JP7236738B2 - 神経前駆細胞の選別方法 - Google Patents
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Description
[1]神経前駆細胞の選別方法であって、下記(1)から(2)の工程:
(1)神経前駆細胞で発現しているmiRNAによって認識される配列に、マーカータンパク質をコードする配列を機能的に連結したmRNA、又は該mRNAをコードするDNAを細胞に導入する工程、及び
(2)該マーカータンパク質の発現が抑制された細胞を選別する工程
を含む方法。
[2]前記神経前駆細胞がドーパミン神経前駆細胞である、[1]に記載の方法。
[3]前記神経前駆細胞が大脳皮質神経前駆細胞である、[1]に記載の方法。
[4]前記miRNAがmiR-9-5p、miR-218-5p、miR-20a-5p、miR-124-3p、miR-7-5p、miR-135a-5p、let-7a-5p、let-7g-5p、let-7i-5p、miR-26a-5p、miR-106a-5p、miR-320e、miR-374a-5p、let-7b-5p、let-7f-5p、miR-508-5p、miR-20b-5p、miR-30c-5p、miR-30d-5p、miR-30e-5p、miR-135b-3p、miR-17-5p、miR-330-3p、let-7d-5p、miR-93-5p、miR-106b-5p、miR-335-5p、miR-98-5p、miR-92b-3p、miR-320c、miR-374b-5p、miR-320d、miR-4532、miR-584-3p、miR-219-5p、miR-21-5p、miR-92a-3p、miR-449a、miR-18a-5p、miR-1908-3p、miR-210-5p、miR-34b-5p、miR-34c-3p、miR-654-5p、miR-660-5p、miR-675-5p、miR-744-3p、miR-942-5p、miR-96-3p、miR-30a-5p、miR-491-5p及びmiR-5001-5pからなる群より選択される1種以上のmiRNAである、[2]に記載の方法。
[5]前記miRNAがmiR-9-5p、let-7a-5p、let-7g-5p、let-7i-5p、miR-330-3p、let-7b-5p、let-7d-5p、let-7f-5p、miR-135b-3p、miR-508-5p、miR-654-5p、miR-758-5p、miR-491-5p、miR-5001-5p、miR-191-5p、miR-20a-5p、miR-342-3p、miR-99b-5p、miR-423-3p、miR-324-3p、miR-22-3p、miR-378a-3p、miR-296-5p、miR-99a-5p、miR-500a-3p、miR-345-5p、miR-335-5p、miR-134、miR-212-3p、miR-154-5p、miR-150-5p、miR-148a-3p、miR-382-5p、miR-486-5p、miR-370、miR-373-3p、miR-512-5p、miR-516b-5p、miR-518b、miR-518c-5p、miR-519d、miR-523-3p、miR-526a、miR-98-5p、miR-140-3p、miR-378b、miR-128、miR-3180-3p、miR-1260a、miR-503-5p、miR-34c-5p、miR-3180、miR-21-3p、miR-4286、miR-4454、miR-138-5p、miR-1307-3p、miR-652-3p、miR-502-3p、miR-92b-5p、miR-501-3p、miR-1285-3p、miR-126-3p、miR-877-5p、miR-9-3p、miR-129-1-3p、miR-760、miR-365a-5p、miR-374a-5p、miR-4532、miR-20b-3p、miR-363-5p、miR-339-3p、miR-513a-3p、miR-532-3p、miR-3180-5p、miR-4324、miR-1234-5p、miR-329、miR-362-3p、miR-671-5p、miR-24-2-5p、miR-27a-5p、miR-411-5p、miR-197-5p、miR-222-5p、miR-584-3p、miR-326、miR-133a、miR-17-5p、miR-92a-3p、miR-16-5p、miR-339-5p、miR-331-3p、miR-203a、miR-298、miR-134-3p、miR-135a-3p、miR-138-1-3p、miR-144-5p、miR-154-3p、miR-15a-5p、miR-15b-3p、miR-15b-5p、miR-16-1-3p、miR-181a-3p、miR-1910-3p、miR-1910-5p、miR-192-3p、miR-194-3p、miR-194-5p、miR-196a-3p、miR-210-5p、miR-34c-3p、miR-450b-3p、miR-4536-3p、miR-4707-5p、miR-490-3p、miR-494-3p、miR-510-3p、miR-5196-3p、miR-542-5p、miR-574-3p、miR-589-3p、miR-642a-3p、miR-6503-5p、miR-654-3p、miR-660-5p、miR-675-5p、miR-766-3p、miR-874-5p、miR-942-5p及びmiR-96-3pからなる群より選択される1種以上のmiRNAである、[3]に記載の方法。
[6]前記miRNAがmiR-9-5p、let-7a-5p、let-7g-5p、let-7i-5p、let-7b-5p、let-7f-5p及びmiR-508-5pからなる群より選択される1種以上のmiRNAである、[1]~[5]のいずれかに記載の方法。
[7]前記miRNAがmiR-9-5pを含む、[1]~[6]のいずれかに記載の方法。
[8]前記mRNAが、5’から3'の方向に、前記miRNAによって認識される1つ以上の配列、マーカータンパク質をコードする配列、及び該miRNAによって認識される1つ以上の配列を含む、[1]~[7]のいずれかに記載の方法。
[9]前記mRNAが、5’から3'の方向に、前記miRNAによって認識される1つの配列、マーカータンパク質をコードする配列、及び該miRNAによって認識される1つ以上の配列を含む、[8]に記載の方法。
[10]前記mRNAが、5’から3'の方向に、miRNAによって認識される1つの配列、マーカータンパク質をコードする配列、及び該miRNAによって認識される同一の4つの配列を含む、[9]に記載の方法。
[11]前記マーカータンパク質が、蛍光タンパク質又はアポトーシス誘導タンパク質である、[1]~[10]のいずれかに記載の方法。
[12]前記アポトーシス誘導タンパク質がBimである、[11]に記載の方法。
[13]前記マーカータンパク質とは異なるマーカータンパク質をコードする核酸をさらに細胞に導入する工程を含む、[1]から[12]のいずれかに記載の方法。
[14]前記異なるマーカータンパク質が蛍光タンパク質又は薬剤耐性タンパク質である、[13]に記載の方法。
[15]前記神経前駆細胞が多能性幹細胞から分化誘導した細胞である、[1]~[14]のいずれかに記載の方法。
[16]前記多能性幹細胞がヒト由来である、[15]に記載の方法。
[17]前記神経前駆細胞を分化誘導開始から22~29日目に選別する、[15]又は[16]に記載の方法。
[18]多能性幹細胞からの神経前駆細胞の製造方法であって、下記(1)から(3)の工程:
(1)多能性幹細胞から神経前駆細胞を分化誘導する工程、
(2)(1)の工程で得られた細胞へ、神経前駆細胞で発現しているmiRNAによって認識される配列に、マーカータンパク質をコードする配列を機能的に連結したmRNA、又は該mRNAをコードするDNAを導入する工程、及び
(3)前記マーカータンパク質の発現が抑制された細胞を選別する工程
を含む、神経前駆細胞の製造方法。
[19]前記マーカータンパク質とは異なるマーカータンパク質をコードする核酸をさらに細胞に導入する工程を含む、[18]に記載の方法。
[20]miR-9-5p、let-7a-5p、let-7g-5p、let-7i-5p、let-7b-5p、let-7f-5p及びmiR-508-5pからなる群より選択されるmiRNAによって認識される配列及びマーカータンパク質をコードする配列を含むmRNA、又は該mRNAをコードするDNAを含有してなる、神経前駆細胞を選別するためのキット。
[21]前記mRNAが、5'から3'の方向に、前記miRNAによって認識される1つ以上の配列、マーカータンパク質をコードする配列、及び該miRNAによって認識される1つ以上の配列を含む、[20]に記載のキット。
[22]前記mRNAが、5'から3'の方向に、前記miRNAによって認識される1つの配列、マーカータンパク質をコードする配列、及び該miRNAによって認識される1つ以上の配配列を含む、[21]に記載のキット。
[23]前記mRNAが、5'から3'の方向に、前記miRNAによって認識される1つの配列、マーカータンパク質をコードする配列、及び該miRNAによって認識される同一の4つの配列を含む、[22]に記載のキット。
[24]さらに前記マーカータンパク質とは異なるマーカータンパク質をコードする配列を含む核酸を含有してなる、[20]から[23]のいずれかに記載のキット。
本発明は、(1)神経前駆細胞で発現しているmiRNAに対する応答性を有するmRNA(以下「miRNA応答性mRNA」と略記する場合がある)、又は該mRNAをコードするDNA(以下ではこれらのmRNAとDNAをまとめて「miRNA応答性核酸」と略記する場合がある)を細胞に導入する工程、及び(2)該核酸にコードされるマーカータンパク質の発現抑制を指標として、神経前駆細胞を選別する工程を含む、神経前駆細胞の選別方法(以下「本発明の選別方法」と略記する場合がある)を提供する。
本明細書において、「神経前駆細胞」とは、成熟した神経細胞への分化能を有する未分化細胞を意味し、該細胞を含む細胞集団も「神経前駆細胞」に包含される。本発明において使用される神経前駆細胞としては、ドーパミン神経前駆細胞、大脳皮質神経前駆細胞、GABA作動性神経前駆細胞、運動神経前駆細胞などが挙げられる。
本明細書において、「miRNA応答性mRNA」(「miRNAスイッチ」と称することがある)とは、神経前駆細胞で発現している(好ましくは特異的に発現している)miRNAによって認識される配列(「miRNA標的配列」と称することがある)、及びマーカータンパク質をコードする配列を含み、当該マーカータンパク質の発現(翻訳)が、miRNA標的配列に制御されるよう機能的に連結されているmRNAを意味する。
5’-GGUUCCGCGAUCGCGGAUCCAGAUCCACCGGUCGCCACCAUG-3’:配列番号735、
5’-GGUUCCGCGAUCGCGGAUCCAGAUCACACCGGUCGCCACCAUG-3’:配列番号736、
