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JP7058219B2 - Ｃｄ３及びｐｓｍａに結合するヘテロ二量体抗体 - Google Patents

Ｃｄ３及びｐｓｍａに結合するヘテロ二量体抗体 Download PDF

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Description

優先権の主張
本出願は、２０１５年１２月７日出願の米国仮出願第６２／２６４，２６１号及び２０１６年４月１９日出願の同第６２／３２４，８２３号に対して優先権を主張し、これらは、参照によりそれらの全体が明確に組み込まれる。
本開示は、癌（例えば、前立腺癌）の治療のための方法及び組成物に関する。
抗体に基づく療法は、癌及び自己免疫疾患／炎症疾患を含む様々な疾患の治療に、成功裏に使用されてきた。しかしながら、このクラスの薬物には、依然として改善が必要であり、特に、その臨床的有効性の増強に関して改善が必要である。探索されている１つの手段は、単一免疫グロブリン分子が、２つの異なる抗原を共捕捉するように、追加かつ新規の抗原結合部位を操作し、抗体に基づく薬物にすることである。２つの異なる抗原を捕捉するそのような非天然または代替の抗体形式は、二重特異性体と称されることが多い。抗体可変領域（Ｆｖ）の相当な多様性によって、実質的にあらゆる分子を認識するＦｖを産生することが可能であるため、二重特異性の生成に対する典型的な手法は、新しい可変領域を抗体へ導入することである。
多くの代替抗体形式が、二重特異性ターゲッティングに向けて探索されてきた（Ｃｈａｍｅｓ＆Ｂａｔｙ，２００９，ｍＡｂｓ １［６］：１－９；Ｈｏｌｌｉｇｅｒ＆Ｈｕｄｓｏｎ，２００５，Ｎａｔｕｒｅ Ｂｉｏｔｅｃｈｎｏｌｏｇｙ ２３［９］：１１２６－１１３６；Ｋｏｎｔｅｒｍａｎｎ，ｍＡｂｓ ４（２）：１８２（２０１２）、これらのすべてが、参照によって、本明細書に明確に組み込まれる）。初期には、二重特異性抗体は、それぞれが単一のモノクローナル抗体を産生する２つの細胞株を融合することによって作製された（Ｍｉｌｓｔｅｉｎ ｅｔ ａｌ．，１９８３，Ｎａｔｕｒｅ ３０５：５３７－５４０）。得られたハイブリッドのハイブリドーマまたはクアドローマは、二重特異性抗体を確かに産生はしたが、少数集団にすぎず、所望の抗体の単離には、広範な精製が必要であった。これに対する操作的な解決策は、抗体断片を使用して、二重特異性体を作製することであった。そのような断片は、完全長抗体の複雑な四次構造を欠いているため、可変軽鎖及び可変重鎖を、単一の遺伝子構築物において連結することができる。ダイアボディ、単鎖ダイアボディ、直列型ｓｃＦｖ、及びＦａｂ２の二重特異性体を含む、多くの異なる形態の抗体断片が生成されてきた（Ｃｈａｍｅｓ＆Ｂａｔｙ，２００９，ｍＡｂｓ １［６］：１－９；Ｈｏｌｌｉｇｅｒ＆Ｈｕｄｓｏｎ，２００５，Ｎａｔｕｒｅ Ｂｉｏｔｅｃｈｎｏｌｏｇｙ ２３［９］：１１２６－１１３６が、参照により本明細書に明確に組み込まれる）。こうした形式は、細菌において高レベルで発現でき、サイズが小さいため、有利に浸透する利点を有し得るが、一方で、インビボにおいて速やかに減失し、それらの産生及び安定性に関して、製造性上の障壁が存在し得る。こうした弱点の主要な原因は、抗体断片が、それに関連する機能特性を有する抗体の定常領域を典型的には欠いていることにあり、この関連機能特性には、サイズの大型化、高安定性、ならびに血清における長期半減期の維持（すなわち、新生児型Ｆｃ受容体であるＦｃＲｎ）または精製のための結合部位として機能する（すなわち、プロテインＡ及びプロテインＧ）様々なＦｃ受容体及びＦｃリガンドへの結合が含まれる。
より最新の研究では、二重結合を完全長抗体様形式へと操作することによって、断片に基づく二重特異性体の欠点に対処することが試みられている（Ｗｕ ｅｔ ａｌ．，２００７，Ｎａｔｕｒｅ Ｂｉｏｔｅｃｈｎｏｌｏｇｙ ２５［１１］：１２９０－１２９７；ＵＳＳＮ１２／４７７，７１１；Ｍｉｃｈａｅｌｓｏｎ ｅｔ ａｌ．，２００９，ｍＡｂｓ １［２］：１２８－１４１；ＰＣＴ／ＵＳ２００８／０７４６９３；Ｚｕｏ ｅｔ ａｌ．，２０００，Ｐｒｏｔｅｉｎ Ｅｎｇｉｎｅｅｒｉｎｇ １３［５］：３６１－３６７；ＵＳＳＮ０９／８６５，１９８；Ｓｈｅｎ ｅｔ ａｌ．，２００６，Ｊ Ｂｉｏｌ Ｃｈｅｍ ２８１［１６］：１０７０６－１０７１４；Ｌｕ ｅｔ ａｌ．，２００５，Ｊ Ｂｉｏｌ Ｃｈｅｍ ２８０［２０］：１９６６５－１９６７２；ＰＣＴ／ＵＳ２００５／０２５４７２、これらはすべて、参照により本明細書に明確に組み込まれる）。こうした形式は、抗体断片二重特異性体の障壁のいくつかを克服しており、これは、それらがＦｃ領域を含んでいることが主な理由である。こうした形式の１つの重大な弱点は、それらが、ホモ二量体定常鎖に加えて新しい抗原結合部位を構築するため、新しい抗原に対する結合が、常に二価であるということである。
治療用の二重特異性形式において、共標的（ｃｏ－ｔａｒｇｅｔ）として注目される多くの抗原に関して、所望の結合は、二価というよりもむしろ一価である。多くの免疫受容体では、細胞活性化は、一価の結合相互作用の架橋結合によって達成される。架橋結合の機構は、典型的には、抗体／抗原免疫複合体によって媒介されるものであるか、またはエフェクター細胞が、標的細胞へと会合することを介するものである。例えば、ＦｃγＲＩＩａ、ＦｃγＲＩＩｂ、及びＦｃγＲＩＩＩａなどの低親和性Ｆｃガンマ受容体（ＦｃγＲ）は、抗体Ｆｃ領域に一価で結合する。一価の結合は、こうしたＦｃγＲを発現している細胞を活性化しないが、免疫複合体形成または細胞対細胞接触の際は、受容体は、架橋結合され、細胞表面にクラスターを形成し、活性化を引き起こす。例えば、ナチュラルキラー（ＮＫ）細胞上のＦｃγＲＩＩＩａのような、細胞殺傷の媒介を担う受容体では、エフェクター細胞が、非常に親和性が高い形式において標的細胞を捕捉するとき、受容体の架橋結合及び細胞の活性化が起こる（Ｂｏｗｌｅｓ＆Ｗｅｉｎｅｒ，２００５，Ｊ Ｉｍｍｕｎｏｌ Ｍｅｔｈｏｄｓ３０４：８８－９９が、参照により明確に組み込まれる）。同様に、Ｂ細胞上で、抑制性受容体であるＦｃγＲＩＩｂは、Ｂ細胞活性化の下方制御を行い、これは、ＦｃγＲＩＩｂが、細胞表面Ｂ細胞受容体（ＢＣＲ）との免疫複合体へと捕捉されるときにのみ起こるものであり、ＢＣＲによって認識されるものと同一の抗原と、可溶性ＩｇＧのものとの免疫複合体形成によって媒介される機構である（Ｈｅｙｍａｎ ２００３，Ｉｍｍｕｎｏｌ Ｌｅｔｔ ８８［２］：１５７－１６１；Ｓｍｉｔｈ ａｎｄ Ｃｌａｔｗｏｒｔｈｙ，２０１０，Ｎａｔｕｒｅ Ｒｅｖｉｅｗｓ Ｉｍｍｕｎｏｌｏｇｙ １０：３２８－３４３が、参照により本明細書に明確に組み込まれる）。別の例として、Ｔ細胞のＣＤ３活性化は、その関連するＴ細胞受容体（ＴＣＲ）が、非常に親和性が高い細胞対細胞シナプスにおいて、抗原提示細胞上の抗原負荷されたＭＨＣを捕捉するときにのみ起こる（Ｋｕｈｎｓ ｅｔ ａｌ．，２００６，Ｉｍｍｕｎｉｔｙ ２４：１３３－１３９）。実際、抗ＣＤ３抗体を使用したＣＤ３の非特異的二価架橋結合は、サイトカインの急増及び毒性を誘発する（Ｐｅｒｒｕｃｈｅ ｅｔ ａｌ．，２００９，Ｊ Ｉｍｍｕｎｏｌ １８３［２］：９５３－６１；Ｃｈａｔｅｎｏｕｄ＆Ｂｌｕｅｓｔｏｎｅ，２００７，Ｎａｔｕｒｅ Ｒｅｖｉｅｗｓ Ｉｍｍｕｎｏｌｏｇｙ ７：６２２－６３２が、参照により明確に組み込まれる）。したがって、実践的な臨床使用に向けた、標的細胞の再配向化殺傷（ｒｅｄｉｒｅｃｔｅｄ ｋｉｌｌｉｎｇ）のためのＣＤ３共会合の好ましいモードは、共捕捉される標的との会合時にのみ活性化をもたらす一価の結合である。
したがって、抗体断片から生成された二重特異性体は、生物物理学的及び薬物動態学的なハードルに直面している上に、完全長抗体様形式で構築されたこれらの弱点は、一次標的抗原が存在しない状態において、共標的抗原を多価で捕捉し、非特異的な活性化及び潜在的毒性を引き起こすことである。本発明は、この問題を、ＣＤ３及び前立腺特異的膜抗原（ＰＳＭＡ）を対象とする新規の二重特異抗体を導入することによって解決する。
ＣＤ３及び大半の前立腺癌細胞上で大幅に過剰発現される膜貫通タンパク質である前立腺特異的膜抗原（ＰＳＭＡ）に結合するヘテロ二量体抗体が本明細書において提供される。そのような抗体は、例えば、ＰＳＭＡ発現腫瘍細胞へのターゲティングＣＤ３＋Ｔ細胞を促進することにより、癌（例えば、前立腺癌）の治療に有用である。
一態様では、ａ）配列番号６４を含む第１の単量体と、ｂ）配列番号６５を含む第２の単量体と、ｃ）配列番号６６を含む軽鎖とを含むヘテロ二量体抗体が本明細書において提供される。さらなる態様では、ａ）配列番号６４を含む第１の単量体をコードする第１の核酸と、ｂ）配列番号６５を含む第２の単量体をコードする第２の核酸と、ｃ）配列番号６６を含む軽鎖をコードする第３の核酸とを含む核酸組成物が本明細書において提供される。別の態様では、ａ）配列番号６４を含む第１の単量体をコードする第１の核酸を含む第１の発現ベクターと、ｂ）配列番号６５を含む第２の単量体をコードする第２の核酸を含む第２の発現ベクターと、ｃ）配列番号６６を含む軽鎖をコードする第３の核酸を含む第３の発現ベクターとを含む発現ベクター組成物が本明細書において提供される。
別の態様では、ａ）配列番号１１８を含む第１の単量体と、ｂ）配列番号１１９を含む第２の単量体と、ｃ）配列番号１２０を含む軽鎖とを含むヘテロ二量体抗体が本明細書において提供される。さらなる態様では、ａ）配列番号１１８を含む第１の単量体をコードする第１の核酸と、ｂ）配列番号１１９を含む第２の単量体をコードする第２の核酸と、ｃ）配列番号１２０を含む軽鎖をコードする第３の核酸とを含む核酸組成物が本明細書において提供される。別の態様では、ａ）配列番号１１８を含む第１の単量体をコードする第１の核酸を含む第１の発現ベクターと、ｂ）配列番号１１９を含む第２の単量体をコードする第２の核酸を含む第２の発現ベクターと、ｃ）配列番号１２０を含む軽鎖をコードする第３の核酸を含む核酸を含む第３の発現ベクターとを含む発現ベクター組成物が本明細書において提供される。
一態様では、ａ）配列番号１２１を含む第１の単量体と、ｂ）配列番号１２２を含む第２の単量体と、ｃ）配列番号１２３を含む軽鎖とを含むヘテロ二量体抗体が本明細書において提供される。別の態様では、ａ）配列番号１２１を含む第１の単量体をコードする第１の核酸と、ｂ）配列番号１２２を含む第２の単量体をコードする第２の核酸と、ｃ）配列番号１２３を含む軽鎖をコードする第３の核酸とを含む核酸組成物が本明細書において提供される。さらなる態様では、ａ）配列番号１２１を含む第１の単量体をコードする第１の核酸を含む第１の発現ベクターと、ｂ）配列番号１２２を含む第２の単量体をコードする第２の核酸を含む第２の発現ベクターと、ｃ）配列番号１２３を含む軽鎖をコードする第３の核酸をコードする核酸を含む第３の発現ベクターとを含む発現ベクター組成物が本明細書において提供される。
一態様では、ａ）配列番号１２４を含む第１の単量体と、ｂ）配列番号１２５を含む第２の単量体と、ｃ）配列番号１２６を含む軽鎖とを含むヘテロ二量体抗体が本明細書において提供される。別の態様では、ａ）配列番号１２４を含む第１の単量体をコードする第１の核酸と、ｂ）配列番号１２５を含む第２の単量体をコードする第２の核酸と、ｃ）配列番号１２６を含む軽鎖をコードする第３の核酸とを含む核酸組成物が本明細書において提供される。さらなる別の態様では、ａ）配列番号１２４を含む第１の単量体をコードする第１の核酸を含む第１の発現ベクターと、ｂ）配列番号１２５を含む第２の単量体をコードする第２の核酸を含む第２の発現ベクターと、ｃ）配列番号１２６を含む軽鎖をコードする第３の核酸をコードする核酸を含む第３の発現ベクターとを含む発現ベクター組成物が本明細書において提供される。
一態様では、第１の単量体と、第２の単量体と、軽鎖とを含むヘテロ二量体抗体が本明細書において提供される。第１の単量体は、ｉ）第１のＦｃドメイン、ｉｉ）ｓｃＦｖ可変軽ドメイン、及びｓｃＦｖリンカー、ならびにｓｃＦｖ可変重ドメインを含む抗ＣＤ３ ｓｃＦｖを含み、このｓｃＦｖは、ドメインリンカーを使用してＦｃドメインのＮ末端に共有結合されている。第２の単量体は、ｉ）重可変ドメインと、ｉｉ）第２のＦｃドメインを含む重定常ドメインとを含む重鎖を含む。軽鎖は、可変軽ドメイン及び定常軽ドメインを含む。重可変ドメイン及び可変軽ドメインは、ＰＳＭＡに結合する。
別の態様では、第１の単量体と、第２の単量体と、軽鎖とを含むヘテロ二量体抗体が本明細書において提供される。第１の単量体は、ｉ）第１のＦｃドメインと、ｉｉ）ｓｃＦｖ可変軽ドメイン、ｓｃＦｖリンカー、及びｓｃＦｖ可変重ドメインを含む抗ＣＤ３ ｓｃＦｖとを含み、このｓｃＦｖは、ドメインリンカーを使用してＦｃドメインのＮ末端に共有結合されている。第２の単量体は、ｉ）重可変ドメインと、ｉｉ）第２のＦｃドメインを含む重定常ドメインとを含む重鎖を含む。軽鎖は、可変軽ドメイン及び定常軽ドメインを含む。ｓｃＦｖ可変軽ドメインは、ＣＤ３ Ｌ１．４７のｖｌＣＤＲ（配列番号６を有するｖｌＣＤＲ１、配列番号７を有するｖｌＣＤＲ２、及び配列番号８を有するｖｌＣＤＲ３）を含み、ｓｃＦｖ可変重ドメインが、ＣＤ３ Ｈ１．３０のｖｈＣＤＲ（配列番号２を有するｖｈＣＤＲ１、配列番号３を有するｖｈＣＤＲ２、及び配列番号４を有するｖｈＣＤＲ３）を含み、重可変ドメイン及び可変軽ドメインは、ＰＳＭＡに結合する。
別の態様では、第１の単量体と、第２の単量体と、軽鎖とを含むヘテロ二量体抗体が本明細書において提供される。第１の単量体は、ｉ）第１のＦｃドメインと、ｉｉ）ｓｃＦｖ可変軽ドメイン、ｓｃＦｖリンカー、及びｓｃＦｖ可変重ドメインを含む抗ＣＤ３ ｓｃＦｖとを含み、このｓｃＦｖは、ドメインリンカーを使用してＦｃドメインのＮ末端に共有結合されている。第２の単量体は、ｉ）重可変ドメインと、ｉｉ）第２のＦｃドメインを含む重定常ドメインとを含む重鎖を含む。軽鎖は、可変軽ドメイン及び定常軽ドメインを含む。ｓｃＦｖ可変軽ドメインは、ＣＤ３ Ｌ１．４７のｖｌＣＤＲ（配列番号１５を有するｖｌＣＤＲ１、配列番号１６を有するｖｌＣＤＲ２、及び配列番号１７を有するｖｌＣＤＲ３）を含み、ｓｃＦｖ可変重ドメインは、ＣＤ３ Ｈ１．３２のｖｈＣＤＲ（配列番号１１を有するｖｈＣＤＲ１、配列番号１２を有するｖｈＣＤＲ２、及び配列番号１３を有するｖｈＣＤＲ３）を含み、重可変ドメイン及び可変軽ドメインは、ＰＳＭＡに結合する。
一態様では、第１の単量体と、第２の単量体と、軽鎖とを含むヘテロ二量体抗体が本明細書において提供される。第１の単量体は、ｉ）第１のＦｃドメインと、ｉｉ）ｓｃＦｖ可変軽ドメイン、ｓｃＦｖリンカー、及びｓｃＦｖ可変重ドメインを含む抗ＣＤ３ ｓｃＦｖとを含み、このｓｃＦｖは、ドメインリンカーを使用してＦｃドメインのＮ末端に共有結合されている。第２の単量体は、ｉ）重可変ドメインと、ｉｉ）第２のＦｃドメインを含む重定常ドメインとを含む重鎖を含む。軽鎖は、可変軽ドメイン及び定常軽ドメインを含む。ｓｃＦｖ可変軽ドメインは、ＣＤ３ Ｌ１．４７のｖｌＣＤＲ（配列番号２４を有するｖｌＣＤＲ１、配列番号２５を有するｖｌＣＤＲ２、及び配列番号２６を有するｖｌＣＤＲ３）を含み、ｓｃＦｖ可変重ドメインは、ＣＤ３ Ｈ１．８９のｖｈＣＤＲ（配列番号２０を有するｖｈＣＤＲ１、配列番号２１を有するｖｈＣＤＲ２、及び配列番号２２を有するｖｈＣＤＲ３）を含み、重可変ドメイン及び可変軽ドメインは、ＰＳＭＡに結合する。
一態様では、第１の単量体と、第２の単量体と、軽鎖とを含むヘテロ二量体抗体が本明細書において提供される。第１の単量体は、ｉ）第１のＦｃドメインと、ｉｉ）ｓｃＦｖ可変軽ドメイン、ｓｃＦｖリンカー、及びｓｃＦｖ可変重ドメインを含む抗ＣＤ３ ｓｃＦｖとを含み、このｓｃＦｖは、ドメインリンカーを使用してＦｃドメインのＮ末端に共有結合されている。第２の単量体は、ｉ）重可変ドメインと、ｉｉ）第２のＦｃドメインを含む重定常ドメインとを含む重鎖を含む。軽鎖は、可変軽ドメイン及び定常軽ドメインを含む。ｓｃＦｖ可変軽ドメインは、ＣＤ３ Ｌ１．４７のｖｌＣＤＲ（配列番号３３を有するｖｌＣＤＲ１、配列番号３４を有するｖｌＣＤＲ２、及び配列番号３５を有するｖｌＣＤＲ３）を含み、ｓｃＦｖ可変重ドメインは、ＣＤ３ Ｈ１．９０のｖｈＣＤＲ（配列番号２９を有するｖｈＣＤＲ１、配列番号３０を有するｖｈＣＤＲ２、及び配列番号３１を有するｖｈＣＤＲ３）を含み、重可変ドメイン及び可変軽ドメインは、ＰＳＭＡに結合する。
別の態様では、第１の単量体と、第２の単量体と、軽鎖とを含むヘテロ二量体抗体が本明細書において提供される。第１の単量体は、ｉ）第１のＦｃドメインと、ｉｉ）ｓｃＦｖ可変軽ドメイン、ｓｃＦｖリンカー、及びｓｃＦｖ可変重ドメインを含む抗ＣＤ３ ｓｃＦｖとを含み、このｓｃＦｖは、ドメインリンカーを使用してＦｃドメインのＮ末端に共有結合されている。第２の単量体は、ｉ）重可変ドメインと、ｉｉ）第２のＦｃドメインを含む重定常ドメインとを含む重鎖を含む。軽鎖は、可変軽ドメイン及び定常軽ドメインを含む。ｓｃＦｖ可変軽ドメインは、ＣＤ３ Ｌ１．４７のｖｌＣＤＲ（配列番号４２を有するｖｌＣＤＲ１、配列番号４３を有するｖｌＣＤＲ２、及び配列番号４４を有するｖｌＣＤＲ３）を含み、ｓｃＦｖ可変重ドメインは、ＣＤ３ Ｈ１．３３のｖｈＣＤＲ（配列番号３８を有するｖｈＣＤＲ１、配列番号３９を有するｖｈＣＤＲ２、及び配列番号４０を有するｖｈＣＤＲ３）を含み、重可変ドメイン及び可変軽ドメインは、ＰＳＭＡにする。
別の態様では、第１の単量体と、第２の単量体と、軽鎖とを含むヘテロ二量体抗体が本明細書において提供される。第１の単量体は、ｉ）第１のＦｃドメインと、ｉｉ）ｓｃＦｖ可変軽ドメイン、ｓｃＦｖリンカー、及びｓｃＦｖ可変重ドメインを含む抗ＣＤ３ ｓｃＦｖとを含み、このｓｃＦｖは、ドメインリンカーを使用してＦｃドメインのＮ末端に共有結合されている。第２の単量体は、ｉ）重可変ドメインと、ｉｉ）第２のＦｃドメインを含む重定常ドメインとを含む重鎖を含む。軽鎖は、可変軽ドメイン及び定常軽ドメインを含む。ｓｃＦｖ可変軽ドメインは、ＣＤ３ Ｌ１．４７のｖｌＣＤＲ（配列番号５１を有するｖｌＣＤＲ１、配列番号５２を有するｖｌＣＤＲ２、及び配列番号５３を有するｖｌＣＤＲ３）を含み、ｓｃＦｖ可変重ドメインは、ＣＤ３ Ｈ１．３１のｖｈＣＤＲ（配列番号４７を有するｖｈＣＤＲ１、配列番号４８を有するｖｈＣＤＲ２、及び配列番号４９を有するｖｈＣＤＲ３）を含み、重可変ドメイン及び可変軽ドメインは、ＰＳＭＡに結合する。
上述の抗体の一実施形態では、重可変ドメインは、抗ＰＳＭＡ Ｊ５９１ Ｈ１＿Ｌ１のｖｈＣＤＲ（配列番号１１１を有するｖｈＣＤＲ１、配列番号１１２を有するｖｈＣＤＲ２、及び配列番号１１３を有するｖｈＣＤＲ３）を含み、可変軽ドメインは、抗ＰＳＭＡ Ｊ５９１ Ｈ１＿Ｌ１のｖｌＣＤＲ（配列番号１０７を有するｖｌＣＤＲ１、配列番号１０８を有するｖｌＣＤＲ２、及び配列番号１０９を有するｖｌＣＤＲ３）を含む。例示的な実施形態では、重可変ドメインは、抗ＰＳＭＡ Ｊ５９１ Ｈ１＿Ｌ１の可変重ドメイン（配列番号１１０）を含み、可変軽ドメインは、抗ＰＳＭＡ Ｊ５９１ Ｈ１＿Ｌ１の可変軽ドメイン（配列番号１０６）を含む。
一態様では、第１の単量体と、第２の単量体と、軽鎖とを含むヘテロ二量体抗体が本明細書において提供される。第１の単量体は、ｉ）第１のＦｃドメインと、ｉｉ）ｓｃＦｖ可変軽ドメイン、ｓｃＦｖリンカー、及びｓｃＦｖ可変重ドメインを含む抗ＣＤ３ ｓｃＦｖとを含み、このｓｃＦｖは、ドメインリンカーを使用してＦｃドメインのＮ末端に共有結合されている。第２の単量体は、ｉ）重可変ドメインと、ｉｉ）第２のＦｃドメインを含む重定常ドメインとを含む重鎖を含む。軽鎖は、可変軽ドメイン及び定常軽ドメインを含む。重可変ドメインは、抗ＰＳＭＡ Ｊ５９１ Ｈ１＿Ｌ１のｖｈＣＤＲ（配列番号１１１を有するｖｈＣＤＲ１、配列番号１１２を有するｖｈＣＤＲ２、及び配列番号１１３を有するｖｈＣＤＲ３）を含み、可変軽ドメインは、抗ＰＳＭＡ Ｊ５９１ Ｈ１＿Ｌ１のｖｌＣＤＲ（配列番号１０７を有するｖｌＣＤＲ１、配列番号１０８を有するｖｌＣＤＲ２、及び配列番号１０９を有するｖｌＣＤＲ３）を含む。重可変ドメイン及び可変軽ドメインは、ＰＳＭＡに結合する。いくつかの実施形態では、重可変ドメインは、抗ＰＳＭＡ Ｊ５９１ Ｈ１＿Ｌ１の可変重ドメイン（配列番号１１０）を含み、可変軽ドメインは、抗ＰＳＭＡ Ｊ５９１ Ｈ１＿Ｌ１の可変軽ドメイン（配列番号１０６）を含む。
上述の抗体のいくつかの実施形態では、第１のＦｃドメイン及び第２のＦｃドメインは、Ｓ３６４Ｋ／Ｅ３５７Ｑ：Ｌ３６８Ｄ／Ｋ３７０Ｓ、Ｌ３６８Ｄ／Ｋ３７０Ｓ：Ｓ３６４Ｋ、Ｌ３６８Ｅ／Ｋ３７０Ｓ：Ｓ３６４Ｋ、Ｔ４１１Ｔ／Ｅ３６０Ｅ／Ｑ３６２Ｅ：Ｄ４０１Ｋ、Ｌ３６８Ｄ／Ｋ３７０Ｓ：Ｓ３６４Ｋ／Ｅ３５７Ｌ、及びＫ３７０Ｓ：Ｓ３６４Ｋ／Ｅ３５７Ｑからなる群から選択される１セットの変異体を含む。
上述の抗体のいくつかの実施形態では、ｓｃＦｖリンカーは、荷電リンカーである。
上述の抗体のいくつかの実施形態では、重鎖定常ドメインは、アミノ酸置換Ｎ２０８Ｄ／Ｑ２９５Ｅ／Ｎ３８４Ｄ／Ｑ４１８Ｅ／Ｎ４２１Ｄを含む。
上述の抗体のいくつかの実施形態では、第１及び第２のＦｃドメインは、アミノ酸置換Ｅ２３３Ｐ／Ｌ２３４Ｖ／Ｌ２３５Ａ／Ｇ２３６ｄｅｌ／Ｓ２６７Ｋを含む。
別の態様では、第１の単量体と、第２の単量体と、共通の軽鎖とを含むヘテロ二量体抗体が本明細書において提供される。第１の単量体は、ｉ）１）第１の可変重ドメイン、２）第１のＦｃドメインを含む第１の定常重鎖、及び３）ｓｃＦｖ可変軽ドメイン、ｓｃＦｖリンカー、及びｓｃＦｖ可変重ドメインを含むｓｃＦｖを含む、第１の重鎖を含み、このｓｃＦｖは、ドメインリンカーを使用してＦｃドメインのＣ末端に共有結合されている。第２の単量体は、第２の可変重ドメインを含む第２の重鎖、及び第２のＦｃドメインを含む第２の定常重鎖を含む。共通の軽鎖は、可変軽ドメイン及び定常軽ドメインを含む。第１及び第２のＦｃドメインは、Ｓ３６４Ｋ／Ｅ３５７Ｑ：Ｌ３６８Ｄ／Ｋ３７０Ｓ、Ｌ３６８Ｄ／Ｋ３７０Ｓ：Ｓ３６４Ｋ、Ｌ３６８Ｅ／Ｋ３７０Ｓ：Ｓ３６４Ｋ、Ｔ４１１Ｔ／Ｅ３６０Ｅ／Ｑ３６２Ｅ：Ｄ４０１Ｋ、Ｌ３６８Ｄ／Ｋ３７０Ｓ：Ｓ３６４Ｋ／Ｅ３５７Ｌ、及びＫ３７０Ｓ：Ｓ３６４Ｋ／Ｅ３５７Ｑからなる群から選択される１セットのアミノ酸置換を有する。第１の可変重ドメイン及び可変軽ドメインは、ヒトＰＳＭＡ（配列番号１３１）に結合し、第２の可変重ドメイン及び可変軽ドメインは、ヒトＰＳＭＡに結合し、ｓｃＦｖは、ヒトＣＤ３に結合する。
