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JP2022505450A - コンジュゲート化された化学的分解誘導物質および使用方法 - Google Patents

コンジュゲート化された化学的分解誘導物質および使用方法 Download PDF

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JP2022505450A JP2021521488A JP2021521488A JP2022505450A JP 2022505450 A JP2022505450 A JP 2022505450A JP 2021521488 A JP2021521488 A JP 2021521488A JP 2021521488 A JP2021521488 A JP 2021521488A JP 2022505450 A JP2022505450 A JP 2022505450A
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ロバート アンソニー ブレイク,
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エフ・ホフマン-ラ・ロシュ・アクチェンゲゼルシャフト
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Abstract

Figure 2022505450000001
ここに記載の主題は、抗体-CIDEコンジュゲート(Ab-CIDE)、それらを含有する医薬組成物、ならびに標的化タンパク質分解が有益である疾患および症状の治療におけるそれらの使用に関する。
【選択図】図1

Description

関連出願の相互参照
本出願は、2018年10月24日に出願された米国仮特許出願第62/749,812号に対する優先権および利益を主張するものであり、その開示は参照によりその全体が本明細書に組み込まれている。
EFS-WEBを介してテキストファイルとして提出された配列表の参照
配列表の公式コピーは、2018年10月24日に作成された、274キロバイトのサイズを有する515668_SEQLIST.TXTという名前のファイルを有するASCII形式の配列表としてEFS-Webを介して電子的に提出され、明細書と同時に提出される。このASCII形式の文書に含まれる配列表は、本明細書の一部であり、その全体が参照により本明細書に組み込まれる。
本明細書に記載の主題は、一般に、標的タンパク質の細胞内分解を促進するのに有用な抗体-タンパク質分解標的化キメラ分子を含む分解物コンジュゲートに関する。
細胞維持および正常な機能は、細胞タンパク質の制御された分解を必要とする。例えば、調節タンパク質の分解は、DNA複製、染色体分離などの細胞周期における事象を引き起こす。したがって、そのようなタンパク質の分解は、細胞の増殖、分化、および死に影響を及ぼす。
タンパク質の阻害剤は、細胞内のタンパク質活性を遮断または低下させることができるが、細胞内のタンパク質分解はまた、活性を低下させるかまたは標的タンパク質を完全に除去することができる。したがって、細胞のタンパク質分解経路を利用することは、タンパク質活性を低下させるまたは除去するための手段を提供することができる。細胞の主要な分解経路の1つは、ユビキチン-プロテアソーム系として知られている。この系では、タンパク質は、タンパク質をユビキチン化することによってプロテアソームによる分解のためにマークされる。タンパク質のユビキチン化は、タンパク質に結合し、ユビキチン分子をタンパク質に付加するE3ユビキチンリガーゼによって達成される。E3ユビキチンリガーゼは、E1およびE2ユビキチンリガーゼを含む経路の一部であり、これらは、ユビキチンをE3ユビキチンリガーゼに利用可能にしてタンパク質に付加する。
この分解経路を利用するために、分子構築物は、E3ユビキチンリガーゼを分解の標的となるタンパク質および標的とする抗体と一緒にする。プロテアソームによる分解のためのタンパク質を促進するために、分子構築物は、E3ユビキチンリガーゼに結合する基および分解のためのタンパク質標的に結合する基から構成される。これらの基は、典型的には、リンカーで連結されている。この分子構築物は、E3ユビキチンリガーゼをタンパク質に近接させることができ、その結果、E3ユビキチンリガーゼはユビキチン化され、分解のために標識される。しかしながら、分子構築物の比較的大きなサイズは、標的化送達にとって問題となり得る。
当技術分野では、タンパク質標的を含む細胞へのそのような分子構築物の増強された標的化送達が継続的に必要とされている。本明細書に記載の主題は、当技術分野におけるこの欠点およびその他の欠点に対処する。
一態様において、本明細書中に記載される主題は、共有結合的に連結されたAb-CIDE(PAC)であって、Ab-CIDEの構成要素を連結する共有結合の位置:Ab、L1(リンカー1)、L2(リンカー2)、タンパク質結合基およびE3リガーゼ結合基は、インビボ薬物動態、安定性および溶解性などの望ましい特性を有するAb-CIDEを調製するために所望に応じて調整することができる。
一態様では、本明細書に記載の主題は、下記式:
Ab-(L1-D)
式中、
Dは構造E3LB-L2-PBを有するCIDEであり;
E3LBはL2に共有結合しており、当該E3LBはE3リガーゼを結合する基であり、当該E3リガーゼはフォンヒッペル・リンドウ(VHL)であり;
L2は、E3LBおよびPBに共有結合したリンカーであり;
PBは、L2に共有結合したタンパク質結合基であり、当該PBは、その全ての変異体、突然変異、スプライス変異体、インデルおよび融合体を含む、BRD4またはERαを結合する基であり、
Abは、L1に共有結合した抗体であり;
L1は、AbおよびDに共有結合したリンカーであり;および
pは、約1~約8の値を有する、
を有するコンジュゲート化された化学的分解誘導物質(「CIDE」)に関する。
本明細書中に記載される主題の別の態様は、Ab-CIDEと、1つまたは複数の薬学的に許容可能な賦形剤とを含む医薬組成物である。
本明細書中に記載される主題の別の態様は、Ab-CIDEを含む医薬組成物を対象に投与することによって症状および疾患を治療する方法におけるAb-CIDEの使用である。
本明細書に記載の主題の別の態様は、Ab-CIDEを作製する方法である。
本明細書に記載の主題の別の態様は、Ab-CIDE、容器、および医薬組成物が疾患または症状を治療するために使用され得ることを示す添付文書またはラベルを含む医薬組成物を含む製造品である。
図1は、ERα標的化Ab-CIDEを有するMCF7 neo/HER2細胞におけるERα分解活性パーセントを示す。赤色曲線(最下部の曲線)=7C2-HER2-ms-L1EC10、青色曲線(最上部の曲線)=CD22-ms-L1EC10。 図2は、ERα標的化Ab-CIDEを有するMCF7 neo/HER2細胞におけるERα分解活性パーセントを示す。赤色曲線(最下部の曲線)=7C2-HER2-ms-L1EC11、青色曲線(最上部の曲線)=CD22-ms-L1EC11。 図3は、ERα標的化Ab-CIDEを有するMCF7 neo/HER2細胞におけるERα分解活性パーセントを示す。赤色曲線(最下部の曲線)=7C2-HER2-ms-L1EC12、青色曲線(最上部の曲線)=CD22-ms-L1EC12。 図4は、分解アッセイにおける分解アッセイ対照を示す。赤色曲線(最上部の曲線)=Ab緩衝液のみ、実施#1、オレンジ色曲線(最上部の曲線、重なり合っている赤色の曲線)=Ab緩衝液のみ、実施#2、青色曲線(中央の曲線)=7C2-HER2 mAb(高DAR[LC:K149C HC:L174C HC:Y373C]);実施#1、緑色曲線(最下部の曲線)=7C2-HER2 mAb(高DAR[LC:K149C HC:L174C HC:Y373C]);実施#2。 図5は、示された用量での列挙されたコンジュゲートの単回IV投与後のMCF7neo/HER2異種移植片におけるERαタンパク質レベルのインビボ低下を示す。時間点=4日。各点は、個々の動物由来のMCF7neo/HER2腫瘍の分析を表す。群01=賦形剤;群02=CD22-ms-L1EC10、10mg/kg;群03=7C2-HER2-ms-L1EC10、5mg/kg;群04=7C2-HER2-ms-L1EC10、10mg/kg;群05=7C2-HER2-ms-L1EC10、25mg/kg;第06群=7C2-HER2-mAb、10mg/kg。 図6aおよび図6bは、Ab-CIDEおよび対応する非コンジュゲート化CIDEの薬物動態特性を示す。 図7は、EOL-1腫瘍モデルにおける抗CLL1-CIDE抱合体のインビボ用量依存的有効性を示す。 非コンジュゲート化CIDEと比較したAb-CIDE(PAC)のインビボ有効性を示す図である。 図9は、非コンジュゲート化合物2、6、7もしくは9(下段、時間点=4時間)またはHER2-12、CD22-12もしくはHER2-13のコンジュゲート(上段、時間点=72時間)のいずれかで処理したMCF7-neo/HER2細胞におけるERαレベルのインビトロ低下を示す。非コンジュゲート化HER2-mAbの活性も示す(上段、左端)。試験したコンジュゲートについて、示される濃度は、実験中に存在する対応する分解物の濃度を指す(すなわち、400、40、4、0.4nMの分解物濃度がそれぞれ、10、1、0.1および0.01μg/mLの濃度のDAR6コンジュゲートに対応する)。
標的化タンパク質分解、ならびに関連する疾患および障害の治療に有用な抗体-化学的分解誘導物質(「CIDE」)コンジュゲート(本明細書ではAb-CIDEまたはPACと呼ばれる)が本明細書に開示される。本明細書に記載の主題は、抗体標的化を利用して、CIDEを標的細胞または組織に誘導する。本明細書中に記載されるように、抗体をCIDEに連結してAb-CIDEを形成することにより、CIDEが標的細胞または標的組織に送達されることが示されている。本明細書において、例えば実施例において示されるように、抗原を発現する細胞は、抗原特異的Ab-CIDEによって標的化され得て、それにより、Ab-CIDEのCIDE部分が標的細胞内に送達される。細胞上に見られない抗原に対する抗体を含むCIDEは、細胞へのCIDEの有意な細胞内送達をもたらさない。
したがって、本明細書中に記載される主題は、標的タンパク質のユビキチン化およびその後のタンパク質の分解をもたらすAb-CIDE組成物に関する。組成物は、リンカー(L1)に共有結合した抗体を含み、これは、CIDEへの任意の利用可能な結合点で共有結合しており、CIDEは、E3ユビキチンリガーゼ結合(E3LB)部分を含み、E3LB部分は、VHLまたはXIAPであるE3ユビキチンリガーゼタンパク質と、ERαまたはBRD4である標的タンパク質を認識するタンパク質結合部分(PB)とを認識する。本明細書に記載の主題は、タンパク質活性を調節し、タンパク質活性に関連する疾患および症状を治療するために有用である。
ここで、本明細書に開示されている主題を以下により完全に記載する。しかし、本明細書で説明する、本明細書にて開示する主題の多くの修正および他の実施形態が、前述の記載にて提示される教示の利益を有する、本明細書にて開示する主題が関係する当業者に想到されるであろう。したがって、本明細書にて開示する主題は、開示した特定の実施形態に限定されるべきではなく、修正および他の実施形態が、添付の特許請求の範囲の範囲内に含まれると意図されるものと考えられるべきである。換言すれば、本明細書に記載されている主題は、全ての代替物、変更および均等物を包含する。組み込まれる文献、特許、および同様の資料のうちの1つまたは複数が、本出願(定義される用語、用語の用法、記載される技法等を含むがそれらに限定されない)と異なるか、または矛盾する場合は、本出願が優先される。別途定義されない限り、本明細書において使用される全ての技術および科学用語は、当業者により一般に理解されるものと同じ意味を有する。本明細書で言及される全ての刊行物、特許出願、特許、および他の参考文献は、参照によりその全体が援用される。
I.定義
「CIDE」という用語は、一般に3つの成分、E3ユビキチンリガーゼ結合基(E3LB)、リンカーL2、およびタンパク質結合基(PB)を有するタンパク質分解標的化キメラ分子を指す。
「残基」、「部分」または「基」という用語は、別の成分に共有結合または連結された成分を指す。例として、化合物の残基は、共有結合で置き換えられた水素またはヒドロキシなどの化合物の原子(複数の場合がある)を有し、それによって残基をCIDE、L1-CIDEまたはAb-CIDEの別の成分に結合する。例えば、「CIDEの残基」とは、リンカーL2などの1つまたは複数の基に共有結合しているCIDEを指し、それ自体は必要に応じて抗体にさらに連結され得る。
「共有結合した(covalently bound)」または「共有結合した(covalently linked)」という用語は、1つまたは複数の電子対の共有によって形成される化学結合を指す。
本明細書で使用される「ペプチド模倣物」またはPMという用語は、非ペプチド化学部分を意味する。ペプチドは、あるアミノ酸のカルボキシル基が別のアミノ酸のアミノ基と反応するときに形成される共有化学結合であるペプチド(アミド)結合によって連結されたアミノ酸モノマーの短鎖である。最短のペプチドは、単一のペプチド結合によって結合された2アミノ酸からなるジペプチド、続いてトリペプチド、テトラペプチドなどである。ペプチド模倣化学的部分には、非アミノ酸化学的部分が含まれる。ペプチド模倣化学部分はまた、1つまたは複数の非アミノ酸化学単位によって分離された1つまたは複数のアミノ酸を含み得る。ペプチド模倣化学部分は、その化学構造のいずれの部分にも、ペプチド結合によって連結された2個以上の隣接アミノ酸を含有しない。
本明細書における「抗体」という用語は、最も広義に使用され、それらが所望される生物活性を呈する限り、モノクローナル抗体、ポリクローナル抗体、二量体、多量体、多重特異性抗体(例えば、二重特異性抗体)、および抗体断片を具体的に網羅する(Miller et al(2003)Jour.of Immunology 170:4854-4861)。抗体は、マウス、ヒト、ヒト化、キメラであってもよいか、または他の種に由来するものであってもよい。抗体は、特定の抗原を認識し、それに結合することができる、免疫系によって生成されるタンパク質である(Janeway,C.,Travers,P.,Walport,M.,Shlomchik(2001)Immuno Biology,5th Ed.,Garland Publishing,New York)。標的抗原は、一般に、複数の抗体のCDR(相補性決定領域)によって認識されるエピトープとも呼ばれる多数の結合部位を有する。異なるエピトープに特異的に結合するそれぞれの抗体は、異なる構造を有する。したがって、1つの抗原は、1を超える対応する抗体を有し得る。抗体は、完全長免疫グロブリン分子または完全長免疫グロブリン分子の免疫学的に活性な部分、すなわち、目的の標的またはその一部の抗原を免疫特異的に結合する抗原結合部位を含む分子を含み、そのような標的としては、癌細胞または自己免疫疾患に関連する自己免疫抗体を産生する細胞が挙げられるが、これらに限定されない。本明細書に開示される免疫グロブリンは、免疫グロブリン分子の任意の種類(例えば、IgG、IgE、IgM、IgD、およびIgA)、クラス(例えば、IgG1、IgG2、IgG3、IgG4、IgA1、およびIgA2)、またはサブクラスのものであり得る。免疫グロブリンは、任意の種に由来し得る。しかしながら、一態様において、免疫グロブリンは、ヒト、マウス、またはウサギ起源のものである。
本明細書で使用される「抗体断片(複数の場合がある)」という用語は、完全長抗体の一部分、一般にはその抗原結合領域または可変領域を含む。例示的な抗体断片としては、Fab、Fab’、F(ab’)、およびFv断片;ダイアボディ;線形抗体;ミニボディ(Olafsenら(2004)「Protein Eng.Design&Sel」17(4):315-323)、Fab発現ライブラリによって産生される断片、抗イディオタイプ(抗Id)抗体、CDR(相補性決定領域)、および癌細胞抗原、ウイルス抗原、または微生物抗原に免疫特異的に結合する、上記のいずれかのエピトープ結合断片、一本鎖抗体分子;ならびに抗体断片から形成される多重特異性抗体が挙げられる。
本明細書で使用される場合、「モノクローナル抗体」という用語は、実質的に同種の抗体の集団から得られた抗体を指し、すなわち、その集団を構成する個々の抗体は、少量で存在し得る天然に存在する突然変異の可能性を除いて同一である。モノクローナル抗体は、高度に特異的であり、単一の抗原部位に対して指向されている。さらに、異なる決定基(エピトープ)に対して指向される異なる抗体を含むポリクローナル抗体調製物とは対照的に、各モノクローナル抗体は、抗原上の単一の決定基に対して指向される。それらの特異性に加えて、モノクローナル抗体は、他の抗体が混入することなく合成することができるという点で、有利である。「モノクローナル」という修飾語は、実質的に同種の抗体集団から得られるという抗体の特徴を示し、任意の特定の方法による抗体の産生を必要とするものと解釈されるべきではない。例えば、本明細書に記載の主題に従って使用されるモノクローナル抗体は、Kohlerら(1975年)「Nature」、256:495によって最初に記載されたハイブリドーマ法によって作製されても、または組み換えDNA法(例えば、米国特許第4816567号;米国特許第5807715を参照されたい)によって作製されてもよい。「モノクローナル抗体」はまた、例えば、Clacksonら、(1991年)「Nature」、352:624~628頁;Marksら(1991年)「J.Mol.Biol.」、222:581~597頁に記載の技術を用いてファージ抗体ライブラリから単離され得る。
本明細書におけるモノクローナル抗体には、重鎖および/または軽鎖の一部分が、特定の種に由来するか、または特定の抗体クラスもしくはサブクラスに属する抗体内の対応する配列と同一または相同である一方で、鎖(複数の場合がある)の残りが、別の種に由来するか、または別の抗体クラスもしくはサブクラスに属する抗体における対応する配列と同一または相同である「キメラ」抗体、ならびにそのような抗体の断片を具体的に含み、これは、それらが所望される生物活性を呈する限りにおいてである(米国特許第4816567号;およびMorrisonら(1984年)、Proc.Natl.Acad.Sci.USA,81:6851~6855頁)。本明細書において対象となるキメラ抗体としては、非ヒト霊長類(例えば、旧世界ザル、類人猿など)に由来する可変ドメイン抗原結合配列と、ヒト定常領域配列とを含む、「霊長類化」抗体が挙げられる。
用語「キメラ」抗体とは、重鎖および/または軽鎖の一部が特定の源または種に由来し、重鎖および/または軽鎖の残りが異なる源または種に由来する抗体を指す。
抗体の「クラス」とは、その重鎖によって保有される定常ドメインまたは定常領域の型を指す。抗体には大きく分けて5つのクラス:IgA、IgD、IgE、IgG、およびIgMがあり、これらのうちのいくつかは、下位クラス(アイソタイプ)、例えば、IgG、IgG、IgG、IgG、IgA、およびIgAにさらに分けることができる。免疫グロブリンの異なるクラスに対応する重鎖定常ドメインは、それぞれα、δ、ε、γ、およびμと呼ばれる。
本明細書で使用される「インタクト抗体」という用語は、VLおよびVHドメイン、ならびに軽鎖定常ドメイン(CL)および重鎖定常ドメインCH1、CH2、およびCH3を含むものである。定常ドメインは、天然配列の定常ドメイン(例えば、ヒトの天然配列の定常ドメイン)またはそのアミノ酸配列変異体であり得る。インタクト抗体は、1つまたは複数の「エフェクター機能」を有し得、この機能は、抗体のFc定常領域(天然配列のFc領域またはアミノ酸配列変異体のFc領域)に起因し得る生物学的活性を指す。抗体エフェクター機能の例としては、C1q結合、補体依存性細胞毒性、Fc受容体結合、抗体依存性細胞媒介性細胞毒性(ADCC)、食作用、ならびにB細胞受容体およびBCRなどの細胞表面受容体の下方制御が挙げられる。
本明細書で使用される「Fc領域」という用語は、定常領域の少なくとも一部分を含有する免疫グロブリン重鎖のC末端領域を定義するために使用される。この用語は、天然配列Fc領域と可変Fc領域を含む。一実施形態において、ヒトIgG重鎖Fc領域は、Cys226から、またはPro230から、重鎖のカルボキシル末端までに及ぶ。しかしながら、Fc領域のC末端リジン(Lys447)は、存在していてもよく、または存在していなくてもよい。本明細書で特に明記されない限り、Fc領域または定常領域におけるアミノ酸残基の番号付けは、Kabat et al.,Sequences of Proteins of Immunological Interest,5th Ed.Public Health Service,National Institutes of Health,Bethesda,MD,1991に記載されるような、EU番号付けシステム(EUインデックスとも呼ばれる)に従う。
本明細書で使用される「フレームワーク」または「FR」という用語は、超可変領域(hypervariable region:HVR)残基以外の可変ドメイン残基を指す。可変ドメインのFRは、一般的に、FR1、FR2、FR3およびFR4の4つのFRドメインからなる。したがって、HVR配列およびFR配列は、概して、VH(またはVL)における次の配列において現れる。FR1-H1(L1)-FR2-H2(L2)-FR3-H3(L3)-FR4。
用語「全長抗体」、「インタクト抗体」、および「全抗体」とは、本明細書では相互に交換可能に使用され、天然抗体構造と実質的に類似の構造を有するか、または本明細書に定義されるFc領域を含有する重鎖を有する抗体を指す。
「ヒト抗体」は、ヒトもしくはヒト細胞によって産生された、もしくはヒト抗体レパートリを利用する非ヒト源に由来する、抗体のアミノ酸配列、または他のヒト抗体コード配列に対応する、アミノ酸配列を保有するものである。このヒト抗体の定義は、非ヒト抗原結合残基を含むヒト化抗体を特定的に除外する。
「ヒト化」抗体は、非ヒトHVR由来のアミノ酸残基と、ヒトFR由来のアミノ酸残基とを含むキメラ抗体を指す。特定の実施形態において、ヒト化抗体は、少なくとも1つ、典型的には2つの可変ドメインの実質的に全てを含むものであり、それにおいて、HVR(例えば、CDR)の全てまたは実質的に全てが非ヒト抗体のものに相当し、FRの全てまたは実質的に全てがヒト抗体のものに相当する。ヒト化抗体は、必要に応じて、ヒト抗体に由来する抗体定常領域の少なくとも一部を含んでいてもよい。抗体の「ヒト化形態」とは、例えば非ヒト抗体のように、ヒト化を受けた抗体を指す。
「単離抗体」は、その天然環境の構成成分から分離された抗体である。一部の実施形態において、抗体は、例えば、電気泳動(例えば、SDS-PAGE、等電点電気泳動(IEF)、キャピラリー電気泳動)またはクロマトグラフ(例えば、イオン交換または逆相HPLC)によって決定される、95%超または99%超の純度まで精製される。抗体純度の評価のための方法の総説については、例えば、Flatmanら、「J.Chromatogr.B」、第848巻79~87頁(2007年)を参照されたい。
「単離核酸」は、その天然環境の成分から分離された核酸分子を指す。単離された核酸は、元々その核酸分子を含む細胞に含まれているが、その核酸分子が、染色体外に存在するか、またはその天然の染色体位置とは異なる染色体位置に存在する核酸分子を含む。
「抗体をコードする単離された核酸」とは、抗体重鎖および軽鎖(またはその断片)をコードする1つまたは複数の核酸分子を指し、単一のベクターまたは別個のベクター内の核酸分子(複数可の場合がある)を含み、かかる核酸分子(複数可の場合がある)は、宿主細胞内の1つまたは複数の場所に存在する。
「ネイキッド抗体」とは、異種部位(例えば、細胞毒性部位)または放射性標識に結合していない抗体を指す。ネイキッド抗体は、医薬製剤中に存在し得る。
「天然抗体」とは、様々な構造を有する天然に存在する免疫グロブリン分子を指す。例えば、天然IgG抗体は、ジスルフィド結合されている2つの同一の軽鎖および2つの同一の重鎖からなる約150,000ダルトンのヘテロ四量体糖タンパク質である。N末端からC末端まで、各重鎖は、可変重ドメインまたは重鎖可変ドメインとも呼ばれる可変領域(VH)を有し、続いて3つの定常ドメイン(CH1、CH2、およびCH3)を有する。同様に、N末端からC末端まで、各軽鎖は、可変軽ドメインまたは軽鎖可変ドメインとも呼ばれる可変領域(VL)を有し、続いて定常軽(CL)ドメインを有する。抗体の軽鎖は、その定常ドメインのアミノ酸配列に基づき、カッパ(κ)およびラムダ(λ)と呼ばれる2種類の1つに割り当てられてもよい。
参照ポリペプチド配列に関する「アミノ酸配列同一性パーセント(%)」は、配列をアライメントし、配列同一性最大パーセントを得るのに必要な場合はギャップを導入した後に、いかなる保存的置換も配列同一性の部分として考慮せずに、参照ポリペプチド配列におけるアミノ酸残基と同一である、候補配列におけるアミノ酸残基の割合として定義される。パーセントのアミノ酸配列同一性を決定する目的のためのアラインメントは、当技術分野の熟練の範囲内である様々な方法で、例えば、BLAST、BLAST-2、ALIGNまたはMegalign(DNASTAR)ソフトウェアのような公知のコンピュータソフトウェアを使用して達成することができる。当業者は、比較される配列の全長にわたって最大整列度を達成するのに必要とされる任意のアルゴリズムを含め、配列を整列させるのに適切なパラメータを決定することができる。しかしながら、本明細書では目的のために、アミノ酸配列同一%値は、配列比較コンピュータプログラムALIGN-2を用いて生じる。ALIGN-2配列比較コンピュータプログラムは、Genentech,Inc.によって作成されており、ソースコードは、U.S.Copyright Office(Washington D.C.,20559)のユーザドキュメンテーションにファイルされており、U.S.Copyright Registration No.TXU510087の下に登録されている。ALIGN-2プログラムは、Genentech,Inc.(South San Francisco,California)から公的に入手可能であり、またはそのソースコードからコンパイルされてもよい。ALIGN-2プログラムは、デジタルUNIX V4.0Dを含め、UNIXオペレーティングシステムで使用するためにコンパイルされるべきである。全ての配列比較パラメータは、ALIGN-2プログラムによって設定されており、かつ変わらない。
ALIGN-2がアミノ酸配列比較に採用されている状況においては、(あるいは所与のアミノ酸配列Bに対する、配列Bとの、または配列Bに対向するある特定のアミノ酸配列同一性%を有するかまたは含む所与のアミノ酸配列Aとして購入することができる)所与のアミノ酸配列Aの、所与のアミノ酸配列Bに対する、配列Bとの、または配列Bに対向するアミノ酸配列同一性%は、次のように計算される:
分数X/Yの100倍
式中、Xは、AおよびBのこのプログラムのアラインメントにおいて、配列アラインメントプログラムALIGN-2によって同一性マッチとしてスコアリングされたアミノ酸残基の数であり、Yは、Bにおけるアミノ酸残基の合計数である。アミノ酸配列Aの長さが、アミノ酸配列Bの長さと等しくない場合、Bに対するAのアミノ酸配列同一性%は、Aに対するBのアミノ酸配列同一性%に等しくないことが理解されるだろう。特に明記しない限り、本明細書で使用されるアミノ酸配列同一性%の値は全て、ALIGN-2コンピュータプログラムを用いる直前の段落に記載されるように得られる。
重鎖の定常ドメインのアミノ酸配列に応じて、無傷抗体には、異なる「クラス」が割り当てられ得る。インタクトな免疫グロブリン抗体には5つの主要なクラス、すなわち、IgA、IgD、IgE、IgG、およびIgMが存在し、これらのうちのいくつかは、「サブクラス」(アイソタイプ)、例えば、IgG1、IgG2、IgG3、IgG4、IgA1、およびIgA2にさらに分けることができる。抗体の異なるクラスに対応する重鎖定常ドメインは、それぞれ、α、δ、ε、γ、およびμと呼ばれる。免疫グロブリンの異なるクラスのサブユニット構造および三次元配置は、周知である。Ig形態には、ヒンジ修飾またはヒンジなしの形態(Rouxら(1998年)、「J.Immunol.」161:4083~4090頁;Lundら(2000年)、「Eur.J.Biochem.」267:7246~7256頁;米国特許出願公開第2005/0048572号;米国特許出願公開第2004/0229310号明細書)が含まれる。
本明細書で使用される「ヒトコンセンサスフレームワーク」という用語は、ヒト免疫グロブリンVLまたはVHフレームワーク配列の選択において最も一般的に生じるアミノ酸残基を表すフレームワークを指す。一般に、ヒト免疫グロブリンVLまたはVH配列の選択は、可変ドメイン配列のサブグループからである。一般に、配列のサブグループは、Kabatら、「Sequences of Proteins of Immunological Interest」第5版、NIH Publication、第91~3242頁、メリーランド州ベセスダ(1991年)、第1~3巻にあるようなサブグループである。一実施形態において、VLについては、サブグループは、Kabatら(上記参照)におけるサブグループカッパIである。一実施形態において、VHについては、サブグループは、Kabatら(上記参照)におけるサブグループIIIである。
本明細書の目的のための「アクセプターヒトフレームワーク」は、以下に定義される、ヒト免疫グロブリンフレームワークまたはヒトコンセンサスフレームワークに由来する、軽鎖可変ドメイン(VL)フレームワークまたは重鎖可変ドメイン(VH)フレームワークのアミノ酸配列を含むフレームワークである。ヒト免疫グロブリンフレームワークまたはヒトコンセンサスフレームワーク「由来の」アクセプターヒトフレームワークは、その同じアミノ酸配列を含んでいてもよく、またはアミノ酸配列の変更を含んでいてもよい。いくつかの実施形態において、アミノ酸変更の数は、10以下、9以下、8以下、7以下、6以下、5以下、4以下、3以下、または2以下である。いくつかの実施形態において、VLアクセプターヒトフレームワークは、VLヒト免疫グロブリンフレームワーク配列またはヒトコンセンサスフレームワーク配列に対して、配列が同一である。
本明細書で使用される「可変領域」または「可変ドメイン」という用語は、抗原に対する抗体の結合に抗体重鎖または軽鎖のドメインを指す。天然の抗体の重鎖および軽鎖の可変ドメイン(それぞれVHおよびVL)は、概して、類似の構造を有しており、各ドメインは、4つの保存されたフレームワーク領域(FR)と、3つの超可変領域(HVR)とを含む。例えば、Kindt et al.,Kuby Immunology,6th、W.H.Freeman and Co.,page 91(2007)を参照のこと。抗原結合特異性を与えるために、単一のVHまたはVLドメインで十分な場合がある。さらに、特定の抗原を結合する抗体は、抗原を結合する抗体のVHまたはVLドメインを使用し、それぞれ、相補的VLまたはVHドメインのライブラリをスクリーニングして、単離してもよい。例えば、Portolanoら、「J.Immunol.」、第150巻880~887頁(1993年)、Clarksonら、「Nature」、第352巻624~628頁(1991年)を参照されたい。
「超可変領域」または「HVR」という用語は、本明細書で使用される場合、配列において超可変性であり、および/または構造上規定されたループ(「超可変ループ」)を形成する、抗体可変ドメインの領域の各々を指す。概して、ネイティブの4本鎖抗体は、6個のHVRを含み、VHにおいては3個(H1、H2、H3)、VLにおいては3個(L1、L2、L3)を含む。HVRは、一般的に、超可変ループ由来および/または「相補性決定領域」(CDR)由来のアミノ酸残基を含み、CDRは、最も高い配列可変性を有し、および/または抗原認識に関与している。例示的な超可変ループは、アミノ酸残基26-32(L1)、50-52(L2)、91-96(L3)、26-32(H1)、53-55(H2)および96-101(H3)で生じる。(ChothiaおよびLesk、「J.Mol.Biol.」196:901~917頁(1987年)。)例示的なCDR(CDR-L1、CDR-L2、CDR-L3、CDR-H1、CDR-H2およびCDR-H3)は、L1のアミノ酸残基24-34、L2の50-56、L3の89-97、H1の31-35B、H2の50-65およびH3の95-102に存在する。(Kabat et al.、Sequences of Proteins of Immunological Interest、5th Ed.Public Health Service、National Institutes of Health、Bethesda、MD(1991))VHにおけるCDR1を除き、CDRは、概して、超可変ループを形成するアミノ酸残基を含む。CDRは、「特異性決定領域」、すなわち「SDR」も含み、SDRは、抗原と接触する残基である。SDRは、省略-CDR、すなわちa-CDRと呼ばれるCDRの領域内に含まれる。例示的なa-CDR(a-CDR-L1、a-CDR-L2、a-CDR-L3、a-CDR-H1、a-CDR-H2およびa-CDR-H3)は、L1の31-34、L2の50-55、L3の89-96、H1の31-35B、H2の50-58およびH3の95-102のアミノ酸残基に存在する。(Almagro and Fransson,Front.Biosci.13:1619-1633(2008)を参照。)別途指定されない限り、HVR残基、および可変ドメイン中の他の残基(例えば、FR残基)は、Kabatら(前出)に従って本明細書では番号付けされる。
「エフェクター機能」とは、抗体のアイソタイプにより異なる抗体のFc領域に起因する生物活性を指す。抗体エフェクター機能の例としては、以下のものが挙げられる。C1q結合および補体依存性細胞毒性(CDC);Fc受容体結合;抗体依存性細胞媒介細胞毒性(ADCC);食作用;細胞表面受容体(例えば、B細胞受容体)の下方制御;ならびにB細胞活性化。
「エピトープ」という用語は、抗体が結合する抗原分子上の特定の部位を指す。
「エピトープ4D5」または「4D5エピトープ」または「4D5」は、抗体4D5(ATCC CRL 10463)およびトラスツズマブが結合するHER2の細胞外ドメイン内の領域である。このエピトープは、HER2の膜貫通ドメインに近接し、HER2のドメインIV内にある。4D5エピトープに結合する抗体をスクリーニングするために、「Antibodies,A Laboratory Manual」Cold Spring Harbor Laboratory、HarlowおよびDavid Lane編(1988年)に記載されるもの等のルーチンクロスブロッキングアッセイを行うことができる。代替として、エピトープマッピングを行い、抗体がHER2の4D5エピトープ(HER2(配列番号39)を含む、約残基550~約残基610に由来する領域内の任意の1つまたは複数の残基)に結合するかどうかを評価することができる。
「エピトープ2C4」または「2C4エピトープ」は、抗体2C4が結合するHER2の細胞外ドメイン内の領域である。2C4エピトープに結合する抗体をスクリーニングするために、「Antibodies,A Laboratory Manual」、Cold Spring Harbor Laboratory、HarlowおよびDavid Lane編(1988年)に記載されるもの等のルーチンクロスブロッキングアッセイを行うことができる。代替として、エピトープマッピングを行い、抗体がHER2の2C4エピトープに結合するかどうかを評価することができる。エピトープ2C4は、HER2の細胞外ドメイン中のドメインII由来の残基を含む。2C4抗体およびペルツズマブは、ドメインI、IIおよびIIIの接合部でHER2の細胞外ドメインに結合する(Franklinら「Cancer Cell」5:317~328頁(2004年))。
「親和性」とは、分子(例えば、抗体)の単一の結合部位とその結合パートナー(例えば、抗原)との間の、合計の非共有性相互作用の強度を指す。特に明記しない限り、本明細書で使用される場合、「結合親和性」は、結合対(例えば、抗体と抗原)のメンバー間の1:1相互作用を反映する特異的結合親和性を指す。分子XのそのパートナーYに対する親和性は一般に、解離定数(Kd)によって表され得る。アフィニティは、本明細書に記載するものを含め、当該技術分野で一般的な方法によって測定することができる。結合親和性を測定するための具体的な例証的説明および例示的な実施形態が、以下に記載される。特定の実施形態において、本明細書に記載される抗体は、≦1μM、≦100nM、≦10nM、≦5nm、≦4nM、≦3nM、≦2nM、≦1nM、≦0.1nM、≦0.01nM、または≦0.001nM(例えば10-8M以下、例えば10-8M~10-13M、例えば10-9M~10-13M)の解離定数(Kd)を有する。
「親和性成熟」抗体とは、改変などを有しない親抗体と比較して、1つまたは複数の超可変領域(HVR)に1つまたは複数の改変を有し、そのような改変により抗体の抗原に対する親和性が改善される抗体を指す。
「ベクター」という用語は、本明細書で使用される場合、連結している別の核酸を増殖することができる核酸分子を指す。本用語は、自己複製する核酸構造としてのベクター、およびベクターが導入された宿主細胞のゲノム内へと組み込まれたベクターを含む。特定のベクターは、それらが機能的に連結されている核酸の発現を指示することができる。そのようなベクターは、本明細書では「発現ベクター」と称される。
本明細書で使用される「遊離システインアミノ酸」という用語は、親抗体へと操作され、チオール官能基(-SH)を有し、分子内または分子間ジスルフィド架橋として対になっていないシステインアミノ酸残基を指す。本明細書で使用される「アミノ酸」という用語は、グリシン、アラニン、バリン、ロイシン、イソロイシン、フェニルアラニン、プロリン、セリン、トレオニン、チロシン、システイン、メチオニン、リジン、アルギニン、ヒスチジン、トリプトファン、アスパラギン酸、グルタミン酸、アスパラギン、グルタミンまたはシトルリンを意味する。
本明細書で使用される「リンカー」、「リンカー単位」または「連結」という用語は、CIDE部分を抗体に共有結合させる原子の鎖を含む化学部分、またはCIDEの成分をCIDEの別の成分に共有結合させる原子の鎖を含む化学部分を意味する。様々な実施形態において、リンカーは、L1またはL2として特定される二価の基である。
「患者」または「個体」または「対象」は、哺乳動物である。哺乳類としては、家畜化動物(例えば、牛、羊、猫、犬、馬など)、霊長類(例えば、ヒト、サルなどの非ヒト霊長類)、ウサギ、げっ歯類(例えば、マウス、ラットなど)などが挙げられるが、これらに限定されるものではない。特定の実施形態において、患者、個体、または対象は、ヒトである。いくつかの実施形態において、患者は「癌患者」、すなわち、癌の1つまたは複数の症状を罹患しているか、または罹患するリスクがある者であり得る。
「患者母集団」は、癌患者の群を指す。これらのような母集団を使用して、薬物の統計的に有意な有効性および/または安全性を実証することができる。
「再発」患者は、寛解後に癌の兆候または症状を有する者である。必要に応じて、患者は、アジュバントまたはネオアジュバント療法後に再発した。
「HER発現、増幅、または活性化を示す」癌または生体試料は、診断試験において、HER受容体を発現する(過剰発現を含む)、増幅したHER遺伝子を含む、および/またはそれ以外のHER受容体の活性化もしくはリン酸化を実証するものである。
本明細書における「ネオアジュバント療法」または「術前療法」は、手術前に行われる療法を指す。ネオアジュバント療法の目標は、即時の全身治療を提供することであり、標準的な一連の手術とそれに続く全身療法に従った場合に増殖する微小転移を潜在的に根絶することである。ネオアジュバント療法はまた、腫瘍サイズを減少させ、それによって最初は切除不能な腫瘍の完全な切除または臓器の一部およびその機能の保存を可能にするのに役立ち得る。さらに、ネオアジュバント療法は、その後の治療の選択を導くことができる薬物有効性のインビボ評価を可能にする。
本明細書における「アジュバント療法」とは、疾患再発のリスクを低下させるために、残存疾患の証拠を検出することができない、根治手術後に行われる治療法を指す。アジュバント療法の目的は、癌の再発を予防し、したがって癌関連死の可能性を低下させることである。本明細書におけるアジュバント療法は、ネオアジュバント療法を特に除外する。
「根治手術」は、その用語が医学界内で使用されるとおりに使用される。根治手術には、例えば、腫瘍の除去または切除をもたらす手術、外科的またはその他の手技が含まれ、肉眼で見える全ての腫瘍の除去または切除をもたらすものを含む。根治手術には、例えば、腫瘍の完全もしくは治癒的切除または完全な肉眼的切除が含まれる。根治手術は、1つまたは複数の段階で生じる手技を含み、例えば、腫瘍の切除前に1つまたは複数の外科的またはその他の手技が行われる多段階外科手技を含む。根治手術には、関与する器官、器官および組織の一部、ならびにリンパ節、器官の一部または組織などの周囲器官を含む腫瘍を除去または切除するための手技が含まれる。除去は、腫瘍細胞が検出されないにもかかわらず残存し得るように不完全な場合がある。
「生存」は、生存したままである患者を指し、無病生存率(DFS)、無増悪生存率(PFS)および全生存率(OS)を含む。生存はカプラン・マイヤー法によって推定することができ、生存の差は層別化ログランク検定を使用して計算される。
「無増悪生存期間」(PFS)は、治療の1日目から、実証された疾患進行(孤立性CNS進行を含む)または研究上の任意の原因による死亡までの、いずれか早い方の時間である。
「無病生存率(DFS)」とは、治療開始または最初の診断から、約1年、約2年、約3年、約4年、約5年、約10年などの規定の期間、癌が復活することなく生存している患者を指す。本明細書に記載の主題の一態様では、DFSは、治療意図の原理に従って分析され、すなわち、患者は、割り当てられた治療法に基づいて評価される。DFSの分析で使用される事象には、癌の局所、領域および遠隔再発、二次癌の発生、ならびに以前の事象のない患者における何らかの原因による死亡(例えば、乳癌再発または第2の原発性癌)が含まれ得る。
「全生存率」とは、治療開始または最初の診断から、約1年、約2年、約3年、約4年、約5年、約10年などの規定の期間生存している患者を指す。
「生存期間を延長する」とは、未治療患者と比較して、または対照治療プロトコルと比較して、治療患者においてDFSおよび/またはOSを増加させることを意味する。生存は、治療の開始後または最初の診断後、少なくとも約6ヶ月間、または少なくとも約1年間、または少なくとも約2年間、または少なくとも約3年間、または少なくとも約4年間、または少なくとも約5年間、または少なくとも約10年間など監視される。
「単剤療法」とは、一連の治療期間中の癌または腫瘍の治療のための単一治療剤のみを含む治療レジメンを意味する。
「維持療法」とは、疾患再発または進行の可能性を低減するために付与される治療レジメンを意味する。維持療法は、対象の寿命までの長期間を含む、任意の長さの時間にわたって提供され得る。維持療法は、初期療法後に提供されるか、または初期療法もしくは追加の治療法と組み合わせて提供され得る。維持療法に使用される投薬量は変化する可能性があり、他の種類の治療法に使用される投薬量と比較して縮小した投薬量を含み得る。
「宿主細胞」、「宿主細胞株」、および「宿主細胞培養物」という用語は、同義で使用され、外因性核酸が導入された細胞を指し、かかる細胞の子孫を含む。宿主細胞としては、初代形質転換細胞、および継代の数にかかわらずそれに由来する子孫を含む、「形質転換体」および「形質転換細胞」が含まれる。後代は、核酸含有量が親細胞と完全に同一でなくてもよいが、突然変異を含有していてもよい。元々の形質転換された細胞についてスクリーニングされるかまたは選択されるのと同じ機能または生物活性を有する突然変異体の後代は、本発明に含まれる。
「癌」および「癌性」という用語は、細胞成長/増殖の未調節によって典型的に特徴付けられる、哺乳動物における生理的症状を指すか、または説明する。「腫瘍」は、1つまたは複数の癌細胞を含む。癌の例は、本明細書の他の箇所に提供される。
「HER2陽性」癌は、正常レベルよりも高いHER2を有する癌細胞を含む。HER2陽性癌の例としては、HER2陽性乳癌およびHER2陽性胃癌が挙げられる。必要に応じて、HER2陽性癌は、2+もしくは3+の免疫組織化学的検査(IHC)スコア、および/または≧2.0のインサイチュハイブリダイゼーション(ISH)増幅率を有する。「HER2陽性細胞」という用語は、その表面上でHER2を発現する細胞を指す。
「早期ステージ乳癌(EBC)」または「早期乳癌」という用語は、本明細書では、乳房または腋窩リンパ節を越えて広がっていない乳癌を指すために使用される。これには、非浸潤性乳管癌ならびにI期、IIA期、IIB期およびIIIA期の乳癌が含まれる。
「ステージ0」、「ステージI」、「ステージII」、「ステージIII」または「ステージIV」としての腫瘍または癌、およびこの分類内の様々なサブステージへの言及は、当技術分野で公知の全ステージ分類またはローマ数字病期分類法を使用した腫瘍または癌の分類を示す。癌の実際の病期は癌の種類に依存するが、一般に、0期癌は非浸潤性(in situ)病変であり、I期癌は小さな限局性腫瘍であり、II期およびIII期癌は局所リンパ節の関与を示す局所進行性腫瘍であり、IV期癌は転移性癌を表す。各タイプの腫瘍の具体的な病期は、当業者に公知である。
「転移性乳癌」という用語は、癌細胞が元の部位から体内の他の場所の1つまたは複数の部位に血管またはリンパ管によって伝達されて、乳房以外の1つまたは複数の器官に1つまたは複数の二次腫瘍を形成する乳癌の状態を意味する。
「進行」癌とは、元の部位または器官の外に、局所浸潤または転移のいずれかによって広がった癌である。したがって、「進行した」癌という用語は、局所進行性疾患および転移性疾患の両方を含む。「再発」癌は、手術等の初期療法への応答後に、初期部位または遠位部位のいずれかにおいて再成長したものである。「局所的再発」癌は、治療後に以前に治療された癌と同じ場所で再発する癌である。「手術可能な」または「切除可能な」癌は、原発器官に限定され、手術(切除)に適した癌である。「切除不能な(non-resectable)」または「切除不能な(unresectable)」癌は、手術によって除去(切除)されることができない。
本明細書で使用される「細胞毒性薬」という用語は、細胞機能を阻害もしくは阻止し、および/または細胞死もしくは破壊を引き起こす物質を指す。細胞毒性剤としては、放射性同位体(例えば、At211、I131、I125、Y90、Re186、Re188、Sm153、Bi212、P32、Pb212、およびLu放射性同位体);化学療法剤または薬物(例えば、メトトレキサート、アドリアマイシン、ビンカアルカロイド(ビンクリスチン、ビンブラスチン、エトポシド)、ドキソルビシン、メルファラン、マイトマイシンC、クロラムブシル、ダウノルビシンまたは他の挿入剤);成長阻害剤;酵素およびそのフラグメント、例えば核分解酵素;抗生物質;細菌、真菌、植物または動物由来の低分子毒素または酵素的活性毒素などの毒素(そのフラグメントおよび/または変異体を含む);ならびに下記に開示される様々な抗腫瘍剤または抗癌剤が挙げられるが、これらに限定されない。
「化学治療剤」とは、癌の治療において有用な化学物質を指す。化学療法剤の例としては、アルキル化剤、例えばチオテパおよびシクロホスファミド(CYTOXAN(登録商標));アルキルスルホネート、例えばブスルファン、インプロスルファンおよびピポスルファン;アジリジン、例えばベンゾド-パ、カルボクオン、メツレドーパ(meturedopa)、およびウレド-パ;アルトレタミン、トリエチレンメラミン、トリエチレンホスホルアミド、トリエチレンチオホスホルアミドおよびトリメチロメラミンを含むエチレンイミンおよびメチルアメラミン(methylamelamines);アセトゲニン(特にブラタシンおよびブラタシノン);デルタ-9-テトラヒドロカンナビノ-ル(ドロナビノール、MARINOL(登録商標));ベ-タ-ラパコン;ラパコール;コルヒチン;ベツリン酸;カンプトテシン(合成アナログトポテカン(HYCAMTIN(登録商標))、CPT-11(イリノテカン、CAMPTOSAR(登録商標))、アセチルカンプトテシン、スコポレクチン、および9-アミノカンプトテシンを含む);ブリオスタチン;カリスタチン;CC-1065(そのアドゼレシン、カルゼレシンおよびビゼレシン合成アナログを含む);ポドフィロトキシン;ポドフィリン酸;テニポシド;クリプトフィシン(特にクリプトフィシン1およびクリプトフィシン8);ドラスタチン;デュオカルマイシン(合成アナログ、KW-2189およびCB1-TM1を含む);エリュテロビン;パンクラチスタチン;サルコジクチン;スポンジスタチン;ナイトローゼンマスタード、例えばクロラムブシル、クロルナファジン、クロロホスファミド、エストラムスチン、イホスファミド、メクロレタミン、塩酸メクロレタミンオキシド、メルファラン、ノベンビチン、フェネステリン、プレドニムスチン、トロホスファミド、ウラシルマスタード;ニトロソウレア、例えばカルムスチン、クロロゾトシン、フォテムスチン、ロムスチン、ニムスチンおよびラニムヌスチン;抗生物質、例えばエンジイン抗生物質(例えば、カリケアマイシン、特にカリケアマイシンγ1IおよびカリケアマイシンオメガI1(例えば、Nicolaouら、Angew.Chem Intl.Ed.Engl.、33:183~186頁(1994年)を参照されたい);CDP323、経口アルファ-4インテグリン阻害剤;ダイネミシンAを含むダイネミシン;エスペラマイシン;ならびにネオカルジノスタチンクロモフォアおよび関連するクロモプロテインエンジイン抗生物質クロモフォア)、アクラシノマイシン、アクチノマイシン、アントラマイシン、アザセリン、ブレオマイシン、カクチノマイシン、カラビシン、カミノマイシン、カルジノフィリン、クロモマイシン、ダクチノマイシン、ダウノルビシン、デトルビシン、6-ジアゾ-5-オキソ-L-ノルロイシン、ドキソルビシン(ADRIAMYCIN(登録商標)、モルホリノ-ドキソルビシン、シアノモルホリノ-ドキソルビシン、2-ピロリノ-ドキソルビシン、ドキソルビシンHClリポソ-ム注射(DOXIL(登録商標))、リポソームドキソルビシンTLC D-99(MYOCET(登録商標))、ペグリル化リポソームドキソルビシン(CAELYX(登録商標))、およびデオキシドキソルビシン)、エピルビシン、エソルビシン、イダルビシン、マルセロマイシン、マイトマイシン、例えばマイトマイシンC、マイコフェノール酸、ノガラマイシン、オリボマイシン、ペプロマイシン、ポルフィロマイシン、ピューロマイシン、ケラマイシン、ロドルビシン、ストレプトニグリン、ストレプトゾシン、ツベルシジン、ウベニメクス、ジノスタチン、ゾルビシン;代謝拮抗物質、例えばメトトレキサート、ゲムシタビン(GEMZAR(登録商標))、テガフール(UFTORAL(登録商標))、カペシタビン(XELODA(登録商標))、エポチロン、および5-フルオロウラシル(5-FU);葉酸類縁体、例えばデノプテリン、メトトレキサート、プテロプテリン、トリメトレキサート;プリジンアナログ、例えばフルダラビン、6-メルカプトプリン、チアミプリン、チオグアニン;ピリミジン類縁体、例えばアンシタビン、アザシチジン、6-アザウリジン、カルモフール、シタラビン、ジデオキシウリジン、ドキシフルリジン、エノシタビン、フロクスウリジン;アンドロゲン、例えばカルステロン、ドロスタノロンプロピオン酸エステル、エピチオスタノール、メピチオスタン、テストトラクトン;抗副腎剤、例えばアミノグルテチミド、ミトタン、トリロスタン;葉酸補充剤、例えばフォリン酸;アセグラトン;アルドホスファミドグリコシド;アミノレブリン酸;エニルウラシル;アムサクリン;ベストラブシル;ビサントレン;エダトレキサート;デフォファミン;デメコルシン;ジアジクオン;エルフォルニチン(elfornithine);酢酸エリプチニウム;エポチロン;エトグルシド;硝酸ガリウム;ヒドロキシウレア;レンチナン;ロニダイニン;メイタンシノイド、例えばメイタンシンおよびアンサミトシン;ミトグアゾン;ミトキサントロン;モピダンモール;ニトラエリン;ペントスタチン;フェナメット;ピラルビシン;ロソキサントロン;2-エチルヒドラジド;プロカルバジン;PSK(登録商標)多糖複合体(JHS Natural Products,オレゴン州ユージーン);ラゾキサン;リゾキシン;シゾフィラン(sizofiran);スピロゲルマニウム;テヌアゾン酸;トリアジクオン;2,2’,2’-トリクロロトリエチルアミン;トリコテセン(特にT-2トキシン、ベラクリンA、ロリジンAおよびアングイジン);ウレタン;ビンデシン(ELDISINE(登録商標)、FILDESIN(登録商標));ダカルバジン;マンノムスチン;ミトブロニトール;ミトラクトール;ピポブロマン;ガシトシン;アラビノシド(「Ara-C」);チオテパ;タキソイド、例えば、パクリタキセル(TAXOL(登録商標))、パクリタキセルのアルブミン改変ナノ粒子製剤(ABRAXANETM)、およびドセタキセル(TAXOTERE(登録商標));クロランブシル;6-チオグアニン;メルカプトプリン;メトトレキサート;白金剤、例えばシスプラチン、オキサリプラチン(例えば、ELOXATIN(登録商標))、およびカルボプラチン;ビンブラスチン(VELBAN(登録商標))、ビンクリスチン(ONCOVIN(登録商標))、ビンデシン(ELDISINE(登録商標)、FILDESIN(登録商標))、およびビノレルビン(NAVELBINE(登録商標))を含む、チューブリン重合を防止して微小管の形成を防ぐビンカ類;エトポシド(VP-16);イホスファミド;ミトキサントロン;ロイコボリン;ノバントロン;エダトレキサート;ダウノマイシン;アミノプテリン;イバンドロネート;トポイソメラーゼ阻害剤RFS 2000;ジフルオロメチルオルニチン(DMFO:difluoromethylornithine);レチノイド類、例えば、ベキサロテン(TARGRETIN(登録商標))を含むレチノイン酸;ビスホスホネート、例えばクロドロネート(例えば、BONEFOS(登録商標)またはOSTAC(登録商標)、エチドロネート(DIDROCAL(登録商標))、NE-58095、ゾレドロン酸/ゾレドロネート(ZOMETA(登録商標))、アレンドロネート(FOSAMAX(登録商標))、パミドロネート(AREDIA(登録商標))、チルドロネート(SKELID(登録商標))、またはリセドロネート(ACTONEL(登録商標));トロキサシタビン(1,3-ジオキソランヌクレオシドシトシン類縁体);アンチセンスオリゴヌクレオチド、特に異常な細胞増殖に関与するシグナル伝達経路の遺伝子、例えば、PKC-アルファ、Raf、H-Ras、および上皮増殖因子受容体(EGF-R);ワクチン、例えばTHERATOPE(登録商標)ワクチンおよび遺伝子治療ワクチン、例えば、ALLOVECTIN(登録商標)ワクチン、LEUVECTIN(登録商標)ワクチン、およびVAXID(登録商標)ワクチン;トポイソメラーゼ1阻害剤(例えば、LURTOTECAN(登録商標));rmRH(例えば、ABARELIX(登録商標));BAY439006(ソラフェニブ、Bayer);SU-11248(スニチニブ、SUTENT(登録商標)、Pfizer);ペリホシン、COX-2阻害剤(例えば、セレコキシブまたはエトリコキシブ)、プロテオソ-ム阻害剤(例えば、PS341);ボルテゾミブ(VELCADE(登録商標));CCI-779;チピファルニビ(R11577);オラフェニブ、ABT510;Bcl-2阻害剤、例えばオブリメルセンナトリウム(GENASENSE(登録商標)、アンチセンスオリゴヌクレオチド);ピクサントロン;EGFR阻害剤(下記の定義を参照されたい);チロシンキナーゼ阻害剤;セリン-スレオニンキナーゼ阻害剤、例えばラパマイシン(シロリムス、RAPAMUNE(登録商標));ファルネシルトランスフェラーゼ阻害剤、例えばロナファルニブ(SCH 6636、SARASARTM);および上記のいずれかの薬学的に許容可能な塩、酸または誘導体;ならびに上記の2種以上の組み合わせ、例えばCHOP((シクロホスファミド、ドキソルビシン、ビンクリスチン、プレドニゾロンの併用療法の略語)、FOLFOX(オキサリプラチン(ELOXATINTM)と5-FU、ロイコボリンの併用治療の略語)が挙げられる。
