JP6491294B2 - 細菌感染治療用のベンゾオキサボロール誘導体 - Google Patents
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Description
本出願は、あらゆる目的についてその全体が参照することによって組み込まれる、2010年9月7日付で出願された米国特許仮出願番号第61/380,596号の恩恵を主張する。
本明細書中で用いられる場合、単数形「a」、「an」、および「the」は、文脈で明らかに別段の記載がない限り、複数を含む。例えば、「活性剤(an active agent)」ということは、1つの活性剤ならびに組み合わされた2以上の異なる活性剤を包含する。本発明の教唆は、本明細書中で開示された、特定の投与形態、担体などに限定されず、したがってさまざまであり得ることを理解されたい。
本発明は、新規ホウ素化合物およびこれらの分子の調製のための方法を提供する。本発明は、一部または全体として本明細書中で記載される化合物の使用による、細菌感染症の治療、細菌の殺滅または細菌の成長の阻害の方法をさらに提供する。別の態様において、本発明は、本発明の化合物と抗生物質との組み合わせである。別の態様において、本発明は、薬剤的に許容される賦形剤および本発明の化合物を含む医薬製剤である。別の態様において、本発明は、本発明の化合物、抗生物質、および薬剤的に許容される賦形剤を含む医薬製剤である。
III.a.)化合物
1つの態様において、本発明は、本発明の化合物を提供する。例示的実施形態において、本発明は、本明細書中で記載される化合物、またはその塩を提供する。例示的実施形態において、本発明は、本明細書中で記載される化合物の塩は薬剤的に許容される塩である。例示的実施形態において、本発明は、本明細書中で記載される化合物、またはその薬剤的に許容される塩を提供する。例示的実施形態において、本発明は、本明細書中で提供される式で記載される化合物を提供する。例示的実施形態において、本発明は本明細書中で記載される化合物を提供する。
本発明の化合物はまた、さらなる治療薬と組み合わせて用いることもできる。本発明はしたがって、さらなる態様において、本発明の化合物を、少なくとも1つのさらなる治療薬、またはその塩、プロドラッグ、水和物もしくは溶媒和物とともに含む組み合わせを提供する。例示的実施形態において、本発明の化合物は、本明細書中で記載される化合物、またはその塩である。例示的実施形態において、さらなる治療薬は本発明の化合物である。例示的実施形態において、さらなる治療薬は、ホウ素原子を含む。例示的実施形態において、さらなる治療薬は、ホウ素原子を含有しない。例示的実施形態において、さらなる治療薬は、セクションIIIa)またはb)で記載される化合物である。
本発明で有用な化合物は、市販の出発物質、公知中間体を使用するか、または米国特許出願第12/142,692号および米国特許公開第US20060234981号、同第US20070155699号および同第US20070293457号などの本明細書中で記載され、参照することによって組み込まれる参考文献で公開された合成法を用いることによって調製することができる。
一般的反応スキーム2
一般的反応スキーム3
一般的反応スキーム4
一般的反応スキーム5:キラル分離
一般的反応スキーム6:キラル分離
当該技術分野で承認されている遺伝学および分子生物学の技術は、tRNAシンセターゼなどの酵素を結合および/または阻害する化合物を同定するために有用である。さらに、これらの技術は、化合物が、酵素の特定のドメインと結合および/または阻害するかどうかを識別するために有用である。例えば、ロイシルtRNAシンセターゼ(LeuRS)について、これらの技術は、化合物が合成ドメイン、編集ドメイン、または編集ドメインおよび合成ドメインの両方を結合および/または阻害するかどうかを区別することができる。マイコバクテリウム・ツベルクローシス(Mycobacterium tuberculosis)leuS遺伝子は、大腸菌(E. coli)最適化コドンを用いてGenscript(Piscataway, NJ)によって合成され、タンパク質は、標準的なT7 RNAポリメラーゼ過剰発現プロトコルおよび標準的な精製プロトコルを用いて作製された。
例示的アッセイにおいて、編集ドメインに対する代表的な化合物の活性を確認した。新規ホウ素含有抗菌剤化合物の標的を同定するために、この化合物に対する耐性を示す大腸菌における突然変異体を単離した。突然変異体の特性化は、それらが野生型よりも化合物に対する耐性において32〜256倍増加することを示した。突然変異体は、既知作用機序を有する種々の抗菌剤に対して感受性であることがさらに示され、このことは、化合物の細胞標的が他の抗菌剤の標的から区別されることを示唆する。突然変異体からのleuS遺伝子をプラスミド上にクローンし、それらの耐性をMICによって確認した。これらの突然変異体からの編集ドメインを配列決定し、突然変異はすべてこの酵素の編集ドメイン中に位置していた。
本発明において使用されるアミノ酸およびヌクレオチド配列は、本明細書中で記載され、参照することによって組み込まれる参考文献、例えば米国特許出願第12/142,692号および米国特許公開第US20060234981号、同第US20070155699号および同第US20070293457号で公開されている。コドン最適化エム・ツベルクローシス(M. tuberculosis)leuS遺伝子の配列は次のとおりである:
別の態様において、本発明の化合物は、酵素を阻害するために利用することができる。別の態様において、本発明の化合物および/または本発明の組み合わせは、細菌などの微生物に対して効力を示し、したがって、微生物を殺滅および/または微生物の成長を阻害する可能性を有する。別の態様において、本発明の化合物および/または本発明の組み合わせは、細菌などの微生物に対して効力を示し、したがって本明細書中に記載される動物において治療効果を達成する可能性を有する。
例示的実施形態において、本発明の化合物は、細菌などの微生物の、ロイシルtRNAシンセターゼなどのtRNAシンセターゼの編集ドメインを阻害する能力を示し、したがって、微生物tRNAシンセターゼの編集ドメイン阻害剤として使用される可能性を有する。
本発明の化合物および/または本発明の組み合わせは、細菌などの微生物に対する効力を示し、したがって微生物感染の治療および/もしくは防止、または微生物の殺滅および/または微生物成長の阻害をする可能性を有する。
e)、レジオネラ・ニューモフィラおよびクラミジア・ニューモニエ(Chlamydia pneumoniae)からなる群から選択される。別の例示的実施形態において、細菌は、エンテロバクター・クロアカエ、大腸菌、クレブシエラ・ニューモニエ、プロテウス・ミラビリス、セラチア・マルセッセンス、シトロバクター・フロインディイ、プロビデンシア・スチュアルティイ、シュードモナス・エルジノーサ、アシネトバクター・バウマニー、ステノトロフォモナス・マルトフィリア、バークホルデリア・セパシア、黄色ブドウ球菌、肺炎連鎖球菌、化膿連鎖球菌、エンテロコッカス・フェカリス、およびエンテロコッカス・フェシウムからなる群から選択される。別の例示的実施形態において、細菌は、黄色ブドウ球菌、スタフィロコッッカス・エピデルミディス、スタフィロコッッカス・ヘモリチカス、化膿連鎖球菌、ストレプトコッカス・アガラクチエおよび肺炎連鎖球菌からなる群から選択される。
