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JP2023548045A - 免疫細胞機能をモジュレートするためのcd8抗原結合分子を有する融合物 - Google Patents

免疫細胞機能をモジュレートするためのcd8抗原結合分子を有する融合物 Download PDF

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JP2023548045A JP2023524628A JP2023524628A JP2023548045A JP 2023548045 A JP2023548045 A JP 2023548045A JP 2023524628 A JP2023524628 A JP 2023524628A JP 2023524628 A JP2023524628 A JP 2023524628A JP 2023548045 A JP2023548045 A JP 2023548045A
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Abstract

本明細書では、他の免疫細胞の機能よりもCD8+T細胞の機能を選択的にモジュレートするための、抗CD8抗原結合分子及び該CD8抗原結合分子を含む融合ポリペプチドが提供される。加えて、本開示は、開示される抗原結合分子及び融合ポリペプチドをコードするポリヌクレオチド、ならびにかかるポリヌクレオチドを含むベクター及び宿主細胞も提供する。本開示はさらに、該抗原結合分子及び融合ポリペプチドを産生するための方法、それらを含む医薬組成物、ならびにその使用を提供する。

Description

関連出願の相互参照
本出願は、2020年10月23日に出願された米国仮出願第63/105,162号、2020年12月4日に出願された同第63/121,663号、及び2021年5月19日に出願された同第63/190,669号の優先権の利益を主張するものであり、これら仮出願のそれぞれは、その全体が参照により本明細書に組み込まれる。
ASCIIテキストファイルでの配列表の提出
ASCIIテキストファイルでの以下の提出物の内容は、その全体が参照により本明細書に組み込まれる:コンピュータ可読形式(CRF)の配列表(ファイル名:182842000440SEQLIST.TXT、記録日:2021年10月21日、サイズ:557,283バイト)。
本開示は、他の免疫細胞の機能よりもCD8+T細胞の機能を選択的にモジュレートするための、CD8抗原結合分子及び該CD8抗原結合分子を含む融合ポリペプチドを開示する。加えて、本開示は、開示される抗原結合分子及び融合ポリペプチドをコードするポリヌクレオチド、ならびにかかるポリヌクレオチドを含むベクター及び宿主細胞も提供する。本開示はさらに、該抗原結合分子及び融合ポリペプチドを産生するための方法、それらを含む医薬組成物、ならびにその使用を提供する。
アルファベータT細胞受容体を発現するCD8+T細胞は、様々な病原体及びがんに対する獲得免疫を媒介する、主要組織適合性(MHC)クラスI拘束性T細胞の大きなサブセットである。加えて、それらはまた、特定の自己免疫疾患及び炎症性疾患においては病原であり得、疾患の原因となり得る。CD8+T細胞の機能をモジュレートし、感染症及びがんの関係ではその機能を活性化するか、または特定の自己免疫疾患の関係ではその機能を阻害することにより、治療上の利益を得ることができる。
CD8+T細胞の活性化及び分化は、サイトカイン等の可溶性免疫調節タンパク質によって主に制御される。サイトカインの生物学的活性は、細胞表面上のそれらそれぞれのサイトカイン受容体に、通常非常に高い親和性で結合することによって媒介され、その結果、免疫細胞の表現型及び機能を調節する様々な細胞プロセスを誘発する、それら受容体の下流シグナル伝達を強力に刺激するそれらの能力が生じる。通常、サイトカインは多面的な効果を有し、活性化、増殖、生存、アポトーシス、及び他の免疫調節タンパク質の分泌等、複数の下流細胞事象を引き起こす。加えて、それらの受容体は複数の免疫細胞サブセット上に発現しているため、サイトカインはCD8+T細胞だけでなく、それらの受容体を発現する他の免疫細胞及び非免疫細胞にも作用する。
例えば、インターロイキン-2(IL-2)は、アルファベータCD4+及びCD8+T細胞、ならびにNK細胞、NK T細胞、ガンマデルタT細胞(Tγδ細胞)、及び自然リンパ球系細胞(ILC1、ILC2、及びILC3細胞)等の様々な自然及び自然様リンパ球を含む、多数のリンパ球サブセットを調節するサイトカインである。
IL-2は、IL-2Rβ及びIL-2Rγサブユニット(それら両方が免疫細胞における下流シグナル伝達を誘発するのに必要かつ十分である)からなる受容体複合体(IL-2Rβγ、中程度親和性受容体)に中程度の親和性で結合することによってシグナルを伝達することができる。加えて、IL-2は、IL-2Rα、IL-2Rβ、及びIL-2Rγサブユニットからなる受容体複合体(IL-2Rαβγ、高親和性受容体)に高親和性で結合する(Stauber et al,Proc Natl Acad Sci U S A.2006 Feb 21;103(8):2788-93)。IL-2Rαの発現は、CD4+Treg細胞、活性化Tリンパ球、ならびにILC2及びILC3細胞に限定され、これらのサブセットのIL-2シグナル伝達に対する感受性を最も高くする。IL-2Rβ及びIL-2Rγサブユニットは、別の関連サイトカインであるIL-15と共有されており、IL-2Rγサブユニットは、他の一般的なガンマ鎖サイトカイン(IL-4、IL-7、IL-9、及びIL-21)間で共有されている。NK細胞、NK T細胞、Tγδ細胞、ならびにILC1、ILC2、及びILC3細胞を含むほとんどの自然及び自然様リンパ球は、IL-2Rβを高レベルで発現し(ImmGen consortium;Heng TS et al,Immunological Genome Project Consortium.Nat Immunol.2008 Oct;9(10):1091-4)、これによりそれらのIL-2とIL-15サイトカインの両方に対する感受性も高まる。
IL-2のその受容体への結合は、受容体に会合したヤヌスキナーゼであるJAK3及びJAK1のリン酸化を誘導し、これによりリンパ球における多くの遺伝子の転写を調節するSTAT5転写因子のリン酸化(pSTAT5)が促進される。リンパ球におけるIL-2シグナル伝達は、細胞の生存、増殖、ならびに炎症性サイトカイン分泌及び細胞傷害性機能を含むエフェクター機能の増強、また場合によっては活性化誘導性細胞死を促進する(Ross & Cantrell,Annu Rev Immunol.2018 Apr 26;36:411-433で概説されている)。
CD8+T細胞はCD8を発現しており、該CD8は、細胞表面でCD8アルファ(CD8α、CD8a)ホモ二量体及びCD8アルファ-CD8ベータ(CD8β、CD8b)ヘテロ二量体として見出されるI型膜貫通糖タンパク質である。CD8二量体は標的細胞上のMHCクラスI分子と相互作用し、この相互作用により、CD8+T細胞の活性化の間、TCRはMHCと密接して係合し続ける。CD8αの細胞質側末端が、T細胞活性化時にTCRの下流シグナル伝達を惹起するT細胞キナーゼ(Lck)との結合部位を含有する一方で、CD8βの役割は、CD8のMHCクラスIへの結合活性を増大させること、及びCD8/MHC/TCR相互作用の特異性に影響を及ぼすことにあると考えられている(Bosselut et al,Immunity.2000 Apr;12(4):409-18)。TCRアルファベータ発現CD8+T細胞は、通常、CD8ab二量体とCD8aa二量体の両方を発現するが、NK細胞、粘膜関連インバリアントT(MAIT)細胞、及びガンマデルタT細胞等の一部の自然リンパ球では、CD8ab二量体ではなく、CD8aa二量体が高レベルで見出され得る。
したがって、CD8aaホモ二量体よりもCD8abヘテロ二量体に選択的に結合する抗体が必要とされる。これらの抗体は、例えば、IL-2等の特定の免疫調節性ポリペプチドをCD8ab+T細胞に標的化し、CD8-免疫細胞及びNK細胞等のCD8aa+免疫細胞でのそれらの活性を制限するために使用され得る。
特許出願、特許公報、及びUniProtKB/Swiss-Protアクセッション番号を含む本明細書で引用される全ての参考文献は、あたかも個々の参考文献が参照により組み込まれることが具体的かつ個別に示されているかのように、それらの全体が参照により本明細書に組み込まれる。
Stauber et al,Proc Natl Acad Sci U S A.2006 Feb 21;103(8):2788-93 Heng TS et al,Immunological Genome Project Consortium.Nat Immunol.2008 Oct;9(10):1091-4 Ross & Cantrell,Annu Rev Immunol.2018 Apr 26;36:411-433 Bosselut et al,Immunity.2000 Apr;12(4):409-18
本開示は、特に、ヒトCD8bに結合するヒトまたはヒト化抗体、抗原結合フラグメント、及び融合タンパク質を説明するものである。いくつかの実施形態において、ヒトまたはヒト化抗体、抗原結合フラグメント、及び融合タンパク質は、ヒトCD8aaホモ二量体への結合よりも優先的にヒトCD8bまたはヒトCD8abヘテロ二量体に結合する。いくつかの実施形態において、ヒトまたはヒト化抗体、抗原結合フラグメント、及び融合タンパク質は、CD8b、CD8ab、または両方に結合する。
本開示のある態様は、ヒトもしくはヒト化抗体またはその抗原結合フラグメントに関する。いくつかの実施形態において、抗体またはフラグメントは、ヒトCD8a及び/またはヒトCD8aaに対する結合よりも少なくとも10倍高い親和性で、ヒトCD8b及び/またはヒトCD8abに特異的に結合する。いくつかの実施形態において、抗体またはフラグメントは、ヒトCD8a及び/またはヒトCD8aaの細胞外ドメイン(複数可)への結合よりも少なくとも10倍高い親和性で、ヒトCD8b及び/またはヒトCD8abの細胞外ドメイン(複数可)に特異的に結合する。いくつかの実施形態において、抗体またはフラグメントは、1000nM未満であるEC50で、ヒトCD8abヘテロ二量体を表面に発現している細胞に結合する。いくつかの実施形態において、抗体またはフラグメントは、ヒトCD8+T細胞に結合する。いくつかの実施形態において、抗体またはフラグメントは、ナチュラルキラー(NK)細胞の表面に発現されるヒトCD8a及び/またはヒトCD8aaに対する結合よりも少なくとも10倍高い親和性で、ヒトCD8b及び/またはヒトCD8abに特異的に結合する。いくつかの実施形態において、抗体またはフラグメントは、ヒトCD8a及び/またはヒトCD8aaを表面に発現している細胞(例えば、NK細胞)に対する結合よりも少なくとも10倍高い親和性で、ヒトCD8b及び/またはヒトCD8abを表面に発現している細胞(例えば、T細胞)に特異的に結合する。
いくつかの実施形態において、抗体またはフラグメントは、重鎖可変(VH)ドメイン及び軽鎖可変(VL)ドメインを含み、該VHドメインは、配列番号13のアミノ酸配列を含むCDR-H1、配列番号14のアミノ酸配列を含むCDR-H2、及び配列番号15のアミノ酸配列を含むCDR-H3を含み、該VLドメインは、配列番号16のアミノ酸配列を含むCDR-L1、配列番号17のアミノ酸配列を含むCDR-L2、及び配列番号18のアミノ酸配列を含むCDR-L3を含む。いくつかの実施形態において、抗体またはフラグメントは、重鎖可変(VH)ドメイン及び軽鎖可変(VL)ドメインを含み、該VHドメインは、配列番号51のアミノ酸配列を含むCDR-H1、配列番号52のアミノ酸配列を含むCDR-H2、及び配列番号15のアミノ酸配列を含むCDR-H3を含み、該VLドメインは、配列番号16のアミノ酸配列を含むCDR-L1、配列番号17のアミノ酸配列を含むCDR-L2、及び配列番号18のアミノ酸配列を含むCDR-L3を含む。いくつかの実施形態において、VHドメインは、配列番号62の配列と少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも99%、または100%同一であるアミノ酸配列を含み、VLドメインは、配列番号63の配列と少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも99%、または100%同一であるアミノ酸配列を含む。いくつかの実施形態において、抗体またはフラグメントは、重鎖可変(VH)ドメイン及び軽鎖可変(VL)ドメインを含み、該VHドメインは、配列番号19のアミノ酸配列を含むCDR-H1、配列番号20のアミノ酸配列を含むCDR-H2、及び配列番号21のアミノ酸配列を含むCDR-H3を含み、該VLドメインは、配列番号22のアミノ酸配列を含むCDR-L1、配列番号23のアミノ酸配列を含むCDR-L2、及び配列番号24のアミノ酸配列を含むCDR-L3を含む。いくつかの実施形態において、抗体またはフラグメントは、重鎖可変(VH)ドメイン及び軽鎖可変(VL)ドメインを含み、該VHドメインは、配列番号53のアミノ酸配列を含むCDR-H1、配列番号52のアミノ酸配列を含むCDR-H2、及び配列番号21のアミノ酸配列を含むCDR-H3を含み、該VLドメインは、配列番号22のアミノ酸配列を含むCDR-L1、配列番号23のアミノ酸配列を含むCDR-L2、及び配列番号24のアミノ酸配列を含むCDR-L3を含む。いくつかの実施形態において、VHドメインは、配列番号64の配列と少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも99%、または100%同一であるアミノ酸配列を含み、VLドメインは、配列番号65の配列と少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも99%、または100%同一であるアミノ酸配列を含む。いくつかの実施形態において、抗体またはフラグメントは、重鎖可変(VH)ドメイン及び軽鎖可変(VL)ドメインを含み、該VHドメインは、配列番号25のアミノ酸配列を含むCDR-H1、配列番号26のアミノ酸配列を含むCDR-H2、及び配列番号27のアミノ酸配列を含むCDR-H3を含み、該VLドメインは、配列番号28のアミノ酸配列を含むCDR-L1、配列番号29のアミノ酸配列を含むCDR-L2、及び配列番号30のアミノ酸配列を含むCDR-L3を含む。いくつかの実施形態において、抗体またはフラグメントは、重鎖可変(VH)ドメイン及び軽鎖可変(VL)ドメインを含み、該VHドメインは、配列番号49のアミノ酸配列を含むCDR-H1、配列番号52のアミノ酸配列を含むCDR-H2、及び配列番号27のアミノ酸配列を含むCDR-H3を含み、該VLドメインは、配列番号28のアミノ酸配列を含むCDR-L1、配列番号29のアミノ酸配列を含むCDR-L2、及び配列番号30のアミノ酸配列を含むCDR-L3を含む。いくつかの実施形態において、VHドメインは、配列番号66の配列と少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも99%、または100%同一であるアミノ酸配列を含み、VLドメインは、配列番号67の配列と少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも99%、または100%同一であるアミノ酸配列を含む。いくつかの実施形態において、抗体またはフラグメントは、重鎖可変(VH)ドメイン及び軽鎖可変(VL)ドメインを含み、該VHドメインは、配列番号31のアミノ酸配列を含むCDR-H1、配列番号32のアミノ酸配列を含むCDR-H2、及び配列番号33のアミノ酸配列を含むCDR-H3を含み、該VLドメインは、配列番号34のアミノ酸配列を含むCDR-L1、配列番号35のアミノ酸配列を含むCDR-L2、及び配列番号36のアミノ酸配列を含むCDR-L3を含む。いくつかの実施形態において、抗体またはフラグメントは、重鎖可変(VH)ドメイン及び軽鎖可変(VL)ドメインを含み、該VHドメインは、配列番号54のアミノ酸配列を含むCDR-H1、配列番号52のアミノ酸配列を含むCDR-H2、及び配列番号33のアミノ酸配列を含むCDR-H3を含み、該VLドメインは、配列番号34のアミノ酸配列を含むCDR-L1、配列番号35のアミノ酸配列を含むCDR-L2、及び配列番号36のアミノ酸配列を含むCDR-L3を含む。いくつかの実施形態において、VHドメインは、配列番号68の配列と少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも99%、または100%同一であるアミノ酸配列を含み、VLドメインは、配列番号69の配列と少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも99%、または100%同一であるアミノ酸配列を含む。いくつかの実施形態において、抗体またはフラグメントは、重鎖可変(VH)ドメイン及び軽鎖可変(VL)ドメインを含み、該VHドメインは、配列番号37のアミノ酸配列を含むCDR-H1、配列番号38のアミノ酸配列を含むCDR-H2、及び配列番号39のアミノ酸配列を含むCDR-H3を含み、該VLドメインは、配列番号40のアミノ酸配列を含むCDR-L1、配列番号41のアミノ酸配列を含むCDR-L2、及び配列番号42のアミノ酸配列を含むCDR-L3を含む。いくつかの実施形態において、抗体またはフラグメントは、重鎖可変(VH)ドメイン及び軽鎖可変(VL)ドメインを含み、該VHドメインは、配列番号55のアミノ酸配列を含むCDR-H1、配列番号56のアミノ酸配列を含むCDR-H2、及び配列番号39のアミノ酸配列を含むCDR-H3を含み、該VLドメインは、配列番号40のアミノ酸配列を含むCDR-L1、配列番号41のアミノ酸配列を含むCDR-L2、及び配列番号42のアミノ酸配列を含むCDR-L3を含む。いくつかの実施形態において、VHドメインは、配列番号70の配列と少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも99%、または100%同一であるアミノ酸配列を含み、VLドメインは、配列番号71の配列と少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも99%、または100%同一であるアミノ酸配列を含む。いくつかの実施形態において、抗体またはフラグメントは、重鎖可変(VH)ドメイン及び軽鎖可変(VL)ドメインを含み、該VHドメインは、配列番号43のアミノ酸配列を含むCDR-H1、配列番号44のアミノ酸配列を含むCDR-H2、及び配列番号45のアミノ酸配列を含むCDR-H3を含み、該VLドメインは、配列番号46のアミノ酸配列を含むCDR-L1、配列番号47のアミノ酸配列を含むCDR-L2、及び配列番号48のアミノ酸配列を含むCDR-L3を含む。いくつかの実施形態において、抗体またはフラグメントは、重鎖可変(VH)ドメイン及び軽鎖可変(VL)ドメインを含み、該VHドメインは、配列番号55のアミノ酸配列を含むCDR-H1、配列番号57のアミノ酸配列を含むCDR-H2、及び配列番号45のアミノ酸配列を含むCDR-H3を含み、該VLドメインは、配列番号46のアミノ酸配列を含むCDR-L1、配列番号47のアミノ酸配列を含むCDR-L2、及び配列番号48のアミノ酸配列を含むCDR-L3を含む。いくつかの実施形態において、VHドメインは、配列番号72の配列と少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも99%、または100%同一であるアミノ酸配列を含み、VLドメインは、配列番号73の配列と少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも99%、または100%同一であるアミノ酸配列を含む。いくつかの実施形態において、抗体またはフラグメントは、重鎖可変(VH)ドメイン及び軽鎖可変(VL)ドメインを含み、該VHドメインは、配列番号1のアミノ酸配列を含むCDR-H1、配列番号2のアミノ酸配列を含むCDR-H2、及び配列番号3のアミノ酸配列を含むCDR-H3を含み、該VLドメインは、配列番号4のアミノ酸配列を含むCDR-L1、配列番号5のアミノ酸配列を含むCDR-L2、及び配列番号6のアミノ酸配列を含むCDR-L3を含む。いくつかの実施形態において、抗体またはフラグメントは、重鎖可変(VH)ドメイン及び軽鎖可変(VL)ドメインを含み、該VHドメインは、配列番号49のアミノ酸配列を含むCDR-H1、配列番号50のアミノ酸配列を含むCDR-H2、及び配列番号3のアミノ酸配列を含むCDR-H3を含み、該VLドメインは、配列番号4のアミノ酸配列を含むCDR-L1、配列番号5のアミノ酸配列を含むCDR-L2、及び配列番号6のアミノ酸配列を含むCDR-L3を含む。いくつかの実施形態において、抗体またはフラグメントは、重鎖可変(VH)ドメイン及び軽鎖可変(VL)ドメインを含み、該VHドメインは、配列番号177のアミノ酸配列を含むCDR-H1、配列番号178のアミノ酸配列を含むCDR-H2、及び配列番号179のアミノ酸配列を含むCDR-H3を含み、該VLドメインは、配列番号180のアミノ酸配列を含むCDR-L1、配列番号181のアミノ酸配列を含むCDR-L2、及び配列番号182のアミノ酸配列を含むCDR-L3を含む。いくつかの実施形態において、抗体またはフラグメントは、重鎖可変(VH)ドメイン及び軽鎖可変(VL)ドメインを含み、該VHドメインは、配列番号183のアミノ酸配列を含むCDR-H1、配列番号184のアミノ酸配列を含むCDR-H2、及び配列番号179のアミノ酸配列を含むCDR-H3を含み、該VLドメインは、配列番号180のアミノ酸配列を含むCDR-L1、配列番号181のアミノ酸配列を含むCDR-L2、及び配列番号182のアミノ酸配列を含むCDR-L3を含む。いくつかの実施形態において、VHドメインは、配列番号185の配列と少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも99%、または100%同一であるアミノ酸配列を含み、VLドメインは、配列番号186の配列と少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも99%、または100%同一であるアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態において、抗体またはフラグメントは、重鎖可変(VH)ドメイン及び軽鎖可変(VL)ドメインを含み、該VHドメインは、XAISのアミノ酸配列であって、ここでXはS、K、G、N、R、D、T、またはGであり、XはY、L、H、またはFである該アミノ酸配列(配列番号259)を含むCDR-H1、XPXYX10QKFX11Gのアミノ酸配列であって、ここでXはGまたはHであり、XはIまたはFであり、XはI、N、またはMであり、XはG、N、H、S、R、I、またはAであり、XはA、N、H、S、T、F、またはYであり、XはA、D、またはGであり、XはT、E、K、V、Q、またはAであり、XはAまたはTであり、XはNまたはKであり、X10はAまたはNであり、X11はQまたはTである該アミノ酸配列(配列番号260)を含むCDR-H2、及びXGXLFXのアミノ酸配列であって、ここでXはDまたはAであり、XはA、G、E、R、Y、K、N、Q、L、またはFであり、XはA、L、P、またはYであり、XはIまたはLであり、XはR、A、Q、またはSであり、XはAまたはDであり、XはD、E、A、またはSである該アミノ酸配列(配列番号261)を含むCDR-H3を含み、該VLドメインは、XSXIXGXLNのアミノ酸配列であって、ここでXはRまたはGであり、XはAまたはTであり、XはQまたはEであり、XはE、N、T、S、A、K、D、G、R、またはQであり、XはYまたはSであり、XはAまたはVである該アミノ酸配列(配列番号262)を含むCDR-L1、GXLXのアミノ酸配列であって、ここでXはAまたはSであり、XはT、S、E、Q、またはDであり、XはN、R、A、E、またはHであり、XはQまたはAであり、XはSまたはDである該アミノ酸配列(配列番号263)を含むCDR-L2、及びQXPWTのアミノ酸配列であって、ここでXはS、N、D、Q、A、またはEであり、XはT、I、またはSであり、XはY、L、またはFであり、XはD、G、T、E、Q、A、またはYであり、XはA、T、R、S、K、またはYである該アミノ酸配列(配列番号264)を含むCDR-L3を含む。いくつかの実施形態において、抗体またはフラグメントは、重鎖可変(VH)ドメイン及び軽鎖可変(VL)ドメインを含み、該VHドメインは、配列番号225のアミノ酸配列を含むCDR-H1、配列番号226のアミノ酸配列を含むCDR-H2、及び配列番号227のアミノ酸配列を含むCDR-H3を含み、該VLドメインは、配列番号16のアミノ酸配列を含むCDR-L1、配列番号17のアミノ酸配列を含むCDR-L2、及び配列番号228のアミノ酸配列を含むCDR-L3を含む。いくつかの実施形態において、VHドメインは、配列番号245の配列と少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも99%、または100%同一であるアミノ酸配列を含み、VLドメインは、配列番号246の配列と少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも99%、または100%同一であるアミノ酸配列を含む。いくつかの実施形態において、抗体またはフラグメントは、重鎖可変(VH)ドメイン及び軽鎖可変(VL)ドメインを含み、該VHドメインは、配列番号225のアミノ酸配列を含むCDR-H1、配列番号232のアミノ酸配列を含むCDR-H2、及び配列番号233のアミノ酸配列を含むCDR-H3を含み、該VLドメインは、配列番号234のアミノ酸配列を含むCDR-L1、配列番号235のアミノ酸配列を含むCDR-L2、及び配列番号236のアミノ酸配列を含むCDR-L3を含む。いくつかの実施形態において、VHドメインは、配列番号251の配列と少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも99%、または100%同一であるアミノ酸配列を含み、VLドメインは、配列番号252の配列と少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも99%、または100%同一であるアミノ酸配列を含む。いくつかの実施形態において、VHドメインは配列番号251のアミノ酸配列を含み、VLドメインは配列番号252のアミノ酸配列を含む。いくつかの実施形態において、抗体またはフラグメントは、重鎖可変(VH)ドメイン及び軽鎖可変(VL)ドメインを含み、該VHドメインは、配列番号225のアミノ酸配列を含むCDR-H1、配列番号232のアミノ酸配列を含むCDR-H2、及び配列番号233のアミノ酸配列を含むCDR-H3を含み、該VLドメインは、配列番号16のアミノ酸配列を含むCDR-L1、配列番号17のアミノ酸配列を含むCDR-L2、及び配列番号228のアミノ酸配列を含むCDR-L3を含む。いくつかの実施形態において、VHドメインは、配列番号253の配列と少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも99%、または100%同一であるアミノ酸配列を含み、VLドメインは、配列番号254の配列と少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも99%、または100%同一であるアミノ酸配列を含む。いくつかの実施形態において、VHドメインは、配列QVQLVQSGAEVKKPGSSVKVSCKASGGTFS(配列番号274)を含むFW-1、配列WVRQAPGQGLEWMG(配列番号275)を含むFW-2、配列RVTITADESTSTAYMELSSLRSEDTAVYYCAR(配列番号276)を含むFW-3、及び/または配列WGQGTLVTVSS(配列番号277)を含むFW-4をさらに含む。いくつかの実施形態において、VLドメインは、配列DIQMTQSPSSLSASVGDRVTITC(配列番号289)を含むFW-1、配列WYQQKPGKAPKLLIY(配列番号290)を含むFW-2、配列GVPSRFSGSGSGTDFTLTISSLQPEDFATYYC(配列番号291)を含むFW-3、及び/または配列FGGGTKVEIK(配列番号292)を含むFW-4をさらに含む。
いくつかの実施形態において、抗体またはフラグメントは、重鎖可変(VH)ドメイン及び軽鎖可変(VL)ドメインを含み、該VHドメインは、GXFXのアミノ酸配列であって、ここでXはG、Y、S、またはAであり、XはT、S、G、R、N、またはHであり、XはS、T、R、H、Y、G、またはPであり、XはS、K、G、N、R、D、T、またはGであり、XはY、L、H、またはFである該アミノ酸配列(配列番号265)を含むCDR-H1、XPXのアミノ酸配列であって、ここでXはI、N、またはMであり、XはG、N、H、S、R、I、またはAであり、XはA、N、H、S、T、F、またはYであり、XはA、D、またはGであり、XはT、E、K、V、Q、またはAである該アミノ酸配列(配列番号266)を含むCDR-H2、及びXGXLFXのアミノ酸配列であって、ここでXはDまたはAであり、XはA、G、E、R、Y、K、N、Q、L、またはFであり、XはA、L、P、またはYであり、XはIまたはLであり、XはR、A、Q、またはSであり、XはAまたはDであり、XはD、E、A、またはSである該アミノ酸配列(配列番号267)を含むCDR-H3を含み、該VLドメインは、XSXIXGXLNのアミノ酸配列であって、ここでXはRまたはGであり、XはAまたはTであり、XはQまたはEであり、XはE、N、T、S、A、K、D、G、R、またはQであり、XはYまたはSであり、XはAまたはVである該アミノ酸配列(配列番号262)を含むCDR-L1、GXLXのアミノ酸配列であって、ここでXはAまたはSであり、XはT、S、E、Q、またはDであり、XはN、R、A、E、またはHであり、XはQまたはAであり、XはSまたはDである該アミノ酸配列(配列番号263)を含むCDR-L2、及びQXPWTのアミノ酸配列であって、ここでXはS、N、D、Q、A、またはEであり、XはT、I、またはSであり、XはY、L、またはFであり、XはD、G、T、E、Q、A、またはYであり、XはA、T、R、S、K、またはYである該アミノ酸配列(配列番号264)を含むCDR-L3を含む。いくつかの実施形態において、VHドメインは、配列番号238のアミノ酸配列を含むCDR-H1、配列番号239のアミノ酸配列を含むCDR-H2、及び配列番号233のアミノ酸配列を含むCDR-H3を含み、VLドメインは、配列番号16のアミノ酸配列を含むCDR-L1、配列番号17のアミノ酸配列を含むCDR-L2、及び配列番号228のアミノ酸配列を含むCDR-L3を含む。いくつかの実施形態において、VHドメインは、配列番号245の配列と少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも99%、または100%同一であるアミノ酸配列を含み、VLドメインは、配列番号246の配列と少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも99%、または100%同一であるアミノ酸配列を含む。いくつかの実施形態において、VHドメインは、配列番号238のアミノ酸配列を含むCDR-H1、配列番号243のアミノ酸配列を含むCDR-H2、及び配列番号233のアミノ酸配列を含むCDR-H3を含み、VLドメインは、配列番号234のアミノ酸配列を含むCDR-L1、配列番号235のアミノ酸配列を含むCDR-L2、及び配列番号236のアミノ酸配列を含むCDR-L3を含む。いくつかの実施形態において、VHドメインは、配列番号251の配列と少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも99%、または100%同一であるアミノ酸配列を含み、VLドメインは、配列番号252の配列と少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも99%、または100%同一であるアミノ酸配列を含む。いくつかの実施形態において、VHドメインは配列番号251のアミノ酸配列を含み、VLドメインは配列番号252のアミノ酸配列を含む。いくつかの実施形態において、VHドメインは、配列番号238のアミノ酸配列を含むCDR-H1、配列番号243のアミノ酸配列を含むCDR-H2、及び配列番号233のアミノ酸配列を含むCDR-H3を含み、VLドメインは、配列番号16のアミノ酸配列を含むCDR-L1、配列番号17のアミノ酸配列を含むCDR-L2、及び配列番号228のアミノ酸配列を含むCDR-L3を含む。いくつかの実施形態において、VHドメインは、配列番号253の配列と少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも99%、または100%同一であるアミノ酸配列を含み、VLドメインは、配列番号254の配列と少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも99%、または100%同一であるアミノ酸配列を含む。いくつかの実施形態において、VHドメインは、配列QVQLVQSGAEVKKPGSSVKVSCKAS(配列番号278)を含むFW-1、配列AISWVRQAPGQGLEWMGGI(配列番号279)を含むFW-2、配列ANYAQKFQGRVTITADESTSTAYMELSSLRSEDTAVYYCAR(配列番号280)を含むFW-3、及び/または配列WGQGTLVTVSS(配列番号277)を含むFW-4をさらに含む。いくつかの実施形態において、VLドメインは、配列DIQMTQSPSSLSASVGDRVTITC(配列番号289)を含むFW-1、配列WYQQKPGKAPKLLIY(配列番号290)を含むFW-2、配列GVPSRFSGSGSGTDFTLTISSLQPEDFATYYC(配列番号291)を含むFW-3、及び/または配列FGGGTKVEIK(配列番号292)を含むFW-4をさらに含む。
いくつかの実施形態において、抗体またはフラグメントは、重鎖可変(VH)ドメイン及び軽鎖可変(VL)ドメインを含み、該VHドメインは、XYXMSのアミノ酸配列であって、ここでXはS、D、E、A、またはQであり、XはA、G、またはTである該アミノ酸配列(配列番号268)を含むCDR-H1、DIXGXTXYADSVKGのアミノ酸配列であって、ここでXはT、N、S、Q、E、H、R、またはAであり、XはY、W、F、またはHであり、XはA、S、Q、E、またはTであり、XはGまたはEであり、XはSまたはIであり、XはAまたはGである該アミノ酸配列(配列番号269)を含むCDR-H2、及びXYXWXAXDXのアミノ酸配列であって、ここでXはSまたはAであり、XはN、H、A、D、L、Q、Y、またはRであり、XはA、N、S、またはGであり、XはA、V、R、E、またはSであり、XはDまたはSであり、XはD、N、Q、E、S、T、またはLであり、XはL、F、またはMであり、XはI、Y、またはVである該アミノ酸配列(配列番号270)を含むCDR-H3を含み、VLドメインは、RASQSVSSNLAのアミノ酸配列(配列番号40)を含むCDR-L1、GASSRATのアミノ酸配列(配列番号41)を含むCDR-L2、及びQQYGSSPPVTのアミノ酸配列(配列番号42)を含むCDR-L3を含む。いくつかの実施形態において、抗体またはフラグメントは、重鎖可変(VH)ドメイン及び軽鎖可変(VL)ドメインを含み、該VHドメインは、配列番号229のアミノ酸配列を含むCDR-H1、配列番号230のアミノ酸配列を含むCDR-H2、及び配列番号231のアミノ酸配列を含むCDR-H3を含み、該VLドメインは、配列番号40のアミノ酸配列を含むCDR-L1、配列番号41のアミノ酸配列を含むCDR-L2、及び配列番号42のアミノ酸配列を含むCDR-L3を含む。いくつかの実施形態において、VHドメインは、配列番号247の配列と少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも99%、または100%同一であるアミノ酸配列を含み、VLドメインは、配列番号248の配列と少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも99%、または100%同一であるアミノ酸配列を含む。いくつかの実施形態において、VHドメインは、配列番号249の配列と少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも99%、または100%同一であるアミノ酸配列を含み、VLドメインは、配列番号250の配列と少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも99%、または100%同一であるアミノ酸配列を含む。いくつかの実施形態において、VHドメインは配列番号249のアミノ酸配列を含み、VLドメインは配列番号250のアミノ酸配列を含む。いくつかの実施形態において、抗体またはフラグメントは、重鎖可変(VH)ドメイン及び軽鎖可変(VL)ドメインを含み、該VHドメインは、配列番号229のアミノ酸配列を含むCDR-H1、配列番号237のアミノ酸配列を含むCDR-H2、及び配列番号231のアミノ酸配列を含むCDR-H3を含み、該VLドメインは、配列番号40のアミノ酸配列を含むCDR-L1、配列番号41のアミノ酸配列を含むCDR-L2、及び配列番号42のアミノ酸配列を含むCDR-L3を含む。いくつかの実施形態において、VHドメインは、配列番号255の配列と少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも99%、または100%同一であるアミノ酸配列を含み、VLドメインは、配列番号256の配列と少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも99%、または100%同一であるアミノ酸配列を含む。いくつかの実施形態において、VHドメインは、配列番号257の配列と少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも99%、または100%同一であるアミノ酸配列を含み、VLドメインは、配列番号258の配列と少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも99%、または100%同一であるアミノ酸配列を含む。いくつかの実施形態において、VHドメインは、配列EVQLVESGGGLVQPGGSLRLSCAASGFTFS(配列番号281)を含むFW-1、配列WVRQAPGKGLEWVS(配列番号282)を含むFW-2、配列RFTISRDNAKNSLYLQMNSLRAEDTAVYYCAR(配列番号283)を含むFW-3、及び/または配列WGQGTMVTVSS(配列番号284)またはWGQGTLVTVSS(配列番号285)を含むFW-4をさらに含む。いくつかの実施形態において、VLドメインは、配列EIVLTQSPGTLSLSPGERATLSC(配列番号293)を含むFW-1、配列WYQQKPGQAPRLLIY(配列番号294)を含むFW-2、配列GIPDRFSGSGSGTDFTLTISRLEPEDFAVYYC(配列番号295)を含むFW-3、及び/または配列FGQGTKVEIK(配列番号296)を含むFW-4をさらに含む。
いくつかの実施形態において、抗体またはフラグメントは、重鎖可変(VH)ドメイン及び軽鎖可変(VL)ドメインを含み、該VHドメインは、GFTFXYのアミノ酸配列であって、ここでXはS、D、E、Q、S、またはAであり、XはS、D、E、A、またはQである該アミノ酸配列(配列番号271)を含むCDR-H1、XGXのアミノ酸配列であって、ここでXはT、N、S、Q、E、H、R、またはAであり、XはY、W、F、またはHであり、XはA、S、Q、E、またはTであり、XはGまたはEであり、XはSまたはIである該アミノ酸配列(配列番号272)を含むCDR-H2、及びXYXWXAXDXのアミノ酸配列であって、ここでXはSまたはAであり、XはN、H、A、D、L、Q、Y、またはRであり、XはA、N、S、またはGであり、XはA、V、R、E、またはSであり、XはDまたはSであり、XはD、N、Q、E、S、T、またはLであり、XはL、F、またはMであり、XはI、Y、またはVである該アミノ酸配列(配列番号273)を含むCDR-H3を含み、該VLドメインは、RASQSVSSNLA(配列番号40)のアミノ酸配列を含むCDR-L1、GASSRAT(配列番号41)のアミノ酸配列を含むCDR-L2、及びQQYGSSPPVT(配列番号42)のアミノ酸配列を含むCDR-L3を含む。いくつかの実施形態において、VHドメインは、配列番号240のアミノ酸配列を含むCDR-H1、配列番号241のアミノ酸配列を含むCDR-H2、及び配列番号242のアミノ酸配列を含むCDR-H3を含み、VLドメインは、配列番号40のアミノ酸配列を含むCDR-L1、配列番号41のアミノ酸配列を含むCDR-L2、及び配列番号42のアミノ酸配列を含むCDR-L3を含む。いくつかの実施形態において、VHドメインは、配列番号247の配列と少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも99%、または100%同一であるアミノ酸配列を含み、VLドメインは、配列番号248の配列と少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも99%、または100%同一であるアミノ酸配列を含む。いくつかの実施形態において、VHドメインは、配列番号249の配列と少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも99%、または100%同一であるアミノ酸配列を含み、VLドメインは、配列番号250の配列と少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも99%、または100%同一であるアミノ酸配列を含む。いくつかの実施形態において、VHドメインは配列番号249のアミノ酸配列を含み、VLドメインは配列番号250のアミノ酸配列を含む。いくつかの実施形態において、VHドメインは、配列番号240のアミノ酸配列を含むCDR-H1、配列番号244のアミノ酸配列を含むCDR-H2、及び配列番号242のアミノ酸配列を含むCDR-H3を含み、VLドメインは、配列番号40のアミノ酸配列を含むCDR-L1、配列番号41のアミノ酸配列を含むCDR-L2、及び配列番号42のアミノ酸配列を含むCDR-L3を含む。いくつかの実施形態において、VHドメインは、配列番号255の配列と少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも99%、または100%同一であるアミノ酸配列を含み、VLドメインは、配列番号256の配列と少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも99%、または100%同一であるアミノ酸配列を含む。いくつかの実施形態において、VHドメインは、配列番号257の配列と少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも99%、または100%同一であるアミノ酸配列を含み、VLドメインは、配列番号258の配列と少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも99%、または100%同一であるアミノ酸配列を含む。いくつかの実施形態において、VHドメインは、配列EVQLVESGGGLVQPGGSLRLSCAAS(配列番号286)を含むFW-1、配列AMSWVRQAPGKGLEWVSDI(配列番号287)を含むFW-2、配列TAYADSVKGRFTISRDNAKNSLYLQMNSLRAEDTAVYYCAR(配列番号288)を含むFW-3、及び/または配列WGQGTMVTVSS(配列番号284)またはWGQGTLVTVSS(配列番号285)を含むFW-4をさらに含む。いくつかの実施形態において、VLドメインは、配列EIVLTQSPGTLSLSPGERATLSC(配列番号293)を含むFW-1、配列WYQQKPGQAPRLLIY(配列番号294)を含むFW-2、配列GIPDRFSGSGSGTDFTLTISRLEPEDFAVYYC(配列番号295)を含むFW-3、及び配列FGQGTKVEIK(配列番号296)を含むFW-4をさらに含む。
本明細書に記載の実施形態のいずれかによるいくつかの実施形態では、抗体は、多重特異性抗体(例えば、二重特異性抗体)である。
本明細書ではさらに、上記実施形態のいずれか1つの抗体またはフラグメントを含む第1の部分及びサイトカイン、ケモカイン、または成長因子を含む第2の部分を含む融合タンパク質を提供する。いくつかの実施形態において、第1の部分は、第2の部分に直接またはリンカーを介して融合する。いくつかの実施形態において、第1の部分は、CD8b及び/またはCD8abに特異的に結合するヒトもしくはヒト化抗体またはその抗原結合フラグメントを含み、該抗体またはフラグメントは、重鎖可変(VH)ドメイン及び軽鎖可変(VL)ドメインを含む(ここで、該VHドメインは、配列番号13のアミノ酸配列を含むCDR-H1、配列番号14のアミノ酸配列を含むCDR-H2、及び配列番号15のアミノ酸配列を含むCDR-H3を含み、該VLドメインは、配列番号16のアミノ酸配列を含むCDR-L1、配列番号17のアミノ酸配列を含むCDR-L2、及び配列番号18のアミノ酸配列を含むCDR-L3を含む;該VHドメインは、配列番号19のアミノ酸配列を含むCDR-H1、配列番号20のアミノ酸配列を含むCDR-H2、及び配列番号21のアミノ酸配列を含むCDR-H3を含み、該VLドメインは、配列番号22のアミノ酸配列を含むCDR-L1、配列番号23のアミノ酸配列を含むCDR-L2、及び配列番号24のアミノ酸配列を含むCDR-L3を含む;該VHドメインは、配列番号25のアミノ酸配列を含むCDR-H1、配列番号26のアミノ酸配列を含むCDR-H2、及び配列番号27のアミノ酸配列を含むCDR-H3を含み、該VLドメインは、配列番号28のアミノ酸配列を含むCDR-L1、配列番号29のアミノ酸配列を含むCDR-L2、及び配列番号30のアミノ酸配列を含むCDR-L3を含む;該VHドメインは、配列番号31のアミノ酸配列を含むCDR-H1、配列番号32のアミノ酸配列を含むCDR-H2、及び配列番号33のアミノ酸配列を含むCDR-H3を含み、該VLドメインは、配列番号34のアミノ酸配列を含むCDR-L1、配列番号35のアミノ酸配列を含むCDR-L2、及び配列番号36のアミノ酸配列を含むCDR-L3を含む;該VHドメインは、配列番号37のアミノ酸配列を含むCDR-H1、配列番号38のアミノ酸配列を含むCDR-H2、及び配列番号39のアミノ酸配列を含むCDR-H3を含み、該VLドメインは、配列番号40のアミノ酸配列を含むCDR-L1、配列番号41のアミノ酸配列を含むCDR-L2、及び配列番号42のアミノ酸配列を含むCDR-L3を含む;該VHドメインは、配列番号43のアミノ酸配列を含むCDR-H1、配列番号44のアミノ酸配列を含むCDR-H2、及び配列番号45のアミノ酸配列を含むCDR-H3を含み、該VLドメインは、配列番号46のアミノ酸配列を含むCDR-L1、配列番号47のアミノ酸配列を含むCDR-L2、及び配列番号48のアミノ酸配列を含むCDR-L3を含む;該VHドメインは、配列番号1のアミノ酸配列を含むCDR-H1、配列番号2のアミノ酸配列を含むCDR-H2、及び配列番号3のアミノ酸配列を含むCDR-H3を含み、該VLドメインは、配列番号4のアミノ酸配列を含むCDR-L1、配列番号5のアミノ酸配列を含むCDR-L2、及び配列番号6のアミノ酸配列を含むCDR-L3を含む;該VHドメインは、配列番号177のアミノ酸配列を含むCDR-H1、配列番号178のアミノ酸配列を含むCDR-H2、及び配列番号179のアミノ酸配列を含むCDR-H3を含み、該VLドメインは、配列番号180のアミノ酸配列を含むCDR-L1、配列番号181のアミノ酸配列を含むCDR-L2、及び配列番号182のアミノ酸配列を含むCDR-L3を含む;該VHドメインは、配列番号225のアミノ酸配列を含むCDR-H1、配列番号226のアミノ酸配列を含むCDR-H2、及び配列番号227のアミノ酸配列を含むCDR-H3を含み、該VLドメインは、配列番号16のアミノ酸配列を含むCDR-L1、配列番号17のアミノ酸配列を含むCDR-L2、及び配列番号228のアミノ酸配列を含むCDR-L3を含む;該VHドメインは、配列番号229のアミノ酸配列を含むCDR-H1、配列番号230のアミノ酸配列を含むCDR-H2、及び配列番号231のアミノ酸配列を含むCDR-H3を含み、該VLドメインは、アミノ酸配列RASQSVSSNLA(配列番号40)を含むCDR-L1、アミノ酸配列GASSRAT(配列番号41)を含むCDR-L2、及びアミノ酸配列QQYGSSPPVT(配列番号42)を含むCDR-L3を含む;該VHドメインは、配列番号225のアミノ酸配列を含むCDR-H1、配列番号232のアミノ酸配列を含むCDR-H2、及び配列番号233のアミノ酸配列を含むCDR-H3を含み、該VLドメインは、配列番号234のアミノ酸配列を含むCDR-L1、配列番号235のアミノ酸配列を含むCDR-L2、及び配列番号236のアミノ酸配列を含むCDR-L3を含む;該VHドメインは、配列番号225のアミノ酸配列を含むCDR-H1、配列番号232のアミノ酸配列を含むCDR-H2、及び配列番号233のアミノ酸配列を含むCDR-H3を含み、該VLドメインは、配列番号16のアミノ酸配列を含むCDR-L1、配列番号17のアミノ酸配列を含むCDR-L2、及び配列番号228のアミノ酸配列を含むCDR-L3を含む;または該VHドメインは、配列番号229のアミノ酸配列を含むCDR-H1、配列番号237のアミノ酸配列を含むCDR-H2、及び配列番号231のアミノ酸配列を含むCDR-H3を含み、該VLドメインは、アミノ酸配列RASQSVSSNLA(配列番号40)を含むCDR-L1、アミノ酸配列GASSRAT(配列番号41)を含むCDR-L2、及びアミノ酸配列QQYGSSPPVT(配列番号42)を含むCDR-L3を含む)。いくつかの実施形態において、第1の部分は、CD8b及び/またはCD8abに特異的に結合するヒトもしくはヒト化抗体またはその抗原結合フラグメントを含み、該抗体またはフラグメントは、重鎖可変(VH)ドメイン及び軽鎖可変(VL)ドメインを含む(ここで、該VHドメインは、配列番号51のアミノ酸配列を含むCDR-H1、配列番号52のアミノ酸配列を含むCDR-H2、及び配列番号15のアミノ酸配列を含むCDR-H3を含み、該VLドメインは、配列番号16のアミノ酸配列を含むCDR-L1、配列番号17のアミノ酸配列を含むCDR-L2、及び配列番号18のアミノ酸配列を含むCDR-L3を含む;該VHドメインは、配列番号53のアミノ酸配列を含むCDR-H1、配列番号52のアミノ酸配列を含むCDR-H2、及び配列番号21のアミノ酸配列を含むCDR-H3を含み、該VLドメインは、配列番号22のアミノ酸配列を含むCDR-L1、配列番号23のアミノ酸配列を含むCDR-L2、及び配列番号24のアミノ酸配列を含むCDR-L3を含む;該VHドメインは、配列番号49のアミノ酸配列を含むCDR-H1、配列番号52のアミノ酸配列を含むCDR-H2、及び配列番号27のアミノ酸配列を含むCDR-H3を含み、該VLドメインは、配列番号28のアミノ酸配列を含むCDR-L1、配列番号29のアミノ酸配列を含むCDR-L2、及び配列番号30のアミノ酸配列を含むCDR-L3を含む;該VHドメインは、配列番号54のアミノ酸配列を含むCDR-H1、配列番号52のアミノ酸配列を含むCDR-H2、及び配列番号33のアミノ酸配列を含むCDR-H3を含み、該VLドメインは、配列番号34のアミノ酸配列を含むCDR-L1、配列番号35のアミノ酸配列を含むCDR-L2、及び配列番号36のアミノ酸配列を含むCDR-L3を含む;該VHドメインは、配列番号55のアミノ酸配列を含むCDR-H1、配列番号56のアミノ酸配列を含むCDR-H2、及び配列番号39のアミノ酸配列を含むCDR-H3を含み、該VLドメインは、配列番号40のアミノ酸配列を含むCDR-L1、配列番号41のアミノ酸配列を含むCDR-L2、及び配列番号42のアミノ酸配列を含むCDR-L3を含む;該VHドメインは、配列番号55のアミノ酸配列を含むCDR-H1、配列番号57のアミノ酸配列を含むCDR-H2、及び配列番号45のアミノ酸配列を含むCDR-H3を含み、該VLドメインは、配列番号46のアミノ酸配列を含むCDR-L1、配列番号47のアミノ酸配列を含むCDR-L2、及び配列番号48のアミノ酸配列を含むCDR-L3を含む;該VHドメインは、配列番号49のアミノ酸配列を含むCDR-H1、配列番号50のアミノ酸配列を含むCDR-H2、及び配列番号3のアミノ酸配列を含むCDR-H3を含み、該VLドメインは、配列番号4のアミノ酸配列を含むCDR-L1、配列番号5のアミノ酸配列を含むCDR-L2、及び配列番号6のアミノ酸配列を含むCDR-L3を含む;該VHドメインは、配列番号183のアミノ酸配列を含むCDR-H1、配列番号184のアミノ酸配列を含むCDR-H2、及び配列番号179のアミノ酸配列を含むCDR-H3を含み、該VLドメインは、配列番号180のアミノ酸配列を含むCDR-L1、配列番号181のアミノ酸配列を含むCDR-L2、及び配列番号182のアミノ酸配列を含むCDR-L3を含む;該VHドメインは、配列番号238のアミノ酸配列を含むCDR-H1、配列番号239のアミノ酸配列を含むCDR-H2、及び配列番号233のアミノ酸配列を含むCDR-H3を含み、該VLドメインは、配列番号16のアミノ酸配列を含むCDR-L1、配列番号17のアミノ酸配列を含むCDR-L2、及び配列番号228のアミノ酸配列を含むCDR-L3を含む;該VHドメインは、配列番号240のアミノ酸配列を含むCDR-H1、配列番号241のアミノ酸配列を含むCDR-H2、及び配列番号242のアミノ酸配列を含むCDR-H3を含み、該VLドメインは、配列番号40のアミノ酸配列を含むCDR-L1、配列番号41のアミノ酸配列を含むCDR-L2、及び配列番号42のアミノ酸配列を含むCDR-L3を含む;該VHドメインは、配列番号238のアミノ酸配列を含むCDR-H1、配列番号243のアミノ酸配列を含むCDR-H2、及び配列番号233のアミノ酸配列を含むCDR-H3を含み、該VLドメインは、配列番号234のアミノ酸配列を含むCDR-L1、配列番号235のアミノ酸配列を含むCDR-L2、及び配列番号236のアミノ酸配列を含むCDR-L3を含む;該VHドメインは、配列番号238のアミノ酸配列を含むCDR-H1、配列番号243のアミノ酸配列を含むCDR-H2、及び配列番号233のアミノ酸配列を含むCDR-H3を含み、該VLドメインは、配列番号16のアミノ酸配列を含むCDR-L1、配列番号17のアミノ酸配列を含むCDR-L2、及び配列番号228のアミノ酸配列を含むCDR-L3を含む;または該VHドメインは、配列番号240のアミノ酸配列を含むCDR-H1、配列番号244のアミノ酸配列を含むCDR-H2、及び配列番号242のアミノ酸配列を含むCDR-H3を含み、該VLドメインは、配列番号40のアミノ酸配列を含むCDR-L1、配列番号41のアミノ酸配列を含むCDR-L2、及び配列番号42のアミノ酸配列を含むCDR-L3を含む)。
本明細書に記載の実施形態のいずれかによるいくつかの実施形態(例えば、本開示の融合タンパク質)では、第2の部分は、CD8+T細胞の活性化を誘導する。いくつかの実施形態において、融合タンパク質は、ヒトCD8aaホモ二量体を発現している細胞の活性化よりも少なくとも10倍高い効力を持って、ヒトCD8abヘテロ二量体を発現している細胞の活性化を誘導する。いくつかの実施形態において、融合タンパク質は、NK細胞の活性化よりも少なくとも10倍高い効力を持って、CD8+T細胞の活性化を誘導する。いくつかの実施形態において、活性化の効力は、細胞増殖によって評価されるEC50により測られる。いくつかの実施形態において、第1の部分は、N末端からC末端までの式[I]による構造を含む2つの抗体重鎖ポリペプチド:
VH-CH1-ヒンジ-CH2-CH3 [I]
及びN末端からC末端までの式[II]による構造を含む2つの抗体軽鎖ポリペプチド:
VL-CL [II]
を含み(式中、VHは抗体重鎖可変(VH)ドメインであり、CH1は抗体CH1ドメインであり、ヒンジは抗体ヒンジドメインであり、CH2-CH3は抗体Fcドメインであり、VLは抗体軽鎖可変(VL)ドメインであり、CLは抗体定常軽鎖ドメインである)、ここで、第2の部分のN末端は、(例えば、本開示のリンカーを介して)2つのCH3ドメインのうちの1つのC末端に融合する。いくつかの実施形態において、第1の部分は、N末端からC末端までの式[I]による構造を含む第1の抗体重鎖ポリペプチド:
VH-CH1-ヒンジ-CH2-CH3 [I]、
N末端からC末端までの式[II]による構造を含む抗体軽鎖ポリペプチド:
VL-CL [II]、
及びN末端からC末端までの式[III]による構造を含む第2の抗体重鎖ポリペプチド:
ヒンジ-CH2-CH3 [III]、
を含み(式中、VHは抗体重鎖可変(VH)ドメインであり、CH1は抗体CH1ドメインであり、ヒンジは抗体ヒンジドメインであり、CH2-CH3は抗体Fcドメインであり、VLは抗体軽鎖可変(VL)ドメインであり、CLは抗体定常軽鎖ドメインである)、ここで、第2の部分のN末端は、(例えば、本開示のリンカーを介して)第2の抗体重鎖ポリペプチドのCH3ドメインのC末端に融合する。いくつかの実施形態において、第2の部分のN末端は、(例えば、本開示のリンカーを介して)第1の抗体重鎖ポリペプチドのCH3ドメインのC末端に融合する。いくつかの実施形態において、第1の部分は、N末端からC末端までの式[I]による構造を含む第1の抗体重鎖ポリペプチド:
VH-CH1-ヒンジ-CH2-CH3 [I]、
N末端からC末端までの式[II]による構造を含む抗体軽鎖ポリペプチド:
VL-CL [II]、
及びN末端からC末端までの式[III]による構造を含む第2の抗体重鎖ポリペプチド:
ヒンジ-CH2-CH3 [III]、
を含み(式中、VHは抗体重鎖可変(VH)ドメインであり、CH1は抗体CH1ドメインであり、ヒンジは抗体ヒンジドメインであり、CH2-CH3は抗体Fcドメインであり、VLは抗体軽鎖可変(VL)ドメインであり、CLは抗体定常軽鎖ドメインである)、ここで、第2の部分のC末端は、(例えば、本開示のリンカーを介して)第2の抗体重鎖ポリペプチドのヒンジドメインのN末端に融合する。いくつかの実施形態において、第1の部分は、1つまたは2つの抗体重鎖ポリペプチド及び1つまたは2つの抗体軽鎖ポリペプチドを含む。いくつかの実施形態において、第1の部分は、単鎖抗体または単鎖可変フラグメント(scFv)を含む。いくつかの実施形態において、第1の部分は、VHH抗体を含む。本明細書に記載の実施形態のいずれかによるいくつかの実施形態(例えば、上記の融合タンパク質)では、VH及びVLは、抗原結合部位(例えば、CD8b及び/またはCD8abに特異的に結合する)を形成する。いくつかの実施形態において、第1の部分は、N末端からC末端までの式[I]による構造を含む第1の抗体重鎖ポリペプチド:
VH-CH1-ヒンジ-CH2-CH3 [I]、
N末端からC末端までの式[II]による構造を含む抗体軽鎖ポリペプチド:
VL-CL [II]、
及びN末端からC末端までの式[III]による構造を含む第2の抗体重鎖ポリペプチド:
ヒンジ-CH2-CH3 [III]、
