JP4106094B2 - クローン化グルカゴン様ペプチド２受容体 - Google Patents

Description

発明の分野
本発明は分子生物学の分野におけるものである。より具体的には、本発明はクローン化グルカゴン様ペプチド２受容体、ならびに薬剤スクリーニングおよび関連用途におけるそれら受容体の使用に関する。
発明の背景
グルカゴン様ペプチド２（GLP-2）は33個のアミノ酸からなるペプチドである。このペプチドは、多面発現性グルカン遺伝子より組織特異的な様式で発現され、そしてグルカゴンおよびグルカゴン様ペプチド１（GLP-1）とアミノ酸配列の点で高度に関連している。GLP-2の哺乳動物における形態は高度に保存されている。例えば、ヒトおよびデグー（degu）（南米の齧歯動物）の形態はラットのGLP-2とアミノ酸がそれぞれ１個および３個だけ異なっている。最近、GLP-2は腸刺激性ペプチドホルモンであることが示された。GLP-2を外因的に投与した場合、被験マウスの小腸上皮の増殖に顕著な増大を引き起こしうる（Druckerら，（1996）PNAS, 93:7911-7961）。より最近になって、GLP-2は腸の基底外側膜におけるD-グルコース最大輸送速度を増大させることが示された（CheesemanおよびTseng, American Journal of Physiology（1996）271:G477-G482）。
胃腸生物学の研究、および胃腸障害を含む種々の医学的症状を治療するのに有用な薬剤の開発を促進するため、GLP-2の作用を媒介する受容体を提供することは有用であろう。
発明の要約
GLP-2受容体はクローン化され、特徴づけられている。したがって、本発明はGLP-2受容体（特に、具体的にはラットおよびヒト形態等の哺乳動物形態およびそれらの相同体を含む）をコードする単離されたポリヌクレオチドを提供する。本発明の態様においては、GLP-2受容体をコードするポリヌクレオチドは機能性受容体タンパク質を得るための発現に使用され、そして、場合により標識された形で、構造的に関連した受容体タンパク質を同定するための遺伝子クローニングにさらに使用される。本発明の関連した態様においては、GLP-2受容体の発現を調節するため、GLP-2受容体をコードするポリヌクレオチドのアンチセンス形態およびそれらの断片が獲得され、使用される。
本発明の別な態様においては、本発明は細胞性宿主を用いた組換え産生の産物としてGLP-2受容体を提供する。関連する態様においては、GLP-2受容体を発現する組換え宿主細胞；並びに、そのような細胞から誘導される、受容体を担持する膜；およびGLP-2受容体をコードするポリヌクレオチドが、選択された宿主細胞中で機能する発現制御エレメントに連結されている発現構築物が提供される。
本発明の別な態様においては、GLP-2受容体リガンドを同定するための化学的スクリーニングプログラムにGLP-2受容体が使用される。この方法は、候補リガンドを本発明のGLP-2受容体産生細胞または該細胞由来の膜調製物と共にインキュベートする工程、および次に結合が起こったかどうか、またはどの程度まで起こったかを測定する工程を含んで成る。セカンドメッセンジャー系に機能的に結合したGLP-2受容体を発現する細胞を用いて、適切なリポーターを検出することによって、そのような結合を間接的に測定して活性に対するリガンドを明らかにすることができる。
本発明の別な態様においては、例えば診断方法等に使用される、GLP-2受容体に対する抗体が提供される。
以下の図面を参照して本発明を更に説明する。
【図面の簡単な説明】
図１はcDNA配列（配列番号１）を示す。この配列のヌクレオチド137〜1789はラットGLP-2受容体をコードしており、曖昧な塩基対は標準的IUB命名法（Ｒ：ＡまたはＧ、Ｙ：ＣまたはＴ、Ｍ：ＡまたはＣ、Ｋ：ＧまたはＴ、Ｓ：ＧまたはＣ、Ｗ：ＡまたはＴ）を用いて示してある。
図２は図１のcDNA由来の発現産物のアミノ酸配列（配列番号２）を示す。
図３は、配列番号１によってコードされる受容体に対するGLP-2ペプチドおよびGLP-1ペプチドの相対的効力（potency）を示す。
図４は、ヒトGLP-2受容体の222アミノ酸断片（配列番号10）をコードする、667ヌクレオチドからなるcDNA配列（配列番号９）を示す。
図５は、図４のcDNAから発現されるアミノ酸配列（配列番号10）を示す。
図６はcDNA配列（配列番号11）を示す。この配列のヌクレオチド121〜1779はヒトGLP-2受容体をコードする。
図７は、図６のcDNA由来の発現産物のアミノ酸配列（配列番号12）を示す。
図８は、配列番号11（図８）によってコードされるヒト受容体のGLP-2ペプチドによる機能的活性化を示す。
図９は、ラットGLP-2受容体とヒトGLP-2受容体とのアミノ酸配列の比較を示す。
図10は、ラットGLP-2受容体およびヒトGLP-2受容体のアミノ酸配列とラットGLP-1受容体のアミノ酸配列との比較を示す。
発明の詳細な説明および好ましい実施形態
本発明はその１態様において、GLP-2受容体をコードする単離された形態のポリヌクレオチドに関する。本発明に用いる「単離された」という用語は、他のタンパク質をコードするポリヌクレオチドから分離されていることを意味する。例えば、ポリヌクレオチドライブラリーとの関連においては、GLP-2受容体をコードするポリヌクレオチドは、選択され、そしてそれゆえライブラリー内の他のポリヌクレオチドとの関連から離された時に「単離された」と見なされる。そのようなポリヌクレオチドはRNAの形であってよい。または、cDNA、ゲノムDNAおよび合成DNAを含むDNAの形であってもよい。GLP-2受容体は、Ｇタンパク質共役受容体クラスに共通する構造的特徴（７つの膜貫通領域を含む）、およびGLP-2ペプチドに選択的に（すなわち、GLP-1ペプチドよりも優先的に）結合するという機能的特性によって特徴づけられる。このような選択的結合は、結合アフィニティーを測定するために選択されたアッセイにおいて、GLP-1よりも統計学的に有意に大きいGLP-2の結合アフィニティーとして現れる。宿主細胞中で機能的に（すなわち、応答性セカンドメッセンジャー系と機能しうる形で連結されて）発現された場合、GLP-2受容体はさらにシグナル伝達によってGLP-2結合に応答することができる。
この点で、GLP-2受容体等のＧタンパク質共役受容体の活性は、受容体の活性化が何らかのセカンドメッセンジャー系のレベル（例えば、アデニル酸シクラーゼ、カルシウム動員、イノシトールリン脂質加水分解生成物またはグアニリルシクラーゼ）に検出可能な変化をもたらす種々の適切な機能アッセイのうち任意のものを用いて測定することができる。
ヒトおよびラットGLP-2受容体を表すアミノ酸配列における相同性を示す図９および図10において、100%同一の領域は実線で描いた縦の棒で示されている。本発明の実施形態においては、GLP-2受容体はアミノ酸配列のこれらの領域を組み込んだ受容体であって、また（GLP-1ペプチドと比較して）GLP-2ペプチドに選択的に結合するという機能的特徴を示す受容体である、として構造的に規定される。より具体的な実施形態においては、GLP-2受容体構造はヒトおよびラット受容体種において高度に保存されたアミノ酸（図中「：」で示す）を更に組み込んでいる。これらの部位においては、配列は上記のように同定されたアミノ酸が属する高度に保存されたアミノ酸ファミリー内の任意のアミノ酸を含みうることが認識されるであろう。さらに具体的な実施形態においては、GLP-2受容体は中程度に保存されたアミノ酸（図中「．」で示す）を更に組み込んだ構造を有し、これらの部位においては、アミノ酸はそれらが属する中程度に保存されたファミリー内のアミノ酸であることを意味する。本発明の実施形態においては、GLP-2受容体構造はこれらの配列を超えて、アミノ酸の非保存的置換を考慮に入れて、広範に変わりうる。
本発明の１つの実施形態においては、GLP-2受容体は配列番号２のアミノ酸配列を有するラットGLP-2受容体である。本発明の特定の実施形態においては、このラットGLP-2受容体は配列番号１のポリヌクレオチド配列によってコードされる。この特定のGLP-2受容体をコードするポリヌクレオチド（WBR遺伝子とも呼ぶ）は、ラット起源のcDNAである。このポリヌクレオチドの発現産物は、成熟形態のGLP-2受容体を組み込んでおり、また成熟GLP-2受容体産物の膜への組込みに先立って除去される分泌シグナルを付加的に組み込んでいる。このようなシグナル配列は天然のものがポリペプチド上に存在してもよく、またはGLP-2受容体に対して異種の機能的に等価な分泌シグナルと置換してもよい。選択される置換分泌シグナルは用いられる発現系に依存し、そして本質的にではないが典型的には選択された宿主に内因性であり、また本質的にではないが典型的には選択された発現制御配列に相同である。
発現されたラットGLP-2受容体産物（図２、配列番号２）は、予測分子量が72kDaの、550アミノ酸からなる１本のポリペプチド鎖として構造的に特徴づけられる。ラットGLP-2受容体の２つの機能的な翻訳開始部位が同定された。これらは配列番号２のメチオニン１およびメチオニン42をコードするコドンである。限定を望むものではないが、GLP-1受容体とのアナロジーにより、配列番号２の残基１〜66は開裂されて484アミノ酸からなる成熟タンパク質（すなわち、細胞膜中に現れる場合の受容体のアミノ酸配列）をもたらすと考えられる。このGLP-2受容体の構造性ドメインについて、ピドロパシー分析およびＧタンパク質共役受容体のこのサブファミリーの関連メンバーとの配列アライメントは、７個の推定上の膜貫通領域を示している。このうち第１の領域は残基181から203にわたり（181及び203も含む）（TM I）、第２は残基211から230にわたり（TM II）、第３は残基262から285にわたり（TM III）、第４は残基300から321にわたり（TM VI）、第５は残基339から362にわたり（TM V）、第６は残基386から405にわたり（TM VI）、そして第７は残基422から441にわたっている（TM VII）。この構成に基づくと、このGLP-2受容体は天然の膜結合形態においては、Ｎ末端細胞外ドメイン、それに続く７個の膜貫通ドメインを含む疎水性領域、および442〜550アミノ酸からなる細胞内Ｃ末端ドメインから成るように思われる。このタンパク質はラットGLP-1受容体に対してアミノ酸レベルにおいて49%同一という最も高い相同性を示す。
関連する実施形態においては、GLP-2受容体はヒト起源のものであり（配列番号９）、配列番号10のアミノ酸配列を有するヒトGLP-2受容体断片を組み込んでいる。このポリヌクレオチドは、以下に概略を記述し、実施例３に詳細を記述するラットcDNA配列を用いて単離された。本発明の更に関連した実施形態においては、cDNAはヒト起源のものであって（配列番号11）、配列番号12のアミノ酸配列の残基67〜533を有する全長ヒトGLP-2受容体をコードする。ヒトGLP-2受容体の前駆体産物（図７、配列番号12）は予測分子量が72kDaの、553アミノ酸からなる１本のポリペプチド鎖として構造的に特徴づけられる。ラットGLP-2受容体の場合と同様、この配列、つまりヒトGLP-2受容体のこの前駆体形態はＮ末端シグナル配列を組み込んでいるものと考えられる。そしてこのシグナル配列は機能的に等価な異種シグナル配列と置換することができる。限定を望むものではないが、成熟形態のヒトGLP-2受容体は配列番号12（図７）の残基１〜66の開裂後に生じると考えられる。このGLP-2受容体の構造ドメインについて、ピドロパシー分析およびＧタンパク質共役受容体のこのサブファミリーの関連メンバーとの配列アライメントは、７個の推定上の膜貫通領域を示している。このうち第１の領域は残基181から203にわたり（181及び203も含む）（TM I）、第２は残基211から230にわたり（TM II）、第３は残基262から285にわたり（TM III）、第４は残基300から321にわたり（TM VI）、第５は残基339から362にわたり（TM V）、第６は残基386から405にわたり（TM VI）、そして第７は残基422から441にわたっている（TM VII）。この構成に基づくと、このGLP-2受容体は天然の膜結合形態においては、Ｎ末端細胞外ドメイン、それに続く６個の短い親水性ドメインを間に散在させた７個の膜貫通ドメインを含む疎水性領域、および残基442から553にわたると予測される細胞内ドメインから成るように思われる。本発明に包含されるこのGLP-2受容体の第２の形は、図７、配列番号12に示すアミノ酸配列の第26位のメチオニンコドンが翻訳開始部位である。得られる528アミノ酸からなるポリペプチド鎖もまた、細胞外ドメイン、７個の膜貫通ドメイン、およびＣ末端細胞内ドメインから成り、そして配列において図７、配列番号12に示すアミノ酸配列の残基26〜553と少なくとも95%同一である。
別の実施形態において、本発明は構造的に関連したポリヌクレオチドを同定及び単離するのに有用な道具として、GLP-2受容体ポリヌクレオチド配列およびそれらのユニークな配列断片を提供する。例えば、低ストリンジェンシーのハイブリダイゼーション条件下で、ポリヌクレオチドライブラリーを釣り上げて、GLP-2受容体遺伝子に少なくとも約50%相同な遺伝子を同定することが可能である。GLP-2受容体をコードしているラットGLP-2受容体遺伝子相同体の単離を容易にするため、望ましくはストリンジェンシー条件を強化してポリヌクレオチドレベルにおいて受容体遺伝子と少なくとも80%（中程度のストリンジェンシー）の配列同一性相同性を有する相同体を同定する。より望ましくは、WBR遺伝子相同体はWBRと比較して90%配列が同一（高ストリンジェンシー）、そして最も望ましくは少なくとも95%同一（高ストリンジェンシー）である。好ましくは、単離されたWBR相同体は以下の点で特徴づけられる。すなわち、（1）それらは配列番号３および配列番号４というPCRプライマーを用いて増幅することができる；そして（2）それらは高ストリンジェンシー条件下で配列番号５というプローブに結合する。
より好ましくは、単離された相同体はGLP-2受容体をコードするポリヌクレオチドの共通領域（すなわち、ラットおよびヒトGLP-2受容体をそれぞれコードするポリヌクレオチドにおいて同一で、かつGLP-1受容体をコードする配列に較べてGLP-2受容体をコードするポリヌクレオチドに独特の領域）に高ストリンジェンシー条件下で結合するものである。この性質のアライメントは、GLP-2について複数の共通領域を明らかにする。例えば、1460〜1786にわたるヌクレオチドである。本発明の１つの実施形態においては、これらの配列およびその相補体は、本発明のヒトおよびラットGLP-2受容体の実施形態に構造的に関連するポリヌクレオチドを同定するために完全な遺伝子について記述したのと全く同じように有用なポリヌクレオチド断片を構成する。