本発明の化合物および/または本発明の組み合わせは、細菌などの微生物に対して効力を示し、したがって、細菌感染症などの微生物感染を治療および/または防止するために用いられる可能性を有する。
本発明の化合物および/または本発明の組み合わせは、細菌などの微生物に対する効力を示し、したがって、本明細書中で記載される動物において治療効果を達成する可能性を有する。
別の態様において、本発明は、全身性疾患を治療する方法を提供する。方法は、動物を本発明の化合物および/または本発明の組み合わせと接触させることを含む。
別の態様において、本発明は:a)本発明の化合物;およびb)薬剤的に許容される賦形剤を含む医薬製剤を提供する。別の態様において、本発明は:a)本発明の組み合わせ;およびb)薬剤的に許容される賦形剤を含む医薬製剤を提供する。例示的実施形態において、化合物は、本明細書中で記載される式による。例示的実施形態において、化合物は、本明細書中に記載される実施例による。例示的実施形態において、本発明の化合物または本発明の組み合わせは、本明細書中で記載される化合物もしくは本明細書中に記載される組み合わせ、またはその薬剤的に許容される塩である。例示的実施形態において、本発明の化合物は本明細書中で記載される化合物である。
好ましい実施形態において、本発明の方法は、本明細書中で記載される化合物の局所適用によって用いることができる。局所投与は、例えば、経粘膜、経皮、爪および経爪投与経路を含む。対象の発明で有用な局所組成物は、多種多様な製品タイプに作製することができる。これらとしては、とりわけ、ローション、クリーム、ゲル、スティック、スプレー、軟膏、ペースト、フォーム、ムース、マスク、眼軟膏、点眼剤もしくは点耳剤、含浸包帯、ワイプ、セッケン、ボディーウォッシュおよびシャンプーを含む洗浄剤、ならびにベース、ほお紅、口紅、およびアイシャドーなどの化粧品が挙げられるが、これらに限定されるものではない。これらの製品タイプは、粒子、ナノ粒子、およびリポソームを含むが、これらに限定されない数種類の担体系を含み得る。所望により、架橋ポリビニルピロリドン、寒天またはアルギン酸もしくはその塩、例えばアルギン酸ナトリウムなどの崩壊剤を添加することができる。処方および投与の技術は、Remington: The Science and Practice of Pharmacy(上出)で見出すことができる。処方は、体内の所望の標的部位への送達を最大にするように選択することができる。処方はさらに、例えば、局所調製の感触および/または外観の改善などのさらなる利点を提供するために添加することができる種々の通常の着色剤、芳香剤、増粘剤、防腐剤、保湿剤、皮膚軟化剤、緩和剤、可溶化賦形剤、分散剤、浸透促進剤、可塑剤、防腐剤、安定剤、解乳化剤、湿潤剤、日焼け止め、乳化剤、モイスチャライザー、収斂剤、脱臭剤なども含むことができる。
各R20および各R21は独立して、H、R26、OR26、NR26R27、SR26、−S(O)R26、−S(O)2R26、−S(O)2NR26R27、−C(O)R27、−C(O)OR27、および−C(O)NR26R27からなる群から選択され、R22およびR23は独立して、H、−S(O)R28、−S(O)2R28、−S(O)2NR28R29、−C(O)R28、−C(O)OR28、−C(O)NR28R29、置換もしくは非置換アルキル、置換もしくは非置換ヘテロアルキル、置換もしくは非置換シクロアルキル、置換もしくは非置換ヘテロシクロアルキル、置換もしくは非置換アリール、および置換もしくは非置換ヘテロアリールからなる群から選択される;ここで、各R26、各R27、各R28および各R29は独立して、H、置換もしくは非置換アルキル、置換もしくは非置換ヘテロアルキル、置換もしくは非置換シクロアルキル、置換もしくは非置換ヘテロシクロアルキル、置換もしくは非置換アリール、および置換もしくは非置換ヘテロアリールからなる群から選択される。
R12は、H、R7、ハロゲン、シアノ、アミジノ、OR7、NR7R8、SR7、−N(R7)S(O)2R8、−C(O)R7、−C(O)OR7、−C(O)NR7R8からなる群から選択され、ここで、各R7および各R8は独立して、H、置換もしくは非置換アルキル、置換もしくは非置換ヘテロアルキル、置換もしくは非置換シクロアルキル、置換もしくは非置換ヘテロシクロアルキル、置換もしくは非置換アリール、および置換もしくは非置換ヘテロアリールからなる群から選択される。
プロトンNMRは、Varian AS300分光計で記録し、化学シフトはテトラメチルシランからのδ(ppm)の
低磁場として報告する。質量スペクトルをMicromass Quattro IIで測定する。
A.3−アミノメチル−4−フルオロ−7−(3−ヒドロキシ−プロポキシ)−3H−ベンゾ[c][1,2]オキサボロール−1−オール;ビストリフルオロ酢酸塩
6−フルオロ−2,3−ジメトキシ−ベンズアルデヒド
3−(3−ベンジルオキシ−プロポキシ)−2−ヒドロキシ−ベンズアルデヒド
6−フルオロ−2,3−ジメトキシ−ベンズアルデヒド
2−ブロモ−3−ヒドロキシベンズアルデヒド
3−(アミノメチル)−7−エトキシベンゾ[c][1,2]オキサボロール−1(3H)−オール塩酸塩
7−エトキシ−4−メチル−3−(ニトロメチル)ベンゾ[c][1,2]オキサボロール−1(3H)−オール
7−エトキシ−3−(ニトロメチル)−4−ビニルベンゾ[c][1,2]オキサボロール−1(3H)−オール
7−エトキシ−3−(ニトロメチル)−4−フェニルベンゾ[c][1,2]オキサボロール−1(3H)−オール
4−ヒドロキシブチルカルバミン酸tert−ブチル
3−ブロモプロピルカルバミン酸tert−ブチル
L.(S)−3−(アミノメチル)−4−クロロ−7−エトキシベンゾ[c][1,2]オキサボロール−1(3H)−オール塩酸塩
N.(S)−3−(アミノメチル)−4−フルオロ−7−エトキシベンゾ[c][1,2]オキサボロール−1(3H)−オール塩酸塩
5−クロロ−2−ヒドロキシ−3−メトキシ−ベンズアルデヒド(7g、37.5ミリモル)の無水CH2Cl2 (200mL)中溶液に0℃でBBr3のCH2Cl2(1M、93.7mL、93.7ミリモル)中溶液を添加し、そして反応混合物を一晩室温で撹拌した。溶液をCH2Cl2(200mL)で希釈し、水、塩水で洗浄し、Na2SO4上で乾燥し、ろ過し、減圧下で濃縮して、標記化合物(6.2g、36.0ミリモル、96%)を明黄色固体として得た。1H NMR (400 MHz, CHLOROFORM-d) δ ppm 11.02 (s, 1 H), 9.83 (s, 1 H), 7.18 (s, 1 H), 7.14 (d, J=2.3 Hz, 1 H), 5.71 (s, 1 H).
