JP6722175B2 - 代謝障害を処置するための組成物及びその使用方法 - Google Patents
代謝障害を処置するための組成物及びその使用方法 Download PDFInfo
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Description
配列一覧を、2015年10月28日に作成され、188KBのサイズを有するテキストファイル「NGMB−142_SeqList.txt」として本明細書と共に提供する。そのテキストファイルの内容は、それらの全体が参照によって本明細書に組み込まれる。
本出願は、2014年10月31日出願の米国特許仮出願第62/073,737号、及び2015年10月21日出願の米国特許仮出願第62/244,604号の優先権を主張し、それらの出願は、それらの全体が参照によって本明細書に組み込まれる。
本発明は特に、代謝関連状態の処置において有用であるポリペプチド複合体及びその組成物に関する。
肥満は最も一般的には、限られたエネルギー消費及び/または身体運動の欠如と結びついた過剰な食物摂取に起因する。肥満は、真性糖尿病、高血圧、アテローム硬化症、冠動脈疾患、睡眠無呼吸、通風、リウマチ、及び関節炎などの様々な疾患の発症の可能性を増大させる。さらに、例えば、40を超える肥満指数が10年超の平均余命の減少をもたらすように、死亡率リスクは肥満と直接相関する。
代謝障害を処置するための修飾GDF15ポリペプチドを提供する。当該修飾GDF15ポリペプチドは、複合体で存在し得る。本開示の複合体は、2個のGDF15ポリペプチドを含み得る。
少なくとも1つの組み込まれた突起を含むCH3配列を含むIgG Fc配列を含む、第1のポリペプチドと;
少なくとも1つの組み込まれた空隙を含むCH3配列を含むIgG Fc配列を含む、第2のポリペプチドと
を含み、その際、第1のポリペプチドの突起が第2のポリペプチドの空隙内に位置することによって、第1のポリペプチドが第2のポリペプチドと二量化しており、かつ第1のポリペプチドのC末端または第2のポリペプチドのC末端のいずれかが、少なくとも1つのN連結グリコシル化コンセンサス部位を含むGDF15変異タンパク質のN末端にコンジュゲートされている。
少なくとも1つのN連結グリコシル化コンセンサス部位を含むGDF15変異タンパク質であって、第1のポリペプチドのC末端がGDF15変異タンパク質のN末端にコンジュゲートされている、前記GDF15変異タンパク質
も、本明細書において企図する。第1のポリペプチドは、第2のポリペプチドも含んでよい複合体で存在してよい。
少なくとも1つのN連結グリコシル化コンセンサス部位を含むGDF15変異タンパク質であって、第1のポリペプチドのC末端がGDF15変異タンパク質のN末端にコンジュゲートされている、前記GDF15変異タンパク質
も、本明細書において開示する。第1のポリペプチドは、第2のポリペプチドも含んでよい複合体で存在してよい。
[本発明1001]
複合体であって、
少なくとも1つの組み込まれた突起を含むCH3配列を含むIgG Fc配列を含む、第1のポリペプチドと;
少なくとも1つの組み込まれた空隙を含むCH3配列を含むIgG Fc配列を含む、第2のポリペプチドと
を含み、
前記第1のポリペプチドの突起が前記第2のポリペプチドの空隙内に位置することによって、前記第1のポリペプチドが前記第2のポリペプチドと二量化しており、かつ
前記第1のポリペプチドのC末端または前記第2のポリペプチドのC末端のいずれかが、少なくとも1つのN連結グリコシル化コンセンサス部位を含むGDF15変異タンパク質のN末端にコンジュゲートされている、前記複合体。
[本発明1002]
第1のヘテロ二量体及び第2のヘテロ二量体を含む複合体であって、前記第1のヘテロ二量体及び第2のヘテロ二量体のそれぞれが、第1のポリペプチド及び第2のポリペプチドを含み、
前記第1のポリペプチドがIgG Fc配列を含み、前記IgG Fc配列が少なくとも1つの組み込まれた突起を含むCH3配列を含み;かつ
前記第2のポリペプチドがIgG Fc配列を含み、前記IgG Fc配列が少なくとも1つの組み込まれた空隙を含むCH3配列を含み;
前記第1のポリペプチドの突起が前記第2のポリペプチドの空隙内に位置することによって、前記第1のポリペプチドが前記第2のポリペプチドと二量化しており、
前記第1のポリペプチドのC末端または前記第2のポリペプチドのC末端のいずれかが、少なくとも1つのN連結グリコシル化コンセンサス部位を含むGDF15変異タンパク質のN末端にコンジュゲートされており、かつ
前記第1のヘテロ二量体におけるGDF15変異タンパク質が前記第2のヘテロ二量体におけるGDF15変異タンパク質と二量化し、それによって、前記第1のヘテロ二量体及び第2のヘテロ二量体を含む複合体を形成している、前記複合体。
[本発明1003]
前記第1のポリペプチドのC末端が前記GDF15変異タンパク質のN末端にコンジュゲートされている、本発明1001から1002のいずれかの複合体。
[本発明1004]
前記第2のポリペプチドのC末端が前記GDF15変異タンパク質のN末端にコンジュゲートされている、本発明1001から1002のいずれかの複合体。
[本発明1005]
第1のポリペプチドを含む複合体であって、前記第1のポリペプチドが、
少なくとも1つの組み込まれた突起を含むCH3配列を含むIgG Fc配列であって、前記第1のポリペプチドが、少なくとも1つの組み込まれた空隙を含むCH3配列を含むIgG Fc配列を含む第2のポリペプチドと二量化している、前記IgG Fc配列と、
少なくとも1つのN連結グリコシル化コンセンサス部位を含むGDF15変異タンパク質であって、前記第1のポリペプチドのC末端が前記GDF15変異タンパク質のN末端にコンジュゲートされている、前記GDF15変異タンパク質と
を含む、前記複合体。
[本発明1006]
第1のポリペプチドを含む複合体であって、前記第1のポリペプチドが、
少なくとも1つの組み込まれた空隙を含むCH3配列を含むIgG Fc配列であって、前記第1のポリペプチドが、少なくとも1つの組み込まれた突起を含むCH3配列を含むIgG Fc配列を含む第2のポリペプチドと二量化している、前記IgG Fc配列と、