5’-GGUUCCGCGAUCGCGGAUCCAGAUCAACACCGGUCGCCACCAUG-3’:配列番号737、
5’-GGUUCCGCGAUCGCGGAUCCAGAUCAAACACCGGUCGCCACCAUG-3’:配列番号738、
5’-GGUUCCGCGAUCGCGGAUCCAGAUCACCGGUCGCCACCAUG-3’:配列番号739、
5’-GGUUCCGCGAUCGCGGAUCCAGUAUCCACCGGUCGCCACCAUG-3’:配列番号740、
5’-GGUUCCGCGAUCGCGGAUCCAGAUCCAAACACCGGUCGCCACCAUG-3’:配列番号741、
5’-GGUUCCGCGAUCGCGGAUCCAGAAACACCGGUCGCCACCAUG-3’:配列番号742、
5’-GGUUCCGCGAUCGCGGAUCCAGAUACCGGUCGCCACCAUG-3’:配列番号743、
5’-GGUUCCGCGAUCGCGGAUCCAGAAACACCGGUCGCCACCAUG-3’:配列番号744
(各配列の3’末端のAUGは開始コドンを示す)などが挙げられるが、この配列に限定されない。また、5’UTRの配列中にmiRNA標的配列が存在する場合の位置も限定されないが、上記配列中、下線を引いたCとAの間にmiRNA標的配列が存在することが好ましい。
本発明の選別方法のmiRNA応答性核酸を細胞に導入する工程において、細胞に導入されることとなるmiRNA応答性mRNAは、1種のみ用いる場合もあり、2種以上、例えば、3種、4種、5種、6種、7種、又は8種以上用いる場合もある。例えば、2種以上のmiRNA応答性mRNAを用いる場合、それぞれのmiRNA応答性mRNAは、miRNA標的配列、マーカータンパク質ともに、異なることが望ましい。また、2種以上のmiRNA応答性mRNAを用いる場合、miRNA応答性mRNAに含まれるmiRNA標的配列の数、miRNA標的配列の5’末端からの距離、並びにmiRNA応答性mRNAにおけるその他の構造的特徴は、各miRNA応答性mRNAにおいて同一であってもよく、異なっていてもよい。あるいは、miRNA標的配列は同一であるが、マーカータンパク質は異なるmiRNA応答性mRNAを用いることも可能である。例えば、異なる経路でシグナル伝達するアポトーシス誘導タンパク質をコードする配列を含む核酸、例えば、FasとBim等を同一のmiRNA標的配列と組み合わせたmiRNA応答性mRNAを用いることも可能であり、この場合には、神経前駆細胞以外の細胞の除去を効率よく行うことが期待できる。
本発明の選別方法において、miRNA応答性mRNAにコードされるマーカータンパク質の発現が抑制された細胞を選別する工程は、所定の検出装置を用いて、マーカータンパク質からの信号を検出することにより実施することができる。検出装置としては、フローサイトメーター、イメージングサイトメーター、蛍光顕微鏡、発光顕微鏡、CCDカメラ等が挙げられるが、これらには限定されない。このような検出装置は、マーカータンパク質により、当業者が適したものを用いることができる。例えば、マーカーが、蛍光タンパク質又は発光タンパク質の場合には、フローサイトメーターを用いて選別が可能であり、マーカーが、蛍光、発光又は呈色を補助するタンパク質の場合には、顕微鏡を用いて、光応答性細胞培養器材をコーティングした培養皿を用いて、呈色等された細胞へ光照射し、照射されなかった細胞が培養皿から剥離されることを利用して選別することができ、マーカータンパク質が、膜局在タンパク質の場合には、抗体等の細胞表面タンパク質特異的な検出試薬と、上記の検出装置を用いたマーカータンパク質の定量方法が可能である他、磁気細胞分離装置(MACS)といった、マーカータンパク質の定量過程を経ない細胞の単離方法が可能であり、マーカータンパク質が薬剤耐性遺伝子の場合、薬剤投与によりマーカータンパク質の発現を検出して、生細胞を単離する方法が可能である。マーカータンパク質が、アポトーシス誘導タンパク質の場合は、miRNAの存在によりマーカータンパク質の発現量が減少することによって、miRNAを発現する細胞が選択的に生存し、マーカータンパク質の定量過程を経ずに細胞の単離が可能である。
本発明において使用される多能性幹細胞は、生体に存在する全ての細胞に分化可能である多能性を有し、かつ、増殖能をも併せもつ幹細胞であり、それには、以下のものに限定されないが、例えば、胚性幹(ES)細胞、精子幹(GS)細胞、胚性生殖(EG)細胞、人工多能性幹(iPS)細胞、核移植により得られるクローン胚由来の胚性幹(ntES)細胞、Muse細胞等が含まれる。好ましい多能性幹細胞は、ES細胞、iPS細胞及びntES細胞であり、神経変性疾患等の治療に用いるという観点から、より好ましくは、ヒトES細胞、ヒトiPS細胞であり、さらに好ましくは、ヒトiPS細胞である。
ES細胞は、ヒトやマウス等の哺乳動物の初期胚(例えば胚盤胞)の内部細胞塊から樹立された、多能性と自己複製による増殖能を有する幹細胞である。
精子幹細胞は、精巣由来の多能性幹細胞であり、精子形成のための起源となる細胞である。この細胞は、ES細胞と同様に、種々の系列の細胞に分化誘導可能であり、例えばマウス胚盤胞に移植するとキメラマウスを作出できる等の性質をもつ(M. Kanatsu-Shinohara et al. (2003) Biol. Reprod., 69:612-616; K. Shinohara et al. (2004), Cell, 119:1001-1012)。神経膠細胞系由来神経栄養因子(glial cell line-derived neurotrophic factor (GDNF))を含む培養液で自己複製可能であるし、またES細胞と同様の培養条件下で継代を繰り返すことによって、精子幹細胞を得ることができる(竹林正則ら(2008),実験医学,26巻,5号(増刊),41~46頁,羊土社(東京、日本))。
胚性生殖細胞は、胎生期の始原生殖細胞から樹立される、ES細胞と同様な多能性をもつ細胞であり、LIF、bFGF、幹細胞因子(stem cell factor)等の物質の存在下で始原生殖細胞を培養することによって樹立しうる(Y. Matsui et al. (1992), Cell, 70:841-847; J.L. Resnick et al. (1992), Nature, 359:550-551)。
人工多能性幹細胞(iPS細胞)は、特定の初期化因子を、DNA又はタンパク質の形態で体細胞に導入することによって作製することができる、ES細胞とほぼ同等の特性、例えば分化多能性と自己複製による増殖能を有する体細胞由来の人工の幹細胞である(K. Takahashi and S. Yamanaka (2006) Cell, 126:663-676; K. Takahashi et al. (2007), Cell, 131:861-872; J. Yu et al. (2007), Science, 318:1917-1920; Nakagawa, M.ら, Nat. Biotechnol. 26:101-106 (2008);国際公開WO 2007/069666)。初期化因子は、ES細胞に特異的に発現している遺伝子、その遺伝子産物若しくはnon-coding RNA又はES細胞の未分化維持に重要な役割を果たす遺伝子、その遺伝子産物若しくはnon-coding RNA、あるいは低分子化合物によって構成されてもよい。初期化因子に含まれる遺伝子として、例えば、Oct3/4、Sox2、Sox1、Sox3、Sox15、Sox17、Klf4、Klf2、c-Myc、N-Myc、L-Myc、Nanog、Lin28、Fbx15、ERas、ECAT15-2、Tcl1、beta-catenin、Lin28b、Sall1、Sall4、Esrrb、Nr5a2、Tbx3等が例示され、これらの初期化因子は、単独で用いても良く、組み合わせて用いてもよい。初期化因子の組み合わせとしては、WO2007/069666、WO2008/118820、WO2009/007852、WO2009/032194、WO2009/058413、WO2009/057831、WO2009/075119、WO2009/079007、WO2009/091659、WO2009/101084、WO2009/101407、WO2009/102983、WO2009/114949、WO2009/117439、WO2009/126250、WO2009/126251、WO2009/126655、WO2009/157593、WO2010/009015、WO2010/033906、WO2010/033920、WO2010/042800、WO2010/050626、WO2010/056831、WO2010/068955、WO2010/098419、WO2010/102267、WO2010/111409、WO 2010/111422、WO2010/115050、WO2010/124290、WO2010/147395、WO2010/147612、Huangfu D, et al. (2008), Nat. Biotechnol., 26: 795-797、Shi Y, et al. (2008), Cell Stem Cell, 2: 525-528、Eminli S, et al. (2008), Stem Cells. 26:2467-2474、Huangfu D, et al. (2008), Nat Biotechnol. 26:1269-1275、Shi Y, et al. (2008), Cell Stem Cell, 3, 568-574、Zhao Y, et al. (2008), Cell Stem Cell, 3:475-479、Marson A, (2008), Cell Stem Cell, 3, 132-135、Feng B, et al. (2009), Nat Cell Biol. 11:197-203、R.L. Judson et al., (2009), Nat. Biotech., 27:459-461、Lyssiotis CA, et al. (2009), Proc Natl Acad Sci U S A. 106:8912-8917、Kim JB, et al. (2009), Nature. 461:649-643、Ichida JK, et al. (2009), Cell Stem Cell. 5:491-503、Heng JC, et al. (2010), Cell Stem Cell. 6:167-74、Han J, et al. (2010), Nature. 463:1096-100、Mali P, et al. (2010), Stem Cells. 28:713-720に記載の組み合わせが例示される。