5−クロロ−2,3−ジヒドロキシ−ベンズアルデヒド(3.1g、17.7ミリモル)の無水DMSO(20mL)中溶液に、NaH(鉱物油中60%、1.50g、35.4ミリモル)を数回に分けて添加し、混合物を30分間撹拌した。溶液を0℃まで冷却し、3−ベンジルオキシ−1−ブロモプロパン(3.1mL、17.7ミリモル)のDMSO(3mL)中溶液を10分にわたって滴加した。氷浴をはずした。一晩後、溶液をEtOAc(100mL)で希釈し、水、塩水で洗浄し、Na2SO4上で乾燥し、ろ過し、減圧下で濃縮した。生成物をシリカゲルカラムクロマトグラフィー(2:1ヘキサン−EtOAc移動相)によって精製して、標記化合物(5.3g、16.6ミリモル、94%)を明黄色油状物として得た。1H NMR (400 MHz, CHLOROFORM-d) δ ppm 10.81 (s, 1 H), 9.87 (s, 1 H), 7.42 - 7.28 (m, 5 H), 7.17 (s, 1 H), 7.08 (s, 1 H), 4.53 (s, 2 H), 4.17 (t, J=6.2 Hz, 2 H), 3.69 (t, J=5.8 Hz, 2 H), 2.15 (t, J=6.2 Hz, 2 H).
3−(3−ベンジルオキシ−プロポキシ)−5−クロロ−2−ヒドロキシ−ベンズアルデヒド(5.3g、16.6ミリモル)およびピリジン(3.4mL、41.5ミリモル)のCH2Cl2(70mL)中溶液に0℃で、Tf2O(3.1mL、18.3ミリモル)を5分にわたって滴加し、反応混合物を3時間室温にて撹拌した。溶液をCH2Cl2(100mL)で希釈し、水、塩水で洗浄し、Na2SO4上で乾燥し、次いで減圧下で濃縮した。生成物をシリカゲルカラムクロマトグラフィー(2:1ヘキサン−EtOAc移動相)によって精製して、標記化合物(3.8g、8.5ミリモル、51%)を明黄色油状物として得た。1H NMR (400 MHz, CHLOROFORM-d) δ ppm 10.18 (s, 1 H), 7.48 (d, J=2.3 Hz, 1 H), 7.37 - 7.29 (m, 6 H), 4.52 (s, 2 H), 4.23 (t, J=6.2 Hz, 2 H), 3.69 (t, J=5.8 Hz, 2 H), 2.16 (t, J=6.0 Hz, 2 H); 19F NMR (376 MHz, CHLOROFORM-d) δ ppm -73.23 (s).
トリフルオロ−メタンスルホン酸2−(3−ベンジルオキシ−プロポキシ)−4−クロロ−6−ホルミル−フェニルエステル(3.8g、8.4ミリモル)の無水1,4−ジオキサン(50mL)中溶液に、ビス(ピナコラート)ジボラン(4.3g、16.9ミリモル)およびKOAc(2.5g、25.4ミリモル)を連続して添加し、結果として得られた溶液をN2で20分間脱気した。PdCl2(dppf)(0.5g、0.67ミリモル)を添加し、結果として得られた混合物を一晩90℃で撹拌した。溶液をEtOAc(100mL)で希釈し、水、塩水で洗浄し、Na2SO4上で乾燥し、ろ過し、減圧下で濃縮した。生成物をシリカゲルカラムクロマトグラフィー(4:1ヘキサン−EtOAc移動相)によって精製して、標記化合物(3.4g、7.8ミリモル、92%)を無色油状物として得た。1H NMR (400 MHz, CHLOROFORM-d) δ ppm 9.87 (s, 1 H), 7.40 - 7.28 (m, 6 H), 7.03 (br s, 1 H), 4.50 (s, 2 H), 4.09 (t, J=6.4 Hz, 2 H), 3.70 - 3.60 (m, 2 H), 2.10 (t, J=6.2 Hz, 2 H), 1.42 (s, 12 H).
3−(3−ベンジルオキシ−プロポキシ)−5−クロロ−2−(4,4,5−トリメチル−[1,3,2]ジオキサボロラン−2−イル)−ベンズアルデヒド(3.4g、7.8ミリモル)およびニトロメタン(1.7mL、31.3ミリモル)のTHF(20mL)中溶液に、NaOHの溶液(0.025M、40mL)を添加した。12時間後、pHが1になるまで2N HClを添加した。溶液をEtOAc(150mL)で希釈し、水で洗浄し、Na2SO4上で乾燥し、ろ過し、減圧下で濃縮した。生成物をシリカゲルカラムクロマトグラフィー(4:1ヘキサン−EtOAc移動相)によって精製して、標記化合物生成物(1.7g、56%)を無色ゲルとして得た。1H NMR (400 MHz, CHLOROFORM-d) δ ppm 7.39 - 7.28 (m, 5 H), 6.92 (s, 1 H), 6.83 (s, 1 H), 5.85 (br s, 1 H), 5.81 (dd, J=8.5, 3.9 Hz, 1 H), 4.70 (dd, J=13.2, 3.9 Hz, 1 H), 4.59 (s, 2 H), 4.47 (dd, J=13.0, 8.7 Hz, 1 H), 4.21 - 4.07 (m, 2 H), 3.71 - 3.60 (m, 2 H), 2.10 (quin, J=5.7 Hz, 2 H).
米国特許公開第20090227541号(米国特許出願第12/142,692号)の一般的手順4の方法にしたがって、次の反応物質および量を用いて合成した:2−ブロモ−3−ヒドロキシ−4−メトキシ−ベンズアルデヒド(1.0g、4.32ミリモル)、(3−ブロモ−プロポキシメチル)−ベンゼン(0.76mL、4.32ミリモル)、炭酸セシウム(2.11g、6.5ミリモル)、DMF(30mL)。精製:フラッシュクロマトグラフィー(10%EtOAc/ヘキサン):収率1.54g(95%)。1H NMR (400 MHz, CDCl3) δ (ppm): 10.26 (s, 1 H), 7.73 (d, J=8.6 Hz, 1 H), 7.46-7.18 (m, 5 H), 6.95 (d, J=8.6 Hz, 1 H), 4.56 (s, 2 H), 4.14 (t, J=6.1 Hz, 2 H), 3.92 (s, 3 H), 3.77 (t, J=6.2 Hz, 2 H), 2.15 (quin, J=6.5 Hz, 2 H); MS (ESI): m/z=381 (M+1, positive).
米国特許公開第20090227541号(米国特許出願第12/142,692号)の一般的手順5の方法にしたがって、次の反応物質および量を用いて合成した:3−(3−ベンジルオキシ−プロポキシ)−2−ブロモ−4−メトキシ−ベンズアルデヒド(14.82g、39ミリモル)、ビス(ピナコラート)ジボラン(14.86g、58.5ミリモル)、KOAc(11.46g、117ミリモル)、PdCl2(dppf)(8.5g、11.7ミリモル)、ジオキサン(200mL)。精製:フラッシュカラムクロマトグラフィー(15%EtOAc/ヘキサン):収率3.42g(22%)。1H NMR (400 MHz, CDCl3) δ (ppm): 9.79 (s, 1 H), 7.53 (d, J=8.2 Hz, 1 H), 7.40-7.24 (m, 5 H), 6.98 (d, J=8.2 Hz, 1 H), 4.53 (s, 2 H), 4.12 (t, J=6.4 Hz, 2 H), 3.88 (s, 3 H), 3.69 (t, J=6.4 Hz, 2 H), 2.10 (quin, J=6.5 Hz, 2 H), 1.44 (s, 12 H).