少なくとも1つのN連結グリコシル化コンセンサス部位を含むGDF15変異タンパク質であって、前記第1のポリペプチドのC末端が前記GDF15変異タンパク質のN末端にコンジュゲートされている、前記GDF15変異タンパク質と
を含む、前記複合体。
[本発明1007]
前記GDF15変異タンパク質が、野生型GDF15(配列番号:1)のアミノ酸配列と少なくとも90%同一である連続アミノ酸配列を含む、本発明1001から1006のいずれかの複合体。
[本発明1008]
前記GDF15変異タンパク質が、
前記N連結グリコシル化コンセンサス部位を作製する、配列番号:1における対応するアミノ酸の少なくとも1つの置換
を含む、本発明1001から1007のいずれかの複合体。
[本発明1009]
前記置換がD5TまたはD5Sを含む、本発明1008の複合体。
[本発明1010]
前記置換がR21Nを含む、本発明1008の複合体。
[本発明1011]
前記GDF15変異タンパク質が、
前記N連結グリコシル化コンセンサス部位を作製する、配列番号:1における対応するアミノ酸の以下の置換対の少なくとも1つ
を含む、本発明1008の複合体:
i) R16N及びH18T、またはR16N及びH18S;
ii) S23N及びE25T、またはS23N及びE25S;
iii) S50N及びF52T、またはS50N及びF52S;
iv) F52N及びA54T、またはF52N及びA54S;
v) R53N及びA55T、またはR53N及びA55S;
vi) S64N及びH66T、またはS64N及びH66S;
vii) K91N及びD93T、またはK91N及びD93S;
viii) D93N及びG95T、またはD93N及びG95S;
ix) T94N及びV96T、またはT94N及びV96S;
x) V96N及びL98T、またはV96N及びL98S;
xi) S97N及びQ99T、またはS97N及びQ99S;ならびに
xii) A106N及びD108T、またはA106N及びD108S。
[本発明1012]
配列番号:1における対応するアミノ酸の以下の置換対の少なくとも1つを含む、本発明1011の複合体:
S23N及びE25T、またはS23N及びE25S;
R53N及びA55T、またはR53N及びA55S;
S64N及びH66T、またはS64N及びH66S;
K91N及びD93T、またはK91N及びD93S;
D93N及びG95T、またはD93N及びG95S;
S97N及びQ99T、またはS97N及びQ99S;ならびに
A106N及びD108T、またはA106N及びD108S。
[本発明1013]
配列番号:1における対応するアミノ酸の以下の置換対の少なくとも1つを含む、本発明1011の複合体:
S64N及びH66T、またはS64N及びH66S;
K91N及びD93T、またはK91N及びD93S;
D93N及びG95T、またはD93N及びG95S;ならびに
S97N及びQ99T、またはS97N及びQ99S。
[本発明1014]
配列番号:1における対応するアミノ酸の以下の置換対の少なくとも1つを含む、本発明1011の複合体:
K91N及びD93T、またはK91N及びD93S;ならびに
D93N及びG95T、またはD93N及びG95S。
[本発明1015]
前記GDF15変異タンパク質が、少なくとも98アミノ酸長で、配列番号:1のアミノ酸配列と少なくとも95%同一な連続アミノ酸配列を含み、前記ポリペプチドのC末端アミノ酸が、配列番号:1において112位にあるイソロイシンに対応する、前記本発明のいずれかの複合体。
[本発明1016]
前記連続アミノ酸配列が少なくとも98アミノ酸長であり、配列番号:1のN末端に存在する最初のアミノ酸に対応する最初のアミノ酸を含まず、前記C末端アミノ酸が、配列番号:1において112位にあるイソロイシンに対応する、本発明1015の複合体。
[本発明1017]
前記連続アミノ酸配列が少なくとも98アミノ酸長であり、配列番号:1のN末端に存在する最初の2個のアミノ酸に対応する最初の2個のアミノ酸を含まず、前記C末端アミノ酸が、配列番号:1において112位にあるイソロイシンに対応する、本発明1015の複合体。
[本発明1018]
前記連続アミノ酸配列が少なくとも98アミノ酸長であり、配列番号:1のN末端に存在する最初の3個のアミノ酸に対応する最初の3個のアミノ酸を含まず、前記C末端アミノ酸が、配列番号:1において112位にあるイソロイシンに対応する、本発明1015のいずれかの複合体。
[本発明1019]
前記連続アミノ酸配列が少なくとも98アミノ酸長であり、配列番号:1のN末端に存在する最初の6個のアミノ酸に対応する最初の6個のアミノ酸を含まず、前記C末端アミノ酸が、配列番号:1において112位にあるイソロイシンに対応する、本発明1015の複合体。
[本発明1020]
前記連続アミノ酸配列が少なくとも98アミノ酸長であり、配列番号:1のN末端に存在する最初の14個のアミノ酸に対応する最初の14個のアミノ酸を含まない、本発明1015の複合体。
[本発明1021]
前記第1のポリペプチドまたは前記第2のポリペプチドのいずれかのC末端が、リンカーを介して、前記GDF15変異タンパク質のN末端にコンジュゲートされている、前記本発明のいずれかの複合体。
[本発明1022]
前記IgG Fcが、配列番号:2におけるアミノ酸配列と少なくとも90%同一な連続アミノ酸配列を含む、前記本発明のいずれかの複合体。
[本発明1023]
前記組み込まれた突起が、ヒトIgG1 Fc配列における対応するアミノ酸の少なくとも1つの置換を含み、前記置換が、EUナンバリングによるアミノ酸残基347、366、及び394からなる群から選択される位置にある、前記本発明のいずれかの複合体。
[本発明1024]
前記少なくとも1つの置換が、EUナンバリングによるQ347W/Y、T366W/Y、及びT394W/Yからなる群から選択される、本発明1023の複合体。
[本発明1025]
前記組み込まれた空隙が、ヒトIgG1 Fc配列における対応するアミノ酸の少なくとも1つの置換を含み、前記置換が、EUナンバリングによるアミノ酸残基366、368、394、405、及び407からなる群から選択される位置にある、前記本発明のいずれかの複合体。