を含み(式中、VHはVHドメインであり、CH1は抗体CH1ドメインであり、ヒンジは抗体ヒンジドメインであり、CH2-CH3は抗体Fcドメインであり、VLはVLドメインであり、CLは抗体定常軽鎖ドメインである)、ここで、第2の部分のN末端は、第1の抗体重鎖ポリペプチドのCH3ドメインのC末端に融合する。いくつかの実施形態において、両抗体重鎖ポリペプチドのVHドメインは、配列番号13のアミノ酸配列を含むCDR-H1、配列番号14のアミノ酸配列を含むCDR-H2、及び配列番号15のアミノ酸配列を含むCDR-H3を含み、両抗体軽鎖ポリペプチドのVLドメインは、配列番号16のアミノ酸配列を含むCDR-L1、配列番号17のアミノ酸配列を含むCDR-L2、及び配列番号18のアミノ酸配列を含むCDR-L3を含む;両抗体重鎖ポリペプチドのVHドメインは、配列番号19のアミノ酸配列を含むCDR-H1、配列番号20のアミノ酸配列を含むCDR-H2、及び配列番号21のアミノ酸配列を含むCDR-H3を含み、両抗体軽鎖ポリペプチドのVLドメインは、配列番号22のアミノ酸配列を含むCDR-L1、配列番号23のアミノ酸配列を含むCDR-L2、及び配列番号24のアミノ酸配列を含むCDR-L3を含む;両抗体重鎖ポリペプチドのVHドメインは、配列番号25のアミノ酸配列を含むCDR-H1、配列番号26のアミノ酸配列を含むCDR-H2、及び配列番号27のアミノ酸配列を含むCDR-H3を含み、両抗体軽鎖ポリペプチドのVLドメインは、配列番号28のアミノ酸配列を含むCDR-L1、配列番号29のアミノ酸配列を含むCDR-L2、及び配列番号30のアミノ酸配列を含むCDR-L3を含む;両抗体重鎖ポリペプチドのVHドメインは、配列番号31のアミノ酸配列を含むCDR-H1、配列番号32のアミノ酸配列を含むCDR-H2、及び配列番号33のアミノ酸配列を含むCDR-H3を含み、両抗体軽鎖ポリペプチドのVLドメインは、配列番号34のアミノ酸配列を含むCDR-L1、配列番号35のアミノ酸配列を含むCDR-L2、及び配列番号36のアミノ酸配列を含むCDR-L3を含む;両抗体重鎖ポリペプチドのVHドメインは、配列番号37のアミノ酸配列を含むCDR-H1、配列番号38のアミノ酸配列を含むCDR-H2、及び配列番号39のアミノ酸配列を含むCDR-H3を含み、両抗体軽鎖ポリペプチドのVLドメインは、配列番号40のアミノ酸配列を含むCDR-L1、配列番号41のアミノ酸配列を含むCDR-L2、及び配列番号42のアミノ酸配列を含むCDR-L3を含む;両抗体重鎖ポリペプチドのVHドメインは、配列番号43のアミノ酸配列を含むCDR-H1、配列番号44のアミノ酸配列を含むCDR-H2、及び配列番号45のアミノ酸配列を含むCDR-H3を含み、両抗体軽鎖ポリペプチドのVLドメインは、配列番号46のアミノ酸配列を含むCDR-L1、配列番号47のアミノ酸配列を含むCDR-L2、及び配列番号48のアミノ酸配列を含むCDR-L3を含む;両抗体重鎖ポリペプチドのVHドメインは、配列番号1のアミノ酸配列を含むCDR-H1、配列番号2のアミノ酸配列を含むCDR-H2、及び配列番号3のアミノ酸配列を含むCDR-H3を含み、両抗体軽鎖ポリペプチドのVLドメインは、配列番号4のアミノ酸配列を含むCDR-L1、配列番号5のアミノ酸配列を含むCDR-L2、及び配列番号6のアミノ酸配列を含むCDR-L3を含む;両抗体重鎖ポリペプチドのVHドメインは、配列番号177のアミノ酸配列を含むCDR-H1、配列番号178のアミノ酸配列を含むCDR-H2、及び配列番号179のアミノ酸配列を含むCDR-H3を含み、両抗体軽鎖ポリペプチドのVLドメインは、配列番号180のアミノ酸配列を含むCDR-L1、配列番号181のアミノ酸配列を含むCDR-L2、及び配列番号182のアミノ酸配列を含むCDR-L3を含む;両抗体重鎖ポリペプチドのVHドメインは、配列番号225のアミノ酸配列を含むCDR-H1、配列番号226のアミノ酸配列を含むCDR-H2、及び配列番号227のアミノ酸配列を含むCDR-H3を含み、両抗体軽鎖ポリペプチドのVLドメインは、配列番号16のアミノ酸配列を含むCDR-L1、配列番号17のアミノ酸配列を含むCDR-L2、及び配列番号228のアミノ酸配列を含むCDR-L3を含む;両抗体重鎖ポリペプチドのVHドメインは、配列番号229のアミノ酸配列を含むCDR-H1、配列番号230のアミノ酸配列を含むCDR-H2、及び配列番号231のアミノ酸配列を含むCDR-H3を含み、両抗体軽鎖ポリペプチドのVLドメインは、配列番号40のアミノ酸配列を含むCDR-L1、配列番号41のアミノ酸配列を含むCDR-L2、及び配列番号42のアミノ酸配列を含むCDR-L3を含む;両抗体重鎖ポリペプチドのVHドメインは、配列番号225のアミノ酸配列を含むCDR-H1、配列番号232のアミノ酸配列を含むCDR-H2、及び配列番号233のアミノ酸配列を含むCDR-H3を含み、両抗体軽鎖ポリペプチドのVLドメインは、配列番号234のアミノ酸配列を含むCDR-L1、配列番号235のアミノ酸配列を含むCDR-L2、及び配列番号236のアミノ酸配列を含むCDR-L3を含む;両抗体重鎖ポリペプチドのVHドメインは、配列番号225のアミノ酸配列を含むCDR-H1、配列番号232のアミノ酸配列を含むCDR-H2、及び配列番号233のアミノ酸配列を含むCDR-H3を含み、両抗体軽鎖ポリペプチドのVLドメインは、配列番号16のアミノ酸配列を含むCDR-L1、配列番号17のアミノ酸配列を含むCDR-L2、及び配列番号228のアミノ酸配列を含むCDR-L3を含む;または両抗体重鎖ポリペプチドのVHドメインは、配列番号229のアミノ酸配列を含むCDR-H1、配列番号237のアミノ酸配列を含むCDR-H2、及び配列番号231のアミノ酸配列を含むCDR-H3を含み、両抗体軽鎖ポリペプチドのVLドメインは、配列番号40のアミノ酸配列を含むCDR-L1、配列番号41のアミノ酸配列を含むCDR-L2、及び配列番号42のアミノ酸配列を含むCDR-L3を含む。いくつかの実施形態において、両抗体重鎖ポリペプチドのVHドメインは、配列番号51のアミノ酸配列を含むCDR-H1、配列番号52のアミノ酸配列を含むCDR-H2、及び配列番号15のアミノ酸配列を含むCDR-H3を含み、両抗体軽鎖ポリペプチドのVLドメインは、配列番号16のアミノ酸配列を含むCDR-L1、配列番号17のアミノ酸配列を含むCDR-L2、及び配列番号18のアミノ酸配列を含むCDR-L3を含む;両抗体重鎖ポリペプチドのVHドメインは、配列番号53のアミノ酸配列を含むCDR-H1、配列番号52のアミノ酸配列を含むCDR-H2、及び配列番号21のアミノ酸配列を含むCDR-H3を含み、両抗体軽鎖ポリペプチドのVLドメインは、配列番号22のアミノ酸配列を含むCDR-L1、配列番号23のアミノ酸配列を含むCDR-L2、及び配列番号24のアミノ酸配列を含むCDR-L3を含む;両抗体重鎖ポリペプチドのVHドメインは、配列番号49のアミノ酸配列を含むCDR-H1、配列番号52のアミノ酸配列を含むCDR-H2、及び配列番号27のアミノ酸配列を含むCDR-H3を含み、両抗体軽鎖ポリペプチドのVLドメインは、配列番号28のアミノ酸配列を含むCDR-L1、配列番号29のアミノ酸配列を含むCDR-L2、及び配列番号30のアミノ酸配列を含むCDR-L3を含む;両抗体重鎖ポリペプチドのVHドメインは、配列番号54のアミノ酸配列を含むCDR-H1、配列番号52のアミノ酸配列を含むCDR-H2、及び配列番号33のアミノ酸配列を含むCDR-H3を含み、両抗体軽鎖ポリペプチドのVLドメインは、配列番号34のアミノ酸配列を含むCDR-L1、配列番号35のアミノ酸配列を含むCDR-L2、及び配列番号36のアミノ酸配列を含むCDR-L3を含む;両抗体重鎖ポリペプチドのVHドメインは、配列番号55のアミノ酸配列を含むCDR-H1、配列番号56のアミノ酸配列を含むCDR-H2、及び配列番号39のアミノ酸配列を含むCDR-H3を含み、両抗体軽鎖ポリペプチドのVLドメインは、配列番号40のアミノ酸配列を含むCDR-L1、配列番号41のアミノ酸配列を含むCDR-L2、及び配列番号42のアミノ酸配列を含むCDR-L3を含む;両抗体重鎖ポリペプチドのVHドメインは、配列番号55のアミノ酸配列を含むCDR-H1、配列番号57のアミノ酸配列を含むCDR-H2、及び配列番号45のアミノ酸配列を含むCDR-H3を含み、両抗体軽鎖ポリペプチドのVLドメインは、配列番号46のアミノ酸配列を含むCDR-L1、配列番号47のアミノ酸配列を含むCDR-L2、及び配列番号48のアミノ酸配列を含むCDR-L3を含む;両抗体重鎖ポリペプチドのVHドメインは、配列番号49のアミノ酸配列を含むCDR-H1、配列番号50のアミノ酸配列を含むCDR-H2、及び配列番号3のアミノ酸配列を含むCDR-H3を含み、両抗体軽鎖ポリペプチドのVLドメインは、配列番号4のアミノ酸配列を含むCDR-L1、配列番号5のアミノ酸配列を含むCDR-L2、及び配列番号6のアミノ酸配列を含むCDR-L3を含む;両抗体重鎖ポリペプチドのVHドメインは、配列番号183のアミノ酸配列を含むCDR-H1、配列番号184のアミノ酸配列を含むCDR-H2、及び配列番号179のアミノ酸配列を含むCDR-H3を含み、両抗体軽鎖ポリペプチドのVLドメインは、配列番号180のアミノ酸配列を含むCDR-L1、配列番号181のアミノ酸配列を含むCDR-L2、及び配列番号182のアミノ酸配列を含むCDR-L3を含む;両抗体重鎖ポリペプチドのVHドメインは、配列番号238のアミノ酸配列を含むCDR-H1、配列番号239のアミノ酸配列を含むCDR-H2、及び配列番号233のアミノ酸配列を含むCDR-H3を含み、両抗体軽鎖ポリペプチドのVLドメインは、配列番号16のアミノ酸配列を含むCDR-L1、配列番号17のアミノ酸配列を含むCDR-L2、及び配列番号228のアミノ酸配列を含むCDR-L3を含む;両抗体重鎖ポリペプチドのVHドメインは、配列番号240のアミノ酸配列を含むCDR-H1、配列番号241のアミノ酸配列を含むCDR-H2、及び配列番号242のアミノ酸配列を含むCDR-H3を含み、両抗体軽鎖ポリペプチドのVLドメインは、配列番号40のアミノ酸配列を含むCDR-L1、配列番号41のアミノ酸配列を含むCDR-L2、及び配列番号42のアミノ酸配列を含むCDR-L3を含む;両抗体重鎖ポリペプチドのVHドメインは、配列番号238のアミノ酸配列を含むCDR-H1、配列番号243のアミノ酸配列を含むCDR-H2、及び配列番号233のアミノ酸配列を含むCDR-H3を含み、両抗体軽鎖ポリペプチドのVLドメインは、配列番号234のアミノ酸配列を含むCDR-L1、配列番号235のアミノ酸配列を含むCDR-L2、及び配列番号236のアミノ酸配列を含むCDR-L3を含む;両抗体重鎖ポリペプチドのVHドメインは、配列番号238のアミノ酸配列を含むCDR-H1、配列番号243のアミノ酸配列を含むCDR-H2、及び配列番号233のアミノ酸配列を含むCDR-H3を含み、両抗体軽鎖ポリペプチドのVLドメインは、配列番号16のアミノ酸配列を含むCDR-L1、配列番号17のアミノ酸配列を含むCDR-L2、及び配列番号228のアミノ酸配列を含むCDR-L3を含む;または両抗体重鎖ポリペプチドのVHドメインは、配列番号240のアミノ酸配列を含むCDR-H1、配列番号244のアミノ酸配列を含むCDR-H2、及び配列番号242のアミノ酸配列を含むCDR-H3を含み、両抗体軽鎖ポリペプチドのVLドメインは、配列番号40のアミノ酸配列を含むCDR-L1、配列番号41のアミノ酸配列を含むCDR-L2、及び配列番号42のアミノ酸配列を含むCDR-L3を含む。いくつかの実
施形態において、VHドメインは、配列番号13のアミノ酸配列を含むCDR-H1、配列番号14のアミノ酸配列を含むCDR-H2、及び配列番号15のアミノ酸配列を含むCDR-H3を含み、VLドメインは、配列番号16のアミノ酸配列を含むCDR-L1、配列番号17のアミノ酸配列を含むCDR-L2、及び配列番号18のアミノ酸配列を含むCDR-L3を含む;VHドメインは、配列番号19のアミノ酸配列を含むCDR-H1、配列番号20のアミノ酸配列を含むCDR-H2、及び配列番号21のアミノ酸配列を含むCDR-H3を含み、VLドメインは、配列番号22のアミノ酸配列を含むCDR-L1、配列番号23のアミノ酸配列を含むCDR-L2、及び配列番号24のアミノ酸配列を含むCDR-L3を含む;VHドメインは、配列番号25のアミノ酸配列を含むCDR-H1、配列番号26のアミノ酸配列を含むCDR-H2、及び配列番号27のアミノ酸配列を含むCDR-H3を含み、VLドメインは、配列番号28のアミノ酸配列を含むCDR-L1、配列番号29のアミノ酸配列を含むCDR-L2、及び配列番号30のアミノ酸配列を含むCDR-L3を含む;VHドメインは、配列番号31のアミノ酸配列を含むCDR-H1、配列番号32のアミノ酸配列を含むCDR-H2、及び配列番号33のアミノ酸配列を含むCDR-H3を含み、VLドメインは、配列番号34のアミノ酸配列を含むCDR-L1、配列番号35のアミノ酸配列を含むCDR-L2、及び配列番号36のアミノ酸配列を含むCDR-L3を含む;VHドメインは、配列番号37のアミノ酸配列を含むCDR-H1、配列番号38のアミノ酸配列を含むCDR-H2、及び配列番号39のアミノ酸配列を含むCDR-H3を含み、VLドメインは、配列番号40のアミノ酸配列を含むCDR-L1、配列番号41のアミノ酸配列を含むCDR-L2、及び配列番号42のアミノ酸配列を含むCDR-L3を含む;VHドメインは、配列番号43のアミノ酸配列を含むCDR-H1、配列番号44のアミノ酸配列を含むCDR-H2、及び配列番号45のアミノ酸配列を含むCDR-H3を含み、VLドメインは、配列番号46のアミノ酸配列を含むCDR-L1、配列番号47のアミノ酸配列を含むCDR-L2、及び配列番号48のアミノ酸配列を含むCDR-L3を含む;VHドメインは、配列番号1のアミノ酸配列を含むCDR-H1、配列番号2のアミノ酸配列を含むCDR-H2、及び配列番号3のアミノ酸配列を含むCDR-H3を含み、VLドメインは、配列番号4のアミノ酸配列を含むCDR-L1、配列番号5のアミノ酸配列を含むCDR-L2、及び配列番号6のアミノ酸配列を含むCDR-L3を含む;VHドメインは、配列番号177のアミノ酸配列を含むCDR-H1、配列番号178のアミノ酸配列を含むCDR-H2、及び配列番号179のアミノ酸配列を含むCDR-H3を含み、VLドメインは、配列番号180のアミノ酸配列を含むCDR-L1、配列番号181のアミノ酸配列を含むCDR-L2、及び配列番号182のアミノ酸配列を含むCDR-L3を含む;VHドメインは、配列番号225のアミノ酸配列を含むCDR-H1、配列番号226のアミノ酸配列を含むCDR-H2、及び配列番号227のアミノ酸配列を含むCDR-H3を含み、VLドメインは、配列番号16のアミノ酸配列を含むCDR-L1、配列番号17のアミノ酸配列を含むCDR-L2、及び配列番号228のアミノ酸配列を含むCDR-L3を含む;VHドメインは、配列番号229のアミノ酸配列を含むCDR-H1、配列番号230のアミノ酸配列を含むCDR-H2、及び配列番号231のアミノ酸配列を含むCDR-H3を含み、VLドメインは、配列番号40のアミノ酸配列を含むCDR-L1、配列番号41のアミノ酸配列を含むCDR-L2、及び配列番号42のアミノ酸配列を含むCDR-L3を含む;VHドメインは、配列番号225のアミノ酸配列を含むCDR-H1、配列番号232のアミノ酸配列を含むCDR-H2、及び配列番号233のアミノ酸配列を含むCDR-H3を含み、VLドメインは、配列番号234のアミノ酸配列を含むCDR-L1、配列番号235のアミノ酸配列を含むCDR-L2、及び配列番号236のアミノ酸配列を含むCDR-L3を含む;VHドメインは、配列番号225のアミノ酸配列を含むCDR-H1、配列番号232のアミノ酸配列を含むCDR-H2、及び配列番号233のアミノ酸配列を含むCDR-H3を含み、VLドメインは、配列番号16のアミノ酸配列を含むCDR-L1、配列番号17のアミノ酸配列を含むCDR-L2、及び配列番号228のアミノ酸配列を含むCDR-L3を含む;またはVHドメインは、配列番号229のアミノ酸配列を含むCDR-H1、配列番号237のアミノ酸配列を含むCDR-H2、及び配列番号231のアミノ酸配列を含むCDR-H3を含み、VLドメインは、配列番号40のアミノ酸配列を含むCDR-L1、配列番号41のアミノ酸配列を含むCDR-L2、及び配列番号42のアミノ酸配列を含むCDR-L3を含む。いくつかの実施形態において、VHドメインは、配列番号51のアミノ酸配列を含むCDR-H1、配列番号52のアミノ酸配列を含むCDR-H2、及び配列番号15のアミノ酸配列を含むCDR-H3を含み、VLドメインは、配列番号16のアミノ酸配列を含むCDR-L1、配列番号17のアミノ酸配列を含むCDR-L2、及び配列番号18のアミノ酸配列を含むCDR-L3を含む;VHドメインは、配列番号53のアミノ酸配列を含むCDR-H1、配列番号52のアミノ酸配列を含むCDR-H2、及び配列番号21のアミノ酸配列を含むCDR-H3を含み、VLドメインは、配列番号22のアミノ酸配列を含むCDR-L1、配列番号23のアミノ酸配列を含むCDR-L2、及び配列番号24のアミノ酸配列を含むCDR-L3を含む;VHドメインは、配列番号49のアミノ酸配列を含むCDR-H1、配列番号52のアミノ酸配列を含むCDR-H2、及び配列番号27のアミノ酸配列を含むCDR-H3を含み、VLドメインは、配列番号28のアミノ酸配列を含むCDR-L1、配列番号29のアミノ酸配列を含むCDR-L2、及び配列番号30のアミノ酸配列を含むCDR-L3を含む;VHドメインは、配列番号54のアミノ酸配列を含むCDR-H1、配列番号52のアミノ酸配列を含むCDR-H2、及び配列番号33のアミノ酸配列を含むCDR-H3を含み、VLドメインは、配列番号34のアミノ酸配列を含むCDR-L1、配列番号35のアミノ酸配列を含むCDR-L2、及び配列番号36のアミノ酸配列を含むCDR-L3を含む;VHドメインは、配列番号55のアミノ酸配列を含むCDR-H1、配列番号56のアミノ酸配列を含むCDR-H2、及び配列番号39のアミノ酸配列を含むCDR-H3を含み、VLドメインは、配列番号40のアミノ酸配列を含むCDR-L1、配列番号41のアミノ酸配列を含むCDR-L2、及び配列番号42のアミノ酸配列を含むCDR-L3を含む;VHドメインは、配列番号55のアミノ酸配列を含むCDR-H1、配列番号57のアミノ酸配列を含むCDR-H2、及び配列番号45のアミノ酸配列を含むCDR-H3を含み、VLドメインは、配列番号46のアミノ酸配列を含むCDR-L1、配列番号47のアミノ酸配列を含むCDR-L2、及び配列番号48のアミノ酸配列を含むCDR-L3を含む;VHドメインは、配列番号49のアミノ酸配列を含むCDR-H1、配列番号50のアミノ酸配列を含むCDR-H2、及び配列番号3のアミノ酸配列を含むCDR-H3を含み、VLドメインは、配列番号4のアミノ酸配列を含むCDR-L1、配列番号5のアミノ酸配列を含むCDR-L2、及び配列番号6のアミノ酸配列を含むCDR-L3を含む;VHドメインは、配列番号183のアミノ酸配列を含むCDR-H1、配列番号184のアミノ酸配列を含むCDR-H2、及び配列番号179のアミノ酸配列を含むCDR-H3を含み、VLドメインは、配列番号180のアミノ酸配列を含むCDR-L1、配列番号181のアミノ酸配列を含むCDR-L2、及び配列番号182のアミノ酸配列を含むCDR-L3を含む;VHドメインは、配列番号238のアミノ酸配列を含むCDR-H1、配列番号239のアミノ酸配列を含むCDR-H2、及び配列番号233のアミノ酸配列を含むCDR-H3を含み、VLドメインは、配列番号16のアミノ酸配列を含むCDR-L1、配列番号17のアミノ酸配列を含むCDR-L2、及び配列番号228のアミノ酸配列を含むCDR-L3を含む;VHドメインは、配列番号240のアミノ酸配列を含むCDR-H1、配列番号241のアミノ酸配列を含むCDR-H2、及び配列番号242のアミノ酸配列を含むCDR-H3を含み、VLドメインは、配列番号40のアミノ酸配列を含むCDR-L1、配列番号41のアミノ酸配列を含むCDR-L2、及び配列番号42のアミノ酸配列を含むCDR-L3を含む;VHドメインは、配列番号238のアミノ酸配列を含むCDR-H1、配列番号243のアミノ酸配列を含むCDR-H2、及び配列番号233のアミノ酸配列を含むCDR-H3を含み、VLドメインは、配列番号234のアミノ酸配列を含むCDR-L1、配列番号235のアミノ酸配列を含むCDR-L2、及び配列番号236のアミノ酸配列を含むCDR-L3を含む;VHドメインは、配列番号238のアミノ酸配列を含むCDR-H1、配列番号243のアミノ酸配列を含むCDR-H2、及び配列番号233のアミノ酸配列を含むCDR-H3を含み、VLドメインは、配列番号16のアミノ酸配列を含むCDR-L1、配列番号17のアミノ酸配列を含むCDR-L2、及び配列番号228のアミノ酸配列を含むCDR-L3を含む;またはVHドメインは、配列番号240のアミノ酸配列を含むCDR-H1、配列番号244のアミノ酸配列を含むCDR-H2、及び配列番号242のアミノ酸配列を含むCDR-H3を含み、VLドメインは、配列番号40のアミノ酸配列を含むCDR-L1、配列番号41のアミノ酸配列を含むCDR-L2、及び配列番号42のアミノ酸配列を含むCDR-L3を含む。いくつかの実施形態において、両抗体重鎖ポリペプチドのVHドメインは、配列番号62の配列と少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも99%、または100%同一であるアミノ酸配列を含み、両抗体軽鎖ポリペプチドのVLドメインは、配列番号63の配列と少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも99%、または100%同一であるアミノ酸配列を含む;両抗体重鎖ポリペプチドのVHドメインは、配列番号64の配列と少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも99%、または100%同一であるアミノ酸配列を含み、両抗体軽鎖ポリペプチドのVLドメインは、配列番号65の配列と少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも99%、または100%同一であるアミノ酸配列を含む;両抗体重鎖ポリペプチドのVHドメインは、配列番号66の配列と少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも99%、または100%同一であるアミノ酸配列を含み、両抗体軽鎖ポリペプチドのVLドメインは、配列番号67の配列と少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも99%、または100%同一であるアミノ酸配列を含む;両抗体重鎖ポリペプチドのVHドメインは、配列番号68の配列と少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも99%、または100%同一であるアミノ酸配列を含み、両抗体軽鎖ポリペプチドのVLドメインは、配列番号69の配列と少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも99%、または100%同一であるアミノ酸配列を含む;両抗体重鎖ポリペプチドのVHドメインは、配列番号70の配列と少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも99%、または100%同一であるアミノ酸配列を含み、両抗体軽鎖ポリペプチドのVLドメインは、配列番号71の配列と少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも99%、または10
0%同一であるアミノ酸配列を含む;両抗体重鎖ポリペプチドのVHドメインは、配列番号72の配列と少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも99%、または100%同一であるアミノ酸配列を含み、両抗体軽鎖ポリペプチドのVLドメインは、配列番号73の配列と少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも99%、または100%同一であるアミノ酸配列を含む;両抗体重鎖ポリペプチドのVHドメインは、配列番号185の配列と少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも99%、または100%同一であるアミノ酸配列を含み、両抗体軽鎖ポリペプチドのVLドメインは、配列番号186の配列と少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも99%、または100%同一であるアミノ酸配列を含む;両抗体重鎖ポリペプチドのVHドメインは、配列番号245の配列と少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも99%、または100%同一であるアミノ酸配列を含み、両抗体軽鎖ポリペプチドのVLドメインは、配列番号246の配列と少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも99%、または100%同一であるアミノ酸配列を含む;両抗体重鎖ポリペプチドのVHドメインは、配列番号251の配列と少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも99%、または100%同一であるアミノ酸配列を含み、両抗体軽鎖ポリペプチドのVLドメインは、配列番号252の配列と少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも99%、または100%同一であるアミノ酸配列を含む;VHドメインは、配列番号251のアミノ酸配列を含み、VLドメインは、配列番号252のアミノ酸配列を含む;両抗体重鎖ポリペプチドのVHドメインは、配列番号253の配列と少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも99%、または100%同一であるアミノ酸配列を含み、両抗体軽鎖ポリペプチドのVLドメインは、配列番号254の配列と少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも99%、または100%同一であるアミノ酸配列を含む;両抗体重鎖ポリペプチドのVHドメインは、配列番号247の配列と少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも99%、または100%同一であるアミノ酸配列を含み、両抗体軽鎖ポリペプチドのVLドメインは、配列番号248の配列と少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも99%、または100%同一であるアミノ酸配列を含む;両抗体重鎖ポリペプチドのVHドメインは、配列番号249の配列と少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも99%、または100%同一であるアミノ酸配列を含み、両抗体軽鎖ポリペプチドのVLドメインは、配列番号250の配列と少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも99%、または100%同一であるアミノ酸配列を含む;VHドメインは、配列番号249のアミノ酸配列を含み、VLドメインは、配列番号250のアミノ酸配列を含む;両抗体重鎖ポリペプチドのVHドメインは、配列番号255の配列と少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも99%、または100%同一であるアミノ酸配列を含み、両抗体軽鎖ポリペプチドのVLドメインは、配列番号256の配列と少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも99%、または100%同一であるアミノ酸配列を含む;または、両抗体重鎖ポリペプチドのVHドメインは、配列番号257の配列と少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも99%、または100%同一であるアミノ酸配列を含み、両抗体軽鎖ポリペプチドのVLドメインは、配列番号258の配列と少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも99%、または100%同一であるアミノ酸配列を含む。いくつかの実施形態において、VHドメインは、配列番号62の配列と少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも99%、または100%同一であるアミノ酸配列を含み、VLドメインは、配列番号63の配列と少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも99%、または100%同一であるアミノ酸配列を含む;VHドメインは、配列番号64の配列と少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも99%、または100%同一であるアミノ酸配列を含み、VLドメインは、配列番号65の配列と少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも99%、または100%同一であるアミノ酸配列を含む;VHドメインは、配列番号66の配列と少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも99%、または100%同一であるアミノ酸配列を含み、VLドメインは、配列番号67の配列と少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも99%、または100%同一であるアミノ酸配列を含む;VHドメインは、配列番号68の配列と少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも99%、または100%同一であるアミノ酸配列を含み、VLドメインは、配列番号69の配列と少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも99%、または100%同一であるアミノ酸配列を含む;VHドメインは、配列番号70の配列と少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも99%、または100%同一であるアミノ酸配列を含み、VLドメインは、配列番号71の配列と少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも99%、または100%同一であるアミノ酸配列を含む;VHドメインは、配列番号72の配列と少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも99%、または100%同一であるアミノ酸配列を含み、VLドメインは、配列番号73の配列と少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも99%、または100%同一であるアミノ酸配列を含む;VHドメインは、配列番号185の配列と少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも99%、または100%同一であるアミノ酸配列を含み、VLドメインは、配列番号186の配列と少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも99%、または100%同一であるアミノ酸配列を含む;VHドメインは、配列番号245の配列と少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも99%、または100%同一であるアミノ酸配列を含み、VLドメインは、配列番号246の配列と少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも99%、または100%同一であるアミノ酸配列を含む;VHドメインは、配列番号251の配列と少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも99%、または100%同一であるアミノ酸配列を含み、VLドメインは、配列番号252の配列と少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも99%、または100%同一であるアミノ酸配列を含む;VHドメインは、配列番号251のアミノ酸配列を含み、VLドメインは、配列番号252のアミノ酸配列を含む;VHドメインは、配列番号253の配列と少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも99%、または100%同一であるアミノ酸配列を含み、VLドメインは、配列番号254の配列と少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも99%、または100%同一であるアミノ酸配列を含む;VHドメインは、配列番号247の配列と少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも99%、または100%同一であるアミノ酸配列を含み、VLドメインは、配列番号248の配列と少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも99%、または100%同一であるアミノ酸配列を含む;VHドメインは、配列番号249の配列と少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも99%、または100%同一であるアミノ酸配列を含み、VLドメインは、配列番号250の配列と少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも99%、または100%同一であるアミノ酸配列を含む;VHドメインは、配列番号249のアミノ酸配列を含み、VLドメインは、配列番号250のアミノ酸配列を含む;VHドメインは、配列番号255の配列と少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも99%、または100%同一であるアミノ酸配列を含み、VLドメインは、配列番号256の配列と少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも99%、または100%同一であるアミノ酸配列を含む;または、VHドメインは、配列番号257の配列と少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも99%、または100%同一であるアミノ酸配列を含み、VLドメインは、配列番号258の配列と少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも99%、または100%同一であるアミノ酸配列を含む。いくつかの実施形態において、抗体重鎖ポリペプチドの一方または両方は、以下:L234A、L235A、及びG237A(番号付けはEUインデックスによる)のアミノ酸置換を含む。いくつかの実施形態において、抗体重鎖ポリペプチドのうちの1つ目は、アミノ酸置換Y349C及びT366Wを含み、抗体重鎖ポリペプチドのうちの2つ目は、アミノ酸置換S354C、T366S、L368A及びY407Vを含む(番号付けはEUインデックスによる)。
本明細書に記載の実施形態のいずれかによるいくつかの実施形態では、第2の部分はIL-2ポリペプチドを含む。いくつかの実施形態において、IL-2ポリペプチドは、APTSSSTKKTQLQLEHLLLDLQMILNGINNYKNPKLTRMLTFKFYMPKKATELKHLQCLEEELKPLEEVLNLAQSKNFHLRPRDLISNINVIVLELKGSETTFMCEYADETATIVEFLNRWITFCQSIISTLT(配列番号81)の配列を含むヒトIL-2ポリペプチドに対して1つ以上の変異を含むIL-2ポリペプチド変異体である。いくつかの実施形態において、IL-2ポリペプチド変異体は、配列番号81の配列を含む野生型IL-2ポリペプチドのIL-2Rαに対する結合親和性と比較して、50%以上低下したIL-2Rαへの結合親和性を有する。いくつかの実施形態において、IL-2ポリペプチド変異体は、配列番号81の配列を含む野生型IL-2ポリペプチドのIL-2Rβに対する結合親和性と比較して、50%以上低下したIL-2Rβへの結合親和性を有する;及び/またはIL-2ポリペプチド変異体は、配列番号81の配列を含む野生型IL-2ポリペプチドのIL-2Rγに対する結合親和性と比較して、50%以上低下したIL-2Rγへの結合親和性を有する。いくつかの実施形態において、IL-2ポリペプチドは、配列番号81に対して1、2、3、4、または5つのアミノ酸置換を有する配列番号81の配列を含み、該1、2、3、4、または5つの置換(複数可)は、以下:Q11、H16、L18、L19、D20、Q22、R38、F42、K43、Y45、E62、P65、E68、V69、L72、D84、S87、N88、V91、I92、T123、Q126、S127、I129、及びS130からなる群から選択される配列番号81の位置での置換(複数可)を含む。いくつかの実施形態において、IL-2ポリペプチドは、(配列番号81の配列に対する)以下:R38E及びF42A;R38D及びF42A;F42A及びE62Q;R38A及びF42K;R38E、F42A、及びN88S;R38E、F42A、及びN88A;R38E、F42A、及びN88G;R38E、F42A、及びN88R;R38E、F42A、及びN88T;R38E、F42A、及びN88D;R38E、F42A、及びV91E;R38E、F42A、及びD84H;R38E、F42A、及びD84K;R38E、F42A、及びD84R;H16D、R38E及びF42A;H16E、R38E及びF42A;R38E、F42A及びQ126S;R38D、F42A及びN88S;R38D、F42A及びN88A;R38D、F42A及びN88G;R38D、F42A及びN88R;R38D、F42A及びN88T;R38D、F42A及びN88D;R38D、F42A及びV91E;R38D、F42A、及びD84H;R38D、F42A、及びD84K;R38D、F42A、及びD84R;H16D、R38D及びF42A;H16E、R38D及びF42A;R38D、F42A及びQ126S;R38A、F42K、及びN88S;R38A、F42K、及びN88A;R38A、F42K、及びN88G;R38A、F42K、及びN88R;R38A、F42K、及びN88T;R38A、F42K、及びN88D;R38A、F42K、及びV91E;R38A、F42K、及びD84H;R38A、F42K、及びD84K;R38A、F42K、及びD84R;H16D、R38A、及びF42K;H16E、R38A、及びF42K;R38A、F42K、及びQ126S;F42A、E62Q、及びN88S;F42A、E62Q、及びN88A;F42A、E62Q、及びN88G;F42A、E62Q、及びN88R;F42A、E62Q、及びN88T;F42A、E62Q、及びN88D;F42A、E62Q、及びV91E;F42A、E62Q、及びD84H;F42A、E62Q、及びD84K;F42A、E62Q、及びD84R;H16D、F42A、及びE62Q;H16E、F42A、及びE62Q;F42A、E62Q、及びQ126Sのアミノ酸置換セットのうちの1つを有する配列番号81の配列を含む。いくつかの実施形態において、IL-2ポリペプチドは、配列番号81に対して位置C125においてさらなるアミノ酸置換を有する配列番号81の配列を含む。いくつかの実施形態において、IL-2ポリペプチドは、(配列番号81の配列に対する)以下:R38E、F42A、及びC125A;R38D、F42A、及びC125A;F42A、E62Q、及びC125A;R38A、F42K、及びC125A;R38E、F42A、N88S、及びC125A;R38E、F42A、N88A、及びC125A;R38E、F42A、N88G、及びC125A;R38E、F42A、N88R、及びC125A;R38E、F42A、N88T、及びC125A;R38E、F42A、N88D、及びC125A;R38E、F42A、V91E、及びC125A;R38E、F42A、D84H、及びC125A;R38E、F42A、D84K、及びC125A;R38E、F42A、D84R、及びC125A;H16D、R38E、F42A、及びC125A;H16E、R38E、F42A、及びC125A;R38E、F42A、C125A及びQ126S;R38D、F42A、N88S、及びC125A;R38D、F42A、N88A、及びC125A;R38D、F42A、N88G、及びC125A;R38D、F42A、N88R、及びC125A;R38D、F42A、N88T、及びC125A;R38D、F42A、N88D、及びC125A;R38D、F42A、V91E、及びC125A;R38D、F42A、D84H、及びC125A;R38D、F42A、D84K、及びC125A;R38D、F42A、D84R、及びC125A;H16D、R38D、F42A、及びC125A;H16E、R38D、F42A、及びC125A;R38D、F42A、C125A、及びQ126S;R38A、F42K、N88S、及びC125A;R38A、F42K、N88G、及びC125A;R38A、F42K、N88R、及びC125A;R38A、F42K、N88T、及びC125A;R38A、F42K、N88D、及びC125A;R38A、F42K、N88A、及びC125A;R38A、F42K、V91E、及びC125A;R38A、F42K、D84H、及びC125A;R38A、F42K、D84K、及びC125A;R38A、F42K、D84R、及びC125A;H16D、R38A、F42K、及びC125A;H16E、R38A、F42K、及びC125A;R38A、F42K、C125A及びQ126S;F42A、E62Q、N88S、及びC125A;F42A、E62Q、N88A、及びC125A;F42A、E62Q、N88G、及びC125A;F42A、E62Q、N88R、及びC125A;F42A、E62Q、N88T、及びC125A;F42A、E62Q、N88D、及びC125A;F42A、E62Q、V91E、及びC125A;F42A、E62Q、及びD84H、及びC125A;F42A、E62Q、及びD84K、及びC125A;F42A、E62Q、及びD84R、及びC125A;H16D、F42A、及びE62Q、及びC125A;H16E、F42A、E62Q、及びC125A;F42A、E62Q、C125A及びQ126S;F42A、N88S、及びC125A;F42A、N88A、及びC125A;F42A、N88G、及びC125A;F42A、N88R、及びC125A;F42A、N88T、及びC125A;F42A、N88D、及びC125A;F42A、V91E、及びC125A;F42A、D84H、及びC125A;F42A、D84K、及びC125A;F42A、D84R、及びC125A;H16D、F42A、及びC125A;H16E、F42A、及びC125A;ならびにF42A、C125A及びQ126Sのアミノ酸置換セットのうちの1つを有する配列番号81の配列を含む。いくつかの実施形態において、IL-2ポリペプチドは、配列APTSSSTKKTQLQLEHLLLDLQMILNGINNYKNPKLTEMLTAKFYMPKKATELKHLQCLEEELKPLEEVLNLAQSKNFHLRPRDLISAINVIVLELKGSETTFMCEYADETATIVEFLNRWITFAQSIISTLT(配列番号80)を含む。いくつかの実施形態において、IL-2ポリペプチドは、配列APTSSSTKKTQLQLEELLLDLQMILNGINNYKNPKLTEMLTAKFYMPKKATELKHLQCLEEELKPLEEVLNLAQSKNFHLRPRDLISNINVIVLELKGSETTFMCEYADETATIVEFLNRWITFAQSIISTLT(配列番号297)を含む。いくつかの実施形態において、IL-2ポリペプチドは、配列番号85~155及び190~216からなる群から選択される配列を含む。いくつかの実施形態において、IL-2ポリペプチドは、配列番号80、85~155、190~216、297、及び354~383からなる群から選択される配列を含む。いくつかの実施形態において、第2の部分は、IL2Rβγを介したシグナル伝達を誘導するポリペプチドを含む。いくつかの実施形態において、第2の部分は、IL-21ポリペプチドを含む。
本明細書に記載の実施形態のいずれかによるいくつかの実施形態(例えば、本開示の融合タンパク質)では、抗体Fcドメインの一方または両方は、以下:L234A、L235A、G237A、及びK322A(番号付けはEUインデックスによる)のアミノ酸置換を有するヒトIgG1 Fcドメインを含む。いくつかの実施形態において、抗体Fcドメインの一方または両方は、C末端リジンを有しない。いくつかの実施形態において、抗体Fcドメインの一方または両方は、以下:L234A、L235A、及びG237A(番号付けはEUインデックスによる)のアミノ酸置換を有するヒトIgG1 Fcドメインを含む。いくつかの実施形態において、抗体Fcドメインの一方または両方は、C末端リジンを有しない。いくつかの実施形態において、2つのFcドメインのうちの1つ目は、アミノ酸置換Y349C及びT366Wを有するヒトIgG1 Fcドメインを含み、2つのFcドメインのうちの2つ目は、アミノ酸置換S354C、T366S、L368A及びY407Vを有するヒトIgG1 Fcドメインを含む(番号付けはEUインデックスによる)。いくつかの実施形態において、抗体Fcドメインの一方または両方は、C末端リジンを有しない。いくつかの実施形態(例えば、本開示の融合タンパク質)において、リンカーは、配列(GGGS)xGn(配列番号74)、(GGGGS)xGn(配列番号75)、もしくは(GGGGGS)xGn(配列番号76)、S(GGGS)xGn(配列番号386)、S(GGGGS)xGn(配列番号387)、もしくはS(GGGGGS)xGn(配列番号388)を含み、ここで、x=1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、または12、及びn=0、1、2または3である。いくつかの実施形態において、リンカーは、配列GGGGSGGGGSGGGGS(配列番号79)またはSGGGGSGGGGSGGGGS(配列番号389)を含む。いくつかの実施形態において(例えば、本開示の融合タンパク質において)、リンカーは、本開示の第1の部分(例えば、CD8b及び/またはCD8abに特異的に結合するヒトもしくはヒト化抗体またはその抗原結合フラグメント)と本開示の第2の部分(例えば、本開示のIL-2ポリペプチド、本開示のIL-21ポリペプチド、または本開示のIL2Rβγを介したシグナル伝達を誘導するポリペプチド)とをつなげる。
いくつかの実施形態において、本開示の融合タンパク質は、配列番号156のアミノ酸配列を含む1つまたは2つの軽鎖、配列番号157のアミノ酸配列を含む重鎖、及び配列番号158のアミノ酸配列を含む重鎖を含む。いくつかの実施形態において、本開示の融合タンパク質は、配列番号156のアミノ酸配列を含む1つまたは2つの軽鎖、配列番号157のアミノ酸配列を含む重鎖、及び配列番号217のアミノ酸配列を含む重鎖を含む。いくつかの実施形態において、本開示の融合タンパク質は、配列番号159のアミノ酸配列を含む1つまたは2つの軽鎖、配列番号160のアミノ酸配列を含む重鎖、及び配列番号161のアミノ酸配列を含む重鎖を含む。いくつかの実施形態において、本開示の融合タンパク質は、配列番号159のアミノ酸配列を含む1つまたは2つの軽鎖、配列番号160のアミノ酸配列を含む重鎖、及び配列番号218のアミノ酸配列を含む重鎖を含む。いくつかの実施形態において、本開示の融合タンパク質は、配列番号162のアミノ酸配列を含む1つまたは2つの軽鎖、配列番号163のアミノ酸配列を含む重鎖、及び配列番号164のアミノ酸配列を含む重鎖を含む。いくつかの実施形態において、本開示の融合タンパク質は、配列番号162のアミノ酸配列を含む1つまたは2つの軽鎖、配列番号163のアミノ酸配列を含む重鎖、及び配列番号219のアミノ酸配列を含む重鎖を含む。いくつかの実施形態において、本開示の融合タンパク質は、配列番号165のアミノ酸配列を含む1つまたは2つの軽鎖、配列番号166のアミノ酸配列を含む重鎖、及び配列番号167のアミノ酸配列を含む重鎖を含む。いくつかの実施形態において、本開示の融合タンパク質は、配列番号165のアミノ酸配列を含む1つまたは2つの軽鎖、配列番号166のアミノ酸配列を含む重鎖、及び配列番号220のアミノ酸配列を含む重鎖を含む。いくつかの実施形態において、本開示の融合タンパク質は、配列番号168のアミノ酸配列を含む1つまたは2つの軽鎖、配列番号169のアミノ酸配列を含む重鎖、及び配列番号170のアミノ酸配列を含む重鎖を含む。いくつかの実施形態において、本開示の融合タンパク質は、配列番号168のアミノ酸配列を含む1つまたは2つの軽鎖、配列番号169のアミノ酸配列を含む重鎖、及び配列番号221のアミノ酸配列を含む重鎖を含む。いくつかの実施形態において、本開示の融合タンパク質は、配列番号171のアミノ酸配列を含む1つまたは2つの軽鎖、配列番号172のアミノ酸配列を含む重鎖、及び配列番号173のアミノ酸配列を含む重鎖を含む。いくつかの実施形態において、本開示の融合タンパク質は、配列番号171のアミノ酸配列を含む1つまたは2つの軽鎖、配列番号172のアミノ酸配列を含む重鎖、及び配列番号222のアミノ酸配列を含む重鎖を含む。いくつかの実施形態において、本開示の融合タンパク質は、配列番号174のアミノ酸配列を含む1つまたは2つの軽鎖、配列番号175のアミノ酸配列を含む重鎖、及び配列番号176のアミノ酸配列を含む重鎖を含む。いくつかの実施形態において、本開示の融合タンパク質は、配列番号174のアミノ酸配列を含む1つまたは2つの軽鎖、配列番号175のアミノ酸配列を含む重鎖、及び配列番号223のアミノ酸配列を含む重鎖を含む。いくつかの実施形態において、本開示の融合タンパク質は、配列番号187のアミノ酸配列を含む1つまたは2つの軽鎖、配列番号188のアミノ酸配列を含む重鎖、及び配列番号189のアミノ酸配列を含む重鎖を含む。いくつかの実施形態において、本開示の融合タンパク質は、配列番号187のアミノ酸配列を含む1つまたは2つの軽鎖、配列番号188のアミノ酸配列を含む重鎖、及び配列番号224のアミノ酸配列を含む重鎖を含む。いくつかの実施形態において、本開示の融合タンパク質は、配列番号298のアミノ酸配列を含む1つまたは2つの軽鎖、配列番号299のアミノ酸配列を含む重鎖、及び配列番号300のアミノ酸配列を含む重鎖を含む。いくつかの実施形態において、本開示の融合タンパク質は、配列番号298のアミノ酸配列を含む1つまたは2つの軽鎖、配列番号299のアミノ酸配列を含む重鎖、及び配列番号301のアミノ酸配列を含む重鎖を含む。いくつかの実施形態において、本開示の融合タンパク質は、配列番号302のアミノ酸配列を含む1つまたは2つの軽鎖、配列番号303のアミノ酸配列を含む重鎖、及び配列番号304のアミノ酸配列を含む重鎖を含む。いくつかの実施形態において、本開示の融合タンパク質は、配列番号302のアミノ酸配列を含む1つまたは2つの軽鎖、配列番号303のアミノ酸配列を含む重鎖、及び配列番号305のアミノ酸配列を含む重鎖を含む。いくつかの実施形態において、本開示の融合タンパク質は、配列番号306のアミノ酸配列を含む1つまたは2つの軽鎖、配列番号307のアミノ酸配列を含む重鎖、及び配列番号308のアミノ酸配列を含む重鎖を含む。いくつかの実施形態において、本開示の融合タンパク質は、配列番号306のアミノ酸配列を含む1つまたは2つの軽鎖、配列番号307のアミノ酸配列を含む重鎖、及び配列番号309のアミノ酸配列を含む重鎖を含む。いくつかの実施形態において、本開示の融合タンパク質は、配列番号310のアミノ酸配列を含む1つまたは2つの軽鎖、配列番号311のアミノ酸配列を含む重鎖、及び配列番号312のアミノ酸配列を含む重鎖を含む。いくつかの実施形態において、本開示の融合タンパク質は、配列番号310のアミノ酸配列を含む1つまたは2つの軽鎖、配列番号311のアミノ酸配列を含む重鎖、及び配列番号313のアミノ酸配列を含む重鎖を含む。いくつかの実施形態において、本開示の融合タンパク質は、配列番号314のアミノ酸配列を含む1つまたは2つの軽鎖、配列番号315のアミノ酸配列を含む重鎖、及び配列番号316のアミノ酸配列を含む重鎖を含む。いくつかの実施形態において、本開示の融合タンパク質は、配列番号314のアミノ酸配列を含む1つまたは2つの軽鎖、配列番号315のアミノ酸配列を含む重鎖、及び配列番号317のアミノ酸配列を含む重鎖を含む。いくつかの実施形態において、本開示の融合タンパク質は、配列番号318のアミノ酸配列を含む1つまたは2つの軽鎖、配列番号319のアミノ酸配列を含む重鎖、及び配列番号320のアミノ酸配列を含む重鎖を含む。いくつかの実施形態において、本開示の融合タンパク質は、配列番号318のアミノ酸配列を含む1つまたは2つの軽鎖、配列番号319のアミノ酸配列を含む重鎖、及び配列番号321のアミノ酸配列を含む重鎖を含む。いくつかの実施形態において、本開示の融合タンパク質は、配列番号322のアミノ酸配列を含む1つまたは2つの軽鎖、配列番号323のアミノ酸配列を含む重鎖、及び配列番号324のアミノ酸配列を含む重鎖を含む。いくつかの実施形態において、本開示の融合タンパク質は、配列番号322のアミノ酸配列を含む1つまたは2つの軽鎖、配列番号323のアミノ酸配列を含む重鎖、及び配列番号325のアミノ酸配列を含む重鎖を含む。いくつかの実施形態において、本開示の融合タンパク質は、配列番号326のアミノ酸配列を含む1つまたは2つの軽鎖、配列番号327のアミノ酸配列を含む重鎖、及び配列番号328のアミノ酸配列を含む重鎖を含む。いくつかの実施形態において、本開示の融合タンパク質は、配列番号326のアミノ酸配列を含む1つまたは2つの軽鎖、配列番号327のアミノ酸配列を含む重鎖、及び配列番号329のアミノ酸配列を含む重鎖を含む。いくつかの実施形態において、本開示の融合タンパク質は、配列番号330のアミノ酸配列を含む1つまたは2つの軽鎖、配列番号331のアミノ酸配列を含む重鎖、及び配列番号332のアミノ酸配列を含む重鎖を含む。いくつかの実施形態において、本開示の融合タンパク質は、配列番号330のアミノ酸配列を含む1つまたは2つの軽鎖、配列番号331のアミノ酸配列を含む重鎖、及び配列番号333のアミノ酸配列を含む重鎖を含む。いくつかの実施形態において、本開示の融合タンパク質は、配列番号334のアミノ酸配列を含む1つまたは2つの軽鎖、配列番号335のアミノ酸配列を含む重鎖、及び配列番号336のアミノ酸配列を含む重鎖を含む。いくつかの実施形態において、本開示の融合タンパク質は、配列番号334のアミノ酸配列を含む1つまたは2つの軽鎖、配列番号335のアミノ酸配列を含む重鎖、及び配列番号337のアミノ酸配列を含む重鎖を含む。いくつかの実施形態において、本開示の融合タンパク質は、配列番号338のアミノ酸配列を含む1つまたは2つの軽鎖、配列番号339のアミノ酸配列を含む重鎖、及び配列番号340のアミノ酸配列を含む重鎖を含む。いくつかの実施形態において、本開示の融合タンパク質は、配列番号338のアミノ酸配列を含む1つまたは2つの軽鎖、配列番号339のアミノ酸配列を含む重鎖、及び配列番号341のアミノ酸配列を含む重鎖を含む。いくつかの実施形態において、本開示の融合タンパク質は、配列番号342のアミノ酸配列を含む1つまたは2つの軽鎖、配列番号343のアミノ酸配列を含む重鎖、及び配列番号344のアミノ酸配列を含む重鎖を含む。いくつかの実施形態において、本開示の融合タンパク質は、配列番号342のアミノ酸配列を含む1つまたは2つの軽鎖、配列番号343のアミノ酸配列を含む重鎖、及び配列番号345のアミノ酸配列を含む重鎖を含む。いくつかの実施形態において、本開示の融合タンパク質は、配列番号346のアミノ酸配列を含む1つまたは2つの軽鎖、配列番号347のアミノ酸配列を含む重鎖、及び配列番号348のアミノ酸配列を含む重鎖を含む。いくつかの実施形態において、本開示の融合タンパク質は、配列番号346のアミノ酸配列を含む1つまたは2つの軽鎖、配列番号347のアミノ酸配列を含む重鎖、及び配列番号349のアミノ酸配列を含む重鎖を含む。いくつかの実施形態において、本開示の融合タンパク質は、配列番号350のアミノ酸配列を含む1つまたは2つの軽鎖、配列番号351のアミノ酸配列を含む重鎖、及び配列番号352のアミノ酸配列を含む重鎖を含む。いくつかの実施形態において、本開示の融合タンパク質は、配列番号156のアミノ酸配列を含む1つまたは2つの軽鎖、配列番号157のアミノ酸配列を含む重鎖、及び配列番号217のアミノ酸配列を含む重鎖を含む。いくつかの実施形態において、本開示の融合タンパク質は、配列番号159のアミノ酸配列を含む1つまたは2つの軽鎖、配列番号160のアミノ酸配列を含む重鎖、及び配列番号218のアミノ酸配列を含む重鎖を含む。いくつかの実施形態において、本開示の融合タンパク質は、配列番号162のアミノ酸配列を含む1つまたは2つの軽鎖、配列番号163のアミノ酸配列を含む重鎖、及び配列番号219のアミノ酸配列を含む重鎖を含む。いくつかの実施形態において、本開示の融合タンパク質は、配列番号165のアミノ酸配列を含む1つまたは2つの軽鎖、配列番号166のアミノ酸配列を含む重鎖、及び配列番号220のアミノ酸配列を含む重鎖を含む。いくつかの実施形態において、本開示の融合タンパク質は、配列番号168のアミノ酸配列を含む1つまたは2つの軽鎖、配列番号169のアミノ酸配列を含む重鎖、及び配列番号221のアミノ酸配列を含む重鎖を含む。いくつかの実施形態において、本開示の融合タンパク質は、配列番号171のアミノ酸配列を含む1つまたは2つの軽鎖、配列番号172のアミノ酸配列を含む重鎖、及び配列番号222のアミノ酸配列を含む重鎖を含む。いくつかの実施形態において、本開示の融合タンパク質は、配列番号174のアミノ酸配列を含む1つまたは2つの軽鎖、配列番号175のアミノ酸配列を含む重鎖、及び配列番号223のアミノ酸配列を含む重鎖を含む。いくつかの実施形態において、本開示の融合タンパク質は、配列番号187のアミノ酸配列を含む1つまたは2つの軽鎖、配列番号188のアミノ酸配列を含む重鎖、及び配列番号224のアミノ酸配列を含む重鎖を含む。いくつかの実施形態において、本開示の融合
タンパク質は、配列番号298のアミノ酸配列を含む1つまたは2つの軽鎖、配列番号299のアミノ酸配列を含む重鎖、及び配列番号301のアミノ酸配列を含む重鎖を含む。いくつかの実施形態において、本開示の融合タンパク質は、配列番号302のアミノ酸配列を含む1つまたは2つの軽鎖、配列番号303のアミノ酸配列を含む重鎖、及び配列番号305のアミノ酸配列を含む重鎖を含む。いくつかの実施形態において、本開示の融合タンパク質は、配列番号306のアミノ酸配列を含む1つまたは2つの軽鎖、配列番号307のアミノ酸配列を含む重鎖、及び配列番号309のアミノ酸配列を含む重鎖を含む。いくつかの実施形態において、本開示の融合タンパク質は、配列番号310のアミノ酸配列を含む1つまたは2つの軽鎖、配列番号311のアミノ酸配列を含む重鎖、及び配列番号313のアミノ酸配列を含む重鎖を含む。いくつかの実施形態において、本開示の融合タンパク質は、配列番号314のアミノ酸配列を含む1つまたは2つの軽鎖、配列番号315のアミノ酸配列を含む重鎖、及び配列番号317のアミノ酸配列を含む重鎖を含む。いくつかの実施形態において、本開示の融合タンパク質は、配列番号318のアミノ酸配列を含む1つまたは2つの軽鎖、配列番号319のアミノ酸配列を含む重鎖、及び配列番号321のアミノ酸配列を含む重鎖を含む。いくつかの実施形態において、本開示の融合タンパク質は、配列番号322のアミノ酸配列を含む1つまたは2つの軽鎖、配列番号323のアミノ酸配列を含む重鎖、及び配列番号325のアミノ酸配列を含む重鎖を含む。いくつかの実施形態において、本開示の融合タンパク質は、配列番号326のアミノ酸配列を含む1つまたは2つの軽鎖、配列番号327のアミノ酸配列を含む重鎖、及び配列番号329のアミノ酸配列を含む重鎖を含む。いくつかの実施形態において、本開示の融合タンパク質は、配列番号330のアミノ酸配列を含む1つまたは2つの軽鎖、配列番号331のアミノ酸配列を含む重鎖、及び配列番号333のアミノ酸配列を含む重鎖を含む。いくつかの実施形態において、本開示の融合タンパク質は、配列番号334のアミノ酸配列を含む1つまたは2つの軽鎖、配列番号335のアミノ酸配列を含む重鎖、及び配列番号337のアミノ酸配列を含む重鎖を含む。いくつかの実施形態において、本開示の融合タンパク質は、配列番号338のアミノ酸配列を含む1つまたは2つの軽鎖、配列番号339のアミノ酸配列を含む重鎖、及び配列番号341のアミノ酸配列を含む重鎖を含む。いくつかの実施形態において、本開示の融合タンパク質は、配列番号342のアミノ酸配列を含む1つまたは2つの軽鎖、配列番号343のアミノ酸配列を含む重鎖、及び配列番号345のアミノ酸配列を含む重鎖を含む。いくつかの実施形態において、本開示の融合タンパク質は、配列番号346のアミノ酸配列を含む1つまたは2つの軽鎖、配列番号347のアミノ酸配列を含む重鎖、及び配列番号349のアミノ酸配列を含む重鎖を含む。いくつかの実施形態において、本開示の融合タンパク質は、配列番号350のアミノ酸配列を含む1つまたは2つの軽鎖、配列番号351のアミノ酸配列を含む重鎖、及び配列番号353のアミノ酸配列を含む重鎖を含む。いくつかの実施形態において、融合タンパク質は、1つまたは2つの抗原結合部位を含み、各抗原結合部位は、軽鎖(複数可)の1つからのVLドメイン及び重鎖の1つからのVHドメインを含む(例えば、融合タンパク質は、2つの抗原結合部位:一方は2つの軽鎖のうちの1つからのVLドメイン及び重鎖の1つからのVHドメインを含み、別の方はもう1つの軽鎖からのVLドメイン及びもう1つの重鎖からのVHドメインを含む)。
いくつかの実施形態において、本開示の融合タンパク質は、配列番号156のアミノ酸配列を含む1つまたは2つのポリペプチド、配列番号157のアミノ酸配列を含むポリペプチド、及び配列番号158のアミノ酸配列を含むポリペプチドを含む。いくつかの実施形態において、本開示の融合タンパク質は、配列番号156のアミノ酸配列を含む1つまたは2つのポリペプチド、配列番号157のアミノ酸配列を含むポリペプチド、及び配列番号217のアミノ酸配列を含むポリペプチドを含む。いくつかの実施形態において、本開示の融合タンパク質は、配列番号159のアミノ酸配列を含む1つまたは2つのポリペプチド、配列番号160のアミノ酸配列を含むポリペプチド、及び配列番号161のアミノ酸配列を含むポリペプチドを含む。いくつかの実施形態において、本開示の融合タンパク質は、配列番号159のアミノ酸配列を含む1つまたは2つのポリペプチド、配列番号160のアミノ酸配列を含むポリペプチド、及び配列番号218のアミノ酸配列を含むポリペプチドを含む。いくつかの実施形態において、本開示の融合タンパク質は、配列番号162のアミノ酸配列を含む1つまたは2つのポリペプチド、配列番号163のアミノ酸配列を含むポリペプチド、及び配列番号164のアミノ酸配列を含むポリペプチドを含む。いくつかの実施形態において、本開示の融合タンパク質は、配列番号162のアミノ酸配列を含む1つまたは2つのポリペプチド、配列番号163のアミノ酸配列を含むポリペプチド、及び配列番号219のアミノ酸配列を含むポリペプチドを含む。いくつかの実施形態において、本開示の融合タンパク質は、配列番号165のアミノ酸配列を含む1つまたは2つのポリペプチド、配列番号166のアミノ酸配列を含むポリペプチド、及び配列番号167のアミノ酸配列を含むポリペプチドを含む。いくつかの実施形態において、本開示の融合タンパク質は、配列番号165のアミノ酸配列を含む1つまたは2つのポリペプチド、配列番号166のアミノ酸配列を含むポリペプチド、及び配列番号220のアミノ酸配列を含むポリペプチドを含む。いくつかの実施形態において、本開示の融合タンパク質は、配列番号168のアミノ酸配列を含む1つまたは2つのポリペプチド、配列番号169のアミノ酸配列を含むポリペプチド、及び配列番号170のアミノ酸配列を含むポリペプチドを含む。いくつかの実施形態において、本開示の融合タンパク質は、配列番号168のアミノ酸配列を含む1つまたは2つのポリペプチド、配列番号169のアミノ酸配列を含むポリペプチド、及び配列番号221のアミノ酸配列を含むポリペプチドを含む。いくつかの実施形態において、本開示の融合タンパク質は、配列番号171のアミノ酸配列を含む1つまたは2つのポリペプチド、配列番号172のアミノ酸配列を含むポリペプチド、及び配列番号173のアミノ酸配列を含むポリペプチドを含む。いくつかの実施形態において、本開示の融合タンパク質は、配列番号171のアミノ酸配列を含む1つまたは2つのポリペプチド、配列番号172のアミノ酸配列を含むポリペプチド、及び配列番号222のアミノ酸配列を含むポリペプチドを含む。いくつかの実施形態において、本開示の融合タンパク質は、配列番号174のアミノ酸配列を含む1つまたは2つのポリペプチド、配列番号175のアミノ酸配列を含むポリペプチド、及び配列番号176のアミノ酸配列を含むポリペプチドを含む。いくつかの実施形態において、本開示の融合タンパク質は、配列番号174のアミノ酸配列を含む1つまたは2つのポリペプチド、配列番号175のアミノ酸配列を含むポリペプチド、及び配列番号223のアミノ酸配列を含むポリペプチドを含む。いくつかの実施形態において、本開示の融合タンパク質は、配列番号187のアミノ酸配列を含む1つまたは2つのポリペプチド、配列番号188のアミノ酸配列を含むポリペプチド、及び配列番号189のアミノ酸配列を含むポリペプチドを含む。いくつかの実施形態において、本開示の融合タンパク質は、配列番号187のアミノ酸配列を含む1つまたは2つのポリペプチド、配列番号188のアミノ酸配列を含むポリペプチド、及び配列番号224のアミノ酸配列を含むポリペプチドを含む。いくつかの実施形態において、本開示の融合タンパク質は、配列番号298のアミノ酸配列を含む1つまたは2つのポリペプチド、配列番号299のアミノ酸配列を含むポリペプチド、及び配列番号300のアミノ酸配列を含むポリペプチドを含む。いくつかの実施形態において、本開示の融合タンパク質は、配列番号298のアミノ酸配列を含む1つまたは2つのポリペプチド、配列番号299のアミノ酸配列を含むポリペプチド、及び配列番号301のアミノ酸配列を含むポリペプチドを含む。いくつかの実施形態において、本開示の融合タンパク質は、配列番号302のアミノ酸配列を含む1つまたは2つのポリペプチド、配列番号303のアミノ酸配列を含むポリペプチド、及び配列番号304のアミノ酸配列を含むポリペプチドを含む。いくつかの実施形態において、本開示の融合タンパク質は、配列番号302のアミノ酸配列を含む1つまたは2つのポリペプチド、配列番号303のアミノ酸配列を含むポリペプチド、及び配列番号305のアミノ酸配列を含むポリペプチドを含む。いくつかの実施形態において、本開示の融合タンパク質は、配列番号306のアミノ酸配列を含む1つまたは2つのポリペプチド、配列番号307のアミノ酸配列を含むポリペプチド、及び配列番号308のアミノ酸配列を含むポリペプチドを含む。いくつかの実施形態において、本開示の融合タンパク質は、配列番号306のアミノ酸配列を含む1つまたは2つのポリペプチド、配列番号307のアミノ酸配列を含むポリペプチド、及び配列番号309のアミノ酸配列を含むポリペプチドを含む。いくつかの実施形態において、本開示の融合タンパク質は、配列番号310のアミノ酸配列を含む1つまたは2つのポリペプチド、配列番号311のアミノ酸配列を含むポリペプチド、及び配列番号312のアミノ酸配列を含むポリペプチドを含む。いくつかの実施形態において、本開示の融合タンパク質は、配列番号310のアミノ酸配列を含む1つまたは2つのポリペプチド、配列番号311のアミノ酸配列を含むポリペプチド、及び配列番号313のアミノ酸配列を含むポリペプチドを含む。いくつかの実施形態において、本開示の融合タンパク質は、配列番号314のアミノ酸配列を含む1つまたは2つのポリペプチド、配列番号315のアミノ酸配列を含むポリペプチド、及び配列番号316のアミノ酸配列を含むポリペプチドを含む。いくつかの実施形態において、本開示の融合タンパク質は、配列番号314のアミノ酸配列を含む1つまたは2つのポリペプチド、配列番号315のアミノ酸配列を含むポリペプチド、及び配列番号317のアミノ酸配列を含むポリペプチドを含む。いくつかの実施形態において、本開示の融合タンパク質は、配列番号318のアミノ酸配列を含む1つまたは2つのポリペプチド、配列番号319のアミノ酸配列を含むポリペプチド、及び配列番号320のアミノ酸配列を含むポリペプチドを含む。いくつかの実施形態において、本開示の融合タンパク質は、配列番号318のアミノ酸配列を含む1つまたは2つのポリペプチド、配列番号319のアミノ酸配列を含むポリペプチド、及び配列番号321のアミノ酸配列を含むポリペプチドを含む。いくつかの実施形態において、本開示の融合タンパク質は、配列番号322のアミノ酸配列を含む1つまたは2つのポリペプチド、配列番号323のアミノ酸配列を含むポリペプチド、及び配列番号324のアミノ酸配列を含むポリペプチドを含む。いくつかの実施形態において、本開示の融合タンパク質は、配列番号322のアミノ酸配列を含む1つまたは2つのポリペプチド、配列番号323のアミノ酸配列を含むポリペプチド、及び配列番号325のアミノ酸配列を含むポリペプチドを含む。いくつかの実施形態において、本開示の融合タンパク質は、配列番号326のアミノ酸配列を含む1つまたは2つのポリペプチド、配列番号327のアミノ酸配列を含むポリペプチド、及び配列番号328のアミノ酸配列を含むポリペプチドを含む。いくつかの実施形態において、本開示の融合タンパク質は、配列番号326のアミノ酸配列を含む1つまたは2つのポリペプチド、配列番号327のアミノ酸配列を含むポリペプチド、及び配列番号329のアミノ酸配列を含むポリペプチドを含む。いくつかの実施形態において、本開示の融合タンパク質は、配列番号330のアミノ酸配列を含む1つまたは2つのポリペプチド、配列番号331のアミノ酸配列を含むポリペプチド、及び配列番号332のアミノ酸配列を含むポリペプチドを含む。いくつかの実施形態において、本開示の融合タンパク質は、配列番号330のアミノ酸配列を含む1つまたは2つのポリペプチド、配列番号331のアミノ酸配列を含むポリペプチド、及び配列番号333のアミノ酸配列を含むポリペプチドを含む。いくつかの実施形態において、本開示の融合タンパク質は、配列番号334のアミノ酸配列を含む1つまたは2つのポリペプチド、配列番号335のアミノ酸配列を含むポリペプチド、及び配列番号336のアミノ酸配列を含むポリペプチドを含む。いくつかの実施形態において、本開示の融合タンパク質は、配列番号334のアミノ酸配列を含む1つまたは2つのポリペプチド、配列番号335のアミノ酸配列を含むポリペプチド、及び配列番号337のアミノ酸配列を含むポリペプチドを含む。いくつかの実施形態において、本開示の融合タンパク質は、配列番号338のアミノ酸配列を含む1つまたは2つのポリペプチド、配列番号339のアミノ酸配列を含むポリペプチド、及び配列番号340のアミノ酸配列を含むポリペプチドを含む。いくつかの実施形態において、本開示の融合タンパク質は、配列番号338のアミノ酸配列を含む1つまたは2つのポリペプチド、配列番号339のアミノ酸配列を含むポリペプチド、及び配列番号341のアミノ酸配列を含むポリペプチドを含む。いくつかの実施形態において、本開示の融合タンパク質は、配列番号342のアミノ酸配列を含む1つまたは2つのポリペプチド、配列番号343のアミノ酸配列を含むポリペプチド、及び配列番号344のアミノ酸配列を含むポリペプチドを含む。いくつかの実施形態において、本開示の融合タンパク質は、配列番号342のアミノ酸配列を含む1つまたは2つのポリペプチド、配列番号343のアミノ酸配列を含むポリペプチド、及び配列番号345のアミノ酸配列を含むポリペプチドを含む。いくつかの実施形態において、本開示の融合タンパク質は、配列番号346のアミノ酸配列を含む1つまたは2つのポリペプチド、配列番号347のアミノ酸配列を含むポリペプチド、及び配列番号348のアミノ酸配列を含むポリペプチドを含む。いくつかの実施形態において、本開示の融合タンパク質は、配列番号346のアミノ酸配列を含む1つまたは2つのポリペプチド、配列番号347のアミノ酸配列を含むポリペプチド、及び配列番号349のアミノ酸配列を含むポリペプチドを含む。いくつかの実施形態において、本開示の融合タンパク質は、配列番号350のアミノ酸配列を含む1つまたは2つのポリペプチド、配列番号351のアミノ酸配列を含むポリペプチド、及び配列番号352のアミノ酸配列を含むポリペプチドを含む。いくつかの実施形態において、本開示の融合タンパク質は、配列番号350のアミノ酸配列を含む1つまたは2つのポリペプチド、配列番号351のアミノ酸配列を含むポリペプチド、及び配列番号353のアミノ酸配列を含むポリペプチドを含む。
