60
Pro Leu Glu Glu Ala Leu Arg Leu Ala Pro Ser Lys Asn Phe His Leu
65 70 75 80
Arg Pro Arg Asp Leu Ile Ser Asp Ile Asn Val Ile Val Leu Glu Leu
85 90 95
Lys Gly Ser Glu Thr Thr Phe Met Cys Glu Tyr Ala Asp Glu Thr Ala
100 105 110
Thr Ile Val Glu Phe Leu Asn Arg Trp Ile Thr Phe Ala Gln Ser Ile
115 120 125
Ile Ser Thr Leu Thr
130
<210> 15
<211> 133
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic Polypeptide
<400> 15
Ala Pro Thr Ser Ser Ser Thr Lys Lys Thr Gln Leu Gln Leu Glu His
1 5 10 15
Leu Leu Leu Asp Leu Gln Met Ile Leu Asn Gly Ile Asn Asn Tyr Lys
20 25 30
Asn Pro Arg Leu Thr Arg Met Leu Thr Phe Lys Phe Tyr Met Pro Glu
35 40 45
Lys Ala Thr Glu Leu Lys His Leu Gln Cys Leu Glu Glu Glu Leu Lys
50 55 60
Pro Leu Glu Asp Val Leu Asn Leu Ala Gln Ser Lys Asn Phe His Leu
65 70 75 80
Arg Pro Arg Asp Leu Ile Ser Asp Ile Asn Val Ile Val Leu Glu Leu
85 90 95
Lys Gly Ser Glu Thr Thr Phe Met Cys Glu Tyr Ala Asp Glu Thr Ala
100 105 110
Thr Ile Val Glu Phe Leu Asn Arg Trp Ile Thr Phe Ala Gln Ser Ile
115 120 125
Ile Ser Thr Leu Thr
130
<210> 16
<211> 364
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic Polypeptide
<400> 16
Asp Lys Thr His Thr Cys Pro Pro Cys Pro Ala Pro Glu Leu Leu Gly
1 5 10 15
Gly Pro Ser Val Phe Leu Phe Pro Pro Lys Pro Lys Asp Thr Leu Met
20 25 30
Ile Ser Arg Thr Pro Glu Val Thr Cys Val Val Val Asp Val Ser His
35 40 45
Glu Asp Pro Glu Val Lys Phe Asn Trp Tyr Val Asp Gly Val Glu Val
50 55 60
His Asn Ala Lys Thr Lys Pro Arg Glu Glu Gln Tyr Gly Ser Thr Tyr
65 70 75 80
Arg Val Val Ser Val Leu Thr Val Leu His Gln Asp Trp Leu Asn Gly
85 90 95
Lys Glu Tyr Lys Cys Lys Val Ser Asn Lys Ala Leu Pro Ala Pro Ile
100 105 110
Glu Lys Thr Ile Ser Lys Ala Lys Gly Gln Pro Arg Glu Pro Gln Val
115 120 125
Tyr Thr Leu Pro Pro Ser Arg Glu Glu Met Thr Lys Asn Gln Val Ser
130 135 140
Leu Thr Cys Leu Val Lys Gly Phe Tyr Pro Ser Asp Ile Ala Val Glu
145 150 155 160
Trp Glu Ser Asn Gly Gln Pro Glu Asn Asn Tyr Lys Thr Thr Pro Pro
165 170 175
Val Leu Asp Ser Asp Gly Ser Phe Phe Leu Tyr Ser Lys Leu Thr Val
180 185 190
Asp Lys Ser Arg Trp Gln Gln Gly Asn Val Phe Ser Cys Ser Val Met
195 200 205
His Glu Ala Leu His Asn His Tyr Thr Gln Lys Ser Leu Ser Leu Ser
210 215 220
Pro Gly Gly Gly Gly Gly Ser Ala Pro Thr Ser Ser Ser Thr Lys Lys
225 230 235 240
Thr Gln Leu Gln Leu Glu His Leu Leu Leu Asp Leu Gln Met Ile Leu
245 250 255
Asn Gly Ile Asn Asn Tyr Lys Asn Pro Lys Leu Thr Arg Met Leu Thr
260 265 270
Phe Lys Phe Tyr Met Pro Lys Lys Ala Thr Glu Leu Lys His Leu Gln
275 280 285
Cys Leu Glu Glu Glu Leu Lys Pro Leu Glu Glu Val Leu Asn Leu Ala
290 295 300
Gln Ser Lys Asn Phe His Leu Arg Pro Arg Asp Leu Ile Ser Asn Ile
305 310 315 320
Asn Val Ile Val Leu Glu Leu Lys Gly Ser Glu Thr Thr Phe Met Cys
325 330 335
Glu Tyr Ala Asp Glu Thr Ala Thr Ile Val Glu Phe Leu Asn Arg Trp
340 345 350
Ile Thr Phe Ala Gln Ser Ile Ile Ser Thr Leu Thr
355 360
<210> 17
<211> 364
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Synthetic Polypeptide
<400> 17
Asp Lys Thr His Thr Cys Pro Pro Cys Pro Ala Pro Glu Leu Leu Gly
1 5 10 15
Gly Pro Ser Val Phe Leu Phe Pro Pro Lys Pro Lys Asp Thr Leu Met
20 25 30
Ile Ser Arg Thr Pro Glu Val Thr Cys Val Val Val Asp Val Ser His
35 40 45
Glu Asp Pro Glu Val Lys Phe Asn Trp Tyr Val Asp Gly Val Glu Val
50 55 60
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Glu Phe Leu Asn Arg Trp Ile Thr Phe Ala Gln Ser Ile Ile Ser Thr
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Leu Thr
385
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<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> synthetic polypeptide
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Leu Arg Gly Ala Arg Cys Asp Lys Thr His Thr Cys Pro Pro Cys Pro
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Ala Pro Glu Leu Leu Gly Gly Pro Ser Val Phe Leu Phe Pro Pro Lys
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Pro Lys Asp Thr Leu Met Ile Ser Arg Thr Pro Glu Val Thr Cys Val
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Val Val Asp Val Ser His Glu Asp Pro Glu Val Lys Phe Asn Trp Tyr
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Val Asp Gly Val Glu Val His Asn Ala Lys Thr Lys Pro Arg Glu Glu
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Gln Tyr Gly Ser Thr Tyr Arg Val Val Ser Val Leu Thr Val Leu His
100 105 110
Gln Asp Trp Leu Asn Gly Lys Glu Tyr Lys Cys Lys Val Ser Asn Lys
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Ala Leu Pro Ala Pro Ile Glu Lys Thr Ile Ser Lys Ala Lys Gly Gln
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Pro Arg Glu Pro Gln Val Tyr Thr Leu Pro Pro Ser Arg Glu Glu Met
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Thr Lys Asn Gln Val Ser Leu Thr Cys Leu Val Lys Gly Phe Tyr Pro
165 170 175
Ser Asp Ile Ala Val Glu Trp Glu Ser Asn Gly Gln Pro Glu Asn Asn
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Tyr Lys Thr Thr Pro Pro Val Leu Asp Ser Asp Gly Ser Phe Phe Leu
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Tyr Ser Lys Leu Thr Val Asp Lys Ser Arg Trp Gln Gln Gly Asn Val
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Lys Ser Leu Ser Leu Ser Pro Gly Gly Gly Gly Gly Ser Ala Pro Thr
245 250 255
Ser Ser Ser Thr Lys Lys Thr Gln Leu Gln Leu Glu His Leu Leu Leu
260 265 270
Asp Leu Gln Met Ile Leu Asn Gly Ile Asn Asn Tyr Lys Asn Pro Lys
275 280 285
Leu Thr Arg Met Leu Thr Phe Lys Phe Tyr Met Pro Lys Lys Ala Thr
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Glu Leu Lys His Leu Gln Cys Leu Glu Glu Glu Leu Lys Pro Leu Glu
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Glu Val Leu Asn Leu Ala Gln Ser Lys Asn Phe His Leu Arg Pro Arg
325 330 335
Asp Leu Ile Ser Asn Ile Asn Val Ile Val Leu Gly Leu Lys Gly Ser
340 345 350
Glu Thr Thr Phe Met Cys Glu Tyr Ala Asp Glu Thr Ala Thr Ile Val
355 360 365
Glu Phe Leu Asn Arg Trp Ile Thr Phe Ala Gln Ser Ile Ile Ser Thr
370 375 380
Leu Thr
385
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<212> DNA
<213> Artificial Sequence
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atcatctcca ctttgact 1158
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atggacatga gagtgcctgc acagctgctg ggcctgctgc tgctgtggct gagaggcgcc 60
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accaagaacc aggtcagcct gacctgcctg gtcaaaggct tctatcccag cgacatcgcc 540
gtggagtggg agagcaatgg gcagccggag aacaactaca agaccacgcc tcccgtgctg 600
gactccgacg gctccttctt cctctatagc aagctcaccg tggacaagag caggtggcag 660
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atggacatga gagtgcctgc acagctgctg ggcctgctgc tgctgtggct gagaggcgcc 60
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85 90 95
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65 70 75 80
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Thr Gln Phe Pro Thr Phe Gly Gly Gly Thr Lys Val Glu Ile Lys Arg
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Glu Arg Ala Thr Leu Ser Cys Arg Ala Ser Gln Ser Val Ser Ser Ser
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Glu Ile Val Leu Thr Gln Ser Pro Gly Thr Leu Ser Leu Ser Pro Gly
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Glu Arg Ala Thr Leu Ser Cys Arg Ala Ser Gln Ser Val Ser Ser Arg
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Asp Ile Gln Met Thr Gln Ser Pro Ser Ser Leu Ser Ala Ser Val Gly
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Leu Asn Trp Tyr Gln Gln Lys Pro Gly Lys Ala Pro Lys Val Leu Ile
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Ser Gly Ser Gly Thr Asp Phe Thr Leu Thr Ile Ser Ser Leu Gln Pro
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Thr Phe Gly Gln Gly Thr Lys Val Glu Ile Lys Arg
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50 55 60
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Asp Ile Gln Met Thr Gln Ser Pro Ser Ser Leu Ser Ala Ser Val Gly
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Asp Arg Val Thr Ile Thr Cys Arg Ala Ser Gln Asp Ile Arg Asn Asp
20 25 30
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Tyr Ala Ala Ser Ser Leu Gln Ser Gly Val Pro Ser Arg Phe Ser Gly
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Asp Ile Gln Met Thr Gln Ser Pro Ser Ser Leu Ser Ala Ser Val Gly
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Asp Arg Val Thr Ile Thr Cys Arg Ala Ser Gln Gly Ile Arg Asp Asp
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Tyr Ile Ala Thr Ser Leu Gln Ser Gly Val Pro Ser Arg Phe Ser Gly
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Asp Ile Gln Met Thr Gln Ser Pro Ser Ser Leu Ser Ala Ser Val Gly
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<400> 191
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Asp Arg Val Thr Ile Thr Cys Arg Ala Ser Gln Asp Ile Glu His Asp
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Ser Phe Gly Gln Gly Thr Gln Leu Glu Ile Lys Arg
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Asp Ile Val Met Thr Gln Thr Pro Leu Ser Leu Pro Val Thr Pro Gly
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<220>
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<400> 193
Asp Ile Val Met Thr Gln Thr Pro Leu Ser Leu Pro Val Thr Pro Gly
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100 105 110
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<211> 108
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<213> Artificial Sequence
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<400> 194
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Asp Arg Val Thr Ile Thr Cys Gln Ala Ser Gln Asp Ile Ser Asn Tyr
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Tyr Asp Ala Ser Asn Leu Glu Thr Gly Val Pro Ser Arg Phe Ser Gly
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<213> Artificial Sequence
<220>
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<400> 195
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<213> Artificial Sequence
<220>
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<400> 196
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<212> PRT
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<220>
<223> synthetic polypeptide
<400> 197
Asp Ile Gln Met Thr Gln Ser Pro Ser Ser Leu Ser Ala Ser Val Gly
1 5 10 15
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100 105
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<211> 108
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> synthetic polypeptide
<400> 198
Asp Ile Gln Met Thr Gln Ser Pro Ser Ser Leu Ser Ala Ser Val Gly
1 5 10 15
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Thr Phe Gly Pro Gly Thr Lys Val Asp Ile Lys Arg