1,2−ジメトキシ−3−メチルベンゼン(2.05g、13.45ミリモル)およびTMEDA(2.8mL、18.83ミリモル)のジエチルエーテル(100mL)中冷却(0℃)溶液に、t−ブチルリチウム(ペンタン中1.7M、9.5mL、16.14ミリモル)を添加した。溶液の色が明黄色に変化し、そして数分後、白色沈殿が観察された。懸濁液を室温で18時間撹拌し、0℃まで冷却し、ジメチルホルムアミド(2.08mL、26.90ミリモル)を滴加した。沈殿が消失し、溶液の色が明ピンク色に変化した。0.5時間撹拌した後、氷を添加し、続いて1N HCl(30mL)を添加し、化合物を酢酸エチルで抽出し、乾燥し(Na2SO4)、溶媒を蒸発させて、明褐色油状物を得た。フラッシュカラムクロマトグラフィー(5%EtOAc/ヘキサン)によって精製して、標記化合物を得た:収量1.4g(58%)。1H NMR (400 MHz, CDCl3) δ (ppm): 10.34 (s, 1 H), 7.49 (d, J=8.2 Hz, 1 H), 7.01 (d, J=7.8 Hz, 1 H), 4.00 (s, 3 H), 3.86 (s, 3 H), 2.33 (s, 3 H). MS (ESI): m/z=181 (M+1, positive).
ジクロロメタン(200mL)中−30℃(ドライアイス/アセトン)まで冷却した1,2−ジメトキシ−3−メチル−ベンゼン(13.8g、76.66ミリモル)の溶液に、三塩化ホウ素(230mL、230ミリモル)を滴加し、混合物を一晩室温で撹拌した。溶液を0℃まで冷却し、氷/水を慎重に添加し、次いで過剰のジクロロメタンで抽出した。有機層を水で洗浄し、乾燥し(Na2SO4)、溶媒を蒸発させた。シリカゲルカラムクロマトグラフィー(10〜20%EtOAc/ヘキサン)によって精製して、標記化合物を結晶性固体として得た:収量9.2g(80%)。1H NMR (400 MHz, CDCl3) δ (ppm): 11.11 (s, 1 H), 9.82 (s, 1 H), 7.05 (d, J=8.2 Hz, 1 H), 6.81 (d, J=8.6 Hz, 1 H), 5.67 (s, 1 H), 2.33 (s, 3 H).
米国特許公開第20090227541号(米国特許出願第12/142,692号)の一般的手順4の方法にしたがって、次の反応物質および量を用いて合成した:2,3−ジヒドロキシ−4−メチル−ベンズアルデヒド(9g、59.21ミリモル)、(3−ブロモ−プロポキシメチル)−ベンゼン(11.5mL、65.13ミリモル)、ナトリウムtert−ブトキシド(12.52g、130.26ミリモル)およびDMSO(100mL)。精製:フラッシュカラムクロマトグラフィー(5−10%EtOAc/ヘキサン):収量15.1g(85%)。1H NMR (400 MHz, CDCl3) δ (ppm): 11.05 (s, 1 H), 9.84 (s, 1 H), 7.38-7.26 (m, 5 H), 7.20 (d, J=7.8 Hz, 1 H), 6.80 (d, J=8.2 Hz, 1 H), 4.55 (s, 2 H), 4.15 (t, J=6.2 Hz, 2 H), 3.73 (t, J=6.2 Hz, 2 H), 2.31 (s, 3 H), 2.19-2.00 (m, 2 H).
米国特許公開第20090227541号(米国特許出願第12/142,692号)の一般的手順6の方法にしたがって、次の反応物質および量を用いて合成した:3−(3−ベンジルオキシ−プロポキシ)−2−ヒドロキシ−4−メチル−ベンズアルデヒド(0.3g、1.0ミリモル)、トリフルオロメタンスルホン酸(0.34mL、2.0ミリモル)、ピリジン(0.25mL、3.1ミリモル)、ジクロロメタン(15mL)。精製:フラッシュカラムクロマトグラフィー(10−15%EtOAc/ヘキサン):収量0.25g(59%)。1H NMR (400 MHz, CDCl3) δ (ppm): 10.14 (s, 1 H), 7.61 (d, J=7.8 Hz, 1 H), 7.42-7.29 (m, 6 H), 4.53 (s, 2 H), 4.07 (t, J=6.4 Hz, 2 H), 3.71 (t, J=6.1 Hz, 2 H), 2.40 (s, 3 H), 2.07 - 2.22 (m, 2 H). 19F NMR (400 MHz, CDCl3) δ (ppm): -73.63 (s).
米国特許公開第20090227541号(米国特許出願第12/142,692号)の一般的手順5の方法にしたがって、次の反応物質および量を用いて合成した:トリフルオロ−メタンスルホン酸2−(3−ベンジルオキシ−プロポキシ)−6−ホルミル−3−メチル−フェニルエステル(0.26g、0.6ミリモル)、ビス(ピナコラート)ジボラン(0.31g、1.2ミリモル)、KOAc(0.18g、1.8ミリモル)、PdCl2(dppf)(0.13g、0.18ミリモル)、THF(10mL)。精製:フラッシュカラムクロマトグラフィー(15%EtOAc/ヘキサン):収量0.091g(36%)。1H NMR (400 MHz, CDCl3) δ (ppm): 9.89 (s, 1 H), 7.47 (d, J=7.4 Hz, 1 H), 7.40-7.25 (m, 6 H), 4.52 (s, 2 H), 4.02 (t, J=6.4 Hz, 2 H), 3.70 (t, J=6.2 Hz, 2 H), 2.32 (s, 3 H), 2.20-2.08 (m, 2 H), 1.45 (s, 12 H).
3−フルオロ−ベンゼン−1,2−ジオール(20g、156ミリモル)の無水アセトニトリル(400mL)中溶液に、塩化マグネシウム(37.1g、312ミリモル)、パラホルムアルデヒド(31.6g)およびトリエチルアミン(134mL、975ミリモル)を添加した。反応混合物を80℃で8時間加熱した。反応混合物を室温まで冷却し、ろ過によって固体を集めた。固体を冷2N HClで処理し、水性層をEtOAcで抽出した。有機層を真空で濃縮して、20.4gの粗物質を得た。2回目の実施の後、40.8gの粗物質をDMF(1L)中に溶解させ、0℃まで冷却し、Cs2CO3(340g、1.04モル)に数回にわけて添加した。次いで、ヨウ化メチル(330mL、5.28モル)を添加した。室温まで温め、一晩撹拌した後、溶液をろ過し、酢酸エチルを添加し、有機層を水で洗浄した(3×)。真空で濃縮した後、生成物をBiotageシリカゲルクロマトグラフィー(2%〜3%/10%〜20%EtOAc/ヘキサン)によって精製し、結果として14.8gのジメトキシ化合物を得た。この物質をDCM中に溶解させ、−30℃まで冷却し、BCl3(DCM中1M、134mL、0.1343モル)を溶液に−30℃で添加した。室温で一晩後、溶液を−70℃まで冷却し、BBr3(DCM中1M、67.25mL、0.067モル)を添加した。一晩室温まで温めた後、溶液を氷浴中で冷却し、ゆっくりと氷水を添加した。DCM層を分離し、水性層をDCMで抽出した(2×)。合わせた有機層を塩水で抽出し(2X)、Na2SO4上で乾燥し、ろ過し、真空で濃縮した。得られた残留物をヘキサン/DCM(6:4)で摩砕した後、5.60g(11%収率)の得られた標記化合物は、茶色がかったピンク色固体であった。この物質をさらに精製することなく次のステップで使用した。1H NMR (400 MHz, DMSO-d6) δ (ppm): 11.36 (s, 1H), 9.83 (s, 1H), 7.16 - 7.13 (m, 1H), 6.82 - 6.78 (m, 1H), 5.48 (brs,1H). 19F NMR (376 MHz, DMSO-d6 with D2O) δ (ppm): -119.03 - -119.08 (m, 1F).