関連する実施形態において、GLP-2受容体（最も好ましくはヒトGLP-2受容体）のcDNA配列またはそのユニークな断片は、適切に標識した形で用いることができる。例えば、GLP-2受容体の異常な発現（例えば、過剰もしくは過少発現、または不適切な組織における発現）に関連する状態の診断のための³²P標識などである。１つの実施形態においては、適切なPCRプライマー（例：GLP-2受容体に独特であるが、種の間で保存されている領域）を診断的に用いて、GLP-2受容体mRNAの、例えば遺伝性のまたは後天性の病態に関連する、異常な構造またはレベルを同定することができる。
ヒトGLP-2受容体は染色体17P13上に位置することが見いだされている。したがって、更なる実施形態において、本発明はヒトGLP-2受容体ポリヌクレオチド（図６、配列番号11）と高ストリンジェンシー条件下でハイブリダイズする、この遺伝子座由来の発現産物を提供する。
ラットGLP-2受容体をコードするポリヌクレオチド遺伝子のGLP-2受容体をコードする相同体を単離するための供給源材料としては、受容体単離の標的となった脊椎動物種から得た胎児の、または成熟した視床下部、空腸、後脳または胃組織のライブラリーを使用することが必要ではないが望ましい。したがって、本発明はラットGLP-2受容体をコードする配列番号１のポリヌクレオチドのみでなく、その構造的相同体、および特にGLP-2受容体特性を有するタンパク質をコードする相同体をも含む。
以下に実証されるように、WBR遺伝子はラットGLP-2受容体のヒト相同体をクローン化するための出発材料として好結果に使用されてきた。したがって、本発明はラットGLP-2受容体および脊椎動物相同体、特にヒト相同体を含む哺乳動物相同体を含むGLP-2受容体をコードするポリヌクレオチド、ならびにこれらの合成変異体を提供する。
そのような相同体は、ラット受容体遺伝子またはそのヒト相同体の少なくとも15ヌクレオチド、好ましくは少なくとも25ヌクレオチドを組み込んでいる断片を用いたスクリーニングによってライブラリー中に同定することも可能であることが認識されるであろう。配列番号１およびそこに示すヌクレオチド番号に言及するならば、適切なヌクレオチド断片は上述の共通ヌクレオチド断片に加えて、受容体の細胞外GLP-2結合ドメイン、定められた膜貫通領域およびＣ末端領域に順次（in sequence）対応するヌクレオチドを含む。
技術的には、GLP-2受容体遺伝子の同定は組織由来のポリヌクレオチドライブラリーに対して標準的ハイブリダイゼーションまたは増幅技法を適用することによって達成できる。そのようなライブラリーは種々のものが市販されている。cDNAライブラリーの構築が必要な場合は、確立された技法が利用される。例えば、上記のようなWBR相同体の単離は典型的には、視床下部、空腸、胃または後脳組織、等の組織（好ましくは視床下部組織）またはこれら組織から誘導された細胞系、等の新鮮な供給源からの全mRNAの抽出、およびそれに続くmRNAからcDNAへの変換、および例えば細菌プラスミド中、より典型的にはバクテリオファージ中におけるライブラリーの形成を必然的に伴う。
そのようなバクテリオファージを担持するDNA断片は、典型的には、個々のファージプラークまたはコロニーが単離されうるように感受性大腸菌の菌叢に播くことによって増殖させる。次に、ファージコロニーに担持されているDNAを典型的にはニトロセルロースの、またはナイロンに基づくハイブリダイゼーション膜上に固定し、注意深く制御した条件下で放射能（または他のもの）で標識したプローブ配列とハイブリダイズさせ、特に目的のDNA（この場合、ラットまたはヒトGLP-2相同体）の断片を担持する特定のファージコロニーを同定する。次に、外来遺伝子がより容易に特徴づけられるように、目的の特定の遺伝子を担持するファージを上記ライブラリー由来の他の全ファージから精製する。典型的には、該遺伝子またはその一部を便宜のため、特にそのDNA配列の完全な決定のために、プラスミドベクター中にサブクローン化することによって単離する。
GLP-2をコードするDNAをDNAインサートとして利用可能な又は構築したcDNAライブラリーから直接得る代わりに、本発明の開示に照らして該DNAを確立された遺伝子合成技法を用いてde novoに合成することが可能である。配列番号１、配列番号９および配列番号11のGLP-2受容体をコードするDNAの長さゆえに、自動合成の利用は段階的な遺伝子構築を必要とするであろう。長さが約300ヌクレオチドまでの遺伝子領域が個別に合成され、次にそれらが最終的な組立のために正しい順序で連結される。個別に合成された遺伝子領域は、PCRによって増幅することができる。自動合成は、典型的には遺伝子の特定領域または断片を合成し、そして通常は設計された重複によってそれらを正しい順序に連結し、最終的遺伝子配列を形成することによって利用される。この場合、オリゴヌクレオチドのビルディングブロック（building block）が長いほど必要な連結が少なくなり、組立が非常に容易になる。
自動遺伝子合成技法の利用は、天然に存在するGLP-2受容体遺伝子の配列変異体を生じる機会をもたらす。例えば、本明細書に記述するGLP-2受容体をコードするポリヌクレオチドは、本明細書が提供する天然に存在するポリヌクレオチド配列において表されているコドンの代わりに１またはそれ以上の同義コドンを用いることによって生成できることが認識されるであろう。そして、そのような「同義コドン等価物」は本発明の範囲内にある。さらに、１から20（例えば１から５）のアミノ酸置換、欠失、または付加を組み入れた、本明細書が提供する、GLP-2受容体の合成変異体をコードするポリヌクレオチドを生成することができる。このような改変のための好ましい部位は、ラット配列とヒト配列との間の非相同領域、例えばアミノ酸70〜92、328〜350および475〜504の領域である。スクリーニングの目的上、典型的には受容体の天然のリガンド結合特性を保持することが望ましいため、アミノ酸置換を例えばいわゆる同類置換（類似した電荷のアミノ酸が置換される）（図９）に限定し、また受容体活性にとって重要性のより低い部位に置換を限定することが望ましい。例えば、配列番号11のヒトcDNA配列の第374位および第375位のヌクレオチド「Ａ」および「Ｇ」を、それぞれヌクレオチド「Ｇ」および「Ａ」に代えることは、配列番号12の第85位の天然に存在するアルギニン残基のグルタミン酸残基への置換をもたらし、機能性受容体を提供する。この機能性受容体は、本明細書においてGlu⁸⁵変異型ヒトGLP-2受容体と呼ばれる。
GLP-2受容体をコードするポリヌクレオチドを得たならば、該DNAのin vitro転写および適切な発現ベクターへの組み込み、および大腸菌等の細菌、酵母、または昆虫もしくは哺乳動物細胞等の適切な宿主中における発現、を含む多数の方法でGLP-2受容体を作製することができる。種々の遺伝子発現系がこれらの宿主と共に使用するために適合化されており、それらは現在市販されている。これらの系の任意のものを選択して、GLP-2受容体をコードするDNAの発現を引き出すことが可能である。発現ベクターを選択して、一過性に又は安定した様式で受容体をコードするDNAを発現する形質転換細胞系をもたらすことが可能である。一過性発現のためには、宿主細胞は典型的には哺乳動物細胞中で機能する複製起点を有する発現ベクターによって形質転換される。安定した発現のためには、そのような複製起点は不要であるが、典型的には、ベクターは形質転換体の選択を可能とする、生存に有利な条件を形質転換体に付与する産物をコードする遺伝子、例えばネオマイシン耐性をコードする遺伝子を有する。この場合、形質転換体はネオマイシンを補充した培地に播かれる。
典型的にはプラスミドベクターの形で入手可能であるが、その形だけに限定されないこれらの発現系は、発現カセットを組み込んでいる。発現カセットの機能的構成要素は、発現制御配列および場合によりシグナルペプチドをコードする配列を構成するDNAを含む。発現カセットは宿主によって認識され、そして受容体をコードするDNAの5’末端に結合した時にその発現を可能とする。この系はさらに、受容体をコードする領域の’3末端に結合した時に発現を終結するDNA配列を組み込んでいる。したがって、選択された哺乳動物宿主細胞における発現のために、受容体をコードするDNAが宿主によって認識される発現制御DNA配列に連結している、組換えDNA発現構築物が作製される。そして、この構築物は発現を引き出す、受容体をコードするDNAの5’末端領域、および発現を終結させる3’末端領域を含む。
受容体をコードするDNAの哺乳動物細胞発現を達成するのに用いうる種々の組換えDNA発現系の中には、哺乳動物細胞に感染するウイルスのプロモーターを利用する発現系が含まれる。例えば、サイトメガロウイルス（CMV）、ラウス肉腫ウイルス（RSV）、サルウイルス（SV40）、マウス乳癌ウィルス（MMTV）およびその他に由来するプロモーターが挙げられる。レトロウイルスのLTR、温度によって調節されるもの等の昆虫細胞プロモーターおよびショウジョウバエから単離されたプロモーター、ならびに重金属によって調節されるもの（すなわち、メタロチオネイン遺伝子プロモーター）等の哺乳動物遺伝子プロモーターおよび他のステロイド誘導性プロモーター、等のプロモーターもまた発現を引き出すのに有用である。
本発明の別な態様において、本発明は例えばGLP-2受容体リガンドの同定に用いるために遺伝子変更（genetic alteration）によって適合させた細胞、または該細胞由来の膜を提供する。好ましい実施形態においては、このような細胞はGLP-2受容体をコードするポリヌクレオチドの挿入によって遺伝子的に適合させられる。特に好ましい実施形態においては、このような細胞は組換えDNA分子、例えば、GLP-2受容体をコードするDNAおよび宿主中で機能する発現制御エレメントが該DNAの発現を引き出すのに機能しうる形で連結されている発現構築物／ベクターを組み入れている。細胞原形質膜中に受容体を取り込むため、上記ベクターは所望であれば、天然において受容体DNA内にコードされているシグナルペプチドに代わる適切な異種シグナルペプチド配列を提供するように設計することが可能である。
適切なGLP-2産生細胞は、例えば、Pro5変異株（ATCC CRL 1281）を含むK1系統（ATCC CCL 61）のチャイニーズハムスター卵巣（CHO）細胞；CV-1系統（ATCC CCL 70）、COS-1系統（ATCC CRL 1650）およびCOS-7系統（ATCC CRL 1651）の、SV40で形質転換したアフリカミドリザル腎臓由来の繊維芽細胞様細胞；マウスL-細胞、マウス3T3細胞（ATCC CRL 1658）、マウスC127細胞、293系統（ATCC CRL 1573）ヒト胎児腎細胞、HeLa系統（ATCC CCL 2）のものを含むヒト癌細胞、およびIMR-32（ATCC CCL 127）、SK-N-MC（ATCC HTB 10）およびSK-N-SH（ATCC HTB 11）系の神経芽腫細胞を含む。
リガンドスクリーニングアッセイに用いるため、受容体をコードするDNAを発現する細胞系を冷凍保存して、後に使用することができる。そのようなアッセイは完全な細胞を用いて、またはそのような細胞由来の膜調製物を用いて実施することができる。膜調製物は典型的にはリガンド結合実験のためのより便利な基質を提供し、そしてそれゆえ結合基質として好ましい。スクリーニング用、すなわち、リガンド結合実験用の膜調製物を調製するためには、冷凍した完全な細胞を冷水に浮遊させながらホモジナイズする。そして遠心後、膜ペレットを回収する。次にペレットを冷水で洗浄し、透析して、除去しなければアッセイにおいて結合を競合するであろう内因性GLP-2受容体リガンドを全て除去する。次に透析した膜をそのまま、または凍結乾燥形態で保存した後、リガンド結合アッセイに使用することができる。
本発明の選ばれたGLP-2受容体への候補リガンドの結合は、典型的には、細胞由来の膜の予め定めた量（例えばタンパク質定量により測定した）、一般的にほぼ25μg〜100μgを使って、評価することができる。一般的に、競合結合アッセイが、GLP-2に関係する試験化合物の親和性を評価するために有用であろう。この競合結合アッセイは、様々な濃度で加えた未標識試験化合物の存在下で、膜調製物を放射性標識したGLP-2ペプチド、例えば[H³]または放射性ヨウ素標識したGLP-2類似体と共にインキュベートして実施される。インキュベーションの後、置き換わったまたは結合した放射性標識GLP-2を回収し測定して、基質として使ったGLP-2受容体に対する試験化合物およびGLP-2の相対的結合親和性を定量することができる。この方法で、GLP-2受容体に対する様々な化合物の親和性を測定することができる。
あるいはまた、候補リガンドのGLP-2受容体に対する結合を機能アッセイを使って評価することができる。この方法を使うと、例えば、一過性トランスフェクションのほぼ２日後もしくは安定的にトランスフェクトした細胞のプレーティングの約２日後に収穫した無傷の細胞を、リガンド結合を評価するために使うことができる。好ましい実施様態では、293 EBNA細胞（Invitrogenカタログ番号R620-07）を、GLP-2受容体を発現可能に組み込んでいるpREP7ベクター（Invitrogenカタログ番号V007-50）で安定に形質転換する。その後、アゴニスト（または競合ベースフォーマットとアンタゴニストを使用）の受容体への結合は、細胞内cAMPのレベルを測定して確認することができる。最も便宜的には、容易に測定可能で好ましくは容易に定量化できる下流事象が細胞内cAMPレベルを示すリポーター系を使って、細胞内cAMPを間接的に測定する。例えば、cAMPに応答性のプロモーターの調節下にあるポリヌクレオチド配列を有するリポーター遺伝子構築物の発現レベルを測定する。あるいはまた、例えば、形質転換細胞中にカルシウムと結合すると蛍光を発するタンパク質を組み込むことにより、細胞内cAMPの増加に応答して細胞内貯蔵所から放出される細胞内カルシウムの測定を、細胞内cAMPレベルの指標として使うことができる。好ましい実施様態では、細胞内cAMPレベルは、市販EIAキットを使って測定される。機能に基づいてリガンド結合を評価する手法のさらなる利点は、該システムを自動化することができて、膨大な化学ライブラリーのハイスループットおよびウルトラハイスルーのスクリーニングを可能とすることである。