一態様では、第１の単量体と、第２の単量体と、共通の軽鎖とを含むヘテロ二量体抗体が本明細書において提供される。第１の単量体は、ｉ）１）第１の可変重ドメイン、２）第１のＦｃドメインを含む第１の定常重ドメイン、及び３）第１の可変軽ドメインを含む、第１の重鎖を含み、この第１の可変軽ドメインは、ドメインリンカーを使用して第１のＦｃドメインのＣ末端に共有結合されている。第２の単量体は、ｉ）第２の可変重ドメイン、ｉｉ）第２のＦｃドメインを含む第２の定常重ドメイン、及びｉｉｉ）第３の可変重ドメインを含み、この第３の可変重ドメインは、ドメインリンカーを使用して第２のＦｃドメインのＣ末端に共有結合されている。共通の軽鎖は、第２の可変軽ドメイン及び定常軽ドメインを含む。第１及び第２のＦｃドメインは、Ｓ３６４Ｋ／Ｅ３５７Ｑ：Ｌ３６８Ｄ／Ｋ３７０Ｓ、Ｌ３６８Ｄ／Ｋ３７０Ｓ：Ｓ３６４Ｋ、Ｌ３６８Ｅ／Ｋ３７０Ｓ：Ｓ３６４Ｋ、Ｔ４１１Ｔ／Ｅ３６０Ｅ／Ｑ３６２Ｅ：Ｄ４０１Ｋ、Ｌ３６８Ｄ／Ｋ３７０Ｓ：Ｓ３６４Ｋ／Ｅ３５７Ｌ、及びＫ３７０Ｓ：Ｓ３６４Ｋ／Ｅ３５７Ｑからなる群から選択される１セットのアミノ酸置換を有する。第１の可変重ドメイン及び第２の可変軽ドメインは、ＰＳＭＡに結合し、第２の可変重ドメイン及び第２の可変軽ドメインは、ＰＳＭＡに結合し、第１の可変軽ドメイン及び第３の可変重ドメインは、ＣＤ３に結合する。
一態様では、第１の単量体と、第２の単量体と、共通の軽鎖とを含むヘテロ二量体抗体が本明細書において提供される。第１の単量体は、ｉ）ｉ）１）第１の可変重ドメイン、２）第１のＣＨ１ドメイン及び第１のＦｃドメインを含む第１の定常重鎖、ならびに３）ｓｃＦｖ可変軽ドメイン、ｓｃＦｖリンカー、及びｓｃＦｖ可変重ドメインを含むｓｃＦｖを含む、第１の重鎖を含む、第１の重鎖を含み、このｓｃＦｖは、ドメインリンカーを使用してＣＨ１ドメインのＣ末端と第１のＦｃドメインのＮ末端との間で共有結合されている 第２の単量体は、第２の可変重ドメインを含む第２の重鎖、及び第２のＦｃドメインを含む第２の定常重鎖を含む。共通の軽鎖は、可変軽ドメイン及び定常軽ドメインを含む。第１及び第２のＦｃドメインは、Ｓ３６４Ｋ／Ｅ３５７Ｑ：Ｌ３６８Ｄ／Ｋ３７０Ｓ、Ｌ３６８Ｄ／Ｋ３７０Ｓ：Ｓ３６４Ｋ、Ｌ３６８Ｅ／Ｋ３７０Ｓ：Ｓ３６４Ｋ、Ｔ４１１Ｔ／Ｅ３６０Ｅ／Ｑ３６２Ｅ：Ｄ４０１Ｋ、Ｌ３６８Ｄ／Ｋ３７０Ｓ：Ｓ３６４Ｋ／Ｅ３５７Ｌ、及びＫ３７０Ｓ：Ｓ３６４Ｋ／Ｅ３５７Ｑからなる群から選択される１セットのアミノ酸置換を有する。第１の可変重ドメイン及び可変軽ドメインは、ＰＳＭＡに結合し、第２の可変重ドメイン及び可変軽ドメインは、ＰＳＭＡに結合し、ｓｃＦｖは、ＣＤ３に結合する。
一態様では、第１の単量体と、第２の単量体と、共通の軽鎖とを含むヘテロ二量体抗体が本明細書において提供される。第１の単量体は、ｉ）ｉ）第１の可変重ドメインと、ｉｉ）第１のＦｃドメインを含む第１の定常重ドメインと、ｉｉｉ）第１の可変軽ドメインとを含む、第１の重鎖を含み、この第１の可変軽ドメインは、ドメインリンカーを使用して第１の定常重ドメインのＣＨ１ドメインのＣ末端と第１のＦｃドメインのＮ末端との間で共有結合されている。第２の単量体は、ｉ）第２の可変重ドメインと、ｉｉ）第２のＦｃドメインを含む第２の定常重ドメインと、ｉｉｉ）第３の可変重ドメインとを含み、この第３の可変重ドメインは、ドメインリンカーを使用して第２の定常重ドメインのＣＨ１ドメインのＣ末端と第２のＦｃドメインのＮ末端との間で共有結合されている。共通の軽鎖は、第２の可変軽ドメイン及び定常軽ドメインを含む。第１及び第２のＦｃドメインは、Ｓ３６４Ｋ／Ｅ３５７Ｑ：Ｌ３６８Ｄ／Ｋ３７０Ｓ、Ｌ３６８Ｄ／Ｋ３７０Ｓ：Ｓ３６４Ｋ、Ｌ３６８Ｅ／Ｋ３７０Ｓ：Ｓ３６４Ｋ、Ｔ４１１Ｔ／Ｅ３６０Ｅ／Ｑ３６２Ｅ：Ｄ４０１Ｋ、Ｌ３６８Ｄ／Ｋ３７０Ｓ：Ｓ３６４Ｋ／Ｅ３５７Ｌ、及びＫ３７０Ｓ：Ｓ３６４Ｋ／Ｅ３５７Ｑからなる群から選択される１セットのアミノ酸置換を有する。第１の可変重ドメイン及び第２の可変軽ドメインは、ＰＳＭＡに結合し、第２の可変重ドメイン及び第２の可変軽ドメインは、ＰＳＭＡに結合し、第１の可変軽ドメイン及び第３の可変重ドメインは、ＣＤ３に結合する。
［００２５］一態様では、第１の単量体と、第２の単量体と、軽鎖とを含むヘテロ二量体抗体が本明細書において提供される。第１の単量体は、ｉ）ｉ）１）第１の可変重ドメイン、２）第１のＣＨ１ドメイン及び第１のＦｃドメインを含む第１の定常重鎖、ならびに３）ｓｃＦｖ可変軽ドメイン、ｓｃＦｖリンカー、及びｓｃＦｖ可変重ドメインを含むｓｃＦｖを含む、第１の重鎖を含む、第１の重鎖を含み、このｓｃＦｖは、ドメインリンカーを使用してＣＨ１ドメインのＣ末端と第１のＦｃドメインのＮ末端との間で共有結合されている 第２の単量体は、第２のＦｃドメインを含む。軽鎖は、可変軽ドメイン及び定常軽ドメインを含む。第１及び第２のＦｃドメインは、Ｓ３６４Ｋ／Ｅ３５７Ｑ：Ｌ３６８Ｄ／Ｋ３７０Ｓ、Ｌ３６８Ｄ／Ｋ３７０Ｓ：Ｓ３６４Ｋ、Ｌ３６８Ｅ／Ｋ３７０Ｓ：Ｓ３６４Ｋ、Ｔ４１１Ｔ／Ｅ３６０Ｅ／Ｑ３６２Ｅ：Ｄ４０１Ｋ、Ｌ３６８Ｄ／Ｋ３７０Ｓ：Ｓ３６４Ｋ／Ｅ３５７Ｌ、及びＫ３７０Ｓ：Ｓ３６４Ｋ／Ｅ３５７Ｑからなる群から選択される１セットのアミノ酸置換を有する。第１の可変重ドメイン及び可変軽ドメインは、第１の抗原に結合し、ｓｃＦｖは、第２の抗原に結合し、第１及び第２の抗原のうちの一方がＰＳＭＡであり、他方がＣＤ３である。
別の態様では、本明細書に記載の対象のヘテロ二量体抗体のいずれかをコードする核酸組成物が本明細書において提供される。いくつかの実施形態では、核酸組成物は、ａ）第１の単量体をコードする第１の核酸と、ｂ）第２の単量体をコードする第２の核酸と、ｃ）軽鎖をコードする第３の核酸とを含む。
別の態様では、ＸＥＮＰ１４４８４、ＸＥＮＰ１６８７３、ＸＥＮＰ１６８７４、及びＸＥＮＰ１９７２２からなる群から選択されるヘテロ二量体抗体が本明細書において提供される。
別の態様では、本明細書に記載の核酸組成物のいずれか１つを含む発現ベクター組成物が本明細書において提供される。別の態様では、本明細書に記載の核酸組成物または発現ベクター組成物の任意の１つを含む宿主細胞が本明細書において提供される。また別の態様では、抗体が発現される条件下で、本明細書に記載の宿主細胞を培養することと、抗体を回収することとを含む、本明細書に記載の対象のヘテロ二量体抗体を作製する方法が本明細書において提供される。
本発明のいくつかの形式を示す。「ボトルオープナー」形式の２つの形態が示され、１つは、ｓｃＦｖを含む抗ＣＤ３抗原結合ドメイン、及びＦａｂを含む抗ＰＳＭＡ抗原結合ドメインを有し、１つはこれらの逆を有する。ｍＡｂ－Ｆｖ、ｍＡｂ－ｓｃＦｖ、中心ｓｃＦｖ、及び中心Ｆｖ、共通の軽鎖、及び二重特異性ＩｇＧ形式がすべて示される。これらの図における構造のそれぞれは、ｓｃＦｖまたはＦｖとして抗ＰＳＭＡ及び抗ＣＤ３ドメインを示すが、これらの構造のそれぞれの抗ＰＳＭＡ及び抗ＣＤ３ドメインも「逆」であってもよい。例えば、図１Ａに示されるｍＡｂ－ｓｃＦｖが抗ＰＳＭＡ ｓｃＦｖ及び抗ＣＤ３ Ｆｖを有し得ることも企図される。加えて、１つの単量体がＦｃドメインのみを含む「ワンアーム化（ｏｎｅ－ａｒｍｅｄ）」形式が示され、これには、ワンアーム中心ｓｃＦｖ及びワンアーム中心Ｆｖが含まれる。二重ｓｃＦｖ形式もまた示される。 本発明のいくつかの形式を示す。「ボトルオープナー」形式の２つの形態が示され、１つは、ｓｃＦｖを含む抗ＣＤ３抗原結合ドメイン、及びＦａｂを含む抗ＰＳＭＡ抗原結合ドメインを有し、１つはこれらの逆を有する。ｍＡｂ－Ｆｖ、ｍＡｂ－ｓｃＦｖ、中心ｓｃＦｖ、及び中心Ｆｖ、共通の軽鎖、及び二重特異性ＩｇＧ形式がすべて示される。これらの図における構造のそれぞれは、ｓｃＦｖまたはＦｖとして抗ＰＳＭＡ及び抗ＣＤ３ドメインを示すが、これらの構造のそれぞれの抗ＰＳＭＡ及び抗ＣＤ３ドメインも「逆」であってもよい。例えば、図１Ａに示されるｍＡｂ－ｓｃＦｖが抗ＰＳＭＡ ｓｃＦｖ及び抗ＣＤ３ Ｆｖを有し得ることも企図される。加えて、１つの単量体がＦｃドメインのみを含む「ワンアーム化（ｏｎｅ－ａｒｍｅｄ）」形式が示され、これには、ワンアーム中心ｓｃＦｖ及びワンアーム中心Ｆｖが含まれる。二重ｓｃＦｖ形式もまた示される。 可変重及び軽ドメイン（ＣＤＲには下線が引かれている）、ならびに個々のｖｌ及びｖｈＣＤＲ、ならびに荷電リンカー（二重下線が引かれている）を有するｓｃＦｖ構築物を含む「高ＣＤ３」抗ＣＤ３＿Ｈ１．３０＿Ｌ１．４７構築物の配列を示す。図に示す配列のすべてにあてはまるように、この荷電リンカーは、必要に応じて、非荷電リンカーまたは異なる荷電リンカーによって置き換えられ得る。 可変重及び軽ドメイン（ＣＤＲには下線が引かれている）、ならびに個々のｖｌ及びｖｈＣＤＲ、ならびに荷電リンカー（二重下線が引かれている）を有するｓｃＦｖ構築物を含む「高中間（Ｈｉｇｈ－Ｉｎｔ）＃１」抗ＣＤ３＿Ｈ１．３２＿Ｌ１．４７構築物の配列を示す。図に示す配列のすべてにあてはまるように、この荷電リンカーは、必要に応じて、非荷電リンカーまたは異なる荷電リンカーによって置き換えられ得る。 可変重及び軽ドメイン（ＣＤＲには下線が引かれている）、ならびに個々のｖｌ及びｖｈＣＤＲ、ならびに荷電リンカー（二重下線が引かれている）を有するｓｃＦｖ構築物を含む「高中間＃２」抗ＣＤ３＿Ｈ１．８９＿Ｌ１．４７構築物の配列を示す。図に示す配列のすべてにあてはまるように、この荷電リンカーは、必要に応じて、非荷電リンカーまたは異なる荷電リンカーによって置き換えられ得る。 可変重及び軽ドメイン（ＣＤＲには下線が引かれている）、ならびに個々のｖｌ及びｖｈＣＤＲ、ならびに荷電リンカー（二重下線が引かれている）を有するｓｃＦｖ構築物を含む「高中間＃３」抗ＣＤ３＿Ｈ１．９０＿Ｌ１．４７構築物の配列を示す。図に示す配列のすべてにあてはまるように、この荷電リンカーは、必要に応じて、非荷電リンカーまたは異なる荷電リンカーによって置き換えられ得る。 可変重及び軽ドメイン（ＣＤＲには下線が引かれている）、ならびに個々のｖｌ及びｖｈＣＤＲ、ならびに荷電リンカー（二重下線が引かれている）を有するｓｃＦｖ構築物を含む「中間」抗ＣＤ３＿Ｈ１．３３＿Ｌ１．４７構築物の配列を示す。図に示す配列のすべてにあてはまるように、この荷電リンカーは、必要に応じて、非荷電リンカーまたは異なる荷電リンカー（例えば、図１４の任意の荷電リンカー）によって置き換えられ得る。 可変重及び軽ドメイン（ＣＤＲには下線が引かれている）、ならびに個々のｖｌ及びｖｈＣＤＲ、ならびに荷電リンカー（二重下線が引かれている）を有するｓｃＦｖ構築物を含む「低」抗ＣＤ３＿Ｈ１．３１＿Ｌ１．４７構築物の配列を示す。図に示す配列のすべてにあてはまるように、この荷電リンカーは、必要に応じて、非荷電リンカーまたは異なる荷電リンカー（例えば、図１４の任意の荷電リンカー）によって置き換えられ得る。 可変重及び軽ドメイン（ＣＤＲには下線が引かれている）、ならびに個々のｖｌ及びｖｈＣＤＲ、ならびに荷電リンカー（二重下線が引かれている）を有するｓｃＦｖ構築物を含むＸＥＮＰ１４４８４の可変重ドメイン及び可変軽ドメインの配列を示す。しかしながら、当業者に理解されるように、ＰＳＭＡの実施形態の場合の荷電リンカーの正に荷電したリンカーも、図１４に示される負に荷電したリンカーまたは非荷電の従来のＧＳリンカーによって置き換えられ得る。 ＸＥＮＰ１４４８４の配列を示す。 ヘテロ二量体化変異体のセットの有用な対（歪曲及びｐＩ変異体を含む）を示す。図１０Ｅで、対応する「単量体２」変異体が存在しない変異体があり、これらは、例えば、どちらかの単量体上で単独で使用されるか、またはボトルオープナーのＦａｂ側上に含まれ得るｐＩ変異体であり、適切な荷電ｓｃＦｖリンカーが、第２の抗原結合ドメインとしてｓｃＦｖを利用する第２の単量体上で使用され得る。好適な荷電リンカーは、図１４に示される。 ヘテロ二量体化変異体のセットの有用な対（歪曲及びｐＩ変異体を含む）を示す。図１０Ｅで、対応する「単量体２」変異体が存在しない変異体があり、これらは、例えば、どちらかの単量体上で単独で使用されるか、またはボトルオープナーのＦａｂ側上に含まれ得るｐＩ変異体であり、適切な荷電ｓｃＦｖリンカーが、第２の抗原結合ドメインとしてｓｃＦｖを利用する第２の単量体上で使用され得る。好適な荷電リンカーは、図１４に示される。 ヘテロ二量体化変異体のセットの有用な対（歪曲及びｐＩ変異体を含む）を示す。図１０Ｅで、対応する「単量体２」変異体が存在しない変異体があり、これらは、例えば、どちらかの単量体上で単独で使用されるか、またはボトルオープナーのＦａｂ側上に含まれ得るｐＩ変異体であり、適切な荷電ｓｃＦｖリンカーが、第２の抗原結合ドメインとしてｓｃＦｖを利用する第２の単量体上で使用され得る。好適な荷電リンカーは、図１４に示される。 ヘテロ二量体化変異体のセットの有用な対（歪曲及びｐＩ変異体を含む）を示す。図１０Ｅで、対応する「単量体２」変異体が存在しない変異体があり、これらは、例えば、どちらかの単量体上で単独で使用されるか、またはボトルオープナーのＦａｂ側上に含まれ得るｐＩ変異体であり、適切な荷電ｓｃＦｖリンカーが、第２の抗原結合ドメインとしてｓｃＦｖを利用する第２の単量体上で使用され得る。好適な荷電リンカーは、図１４に示される。 ヘテロ二量体化変異体のセットの有用な対（歪曲及びｐＩ変異体を含む）を示す。図１０Ｅで、対応する「単量体２」変異体が存在しない変異体があり、これらは、例えば、どちらかの単量体上で単独で使用されるか、またはボトルオープナーのＦａｂ側上に含まれ得るｐＩ変異体であり、適切な荷電ｓｃＦｖリンカーが、第２の抗原結合ドメインとしてｓｃＦｖを利用する第２の単量体上で使用され得る。好適な荷電リンカーは、図１４に示される。 等比体積変異体抗体の定常領域、及びそのそれぞれの置換の一覧を示す。ｐＩ＿（－）は、より低いｐＩ変異体を示す一方で、ｐＩ＿（＋）は、より高いｐＩ変異体を示す。これらは、本発明の他の二量体化変異体と、（かつ本明細書に概要が記載されるように、他の変異体型と）任意選択かつ独立して組み合わせられ得る。 ＦｃγＲ結合を消去する有用な消去変異体（「ノックアウト」または「ＫＯ」変異体と称されることがある）を示す。 本発明の２つの特に有用な実施形態を示す。 １つ以上のｓｃＦｖを成分として利用するヘテロ二量体抗体のｐＩを増加または減少させることにおいて用途を見出すいくつかの荷電ｓｃＦｖリンカーを示す。（＋Ｈ）の正のリンカーは、本明細書において、特に本明細書に示される抗ＣＤ３及びｖｈ配列で特定の用途を見出す。単一電荷を有する、単一の先行技術ｓｃＦｖリンカーは、Ｗｈｉｔｌｏｗ ｅｔ ａｌ．，Ｐｒｏｔｅｉｎ Ｅｎｇｉｎｅｅｒｉｎｇ ６（８）：９８９－９９５（１９９３）にちなんで、「Ｗｈｉｔｌｏｗ」と呼ばれる。このリンカーは、ｓｃＦｖにおいて、凝集の低減、及びタンパク質分解に対する安定性の増進に向けて使用されることに留意するべきである。 １つ以上のｓｃＦｖを成分として利用するヘテロ二量体抗体のｐＩを増加または減少させることにおいて用途を見出すいくつかの荷電ｓｃＦｖリンカーを示す。（＋Ｈ）の正のリンカーは、本明細書において、特に本明細書に示される抗ＣＤ３及びｖｈ配列で特定の用途を見出す。単一電荷を有する、単一の先行技術ｓｃＦｖリンカーは、Ｗｈｉｔｌｏｗ ｅｔ ａｌ．，Ｐｒｏｔｅｉｎ Ｅｎｇｉｎｅｅｒｉｎｇ ６（８）：９８９－９９５（１９９３）にちなんで、「Ｗｈｉｔｌｏｗ」と呼ばれる。このリンカーは、ｓｃＦｖにおいて、凝集の低減、及びタンパク質分解に対する安定性の増進に向けて使用されることに留意するべきである。 操作されたヘテロ二量体歪曲Ｆｃ変異体の一覧をヘテロ二量体の収率（ＨＰＬＣ－ＣＩＥＸにより決定）及び熱安定性（ＤＳＣにより決定）と共に示す。未決定の熱安定性は、「ｎ．ｄ．」と示される。 試験物は、抗ＰＳＭＡまたは抗ＲＳＶ×抗ＣＤ３二重特異性体である。上のパネル：１００，０００個のＬＮＣａＰ細胞への細胞表面結合。検出には、ＦＩＴＣ標識抗ヒトＩｇＧ Ｆｃ二次抗体が使用された。下のパネル：再配向化Ｔ細胞の細胞傷害性アッセイ、２４時間のインキュベーション、１０，０００個のＬＮＣａＰ細胞、４００，０００個の精製されたＴ細胞。検出には、ＬＤＨが使用された。 Ｔ細胞応答及びサイトカイン放出症候群（ＣＲＳ）がサルにおいて標的細胞の会合に依存することを示すグラフを含む。カニクイザル（ｎ＝３）に、ＸＥＮＰ１４４８４（抗ＰＳＭＡ×抗ＣＤ３、３０μｇ／ｋｇ）またはＸＥＮＰ１３２４５（抗ＲＳＶ×ＣＤ３、３ｍｇ／ｋｇ）のいずれかを単回投与した。図１７ＡのＣＤ４＋Ｔ細胞の辺縁趨向（上のパネル）及びＣＤ６９ ＭＦＩによる活性化（中央のパネル）は、フローサイトメトリーによって調べられた。ＩＬ－６血清レベルは、ＥＬＩＳＡ（下のパネル）によって調べられた。 図１７ＢのＣＤ８＋Ｔ細胞の辺縁趨向（上のパネル）及びＣＤ６９ ＭＦＩによる活性化（中央のパネル）は、フローサイトメトリーによって調べられた。ＴＮＦ血清レベルは、ＥＬＩＳＡ（下のパネル）によって調べられた。 本発明の実施形態の可能性のある組み合わせのマトリックスを示す。「Ａ」は、参照される抗ＣＤ３配列のＣＤＲが、左手側で抗ＰＳＭＡ構築物のＣＤＲと組み合わせることができることを意味する。すなわち、例えば左上のセルについて、可変重鎖抗ＣＤ３ Ｈ１．３０配列からのｖｈＣＤＲ及び抗ＣＤ３ Ｌ１．４７配列の可変軽鎖からのｖｌＣＤＲが、抗ＰＳＭＡ Ｊ５９１ Ｈ１＿Ｌ１配列からのｖｈＣＤＲ及びＪ５９１ Ｈ１＿Ｌ１配列からのｖｌＣＤＲと組み合わせることができるということである（図２０を参照されたい）。「Ｂ」は、抗ＣＤ３構築物からのＣＤＲが、抗ＰＳＭＡ構築物からの可変重及び軽ドメインと組み合わせることができることを意味する。すわなち、例えば左上のセルについて、可変重鎖抗ＣＤ３ Ｈ１．３０配列からのｖｈＣＤＲ及び抗ＣＤ３ Ｌ１．４７配列の可変軽鎖からのｖｌＣＤＲが、可変重ドメインＪ５９１ Ｈ１＿Ｌ１配列及びＪ５９１ Ｈ１＿Ｌ１配列と組み合わせることができるということである。「Ｃ」は、ＣＤ３配列からの可変重ドメイン及び可変軽ドメインが、ＰＳＭＡ配列のＣＤＲと共に使用されるように逆にされる。「Ｄ」では、それぞれからの可変重鎖及び可変軽鎖の両方が組み合わされる。「Ｅ」では、抗ＣＤ３のｓｃＦｖがＰＳＭＡ抗原結合ドメイン構築物のＣＤＲと共に使用される。「Ｆ」では、ＣＤ３のｓｃＦｖがＰＳＭＡ抗原結合ドメインの可変重及び可変軽ドメインと共に使用される。「Ｇ」では、抗ＣＤ３構築物のＣＤＲがＰＳＭＡ構築物のｓｃＦｖと共に使用される。「Ｈ」では、抗ＣＤ３の可変重ドメイン及び可変軽ドメインが抗ＰＳＭＡのｓｃＦｖと共に使用される。 様々な前立腺特異的膜抗原（ＰＳＭＡ）のアミノ酸配列を示し、これには、完全ヒトＰＳＭＡ、ヒトＰＳＭＡ細胞外ドメイン、完全Ｍａｃａｃａ ｆａｓｃｉｃｕｌａｒｉｓ ＰＳＭＡ、及びＭａｃａｃａ ｆａｓｃｉｃｕｌａｒｉｓ ＰＳＭＡ細胞外ドメインが含まれる。 非ヒト化抗ＰＳＭＡ抗体Ｊ５９１及びヒト化抗ＰＳＭＡ抗体Ｊ５９１ Ｈ１＿Ｌ１の可変重（ＶＨ）及び可変軽（ＶＬ）ドメインのアミノ酸配列を示す。これらの可変重及び可変軽ドメインに含まれる可変重（ｖｈＣＤＲ１～３）及び可変軽（ｖｌＣＤＲ１～３）ドメインの相補性決定領域も示される。いくつかの実施形態では、抗ＰＳＭＡ ＣＤＲ、ならびにＶＨ及びＶＬは、本明細書に記載の抗体である単一特異性及びヘテロ二量体抗体（例えば、抗ＰＳＭＡ×抗ＣＤ３）において使用され得る。いくつかの実施形態では、ヘテロ二量体抗体が抗ＣＤ３結合ドメインをさらに含む場合、抗ＣＤ３結合ドメインは、図５～７に示されるＶＨ、ＶＬ、またはＣＤＲのいずれかを含むことができる。 ＸＥＮＰ１４４８４（図２１Ａ）、ＸＥＮＰ１６８７３（図２１Ｂ）、ＸＥＮＰ１６８７４（図２１Ｃ）、及びＸＥＮＰ１９７２２（図２１Ｄ）を含む、本明細書に記載の例示的な抗ＰＳＭＡ×抗ＣＤ３抗体のアミノ酸配列を示す。図２２Ｅは、例示的なボトルオープナー骨格のアミノ酸配列を示す。そのような骨格は、本明細書に記載の様々な可変重ドメイン、可変軽ドメイン、及びｓｃＦｖと組み合わされ得る。 ＸＥＮＰ１４４８４（図２１Ａ）、ＸＥＮＰ１６８７３（図２１Ｂ）、ＸＥＮＰ１６８７４（図２１Ｃ）、及びＸＥＮＰ１９７２２（図２１Ｄ）を含む、本明細書に記載の例示的な抗ＰＳＭＡ×抗ＣＤ３抗体のアミノ酸配列を示す。図２２Ｅは、例示的なボトルオープナー骨格のアミノ酸配列を示す。そのような骨格は、本明細書に記載の様々な可変重ドメイン、可変軽ドメイン、及びｓｃＦｖと組み合わされ得る。 ＸＥＮＰ１４４８４（図２１Ａ）、ＸＥＮＰ１６８７３（図２１Ｂ）、ＸＥＮＰ１６８７４（図２１Ｃ）、及びＸＥＮＰ１９７２２（図２１Ｄ）を含む、本明細書に記載の例示的な抗ＰＳＭＡ×抗ＣＤ３抗体のアミノ酸配列を示す。図２２Ｅは、例示的なボトルオープナー骨格のアミノ酸配列を示す。そのような骨格は、本明細書に記載の様々な可変重ドメイン、可変軽ドメイン、及びｓｃＦｖと組み合わされ得る。 ＸＥＮＰ１４４８４（図２１Ａ）、ＸＥＮＰ１６８７３（図２１Ｂ）、ＸＥＮＰ１６８７４（図２１Ｃ）、及びＸＥＮＰ１９７２２（図２１Ｄ）を含む、本明細書に記載の例示的な抗ＰＳＭＡ×抗ＣＤ３抗体のアミノ酸配列を示す。図２２Ｅは、例示的なボトルオープナー骨格のアミノ酸配列を示す。そのような骨格は、本明細書に記載の様々な可変重ドメイン、可変軽ドメイン、及びｓｃＦｖと組み合わされ得る。 ＸＥＮＰ１４４８４（図２１Ａ）、ＸＥＮＰ１６８７３（図２１Ｂ）、ＸＥＮＰ１６８７４（図２１Ｃ）、及びＸＥＮＰ１９７２２（図２１Ｄ）を含む、本明細書に記載の例示的な抗ＰＳＭＡ×抗ＣＤ３抗体のアミノ酸配列を示す。図２２Ｅは、例示的なボトルオープナー骨格のアミノ酸配列を示す。そのような骨格は、本明細書に記載の様々な可変重ドメイン、可変軽ドメイン、及びｓｃＦｖと組み合わされ得る。 抗ＰＳＭＡ×抗ＣＤ３抗体ＸＥＮＰ１４４８４及びＸＥＮＰ１９７２２のＰＳＭＡ親和性（Ｋｄ）決定を示すグラフを示す。 例示的な抗ＰＳＭＡ×抗ＣＤ３抗体ＸＥＮＰ１４４８４及びＸＥＮＰ１９７２２のＬＮＣａＰ前立腺癌細胞（ＬＮＣａＰ）への結合（上）、ならびにそのような例示的な抗体がＬＮＣａＰ前立腺癌細胞株の再配向化Ｔ細胞の細胞傷害性（ＲＴＣＣ）を媒介する能力（下）を示すグラフである。上のパネル：１００，０００個のＬＮＣａＰ細胞への細胞表面結合。検出は、ＦＩＴＣ標識抗ヒトＩｇＧ Ｆｃ二次抗体が使用された。下のパネル：再配向化Ｔ細胞の細胞傷害性アッセイ、一晩のインキュベーション、１０，０００個のＬＮＣａＰ細胞、ヒトＰＢＭＣからの１００，０００個の精製されたＴ細胞。検出には、ＬＤＨが使用された。 ＣＤ３親和性が低下している抗ＰＳＭＡ×抗ＣＤ３二重特異性抗体（ＸＥＮＰ１９７２２）は類似するＴ細胞活性を示すが（上、中央）、高ＣＤ３親和性を有する抗ＰＳＭＡ×抗ＣＤ３二重特異性抗体（ＸＥＮＰ１４４８４）（下）と比較して、サルにおいてＣＲＳが低いことを示すグラフである。 Ｆｖ配列（例えば、Ｆａｂ側のｓｃＦｖ、ならびにｖｈ及びｖｌ）を伴わない、いくつかの有用なボトルオープナー形式主鎖の配列を示す。