米国特許公開第20090227541号(米国特許出願第12/142,692号)の一般的手順の方法にしたがい、次の反応物質および量を用いて合成した:4−フルオロ−2,3−ジヒドロキシ−ベンズアルデヒド(5.15g、32.9ミリモル)、NaOtBu(6.95g、72.3ミリモル)、DMSO(200mL)、(3−ブロモ−プロポキシメチル)−ベンゼン(8.31g、36.3ミリモル)。精製:Biotageシリカゲルクロマトグラフィー(ヘキサン/酢酸エチル勾配)によって、標記化合物とジアルキル化生成物との混合物4.00gが生成した。この物質をさらに精製することなく次のステップで使用した。1H NMR (400 MHz, DMSO-d6) δ (ppm): 10.13 (s, 1H), 7.66 -7.54 (m, 5H), 7.53 - 7.33 (m, 1H), 6.92 - 6.90 (m, 1H), 4.53 (s, 2H), 4.52 - 4.44 (m, 2H), 3.71 - 3.62 (m, 2H), 2.18 - 2.13 (m, 2H). 19F NMR (376 MHz, DMSO-d6 with D2O) δ (ppm): -121.03 - -121.08 (m, 1F).
米国特許公開第20090227541号(米国特許出願第12/142,692号)の一般的手順6の方法にしたがい、次の反応物質および量を用いて合成した:3−(3−ベンジルオキシ−プロポキシ)−4−フルオロ−2−ヒドロキシ−ベンズアルデヒド(4.00g、13.1ミリモル)、ピリジン(2.34mL、28.9ミリモル)、DCM(100mL)、トリフレート無水物(2.21mL、13.5ミリモル)。精製:Biotageシリカゲルクロマトグラフィー(ヘキサン/酢酸エチル勾配)によって2.00gのトリフレートを得、これを米国特許公開第20090227541号(米国特許出願第12/142,692号)の一般的手順5にしたがって直ちに使用した。
エチルブロミド(2.88g、26.4ミリモル)を2−ブロモ−3−ヒドロキシ−4−メトキシベンズアルデヒド(5.08g、22ミリモル)および炭酸カリウム(4.56g、33ミリモル)の無水DMF(50mL)中混合物に室温にて窒素下で添加した。反応混合物を35℃で18時間撹拌し、EtOAc(150mL)で希釈し、水(2×50mL)、塩水で洗浄し、Na2SO4上で乾燥し、濃縮して、粗生成物を白色固体として得た。シリカカラムクロマトグラフィー(溶離液:30%ヘキサン中EtOAc)によって精製して、5.65g(99%収率)の標記化合物を白色固体として得た。1H NMR (400 MHz, CDCl3) δ (ppm) 10.26 (s, 1H), 7.73 (d, J=8.4 Hz, 1H), 6.95 (d, J=8.8 Hz, 1H), 4.08 (q, J=7.1 Hz, 2H), 3.95 (s, 3H), 1.46 (t, J=7.0 Hz, 3H); MS (ESI) m/z=261 (M+1, positive).
米国特許公開第20090227541号(米国特許出願第12/142,692号)の一般的手順5の方法にしたがい、次の反応物質および量を用いて合成した:2−ブロモ−3−エトキシ−4−メトキシ−ベンズアルデヒド(4g、15.43ミリモル)、KOAc(4.55g、46.29ミリモル)、ビス(ピナコラート)ジボロン(7.84g、30.86ミリモル)。乾燥ジオキサン(90mL)中PdCl2(dppf)(0.91g、1.24ミリモル)。粗生成物をシリカゲルカラムクロマトグラフィー(溶離液:EtOAc/ヘキサン1:9、次いで1:3)によって精製して、標記化合物を白色固体として得た(1.50g、32%収率)。1H NMR (400 MHz, CDCl3) δ (ppm) 9.71 (s, 1H), 7.44 (d, J=8.4 Hz, 1H), 6.89 (d, J=8.4 Hz, 1H), 4.01 (q, J=7.1 Hz, 2H), 3.82 (s, 3H), 1.38 (s, 12H), 1.35 (t, J=7.0 Hz, 3H).
2,3−ジメトキシ−4−フルオロベンズアルデヒド(7.0g、38.0ミリモル)の乾燥ジクロロメタン(150mL)中溶液に−78℃で、ジクロロメタン(30mL)中BBr3(23.8g、95.0ミリモル)を滴加した。反応混合物を室温に到達させ、18時間撹拌した。次いで反応混合物を−78℃まで冷却し、メタノール(10mL)および水(50mL)の混合物でクエンチし、そして室温で30分間撹拌した。沈殿した固体をろ過によって分離し、冷ジクロロメタンで洗浄した。ジクロロメタン層を濃縮して、標記化合物を固体として得た(5.2g、88%)。1H NMR (400 MHz, CHLOROFORM-d) δ ppm: 11.38 (s, 1 H), 9.84 (s, 1 H), 7.15 (dd, J=8.6, 5.5 Hz, 1 H), 6.81 (t, J=9.4 Hz, 1 H), 5.47 (s, 1 H); MS (ESI) m/z=155 (M-1, negative).
2,3−ジヒドロキシ−4−フルオロベンズアルデヒド(3.0g、19.23ミリモル)のDMSO(100mL)中溶液に、NaOBu−t(3.692g、38.46ミリモル)を数回にわけて室温で添加し、そして15分間撹拌した。ヨードエタンを室温で滴加し、18時間撹拌した。反応混合物をクラッシュアイス(200mL)上に注ぎ、2.5MのHClで酸性化して、pH3.0にした。生成物を酢酸エチル(2×100mL)で抽出し、濃縮し、そして生成物をシリカゲルのカラム上クロマトグラフィー(Hex:EtOAc=95:5)にかけて、標記化合物を結晶性固体として得た(2.3g、65%)。1H NMR (400 MHz, CHLOROFORM-d) δ ppm:11.36 (s, 1 H), 9.83 (s, 1 H), 7.39 - 7.19 (m, 1 H), 6.77 (t, J=9.2 Hz, 1 H), 4.22 (q, J=7.0 Hz, 2 H), 1.40 (t, J=7.0 Hz, 3 H); MS (ESI) m/z=183 (M+1, positive).
3−エトキシ−4−フルオロ−2−ヒドロキシベンズアルデヒドベンズアルデヒド(2.208g、12.0ミリモル)およびピリジン(1.986g、24.0ミリモル)のジクロロメタン(30.0mL)中混合物に、0℃で、ジクロロメタン(5.0mL)中無水トリフルオロメタンスルホン酸(4.060、14.4ミリモル)のを滴加した。反応混合物を0℃で2時間、そして室温で3時間撹拌した。次いでジクロロメタン(40mL)で希釈し、2M HCl、塩水で洗浄し、そして無水硫酸ナトリウム上で乾燥した。溶媒を減圧下で除去して、標記化合物を明黄色液体(3.3g、87%)として得た。1H NMR (400 MHz, CHLOROFORM-d) δ ppm:10.15 (s, 1 H), 7.66 (dd, J=8.6, 5.5 Hz, 1 H), 7.28 - 7.22 (m, 1 H), 4.36 (q, J=6.9 Hz, 2 H), 1.47 (t, J=7.0 Hz, 3 H).