本明細書ではさらに、ヒトCD8bに結合する第1の部分及びIL2ポリペプチドを含む第2の部分を含む融合タンパク質が提供され、該融合タンパク質は、4つのポリペプチド鎖を含み、(1)第1のポリペプチド鎖は、配列番号334のアミノ酸配列を含み、第2のポリペプチド鎖は、配列番号335のアミノ酸配列を含み、第3のポリペプチド鎖は、配列番号336のアミノ酸配列を含み、第4のポリペプチド鎖は、配列番号334のアミノ酸配列を含む;(2)第1のポリペプチド鎖は、配列番号334のアミノ酸配列を含み、第2のポリペプチド鎖は、配列番号335のアミノ酸配列を含み、第3のポリペプチド鎖は、配列番号337のアミノ酸配列を含み、第4のポリペプチド鎖は、配列番号334のアミノ酸配列を含む;(3)第1のポリペプチド鎖は、配列番号338のアミノ酸配列を含み、第2のポリペプチド鎖は、配列番号339のアミノ酸配列を含み、第3のポリペプチド鎖は、配列番号340のアミノ酸配列を含み、第4のポリペプチド鎖は、配列番号338のアミノ酸配列を含む;または(4)第1のポリペプチド鎖は、配列番号338のアミノ酸配列を含み、第2のポリペプチド鎖は、配列番号339のアミノ酸配列を含み、第3のポリペプチド鎖は、配列番号341のアミノ酸配列を含み、第4のポリペプチド鎖は、配列番号338のアミノ酸配列を含む。
本明細書ではさらに、上記実施形態のいずれか1つによる抗体または融合タンパク質をコードするポリヌクレオチド(例えば、単離されたポリヌクレオチド)が提供される。本明細書ではさらに、上記実施形態のいずれか1つによるポリヌクレオチド(複数可)を含むベクター(例えば、発現ベクター)が提供される。本明細書ではさらに、上記実施形態のいずれか1つによるポリヌクレオチド(複数可)またはベクター(複数可)を含む宿主細胞(例えば、単離された宿主細胞または細胞株)が提供される。本明細書ではさらに、抗体または融合タンパク質を産生する方法であって、該抗体または融合タンパク質の産生に適した条件下で、上記実施形態のいずれか1つによる宿主細胞を培養することを含む、該方法が提供される。いくつかの実施形態において、方法は、宿主細胞から抗体または融合タンパク質を回収することをさらに含む。
本明細書ではさらに、上記実施形態のいずれか1つによる抗体または融合タンパク質及び薬学的に許容される担体を含む医薬組成物が提供される。
本明細書ではさらに、上記実施形態のいずれか1つによる抗体、融合タンパク質、または組成物の、医薬としての使用が提供される。本明細書ではさらに、がんまたは感染症(例えば、慢性感染症)を処置するための方法における、上記実施形態のいずれか1つによる抗体、融合タンパク質、または組成物の使用が提供される。本明細書ではさらに、がんまたは感染症(例えば、慢性感染症)を処置するための医薬の製造に向けた、上記実施形態のいずれか1つによる抗体、融合タンパク質、または組成物の使用が提供される。本明細書ではさらに、有効量の上記実施形態のいずれか1つによる抗体、融合タンパク質、または組成物を、がんを有する個体に投与することを含む、がんの処置方法が提供される。いくつかの実施形態において、方法は、T細胞療法、がんワクチン、化学療法剤、または免疫チェックポイント阻害剤(ICI)を個体に投与することをさらに含む。本明細書ではさらに、有効量の上記実施形態のいずれか1つによる抗体、融合タンパク質、または組成物を、感染症を有する個体に投与することを含む、感染症(例えば、慢性感染症)の処置方法が提供される。本明細書ではさらに、ex vivo(例えば、エクスビボ)で1つ以上のT細胞(例えば、腫瘍浸潤リンパ球)を有効量の上記実施形態のいずれか1つによる抗体、融合タンパク質、または組成物と接触させることを含む、T細胞を増大させる方法(例えば、ex vivo)が提供される。
本明細書に記載される様々な実施形態の特性のうちの1つ、いくつか、または全てが組み合わされて、本開示の他の実施形態が形成され得ることを理解されたい。本開示のこれらの及び他の態様は、当業者にとって明らかになるであろう。本開示のこれらの及び他の実施形態は、後続の発明を実施するための形態によってさらに説明される。
CD8a、CD8b及びCD8abヘテロ二量体に対する結合優先度に従って同定され得る3タイプのCD8ab抗体を描示している。Aは、CD8aエピトープに結合する抗体を示し、Bは、CD8aとCD8bの両方にまたがるエピトープに結合する抗体を示し、Cは、CD8bエピトープに結合する抗体を示している。各抗体タイプによるCD8a、CD8b及びCD8abヘテロ二量体に対する結合優先度も表している。 図1のA~Cで描示した3タイプのCD8ab抗体を区別するために使用したELISAアッセイの結果を示している。組換えCD8a(黒四角)、CD8b(黒三角)、CD8abヘテロ二量体(黒丸)及び無関係な抗原であるオバルブミン(白三角)への結合を測定した。xhCD8a1(クローンOKT8)及びxhCD8a2抗体(クローンSK1)は前述したものである。 図1のA~Cで描示した3タイプのCD8ab抗体を区別するために使用したELISAアッセイの結果を示している。組換えCD8a(黒四角)、CD8b(黒三角)、CD8abヘテロ二量体(黒丸)及び無関係な抗原であるオバルブミン(白三角)への結合を測定した。 図1のA~Cで描示した3タイプのCD8ab抗体を区別するために使用したELISAアッセイの結果を示している。組換えCD8a(黒四角)、CD8b(黒三角)、CD8abヘテロ二量体(黒丸)及び無関係な抗原であるオバルブミン(白三角)への結合を測定した。 図2A~2Cに表されている3タイプの抗CD8ab抗体による、種々のCD8+免疫細胞型への結合優先性を描示している。図1のAに描示しているCD8aエピトープに関する抗体は、図3Aに描示しているように、CD8ab+T細胞及びCD8aa+NK細胞の両方に結合する。 図2A~2Cに表されている3タイプの抗CD8ab抗体による、種々のCD8+免疫細胞型への結合優先性を描示している。図1のBに描示している、CD8aとCD8bの両方にまたがるエピトープに関する抗体は、図3Bに描示しているように、CD8aa+NK細胞よりもCD8ab+T細胞に優先的に結合する。 図2A~2Cに表されている3タイプの抗CD8ab抗体による、種々のCD8+免疫細胞型への結合優先性を描示している。図1のCに描示しているCD8bエピトープに関する抗体は、図3Cに描示しているように、CD8aa+NK細胞よりもCD8ab+T細胞に優先的に結合する。 ヒトPBMCへのCD8ab抗体の結合を検出し、図1のA~Cに描示している3タイプのCD8ab抗体を区別するためのフローサイトメトリーアッセイの結果を表している。hPBMCのT細胞へのCD8ab抗体の結合は、APCにコンジュゲートした抗ヒトFc抗体で染色することによって検出した。抗hFcは、hFcを含有するCD8抗体の結合を測定するために使用した。抗hFcによる染色の平均蛍光強度(MFI)を結合の表示として使用した。抗hFcの結合は、CD3+CD8a+CD8b+細胞(CD8+T細胞)において測定した。 ヒトPBMCへのCD8ab抗体の結合を検出し、図1のA~Cに描示している3タイプのCD8ab抗体を区別するためのフローサイトメトリーアッセイの結果を表している。hPBMCのNK細胞へのCD8ab抗体の結合は、APCにコンジュゲートした抗ヒトFc抗体で染色することによって検出した。抗hFcは、hFcを含有するCD8抗体の結合を測定するために使用した。抗hFcによる染色の平均蛍光強度(MFI)を結合の表示として使用した。抗hFcの結合は、CD3-CD56+CD8a+細胞(CD8+NK細胞)において測定した。 CD8bエピトープに結合するCD8ab抗体xhCD8v1~xhCD8v5のCD8+T細胞への結合を測定するフローサイトメトリーアッセイの結果を表している。HA抗原に結合する陰性対照抗体も含めている。 いくつかの実施形態による本開示のCD8ab抗体を含む融合タンパク質の4種の異なるフォーマット(フォーマットA、B、C、及びD)を描示している。 図1のA~C及び図3A~3Cに描示している3タイプのCD8ab抗体ならびにIL-2Rbg結合ポリペプチドを含む融合タンパク質を描示している。CD8aa+NK細胞よりもCD8ab+T細胞を優先的に活性化することを示している。 図1のA~C及び図3A~3Cに描示している3タイプのCD8ab抗体ならびにIL-2Rbg結合ポリペプチドを含む融合タンパク質を描示している。CD8aa+NK細胞よりもCD8ab+T細胞を優先的に活性化することを示している。 図1のA~C及び図3A~3Cに描示している3タイプのCD8ab抗体ならびにIL-2Rbg結合ポリペプチドを含む融合タンパク質を描示している。CD8aa+NK細胞よりもCD8ab+T細胞を優先的に活性化することを示している。 CD8ab抗体及びIL-2Rbg結合ポリペプチドであるIL2m1を含む融合タンパク質の選択性を判定するためのアッセイの結果である。hPBMCドナー由来のCD8+T細胞及びNK細胞における増殖マーカーKi-67の発現を、以下の融合タンパク質と共に5日間共培養した後、フローサイトメトリーにより測定した:対照抗体及び既公開のIL-2バリアント(Klein et al,Oncoimmunol.2017;6(3);e1277306)を含む対照Ab-IL2v(図上部);CD8aエピトープを標的とするCD8抗体であるxhCD8a1、及び本開示のIL-2ポリペプチド変異体であるIL2m1を含むxhCD8a1-IL-2m1(図左下);及び本開示のCD8ab抗体であるxhCD8v1及びIL2m1を含むxhCD8v1-IL2m1(図右下)。xhCD8a1-IL2m1はフォーマットCであり、対照Ab-IL2v及びxhCD8v1-IL2m1はフォーマットAであった。Ki-67発現は、CD8+T細胞(黒丸)及びNK細胞(黒四角)において測定した。NK細胞は、CD3-CD56+と定義した。CD8発現は、CD8抗体SK1による染色で測定した。 3人の異なるドナーからのhPBMCを、表示している融合タンパク質と共に5日間共培養した後のKi-67増殖マーカーの発現を表している。全ての融合タンパク質は、IL-2ポリペプチド変異体であるIL2m1、及び本開示のCD8ab抗体であるxhCD8v1~xhCD8v7を含有し、フォーマットAであった。Ki-67発現は、CD8+T細胞(実線)及びNK細胞(破線)において測定した。 3人の異なるドナーからのhPBMCを、表示している融合タンパク質と共に5日間共培養した後のKi-67増殖マーカーの発現を表している。全ての融合タンパク質は、IL-2ポリペプチド変異体であるIL2m1、及び本開示のCD8ab抗体であるxhCD8v1~xhCD8v7を含有し、フォーマットAであった。Ki-67発現は、CD8+T細胞(実線)及びNK細胞(破線)において測定した。 3人の異なるドナーからのhPBMCを、表示している融合タンパク質と共に5日間共培養した後のKi-67増殖マーカーの発現を表している。全ての融合タンパク質は、IL-2ポリペプチド変異体であるIL2m1、及び本開示のCD8ab抗体であるxhCD8v1~xhCD8v7を含有し、フォーマットAであった。Ki-67発現は、CD8+T細胞(実線)及びNK細胞(破線)において測定した。 表示した融合タンパク質(全てフォーマットC)と共に培養した1人のドナーからのhPBMCを用いたリン酸化STAT5アッセイの結果を示している。pSTAT5発現細胞パーセントは、以下のhPBMCサブセットにおいて表している:CD8+T細胞。 表示した融合タンパク質(全てフォーマットC)と共に培養した1人のドナーからのhPBMCを用いたリン酸化STAT5アッセイの結果を示している。pSTAT5発現細胞パーセントは、以下のhPBMCサブセットにおいて表している:NK細胞。NK細胞は、CD3-パーフォリン+として同定した。 表示した融合タンパク質(全てフォーマットC)と共に培養した1人のドナーからのhPBMCを用いたリン酸化STAT5アッセイの結果を示している。pSTAT5発現細胞パーセントは、以下のhPBMCサブセットにおいて表している:Treg細胞。Treg細胞は、CD4+Foxp3+CD25+として同定した。 表示した融合タンパク質(全てフォーマットC)と共に培養した1人のドナーからのhPBMCを用いたリン酸化STAT5アッセイの結果を示している。pSTAT5発現細胞パーセントは、以下のhPBMCサブセットにおいて表している:CD4+Foxp3-T細胞。 1人のドナーからのhPBMCを、表示している融合タンパク質と共に5日間共培養した後のKi-67増殖マーカーの発現を示している。全ての融合タンパク質は、本開示のCD8ab抗体であるxhCD8v1、及び本開示の種々のIL-2ポリペプチド変異体であるIL2m1~IL2m5を含有し、フォーマットAであった。Ki-67発現は、CD8+T細胞(図左)及びNK細胞(図右)において測定した。 表示した融合タンパク質と共に培養した1人のドナーからのhPBMCを用いたリン酸化STAT5アッセイの結果を示している。pSTAT5発現細胞パーセントは、以下のhPBMCサブセット:CD8+T細胞及びNK細胞において表している。全ての融合タンパク質は、本開示のCD8ab抗体であるxhCD8v1、ならびに本開示の種々のIL-2ポリペプチド変異体であるIL2m1、IL2m2、及びIL2m6~IL2m10を含有し、フォーマットAであった。NK細胞は、CD3-パーフォリン+として同定した。 表示した融合タンパク質と共に培養した1人のドナーからのhPBMCを用いたリン酸化STAT5アッセイの結果を示している。pSTAT5発現細胞パーセントは、以下のhPBMCサブセット:CD8+T細胞及びNK細胞において表している。融合タンパク質は、本開示のCD8ab抗体であるxhCD8v11及びxhCD8v12、ならびに本開示の種々のIL-2ポリペプチド変異体であるIL2m11、IL2m12、及びIL2m13を含有し、フォーマットAであった。NK細胞は、CD3-パーフォリン+として同定した。 1人のドナーからのhPBMCを、xhCD8v1-IL2m1(図左)及びxhCD8v6-IL2m1(図右)と共に5日間共培養した後のKi-67増殖マーカーの発現を示している。図7に描示している通りの3種の異なる融合タンパク質フォーマットを試験した:表示の通り、フォーマットA、フォーマットB及びフォーマットC。実線はCD8+T細胞におけるKi-67発現を表し、破線はNK細胞におけるKi-67発現を示している。フォーマットAでは、試験した両方のCD8ab抗体について、NK細胞よりもCD8+T細胞で活性が大幅に増加した。このことは、フォーマットAが、CD8aとCD8bとの間のエピトープ(図8B)またはCD8bエピトープ(図8C)を標的とするCD8ab抗体を含有する融合タンパク質に好ましいフォーマットであることを示唆している。 1人のドナーからのCD8+T細胞におけるxhCD8v6-IL2m1による結合(図左)及びKi67の誘導(図右)を表している。図7に描示しているような4種の異なる融合タンパク質フォーマットを試験した:表示の通り、フォーマットA、フォーマットB、フォーマットC、及びフォーマットD。細胞結合において、フォーマットAは、他のフォーマットよりも約5倍強く、Ki-67の誘導において、フォーマットAは、他のフォーマットよりも20倍~40倍強力である。 CD8+T細胞への結合、及びCD8+T細胞におけるKi67の誘導について評価した際の、フォーマットA及びDにおける9種の融合分子の結果を表している。xhCD8v12-IL2m4の結合曲線及びki-67曲線についての例を図左に示した。図右において、所与の結合物と変異タンパク質のペアに関する、フォーマットAに対するフォーマットDのEC50比を、結合及びKi-67について示している。試験した全ての分子について、フォーマットAでは、フォーマットDに対して結合EC50における約10倍の効力変化が示された。しかし、さらに下流の増殖マーカーKi67の活性化について評価した場合、フォーマットAは、Ki67の誘導において、フォーマットDに対して約1000倍の効力の増加を示す。 IL-2ポリペプチド変異体であるIL2m1及び本開示のCD8ab抗体であるxhCD8v8を含有する、フォーマットAの融合タンパク質であるxhCD8v8-IL2m1と共にhPBMCを5日間共培養した後のKi-67増殖マーカーの発現を示している。Ki-67発現を、CD8+T細胞(四角)及びNK細胞(三角)において測定した。 CD8+T細胞(図左)及びNK細胞(図右)でゲーティングした、腫瘍浸潤リンパ球(TIL)におけるKi-67の発現を表している。分析前に、TILをrhIL-2または表示している融合タンパク質(フォーマットA)と共に5日間インキュベートした。 表示している条件のそれぞれにおける、ウェル当たりのCD8+T細胞数、NK細胞数、及びCD4+T細胞数を表している。 IL-2ポリペプチド変異体(IL2m1またはIL2m4)及び本開示のCD8ab抗体を含有するフォーマットAの融合タンパク質と共にhPBMCを5日間共培養した後のKi-67増殖マーカーの発現を示している。CD8ab抗体xhCD8v9~14を試験した。Ki-67発現を、CD8+T細胞(四角)及びNK細胞(三角)において測定した。 IL-2ポリペプチド変異体(IL2m1またはIL2m4)及び本開示のCD8ab抗体を含有するフォーマットAの融合タンパク質と共にhPBMCを5日間共培養した後のKi-67増殖マーカーの発現を示している。CD8ab抗体xhCD8v9~14を試験した。Ki-67発現を、CD8+T細胞(四角)及びNK細胞(三角)において測定した。 IL-2ポリペプチド変異体(IL2m1またはIL2m4)及び本開示のCD8ab抗体を含有するフォーマットAの融合タンパク質と共にhPBMCを5日間共培養した後のKi-67増殖マーカーの発現を示している。CD8ab抗体xhCD8v9~14を試験した。Ki-67発現を、CD8+T細胞(四角)及びNK細胞(三角)において測定した。 IL-2ポリペプチド変異体(IL2m1またはIL2m4)及び本開示のCD8ab抗体を含有するフォーマットAの融合タンパク質と共にhPBMCを5日間共培養した後のKi-67増殖マーカーの発現を示している。CD8ab抗体xhCD8v9~14を試験した。Ki-67発現を、CD8+T細胞(四角)及びNK細胞(三角)において測定した。 IL-2ポリペプチド変異体(IL2m1またはIL2m4)及び本開示のCD8ab抗体を含有するフォーマットAの融合タンパク質と共にhPBMCを5日間共培養した後のKi-67増殖マーカーの発現を示している。CD8ab抗体xhCD8v9~14を試験した。Ki-67発現を、CD8+T細胞(四角)及びNK細胞(三角)において測定した。 表示している抗CD8ab抗体のアミノ酸障害(例えば、推定N結合型グリコシル化、脱アミノ化、または酸切断部位)の数及びヒト生殖細胞系と比較したアミノ酸ミスマッチの数を示している。 xhCD8v1のVH(上部)及びVK(下部)のCDR(イタリック)を、それぞれVH1-69及びVK1-39ヒト生殖細胞系フレームワーク上にどのように移植したかを例示するアライメントを示すものである。VHドメイン配列(上部)は、それぞれ配列番号58、384、及び60に対応する(上から下)。VLドメイン配列(下部)は、それぞれ配列番号59、385、及び61に対応する(上から下)。下線部の残基は、ヒト生殖細胞系のフレームワーク残基を表している。 表示している本開示の抗CD8ab抗体のVHドメインのアライメントを示すものである。VHドメイン配列は、それぞれ配列番号60、62、64、66、68、245、251、及び253に対応する(上から下)。 表示している本開示の抗CD8ab抗体のVLドメインのアライメントを示すものである。VLドメイン配列は、それぞれ配列番号61、63、65、67、69、246、252、及び254に対応する(上から下)。 親xhCD8v6(黒実線に黒四角)のグリコシル化(グリコシダーゼで処理すると除去される(黒破線に黒四角))を確認するために用いたELISAアッセイの結果を示している。xhCD8v11ではグリコシル化が検出されない(灰色線に白三角)。フェチュインを陽性対照として示している。
定義
本明細書及び添付の特許請求の範囲で使用される場合、内容により明らかに別段の指示がない限り、単数形の「a」、「an」、及び「the」には、複数の指示対象が含まれる。したがって、例えば、「分子(a molecule)」への言及には、任意選択で、2つ以上のかかる分子の組み合わせなどが含まれる。
本開示の態様及び実施形態は、態様及び実施形態を「含む」、態様及び実施形態「からなる」、ならびに態様及び実施形態「から本質的になる」を含むことを理解されたい。
本明細書で使用される場合、「約」という用語は、当業者であれば容易に理解するそれぞれの値の通常の誤差範囲を指す。本明細書における「約」の値またはパラメータへの言及には、その値またはパラメータそれ自体を目的とする実施形態が含まれる(かつ説明される)。
本明細書で使用される場合、「免疫細胞」は、宿主の免疫系にとって異質とみなされる生物または他の実体に対して反応する、免疫系の細胞である。それらは、外来病原体、生物及び疾患から宿主を保護する。免疫細胞は、白血球とも呼ばれ、病原体と闘うための自然免疫応答と獲得免疫応答の両方に関与する。自然免疫応答は、病原体への曝露時にさらなる抗原刺激または学習プロセスなしに直ちに起こる。獲得免疫プロセスでは、初回の抗原刺激を必要とし、続いて記憶形成を行い、その結果として、同一の病原体とのその後の遭遇において応答性が強化される。自然免疫細胞としては、単球、マクロファージ、樹状細胞、ナチュラルキラー(NK)細胞を含む自然リンパ球系細胞(ILC)、好中球、巨核球、好酸球及び好塩基球が挙げられるが、これらに限定されない。獲得免疫細胞としては、B及びTリンパ球/細胞が挙げられる。T細胞サブセットとしては、アルファベータCD4+T(ナイーブCD4+、メモリーCD4+、エフェクターメモリーCD4+、エフェクターCD4+、制御性CD4+)、及びアルファベータCD8+T(ナイーブCD8+、メモリーCD8+、エフェクターメモリーCD8+、エフェクターCD8+)が挙げられるが、これらに限定されない。B細胞サブセットとしては、ナイーブB、メモリーB、及び形質細胞が挙げられるが、これらに限定されない。NK T細胞及びTガンマデルタ(Tγδ)細胞は、自然リンパ球と獲得リンパ球の両方の特性を示す。
「T細胞」または「Tリンパ球」は、健康及び疾患時の免疫応答の編成に重要な役割を果たす免疫細胞である。特有の機能及び特性を有する2つの主要なT細胞サブセットが存在する:CD8抗原を発現するT細胞(CD8T細胞)は、グランザイム及びパーフォリン等の細胞傷害性タンパク質を使用して標的細胞を溶解することができる細胞傷害性またはキラーT細胞である;及びCD4抗原を発現するT細胞(CD4T細胞)は、CD8T細胞、B細胞及びマクロファージなどの機能を含む、多くの他の免疫細胞型の機能を制御することができるヘルパーT細胞である。さらに、CD4T細胞は、免疫応答を抑制することができる制御性T(Treg)細胞、ならびにサイトカイン等の免疫調節タンパク質を分泌することにより異なるタイプの免疫応答を制御するヘルパーT1(Th1)、ヘルパーT2(Th2)及びヘルパーT17(Th17)細胞等の、いくつかのサブセットにさらに細分される。T細胞は、特有の抗原特異的モチーフに結合するアルファベータT細胞受容体を介してそれらの標的を認識し、この認識機序は、一般に、それらの細胞傷害機能及びサイトカイン分泌機能を誘発するために必要とされる。「自然リンパ球」は、細胞傷害活性またはTh1、Th2及びTh17サイトカインの分泌等の、CD8及びCD4T細胞の特性も示し得る。これらの自然リンパ球サブセットの一部としては、NK細胞ならびにILC1、ILC2及びILC3細胞;ならびにTγδ細胞等の自然様T細胞;ならびにNK T細胞が挙げられる。典型的に、これらの細胞は、免疫調節性サイトカイン等の、感染または傷害組織からの炎症刺激に迅速に応答することができるが、アルファベータT細胞とは異なり、それらは、抗原特異的パターンを認識する必要なく応答することができる。
「サイトカイン」は、始原/初代細胞と標的/エフェクター細胞との間のクロストークを媒介する免疫調節性ポリペプチドの一形態である。サイトカインは、可溶性形態としてまたは細胞表面と会合して標的免疫細胞上の「サイトカイン受容体」に結合してシグナル伝達を活性化するように機能し得る。本明細書で使用される場合、「サイトカイン受容体」は、サイトカインが細胞の細胞外表面へ結合するとすぐに細胞内シグナル伝達を活性化する、細胞表面のポリペプチドである。サイトカインとしては、ケモカイン、インターフェロン、インターロイキン、リンホカイン及び腫瘍壊死因子が挙げられるが、これらに限定されない。サイトカインは、免疫細胞、内皮細胞、線維芽細胞、及び間質細胞を含む広範な細胞により産生される。所与のサイトカインが1つ超の細胞型により産生されることもある。サイトカインは多面的であり、その受容体が複数の免疫細胞サブセット上に発現されるため、1つのサイトカインが複数の細胞内のシグナル伝達経路を活性化することができる。しかし、細胞型に依存して、サイトカインのシグナル伝達事象は、活性化、増殖、生存、アポトーシス、エフェクター機能及び他の免疫調節性タンパク質の分泌等の異なる下流細胞事象をもたらし得る。
本明細書で使用される場合、「アミノ酸」は、アラニン(3文字コード:ala、1文字コード:A)、アルギニン(arg、R)、アスパラギン(asn、N)、アスパラギン酸(asp、D)、システイン(cys、C)、グルタミン(gln、Q)、グルタミン酸(glu、E)、グリシン(gly、G)、ヒスチジン(his、H)、イソロイシン(ile、I)、ロイシン(leu、L)、リジン(lys、K)、メチオニン(met、M)、フェニルアラニン(phe、F)、プロリン(pro、P)、セリン(ser、S)、スレオニン(thr、T)、トリプトファン(trp、W)、チロシン(tyr、Y)、及びバリン(val、V)を含む、天然に存在するカルボキシα-アミノ酸を指す。
本明細書で使用される場合、「ポリペプチド」または「タンパク質」は、単量体(アミノ酸)がペプチド結合(アミド結合としても公知)により互いに直鎖状に連結されている分子を指す。「ポリペプチド」という用語は、2個以上のアミノ酸の任意の鎖を指し、産物の特定の長さを指さない。したがって、ペプチド、ジペプチド、トリペプチド、オリゴペプチド、「タンパク質」、「アミノ酸鎖」、または2個以上のアミノ酸の鎖を指すために使用される任意の他の用語は、「ポリペプチド」の定義に含まれ、「ポリペプチド」という用語は、これらの用語のいずれかの代わりに、またはいずれかと同義的に使用され得る。「ポリペプチド」という用語はまた、天然生物源に由来し得るか、または組換え技術により産生され得る、ポリペプチドの産物を指すように意図されているが、必ずしも指定核酸配列から翻訳されるとは限らない。ポリペプチドは、化学合成による様式を含む任意の様式で生成され得る。ポリペプチドは、規定の三次元構造を通常は有するが、必ずしもかかる構造を有する必要はない。本開示のポリペプチドは、アミノ酸約3個以上、5個以上、10個以上、20個以上、25個以上、50個以上、75個以上、100個以上、200個以上、500個以上、1,000個以上、または2,000個以上のサイズのものであり得る。規定の三次元構造を有するポリペプチドは、フォールディングされていると言及され、規定の三次元構造を有することなく、むしろ多数の異なるコンフォメーションをとり得るポリペプチドは、フォールディングされていないと言及される。ポリペプチドは、二量体、三量体及びより高級の低重合体等の、すなわち、1つ超のポリペプチド分子からなる、多量体をさらに形成することがある。かかる二量体、三量体などを形成するポリペプチド分子は、同一であることもあり、または同一でないこともある。それ故、かかる多量体の対応するより高次の構造は、ホモもしくはヘテロ二量体、ホモもしくはヘテロ三量体などと呼ばれる。「ポリペプチド」及び「タンパク質」という用語は、修飾ポリペプチド/タンパク質も指し、グリコシル化、アセチル化、リン酸化、アミド化、公知の保護/ブロッキング基による誘導体化、タンパク質分解的切断、または天然に存在しないアミノ酸による修飾を含むがこれらに限定されない、発現後修飾に関わる。
本明細書で使用される場合、「残基」とは、タンパク質内の位置及びその対応付けられたアミノ酸本体を意味する。例えば、Leu 234(Leu234またはL234とも呼ばれる)は、ヒト抗体IgG1内の234位の残基である。
本明細書では、「野生型」とは、対立遺伝子変異を含む、自然界に見られるアミノ酸配列またはヌクレオチド配列を意味する。野生型タンパク質は、意図的に改変されていない、アミノ酸配列またはヌクレオチド配列を有する。
「置換」または「変異」は、ポリペプチドの野生型配列内に天然に存在するアミノ酸が、当該ポリペプチド内の同じ位置に天然に存在しない別のアミノ酸に置換される、ポリペプチド骨格に対する変化を指す。好ましくは、変異(複数可)は、ポリペプチドのその受容体に対する親和性を改変するために導入され、それによって、野生型同種ポリペプチドの親和性及び活性とは異なるように該ポリペプチドの活性が変更する。変異は、ポリペプチドの生物物理学的特性を向上させることもできる。アミノ酸変異は、当技術分野において周知の遺伝学的または化学的方法を使用して生じさせることができる。遺伝学的方法は、部位特異的変異誘発、PCR、遺伝子合成及びこれらに類するものを含み得る。化学的改変等、遺伝子操作以外の方法によりアミノ酸の側鎖基を変更する方法も有用であり得ることが企図されている。
本明細書で使用される場合、「CD8」は、任意の天然ヒトCD8を指す。明確にまたは文脈によって別段の指示がない限り、「CD8」への言及は、CD8aa及び/またはCD8abを指す。例示的なヒトCD8のベータ鎖であるヒトCD8bのアミノ酸配列は、UniProt P10966(CD8B_HUMAN)の下に記載されている。「CD8a」は、ヒトCD8のアルファ鎖を指す(例えば、UniProt P01732(CD8A_HUMAN)の下に記載されているもの)。「CD8aa」は、CD8aのホモ二量体を指す。「CD8ab」は、CD8a及びCD8bのヘテロ二量体を指す。「CD8」、「CD8a」、「CD8b」、「CD8aa」、及び「CD8ab」は、プロセシングされていない形態、ならびに細胞内でのプロセシングに起因する成熟形態を包含する。また、「CD8」、「CD8a」、「CD8b」、「CD8aa」、及び「CD8ab」には、天然に存在するバリアント、例えば対立遺伝子もしくはスプライスバリアントまたはバリアントが含まれるが、これらに限定されない。
本明細書で使用される場合、「インターロイキン-2」または「IL-2」は、別段の指示がない限り、任意の天然ヒトIL-2を指す。「IL-2」は、プロセシングされていないIL-2、ならびに細胞内でのプロセシングに起因するIL-2の一形態である「成熟IL-2」も包含する。「成熟IL-2」の配列は、図1Aに示されている。プロセシングされていないヒトIL-2の1つの例示的形態は、成熟IL-2に結合した追加のN末端アミノ酸シグナルペプチドから構成される。「IL-2」には、IL-2の天然に存在するバリアント、例えば、対立遺伝子もしくはスプライスバリアントまたはバリアントが含まれるが、これらに限定されない。例示的なヒトIL-2のアミノ酸配列は、UniProt P60568(IL2_HUMAN)の下に記載されている。
「親和性」または「結合親和性」は、分子(例えば、抗体)の単一の結合部位とその結合パートナー(例えば、抗原)との間の非共有結合性相互作用の総計の強度を指す。別段の指示がない限り、本明細書で使用される場合、「結合親和性」は、結合対のメンバー(例えば、抗体と抗原との)間の1:1の相互作用を反映する、固有の結合親和性を指す。親和性は、解離速度定数と会合速度定数(それぞれ、koff及びkon)との比である解離定数(K)によって、一般に表すことができる。したがって、同等の親和性は、速度定数の比が同じままであるならば、異なる速度定数を含み得る。親和性は、酵素結合免疫吸着検定法(ELISA)、表面プラズモン共鳴(SPR)法(例えば、BIAcore)、バイオレイヤー干渉(BLI)法(例えば、Octet)及び他の従来の結合アッセイ(Heeley,Endocr Res 28,217-229(2002))等の当技術分野において公知の一般的な方法によって測定することができる。
本明細書で使用される場合、「結合」または「特異的結合」は、ポリペプチドまたは抗原結合分子がそのポリペプチドまたは標的抗原の受容体とそれぞれ選択的に相互作用する能力を指し、この特異的相互作用は、非標的化相互作用もしくは望ましくない相互作用または非特異的相互作用と区別され得る。特異的結合の例としては、IL-2サイトカインのその特異的受容体(例えば、IL-2Rα、IL-2Rβ及びIL-2Rγ)への結合、及び抗原結合分子の特異的抗原(例えば、CD8またはPD-1)への結合が挙げられるが、これらに限定されない。
「IL-2ポリペプチド変異体」は、その受容体への親和性が低減したIL-2ポリペプチドを指し、かかる親和性の減少は、変異体の生物活性の低減をもたらすことになる。親和性の低減及びそれによる活性の低減は、少数のアミノ酸変異または置換を導入することにより、達成することができる。IL-2ポリペプチド変異体は、IL-2Rβγへの親和性低減等の、所望の特性を有する最終構築物を生成するために、ペプチド骨格への他の改変を有することもあり、そのような改変としては、ポリペプチドのアミノ酸欠失、並べ替え、環化、ジスルフィド結合または翻訳後修飾(例えば、グリコシル化もしくは炭水化物変更)、ポリペプチドに対する化学的もしくは酵素的改変(例えば、ポリペプチド骨格へのPEGの結合)、ペプチドタグもしくは標識の付加、またはタンパク質もしくはタンパク質ドメインへの融合が挙げられるが、これらに限定されない。所望の活性としては、野生型IL-2ポリペプチドと比較した生物物理学的特性の向上も挙げることができる。複数の改変を組み合わせて、親和性の低減、または生物物理学的特性の向上等の、所望の活性改変を達成してもよい。非限定的な例として、コンセンサスN結合型グリコシル化のためのアミノ酸配列をポリペプチドに組み込んでグリコシル化を可能にすることができる。別の非限定的な例は、リジンをポリペプチド上に組み込んでPEG化を可能にし得ることである。好ましくは、変異(複数可)が、ポリペプチドに、その活性を改変するために導入される。
「抗体」及び「免疫グロブリン」という用語は、同義的に使用され、本明細書では最も広い意味で使用され、様々な抗体構造を包含し、そのような抗体構造には、モノクローナル抗体(例えば、完全長またはインタクトなモノクローナル抗体)、ポリクローナル抗体、多重特異性抗体(例えば、二重特異性抗体)、抗体フラグメント及び単一ドメイン抗体(本明細書でより詳細に説明されるもの)が、これらが所望の抗原結合活性を示す限り含まれるが、これらに限定されない。
抗体(免疫グロブリン)は、天然抗体構造と実質的に同様の構造を有するタンパク質を指す。「天然抗体」は、様々な構造を有する天然に存在する免疫グロブリン分子を指す。例えば、IgGクラスの天然免疫グロブリンは、ジスルフィド結合されている2つの軽鎖と2つの重鎖から構成されている、約150,000ダルトンのヘテロ四量体糖タンパク質である。N末端からC末端へ、各重鎖は、可変重鎖ドメインまたは重鎖可変ドメインとも呼ばれる可変領域(VH)、続いて、重鎖定常領域とも呼ばれる3つの定常ドメイン(CH1、CH2、及びCH3)を有する。同様に、N末端からC末端へ、各軽鎖は、可変軽鎖ドメインまたは軽鎖可変ドメインとも呼ばれる可変領域(VL)、続いて、軽鎖定常領域とも呼ばれる定常軽鎖(CL)ドメインを有する。異なるクラスの免疫グロブリンのサブユニット構造及び三次元立体配置が周知であり、例えば、Abbas et al.,2000,Cellular and Mol、及びKindt et al.,Kuby Immunology,6th ed.,W.H.Freeman and Co.,page 91(2007)に、一般に記載されている。抗体(免疫グロブリン)は、重鎖定常ドメインのアミノ酸配列に依存して、異なるクラスに割り当てられる。抗体には5つの主要なクラス:α(IgA)、δ(IgD)、ε(IgE)、γ(IgG)またはμ(IgM)があり、これらの一部は、サブタイプ、例えば、γ1(IgG1)、γ2(IgG2)、γ3(IgG3)、γ4(IgG4)、α1(IgA1)及びα2(IgA2)にさらに分けることができる。免疫グロブリンの軽鎖は、その定常ドメインのアミノ酸配列に基づいて、カッパ(κ)及びラムダ(λ)と呼ばれる2つのタイプの一方に割り当てることができる。免疫グロブリンは、免疫グロブリンヒンジ領域を介して連結されている、2つのFab分子及びFcドメインから本質的になる。
本明細書で使用される場合、「Fc」または「Fc領域」もしくは「Fcドメイン」は、定常領域の少なくとも一部分を含有する抗体重鎖のC末端領域を指す。この用語は、天然配列Fc領域及びバリアントFc領域を含む。Fcは、IgA、IgD及びIgGの最後の2つの定常領域免疫グロブリンドメイン(例えば、CH2及びCH3)、IgE及びIgMの最後の3つの定常領域免疫グロブリンドメイン、ならびに任意選択で、これらのドメインのN末端側の可撓性ヒンジの全てまたは一部分を指すことができる。IgA及びIgMについては、FcはJ鎖を含み得る。IgG Fc領域は、IgG CH2及びIgG CH3ドメインを、場合によってはヒンジを含めて含む。本明細書中で別段の定めがない限り、Fc領域または定常領域内のアミノ酸残基の番号付けは、Kabat et al.,Sequences of Proteins of Immunological Interest,5th Ed.Public Health Service,National Institutes of Health,Bethesda,Md.,1991に記載されているような、EUインデックスとも呼ばれる、EU番号付けシステムによるものである。「ヒンジ」領域は、通常は、約216位のアミノ酸残基から約230位のアミノ酸残基に及ぶ。本明細書では、ヒンジ領域は、天然ヒンジドメインまたはバリアントヒンジドメインであり得る。ヒトIgG Fc領域の「CH2ドメイン」は、通常は、約231位のアミノ酸残基から約340位のアミノ酸残基に及ぶ。本明細書では、CH2ドメインは、天然配列CH2ドメインまたはバリアントCH2ドメインであり得る。「CH3ドメイン」は、Fc領域におけるC末端からCH2ドメインまで(IgGの約341位のアミノ酸残基から約447位のアミノ酸残基まで)の残基のストレッチを含む。本明細書では、CH3領域は、天然配列CH3ドメインまたはバリアントCH3ドメイン(例えば、その一方の鎖に「突出部」(「ノブ」)が導入されており、その他方の鎖に対応する「空洞」(「ホール」)が導入されている、CH3ドメイン;本明細書に参照により明確に組み込まれる米国特許第5,821,333号を参照されたい)であり得る。したがって、「Fcドメイン」の定義には、アミノ酸231~447(CH2-CH3)もしくは216~447(ヒンジ-CH2-CH3)の両方、またはこれらのフラグメントが含まれる。この文脈での「Fcフラグメント」は、N末端及びC末端のどちらかまたは両方からのより少数のアミノ酸を含有することがあるが、一般にサイズに基づく、標準的な方法(例えば、非変性クロマトグラフィー、サイズ排除クロマトグラフィーなど)を使用して検出され得るように、別のFcドメインまたはFcフラグメントと二量体を形成する能力をなお保持する。ヒトIgG Fcドメインは、本開示において特に有用なものであり、ヒトIgG1、IgG2またはIgG4からのFcドメインであり得る。
「バリアントFcドメイン」または「Fcバリアント」もしくは「バリアントFc」は、親Fcドメインと比較してアミノ酸改変(例えば、置換、付加、及び欠失)を有する。この用語には、免疫グロブリンのFc領域の天然に存在する対立遺伝子バリアントも含まれる。一般に、バリアントFcドメインは、対応する親ヒトIgG Fcドメインに対して(下記で論じられる同一性アルゴリズムを使用して、当技術分野において公知であるようなBLASTアルゴリズムを利用する一実施形態でデフォルトパラメータを使用して)少なくとも約80、85、90、95、97、98または99パーセントの同一性を有する。あるいは、バリアントFcドメインは、親Fcドメインと比較して1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、11、12、13、14、15、16、17、18、19または20個のアミノ酸改変を有し得る。例えば、生物学的機能を大幅に失うことなく、1個以上のアミノ酸を免疫グロブリンのFc領域のN末端またはC末端から欠失させることができる。加えて、本明細書中で論じられるように、本明細書でのバリアントFcドメインは、非変性ゲル電気泳動等の、本明細書に記載の公知の技法を使用して測定されるように、別のFcドメインと二量体を形成する能力をなお保持する。
本明細書で使用される場合、「Fcガンマ受容体」、「FcγR」または「FcガンマR」とは、IgG抗体Fc領域に結合し、FcγR遺伝子によりコードされる、タンパク質のファミリーの任意のメンバーを意味する。ヒトにおいては、このファミリーには、アイソフォームFcγRIa、FcγRIb、及びFcγRIcを含む、FcγRI(CD64);アイソフォームFcγRIIa(アロタイプH131及びR131を含む)、FcγRIIb(FcγRIIb-1及びFcγRIIb-2を含む)、及びFcγRIIcを含む、FcγRII(CD32);ならびにアイソフォームFcγRIIIa(アロタイプV158及びF158を含む)及びFcγRIIIb(アロタイプFcγRIIb-NA1及びFcγRIIb-NA2を含む)を含む、FcγRIII(CD16)(全体が参照により組み込まれる、Jefferis et al.,2002,Immunol Lett 82:57-65)だけでなく、任意の未発見のヒトFcγRまたはFcγRアイソフォームもしくはアロタイプが含まれるが、これらに限定されない。FcγRは、ヒト、マウス、ラット、ウサギ、及びサルを含むがこれらに限定されない、任意の生物由来であり得る。マウスFcγRには、FcγRI(CD64)、FcγRII(CD32)、FcγRIII(CD16)、及びFcγRIII-2(CD16-2)、ならびに任意の未発見のマウスFcγRまたはFcγRアイソフォームもしくはアロタイプが含まれるが、これらに限定されない。
本明細書で使用される場合、「エフェクター機能」とは、抗体アイソタイプによって異なる、抗体Fc領域とFc受容体またはリガンドとの相互作用の結果として生じる、生化学的事象を意味する。エフェクター機能としては、抗体依存性細胞媒介性細胞傷害(ADCC)、抗体依存性細胞媒介性ファゴサイトーシス(ADCP)、補体依存性細胞傷害(CDC)、サイトカイン分泌、抗原提示細胞による免疫複合体媒介性抗原取込み、細胞表面受容体(例えば、B細胞受容体)の下方制御、及びB細胞活性化が挙げられるが、これらに限定されない。「抗体依存性細胞媒介性細胞傷害」または「ADCC」は、FcRを発現する非特異的細胞傷害性細胞(ナチュラルキラー(NK)細胞、好中球、及びマクロファージ等)が、標的細胞上に結合している抗体を認識し、その後、その標的細胞の溶解を引き起こす、細胞により媒介される反応を指す。ADCCは、FcγRIIIaへの結合と相関しており、FcγRIIIaへの結合の増加は、ADCC活性の増大につながる。目的の分子のADCC活性を評価するために、米国特許第5,500,362号または同第5,821,337号に記載されているものなどの、in vitro ADCCアッセイを行うことができる。本明細書で使用される場合、「ADCP」または抗体依存性細胞媒介性ファゴサイトーシスとは、FcγRを発現する非特異的細胞傷害性細胞が、標的細胞上に結合している抗体を認識し、その後、その標的細胞のファゴサイトーシスを引き起こす、細胞により媒介される反応を意味する。
「Fcヌル」及び「Fcヌルバリアント」は、同義的に使用され、本明細書では、エフェクター機能の低減または消失を有する改変Fcを記述するために使用される。かかるFcヌルまたはFcヌルバリアントは、FcγR及び/または補体受容体に対して低減または消失されている。好ましくは、かかるFcヌルまたはFcヌルバリアントは、エフェクター機能の消失を有する。改変のための例示的な方法としては、化学的変更、アミノ酸残基置換、挿入及び欠失が挙げられるが、これらに限定されない。Fc分子上の例示的なアミノ酸位置では、結果として生じるバリアントのエフェクター機能を低下させるために、1つ以上の改変が、位置i)IgG1:C220、C226、C229、E233、L234、L235、G237、P238、S239 D265、S267、N297、L328、P331、K322、A327及びP329、ii)IgG2:V234、G237、D265、H268、N297、V309、A330、A331、K322ならびにiii)IgG4:L235、G237、D265及びE318に導入されている(番号付けはEU番号付けスキームに基づく)。エフェクター機能の低下を有する例示的なFc分子としては、以下の置換のうちの1つ以上を有するものが挙げられる:i)IgG1:N297A、N297Q、N297G、D265A/N297A、D265A/N297Q、C220S/C226S/C229S/P238S、S267E/L328F、C226S/C229S/E233P/L234V/L235A、L234F/L235E/P331S、L234A/L235A、L234A/L235A/G237A、L234A/L235A/G237A/K322A、L234A/L235A/G237A/A330S/A331S、L234A/L235A/P329G、E233P/L234V/L235A/G236欠失/S239K、E233P/L234V/L235A/G236欠失/S267K、E233P/L234V/L235A/G236欠失/S239K/A327G、E233P/L234V/L235A/G236欠失/S267K/A327G及びE233P/L234V/L235A/G236欠失、L234A/L235A/G237欠失;ii)IgG2:A330S/A331S、V234A/G237A、V234A/G237A/D265A、D265A/A330S/A331S、V234A/G237A/D265A/A330S/A331S、及びH268Q/V309L/A330S/A331S;iii)IgG4:L235A/G237A/E318A、D265A、L235A/G237A/D265A及びL235A/G237A/D265A/E318A。
本明細書で使用される場合、「エピトープ」は、パラトープとして公知の抗体分子の可変領域に特異的に結合することができる決定基を指す。エピトープは、アミノ酸または糖側鎖等の分子の集まりであり、通常は、特異的構造特性ならびに特異的電荷特性を有する。単一の抗原は、1つを超えるエピトープを有することもある。エピトープは、結合に直接関与するアミノ酸残基と、結合に直接関与しない他のアミノ酸残基、例えば、抗原結合ペプチドにより有効に遮断されているアミノ酸残基(言い換えると、該アミノ酸残基は、抗原結合ペプチドのフットプリント内にある)とを含み得る。エピトープは、コンフォメーションエピトープまたは直鎖状エピトープのどちらかであり得る。エピトープは、典型的には、少なくとも3個、通常はより多く、少なくとも5個または8個~10個のアミノ酸を含む。同じエピトープを認識する抗体は、ある抗体が別の抗体の標的抗原への結合を遮断する能力を明らかにする、単純なイムノアッセイ(例えば「ビニング」)で検証することができる。
本明細書で使用される場合、「リンカー」は、2本のポリペプチド鎖を接続する分子を指す。リンカーは、ポリペプチドリンカーであることもあり、または合成の化学的リンカーであることもある(例えば、Protein Engineering,9(3),299-305,1996において開示されているものを参照されたい)。ポリペプチドリンカーの長さ及び配列は、特に限定されず、当業者により目的に従って選択され得る。ポリペプチドリンカーは、1個以上のアミノ酸を含む。いくつかの実施形態において、ポリペプチドリンカーは、少なくとも5アミノ酸の長さを有する、好ましくは、5~100、より好ましくは10~50アミノ酸の長さを有するペプチドである。一実施形態では、当該ペプチドリンカーは、G、S、GS、SG、SGG、GGS、及びGSG(G=グリシン及びS=セリン)である。別の実施形態では、当該ペプチドリンカーは、(GGGS)xGn(配列番号74)または(GGGGS)xGn(配列番号75)または(GGGGGS)xGn(配列番号76)またはS(GGGS)xGn(配列番号386)またはS(GGGGS)xGn(配列番号387)またはS(GGGGGS)xGn(配列番号388)(x=1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、または12、及びn=0、1、2または3)である。好ましくは、当該リンカーは、(GGGGS)xGn(x=2、3、または4、及びn=0)(配列番号77)であり、より好ましくは、当該リンカーは、(GGGGS)xGn(x=3、及びn=0)(配列番号78)である。いくつかの実施形態において、リンカーは、配列GGGGSGGGGSGGGGS(配列番号79)またはSGGGGSGGGGSGGGGS(配列番号389)を含む。合成の化学的リンカーは、ペプチドを架橋するために日常的に使用される架橋剤、例えば、N-ヒドロキシスクシンイミド(NHS)、スベリン酸ジスクシンイミジル(DSS)、スベリン酸ビス(スクシンイミジル)(BS3)、ジチオビス(プロピオン酸スクシンイミジル)(DSP)、ジチオビス(プロピオン酸スクシンイミジル)(DTSSP)、エチレングリコールビス(コハク酸スクシンイミジル)(EGS)、エチレングリコールビス(コハク酸スルホスクシンイミジル)(スルホ-EGS)、酒石酸ジスクシンイミジル(DST)、酒石酸ジスルホスクシンイミジル(スルホ-DST)、ビス[2-(スクシンイミドオキシカルボニルオキシ)エチル]スルホン(BSOCOES)、及びビス[2-(スクシンイミドオキシカルボニルオキシ)エチル]スルホン(スルホ-BSOCOES)を含む。
「ポリヌクレオチド」という用語は、本開示のポリペプチドをコードする、単離された核酸分子または構築物、例えば、メッセンジャーRNA(mRNA)、ウイルス由来RNA、またはプラスミドDNA(pDNA)を指す。ポリヌクレオチドは、従来的なホスホジエステル結合を含むこともあり、または非従来的な結合(例えば、ペプチド核酸(PNA)に見られるもの等の、アミド結合)を含むこともある。「核酸分子」という用語は、ポリヌクレオチド中に存在する任意の1つ以上の核酸セグメント、例えば、DNAまたはRNAフラグメントを指す。一部の態様では、かかる核酸を含む1つ以上のベクター(特に、発現ベクター)が提供される。一態様では、本開示のポリペプチドを作製するための方法であって、ポリペプチドをコードする核酸を含む宿主細胞を、ポリペプチドの発現に好適な条件下で培養することと、ポリペプチドを宿主細胞から回収することと、を含む該方法が提供される。「組換え」は、外来性宿主細胞において組換え核酸技法を使用して生成されるタンパク質を意味する。宿主細胞において発現された、組換えにより産生されたタンパク質は、本開示の趣旨では単離されたと考えられ、任意の好適な技法によって分離された、分画された、または部分的にもしくは実質的に精製された天然または組換えタンパク質も、単離されたと考えられる。
「単離された」は、本明細書で開示される様々なポリペプチドを記述するために使用される場合、そのポリペプチドを発現した細胞または細胞培養物から同定ならびに分離及び/または回収された、ポリペプチドを意味する。典型的に、単離されたポリペプチドは、少なくとも1つの精製ステップにより精製されることになる。精製レベルの要求はなく、「精製」または「精製された」は、出発物質と比較して、組成物中の夾雑物の濃度に対する標的タンパク質濃度の上昇を指す。本明細書で使用される場合、「単離されたタンパク質」は、異なる結合特異性を有する他のタンパク質が実質的にない標的タンパク質を指す。
「がん」という用語は、身体の他の部分に浸潤または拡散する可能性がある、制御されないかつ異常な細胞増殖を典型的に特徴とする、哺乳動物における生理的状態を指す。がんの例としては、癌腫、リンパ腫、芽細胞腫、肉腫、及び白血病が挙げられるが、これらに限定されない。かかるがんのより詳細な例としては、肺癌、小細胞肺癌、非小細胞肺(NSCL)癌、細気管支肺胞上皮細胞肺癌(bronchioloalviolar cell lung cancer)、扁平上皮癌、肺腺癌、肺扁平上皮癌、腹膜癌、頭頸部癌、骨癌、膵臓癌、皮膚癌、頭部または頸部の癌、皮膚または眼内黒色腫、甲状腺癌、子宮癌、消化管癌、卵巣癌、直腸癌、肛門部癌、胃癌(stomach cancer)、胃癌(gastric cancer)、結腸癌、乳癌、子宮内膜癌、子宮癌、卵管癌、頸部癌、膣癌、外陰癌、ホジキン病、食道癌、小腸癌、内分泌系癌、甲状腺癌、副甲状腺癌、副腎癌、軟部組織肉腫、尿道癌、陰茎癌、前立腺癌、膀胱癌、腎臓または尿管癌、腎細胞癌、腎盂癌、中皮腫、膀胱癌、肝臓癌、ヘパトーマ、肝細胞癌、子宮頸癌、唾液腺癌、胆道癌、中枢神経系(CNS)腫瘍、脊髄軸腫瘍(spinal axis tumor)、脳幹神経膠腫、多形神経膠芽腫、星状細胞種、神経鞘腫、上衣腫、髄芽腫、髄膜腫、扁平上皮癌、下垂体腺腫及びユーイング肉腫、上記のがんのいずれかの難治性バージョン、または上記のがんのうちの1つ以上の組み合わせを含めて挙げられるが、これらに限定されない。
抗体及び抗原結合ドメイン
本開示のある態様は、ヒトCD8b及び/またはヒトCD8abに特異的に結合する抗体、抗体フラグメント、及び抗原結合ドメインに関する。本開示の抗CD8抗体(例えば、ヒトCD8b及び/またはヒトCD8abに特異的に結合するもの)のいずれもが、本明細書に開示される融合タンパク質、方法、及び使用において用いられることが認められ得る。
いくつかの実施形態において、本開示の抗CD8抗体は、例えば、ナチュラルキラー(NK)細胞(例えば、ヒトNK細胞)上に発現されるようなヒトCD8a及び/またはヒトCD8aaに対する結合よりも少なくとも10倍、少なくとも20倍、少なくとも30倍、少なくとも40倍、少なくとも50倍、少なくとも60倍、少なくとも70倍、少なくとも80倍、少なくとも90倍、少なくとも100倍、または少なくとも200倍高い親和性で、ヒトCD8b及び/またはヒトCD8abに特異的に結合する。いくつかの実施形態において、本開示の抗CD8抗体は、例えば、ナチュラルキラー(NK)細胞上に発現されるようなヒトCD8a及び/またはヒトCD8aaに対する結合よりも少なくとも10倍高い親和性で、ヒトCD8b及び/またはヒトCD8abに特異的に結合する。いくつかの実施形態において、ヒトCD8b及び/またはヒトCD8abは、ヒト細胞、例えば、ヒトT細胞の表面に発現される。
いくつかの実施形態において、本開示の抗CD8抗体は、1000nM未満であるEC50で、ヒトCD8abヘテロ二量体を表面に発現している細胞(例えば、ヒトT細胞)に特異的に結合する。いくつかの実施形態において、本開示の抗CD8抗体は、ヒトCD8+T細胞に特異的に結合する。
いくつかの実施形態において、本開示の抗CD8抗体は、ヒト抗体または抗体フラグメントである。いくつかの実施形態において、ヒト抗体または抗体フラグメントは、例えば、ヒトから単離される、またはヒト抗体配列(例えば、CDR配列)を有するライブラリーを使用して生成されるような、可変ドメインにおけるヒト由来のCDR及びフレームワーク配列を含む。いくつかの実施形態において、本開示の抗CD8抗体は、ヒト化抗体または抗体フラグメントである。いくつかの実施形態において、ヒト化抗体または抗体フラグメントは、可変ドメインにおける非ヒト由来のCDR(例えば、マウス、ウサギ、ヤギなどに由来するもの)及びヒト由来のフレームワーク配列を含む。いくつかの実施形態において、ヒトまたはヒト化抗体は、ヒトFc領域をさらに含む。いくつかの実施形態において、ヒトFc領域は、例えば、本明細書に開示されるような、1つ以上のFc変異をさらに含む。インタクトな抗体には、5つの主要なクラス:IgA、IgD、IgE、IgG、及びIgMがあり、これらのうちのいくつかは、サブクラス(アイソタイプ)、例えば、IgG1、IgG2、IgG3、IgG4、IgA、及びIgA2にさらに分けることができる。異なるクラスの抗体に対応する重鎖定常ドメインは、それぞれα、δ、ε、γ、及びμと呼ばれる。異なるクラスの免疫グロブリンのサブユニット構造及び三次元立体配置が周知である。
抗体可変ドメインのCDR配列についての複数の定義が、当技術分野で公知である。別段の定めがない限り、CDR配列は、Kabatの定義に従って本明細書に記述される(例えば、Kabat et al.,Sequences of Proteins of Immunological Interest,Fifth Edition,NIH Publication 91-3242,Bethesda MD(1991),vols.1-3を参照されたい)。しかしながら、他の定義が知られており、その使用が企図されている。例えば、いくつかの実施形態において、CDR配列は、Chothiaの定義によって記述することができる(例えば、Chothia and Lesk,J. Mol.Biol.196:901-917(1987)を参照されたい)。使用される特定のCDR定義に応じて、正確なフレームワーク配列も異なり得るが、当技術分野で公知のように、第1のフレームワーク配列(FW-1)は、VHまたはVLドメインのN末端からCDR-H1/-L1の始まりまでの配列を指し、第2のフレームワーク配列(FW-2)は、CDR-H1/-L1の終わりからCDR-H2/-L2の始まりまでの配列を指し、第3のフレームワーク配列(FW-3)は、CDR-H2/-L2の終わりからCDR-H3/-L3の始まりまでの配列を指し、第4のフレームワーク配列(FW-4)は、CDR-H3/-L3の終わりからVHまたはVLドメインのC末端の境界までの配列を指す。
いくつかの実施形態において、本開示の抗CD8抗体は、配列番号1のアミノ酸配列を含むCDR-H1、配列番号2のアミノ酸配列を含むCDR-H2、及び配列番号3のアミノ酸配列を含むCDR-H3を含むVHドメイン、ならびに配列番号4のアミノ酸配列を含むCDR-L1、配列番号5のアミノ酸配列を含むCDR-L2、及び配列番号6のアミノ酸配列を含むCDR-L3を含むVLドメインを含む。いくつかの実施形態において、本開示の抗CD8抗体は、抗体xhCD8v1の1、2、または3つの重鎖CDR(例えば、表1~3に示されているもの)及び/または抗体xhCD8v1の1、2、または3つの軽鎖CDR(例えば、表1~3に示されているもの)を含む。いくつかの実施形態において、抗体はヒト化されている。いくつかの実施形態において、本開示の抗CD8抗体は、配列番号58の配列のCDR-H1、CDR-H2、及びCDR-H3を含むVHドメイン、ならびに配列番号59の配列のCDR-L1、CDR-L2、及びCDR-L3を含むVLドメインを含む。
いくつかの実施形態において、本開示の抗CD8抗体は、配列番号177のアミノ酸配列を含むCDR-H1、配列番号178のアミノ酸配列を含むCDR-H2、及び配列番号179のアミノ酸配列を含むCDR-H3を含むVHドメイン、ならびに配列番号180のアミノ酸配列を含むCDR-L1、配列番号181のアミノ酸配列を含むCDR-L2、及び配列番号182のアミノ酸配列を含むCDR-L3を含むVLドメインを含む。いくつかの実施形態において、本開示の抗CD8抗体は、抗体xhCD8v8の1、2、または3つの重鎖CDR(例えば、表1~3に示されているもの)及び/または抗体xhCD8v8の1、2、または3つの軽鎖CDR(例えば、表1~3に示されているもの)を含む。いくつかの実施形態において、抗体はヒト化されている。いくつかの実施形態において、本開示の抗CD8抗体は、配列番号185の配列のCDR-H1、CDR-H2、及びCDR-H3を含むVHドメイン、ならびに配列番号186の配列のCDR-L1、CDR-L2、及びCDR-L3を含むVLドメインを含む。
いくつかの実施形態において、本開示の抗CD8抗体は、配列番号13のアミノ酸配列を含むCDR-H1、配列番号14のアミノ酸配列を含むCDR-H2、及び配列番号15のアミノ酸配列を含むCDR-H3を含むVHドメイン、ならびに配列番号16のアミノ酸配列を含むCDR-L1、配列番号17のアミノ酸配列を含むCDR-L2、及び配列番号18のアミノ酸配列を含むCDR-L3を含むVLドメインを含む。いくつかの実施形態において、VHドメインは、配列番号62の配列と少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも99%、または100%同一であるアミノ酸配列を含む、及び/またはVLドメインは、配列番号63の配列と少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも99%、または100%同一であるアミノ酸配列を含む。いくつかの実施形態において、本開示の抗CD8抗体は、抗体xhCD8v2の1、2、または3つの重鎖CDR(例えば、表1~3に示されているもの)及び/または抗体xhCD8v2の1、2、または3つの軽鎖CDR(例えば、表1~3に示されているもの)を含む。いくつかの実施形態において、抗体はヒト化されている。いくつかの実施形態において、本開示の抗CD8抗体は、配列番号62の配列のCDR-H1、CDR-H2、及びCDR-H3を含むVHドメイン、ならびに配列番号63の配列のCDR-L1、CDR-L2、及びCDR-L3を含むVLドメインを含む。
いくつかの実施形態において、本開示の抗CD8抗体は、配列番号19のアミノ酸配列を含むCDR-H1、配列番号20のアミノ酸配列を含むCDR-H2、及び配列番号21のアミノ酸配列を含むCDR-H3を含むVHドメイン、ならびに配列番号22のアミノ酸配列を含むCDR-L1、配列番号23のアミノ酸配列を含むCDR-L2、及び配列番号24のアミノ酸配列を含むCDR-L3を含むVLドメインを含む。いくつかの実施形態において、VHドメインは、配列番号64の配列と少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも99%、または100%同一であるアミノ酸配列を含む、及び/またはVLドメインは、配列番号65の配列と少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも99%、または100%同一であるアミノ酸配列を含む。いくつかの実施形態において、本開示の抗CD8抗体は、抗体xhCD8v3の1、2、または3つの重鎖CDR(例えば、表1~3に示されているもの)及び/または抗体xhCD8v3の1、2、または3つの軽鎖CDR(例えば、表1~3に示されているもの)を含む。いくつかの実施形態において、抗体はヒト化されている。いくつかの実施形態において、本開示の抗CD8抗体は、配列番号64の配列のCDR-H1、CDR-H2、及びCDR-H3を含むVHドメイン、ならびに配列番号65の配列のCDR-L1、CDR-L2、及びCDR-L3を含むVLドメインを含む。