当業者に理解され、また以下に概要が記載されるように、これらの配列は、本明細書に概要が記載される任意のｖｈ及びｖｌ対と共に使用され得、一方の単量体はｓｃＦｖ（任意選択で荷電ｓｃＦｖリンカーを含む）を含み、他方の単量体はＦａｂ配列（例えば、「Ｆａｂ側の重鎖に結合されるｖｈ及び「定常軽鎖」に結合されるｖｌ）を含む。ｓｃＦｖは抗ＣＤ３または抗ＴＴＡであってもよく、Ｆａｂは他方である。すなわち、本明細書に概要が記載される任意の抗ＣＤ３及び抗ＰＳＭＡ Ｆｖ配列（そのような配列のＣＤＲを含む）は、これらの図２５の主鎖に任意の組み合わせで組み込まれ得る。 これらのボトルオープナー主鎖が、第１のＦａｂと同じ抗原結合を有する追加の第２のＦａｂ（ｖｈ－ＣＨ１及びｖｌ定常軽）が「ボトルオープナー側」上のｓｃＦｖのＮ末端に付加される図１Ｂの中心ｓｃＦｖ形式に用途を見出すことに留意するべきである。 Ｆｖ配列（例えば、Ｆａｂ側のｓｃＦｖ、ならびにｖｈ及びｖｌ）を伴わない、いくつかの有用なボトルオープナー形式主鎖の配列を示す。当業者に理解され、また以下に概要が記載されるように、これらの配列は、本明細書に概要が記載される任意のｖｈ及びｖｌ対と共に使用され得、一方の単量体はｓｃＦｖ（任意選択で荷電ｓｃＦｖリンカーを含む）を含み、他方の単量体はＦａｂ配列（例えば、「Ｆａｂ側の重鎖に結合されるｖｈ及び「定常軽鎖」に結合されるｖｌ）を含む。ｓｃＦｖは抗ＣＤ３または抗ＴＴＡであってもよく、Ｆａｂは他方である。すなわち、本明細書に概要が記載される任意の抗ＣＤ３及び抗ＰＳＭＡ Ｆｖ配列（そのような配列のＣＤＲを含む）は、これらの図２５の主鎖に任意の組み合わせで組み込まれ得る。 これらのボトルオープナー主鎖が、第１のＦａｂと同じ抗原結合を有する追加の第２のＦａｂ（ｖｈ－ＣＨ１及びｖｌ定常軽）が「ボトルオープナー側」上のｓｃＦｖのＮ末端に付加される図１Ｂの中心ｓｃＦｖ形式に用途を見出すことに留意するべきである。 Ｆｖ配列（例えば、Ｆａｂ側のｓｃＦｖ、ならびにｖｈ及びｖｌ）を伴わない、いくつかの有用なボトルオープナー形式主鎖の配列を示す。当業者に理解され、また以下に概要が記載されるように、これらの配列は、本明細書に概要が記載される任意のｖｈ及びｖｌ対と共に使用され得、一方の単量体はｓｃＦｖ（任意選択で荷電ｓｃＦｖリンカーを含む）を含み、他方の単量体はＦａｂ配列（例えば、「Ｆａｂ側の重鎖に結合されるｖｈ及び「定常軽鎖」に結合されるｖｌ）を含む。ｓｃＦｖは抗ＣＤ３または抗ＴＴＡであってもよく、Ｆａｂは他方である。すなわち、本明細書に概要が記載される任意の抗ＣＤ３及び抗ＰＳＭＡ Ｆｖ配列（そのような配列のＣＤＲを含む）は、これらの図２５の主鎖に任意の組み合わせで組み込まれ得る。 これらのボトルオープナー主鎖が、第１のＦａｂと同じ抗原結合を有する追加の第２のＦａｂ（ｖｈ－ＣＨ１及びｖｌ定常軽）が「ボトルオープナー側」上のｓｃＦｖのＮ末端に付加される図１Ｂの中心ｓｃＦｖ形式に用途を見出すことに留意するべきである。 Ｆｖ配列（例えば、Ｆａｂ側のｓｃＦｖ、ならびにｖｈ及びｖｌ）を伴わない、いくつかの有用なボトルオープナー形式主鎖の配列を示す。当業者に理解され、また以下に概要が記載されるように、これらの配列は、本明細書に概要が記載される任意のｖｈ及びｖｌ対と共に使用され得、一方の単量体はｓｃＦｖ（任意選択で荷電ｓｃＦｖリンカーを含む）を含み、他方の単量体はＦａｂ配列（例えば、「Ｆａｂ側の重鎖に結合されるｖｈ及び「定常軽鎖」に結合されるｖｌ）を含む。ｓｃＦｖは抗ＣＤ３または抗ＴＴＡであってもよく、Ｆａｂは他方である。すなわち、本明細書に概要が記載される任意の抗ＣＤ３及び抗ＰＳＭＡ Ｆｖ配列（そのような配列のＣＤＲを含む）は、これらの図２５の主鎖に任意の組み合わせで組み込まれ得る。 これらのボトルオープナー主鎖が、第１のＦａｂと同じ抗原結合を有する追加の第２のＦａｂ（ｖｈ－ＣＨ１及びｖｌ定常軽）が「ボトルオープナー側」上のｓｃＦｖのＮ末端に付加される図１Ｂの中心ｓｃＦｖ形式に用途を見出すことに留意するべきである。
Ｉ．定義
本出願をより完全に理解し得るために、いくつかの定義を以下に示す。そのような定義は、文法的に等価であるものを包含することを意図する。
本明細書において、「消去」は、活性の減少または除去を意味する。したがって、例えば、「ＦｃγＲ結合の消去」は、特定の変異体を含まないＦｃ領域と比較して、Ｆｃ領域アミノ酸変異体が、出発結合の５０％未満を有することを意味し、活性を７０～８０～９０～９５～９８％喪失していることが好ましく、一般に、活性は、Ｂｉａｃｏｒｅアッセイにおいて、検出可能な結合レベルを下回る。ＦｃγＲ結合の消去において特に使用されるものは、図１２に示されるものである。
本明細書で使用される「ＡＤＣＣ」または「抗体依存性細胞媒介細胞傷害性」は、細胞が媒介する反応であり、ＦｃγＲを発現する非特異的細胞傷害性細胞が、標的細胞上に結合した抗体を認識し、その後に標的細胞の溶解を引き起こすことを意味する。ＡＤＣＣは、ＦｃγＲＩＩＩａに対する結合と相関しており、ＦｃγＲＩＩＩａに対する結合の増加は、ＡＤＣＣ活性の増加につながる。
本明細書で使用される「ＡＤＣＰ」または抗体依存性細胞媒介貪食は、細胞が媒介する反応であり、ＦｃγＲを発現する非特異的細胞傷害性細胞が、標的細胞上に結合した抗体を認識し、その後に標的細胞の貪食を引き起こすことを意味する。
本明細書において、「改変」とは、ポリペプチド配列における、アミノ酸の置換、挿入、及び／もしくは欠失、またはタンパク質に化学的に連結された部分に対する変更を意味する。例えば、改変は、糖質の変更またはタンパク質に結合されたＰＥＧ構造であってよい。本明細書において、「アミノ酸改変」とは、ポリペプチド配列における、アミノ酸の置換、挿入、及び／または欠失を意味する。明確化のため、別段の記載がない限り、アミノ酸改変は、常に、ＤＮＡよってコードされるアミノ酸への改変であり、例えば、ＤＮＡ及びＲＮＡにおいてコドンを有する２０個のアミノ酸である。
本明細書において、「アミノ酸置換」または「置換」とは、親ポリペプチド配列における特定位置で、アミノ酸を異なるアミノ酸と置き換えることを意味する。具体的には、いくつかの実施形態では、置換は、特定位置で自然発生しないアミノ酸に対するものであり、生物内において、または任意の生物において、いずれでも自然発生しない。例えば、置換Ｅ２７２Ｙは、変異体ポリペプチドを指し、この場合、位置２７２で、グルタミン酸が、チロシンで置き換えられているＦｃ変異体である。明確化のため、核酸コード配列を変更するが、出発アミノ酸を変更しない（例えば、宿主生物の発現レベルを増加させるために、ＣＧＧ（アルギニンをコードする）をＣＧＡ（依然としてアルギニンをコードする）に交換する）ように操作されたタンパク質は、「アミノ酸置換」ではない、すなわち、同じタンパク質をコードする新しい遺伝子の創出にも関わらず、タンパク質が出発した特定位置で同じアミノ酸を有する場合、それはアミノ酸置換ではない。
本明細書で使用される「アミノ酸挿入」または「挿入」とは、親ポリペプチド配列における特定位置でのアミノ酸配列の追加を意味する。例えば、－２３３Ｅまたは２３３Ｅは、位置２３３の後かつ位置２３４の前でのグルタミン酸の挿入を指定する。加えて、－２３３ＡＤＥまたはＡ２３３ＡＤＥは、位置２３３の後かつ位置２３４の前でのＡｌａＡｓｐＧｌｕの挿入を指定する。
本明細書で使用される「アミノ酸欠失」または「欠失」とは、親ポリペプチド配列における特定位置でのアミノ酸配列の除去を意味する。例えば、Ｅ２３３－またはＥ２３３＃またはＥ２３３（）は、位置２３３でグルタミン酸の欠失を指定する。加えて、ＥＤＡ２３３－またはＥＤＡ２３３＃は、位置２３３から始まる配列ＧｌｕＡｓｐＡｌａの欠失を指定する。
本明細書で使用される「変異体タンパク質」または「タンパク質変異体」または「変異体」とは、少なくとも１つのアミノ酸改変の理由によって、親タンパク質のそれとは異なるタンパク質を意味する。タンパク質変異体は、タンパク質自体、タンパク質を含む組成物、またはそれをコードするアミノ配列を指し得る。好ましくは、タンパク質変異体は、親タンパク質と比較して少なくとも１つのアミノ酸改変を有し、例えば、親と比較して、約１～約７０個のアミノ酸改変、好ましくは、約１～約５個のアミノ酸改変を有する。以下に記載されるように、いくつかの実施形態では、親ポリペプチド、例えば、Ｆｃ親ポリペプチドは、ＩｇＧ１、ＩｇＧ２、ＩｇＧ３、またはＩｇＧ４由来のＦｃ領域などのヒト野生型配列であるが、変異体を有するヒト配列は、「親ポリペプチド」、例えば、既に開示されているＩｇＧ１／２ハイブリッドとしても機能することができる。本明細書のタンパク質変異体配列は、好ましくは、親タンパク質配列と少なくとも約８０％の同一性、最も好ましくは、少なくとも約９０％の同一性、より好ましくは、少なくとも９５～９８～９９％の同一性を有する。変異体タンパク質は、変異体タンパク質自体、タンパク質変異体を含む組成物、またはそれをコードするＤＮＡ配列を指し得る。したがって、本明細書で使用される「抗体変異体」または「変異体抗体」とは、少なくとも１つのアミノ酸改変の理由によって、親抗体とは異なる抗体を意味し、本明細書で使用される「ＩｇＧ変異体」または「変異体ＩｇＧ」は、少なくとも１つのアミノ酸改変の理由によって、親ＩｇＧ（同様に、多くの場合、ヒトＩｇＧ配列由来）とは異なる抗体を意味し、本明細書で使用される「免疫グロブリン変異体」または「変異体免疫グロブリン」は、少なくとも１つのアミノ酸改変の理由によって、親免疫グロブリン配列のそれとは異なる免疫グロブリン配列を意味する。本明細書で使用される「Ｆｃ変異体」または「変異体Ｆｃ」は、Ｆｃドメインにおいてアミノ酸改変を含むタンパク質を意味する。本発明のＦｃ変異体は、それらを構成するアミノ酸改変に従って定義される。したがって、例えば、Ｎ４３４Ｓまたは４３４Ｓは、親Ｆｃポリペプチドに対して、位置４３４で置換セリンを有するＦｃ変異体であり、番号付けは、ＥＵインデックスに従うものである。同様に、Ｍ４２８Ｌ／Ｎ４３４Ｓは、親Ｆｃポリペプチドに対して、置換Ｍ４２８Ｌ及び置換Ｎ４３４Ｓを有するＦｃ変異体を定義する。ＷＴアミノ酸の同一性が、特定されていなくてもよく、その場合、先に記載した変異体は、４２８Ｌ／４３４Ｓと称される。置換が提供される規則は任意であることに留意されたい。つまり、例えば、４２８Ｌ／４３４Ｓは、Ｍ４２８Ｌ／Ｎ４３４Ｓと同一のＦｃ変異体であるなどである。抗体に関連する本発明において論じられるすべての位置に関して、別段の記載がない限り、アミノ酸位置の番号付けは、ＥＵインデックスに従うものである。ＥＵインデックス、またはＫａｂａｔもしくはＥＵの番号付けスキームにあるようなＥＵインデックスは、ＥＵ抗体の番号付けを指す（Ｅｄｅｌｍａｎ ｅｔ ａｌ．，１９６９，Ｐｒｏｃ Ｎａｔｌ Ａｃａｄ Ｓｃｉ ＵＳＡ ６３：７８－８５は参照により完全に本明細書に組み込まれる。）改変は、付加、欠失、または置換であり得る。置換は、自然発生するアミノ酸を含み得、場合によっては、合成アミノ酸を含み得る。例には、米国特許第６，５８６，２０７号、ＷＯ９８／４８０３２、ＷＯ０３／０７３２３８、ＵＳ２００４－０２１４９８８Ａ１、ＷＯ０５／３５７２７Ａ２、ＷＯ０５／７４５２４Ａ２、Ｊ．Ｗ．Ｃｈｉｎ ｅｔ ａｌ．，（２００２），Ｊｏｕｒｎａｌ ｏｆ ｔｈｅ Ａｍｅｒｉｃａｎ Ｃｈｅｍｉｃａｌ Ｓｏｃｉｅｔｙ １２４：９０２６－９０２７、Ｊ．Ｗ．Ｃｈｉｎ，＆Ｐ．Ｇ．Ｓｃｈｕｌｔｚ，（２００２），ＣｈｅｍＢｉｏＣｈｅｍ １１：１１３５－１１３７、Ｊ．Ｗ．Ｃｈｉｎ，ｅｔ ａｌ．，（２００２），ＰＩＣＡＳ Ｕｎｉｔｅｄ Ｓｔａｔｅｓ ｏｆ Ａｍｅｒｉｃａ ９９：１１０２０－１１０２４、及びＬ．Ｗａｎｇ，＆Ｐ．Ｇ．Ｓｃｈｕｌｔｚ，（２００２），Ｃｈｅｍ．１－１０が含まれ、すべてが参照により完全に組み込まれる。
本明細書で使用される、本明細書の「タンパク質」は、少なくとも２つの共有結合したアミノ酸を意味し、これには、タンパク質、ポリペプチド、オリゴペプチド、及びペプチドが含まれる。ペプチジル基は、自然発生するアミノ酸及びペプチド結合、または合成ペプチド模倣構造、すなわち、ペプトイドなどの「類似体」を含み得る（Ｓｉｍｏｎ ｅｔ ａｌ．，ＰＮＡＳ ＵＳＡ ８９（２０）：９３６７（１９９２）を参照されたい、参照により完全に組み込まれる）。当業者に理解されるように、アミノ酸は、自然発生または合成（例えば、ＤＮＡによってコードされるアミノ酸ではない）のいずれでもよい。例えば、ホモ－フェニルアラニン、シトルリン、オルニチン、及びノルロイシンは、本発明の目的のための合成アミノ酸であると考えられ、Ｄ－及びＬ－（ＲまたはＳ）で形成されたアミノ酸の両方を利用してもよい。本発明の変異体は、例えば、Ｓｃｈｕｌｔｚ及び共同研究者によって開発された技術を使用して組み込まれた合成アミノ酸の使用を含む改変を含んでもよく、限定されないが、Ｃｒｏｐｐ＆Ｓｈｕｌｔｚ，２００４，Ｔｒｅｎｄｓ Ｇｅｎｅｔ．２０（１２）：６２５－３０、Ａｎｄｅｒｓｏｎ ｅｔ ａｌ．，２００４，Ｐｒｏｃ Ｎａｔｌ Ａｃａｄ Ｓｃｉ ＵＳＡ １０１（２）：７５６６－７１、Ｚｈａｎｇ ｅｔ ａｌ．，２００３，３０３（５６５６）：３７１－３、及びＣｈｉｎ ｅｔ ａｌ．，２００３，Ｓｃｉｅｎｃｅ ３０１（５６３５）：９６４－７によって説明される方法が含まれ、すべてが参照により完全に組み込まれる。加えて、ポリペプチドは、１つまたは複数の側鎖または末端の合成誘導体化、グリコシル化、ＰＥＧ化、円順列、環化、他の分子へのリンカー、タンパク質またはタンパク質ドメインへの融合、及びペプチドタグまたはペプチド標識の付加を含んでもよい。
本明細書で使用される「残基」とは、タンパク質及びその関連するアミノ酸同一性における位置を意味する。例えば、アスパラギン２９７（Ａｓｎ２９７またはＮ２９７とも呼ばれる）は、ヒト抗体ＩｇＧ１における位置２９７の残基である。
本明細書で使用される「Ｆａｂ」または「Ｆａｂ領域」とは、ＶＨ、ＣＨ１、ＶＬ、及びＣＬ免疫グロブリンドメインを含むポリペプチドを意味する。Ｆａｂは、この領域を単独で、または完全長抗体、抗体断片、もしくはＦａｂ融合タンパク質の構成におけるこの領域を指し得る。本明細書で使用される「Ｆｖ」または「Ｆｖ断片」または「Ｆｖ領域」とは、単一抗体のＶＬドメイン及びＶＨドメインを含むポリペプチドを意味する。当業者に理解されるように、これらは一般に、２つの鎖で構成されている。
本明細書で使用される「ＩｇＧサブクラス改変」または「アイソタイプ改変」とは、１つのＩｇＧアイソタイプの１つのアミノ酸を、異なる、位置合わせされたＩｇＧアイソタイプにおいて、対応するアミノ酸に変換するアミノ酸改変を意味する。例えば、ＥＵ位置２９６に、ＩｇＧ１は、チロシンを含み、ＩｇＧ２は、フェニルアラニンを含むため、ＩｇＧ２におけるＦ２９６Ｙ置換は、ＩｇＧサブクラス改変であると考えられる。
本明細書で使用される「非自然発生改変」とは、アイソタイプではないアミノ酸改変を意味する。例えば、ＩｇＧのいずれも位置４３４にセリンを含まないため、ＩｇＧ１、ＩｇＧ２、ＩｇＧ３、もしくはＩｇＧ４（またはそのハイブリッド）における置換４３４Ｓは、非自然発生改変であると考えられる。
本明細書で使用される「アミノ酸」及び「アミノ酸同一性」とは、ＤＮＡ及びＲＮＡによってコードされる自然発生する２０個のアミノ酸のうちの１つを意味する。
本明細書で使用される「エフェクター機能」とは、抗体Ｆｃ領域と、Ｆｃ受容体またはＦｃリガンドとの相互作用からもたらされる生化学的現象を意味する。エフェクター機能には、限定されないが、ＡＤＣＣ、ＡＤＣＰ、及びＣＤＣが含まれる。
本明細書で使用される「ＩｇＧ Ｆｃリガンド」とは、ＩｇＧ抗体のＦｃ領域に結合し、Ｆｃ／Ｆｃリガンド複合体を形成する、任意の生物由来の分子、好ましくは、ポリペプチドを意味する。Ｆｃリガンドには、限定されないが、ＦｃγＲＩ、ＦｃγＲＩＩ、ＦｃγＲＩＩＩ、ＦｃＲｎ、Ｃ１ｑ、Ｃ３、マンナン結合レクチン、マンノース受容体、ブドウ球菌プロテインＡ、ブドウ球菌プロテインＧ、及びウイルスＦｃγＲが含まれる。Ｆｃリガンドは、ＦｃγＲに相同性のＦｃ受容体のファミリーであるＦｃ受容体相同体（ＦｃＲＨ）（Ｄａｖｉｓ ｅｔ ａｌ．，２００２，Ｉｍｍｕｎｏｌｏｇｉｃａｌ Ｒｅｖｉｅｗｓ １９０：１２３－１３６は参照により完全に組み込まれる）も含む。Ｆｃリガンドには、Ｆｃに結合する未発見分子を含み得る。特定のＩｇＧ Ｆｃリガンドは、ＦｃＲｎ及びＦｃガンマ受容体である。本明細書で使用される「Ｆｃリガンド」とは、抗体のＦｃ領域に結合し、Ｆｃ／Ｆｃリガンド複合体を形成する、任意の生物由来の分子、好ましくは、ポリペプチドを意味する。
本明細書で使用される「Ｆｃガンマ受容体」、「ＦｃγＲ」、または「ＦｃｑａｍｍａＲ」は、ＩｇＧ抗体のＦｃ領域に結合するタンパク質ファミリーの任意のメンバーを意味し、ＦｃγＲ遺伝子によってコードされる。ヒトにおいては、このファミリーには、限定されないが、アイソフォームＦｃγＲＩａ、ＦｃγＲＩｂ、及びＦｃγＲＩｃを含むＦｃγＲＩ（ＣＤ６４）、アイソフォームＦｃγＲＩＩａ（アロタイプＨ１３１及びアロタイプＲ１３１を含む）、ＦｃγＲＩＩｂ（ＦｃγＲＩＩｂ－１及びＦｃγＲＩＩｂ－２を含む）、ならびにＦｃγＲＩＩｃを含むＦｃγＲＩＩ（ＣＤ３２）、ならびにアイソフォームＦｃγＲＩＩＩａ（アロタイプＶ１５８及びアロタイプＦ１５８を含む）及びＦｃγＲＩＩＩｂ（アロタイプＦｃγＲＩＩｂ－ＮＡ１及びアロタイプＦｃγＲＩＩｂ－ＮＡ２を含む）を含むＦｃγＲＩＩＩ（ＣＤ１６）（Ｊｅｆｆｅｒｉｓ ｅｔ ａｌ．，２００２，Ｉｍｍｕｎｏｌ Ｌｅｔｔ ８２：５７－６５は参照により完全に組み込まれる）、ならびに任意の未発見のヒトＦｃγＲまたはＦｃγＲアイソフォームもしくはＦｃγＲアロタイプが含まれる。ＦｃγＲは、任意の生物由来であってもよく、限定されないが、ヒト、マウス、ラット、ウサギ、及びサルが含まれる。マウスＦｃγＲには、限定されないが、ＦｃγＲＩ（ＣＤ６４）、ＦｃγＲＩＩ（ＣＤ３２）、ＦｃγＲＩＩＩ（ＣＤ１６）、及びＦｃγＲＩＩＩ－２（ＣＤ１６－２）、ならびに任意の未発見のマウスＦｃγＲまたはＦｃγＲアイソフォームもしくはＦｃγＲアロタイプが含まれる。
本明細書で使用される「ＦｃＲｎ」または「新生児型Ｆｃ受容体」は、ＩｇＧ抗体のＦｃ領域に結合するタンパク質を意味し、少なくとも一部がＦｃＲｎ遺伝子によってコードされる。ＦｃＲｎは、任意の生物由来であってもよく、限定されないが、ヒト、マウス、ラット、ウサギ、及びサルが含まれる。当該技術分野で知られるように、機能性ＦｃＲｎタンパク質は、２つのポリペプチドを含み、重鎖及び軽鎖と称されることが多い。軽鎖は、ベータ－２－ミクログロブリンであり、重鎖は、ＦｃＲｎ遺伝子によってコードされる。別段の記載がない限り、ＦｃＲｎまたはＦｃＲｎタンパク質は、ＦｃＲｎ重鎖のベータ－２－ミクログロブリンとの複合体を指す。４２８Ｌ／４３４Ｓなど、本明細書に概要が記載されるように、様々なＦｃＲｎ変異体が、ＦｃＲｎ受容体に対する結合の増加に使用され、場合によっては、血清半減期の増加に使用される。
本明細書で使用される「親ポリペプチド」は、後に改変されて変異体を生成する出発ポリペプチドを意味する。親ポリペプチドは、自然発生するポリペプチド、または変異体、または自然発生するポリペプチドの操作された型であってよい。親ポリペプチドは、ポリペプチド自体、親ポリペプチドを含む組成物、またはそれをコードするアミノ酸配列を指し得る。したがって、本明細書で使用される「親免疫グロブリン」とは、改変されて変異体を生成する未改変の免疫グロブリンポリペプチドを意味し、本明細書で使用される「親抗体」とは、改変されて変異体抗体を生成する未改変の抗体を意味する。「親抗体」は、以下に概要が記載されるように、既知の市販の組換え産生された抗体を含むことに留意するべきである。
本明細書で使用される「Ｆｃ」または「Ｆｃ領域」または「Ｆｃドメイン」は、第１の定常領域免疫グロブリンドメイン、及び場合によっては、ヒンジ部分を除く抗体の定常領域を含むポリペプチドを意味する。したがって、Ｆｃは、ＩｇＡ、ＩｇＤ、及びＩｇＧの最後の２つの定常領域免疫グロブリンドメイン、ＩｇＥ及びＩｇＭの最後の３つの定常領域免疫グロブリンドメイン、ならびにこれらのドメインに対する可動性のヒンジＮ末端を指す。ＩｇＡ及びＩｇＭ向けに、Ｆｃは、Ｊ鎖を含んでもよい。ＩｇＧ向けに、Ｆｃドメインは、免疫グロブリンドメインＣγ２及びＣγ３（Ｃγ２及びＣγ３）、ならびにＣγ１（Ｃγ１）とＣγ２（Ｃγ２）との間の下位ヒンジ領域を含む。Ｆｃ領域の境界は、変わってもよいが、ヒトＩｇＧ重鎖Ｆｃ領域は、通常、残基Ｃ２２６またはＰ２３０をそのカルボキシル末端に含むと定義され、番号付けは、Ｋａｂａｔにあるように、ＥＵインデックスに従う。いくつかの実施形態では、以下により完全に記載されるように、アミノ酸改変がＦｃ領域に対してなされることで、例えば、１つ以上のＦｃγＲ受容体に対する結合、またはＦｃＲｎ受容体に対する結合が変更される。
本明細書において、「重定常領域」とは、抗体のＣＨ１－ヒンジ－ＣＨ２－ＣＨ３部分を意味する。
本明細書において、「Ｆｃ融合タンパク質」または「イムノアドヘシン」は、一般に、本明細書に記載される、標的タンパク質に対する結合部分などの異なるタンパク質に連結（任意選択で、本明細書に記載されるリンカー部分を介する）される、Ｆｃ領域を含むタンパク質を意味する。場合によっては、ヘテロ二量体抗体の一方の単量体は、抗体重鎖（ｓｃＦｖを含むか、または軽鎖をさらに含むかのいずれか）を含み、もう一方の単量体はＦｃ融合であり、変異体Ｆｃドメイン及びリガンドを含む。いくつかの実施形態では、これらの「半抗体半融合タンパク質」は、「融合体」と呼ばれる。
本明細書で使用される「位置」とは、タンパク質の配列における場所（ｌｏｃａｔｉｏｎ）を意味する。位置は、連続して番号付けされるか、または確立された形式に従ってもよく、例えば、抗体の番号付けのためのＥＵインデックスに従ってもよい。
本明細書で使用される「標的抗原」とは、所与の抗体の可変領域によって特異的に結合される分子を意味する。標的抗原は、タンパク質、糖質、脂質、または他の化学化合物であってもよい。幅広い数の好適な標的抗原が以下に記載される。
本明細書において、本発明のヘテロ二量体抗体の単量体の構成における「鎖性（ｓｔｒａｎｄｅｄｎｅｓｓ）」とは、「適合」するＤＮＡの２つの鎖（ｓｔｒａｎｄ）と同様に、ヘテロ二量体化変異体が、「適合」してヘテロ二量体を形成する能力を保つように、それぞれの単量体へと取り込まれることを意味する。例えば、いくつかのｐＩ変異体が、単量体Ａへと操作導入されている（例えば、ｐＩを高くする）場合、「電荷対」である立体変異体も利用することができ、ｐＩ変異体を妨害しない。例えば、ｐＩを高くする電荷変異体を、同一「鎖」または同一「単量体」に加えることにより、両機能性が保たれる。同様に、以下により完全に概要が記載されるセットの対で起こる「歪曲」変異体については、当業者は、ｐＩ分離も歪曲のｐＩを使用して最大になるように、１セットの対を組み込む鎖または単量体のどれが機能するか決定するときにｐＩを考慮する。