[本発明1026]
前記少なくとも1つの置換が、EUナンバリングによるT366S、L368A、T394S、F405T/V/A、及びY407T/V/Aからなる群から選択される、本発明1025の複合体。
[本発明1027]
前記突起が、EUナンバリングによる前記置換T366W/Yを含み、前記空隙が前記置換T366S、L368A、及びY407T/V/Aを含む、前記本発明のいずれかの複合体。
[本発明1028]
前記突起が、EUナンバリングによる前記置換T366W/Yを含み、前記空隙が前記置換Y407T/V/Aを含む、前記本発明のいずれかの複合体。
[本発明1029]
前記突起が、EUナンバリングによる前記置換T366Yを含み、前記空隙が前記置換Y407Tを含む、前記本発明のいずれかの複合体。
[本発明1030]
前記突起が、EUナンバリングによる前記置換T366Wを含み、前記空隙が前記置換Y407Aを含む、前記本発明のいずれかの複合体。
[本発明1031]
前記突起が、EUナンバリングによる前記置換T394Yを含み、前記空隙が前記置換Y407Tを含む、前記本発明のいずれかの複合体。
[本発明1032]
前記第1及び第2のポリペプチドにおけるIg Fc配列中に存在するヒンジ領域間で形成される1つまたは2つのジスルフィド結合を介して、前記第1のポリペプチドが前記第2のポリペプチドと二量化している、前記本発明のいずれかの複合体。
[本発明1033]
前記本発明のいずれかの第1及び第2のポリペプチドをコードする、核酸。
[本発明1034]
前記核酸からの第1及び第2のポリペプチドの発現をもたらす発現制御要素に作動可能に連結されている、本発明1033の核酸。
[本発明1035]
本発明1033から1034のいずれかの核酸分子を含む、ベクター。
[本発明1036]
ウイルスベクターを含む、本発明1035のベクター。
[本発明1037]
本発明1001から1032のいずれかの第1及び第2のポリペプチドを発現する、宿主細胞。
[本発明1038]
本発明1033から1034のいずれかの核酸分子または本発明1035から1036のいずれかのベクターを含む、宿主細胞。
[本発明1039]
前記本発明のいずれかの第1のポリペプチドをコードする第1の核酸、及び前記本発明のいずれかの第2のポリペプチドをコードする第2の核酸。
[本発明1040]
前記核酸のそれぞれが、それぞれ第1及び第2の核酸からの第1及び第2のポリペプチドの発現をもたらす発現制御要素に作動可能に連結されている、本発明1039の第1及び第2の核酸。
[本発明1041]
本発明1039から1040のいずれかの、第1の核酸を含む第1のベクター及び第2の核酸を含む第2のベクター。
[本発明1042]
前記ベクターのそれぞれがウイルスベクターを含む、本発明1041の第1及び第2のベクター。
[本発明1043]
本発明1001から1032のいずれかの第1のポリペプチド及び第2のポリペプチドを発現する、宿主細胞。
[本発明1044]
本発明1039から1040のいずれかの第1の核酸を含む宿主細胞及び第2の宿主細胞;または本発明1041から1042のいずれかの第1のベクター及び第2のベクターを含む宿主細胞。
[本発明1045]
本発明1001から1032のいずれかの第1のポリペプチドを発現する第1の宿主細胞、及び本発明1001から1032のいずれかの第2のポリペプチドを発現する第2の宿主細胞。
[本発明1046]
本発明1039から1040のいずれかの第1の核酸を含む第1の宿主細胞、及び本発明1039から1040のいずれかの第2の核酸を含む第2の宿主細胞;または本発明1041から1042のいずれかの第1のベクターを含む第1の宿主細胞、及び本発明1040から1041のいずれかの第2のベクターを含む第2の宿主細胞。
[本発明1047]
本発明1001から1032のいずれかの複合体と、薬学的に許容される希釈剤、担体、または添加剤とを含む、医薬組成物。
[本発明1048]
少なくとも1つの追加の予防薬または治療薬をさらに含む、本発明1047の医薬組成物。
[本発明1049]
本発明1001から1032のいずれかのGDF15変異タンパク質に特異的に結合する、抗体。
[本発明1050]
本発明1049の抗体と、薬学的に許容される希釈剤、担体、または添加剤とを含む、医薬組成物。
[本発明1051]
少なくとも1つの追加の予防薬または治療薬をさらに含む、本発明1050の医薬組成物。
[本発明1052]
本発明1047から1048及び1050から1051のいずれかの医薬組成物を含む、滅菌容器。
[本発明1053]
シリンジである、本発明1052の滅菌容器。
[本発明1054]
本発明1052から1053のいずれかの滅菌容器を含む、キット。
[本発明1055]
本発明1001から1032のいずれかの複合体を作製する方法であって、
前記第1及び第2のポリペプチドを発現する宿主細胞を培養する工程、および
前記第1のポリペプチド及び前記第2のポリペプチドを含む複合体を単離する工程
を含む、前記方法。
[本発明1056]
対象において体重障害を処置または予防する方法であって、対象に、本発明1001から1032のいずれかの複合体を投与する工程を含み、前記複合体が、対象における前記体重障害の処置または予防において有効な量で投与される、前記方法。
[本発明1057]
対象においてグルコース代謝障害を処置または予防する方法であって、対象に、本発明1001から1032のいずれかの複合体を投与する工程を含み、前記複合体が、対象における前記グルコース代謝障害の処置または予防において有効な量で投与される、前記方法。
[本発明1058]
前記投与が、前記対象による食物摂取の減少をもたらす、本発明1056から1057のいずれかの方法。
[本発明1059]
前記投与が、前記対象の体重減少をもたらす、本発明1056から1057のいずれかの方法。
[本発明1060]
前記投与が、前記対象において血糖低下をもたらす、本発明1056から1057のいずれかの方法。
[本発明1061]
前記グルコース代謝障害が真性糖尿病である、本発明1057の方法。