受容体コード化DNAを発現する細胞を使う別法として、リガンド特性決定は、GLP-2受容体をコードするメッセンジャーRNA導入後に機能性の膜結合受容体を産生する細胞、例えばアフリカツメガエル卵母細胞（Xenopus oocytes）を使って行うこともできる。この場合、本発明のGLP-2受容体をコードするポリヌクレオチドは、典型的には、プラスミドベクターにサブクローニングして、そのプラスミドベクターより供給される隣接RNA転写プロモーター、例えばT3もしくはT7バクテリオファージプロモーターにより、導入された遺伝子が容易にRNAに転写されるようにする。その後、挿入された遺伝子からin vitroでRNAに転写し、その後、アフリカツメガエル卵母細胞に注射することができる。各卵母細胞は単一細胞であるが、先端の細い微小針により修復不可能な傷害を生じることなく貫入するに十分な大きさである。nL容積のRNA溶液を注射した後、卵母細胞を数日間インキュベートしたままとし、そこで卵母細胞を、浴溶液中に供給した特定リガンド分子に対する応答能力について試験する。
候補GLP-2受容体リガンドは構造的に多様であるが、最も適切には、アミノ酸配列がGLP-2自身に高度に関係するタンパク質を含む。例えば、参照により本明細書に組み入れる同時係属中の米国特許出願WO97/39031およびWO96/32414に開示されたペプチドは、GLP-2受容体結合活性について有利にスクリーニングされ得る。
天然に存在するGLP-2受容体配列に加えて、GLP-2受容体配列の部分を含む機能性キメラ受容体、およびそれらをコードするポリヌクレオチドも本発明の実施様態である。機能性キメラGLP-2受容体は、試験目的のために、GLP-2受容体の細胞外受容配列を、公知の７回膜貫通Gタンパク質共役受容体の１個以上の膜貫通および細胞内セグメントと結合させることで構築される。この概念は、β2-アドレナリン作動性受容体（AR）にα2-AR膜貫通配列を漸次増量して挿入することにより、一連のキメラα2-β2-ARを作製したKobilkaら（1988, Science 240: 1310-1316）により実証された。公知のアゴニストの結合活性は、分子のコンフォメーションがβ2からよりα2にシフトするに従って変化し、中間構築物は入り混じった特異性を示した。しかし、アンタゴニストと結合する特異性は、膜貫通ドメインVIIのソースと関係付けられた。リガンド認識に対する膜貫通ドメインVIIの重要性は、２つの酵母α因子受容体を利用するキメラでも見出され、酵母受容体は雑（miscellaneous）受容体として分類されている故に重要である。かくして、特定ドメインの機能的役割は、７回膜貫通Gタンパク質共役受容体ファミリー全体で、カテゴリーに関係なく、保存されるようである。
平行して、特定のGLP-2受容体由来の内部セグメントまたは細胞質ドメインを公知の７回膜貫通Gタンパク質共役受容体の類似ドメインと交換して、受容体と3量体Gタンパク質との共役に関わる構造決定要因を同定するために使われる（Dohlmanら（1991）Annu Rev Biochem 60: 653-688）。β2-AR由来のドメインV、VI、および細胞内結合ループをa2-AR中に置換したキメラ受容体は、a2-AR特異性をもつリガンドと結合するが、β2-ARの様にアデニル酸シクラーゼを刺激することが示された。これは、アドレナリン作動型受容体には、Gタンパク質認識がドメインVおよびVIならびにそれらの結合ループ中に存在することを実証する。α1-AR由来のV→VIループをβ2-ARの対応するドメインと置き換えたキメラでは逆の状況が予測かつ観察され、そして、得られた受容体はβ2-AR特異性をもつリガンドと結合し、Gタンパク質介在ホスファチジルイノシトール・ターンオーバーをα1-ARの様に活性化した。最後に、ムスカリン受容体から構築されたキメラも、V→VIループがGタンパク質活性の特異性の主要決定要因であることを実証した。
細胞外および膜貫通領域に置換を含有するキメラ型または改変型の７回膜貫通Gタンパク質共役受容体は、受容体のこれらの部分がリガンド結合特異性を決定することを示した。例えば、全てのアドレナリン作動性およびDカテコールアミン受容体のドメインVに保存された２個のSer残基は、強力なアゴニスト活性に必要である。これらのセリンは、結合部位内のアゴニストのカテコール部分と水素結合を形成すると思われる。同様に、生体アミンと結合する全ての７回膜貫通Gタンパク質共役受容体のドメインIIIに存在するAsp残基は、結合部位のリガンドアミン基とイオン対を形成すると思われる。
機能的クローン化７回膜貫通Gタンパク質共役受容体が異種発現系で発現され、それらの生物学的活性が評価された（例えば、Marulloら（1988）Proc Natl Acad Sci 85: 7551-7555; Kingら（1990）Science 250: 121-123）。１つの異種系は、哺乳動物７回膜貫通Gタンパク質共役受容体および哺乳動物Gタンパク質の遺伝子を酵母細胞に導入する。７回膜貫通Gタンパク質共役受容体は適切なリガンド特異性と親和性を有し、酵母細胞の適切な生物学的活性化（増殖停止および形態学的変化）をトリガーすることが示された。
キメラ受容体を試験する代替の方法は、Erbら（1993, Proc Natl Acad Sci 90: 104411-104453）により報じられたP_2uプリン作動性受容体（P_2u）を利用する方法に基づく。K562ヒト白血病細胞はP_2u受容体を欠くため、これらの培養細胞において機能を容易に試験できる。K562細胞を、正常またはキメラP_2uを含有する発現ベクターによりトランスフェクトし、Ca⁺⁺に対する蛍光プローブであるfura-aを加えた。適切に組み立てられた機能性P_2u受容体を細胞外UTPまたはATPにより活性化すると、細胞内Ca⁺⁺を動態化し、これがfura-aと反応し、分光蛍光分析で測定される。上記の７回膜貫通Gタンパク質共役受容体と同様に、キメラ遺伝子は、新しく発見された７回膜貫通Gタンパク質共役受容体ポリペプチドの細胞外受容体セグメントの配列と、公知のP_2u分子の膜貫通および細胞内セグメントのヌクレオチドとを結合して作製される。トランスフェクトしたK562細胞を適切なリガンドを含有するマイクロウエルに入れると、結合および７回膜貫通Gタンパク質共役受容体分子のエフェクターを規定する蛍光活性が起こる。一度、リガンドと機能が確定されると、P_2u系は、結合を遮断してかかる蛍光反応を防止するアンタゴニストまたはインヒビターを規定するために有用である。
受容体コード化DNAをリガンドスクリーニングに有用な細胞系の構築に使うことに加えて、このDNAの発現は、本発明の他の様態に従って、抗体を産生する構造研究および他の実験的使用のための可溶性形態の受容体断片を得るために行うことができる。GLP-2受容体の細胞外部分はリガンド分子の結合に著しく寄与すると予測される。従って、先ず第一に、この細胞外リガンド結合ドメインを大量にかつ単離した形で、すなわち受容体の残部の無いように提供することにより、受容体−リガンド相互作用の特性決定を容易にすることが望ましい。かかる構築物はラットGLP-1受容体に対して作られており、GLP-1と結合することが示された（Wilmenら，（1996）FEBS LETTS, 398: 43-47）。
これを行うためには、全長GLP-2受容体をコードするDNAを部位特異的突然変異誘発により改変して、細胞外N末端領域に、第１回膜貫通ドメイン（TM1）をコードする配列の直前に、すなわち配列番号２の残基181の前におよび配列番号12の残基181の前に、翻訳停止コドンを導入する。もはや、受容体を膜に「固着する」膜貫通ドメインは産生されないので、改変遺伝子の発現は可溶性形態の細胞外リガンド結合ドメインのみの分泌をもたらすだろう。その後、標準リガンド結合アッセイを実施して、このように産生した細胞外ドメインへの候補化合物の結合度を確かめることができる。勿論、単離したドメインへのリガンド結合度を最適化する目的で、部位特異的突然変異誘発を使って、細胞外領域のいくつかの異なる改変体を産生することが必要であるかもしれない。
このような細胞外リガンド結合ドメインの産生は、様々な宿主細胞で実施し得ることは認められるであろう。CHO細胞のような哺乳動物細胞をこの目的に使うことができ、その発現は、典型的には高レベル発現能のある発現プロモーター、例えばCMV（サイトメガロウイルス）プロモーターにより駆動される。あるいはまた、昆虫Sf９（Spodoptera frugiperda）細胞のような非哺乳動物細胞を使ってもよく、その発現は典型的にはバキュロウイルスの発現プロモーター、例えば強力な後期ポリヘトロンタンパク質プロモーターにより駆動される。大量のかかるGLP-2受容体の細胞外ドメインを分泌するために、糸状菌発現系を使ってもよい。例えば発現がalcAプロモーターにより駆動されるアスペルギルス・ニドゥランス（Aspergillus nidulans）は、このような許容される系を構築するであろう。このような発現宿主に加えて、さらに、細胞内または細胞外を問わず、異種遺伝子または遺伝子断片を発現する能力のあるどの原核生物または他の真核生物発現系も、同様に受け入れられることが認められるであろう。
受容体タンパク質の単離した細胞外リガンド結合ドメインを利用することにより、結合した候補リガンドをもつ場合またはもたない場合のこれらリガンド結合ドメインの３次元構造を、Ｘ線結晶学と最新２D−NMR技術の組合わせによって決定することが可能となる。この方法によって、３次元受容体構造との必要な相互作用を有すると予測されるさらに新しい候補化合物を、特定的に設計し試験することができる。
大きなドメインでは、結晶学が、単離ドメインおよび天然リガンド（または適切なアンタゴニストまたはアゴニスト分子）との共複合体の両方の構造決定のために選ばれた方法である。もし、特定ドメインが十分に小さく、例えば長さで100〜130アミノ酸ほどにすることができれば、その後、強力な２D−NMRも構造決定に使うことができる。これにより、ドメイン構造のみでなく、医薬−受容体相互作用に関する動的情報が得られる。
本発明は、例えば腸組織内の存在および／または位置の検出に特定的に使用するために、他の様態で、GLP-2受容体に対する標識抗体も提供する。かかる抗体を産生するために、上記のごとく微生物または哺乳動物細胞宿主において産生されたまたは標準ペプチド合成技術により製造された、無傷の可溶性受容体またはそれらの免疫原性フラグメントを免疫原として使うことができる。免疫原性フラグメントとしての使用に特に適したGLP-2受容体領域は、配列が受容体の細胞外領域に対応するもの、または、配列番号２の401〜509領域の10以上のアミノ酸からなるペプチドのような細胞外領域の一部を含む。ヒトGLP-2受容体（配列番号12）に関しては、成熟細胞外ドメイン（残基65〜180）；細胞内ループ３（残基363〜385）および細胞内C末端ドメイン（残基442〜533）を含んでなるペプチドは、ヒトGLP-2受容体に対する抗体産生用の免疫原として有利に用いることができる。
ポリクローナル抗体産生のために、所望のGLP-2受容体またはフラグメント免疫原に対する抗体を、免疫原で免疫した動物の血液から取得する。これとは別に、モノクローナル抗体産生のためには、脾細胞のような免疫細胞を免疫動物から回収し、ハイブリドーマ技術を使って骨髄腫細胞と融合させる。その後、融合産物は、選択培地中で培養し、抗体を産生する細胞を回収して連続増殖し、そして抗体を回収する。その後、回収した抗体は、放射性標識、酵素標識、発光標識などのような検出可能な標識に、この目的のために確立されたリンカー技術を使って、共有結合させることができる。
GLP-2受容体の生理学的および挙動的役割を解明するモデル動物系はトランスジェニック動物を作製することによって作られ、トランスジェニック動物では、様々な技術により、GLP-2受容体の活性が増加または減少しており、または発現されるGLP-2受容体のアミノ酸配列が変化している。これらの技術は、限定されるものでないが：１）トランスジェニック動物を作製する目的で、マイクロインジェクション、電気穿孔、レトロウイルストランスフェクションまたは当業界で公知の他の方法による、GLP-2受容体をコードするDNAの正常型または変異型の、適切に受精した胚への挿入、または２）発現の調節もしくはこれらGLP-2受容体配列の構造を変えるために、これら遺伝子のヒトもしくは動物の変異型もしくは正常型とトランスジェニック動物の天然の遺伝子座との相同的組換えを含む。相同的組換えの技術は、当業界では公知である。この技術は、天然の遺伝子を挿入遺伝子と置きかえて、天然のGLP-2受容体を発現することはできないが、例えば、組換えにより動物のゲノムの天然GLP-2受容体と置き換わった挿入変異型GLP-2受容体を発現し、輸送体（transporter）の発現低下をもたらす動物を作製するのに有用である。マイクロインジェクションは、遺伝子をゲノムに追加するが、それらを除去しないので、それ自身および追加したGLP-2受容体を発現する動物を作製するのに有用である。
トランスジェニック動物、例えばマウスを作製するために利用できる１つの手段は次のとおりである。すなわち、雌マウスをつがわせて、生じた受精卵を卵管から解剖して取り出す。卵を、M2培地のような適切な培地中に保存する。GLP-2受容体をコードするDNAまたはcDNAを、ベクターから当業界で公知の方法である塩化セシウム法で精製する。トランスジーンの発現を制御する実験的手段を得るために、誘導可能なプロモーターをDNAのコード領域と融合してもよい。これとは別に、またはこれに加えて、トランスジーンの組織特異的発現を可能とするために、組織特異的制御エレメントをコード領域と融合してもよい。適切なバッファ溶液中のDNAをマイクロインジェクション用注射針（パイパープラー（piper puller）を使って毛細管から作ることができる）に入れ、注射される卵を抑えつけスライド（depression slide）中におく。針を卵の前核中に挿入し、DNA溶液を注射する。その後、注射した卵を、偽妊娠マウス（適切なホルモンにより刺激されて妊娠を維持するが、実際は妊娠してない）の卵管に移し、そこから子宮に進み、移植して満期まで発育させる。上記のように、マイクロインジェクションは、DNAを卵細胞に挿入する唯一の方法ではなく、本明細書では例示の目的でのみ使用した。
以上記載した本発明は、次の実施例を参照することにより、さらによく理解されるであろう。次の実施例は本発明を説明する目的で提示されており、本発明を限定すると解釈されてはならない。
実施例 １
GLP-2受容体の単離
部分ラットおよびマウスGLP-2受容体cDNAのPCR利用クローニング
ラット新生児腸のcDNAライブラリー（Stratagene, La Jolla, CA; カタログ番号936508）およびマウス空腸の第１鎖（first strand）cDNAを調製した。縮重プライマーM-2F/S（配列番号３）およびM-7R/S（配列番号４）を使って、ラット新生児腸cDNAライブラリーからラットGLP-2受容体の部分断片を、またマウス空腸テンプレートからマウスGLP-2受容体の部分断片を増幅した。プロトコルは以下に記載の通りである：
縮重PCR：
6μl 10x VENTバッファー（New England Biolabsから）
6μl 2.5μM dATP、dCTP、dGTPおよびdTTPの各ストック
4μl ラット新生児腸cDNA（1：10希釈）