本明細書で使用される「標的細胞」は、標的抗原を発現する細胞を意味する。
本明細書で使用される「可変領域」とは、カッパ、ラムダ、及び重鎖免疫グロブリンの遺伝子座位をそれぞれ構成するＶ．カッパ、Ｖ．ラムダ、及び／またはＶＨ遺伝子のいずれかによって実質的にコードされる１つ以上のＩｇドメインを含む免疫グロブリンの領域を意味する。
本明細書において、「野生型またはＷＴ」は、天然においてみられるアミノ酸配列またはヌクレオチド配列を意味し、対立遺伝子変動を含む。ＷＴタンパク質は、意図的に改変されていないアミノ酸配列またはヌクレオチド配列を有する。
本発明の抗体は、一般に、単離されているか、または組換え体である。「単離された」が、本明細書に開示される様々なポリペプチドについての説明に使用されるとき、それが発現される細胞または細胞培養から、同定され、分離され、及び／または回収されたポリペプチドを意味する。通常、単離されたポリペプチドは、少なくとも１つの精製ステップによって調製される。「単離された抗体」は、異なる抗原特異性を有する他の抗体を実質的に含まない抗体を指す。「組換え体」は、抗体が、外来宿主細胞において組換え核酸技術を使用して生成されることを意味する。
「特異的結合」、または特定の抗原もしくはエピトープ「に特異的に結合する」、または特定の抗原もしくはエピトープ「に対して特異的」は、非特異的相互作用とは、測定可能な程に異なる結合を意味する。特異的結合は、例えば、一般に、結合活性を有さない類似構造の分子である対照分子の結合と比較した分子の結合を決定することによって、測定することができる。例えば、特異的結合は、標的に類似した対照分子との競合によって決定することができる。
特定の抗原またはエピトープに対する特異的結合は、例えば、抗原またはエピトープに対して、抗体が、少なくとも約１０～４Ｍ、少なくとも約１０～５Ｍ、少なくとも約１０～６Ｍ、少なくとも約１０～７Ｍ、少なくとも約１０～８Ｍ、少なくとも約１０～９Ｍ、あるいは、少なくとも約１０～１０Ｍ、少なくとも約１０～１１Ｍ、少なくとも約１０～１２Ｍ以上のＫＤを有することによって示すことができ、ＫＤは、特定の抗体－抗原相互作用の解離速度を指す。典型的には、抗原を特異的に結合する抗体は、抗原またはエピトープに対して、対照分子が、２０倍～、５０倍～、１００倍～、５００倍～、１０００倍～、５，０００倍～、１０，０００倍～以上のＫＤを有する。
また、特定の抗原またはエピトープに対する特異的結合は、例えば、対照に対して、抗体が、そのエピトープに対して、少なくとも２０倍～、５０倍～、１００倍～、５００倍～、１０００倍～、５，０００倍～、１０，０００倍～以上の、抗原またはエピトープに対するＫＡまたはＫａを有することによって示すことができ、ＫＡまたはＫａは、特定の抗体－抗原相互作用の会合速度を指す。
ＩＩ．概要
ＣＤ３及び腫瘍抗原標的を共捕捉する二重特異性抗体は、Ｔ細胞を再配向化して標的腫瘍細胞を攻撃し溶解するために、設計され使用されてきた。例には、ＣＤ３及び腫瘍抗原を一価で捕捉するＢｉＴＥ及びＤＡＲＴ形式が含まれる。ＣＤ３ターゲティング手法が相当な見込みを示した一方、そのような治療の共通の副作用は、サイトカインの関連する産生であり、毒性サイトカイン放出症候群につながることが多い。二重特異性抗体の抗ＣＤ３結合ドメインが、すべてのＴ細胞を捕捉するため、高サイトカイン産生ＣＤ４ Ｔ細胞サブセットが補充される。その上、ＣＤ４ Ｔ細胞サブセットは、制御性Ｔ細胞を含み、その補充及び拡大は、免疫抑制に潜在的につながり、長期の腫瘍抑制に悪影響を有し得る。さらに、これらの形式は、Ｆｃドメインを含有せず、患者において非常に短い血清半減期を示す。
ＣＤ３ターゲティング手法が相当な見込みを示した一方、そのような治療の共通の副作用は、サイトカインの関連する産生であり、毒性サイトカイン放出症候群につながることが多い。二重特異性抗体の抗ＣＤ３結合ドメインが、すべてのＴ細胞を捕捉するため、高サイトカイン産生ＣＤ４ Ｔ細胞サブセットが補充される。その上、ＣＤ４ Ｔ細胞サブセットは、制御性Ｔ細胞を含み、その補充及び拡大は、免疫抑制に潜在的につながり、長期の腫瘍抑制に悪影響を有し得る。サイトカイン産生を低下させ、かつＣＤ４ Ｔ細胞の活性化をおそらく低下させる１つのそのような可能性のある方法は、ＣＤ３に対する抗ＣＤ３ドメインの親和性を低下させることによるものである。
したがって、いくつかの実施形態では、本発明は、前立腺特異的膜抗原（ＰＳＭＡ）に結合する抗原結合ドメインと組み合わせて抗ＣＤ３抗原結合ドメインを含む抗体構築物を提供する。
さらに、いくつかの実施形態では、抗ＣＤ３抗原結合ドメインは、ＣＤ３に対する「強」または「高親和性」結合体（例えば、１つの例は、Ｈ１．３０＿Ｌ１．４７として示される重及び軽可変ドメインである（必要に応じて任意選択で荷電リンカーを含む））であり、ＰＳＭＡにも結合する。他の実施形態では、本発明は、ＣＤ３に対する「軽（ｌｉｔｅ）」または「低親和性」結合体である抗ＣＤ３抗原結合ドメインを含む抗体構築物を提供する。追加の実施形態は、ＣＤ３に対して中間または「中」親和性を有し、ＰＳＭＡにも結合する抗ＣＤ３抗原結合ドメインを含む抗体構築物を提供する。親和性は、一般に、Ｂｉａｃｏｒｅアッセイを使用して測定される。
本発明の「高、中、低」抗ＣＤ３配列が、様々なヘテロ二量体化形式において使用され得ることを理解するべきである。本明細書の開示の大部分が、ヘテロ二量体の「ボトルオープナー」形式を使用する一方で、これらの可変重及び軽配列、ならびにｓｃＦｖ配列（ならびにこれらの可変重及び軽配列を含むＦａｂ配列）は、ＷＯ公開第２０１４／１４５８０６号の図２に示されるもの、参照により明確に本明細書に組み込まれる図、形式、及び説明文などの他の形式で使用され得る。
したがって、本発明は、２つの異なる抗原に結合するヘテロ二量体抗体を提供し、例えば、その抗体は、本発明において２つの異なる標的抗原、例えば、ＣＤ３及びＰＳＭＡに結合するという点で「二重特異性」である。これらのヘテロ二量体抗体は、一価（例えば、可変重及び可変軽ドメインの対などの単一抗原結合ドメインがある）または二価（それぞれが独立して抗原に結合する２つの抗原結合ドメインがある）のいずれかでこれらの標的抗原に結合し得る。本発明のヘテロ二量体抗体は、以下により詳細に概要が記載されるように、ヘテロ二量体形成をホモ二量体形成より優先させるアミノ酸置換を含有する異なる単量体と、以下に同様に概要が記載されるように、ホモ二量体を除去するヘテロ二量体の単純な精製を可能にする「ｐＩ変異体」と組み合わせて使用することに基づく。本発明のヘテロ二量体二重特異性抗体に関して、本発明は、一般に、ヘテロ二量体タンパク質を産生するために産生細胞内で自己組織化し得る操作されたＦｃドメインまたは変異体Ｆｃドメインの使用、及びそのようなヘテロ二量体タンパク質を生成し精製するための方法に依存する。
ＩＩＩ．抗体
本発明は、ＣＤ３及びＰＳＭＡに結合する二重特異性抗体、一般には、治療用抗体の生成に関する。以下に論じられるように、「抗体」という用語が、一般に使用される。本発明において用途を見出す抗体は、本明細書に記載されるいくつかの形式で使用でき、伝統的な抗体、ならびに以下に記載される抗体の誘導体、断片、及び模倣体が含まれる。
伝統的な抗体構造単位は、典型的には、四量体を含む。それぞれの四量体は、典型的には、ポリペプチド鎖の２つの同一対からなり、それぞれの対が、１つの「軽」鎖（典型的には、約２５ｋＤａの分子量を有する）、及び１つの「重」鎖（典型的には、約５０～７０ｋＤａの分子量を有する）を有する。ヒト軽鎖は、カッパ軽鎖及びラムダ軽鎖として分類される。本発明は、ＩｇＧクラスを対象とし、ＩｇＧクラスは、いくつかのサブクラスを有し、限定されないが、ＩｇＧ１、ＩｇＧ２、ＩｇＧ３、及びＩｇＧ４が含まれる。ＩｇＧ１は、３５６（ＤまたはＥ）及び３５８（ＬまたはＭ）に多型を有する、異なるアロタイプを有することに留意するべきである。本明細書に示される配列は、３５６Ｄ／３５８Ｍアロタイプを使用するが、他のアロタイプも本明細書に含まれる。すなわち、本明細書に含まれるＩｇＧ１ Ｆｃドメインを含む任意の配列は、３５６Ｄ／３５８Ｍアロタイプを置き換える３５６Ｅ／３５８Ｌを有し得る。
加えて、本明細書の配列の多くは、位置２２０に、セリンに置き換えられる少なくとも１つのシステインを有し、一般に、これは、本明細書に示される配列の大半に関して、ジスルフィド形成を低下させるために、「ｓｃＦｖ単量体」側上にあるが、「Ｆａｂ単量体」側またはその両方上にあってもよい。本明細書の配列内に具体的に含まれるものは、これらの置き換えられたシステイン（Ｃ２２０Ｓ）のうちの１つまたは両方である。
したがって、本明細書で使用される「アイソタイプ」は、その定常領域の化学的及び抗原特徴によって定義される免疫グロブリンのサブクラスのいずれかを意味する。治療用抗体は、アイソタイプ及び／またはサブクラスのハイブリッドも含み得ることを理解するべきである。例えば、参照によって組み込まれる米国公開第２００９／０１６３６９９号に示されるように、本発明は、ＩｇＧ１／Ｇ２ハイブリッドのｐＩ操作を含む。
それぞれの鎖のアミノ末端部分は、抗原認識を第１に担う約１００～１１０個以上のアミノ酸の可変領域を含み、可変領域は、一般に、当該技術分野及び本明細書において「Ｆｖドメイン」または「Ｆｖ領域」と呼ばれる。可変領域では、３つのループが、重鎖及び軽鎖のＶドメインのそれぞれのために集まり、抗原結合部位を形成する。ループのそれぞれは、相補性決定領域と称され（以後「ＣＤＲ」と称される）、アミノ酸配列における変動が最も顕著である。「可変」は、可変領域のある特定のセグメントが、抗体間の配列において広く異なるという事実を指す。可変領域内の可変性は、均等に分布していない。その代わりに、Ｖ領域は、相対的に不変な区間からなり、この区間は、それぞれの長さが９～１５個以上のアミノ酸である、「超可変領域」と呼ばれる極度に可変性の、より短い領域によって分離されている、１５～３０個のアミノ酸のフレームワーク領域（ＦＲ）と呼ばれる。
ＶＨ及びＶＬは、それぞれが３つの超可変領域（「相補性決定領域」、「ＣＤＲ」）及び４つのＦＲから構成され、次の順序で、アミノ末端からカルボキシ末端へと配置される：ＦＲ１－ＣＤＲ１－ＦＲ２－ＣＤＲ２－ＦＲ３－ＣＤＲ３－ＦＲ４。
超可変領域は、軽鎖可変領域における約アミノ酸残基２４～３４（ＬＣＤＲ１；「Ｌ」は軽鎖を示す）、５０～５６（ＬＣＤＲ２）、及び８９～９７（ＬＣＤＲ３）、ならびに重鎖可変領域におけるおよそ約３１～３５Ｂ（ＨＣＤＲ１；「Ｈ」は、重鎖を示す）、約５０～６５（ＨＣＤＲ２）、及び約９５～１０２（ＨＣＤＲ３）のアミノ酸残基；Ｋａｂａｔ ｅｔ ａｌ．，ＳＥＱＵＥＮＣＥＳ ＯＦ ＰＲＯＴＥＩＮＳ ＯＦ ＩＭＭＵＮＯＬＯＧＩＣＡＬ ＩＮＴＥＲＥＳＴ，５ｔｈ Ｅｄ．Ｐｕｂｌｉｃ Ｈｅａｌｔｈ Ｓｅｒｖｉｃｅ，Ｎａｔｉｏｎａｌ Ｉｎｓｔｉｔｕｔｅｓ ｏｆ Ｈｅａｌｔｈ，Ｂｅｔｈｅｓｄａ，Ｍｄ．（１９９１）、ならびに／または超可変ループを形成するそうした残基（例えば、軽鎖可変領域における残基２６～３２（ＬＣＤＲ１）、５０～５２（ＬＣＤＲ２）、及び９１～９６（ＬＣＤＲ３）、ならびに重鎖可変領域における２６～３２（ＨＣＤＲ１）、５３～５５（ＨＣＤＲ２）、及び９６～１０１（ＨＣＤＲ３）；Ｃｈｏｔｈｉａ ａｎｄ Ｌｅｓｋ（１９８７）Ｊ．Ｍｏｌ．Ｂｉｏｌ．１９６：９０１－９１７、由来のアミノ酸残基を包含することが一般的である。本発明の特定のＣＤＲは、以下に記載される。
当業者に理解されるように、ＣＤＲの正確な番号付け及び配置は、異なる番号付けシステム間で異なり得る。しかしながら、可変重及び／または可変軽配列の開示は関連するＣＤＲの開示を含むことを理解するべきである。したがって、それぞれの可変重領域の開示は、ｖｈＣＤＲ（例えば、ｖｈＣＤＲ１、ｖｈＣＤＲ２、及びｖｈＣＤＲ３）の開示であり、それぞれの可変軽領域の開示は、ｖｌＣＤＲ（例えば、ｖｌＣＤＲ１、ｖｌＣＤＲ２、及びｖｌＣＤＲ３）の開示である。
本明細書を通して、可変ドメイン（およそ、軽鎖可変領域の残基１～１０７、及び重鎖可変領域の残基１～１１３）における残基を指すときは、Ｋａｂａｔ番号付けシステム、Ｆｃ領域についてはＥＵ番号付けシステムが一般に使用される（例えば、Ｋａｂａｔ ｅｔ ａｌ．，上記（１９９１））。
本発明は、多数の異なるＣＤＲのセットを提供する。この場合、「完全なＣＤＲのセット」は、３つの可変軽ＣＤＲ及び３つの可変重ＣＤＲ、例えば、ｖｌＣＤＲ１、ｖｌＣＤＲ２、ｖｌＣＤＲ３、ｖｈＣＤＲ１、ｖｈＣＤＲ２、及びｖｈＣＤＲ３を含む。これらは、それぞれより大きい可変軽または可変重ドメインの一部であり得る。加えて、より完全に本明細書に概要が記載されるように、可変重及び可変軽ドメインは、重鎖及び軽鎖が使用される場合（例えば、Ｆａｂが使用される場合）別個のポリペプチド鎖上に、またはｓｃＦｖ配列の場合は単一ポリペプチド鎖上にあり得る。
ＣＤＲは、抗原結合の形成、またはより具体的には、抗体のエピトープ結合部位の形成に寄与する。「エピトープ」は、パラトープとして知られる、抗体分子の可変領域における特定抗原結合部位と相互作用する決定基を指す。エピトープは、アミノ酸または糖側鎖などの分子の分類であり、通常、特定の構造特徴、及び特定の電荷特徴を有する。単一抗原が２つ以上のエピトープを有してもよい。
エピトープは、結合に直接関与するアミノ酸残基（エピトープの免疫優性成分とも呼ばれる）、及び特異的な抗原結合ペプチドによって、効果的に遮断されるアミノ残基などの、結合に直接関与しない他のアミノ酸残基を含んでもよい。換言すれば、このアミノ酸残基は、特異的な抗原結合ペプチドのフットプリントの範疇である。
エピトープは、立体構造的、または直線的のいずれでもよい。立体構造的エピトープは、空間的に並置されたアミノ酸によって、直線的ポリペプチド鎖の異なるセグメントから産生される。直線的エピトープは、ポリペプチド鎖における隣接アミノ酸残基によって産生されるものである。立体的及び非立体的エピトープは、前者に対する結合であって、後者に対するものではない結合が、変性溶媒の存在下で消失するという点で区別されてもよい。
エピトープは、特有の空間的立体構造において、典型的には少なくとも３個、より典型的には、少なくとも５または８～１０個のアミノ酸を含む。同じエピトープを認識する抗体は、１つの抗体が、標的抗原に対する別の抗体の結合を遮断する能力を示す単純なイムノアッセイ、例えば、「ビニング（ｂｉｎｎｉｎｇ）」において検証することができる。
それぞれの鎖のカルボキシ末端部分は、エフェクター機能を第１に担う定常領域を定義する。Ｋａｂａｔらは、重鎖及び軽鎖の可変領域の多数の一次配列を収集した。配列保存の程度に基づき、彼らは、個々の一次配列をＣＤＲ及びフレームワークへと分類し、その一覧を作成した（ＳＥＱＵＥＮＣＥＳ ＯＦ ＩＭＭＵＮＯＬＯＧＩＣＡＬ ＩＮＴＥＲＥＳＴ，５ｔｈ ｅｄｉｔｉｏｎ，ＮＩＨ ｐｕｂｌｉｃａｔｉｏｎ，Ｎｏ．９１－３２４２，Ｅ．Ａ．Ｋａｂａｔ ｅｔ ａｌ．を参照のこと。参照により完全に組み込まれる）。
免疫グロブリンのＩｇＧサブクラスでは、重鎖において、いくつかの免疫グロブリンドメインが存在する。本明細書において、「免疫グロブリン（Ｉｇ）ドメイン」とは、明確に異なる三次構造を有する免疫グロブリンの領域を意味する。本発明における対象は、定常重（ＣＨ）ドメイン及びヒンジドメインを含む重鎖ドメインにある。ＩｇＧ抗体の構成では、ＩｇＧアイソタイプは、それぞれが３つのＣＨ領域を有する。したがって、ＩｇＧの構成における「ＣＨ」ドメインは、次のとおりである。「ＣＨ１」は、Ｋａｂａｔにあるように、ＥＵインデックスに従う位置１１８～２２０を指す。「ＣＨ２」は、Ｋａｂａｔにあるように、ＥＵインデックスに従う位置２３７～３４０を指し、「ＣＨ３」は、Ｋａｂａｔにあるように、ＥＵインデックスに従う位置３４１～４４７を指す。本明細書に示され、以下に記載されるように、ｐＩ変異体は、以下に論じられるＣＨ領域のうちの１つ以上、及びヒンジ領域にあり得る。
本明細書に示される配列は、位置１１８であるＣＨ１領域から始まり、別段の記載がない限り、可変領域は含まれないことに留意するべきである。例えば、配列番号２の第１のアミノ酸は、配列一覧表で、位置「１」であると指定されるが、ＥＵ番号付けに従うＣＨ１領域の位置１１８に対応する。
重鎖のＩｇドメインの別の型は、ヒンジ領域である。本明細書において、「ヒンジ」または「ヒンジ領域」または「抗体ヒンジ領域」または「免疫グロブリンヒンジ領域」とは、抗体の第１の定常ドメイン及び第二定常ドメインの間にアミノ酸を含む可動性ポリペプチドを意味する。構造的に、ＩｇＧ ＣＨ１ドメインは、ＥＵ位置２２０で終了し、ＩｇＧ ＣＨ２ドメインは、残基ＥＵ位置２３７から始まる。したがって、ＩｇＧに関して、抗体ヒンジは、本明細書において、位置２２１（ＩｇＧ１においてＤ２２１）～２３６（ＩｇＧ１においてＧ２３６）を含むように定義され、番号付けは、Ｋａｂａｔにあるように、ＥＵインデックスに従う。いくつかの実施形態では、例えば、Ｆｃ領域の構成において、下位ヒンジが含まれ、「下位ヒンジ」は、一般に、位置２２６または２３０を指す。本明細書に留意されるように、ｐＩ変異体は、ヒンジ領域においても作製することができる。
軽鎖は、一般に、２つのドメイン、可変軽ドメイン（Ｆｖ領域を形成する可変重ドメインと共に軽鎖ＣＤＲを含む）、及び定常軽鎖領域（ＣＬまたはＣκと称されることが多い）を含む。
以下に概要が記載される、追加の置換に関する別の関心領域は、Ｆｃ領域である。
したがって、本発明は、異なる抗体ドメインを提供する。本明細書に記載され、当該技術分野で知られるように、本発明のヘテロ二量体抗体は、重鎖及び軽鎖内に異なるドメインを含み、そのドメインはまた、重複し得る。これらのドメインには、限定されないが、Ｆｃドメイン、ＣＨ１ドメイン、ＣＨ２ドメイン、ＣＨ３ドメイン、ヒンジドメイン、重定常ドメイン（ＣＨ１－ヒンジ－ＦｃドメインまたはＣＨ１－ヒンジ－ＣＨ２－ＣＨ３）、可変重ドメイン、可変軽ドメイン、軽定常ドメイン、ＦＡｂドメイン、及びｓｃＦｖドメインが含まれる。
したがって、「Ｆｃドメイン」は、－ＣＨ２－ＣＨ３ドメイン、及び任意選択でヒンジドメインを含む。本明細書の実施形態では、ｓｃＦｖがＦｃドメインに結合されるとき、それは、Ｆｃドメインのヒンジに結合されるｓｃＦｖ構築物のＣ末端であり、例えば、それは、一般に、ヒンジの最初の配列ＥＰＫＳに結合される。重鎖は、可変重ドメイン及び定常ドメインを含み、ＣＨ２－ＣＨ３を含むＣＨ１－任意選択のヒンジ－Ｆｃドメインを含む。軽鎖は、可変軽鎖及び軽定常ドメインを含む。ｓｃＦｖは、可変重鎖、ｓｃＦｖリンカー、及び可変軽ドメインを含む。本明細書に概要が記載される構築物及び配列の大半において、可変軽鎖のＣ末端は、ｓｃＦｖリンカーのＮ末端に結合され、そのＣ末端は、可変重鎖のＮ末端に結合される（Ｎ－ｖｈ－リンカー－ｖｌ－Ｃ）が、それは交換されてもよい（Ｎ－ｖｌ－リンカー－ｖｈ－Ｃ）。
本発明のいくつかの実施形態は、自然に発生しないが、一般に、ｓｃＦｖリンカーによって一緒に連結される可変重ドメイン及び可変軽ドメインを含む少なくとも１つのｓｃＦｖドメインを含む。本明細書に示されるように、使用され得るいくつかの好適なｓｃＦｖリンカーがあり、それらのリンカーは、組換え技術によって生成される伝統的なペプチド結合を含む。
リンカーペプチドは、次のアミノ酸残基を主に含み得る：Ｇｌｙ、Ｓｅｒ、Ａｌａ、またはＴｈｒ。リンカーペプチドは、２つの分子を連結するために適切な長さを有するべきであり、そのようにして、それらは、お互いに対して正しい立体構造をとり、その結果、それらは、所望の活性を保持する。一実施形態では、リンカーは、長さが約１～５０個のアミノ酸、好ましくは、長さが約１～３０個のアミノ酸である。一実施形態では、長さが１～２０個のアミノ酸であるリンカーを、いくつかの実施形態では用途を見出す約５～約１０個のアミノ酸と共に使用してもよい。有用なリンカーには、グリシン－セリン重合体、例えば、（ＧＳ）ｎ、（ＧＳＧＧＳ）ｎ、（ＧＧＧＧＳ）ｎ、及び（ＧＧＧＳ）ｎ（ここで、ｎは、少なくとも１（及び一般に３～４）の整数である）、グリシン－アラニン重合体、アラニン－セリン重合体、ならびに他の可動性リンカーが含まれる。あるいは、限定されないが、ポリエチレングリコール（ＰＥＧ）、ポリプロピレングリコール、ポリオキシアルキレン、またはポリエチレングリコール及びポリプロピレングリコールの共重合体を含む様々な非タンパク質性の重合体が、リンカーとして用途を見出すことができ、すなわち、リンカーとして用途を見出すことができる。
他のリンカー配列は、ＣＬ／ＣＨ１ドメインのすべての残基ではないが、ＣＬ／ＣＨ１ドメインの任意の長さの任意の配列を含んでもよく、例えば、ＣＬ／ＣＨ１ドメインの最初の５～１２個のアミノ酸残基を含んでよい。リンカーは、免疫グロブリン軽鎖由来であり得、例えば、ＣκまたはＣλである。リンカーは、任意のアイソタイプの免疫グロブリン重鎖由来であり得、例えば、Ｃγ１、Ｃγ２、Ｃγ３、Ｃγ４、Ｃα１、Ｃα２、Ｃδ、Ｃε、及びＣμが含まれる。リンカー配列は、Ｉｇ様タンパク質（例えば、ＴＣＲ、ＦｃＲ、ＫＩＲ）、ヒンジ領域由来の配列、及び他のタンパク質由来の他の天然の配列などの他のタンパク質由来であってもよい。
いくつかの実施形態では、リンカーは、本明細書に一緒に概要が記載される任意の２つのドメインを連結させるために使用される「ドメインリンカー」である。任意の好適なリンカーが使用され得るが、多くの実施形態は、グリシン－セリン重合体を利用し、このグリシン－セリン重合体には、例えば、（ＧＳ）ｎ、（ＧＳＧＧＳ）ｎ、（ＧＧＧＧＳ）ｎ、及び（ＧＧＧＳ）ｎ（ここで、ｎは、少なくとも１（及び一般に３～４～５）の整数である）、ならびに２つのドメインの組換え付加を可能にする任意のペプチド配列が含まれ、この２つのドメインは、各ドメインがその生物学的機能を保持することを可能にするのに十分な長さ及び可動性を有する。。場合によっては、以下に概要が記載されるように「鎖性」に注目すると、ｓｃＦｖリンカーのいくつかの実施形態において使用されるように、荷電ドメインリンカーが使用され得る。
いくつかの実施形態では、ｓｃＦｖリンカーは、荷電ｓｃＦｖリンカーであり、そのいくつかが、図１４に示される。したがって、本発明は、第１の単量体と第２の単量体との間でｐＩにおける分離を促進するために荷電ｓｃＦｖリンカーをさらに提供する。すなわち、荷電ｓｃＦｖリンカーを組み込むことによって、正であっても、負であっても（あるいは異なる単量体上でｓｃＦｖを使用する骨格の場合は両方）、これは、荷電リンカーを含む単量体が、Ｆｃドメインをさらに変更することなくｐＩを変えることを可能にする。これらの荷電リンカーは、標準リンカーを含有するあらゆるｓｃＦｖに置換されることができる。かさねて、当業者によって理解されるように、荷電ｓｃＦｖリンカーは、ｐＩにおける所望の変更に従って、正しい「鎖」または単量体上で使用される。例えば、本明細書で論じられるように、三重Ｆ形式のヘテロ二量体抗体を作製するために、所望の抗原結合ドメインのそれぞれについてのＦｖ領域の最初のｐＩが計算され、１つがｓｃＦｖを作製するために選択され、ｐＩによって、正または負のリンカーいずれかが選択される。