[本発明1062]
前記対象がヒトである、本発明1056から1061のいずれかの方法。
[本発明1063]
前記対象が肥満である、本発明1056から1062のいずれかの方法。
[本発明1064]
前記投与が非経口注射による、本発明1056から1063のいずれかの方法。
[本発明1065]
前記非経口注射が皮下である、本発明1064の方法。
[本発明1066]
前記投与が、前記複合体を毎日投与することを含む、本発明1056から1065のいずれかの方法。
[本発明1067]
前記投与が、前記複合体を週に2回投与することを含む、本発明1056から1065のいずれかの方法。
[本発明1068]
前記投与が、前記複合体を週に1回投与することを含む、本発明1056から1065のいずれかの方法。
[本発明1069]
前記投与が、前記複合体を隔週投与することを含む、本発明1056から1065のいずれかの方法。
[本発明1070]
前記投与が、前記複合体を月に1回投与することを含む、本発明1056から1065のいずれかの方法。
[本発明1071]
対象において体重障害を処置または予防するための、本発明1001から1032のいずれかの複合体を含む組成物。
[本発明1072]
対象における前記体重障害の処置において有効な量で対象に投与される、対象において前記体重障害を処置するための本発明1071の組成物。
[本発明1073]
対象における前記体重障害の予防において有効な量で対象に投与される、対象において前記体重障害を予防するための本発明1071の組成物。
[本発明1074]
対象においてグルコース代謝障害を処置または予防するための、本発明1001から1032のいずれかの複合体を含む組成物。
[本発明1075]
対象における前記グルコース代謝障害の処置において有効な量で投与される、対象においてグルコース代謝障害を処置するための本発明1074の組成物。
[本発明1076]
対象における前記グルコース代謝障害の予防において有効な量で投与される、対象においてグルコース代謝障害を予防するための本発明1074の組成物。
[本発明1077]
前記組成物の投与が、対象による食物摂取の減少をもたらす、本発明1071から1076のいずれかの組成物。
[本発明1078]
前記組成物の投与が、対象の体重減少をもたらす、本発明1071から1076のいずれかの組成物。
[本発明1079]
前記組成物の投与が、対象における血糖の低下をもたらす、本発明1071から1076のいずれかの組成物。
[本発明1080]
対象が真性糖尿病を有するか、または真性糖尿病を発症するリスクを有する、本発明1071から1076のいずれかの組成物。
[本発明1081]
非経口注射のために製剤化されている、本発明1071から1080のいずれかの組成物。
本開示の方法及び組成物をさらに記載する前に、本開示は、本明細書において記述する特定の実施形態に限定されないことを理解し、また本明細書において使用する専門用語は、特定の実施形態を記載することだけを目的としており、限定を意図したものではないことも理解されたい。
本明細書において互換的に使用される「ポリペプチド」、「ペプチド」、及び「タンパク質」という用語は、遺伝的にコードされた、及び非遺伝的にコードされたアミノ酸、化学的に、または生化学的に修飾または誘導体化されたアミノ酸、ならびに修飾ポリペプチド骨格を有するポリペプチドを含み得る任意の長さのアミノ酸のポリマー形態を指す。この用語には、これらだけに限定されないが、同種アミノ酸配列を有する融合タンパク質、N末端メチオニン残基を含むか、または含まない異種及び同種リーダー配列を有する融合タンパク質を含む融合タンパク質;免疫的にタグ付けされたタンパク質などが含まれる。具体的な実施形態では、この用語は、遺伝的にコードされたアミノ酸を含む任意の長さのアミノ酸のポリマー形態を指す。特定の実施形態では、この用語は、異種アミノ酸配列に融合した遺伝的にコードされたアミノ酸を含む任意の長さのアミノ酸のポリマー形態を指す。特定の実施形態では、この用語は、場合により、異種配列に融合している98〜112アミノ酸長のアミノ酸を指す。具体的な実施形態では、適切な場合には、本明細書に開示及び記載のタンパク質及び分子に言及する場合、「ポリペプチド」、「ペプチド」、及び「タンパク質」という用語は、本明細書において定義するとおりのポリペプチドを指す。
MIC−1(マクロファージ阻害性サイトカイン−1)としても知られるGDF15、PDF(前立腺分化因子)、PLAB(胎盤骨形成タンパク質)、NAG−1(非ステロイド系抗炎症薬(NSAID)活性化遺伝子)、TGF−PL、及びPTGFBは、トランスフォーミング増殖因子β(TGF−β)スーパーファミリーのメンバーである。62kDa細胞内前駆体タンパク質として合成され、フューリン様プロテアーゼによって後に切断されるGDF15は、25kDaジスルフィド連結タンパク質として分泌される。(例えば、Fairlie et al., J. Leukoc. Biol 65:2−5 (1999)を参照されたい)。GDF15 mRNAは、肝臓、腎臓、膵臓、結腸、及び胎盤を含むいくつかの組織において見られ、肝臓におけるGDF15発現は、肝臓、腎臓、心臓、及び肺などの臓器の損傷中に顕著に上方制御され得る。
本開示は、一部では、配列番号:1(成熟112アミノ酸長ヒトGDF15)のアミノ酸配列と少なくとも80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%、または100%同一である連続アミノ酸配列を含むポリペプチドを企図する。当該ポリペプチドは、配列番号:1のアミノ酸配列に対して1つまたは複数のアミノ酸置換及び/または欠失を含んでよい。ある種の実施形態では、アミノ酸置換に加えて、本開示のポリペプチドはまた、配列番号:1のアミノ酸配列に対してアミノ酸欠失を含んでよい。一部の実施形態では、本開示のポリペプチドは、配列番号:1のアミノ酸配列に対してアミノ酸欠失を含んでよい。
i. R16N及びH18T、またはR16N及びH18S;
ii. S23N及びE25T、またはS23N及びE25S;
iii. L24N及びD26T、またはL24N及びD26S;