2μl（10ユニット）Amplitaq DNAポリメラーゼ（Perkin Elmer）
36μl ddH₂O
反応条件：94℃、2分；94℃、1分；53℃、30秒；72℃、1分を35サイクル。
主要PCR産物は、303塩基対（bp）のDNA断片であった。上記PCRの30μlサンプルを、QIAGEN PCR精製キットを使って精製し、30μlのddH₂Oで溶出した。その後、得られた産物を、94℃で31サイクルであることを除くと同じ縮重PCR条件を使って再増幅した。
303塩基対（bp）の主要産物を切り取って、QIAGEN QIAquickゲル精製プロトコルを使って、30μl ddH₂Oに精製した。その後、得られた産物を、94℃で31サイクルであることを除くと同じ縮重PCR条件を使って再増幅した。
次に、全体の再増幅PCR反応産物に対して、二重消化（Xba ＩおよびXho Ｉ）を、次の通り行った：28μl DNA; 16μl 10X One-Phor-Allバッファー（Pharmacia）；2μl（40ユニット）Xba I酵素（Pharmacia）；2μl（40ユニット）Xho I酵素（Pharmacia）；および30μl ddH₂O。
サンプルを37℃ウォーターブロックヒーター（water block heater）中で4時間消化し、ddH₂O（無菌）で100μl容積とし、（１）等量（100μl）クロロホルム抽出；（２）2容エタノール／10容3M酢酸ナトリウムで週末に沈殿；（３）70%EtOHで1x洗浄；（４）10μl 1x TE（pH8.0）中の再懸濁、により精製した。
次にpBluescriptクローン5HTIF#9をXba IおよびXho Iで次のように消化した。
10μl DNA（pBluescriptクローン5HTIF#9）
5μl 10X NEBバッファー２（New England Biolabs）
3μl（1:20希釈＝3ユニット）Xba I（New England Biolabs）
3μl（1:20希釈＝3ユニット）Xho I（New England Biolabs）
5μl（10x）BSA（New England Biolabs）
24μl ddH₂O
サンプルを37℃ウォーターブロックヒーター中で3時間消化し、65℃で20分間熱不活性化し、そしてBIO 101からのGeneCleanIIキットを使って精製した。PCR反応のアリコートを上記のpBluescriptプラスミドベクターに、T4 DNAリガーゼキット（New England Biolabs）を使ってクローニングし、Epicurean Coli XL-2 Blue MRF’ウルトラコンピテント細胞（Stratagene）に形質転換した。形質転換体を2xYT+AMPプレート上にまき、単一コロニーを拾った。DNAミニプレップをQIAGEN QIA-prep８ミニプレップキットを使って作製し、断片の配列をABIシステムを使って決定した。ラットおよびマウスGLP-2受容体配列の部分断片を含有する新規の配列を同定した。
完全なGLP-2受容体コード領域をもつcDNAのクローニングは、次のように達成した：
最初に、次の３組織からのcDNAライブラリーをスクリーニングに使った。
1．ラット視床下部（Hypothalamus）（RHT）
2．ラット後脳（Hind Brain）（RHB）
3．ラット十二指腸（Duodenum）および空腸（Jejunum）（RDJ）
これら３つのcDNAライブラリーをランダムプライマーでのプライミング、ならびにpcDNA3のHind IIIとNot I部位への一方向サブクローニングによって作製した。
次に、３つのcDNAライブラリーをコロニー・リフトおよびフィルター・ハイブリダイゼーションによって、縮重オリゴC4-4