いくつかの実施形態において、本開示の抗CD8抗体は、配列番号25のアミノ酸配列を含むCDR-H1、配列番号26のアミノ酸配列を含むCDR-H2、及び配列番号27のアミノ酸配列を含むCDR-H3を含むVHドメイン、ならびに配列番号28のアミノ酸配列を含むCDR-L1、配列番号29のアミノ酸配列を含むCDR-L2、及び配列番号30のアミノ酸配列を含むCDR-L3を含むVLドメインを含む。いくつかの実施形態において、VHドメインは、配列番号66の配列と少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも99%、または100%同一であるアミノ酸配列を含む、及び/またはVLドメインは、配列番号67の配列と少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも99%、または100%同一であるアミノ酸配列を含む。いくつかの実施形態において、本開示の抗CD8抗体は、抗体xhCD8v4の1、2、または3つの重鎖CDR(例えば、表1~3に示されているもの)及び/または抗体xhCD8v4の1、2、または3つの軽鎖CDR(例えば、表1~3に示されているもの)を含む。いくつかの実施形態において、抗体はヒト化されている。いくつかの実施形態において、本開示の抗CD8抗体は、配列番号66の配列のCDR-H1、CDR-H2、及びCDR-H3を含むVHドメイン、ならびに配列番号67の配列のCDR-L1、CDR-L2、及びCDR-L3を含むVLドメインを含む。
いくつかの実施形態において、本開示の抗CD8抗体は、配列番号31のアミノ酸配列を含むCDR-H1、配列番号32のアミノ酸配列を含むCDR-H2、及び配列番号33のアミノ酸配列を含むCDR-H3を含むVHドメイン、ならびに配列番号34のアミノ酸配列を含むCDR-L1、配列番号35のアミノ酸配列を含むCDR-L2、及び配列番号36のアミノ酸配列を含むCDR-L3を含むVLドメインを含む。いくつかの実施形態において、VHドメインは、配列番号68の配列と少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも99%、または100%同一であるアミノ酸配列を含む、及び/またはVLドメインは、配列番号69の配列と少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも99%、または100%同一であるアミノ酸配列を含む。いくつかの実施形態において、本開示の抗CD8抗体は、抗体xhCD8v5の1、2、または3つの重鎖CDR(例えば、表1~3に示されているもの)及び/または抗体xhCD8v5の1、2、または3つの軽鎖CDR(例えば、表1~3に示されているもの)を含む。いくつかの実施形態において、抗体はヒト化されている。いくつかの実施形態において、本開示の抗CD8抗体は、配列番号68の配列のCDR-H1、CDR-H2、及びCDR-H3を含むVHドメイン、ならびに配列番号69の配列のCDR-L1、CDR-L2、及びCDR-L3を含むVLドメインを含む。
いくつかの実施形態において、本開示の抗CD8抗体は、配列番号37のアミノ酸配列を含むCDR-H1、配列番号38のアミノ酸配列を含むCDR-H2、及び配列番号39のアミノ酸配列を含むCDR-H3を含むVHドメイン、ならびに配列番号40のアミノ酸配列を含むCDR-L1、配列番号41のアミノ酸配列を含むCDR-L2、及び配列番号42のアミノ酸配列を含むCDR-L3を含むVLドメインを含む。いくつかの実施形態において、VHドメインは、配列番号70の配列と少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも99%、または100%同一であるアミノ酸配列を含む、及び/またはVLドメインは、配列番号71の配列と少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも99%、または100%同一であるアミノ酸配列を含む。いくつかの実施形態において、本開示の抗CD8抗体は、抗体xhCD8v6の1、2、または3つの重鎖CDR(例えば、表1~3に示されているもの)及び/または抗体xhCD8v6の1、2、または3つの軽鎖CDR(例えば、表1~3に示されているもの)を含む。いくつかの実施形態において、抗体はヒトである。いくつかの実施形態において、本開示の抗CD8抗体は、配列番号70の配列のCDR-H1、CDR-H2、及びCDR-H3を含むVHドメイン、ならびに配列番号71の配列のCDR-L1、CDR-L2、及びCDR-L3を含むVLドメインを含む。
いくつかの実施形態において、本開示の抗CD8抗体は、配列番号43のアミノ酸配列を含むCDR-H1、配列番号44のアミノ酸配列を含むCDR-H2、及び配列番号45のアミノ酸配列を含むCDR-H3を含むVHドメイン、ならびに配列番号46のアミノ酸配列を含むCDR-L1、配列番号47のアミノ酸配列を含むCDR-L2、及び配列番号48のアミノ酸配列を含むCDR-L3を含むVLドメインを含む。いくつかの実施形態において、VHドメインは、配列番号72の配列と少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも99%、または100%同一であるアミノ酸配列を含、及び/またはVLドメインは、配列番号73の配列と少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも99%、または100%同一であるアミノ酸配列を含む。いくつかの実施形態において、本開示の抗CD8抗体は、抗体xhCD8v7の1、2、または3つの重鎖CDR(例えば、表1~3に示されているもの)及び/または抗体xhCD8v7の1、2、または3つの軽鎖CDR(例えば、表1~3に示されているもの)を含む。いくつかの実施形態において、抗体はヒトである。いくつかの実施形態において、本開示の抗CD8抗体は、配列番号72の配列のCDR-H1、CDR-H2、及びCDR-H3を含むVHドメイン、ならびに配列番号73の配列のCDR-L1、CDR-L2、及びCDR-L3を含むVLドメインを含む。
いくつかの実施形態において、本開示の抗CD8抗体は、XAISのアミノ酸配列であって、ここでXはS、K、G、N、R、D、T、またはGであり、XはY、L、H、またはFである該アミノ酸配列(配列番号259)を含むCDR-H1、XPXYX10QKFX11Gのアミノ酸配列であって、ここでXはGまたはHであり、XはIまたはFであり、XはI、N、またはMであり、XはG、N、H、S、R、I、またはAであり、XはA、N、H、S、T、F、またはYであり、XはA、D、またはGであり、XはT、E、K、V、Q、またはAであり、XはAまたはTであり、XはNまたはKであり、X10はAまたはNであり、X11はQまたはTである該アミノ酸配列(配列番号260)を含むCDR-H2、及びXGXLFXのアミノ酸配列であって、ここでXはDまたはAであり、XはA、G、E、R、Y、K、N、Q、L、またはFであり、XはA、L、P、またはYであり、XはIまたはLであり、XはR、A、Q、またはSであり、XはAまたはDであり、XはD、E、A、またはSである該アミノ酸配列(配列番号261)を含むCDR-H3を含むVHドメイン、ならびにXSXIXGXLNのアミノ酸配列であって、ここでXはRまたはGであり、XはAまたはTであり、XはQまたはEであり、XはE、N、T、S、A、K、D、G、R、またはQであり、XはYまたはSであり、XはAまたはVである該アミノ酸配列(配列番号262)を含むCDR-L1、GXLXのアミノ酸配列であって、ここでXはAまたはSであり、XはT、S、E、Q、またはDであり、XはN、R、A、E、またはHであり、XはQまたはAであり、XはSまたはDである該アミノ酸配列(配列番号263)を含むCDR-L2、及びQXPWTのアミノ酸配列であって、ここでXはS、N、D、Q、A、またはEであり、XはT、I、またはSであり、XはY、L、またはFであり、XはD、G、T、E、Q、A、またはYであり、XはA、T、R、S、K、またはYである該アミノ酸配列(配列番号264)を含むCDR-L3を含むVLドメインを含む。いくつかの実施形態において、VHドメインは、配列QVQLVQSGAEVKKPGSSVKVSCKASGGTFS(配列番号274)を含むFW-1、配列WVRQAPGQGLEWMG(配列番号275)を含むFW-2、配列RVTITADESTSTAYMELSSLRSEDTAVYYCAR(配列番号276)を含むFW-3、及び/または配列WGQGTLVTVSS(配列番号277)を含むFW-4をさらに含む。いくつかの実施形態において、VLドメインは、配列DIQMTQSPSSLSASVGDRVTITC(配列番号289)を含むFW-1、配列WYQQKPGKAPKLLIY(配列番号290)を含むFW-2、配列GVPSRFSGSGSGTDFTLTISSLQPEDFATYYC(配列番号291)を含むFW-3、及び/または配列FGGGTKVEIK(配列番号292)を含むFW-4をさらに含む。
いくつかの実施形態において、本開示の抗CD8抗体は、配列番号225のアミノ酸配列を含むCDR-H1、配列番号226のアミノ酸配列を含むCDR-H2、及び配列番号227のアミノ酸配列を含むCDR-H3を含むVHドメイン、ならびに配列番号16のアミノ酸配列を含むCDR-L1、配列番号17のアミノ酸配列を含むCDR-L2、及び配列番号228のアミノ酸配列を含むCDR-L3を含むVLドメインを含む。いくつかの実施形態において、VHドメインは、配列番号245の配列と少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも99%、または100%同一であるアミノ酸配列を含む、及び/またはVLドメインは、配列番号246の配列と少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも99%、または100%同一であるアミノ酸配列を含む。いくつかの実施形態において、本開示の抗CD8抗体は、抗体xhCD8v9の1、2、または3つの重鎖CDR(例えば、表1~3に示されているもの)及び/または抗体xhCD8v9の1、2、または3つの軽鎖CDR(例えば、表1~3に示されているもの)を含む。いくつかの実施形態において、抗体はヒト化されている。いくつかの実施形態において、本開示の抗CD8抗体は、配列番号245の配列のCDR-H1、CDR-H2、及びCDR-H3を含むVHドメイン、ならびに配列番号246の配列のCDR-L1、CDR-L2、及びCDR-L3を含むVLドメインを含む。いくつかの実施形態において、VHドメインは、配列QVQLVQSGAEVKKPGSSVKVSCKASGGTFS(配列番号274)を含むFW-1、配列WVRQAPGQGLEWMG(配列番号275)を含むFW-2、配列RVTITADESTSTAYMELSSLRSEDTAVYYCAR(配列番号276)を含むFW-3、及び/または配列WGQGTLVTVSS(配列番号277)を含むFW-4をさらに含む。いくつかの実施形態において、VLドメインは、配列DIQMTQSPSSLSASVGDRVTITC(配列番号289)を含むFW-1、配列WYQQKPGKAPKLLIY(配列番号290)を含むFW-2、配列GVPSRFSGSGSGTDFTLTISSLQPEDFATYYC(配列番号291)を含むFW-3、及び/または配列FGGGTKVEIK(配列番号292)を含むFW-4をさらに含む。
いくつかの実施形態において、本開示の抗CD8抗体は、配列番号225のアミノ酸配列を含むCDR-H1、配列番号232のアミノ酸配列を含むCDR-H2、及び配列番号233のアミノ酸配列を含むCDR-H3を含むVHドメイン、ならびに配列番号234のアミノ酸配列を含むCDR-L1、配列番号235のアミノ酸配列を含むCDR-L2、及び配列番号236のアミノ酸配列を含むCDR-L3を含むVLドメインを含む。いくつかの実施形態において、VHドメインは、配列番号251の配列と少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも99%、または100%同一であるアミノ酸配列を含む、及び/またはVLドメインは、配列番号252の配列と少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも99%、または100%同一であるアミノ酸配列を含む。いくつかの実施形態において、VHドメインは配列番号251のアミノ酸配列を含み、VLドメインは配列番号252のアミノ酸配列を含む。いくつかの実施形態において、本開示の抗CD8抗体は、抗体xhCD8v12の1、2、または3つの重鎖CDR(例えば、表1~3に示されているもの)及び/または抗体xhCD8v12の1、2、または3つの軽鎖CDR(例えば、表1~3に示されているもの)を含む。いくつかの実施形態において、抗体はヒト化されている。いくつかの実施形態において、本開示の抗CD8抗体は、配列番号251の配列のCDR-H1、CDR-H2、及びCDR-H3を含むVHドメイン、ならびに配列番号252の配列のCDR-L1、CDR-L2、及びCDR-L3を含むVLドメインを含む。いくつかの実施形態において、VHドメインは、配列QVQLVQSGAEVKKPGSSVKVSCKASGGTFS(配列番号274)を含むFW-1、配列WVRQAPGQGLEWMG(配列番号275)を含むFW-2、配列RVTITADESTSTAYMELSSLRSEDTAVYYCAR(配列番号276)を含むFW-3、及び/または配列WGQGTLVTVSS(配列番号277)を含むFW-4をさらに含む。いくつかの実施形態において、VLドメインは、配列DIQMTQSPSSLSASVGDRVTITC(配列番号289)を含むFW-1、配列WYQQKPGKAPKLLIY(配列番号290)を含むFW-2、配列GVPSRFSGSGSGTDFTLTISSLQPEDFATYYC(配列番号291)を含むFW-3、及び/または配列FGGGTKVEIK(配列番号292)を含むFW-4をさらに含む。
いくつかの実施形態において、本開示の抗CD8抗体は、配列番号225のアミノ酸配列を含むCDR-H1、配列番号232のアミノ酸配列を含むCDR-H2、及び配列番号233のアミノ酸配列を含むCDR-H3を含むVHドメイン、ならびに配列番号16のアミノ酸配列を含むCDR-L1、配列番号17のアミノ酸配列を含むCDR-L2、及び配列番号228のアミノ酸配列を含むCDR-L3を含むVLドメインを含む。いくつかの実施形態において、VHドメインは、配列番号253の配列と少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも99%、または100%同一であるアミノ酸配列を含む、及び/またはVLドメインは、配列番号254の配列と少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも99%、または100%同一であるアミノ酸配列を含む。いくつかの実施形態において、本開示の抗CD8抗体は、抗体xhCD8v13の1、2、または3つの重鎖CDR(例えば、表1~3に示されているもの)及び/または抗体xhCD8v13の1、2、または3つの軽鎖CDR(例えば、表1~3に示されているもの)を含む。いくつかの実施形態において、抗体はヒト化されている。いくつかの実施形態において、本開示の抗CD8抗体は、配列番号253の配列のCDR-H1、CDR-H2、及びCDR-H3を含むVHドメイン、ならびに配列番号254の配列のCDR-L1、CDR-L2、及びCDR-L3を含むVLドメインを含む。いくつかの実施形態において、VHドメインは、配列QVQLVQSGAEVKKPGSSVKVSCKASGGTFS(配列番号274)を含むFW-1、配列WVRQAPGQGLEWMG(配列番号275)を含むFW-2、配列RVTITADESTSTAYMELSSLRSEDTAVYYCAR(配列番号276)を含むFW-3、及び/または配列WGQGTLVTVSS(配列番号277)を含むFW-4をさらに含む。いくつかの実施形態において、VLドメインは、配列DIQMTQSPSSLSASVGDRVTITC(配列番号289)を含むFW-1、配列WYQQKPGKAPKLLIY(配列番号290)を含むFW-2、配列GVPSRFSGSGSGTDFTLTISSLQPEDFATYYC(配列番号291)を含むFW-3、及び/または配列FGGGTKVEIK(配列番号292)を含むFW-4をさらに含む。
いくつかの実施形態において、本開示の抗CD8抗体は、XYXMSのアミノ酸配列であって、ここでXはS、D、E、A、またはQであり、XはA、G、またはTである該アミノ酸配列(配列番号268)を含むCDR-H1、DIXGXTXYADSVKGのアミノ酸配列であって、ここでXはT、N、S、Q、E、H、R、またはAであり、XはY、W、F、またはHであり、XはA、S、Q、E、またはTであり、XはGまたはEであり、XはSまたはIであり、XはAまたはGである該アミノ酸配列(配列番号269)を含むCDR-H2、及びXYXWXAXDXのアミノ酸配列であって、ここでXはSまたはAであり、XはN、H、A、D、L、Q、Y、またはRであり、XはA、N、S、またはGであり、XはA、V、R、E、またはSであり、XはDまたはSであり、XはD、N、Q、E、S、T、またはLであり、XはL、F、またはMであり、XはI、Y、またはVである該アミノ酸配列(配列番号270)を含むCDR-H3を含むVHドメイン、ならびにRASQSVSSNLAのアミノ酸配列(配列番号40)を含むCDR-L1、GASSRATのアミノ酸配列(配列番号41)を含むCDR-L2、及びQQYGSSPPVTのアミノ酸配列(配列番号42)を含むCDR-L3を含むVLドメインを含む。いくつかの実施形態において、VHドメインは、配列EVQLVESGGGLVQPGGSLRLSCAASGFTFS(配列番号281)を含むFW-1、配列WVRQAPGKGLEWVS(配列番号282)を含むFW-2、配列RFTISRDNAKNSLYLQMNSLRAEDTAVYYCAR(配列番号283)を含むFW-3、及び/または配列WGQGTMVTVSS(配列番号284)またはWGQGTLVTVSS(配列番号285)を含むFW-4をさらに含む。いくつかの実施形態において、VLドメインは、配列EIVLTQSPGTLSLSPGERATLSC(配列番号293)を含むFW-1、配列WYQQKPGQAPRLLIY(配列番号294)を含むFW-2、配列GIPDRFSGSGSGTDFTLTISRLEPEDFAVYYC(配列番号295)を含むFW-3、及び/または配列FGQGTKVEIK(配列番号296)を含むFW-4をさらに含む。
いくつかの実施形態において、本開示の抗CD8抗体は、配列番号229のアミノ酸配列を含むCDR-H1、配列番号230のアミノ酸配列を含むCDR-H2、及び配列番号231のアミノ酸配列を含むCDR-H3を含むVHドメイン、ならびに配列番号40のアミノ酸配列を含むCDR-L1、配列番号41のアミノ酸配列を含むCDR-L2、及び配列番号42のアミノ酸配列を含むCDR-L3を含むVLドメインを含む。いくつかの実施形態において、VHドメインは、配列番号247の配列と少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも99%、または100%同一であるアミノ酸配列を含む、及び/またはVLドメインは、配列番号248の配列と少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも99%、または100%同一であるアミノ酸配列を含む。いくつかの実施形態において、本開示の抗CD8抗体は、抗体xhCD8v10の1、2、または3つの重鎖CDR(例えば、表1~3に示されているもの)及び/または抗体xhCD8v10の1、2、または3つの軽鎖CDR(例えば、表1~3に示されているもの)を含む。いくつかの実施形態において、抗体はヒト化されている。いくつかの実施形態において、本開示の抗CD8抗体は、配列番号247の配列のCDR-H1、CDR-H2、及びCDR-H3を含むVHドメイン、ならびに配列番号248の配列のCDR-L1、CDR-L2、及びCDR-L3を含むVLドメインを含む。いくつかの実施形態において、VHドメインは、配列EVQLVESGGGLVQPGGSLRLSCAASGFTFS(配列番号281)を含むFW-1、配列WVRQAPGKGLEWVS(配列番号282)を含むFW-2、配列RFTISRDNAKNSLYLQMNSLRAEDTAVYYCAR(配列番号283)を含むFW-3、及び/または配列WGQGTMVTVSS(配列番号284)またはWGQGTLVTVSS(配列番号285)を含むFW-4をさらに含む。いくつかの実施形態において、VLドメインは、配列EIVLTQSPGTLSLSPGERATLSC(配列番号293)を含むFW-1、配列WYQQKPGQAPRLLIY(配列番号294)を含むFW-2、配列GIPDRFSGSGSGTDFTLTISRLEPEDFAVYYC(配列番号295)を含むFW-3、及び/または配列FGQGTKVEIK(配列番号296)を含むFW-4をさらに含む。
いくつかの実施形態において、本開示の抗CD8抗体は、配列番号229のアミノ酸配列を含むCDR-H1、配列番号230のアミノ酸配列を含むCDR-H2、及び配列番号231のアミノ酸配列を含むCDR-H3を含むVHドメイン、ならびに配列番号40のアミノ酸配列を含むCDR-L1、配列番号41のアミノ酸配列を含むCDR-L2、及び配列番号42のアミノ酸配列を含むCDR-L3を含むVLドメインを含む。いくつかの実施形態において、VHドメインは、配列番号249の配列と少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも99%、または100%同一であるアミノ酸配列を含む、及び/またはVLドメインは、配列番号250の配列と少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも99%、または100%同一であるアミノ酸配列を含む。いくつかの実施形態において、VHドメインは配列番号249のアミノ酸配列を含み、VLドメインは配列番号250のアミノ酸配列を含む。いくつかの実施形態において、本開示の抗CD8抗体は、抗体xhCD8v11の1、2、または3つの重鎖CDR(例えば、表1~3に示されているもの)及び/または抗体xhCD8v11の1、2、または3つの軽鎖CDR(例えば、表1~3に示されているもの)を含む。いくつかの実施形態において、抗体はヒト化されている。いくつかの実施形態において、本開示の抗CD8抗体は、配列番号249の配列のCDR-H1、CDR-H2、及びCDR-H3を含むVHドメイン、ならびに配列番号250の配列のCDR-L1、CDR-L2、及びCDR-L3を含むVLドメインを含む。いくつかの実施形態において、VHドメインは、配列EVQLVESGGGLVQPGGSLRLSCAASGFTFS(配列番号281)を含むFW-1、配列WVRQAPGKGLEWVS(配列番号282)を含むFW-2、配列RFTISRDNAKNSLYLQMNSLRAEDTAVYYCAR(配列番号283)を含むFW-3、及び/または配列WGQGTMVTVSS(配列番号284)またはWGQGTLVTVSS(配列番号285)を含むFW-4をさらに含む。いくつかの実施形態において、VLドメインは、配列EIVLTQSPGTLSLSPGERATLSC(配列番号293)を含むFW-1、配列WYQQKPGQAPRLLIY(配列番号294)を含むFW-2、配列GIPDRFSGSGSGTDFTLTISRLEPEDFAVYYC(配列番号295)を含むFW-3、及び/または配列FGQGTKVEIK(配列番号296)を含むFW-4をさらに含む。
いくつかの実施形態において、本開示の抗CD8抗体は、配列番号229のアミノ酸配列を含むCDR-H1、配列番号237のアミノ酸配列を含むCDR-H2、及び配列番号231のアミノ酸配列を含むCDR-H3を含むVHドメイン、ならびに配列番号40のアミノ酸配列を含むCDR-L1、配列番号41のアミノ酸配列を含むCDR-L2、及び配列番号42のアミノ酸配列を含むCDR-L3を含むVLドメインを含む。いくつかの実施形態において、VHドメインは、配列番号255の配列と少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも99%、または100%同一であるアミノ酸配列を含む、及び/またはVLドメインは、配列番号256の配列と少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも99%、または100%同一であるアミノ酸配列を含む。いくつかの実施形態において、本開示の抗CD8抗体は、抗体xhCD8v14の1、2、または3つの重鎖CDR(例えば、表1~3に示されているもの)及び/または抗体xhCD8v14の1、2、または3つの軽鎖CDR(例えば、表1~3に示されているもの)を含む。いくつかの実施形態において、抗体はヒト化されている。いくつかの実施形態において、本開示の抗CD8抗体は、配列番号255の配列のCDR-H1、CDR-H2、及びCDR-H3を含むVHドメイン、ならびに配列番号256の配列のCDR-L1、CDR-L2、及びCDR-L3を含むVLドメインを含む。いくつかの実施形態において、VHドメインは、配列EVQLVESGGGLVQPGGSLRLSCAASGFTFS(配列番号281)を含むFW-1、配列WVRQAPGKGLEWVS(配列番号282)を含むFW-2、配列RFTISRDNAKNSLYLQMNSLRAEDTAVYYCAR(配列番号283)を含むFW-3、及び/または配列WGQGTMVTVSS(配列番号284)またはWGQGTLVTVSS(配列番号285)を含むFW-4をさらに含む。いくつかの実施形態において、VLドメインは、配列EIVLTQSPGTLSLSPGERATLSC(配列番号293)を含むFW-1、配列WYQQKPGQAPRLLIY(配列番号294)を含むFW-2、配列GIPDRFSGSGSGTDFTLTISRLEPEDFAVYYC(配列番号295)を含むFW-3、及び/または配列FGQGTKVEIK(配列番号296)を含むFW-4をさらに含む。
いくつかの実施形態において、本開示の抗CD8抗体は、配列番号229のアミノ酸配列を含むCDR-H1、配列番号237のアミノ酸配列を含むCDR-H2、及び配列番号231のアミノ酸配列を含むCDR-H3を含むVHドメイン、ならびに配列番号40のアミノ酸配列を含むCDR-L1、配列番号41のアミノ酸配列を含むCDR-L2、及び配列番号42のアミノ酸配列を含むCDR-L3を含むVLドメインを含む。いくつかの実施形態において、VHドメインは、配列番号257の配列と少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも99%、または100%同一であるアミノ酸配列を含む、及び/またはVLドメインは、配列番号258の配列と少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも99%、または100%同一であるアミノ酸配列を含む。いくつかの実施形態において、本開示の抗CD8抗体は、抗体xhCD8v15の1、2、または3つの重鎖CDR(例えば、表1~3に示されているもの)及び/または抗体xhCD8v15の1、2、または3つの軽鎖CDR(例えば、表1~3に示されているもの)を含む。いくつかの実施形態において、抗体はヒト化されている。いくつかの実施形態において、本開示の抗CD8抗体は、配列番号257の配列のCDR-H1、CDR-H2、及びCDR-H3を含むVHドメイン、ならびに配列番号258の配列のCDR-L1、CDR-L2、及びCDR-L3を含むVLドメインを含む。いくつかの実施形態において、VHドメインは、配列EVQLVESGGGLVQPGGSLRLSCAASGFTFS(配列番号281)を含むFW-1、配列WVRQAPGKGLEWVS(配列番号282)を含むFW-2、配列RFTISRDNAKNSLYLQMNSLRAEDTAVYYCAR(配列番号283)を含むFW-3、及び/または配列WGQGTMVTVSS(配列番号284)またはWGQGTLVTVSS(配列番号285)を含むFW-4をさらに含む。いくつかの実施形態において、VLドメインは、配列EIVLTQSPGTLSLSPGERATLSC(配列番号293)を含むFW-1、配列WYQQKPGQAPRLLIY(配列番号294)を含むFW-2、配列GIPDRFSGSGSGTDFTLTISRLEPEDFAVYYC(配列番号295)を含むFW-3、及び/または配列FGQGTKVEIK(配列番号296)を含むFW-4をさらに含む。
いくつかの実施形態において、本開示の抗CD8抗体は、配列番号49のアミノ酸配列を含むCDR-H1、配列番号50のアミノ酸配列を含むCDR-H2、及び配列番号3のアミノ酸配列を含むCDR-H3を含むVHドメイン、ならびに配列番号4のアミノ酸配列を含むCDR-L1、配列番号5のアミノ酸配列を含むCDR-L2、及び配列番号6のアミノ酸配列を含むCDR-L3を含むVLドメインを含む。いくつかの実施形態において、本開示の抗CD8抗体は、配列番号51のアミノ酸配列を含むCDR-H1、配列番号52のアミノ酸配列を含むCDR-H2、及び配列番号15のアミノ酸配列を含むCDR-H3を含むVHドメイン、ならびに配列番号16のアミノ酸配列を含むCDR-L1、配列番号17のアミノ酸配列を含むCDR-L2、及び配列番号18のアミノ酸配列を含むCDR-L3を含むVLドメインを含む。いくつかの実施形態において、本開示の抗CD8抗体は、配列番号53のアミノ酸配列を含むCDR-H1、配列番号52のアミノ酸配列を含むCDR-H2、及び配列番号21のアミノ酸配列を含むCDR-H3を含むVHドメイン、ならびに配列番号22のアミノ酸配列を含むCDR-L1、配列番号23のアミノ酸配列を含むCDR-L2、及び配列番号24のアミノ酸配列を含むCDR-L3を含むVLドメインを含む。いくつかの実施形態において、本開示の抗CD8抗体は、配列番号49のアミノ酸配列を含むCDR-H1、配列番号52のアミノ酸配列を含むCDR-H2、及び配列番号27のアミノ酸配列を含むCDR-H3を含むVHドメイン、ならびに配列番号28のアミノ酸配列を含むCDR-L1、配列番号29のアミノ酸配列を含むCDR-L2、及び配列番号30のアミノ酸配列を含むCDR-L3を含むVLドメインを含む。いくつかの実施形態において、本開示の抗CD8抗体は、配列番号54のアミノ酸配列を含むCDR-H1、配列番号52のアミノ酸配列を含むCDR-H2、及び配列番号33のアミノ酸配列を含むCDR-H3を含むVHドメイン、ならびに配列番号34のアミノ酸配列を含むCDR-L1、配列番号35のアミノ酸配列を含むCDR-L2、及び配列番号36のアミノ酸配列を含むCDR-L3を含むVLドメインを含む。いくつかの実施形態において、本開示の抗CD8抗体は、配列番号55のアミノ酸配列を含むCDR-H1、配列番号56のアミノ酸配列を含むCDR-H2、及び配列番号39のアミノ酸配列を含むCDR-H3を含むVHドメイン、ならびに配列番号40のアミノ酸配列を含むCDR-L1、配列番号41のアミノ酸配列を含むCDR-L2、及び配列番号42のアミノ酸配列を含むCDR-L3を含むVLドメインを含む。いくつかの実施形態において、本開示の抗CD8抗体は、配列番号55のアミノ酸配列を含むCDR-H1、配列番号57のアミノ酸配列を含むCDR-H2、及び配列番号45のアミノ酸配列を含むCDR-H3を含むVHドメイン、ならびに配列番号46のアミノ酸配列を含むCDR-L1、配列番号47のアミノ酸配列を含むCDR-L2、及び配列番号48のアミノ酸配列を含むCDR-L3を含むVLドメインを含む。いくつかの実施形態において、本開示の抗CD8抗体は、配列番号183のアミノ酸配列を含むCDR-H1、配列番号184のアミノ酸配列を含むCDR-H2、及び配列番号179のアミノ酸配列を含むCDR-H3を含むVHドメイン、ならびに配列番号180のアミノ酸配列を含むCDR-L1、配列番号181のアミノ酸配列を含むCDR-L2、及び配列番号182のアミノ酸配列を含むCDR-L3を含むVLドメインを含む。
いくつかの実施形態において、本開示の抗CD8抗体は、GXFXのアミノ酸配列であって、ここでXはG、Y、S、またはAであり、XはT、S、G、R、N、またはHであり、XはS、T、R、H、Y、G、またはPであり、XはS、K、G、N、R、D、T、またはGであり、XはY、L、H、またはFである該アミノ酸配列(配列番号265)を含むCDR-H1、XPXのアミノ酸配列であって、ここでXはI、N、またはMであり、XはG、N、H、S、R、I、またはAであり、XはA、N、H、S、T、F、またはYであり、XはA、D、またはGであり、XはT、E、K、V、Q、またはAである該アミノ酸配列(配列番号266)を含むCDR-H2、及びXGXLFXのアミノ酸配列であって、ここでXはDまたはAであり、XはA、G、E、R、Y、K、N、Q、L、またはFであり、XはA、L、P、またはYであり、XはIまたはLであり、XはR、A、Q、またはSであり、XはAまたはDであり、XはD、E、A、またはSである該アミノ酸配列(配列番号267)を含むCDR-H3を含むVHドメイン、ならびにXSXIXGXLNのアミノ酸配列であって、ここでXはRまたはGであり、XはAまたはTであり、XはQまたはEであり、XはE、N、T、S、A、K、D、G、R、またはQであり、XはYまたはSであり、XはAまたはVである該アミノ酸配列(配列番号262)を含むCDR-L1、GXLXのアミノ酸配列であって、ここでXはAまたはSであり、XはT、S、E、Q、またはDであり、XはN、R、A、E、またはHであり、XはQまたはAであり、XはSまたはDである該アミノ酸配列(配列番号263)を含むCDR-L2、及びQXPWTのアミノ酸配列であって、ここでXはS、N、D、Q、A、またはEであり、XはT、I、またはSであり、XはY、L、またはFであり、XはD、G、T、E、Q、A、またはYであり、XはA、T、R、S、K、またはYである該アミノ酸配列(配列番号264)を含むCDR-L3を含むVLドメインを含む。いくつかの実施形態において、VHドメインは、配列QVQLVQSGAEVKKPGSSVKVSCKAS(配列番号278)を含むFW-1、配列AISWVRQAPGQGLEWMGGI(配列番号279)を含むFW-2、配列ANYAQKFQGRVTITADESTSTAYMELSSLRSEDTAVYYCAR(配列番号280)を含むFW-3、及び/または配列WGQGTLVTVSS(配列番号277)を含むFW-4をさらに含む。いくつかの実施形態において、VLドメインは、配列DIQMTQSPSSLSASVGDRVTITC(配列番号289)を含むFW-1、配列WYQQKPGKAPKLLIY(配列番号290)を含むFW-2、配列GVPSRFSGSGSGTDFTLTISSLQPEDFATYYC(配列番号291)を含むFW-3、及び/または配列FGGGTKVEIK(配列番号292)を含むFW-4をさらに含む。
いくつかの実施形態において、本開示の抗CD8抗体は、配列番号238のアミノ酸配列を含むCDR-H1、配列番号239のアミノ酸配列を含むCDR-H2、及び配列番号233のアミノ酸配列を含むCDR-H3を含むVHドメイン、ならびに配列番号16のアミノ酸配列を含むCDR-L1、配列番号17のアミノ酸配列を含むCDR-L2、及び配列番号228のアミノ酸配列を含むCDR-L3を含むVLドメインを含む。いくつかの実施形態において、VHドメインは、配列QVQLVQSGAEVKKPGSSVKVSCKAS(配列番号278)を含むFW-1、配列AISWVRQAPGQGLEWMGGI(配列番号279)を含むFW-2、配列ANYAQKFQGRVTITADESTSTAYMELSSLRSEDTAVYYCAR(配列番号280)を含むFW-3、及び/または配列WGQGTLVTVSS(配列番号277)を含むFW-4をさらに含む。いくつかの実施形態において、VLドメインは、配列DIQMTQSPSSLSASVGDRVTITC(配列番号289)を含むFW-1、配列WYQQKPGKAPKLLIY(配列番号290)を含むFW-2、配列GVPSRFSGSGSGTDFTLTISSLQPEDFATYYC(配列番号291)を含むFW-3、及び/または配列FGGGTKVEIK(配列番号292)を含むFW-4をさらに含む。
いくつかの実施形態において、本開示の抗CD8抗体は、配列番号238のアミノ酸配列を含むCDR-H1、配列番号243のアミノ酸配列を含むCDR-H2、及び配列番号233のアミノ酸配列を含むCDR-H3を含むVHドメイン、ならびに配列番号234のアミノ酸配列を含むCDR-L1、配列番号235のアミノ酸配列を含むCDR-L2、及び配列番号236のアミノ酸配列を含むCDR-L3を含むVLドメインを含む。いくつかの実施形態において、VHドメインは、配列QVQLVQSGAEVKKPGSSVKVSCKAS(配列番号278)を含むFW-1、配列AISWVRQAPGQGLEWMGGI(配列番号279)を含むFW-2、配列ANYAQKFQGRVTITADESTSTAYMELSSLRSEDTAVYYCAR(配列番号280)を含むFW-3、及び/または配列WGQGTLVTVSS(配列番号277)を含むFW-4をさらに含む。いくつかの実施形態において、VLドメインは、配列DIQMTQSPSSLSASVGDRVTITC(配列番号289)を含むFW-1、配列WYQQKPGKAPKLLIY(配列番号290)を含むFW-2、配列GVPSRFSGSGSGTDFTLTISSLQPEDFATYYC(配列番号291)を含むFW-3、及び/または配列FGGGTKVEIK(配列番号292)を含むFW-4をさらに含む。
いくつかの実施形態において、本開示の抗CD8抗体は、配列番号238のアミノ酸配列を含むCDR-H1、配列番号243のアミノ酸配列を含むCDR-H2、及び配列番号233のアミノ酸配列を含むCDR-H3を含むVHドメイン、ならびに配列番号16のアミノ酸配列を含むCDR-L1、配列番号17のアミノ酸配列を含むCDR-L2、及び配列番号228のアミノ酸配列を含むCDR-L3を含むVLドメインを含む。いくつかの実施形態において、VHドメインは、配列QVQLVQSGAEVKKPGSSVKVSCKAS(配列番号278)を含むFW-1、配列AISWVRQAPGQGLEWMGGI(配列番号279)を含むFW-2、配列ANYAQKFQGRVTITADESTSTAYMELSSLRSEDTAVYYCAR(配列番号280)を含むFW-3、及び/または配列WGQGTLVTVSS(配列番号277)を含むFW-4をさらに含む。いくつかの実施形態において、VLドメインは、配列DIQMTQSPSSLSASVGDRVTITC(配列番号289)を含むFW-1、配列WYQQKPGKAPKLLIY(配列番号290)を含むFW-2、配列GVPSRFSGSGSGTDFTLTISSLQPEDFATYYC(配列番号291)を含むFW-3、及び/または配列FGGGTKVEIK(配列番号292)を含むFW-4をさらに含む。
いくつかの実施形態において、本開示の抗CD8抗体は、GFTFXYのアミノ酸配列であって、ここでXはS、D、E、Q、S、またはAであり、XはS、D、E、A、またはQである該アミノ酸配列(配列番号271)を含むCDR-H1、XGXのアミノ酸配列であって、ここでXはT、N、S、Q、E、H、R、またはAであり、XはY、W、F、またはHであり、XはA、S、Q、E、またはTであり、XはGまたはEであり、XはSまたはIである該アミノ酸配列(配列番号272)を含むCDR-H2、及びXYXWXAXDXのアミノ酸配列であって、ここでXはSまたはAであり、XはN、H、A、D、L、Q、Y、またはRであり、XはA、N、S、またはGであり、XはA、V、R、E、またはSであり、XはDまたはSであり、XはD、N、Q、E、S、T、またはLであり、XはL、F、またはMであり、XはI、Y、またはVである該アミノ酸配列(配列番号273)を含むCDR-H3を含むVHドメイン、ならびにRASQSVSSNLA(配列番号40)のアミノ酸配列を含むCDR-L1、GASSRAT(配列番号41)のアミノ酸配列を含むCDR-L2、及びQQYGSSPPVT(配列番号42)のアミノ酸配列を含むCDR-L3を含むVLドメインを含む。いくつかの実施形態において、VHドメインは、配列EVQLVESGGGLVQPGGSLRLSCAAS(配列番号286)を含むFW-1、配列AMSWVRQAPGKGLEWVSDI(配列番号287)を含むFW-2、配列TAYADSVKGRFTISRDNAKNSLYLQMNSLRAEDTAVYYCAR(配列番号288)を含むFW-3、及び/または配列WGQGTMVTVSS(配列番号284)またはWGQGTLVTVSS(配列番号285)を含むFW-4をさらに含む。いくつかの実施形態において、VLドメインは、配列EIVLTQSPGTLSLSPGERATLSC(配列番号293)を含むFW-1、配列WYQQKPGQAPRLLIY(配列番号294)を含むFW-2、配列GIPDRFSGSGSGTDFTLTISRLEPEDFAVYYC(配列番号295)を含むFW-3、及び/または配列FGQGTKVEIK(配列番号296)を含むFW-4をさらに含む。
いくつかの実施形態において、本開示の抗CD8抗体は、配列番号240のアミノ酸配列を含むCDR-H1、配列番号241のアミノ酸配列を含むCDR-H2、及び配列番号242のアミノ酸配列を含むCDR-H3を含むVHドメイン、ならびに配列番号40のアミノ酸配列を含むCDR-L1、配列番号41のアミノ酸配列を含むCDR-L2、及び配列番号42のアミノ酸配列を含むCDR-L3を含むVLドメインを含む。いくつかの実施形態において、VHドメインは、配列EVQLVESGGGLVQPGGSLRLSCAAS(配列番号286)を含むFW-1、配列AMSWVRQAPGKGLEWVSDI(配列番号287)を含むFW-2、配列TAYADSVKGRFTISRDNAKNSLYLQMNSLRAEDTAVYYCAR(配列番号288)を含むFW-3、及び/または配列WGQGTMVTVSS(配列番号284)またはWGQGTLVTVSS(配列番号285)を含むFW-4をさらに含む。いくつかの実施形態において、VLドメインは、配列EIVLTQSPGTLSLSPGERATLSC(配列番号293)を含むFW-1、配列WYQQKPGQAPRLLIY(配列番号294)を含むFW-2、配列GIPDRFSGSGSGTDFTLTISRLEPEDFAVYYC(配列番号295)を含むFW-3、及び/または配列FGQGTKVEIK(配列番号296)を含むFW-4をさらに含む。
いくつかの実施形態において、本開示の抗CD8抗体は、配列番号240のアミノ酸配列を含むCDR-H1、配列番号244のアミノ酸配列を含むCDR-H2、及び配列番号242のアミノ酸配列を含むCDR-H3を含むVHドメイン、ならびに配列番号40のアミノ酸配列を含むCDR-L1、配列番号41のアミノ酸配列を含むCDR-L2、及び配列番号42のアミノ酸配列を含むCDR-L3を含むVLドメインを含む。いくつかの実施形態において、VHドメインは、配列EVQLVESGGGLVQPGGSLRLSCAAS(配列番号286)を含むFW-1、配列AMSWVRQAPGKGLEWVSDI(配列番号287)を含むFW-2、配列TAYADSVKGRFTISRDNAKNSLYLQMNSLRAEDTAVYYCAR(配列番号288)を含むFW-3、及び/または配列WGQGTMVTVSS(配列番号284)またはWGQGTLVTVSS(配列番号285)を含むFW-4をさらに含む。いくつかの実施形態において、VLドメインは、配列EIVLTQSPGTLSLSPGERATLSC(配列番号293)を含むFW-1、配列WYQQKPGQAPRLLIY(配列番号294)を含むFW-2、配列GIPDRFSGSGSGTDFTLTISRLEPEDFAVYYC(配列番号295)を含むFW-3、及び/または配列FGQGTKVEIK(配列番号296)を含むFW-4をさらに含む。いくつかの実施形態において、本開示は、表1に列挙されている単一抗体のCDR-H1、CDR-H2、及びCDR-H3配列を含むVHドメイン、ならびに表1に列挙されている単一抗体のCDR-L1、CDR-L2、及びCDR-L3配列を含むVLドメインを含む抗CD8抗体を提供する。例えば、抗CD8抗体は、表1に示されている抗体xhCD8v1、xhCD8v1.1、xhCD8v2、xhCD8v3、xhCD8v4、xhCD8v5、xhCD8v6、xhCD8v7、xhCD8v8、xhCD8v9、xhCD8v10、xhCD8v11、xhCD8v12、xhCD8v13、xhCD8v14、xhCD8v15、V9ファミリー、またはV11ファミリーの6つのCDRを含む。いくつかの実施形態において、本開示は、表2に列挙されている単一抗体のCDR-H1、CDR-H2、及びCDR-H3配列を含むVHドメイン、ならびに表2に列挙されている単一抗体のCDR-L1、CDR-L2、及びCDR-L3配列を含むVLドメインを含む抗CD8抗体を提供する。例えば、抗CD8抗体は、表2に示されている抗体xhCD8v1、xhCD8v1.1、xhCD8v2、xhCD8v3、xhCD8v4、xhCD8v5、xhCD8v6、xhCD8v7、xhCD8v8、xhCD8v9、xhCD8v10、xhCD8v11、xhCD8v12、xhCD8v13、xhCD8v14、xhCD8v15、V9ファミリー、またはV11ファミリーの6つのCDRを含む。いくつかの実施形態において、本開示は、表1に列挙されている単一抗体のCDR-H1、CDR-H2、及びCDR-H3配列を含むVHドメイン、ならびに表1に列挙されている単一抗体のCDR-L1、CDR-L2、及びCDR-L3配列を含むVLドメインを含む抗CD8抗体を含む融合タンパク質を提供する。例えば、融合タンパク質の抗CD8抗体は、表1に示されている抗体xhCD8v1、xhCD8v1.1、xhCD8v2、xhCD8v3、xhCD8v4、xhCD8v5、xhCD8v6、xhCD8v7、xhCD8v8、xhCD8v9、xhCD8v10、xhCD8v11、xhCD8v12、xhCD8v13、xhCD8v14、xhCD8v15、V9ファミリー、またはV11ファミリーの6つのCDRを含む。いくつかの実施形態において、本開示は、表2に列挙されている単一抗体のCDR-H1、CDR-H2、及びCDR-H3配列を含むVHドメイン、ならびに表2に列挙されている単一抗体のCDR-L1、CDR-L2、及びCDR-L3配列を含むVLドメインを含む抗CD8抗体を含む融合タンパク質を提供する。例えば、融合タンパク質の抗CD8抗体は、表2に示されている抗体xhCD8v1、xhCD8v1.1、xhCD8v2、xhCD8v3、xhCD8v4、xhCD8v5、xhCD8v6、xhCD8v7、xhCD8v8、xhCD8v9、xhCD8v10、xhCD8v11、xhCD8v12、xhCD8v13、xhCD8v14、xhCD8v15、V9ファミリー、またはV11ファミリーの6つのCDRを含む。いくつかの実施形態において、本開示は、表3に列挙されているVHドメインのCDR-H1、CDR-H2、及びCDR-H3配列を含むVHドメイン、ならびに表3に列挙されているVLドメインのCDR-L1、CDR-L2、及びCDR-L3配列を含むVLドメインを含む抗CD8抗体を提供する(いくつかの実施形態において、VH及びVLドメインは、表3に列挙されている同一の単一抗体に由来するものである)。例えば、抗CD8抗体は、表3に示されている抗体xhCD8v1、xhCD8v1.1、xhCD8v2、xhCD8v3、xhCD8v4、xhCD8v5、xhCD8v6、xhCD8v7、xhCD8v8、xhCD8v9、xhCD8v10、xhCD8v11、xhCD8v12、xhCD8v13、xhCD8v14、またはxhCD8v15のVH及びVLを含む。いくつかの実施形態において、本開示は、表3に列挙されているVHドメインのCDR-H1、CDR-H2、及びCDR-H3配列を含むVHドメイン、ならびに表3に列挙されているVLドメインのCDR-L1、CDR-L2、及びCDR-L3配列を含むVLドメインを含む抗CD8抗体を含む融合タンパク質を提供する(いくつかの実施形態において、VH及びVLドメインは、表3に列挙されている同一の単一抗体に由来するものである)。いくつかの実施形態において、本開示は、表3に列挙されているような単一抗体についてのVHドメイン配列及びVLドメイン配列を含む抗CD8抗体を提供する。いくつかの実施形態において、本開示は、表3に列挙されているような単一抗体についてのVHドメイン配列及びVLドメイン配列を含む抗CD8抗体を含む融合タンパク質を提供する。例えば、融合タンパク質の抗CD8抗体は、表3に示されている抗体xhCD8v1、xhCD8v1.1、xhCD8v2、xhCD8v3、xhCD8v4、xhCD8v5、xhCD8v6、xhCD8v7、xhCD8v8、xhCD8v9、xhCD8v10、xhCD8v11、xhCD8v12、xhCD8v13、xhCD8v14、またはxhCD8v15のVH及びVLを含む。
融合タンパク質
本明細書ではさらに、本明細書で開示される抗CD8抗体、または抗原結合ドメイン、あるいは抗体フラグメントのいずれか1つを含む融合タンパク質が提供される。いくつかの実施形態において、本開示の融合タンパク質は、CD8b及び/またはCD8abに特異的に結合するヒトもしくはヒト化抗体またはその抗原結合フラグメント(例えば、上述の抗CD8抗体のいずれか1つ)を含む第1の部分及びサイトカイン、ケモカイン、または増殖因子を含む第2の部分を含む。いくつかの実施形態において、第1の部分は、第2の部分に直接融合する。いくつかの実施形態において、第1の部分は、第2の部分にリンカーを介して融合する。本開示の融合タンパク質の例示的かつ非限定的な図が、図7に描かれている。
融合タンパク質フォーマット
いくつかの実施形態において、第1の部分は、抗体(例えば、本開示の抗CD8抗体)を含む。いくつかの実施形態において、第1の部分は、抗体フラグメント(例えば、本開示の抗CD8抗体フラグメント)を含む。いくつかの実施形態において、第1の部分は、単鎖抗体または単鎖可変フラグメント(scFv)を含む。いくつかの実施形態において、第1の部分は、VHH抗体を含む。いくつかの実施形態において、第1の部分は、1つまたは2つの抗体重鎖ポリペプチド及び1つまたは2つの抗体軽鎖ポリペプチド(例えば、本開示の抗CD8抗体のもの)を含む。いくつかの実施形態において、第1の部分は、本開示の単一の抗CD8抗体の3つの重鎖CDR及び/または3つの軽鎖CDR(例えば、表1~3に示されているもの)を含む。いくつかの実施形態において、第1の部分は、本開示の単一の抗CD8抗体のVH及び/またはVLドメイン(複数可)(例えば、表3に示されているもの)を含む。いくつかの実施形態において、第1の部分は、1つまたは2つのヒトIgG Fcドメインをさらに含む。いくつかの実施形態において、1つまたは2つのヒトIgG Fcドメインは、IgG1、IgG2、IgG3またはIgG4 Fcドメインである。いくつかの実施形態において、1つまたは2つのヒトIgG Fcドメインは、C末端リジン残基を有しない。いくつかの実施形態において、1つまたは2つのヒトIgG Fcドメインは、アミノ酸改変(置換、欠失、付加など)を含む。いくつかの実施形態において、Fcドメイン改変により、ヘテロ二量体の形成が促進される(例えば、表4に示されているもの)。いくつかの実施形態において、1つまたは2つのFcドメインは、Fcガンマヌル変異を含む。
いくつかの実施形態において、第1の部分は、N末端からC末端までの式[I]による構造を含む2つの抗体重鎖ポリペプチド:
VH-CH1-ヒンジ-CH2-CH3 [I]
及びN末端からC末端までの式[II]による構造を含む2つの抗体軽鎖ポリペプチド:
VL-CL [II]
を含む(式中、VHはVHドメインであり、CH1は抗体CH1ドメインであり、ヒンジは抗体ヒンジドメインであり、CH2-CH3は抗体Fcドメインであり、VLはVLドメインであり、CLは抗体定常軽鎖ドメインである)。いくつかの実施形態において、第2の部分のN末端は、2つのCH3ドメインのうちの1つのC末端に融合する(例えば、図7のフォーマットAを参照されたい)。
いくつかの実施形態において、第1の部分は、N末端からC末端までの式[I]による構造を含む第1の抗体重鎖ポリペプチド:
VH-CH1-ヒンジ-CH2-CH3 [I]、
N末端からC末端までの式[II]による構造を含む抗体軽鎖ポリペプチド:
VL-CL [II]、
及びN末端からC末端までの式[III]による構造を含む第2の抗体重鎖ポリペプチド:
ヒンジ-CH2-CH3 [III]、
を含む(式中、VHはVHドメインであり、CH1は抗体CH1ドメインであり、ヒンジは抗体ヒンジドメインであり、CH2-CH3は抗体Fcドメインであり、VLはVLドメインであり、CLは抗体定常軽鎖ドメインである)。いくつかの実施形態において、第2の部分のN末端は、第2の抗体重鎖ポリペプチドのCH3ドメインのC末端に融合する(例えば、図7のフォーマットBを参照されたい)。いくつかの実施形態において、第2の部分のN末端は、第1の抗体重鎖ポリペプチドのCH3ドメインのC末端に融合する(例えば、図7のフォーマットDを参照されたい)。
いくつかの実施形態において、第1の部分は、N末端からC末端までの式[I]による構造を含む第1の抗体重鎖ポリペプチド:
VH-CH1-ヒンジ-CH2-CH3 [I]、
N末端からC末端までの式[II]による構造を含む抗体軽鎖ポリペプチド:
VL-CL [II]、
及びN末端からC末端までの式[III]による構造を含む第2の抗体重鎖ポリペプチド:
ヒンジ-CH2-CH3 [III]、
を含む(式中、VHはVHドメインであり、CH1は抗体CH1ドメインであり、ヒンジは抗体ヒンジドメインであり、CH2-CH3は抗体Fcドメインであり、VLはVLドメインであり、CLは抗体定常軽鎖ドメインである)。いくつかの実施形態において、第2の部分のC末端は、第2の抗体重鎖ポリペプチドのヒンジドメインのN末端に融合する(例えば、図7のフォーマットCを参照されたい)。
いくつかの実施形態において、本開示の抗CD8抗体は、多重特異性(例えば、二重特異性)抗体または抗体フラグメントである。例えば、いくつかの実施形態において、多重特異性抗体(例えば、二重特異性抗体)は、CD8に結合する第1の抗原結合ドメイン(例えば、上述のもの)及び目的の標的に結合する第2の抗原結合ドメインを含む。いくつかの実施形態において、二重特異性抗体は、免疫グロブリンの重鎖または軽鎖のいずれかに追加の結合部位を融合することによって生成され得る。追加の結合部位の例としては、可変領域、scFv、Fab、VHH、及びペプチドが挙げられるが、これらに限定されない。
いくつかの実施形態において、本明細書に開示される組換え二重特異性抗体は、2つのカテゴリー、すなわち、i)可変領域のみの組み合わせから生じるフォーマット、及びii)可変領域とFcドメインとを組み合わせたフォーマットに、非常に大まかに分類することができる。第1のカテゴリーの代表は、タンデムscFv(taFv)、ダイアボディ(Db)、DART、単鎖ダイアボディ(scDbs)、Fab-Fc、タンデムFab、二重可変領域Fab及びタンデムdAb/VHHである。2つの可変領域は、共有結合または非共有結合性相互作用を介して互いに連結され得る。
非共有結合性相互作用は、ロイシンジッパー、cAMP依存性プロテインキナーゼ(PKA)調節サブユニット及びAキナーゼアンカータンパク質(AKAP)アンカードメインを使用するドック-アンド-ロック(dock-and-lock)法、またはノブ-イントゥ-ホール(knob-into-holes)CH3ドメイン等(米国特許第5,731,168号、米国特許第7,695,936号、Ridgway et al.,Prot Eng 9,617-621(1996)及びCarter,J Immunol Meth 248,7-15(2001))のヘテロ二量体化モジュールを使用して可変領域を対にすることに関与し得る。
いくつかの実施形態において、二重特異性抗体は、各対が異なる結合特異性を有する、重鎖と軽鎖との組み合わせの2つの対を含有する天然の免疫グロブリン構造上に生成される。IgGにおける2つの重鎖のホモ二量体化は、CH3相互作用によって媒介される。ヘテロ二量体の形成を促進するために、遺伝子改変が2つのそれぞれのCH3領域に導入される。その点で、ヘテロ二量体化変異は、立体反発、電荷操縦相互作用(charge steering interaction)、または鎖間ジスルフィド結合形成に関与することが多い。ヘテロ二量体化を促進するための例示的かつ非限定的なFc改変としては、以下のものが挙げられる:
いくつかの実施形態において、二重特異性抗体は、半抗体の産生後のアセンブリによって生成することができ、それによって重鎖と軽鎖のミスペアの問題を解決することができる。これらの抗体は、しばしば、半抗体のヘテロ二量体化を支持する改変を含有する。例示的な系としては、表5に収載されている、ノブ-イントゥ-ホール、IgG1(EEE-RRR)、IgG2(EEE-RRRR)(Strop et al.J Mol Biol(2012))、及びDuoBody(F405L-K409R)が挙げられるが、これらに限定されない。このような場合、半抗体は、個別に独立した細胞株で産生し、精製する。次いで、精製した抗体を穏やかな還元に付して半抗体を得、次いで、これらを組み合わせて二重特異性抗体を構築した。次いで、ヘテロ二量体二重特異性抗体を従来の精製方法を用いて混合物から精製した。
いくつかの実施形態において、優先的な鎖のペアリングに依拠しない二重特異性抗体生成ストラテジーも採用することができる。これらのストラテジーは、典型的には、ヘテロ二量体がホモ二量体とは異なる生化学的または生物物理学的特性を有することになるようにして、抗体に遺伝子改変を導入することに関与する。したがって、組み合わせ後または発現したヘテロ二量体を、ホモ二量体から選択的に精製することができる。一例には、IgG1 CH3ドメインにH435R/Y436Fを導入して、プロテインA樹脂へのFc結合を消失させ、次いで、H435R/Y436Fバリアントを野生型Fcと同時発現させることがあった。結果として生じるH435R/Y436Fを2コピー含有するホモ二量体抗体は、プロテインAカラムに結合できない一方、H435R/Y436F変異を1コピー含むヘテロ二量体抗体は、プロテインAへの親和性が、ホモ二量体野生型抗体の強い相互作用と比較して低下することになる(Tustian et al Mabs 2016)。他の例としては、カッパ/ラムダ抗体(Fischer et al.,Nature Communication 2015)及びそれぞれの鎖に電荷の差(E357Q、S267KまたはN208D/Q295E/N384D/Q418E/N421D)を導入すること(US 2018/0142040 A1、(Strop et al.J Mol Biol(2012))が挙げられる。
いくつかの実施形態において、免疫グロブリンの重鎖または軽鎖のいずれかに追加の結合部位を融合することによって、二重特異性抗体を生成することができる。追加の結合部位の例としては、可変領域、scFv、Fab、VHH、及びペプチドが挙げられるが、これらに限定されない。
融合タンパク質Fc領域
いくつかの実施形態において、本開示の抗体または融合タンパク質は、Fc領域を含む。いくつかの実施形態において、Fc領域は、FcγR結合及び/またはエフェクター機能を低減または排除する1つ以上の変異を含む。いくつかの実施形態において、Fc領域(例えば、IgG1 Fc領域)は、以下の位置のうちの1つ以上における置換を含む:C220、C226、C229、E233、L234、L235、G237、P238、S239 D265、S267、N297、L328、P331、K322、A327及びP329。いくつかの実施形態において、Fc領域(例えば、IgG2 Fc領域)は、以下の位置のうちの1つ以上における置換を含む:V234、G237、D265、H268、N297、V309、A330、A331、K322。いくつかの実施形態において、Fc領域(例えば、IgG4 Fc領域)は、以下の位置のうちの1つ以上における置換を含む:L235、G237、D265及びE318。いくつかの実施形態において、Fc領域(例えば、IgG1 Fc領域)は、以下の変異または変異群のうちの1つ以上を含む:N297A、N297Q、N297G、D265A/N297A、D265A/N297Q、C220S/C226S/C229S/P238S、S267E/L328F、C226S/C229S/E233P/L234V/L235A、L234F/L235E/P331S、L234A/L235A、L234A/L235A/G237A、L234A/L235A/G237A/K322A、L234A/L235A/G237A/A330S/A331S、L234A/L235A/P329G、E233P/L234V/L235A/G236欠失/S239K、E233P/L234V/L235A/G236欠失/S267K、E233P/L234V/L235A/G236欠失/S239K/A327G、E233P/L234V/L235A/G236欠失/S267K/A327G及びE233P/L234V/L235A/G236欠失、L234A/L235A/G237欠失。いくつかの実施形態において、Fc領域(例えば、IgG2 Fc領域)は、以下の変異または変異群のうちの1つ以上を含む:A330S/A331S、V234A/G237A、V234A/G237A/D265A、D265A/A330S/A331S、V234A/G237A/D265A/A330S/A331S、及びH268Q/V309L/A330S/A331S。いくつかの実施形態において、Fc領域(例えば、IgG4 Fc領域)は、以下の変異または変異群のうちの1つ以上を含む:L235A/G237A/E318A、D265A、L235A/G237A/D265A及びL235A/G237A/D265A/E318A。いくつかの実施形態において、Fc領域は、以下の変異のうちの1つ、2つ、3つ、または全てを含む:L234A、L235A、G237A、及びK322A(番号付けはEUインデックスによる)。いくつかの実施形態において、Fc領域は、以下の変異のうちの1つ、2つ、または全てを含む:L234A、L235A、及びG237A(番号付けはEUインデックスによる)。
いくつかの実施形態において、融合タンパク質の当該第1及び第2のFcドメインは、エフェクター機能を低下させるために、EU番号付けに従った以下のFc変異のうちの1つ以上を含有する:L234A、L235A、G237A、及びK322A。いくつかの実施形態において、融合タンパク質の当該第1及び第2のFcドメインは、エフェクター機能を低下させるために、EU番号付けに従った以下のFc変異を含有する:L234A、L235A、及びG237A。いくつかの実施形態において、融合タンパク質の当該第1及び第2のFcドメインは、エフェクター機能を低下させるために、EU番号付けに従った以下のFc変異を含有する:L234A、L235A、G237A、及びK322A。いくつかの実施形態において、融合タンパク質の当該第1及び第2のFcドメインは、ヘテロ二量体の形成を促進するために、以下のアミノ酸置換を含有する:Y349C/T366W(ノブ)ならびにS354C、T366S、L368A及びY407V(ホール)。
いくつかの実施形態において、ヘテロ二量体変異及び/またはFcガンマ受容体結合を改変するための変異により、Fcの安定性の低下がもたらされた。したがって、追加の変異(複数可)をFc領域に追加して、その安定性を向上させた。例えば、A287CとL306C、V259CとL306C、R292CとV302C、及びV323CとI332C等のジスルフィド結合の1対以上がFc領域に導入される。別の例には、IgG4ベースの二重特異性抗体にS228Pを導入して、ヒンジのジスルフィドを安定化させることがある。追加の例としては、K338I、A339K、及びK340S変異を導入して、Fc安定性及び凝集耐性を高めることが挙げられる(Gao et al,2019 Mol Pharm.2019;16:3647)。
融合タンパク質サイトカイン
いくつかの実施形態において、第2の部分は、CD8+T細胞の活性化を誘導する。いくつかの実施形態において、第2の部分は、IL2Rβγを介したシグナル伝達を誘導するポリペプチドを含む。例えば、いくつかの実施形態において、第2の部分は、IL-15ポリペプチド(例えば、ヒトIL-15ポリペプチドまたはその誘導体)またはネオロイキン(neoleukin)を含む。いくつかの実施形態において、第2の部分は、IL-21ポリペプチド(例えば、ヒトIL-21ポリペプチドまたはその誘導体)を含む。
いくつかの実施形態において、第2の部分は、IL-2ポリペプチド(例えば、ヒトIL-2ポリペプチドまたはその誘導体)を含む。
いくつかの実施形態において、IL-2ポリペプチド変異体は、配列番号81の配列を含む野生型IL-2ポリペプチドのIL-2Rαに対する結合親和性と比較して、50%以上低下したIL-2Rαへの結合親和性を有する。いくつかの実施形態において、IL-2ポリペプチド変異体は、配列番号81の配列を含む野生型IL-2ポリペプチドのIL-2Rβに対する結合親和性と比較して、50%以上低下したIL-2Rβへの結合親和性を有する。いくつかの実施形態において、IL-2ポリペプチド変異体は、配列番号81の配列を含む野生型IL-2ポリペプチドのIL-2Rγに対する結合親和性と比較して、50%以上低下したIL-2Rγへの結合親和性を有する。野生型及び開示されるポリペプチド変異体のIL-2Rα及びIL-2Rβに対する結合親和性の差は、例えば、当業者によく知られているタンパク質-タンパク質相互作用の親和性を測定する標準表面プラズモン共鳴(SPR)アッセイで測定することができる。野生型及び開示されるポリペプチド変異体のIL-2Rγに対する結合親和性の差は、IL-2Rγに対する野生型IL-2ポリペプチドの親和性が非常に低いので、SPRアッセイによって確実に測定することができない。代わりに、それらのIL-2Rγに対する親和性の低下は、IL-2R発現細胞でpSTAT5を測定し、IL-2Rγ親和性低下置換を有する及び有しないIL-2ポリペプチドの活性を比較するin vitroアッセイを行うことによって推定することができる。IL-2Rα、IL-2Rβ、及びIL-2Rγについての例示的な配列を以下に示す。