iv. S50N及びF52T、またはS50N及びF52S;
v. F52N及びA54T、またはF52N及びA54S;
vi. Q51N及びR53T、またはQ51N及びR53S;
vii. R53N及びA55T、またはR53N及びA55S;
viii. S64N及びH66T、またはS64N及びH66S;
ix. L65N及びR67T、またはL65N及びR67S;
x. S82N及びN84T、またはS82N及びN84S;
xi. K91N及びD93T、またはK91N及びD93S;
xii. D93N及びG95T、またはD93N及びG95S;
xiii. T94N及びV96T、またはT94N及びV96S;
xiv. V96N及びL98T、またはV96N及びL98S;
xv. S97N及びQ99T、またはS97N及びQ99S;ならびに
xvi. A106N及びD108T、またはA106N及びD108S。
例示的な実施形態では、本明細書において開示するGDF15ポリペプチドは、本明細書に記載のポリペプチド(例えば、ヒトGDF15分子、修飾ヒトGDF15分子、GDF15変異タンパク質、及び修飾GDF15変異タンパク質)の1つまたは複数のアミノ酸配列に融合したFcポリペプチドまたはその断片を含む融合ポリペプチドとして存在し得る。本明細書において提供するとおり、当該GDF15ポリペプチドは、野生型ポリペプチドまたは変異タンパク質、例えば、グリコシル化変異タンパク質であってよい。本明細書において使用する場合、ポリペプチド、例えば、GDF15ポリペプチドの文脈における「グリコシル化変異タンパク質」または「糖変異タンパク質」または「グリコシル化変異体」または「糖変異体」は、1つまたは複数のグリコシル化コンセンサス部位を、参照(野生型)ポリペプチドがその位置にグリコシル化コンセンサス部位を含まないアミノ酸配列における位置に含むポリペプチドを指す。ある種のケースでは、当該融合ポリペプチドは、本明細書において開示するGDF15糖変異タンパク質のN末端に融合しているFc−配列を含んでよい。
が含まれる。
xvii. R16N及びH18T、またはR16N及びH18S;
xviii. S23N及びE25T、またはS23N及びE25S;
xix. S50N及びF52T、またはS50N及びF52S;
xx. F52N及びA54T、またはF52N及びA54S;
xxi. R53N及びA55T、またはR53N及びA55S;
xxii. S64N及びH66T、またはS64N及びH66S;
xxiii. K91N及びD93T、またはK91N及びD93S;
xxiv. D93N及びG95T、またはD93N及びG95S;
xxv. T94N及びV96T、またはT94N及びV96S;
xxvi. V96N及びL98T、またはV96N及びL98S;
xxvii. S97N及びQ99T、またはS97N及びQ99S;ならびに
xxviii. A106N及びD108T、またはA106N及びD108S。
(a)ノブ(Fc−ノブ)を含み、かつ下記の配列を有するhIgG1−Fcポリペプチド:
(配列番号:127);及び
(b)ホール(Fc−ホール)を含み、かつ下記の配列を有するhIgG1−Fcポリペプチド:
(配列番号:4)
を含み、
Fc−ノブ(a)またはFc−ホール(b)のいずれかは、C末端で、GDF15糖変異タンパク質のN末端に融合している。当該GDF15糖変異タンパク質の配列は、下記のとおりであってよい。
ある種の例では、当該Fc−ノブのアミノ酸配列は、配列番号:127のアミノ酸配列と少なくとも85%、90%、92%、95%、96%、97%、98%、99%、またはそれ以上同一であってよい。ある種の例では、当該Fc−ホールのアミノ酸配列は、配列番号:4のアミノ酸配列と少なくとも85%、90%、92%、95%、96%、97%、98%、99%、またはそれ以上同一であってよい。ある種の例では、当該GDF15変異タンパク質のアミノ酸配列は、配列番号:128〜136のいずれか1つのアミノ酸配列と少なくとも85%、90%、92%、95%、96%、97%、98%、99%、またはそれ以上同一であってよい。
本開示のポリペプチドを、組換え方法及び非組換え方法(例えば、化学合成)を含む任意の適切な方法によって生成することができる。
ポリペプチドを化学的に合成する場合、液相または固相を介して合成を進めることができる。固相ペプチド合成(SPPS)は、非天然アミノ酸及び/またはペプチド/タンパク質骨格の修飾の組み込みを可能にする。Fmoc及びBocなどのSPPSの様々な形態を、本開示のポリペプチドを合成するために利用可能である。化学合成の詳細は当技術分野において公知である(例えば、Ganesan A. 2006 Mini Rev. Med. Chem. 6:3−10;及びCamarero J.A. et al., 2005 Protein Pept Lett. 12:723−8)。
ポリペプチドを、組換え技術を使用して生成する場合、そのポリペプチドを、任意の適切なコンストラクト、及び細菌(例えば、E.coli)または酵母宿主細胞などの、それぞれ、原核細胞または真核細胞であり得る任意の適切な宿主細胞を使用して、細胞内タンパク質として、または分泌タンパク質として生成してよい。宿主細胞として使用してよい真核細胞の他の例には、昆虫細胞、哺乳類細胞、及び/または植物細胞が含まれる。哺乳類宿主細胞を使用する場合、それらには、ヒト細胞(例えば、HeLa、293、H9、及びJurkat細胞);マウス細胞(例えば、NIH3T3、L細胞、及びC127細胞);霊長類細胞(例えば、Cos1、Cos7、及びCV1)、及びハムスター細胞(例えば、チャイニーズハムスター卵巣(CHO)細胞)が含まれ得る。具体的な実施形態では、当該ポリペプチド及びそのポリペプチドを含む複合体をCHO細胞中で生成する。他の実施形態では、当該ポリペプチド及びそのポリペプチドを含む複合体を酵母細胞中で生成し、特定の実施形態では、酵母細胞は、哺乳類様N−グリカンを含む糖タンパク質を生成するように遺伝子操作された酵母細胞であってよい。