本明細書で定義される化学治療剤は、癌の成長を促進し得るホルモンの効果を調節、低減、遮断、または阻害するように作用する「抗ホルモン剤」または「内分泌治療薬」を含む。それらは、それら自体がホルモンであってもよく、タモキシフェン(NOLVADEX(登録商標))、4-ヒドロキシタモキシフェン、トレミフェン(FARESTON(登録商標))、イドキシフェン、ドロロキシフェン、ラロキシフェン(EVISTA(登録商標))、トリオキシフェン、ケオキシフェン、およびSERM3等の選択的エストロゲン受容体調節剤(SERM)を含む、混合アゴニスト/アンタゴニストプロファイルを有する抗エストロゲン;フルベストラント(FASLODEX(登録商標))、およびEM800(かかる薬剤は、エストロゲン受容体(ER)二量体化を遮断する、DNA結合を阻害する、ERターンオーバーを増加させる、および/またはERレベルを抑制する場合がある)などのアゴニスト特性を有しない純粋な抗エストロゲン;ホルメスタンおよびエキセメスタン(AROMASIN(登録商標))などのステロイド性アロマターゼ阻害剤、ならびにアナストラゾール(ARIMIDEX(登録商標))、レトロゾール(FEMARA(登録商標))、およびアミノグルテチミドなどの非ステロイド性アロマターゼ阻害剤を含むアロマターゼ阻害剤、ならびにボロゾール(RIVISOR(登録商標))、メゲストロールアセテート(MEGASE(登録商標))、ファドロゾール、および4(5)-イミダゾールを含む、他のアロマターゼ阻害剤;リュープロリド(LUPRON(登録商標)およびELIGARD(登録商標))、ゴセレリン、ブセレリン、およびトリプテレリン(tripterelin)を含む、黄体形成ホルモン放出ホルモンアゴニスト;メゲストロールアセテートおよびメドロキシプロゲステロンアセテートなどのプロゲスチン、ジエチルスチルベストロールおよびプレマリンなどのエストロゲン、ならびにフルオキシメステロン、全てのトランスレチオン酸(transretionic acid)、およびフェンレチニドなどのアンドロゲン/レチノイドを含む、性ステロイド;オナプリストン;抗プロゲステロン;エストロゲン受容体下方調節剤(ERD);フルタミド、ニルタミド、およびビカルタミドなどの抗アンドロゲン;ならびに上記のうちのいずれかの薬学的に許容可能な塩、酸、または誘導体;ならびに上記のうちの2つ以上の組み合わせを含むが、これらに限定されない。
「免疫抑制剤」という用語は、補助療法に関して本明細書で使用されるとき、本明細書で治療されている哺乳動物の免疫系を抑制またはマスクするように作用する物質を指す。これには、サイトカイン産生を抑制するか、自己抗原発現を下方調節もしくは抑制するか、またはMHC抗原をマスクする物質が含まれることになる。そのような薬剤の例としては、2-アミノ-6-アリール-5-置換ピリミジン(米国特許第4,665,077号明細書を参照されたい);非ステロイド系抗炎症薬(NSAID);ガンシクロビル、タクロリムス、コルチゾールまたはアルドステロンなどのグルココルチコイド、シクロオキシゲナーゼ阻害剤、5-リポキシゲナーゼ阻害剤、またはロイコトリエン受容体拮抗薬などの抗炎症剤;アザチオプリンまたはミコフェノール酸モフェチル(MMF)などのプリン拮抗薬;アルキル化剤、例えばシクロホスファミド;ブロモクリプチン;ダナゾール;ダプゾン;グルタルアルデヒド(これは、米国特許第5,290,654号に記載されているように、MHC抗原をマスクする。第4,120,649号);MHC抗原およびMHCフラグメントに対する抗イディオタイプ抗体;シクロスポリンA;ステロイド、例えば、コルチコステロイドまたは糖質コルチコステロイドまたは糖質コルチコイドアナログ、例えば、プレドニゾン、メチルプレドニゾロン、例えば、SOLU-MEDROL(登録商標)メチルプレドニゾロンコハク酸ナトリウムおよびデキサメタゾン;ジヒドロ葉酸レダクターゼ阻害剤、例えばメトトレキサート(経口または皮下);クロロキンおよびヒドロキシなどの抗マラリア剤;スルファサラジン;レフルノミド;抗インターフェロン-アルファ、-ベータ、または-ガンマ抗体、抗腫瘍壊死因子(TNF)-アルファ抗体(インフリキシマブ(REMICADE(登録商標))またはアダリムマブを含むサイトカインまたはサイトカイン受容体抗体、抗TNF-アルファ免疫アデシン(エタネルセプト)、抗TNF-β抗体、抗インターロイキン-2(IL-2)抗体および抗IL-2受容体抗体、および抗インターロイキン-6(IL-6)受容体抗体および拮抗薬(ACTEMRA(商標)トシリズマブ)など);抗CD11aおよび抗CD18抗体を含む、抗LFA-1抗体;抗L3T4抗体;異種抗リンパ球グロブリン;汎T抗体、好ましくは抗CD3または抗CD4/CD4a抗体;LFA-3結合ドメインを含む可溶性ペプチド(国際公開第90/08187号、1990年7月26日後悔);ストレプトキナーゼ;トランスフォーミング増殖因子ベータ(TGF-ベータ);ストレプトドーナーゼ;宿主由来のRNAまたはDNA;FK506;RS-61443;クロラムブシル;デオキシスパーグアリン;ラパマイシン;T細胞受容体(Cohen ら、米国特許第5,114,721号明細書);T細胞受容体断片(Offnerら、「Science」251:430~432頁(1991年);国際公開第90/11294号;Ianeway、「Nature」、341:482(1989年);および国際公開第91/01133号);BAFF抗体およびBR3抗体およびzTNF4アンタゴニストなどのBAFFアンタゴニスト(総説では、MackayおよびMackay、「Trends Immunol」、23:113~5頁(2002年)を参照されたい、また下記の定義も参照のこと);抗CD40受容体または抗CD40リガンド(CD154)などのT細胞ヘルパーシグナルを妨害する生物学的薬剤は、CD40-CD40リガンド(例えば、Durieら、「Science」261:1328~30頁(1993年);Mohanら、「J.Immunol」、154:1470~80頁(1995年))、およびCTLA4-Ig(Finckら、「Science」、265:1225~7頁(1994年));ならびにT細胞受容体抗体(EP340,109)、例えばT10B9が挙げられる。本明細書のいくつかの好ましい免疫抑制剤には、シクロホスファミド、クロラムブシル、アザチオプリン、レフルノミド、MMF、またはメトトレキサートが挙げられる。
本明細書で使用される場合、「治療」(およびその文法的な変形語、例えば、「治療する」または「治療すること」)は、治療される個体において本来の経過を変える試みにおける臨床的介入を指し、予防のために、または臨床病理の経過の間に行うことができる。治療の所望の効果としては、疾患の発症または再発を予防すること、症状の軽減、疾患の任意の直接的または間接的な病理学的結果の減弱、転移を予防すること、疾患進行率を低下させること、病状の寛解または緩和、および回復または改良された予後が挙げられる。いくつかの実施形態において、本明細書に記載さえる主題の抗体は、疾患の発症を遅延させるために、または疾患の進行を遅らせるために使用される。
1つまたは複数の他の薬物と「同時に」投与される薬物は、同一治療サイクル中、1つまたは複数の他の薬物と同じ治療日に、また必要に応じて1つまたは複数の他の薬物と同じ時間に投与される。例えば、3週間毎に付与される癌療法の場合、同時に投与される薬物はそれぞれ、3週間のサイクルの1日目に投与される。
薬剤、例えば、医薬製剤の「有効量」は、所望の治療結果または予防結果を達成するために必要な薬用量および所要期間で有効な量を指す。例えば、癌を治療するための有効量の薬物によって、癌細胞の数が低減し、腫瘍サイズが縮小し、抹消臓器への癌細胞浸潤が阻害され(すなわち、ある程度遅れる、好ましくは止まる)、腫瘍転移が阻害され(すなわち、ある程度遅れる、好ましくは止まる)、腫瘍成長がある程度阻害され、および/または癌と関連付けられる症状のうちの1つまたは複数がある程度緩和され得る。薬物が既存の癌細胞の成長を予防し、および/またはそれらを死滅させることができる程度まで、この薬物は、細胞増殖抑制性および/または細胞毒性であり得る。有効量によって、無進行生存率が上昇し(例えば、固体腫瘍の奏効評価基準(RECIST)もしくはCA-125変化によって測定される)、客観的奏効がもたらされ(部分奏効(PR)もしくは完全奏効(CR))がもたらされ、全生存期間が延長し、および/または癌の1つまたは複数の症状が改善される(例えば、FOSIによって評価される)。
本明細書で使用される場合、「治療有効量」という用語は、そのような量を受けていない対応する対象と比較して、疾患、障害、もしくは副作用の治療、または疾患もしくは障害の進行速度の低下をもたらす任意の量を意味する。この用語はまた、その範囲内に、正常な生理学的機能を増強するのに有効な量を含む。治療に使用するために、治療有効量のAb-CIDEおよびその塩を生の化学物質として投与することができる。加えて、有効成分は医薬組成物として提供され得る。
本明細書で使用される場合、特許請求の範囲で他に定義されない限り、「必要に応じて」という用語は、続いて記載される事象(複数の場合がある)が発生してもしなくてもよいことを意味し、発生する事象(複数の場合がある)と発生しない事象(複数の場合がある)の両方を含む。
本明細書で使用される場合、特に定義されない限り、「必要に応じて置換された」、「置換された」という語句またはそれらの変形は、1つまたは複数の置換基、例えば1、2または3の複数の置換度を含む必要に応じた置換を示す。この語句は、本明細書に記載および図示された置換と重複すると解釈されるべきではない。
「薬学的製剤」という用語は、調製物中に含有される活性成分の生物学的活性が有効になるような形態であり、および製剤が投与される対象にとって許容できないほど有毒である更なる構成成分を含有しない調製物を指す。
「薬学的に許容可能な賦形剤」とは、対象にとって無毒である活性成分以外の薬学的製剤中の成分を指す。薬学的に許容可能な賦形剤としては、緩衝液、担体、安定剤、または防腐剤が挙げられるが、これらに限定されない。
本明細書で使用する場合、語句「薬学的に許容可能な塩」とは、分子の薬学的に許容可能な有機または無機塩を意味する。代表的な塩としては、硫酸塩、クエン酸塩、酢酸塩、シュウ酸塩、塩化物、臭化物、ヨウ化物、硝酸塩、重硫酸塩、リン酸塩、酸性リン酸塩、イソニコチン酸塩、乳酸塩、サリチル酸塩、酸性クエン酸塩、酒石酸塩、オレイン酸塩、タンニン酸塩、パントテン酸塩、酒石酸水素塩、アスコルビン酸塩、コハク酸塩、マレイン酸塩、ゲンチジン酸塩、フマル酸塩、グルコン酸塩、グルクロン酸塩、糖酸塩、ギ酸塩、安息香酸塩、グルタミン酸塩、メタンスルホン酸塩、エタンスルホン酸塩、ベンゼンスルホン酸塩、p--トルエンスルホン酸塩、およびパモ酸塩(すなわち、1,1’-メチレン-ビス-(2-ヒドロキシ-3-ナフトエート))が挙げられるが、これらに限定されない。薬学的に許容可能な塩には、酢酸イオン、コハク酸イオンまたは他の対イオン等の、別の分子が含まれてもよい。対イオンは、親化合物の電荷を安定させる任意の有機または無機部位であってよい。さらに、薬学的に許容可能な塩は、その構造に1つを超える荷電原子を有してもよい。複数の荷電原子が薬学的に許容可能な塩の一部となっている例においては、複数の対イオンを有することができる。したがって、薬学的に許容可能な塩は、1つまたは複数の荷電原子および/または1つまたは複数の対イオンを有することができる。
薬学的に許容され得ない他の塩は、本明細書に記載の化合物の調製に有用であり得て、これらは主題のさらなる態様を形成すると見なされるべきである。シュウ酸塩またはトリフルオロ酢酸塩などのこれらの塩は、それ自体は薬学的に許容され得ないが、本明細書に記載の化合物およびそれらの薬学的に許容可能な塩を得る際の中間体として有用な塩の調製に有用であり得る。
本明細書で使用される場合、「複数」という用語は、2つ以上のコンジュゲートを指す。各コンジュゲートは、複数の中の任意の他のコンジュゲートと同じであっても異なっていてもよい。
「小分子」または「小分子化合物」は、一般に、サイズが約5キロダルトン(Kd)未満の有機分子を指す。いくつかの実施形態において、小分子は、約4Kd、3Kd、約2Kd、または約1Kd未満である。いくつかの実施形態において、小分子は、約800ダルトン(D)、約600D、約500D、約400D、約300D、約200D、または約100D未満である。いくつかの実施形態において、小分子は、約2000g/mol未満、約1500g/mol未満、約1000g/mol未満、約800g/mol未満、または約500g/mol未満である。いくつかの実施形態において、小分子は非ポリマーである。小分子は、タンパク質、ポリペプチド、オリゴペプチド、ペプチド、ポリヌクレオチド、オリゴヌクレオチド、多糖類、糖タンパク質、プロテオグリカンなどではない。小分子の誘導体とは、元の小分子と同じ構造コアを共有するが、元の小分子からの一連の化学反応によって調製できる分子を指す。
本明細書で使用される「アルキル」という用語は、1~12個のいずれかの長さの炭素原子(C~C12)の飽和した直鎖または分岐鎖の一価の炭化水素ラジカルを指し、アルキルラジカルは、必要に応じて、以下に記載する1つまたは複数の置換基で、独立して置換されていてもよい。別の実施形態において、アルキルラジカルは、1~8個の炭素原子(C~C)、または1~6個の炭素原子(C~C)である。アルキル基の例としては、限定されないが、メチルl(Me、-CH)、エチル(Et-CHCH)、1-プロピル(n-PR、n-プロピル、-CHCHCH)、2-プロピル(i-PR、i-プロピル、-CH(CH)、1-ブチル(n-Bu、n-ブチル、-CHCHCHCH)、2-メチル-1-プロピル(i-Bu、i-ブチル、-CHCH(CH)、2-ブチル(s-Bu、s-ブチル、-CH(CH)CHCH)、2-メチル-2-プロピル(t-Bu、t-ブチル-C(CH)、1-ペンチル(n-ペンチル、-CHCHCHCHCH)、2-ペンチル(-CH(CH)CHCHCH)、3-ペンチル(-CH(CHCH)、2-メチル-2-ブチル(-C(CHCHCH)、3-メチル-2-ブチル(-CH(CH)CH(CH)、3-メチル-1-ブチル(-CHCHCH(CH)、2-メチル-1-ブチル(-CHCH(CH)CHCH)、1-ヘキシル(-CHCHCHCHCHCH)、2-ヘキシル(-CH(CH)CHCHCHCH)、3-ヘキシル(-CH(CHCH)(CHCHCH))、2-メチル-2-ペンチル(-C(CHCHCHCH)、3-メチル-2-ペンチル(-CH(CH)CH(CH)CHCH)、4-メチル-2-ペンチル(-CH(CH)CHCH(CH)、3-メチル-3-ペンチル(-C(CH)(CHCH)、2-メチル-3-ペンチル(-CH(CHCH)CH(CH)、2,3-ジメチル-2-ブチル(-C(CHCH(CH)、3,3-ジメチル-2-ブチル(-CH(CH)C(CH、1-へプチル、1-オクチルなどが挙げられる。
本明細書で使用される「アルキレン」という用語は、1~12個の任意の長さの炭素原子(C~C12)の飽和した直鎖または分岐鎖の二価の炭化水素ラジカルを指し、アルキレンラジカルは、必要に応じて、以下に記載する1つまたは複数の置換基で、独立して置換されていてもよい。別の実施形態において、アルキレンラジカルは、1~8個の炭素原子(C~C)、または1~6個の炭素原子(C~C)である。アルキレン基としては、メチレン(-CH-)、エチレン(-CHCH-)、プロピレン(-CHCHCH-)などが挙げられるが、これらに限定されない。
「アルケニル」という用語は、少なくとも1つの不飽和部位、すなわち炭素-炭素sp二重結合を有する2~8個の炭素原子(C~C)の直鎖または分岐鎖の一価の炭化水素ラジカルを指し、アルケニルラジカルは、必要に応じて、本明細書に記載される1つまたは複数の置換基で、独立して置換されていてもよく、「シス」および「トランス」配向、またはあるいは「E」および「Z」配向を有するラジカルを含む。例としては、エチニレニルまたはビニル(-CH=CH)、アリル(-CHCH=CH)などが挙げられるが、これらに限定されない。
「アルケニレン」という用語は、少なくとも1つの不飽和部位、すなわち炭素-炭素sp二重結合を有する2~8個の炭素原子(C~C)の直鎖または分岐鎖の二価の炭化水素ラジカルを指し、アルケニレンラジカルは、必要に応じて、本明細書に記載される1つまたは複数の置換基で、独立して置換されていてもよく、「シス」および「トランス」配向、またはあるいは「E」および「Z」配向を有するラジカルを含む。例としては、エチニレンまたはビニレン(-CH=CH-)、アリル(-CHCH=CH-)などが挙げられるが、これらに限定されない。
「アルキニル」という用語は、少なくとも1つの不飽和部位、すなわち炭素-炭素sp三重結合を有する2~8個の任意の長さの炭素原子(C~C)の直鎖または分岐鎖の一価の炭化水素ラジカルを指し、アルキニルラジカルは、必要に応じて、本明細書に記載される1つまたは複数の置換基で、独立して置換されていてもよい。例としては、エチニル(-C≡CH)、プロピニル(プロパルギル、-CHC≡CH)などが挙げられるが、これらに限定されない
「アルキニレン」という用語は、少なくとも1つの不飽和部位、すなわち炭素-炭素sp三重結合を有する2~8個の任意の長さの炭素原子(C~C)の直鎖または分岐鎖の二価の炭化水素ラジカルを指し、アルキニレンラジカルは、必要に応じて、本明細書に記載される1つまたは複数の置換基で、独立して置換されていてもよい。例としては、エチレン(-C≡C-)、プロピニレン(プロパルギレン、-CHC≡C-)などが挙げられるが、これらに限定されない。
「炭素環」、「カルボシクリル」、「炭素環式環」、および「シクロアルキル」という用語は、単環式環として3~12個の炭素原子(C~C12)または二環式環として7~12個の炭素原子を有する一価の非芳香族の飽和したまたは部分的に不飽和の環を指す。7~12個の原子を有する二環式炭素環は、例えば、ビシクロ[4,5]、[5,5]、[5,6]、もしくは[6,6]系として配置することができ、9または10個の原子を有する二環式炭素環は、ビシクロ[5,6]または[6,6]系として、またはビシクロ[2.2.1]ヘプタン、ビシクロ[2.2.2]オクタン、およびビシクロ[3.2.2]ノナン等の架橋系として配置することができる。スピロ部分も本定義の範囲に含まれる。単環式炭素環の例としては、シクロプロピル、シクロブチル、シクロペンチル、1-シクロペント-1-エニル、1-シクロペント-2-エニル、1-シクロペント-3-エニル、シクロヘキシル、1-シクロヘキシ-1-エニル、1-シクロヘキシ-2-エニル、1-シクロヘキシ-3-エニル、シクロヘキサジエニル、シクロヘプチル、シクロオクチル、シクロノニル、シクロデシル、シクロウンデシル、シクロドデシル等が挙げられるが、これらに限定されない。カルボシクリル基は、必要に応じて、本明細書に記載される1つまたは複数の置換基で、独立して置換される。
「アリール」は、親の芳香環系の単一炭素原子から1個の水素原子を除去することにより導かれる6~20個の炭素原子(C~C20)の一価の芳香族炭化水素ラジカルを意味する。いくつかのアリール基は、例示的な構造において「Ar」として表される。アリールは、飽和、部分不飽和環、または芳香族炭素環式環に縮合した芳香環を含む二環式ラジカルを含む。典型的なアリール基としては、ベンゼン(フェニル)、置換ベンゼン、ナフタレン、アントラセン、ビフェニル、インデニル、インダニル、1,2-ジヒドロナフタレン、1,2,3,4-テトラヒドロナフチル等に由来するラジカルが挙げられるが、これらに限定されない。アリール基は、必要に応じて、本明細書に記載される1つまたは複数の置換基で、独立して置換される。
「アリーレン」は、親の芳香環系の2個の炭素原子から2個の水素原子を除去することにより導かれる6~20個の炭素原子(C~C20)の二価の芳香族炭化水素ラジカルを意味する。いくつかのアリーレン基は、例示的な構造において「Ar」として表される。アリーレンは、飽和、部分不飽和環、または芳香族炭素環式環に縮合した芳香環を含む二環式ラジカルを含む。典型的なアリーレン基としては、ベンゼン(フェニレン)、置換ベンゼン、ナフタレン、アントラセン、ビフェニレン、インデニレン、インダニレン、1,2-ジヒドロナフタレン、1,2,3,4-テトラヒドロナフチル等に由来するラジカルが挙げられるが、これらに限定されない。アリーレン基は、必要に応じて、本明細書に記載される1つまたは複数の置換基で置換される。
「複素環」、「複素環」、および「複素環式環」という用語は、本明細書において同義で用いられ、3~約20個の環原子の飽和または部分的に不飽和(すなわち1つまたは複数の二重および/または三重結合を環の中に有する)の炭素環式ラジカルを指し、少なくとも1つの環原子は、窒素、酸素、リン、および硫黄から選択されるヘテロ原子であり、残りの環原子はCであり、1つまたは複数の環原子は、必要に応じて、以下に記載される1つまたは複数の置換基で、独立して置換される。複素環は、3~7員環(2~6個の炭素原子ならびにN、O、P、およびSから選択される1~4個のヘテロ原子)の単環または7~10員環(4~9個の炭素原子ならびにN、O、P、およびSから選択される1~6個のヘテロ原子)の二環、例えば、ビシクロ[4,5]、[5,5]、[5,6]、または[6,6]系であってよい。複素環は、Paquette,Leo A;「Principles of Modern Heterocyclic Chemistry」(W.A.Benjamin、ニューヨーク、1968年)、特に第1、3、4、6、7、9章;「The Chemistry of Heterocyclic Compounds,A series of Monographs」(John Wiley&Sons、ニューヨーク、1950年から現在)、特に第13巻、第14巻、第16巻、第19巻、および第28巻;およびJ.Am.Chem.Soc.(1960)82:5566に記載されている。「複素環」は、複素環ラジカルが、飽和、部分的に不飽和の環、または芳香族炭素環式もしくは複素環式環と縮合したラジカルも含む。複素環式環としては、例えば、モルホリン-4-イル、ピペリジン-1-イル、ピペラジニル、ピペラジン-4-イル-2-オン、ピペラジン-4-イル-3-オン、ピロリジン-1-イル、チオモルホリン-4-イル、S-ジオキソチオモルホリン-4-イル、アゾカン-1-イル、アゼチジン-1-イル、オクタヒドロピリド[1,2-a]ピラジン-2-イル、[1,4]ジアゼパン-1-イル、ピロリジニル、テトラヒドロフラニル、ジヒドロフラニル、テトラヒドロチエニル、テトラヒドロピラニル、ジヒドロピラニル、テトラヒドロチオピラニル、ピペリジノ、モルホリノ、チオモルホリノ、チオキサニル、ピペラジニル、ホモピペラジニル、アゼチジニル、オキセタニル、チエタニル、ホモピペリジニル、オキセパニル、チエパニル、オキサゼピニル、ジアゼピニル、チアゼピニル、2-ピロリニル、3-ピロリニル、インドリニル、2H-ピラニル、4H-ピラニル、ジオキサニル、1,3-ジオキソラニル、ピラゾリニル、ジチアニル、ジチオラニル、ジヒドロピラニル、ジヒドロチエニル、ジヒドロフラニル、ピラゾリニルイミダゾリニル、イミダゾリニル、3-アザビシクロ[3.1.0]ヘキサニル、3-アザビシクロ[4.1.0]ヘプタニル、アザビシクロ[2.2.2]ヘキサニル、3H-インドリルキノリジニル、およびN-ピリジルウレアが挙げられるが、これらに限定されない。スピロ部分も本定義の範囲に含まれる。2つの環原子がオキソ(=O)部分で置換された複素環式基の例は、ピリミジノニルおよび1,1-ジオキソ-チオモルホリニルである。本明細書における複素環基は、必要に応じて、本明細書に記載される1つまたは複数の置換基で、独立して置換される。
「ヘテロアリール」という用語は、5、6、または7員環の一価の芳香族ラジカルを指し、窒素、酸素、および硫黄から独立して選択される1つまたは複数のヘテロ原子を含む5~20個の原子の縮合環系(その少なくとも1つは芳香族である)を含む。ヘテロアリール基の例は、ピリジニル(例えば2-ヒドロキシピリジニルを含む)、イミダゾリル、イミダゾピリジニル、1-メチル-1H-ベンゾ[d]イミダゾール、[1,2,4]トリアゾロ[1,5-a]ピリジン、ピリミジニル(例えば4-ヒドロキシピリミジニルを含む)、ピラゾリル、トリアゾリル、ピラジニル、テトラゾリル、フリル、チエニル、イソキサゾリル、チアゾリル、オキサジアゾリル、オキサゾリル、イソチアゾリル、ピロリル、キノリニル、イソキノリニル、テトラヒドロイソキノリニル、インドリル、ベンズイミダゾリル、ベンゾフラニル、シンノリニル、インダゾリル、インドリジニル、フタラジニル、ピリダジニル、トリアジニル、イソインドリル、プテリジニル、プリニル、オキサジアゾリル、チアジアゾリル、チアジアゾリル、フラザニル、ベンゾフラザニル、ベンゾチオフェニル、ベンゾチアゾリル、ベンゾオキサゾリル、キナゾリニル、キノキサリニル、ナフチリジニル、およびフロピリジニルである。ヘテロアリール基は、必要に応じて、本明細書に記載される1つまたは複数の置換基で、独立して置換される。
複素環またはヘテロアリール基は、可能であれば、炭素(炭素結合した)または窒素(窒素結合した)結合してもよい。例として、限定されないが、炭素結合した複素環またはヘテロアリールは、ピリジンの2、3、4、5、もしくは6位、ピリダジンの3、4、5、もしくは6位、ピリミジンの2、4、5、もしくは6位、ピラジンの2、3、5、もしくは6位、フラン、テトラヒドロフラン、チオフラン、チオフェン、ピロール、もしくはテトラヒドロピロールの2、3、4、もしくは5位、オキサゾール、イミダゾール、もしくはチアゾールの2、4、もしくは5位、イソキサゾール、ピラゾール、もしくはイソチアゾールの3、4、もしくは5位、アジリジンの2もしくは3位、アゼチジンの2、3、もしくは4位、キノリンの2、3、4、5、6、7、もしくは8位、またはイソキノリンの1、3、4、5、6、7、もしくは8位で結合される。
例として、限定されないが、窒素結合した複素環またはヘテロアリールは、アジリジン、アゼチジン、ピロール、ピロリジン、2-ピロリン、3-ピロリン、イミダゾール、イミダゾリジン、2-イミダゾリン、3-イミダゾリン、ピラゾール、ピラゾリン、2-ピラゾリン、3-ピラゾリン、ピペリジン、ピペラジン、インドール、インドリン、1H-インダゾールの1位、イソインドールまたはイソインドリンの2位、モルホリンの4位、およびカルバゾ-ルまたはβ-カルボリンの9位で結合される。
「キラル」という用語は、鏡像パートナーの重ね合わせできない特性を有する分子を指し、一方で「アキラル」という用語は、それらの鏡像パートナーと重ね合わせできる分子を指す。
「立体異性体」という用語は、同一の化学構成を有するが、空間内の原子または基の配置に関して異なる、化合物を指す。
「ジアステレオマー」は、2つ以上のキラル性の中心を有し、それらの分子が互いの鏡像でない、立体異性体を指す。ジアステレオマーは、例えば、融点、沸点、スペクトル特性、および反応性などの異なる物理特性を有する。ジアステレオマーの混合物は、電気泳動法およびクロマトグラフィー等の高分解能分析手順の下で分離されてもよい。
「鏡像異性体」は、互いに重ね合わせできない鏡像である、化合物の2つの立体異性体を指す。
本明細書で使用される立体化学的な定義および慣例は、一般的に、S.P.Parker編、「McGraw-Hill Dictionary of Chemical Terms」(1984年)、McGraw-Hill Book Company(ニューヨーク)およびEliel,E.およびWilen,S.、「Stereochemistry of Organic Compounds」(1994年)、John Wiley&Sons,Inc.ニューヨークに従う。多くの有機化合物は、光学的に活性な形態で存在する、すなわち、それらは、平面偏光の面を回転させる能力を有する。光学活性化合物を説明する際、接頭辞DおよびL、またはRおよびSは、そのキラル中心を中心とした分子の絶対配置を表すために使用される。接頭辞dおよびlまたは(+)および(-)は、化合物による平面偏光の回転の表示を指定するために用いられ、(-)または1は、化合物が左旋性であることを意味する。接頭辞が(+)またはdの化合物は、右旋性である。所与の化学構造について、これらの立体異性体は、互いに鏡像であることを除き、同一である。特定の立体異性体はまた、鏡像異性体とも称されることがあり、このような異性体の混合物は、鏡像異性体混合物としばしば呼ばれる。鏡像異性体の50:50混合物は、ラセミ混合物またはラセミ化合物と称され、これらは、化学的な反応またはプロセスにおいて立体選択または立体特異性がなかった場合に生じることができる。「ラセミ混合物」および「ラセミ化合物」という用語は、光学活性がない2つの鏡像異性体種の等モル混合物を指す。
本明細書における他の用語、定義および略語には、以下が含まれる。野生型(「WT」);システイン操作変形体抗体(「チオ」);軽鎖(「LC」);重鎖(「HC」);6-マレイミドカプロイル(「MC」);マレイミドプロパノイル(「MP」);バリン-シトルリン(「val-cit」または「vc」)、アラニン-フェニルアラニン(「ala-phe」)、p-アミノベンジル(「PAB」)およびp-アミノベンジルオキシカルボニル(「PABC」);A118C(EUナンバリング)=A121C(順次ナンバリング)=軽鎖の重鎖K149C(Kabatナンバリング)のA114C(Kabatナンバリング)。本明細書では、さらに追加の定義および略語が提供される。
II.化学的分解誘導物質
化学的分解誘発物質(CIDE)分子を抗体とコンジュゲートさせて「Ab-CIDE」コンジュゲートを形成することができる。抗体は、リンカー(L1)を介してCIDE(「D」)にコンジュゲートされ、CIDEは、ユビキチンE3リガーゼ結合基(groug)(「E3LB」)、リンカー(「L2」)およびタンパク質結合基(「PB」)を含む。Ab-CIDE分子の一般式は以下のとおりである:
Ab-(L1-D)
式中、Dは構造E3LB-L2-PBを有するCIDEであり;E3LBは、L2に共有結合したE3リガーゼ結合基であり;L2は、E3LBおよびPBに共有結合したリンカーであり;PBは、L2に共有結合したタンパク質結合基であり;Abは、L1に共有結合した抗体であり;L1は、AbおよびDに共有結合したリンカーであり;pは約1~約50の値を有する。変数pは、抗体が1つまたは複数のL1-D基に連結され得ることを反映する。一実施形態において、pは、1~8である。別の実施形態において、pは、約2である。
以下のセクションでは、Ab-CIDEを構成する成分について説明する。強力な効力および望ましい治療指数を有するAb-CIDEを得るために、以下の成分を提供する。
1.抗体(Ab)
本明細書に記載されるように、抗体、例えばモノクローナル抗体(mAb)を使用して、CIDEを標的細胞、例えば抗体によって標的化される特異的タンパク質を発現する細胞に送達する。Ab-CIDEの抗体部分は、抗原を発現する細胞を標的とすることができ、それによって抗原特異的Ab-CIDEは、典型的にはエンドサイトーシスによって標的細胞に細胞内送達される。細胞表面上に見出されない抗原に対する抗体を含むAb-CIDEは、細胞内へのCIDE部分のより特異性の低い細胞内送達をもたらし得るが、Ab-CIDEは依然として飲作用を受け得る。本明細書に記載されるAb-CIDEおよびそれらの使用方法は、細胞表面の抗体認識および/またはAb-CIDEのエンドサイトーシスを有利に利用して、細胞内のCIDE部分を送達する。
a.ヒト抗体
特定の実施形態において、本明細書に提供される抗体は、ヒト抗体である。ヒト抗体は、当該技術分野で既知の様々な技法を使用して産生され得る。ヒト抗体は通常、van Dijkおよびvan de Winkel、「Curr.Opin.Pharmacol.」、第5巻:第368~74頁(2001年)およびLonberg、「Curr.Opin.Immunol.」、第20巻:第450~459頁(2008年)に記載されている。
ヒト抗体は、免疫原を、インタクトなヒト抗体または抗原性チャレンジに応答してヒト可変領域を有するインタクト抗体を産生するように改変されたトランスジェニック動物に投与することによって調製されてもよい。かかる動物は、典型的には、内因性免疫グロブリン遺伝子座を置き換えるか、または染色体外に存在するか、もしくは動物の染色体にランダムに組み込まれるヒト免疫グロブリン遺伝子座の全てまたは一部を含有する。このようなトランスジェニックマウスにおいて、外因性免疫グロブリン遺伝子座は、一般的に不活性化されている。トランスジェニック動物からヒト抗体を得るための方法のレビューについては、Lonberg、「Nat.Biotech.」第23巻1117~1125頁(2005年)を参照されたい。また、例えば、XENOMOUSE(商標)技術を記載する米国特許第6,075,181号および同第6,150,584号;HuMab(登録商標)技術を記載する米国特許第5,770,429号;K-M MOUSE(登録商標)技術を記載する米国特許第7,041,870号;および、VelociMouse(登録商標)技術を記載する米国特許出願公開第2007/0061900号も参照されたい。かかる動物によって生成されたインタクトな抗体由来のヒト可変領域は、例えば、異なるヒト定常領域と組み合わせることによってさらに修飾され得る。
ヒト抗体は、ハイブリドーマに基づく方法によっても製造することができる。ヒトモノクローナル抗体を産生するためのヒト骨髄腫およびマウス-ヒト異種骨髄腫細胞株が記載されている。(例えば、Kozbor、「J.Immunol.」、第133巻3001頁(1984年);Brodeurら、「Monoclonal Antibody Production Techniques and Applications」、第51~63頁(Marcel Dekker,Inc.、ニューヨーク、1987年);およびBoernerら、「J.Immunol.」、第147巻86頁(1991年)を参照されたい。)ヒトB細胞ハイブリドーマ技術を介して生成されたヒト抗体もまた、Liら、「Proc.Natl.Acad.Sci.USA」第103巻3557~3562頁(2006年)に記載されている。さらなる方法は、例えば、米国特許第7,189,826号(ハイブリドーマ細胞株由来のモノクローナルヒトIgM抗体の産生を記載する)、およびNi、「Xiandai Mianyixue」、第26巻4号第265~268頁(2006年)(ヒト-ヒトハイブリドーマを記載する)を含む。ヒトハイブリドーマ技術(トリオーマ技術)はまた、Vollmers and Brandlein、「Histology and Histopathology」、第20巻、第3号:第927~937頁(2005年)およびVollmers and Brandlein、「Methods and Findings in Experimental and Clinical Pharmacology」、第27巻、第3号:第185~91頁(2005年)にも記載されている。
ヒト抗体は、ヒト由来のファージディスプレイライブラリから選択されるFvクローン可変ドメイン配列を単離することによって生成することもできる。その後、かかる可変ドメイン配列は、所望のヒト定常ドメインと組み合わせられ得る。抗体ライブラリからヒト抗体を選択するための技法が以下に記載されている。
b.ライブラリ由来抗体
Ab-CIDEで使用するための抗体は、コンビナトリアルライブラリを所望される活性(複数の場合がある)を有する抗体についてスクリーニングすることによって、単離することができる。例えば、ファージディスプレイライブラリを生成し、所望の結合特性を保有する抗体に関してかかるライブラリをスクリーニングするための様々な方法が当該技術分野で公知である。そのような方法については、例えば、Hoogenboomら、「Methods in Molecular Biology」第178巻1~37頁(O’Brienら編、Human Press、ニュージャージー州トトワ、2001年)で概説し、さらに下に記載されている:例えば、McCaffertyら、「Nature」第348巻552~554頁;Clacksonら、「Nature」第352巻624~628頁(1991年);Marksら、「J.Mol.Biol.」第222巻581~597頁(1992年);MarksおよびBradbury、「Methods in Molecular Biology」第248巻161~175頁(Loら、Human Press、ニュージャージー州トトワ、2003年);Sidhuら、「J.Mol.Biol.」第338巻2号第299~310頁(2004年);Leeら、「J.Mol.Biol.」第340巻5号1073~1093頁(2004年);Fellouse、「Proc.Natl.Acad.Sci.USA」第101巻34号第12467~12472頁(2004年);およびLeeら、「J.Immunol.Methods」第284巻1~2号第119~132頁(2004年)。
特定のファージディスプレイ方法において、VHおよびVL遺伝子のレパートリは、ポリメラーゼ連鎖反応(PCR)によって別々にクローニングされ、ファージライブラリ中でランダムに再結合され、次いで、Winterら、「Ann.Rev.Immunol.」第12巻433~455頁(1994年)に記載されているように抗原結合ファージのスクリーニングを行うことができる。ファージは、典型的には、一本鎖Fv(scFv)フラグメントとして、またはFabフラグメントとしてのいずれかで、抗体フラグメントを呈する。免疫化源からのライブラリは、ハイブリドーマを構築する必要なく、免疫原に対する高アフィニティ抗体を与える。あるいは、ナイーブレパートリーは、Griffithsら、「EMBO J」、第12巻:第725~734頁(1993年)によって記載されるように、(例えば、ヒトから)クローニングされて、いかなる免疫化も伴うことなく、広範囲の非自己抗原および自己抗原に対する単一抗体源を提供することができる。最後に、ナイーブライブラリは、幹細胞から再配列されていないV遺伝子セグメントをクローニングし、ランダムな配列を含むPCRプライマを使用して、非常に可変的なCDR3領域をコードし、HoogenboomおよびWinter、「J.Mol.Biol.」第227巻381~388頁(1992年)に記載されているように、インビトロで再配列を達成することによって、合成的に作製することもできる。ヒト抗体ファージライブラリを説明する特許公表物としては、例えば、以下のものが挙げられる:米国特許第5,750,373号、ならびに米国特許出願公開第2005/0079574号、同第2005/0119455号、同第2005/0266000号、同第2007/0117126号、同第2007/0160598号、同第2007/0237764号、同第2007/0292936号、および同第2009/0002360号が挙げられる。
ヒト抗体ライブラリから単離された抗体または抗体断片は、本明細書においてヒト抗体またはヒト抗体断片と見なされる。
c.キメラ抗体およびヒト化抗体
特定の実施形態において、本明細書に提供される抗体は、キメラ抗体である。特定のキメラ抗体は、例えば、米国特許第4,816,567号;およびMorrisonら、「Proc.Natl.Acad.Sci.USA」第81巻6851~6855頁(1984年))に記載されている。一つの例では、キメラ抗体は、非ヒト可変領域(例えば、マウス、ラット、ハムスター、ウサギ、またはサルなどの非ヒト霊長類に由来する可変領域)とヒト定常領域を含む。さらなる例では、キメラ抗体は、クラスまたはサブクラスが親抗体のそれらから変更されている「クラススイッチ」抗体である。キメラ抗体は、その抗原結合断片を含む。
特定の実施形態において、キメラ抗体はヒト化抗体である。典型的には、非ヒト抗体は、ヒトに対する免疫原性を低減する一方で、親非ヒト抗体の特異性および親和性は保持するようにヒト化される。通常、ヒト化抗体は、HVR、例えばCDR(またはその一部)が非ヒト抗体に由来する1つまたは複数の可変ドメインを含み、FR(またはその一部)はヒト抗体配列に由来する。ヒト化抗体は、必要に応じて、ヒト定常領域の少なくとも一部も含む。いくつかの実施形態において、ヒト化抗体中のいくつかのFR残基は、例えば、抗体特異性または親和性を復元または改善するために、非ヒト抗体(例えば、HVR残基が由来する抗体)由来の対応する残基で置換される。
ヒト化された抗体およびその作製方法については、例えば、AlmagroおよびFransson、「Front.Biosci.」13:1619~1633頁(2008年)に総説があり、さらに以下に記載されている:例えば、Riechmannら、「Nature」、332:323~329頁(1988年);Queenら、「Proc.Nat’l Acad.Sci.USA」、86:10029~10033頁(1989年);米国特許第5,821,337号、第7,527,791号、第6,982,321号および第7,087,409号;Kashmiriら、「Methods」36:25~34頁(2005年)(特異性決定領域(CDR)グラフト化を記載);Padlan、「Mol.Immunol.」、28:489~498頁(1991年)(「リサーフェシング」について記載);Dall’Acquaら、「Methods」、36:43~60頁(2005年)(「FRシャッフル」について記載);ならびにOsbournら、「Methods」、36:61~68頁(2005年)、およびKlimkaら、「Br.J.Cancer」、83:252~260頁(2000年)(FRシャッフルの「ガイド付き選択アプローチを記載)。
ヒト化に使用可能なフレームワーク領域としては、限定されないが、「ベストフィット」法を用いて選択されるフレームワーク領域(例えば、Simsら、「J.Immunol.」、151巻:2296頁(1993年)を参照されたい);軽鎖または重鎖可変領域の特定のサブグループのヒト抗体のコンセンサス配列から誘導されるフレームワーク領域(例えば、Carterら、「Proc.Natl.Acad.Sci.USA」、89巻:4285頁(1992年);およびPrestaら、「J.Immunol.」、151巻:2623頁(1993年)を参照されたい);ヒト成熟(体細胞性変異を受けた)フレームワーク領域またはヒト生殖系フレームワーク領域(例えば、Almagro and Fransson、「Front.Biosci.」、13巻:1619~1633頁(2008年)を参照されたい);ならびに、FRライブラリのスクリーニングから誘導されるフレームワーク領域(例えば、Bacaら、「J.Biol.Chem.」、272巻:10678~10684頁(1997年)および、Rosokら、「J.Biol.Chem.」、271巻:22611~22618頁(1996年)を参照されたい)が挙げられる。
d.多重特異性抗体
特定の実施形態において、本明細書で提供される抗体は、多重特異性抗体、例えば、二重特異性抗体である。本明細書で使用される「多重特異性抗体」という用語は、多重エピトープ特異性を有する(すなわち、1つの生物学的分子上の2つもしくはそれ以上の異なるエピトープに結合することができるか、または2つもしくはそれ以上の異なる分子上のエピトープに結合することができる)抗原結合ドメインを含む抗体を網羅する。
いくつかの実施形態において、多重特異性抗体は、少なくとも2つの異なる抗原結合部位(二重特異性抗体など)に対する結合特異性を有するモノクローナル抗体である。いくつかの実施形態において、多重特異的抗体の第1の抗原結合ドメインおよび第2の抗原結合ドメインは、1つかつ同一の分子内の2つのエピトープを結合してもよい(分子内結合)。例えば、多重特異的抗体の第1の抗原結合ドメインおよび第2の抗原結合ドメインは、同じタンパク質分子上の2つの異なるエピトープに結合してもよい。特定の実施形態において、多重特異的抗体が結合する2つの異なるエピトープは、通常1つの単一特異性抗体(例えば、従来の抗体など)または1つの免疫グロブリンの単一可変ドメインに同時には結合しないエピトープである。いくつかの実施形態において、多重特異的抗体の第1の抗原結合ドメインおよび第2の抗原結合ドメインは、2つの別個の分子内に位置するエピトープに結合してもよい(分子内結合)。例えば、多重特異性抗体の第1の抗原結合ドメインは、1つのタンパク質分子上の1つのエピトープに結合し得るが、多重特異性抗体の第2の抗原結合ドメインは、異なるタンパク質分子上の別のエピトープに結合し、それによって2つの分子を架橋し得る。
いくつかの実施形態において、多重特異性抗体(二重特異性抗体など)の抗原結合ドメインは、2つのVH/VL単位を含み、第1のVH/VL単位は、第1のエピトープに結合し、第2のVH/VL単位は、第2のエピトープに結合し、各VH/VL単位は、重鎖可変ドメイン(VH)および軽鎖可変ドメイン(VL)を含む。そのような多重特異性抗体としては、完全長抗体、2つ以上のVLおよびVHドメインを有する抗体、および抗体断片(共有結合的または非共有結合的に連結されているFab、Fv、dsFv、scFv、ダイアボディ、二重特異性ダイアボディ、およびトリアボディなど)が挙げられるが、これらに限定されない。重鎖可変領域の少なくとも一部分および/または軽鎖可変領域の少なくとも一部分をさらに含むVH/VL単位はまた、「アーム」または「ヘミマー」または「半抗体」とも称され得る。いくつかの実施形態において、ヘミマーは、第2のヘミマーとの分子内ジスルフィド結合が形成されることを可能にするのに十分な重鎖可変領域の一部分を含む。いくつかの実施形態において、ヘミマーは、例えば、相補的ホール変異またはノブ変異を含む第2のヘミマーまたは半抗体とのヘテロ二量体化を可能にする、ノブ変異またはホール変異を含む。ノブ変異およびホール変異は、以下でさらに論じられる。
特定の実施形態において、本明細書に提供される多重特異性抗体は、二重特異性抗体であり得る。本明細書で使用される「二重特異性抗体」という用語は、1つの分子上の2つの異なるエピトープに結合することができるか、または2つの異なる分子上のエピトープに結合することができる抗原結合ドメインを含む多重特異性抗体を指す。二重特異性抗体はまた、本明細書において、「二重特異性」を有するもの、または「二重特異性」であるとも称される。例示的な二重特異性抗体は、タンパク質および任意の他の抗原の両方に結合し得る。特定の実施形態において、結合特異性のうちの一方は、タンパク質に対するものであり、他方はCD3に対するものである。例えば、米国特許第5,821,337号を参照されたい。特定の実施形態において、二重特異性抗体は、同じタンパク質分子の2つの異なるエピトープに結合し得る。特定の実施形態において、二重特異性抗体は、2つの異なるタンパク質分子に対する2つの異なるエピトープに結合し得る。二重特異性抗体を使用して、タンパク質を発現する細胞に細胞毒性薬剤を局在化することもできる。二重特異性抗体は、完全長抗体または抗体断片として調製され得る。
多重特異性抗体を作製するための技法には、異なる特異性を有する2つの免疫グロブリン重鎖-軽鎖対の組み換え共発現が含まれるが、これらに限定されない(MilsteinおよびCuello、「Nature」305:537(1983年)、国際公開第93/08829号、ならびにTrauneckerら「EMBO J.」10:3655(1991年)を参照のこと)、および「ノブ・イン・ホール」操作(例えば、米国特許第5,731,168号を参照のこと)、国際公開第2009/089004号、米国特許出願公開第2009/0182127号、同第2011/0287009号、MarvinおよびZhu、「Acta Pharmacol.Sin.」(2005年)26(6):649~658頁、ならびにKontermann(2005年)「Acta Pharmacol.Sin.」、26:1~9頁)。本明細書で使用される場合、「ノブイントゥホール」または「KnH」技術という用語は、2つのポリペプチドを、それらが相互作用する界面で一方のポリペプチドに隆起(ノブ)を導入し、他方のポリペプチドに空洞(ホール)を導入することによって、インビトロまたはインビボでの対合を指向する技術を指す。例えば、KnHは、抗体のFc:Fc結合界面、CL:CH1界面、またはVH/VL界面に導入されている(例えば、米国特許出願公開第2011/0287009号、米国特許出願公開第2007/0178552号、国際公開第96/027011号、国際公開第98/050431号、Zhuら、1997年、「Protein Science」6:781~788頁、および国際公開第2012/106587号を参照のこと)。いくつかの実施形態において、KnHにより、多重特異性抗体の製造中に2つの異なる重鎖の対合が駆動される。例えば、それらのFc領域内にKnHを有する多重特異性抗体は、各Fc領域に連結された単一可変ドメインをさらに含み得るか、または類似のもしくは異なる軽鎖可変ドメインと対合する異なる重鎖可変ドメインをさらに含み得る。KnH技術を使用して、2つの異なる受容体細胞外ドメインをともに、または異なる標的認識配列を含む(例えば、アフィボディ、ペプチボディ、および他のFc融合を含む)任意の他のポリペプチド配列を対合させることもできる。
本明細書で使用される「ノブ変異」という用語は、ポリペプチドが別のポリペプチドと相互作用する界面で隆起(ノブ)をポリペプチドに導入する突然変異を指す。いくつかの実施形態において、他のポリペプチドは、ホール突然変異を有する。
本明細書で使用される「ホール変異」という用語は、ポリペプチドが別のポリペプチドと相互作用する界面で空洞(ホール)をポリペプチドに導入する突然変異を指す。いくつかの実施形態において、他のポリペプチドは、ノブ突然変異を有する。
「隆起」は、第1のポリペプチドの界面から突出し、したがって、隣接界面(すなわち、第2のポリペプチドの界面)の補償空洞内に位置付け可能となることで、例えば、ヘテロ多量体を安定させ、それによりホモ多量体形成よりもヘテロ多量体形成が好都合になる、少なくとも1つのアミノ酸側鎖を指す。隆起は、元の界面に存在し得るか、または合成的に(例えば、界面をコードする核酸を改変することによって)導入され得る。いくつかの実施形態において、第1のポリペプチドの界面をコードする核酸は、突起をコードするように変化する。これを達成するために、第1のポリペプチドの界面の少なくとも1つの「元の」アミノ酸残基をコードする核酸が、元のアミノ酸残基よりも大きい側鎖体積を有する少なくとも1つの「移入」アミノ酸残基をコードする核酸で置き換えられる。1つを超える元の残基および対応する移入残基が存在し得ることが理解される。様々なアミノ残基の側鎖体積は、例えば、米国特許出願公開第2011/0287009号の表1に示される。「突起」を導入する突然変異は、「ノブ突然変異」と称され得る。
いくつかの実施形態において、隆起の形成のための移入残基は、アルギニン(R)、フェニルアラニン(F)、チロシン(Y)、およびトリプトファン(W)から選択される天然に存在するアミノ酸残基である。いくつかの実施形態において、移入残基は、トリプトファンまたはチロシンである。いくつかの実施形態において、アラニン、アスパラギン、アスパラギン酸、グリシン、セリン、トレオニン、またはバリンなどの隆起の形成のための元の残基は、小さい側鎖体積を有する。
「空洞」は、第2のポリペプチドの界面から凹んでおり、したがって、隣接する第1のポリペプチドの界面上の対応する隆起を収容する少なくとも1つのアミノ酸側鎖を指す。空洞は、元の界面に存在し得るか、または合成的に(例えば、界面をコードする核酸を改変することによって)導入され得る。いくつかの実施形態において、第2のポリペプチドの界面をコードする核酸は、空洞をコードするように変化する。これを達成するために、第2のポリペプチドの界面の少なくとも1つの「元の」アミノ酸残基をコードする核酸が、元のアミノ酸残基よりも小さい側鎖体積を有する少なくとも1つの「移入」アミノ酸残基をコードするDNAで置き換えられる。1つを超える元の残基および対応する移入残基が存在し得ることが理解される。いくつかの実施形態において、空洞の形成のための移入残基は、アラニン(A)、セリン(S)、トレオニン(T)、およびバリン(V)から選択される天然に存在するアミノ酸残基である。いくつかの実施形態において、移入残基は、セリン、アラニン、またはトレオニンである。いくつかの実施形態において、チロシン、アルギニン、フェニルアラニン、またはトリプトファンなどの空洞の形成のための元の残基は、大きい側鎖体積を有する。「空洞」を導入する変異は、「ホール変異」と称され得る。
隆起は、空洞内で「位置付け可能」であり、これは、それぞれ、第1のポリペプチドおよび第2のポリペプチドの界面の隆起および空洞の空間的位置、ならびに隆起および空洞の大きさが、界面での第1のポリペプチドと第2のポリペプチドとの正常な会合を著しく乱すことなく隆起が空洞内に位置し得るようなものであることを意味する。Tyr、Phe、およびTrpなどの隆起は典型的には、界面の軸から垂直には延びず、好ましい立体構造を有さず、隆起と対応する空洞との整列は、場合によっては、X線結晶学または核磁気共鳴(NMR)によって得られるものなどの三次元構造に基づいて隆起/空洞の対をモデル化することに依存し得る。これは、当該技術分野で広く受け入れられている技術を使用して達成され得る。
いくつかの実施形態において、IgG1定常領域内のノブ突然変異は、T366W(EU番号付け)である。いくつかの実施形態において、IgG1定常領域内のホール突然変異は、T366S、L368A、およびY407V(EU番号付け)から選択される1つまたは複数の突然変異を含む。いくつかの実施形態において、IgG1定常領域内のホール突然変異は、T366S、L368A、およびY407V(EU番号付け)を含む。
いくつかの実施形態において、IgG4定常領域内のノブ突然変異は、T366W(EU番号付け)である。いくつかの実施形態において、IgG4定常領域内のホール突然変異は、T366S、L368A、およびY407V(EU番号付け)から選択される1つまたは複数の突然変異を含む。いくつかの実施形態において、IgG4定常領域内のホール突然変異は、T366S、L368A、およびY407V(EU番号付け)を含む。
多重特異性抗体は、抗体Fc-ヘテロ二量体分子を作製するための静電気ステアリング(electrostatic steering)作用の操作(国際公開第2009/089004号A1);2つ以上の抗体または断片の架橋(例えば、米国特許第4,676,980号、およびBrennanら、「Science」、229:81(1985年)を参照されたい);二重特異性抗体を産生するためのロイシンジッパーの使用(例えば、Kostelnyら、「J.Immunol.」、148(5):1547~1553頁(1992年)を参照されたい);二重特異性抗体断片を作製するための「ダイアボディ」技術の使用(例えば、Hollingerら、「Proc.Natl.Acad.Sci.USA」、90:6444~6448頁(1993年));ならびに単鎖Fv(sFv)二量体の使用(例えば、Gruber et al.,J.Immunol.,152:5368(1994)を参照されたい);ならびに、例えば、Tuttら、「J.Immunol.」147:60(1991年)に記載されるように作ることができる。
