JP6990244B2 - ヒトcd123を標的とするキメラ受容体リガンド及びその応用 - Google Patents
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Description
CD123、すなわちヒトインターロイキン3受容体α鎖(インターロイキン3受容体サブユニットアルファ、IL-3Rα)は、シグナルペプチドに18個のアミノ酸(1~18)を含み、細胞外領域に287個のアミノ酸(19~305)を含み、膜貫通領域に20個のアミノ酸(306~325)を含み、細胞内領域に53個のアミノ酸(326~378)を含む全長378個のアミノ酸(NP_002174.1)を有する。過去20年間にわたる研究の結果、急性骨髄性白血病(AML)、急性B細胞リンパ性白血病(B-ALL)、有毛細胞白血病、及び芽球性形質細胞様樹状細胞腫瘍(BPDCN)を含む多くの血液腫瘍でCD123が過剰発現することがわかっている。Munoz L et al.は64例の急性白血病患者を分析し、そのうち45例のAML患者のうちの43例はCD123陽性であり、CD123陰性はM7 AMLの2例であり、13例のB細胞急性白血病患者はすべてCD123陽性であったが、6例の急性T細胞白血病患者はすべてCD123陰性であることを見出した(Haematologica.2001,Dec;86(12):1261-9)。Xueqiang Ji et al.の報告によれば、健康な小児由来の骨髄リンパ球はCD123の発現が陰性であり、91例の小児B-ALL患者のうち65例由来の骨髄リンパ球はCD123の発現が陽性であり(陽性率71.43%)、発現レベルが白血病細胞の成熟と負の相関をしていた(Journal of Jiangsu University:Medical Science Edition,2012)。またA Ehninger et al.の報告によれば、AML患者の79%(232/298)がCD123分子を発現する細胞を有していた。これらの報告はすべて、CD123がAMLの有効な血液疾患治療標的であることを示している(Blood Cancer Journal,2014)。
本発明は、CD123分子を特異的標的とする細胞外結合領域としてヒトIL-3分子を独創的に使用し、リガンド/受容体によって腫瘍関連表面抗原CD123を特異的に認識した後、細胞内共刺激分子によって細胞内に認識シグナルを転送し、免疫細胞の殺傷効果を活性化し、それによって腫瘍細胞を縮小及び排除する、ヒトCD123を標的とするCRL(CD123 CRL)を提供する。同時に、本発明は、腫瘍細胞表面のCD123に特異的に結合することができ、それによって腫瘍細胞に対して特異的な殺傷効果を生み出すことができるヒトCD123を標的とするCRL改変T細胞(CD123 CRL-T)を提供する。scFv断片などの抗体を基にした従来のCD123 CAR-Tと比較して、CD123 CRL-Tは優れたCD123標的特異的腫瘍殺傷効果及びサイトカイン放出量を示しており、その結果、標的治療の特異性及び安全性を向上させる。
本発明は以下の通りである。
[1]IL-3分子を基にしたCD123結合ドメイン、膜貫通領域、及び細胞内シグナル伝達ドメインを含む、ヒトCD123を標的とするキメラ受容体リガンド。
[2]前記CD123結合ドメインが、配列番号1の少なくとも100個の連続するアミノ酸残基を含む、上記[1]に記載のヒトCD123を標的とするキメラ受容体リガンド。
[3]前記CD123結合ドメインをコードするアミノ酸配列が配列番号1または2で示されるか、またはそれと85%~99%、90%~99%、または95%~99%の同一性を有する改変アミノ酸配列である、上記[1]に記載のヒトCD123を標的とするキメラ受容体リガンド。
[4]前記キメラ受容体リガンドが、IL-3分子を基にしたCD123結合ドメインを2つ以上含む、上記[1]または[2]に記載のヒトCD123を標的とするキメラ受容体リガンド。
[5]前記膜貫通領域が、CD4、CD8α、CD28、PD1、及び/または4-1BB膜貫通領域から選択される、上記[1]~[4]のいずれかに記載のヒトCD123を標的とするキメラ受容体リガンド。