100 105
<210> 199
<211> 109
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> synthetic polypeptide
<400> 199
Ser Tyr Glu Leu Thr Gln Pro Pro Ser Val Ser Val Ser Pro Gly Gln
1 5 10 15
Thr Ala Arg Ile Thr Cys Ser Gly Asp Ala Leu Pro Arg Lys Phe Ala
20 25 30
Tyr Trp Tyr Gln Gln Lys Ser Gly Gln Ala Pro Val Leu Val Ile Tyr
35 40 45
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50 55 60
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65 70 75 80
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85 90 95
Val Val Phe Gly Gly Gly Thr Lys Leu Thr Val Leu Gly
100 105
<210> 200
<211> 108
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> synthetic polypeptide
<400> 200
Asp Ile Gln Met Thr Gln Ser Pro Ser Ser Val Ser Ala Ser Val Gly
1 5 10 15
Asp Arg Val Thr Ile Thr Cys Arg Ala Ser Gln Gly Ile Ser Asn Trp
20 25 30
Leu Val Trp Tyr Gln Gln Lys Pro Gly Lys Pro Pro Lys Leu Leu Ile
35 40 45
Tyr Ala Ala Ser Ser Leu Gln Asn Gly Val Pro Ser Arg Phe Ser Gly
50 55 60
Ser Gly Ser Gly Thr Asp Phe Thr Leu Thr Ile Ser Ser Leu Gln Thr
65 70 75 80
Glu Asp Phe Ala Thr Tyr Tyr Cys Gln Gln Ala Leu Ser Phe Pro Trp
85 90 95
Thr Phe Gly Pro Gly Thr Lys Val Glu Val Lys Arg
100 105
<210> 201
<211> 342
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> nucleic acid
<400> 201
gatattgtga tgacccagac tccactctcc ttgcccgtca cccctggaga gccggcctcc 60
atctcctgca ggtctagtca gagcctctta gatagtgatg agggaaacac ctatttggac 120
tggtacctgc agaagccagg gcagtctcca cagctcctga tctatacgct ttcctatcgg 180
gcctctggag tcccagacag gttcagtggc actgggtcag acactgattt cacactgaaa 240
atcagcaggg tggaggctga ggatgttgga gtttattact gcatgcaacg tatagagttt 300
cctctcactt tcggcggagg gaccaaggtg gagatcaaac ga 342
<210> 202
<211> 327
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> nucleic acid
<400> 202
gaaattgtat tgacgcagtc tccaggcacc ctgtctttgt ctccagggga aagagccacc 60
ctctcctgca gggccagtca gagttttagc agcagctact tagtctggta ccagcagaaa 120
cctggccagg ctcccaggct cctcatctat ggtgcatcca gcagggccac tggcatccca 180
gacaggttcg gtggcagtgg gtctgggaca gacttcactc tcaccatcag cagactggag 240
cctgaagatt ttgcagtgta ttactgtcag cagtatggta gctcacctct cactttcggc 300
ggagggacca aggtggagat caaacga 327
<210> 203
<211> 336
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> nucleic acid
<400> 203
gatattgtgc tgacccagac tccactctcc tcacctgtca cccttggaca gccggcctcc 60
atctcctgca ggtctagtca tcacctcata cacagtgatg gaaacaccta cttgagttgg 120
cttcagcaga ggccaggcca gcctccaaga ctcctaattt ataagatttc taaccggttc 180
tctggggtcc cagacagatt cactggcagt gggacaggga cagatttcac actgaaaatc 240
agcagggtgg aagctgggga tgtcggggtt tattactgca tgcaaactac acaatttccg 300
acgttcggcc aagggaccaa ggtggaaatc aaacga 336
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<211> 336
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> nucleic acid
<400> 204
gatattgtga tgacccagac tccactctcc tcacctgtca cccttggaca gccggcctcc 60
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<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> nucleic acid
<400> 205
gatattgtga tgacccagac tccactctcc tcacctgtca cccttggaca gccggcctcc 60
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<212> DNA
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<223> nucleic acid
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<212> DNA
<213> Artificial Sequence
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<223> nucleic acid
<400> 207
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<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> nucleic acid
<400> 208
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<213> Artificial Sequence
<220>
<223> nucleic acid
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<210> 210
<211> 339
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> nucleic acid
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ctcactttcg gcggagggac caaggtggag atcaaacga 339
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<211> 336
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> nucleic acid
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<211> 336
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> nucleic acid
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<212> DNA
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<212> DNA
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<220>
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<220>
<223> nucleic acid
<400> 215
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<211> 327
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> nucleic acid
<400> 218
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<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> nucleic acid
<400> 219
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<210> 220
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<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> nucleic acid
<400> 220
gacatccaga tgacccagtc tccatcctcc ctgtctgcat ctgtaggaga cagagtcacc 60
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<211> 327
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> nucleic acid
<400> 221
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<210> 222
<211> 324
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> nucleic acid
<400> 222
gacatccaga tgacccagtc tccatcctcc ctgtctgcat ctgtaggaga cagagtcacc 60
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<210> 223
<211> 324
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> nucleic acid
<400> 223
gacatccaga tgacccagtc tccatcctcc ctgtctgcat ctgtaggaga cagagtcacc 60
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<211> 324
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> nucleic acid
<400> 224
gacatccaga tgacccagtc tccatcctcc ctgtctgcat ctgtaggaga cagagtcacc 60
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<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> nucleic acid
<400> 225
gacatccaga tgacccagtc tccatcctcc ctgtctgcat ctgtaggaga cagagtcacc 60
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gggaccaagg tggaaatcaa acga 324
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<211> 324
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> nucleic acid
<400> 226
gacatccaga tgacccagtc tccatcctcc ctgtctgcat ctgtaggaga cagagtcacc 60
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<211> 324
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<213> Artificial Sequence
<220>
<223> nucleic acid
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gacatccaga tgacccagtc tccatcctcc ctgtctgcat ctgtaggaga cagagtcacc 60
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<213> Artificial Sequence
<220>
<223> nucleic acid
<400> 228
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<211> 342
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> nucleic acid
<400> 229
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<211> 324
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> nucleic acid
<400> 230
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gggaccaaag tggatatcaa acga 324
<210> 231
<211> 327
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> nucleic acid
<400> 231
tcctatgagc tgacacagcc accctcggtg tcagtgtccc caggacagac ggccaggatc 60
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ggagggacca agctgaccgt cctaggt 327
<210> 232
<211> 327
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> nucleic acid
<400> 232
tcctatgagc tgacacagcc accctcggtg tcagtgtccc caggacaaac ggccaggatc 60
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<213> Artificial Sequence
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<213> Artificial Sequence
<220>
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<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> nucleic acid
<400> 235
tcctatgagc tgacacagcc accctcggtg tcagtgtccc caggacaaac ggccaggatc 60
acctgctctg gagatgcatt gccaagaaaa tttgcttatt ggtaccagca gaagtcaggc 120
caggcccctg tgctggtcat ctatgaggac aggaaacgac cctccgggat ccctgagaga 180
ttctctggct ccagctcagg gacaatggcc accttgacta tcagtggggc ccaggtggag 240
gatgaagctg actactactg ttactcaaca gaccgcagtg gtgatcatgt ggtattcggc 300
ggagggacca agctgaccgt cctaggt 327
<210> 236
<211> 324
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> nucleic acid
<400> 236
gacatccaga tgacccagtc tccatcttcc gtgtctgcat ctgtaggaga cagagtcacc 60
atcacttgtc gggcgagtca gggtattagc aactggttag tctggtatca gcagaaacca 120
gggaaacccc ctaaactcct gatctatgct gcatccagtt tgcaaaatgg ggtcccatca 180
agattcagcg gcagtggatc tgggacagat ttcactctca ccatcagcag cctgcagact 240
gaagattttg caacttacta ttgtcaacag gctctcagtt tcccgtggac gttcggccca 300
gggaccaagg tggaagtcaa acga 324
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<220>
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Ser Leu Lys Ile Ser Cys Lys Gly Ser Gly Tyr Arg Phe Thr Ser Tyr
20 25 30
Trp Ile Gly Trp Val Arg Gln Met Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Met
35 40 45
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50 55 60
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65 70 75 80
Leu Gln Trp Ser Ser Leu Lys Ala Ser Asp Thr Ala Met Tyr Tyr Cys
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100 105 110
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Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Ser Ile Tyr
20 25 30
Gly Met His Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val
35 40 45
Thr Val Ile Trp Tyr Asp Gly Ser Asn Glu Tyr Tyr Ala Asp Ser Val
50 55 60
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65 70 75 80
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100 105 110
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Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Ser Ser Tyr
20 25 30
Gly Met His Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val
35 40 45
Ala Val Ile Trp Tyr Asp Gly Ser Asn Glu Tyr Tyr Ala Asp Ser Val
50 55 60
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65 70 75 80
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Gln Val Gln Leu Val Glu Ser Gly Gly Gly Val Val Gln Pro Gly Arg
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Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Ser Ser Tyr
20 25 30
Gly Met His Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val
35 40 45
Ala Val Ile Trp Tyr Asp Gly Ser Asn Glu Tyr Tyr Ala Asp Ser Val
50 55 60
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65 70 75 80
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85 90 95
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<400> 242