「オクトパス抗体」または「二重可変ドメイン免疫グロブリン」(DVD)を含む、3つ以上の機能的抗原結合部位を有する操作された抗体もまた、本明細書に含まれる(例えば、米国特許出願公開第2006/0025576号A1、およびWuら、「Nature Biotechnology」(2007年))。本明細書の抗体または断片には、標的タンパク質ならびに別の異なる抗原に結合する抗原結合部位を含む「二重作用(Dual Acting)FAb」または「DAF」も含まれる(例えば、US2008/0069820を参照されたい)。
e.抗体断片
特定の実施形態において、本明細書に提供される抗体は、抗体断片である。抗体断片としては、Fab、Fab’、Fab’-SH、F(ab’)、Fv、およびscFv断片、ならびに以下に記載する他の断片が挙げられるがこれらに限定されない。特定の抗体断片のレビューとしては、Hudsonら、「Nat.Med.」第9巻129~134頁(2003年)を参照されたい。scFv断片の総説に関して、例えばPluckthun、「The Pharmacology of Monoclonal Antibodies」中、第113巻、RosenburgおよびMoore編(Springer-Verlag、ニューヨーク)、第269~315頁(1994年)を参照されたい;また、国際公開第WO93/16185号を参照されたい米国特許第5,571,894号および同第5,587,458号も参照されたい。サルベージ受容体結合エピトープ残基を含み、in vivoでの半減期が長くなったFabおよびF(ab’)断片の説明については、米国特許第5,869,046号を参照。
ダイアボディとは、二価または二重特異性であることができる、2つの抗原結合部位を有する抗体断片である。例えば、欧州特許第404,097号、国際公開第WO1993/01161号、Hudsonら、「Nat.Med.」第9巻129~134頁(2003年)、およびHollingerら、「Proc.Natl.Acad.Sci.USA」第90巻6444~6448頁(1993年)を参照されたい。三重特異性抗体および四重特異性抗体については、Hudsonら、「Nat.Med.」第9巻129~134頁(2003年)にもまた記載されている。
シングルドメイン抗体は、抗体の重鎖可変ドメインの全てまたは一部または軽鎖可変ドメインの全てまたは一部を含む抗体フラグメントである。特定の実施形態において、単一ドメイン抗体は、ヒト単一ドメイン抗体である(Domantis,Inc.、マサチューセッツ州ウォルサム;例えば、米国特許第6,248,516号B1を参照)。
抗体断片は、本明細書に記載されているように、インタクト抗体のタンパク質分解消化、および組み換え宿主細胞(例えば、大腸菌またはファージ)による生産を含むがこれらに限定されない様々な技術によって作製することができる。
f.抗体変異体
特定の実施形態において、本明細書に提供される抗体のアミノ酸配列変異形が企図される。例えば、抗体の結合親和性および/または他の生物学的特性を改善することが望ましくあり得る。抗体のアミノ酸配列変異体は、抗体をコードするヌクレオチド配列中に適正な修飾を導入することによって、またはペプチド合成によって調製されてもよい。このような改変としては、例えば、抗体のアミノ酸配列内の残基からの欠失、および/または抗体のアミノ酸配列内の残基への挿入、および/または抗体のアミノ酸配列内の残基の置換が挙げられる。最終構築物に到達するために欠失、挿入、および置換を任意に組み合わせることができるが、但し、その最終構築物が所望の特性、例えば、抗原結合を保有することを条件とする。
g.組み換え方法および組成物
抗体は、例えば、米国特許第4,816,567号に記載される組み換え法および組成物を使用して生成されてもよい。一実施形態において、本明細書に記載される抗体をコードする単離核酸が提供される。そのような核酸は、抗体のVLを含むアミノ酸配列および/またはVHを含むアミノ酸配列(例えば、抗体の軽鎖および/または重鎖)をコードすることができる。さらなる実施形態において、そのような核酸を含む1つまたは複数のベクター(例えば、発現ベクター)が提供される。さらなる実施形態において、そのような核酸を含む宿主細胞が提供される。そのような一実施形態において、宿主細胞は、以下を含む(例えば、以下を用いて形質転換されている):(1)抗体のVLを含むアミノ酸配列および抗体のVHを含むアミノ酸配列をコードする核酸を含むベクター、または(2)抗体のVLを含むアミノ酸配列をコードする核酸を含む第1のベクター、および抗体のVHを含むアミノ酸配列をコードする核酸を含む第2のベクターを含み得る(例えば、これらで形質転換されている)。一実施形態において、宿主細胞は、真核細胞、例えば、チャイニーズハムスター卵巣(CHO)細胞またはリンパ球細胞(例えば、Y0、NS0、Sp20細胞)である。一実施形態において、抗体の作製方法が提供され、本方法は、上述される抗体をコードする核酸を含む宿主細胞を、抗体の発現に好適な条件下で培養することと、任意で、抗体を宿主細胞(または宿主細胞培養培地)から回収することとを含む。
抗体の組み換え産生に関しては、例えば、上述の抗体をコードする核酸が単離され、宿主細胞内でのさらなるクローニングおよび/または発現のために、1つまたは複数のベクター中に挿入される。そのような核酸は、従来の手順を使用して(例えば、抗体の重鎖および軽鎖をコードする遺伝子に特異的に結合することができるオリゴヌクレオチドプローブを使用することによって)、容易に単離し、配列決定することができる。
抗体をコードするベクターのクローニングまたは発現に好適な宿主細胞は、本明細書に記載の原核生物細胞または真核生物細胞を含む。例えば、抗体は、特に、グリコシル化およびエフェクター機能が必要とされていない場合には、細菌中で産生されてもよい。バクテリアにおける抗体断片およびポリペプチドの発現については、例えば、米国特許第5,648,237号、第5,789,199号、および第5,840,523号を参照されたい。(Charlton,「Methods in Molecular Biology」、248(E.coliにおける抗体断片の発現を記載するもB.K.C.Lo,ed.,Humana Press、ニュージャージー州トトワ、2003年)、245~254頁参照されたい)発現後、抗体は、可溶性画分中で細菌細胞ペーストから単離され得、さらに精製され得る。
原核生物に加え、真核生物の微生物、例えば、糸状菌または酵母は、抗体をコードするベクターに適切なクローニングまたは発現の宿主であり、グリコシル化経路が「ヒト化」された真菌株および酵母株を含み、部分的または完全にヒトグリコシル化パターンを有する抗体を産生する。Gerngross「Nat.Biotech.」22:1409~1414頁(2004年)、およびLiら「Nat.Biotech.」24:210~215頁(2006年)を参照されたい。
グリコシル化抗体の発現に好適な宿主細胞は、多細胞生物(無脊椎動物および脊椎動物)からも得られる。無脊椎動物細胞の例としては、植物細胞および昆虫細胞が挙げられる。数多くのバキュロウイルス株が同定されており、特に、Spodoptera frugiperda細胞のトランスフェクションのために、これを昆虫細胞と組み合わせて使用してもよい。
植物細胞培養物も、宿主として利用することができる。例えば、米国特許第5,959,177号、同第6,040,498号、同第6,420,548号、同第7,125,978号、および同第6,417,429号(トランスジェニック植物で抗体を産生するためのPLANTIBODIES(商標)技術を記載している)を参照されたい。
脊椎動物細胞も、宿主として使用されてもよい。例えば、懸濁物中で成長するように適合した哺乳動物細胞株が有用な場合がある。有用な哺乳動物宿主細胞株の非限定的な例は、SV40(COS-7)によって形質転換されたサル腎臓CV1株;ヒト胎児性腎株(例えば、Grahamら、「J.Gen Virol.」、36巻:59頁(1977年)に記載される293または293細胞);ベビーハムスター腎細胞(baby hamster kidney cell:BHK);マウスセルトリ細胞(例えば、Mather、「Biol.Reprod.」、23巻:243~251頁(1980年)に記載されるTM4細胞;サル腎細胞(CV1);アフリカミドリザル腎細胞(VERO-76);ヒト子宮頸癌細胞(HELA);イヌ腎細胞(MDCK);バッファロラット肝細胞(BRL 3A);ヒト肺細胞(W138);ヒト肝細胞(Hep G2);マウス乳癌(MMT 060562);TRI細胞、例えばMatherら、「Annals N.Y.Acad.Sci」383:44~68頁(1982年);MRC 5細胞;ならびにFS4細胞である。他の有用な哺乳動物宿主細胞株としては、DHFR-CHO細胞(Urlaubら、「Proc.Natl.Acad.Sci.USA」、第77巻:第4216頁(1980年))を含むチャイニーズハムスター卵巣(CHO)細胞、ならびにY0、NS0、およびSp2/0などの骨髄腫細胞株が挙げられる。抗体産生に適した特定の哺乳類宿主細胞株の総説に関して、例えば、YazakiおよびWu、「Methods in Molecular Biology」、248巻(B.K.C.Lo,ed.,Human APress、ニュージャージー州トトワ)255~268頁(2003年)を参照されたい。
ここで抗体親和性に関して、実施形態において、抗体は、(1)~(53)から選択される1つまたは複数の腫瘍関連抗原または細胞表面受容体に結合する:
(1)BMPR1B(骨形成タンパク質受容体IB型、Genbankアクセション番号NM_001203)
ten Dijke,P.ら、「Science」264(5155):101~104頁(1994年)、「Oncogene」14(11):1377~1382頁(1997年))、国際公開第2004063362号(請求項2)、国際公開第2003042661号(請求項12)、米国特許出願公開第2003134790号A1(38~39頁)、国際公開第2002102235(請求項13、296頁)、国際公開第2003055443号(91~92頁)、国際公開第200299122号(実施例2、528~530頁)、国際公開第2003029421号(請求項6)、国際公開第2003024392号(請求項2、図112)、国際公開第200298358号(請求項1、183頁)、WO200254940(100~101頁)、国際公開第200259377号(349~350頁)、国際公開第200230268号(請求項27、376頁)、国際公開第200148204(実施例、図4)
NP_001194骨形成タンパク質受容体、IB型/pid=NP_001194.1-
相互参照:MIM:603248;NP_001194.1;AY065994
(2)E16(LAT1、SLC7A5、Genbank受託番号NM_003486)
「Biochem.Biophys.Res.Commun.」255(2)、283~288頁(1999年)、「Nature」395(6699):288~291頁(1998年)、Gaugitsch,H.W.ら、(1992年)「J.Biol.Chem.」267(16):11267~11273頁);国際公開第2004048938号(実施例2);国際公開第2004032842号(実施例IV);国際公開第2003042661号(請求項12);国際公開第2003016475号(請求項1);国際公開第200278524号(実施例2);国際公開第200299074号(請求項19;127~129頁);国際公開第200286443号(請求項27;222頁,393頁);国際公開第2003003906号(請求項10;293頁);国際公開第200264798号(請求項33;93~95頁);国際公開第200014228号(請求項5;133~136頁);米国特許出願公開第2003224454号(図3);国際公開第2003025138号(請求項12;150頁);
NP_003477溶質担体ファミリー7(カチオン性アミノ酸輸送体、y+
システム)、メンバー5/pid=NP_003477.3-ホモサピエンス
相互参照:MIM:600182;NP_003477.3;NM_015923;NM_003486_1
(3)STEAP1(前立腺の6回膜貫通上皮抗原、Genbank受託番号NM_012449)
「Cancer Res.」61(15)、5857~5860頁(2001年)、Hubert,R.S.ら(1999年)「Proc.Natl.Acad.Sci.U.S.A.」96(25):14523~14528年);国際公開第2004065577号(請求項6);国際公開第2004027049号(図1L);欧州特許第1394274号(実施例11);国際公開第2004016225号(請求項2);国際公開第2003042661号(請求項12);米国特許出願公開第2003157089号(実施例5);米国特許出願公開第2003185830(実施例5);米国特許出願公開第2003064397号(図2);国際公開第200289747号(実施例5;618~619頁);国際公開第2003022995号(実施例9;図13A、実施例53;173頁、実施例2;図2A);
NP_036581 前立腺の6回膜貫通上皮抗原
相互参照:MIM:604415;NP_036581.1;NM_012449_1
(4)0772P(CA125、MUC16、Genbank受託番号AF361486)
「J.Biol.Chem.」276(29):27371~27375頁(2001年));国際公開第2004045553号(請求項14);国際公開第200292836号(請求項6;図12);国際公開第200283866号(請求項15;116~121頁);米国特許出願公開第2003124140号(実施例16);米国特許出願公開第798959.相互参照:GI:34501467;AAK74120.3;AF361486_1
(5)MPF(MPF、MSLN、SMR、巨核球増強因子、メソテリン、Genbank受託番号NM_005823)Yamaguchi,N.ら「Biol.Chem.」269(2)、805~808頁(1994年)、「Proc.Natl.Acad.Sci.U.S.A.」96(20):11531~11536頁(1999年)、「Proc.Natl.Acad.Sci.U.S.A.」93(1):136~140頁(1996年)、「J.Biol.Chem.」270(37):21984~21990頁(1995年));国際公開第2003101283号(請求項14);(国際公開第2002102235号(請求項13;287~288頁);国際公開第2002101075号(請求項4;308~309頁);国際公開第200271928号(320~321頁);国際公開第9410312号(52~57頁);相互参照:MIM:601051;NP_005814.2;NM_005823_1
(6)Napi2b(Napi3b、NAPI-3B、NPTIIb、SLC34A2、溶質輸送体ファミリー34(リン酸ナトリウム)、メンバー2、II型ナトリウム依存性リン酸輸送体3b、Genbank受託番号NM_006424)
J.Biol.Chem.277(22):19665~19672頁(2002年),「Genomics」62(2):281~284頁(1999年),Feild,J.A.ら(1999年)「Biochem.Biophys.Res.Commun.」258(3):578~582頁);国際公開第2004022778号(請求項2);欧州特許第1394274号(実施例11);国際公開第2002102235号(請求項13;326頁);欧州特許第875569号(請求項1;17~19頁);国際公開第200157188号(請求項20;329頁);国際公開第2004032842号(実施例IV);国際公開第200175177号(請求項24;139~140頁);
相互参照:MIM:604217;NP_006415.1;NM_006424_1
(7)Sema 5b(FLJ10372、KIAA1445、Mm.42015、SEMA5B、SEMAG、セマフォリン5b Hlog、セマドメイン、7回トロンボスポンジン反復(1型および1型様)、膜貫通ドメイン(TM)、および短い細胞質ドメイン、(セマフォリン)5B、Genbank受託番号AB040878)
Nagase T.ら(2000年)「DNA Res.」7(2):143~150頁)、国際公開第2004000997号(請求項1)、国際公開第2003003984号(請求項1)、国際公開第200206339号(請求項1、50頁)、国際公開第200188133号(請求項1、41~43、48~58頁)、国際公開第2003054152号(請求項20)、国際公開第2003101400号(請求項11)、
受託:Q9P283;EMBL;AB040878;BAA95969.1.Genew;HGNC:10737;
(8)PSCA hlg(2700050C12Rik、C530008O16Rik、RIKEN cDNA 2700050C12、RIKEN cDNA 2700050C12遺伝子、Genbank受託番号AY358628);Rossら(2002年)「Cancer Res.」62:2546~2553年;米国特許出願公開第2003129192号(請求項2);米国特許出願公開第2004044180号(請求項12);米国特許出願公開第2004044179号(請求項11);米国特許出願公開第2003096961号(請求項11);米国特許出願公開第2003232056(実施例5);国際公開第2003105758号(請求項12);米国特許出願公開第2003206918号(実施例5);欧州特許第EP1347046号(請求項1);国際公開第2003025148号(請求項20);
相互参照:GI:37182378;AAQ88991.1;AY358628_1
(9)ETBR(エンドセリンB型受容体、Genbank受託番号AY275463);
Nakamuta Mら「Biochem.Biophys.Res.Commun.」177、34~39頁、1991年;Ogawa Y.ら「Biochem.Biophys.Res.Commun.」178、248~255頁、1991年;Arai H.ら「Jpn.Circ.J.」56、1303~1307頁、1992年;Arai H.ら「J.Biol.Chem.」268、3463~3470頁、1993年;Sakamoto A.、Yanagisawa M.ら「Biochem.Biophys.Res.Commun.」178、656~663頁、1991年;Elshourbagy N.A.ら「J.Biol.Chem.」268,3873~3879頁、1993年;Haendler B.,ら「J.Cardiovasc.Pharmacol.」20、s1-S4、1992年;Tsutsumi M.ら「Gene」228、43~49頁、1999年;Strausberg R.L.ら「Proc.Natl.Acad.Sci.U.S.A.」99、16899~16903頁、2002年;Bourgeois C.ら「J.Clin.Endocrinol.Metab.」82、3116~3123頁、1997年;Okamoto Y.ら「Biol.Chem.」272、21589~21596頁、1997年;Verheij J.B.ら「Am.J.Med.Genet.」108、223~225頁、2002年;Hofstra R.M.W.ら「Eur.J.Hum.Genet.」5、180~185頁、1997年;Puffenberger E.G.ら「Cell」79、1257~1266頁、1994年;Attie T.ら、「Hum.Mol.Genet.」4、2407~2409頁、1995年;Auricchio A.ら「Hum.Mol.Genet.」5:351~354頁、1996年;Amiel J.ら「Hum.Mol.Genet.」5、355~357頁、1996年;Hofstra R.M.W.ら「Nat.Genet.」12、445~447頁、1996年;Svensson P.J.ら「Hum.Genet.」103、145~148頁、1998年;Fuchs S.ら「Mol.Med.」7、115~124頁、2001年;Pingault V.ら(2002年)「Hum.Genet.」111、198~206頁;国際公開第2004045516号(請求項1);国際公開第2004048938号(実施例2);国際公開第2004040000号(請求項151);国際公開第2003087768号(請求項1);国際公開第2003016475号(請求項1);国際公開第2003016475号(請求項1);国際公開第200261087号(図1);国際公開第2003016494号(図6);国際公開第2003025138号(請求項12;144頁);国際公開第200198351号(請求項1;124~125頁);欧州特許第522868号(請求項8;図2);国際公開第200177172号(請求項1;297~299頁);米国特許出願公開第2003109676号;米国特許第6518404号(図3);米国特許第5773223号(請求項1a;31~34欄);国際公開第2004001004;
(10)MSG783(RNF124、仮説上のタンパク質FLJ20315、Genbank受託番号M_017763);
国際公開第2003104275号(請求項1);国際公開第2004046342号(実施例2);国際公開第2003042661号(請求項12);国際公開第2003083074号(請求項14、61頁);国際公開第2003018621号(請求項1);国際公開第2003024392号(請求項2、図93);国際公開第200166689号(実施例6);
相互参照:LocusID:54894;NP_060233.2;NM_017763_1
(11)STEAP2(HGNC_8639、IPCA-1、PCANAP1、STAMP1、STEAP2、STMP、前立腺癌関連遺伝子1、前立腺癌関連タンパク質1、前立腺の6回膜貫通上皮抗原2、6回膜貫通前立腺タンパク質、Genbank受託番号AF455138)
「Lab.Invest.」82(11):1573~1582頁(2002年));国際公開第2003087306号、米国特許出願公開第2003064397号(請求項1、図1);国際公開第200272596号(請求項13、54~55頁);国際公開第200172962号(請求項1、図4B);国際公開第2003104270号(請求項11);国際公開第2003104270号(請求項16);米国特許出願公開第2004005598号(請求項22);国際公開第2003042661号(請求項12);米国特許出願公開第2003060612号(請求項12、図10);国際公開第200226822号(請求項23、図2);国際公開第200216429号(請求項12、図10);
相互参照:GI:22655488;AAN04080.1;AF455138_1
(12)TrpM4(BR22450、FLJ20041、TRPM4、TRPM4B、一過性受容体電位カチオンチャネル、サブファミリーM、メンバー4、Genbank受託番号NM_017636)
Xu,X.Z.ら「Proc.Natl.Acad.Sci.U.S.A.」98(19):10692~10697頁(2001年);「Cell」109(3):397~407頁(2002年);「J.Biol.Chem.」278(33):30813~30820頁(2003年));米国特許出願公開第2003143557号(請求項4);国際公開第200040614号(請求項14、ページ100~103);国際公開第200210382号(請求項1、図9A);国際公開第2003042661号(請求項12);国際公開第200230268号(請求項27、391頁);米国特許出願公開第2003219806号(請求項4);国際公開第200162794号(請求項14、図1A~D);
相互参照:MIM:606936;NP_060106.2;NM_017636_1
(13)CRIPTO(CR、CR1、CRGF、CRIPTO、TDGF1、奇形癌腫由来成長因子、Genbank受入番号NP_003203またはNM_003212)
Ciccodicola,A.ら「EMBO J.」8(7):1987~1991頁(1989年)、「Am.J.Hum.Genet.」49(3):555~565頁(1991年));米国特許出願公開第2003224411号(請求項1);国際公開第2003083041号(実施例1);国際公開第2003034984号(請求項12);国際公開第200288170号(請求項2;52~53頁);国際公開第2003024392号(請求項2;図58);国際公開第200216413号(請求項1;94~95、105頁);国際公開第200222808号(請求項2;図1);米国特許第5854399号(実施例2;17~18欄);米国特許第5792616号(図2);
相互参照:MIM:187395;NP_003203.1;NM_003212_1
(14)CD21(CR2(補体受容体2)またはC3DR(C3d/エプスタイン・バーウイルス受容体)またはHs.73792、Genbank受託番号M26004)
Fujisakuら(1989年)「J.Biol.Chem.」264(4):2118~2125頁);Weis J.J.ら「J.Exp.Med.」167,1047~1066頁、1988年;Moore M.ら「Proc.Natl.Acad.Sci.U.S.A.」84、9194~9198頁、1987年;Barel M.ら「Mol.Immunol.」35、1025~1031頁、1998年;Weis J.J.ら「Proc.Natl.Acad.Sci.U.S.A.」83、5639~5643頁、1986年;Sinha S.K.ら(1993年)J.Immunol.150、5311~5320頁;国際公開第2004045520号(実施例4);米国特許出願公開第2004005538号(実施例1);国際公開第2003062401号(請求項9);国際公開第2004045520号(実施例4);国際公開第9102536号(図9.1~9.9);国際公開第2004020595号(請求項1);
受託:P20023;Q13866;Q14212;EMBL;M26004;AAA35786.1.
(15)CD79b(CD79B、CD79β、IGb(イムノグロブリン関連β)、B29、Genbank受託番号NM_000626または11038674)
「Proc.Natl.Acad.Sci.U.S.A.」(2003年)100(7):4126~4131頁、「Blood」(2002年)100(9):3068~3076頁、Mullerら(1992年)「Eur.J.Immunol.」22(6):1621~1625頁);国際公開第2004016225号(請求項2、図140);国際公開第2003087768号、米国特許出願公開第2004101874号(請求項1、102頁);国際公開第2003062401号(請求項9);国際公開第200278524(実施例2);米国特許出願公開第2002150573号(請求項5、15頁);米国特許第5644033号;国際公開第2003048202号(請求項1、306および309頁);国際公開第99/558658号、米国特許第6534482号(請求項13、図17A/B);国際公開第200055351号(請求項11、1145~1146頁);
相互参照:MIM:147245;NP_000617.1;NM_000626_1
(16)FcRH2(IFGP4、IRTA4、SPAP1A(ホスファターゼアンカータンパク質1aを含むSH2ドメイン)、SPAP1B、SPAP1C、Genbank受託番号NM_030764、AY358130)
「Genome Res.」13(10):2265~2270頁(2003年)、「Immunogenetics」54(2):87~95頁(2002年)、「Blood」99(8):2662~2669頁(2002年)、「Proc.Natl.Acad.Sci.U.S.A.」98(17):9772~9777頁(2001年)、Xu,M.J.ら(2001年)「Biochem.Biophys.Res.Commun.」280(3):768~775頁;国際公開第2004016225号(請求項2);国際公開第2003077836号;国際公開第200138490号(請求項5;図18D-1~18D-2);国際公開第2003097803号(請求項12);国際公開第2003089624(請求項25);
相互参照:MIM:606509;NP_110391.2;NM_030764_1
(17)HER2(ErbB2、Genbank受託番号M11730)
Coussens L.ら「Science」(1985年)230(4730):1132~1139頁);Yamamoto T.,ら「Nature」319,230~234年、1986;Semba K.,ら「Proc.Natl.Acad.Sci.U.S.A.」82、6497~6501頁、1985年;Swiercz J.M.ら「J.Cell Biol.」165,869~880頁、2004年;Kuhns J.J.らJ.Biol.Chem.」274、36422~36427頁、1999年;Cho H.-S.ら「Nature」421、756~760頁、2003年;Ehsani A.ら(1993年)「Genomics」15、426~429頁;国際公開第2004048938号(実施例2);国際公開第2004027049号(図1I);国際公開第2004009622号;国際公開第2003081210号;国際公開第2003089904号(請求項9);国際公開第2003016475号(請求項1);米国特許出願公開第2003118592号;国際公開第2003008537号(請求項1);国際公開第2003055439号(請求項29;図1A~B);国際公開第2003025228号(請求項37;図5C);国際公開第200222636号(実施例13;95~107頁);国際公開第200212341号(請求項68;図7);国際公開第200213847号(71~74頁);国際公開第200214503号(114~117頁);国際公開第200153463号(請求項2;41~46頁);国際公開第200141787号(15頁);国際公開第200044899号(請求項52;図7);国際公開第200020579号(請求項3;図2);米国特許第5869445号(請求項3;31~38欄);国際公開第9630514号(請求項2;56~61頁);欧州特許第1439393号(請求項7);国際公開第2004043361号(請求項7);国際公開第2004022709号;国際公開第200100244号(実施例3;図4);
受託:P04626;EMBL;M11767;AAA35808.1.EMBL;M11761;AAA35808.1.
(18)NCA(CEACAM6、Genbank受託番号M18728);
Barnett T.ら「Genomics」3,59~66頁、1988年;Tawaragi Y.ら「Biochem.Biophys.Res.Commun.」150,89~96頁、1988年;Strausberg R.L.ら「Proc.Natl.Acad.Sci.U.S.A.」99:16899~16903頁、2002年;国際公開第2004063709号;欧州特許第1439393号(請求項7);国際公開第2004044178号(実施例4);国際公開第2004031238;国際公開第2003042661号(請求項12);国際公開第200278524号(実施例2);国際公開第200286443号(請求項27;427頁);国際公開第200260317号(請求項2);
受託:P40199;Q14920;EMBL;M29541;AAA59915.1.EMBL;M18728;
(19)MDP(DPEP1、Genbank受託番号BC017023)
「Proc.Natl.Acad.Sci.U.S.A.」99(26):16899~16903頁(2002年));国際公開第2003016475号(請求項1);国際公開第200264798号(請求項33;85~87頁);日本国特許出願公開第05003790号(図6~8);国際公開第9946284号(図9);
相互参照:MIM:179780;AAH17023.1;BC017023_1
(20)IL20Rα(IL20Ra、ZCYTOR7、Genbank受託番号AF184971);
Clark H.F.ら「Genome Res.」13、2265~2270頁、2003年;Mungall A.J.ら「Nature」425、805~811頁、2003年;Blumberg H.ら「Cell」104、9~19頁、2001年;Dumoutier L.ら「J.Immunol.」167、3545~3549頁、2001年;Parrish-Novak J.ら「J.Biol.Chem.」277、47517~47523頁、2002年;Pletnev S.ら(2003年)「Biochemistry」42:12617~12624頁;Sheikh F.ら(2004年)「J.Immunol.」172、2006~2010頁;欧州特許第1394274号(実施例11);米国特許出願公開第2004005320号(実施例5);国際公開第2003029262号(74~75頁);国際公開第2003002717号(請求項2;63頁);国際公開第200222153号(45~47頁);米国特許出願公開第2002042366号(20~21頁);国際公開第200146261号(57~59頁);国際公開第200146232号(63~65頁);国際公開第9837193号(請求項1;55~59頁);
受託:Q9UHF4;Q6UWA9;Q96SH8;EMBL;AF184971;AAF01320.1.
(21)Brevican(BCAN、BEHAB、Genbank受託番号AF229053)
Gary S.C.ら「Gene」256、139~147頁、2000年;Clark H.F.ら「Genome Res.」13、2265~2270頁、2003年;Strausberg R.L.ら「Proc.Natl.Acad.Sci.U.S.A.」99、16899~16903頁、2002年;米国特許出願公開第2003186372号(請求項11);米国特許出願公開第2003186373号(請求項11);米国特許出願公開第2003119131号(請求項1;図52);米国特許出願公開第2003119122号(請求項1;図52);米国特許出願公開第2003119126号(請求項1);米国特許出願公開第2003119121号(請求項1;図52);米国特許出願公開第2003119129号(請求項1);米国特許出願公開第2003119130号(請求項1);米国特許出願公開第2003119128(請求項1;図52);米国特許出願公開第2003119125号(請求項1);国際公開第2003016475号(請求項1);国際公開第200202634号(請求項1);
(22)EphB2R(DRT、ERK、Hek5、EPHT3、Tyro5、Genbank受託番号NM_004442)
Chan,J.およびWatt,V.M.「Oncogene」6(6)、1057~1061頁(1991年)「Oncogene」10(5):897~905頁(1995年)、「Annu.Rev.Neurosci.」21:309~345頁(1998年)、「Int.Rev.Cytol.196:177~244頁(2000年));国際公開第2003042661号(請求項12);国際公開第200053216号(請求項1、41頁);国際公開第2004065576号(請求項1);国際公開第2004020583号(請求項9);国際公開第2003004529号(128~132頁);国際公開第200053216号(請求項1、42頁);
相互参照:MIM:600997;NP_004433.2;NM_004442_1
(23)ASLG659(B7h、Genbank受託番号AX092328)
米国特許出願公開第20040101899号(請求項2);国際公開第2003104399号(請求項11);国際公開第2004000221号(図3);米国特許出願公開第2003165504号(請求項1);米国特許出願公開第2003124140号(実施例2);米国特許出願公開第2003065143号(図60);国際公開第2002102235号(請求項13;299);米国特許出願公開第2003091580号(実施例2);国際公開第200210187号(請求項6;図10);国際公開第200194641号(請求項12;図7b);国際公開第200202624号(請求項13;図1A~1B);米国特許出願公開第2002034749号(請求項54;45~46頁);国際公開第200206317号(実施例2;320~321頁、請求項34;321~322頁);国際公開第200271928号(468~469頁);国際公開第200202587号(実施例1;図1);国際公開第200140269号(実施例3;190~192頁);国際公開第200036107号(実施例2;205~207頁);国際公開第2004053079号(請求項12);国際公開第2003004989号(請求項1);国際公開第200271928号(233~234、452~453頁);国際公開第0116318号;
(24)PSCA(前立腺幹細胞抗原前駆体、Genbank受託番号AJ297436)
Reiter R.E.ら「Proc.Natl.Acad.Sci.U.S.A.」95,1735~1740頁、1998年;Gu Z.ら「Oncogene」19、1288~1296頁、2000年;「Biochem.Biophys.Res.Commun.」(2000年)275(3):783~788頁;国際公開第2004022709号;欧州特許第1394274号(実施例11);米国特許出願公開第2004018553号(請求項17);国際公開第2003008537号(請求項1);国際公開第200281646号(請求項1;164頁);国際公開第2003003906号(請求項10;288頁);国際公開第200140309号(実施例1;図17);米国特許出願公開第2001055751号(実施例1;図1b);国際公開第200032752号(請求項18;図1);国際公開第9851805号(請求項17;97頁);国際公開第9851824号(請求項10;94頁);国際公開第9840403号(請求項2;図1B);
受託:O43653;EMBL;AF043498;AAC39607.1.
(25)GEDA(Genbank受託番号AY260763);
AAP14954脂肪腫HMGIC融合-パートナー様タンパク質/pid=AAP 14954.1-ホモサピエンス
種ホモサピエンス(ヒト)
国際公開第2003054152号(請求項20);国際公開第2003000842号(請求項1);国際公開第2003023013号(実施例3、請求項20);US2003194704(請求項45);
相互参照:GI:30102449;AAP14954.1;AY260763_1
(26)BAFF-R(B細胞活性化因子受容体、BLyS受容体3、BR3、Genbank受託番号AF116456);BAFF受容体/pid=NP_443177.1-ホモサピエンス
Thompson,J.S.ら「Science」293(5537)、2108~2111頁(2001年);国際公開第2004058309号;国際公開第2004011611号;国際公開第2003045422号(実施例;32~33頁);国際公開第2003014294号(請求項35;図6B);国際公開第2003035846号(請求項70;615~616頁);国際公開第200294852号(136~137欄);国際公開第200238766号(請求項3;133頁);国際公開第200224909号(実施例3;図3);
相互参照:MIM:606269;NP_443177.1;NM_052945_1;AF132600
(27)CD22(B細胞受容体CD22-Bアイソフォーム、BL-CAM、Lyb-8、Lyb8、SIGLEC-2、FLJ22814、Genbank受託番号AK026467);
Wilsonら(1991年)「J.Exp.Med.」173:137~146頁;国際公開第2003072036号(請求項1;図1);
相互参照:MIM:107266;NP_001762.1;NM_001771_1
(28)CD79a(CD79A、CD79α、免疫グロブリン関連アルファ、Igベータ(CD79B)と共有結合的に相互作用し、IgM分子と表面上で複合体を形成するB細胞特異的タンパク質、B細胞分化に関与するシグナルを伝達する)、pI:4.84、MW:25028 TM:2[P]遺伝子染色体:19q13.2、Genbank寄託番号NP_001774.10)
国際公開第2003088808号、米国特許出願公開第号20030228319号;国際公開第2003062401号(請求項9);米国特許出願公開第号2002150573号(請求項4、13~14頁);国際公開第9958658号(請求項13、図16);国際公開第9207574号(図1);米国特許第5644033号;Haら(1992年)「J.Immunol.」148(5):1526~1531頁;Muellerら(1992年)「Eur.J.Biochem.」22:1621~1625頁;Hashimotoら(1994年)「Immunogenetics」40(4):287~295頁;Preud’hommeら(1992年)「Clin.Exp.Immunol.」90(1):141~146頁;Yuら(1992年)「J.Immunol.」148(2)633~637頁;Sakaguchiら(1988年)「EMBO J.」7(11):3457~3464頁;
(29)CXCR5(CXCL13ケモカインによって活性化されるGタンパク質共役受容体であるバーキットリンパ腫受容体1は、リンパ球遊走および体液性防御において機能し、HIV-2感染ならびにおそらくAIDS、リンパ腫、骨髄腫および白血病の発症において役割を果たす);372 aa、pI:8.54 MW:41959 TM:7[P]Gene Chromosome:11q23.3、Genbank寄託番号NP_001707.1)
国際公開第2004040000号;国際公開第2004015426号;米国特許出願公開第号2003105292号(実施例2);米国特許出願公開第号6555339号(実施例2);国際公開第200261087号(図1);国際公開第200157188号(請求項20、269頁);国際公開第200172830号(12~13頁);国際公開第200022129号(実施例1、152~153頁、実施例2、254~256頁);国際公開第9928468号(請求項1、38頁);米国特許出願公開第号5440021号(実施例2、49~52欄);国際公開第9428931号(56~58頁);国際公開第9217497号(請求項7、図5);Dobnerら(1992年)「Eur.J.Immunol.」22:2795~2799頁;Barellaら(1995年)「Biochem.J.」309:773~779頁;
(30)HLA-DOB(ペプチドに結合し、それらをCD4+Tリンパ球に提示するMHCクラスII分子(Ia抗原)のβサブユニット);273 aa、pI:6.56 MW:30820 TM:1 [P]Gene Chromosome:6p21.3、Genbank寄託番号NP_002111.1)
Tonnelleら(1985年)「EMBO J.」4(11):2839~2847頁;Jonssonら(1989年)「Immunogenetics」29(6):411~413頁;Beckら(1992年)「J.Mol.Biol.」228:433~441頁;Strausbergら(2002年)「Proc.Natl.Acad.Sci USA」99:16899~16903頁;Serveniusら(1987年)「J.Biol.Chem.」262:8759~8766頁;Beckら(1996年)「J.Mol.Biol.」255:1~13頁;Naruseら(2002年)「Tissue Antigens」59:512~519頁;国際公開第9958658号(請求項13、図15);米国特許第6153408号(35~38欄);米国特許第5976551号(168~170欄);米国特許第6011146号(145~146欄);Kasaharaら(1989年)「Immunogenetics」30(1):66~68頁;Larhammarら(1985年)「J.Biol.Chem.」260(26):14111~14119頁;
(31)P2X5(細胞外ATPによってゲート制御されるイオンチャネルであるプリン作動性受容体P2Xリガンドゲート制御イオンチャネル5は、シナプス伝達および神経発生に関与し得、欠損は特発性排尿筋不安定性の病態生理学に寄与し得る);422 aa)、pI:7.63、MW:47206 TM:1 [P]遺伝子染色体:17p13.3、Genbank寄託番号NP_002552.2)
Leら(1997年)「FEBS Lett.」418(1-2):195~199頁;国際公開第2004047749号;国際公開第2003072035号(請求項10);Touchmanら(2000年)「Genome Res.」10:165~173頁;国際公開第200222660号(請求項20);国際公開第2003093444号(請求項1)、国際公開第2003087768号(請求項1);国際公開第2003029277号(82頁);
(32)CD72(B細胞分化抗原CD72、Lyb-2)PROTEIN SEQUENCE Full maeaity...tafrfpd(1..359;359aa)、pI:8.66、MW:40225 TM:1 [P]Gene Chromosome:9p13.3、Genbank寄託番号NP_001773.1)
国際公開第2004042346号(請求項65);国際公開第2003026493号(51~52頁、57~58頁);国際公開第200075655号(105~106頁);Von Hoegenら(1990年)「J.Immunol.」144(12):4870~4877頁;Strausbergら(2002年)「Proc.Natl.Acad.Sci USA」99:16899~16903頁;
(33)LY64(リンパ球抗原64(RP105)、ロイシンリッチリピート(LRR)ファミリーのI型膜タンパク質は、B細胞の活性化およびアポトーシスを調節し、機能の喪失は、全身性エリテマトーデス患者における疾患活性の増加に関連する);661 aa、pI:6.20、MW:74147 TM:1 [P]Gene Chromosome:5q12、Genbank寄託番号NP_005573.1)
米国特許出願公開第2002193567号;国際公開第9707198号(請求の範囲第11項第39~42頁);Miuraら(1996年)「Genomics」38(3):299~304頁;Miuraら(1998年)「Blood」92:2815~2822頁;国際公開第2003083047号;国際公開第9744452号(請求の範囲8、57~61頁);国際公開第200012130号(24~26頁);
(34)FcRH1(C2型Ig様ドメインおよびITAMドメインを含有する免疫グロブリンFcドメインの推定受容体であるFc受容体様タンパク質1は、Bリンパ球分化において役割を有し得る。);429 aa、pI:5.28、MW:46925 TM:1 [P]遺伝子染色体:1q21-1q22、Genbank寄託番号NP_443170.1)
国際公開第2003077836号;国際公開第200138490号(請求項6、図18E-1~18-E-2);Davisら(2001年)「Proc.Natl.Acad.Sci USA」98(17):9772~9777頁;国際公開第2003089624号(請求項8);欧州特許第1347046号(請求項1);国際公開第2003089624号(請求項7);
(35)FCRH5(IRTA2、免疫グロブリンスーパーファミリー受容体転座関連2、B細胞発生およびリンパ球形成において可能性のある役割を有する推定免疫受容体;転座による遺伝子の調節解除がいくつかのB細胞悪性腫瘍において起こる);977aa、pI:6.88 MW:106468 TM:1 [P]遺伝子染色体:1q21、Genbank受託番号ヒト:AF343662、AF343663、AF343664、AF343665、AF369794、AF397453、AK090423、AK090475、AL834187、AY358085;マウス:AK089756、AY158090、AY506558;NP_112571.1
国際公開第2003024392号(請求項2、図97);Nakayamaら(2000年)「Biochem.Biophys.Res.Commun.」277(1):124~127頁;国際公開第2003077836号;国際公開第200138490号(請求項3、図18B-1~18B-2);
(36)TENB2(TMEFF2、トモレグリン、TPEF、HPP1、TR、推定膜貫通プロテオグリカン、増殖因子のEGF/ヘレグレンファミリーおよびフォリスタチンに関連);374 aa、NCBI受託:AAD55776、AAF91397、AAG49451、NCBI参照配列:NP_057276;NCBI遺伝子:23671;OMIM:605734;SwissProt Q9UIK5;Genbank受託番号AF179274;AY358907、CAF85723、CQ782436
国際公開第2004074320号(配列番号810);日本国特許出願公開第2004113151号(配列番号2、4、8);国際公開第2003042661号(配列番号580);国際公開第2003009814号(配列番号411);欧州特許第1295944号(69~70頁);国際公開第200230268号(329頁);国際公開第200190304号(配列番号2706);米国特許出願公開第2004249130号;米国特許出願公開第2004022727号;国際公開第2004063355号;米国特許出願公開第2004197325号;米国特許第2003232350号明細書;米国特許第2004005563号明細書;米国特許出願公開第2003124579号;Horieら(2000年)「Genomics」67:146~152頁;Uchidaら(1999年)「Biochem.Biophys.Res.Commun.」266:593~602頁;Liangら(2000年)「Cancer Res.」60:4907~12頁;Glynne-Jonesら(2001年)「Int J Cancer.」10月15日;94(2):178~84頁;
(37)PMEL17(銀ホモログ;SILV;D12S53E;PMEL17;SI;SIL);ME20;gp100)BC001414;BT007202;M32295;M 77348;NM_006928;McGlinchey,R.P.ら(2009年)「Proc.Natl.Acad.Sci.U.S.A.」106(33)、13731~13736頁;Kummer,M.P.ら(2009年)「J.Biol.Chem.」284(4)、2296~2306頁;
(38)TMEFF1(EGF様ドメインおよび2つのフォリスタチン様ドメインを有する膜貫通タンパク質1;トモレグリン-1);H7365;C9orf2;C9ORF2;U19878;X83961;NM_080655;NM_003692;Harms,P.W.(2003年)「Genes Dev.」17(21)、2624~2629頁;Gery,S.ら(2003年)「Oncogene」22(18):2723~2727頁;
(39)GDNF-Ra1(GDNFファミリー受容体アルファ1;GFRA1;GDNFR;GDNFRA;RETL1;TRNR1;RET1L;GDNFR-alpha1;GFR-ALPHA-1);U95847;BC014962;NM_145793NM_005264;Kim,M.H.ら(2009年)「Mol.Cell.Biol.」29(8)、2264~2277頁;Treanor,J.J.ら(1996年)「Nature」382(6586):80~83頁;
(40)Ly6E(リンパ球抗原6複合体、遺伝子座E;Ly67,RIG-E,SCA-2,TSA-1);NP_002337.1;NM_002346.2;de Nooij-van Dalen,A.G.ら(2003年)「Int.J.Cancer」103(6)、768~774頁;Zammit,D.J.ら(2002年)「Mol.Cell.Biol.」22(3):946~952頁;国際公開第2013/17705号;
(41)TMEM46(shisaホモログ2(アフリカツメガエル:Xenopus laevis);SHISA2);NP_001007539.1;NM_001007538.1;Furushima,K.ら(2007年)「Dev.Biol.」306(2)、480~492頁;Clark,H.F.ら(2003年)「Genome Res.」13(10):2265~2270頁;
(42)Ly6G6D(リンパ球抗原6複合体、遺伝子座G6D;Ly6-D、MEGT1);NP_067079.2;NM_021246.2;Mallya,M.ら(2002年)「Genomics」80(1):113~123頁;Ribas,G.ら(1999年)「J.Immunol.」163(1):278~287頁;
(43)LGR5(ロイシンリッチリピート含有Gタンパク質共役受容体5;GPR49、GPR67);NP_003658.1;NM_003667.2;Salanti,G.ら(2009年)「Am.J.Epidemiol.」170(5):537~545頁;Yamamoto,Y.ら(2003年)「Hepatology」37(3):528~533頁;
(44)RET(ret癌原遺伝子;MEN2A;HSCR1;MEN2B;MTC1;PTC;CDHF12;Hs.168114;RET51;RET-ELE1);NP_066124.1;NM_020975.4;Tsukamoto,H.ら(2009年)「Cancer Sci.」100(10):1895~1901頁;Narita,N.ら(2009年)「Oncogene」28(34):3058~3068頁;
(45)LY6K(リンパ球抗原6複合体、遺伝子座K;LY6K;HSJ001348;FLJ35226);NP_059997.3;NM_017527.3;Ishikawa,N.ら(2007年)「Cancer Res.」67(24):11601~11611頁;de Nooij-van Dalen,A.G.ら(2003年)「Int.J.Cancer」103(6):768~774頁;
(46)GPR19(Gタンパク質共役受容体19;Mm.4787);NP_006134.1;NM_006143.2;Montpetit,A.およびSinnett,D.(1999年)「Hum.Genet.」105(1-2):162~164頁;O’Dowd,B.F.ら(1996年)「FEBS Lett.」394(3):325~329頁;
(47)GPR54(KISS1受容体;KISS1R;GPR54;HOT7T175;AXOR12);NP_115940.2;NM_032551.4;Navenot,J.M.ら(2009年)「Mol.Pharmacol.」75(6):1300~1306頁;Hata,K.ら(2009年)「Anticancer Res.」29(2):617~623頁;
(48)ASPHD1(アスパラギン酸ベータ-ヒドロキシラーゼドメイン含有1;LOC253982);NP_859069.2;NM_181718.3;Gerhard,D.S.ら(2004年)「Genome Res.」14(10B):2121~2127頁;
(49)チロシナーゼ(TYR;OCAIA;OCA1A;チロシナーゼ;SHEP3);NP_000363.1;NM_000372.4;Bishop,D.T.ら(2009)「Nat.Genet.」41(8):920~925頁;Nan,H.ら(2009年)「Int.J.Cancer」125(4):909~917頁;
(50)TMEM118(リング(ring)フィンガータンパク質、膜貫通2、RNFT2、FLJ14627);NP_001103373.1;NM_001109903.1;Clark,H.F.ら(2003年)「Genome Res.」13(10):2265~2270頁、Scherer,S.E.ら(2006年)「Nature」440(7082):346~351頁
(51)GPR172A(Gタンパク質共役受容体172A;GPCR41;FLJ11856;D15Ertd747e);NP_078807.1;NM_024531.3;Ericsson,T.A.ら(2003年)「Proc.Natl.Acad.Sci.U.S.A.」100(11):6759~6764頁;Takeda,S.ら(2002年)「FEBS Lett.」520(1-3):97~101頁.