[6]前記膜貫通領域がCD8α膜貫通領域である、上記[5]に記載のヒトCD123を標的とするキメラ受容体リガンド。
[7]前記細胞内シグナル伝達ドメインが、以下のシグナル分子:CD27、CD28、4-1BB、OX40、CD30、CD40、CD3、リンパ球機能関連抗原1(LFA-1)、CD2、CD7、LIGHT、NKG2C、B7-H3、及びCD83特異的結合リガンドまたはそれらの組み合わせの細胞内ドメインから選択されるシグナル伝達ドメイン及び/または共刺激シグナル伝達ドメインを含む、上記[1]~[6]のいずれかに記載のヒトCD123を標的とするキメラ受容体リガンド。
[8]前記細胞内シグナル伝達ドメインが、シグナル伝達ドメイン及び/または共刺激シグナル伝達ドメイン、さらに好ましくはCD3、4-1BB、及び/またはCD28シグナル伝達ドメインを含む、上記[7]に記載のヒトCD123を標的とするキメラ受容体リガンド。
[9]細胞外シグナルペプチド構造、好ましくはCD8αシグナルペプチド、GM-CSFRαシグナルペプチド、CD4シグナルペプチド、またはIL-3シグナルペプチドを含む、上記[1]~[8]のいずれかに記載のヒトCD123を標的とするキメラ受容体リガンド。
[10]前記細胞外シグナルペプチドが、好ましくはCD8αシグナルペプチドまたはIL-3シグナルペプチド、より好ましくはIL-3シグナルペプチドである、上記[9]に記載のヒトCD123を標的とするキメラ受容体リガンド。
[11]その前記細胞外シグナルペプチドが、配列番号3で示されるIL-3シグナルペプチドのアミノ酸配列を含む、[9]~[10]のいずれかに記載のヒトCD123を標的とするキメラ受容体リガンド。
[12]その前記細胞外シグナルペプチドが、配列番号4で示されるCD8αシグナルペプチドのアミノ酸配列を含む、上記[9]~[10]のいずれかに記載のヒトCD123を標的とするキメラ受容体リガンド。
[13]前記ヒトCD123を標的とするキメラ受容体リガンドがヒンジ領域構造を含まない、上記[1]~[12]のいずれかに記載のヒトCD123を標的とするキメラ受容体リガンド。
[14]前記ヒトCD123を標的とするキメラ受容体リガンドがヒンジ領域構造、好ましくはCD8α分子を含む、上記[1]~[12]のいずれかに記載のヒトCD123を標的とするキメラ受容体リガンド。
[15]前記ヒンジ領域が、配列番号5で示されるCD8αヒンジ領域のアミノ酸配列を含む、上記[14]に記載のヒトCD123を標的とするキメラ受容体リガンド。
[16]前記膜貫通領域構造が、配列番号6で示されるCD8α膜貫通領域のアミノ酸配列または配列番号7で示されるCD28膜貫通領域のアミノ酸配列を含む、上記[1]~[15]のいずれかに記載のヒトCD123を標的とするキメラ受容体リガンド。
[17]前記細胞内シグナル伝達ドメインが、配列番号8で示されるCD3ゼータのアミノ酸配列を含む、上記[1]~[16]のいずれかに記載のヒトCD123を標的とするキメラ受容体リガンド。
[18]前記細胞内共刺激シグナル伝達ドメインが、配列番号9で示される4-1BBのアミノ酸配列及び/または配列番号10で示されるCD28のアミノ酸配列を含む、上記[1]~[17]のいずれかに記載のヒトCD123を標的とするキメラ受容体リガンド。
[19]コードするアミノ酸配列が配列番号14で示されるか、またはそれと95%~99%の同一性を有するアミノ酸配列である、上記[1]~[18]のいずれかに記載のヒトCD123を標的とするキメラ受容体リガンド。
[20]コードされるアミノ酸配列が配列番号15、配列番号16、配列番号17、配列番号18、または配列番号19で示されるか、またはそれと95%~99%の同一性を有するアミノ酸配列である、上記[1]~[18]のいずれかに記載のヒトCD123を標的とするキメラ受容体リガンド。
[21]上記[1]~[20]のいずれかに記載のヒトCD123を標的とするキメラ受容体リガンドのヌクレオチド配列をコードする核酸分子。
[22]前記ヌクレオチドコード配列が、配列番号33、配列番号34、配列番号35、配列番号36、配列番号37、または配列番号38で示される、上記[21]に記載の核酸分子。
[23]上記[21]または[22]に記載の核酸分子を含むベクター。