Gln Val Gln Leu Val Glu Ser Gly Gly Gly Val Val Gln Pro Gly Arg
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Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Ser Asn Tyr
20 25 30
Gly Met His Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val
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Thr Val Ile Trp Asn Asp Gly Ser Asn Glu Tyr Tyr Ala Asp Ser Val
50 55 60
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65 70 75 80
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Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Ser Ser Tyr
20 25 30
Gly Met His Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val
35 40 45
Ala Val Ile Trp Tyr Asp Gly Ser Asn Lys Tyr Tyr Ala Asp Ser Val
50 55 60
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65 70 75 80
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<400> 244
Gln Val Gln Leu Val Glu Ser Gly Gly Gly Val Val Gln Pro Gly Arg
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Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Ser Ser Tyr
20 25 30
Gly Met Tyr Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val
35 40 45
Ala Val Ile Trp Tyr Asp Gly Ser Asn Lys Tyr Tyr Val Asp Ser Val
50 55 60
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65 70 75 80
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85 90 95
Ala Arg Gly Ala Val Ala Gly Thr Gly Arg Asp Tyr Tyr Tyr Tyr Gly
100 105 110
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<213> Artificial Sequence
<220>
<223> synthetic polypeptide
<400> 245
Gln Val Gln Leu Val Glu Ser Gly Gly Gly Val Val Gln Pro Gly Arg
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Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Ser Ser Tyr
20 25 30
Gly Met Tyr Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val
35 40 45
Ala Val Ile Trp Tyr Asp Gly Ser Asn Lys Tyr His Gly Asp Ser Val
50 55 60
Lys Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Ser Lys Asn Thr Leu Tyr
65 70 75 80
Leu Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys
85 90 95
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100 105 110
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115 120 125
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<211> 126
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> synthetic polypeptide
<400> 246
Gln Val Gln Leu Val Glu Ser Gly Gly Gly Val Val Gln Pro Gly Arg
1 5 10 15
Ser Gln Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Ser Ser Tyr
20 25 30
Gly Met Tyr Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val
35 40 45
Ala Val Ile Trp Tyr Asp Gly Ser Asn Lys Asn Tyr Ala Asp Ser Val
50 55 60
Lys Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Ser Lys Asn Thr Leu Tyr
65 70 75 80
Leu Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Val Tyr His Cys
85 90 95
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100 105 110
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115 120 125
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<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> synthetic polypeptide
<400> 247
Gln Val Gln Leu Val Glu Ser Gly Gly Gly Val Val Gln Pro Gly Arg
1 5 10 15
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Ser Ser Phe
20 25 30
Gly Met His Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val
35 40 45
Ala Val Ile Trp Phe Asp Gly Ser Asn Lys Tyr Tyr Val Asp Ser Val
50 55 60
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65 70 75 80
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<213> Artificial Sequence
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<400> 248
Gln Val Gln Leu Val Glu Ser Gly Gly Gly Val Val Gln Pro Gly Arg
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Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Arg Ser Tyr
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Gly Met His Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val
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Ala Val Ile Ser Asp Asp Gly Ser Asn Lys Tyr Tyr Ala Asp Ser Val
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Gln Val Gln Leu Val Glu Ser Gly Gly Gly Val Val Gln Pro Gly Arg
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Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Ser Ser Tyr
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<220>
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<400> 250
Gln Val Gln Leu Val Glu Ser Gly Gly Gly Val Val Gln Pro Gly Arg
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Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Ser Ser Tyr
20 25 30
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35 40 45
Ala Val Ile Trp Tyr Asp Gly Ser Ile Lys Tyr Tyr Ala Asp Ser Val
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100 105 110
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<213> Artificial Sequence
<220>
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<400> 251
Gln Val Gln Leu Val Glu Ser Gly Gly Gly Val Val Gln Pro Gly Arg
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Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Ser Thr Tyr
20 25 30
Gly Met His Trp Val Arg Gln Ala Pro Asp Met Gly Leu Glu Trp Val
35 40 45
Ala Val Ile Trp Tyr Asp Gly Ser Asn Lys Tyr Tyr Ala Asp Ser Val
50 55 60
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65 70 75 80
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100 105 110
Thr Met Val Thr Val Ser Ser
115
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<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> synthetic polypeptide
<400> 252
Gln Val Gln Leu Val Glu Ser Gly Gly Gly Val Val Gln Pro Gly Arg
1 5 10 15
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Ser Thr Tyr
20 25 30
Ala Met His Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val
35 40 45
Ala Val Ile Trp Tyr Asp Gly Ile Asn Lys Tyr Tyr Ala Asp Ser Val
50 55 60
Lys Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Ser Lys Asn Thr Leu Tyr
65 70 75 80
Leu Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys
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Ala Arg Gly Ser Tyr Tyr Asp Ser Ser Gly Tyr Tyr Tyr Gly Glu Asp
100 105 110
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115 120 125
<210> 253
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<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> synthetic polypeptide
<400> 253
Gln Val Gln Leu Val Glu Ser Gly Gly Gly Val Val Gln Pro Gly Arg
1 5 10 15
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Ser Ser Tyr
20 25 30
Ala Met His Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val
35 40 45
Ala Val Ile Trp Tyr Asp Gly Ile Asn Lys Tyr Tyr Ala Asp Ser Val
50 55 60
Lys Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Ser Lys Asn Thr Leu Tyr
65 70 75 80
Leu Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys
85 90 95
Ala Arg Gly Ser Tyr Tyr Asp Ser Ser Gly Tyr Tyr Phe Gly Glu Asp
100 105 110
Phe Asp Tyr Trp Gly Gln Gly Thr Leu Val Thr Val Ser Ser
115 120 125
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<211> 118
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> synthetic polypeptide
<400> 254
Gln Val Gln Leu Val Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Lys Pro Gly Gly
1 5 10 15
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Ser Asp Tyr
20 25 30
Tyr Met Ser Trp Ile Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val
35 40 45
Ser Tyr Ile Ser Ser Ser Gly Ser Ile Ile Phe Tyr Ala Asp Ser Val
50 55 60
Lys Gly Arg Phe Thr Met Ser Arg Asp Asn Ala Lys Asn Ser Leu Tyr
65 70 75 80
Leu Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys
85 90 95
Val Arg Arg Ile Ser Ile Thr Pro Phe Asp Tyr Trp Gly Gln Gly Thr
100 105 110
Leu Val Thr Val Ser Ser
115
<210> 255
<211> 126
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> synthetic polypeptide
<400> 255
Gln Val Thr Leu Lys Glu Ser Gly Pro Val Leu Val Lys Pro Thr Glu
1 5 10 15
Thr Leu Thr Leu Thr Cys Thr Val Ser Gly Phe Ser Leu Ser Asn Ala
20 25 30
Arg Met Gly Val Ser Trp Ile Arg Gln Pro Pro Gly Lys Ala Leu Glu
35 40 45
Trp Leu Ala His Ile Phe Ser Asn Asp Glu Lys Ser Tyr Ser Thr Ser
50 55 60
Leu Lys Ser Arg Leu Thr Ile Ser Lys Asp Thr Ser Lys Ser Gln Val
65 70 75 80
Val Leu Thr Met Thr Asn Met Asp Pro Val Asp Thr Ala Thr Tyr Tyr
85 90 95
Cys Val Arg Ile Pro Arg Trp Leu Gln Pro Pro Tyr Tyr Tyr Tyr Gly
100 105 110
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115 120 125
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<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> synthetic polypeptide
<400> 256
Gln Val Gln Leu Gln Glu Ser Gly Pro Gly Leu Val Lys Pro Ser Gln
1 5 10 15
Thr Leu Ser Leu Thr Cys Thr Val Ser Gly Gly Ser Ile Ser Ser Gly
20 25 30
Gly Tyr Tyr Trp Asn Trp Ile Arg Gln His Pro Gly Lys Gly Leu Glu
35 40 45
Trp Ile Gly Tyr Ile Tyr Tyr Ser Gly Asn Thr His Tyr Asn Pro Ser
50 55 60
Leu Lys Ser Arg Val Thr Ile Ser Val Asp Thr Ser Lys Asn Gln Phe
65 70 75 80
Ser Leu Lys Leu Ser Ser Val Ile Ala Ala Asp Thr Ala Val Tyr Tyr
85 90 95
Cys Ala Arg Asp Trp Gly Arg Asp Ala Phe Asp Ile Trp Gly Gln Gly
100 105 110
Thr Met Val Thr Val Ser Ser
115
<210> 257
<211> 124
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> synthetic polypeptide
<400> 257
Gln Val Gln Leu Gln Glu Ser Gly Pro Gly Leu Val Lys Pro Ser Gln
1 5 10 15
Thr Leu Ser Leu Thr Cys Thr Val Ser Gly Gly Ser Ile Ser Ser Gly
20 25 30
Gly Tyr Tyr Trp Ser Trp Ile Arg Gln His Pro Gly Lys Gly Leu Glu
35 40 45
Trp Ile Gly Tyr Ile Tyr Tyr Ser Gly Ser Thr Asp Tyr Asn Pro Ser
50 55 60
Leu Lys Ser Arg Gly Ile Ile Ser Gly Asp Thr Ser Lys Asn Gln Phe
65 70 75 80
Ser Leu Lys Leu Asn Ser Val Thr Ala Ala Asp Thr Ala Val Tyr Tyr
85 90 95
Cys Ala Arg Glu Gly Arg Phe Gly Glu Leu Gly Ser Tyr Tyr Phe Asp
100 105 110
Tyr Trp Gly Gln Gly Thr Leu Val Thr Val Ser Ser
115 120
<210> 258
<211> 121
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> synthetic polypeptide
<400> 258
Gln Val Gln Leu Gln Glu Ser Gly Pro Gly Leu Val Lys Pro Ser Glu
1 5 10 15
Thr Leu Ser Leu Thr Cys Thr Val Ser Gly Gly Ser Val Ser Ser Gly
20 25 30
Gly Tyr Tyr Trp Ser Trp Ile Arg Gln Pro Pro Gly Lys Gly Leu Glu
35 40 45
Trp Ile Gly Asn Thr Tyr Tyr Ser Gly Ser Thr Asn Tyr Lys Pro Ser
50 55 60
Leu Lys Ser Arg Val Thr Ile Ser Val Asp Thr Ser Lys Asn Gln Phe
65 70 75 80
Ser Leu Lys Leu Ser Ser Val Thr Ala Ala Asp Thr Ala Val Tyr Tyr
85 90 95
Cys Gly Arg Asp Arg Gly Arg Ala Val Gly Pro Phe Asp Tyr Trp Gly
100 105 110
Gln Gly Thr Leu Val Thr Val Ser Ser
115 120
<210> 259
<211> 118
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> synthetic polypeptide
<400> 259