IL-2Rα:
MDSYLLMWGLLTFIMVPGCQAELCDDDPPEIPHATFKAMAYKEGTMLNCECKRGFRRIKSGSLYMLCTGNSSHSSWDNQCQCTSSATRNTTKQVTPQPEEQKERKTTEMQSPMQPVDQASLPGHCREPPPWENEATERIYHFVVGQMVYYQCVQGYRALHRGPAESVCKMTHGKTRWTQPQLICTGEMETSQFPGEEKPQASPEGRPESETSCLVTTTDFQIQTEMAATMETSIFTTEYQVAVAGCVFLLISVLLLSGLTWQRRQRKSRRTI(配列番号82)

IL-2Rβ:
MAAPALSWRLPLLILLLPLATSWASAAVNGTSQFTCFYNSRANISCVWSQDGALQDTSCQVHAWPDRRRWNQTCELLPVSQASWACNLILGAPDSQKLTTVDIVTLRVLCREGVRWRVMAIQDFKPFENLRLMAPISLQVVHVETHRCNISWEISQASHYFERHLEFEARTLSPGHTWEEAPLLTLKQKQEWICLETLTPDTQYEFQVRVKPLQGEFTTWSPWSQPLAFRTKPAALGKDTIPWLGHLLVGLSGAFGFIILVYLLINCRNTGPWLKKVLKCNTPDPSKFFSQLSSEHGGDVQKWLSSPFPSSSFSPGGLAPEISPLEVLERDKVTQLLLQQDKVPEPASLSSNHSLTSCFTNQGYFFFHLPDALEIEACQVYFTYDPYSEEDPDEGVAGAPTGSSPQPLQPLSGEDDAYCTFPSRDDLLLFSPSLLGGPSPPSTAPGGSGAGEERMPPSLQERVPRDWDPQPLGPPTPGVPDLVDFQPPPELVLREAGEEVPDAGPREGVSFPWSRPPGQGEFRALNARLPLNTDAYLSLQELQGQDPTHLV(配列番号83)

IL-2Rγ:
MLKPSLPFTSLLFLQLPLLGVGLNTTILTPNGNEDTTADFFLTTMPTDSLSVSTLPLPEVQCFVFNVEYMNCTWNSSSEPQPTNLTLHYWYKNSDNDKVQKCSHYLFSEEITSGCQLQKKEIHLYQTFVVQLQDPREPRRQATQMLKLQNLVIPWAPENLTLHKLSESQLELNWNNRFLNHCLEHLVQYRTDWDHSWTEQSVDYRHKFSLPSVDGQKRYTFRVRSRFNPLCGSAQHWSEWSHPIHWGSNTSKENPFLFALEAVVISVGSMGLIISLLCVYFWLERTMPRIPTLKNLEDLVTEYHGNFSAWSGVSKGLAESLQPDYSERLCLVSEIPPKGGALGEGPGASPCNQHSPYWAPPCYTLKPET(配列番号84)
いくつかの実施形態において、IL-2ポリペプチドは、APTSSSTKKTQLQLEHLLLDLQMILNGINNYKNPKLTRMLTFKFYMPKKATELKHLQCLEEELKPLEEVLNLAQSKNFHLRPRDLISNINVIVLELKGSETTFMCEYADETATIVEFLNRWITFCQSIISTLT(配列番号81)の配列を含むヒトIL-2ポリペプチドに対して1つ以上の変異を含むIL-2ポリペプチド変異体である。いくつかの実施形態において、本開示のIL-2ポリペプチド変異体は、野生型成熟IL-2ポリペプチド(例えば、配列番号81のアミノ酸配列を有する)に対して1つ以上、2つ以上、または3つ以上の親和性低下アミノ酸置換を有する。いくつかの実施形態において、1つ以上、2つ以上、または3つ以上の置換される残基は、以下の群から選択される:Q11、H16、L18、L19、D20、D84、S87、Q22、R38、F42、K43、Y45、E62、P65、E68、V69、L72、D84、S87、N88、V91、I92、T123、Q126、S127、I129、及びS130。IL-2Rαへの親和性の減少は、野生型成熟IL-2ポリペプチドの配列において、以下の残基の1つ以上を置換することによって得てもよい:R38、F42、K43、Y45、E62、P65、E68、V69、及びL72。IL-2Rβへの親和性の減少は、以下の残基の1つ以上を置換することによって得てもよい:E15、H16、L19、D20、D84、S87、N88、V91、及びI92。IL-2Rγへの親和性の減少は、野生型成熟IL-2ポリペプチドの配列において、以下の残基の1つ以上を置換することによって得てもよい:Q11、L18、Q22、T123、Q126、S127、I129、及びS130。
いくつかの実施形態において、IL-2ポリペプチド変異体は、野生型成熟IL-2アミノ酸配列に対して、F42AまたはF42Kのアミノ酸置換を含む。いくつかの実施形態において、IL-2ポリペプチド変異体は、野生型成熟IL-2アミノ酸配列に対して、F42AまたはF42Kのアミノ酸置換及びR38A、R38D、R38E、E62Q、E68A、E68Q、E68K、またはE68Rのアミノ酸置換を含む。例えば、いくつかの実施形態において、IL-2ポリペプチド変異体は、野生型成熟IL-2アミノ酸配列(例えば、配列番号81に示されているもの)に対して、F42A;R38A及びF42A;R38D及びF42A;R38E及びF42A;F42A及びE62Q;F42A及びE68A;F42A及びE68Q;F42A及びE68K;F42A及びE68R;またはR38A及びF42Kのアミノ酸置換(複数可)を含む。いくつかの実施形態において、IL-2ポリペプチド変異体は、野生型IL-2アミノ酸配列に対して、R38E及びF42Aのアミノ酸置換を含む。いくつかの実施形態において、IL-2ポリペプチド変異体は、野生型IL-2アミノ酸配列に対して、R38D及びF42Aのアミノ酸置換を含む。いくつかの実施形態において、IL-2ポリペプチド変異体は、野生型IL-2アミノ酸配列に対して、F42A及びE62Qのアミノ酸置換を含む。いくつかの実施形態において、IL-2ポリペプチド変異体は、野生型IL-2アミノ酸配列に対して、R38A及びF42Kのアミノ酸置換を含む。いくつかの実施形態において、IL-2ポリペプチド変異体は、野生型IL-2アミノ酸配列に対して、R38D及びF42Aのアミノ酸置換を含む。いくつかの実施形態において、IL-2ポリペプチド変異体は、野生型IL-2アミノ酸配列に対して、R38A及びF42Kのアミノ酸置換を含む。いくつかの実施形態において、IL-2ポリペプチド変異体は、野生型IL-2アミノ酸配列に対して、F42A及びE62Qのアミノ酸置換を含む。いくつかの実施形態において、IL-2ポリペプチド変異体は、野生型IL-2アミノ酸配列に対して、H16E、H16D、D20N、M23A、M23R、M23K、D84L、D84N、D84V、D84H、D84Y、D84R、D84K、S87K、S87A、N88A、N88D、N88G、N88S、N88T、N88R、N88I、V91A、V91T、V91E、I92A、E95S、E95A、E95R、T123A、T123E、T123K、T123Q、Q126A、Q126S、Q126T、Q126E、S127A、S127E、S127K、またはS127Qのアミノ酸置換を含む。いくつかの実施形態において、IL-2ポリペプチド変異体は、野生型成熟IL-2アミノ酸配列に対して、F42A;R38A及びF42A;R38D及びF42A;R38E及びF42A;F42A及びE62Q;F42A及びE68A;F42A及びE68Q;F42A及びE68K;F42A及びE68R;またはR38A及びF42Kのアミノ酸置換(複数可)及び野生型成熟IL-2アミノ酸配列(例えば、配列番号81に示されているもの)に対して、H16E、H16D、D20N、M23A、M23R、M23K、D84L、D84N、D84V、D84H、D84Y、D84R、D84K、S87K、S87A、N88A、N88D、N88G、N88S、N88T、N88R、N88I、V91A、V91T、V91E、I92A、E95S、E95A、E95R、T123A、T123E、T123K、T123Q、Q126A、Q126S、Q126T、Q126E、S127A、S127E、S127K、またはS127Qのアミノ酸置換を含む。例えば、いくつかの実施形態において、IL-2ポリペプチド変異体は、野生型IL-2アミノ酸配列に対して、R38E、F42A、及びH16Eのアミノ酸置換を含む。いくつかの実施形態において、IL-2ポリペプチド変異体は、野生型IL-2アミノ酸配列に対して、R38E、F42A、及びH16Dのアミノ酸置換を含む。いくつかの実施形態において、IL-2ポリペプチド変異体は、野生型IL-2アミノ酸配列に対して、R38E、F42A、及びD84Kのアミノ酸置換を含む。いくつかの実施形態において、IL-2ポリペプチド変異体は、野生型IL-2アミノ酸配列に対して、R38E、F42A、及びD84Rのアミノ酸置換を含む。いくつかの実施形態において、IL-2ポリペプチド変異体は、野生型IL-2アミノ酸配列に対して、R38E、F42A、及びN88Sのアミノ酸置換を含む。いくつかの実施形態において、IL-2ポリペプチド変異体は、野生型IL-2アミノ酸配列に対して、R38E、F42A、及びN88Aのアミノ酸置換を含む。いくつかの実施形態において、IL-2ポリペプチド変異体は、野生型IL-2アミノ酸配列に対して、R38E、F42A、及びN88Gのアミノ酸置換を含む。いくつかの実施形態において、IL-2ポリペプチド変異体は、野生型IL-2アミノ酸配列に対して、R38E、F42A、及びN88Rのアミノ酸置換を含む。いくつかの実施形態において、IL-2ポリペプチド変異体は、野生型IL-2アミノ酸配列に対して、R38E、F42A、及びN88Tのアミノ酸置換を含む。いくつかの実施形態において、IL-2ポリペプチド変異体は、野生型IL-2アミノ酸配列に対して、R38E、F42A、及びN88Dのアミノ酸置換を含む。いくつかの実施形態において、IL-2ポリペプチド変異体は、野生型IL-2アミノ酸配列に対して、R38E、F42A、及びV91Eのアミノ酸置換を含む。いくつかの実施形態において、IL-2ポリペプチド変異体は、野生型IL-2アミノ酸配列に対して、R38E、F42A、及びQ126Sのアミノ酸置換を含む。いくつかの実施形態において、IL-2ポリペプチド変異体は、(配列番号81の配列に対する)以下のアミノ酸置換セットのうちの1つを有する配列番号81のアミノ酸配列を含む:R38E及びF42A;R38D及びF42A;F42A及びE62Q;R38A及びF42K;R38E、F42A、及びN88S;R38E、F42A、及びN88A;R38E、F42A、及びN88G;R38E、F42A、及びN88R;R38E、F42A、及びN88T;R38E、F42A、及びN88D;R38E、F42A、及びV91E;R38E、F42A、及びD84H;R38E、F42A、及びD84K;R38E、F42A、及びD84R;H16D、R38E及びF42A;H16E、R38E及びF42A;R38E、F42A及びQ126S;R38D、F42A及びN88S;R38D、F42A及びN88A;R38D、F42A及びN88G;R38D、F42A及びN88R;R38D、F42A及びN88T;R38D、F42A及びN88D;R38D、F42A及びV91E;R38D、F42A、及びD84H;R38D、F42A、及びD84K;R38D、F42A、及びD84R;H16D、R38D及びF42A;H16E、R38D及びF42A;R38D、F42A及びQ126S;R38A、F42K、及びN88S;R38A、F42K、及びN88A;R38A、F42K、及びN88G;R38A、F42K、及びN88R;R38A、F42K、及びN88T;R38A、F42K、及びN88D;R38A、F42K、及びV91E;R38A、F42K、及びD84H;R38A、F42K、及びD84K;R38A、F42K、及びD84R;H16D、R38A、及びF42K;H16E、R38A、及びF42K;R38A、F42K、及びQ126S;F42A、E62Q、及びN88S;F42A、E62Q、及びN88A;F42A、E62Q、及びN88G;F42A、E62Q、及びN88R;F42A、E62Q、及びN88T;F42A、E62Q、及びN88D;F42A、E62Q、及びV91E;F42A、E62Q、及びD84H;F42A、E62Q、及びD84K;F42A、E62Q、及びD84R;H16D、F42A、及びE62Q;H16E、F42A、及びE62Q;F42A、E62Q、及びQ126S;R38E、F42A、及びC125A;R38D、F42A、及びC125A;F42A、E62Q、及びC125A;R38A、F42K、及びC125A;R38E、F42A、N88S、及びC125A;R38E、F42A、N88A、及びC125A;R38E、F42A、N88G、及びC125A;R38E、F42A、N88R、及びC125A;R38E、F42A、N88T、及びC125A;R38E、F42A、N88D、及びC125A;R38E、F42A、V91E、及びC125A;R38E、F42A、D84H、及びC125A;R38E、F42A、D84K、及びC125A;R38E、F42A、D84R、及びC125A;H16D、R38E、F42A、及びC125A;H16E、R38E、F42A、及びC125A;R38E、F42A、C125A及びQ126S;R38D、F42A、N88S、及びC125A;R38D、F42A、N88A、及びC125A;R38D、F42A、N88G、及びC125A;R38D、F42A、N88R、及びC125A;R38D、F42A、N88T、及びC125A;R38D、F42A、N88D、及びC125A;R38D、F42A、V91E、及びC125A;R38D、F42A、D84H、及びC125A;R38D、F42A、D84K、及びC125A;R38D、F42A、D84R、及びC125A;H16D、R38D、F42A、及びC125A;H16E、R38D、F42A、及びC125A;R38D、F42A、C125A、及びQ126S;R38A、F42K、N88S、及びC125A;R38A、F42K、N88A、及びC125A;R38A、F42K、N88G、及びC125A;R38A、F42K、N88R、及びC125A;R38A、F42K、N88T、及びC125A;R38A、F42K、N88D、及びC125A;R38A、F42K、V91E、及びC125A;R38A、F42K、D84H、及びC125A;R38A、F42K、D84K、及びC125A;R38A、F42K、D84R、及びC125A;H16D、R38A、F42K、及びC125A;H16E、R38A、F42K、及びC125A;R38A、F42K、C125A及びQ126S;F42A、E62Q、N88S、及びC125A;F42A、E62Q、N88A、及びC125A;F42A、E62Q、N88G、及びC125A;F42A、E62Q、N88R、及びC125A;F42A、E62Q、N88T、及びC125A;F42A、E62Q、N88D、及びC125A;F42A、E62Q、V91E、及びC125A;F42A、E62Q、及びD84H、及びC125A;F42A、E62Q、及びD84K、及びC125A;F42A、E62Q、及びD84R、及びC125A;H16D、F42A、及びE62Q、及びC125A;H16E、F42A、E62Q、及びC125A;F42A、E62Q、C125A及びQ126S;F42A、N88S、及びC125A;F42A、N88A、及びC125A;F42A、N88G、及びC125A;F42A、N88R、及びC125A;F42A、N88T、及びC125A;F42A、N88D、及びC125A;F42A、V91E、及びC125A;F42A、D84H、及びC125A;F42A、D84K、及びC125A;F42A、D84R、及びC125A;H16D、F42A、及びC125A;H16E、F42A、及びC125A;ならびにF42A、C125A及びQ126S。いくつかの実施形態において、IL-2ポリペプチドは、配列番号81に対して1、2、3、4、または5つのアミノ酸置換を有する配列番号81の配列を含み、該1、2、3、4、または5つの置換(複数可)は、以下:Q11、H16、L18、L19、D20、Q22、R38、
F42、K43、Y45、E62、P65、E68、V69、L72、D84、S87、N88、V91、I92、T123、Q126、S127、I129、及びS130からなる群から選択される配列番号81の位置での置換(複数可)を含む。いくつかの実施形態において、IL-2ポリペプチドは、(配列番号81の配列に対する)以下:R38E及びF42A;R38D及びF42A;F42A及びE62Q;R38A及びF42K;R38E、F42A、及びN88S;R38E、F42A、及びN88A;R38E、F42A、及びN88G;R38E、F42A、及びN88R;R38E、F42A、及びN88T;R38E、F42A、及びN88D;R38E、F42A、及びV91E;R38E、F42A、及びD84H;R38E、F42A、及びD84K;R38E、F42A、及びD84R;H16D、R38E及びF42A;H16E、R38E及びF42A;R38E、F42A及びQ126S;R38D、F42A及びN88S;R38D、F42A及びN88A;R38D、F42A及びN88G;R38D、F42A及びN88R;R38D、F42A及びN88T;R38D、F42A及びN88D;R38D、F42A及びV91E;R38D、F42A、及びD84H;R38D、F42A、及びD84K;R38D、F42A、及びD84R;H16D、R38D及びF42A;H16E、R38D及びF42A;R38D、F42A及びQ126S;R38A、F42K、及びN88S;R38A、F42K、及びN88A;R38A、F42K、及びN88G;R38A、F42K、及びN88R;R38A、F42K、及びN88T;R38A、F42K、及びN88D;R38A、F42K、及びV91E;R38A、F42K、及びD84H;R38A、F42K、及びD84K;R38A、F42K、及びD84R;H16D、R38A、及びF42K;H16E、R38A、及びF42K;R38A、F42K、及びQ126S;F42A、E62Q、及びN88S;F42A、E62Q、及びN88A;F42A、E62Q、及びN88G;F42A、E62Q、及びN88R;F42A、E62Q、及びN88T;F42A、E62Q、及びN88D;F42A、E62Q、及びV91E;F42A、E62Q、及びD84H;F42A、E62Q、及びD84K;ならびにF42A、E62Q、及びD84Rのアミノ酸置換セットのうちの1つを有する配列番号81の配列を含む。
いくつかの実施形態において、IL-2ポリペプチドは、配列番号81に対して位置C125においてさらなるアミノ酸置換を有する配列番号81の配列を含む。いくつかの実施形態において、IL-2ポリペプチドは、(配列番号81の配列に対する)以下:R38E、F42A、及びC125A;R38D、F42A、及びC125A;F42A、E62Q、及びC125A;R38A、F42K、及びC125A;R38E、F42A、N88S、及びC125A;R38E、F42A、N88A、及びC125A;R38E、F42A、N88G、及びC125A;R38E、F42A、N88R、及びC125A;R38E、F42A、N88D、及びC125A;R38E、F42A、N88T、及びC125A;R38E、F42A、V91E、及びC125A;R38E、F42A、D84H、及びC125A;R38E、F42A、D84K、及びC125A;R38E、F42A、D84R、及びC125A;H16D、R38E、F42A、及びC125A;H16E、R38E、F42A、及びC125A;R38E、F42A、C125A及びQ126S;R38D、F42A、N88S、及びC125A;R38D、F42A、N88A、及びC125A;R38D、F42A、N88G、及びC125A;R38D、F42A、N88R、及びC125A;R38D、F42A、N88T、及びC125A;R38D、F42A、N88D、及びC125A;R38D、F42A、V91E、及びC125A;R38D、F42A、D84H、及びC125A;R38D、F42A、D84K、及びC125A;R38D、F42A、D84R、及びC125A;H16D、R38D、F42A、及びC125A;H16E、R38D、F42A、及びC125A;R38D、F42A、C125A、及びQ126S;R38A、F42K、N88S、及びC125A;R38A、F42K、N88G、及びC125A;R38A、F42K、N88R、及びC125A;R38A、F42K、N88T、及びC125A;R38A、F42K、N88D、及びC125A;R38A、F42K、N88A、及びC125A;R38A、F42K、V91E、及びC125A;R38A、F42K、D84H、及びC125A;R38A、F42K、D84K、及びC125A;R38A、F42K、D84R、及びC125A;H16D、R38A、F42K、及びC125A;H16E、R38A、F42K、及びC125A;R38A、F42K、C125A及びQ126S;F42A、E62Q、N88S、及びC125A;F42A、E62Q、N88A、及びC125A;F42A、E62Q、N88G、及びC125A;F42A、E62Q、N88R、及びC125A;F42A、E62Q、N88T、及びC125A;F42A、E62Q、N88D、及びC125A;F42A、E62Q、V91E、及びC125A;F42A、E62Q、及びD84H、及びC125A;F42A、E62Q、及びD84K、及びC125A;F42A、E62Q、及びD84R、及びC125A;H16D、F42A、及びE62Q、及びC125A;H16E、F42A、E62Q、及びC125A;F42A、E62Q、C125A及びQ126S;F42A、N88S、及びC125A;F42A、N88A、及びC125A;F42A、N88G、及びC125A;F42A、N88R、及びC125A;F42A、N88T、及びC125A;F42A、N88D、及びC125A;F42A、V91E、及びC125A;F42A、D84H、及びC125A;F42A、D84K、及びC125A;F42A、D84R、及びC125A;H16D、F42A、及びC125A;H16E、F42A、及びC125A;ならびにF42A、C125A及びQ126Sのアミノ酸置換セットのうちの1つを有する配列番号81の配列を含む。
いくつかの実施形態において、IL-2ポリペプチド変異体は、アミノ酸配列APTSSSTKKTQLQLEHLLLDLQMILNGINNYKNPKLTEMLTAKFYMPKKATELKHLQCLEEELKPLEEVLNLAQSKNFHLRPRDLISAINVIVLELKGSETTFMCEYADETATIVEFLNRWITFAQSIISTLT(配列番号80)を含む。いくつかの実施形態において、IL-2ポリペプチド変異体は、アミノ酸配列APTSSSTKKTQLQLEHLLLDLQMILNGINNYKNPKLTEMLTAKFYMPKKATELKHLQCLEEELKPLEEVLNLAQSKNFHLRPRDLISNINVIVLELKGSETTFMCEYADETATIVEFLNRWITFCQSIISTLT(配列番号85)を含む。いくつかの実施形態において、IL-2ポリペプチド変異体は、アミノ酸配列APTSSSTKKTQLQLEHLLLDLQMILNGINNYKNPKLTDMLTAKFYMPKKATELKHLQCLEEELKPLEEVLNLAQSKNFHLRPRDLISNINVIVLELKGSETTFMCEYADETATIVEFLNRWITFCQSIISTLT(配列番号86)を含む。いくつかの実施形態において、IL-2ポリペプチド変異体は、アミノ酸配列APTSSSTKKTQLQLEHLLLDLQMILNGINNYKNPKLTRMLTAKFYMPKKATELKHLQCLEEQLKPLEEVLNLAQSKNFHLRPRDLISNINVIVLELKGSETTFMCEYADETATIVEFLNRWITFCQSIISTLT(配列番号87)を含む。いくつかの実施形態において、IL-2ポリペプチド変異体は、アミノ酸配列APTSSSTKKTQLQLEHLLLDLQMILNGINNYKNPKLTAMLTKKFYMPKKATELKHLQCLEEELKPLEEVLNLAQSKNFHLRPRDLISNINVIVLELKGSETTFMCEYADETATIVEFLNRWITFCQSIISTLT(配列番号88)を含む。いくつかの実施形態において、IL-2ポリペプチド変異体は、アミノ酸配列APTSSSTKKTQLQLEHLLLDLQMILNGINNYKNPKLTEMLTAKFYMPKKATELKHLQCLEEELKPLEEVLNLAQSKNFHLRPRDLISSINVIVLELKGSETTFMCEYADETATIVEFLNRWITFCQSIISTLT(配列番号89)を含む。いくつかの実施形態において、IL-2ポリペプチド変異体は、アミノ酸配列APTSSSTKKTQLQLEHLLLDLQMILNGINNYKNPKLTEMLTAKFYMPKKATELKHLQCLEEELKPLEEVLNLAQSKNFHLRPRDLISAINVIVLELKGSETTFMCEYADETATIVEFLNRWITFCQSIISTLT(配列番号90)を含む。いくつかの実施形態において、IL-2ポリペプチド変異体は、アミノ酸配列APTSSSTKKTQLQLEHLLLDLQMILNGINNYKNPKLTEMLTAKFYMPKKATELKHLQCLEEELKPLEEVLNLAQSKNFHLRPRDLISNINEIVLELKGSETTFMCEYADETATIVEFLNRWITFCQSIISTLT(配列番号91)を含む。いくつかの実施形態において、IL-2ポリペプチド変異体は、アミノ酸配列APTSSSTKKTQLQLEHLLLDLQMILNGINNYKNPKLTEMLTAKFYMPKKATELKHLQCLEEELKPLEEVLNLAQSKNFHLRPRHLISNINVIVLELKGSETTFMCEYADETATIVEFLNRWITFCQSIISTLT(配列番号92)を含む。いくつかの実施形態において、IL-2ポリペプチド変異体は、アミノ酸配列APTSSSTKKTQLQLEDLLLDLQMILNGINNYKNPKLTEMLTAKFYMPKKATELKHLQCLEEELKPLEEVLNLAQSKNFHLRPRDLISNINVIVLELKGSETTFMCEYADETATIVEFLNRWITFCQSIISTLT(配列番号93)を含む。いくつかの実施形態において、IL-2ポリペプチド変異体は、アミノ酸配列APTSSSTKKTQLQLEELLLDLQMILNGINNYKNPKLTEMLTAKFYMPKKATELKHLQCLEEELKPLEEVLNLAQSKNFHLRPRDLISNINVIVLELKGSETTFMCEYADETATIVEFLNRWITFCQSIISTLT(配列番号94)を含む。いくつかの実施形態において、IL-2ポリペプチド変異体は、アミノ酸配列APTSSSTKKTQLQLEHLLLDLQMILNGINNYKNPKLTEMLTAKFYMPKKATELKHLQCLEEELKPLEEVLNLAQSKNFHLRPRDLISNINVIVLELKGSETTFMCEYADETATIVEFLNRWITFCSSIISTLT(配列番号95)を含む。いくつかの実施形態において、IL-2ポリペプチド変異体は、アミノ酸配列APTSSSTKKTQLQLEHLLLDLQMILNGINNYKNPKLTDMLTAKFYMPKKATELKHLQCLEEELKPLEEVLNLAQSKNFHLRPRDLISSINVIVLELKGSETTFMCEYADETATIVEFLNRWITFCQSIISTLT(配列番号96)を含む。いくつかの実施形態において、IL-2ポリペプチド変異体は、アミノ酸配列APTSSSTKKTQLQLEHLLLDLQMILNGINNYKNPKLTDMLTAKFYMPKKATELKHLQCLEEELKPLEEVLNLAQSKNFHLRPRDLISAINVIVLELKGSETTFMCEYADETATIVEFLNRWITFCQSIISTLT(配列番号97)を含む。いくつかの実施形態において、IL-2ポリペプチド変異体は、アミノ酸配列APTSSSTKKTQLQLEHLLLDLQMILNGINNYKNPKLTDMLTAKFYMPKKATELKHLQCLEEELKPLEEVLNLAQSKNFHLRPRDLISNINEIVLELKGSETTFMCEYADETATIVEFLNRWITFCQSIISTLT(配列番号98)を含む。いくつかの実施形態において、IL-2ポリペプチド変異体は、アミノ酸配列APTSSSTKKTQLQLEHLLLDLQMILNGINNYKNPKLTDMLTAKFYMPKKATELKHLQCLEEELKPLEEVLNLAQSKNFHLRPRHLISNINVIVLELKGSETTFMCEYADETATIVEFLNRWITFCQSIISTLT(配列番号99)を含む。いくつかの実施形態において、IL-2ポリペプチド変異体は、アミノ酸配列APTSSSTKKTQLQLEDLLLDLQMILNGINNYKNPKLTDMLTAKFYMPKKATELKHLQCLEEELKPLEEVLNLAQSKNFHLRPRDLISNINVIVLELKGSETTFMCEYADETATIVEFLNRWITFCQSIISTLT(配列番号100)を含む。いくつかの実施形態において、IL-2ポリペプチド変異体は、アミノ酸配列APTSSSTKKTQLQLEELLLDLQMILNGINNYKNPKLTDMLTAKFYMPKKATELKHLQCLEEELKPLEEVLNLAQSKNFHLRPRDLISNINVIVLELKGSETTFMCEYADETATIVEFLNRWITFCQSIISTLT(配列番号101)を含む。いくつかの実施形態において、IL-2ポリペプチド変異体は、アミノ酸配列APTSSSTKKTQLQLEHLLLDLQMILNGINNYKNPKLTDMLTAKFYMPKKATELKHLQCLEEELKPLEEVLNLAQSKNFHLRPRDLISNINVIVLELKGSETTFMCEYADETATIVEFLNRWITFCSSIISTLT(配列番号102)を含む。いくつかの実施形態において、IL-2ポリペプチド変異体は、アミノ酸配列APTSSSTKKTQLQLEHLLLDLQMILNGINNYKNPKLTAMLTKKFYMPKKATELKHLQCLEEELKPLEEVLNLAQSKNFHLRPRDLISSINVIVLELKGSETTFMCEYADETATIVEFLNRWITFCQSIISTLT(配列番号103)を含む。いくつかの実施形態において、IL-2ポリペプチド変異体は、アミノ酸配列APTSSSTKKTQLQLEHLLLDLQMILNGINNYKNPKLTAMLTKKFYMPKKATELKHLQCLEEELKPLEEVLNLAQSKNFHLRPRDLISAINVIVLELKGSETTFMCEYADETATIVEFLNRWITFCQSIISTLT(配列番号104)を含む。いくつかの実施形態において、IL-2ポリペプチド変異体は、アミノ酸配列APTSSSTKKTQLQLEHLLLDLQMILNGINNYKNPKLTAMLTKKFYMPKKATELKHLQCLEEELKPLEEVLNLAQSKNFHLRPRDLISNINEIVLELKGSETTFMCEYADETATIVEFLNRWITFCQSIISTLT(配列番号105)を含む。いくつかの実施形態において、IL-2ポリペプチド変異体は、アミノ酸配列APTSSSTKKTQLQLEHLLLDLQMILNGINNYKNPKLTAMLTKKFYMPKKATELKHLQCLEEELKPLEEVLNLAQSKNFHLRPRHLISNINVIVLELKGSETTFMCEYADETATIVEFLNRWITFCQSIISTLT(配列番号106)を含む。いくつかの実施形態において、IL-2ポリペプチド変異体は、アミノ酸配列APTSSSTKKTQLQLEDLLLDLQMILNGINNYKNPKLTAMLTKKFYMPKKATELKHLQCLEEELKPLEEVLNLAQSKNFHLRPRDLISNINVIVLELKGSETTFMCEYADETATIVEFLNRWITFCQSIISTLT(配列番号107)を含む。いくつかの実施形態において、IL-2ポリペプチド変異体は、アミノ酸配列APTSSSTKKTQLQLEELLLDLQMILNGINNYKNPKLTAMLTKKFYMPKKATELKHLQCLEEELKPLEEVLNLAQSKNFHLRPRDLISNINVIVLELKGSETTFMCEYADETATIVEFLNRWITFCQSIISTLT(配列番号108)を含む。いくつかの実施形態において、IL-2ポリペプチド変異体は、アミノ酸配列APTSSSTKKTQLQLEHLLLDLQMILNGINNYKNPKLTAMLTKKFYMPKKATELKHLQCLEEELKPLEEVLNLAQSKNFHLRPRDLISNINVIVLELKGSETTFMCEYADETATIVEFLNRWITFCSSIISTLT(配列番号109)を含む。いくつかの実施形態において、IL-2ポリペプチド変異体は、アミノ酸配列APTSSSTKKTQLQLEHLLLDLQMILNGINNYKNPKLTRMLTAKFYMPKKATELKHLQCLEEQLKPLEEVLNLAQSKNFHLRPRDLISSINVIVLELKGSETTFMCEYADETATIVEFLNRWITFCQSIISTLT(配列番号110)を含む。いくつかの実施形態において、IL-2ポリペプチド変異体は、アミノ酸配列APTSSSTKKTQLQLEHLLLDLQMILNGINNYKNPKLTRMLTAKFYMPKKATELKHLQCLEEQLKPLEEVLNLAQSKNFHLRPRDLISAINVIVLELKGSETTFMCEYADETATIVEFLNRWITFCQSIISTLT(配列番号111)を含む。いくつかの実施形態において、IL-2ポリペプチド変異体は、アミノ酸配列APTSSSTKKTQLQLEHLLLDLQMILNGINNYKN
PKLTRMLTAKFYMPKKATELKHLQCLEEQLKPLEEVLNLAQSKNFHLRPRDLISNINEIVLELKGSETTFMCEYADETATIVEFLNRWITFCQSIISTLT(配列番号112)を含む。いくつかの実施形態において、IL-2ポリペプチド変異体は、アミノ酸配列APTSSSTKKTQLQLEHLLLDLQMILNGINNYKNPKLTRMLTAKFYMPKKATELKHLQCLEEQLKPLEEVLNLAQSKNFHLRPRHLISNINVIVLELKGSETTFMCEYADETATIVEFLNRWITFCQSIISTLT(配列番号113)を含む。いくつかの実施形態において、IL-2ポリペプチド変異体は、アミノ酸配列APTSSSTKKTQLQLEDLLLDLQMILNGINNYKNPKLTRMLTAKFYMPKKATELKHLQCLEEQLKPLEEVLNLAQSKNFHLRPRDLISNINVIVLELKGSETTFMCEYADETATIVEFLNRWITFCQSIISTLT(配列番号114)を含む。いくつかの実施形態において、IL-2ポリペプチド変異体は、アミノ酸配列APTSSSTKKTQLQLEELLLDLQMILNGINNYKNPKLTRMLTAKFYMPKKATELKHLQCLEEQLKPLEEVLNLAQSKNFHLRPRDLISNINVIVLELKGSETTFMCEYADETATIVEFLNRWITFCQSIISTLT(配列番号115)を含む。いくつかの実施形態において、IL-2ポリペプチド変異体は、アミノ酸配列APTSSSTKKTQLQLEHLLLDLQMILNGINNYKNPKLTRMLTAKFYMPKKATELKHLQCLEEQLKPLEEVLNLAQSKNFHLRPRDLISNINVIVLELKGSETTFMCEYADETATIVEFLNRWITFCSSIISTLT(配列番号116)を含む。いくつかの実施形態において、IL-2ポリペプチド変異体は、アミノ酸配列APTSSSTKKTQLQLEHLLLDLQMILNGINNYKNPKLTEMLTAKFYMPKKATELKHLQCLEEELKPLEEVLNLAQSKNFHLRPRDLISNINVIVLELKGSETTFMCEYADETATIVEFLNRWITFAQSIISTLT(配列番号117)を含む。いくつかの実施形態において、IL-2ポリペプチド変異体は、アミノ酸配列APTSSSTKKTQLQLEHLLLDLQMILNGINNYKNPKLTDMLTAKFYMPKKATELKHLQCLEEELKPLEEVLNLAQSKNFHLRPRDLISNINVIVLELKGSETTFMCEYADETATIVEFLNRWITFAQSIISTLT(配列番号118)を含む。いくつかの実施形態において、IL-2ポリペプチド変異体は、アミノ酸配列APTSSSTKKTQLQLEHLLLDLQMILNGINNYKNPKLTRMLTAKFYMPKKATELKHLQCLEEQLKPLEEVLNLAQSKNFHLRPRDLISNINVIVLELKGSETTFMCEYADETATIVEFLNRWITFAQSIISTLT(配列番号119)を含む。いくつかの実施形態において、IL-2ポリペプチド変異体は、アミノ酸配列APTSSSTKKTQLQLEHLLLDLQMILNGINNYKNPKLTAMLTKKFYMPKKATELKHLQCLEEELKPLEEVLNLAQSKNFHLRPRDLISNINVIVLELKGSETTFMCEYADETATIVEFLNRWITFAQSIISTLT(配列番号120)を含む。いくつかの実施形態において、IL-2ポリペプチド変異体は、アミノ酸配列APTSSSTKKTQLQLEHLLLDLQMILNGINNYKNPKLTEMLTAKFYMPKKATELKHLQCLEEELKPLEEVLNLAQSKNFHLRPRDLISSINVIVLELKGSETTFMCEYADETATIVEFLNRWITFAQSIISTLT(配列番号121)を含む。いくつかの実施形態において、IL-2ポリペプチド変異体は、アミノ酸配列APTSSSTKKTQLQLEHLLLDLQMILNGINNYKNPKLTEMLTAKFYMPKKATELKHLQCLEEELKPLEEVLNLAQSKNFHLRPRDLISAINVIVLELKGSETTFMCEYADETATIVEFLNRWITFAQSIISTLT(配列番号122)を含む。いくつかの実施形態において、IL-2ポリペプチド変異体は、アミノ酸配列APTSSSTKKTQLQLEHLLLDLQMILNGINNYKNPKLTEMLTAKFYMPKKATELKHLQCLEEELKPLEEVLNLAQSKNFHLRPRDLISNINEIVLELKGSETTFMCEYADETATIVEFLNRWITFAQSIISTLT(配列番号123)を含む。いくつかの実施形態において、IL-2ポリペプチド変異体は、アミノ酸配列APTSSSTKKTQLQLEHLLLDLQMILNGINNYKNPKLTEMLTAKFYMPKKATELKHLQCLEEELKPLEEVLNLAQSKNFHLRPRHLISNINVIVLELKGSETTFMCEYADETATIVEFLNRWITFAQSIISTLT(配列番号124)を含む。いくつかの実施形態において、IL-2ポリペプチド変異体は、アミノ酸配列APTSSSTKKTQLQLEDLLLDLQMILNGINNYKNPKLTEMLTAKFYMPKKATELKHLQCLEEELKPLEEVLNLAQSKNFHLRPRDLISNINVIVLELKGSETTFMCEYADETATIVEFLNRWITFAQSIISTLT(配列番号125)を含む。いくつかの実施形態において、IL-2ポリペプチド変異体は、アミノ酸配列APTSSSTKKTQLQLEELLLDLQMILNGINNYKNPKLTEMLTAKFYMPKKATELKHLQCLEEELKPLEEVLNLAQSKNFHLRPRDLISNINVIVLELKGSETTFMCEYADETATIVEFLNRWITFAQSIISTLT(配列番号126)を含む。いくつかの実施形態において、IL-2ポリペプチド変異体は、アミノ酸配列APTSSSTKKTQLQLEHLLLDLQMILNGINNYKNPKLTEMLTAKFYMPKKATELKHLQCLEEELKPLEEVLNLAQSKNFHLRPRDLISNINVIVLELKGSETTFMCEYADETATIVEFLNRWITFASSIISTLT(配列番号127)を含む。いくつかの実施形態において、IL-2ポリペプチド変異体は、アミノ酸配列APTSSSTKKTQLQLEHLLLDLQMILNGINNYKNPKLTDMLTAKFYMPKKATELKHLQCLEEELKPLEEVLNLAQSKNFHLRPRDLISSINVIVLELKGSETTFMCEYADETATIVEFLNRWITFAQSIISTLT(配列番号128)を含む。いくつかの実施形態において、IL-2ポリペプチド変異体は、アミノ酸配列APTSSSTKKTQLQLEHLLLDLQMILNGINNYKNPKLTDMLTAKFYMPKKATELKHLQCLEEELKPLEEVLNLAQSKNFHLRPRDLISAINVIVLELKGSETTFMCEYADETATIVEFLNRWITFAQSIISTLT(配列番号129)を含む。いくつかの実施形態において、IL-2ポリペプチド変異体は、アミノ酸配列APTSSSTKKTQLQLEHLLLDLQMILNGINNYKNPKLTDMLTAKFYMPKKATELKHLQCLEEELKPLEEVLNLAQSKNFHLRPRDLISNINEIVLELKGSETTFMCEYADETATIVEFLNRWITFAQSIISTLT(配列番号130)を含む。いくつかの実施形態において、IL-2ポリペプチド変異体は、アミノ酸配列APTSSSTKKTQLQLEHLLLDLQMILNGINNYKNPKLTDMLTAKFYMPKKATELKHLQCLEEELKPLEEVLNLAQSKNFHLRPRHLISNINVIVLELKGSETTFMCEYADETATIVEFLNRWITFAQSIISTLT(配列番号131)を含む。いくつかの実施形態において、IL-2ポリペプチド変異体は、アミノ酸配列APTSSSTKKTQLQLEDLLLDLQMILNGINNYKNPKLTDMLTAKFYMPKKATELKHLQCLEEELKPLEEVLNLAQSKNFHLRPRDLISNINVIVLELKGSETTFMCEYADETATIVEFLNRWITFAQSIISTLT(配列番号132)を含む。いくつかの実施形態において、IL-2ポリペプチド変異体は、アミノ酸配列APTSSSTKKTQLQLEELLLDLQMILNGINNYKNPKLTDMLTAKFYMPKKATELKHLQCLEEELKPLEEVLNLAQSKNFHLRPRDLISNINVIVLELKGSETTFMCEYADETATIVEFLNRWITFAQSIISTLT(配列番号133)を含む。いくつかの実施形態において、IL-2ポリペプチド変異体は、アミノ酸配列APTSSSTKKTQLQLEHLLLDLQMILNGINNYKNPKLTDMLTAKFYMPKKATELKHLQCLEEELKPLEEVLNLAQSKNFHLRPRDLISNINVIVLELKGSETTFMCEYADETATIVEFLNRWITFASSIISTLT(配列番号134)を含む。いくつかの実施形態において、IL-2ポリペプチド変異体は、アミノ酸配列APTSSSTKKTQLQLEHLLLDLQMILNGINNYKNPKLTAMLTKKFYMPKKATELKHLQCLEEELKPLEEVLNLAQSKNFHLRPRDLISSINVIVLELKGSETTFMCEYADETATIVEFLNRWITFAQSIISTLT(配列番号135)を含む。いくつかの実施形態において、IL-2ポリペプチド変異体は、アミノ酸配列APTSSSTKKTQLQLEHLLLDLQMILNGINNYKNPKLTAMLTKKFYMPKKATELKHLQCLEEELKPLEEVLNLAQSKNFHLRPRDLISAINVIVLELKGSETTFMCEYADETATIVEFLNRWITFAQSIISTLT(配列番号136)を含む。いくつかの実施形態において、IL-2ポリペプチド変異体は、アミノ酸配列APTSSSTKKTQLQLEHLLLDLQMILNGINNYKNPKLTAMLTKKFYMPKKATELKHLQCLEEELKPLEEVLNLAQSKNFHLRPRDLISNINEIVLELKGSETTFMCEYADETATIVEFLNRWITFAQSIISTLT(配列番号137)を含む。いくつかの実施形態において、IL-2ポリペプチド変異体は、アミノ酸配列APTSSSTKKTQLQLEHLLLDLQMILNGINNYKNPKLTAMLTKKFYMPKKATELKHLQCLEEELKPLEEVLNLAQSKNFHLRPRHLISNINVIVLELKGSETTFMCEYADETATIVEFLNRWITFAQSIISTLT(配列番号138)を含む。いくつかの実施形態において、IL-2ポリペプチド変異体は、アミノ酸配列APTSSSTKKTQLQLEDLLLDLQMILNGINNYKNPKLTAMLTKKFYMPKKATELKHLQCLEEELKPLEEVLNLAQSKNFHLRPRDLISNINVIVLELKGSETTFMCEYADETATIVEFLNRWITFAQSIISTLT(配列番号139)を含む。いくつかの実施形態において、IL-2ポリペプチド変異体は、アミノ酸配列APTSSSTKKTQLQLEELLLDLQMILNGINNYKNPKLTAMLTKKFYMPKKATELKHLQCLEEELKPLEEVLNLAQSKNFHLRPRDLI
SNINVIVLELKGSETTFMCEYADETATIVEFLNRWITFAQSIISTLT(配列番号140)を含む。いくつかの実施形態において、IL-2ポリペプチド変異体は、アミノ酸配列APTSSSTKKTQLQLEHLLLDLQMILNGINNYKNPKLTAMLTKKFYMPKKATELKHLQCLEEELKPLEEVLNLAQSKNFHLRPRDLISNINVIVLELKGSETTFMCEYADETATIVEFLNRWITFASSIISTLT(配列番号141)を含む。いくつかの実施形態において、IL-2ポリペプチド変異体は、アミノ酸配列APTSSSTKKTQLQLEHLLLDLQMILNGINNYKNPKLTRMLTAKFYMPKKATELKHLQCLEEQLKPLEEVLNLAQSKNFHLRPRDLISSINVIVLELKGSETTFMCEYADETATIVEFLNRWITFAQSIISTLT(配列番号142)を含む。いくつかの実施形態において、IL-2ポリペプチド変異体は、アミノ酸配列APTSSSTKKTQLQLEHLLLDLQMILNGINNYKNPKLTRMLTAKFYMPKKATELKHLQCLEEQLKPLEEVLNLAQSKNFHLRPRDLISAINVIVLELKGSETTFMCEYADETATIVEFLNRWITFAQSIISTLT(配列番号143)を含む。いくつかの実施形態において、IL-2ポリペプチド変異体は、アミノ酸配列APTSSSTKKTQLQLEHLLLDLQMILNGINNYKNPKLTRMLTAKFYMPKKATELKHLQCLEEQLKPLEEVLNLAQSKNFHLRPRDLISNINEIVLELKGSETTFMCEYADETATIVEFLNRWITFAQSIISTLT(配列番号144)を含む。いくつかの実施形態において、IL-2ポリペプチド変異体は、アミノ酸配列APTSSSTKKTQLQLEHLLLDLQMILNGINNYKNPKLTRMLTAKFYMPKKATELKHLQCLEEQLKPLEEVLNLAQSKNFHLRPRHLISNINVIVLELKGSETTFMCEYADETATIVEFLNRWITFAQSIISTLT(配列番号145)を含む。いくつかの実施形態において、IL-2ポリペプチド変異体は、アミノ酸配列APTSSSTKKTQLQLEDLLLDLQMILNGINNYKNPKLTRMLTAKFYMPKKATELKHLQCLEEQLKPLEEVLNLAQSKNFHLRPRDLISNINVIVLELKGSETTFMCEYADETATIVEFLNRWITFAQSIISTLT(配列番号146)を含む。いくつかの実施形態において、IL-2ポリペプチド変異体は、アミノ酸配列APTSSSTKKTQLQLEELLLDLQMILNGINNYKNPKLTRMLTAKFYMPKKATELKHLQCLEEQLKPLEEVLNLAQSKNFHLRPRDLISNINVIVLELKGSETTFMCEYADETATIVEFLNRWITFAQSIISTLT(配列番号147)を含む。いくつかの実施形態において、IL-2ポリペプチド変異体は、アミノ酸配列APTSSSTKKTQLQLEHLLLDLQMILNGINNYKNPKLTRMLTAKFYMPKKATELKHLQCLEEQLKPLEEVLNLAQSKNFHLRPRDLISNINVIVLELKGSETTFMCEYADETATIVEFLNRWITFASSIISTLT(配列番号148)を含む。いくつかの実施形態において、IL-2ポリペプチド変異体は、アミノ酸配列APTSSSTKKTQLQLEHLLLDLQMILNGINNYKNPKLTRMLTAKFYMPKKATELKHLQCLEEELKPLEEVLNLAQSKNFHLRPRDLISSINVIVLELKGSETTFMCEYADETATIVEFLNRWITFAQSIISTLT(配列番号149)を含む。いくつかの実施形態において、IL-2ポリペプチド変異体は、アミノ酸配列APTSSSTKKTQLQLEHLLLDLQMILNGINNYKNPKLTRMLTAKFYMPKKATELKHLQCLEEELKPLEEVLNLAQSKNFHLRPRDLISAINVIVLELKGSETTFMCEYADETATIVEFLNRWITFAQSIISTLT(配列番号150)を含む。いくつかの実施形態において、IL-2ポリペプチド変異体は、アミノ酸配列APTSSSTKKTQLQLEHLLLDLQMILNGINNYKNPKLTRMLTAKFYMPKKATELKHLQCLEEELKPLEEVLNLAQSKNFHLRPRDLISNINEIVLELKGSETTFMCEYADETATIVEFLNRWITFAQSIISTLT(配列番号151)を含む。いくつかの実施形態において、IL-2ポリペプチド変異体は、アミノ酸配列APTSSSTKKTQLQLEHLLLDLQMILNGINNYKNPKLTRMLTAKFYMPKKATELKHLQCLEEELKPLEEVLNLAQSKNFHLRPRHLISNINVIVLELKGSETTFMCEYADETATIVEFLNRWITFAQSIISTLT(配列番号152)を含む。いくつかの実施形態において、IL-2ポリペプチド変異体は、アミノ酸配列APTSSSTKKTQLQLEDLLLDLQMILNGINNYKNPKLTRMLTAKFYMPKKATELKHLQCLEEELKPLEEVLNLAQSKNFHLRPRDLISNINVIVLELKGSETTFMCEYADETATIVEFLNRWITFAQSIISTLT(配列番号153)を含む。いくつかの実施形態において、IL-2ポリペプチド変異体は、アミノ酸配列APTSSSTKKTQLQLEELLLDLQMILNGINNYKNPKLTRMLTAKFYMPKKATELKHLQCLEEELKPLEEVLNLAQSKNFHLRPRDLISNINVIVLELKGSETTFMCEYADETATIVEFLNRWITFAQSIISTLT(配列番号154)を含む。いくつかの実施形態において、IL-2ポリペプチド変異体は、アミノ酸配列APTSSSTKKTQLQLEHLLLDLQMILNGINNYKNPKLTRMLTAKFYMPKKATELKHLQCLEEELKPLEEVLNLAQSKNFHLRPRDLISNINVIVLELKGSETTFMCEYADETATIVEFLNRWITFASSIISTLT(配列番号155)を含む。いくつかの実施形態において、IL-2ポリペプチド変異体は、アミノ酸配列APTSSSTKKTQLQLEHLLLDLQMILNGINNYKNPKLTEMLTAKFYMPKKATELKHLQCLEEELKPLEEVLNLAQSKNFHLRPRDLISGINVIVLELKGSETTFMCEYADETATIVEFLNRWITFCQSIISTLT(配列番号190)を含む。いくつかの実施形態において、IL-2ポリペプチド変異体は、アミノ酸配列APTSSSTKKTQLQLEHLLLDLQMILNGINNYKNPKLTEMLTAKFYMPKKATELKHLQCLEEELKPLEEVLNLAQSKNFHLRPRKLISNINVIVLELKGSETTFMCEYADETATIVEFLNRWITFCQSIISTLT(配列番号191)を含む。いくつかの実施形態において、IL-2ポリペプチド変異体は、アミノ酸配列APTSSSTKKTQLQLEHLLLDLQMILNGINNYKNPKLTEMLTAKFYMPKKATELKHLQCLEEELKPLEEVLNLAQSKNFHLRPRRLISNINVIVLELKGSETTFMCEYADETATIVEFLNRWITFCQSIISTLT(配列番号192)を含む。いくつかの実施形態において、IL-2ポリペプチド変異体は、アミノ酸配列APTSSSTKKTQLQLEHLLLDLQMILNGINNYKNPKLTDMLTAKFYMPKKATELKHLQCLEEELKPLEEVLNLAQSKNFHLRPRDLISGINVIVLELKGSETTFMCEYADETATIVEFLNRWITFCQSIISTLT(配列番号193)を含む。いくつかの実施形態において、IL-2ポリペプチド変異体は、アミノ酸配列APTSSSTKKTQLQLEHLLLDLQMILNGINNYKNPKLTDMLTAKFYMPKKATELKHLQCLEEELKPLEEVLNLAQSKNFHLRPRKLISNINVIVLELKGSETTFMCEYADETATIVEFLNRWITFCQSIISTLT(配列番号194)を含む。いくつかの実施形態において、IL-2ポリペプチド変異体は、アミノ酸配列APTSSSTKKTQLQLEHLLLDLQMILNGINNYKNPKLTDMLTAKFYMPKKATELKHLQCLEEELKPLEEVLNLAQSKNFHLRPRRLISNINVIVLELKGSETTFMCEYADETATIVEFLNRWITFCQSIISTLT(配列番号195)を含む。いくつかの実施形態において、IL-2ポリペプチド変異体は、アミノ酸配列APTSSSTKKTQLQLEHLLLDLQMILNGINNYKNPKLTAMLTKKFYMPKKATELKHLQCLEEELKPLEEVLNLAQSKNFHLRPRDLISGINVIVLELKGSETTFMCEYADETATIVEFLNRWITFCQSIISTLT(配列番号196)を含む。いくつかの実施形態において、IL-2ポリペプチド変異体は、アミノ酸配列APTSSSTKKTQLQLEHLLLDLQMILNGINNYKNPKLTAMLTKKFYMPKKATELKHLQCLEEELKPLEEVLNLAQSKNFHLRPRKLISNINVIVLELKGSETTFMCEYADETATIVEFLNRWITFCQSIISTLT(配列番号197)を含む。いくつかの実施形態において、IL-2ポリペプチド変異体は、アミノ酸配列APTSSSTKKTQLQLEHLLLDLQMILNGINNYKNPKLTAMLTKKFYMPKKATELKHLQCLEEELKPLEEVLNLAQSKNFHLRPRRLISNINVIVLELKGSETTFMCEYADETATIVEFLNRWITFCQSIISTLT(配列番号198)を含む。いくつかの実施形態において、IL-2ポリペプチド変異体は、アミノ酸配列APTSSSTKKTQLQLEHLLLDLQMILNGINNYKNPKLTRMLTAKFYMPKKATELKHLQCLEEQLKPLEEVLNLAQSKNFHLRPRDLISGINVIVLELKGSETTFMCEYADETATIVEFLNRWITFCQSIISTLT(配列番号199)を含む。いくつかの実施形態において、IL-2ポリペプチド変異体は、アミノ酸配列APTSSSTKKTQLQLEHLLLDLQMILNGINNYKNPKLTRMLTAKFYMPKKATELKHLQCLEEQLKPLEEVLNLAQSKNFHLRPRKLISNINVIVLELKGSETTFMCEYADETATIVEFLNRWITFCQSIISTLT(配列番号200)を含む。いくつかの実施形態において、IL-2ポリペプチド変異体は、アミノ酸配列APTSSSTKKTQLQLEHLLLDLQMILNGINNYKNPKLTRMLTAKFYMPKKATELKHLQCLEEQLKPLEEVLNLAQSKNFHLRPRRLISNINVIVLELKGSETTFMCEYADETATIVEFLNRWITFCQSIISTLT(配列番号201)を含む。いくつかの実施形態において、IL-2ポリペプチド変異体は、アミノ酸配列APTSSSTKKTQLQLEHLLLDLQMILNGINNYKNPKLTEMLTAKFYMPKKATELKHLQCLEEELKPLEEVLNLAQSKNFHLRPRDLISGINVIVLELKGSETTFMCEYADETATIVEFLNRWITFAQSIISTLT(配列番号2
02)を含む。いくつかの実施形態において、IL-2ポリペプチド変異体は、アミノ酸配列APTSSSTKKTQLQLEHLLLDLQMILNGINNYKNPKLTEMLTAKFYMPKKATELKHLQCLEEELKPLEEVLNLAQSKNFHLRPRKLISNINVIVLELKGSETTFMCEYADETATIVEFLNRWITFAQSIISTLT(配列番号203)を含む。いくつかの実施形態において、IL-2ポリペプチド変異体は、アミノ酸配列APTSSSTKKTQLQLEHLLLDLQMILNGINNYKNPKLTEMLTAKFYMPKKATELKHLQCLEEELKPLEEVLNLAQSKNFHLRPRRLISNINVIVLELKGSETTFMCEYADETATIVEFLNRWITFAQSIISTLT(配列番号204)を含む。いくつかの実施形態において、IL-2ポリペプチド変異体は、アミノ酸配列APTSSSTKKTQLQLEHLLLDLQMILNGINNYKNPKLTDMLTAKFYMPKKATELKHLQCLEEELKPLEEVLNLAQSKNFHLRPRDLISGINVIVLELKGSETTFMCEYADETATIVEFLNRWITFAQSIISTLT(配列番号205)を含む。いくつかの実施形態において、IL-2ポリペプチド変異体は、アミノ酸配列APTSSSTKKTQLQLEHLLLDLQMILNGINNYKNPKLTDMLTAKFYMPKKATELKHLQCLEEELKPLEEVLNLAQSKNFHLRPRKLISNINVIVLELKGSETTFMCEYADETATIVEFLNRWITFAQSIISTLT(配列番号206)を含む。いくつかの実施形態において、IL-2ポリペプチド変異体は、アミノ酸配列APTSSSTKKTQLQLEHLLLDLQMILNGINNYKNPKLTDMLTAKFYMPKKATELKHLQCLEEELKPLEEVLNLAQSKNFHLRPRRLISNINVIVLELKGSETTFMCEYADETATIVEFLNRWITFAQSIISTLT(配列番号207)を含む。いくつかの実施形態において、IL-2ポリペプチド変異体は、アミノ酸配列APTSSSTKKTQLQLEHLLLDLQMILNGINNYKNPKLTAMLTKKFYMPKKATELKHLQCLEEELKPLEEVLNLAQSKNFHLRPRDLISGINVIVLELKGSETTFMCEYADETATIVEFLNRWITFAQSIISTLT(配列番号208)を含む。いくつかの実施形態において、IL-2ポリペプチド変異体は、アミノ酸配列APTSSSTKKTQLQLEHLLLDLQMILNGINNYKNPKLTAMLTKKFYMPKKATELKHLQCLEEELKPLEEVLNLAQSKNFHLRPRKLISNINVIVLELKGSETTFMCEYADETATIVEFLNRWITFAQSIISTLT(配列番号209)を含む。いくつかの実施形態において、IL-2ポリペプチド変異体は、アミノ酸配列APTSSSTKKTQLQLEHLLLDLQMILNGINNYKNPKLTAMLTKKFYMPKKATELKHLQCLEEELKPLEEVLNLAQSKNFHLRPRRLISNINVIVLELKGSETTFMCEYADETATIVEFLNRWITFAQSIISTLT(配列番号210)を含む。いくつかの実施形態において、IL-2ポリペプチド変異体は、アミノ酸配列APTSSSTKKTQLQLEHLLLDLQMILNGINNYKNPKLTRMLTAKFYMPKKATELKHLQCLEEQLKPLEEVLNLAQSKNFHLRPRDLISGINVIVLELKGSETTFMCEYADETATIVEFLNRWITFAQSIISTLT(配列番号211)を含む。いくつかの実施形態において、IL-2ポリペプチド変異体は、アミノ酸配列APTSSSTKKTQLQLEHLLLDLQMILNGINNYKNPKLTRMLTAKFYMPKKATELKHLQCLEEQLKPLEEVLNLAQSKNFHLRPRKLISNINVIVLELKGSETTFMCEYADETATIVEFLNRWITFAQSIISTLT(配列番号212)を含む。いくつかの実施形態において、IL-2ポリペプチド変異体は、アミノ酸配列APTSSSTKKTQLQLEHLLLDLQMILNGINNYKNPKLTRMLTAKFYMPKKATELKHLQCLEEQLKPLEEVLNLAQSKNFHLRPRRLISNINVIVLELKGSETTFMCEYADETATIVEFLNRWITFAQSIISTLT(配列番号213)を含む。いくつかの実施形態において、IL-2ポリペプチド変異体は、アミノ酸配列APTSSSTKKTQLQLEHLLLDLQMILNGINNYKNPKLTRMLTAKFYMPKKATELKHLQCLEEELKPLEEVLNLAQSKNFHLRPRDLISGINVIVLELKGSETTFMCEYADETATIVEFLNRWITFAQSIISTLT(配列番号214)を含む。いくつかの実施形態において、IL-2ポリペプチド変異体は、アミノ酸配列APTSSSTKKTQLQLEHLLLDLQMILNGINNYKNPKLTRMLTAKFYMPKKATELKHLQCLEEELKPLEEVLNLAQSKNFHLRPRKLISNINVIVLELKGSETTFMCEYADETATIVEFLNRWITFAQSIISTLT(配列番号215)を含む。いくつかの実施形態において、IL-2ポリペプチド変異体は、アミノ酸配列APTSSSTKKTQLQLEHLLLDLQMILNGINNYKNPKLTRMLTAKFYMPKKATELKHLQCLEEELKPLEEVLNLAQSKNFHLRPRRLISNINVIVLELKGSETTFMCEYADETATIVEFLNRWITFAQSIISTLT(配列番号216)を含む。いくつかの実施形態において、IL-2ポリペプチド変異体は、アミノ酸配列APTSSSTKKTQLQLEELLLDLQMILNGINNYKNPKLTEMLTAKFYMPKKATELKHLQCLEEELKPLEEVLNLAQSKNFHLRPRDLISNINVIVLELKGSETTFMCEYADETATIVEFLNRWITFAQSIISTLT(配列番号297)を含む。いくつかの実施形態において、IL-2ポリペプチド変異体は、アミノ酸配列APTSSSTKKTQLQLEHLLLDLQMILNGINNYKNPKLTEMLTAKFYMPKKATELKHLQCLEEELKPLEEVLNLAQSKNFHLRPRDLISDINVIVLELKGSETTFMCEYADETATIVEFLNRWITFAQSIISTLT(配列番号354)を含む。いくつかの実施形態において、IL-2ポリペプチド変異体は、アミノ酸配列APTSSSTKKTQLQLEHLLLDLQMILNGINNYKNPKLTEMLTAKFYMPKKATELKHLQCLEEELKPLEEVLNLAQSKNFHLRPRDLISTINVIVLELKGSETTFMCEYADETATIVEFLNRWITFAQSIISTLT(配列番号355)を含む。いくつかの実施形態において、IL-2ポリペプチド変異体は、アミノ酸配列APTSSSTKKTQLQLEHLLLDLQMILNGINNYKNPKLTEMLTAKFYMPKKATELKHLQCLEEELKPLEEVLNLAQSKNFHLRPRDLISRINVIVLELKGSETTFMCEYADETATIVEFLNRWITFAQSIISTLT(配列番号356)を含む。いくつかの実施形態において、IL-2ポリペプチド変異体は、アミノ酸配列APTSSSTKKTQLQLEHLLLDLQMILNGINNYKNPKLTEMLTAKFYMPKKATELKHLQCLEEELKPLEEVLNLAQSKNFHLRPRDLISRINVIVLELKGSETTFMCEYADETATIVEFLNRWITFCQSIISTLT(配列番号357)を含む。いくつかの実施形態において、IL-2ポリペプチド変異体は、アミノ酸配列APTSSSTKKTQLQLEHLLLDLQMILNGINNYKNPKLTEMLTAKFYMPKKATELKHLQCLEEELKPLEEVLNLAQSKNFHLRPRDLISTINVIVLELKGSETTFMCEYADETATIVEFLNRWITFCQSIISTLT(配列番号358)を含む。いくつかの実施形態において、IL-2ポリペプチド変異体は、アミノ酸配列APTSSSTKKTQLQLEHLLLDLQMILNGINNYKNPKLTEMLTAKFYMPKKATELKHLQCLEEELKPLEEVLNLAQSKNFHLRPRDLISDINVIVLELKGSETTFMCEYADETATIVEFLNRWITFCQSIISTLT(配列番号359)を含む。いくつかの実施形態において、IL-2ポリペプチド変異体は、アミノ酸配列APTSSSTKKTQLQLEHLLLDLQMILNGINNYKNPKLTDMLTAKFYMPKKATELKHLQCLEEELKPLEEVLNLAQSKNFHLRPRDLISRINVIVLELKGSETTFMCEYADETATIVEFLNRWITFCQSIISTLT(配列番号360)を含む。いくつかの実施形態において、IL-2ポリペプチド変異体は、アミノ酸配列APTSSSTKKTQLQLEHLLLDLQMILNGINNYKNPKLTDMLTAKFYMPKKATELKHLQCLEEELKPLEEVLNLAQSKNFHLRPRDLISTINVIVLELKGSETTFMCEYADETATIVEFLNRWITFCQSIISTLT(配列番号361)を含む。いくつかの実施形態において、IL-2ポリペプチド変異体は、アミノ酸配列APTSSSTKKTQLQLEHLLLDLQMILNGINNYKNPKLTDMLTAKFYMPKKATELKHLQCLEEELKPLEEVLNLAQSKNFHLRPRDLISDINVIVLELKGSETTFMCEYADETATIVEFLNRWITFCQSIISTLT(配列番号362)を含む。いくつかの実施形態において、IL-2ポリペプチド変異体は、アミノ酸配列APTSSSTKKTQLQLEHLLLDLQMILNGINNYKNPKLTAMLTKKFYMPKKATELKHLQCLEEELKPLEEVLNLAQSKNFHLRPRDLISRINVIVLELKGSETTFMCEYADETATIVEFLNRWITFCQSIISTLT(配列番号363)を含む。いくつかの実施形態において、IL-2ポリペプチド変異体は、アミノ酸配列APTSSSTKKTQLQLEHLLLDLQMILNGINNYKNPKLTAMLTKKFYMPKKATELKHLQCLEEELKPLEEVLNLAQSKNFHLRPRDLISTINVIVLELKGSETTFMCEYADETATIVEFLNRWITFCQSIISTLT(配列番号364)を含む。いくつかの実施形態において、IL-2ポリペプチド変異体は、アミノ酸配列APTSSSTKKTQLQLEHLLLDLQMILNGINNYKNPKLTAMLTKKFYMPKKATELKHLQCLEEELKPLEEVLNLAQSKNFHLRPRDLISDINVIVLELKGSETTFMCEYADETATIVEFLNRWITFCQSIISTLT(配列番号365)を含む。いくつかの実施形態において、IL-2ポリペプチド変異体は、アミノ酸配列APTSSSTKKTQLQLEHLLLDLQMILNGINNYKNPKLTRMLTAKFYMPKKATELKHLQCLEEQLKPLEEVLNLAQSKNFHLRPRDLISRINVIVLELKGSETTFMCEYADETATIVEFLNRWITFCQSIISTLT(配列番号366)を含む。いくつかの実施形態において、IL-2ポリペプチド変異体は、アミノ酸配列APTSSSTKKTQ