一方、DNAの形態の場合、例えば、miRNA応答性mRNA等の導入方法と同様のベクターを用いることができる。ベクターには、核初期化物質が発現可能なように、プロモーター、エンハンサー、リボゾーム結合配列、ターミネーター、ポリアデニル化サイト等の制御配列を含むことができるし、さらに、必要に応じて、薬剤耐性遺伝子(例えばカナマイシン耐性遺伝子、アンピシリン耐性遺伝子、ピューロマイシン耐性遺伝子等)、チミジンキナーゼ遺伝子、ジフテリアトキシン遺伝子等の選択マーカー配列、緑色蛍光タンパク質(GFP)、βグルクロニダーゼ(GUS)、FLAG等のレポーター遺伝子配列等を含むことができる。また、上記ベクターには、体細胞への導入後、初期化因子をコードする遺伝子若しくはプロモーターとそれに結合する初期化因子をコードする遺伝子を共に切除するために、それらの前後にLoxP配列を有してもよい。
はWO2010/137746)、若しくは細胞外基質(例えば、Laminin-5(WO2009/123349)及びマトリゲル(BD社))を用いる方法が例示される。
この他にも、血清を含有しない培地を用いて培養する方法も例示される(Sun N, et al. (2009), Proc Natl Acad Sci U S A. 106:15720-15725)。さらに、樹立効率を上げるため、低酸素条件(0.1%以上、15%以下の酸素濃度)によりiPS細胞を樹立してもよい(Yoshida Y, et al. (2009), Cell Stem Cell. 5:237-241又はWO2010/013845)。
ntES細胞は、核移植技術によって作製されたクローン胚由来のES細胞であり、受精卵由来のES細胞とほぼ同じ特性を有している(T. Wakayama et al. (2001), Science, 292:740-743; S. Wakayama et al. (2005), Biol. Reprod., 72:932-936; J. Byrne et al. (2007), Nature, 450:497-502)。すなわち、未受精卵の核を体細胞の核と置換することによって得られたクローン胚由来の胚盤胞の内部細胞塊から樹立されたES細胞がntES(nuclear transfer ES)細胞である。ntES細胞の作製のためには、核移植技術(J.B. Cibelli et al. (1998), Nature Biotechnol., 16:642-646)とES細胞作製技術(上記)との組み合わせが利用される(若山清香ら(2008),実験医学,26巻,5号(増刊), 47~52頁)。核移植においては、哺乳動物の除核した未受精卵に、体細胞の核を注入し、数時間培養することで初期化することができる。
Muse細胞は、WO2011/007900に記載された方法にて製造された多能性幹細胞であり、詳細には、線維芽細胞又は骨髄間質細胞を長時間トリプシン処理、好ましくは8時間又は16時間トリプシン処理した後、浮遊培養することで得られる多能性を有した細胞であり、SSEA-3及びCD105が陽性である。
本発明はまた、本発明の選別方法の工程(1)の前に、多能性幹細胞から神経前駆細胞を分化誘導する工程を含む、神経前駆細胞の製造方法(以下「本発明の製造方法」と略記する場合がある)を提供する。
本発明で使用されるドーパミン神経前駆細胞を得る方法としては、特に限定されず、生体から直接採取してもよいが、大量にドーパミン神経前駆細胞を得るという観点からは、多能性幹細胞を出発材料として分化誘導することが好ましい。
多能性幹細胞からドーパミン神経前駆細胞を分化誘導する方法は、特に限定されないが、例えば、(i)多能性幹細胞をBMP阻害剤、TGFβ阻害剤、SHHシグナル刺激剤、FGF8及びGSK3β阻害剤から成る群より選択される試薬を含む培養液中で細胞外基質上にて接着培養する工程、及び(ii)前記工程(i)で得られた細胞を神経栄養因子を含む培養液中で浮遊培養する工程により、ドーパミン神経前駆細胞を分化誘導する方法などが挙げられる(WO2015/034012)。
本明細書において、「細胞外基質」とは、細胞の外に存在する超分子構造体を意味し、天然由来であっても、人工物(組換え体)であってもよい。例えば、コラーゲン、プロテオグリカン、フィブロネクチン、ヒアルロン酸、テネイシン、エンタクチン、エラスチン、フィブリリン及びラミニンといった物質又はこれらの断片が挙げられる。これらの細胞外基質は、組み合わせて用いられてもよく、例えば、BD Matrigel(商標)などの細胞からの調製物であってもよい。好ましくは、ラミニン又はその断片である。本発明においてラミニンとは、α鎖、β鎖、γ鎖をそれぞれ1本ずつ持つヘテロ三量体構造を有するタンパク質であり、特に限定されないが、例えば、α鎖は、α1、α2、α3、α4又はα5であり、β鎖は、β1、β2又はβ3であり、ならびにγ鎖は、γ1、γ2又はγ3が例示される。より好ましくは、α5、β1及びγ1からなるラミニン511である。本発明では、ラミニンは断片であってもよく、インテグリン結合活性を有している断片であれば、特に限定されないが、例えば、エラスターゼにて消化して得られる断片であるE8フラグメントであってもよい。従って、本発明では、WO2011/043405に記載されたラミニン511E8(好ましくはヒトラミニン511E8)が例示される。
本発明において使用されるBMP阻害剤としては、Chordin、Noggin、Follistatin、などのタンパク質性阻害剤、Dorsomorphin (すなわち、6-[4-(2-piperidin-1-yl-ethoxy)phenyl]-3-pyridin-4-yl-pyrazolo[1,5-a]pyrimidine)、その誘導体 (P. B. Yu et al. (2007), Circulation, 116:II_60; P.B. Yu et al. (2008), Nat. Chem. Biol., 4:33-41; J. Hao et al. (2008), PLoS ONE, 3(8):e2904)及びLDN193189(すなわち、4-(6-(4-(piperazin-1-yl)phenyl)pyrazolo[1,5-a]pyrimidin-3-yl)quinoline)などが挙げられる。Dorsomorphin及びLDN193189は市販されており、それぞれSigma-Aldrich社及びStemgent社から入手可能である。好ましくは、LDN193189である。
本明細書において、「TGFβ阻害剤」とは、TGFβの受容体への結合からSMADへと続くシグナル伝達を阻害する物質を意味し、受容体であるALKファミリーへの結合を阻害する物質、又はALKファミリーによるSMADのリン酸化を阻害する物質が挙げられ、例えば、Lefty-1(NCBI Accession No.として、マウス:NM_010094、ヒト:NM_020997が例示される)、SB431542、SB202190(以上、R.K.Lindemann et al., Mol. Cancer, 2003, 2:20)、SB505124 (GlaxoSmithKline)、 NPC30345、SD093、SD908、SD208 (Scios)、LY2109761、LY364947、 LY580276 (Lilly Research Laboratories)、A83-01(WO 2009146408)及びこれらの誘導体などが例示される。好ましくは、A83-01である。
本明細書において、「SHH(Sonic hedgehog)シグナル刺激剤」とは、SHHが受容体であるPatched (Ptch1)に結合して引き起こされるSmoothened (Smo)の脱抑制及びさらに続くGli2の活性化を引き起こす物質を意味し、例えば、SHH、Hh-Ag1.5 (Li, X., e t al., Nature Biotechnology, 23, 215~ 221 (2005).)、Smoothened Agonist, SAG (N-Methyl-N’-(3-pyridinylbenzyl)-N’-(3-chlorobenzo[b]thiophene-2-carbonyl)-1,4-diaminocyclohexane)、20a-hydroxycholesterol、Purmorphamine及びこれらの誘導体などが例示される(Stanton BZ, Peng LF., Mol Biosyst. 6:44-54, 2010)。好ましくは、Purmorphamineである。
本明細書において、「GSK3β阻害剤」とは、GSK-3βタンパク質のキナーゼ活性(例えば、βカテニンに対するリン酸化能)を阻害する物質として定義され、既に多数のものが知られているが、例えば、インジルビン誘導体であるBIO(別名、GSK-3β阻害剤IX;6-ブロモインジルビン3'-オキシム)、マレイミド誘導体であるSB216763(3-(2,4-ジクロロフェニル)-4-(1-メチル-1H-インドール-3-イル)-1H-ピロール-2,5-ジオン)、フェニルαブロモメチルケトン化合物であるGSK-3β阻害剤VII(4-ジブロモアセトフェノン)、細胞膜透過型のリン酸化ペプチドであるL803-mts(別名、GSK-3βペプチド阻害剤;Myr-N-GKEAPPAPPQpSP-NH2(配列番号1))及び高い選択性を有するCHIR99021(6-[2-[4-(2,4-Dichlorophenyl)-5-(4-methyl-1H-imidazol-2-yl)pyrimidin-2-ylamino]ethylamino]pyridine-3-carbonitrile)が挙げられる。これらの化合物は、例えばCalbiochem社やBiomol社等から市販されており容易に利用することが可能であるが、他の入手先から入手してもよく、あるいはまた自ら作製してもよい。本発明で使用されるGSK-3β阻害剤は、好ましくは、CHIR99021である。
本発明において使用されるFGF8としては、特に限定されないが、ヒトFGF8の場合、FGF8a、FGF8b、FGF8e又はFGF8fの4つのスプライシングフォームが挙げられ、好ましくは、FGF8bである。FGF8は、例えばWako社やR&D systems社等から市販されており容易に利用することが可能であるが、当業者に公知の方法によって細胞へ強制発現させることによって得ることもできる。
本明細書において、「神経栄養因子」とは、運動ニューロンの生存と機能維持に重要な役割を果たしている膜受容体へのリガンドを意味し、例えば、Nerve Growth Factor (NGF)、Brain-derived Neurotrophic Factor (BDNF)、Neurotrophin 3 (NT-3)、Neurotrophin 4/5 (NT-4/5)、Neurotrophin 6 (NT-6)、basic FGF、acidic FGF、FGF-5、Epidermal Growth Factor (EGF)、Hepatocyte Growth Factor (HGF)、Insulin、Insulin Like Growth Factor 1 (IGF 1)、Insulin Like Growth Factor 2 (IGF 2)、Glia cell line-derived Neurotrophic Factor (GDNF)、TGF-b2、TGF-b3、Interleukin 6 (IL-6)、Ciliary Neurotrophic Factor (CNTF)及びLIFなどが挙げられる。好ましい神経栄養因子は、GDNF及び/又はBDNFである。神経栄養因子は、例えばWako社やR&D systems社等から市販されており容易に利用することが可能であるが、当業者に公知の方法によって細胞へ強制発現させることによって得ることもできる。