Gln Val Gln Leu Val Gln Ser Gly Ala Glu Val Lys Lys Pro Gly Ala
1 5 10 15
Ser Val Lys Val Ser Cys Lys Ala Ser Gly Tyr Thr Phe Thr Asn Tyr
20 25 30
Asp Ile Asn Trp Val Arg Gln Ala Thr Gly Gln Gly Leu Glu Trp Met
35 40 45
Gly Trp Met Asn Pro Asn Ser Gly Asn Thr Gly Tyr Ala Gln Lys Phe
50 55 60
Gln Gly Arg Val Thr Met Thr Arg Asn Thr Ser Ile Ser Thr Ala Tyr
65 70 75 80
Met Glu Leu Ser Ser Leu Arg Ser Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys
85 90 95
Ala Arg Ser Arg Gln Trp Leu Val Leu Asp Tyr Trp Gly Gln Gly Thr
100 105 110
Leu Val Thr Val Ser Ser
115
<210> 260
<211> 118
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> synthetic polypeptide
<400> 260
Gln Val Gln Leu Val Gln Ser Gly Ala Glu Val Lys Lys Pro Gly Ala
1 5 10 15
Ser Val Lys Val Ser Cys Lys Ala Ser Gly Tyr Thr Phe Thr Asn Tyr
20 25 30
Asp Ile Asn Trp Val Arg Gln Ala Thr Gly Gln Gly Leu Glu Trp Met
35 40 45
Gly Trp Met Asn Pro Asn Ser Gly Asn Thr Gly Tyr Val Gln Lys Phe
50 55 60
Gln Gly Arg Val Thr Met Thr Arg Asn Thr Ser Ile Ser Thr Ala Tyr
65 70 75 80
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Ala Arg Ser Arg Gln Trp Leu Val Leu Asp Tyr Trp Gly Gln Gly Thr
100 105 110
Leu Val Thr Val Ser Ser
115
<210> 261
<211> 118
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> synthetic polypeptide
<400> 261
Gln Val Gln Leu Val Gln Ser Gly Ala Glu Val Lys Lys Pro Gly Ala
1 5 10 15
Ser Val Lys Val Ser Cys Lys Ala Ser Gly Tyr Arg Phe Thr Ser Tyr
20 25 30
Asp Ile Asn Trp Val Arg Gln Ala Thr Gly Gln Gly Leu Glu Trp Met
35 40 45
Gly Trp Met Asn Pro Asn Ser Gly Asn Thr Gly Tyr Ala Gln Lys Phe
50 55 60
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65 70 75 80
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Ala Arg Ser Arg Gln Trp Leu Val Leu Asp Tyr Trp Gly Gln Gly Thr
100 105 110
Leu Val Thr Val Ser Ser
115
<210> 262
<211> 118
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> synthetic polypeptide
<400> 262
Gln Val Gln Leu Val Gln Ser Gly Ala Glu Val Lys Lys Pro Gly Ala
1 5 10 15
Ser Val Lys Val Ser Cys Lys Ala Ser Gly Tyr Thr Phe Thr Thr Tyr
20 25 30
Asp Ile Asn Trp Val Arg Gln Ala Thr Gly Gln Gly Leu Glu Trp Met
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50 55 60
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Ala Arg Gly Arg Gln Trp Leu Gly Phe Asp Tyr Trp Gly Gln Gly Thr
100 105 110
Leu Val Thr Val Ser Ser
115
<210> 263
<211> 118
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> synthetic polypeptide
<400> 263
Gln Val Gln Leu Val Gln Ser Gly Ala Glu Val Lys Lys Pro Gly Ala
1 5 10 15
Ser Val Lys Val Ser Cys Lys Ala Ser Gly Tyr Thr Phe Thr Asn Tyr
20 25 30
Asp Ile Asn Trp Val Arg Gln Ala Thr Gly Gln Gly Leu Glu Trp Met
35 40 45
Gly Trp Met Asn Pro Asn Ser Gly Asn Thr Gly Tyr Ala Gln Lys Phe
50 55 60
Gln Gly Arg Val Thr Met Thr Arg Asn Thr Ser Ile Asn Thr Ala Tyr
65 70 75 80
Met Glu Leu Ser Ser Leu Arg Ser Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys
85 90 95
Ala Arg Gly Arg Gln Trp Leu Gly Phe Asp Tyr Trp Gly Gln Gly Thr
100 105 110
Leu Val Thr Val Ser Ser
115
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<211> 121
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> synthetic polypeptide
<400> 264
Glu Val Gln Leu Val Gln Ser Gly Ala Glu Val Lys Lys Pro Gly Glu
1 5 10 15
Ser Leu Lys Ile Ser Cys Lys Gly Ser Gly Tyr Ser Phe Thr Ser Gln
20 25 30
Trp Ile Gly Trp Val Arg Gln Met Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Met
35 40 45
Gly Ile Ile Phe Pro Gly Asp Ser Asp Thr Arg Tyr Ser Pro Ser Phe
50 55 60
Gln Gly Gln Val Thr Ile Ser Ala Asp Lys Ser Ile Ser Thr Ala Tyr
65 70 75 80
Leu Gln Trp Ser Ser Leu Lys Ala Ser Asp Thr Ala Met Tyr Tyr Cys
85 90 95
Ala Arg Gln Gly Arg Ser Tyr His Tyr Tyr Gly Met Asp Val Trp Gly
100 105 110
Gln Gly Thr Thr Val Thr Val Ser Ser
115 120
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<211> 121
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> synthetic polypeptide
<400> 265
Glu Val Gln Leu Val Gln Ser Gly Ala Glu Val Lys Lys Pro Gly Glu
1 5 10 15
Ser Leu Lys Ile Ser Cys Lys Gly Ser Gly Tyr Gly Phe Thr Asn Tyr
20 25 30
Trp Ile Gly Trp Val Arg Gln Met Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Met
35 40 45
Gly Thr Ile Tyr Pro Gly Asp Ser Asp Thr Arg Tyr Ser Pro Ser Phe
50 55 60
Gln Gly Gln Val Thr Phe Ser Ala Asp Lys Ser Ile Ser Thr Ala Tyr
65 70 75 80
Leu Gln Trp Ser Ser Leu Lys Ala Ser Asp Thr Ala Met Tyr Tyr Cys
85 90 95
Ala Arg Gln Gly Arg Ser Tyr Tyr Tyr Phe Gly Met Asp Val Trp Gly
100 105 110
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115 120
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<213> Artificial Sequence
<220>
<223> synthetic polypeptide
<400> 266
Glu Val Gln Leu Val Gln Ser Gly Ala Glu Val Lys Lys Pro Gly Glu
1 5 10 15
Ser Leu Lys Ile Ser Cys Lys Gly Ser Gly Tyr Ser Phe Thr Asp Tyr
20 25 30
Trp Ile Gly Trp Val Arg Gln Met Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Met
35 40 45
Gly Ile Ile Tyr Pro Tyr Asp Ser Asp Thr Arg Tyr Ser Pro Ser Phe
50 55 60
Gln Gly Gln Val Thr Leu Ser Ala Asp Lys Ser Ile Ser Thr Ala Tyr
65 70 75 80
Leu Arg Trp Ser Ser Leu Lys Ala Ser Asp Thr Ala Met Tyr Tyr Cys
85 90 95
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100 105 110
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115 120
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<213> Artificial Sequence
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<223> synthetic polypeptide
<400> 267
Glu Val Gln Leu Val Gln Ser Gly Ala Glu Val Lys Lys Pro Gly Glu
1 5 10 15
Ser Leu Lys Ile Ser Cys Lys Gly Ser Gly Tyr Ser Phe Thr Ser Tyr
20 25 30
Trp Ile Gly Trp Val Arg Gln Met Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Met
35 40 45
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50 55 60
Gln Gly Gln Val Thr Ile Ser Ala Asp Lys Ser Ile Asn Thr Ala Tyr
65 70 75 80
Leu Gln Trp Ser Ser Leu Lys Ala Ser Asp Thr Ala Met Tyr Tyr Cys
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100 105 110
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<213> Artificial Sequence
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<400> 268
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1 5 10 15
Ser Leu Lys Ile Ser Cys Lys Gly Ser Gly Tyr Asn Phe Thr Asn Tyr
20 25 30
Trp Ile Gly Trp Val Arg Gln Met Ser Gly Lys Gly Leu Glu Trp Met
35 40 45
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50 55 60
Gln Gly Gln Val Thr Ile Ser Ala Asp Lys Ser Ile Ser Thr Ala Tyr
65 70 75 80
Leu Gln Trp Ser Ser Leu Lys Ala Ser Asp Thr Ala Met Tyr Tyr Cys
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100 105 110
Gln Gly Thr Thr Val Thr Val Ser Ser
115 120
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<213> Artificial Sequence
<220>
<223> synthetic polypeptide
<400> 269
Glu Val Gln Leu Val Gln Ser Gly Ala Glu Val Lys Lys Pro Gly Glu
1 5 10 15
Ser Leu Lys Ile Ser Cys Lys Gly Ser Gly Tyr Arg Phe Thr Asn Tyr
20 25 30
Trp Ile Gly Trp Val Arg Gln Met Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Met
35 40 45
Gly Ile Ile Tyr Pro Gly Asp Ser Asp Thr Lys Tyr Ser Pro Ser Phe
50 55 60
Gln Gly Gln Val Thr Ile Ser Ala Asp Lys Ser Ile Ser Thr Ala Tyr
65 70 75 80
Leu Gln Trp Ser Ser Leu Lys Ala Ser Asp Thr Ala Met Tyr Tyr Cys
85 90 95
Ala Arg His Gly Gly Tyr Ser Gly Arg Ser Tyr Tyr Tyr Gly Met Asp
100 105 110
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115 120
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<213> Artificial Sequence
<220>
<223> synthetic polypeptide
<400> 270
Glu Val Gln Leu Val Gln Ser Gly Ala Glu Val Lys Lys Pro Gly Glu
1 5 10 15
Ser Leu Lys Ile Ser Cys Lys Gly Ser Gly Tyr Arg Phe Thr Ser Tyr
20 25 30
Trp Ile Gly Trp Val Arg Gln Met Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Met
35 40 45
Gly Ile Ile Phe Pro Gly Asp Ser Asp Thr Arg Tyr Ser Pro Ser Phe
50 55 60
Gln Gly Gln Val Thr Ile Ser Ala Asp Lys Ser Ile Thr Thr Ala Tyr
65 70 75 80
Leu Gln Trp Ser Ser Leu Lys Ala Ser Asp Thr Ala Ile Tyr Tyr Cys
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Leu Asp Val Trp Gly Gln Gly Thr Thr Val Thr Val Ser Ser
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<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> synthetic polypeptide
<400> 271
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1 5 10 15
Ser Leu Lys Ile Ser Cys Lys Gly Ser Gly Tyr Asn Phe Thr Thr Tyr
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Trp Ile Gly Trp Val Arg Gln Met Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Met
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Gly Ile Ile Tyr Pro Gly Asp Ser Asp Thr Arg Tyr Ser Pro Ser Phe
50 55 60
Gln Gly Gln Val Thr Ile Ser Ala Asp Lys Ser Ile Asn Thr Ala Tyr
65 70 75 80
Leu Gln Trp Ser Ser Leu Lys Ala Ser Asp Thr Ala Ile Tyr Tyr Cys
85 90 95
Ala Arg Asp Thr Gly Tyr Phe Asp Tyr Trp Gly Gln Gly Thr Leu Val
100 105 110
Thr Val Ser Ser
115
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<211> 122
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> synthetic polypeptide
<400> 272
Gln Val Gln Leu Val Glu Ser Gly Gly Gly Val Val Gln Pro Gly Arg
1 5 10 15
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Ser Ser Tyr
20 25 30
Gly Met His Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val
35 40 45
Ala Val Ile Trp Tyr Asp Gly Ser Asn Lys Phe Tyr Val Asp Ser Val
50 55 60
Lys Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Ser Lys Asn Thr Leu Tyr
65 70 75 80
Leu Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys
85 90 95
Ala Arg Pro Gly Ser Asp Tyr Tyr Phe Tyr Tyr Gly Met Asp Val Trp
100 105 110
Gly Gln Gly Thr Thr Val Thr Val Ser Ser
115 120
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<211> 363
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> nucleic acid
<400> 273
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tcctgtaagg gttctggata caggtttacc agctactgga tcggctgggt gcgccagatg 120
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agcccgtcct tccaaggcca ggtcaccatc tcagccgaca agtccatcag caccgcctac 240
ctgcagtgga gcagcctgaa ggcctcggac actgccatat attactgtac gagacagggt 300
agaagcttct actactacgg tatggacgtc tggggccaag ggaccacggt caccgtctcc 360
tca 363
<210> 274
<211> 354
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> nucleic acid
<400> 274
gaggtgcagc tggtgcagtc tggagcagag gtgaaaaagc ccggggagtc tctgaagatc 60
tcctgtaagg gttctggata caggtttacc agctactgga tcggctgggt gcgccagatg 120
cccgggaaag gcctggagtg gatggggatc atctatcctg gtgactctga taccagatac 180
agcccgtcct tccaaggcca ggtcaccatc tcagccgaca agtccatcag cgccgcctac 240
ctgcagtgga gcagcctgaa ggcctcggac accgccatgt attactgtgc gagacaacaa 300