荷電ドメインリンカーはまた、本発明の単量体のｐＩ分離を増加させるためにも使用することができ、したがって、図１４に含まれるものは、リンカーが利用される本明細書のいずれの実施形態においても使用することができる。
いくつかの実施形態では、抗体は、完全長である。本明細書において、「完全長抗体」とは、抗体の天然の生物学的形態を構成する構造を意味し、特にホモ二量体を除去してヘテロ二量体化形成またはヘテロ二量体の精製のいずれかを可能にするためにＦｃドメインに、以下に概要が記載される１つ以上の改変を含む可変及び定常領域を含む。完全長抗体は、一般に、Ｆａｂ及びＦｃドメインを含み、図１に一般に示されるように、ｓｃＦｖなどの余分な抗原結合ドメインをさらに含有し得る。
一実施形態では、抗体は、抗体断片であり、それが、ｐＩ操作などで、ヘテロ二量体を産生するように操作され得る少なくとも１つの定常ドメインを含む場合に限られる。使用することができる他の抗体断片には、ｐＩが操作される、本発明のＣＨ１、ＣＨ２、ＣＨ３、ヒンジ、及びＣＬドメインのうちの１つ以上を含有する断片が含まれる。例えば、Ｆｃ融合体は、Ｆｃ領域（ＣＨ２及びＣＨ３、任意選択でヒンジ領域を有する）が別のタンパク質に融合した融合体である。いくつかのＦｃ融合体が、当該技術分野で知られており、本発明のヘテロ二量体化変異体の付加によって改良することができる。この場合、抗体融合体を、ＣＨ１と、ＣＨ１、ＣＨ２、及びＣＨ３と、ＣＨ２と、ＣＨ３と、ＣＨ２及びＣＨ３と、ＣＨ１及びＣＨ３と、を含めて作製することができ、それらのいずれか、またはすべてを、本明細書に記載されるヘテロ二量体化変異体のいずれかの組み合わせを利用して、任意選択でヒンジ領域を含めて作製することができる。
具体的には、図１に示される形式は、通常「ヘテロ二量体抗体」と呼ばれる抗体であり、タンパク質が、ヘテロ二量体Ｆｃドメインに自己組織化される少なくとも２つの関連Ｆｃ配列を有することを意味する。
キメラ及びヒト化抗体
いくつかの実施形態では、抗体は、異なる種由来の混合物であり得、例えば、キメラ抗体及び／またはヒト化抗体である。一般に、「キメラ抗体」及び「ヒト化抗体」の両方が、２つ以上の種由来の領域を組み合わせる抗体を指す。例えば、「キメラ抗体」は、伝統的に、マウス（または場合によってはラット）由来の可変領域（複数可）、及びヒト由来の定常領域（複数可）を含む。「ヒト化抗体」は、一般に、ヒト抗体においてみられる配列と交換された可変ドメインフレームワーク領域を有する非ヒト抗体を指す。一般に、ヒト化抗体では、ＣＤＲを除き、抗体全体が、ヒト起源のポリヌクレオチドによってコードされるか、またはそのＣＤＲ内は除いて、そのような抗体と同一である。ＣＤＲのいくつか、またはすべては、非ヒト生物起源の核酸によってコードされており、抗体を創出するためにヒト抗体可変領域のベータシートフレームワークへ移植され、その特異性は、移植されたＣＤＲによって決定される。そのような抗体の創出は、例えば、ＷＯ９２／１１０１８、Ｊｏｎｅｓ，１９８６，Ｎａｔｕｒｅ ３２１：５２２－５２５、Ｖｅｒｈｏｅｙｅｎ ｅｔ ａｌ．，１９８８，Ｓｃｉｅｎｃｅ ２３９：１５３４－１５３６において説明されており、これらはすべて、参照により完全に組み込まれる。対応するドナー残基に対して選択されたアクセプターフレームワーク残基の「復帰突然変異（Ｂａｃｋｍｕｔａｔｉｏｎ）」が、初期移植構築物において消失した親和性を回復するために必要であることが多い（ＵＳ５５３０１０１、ＵＳ５５８５０８９、ＵＳ５６９３７６１、ＵＳ５６９３７６２、ＵＳ６１８０３７０、ＵＳ５８５９２０５、ＵＳ５８２１３３７、ＵＳ６０５４２９７、ＵＳ６４０７２１３、これらはすべて、参照により完全に組み込まれる）。ヒト化抗体は、免疫グロブリンの定常領域の少なくとも一部も最適に含み、これは、典型的には、ヒト免疫グロブリンのものであり、したがって、典型的には、ヒトＦｃ領域を含む。ヒト化抗体は、遺伝学的に操作された免疫系を有するマウスを使用して生成させることもできる。Ｒｏｑｕｅ ｅｔ ａｌ．，２００４，Ｂｉｏｔｅｃｈｎｏｌ．Ｐｒｏｇ．２０：６３９－６５４が、参照により完全に組み込まれる。非ヒト抗体のヒト化及び再形成のための様々な技術及び方法が、当該技術分野でよく知られている（Ｔｓｕｒｕｓｈｉｔａ＆Ｖａｓｑｕｅｚ，２００４，Ｈｕｍａｎｉｚａｔｉｏｎ ｏｆ Ｍｏｎｏｃｌｏｎａｌ Ａｎｔｉｂｏｄｉｅｓ，Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ Ｂｉｏｌｏｇｙ ｏｆ Ｂ Ｃｅｌｌｓ，５３３－５４５，Ｅｌｓｅｖｉｅｒ Ｓｃｉｅｎｃｅ（ＵＳＡ）、及びそこで引用される参照文献を参照のこと。これらはすべて、参照により完全に組み込まれる）。ヒト化の方法には、限定されないが、Ｊｏｎｅｓ ｅｔ ａｌ．，１９８６，Ｎａｔｕｒｅ ３２１：５２２－５２５、Ｒｉｅｃｈｍａｎｎ ｅｔ ａｌ．，１９８８、Ｎａｔｕｒｅ ３３２：３２３－３２９、Ｖｅｒｈｏｅｙｅｎ ｅｔ ａｌ．，１９８８，Ｓｃｉｅｎｃｅ，２３９：１５３４－１５３６、Ｑｕｅｅｎ ｅｔ ａｌ．，１９８９，Ｐｒｏｃ Ｎａｔｌ Ａｃａｄ Ｓｃｉ，ＵＳＡ ８６：１００２９－３３、Ｈｅ ｅｔ ａｌ．，１９９８，Ｊ．Ｉｍｍｕｎｏｌ．１６０：１０２９－１０３５、Ｃａｒｔｅｒ ｅｔ ａｌ．，１９９２，Ｐｒｏｃ Ｎａｔｌ Ａｃａｄ Ｓｃｉ ＵＳＡ ８９：４２８５－９，Ｐｒｅｓｔａ ｅｔ ａｌ．，１９９７，Ｃａｎｃｅｒ Ｒｅｓ．５７（２０）：４５９３－９、Ｇｏｒｍａｎ ｅｔ ａｌ．，１９９１，Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．ＵＳＡ ８８：４１８１－４１８５、Ｏ’Ｃｏｎｎｏｒ ｅｔ ａｌ．，１９９８，Ｐｒｏｔｅｉｎ Ｅｎｇ １１：３２１－８において説明される方法が含まれ、これらはすべて、参照により完全に組み込まれる。非ヒト抗体可変領域の免疫原性を低下させるヒト化または他の方法には、例えば、Ｒｏｇｕｓｋａ ｅｔ ａｌ．，１９９４，Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．ＵＳＡ ９１：９６９－９７３において説明されるような表面再構成法（ｒｅｓｕｒｆａｃｉｎｇ ｍｅｔｈｏｄ）が含まれ、参照により完全に組み込まれる。
ある特定の実施形態では、本発明の抗体は、特定の生殖系列重鎖免疫グロブリン遺伝子由来の重鎖可変領域及び／または特定の生殖系列軽鎖免疫グロブリン遺伝子由来の軽鎖可変領域を含む。例えば、そのような抗体は、特定の生殖系列配列の「産物」または「由来」の重鎖もしくは軽鎖可変領域を含むヒト抗体を含むか、またはそれからなり得る。ヒト生殖系列免疫グロブリン配列の「産物」または「由来」のヒト抗体は、ヒト抗体のアミノ酸配列をヒト生殖系列免疫グロブリンのアミノ酸配列と比較し、ヒト抗体の配列に対して配列が最も近い（すなわち、最大同一性％）ヒト生殖系列免疫グロブリン配列を選択することによって、そのように特定することができる。特定のヒト生殖系列免疫グロブリン配列の「産物」または「由来」のヒト抗体は、例えば、自然発生する体細胞変異または部位特異的変異の意図的な導入により、生殖系列配列と比較したときにアミノ酸差異を含有し得る。しかしながら、ヒト化抗体は、典型的には、アミノ酸配列において、ヒト生殖系列免疫グロブリン遺伝子によりコードされるアミノ酸配列に対して少なくとも９０％同一であり、他の種の生殖系列免疫グロブリンアミノ酸配列（例えば、マウス生殖系列配列）と比較したときに、抗体がヒト配列由来であると特定するアミノ酸残基を含有する。ある特定の場合では、ヒト化抗体は、アミノ酸配列において、生殖系列免疫グロブリン遺伝子によりコードされるアミノ酸配列に対して少なくとも９５、９６、９７、９８、もしくは９９％、またはさらには少なくとも９６％、９７％、９８％、もしくは９９％同一であり得る。典型的には、特定のヒト生殖系列配列由来のヒト化抗体は、ヒト生殖系列免疫グロブリン遺伝子によりコードされるアミノ酸配列とは１０～２０個以下のアミノ酸差異を示す（任意の歪曲の導入前の、本明細書のｐＩ及び消去変異体、すなわち、本発明の変異体の導入前には、変異体の数が一般に低い）。ある特定の場合では、ヒト化抗体は、生殖系列免疫グロブリン遺伝子によりコードされるアミノ酸配列とは５個以下、またはさらには４、３、２、もしくは１個以下のアミノ酸差異を示し得る（同様に、任意の歪曲の導入前の、本明細書のｐＩ及び消去変異体、すなわち、本発明の変異体の導入前には、変異体の数が一般に低い）。
一実施形態では、親抗体は、親和性が成熟しており、当該技術分野で知られるとおりである。構造に基づく方法が、ヒト化及び親和性の成熟に用いられてもよく、例えば、ＵＳＳＮ１１／００４，５９０において記載されるとおりである。ヒト化及び／または抗体可変領域の親和性成熟のために、選択に基づく方法が用いられてもよく、限定されないが、Ｗｕ ｅｔ ａｌ．，１９９９，Ｊ．Ｍｏｌ．Ｂｉｏｌ．２９４：１５１－１６２、Ｂａｃａ ｅｔ ａｌ．，１９９７，Ｊ．Ｂｉｏｌ．Ｃｈｅｍ．２７２（１６）：１０６７８－１０６８４、Ｒｏｓｏｋ ｅｔ ａｌ．，１９９６，Ｊ．Ｂｉｏｌ．Ｃｈｅｍ．２７１（３７）：２２６１１－２２６１８、Ｒａｄｅｒ ｅｔ ａｌ．，１９９８，Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．ＵＳＡ ９５：８９１０－８９１５、Ｋｒａｕｓｓ ｅｔ ａｌ．，２００３，Ｐｒｏｔｅｉｎ Ｅｎｇｉｎｅｅｒｉｎｇ １６（１０）：７５３－７５９において説明される方法が含まれ、これらはすべて、参照により完全に組み込まれる。他のヒト化方法は、ＣＤＲの一部のみの移植を伴うものでもよく、限定されないが、ＵＳＳＮ０９／８１０，５１０、Ｔａｎ ｅｔ ａｌ．，２００２，Ｊ．Ｉｍｍｕｎｏｌ．１６９：１１１９－１１２５、Ｄｅ Ｐａｓｃａｌｉｓ ｅｔ ａｌ．，２００２，Ｊ．Ｉｍｍｕｎｏｌ．１６９：３０７６－３０８４に記載される方法が含まれ、これらはすべて、参照により完全に組み込まれる。
ＩＶ．ヘテロ二量体抗体
したがって、いくつかの実施形態では、本発明は、ヘテロ二量体抗体を形成するために自己組織化する２つの異なる重鎖変異体Ｆｃドメインの使用に依存するヘテロ二量体抗体を提供する。
本発明は、例えば、二重特異性結合を可能にするために、２つ以上の抗原またはリガンドへの結合を可能にするヘテロ二量体抗体を提供するための新規構築物を対象とする。ヘテロ二量体抗体構築物は、抗体の重鎖の２つのＦｃドメイン、例えば、「二量体」に組織化する２つの「単量体」の自己組織化の性質に基づく。ヘテロ二量体抗体は、以下により完全に論じられる各単量体のアミノ酸配列を変えることによって作製される。したがって、本発明は、一般に、いくつかの方法で、抗原を共捕捉することができるヘテロ二量体抗体の創出を対象とし、それぞれの鎖で異なる、定常領域のアミノ酸変異体に依存することで、ヘテロ二量体形成が促進され、かつ／またはホモ二量体よりもヘテロ二量体精製を容易にすることが可能となる。
したがって、本発明は、二重特異性抗体を提供する。抗体技術における進行中の問題は、２つの異なる抗原に同時に結合し、一般に、そのようにして、異なる抗原を近接させることを可能にし、新しい機能性及び新しい治療をもたらす「二重特異性」抗体が、所望されていることである。一般に、こうした抗体は、重鎖及び軽鎖それぞれの遺伝子を宿主細胞へと含めることによって作製される。これにより、一般に、所望のヘテロ二量体（Ａ－Ｂ）、ならびに２つのホモ二量体（Ａ－Ａ及びＢ－Ｂ（軽鎖ヘテロ二量体の問題を含まない））の形成がもたらされる。しかしながら、二重特異性抗体形成における主な障壁は、ヘテロ二量体抗体を精製してホモ二量体抗体を除去すること、及び／またはホモ二量体形成を上回るようにヘテロ二量体形成に偏らせることが困難であるということである。
本発明のヘテロ二量体を生成するために使用することができる機構がいくつか存在する。加えて、当業者によって理解されるように、こうした機構は、高いヘテロ二量体化を確実にするために組み合わせることができる。したがって、ヘテロ二量体の産生につながるアミノ酸変異体は、「ヘテロ二量体化変異体」と称される。以下に論じられるように、ヘテロ二量体化変異体は、立体変異体（例えば、以下に記載される「ノブアンドホール」または「歪曲」変異体、及び以下に記載される「電荷対」変異体）、及びヘテロ二量体を除去してホモ二量体の精製を可能にする「ｐＩ変異体」を含み得る。その全体が参照により本明細書に組み込まれるＷＯ２０１４／１４５８０６に一般に記載されるように、また具体的に「ヘテロ二量体化変異体」の議論について以下のように、ヘテロ二量体化の有用な機構には、「ノブアンドホール」（「ＫＩＨ」、時折、本明細書において「歪曲」変異体として（ＷＯ２０１４／１４５８０６の議論参照）、ＷＯ２０１４／１４５８０６に記載される「静電操縦」または「電荷対」、ＷＯ２０１４／１４５８０６に記載されるｐＩ変異体、及びＷＯ２０１４／１４５８０６及び以下に概要が記載される一般的な追加のＦｃ変異体が含まれる。
本発明において、ヘテロ二量体抗体の精製を容易にすることができるいくつかの基礎的な機構が存在する。すなわち、ｐＩ変異体の使用に依存し、その結果、単量体は、それぞれが異なるｐＩを有し、そうすることで、Ａ－Ａ、Ａ－Ｂ、及びＢ－Ｂ二量体タンパク質の等電点精製を可能にするものである。あるいは、「三重Ｆ」形式などのいくつかの骨格形式は、サイズに基づく分離も可能にする。以下にさらに概要が記載されるように、ヘテロ二量体形成が、ホモ二量体を上回るようにする「歪曲」も可能である。したがって、立体二量体化変異体、及びｐＩまたは電荷対変異体の組み合わせは、本発明において、特定の用途を見出す。
一般に、本発明において特に使用される実施形態は、歪曲変異体を含む変異体のセットに依存し、この変異体は、２つの単量体の間でｐＩ差異を増加させるｐＩ変異体と組み合わせて使用するホモ二量体化形成よりもヘテロ二量体化の形成を促す。
加えて、以下に、より完全に概要が記載されるように、ヘテロ二量体抗体の形式に応じて、ｐＩ変異体は、単量体の定常及び／またはＦｃドメイン内のいずれかに含有され得るか、あるいはドメインリンカーまたはｓｃＦｖリンカーのいずれかである荷電リンカーが使用され得る。すなわち、三重Ｆ形式などのｓｃＦｖ（複数可）を利用する骨格は、精製目的のため、さらなるｐＩの増大を与える荷電ｓｃＦｖリンカー（正か負のいずれか）を含むことができる。当業者により理解されるように、三重Ｆ形式によっては、荷電ｓｃＦｖリンカーのみを有し、追加のｐＩ調整無しでも有用であるが、本発明は、単量体のうちの１つまたは両方にあるｐＩ変異体、及び／または荷電ドメインリンカーも提供する。加えて、代替機能性のために操作する追加のアミノ酸はまた、Ｆｃ、ＦｃＲｎ、及びＫＯ変異体などのｐＩの変更も付与し得る。
ヘテロ二量体タンパク質の精製を可能にする分離機構としてｐＩを利用する本発明において、アミノ酸変異体は、単量体ポリペプチドのうちの１つまたは両方に導入され得る、すなわち、単量体（本明細書において、単純化のため「単量体Ａ」と称される）のうちの１つのｐＩが、単量体Ｂから離れるように操作され得るか、または単量体Ａ及びＢの両方の変更が変更され得、単量体ＡのｐＩは増加し、単量体ＢのｐＩは減少する。以下に、より完全に概要が記載されるように、単量体のいずれか、または両方のｐＩの変更は、荷電残基を除去もしくは追加（例えば、中性アミノ酸は、正もしくは負に荷電したアミノ酸残基によって、例えば、グリシンからグルタミン酸に置き換えられる）するか、荷電残基を正もしくは負から反対の電荷へと変更（アスパラギン酸からリジンへ）するか、または荷電残基を中性残基へと変更（例えば、リジンからセリンへの荷電の消失）することによって実施することができる。いくつかのこうした変異体が、図に示される。
したがって、本発明のこの実施形態は、単量体のうちの少なくとも１つにおいて、ｐＩの十分な変更の創出を提供し、その結果、ヘテロ二量体は、ホモ二量体から分離され得る。当業者により理解されるように、そして、以下にさらに論じられるように、これは、「野生型」重鎖定常領域と、そのｐＩが増加もしくは減少（ｗｔ Ａ－＋Ｂもしくはｗｔ Ａ－ －Ｂ）のいずれかとなるように操作された変異体領域と、を使用することによって、または一方の領域を増加し、もう一方の領域を減少させること（Ａ＋ －Ｂ－もしくはＡ－ Ｂ＋）によって実施され得る。
したがって、一般に、本発明のいくつかの実施形態の成分は、抗体の定常領域におけるアミノ酸変異体であり、このアミノ酸変異体は、アミノ酸置換（「ｐＩ変異体」または「ｐＩ置換」）を単量体のうちの１つまたは両方に組み込むことによって、「ｐＩ抗体」）を形成するために、二量体タンパク質の単量体の両方か、もし両方でない場合、少なくとも１つの等電点（ｐＩ）を変えることに向けられる。本明細書で示されるように、２つのホモ二量体からのヘテロ二量体の分離は、２つの単量体のｐＩが、わずか０．１ｐＨ単位でも異なれば達成することができ、０．２、０．３、０．４、及び０．５以上の差異は、すべて本発明において用途を見出す。
当業者により理解されるように、良好な分離を得るために単量体のそれぞれまたは両方に含まれるｐＩ変異体の数は、成分の出発ｐＩ、例えば、三重Ｆ形式で、対象のｓｃＦｖ及びＦａｂの出発ｐＩに依存する部分があるであろう。すなわち、どの単量体を操作するか、またはどの「方向」（例えば、より正、もしくはより負）にするかを決定するために、２つの標的抗原のＦｖ配列が計算され、そこから決定がなされる。当該技術分野で知られるように、異なるＦｖであれば、本発明で活用される異なる出発ｐＩを有する。一般に、本明細書に概要が記載されるように、ｐＩが操作されることにより、それぞれの単量体で、少なくとも約０．１ｌｏｇの総ｐＩ差異がもたらされ、本明細書に概要が記載されるように総ｐＩ差異は、０．２～０．５であることが好ましい。
さらに、当業者により理解され、本明細書に概要が記載されるように、いくつかの実施形態では、ヘテロ二量体は、サイズに基づいてホモ二量体から分離することができる。例えば図１に示されるように、形式のいくつかは、サイズに基づくヘテロ二量体及びホモ二量体の分離を可能にする。
ｐＩ変異体が、重鎖（複数可）の定常領域（複数可）を使用することによって、ヘテロ二量体化を達成するために使用される場合は、抗体を含む二重特異性タンパク質の設計及び精製に対する、よりモジュール型の手法が提供される。したがって、いくつかの実施形態では、ヘテロ二量体化変異体（歪曲及び精製ヘテロ二量体化変異体を含む）は、可変領域に含まれておらず、その結果、個々の抗体は、それぞれ操作されなければならない。加えて、いくつかの実施形態では、ｐＩ変異体からもたらされる免疫原性の可能性は、異なるＩｇＧアイソタイプ由来のｐＩ変異体を移入することによって、著しく低下し、その結果、ｐＩは、著しい免疫原性を導入することなく変更される。したがって、解決すべきさらなる問題は、ヒト配列含量が高い低ｐＩ定常ドメインの解明であり、例えば、任意の特定位置における非ヒト残基の最小化または回避である。
このｐＩ操作で起こり得る付帯利点は、血清半減期の延長及びＦｃＲｎ結合の増加でもある。すなわち、ＵＳＳＮ１３／１９４，９０４に記載されるように（参照によりその全体が組み込まれる）、抗体定常ドメイン（抗体及びＦｃ融合体においてみられるものを含む）のｐＩを下げることは、インビボにおける血清保持の長期化につながり得る。血清半減期の増加のための、こうしたｐＩ変異体によって、精製のためのｐＩの変更も促進される。
加えて、ホモ二量体が存在する場合に、排除、最小化、及び区別するいずれかの能力が顕著であるため、ヘテロ二量体化変異体のｐＩ変異体が、二重特異性抗体の分析論及び品質管理工程のための追加の利点をもたらすことに留意するべきである。同様に、ヘテロ二量体抗体産生の再現性を確実に試験する能力が重要である。
ヘテロ二量体化変異体
本発明は、ホモ二量体を除去してヘテロ二量体形成及び／または精製を可能にするためにヘテロ二量体変異体を利用する様々な形式のヘテロ二量体抗体を含む、ヘテロ二量体タンパク質を提供する。
いくつかの好適なヘテロ二量体化歪曲変異体のセットの対がある。これらの変異体は、「セット」の「対」で起こる。すなわち、対の一方のセットは、第１の単量体に組み込まれ、対のもう一方のセットは、第２の単量体に組み込まれる。これらのセットは、一方の単量体上の残基ともう一方の単量体上の残基との間の１対１の対応を有する「ノブインホール」変異体として必ずしも機能せず、すなわち、これらの対のセットは、ヘテロ二量体形成を促し、ホモ二量体形成を防止する２つの単量体の間で境界面を形成し、生物学的条件下で自発的に形成するヘテロ二量体のパーセンテージが、予想された５０％よりもむしろ９０％を超えることを可能にする（２５％のホモ二量体Ａ／Ａ：５０％のヘテロ二量体Ａ／Ｂ：２５％のホモ二量体Ｂ／Ｂ）ことに留意するべきである。
立体変異体
いくつかの実施形態では、ヘテロ二量体の形成は、立体変異体の追加によって促進され得る。すなわち、それぞれの重鎖におけるアミノ酸を変更することによって、同一Ｆｃアミノ酸配列を有するホモ二量体の形成と比較して、異なる重鎖が、会合してヘテロ二量体構造を形成する可能性が高くなる。好適な立体変異体は、図１０に含まれる。
１つの機構は、当該技術分野において、「ノブアンドホール」と一般に称されるものであり、立体的な影響を創出し、ヘテロ二量体形成に有利に働き、ホモ二量体形成を抑制するアミノ酸操作を指し、任意選択で使用することもできる。これは、「ノブアンドホール」と称されることがあり、ＵＳＳＮ６１／５９６，８４６，Ｒｉｄｇｗａｙ ｅｔ ａｌ．，Ｐｒｏｔｅｉｎ Ｅｎｇｉｎｅｅｒｉｎｇ ９（７）：６１７（１９９６）、Ａｔｗｅｌｌ ｅｔ ａｌ．，Ｊ．Ｍｏｌ．Ｂｉｏｌ．１９９７ ２７０：２６、米国特許第８，２１６，８０５号に記載されるとおりであり、これらはすべて、参照によりその全体が本明細書に組み込まれる。図によっていくつかの「ノブアンドホール」に依存する「単量体Ａ－単量体Ｂ」の対が特定されている。加えて、Ｍｅｒｃｈａｎｔ ｅｔ ａｌ．，Ｎａｔｕｒｅ Ｂｉｏｔｅｃｈ．１６：６７７（１９９８）に記載されるように、こうした「ノブアンドホール」変異は、ジスルフィド結合と組み合わせて、形成をヘテロ二量体化へと歪曲することができる。