トリフルオロメタンスルホン酸2−エトキシ−3−フルオロ−6−ホルミル−フェニルエステル(2.2g、6.96ミリモル)の乾燥THF(35.0mL)中溶液に、ビス(ピナコラート)ジボロン(2.134g、8.4ミリモル)、PdCl2(dppf)(367mg、0.5ミリモル)および酢酸カリウム(1.372g、14.0ミリモル)を添加し、窒素で15分間パージした。反応混合物を還流下で24時間加熱した。室温まで冷却し、酢酸エチル(40mL)で希釈し、そしてセライトを通してろ過した。溶媒を減圧下で除去し、残留物をシリカゲルのカラム上クロマトグラフィー(Hex:EtOAc=9:1)にかけて、標記化合物を灰白色固体として得た(850.0mg、42%)。1H NMR (400 MHz, CHLOROFORM-d) δ ppm:9.87 (s, 1 H), 7.51 (dd, J=8.2, 4.3 Hz, 1 H), 7.22 (dd, J=10.9, 8.6 Hz, 1 H), 4.20 (q, J=7.0 Hz, 2 H), 1.46 (s, 12 H), 1.40 (t, J=7.0 Hz, 3 H); MS (ESI) m/z=295 (M+1, positive).
3−エトキシ−2−ヒドロキシベンズアルデヒド(20g、120.4ミリモル)のAcOH(200mL)中溶液にN−クロロスクシンイミド(16.1g、120.4ミリモル)を添加した。反応混合物を105℃まで30分間加熱した。室温まで冷却した後、混合物をさらに2.5時間撹拌した。続いて、200mlの水を10分にわたってゆっくりと添加した。混合物をろ過し、乾燥して、黄色固体を得、これをエタノール中で再結晶させて、4gの標的化合物(4g、17%収率)を得た。
5−クロロ−3−エトキシ−2−ヒドロキシベンズアルデヒド(2.0g、10.0ミリモル)のピリジン(2mL)およびDCM(20mL)中溶液に0℃で無水トリフルオロメタンスルホン酸(1mL)を滴加した。反応を1時間0℃で撹拌した後、氷水でクエンチした。有機層を飽和水性NaHCO3(20mL)および塩水(20mL)で洗浄し、無水Na2SO4上で乾燥させ、次いで真空で濃縮した。残留物をシリカゲル上カラムクロマトグラフィーによって精製して、標的化合物を得た(2.0g、収率:60%)。
トリフルオロメタンスルホン酸4−クロロ−2−エトキシ−6−ホルミルフェニル(330mg、1ミリモル)、KOAc(350mg、2.0ミリモル)、ビス(ピナコラート)ジボラン(600mg、2.0ミリモル)およびPdCl2(dppf)CH2Cl2(65mg、0.08ミリモル、8モル%)のジオキサン(30mL)中混合物を15分間N2で脱気し、100℃で3時間撹拌した。氷水でクエンチした後、反応混合物をEtOAc(3×30mL)で抽出した。合わせた有機層を飽和水性NaHCO3(20mL)および塩水(20mL)で洗浄し、無水Na2SO4上で乾燥させ、次いで濃縮した。残留物をシリカゲル上カラムクロマトグラフィーによって精製して、化合物を得た(150mg、収率:43%)。
5−クロロ−3−エトキシ−2−(4,4,5,5−テトラメチル−1,3,2−ジオキサボロラン−2−イル)ベンズアルデヒド(310mg、1ミリモル)、NaOH(40mg、1ミリモル)およびCTAB(5mg、0.05ミリモル)のH2O(2mL)およびTHF(10mL)中混合物を0.5時間室温で撹拌した。ニトロメタン(0.2mL、2ミリモル)の滴加後、反応混合物を室温で3時間撹拌した。次いで希HCl水溶液(2N)をpH=2まで添加することによって環化させ、次いでEtOAc(3×30mL)で抽出した。合わせた有機層を塩水(25mL)で洗浄し、無水Na2SO4上で乾燥させ、濃縮乾固させた。残留物をprep−HPLCによって精製して、化合物(100mg、収率:56%)を得た。1H NMR (400 MHz, DMSO-d6) δ 9.20 (s, 1 H), 7.22 (s, 1H), 6.96 (s, 1H), 5.69-5.72 (m, 1H), 5.30-5.34 (m,1H), 4.61-4.67 (m, 1H), 4.10-4.15 (m, 2H), 1.31-1.34 (m, 3H);
ステップ1:(7−エトキシ−1−ヒドロキシ−1,3−ジヒドロベンゾ[c][1,2]オキサボロール−3−イル)メチル−カルバミン酸tert−ブチル
LeuRS IC50試験
96ウェルマイクロタイタープレート中で、50mMのHEPES−KOH(pH8.0)、30mMのMgCl2および30mMのKClを含有する80μLの反応混合物、13μM[14C]ロイシン(306mCi/ミリモル、Perkin−Elmer)、15uMの全大腸菌tRNA(Roche, Switzerland)、0.02%(w/v)BSA、1mMのDTT、0.2pMのLeuRSおよび4mMのATPを30℃で使用して実験を実施した。4mMのATPを添加することによって反応を開始した。7分後、反応をクエンチし、50μLの10%(w/v)TCAの添加によってtRNAを沈殿させ、96ウェルニトロセルロースメンブランフィルタープレート(Millipore Multiscreen HTS, MSHAN4B50)に移した。各ウェルを次いで100μLの5%TCAで3回洗浄した。フィルタープレートを次いで加熱ランプ下で乾燥し、沈殿した[14C]ロイシンtRNALeuを、Wallac MicroBeta Triluxモデル1450液体シンチレーションカウンター(PerkinElmer, Waltham MA)を用いた液体シンチレーションカウンティングによって定量化した。
抗菌剤MIC試験
細菌の全てのMIC試験は、好気性菌(Methods for Dilution Antimicrobial Susceptibility Tests for Bacteria That Grow Aerobically; Approved Standard- Seventh Edition)(M07−A7)および嫌気性菌(Methods for Antimicrobial Susceptibility Testing of Anaerobic Bacteria; Approved Standard- Seventh Edition)(M11−A7)の抗菌性試験についての臨床検査標準委員会(CLSI)指針にしたがった。
マイクロプレートアラマーブルーアッセイ(MABA)