gtggctggta tgttggacta ctggggccag ggaaccctgg tcaccgtctc ctca 354
<210> 275
<211> 360
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> nucleic acid
<400> 275
caggtgcagc tggtggagtc tgggggaggc gtggtccagc ctgggaggtc cctgagactc 60
tcctgtgcag cgtctggatt caccttcagt atttatggca tgcactgggt ccgccaggct 120
ccaggcaagg ggctggagtg ggtgacagtt atatggtatg atggaagtaa tgaatactat 180
gcagactccg tgaagggccg attcaccatc tccagagaca attccaagaa cacgctgtat 240
ctgcaaatga acagcctgag agccgaggac acggctgtgt attactgtgc gagagaggac 300
ttcgactccc actacggtat ggacgtctgg ggccaaggga ccacggtcac cgtctcctca 360
<210> 276
<211> 366
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> nucleic acid
<400> 276
caggtgcagc tggtggagtc tgggggaggc gtggtccagc ctgggaggtc cctgagactc 60
tcctgtgcag cgtctggatt caccttcagt agctatggca tgcactgggt ccgccaggct 120
ccaggcaagg ggctggagtg ggtggcagtt atatggtatg atggaagtaa tgaatactat 180
gcagactccg tgaagggccg attcaccatc tccagagaca attccaagaa cacgctgtat 240
ctacaaatgc acagcctgag agccgaggac acggctgtgt attattgtgc gagagaagaa 300
tggttcgggg aggcggacta cggtatggac gtctggggcc aagggaccac ggtcaccgtc 360
tcctca 366
<210> 277
<211> 366
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> nucleic acid
<400> 277
caggtgcagc tggtggagtc tgggggaggc gtggtccagc cagggaggtc cctgagactc 60
tcctgtgcag cgtctggatt caccttcagt agctatggca tgcactgggt ccgccaggct 120
ccaggcaagg ggctggagtg ggtggcagtt atatggtatg atggaagtaa tgaatattat 180
gcagactccg tgaagggccg attcaccatc tccagagaca attccaagaa cacgctgttt 240
ctgcaaatga acagcctgag agccgaggac acggctgtgt attactgtgc gagagatgat 300
tggttcgggg aggcggacta cggtatggac gtctggggcc aagggaccac ggtcaccgtc 360
tcctca 366
<210> 278
<211> 366
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> nucleic acid
<400> 278
caggtgcagc tggtggagtc tgggggaggc gtggtccagc ctgggaggtc cctgagactc 60
tcctgtgcag cgtctggatt caccttcagt aactatggca tgcactgggt ccgccaggct 120
ccaggcaagg ggctggagtg ggtgacagtt atatggaatg atggaagtaa tgaatactat 180
gcagactccg tgaagggccg attcaccatc tccagagaca attccaagaa cacgctgttt 240
ctgcaaatga acagcctgag agccgaggac acggctgtgt attactgtgc gagagaagat 300
tggctcgggg aggcggacta cggtatggac gtctggggcc aagggaccac ggtcaccgtc 360
tcctca 366
<210> 279
<211> 363
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> nucleic acid
<400> 279
caggtgcagc tggtggagtc tgggggaggc gtggtccagc ctgggaggtc cctgagactc 60
tcctgtgcag cgtctggatt caccttcagt agctatggca tgcactgggt ccgccaggct 120
ccaggcaagg ggctggagtg ggtggcagtt atatggtatg atggaagtaa taaatactat 180
gcagactccg tgaagggccg attcaccatc tccagagaca attccaagaa cacgctgtat 240
ctgcaaatga acagcctgag agccgaggac acggctgtgt attactgtgc gagagaagag 300
tgggagctag aggactacgg tatggacgtc tggggccaag ggaccacggt caccgtctcc 360
tca 363
<210> 280
<211> 378
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> nucleic acid
<400> 280
caggtgcagt tggtggagtc tgggggaggc gtggtccagc ctgggaggtc cctgagactc 60
tcctgtgcag cgtctggatt caccttcagt agttatggca tgtactgggt ccgccaggct 120
ccaggcaagg ggctggagtg ggtggcagtt atatggtatg atggaagtaa taaatactat 180
gtagactccg tgaagggccg attcaccatc tccagagaca attccaagaa cacgctgtat 240
ctgcaaatga acagcctgag agccgaggac acggctgtgt attactgtgc gagaggagca 300
gtggctggta cgggacggga ctactactac tacggtatgg acgtctgggg ccaagggacc 360
acggtcaccg tctcctca 378
<210> 281
<211> 378
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> nucleic acid
<400> 281
caggtgcagt tggtggagtc tgggggaggc gtggtccagc ctgggaggtc cctgagactc 60
tcctgtgcag cgtctggatt cacgttcagt agttatggca tgtactgggt ccgccaggct 120
ccaggcaagg ggctggagtg ggtggcagtt atatggtatg atggaagtaa taaataccat 180
ggagactccg tgaagggccg attcaccatc tccagagaca attccaagaa tacgctgtat 240
ctgcaaatga acagcctgag agccgaggac acggctgtgt attactgtgc gaaaggagca 300
gtggctggta cgggacggga ctactactac tacggtatgg acgtctgggg ccaagggacc 360
acggtcaccg tctcctca 378
<210> 282
<211> 378
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> nucleic acid
<400> 282
caggtgcagc tggtggagtc tgggggaggc gtggtccagc ctgggaggtc ccagagactc 60
tcctgtgcag cgtctggatt cacctttagt agttatggca tgtactgggt ccgccaggct 120
ccaggcaagg ggctggagtg ggtggcagtt atatggtatg atggaagtaa taaaaactat 180
gcagactccg tgaagggccg attcaccatc tccagagaca attccaagaa tacgttgtat 240
ctgcaaatga acagcctgag agccgaggac acggctgtgt atcactgtgc gaaaggaaca 300
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<211> 360
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> nucleic acid
<400> 283
caggtgcaac tggtggagtc tgggggaggc gtggtccagc ctgggaggtc cctgagactc 60
tcctgtgcag cgtctggatt caccttcagt agctttggca tgcactgggt ccgccaggct 120
ccaggcaagg ggctggagtg ggtggcagtt atttggtttg atggaagtaa taaatactat 180
gtagactccg tgaagggccg attcaccatc tccagagaca attccaagaa tacgctgtat 240
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<210> 284
<211> 360
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> nucleic acid
<400> 284
caggtgcaac tggtggagtc tgggggaggc gtggtccagc ctgggaggtc cctgagactc 60
tcctgtgcag cctctggatt caccttcagg agctatggca tgcactgggt ccgccaggct 120
ccaggcaagg ggctggagtg ggtggcagtt atatcagatg atggaagtaa taaatactat 180
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<210> 285
<211> 357
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> nucleic acid
<400> 285
caggtgcagc tggtggagtc tgggggaggc gtggtccagc ctgggaggtc cctgagactc 60
tcctgtgcag cgtctggatt caccttcagt agctatgaca tacactgggt ccgccaggct 120
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gcagactccg tgaagggccg attcaccatc tccagagaca attccaagaa cacgctgtat 240
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<210> 286
<211> 357
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> nucleic acid
<400> 286
caggtgcagc tggtggagtc tgggggaggc gtggtccagc ctgggaggtc cctgagactc 60
tcctgtgcag cgtctggatt caccttcagt agctatgaca tacactgggt ccgtcaggct 120
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<210> 287
<211> 357
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> nucleic acid
<400> 287
caggtgcagt tggtggagtc tgggggaggc gtggtccagc ctgggaggtc cctgagactc 60
tcctgtgcag cgtctggatt caccttcagt acctatggca tgcactgggt ccgccaggct 120
ccagacatgg ggctggagtg ggtggcagtt atatggtatg atggaagtaa taaatactat 180
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ctggaaatga acagcctgag agccgaggac acggctgtgt attactgtgc gagagacaac 300
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<210> 288
<211> 378
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> nucleic acid
<400> 288
caggtgcagc tggtggagtc tgggggaggc gtggtccagc ctgggaggtc cctgagactc 60
tcctgtgcag cgtctggatt caccttcagt acctatgcca tgcactgggt ccgccaggct 120
ccaggcaagg ggctggagtg ggtggcagtt atatggtatg atggaattaa taaatactat 180
gcagactccg tgaagggccg attcaccatc tccagagaca attccaagaa cacgctgtat 240
ctgcaaatga acagcctgag agccgaggac acggctgtgt attactgtgc gagagggagt 300
tactatgata gtagtggtta ttactacggg gaggactttg actactgggg ccagggaacc 360
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<210> 289
<211> 378
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> nucleic acid
<400> 289
caggtgcagc tggtggagtc tgggggaggc gtggtccagc ctgggaggtc cctgagactc 60
tcctgtgcag cgtctggatt caccttcagt agctatgcca tgcactgggt ccgccaggct 120
ccaggcaagg ggctggagtg ggtggcagtt atctggtatg atggaattaa taaatactat 180
gcagactccg tgaagggccg attcaccatc tccagagaca attccaagaa cacgctgtat 240
ctgcaaatga acagcctgag agccgaggac acggctgtgt attactgtgc gagagggagt 300
tactatgata gtagtggtta ttacttcggg gaggactttg actactgggg ccagggaacc 360
ctggtcaccg tctcctca 378
<210> 290
<211> 354
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> nucleic acid
<400> 290
caggtgcagc tggtggagtc tgggggaggc ttggtcaagc ctggagggtc cctgagactc 60
tcctgtgcag cctctggatt caccttcagt gactactaca tgagctggat ccgccaggct 120
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gcagactctg tgaagggccg attcaccatg tccagggaca acgccaagaa ctcactgtat 240
ctgcaaatga acagcctgag agccgaggac acggccgtgt attattgtgt gagaaggatt 300
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<211> 378
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> nucleic acid
<400> 291
caggtcacct tgaaggagtc tggtcctgtg ctggtgaaac ccacagagac cctcacgctg 60
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acggtcaccg tctcctca 378
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<211> 357
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> nucleic acid
<400> 292
caggtgcagc tgcaggagtc gggcccagga ctggtgaagc cttcacagac cctgtccctc 60
acctgcactg tctctggtgg ctccatcagc agtggtggtt actactggaa ctggatccgc 120
cagcacccag ggaagggcct ggagtggatt gggtacatct attacagtgg gaacacccac 180
tacaacccgt ccctcaagag tcgagttacc atatcagtag acacgtctaa gaaccagttc 240
tccctgaagc tgagctctgt gattgccgcg gacacggccg tgtattactg tgcgagagac 300
tggggacgtg atgcttttga tatctggggc caagggacaa tggtcaccgt ctcttca 357
<210> 293
<211> 372
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> nucleic acid
<400> 293
caggtgcagc tgcaggagtc gggcccagga ctggtgaagc cttcacagac cctgtccctc 60
acctgcactg tctcgggtgg ctccatcagc agtggtggtt actactggag ctggatccgc 120
cagcacccag ggaagggcct ggagtggatt gggtacatct attatagtgg gagcaccgac 180
tacaacccgt ccctcaagag tcgaggtatc atatcaggag acacgtctaa gaaccagttc 240
tccctgaagc tgaactctgt gactgccgcg gacacggccg tgtattactg tgcgagagag 300
gggaggttcg gggagttagg ctcctactac tttgactact ggggccaggg aaccctggtc 360
accgtctcct ca 372
<210> 294
<211> 363
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> nucleic acid
<400> 294
caggtgcagc tgcaggagtc gggcccagga ctggtgaagc cttcggagac cctgtccctc 60
acctgcactg tctctggtgg ctccgtcagc agtggtggtt actactggag ctggatccgg 120
cagcccccag ggaagggact ggagtggatt gggaatacct attacagtgg gagcaccaac 180
tacaaaccct ccctcaagag tcgagtcacc atatcagtag acacgtccaa gaaccagttc 240
tccctgaagc tgagttctgt gaccgctgcg gacacggccg tgtattactg tgggagagac 300
cggggtagag cagtgggtcc ctttgactac tggggccagg gaaccctggt caccgtctcc 360
tca 363
<210> 295
<211> 354
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> nucleic acid
<400> 295
caggtgcagc tggtgcagtc tggggctgag gtgaagaagc ctggggcctc agtgaaggtc 60
tcctgcaagg cttctggata caccttcacc aattatgata tcaactgggt gcgacaggcc 120
actggacaag ggcttgagtg gatgggatgg atgaacccta acagtggtaa cacaggctat 180
gcacagaagt tccagggcag agtcaccatg accaggaaca cctccataag cacagcctac 240
atggagctga gcagcctgag atctgaggac acggccgtgt attactgtgc gagaagtagg 300
cagtggctgg tacttgacta ctggggccag ggaaccctgg tcaccgtctc ctca 354
<210> 296
<211> 354
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> nucleic acid
<400> 296
caggtgcagc tggtgcagtc tggggctgag gtgaagaagc ctggggcctc agtgaaggtc 60
tcctgcaagg cttctggata caccttcacc aattatgata tcaactgggt gcgacaggcc 120