LQLEHLLLDLQMILNGINNYKNPKLTRMLTAKFYMPKKATELKHLQCLEEQLKPLEEVLNLAQSKNFHLRPRDLISTINVIVLELKGSETTFMCEYADETATIVEFLNRWITFCQSIISTLT(配列番号367)を含む。いくつかの実施形態において、IL-2ポリペプチド変異体は、アミノ酸配列APTSSSTKKTQLQLEHLLLDLQMILNGINNYKNPKLTRMLTAKFYMPKKATELKHLQCLEEQLKPLEEVLNLAQSKNFHLRPRDLISDINVIVLELKGSETTFMCEYADETATIVEFLNRWITFCQSIISTLT(配列番号368)を含む。いくつかの実施形態において、IL-2ポリペプチド変異体は、アミノ酸配列APTSSSTKKTQLQLEHLLLDLQMILNGINNYKNPKLTEMLTAKFYMPKKATELKHLQCLEEELKPLEEVLNLAQSKNFHLRPRDLISRINVIVLELKGSETTFMCEYADETATIVEFLNRWITFAQSIISTLT(配列番号369)を含む。いくつかの実施形態において、IL-2ポリペプチド変異体は、アミノ酸配列APTSSSTKKTQLQLEHLLLDLQMILNGINNYKNPKLTEMLTAKFYMPKKATELKHLQCLEEELKPLEEVLNLAQSKNFHLRPRDLISTINVIVLELKGSETTFMCEYADETATIVEFLNRWITFAQSIISTLT(配列番号370)を含む。いくつかの実施形態において、IL-2ポリペプチド変異体は、アミノ酸配列APTSSSTKKTQLQLEHLLLDLQMILNGINNYKNPKLTEMLTAKFYMPKKATELKHLQCLEEELKPLEEVLNLAQSKNFHLRPRDLISDINVIVLELKGSETTFMCEYADETATIVEFLNRWITFAQSIISTLT(配列番号371)を含む。いくつかの実施形態において、IL-2ポリペプチド変異体は、アミノ酸配列APTSSSTKKTQLQLEHLLLDLQMILNGINNYKNPKLTDMLTAKFYMPKKATELKHLQCLEEELKPLEEVLNLAQSKNFHLRPRDLISRINVIVLELKGSETTFMCEYADETATIVEFLNRWITFAQSIISTLT(配列番号372)を含む。いくつかの実施形態において、IL-2ポリペプチド変異体は、アミノ酸配列APTSSSTKKTQLQLEHLLLDLQMILNGINNYKNPKLTDMLTAKFYMPKKATELKHLQCLEEELKPLEEVLNLAQSKNFHLRPRDLISTINVIVLELKGSETTFMCEYADETATIVEFLNRWITFAQSIISTLT(配列番号373)を含む。いくつかの実施形態において、IL-2ポリペプチド変異体は、アミノ酸配列APTSSSTKKTQLQLEHLLLDLQMILNGINNYKNPKLTDMLTAKFYMPKKATELKHLQCLEEELKPLEEVLNLAQSKNFHLRPRDLISDINVIVLELKGSETTFMCEYADETATIVEFLNRWITFAQSIISTLT(配列番号374)を含む。いくつかの実施形態において、IL-2ポリペプチド変異体は、アミノ酸配列APTSSSTKKTQLQLEHLLLDLQMILNGINNYKNPKLTAMLTKKFYMPKKATELKHLQCLEEELKPLEEVLNLAQSKNFHLRPRDLISRINVIVLELKGSETTFMCEYADETATIVEFLNRWITFAQSIISTLT(配列番号375)を含む。いくつかの実施形態において、IL-2ポリペプチド変異体は、アミノ酸配列APTSSSTKKTQLQLEHLLLDLQMILNGINNYKNPKLTAMLTKKFYMPKKATELKHLQCLEEELKPLEEVLNLAQSKNFHLRPRDLISTINVIVLELKGSETTFMCEYADETATIVEFLNRWITFAQSIISTLT(配列番号376)を含む。いくつかの実施形態において、IL-2ポリペプチド変異体は、アミノ酸配列APTSSSTKKTQLQLEHLLLDLQMILNGINNYKNPKLTAMLTKKFYMPKKATELKHLQCLEEELKPLEEVLNLAQSKNFHLRPRDLISDINVIVLELKGSETTFMCEYADETATIVEFLNRWITFAQSIISTLT(配列番号377)を含む。いくつかの実施形態において、IL-2ポリペプチド変異体は、アミノ酸配列APTSSSTKKTQLQLEHLLLDLQMILNGINNYKNPKLTRMLTAKFYMPKKATELKHLQCLEEQLKPLEEVLNLAQSKNFHLRPRDLISRINVIVLELKGSETTFMCEYADETATIVEFLNRWITFAQSIISTLT(配列番号378)を含む。いくつかの実施形態において、IL-2ポリペプチド変異体は、アミノ酸配列APTSSSTKKTQLQLEHLLLDLQMILNGINNYKNPKLTRMLTAKFYMPKKATELKHLQCLEEQLKPLEEVLNLAQSKNFHLRPRDLISTINVIVLELKGSETTFMCEYADETATIVEFLNRWITFAQSIISTLT(配列番号379)を含む。いくつかの実施形態において、IL-2ポリペプチド変異体は、アミノ酸配列APTSSSTKKTQLQLEHLLLDLQMILNGINNYKNPKLTRMLTAKFYMPKKATELKHLQCLEEQLKPLEEVLNLAQSKNFHLRPRDLISDINVIVLELKGSETTFMCEYADETATIVEFLNRWITFAQSIISTLT(配列番号380)を含む。いくつかの実施形態において、IL-2ポリペプチド変異体は、アミノ酸配列APTSSSTKKTQLQLEHLLLDLQMILNGINNYKNPKLTRMLTAKFYMPKKATELKHLQCLEEELKPLEEVLNLAQSKNFHLRPRDLISRINVIVLELKGSETTFMCEYADETATIVEFLNRWITFAQSIISTLT(配列番号381)を含む。いくつかの実施形態において、IL-2ポリペプチド変異体は、アミノ酸配列APTSSSTKKTQLQLEHLLLDLQMILNGINNYKNPKLTRMLTAKFYMPKKATELKHLQCLEEELKPLEEVLNLAQSKNFHLRPRDLISTINVIVLELKGSETTFMCEYADETATIVEFLNRWITFAQSIISTLT(配列番号382)を含む。いくつかの実施形態において、IL-2ポリペプチド変異体は、アミノ酸配列APTSSSTKKTQLQLEHLLLDLQMILNGINNYKNPKLTRMLTAKFYMPKKATELKHLQCLEEELKPLEEVLNLAQSKNFHLRPRDLISDINVIVLELKGSETTFMCEYADETATIVEFLNRWITFAQSIISTLT(配列番号383)を含む。いくつかの実施形態において、IL-2ポリペプチド変異体は、表7に列挙されているIL-2ポリペプチドのアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態において、本開示のIL-2ポリペプチド変異体はまた、改善された生物物理学的特性等の追加の利点を提供する、変異及び欠失を含むがこれらに限定されない他の改変を含む。改善された生物物理学的特性としては、改善された熱安定性、凝集性、酸可逆性、粘性、及び哺乳動物または細菌もしくは酵母細胞における産生が挙げられるが、これらに限定されない。例えば、残基C125は、セリン、アラニン、スレオニンまたはバリン等の中性アミノ酸で置き換えてもよく、N末端A1残基を欠失させることもできる(これらの両方は、米国特許第4,518,584号に記載されている)。IL-2ポリペプチド変異体はまた、米国特許第5,206,344号に記載されているように、M104A等の残基M104の変異も含むことがある。したがって、特定の実施形態では、本開示のIL-2ポリペプチド変異体は、アミノ酸置換C125Aを含む。他の実施形態では、1つ、2つ、または3つのN末端残基が欠失している。
融合タンパク質リンカー
いくつかの実施形態において、本開示の融合タンパク質は、リンカーを含む。いくつかの実施形態において、リンカーは化学的リンカーである(例えば、Protein Engineering,9(3),299-305,1996において開示されているものを参照されたい)。合成の化学的リンカーは、ペプチドを架橋するために日常的に使用される架橋剤、例えば、N-ヒドロキシスクシンイミド(NHS)、スベリン酸ジスクシンイミジル(DSS)、スベリン酸ビス(スクシンイミジル)(BS3)、ジチオビス(プロピオン酸スクシンイミジル)(DSP)、ジチオビス(プロピオン酸スクシンイミジル)(DTSSP)、エチレングリコールビス(コハク酸スクシンイミジル)(EGS)、エチレングリコールビス(コハク酸スルホスクシンイミジル)(スルホ-EGS)、酒石酸ジスクシンイミジル(DST)、酒石酸ジスルホスクシンイミジル(スルホ-DST)、ビス[2-(スクシンイミドオキシカルボニルオキシ)エチル]スルホン(BSOCOES)、及びビス[2-(スクシンイミドオキシカルボニルオキシ)エチル]スルホン(スルホ-BSOCOES)を含む。
いくつかの実施形態において、リンカーは、アミノ酸ベースまたはペプチドベースのリンカーである。いくつかの実施形態において、ポリペプチドリンカーは、少なくとも5アミノ酸の長さを有する、好ましくは、5~100、より好ましくは10~50アミノ酸の長さを有する、ペプチドである。一実施形態では、当該ペプチドリンカーは、G、S、GS、SG、SGG、GGS、及びGSG(G=グリシン及びS=セリン)である。いくつかの実施形態において、リンカーは、配列(GGGS)xGn(配列番号74)、(GGGGS)xGn(配列番号75)、(GGGGGS)xGn(配列番号76)、S(GGGS)xGn(配列番号386)、S(GGGGS)xGn(配列番号387)、またはS(GGGGGS)xGn(配列番号388)を含み、ここで、x=1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、または12、及びn=0、1、2または3である。いくつかの実施形態において、リンカーは、配列GGGGSGGGGSGGGGS(配列番号79)またはSGGGGSGGGGSGGGGS(配列番号389)を含む。
融合タンパク質特性
いくつかの実施形態において、融合タンパク質は、ヒトCD8aaホモ二量体を発現している細胞の活性化よりも少なくとも2倍、少なくとも5倍、または少なくとも10倍高い効力を持って、ヒトCD8abヘテロ二量体を発現している細胞の活性化を誘導する。いくつかの実施形態において、融合タンパク質は、NK細胞の活性化よりも少なくとも2倍、少なくとも5倍、または少なくとも10倍高い効力を持って、CD8+T細胞の活性化を誘導する。いくつかの実施形態において、活性化の効力は、細胞増殖によって評価されるEC50により測られる。例示的なアッセイについては、さらに後述する。
IL-2ポリペプチド変異体を含む標的化IL-2融合タンパク質の抗原発現細胞に対する優先的な活性は、IL-2RβγまたはIL-2Rαβγも発現する抗原発現細胞及び抗原非発現細胞を含有するアッセイで実証される。かかるアッセイの1つは、IL-2ポリペプチドへの曝露による、ヒト末梢血細胞及び/または腫瘍浸潤免疫細胞等のヒト免疫細胞におけるSTAT5のリン酸化(pSTAT5)及び/または増殖マーカーKi-67の発現を測定するin vitroアッセイである。アッセイの1つの形式において、標的化IL-2融合タンパク質の活性は、抗原発現細胞及び非発現細胞で測定されて、抗原発現細胞における選択性が実証される。アッセイの別の形式において、IL-2ポリペプチド変異体を含む標的化IL-2融合タンパク質の抗原発現細胞に対する活性は、同一のIL-2ポリペプチド変異体及びいかなる抗原も認識しない対照抗体を含む非標的化IL-2融合タンパク質の抗原発現細胞に対する活性と比較されて、抗原結合分子に融合した場合のIL-2ポリペプチド変異体のシグナル伝達における救援の大きさが実証される。
いくつかの実施形態において、CD8b抗原結合分子を含有する本開示の融合タンパク質は、CD8b-IL-2Rβ+細胞よりもCD8b+IL-2Rβ+細胞を少なくとも10倍、少なくとも50倍、または少なくとも100倍活性化する。いくつかの実施形態において、当該融合タンパク質は、当該IL-2ポリペプチド変異体及び当該細胞上に発現されるいかなる抗原にも結合しない対照抗体を含む融合分子と比較して、50倍、100倍、または200倍より多くCD8b+IL-2Rβ+細胞を活性化する。IL-2融合タンパク質による当該細胞の活性化は、当該IL-2融合タンパク質での処理後の当該細胞におけるpSTAT5または細胞増殖マーカーKi67の発現を測定することにより決定される。
いくつかの実施形態において、本開示の融合タンパク質は、以下のうちの1つ以上を示す:ヒトCD8に結合し、CD8とMHCクラスIとの相互作用を遮断しない;及び例えば、NK細胞の活性化と比較して、少なくとも10倍、25倍、50倍、100倍、250倍、500倍、または1000倍大きな効力で、CD8+T細胞を活性化する。いくつかの実施形態において、本開示の抗CD8抗体または融合タンパク質がCD8とMHCクラスIとの相互作用を遮断するかどうかは、例えば、抗CD8抗体または融合タンパク質の存在下または非存在下でCD8+T細胞の活性化状態を定量すること(例えば、抗原刺激時)によって分析することができる。いくつかの実施形態において、CD8+T細胞及び/またはNK細胞の活性化は、例えば、増殖(例えば、Ki67)、IL-2Rβ/γ下流シグナル伝達、及び/またはSTAT5下流シグナル伝達のうちの1つ以上のマーカー(例えば、1つ以上のマーカーを表している処理された細胞の割合)を定量することによって測定することができる。
例示的融合タンパク質
いくつかの実施形態において、本開示の融合タンパク質は、表5の単一の融合タンパク質について示されている1種、2種、または3種全てのポリペプチドを含む。いくつかの実施形態において、本開示の融合タンパク質は、表5の単一の融合タンパク質について、2つの軽鎖、IL-2融合物を含む重鎖、及びIL-2融合物を含まない重鎖を含む。当技術分野で公知のように、いくつかの抗体重鎖種のC末端リジンは、分子のいくつかの画分において切断され得る。したがって、いくつかの実施形態において、本開示の融合タンパク質は、表5の単一の融合タンパク質について、2つの軽鎖、IL-2融合物を含む重鎖、及びIL-2融合物を含まない重鎖を含み、該IL-2融合物を含まない重鎖は、それぞれの融合タンパク質について、配列番号158、161、164、167、170、173、176、189、300、304、308、312、326、320、324、328、332、336、340、344、348、または352の配列を含む。いくつかの実施形態において、本開示の融合タンパク質は、表5の単一の融合タンパク質について、2つの軽鎖、IL-2融合物を含む重鎖、及びIL-2融合物を含まない重鎖を含み、該IL-2融合物を含まない重鎖は、それぞれの融合タンパク質について、配列番号217~224、301、305、309、313、317、321、325、329、333、337、341、345、349、または353の配列を含む。いくつかの実施形態において、本開示は、複数の本開示の融合タンパク質(例えば、混合物で)を提供し、複数のうちの各融合タンパク質は、表5の単一の融合タンパク質について、2つの軽鎖、IL-2融合物を含む重鎖、及びIL-2融合物を含まない重鎖を含み、該IL-2融合物を含まない重鎖は、それぞれの融合タンパク質について、配列番号158、161、164、167、170、173、176、189、300、304、308、312、326、320、324、328、332、336、340、344、348、または352の配列、またはそれぞれの融合タンパク質について、配列番号217~224、301、305、309、313、317、321、325、329、333、337、341、345、349、または353の配列を含み、あるいは該複数物は、切断型を示している種(例えば、それぞれの融合タンパク質について、配列番号158、161、164、167、170、173、176、189、300、304、308、312、326、320、324、328、332、336、340、344、348、または352の配列を含む)と非切断型の種(例えば、それぞれの融合タンパク質について、配列番号217~224、301、305、309、313、317、321、325、329、333、337、341、345、349、または353の配列を含む)との混合物を含む。
例えば、いくつかの実施形態において、本開示の融合タンパク質は、配列番号156のアミノ酸配列を含む1つまたは2つの軽鎖、配列番号157のアミノ酸配列を含む重鎖、及び配列番号158のアミノ酸配列を含む重鎖を含む。いくつかの実施形態において、本開示の融合タンパク質は、配列番号159のアミノ酸配列を含む1つまたは2つの軽鎖、配列番号160のアミノ酸配列を含む重鎖、及び配列番号161のアミノ酸配列を含む重鎖を含む。いくつかの実施形態において、本開示の融合タンパク質は、配列番号162のアミノ酸配列を含む1つまたは2つの軽鎖、配列番号163のアミノ酸配列を含む重鎖、及び配列番号164のアミノ酸配列を含む重鎖を含む。いくつかの実施形態において、本開示の融合タンパク質は、配列番号165のアミノ酸配列を含む1つまたは2つの軽鎖、配列番号166のアミノ酸配列を含む重鎖、及び配列番号167のアミノ酸配列を含む重鎖を含む。いくつかの実施形態において、本開示の融合タンパク質は、配列番号168のアミノ酸配列を含む1つまたは2つの軽鎖、配列番号169のアミノ酸配列を含む重鎖、及び配列番号170のアミノ酸配列を含む重鎖を含む。いくつかの実施形態において、本開示の融合タンパク質は、配列番号171のアミノ酸配列を含む1つまたは2つの軽鎖、配列番号172のアミノ酸配列を含む重鎖、及び配列番号173のアミノ酸配列を含む重鎖を含む。いくつかの実施形態において、本開示の融合タンパク質は、配列番号174のアミノ酸配列を含む1つまたは2つの軽鎖、配列番号175のアミノ酸配列を含む重鎖、及び配列番号176のアミノ酸配列を含む重鎖を含む。いくつかの実施形態において、本開示の融合タンパク質は、配列番号187のアミノ酸配列を含む1つまたは2つの軽鎖、配列番号188のアミノ酸配列を含む重鎖、及び配列番号189のアミノ酸配列を含む重鎖を含む。いくつかの実施形態において、本開示の融合タンパク質は、配列番号298のアミノ酸配列を含む1つまたは2つの軽鎖、配列番号299のアミノ酸配列を含む重鎖、及び配列番号300のアミノ酸配列を含む重鎖を含む。いくつかの実施形態において、本開示の融合タンパク質は、配列番号302のアミノ酸配列を含む1つまたは2つの軽鎖、配列番号303のアミノ酸配列を含む重鎖、及び配列番号304のアミノ酸配列を含む重鎖を含む。いくつかの実施形態において、本開示の融合タンパク質は、配列番号306のアミノ酸配列を含む1つまたは2つの軽鎖、配列番号307のアミノ酸配列を含む重鎖、及び配列番号308のアミノ酸配列を含む重鎖を含む。いくつかの実施形態において、本開示の融合タンパク質は、配列番号310のアミノ酸配列を含む1つまたは2つの軽鎖、配列番号311のアミノ酸配列を含む重鎖、及び配列番号312のアミノ酸配列を含む重鎖を含む。いくつかの実施形態において、本開示の融合タンパク質は、配列番号314のアミノ酸配列を含む1つまたは2つの軽鎖、配列番号315のアミノ酸配列を含む重鎖、及び配列番号316のアミノ酸配列を含む重鎖を含む。いくつかの実施形態において、本開示の融合タンパク質は、配列番号318のアミノ酸配列を含む1つまたは2つの軽鎖、配列番号319のアミノ酸配列を含む重鎖、及び配列番号320のアミノ酸配列を含む重鎖を含む。いくつかの実施形態において、本開示の融合タンパク質は、配列番号322のアミノ酸配列を含む1つまたは2つの軽鎖、配列番号323のアミノ酸配列を含む重鎖、及び配列番号324のアミノ酸配列を含む重鎖を含む。いくつかの実施形態において、本開示の融合タンパク質は、配列番号326のアミノ酸配列を含む1つまたは2つの軽鎖、配列番号327のアミノ酸配列を含む重鎖、及び配列番号328のアミノ酸配列を含む重鎖を含む。いくつかの実施形態において、本開示の融合タンパク質は、配列番号334のアミノ酸配列を含む1つまたは2つの軽鎖、配列番号335のアミノ酸配列を含む重鎖、及び配列番号336のアミノ酸配列を含む重鎖を含む。いくつかの実施形態において、本開示の融合タンパク質は、配列番号338のアミノ酸配列を含む1つまたは2つの軽鎖、配列番号339のアミノ酸配列を含む重鎖、及び配列番号340のアミノ酸配列を含む重鎖を含む。いくつかの実施形態において、本開示の融合タンパク質は、配列番号342のアミノ酸配列を含む1つまたは2つの軽鎖、配列番号343のアミノ酸配列を含む重鎖、及び配列番号344のアミノ酸配列を含む重鎖を含む。いくつかの実施形態において、本開示の融合タンパク質は、配列番号346のアミノ酸配列を含む1つまたは2つの軽鎖、配列番号347のアミノ酸配列を含む重鎖、及び配列番号348のアミノ酸配列を含む重鎖を含む。いくつかの実施形態において、本開示の融合タンパク質は、配列番号350のアミノ酸配列を含む1つまたは2つの軽鎖、配列番号351のアミノ酸配列を含む重鎖、及び配列番号352のアミノ酸配列を含む重鎖を含む。
いくつかの実施形態において、本開示の融合タンパク質は、配列番号156のアミノ酸配列を含む1つまたは2つの軽鎖、配列番号157のアミノ酸配列を含む重鎖、及び配列番号217のアミノ酸配列を含む重鎖を含む。いくつかの実施形態において、本開示の融合タンパク質は、配列番号159のアミノ酸配列を含む1つまたは2つの軽鎖、配列番号160のアミノ酸配列を含む重鎖、及び配列番号218のアミノ酸配列を含む重鎖を含む。いくつかの実施形態において、本開示の融合タンパク質は、配列番号162のアミノ酸配列を含む1つまたは2つの軽鎖、配列番号163のアミノ酸配列を含む重鎖、及び配列番号219のアミノ酸配列を含む重鎖を含む。いくつかの実施形態において、本開示の融合タンパク質は、配列番号165のアミノ酸配列を含む1つまたは2つの軽鎖、配列番号166のアミノ酸配列を含む重鎖、及び配列番号220のアミノ酸配列を含む重鎖を含む。いくつかの実施形態において、本開示の融合タンパク質は、配列番号168のアミノ酸配列を含む1つまたは2つの軽鎖、配列番号169のアミノ酸配列を含む重鎖、及び配列番号221のアミノ酸配列を含む重鎖を含む。いくつかの実施形態において、本開示の融合タンパク質は、配列番号171のアミノ酸配列を含む1つまたは2つの軽鎖、配列番号172のアミノ酸配列を含む重鎖、及び配列番号222のアミノ酸配列を含む重鎖を含む。いくつかの実施形態において、本開示の融合タンパク質は、配列番号174のアミノ酸配列を含む1つまたは2つの軽鎖、配列番号175のアミノ酸配列を含む重鎖、及び配列番号223のアミノ酸配列を含む重鎖を含む。いくつかの実施形態において、本開示の融合タンパク質は、配列番号187のアミノ酸配列を含む1つまたは2つの軽鎖、配列番号188のアミノ酸配列を含む重鎖、及び配列番号224のアミノ酸配列を含む重鎖を含む。いくつかの実施形態において、本開示の融合タンパク質は、配列番号298のアミノ酸配列を含む1つまたは2つの軽鎖、配列番号299のアミノ酸配列を含む重鎖、及び配列番号301のアミノ酸配列を含む重鎖を含む。いくつかの実施形態において、本開示の融合タンパク質は、配列番号302のアミノ酸配列を含む1つまたは2つの軽鎖、配列番号303のアミノ酸配列を含む重鎖、及び配列番号305のアミノ酸配列を含む重鎖を含む。いくつかの実施形態において、本開示の融合タンパク質は、配列番号306のアミノ酸配列を含む1つまたは2つの軽鎖、配列番号307のアミノ酸配列を含む重鎖、及び配列番号309のアミノ酸配列を含む重鎖を含む。いくつかの実施形態において、本開示の融合タンパク質は、配列番号310のアミノ酸配列を含む1つまたは2つの軽鎖、配列番号311のアミノ酸配列を含む重鎖、及び配列番号313のアミノ酸配列を含む重鎖を含む。いくつかの実施形態において、本開示の融合タンパク質は、配列番号314のアミノ酸配列を含む1つまたは2つの軽鎖、配列番号315のアミノ酸配列を含む重鎖、及び配列番号317のアミノ酸配列を含む重鎖を含む。いくつかの実施形態において、本開示の融合タンパク質は、配列番号318のアミノ酸配列を含む1つまたは2つの軽鎖、配列番号319のアミノ酸配列を含む重鎖、及び配列番号321のアミノ酸配列を含む重鎖を含む。いくつかの実施形態において、本開示の融合タンパク質は、配列番号322のアミノ酸配列を含む1つまたは2つの軽鎖、配列番号323のアミノ酸配列を含む重鎖、及び配列番号325のアミノ酸配列を含む重鎖を含む。いくつかの実施形態において、本開示の融合タンパク質は、配列番号326のアミノ酸配列を含む1つまたは2つの軽鎖、配列番号327のアミノ酸配列を含む重鎖、及び配列番号329のアミノ酸配列を含む重鎖を含む。いくつかの実施形態において、本開示の融合タンパク質は、配列番号330のアミノ酸配列を含む1つまたは2つの軽鎖、配列番号331のアミノ酸配列を含む重鎖、及び配列番号333のアミノ酸配列を含む重鎖を含む。いくつかの実施形態において、本開示の融合タンパク質は、配列番号334のアミノ酸配列を含む1つまたは2つの軽鎖、配列番号335のアミノ酸配列を含む重鎖、及び配列番号337のアミノ酸配列を含む重鎖を含む。いくつかの実施形態において、本開示の融合タンパク質は、配列番号338のアミノ酸配列を含む1つまたは2つの軽鎖、配列番号339のアミノ酸配列を含む重鎖、及び配列番号341のアミノ酸配列を含む重鎖を含む。いくつかの実施形態において、本開示の融合タンパク質は、配列番号342のアミノ酸配列を含む1つまたは2つの軽鎖、配列番号343のアミノ酸配列を含む重鎖、及び配列番号345のアミノ酸配列を含む重鎖を含む。いくつかの実施形態において、本開示の融合タンパク質は、配列番号346のアミノ酸配列を含む1つまたは2つの軽鎖、配列番号347のアミノ酸配列を含む重鎖、及び配列番号349のアミノ酸配列を含む重鎖を含む。いくつかの実施形態において、本開示の融合タンパク質は、配列番号350のアミノ酸配列を含む1つまたは2つの軽鎖、配列番号351のアミノ酸配列を含む重鎖、及び配列番号353のアミノ酸配列を含む重鎖を含む。
いくつかの実施形態において、本開示は、融合タンパク質種の混合物を提供し、各種は、配列番号156のアミノ酸配列を含む1つまたは2つの軽鎖、配列番号157のアミノ酸配列を含む重鎖、及び配列番号158または217のアミノ酸配列を含む重鎖を含む。いくつかの実施形態において、本開示は、融合タンパク質種の混合物を提供し、各種は、配列番号159のアミノ酸配列を含む1つまたは2つの軽鎖、配列番号160のアミノ酸配列を含む重鎖、及び配列番号161または218のアミノ酸配列を含む重鎖を含む。いくつかの実施形態において、本開示は、融合タンパク質種の混合物を提供し、各種は、配列番号162のアミノ酸配列を含む1つまたは2つの軽鎖、配列番号163のアミノ酸配列を含む重鎖、及び配列番号164または219のアミノ酸配列を含む重鎖を含む。いくつかの実施形態において、本開示は、融合タンパク質種の混合物を提供し、各種は、配列番号165のアミノ酸配列を含む1つまたは2つの軽鎖、配列番号166のアミノ酸配列を含む重鎖、及び配列番号167または220のアミノ酸配列を含む重鎖を含む。いくつかの実施形態において、本開示は、融合タンパク質種の混合物を提供し、各種は、配列番号168のアミノ酸配列を含む1つまたは2つの軽鎖、配列番号169のアミノ酸配列を含む重鎖、及び配列番号170または221のアミノ酸配列を含む重鎖を含む。いくつかの実施形態において、本開示は、融合タンパク質種の混合物を提供し、各種は、配列番号171のアミノ酸配列を含む1つまたは2つの軽鎖、配列番号172のアミノ酸配列を含む重鎖、及び配列番号173または222のアミノ酸配列を含む重鎖を含む。いくつかの実施形態において、本開示は、融合タンパク質種の混合物を提供し、各種は、配列番号174のアミノ酸配列を含む1つまたは2つの軽鎖、配列番号175のアミノ酸配列を含む重鎖、及び配列番号176または223のアミノ酸配列を含む重鎖を含む。いくつかの実施形態において、本開示は、融合タンパク質種の混合物を提供し、各種は、配列番号187のアミノ酸配列を含む1つまたは2つの軽鎖、配列番号188のアミノ酸配列を含む重鎖、及び配列番号189または224のアミノ酸配列を含む重鎖を含む。いくつかの実施形態において、本開示は、融合タンパク質種の混合物を提供し、各種は、配列番号298のアミノ酸配列を含む1つまたは2つの軽鎖、配列番号299のアミノ酸配列を含む重鎖、及び配列番号300または301のアミノ酸配列を含む重鎖を含む。いくつかの実施形態において、本開示は、融合タンパク質種の混合物を提供し、各種は、配列番号302のアミノ酸配列を含む1つまたは2つの軽鎖、配列番号303のアミノ酸配列を含む重鎖、及び配列番号304または305のアミノ酸配列を含む重鎖を含む。いくつかの実施形態において、本開示は、融合タンパク質種の混合物を提供し、各種は、配列番号306のアミノ酸配列を含む1つまたは2つの軽鎖、配列番号307のアミノ酸配列を含む重鎖、及び配列番号308または309のアミノ酸配列を含む重鎖を含む。いくつかの実施形態において、本開示は、融合タンパク質種の混合物を提供し、各種は、配列番号310のアミノ酸配列を含む1つまたは2つの軽鎖、配列番号311のアミノ酸配列を含む重鎖、及び配列番号312または313のアミノ酸配列を含む重鎖を含む。いくつかの実施形態において、本開示は、融合タンパク質種の混合物を提供し、各種は、配列番号314のアミノ酸配列を含む1つまたは2つの軽鎖、配列番号315のアミノ酸配列を含む重鎖、及び配列番号316または317のアミノ酸配列を含む重鎖を含む。いくつかの実施形態において、本開示は、融合タンパク質種の混合物を提供し、各種は、配列番号318のアミノ酸配列を含む1つまたは2つの軽鎖、配列番号319のアミノ酸配列を含む重鎖、及び配列番号320または321のアミノ酸配列を含む重鎖を含む。いくつかの実施形態において、本開示は、融合タンパク質種の混合物を提供し、各種は、配列番号322のアミノ酸配列を含む1つまたは2つの軽鎖、配列番号323のアミノ酸配列を含む重鎖、及び配列番号324または325のアミノ酸配列を含む重鎖を含む。いくつかの実施形態において、本開示は、融合タンパク質種の混合物を提供し、各種は、配列番号326のアミノ酸配列を含む1つまたは2つの軽鎖、配列番号327のアミノ酸配列を含む重鎖、及び配列番号328または329のアミノ酸配列を含む重鎖を含む。いくつかの実施形態において、本開示は、融合タンパク質種の混合物を提供し、各種は、配列番号330のアミノ酸配列を含む1つまたは2つの軽鎖、配列番号331のアミノ酸配列を含む重鎖、及び配列番号332または333のアミノ酸配列を含む重鎖を含む。いくつかの実施形態において、本開示は、融合タンパク質種の混合物を提供し、各種は、配列番号334のアミノ酸配列を含む1つまたは2つの軽鎖、配列番号335のアミノ酸配列を含む重鎖、及び配列番号336または337のアミノ酸配列を含む重鎖を含む。いくつかの実施形態において、本開示は、融合タンパク質種の混合物を提供し、各種は、配列番号338のアミノ酸配列を含む1つまたは2つの軽鎖、配列番号339のアミノ酸配列を含む重鎖、及び配列番号340または341のアミノ酸配列を含む重鎖を含む。いくつかの実施形態において、本開示は、融合タンパク質種の混合物を提供し、各種は、配列番号342のアミノ酸配列を含む1つまたは2つの軽鎖、配列番号343のアミノ酸配列を含む重鎖、及び配列番号344または345のアミノ酸配列を含む重鎖を含む。いくつかの実施形態において、本開示は、融合タンパク質種の混合物を提供し、各種は、配列番号346のアミノ酸配列を含む1つまたは2つの軽鎖、配列番号347のアミノ酸配列を含む重鎖、及び配列番号348または349のアミノ酸配列を含む重鎖を含む。いくつかの実施形態において、本開示は、融合タンパク質種の混合物を提供し、各種は、配列番号350のアミノ酸配列を含む1つまたは2つの軽鎖、配列番号351のアミノ酸配列を含む重鎖、及び配列番号352または353のアミノ酸配列を含む重鎖を含む。
いくつかの実施形態において、本開示は、表5に列挙されている単一の融合タンパク質の2つの重鎖配列及び2つの軽鎖配列を含む融合タンパク質を提供し、該重鎖配列の1つはIL2融合物を有し、他方の重鎖配列はIL2融合物を有さず、該2つの軽鎖配列は同一である。いくつかの実施形態において、IL2融合物を有しない重鎖配列は、C末端にリジンを含む。いくつかの実施形態において、融合タンパク質は、図7に示されているフォーマットAのものである。例えば、いくつかの実施形態において、融合タンパク質は、4つのポリペプチド鎖を含み、(1)第1のポリペプチド鎖は、配列番号334のアミノ酸配列を含み、第2のポリペプチド鎖は、配列番号335のアミノ酸配列を含み、第3のポリペプチド鎖は、配列番号336のアミノ酸配列を含み、第4のポリペプチド鎖は、配列番号334のアミノ酸配列を含む;(2)第1のポリペプチド鎖は、配列番号334のアミノ酸配列を含み、第2のポリペプチド鎖は、配列番号335のアミノ酸配列を含み、第3のポリペプチド鎖は、配列番号337のアミノ酸配列を含み、第4のポリペプチド鎖は、配列番号334のアミノ酸配列を含む;(3)第1のポリペプチド鎖は、配列番号338のアミノ酸配列を含み、第2のポリペプチド鎖は、配列番号339のアミノ酸配列を含み、第3のポリペプチド鎖は、配列番号340のアミノ酸配列を含み、第4のポリペプチド鎖は、配列番号338のアミノ酸配列を含む;または(4)第1のポリペプチド鎖は、配列番号338のアミノ酸配列を含み、第2のポリペプチド鎖は、配列番号339のアミノ酸配列を含み、第3のポリペプチド鎖は、配列番号341のアミノ酸配列を含み、第4のポリペプチド鎖は、配列番号338のアミノ酸配列を含む。
抗体及び融合タンパク質の産生
本明細書ではさらに、本明細書に記載の抗体、抗体フラグメント、及び融合タンパク質のいずれかをコードするポリヌクレオチド(例えば、単離されたポリヌクレオチド)が提供される。本明細書ではさらに、本明細書に記載の抗体、抗体フラグメント、及び融合タンパク質のいずれかをコードするベクター(例えば、発現ベクター)が提供される。
本明細書ではさらに、本明細書に記載のポリヌクレオチドまたはベクターのいずれかを含む宿主細胞(例えば、単離された宿主細胞または宿主細胞株)が提供される。
本明細書ではさらに、本明細書に記載の抗体、抗体フラグメント、及び融合タンパク質のいずれかを産生する方法が提供される。いくつかの実施形態において、方法は、抗体、抗体フラグメント、または融合タンパク質の産生に適した条件下で、本開示の宿主細胞を培養することを含む。いくつかの実施形態において、方法は、抗体、抗体フラグメント、または融合タンパク質を回収することをさらに含む。
抗体、抗体フラグメント、及び融合タンパク質は、例えば、以下に例示するような組換え法を用いて産生されてもよい。いくつかの実施形態において、抗体/融合タンパク質をコードする核酸は、単離され、さらなるクローニングのため、または発現のための複製可能なベクターに挿入され得る。抗体/融合タンパク質をコードするDNAは、従来の手順(例えば、抗体/フラグメントの重鎖及び軽鎖をコードする遺伝子に特異的に結合できるオリゴヌクレオチドプローブを介して)を用いて、容易に単離及び配列決定され得る。多くのベクターが当技術分野で公知であり、ベクター構成要素には、一般に、以下:シグナル配列、複製起点、1つ以上のマーカー遺伝子、エンハンサーエレメント、プロモーター、及び転写終結配列のうちの1つ以上が含まれるが、これらに限定されない。本明細書におけるベクター中のDNAをクローニングまたは発現させるのに適した宿主細胞は、原核生物細胞、酵母細胞、または高等真核生物細胞である。組換え技法を使用する場合、抗体/融合タンパク質は、細胞内に、細胞膜周辺腔内に、または培地中に直接分泌されて産生され得る。抗体/フラグメントが細胞内に産生される場合、宿主細胞または溶解したフラグメントのいずれかである粒状のデブリは、例えば、遠心分離または限外濾過によって除去される。抗体/融合タンパク質が培地中に分泌される場合には、かかる発現系の上清は、一般に、まず市販のタンパク質濃縮フィルターを用いて濃縮される。
医薬組成物
いくつかの実施形態において、本開示の融合タンパク質は、例えば、融合タンパク質及び1つ以上の薬学的に許容される担体を含む医薬組成物の一部である。本明細書に記載される医薬組成物及び製剤は、所望の純度を有する活性成分(例えば、融合タンパク質)と、1つ以上の任意選択の薬学的に許容される担体(Remington’s Pharmaceutical Sciences 16th edition,Osol,A.Ed.(1980))とを混合することにより、凍結乾燥製剤または水溶液の形態で調製することができる。薬学的に許容される担体は、一般に、用いられる投薬量及び濃度でレシピエントにとって非毒性であり、リン酸、クエン酸、及び他の有機酸等の緩衝液;アスコルビン酸及びメチオニンを含む抗酸化剤;保存薬;低分子量(約10残基未満)のポリペプチド;血清アルブミン、ゼラチン、または免疫グロブリン等のタンパク質;ポリビニルピロリドン等の親水性ポリマー;アミノ酸;グルコース、マンノース、またはデキストリンを含む、単糖類、二糖類、及び他の炭水化物;EDTA等のキレート剤;スクロース、マンニトール、トレハロースまたはソルビトール等の糖;ナトリウム等の塩形成性対イオン;金属錯体(例えば、Zn-タンパク質錯体);及び/またはポリエチレングリコール(PEG)等の非イオン性界面活性剤が挙げられるが、これらに限定されない。いくつかの実施形態において、本開示の融合タンパク質は、凍結乾燥される。
方法及びキット
本開示のある態様は、がんまたは慢性感染症を処置する方法に関する。いくつかの実施形態において、方法は、有効量の融合タンパク質もしくは抗体、または融合タンパク質もしくは抗体及び薬学的に許容される担体を含む医薬組成物を、患者に投与することを含む。いくつかの実施形態において、当該処置を必要とする患者は、がんと診断されている。
いくつかの実施形態において、融合タンパク質または組成物は、T細胞療法、がんワクチン、化学療法剤、または免疫チェックポイント阻害剤(ICI)と組み合わせて投与される。いくつかの実施形態において、化学療法剤は、キナーゼ阻害剤、代謝拮抗剤、細胞毒素もしくは細胞分裂阻害剤、抗ホルモン剤、白金ベース化学療法剤、メチルトランスフェラーゼ阻害剤、抗体、または抗がんペプチドである。いくつかの実施形態において、免疫チェックポイント阻害剤は、PD-L1、PD-1、CTLA-4、CEACAM、LAIR1、CD160、2B4、CD80、CD86、CD276、VTCN1、HVEM、KIR、A2AR、MHCクラスI、MHCクラスII、GALS、アデノシン、TGFR、OX40、CD137、CD40、CD47、TREM1、TREM2、HLA-G、CCR4、CCR8、CD39、CD73、IDO、CSF1R、TIM-3、BTLA、VISTA、LAG-3、TIGIT、IDO、MICA/B、LILRB4、SIGLEC-15、またはアルギナーゼを標的にし、限定されないが、PD-1阻害剤(例えば、抗PD-1抗体)、PD-L1阻害剤(例えば、抗PD-L1抗体)、またはCTLA-4阻害剤(例えば、抗CTLA-4抗体)を含む。
抗PD-1抗体の例としては、限定されないが、ペムブロリズマブ、ニボルマブ、セミプリマブ、ジンベレリマブ(Arcus)、ササンリマブ(Pfizer)、JTX-4014、スパルタリズマブ(PDR001;Novartis)、カムレリズマブ(SHR1210;Jiangsu HengRui Medicine)、シンチリマブ(IBI308;Innovent及びEli Lilly)、チスレリズマブ(BGB-A317)、トリパリマブ(JS 001)、ドスタルリマブ(TSR-042、WBP-285)、INCMGA00012(MGA012)、AMP-224、及びAMP-514(MEDI0680)が挙げられる。抗PD-L1抗体の例としては、限定されないが、アテゾリズマブ、アベルマブ、デュルバルマブ、KN035、及びCK-301(Checkpoint Therapeutics)が挙げられる。PD-L1阻害剤(非抗体ベース)の例としては、限定されないが、AUNP12、CA-170、及びBMS-986189が挙げられる。抗CTLA-4抗体の例としては、限定されないが、イピリムマブ、トレメリムマブ、BMS-986218、BMS-986249、BMS-986288、HBM4003、ONC-392、KN044、ADG116、ADU-1604、AGEN1181、AGEN1884、MK-1308、及びREGN4659が挙げられる。
T細胞療法の例としては、限定されないが、CD4+またはCD8+T細胞ベースの治療法、養子T細胞療法、キメラ抗原受容体(CAR)ベースのT細胞療法、腫瘍浸潤リンパ球(TIL)ベースの治療法、自家T細胞療法、同種異系T細胞療法、及び形質導入されたTCRを有するT細胞を用いる治療法が挙げられる。例示的ながんワクチンとしては、限定されないが、樹状細胞ワクチン、1つ以上のがん抗原をコードする1つ以上のポリヌクレオチドを含むワクチン、及び1つ以上のがん抗原ペプチドを含むワクチンが挙げられる。
本開示のある態様は、T細胞を、例えば、ex vivoで増大させる方法に関する。いくつかの実施形態において、方法は、1つ以上のT細胞を、例えば、ex vivoで、有効量の本開示の抗体または融合タンパク質と接触させることを含む。いくつかの実施形態において、1つ以上のT細胞は、腫瘍浸潤リンパ球(TIL)である。いくつかの実施形態において、方法はさらに、腫瘍または腫瘍検体から腫瘍浸潤リンパ球(TIL)を単離することを含む。
本開示のある態様は、本明細書に開示される抗体、抗体フラグメント、または融合タンパク質のいずれかを含むキットまたは製造品に関する。いくつかの実施形態において、製造品は、容器及び該容器上のもしくは該容器に付随しているラベルまたは添付文書を含む。いくつかの実施形態において、キットまたは製造品は、本明細書に開示される方法のいずれかによる抗体または融合タンパク質を使用するための説明書(例えば、がんもしくは慢性感染症の処置またはT細胞の増大(例えば、ex vivoで)に向けたもの)をさらに含む。
好適な容器としては、例えば、ボトル、バイアル、シリンジなどが挙げられる。容器は、ガラスまたはプラスチック等の多様な材料から形成され得る。容器は、病態を処置するのに有効な組成物を保持するものであり、無菌のアクセスポートを有していてもよい(例えば、容器は、静注液バッグまたは皮下注射針によって穿刺可能な栓を有するバイアルであり得る)。組成物中の少なくとも1つの活性剤は、本明細書に記載される抗体または融合タンパク質である。ラベルまたは添付文書は、組成物が特定の病態を処置するために使用されることを指し示す。ラベルまたは添付文書には、抗体または融合タンパク質組成物を対象に投与するための説明がさらに含まれることになる。本明細書に記載の組み合わせ療法を含む製造品及びキットもまた企図されている。
添付文書とは、市販の治療用製品のパッケージに慣例的に収められている説明書であり、かかる治療用製品の使用に関わる適応症、用法、投与量、投与、禁忌及び/または警告についての情報を含有するものである。
加えて、製造品は、静菌注射用水(BWFI)、リン酸緩衝食塩水、リンゲル液及びデキストロース溶液等の薬学的に許容される緩衝液を含む第2の容器をさらに含んでいてもよい。さらに、製造品は、他の緩衝液、希釈剤、フィルター、針、及びシリンジを含む、商業的な立場及び使用者の立場から考慮される他の物質を含んでいてもよい。
実施例1:ヒトCD8abに結合する抗体の生成及び特性評価
材料及び方法
組換えDNA技法
組換えDNA操作を伴う技法は、以前に、Sambrook et al.,Molecular cloning:A laboratory manual;Cold Spring Harbor Laboratory Press,Cold Spring Harbor,N.Y.,1989に記載された。全ての試薬は、製造業者の指示に従って使用した。DNA配列は、二本鎖シークエンシングにより決定した。
遺伝子合成
所望の遺伝子セグメントは、適切な鋳型を使用してPCRにより生成したか、または合成オリゴヌクレオチドからGenewiz(South Plainfield,NJ)、Integrated DNA Technologies(Coralville,IA)またはGeneScript(Piscataway,NJ)で合成したものであった。遺伝子セグメントは、Gibson assembly(登録商標)法を用いるかまたは制限消化後のライゲーションを用いて発現ベクターにクローニングした。DNAは、形質転換された細菌から精製し、濃度をUV可視分光法により決定した。DNAシークエンシングを使用して、サブクローニングされた遺伝子フラグメントのDNA配列を確認した。
抗体の単離
CD8抗原に結合する抗体を、マウス抗体のヒト化またはin vitroファージディスプレイ系のどちらかを使用して生成した。
ヒト化については、マウス残基の相補性決定領域(CDR)を、親マウスフレームワークと配列類似性が高く、かつ安定性に優れている、選択したヒトフレームワーク(複数可)に移植した。得られたCDR移植抗体をさらにヒト化して、あらゆる不要な非ヒト変異を除去した。
in vitroディスプレイ法については、ナイーブB細胞から生成した非免疫ヒト単鎖Fvファージライブラリーを、5~6ラウンド、パニングして、CD8抗原に対する抗体を単離した。パニング後、ELISAで、非特異的抗原よりも標的抗原への特異的な結合を示した個々のファージクローンを同定した。その後、特異的結合物の重鎖及び軽鎖VドメインのDNAフラグメントをクローニングし、シークエンシングした。xhCD8v6及びxhCD8v7の親クローンは、ヒト抗体ファージライブラリーから単離したものである。xhCD8v1は、CD8bに対するマウスモノクローナル抗体であり、xhCD8v1.1は、xCD8v1のヒト化バージョンであった。
ヒト抗体のin vitro親和性成熟
親クローンの軽鎖を健康なドナーのナイーブB細胞から単離した軽鎖とシャッフルするか、または選択したCDR残基を変異させることにより、親和性成熟ライブラリーを生成した。得られたライブラリーは、ファージまたは酵母のいずれかの表面でscFvとして表示された。可溶性CD8抗原の濃度を下げながら、スクリーニングを3~5ラウンド行った。その後、得られた選択クローンをクローニングし、シークエンシングした。xhCD8v6及びxhCD8v7は、親和性成熟から得られたクローンである。xhCD8v2、xhCD8v3、xhCD8v4、及びxhCD8v5は、xhCD8v1.1に由来する親和性成熟抗体である。
抗体構築物のクローニング
ヒト免疫グロブリン軽鎖及び重鎖のヌクレオチド配列に関する一般情報は、Lefranc et al.IMGT(登録商標),the international ImMunoGeneTics information system(登録商標)25 years on.Nucleic Acids Res.2015 Jan;43からのIMGT(登録商標)(international ImMunoGeneTics information system(登録商標))で得られる。重鎖及び軽鎖VドメインのDNAフラグメントを、ヒトIgG1及びCK含有哺乳動物発現ベクターにインフレームで挿入した。
抗体の調製
抗体の重鎖及び軽鎖を含有するDNA配列確認済み構築物を、ポリエチレンイミン(PEI)を使用して、Expi 293細胞にトランスフェクトした。5日間培養後、上清を収集し、プロテインA樹脂と共に室温で>2時間インキュベートした。次に、樹脂をPBSと共に複数回使用し、次いで、20mMクエン酸ナトリウム(pH3.6)で樹脂から抗体を溶出させた。溶出画分をプールし、PBS中でのサイズ排除クロマトグラフィー(Superdex 200、GE Healthcare)により、さらに精製した。
表面プラズモン共鳴(SPR)によるCD8ab抗原に対する結合親和性の測定
組換えヒトCD8abタンパク質を生成した。酸性ロイシンジッパー及び8× Histidine tagに融合したCD8aの細胞外ドメインと、塩基性ロイシンジッパー及びStrep-tag IIに融合したCD8bの細胞外ドメインとで構成される組換えCD8abを、HEK293細胞から分泌型で発現させ、IMAC、サイズ排除、及びストレプトアビジンアフィニティーカラムクロマトグラフィーにより精製した。CD8に対する抗体の37℃での親和性は、Biacore T200(Cytiva)を用いて表面プラズモン共鳴により測定した。まず、抗体を、Human Antibody Capture Kit(Cytiva)を用いて調製した抗hIgG-Fc CM5またはCM4表面上に捕捉した。0.1×~10×KDにわたる4種以上の濃度にてHBS-EP+緩衝液で希釈した可溶性CD8ab抗原を、表面に捕捉した抗CD8 mAb上に1~2分間流した。解離を5~10分間モニターし、抗hIgG-Fc表面を3M MgCl2で再生してから、その後の各サイクルでmAbを再捕捉した。結合データは、Biacore T200 Evaluation Software version 3.2により、1:1結合モデルを用いて解析した。
結果
表1は、表面プラズモン共鳴により測定した、組換えヒトCD8abタンパク質に対する単離した抗CD8ab抗体(xhCD8v1~xhCD8v7)の結合動態を示している。
表1で表したように、単離したCD8ab抗体では、親和性の範囲が0.35nM~137nMと様々であった。
図1のA~Cに描示しているように、CD8ab抗原に結合する3タイプの抗体(CD8ab抗体)を特定することができた:1)単独のCD8a抗原に結合するが、CD8b抗原には結合しない抗体(図1A)、これらの抗体はCD8a分子上に存在するエピトープを標的とする;2)単独のCD8a抗原及び単独のCD8b抗原に弱く結合するか結合しない抗体(図1B)、これらの抗体はCD8abヘテロ二量体のCD8aとCD8bとの間にあるエピトープに結合する;3)単独のCD8b抗原に結合するが、単独のCD8a抗原には結合しない抗体(図1C)、これらの抗体はCD8b分子上のエピトープを標的とする。
抗体の結合特異性はELISAで測定した。PBS中の2μg/mLの組換えCD8ab、CD8a(Sino biological)、CD8b(Sino biological)及びオバルブミン(Sigma)またはErb2(ヒト上皮成長因子受容体2)(Sino biological)をマキシソーププレート上に4℃にて一晩コーティングした。オバルブミンまたはErb2は陰性対照として使用した。次いで、カゼインブロッキング液(Thermo Scientific)により、1時間、室温にてプレートをブロッキングした。ブロッキング後、プレートを洗浄緩衝液(PBS/0.05% Tween(登録商標)-20)で洗浄した。次に、PBS/0.5%BSA/0.05%Tween(登録商標)-20で30nM~0.0009nMに希釈した抗体をプレート上に添加し、室温で1~2時間インキュベートした。インキュベート後、プレートを洗浄し、PBS/0.5%BSA/0.05%Tween(登録商標)-20中で、抗ヒトIgG(Fc特異的)-HRPコンジュゲートまたは抗マウスIgG(Fc特異的)-HRPコンジュゲート(Jackson Immunoresearch)と1時間インキュベートした。プレートにTMB基質(SeraCare)、続いて0.1M HCl停止液を添加することにより、結合を検出した。結合吸光度は、GloMax(登録商標)Discover Microplate Reader(Promega)を用いて読み取った。
図2Aは、CD8aエピトープを有する抗体の2つの例を示している:xhCD8a1(クローンOKT8、Invitrogen)及びxhCD8a2(クローンSK1、Biolegend)(両方とも単独のCD8aに結合するが、単独のCD8bには結合しない)。抗CD8ab抗体xhCD8v6及びxhCD8v7は、両方ともCD8aとCD8bとの間のエピトープに結合し、単独のCD8a及び単独のCD8bには結合しない(図2B)。マウスモノクローナル抗体xhCD8v1及びそのヒト化バリアントであるxhCD8v2~xhCD8v5、xhCD8v9、xhCD8v12及びxhCD8v13は全て、単独のCD8bに結合するが、単独のCD8には結合せず、したがってCD8b分子上のエピトープに結合する(図2C)。
図3A~3Cに描示しているように、CD8ab抗体の結合エピトープにより、CD8+NK細胞よりもCD8+T細胞に対するCD8ab抗体の特異性が決定される。NK細胞等の特定の免疫細胞は、CD8aaホモ二量体のみを発現し、図3Aに描示している抗体によって認識されることになる。T細胞は、典型的にはCD8aaホモ二量体とCD8abヘテロ二量体の両方を発現し、図3A~3Cに描示している3タイプの抗体全てによって認識されることになる。しかし、図3B及び図3Cに描示している抗体は、CD8+T細胞のみに結合し、CD8+NK細胞には結合せず、したがって、これら2種の細胞型を区別するのに有用である。
CD8ab抗体の細胞への結合は、フローサイトメトリーにより測定した。新たに単離したPBMCをCD8ab抗体と4℃にて2時間インキュベートした。次いで、細胞を表面マーカーCD3(UCHT1)、CD4(RPA-T4)、CD8a(SK1)、CD56(HCD56)、及び抗ヒトFc抗体(HP6017)に対する抗体で染色した。抗ヒトFc抗体は、hFcを含有するCD8ab抗体の結合を測定するために使用した。染色した細胞を洗浄し、フローサイトメトリーで解析し、抗hFcによる染色の平均蛍光強度(MFI)を結合の表示として使用した。
図4&5で表されているように、CD8a上のエピトープを認識するxhCD8a1抗体は、CD8+T細胞とCD8+NK細胞の両方に結合した。CD8abエピトープまたはCD8bエピトープを認識したCD8ab抗体は、CD8+NK細胞よりもCD8+T細胞に選択的に結合した。
次に、抗CD8抗体xhCD8v1をヒト化し、親和性成熟させた。驚くべきことに、xhCD8v1をヒトフレームワークに移植してxhCD8v1.1を生成した場合、CD8+T細胞への結合が失われた(図6)。
xhCD8v1.1の親和性成熟により、CD8+T細胞への結合が向上したいくつかの新規バリアント、xhCD8v2、xhCD8v3、xhCD8v4、及びxhCD8v5が得られた。
実施例2:CD8abヘテロ二量体を標的とするがCD8aaホモ二量体を標的としない融合タンパク質はヒトCD8+NK細胞よりもCD8+T細胞を選択的に活性化する
材料及び方法
融合構築物のクローニング
抗体構築物は、実施例1に記載したようにクローニングした。構築物のIL-2部分を、IgG重鎖のC末端とIL-2のN末端との間の(G4S)3 15-merリンカーを使用して、重鎖と共にインフレームでクローニングした。IL-2部分を融合した後、IgG重鎖のC末端リジン残基を除去した。単一IL-2遺伝子が完全IgGに融合している構築物を生成するには、IgG CH3ドメインにおけるノブ-イントゥ-ホール改変により促進されるヘテロ二量体化のために、2つの重鎖プラスミドを構築してトランスフェクトする必要があった。IL-2部分に接続された「ホール」重鎖は、CH3ドメインにY349C、T366S、L368A及びY407V変異を保有した一方で、融合していない「ノブ」重鎖は、CH3ドメインにS354C及びT366W変異を保有した(EU番号付け)。FcγR結合/エフェクター機能を消失させ、FcR同時活性化を防止するために、IgG重鎖の各々のCH2ドメインに以下の変異を導入した:L234A/L235A/G237A(EU番号付け)。抗体-IL-2融合構築物の発現をCMVプロモーターにより駆動し、コード配列の下流に位置する合成ポリAシグナル配列により転写を終結させた。
IL-2ポリペプチドを有する融合タンパク質の調製
実施例で使用したIL-2ポリペプチドを有する融合タンパク質をコードする構築物は、ポリエチレンイミン(PEI)を使用して、哺乳動物発現ベクターと共に、指数関数的に増殖しているExpi293細胞に同時導入することにより産生させた。4~5日間培養後、上清を収集した。まず、IL-2融合構築物を、プロテインAマトリックスを使用してアフィニティークロマトグラフィーにより精製した。プロテインAカラムをリン酸緩衝食塩水(PBS)で平衡化し、洗浄した。融合構築物を、20mMクエン酸ナトリウム、50mM塩化ナトリウム、pH3.6で溶出した。溶出画分をプールし、10mM MES、25mM塩化ナトリウムpH6に透析した。ホモ二量体よりもヘテロ二量体を精製するために、イオン交換クロマトグラフィー(Mono-S、GE Healthcare)を使用してタンパク質をさらに精製した。タンパク質をロードした後、カラムを10mM MES、25mM塩化ナトリウム pH6で洗浄した。次いで、タンパク質を、10mM MES pH6緩衝液中25mMから500mMまで漸増勾配させた塩化ナトリウムで溶出した。ヘテロ二量体に相当する主溶離液ピークを回収し、濃縮した。次いで、精製したタンパク質をPBS中でのサイズ排除クロマトグラフィー(Superdex 200、GE Healthcare)により仕上げた。
アミノ酸配列に基づいて算出したモル吸光係数を使用して、280nmで光学密度(OD)を測定することにより、精製IL-2融合構築物のタンパク質濃度を決定した。融合構築物の純度、完全性及び単量体状態を、還元剤(5mM 1,4-ジチオトレイトール)の存在及び非存在下でのSDS-PAGEにより分析し、クーマシーブルー(SimpleBlue(商標)SafeStain、Invitrogen)で染色した。NuPAGE(登録商標)Pre-Cast gel system(Invitrogen)を製造業者の指示に従って使用した(4~20%トリス-グリシンゲルまたは3~12%ビス-トリス)。Superdex 200 10/300 GL分析用サイズ排除カラム(GE Healthcare)を使用して、イムノコンジュゲート試料の凝集物の含有量を分析した。
IL-2融合タンパク質による活性化を測定するためのpSTAT5及びKi-67アッセイ
IL-2融合タンパク質の活性を、STAT5のリン酸化を測定するヒトPBMCでのアッセイで判定した。Ficoll-Paque Plus(GE Healthcare)を使用して健康なドナーの血液からPBMCを単離し、ACK溶解緩衝液(Gibco)を製造業者の指示に従って使用して赤血球を溶解した。典型的には、PBMCを無血清RPMI1640培地に20×10個の細胞/mlで再懸濁させ、96ウェルU底プレートに分取した(ウェル当たり50μl)。組換えヒトIL-2及び対照融合タンパク質等のIL-2融合タンパク質及び対照タンパク質を希釈して所望の濃度にし、ウェルに添加した(2×刺激として50μlを添加した)。インキュベーションを典型的には37℃にて30分間行い、その後、100μlの予熱した8%PFA(最終4%)を用いて10分間、室温にてそれを停止させた。細胞を洗浄緩衝液(PBS中の2%FBS)で3回洗浄した。細胞を、製造業者のプロトコルに従い、予冷したPhosflow Perm buffer III(BD Biosciences)で透過処理し、-20℃で一晩保管した。翌日、細胞を、洗浄緩衝液で3回洗浄し、CD3(UCHT1、BD Biosciences)、CD8α(SK1、Biolegend;RPA-T8、Biolegend)、CD4(RPA-T4、Biolegend)、及びCD25(M-A251、Biolegend)、パーフォリン(clone δG9、BD Biosciences)、Foxp3(clone 259D、Biolegend)、pSTAT5[pY694](clone 47、BD Biosciences)に対する抗体で、30~45分間4℃にて染色した。次いで、細胞をフローサイトメーターで分析した。データを、pSTAT5陽性パーセントとして、場合によってはpSTAT5平均蛍光強度(MFI)として表し、GraphPad Prismにインポートした。
増殖などの、pSTAT5からさらに下流のIL-2融合タンパク質により誘導される細胞の変化を測定するために、フローサイトメトリーアッセイを使用して、細胞内増殖マーカーKi-67の発現を検出した。簡潔には、PBMCを上で説明したように単離し、血清を補充したRPMI1640(10% FBS)または無血清AIM V培地(Gibco)中1x10個の細胞/mlにて、4~6日間再懸濁させた。細胞を96ウェルU底プレートに播種し(ウェル当たり150μl)、150μlのIL-2融合タンパク質と共に、37℃にて5日間インキュベートした。最終日に、まず細胞表面の染色を、CD3(UCHT1、BD-Biosciences)、CD8α(SK1、Biolegend)、CD4(RPA-T4、Biolegend)、CD56(HCD56、Biolegend)及びCD25(M-A251、Biolegend)に対する抗体を添加して行った。細胞を、洗浄緩衝液で3回洗浄し、Foxp3/Transcription Factor Staining Buffer Set(Thermo Fisher Scientific)を製造業者のプロトコルに従って使用して、細胞内染色を行った。簡潔には、1x Fix/Perm bufferを、暗所で4℃にて45分間、細胞に添加した。細胞を1x Perm Wash bufferで3回洗浄し、細胞内マーカーKi-67(B56、BD Biosciences)及びFoxp3(259D、Biolegend)に対する抗体により、暗所で4℃にて45分間染色した。次いで、細胞をPerm Wash bufferで3回洗浄し、フローサイトメーターで分析した。
結果
本開示のCD8ab抗体及びIL-2ポリペプチドを含む融合タンパク質は、4つのフォーマット(図7に示されているフォーマットA、B、C、及びD)のうちの1つで作製した。