マイクロプレートアラマーブルーアッセイ(MABA)は、本質的にはCollins, L., et al., Antimicrob Agents Chemother 41: 1004-1009 (1997)により記載されているようにして実施した。例えば、実験ウェル中の脱水を防止するために周辺ウェルを滅菌水で満たした、黒色の透明な底の96ウェルマイクロプレート(ブラックビュープレート;Packard Instrument Company, Meriden, Conn.)。初期薬物希釈液をジメチルスルホキシド中で調製し、その後、マイクロプレート中、0.1mlの7H9GC(Tween80なし)中で2倍希釈を実施した。凍結した接種材料をまずBACTEC12B培地中1:20に希釈し、続いて7H9GC中で1:50に希釈した。100μLをウェルに添加して、H37RvおよびH37Raについてそれぞれ2.0×105〜5×104CFU/mLの最終細菌価(bacterial titer)が得られた。薬物のみを含有するウェルを用いて自己蛍光を検出し、さらに細菌のみ(B)および培地のみ(M)から構成されるさらなる対照ウェルを使用した。プレートを37℃でインキュベートした。インキュベーションの第4日に開始して、20μLの10×アラマーブルー溶液(Alamar Biosciences/Accumed, Westlake, Ohio)および12.5μLの20%Tween 80を1つのBウェルおよび1つのMウェルに添加し、プレートを37℃で再インキュベートした。ウェルを12および24時間で青からピンクへの色の変化について、そして50,000蛍光単位(FU)以上の読みについて観察した。蛍光をCytofluor IIマイクロプレート蛍光光度計(PerSeptive Biosystems, Framingham, Mass.)で530nmの励起および590nmでの発光をともなう底部読みモード(bottom-reading mode)で測定した。Bウェルが24時間までにピンク色になるならば、試薬をプレート全体に添加した。ウェルが青色のままであるか、または50,000FUが測定されたならば、色の変化が起こるまで、さらなるMおよびBウェルを毎日試験し、色の変化が起こった時点で、試薬を残りのウェル全てに添加した。プ
レートを次いで37℃でインキュベートし、結果を試薬添加後24時間で記録した。視覚的MICを、色の変化を防止する薬物の最低濃度として定義した。蛍光分析MICについて、バックグラウンド減算を3連のMウェルの平均を有する全てのウェルに関して実施した。パーセント阻害は、1−(試験ウェルFU/3連のBウェルの平均FU)×100として定義された。90%の阻害をおこなう最低薬物濃度をMICとみなした。
低酸素回復アッセイ(LORA)
低酸素回復アッセイ(low-oxygen recovery assay)(LORA)は本質的にCho et al. Antimicrob Agents Chemother 51: 1380-1385 (2007)によって記載されているようにして実施した。プラスミドpFCA−luxAB上にluxABを有する組換えエム・ツベルクローシスH37Rvを全てのLORA実験で使用した。低酸素適用培養からの凍結したアリコートを解凍し、Middlebrook 7H12ブロス中(1mg/mLのCasitone、5.6μg/mLパルミチン酸、5mg/mLウシ血清アルブミン、および4μg/mlのフィルター滅菌したカタラーゼを含有するMiddlebrook 7H9ブロス)で希釈し、15秒間音波処理した。培養物を希釈して、100μLあたり0.03〜0.05および3,000〜7,000RLUのA570を得た。これは、5×105〜2×106CFU/mLに相当する。2倍の段階希釈を黒色96ウェルマイクロタイタープレート中、体積100μLで調製し、100μLの細胞懸濁液を添加した。LORAについて、マイクロプレート培養物を、AnoxomatモデルWS−8080(MART Microbiology)および10%H2、5%CO2、および85%N2の混合物での充填の3サイクルを用いることによって嫌気性条件(酸素濃度、0.16%未満)下に置いた。嫌気性インジケーターストリップをチャンバーの内部に置いて、酸素の除去を視覚的に確認した。プレートを37℃で10日間インキュベートし、次いで周囲気体条件(5%CO2富化空気)インキュベーターに28時間「回復」のために移した。第11日(28時間好気性回復後)に、発光測定のために、100μLの培養物を白色96ウェルマイクロタイタープレートに移した。n−デカナールアルデヒド(Sigma)のエタノールの10%溶液をPBS中で新たに希釈し、100μlを各ウェルにオートインジェクターで添加した。1秒の読み取り時間を用いることによって、発光をVictor2マルチ標識リーダー(Perkin-Elmer Life Sciences)で測定した。MICを、無薬物対照の成長に対して90%の成長阻害をもたらす最低薬物濃度として定義した。
結核インビボ有効性実験
TBインビボ有効性実験は、本質的に、Lenaerts et al. Antimicrob Agents Chemother 47: 783-785 (2003)で記載されているようにして、2、3の変更を加えて実施した。高感受性ガンマインターフェロン特定病原体未感染C57BL/6−Ifngtm1ts(GKO)マウス(Jackson Laboratories, Bar Harbor, Maine)を、Kelly et al. Antimicrob Agents Chemother 40: 2809-2812 (1996)で以前に記載されているようなGlas−Col吸入曝露システム中エム・ツベルクローシス株Erdmanでの低用量エアロゾル感染に曝露した。各治療群は、次の各時点について5匹のマウスから構成されていた。治療を感染の10日後に開始した。感染マウスの1つの対照群を治療開始時に屠殺した。感染したが未治療のマウスの第2群を24日で治療中止後に屠殺した。CおよびLを生理食塩水中で処方し、Eを50%水/35%PEG400/5%PG中で処方し、一方、リファンピシンを20%シクロデキストリン中で処方した。全ての化合物を経口強制飼養によって投与した。リファンピシンを10mg/kg QD POで投与した。Cを100mg/kg BID POで投与した。Eを100mg/kg BID POで投与した。Lを100mg/kg QD POで投与した。治療終了後に、二酸化炭素吸入によってマウスを屠殺した。肺を無菌的に摘出し、組織ホモジナザーで破壊した。生菌数を、栄養Middlebrook 7H11寒天プレート(GIBCO BRL, Gaithersburg, Md.)上でのホモジネートの段階希釈によって測定した。プレートを37℃にて周囲空気中、4週間インキュベートした後、生存エム・ツベルクローシスコロニー(CFU)を計数した。
結核インビボ有効性実験
TBインビボ有効性実験は、本質的にLenaerts et al. Antimicrob Agents Chemother 47: 783-785 (2003)で記載されているようにして、いくつかの変更を加えて実施した。高感受性ガンマインターフェロン特定病原体未感染C57BL/6−Ifngtm1ts(GKO)マウス(Jackson Laboratories, Bar Harbor, Maine)をKelly et al. Antimicrob Agents Chemother 40: 2809-2812 (1996)で以前に記載されているようなGlas−Col吸入曝露システム中、エム・ツベルクローシス株Erdmanでの低用量エアロゾル感染に曝露した。すべての治療群は、次の各時点について5匹のマウスから構成されていた。治療は感染後13日で開始した。感染マウスの1つの対照群は、治療開始時に屠殺した。感染しているが未治療のマウスの第2群は、22日で治療を中止した後に屠殺した。Nは、生理食塩水中で処方し、そしてEは50%水/35%PEG400/5%PG中で処方し、一方、イソニアジド(INH)は蒸留水中で処方した。全ての化合物を経口強制飼養によって投与した。INHを25mg/kg QD POで投与した。Eを100mg/kg QD POで投与した。Nを100mg/kg BID POで投与した。治療終了後に、マウスを二酸化炭素吸入によって屠殺した。脾臓および肺を無菌的に摘出し、組織ホモジナザーで破壊した。栄養Middlebrook 7H11寒天プレート(GIBCO BRL, Gaithersburg, Md.)上でのホモジネートの段階希釈によって、生菌数を測定した。プレートを、37℃にて周囲空気中4週間インキュベートした後、生存エム・ツベルクローシスコロニー(CFU)を計数した。