工程(i)で用いる培養液は、動物細胞の培養に用いられる培地を基礎培地として調製することができる。基礎培地としては、例えば、Glasgow's Minimal Essential Medium(GMEM)培地、IMDM培地、Medium 199培地、Eagle's Minimum Essential Medium (EMEM)培地、αMEM培地、Dulbecco's modified Eagle's Medium (DMEM)培地、Ham's F12培地、RPMI 1640培地、Fischer's培地、Neurobasal Medium(ライフテクノロジーズ)及びこれらの混合培地などが包含される。好ましくは、GMEM培地である。培地には、血清が含有されていてもよいし、あるいは無血清でもよい。必要に応じて、培地は、例えば、アルブミン、トランスフェリン、Knockout Serum Replacement(KSR)(ES細胞培養時のFBSの血清代替物)、N2サプリメント(Invitrogen)、B27サプリメント(Invitrogen)、脂肪酸、インスリン、コラーゲン前駆体、微量元素、2-メルカプトエタノール、3'-チオールグリセロールなどの1つ以上の血清代替物を含んでもよいし、脂質、アミノ酸、L-グルタミン、Glutamax(Invitrogen)、非必須アミノ酸、ビタミン、増殖因子、低分子化合物、抗生物質、抗酸化剤、ピルビン酸、緩衝剤、無機塩類などの1つ以上の物質も含有し得る。好ましい培養液は、KSR、2-メルカプトエタノール、非必須アミノ酸及びピルビン酸を含有するGMEM培地である。この培養液へ適宜BMP阻害剤、TGFβ阻害剤、SHHシグナル刺激剤、FGF8及びGSK3β阻害剤から成る群より選択される試薬を加えて培養することができる。
工程(ii)で用いる培養液は、動物細胞の培養に用いられる培地を基礎培地として調製することができる。基礎培地としては、例えば、上記工程(i)で記載したものと同様のものが挙げられる。好ましくは、Neurobasal Mediumである。培地には、血清が含有されていてもよいし、あるいは無血清でもよい。必要に応じて、培地は、例えば、アルブミン、トランスフェリン、Knockout Serum Replacement(KSR)(ES細胞培養時のFBSの血清代替物)、N2サプリメント(Invitrogen)、B27サプリメント(Invitrogen)、脂肪酸、インスリン、コラーゲン前駆体、微量元素、2-メルカプトエタノール、3'-チオールグリセロールなどの1つ以上の血清代替物を含んでもよいし、脂質、アミノ酸、L-グルタミン、Glutamax(Invitrogen)、非必須アミノ酸、ビタミン、増殖因子、低分子化合物、抗生物質、抗酸化剤、ピルビン酸、緩衝剤、無機塩類、核酸(例えば、Dibutyryl cyclic AMP(dbcAMP))などの1つ以上の物質も含有し得る。好ましい培養液は、B27サプリメント、アスコルビン酸及びdbcAMPを含有するNeurobasal Mediumである。この培養液へ適宜神経栄養因子を加えて培養することができる。
本発明で使用される大脳皮質神経前駆細胞を得る方法としては、特に限定されず、生体から直接採取してもよいが、大量に大脳皮質神経前駆細胞を得るという観点からは、多能性幹細胞を出発材料として製造することが好ましい。
多能性幹細胞から大脳皮質神経前駆細胞を分化誘導する方法は、特に限定されないが、例えば、(i)多能性幹細胞をTGFβ阻害剤、bFGF、Wnt阻害剤及び/又はBMP阻害剤を含む培養液中で浮遊培養する工程、及び(ii)前記工程(i)で得られた細胞をさらに培養する工程により、大脳皮質神経前駆細胞を分化誘導する方法などが挙げられる(WO2016/167372)。
「TGFβ阻害剤」とは、前述した通りであり、TGFβ阻害剤としては、例えば、ドーパミン神経前駆細胞の製造方法で記載したものと同様のものが挙げられる。本工程で使用されるTGFβ阻害剤は、好ましくは、SB431542又はA-83-01である。
本明細書において、bFGFは、FGF2とも称し、例えばWako社やInvitrogen社等から市販されており容易に利用することが可能であるが、当業者に公知の方法によって細胞へ強制発現によって得ることもできる。
本明細書において、「Wnt阻害剤」とは、Wntの産生を抑制する物質、又はWntの受容体への結合からβカテニンの蓄積へと続くシグナル伝達を阻害する物質を意味し、受容体であるFrizzledファミリーへの結合を阻害する物質、又はβカテニンの分解を促進する物質などが挙げられる。このようなWnt阻害剤としては、例えば、DKK1タンパク質(例えば、ヒトの場合、NCBIのアクセッション番号:NM_012242)、スクレロスチン(例えば、ヒトの場合、NCBIのアクセッション番号:NM_025237)、IWR-1(Merck Millipore)、IWP-2(Sigma-Aldrich)、IWP-3(Sigma-Aldrich)、IWP-4(Sigma-Aldrich)、IWP-L6(EMD Millipore)、C59(又は、Wnt-C59)(Cellagen technology)、ICG-001(Cellagen Technology)、LGK-974(又は、NVP-LGK-974)(Cellagen Technology)、FH535(Sigma-Aldrich)、WIKI4(Sigma-Aldrich)、KYO2111(Minami I,et al,Cell Rep.2:1448-1460,2012)、PNU-74654(Sigma-Aldrich)、XAV939(Stemgent)及びこれらの誘導体などが例示される。本発明の多能性幹細胞から大脳皮質ニューロンを製造するにあたり、好ましいWnt阻害剤は、Wntの産生を抑制する物質であり、例えば、Wntタンパク質のプロセシングに関与するPORCN(ヒトの場合、NCBIのアクセション番号:NP_001269096、NP_073736、NP_982299、NP_982300、又はNP_982301で表されるタンパク質が例示される)を阻害する物質が挙げられ、C59、IWP-3、IWP-4、IWP-L6又はLGK-974が好ましく、C59がより好ましい。
「BMP阻害剤」とは、前述した通りであり、BMP阻害剤としては、例えば、ドーパミン神経前駆細胞の製造方法で記載したものと同様のものが挙げられる。本工程で使用されるBMP阻害剤は、好ましくは、LDN193189である。
工程(i)で用いる培養液は、動物細胞の培養に用いられる培地を基礎培地として、上述したTGFβ阻害剤、bFGF、Wnt阻害剤、BMP阻害剤を添加して調製することができる。基礎培地としては、例えば、上記ドーパミン神経前駆細胞の製造方法の工程(i)で記載したものと同様のものが挙げられる。好ましくは、DMEM又はDMEMとHam‘s F12培地を1:1で混合した培地である。基礎培地には、血清が含有されていてもよいし、あるいは血清に代えて血清代替物を添加してもよい。血清代替物は、例えば、アルブミン、トランスフェリン、Knockout Serum Replacement(KSR)、N2サプリメント(Invitrogen)、B27サプリメント(Invitrogen)、脂肪酸、インスリン、コラーゲン前駆体、微量元素及びこれらから選択される複数の組み合わせなどが挙げられる。好ましくは、血清代替物はKSRである。
本発明の工程(ii)で用いる培養液は、動物細胞の培養に用いられる基礎培地を用いることができる。基礎培地としては、例えば、上記ドーパミン神経前駆細胞の製造方法の工程(i)で記載したものと同様のものが挙げられる。好ましくは、DMEMとHam’s F12培地を1:1で混合した培地である。基礎培地には、血清が含有されていてもよいし、あるいは血清に代えて血清代替物を添加してもよい。血清代替物は、例えば、アルブミン、トランスフェリン、KSR、N2サプリメント(Invitrogen)、B27サプリメント(Invitrogen)、脂肪酸、インスリン、コラーゲン前駆体、微量元素及びこれらから選択される複数の組み合わせなどが挙げられる。好ましくは、血清代替物はN2サプリメント及びB27サプリメントである。基礎培地には、2-メルカプトエタノール、3’-チオールグリセロール、脂質、アミノ酸、L-グルタミン、Glutamax(Invitrogen)、非必須アミノ酸、ビタミン、増殖因子、低分子化合物、抗生物質、抗酸化剤、ピルビン酸、緩衝剤、無機塩類などの1つ以上の物質も含有し得る。工程(ii)で用いる培養液は、上記基礎培地に例えば、FGF8(線維芽細胞成長因子8(fibroblast growth factor8))、SHHシグナル阻害剤(例:Cyclopamine、Forskolin、Rapamycin (mixture of isomers)等)、神経栄養因子などを適宜添加したものを用いることができる。
本発明はまた、多能性幹細胞からの神経前駆細胞の選別用キットを提供する。本キットには、上述したmiRNA応答性mRNAや該mRNAをコードするDNAに加えて、上記トランスフェクションコントロールのmRNAや該mRNAをコードするDNA、神経前駆細胞の誘導のための特定の因子を含む神経前駆細胞誘導剤(例えば、凍結乾燥物、適当な緩衝液に溶解した凍結液剤等)、多能性幹細胞、試薬及び培養液を含んでいてもよく、本キットには、さらに分化誘導の手順を記載した書面や説明書を含んでもよい。さらにセルソーターを用いて選別するための抗体や、セルソーターを用いずに選別するための上述した抗生物質等の薬剤を含んでいてもよい。好ましくは、該薬剤はピューロマイシンである。
本発明では、神経前駆細胞を含む医薬を提供する。ここで神経前駆細胞は、本発明の方法により得られた細胞であれば特に限定されない。神経前駆細胞はそのまま、若しくはフィルター濾過等により濃縮したペレット等の細胞塊等として用いられる。さらに、該医薬は、DMSO(ジメチルスルホキシド)等の保護剤を加え、凍結保存することもできる。該医薬は、医薬として、より安全に利用するために、加熱処理、放射線処理等、目的の神経前駆細胞としての機能を残しつつ、病原体のタンパク質が変性する程度の条件下での処理に付してもよい。また、神経前駆細胞が必要量以上に増殖することを防止するために、上記処理と組み合わせて、マイトマイシンC前処理等による増殖の抑制や、哺乳類が自然には持っていない代謝酵素の遺伝子を当該細胞に導入して、その後、必要に応じて未活性型の薬を投与し、哺乳類が自然には持っていない代謝酵素の遺伝子を導入した細胞の中だけでその薬を毒物に変化させて細胞を死滅させる方法(自殺遺伝子療法)等の処理に付してもよい。
<ヒトiPS細胞の培養>