CD8aを標的とするCD8ab抗体を含む融合タンパク質は、CD8+T細胞とCD8+NK細胞の両方でIL-2Rβγシグナル伝達を活性化する(図8A)。CD8aとCD8bとの間のエピトープを標的とするCD8ab抗体を含む融合タンパク質は、CD8+NK細胞よりもCD8+T細胞でIL-2Rβγシグナル伝達を優先的に活性化する(図8B)。CD8bを標的とするCD8ab抗体を含む融合タンパク質は、CD8+NK細胞よりもCD8+T細胞でIL-2Rβγシグナル伝達を優先的に活性化する(図8C)。
NK細胞の多くがCD8を発現し得るといっても、CD8aエピトープには結合しないCD8ab抗体を含む融合タンパク質はまた、全NK細胞よりもCD8+T細胞を優先的に活性化した。図9において、ヒトCD8+T細胞及びNK細胞に対する異なる融合タンパク質の選択性は、実施例1に記載したようにKi-67発現を測定することによって判定した。対照抗体及び既公開のIL-2バリアント(IL2v)を含む融合タンパク質では、NK細胞がCD8+T細胞よりも優先的に活性化された。CD8aを標的とするCD8ab抗体(xhCD8a1)及びIL-2ポリペプチド変異体であるIL2m1を含む融合タンパク質では、CD8+T細胞がNK細胞よりも優先的に活性化されたが、優先度は約10xにすぎなかった。CD8+T細胞の活性化における非常に強い優先性は、CD8bを標的とするCD8ab抗体(xhCD8v1)及びIL-2ポリペプチド変異体であるIL2m1を含む融合タンパク質によって得られた(>1000x)。
図10A~10Cに示す追加の例では、NK細胞よりもCD8+T細胞でKi-67増殖マーカーが活性化する強い優先性が、CD8aとCD8bとの間のエピトープ(xhCD8v6(図10A)、及びxhCD8v7(図10B)等)または単独のCD8bエピトープ(xhCD8v2~xhCD8v5(図10A及び図10C)等)のいずれかを標的とする他のCD8ab抗体によって示された。CD8ab抗体を含む試験した融合タンパク質のそれぞれでは、NK細胞よりもCD8 T細胞に対する優先度は、読み取り値としてKi-67アッセイを使用して>100xであった。
NK細胞よりもCD8+T細胞に対する同様の優先性はまた、図11A~11Dに示しているように、pSTAT5アッセイを使用して実証した。STAT5活性化は、1人のヒトPBMCドナーからの異なるリンパ球サブセットにおいて測定した。融合タンパク質対照-IL2vがCD8+T細胞、NK細胞、Treg細胞及びTエフェクター(CD4+Foxp3-)細胞を無差別に活性化した一方で、本開示のCD8ab抗体及びIL-2ポリペプチド変異体を含む融合タンパク質は、NK細胞よりもCD8+T細胞を少なくとも100xで選択的に活性化した。
CD8+T細胞及びNK細胞におけるKi67活性化は、別のドナーからのhPBMCを同一のxhCD8v1抗体及び以下のIL-2ポリペプチド:IL2m1、IL2m2、IL2m3、IL2m4またはIL2m5のうちの1つを含む融合タンパク質と共にインキュベートした後に試験した。IL-2ポリペプチド配列は表7に示している。図12に表しているように、全ての5種の融合タンパク質は、NK細胞に優先する同様のCD8+T細胞活性化(EC50約0.01nM)を、NK細胞に対するEC50についての以下の順位:IL2m3、IL2m4<IL2m1、IL2m2<IL2m5で実現した。
図13Aは、同一のxhCD8v1抗体及び以下のIL-2ポリペプチド:IL2m1、IL2m2、IL2m6、IL2m7、IL2m8、IL2m9またはIL2m10のうちの1つを含有する融合タンパク質(実線)によるCD8+T細胞及びNK細胞のSTAT5活性化を、対照Ab-IL2v(破線)と比較して示すものである。xhCD8v1を含む全ての融合タンパク質は、対照Ab-IL2vよりも低いEC50で、また、EC50についての以下の順位:IL2m6<IL2m7<IL2m1、IL2m8<IL2m2<IL2m9、IL2m10でCD8+T細胞を活性化した。xhCD8v1を含む全ての融合タンパク質は、対照Ab-IL2vよりも高いEC50でNK細胞を活性化した。xhCD8v1-IL2m6及びxhCD8v1-IL2m7を除いて、NK細胞に対するSTAT5活性化のEC50は、>100nMであった。図13Bは、xhCD8v11抗体またはxhCD8v12抗体のいずれか及び以下のIL-2ポリペプチド:IL2m11、IL2m12、またはIL2m13のうちの1つを含有する融合タンパク質によるCD8+T細胞及びNK細胞のSTAT5活性化を、対照Ab-IL2vと比較して示すものである。xhCD8v11またはxhCD8v12のいずれかを含む全ての融合タンパク質は、NK細胞よりも低いEC50で、また、EC50についての以下の順位:IL2m12、IL2m11<IL2m13でCD8+T細胞を活性化した。xhCD8v11抗体またはxhCD8v12抗体を含む全ての融合タンパク質は、対照Ab-IL2vよりも高いEC50でNK細胞を活性化した。NK細胞に対するSTAT5活性化のEC50は、>100nMであった。
実施例3:融合タンパク質フォーマットのCD8+T細胞活性化に対する効果
図14Aは、融合タンパク質フォーマットの優先的なCD8+T細胞活性化に対する影響を表している。図14Aの説明文で表示しているように、3種の異なるフォーマット(A、B、C、図7を参照されたい)におけるxhCD8v1-IL2m1(図左)及びxhCD8v6-IL2m1(図右)によるCD8+T細胞(実線)及びNK細胞(点線)の活性化について示す。3種全てのフォーマットが、NK細胞よりもCD8+T細胞を優先的に活性化したが、フォーマットB及びCと比較して、フォーマットAで最大に優先される結果になった。このことは、フォーマットAが、CD8aとCD8bとの間のエピトープまたは単独のCD8bを標的とするCD8ab抗体を有する融合タンパク質に最適であることを示唆している。
図14Bは、融合タンパク質フォーマットの優先的なCD8+T細胞活性化に対する影響を表している。図7に示した4種のフォーマット(A、B、C、&D)全てにおけるxhCD8v6-IL2m1の結合及びKi67を誘導する能力を評価した。フォーマットAは、他のフォーマットと比較して、細胞結合において約5倍高い親和性を示した。このことは、フォーマットAによるアビディティ主導の結合増強によると考えられる。驚くべきことに、結合倍率変化と比較して、フォーマットA(黒実線)は、フォーマットB、C、及びD(灰色破線)よりもKi67誘導の程度が大きく、約20倍~40倍を示した。この結果は、フォーマットAが、他のフォーマットと比較して、より大きなレベルのKi-67活性化を優先的かつ不均衡に誘導し得ることを示唆した。図14Cは、CD8+T細胞への結合、及びCD8+T細胞におけるKi67の誘導について、IL2m1及びIL2m4に融合した広範なxhCD8結合物を評価した際の、フォーマットA及びDにおける融合分子の結果を表している。二価の結合によって媒介されるアビディティの向上により、全融合物について、フォーマットAでは、結合EC50がフォーマットDよりも約10倍減少したことが示された。予想外に、増殖バイオマーカーであるKi-67の活性化において、フォーマットAでは、フォーマットDに対し、結合について認められた10倍の増加以上の、約200倍~1,000倍超の効力の増加が示された。したがって、この結果は、フォーマットAが、下流の増殖を誘導する上でより優れており、故に、CD8aとCD8bとの間のエピトープ(図8B)またはCD8bエピトープ(図8C)を標的とするCD8ab抗体を含有する融合タンパク質の好ましいフォーマットであることを支持するものであった。
図15は、CD8ab抗体xCD8v8を含有するxCD8v8-IL2m1融合タンパク質により、NK細胞(黒三角)よりもCD8 T細胞(黒四角)において、Ki67活性化が10倍より大きく優先されることを表している。
実施例4:本開示の融合タンパク質はヒトがん患者に由来するTILのCD8+T細胞を選択的に活性化し拡充する
TILを含有する単一細胞懸濁液を、腎細胞癌患者から採取した生検腫瘍から、Human Tumor Dissociation Kit(Miltenyi)を用いて、製造者のプロトコルに従って単離した。単一細胞懸濁液を完全RPMI培地に再懸濁させ、1x10個の細胞/ウェルで、必要とされる融合タンパク質と共に、ウェル当たり合計300μlで播種した。5日後、フローサイトメトリーにより、培養物を種々のサブセットにおけるKi-67の発現について分析し、ウェル当たりの総細胞数を測定した。
腎細胞癌から単離した単一細胞懸濁液のCD8+T細胞及びNK細胞における、Ki-67を活性化するためのrhIL-2、対照Ab-IL2v及びxhCD8v1-IL2m1の能力を判定した(図16A)。結果は、xhCD8v1-IL2m1が、rhIL-2及び対照-IL2vよりも強力にCD8+T細胞においてKi-67を活性化し、NK細胞においてはKi-67を活性化しないことを示した。さらに、CD8+T細胞数は、NK細胞数及びCD4+T細胞数と比較して優先的に増加した(図16B)。
これらの所見を拡大解釈すれば、CD8ab標的抗体を有する融合タンパク質の用途の1つは、がん患者から単離したTILを、処置のために患者へ再注入する目的で、該TILにおけるCD8+T細胞の選択的増殖を亢進させることである。
別の用途は、CD8ab抗体を有する融合タンパク質を、TIL療法または他のT細胞療法、特にMHCクラスI拘束性T細胞を用いたTCR-T細胞療法と組み合わせて使用することである。
実施例5:ヒトCD8+NK細胞よりもCD8+T細胞を選択的に活性化するためのCD8abヘテロ二量体を標的とするCD8抗体を追加した試験
追加のCD8ab抗体xhCD8v9-v15を生成し、実施例1に記載の通り、組換えCD8abへの結合について試験した。これらの抗体は、(1)潜在的なアミノ酸障害(例えば、推定N結合型グリコシル化、脱アミノ化、または酸切断部位)の数を減らし、製造性が潜在的に改善している;及び(2)ヒト生殖細胞系に対するアミノ酸ミスマッチの数を減らし、in vivoでの免疫原性が潜在的に低減されている、改良バージョン(例えば、v2に基づくv9、v12、及びv13、ならびにv6に基づくv10、v11、v14、及びv15)として設計した(図18A)。上述のように、抗CD8抗体xhCD8v1をヒトフレームワークに移植してxhCD8v1.1を生成した場合(図18Bに表している)、CD8+T細胞への結合が驚くほど失われた(図6)。ヒト化抗体の面に関して、結合を回復するためにさらなる置換が必要であり、潜在的な障害及び/またはヒト生殖細胞系に対するミスマッチを減らすために、さらに他の置換を導入した(図18C&図18D)。
表6に示すように、全ての追加の抗体xhCD8v9~v15では、CD8abに対する高親和性の結合が示された。
また、これらの抗体を、実施例2で上述したように、ヒトCD8+NK細胞よりもCD8+T細胞を選択的に活性化する能力について、IL-2ポリペプチド変異体(IL2m1またはIL2m4)を有するフォーマットA(図7に示しているもの)の融合タンパク質として試験した。図17A~17Eに示すように、これらの抗体は、IL-2ポリペプチド変異体を有する融合タンパク質の面に関して使用した場合、ヒトCD8+NK細胞よりもCD8+T細胞を選択的に活性化することを促進できた。
実施例6:xhCD8v2関連ファミリークローンの熱安定性評価
材料及び方法
強制的分解アッセイ
分子安定性及び凝集性を評価するため、PBS中1mg/mLの濃度の精製抗体に4℃~64℃の温度で24時間ストレスを与えた。試料を濾過し、Superdex 200 5/150 GL(Cytiva)での分析用サイズ排除クロマトグラフィーにより分析した。単量体及び単量体面積のパーセントは、OpenLab ChemStation(Agilent Technologies)を用いて計算した。実験は二度繰り返して行った。
熱安定性測定
熱安定性特性を決定するために、UNit装置(Unchained labs)で、内在性の示差走査蛍光光度(DSF)及び静的光散乱(SLS)を測定した。PBS中1mg/mLの濃度の精製抗体を、1℃/分の率で25℃~95℃の熱勾配に供した。DSF用にUVスペクトルを記録し、SLSは266nmで記録した。試料は4通りで行った。融解温度(Tm)、及び凝集温度(Tagg)は、UNcle Analysis Software V3.2(Unchained labs)により分析し、算出した。
結果
親xhCD8v2と比較したxhCD8v9、xhCD8v12及びxhCD8v13の熱安定性向上
親抗体xhCD8v2、ならびにその誘導体xhCD8v9、xhCD8v12及びxhCD8v13を、強制的分解アッセイ及び熱安定性アッセイに供した。強制的分解アッセイの結果を、異なる抗体についての単量体回収%(64℃での単量体面積の4℃に対する比)として表し、表7に示している。xhCD8v9、xhCD8v12及びxhCD8v13抗体では、親抗体xhCD8v2と比較して、回収%がより大きい。表7に示している熱安定性測定値から、xhCD8v9、xhCD8v12及びxhCD8v13抗体のTm及びTagg値は、親抗体xhCD8v2のTm及びTagg値よりも高いことが明らかになった。まとめると、これらの結果から、xhCD8v9、xhCD8v12及びxhCD8v13分子は、親抗体xhCD8v2よりも熱安定性が向上しており、したがって、xhCD8v9、xhCD8v12及びxhCD8v13は治療薬としてより好ましいことが実証される。
実施例7:親xhCD8v6及びその誘導体上のグリカン占有率の評価
材料及び方法
抗体の脱グリコシル化
N結合型及びO結合型グリコシル化の両方を解消するために、10μgの抗体を、1μlの10X GlycoBuffer 2(New England Biolabs)、1μlのProtein Deglycosylation Mix II(New England Biolabs)と混合し、水を加えて10μlにした。反応物を室温で一晩インキュベートした。
P3F4関連分子のグリコシル化検出に向けたELISA
N結合型グリコシル化の存在をELISAによって判定した。簡潔には、0.5~10μg/mLのタンパク質25μLを、384ウェルNunc MaxiSorpプレート(Thermo Fisher Scientific)上にコーティングし、37℃にて1時間インキュベートした。タンパク質を除去し、プレートをPBS+0.05% Tween(登録商標)-20(PBST)で洗浄した。炭水化物を含まないブロッキング溶液(Vector Labs)でウェルを満たし、室温で30分間インキュベートした。ブロッキング溶液を除去し、ウェルをPBSTで洗浄した。糖複合体に結合する、PBS中5μg/mLのビオチン化小麦胚芽凝集素(Vector Labs)を25μL添加し、室温で30分間インキュベートした。次いで、それを除去し、プレートをPBSTで再度洗浄した。検出試薬である、VECTASTAIN Elite ABC-HRP Reagent、ペルオキシダーゼ、R.T.U.(Vector Labs)を25μL添加し、室温で30分間インキュベートさせた。試薬を除去し、ウェルをPBSTで洗浄した。KPL SureBlue TMB Microwell Substrate(SeraCare)を25μL使用して、ウェルを5~7分間現像し、25μLの0.1M HClでクエンチした。450nmの吸光度をSpectraMax iD5プレートリーダー(Molecular Devices)で記録した。シアル酸付加N結合型及びO結合型グリカンを含有する糖タンパク質のフェチュインを陽性対照として使用した。全ての実験はn=8で行った。
結果
xhCD8v6上のN結合型グリコシル化部位の除去による均質性向上
xCD8v6は、CDR-H2領域に推定N結合型グリコシル化モチーフを有している。xhCD8v6の誘導体、すなわちxhCD8v10、xhCD8v11、xhCD8v14、及びxhCD8v15では、この推定N結合型グリコシル化モチーフは除去されている。CDR領域に様々な量のグリカンが存在すると、最終産物の均質性が低下し、結合能力に影響を与える可能性がある。グリカンの存在を探索するため、N-アセチルグルコサミンに結合する小麦胚芽凝集素(WGA)を用いたELISAを実施した。可変ドメインのみを調べるため、親xhCD8v6及び陰性対照として働くxhCD8v11のFabをアッセイした。フェチュインを陽性対照として用いた。図19に示すように、WGAの結合は、親xhCD8v6では検出されたが、xhCD8v11では検出されなかった。デグリコシダーゼ(deglycosidase)で処理したところ、脱グリコシル化したxhCD8v6へのWGAの結合はなく、xhCD8v6上にグリカンが存在することが確認された。この結果から、推定N結合型グリコシル化モチーフを有しないxhCD8v10、xhCD8v11、xhCD8v14、及びxhCD8v15は、親xCD8v6と比較して、より優れ、かつより均質な治療薬であることが示唆された。

Claims (110)

  1. ヒトもしくはヒト化抗体またはその抗原結合フラグメントであって、前記抗体またはフラグメントは、ヒトCD8a及び/またはヒトCD8aaに対する結合よりも少なくとも10倍高い親和性で、ヒトCD8b及び/またはヒトCD8abに特異的に結合する、前記ヒトもしくはヒト化抗体またはその抗原結合フラグメント。
  2. 前記抗体またはフラグメントは、1000nM未満であるEC50で、ヒトCD8abヘテロ二量体を表面に発現している細胞に結合する、請求項1に記載の抗体またはフラグメント。
  3. 前記抗体またはフラグメントは、ヒトCD8+T細胞に結合する、請求項1または請求項2に記載の抗体またはフラグメント。
  4. CD8b及び/またはCD8abに特異的に結合するヒト化抗体またはその抗原結合フラグメントであって、前記抗体またはフラグメントは、重鎖可変(VH)ドメイン及び軽鎖可変(VL)ドメインを含み、前記VHドメインは、配列番号13のアミノ酸配列を含むCDR-H1、配列番号14のアミノ酸配列を含むCDR-H2、及び配列番号15のアミノ酸配列を含むCDR-H3を含み、前記VLドメインは、配列番号16のアミノ酸配列を含むCDR-L1、配列番号17のアミノ酸配列を含むCDR-L2、及び配列番号18のアミノ酸配列を含むCDR-L3を含む、前記ヒト化抗体またはその抗原結合フラグメント。
  5. CD8b及び/またはCD8abに特異的に結合するヒト化抗体またはその抗原結合フラグメントであって、前記抗体またはフラグメントは、重鎖可変(VH)ドメイン及び軽鎖可変(VL)ドメインを含み、前記VHドメインは、配列番号51のアミノ酸配列を含むCDR-H1、配列番号52のアミノ酸配列を含むCDR-H2、及び配列番号15のアミノ酸配列を含むCDR-H3を含み、前記VLドメインは、配列番号16のアミノ酸配列を含むCDR-L1、配列番号17のアミノ酸配列を含むCDR-L2、及び配列番号18のアミノ酸配列を含むCDR-L3を含む、前記ヒト化抗体またはその抗原結合フラグメント。
  6. 前記VHドメインは、配列番号62の配列と少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも99%、または100%同一であるアミノ酸配列を含み、前記VLドメインは、配列番号63の配列と少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも99%、または100%同一であるアミノ酸配列を含む、請求項4または請求項5に記載の抗体またはフラグメント。
  7. CD8b及び/またはCD8abに特異的に結合するヒト化抗体またはその抗原結合フラグメントであって、前記抗体またはフラグメントは、重鎖可変(VH)ドメイン及び軽鎖可変(VL)ドメインを含み、前記VHドメインは、配列番号19のアミノ酸配列を含むCDR-H1、配列番号20のアミノ酸配列を含むCDR-H2、及び配列番号21のアミノ酸配列を含むCDR-H3を含み、前記VLドメインは、配列番号22のアミノ酸配列を含むCDR-L1、配列番号23のアミノ酸配列を含むCDR-L2、及び配列番号24のアミノ酸配列を含むCDR-L3を含む、前記ヒト化抗体またはその抗原結合フラグメント。
  8. CD8b及び/またはCD8abに特異的に結合するヒト化抗体またはその抗原結合フラグメントであって、前記抗体またはフラグメントは、重鎖可変(VH)ドメイン及び軽鎖可変(VL)ドメインを含み、前記VHドメインは、配列番号53のアミノ酸配列を含むCDR-H1、配列番号52のアミノ酸配列を含むCDR-H2、及び配列番号21のアミノ酸配列を含むCDR-H3を含み、前記VLドメインは、配列番号22のアミノ酸配列を含むCDR-L1、配列番号23のアミノ酸配列を含むCDR-L2、及び配列番号24のアミノ酸配列を含むCDR-L3を含む、前記ヒト化抗体またはその抗原結合フラグメント。
  9. 前記VHドメインは、配列番号64の配列と少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも99%、または100%同一であるアミノ酸配列を含み、前記VLドメインは、配列番号65の配列と少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも99%、または100%同一であるアミノ酸配列を含む、請求項7または請求項8に記載の抗体またはフラグメント。
  10. CD8b及び/またはCD8abに特異的に結合するヒト化抗体またはその抗原結合フラグメントであって、前記抗体またはフラグメントは、重鎖可変(VH)ドメイン及び軽鎖可変(VL)ドメインを含み、前記VHドメインは、配列番号25のアミノ酸配列を含むCDR-H1、配列番号26のアミノ酸配列を含むCDR-H2、及び配列番号27のアミノ酸配列を含むCDR-H3を含み、前記VLドメインは、配列番号28のアミノ酸配列を含むCDR-L1、配列番号29のアミノ酸配列を含むCDR-L2、及び配列番号30のアミノ酸配列を含むCDR-L3を含む、前記ヒト化抗体またはその抗原結合フラグメント。
  11. CD8b及び/またはCD8abに特異的に結合するヒト化抗体またはその抗原結合フラグメントであって、前記抗体またはフラグメントは、重鎖可変(VH)ドメイン及び軽鎖可変(VL)ドメインを含み、前記VHドメインは、配列番号49のアミノ酸配列を含むCDR-H1、配列番号52のアミノ酸配列を含むCDR-H2、及び配列番号27のアミノ酸配列を含むCDR-H3を含み、前記VLドメインは、配列番号28のアミノ酸配列を含むCDR-L1、配列番号29のアミノ酸配列を含むCDR-L2、及び配列番号30のアミノ酸配列を含むCDR-L3を含む、前記ヒト化抗体またはその抗原結合フラグメント。
  12. 前記VHドメインは、配列番号66の配列と少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも99%、または100%同一であるアミノ酸配列を含み、前記VLドメインは、配列番号67の配列と少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも99%、または100%同一であるアミノ酸配列を含む、請求項10または請求項11に記載の抗体またはフラグメント。
  13. CD8b及び/またはCD8abに特異的に結合するヒト化抗体またはその抗原結合フラグメントであって、前記抗体またはフラグメントは、重鎖可変(VH)ドメイン及び軽鎖可変(VL)ドメインを含み、前記VHドメインは、配列番号31のアミノ酸配列を含むCDR-H1、配列番号32のアミノ酸配列を含むCDR-H2、及び配列番号33のアミノ酸配列を含むCDR-H3を含み、前記VLドメインは、配列番号34のアミノ酸配列を含むCDR-L1、配列番号35のアミノ酸配列を含むCDR-L2、及び配列番号36のアミノ酸配列を含むCDR-L3を含む、前記ヒト化抗体またはその抗原結合フラグメント。
  14. CD8b及び/またはCD8abに特異的に結合するヒト化抗体またはその抗原結合フラグメントであって、前記抗体またはフラグメントは、重鎖可変(VH)ドメイン及び軽鎖可変(VL)ドメインを含み、前記VHドメインは、配列番号54のアミノ酸配列を含むCDR-H1、配列番号52のアミノ酸配列を含むCDR-H2、及び配列番号33のアミノ酸配列を含むCDR-H3を含み、前記VLドメインは、配列番号34のアミノ酸配列を含むCDR-L1、配列番号35のアミノ酸配列を含むCDR-L2、及び配列番号36のアミノ酸配列を含むCDR-L3を含む、前記ヒト化抗体またはその抗原結合フラグメント。
  15. 前記VHドメインは、配列番号68の配列と少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも99%、または100%同一であるアミノ酸配列を含み、前記VLドメインは、配列番号69の配列と少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも99%、または100%同一であるアミノ酸配列を含む、請求項13または請求項14に記載の抗体またはフラグメント。
  16. CD8b及び/またはCD8abに特異的に結合するヒト抗体またはその抗原結合フラグメントであって、前記抗体またはフラグメントは、重鎖可変(VH)ドメイン及び軽鎖可変(VL)ドメインを含み、前記VHドメインは、配列番号37のアミノ酸配列を含むCDR-H1、配列番号38のアミノ酸配列を含むCDR-H2、及び配列番号39のアミノ酸配列を含むCDR-H3を含み、前記VLドメインは、配列番号40のアミノ酸配列を含むCDR-L1、配列番号41のアミノ酸配列を含むCDR-L2、及び配列番号42のアミノ酸配列を含むCDR-L3を含む、前記ヒト抗体またはその抗原結合フラグメント。
  17. CD8b及び/またはCD8abに特異的に結合するヒト抗体またはその抗原結合フラグメントであって、前記抗体またはフラグメントは、重鎖可変(VH)ドメイン及び軽鎖可変(VL)ドメインを含み、前記VHドメインは、配列番号55のアミノ酸配列を含むCDR-H1、配列番号56のアミノ酸配列を含むCDR-H2、及び配列番号39のアミノ酸配列を含むCDR-H3を含み、前記VLドメインは、配列番号40のアミノ酸配列を含むCDR-L1、配列番号41のアミノ酸配列を含むCDR-L2、及び配列番号42のアミノ酸配列を含むCDR-L3を含む、前記ヒト抗体またはその抗原結合フラグメント。
  18. 前記VHドメインは、配列番号70の配列と少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも99%、または100%同一であるアミノ酸配列を含み、前記VLドメインは、配列番号71の配列と少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも99%、または100%同一であるアミノ酸配列を含む、請求項16または請求項17に記載の抗体またはフラグメント。
  19. CD8b及び/またはCD8abに特異的に結合するヒト抗体またはその抗原結合フラグメントであって、前記抗体またはフラグメントは、重鎖可変(VH)ドメイン及び軽鎖可変(VL)ドメインを含み、前記VHドメインは、配列番号43のアミノ酸配列を含むCDR-H1、配列番号44のアミノ酸配列を含むCDR-H2、及び配列番号45のアミノ酸配列を含むCDR-H3を含み、前記VLドメインは、配列番号46のアミノ酸配列を含むCDR-L1、配列番号47のアミノ酸配列を含むCDR-L2、及び配列番号48のアミノ酸配列を含むCDR-L3を含む、前記ヒト抗体またはその抗原結合フラグメント。
  20. CD8b及び/またはCD8abに特異的に結合するヒト抗体またはその抗原結合フラグメントであって、前記抗体またはフラグメントは、重鎖可変(VH)ドメイン及び軽鎖可変(VL)ドメインを含み、前記VHドメインは、配列番号55のアミノ酸配列を含むCDR-H1、配列番号57のアミノ酸配列を含むCDR-H2、及び配列番号45のアミノ酸配列を含むCDR-H3を含み、前記VLドメインは、配列番号46のアミノ酸配列を含むCDR-L1、配列番号47のアミノ酸配列を含むCDR-L2、及び配列番号48のアミノ酸配列を含むCDR-L3を含む、前記ヒト抗体またはその抗原結合フラグメント。
  21. 前記VHドメインは、配列番号72の配列と少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも99%、または100%同一であるアミノ酸配列を含み、前記VLドメインは、配列番号73の配列と少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも99%、または100%同一であるアミノ酸配列を含む、請求項19または請求項20に記載の抗体またはフラグメント。
  22. CD8b及び/またはCD8abに特異的に結合するヒト化抗体またはその抗原結合フラグメントであって、前記抗体またはフラグメントは、重鎖可変(VH)ドメイン及び軽鎖可変(VL)ドメインを含み、前記VHドメインは、配列番号1のアミノ酸配列を含むCDR-H1、配列番号2のアミノ酸配列を含むCDR-H2、及び配列番号3のアミノ酸配列を含むCDR-H3を含み、前記VLドメインは、配列番号4のアミノ酸配列を含むCDR-L1、配列番号5のアミノ酸配列を含むCDR-L2、及び配列番号6のアミノ酸配列を含むCDR-L3を含む、前記ヒト化抗体またはその抗原結合フラグメント。
  23. CD8b及び/またはCD8abに特異的に結合するヒト化抗体またはその抗原結合フラグメントであって、前記抗体またはフラグメントは、重鎖可変(VH)ドメイン及び軽鎖可変(VL)ドメインを含み、前記VHドメインは、配列番号49のアミノ酸配列を含むCDR-H1、配列番号50のアミノ酸配列を含むCDR-H2、及び配列番号3のアミノ酸配列を含むCDR-H3を含み、前記VLドメインは、配列番号4のアミノ酸配列を含むCDR-L1、配列番号5のアミノ酸配列を含むCDR-L2、及び配列番号6のアミノ酸配列を含むCDR-L3を含む、前記ヒト化抗体またはその抗原結合フラグメント。
  24. CD8b及び/またはCD8abに特異的に結合するヒト化抗体またはその抗原結合フラグメントであって、前記抗体またはフラグメントは、重鎖可変(VH)ドメイン及び軽鎖可変(VL)ドメインを含み、前記VHドメインは、配列番号177のアミノ酸配列を含むCDR-H1、配列番号178のアミノ酸配列を含むCDR-H2、及び配列番号179のアミノ酸配列を含むCDR-H3を含み、前記VLドメインは、配列番号180のアミノ酸配列を含むCDR-L1、配列番号181のアミノ酸配列を含むCDR-L2、及び配列番号182のアミノ酸配列を含むCDR-L3を含む、前記ヒト化抗体またはその抗原結合フラグメント。
  25. CD8b及び/またはCD8abに特異的に結合するヒト化抗体またはその抗原結合フラグメントであって、前記抗体またはフラグメントは、重鎖可変(VH)ドメイン及び軽鎖可変(VL)ドメインを含み、前記VHドメインは、配列番号183のアミノ酸配列を含むCDR-H1、配列番号184のアミノ酸配列を含むCDR-H2、及び配列番号179のアミノ酸配列を含むCDR-H3を含み、前記VLドメインは、配列番号180のアミノ酸配列を含むCDR-L1、配列番号181のアミノ酸配列を含むCDR-L2、及び配列番号182のアミノ酸配列を含むCDR-L3を含む、前記ヒト化抗体またはその抗原結合フラグメント。
  26. CD8b及び/またはCD8abに特異的に結合するヒト化抗体またはその抗原結合フラグメントであって、前記抗体またはフラグメントは、重鎖可変(VH)ドメイン及び軽鎖可変(VL)ドメインを含み、
    前記VHドメインは、
    AISのアミノ酸配列であって、ここでXはS、K、G、N、R、D、T、またはGであり、XはY、L、H、またはFである前記アミノ酸配列(配列番号259)を含むCDR-H1、
    PXYX10QKFX11Gのアミノ酸配列であって、ここでXはGまたはHであり、XはIまたはFであり、XはI、N、またはMであり、XはG、N、H、S、R、I、またはAであり、XはA、N、H、S、T、F、またはYであり、XはA、D、またはGであり、XはT、E、K、V、Q、またはAであり、XはAまたはTであり、XはNまたはKであり、X10はAまたはNであり、X11はQまたはTである前記アミノ酸配列(配列番号260)を含むCDR-H2、及び
    GXLFXのアミノ酸配列であって、ここでXはDまたはAであり、XはA、G、E、R、Y、K、N、Q、L、またはFであり、XはA、L、P、またはYであり、XはIまたはLであり、XはR、A、Q、またはSであり、XはAまたはDであり、XはD、E、A、またはSである前記アミノ酸配列(配列番号261)を含むCDR-H3を含み、
    前記VLドメインは、
    SXIXGXLNのアミノ酸配列であって、ここでXはRまたはGであり、XはAまたはTであり、XはQまたはEであり、XはE、N、T、S、A、K、D、G、R、またはQであり、XはYまたはSであり、XはAまたはVである前記アミノ酸配列(配列番号262)を含むCDR-L1、
    GXLXのアミノ酸配列であって、ここでXはAまたはSであり、XはT、S、E、Q、またはDであり、XはN、R、A、E、またはHであり、XはQまたはAであり、XはSまたはDである前記アミノ酸配列(配列番号263)を含むCDR-L2、及び
    QXPWTのアミノ酸配列であって、ここでXはS、N、D、Q、A、またはEであり、XはT、I、またはSであり、XはY、L、またはFであり、XはD、G、T、E、Q、A、またはYであり、XはA、T、R、S、K、またはYである前記アミノ酸配列(配列番号264)を含むCDR-L3を含む、前記ヒト化抗体またはその抗原結合フラグメント。
  27. 前記VHドメインは、配列番号225のアミノ酸配列を含むCDR-H1、配列番号226のアミノ酸配列を含むCDR-H2、及び配列番号227のアミノ酸配列を含むCDR-H3を含み、前記VLドメインは、配列番号16のアミノ酸配列を含むCDR-L1、配列番号17のアミノ酸配列を含むCDR-L2、及び配列番号228のアミノ酸配列を含むCDR-L3を含む、請求項26に記載の抗体。
  28. 前記VHドメインは、配列番号225のアミノ酸配列を含むCDR-H1、配列番号232のアミノ酸配列を含むCDR-H2、及び配列番号233のアミノ酸配列を含むCDR-H3を含み、前記VLドメインは、配列番号234のアミノ酸配列を含むCDR-L1、配列番号235のアミノ酸配列を含むCDR-L2、及び配列番号236のアミノ酸配列を含むCDR-L3を含む、請求項26に記載の抗体。
  29. 前記VHドメインは、配列番号225のアミノ酸配列を含むCDR-H1、配列番号232のアミノ酸配列を含むCDR-H2、及び配列番号233のアミノ酸配列を含むCDR-H3を含み、前記VLドメインは、配列番号16のアミノ酸配列を含むCDR-L1、配列番号17のアミノ酸配列を含むCDR-L2、及び配列番号228のアミノ酸配列を含むCDR-L3を含む、請求項26に記載の抗体。
  30. 前記VHドメインは、配列QVQLVQSGAEVKKPGSSVKVSCKASGGTFS(配列番号274)を含むFW-1、配列WVRQAPGQGLEWMG(配列番号275)を含むFW-2、配列RVTITADESTSTAYMELSSLRSEDTAVYYCAR(配列番号276)を含むFW-3、及び配列WGQGTLVTVSS(配列番号277)を含むFW-4をさらに含み、前記VLドメインは、配列DIQMTQSPSSLSASVGDRVTITC(配列番号289)を含むFW-1、配列WYQQKPGKAPKLLIY(配列番号290)を含むFW-2、配列GVPSRFSGSGSGTDFTLTISSLQPEDFATYYC(配列番号291)を含むFW-3、及び配列FGGGTKVEIK(配列番号292)を含むFW-4をさらに含む、請求項26~29のいずれか1項に記載の抗体。
  31. CD8b及び/またはCD8abに特異的に結合するヒト化抗体またはその抗原結合フラグメントであって、前記抗体またはフラグメントは、重鎖可変(VH)ドメイン及び軽鎖可変(VL)ドメインを含み、
    前記VHドメインは、
    GXFXのアミノ酸配列であって、ここでXはG、Y、S、またはAであり、XはT、S、G、R、N、またはHであり、XはS、T、R、H、Y、G、またはPであり、XはS、K、G、N、R、D、T、またはGであり、XはY、L、H、またはFである前記アミノ酸配列(配列番号265)を含むCDR-H1、
    PXのアミノ酸配列であって、ここでXはI、N、またはMであり、XはG、N、H、S、R、I、またはAであり、XはA、N、H、S、T、F、またはYであり、XはA、D、またはGであり、XはT、E、K、V、Q、またはAである前記アミノ酸配列(配列番号266)を含むCDR-H2、及び
    GXLFXのアミノ酸配列であって、ここでXはDまたはAであり、XはA、G、E、R、Y、K、N、Q、L、またはFであり、XはA、L、P、またはYであり、XはIまたはLであり、XはR、A、Q、またはSであり、XはAまたはDであり、XはD、E、A、またはSである前記アミノ酸配列(配列番号267)を含むCDR-H3を含み、
    前記VLドメインは、
    SXIXGXLNのアミノ酸配列であって、ここでXはRまたはGであり、XはAまたはTであり、XはQまたはEであり、XはE、N、T、S、A、K、D、G、R、またはQであり、XはYまたはSであり、XはAまたはVである前記アミノ酸配列(配列番号262)を含むCDR-L1、
    GXLXのアミノ酸配列であって、ここでXはAまたはSであり、XはT、S、E、Q、またはDであり、XはN、R、A、E、またはHであり、XはQまたはAであり、XはSまたはDである前記アミノ酸配列(配列番号263)を含むCDR-L2、及び
    QXPWTのアミノ酸配列であって、ここでXはS、N、D、Q、A、またはEであり、XはT、I、またはSであり、XはY、L、またはFであり、XはD、G、T、E、Q、A、またはYであり、XはA、T、R、S、K、またはYである前記アミノ酸配列(配列番号264)を含むCDR-L3を含む、前記ヒト化抗体またはその抗原結合フラグメント。
  32. 前記VHドメインは、配列番号238のアミノ酸配列を含むCDR-H1、配列番号239のアミノ酸配列を含むCDR-H2、及び配列番号233のアミノ酸配列を含むCDR-H3を含み、前記VLドメインは、配列番号16のアミノ酸配列を含むCDR-L1、配列番号17のアミノ酸配列を含むCDR-L2、及び配列番号228のアミノ酸配列を含むCDR-L3を含む、請求項31に記載の抗体。
  33. 前記VHドメインは、配列番号238のアミノ酸配列を含むCDR-H1、配列番号243のアミノ酸配列を含むCDR-H2、及び配列番号233のアミノ酸配列を含むCDR-H3を含み、前記VLドメインは、配列番号234のアミノ酸配列を含むCDR-L1、配列番号235のアミノ酸配列を含むCDR-L2、及び配列番号236のアミノ酸配列を含むCDR-L3を含む、請求項31に記載の抗体。
  34. 前記VHドメインは、配列番号238のアミノ酸配列を含むCDR-H1、配列番号243のアミノ酸配列を含むCDR-H2、及び配列番号233のアミノ酸配列を含むCDR-H3を含み、前記VLドメインは、配列番号16のアミノ酸配列を含むCDR-L1、配列番号17のアミノ酸配列を含むCDR-L2、及び配列番号228のアミノ酸配列を含むCDR-L3を含む、請求項31に記載の抗体。
  35. 前記VHドメインは、配列QVQLVQSGAEVKKPGSSVKVSCKAS(配列番号278)を含むFW-1、配列AISWVRQAPGQGLEWMGGI(配列番号279)を含むFW-2、配列ANYAQKFQGRVTITADESTSTAYMELSSLRSEDTAVYYCAR(配列番号280)を含むFW-3、及び配列WGQGTLVTVSS(配列番号277)を含むFW-4をさらに含み、前記VLドメインは、配列DIQMTQSPSSLSASVGDRVTITC(配列番号289)を含むFW-1、配列WYQQKPGKAPKLLIY(配列番号290)を含むFW-2、配列GVPSRFSGSGSGTDFTLTISSLQPEDFATYYC(配列番号291)を含むFW-3、及び配列FGGGTKVEIK(配列番号292)を含むFW-4をさらに含む、請求項31~34のいずれか1項に記載の抗体。
  36. 前記VHドメインは、配列番号245の配列と少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも99%、または100%同一であるアミノ酸配列を含み、前記VLドメインは、配列番号246の配列と少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも99%、または100%同一であるアミノ酸配列を含む、請求項26または請求項31に記載の抗体。
  37. 前記VHドメインは、配列番号251の配列と少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも99%、または100%同一であるアミノ酸配列を含み、前記VLドメインは、配列番号252の配列と少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも99%、または100%同一であるアミノ酸配列を含み、任意選択で、前記VHドメインは、配列番号251のアミノ酸配列を含み、前記VLドメインは、配列番号252のアミノ酸配列を含む、請求項26または請求項31に記載の抗体。
  38. 前記VHドメインは、配列番号253の配列と少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも99%、または100%同一であるアミノ酸配列を含み、前記VLドメインは、配列番号254の配列と少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも99%、または100%同一であるアミノ酸配列を含む、請求項26または請求項31に記載の抗体。
  39. CD8b及び/またはCD8abに特異的に結合するヒト化抗体またはその抗原結合フラグメントであって、前記抗体またはフラグメントは、重鎖可変(VH)ドメイン及び軽鎖可変(VL)ドメインを含み、
    前記VHドメインは、
    YXMSのアミノ酸配列であって、ここでXはS、D、E、A、またはQであり、XはA、G、またはTである前記アミノ酸配列(配列番号268)を含むCDR-H1、
    DIXGXTXYADSVKGのアミノ酸配列であって、ここでXはT、N、S、Q、E、H、R、またはAであり、XはY、W、F、またはHであり、XはA、S、Q、E、またはTであり、XはGまたはEであり、XはSまたはIであり、XはAまたはGである前記アミノ酸配列(配列番号269)を含むCDR-H2、及び
    YXWXAXDXのアミノ酸配列であって、ここでXはSまたはAであり、XはN、H、A、D、L、Q、Y、またはRであり、XはA、N、S、またはGであり、XはA、V、R、E、またはSであり、XはDまたはSであり、XはD、N、Q、E、S、T、またはLであり、XはL、F、またはMであり、XはI、Y、またはVである前記アミノ酸配列(配列番号270)を含むCDR-H3を含み、
    前記VLドメインは、
    アミノ酸配列RASQSVSSNLA(配列番号40)を含むCDR-L1、
    アミノ酸配列GASSRAT(配列番号41)を含むCDR-L2、及び
    アミノ酸配列QQYGSSPPVT(配列番号42)を含むCDR-L3を含む、前記ヒト化抗体またはその抗原結合フラグメント。
  40. 前記VHドメインは、配列番号229のアミノ酸配列を含むCDR-H1、配列番号230のアミノ酸配列を含むCDR-H2、及び配列番号231のアミノ酸配列を含むCDR-H3を含む、請求項39に記載の抗体。
  41. 前記VHドメインは、配列番号229のアミノ酸配列を含むCDR-H1、配列番号237のアミノ酸配列を含むCDR-H2、及び配列番号231のアミノ酸配列を含むCDR-H3を含む、請求項39に記載の抗体。
  42. 前記VHドメインは、配列EVQLVESGGGLVQPGGSLRLSCAASGFTFS(配列番号281)を含むFW-1、配列WVRQAPGKGLEWVS(配列番号282)を含むFW-2、配列RFTISRDNAKNSLYLQMNSLRAEDTAVYYCAR(配列番号283)を含むFW-3、及び配列WGQGTMVTVSS(配列番号284)またはWGQGTLVTVSS(配列番号285)を含むFW-4をさらに含み、前記VLドメインは、配列EIVLTQSPGTLSLSPGERATLSC(配列番号293)を含むFW-1、配列WYQQKPGQAPRLLIY(配列番号294)を含むFW-2、配列GIPDRFSGSGSGTDFTLTISRLEPEDFAVYYC(配列番号295)を含むFW-3、及び配列FGQGTKVEIK(配列番号296)を含むFW-4をさらに含む、請求項39~41のいずれか1項に記載の抗体。
  43. CD8b及び/またはCD8abに特異的に結合するヒト化抗体またはその抗原結合フラグメントであって、前記抗体またはフラグメントは、重鎖可変(VH)ドメイン及び軽鎖可変(VL)ドメインを含み、
    前記VHドメインは、
    GFTFXYのアミノ酸配列であって、ここでXはS、D、E、Q、S、またはAであり、XはS、D、E、A、またはQである前記アミノ酸配列(配列番号271)を含むCDR-H1、
    GXのアミノ酸配列であって、ここでXはT、N、S、Q、E、H、R、またはAであり、XはY、W、F、またはHであり、XはA、S、Q、E、またはTであり、XはGまたはEであり、XはSまたはIである前記アミノ酸配列(配列番号272)を含むCDR-H2、及び
    YXWXAXDXのアミノ酸配列であって、ここでXはSまたはAであり、XはN、H、A、D、L、Q、Y、またはRであり、XはA、N、S、またはGであり、XはA、V、R、E、またはSであり、XはDまたはSであり、XはD、N、Q、E、S、T、またはLであり、XはL、F、またはMであり、XはI、Y、またはVである前記アミノ酸配列(配列番号273)を含むCDR-H3を含み、
    前記VLドメインは、
    アミノ酸配列RASQSVSSNLA(配列番号40)を含むCDR-L1、
    アミノ酸配列GASSRAT(配列番号41)を含むCDR-L2、及び
    アミノ酸配列QQYGSSPPVT(配列番号42)を含むCDR-L3を含む、前記ヒト化抗体またはその抗原結合フラグメント。
  44. 前記VHドメインは、配列番号240のアミノ酸配列を含むCDR-H1、配列番号241のアミノ酸配列を含むCDR-H2、及び配列番号242のアミノ酸配列を含むCDR-H3を含む、請求項43に記載の抗体。
  45. 前記VHドメインは、配列番号240のアミノ酸配列を含むCDR-H1、配列番号244のアミノ酸配列を含むCDR-H2、及び配列番号242のアミノ酸配列を含むCDR-H3を含む、請求項43に記載の抗体。
  46. 前記VHドメインは、配列EVQLVESGGGLVQPGGSLRLSCAAS(配列番号286)を含むFW-1、配列AMSWVRQAPGKGLEWVSDI(配列番号287)を含むFW-2、配列TAYADSVKGRFTISRDNAKNSLYLQMNSLRAEDTAVYYCAR(配列番号288)を含むFW-3、及び配列WGQGTMVTVSS(配列番号284)またはWGQGTLVTVSS(配列番号285)を含むFW-4をさらに含み、前記VLドメインは、配列EIVLTQSPGTLSLSPGERATLSC(配列番号293)を含むFW-1、配列WYQQKPGQAPRLLIY(配列番号294)を含むFW-2、配列GIPDRFSGSGSGTDFTLTISRLEPEDFAVYYC(配列番号295)を含むFW-3、及び配列FGQGTKVEIK(配列番号296)を含むFW-4をさらに含む、請求項43~45のいずれか1項に記載の抗体。
  47. 前記VHドメインは、配列番号247の配列と少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも99%、または100%同一であるアミノ酸配列を含み、前記VLドメインは、配列番号248の配列と少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも99%、または100%同一であるアミノ酸配列を含む、請求項39または請求項43に記載の抗体。
  48. 前記VHドメインは、配列番号249の配列と少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも99%、または100%同一であるアミノ酸配列を含み、前記VLドメインは、配列番号250の配列と少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも99%、または100%同一であるアミノ酸配列を含み、任意選択で、前記VHドメインは、配列番号249のアミノ酸配列を含み、前記VLドメインは、配列番号250のアミノ酸配列を含む、請求項39または請求項43に記載の抗体。
  49. 前記VHドメインは、配列番号255の配列と少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも99%、または100%同一であるアミノ酸配列を含み、前記VLドメインは、配列番号256の配列と少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも99%、または100%同一であるアミノ酸配列を含む、請求項39または請求項43に記載の抗体。
  50. 前記VHドメインは、配列番号257の配列と少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも99%、または100%同一であるアミノ酸配列を含み、前記VLドメインは、配列番号258の配列と少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも99%、または100%同一であるアミノ酸配列を含む、請求項39または請求項43に記載の抗体。
  51. 前記抗体は、多重特異性抗体である、請求項1~50のいずれか1項に記載の抗体。
  52. 前記抗体は、二重特異性抗体である、請求項51に記載の抗体。
  53. 融合タンパク質であって、以下:
    (a)請求項1~52のいずれか1項に記載の抗体またはフラグメントを含む第1の部分;及び
    (b)サイトカイン、ケモカイン、または増殖因子を含む第2の部分、を含み、
    前記第1の部分は、前記第2の部分に直接またはリンカーを介して融合する、前記融合タンパク質。
  54. 融合タンパク質であって、以下:
    (a)CD8b及び/またはCD8abに特異的に結合するヒトもしくはヒト化抗体またはその抗原結合フラグメントを含む第1の部分であって、前記抗体またはフラグメントは、重鎖可変(VH)ドメイン及び軽鎖可変(VL)ドメインを含み:
    前記VHドメインは、配列番号13のアミノ酸配列を含むCDR-H1、配列番号14のアミノ酸配列を含むCDR-H2、及び配列番号15のアミノ酸配列を含むCDR-H3を含み、前記VLドメインは、配列番号16のアミノ酸配列を含むCDR-L1、配列番号17のアミノ酸配列を含むCDR-L2、及び配列番号18のアミノ酸配列を含むCDR-L3を含む;
    前記VHドメインは、配列番号19のアミノ酸配列を含むCDR-H1、配列番号20のアミノ酸配列を含むCDR-H2、及び配列番号21のアミノ酸配列を含むCDR-H3を含み、前記VLドメインは、配列番号22のアミノ酸配列を含むCDR-L1、配列番号23のアミノ酸配列を含むCDR-L2、及び配列番号24のアミノ酸配列を含むCDR-L3を含む;
    前記VHドメインは、配列番号25のアミノ酸配列を含むCDR-H1、配列番号26のアミノ酸配列を含むCDR-H2、及び配列番号27のアミノ酸配列を含むCDR-H3を含み、前記VLドメインは、配列番号28のアミノ酸配列を含むCDR-L1、配列番号29のアミノ酸配列を含むCDR-L2、及び配列番号30のアミノ酸配列を含むCDR-L3を含む;
    前記VHドメインは、配列番号31のアミノ酸配列を含むCDR-H1、配列番号32のアミノ酸配列を含むCDR-H2、及び配列番号33のアミノ酸配列を含むCDR-H3を含み、前記VLドメインは、配列番号34のアミノ酸配列を含むCDR-L1、配列番号35のアミノ酸配列を含むCDR-L2、及び配列番号36のアミノ酸配列を含むCDR-L3を含む;
    前記VHドメインは、配列番号37のアミノ酸配列を含むCDR-H1、配列番号38のアミノ酸配列を含むCDR-H2、及び配列番号39のアミノ酸配列を含むCDR-H3を含み、前記VLドメインは、配列番号40のアミノ酸配列を含むCDR-L1、配列番号41のアミノ酸配列を含むCDR-L2、及び配列番号42のアミノ酸配列を含むCDR-L3を含む;
    前記VHドメインは、配列番号43のアミノ酸配列を含むCDR-H1、配列番号44のアミノ酸配列を含むCDR-H2、及び配列番号45のアミノ酸配列を含むCDR-H3を含み、前記VLドメインは、配列番号46のアミノ酸配列を含むCDR-L1、配列番号47のアミノ酸配列を含むCDR-L2、及び配列番号48のアミノ酸配列を含むCDR-L3を含む;
    前記VHドメインは、配列番号1のアミノ酸配列を含むCDR-H1、配列番号2のアミノ酸配列を含むCDR-H2、及び配列番号3のアミノ酸配列を含むCDR-H3を含み、前記VLドメインは、配列番号4のアミノ酸配列を含むCDR-L1、配列番号5のアミノ酸配列を含むCDR-L2、及び配列番号6のアミノ酸配列を含むCDR-L3を含む;
    前記VHドメインは、配列番号177のアミノ酸配列を含むCDR-H1、配列番号178のアミノ酸配列を含むCDR-H2、及び配列番号179のアミノ酸配列を含むCDR-H3を含み、前記VLドメインは、配列番号180のアミノ酸配列を含むCDR-L1、配列番号181のアミノ酸配列を含むCDR-L2、及び配列番号182のアミノ酸配列を含むCDR-L3を含む;
    前記VHドメインは、配列番号225のアミノ酸配列を含むCDR-H1、配列番号226のアミノ酸配列を含むCDR-H2、及び配列番号227のアミノ酸配列を含むCDR-H3を含み、前記VLドメインは、配列番号16のアミノ酸配列を含むCDR-L1、配列番号17のアミノ酸配列を含むCDR-L2、及び配列番号228のアミノ酸配列を含むCDR-L3を含む;
    前記VHドメインは、配列番号229のアミノ酸配列を含むCDR-H1、配列番号230のアミノ酸配列を含むCDR-H2、及び配列番号231のアミノ酸配列を含むCDR-H3を含み、前記VLドメインは、配列番号40のアミノ酸配列を含むCDR-L1、配列番号41のアミノ酸配列を含むCDR-L2、及び配列番号42のアミノ酸配列を含むCDR-L3を含む;
    前記VHドメインは、配列番号225のアミノ酸配列を含むCDR-H1、配列番号232のアミノ酸配列を含むCDR-H2、及び配列番号233のアミノ酸配列を含むCDR-H3を含み、前記VLドメインは、配列番号234のアミノ酸配列を含むCDR-L1、配列番号235のアミノ酸配列を含むCDR-L2、及び配列番号236のアミノ酸配列を含むCDR-L3を含む;
    前記VHドメインは、配列番号225のアミノ酸配列を含むCDR-H1、配列番号232のアミノ酸配列を含むCDR-H2、及び配列番号233のアミノ酸配列を含むCDR-H3を含み、前記VLドメインは、配列番号16のアミノ酸配列を含むCDR-L1、配列番号17のアミノ酸配列を含むCDR-L2、及び配列番号228のアミノ酸配列を含むCDR-L3を含む;または
    前記VHドメインは、配列番号229のアミノ酸配列を含むCDR-H1、配列番号237のアミノ酸配列を含むCDR-H2、及び配列番号231のアミノ酸配列を含むCDR-H3を含み、前記VLドメインは、配列番号40のアミノ酸配列を含むCDR-L1、配列番号41のアミノ酸配列を含むCDR-L2、及び配列番号42のアミノ酸配列を含むCDR-L3を含む、前記第1の部分、及び
    (b)サイトカイン、ケモカイン、または増殖因子を含む第2の部分、を含み、
    前記第1の部分は、前記第2の部分に直接またはリンカーを介して融合する、前記融合タンパク質。
  55. 融合タンパク質であって、以下:
    (a)CD8b及び/またはCD8abに特異的に結合するヒトもしくはヒト化抗体またはその抗原結合フラグメントを含む第1の部分であって、前記抗体またはフラグメントは、重鎖可変(VH)ドメイン及び軽鎖可変(VL)ドメインを含み:
    前記VHドメインは、配列番号51のアミノ酸配列を含むCDR-H1、配列番号52のアミノ酸配列を含むCDR-H2、及び配列番号15のアミノ酸配列を含むCDR-H3を含み、前記VLドメインは、配列番号16のアミノ酸配列を含むCDR-L1、配列番号17のアミノ酸配列を含むCDR-L2、及び配列番号18のアミノ酸配列を含むCDR-L3を含む;
    前記VHドメインは、配列番号53のアミノ酸配列を含むCDR-H1、配列番号52のアミノ酸配列を含むCDR-H2、及び配列番号21のアミノ酸配列を含むCDR-H3を含み、前記VLドメインは、配列番号22のアミノ酸配列を含むCDR-L1、配列番号23のアミノ酸配列を含むCDR-L2、及び配列番号24のアミノ酸配列を含むCDR-L3を含む;
    前記VHドメインは、配列番号49のアミノ酸配列を含むCDR-H1、配列番号52のアミノ酸配列を含むCDR-H2、及び配列番号27のアミノ酸配列を含むCDR-H3を含み、前記VLドメインは、配列番号28のアミノ酸配列を含むCDR-L1、配列番号29のアミノ酸配列を含むCDR-L2、及び配列番号30のアミノ酸配列を含むCDR-L3を含む;
    前記VHドメインは、配列番号54のアミノ酸配列を含むCDR-H1、配列番号52のアミノ酸配列を含むCDR-H2、及び配列番号33のアミノ酸配列を含むCDR-H3を含み、前記VLドメインは、配列番号34のアミノ酸配列を含むCDR-L1、配列番号35のアミノ酸配列を含むCDR-L2、及び配列番号36のアミノ酸配列を含むCDR-L3を含む;
    前記VHドメインは、配列番号55のアミノ酸配列を含むCDR-H1、配列番号56のアミノ酸配列を含むCDR-H2、及び配列番号39のアミノ酸配列を含むCDR-H3を含み、前記VLドメインは、配列番号40のアミノ酸配列を含むCDR-L1、配列番号41のアミノ酸配列を含むCDR-L2、及び配列番号42のアミノ酸配列を含むCDR-L3を含む;
    前記VHドメインは、配列番号55のアミノ酸配列を含むCDR-H1、配列番号57のアミノ酸配列を含むCDR-H2、及び配列番号45のアミノ酸配列を含むCDR-H3を含み、前記VLドメインは、配列番号46のアミノ酸配列を含むCDR-L1、配列番号47のアミノ酸配列を含むCDR-L2、及び配列番号48のアミノ酸配列を含むCDR-L3を含む;
    前記VHドメインは、配列番号49のアミノ酸配列を含むCDR-H1、配列番号50のアミノ酸配列を含むCDR-H2、及び配列番号3のアミノ酸配列を含むCDR-H3を含み、前記VLドメインは、配列番号4のアミノ酸配列を含むCDR-L1、配列番号5のアミノ酸配列を含むCDR-L2、及び配列番号6のアミノ酸配列を含むCDR-L3を含む;
    前記VHドメインは、配列番号183のアミノ酸配列を含むCDR-H1、配列番号184のアミノ酸配列を含むCDR-H2、及び配列番号179のアミノ酸配列を含むCDR-H3を含み、前記VLドメインは、配列番号180のアミノ酸配列を含むCDR-L1、配列番号181のアミノ酸配列を含むCDR-L2、及び配列番号182のアミノ酸配列を含むCDR-L3を含む;
    前記VHドメインは、配列番号238のアミノ酸配列を含むCDR-H1、配列番号239のアミノ酸配列を含むCDR-H2、及び配列番号233のアミノ酸配列を含むCDR-H3を含み、前記VLドメインは、配列番号16のアミノ酸配列を含むCDR-L1、配列番号17のアミノ酸配列を含むCDR-L2、及び配列番号228のアミノ酸配列を含むCDR-L3を含む;
    前記VHドメインは、配列番号240のアミノ酸配列を含むCDR-H1、配列番号241のアミノ酸配列を含むCDR-H2、及び配列番号242のアミノ酸配列を含むCDR-H3を含み、前記VLドメインは、配列番号40のアミノ酸配列を含むCDR-L1、配列番号41のアミノ酸配列を含むCDR-L2、及び配列番号42のアミノ酸配列を含むCDR-L3を含む;
    前記VHドメインは、配列番号238のアミノ酸配列を含むCDR-H1、配列番号243のアミノ酸配列を含むCDR-H2、及び配列番号233のアミノ酸配列を含むCDR-H3を含み、前記VLドメインは、配列番号234のアミノ酸配列を含むCDR-L1、配列番号235のアミノ酸配列を含むCDR-L2、及び配列番号236のアミノ酸配列を含むCDR-L3を含む;
    前記VHドメインは、配列番号238のアミノ酸配列を含むCDR-H1、配列番号243のアミノ酸配列を含むCDR-H2、及び配列番号233のアミノ酸配列を含むCDR-H3を含み、前記VLドメインは、配列番号16のアミノ酸配列を含むCDR-L1、配列番号17のアミノ酸配列を含むCDR-L2、及び配列番号228のアミノ酸配列を含むCDR-L3を含む;または
    前記VHドメインは、配列番号240のアミノ酸配列を含むCDR-H1、配列番号244のアミノ酸配列を含むCDR-H2、及び配列番号242のアミノ酸配列を含むCDR-H3を含み、前記VLドメインは、配列番号40のアミノ酸配列を含むCDR-L1、配列番号41のアミノ酸配列を含むCDR-L2、及び配列番号42のアミノ酸配列を含むCDR-L3を含む、前記第1の部分、及び
    (b)サイトカイン、ケモカイン、または増殖因子を含む第2の部分、を含み、
    前記第1の部分は、前記第2の部分に直接またはリンカーを介して融合する、前記融合タンパク質。
  56. 前記第2の部分は、CD8+T細胞の活性化を誘導する、請求項53~55のいずれか1項に記載の融合タンパク質。
  57. 前記融合タンパク質は、ヒトCD8aaホモ二量体を発現している細胞の活性化よりも少なくとも10倍高い効力を持って、ヒトCD8abヘテロ二量体を発現している細胞の活性化を誘導する、請求項56に記載の融合タンパク質。
  58. 前記融合タンパク質は、NK細胞の活性化よりも少なくとも10倍高い効力を持って、CD8+T細胞の活性化を誘導する、請求項56に記載の融合タンパク質。
  59. 活性化の効力は、細胞増殖によって評価されるEC50により測られる、請求項57または請求項58に記載の融合タンパク質。
  60. 前記第1の部分は、N末端からC末端までの式[I]による構造を含む2つの抗体重鎖ポリペプチド:
    VH-CH1-ヒンジ-CH2-CH3 [I]
    及びN末端からC末端までの式[II]による構造を含む2つの抗体軽鎖ポリペプチド:
    VL-CL [II]
    を含み(式中、VHは前記VHドメインであり、CH1は抗体CH1ドメインであり、ヒンジは抗体ヒンジドメインであり、CH2-CH3は抗体Fcドメインであり、VLは前記VLドメインであり、CLは抗体定常軽鎖ドメインである)、
    前記第2の部分のN末端は、前記2つのCH3ドメインのうちの1つのC末端に融合する、請求項53~59のいずれか1項に記載の融合タンパク質。
  61. 前記第1の部分は、N末端からC末端までの式[I]による構造を含む第1の抗体重鎖ポリペプチド:
    VH-CH1-ヒンジ-CH2-CH3 [I]、
    N末端からC末端までの式[II]による構造を含む抗体軽鎖ポリペプチド:
    VL-CL [II]、
    及びN末端からC末端までの式[III]による構造を含む第2の抗体重鎖ポリペプチド:
    ヒンジ-CH2-CH3 [III]、
    を含み(式中、VHは前記VHドメインであり、CH1は抗体CH1ドメインであり、ヒンジは抗体ヒンジドメインであり、CH2-CH3は抗体Fcドメインであり、VLは前記VLドメインであり、CLは抗体定常軽鎖ドメインである)、
    前記第2の部分のN末端は、前記第2の抗体重鎖ポリペプチドの前記CH3ドメインのC末端に融合する、請求項53~59のいずれか1項に記載の融合タンパク質。
  62. 前記第1の部分は、N末端からC末端までの式[I]による構造を含む第1の抗体重鎖ポリペプチド:
    VH-CH1-ヒンジ-CH2-CH3 [I]、
    N末端からC末端までの式[II]による構造を含む抗体軽鎖ポリペプチド:
    VL-CL [II]、
    及びN末端からC末端までの式[III]による構造を含む第2の抗体重鎖ポリペプチド:
    ヒンジ-CH2-CH3 [III]、
    を含み(式中、VHは前記VHドメインであり、CH1は抗体CH1ドメインであり、ヒンジは抗体ヒンジドメインであり、CH2-CH3は抗体Fcドメインであり、VLは前記VLドメインであり、CLは抗体定常軽鎖ドメインである)、
    前記第2の部分のC末端は、前記第2の抗体重鎖ポリペプチドの前記ヒンジドメインのN末端に融合する、請求項53~59のいずれか1項に記載の融合タンパク質。
  63. 前記第1の部分は、N末端からC末端までの式[I]による構造を含む第1の抗体重鎖ポリペプチド:
    VH-CH1-ヒンジ-CH2-CH3 [I]、
    N末端からC末端までの式[II]による構造を含む抗体軽鎖ポリペプチド:
    VL-CL [II]、