(付記)
(付記1)
R 4 は、ハロゲン、非置換アルキル、非置換アルコキシ、および非置換フェニルからなる群から選択され、
Yは、OまたはSであり、
R 5 は、置換もしくは非置換アルキルおよび置換もしくは非置換ヘテロアルキルからなる群から選択される)
である構造を有する化合物
またはその塩、水和物もしくは溶媒和物。
(付記2)
(付記3)
である構造を有する、付記1記載の化合物。
(付記4)
C*立体中心が(S)立体配置である、付記2記載の化合物。
(付記5)
R 3 が−CH 2 NH 2 である、付記1記載の化合物。
(付記6)
R 4 が、フッ素、塩素、臭素、およびヨウ素からなる群から選択される、付記1記載の化合物。
(付記7)
YがOである、付記1記載の化合物。
(付記8)
R 5 が、メチル、エチル、プロピル、イソプロピル、ブチル、イソブチル、t−ブチル、およびsec−ブチルからなる群から選択される、付記1記載の化合物。
(付記9)
R 3 が−CH 2 NH 2 であり、R 4 がハロゲンである、付記1記載の化合物。
(付記10)
R 3 が−CH 2 NH 2 であり、R 4 が塩素であり、YがOであり、R 5 が置換もしくは非置換アルキルである、付記1記載の化合物。
(付記11)
組成物であって、
a)付記2記載の化合物の第1立体異性体と、
b)第1立体異性体の少なくとも1つのさらなる立体異性体と
を含み、
前記立体異性体が、前記少なくとも1つのさらなる立体異性体に対して少なくとも80%エナンチオマー過剰で存在する、組成物。
(付記12)
付記1記載の化合物、またはその薬剤的に許容される塩を、少なくとも1つの他の治療活性剤と共に含む組み合わせ。
(付記13)
a)付記1記載の化合物、またはその薬剤的に許容される塩と、
b)薬剤的に許容される賦形剤と、
を含む、医薬製剤。
(付記14)
酵素を阻害する方法であって、酵素を付記1記載の化合物と接触させ、それによって酵素を阻害することを含む、方法。
(付記15)
微生物を殺滅および/または微生物の成長を防止する方法であって、
前記微生物を有効量の付記1記載の化合物と接触させ、それによって、微生物を殺滅および/または微生物の成長を防止すること
を含む、方法。
(付記16)
動物における疾患を治療および/または防止する方法であって、
治療有効量の付記1記載の化合物、またはその薬剤的に許容される塩を前記動物に投与し、それによって前記疾患を治療および/または防止すること
を含む、方法。
(付記17)
前記疾患が結核である、付記16記載の方法。
(付記18)
動物がヒトである、付記16記載の方法。
(付記19)
t−RNAシンセターゼの編集ドメインを阻害する方法であって、
前記シンセターゼを有効量の付記1記載の化合物、またはその薬剤的に許容される塩と接触させ、それによって前記シンセターゼを阻害することを含む、方法。
(付記20)
付記1記載の化合物または付記12記載の組み合わせまたはその薬剤的に許容される塩の、細菌感染症の治療および/または予防のための薬物の製造における使用。
Claims (22)
-
R4は、ハロゲンおよび非置換アルキルからなる群から選択され、
Yは、Oであり、
R5は、−OH、−O−(C 1 〜C 6 非置換アルキル)、−S−(C 1 〜C 6 非置換アルキル)、−NH 2 、−NH(C 1 〜C 6 非置換アルキル)、−N(C 1 〜C 6 非置換アルキル)(C 1 〜C 6 非置換アルキル)、および−OBnからなる群から選択される一つの置換基を有するC 1 〜C 8 アルキルであるか、またはR 5 は、下記式;
である構造を有する化合物
またはその塩、水和物もしくは溶媒和物。 - R 4 が、メチル、エチル、プロピル、イソプロピル、ブチル、イソブチル、t−ブチルおよびsec−ブチルからなる群から選択される、請求項1に記載の化合物またはその塩、水和物もしくは溶媒和物。
- R 4 が、塩素または臭素である、請求項1〜2のいずれか1項に記載の化合物またはその塩、水和物もしくは溶媒和物。
- R 4 が、塩素である、請求項1〜2のいずれか1項に記載の化合物またはその塩、水和物もしくは溶媒和物。
- R 4 が、メチルである、請求項1に記載の化合物またはその塩、水和物もしくは溶媒和物。
- 請求項1〜7のいずれか1項に記載の化合物またはその塩、水和物もしくは溶媒和物を、少なくとも1つの他の治療活性剤と共に含む組み合わせ。
- 少なくとも1つの他の治療活性剤が、抗結核剤である、請求項8に記載の組み合わせ。
- a)請求項1〜7のいずれか1項に記載の化合物またはその塩、水和物もしくは溶媒和物あるいは請求項8〜9のいずれか1項に記載の組み合わせと、
b)薬剤的に許容される賦形剤と、
を含む、医薬製剤。 - ロイシルtRNAシンセターゼ酵素を阻害するin vitroでの方法であって、ロイシルtRNAシンセターゼ酵素を請求項1〜7のいずれか1項に記載の化合物またはその塩、水和物もしくは溶媒和物と接触させるか、またはロイシルtRNAシンセターゼ酵素を請求項8〜9のいずれか1項に記載の組み合わせと接触させ、それによってロイシルtRNAシンセターゼ酵素を阻害することを含む、方法。
- 微生物を殺滅および/または微生物の成長を防止するin vitroでの方法であって、
前記微生物を有効量の請求項1〜7のいずれか1項に記載の化合物またはその塩、水和物もしくは溶媒和物あるいは請求項8〜9のいずれか1項に記載の組み合わせと接触させ、それによって、微生物を殺滅および/または微生物の成長を防止すること
を含む、方法。 - 微生物が、マイコバクテリウムである、請求項12に記載のin vitroでの方法。
- マイコバクテリウムが、マイコバクテリウム・ツベルクローシス(Mycobacterium tuberculosis)である、請求項13に記載のin vitroでの方法。
- マイコバクテリウムが、マイコバクテリウム・アビウム(Mycobacterium avium)である、請求項13に記載のin vitroでの方法。
- マイコバクテリウムが、マイコバクテリウム・アビウム・イントラセルラーレ(Mycobacterium avium intracellulare)である、請求項13に記載のin vitroでの方法。
- 請求項1〜7のいずれか1項に記載の化合物またはその塩、水和物もしくは溶媒和物、請求項8〜9のいずれか1項に記載の組み合わせ、あるいは請求項10に記載の医薬製剤の、動物における細菌感染症の治療および/または予防のための薬物の製造における使用。
- マイコバクテリウムが、多剤耐性マイコバクテリウム・ツベルクローシス(Mycobacterium tuberculosis)である、請求項14に記載のin vitroでの方法。
- マイコバクテリウムが、広範囲薬物耐性マイコバクテリウム・ツベルクローシス(Mycobacterium tuberculosis)である、請求項14に記載のin vitroでの方法。
- 結核の治療および/または予防のために用いられる、請求項10に記載の医薬製剤。
- 細菌感染症が結核である、請求項17に記載の使用。
- 動物がヒトである、請求項17に記載の使用。
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