[24]上記[21]または[22]に記載の核酸分子を含む、遺伝子操作された免疫細胞。
[25]上記[23]に記載のベクターを含む、上記[24]に記載の遺伝子操作された免疫細胞。
[26]前記免疫細胞が、造血幹細胞、多能性幹細胞、または胚性幹細胞を培養して分化することにより得たTリンパ球細胞、NK細胞、及び免疫細胞から選択することができ、より好ましくはTリンパ球である、上記[24]~[25]のいずれかに記載の遺伝子操作された免疫細胞。
[27]前記発現されるヒトCD123を標的とするキメラ受容体リガンドが、細胞外シグナルペプチド、IL-3分子を基にしたCD123結合ドメイン、膜貫通領域、及び細胞内シグナル伝達ドメインを含む、上記[24]~[26]のいずれかに記載の遺伝子操作された免疫細胞。
[28]前記発現されるヒトCD123を標的とするキメラ受容体リガンドが、配列番号14で示されるアミノ酸配列、またはそれと95%~99%の同一性を有するアミノ酸配列を含む、上記[24]~[27]のいずれかに記載の遺伝子操作された免疫細胞。
[29]前記発現されるヒトCD123を標的とするキメラ受容体リガンドが、配列番号15、配列番号16、配列番号17、配列番号18、もしくは配列番号19で示されるアミノ酸配列、またはそれと95%~99%の同一性を有するアミノ酸配列を含む、上記[24]~[27]のいずれかに記載の遺伝子操作された免疫細胞。
[30]上記[1]~[20]のいずれかに記載のヒトCD123を標的とするキメラ受容体リガンドの調製方法。
[31]上記[24]~[29]のいずれかに記載の遺伝子操作された免疫細胞を調製するための上記[30]に記載の方法。
[32]抗腫瘍薬の調製における、上記[1]~[20]のいずれかに記載のヒトCD123を標的とするキメラ受容体リガンドの使用、好ましくは抗悪性血液腫瘍薬の調製におけるその使用。
[33]抗腫瘍薬の調製における、上記[24]~[29]のいずれかに記載の遺伝子操作された免疫細胞の使用、好ましくは抗悪性血液腫瘍薬の調製におけるその使用。
K562細胞はCD123をほとんど発現しない。最初に本発明では、遺伝子合成によりヒトCD123分子をコードするヌクレオチド配列を得る。遺伝子合成サービスは南京のGenScript Biotech Corp.が提供した。T4リガーゼの作用下、合成したCD123ヌクレオチド配列を、事前にBamH1及びXbaI制限部位の消化を施したpLVX-Puro(Clontech、カタログ番号632164)レンチウイルスベクターと20℃で一晩かけて連結する。ライゲーション産物をDH5αコンピテント細胞に形質転換し、細菌プレートの上に広げる。複数のクローンパッチを採取してプラスミドを抽出する(Qiagen Endofree Megaキット)。制限酵素で消化し、配列決定して比較し、配列の一致する構築の成功したベクターをpLVX-CD123-Puroと命名する。
本発明に従って、ヒト細胞での発現を最適化するようにヒトIL-3分子のヌクレオチド配列のコドン最適化を行う。コドン最適化は、南京のGenScript Biotech Corp.のOptimumGene(商標)コドン最適化技術を用いて実施する。コドン最適化後のIL-3ヌクレオチド配列は配列番号39で示され、それによってコードされるアミノ酸配列は配列番号40で示され、その遺伝子によって発現されるIL-3分子は、IL-3シグナルペプチド及びIL-3受容体結合ドメインを含む。
(I)CD123キメラ受容体リガンドのレンチウイルスベクター構築物
本発明に従って、Clontechから購入したpLVX-PuroベクターをClaI及びEcoRI制限酵素を用いて消化反応させてCMVプロモーターをノックアウトし、消化されたベクターにヒトEF1αプロモーター(GenBank:J04617.1)をクローニングしてpLVX-hEF1αベクターを得る。遺伝子合成で得たCD123 CRL融合遺伝子配列を発現プラスミドpLVX-hEF1αにクローニングして組換えCRL発現プラスミドを作製する。組換えCRL発現プラスミド(pLLV-CRL)を抽出してpCMV-ΔR-8.74及びpMD2.Gヘルパープラスミドと一定の比率に従って混合し、293FT細胞を同時トランスフェクトする。トランスフェクションの96時間後、ウイルスを含有する細胞培養上清を回収し、4℃、3000rpmで5分間遠心分離する。0.45μmフィルターを通して濾過した後、上清を4℃、25000rpmで120分間高速遠心分離にかける。上清を廃棄し、再懸濁して溶解させることで濃縮ウイルス液を得る。この濃縮ウイルス液を後ほど使用するため-80℃で保存する。