(52)シアル酸に結合する免疫グロブリン様レクチンファミリーのメンバーであるCD33は、67kDaのグリコシル化膜貫通タンパク質である。CD33は、拘束された骨髄単球性前駆細胞および赤血球前駆細胞に加えて、ほとんどの骨髄性白血病細胞および単球性白血病細胞上で発現される。初期の多能性幹細胞、成熟顆粒球、リンパ球、または非造血細胞(Sabbathら、(1985年)J.Clin.Invest.75:756-56;Andrewsら、(1986)Blood 68:1030-5)には見られない。CD33は、その細胞質尾部に2つのチロシン残基を含有し、これらの各々に、多くの阻害性受容体に見られる免疫受容体チロシン系阻害モチーフ(ITIM)に類似する疎水性残基が続いている。
(53)CLL-1(CLEC12A、MICL、およびDCAL2)は、C型レクチン/C型レクチン様ドメイン(CTL/CTLD)スーパーファミリーのメンバーをコードする。このファミリーのメンバーは、タンパク質の折り畳みが共通しており、細胞接着、細胞間シグナル伝達、糖タンパク質代謝回転、ならびに炎症および免疫応答における役割など、多様な機能を有する。この遺伝子によりコードされるタンパク質は、顆粒球および単球の機能の負の制御因子である。この遺伝子のいくつかの代替的なスプライス転写物変異体が記載されているが、これらの変異体のうちのいくつかに関しては完全長の性質が決定されていない。この遺伝子は、染色体12p13上のナチュラルキラー遺伝子複合体領域内の他のCTL/CTLDスーパーファミリーメンバーに密接に連結されている(Drickamer K(1999年)「Curr.Opin.Struct.Biol.」9(5):585~90頁;van Rhenen Aら(2007年)「Blood」110(7):2659~66頁;Chen CHら(2006年)「Blood」107(4):1459~67頁;Marshall ASら(2006年)「Eur.J.Immunol.」36(8):2159~69頁;Bakker ABら(2005年)「Cancer Res.」64(22):8443~50頁;Marshall ASら(2004年)「J.Biol.Chem.」279(15):14792~802頁)。CLL-1は、単一のC型レクチン様ドメイン(カルシウムまたは糖類のいずれにも結合することが予測されていない)、ストーク領域、膜貫通ドメイン、およびITIMモチーフを含有する短い細胞質尾部を含む、II型膜貫通受容体であることが示されている。
一態様では、Ab-CIDEの抗体は、多数の細胞または組織型上に見出されるタンパク質に対する抗体であり得る。そのような抗体の例としては、gDおよびEpCAMが挙げられる。上皮細胞接着分子(EpCAM)は、上皮におけるCa2+非依存性ホモタイプ細胞-細胞接着を媒介する膜貫通糖タンパク質である(Litvinov,S.ら(1994年)「Journal of Cell Biology」125(2):437~46頁)。DIAR5、EGP-2、EGP314、EGP40、ESA、HNPCC8、KS1/4、KSA、M 4 S 1、MIC18、MK-1、TACSTD1、TROP1、EpCAMとしても知られており、細胞シグナル伝達(Maetzel,D.ら(2009年)「Nature Cell Biology」11(2):162~71頁)、遊走(ワシントン州オスタ;ら(2004)、「Cancer Res.」、64(16):5818~24頁)、増殖および分化(Litvinov,S.ら(1996年)「Am J Pathol.」148(3):865~75頁)にも関与している。さらに、EpCAMは、c-myc、e-fabpおよびサイクリンAおよびEを上方調節する能力を介して発癌性の可能性を有する(Munz,M.ら(2004年)「Oncogene」23(34):5748~58頁)。EpCAMは、上皮および上皮由来新生物において排他的に発現されるので、EpCAMは、様々な癌の診断マーカーとして使用することができる。言い換えれば、Ab-CIDEを使用して、標的化抗体を使用する場合のように特定の細胞型または組織型ではなく、多くの細胞または組織にCIDEを送達することができる。
本明細書に記載されるように、Ab-CIDEは、抗体、例えば、以下から選択される抗体を含み得る:
抗Ly6E抗体
特定の実施形態において、Ab-CIDEは抗Ly6E抗体を含むことができる。レチノイン酸誘導型遺伝子E(RIG-E)および幹細胞抗原2(SCA-2)としても知られるリンパ球抗原6複合体、遺伝子座E(Ly6E)。GPI結合した131アミノ酸長、約8.4kDaタンパク質の既知でない結合パートナーとの未知の機能である。これは、マウスの未成熟胸腺細胞、胸腺髄質上皮細胞で発現される転写物として最初に同定された(Maoら(1996年)「Proc.Natl.Acad.Sci.U.S.A.」93:5910~5914頁)。いくつかの実施形態において、本明細書中に記載される主題は、PCT公開番号WO2013/177055号に記載される抗Ly6E抗体を含むAb-CIDEを提供する。
いくつかの実施形態において、本明細書に記載される主題は、(a)配列番号12のアミノ酸配列を含むHVR-H1、(b)配列番号13のアミノ酸配列を含むHVR-H2、(c)配列番号14のアミノ酸配列を含むHVR-H3、(d)配列番号9のアミノ酸配列を含むHVR-L1、(e)配列番号10のアミノ酸配列を含むHVR-L2、および(f)配列番号11のアミノ酸配列を含むHVR-L3から選択される、少なくとも1つ、2つ、3つ、4つ、5つ、または6つのHVRを含む、抗Ly6E抗体を含むAb-CIDEを提供する。
一態様において、本明細書に記載される主題は、(a)配列番号12のアミノ酸配列を含むHVR-H1、(b)配列番号13のアミノ酸配列を含むHVR-H2、および(c)配列番号14のアミノ酸配列を含むHVR-H3から選択される、少なくとも1つ、少なくとも2つ、または3つ全てのVH HVR配列を含む抗体を含むAb-CIDEを提供する。さらなる実施形態において、抗体は、(a)配列番号12のアミノ酸配列を含むHVR-H1、(b)配列番号13のアミノ酸配列を含むHVR-H2、および(c)配列番号14のアミノ酸配列を含むHVR-H3を含む。
別の態様において、本明細書に記載される主題は、(a)配列番号9のアミノ酸配列を含むHVR-L1、(b)配列番号10のアミノ酸配列を含むHVR-L2、および(c)配列番号11のアミノ酸配列を含むHVR-L3から選択される、少なくとも1つ、少なくとも2つ、または3つ全てのVL HVR配列を含む抗体を含むAb-CIDEを提供する。一実施形態において、抗体は、(a)配列番号9のアミノ酸配列を含むHVR-L1、(b)配列番号10のアミノ酸配列を含むHVR-L2、および(c)配列番号11のアミノ酸配列を含むHVR-L3を含む。
別の態様において、Ab-CIDEは、(a)(i)配列番号12のアミノ酸配列を含むHVR-H1、(ii)配列番号13のアミノ酸配列を含むHVR-H2、および(iii)配列番号14から選択されるアミノ酸配列を含むHVR-H3から選択される少なくとも1つ、少なくとも2つ、または3つ全てのVH HVR配列を含むVHドメイン、ならびに(b)(i)配列番号9のアミノ酸配列を含むHVR-L1、(ii)配列番号10のアミノ酸配列を含むHVR-L2、および(c)配列番号11のアミノ酸配列を含むHVR-L3から選択される少なくとも1つ、少なくとも2つ、または3つ全てのVL HVR配列を含むVLドメインを含む、抗体を含む。
別の態様では、本明細書に記載される主題は、(a)配列番号12のアミノ酸配列を含むHVR-H1、(b)配列番号13のアミノ酸配列を含むHVR-H2、(c)配列番号14のアミノ酸配列を含むHVR-H3、(d)配列番号9のアミノ酸配列を含むHVR-L1、(e)配列番号10のアミノ酸配列を含むHVR-L2、および(f)配列番号11のアミノ酸配列を含むHVR-L3を含む抗体を含む、Ab-CIDEを提供する。
上述の実施形態のうちのいずれかにおいて、Ab-CIDEの抗Ly6E抗体はヒト化されている。一実施形態において、抗Ly6E抗体は、上の実施形態のいずれかにあるようなHVRを含み、ヒトアクセプターフレームワーク、例えば、ヒト免疫グロブリンフレームワークまたはヒトコンセンサスフレームワークをさらに含む。
別の態様では、Ab-CIDEの抗Ly6E抗体は、配列番号8のアミノ酸配列に対して少なくとも90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%、または100%の配列同一性を有する重鎖可変ドメイン(VH)配列を含む。特定の実施形態において、配列番号8のアミノ酸配列に対して少なくとも90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、または99%の同一性を有するVH配列は、参照配列と比べて、置換(例えば、保存的置換)、挿入、または欠失を含有するが、その配列を含む抗Ly6E抗体は、Ly6Eに結合する能力を保持する。特定の実施形態において、配列番号8において合計で1~10個のアミノ酸が置換、挿入、および/または欠失している。特定の実施形態において、配列番号8において合計で1~5個のアミノ酸が置換、挿入、および/または欠失している。特定の実施形態において、置換、挿入、または欠失は、HVRの外側の領域内で(すなわち、FR内で)生じる。必要に応じて、抗Ly6E抗体は、配列番号8のVH配列を含み、その配列の翻訳後修飾を含む。特定の実施形態において、VHは、以下から選択される2つまたは3つのHVRを含む:(a)配列番号12のアミノ酸配列を含むHVR-H1、(b)配列番号13のアミノ酸配列を含むHVR-H2、および(c)配列番号14のアミノ酸配列を含むHVR-H3。
別の態様では、Ab-CIDEの抗Ly6E抗体が提供され、該抗体は、配列番号7のアミノ酸配列に対して、少なくとも90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%、または100%の配列同一性を有する軽鎖可変ドメイン(VL)を含む。特定の実施形態において、配列番号7のアミノ酸配列に対して少なくとも90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、または99%の同一性を有するVKL列は、参照配列と比べて、置換(例えば、保存的置換)、挿入、または欠失を含有するが、その配列を含む抗Ly6E抗体は、Ly6Eに結合する能力を保持する。特定の実施形態において、配列番号7において合計で1~10個のアミノ酸が置換、挿入、および/または欠失している。特定の実施形態において、配列番号7において合計で1~5個のアミノ酸が置換、挿入、および/または欠失している。特定の実施形態において、置換、挿入、または欠失は、HVRの外側の領域で(すなわち、FR内で)生じる。必要に応じて、抗Ly6E抗体は、配列番号7のVL配列を含み、その配列の翻訳後修飾を含む。特定の実施形態において、VLは、(a)配列番号9のアミノ酸配列を含むHVR-L1、(b)配列番号10のアミノ酸配列を含むHVR-L2、および(c)配列番号11のアミノ酸配列を含むHVR-L3から選択される、1つ、2つ、または3つのHVRを含む。
別の態様において、抗Ly6E抗体を含むAb-CIDEが提供され、この抗体は、上述の実施形態のいずれかにあるようなVH、および上述の実施形態のいずれかにあるようなVLを含む。
一実施形態において、Ab-CIDEが提供され、該抗体は、それぞれ配列番号8および配列番号7のVH配列およびVL配列を含み、これにはそれらの配列の翻訳後修飾が含まれる。
さらなる態様において、本明細書において、本明細書に提供される抗Ly6E抗体と同じエピトープに結合する抗体を含む、Ab-CIDEが提供される。例えば、特定の実施形態において、配列番号8のVH配列および配列番号7のVL配列をそれぞれ含む抗Ly6E抗体と同じエピトープに結合する抗体を含むAb-CIDEが提供される。
さらなる態様において、上記のいずれかの実施形態によるAb-CIDEの抗Ly6E抗体は、ヒト抗体を含むモノクローナル抗体である。一実施形態において、Ab-CIDEの抗Ly6E抗体は、抗体断片、例えば、Fv、Fab、Fab’、scFv、ダイアボディ、またはF(ab’)断片である。別の実施形態において、本抗体は、実質的に完全長の抗体、例えば、本明細書に定義されるIgG1抗体、IgG2a抗体、または他の抗体クラスもしくはアイソタイプである。いくつかの実施形態において、Ab-CIDEは、それぞれ配列番号16および15のアミノ酸配列を含む重鎖および軽鎖を含む抗Ly6E抗体を含む
抗HER2抗体
特定の実施形態において、Ab-CIDEは抗HER2抗体を含む。一実施形態において、Ab-CIDEの抗HER2抗体は、米国特許第5821337号の表3に記載されているように、ヒト化抗HER2抗体、例えばhuMAb4D5-1、huMAb4D5-2、huMAb4D5-3、huMAb4D5-4、huMAb4D5-5、huMAb4D5-6、huMAb4D5-7およびhuMAb4D5-8を含む。これらの抗体は、HER2に結合するマウス抗体(4D5)の相補性決定領域を有するヒトフレームワーク領域を含む。ヒト化抗体huMAb4D5-8はトラスツズマブとも呼ばれ、商品名HERCEPTIN(登録商標)で市販されている。別の実施形態において、Ab-CIDEの抗HER2抗体は、米国特許第7862817号に記載されているようなヒト化抗HER2抗体、例えばヒト化2C4を含む。例示的なヒト化2C4抗体は、商品名PERJETA(登録商標)で市販されているペルツズマブである。
別の実施形態において、Ab-CIDEの抗HER2抗体は、ヒト化7C2抗HER2抗体を含む。ヒト化7C2抗体は、抗HER2抗体である。
いくつかの実施形態において、本明細書には、(a)配列番号22のアミノ酸配列を含むHVR-H1、(b)配列番号23、27、または28のアミノ酸配列を含むHVR-H2、(c)配列番号24または29のアミノ酸配列を含むHVR-H3、(d)配列番号19のアミノ酸配列を含むHVR-L1、(e)配列番号20のアミノ酸配列を含むHVR-L2、および(f)配列番号21のアミノ酸配列を含むHVR-L3から選択される、少なくとも1つ、2つ、3つ、4つ、5つ、または6つのHVRを含む、抗HER2抗体を含むAb-CIDEが記載される。いくつかの実施形態において、本明細書には、(a)配列番号22のアミノ酸配列を含むHVR-H1、(b)配列番号23のアミノ酸配列を含むHVR-H2、(c)配列番号24のアミノ酸配列を含むHVR-H3、(d)配列番号19のアミノ酸配列を含むHVR-L1、(e)配列番号20のアミノ酸配列を含むHVR-L2、および(f)配列番号21のアミノ酸配列を含むHVR-L3から選択される、少なくとも1つ、2つ、3つ、4つ、5つ、または6つのHVRを含む、抗HER2抗体を含むPACが記載される。
一態様において、本明細書には、(a)配列番号22のアミノ酸配列を含むHVR-H1、(b)配列番号23、27、または28のアミノ酸配列を含むHVR-H2、および(c)配列番号24または29のアミノ酸配列を含むHVR-H3から選択される、少なくとも1つ、少なくとも2つ、または3つ全てのVH HVR配列を含む抗体を含むAb-CIDEが記載される。一態様において、本明細書には、(a)配列番号22のアミノ酸配列を含むHVR-H1、(b)配列番号23のアミノ酸配列を含むHVR-H2、および(c)配列番号24のアミノ酸配列を含むHVR-H3から選択される、少なくとも1つ、少なくとも2つ、または3つ全てのVH HVR配列を含む抗体を含むAb-CIDEが記載される。さらなる実施形態において、該抗体は、(a)配列番号68のアミノ酸配列を含むHVR-H1、(b)配列番号23、27、または28のアミノ酸配列を含むHVR-H2、および(c)配列番号24または29のアミノ酸配列を含むHVR-H3を含む。さらなる実施形態において、抗体は、(a)配列番号22のアミノ酸配列を含むHVR-H1、(b)配列番号23のアミノ酸配列を含むHVR-H2、および(c)配列番号24のアミノ酸配列を含むHVR-H3を含む。
別の態様において、本明細書には、(a)配列番号19のアミノ酸配列を含むHVR-L1、(b)配列番号20のアミノ酸配列を含むHVR-L2、および(c)配列番号21のアミノ酸配列を含むHVR-L3から選択される、少なくとも1つ、少なくとも2つ、または3つ全てのVL HVR配列を含む抗体を含むAb-CIDEが記載される。一実施形態において、抗体は、(a)配列番号19のアミノ酸配列を含むHVR-L1、(b)配列番号20のアミノ酸配列を含むHVR-L2、および(c)配列番号21のアミノ酸配列を含むHVR-L3を含む。
別の態様において、Ab-CIDEは、(a)(i)配列番号22のアミノ酸配列を含むHVR-H1、(ii)配列番号23、27、または28のアミノ酸配列を含むHVR-H2、および(iii)配列番号24または29から選択されるアミノ酸配列を含むHVR-H3から選択される少なくとも1つ、少なくとも2つ、または3つ全てのVH HVR配列を含むVHドメイン、ならびに(b)(i)配列番号19のアミノ酸配列を含むHVR-L1、(ii)配列番号20のアミノ酸配列を含むHVR-L2、および(c)配列番号21のアミノ酸配列を含むHVR-L3から選択される少なくとも1つ、少なくとも2つ、または3つ全てのVL HVR配列を含むVLドメインを含む、抗体を含む。別の態様において、Ab-CIDEは、(a)(i)配列番号22のアミノ酸配列を含むHVR-H1、(ii)配列番号23のアミノ酸配列を含むHVR-H2、および(iii)配列番号24から選択されるアミノ酸配列を含むHVR-H3から選択される少なくとも1つ、少なくとも2つ、または3つ全てのVH HVR配列を含むVHドメイン、ならびに(b)(i)配列番号19のアミノ酸配列を含むHVR-L1、(ii)配列番号20のアミノ酸配列を含むHVR-L2、および(c)配列番号21のアミノ酸配列を含むHVR-L3から選択される少なくとも1つ、少なくとも2つ、または3つ全てのVL HVR配列を含むVLドメインを含む、抗体を含む。
別の態様では、本明細書には、(a)配列番号22のアミノ酸配列を含むHVR-H1、(b)配列番号23、27、または28のアミノ酸配列を含むHVR-H2、(c)配列番号24または29のアミノ酸配列を含むHVR-H3、(d)配列番号19のアミノ酸配列を含むHVR-L1、(e)配列番号20のアミノ酸配列を含むHVR-L2、および(f)配列番号21のアミノ酸配列を含むHVR-L3を含む抗体を含む、Ab-CIDEが記載される。別の態様では、本明細書には、(a)配列番号22のアミノ酸配列を含むHVR-H1、(b)配列番号23のアミノ酸配列を含むHVR-H2、(c)配列番号24のアミノ酸配列を含むHVR-H3、(d)配列番号19のアミノ酸配列を含むHVR-L1、(e)配列番号20のアミノ酸配列を含むHVR-L2、および(f)配列番号21のアミノ酸配列を含むHVR-L3を含む抗体を含む、Ab-CIDEが記載される。
上述の実施形態のうちのいずれかにおいて、Ab-CIDEの抗HER2抗体はヒト化されている。一実施形態において、Ab-CIDEの抗HER2抗体は、上の実施形態のいずれかにあるようなHVRを含み、ヒトアクセプターフレームワーク、例えば、ヒト免疫グロブリンフレームワークまたはヒトコンセンサスフレームワークをさらに含む。
別の態様では、Ab-CIDEの抗HER2抗体は、配列番号18のアミノ酸配列に対して少なくとも90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%、または100%の配列同一性を有する重鎖可変ドメイン(VH)配列を含む。特定の実施形態において、配列番号18のアミノ酸配列に対して少なくとも90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、または99%の同一性を有するVH配列は、参照配列と比べて、置換(例えば、保存的置換)、挿入、または欠失を含有するが、その配列を含む抗HER2抗体は、HER2に結合する能力を保持する。特定の実施形態において、配列番号18において合計で1~10個のアミノ酸が置換、挿入、および/または欠失している。特定の実施形態において、配列番号18において合計で1~5個のアミノ酸が置換、挿入、および/または欠失している。特定の実施形態において、置換、挿入、または欠失は、HVRの外側の領域内で(すなわち、FR内で)生じる。必要に応じて、抗HER2抗体は、配列番号18のVH配列を含み、その配列の翻訳後修飾を含む。特定の実施形態において、VHは、以下から選択される2つまたは3つのHVRを含む:(a)配列番号22のアミノ酸配列を含むHVR-H1、(b)配列番号23のアミノ酸配列を含むHVR-H2、および(c)配列番号24のアミノ酸配列を含むHVR-H3。
別の態様では、Ab-CIDEの抗HER2抗体が提供され、該抗体は、配列番号17のアミノ酸配列に対して、少なくとも90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%、または100%の配列同一性を有する軽鎖可変ドメイン(VL)を含む。特定の実施形態において、配列番号17のアミノ酸配列に対して少なくとも90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、または99%の同一性を有するVL配列は、参照配列と比べて、置換(例えば、保存的置換)、挿入、または欠失を含有するが、その配列を含む抗HER2抗体は、HER2に結合する能力を保持する。特定の実施形態において、配列番号17において合計で1~10個のアミノ酸が置換、挿入、および/または欠失している。特定の実施形態において、配列番号17において合計で1~5個のアミノ酸が置換、挿入、および/または欠失している。特定の実施形態において、置換、挿入、または欠失は、HVRの外側の領域で(すなわち、FR内で)生じる。必要に応じて、抗HER2抗体は、配列番号17のVL配列を含み、その配列の翻訳後修飾を含む。特定の実施形態において、VLは、(a)配列番号19のアミノ酸配列を含むHVR-L1、(b)配列番号20のアミノ酸配列を含むHVR-L2、および(c)配列番号21のアミノ酸配列を含むHVR-L3から選択される、1つ、2つ、または3つのHVRを含む。
別の態様において、抗HER2抗体を含むAb-CIDEが提供され、この抗体は、上述の実施形態のいずれかにあるようなVH、および上述の実施形態のいずれかにあるようなVLを含む。
一実施形態において、抗体を含むAb-CIDEが提供され、該抗体は、それぞれ配列番号18および配列番号17のVH配列およびVL配列を含み、これにはそれらの配列の翻訳後修飾が含まれる。
一実施形態において、配列番号30のヒト化7C2.v2.2.LA(hu7C2)K149Cカッパ軽鎖配列を含む抗体を含むAb-CIDEが提供される。
一実施形態において、配列番号31のHu7C2 A118C IgG1重鎖配列を含む抗体を含むAb-CIDEが提供される。
さらなる態様において、本明細書において、本明細書に提供される抗HER2抗体と同じエピトープに結合する抗体を含む、PACが提供される。例えば、特定の実施形態において、配列番号18のVH配列および配列番号17のVL配列をそれぞれ含む抗HER2抗体と同じエピトープに結合する抗体を含むAb-CIDEが提供される。
さらなる態様において、上記のいずれかの実施形態によるAb-CIDEの抗HER2抗体は、ヒト抗体を含むモノクローナル抗体である。一実施形態において、Ab-CIDEの抗HER2抗体は、抗体断片、例えば、Fv、Fab、Fab’、scFv、ダイアボディ、またはF(ab’)断片である。別の実施形態において、Ab-CIDEは、実質的に完全長の抗体、例えば、本明細書に定義されるIgG1抗体、IgG2a抗体、または他の抗体クラスもしくはアイソタイプである抗体を含む。
抗B7-H4抗体
特定の実施形態において、Ab-CIDEは抗B7-H4抗体を含むことができる。B7-H4は、I型膜貫通タンパク質であり、T細胞受容体抗原性シグナルと併せて共シグナルを提供するタンパク質のB7スーパーファミリーのメンバーである。B7-H4は、T細胞機能の負の調節因子であり、T細胞のライゲーションは、それらの成長、サイトカイン分泌および細胞傷害性を阻害する。マウスにおけるB7-H4の排除は、免疫細胞の恒常性に影響せず、自己免疫の徴候もない。Zhuら「Blood」113(8):1759~1767頁(2009年);Suhら「Molecular and Cellular Biology」26(17):6403~6411頁(2006年).B7-H4の受容体は未知であり、特定されていない。
ヒトB7-H4は282アミノ酸のタンパク質(アミノ末端シグナル配列を含む)であり、そのうちの約227アミノ酸がアミノ末端シグナル配列の切断後に細胞外空間にあると予測される。B7-H4は、Ig様Vドメイン、Ig様Cドメイン、膜貫通ドメインおよび短い細胞質尾部を含む。B7-H4は、T細胞受容体による抗原依存性シグナル伝達と併せて、その共阻害シグナルを介して免疫系を下方制御する可能性を有するB7ファミリーのメンバーである。B7-H4は、正常なヒト組織では名目上発現されるが、女性生殖系の癌(乳房、卵巣および子宮内膜)を含む無数のヒト癌では高度に過剰発現される。B7-H4の有病率は、原発性乳癌(約95%)および転移性乳癌(約97%)の両方を含む浸潤性乳管癌および小葉癌において高いことが報告されている。B7-H4染色の増加は陰性PRおよびHER2の状態と関連していたが、発現は腫瘍グレードまたはステージとは無関係であった。これらのタイプの乳癌におけるB7H4染色細胞の高い割合に加えて、浸潤リンパ球の数も同時に減少した。最近、肺転移性乳癌のB7-H4ノックアウトモデルにおいて、著者らは、B7-H4-/-マウスがより少ない肺腫瘍結節を有し、野生型マウスと比較して腫瘍チャレンジに対する向上した生存および記憶応答を示したことを報告した。これは、B7-H4-Ig融合タンパク質に結合した腫瘍関連好中球によるCD4およびCD8細胞に対する免疫抑制効果に起因した。これはまた、SCIDマウスにおいてB7-H4を過剰発現する移植SKOV3細胞が野生型SKOV3細胞よりも積極的に増殖した理由を説明し得る。さらに、SKBR3細胞におけるB7-H4 mRNAおよびタンパク質のノックダウンは、カスパーゼ活性およびアポトーシスの増加をもたらしたことが示された。いくつかの実施形態において、本明細書中に記載される主題は、PCT公開番号WO2016/040724号に記載される抗B7-H4抗体を含むAb-CIDEを提供する。
いくつかの実施形態において、Ab-CIDEの抗B7-H4抗体は以下を含む:
(a)(i)配列番号128のアミノ酸配列を含むHVR-H3、(ii)配列番号129のアミノ酸配列を含むHVR-L3、および(iii)配列番号200のアミノ酸配列を含むHVR-H2;または
(b)(i)配列番号201のアミノ酸配列を含むHVR-H3、(ii)配列番号129のアミノ酸配列を含むHVR-L3、および(iii)配列番号200のアミノ酸配列を含むHVR-H2。
いくつかの実施形態において、Ab-CIDEの抗B7-H4抗体は、以下を含む:
(a)(i)配列番号199のアミノ酸配列を含むHVR-H1、(ii)配列番号200のアミノ酸配列を含むHVR-H2、および(iii)配列番号128のアミノ酸配列を含むHVR-H3;または
(b)(i)配列番号199のアミノ酸配列を含むHVR-H1、(ii)配列番号200のアミノ酸配列を含むHVR-H2、および(iii)配列番号201のアミノ酸配列を含むHVR-H3。
いくつかの実施形態において、Ab-CIDEの抗B7-H4抗体は、配列番号213の重鎖フレームワークFR3配列を含む。
いくつかの実施形態において、Ab-CIDEの抗B7-H4抗体は、以下を含む:(a)配列番号202のアミノ酸配列を含むHVR-L1、(b)配列番号203のアミノ酸配列を含むHVR-L2、および(c)配列番号129のアミノ酸配列を含むHVR-L3。いくつかの実施形態において、Ab-CIDEの抗B7-H4抗体は、配列番号207の軽鎖フレームワークFR3配列を含む。
いくつかの実施形態において、Ab-CIDEの抗B7-H4抗体は、以下を含む:
(a)配列番号198のアミノ酸配列に少なくとも95%の配列同一性を有するVH配列;
(b)配列番号126のアミノ酸配列に少なくとも95%の配列同一性を有するVL配列;または
(c)配列番号127のアミノ酸配列に少なくとも95%の配列同一性を有するVH配列;または
(d)(a)のようなVH配列、および(b)のようなVL配列;または
(e)(c)のようなVH配列、および(b)のようなVL配列。
いくつかの実施形態において、Ab-CIDEの抗B7-H4抗体は、配列番号198または127のVH配列を含む。いくつかの実施形態において、Ab-CIDEの抗B7-H4抗体は、配列番号126のVL配列を含む。
いくつかの実施形態において、Ab-CIDEの抗B7-H4抗体であって、(a)配列番号198のVH配列および配列番号126のVL配列、または(b)配列番号127のVH配列および配列番号126のVL配列を含む抗B7-H4抗体。
いくつかの実施形態において、Ab-CIDEの抗B7-H4抗体が提供され、該抗体は以下を含む:
(a)(i)配列番号199のアミノ酸配列を含むHVR-H1、(ii)配列番号200のアミノ酸配列を含むHVR-H2、(iii)配列番号128のアミノ酸配列を含むHVR-H3、(iv)配列番号202のアミノ酸配列を含むHVR-L1、(v)配列番号203のアミノ酸配列を含むHVR-L2、および(vi)配列番号129のアミノ酸配列を含むHVR-L3;または
(b)(i)配列番号199のアミノ酸配列を含むHVR-H1、(ii)配列番号200のアミノ酸配列を含むHVR-H2、(iii)配列番号201のアミノ酸配列を含むHVR-H3、(iv)配列番号202のアミノ酸配列を含むHVR-L1、(v)配列番号203のアミノ酸配列を含むHVR-L2、および(vi)配列番号129のアミノ酸配列を含むHVR-L3。
本明細書中に記載される実施形態のいずれかにおいて、Ab-CIDEの抗B7-H4抗体はモノクローナル抗体であり得る。本明細書中に記載される実施形態のいずれかにおいて、Ab-CIDEの抗B7-H4抗体は、ヒト抗体、ヒト化抗体またはキメラ抗体であり得る。本明細書中に記載される実施形態のいずれかにおいて、Ab-CIDEの抗B7-H4抗体は、B7-H4を結合する抗体断片であり得る。抗体断片としては、Fab、Fab’、Fab’-SH、F(ab’)、Fv、およびscFv断片、ならびに以下に記載する他の断片が挙げられるがこれらに限定されない。
本明細書中に記載される実施形態のいずれかにおいて、Ab-CIDEの抗B7-H4抗体は、IgG1、IgG2aまたはIgG2b抗体であり得る。本明細書中に記載される実施形態のいずれかにおいて、Ab-CIDEの抗B7-H4抗体は、1つまたは複数の操作されたシステインアミノ酸残基を含み得る。本明細書に記載されるいずれかの実施形態において、1つまたは複数の操作されたシステインアミノ酸残基は、重鎖に位置し得る。本明細書に記載されるいずれかの実施形態において、1つまたは複数の操作されたシステインアミノ酸残基は、軽鎖に位置し得る。本明細書中に記載される実施形態のいずれかにおいて、Ab-CIDEの抗B7-H4抗体は、A118CおよびS400Cから選択される重鎖定常領域に少なくとも1つの突然変異を含み得る。本明細書中に記載される実施形態のいずれかにおいて、Ab-CIDEの抗B7-H4抗体は、K149CおよびV205Cから選択される軽鎖定常領域に少なくとも1つの突然変異を含み得る。
いくつかの実施形態において、Ab-CIDEの抗B7-H4が提供され、該抗体は、(a)配列番号132の重鎖配列および配列番号134の軽鎖配列;または(b)配列番号133の重鎖配列および配列番号134軽鎖配列;または(c)配列番号130の重鎖配列および配列番号140の軽鎖配列;または(d)配列番号130の重鎖配列および配列番号141の軽鎖配列;または(e)配列番号131の重鎖配列および配列番号140の軽鎖配列;または(f)配列番号131の重鎖配列および配列番号141の軽鎖配列;または(g)配列番号144の重鎖配列および配列番号142の軽鎖配列;または(h)配列番号144の重鎖配列および配列番号143の軽鎖配列;または(i)配列番号137の重鎖配列および配列番号138の軽鎖配列;または(j)配列番号130の重鎖配列および配列番号145の軽鎖配列;または(d)配列番号130の重鎖配列および配列番号146の軽鎖配列;または(e)配列番号131の重鎖配列および配列番号145の軽鎖配列;または(f)配列番号131の重鎖配列および146の軽鎖配列;または(g)配列番号144の重鎖配列および配列番号147の軽鎖配列;または(h)配列番号144の重鎖配列および配列番号148の軽鎖配列を含む。
いくつかの実施形態において、Ab-CIDEの抗B7-H4抗体は、第1の半抗体および第2の半抗体を含むバイエピトープ抗体であり、それが提供され、第1の半抗体は、B7-H4の第1のエピトープを結合する第1のVH/VL単位を含み、第2の半抗体は、B7-H4の第2のエピトープを結合する第2のVH/VL単位を含む。いくつかの実施形態において、第1のエピトープまたは第2のエピトープは、B7-H4Ig-V含有ドメインの全部または一部内のエピトープである。いくつかの実施形態において、第1のエピトープまたは第2のエピトープは、B7-H4Ig-Vドメイン内にないか、またはB7-H4Ig-V含有ドメイン内に完全にはない。いくつかの実施形態において、第1のエピトープは、B7-H4Ig-V含有ドメインの全部または一部内にあり、第2のエピトープは、B7-H4Ig-Vドメイン内にないか、またはB7-H4Ig-V含有ドメイン内に完全にはない;または、第1のエピトープがB7-H4Ig-Vドメイン内にないか、または完全にB7-H4Ig-V含有ドメイン内になく、第2のエピトープがB7-H4Ig-V含有ドメインの全部または一部内にある。いくつかの実施形態において、第1のエピトープおよび第2のエピトープは、それぞれ独立して、以下から選択される:
a)B7-H4Ig-V含有ドメインの全部または一部内のエピトープ;
b)B7-H4Ig-C含有ドメインの全部または一部内のエピトープ;および
c)B7-H4Ig-VおよびIg-C含有ドメインの全部または一部内のエピトープ。
いくつかの実施形態において、B7-H4Ig-V含有ドメインは、配列番号233のアミノ酸29~157の配列を有する。いくつかの実施形態において、B7-H4Ig-C含有ドメインは、配列番号233のアミノ酸158~250の配列を有する。
いくつかの実施形態において、
a)第1の半抗体は、B7-H4Ig-V含有ドメインの全部または一部内のエピトープを結合し、第2の半抗体は、B7-H4Ig-C含有ドメインの全部または一部内のエピトープを結合する;または
b)第1の半抗体は、B7-H4Ig-V含有ドメインの全部または一部内のエピトープを結合し、第2の半抗体は、B7-H4Ig-VおよびIg-C含有ドメインの全部または一部内のエピトープを結合する;または
c)第1の半抗体は、B7-H4Ig-C含有ドメインの全部または一部内のエピトープを結合し、第2の半抗体は、B7-H4Ig-VおよびIg-C含有ドメインの全部または一部内のエピトープを結合する;または
d)第1の半抗体は、B7-H4Ig-C含有ドメインの全部または一部内のエピトープを結合し、第2の半抗体は、B7-H4Ig-V含有ドメインの全部または一部内のエピトープを結合する;または
e)第1の半抗体は、B7-H4Ig-VおよびIg-C含有ドメインの全部または一部内のエピトープを結合し、第2の半抗体は、B7-H4Ig-V含有ドメイン内の全部または一部のエピトープを結合する;または
f)第1の半抗体は、B7-H4Ig-VおよびIg-C含有ドメインの全部または一部内のエピトープを結合し、第2の半抗体は、B7-H4Ig-C含有ドメインの全部または一部内のエピトープを結合する。
いくつかの実施形態において、第1の半抗体は、B7-H4Ig-V含有ドメインの全部または一部内のエピトープを結合し、第2の半抗体は、B7-H4Ig-VおよびIg-C含有ドメインの全部または一部内のエピトープを結合する;または、第1の半抗体は、B7-H4Ig-VおよびIg-C含有ドメインの全部または一部内のエピトープを結合し、第2の半抗体は、B7-H4Ig-V含有ドメインの全部または一部の内のエピトープを結合する。
いくつかの実施形態において、第1の半抗体は、以下を含む:
(a)(i)配列番号199のアミノ酸配列を含むHVR-H1、(ii)配列番号200のアミノ酸配列を含むHVR-H2、(iii)配列番号128のアミノ酸配列を含むHVR-H3、(iv)配列番号202のアミノ酸配列を含むHVR-L1、(v)配列番号203のアミノ酸配列を含むHVR-L2、および(vi)配列番号129のアミノ酸配列を含むHVR-L3;
(b)(i)配列番号199のアミノ酸配列を含むHVR-H1、(ii)配列番号200のアミノ酸配列を含むHVR-H2、(iii)配列番号201のアミノ酸配列を含むHVR-H3、(iv)配列番号202のアミノ酸配列を含むHVR-L1、(v)配列番号203のアミノ酸配列を含むHVR-L2、および(vi)配列番号129のアミノ酸配列を含むHVR-L3;
(c)配列番号198のVH配列および配列番号126のVL配列;または
(d)配列番号127のVH配列および配列番号126のVL配列。
いくつかの実施形態において、第2の半抗体は、以下を含む:
(a)(i)配列番号199のアミノ酸配列を含むHVR-H1、(ii)配列番号200のアミノ酸配列を含むHVR-H2、(iii)配列番号128のアミノ酸配列を含むHVR-H3、(iv)配列番号202のアミノ酸配列を含むHVR-L1、(v)配列番号203のアミノ酸配列を含むHVR-L2、および(vi)配列番号129のアミノ酸配列を含むHVR-L3;
(b)(i)配列番号199のアミノ酸配列を含むHVR-H1、(ii)配列番号200のアミノ酸配列を含むHVR-H2、(iii)配列番号201のアミノ酸配列を含むHVR-H3、(iv)配列番号202のアミノ酸配列を含むHVR-L1、(v)配列番号203のアミノ酸配列を含むHVR-L2、および(vi)配列番号129のアミノ酸配列を含むHVR-L3;
(c)配列番号198のVH配列および配列番号126のVL配列;または
(d)配列番号127のVH配列および配列番号126のVL配列。
いくつかの実施形態において、第1の半抗体は以下を含む:
(a)(i)配列番号218のアミノ酸配列を含むHVR-H1、(ii)配列番号219のアミノ酸配列を含むHVR-H2、(iii)配列番号220のアミノ酸配列を含むHVR-H3、(iv)配列番号221のアミノ酸配列を含むHVR-L1、(v)配列番号222のアミノ酸配列を含むHVR-L2、および(vi)配列番号223のアミノ酸配列を含むHVR-L3;または
(b)配列番号216のVH配列および配列番号215のVL配列。
いくつかの実施形態において、第2の半抗体は、以下を含む:
(a)(i)配列番号218のアミノ酸配列を含むHVR-H1、(ii)配列番号219のアミノ酸配列を含むHVR-H2、(iii)配列番号220のアミノ酸配列を含むHVR-H3、(iv)配列番号221のアミノ酸配列を含むHVR-L1、(v)配列番号222のアミノ酸配列を含むHVR-L2、および(vi)配列番号223のアミノ酸配列を含むHVR-L3;または
(b)配列番号216のVH配列および配列番号215のVL配列。
いくつかの態様では、Ab-CIDEの抗B7-H4抗体は、IgG1またはIgG4抗体であるバイエピトープ抗体である。いくつかの実施形態において、第1の半抗体は、ノブ変異を含む第1重鎖定常領域を含み、第2重鎖は、ホール変異を含む第2重鎖定常領域を含む;または、第1の半抗体は、ホール変異を含む第1重鎖定常領域を含み、第2重鎖は、ノブ変異を含む第2重鎖定常領域を含む。いくつかの態様において、バイエピトープ抗体はIgG1抗体であり、ノブ変異はT366W変異を含む。いくつかの実施形態において、バイエピトープ抗体はIgG1抗体であり、ホール変異は、T366S、L368AおよびY407Vから選択される少なくとも1つ、少なくとも2つまたは3つの突然変異を含む。いくつかの態様において、バイエピトープ抗体はIgG4抗体であり、ノブ変異はT366W変異を含む。いくつかの実施形態において、バイエピトープ抗体はIgG4抗体であり、ホール変異は、T366S、L368AおよびY407Vの変異から選択される少なくとも1つ、少なくとも2つまたは3つの突然変異を含む。
いくつかの態様では、バイエピトープ抗体であるAb-CIDEの抗B7-H4抗体が提供され:
a)第1の半抗体が、配列番号159または163の重鎖配列、および配列番号145または146の軽鎖配列を含み、
b)第1の半抗体が、配列番号160もしくは164の重鎖配列、および配列番号145もしくは146の軽鎖配列を含み;
c)第1の半抗体が、配列番号161もしくは165の重鎖配列、および配列番号147もしくは148の軽鎖配列を含み;
d)第1の半抗体が、配列番号162もしくは166の重鎖配列、および配列番号147もしくは148の軽鎖配列を含み;
e)第2の半抗体が、配列番号159もしくは163の重鎖配列、および配列番号145もしくは146の軽鎖配列を含み;
f)第2の半抗体が、配列番号160もしくは164の重鎖配列、および配列番号145もしくは146の軽鎖配列を含み;
g)第2の半抗体が、配列番号161もしくは165の重鎖配列、および配列番号147もしくは148の軽鎖配列を含み;または
h)第2の半抗体が、配列番号162もしくは166の重鎖配列、および配列番号147もしくは148の軽鎖配列を含む。
いくつかの態様では、バイエピトープ抗体であるAb-CIDEの抗B7-H4抗体が提供され:
a)第1の半抗体は、配列番号159もしくは163の重鎖配列および配列番号145もしくは146の軽鎖配列を含み、第2の半抗体は、配列番号162もしくは166の重鎖配列および配列番号147もしくは148の軽鎖配列を含む;または
b)第1の半抗体は、配列番号161もしくは165の重鎖配列および配列番号147もしくは148の軽鎖配列を含み、第2の半抗体は、配列番号160もしくは164の重鎖配列および配列番号145もしくは146の軽鎖配列を含む。
いくつかの実施形態において、バイエピトープ抗体であるAb-CIDEの抗B7-H4抗体であって、第1の半抗体および第2の半抗体を含み、第1の半抗体が、B7-H4の第1のエピトープを結合する第1のVH/VL単位を含み、第2の半抗体が、B7-H4の第2のエピトープを結合する第2のVH/VL単位を含み、第1の半抗体が、配列番号159または163の重鎖配列および配列番号145の軽鎖配列を含み、第2の半抗体が、配列番号162または166の重鎖配列および配列番号147の軽鎖配列を含む抗B7-H4抗体が提供される。
本明細書に記載されるいずれかの実施形態において、B7-H4は、配列番号233のヒトB7-H4であり得る。
シグナル配列(アミノ酸1~28)を有する例示的な天然のヒトB7-H4前駆体タンパク質配列を配列番号233に提供し、対応する成熟B7-H4タンパク質配列を配列番号234(配列番号233のアミノ酸29~282に対応する)に示す。
特定の実施形態において、抗B7-H4抗体は、任意の組み合わせにおいて、次の特徴のうち1つまたは複数を有する:
(a)B7-H4Ig-V含有ドメイン(配列番号233のアミノ酸29~157)の全部または一部内のエピトープに結合する;またはB7-H4Ig-C含有ドメイン(配列番号233のアミノ酸158~250)の全部もしくは一部内のエピトープに結合する;またはB7-H4Ig-VおよびIg-Cドメインの全部または一部内のエピトープに結合する(配列番号233のアミノ酸29~250);または配列番号234(成熟ヒトB7-H4)の全部もしくは一部内のエピトープに結合する;または配列番号233(ヒトB7-H4前駆体)の全部もしくは一部内のエピトープに結合する、ならびに
(b)≦100nM、≦50nM、≦10nM、または≦9nM、または≦8nM、または≦7nM、または≦6nM、または≦5nM、または≦4nM、または≦3nM、または≦2nM、または≦1nM、必要に応じて≧0.0001nM、または≧0.001nM、または≧0.01nMの親和性でB7-H4を結合する。
Ab-CIDEの非限定的な例示的抗B7-H4抗体としては、本明細書中に記載のhu1D11.v1.9 varC2およびhu1D11.v1.9 varDが挙げられる。いくつかの実施形態において、B7-H4は、ヒトB7-H4である。いくつかの実施形態において、B7-H4は、ヒト、カニクイザル、マウス、およびラットB7-H4から選択される。
いくつかの実施形態において、Ab-CIDEの抗B7-H4抗体は、B7-H4Ig-V含有ドメイン(配列番号233のアミノ酸29~157)の全部または一部内のエピトープに結合する。いくつかの実施形態において、Ab-CIDEの抗B7-H4抗体は、B7-H4Ig-C含有ドメイン(配列番号233のアミノ酸158~250)の全部または一部内のエピトープに結合する。いくつかの実施形態において、Ab-CIDEの抗B7-H4抗体は、B7-H4Ig-VおよびIg-C含有ドメイン(配列番号233のアミノ酸29~250)の全部または一部内のエピトープに結合する。いくつかの実施形態において、Ab-CIDEの抗B7-H4抗体は、配列番号234(成熟ヒトB7-H4)の全部または一部内のエピトープに結合する。いくつかの実施形態において、Ab-CIDEの抗B7-H4抗体は、配列番号233(ヒトB7-H4前駆体)の全部または一部内のエピトープに結合する。そのようないくつかの実施形態において、Ab-CIDEの抗B7-H4抗体は、≦100nM、≦50nM、≦10nM、または≦9nM、または≦8nM、または≦7nM、または≦6nM、または≦5nM、または≦4nM、または≦3nM、または≦2nM、または≦1nM、必要に応じて、≧0.0001nM、または≧0.001nM、または≧0.01nMの親和性でB7-H4を結合する。
抗体1D11v1.9変異体および他の実施形態
いくつかの実施形態において、Ab-CIDEの抗B7-H4抗体は、(a)配列番号199のアミノ酸配列を含むHVR-H1、(b)配列番号200のアミノ酸配列を含むHVR-H2、(c)配列番号128のアミノ酸配列を含むHVR-H3、(d)配列番号202のアミノ酸配列を含むHVR-L1、(e)配列番号203のアミノ酸配列を含むHVR-L2、および(f)配列番号129のアミノ酸配列を含むHVR-L3から選択される、少なくとも1つ、2つ、3つ、4つ、5つ、または6つのHVRを含む。
いくつかの実施形態において、Ab-CIDEの抗B7-H4抗体は、(a)配列番号199のアミノ酸配列を含むHVR-H1、(b)配列番号200のアミノ酸配列を含むHVR-H2、(c)配列番号201のアミノ酸配列を含むHVR-H3、(d)配列番号202のアミノ酸配列を含むHVR-L1、(e)配列番号203のアミノ酸配列を含むHVR-L2、および(f)配列番号129のアミノ酸配列を含むHVR-L3から選択される、少なくとも1つ、2つ、3つ、4つ、5つ、または6つのHVRを含む。
一態様では、Ab-CIDEの抗B7-H4抗体は、(a)配列番号199のアミノ酸配列を含むHVR-H1、(b)配列番号200のアミノ酸配列を含むHVR-H2、および(c)配列番号128のアミノ酸配列を含むHVR-H3から選択される、少なくとも1つ、少なくとも2つ、または3つのすべてのVH HVR配列を含む。一実施形態において、Ab-CIDEの抗B7-H4抗体は、配列番号201のアミノ酸配列を含むHVR-H3を含む。別の実施形態において、Ab-CIDEの抗B7-H4抗体は、配列番号128のアミノ酸配列を含むHVR-H3および配列番号129のアミノ酸配列を含むHVR-L3を含む。更なる実施形態において、Ab-CIDEの抗B7-H4抗体は、配列番号128のアミノ酸配列を含むHVR-H3、配列番号129のアミノ酸配列を含むHVR-L3、および配列番号200のアミノ酸配列を含むHVR-H2を含む。更なる実施形態において、Ab-CIDEの抗B7-H4抗体は、(a)配列番号199のアミノ酸配列を含むHVR-H1、(b)配列番号200のアミノ酸配列を含むHVR-H2、および(c)配列番号128のアミノ酸配列を含むHVR-H3を含む。
一態様では、Ab-CIDEの抗B7-H4抗体は、(a)配列番号199のアミノ酸配列を含むHVR-H1、(b)配列番号200のアミノ酸配列を含むHVR-H2、および(c)配列番号201のアミノ酸配列を含むHVR-H3から選択される、少なくとも1つ、少なくとも2つ、または3つのすべてのVH HVR配列を含む。一実施形態において、Ab-CIDEの抗B7-H4抗体は、配列番号201のアミノ酸配列を含むHVR-H3を含む。別の実施形態において、Ab-CIDEの抗B7-H4抗体は、配列番号201のアミノ酸配列を含むHVR-H3および配列番号129のアミノ酸配列を含むHVR-L3を含む。更なる実施形態において、Ab-CIDEの抗B7-H4抗体は、配列番号201のアミノ酸配列を含むHVR-H3、配列番号129のアミノ酸配列を含むHVR-L3、および配列番号200のアミノ酸配列を含むHVR-H2を含む。更なる実施形態において、Ab-CIDEの抗B7-H4抗体は、(a)配列番号199のアミノ酸配列を含むHVR-H1、(b)配列番号200のアミノ酸配列を含むHVR-H2、および(c)配列番号201のアミノ酸配列を含むHVR-H3を含む。
別の態様では、(a)配列番号202のアミノ酸配列を含むHVR-L1、(b)配列番号203のアミノ酸配列を含むHVR-L2、および(c)配列番号129のアミノ酸配列を含むHVR-L3から選択される、少なくとも1つ、少なくとも2つ、または3つすべてのVL HVR配列を含むAb-CIDEの抗B7-H4抗体が提供される。一実施形態において、Ab-CIDEの抗B7-H4抗体は、(a)配列番号202のアミノ酸配列を含むHVR-L1、(b)配列番号203のアミノ酸配列を含むHVR-L2、および(c)配列番号129のアミノ酸配列を含むHVR-L3を含む。
別の態様において、Ab-CIDEの抗体B7-H4抗体は、(a)(i)配列番号199のアミノ酸配列を含むHVR-H1、(ii)配列番号200のアミノ酸配列を含むHVR-H2、および(iii)配列番号128から選択されるアミノ酸配列を含むHVR-H3から選択される少なくとも1つ、少なくとも2つ、または3つ全てのVH HVR配列を含むVHドメイン、ならびに(b)(i)配列番号202のアミノ酸配列を含むHVR-L1、(ii)配列番号203のアミノ酸配列を含むHVR-L2、および(c)配列番号129のアミノ酸配列を含むHVR-L3から選択される少なくとも1つ、少なくとも2つ、または3つ全てのVL HVR配列を含むVLドメインを含む、抗体を含む。
別の態様において、Ab-CIDEの抗体B7-H4抗体は、(a)(i)配列番号199のアミノ酸配列を含むHVR-H1、(ii)配列番号200のアミノ酸配列を含むHVR-H2、および(iii)配列番号201から選択されるアミノ酸配列を含むHVR-H3から選択される少なくとも1つ、少なくとも2つ、または3つ全てのVH HVR配列を含むVHドメイン、ならびに(b)(i)配列番号202のアミノ酸配列を含むHVR-L1、(ii)配列番号203のアミノ酸配列を含むHVR-L2、および(c)配列番号129のアミノ酸配列を含むHVR-L3から選択される少なくとも1つ、少なくとも2つ、または3つ全てのVL HVR配列を含むVLドメインを含む、抗体を含む。
別の態様では、Ab-CIDEの抗B7-H4抗体は、(a)配列番号199のアミノ酸配列を含むHVR-H1、(b)配列番号200のアミノ酸配列を含むHVR-H2、(c)配列番号128のアミノ酸配列を含むHVR-H3、(d)配列番号202のアミノ酸配列を含むHVR-L1、(e)配列番号203のアミノ酸配列を含むHVR-L2、および(f)配列番号129のアミノ酸配列を含むHVR-L3を含む。
別の態様では、Ab-CIDEの抗B7-H4抗体は、(a)配列番号199のアミノ酸配列を含むHVR-H1、(b)配列番号200のアミノ酸配列を含むHVR-H2、(c)配列番号201のアミノ酸配列を含むHVR-H3、(d)配列番号202のアミノ酸配列を含むHVR-L1、(e)配列番号203のアミノ酸配列を含むHVR-L2、および(f)配列番号129のアミノ酸配列を含むHVR-L3を含む。
上述の実施形態のうちのいずれかにおいて、Ab-CIDEの抗B7-H4抗体はヒト化されている。一実施形態において、Ab-CIDEの抗B7-H4抗体は、上の実施形態のいずれかにあるようなHVRを含み、ヒトアクセプターフレームワーク、例えば、ヒト免疫グロブリンフレームワークまたはヒトコンセンサスフレームワークをさらに含む。特定の実施形態において、ヒトアクセプターフレームワークは、ヒトVLカッパIコンセンサス(VLKI)フレームワークおよび/またはVHフレームワークVHである。特定の実施形態において、ヒトアクセプターフレームワークは、以下の突然変異のうちのいずれか1つを含む、ヒトVLカッパIコンセンサス(VLKI)フレームワークおよび/またはVHフレームワークVHである:軽鎖フレームワーク領域FR3におけるY49H、V58I、T69Rおよび/またはF71Y変異;重鎖フレームワーク領域FR3中のV67A、I69L、R71A、T73Kおよび/またはT75S変異。