を使い、相同性スクリーニングをした。次のハイブリダイゼーション条件を用いた：5X SSPE（1X SSPEは0.18M NaCl、10mM NaH₂PO₄（pH7.4）、10mM EDTA（pH7.4））および5X Denharts溶液（1％Ficoll、1%ポリビニルピロリドン、1％ BSA）；25mg/mlサケ精子DNA。
フィルターを50℃で一夜ハイブリダイゼーションした。その後、フィルターを2X SSPEおよび1％SDS中で室温で30分間２回、2X SSPEおよび1％SDS中で50℃で20分間２回、そして最後に、1X SSPEおよび0.5％SDS中で２回、洗浄した。陽性クローンをオートラジオグラフィーにより同定した。陽性クローンを囲む1cm²のプラグをプレートから取り出し、1mlの2x YT+20％グリセロール中に入れて、ボルテックスをかけ、-80℃で凍結した。
プラスミドDNAを陽性プラグから次のように調製した：各陽性プラグの100mlの細菌培養物を寒天プレート上で増殖した。細菌細胞を掻きとり、1mlの2xYT培地+20％グリセロール中に再懸濁した。250mlの細菌再懸濁液からの細菌ペレットを150mlの溶液Ｉ（50mMグルコース、10mM Tris-HCl、1mM EDTA）中に再懸濁し、溶液II（0.2M NaOH、1％SDS）中で溶解し、氷冷溶液III（酢酸カリウム；4容の5M酢酸カリウム＋1容の10M酢酸）で中和した。細菌DNAをペレット化した後、340mlのイソプロパノールを上清に加えた。これを15分間最高速度で遠心分離した。ペレットをTE+20mg/ml RNase中に再懸濁し、37℃で30分間インキュベートし、イソプロパノール+0.2M酢酸カリウムで沈殿させた。遠心分離後、ペレットを70％アルコールで洗浄し、空気乾燥し、TE中に再懸濁した。
ラット視床下部cDNAライブラリー（RHT cDNAライブラリー）の2777クローン・プール由来のプラスミドDNAを次に、以下のように利用した：遺伝子ファミリーの既知の受容体に対して同一性を示さないPCR-クローン化GLP-2受容体cDNA配列の領域から、２つのプライマーを設計した。２つのプライマー、P23-R1およびP23-F1は、新規クローンDNAからのみ196bp断片を増幅したが、GLP-1受容体cDNAまたはPACAP受容体cDNAではこれを増幅しなかった。Boehringer MannheimからのExpand^TMPCRシステム（カタログ番号1681-842）を次の条件で使った：
2μlの10x Expand^TMバッファーI
2.8μlの2.5mM dNTP混合物

0.3μlのExpand PCR酵素（１ユニット）
12.7μlの水
１μlのDNA
反応条件：93℃、40秒；58℃、40秒；68℃、40秒を32サイクル
2777クローンプールのそれぞれの陽性プラグまたはプール由来のDNAを、上記条件下で、特異的プライマーP23-F1およびP23-R1で増幅した。1057のC4-4ハイブリダイゼーション陽性プラグと884の2777クローンプールから、わずかに５つのテンプレート源が196bpPCR産物を増幅した。これらは：（1）プラグ334、（2）プラグ780、（3）RHTプール233、（4）RHTプール440および（5）RHTプール587であった。
その後、５つの陽性テンプレートからのGLP-2R cDNAの増幅を実施した。１つの特異的プライマー（P23-F1もしくはP23-R1）およびpcDNA3ベクター（Invitrogen）配列に基づく１つのプライマー（830Fもしくは1186R）を使うことにより、GLP-2R cDNAインサートを、クローン的に不純なプラグまたは2777クローンプールから直接増幅した。ベクタープライマーの配列は次の通りであった：

PCRは、記述した条件下で、Expand^TMPCRシステムを使って実施した。
最も顕著なバンドを再増幅し、精製し、配列決定した。得られた増幅配列に基づいて、追加のプライマーを設計し、新しい配列決定を遂行した。この方法で、５つのクローン源の全てについてGLP-2R cDNAインサートの完全な配列を決定した。配列分析は、プールRHT440およびプールRHT587のみが、GLP-2Rの完全なコード配列をもつクローンを含有し、２つのクローンは同一である（同じcDNAクローンに由来する）ことを示した。
RHT440またはRHT587 cDNAライブラリープール由来のGLP-2受容体cDNAクローンを、クローン的に精製することが困難であるので、このcDNAを増幅し、pcDNA3に再クローン化した。RHT440およびRHT587から得られた配列に基づいて、１つは開始コドンの4bp上流で開始してプライミングし、他の１つは停止コドンの8bp下流で開始してプライミングする２つのプライマーを設計した。