本開示は、本開示のポリペプチドまたは融合タンパク質に特異的に結合する単離抗体を含む抗体を提供する。「抗体」という用語は、インタクトなモノクローナル抗体、ポリクローナル抗体、少なくとも2つのインタクトな抗体から形成される多特異性抗体(例えば、二重特異性抗体)、ならびにFab及びF(ab)'2を含む抗体結合断片を包含するが、ただし、それらが所望の生物学活性を呈することを条件とする。基本的な全抗体構造単位は四量体を含み、各四量体は2つの同一のポリペプチド鎖対から構成され、各対は、1つの「軽」鎖(約25kDa)と1つの「重」鎖(約50〜70kDa)とを有する。各鎖のアミノ末端部分は、主に抗原認識を担う約100〜110個またはそれ以上のアミノ酸の可変領域を含む。対照的に、各鎖のカルボキシ末端部分は、主にエフェクター機能を担う定常領域を画定する。ヒトの軽鎖はカッパ及びラムダとして分類される一方で、ヒト重鎖はミュー、デルタ、ガンマ、アルファ、またはイプシロンとして分類され、それぞれ、IgM、IgD、IgG、IgA、及びIgEとして抗体のアイソタイプを定義する。結合断片は、組換えDNA技術によって、またはインタクトな抗体の酵素もしくは化学切断によって生成される。結合断片は、Fab、Fab'、F(ab')2、Fv、及び単鎖抗体を含む。
本開示は、本明細書に記載のとおりの本開示の複合体またはその組成物を投与することによって、肥満及び他の体重障害、高血糖、インスリン過剰血症、グルコース不耐性、グルコース代謝障害などの代謝及び代謝関連の疾患を処置または予防するための方法を提供する。そのような方法は、例えば、症状の重症度または頻度を減少させることによって、疾患、障害、または状態に関連する1つまたは複数の症状に対して有利な作用も有し得る。
本開示の複合体は、対象に投与するために適した組成物の形態であり得る。一般的に、そのような組成物は、1つもしくは複数の複合体、及び1つもしくは複数の薬学的に許容される、もしくは生理学的に許容される希釈剤、担体、または添加剤を含む「医薬組成物」である。ある種の実施形態では、当該複合体は、医薬組成物中に治療有効量で存在する。当該医薬組成物を、本開示の方法において使用してよく;したがって、例えば、当該医薬組成物は、本明細書に記載の治療法及び予防法ならびに使用を実践するために、ex vivoまたはin vivoで対象に投与することができる。本明細書において言及するとおり、当該複合体は、グリコシル化されていても、またはされていなくてもよい。例えば、当該複合体は、真核宿主細胞において生成されるときにグリコシル化されてもよいし、医薬組成物へと製剤化する前に炭水化物部分を除去するためのプロセスを受けてもよい。炭水化物部分の除去は、当該複合体におけるポリペプチドのグリコシル化の顕著な低減または当該複合体におけるポリペプチドのグリコシル化の完全な非存在をもたらし得る。
本開示は、任意の適切な手法での、本開示の複合体及びその組成物の投与を企図する。適切な投与経路には、非経口(例えば、筋肉内、静脈内、皮下(例えば、注射または移植片)、腹腔内、槽内、関節内、腹腔内、脳内(実質内)、及び脳室内)、経口、経鼻、経膣、舌下、眼内、直腸内、局所(例えば、経皮)、舌下、及び吸入が含まれる。
本開示は、1つまたは複数の活性治療薬または他の予防もしくは治療モダリティと併用しての、本明細書において提供する複合体の使用を企図する。そのような併用療法では、様々な活性薬剤は往々にして、異なる作用機序を有する。そのような併用療法は、薬剤の1つまたは複数の用量低減を可能にし、それによって、薬剤の1つまたは複数に関連する有害な作用を減少または排除することによって特に有利であり得;さらに、そのような併用療法は、基礎疾患、障害、または状態に対して相乗的な治療または予防作用を有し得る。
本開示の複合体を、例えば、投与の目標(例えば、所望される解消程度);処置される対象の年齢、体重、性別、ならびに健康及び身体状態;当該ポリペプチドの性質、及び/または投与される製剤;投与経路;ならびに疾患、障害、状態、またはその症状の性質(例えば、グルコース/インスリンの調節不全の重症度、及び障害の段階)に依存する量で、対象に投与してよい。当該投薬レジメンは、投与される薬剤に関連する任意の有害作用の存在、性質、及び程度も考慮に入れてよい。有効な投薬量及び投薬レジメンは、例えば、安全性及び用量漸増試験、in vivo研究(例えば、動物モデル)、及び当業者に公知の他の方法から容易に決定することができる。
本開示は、本開示の複合体(複数可)、及びその医薬組成物を含むキットも企図する。当該キットは一般的に、以下に記載するとおりの様々な成分を収容する物理的構造の形態であり、例えば、上述の方法の実行(例えば、体重減少を必要とする対象への複合体の投与)において利用され得る。
次の実施例は、当業者に、本発明をどのように作製及び使用するかの完全な開示及び説明を提供するように提示され、本発明者らが自身の発明とみなすものの範囲を限定するようには意図されておらず、以下の実験が全てまたは唯一の実行される実験であると示すようにも意図されていない。使用される数値(例えば、量、温度等)に関して確度を確保する努力が成されているが、多少の実験誤差及び偏差が計上されるはずである。
次の方法及び材料を以下の実施例において使用した。
(配列番号:55)
である。
(配列番号:56)を挿入することによって修飾した。両方の制限部位を除去する一方で、分泌される因子のさらなるインフレームクローニングのために、AgeI部位を作製した。単一断片挿入(例えば、ヒトIgG1のFc部分)のために、In−Fusion技術(Clontech)を使用した。2つ以上のPCR生成断片(すなわち、hIgG1−Fc+GDF15)を挿入するために、本発明者らは、製造プロトコルに従ってGibson Assembly Master Mix(NEB)を使用した。すべてのPCR断片を、Sapphire PCRミックスによって増幅し、Qiagen Gel Extractionキットを使用してゲル精製した。TOP10 Electroコンピテント細胞(Life Technologies)をクローニング反応で形質転換し、カルベニシリンを含有するLB寒天プレート上に播種し、終夜37℃でインキュベートした。単一コロニーを取り出し、配列決定によって分析した。陽性コロニーからのDNAを増幅し(DNA−Maxi−prep、Qiagen)、全配列を確認し、組換えタンパク質発現のために哺乳類細胞に遺伝子導入するために使用した。