新鮮な末梢血50mLを志願者から採取し、リンパ球分離液及び密度勾配遠心分離法を用いて末梢血単核球(PBMC)を単離する。Pan T細胞単離キット(Miltenyi Biotech)を使用して、細胞を磁気ビーズで標識し、Tリンパ球を単離して精製する。さらにCD3/CD28磁気ビーズを使用して、精製T細胞でTリンパ球の活性化及び増殖を行う。
活性化Tリンパ球を回収し、RPMI1640培地に再懸濁する。レンチウイルスを使用して1×106個の活性化Tリンパ球を感染させ、細胞懸濁液を6ウェルプレートに加え、37℃、5%CO2のインキュベーターに一晩置く。翌日、再度遠心分離を行い、培養液を新鮮な培地と交換する。2日ごとに新鮮な培地を加え、培養液の増殖を続ける。
調製したCRL-T及びCAR-T細胞を遠心分離により回収し、細胞をDPBSで3回洗浄した後、ヒトゲノム抽出キットGentra Puregene Cell Kit(Qiagenから購入)を使用してゲノムDNAを調製する。NanoDrop2000(Thermo Scientific)を使用して、調製したDNAのOD260nm及びOD280nmの吸光度を検出し、濃度を算出する。キットSYBRグリーンリアルタイムPCRマスターミックスプラス(Toyoboから購入)の説明書に従って50μlの反応系を構成し、次いで蛍光定量的PCR装置(ABI#7300)で遺伝子コピー数を検出する。qPCR検出には、正確に定量された目的の断片を含有するプラスミドを陽性対照として使用し、標準曲線をプロットする。種々のコピー数濃度及び対応するコピー数でのqPCRのCT値に従って、標準曲線に適合するように直線をプロットする。標準曲線のフィッティング式に従って、他の検出試料に対する相対コピー数を算出する。
RPMI8226細胞は一定レベルのCD123受容体を発現し(http://www.proteinatlas.org/ENSG0000018 5291-IL-3RA/tissue)、CD123分子を標的とするCAR-TはRPMI8226細胞に対して良好なin vitro細胞傷害性を有することが報告されている(WO2015193406A1)。本発明に従って、ルシフェラーゼを安定的に発現するRPMI8226細胞株を構築する(RPMI8226.Luc)。この構築方法については実施例1で参照することができる。本発明によれば、RPMI8226.Luc細胞をCRL-T細胞のin vitro機能に関する試験のためのモデル細胞として使用し、CAR1、CAR2、CAR3改変T細胞を対照として使用し、これらをそれぞれCAR1-T、CAR2-T、及びCAR3-Tと命名する。
本発明に従って、好ましくはT細胞の改変にCRL1ベクターを選択し、CD123陽性腫瘍細胞に対するサイトカインIFN-γ及びIL-2による刺激試験を実施する。本発明では、CRL-T細胞及び分化標的細胞を一定比率で37℃、5%CO2下で一晩共培養する。共培養の終了後、試験用マイクロプレートを200gで5分間遠心分離した後、上清の一部を慎重に取り出して、リアルタイム蛍光分解技術用キット(HTRF、Cisbio#64IL2PEB)を使用して、上清中のIFN-γ及びIL-2分泌レベルを検出する。
CRL-T細胞、CAR-T細胞、及びUnT細胞をそれぞれ標的細胞と20:1の比率で37℃、5%CO2下で一晩共培養する。共培養の終了後、各細胞を遠心分離にかけ、次いでONE-Glo(商標)ルシフェラーゼアッセイ試薬を添加する。PHERAStar Plusを使用してRLUの読取値を検出し、in vitro細胞傷害性を評価する。図7に示すように、実施例4と同様に、Y軸は共培養終了後の反応ウェル中の残存する相対ルシフェラーゼ活性(RLU)を示し、これはウェル中の相対的な生存細胞数に相当する。示されたルシフェラーゼRLU値が高い場合、殺傷されていない多くの標的細胞が反応ウェル中に残存しており、ウェル内の細胞傷害性が低いことを示す。逆に、示されたルシフェラーゼRLU値が低い場合、殺傷されていない標的細胞が反応ウェル中にあまり残存しておらず、ウェル内の細胞傷害性が高いことを示す。