いくつかの実施形態において、Ab-CIDEの抗B7-H4抗体は、上記の実施形態のいずれかのHVRを含み、配列番号213の重鎖フレームワークFR3配列をさらに含む。いくつかのかかる実施形態において、重鎖可変ドメインフレームワークは、配列番号213のFR3配列を有する改変ヒトVHフレームワークである。
別の態様では、Ab-CIDEの抗B7-H4抗体は、配列番号198または127のアミノ酸配列に対して少なくとも90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%、または100%の配列同一性を有する重鎖可変ドメイン(VH)配列を含む。特定の実施形態において、配列番号198または127のアミノ酸配列に対して少なくとも90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、または99%の同一性を有するVH配列は、参照配列と比べて、置換(例えば、保存的置換)、挿入、または欠失を含有するが、その配列を含む抗B7-H4抗体は、B7-H4に結合する能力を保持する。特定の実施形態において、配列番号198または127において合計1~10個のアミノ酸が置換、挿入および/または欠失されている。特定の実施形態において、合計1~5個のアミノ酸が、配列番号198または127において置換、挿入、および/または欠失されている。特定の実施形態において、置換、挿入、または欠失は、HVRの外側の領域で(すなわち、FRで)生じる。
必要に応じて、Ab-CIDEの抗B7-H4抗体は、配列番号198のVH配列を含み、その配列の翻訳後修飾を含む。特定の実施形態において、VHは、以下から選択される2つまたは3つのHVRを含む:(a)配列番号199のアミノ酸配列を含むHVR-H1、(b)配列番号200のアミノ酸配列を含むHVR-H2、および(c)配列番号201のアミノ酸配列を含むHVR-H3。必要に応じて、Ab-CIDEの抗B7-H4抗体は、配列番号127のVH配列を含み、その配列の翻訳後修飾を含む。特定の実施形態において、VHは、以下から選択される2つまたは3つのHVRを含む:(a)配列番号199のアミノ酸配列を含むHVR-H1、(b)配列番号200のアミノ酸配列を含むHVR-H2、および(c)配列番号128のアミノ酸配列を含むHVR-H3。別の態様では、抗B7-H4抗体が提供され、該抗体は、配列番号126のアミノ酸配列に対して、少なくとも90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%、または100%の配列同一性を有する軽鎖可変ドメイン(VL)を含む。特定の実施形態において、配列番号126のアミノ酸配列に対して少なくとも90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、または99%の同一性を有するVL配列は、参照配列と比べて、置換(例えば、保存的置換)、挿入、または欠失を含有するが、その配列を含む抗B7-H4抗体は、B7-H4に結合する能力を保持する。特定の実施形態において、配列番号126において合計で1~10個のアミノ酸が置換、挿入、および/または欠失している。特定の実施形態において、配列番号126において合計で1~5個のアミノ酸が置換、挿入、および/または欠失している。特定の実施形態において、置換、挿入、または欠失は、HVRの外側の領域で(すなわち、FRで)生じる。必要に応じて、Ab-CIDEの抗B7-H4抗体は、配列番号126のVL配列を含み、その配列の翻訳後修飾を含む。特定の実施形態において、VLは、(a)配列番号202のアミノ酸配列を含むHVR-L1、(b)配列番号203のアミノ酸配列を含むHVR-L2、および(c)配列番号129のアミノ酸配列を含むHVR-L3から選択される、1つ、2つ、または3つのHVRを含む。
別の態様では、Ab-CIDEの抗B7-H4抗体が提供され、ここで、抗体は、上記に提供される実施形態のいずれかにあるようなVH、および上記に提供される実施形態のいずれかにあるようなVLを含む。
一実施形態において、Ab-CIDEの抗B7-H4抗体は、それぞれ配列番号198および配列番号126のVH配列およびVL配列を含み、これにはそれらの配列の翻訳後修飾が含まれる。一実施形態において、Ab-CIDEの抗B7-H4抗体は、それぞれ配列番号127および配列番号126のVH配列およびVL配列を含み、これにはそれらの配列の翻訳後修飾が含まれる。
特定の実施形態において、B7-H4に結合し、以下の特徴の少なくとも1つを有する、上記実施形態のいずれかによるAb-CIDEの抗B7-H4抗体が提供される:(a)B7-H4Ig-V含有ドメイン(配列番号233のアミノ酸29~157)の全部または一部内のエピトープに結合する;またはB7-H4Ig-C含有ドメイン(配列番号233のアミノ酸158~250)の全部もしくは一部内のエピトープに結合する;またはB7-H4Ig-VおよびIg-Cドメインの全部または一部内のエピトープに結合する(配列番号233のアミノ酸29~250);または配列番号234(成熟ヒトB7-H4)の全部もしくは一部内のエピトープに結合する;または配列番号233(ヒトB7-H4前駆体)の全部もしくは一部内のエピトープに結合する。いくつかの実施形態において、抗B7-H4抗体は、任意の組み合わせにおいて、次の特徴のうち1つまたは複数を有する:(a)B7-H4Ig-V含有ドメイン(配列番号233のアミノ酸29~157)の全部または一部内のエピトープに結合する;またはB7-H4Ig-C含有ドメイン(配列番号233のアミノ酸158~250)の全部もしくは一部内のエピトープに結合する;またはB7-H4Ig-VおよびIg-Cドメインの全部または一部内のエピトープに結合する(配列番号233のアミノ酸29~250);または配列番号234(成熟ヒトB7-H4)の全部もしくは一部内のエピトープに結合する;または配列番号233(ヒトB7-H4前駆体)の全部もしくは一部内のエピトープに結合する。
更なる態様では、上記の実施形態のいずれかによるAb-CIDEの抗B7-H4抗体は、キメラ抗体、ヒト化抗体、またはヒト抗体を含む、モノクローナル抗体である。一実施形態において、Ab-CIDEの抗B7-H4抗体は、抗体断片、例えば、Fv、Fab、Fab’、scFv、ダイアボディ、またはF(ab’)断片である。別の実施形態において、Ab-CIDEの抗B7-H4抗体は、実質的に完全長の抗体、例えば、本明細書に定義されるIgG1抗体、または他の抗体クラスもしくはアイソタイプである。
抗体1D11および他の実施形態
いくつかの実施形態において、Ab-CIDEの抗B7-H4抗体は、(a)配列番号5のアミノ酸配列を含むHVR-H1、(b)配列番号6のアミノ酸配列を含むHVR-H2、(c)配列番号167のアミノ酸配列を含むHVR-H3、(d)配列番号168のアミノ酸配列を含むHVR-L1、(e)配列番号169のアミノ酸配列を含むHVR-L2、および(f)配列番号10のアミノ酸配列を含むHVR-L3から選択される、少なくとも1つ、2つ、3つ、4つ、5つ、または6つのHVRを含む。別の実施形態において、Ab-CIDEの抗B7-H4抗体は、(a)配列番号199のアミノ酸配列を含むHVR-H1、(b)配列番号200のアミノ酸配列を含むHVR-H2、(c)配列番号201のアミノ酸配列を含むHVR-H3、(d)配列番号202のアミノ酸配列を含むHVR-L1、(e)配列番号203のアミノ酸配列を含むHVR-L2、および(f)配列番号204のアミノ酸配列を含むHVR-L3から選択される、少なくとも1つ、2つ、3つ、4つ、5つ、または6つのHVRを含む。
一態様では、Ab-CIDEの抗B7-H4抗体は、(a)配列番号5のアミノ酸配列を含むHVR-H1、(b)配列番号6のアミノ酸配列を含むHVR-H2、および(c)配列番号167のアミノ酸配列を含むHVR-H3から選択される、少なくとも1つ、少なくとも2つ、または3つのすべてのVH HVR配列を含む。一実施形態において、Ab-CIDEの抗B7-H4抗体は、配列番号167のアミノ酸配列を含むHVR-H3を含む。別の実施形態において、Ab-CIDEの抗B7-H4抗体は、配列番号167のアミノ酸配列を含むHVR-H3および配列番号170のアミノ酸配列を含むHVR-L3を含む。更なる実施形態において、Ab-CIDEの抗B7-H4抗体は、配列番号167のアミノ酸配列を含むHVR-H3、配列番号170のアミノ酸配列を含むHVR-L3、および配列番号6のアミノ酸配列を含むHVR-H2を含む。更なる実施形態において、Ab-CIDEの抗B7-H4抗体は、(a)配列番号5のアミノ酸配列を含むHVR-H1、(b)配列番号6のアミノ酸配列を含むHVR-H2、および(c)配列番号167のアミノ酸配列を含むHVR-H3を含む。
一態様では、Ab-CIDEの抗B7-H4抗体は、(a)配列番号199のアミノ酸配列を含むHVR-H1、(b)配列番号200のアミノ酸配列を含むHVR-H2、および(c)配列番号201のアミノ酸配列を含むHVR-H3から選択される、少なくとも1つ、少なくとも2つ、または3つのすべてのVH HVR配列を含む。一実施形態において、Ab-CIDEの抗B7-H4抗体は、配列番号201のアミノ酸配列を含むHVR-H3を含む。別の実施形態において、Ab-CIDEの抗B7-H4抗体は、配列番号201のアミノ酸配列を含むHVR-H3および配列番号204のアミノ酸配列を含むHVR-L3を含む。更なる実施形態において、Ab-CIDEの抗B7-H4抗体は、配列番号201のアミノ酸配列を含むHVR-H3、配列番号204のアミノ酸配列を含むHVR-L3、および配列番号200のアミノ酸配列を含むHVR-H2を含む。更なる実施形態において、Ab-CIDEの抗B7-H4抗体は、(a)配列番号199のアミノ酸配列を含むHVR-H1、(b)配列番号200のアミノ酸配列を含むHVR-H2、および(c)配列番号201のアミノ酸配列を含むHVR-H3を含む。
別の態様では、(a)配列番号168のアミノ酸配列を含むHVR-L1、(b)配列番号169のアミノ酸配列を含むHVR-L2、および(c)配列番号170のアミノ酸配列を含むHVR-L3から選択される、少なくとも1つ、少なくとも2つ、または3つすべてのVL HVR配列を含むAb-CIDEの抗B7-H4抗体が提供される。一実施形態において、Ab-CIDEの抗B7-H4抗体は、(a)配列番号168のアミノ酸配列を含むHVR-L1、(b)配列番号169のアミノ酸配列を含むHVR-L2、および(c)配列番号170のアミノ酸配列を含むHVR-L3を含む。
別の態様では、(a)配列番号202のアミノ酸配列を含むHVR-L1、(b)配列番号203のアミノ酸配列を含むHVR-L2、および(c)配列番号204のアミノ酸配列を含むHVR-L3から選択される、少なくとも1つ、少なくとも2つ、または3つすべてのVL HVR配列を含むAb-CIDEの抗B7-H4抗体が提供される。一実施形態において、抗体は、(a)配列番号202のアミノ酸配列を含むHVR-L1、(b)配列番号203のアミノ酸配列を含むHVR-L2、および(c)配列番号204のアミノ酸配列を含むHVR-L3を含む。
別の態様において、Ab-CIDEの抗体B7-H4抗体は、(a)(i)配列番号5のアミノ酸配列を含むHVR-H1、(ii)配列番号6のアミノ酸配列を含むHVR-H2、および(iii)配列番号167から選択されるアミノ酸配列を含むHVR-H3から選択される少なくとも1つ、少なくとも2つ、または3つ全てのVH HVR配列を含むVHドメイン、ならびに(b)(i)配列番号168のアミノ酸配列を含むHVR-L1、(ii)配列番号169のアミノ酸配列を含むHVR-L2、および(c)配列番号170のアミノ酸配列を含むHVR-L3から選択される少なくとも1つ、少なくとも2つ、または3つ全てのVL HVR配列を含むVLドメインを含む、抗体を含む。
別の態様において、Ab-CIDEの抗体B7-H4抗体は、(a)(i)配列番号199のアミノ酸配列を含むHVR-H1、(ii)配列番号200のアミノ酸配列を含むHVR-H2、および(iii)配列番号201から選択されるアミノ酸配列を含むHVR-H3から選択される少なくとも1つ、少なくとも2つ、または3つ全てのVH HVR配列を含むVHドメイン、ならびに(b)(i)配列番号202のアミノ酸配列を含むHVR-L1、(ii)配列番号203のアミノ酸配列を含むHVR-L2、および(c)配列番号204のアミノ酸配列を含むHVR-L3から選択される少なくとも1つ、少なくとも2つ、または3つ全てのVL HVR配列を含むVLドメインを含む、抗体を含む。
別の態様では、Ab-CIDEの抗B7-H4抗体は、(a)配列番号5のアミノ酸配列を含むHVR-H1、(b)配列番号6のアミノ酸配列を含むHVR-H2、(c)配列番号167のアミノ酸配列を含むHVR-H3、(d)配列番号168のアミノ酸配列を含むHVR-L1、(e)配列番号169のアミノ酸配列を含むHVR-L2、および(f)配列番号170のアミノ酸配列を含むHVR-L3を含む。
別の態様では、Ab-CIDEの抗B7-H4抗体は、(a)配列番号199のアミノ酸配列を含むHVR-H1、(b)配列番号200のアミノ酸配列を含むHVR-H2、(c)配列番号201のアミノ酸配列を含むHVR-H3、(d)配列番号202のアミノ酸配列配列を含むHVR-L1、(e)配列番号203のアミノ酸配列を含むHVR-L2、および(f)配列番号204のアミノ酸配列を含むHVR-L3を含む。
上述の実施形態のうちのいずれかにおいて、Ab-CIDEの抗B7-H4抗体はヒト化されている。一実施形態において、Ab-CIDEの抗B7-H4抗体は、上の実施形態のいずれかにあるようなHVRを含み、ヒトアクセプターフレームワーク、例えば、ヒト免疫グロブリンフレームワークまたはヒトコンセンサスフレームワークをさらに含む。特定の実施形態において、ヒトアクセプターフレームワークは、ヒトVLカッパIコンセンサス(VLKI)フレームワークおよび/またはVHフレームワークVHである。特定の実施形態において、ヒトアクセプターフレームワークは、以下の突然変異のうちのいずれか1つを含む、ヒトVLカッパIコンセンサス(VLKI)フレームワークおよび/またはVHフレームワークVHである:軽鎖フレームワーク領域FR3におけるY49H、V58I、T69Rおよび/またはF71Y変異;重鎖フレームワーク領域FR3中のV67A、I69L、R71A、T73Kおよび/またはT75S変異。
いくつかの実施形態において、Ab-CIDEの抗B7-H4抗体は、上記の実施形態のいずれかのHVRを含み、配列番号211、212、または213の重鎖フレームワークFR3配列をさらに含む。いくつかのかかる実施形態において、重鎖可変ドメインフレームワークは、配列番号211、212、または213のFR3配列を有する改変ヒトVHフレームワークである。
別の態様では、Ab-CIDEの抗B7-H4抗体は、配列番号4のアミノ酸配列に対して少なくとも90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%、または100%の配列同一性を有する重鎖可変ドメイン(VH)配列を含む。特定の実施形態において、配列番号4のアミノ酸配列に対して少なくとも90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、または99%の同一性を有するVH配列は、参照配列と比べて、置換(例えば、保存的置換)、挿入、または欠失を含有するが、その配列を含む抗B7-H4抗体は、B7-H4に結合する能力を保持する。特定の実施形態において、配列番号4において合計で1~10個のアミノ酸が置換、挿入、および/または欠失している。特定の実施形態において、配列番号4において合計で1~5個のアミノ酸が置換、挿入、および/または欠失している。特定の実施形態において、置換、挿入、または欠失は、HVRの外側の領域で(すなわち、FRで)生じる。必要に応じて、Ab-CIDEの抗B7-H4抗体は、配列番号4のVH配列を含み、その配列の翻訳後修飾を含む。特定の実施形態において、VHは、以下から選択される2つまたは3つのHVRを含む:(a)配列番号5のアミノ酸配列を含むHVR-H1、(b)配列番号6のアミノ酸配列を含むHVR-H2、および(c)配列番号167のアミノ酸配列を含むHVR-H3。
別の態様では、Ab-CIDEの抗B7-H4抗体は、配列番号196、197、198、99、100、101、102、または103のアミノ酸配列に対して少なくとも90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%、または100%の配列同一性を有する重鎖可変ドメイン(VH)配列を含む。特定の実施形態において、配列番号196、197、198、99、100、101、102、または103のアミノ酸配列に対して少なくとも90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、または99%の同一性を有するVH配列は、参照配列と比べて、置換(例えば、保存的置換)、挿入、または欠失を含有するが、その配列を含む抗B7-H4抗体は、B7-H4に結合する能力を保持する。特定の実施形態において、合計1~10個のアミノ酸が、配列番号196、197、198、99、100、101、102、または103において置換、挿入、および/または欠失されている。特定の実施形態において、合計1~5個のアミノ酸が、配列番号196、197、198、99、100、101、102、または103において置換、挿入、および/または欠失されている。特定の実施形態において、置換、挿入、または欠失は、HVRの外側の領域で(すなわち、FRで)生じる。必要に応じて、Ab-CIDEの抗B7-H4抗体は、配列番号196、197、198、99、100、101、102、または103のVH配列を含み、その配列の翻訳後修飾を含む。特定の実施形態において、VHは、以下から選択される2つまたは3つのHVRを含む:(a)配列番号199のアミノ酸配列を含むHVR-H1、(b)配列番号200のアミノ酸配列を含むHVR-H2、および(c)配列番号201のアミノ酸配列を含むHVR-H3。
別の態様では、Ab-CIDEの抗B7-H4抗体が提供され、該抗体は、配列番号3のアミノ酸配列に対して、少なくとも90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%、または100%の配列同一性を有する軽鎖可変ドメイン(VL)を含む。特定の実施形態において、配列番号3のアミノ酸配列に対して少なくとも90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、または99%の同一性を有するVL配列は、参照配列と比べて、置換(例えば、保存的置換)、挿入、または欠失を含有するが、その配列を含む抗B7-H4抗体は、B7-H4に結合する能力を保持する。特定の実施形態において、配列番号3において合計で1~10個のアミノ酸が置換、挿入、および/または欠失している。特定の実施形態において、配列番号3において合計で1~5個のアミノ酸が置換、挿入、および/または欠失している。特定の実施形態において、置換、挿入、または欠失は、HVRの外側の領域で(すなわち、FRで)生じる。必要に応じて、Ab-CIDEの抗B7-H4抗体は、配列番号3のVL配列を含み、その配列の翻訳後修飾を含む。特定の実施形態において、VLは、(a)配列番号168のアミノ酸配列を含むHVR-L1、(b)配列番号169のアミノ酸配列を含むHVR-L2、および(c)配列番号170のアミノ酸配列を含むHVR-L3から選択される、1つ、2つ、または3つのHVRを含む。
別の態様では、抗B7-H4抗体が提供され、該抗体は、配列番号195、253、254、255、256、257、または258のアミノ酸配列に対して、少なくとも90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%、または100%の配列同一性を有する軽鎖可変ドメイン(VL)を含む。特定の実施形態において、配列番号195、253、254、255、256、257、または258のアミノ酸配列に対して少なくとも90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、または99%の同一性を有するVL配列は、参照配列と比べて、置換(例えば、保存的置換)、挿入、または欠失を含有するが、その配列を含む抗B7-H4抗体は、B7-H4に結合する能力を保持する。特定の実施形態において、合計1~10個のアミノ酸が、配列番号195、253、254、255、256、257、または258において置換、挿入、および/または欠失されている。特定の実施形態において、合計1~5個のアミノ酸が、配列番号195、253、254、255、256、257、または258において置換、挿入、および/または欠失されている。特定の実施形態において、置換、挿入、または欠失は、HVRの外側の領域で(すなわち、FRで)生じる。必要に応じて、Ab-CIDEの抗B7-H4抗体は、配列番号195、253、254、255、256、257、または258のVL配列を含み、その配列の翻訳後修飾を含む。特定の実施形態において、VLは、(a)配列番号202のアミノ酸配列を含むHVR-L1、(b)配列番号203のアミノ酸配列を含むHVR-L2、および(c)配列番号204のアミノ酸配列を含むHVR-L3から選択される、1つ、2つ、または3つのHVRを含む。
別の態様では、Ab-CIDEの抗B7-H4抗体が提供され、ここで、抗体は、上記に提供される実施形態のいずれかにあるようなVH、および上記に提供される実施形態のいずれかにあるようなVLを含む。
一実施形態において、Ab-CIDEの抗B7-H4抗体は、それぞれ配列番号4および配列番号3のVH配列およびVL配列を含み、これにはそれらの配列の翻訳後修飾が含まれる。一実施形態において、Ab-CIDEの抗B7-H4抗体は、それぞれ配列番号101および配列番号253のVH配列およびVL配列を含み、これにはそれらの配列の翻訳後修飾が含まれる。一実施形態において、Ab-CIDEの抗B7-H4抗体は、それぞれ配列番号101および配列番号257のVH配列およびVL配列を含み、これにはそれらの配列の翻訳後修飾が含まれる。一実施形態において、Ab-CIDEの抗B7-H4抗体は、それぞれ配列番号102および配列番号258のVH配列およびVL配列を含み、これにはそれらの配列の翻訳後修飾が含まれる。一実施形態において、Ab-CIDEの抗B7-H4抗体は、それぞれ配列番号103および配列番号258のVH配列およびVL配列を含み、これにはそれらの配列の翻訳後修飾が含まれる。一実施形態において、Ab-CIDEの抗B7-H4抗体は、それぞれ配列番号101および配列番号256のVH配列およびVL配列を含み、これにはそれらの配列の翻訳後修飾が含まれる。一実施形態において、Ab-CIDEの抗B7-H4抗体は、それぞれ配列番号101および配列番号255のVH配列およびVL配列を含み、これにはそれらの配列の翻訳後修飾が含まれる。一実施形態において、Ab-CIDEの抗B7-H4抗体は、それぞれ配列番号101および配列番号254のVH配列およびVL配列を含み、これにはそれらの配列の翻訳後修飾が含まれる。一実施形態において、Ab-CIDEの抗B7-H4抗体は、それぞれ配列番号100および配列番号253のVH配列およびVL配列を含み、これにはそれらの配列の翻訳後修飾が含まれる。一実施形態において、Ab-CIDEの抗B7-H4抗体は、それぞれ配列番号99および配列番号253のVH配列およびVL配列を含み、これにはそれらの配列の翻訳後修飾が含まれる。一実施形態において、Ab-CIDEの抗B7-H4抗体は、それぞれ配列番号196および配列番号253のVH配列およびVL配列を含み、これにはそれらの配列の翻訳後修飾が含まれる。一実施形態において、Ab-CIDEの抗B7-H4抗体は、それぞれ配列番号196および配列番号195のVH配列およびVL配列を含み、これにはそれらの配列の翻訳後修飾が含まれる。一実施形態において、Ab-CIDEの抗B7-H4抗体は、それぞれ配列番号197および配列番号195のVH配列およびVL配列を含み、これにはそれらの配列の翻訳後修飾が含まれる。一実施形態において、Ab-CIDEの抗B7-H4抗体は、それぞれ配列番号198および配列番号195のVH配列およびVL配列を含み、これにはそれらの配列の翻訳後修飾が含まれる。
更なる態様において、抗B7-H4抗体と同じエピトープに結合するAb-CIDEの抗B7-H4抗体が本明細書で提供される。例えば、特定の実施形態において、配列番号4のVH配列および配列番号3のVL配列を含む抗B7-H4抗体と、同じエピトープに結合するAb-CIDEの抗B7-H4抗体。特定の実施形態において、配列番号101のVH配列および配列番号253のVL配列を含む抗B7-H4抗体と、同じエピトープに結合するAb-CIDEの抗B7-H4抗体。特定の実施形態において、配列番号101のVH配列および配列番号257のVL配列を含む抗B7-H4抗体と、同じエピトープに結合するAb-CIDEの抗B7-H4抗体。特定の実施形態において、配列番号102のVH配列および配列番号258のVL配列を含む抗B7-H4抗体と、同じエピトープに結合するAb-CIDEの抗B7-H4抗体。特定の実施形態において、配列番号103のVH配列および配列番号258のVL配列を含む抗B7-H4抗体と、同じエピトープに結合するAb-CIDEの抗B7-H4抗体。特定の実施形態において、配列番号101のVH配列および配列番号256のVL配列を含む抗B7-H4抗体と、同じエピトープに結合するAb-CIDEの抗B7-H4抗体。特定の実施形態において、配列番号101のVH配列および配列番号255のVL配列を含む抗B7-H4抗体と、同じエピトープに結合するAb-CIDEの抗B7-H4抗体。特定の実施形態において、配列番号101のVH配列および配列番号254のVL配列を含む抗B7-H4抗体と、同じエピトープに結合するAb-CIDEの抗B7-H4抗体。特定の実施形態において、配列番号100のVH配列および配列番号253のVL配列を含む抗B7-H4抗体と、同じエピトープに結合するAb-CIDEの抗B7-H4抗体。特定の実施形態において、配列番号99のVH配列および配列番号253のVL配列を含む抗B7-H4抗体と、同じエピトープに結合するAb-CIDEの抗B7-H4抗体。特定の実施形態において、配列番号256のVH配列および配列番号253のVL配列を含む抗B7-H4抗体と、同じエピトープに結合するAb-CIDEの抗B7-H4抗体。特定の実施形態において、配列番号256のVH配列および配列番号255のVL配列を含む抗B7-H4抗体と、同じエピトープに結合するAb-CIDEの抗B7-H4抗体。特定の実施形態において、配列番号257のVH配列および配列番号195のVL配列を含む抗B7-H4抗体と、同じエピトープに結合するAb-CIDEの抗B7-H4抗体。特定の実施形態において、配列番号198のVH配列および配列番号195のVL配列を含む抗B7-H4抗体と、同じエピトープに結合するAb-CIDEの抗B7-H4抗体。
特定の実施形態において、B7-H4に結合し、以下の特徴の少なくとも1つを有する、上記実施形態のいずれかによるAb-CIDEの抗B7-H4抗体が提供される:(a)B7-H4Ig-V含有ドメイン(配列番号233のアミノ酸29~157)の全部または一部内のエピトープに結合する;またはB7-H4Ig-C含有ドメイン(配列番号233のアミノ酸158~250)の全部もしくは一部内のエピトープに結合する;またはB7-H4Ig-VおよびIg-Cドメインの全部または一部内のエピトープに結合する(配列番号233のアミノ酸29~250);または配列番号234(成熟ヒトB7-H4)の全部もしくは一部内のエピトープに結合する;または配列番号233(ヒトB7-H4前駆体)の全部もしくは一部内のエピトープに結合する。いくつかの実施形態において、抗B7-H4抗体は、任意の組み合わせにおいて、次の特徴のうち1つまたは複数を有する:(a)B7-H4Ig-V含有ドメイン(配列番号233のアミノ酸29~157)の全部または一部内のエピトープに結合する;またはB7-H4Ig-C含有ドメイン(配列番号233のアミノ酸158~250)の全部もしくは一部内のエピトープに結合する;またはB7-H4Ig-VおよびIg-Cドメインの全部または一部内のエピトープに結合する(配列番号233のアミノ酸29~250);または配列番号234(成熟ヒトB7-H4)の全部もしくは一部内のエピトープに結合する;または配列番号233(ヒトB7-H4前駆体)の全部もしくは一部内のエピトープに結合する。
更なる態様では、上記の実施形態のいずれかによるAb-CIDEの抗B7-H4抗体は、キメラ抗体、ヒト化抗体、またはヒト抗体を含む、モノクローナル抗体である。一実施形態において、Ab-CIDEの抗B7-H4抗体は、抗体断片、例えば、Fv、Fab、Fab’、scFv、ダイアボディ、またはF(ab’)断片である。別の実施形態において、Ab-CIDEの抗B7-H4抗体は、実質的に完全長の抗体、例えば、本明細書に定義されるIgG1抗体、または他の抗体クラスもしくはアイソタイプである。
抗体22C10および他の実施形態
いくつかの実施形態において、Ab-CIDEの抗B7-H4抗体は、(a)配列番号189のアミノ酸配列を含むHVR-H1、(b)配列番号190のアミノ酸配列を含むHVR-H2、(c)配列番号191のアミノ酸配列を含むHVR-H3、(d)配列番号192のアミノ酸配列を含むHVR-L1、(e)配列番号193のアミノ酸配列を含むHVR-L2、および(f)配列番号194のアミノ酸配列を含むHVR-L3から選択される、少なくとも1つ、2つ、3つ、4つ、5つ、または6つのHVRを含む。
別の態様において、Ab-CIDEの抗B7-H4抗体は、(a)配列番号218のアミノ酸配列を含むHVR-H1、(b)配列番号219のアミノ酸配列を含むHVR-H2、(c)配列番号220のアミノ酸配列を含むHVR-H3、(d)配列番号221のアミノ酸配列を含むHVR-L1、(e)配列番号222のアミノ酸配列を含むHVR-L2、および(f)配列番号223のアミノ酸配列を含むHVR-L3から選択される、少なくとも1つ、2つ、3つ、4つ、5つ、または6つのHVRを含む。
一態様では、Ab-CIDEの抗B7-H4抗体は、(a)配列番号189のアミノ酸配列を含むHVR-H1、(b)配列番号190のアミノ酸配列を含むHVR-H2、および(c)配列番号191のアミノ酸配列を含むHVR-H3から選択される、少なくとも1つ、少なくとも2つ、または3つのすべてのVH HVR配列を含む。一実施形態において、Ab-CIDEの抗B7-H4抗体は、配列番号191のアミノ酸配列を含むHVR-H3を含む。別の実施形態において、Ab-CIDEの抗B7-H4抗体は、配列番号191のアミノ酸配列を含むHVR-H3および配列番号194のアミノ酸配列を含むHVR-L3を含む。更なる実施形態において、Ab-CIDEの抗B7-H4抗体は、配列番号191のアミノ酸配列を含むHVR-H3、配列番号194のアミノ酸配列を含むHVR-L3、および配列番号190のアミノ酸配列を含むHVR-H2を含む。更なる実施形態において、Ab-CIDEの抗B7-H4抗体は、(a)配列番号189のアミノ酸配列を含むHVR-H1、(b)配列番号190のアミノ酸配列を含むHVR-H2、および(c)配列番号191のアミノ酸配列を含むHVR-H3を含む。
別の態様において、Ab-CIDEの抗B7-H4抗体は、(a)配列番号218のアミノ酸配列を含むHVR-H1、(b)配列番号219のアミノ酸配列を含むHVR-H2、および(c)配列番号220のアミノ酸配列を含むHVR-H3から選択される、少なくとも1つ、少なくとも2つ、または3つのすべてのVH HVR配列を含む。一実施形態において、Ab-CIDEの抗B7-H4抗体は、配列番号220のアミノ酸配列を含むHVR-H3を含む。別の実施形態において、Ab-CIDEの抗B7-H4抗体は、配列番号220のアミノ酸配列を含むHVR-H3および配列番号223のアミノ酸配列を含むHVR-L3を含む。更なる実施形態において、Ab-CIDEの抗B7-H4抗体は、配列番号220のアミノ酸配列を含むHVR-H3、配列番号223のアミノ酸配列を含むHVR-L3、および配列番号219のアミノ酸配列を含むHVR-H2を含む。更なる実施形態において、Ab-CIDEの抗B7-H4抗体は、(a)配列番号218のアミノ酸配列を含むHVR-H1、(b)配列番号219のアミノ酸配列を含むHVR-H2、および(c)配列番号220のアミノ酸配列を含むHVR-H3を含む。
別の態様では、(a)配列番号192のアミノ酸配列を含むHVR-L1、(b)配列番号193のアミノ酸配列を含むHVR-L2、および(c)配列番号194のアミノ酸配列を含むHVR-L3から選択される、少なくとも1つ、少なくとも2つ、または3つすべてのVL HVR配列を含むAb-CIDEの抗B7-H4抗体が提供される。一実施形態において、Ab-CIDEの抗B7-H4抗体は、(a)配列番号192のアミノ酸配列を含むHVR-L1、(b)配列番号193のアミノ酸配列を含むHVR-L2、および(c)配列番号194のアミノ酸配列を含むHVR-L3を含む。
別の態様では、(a)配列番号221のアミノ酸配列を含むHVR-L1、(b)配列番号222のアミノ酸配列を含むHVR-L2、および(c)配列番号223のアミノ酸配列を含むHVR-L3から選択される、少なくとも1つ、少なくとも2つ、または3つすべてのVL HVR配列を含むAb-CIDEの抗B7-H4抗体が提供される。一実施形態において、Ab-CIDEの抗B7-H4抗体は、(a)配列番号221のアミノ酸配列を含むHVR-L1、(b)配列番号222のアミノ酸配列を含むHVR-L2、および(c)配列番号223のアミノ酸配列を含むHVR-L3を含む。
別の態様において、Ab-CIDEの抗体B7-H4抗体は、(a)(i)配列番号189のアミノ酸配列を含むHVR-H1、(ii)配列番号190のアミノ酸配列を含むHVR-H2、および(iii)配列番号191のアミノ酸配列を含むHVR-H3から選択される少なくとも1つ、少なくとも2つ、または3つ全てのVH HVR配列を含むVHドメイン、ならびに(b)(i)配列番号192のアミノ酸配列を含むHVR-L1、(ii)配列番号193のアミノ酸配列を含むHVR-L2、および(c)配列番号194のアミノ酸配列を含むHVR-L3から選択される少なくとも1つ、少なくとも2つ、または3つ全てのVL HVR配列を含むVLドメインを含む、抗体を含む。
別の態様において、Ab-CIDEの抗体B7-H4抗体は、(a)(i)配列番号218のアミノ酸配列を含むHVR-H1、(ii)配列番号219のアミノ酸配列を含むHVR-H2、および(iii)配列番号220のアミノ酸配列を含むHVR-H3から選択される少なくとも1つ、少なくとも2つ、または3つ全てのVH HVR配列を含むVHドメイン、ならびに(b)(i)配列番号221のアミノ酸配列を含むHVR-L1、(ii)配列番号222のアミノ酸配列を含むHVR-L2、および(c)配列番号223のアミノ酸配列を含むHVR-L3から選択される少なくとも1つ、少なくとも2つ、または3つ全てのVL HVR配列を含むVLドメインを含む、抗体を含む。
別の態様では、Ab-CIDEの抗B7-H4抗体は、(a)配列番号189のアミノ酸配列を含むHVR-H1、(b)配列番号190のアミノ酸配列を含むHVR-H2、(c)配列番号191のアミノ酸配列を含むHVR-H3、(d)配列番号192のアミノ酸配列を含むHVR-L1、(e)配列番号193のアミノ酸配列を含むHVR-L2、および(f)配列番号194から選択されるアミノ酸配列を含むHVR-L3を含む。
別の態様では、Ab-CIDEの抗B7-H4抗体は、(a)配列番号218のアミノ酸配列を含むHVR-H1、(b)配列番号219のアミノ酸配列を含むHVR-H2、(c)配列番号220のアミノ酸配列を含むHVR-H3、(d)配列番号221のアミノ酸配列配列を含むHVR-L1、(e)配列番号222のアミノ酸配列を含むHVR-L2、および(f)配列番号223から選択されるアミノ酸配列を含むHVR-L3を含む。
上記の実施形態のいずれかにおいて、Ab-CIDEの抗B7-H4抗体はヒト抗体である。
別の態様では、Ab-CIDEの抗B7-H4抗体は、配列番号188のアミノ酸配列に対して少なくとも90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%、または100%の配列同一性を有する重鎖可変ドメイン(VH)配列を含む。特定の実施形態において、配列番号188のアミノ酸配列に対して少なくとも90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、または99%の同一性を有するVH配列は、参照配列と比べて、置換(例えば、保存的置換)、挿入、または欠失を含有するが、その配列を含む抗B7-H4抗体は、B7-H4に結合する能力を保持する。特定の実施形態において、配列番号188において合計で1~10個のアミノ酸が置換、挿入、および/または欠失している。特定の実施形態において、配列番号188において合計で1~5個のアミノ酸が置換、挿入、および/または欠失している。特定の実施形態において、置換、挿入、または欠失は、HVRの外側の領域で(すなわち、FRで)生じる。必要に応じて、Ab-CIDEの抗B7-H4抗体は、配列番号188のVH配列を含み、その配列の翻訳後修飾を含む。特定の実施形態において、VHは、以下から選択される2つまたは3つのHVRを含む:(a)配列番号189のアミノ酸配列を含むHVR-H1、(b)配列番号190のアミノ酸配列を含むHVR-H2、および(c)配列番号191のアミノ酸配列を含むHVR-H3。
別の態様では、Ab-CIDEの抗B7-H4抗体が提供され、該抗体は、配列番号187のアミノ酸配列に対して、少なくとも90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%、または100%の配列同一性を有する軽鎖可変ドメイン(VL)を含む。特定の実施形態において、配列番号187のアミノ酸配列に対して少なくとも90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、または99%の同一性を有するVL配列は、参照配列と比べて、置換(例えば、保存的置換)、挿入、または欠失を含有するが、その配列を含む抗B7-H4抗体は、B7-H4に結合する能力を保持する。特定の実施形態において、配列番号187において合計で1~5個のアミノ酸が置換、挿入、および/または欠失している。特定の実施形態において、配列番号187において合計で1~10個のアミノ酸が置換、挿入、および/または欠失している。特定の実施形態において、置換、挿入、または欠失は、HVRの外側の領域で(すなわち、FRで)生じる。必要に応じて、Ab-CIDEの抗B7-H4抗体は、配列番号187のVL配列を含み、その配列の翻訳後修飾を含む。特定の実施形態において、VLは、(a)配列番号192のアミノ酸配列を含むHVR-L1、(b)配列番号193のアミノ酸配列を含むHVR-L2、および(c)配列番号194のアミノ酸配列を含むHVR-L3から選択される、1つ、2つ、または3つのHVRを含む。
別の態様では、抗B7-H4抗体が提供され、該抗体は、配列番号215、217、104、105、または106のアミノ酸配列に対して、少なくとも90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%、または100%の配列同一性を有する軽鎖可変ドメイン(VL)を含む。特定の実施形態において、配列番号215、217、104、105、または106のアミノ酸配列に対して少なくとも90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、または99%の同一性を有するVL配列は、参照配列と比べて、置換(例えば、保存的置換)、挿入、または欠失を含有するが、その配列を含む抗B7-H4抗体は、B7-H4に結合する能力を保持する。特定の実施形態において、合計1~5個のアミノ酸が、配列番号215、217、104、105、または106において置換、挿入、および/または欠失されている。特定の実施形態において、合計1~10個のアミノ酸が、配列番号215、217、104、105、または106において置換、挿入、および/または欠失されている。特定の実施形態において、置換、挿入、または欠失は、HVRの外側の領域で(すなわち、FRで)生じる。必要に応じて、Ab-CIDEの抗B7-H4抗体は、配列番号215、217、104、105、または106のVL配列を含み、その配列の翻訳後修飾を含む。特定の実施形態において、VLは、(a)配列番号221のアミノ酸配列を含むHVR-L1、(b)配列番号222のアミノ酸配列を含むHVR-L2、および(c)配列番号223のアミノ酸配列を含むHVR-L3から選択される、1つ、2つ、または3つのHVRを含む。
別の態様では、Ab-CIDEの抗B7-H4抗体であって、該抗体は、上記に提供される実施形態のいずれかにあるようなVH、および上記に提供される実施形態のいずれかにあるようなVLを含む。一実施形態において、Ab-CIDEの抗B7-H4抗体は、それぞれ配列番号111および配列番号104のVH配列およびVL配列を含み、これにはそれらの配列の翻訳後修飾が含まれる。一実施形態において、Ab-CIDEの抗B7-H4抗体は、それぞれ配列番号111および配列番号215のVH配列およびVL配列を含み、これにはそれらの配列の翻訳後修飾が含まれる。一実施形態において、Ab-CIDEの抗B7-H4抗体は、それぞれ配列番号112および配列番号215のVH配列およびVL配列を含み、これにはそれらの配列の翻訳後修飾が含まれる。一実施形態において、Ab-CIDEの抗B7-H4抗体は、それぞれ配列番号113および配列番号215のVH配列およびVL配列を含み、これにはそれらの配列の翻訳後修飾が含まれる。一実施形態において、Ab-CIDEの抗B7-H4抗体は、それぞれ配列番号114および配列番号215のVH配列およびVL配列を含み、これにはそれらの配列の翻訳後修飾が含まれる。一実施形態において、Ab-CIDEの抗B7-H4抗体は、それぞれ配列番号111および配列番号105のVH配列およびVL配列を含み、これにはそれらの配列の翻訳後修飾が含まれる。一実施形態において、Ab-CIDEの抗B7-H4抗体は、それぞれ配列番号111および配列番号106のVH配列およびVL配列を含み、これにはそれらの配列の翻訳後修飾が含まれる。一実施形態において、Ab-CIDEの抗B7-H4抗体は、それぞれ配列番号110および配列番号215のVH配列およびVL配列を含み、これにはそれらの配列の翻訳後修飾が含まれる。一実施形態において、Ab-CIDEの抗B7-H4抗体は、それぞれ配列番号109および配列番号215のVH配列およびVL配列を含み、これにはそれらの配列の翻訳後修飾が含まれる。一実施形態において、Ab-CIDEの抗B7-H4抗体は、それぞれ配列番号108および配列番号215のVH配列およびVL配列を含み、これにはそれらの配列の翻訳後修飾が含まれる。一実施形態において、Ab-CIDEの抗B7-H4抗体は、それぞれ配列番号107および配列番号215のVH配列およびVL配列を含み、これにはそれらの配列の翻訳後修飾が含まれる。一実施形態において、Ab-CIDEの抗B7-H4抗体は、それぞれ配列番号216および配列番号215のVH配列およびVL配列を含み、これにはそれらの配列の翻訳後修飾が含まれる。別の実施形態において、Ab-CIDEの抗B7-H4抗体は、それぞれ配列番号216および配列番号217のVH配列およびVL配列を含み、これにはそれらの配列の翻訳後修飾が含まれる。
更なる態様において、抗B7-H4抗体と同じエピトープに結合するAb-CIDEの抗B7-H4抗体が本明細書で提供される。例えば、特定の実施形態において、配列番号188のVH配列および配列番号187のVL配列を含む抗B7-H4抗体と、同じエピトープに結合するAb-CIDEの抗B7-H4抗体が提供される。特定の実施形態において、配列番号111のVH配列および配列番号104のVL配列を含む抗B7-H4抗体と同じエピトープに結合する、Ab-CIDEの抗B7-H4抗体が提供される。特定の実施形態において、配列番号111のVH配列および配列番号215のVL配列を含む抗B7-H4抗体と同じエピトープに結合する、Ab-CIDEの抗B7-H4抗体が提供される。特定の実施形態において、配列番号112のVH配列および配列番号215のVL配列を含む抗B7-H4抗体と同じエピトープに結合する、Ab-CIDEの抗B7-H4抗体が提供される。特定の実施形態において、配列番号113のVH配列および配列番号215のVL配列を含む抗B7-H4抗体と同じエピトープに結合する、Ab-CIDEの抗B7-H4抗体が提供される。特定の実施形態において、配列番号114のVH配列および配列番号215のVL配列を含む抗B7-H4抗体と、同じエピトープに結合するAb-CIDEの抗B7-H4抗体が提供される。特定の実施形態において、配列番号111のVH配列および配列番号105のVL配列を含む抗B7-H4抗体と、同じエピトープに結合するAb-CIDEの抗B7-H4抗体が提供される。特定の実施形態において、配列番号111のVH配列および配列番号106のVL配列を含む抗B7-H4抗体と、同じエピトープに結合するAb-CIDEの抗B7-H4抗体が提供される。特定の実施形態において、配列番号110のVH配列および配列番号215のVL配列を含む抗B7-H4抗体と、同じエピトープに結合するAb-CIDEの抗B7-H4抗体が提供される。特定の実施形態において、配列番号109のVH配列および配列番号215のVL配列を含む抗B7-H4抗体と、同じエピトープに結合するAb-CIDEの抗B7-H4抗体が提供される。特定の実施形態において、配列番号108のVH配列および配列番号215のVL配列を含む抗B7-H4抗体と、同じエピトープに結合するAb-CIDEの抗B7-H4抗体。特定の実施形態において、配列番号107のVH配列および配列番号215のVL配列を含む抗B7-H4抗体と、同じエピトープに結合するAb-CIDEの抗B7-H4抗体。特定の実施形態において、配列番号216のVH配列および配列番号215のVL配列を含む抗B7-H4抗体と、同じエピトープに結合するAb-CIDEの抗B7-H4抗体。特定の実施形態において、配列番号216のVH配列および配列番号217のVL配列を含む抗B7-H4抗体と、同じエピトープに結合するAb-CIDEの抗B7-H4抗体。
特定の実施形態において、B7-H4に結合し、以下の特徴の少なくとも1つを有する、上記実施形態のいずれかによるAb-CIDEの抗B7-H4抗体が提供される:(a)B7-H4Ig-V含有ドメイン(配列番号233のアミノ酸29~157)の全部または一部内のエピトープに結合する;またはB7-H4Ig-C含有ドメイン(配列番号233のアミノ酸158~250)の全部もしくは一部内のエピトープに結合する;またはB7-H4Ig-VおよびIg-Cドメインの全部または一部内のエピトープに結合する(配列番号233のアミノ酸29~250);または配列番号234(成熟ヒトB7-H4)の全部もしくは一部内のエピトープに結合する;または配列番号233(ヒトB7-H4前駆体)の全部もしくは一部内のエピトープに結合する。いくつかの実施形態において、抗B7-H4抗体は、任意の組み合わせにおいて、次の特徴のうち1つまたは複数を有する:(a)B7-H4Ig-V含有ドメイン(配列番号233のアミノ酸29~157)の全部または一部内のエピトープに結合する;またはB7-H4Ig-C含有ドメイン(配列番号233のアミノ酸158~250)の全部もしくは一部内のエピトープに結合する;またはB7-H4Ig-VおよびIg-Cドメインの全部または一部内のエピトープに結合する(配列番号233のアミノ酸29~250);または配列番号234(成熟ヒトB7-H4)の全部もしくは一部内のエピトープに結合する;または配列番号233(ヒトB7-H4前駆体)の全部もしくは一部内のエピトープに結合する。
更なる態様において、上記のいずれかの実施形態によるAb-CIDEの抗B7-H4抗体は、ヒト抗体を含むモノクローナル抗体である。一実施形態において、Ab-CIDEの抗B7-H4抗体は、抗体断片、例えば、Fv、Fab、Fab’、scFv、ダイアボディ、またはF(ab’)断片である。別の実施形態において、Ab-CIDEの抗B7-H4抗体は、実質的に完全長の抗体、例えば、本明細書に定義されるIgG2a抗体、または他の抗体クラスもしくはアイソタイプである。
抗体32D6および他の実施形態
いくつかの実施形態において、Ab-CIDEの抗B7-H4抗体は、(a)配列番号173のアミノ酸配列を含むHVR-H1、(b)配列番号174のアミノ酸配列を含むHVR-H2、(c)配列番号175のアミノ酸配列を含むHVR-H3、(d)配列番号176のアミノ酸配列を含むHVR-L1、(e)配列番号177のアミノ酸配列を含むHVR-L2、および(f)配列番号178のアミノ酸配列を含むHVR-L3から選択される、少なくとも1つ、2つ、3つ、4つ、5つ、または6つのHVRを含む。
一態様では、Ab-CIDEの抗B7-H4抗体は、(a)配列番号173のアミノ酸配列を含むHVR-H1、(b)配列番号174のアミノ酸配列を含むHVR-H2、および(c)配列番号175のアミノ酸配列を含むHVR-H3から選択される、少なくとも1つ、少なくとも2つ、または3つのすべてのVH HVR配列を含む。一実施形態において、Ab-CIDEの抗B7-H4抗体は、配列番号175のアミノ酸配列を含むHVR-H3を含む。別の実施形態において、Ab-CIDEの抗B7-H4抗体は、配列番号175のアミノ酸配列を含むHVR-H3および配列番号178のアミノ酸配列を含むHVR-L3を含む。更なる実施形態において、Ab-CIDEの抗B7-H4抗体は、配列番号175のアミノ酸配列を含むHVR-H3、配列番号178のアミノ酸配列を含むHVR-L3、および配列番号174のアミノ酸配列を含むHVR-H2を含む。更なる実施形態において、Ab-CIDEの抗B7-H4抗体は、(a)配列番号173のアミノ酸配列を含むHVR-H1、(b)配列番号174のアミノ酸配列を含むHVR-H2、および(c)配列番号175のアミノ酸配列を含むHVR-H3を含む。
別の態様では、(a)配列番号176のアミノ酸配列を含むHVR-L1、(b)配列番号177のアミノ酸配列を含むHVR-L2、および(c)配列番号178のアミノ酸配列を含むHVR-L3から選択される、少なくとも1つ、少なくとも2つ、または3つすべてのVL HVR配列を含むAb-CIDEの抗B7-H4抗体が提供される。一実施形態において、Ab-CIDEの抗B7-H4抗体は、(a)配列番号176のアミノ酸配列を含むHVR-L1、(b)配列番号177のアミノ酸配列を含むHVR-L2、および(c)配列番号178のアミノ酸配列を含むHVR-L3を含む。
別の態様において、Ab-CIDEの抗体B7-H4抗体は、(a)(i)配列番号173のアミノ酸配列を含むHVR-H1、(ii)配列番号174のアミノ酸配列を含むHVR-H2、および(iii)配列番号175のアミノ酸配列を含むHVR-H3から選択される少なくとも1つ、少なくとも2つ、または3つ全てのVH HVR配列を含むVHドメイン、ならびに(b)(i)配列番号176のアミノ酸配列を含むHVR-L1、(ii)配列番号177のアミノ酸配列を含むHVR-L2、および(c)配列番号178のアミノ酸配列を含むHVR-L3から選択される少なくとも1つ、少なくとも2つ、または3つ全てのVL HVR配列を含むVLドメインを含む、抗体を含む。
別の態様では、Ab-CIDEの抗B7-H4抗体は、(a)配列番号173のアミノ酸配列を含むHVR-H1、(b)配列番号174のアミノ酸配列を含むHVR-H2、(c)配列番号175のアミノ酸配列を含むHVR-H3、(d)配列番号176のアミノ酸配列配列を含むHVR-L1、(e)配列番号177のアミノ酸配列を含むHVR-L2、および(f)配列番号178から選択されるアミノ酸配列を含むHVR-L3を含む。
上記の実施形態のいずれかにおいて、Ab-CIDEの抗B7-H4抗体はヒト抗体である。
別の態様では、Ab-CIDEの抗B7-H4抗体は、配列番号172のアミノ酸配列に対して少なくとも90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%、または100%の配列同一性を有する重鎖可変ドメイン(VH)配列を含む。特定の実施形態において、配列番号172のアミノ酸配列に対して少なくとも90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、または99%の同一性を有するVH配列は、参照配列と比べて、置換(例えば、保存的置換)、挿入、または欠失を含有するが、その配列を含む抗B7-H4抗体は、B7-H4に結合する能力を保持する。特定の実施形態において、配列番号172において合計で1~10個のアミノ酸が置換、挿入、および/または欠失している。特定の実施形態において、配列番号172において合計で1~5個のアミノ酸が置換、挿入、および/または欠失している。特定の実施形態において、置換、挿入、または欠失は、HVRの外側の領域で(すなわち、FRで)生じる。必要に応じて、Ab-CIDEの抗B7-H4抗体は、配列番号172のVH配列を含み、その配列の翻訳後修飾を含む。特定の実施形態において、VHは、以下から選択される2つまたは3つのHVRを含む:(a)配列番号173のアミノ酸配列を含むHVR-H1、(b)配列番号174のアミノ酸配列を含むHVR-H2、および(c)配列番号175のアミノ酸配列を含むHVR-H3。