    及びN末端からC末端までの式[III]による構造を含む第2の抗体重鎖ポリペプチド:
    ヒンジ-CH2-CH3 [III]、
    を含み(式中、VHは前記VHドメインであり、CH1は抗体CH1ドメインであり、ヒンジは抗体ヒンジドメインであり、CH2-CH3は抗体Fcドメインであり、VLは前記VLドメインであり、CLは抗体定常軽鎖ドメインである)、
    前記第2の部分のN末端は、前記第1の抗体重鎖ポリペプチドの前記CH3ドメインのC末端に融合する、請求項53~59のいずれか1項に記載の融合タンパク質。
  64. 請求項60に記載の融合タンパク質であって:
    両抗体重鎖ポリペプチドの前記VHドメインは、配列番号13のアミノ酸配列を含むCDR-H1、配列番号14のアミノ酸配列を含むCDR-H2、及び配列番号15のアミノ酸配列を含むCDR-H3を含み、両抗体軽鎖ポリペプチドの前記VLドメインは、配列番号16のアミノ酸配列を含むCDR-L1、配列番号17のアミノ酸配列を含むCDR-L2、及び配列番号18のアミノ酸配列を含むCDR-L3を含む;
    両抗体重鎖ポリペプチドの前記VHドメインは、配列番号19のアミノ酸配列を含むCDR-H1、配列番号20のアミノ酸配列を含むCDR-H2、及び配列番号21のアミノ酸配列を含むCDR-H3を含み、両抗体軽鎖ポリペプチドの前記VLドメインは、配列番号22のアミノ酸配列を含むCDR-L1、配列番号23のアミノ酸配列を含むCDR-L2、及び配列番号24のアミノ酸配列を含むCDR-L3を含む;
    両抗体重鎖ポリペプチドの前記VHドメインは、配列番号25のアミノ酸配列を含むCDR-H1、配列番号26のアミノ酸配列を含むCDR-H2、及び配列番号27のアミノ酸配列を含むCDR-H3を含み、両抗体軽鎖ポリペプチドの前記VLドメインは、配列番号28のアミノ酸配列を含むCDR-L1、配列番号29のアミノ酸配列を含むCDR-L2、及び配列番号30のアミノ酸配列を含むCDR-L3を含む;
    両抗体重鎖ポリペプチドの前記VHドメインは、配列番号31のアミノ酸配列を含むCDR-H1、配列番号32のアミノ酸配列を含むCDR-H2、及び配列番号33のアミノ酸配列を含むCDR-H3を含み、両抗体軽鎖ポリペプチドの前記VLドメインは、配列番号34のアミノ酸配列を含むCDR-L1、配列番号35のアミノ酸配列を含むCDR-L2、及び配列番号36のアミノ酸配列を含むCDR-L3を含む;
    両抗体重鎖ポリペプチドの前記VHドメインは、配列番号37のアミノ酸配列を含むCDR-H1、配列番号38のアミノ酸配列を含むCDR-H2、及び配列番号39のアミノ酸配列を含むCDR-H3を含み、両抗体軽鎖ポリペプチドの前記VLドメインは、配列番号40のアミノ酸配列を含むCDR-L1、配列番号41のアミノ酸配列を含むCDR-L2、及び配列番号42のアミノ酸配列を含むCDR-L3を含む;
    両抗体重鎖ポリペプチドの前記VHドメインは、配列番号43のアミノ酸配列を含むCDR-H1、配列番号44のアミノ酸配列を含むCDR-H2、及び配列番号45のアミノ酸配列を含むCDR-H3を含み、両抗体軽鎖ポリペプチドの前記VLドメインは、配列番号46のアミノ酸配列を含むCDR-L1、配列番号47のアミノ酸配列を含むCDR-L2、及び配列番号48のアミノ酸配列を含むCDR-L3を含む;
    両抗体重鎖ポリペプチドの前記VHドメインは、配列番号1のアミノ酸配列を含むCDR-H1、配列番号2のアミノ酸配列を含むCDR-H2、及び配列番号3のアミノ酸配列を含むCDR-H3を含み、両抗体軽鎖ポリペプチドの前記VLドメインは、配列番号4のアミノ酸配列を含むCDR-L1、配列番号5のアミノ酸配列を含むCDR-L2、及び配列番号6のアミノ酸配列を含むCDR-L3を含む;
    両抗体重鎖ポリペプチドの前記VHドメインは、配列番号177のアミノ酸配列を含むCDR-H1、配列番号178のアミノ酸配列を含むCDR-H2、及び配列番号179のアミノ酸配列を含むCDR-H3を含み、両抗体軽鎖ポリペプチドの前記VLドメインは、配列番号180のアミノ酸配列を含むCDR-L1、配列番号181のアミノ酸配列を含むCDR-L2、及び配列番号182のアミノ酸配列を含むCDR-L3を含む;
    両抗体重鎖ポリペプチドの前記VHドメインは、配列番号225のアミノ酸配列を含むCDR-H1、配列番号226のアミノ酸配列を含むCDR-H2、及び配列番号227のアミノ酸配列を含むCDR-H3を含み、両抗体軽鎖ポリペプチドの前記VLドメインは、配列番号16のアミノ酸配列を含むCDR-L1、配列番号17のアミノ酸配列を含むCDR-L2、及び配列番号228のアミノ酸配列を含むCDR-L3を含む;
    両抗体重鎖ポリペプチドの前記VHドメインは、配列番号229のアミノ酸配列を含むCDR-H1、配列番号230のアミノ酸配列を含むCDR-H2、及び配列番号231のアミノ酸配列を含むCDR-H3を含み、両抗体軽鎖ポリペプチドの前記VLドメインは、配列番号40のアミノ酸配列を含むCDR-L1、配列番号41のアミノ酸配列を含むCDR-L2、及び配列番号42のアミノ酸配列を含むCDR-L3を含む;
    両抗体重鎖ポリペプチドの前記VHドメインは、配列番号225のアミノ酸配列を含むCDR-H1、配列番号232のアミノ酸配列を含むCDR-H2、及び配列番号233のアミノ酸配列を含むCDR-H3を含み、両抗体軽鎖ポリペプチドの前記VLドメインは、配列番号234のアミノ酸配列を含むCDR-L1、配列番号235のアミノ酸配列を含むCDR-L2、及び配列番号236のアミノ酸配列を含むCDR-L3を含む;
    両抗体重鎖ポリペプチドの前記VHドメインは、配列番号225のアミノ酸配列を含むCDR-H1、配列番号232のアミノ酸配列を含むCDR-H2、及び配列番号233のアミノ酸配列を含むCDR-H3を含み、両抗体軽鎖ポリペプチドの前記VLドメインは、配列番号16のアミノ酸配列を含むCDR-L1、配列番号17のアミノ酸配列を含むCDR-L2、及び配列番号228のアミノ酸配列を含むCDR-L3を含む;または
    両抗体重鎖ポリペプチドの前記VHドメインは、配列番号229のアミノ酸配列を含むCDR-H1、配列番号237のアミノ酸配列を含むCDR-H2、及び配列番号231のアミノ酸配列を含むCDR-H3を含み、両抗体軽鎖ポリペプチドの前記VLドメインは、配列番号40のアミノ酸配列を含むCDR-L1、配列番号41のアミノ酸配列を含むCDR-L2、及び配列番号42のアミノ酸配列を含むCDR-L3を含む、前記融合タンパク質。
  65. 請求項60に記載の融合タンパク質であって:
    両抗体重鎖ポリペプチドの前記VHドメインは、配列番号51のアミノ酸配列を含むCDR-H1、配列番号52のアミノ酸配列を含むCDR-H2、及び配列番号15のアミノ酸配列を含むCDR-H3を含み、両抗体軽鎖ポリペプチドの前記VLドメインは、配列番号16のアミノ酸配列を含むCDR-L1、配列番号17のアミノ酸配列を含むCDR-L2、及び配列番号18のアミノ酸配列を含むCDR-L3を含む;
    両抗体重鎖ポリペプチドの前記VHドメインは、配列番号53のアミノ酸配列を含むCDR-H1、配列番号52のアミノ酸配列を含むCDR-H2、及び配列番号21のアミノ酸配列を含むCDR-H3を含み、両抗体軽鎖ポリペプチドの前記VLドメインは、配列番号22のアミノ酸配列を含むCDR-L1、配列番号23のアミノ酸配列を含むCDR-L2、及び配列番号24のアミノ酸配列を含むCDR-L3を含む;
    両抗体重鎖ポリペプチドの前記VHドメインは、配列番号49のアミノ酸配列を含むCDR-H1、配列番号52のアミノ酸配列を含むCDR-H2、及び配列番号27のアミノ酸配列を含むCDR-H3を含み、両抗体軽鎖ポリペプチドの前記VLドメインは、配列番号28のアミノ酸配列を含むCDR-L1、配列番号29のアミノ酸配列を含むCDR-L2、及び配列番号30のアミノ酸配列を含むCDR-L3を含む;
    両抗体重鎖ポリペプチドの前記VHドメインは、配列番号54のアミノ酸配列を含むCDR-H1、配列番号52のアミノ酸配列を含むCDR-H2、及び配列番号33のアミノ酸配列を含むCDR-H3を含み、両抗体軽鎖ポリペプチドの前記VLドメインは、配列番号34のアミノ酸配列を含むCDR-L1、配列番号35のアミノ酸配列を含むCDR-L2、及び配列番号36のアミノ酸配列を含むCDR-L3を含む;
    両抗体重鎖ポリペプチドの前記VHドメインは、配列番号55のアミノ酸配列を含むCDR-H1、配列番号56のアミノ酸配列を含むCDR-H2、及び配列番号39のアミノ酸配列を含むCDR-H3を含み、両抗体軽鎖ポリペプチドの前記VLドメインは、配列番号40のアミノ酸配列を含むCDR-L1、配列番号41のアミノ酸配列を含むCDR-L2、及び配列番号42のアミノ酸配列を含むCDR-L3を含む;
    両抗体重鎖ポリペプチドの前記VHドメインは、配列番号55のアミノ酸配列を含むCDR-H1、配列番号57のアミノ酸配列を含むCDR-H2、及び配列番号45のアミノ酸配列を含むCDR-H3を含み、両抗体軽鎖ポリペプチドの前記VLドメインは、配列番号46のアミノ酸配列を含むCDR-L1、配列番号47のアミノ酸配列を含むCDR-L2、及び配列番号48のアミノ酸配列を含むCDR-L3を含む;
    両抗体重鎖ポリペプチドの前記VHドメインは、配列番号49のアミノ酸配列を含むCDR-H1、配列番号50のアミノ酸配列を含むCDR-H2、及び配列番号3のアミノ酸配列を含むCDR-H3を含み、両抗体軽鎖ポリペプチドの前記VLドメインは、配列番号4のアミノ酸配列を含むCDR-L1、配列番号5のアミノ酸配列を含むCDR-L2、及び配列番号6のアミノ酸配列を含むCDR-L3を含む;
    両抗体重鎖ポリペプチドの前記VHドメインは、配列番号183のアミノ酸配列を含むCDR-H1、配列番号184のアミノ酸配列を含むCDR-H2、及び配列番号179のアミノ酸配列を含むCDR-H3を含み、両抗体軽鎖ポリペプチドの前記VLドメインは、配列番号180のアミノ酸配列を含むCDR-L1、配列番号181のアミノ酸配列を含むCDR-L2、及び配列番号182のアミノ酸配列を含むCDR-L3を含む;
    両抗体重鎖ポリペプチドの前記VHドメインは、配列番号238のアミノ酸配列を含むCDR-H1、配列番号239のアミノ酸配列を含むCDR-H2、及び配列番号233のアミノ酸配列を含むCDR-H3を含み、両抗体軽鎖ポリペプチドの前記VLドメインは、配列番号16のアミノ酸配列を含むCDR-L1、配列番号17のアミノ酸配列を含むCDR-L2、及び配列番号228のアミノ酸配列を含むCDR-L3を含む;
    両抗体重鎖ポリペプチドの前記VHドメインは、配列番号240のアミノ酸配列を含むCDR-H1、配列番号241のアミノ酸配列を含むCDR-H2、及び配列番号242のアミノ酸配列を含むCDR-H3を含み、両抗体軽鎖ポリペプチドの前記VLドメインは、配列番号40のアミノ酸配列を含むCDR-L1、配列番号41のアミノ酸配列を含むCDR-L2、及び配列番号42のアミノ酸配列を含むCDR-L3を含む;
    両抗体重鎖ポリペプチドの前記VHドメインは、配列番号238のアミノ酸配列を含むCDR-H1、配列番号243のアミノ酸配列を含むCDR-H2、及び配列番号233のアミノ酸配列を含むCDR-H3を含み、両抗体軽鎖ポリペプチドの前記VLドメインは、配列番号234のアミノ酸配列を含むCDR-L1、配列番号235のアミノ酸配列を含むCDR-L2、及び配列番号236のアミノ酸配列を含むCDR-L3を含む;
    両抗体重鎖ポリペプチドの前記VHドメインは、配列番号238のアミノ酸配列を含むCDR-H1、配列番号243のアミノ酸配列を含むCDR-H2、及び配列番号233のアミノ酸配列を含むCDR-H3を含み、両抗体軽鎖ポリペプチドの前記VLドメインは、配列番号16のアミノ酸配列を含むCDR-L1、配列番号17のアミノ酸配列を含むCDR-L2、及び配列番号228のアミノ酸配列を含むCDR-L3を含む;または
    両抗体重鎖ポリペプチドの前記VHドメインは、配列番号240のアミノ酸配列を含むCDR-H1、配列番号244のアミノ酸配列を含むCDR-H2、及び配列番号242のアミノ酸配列を含むCDR-H3を含み、両抗体軽鎖ポリペプチドの前記VLドメインは、配列番号40のアミノ酸配列を含むCDR-L1、配列番号41のアミノ酸配列を含むCDR-L2、及び配列番号42のアミノ酸配列を含むCDR-L3を含む、前記融合タンパク質。
  66. 請求項60、64、または65に記載の融合タンパク質であって:
    両抗体重鎖ポリペプチドの前記VHドメインは、配列番号62の配列と少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも99%、または100%同一であるアミノ酸配列を含み、両抗体軽鎖ポリペプチドの前記VLドメインは、配列番号63の配列と少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも99%、または100%同一であるアミノ酸配列を含み、任意選択で、両抗体重鎖ポリペプチドの前記VHドメインは、配列番号62のアミノ酸配列を含み、両抗体軽鎖ポリペプチドの前記VLドメインは、配列番号63のアミノ酸配列を含む;
    両抗体重鎖ポリペプチドの前記VHドメインは、配列番号64の配列と少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも99%、または100%同一であるアミノ酸配列を含み、両抗体軽鎖ポリペプチドの前記VLドメインは、配列番号65の配列と少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも99%、または100%同一であるアミノ酸配列を含み、任意選択で、両抗体重鎖ポリペプチドの前記VHドメインは、配列番号64のアミノ酸配列を含み、両抗体軽鎖ポリペプチドの前記VLドメインは、配列番号65のアミノ酸配列を含む;
    両抗体重鎖ポリペプチドの前記VHドメインは、配列番号66の配列と少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも99%、または100%同一であるアミノ酸配列を含み、両抗体軽鎖ポリペプチドの前記VLドメインは、配列番号67の配列と少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも99%、または100%同一であるアミノ酸配列を含み、任意選択で、両抗体重鎖ポリペプチドの前記VHドメインは、配列番号66のアミノ酸配列を含み、両抗体軽鎖ポリペプチドの前記VLドメインは、配列番号67のアミノ酸配列を含む;
    両抗体重鎖ポリペプチドの前記VHドメインは、配列番号68の配列と少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも99%、または100%同一であるアミノ酸配列を含み、両抗体軽鎖ポリペプチドの前記VLドメインは、配列番号69の配列と少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも99%、または100%同一であるアミノ酸配列を含み、任意選択で、両抗体重鎖ポリペプチドの前記VHドメインは、配列番号68のアミノ酸配列を含み、両抗体軽鎖ポリペプチドの前記VLドメインは、配列番号69のアミノ酸配列を含む;
    両抗体重鎖ポリペプチドの前記VHドメインは、配列番号70の配列と少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも99%、または100%同一であるアミノ酸配列を含み、両抗体軽鎖ポリペプチドの前記VLドメインは、配列番号71の配列と少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも99%、または100%同一であるアミノ酸配列を含み、任意選択で、両抗体重鎖ポリペプチドの前記VHドメインは、配列番号70のアミノ酸配列を含み、両抗体軽鎖ポリペプチドの前記VLドメインは、配列番号71のアミノ酸配列を含む;
    両抗体重鎖ポリペプチドの前記VHドメインは、配列番号72の配列と少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも99%、または100%同一であるアミノ酸配列を含み、両抗体軽鎖ポリペプチドの前記VLドメインは、配列番号73の配列と少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも99%、または100%同一であるアミノ酸配列を含み、任意選択で、両抗体重鎖ポリペプチドの前記VHドメインは、配列番号72のアミノ酸配列を含み、両抗体軽鎖ポリペプチドの前記VLドメインは、配列番号73のアミノ酸配列を含む;
    両抗体重鎖ポリペプチドの前記VHドメインは、配列番号185の配列と少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも99%、または100%同一であるアミノ酸配列を含み、両抗体軽鎖ポリペプチドの前記VLドメインは、配列番号186の配列と少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも99%、または100%同一であるアミノ酸配列を含み、任意選択で、両抗体重鎖ポリペプチドの前記VHドメインは、配列番号185のアミノ酸配列を含み、両抗体軽鎖ポリペプチドの前記VLドメインは、配列番号186のアミノ酸配列を含む;
    両抗体重鎖ポリペプチドの前記VHドメインは、配列番号245の配列と少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも99%、または100%同一であるアミノ酸配列を含み、両抗体軽鎖ポリペプチドの前記VLドメインは、配列番号246の配列と少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも99%、または100%同一であるアミノ酸配列を含み、任意選択で、両抗体重鎖ポリペプチドの前記VHドメインは、配列番号245のアミノ酸配列を含み、両抗体軽鎖ポリペプチドの前記VLドメインは、配列番号246のアミノ酸配列を含む;
    両抗体重鎖ポリペプチドの前記VHドメインは、配列番号251の配列と少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも99%、または100%同一であるアミノ酸配列を含み、両抗体軽鎖ポリペプチドの前記VLドメインは、配列番号252の配列と少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも99%、または100%同一であるアミノ酸配列を含み、任意選択で、両抗体重鎖ポリペプチドの前記VHドメインは、配列番号251のアミノ酸配列を含み、両抗体軽鎖ポリペプチドの前記VLドメインは、配列番号252のアミノ酸配列を含む;
    両抗体重鎖ポリペプチドの前記VHドメインは、配列番号253の配列と少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも99%、または100%同一であるアミノ酸配列を含み、両抗体軽鎖ポリペプチドの前記VLドメインは、配列番号254の配列と少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも99%、または100%同一であるアミノ酸配列を含み、任意選択で、両抗体重鎖ポリペプチドの前記VHドメインは、配列番号253のアミノ酸配列を含み、両抗体軽鎖ポリペプチドの前記VLドメインは、配列番号254のアミノ酸配列を含む;
    両抗体重鎖ポリペプチドの前記VHドメインは、配列番号247の配列と少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも99%、または100%同一であるアミノ酸配列を含み、両抗体軽鎖ポリペプチドの前記VLドメインは、配列番号248の配列と少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも99%、または100%同一であるアミノ酸配列を含み、任意選択で、両抗体重鎖ポリペプチドの前記VHドメインは、配列番号247のアミノ酸配列を含み、両抗体軽鎖ポリペプチドの前記VLドメインは、配列番号248のアミノ酸配列を含む;
    両抗体重鎖ポリペプチドの前記VHドメインは、配列番号249の配列と少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも99%、または100%同一であるアミノ酸配列を含み、両抗体軽鎖ポリペプチドの前記VLドメインは、配列番号250の配列と少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも99%、または100%同一であるアミノ酸配列を含み、任意選択で、両抗体重鎖ポリペプチドの前記VHドメインは、配列番号249のアミノ酸配列を含み、両抗体軽鎖ポリペプチドの前記VLドメインは、配列番号250のアミノ酸配列を含む;
    両抗体重鎖ポリペプチドの前記VHドメインは、配列番号255の配列と少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも99%、または100%同一であるアミノ酸配列を含み、両抗体軽鎖ポリペプチドの前記VLドメインは、配列番号256の配列と少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも99%、または100%同一であるアミノ酸配列を含み、任意選択で、両抗体重鎖ポリペプチドの前記VHドメインは、配列番号255のアミノ酸配列を含み、両抗体軽鎖ポリペプチドの前記VLドメインは、配列番号256のアミノ酸配列を含む;または
    両抗体重鎖ポリペプチドの前記VHドメインは、配列番号257の配列と少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも99%、または100%同一であるアミノ酸配列を含み、両抗体軽鎖ポリペプチドの前記VLドメインは、配列番号258の配列と少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも99%、または100%同一であるアミノ酸配列を含み、任意選択で、両抗体重鎖ポリペプチドの前記VHドメインは、配列番号257のアミノ酸配列を含み、両抗体軽鎖ポリペプチドの前記VLドメインは、配列番号258のアミノ酸配列を含む、前記融合タンパク質。
  67. 請求項61~63のいずれか1項に記載の融合タンパク質であって:
    前記VHドメインは、配列番号13のアミノ酸配列を含むCDR-H1、配列番号14のアミノ酸配列を含むCDR-H2、及び配列番号15のアミノ酸配列を含むCDR-H3を含み、前記VLドメインは、配列番号16のアミノ酸配列を含むCDR-L1、配列番号17のアミノ酸配列を含むCDR-L2、及び配列番号18のアミノ酸配列を含むCDR-L3を含む;
    前記VHドメインは、配列番号19のアミノ酸配列を含むCDR-H1、配列番号20のアミノ酸配列を含むCDR-H2、及び配列番号21のアミノ酸配列を含むCDR-H3を含み、前記VLドメインは、配列番号22のアミノ酸配列を含むCDR-L1、配列番号23のアミノ酸配列を含むCDR-L2、及び配列番号24のアミノ酸配列を含むCDR-L3を含む;
    前記VHドメインは、配列番号25のアミノ酸配列を含むCDR-H1、配列番号26のアミノ酸配列を含むCDR-H2、及び配列番号27のアミノ酸配列を含むCDR-H3を含み、前記VLドメインは、配列番号28のアミノ酸配列を含むCDR-L1、配列番号29のアミノ酸配列を含むCDR-L2、及び配列番号30のアミノ酸配列を含むCDR-L3を含む;
    前記VHドメインは、配列番号31のアミノ酸配列を含むCDR-H1、配列番号32のアミノ酸配列を含むCDR-H2、及び配列番号33のアミノ酸配列を含むCDR-H3を含み、前記VLドメインは、配列番号34のアミノ酸配列を含むCDR-L1、配列番号35のアミノ酸配列を含むCDR-L2、及び配列番号36のアミノ酸配列を含むCDR-L3を含む;
    前記VHドメインは、配列番号37のアミノ酸配列を含むCDR-H1、配列番号38のアミノ酸配列を含むCDR-H2、及び配列番号39のアミノ酸配列を含むCDR-H3を含み、前記VLドメインは、配列番号40のアミノ酸配列を含むCDR-L1、配列番号41のアミノ酸配列を含むCDR-L2、及び配列番号42のアミノ酸配列を含むCDR-L3を含む;
    前記VHドメインは、配列番号43のアミノ酸配列を含むCDR-H1、配列番号44のアミノ酸配列を含むCDR-H2、及び配列番号45のアミノ酸配列を含むCDR-H3を含み、前記VLドメインは、配列番号46のアミノ酸配列を含むCDR-L1、配列番号47のアミノ酸配列を含むCDR-L2、及び配列番号48のアミノ酸配列を含むCDR-L3を含む;
    前記VHドメインは、配列番号1のアミノ酸配列を含むCDR-H1、配列番号2のアミノ酸配列を含むCDR-H2、及び配列番号3のアミノ酸配列を含むCDR-H3を含み、前記VLドメインは、配列番号4のアミノ酸配列を含むCDR-L1、配列番号5のアミノ酸配列を含むCDR-L2、及び配列番号6のアミノ酸配列を含むCDR-L3を含む;
    前記VHドメインは、配列番号177のアミノ酸配列を含むCDR-H1、配列番号178のアミノ酸配列を含むCDR-H2、及び配列番号179のアミノ酸配列を含むCDR-H3を含み、前記VLドメインは、配列番号180のアミノ酸配列を含むCDR-L1、配列番号181のアミノ酸配列を含むCDR-L2、及び配列番号182のアミノ酸配列を含むCDR-L3を含む;
    前記VHドメインは、配列番号225のアミノ酸配列を含むCDR-H1、配列番号226のアミノ酸配列を含むCDR-H2、及び配列番号227のアミノ酸配列を含むCDR-H3を含み、前記VLドメインは、配列番号16のアミノ酸配列を含むCDR-L1、配列番号17のアミノ酸配列を含むCDR-L2、及び配列番号228のアミノ酸配列を含むCDR-L3を含む;
    前記VHドメインは、配列番号229のアミノ酸配列を含むCDR-H1、配列番号230のアミノ酸配列を含むCDR-H2、及び配列番号231のアミノ酸配列を含むCDR-H3を含み、前記VLドメインは、配列番号40のアミノ酸配列を含むCDR-L1、配列番号41のアミノ酸配列を含むCDR-L2、及び配列番号42のアミノ酸配列を含むCDR-L3を含む;
    前記VHドメインは、配列番号225のアミノ酸配列を含むCDR-H1、配列番号232のアミノ酸配列を含むCDR-H2、及び配列番号233のアミノ酸配列を含むCDR-H3を含み、前記VLドメインは、配列番号234のアミノ酸配列を含むCDR-L1、配列番号235のアミノ酸配列を含むCDR-L2、及び配列番号236のアミノ酸配列を含むCDR-L3を含む;
    前記VHドメインは、配列番号225のアミノ酸配列を含むCDR-H1、配列番号232のアミノ酸配列を含むCDR-H2、及び配列番号233のアミノ酸配列を含むCDR-H3を含み、前記VLドメインは、配列番号16のアミノ酸配列を含むCDR-L1、配列番号17のアミノ酸配列を含むCDR-L2、及び配列番号228のアミノ酸配列を含むCDR-L3を含む;または
    前記VHドメインは、配列番号229のアミノ酸配列を含むCDR-H1、配列番号237のアミノ酸配列を含むCDR-H2、及び配列番号231のアミノ酸配列を含むCDR-H3を含み、前記VLドメインは、配列番号40のアミノ酸配列を含むCDR-L1、配列番号41のアミノ酸配列を含むCDR-L2、及び配列番号42のアミノ酸配列を含むCDR-L3を含む、前記融合タンパク質。
  68. 請求項61~63のいずれか1項に記載の融合タンパク質であって:
    前記VHドメインは、配列番号51のアミノ酸配列を含むCDR-H1、配列番号52のアミノ酸配列を含むCDR-H2、及び配列番号15のアミノ酸配列を含むCDR-H3を含み、前記VLドメインは、配列番号16のアミノ酸配列を含むCDR-L1、配列番号17のアミノ酸配列を含むCDR-L2、及び配列番号18のアミノ酸配列を含むCDR-L3を含む;
    前記VHドメインは、配列番号53のアミノ酸配列を含むCDR-H1、配列番号52のアミノ酸配列を含むCDR-H2、及び配列番号21のアミノ酸配列を含むCDR-H3を含み、前記VLドメインは、配列番号22のアミノ酸配列を含むCDR-L1、配列番号23のアミノ酸配列を含むCDR-L2、及び配列番号24のアミノ酸配列を含むCDR-L3を含む;
    前記VHドメインは、配列番号49のアミノ酸配列を含むCDR-H1、配列番号52のアミノ酸配列を含むCDR-H2、及び配列番号27のアミノ酸配列を含むCDR-H3を含み、前記VLドメインは、配列番号28のアミノ酸配列を含むCDR-L1、配列番号29のアミノ酸配列を含むCDR-L2、及び配列番号30のアミノ酸配列を含むCDR-L3を含む;
    前記VHドメインは、配列番号54のアミノ酸配列を含むCDR-H1、配列番号52のアミノ酸配列を含むCDR-H2、及び配列番号33のアミノ酸配列を含むCDR-H3を含み、前記VLドメインは、配列番号34のアミノ酸配列を含むCDR-L1、配列番号35のアミノ酸配列を含むCDR-L2、及び配列番号36のアミノ酸配列を含むCDR-L3を含む;
    前記VHドメインは、配列番号55のアミノ酸配列を含むCDR-H1、配列番号56のアミノ酸配列を含むCDR-H2、及び配列番号39のアミノ酸配列を含むCDR-H3を含み、前記VLドメインは、配列番号40のアミノ酸配列を含むCDR-L1、配列番号41のアミノ酸配列を含むCDR-L2、及び配列番号42のアミノ酸配列を含むCDR-L3を含む;
    前記VHドメインは、配列番号55のアミノ酸配列を含むCDR-H1、配列番号57のアミノ酸配列を含むCDR-H2、及び配列番号45のアミノ酸配列を含むCDR-H3を含み、前記VLドメインは、配列番号46のアミノ酸配列を含むCDR-L1、配列番号47のアミノ酸配列を含むCDR-L2、及び配列番号48のアミノ酸配列を含むCDR-L3を含む;
    前記VHドメインは、配列番号49のアミノ酸配列を含むCDR-H1、配列番号50のアミノ酸配列を含むCDR-H2、及び配列番号3のアミノ酸配列を含むCDR-H3を含み、前記VLドメインは、配列番号4のアミノ酸配列を含むCDR-L1、配列番号5のアミノ酸配列を含むCDR-L2、及び配列番号6のアミノ酸配列を含むCDR-L3を含む;
    前記VHドメインは、配列番号183のアミノ酸配列を含むCDR-H1、配列番号184のアミノ酸配列を含むCDR-H2、及び配列番号179のアミノ酸配列を含むCDR-H3を含み、前記VLドメインは、配列番号180のアミノ酸配列を含むCDR-L1、配列番号181のアミノ酸配列を含むCDR-L2、及び配列番号182のアミノ酸配列を含むCDR-L3を含む;
    前記VHドメインは、配列番号238のアミノ酸配列を含むCDR-H1、配列番号239のアミノ酸配列を含むCDR-H2、及び配列番号233のアミノ酸配列を含むCDR-H3を含み、前記VLドメインは、配列番号16のアミノ酸配列を含むCDR-L1、配列番号17のアミノ酸配列を含むCDR-L2、及び配列番号228のアミノ酸配列を含むCDR-L3を含む;
    前記VHドメインは、配列番号240のアミノ酸配列を含むCDR-H1、配列番号241のアミノ酸配列を含むCDR-H2、及び配列番号242のアミノ酸配列を含むCDR-H3を含み、前記VLドメインは、配列番号40のアミノ酸配列を含むCDR-L1、配列番号41のアミノ酸配列を含むCDR-L2、及び配列番号42のアミノ酸配列を含むCDR-L3を含む;
    前記VHドメインは、配列番号238のアミノ酸配列を含むCDR-H1、配列番号243のアミノ酸配列を含むCDR-H2、及び配列番号233のアミノ酸配列を含むCDR-H3を含み、前記VLドメインは、配列番号234のアミノ酸配列を含むCDR-L1、配列番号235のアミノ酸配列を含むCDR-L2、及び配列番号236のアミノ酸配列を含むCDR-L3を含む;
    前記VHドメインは、配列番号238のアミノ酸配列を含むCDR-H1、配列番号243のアミノ酸配列を含むCDR-H2、及び配列番号233のアミノ酸配列を含むCDR-H3を含み、前記VLドメインは、配列番号16のアミノ酸配列を含むCDR-L1、配列番号17のアミノ酸配列を含むCDR-L2、及び配列番号228のアミノ酸配列を含むCDR-L3を含む;または
    前記VHドメインは、配列番号240のアミノ酸配列を含むCDR-H1、配列番号244のアミノ酸配列を含むCDR-H2、及び配列番号242のアミノ酸配列を含むCDR-H3を含み、前記VLドメインは、配列番号40のアミノ酸配列を含むCDR-L1、配列番号41のアミノ酸配列を含むCDR-L2、及び配列番号42のアミノ酸配列を含むCDR-L3を含む、前記融合タンパク質。
  69. 請求項61~63、67及び68のいずれか1項に記載の融合タンパク質であって:
    前記VHドメインは、配列番号62の配列と少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも99%、または100%同一であるアミノ酸配列を含み、前記VLドメインは、配列番号63の配列と少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも99%、または100%同一であるアミノ酸配列を含み、任意選択で、前記VHドメインは、配列番号62のアミノ酸配列を含み、前記VLドメインは、配列番号63のアミノ酸配列を含む;
    前記VHドメインは、配列番号64の配列と少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも99%、または100%同一であるアミノ酸配列を含み、前記VLドメインは、配列番号65の配列と少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも99%、または100%同一であるアミノ酸配列を含み、任意選択で、前記VHドメインは、配列番号64のアミノ酸配列を含み、前記VLドメインは、配列番号65のアミノ酸配列を含む;
    前記VHドメインは、配列番号66の配列と少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも99%、または100%同一であるアミノ酸配列を含み、前記VLドメインは、配列番号67の配列と少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも99%、または100%同一であるアミノ酸配列を含み、任意選択で、前記VHドメインは、配列番号66のアミノ酸配列を含み、前記VLドメインは、配列番号67のアミノ酸配列を含む;
    前記VHドメインは、配列番号68の配列と少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも99%、または100%同一であるアミノ酸配列を含み、前記VLドメインは、配列番号69の配列と少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも99%、または100%同一であるアミノ酸配列を含み、任意選択で、前記VHドメインは、配列番号68のアミノ酸配列を含み、前記VLドメインは、配列番号69のアミノ酸配列を含む;
    前記VHドメインは、配列番号70の配列と少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも99%、または100%同一であるアミノ酸配列を含み、前記VLドメインは、配列番号71の配列と少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも99%、または100%同一であるアミノ酸配列を含み、任意選択で、前記VHドメインは、配列番号70のアミノ酸配列を含み、前記VLドメインは、配列番号71のアミノ酸配列を含む;
    前記VHドメインは、配列番号72の配列と少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも99%、または100%同一であるアミノ酸配列を含み、前記VLドメインは、配列番号73の配列と少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも99%、または100%同一であるアミノ酸配列を含み、任意選択で、前記VHドメインは、配列番号72のアミノ酸配列を含み、前記VLドメインは、配列番号73のアミノ酸配列を含む;
    前記VHドメインは、配列番号185の配列と少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも99%、または100%同一であるアミノ酸配列を含み、前記VLドメインは、配列番号186の配列と少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも99%、または100%同一であるアミノ酸配列を含み、任意選択で、前記VHドメインは、配列番号185のアミノ酸配列を含み、前記VLドメインは、配列番号186のアミノ酸配列を含む;
    前記VHドメインは、配列番号245の配列と少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも99%、または100%同一であるアミノ酸配列を含み、前記VLドメインは、配列番号246の配列と少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも99%、または100%同一であるアミノ酸配列を含み、任意選択で、前記VHドメインは、配列番号245のアミノ酸配列を含み、前記VLドメインは、配列番号246のアミノ酸配列を含む;
    前記VHドメインは、配列番号251の配列と少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも99%、または100%同一であるアミノ酸配列を含み、前記VLドメインは、配列番号252の配列と少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも99%、または100%同一であるアミノ酸配列を含み、任意選択で、前記VHドメインは、配列番号251のアミノ酸配列を含み、前記VLドメインは、配列番号252のアミノ酸配列を含む;
    前記VHドメインは、配列番号253の配列と少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも99%、または100%同一であるアミノ酸配列を含み、前記VLドメインは、配列番号254の配列と少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも99%、または100%同一であるアミノ酸配列を含み、任意選択で、前記VHドメインは、配列番号253のアミノ酸配列を含み、前記VLドメインは、配列番号254のアミノ酸配列を含む;
    前記VHドメインは、配列番号247の配列と少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも99%、または100%同一であるアミノ酸配列を含み、前記VLドメインは、配列番号248の配列と少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも99%、または100%同一であるアミノ酸配列を含み、任意選択で、前記VHドメインは、配列番号247のアミノ酸配列を含み、前記VLドメインは、配列番号248のアミノ酸配列を含む;
    前記VHドメインは、配列番号249の配列と少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも99%、または100%同一であるアミノ酸配列を含み、前記VLドメインは、配列番号250の配列と少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも99%、または100%同一であるアミノ酸配列を含み、任意選択で、前記VHドメインは、配列番号249のアミノ酸配列を含み、前記VLドメインは、配列番号250のアミノ酸配列を含む;
    前記VHドメインは、配列番号255の配列と少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも99%、または100%同一であるアミノ酸配列を含み、前記VLドメインは、配列番号256の配列と少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも99%、または100%同一であるアミノ酸配列を含み、任意選択で、前記VHドメインは、配列番号255のアミノ酸配列を含み、前記VLドメインは、配列番号256のアミノ酸配列を含む;または
    前記VHドメインは、配列番号257の配列と少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも99%、または100%同一であるアミノ酸配列を含み、前記VLドメインは、配列番号258の配列と少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも99%、または100%同一であるアミノ酸配列を含み、任意選択で、前記VHドメインは、配列番号257のアミノ酸配列を含み、前記VLドメインは、配列番号258のアミノ酸配列を含む、前記融合タンパク質。
  70. 前記抗体重鎖ポリペプチドの一方または両方は、以下:L234A、L235A、及びG237Aのアミノ酸置換を含み、番号付けはEUインデックスによるものである、請求項60~69のいずれか1項に記載の融合タンパク質。
  71. 前記抗体重鎖ポリペプチドのうちの1つ目は、アミノ酸置換Y349C及びT366Wを含み、前記抗体重鎖ポリペプチドのうちの2つ目は、アミノ酸置換S354C、T366S、L368A及びY407Vを含み、番号付けはEUインデックスによるものである、請求項60~70のいずれか1項に記載の融合タンパク質。
  72. 前記第1の部分は、1つまたは2つの抗体重鎖ポリペプチド及び1つまたは2つの抗体軽鎖ポリペプチドを含む、請求項53~59のいずれか1項に記載の融合タンパク質。
  73. 前記第1の部分は、単鎖抗体または単鎖可変フラグメント(scFv)を含む、請求項53~59のいずれか1項に記載の融合タンパク質。
  74. 前記第1の部分は、VHH抗体を含む、請求項53~59のいずれか1項に記載の融合タンパク質。
  75. 前記第2の部分は、IL-2ポリペプチドを含む、請求項53~74のいずれか1項に記載の融合タンパク質。
  76. 前記IL-2ポリペプチドは、
    APTSSSTKKTQLQLEHLLLDLQMILNGINNYKNPKLTRMLTFKFYMPKKATELKHLQCLEEELKPLEEVLNLAQSKNFHLRPRDLISNINVIVLELKGSETTFMCEYADETATIVEFLNRWITFCQSIISTLT(配列番号81)
    の配列を含むヒトIL-2ポリペプチドに対して1つ以上の変異を含むIL-2ポリペプチド変異体である、請求項75に記載の融合タンパク質。
  77. 前記IL-2ポリペプチド変異体は、配列番号81の配列を含む野生型IL-2ポリペプチドのIL-2Rαに対する結合親和性と比較して、50%以上低下したIL-2Rαへの結合親和性を有する、請求項76に記載の融合タンパク質。
  78. 前記IL-2ポリペプチド変異体は、配列番号81の配列を含む野生型IL-2ポリペプチドのIL-2Rβに対する結合親和性と比較して、50%以上低下したIL-2Rβへの結合親和性を有する;及び/または
    前記IL-2ポリペプチド変異体は、配列番号81の配列を含む野生型IL-2ポリペプチドのIL-2Rγに対する結合親和性と比較して、50%以上低下したIL-2Rγへの結合親和性を有する、請求項77に記載の融合タンパク質。
  79. 前記IL-2ポリペプチドは、配列番号81に対して1、2、3、4、または5つのアミノ酸置換を有する配列番号81の配列を含み、前記1、2、3、4、または5つの置換(複数可)は、以下:Q11、H16、L18、L19、D20、Q22、R38、F42、K43、Y45、E62、P65、E68、V69、L72、D84、S87、N88、V91、I92、T123、Q126、S127、I129、及びS130からなる群から選択される配列番号81の位置での置換(複数可)を含む、請求項63~78のいずれか1項に記載の融合タンパク質。
  80. 前記IL-2ポリペプチドは、(配列番号81の配列に対する)以下:R38E及びF42A;R38D及びF42A;F42A及びE62Q;R38A及びF42K;R38E、F42A、及びN88S;R38E、F42A、及びN88A;R38E、F42A、及びN88G;R38E、F42A、及びN88R;R38E、F42A、及びN88T;R38E、F42A、及びN88D;R38E、F42A、及びV91E;R38E、F42A、及びD84H;R38E、F42A、及びD84K;R38E、F42A、及びD84R;H16D、R38E及びF42A;H16E、R38E及びF42A;R38E、F42A及びQ126S;R38D、F42A及びN88S;R38D、F42A及びN88A;R38D、F42A及びN88G;R38D、F42A及びN88R;R38D、F42A及びN88T;R38D、F42A及びN88D;R38D、F42A及びV91E;R38D、F42A、及びD84H;R38D、F42A、及びD84K;R38D、F42A、及びD84R;H16D、R38D及びF42A;H16E、R38D及びF42A;R38D、F42A及びQ126S;R38A、F42K、及びN88S;R38A、F42K、及びN88A;R38A、F42K、及びN88G;R38A、F42K、及びN88R;R38A、F42K、及びN88T;R38A、F42K、及びN88D;R38A、F42K、及びV91E;R38A、F42K、及びD84H;R38A、F42K、及びD84K;R38A、F42K、及びD84R;H16D、R38A、及びF42K;H16E、R38A、及びF42K;R38A、F42K、及びQ126S;F42A、E62Q、及びN88S;F42A、E62Q、及びN88A;F42A、E62Q、及びN88G;F42A、E62Q、及びN88R;F42A、E62Q、及びN88T;F42A、E62Q、及びN88D;F42A、E62Q、及びV91E;F42A、E62Q、及びD84H;F42A、E62Q、及びD84K;ならびにF42A、E62Q、及びD84Rのアミノ酸置換セットのうちの1つを有する配列番号81の配列を含む、請求項79に記載の融合タンパク質。
  81. 前記IL-2ポリペプチドは、配列番号81に対して位置C125においてさらなるアミノ酸置換を有する配列番号81の配列を含む、請求項79に記載の融合タンパク質。
  82. 前記IL-2ポリペプチドは、(配列番号81の配列に対する)以下:R38E、F42A、及びC125A;R38D、F42A、及びC125A;F42A、E62Q、及びC125A;R38A、F42K、及びC125A;R38E、F42A、N88S、及びC125A;R38E、F42A、N88A、及びC125A;R38E、F42A、N88G、及びC125A;R38E、F42A、N88R、及びC125A;R38E、F42A、N88D、及びC125A;R38E、F42A、N88T、及びC125A;R38E、F42A、V91E、及びC125A;R38E、F42A、D84H、及びC125A;R38E、F42A、D84K、及びC125A;R38E、F42A、D84R、及びC125A;H16D、R38E、F42A、及びC125A;H16E、R38E、F42A、及びC125A;R38E、F42A、C125A及びQ126S;R38D、F42A、N88S、及びC125A;R38D、F42A、N88A、及びC125A;R38D、F42A、N88G、及びC125A;R38D、F42A、N88R、及びC125A;R38D、F42A、N88T、及びC125A;R38D、F42A、N88D、及びC125A;R38D、F42A、V91E、及びC125A;R38D、F42A、D84H、及びC125A;R38D、F42A、D84K、及びC125A;R38D、F42A、D84R、及びC125A;H16D、R38D、F42A、及びC125A;H16E、R38D、F42A、及びC125A;R38D、F42A、C125A、及びQ126S;R38A、F42K、N88S、及びC125A;R38A、F42K、N88G、及びC125A;R38A、F42K、N88R、及びC125A;R38A、F42K、N88T、及びC125A;R38A、F42K、N88D、及びC125A;R38A、F42K、N88A、及びC125A;R38A、F42K、V91E、及びC125A;R38A、F42K、D84H、及びC125A;R38A、F42K、D84K、及びC125A;R38A、F42K、D84R、及びC125A;H16D、R38A、F42K、及びC125A;H16E、R38A、F42K、及びC125A;R38A、F42K、C125A及びQ126S;F42A、E62Q、N88S、及びC125A;F42A、E62Q、N88A、及びC125A;F42A、E62Q、N88G、及びC125A;F42A、E62Q、N88R、及びC125A;F42A、E62Q、N88T、及びC125A;F42A、E62Q、N88D、及びC125A;F42A、E62Q、V91E、及びC125A;F42A、E62Q、及びD84H、及びC125A;F42A、E62Q、及びD84K、及びC125A;F42A、E62Q、及びD84R、及びC125A;H16D、F42A、及びE62Q、及びC125A;H16E、F42A、E62Q、及びC125A;F42A、E62Q、C125A及びQ126S;F42A、N88S、及びC125A;F42A、N88A、及びC125A;F42A、N88G、及びC125A;F42A、N88R、及びC125A;F42A、N88T、及びC125A;F42A、N88D、及びC125A;F42A、V91E、及びC125A;F42A、D84H、及びC125A;F42A、D84K、及びC125A;F42A、D84R、及びC125A;H16D、F42A、及びC125A;H16E、F42A、及びC125A;ならびにF42A、C125A及びQ126Sのアミノ酸置換セットのうちの1つを有する配列番号81の配列を含む、請求項81に記載の方法。
  83. 前記IL-2ポリペプチドは、配列APTSSSTKKTQLQLEHLLLDLQMILNGINNYKNPKLTEMLTAKFYMPKKATELKHLQCLEEELKPLEEVLNLAQSKNFHLRPRDLISAINVIVLELKGSETTFMCEYADETATIVEFLNRWITFAQSIISTLT(配列番号80)または配列APTSSSTKKTQLQLEELLLDLQMILNGINNYKNPKLTEMLTAKFYMPKKATELKHLQCLEEELKPLEEVLNLAQSKNFHLRPRDLISNINVIVLELKGSETTFMCEYADETATIVEFLNRWITFAQSIISTLT(配列番号297)を含む、請求項63~78のいずれか1項に記載の融合タンパク質。
  84. 前記IL-2ポリペプチドは、配列番号80、85~155、190~216、297、及び354~383からなる群から選択される配列を含む、請求項75~78のいずれか1項に記載の融合タンパク質。
  85. 前記第2の部分は、IL2Rβγを介したシグナル伝達を誘導するポリペプチドを含む、請求項53~74のいずれか1項に記載の融合タンパク質。
  86. 前記第2の部分は、IL-21ポリペプチドを含む、請求項53~74のいずれか1項に記載の融合タンパク質。
  87. 前記抗体Fcドメインの一方または両方は、以下:番号付けはEUインデックスによる、L234A、L235A、及びG237Aのアミノ酸置換を有するヒトIgG1 Fcドメインを含み、任意選択で、前記抗体Fcドメインの前記一方または両方は、C末端リジンを有しない、請求項60~86のいずれか1項に記載の融合タンパク質。
  88. 前記2つのFcドメインのうちの1つ目は、アミノ酸置換Y349C及びT366Wを有するヒトIgG1 Fcドメインを含み、前記2つのFcドメインのうちの2つ目は、アミノ酸置換S354C、T366S、L368A及びY407Vを有するヒトIgG1 Fcドメインを含み、番号付けはEUインデックスによるものであり、任意選択で、前記抗体Fcドメインの前記一方または両方は、C末端リジンを有しない、請求項60~87のいずれか1項に記載の融合タンパク質。
  89. 前記リンカーは、配列(GGGS)xGn(配列番号74)、(GGGGS)xGn(配列番号75)、もしくは(GGGGGS)xGn(配列番号76)、S(GGGS)xGn(配列番号386)、S(GGGGS)xGn(配列番号387)、もしくはS(GGGGGS)xGn(配列番号388)を含み、ここで、x=1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、または12、及びn=0、1、2または3である、請求項53~88のいずれか1項に記載の融合タンパク質。
  90. 前記リンカーは、配列GGGGSGGGGSGGGGS(配列番号79)またはSGGGGSGGGGSGGGGS(配列番号389)を含む、請求項53~88のいずれか1項に記載の融合タンパク質。
  91. 前記融合タンパク質は、以下:
    配列番号156のアミノ酸配列を含む1つまたは2つの軽鎖、配列番号157のアミノ酸配列を含む重鎖、及び配列番号158のアミノ酸配列を含む重鎖;
    配列番号159のアミノ酸配列を含む1つまたは2つの軽鎖、配列番号160のアミノ酸配列を含む重鎖、及び配列番号161のアミノ酸配列を含む重鎖;
    配列番号162のアミノ酸配列を含む1つまたは2つの軽鎖、配列番号163のアミノ酸配列を含む重鎖、及び配列番号164のアミノ酸配列を含む重鎖;
    配列番号165のアミノ酸配列を含む1つまたは2つの軽鎖、配列番号166のアミノ酸配列を含む重鎖、及び配列番号167のアミノ酸配列を含む重鎖;
    配列番号168のアミノ酸配列を含む1つまたは2つの軽鎖、配列番号169のアミノ酸配列を含む重鎖、及び配列番号170のアミノ酸配列を含む重鎖;
    配列番号171のアミノ酸配列を含む1つまたは2つの軽鎖、配列番号172のアミノ酸配列を含む重鎖、及び配列番号173のアミノ酸配列を含む重鎖;
    配列番号174のアミノ酸配列を含む1つまたは2つの軽鎖、配列番号175のアミノ酸配列を含む重鎖、及び配列番号176のアミノ酸配列を含む重鎖;
    配列番号187のアミノ酸配列を含む1つまたは2つの軽鎖、配列番号188のアミノ酸配列を含む重鎖、及び配列番号189のアミノ酸配列を含む重鎖;
    配列番号298のアミノ酸配列を含む1つまたは2つの軽鎖、配列番号299のアミノ酸配列を含む重鎖、及び配列番号300のアミノ酸配列を含む重鎖;
    配列番号302のアミノ酸配列を含む1つまたは2つの軽鎖、配列番号303のアミノ酸配列を含む重鎖、及び配列番号304のアミノ酸配列を含む重鎖;
    配列番号306のアミノ酸配列を含む1つまたは2つの軽鎖、配列番号307のアミノ酸配列を含む重鎖、及び配列番号308のアミノ酸配列を含む重鎖;
    配列番号310のアミノ酸配列を含む1つまたは2つの軽鎖、配列番号311のアミノ酸配列を含む重鎖、及び配列番号312のアミノ酸配列を含む重鎖;
    配列番号314のアミノ酸配列を含む1つまたは2つの軽鎖、配列番号315のアミノ酸配列を含む重鎖、及び配列番号316のアミノ酸配列を含む重鎖;
    配列番号318のアミノ酸配列を含む1つまたは2つの軽鎖、配列番号319のアミノ酸配列を含む重鎖、及び配列番号320のアミノ酸配列を含む重鎖;
    配列番号322のアミノ酸配列を含む1つまたは2つの軽鎖、配列番号323のアミノ酸配列を含む重鎖、及び配列番号324のアミノ酸配列を含む重鎖;
    配列番号326のアミノ酸配列を含む1つまたは2つの軽鎖、配列番号327のアミノ酸配列を含む重鎖、及び配列番号328のアミノ酸配列を含む重鎖;
    配列番号330のアミノ酸配列を含む1つまたは2つの軽鎖、配列番号331のアミノ酸配列を含む重鎖、及び配列番号332のアミノ酸配列を含む重鎖;
    配列番号334のアミノ酸配列を含む1つまたは2つの軽鎖、配列番号335のアミノ酸配列を含む重鎖、及び配列番号336のアミノ酸配列を含む重鎖;
    配列番号338のアミノ酸配列を含む1つまたは2つの軽鎖、配列番号339のアミノ酸配列を含む重鎖、及び配列番号340のアミノ酸配列を含む重鎖;
    配列番号342のアミノ酸配列を含む1つまたは2つの軽鎖、配列番号343のアミノ酸配列を含む重鎖、及び配列番号344のアミノ酸配列を含む重鎖;
    配列番号346のアミノ酸配列を含む1つまたは2つの軽鎖、配列番号347のアミノ酸配列を含む重鎖、及び配列番号348のアミノ酸配列を含む重鎖;
    配列番号350のアミノ酸配列を含む1つまたは2つの軽鎖、配列番号351のアミノ酸配列を含む重鎖、及び配列番号352のアミノ酸配列を含む重鎖;
    配列番号156のアミノ酸配列を含む1つまたは2つの軽鎖、配列番号157のアミノ酸配列を含む重鎖、及び配列番号217のアミノ酸配列を含む重鎖;
    配列番号159のアミノ酸配列を含む1つまたは2つの軽鎖、配列番号160のアミノ酸配列を含む重鎖、及び配列番号218のアミノ酸配列を含む重鎖;
    配列番号162のアミノ酸配列を含む1つまたは2つの軽鎖、配列番号163のアミノ酸配列を含む重鎖、及び配列番号219のアミノ酸配列を含む重鎖;
    配列番号165のアミノ酸配列を含む1つまたは2つの軽鎖、配列番号166のアミノ酸配列を含む重鎖、及び配列番号220のアミノ酸配列を含む重鎖;
    配列番号168のアミノ酸配列を含む1つまたは2つの軽鎖、配列番号169のアミノ酸配列を含む重鎖、及び配列番号221のアミノ酸配列を含む重鎖;
    配列番号171のアミノ酸配列を含む1つまたは2つの軽鎖、配列番号172のアミノ酸配列を含む重鎖、及び配列番号222のアミノ酸配列を含む重鎖;
    配列番号174のアミノ酸配列を含む1つまたは2つの軽鎖、配列番号175のアミノ酸配列を含む重鎖、及び配列番号223のアミノ酸配列を含む重鎖;
    配列番号187のアミノ酸配列を含む1つまたは2つの軽鎖、配列番号188のアミノ酸配列を含む重鎖、及び配列番号224のアミノ酸配列を含む重鎖;
    配列番号298のアミノ酸配列を含む1つまたは2つの軽鎖、配列番号299のアミノ酸配列を含む重鎖、及び配列番号301のアミノ酸配列を含む重鎖;
    配列番号302のアミノ酸配列を含む1つまたは2つの軽鎖、配列番号303のアミノ酸配列を含む重鎖、及び配列番号305のアミノ酸配列を含む重鎖;
    配列番号306のアミノ酸配列を含む1つまたは2つの軽鎖、配列番号307のアミノ酸配列を含む重鎖、及び配列番号309のアミノ酸配列を含む重鎖;
    配列番号310のアミノ酸配列を含む1つまたは2つの軽鎖、配列番号311のアミノ酸配列を含む重鎖、及び配列番号313のアミノ酸配列を含む重鎖;
    配列番号314のアミノ酸配列を含む1つまたは2つの軽鎖、配列番号315のアミノ酸配列を含む重鎖、及び配列番号317のアミノ酸配列を含む重鎖;
    配列番号318のアミノ酸配列を含む1つまたは2つの軽鎖、配列番号319のアミノ酸配列を含む重鎖、及び配列番号321のアミノ酸配列を含む重鎖;
    配列番号322のアミノ酸配列を含む1つまたは2つの軽鎖、配列番号323のアミノ酸配列を含む重鎖、及び配列番号325のアミノ酸配列を含む重鎖;
    配列番号326のアミノ酸配列を含む1つまたは2つの軽鎖、配列番号327のアミノ酸配列を含む重鎖、及び配列番号329のアミノ酸配列を含む重鎖;
    配列番号330のアミノ酸配列を含む1つまたは2つの軽鎖、配列番号331のアミノ酸配列を含む重鎖、及び配列番号333のアミノ酸配列を含む重鎖;
    配列番号334のアミノ酸配列を含む1つまたは2つの軽鎖、配列番号335のアミノ酸配列を含む重鎖、及び配列番号337のアミノ酸配列を含む重鎖;
    配列番号338のアミノ酸配列を含む1つまたは2つの軽鎖、配列番号339のアミノ酸配列を含む重鎖、及び配列番号341のアミノ酸配列を含む重鎖;
    配列番号342のアミノ酸配列を含む1つまたは2つの軽鎖、配列番号343のアミノ酸配列を含む重鎖、及び配列番号345のアミノ酸配列を含む重鎖;
    配列番号346のアミノ酸配列を含む1つまたは2つの軽鎖、配列番号347のアミノ酸配列を含む重鎖、及び配列番号349のアミノ酸配列を含む重鎖;または
    配列番号350のアミノ酸配列を含む1つまたは2つの軽鎖、配列番号351のアミノ酸配列を含む重鎖、及び配列番号353のアミノ酸配列を含む重鎖、を含む、請求項53~88のいずれか1項に記載の融合タンパク質。
  92. ヒトCD8bに結合する第1の部分及びIL2ポリペプチドを含む第2の部分を含む融合タンパク質であって、前記融合タンパク質は、4つのポリペプチド鎖を含み:
    第1のポリペプチド鎖は配列番号334のアミノ酸配列を含み、第2のポリペプチド鎖は配列番号335のアミノ酸配列を含み、第3のポリペプチド鎖は配列番号336のアミノ酸配列を含み、第4のポリペプチド鎖は配列番号334のアミノ酸配列を含む;
    第1のポリペプチド鎖は配列番号334のアミノ酸配列を含み、第2のポリペプチド鎖は配列番号335のアミノ酸配列を含み、第3のポリペプチド鎖は配列番号337のアミノ酸配列を含み、第4のポリペプチド鎖は配列番号334のアミノ酸配列を含む;
    第1のポリペプチド鎖は配列番号338のアミノ酸配列を含み、第2のポリペプチド鎖は配列番号339のアミノ酸配列を含み、第3のポリペプチド鎖は配列番号340のアミノ酸配列を含み、第4のポリペプチド鎖は配列番号338のアミノ酸配列を含む;または
    第1のポリペプチド鎖は配列番号338のアミノ酸配列を含み、第2のポリペプチド鎖は配列番号339のアミノ酸配列を含み、第3のポリペプチド鎖は配列番号341のアミノ酸配列を含み、第4のポリペプチド鎖は配列番号338のアミノ酸配列を含む、前記融合タンパク質。
  93. 請求項1~92のいずれか1項に記載の抗体または融合タンパク質をコードする1つ以上のポリヌクレオチド。
  94. 請求項93に記載の1つ以上のポリヌクレオチドを含む、1つ以上のベクター。
  95. 前記ベクター(複数可)は、発現ベクター(複数可)である、請求項94に記載の1つ以上のベクター。
  96. 請求項93~95のいずれか1項に記載の1つ以上のポリヌクレオチドまたはベクターを含む、単離された宿主細胞。
  97. 抗体または融合タンパク質の産生方法であって、前記抗体または融合タンパク質の産生に適した条件下で、請求項96に記載の宿主細胞を培養することを含む、前記産生方法。
  98. 前記宿主細胞から前記抗体または融合タンパク質を回収することをさらに含む、請求項97に記載の方法。
  99. 請求項1~92のいずれか1項に記載の抗体または融合タンパク質及び薬学的に許容される担体を含む、医薬組成物。
  100. 医薬として使用するための、請求項1~92のいずれか1項に記載の抗体または融合タンパク質。
  101. 有効量の請求項1~92のいずれか1項に記載の抗体もしくは融合タンパク質または請求項99に記載の組成物を、がんを有する個体に投与することを含む、がんの処置方法。
  102. T細胞療法、がんワクチン、化学療法剤、または免疫チェックポイント阻害剤(ICI)を前記個体に投与することをさらに含む、請求項101に記載の方法。
  103. 前記ICIは、PD-1、PD-L1、またはCTLA-4の阻害剤である、請求項102に記載の方法。
  104. 前記T細胞療法は、キメラ抗原受容体(CAR)ベースのT細胞療法、腫瘍浸潤リンパ球(TIL)ベースの治療法、または形質導入されたTCRを有するT細胞を用いる治療法を含む、請求項102に記載の方法。
  105. がんの処置方法において使用するための請求項1~92のいずれか1項に記載の抗体または融合タンパク質であって、前記方法は、有効量の前記抗体または融合タンパク質を、がんを有する個体に投与することを含む、前記抗体または融合タンパク質。
  106. 感染症の処置方法であって、それを必要とする個体に、有効量の請求項1~92のいずれか1項に記載の抗体もしくは融合タンパク質または請求項99に記載の組成物を投与することを含む、前記感染症の処置方法。
  107. 前記感染症は、ウイルス感染症である、請求項106に記載の方法。
  108. がんまたは慢性感染症を処置するための医薬の製造に向けた、請求項1~92のいずれか1項に記載の抗体または融合タンパク質の使用。
  109. ex vivoで1つ以上のT細胞を、有効量の請求項1~92のいずれか1項に記載の抗体もしくは融合タンパク質または請求項99に記載の組成物と接触させることを含む、ex vivoでT細胞を増大させる方法。
  110. 前記1つ以上のT細胞は、腫瘍浸潤リンパ球(TIL)である、請求項109に記載の方法。
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