２つのプライマーを使い、次のPCR条件下で、Boehringer MannheimからのExpand^TMPCRシステム（カタログ番号1681-842）を使って、約1525bpのDNA断片を増幅した。
10μlの10x Expand^TMバッファーI
14μlの2.5mM dNTP混合物
3.0μlのプライマー１（10μM）（WBR-C5）
3.0μlのプライマー２（10μM）（WBR-C3）
1.5μlの酵素（5ユニット）
63.5μlの水
５μlのDNA
反応条件：５サイクル（93℃、1分；72℃、40秒；60℃、45秒；68℃、2分）および25サイクル（93℃、1分；72℃、1分；68℃、２分）。
増幅産物を、pcDNA3ベクター（Invitrogen）のKpn IおよびXho I部位にサブクローニングした。プラスミドDNAを上記の方法を使って調製した。
実施例 ２
機能アッセイ
Cos-1細胞を、Analytical Biochemistry, 218:460-463（1994）に記載されたように、ラットクローン587 GLP-2受容体、クローン化ヒトGLP-2受容体（pC3/HuGL2R-2）、またはクローン化残基85変異型ヒトGLP-2受容体（pC3.1/HuGL2R-MH4）、pcDNA3によりトランスフェクトした。ラットGLP-1（7-36）アミドを対照ペプチドとして使った。使用した溶液は次の通りである：
RPMI 1640中のRSC（49ml RPMI+1ml FCS+50ulクロロキン、100mM）；
DEAE/RSC溶液：18.4ml RSC+1.6ml DEAE/デキストラン（10mg/ml）。
アッセイ手順は次に従った：
a）ラットクローン587 GLP-2受容体、またはクローン化ヒトGLP-2受容体、またはクローン化残基85変異型ヒトGLP-2受容体のいずれか50mgを、6mlのRSCを含有する50mlチューブに加え（プラスミドpcDNA3として）、37℃でインキュベートした。
b）6mlのDEAE/RSC溶液を各チューブに加え、37℃で２分間インキュベートした。
c）1.5mlのCOS-1細胞懸濁液（550万個の細胞）を各チューブに加え、37℃で1時間45分インキュベートした。
d）インキュベーションの後、サンプルを５分間、低速でスピンし、DMEM/F12+10%FBSで２回洗浄し、ペレットを12.5mlのDMEM/F12+10%FBS培地中に再懸濁した。
e）1mlの細胞懸濁液（ステップd）を、3mlの培地（45万個の細胞／ウエル）を含有する、ポリ−D-リシンで被覆した６ウエルプレート（Collaborative Biomedicalから）の各ウエルに加えた。
f）プレートを37℃で３日間インキュベートした。
GLP-1/GLP-2類似体によるトランスフェクトしたCos-1細胞の処理は、次のように行った：
溶液：DMEM/F12（SFM）+IBMX（3-イソブチル-1-メチルキサンチン）0.85mM+0.1%アスコルビン酸および10umパルジリン（全溶液はSigmaから購入した）。培地は使用日に新しく調製した。
アッセイ手順：各ウエル（トランスフェクトした６ウエルプレート、細胞）の培地を除去し、ウエルを１回SFM培地で洗浄した。その後、2mlのSFM+IBMX培地を各ウエルに加えて、プレートを37℃で10分間インキュベートした。インキュベーションの後、SFM+IBMXを各ウエルから除去し、GLP-1/GLP-2（SigmaからのGLP-1,7-36,amide、Allelixからの[Gly2]hGLP-2）濃度1、3、10および30nMを含有する新しいSFM+IBMX培地を適切なウエルに加えた。プレートを37℃インキュベーターで30分間インキュベートした。インキュベーションの後、培地を各ウエルから除去した。ウエルを１回、1ml PBS（リン酸緩衝食塩水）で洗浄した。その後、各ウエルを1ml冷95%エタノール:5mM EDTA（2:1）で、4℃で1時間、処理した。各ウエルから細胞を掻き取り、個別のエッペンドルフチューブに移した。チューブを5分間4℃で遠心分離し、上清を新しいエッペンドルフチューブに移し、そして高速真空で乾燥した。乾燥の後、チューブを100μlの酢酸ナトリウムで再構成し、4℃で保存し、この溶液の25μlをcAMPアッセイに使った。
機能アッセイは次の通り実施した：それぞれの抽出物に対するcAMP含量を、Amersham Biotrak cAMP EIAキット（Amersham 225）を使って、EIA（Enzyme Immuno Assay）により２反復実験で定量した。図３および図８に示したアッセイの結果は、クローン化したラットおよびヒト受容体により示されたGLP-2選択性を実証する。GLP-1受容体に結合するユーザーに使われる同様の機能アッセイにおいて、予測されたGLP-1に対する特異性が観察された。
実施例３
ヒトGLP2受容体cDNAの単離
ヒト視床下部cDNAライブラリーの中程度にストリンジェントなハイブリダイゼーションスクリーニング
ヒト視床下部由来λgt10 cDNAライブラリー（ClontechカタログNo.1172a）から得た100万個のクローンをニトロセルロースフィルター（Amersham, カタログNo.RPN137E）上でプラークリフトによってスクリーニングした。プローブはラットGLP-2受容体の完全コード領域を含む、DNA断片のランダムプライマー標識によって調製した。そのDNA断片はクローン587-C1から単離したが、このクローンは配列番号2からの完全コード領域を含む。
プレハイブリダイゼーションおよびハイブリダイゼーションはそれぞれ、50%ホルムアミド、5X SSPE、5X Denhart溶液、0.5% SDSおよびサケ精子DNA（200mg/ml）からなるハイブリダイゼーション溶液中で一晩かけて行った。ハイブリダイゼーション後、フィルターを下記の条件で洗浄した（中程度のストリンジェンシー）。
・室温で2X SSPEおよび0.01% SDSで2回
・42℃で2X SSPEおよび0.Ol% SDSで2回
・42℃で0.2X SSPEおよび0.01% SDSで2回
フィルターをオートラジオグラフィーにかけ、それぞれ多数のバクテリオファージのプラークを含んでいる寒天プラグを、フィルター上の陽性シグナルを示す位置に対応するプレート上の領域から採取した。第１ラウンドのスクリーニングにおいて採取した100万個のcDNAクローンから2個の陽性クローン（HHP6-1およびHHP13）を同定した。第2次スクリーニングではHHP13のみが陽性であった。HHP13プレートから得た数個の陽性プラーク（HHS13）をプールし、第3次スクリーニングを行った。このラウンドのスクリーニングでは3個の単一の陽性プラーク（HHT13-1, HHT13-2, およびHHT13-3）を得た。
次いで陽性クローンの部分的配列決定のためにPCR増幅を行った。細菌細胞（大腸菌C600Hfl）の床（lawn）上において、各クローンからのファージ懸濁液10μlを、印を付けたスポットに適用した。37℃で5時間インキュベートした後、ファージプラークは明瞭に目視でき、1cm²以内を覆っていた。各プラークの一部を200μlの水に移した。このサンプルを沸騰した湯浴中で5分間インキュベートし、室温で10分間遠心した。次の２組の縮重プライマーを用いて、サンプル1mlをPCRで増幅した：

Boehringer MannheimのExpand^TM PCRシステム（カタログNo.1681-842）を下記の条件で用いた：
10x Expand^TMバッファー3 5μl
2.5mM dNTP mix 7μl
M2FSプライマー又はC4-4プライマー 1.5μl
M7RSプライマー（M2FSと共に）またはC9-2Rプライマー（C4-4と共に） 1.5μl
Expand PCR酵素（1ユニット） 0.75μl
水 33.25μl
及び DNA 1μl。
反応条件は93℃1分間、50℃1分間、45℃1分間、68℃2分間を32サイクルとした。
M2F/SおよびM7R/Sは約300塩基対のDNA断片を増幅し、C4-4およびC92-Rは約700塩基対のDNA断片を増幅した。PCR産物をQIAGEN QIAquick PCR精製キット（カタログNo.28104）を用いて精製し、10mM Tris, pH8.0の50μl中に溶出させた。該産物の配列分析により、鋳型間での相異がないことが明らかとなったが、これは鋳型には単一のcDNAクローン（HHT13）の複数のコピーが含まれていることから予期していたとおりであった。
このクローンがヒトGLP-2受容体のコード配列を含んでいることは、多数のファクターが示している。その１つは配列の類似性の程度である。グルカゴン受容体cDNAを、ヒトとラットの受容体で配列の保存の程度がどの程度であるか予言するために用いることができる。ヌクレオチドのレベルではラットとヒトのグルカゴン受容体のコード領域内では82.6%の同一性があった。アミノ酸のレベルではこの2種のグルカゴン受容体間のアミノ酸は80.9%の同一性、および89.1%の類似性を示している。
ここでクローン化したヒトGLP-2受容体の場合には、ヒトGLP-2受容体cDNA（HHT13）の部分配列は、ラットGLP-2受容体cDNAに対して、ヌクレオチドレベル、アミノ酸レベルの双方で高度な相同性を有する。配列番号9の配列はラットGLP-2受容体cDNA配列と87.1%の同一性を示した。このcDNA領域の配列から予言されるアミノ酸配列は、ラットGLP-2受容体の予言されるアミノ酸配列と87.4%の同一性および93.2%の類似性を有している。ラット受容体のプレタンパク質の予言される長さはアミノ酸550個であり、このことはヒト受容体のコード領域の約44%が同定されたことを示している。
さらにこの結論は、ヒトGLP-2受容体の部分アミノ酸配列とラットGLP-2受容体および下記の3種類の近縁のファミリーメンバーの配列との比較によっても支持される。