actggacaag ggcttgagtg gatgggatgg atgaacccta acagtggtaa cacaggctat 180
gtacagaagt tccagggcag agtcaccatg accaggaaca cctccataag cacagcctac 240
atggagctga gcagcctgag atctgaggac acggccgtgt attactgtgc gagaagtagg 300
cagtggctgg tacttgacta ctggggccag ggaaccctgg tcaccgtctc ctca 354
<210> 297
<211> 354
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> nucleic acid
<400> 297
caggtgcagc tggtgcagtc tggggctgag gtgaagaagc ctggggcctc agtgaaggtc 60
tcctgcaagg cttctggata caggttcacc agttatgata tcaactgggt gcgacaggcc 120
actggacaag ggcttgagtg gatgggatgg atgaacccaa acagtggtaa cacaggctat 180
gcacagaagt tccagggcag agtcaccatg accaggaaca cctccataag cacagcctac 240
atggagctga gcagcctgag atctgaggac acggccgtgt attactgtgc gagaagtagg 300
cagtggctgg tacttgacta ctggggccag ggaaccctgg tcaccgtctc ctca 354
<210> 298
<211> 354
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> nucleic acid
<400> 298
caggtgcagc tggtgcagtc tggggctgag gtgaagaagc ctggggcctc agtgaaggtc 60
tcctgcaagg cttctggata caccttcacc acttatgata tcaactgggt gcgacaggcc 120
actggacaag ggcttgagtg gatgggatgg atgaacccta acagtggtaa cacaggctat 180
gcacagaagt tccagggcag agtcaccatg accaggaaca cctccataag cacagcctac 240
atggagctga gcagcctaag atctgaggac acggccgtgt attactgtgc gagaggccgg 300
cagtggctgg gctttgacta ctggggccag ggaaccctgg tcaccgtctc ctca 354
<210> 299
<211> 354
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> nucleic acid
<400> 299
caggtgcagc tggtgcagtc tggggctgag gtgaagaagc ctggggcctc agtgaaggtc 60
tcctgcaagg cttctggata caccttcacc aattatgata tcaactgggt gcgacaggcc 120
actggacaag ggcttgagtg gatgggatgg atgaacccta atagtggtaa cacaggctat 180
gcacagaagt tccagggcag agtcaccatg accaggaaca cctccataaa cacagcctac 240
atggagctga gcagcctgag atctgaggac acggccgtgt attactgtgc gagaggccgg 300
cagtggctgg gctttgacta ctggggccag ggaaccctgg tcaccgtctc ctca 354
<210> 300
<211> 363
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> nucleic acid
<400> 300
gaggtgcagc tggtgcagtc tggagcagag gtgaaaaagc ccggggagtc tctgaagatc 60
tcctgtaagg gttctggata cagctttacc agccagtgga tcggctgggt gcgccagatg 120
cccgggaaag gcctggagtg gatggggatc atctttcctg gtgactctga taccagatac 180
agcccgtcct tccaaggcca ggtcaccatc tcagccgaca agtccatcag caccgcctac 240
ctgcagtgga gcagcctgaa ggcctcggac accgccatgt attactgtgc gcgacagggt 300
agaagttacc actactacgg tatggacgtc tggggccaag ggaccacggt caccgtctcc 360
tca 363
<210> 301
<211> 363
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> nucleic acid
<400> 301
gaggtgcagc tggtgcagtc tggagcagag gtgaaaaagc ccggggagtc tctgaagatc 60
tcctgtaagg gttctggata cggctttacc aactactgga tcggctgggt gcgccagatg 120
cccggaaaag gcctggagtg gatggggacc atctatcctg gtgactctga taccagatac 180
agtccgtcct tccaaggcca ggtcaccttc tcagccgaca agtccatcag caccgcctac 240
ctgcagtgga gcagcctgaa ggcctcggac accgccatgt attactgtgc gagacagggt 300
agaagttact actacttcgg tatggacgtc tggggccaag ggaccacggt caccgtctcc 360
tca 363
<210> 302
<211> 366
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> nucleic acid
<400> 302
gaggtgcagc tggtgcagtc tggagcagag gtgaaaaagc ccggggagtc tctgaagatc 60
tcctgtaagg gttctggata cagctttacc gactactgga tcggctgggt gcgccagatg 120
cccgggaaag gcctggaatg gatggggatc atctatcctt atgactctga taccagatac 180
agcccgtcct tccaaggcca ggtcaccctc tcagccgaca agtccatcag caccgcctac 240
ctgcggtgga gcagcctgaa ggcctcggac accgccatgt attactgtgc gagacatcgg 300
ggggggaggt cctactacta cggtatggac gtctggggcc aagggaccac ggtcaccgtc 360
tcctca 366
<210> 303
<211> 366
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> nucleic acid
<400> 303
gaggtgcagc tggtgcagtc tggagcagag gtgaaaaagc ccggggagtc tctgaagatc 60
tcctgtaagg gttctggata cagctttacc agctactgga tcggctgggt gcgccagatg 120
cccgggaaag gcctagaatg gatggggatc atctatcctg gtgactctga taccacatac 180
agcccgtcct tccaaggcca agtcaccatc tcagccgaca agtccatcaa caccgcctac 240
ctgcagtgga gcagcctgaa ggcctcggac accgccatgt attactgtgc gagagagggt 300
ttcggggagt ctattcacta cggtttggac gtctggggcc aagggaccac ggtcaccgtc 360
tcctca 366
<210> 304
<211> 363
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> nucleic acid
<400> 304
gaggtgcagc tggtgcagtc tggagcagag gtgaaaaagc ccggggagtc tctgaagatc 60
tcctgtaagg gttctggata caattttacc aactactgga tcggctgggt gcgccagatg 120
tccgggaaag gcctggagtg gatgggaatc atctatcctg gtgactctga aaccagatac 180
agcccgtcct tccaaggcca ggtcaccatc tcagccgaca agtccatcag caccgcctac 240
ctgcagtgga gcagcctgaa ggcctcggac accgccatgt attactgtgc gagacatgga 300
gggggatgga gtggttgggg tatggacgtc tggggccaag ggaccacggt caccgtctcc 360
tca 363
<210> 305
<211> 372
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> nucleic acid
<400> 305
gaggtgcagc tggtgcagtc tggagcagag gtgaaaaagc ccggggagtc tctgaagatc 60
tcctgtaagg gttctggata caggtttacc aactactgga tcggctgggt gcgccagatg 120
cccgggaaag gcctggagtg gatggggatc atctatcctg gtgactctga taccaaatac 180
agcccgtcct tccaaggcca ggtcaccatc tcagccgaca agtccatcag taccgcctac 240
ctgcagtgga gcagcctgaa ggcctcggac accgccatgt attactgtgc gagacatggt 300
ggatatagtg gccgttccta ctactacggt atggacgtct ggggccaggg gaccgcggtc 360
accgtctcct ca 372
<210> 306
<211> 378
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> nucleic acid
<400> 306
gaggtgcagc tggtgcagtc tggagcagag gtgaaaaagc ccggggagtc tctgaagatc 60
tcctgtaagg gttctggata caggtttacc agctactgga tcggctgggt gcgccagatg 120
cccgggaaag gcctggagtg gatggggatc atctttcctg gtgactctga taccagatac 180
agcccgtcct tccaaggcca ggtcaccatc tcagccgaca agtccatcac caccgcctac 240
ctgcagtgga gcagcctgaa ggcctcggac accgccatct attactgtgc gcgacatggg 300
catggcagct cgtccgggcg gacctactac tacggtttgg acgtctgggg ccaagggacc 360
acggtcaccg tctcctca 378
<210> 307
<211> 348
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> nucleic acid
<400> 307
gaggtgcagc tggtgcaatc tggagcagag gtgaaaaagc ccggggagtc tctgaagatc 60
tcctgtaagg gttctggata caactttacc acctactgga tcggctgggt gcgccagatg 120
cccgggaaag gcctggagtg gatggggatc atctatcctg gtgactctga taccagatac 180
agcccgtcct tccaaggcca ggtcaccatt tcagccgaca agtccatcaa caccgcctac 240
ctgcagtgga gcagcctgaa ggcctcggac acagccattt attactgtgc gagagacaca 300
ggatactttg actactgggg ccagggcacc ctggtcaccg tctcctca 348
<210> 308
<211> 366
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> nucleic acid
<400> 308
caggtgcagt tggtggagtc tgggggaggc gtggtccagc ctgggaggtc cctgagactc 60
tcctgtgcag cgtctggatt caccttcagt agctatggca tgcactgggt ccgccaggct 120
ccaggcaagg gcctggagtg ggtggcagtt atctggtatg atggaagtaa taaattctat 180
gtagactccg tgaagggccg attcaccatc tccagagaca attccaagaa cacgctgtat 240
ctgcaaatga acagcctgag agccgaggac acggctgtgt attactgtgc gagacccggg 300
tccgattact acttctacta cggtatggac gtctggggcc aagggaccac ggtcaccgtc 360
tcctca 366
Claims (131)
- 서열번호:1에 제시된 아미노산 서열에 적어도 90% 동일한 아미노산 서열을 포함하는 인간 인터류킨-2 (IL-2) 뮤테인이며,
L12G, L12K, L12Q, L12S, Q13G, E15A, E15G, E15S, H16A, H16D, H16G, H16K, H16M, H16N, H16R, H16S, H16T, H16V, H16Y, L19A, L19D, L19E, L19G, L19N, L19R, L19S, L19T, L19V, D20A, D20E, D20F, D20G, D20T, D20W, M23R, R81A, R81G, R81S, R81T, D84A, D84E, D84G, D84I, D84M, D84Q, D84R, D84S, D84T, S87R, N88A, N88D, N88E, N88F, N88G, N88M, N88R, N88S, N88V, N88W, V91D, V91E, V91G, V91S, I92K, I92R, 및 E95G로부터 선택된 적어도 하나의 돌연변이를 갖고, 시험관내 검정 및 인간화(humanized) 마우스 (CD34+ 조혈 줄기 세포로 재구성된 NSG 마우스) 둘다에서 기타 T 세포 또는 NK 세포와 비교하여 T 조절 세포를 우선적으로 자극하는, 인간 인터류킨-2 (IL-2) 뮤테인. - 청구항 1에 있어서, 서열번호:1에 제시된 아미노산 서열에 적어도 95% 동일한 인간 IL-2 뮤테인.
- 청구항 1에 있어서, 서열번호:1에 제시된 아미노산 서열에 적어도 97% 동일한 인간 IL-2 뮤테인.
- 청구항 1 내지 3 중 어느 한 항에 있어서, 상기 뮤테인의 아미노산 서열이 서열번호:1에 제시된 아미노산 서열과 비교하여 오직 C125A, 및 L12G, L12K, L12Q, L12S, Q13G, E15A, E15G, E15S, H16A, H16D, H16G, H16K, H16M, H16N, H16R, H16S, H16T, H16V, H16Y, L19A, L19D, L19E, L19G, L19N, L19R, L19S, L19T, L19V, D20A, D20E, D20F, D20G, D20T, D20W, M23R, R81A, R81G, R81S, R81T, D84A, D84E, D84G, D84I, D84M, D84Q, D84R, D84S, D84T, S87R, N88A, N88D, N88E, N88F, N88G, N88M, N88R, N88S, N88V, N88W, V91D, V91E, V91G, V91S, I92K, I92R, 및 E95G로부터 선택된 하나의 위치에서만 상이한 것인 인간 IL-2 뮤테인.
- 청구항 4에 있어서, 상기 뮤테인의 아미노산 서열이 서열번호:1에 제시된 아미노산 서열과 오직 C125A, 및 D20E, D20G, D20W, D84A, D84S, H16D, H16G, H16K, H16R, H16T, H16V, I92K, I92R, L12K, L19D, L19N, L19T, N88D, N88R, N88S, V91D, V91G, V91K, 및 V91S로부터 선택된 하나의 위치에서만 상이한 것인 인간 IL-2 뮤테인.
- Fc 및 청구항 1 내지 5 중 어느 한 항의 인간 IL-2 뮤테인을 포함하는 Fc-융합 단백질.
- 청구항 6에 있어서, 상기 Fc가 인간 IgG1 Fc인 Fc-융합 단백질.
- 청구항 7에 있어서, 상기 인간 IgG1 Fc가 상기 Fc의 효과기 기능을 변경시키는 하나 이상의 돌연변이를 포함하는 것인 Fc-융합 단백질.
- 청구항 8에 있어서, 상기 인간 IgG1이 N297에서의 치환을 포함하는 것인 Fc-융합 단백질.
- 청구항 9에 있어서, 상기 N297에서의 치환이 N297G인 Fc-융합 단백질.
- 청구항 7 내지 10 중 어느 한 항에 있어서, 상기 인간 IgG Fc의 상기 C-말단 리신의 치환 또는 결실을 포함하는 Fc-융합 단백질.
- 청구항 11에 있어서, 상기 인간 IgG Fc의 C-말단 리신이 결실된 것인 Fc-융합 단백질.
- 청구항 6 내지 12 중 어느 한 항에 있어서, 링커가 상기 단백질의 인간 IL-2 뮤테인 부분 및 Fc를 연결시키는 것인 Fc-융합 단백질.
- 청구항 13에 있어서, 상기 링커가 GGGGS (서열번호:5), GGNGT, 또는 (서열번호:6), 및 YGNGT (서열번호:7)인 Fc-융합 단백질.
- 청구항 14에 있어서, 상기 링커가 GGGGS (서열번호:5)인 Fc-융합 단백질.
- 청구항 6 내지 15 중 어느 한 항에 있어서, 포유동물 세포에서 발현될 때 상기 IL-2 뮤테인이 상기 Fc-융합 단백질의 글리코실화를 변경시키는 아미노산 첨가, 치환, 또는 결실을 추가로 포함하는 것인 Fc-융합 단백질.
- 청구항 16에 있어서, 상기 IL-2 뮤테인이 T3 치환을 포함하는 것인 Fc-융합 단백질.
- 청구항 17에 있어서, 상기 IL-2 뮤테인이 T3N 또는 T3A 치환을 포함하는 것인 Fc-융합 단백질.
- 청구항 18에 있어서, 상기 IL-2 뮤테인이 T3N 치환을 포함하는 것인 Fc-융합 단백질.
- 청구항 19에 있어서, 상기 IL-2 뮤테인이 S5 돌연변이를 추가로 포함하는 것인 Fc-융합 단백질.
- 청구항 20에 있어서, 상기 IL-2 뮤테인이 S5T 돌연변이를 추가로 포함하는 것인 Fc-융합 단백질.
- 청구항 6 내지 21 중 어느 한 항에 있어서, Fc 이량체를 포함하는 Fc-융합 단백질.
- 청구항 22에 있어서, 2개의 IL-2 뮤테인을 포함하는 Fc-융합 단백질.
- 청구항 22에 있어서, 단일 IL-2 뮤테인을 포함하는 Fc-융합 단백질.
- 청구항 1 내지 5 중 어느 한 항의 인간 IL-2 뮤테인을 암호화하는 단리된 핵산.
- 항체의 Fc 부분, 및 청구항 1 내지 5 중 어느 한 항의 인간 IL-2 뮤테인을 암호화하는 단리된 핵산.
- 청구항 26에 있어서, 상기 항체의 Fc 부분 및 상기 인간 IL-2 뮤테인이 단일 개방형 판독 프레임(open-reading frame) 내에서 암호화되는 것인 단리된 핵산.
- 청구항 26 또는 27에 있어서, 상기 Fc가 인간 IgG1 Fc인 단리된 핵산.
- 청구항 28에 있어서, 상기 인간 IgG1 Fc가 상기 Fc의 효과기 기능을 변경시키는 하나 이상의 돌연변이를 포함하는 것인 단리된 핵산.
- 청구항 29에 있어서, 상기 인간 IgG1이 N297에서의 치환을 포함하는 것인 단리된 핵산.
- 청구항 28에 있어서, 상기 N297에서의 치환이 N297G인 단리된 핵산.
- 청구항 28 내지 31 중 어느 한 항에 있어서, 상기 인간 IgG Fc의 C-말단 리신의 치환 또는 결실을 암호화하는 단리된 핵산.
- 청구항 32에 있어서, 상기 인간 IgG Fc의 C-말단 리신이 결실된 것인 단리된 핵산.
- 청구항 26 내지 33 중 어느 한 항에 있어서, 항체의 Fc 영역 및 인간 IL-2 뮤테인을 연결시키는 링커를 추가로 암호화하는 단리된 핵산.
- 청구항 34에 있어서, 상기 링커가 GGGGS (서열번호:5), GGNGT, 또는 (서열번호:6), 및 YGNGT (서열번호:7)인 단리된 핵산.
- 청구항 35에 있어서, 상기 링커가 GGGGS (서열번호:5)인 단리된 핵산.
- 청구항 26 내지 36 중 어느 한 항에 있어서, 포유동물 세포에서 발현될 때 상기 IL-2 뮤테인이 상기 IL-2 뮤테인을 포함하는 단백질의 글리코실화를 변경시키는 아미노산 첨가, 치환, 또는 결실을 추가로 포함하는 것인 단리된 핵산.
- 청구항 37에 있어서, 상기 IL-2 뮤테인이 T3 치환을 포함하는 것인 단리된 핵산.
- 청구항 38에 있어서, 상기 IL-2 뮤테인이 T3N 또는 T3A 치환을 포함하는 것인 단리된 핵산.
- 청구항 39에 있어서, 상기 IL-2 뮤테인이 T3N 치환을 포함하는 것인 단리된 핵산.
- 청구항 40에 있어서, 상기 IL-2 뮤테인이 S5 돌연변이를 추가로 포함하는 것인 단리된 핵산.
- 청구항 41에 있어서, 상기 IL-2 뮤테인이 S5T 돌연변이를 추가로 포함하는 것인 단리된 핵산.