Claims (16)
- IL-3分子を基にしたCD123結合ドメイン、膜貫通領域、及び細胞内シグナル伝達ドメインを含む、ヒトCD123を標的とするキメラ受容体リガンドであって、前記IL-3分子を基にしたCD123結合ドメインが、配列番号1の少なくとも120個の連続するアミノ酸残基を含むか、または、前記CD123結合ドメインをコードするアミノ酸配列が配列番号1もしくは2で示されるか、もしくはそれと90%~99%の同一性を有する改変アミノ酸配列であり、かつ、前記IL-3分子を基にしたCD123結合ドメインが、CD123に特異的に結合する能力を有する、キメラ受容体リガンド。
- 前記キメラ受容体リガンドが、IL-3分子を基にしたCD123結合ドメインを2つ以上含む、請求項1に記載のヒトCD123を標的とするキメラ受容体リガンド。
- 前記膜貫通領域が、CD4、CD8α、CD28、PD1、及び/または4-1BB膜貫通領域から選択される、請求項1または2に記載のヒトCD123を標的とするキメラ受容体リガンド。
- 前記細胞内シグナル伝達ドメインが、以下のシグナル分子:CD27、CD28、4-1BB、OX40、CD30、CD40、CD3、リンパ球機能関連抗原1(LFA-1)、CD2、CD7、LIGHT、NKG2C、B7-H3、及びCD83特異的結合リガンドまたはそれらの組み合わせの細胞内ドメインから選択されるシグナル伝達ドメイン及び/または共刺激シグナル伝達ドメインを含む、請求項1~3のいずれか1項に記載のヒトCD123を標的とするキメラ受容体リガンド。
- 細胞外シグナルペプチド構造を含む、請求項1~4のいずれか1項に記載のヒトCD123を標的とするキメラ受容体リガンド。
- 前記細胞外シグナルペプチド構造がCD8αシグナルペプチド、GM-CSFRαシグナルペプチド、CD4シグナルペプチド、またはIL-3シグナルペプチドである、請求項5に記載のヒトCD123を標的とするキメラ受容体リガンド。
- コードするアミノ酸配列が配列番号14、配列番号15、配列番号16、配列番号17、配列番号18、または配列番号19で示されるか、またはそれと95%~99%の同一性を有するアミノ酸配列である、請求項1~6のいずれか1項に記載のヒトCD123を標的とするキメラ受容体リガンド。
- 請求項1~7のいずれか1項に記載のヒトCD123を標的とするキメラ受容体リガンドをコードする核酸分子。
- ヌクレオチドコード配列が、配列番号33、配列番号34、配列番号35、配列番号36、配列番号37、または配列番号38で示される、請求項8に記載の核酸分子。
- 請求項8または9に記載の核酸分子を含む、遺伝子操作された免疫細胞。
- 前記免疫細胞が、造血幹細胞、多能性幹細胞、または胚性幹細胞を培養して分化することにより得たTリンパ球細胞、NK細胞、及び免疫細胞から選択することができる、請求項10に記載の遺伝子操作された免疫細胞。
- 前記免疫細胞がTリンパ球細胞である、請求項11に記載の遺伝子操作された免疫細胞。
- 前記発現されるヒトCD123を標的とするキメラ受容体リガンドが、細胞外シグナルペプチド、IL-3分子を基にしたCD123結合ドメイン、膜貫通領域、及び細胞内シグナル伝達ドメインを含む、請求項10~12のいずれか1項に記載の遺伝子操作された免疫細胞。
- 前記発現されるヒトCD123を標的とするキメラ受容体リガンドが、配列番号14、配列番号15、配列番号16、配列番号17、配列番号18、もしくは配列番号19で示されるアミノ酸配列、またはそれと95%~99%の同一性を有するアミノ酸配列を含む、請求項10~13のいずれか1項に記載の遺伝子操作された免疫細胞。
- 請求項1~7のいずれか1項に記載のヒトCD123を標的とするキメラ受容体リガンドまたは請求項10~14のいずれか1項に記載の遺伝子操作された免疫細胞を含む、抗腫瘍治療に使用するための組成物。
- 前記抗腫瘍治療が抗悪性血液腫瘍治療である、請求項15に記載の組成物。
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