別の態様では、Ab-CIDEの抗B7-H4抗体が提供され、該抗体は、配列番号171のアミノ酸配列に対して、少なくとも90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%、または100%の配列同一性を有する軽鎖可変ドメイン(VL)を含む。特定の実施形態において、配列番号171のアミノ酸配列に対して少なくとも90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、または99%の同一性を有するVL配列は、参照配列と比べて、置換(例えば、保存的置換)、挿入、または欠失を含有するが、その配列を含む抗B7-H4抗体は、B7-H4に結合する能力を保持する。特定の実施形態において、配列番号171において合計で1~5個のアミノ酸が置換、挿入、および/または欠失している。特定の実施形態において、配列番号171において合計で1~10個のアミノ酸が置換、挿入、および/または欠失している。特定の実施形態において、置換、挿入、または欠失は、HVRの外側の領域で(すなわち、FRで)生じる。必要に応じて、Ab-CIDEの抗B7-H4抗体は、配列番号171のVL配列を含み、その配列の翻訳後修飾を含む。特定の実施形態において、VLは、(a)配列番号176のアミノ酸配列を含むHVR-L1、(b)配列番号177のアミノ酸配列を含むHVR-L2、および(c)配列番号178のアミノ酸配列を含むHVR-L3から選択される、1つ、2つ、または3つのHVRを含む。
別の態様では、Ab-CIDEの抗B7-H4抗体であって、該抗体は、上記に提供される実施形態のいずれかにあるようなVH、および上記に提供される実施形態のいずれかにあるようなVLを含む。一実施形態において、Ab-CIDEの抗B7-H4抗体は、それぞれ配列番号172および配列番号171のVH配列およびVL配列を含み、これにはそれらの配列の翻訳後修飾が含まれる。別の実施形態において、Ab-CIDEの抗B7-H4抗体は、それぞれ配列番号172および配列番号171のVH配列およびVL配列を含み、これにはそれらの配列の翻訳後修飾が含まれる。
更なる態様において、抗B7-H4抗体と同じエピトープに結合するAb-CIDEの抗B7-H4抗体が本明細書で提供される。例えば、特定の実施形態において、配列番号172のVH配列および配列番号171のVL配列を含む抗B7-H4抗体と、同じエピトープに結合するAb-CIDEの抗B7-H4抗体。
特定の実施形態において、B7-H4に結合し、以下の特徴の少なくとも1つを有する、上記実施形態のいずれかによるAb-CIDEの抗B7-H4抗体が提供される:(a)B7-H4Ig-V含有ドメイン(配列番号233のアミノ酸29~157)の全部または一部内のエピトープに結合する;またはB7-H4Ig-C含有ドメイン(配列番号233のアミノ酸158~250)の全部もしくは一部内のエピトープに結合する;またはB7-H4Ig-VおよびIg-Cドメインの全部または一部内のエピトープに結合する(配列番号233のアミノ酸29~250);または配列番号234(成熟ヒトB7-H4)の全部もしくは一部内のエピトープに結合する;または配列番号233(ヒトB7-H4前駆体)の全部もしくは一部内のエピトープに結合する。いくつかの実施形態において、抗B7-H4抗体は、任意の組み合わせにおいて、次の特徴のうち1つまたは複数を有する:(a)B7-H4Ig-V含有ドメイン(配列番号233のアミノ酸29~157)の全部または一部内のエピトープに結合する;またはB7-H4Ig-C含有ドメイン(配列番号233のアミノ酸158~250)の全部もしくは一部内のエピトープに結合する;またはB7-H4Ig-VおよびIg-Cドメインの全部または一部内のエピトープに結合する(配列番号233のアミノ酸29~250);または配列番号234(成熟ヒトB7-H4)の全部もしくは一部内のエピトープに結合する;配列番号233(ヒトB7-H4前駆体)の全部もしくは一部内のエピトープに結合する。
更なる態様において、上記のいずれかの実施形態によるAb-CIDEの抗B7-H4抗体は、ヒト抗体を含むモノクローナル抗体である。一実施形態において、Ab-CIDEの抗B7-H4抗体は、抗体断片、例えば、Fv、Fab、Fab’、scFv、ダイアボディ、またはF(ab’)断片である。別の実施形態において、Ab-CIDEの抗B7-H4抗体は、実質的に完全長の抗体、例えば、本明細書に定義されるIgG2a抗体、または他の抗体クラスもしくはアイソタイプである。
抗体9B9および他の実施形態
いくつかの実施形態において、Ab-CIDEの抗B7-H4抗体は、(a)配列番号181のアミノ酸配列を含むHVR-H1、(b)配列番号182のアミノ酸配列を含むHVR-H2、(c)配列番号183のアミノ酸配列を含むHVR-H3、(d)配列番号184のアミノ酸配列を含むHVR-L1、(e)配列番号185のアミノ酸配列を含むHVR-L2、および(f)配列番号186のアミノ酸配列を含むHVR-L3から選択される、少なくとも1つ、2つ、3つ、4つ、5つ、または6つのHVRを含む。
一態様では、Ab-CIDEの抗B7-H4抗体は、(a)配列番号181のアミノ酸配列を含むHVR-H1、(b)配列番号182のアミノ酸配列を含むHVR-H2、および(c)配列番号183のアミノ酸配列を含むHVR-H3から選択される、少なくとも1つ、少なくとも2つ、または3つのすべてのVH HVR配列を含む。一実施形態において、Ab-CIDEの抗B7-H4抗体は、配列番号183のアミノ酸配列を含むHVR-H3を含む。別の実施形態において、Ab-CIDEの抗B7-H4抗体は、配列番号183のアミノ酸配列を含むHVR-H3および配列番号186のアミノ酸配列を含むHVR-L3を含む。更なる実施形態において、Ab-CIDEの抗B7-H4抗体は、配列番号183のアミノ酸配列を含むHVR-H3、配列番号186のアミノ酸配列を含むHVR-L3、および配列番号182のアミノ酸配列を含むHVR-H2を含む。更なる実施形態において、Ab-CIDEの抗B7-H4抗体は、(a)配列番号181のアミノ酸配列を含むHVR-H1、(b)配列番号182のアミノ酸配列を含むHVR-H2、および(c)配列番号183のアミノ酸配列を含むHVR-H3を含む。
別の態様では、(a)配列番号184のアミノ酸配列を含むHVR-L1、(b)配列番号185のアミノ酸配列を含むHVR-L2、および(c)配列番号186のアミノ酸配列を含むHVR-L3から選択される、少なくとも1つ、少なくとも2つ、または3つすべてのVL HVR配列を含むAb-CIDEの抗B7-H4抗体が提供される。一実施形態において、Ab-CIDEの抗B7-H4抗体は、(a)配列番号184のアミノ酸配列を含むHVR-L1、(b)配列番号185のアミノ酸配列を含むHVR-L2、および(c)配列番号186のアミノ酸配列を含むHVR-L3を含む。
別の態様において、Ab-CIDEの抗体B7-H4抗体は、(a)(i)配列番号181のアミノ酸配列を含むHVR-H1、(ii)配列番号182のアミノ酸配列を含むHVR-H2、および(iii)配列番号183のアミノ酸配列を含むHVR-H3から選択される少なくとも1つ、少なくとも2つ、または3つ全てのVH HVR配列を含むVHドメイン、ならびに(b)(i)配列番号184のアミノ酸配列を含むHVR-L1、(ii)配列番号185のアミノ酸配列を含むHVR-L2、および(c)配列番号186のアミノ酸配列を含むHVR-L3から選択される少なくとも1つ、少なくとも2つ、または3つ全てのVL HVR配列を含むVLドメインを含む、抗体を含む。
別の態様では、Ab-CIDEの抗B7-H4抗体は、(a)配列番号181のアミノ酸配列を含むHVR-H1、(b)配列番号182のアミノ酸配列を含むHVR-H2、(c)配列番号183のアミノ酸配列を含むHVR-H3、(d)配列番号184のアミノ酸配列配列を含むHVR-L1、(e)配列番号185のアミノ酸配列を含むHVR-L2、および(f)配列番号186から選択されるアミノ酸配列を含むHVR-L3を含む。
上記の実施形態のいずれかにおいて、Ab-CIDEの抗B7-H4抗体はヒト抗体である。
別の態様では、Ab-CIDEの抗B7-H4抗体は、配列番号180のアミノ酸配列に対して少なくとも90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%、または100%の配列同一性を有する重鎖可変ドメイン(VH)配列を含む。特定の実施形態において、配列番号180のアミノ酸配列に対して少なくとも90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、または99%の同一性を有するVH配列は、参照配列と比べて、置換(例えば、保存的置換)、挿入、または欠失を含有するが、その配列を含む抗B7-H4抗体は、B7-H4に結合する能力を保持する。特定の実施形態において、配列番号180において合計で1~10個のアミノ酸が置換、挿入、および/または欠失している。特定の実施形態において、配列番号180において合計で1~5個のアミノ酸が置換、挿入、および/または欠失している。特定の実施形態において、置換、挿入、または欠失は、HVRの外側の領域で(すなわち、FRで)生じる。必要に応じて、Ab-CIDEの抗B7-H4抗体は、配列番号180のVH配列を含み、その配列の翻訳後修飾を含む。特定の実施形態において、VHは、以下から選択される2つまたは3つのHVRを含む:(a)配列番号181のアミノ酸配列を含むHVR-H1、(b)配列番号182のアミノ酸配列を含むHVR-H2、および(c)配列番号183のアミノ酸配列を含むHVR-H3。
別の態様では、抗B7-H4抗体が提供され、該抗体は、配列番号179のアミノ酸配列に対して、少なくとも90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%、または100%の配列同一性を有する軽鎖可変ドメイン(VL)を含む。特定の実施形態において、配列番号179のアミノ酸配列に対して少なくとも90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、または99%の同一性を有するVL配列は、参照配列と比べて、置換(例えば、保存的置換)、挿入、または欠失を含有するが、その配列を含む抗B7-H4抗体は、B7-H4に結合する能力を保持する。特定の実施形態において、配列番号179において合計で1~5個のアミノ酸が置換、挿入、および/または欠失している。特定の実施形態において、配列番号179において合計で1~10個のアミノ酸が置換、挿入、および/または欠失している。特定の実施形態において、置換、挿入、または欠失は、HVRの外側の領域で(すなわち、FRで)生じる。必要に応じて、Ab-CIDEの抗B7-H4抗体は、配列番号171のVL配列を含み、その配列の翻訳後修飾を含む。特定の実施形態において、VLは、(a)配列番号184のアミノ酸配列を含むHVR-L1、(b)配列番号185のアミノ酸配列を含むHVR-L2、および(c)配列番号186のアミノ酸配列を含むHVR-L3から選択される、1つ、2つ、または3つのHVRを含む。
別の態様では、Ab-CIDEの抗B7-H4抗体であって、該抗体は、上記に提供される実施形態のいずれかにあるようなVH、および上記に提供される実施形態のいずれかにあるようなVLを含む。一実施形態において、Ab-CIDEの抗B7-H4抗体は、それぞれ配列番号180および配列番号179のVH配列およびVL配列を含み、これにはそれらの配列の翻訳後修飾が含まれる。
更なる態様において、抗B7-H4抗体と同じエピトープに結合するAb-CIDEの抗B7-H4抗体が本明細書で提供される。例えば、特定の実施形態において、配列番号180のVH配列および配列番号179のVL配列を含む抗B7-H4抗体と、同じエピトープに結合するAb-CIDEの抗B7-H4抗体が提供される。
特定の実施形態において、B7-H4に対する、以下の特徴の少なくとも1つを有する、上記実施形態のいずれかによるAb-CIDEの抗B7-H4抗体が提供される:(a)B7-H4Ig-V含有ドメイン(配列番号233のアミノ酸29~157)の全部または一部内のエピトープに結合する;またはB7-H4Ig-C含有ドメイン(配列番号233のアミノ酸158~250)の全部もしくは一部内のエピトープに結合する;またはB7-H4Ig-VおよびIg-Cドメインの全部または一部内のエピトープに結合する(配列番号233のアミノ酸29~250);または配列番号234(成熟ヒトB7-H4)の全部もしくは一部内のエピトープに結合する;または配列番号233(ヒトB7-H4前駆体)の全部もしくは一部内のエピトープに結合する;いくつかの実施形態において、抗B7-H4抗体は、任意の組み合わせにおいて、次の特徴のうち1つまたは複数を有する:(a)B7-H4Ig-V含有ドメイン(配列番号233のアミノ酸29~157)の全部または一部内のエピトープに結合する;またはB7-H4Ig-C含有ドメイン(配列番号233のアミノ酸158~250)の全部もしくは一部内のエピトープに結合する;またはB7-H4Ig-VおよびIg-Cドメインの全部または一部内のエピトープに結合する(配列番号233のアミノ酸29~250);または配列番号234(成熟ヒトB7-H4)の全部もしくは一部内のエピトープに結合する;または配列番号233(ヒトB7-H4前駆体)の全部もしくは一部内のエピトープに結合する。
更なる態様において、上記のいずれかの実施形態によるAb-CIDEの抗B7-H4抗体は、ヒト抗体を含むモノクローナル抗体である。一実施形態において、Ab-CIDEの抗B7-H4抗体は、抗体断片、例えば、Fv、Fab、Fab’、scFv、ダイアボディ、またはF(ab’)断片である。別の実施形態において、Ab-CIDEの抗B7-H4抗体は、実質的に完全長の抗体、例えば、本明細書に定義されるIgG2a抗体、または他の抗体クラスもしくはアイソタイプである。
抗MUC16抗体
特定の実施形態において、Ab-CIDEは抗MUC16抗体を含む。
いくつかの実施形態において、本明細書には、(a)配列番号35のアミノ酸配列を含むHVR-H1、(b)配列番号36のアミノ酸配列を含むHVR-H2、(c)配列番号37のアミノ酸配列を含むHVR-H3、(d)配列番号32のアミノ酸配列を含むHVR-L1、(e)配列番号33のアミノ酸配列を含むHVR-L2、および(f)配列番号34のアミノ酸配列を含むHVR-L3から選択される、少なくとも1つ、2つ、3つ、4つ、5つ、または6つのHVRを含む、抗MUC16抗体を含むPACが記載される。
一態様において、本明細書には、(a)配列番号35のアミノ酸配列を含むHVR-H1、(b)配列番号36のアミノ酸配列を含むHVR-H2、(c)配列番号37のアミノ酸配列を含むHVR-H3から選択される、少なくとも1つ、少なくとも2つ、または3つ全てのVH HVR配列を含む抗体を含むAb-CIDEが記載される。更なる実施形態において、抗体は、(a)配列番号35のアミノ酸配列を含むHVR-H1、(b)配列番号36のアミノ酸配列を含むHVR-H2、(c)配列番号37のアミノ酸配列を含むHVR-H3を含む。
別の態様において、本明細書には、(a)配列番号32のアミノ酸配列を含むHVR-L1、(b)配列番号33のアミノ酸配列を含むHVR-L2、および(c)配列番号34のアミノ酸配列を含むHVR-L3から選択される、少なくとも1つ、少なくとも2つ、または3つ全てのVL HVR配列を含む抗体を含むAb-CIDEが記載される。一実施形態において、抗体は、(a)配列番号32のアミノ酸配列を含むHVR-L1、(b)配列番号33のアミノ酸配列を含むHVR-L2、および(c)配列番号34のアミノ酸配列を含むHVR-L3を含む。
別の態様において、Ab-CIDEは、(a)(i)配列番号35のアミノ酸配列を含むHVR-H1、(ii)配列番号36のアミノ酸配列を含むHVR-H2、および(iii)配列番号37から選択されるアミノ酸配列を含むHVR-H3から選択される少なくとも1つ、少なくとも2つ、または3つ全てのVH HVR配列を含むVHドメイン、ならびに(b)(i)配列番号32のアミノ酸配列を含むHVR-L1、(ii)配列番号33のアミノ酸配列を含むHVR-L2、および(c)配列番号34のアミノ酸配列を含むHVR-L3から選択される少なくとも1つ、少なくとも2つ、または3つ全てのVL HVR配列を含むVLドメインを含む、抗体を含む。
別の態様では、本明細書には、(a)配列番号35のアミノ酸配列を含むHVR-H1、(b)配列番号36のアミノ酸配列を含むHVR-H2、(c)配列番号37のアミノ酸配列を含むHVR-H3、(d)配列番号32のアミノ酸配列を含むHVR-L1、(e)配列番号33のアミノ酸配列を含むHVR-L2、および(f)配列番号34のアミノ酸配列を含むHVR-L3を含む抗体を含む、Ab-CIDEが記載される。
上述の実施形態のうちのいずれかにおいて、Ab-CIDEの抗MUC16抗体はヒト化されている。一実施形態において、抗MUC16抗体は、上の実施形態のいずれかにあるようなHVRを含み、ヒトアクセプターフレームワーク、例えば、ヒト免疫グロブリンフレームワークまたはヒトコンセンサスフレームワークをさらに含む。
別の態様では、Ab-CIDEの抗MUC16抗体は、配列番号39のアミノ酸配列に対して少なくとも90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%、または100%の配列同一性を有する重鎖可変ドメイン(VH)配列を含む。特定の実施形態において、配列番号39のアミノ酸配列に対して少なくとも90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、または99%の同一性を有するVH配列は、参照配列と比べて、置換(例えば、保存的置換)、挿入、または欠失を含有するが、その配列を含む抗MUC16抗体は、MUC16に結合する能力を保持する。特定の実施形態において、配列番号39において合計で1~10個のアミノ酸が置換、挿入、および/または欠失している。特定の実施形態において、配列番号39において合計で1~5個のアミノ酸が置換、挿入、および/または欠失している。特定の実施形態において、置換、挿入、または欠失は、HVRの外側の領域内で(すなわち、FR内で)生じる。必要に応じて、抗MUC16抗体は、配列番号39のVH配列を含み、その配列の翻訳後修飾を含む。特定の実施形態において、VHは、以下から選択される2つまたは3つのHVRを含む:(a)配列番号35のアミノ酸配列を含むHVR-H1、(b)配列番号36のアミノ酸配列を含むHVR-H2、および(c)配列番号37のアミノ酸配列を含むHVR-H3。
別の態様では、Ab-CIDEの抗MUC16抗体が提供され、該抗体は、配列番号38のアミノ酸配列に対して、少なくとも90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%、または100%の配列同一性を有する軽鎖可変ドメイン(VL)を含む。特定の実施形態において、配列番号38のアミノ酸配列に対して少なくとも90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、または99%の同一性を有するVL配列は、参照配列と比べて、置換(例えば、保存的置換)、挿入、または欠失を含有するが、その配列を含む抗MUC16抗体は、MUC16に結合する能力を保持する。特定の実施形態において、配列番号38において合計で1~10個のアミノ酸が置換、挿入、および/または欠失している。特定の実施形態において、配列番号38において合計で1~5個のアミノ酸が置換、挿入、および/または欠失している。特定の実施形態において、置換、挿入、または欠失は、HVRの外側の領域で(すなわち、FR内で)生じる。必要に応じて、抗MUC16抗体は、配列番号38のVL配列を含み、その配列の翻訳後修飾を含む。特定の実施形態において、VLは、(a)配列番号32のアミノ酸配列を含むHVR-L1、(b)配列番号33のアミノ酸配列を含むHVR-L2、および(c)配列番号34のアミノ酸配列を含むHVR-L3から選択される、1つ、2つ、または3つのHVRを含む。
別の態様において、抗MUC16抗体を含むAb-CIDEが提供され、この抗体は、上述の実施形態のいずれかにあるようなVH、および上述の実施形態のいずれかにあるようなVLを含む。
一実施形態において、Ab-CIDEが提供され、該抗体は、それぞれ配列番号39および配列番号38のVH配列およびVL配列を含み、これにはそれらの配列の翻訳後修飾が含まれる。
さらなる態様において、本明細書において、本明細書に提供される抗MUC16抗体と同じエピトープに結合する抗体を含む、Ab-CIDEが提供される。例えば、特定の実施形態において、配列番号39のVH配列および配列番号38のVL配列をそれぞれ含む抗MUC16抗体と同じエピトープに結合する抗体を含むPACが提供される。
更なる態様において、上記のいずれかの実施形態によるAb-CIDEの抗MUC16抗体は、ヒト抗体を含むモノクローナル抗体である。一実施形態において、Ab-CIDEの抗MUC16抗体は、抗体断片、例えば、Fv、Fab、Fab’、scFv、ダイアボディ、またはF(ab’)断片である。別の実施形態において、本抗体は、実質的に完全長の抗体、例えば、本明細書に定義されるIgG1抗体、IgG2a抗体、または他の抗体クラスもしくはアイソタイプである。
抗STEAP-1抗体
特定の実施形態において、Ab-CIDEは抗STEAP-1抗体を含む。
いくつかの実施形態において、本明細書には、(a)配列番号40のアミノ酸配列を含むHVR-H1、(b)配列番号41のアミノ酸配列を含むHVR-H2、(c)配列番号42のアミノ酸配列を含むHVR-H3、(d)配列番号43のアミノ酸配列を含むHVR-L1、(e)配列番号44のアミノ酸配列を含むHVR-L2、および(f)配列番号45のアミノ酸配列を含むHVR-L3から選択される、少なくとも1つ、2つ、3つ、4つ、5つ、または6つのHVRを含む、抗STEAP-1抗体を含むPACが記載される。
一態様において、本明細書には、(a)配列番号40のアミノ酸配列を含むHVR-H1、(b)配列番号41のアミノ酸配列を含むHVR-H2、(c)配列番号42のアミノ酸配列を含むHVR-H3から選択される、少なくとも1つ、少なくとも2つ、または3つ全てのVH HVR配列を含む抗体を含むAb-CIDEが記載される。更なる実施形態において、抗体は、(a)配列番号40のアミノ酸配列を含むHVR-H1、(b)配列番号41のアミノ酸配列を含むHVR-H2、(c)配列番号42のアミノ酸配列を含むHVR-H3を含む。
別の態様において、本明細書には、(a)配列番号43のアミノ酸配列を含むHVR-L1、(b)配列番号44のアミノ酸配列を含むHVR-L2、および(c)配列番号45のアミノ酸配列を含むHVR-L3から選択される、少なくとも1つ、少なくとも2つ、または3つ全てのVL HVR配列を含む抗体を含むAb-CIDEが記載される。一実施形態において、抗体は、(a)配列番号43のアミノ酸配列を含むHVR-L1、(b)配列番号44のアミノ酸配列を含むHVR-L2、および(c)配列番号45のアミノ酸配列を含むHVR-L3を含む。
別の態様において、Ab-CIDEは、(a)(i)配列番号40のアミノ酸配列を含むHVR-H1、(ii)配列番号41のアミノ酸配列を含むHVR-H2、および(iii)配列番号42から選択されるアミノ酸配列を含むHVR-H3から選択される少なくとも1つ、少なくとも2つ、または3つ全てのVH HVR配列を含むVHドメイン、ならびに(b)(i)配列番号43のアミノ酸配列を含むHVR-L1、(ii)配列番号44のアミノ酸配列を含むHVR-L2、および(c)配列番号45のアミノ酸配列を含むHVR-L3から選択される少なくとも1つ、少なくとも2つ、または3つ全てのVL HVR配列を含むVLドメインを含む、抗体を含む。
別の態様では、本明細書には、(a)配列番号40のアミノ酸配列を含むHVR-H1、(b)配列番号41のアミノ酸配列を含むHVR-H2、(c)配列番号42のアミノ酸配列を含むHVR-H3、(d)配列番号43のアミノ酸配列を含むHVR-L1、(e)配列番号44のアミノ酸配列を含むHVR-L2、および(f)配列番号45のアミノ酸配列を含むHVR-L3を含む抗体を含む、Ab-CIDEが記載される。
上述の実施形態のうちのいずれかにおいて、Ab-CIDEの抗STEAP-1抗体はヒト化されている。一実施形態において、抗STEAP-1抗体は、上の実施形態のいずれかにあるようなHVRを含み、ヒトアクセプターフレームワーク、例えば、ヒト免疫グロブリンフレームワークまたはヒトコンセンサスフレームワークをさらに含む。
別の態様では、Ab-CIDEの抗STEAP-1抗体は、配列番号46のアミノ酸配列に対して少なくとも90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%、または100%の配列同一性を有する重鎖可変ドメイン(VH)配列を含む。特定の実施形態において、配列番号46のアミノ酸配列に対して少なくとも90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、または99%の同一性を有するVH配列は、参照配列と比べて、置換(例えば、保存的置換)、挿入、または欠失を含有するが、その配列を含む抗STEAP-1抗体は、STEAP-1に結合する能力を保持する。特定の実施形態において、配列番号46において合計で1~10個のアミノ酸が置換、挿入、および/または欠失している。特定の実施形態において、配列番号46において合計で1~5個のアミノ酸が置換、挿入、および/または欠失している。特定の実施形態において、置換、挿入、または欠失は、HVRの外側の領域内で(すなわち、FR内で)生じる。必要に応じて、抗STEAP-1抗体は、配列番号46のVH配列を含み、その配列の翻訳後修飾を含む。特定の実施形態において、VHは、以下から選択される2つまたは3つのHVRを含む:(a)配列番号40のアミノ酸配列を含むHVR-H1、(b)配列番号41のアミノ酸配列を含むHVR-H2、および(c)配列番号42のアミノ酸配列を含むHVR-H3。
別の態様では、Ab-CIDEの抗STEAP-1抗体が提供され、該抗体は、配列番号47のアミノ酸配列に対して、少なくとも90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%、または100%の配列同一性を有する軽鎖可変ドメイン(VL)を含む。特定の実施形態において、配列番号47のアミノ酸配列に対して少なくとも90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、または99%の同一性を有するVL配列は、参照配列と比べて、置換(例えば、保存的置換)、挿入、または欠失を含有するが、その配列を含む抗STEAP-1抗体は、STEAP-1に結合する能力を保持する。特定の実施形態において、合計1~10個のアミノ酸が、配列番号47内で置換、挿入、および/または欠失され、特定の実施形態において、合計1~5個のアミノ酸が、配列番号47内で置換、挿入、および/または欠失された。特定の実施形態において、置換、挿入、または欠失は、HVRの外側の領域で(すなわち、FR内で)生じる。必要に応じて、抗STEAP-1抗体は、配列番号47のVL配列を含み、その配列の翻訳後修飾を含む。特定の実施形態において、VLは、(a)配列番号43のアミノ酸配列を含むHVR-L1、(b)配列番号44のアミノ酸配列を含むHVR-L2、および(c)配列番号45のアミノ酸配列を含むHVR-L3から選択される、1つ、2つ、または3つのHVRを含む。
別の態様において、抗STEAP-1抗体を含むAb-CIDEが提供され、この抗体は、上述の実施形態のいずれかにあるようなVH、および上述の実施形態のいずれかにあるようなVLを含む。
一実施形態において、Ab-CIDEが提供され、該抗体は、それぞれ配列番号46および配列番号47のVH配列およびVL配列を含み、これにはそれらの配列の翻訳後修飾が含まれる。
さらなる態様において、本明細書において、本明細書に提供される抗STEAP-1抗体と同じエピトープに結合する抗体を含む、Ab-CIDEが提供される。例えば、特定の実施形態において、配列番号46のVH配列および配列番号47のVL配列をそれぞれ含む抗STEAP-1抗体と同じエピトープに結合する抗体を含むAb-CIDEが提供される。
更なる態様において、上記のいずれかの実施形態によるAb-CIDEの抗STEAP-1抗体は、ヒト抗体を含むモノクローナル抗体である。一実施形態において、Ab-CIDEの抗STEAP-1抗体は、抗体断片、例えば、Fv、Fab、Fab’、scFv、ダイアボディ、またはF(ab’)断片である。別の実施形態において、本抗体は、実質的に完全長の抗体、例えば、本明細書に定義されるIgG1抗体、IgG2a抗体、または他の抗体クラスもしくはアイソタイプである。
抗NaPi2b抗体
特定の実施形態において、Ab-CIDEは抗NaPi2b抗体を含む。
いくつかの実施形態において、本明細書には、(a)配列番号48のアミノ酸配列を含むHVR-H1、(b)配列番号49のアミノ酸配列を含むHVR-H2、(c)配列番号50のアミノ酸配列を含むHVR-H3、(d)配列番号51のアミノ酸配列を含むHVR-L1、(e)配列番号52のアミノ酸配列を含むHVR-L2、および(f)配列番号53のアミノ酸配列を含むHVR-L3から選択される、少なくとも1つ、2つ、3つ、4つ、5つ、または6つのHVRを含む、抗NaPi2b抗体を含むAb-CIDEが記載される。
一態様において、本明細書には、(a)配列番号48のアミノ酸配列を含むHVR-H1、(b)配列番号49のアミノ酸配列を含むHVR-H2、(c)配列番号50のアミノ酸配列を含むHVR-H3から選択される、少なくとも1つ、少なくとも2つ、または3つ全てのVH HVR配列を含む抗体を含むAb-CIDEが記載される。更なる実施形態において、抗体は、(a)配列番号48のアミノ酸配列を含むHVR-H1、(b)配列番号49のアミノ酸配列を含むHVR-H2、(c)配列番号50のアミノ酸配列を含むHVR-H3を含む。
別の態様において、本明細書には、(a)配列番号51のアミノ酸配列を含むHVR-L1、(b)配列番号52のアミノ酸配列を含むHVR-L2、および(c)配列番号53のアミノ酸配列を含むHVR-L3から選択される、少なくとも1つ、少なくとも2つ、または3つ全てのVL HVR配列を含む抗体を含むAb-CIDEが記載される。一実施形態において、抗体は、(a)配列番号51のアミノ酸配列を含むHVR-L1、(b)配列番号52のアミノ酸配列を含むHVR-L2、および(c)配列番号53のアミノ酸配列を含むHVR-L3を含む。
別の態様において、Ab-CIDEは、(a)(i)配列番号48のアミノ酸配列を含むHVR-H1、(ii)配列番号49のアミノ酸配列を含むHVR-H2、および(iii)配列番号50から選択されるアミノ酸配列を含むHVR-H3から選択される少なくとも1つ、少なくとも2つ、または3つ全てのVH HVR配列を含むVHドメイン、ならびに(b)(i)配列番号51のアミノ酸配列を含むHVR-L1、(ii)配列番号52のアミノ酸配列を含むHVR-L2、および(c)配列番号53のアミノ酸配列を含むHVR-L3から選択される少なくとも1つ、少なくとも2つ、または3つ全てのVL HVR配列を含むVLドメインを含む、抗体を含む。
別の態様では、本明細書には、(a)配列番号48のアミノ酸配列を含むHVR-H1、(b)配列番号49のアミノ酸配列を含むHVR-H2、(c)配列番号50のアミノ酸配列を含むHVR-H3、(d)配列番号51のアミノ酸配列を含むHVR-L1、(e)配列番号52のアミノ酸配列を含むHVR-L2、および(f)配列番号53のアミノ酸配列を含むHVR-L3を含む抗体を含む、Ab-CIDEが記載される。
上述の実施形態のうちのいずれかにおいて、Ab-CIDEの抗NaPi2b抗体はヒト化されている。一実施形態において、抗NaPi2b抗体は、上の実施形態のいずれかにあるようなHVRを含み、ヒトアクセプターフレームワーク、例えば、ヒト免疫グロブリンフレームワークまたはヒトコンセンサスフレームワークをさらに含む。
別の態様では、Ab-CIDEの抗NaPi2b抗体は、配列番号54のアミノ酸配列に対して少なくとも90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%、または100%の配列同一性を有する重鎖可変ドメイン(VH)配列を含む。特定の実施形態において、配列番号54のアミノ酸配列に対して少なくとも90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、または99%の同一性を有するVH配列は、参照配列と比べて、置換(例えば、保存的置換)、挿入、または欠失を含有するが、その配列を含む抗NaPi2b抗体は、NaPi2bに結合する能力を保持する。特定の実施形態において、配列番号54において合計で1~10個のアミノ酸が置換、挿入、および/または欠失している。特定の実施形態において、配列番号54において合計で1~5個のアミノ酸が置換、挿入、および/または欠失している。特定の実施形態において、置換、挿入、または欠失は、HVRの外側の領域内で(すなわち、FR内で)生じる。必要に応じて、抗NaPi2b抗体は、配列番号54のVH配列を含み、その配列の翻訳後修飾を含む。特定の実施形態において、VHは、以下から選択される2つまたは3つのHVRを含む:(a)配列番号48のアミノ酸配列を含むHVR-H1、(b)配列番号49のアミノ酸配列を含むHVR-H2、および(c)配列番号50のアミノ酸配列を含むHVR-H3。
別の態様では、Ab-CIDEの抗NaPi2b抗体が提供され、該抗体は、配列番号55のアミノ酸配列に対して、少なくとも90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%、または100%の配列同一性を有する軽鎖可変ドメイン(VL)を含む。特定の実施形態において、配列番号55のアミノ酸配列に対して少なくとも90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、または99%の同一性を有するVL配列は、参照配列と比べて、置換(例えば、保存的置換)、挿入、または欠失を含有するが、その配列を含む抗NaPi2b抗体は、抗NaPi2bに結合する能力を保持する。特定の実施形態において、配列番号55において合計で1~10個のアミノ酸が置換、挿入、および/または欠失している。特定の実施形態において、配列番号55において合計で1~5個のアミノ酸が置換、挿入、および/または欠失している。特定の実施形態において、置換、挿入、または欠失は、HVRの外側の領域で(すなわち、FR内で)生じる。必要に応じて、抗NaPi2b抗体は、配列番号55のVL配列を含み、その配列の翻訳後修飾を含む。特定の実施形態において、VLは、(a)配列番号51のアミノ酸配列を含むHVR-L1、(b)配列番号52のアミノ酸配列を含むHVR-L2、および(c)配列番号53のアミノ酸配列を含むHVR-L3から選択される、1つ、2つ、または3つのHVRを含む。
別の態様において、抗NaPi2b抗体を含むAb-CIDEが提供され、この抗体は、上述の実施形態のいずれかにあるようなVH、および上述の実施形態のいずれかにあるようなVLを含む。
一実施形態において、Ab-CIDEが提供され、該抗体は、それぞれ配列番号54および配列番号55のVH配列およびVL配列を含み、これにはそれらの配列の翻訳後修飾が含まれる。
さらなる態様において、本明細書において、本明細書に提供される抗NaPi2b抗体と同じエピトープに結合する抗体を含む、Ab-CIDEが提供される。例えば、特定の実施形態において、配列番号54のVH配列および配列番号55のVL配列をそれぞれ含む抗NaPi2b抗体と同じエピトープに結合する抗体を含むAb-CIDEが提供される。
更なる態様において、上記のいずれかの実施形態によるAb-CIDEの抗NaPi2b抗体は、ヒト抗体を含むモノクローナル抗体である。一実施形態において、Ab-CIDEの抗NaPi2b抗体は、抗体断片、例えば、Fv、Fab、Fab’、scFv、ダイアボディ、またはF(ab’)断片である。別の実施形態において、本抗体は、実質的に完全長の抗体、例えば、本明細書に定義されるIgG1抗体、IgG2a抗体、または他の抗体クラスもしくはアイソタイプである。
抗CD79b抗体
特定の実施形態において、Ab-CIDEは抗CD79b抗体を含む。
いくつかの実施形態において、本明細書には、(a)配列番58のアミノ酸配列を含むHVR-H1、(b)配列番号59のアミノ酸配列を含むHVR-H2、(c)配列番号60のアミノ酸配列を含むHVR-H3、(d)配列番号61のアミノ酸配列を含むHVR-L1、(e)配列番号62のアミノ酸配列を含むHVR-L2、および(f)配列番号63のアミノ酸配列を含むHVR-L3から選択される、少なくとも1つ、2つ、3つ、4つ、5つ、または6つのHVRを含む、抗CD79b抗体を含むAb-CIDEが記載される。
一態様において、本明細書には、(a)配列番号58のアミノ酸配列を含むHVR-H1、(b)配列番号59のアミノ酸配列を含むHVR-H2、および(c)配列番号60のアミノ酸配列を含むHVR-H3から選択される、少なくとも1つ、少なくとも2つ、または3つ全てのVH HVR配列を含む抗体を含むAb-CIDEが記載される。更なる実施形態において、抗体は、(a)配列番号58のアミノ酸配列を含むHVR-H1、(b)配列番号59のアミノ酸配列を含むHVR-H2、および(c)配列番号60のアミノ酸配列を含むHVR-H3を含む。
別の態様において、本明細書には、(a)配列番号61のアミノ酸配列を含むHVR-L1、(b)配列番号62のアミノ酸配列を含むHVR-L2、および(c)配列番号63のアミノ酸配列を含むHVR-L3から選択される、少なくとも1つ、少なくとも2つ、または3つ全てのVL HVR配列を含む抗体を含むAb-CIDEが記載される。一実施形態において、抗体は、(a)配列番号61のアミノ酸配列を含むHVR-L1、(b)配列番号62のアミノ酸配列を含むHVR-L2、および(c)配列番号63のアミノ酸配列を含むHVR-L3を含む。
別の態様において、Ab-CIDEは、(a)(i)配列番号58のアミノ酸配列を含むHVR-H1、(ii)配列番号59のアミノ酸配列を含むHVR-H2、および(iii)配列番号60から選択されるアミノ酸配列を含むHVR-H3から選択される少なくとも1つ、少なくとも2つ、または3つ全てのVH HVR配列を含むVHドメイン、ならびに(b)(i)配列番号61のアミノ酸配列を含むHVR-L1、(ii)配列番号62のアミノ酸配列を含むHVR-L2、および(c)配列番号63のアミノ酸配列を含むHVR-L3から選択される少なくとも1つ、少なくとも2つ、または3つ全てのVL HVR配列を含むVLドメインを含む、抗体を含む。
別の態様では、本明細書には、(a)配列番号58のアミノ酸配列を含むHVR-H1、(b)配列番号59のアミノ酸配列を含むHVR-H2、(c)配列番号60のアミノ酸配列を含むHVR-H3、(d)配列番号61のアミノ酸配列を含むHVR-L1、(e)配列番号62のアミノ酸配列を含むHVR-L2、および(f)配列番号63のアミノ酸配列を含むHVR-L3を含む抗体を含む、Ab-CIDEが記載される。
上述の実施形態のうちのいずれかにおいて、Ab-CIDEの抗CD79b抗体はヒト化されている。一実施形態において、抗CD79b抗体は、上の実施形態のいずれかにあるようなHVRを含み、ヒトアクセプターフレームワーク、例えば、ヒト免疫グロブリンフレームワークまたはヒトコンセンサスフレームワークをさらに含む。
別の態様では、Ab-CIDEの抗CD79b抗体は、配列番号56のアミノ酸配列に対して少なくとも90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%、または100%の配列同一性を有する重鎖可変ドメイン(VH)配列を含む。特定の実施形態において、配列番号56のアミノ酸配列に対して少なくとも90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、または99%の同一性を有するVH配列は、参照配列と比べて、置換(例えば、保存的置換)、挿入、または欠失を含有するが、その配列を含む抗CD79b抗体は、CD79bに結合する能力を保持する。特定の実施形態において、配列番号56において合計で1~10個のアミノ酸が置換、挿入、および/または欠失している。特定の実施形態において、配列番号56において合計で1~5個のアミノ酸が置換、挿入、および/または欠失している。特定の実施形態において、置換、挿入、または欠失は、HVRの外側の領域内で(すなわち、FR内で)生じる。必要に応じて、抗CD79b抗体は、配列番号8のVH配列を含み、その配列の翻訳後修飾を含む。特定の実施形態において、VHは、以下から選択される2つまたは3つのHVRを含む:(a)配列番号58のアミノ酸配列を含むHVR-H1、(b)配列番号59のアミノ酸配列を含むHVR-H2、および(c)配列番号60のアミノ酸配列を含むHVR-H3。
別の態様では、Ab-CIDEの抗CD79b抗体が提供され、該抗体は、配列番号57のアミノ酸配列に対して、少なくとも90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%、または100%の配列同一性を有する軽鎖可変ドメイン(VL)を含む。特定の実施形態において、配列番号57のアミノ酸配列に対して少なくとも90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、または99%の同一性を有するVL列は、参照配列と比べて、置換(例えば、保存的置換)、挿入、または欠失を含有するが、その配列を含む抗Ly6E抗体は、CD79bに結合する能力を保持する。特定の実施形態において、配列番号57において合計で1~10個のアミノ酸が置換、挿入、および/または欠失している。特定の実施形態において、配列番号57において合計で1~5個のアミノ酸が置換、挿入、および/または欠失している。特定の実施形態において、置換、挿入、または欠失は、HVRの外側の領域で(すなわち、FR内で)生じる。必要に応じて、抗CD79b抗体は、配列番号57のVL配列を含み、その配列の翻訳後修飾を含む。特定の実施形態において、VLは、(a)配列番号61のアミノ酸配列を含むHVR-L1、(b)配列番号62のアミノ酸配列を含むHVR-L2、および(c)配列番号63のアミノ酸配列を含むHVR-L3から選択される、1つ、2つ、または3つのHVRを含む。
別の態様において、抗CD79b抗体を含むAb-CIDEが本明細書に記載されて、これが提供され、該抗体は、上述の実施形態のいずれかにあるようなVH、および上述の実施形態のいずれかにあるようなVLを含む。
一実施形態において、Ab-CIDEが提供され、該抗体は、それぞれ配列番号56および配列番号57のVH配列およびVL配列を含み、これにはそれらの配列の翻訳後修飾が含まれる。
さらなる態様において、本明細書において、本明細書に提供される抗CD79b抗体と同じエピトープに結合する抗体を含む、Ab-CIDEが提供される。例えば、特定の実施形態において、配列番号56のVH配列および配列番号57のVL配列をそれぞれ含む抗CD79b抗体と同じエピトープに結合する抗体を含むAb-CIDEが提供される。
更なる態様において、上記のいずれかの実施形態によるAb-CIDEの抗CD79b抗体は、ヒト抗体を含むモノクローナル抗体である。一実施形態において、Ab-CIDEの抗CD79b抗体は、抗体断片、例えば、Fv、Fab、Fab’、scFv、ダイアボディ、またはF(ab’)断片である。別の実施形態において、本抗体は、実質的に完全長の抗体、例えば、本明細書に定義されるIgG1抗体、IgG2a抗体、または他の抗体クラスもしくはアイソタイプである。
抗CD22抗体
特定の実施形態において、Ab-CIDEは、3つの軽鎖超可変領域(HVR-L1、HVR-L2およびHVR-L3)および3つの重鎖超可変領域(HVR-H1、HVR-H2およびHVR-H3)を含む抗CD22抗体を含むことができる。一実施形態において、Ab-CIDEの抗CD22抗体は、3つの軽鎖超可変領域および3つの重鎖超可変領域(配列番号66~71)を含み、その配列を以下に示す。一実施形態において、Ab-CIDEの抗CD22抗体が、配列番号72の可変軽鎖配列および配列番号73の可変重鎖配列を含む。一実施形態において、本発明のAb-CIDEsの抗CD22抗体は、配列番号74の軽鎖配列および配列番号75の重鎖配列を含む:
抗CD33抗体
特定の実施形態において、Ab-CIDEは、3つの軽鎖超可変領域および3つの重鎖超可変領域を含む抗CD33抗体を含むことができ、その配列(配列番号76~81)を以下に示す。一実施形態において、Ab-CIDEの抗CD33抗体は、配列番号82の可変軽鎖配列および配列番号83の可変重鎖配列を含む。
一実施形態において、Ab-CIDEの抗CD33抗体は、配列番号84の軽鎖配列および配列番号85の重鎖配列を含む。一実施形態において、Ab-CIDEの抗CD33抗体は、3つの軽鎖超可変領域および3つの重鎖超可変領域を含み、その配列(配列番号84~89)を以下に示す。一実施形態において、Ab-CIDEの抗CD33抗体は、配列番号90の可変軽鎖配列および配列番号91の可変重鎖配列を含む。一実施形態において、Ab-CIDEの抗CD33抗体は、配列番号92の可変軽鎖配列および配列番号93の可変重鎖配列を含む。一実施形態において、本発明の抗CD33抗体は、配列番号94の可変軽鎖配列および配列番号95の可変重鎖配列を含む。一実施形態において、本発明の抗CD33抗体は、配列番号96の可変軽鎖配列および配列番号97の可変重鎖配列を含む。
1.抗体親和性
特定の実施形態において、本明細書中に提供される抗体は、≦1μM、≦100nM、≦50nM、≦10nM、≦5nM、≦1nM、≦0.1nM、≦0.01nMまたは≦0.001nMの解離定数(Kd)を有し、必要に応じて、≧10-13M(例えば10-8M以下、例えば10-8M~10-13M、例えば、10-9M~10-13M)である。
一実施形態において、Kdは、以下のアッセイにより説明されるように、目的とする抗体のFabバージョンおよびその抗原を用いて行われる放射標識抗原結合アッセイ(RIA)によって測定される。抗原に対するFabの溶液結合親和性は、未標識抗原の一連の滴定の存在下で、Fabを最小濃度の(125I)標識抗原と平衡化し、その後抗Fab抗体コーティングプレートと結合した抗原を捕捉することによって測定される(例えば、Chenら、「J.Mol.Biol.」、293:865~881頁(1999年)を参照されたい)。アッセイの条件を確立するために、MICROTITER(登録商標)マルチウェルプレート(Thermo Scientific)を、50mMの炭酸ナトリウム(pH 9.6)中の5μg/mlの捕捉用抗Fab抗体(Cappel Labs)で一晩コーティングし、その後、PBS中の2%(w/v)ウシ血清アルブミンで2~5時間にわたって室温(およそ23℃)で遮断する。非吸着性プレート(Nunc番号269620)中、100pMまたは26pMの[125I]-抗原を、目的とされるFabの段階希釈液と混合する(例えば、Prestaら、「Cancer Res.」、57巻:4593~4599頁(1997年)における抗VEGF抗体Fab-12の評価と一貫する)。次に、目的とするFabを一晩インキュベートするが、このインキュベーションは、平衡が達成されることを確実にするために、より長い期間(例えば、約65時間)継続し得る。その後、混合物を、室温でのインキュベーション(例えば、1時間)のため、捕捉プレートに移す。次に、溶液を除去し、プレートを、PBS中0.1%のポリソルベート20(TWEEN-20(登録商標))で8回洗浄する。プレートが乾燥したら、150μL/ウェルのシンチラント(scintillant)(MICROSCINT-20(商標)、Packard)を付加し、プレートをTOPCOUNT(商標)ガンマ計数器(Packard)上で10分間、計数する。最大結合の20%以下をもたらす各Fabの濃度を競合結合アッセイでの使用に選択する。
別の実施形態によれば、Kdは、BIACORE(登録商標)-2000またはBIACORE(登録商標)-3000(BIAcore,Inc.、ニュージャージー州ピスカタウェイ)を使用した表面プラズモン共鳴アッセイを使用して、25℃で、約10応答単位(RU)で固定化された抗原CM5チップを用いて測定される。簡潔には、カルボキシメチル化デキストランバイオセンサーチップ(CM5、BIACORE,Inc.)を、供給業者の指示に従って、N-エチル-N’-(3-ジメチルアミノプロピル)-カルボジイミド塩酸塩(EDC)およびN-ヒドロキシスクシンイミド(NHS)で活性化する。抗原をpH 4.8の10mMの酢酸ナトリウムによって5μg/ml(約0.2μM)に希釈した後、5μl/分の流量で注射し、カップリングされたタンパク質のおよそ10応答単位(RU)を達成する。抗原の注入後、1Mのエタノールアミンを注入して、未反応基を遮断する。動態測定のため、Fabの2倍段階希釈液(0.78nM~500nM)を、およそ25μL/分の流量にて25℃で0.05%のポリソルベート20(TWEEN-20(商標))界面活性剤(PBST)を有するPBS中に注射する。会合速度(kon)および解離速度(koff)を、会合センサグラムおよび解離センサグラムを同時に適合することによって、単純1対1 Langmuir結合モデル(BIACORE(登録商標)Evaluation Softwareバージョン3.2)を使用して計算する。平衡解離定数(Kd)は、koff/kon比として計算される。例えば、Chenら、「J.Mol.Biol.」、293:865~881頁(1999年)を参照されたい。上述の表面プラズモン共鳴アッセイによりオン速度が106M-1 s-1を超える場合、オン速度を、ストップフローを装備した分光測色計(Aviv Instruments)または撹拌キュベットを有する8000シリーズSLM-AMINCO(商標)分光測色計(ThermoSpectronic)等の分光計で測定される抗原の増加した濃度の存在下でPBS(pH 7.2)中20nMの抗抗原抗体(Fab形態)の25℃での蛍光発光強度(励起=295nm、発光=340nm、16nm帯域通過)の増加または減少を測定する蛍光クエンチ技法を使用することによって決定することができる。
2.リンカー(L1)
本明細書に記載の「リンカー」(L1、リンカー-1)は、1つまたは複数のCIDE部分(D)を抗体(Ab)に連結してAb-CIDEを形成するために使用することができる二官能性または多官能性部分である。いくつかの実施形態において、Ab-CIDEは、CIDEにおよび抗体に共有結合するための反応性官能基を有するL1を使用して調製することができる。例えば、いくつかの実施形態において、抗体(Ab)のシステインチオールは、リンカーの反応性官能基またはリンカーL1-CIDE基と結合を形成して、Ab-CIDEを作製することができる。具体的に、リンカーの化学構造が、Ab-CIDEの効能および安全性の両方に対して大きな影響を及ぼし得る(Ducry&Stump、「Bioconjugate Chem」、2010年、21,5~13頁)。正しいリンカーを選択することは、標的細胞の意図された細胞区画への適切な薬物送達に影響する。
リンカーは、一般に、切断可能(例えば、ペプチド、ヒドラゾンまたはジスルフィドなど)または切断不可能(チオエーテルなど)の2つのカテゴリーに分けることができる。リンカーが切断不可能なリンカーである場合、E3LB部分上のその位置は、VHL結合を妨害しないような位置である。具体的には、切断不可能なリンカーは、VHL結合ドメインのプロリン上のヒドロキシル位置で共有結合されるべきではない。リソソーム酵素(カテプシンB等)によって加水分解され得るバリン-シトルリン(Val-Cit)等のペプチドリンカーが、薬物を抗体と接続するために使用されてきた(米国特許第6,214,345)。それらは、全身循環におけるそれらの相対的安定性および腫瘍内で薬物を効率的に放出する能力に一部起因して、特に有用であった。しかしながら、天然ペプチドによって表されるケミカルスペースは限定されているため、ペプチドのように作用し、リソソームプロテアーゼによって有効に切断され得る、多様な非ペプチドリンカーを有することが望ましい。より優れた非ペプチド構造の多様性が、ペプチドリンカーによって付与されない新規の有益な特性をもたらし得る。リソソーム酵素によって切断され得るリンカーL1のための異なる種類の非ペプチドリンカーが、本明細書に提供される。
a.ペプチド模倣リンカー
リソソーム酵素によって切断可能なAb-CIDEのための異なるタイプの非ペプチド性ペプチド模倣リンカーが本明細書で提供される。例えば、ジペプチド(例えばVal-Cit)の中央のアミド結合をアミド模倣物で置き換えられていた、および/またはアミノ酸全体(例えば、Val-Citジペプチド中のバリンアミノ酸)が非アミノ酸部分(例えば、シクロアルキルジカルボニル構造(例えば、環サイズ=4または5))で置き換えられていた。
L1がペプチド模倣リンカーである場合、下記式:
-Str-(PM)-Sp-、
式中:
Strは、Abに共有結合したストレッチャー単位であり;
Spは、結合またはCIDE部分に共有結合したスペーサー単位であり;;および
PMは、
Figure 2022505450000002
式中、