- 프로모터에 작동가능하게 연결된 청구항 25 내지 42 중 어느 한 항에 따른 단리된 핵산을 포함하는 발현 벡터.
- 청구항 25 내지 42 중 어느 한 항에 따른 단리된 핵산을 포함하는 숙주 세포.
- 청구항 44에 있어서, 상기 단리된 핵산이 프로모터에 작동가능하게 연결된 것인 숙주 세포.
- 청구항 44 또는 45에 있어서, 원핵 세포인 숙주 세포.
- 청구항 46에 있어서, 이.콜라이(E. coli)인 숙주 세포.
- 청구항 44 또는 45에 있어서, 진핵 세포인 숙주 세포.
- 청구항 48에 있어서, 포유동물 세포인 숙주 세포.
- 청구항 49에 있어서, 중국 햄스터 난소 (CHO) 세포주인 숙주 세포.
- 인간 IL-2 뮤테인을 제조하는 방법이며,
청구항 45 내지 50 중 어느 한 항의 숙주 세포를 상기 프로모터가 발현되는 조건하에 배양하는 단계, 및
상기 배양물로부터 인간 IL-2 뮤테인을 수거하는 단계
를 포함하는 방법. - Fc-융합 단백질을 제조하는 방법이며,
청구항 45 내지 50 중 어느 한 항의 숙주 세포를 상기 프로모터가 발현되는 조건하에 배양하는 단계, 및
상기 배양물로부터 Fc-융합 단백질을 수거하는 단계
를 포함하는 방법. - T 세포 집단에서 비-조절 T 세포에 대한 조절 T 세포(Treg)의 비율을 증가시키는 방법이며,
상기 T 세포 집단을 청구항 1 내지 5 중 어느 한 항의 인간 IL-2 뮤테인의 유효량과 접촉시키는 단계를 포함하는 방법. - 청구항 53에 있어서, CD3+FoxP3-에 대한 CD3+FoxP3+ 세포 비율이 증가되는 것인 방법.
- 청구항 54에 있어서, CD3+FoxP3-에 대한 CD3+FoxP3+ 세포 비율이 최소 50% 증가되는 것인 방법.
- T 세포 집단에서 비-조절 T 세포에 대한 조절 T 세포(Treg)의 비율을 증가시키는 방법이며,
상기 T 세포 집단을 청구항 6 내지 24 중 어느 한 항에 따른 Fc-융합 단백질의 유효량과 접촉시키는 단계를 포함하는 방법. - 청구항 56에 있어서, CD3+FoxP3-에 대한 CD3+FoxP3+ 세포 비율이 증가되는 것인 방법.
- 청구항 57에 있어서, CD3+FoxP3-에 대한 CD3+FoxP3+ 세포 비율이 최소 50% 증가되는 것인 방법.
- 대상체의 말초혈액 내에서 비-조절 T 세포에 대한 조절 T 세포(Treg)의 비율을 증가시키는 방법이며,
청구항 1 내지 5 중 어느 한 항의 인간 IL-2 뮤테인의 유효량을 투여하는 단계를 포함하는 방법. - 청구항 59에 있어서, CD3+FoxP3-에 대한 CD3+FoxP3+ 세포 비율이 증가되는 것인 방법.
- 청구항 60에 있어서, CD3+FoxP3-에 대한 CD3+FoxP3+ 세포 비율이 최소 50% 증가되는 것인 방법.
- 대상체의 말초혈액에서 비-조절 T 세포에 대한 조절 T 세포(Treg)의 비율을 증가시키는 방법이며,
청구항 6 내지 24 중 어느 한 항의 Fc-융합 단백질의 유효량을 투여하는 단계를 포함하는 방법. - 청구항 62에 있어서, CD3+FoxP3-에 대한 CD3+FoxP3+ 세포 비율이 증가되는 것인 방법.
- 청구항 63에 있어서, CD3+FoxP3-에 대한 CD3+FoxP3+ 세포 비율이 최소 50% 증가되는 것인 방법.
- 대상체의 말초혈액에서 자연 살해 (NK) 세포에 대한 조절 T 세포(Treg)의 비율을 증가시키는 방법이며,
청구항 1 내지 5 중 어느 한 항의 인간 IL-2 뮤테인의 유효량을 투여하는 단계를 포함하는 방법. - 청구항 65에 있어서, CD56 및/또는 CD16을 발현하는 CD3-CD19-림프구에 대한 CD3+FoxP3+ 세포 비율이 증가되는 것인 방법.
- 청구항 66에 있어서, CD56 및/또는 CD16을 발현하는 CD3-CD19-림프구에 대한 CD3+FoxP3+ 세포 비율이 최소 50% 증가되는 것인 방법.
- 대상체의 말초혈액에서 자연 살해 (NK) 세포에 대한 조절 T 세포(Treg)의 비율을 증가시키는 방법이며,
청구항 6 내지 24 중 어느 한 항의 Fc-융합 단백질의 유효량을 투여하는 단계를 포함하는 방법. - 청구항 68에 있어서, CD56 및/또는 CD16을 발현하는 CD3-CD19-림프구에 대한 CD3+FoxP3+ 세포 비율이 증가되는 것인 방법.
- 청구항 63에 있어서, CD56 및/또는 CD16을 발현하는 CD3-CD19-림프구에 대한 CD3+FoxP3+ 세포 비율이 최소 50% 증가되는 것인 방법.
- 염증성 질환 또는 자가면역 질환을 가진 대상체를 치료하는 방법이며,
상기 대상체에게 청구항 1 내지 5 중 어느 한 항의 IL-2 뮤테인의 치료적 유효량을 투여하는 단계를 포함하는 방법. - 염증성 질환 또는 자가면역 질환을 가진 대상체를 치료하는 방법이며,
상기 대상체에게 청구항 6 내지 21 중 어느 한 항의 Fc-융합 단백질의 치료적 유효량을 투여하는 단계를 포함하는 방법. - 청구항 71 또는 72에 있어서, 투여에 의해 상기 질환의 적어도 하나의 증상이 감소되는 것인, 염증성 질환 또는 자가면역 질환을 가진 대상체를 치료하는 방법.
- 청구항 73에 있어서, 상기 투여 후 대상체의 말초혈액 내에서 비-조절 T 세포에 대한 조절 T 세포(Treg)의 비율이 증가되는 것인 방법.
- 청구항 73에 있어서, 상기 투여 후 대상체의 말초혈액 내에서 비-조절 T 세포에 대한 조절 T 세포(Treg)의 비율이 본질적으로 동일하게 유지되는 것인 방법.
- 청구항 71 내지 75 중 어느 한 항에 있어서, 상기 염증성 질환 또는 자가면역 질환이 낭창, 이식편 대 숙주 질환, C 형 간염-유도된 맥관염, I 형 당뇨병, II 형 당뇨병, 다발성 경화증, 류마티스성 관절염, 탈모증(alopecia areata), 죽상동맥경화증, 건선, 장기 이식 거부, 쇼그렌 증후군(Sjogren's Syndrome), 베체트 증후군(Behget's Syndrome), 자연유산, 아토피성 질환, 천식 또는 염증성 장 질환인 방법.
- 인간 IgG1 항체의 Fc 영역을 포함하는 폴리펩티드이며,
상기 Fc 영역은 N297G 돌연변이를 포함하고 상기 인간 IgG1의 Fc 영역은 서열번호:3에 제시된 아미노산 서열에 대해 적어도 90% 동일성을 포함하는 것인 폴리펩티드. - 청구항 77에 있어서, 상기 인간 IgG1의 Fc 영역이 서열번호:3에 제시된 아미노산 서열에 대해 적어도 95% 동일성을 포함하는 것인 폴리펩티드.
- 청구항 77에 있어서, 상기 인간 IgG1의 Fc 영역이 서열번호:3에 제시된 아미노산 서열을 포함하는 것인 폴리펩티드.
- 청구항 77에 있어서, 상기 인간 IgG1의 Fc 영역이 상기 폴리펩티드를 안정화시키기 위한 하나 이상의 돌연변이를 추가로 포함하는 것인 폴리펩티드.
- 청구항 80에 있어서, 서열번호:3에 제시된 하나 이상의 아미노산이 시스테인으로 치환된 것인 폴리펩티드.
- 청구항 81에 있어서, 서열번호:3에 제시된 아미노산 서열의 V259, A287, R292, V302, L306, V323, 또는 I332이 시스테인으로 치환된 것인 폴리펩티드.
- 청구항 82에 있어서, 상기 Fc 영역이 서열번호:3에 제시된 아미노산 서열 내에 A287C 및 L306C 치환을 포함하는 것인 폴리펩티드.
- 청구항 82에 있어서, 상기 Fc 영역이 서열번호:3에 제시된 아미노산 서열 내에 V259C 및 L306C 치환을 포함하는 것인 폴리펩티드.
- 청구항 82에 있어서, 상기 Fc 영역이 서열번호:3에 제시된 아미노산 서열 내에 R292C 및 V302C 치환을 포함하는 것인 폴리펩티드.
- 청구항 82에 있어서, 상기 Fc 영역이 서열번호:3에 제시된 아미노산 서열 내에 V323C 및 I332C 치환을 포함하는 것인 폴리펩티드.
- 청구항 77 내지 86 중 어느 한 항의 Fc 영역을 포함하는 항체.
- 청구항 77 내지 86 중 어느 한 항의 Fc 영역을 포함하는 Fc-융합 단백질.
- 링커를 포함하는 폴리펩티드이며, 상기 링커가 GGNGT (서열번호:6) 또는 YGNGT (서열번호:7)인 폴리펩티드.
- 청구항 89에 있어서, 상기 링커가 N-글리코실화를 포함하는 것인 폴리펩티드.
- 청구항 89에 있어서, 상기 링커가 상기 폴리펩티드 구조 내 루프(loop)를 대체하거나 이에 삽입되는 것인 폴리펩티드.
- 탈글리코실화된 IgG1 Fc-함유 분자를 제조하는 방법이며,
a) 포유동물 세포 배양물에서 청구항 77 내지 86 중 어느 한 항의 폴리펩티드를 암호화하는 핵산을 발현시키는 단계; 및
b) 상기 배양물로부터 탈글리코실화된 IgG1 Fc-함유 분자를 수거하는 단계
를 포함하는 방법. - 포유동물 세포에서 발현될 때 탈글리코실화된 IgG1 Fc-함유 분자를 제조하는 방법이며,
상기 Fc 영역에서 N297에 대한 코돈을 글리신 코돈으로 돌연변이시키는 단계를 포함하는 방법. - Fc-융합 단백질이며,
상기 Fc-융합 단백질의 아미노산 서열이 도 24에서 도시된 인간 IL-2 뮤테인 융합 단백질의 아미노산 서열에 적어도 90% 동일한 것인 Fc-융합 단백질. - 청구항 94에 있어서, 상기 Fc-융합 단백질의 아미노산 서열이 도 24에서 도시된 인간 IL-2 뮤테인 융합 단백질의 아미노산 서열에 적어도 95% 동일한 것인 Fc-융합 단백질.
- 청구항 94에 있어서, 상기 Fc-융합 단백질의 아미노산 서열이 도 24에서 도시된 인간 IL-2 뮤테인 융합 단백질의 아미노산 서열에 적어도 97% 동일한 것인 Fc-융합 단백질.
- 청구항 94에 있어서, 상기 Fc-융합 단백질의 아미노산 서열이 도 24에서 도시된 인간 IL-2 뮤테인 융합 단백질의 아미노산 서열에 적어도 99% 동일한 것인 Fc-융합 단백질.
- 청구항 94에 있어서, 상기 Fc-융합 단백질의 아미노산 서열이 도 24에서 도시된 인간 IL-2 뮤테인 융합 단백질의 아미노산 서열과 동일한 것인 Fc-융합 단백질.
- 청구항 94의 Fc-융합체를 암호화하는 핵산.
- 청구항 99의 핵산을 포함하는 세포.
- Fc-융합 단백질을 제조하는 방법이며,
상기 Fc-융합 단백질의 발현을 허용하는 조건하에 청구항 100의 세포를 배양하는 단계를 포함하는 방법. - 대상체의 염증성 또는 자가-면역 병태를 치료하는 방법이며,
청구항 94의 Fc-융합 단백질의 유효량을 상기 대상체에게 투여하는 단계를 포함하는 방법. - 청구항 102에 있어서, 상기 염증성 질환 또는 자가면역 병태가 낭창, 이식편 대 숙주 질환, C 형 간염-유도된 맥관염, I 형 당뇨병, II 형 당뇨병, 다발성 경화증, 류마티스성 관절염, 탈모증, 죽상동맥경화증, 건선, 장기 이식 거부, 쇼그렌 증후군, 베체트 증후군, 자연유산, 아토피성 질환, 천식 또는 염증성 장 질환인 방법.