ヘテロ二量体の生成に用途を見出すさらなる機構は、「静電操縦」と称されることがあり、Ｇｕｎａｓｅｋａｒａｎ ｅｔ ａｌ．，Ｊ．Ｂｉｏｌ．Ｃｈｅｍ．２８５（２５）：１９６３７（２０１０）に記載されるとおりであり、参照によりその全体が本明細書に組み込まれる。これは、本明細書で「電荷対」と称されることがある。この実施形態では、静電気が、形成をヘテロ二量体化へと歪曲するために使用される。当業者であれば、これらは、ｐＩに対しても効果を有し得、そうすることで、精製に対しても効果を有し得、したがって、場合によっては、ｐＩ変異体であり得るとも考えられることを理解するであろう。しかしながら、これらは、ヘテロ二量体化を押し進めるために生成され、精製手段としては使用されなかったため、それらは、「立体変異体」として分類される。これらには、限定されないが、Ｄ２２１Ｒ／Ｐ２２８Ｒ／Ｋ４０９Ｒと対であるＤ２２１Ｅ／Ｐ２２８Ｅ／Ｌ３６８Ｅ（例えば、これらは、「単量体が対応するセットである）及びＣ２２０Ｒ／Ｅ２２４Ｒ／Ｐ２２８Ｒ／Ｋ４０９Ｒと対であるＣ２２０Ｅ／Ｐ２２８Ｅ／３６８Ｅが含まれる。
追加の単量体Ａ及び単量体Ｂ変異体を、本明細書に概要が記載されるｐＩ変異体、またはＵＳ２０１２／０１４９８７６の図３７に示される他の立体変異体などの他の変異体と、任意選択かつ独立して、任意の量で、組み合わせることができる。この特許文献の図及び説明文ならびに配列番号は、参照により本明細書に明確に組み込まれる。
いくつかの実施形態では、本明細書に概要が記載される立体変異体を、任意のｐＩ変異体（またはＦｃ変異体、ＦｃＲｎ変異体などの他の変異体）と共に１つまたは両方の単量体に、任意選択かつ独立して、組み込むことができ、本発明のタンパク質を独立かつ任意選択で含む、またはそれから除外することができる。
好適な歪曲変異体の一覧は、図１０にみられ、併せて図１５は、多くの実施形態における特定の有用性のいくつかの対を示す。多くの実施形態における特定用途には、限定されないが、を含むセットの対である、特に好ましい立体変異体対には、限定されないが、Ｌ３６８Ｄ／Ｋ３７０Ｓ：Ｓ３６４Ｋ、Ｌ３６８Ｅ／Ｋ３７０Ｓ：Ｓ３６４Ｋ、Ｔ４１１Ｅ／Ｋ３６０Ｅ／Ｑ３６２Ｅ：Ｄ４０１Ｋ、Ｌ３６８Ｄ／Ｋ３７０Ｓ：Ｓ３６４Ｋ／Ｅ３５７Ｌ、Ｋ３７０Ｓ：Ｓ３６４Ｋ／Ｅ３５７Ｑ、及びＳ３６４Ｋ／Ｅ３５７Ｑ：Ｌ３６８Ｄ／Ｋ３７０Ｓが含まれる。命名法の点から、対「Ｓ３６４Ｋ／Ｅ３５７Ｑ：Ｌ３６８Ｄ／Ｋ３７０Ｓ」は、単量体の一方が二重変異体セットＳ３６４Ｋ／Ｅ３５７Ｑを有し、もう一方が二重変異体セットＬ３６８Ｄ／Ｋ３７０Ｓを有することを意味する。
ヘテロ二量体のｐＩ（等電点）変異体
一般に、当業者に理解されるように、ｐＩ変異体には２つの一般的なカテゴリー：タンパク質のｐＩを増加させるもの（塩基性の変更）、及びタンパク質のｐＩを減少させるもの（酸性の変更）が存在する。本明細書に記載されるように、これらの変異体の組み合わせはすべて実施することができる、すなわち、一方の単量体が、野生型、または野生型と顕著に異なるｐＩを示さない変異体であり得、他方は、より塩基性、またはより酸性であり得る。あるいは、それぞれの単量体が、１つは、より塩基性へ、１つは、より酸性へと変更される。
ｐＩ変異体の好ましい組み合わせは図１１に示される。本明細書に概要が記載され、図に示されるように、こうした変更は、ＩｇＧ１に対して示されるが、すべてのアイソタイプ及びアイソタイプハイブリッドを、このように変えることができる。重鎖定常ドメインが、ＩｇＧ２～４由来である場合は、Ｒ１３３Ｅ及びＲ１３３Ｑも使用することができる。
一実施形態では、例えば、ボトルオープナー形式において、ｐＩ変異体の好ましい組み合わせは、２０８Ｄ／２９５Ｅ／３８４Ｄ／４１８Ｅ／４２１Ｄ変異体（ヒトＩｇＧ１に対するときは、Ｎ２０８Ｄ／Ｑ２９５Ｅ／Ｎ３８４Ｄ／Ｑ４１８Ｅ／Ｎ４２１Ｄ）を含む１つの単量体（負のＦａｂ側）、及び（ＧＫＰＧＳ）４を含む正に荷電したｓｃＦｖリンカーを含む第２の単量体（正のｓｃＦｖ側）を有する。しかしながら、当業者に理解されるように、第１の単量体は、位置２０８を含む、ＣＨ１ドメインを含む。したがって、ＣＨ１ドメインを含まない構築物において（例えば、二重ｓｃＦｖ形式において、例えば、ドメインのうちの１つにＣＨ１ドメインを利用しないヘテロ二量体Ｆｃ融合タンパク質に関して）、好ましい負のｐＩ変異体Ｆｃセットは、２９５Ｅ／３８４Ｄ／４１８Ｅ／４２１Ｄ変異体（ヒトＩｇＧ１に対するときは、Ｑ２９５Ｅ／Ｎ３８４Ｄ／Ｑ４１８Ｅ／Ｎ４２１Ｄ）を含む。
抗体ヘテロ二量体軽鎖変異体
抗体に基づくヘテロ二量体の場合では、例えば、単量体のうちの少なくとも１つが、重鎖ドメインに加えて軽鎖を含む場合、ｐＩ変異体を軽鎖に作ることもできる。軽鎖のｐＩを低下させるためのアミノ酸置換には、限定されないが、Ｋ１２６Ｅ、Ｋ１２６Ｑ、Ｋ１４５Ｅ、Ｋ１４５Ｑ、Ｎ１５２Ｄ、Ｓ１５６Ｅ、Ｋ１６９Ｅ、Ｓ２０２Ｅ、Ｋ２０７Ｅ、及び軽鎖のＣ末端におけるペプチドＤＥＤＥの追加が含まれる。定常ラムダ軽鎖に基づくこのカテゴリーにおける変更には、Ｒ１０８Ｑ、Ｑ１２４Ｅ、Ｋ１２６Ｑ、Ｎ１３８Ｄ、Ｋ１４５Ｔ、及びＱ１９９Ｅでの１つ以上の置換が含まれる。加えて、軽鎖のｐＩの増加も可能である。
アイソタイプ変異体
加えて、本発明の多くの実施形態が、１つのＩｇＧアイソタイプから別のものへの、特定位置でのｐＩアミノ酸の「取り込み」に依存しており、したがって、変異体へ導入される不要な免疫原性の可能性を低下または除去している。これらのいくつかは、米国公開第２０１４／０３７００１３号の図２１に示され、参照により本明細書に組み込まれる。すなわち、ＩｇＧ１は、高いエフェクター機能を含む様々な理由のため、治療用抗体のための共通のアイソタイプである。しかしながら、ＩｇＧ１の重定常領域は、ＩｇＧ２よりも高いｐＩを有する（８．１０対７．３１）。特定位置で、ＩｇＧ２残基を、ＩｇＧ１主鎖へ導入することによって、得られる単量体のｐＩは低下（または増加）し、付加的に血清半減期の長期化を示す。例えば、ＩｇＧ１は、位置１３７にグリシン（ｐＩ５．９７）を有し、ＩｇＧ２は、グルタミン酸（ｐＩ３．２２）を有する。つまり、グルタミン酸の取り込みは、得られるタンパク質のｐＩに影響を与える。以下に記載されるように、いくつかのアミノ酸置換は、一般に、変異体抗体のｐＩに顕著な影響を与えることが必要とされている。しかしながら、以下に論じられるように、ＩｇＧ２分子における変更でさえ、血清半減期の増加を可能にすることに留意するべきである。
他の実施形態では、以下にさらに記載されるように、得られるタンパク質の全体の電荷状態を低下（例えば、より高いｐＩアミノ酸を、より低いｐＩアミノ酸へと変更することによって）させるか、または安定のための構造の適応を可能にするなどのいずれかのために、非アイソタイプアミノ酸の変更が行われる。
加えて、重及び軽定常ドメインの両方のｐＩ操作によって、ヘテロ二量体のそれぞれの単量体において、顕著な変化をみることができる。本明細書で論じられるように、２つの単量体のｐＩを少なくとも０．５異なるようにすることで、イオン交換クロマトグラフィーもしくは等電点電気泳動、または等電点感受性の他の方法によっての分離が可能になる。
ｐＩの計算
それぞれの単量体のｐＩは、変異体重鎖定常ドメイン及び融合パートナーを含む、変異体重鎖定常ドメイン及び総単量体のｐＩに依存し得る。したがって、いくつかの実施形態では、米国公開第２０１４／０３７００１３号の図１９中のチャートを使用して、変異体重鎖定常ドメインに基づいて、ｐＩの変化が計算される。本明細書で論じられるように、どの単量体を操作するかは、一般に、Ｆｖ及び骨格領域の固有ｐＩによって決定される。あるいは、それぞれの単量体のｐＩを、比較することができる。
より良好なＦｃＲｎインビボ結合も付与するｐＩ変異体
ｐＩ変異体が、単量体のｐＩを減少させる場合、インビボにおける血清保持の改善という利点が追加され得る。
未だ試験中であるが、Ｆｃ領域は、インビボにおいてより長い半減期を有すると考えられ、これは、エンドソームにおける、ｐＨ６でのＦｃＲｎに対する結合が、Ｆｃを隔離するためである（Ｇｈｅｔｉｅ ａｎｄ Ｗａｒｄ，１９９７ Ｉｍｍｕｎｏｌ Ｔｏｄａｙ．１８（１２）：５９２－５９８、参照により完全に組み込まれる）。その後、エンドソームの区画は、細胞表面へとＦｃを再循環させる。区画が、より高いｐＨである約７．４の細胞外空間へと一旦開くと、Ｆｃの放出が誘導され、血液へ戻る。マウスにおいて、Ｄａｌｌ’Ａｃｑｕａらは、ｐＨ６及びｐＨ７．４でのＦｃＲｎ結合が増加したＦｃ変異型（Ｆｃ ｍｕｔａｎｔ）が、実際は、血清濃度を低下させ、野生型Ｆｃと同じ半減期を有することを示した（Ｄａｌｌ’Ａｃｑｕａ ｅｔ ａｌ．２００２，Ｊ．Ｉｍｍｕｎｏｌ．１６９：５１７１－５１８０、参照により完全に組み込まれる）。ｐＨ７．４でのＦｃＲｎに対するＦｃの親和性の増加は、Ｆｃが放出されて血流へ戻ることを妨げると考えられる。それ故に、インビボにおけるＦｃの半減期を増加させるＦｃ変異は、より高いｐＨでのＦｃの放出を、可能なままにしつつ、より低いｐＨでＦｃＲｎ結合を理想的に増加させる。アミノ酸であるヒスチジンは、６．０～７．４のｐＨ範囲でその電荷状態が変化する。したがって、Ｈｉｓ残基が、Ｆｃ／ＦｃＲｎ複合体において、重要な位置を占めるという発見は、驚くべきことではない。
最近、より低い等電点を有する可変領域を有する抗体が、より長い血清半減期も有し得ることが示唆された（Ｉｇａｗａ ｅｔ ａｌ．，２０１０ ＰＥＤＳ．２３（５）：３８５－３９２、参照により完全に組み込まれる）。しかしながら、この機構の理解は、依然として不十分である。その上、可変領域は、抗体毎に異なる。本明細書に記載されるように、ｐＩを低下させ、半減期を延長する定常領域変異体は、抗体の薬物動態特性の改善に対する、よりモジュール型の手法を提供するであろう。
追加の機能性のための追加のＦｃ変異体
ｐＩアミノ酸変異体に加えて、様々な理由から実施することのできる、いくつかの有用なＦｃアミノ酸改変が存在し、限定されないが、１つ以上のＦｃγＲ受容体に対する結合の変更、ＦｃＲｎ受容体に対する結合の変更などが含まれる。
したがって、本発明のタンパク質は、アミノ酸改変を含むことができ、アミノ酸改変には、ｐＩ変異体及び立体変異体を含む、本明細書に概要が記載されるヘテロ二量体化変異体が含まれる。変異体の各セットは、任意の特定のヘテロ二量体タンパク質を独立かつ任意選択で含むか、またはそれから除外することができる。
ＦｃγＲ変異体
したがって、ＦｃγＲ受容体のうちの１つ以上に対する結合を変えるために作製することができるいくつかの有用なＦｃ置換が存在する。結合の増加及び結合の減少をもたらす置換が有用であり得る。例えば、ＦｃγＲＩＩＩａに対する結合の増加は、一般に、ＡＤＣＣ（抗体依存性細胞媒介細胞傷害性。これは、細胞が媒介する反応であって、ＦｃγＲを発現する非特異性である細胞傷害性の細胞が、標的細胞上の結合した抗体を認識し、その後に標的細胞の溶解を引き起こす反応である）の増加をもたらすことが知られている。同様に、ＦｃγＲＩＩｂ（抑制性受容体）に対する結合の減少も、状況によっては、有益であり得る。本発明において用途を見出すアミノ酸置換には、ＵＳＳＮ１１／１２４，６２０（特に図４１）、１１／１７４，２８７、１１／３９６，４９５、１１／５３８，４０６において記載されるものが含まれ、これらはすべて参照によりその全体、及び特に、そこで開示される変異体に関して明確に本明細書に組み込まれる。用途を見出す特定の変異体には、限定されないが、２３６Ａ、２３９Ｄ、２３９Ｅ、３３２Ｅ、３３２Ｄ、２３９Ｄ／３３２Ｅ、２６７Ｄ、２６７Ｅ、３２８Ｆ、２６７Ｅ／３２８Ｆ、２３６Ａ／３３２Ｅ、２３９Ｄ／３３２Ｅ／３３０Ｙ、２３９Ｄ、３３２Ｅ／３３０Ｌ、２４３Ａ、２４３Ｌ、２６４Ａ、２６４Ｖ、及び２９９Ｔが含まれる。
加えて、ＵＳＳＮ１２／３４１，７６９（その全体が参照により本明細書に組み込まれる）において具体的に開示されるように、ＦｃＲｎ受容体に対する結合の増加、及び血清半減期の増加において用途を見出す追加のＦｃ置換が存在し、限定されないが、４３４Ｓ、４３４Ａ、４２８Ｌ、３０８Ｆ、２５９Ｉ、４２８Ｌ／４３４Ｓ、２５９Ｉ／３０８Ｆ、４３６Ｉ／４２８Ｌ、４３６Ｉ、またはＶ／４３４Ｓ、４３６Ｖ／４２８Ｌ、及び２５９Ｉ／３０８Ｆ／４２８Ｌが含まれる。
消去変異体
同様に、機能性変異体の別のカテゴリーは、「ＦｃγＲ消去変異体」または「Ｆｃノックアウト（ＦｃＫＯもしくはＫＯ）」変異体である。こうした実施形態では、いくつかの治療用途のため、Ｆｃγ受容体（例えば、ＦｃγＲ１、ＦｃγＲＩＩａ、ＦｃγＲＩＩｂ、ＦｃγＲＩＩＩａなど）のうちの１つ以上またはすべてに対するＦｃドメインの通常の結合を低下または除去して、作用の付加的な機構を回避することが望ましい。すなわち、例えば、多くの実施形態では、特にＣＤ３を一価で結合する二重特異性抗体の使用において、ＦｃγＲＩＩＩａ結合を消去して、ＡＤＣＣ活性を排除、または著しく低下させることが一般に望ましい。Ｆｃドメインのうちの１つは、１つ以上のＦｃγ受容体消去変異体を含む。これらの消去変異体は、図１２に示され、それぞれは、Ｇ２３６Ｒ／Ｌ３２８Ｒ、Ｅ２３３Ｐ／Ｌ２３４Ｖ／Ｌ２３５Ａ／Ｇ２３６ｄｅｌ／Ｓ２３９Ｋ、Ｅ２３３Ｐ／Ｌ２３４Ｖ／Ｌ２３５Ａ／Ｇ２３６ｄｅｌ／Ｓ２６７Ｋ、Ｅ２３３Ｐ／Ｌ２３４Ｖ／Ｌ２３５Ａ／Ｇ２３６ｄｅｌ／Ｓ２３９Ｋ／Ａ３２７Ｇ、Ｅ２３３Ｐ／Ｌ２３４Ｖ／Ｌ２３５Ａ／Ｇ２３６ｄｅｌ／Ｓ２６７Ｋ／Ａ３２７Ｇ、及びＥ２３３Ｐ／Ｌ２３４Ｖ／Ｌ２３５Ａ／Ｇ２３６ｄｅｌからなる群から選択される消去変異体を利用する好ましい態様と共に独立かつ任意選択で含むか、または除外することができる。本明細書において参照される消去変異体が、一般に、ＦｃＲｎ結合ではなくＦｃγＲ結合を消去することに留意するべきである。
ヘテロ二量体及びＦｃ変異体の組み合わせ
当業者により理解されるように、列挙されるヘテロ二量体化変異体（歪曲及び／またはｐＩ変異体を含む）のすべては、その「鎖性」または「単量体区分（ｍｏｎｏｍｅｒ ｐａｒｔｉｔｉｏｎ）」が保持される限り、任意選択かつ独立して、任意の方法で組み合わせることができる。加えて、これらの変異体のすべてが、ヘテロ二量体化形式のいずれかに組み入れることができる。
ｐＩ変異体の場合、特定用途を見出す実施形態は、図に示されているが、精製を促進するために２つの単量体間のｐＩ差異を変える基礎的な規則に従って、他の組み合わせを生成することができる。
加えて、ヘテロ二量体化変異体、歪曲、及びｐＩのうちのいずれかはまた、一般に本明細書に概要が記載されるように、Ｆｃ消去変異体、Ｆｃ変異体、ＦｃＲｎ変異体と独立かつ任意選択で組み合わせられる。
本発明の有用な形式
当業者によって理解され、以下により完全に論じられるように、本発明のヘテロ二量体融合タンパク質は、一般に、図１に示されるように、幅広い種類の立体配置をとることができる。いくつかの図は、分子の一方の「アーム」上に１種類の特異性、及びもう一方の「アーム」上に異なる特異性がある「シングルエンド化（ｓｉｎｇｌｅ ｅｎｄｅｄ）」立体配置を示す。他の図は、分子の「上部」に少なくとも１種類の特異性、及び分子の「下部」に１つ以上の異なる特異性がある「二重エンド化（ｄｕａｌ ｅｎｄｅｄ）」立体配置を示す。したがって、本発明は、異なる第１及び第２の抗原を共捕捉する新規の免疫グロブリン組成物を対象とする。
当業者により理解されるように、本発明のヘテロ二量体形式は、異なる原子価を有し、かつ二重特異性であり得る。すなわち、本発明のヘテロ二量体抗体は、二価かつ二重特異性であってもよく、ＣＤ３が、１つの結合ドメインによって結合され、ＰＳＭＡが、第２の結合ドメインによって結合される。ヘテロ二量体抗体はまた、三価かつ二重特異性であってもよく、ＰＳＭＡが、２つの結合ドメインによって結合され、ＣＤ３が、第２の結合ドメインによって結合される。本明細書に概要が記載されるように、潜在的な副作用を減少させるために、ＣＤ３が一価のみで結合されることが好ましい。
本発明は、抗ＣＤ３抗原結合ドメイン及び抗ＰＳＭＡ抗原結合ドメインを利用する。当業者により理解されるように、図のいずれか（特に図２～７、及び２１を参照されたい）に示される抗ＣＤ３ ＣＤＲ、抗ＣＤ３可変軽及び可変重ドメイン、Ｆａｂ、及びｓｃＦｖのいずれの集合を使用することができる。
いくつかの実施形態では、対象抗体は、抗ＣＤ３ Ｈ１．３０＿Ｌ１．４７（図２）の可変軽及び可変重ドメインを含む抗ＣＤ３抗原結合ドメインを含む。いくつかの実施形態では、対象抗体は、抗ＣＤ３ Ｈ１．３０＿Ｌ１．４７（図２）のｖｈＣＤＲ１～３及びｖｌＣＤＲ１～３を含む抗ＣＤ３抗原結合ドメインを含む。いくつかの実施形態では、対象抗体は、抗ＣＤ３ ＿Ｈ１．３０＿Ｌ１．４７ ｓｃＦｖ（図２）を含む。
いくつかの実施形態では、対象抗体は、抗ＣＤ３ Ｈ１．３２＿Ｌ１．４７（図３）の可変軽及び可変重ドメインを含む抗ＣＤ３抗原結合ドメインを含む。いくつかの実施形態では、対象抗体は、抗ＣＤ３ Ｈ１．３２＿Ｌ１．４７（図３）のｖｈＣＤＲ１～３及びｖｌＣＤＲ１～３を含む抗ＣＤ３抗原結合ドメインを含む。いくつかの実施形態では、対象抗体は、抗ＣＤ３ Ｈ１．３２＿Ｌ１．４７ ｓｃＦｖ（図３）を含む。
いくつかの実施形態では、対象抗体は、抗ＣＤ３ Ｈ１．８９＿Ｌ１．４７（図４）の可変軽及び可変重ドメインを含む抗ＣＤ３抗原結合ドメインを含む。いくつかの実施形態では、対象抗体は、抗ＣＤ３ Ｈ１．８９＿Ｌ１．４７（図４）のｖｈＣＤＲ１～３及びｖｌＣＤＲ１～３を含む抗ＣＤ３抗原結合ドメインを含む。いくつかの実施形態では、対象抗体は、抗ＣＤ３ Ｈ１．８９＿Ｌ１．４７ ｓｃＦｖ（図４）を含む。
いくつかの実施形態では、対象抗体は、抗ＣＤ３ Ｈ１．９０＿Ｌ１．４７（図５）の可変軽及び可変重ドメインを含む抗ＣＤ３抗原結合ドメインを含む。いくつかの実施形態では、対象抗体は、抗ＣＤ３ Ｈ１．９０＿Ｌ１．４７（図５）のｖｈＣＤＲ１～３及びｖｌＣＤＲ１～３を含む抗ＣＤ３抗原結合ドメインを含む。いくつかの実施形態では、対象抗体は、抗ＣＤ３ Ｈ１．９０＿Ｌ１．４７ ｓｃＦｖ（図５）を含む。
いくつかの実施形態では、対象抗体は、抗ＣＤ３ Ｈ１．３３＿Ｌ１．４７（図６）の可変軽及び可変重ドメインを含む抗ＣＤ３抗原結合ドメインを含む。いくつかの実施形態では、対象抗体は、抗ＣＤ３ Ｈ１．３３＿Ｌ１．４７（図６）のｖｈＣＤＲ１～３及びｖｌＣＤＲ１～３を含む抗ＣＤ３抗原結合ドメインを含む。いくつかの実施形態では、対象抗体は、抗ＣＤ３ Ｈ１．３３＿Ｌ１．４７ ｓｃＦｖ（図６）を含む。
いくつかの実施形態では、対象抗体は、抗ＣＤ３ Ｈ１．３１＿Ｌ１．４７（図７）の可変軽及び可変重ドメインを含む抗ＣＤ３抗原結合ドメインを含む。いくつかの実施形態では、対象抗体は、抗ＣＤ３ Ｈ１．３１＿Ｌ１．４７（図７）のｖｈＣＤＲ１～３及びｖｌＣＤＲ１～３を含む抗ＣＤ３抗原結合ドメインを含む。いくつかの実施形態では、対象抗体は、抗ＣＤ３ Ｈ１．３１＿Ｌ１．４７ ｓｃＦｖ（図７）を含む。
同様に、図８及び２０に示される抗ＰＳＭＡ ＣＤＲ、抗ＰＳＭＡ可変軽及び可変重ドメイン、Ｆａｂ、及びｓｃＦｖにかかわらず、抗ＰＳＭＡ抗原結合ドメインのいずれかが、使用され、任意の組み合わせで任意選択かつ独立して組み合わされ得る。いくつかの実施形態では、対象抗体は、抗ＰＳＭＡ Ｊ５９１ Ｈ１＿Ｌ１（図２０）の可変軽及び可変重ドメインを含む抗ＰＳＭＡ抗原結合ドメインを含む。いくつかの実施形態では、対象抗体は、抗ＰＳＭＡ Ｊ５９１ Ｈ１＿Ｌ１（図２０）のｖｈＣＤＲ１～３及びｖｌＣＤＲ１～３を含む抗ＰＳＭＡ抗原結合ドメインを含む。いくつかの実施形態では、対象抗体は、抗ＰＳＭＡ Ｊ５９１ Ｈ１＿Ｌ１（図２０）の可変軽及び可変重ドメインまたはｖｈＣＤＲ１～３及びｖｌＣＤＲ１～３を有する抗ＰＳＭＡ Ｊ５９１ Ｈ１＿Ｌ１ ｓｃＦｖを含む。
ボトルオープナー形式
本発明において特に用途が見出される１つのヘテロ二量体骨格は、「三重Ｆ」または図１Ａに示される「ボトルオープナー」骨格形式である。この実施形態では、抗体の一方の重鎖は、単鎖Ｆｖ（以下に定義される「ｓｃＦｖ」）を含み、もう一方の重鎖は、「定型的な（ｒｅｇｕｌａｒ）」ＦＡｂ形式であって、可変重鎖及び軽鎖を含む。この構造は、本明細書において「三重Ｆ」形式（ｓｃＦｖ－ＦＡｂ－Ｆｃ）、またはボトルオープナーにおおよそ視覚的に類似している（図１を参照されたい）ことから「ボトルオープナー」形式と称されることがある。以下により完全に記載されるように、２つの鎖は、ヘテロ二量体抗体の形成を促進する定常領域（例えば、Ｆｃドメイン、ＣＨ１ドメイン、及び／またはヒンジ領域）において、アミノ酸変異体を使用することによって一緒にまとめられている。
本発明の「三重Ｆ」形式には、いくつかの明確に異なる利点が存在する。当該技術分野で知られるとおり、２つのｓｃＦｖ構築物に依存する抗体類似体は、安定性及び凝集の問題を有することが多いが、本発明においては、「定型的な」重鎖及び軽鎖の対を追加することによって、こうした問題を軽減することができる。加えて、２つの重鎖及び２つの軽鎖に依存する形式とは対照的に、重鎖及び軽鎖が、不正確に対になる（例えば、重１が、軽２と対になるなど）という問題は存在しない。
本明細書に概要が記載される実施形態の多くは、一般に、ｓｃＦｖを含む第１の単量体を含むボトルオープナー形式に依存し、このｓｃＦｖは、ｓｃＦｖリンカー（多くの実施例において荷電）を使用して共有結合される可変重及び可変軽ドメインを含み、ｓｃＦｖは、ドメインリンカー（本明細書に概要が記載されるように、非荷電または荷電のいずれかであり得る）を通常介して、第１のＦｃドメインのＮ末端に共有結合される。ボトルオープナー形式の第２の単量体は重鎖であり、組成物は、軽鎖をさらに含む。
一般に、多くの好ましい実施形態では、ｓｃＦｖは、ＰＳＭＡに結合する重及び軽鎖のＦａｂを用いて、ＣＤ３に結合するドメインである。加えて、本発明のＦｃドメインは、一般に、歪曲変異体（例えば、Ｓ３６４Ｋ／Ｅ３５７Ｑ：Ｌ３６８Ｄ／Ｋ３７０Ｓ、Ｌ３６８Ｄ／Ｋ３７０Ｓ：Ｓ３６４Ｋ、Ｌ３６８Ｅ／Ｋ３７０Ｓ：Ｓ３６４Ｋ、Ｔ４１１Ｔ／Ｅ３６０Ｅ／Ｑ３６２Ｅ：Ｄ４０１Ｋ、Ｌ３６８Ｄ／Ｋ３７０Ｓ：Ｓ３６４Ｋ／Ｅ３５７Ｌ、及びＫ３７０Ｓ：Ｓ３６４Ｋ／Ｅ３５７Ｑからなる群から選択される特に有用な歪曲変異体を有する図１０及び１５に示されるアミノ酸置換のセット）、任意選択で消去変異体を含み、重鎖は、ｐＩ変異体を含む。
いくつかの実施形態では、本明細書に示されるｖｈ及びｖｌ配列のいずれか（図に示されるすべての抗ＰＳＭＡ及び抗ＣＤ３ｖｈ及びｖｌ配列、ならびに関連するＣＤＲ配列を含む）が、図に示される抗ＣＤ３ ｓｃＦｖ配列のいずれかを使用して、「Ｆａｂ側」として、図２５のボトルオープナー主鎖形式に付加され得る。これらの実施形態において特に用途を見出す抗ＣＤ３配列は、図２５に示される主鎖のｓｃＦｖ側として結合される、抗ＣＤ３ Ｈ１．３０＿Ｌ１．４７、抗ＣＤ３ Ｈ１．３２＿Ｌ１．４７、抗ＣＤ３ Ｈ１．８９＿Ｌ１．４７、抗ＣＤ３ Ｈ１．９０＿Ｌ１．４７、抗ＣＤ３ Ｈ１．３３＿Ｌ１．４７、及び抗ＣＤ３ Ｈ１．３１＿Ｌ１．４７（それぞれ、図２～７に示される、ｖｈ、ｖｌ、及びＣＤＲ配列）である。