Wは、-NH-ヘテロシクロアルキル-またはヘテロシクロアルキルであり;
Yは、ヘテロアリール、アリール、-C(O)C~Cアルキレン、C~Cアルキレン-NH、C~Cアルキレン-NH-CH、C~Cアルキレン-N-(CH、C~Cアルケニル、またはC~Cアルキレニルであり;
各Rは、独立して、C~C10アルキル、C~C10アルケニル、(C~C10アルキル)NHC(NH)NH、または(C~C10アルキル)NHC(O)NHであり;
およびRは、それぞれ独立して、H、C~C10アルキル、C~C10アルケニル、アリールアルキル、または、ヘテロアリールアルキルであるか、または、RおよびRは、一緒に、C~Cシクロアルキルを形成してもよく;および
およびRは、それぞれ独立して、C~C10アルキル、C~C10アルケニル、アリールアルキル、ヘテロアリールアルキル、(C~C10アルキル)OCH-であるか、または、RおよびRは、C~Cシクロアルキル環を形成してもよい、
からなる群から選択される、非ペプチド化学部分)、
によって表される。
L1は、E3LB、L2、またはPB基のいずれかを介してCIDEに接続されてもよいことに留意されたい。
実施形態において、Yは、ヘテロアリールであり、RおよびRは、一緒に、シクロブチル環を形成する。
実施形態において、Yは以下からなる群から選択される部分である。
Figure 2022505450000003
実施形態において、Strは、下記式で表される化学部分である:
Figure 2022505450000004
式中、Rは、C~C10アルキレン、C~C10アルケニル、C~Cシクロアルキル、(C~Cアルキレン)O-、およびC~C10アルキレン-C(O)N(R)-C~Cアルキレンからなる群から選択され、各アルキレンは、ハロ、トリフルオロメチル、ジフルオロメチル、アミノ、アルキルアミノ、シアノ、スルホニル、スルホンアミド、スルホキシド、ヒドロキシ、アルコキシ、エステル、カルボン酸、アルキルチオ、C~Cシクロアルキル、C~Cヘテロシクロアルキル、ヘテロアリールアルキル、アリールアリールアルキル、ヘテロアリールアルキルおよびヘテロアリールからなる群から選択される1~5個の置換基で置換されていてもよく、各Rは、独立して、Hまたは~Cアルキルであり;Spは、-Ar-R-であり、Arはアリールまたはヘテロアリールであり、Rは(C~C10アルキレン)O-である。
例示的な一実施形態において、Strは、下記式を有する:
Figure 2022505450000005
式中、Rは、C~C10アルキレン、C~C10アルケニル、(C~C10アルキレン)O-、N(R)-(C~Cアルキレン)-N(R)およびN(R)-(C~Cアルキレン)から選択され、各Rは、独立して、HまたはC~Cアルキルであり;Spは、-Ar-R-であり、Arはアリールまたはヘテロアリールであり、Rは、(C~C10アルキレン)O-またはSp-C~C-アルキレン-C(O)NH-である。
実施形態において、L1は、下記式で表される非ペプチド化学部分である:
Figure 2022505450000006
は、C~Cアルキル、C~Cアルケニル、(C~Cアルキル)NHC(NH)NHまたは(C~Cアルキル)NHC(O)NHであり;
およびRは、それぞれ独立して、HまたはC~C10アルキルである。
実施形態において、L1は、下記式で表される非ペプチド化学部分である:
Figure 2022505450000007
は、C~Cアルキル、(C~Cアルキル)NHC(NH)NH、または(C~Cアルキル)NHC(O)NHであり;
およびRは、一緒に、C~Cシクロアルキル環を形成する。
実施形態において、L1は、下記式で表される非ペプチド化学部分である:
Figure 2022505450000008
は、C~Cアルキル、C~Cアルキル)NHC(NH)NHまたは(C~Cアルキル)NHC(O)NHであり、Wは上に定義されるとおりである。
いくつかの実施形態において、リンカーは、国際公開第2015/095227号、国際公開第2015/095124号または国際公開第2015/095223号に記載されているものなどのペプチド模倣リンカーであり得る。
特定の実施形態において、リンカーは以下からなる群から選択される:
Figure 2022505450000009
b.非ペプチド模倣リンカー
一態様では、リンカーL1は、抗体とジスルフィド結合を形成する。一態様では、リンカーは、下記構造を有する:
Figure 2022505450000010
式中、RおよびRは、独立して、H、およびC~Cアルキルから独立して選択されるか、または、RおよびRは、3、4、5、もしくは6員のシクロアルキル基または複素環基を形成する。リンカーは、以下のように抗体およびCIDEに共有結合され得る。
Figure 2022505450000011
一態様では、リンカーL1は、抗体とジスルフィド結合を形成し、リンカーは下記構造を有する:
Figure 2022505450000012
式中、R、R、R、およびRは、独立して、H、必要に応じて置換された分岐鎖または直鎖のC~Cアルキル、および必要に応じて置換されたC~C6シクロアルキルからなる群から選択され、または結合される炭素原子とRおよびRは、一緒に、もしくはRおよびRは、一緒に、C~Cシクロアルキル環を形成する。
一態様では、リンカーのカルボニル基は、CIDE内のアミン基に接続されている。Abに結合した硫黄原子は、抗体中のシステインからの硫黄基であることにも留意されたい。別の態様において、L1は、抗体上に存在する遊離システインと反応して共有結合を形成することが可能である官能性を有する。そのような反応性官能基の非限定的な例には、マレイミド、ハロアセトアミド、α-ハロアセチル、コハク酸イミドエステル、4-ニトロフェニルエステル、ペンタフルオロフェニルエステル、テトラフルオロフェニルエステル等の活性化エステル、無水物、酸塩化物、塩化スルホニル、イソシアン酸塩、およびイソチオシアン酸塩が含まれる。例えば、Klussmanら(2004年)、「Bioconjugate Chemistry」15(4):765~773の766頁における複合方法、およびその中の実施例を参照されたい。
いくつかの実施形態において、リンカーは、抗体上に存在する求電子基と反応することが可能である官能性を有する。そのような求電子性基の例としては、アルデヒドおよびケトンカルボニル基が挙げられるが、これらに限定されない。いくつかの実施形態において、リンカーの反応性官能基のヘテロ原子が、抗体上の求電子基と反応して抗体単位との共有結合を形成することができる。そのような反応性官能基の非限定的な例には、ヒドラジド、オキシム、アミノ、ヒドラジン、チオセミカルバゾン、ヒドラジンカルボン酸塩、およびアリールヒドラジドが含まれるが、これらに限定されない。
リンカーは、1つまたは複数のリンカー構成要素を含んでもよい。例示的なリンカー構成成分としては、6-マレイミドカプロイル(「MC」)、マレイミドプロパノイル(「MP」)、バリン-シトルリン(「val-cit」または「vc」)、アラニン-フェニルアラニン(「ala-phe」)、p-アミノベンジルオキシカルボニル(「PAB」)、N-スクシンイミジル4-(2-ピリジルチオ)吉草酸(「SPP」)、および4-(マレイミドメチル)シクロヘキサン-1カルボキシレート(「MCC」)が挙げられる。様々なリンカー構成成分が当該技術分野で既知であり、このうちのいくつかが以下に記載される。
リンカーは、CIDEの放出を容易にする「切断可能リンカー」であってもよい。非限定的な例示的な切断可能リンカーとしては、酸不安定性リンカー(例えば、ヒドラゾンを含む)、プロテアーゼ感受性(例えば、ペプチダーゼ感受性)リンカー、感光性リンカー、またはジスルフィド含有リンカー(Chariら、「Cancer Research」52:127~131頁(1992年)、米国特許5208020号)が挙げられる。
特定の実施形態において、リンカーは下記式:
Figure 2022505450000013
式中、Aは、「ストレッチャー単位」であり、および、aは0~1の整数であり;Wは「アミノ酸単位」であり、および、wは0~12の整数であり;Yは「スペーサー単位」であり、および、yは0、1、または2である、
を有する。そのようなリンカーの例示的な実施形態は、米国特許第7,498,298号に記載されている。
いくつかの実施形態において、リンカー成分は、抗体を別のリンカー成分またはCIDE部分に連結する「ストレッチャー単位」を含む。例示的なストレッチャー単位を、以下に示す(波線は、抗体、CIDE、または追加のリンカー成分への共有結合の部位を示す)。
Figure 2022505450000014
特定の実施形態において、リンカーは以下のとおりである。
Figure 2022505450000015
特定の実施形態において、リンカーは下記式有する:
-A-Y
式中、AおよびYは上記のように定義される。特定の実施形態において、スペーサー単位Yは、モノホスフェートまたはビスホスフェートなどのホスフェートであってもよい。特定の実施形態において、ストレッチャー成分Aは以下を含む:
Figure 2022505450000016
特定の実施形態において、リンカーは以下のとおりである。
Figure 2022505450000017
3.CIDE(「D」)
有用なCIDEは、上記の一般式を有する。CIDEには、以下の構成要素を有するものが含まれる。
a.E3ユビキチンリガーゼ結合基(E3LB)
E3ユビキチンリガーゼ(そのうち600以上がヒトで知られている)は、ユビキチン化の基質特異性を付与する。これらのリガーゼに結合する既知のリガンドが存在する。本明細書に記載のE3ユビキチンリガーゼ結合基は、フォンヒッペル・リンドウ(VHL)およびXIAPからなる群から選択されるE3ユビキチンリガーゼを結合することができるペプチドまたは小分子である。
特定のE3ユビキチンリガーゼはフォンヒッペル・リンドウ(VHL)腫瘍抑制因子であり、E3リガーゼ複合体VCBの基質認識サブユニットであり、エロンギンBおよびCと、Cul2とRbxlとから構成されている。VHLの主要な基質は、低酸素誘導因子Iα(HIF-Iα)であり、これは、低酸素レベルに応答して血管新生促進増殖因子VEGFおよび赤血球誘導サイトカインエリスロポエチンなどの遺伝子をアップレギュレートする転写因子である。VHLに結合する化合物は、国際公開第2013/106643号、国際公開第2013/106646号に開示されているものなどのヒドロキシプロリン化合物、ならびに米国特許出願公開第2016/0045607号、国際公開第2014187777号、米国特許出願公開第20140356322号および米国特許第9,249,153号に記載されている他の化合物であり得る。
一態様では、本明細書の主題は以下の化学構造る:
Figure 2022505450000018
式中、
1’は、必要に応じて置換されたC~Cアルキル基、必要に応じて置換された-(CHOH、必要に応じて置換された-(CHSH、必要に応じて置換された(OH-O-(C~C)アルキル基、エポキシ部分WCOCWを含む必要に応じて置換された(CH-WCOCW-(C~C)アルキル基であり、各Wは、独立して、HまたはC~Cアルキル基、必要に応じて置換された-(CHCOOH、必要に応じて置換された-(CHC(O)-(C~Cアルキル)、必要に応じて置換された-(CHNHC(O)-R、必要に応じて置換された-(CHC(O)-NR、必要に応じて置換された-(CHOC(O)-NR、-(CHO)H、必要に応じて置換された-(CHOC(O)-(C~Cアルキル)、必要に応じて置換された-(CHC(O)-O-(C~Cアルキル)、必要に応じて置換された-(CHO)COOH、必要に応じて置換された-(OCHO-(C~Cアルキル)、必要に応じて置換された-(CHC(O)-O-(C~Cアルキル)、必要に応じて置換された-(OCHNHC(O)-R、必要に応じて置換された-(CHO)C(O)-NR、-(CHCHO)H、必要に応じて置換された-(CHCHO)COOH、必要に応じて置換された-(OCHCHO-(C~Cアルキル)、必要に応じて置換された-(CHCHO)C(O)-(C~Cアルキル)、必要に応じて置換された-(OCHCHNHC(O)-R、必要に応じて置換された-(CHCHO)C(O)-NRiR、必要に応じて置換された-SO、必要に応じて置換されたS(O)R、NO、CNまたはハロゲン(F、Cl、Br、I、好ましくはFまたはCl)であり;
およびRは、それぞれ独立して、H、または1つもしくは2個のヒドロキシル基または最大3個のハロゲン基(好ましくはフッ素)で必要に応じて置換されたC~Cアルキル基であり;
はC~Cアルキル基、必要に応じて置換されたアリール、ヘテロアリールもしくは複素環基、または-(CH)NR基であり;
XおよびX’は、それぞれ独立して、C=O、O=S、-S(O)、S(O)であり(好ましくは、XおよびX’は両方ともC=Oである);
2’は、
必要に応じて置換された-(CH-(C=O)(NR(SOアルキル基、
必要に応じて置換された-(CH-(C=O)(NR)v(SONR1N2N基、
必要に応じて置換された-(CH-(C=O)(NR(SO-アリール、
必要に応じて置換された-(CH-(C=O)(NR(SO-ヘテロアリール、
必要に応じて置換された-(CH-(C=O)NR(SO-複素環、
必要に応じて置換された-NR-(CH-C(O)(NR(SO-アルキル、
必要に応じて置換された-NR-(CH-C(O)(NR(SO-NR1N2N
必要に応じて置換された-NR-(CH-C(O)(NR(SO-NRC(O)R1N
必要に応じて置換された-NR-(CH-(C=O)(NR(SO-アリール、
必要に応じて置換された-NR-(CH-(C=O)(NR(SO-ヘテロアリール、
必要に応じて置換された-NR-(CH)n-(C=O)NR(SO-複素環、
必要に応じて置換された-XR2’-アルキル基、
必要に応じて置換された-XR2’-アリール基、
必要に応じて置換された-XR2’-ヘテロアリール基、
必要に応じて置換された-XR2’-複素環基であり、
3’は、
必要に応じて置換されたアルキル、
必要に応じて置換された-(CH-C(O)(NR(SO-アルキル、
必要に応じて置換された-(CH-C(O)(NR(SO-NR1N2N
必要に応じて置換された-(CH-C(O)(NR(SO-NRC(O)R1N
必要に応じて置換された-(CH-C(O)(NR(SO-C(O)NR
必要に応じて置換された-(CH-C(O)(NR(SO-アリール、
必要に応じて置換された-(CH-C(O)u(NR(SO-ヘテロアリール、
必要に応じて置換された-(CH-C(O)(NR(SO-複素環、
必要に応じて置換された-NR-(CH-C(O)(NR(SO-アルキル、
必要に応じて置換された-NR-(CH-C(O)(NR(SO-NR1N2N
必要に応じて置換された-NR-(CH-C(O)(NR(SO-NRC(O)R1N
必要に応じて置換された-NR-(CH-C(O)(NR(SO-アリール、
必要に応じて置換された-NR-(CH-C(O)(NR(SO-ヘテロアリール、
必要に応じて置換された-NR-(CH-C(O)(NR(SO-複素環、
必要に応じて置換された-O-(CH)n-(C=O)(NR(SO-アルキル、
必要に応じて置換された-O-(CH)n-(C=O)(NR(SO-NR1N2N
必要に応じて置換された-O-(CH)n-(C=O)(NR(SO-NRC(O)R1N
必要に応じて置換された-O-(CH)n-(C=O)(NR(SO-アリール、
必要に応じて置換された-O-(CH-(C=O)(NR(SO-ヘテロアリール、
必要に応じて置換された-O-(CH-(C=O)(NR(SO-複素環、
必要に応じて置換された-(CH-(V)n’-(CH-(V)n’-アルキル基、
必要に応じて置換された-(CH-(V)n’-(CH-(V)n’-アリール基、
必要に応じて置換された-(CH-(V)n’-(CH-(V)n’-ヘテロアリール基、
必要に応じて置換された-(CH-(V)n’-(CH-(V)n’-複素環基、
必要に応じて置換された-(CH-N(R1’)(C=O)m’-(V)n’-アルキル基、
必要に応じて置換された-(CH-N(R1’)(C=O)m’-(V)n’-アリール基、
必要に応じて置換された-(CH-N(R1’)(C=O)m’-(V)n’-ヘテロアリール基、
必要に応じて置換された-(CH-N(R1’)(C=O)m’-(V)n’-複素環基、
必要に応じて置換された-XR3’-アルキル基、
必要に応じて置換された-XR3’-アリール基、
必要に応じて置換された-XR3’-ヘテロアリール基、
必要に応じて置換された-XR3’-複素環基であり、
必要に応じて置換された;
1NおよびR2Nは、それぞれ独立して、H、1または2個のヒドロキシル基および3個までのハロゲン基で必要に応じて置換されたC~Cアルキル、または必要に応じて置換された-(CH-アリール、-(CH-ヘテロアリールまたは-(CH-複素環基であり;
およびRは、それぞれ独立して、HまたはC~Cアルキル基であり;
Vは、O、SまたはNRであり;
は上記と同じであり;
R2’およびXR3’は、それぞれ独立して、必要に応じて置換された-CH-、-CH
CH(X)=CH(X)-(シスまたはトランス)、-CH-CH≡CH-、-(CHCHO)-またはC~Cシクロアルキル基であり、XはH、ハロ、または必要に応じて置換されたC~Cアルキル基であり;
各mは、独立して、0、1、2、3、4、5、6であり;
各m’は、独立して0もしくは1であり;
各nは、独立して、0、1、2、3、4、5、6であり;
各n’は、独立して0もしくは1であり;
各uは、独立して0もしくは1であり;
各vは、独立して0もしくは1であり;
各wは、独立して0もしくは1である、
による化合物、またはその薬学的に許容可能な塩、エナンチオマー、ジアステレオマー、溶媒和物または多形に関する。
代替の態様では、本発明は、下記化学構造:
Figure 2022505450000019
式中、R1’、R2’およびR3’のそれぞれは上記と同じであり、XはC=O、C=S、-S(O)基またはS(O)基であり、より好ましくはC=O基である、
による化合物、またはその薬学的に許容可能な塩、エナンチオマー、ジアステレオマー、溶媒和物または多形に関する。
本発明のさらに好ましい態様では、本発明による化合物:
Figure 2022505450000020
式中、R1’、R2’およびR3’は上に提示したものと同じである、
またはその薬学的に許容可能なエナンチオマー、ジアステレオマー、溶媒和物または多形。
本発明のさらに好ましい態様では、R1’は、好ましくはヒドロキシル基、またはヒドロキシル基もしくはカルボン酸基、好ましくはヒドロキシル基に代謝され得る基であり、その結果、化合物は活性化合物のプロドラッグ形態を表す。例示的な好ましいR1’基としては、例えば-(CHOH、(CH-O-(C~C)アルキル基、-(CHCOOH、-(CHO)H、必要に応じて置換された-(CHC(O)(C~C)アルキル、必要に応じて置換された-(CHOC(O)-(C)アルキル、または必要に応じて置換された-(CHC(O)-O-(C~C)アルキルが挙げられ、nは0または1である。ほとんどの場合、Rはヒドロキシルである。
XおよびX’は、存在する場合、好ましくはC=O、C=S、-S(O)基またはS(O)基であり、より好ましくはC=O基である。
R2’は、好ましくは、必要に応じて置換された-NR-T-アリール、必要に応じて置換された-NR-T-ヘテロアリール基、または必要に応じて置換された-NR-T-複素環であり、Rは、C~Cアルキル基、好ましくはHまたはCH、より好ましくはHであり、Tは、必要に応じて置換された-(CH-基であり、アルキレン鎖中の各メチレン基は、必要に応じて、1または2個の置換基で置換されてもよく、好ましくはハロゲン、C~Cアルキル基、または本明細書に別途記載されるアミノ酸の側鎖から選択され、好ましくは1または2個のメチル基であってもよく、これらは、必要に応じて、置換されてもよい;ならびにnは0~6、しばしば0、1、2または3、好ましくは0または1である。或いは、Tはまた、-(CHO)-基、-(OCH-基、-(CHCHO)-基、-(OCHCH-基であってもよく、これらの基はいずれも必要に応じて置換される。
2’に好ましいアリール基としては、必要に応じて置換されたフェニル基またはナフチル基、好ましくはフェニル基が挙げられ、フェニル基は、ハロゲン(好ましくはFまたはC1)、アミン、モノアルキル-またはジアルキルアミン(好ましくは、ジメチルアミン)、F、C1、OH、SH、COOH、C~Cアルキル、好ましくはCH、CF、OMe、OCF、NO、またはCN基(その各々は、フェニル環のオルト位、メタ位および/またはパラ位、好ましくはパラ位で置換されてもよい)、必要に応じて置換されたフェニル基(フェニル基自体は、好ましくは、F、C1、OH、SH、COOH、CH、CF、OMe、OCF、NOまたはCN基のうちの少なくとも1つで置換されており、これらは、フェニル環のオルト位、メタ位および/またはパラ位で置換されていてもよく、好ましくはパラ位で置換されていてもよい)、必要に応じて置換されたナフチル基、必要に応じて置換されたヘテロアリール、好ましくはメチル置換イソオキサゾールを含む必要に応じて置換されたイソオキサゾール、メチル置換オキサゾールを含む必要に応じて置換されたオキサゾール、メチル置換チアゾールを含む必要に応じて置換されたチアゾール、メチル置換イソチアゾールを含む必要に応じて置換されたイソチアゾール、メチル置換ピロールを含む必要に応じて置換されたピロール、メチルイミダゾールを含む必要に応じて置換されたイミダゾール、必要に応じて置換されたベンズイミダゾールまたはメトキベンジルイミダゾール、必要に応じて置換されたオキシイミダゾールまたはメチルオキシイミダゾール、メチルジアゾール基を含む必要に応じて置換されたジアゾール基、メチル置換トリアゾール基を含む必要に応じて置換されたトリアゾール基、ハロ-(好ましくは、F)もしくはメチル置換ピリジン基またはオキサピリジン基(ピリジン基は酸素によってフェニル基に結合される)を含む必要に応じて置換されたピリジン基、必要に応じて置換されたフラン、必要に応じて置換されたベンゾフラン、必要に応じて置換されたジヒドロベンゾフラン、必要に応じて置換されたインドール、インドリジンまたはアザインドリジン(2、3、または4-アザインドリジン)、必要に応じて置換されたキノリン、下記化学構造による必要に応じて置換された基で置換されてもよい:
Figure 2022505450000021
は、CHRSS、NRURE、またはOであり;
HETは、H、CN、NO、ハロ(好ましくはC1またはF)、必要に応じて置換されたC~Cアルキル(好ましくは、1もしくは2個のヒドロキシル基、または3個までのハロ基(例えば、CF)で置換される)、必要に応じて置換されたO(C~Cアルキル)(好ましくは、1もしくは2個のヒドロキシル基、または3個までのハロ基で置換される)、または必要に応じて置換されたアセチレン基-C≡C-Rであり、Rは、HまたはC~Cアルキル基(好ましくはC~C3アルキル)であり;
SSは、H、CN、NO、ハロ(好ましくはFまたはC1)、必要に応じて置換されたC~Cアルキル(好ましくは、1もしくは2個のヒドロキシル基、または3個までのハロ基で置換される)、必要に応じて置換されたO(C~Cアルキル)(好ましくは、1もしくは2個のヒドロキシル基、または3個までのハロ基で置換される)、または必要に応じて置換された-C(O)(C~Cアルキル)(好ましくは1または2個のヒドロキシル基、または3個までのハロ基)であり;
UREは、H、C~Cアルキル(好ましくはHまたはC~Cアルキル)または-C(O)(C~Cアルキル)であり、これらの基の各々は、1もしくは2個のヒドロキシル基または3個までのハロゲン、好ましくはフッ素基で必要に応じて置換されるか、または必要に応じて置換されたフェニル基、必要に応じて置換されたヘテロアリールまたは必要に応じて置換された複素環、好ましくはとりわけ、例えばピペリジン、モルホリン、ピロリジン、テトラヒドロフラン)であり;
PROは、H、必要に応じて置換されたC~Cアルキルまたは必要に応じて置換されたアリール(フェニルまたはナフチル)、オキサゾール、イソオキサゾール、チアゾール、イソチアゾール、イミダゾール、ジアゾール、オキシイミダゾール、ピロール、ピロリジン、フラン、ジヒドロフラン、テトラヒドロフラン、チエン、ジヒドロチエン、テトラヒドロチエン、ピリジン、ピペリジン、ピペラジン、モルホリン、キノリン、(それぞれ好ましくはC~Cアルキル基、好ましくはメチルまたはハロ基、好ましくはFまたはC1で置換される)、ベンゾフラン、インドール、インドリジン、アザインドリジンからなる群から選択されるヘテロアリールまたは複素環基であり;
PRO1およびRPRO2は、それぞれ独立して、H、必要に応じて置換されたC~Cアルキル基であるか、または、一緒に、ケト基を形成し;および
各nは、独立して、0、1、2、3、4、5もしくは6(好ましくは0もしくは1)であるか、または
必要に応じて置換された複素環、好ましくはテトラヒドロフラン、テトラヒドロチエン、ピペリジン、ピペラジンまたはモルホリン(置換される場合、それぞれの基は好ましくはメチルまたはハロ(F、Br、C1)で置換される。
特定の好ましい態様では、
Figure 2022505450000022
基であり、RPROおよびnは上記と同じである。
2’の好ましいヘテロアリール基としては、必要に応じて置換されたキノリン(これは、薬理作用団に結合していても、キノリン環内の任意の炭素原子上で置換されていてもよい)、必要に応じて置換されたインドール、必要に応じて置換されたインドリジン、必要に応じて置換されたアザインドリジン、必要に応じて置換されたベンゾフラン(必要に応じて置換されたベンゾフランを含む)、必要に応じて置換されたイソオキサゾール、必要に応じて置換されたチアゾール、必要に応じて置換されたイソチアゾール、必要に応じて置換されたチオフェン、必要に応じて置換されたピリジン(2-、3、または4-ピリジン)、必要に応じて置換されたイミダゾール、必要に応じて置換されたピロール、必要に応じて置換されたジアゾール、必要に応じて置換されたトリアゾール、テトラゾール、必要に応じて置換されたオキシイミダゾール、または以下の化学構造による基が挙げられる:
Figure 2022505450000023
式中、Sは、CHRSS、NRURE、またはOであり;
HETは、H、CN、NO、ハロ(好ましくはClまたはF)、必要に応じて置換されたC~Cアルキル(好ましくは、1もしくは2個のヒドロキシル基、または3個までのハロ基(例えば、CF)で置換される)、必要に応じて置換されたO(C~Cアルキル)(好ましくは、1もしくは2個のヒドロキシル基、または3個までのハロ基で置換される)、または必要に応じて置換されたアセチレン基-C≡C-Rであり、Rは、HまたはC~Cアルキル基(好ましくはC~Cアルキル)であり;
SSは、H、CN、NO、ハロ(好ましくはFまたはCl)、必要に応じて置換されたC~Cアルキル(好ましくは、1もしくは2個のヒドロキシル基、または3個までのハロ基で置換される)、必要に応じて置換されたO(C~Cアルキル)(好ましくは、1もしくは2個のヒドロキシル基、または3個までのハロ基で置換される)、または必要に応じて置換された-C(O)(C~Cアルキル)(好ましくは1または2個のヒドロキシル基、または3個までのハロ基)であり;
UREは、H、C~Cアルキル(好ましくはHまたはC~Cアルキル)または-C(O)(C~Cアルキル)であり、これらの基の各々は、1もしくは2個のヒドロキシル基または3個までのハロゲン、好ましくはフッ素基で必要に応じて置換されるか、または必要に応じて置換された複素環、例えば、ピペリジン、モルホリン、ピロリジン、テトラヒドロフラン、テトラヒドロチオフェン、ピペリジン、ピペラジンであり、これらの各々は、必要に応じて置換され;および
は、NまたはC-RYCであり、RYCは、H、OH、CN、NO、ハロ(好ましくはClまたはF)、必要に応じて置換されたC~Cアルキル(好ましくは、1もしくは2個のヒドロキシル基、または3個までのハロ基(例えば、CF)で置換される)、必要に応じて置換されたO(C~Cアルキル)(好ましくは、1もしくは2個のヒドロキシル基、または3個までのハロ基で置換される)、または必要に応じて置換されたアセチレン基-C≡C-Rであり、Rは、HまたはC~Cアルキル基(好ましくはC~Cアルキル)である。
2’に対する好ましい複素環基には、テトラヒドロキノリン、ピペリジン、ピペラジン、ピロリジン、モルホリン、テトラヒドロフラン、テトラヒドロチオフェン、オキサン、チアンが含まれ、これらの基の各々は、必要に応じて置換されていてもよく、または以下の化学構造による基であり得る。
Figure 2022505450000024
好ましくは
Figure 2022505450000025
基であり、RPROはH、必要に応じて置換されたC~Cアルキルまたは必要に応じて置換されたアリール、ヘテロアリールもしくは複素環基である;RPRO1およびRPRO2は、それぞれ独立して、H、必要に応じて置換されたC~Cアルキル基であるか、または、一緒に、ケト基形成し、および、
各nは、独立して、0、1、2、3、4、5もしくは6(好ましくは0もしくは1)である。
本発明で使用するための好ましいR2’置換基には、具体的には、本明細書に開示される同定された化合物(本明細書に開示されている具体的な化合物、および本明細書に添付されている図面を含む)に見られるR2’置換基も含まれる。これらのR2’置換基のそれぞれは、本明細書にも開示される任意の数のR3’置換基と組み合わせて使用され得る。
は、好ましくは、必要に応じて置換された-T-ありール、必要に応じて置換された-T-ヘテロアリール、必要に応じて置換された-T-複素環、必要に応じて置換された-NR-T-アリール、必要に応じて置換された-NR-T-ヘテロアリール、または必要に応じて置換された-NR-T-複素環であり、Rは、C~Cアルキル基、好ましくはHまたはCH、より好ましくはHであり、Tは、必要に応じて置換された-(CH-基であり、各メチレン基は、必要に応じて、1または2個の置換基で置換されてもよく、好ましくはハロゲン、C~Cアルキル基、または本明細書に別途記載されるアミノ酸の側鎖から選択され、好ましくはメチルであってもよく、これらは、必要に応じて、置換されてもよい;ならびにnは0~6、しばしば0、1、2または3、好ましくは0または1である。あるいは、Tはまた、-(CHO)-基、-(OCH-基、-(CHCHO)-基、-(OCHCH-基であってもよく、それぞれの基は必要に応じて置換される。
3’に好ましいアリール基としては、置換されていてもよいフェニルまたはナフチル基(テトラヒドロナフチルを含む)、好ましくはフェニル基が挙げられ、フェニルまたはナフチル基は、ハロゲン(好ましくはFまたはC1)、アミン、モノアルキル-またはジアルキルアミン(好ましくは、ジメチルアミン)、アミド基(好ましくは(CH-NRC(O)R基(式中、m、RおよびRは上記と同じである))、ハロ(しばしばF、C)、OH、SH、CH、CF、OMe、OCF、NO、CNまたはS(O)基(Rは、C~Cアルキル基、必要に応じて置換されたアリール、ヘテロアリールもしくは複素環基または-(CHNR基)であり、これらの各々は、フェニル環のオルト位、メタ位および/またはパラ位、好ましくはパラ位)で置換されていてもよく、またはアリール(好ましくはフェニル)、ヘテロアリールもしくは複素環で置換されていてもよい。好ましくは、上記置換フェニル基は、必要に応じて置換されたフェニル基(すなわち、置換フェニル基自体は、好ましくは、F、C1、OH、SH、COOH、CH、CF、OM、OCF、NOまたはCN基のうちの少なくとも1つで置換されており、これらは、フェニル環のオルト位、メタ位および/またはパラ位で置換されていてもよく、好ましくはパラ位で置換されていてもよい)、必要に応じて置換され得るナフチル基、必要に応じて置換されたヘテロアリール、メチル置換イソオキサゾールを含む必要に応じて置換されたイソオキサゾールを含む、メチル置換オキサゾールを含む必要に応じて置換されたオキサゾール、メチル置換チアゾールを含む必要に応じて置換されたチアゾール、メチル置換ピロールを含む必要に応じて置換されたピロール、メチルイミダゾールを含む必要に応じて置換されたイミダゾール、必要に応じて置換されたベンズイミダゾールまたはメトキベンジルイミダゾール、必要に応じて置換されたオキシイミダゾールまたはメチルオキシイミダゾール、メチルジアゾール基を含む必要に応じて置換されたジアゾール基、メチル置換トリアゾール基を含む必要に応じて置換されたトリアゾール基、テトラゾール基、ハロ-(好ましくは、F)もしくはメチル置換ピリジン基または必要に応じて置換されたオキサピリジン基(ピリジン基は酸素によってフェニル基に結合される)を含む必要に応じて置換されたピリジン基、必要に応じて置換された複素環(テトラヒドロフラン、テトラヒドロチオフェン、ピロリジン、オキサン、チアン、またはヒテトラヒドロキノリン)であり得る:
3’に好ましいヘテロアリール基としては、必要に応じて置換されたキノリン(これは、ファルマコフォアに結合していても、またはキノリン環内の任意の炭素原子で置換されていてもよい)、必要に応じて置換されたインドール(ジヒドロインドールを含む)、必要に応じて置換されたインドリジン、必要に応じて置換されたアザインドリジン(2、3または4-アザインドリジン)、必要に応じて置換されたベンズイミダゾール、ベンゾジアゾール、ベンゾオキソフラン、必要に応じて置換されたイミダゾール、必要に応じて置換されたイソオキサゾール、必要に応じて置換されたオキサゾール(好ましくはメチル置換された)、必要に応じて置換されたジアゾール、必要に応じて置換されたトリアゾール、テトラゾール、必要に応じて置換されたベンゾフラン、必要に応じて置換されたチオフェン、必要に応じて置換されたチアゾール(好ましくはメチルおよび/またはチオール置換された)、必要に応じて置換されたイソチアゾール、必要に応じて置換されたトリアゾール(好ましくはメチル基で置換された1,2,3トリアゾール、メチル基で置換されたトリアプロピルシリル、必要に応じて置換された-(CH-O-C~Cアルキル基、または必要に応じて置換された-(CH-C(O)-O-C~Cアルキル基)、必要に応じて置換されたピリジン(2-、3、または4-ピリジン)以下の化学構造による基が挙げられる:
Figure 2022505450000026
式中、Sは、CHRSS、NRURE、またはOであり;
HETは、H、CN、NO、ハロ(好ましくはClまたはF)、必要に応じて置換されたC~Cアルキル(好ましくは、1もしくは2個のヒドロキシル基、または3個までのハロ基(例えば、CF)で置換される)、必要に応じて置換されたO(C~Cアルキル)(好ましくは、1もしくは2個のヒドロキシル基、または3個までのハロ基で置換される)、または必要に応じて置換されたアセチレン基-C≡C-Rであり、Rは、HまたはC~Cアルキル基(好ましくはC~Cアルキル)であり;
SSは、H、CN、NO、ハロ(好ましくはFまたはC)、必要に応じて置換されたC~Cアルキル(好ましくは、1もしくは2個のヒドロキシル基、または3個までのハロ基で置換される)、必要に応じて置換されたO(C~Cアルキル)(好ましくは、1もしくは2個のヒドロキシル基、または3個までのハロ基で置換される)、または必要に応じて置換された-C(O)(C~Cアルキル)(好ましくは1または2個のヒドロキシル基、または3個までのハロ基)であり;
UREは、H、C C~Cアルキル(好ましくは、HまたはC~Cアルキル)または-C(O)(C~Cアルキル)であり、これらの基の各々は、1個もしくは2個のヒドロキシル基または3個までのハロゲン、好ましくはフッ素基で必要に応じて置換されており、または必要に応じて置換された複素環、例えば、それぞれが必要に応じて置換されたピペリジン、モルホリン、ピロリジン、テトラヒドロフラリ、テトラヒドロチオフェン、ピペリジン、ピペラジンであり、
は、NまたはC-RYCであり、RYCは、H、OH、CN、NO、ハロ(好ましくはClまたはF)、必要に応じて置換されたC~Cアルキル(好ましくは、1もしくは2個のヒドロキシル基、または3個までのハロ基(例えば、CF)で置換される)、必要に応じて置換されたO(C~Cアルキル)(好ましくは、1もしくは2個のヒドロキシル基、または3個までのハロ基で置換される)、または必要に応じて置換されたアセチレン基-C≡C-Rであり、Rは、HまたはC~Cアルキル基(好ましくはC~Cアルキル)である。
3’に対する好ましい複素環基には、テトラヒドロキノリン、ピペリジン、ピペラジン、ピロリジン、モルホリン、テトラヒドロフラン、テトラヒドロチオフェン、オキサン、およびチアンが含まれ、これらの基の各々は、必要に応じて置換されていてもよく、または以下の化学構造による基であり得る。
Figure 2022505450000027
好ましくは、
Figure 2022505450000028
PROは、H、必要に応じて置換されたC~Cアルキルまたは必要に応じて置換されたアリール(フェニルまたはナフチル)、オキサゾール、イソオキサゾール、チアゾール、イソチアゾール、イミダゾール、ジアゾール、オキシイミダゾール、ピロール、ピロリジン、フラン、ジヒドロフラン、テトラヒドロフラン、チエン、ジヒドロチエン、テトラヒドロチエン、ピリジン、ピペリジン、ピペラジン、モルホリン、キノリン、(それぞれ好ましくはC~Cアルキル基、好ましくはメチルまたはハロ基、好ましくはFまたはClで置換される)、ベンゾフラン、インドール、インドリジン、アザインドリジンからなる群から選択されるヘテロアリールまたは複素環基であり;
PRO1およびRPRO2は、それぞれ独立して、H、必要に応じて置換されたC~Cアルキル基であるか、または、一緒に、ケト基を形成し;および
各nは、0、1、2、3、4、5もしくは6(好ましくは0もしくは1)である。
本発明で使用するための好ましいR3’置換基には、具体的には、本明細書に開示される同定された化合物(本明細書に開示されている具体的な化合物、および本明細書に添付されている図面を含む)に見られるR3’置換基も含まれる。これらのR3’置換基のそれぞれは、本明細書にも開示されている任意の数のR2’置換基と組み合わせて使用されてもよく、特に本明細書の添付の図に示されているR2’基を含む。
特定の代替的な好ましい実施形態において、R2’は、必要に応じて置換された-NR-XR2’-アルキル基、-NR-XR2’-アリール基;必要に応じて置換された-NR-XR2’-HET、必要に応じて置換された-NR-XR2’-アリール-HET、または必要に応じて置換された-NR-XR2’-HET-アリールであり、
は、HまたはC~Cアルキル基(好ましくはH)であり;
2’は、必要に応じて置換された-CH-、-CH-CH(X)=CH(X)-(シスまたはトランス)、-CH-CH≡CH-、-(CHCHO)-またはC~Cシクロアルキル基であり;
は、H、ハロ、または1個もしくは2個のヒドロキシル基もしくは3個までのハロゲン基で場合により必要に応じて置換されたC1~アルキル基である。
アルキルは、必要に応じて置換されたC~C10アルキル(好ましくはC~Cアルキル)基である(特定の好ましい実施形態において、アルキル基はハロ基、多くの場合ClまたはBrでエンドキャップされている);アリールは、必要に応じて置換されたフェニル基またはナフチル基である(好ましくは、フェニル基);およびHETは、必要に応じて置換されたオキサゾール、イソオキサゾール、チアゾール、イソチアゾール、イミダゾール、ジアゾール、オキシイミダゾール、ピロール、ピロリジン、フラン、ジヒドロフラン、テトラヒドロフラン、チエン、ジヒドロチエン、テトラヒドロチエン、ピリジン、ピペリジン、ピペラジン、モルホリン、ベンゾフラン、インドール、インドリジン、アザインドリジン、キノリン、(置換される場合、それぞれ好ましくはC~Cアルキル基、好ましくはメチルまたはハロ基、好ましくはFまたはClで置換される)からなる群から選択されるヘテロアリールを含む複素環で必要に応じて置換されるか、または以下の化学構造による基である:
Figure 2022505450000029
は、CHRSS、NRURE、またはOであり;
HETは、H、CN、NO、ハロ(好ましくはClまたはF)、必要に応じて置換されたC~Cアルキル(好ましくは、1もしくは2個のヒドロキシル基、または3個までのハロ基(例えば、CF)で置換される)、必要に応じて置換されたO(C~Cアルキル)(好ましくは、1もしくは2個のヒドロキシル基、または3個までのハロ基で置換される)、または必要に応じて置換されたアセチレン基-C≡C-Rであり、Rは、HまたはC~Cアルキル基(好ましくはC~Cアルキル)であり;
SSは、H、CN、NO、ハロ(好ましくはFまたはCl)、必要に応じて置換されたC~Cアルキル(好ましくは、1もしくは2個のヒドロキシル基、または3個までのハロ基で置換される)、必要に応じて置換されたO(C~Cアルキル)(好ましくは、1もしくは2個のヒドロキシル基、または3個までのハロ基で置換される)、または必要に応じて置換された-C(O)(C~Cアルキル)(好ましくは1または2個のヒドロキシル基、または3個までのハロ基)であり;
UREは、H、C~Cアルキル(好ましくはHまたはC~Cアルキル)または-C(O)(C~Cアルキル)であり、これらの基の各々は、1もしくは2個のヒドロキシル基または3個までのハロゲン、好ましくはフッ素基で必要に応じて置換されるか、または必要に応じて置換された複素環、例えば、ピペリジン、モルホリン、ピロリジン、テトラヒドロフラン、テトラヒドロチオフェン、ピペリジン、ピペラジンであり、これらの各々は、必要に応じて置換され;および
は、NまたはC-RYCであり、RYCは、H、OH、CN、NO、ハロ(好ましくはClまたはF)、必要に応じて置換されたC~Cアルキル(好ましくは、1もしくは2個のヒドロキシル基、または3個までのハロ基(例えば、CF)で置換される)、必要に応じて置換されたO(C~Cアルキル)(好ましくは、1もしくは2個のヒドロキシル基、または3個までのハロ基で置換される)、または必要に応じて置換されたアセチレン基-C≡C-Rであり、Rは、HまたはC~Cアルキル基(好ましくはC~Cアルキル)であり;
PROは、H、必要に応じて置換されたC~Cアルキルまたは必要に応じて置換されたアリール(フェニルまたはナフチル)、オキサゾール、イソオキサゾール、チアゾール、イソチアゾール、イミダゾール、ジアゾール、オキシイミダゾール、ピロール、ピロリジン、フラン、ジヒドロフラン、テトラヒドロフラン、チエン、ジヒドロチエン、テトラヒドロチエン、ピリジン、ピペリジン、ピペラジン、モルホリン、キノリン、(それぞれ好ましくはC~Cアルキル基、好ましくはメチルまたはハロ基、好ましくはFまたはClで置換される)、ベンゾフラン、インドール、インドリジン、アザインドリジンからなる群から選択されるヘテロアリールまたは複素環基であり;
PRO1およびRPRO2は、それぞれ独立して、H、必要に応じて置換されたC~Cアルキル基であるか、または、一緒に、ケト基を形成し;および
各nは、独立して、0、1、2、3、4、5もしくは6(好ましくは0もしくは1)である。
特定の代替的な好ましい実施形態において、R3’は、必要に応じて置換された-(CH-(V)n-(CH)n-(V)n’-RS3基、必要に応じて置換された-(CH-N(R1’)(C=O)m’-(V)n’-RS3’基、必要に応じて置換された-XR3’-アルキル基、必要に応じて置換された-XR3’-アリール基;必要に応じて置換された-XR3-HET基、必要に応じて置換された-XR3-アリール-HET基、または必要に応じて置換された-XR3’-HET-アリール基であり、
S3’は、必要に応じて置換されたアルキル基(C~Q10、好ましくはC~Cアルキル)、必要に応じて置換されたアリール基またはHET基であり;
1’は、HまたはC~Cアルキル基(好ましくはH)であり;
Vは、O、SまたはNR1’であり;
R3’は、-(CH-、-(CHCHO)-、-CH-CH(X)=CH(X)-(シスまたはトランス)、-CH-CH≡CH-、またはC~Cシクロアルキル基であり、これらはすべて必要に応じて置換され;
は、H、ハロ、または1個もしくは2個のヒドロキシル基もしくは3個までのハロゲン基で場合により必要に応じて置換されたC1~アルキル基である。
アルキルは、必要に応じて置換されたC~C10アルキル(好ましくはC~Cアルキル)基である(特定の好ましい実施形態において、アルキル基はハロ基、多くの場合ClまたはBrでエンドキャップされている);アリールは、必要に応じて置換されたフェニル基またはナフチル基である(好ましくは、フェニル基);およびHETは、必要に応じて置換されたオキサゾール、イソオキサゾール、チアゾール、イソチアゾール、イミダゾール、ジアゾール、オキシイミダゾール、ピロール、ピロリジン、フラン、ジヒドロフラン(dihydroiuran)、テトラヒドロフラン、チエン、ジヒドロチエン、テトラヒドロチエン、ピリジン、ピペリジン、ピペラジン、モルホリン、ベンゾフラン、インドール、インドリジン、アザインドリジン、キノリン、(置換される場合、それぞれ好ましくはC~Cアルキル基、好ましくはメチルまたはハロ基、好ましくはFまたはClで置換される)からなる群から選択されるヘテロアリールを含む複素環で必要に応じて置換されるか、または以下の化学構造による基である:
Figure 2022505450000030
は、CHRSS、NRURE、またはOであり;
HETは、H、CN、NO、ハロ(好ましくはClまたはF)、必要に応じて置換されたQ~Cアルキル(好ましくは、1もしくは2個のヒドロキシル基、または3個までのハロ基(例えば、CF)で置換される)、必要に応じて置換されたO(C~Cアルキル)(好ましくは、1もしくは2個のヒドロキシル基、または3個までのハロ基で置換される)、または必要に応じて置換されたアセチレン基-C≡C-Rであり、Rは、HまたはC~Cアルキル基(好ましくはC~Cアルキル)であり;
SSは、H、CN、NO、ハロ(好ましくはFまたはCl)、必要に応じて置換されたC~Cアルキル(好ましくは、1もしくは2個のヒドロキシル基、または3個までのハロ基で置換される)、必要に応じて置換されたO(C~Cアルキル)(好ましくは、1もしくは2個のヒドロキシル基、または3個までのハロ基で置換される)、または必要に応じて置換された-C(O)(C~Cアルキル)(好ましくは1または2個のヒドロキシル基、または3個までのハロ基)であり;
UREは、H、C~Cアルキル(好ましくはHまたはC~Cアルキル)または-C(O)(C~Cアルキル)であり、これらの基の各々は、1もしくは2個のヒドロキシル基または3個までのハロゲン、好ましくはフッ素基で必要に応じて置換されるか、または必要に応じて置換された複素環、例えば、ピペリジン、モルホリン、ピロリジン、テトラヒドロフラン、テトラヒドロチオフェン、ピペリジン、ピペラジンであり、これらの各々は、必要に応じて置換され;および
は、NまたはC-RYCであり、RYCは、H、OH、CN、NO、ハロ(好ましくはClまたはF)、必要に応じて置換されたC~Cアルキル(好ましくは、1もしくは2個のヒドロキシル基、または3個までのハロ基(例えば、CF)で置換される)、必要に応じて置換されたO(C~Cアルキル)(好ましくは、1もしくは2個のヒドロキシル基、または3個までのハロ基で置換される)、または必要に応じて置換されたアセチレン基-C≡C-Rであり、Rは、HまたはC~Cアルキル基(好ましくはC~Cアルキル)であり;
PROは、H、必要に応じて置換されたC~Cアルキルまたは必要に応じて置換されたアリール(フェニルまたはナフチル)、オキサゾール、イソオキサゾール、チアゾール、イソチアゾール、イミダゾール、ジアゾール、オキシイミダゾール、ピロール、ピロリジン、フラン、ジヒドロフラン、テトラヒドロフラン、チエン、ジヒドロチエン、テトラヒドロチエン、ピリジン、ピペリジン、ピペラジン、モルホリン、キノリン、(それぞれ好ましくはC~Cアルキル基、好ましくはメチルまたはハロ基、好ましくはFまたはClで置換される)、ベンゾフラン、インドール、インドリジン、アザインドリジンからなる群から選択されるヘテロアリールまたは複素環基であり;
PRO1およびRPRO2は、それぞれ独立して、H、必要に応じて置換されたC~Cアルキル基であるか、または、一緒に、ケト基を形成し;および
各nは、独立して、0、1、2、3、4、5もしくは6(好ましくは0もしくは1)であり;
各m’は0または1であり;および
各n’は0または1である。
代替的な実施形態において、R3’は、-(CH-アリール、-(CHCH2O-アリール、-(CH-HET、または-(CHCHO)-HETであり;
アリールが1または2個の置換基で必要に応じて置換されたフェニルである場合、当該置換基(複数の場合がある)は、好ましくは、-(CHOH、それ自体がさらに場合によりCNで置換されたC~Cアルキル、ハロ(3個までのハロ基)OH、-(CHO(C~C)アルキル、アミン、モノ-またはジ-(C~Cアルキル)アミンから選択され、アミン上のアルキル基が1もしくは2個のヒドロキシル基もしくは3個までのハロ(好ましくはF、Cl)基で必要に応じて置換されており、または当該アリール基が、-(CHOH、-(CH-O-(C~C)アルキル、-(CH-O-(CH-(C~C)アルキル、-(CH-C(O)(C~C)アルキル、-(CH-C(O)O(C~C)アルキル、-(CH-OC(O)(C~C)アルキル、アミン、モノ-もしくはジ-(C~Cアルキル)アミンで置換されており、アミン上のアルキル基が1もしくは2ヒドロキシル基または3個までのハロ(好ましくはF、Cl)基、CN、NOで必要に応じて置換されており、必要に応じて置換された-(CH-(V)m’-CH-(V)-(C~C)アルキル基、-(V)-(CHCHO)-RPEG基であり、VがO、S、またはNRである場合、Rは、HまたはC~Cアルキル基(好ましくはH)であり、RPEGはHまたはC~Cアルキル基であり、これは必要に応じて置換されており(カルボキシル基によって必要に応じて置換されることを含む)、または当該アリール基は、ヘテロアリールを含む複素環で置換されており、オキサゾール、イソオキサゾール、チアゾール、イソチアゾール、イミダゾール、ジアゾール、オキシイミダゾール、ピロール、ピロリジン、フラン、ジヒドロフラン、テトラヒドロフラン、チエン、ジヒドロチエン、テトラヒドロチエン、ピリジン、ピペリジン、ピペラジン、モルホリン、キノリン、ベンゾフラン、インドール、インドリジン、アザインドリジン(置換される場合、各々は、好ましくはC~Cアルキル基、好ましくはメチルまたはハロ基、好ましくはFまたはClで置換される)、または以下の化学構造による基である:
Figure 2022505450000031
は、CHRSS、NRURE、またはOであり;
HETは、H、CN、NO、ハロ(好ましくはClまたはF)、必要に応じて置換されたC~Cアルキル(好ましくは、1もしくは2個のヒドロキシル基、または3個までのハロ基(例えば、CF)で置換される)、必要に応じて置換されたO(C~Cアルキル)(好ましくは、1もしくは2個のヒドロキシル基、または3個までのハロ基で置換される)、または必要に応じて置換されたアセチレン基-C≡C-Rであり、Rは、HまたはC~Cアルキル基(好ましくはC~Cアルキル)であり;
SSは、H、CN、NO、ハロ(好ましくはFまたはCl)、必要に応じて置換されたC~Cアルキル(好ましくは、1もしくは2個のヒドロキシル基、または3個までのハロ基で置換される)、必要に応じて置換されたO(C~Cアルキル)(好ましくは、1もしくは2個のヒドロキシル基、または3個までのハロ基で置換される)、または必要に応じて置換された-C(O)(C~Cアルキル)(好ましくは1または2個のヒドロキシル基、または3個までのハロ基)であり;
UREは、H、C~Cアルキル(好ましくはHまたはC~Cアルキル)または-C(O)(C~Cアルキル)であり、これらの基の各々は、1もしくは2個のヒドロキシル基または3個までのハロゲン、好ましくはフッ素基で必要に応じて置換されるか、または必要に応じて置換された複素環、例えば、ピペリジン、モルホリン、ピロリジン、テトラヒドロフラン、テトラヒドロチオフェン、ピペリジン、ピペラジンであり、これらの各々は、必要に応じて置換されており;および
は、NまたはC-RYCであり、RYCは、H、OH、CN、NO、ハロ(好ましくはClまたはF)、必要に応じて置換されたC~Cアルキル(好ましくは、1もしくは2個のヒドロキシル基、または3個までのハロ基(例えば、CF)で置換される)、必要に応じて置換されたO(C~Cアルキル)(好ましくは、1もしくは2個のヒドロキシル基、または3個までのハロ基で置換される)、または必要に応じて置換されたアセチレン基-C≡C-Rであり、Rは、HまたはC~Cアルキル基(好ましくはC~Cアルキル)であり;
PROは、H、必要に応じて置換されたC~Cアルキルまたは必要に応じて置換されたアリール(フェニルまたはナフチル)、オキサゾール、イソオキサゾール、チアゾール、イソチアゾール、イミダゾール、ジアゾール、オキシイミダゾール、ピロール、ピロリジン、フラン、ジヒドロフラン、テトラヒドロフラン、チエン、ジヒドロチエン、テトラヒドロチエン、ピリジン、ピペリジン、ピペラジン、モルホリン、キノリン、(それぞれ好ましくはC~Cアルキル基、好ましくはメチルまたはハロ基、好ましくはFまたはClで置換される)、ベンゾフラン、インドール、インドリジン、アザインドリジンからなる群から選択されるヘテロアリールまたは複素環基であり;
PRO1およびRPRO2は、それぞれ独立して、H、必要に応じて置換されたC~Cアルキル基であるか、または、一緒に、ケト基を形成し;