Fc−GDF15設計は、図1において記載されており、一次配列は、下記に示されている(コンストラクトB1a/b〜B19a/b)。Fc−GDF15分子の生成アセンブリを達成するために、効率的なシステムを設計して、GDF15/GDF15二量化を可能にしつつ、Fc/Fc二量化を可能にした。単鎖Fc−GDF15のミスフォールディング及び凝集の可能性を回避するために、ヘテロ二量体融合パートナーをFc/Fc相互作用のために設計して、高忠実度のGDF15/GDF15ホモ二量化を可能にした。ノブ−イン−ホールFc/Fcヘテロ二量体を、GDF15アセンブリ及びExpi293F一過性系からの分泌に対処するように設計した。(G4S)nリンカー(n=2、3、4、または5)及びGDF15とカップリングさせた[T366Y(ノブ)//Y407T(ホール)]または[T366W(ノブ)//T366S−L368A−Y407V(ホール)]システムを使用して、Fc/Fcヘテロ二量体ノブ−イン−ホールシステムを評価した。FcのCH3ドメインにおけるアミノ酸位のナンバリングは、EUナンバリングシステムに基づくことに留意する(Edelman, G.M. et al., Proc. Natl. Acad. USA, 63, 78−85 (1969))。すべてのケースにおいて、Fc−融合(ノブ/ホール)パートナーを、アミノ酸残基A1〜I112、R2〜I112、N3〜I112、G4〜I112、D5〜I112、H6〜I112、またはC7〜I112を含む成熟GDF15のN末端にカップリングさせた。N末端での配列(ARNGDH、配列番号:95)が、タンパク質分解感受性の部位として予め実証されていて、N末端短縮化が、これらのN末端短縮化を含まないGDF15よりも優れた安定性をもたらすので、GDF15のN末端短縮化(Δ1=R2〜I112、Δ2=N3〜I112、Δ3=G4〜I112、Δ4=D5〜I112、Δ5=H6〜I112、またはΔ6=C7〜I112)を安定性の増強のために導入した。
をIgG1エフェクター機能性の除去のために導入した。(Fc/Fc)−GDF15ヘテロ二量体ノブ−イン−ホール設計をアセンブリについて発現プロファイルし、図2Aにおいて報告する。すべてのケースで、ノブ−イン−ホール(Fc/Fc)−GDF15の一過性発現は、精製の後に、正確にアセンブリされた生成物0mg/L〜74.9mg/Lの回収量をもたらした(0=凝集物/発現なし、<25mg/L、25mg/L〜49.9mg/L、50mg/L〜74.9mg/L、75mg/L〜99.0mg/L、>100mg/L)。すべての場合に、ノブ−イン−ホールヘテロ二量体Fc/Fc−GDF15分子のアセンブリ及び分泌は、Fc(ホール):Fc(ホール)、Fc(ノブ):Fc(ノブ)、Fc(ノブ)−GDF15:Fc(ノブ)−GDF15及びFc(ホール)−GDF15:Fc(ホール)−GDF15などのミスフォールディングされたホモ二量体種の様々な混入レベルを伴った。発現プロファイリングに基づき、ヘテロ二量体Fcパートナー鎖上のT366S−L368A−Y407V(ホール)とカップリングされた、Fc−GDF15鎖上に配置されたT366W(ノブ)(図1D)は、Fc/Fc−ホモ二量体生成物の最大安定性及び最小化ミスペアリングで、生成物を生成することが見出された(図2A、変異体B5a/B5b)。この設計が、さらなる発現操作及び最適化の焦点となった。
体重に対する、組換えヒトGDF15に融合した組換えFc−ヘテロ二量体(すなわち、各ヘテロ二量体がFc−GDF15糖変異タンパク質ポリペプチドと二量化したFcポリペプチドを有する2個のヘテロ二量体の複合体)を有する皮下投与された融合分子の効果を35日間にわたって評価した。簡単には、当該融合分子B9a/B9b、B11a/B11b、及びB13a/B13bを、0.4nmol/kg及び4nmol/kgの用量で、単一皮下大量注射(10mL/kg)として、体重約35〜40gのDIOマウスに毎週1回、21日間にわたって投与した。ビヒクル対照または融合分子の投与後に、21日間のタンパク質投薬、続く、14日間のウォッシュアウト(投与後)からなる35日間にわたる様々な時点で体重減少をモニターして、有効性をモニターした。
Claims (36)
- 第1のヘテロ二量体及び第2のヘテロ二量体を含む複合体であって、前記第1のヘテロ二量体及び第2のヘテロ二量体のそれぞれが、
(i)N末端からC末端に、ヒンジ領域を含むヒトIgG Fc配列、及びヒトIgG1 Fc配列における対応するアミノ酸の少なくとも1つの置換を含む少なくとも1つの組み込まれた突起を含むCH3配列、を含む第1のポリペプチドであって、前記置換がEUナンバリングによるQ347W/Y、T366W/Y、及びT394W/Yからなる群から選択される、第一のポリペプチド、ならびに
(ii)N末端からC末端に、ヒンジ領域を含むヒトIgG Fc配列、及びヒトIgG1 Fc配列における対応するアミノ酸の少なくとも1つの置換を含む少なくとも1つの組み込まれた空隙を含むCH3配列、を含む第2のポリペプチドであって、前記置換がEUナンバリングによるT366S、L368A、T394S、F405T/V/A,及びY407T/V/Aからなる群から選択される、第2のポリペプチド、
を含み、
前記第1のポリペプチドの突起が前記第2のポリペプチドの空隙内に位置することによって、前記第1のポリペプチドが前記第2のポリペプチドと二量化しており、
前記第1のポリペプチドのC末端または前記第2のポリペプチドのC末端のいずれかが、リンカーを介してGDF15変異タンパク質のN末端にコンジュゲートされており、前記GDF15変異タンパク質が、少なくとも98アミノ酸長で、配列番号:1のアミノ酸配列と少なくとも95%同一な連続アミノ酸配列を含み、前記GDF15変異タンパク質の前記C末端アミノ酸が、配列番号:1において112位にあるイソロイシンに対応し、かつ前記連続アミノ酸配列が配列番号:1のN末端に存在する最初の2個のアミノ酸を含まず、かつ前記GDF15変異タンパク質が配列番号:1のアミノ酸配列に対するD5T置換を含み、かつ