本発明は、抗ＣＤ３ ｓｃＦｖ配列が図２～７及び図２１に示される（図２５の主鎖形式との任意の組み合わせを含む）、ボトルオープナー形式を提供する。加えて、図２～７及び２１に示される抗ＣＤ３ ｖｈ、ｖｌ、及びＣＤＲ配列のいずれかがＦａｂ側として使用され得る。
本発明は、ボトルオープナー形式を提供し、抗ＰＳＭＡ配列は、図８及び２０に示されるとおりである。上記と同様に、それぞれの抗ＰＳＭＡ ｖｈ、ｖｌ、及び関連するＣＤＲ配列は、Ｆａｂ側またはｓｃＦｖ側のいずれかであってもよく、図２５のものを含む、ボトルオープナー形式の抗原結合ドメインのうちの１つとして連結され得る。抗ＰＳＭＡ配列がＦａｂ側である場合、図に記載される任意の抗ＣＤ３ ｓｃＦｖ配列、ならびに関連するｖｈ、ｖｌ、及びＣＤＲ配列を使用することができ、特に、図２５に示される主鎖のｓｃＦｖ側として結合される、抗ＣＤ３ Ｈ１．３０＿Ｌ１．４７、抗ＣＤ３ Ｈ１．３２＿Ｌ１．４７、抗ＣＤ３ Ｈ１．８９＿Ｌ１．４７、抗ＣＤ３ Ｈ１．９０＿Ｌ１．４７、抗ＣＤ３ Ｈ１．３３＿Ｌ１．４７、及び抗ＣＤ３ Ｈ１．３１＿Ｌ１．４７を含む。
いくつかの実施形態では、対象抗体は、図２１Ｅに示されるＦａｂ－Ｆｃ重鎖骨格、ｓｃＦｖ－Ｆｃ重鎖骨格、及び軽鎖骨格を有するボトルオープナー形式抗体である。限定されないが、本明細書に記載の可変重ドメインのいずれかを含む任意の可変重ドメインは、図２１Ｅに記載のＦａｂ－Ｆｃ重鎖骨格に作動可能に連結され得る。限定されないが、本明細書に記載の可変軽ドメインのいずれかを含む任意の可変軽ドメインは、図２１Ｅに記載の軽鎖骨格に作動可能に連結され得る。
いくつかの実施形態では、それぞれ、Ｆａｂ－Ｆｃ重鎖骨格及び軽鎖骨格（図２１Ｅ）に作動可能に連結される可変重ドメイン及び可変軽ドメインは、抗ＰＳＭＡ結合ドメインの可変重及び軽ドメインである。いくつかの実施形態では、可変重ドメイン及び可変軽ドメインは、抗ＰＳＭＡ Ｊ５９１ Ｈ１＿Ｌ１（図２０）の可変軽及び可変重ドメインを含む。いくつかの実施形態では、可変重ドメインは、Ｊ５９１ Ｈ１＿Ｌ１（図２０）のｖｈＣＤＲ１～３を含み、可変軽ドメインは、Ｊ５９１ Ｈ１＿Ｌ１（図２０）のｖｌＣＤＲ１～３を含む。
いくつかの実施形態では、それぞれ、Ｆａｂ－Ｆｃ重鎖骨格及び軽鎖骨格（図２１Ｅ）に作動可能に連結される可変重ドメイン及び可変軽ドメインは、抗ＣＤ３結合ドメインの可変重及び軽ドメインである。いくつかの実施形態では、可変重ドメイン及び可変軽ドメインは、抗ＣＤ３ Ｈ１．３０＿Ｌ１．４７（図２）、抗ＣＤ３ Ｈ１．３２＿Ｌ１．４７（図３）、抗ＣＤ３ Ｈ１．８９＿Ｌ１．４７（図４）、Ｈ１．９０＿Ｌ１．４７（図５）、Ｈ１．３３＿Ｌ１．４７（図６）、またはＨ１．３１＿Ｌ１．４７（図７）の可変軽及び可変重ドメインを含む。いくつかの実施形態では、それぞれ、可変重ドメインは、ＣＤ３ Ｈ１．３０＿Ｌ１．４７（図２）、抗ＣＤ３ Ｈ１．３２＿Ｌ１．４７（図３）、抗ＣＤ３ Ｈ１．８９＿Ｌ１．４７（図４）、Ｈ１．９０＿Ｌ１．４７（図５）、Ｈ１．３３＿Ｌ１．４７（図６）、またはＨ１．３１＿Ｌ１．４７（図７）のｖｈＣＤＲ１～３を含み、可変軽ドメインは、抗ＣＤ３ Ｈ１．３０＿Ｌ１．４７（図２）、抗ＣＤ３ Ｈ１．３２＿Ｌ１．４７（図３）、抗ＣＤ３ Ｈ１．８９＿Ｌ１．４７（図４）、Ｈ１．９０＿Ｌ１．４７（図５）、Ｈ１．３３＿Ｌ１．４７（図６）、またはＨ１．３１＿Ｌ１．４７（図７）のｖｌＣＤＲ１～３を含む（例えば、可変重ドメインは、抗ＣＤ３ Ｈ１．３０＿Ｌ１．４７のｖｈＣＤＲ１～３を含み、可変軽ドメインは、抗ＣＤ３ Ｈ１．３０＿Ｌ１．４７のｖｌＣＤＲ１～３を含む）。
いくつかの実施形態では、ｓｃＦｖ－Ｆｃ重鎖骨格（図２１Ｅ）は、抗ＣＤ３ ｓｃＦｖに作動可能に連結される。いくつかの実施形態では、抗ＣＤ３ ｓｃＦｖは、Ｈ１．３０＿Ｌ１．４７（図２）、Ｈ１．３２＿Ｌ１．４７（図３）、Ｈ１．８９＿Ｌ１．４７（図４）、Ｈ１．９０＿Ｌ１．４７（図５）、Ｈ１．３３＿Ｌ１．４７（図６）、またはＨ１．３１＿Ｌ１．４７（図７）の可変重及び可変軽ドメインを含む。いくつかの実施形態では、抗ＣＤ３ ｓｃＦｖは、Ｈ１．３０＿Ｌ１．４７（図２）、Ｈ１．３２＿Ｌ１．４７（図３）、Ｈ１．８９＿Ｌ１．４７（図４）、Ｈ１．９０＿Ｌ１．４７（図５）、Ｈ１．３３＿Ｌ１．４７（図６）、またはＨ１．３１＿Ｌ１．４７（図７）のｖｈＣＤＲ１～３及びｖｌＣＤＲ１～３を含む。いくつかの実施形態では、抗ＣＤ３ ｓｃＦｖは、Ｈ１．３０＿Ｌ１．４７ ｓｃＦｖ（図２）、Ｈ１．３２＿Ｌ１．４７ ｓｃＦｖ（図３）、Ｈ１．８９＿Ｌ１．４７ ｓｃＦｖ（図４）、Ｈ１．９０＿Ｌ１．４７ ｓｃＦｖ（図５）、Ｈ１．３３＿Ｌ１．４７ ｓｃＦｖ（図６）、またはＨ１．３１＿Ｌ１．４７ ｓｃＦｖ（図７）である。
いくつかの実施形態では、ｓｃＦｖ－Ｆｃ重鎖骨格（図２１Ｅ）は、抗ＰＳＭＡに作動可能に連結される。いくつかの実施形態では、抗ＰＳＭＡ ｓｃＦｖは、抗ＰＳＭＡ Ｊ５９１ Ｈ１＿Ｌ１（図２０）の可変重ドメイン及び可変軽ドメインを含む。いくつかの実施形態では、ｓｃＦｖは、Ｊ５９１ Ｈ１＿Ｌ１（図２０）のｖｈＣＤＲ１～３、及びＪ５９１ Ｈ１＿Ｌ１（図２０）のｖｌＣＤＲ１～３を含む。いくつかの実施形態では、抗ＰＳＭＡ ｓｃＦｖは、Ｊ５９１ Ｈ１＿Ｌ１ ｓｃＦｖ（図２０）である。
ある特定の実施形態では、対象抗ＰＳＭＡ×抗×ＣＤ３抗体は、図９、２１Ａ～Ｄ、及び２５に示されるボトルオープナー形式のうちのいずれか１つの配列を有する。
ｍＡｂ－Ｆｖ形式
本発明において特定の用途を見出す１つのヘテロ二量体骨格は、図１に示されるｍＡｂ－Ｆｖ形式である。この実施形態では、形式は、一方の単量体への「余分な」可変重ドメインのＣ末端付加、及びもう一方の単量体への「余分な」可変軽ドメインのＣ末端付加の使用に依存し、したがって、第３の抗原結合ドメインを形成し、２つの単量体のＦａｂ部分は、ＰＳＭＡに結合し、「余分な」Ｆｖドメインは、ＣＤ３に結合する。
この実施形態では、第１の単量体は、第１の可変重ドメイン及び第１の定常重ドメインを含む第１の重鎖を含み、この第１の定常重ドメインは、ドメインリンカーを使用して第１のＦｃドメインのＣ末端に共有結合されている第１の可変軽ドメインを有する第１のＦｃドメインを含む。第２の単量体は、第２の可変重ドメイン、第２のＦｃドメインを含む第２の定常重ドメイン、及びドメインリンカーを使用して第２のＦｃドメインのＣ末端に共有結合されている第３の可変重ドメインを含む。いくつかの実施形態では、２つのＣ末端に結合された可変ドメインは、ＣＤ３に結合するＦｖを構成する（二価のＣＤ３結合を有するのはあまり好ましくないため）。この実施形態は、ＰＳＭＡに結合する２つの同一Ｆａｂを形成するために重鎖に関連する、可変軽ドメイン及び定常軽ドメインを含む共通の軽鎖をさらに利用する。
いくつかの実施形態では、第１の重鎖は、ｖｈ１－ＣＨ１－ヒンジ－ＣＨ２－ＣＨ３－［任意選択のリンカー］－ｖｌ２を含み、第２の単量体は、ｖｈ１－ＣＨ１－ヒンジ－ＣＨ２－ＣＨ３－［任意選択のリンカー］－ｖｈ２を含み、共通の軽鎖はｖｌ１を含む。この実施形態では、ｖｈ１及びｖｌ１は、ＰＳＭＡ結合ドメインを形成し、ｖｈ２及びｖｌ２は、ＣＤ３結合ドメインを形成する。
本明細書の実施形態の多くに関して、これらの構築物には、本明細書で所望され記載される歪曲変異体、ｐＩ変異体、消去変異体、追加のＦｃ変異体などが含まれる。
本発明は、ｍＡｂ－Ｆｖ形式を提供し、抗ＣＤ３ ｓｃＦｖ配列は、図２～図７に示される。
本発明は、ボトルオープナー形式を提供し、抗ＰＳＭＡ配列は、図８及び図２０に示されるとおりである。
本発明は、図１２に示される消去変異体を含むｍＡｂ－Ｆｖ形式を提供する。
本発明は、図１０及び図１５に示される歪曲変異体を含むｍＡｂ－Ｆｖ形式を提供する。
ｍＡｂ－ｓｃＦｖ
本発明において特定の用途を見出す１つのヘテロ二量体骨格は、図１に示されるｍＡｂ－ｓｃＦｖ形式である。この実施形態では、形式は、単量体のうちの１つへのｓｃＦｖのＣ末端付加の使用に依存し、したがって、第３の抗原結合ドメインを形成し、２つの単量体のＦａｂ部分は、ＰＳＭＡに結合し、「余分な」ｓｃＦｖドメインは、ＣＤ３に結合する。したがって、第１の単量体は、第１の重鎖（可変重ドメイン及び定常ドメインを含む）を含み、Ｃ末端共有結合されたｓｃＦｖは、いずれの配向で（ｖｈ１－ＣＨ１－ヒンジ－ＣＨ２－ＣＨ３－［任意選択のリンカー］－ｖｈ２－ｓｃＦｖリンカー－ｖｌ２またはｖｈ１－ＣＨ１－ヒンジ－ＣＨ２－ＣＨ３－［任意選択のリンカー］－ｖｌ２－ｓｃＦｖ ｌｉｎｋｅｒ－ｖｈ２）、ｓｃＦｖ可変軽ドメイン、ｓｃＦｖリンカー、及びｓｃＦｖ可変重ドメインを含む。この実施形態は、ＰＳＭＡに結合する２つの同一Ｆａｂを形成するために重鎖に関連する、可変軽ドメイン及び定常軽ドメインを含む共通の軽鎖をさらに利用する。本明細書の実施形態の多くに関して、これらの構築物には、本明細書で所望され記載される歪曲変異体、ｐＩ変異体、消去変異体、追加のＦｃ変異体などが含まれる。
本発明は、ｍＡｂ－ｓｃＦｖ形式を提供し、抗ＣＤ３ｓｃＦｖ配列は、図２～図７に示されるとおりである。
本発明は、ｍＡｂ－ｓｃＦｖ形式を提供し、抗ＰＳＭＡ配列は、図８及び図２０に示されるとおりである。
本発明は、図１２に示される消去変異体を含むｍＡｂ－ｓｃＦｖ形式を提供する。
本発明は、図１０及び図１５に示される歪曲変異体を含むｍＡｂ－ｓｃＦｖ形式を提供する。
二重ｓｃＦｖ形式
本発明において特定の用途を見出す１つのヘテロ二量体骨格は、図１に示される中心ｓｃＦｖ形式である。この実施形態では、形式は、挿入ｓｃＦｖドメインの使用に依存し、したがって、第３の抗原結合ドメインを形成し、２つの単量体のＦａｂ部分は、ＰＳＭＡに結合し、「余分な」ｓｃＦｖドメインは、ＣＤ３に結合する。ｓｃＦｖドメインは、単量体のうちの１つのＦｃドメインとＣＨ１－Ｆｖ領域との間に挿入され、したがって、第３の抗原結合ドメインを提供する。
この実施形態では、１つの単量体は、第１の可変重ドメイン、ＣＨ１ドメイン、及びＦｃドメイン（及び任意選択のリンカー）を含む第１の重鎖を含み、ｓｃＦｖは、ｓｃＦｖ可変軽ドメイン、ｓｃＦｖリンカー、及びｓｃＦｖ可変重ドメインを有する。ｓｃＦｖは、任意選択のドメインリンカーを使用して重定常ドメインのＣＨ１ドメインのＣ末端と第１のＦｃドメインのＮ末端との間で共有結合されている（例えば、ｖｈ１－ＣＨ１－［任意選択のリンカー］－ｖｈ２－ｓｃＦｖリンカー－ｖｌ２－［ヒンジを含む任意選択のリンカー］－ＣＨ２－ＣＨ３またはｖｈ１－ＣＨ１－［任意選択のリンカー］－ｖｌ２－ｓｃＦｖリンカー－ｖｈ２－［ヒンジを含む任意選択のリンカー］－ＣＨ２－ＣＨ３。第２の単量体は、標準的なＦａｂ側（例えば、ｖｈ１－ＣＨ１－［ヒンジを含む任意選択のリンカー］－ＣＨ２－ＣＨ３）である。この実施形態は、ＰＳＭＡに結合する２つの同一Ｆａｂを形成するために重鎖に関連する、可変軽ドメイン（例えば、ｖｌ１）及び定常軽ドメインを含む共通の軽鎖をさらに利用する。本明細書の実施形態の多くに関して、これらの構築物には、本明細書で所望され記載される歪曲変異体、ｐＩ変異体、消去変異体、追加のＦｃ変異体などが含まれる。
本発明は、中心ｓｃＦｖ形式を提供し、抗ＣＤ３ｓｃＦｖ配列は、図２～７に示されるとおりである。
本発明は、中心ｓｃＦｖ形式を提供し、抗ＰＳＭＡ配列は、図８及び図２０に示されるとおりである。
本発明は、図１２に示される消去変異体を含む中心ｓｃＦｖ形式を提供する。
本発明は、図１０及び図１５に示される歪曲変異体を含む中心ｓｃＦｖ形式を提供する。
中心Ｆｖ形式
本発明において特定の用途を見出す１つのヘテロ二量体骨格は、図１に示される中心Ｆｖ形式である。この実施形態では、形式は、挿入ｓｃＦｖドメインの使用に依存し、したがって、第３の抗原結合ドメインを形成し、２つの単量体のＦａｂ部分は、ＰＳＭＡに結合し、「余分な」Ｆｖドメインは、ＣＤ３に結合する。ｓｃＦｖドメインは、単量体のＦｃドメインとＣＨ１－Ｆｖ領域との間に挿入され、したがって、第３の抗原結合ドメインを提供し、各単量体は、Ｆｖの成分を含有する（例えば、一方の単量体は、可変重ドメインを含み、もう一方は、可変軽ドメインを含む）。
この実施形態では、一方の単量体は、第１の可変重ドメイン、ＣＨ１ドメイン、及びＦｃドメイン、ならびに追加の可変軽ドメインを含む第１の重鎖を含む。追加の可変軽ドメインは、ドメインリンカーを使用して重定常ドメインのＣＨ１ドメインのＣ末端と第１のＦｃドメインのＮ末端との間で共有結合されている（例えば、ｖｈ１－ＣＨ１－［任意選択のリンカー］－ｖｌ２－ヒンジ－ＣＨ２－ＣＨ３）。もう一方の単量体は、第１の可変重ドメイン、ＣＨ１ドメイン、及びＦｃドメイン、ならびに追加の可変重ドメインを含む第１の重鎖を含む（例えば、ｖｈ１－ＣＨ１－［任意選択のリンカー］－ｖｈ２－ヒンジ－ＣＨ２－ＣＨ３）。追加の可変重ドメインは、ドメインリンカーを使用して重定常ドメインのＣＨ１ドメインのＣ末端と第１のＦｃドメインのＮ末端との間で共有結合されている。
この実施形態は、ＰＳＭＡに結合する２つの同一Ｆａｂを形成するために重鎖に関連する、可変軽ドメイン及び定常軽ドメインを含む共通の軽鎖をさらに利用する。本明細書の実施形態の多くに関して、これらの構築物には、本明細書で所望され記載される歪曲変異体、ｐＩ変異体、消去変異体、追加のＦｃ変異体などが含まれる。
本発明は、中心ｓｃＦｖ形式を提供し、抗ＣＤ３ ｓｃＦｖ配列は、図２～７に示されるとおりである。
本発明は、中心ｓｃＦｖ形式を提供し、抗ＰＳＭＡ配列は、図８及び図２０に示されるとおりである。
本発明は、図１２に示される消去変異体を含む中心ｓｃＦｖ形式を提供する。
本発明は、図１０及び図１５に示される歪曲変異体を含む中心ｓｃＦｖ形式を提供する。
ワンアーム化中心ｓｃＦｖ
本発明において特定の用途を見出す１つのヘテロ二量体骨格は、図１に示されるワンアーム化中心ｓｃＦｖ形式である。この実施形態では、一方の単量体は、Ｆｃドメインのみを含み、もう一方の単量体は、挿入ｓｃＦｖドメインを使用し、したがって、第２の抗原結合ドメインを形成する。この形式では、Ｆａｂ部分が、ＰＳＭＡに結合し、ｓｃＦｖが、ＣＤ３に結合するか、またはその逆のいずれかである。ｓｃＦｖドメインは、単量体のうちの１つのＦｃドメインとＣＨ１－Ｆｖ領域との間に挿入される。
この実施形態では、１つの単量体は、第１の可変重ドメイン、ＣＨ１ドメイン、及びＦｃドメインを含む第１の重鎖を含み、ｓｃＦｖは、ｓｃＦｖ可変軽ドメイン、ｓｃＦｖリンカー、及びｓｃＦｖ可変重ドメインを含む。ｓｃＦｖは、ドメインリンカーを使用して重定常ドメインのＣＨ１ドメインのＣ末端と第１のＦｃドメインのＮ末端との間で共有結合されている（例えば、ｖｈ１－ＣＨ１－［任意選択のリンカー］－ｖｈ２－ｓｃＦｖリンカー－ｖｌ２－［ヒンジを含む任意選択のリンカー］－ＣＨ２－ＣＨ３またはｖｈ１－ＣＨ１－［任意選択のリンカー］－ｖｌ２－ｓｃＦｖリンカー－ｖｈ２－［ヒンジを含む任意選択のリンカー］－ＣＨ２－ＣＨ３）。第２の単量体は、Ｆｃドメインを含む（ＣＨ２－ＣＨ３）。この実施形態は、Ｆａｂを形成するために重鎖に関連する、可変軽ドメイン及び定常軽ドメインを含む軽鎖をさらに利用する。本明細書の実施形態の多くに関して、これらの構築物には、本明細書で所望され記載される歪曲変異体、ｐＩ変異体、消去変異体、追加のＦｃ変異体などが含まれる。
本発明は、ワンアーム化中心ｓｃＦｖ形式を提供し、抗ＣＤ３ ｓｃＦｖ配列は、図２～図７に示されるとおりである。
本発明は、ワンアーム化中心ｓｃＦｖ形式を提供し、抗ＰＳＭＡ配列は、図８及び図２０に示されるとおりである。
本発明は、図１２に示される消去変異体を含むワンアーム化中心ｓｃＦｖ形式を提供する。
本発明は、図１０及び図１５に示される歪曲変異体を含むワンアーム化中心ｓｃＦｖ形式を提供する。
二重ｓｃＦｖ形式
本発明はまた、当該技術分野で知られ、図１に示される二重ｓｃＦｖ形式も提供する。具体的には、本発明は、二重ｓｃＦｖ形式を提供し、抗ＣＤ３ ｓｃＦｖ配列は、図２～図７に示されるとおりである。
本発明は、二重ｓｃＦｖ形式を提供し、抗ＰＳＭＡ配列は、図８に示されるとおりである。実施形態のいくつかでは、抗ＰＳＭＡ及び抗ＣＤ３ ｓｃＦｖは、ｓｃＦｖリンカーを含む。ある特定の実施形態では、ｓｃＦｖリンカーは、図１４に示されるｓｃＦｖリンカーである。
本発明は、図１２に示される消去変異体を含む二重ｓｃＦｖ形式を提供する。
本発明は、図１０及び図１５に示される歪曲変異体を含む二重ｓｃＦｖ形式を提供する。
共通の軽鎖形式
本発明において特定の用途を見出す１つのヘテロ二量体骨格は、図１に示される共通の軽鎖形式である。この実施形態では、第１の単量体は、第１の可変重ドメイン、及び第１のＦｃドメインを含む第１の定常重ドメインを含む、第１の重鎖を含む。第２の単量体は、第２の可変重ドメイン、及び第２のＦｃドメインを含む第２の定常重鎖を含む。第１及び第２の単量体のそれぞれは、可変軽ドメイン及び定常軽ドメインを含む共通の軽鎖に関連する。本明細書の実施形態の多くに関して、これらの構築物には、本明細書で所望され記載される歪曲変異体、ｐＩ変異体、消去変異体、追加のＦｃ変異体などが含まれる。
本発明は、共通の軽鎖形式を提供し、抗ＣＤ３配列は、図２～図７に示されるとおりである。
本発明は、共通の軽鎖形式を提供し、抗ＰＳＭＡ配列は、図８及び図２０に示されるとおりである。
本発明は、図１２に示される消去変異体を含む共通の軽鎖形式を提供する。
本発明は、図１０及び図１５に示される歪曲変異体を含む共通の軽鎖形式を提供する。
二重特異性ＩｇＧ
本発明において特定の用途を見出す１つのヘテロ二量体骨格は、図１に示される二重特異性形式である。この実施形態では、第１の単量体は、第１の可変重ドメイン、及び第１のＦｃドメインを含む第１の定常重ドメインを含む、第１の重鎖を含む。第２の単量体は、第２の可変重ドメイン、及び第２のＦｃドメインを含む第２の定常重鎖を含む。第１及び第２の単量体のそれぞれは、可変軽ドメイン及び定常軽ドメインを含む軽鎖（すなわち、それぞれ、第１の軽鎖及び第２の軽鎖）に関連する。本明細書の実施形態の多くに関して、これらの構築物には、本明細書で所望され記載される立体変異体（例えば、ノブイントゥホール変異体）、歪曲変異体、ｐＩ変異体、消去変異体、追加のＦｃ変異体などが含まれる。
本発明は、二重特異性ＩｇＧ形式を提供し、抗ＣＤ３配列は、図２～図７に示されるとおりである。
本発明は、二重特異性ＩｇＧ形式を提供し、抗ＰＳＭＡ配列は、図８及び図２０に示されるとおりである。
本発明は、図１２に示される消去変異体を含む二重特異性ＩｇＧ形式を提供する。
本発明は、図１０及び図１５に示される歪曲変異体を含む二重特異性ＩｇＧ形式を提供する。
本発明の核酸
本発明は、本発明の二重特異性抗体をコードする核酸組成物をさらに提供する。当業者により理解されるように、核酸組成物は、ヘテロ二量体タンパク質の形式及び骨格に依存する。したがって、例えば、形式が、三重Ｆ形式などのために３つのアミノ酸配列を必要とするとき（例えば、Ｆｃドメイン及びｓｃＦｖを含む第１のアミノ酸単量体、重鎖及び軽鎖を含む第２のアミノ酸単量体）、３つの核酸配列は、発現のための１つ以上の発現ベクターに組み込まれ得る。同様に、いくつかの形式（例えば、図１に開示されるものなどの二重ｓｃＦｖ形式）２つの核酸のみが必要とされ、再度それらは、１つまたは２つの発現ベクターに加えられ得る。
当該技術分野で知られるように、本発明の成分をコードする核酸は、当該技術分野で知られる、及び本発明のヘテロ二量体抗体を産生するために使用される宿主細胞によって、発現ベクターに組み込まれ得る。一般に、核酸は、任意の数の制御要素（プロモーター、複製の起源、選択可能なマーカー、リボソーム結合部位、誘導物質など）に作動可能に連結される。発現ベクターは、外部染色体または統合ベクターであってもよい。
本発明の核酸及び／または発現ベクターは、その後、哺乳類、細菌、酵母菌、昆虫、及び／または真菌細胞を含む当該技術分野でよく知られる任意の数の異なる型の宿主細胞に変換され、哺乳類細胞（例えば、ＣＨＯ細胞）は、多くの実施形態において用途を見出す。
いくつかの実施形態では、形式に応じて適用可能であるように、各単量体をコードする核酸及び軽鎖をコードする任意選択の核酸は、一般に、異なるまたは同一のプロモーター制御下で、単一の発現ベクター内にそれぞれ含有される。本発明の特定の用途の実施形態では、これらの２つまたは３つの核酸のそれぞれは、異なる発現ベクター上に含有される。本明細書及び第６２／０２５，９３１号（参照により本明細書に組み込まれる）で示されるように、異なるベクターの比は、ヘテロ二量体形成を誘起するために使用され得る。すなわち、驚くべきことに、タンパク質は、１：１：２の比で第１の単量体：第２の単量体：軽鎖（ヘテロ二量体抗体を含む３つのポリペプチドを有する本明細書の実施形態の多くの場合）を含むが、これらは、最良の結果をもたらす比ではない。
本発明のヘテロ二量体抗体は、当該技術分野においてよく知られている発現ベクター（複数可）を含む宿主細胞を培養することによって作製される。一旦産生されると、イオン交換クロマトグラフィーステップを含む伝統的な抗体精製ステップが行われる。本明細書で論じられるように、２つの単量体のｐＩを少なくとも０．５異なるようにすることで、イオン交換クロマトグラフィーもしくは等電点電気泳動、または等電点感受性の他の方法によっての分離が可能になる。すなわち、各単量体が異なるｐＩを有し、ヘテロ二量体も明確に異なるｐＩを有するように、各単量体の等電点（ｐＩ）を変えるｐＩ置換を含むことにより、「三重Ｆ」ヘテロ二量体の等電精製（例えば、アニオン交換カラム、カチオン交換カラム）を容易にする。こうした置換は、任意の混入している二重ｓｃＦｖ－Ｆｃ及びｍＡｂホモ二量体の、精製後の判定及び監視においても役に立つ（例えば、ＩＥＦゲル、ｃＩＥＦ、及び分析ＩＥＸカラム）。
治療
一旦作製されると、本発明の組成物は、限定されないが、前立腺癌を含む、ＰＳＭＡを発現または過剰発現する癌の治療を含むいくつかの用途に用途を見出す。
したがって、本発明のヘテロ二量体組成物は、これらの癌の治療において用途を見出す。
インビボ投与用の抗体組成物
本発明に従って使用する抗体の製剤は、所望の純度を有し、任意選択で、医薬的に許容可能な担体、賦形剤、または安定剤（Ｒｅｍｉｎｇｔｏｎ’ｓ Ｐｈａｒｍａｃｅｕｔｉｃａｌ Ｓｃｉｅｎｃｅｓ １６ｔｈ ｅｄｉｔｉｏｎ，Ｏｓｏｌ，Ａ．Ｅｄ．［１９８０］）と共に抗体を混合することによって、凍結乾燥製剤または水溶液の形態で、貯蔵のために調製される。許容可能な担体、賦形剤、または安定剤は、用いられる投与量及び濃度で、レシピエントに対して非毒性であり、リン酸、クエン酸、及び他の有機酸などの緩衝剤、アスコルビン酸及びメチオニンを含む抗酸化剤、保存剤（オクタデシルジメチルベンジルアンモニウムクロリド、ヘキサメトニウムクロリド、ベンザルコニウムクロリド、ベンゼトニウムクロリド、フェノール、ブチルもしくはベンジルアルコール、メチルもしくはプロピルパラベンなどのアルキルパラベン、カテコール、レゾルシノール、シクロヘキサノール、３－ペンタノール、及びｍ－クレゾールなど）、低分子量（約１０残基未満）ポリペプチド、血清アルブミン、ゼラチン、もしくは免疫グロブリンなどのタンパク質、ポリビニルピロリドンなどの親水性重合体、グリシン、グルタミン、アスパラギン、ヒスチジン、アルギニン、もしくはリジンなどのアミノ酸、単糖、二糖、及びグルコース、マンノース、もしくはデキストリンを含む他の糖質、ＥＤＴＡなどのキレート物質、スクロース、マンニトール、トレハロース、もしくはソルビトールなどの糖、ナトリウムなどの塩形成対イオン、金属複合体（例えば、亜鉛－タンパク質複合体）、ならびに／またはＴＷＥＥＮ（商標）、ＰＬＵＲＯＮＩＣＳ（商標）、もしくはポリエチレングリコール（ＰＥＧ）などの非イオン性界面活性剤が含まれる。