これらの比較結果は、ラットとヒトのグルカゴン受容体の配列類似性によって得られたベンチマークを考え併せると、HHT13と名付けられたcDNAがラットGLP-2受容体に対応するヒトの受容体の断片を表していることの明確な根拠を提供している。
ヒトGLP-2受容体の完全なアミノ酸配列は、まず、HHT13-1, HHT13-2,およびHHT13-3中の完全なcDNAインサートの配列を決定することによって得られる。PCR増幅およびその後の配列決定に縮重プライマーを用い、本発明者らは各インサートの部分のみからの配列を得た。これらの同一のクローンがヒトGLP-2受容体プレタンパク質の完全コード配列にまたがるインサートを含んでいる可能性がある。cDNAインサートの完全な配列を決定するため、これらのクローンを大量に増殖させてこれらの同等な各クローン約20mgを得る。完全長のcDNAインサートを制限酵素Eco RIで切断し、pcDNA3（Invitrogen）中にサブクローン化する。あるいはまた、インサートに隣接するベクター配列から得た2種のプライマーを、完全長cDNAインサートをBoehringer Mannheim社のExpand^TM PCRシステム（カタログNo.1681-842）で増幅するために用いる。増幅したcDNAを適切な制限酵素で切断し、pcDNA3（Invitrogen）中にサブクローン化する。
HHT13クローン中に完全長のコード配列が存在しない場合には、ヒトGLP-2受容体cDNAのコード領域を完全に含む別のクローンを得るためにcDNAライブラリーをスクリーニングする。次の組織からのヒトcDNAライブラリー（StratageneまたはClontechから得られる）をスクリーニングに用いることが好ましい：ヒト視床下部；ヒト胎児脳；ヒト十二指腸および空腸；ヒト胃；およびヒト胎児腸管。
2種類のプライマーを、既に決定されているヒトGLP-2受容体cDNA配列から設計する。これらのプライマーは、GLP-2受容体cDNAそれ自体以外のファミリーメンバーの関連遺伝子は増幅できないように設計する。cDNAライブラリーストックの希釈はライブラリのサブプールを作りその各プール中に50,000クローンが含まれる様に行われる。PCRは、GLP-2受容体cDNAクローンを含むプールを見出すためにGLP-2受容体特異的プライマーを用い、Boehringer Mannhaeim社のExpand^TM PCRシステム（カタログNo.1681-842）を使用して、下記の条件で行った：
10x Expand^TMバッファー1 2μl
2.5mM dNTP mix 2.8μl
プライマーP1 0.6μl
プライマーP2 0.6μl
Expand PCR酵素（1ユニット） 0.3μl
水 12.7μl
50000クローンを含むライブラリのプール 1μl
反応条件：93℃40秒間、50-58℃40秒間、68℃40秒間を32サイクル。
次いで、陽性のプールからの完全長のGLP-2受容体cDNAインサートから配列を得る。特異的プライマーの1種およびクローニング部位近傍のベクター配列に基づいたプライマー1種を用いて、GLP-2受容体cDNAインサートはクローン的に不純物を含むクローンプールから直接的にBoehringer Mannhaeim社のExpand^TM PCRシステム（カタログNo.1681-842）を用いて下記の条件で最も適当に増幅される：
10x Expand^TMバッファー1 2μl
2.5mM dNTP mix 2.8μl
プライマー１ 0.6μl
プライマー２ 0.6μl
酵素（1ユニット） 0.3μl
水 12.7μl
ライブラリープールのストック 1μl
反応条件：93℃45秒間、50℃45秒間、68℃1分間を32サイクル。
反応は調製用アガロースゲル上で行い、最も明瞭なバンドを精製し配列を調べる。ここで得られた増幅配列に基づき、完全長のコード領域の配列およびクローンを得るために別のプライマーを設計し、完全長cDNAをクローン化する。
5’RACEおよび3’RACEをヒトGLP-2受容体cDNAの完全なコード配列を得るために用いる。Rapid Amplification of cDNA Ends（RACE）は、mRNAの特定の中間部位と3’または5’末端との間のcDNA第1鎖（mRNAから容易に調製しうる）鋳型からDNA配列を増幅するために日常的に用いられる方法である。各種のヒト組織からの全RNAまたはmRNAはClontechから市販されている。3’RACEシステム（Gibco-BRL Life technologies; カタログNo.18373-019）および5’RACEシステム（カタログNo.18374-058）のキットを用いた。この2製品のマニュアルには詳細なプロトコールが付されている。簡単に記せば、プロトコールは下記のとおりである。
3’RACE法では、第１鎖cDNA合成をmRNAのポリ（A）尾部の位置で、RACE産物のユニヴァーサルなPCR増幅のためのユニークな配列が取り込まれているアダプタープライマー（システムに付属）を用いて開始する。第１鎖cDNAのこのプライマーからの合成後オリジナルのmRNA鋳型をRNaseHで破壊する。次いで、増幅を2種のプライマーを用いて行う：一つは遺伝子特異的プライマー（HHT13の部分cDNA配列が利用可能であるのでそこから設計する）；他の一つはキットと共に供給されるユニヴァーサル増幅プライマーである。増幅産物は配列決定用プラスミドベクター中にサブクローン化される。
5’RACEシステムでは第１鎖cDNAはmRNAから遺伝子特異的プライマー（HHT13の部分cDNA配列が利用可能でありその配列に基づいて作製）およびSuperScript II逆転写酵素を用いて合成される。オリジナルのmRNA鋳型はRNaseHによる処理で除去される。取り込まれなかったdNTP、プライマー、およびタンパク質はcDNAからスピンカートリッジを用いて分離される。次いで、ホモポリマーのdCTP尾部を、第１鎖cDNAの3’末端にTdT酵素およびdCTPヌクレオチドを用いて付加する。PCR増幅は2種類のプライマーを用いて行われる：一つはネスティッド遺伝子特異的プライマーであって、HHT13の利用可能な部分DNA配列から設計されたもの；他の一つはシステムに付属の「アンカープライマー」である。これらのプライマーは両方ともプラスミドへのサブクローン化およびそれに続く配列決定のための制限酵素切断部位をその中に有している。
HHT13 λgt10クローンのcDNA3へのサブクローン化、配列決定、および発現
A．λgt10プライマーを用いたcDNAインサートの増幅
各クローンから得たファージの再懸濁液10μlを、細菌細胞（大腸菌C600Hfl）の床（lawn）上の印を付されたスポットに置いた。37℃で5時間インキュベートした後、ファージプラークは明瞭に目視できた。各プラークの表面を200μlの水に移した。サンプルを沸騰している湯浴中で5分間置き、室温で10分間遠心した。1μlのサンプルをλgt10プライマーのセットを用いる増幅に用いた。

Boehringer Mannheim社のExpand^TM PCRシステム（カタログNo.1681-842）を下記の条件で用いた：
10x Expand^TMバッファー3 5μl
2.5mM dNTP mix 7μl
GT10-5KXbプライマー 1.5μl
GT10-3BXhプライマー 1.5μl
Expand PCR酵素（1ユニット） 0.75μl
水 33.25μl
DNA 1μl
反応条件：93℃40秒間、50℃1分間、68℃2分間を5サイクル、および、93℃40秒間、傾斜させて68℃1分間、68℃2分間を30サイクル。
約2200塩基対の長さの増幅されたDNA断片は、3つのクローン全てのアガロースゲル上に認められた。PCR産物をQIAGEN QIAquick PCR精製キット（カタログNo.28104）を用いて精製し、10mM Tris, pH8.0の50μl中に溶出させた。鋳型の配列を決定した。
B．pcDNA3ベクターへのサブクローン化
3種のクローンからの増幅精製したDNAをKpnＩおよびXhoＩで制限酵素消化し、同様の制限酵素で消化したpcDNA3中にサブクローン化した。プラスミドはpHHT13-1, pHHT13-2, pHHT13-3と名付けた。プラスミドDNAを粗製法（アルカリ処理、3M KOAcによる細菌DNA沈殿、イソプロパノール沈殿の後にRNAse処理および第2ラウンドのイソプロパノール沈殿）またはQiagen Inc.のプラスミドDNAキットを用いて調製した。Qiagenのキットを用いて調製した鋳型を配列決定した。
C.機能アッセイ
ラットGLP-2R, 587クローンをGLP-2ペプチドに対するcAMP応答の陽性コントロールとして用いて、各クローンのトランスフェクションを行った。トランスフェクション法、細胞培養、およびcAMPアッセイはラット, 587クローンの機能アッセイについて述べたものと同一のものを用いた。その結果によれば、COS細胞中で陽性対照は良好なcAMP応答をみせたが、HHT13クローンはいずれもcAMP応答を示さなかった。配列を調べてフレームシフトが認められたことから確認されたとおり、機能データはこれらのcDNAクローンからは機能を有するGLP-2Rタンパク質は発現されていないことを示唆している。
D．ラットGLP-2RとHHT13サブクローンとのDNA配列の比較
比較データはラットGLP-2R cDNAのヌクレオチド389-390に対応する位置の2個の塩基対の欠失を示しており、その結果ここに示したヒトGLP-2R cDNA配列のヌクレオチド374-375の欠失となった。
ラットGLP-2Rのコード配列との比較によって同定されたHHT13-1 DNAの2塩基対のフレームシフトの部位に、ラットGLP-2R DNA配列の2個の塩基対を取り込むためにPCRを用いた。下記のプライマーをHHT13 DNA配列から、2個の塩基対を挿入するために設計した：

PCR 1:プライマーHWBR-F7対HWBR/2BPI-506RおよびHWBR/2BPI-475F対HWBR-1910Rを用いた２種のPCRを行うための鋳型として、1ngのpHHT13-1 DNAを用いた。Boehringer Mannheim社のExpand^TM PCRシステム（カタログNo.1681-842）を下記の条件で用いた：
10x Expand^TMバッファー1 5μl
2.5mM dNTP mix 7μl
HWBR-F7またはHWBR/2BPI-475Fプライマー 1.5μl
HWBR/2BPI-506RまたはHWBR-1910Rプライマー 1.5μl
Expand PCR酵素（1ユニット） 0.75μl
水 33.25μl
DNA 1μl
反応条件：92℃40秒間、48℃1分間、68℃3分間を10サイクル、および、92℃40秒間、55℃40秒間、68℃2分間を30サイクル。
HWBR-F7およびHWBR/2BPI-506Rプライマーはアガロースゲル上の400塩基対のDNA断片を増幅し、HWBR/2BPI-475FおよびHWBR-1910Rプライマーはアガロースゲル上の約1.4kbのDNA断片を増幅した。この2つのバンドをアガロースゲルから切り出し、Qiagen Inc.のQiaquickゲル抽出キット（カタログNo.28706）で精製し、DNAを10mM Tris（pH8.5）の50μl中に溶出した。
PCR 2（プライマーを用いない伸長）:上記PCR 1で得た2種の増幅産物の約75ngを混合し、下記の条件下で伸長させることにより、プライマーなしで再結合させた：
10x Expand^TMバッファー1 2μl
2.5mM dNTP mix 2.8μl
Expand PCR酵素（1ユニット） 0.3μl
水 8.9μl
PCR 1産物を混合したもの 6μl
反応条件：92℃1分間、60℃5分間、68℃3分間を15サイクル。
PCR 3:PCR 2で得た増幅混合物の1μlを、HWBR-F7およびHWBR-1910Rプライマーを用いた増幅のための鋳型として、下記の条件で用いた：
10x Expand^TMバッファー1 10μl
2.5mM dNTP mix 14μl
HWBR-F7またはHWBR/2BPI-475Fプライマー 3.0μl
HWBR/2BPI-506RまたはHWBR-1910Rプライマー 3.0μl
Expand PCR酵素（1ユニット） 1.5μl
水 67.5μl
DNA 1μl
反応条件：92℃1分間、60℃1分間、68℃2分間を30サイクル。
約1.7kbのDNA断片が増幅されアガロースゲル上に認められた。そのPCR産物をQIAGENのQIAquick PCR精製キット（カタログNo.28104）を用いて精製し、10mM Tris, pH8.0の50μl中に溶出させた。精製産物をKpnＩで制限酵素消化し、KpnＩで消化したpcDNA3.1（-）/Myc-HisA（Invitrogen, カタログNo.V855-20）中にサブクローン化した。pc3.1/HuGL2R/MH6（pHuMH6）と名付けた一つのクローンは、ベクター対挿入プライマーを用いたPCRによって調べたところ、正しい方向に挿入されていることが確かめられた1.7kbのインサートを有していた。
機能アッセイ
実施例2に記載のアッセイを用いて、このハイブリッドクローンをラットGLP-2Rと比較したその結果、欠失部位であろうと推定されている部位への2個の塩基対”GA”の置換は、GLP-2処理に対してcAMPの応答があることによって示されるとおり、、機能を有するGLP-2Rタンパク質をコードするクローンをもたらした。
実施例6
完全長のヒトGLP-2受容体cDNAの単離
ヒト胃から得たλgt10 cDNAライブラリー（Clontech; カタログNo.HL3017a）からの20,000個のクローンを150mm寒天プレート100個にそれぞれ撒いた。SMバッファー（0.1M NaCl、10mM Mg₂SO₄、35mM Tris pH7.5、0.01%ゼラチン）を各プレートに添加し、それぞれ20,000（20k）のプールされたクローンを含有するファージの融解物を100個得た。最初の50個の20kファージ融解物（20kプール）を、HHT13 DNA配列から設計した2種のプライマーを用いてPCRでスクリーニングした。各プールからの鋳型DNAは、ファージ融解物を10分間沸騰させ、10分間遠心することによって調製した。