前記第1のヘテロ二量体におけるGDF15変異タンパク質が前記第2のヘテロ二量体におけるGDF15変異タンパク質と二量化し、それによって、前記第1のヘテロ二量体及び第2のヘテロ二量体を含む複合体を形成している、前記複合体。 - 前記第1のポリペプチドが、N末端からC末端に、
ヒンジ領域を含む前記ヒトIgG Fc配列及び少なくとも1つの組み込まれた突起を含む前記CH3配列
前記リンカー、及び
前記GDF15変異タンパク質
を含み、かつ
前記第2のポリペプチドが、N末端からC末端に、
ヒンジ領域を含む前記ヒトIgG Fc配列及び少なくとも1つの組み込まれた空隙を含む前記CH3配列
を含む、請求項1に記載の複合体。 - 前記第1のポリペプチドのIgG FcがIgG1 Fcである、請求項1または2に記載の複合体。
- 前記第2のポリペプチドのIgG FcがIgG1 Fcである、請求項1〜3のいずれか一項に記載の複合体。
- 前記第1のポリペプチドが置換T366Wを含む、請求項1〜4のいずれか一項に記載の複合体。
- 前記第2のポリペプチドが置換T366S、L368A、及びY407Vを含む、請求項1〜5のいずれか一項に記載の複合体。
- 前記第1のポリペプチドがCH2配列をさらに含む、請求項1〜6のいずれか一項に記載の複合体。
- 前記第2のポリペプチドがCH2配列をさらに含む、請求項1〜7のいずれか一項に記載の複合体。
- 前記GDF15変異タンパク質が配列番号:129のアミノ酸配列を含む、請求項1〜8のいずれか一項に記載の複合体。
- 前記GDF15変異タンパク質が配列番号:129のアミノ酸配列からなる、請求項1〜9のいずれか一項に記載の複合体。
- 前記リンカーが、グリシン−グリシン−グリシン−グリシン−セリン(G4S)nの配列を含み、ここでn=2〜5である、請求項1〜10のいずれか一項に記載の複合体。
- 前記リンカーが、(G4S)3または(G4S)5の配列を含む、請求項1〜10のいずれか一項に記載の複合体。
- 前記第1のポリペプチドが配列番号:3に記載のアミノ酸配列を含む、請求項2に記載の複合体。
- 前記第2のポリペプチドが配列番号:4に記載のアミノ酸配列を含む、請求項13記載の複合体。
- 前記第1のポリペプチドが配列番号:5に記載のアミノ酸配列を含む、請求項2に記載の複合体。
- 前記GDF15変異タンパク質がN−グリコシル化されている、請求項1〜15のいずれか一項に記載の複合体。
- 第1のヘテロ二量体及び第2のヘテロ二量体を含む複合体であって、前記第1のヘテロ二量体及び第2のヘテロ二量体のそれぞれが、配列番号:5に記載のアミノ酸配列を含む第1のポリペプチド、および配列番号:6に記載のアミノ酸配列を含む第2のポリペプチドを含み、前記第1のポリペプチドがN−グリコシル化されており、かつ前記第1のポリペプチドが前記第2のポリペプチドと二量化している、複合体。
- 請求項1〜17のいずれか1項に記載の第1及び第2のポリペプチドをコードする核酸であって、前記核酸からの第1及び第2のポリペプチドの発現をもたらす発現制御要素に任意で作動可能に連結されている、前記核酸。
- 第1の核酸及び第2の核酸であって、第1の核酸が請求項1〜17のいずれか1項に記載の第1のポリペプチドをコードし、かつ第2の核酸が請求項1〜17のいずれか1項に記載の第2のポリペプチドをコードし、それぞれ第1及び第2の核酸からの第1及び第2のポリペプチドの発現をもたらす発現制御要素にそれぞれ任意で作動可能に連結されている、前記第1及び第2の核酸。
- 請求項18に記載の核酸または請求項19に記載の第1及び第2の核酸を含むベクターであって、任意でウイルスベクターである、前記ベクター。
- 第1及び第2のベクターであって、前記第1のベクターが請求項19に記載の第1の核酸を含み、かつ前記第2のベクターが請求項19に記載の第2の核酸を含み、それぞれ任意でウイルスベクターである、前記第1及び第2のベクター。
- (a)請求項18に記載の核酸;
(b)請求項19に記載の第1及び第2の核酸;
(c)請求項20に記載のベクター;または
(d)請求項21に記載の第1及び第2のベクター
を含む、宿主細胞。 - 請求項22に記載の宿主細胞を培養し、複合体を単離することを含む、請求項1〜17のいずれか一項に記載の複合体を作製する方法。
- 前記第1のポリペプチドが配列番号:80に記載のアミノ酸配列を含み、かつ前記第2のポリペプチドが配列番号:81に記載のアミノ酸配列を含む、請求項23に記載の方法。
- 請求項1〜17のいずれか1項に記載の複合体と、薬学的に許容される希釈剤、担体、または添加剤とを含む、医薬組成物。
- 対象において体重障害またはグルコース代謝障害を処置する方法における使用のための、請求項1〜17のいずれか1項に記載の複合体を含む組成物。
- 対象において体重障害またはグルコース代謝障害を予防する方法における使用のための、請求項1〜17のいずれか一項に記載の複合体を含む組成物。
- 前記グルコース代謝障害が代謝症候群である、請求項26または27に記載の組成物。
- 対象における高血糖症を処置する方法における使用のための、請求項1〜17のいずれか一項に記載の複合体を含む組成物。
- 対象における肥満を処置する方法における使用のための、請求項1〜17のいずれか一項に記載の複合体を含む組成物。
- 前記処置する方法が、対象における血糖または体重の減少をもたらす、請求項29または30に記載の組成物。
- 前記処置する方法が、対象における食物摂取の減少をもたらす、請求項30に記載の組成物。
- 対象における高血糖症を予防する方法における使用のための、請求項1〜17のいずれか一項に記載の複合体を含む組成物。
- 対象における肥満を予防する方法における使用のための、請求項1〜17のいずれか一項に記載の複合体を含む組成物。
- 対象が肥満であるか、または対象が真性糖尿病を有する、請求項26〜29及び33のいずれか一項に記載の組成物。
- 対象がヒトである、請求項26〜35のいずれか一項に記載の組成物。
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