本明細書の製剤は、治療される特定の徴候のために、必要に応じて２つ以上の活性化合物を含んでもよく、好ましくは、お互いに有害な影響を及ぼすことのない相補的な活性を有するものである。例えば、他の特異性を有する抗体を提供することが望ましい場合がある。あるいは、または加えて、組成物は、細胞傷害性物質、サイトカイン、成長阻害物質、及び／または小分子アンタゴニストを含んでもよい。そのような分子は、意図する目的に有効な量の組み合わせで、適切に存在する。
活性成分は、コロイド薬物送達系（例えば、リポソーム、アルブミンマイクロスフェア、マイクロエマルジョン、ナノ粒子、及びナノカプセル）、またはマイクロエマルジョンにおいて、例えば、コアセルベーション技術によって、または界面重合によって調製されたマイクロカプセル、例えば、それぞれヒドロキシメチルセルロースマイクロカプセルまたはゼラチンマイクロカプセル、及びポリ－（メチルメタクリル酸）マイクロカプセルに封入されてもよい。そのような技術は、Ｒｅｍｉｎｇｔｏｎ’ｓ Ｐｈａｒｍａｃｅｕｔｉｃａｌ Ｓｃｉｅｎｃｅｓ １６ｔｈ ｅｄｉｔｉｏｎ，Ｏｓｏｌ，Ａ．Ｅｄ．（１９８０）において開示される。
インビボ投与に使用される製剤は、無菌、またはそれに近くあるべきである。これは、無菌ろ過膜を通過させるろ過によって容易に達成される。
持続放出調製物を調製してよい。持続放出調製物の好適な例には、抗体を含有する固体疎水性重合体の半透性マトリックスが含まれ、このマトリックスは、成形物品の形態であり、例えば、フィルムまたはマイクロカプセルである。持続放出マトリックスの例には、ポリエステル、ヒドロゲル（例えば、ポリ（２－ヒドロキシエチル－メタクリル酸）、またはポリ（ビニルアルコール））、ポリラクチド（米国特許第３，７７３，９１９号）、Ｌ－グルタミン酸及び．ガンマ．エチル－Ｌ－グルタミン酸の共重合体、非分解性エチレン－酢酸ビニル、ＬＵＰＲＯＮ ＤＥＰＯＴ（商標）（乳酸－グリコール酸共重合体及び酢酸リュープロリドからなる注射可能なマイクロスフェア）などの分解性乳酸－グリコール酸共重合体、ならびにポリ－Ｄ－（－）－３－ヒドロキシ酪酸が含まれる。エチレン－酢酸ビニル及び乳酸－グリコール酸などの重合体は、１００日を超える期間の分子放出を可能にする一方で、ある特定のヒドロゲルでは、タンパク質の放出期間は、より短い。
カプセル化された抗体が、体内に長期間残存するとき、抗体は、３７℃での水分へ暴露の結果として変性または凝集し得、生物学的活性の消失と共に免疫原性が変化する可能性をもたらす。関与する機構に応じて、安定化に向けた合理的な方針を立てることができる。例えば、凝集機構が、チオ－ジスルフィド相互交換を介した分子間Ｓ－－Ｓ結合形成であると見出された場合、スルフヒドリル残基の改変、酸性溶液からの凍結乾燥、水分含量の制御、適切な添加物の使用、及び特定の重合体マトリックス組成物の開発によって、安定化を達成してもよい。
投与様式
本発明の抗体物質及び化学療法物質は、ボーラスとしての静脈内投与、または一定期間にわたる継続注入によるなどの既知の方法に従って、筋肉内経路、腹腔内経路、脳脊髄内（ｉｎｔｒａｃｅｒｏｂｒｏｓｐｉｎａｌ）、皮下経路、関節内経路、関節滑液嚢内経路、くも膜下腔内、口腔、局所、または吸入経路によって、対象に投与される。抗体の静脈内投与または皮下投与が好ましい。
治療様式
本発明の方法において、療法は、疾患または状態に関する有益な治療応答を提供するために使用される。「有益な治療応答」は、疾患もしくは状態における改善、及び／または疾患もしくは状態と関連する症状における改善を意図する。例えば、有益な治療応答は、疾患における下記の改善のうちの１つ以上を指すであろう。（１）新生細胞数の減少、（２）新生細胞死の増加、（３）新生細胞の生存阻害、（５）腫瘍成長の阻害（例えば、ある程度の鈍化、好ましくは停止）、（６）患者生存率の増加、及び（７）疾患または状態と関連する１つ以上の症状のある程度の緩和。
任意の所与の疾患または状態における有益な治療応答は、疾患または状態に特有の標準化された応答基準によって決定することができる。腫瘍応答は、磁気共鳴画像法（ＭＲＩ）スキャン、ｘ－線画像法、コンピュータ断層撮影（ＣＴ）スキャン、骨スキャン画像法、内視鏡検査、ならびに骨髄穿刺（ＢＭＡ）及び循環における腫瘍細胞の計数を含む腫瘍生検試料採取などの選別技術を使用して、腫瘍形態学（すなわち、全体的な腫瘍量、腫瘍サイズ、及び同様のもの）における変化で評価することができる。
こうした有益な治療応答に加えて、療法を受けている対象は、疾患に関連する症状において、改善の有益な効果を経験し得る。
疾患の改善は、完全応答として特徴付けられてもよい。「完全応答」は、任意の、以前には異常であったＸ線検査、骨髄、及び脳脊髄液（ＣＳＦ）の正常化、または骨髄腫の場合は、異常なモノクローナルタンパク質の正常化を伴って、臨床的に検出可能な疾患が存在しないことを意図する。
そのような応答は、本発明の方法による治療の後、少なくとも４～８週間、または時には６～８週間持続し得る。あるいは、疾患の改善は、部分応答であるとして分類されてもよい。「部分応答」は、新しい病変が存在せず、すべての測定可能な腫瘍量（すなわち、対象に存在する悪性細胞の数、または腫瘍質量の測定容積、または異常なモノクローナルタンパク質の量）が、少なくとも約５０％減少することを意図し、それが４～８週間、または６～８週間持続し得る。
本発明による治療は、使用する薬剤の「治療有効量」を含む。「治療有効量」は、必要な投与量及び期間で、所望の治療結果を達成するために有効な量を指す。
治療有効量は、個々の疾患の状況、年齢、性別及び体重などの要因、ならびに個々における、薬剤の所望応答を引き出す能力に応じて変化してもよい。治療有効量は、抗体または抗体部分の治療上有利な効果が、任意の毒性作用または有害作用を凌ぐ量でもある。
腫瘍療法の「治療有効量」は、疾患の進行を安定化させるその能力によって測定されてもよい。癌を阻害する化合物の能力を、ヒト腫瘍における有効性を予測する動物モデル系において評価してもよい。
あるいは、組成物のこの性質は、当業者に知られるインビトロアッセイによって、化合物が、細胞の成長を阻害する能力、またはアポトーシスを誘導する能力を試験することによって評価してもよい。治療用化合物の治療有効量は、対象の腫瘍サイズを減少させるか、またはそうでなければ、対象の症状を回復させることができる。当業者であれば、対象のサイズ、対象の症状の重症度、及び特定組成物、または選択される投与経路などの要因に基づいてそのような量を決定できるであろう。
投与レジメンは、最適な所望の応答（例えば、治療応答）を提供するように調整される。例えば、単回ボーラスが投与されてもよく、いくつかに分割された用量が経時的に投与され得るか、または治療状況の要件が示すように、比例的に用量が減少または増加されてもよい。非経口組成物を、投与の容易化及び投与量の均一性のために、投与量単位形態で製剤化してもよい。本明細書で使用される投与量単位形態は、治療される対象の単位投与量として適した、物理的に別々の単位を指し、各単位は、必要な薬学的担体に関連して所望の治療効果をもたらすように計算された予め決められた量の活性化合物を含有する。
本発明の投与量単位形態のための規格は、（ａ）活性化合物特有の特徴、及び達成される特定の治療効果、ならびに（ｂ）そのような活性化合物を、個々の感受性の治療のために配合する技術分野での固有の制限によって決定され、直接的にそれらに依存する。
本発明で使用される二重特異性抗体の効率的な投与量及び投与レジメンは、治療される疾患または状態に依存し、当業者によって決定されてもよい。
本発明で使用される二重特異性抗体の治療有効量のための例示的な非限定範囲は、約０．１～５０ｍｇ／ｋｇなどの約０．１～１００ｍｇ／ｋｇ、例えば、約０．１～１０ｍｇ／ｋｇなどの約０．１～２０ｍｇ／ｋｇ、例えば、約０．３ｍｇ／ｋｇなどの約０．５ｍｇ／ｋｇ、約１ｍｇ／ｋｇ、または約３ｍｇ／ｋｇである。別の実施形態では、抗体は、１～２０ｍｇ／ｋｇの用量などの１ｍｇ／ｋｇ以上の用量、例えば、５～２０ｍｇ／ｋｇの用量、例えば、８ｍｇ／ｋｇの用量で投与される。
当該技術分野の医療従事者であれば、必要な薬学的組成物の有効量を容易に決定し、処方することができる。例えば、医者または獣医師であれば、薬学的組成物において用いられる薬剤の投与を、所望の治療効果を達成するために必要となるよりも低いレベルで開始し、所望の効果が達成されるまで投与量を徐々に増加させることができるであろう。
一実施形態では、二重特異性抗体は、注入によって、２００～４００ｍｇ／ｋｇなどの１０～５００ｍｇ／ｋｇの投与量で毎週投与される そのような投与は、例えば、３～５回など、１～８回繰り返されてもよい。投与は、２～１２時間の時間などの２～２４時間の時間にわたる継続注入によって実施され得る。
一実施形態では、毒性を含む副作用を低減する必要がある場合、二重特異性抗体は、２４時間超などの長時間にわたる、緩徐な継続注入によって投与される。
一実施形態では、二重特異性抗体は、４～６回などの最大８回にわたって、２５０ｍｇ～２０００ｍｇ、例えば、３００ｍｇ、５００ｍｇ、７００ｍｇ、１０００ｍｇ、１５００ｍｇ、または２０００ｍｇなどの投与量が毎週投与される。投与は、２～１２時間の時間などの２～２４時間の時間にわたる継続注入によって実施され得る。そのようなレジメンは、必要に応じて１回以上、例えば、６ヶ月後または１２カ月後に繰り返されてもよい。投与量は、例えば、生物学的試料を採取し、二重特異性抗体の抗原結合領域を標的とする抗イディオタイプ抗体を使用することにより、投与の際に血液中の本発明の化合物の量を測定することによって、決定または調整することができる。
さらなる実施形態では、二重特異性抗体は、３～１０週間など、４～８週間など、毎週１回、２～１２週間投与される。
一実施形態では、二重特異性抗体は、例えば、６ヶ月以上の期間にわたって１週間に１回など、維持療法によって投与される。
一実施形態では、二重特異性抗体は、二重特異性抗体の１回の注入、続いて放射性同位体にコンジュゲートされた二重特異性抗体の注入を含むレジメンによって投与される。レジメンは、例えば、７～９日後に繰り返されてもよい。
非限定的な例として、本発明による治療は、治療の開始後、１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９、２０、２１、２２、２３、２４、２５、２６、２７、２８、２９、３０、３１、３２、３３、３４、３５、３６、３７、３８、３９、もしくは４０日目のうちの少なくとも１日に、あるいは治療の開始後、１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９、もしくは２０週間目のうちの少なくとも１週に、またはそれらのいずれかの組み合わせで、１日当たり、０．５、０．９、１．０、１．１、１．５、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９、２０、２１、２２、２３、２４、２５、２６、２７、２８、２９、３０、４０、４５、５０、６０、７０、８０、９０、または１００ｍｇ／ｋｇなどの約０．１～１００ｍｇ／ｋｇの１日の抗体投与量として、単一または分割された用量を使用して、２４、１２、８、６、４、もしくは２時間毎に、またはそれらのいずれかの組み合わせで提供されてもよい。
いくつかの実施形態では、その二重特異性抗体分子は、例えば、化学療法物質といった、１つ以上の追加の治療用物質と組み合わせて使用される。ＤＮＡ損傷化学療法物質の非限定的な例には、トポイソメラーゼＩ阻害物質（例えば、イリノテカン、トポテカン、カンプトテシン、及びそれらの類似体または代謝物、ならびにドキソルビシン）、トポイソメラーゼＩＩ阻害物質（例えば、エトポシド、テニポシド、及びダウノルビシン）、アルキル化物質（例えば、メルファラン、クロラムブシル、ブスルファン、チオテパ、イホスファミド、カルムスチン、ロムスチン、セムスチン、ストレプトゾシン、デカルバジン（ｄｅｃａｒｂａｚｉｎｅ）、メトトレキサート、マイトマイシンＣ、及びシクロホスファミド）、ＤＮＡインターカレーター（例えば、シスプラチン、オキサリプラチン、及びカルボプラチン）、ブレオマイシンなどのＤＮＡインターカレーター兼遊離ラジカル発生物質、ならびにヌクレオシド模倣物質（例えば、５－フルオロウラシル、カペシチビン（ｃａｐｅｃｉｔｉｂｉｎｅ）、ゲムシタビン、フルダラビン、シタラビン、メルカプトプリン、チオグアニン、ペントスタチン、及びヒドロキシウレア）が含まれる。
細胞複製を攪乱する化学療法物質には、パクリタキセル、ドセタキセル、及び関連類似体、ビンクリスチン、ビンブラスチン及び関連類似体、サリドマイド、レナリドミド及び関連類似体（例えば、ＣＣ－５０１３及びＣＣ－４０４７）、タンパク質チロシンキナーゼ阻害物質（例えば、メシル酸イマチニブ及びゲフィチニブ）、プロテアソーム阻害物質（例えば、ボルテゾミブ）、ＩκＢキナーゼの阻害物質を含むＮＦ－κＢ阻害物質、癌において過剰発現されるタンパク質に結合し、それによって細胞複製を下方制御する抗体（例えば、トラスツズマブ、リツキシマブ、セツキシマブ、及びベバシズマブ）、癌において上方制御、過剰発現、または活性化されることが知られており、それを阻害することにより、細胞複製が下方制御されるタンパク質または酵素の他の阻害物質が含まれる。
いくつかの実施形態では、本発明の抗体は、Ｖｅｌｃａｄｅ（登録商標）（ボルテゾミブ）での治療の前に、同時に、または後に使用することができる。
すべての引用文献は、それらの全体が、参照により明確に本明細書に組み込まれる。
本発明の特定の実施形態を例示目的のために上に説明したが、添付の特許請求の範囲において説明される本発明から逸脱することなく、詳細の変更を数多く実施することができることを当業者は理解するであろう。
本発明を図示するために、実施例を以下に提供する。こうした実施例は、本発明を任意の特定の応用、または実施理論に限定することを意図するものではない。本発明において論じられるすべての定常領域の位置に関して、番号付けは、Ｋａｂａｔ（Ｋａｂａｔ ｅｔ ａｌ．，１９９１，Ｓｅｑｕｅｎｃｅｓ ｏｆ Ｐｒｏｔｅｉｎｓ ｏｆ Ｉｍｍｕｎｏｌｏｇｉｃａｌ Ｉｎｔｅｒｅｓｔ，５ｔｈ Ｅｄ．，Ｕｎｉｔｅｄ Ｓｔａｔｅｓ Ｐｕｂｌｉｃ Ｈｅａｌｔｈ Ｓｅｒｖｉｃｅ，Ｎａｔｉｏｎａｌ Ｉｎｓｔｉｔｕｔｅｓ ｏｆ Ｈｅａｌｔｈ，Ｂｅｔｈｅｓｄａ。参照により完全に組み込まれる）にあるように、ＥＵインデックスに従う。抗体技術分野の当業者であれば、この慣習が、免疫グロブリン配列の特定領域における、非連続的な番号付けからなっており、免疫グロブリンファミリーにおける保存位置に対する標準化された参照を可能にすることを理解するであろう。したがって、ＥＵインデックスによって定義される、任意の所与の免疫グロブリンの位置は、その連続配列に必ずしも対応しない。
一般的かつ特定の科学技術は、米国公開第２０１５／０３０７６２９号、同第２０１４／０２８８２７５号、及びＷＯ２０１４／１４５８０６に概要が記載され、これらはすべて、その全体、及び特に、それらに概要が記載される技術に関して、参照により明確に組み込まれる。
実施例１：二重特異性体産生
抗ＰＳＭＡ×抗ＣＤ３二重特異性体のアミノ酸配列を図９及び２１Ａ～Ｄに列記する。二重特異性発現のために必要とされる３つの鎖をコードするＤＮＡを、遺伝子合成（Ｂｌｕｅ Ｈｅｒｏｎ Ｂｉｏｔｅｃｈｎｏｌｏｇｙ，Ｂｏｔｈｅｌｌ，Ｗａｓｈ．）により生成し、発現ベクターｐＴＴ５に標準的な分子生物学的技術を使用してサブクローニングした。置換を、部位特異的な突然変異誘発（ＱｕｉｋＣｈａｎｇｅ，Ｓｔｒａｔａｇｅｎｅ，Ｃｅｄａｒ Ｃｒｅｅｋ，Ｔｅｘ．）または追加の遺伝子合成及びサブクローニングのいずれかを使用して導入した。ＤＮＡを、発現のためのＨＥＫ２９３Ｅ細胞にトランスフェクトし、得られたタンパク質を、プロテインＡ親和性（ＧＥ Ｈｅａｌｔｈｃａｒｅ）及びカチオンイオン交換クロマトグラフィーを使用して上清から精製した。カチオンイオン交換クロマトグラフィー精製を、５０ｍＭ ＭＥＳ、ｐＨ６．０の洗浄／平衡緩衝剤及び５０ｍＭ ＭＥＳ、ｐＨ６．０＋１Ｍ ＮａＣｌ直線勾配の溶離緩衝剤を用いるＨｉＴｒａｐ ＳＰ ＨＰカラム（ＧＥ Ｈｅａｌｔｈｃａｒｅ）を使用して実施した。
例示の抗体ＸＥＮＰ１４４８４及びＸＥＮＰ１９７２２のＰＳＭＡ親和性（ＫＤ）は、Ｏｃｔｅｔ Ｒｅｄ機器（ＦｏｒｔｅＢｉｏ）のバイオレイヤー干渉（ＢＬＩ）により測定された（図２２）。二重特異性体（ＸＥＮＰ１４４８４、ＸＥＮＰ１９７２２）を、ＡＨＣセンサー上に捕捉し、続いて５０～０．７８１２５ｎＭ（２倍希釈）の濃度でヒトまたはカニクイザルＰＳＭＡを捕捉した。
実施例２：再配向化Ｔ細胞の細胞傷害性
抗ＰＳＭＡ×抗ＣＤ３二重特異性体を、ＰＳＭＡ＋ＬＮＣａＰ前立腺癌細胞株への細胞表面結合及びその再配向化Ｔ細胞の細胞傷害性（ＲＴＣＣ）に関して、インビトロで特徴付けした。（図１６及び２３）アッセイの詳細は図の説明文に示される。これらの図に示されるように、対象抗ＰＳＭＡ×抗ＣＤ３抗体ＸＥＮＰ１４４８４及びＸＥＮＰ１９７２２は、インビトロにおいてＬＮＣａＰ前立腺癌細胞に結合し、ＲＴＣＣ殺傷を媒介することができたが、抗ＲＳＶ対照ＸＥＮＰ１３２４５は、ＰＳＭＡまたはＲＴＣＣを示さなかった。
実施例３：カニクイザル薬理学
カニクイザル（ｎ＝３）に、ＸＥＮＰ１４４８４（抗ＰＳＭＡ×抗ＣＤ３、３０μｇ／ｋｇ）またはＸＥＮＰ１３２４５（抗ＲＳＶ×ＣＤ３、３ｍｇ／ｋｇ）のいずれかを単回投与した。ＣＤ４＋Ｔ細胞の辺縁趨向及びＣＤ６９ ＭＦＩによる活性化は、フローサイトメトリーによって調べられた。ＩＬ－６血清レベルは、ＥＬＩＳＡによって調べられた（図１７Ａ）。加えて、ＣＤ８＋Ｔ細胞の辺縁趨向及びＣＤ６９ ＭＦＩによる活性化は、フローサイトメトリーによって調べられ、ＴＮＦα血清レベルは、ＥＬＩＳＡによって調べられた（図１７Ｂ）。これらの図に示されるように、Ｔ細胞の応答及びサイトカイン放出症候群（ＣＲＳ）は、サルにおいて、抗ＰＳＭＡ×抗ＣＤ３抗体による標的細胞の会合に依存する。
実施例４：ＣＤ３親和性及びサイトカイン放出症候群
カニクイザルカニクイザル（ｎ＝３）に、０．０６ｍｇ／ｋｇのＸＥＮＰ１４４８４（高ＣＤ３親和性）または１ｍｇ／ｋｇのＸＥＮＰ１９７２２（低ＣＤ３親和性）のいずれかの単回静脈内（ｉ．ｖ．）用量を投与した。図２４に示されるように、ＸＥＮＰ１４４８４及びＸＥＮＰ１９７２２抗体は、異なるＣＤ３親和性を有するにも関わらず、類似するＴ細胞の辺縁趨向及び活性化（ＣＤ４＋（上のパネル）及びＣＤ８＋（中央のパネル））を示す。しかしながら、Ｔ細胞活性化における類似性にも関わらず、ＣＤ３に対して低親和性を有するＸＥＮＰ１９７２２が、ＣＤ３に対して高親和性を有するＸＥＮＰ１４４８４と比較して、より少ないサイトカイン放出症候群（ＣＲＳ）を誘導した（図２４、下のパネル）。そのようなより低いＣＤ３親和性は、より高い用量レベルにおいてもサイトカイン放出の低減と相関する。そのため、抗ＰＳＭＡ二重特異性体の効力は、Ｔ細胞を補充するその能力を調整することによって調節することができる。

Claims (10)

  1. ａ）第１の単量体であって、
    ｉ）第１のＦｃドメインと、
    ｉｉ）第１の可変重ドメイン、ｓｃＦｖリンカー、及び第１の可変軽ドメインを含む抗ＣＤ３ ｓｃＦｖであって、前記ｓｃＦｖが、ドメインリンカーを使用して前記ＦｃドメインのＮ末端に共有結合されている、抗ＣＤ３ ｓｃＦｖと、
    を含む、第１の単量体と、
    ｂ）重鎖を含む第２の単量体であって、
    ｉ）第２の可変重ドメインと、
    ｉｉ）第２のＦｃドメインを含む重定常ドメインと、を含む、第２の単量体と、
    ｃ）第２の可変軽ドメイン及び定常軽ドメインを含む軽鎖と、を含み、
    前記第１の可変重ドメインが配列番号１０のアミノ酸配列を含み、前記第１の可変軽ドメインが配列番号１４のアミノ酸配列を含み、
    前記第２の可変重ドメインが配列番号１１０のアミノ酸配列を含み、前記第２の可変軽ドメインが配列番号１０６のアミノ酸配列を含む、ヘテロ二量体抗体。
  2. 前記第１の単量体が配列番号１２５のアミノ酸配列を含み、前記第２の単量体が配列番号１２４のアミノ酸配列を含み、前記軽鎖が配列番号１２６のアミノ酸配列を含む、請求項１に記載のヘテロ二量体抗体。
  3. 前記第１のＦｃドメイン及び前記第２のＦｃドメインが、Ｓ３６４Ｋ／Ｅ３５７Ｑ：Ｌ３６８Ｄ／Ｋ３７０Ｓ、Ｌ３６８Ｄ／Ｋ３７０Ｓ：Ｓ３６４Ｋ、Ｌ３６８Ｅ／Ｋ３７０Ｓ：Ｓ３６４Ｋ、Ｔ４１１Ｔ／Ｅ３６０Ｅ／Ｑ３６２Ｅ：Ｄ４０１Ｋ、Ｌ３６８Ｄ／Ｋ３７０Ｓ：Ｓ３６４Ｋ／Ｅ３５７Ｌ、及びＫ３７０Ｓ：Ｓ３６４Ｋ／Ｅ３５７Ｑからなる群から選択される１セットの変異体を含む、請求項１に記載のヘテロ二量体抗体。
  4. 前記ｓｃＦｖリンカーが、荷電リンカーである、請求項１に記載のヘテロ二量体抗体。
  5. 前記重鎖定常ドメインが、アミノ酸置換Ｎ２０８Ｄ／Ｑ２９５Ｅ／Ｎ３８４Ｄ／Ｑ４１８Ｅ／Ｎ４２１Ｄを更に含む、請求項３に記載のヘテロ二量体抗体。
  6. 前記第１及び第２のＦｃドメインが、アミノ酸置換Ｅ２３３Ｐ／Ｌ２３４Ｖ／Ｌ２３５Ａ／Ｇ２３６ｄｅｌ／Ｓ２６７Ｋを含む、請求項５に記載のヘテロ二量体抗体。
  7. ヘテロ二量体抗体をコードする核酸組成物であって、
    ａ）請求項１に記載の前記第１の単量体をコードする第１の核酸と、
    ｂ）請求項１に記載の前記第２の単量体をコードする第２の核酸と、
    ｃ）請求項１に記載の前記軽鎖をコードする第３の核酸と、を含む、核酸組成物。
  8. 請求項７に記載の核酸組成物を含む、発現ベクター組成物。
  9. 請求項７に記載の核酸組成物又は請求項８に記載の発現ベクター組成物を含む、宿主細胞。
  10. ヘテロ二量体抗体を作製する方法であって、前記抗体が発現される条件下で請求項９に記載の宿主細胞を培養することと、前記抗体を回収することと、を含む、方法。
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