フィーダーを含まないヒトiPS細胞(1147F1及び1231A3株)を、既報のプロトコール(Nakagawa et al. (2014) Sci Rep. 4:3594)に従って、StemFit(+bGF)培地中のiMatrix-511(E8)(Nippi)上で維持した。ヒトiPS細胞を8日ごとに継代した。継代前に、6 wellプレートを37℃で少なくとも1時間、滅菌PBSで0.5μg/cm2の密度に希釈したiMatrix-511(E8)でコーティングした。PBSを吸引後、10μMのROCK阻害剤(Y-26732)を含む1.5mlのStemFitで迅速に置換した。ヒトiPS細胞を採取するために、古い培地を吸引し、細胞を1mlのPBSで洗浄した。PBSを吸引除去した後、0.3mlのTrypSELECT溶液(オンラインプロトコル参照)を各wellに加え、プレートをインキュベーターに移した。その後、TrypSELECT培地を吸引し、1 mlのPBSで洗浄した。PBSを吸引し、各wellに1.5mlのStemFit(ROCK阻害剤を含む)を加えた。ラバーエンドセルスクレーパーを使用して、マトリックスから細胞を回収し、ピペッティングにより、単一細胞にした。トリパンブルー染色及びCell Countess(Invitrogen)によって細胞密度を計算し、1.3×104細胞/wellで播種し、迅速に混合して細胞を均一に分散させた。24時間後、全量をStemFit(ROCK阻害剤なし)に交換し、その後1日おきに培地交換した。
ヒトES細胞(Kh1株)及びマウスES細胞を、上記のiPS細胞と同様の手法によって培養した。
ヒトiPS細胞(1147F1及び1231A3株)及びヒトES細胞(Kh1株)から、ドーパミン神経前駆細胞を以下の方法により分化誘導した。6 wellプレートを、上記と同様にiMatrix-511(E8)でコーティングし、1 well当たり4mlの0日目の分化培地(d0分化培地:100μMピルビン酸ナトリウム、100μM β-メルカプトエタノール(2ME)を添加したGlasgow’s MEM/8% knockout-serum (KSR)(8GMK培地)、10μM Y-26732 (Wako)、100nM LDN-193189 (Stemgent)、500nM A83-01 (Wako))を添加した。分化は、d0分化培地(ROCK阻害剤あり)中のヒトiPSの分散細胞懸濁液から開始し、6 wellプレートに5×106細胞/wellで播種した。プレートを静かに攪拌してからインキュベーターに戻した。24時間後、培地全体をd1培地など(組成は下記参照)に交換し、毎日培地を交換した。1 well当たり、0から2日目までは4ml、3~6日目は6ml、7~8日目は8ml及び9~11日目は10mlを添加した。最初の11日間の培養で、細胞数は1 well当たり約1×107細胞にまで増加した。細胞を、12日目、20日目及び29日目に継代し、6 wellプレート中に常に5×106細胞/wellで播種した。12日以降、細胞は、以下を補充したNeurobasal B27培地中で常に維持された。1 well当たり、培地を8mlずつ添加して交換した。
1-2日目は、8GMK培地に100nM LDN-193189、500nM A83-01、2μMのプルモルファミン(Calbiochem)及び100ng/mlヒト組換えFGF-8(Wako)を添加した培地を用いた。3日目~7日目は8GMK培地に100nM LDN-193189、500 nM A83-01、2μMのプルモルファミン、100ng/ml ヒト組換えFGF-8及び30μM CHIR99021(Stemgent)を添加した培地を、添加した。7-11日目は、8GMK培地に100nM LDN-193189及び30μM CHIR99021を添加した培地を、添加した。12日目以降は、Neurobasal B27培地に、200μMアスコルビン酸(Sigma Aldrich)、400μM dbcAMP、20ng/mlのヒト組換えBDNF及び10ng/mlヒト組換えGDNFを添加した培地を、添加した。
12、20及び29日目に、混在細胞を、Kan Researchの抗CORIN(底板マーカー)抗体及び神経系統を標識するPSA-NCAM抗体で染色することによって、分化効率を評価した。平行して200μlの染色緩衝液(ROCK阻害剤を含む)中の約5×105細胞を200倍希釈したマウス抗ヒトCORIN抗体(Kan Research)又は200倍希釈した抗ヒトPSA-NCAMマウス・モノクローナル抗体(MAB5324、ミリポア)のいずれかで染色した。Alexa 488結合抗マウスIgG/IgM抗体は、それぞれCORIN及びPSA-NCAMについて400倍希釈で用いた。細胞を4℃で30分間染色した。細胞をHBSS培地(Hank’s balanced salt solution/2% KSR、50μg/ml penicillin/streptomycin及び10μM Y-26732)で2回洗浄した。死細胞をFACS分析前に10分間7-AADで染色した。
FITC及び7-AADシグナル用の標準フィルターを用いて、BD FACS aria-II又はBD Accuriのいずれかで細胞を分析した。ゲートは、SSC-A強度(P1)に基づいて死細胞を排除し、FSC-W対FSC-H(P2)及びSSC-W対SSC-H(P3)からダブレットを除去するように設定した。最後に7-AADで染色された細胞を除外し、「LIVE」細胞ゲート(P4/LIVE)を残した。P4でゲートされた20,000細胞を分析した。CORIN陽性及びPSA-NCAM陽性ゲートは、Alexa488-IgG又はIgGアイソタイプ対照二次抗体中に0.2%以下の細胞を有するように設定した。
ヒトiPS細胞(1231A3株)及びヒトES細胞(Kh1株)から、培地にプルモルファミン、FGF8及びCHIRを添加しないことを除き、分化誘導開始から12日目まで、上記ドーパミン神経前駆細胞と同様の方法で分化誘導を行った。
feeder細胞上で維持していたマウスES細胞は、培地を除去した後にPBSバッファーで2回洗浄し、0.05%のトリプシンEDTAで5分間、37℃で処理し、遠心分離によって細胞を回収した。コロニーをen blockで採取し、0.01%ゼラチンコートでコーティングした10cmディッシュで30分間放置し、培地成分を除去した。更に、遠心分離によって上清を除去し、PBSバッファーで2回洗浄した。Accumax(フナコシ)を1ml添加し、5分間、37℃で処理した。ピペッティングによりシングルセルにした後、PBSバッファーを10ml添加して遠心分離した。上清を除去した後、細胞数をカウントし、96 well U底ディッシュに、1 well当たり4,000細胞となるように播種した。
0-6日目は、NEAA、L-グルタミン酸、0.1mM 2ME、1mMピルビン酸及び10%KSRを補充したGMEM(Gibco)培地を使用し、37℃、5% CO2の雰囲気下で培養した。培地を、3日毎に交換した。培養開始時に培地に終濃度で20nMのC59及び10μMのSB431542を添加し、3日後の培地交換の際にも同様に添加した。
培養開始から6日目に継代を行い、2ME及びL-グルタミン酸を補充したDMEM(Gibco)500ml、N2サプリメントを5ml、B27を10ml添加した培養液を使用し、37℃、5%CO2の雰囲気下でインキュベートした。培養開始から8日目に、rmFGF8b(終濃度50ng/ml)及びcyclopamine(終濃度5μM)を添加し、37℃、5% CO2/40% O2の雰囲気下で培養した。
DNAコンストラクトは、5'側から、5'UTRカセット、マーカータンパク質のORF、及び3'UTRカセットを含む。本実験で用いた殆どのDNAコンストラクトは、5'UTRカセット内にmiRNA標的配列を挿入し、この標的配列にmiRNAが結合した場合にマーカータンパク質の翻訳が抑制されるように設計した。用いたオリゴ、プライマーを表1に、PCRの条件を表2~4に示す。
哺乳動物細胞株における効率的な翻訳のために最適化した5'UTRをコードするオリゴを、5'UTR PCR産物を作製するための鋳型として使用した(表1を参照のこと)。この産物は、インビトロ転写後にキャップされる5'グアノシンと、インビトロ合成におけるT7 RNAポリメラーゼに使用されるT7プロモーターとを含む。さらに、最適化した3'UTRをコード、末端の20ntチミジンリピートを含むオリゴをテンプレートとして用いて、3'UTR PCR産物を作製した。5'UTR産物及び3'UTR産物はいずれも、2ステップPCRプログラム(表3及び表4を参照のこと)を用いて生成した。
ORFを、5'UTR PCR産物の3'末端及び3'UTR PCR産物の5'末端に部分的に相補的なプライマーを用いてプラスミドから増幅した。PCRの詳細については、表2を参照のこと。すべてのORFは、2ステップPCRプログラム(表3及び表4を参照のこと)を用いて作製した。得られたピューロマイシン耐性遺伝子、tagBFP及びEGFPのORFの配列をそれぞれ、配列番号745、747及び749で示す。
5'非翻訳領域(5'UTR)、ORF及び付加的な100-ntアデノシンテール(合計で120ポリAテールとなる)を含む逆方向プライマー(3UTR120A)で伸長された3'UTRの融合PCRから、全長DNAの鋳型(図2b参照のこと)を作製した。すべての融合PCRは、3段階PCRプログラムを用いて行った(表3、表4参照のこと)。
MEGAscript T7 kit (Ambion)と上記で作製したDNAコンストラクトを用いてmRNA合成を行った。この反応において、ウリジン三リン酸及びシチジン三リン酸に替えて、シュードウリジン-5'-三リン酸及びメチルシチジン-5'-三リン酸(TriLink BioTechnologies)をそれぞれ用いた。IVT(mRNA合成)反応の前に、グアニジン-5'-三リン酸は、Anti Reverse Cap Analog (New England Biolabs)で5倍希釈した。反応混合液を37℃で5時間インキュベートして、TURBO DNase (Amibion)を加えた後、37℃で更に30分インキュベートした。得られたmRNAは、FavorPrep Blood/Cultured Cells total RNA extraction column (Favorgen Biotech)で精製し、Antarctic phosphatase (New England Biolabs)を用いて37℃で30分インキュベートした。その後、RNeasy Mini Elute Cleanup Kit (QIAGEN)により、更に精製した。得られたコントロール用のピューロマイシン耐性遺伝子 mRNA、tagBFP mRNA及びEGFP mRNAの配列をそれぞれ、配列番号753~755で示す。
以下、DNAコンストラクトからIVTによって作製されたmRNAをmiRNAスイッチと記載する。例えば、「miR-9-5p-tagBFP」から作製したmiRNAスイッチを「miR-9-5スイッチ」と記載する。タンデムスイッチについては、以下、「1x9-5p-tagBFP-4x9-5p」から作製したmiRNAスイッチを「タンデムmiR-9-5pスイッチ」、「1x9-5p-BimEL-4x9-5p」から作製したmiRNAスイッチを「Bimスイッチ」と記載する。