各20kプールDNAの1μlをHWBR-113FおよびHWBR-578Rプライマーを用いて下記の条件でPCRで調べた。
10x Expand^TMバッファー1 2μl
2.5mM dNTP mix 2.8μl
HWBR-113Fプライマー 0.6μl
HWBR-578Rプライマー 0.6μl
Expand PCR酵素（1ユニット） 0.3μl
水 12.7μl
20k プールDNA 1μl
反応条件：92℃40秒間、60℃40秒間、68℃1分間を35サイクル。
2つのプール（HST 19およびHST 38）から得た鋳型の増幅において約450塩基対のDNA断片が認められた。
B．2つの陽性プールHST19とHST38からのクローンのスクリーニング
2つの陽性20kプール各々から撒かれた40,000個のクローンをニトロセルロースフィルター（Amersham;カタログNo.RPN137E）上でのプラークリフトによってスクリーニングした。プローブはpHHT13-1から得たDNA断片へのランダムプライマー標識によって調製した。
1．フィルターを42℃で一晩プレハイブリダイズおよびハイブリダイズした。ハイブリダイゼーション溶液は50%ホルムアミド、5X SSPE、5X Denhart溶液、0.5% SDS、およびサケ精子DNA（200mg/ml）からなる。
2．ハイブリダイゼーション後、フィルターを下記の条件で洗浄した：
・室温で2X SSPEおよび0.01% SDSで2回
・42℃で2X SSPEおよび0.01% SDSで2回、ならびに
・50℃で0.1X SSPEおよび0.01% SDSで2回。
3．フィルターをオートラジオグラフィーにかけ、陽性シグナルに一致するプレート上の領域を単離した。HST38プールから１つの陽性クローン（HST 38-4-30）を単離した。450塩基対のDNA断片を、その陽性クローンからHWBR-113FプライマーおよびHWBR-578Rプライマーを用いて増幅し、配列決定した。その配列は、そのプラスミドがHHT13DNA配列の373-374の位置に2塩基対（AG）を含むことを明瞭に示している。
HST 38-4-30クローンの完全長のインサートを、λgt10プライマーを用いて実施例1に記載のとおりに増幅した。PCRで約1.4kbのDNA断片を増幅した。増幅されたDNAを精製し、配列決定した。
実施例7
完全長で機能を有するヒトGLP-2R cDNAのクローンの再構築および能アッセイ
HST 38-4-30クローンから増幅したDNAをKpnＩおよびPvuIIで制限酵素消化して得た700塩基対の断片、およびpHHT13-1 DNAをXhoＩおよびPvuIIで制限酵素消化して得た1.4kbのDNA断片を、KpnＩおよびXhoＩで制限酵素消化したpcDNA3に3方ライゲーション（three-way ligation）によってサブクローン化した。この新規のプラスミド構築物をpc3/HuGL2R-2と呼んだ。このようにして、ヒトGLP-2受容体の完全長の配列を得た。
機能アッセイ：
この新規のクローンをラットGLP-2Rクローン587と上述したやり方で比較した。その結果は、そのクローンが機能を有するヒトGLP-2Rタンパク質をコードすることを示し、それがCOS細胞中でGLP-2処理に応答してのcAMP産生をもたらすことを示していた（図8）。
実施例8
GLP-2受容体に対する抗体
1．抗ペプチド抗体
ラットGLP-2受容体のN末端ペプチド（QTRENTTDIWQDESE）、C末端ペプチド（SEGDGSETLQKLR）および細胞外ループ1（SHNSUSKRPDDESG）に対する抗ペプチド抗体をウサギで作製した。
上述のとおり作製した血清の免疫細胞化学的分析により、この血清にはGLP-2受容体に対する抗体が含まれ、該抗体はラットGLP-1受容体とは交差反応しないことが確認された。
2．融合タンパク質に対して作製されたGLP-2受容体に対する抗体
ラットGLP-2受容体のC末端領域（アミノ酸444-550）をコードするポリヌクレオチドを、pGEX-2T中のグルタチオンS-トランスフェラーゼ（GST）のC末端にスプライスし、大腸菌SUREI株中で発現させた。上述のGLP-2 C末端断片をマルトース結合タンパク質のC末端に融合させたものを用いて、アフィニティークロマトグラフィーでタンパク質を精製した。カクテルまたはプロテアーゼインヒビター（Boehringer Mannheim）を用いてプロテアーゼによる分解を最小限に抑えた。
抗体の作製は通常はAntibodies: A laboratory manual, Harlow and Lane, Cold Spring Harbor Laboratory, 1988に記載の方法に従って行った。簡単に記せば、ウサギに抗体を作製させるためにGLP-2-GST融合タンパク質を次のように用いた。初回は融合タンパク質100μgをフロイント完全アジュバント中に含むもので筋肉内および皮下に複数箇所注射した。ブースター注射は、融合タンパク質100μgをフロイント不完全アジュバント中に含むものを筋肉内の複数箇所に、14,21,42および56日目に行った。
抗血清はGLP-2-MBP融合タンパク質アフィニティーカラムを用いてアフィニティー精製した。免疫細胞化学分析により、これらの抗体がGLP-2受容体を特異的に認識することが確認された。
均等物
上述の明細書は当業者が本発明を実施するために十分なものであると考えられる。確かに、本発明を実施するための上述の方法について生化学、分子生物学または関連分野の当業者に自明の各種の改変は、後述の請求の範囲に包含されるものとする。

Claims (18)

1. 配列番号12のアミノ酸67〜553のアミノ酸配列及び配列番号2のアミノ酸67〜550のアミノ酸配列よりなる群から選択されるアミノ酸配列を含むGLP-2受容体をコードする単離されたポリヌクレオチド。
2. 配列番号12のアミノ酸67〜553のアミノ酸配列を含むヒトGLP-2受容体をコードする、請求項１に記載の単離されたポリヌクレオチド。
3. 配列番号11のヌクレオチド320〜1780を含む、請求項２に記載の単離されたポリヌクレオチド。
4. 配列番号２のアミノ酸67〜550のアミノ酸配列を含むラットGLP-2受容体をコードする、請求項１に記載の単離されたポリヌクレオチド。
5. 配列番号１のヌクレオチド335〜1786を含む、請求項４に記載の単離されたポリヌクレオチド。
6. 請求項３または５に記載のポリヌクレオチドと高ストリンジェンシー条件下でハイブリダイズし、かつGLP-2受容体をコードする、単離されたポリヌクレオチド。
7. 少なくとも25個のヌクレオチドを含むオリゴヌクレオチドであって、請求項１〜６のいずれかに記載のポリヌクレオチドとストリンジェンシー条件下でハイブリダイズするポリヌクレオチド配列を含む該オリゴヌクレオチド。
8. 前記オリゴヌクレオチドのヌクレオチド配列が請求項３または５に記載のポリヌクレオチドの１領域に完全に一致する、請求項７に記載のオリゴヌクレオチド。
9. 前記オリゴヌクレオチドのヌクレオチド配列が請求項３および５に記載のポリヌクレオチドに共通する１領域に完全に一致する、請求項７に記載のオリゴヌクレオチド。
10. 標識化形態の、請求項１〜６のいずれかに記載のポリヌクレオチドから選択されるポリヌクレオチド、または請求項７〜９のいずれかに記載のオリゴヌクレオチド。
11. GLP-2受容体をコードする、請求項１〜６のいずれかに記載のポリヌクレオチド、または該ポリヌクレオチドの発現を引き起こすように機能しうる形でそれに連結された発現制御エレメントを含む組換えポリヌクレオチド。
12. 請求項１〜６のいずれかに記載のポリヌクレオチドを発現しうる形で細胞に組み込むことによって遺伝子工学的に作製された該細胞。
13. 哺乳動物細胞である、請求項11に記載の細胞。
14. 配列番号12のアミノ酸67〜553のアミノ酸配列及び配列番号2のアミノ酸67〜550のアミノ酸配列よりなる群から選択されるアミノ酸配列を含むGLP-2受容体に選択的に結合する抗体。
15. 配列番号12のアミノ酸67〜553のアミノ酸配列及び配列番号2のアミノ酸67〜550のアミノ酸配列よりなる群から選択されるアミノ酸配列を含む組換えGLP-2受容体。
16. 配列番号12のアミノ酸67〜553を含む、請求項15に記載のGLP-2受容体。
17. 配列番号2のアミノ酸67〜550を含む、請求項15に記載のGLP-2受容体。
18. 以下の工程を含む、GLP-2受容体リガンドの同定方法：
    (1)候補リガンドを請求項12に記載の細胞または該細胞から得た膜調製物と共にインキュベートする工程；及び、次に
    (2)GLP-2受容体と候補リガンドとの結合が起こったかどうかを確認する工程。

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