- 청구항 1의 인간 인터류킨-2 (IL-2) 뮤테인, 청구항 6의 Fc-융합 단백질, 또는 청구항 94의 Fc-융합 단백질로 치료받은 대상체의 반응을 모니터링하는 방법이며,
상기 대상체에서
a) 체온의 증가,
b) 상기 대상체의 말초혈액에서 CRP의 증가,
c) 상기 대상체의 말초혈액에서 혈소판의 감소,
d) 상기 대상체의 말초혈액에서 호중구의 감소, 또는
e) 상기 대상체의 말초혈액에서 알부민의 감소
인 변화를 탐지하는 단계
를 포함하고, 상기 변화가 탐지된 후에는 상기 치료가 종료되거나 유예되거나 투여 빈도가 감소되거나 또는 투여량이 감소되는 것인 방법. - 청구항 104에 있어서, 상기 변화가
a) 체온이 적어도 0.5℃ 증가,
b) 상기 대상체의 말초혈액에서 CRP가 적어도 0.2 mg/mL 증가,
c) 상기 대상체의 말초혈액의 혈소판이 적어도 0.8-배 감소,
d) 상기 대상체의 말초혈액에서 호중구가 적어도 0.8-배 감소, 또는
e) 상기 대상체의 말초혈액에서 알부민이 적어도 0.4-배 감소
를 포함하는 것인 방법. - 단리된 항-인간 IL-2 항체이며,
a) 참조 항체의 중쇄 가변 도메인에 적어도 90% 동일한 중쇄 가변 도메인, 및 상기 참조 항체의 경쇄 가변 도메인에 적어도 90% 동일한 경쇄 가변 도메인을 포함하며, 상기 참조 항체는 9D6, 2C3, 14C9, 8B12, 16A4, 16E1, 13A1, 8F10, 12C4, 9B12, 3H5, 18A6, 10A6, 10H7, 15A10, 12D2, 9B10, 17D3, 15G11, 14D7, 18F3, 17D9, 21F8, 22B9, 221D10, 14A6, 11D6, 10A9, 16E3, 14G7, 5H3, 2B12, 26H7, 26C12, 2H11, 또는 18H9이며, 상기 참조 항체의 상기 중쇄 가변 도메인 및 상기 경쇄 가변 도메인은 각각 도 28 및 도 26에 도시되거나; 또는
b) 참조 항체의 중쇄 가변 도메인의 CDR1, CDR2, 및 CDR3을 포함하는 중쇄 가변 도메인, 및 상기 참조 항체의 경쇄 가변 도메인의 CDR1, CDR2, 및 CDR3을 포함하는 경쇄 가변 도메인을 포함하며, 상기 중쇄 CDR 및 경쇄 CDR은 각각 도 28 및 도 26에 도시되거나; 또는
c) 야생형 인간 IL-2 사이토카인에 대한 참조 항체의 결합과 교차-경쟁하며, 상기 참조 항체는 9D6, 2C3, 14C9, 8B12, 16A4, 16E1, 13A1, 8F10, 12C4, 9B12, 3H5, 18A6, 10A6, 10H7, 15A10, 12D2, 9B10, 17D3, 15G11, 14D7, 18F3, 17D9, 21F8, 22B9, 221D10, 14A6, 11D6, 10A9, 16E3, 14G7, 5H3, 2B12, 26H7, 26C12, 2H11, 또는 18H9
인, 단리된 항-인간 IL-2 항체. - 청구항 106에 있어서, 참조 항체의 중쇄 가변 도메인 아미노산 서열에 적어도 90% 동일한 중쇄 가변 도메인 아미노산 서열, 및 상기 참조 항체의 경쇄 가변 도메인 아미노산 서열에 적어도 90% 동일한 경쇄 가변 도메인 아미노산 서열을 포함하며, 상기 참조 항체는 9D6, 2C3, 14C9, 8B12, 16A4, 16E1, 13A1, 8F10, 12C4, 9B12, 3H5, 18A6, 10A6, 10H7, 15A10, 12D2, 9B10, 17D3, 15G11, 14D7, 18F3, 17D9, 21F8, 22B9, 221D10, 14A6, 11D6, 10A9, 16E3, 14G7, 5H3, 2B12, 26H7, 26C12, 2H11, 또는 18H9이며, 상기 참조 항체의 상기 중쇄 가변 도메인 아미노산 서열 및 상기 경쇄 가변 도메인 아미노산 서열은 각각 도 28 및 도 26에 도시되는 것인 단리된 항-인간 IL-2 항체.
- 청구항 106에 있어서, 참조 항체의 중쇄 가변 도메인 아미노산 서열에 적어도 95% 동일한 중쇄 가변 도메인 아미노산 서열, 및 상기 참조 항체의 경쇄 가변 도메인 아미노산 서열에 적어도 95% 동일한 경쇄 가변 도메인 아미노산 서열을 포함하며, 상기 참조 항체는 9D6, 2C3, 14C9, 8B12, 16A4, 16E1, 13A1, 8F10, 12C4, 9B12, 3H5, 18A6, 10A6, 10H7, 15A10, 12D2, 9B10, 17D3, 15G11, 14D7, 18F3, 17D9, 21F8, 22B9, 221D10, 14A6, 11D6, 10A9, 16E3, 14G7, 5H3, 2B12, 26H7, 26C12, 2H11, 또는 18H9이며, 상기 참조 항체의 상기 중쇄 가변 도메인 아미노산 서열 및 상기 경쇄 가변 도메인 아미노산 서열은 각각 도 28 및 도 26에 도시되는 것인 단리된 항-인간 IL-2 항체.
- 청구항 106에 있어서, 참조 항체의 중쇄 가변 도메인 아미노산 서열에 적어도 97% 동일한 중쇄 가변 도메인 아미노산 서열, 및 상기 참조 항체의 경쇄 가변 도메인 아미노산 서열에 적어도 97% 동일한 경쇄 가변 도메인 아미노산 서열을 포함하며, 상기 참조 항체는 9D6, 2C3, 14C9, 8B12, 16A4, 16E1, 13A1, 8F10, 12C4, 9B12, 3H5, 18A6, 10A6, 10H7, 15A10, 12D2, 9B10, 17D3, 15G11, 14D7, 18F3, 17D9, 21F8, 22B9, 221D10, 14A6, 11D6, 10A9, 16E3, 14G7, 5H3, 2B12, 26H7, 26C12, 2H11, 또는 18H9이며, 상기 참조 항체의 상기 중쇄 가변 도메인 아미노산 서열 및 상기 경쇄 가변 도메인 아미노산 서열은 각각 도 28 및 도 26에 도시되는 것인 단리된 항-인간 IL-2 항체.
- 청구항 106에 있어서, 참조 항체의 중쇄 가변 도메인 아미노산 서열에 적어도 99% 동일한 중쇄 가변 도메인 아미노산 서열, 및 상기 참조 항체의 경쇄 가변 도메인 아미노산 서열에 적어도 99% 동일한 경쇄 가변 도메인 아미노산 서열을 포함하며, 상기 참조 항체는 9D6, 2C3, 14C9, 8B12, 16A4, 16E1, 13A1, 8F10, 12C4, 9B12, 3H5, 18A6, 10A6, 10H7, 15A10, 12D2, 9B10, 17D3, 15G11, 14D7, 18F3, 17D9, 21F8, 22B9, 221D10, 14A6, 11D6, 10A9, 16E3, 14G7, 5H3, 2B12, 26H7, 26C12, 2H11, 또는 18H9이며, 상기 참조 항체의 상기 중쇄 가변 도메인 아미노산 서열 및 상기 경쇄 가변 도메인 아미노산 서열은 각각 도 28 및 도 26에 도시되는 것인 단리된 항-인간 IL-2 항체.
- 청구항 106에 있어서, 참조 항체의 중쇄 가변 도메인 아미노산 서열 및 상기 참조 항체의 경쇄 가변 도메인 아미노산 서열을 포함하며, 상기 참조 항체는 9D6, 2C3, 14C9, 8B12, 16A4, 16E1, 13A1, 8F10, 12C4, 9B12, 3H5, 18A6, 10A6, 10H7, 15A10, 12D2, 9B10, 17D3, 15G11, 14D7, 18F3, 17D9, 21F8, 22B9, 221D10, 14A6, 11D6, 10A9, 16E3, 14G7, 5H3, 2B12, 26H7, 26C12, 2H11, 또는 18H9이고, 상기 참조 항체의 상기 중쇄 가변 도메인 아미노산 서열 및 상기 경쇄 가변 도메인 아미노산 서열은 각각 도 28 및 도 26에 도시되는 것인 단리된 항-인간 IL-2 항체.
- 청구항 106에 있어서,
a) 인간 항체;
b) 인간화 항체;
c) 키메라 항체;
d) 단클론 항체;
e) 다클론 항체;
f) 재조합 항체;
g) 항원-결합 항체 단편;
h) 단일 쇄 항체;
i) 디아바디;
j) 트리아바디;
k) 테트라바디;
l) Fab 단편;
m) F(ab')2 단편;
n) 도메인 항체;
o) IgD 항체;
p) IgE 항체;
q) IgM 항체;
r) IgG1 항체;
s) IgG2 항체;
t) IgG3 항체;
u) IgG4 항체; 또는
v) H 쇄-내 이황화 결합을 형성하는 경향을 완화시키는 적어도 하나의 돌연변이를 힌지 영역에 가지고 있는 IgG4 항체
인 단리된 항-인간 IL-2 항체. - 인간 IL-2 사이토카인에 결합된 청구항 106의 단리된 항-인간 IL-2 항체를 포함하는 단리된 복합체.
- 청구항 106에 있어서, 인간 IgG1 Fc를 포함하는 단리된 항-인간 IL-2 항체.
- 청구항 114에 있어서, 상기 인간 IgG1 Fc가 상기 Fc의 효과기 기능을 변경시키는 하나 이상의 돌연변이를 갖는 것인 단리된 항-인간 IL-2 항체.
- 청구항 115에 있어서, 상기 인간 IgG1 Fc가 N297에서의 치환을 포함하는 것인 단리된 항-인간 IL-2 항체.
- 청구항 116에 있어서, 상기 N297에서의 치환이 N297G인 단리된 항-인간 IL-2 항체.
- 청구항 114에 있어서, 상기 인간 IgG Fc의 C-말단 리신의 치환 또는 결실을 포함하는 단리된 항-인간 IL-2 항체.
- 청구항 118에 있어서, 상기 인간 IgG Fc의 C-말단 리신이 결실된 것인 단리된 항-인간 IL-2 항체.
- 청구항 106의 단리된 항-인간 IL-2 항체의 경쇄, 중쇄, 또는 경쇄와 중쇄 둘 모두를 암호화하는 단리된 핵산.
- 프로모터에 작동가능하게 연결된 청구항 120의 단리된 핵산을 포함하는 발현 벡터.
- 청구항 120 또는 121의 단리된 핵산을 포함하는 숙주 세포.
- 청구항 122에 있어서, 상기 단리된 핵산이 프로모터에 작동가능하게 연결된 것인 숙주 세포.
- 청구항 122에 있어서, 원핵 세포인 숙주 세포.
- 청구항 124에 있어서, 이.콜라이인 숙주 세포.
- 청구항 122에 있어서, 진핵 세포인 숙주 세포.
- 청구항 126에 있어서, 포유동물 세포인 숙주 세포.
- 청구항 127에 있어서, 중국 햄스터 난소 (CHO) 세포주인 숙주 세포.
- 항-인간 IL-2 항체를 제조하는 방법이며,
청구항 122 내지 128 중 어느 한 항의 숙주 세포를 상기 프로모터가 발현되는 조건하에 배양하는 단계, 및
상기 배양물로부터 인간 IL-2 뮤테인을 수거하는 단계
를 포함하는 방법. - 대상체의 염증성 또는 자가-면역 병태를 치료하는 방법이며,
청구항 106의 항-인간 IL-2 항체 또는 청구항 113의 단리된 항-인간 IL-2 항체를 포함하는 단리된 복합체의 유효량을 상기 대상체에게 투여하는 단계를 포함하는 방법. - 청구항 130에 있어서, 상기 염증성 질환 또는 자가면역 질환이 낭창, 이식편 대 숙주 질환, C 형 간염-유도된 맥관염, I 형 당뇨병, II 형 당뇨병, 다발성 경화증, 류마티스성 관절염, 탈모증, 죽상동맥경화증, 건선, 장기 이식 거부, 쇼그렌 증후군, 베체트 증후군, 자연유산, 아토피성 질환, 천식 또는 염증성 장 질환인 방법.
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