miRNAスイッチの導入は図1bに示したスケジュールに従って行った。
トランスフェクション1日目は、分化誘導した神経前駆細胞(接着培養)をAccumaxにて10分インキュベートして剥がれた細胞を回収し、Countessで細胞数を数えた。細胞濃度が5.0×105細胞/mlになるよう、NBB27+GABA+Y培地で希釈し、細胞懸濁液を調製した。24 wellプレート(iMatrixコート)に細胞懸濁液1ml(50万細胞/well)を静かに分注した。37℃、5%CO2のインキュベーターで一晩培養した。
miRNAスイッチと共にmiRNA応答性mRNAとは異なる蛍光タンパク質遺伝子をコードしたmRNA(以下、トランスフェクションコントロールという)をそれぞれの細胞に導入した。
細胞を播種せずmRNA導入を行う場合は、2本の滅菌した1.5mlチューブに1本当たりStemfect RNA transfection kit(Stemgent)を12.5μl添加した。最初のチューブ(A)では、Stemfect RNAトランスフェクション試薬を1.0μlをバッファーに添加して混合した。二本目のチューブ(B)では、100ng/μlのmiRNAスイッチを1.0μl及び100ng/μlのEGFP mRNAを1.0μlをバッファーに添加して混合した。A液及びB液を混合し、室温で15分間インキュベートした。その間、培地を抗生物質を含まない新鮮なI3培地500μlに交換した。15分後、その混合液を細胞に添加し、プレートを温和に振とうし、5%CO2雰囲気下、37℃で4時間インキュベートした。4時間後、培地を吸引し、wellをIMDMで1回洗浄し、新鮮なI3培地500μlをwellに添加した。24時間後、Accumaxを添加して10分インキュベートした後、細胞を回収し、FACSを用いて解析又は選別を行った。
細胞を播種してmRNA導入を行う場合は、24 wellプレートで培養されている細胞に200 μlのAccumaxを加え、37℃、5%CO2下で10~15分インキュベートした後、500 μlの培地(DMEM 2%HS)を加え15 ml チューブに回収して4℃、2000 rpm、10分で遠心を行い、上清を取り除いた。500 μlの培地を加えピペッティングした後、cell countess(invitrogen)で細胞数を計測後、必要に応じて希釈した。24 wellプレートにまき直す場合は2×105細胞/well、6 wellプレートにまき直す場合は1×106細胞/wellで細胞をまき直した。細胞をwellにまくと同時に上述の方法により作製したmRNAを含む混合液をwellに加えた。37℃、5%CO2下で4時間インキュベートした。その後、培地を除き、必要量の培地(DMEM 2%HS)をwellに加えた。24時間後、FACSを用いて解析した。
ヒトiPS細胞(1147F1株と1231A3株)から分化誘導したドーパミン神経前駆細胞を用い、分化13日目に底板マーカータンパク質であるCORINに対する抗体を用いてFACS選別した。CORIN陽性細胞(ドーパミン神経前駆細胞)と陰性細胞(ドーパミン神経以外)からRNAを抽出し、miRNAアレイにかけた。製造業者の指示通りに、Agilent Technologies Human miRNA Microarray Release 19.0及びSurePrint G3 Human GE Microarrayを用いて行った。データはGeneSpring GX12.6ソフトウェア(Agilent Technologies)を用いて解析した。それぞれの株で2以上の変化率でドーパミン神経前駆細胞でより多く発現しているmiRNAを抽出し、2株でoverlapするmiRNA、あるいは既報の文献等(例えば、Huang T, J Mol Cell Biol 2:3, 152-63)に記載のmiRNAを候補として、上述の方法によって、miR-9-5p, 及びmiR-218-5pを含む37種類のmiRNAの標的配列から、miRNAスイッチを作製した。
これらのmiRNAスイッチを導入した細胞をFACS選別することにより、miRNAスイッチとして機能するか解析した。
各解析対象の細胞に24 wellプレート、1 wellあたり200μlのAccumaxを加え(6 wellプレートでは1ml)、37℃、5%CO2下で10~15分インキュベートした。その後500μlの培地(DMEM 2%HS)を加え、細胞を15 mlチューブに回収して4℃、2000rpm、10分で遠心を行い、上清を取り除いた。1 wellあたり200μlの培地(DMEM 2%HS)又はHBSSを加えて、ピペッティングで懸濁しフィルターで通して解析に用いた。
ヒトiPS細胞(1231A3株)及びヒトES細胞(Kh1株)をそれぞれ前脳又はドーパミン神経前駆細胞に分化誘導し、分化誘導開始から0~35日目の間で7日毎に細胞を回収し、液体窒素で凍結した後、-80℃で保存した。RNA抽出は、細胞ペレットを氷上で解凍し、製造者のプロトコールに従ってTrizol試薬(Invitrogen)に再懸濁した。冷凍庫で一晩、RNAを氷冷イソプロパノール中で沈殿させ、75%エタノールで洗浄し、乾燥させ、最後に適量のRNaseフリー精製水に再懸濁し、50℃で5分間加熱して乾燥RNAの懸濁を補助した。製造者のプロトコールに従って、残留したゲノムDNAをTURBO DNase(Ambion)キットを用いて分解し、スラリー(slurry)を用いて反応後の酵素及び過剰の陽イオンを除去した。RNAの純度及び量は、最初にNanodrop 2000(ThermoFisher)で測定した。hsa-miR-9-5p(miRBase.v21:MIMAT0000441;アッセイID. 000583、カタログ番号4427975)及びhsa-miR-218-5p(miRBase.v21:MIMAT0000275;アッセイID. 000521、カタログ番号4427975)に特異的なRTプライマーを用いて、TaqMan MicroRNA逆転写キット(AppliedBiosystems)の製造業者のプロトコールに従って、逆転写のために10ngのトータルRNAを用いた。small RNA TaqManアッセイの指示に従って、1xTaqMan(登録商標)ユニバーサルPCRマスターミックスII(UNGなし)及び1xTaqMan(登録商標)Small RNAアッセイと共に、1.33μlの逆転写反応物を用い、ヌクレアーゼ・フリーの精製水で20μlとした。標準的な温度勾配条件で、StepOnePlusTMリアルタイムシステム(AppliedBiosystems)を用いてPCRを行った。成熟miRNAの発現を、分化0日目のiPS細胞の状態と比較するために、ユニバーサルRNU6B TaqMan(登録商標)Small RNAアッセイ(NR_002752;アッセイID. 001093、カタログ番号4427975)を用いて発現量を標準化し(図4)、-ΔΔCt法で分析した。
miRNAスイッチを用いてFACS選別した細胞又はBimスイッチで選別した細胞からトータルRNAを抽出した。ReverTra Aceキット(TOYOBO)及びオリゴ(dT)20プライマーを用いて、逆転写反応を行った。
定量PCRはTaqManプローブ及びStepOne Plus Real-Time PCR System(Applied Biosystems)を用いて各種マーカー遺伝子の発現解析を行った。解析に用いた、ヒト遺伝子用のプライマーを表5、マウス遺伝子用のプライマーを表6に示す。
ヒトiPS細胞(1231A3株)をドーパミン神経前駆細胞に分化誘導し、分化誘導開始から14日目、21日目及び28日目にmiR-9-5pスイッチ又はmiR-218-5pスイッチを導入し、翌日FACSで選別した(図3)。選別した細胞からRNAを抽出し、上記の方法に従って、各マーカー遺伝子の発現量をqRT-PCRで解析した。各マーカー遺伝子の発現量は、miRNAスイッチ陽性細胞と陰性細胞間で比較を行った(図5~7)。また、以下の方法により免疫染色でマーカータンパク質の発現を調べた(図9)。
ヒトiPS細胞(1231A3株)をドーパミン神経前駆細胞に分化誘導し、分化誘導開始から12日目の細胞に24 wellプレート、1 wellあたり200μlのAccumaxを加え、37℃、5%CO2下で10~15分インキュベートした。その後500μlの培地(DMEM 2%HS)を加え細胞を15mlチューブに回収して4℃、2000rpm、10分で遠心を行い、上清を取り除いた。1 wellあたり200μlの培地(DMEM 2%HS)又はHBSSを加えて、ピペッティングで懸濁しフィルターで通して解析に用いた。解析に用いた抗体は抗CORINマウスIgG抗体(1:200、KAN研究所から譲受)及びAlexa 488-conjugated抗マウスIgG抗体(1:400、Invitrogen)を使用した。抗体を加え4℃で20分間インキュベートし、細胞をHBSSバッファーで2回洗浄した。死細胞及を7-AAD染色によって識別染色した。一次抗体を失ったサンプルの閾値を超えるサンプルが0.1%以下となるように、染色陽性の基準を設定した。解析にはBD FACS Aria III若しくはBD LSRFortess、選別にはBD FACS Aria IIIを用いた。選別した細胞を21日目若しくは28日目まで継続培養したサンプルからRNAを抽出し、上記の方法に従って、各マーカー遺伝子の発現量をqRT-PCRで解析した(図8)。
FACS選別した細胞の免疫染色では、FACS選別後、さらに96 well低接着プレート上で8日間培養を続け細胞集塊としたサンプルを用いた。
Bimスイッチで選別した細胞の免疫染色では、選別後、さらに96 well低接着プレート上で7日間培養を続けて細胞集塊を形成させ、再びAccumaxで単一細胞に解離し、8 well chamber slide (iMatrix coat)に播種し、7日後の細胞をサンプルとして用いた。
これらの細胞を4%PFAで固定し、2%ヤギ血清及び0.5%サポニンを添加したPBSバッファー(Sigma)に懸濁した、各マーカータンパク質に特異的な一次抗体で、各細胞を染色した。Alexa 488結合抗マウスIgG抗体(ミリポア)を500倍希釈し、二次抗体として使用した。核は10,000倍希釈したHoechst(Invitrogen)で染色した。染色画像はBiorevo BZ-9000顕微鏡(Keyence)を用いて撮影した。本実験で使用した抗体を表7に示す。
FACS選別し、回収した陽性又は陰性細胞の一部をRNA抽出サンプルとし、他のものは更に96 well低接着プレート(住友ベークライト、PrimeSurface)に分散して、一週間の培養を追加し凝集塊(aggregation、sphereともいう)を形成させ、RNA抽出用のサンプル、又は4%PFA固定後、凍結切片として免疫染色用のサンプルとした。
ヒトiPS細胞(1231A3株)をドーパミン神経前駆細胞に分化誘導し、分化誘導開始から21日目にmiR-9-5pスイッチ又はタンデムmiR-9-5pスイッチを導入し、上記の方法でFACS選別した(図10、11)。
Bimスイッチのトランスフェクションは図1bに示したスケジュールに従い、分化誘導21日目に、以下の手法によって行った。
6 wellプレートの1 wellについて、2本の滅菌した1.5mlチューブに1本当たりStemfectトランスフェクション・バッファーを50μl添加した。最初のチューブ(A)では、Stemfect RNAトランスフェクション試薬を4.0μl添加した。二本目のチューブ(B)では、100ng/μlのmiR-Bimスイッチを1.0、1.5又は2.0μl及び100ng/μlのピューロマイシン耐性mRNAを2.0μl添加した。A液とB液を混合し、室温で15分間インキュベートした。その間、培地を、抗生物質を含まない新鮮なI3培地2mlに交換した。15分後、その混合液を細胞に添加し、プレートを温和に振とうし、5%CO2雰囲気下、37℃で4時間インキュベートした。4時間後、培地を除去し、wellをIMDMで1回洗浄し、2μg/mlのピューロマイシンを含む新鮮なI3培地2mlを細胞に添加した。
翌日、生残細胞を回収し低接着96 wellプレートに2×104細胞/wellとなるように播種し、aggregationを作製し、7日間追加培養を行った。分化誘導28日目に、aggregationを回収し、その一部を用いてqPCRによって各マーカー遺伝子の発現解析をした。また、残りのaggregationの一部にAccumaxを1ml添加し、5分間、37℃で処理した。ピペッティングによりシングルセルにした後、8 wellチャンバースライド(iMatrixコート)に播種し、7日後(分化誘導35日目)に、4%PFAで固定し、上記と同様にして免疫染色を行った。
ヒトES細胞(Kh1株)及びヒトiPS細胞(1231A3株)を上記の方法によって神経前駆細胞に分化させ、分化後20日及び27日で検討を行った。96 wellプレート(flat bottom、iMatrixコート)に1.7×105細胞/wellで播種し、翌日、終濃度0~15μg/mlとなるようにピューロマイシンを添加した培地に交換し20時間培養し、CyQuant Diret Cell Proliferation Assay Kit (Invitrogen)により細胞の生残率を評価した(図12a)。Controlとして、CyQuant kitで処理していない細胞の自家蛍光を測定した。
次に、終濃度10μg/mlとなるようにピューロマイシンを添加した培地に、ピューロマイシン耐性mRNAを0~100ng/mlでトランスフェクションした各細胞を20時間培養し、上記と同様にして細胞の生残率を評価した(図12b)。
ピューロマイシン耐性mRNAを100ng/mlとなるようにしてトランスフェクションした細胞に、更にBimスイッチとして用いるmRNAを0~100ng/mlでトランスフェクションし、終濃度10μg/mlとなるようにピューロマイシンを添加した培地で20時間培養し、上記と同様にして細胞の生残率を評価すると共に、細胞の状態や細胞の回収率を調べた(図12c及び13)。また、比較としてFACS選別した細胞でも、同様に細胞の状態や細胞の回収率を調べた(図13b)。回収率(Collection efficiency)(%)は、回収した細胞数 / トランスフェクション前に蒔いた細胞数により算出される。この際、FACSによるBFP陽性細胞は、10~30%であり、この陽性細胞をFACSにより選別している。
最後に、Bimスイッチで選別し、生残した細胞からRNAを抽出し、上記と同じ方法によって、各マーカー遺伝子の発現量をqRT-PCRによって解析し(図14)、各マーカータンパク質の発現状況を免疫染色によって確認した(図15)。
マウスES細胞から大脳皮質神経前駆細胞を分化誘導し、miR-9-5pスイッチを用いて、上記の方法によりFACS選別した(図16a)。また、選別後の細胞(miR-9-5p陽性又は陰性)及び未選別の細胞からRNAを抽出し、上記と同じ方法によってqRT-PCRにより、各マーカー遺伝子の発現を解析した(図16b~d)。
ヒトiPS細胞から分化誘導したドーパミン神経前駆細胞に642種類のmiRNAスイッチ(配列番号1~642の配列を含むmiRNAスイッチ)を導入し、ドーパミン神経前駆細胞において発現しているmiRNAに対する応答性を、FACSを用いて解析した。
妊娠13日齢マウスを、ソムノペンチルを用いて安楽死させ、可及的に胎児を摘出した。摘出したE13.5マウスより大脳を摘出し、硬膜を剥離し、神経細胞のみとした状態で、dorsal palliumを切り出し採取した。処置は全て氷冷したHESS内で行い30分以内に完了させた。回収したdorsal palliumを神経細胞分散液(DS Pharma biomedical, MB-X9901D)を用いて分散し、PDLでコートしたflat bottomディッシュに15×104細胞/cm2の密度で播種した。同時に、上記と同じ方法によって642種類のmiRNAスイッチを細胞に導入した。24時間後、上記と同じ方法によって、大脳皮質神経前駆細胞において発現しているmiRNAに対する応答性を、FACSを用いて解析した。
分化誘導したドーパミン神経前駆細胞を用いて行ったFACSによる解析の結果、miR-9-5pスイッチ及びmiR-218-5pを用いた場合に、分化誘導開始後21日及び28日目に、miRNAスイッチをトランスフェクションすることで良好にドーパミン神経前駆細胞を選別できることが示された(図3)。この結果から、以後、ドーパミン神経前駆細胞の選別においては分化誘導開始から21日目以降に、miRNAスイッチをトランスフェクションすることとした。
ヒトiPS細胞(1231A3株)及びヒトES細胞(Kh1株)をそれぞれ、前脳又は中脳に分化させ、経時的にmiR-9-5p及びmiR-218-5pの発現量をqRT-PCRによって調べた。発現量はRNU6Bの結果を用いて標準化した。その結果、miR-9-5pは分化誘導開始から14日目では1231A3株で発現量が少なく、21日目以降はいずれの株においても、前脳又は中脳に分化させたいずれの場合でも、発現が見られた。しかし、28日目、35日目ではいずれの細胞株においても、中脳に分化させた時の発現量は高い状態を維持していたが、前脳に分化させた場合に発現量の減少が見られた。このことから、miR-9-5pは中脳神経の選別に特に適しており、21日目以降に、選別を行うことが適していることが示唆された(図4)。一方、miR-218-5pについては、分化誘導開始から7日目以降に、いずれの株及び前脳又は中脳に分化させたいずれの場合でも発現が確認され、中脳に分化させた時の方が前脳に分化させた時よりも発現量が多い傾向は見られたものの、顕著な差ではなかった(図4)。
ヒトiPS細胞から分化誘導したドーパミン神経前駆細胞において、miR-9-5pスイッチ又はmiR-218-5pスイッチを21日目にトランスフェクションして、FACS選別を行い、各マーカー遺伝子の発現量を調べた。いずれのmiRNAスイッチを用いた場合でも、中脳及び底板(floor plate)マーカー遺伝子の発現が確認された(図5)。ただし、miR-218-5pスイッチによる選別を行った細胞ではNurr1の発現は陽性群、陰性群で差が認められなかった(図5)。他方、いずれのmiRNAスイッチを用いた場合でも、Anterior及び初期神経系転写因子の発現は陽性群で少なかった(図5)。これらの結果から、miR-9-5pスイッチ及びmiR-218-5pスイッチのいずれを用いた場合でも、中脳及び底板マーカー遺伝子を強く発現するドーパミン神経前駆細胞をFACS選別できることが示唆された。
同様に、分化誘導開始から21日目及び28日目に、miR-9-5pスイッチ又はmiR-218-5pスイッチをトランスフェクションして、分化誘導開始からの時間によって発現しているマーカーの変化を調べた。その結果、miR-9-5pスイッチ及びmiR-218-5pスイッチのいずれを用い、分化誘導開始から21日目及び28日目にmiRNAスイッチをトランスフェクションした場合であっても、マーカー遺伝子の発現パターンは類似していた(図6及び7)。
比較例として、ヒトiPS細胞から分化誘導したドーパミン神経前駆細胞を、抗CORIN抗体を用いて21日目と28日目にFACS選別し、マーカー遺伝子の発現パターンを調べた。中脳及び底板マーカー遺伝子については、分化誘導開始から21日目で選別した細胞でCORIN及びEn1の発現が確認されたものの、28日目で選別した細胞ではCORINの発現しか確認できなかった(図8)。miRNAスイッチを用いたFACSによる細胞の選別結果と比較すると、miRNAスイッチを用いた場合の方が中脳及び底板マーカー遺伝子を強く発現している細胞が選別されており、上記日数で選別した場合には、miRNAスイッチを用いた本発明の手法が抗CORIN抗体を用いた手法よりも優れていることが確認された。
上記により、miR-9-5pスイッチでFACS選別したドーパミン神経前駆細胞において発現しているマーカータンパク質を、免疫染色し、miR-9-5p陽性・陰性細胞及び未選別細胞の間で比べた。miR-9-5p陽性細胞はmiR-9-5p陰性細胞及び未選別細胞に比べ、成熟ドーパミン神経細胞に特徴的なマーカータンパク質であるNurr1及びFoxa2を発現しており、前脳の神経前駆細胞マーカータンパク質であるSox1やPax6の発現は弱く、細胞増殖マーカータンパク質であるKi67の発現においては差が見られなかった(図9)。
これまでの結果から、miRNAスイッチを用いた選別で、ドーパミン神経前駆細胞を純度良く選別できることが明らかとなった。しかしながら、この手法においてはセルソーターの使用は不可欠である。セルソーターを用いた選別では、回収に時間を要し、回収効率が低い等、大量に培養した細胞を選別するためには不向きである等の欠点があった。そこで発明者らは将来的に、製造した細胞を再生治療に用いることができるように、セルソーターを用いずに、細胞を選別する手法を検討した。
セルソーターを用いた選別はgate設定が可能で、トランスフェクション効率が細胞間で異なる場合であっても、コントロールEGFPを用いることでシャープに選別することが可能である。しかし、セルソーターを使用しない場合は、一般的にgateが設定できずトランスフェクション効率を選別に反映できない。そこでmiRNAの発現量の差異により陽性と陰性を明確に選別できるmiRNAスイッチを確立することが望ましいと考えられた。そこで、発明者らはmiRNA標的配列をタンデムに複数連結した、タンデムmiRNAスイッチを作製し、それらのタンデムmiRNAスイッチの感度を調べ、タンデムmiR-9-5pスイッチ(1x9-5p-tagBFP-4x9-5p)を完成した。タンデムmiR-9-5pスイッチを用いた場合、miR-9-5pスイッチに比べ、純度良くドーパミン神経前駆細胞をFACS選別できることが示唆された(図10)。
タンデムmiR-9-5pスイッチのマーカータンパク質として蛍光タンパク質BFPの代わりにアポトーシス誘導タンパク質Bimの遺伝子を連結し、miR-9-5pを発現している細胞においてはBimタンパク質の発現を抑制するmiRNAスイッチ(Bimスイッチ)が機能し、アポトーシスが誘導されないことによって選別される系の確立を試みた。ここで、トランスフェクションされにくい細胞を排除するために、Bimスイッチと共に、ピューロマイシン耐性遺伝子を導入し、ピューロマイシン耐性による選別も同時に行った。
まず、培地に添加するピューロマイシンの最適量を検討したところ、5-15μg/mlであり以後10μg/mlで実験を行った(図12a)。次に、培地に10μg/mlのピューロマイシンを添加した場合に、細胞を生存させるために必要なピューロマイシン耐性遺伝子の濃度を検討した。その結果、100ng/mlのピューロマイシン耐性mRNAを導入することとした(図12b)。最後に、10μg/mlのピューロマイシンを添加した培地において、100ng/mlのピューロマイシン耐性mRNAと共に、各種濃度のBimスイッチを導入した場合、100ng/mlのBimスイッチを導入した場合に、細胞を厳しく選別できることが示唆された(図12c)。
一方、細胞の回収率について検討すると、Bimスイッチを用いた本手法では約40%の細胞回収率であり、FACS選別した細胞の回収率(約10%)よりも顕著に高いことが示された(図13b)。
細胞選別(純化)には蛍光標識された細胞染色をFACSで選別する方法が一般的であるため、従来のFACSで選別する方法による細胞の回収率と、本発明の選別方法による細胞の回収率を比較した。FACSを用いて、miR-9-5pスイッチ及びタンデムmiR-9-5pスイッチでFACS選別した際の細胞の検出率は、それぞれ14.9%及び28.0%であった(図11)。ただし、この数値はFACSの機械における検出部での数値であり、実際に細胞をまき直して、トランスフェクションをしたのち、細胞を回収して、FACSの機械にかけて、さらに選別した細胞を回収するという各ステップで細胞のロスが生じるため、FACSの機械の性能の限界で14.9%又は28.0%のすべてが回収できるわけではない。そこで、まき直す際の細胞数を基準にして、最終的にどれだけの目的細胞が回収できるかを調べ、“collection efficiency”(回収率)として計算した。miRNAスイッチ等を用いた選別をすることなく、ただまき直して、翌日回収するという手技だけ(unsort)でも細胞は81%に減った。FACSを使った方法では、タンデムmiR-9-5pスイッチを使うことにより、miR-9-5pスイッチを使った場合よりも、回収率は6%から11%に増えた。一方、FACSの機械性能による細胞のLossがない薬剤によるBim selectionでは回収率が36%であり、Bimスイッチを用いることで、FACSを用いた場合よりも回収率が顕著に高いことが示された。
上記によりBimスイッチで選別した細胞における各種マーカー遺伝子の発現量を調べた。先述のFACSを用いた手法と同じ程度に、中脳及び底板マーカー遺伝子を強く発現している細胞を選別できた(図5及び14)。
また、Bimスイッチで選別した細胞と未選別の細胞とで、細胞のマーカータンパク質の発現を免疫染色によって比べたところ、Bimスイッチで選別した細胞では成熟ドーパミン神経細胞に特徴的なマーカータンパク質であるNurr1陽性率が高く、前脳の神経前駆細胞マーカータンパク質であるSox1の発現率が低かった(図15)。
miRNAスイッチを用いた本手法が、実際にドーパミン神経前駆細胞以外の神経細胞にも適用できるか検証した。
マウスES細胞から分化誘導した神経前駆細胞を、miR-9-5pスイッチを用いてFACS選別した結果、良好な選別パターンが確認された(図16a)。次に、miR-9-5p陽性細胞において、各種マーカー遺伝子の発現量を調べた。その結果、miR-9-5p陽性細胞においては、大脳皮質神経前駆細胞マーカー遺伝子であるPax6、Ctip2、Emx1及びFezf2の発現量が多く(図16b)、成熟神経マーカー遺伝子であるHES1及びNotch2の発現量は少なかった(図16c)。また、その他のマーカー遺伝子であるSox9、FoxF1及びSox10の発現量についてmiR-9-5p陽性細胞を、未選別細胞と比べるとほぼ同程度であったが、miR-9-5p陰性細胞と比べると顕著に少なかった(図16d)。これらの結果から、miR-9-5p陽性細胞は所望の大脳皮質神経前駆細胞であり、ドーパミン神経前駆細胞の場合と同じように、良好に選別できたことが示唆された。
ヒトiPS細胞から分化誘導し、開始から13日目のドーパミン神経前駆細胞を、抗CORIN抗体を用いたFACS選別により、CORIN陽性及び陰性細胞を回収した。これらの細胞に642種類のmiRNAスイッチ(配列番号1~642を含む)を導入し、FACSを用いて各miRNAの応答性を解析した。用いたmiRNA配列及びその結果を表8に示す。表中のDAはドーパミン神経前駆細胞、CNは大脳皮質神経前駆細胞を示し、aaは特に強い応答、aは強い応答、bは弱い応答、記載なしは無反応であったことを意味する。また、miRNA名の文頭のhsa-は省略する。
本出願は、2017年8月10日付で日本国に出願された特願2017-156213を基礎としており、ここで言及することによりその内容は全て本明細書に包含される。
Claims (20)
- 多能性幹細胞から分化誘導した神経前駆細胞の選別方法であって、下記(1)から(2)の工程:
(1)神経前駆細胞で発現しているmiRNAによって認識される配列に、マーカータンパク質をコードする配列を機能的に連結したmRNA、又は該mRNAをコードするDNAを細胞に導入する工程、及び
(2)該マーカータンパク質の発現が抑制された細胞を選別する工程
を含み、
前記神経前駆細胞はドーパミン神経前駆細胞であり、
前記miRNAはmiR-124-3p、miR-9-5p、miR-218-5p、miR-20a-5p、miR-7-5p、miR-135a-5p、let-7a-5p、let-7g-5p、let-7i-5p、miR-26a-5p、miR-106a-5p、miR-320e、miR-374a-5p、let-7b-5p、let-7f-5p、miR-508-5pからなる群より選択される1種以上のmiRNAである、方法。 - 前記miRNAがmiR-124-3pを含む、請求項1に記載の方法。
- 多能性幹細胞から分化誘導した神経前駆細胞の選別方法であって、下記(1)から(2)の工程:
(1)神経前駆細胞で発現しているmiRNAによって認識される配列に、マーカータンパク質をコードする配列を機能的に連結したmRNA、又は該mRNAをコードするDNAを細胞に導入する工程、及び
(2)該マーカータンパク質の発現が抑制された細胞を選別する工程
を含み、
前記神経前駆細胞は大脳皮質神経前駆細胞であり、
前記miRNAはmiR-9-5p、let-7a-5p、let-7g-5p、let-7i-5p、miR-330-3p、let-7b-5p、let-7d-5p、let-7f-5p、miR-135b-3p、miR-508-5p、miR-654-5p、miR-758-5p、miR-491-5p、miR-5001-5pからなる群より選択される1種以上のmiRNAである、方法。 - 前記miRNAがmiR-9-5p、let-7a-5p、let-7g-5p、let-7i-5p、let-7b-5p、let-7f-5p及びmiR-508-5pからなる群より選択される1種以上のmiRNAを含む、請求項1~3のいずれかに記載の方法。
- 前記miRNAがmiR-9-5pを含む、請求項1~4のいずれかに記載の方法。
- 前記mRNAが、5'から3'の方向に、(a)前記miRNAによって認識される1つ以上の配列、(b)マーカータンパク質をコードする配列、及び(c)該miRNAによって認識される1つ以上の配列を含む、請求項1~5のいずれかに記載の方法。
- 前記(a)及び/又は(c)が、同一のmiRNAによって認識される2~6つの配列がタンデムに連結されたものである、請求項6に記載の方法。
- 前記(a)及び/又は(c)が、同一のmiRNAによって認識される4つの配列がタンデムに連結されたものである、請求項6に記載の方法。
- 前記(a)及び(c)が、それぞれ同一のmiRNAによって認識される、1つの配列及び4つの配列がタンデムに連結されたものである、請求項6に記載の方法。
- 前記マーカータンパク質が、蛍光タンパク質又はアポトーシス誘導タンパク質である、請求項1~9のいずれかに記載の方法。
- 前記アポトーシス誘導タンパク質がBimである、請求項10に記載の方法。
- 前記マーカータンパク質とは異なるマーカータンパク質をコードする核酸をさらに細胞に導入する工程を含む、請求項1~11のいずれかに記載の方法。
- 前記異なるマーカータンパク質が蛍光タンパク質又は薬剤耐性タンパク質である、請求項12に記載の方法。
- 前記多能性幹細胞がヒト由来である、請求項1~13のいずれかに記載の方法。
- 前記神経前駆細胞を分化誘導開始から22~29日目に選別する、請求項14に記載の方法。
- 多能性幹細胞からの神経前駆細胞の製造方法であって、下記(1)から(3)の工程:
(1)多能性幹細胞から神経前駆細胞を分化誘導する工程、
(2)(1)の工程で得られた細胞へ、神経前駆細胞で発現しているmiRNAによって認識される配列に、マーカータンパク質をコードする配列を機能的に連結したmRNA、又は該mRNAをコードするDNAを導入する工程、及び
(3)前記マーカータンパク質の発現が抑制された細胞を選別する工程
を含み、
前記神経前駆細胞はドーパミン神経前駆細胞であり、
前記miRNAはmiR-124-3p、miR-9-5p、miR-218-5p、miR-20a-5p、miR-7-5p、miR-135a-5p、let-7a-5p、let-7g-5p、let-7i-5p、miR-26a-5p、miR-106a-5p、miR-320e、miR-374a-5p、let-7b-5p、let-7f-5p、miR-508-5pからなる群より選択される1種以上のmiRNAである、方法。 - 前記マーカータンパク質とは異なるマーカータンパク質をコードする核酸をさらに細胞に導入する工程を含む、請求項16に記載の方法。
- 前記神経前駆細胞を分化誘導開始から22~29日目に選別する、請求項16又は17に記載の方法。
- miR-124-3p、miR-9-5p、let-7a-5p、let-7g-5p、let-7i-5p、let-7b-5p、let-7f-5p及びmiR-508-5pからなる群より選択されるmiRNAによって認識される配列及びマーカータンパク質をコードする配列を含むmRNA、又は該mRNAをコードするDNAを含有し、前記mRNAが、5'から3'の方向に、(a)前記miRNAによって認識される1つの配列、(b)マーカータンパク質をコードする配列、及び(c)該miRNAによって認識される4つの配列がタンデムに連結されたものを含む、神経前駆細胞を選別するためのキット。
- さらに前記マーカータンパク質とは異なるマーカータンパク質をコードする配列を含む核酸を含有してなる、請求項19に記載のキット。
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