HETは、好ましくは、オキサゾール、イソオキサゾール、チアゾール、イソチアゾール、イミダゾール、ジアゾール、オキシイミダゾール、ピロール、ピロリジン、フラン、ジヒドロフラン、テトラヒドロフラン、チエン、ジヒドロチエン、テトラヒドロチエン、ピリジン、ピペリジン、ピペラジン、モルホリン、キノリン(それぞれ好ましくはC~Cアルキル基、好ましくはメチルまたはハロ基、好ましくはFまたはClで置換される)、ベンゾフラン、インドール、インドリジン、アザインドリジンであるか、または以下の化学構造による基である:
Figure 2022505450000032
は、CHRSS、NR、またはOであり;
HETは、H、CN、NO、ハロ(好ましくはClまたはF)、必要に応じて置換されたC~Cアルキル(好ましくは、1もしくは2個のヒドロキシル基、または3個までのハロ基(例えば、CF)で置換される)、必要に応じて置換されたO(C~Cアルキル)(好ましくは、1もしくは2個のヒドロキシル基、または3個までのハロ基で置換される)、または必要に応じて置換されたアセチレン基-C≡C-Rであり、Rは、HまたはC~Cアルキル基(好ましくはC~Cアルキル)であり;
SSは、H、CN、NO、ハロ(好ましくはFまたはCl)、必要に応じて置換されたC~Cアルキル(好ましくは、1もしくは2個のヒドロキシル基、または3個までのハロ基で置換される)、必要に応じて置換されたO(C~Cアルキル)(好ましくは、1もしくは2個のヒドロキシル基、または3個までのハロ基で置換される)、または必要に応じて置換された-C(O)(C~Cアルキル)(好ましくは1または2個のヒドロキシル基、または3個までのハロ基)であり;
UREは、H、C~Cアルキル(好ましくはHまたはC~Cアルキル)または-C(O)(C~Cアルキル)であり、これらの基の各々は、1もしくは2個のヒドロキシル基または3個までのハロゲン、好ましくはフッ素基で必要に応じて置換されるか、または必要に応じて置換された複素環、例えば、ピペリジン、モルホリン、ピロリジン、テトラヒドロフラン(tetrahydroftiran)、テトラヒドロチオフェン、ピペリジン、ピペラジンであり、これらの各々は、必要に応じて置換されており;および
は、NまたはC-RYCであり、RYCは、H、OH、CN、NO、ハロ(好ましくはClまたはF)、必要に応じて置換されたC~Cアルキル(好ましくは、1もしくは2個のヒドロキシル基、または3個までのハロ基(例えば、CF)で置換される)、必要に応じて置換されたO(C~Cアルキル)(好ましくは、1もしくは2個のヒドロキシル基、または3個までのハロ基で置換される)、または必要に応じて置換されたアセチレン基-C≡C-Rであり、Rは、HまたはC~Cアルキル基(好ましくはC~Cアルキル)であり;
PROは、H、必要に応じて置換されたC~Cアルキルまたは必要に応じて置換されたアリール、ヘテロアリールもしくは複素環基であり;
PRO1およびRPRO2は、それぞれ独立して、H、必要に応じて置換されたC~Cアルキル基であるか、または、一緒に、ケト基を形成し;
各m’は、独立して0または1であり;および
各nは、独立して、0、1、2、3、4、5もしくは6(好ましくは0もしくは1)である。
さらに追加の実施形態において、好ましい化合物には、以下の化学構造:
Figure 2022505450000033
式中、R1’は、OH、または患者もしくは対象においてOHに代謝される基であり;
2’は、-NH-CH-アリール-HET(好ましくは、メチル置換チアゾールに直接結合したフェニル)であり;
3’は、-CHRCR3’-NH-C(O)-R3P1基または-CHRCR3’-R3P2基であり;
CR3’は、C~Cアルキル基、好ましくはメチル、イソプロピルまたはtert-ブチルであり;
3P1は、C~Cアルキル(好ましくはメチル)、必要に応じて置換されたオキセタン基(好ましくはメチル置換、nが1または2(好ましくは2)である-(CHOCH基)、または
Figure 2022505450000034
(エチルエーテル基は好ましくはフェニル部分でメタ置換される)、モルホリノ基(2位または3位でカルボニルに連結されている)であり;
3P2は、
Figure 2022505450000035
アリールがフェニルである場合;
HETは、必要に応じて置換されたチアゾールまたはイソチアゾールであり;および
HETは、Hまたはハロ基(好ましくはH)である、
によるもの、またはその薬学的に許容可能な塩、立体異性体、溶媒和物もしくは多形が含まれる。本出願のこの実施形態に属する好ましい組成物を本明細書の図17に示す。
別の態様では、本発明による化合物は、下記式による分子の部分(右側)としてのフェニルアラニンなどのアミノ酸:
Figure 2022505450000036
式中、Xはハロゲン、C~Cアルキルまたは必要に応じて置換された複素環であり;および
およびRは、それぞれ独立して、H、1または2個のヒドロキシル基で必要に応じて置換されたC~Cアルキル、または必要に応じて置換されたフェニル基であり;および
nは、0、1、2もしくは3、好ましくは0もしくは1である、
またはその薬学的に許容可能な塩、エナンチオマー、ジアステレオマー、溶媒和物もしくは多形に基づく。
好ましくは、E3LB部分は、アミド結合を介してL2部分に共有結合することができる-NHCOOH部分で終端する。
特定の実施形態において、E3LB残基は、米国特許出願公開第第2019/0300521号に開示され、その全体が参照により本明細書に組み込まれる。E3LB残基には、以下の構造を有するものが含まれる:
Figure 2022505450000037
式中、
L1は、以下からなる群から選択される:
Figure 2022505450000038
1L1およびR2L1は、独立して、HおよびC~Cアルキルから独立して選択されるか、または、R1L1およびR2L1は、3、4、5、もしくは6員のシクロアルキル基または複素環基であるか;または下記式で表されるペプチド模倣物である:
-Str-(PM)-Sp-、
式中:
Strは、Abに共有結合したストレッチャー単位であり;
Spは、結合またはCIDE部分に共有結合したスペーサー単位であり;および
PMは、
Figure 2022505450000039
式中、
Wは、-NH-ヘテロシクロアルキル-またはヘテロシクロアルキルであり;
Yは、ヘテロアリール、アリール、-C(O)C~Cアルキレン、C~Cアルキレン-NH、C~Cアルキレン-NH-CH、C~Cアルキレン-N-(CH、C~Cアルケニル、またはC~Cアルキレニルであり;
各Rは、独立して、C~C10アルキル、C~C10アルケニル、(C~C10アルキル)NHC(NH)NH、または(C~C10アルキル)NHC(O)NHであり;
およびRは、それぞれ独立して、H、C~C10アルキル、C~C10アルケニル、アリールアルキル、または、ヘテロアリールアルキルであるか、または、RおよびRは、一緒に、C~Cシクロアルキルを形成してもよく;および
およびRは、それぞれ独立して、C~C10アルキル、C~C10アルケニル、アリールアルキル、ヘテロアリールアルキル、(C~C10アルキル)OCH-であるか、または、RおよびRは、C~Cシクロアルキル環を形成してもよい、
からなる群から選択される、非ペプチド化学部分であるか:
または下記式を有するリンカー
Figure 2022505450000040
式中、Aはストレッチャー単位であり、aは0~1の整数であり;Wはアミノ酸単位であり、wは0~12の整数であり;Yはスペーサー単位であり、yは0、1、または2である;
もしくは下記式を有するリンカー:
Figure 2022505450000041
破線は、少なくとも1つのPB、別のE3LB、あるいは少なくとも1つのPB、抗体、もしくは別のE3LBをリンカーの他端にカップリングする化学リンカー部分の結合部位を示す。
L1は、本明細書の他の箇所に記載されるリンカーであり;または、特定の実施形態において、L1は、L1基が、別の位置において、それぞれがE3LB残基である式I-A、I-B、I-C、I-D、I-E、I-F、I-G、I-H、I-I、I-J、I-K、I-L、I-M-、I-N、I-O、I-P、I-Q、I-RおよびL-Iの化合物に共有結合している場合、本明細書中の他の箇所に記載されるようなリンカーまたは水素であり得る(表1-L1に示されるようなフェニル環など)。
式I-AのX、Xは、それぞれ独立して、結合、O、NRY3、CRY3Y4、C-O、C-S、SO、およびSOの群から選択され;
式I-AのRY3、RY4は、それぞれ独立して、H、1つまたは複数のハロで必要に応じて置換された直鎖または分岐鎖のC1~6アルキル、必要に応じて置換されたC1~6アルコキシの群から選択され;
式I-AのWは、必要に応じて置換されたT、必要に応じて置換された-T-N(R1a1b)X、必要に応じて置換された-T-N(R1a1b)、必要に応じて置換された-T-アリール、必要に応じて置換された-T-ヘテロアリール、必要に応じて置換されたT-ビヘテロアリール、必要に応じて置換された-T-複素環、必要に応じて置換された-T-ビ複素環、必要に応じて置換された-NR-T-アリール、必要に応じて置換された-NR-T-ヘテロアリールまたは必要に応じて置換された-NR-T-複素環の群から選択され;
式I-AのXは、C-O、R、R1a、R1bであり;
、R1a、R1bの各々は、H、1つまたは複数のハロまたは-OH基で必要に応じて置換された直鎖または分岐鎖のC~Cアルキル基、RY3C-O,RY3C-S、RY3SO、RY3SO、N(RY3Y4)C-O、N(RY3Y4)C-S、N(RY3Y4)SO、およびN(RY3Y4)SOからなる群から独立して選択され;
式I-AのTは、必要に応じて置換されたアルキル、-(CH-基、-(CH-O-C~Cアルキル(必要に応じて置換された、直鎖、分岐)、または-(CH-O-複素環(必要に応じて置換される)の群から選択され、メチレン基の各々は、ハロゲン、メチル、1つまたは複数のハロゲンもしくは-OH基で必要に応じて置換された直鎖もしくは分岐鎖のC~Cアルキル基、必要に応じて置換されたアミノ酸側鎖、または必要に応じて置換された複素環の群から選択される1個または2個の置換基で必要に応じて置換される;式I-AのWは、必要に応じて置換されたNR-T-アリールであり、該アリール基は必要に応じて置換された5~6員ヘテロアリールもしくは必要に応じて置換されたアリール、必要に応じて置換されたNR-T-ヘテロアリール基であり、該ヘテロアリールは必要に応じて置換されたアリールもしくは必要に応じて置換されたヘテロアリール、または必要に応じて置換されたNR-T-複素環であり、-NRはXに共有結合され、RはHまたはCH、好ましくはHである。
本明細書に記載されるいずれかの実施形態において、Tは、必要に応じて置換されたアルキル、-(CH-基の群から選択され、メチレン基のそれぞれ1つは、ハロゲン、メチル、必要に応じて置換されたアルコキシ、1つまたは複数のハロゲンで必要に応じて置換された直鎖または分岐のC~Cアルキル基、C(O)NR1aまたはNR1aの群から選択される1または2個の置換基で必要に応じて置換されるか、あるいはRおよびR1aが結合して、必要に応じて置換された複素環、または-OH基、または必要に応じて置換されたアミノ酸側鎖を形成し;ならびにnは0~6、多くの場合0、1、2または3、好ましくは0または1である。
特定の実施形態において、式I-AのWは、以下のとおりである。
Figure 2022505450000042
式中、R14aおよびR14bは、それぞれ独立して、H、ハロアルキル(例えば、フルオロアルキル)、必要に応じて置換されたアルキル、必要に応じて置換されたアルコキシ、必要に応じて置換されたヒドロキシルアルキル、必要に応じて置換されたアルキルアミン、必要に応じて置換されたヘテロアルキル、必要に応じて置換されたアルキル-ヘテロシクロアルキル、必要に応じて置換されたアルコキシ-ヘテロシクロアルキル、COR26、CONR27a27b、NHCOR26、もしくはNHCHCOR26であり;R14a、R14bの他方はHであり;またはR14aおよびR14bは、それらが結合している炭素原子と一緒に、必要に応じて置換された3~5員のシクロアルキル、ヘテロシクロアルキル、スピロシクロアルキルまたはスピロ複素環を形成し、スピロ複素環はエポキシドまたはアジリジンではない。
実施形態のいずれかにおいて、式I-AのWは、必要に応じて置換されたフェニル、必要に応じて置換されたナフチルまたは必要に応じて置換された5~10員ヘテロアリールの群から選択され、
式I-AのR15は、H、ハロゲン、CN、OH、NO、NR14a14b、OR14a、CONR14a14b、NR14aCOR14b、SONR14a14b、NR14aSO14b、必要に応じて置換されたアルキル、必要に応じて置換されたハロアルキル、必要に応じて置換されたハロアルコキシ、必要に応じて置換されたアリール、必要に応じて置換されたヘテロアリール、必要に応じて置換されたシクロアルキル、または必要に応じて置換された複素環の群から選択される。
さらなる実施形態において、本開示で使用するためのW置換基はまた、本明細書に開示される同定された化合物に見られるW置換基を具体的に(および限定されないが、開示される特定の化合物に)含む。これらのW置換基のそれぞれは、本明細書にも開示される任意の数のW置換基と組み合わせて使用され得る。
特定のさらなる実施形態において、I-Aは、ピロリジン部分の0~3R基によって必要に応じて置換される。各Riは独立して、H、ハロ、-OH、C1~3アルキル、C=Oである。
本明細書に記載されるいずれかの実施形態において、式I-AのW、Wは、1つまたは複数のPB基に結合したリンカーに独立して共有結合することができる。
破線は、少なくとも1つのPB、別のE3LB、あるいは少なくとも1つのPBをE3LBにカップリングする化学リンカー部分の結合部位を示す。
特定の実施形態において、E3LBは、以下の化学構造で表される:
Figure 2022505450000043
式中:
式I-BのWは、必要に応じて置換されたアリール、必要に応じて置換されたヘテロアリール、または
Figure 2022505450000044
式I-BのRおよびR10は独立して水素、必要に応じて置換されたアルキル、必要に応じて置換されたシクロアルキル、必要に応じて置換されたヒドロキシアルキル、必要に応じて置換されたヘテロアリール、もしくはハロアルキルある;またはR、R10およびそれらが結合している炭素原子は、必要に応じて置換されたシクロアルキルを形成し;
式I-BのR11は、必要に応じて置換された複素環、必要に応じて置換されたアルコキシ、必要に応じて置換されたヘテロアリール、必要に応じて置換されたアリールの群から選択され、
Figure 2022505450000045
式I-BのR12は、Hまたは必要に応じて置換されたアルキルの群から選択され;
式I-BのR13は、H、必要に応じて置換されたアルキル、必要に応じて置換されたアルキルカルボニル、必要に応じて置換された(シクロアルキル)アルキルカルボニル、必要に応じて置換されたアラルキルカルボニル、必要に応じて置換されたアリールカルボニル、必要に応じて置換された(複素環)カルボニル、または必要に応じて置換されたアラルキルの群から選択され;
式I-BのR14aおよびR14bは、それぞれ独立して、H、ハロアルキル(例えば、フルオロアルキル)、必要に応じて置換されたアルキル、必要に応じて置換されたアルコキシ、アミノメチル、アルキルアミノメチル、アルコキシメチル、必要に応じて置換されたヒドロキシルアルキル、必要に応じて置換されたアルキルアミン、必要に応じて置換されたヘテロアルキル、必要に応じて置換されたアルキル-ヘテロシクロアルキル、必要に応じて置換されたアルコキシ-ヘテロシクロアルキル、CONR27a27b、CHNHCOR26、または(CH)N(CH3)COR26の群から選択される;ならびに他方のR14aおよびR14bはHであり;またはR14a、R14bは、それらが結合している炭素原子と一緒に、必要に応じて置換された3~6員のシクロアルキル、ヘテロシクロアルキル、スピロシクロアルキルまたはスピロ複素環を形成し、スピロ複素環はエポキシドまたはアジリジンではない;
式I-BのWは、フェニル、ナフチル、または5~10員のヘテロアリールの群から選択され、
式I-BのR15は、H、ハロゲン、CN、OH、NO、NR27a27b、OR27a、CONR27a27b、NR27aCOR27b、SONR27a27b、NR27aSO27b、必要に応じて置換されたアルキル、必要に応じて置換されたハロアルキル、必要に応じて置換されたハロアルコキシ、必要に応じて置換されたアリール、必要に応じて置換されたヘテロアリール、必要に応じて置換されたシクロアルキル、または必要に応じて置換された複素環の群から選択され;
式I-Bの各R16は、ハロ、CN、必要に応じて置換されたアルキル、必要に応じて置換されたハロアルキル、ヒドロキシ、もしくは必要に応じて置換されたハロアルコキシの群から独立して選択され;
式I-Bのoは、0、1、2、3、または4であり;
式I-BのR18は、Hハロ、必要に応じて置換されたアルコキシ、シアノ、必要に応じて置換されたアルキル、ハロアルキル、ハロアルコキシまたはリンカーの群から独立して選択され;
各R26は、独立して、H、必要に応じて置換されたアルキルまたはNR27a27bから選択され;
各R27aおよびR27bは、独立して、H、必要に応じて置換されたアルキルであるか、またはR27aおよびR27bは、それらが結合している窒素原子と一緒に、4~6員複素環を形成し;および
式I-Bのpは0、1、2、3または4であり、破線は、少なくとも1つのPB、別のE3LB、あるいは少なくとも1つのPBをE3LBにカップリングする化学リンカー部分の結合部位を示す。
式Iの特定の実では施形態、式I-BのR15は、以下のとおりである:
Figure 2022505450000046
式中、R17は、H、ハロ、必要に応じて置換されたC3-6シクロアルキル、必要に応じて置換されたC1-6アルキル、必要に応じて置換されたC1-6アルケニルおよびC1-6ハロアルキルである);ならびにXaはSまたはOである。
特定の実施形態において、式I-BのR17は、メチル、エチル、イソプロピルおよびシクロプロピルの群から選択される。
特定の実施形態において、式I-BのR15は、以下からなる群から選択される:
Figure 2022505450000047
Figure 2022505450000048
特定の実施形態において、式I-BのR11は、以下からなる群から選択される:
Figure 2022505450000049
Figure 2022505450000050
Figure 2022505450000051
特定の実施形態において、式I-BのR14aおよびR14bは、それぞれ独立して、H、必要に応じて置換されたハロアルキル、必要に応じて置換されたアルキル、必要に応じて置換されたアルコキシ、アミノメチル、アルキルアミノメチル、アルコキシメチル、必要に応じて置換されたヒドロキシルアルキル、必要に応じて置換されたアルキルアミン、必要に応じて置換されたヘテロアルキル、必要に応じて置換されたアルキル-ヘテロシクロアルキル、必要に応じて置換されたアルコキシ-ヘテロシクロアルキル、CHOR30、CHNHR30、CHNCH30、CONR27a27b、CHCONR27a27b、CHNHCOR26、またはCHNCHCOR26の群から選択され;および他方のR14aおよびR14bはHであるか;またはR14a、R14bは、それらが結合している炭素原子と一緒に、必要に応じて置換された3~6員のシクロアルキル、ヘテロシクロアルキル、スピロシクロアルキルまたはスピロ複素環を形成し、スピロ複素環はエポキシドまたはアジリジンではなく、当該スピロシクロアルキルまたはスピロヘテロシクロアルキルはそれ自体が、アルキル、ハロアルキル、または-COR33で必要に応じて置換されており、R33はアルキルまたはハロアルキルであり、
30は、H、アルキル、アルキニルアルキル、シクロアルキル、ヘテロシクロアルキル、シクロアルキルアルキル、ヘテロシクロアルキルアルキル、アリールアルキルまたはヘテロアリールアルキルから選択され、さらに必要に応じて置換される;R26およびR27は、上記のとおりである。
特定の実施形態において、式I-BのR15は、H、ハロゲン、CN、OH、NO、NR27a27b,OR27a,CONR27a27b、NR27aCOR27b,SONR27a27b、NR27aSO27b必要に応じて置換されたアルキル、必要に応じて置換されたハロアルキル(例えば必要に応じて置換されたフルオロアルキル)、必要に応じて置換されたハロアルコキシ、必要に応じて置換されたアリール、必要に応じて置換されたヘテロアリール、必要に応じて置換されたシクロアルキル、または必要に応じて置換された複素環から選択され、当該アリール、ヘテロアリール、シクロアルキルおよびヘテロシクロアルキルの必要に応じて置換されたものは、CHOR30、CHNHR30、CHNCH30、CONR27a27b、CHCONR27a27b、CHNHCOR26、CHNCHCOR26を含むか、または
Figure 2022505450000052
26、R27、R30およびR14aは上に記載されるとおりである。
特定の実施形態において、式I-BのR14aおよびR14bは、それぞれ独立して、H、必要に応じて置換されたハロアルキル、必要に応じて置換されたアルキル、CHOR30、CHNHR30、CHNCH30、CONR27a27b、CHCONR27a27b、CHNHCOR26、またはCHNCHCOR26の群から選択される;ならびに他方のR14aおよびR14bはHである;またはR14a、R14bは、それらが結合している炭素原子と一緒に、必要に応じて置換された3~6員のスピロシクロアルキルまたはスピロ複素環を形成し、スピロ複素環はエポキシドまたはアジリジンではなく、当該スピロシクロアルキルまたはスピロヘテロシクロアルキルはそれ自体が、アルキル、ハロアルキル、または-COR33で必要に応じて置換されており、R33はアルキルまたはハロアルキルであり、R30は、H、アルキル、アルキニルアルキル、シクロアルキル、ヘテロシクロアルキル、シクロアルキルアルキル、ヘテロシクロアルキルアルキル、アリールアルキルまたはヘテロアリールアルキルから選択され、さらに必要に応じて置換される;
式I-BのR15は、H、ハロゲン、CN、OH、NO、NR27a27b,OR27a,CONR27a27b、NR27aCOR27b,SONR27a27b、NR27aSO27b必要に応じて置換されたアルキル、必要に応じて置換されたハロアルキル、必要に応じて置換されたハロアルコキシ、必要に応じて置換されたアリール、必要に応じて置換されたヘテロアリール、必要に応じて置換されたシクロアルキル、または必要に応じて置換された複素環から選択され、当該アリール、ヘテロアリール、シクロアルキルおよびヘテロシクロアルキルの必要に応じて置換されたものは、CHOR30、CHNHR30、CHNCH30、CONR27a27b、CHCONR27a27b、CHNHCOR26、CHNCHCOR26を含むか、または
Figure 2022505450000053
26、R27、R30およびR14aは上に記載されるとおりである。
特定の実施形態において、E3LBは、以下の群から選択される化学構造を有する:
Figure 2022505450000054
Figure 2022505450000055
式中:
式I-C、I-DおよびI-Eのは、H、エチル、イソプロピル、tert-ブチル、sec-ブチル、シクロプロピル、シクロブチル、シクロペンチルまたはシクロヘキシルであり、必要に応じて置換されたアルキル、必要に応じて置換されたシクロアルキル、必要に応じて置換されたヒドロキシアルキル、必要に応じて置換されたヘテロアリール、またはハロアルキルであり;
式I-C、I-DおよびI-EのR14aは、H、ハロアルキル、必要に応じて置換されたアルキル、メチル、フルオロメチル、ヒドロキシメチル、エチル、イソプロピルまたはシクロプロピルであり;
式I-C、I-DおよびI-EのR15は、H、ハロゲン、CN、OH、NO、必要に応じて置換されたヘテロアリール、必要に応じて置換されたアリールからなる群から選択され、必要に応じて置換されたアルキル、必要に応じて置換されたハロアルキル、必要に応じて置換されたハロアルコキシ、必要に応じて置換されたシクロアルキル、または必要に応じて置換された複素環であり;
式I-C、I-D、およびI-EのXは、C、CH、またはC=Oであり、
式I-C、I-DおよびI-EのRは存在しないか、または必要に応じて置換された5もしくは6員ヘテロアリールであり;および
破線は、少なくとも1つのPB、別のE3LB、あるいは少なくとも1つのPBもしくは別のE3LBまたはその両方をE3LBにカップリングする化学リンカー部分の結合部位を示す。
特定の実施形態において、E3LB以下の化学構造を含む:
Figure 2022505450000056
式中:
式I-FのR14aは、H、ハロアルキル、必要に応じて置換されたアルキル、メチル、フルオロメチル、ヒドロキシメチル、エチル、イソプロピルまたはシクロプロピルであり;
式I-FのRはHであり;
式I-FのR10は、H、エチル、イソプロピル、tert-ブチル、sec-ブチル、シクロプロピル、シクロブチル、シクロペンチルまたはシクロヘキシルであり;
式I-FのR11は、
Figure 2022505450000057
または必要に応じて置換されたヘテロアリールであり;
式I-Fのpは、0、1、2、3、または4であり;
式I-Fの各R18は、独立して、ハロ、必要に応じて置換されたアルコキシ、シアノ、必要に応じて置換されたアルキル、ハロアルキル、ハロアルコキシまたはリンカーであり;
式I-FのR12はH、C=Oであり;
式I-FのR13は、H、必要に応じて置換されたアルキル、必要に応じて置換されたアルキルカルボニル、必要に応じて置換された(シクロアルキル)アルキルカルボニル、必要に応じて置換されたアラルキルカルボニル、必要に応じて置換されたアリールカルボニル、必要に応じて置換された(複素環)カルボニル、または必要に応じて置換されたアラルキルであり;
式I-FのR15は、H、ハロゲン、Cl、CN、OH、NO、必要に応じて置換されたハロアルキル、必要に応じて置換されたヘテロアリール、必要に応じて置換されたアリールからなる群から選択され;
Figure 2022505450000058
Figure 2022505450000059
および、
式I-Fの破線は、少なくとも1つのPB、別のE3LB、あるいは少なくとも1つのPBもしくは別のE3LBまたはその両方をE3LBにカップリングする化学リンカー部分の結合部位を示す。
特定の実施形態において、E3LBは、下記構造から選択される:
Figure 2022505450000060
Figure 2022505450000061
Figure 2022505450000062
Figure 2022505450000063
式中、nは、0または1である。
特定の実施形態において、E3LBは、下記構造から選択される:
Figure 2022505450000064
Figure 2022505450000065
Figure 2022505450000066
Figure 2022505450000067
Figure 2022505450000068
Figure 2022505450000069
Figure 2022505450000070
Figure 2022505450000071
Figure 2022505450000072
Figure 2022505450000073
式中、I-A1~I-A15、I-B1~I-B12、I-C1~I-C15およびI-D1~I-D9のフェニル環は、フッ素、低級アルキルおよびアルコキシ基で必要に応じて置換されており、破線は、少なくとも1つのPB、別のE3LB、あるいは少なくとも1つのPBもしくは別のE3LBまたはその両方をI-Aにカップリングする化学リンカー部分の結合部位を示す。
一実施形態において、I-A1~I-A15、I-B1~I-B12、I-C1~I-C15およびI-D1~I-D9のフェニル環をエステルとして官能化して、プロドラッグの一部にすることができる。
特定の実施形態において、それぞれI-A1~I-A15、I-B1~I-B12、I-C1~I-C15およびI-D1~I-D9のピロリジン環上のヒドロキシル基は、エステル結合プロドラッグ部分を含む。
本明細書に記載される態様または実施形態のいずれかにおいて、E3LBは、以下の化学構造による基:
Figure 2022505450000074
またはその薬学的に許容可能な塩であって、
式中:
I-GのXおよびX’は、それぞれ独立して、C=O、C=S、-S(O)、S(O)であり、(好ましくは、XおよびX’は両方ともC=O)であり;
I-GのR2’は、必要に応じて置換された-(CH-(C-O)(NR’’)(SOアルキル基、必要に応じて置換された-(CH-(C-O)(NR’’)(SONR1N2N基、必要に応じて置換された-(CH-(C-O)(NR’’)(SO-アリール、必要に応じて置換された-(CH-(C-O)(NR’’)(SO-ヘテロアリール、必要に応じて置換された-(CH-(C-O)NR’’(SO-複素環、必要に応じて置換された-NR’’-(CH-C(O)(NR’’)(SO-アルキル、必要に応じて置換された-NR’’-(CH-C(O)(NR’’)(SO-NR1N2N、必要に応じて置換された-NR’’-(CH-C(O)(NR’’)(SO-NR’’C(O)R1N、必要に応じて置換された-NR’’-(CH-(C-O)(NR’’)(SO-アリール、必要に応じて置換された-NR’’-(CH-(C-O)(NR’’)(SO-ヘテロアリールまたは必要に応じて置換された-NR’’-(CH-(C-O)NR’’(SO-複素環、必要に応じて置換された-XR2’-アルキル基;必要に応じて置換された-XR2’-アリール基;必要に応じて置換された-XR2’-ヘテロアリール基;必要に応じて置換された-XR2’-複素環基であり;
I-GのR3’は、必要に応じて置換されたアルキル、必要に応じて置換された-(CH-(O)(NR’’)(SO-アルキル、必要に応じて置換された-(CH-C(O)(NR’’)(SO-NR1N2N、必要に応じて置換された-(CH-C(O)(NR’’)(SO-NR’’C(O)R1N、必要に応じて置換された-(CH-C(O)(NR’’)(SO-C(O)(R’’)、必要に応じて置換された-(CH-C(O)(NR’’)(SO-アリール、必要に応じて置換された-(CH-C(O)(NR’’)(SO-ヘテロアリール、必要に応じて置換された-(CH-C(O)-(NR’’)(SO-複素環、必要に応じて置換された-NR’’-(CH-C(O)(NR’’)(SO-アルキル、必要に応じて置換された-NR’’-(CH-C(O)(NR’’)(SO-NR1N2N、必要に応じて置換された-NR’’-(CH-C(O)(NR’’)(SO-NR’’C(O)R1N、必要に応じて置換された-NR’’-(CH-C(O)(NR’’)(SO-アリール、必要に応じて置換された-NR’’-(CH-C(O)(NR’’)(SO-ヘテロアリール、必要に応じて置換された-NR-(CH-C(O)(NR’’)(SO-複素環、必要に応じて置換された-O-(CH)n-(C-O)(NR’’)(SO-アルキル、必要に応じて置換された-O-(CH)n-(C-O)(NR’’)(SO-NR1N2N、必要に応じて置換された-O-(CH)n-(C-O)(NR’’)(SO-NR’’C(O)R1N、必要に応じて置換された-O-(CH)n-(C-O)(NR’’)(SO-アリール、必要に応じて置換された-O-(CH-(C-O)(NR’’)(SO-ヘテロアリールoR必要に応じて置換された-O-(CH-(C-O)(NR’’)(SO-複素環;-(CH-(V)n’-(CH-(V)n’-アルキル基、必要に応じて置換された-(CH-(V)n’-(CH-(V)n’-アリール基、必要に応じて置換された-(CH-(V)n’-(CH-(V)n’-ヘテロアリール基、必要に応じて置換された-(CH-(V)n’-(CH-(V)n’-複素環’基、必要に応じて置換された-(CH-N(R1’)(C-O)m’-(V)n’-アルキル基、必要に応じて置換された-(CH-N(R1’)(C-O)m’-(V)n’-アリール基、必要に応じて置換された-(CH-N(R1’)(C-O)m’-(V)-ヘテロアリール基、必要に応じて置換された-(CH-N(R1’)(C-O)m’-(V)n’-複素環基、必要に応じて置換された-XR3’-アルキル基;必要に応じて置換された-XR3’-アリール基;必要に応じて置換された-XR3’-ヘテロアリール基;必要に応じて置換された-XR3’-複素環基であり;
1NおよびR2Nは、それぞれ独立して、H、1もしくは2個のヒドロキシル基および3個までのハロゲン基で必要に応じて置換されたC~Cアルキル、または必要に応じて置換された-(CH-アリール、-(CH-ヘテロアリールもしくは-(CH-複素環基であり;
I-GのVは、O、SまたはNRであり;
I-Gの各R1’は、独立して、HまたはC~Cアルキル基であり;
I-GのXR2’およびXR3’は、それぞれ独立して、-(CH-、-(CH-CH(X)=CH(X)-(シスまたはトランス)、-CH-CH≡CH-、-(CHCHO)-、またはC~Cシクロアルキル基であり、Xは、H、ハロ、または必要に応じて置換されたC~Cアルキル基であり;
I-Gの各R’’は、それぞれ独立して、H、または1つもしくは2個のヒドロキシル基または最大3個のハロゲン基(好ましくはフッ素)で必要に応じて置換されたC~Cアルキル基であり;
I-GのRはC~Cアルキル基、必要に応じて置換されたアリール、ヘテロアリールもしくは複素環基、または-(CHN(R’’)基であり;
I-Gの各mは、独立して、0、1、2、3、4、5、6であり;
I-G各m’は、独立して0または1であり;
I-Gの各nは、独立して、0、1、2、3、4、5、6であり;
I-G各n’は、独立して0または1であり;
I-G各uは、独立して0または1であり;
I-G各vは、独立して0または1であり;
I-G各wは、独立して0または1であり;および
I-GのR2’、R3’、XおよびX’のいずれか1つまたは複数は、PBがE3LBでない場合、またはPBがE3LBである場合、E3LBのそれぞれのR2’、R3’、XおよびX’のいずれか1つまたは複数は、必要に応じて、直接またはリンカー基を介して互いに共有結合するように修飾されている、
またはその薬学的に許容可能な塩、立体異性体、溶媒和物もしくは多形である。
本明細書に記載の態様または実施形態のいずれかにおいて、E3LBは以下のとおりである:
Figure 2022505450000075
式中:
I-HのR2’およびR3’のそれぞれは上記と同じであり、XはC-O、C-S、-S(O)基またはS(O)基であり、より好ましくはC-O基であり、および、
I-HのR2’およびR3’のいずれか1つまたは複数は、PBがE3LBでない場合、PB基にさらに共有結合するリンカー基に結合するように必要に応じて修飾されているか、またはPBがE3LBである場合、E3LBのそれぞれのR2’、R3’のうちのいずれか1つまたは複数が、互いに直接またはリンカー基を介して共有結合するように必要に応じて修飾されている、
またはその薬学的に許容可能な塩、エナンチオマー、ジアステレオマー、溶媒和物もしくは多形である。
本明細書に記載の態様または実施形態のいずれかにおいて、E3LBは下記化学構造によるものである:
Figure 2022505450000076
式中:
I-IのR2’およびR3’のいずれか1つまたは複数は、PBがE3LBでない場合、PB基にさらに共有結合するリンカー基に結合するように必要に応じて修飾されているか、またはPBがE3LBである場合、E3LBのそれぞれのR2’、R3’のうちのいずれか1つまたは複数が、互いに直接またはリンカー基を介して共有結合するように必要に応じて修飾されている、
またはその薬学的に許容可能な塩、エナンチオマー、ジアステレオマー、溶媒和物もしくは多形である。
存在する場合、I-GおよびI-HのXおよびX’は、好ましくはC=O、C=S、-S(O)基またはS(O)基、より好ましくはC=O基である。
I-G~I-IのR2’が、好ましくは、必要に応じて置換された-NH-T-アリール、必要に応じて置換された-N(CH)-T-アリール、必要に応じて置換された-NH-T-ヘテロアリール基、必要に応じて置換された-N(CH)-T-ヘテロアリール、必要に応じて置換された-NH-T-複素環、または必要に応じて置換された-N(CH)-T-複素環であり、好ましくはHであり、Tは必要に応じて置換された-(CH-基であり、メチレン基の各々は、好ましくはハロゲン、本明細書に別途記載するアミノ酸側鎖またはC~Cアルキル基、好ましくは必要に応じて置換された1または2個のメチル基で置換から選択される1または2個の置換基で必要に応じて置換されてもよい;nは0~6、多くの場合0、1、2または3、好ましくは0または1である。代替的には、Tはまた、-(CHO)-基、-(OCH-基、-(CHCHO)-基、-(OCHCH-基であり得て、これらのすべてが必要に応じて置換される。
I-G~I-IのR2’に好ましいアリール基としては、必要に応じて置換されたフェニル基またはナフチル基、好ましくはフェニル基が挙げられ、フェニルまたはナフチル基は、PB(E3LB基を含む)に接続され、および/またはハロゲン(好ましくはFまたはCl)、アミン、モノアルキル-またはジアルキルアミン(好ましくは、ジメチルアミン)、F、Cl、OH、COOH、C~Cアルキル、好ましくはCH、CF、OMe、OCF、NO、またはCN基(その各々は、フェニル環のオルト位、メタ位および/またはパラ位、好ましくはパラ位で置換されてもよい)、必要に応じて置換されたフェニル基(フェニル基は、E3LBを含むPB基にリンカー基によって必要に応じて接続され、および/または必要に応じて、F、Cl、OH、COOH、CH、CF、OMe、OCF、NOまたはCN基のうちの少なくとも1つで置換されており(フェニル環のオルト位、メタ位および/またはパラ位で置換されていてもよく、好ましくはパラ位で置換されていてもよい)、必要に応じて置換されたナフチル基、必要に応じて置換されたヘテロアリール、好ましくはメチル置換イソオキサゾールを含む必要に応じて置換されたイソオキサゾール、メチル置換オキサゾールを含む必要に応じて置換されたオキサゾール、メチル置換チアゾールを含む必要に応じて置換されたチアゾール、メチル置換イソチアゾールを含む必要に応じて置換されたイソチアゾール、メチル置換ピロールを含む必要に応じて置換されたピロール、メチルイミダゾールを含む必要に応じて置換されたイミダゾール、必要に応じて置換されたベンズイミダゾールまたはメトキベンジルイミダゾール、必要に応じて置換されたオキシイミダゾールまたはメチルオキシイミダゾール、メチルジアゾール基を含む必要に応じて置換されたジアゾール基、メチル置換トリアゾール基を含む必要に応じて置換されたトリアゾール基、ハロ-(好ましくは、F)もしくはメチル置換ピリジン基またはオキサピリジン基(ピリジン基は酸素によってフェニル基に結合される)を含む必要に応じて置換されたピリジン基、必要に応じて置換されたフラン、必要に応じて置換されたベンゾフラン、必要に応じて置換されたジヒドロベンゾフラン、必要に応じて置換されたインドール、インドリジンまたはアザインドリジン(2、3、または4-アザインドリジン)、必要に応じて置換されたキノリン、下記化学構造による必要に応じて置換された基で置換されてもよい:
Figure 2022505450000077
式中:
I-G~I-IのSは、CHRSS、NRURE、またはOであり;
I-G~I-IのRHETは、H、CN、NO、ハロ(好ましくはClまたはF)、必要に応じて置換されたC~Cアルキル(好ましくは、1もしくは2個のヒドロキシル基、または3個までのハロ基(例えば、CF)で置換される)、必要に応じて置換されたO(C~Cアルキル)(好ましくは、1もしくは2個のヒドロキシル基、または3個までのハロ基で置換される)、または必要に応じて置換されたアセチレン基-C≡C-Rであり、Rは、HまたはC~Cアルキル基(好ましくはC~Cアルキル)であり;
I-G~I-IのRSSは、H、CN、NO、ハロ(好ましくはFまたはCl)、必要に応じて置換されたC~Cアルキル(好ましくは、1もしくは2個のヒドロキシル基、または3個までのハロ基で置換される)、必要に応じて置換されたO(C~Cアルキル)(好ましくは、1もしくは2個のヒドロキシル基、または3個までのハロ基で置換される)、または必要に応じて置換された-C(O)(C~Cアルキル)(好ましくは1または2個のヒドロキシル基、または3個までのハロ基)であり;
I-G~I-IのRUREは、H、C~Cアルキル(好ましくはHまたはC~Cアルキル)または-C(O)(C~Cアルキル)であり、これらの基の各々は、1もしくは2個のヒドロキシル基または3個までのハロゲン、好ましくはフッ素基で必要に応じて置換されるか、または必要に応じて置換されたフェニル基、必要に応じて置換されたヘテロアリールまたは必要に応じて置換された複素環、好ましくは、例えばピペリジン、モルホリン、ピロリジン、テトラヒドロフラン)であり;
I-G~I-IのRPROは、H、必要に応じて置換されたC~Cアルキルまたは必要に応じて置換されたアリール(フェニルまたはナフチル)、オキサゾール、イソオキサゾール、チアゾール、イソチアゾール、イミダゾール、ジアゾール、オキシイミダゾール、ピロール、ピロリジン、フラン、ジヒドロフラン、テトラヒドロフラン、チエン、ジヒドロチエン、テトラヒドロチエン、ピリジン、ピペリジン、ピペラジン、モルホリン、キノリン、(それぞれ好ましくはC~Cアルキル基、好ましくはメチルまたはハロ基、好ましくはFまたはClで置換される)、ベンゾフラン、インドール、インドリジン、アザインドリジンからなる群から選択されるヘテロアリールまたは複素環基であり;
I-G~I-IのRPRO1およびRPRO2は、それぞれ独立して、H、必要に応じて置換されたC~Cアルキル基であるか、または、一緒に、ケト基を形成し;および
I-G~I-Iの各nは、独立して、0、1、2、3、4、5もしくは6(好ましくは0もしくは1)であり、または必要に応じて置換された複素環、好ましくはテトラヒドロフラン、テトラヒドロチエン、ピペリジン、ピペラジンもしくはモルホリン(置換される場合、それぞれの基は好ましくはメチルまたはハロ(F、Br、C1)で置換される(F、Br、Cl)であり、これらの基の各々は、必要に応じて、リンカー基を介してPB基(E3LB基を含む)に結合していてもよい。
特定の好ましい態様では、
Figure 2022505450000078
I-G~I-Iは
Figure 2022505450000079
式中、I-G~I-IのRPROおよびnは、上記と同じである、
である。
I-G~I-IのR2’の好ましいヘテロアリール基としては、必要に応じて置換されたキノリン(これは、薬理作用団に結合していても、キノリン環内の任意の炭素原子上で置換されていてもよい)、必要に応じて置換されたインドール、必要に応じて置換されたインドリジン、必要に応じて置換されたアザインドリジン、必要に応じて置換されたベンゾフラン(必要に応じて置換されたベンゾフランを含む)、必要に応じて置換されたイソオキサゾール、必要に応じて置換されたチアゾール、必要に応じて置換されたイソチアゾール、必要に応じて置換されたチオフェン、必要に応じて置換されたピリジン(2-、3、または4-ピリジン)、必要に応じて置換されたイミダゾール、必要に応じて置換されたピロール、必要に応じて置換されたジアゾール、必要に応じて置換されたトリアゾール、テトラゾール、必要に応じて置換されたオキシイミダゾール、または以下の化学構造による基が挙げられる:
Figure 2022505450000080
式中:
I-G~I-IのSは、CHRSS、NRURE、またはOであり;
I-G~I-IのRHETは、H、CN、NO、ハロ(好ましくはClまたはF)、必要に応じて置換されたC~Cアルキル(好ましくは、1もしくは2個のヒドロキシル基、または3個までのハロ基(例えば、CF)で置換される)、必要に応じて置換されたO(C~Cアルキル)(好ましくは、1もしくは2個のヒドロキシル基、または3個までのハロ基で置換される)、または必要に応じて置換されたアセチレン基-C≡C-Rであり、I-G~I-IのRは、HまたはC~Cアルキル基(好ましくはC~Cアルキル)であり;
I-G~I-IのRSSは、H、CN、NO、ハロ(好ましくはFまたはCl)、必要に応じて置換されたC~Cアルキル(好ましくは、1もしくは2個のヒドロキシル基、または3個までのハロ基で置換される)、必要に応じて置換されたO(C~Cアルキル)(好ましくは、1もしくは2個のヒドロキシル基、または3個までのハロ基で置換される)、または必要に応じて置換された-C(O)(C~Cアルキル)(好ましくは1または2個のヒドロキシル基、または3個までのハロ基)であり;
I-G~I-IのRUREは、H、C~Cアルキル(好ましくはHまたはC~Cアルキル)または-C(O)(C~Cアルキル)であり、これらの基の各々は、1もしくは2個のヒドロキシル基または3個までのハロゲン、好ましくはフッ素基で必要に応じて置換されるか、または必要に応じて置換された複素環、例えば、ピペリジン、モルホリン、ピロリジン、テトラヒドロフラン、テトラヒドロチオフェン、ピペリジン、ピペラジンであり、これらの各々は、必要に応じて置換されており;および
I-G~I-IのYは、NまたはC-RYCであり、RYCは、H、OH、CN、NO、ハロ(好ましくはClまたはF)、必要に応じて置換されたC~Cアルキル(好ましくは、1もしくは2個のヒドロキシル基、または3個までのハロ基(例えば、CF)で置換される)、必要に応じて置換されたO(C~Cアルキル)(好ましくは、1もしくは2個のヒドロキシル基、または3個までのハロ基で置換される)、または必要に応じて置換されたアセチレン基-C≡C-Rであり、Rは、HまたはC~Cアルキル基(好ましくはC~Cアルキル、これらの各々は、リンカー基を介してPB基(E3LB基を含む)に必要に応じて接続され得る)であり;
I-G~I-IのR2’に対する好ましい複素環複素環基としては、テトラヒドロフラン、テトラヒドロチエン、テトラヒドロキノリン、ピペリジン、ピペラジン、ピロリジン、モルホリン、オキサンもしくはチアンが挙げられ、これらの基の各々は必要に応じて置換されていてもよく、または以下の化学構造による基であり得る。
Figure 2022505450000081
好ましくは、
Figure 2022505450000082
式中:
I-G~I-IのRPROは、H、必要に応じて置換されたC~Cアルキルまたは必要に応じて置換されたアリール、ヘテロアリールもしくは複素環基であり;
I-G~I-IのRPRO1およびRPRO2は、それぞれ独立して、H、必要に応じて置換されたC~Cアルキル基であるか、または、一緒に、ケト基を形成し;および
I-G~I-Iの各nは、独立して、0、1、2、3、4、5または6(多くの場合、0または1)であり、これらの基の各々は、必要に応じてリンカー基を介してPB基(E3LB基を含む)に連結されていてもよい。
I-G~I-Iの好ましいR2’置換基はまた、本明細書に開示される同定された化合物に見られるR2’置換基を具体的に(および限定されないが、開示される特定の化合物に)含む。これらのR2’置換基のそれぞれは、本明細書にも開示される任意の数のR3’置換基と組み合わせて使用され得る。
I-G~I-IのR3’は、好ましくは、必要に応じて置換された-NH-T-アリール、必要に応じて置換された-N(C~Cアルキル)-T-アリール、必要に応じて置換された-NH-T-ヘテロアリール基、必要に応じて置換された-N(C~Cアルキル)-T-ヘテロアリール、必要に応じて置換された-NH-T-複素環、または必要に応じて置換された-N(C~Cアルキル)-T-複素環であり、Tは必要に応じて置換された-(CH-基であり、メチレン基の各々は、必要に応じて、好ましくはハロゲン、C~Cアルキル基、または本明細書に別途記載されているようなアミノ酸から選択される1または2個の置換基、好ましくはメチルで置換されていてもよく;nは0~6、多くの場合0、1、2、または3、好ましくは0または1である。代替的には、Tはまた、-(CHO)-基、-(OCH-基、-(CHCHO)-基、-(OCHCH-基であり得て、これらの各々は必要に応じて置換される。
I-G~I-IのR3’に好ましいアリール基としては、置換されていてもよいフェニルまたはナフチル基、好ましくはフェニル基が挙げられ、フェニルまたはナフチル基はリンカー基を介してPB基(E3LB基を含む)に必要に応じて接続され、および/またはハロゲン(好ましくはFまたはC1)、アミン、モノアルキル-またはジアルキルアミン(好ましくは、ジメチルアミン)、アミド基(好ましくは(CH-NRC(O)R基(式中、m、RおよびRは上記と同じである))、ハロ(しばしばF、Cl)、OH、CH、CF、OMe、OCF、NO、CNまたはS(O)基(は、C~Cアルキル基、必要に応じて置換されたアリール、ヘテロアリールもしくは複素環基または-(CH(R’’)基)であり、これらの各々は、フェニル環のオルト位、メタ位および/またはパラ位、好ましくはパラ位)で置換されていてもよく、またはアリール(好ましくはフェニル)、ヘテロアリールもしくは複素環で必要に応じて置換されていてもよい。好ましくは、上記置換フェニル基は、必要に応じて置換されたフェニル基(すなわち、置換フェニル基自体は、好ましくは、F、Cl、OH、SH、COOH、CH、CF、OMe、OCF、NOまたはCN基、またはPB基(E3LB基を含む)が結合されるリンカー基のうちの少なくとも1つで置換されており、置換は、フェニル環のオルト位、メタ位および/またはパラ位、好ましくはパラ位で生じる)、上記に記載されるようなものを含む必要に応じて置換され得るナフチル基、必要に応じて置換されたヘテロアリール(好ましくは、メチル置換イソオキサゾールを含む必要に応じて置換されたイソオキサゾール)、メチル置換オキサゾールを含む必要に応じて置換されたオキサゾール、メチル置換チアゾールを含む必要に応じて置換されたチアゾール、メチル置換ピロールを含む必要に応じて置換されたピロール、メチルイミダゾールを含む必要に応じて置換されたイミダゾール、ベンズイミダゾールまたはメトキベンジルイミダゾール、オキシイミダゾールまたはメチルオキシイミダゾール、メチルジアゾール基を含む必要に応じて置換されたジアゾール基、メチル置換トリアゾール基を含む必要に応じて置換されたトリアゾール基、テトラゾール基、ハロ-(好ましくは、F)もしくはメチル置換ピリジン基または必要に応じて置換されたオキサピリジン基(ピリジン基は酸素によってフェニル基に結合される)を含む必要に応じて置換されたピリジン基、必要に応じて置換された複素環(テトラヒドロフラン、テトラヒドロチオフェン、ピロリジン、オキサン、チアン、またはヒテトラヒドロキノリン)であり得る:アリール、ヘテロアリール、または複素環基の各々は、必要に応じて、リンカー基を介してPB基(E3LB基を含む)に連結されていてもよい。
I-G~I-IのR3’に好ましいヘテロアリール基としては、必要に応じて置換されたキノリン(これは、ファルマコフォアに結合していても、またはキノリン環内の任意の炭素原子で置換されていてもよい)、必要に応じて置換されたインドール(ジヒドロインドールを含む)、必要に応じて置換されたインドリジン、必要に応じて置換されたアザインドリジン(2、3または4-アザインドリジン)、必要に応じて置換されたベンズイミダゾール、ベンゾジアゾール、ベンゾオキソフラン、必要に応じて置換されたイミダゾール、必要に応じて置換されたイソオキサゾール、必要に応じて置換されたオキサゾール(好ましくはメチル置換された)、必要に応じて置換されたジアゾール、必要に応じて置換されたトリアゾール、テトラゾール、必要に応じて置換されたベンゾフラン、必要に応じて置換されたチオフェン、必要に応じて置換されたチアゾール(好ましくはメチルおよび/またはチオール置換された)、必要に応じて置換されたイソチアゾール、必要に応じて置換されたトリアゾール(好ましくはメチル基で置換された1,2,3トリアゾール、メチル基で置換されたトリアプロピルシリル、必要に応じて置換された-(CH-O-C~Cアルキル基、または必要に応じて置換された-(CH-C(O)-O-C~Cアルキル基)、必要に応じて置換されたピリジン(2-、3、または4-ピリジン)以下の化学構造による基が挙げられる:
Figure 2022505450000083
式中:
I-G~I-IのSは、CHRSS、NRURE、またはOであり;
I-G~I-IのRHETは、H、CN、NO、ハロ(好ましくはClまたはF)、必要に応じて置換されたC~Cアルキル(好ましくは、1もしくは2個のヒドロキシル基、または3個までのハロ基(例えば、CF)で置換される)、必要に応じて置換されたO(C~Cアルキル)(好ましくは、1もしくは2個のヒドロキシル基、または3個までのハロ基で置換される)、または必要に応じて置換されたアセチレン基-C≡C-Rであり、Rは、HまたはC~Cアルキル基(好ましくはC~Cアルキル)であり;
I-G~I-IのRSSは、H、CN、NO、ハロ(好ましくはFまたはCl)、必要に応じて置換されたC~Cアルキル(好ましくは、1もしくは2個のヒドロキシル基、または3個までのハロ基で置換される)、必要に応じて置換されたO(C~Cアルキル)(好ましくは、1もしくは2個のヒドロキシル基、または3個までのハロ基で置換される)、または必要に応じて置換された-C(O)(C~Cアルキル)(好ましくは1または2個のヒドロキシル基、または3個までのハロ基)であり;
I-G~I-IのRUREは、H、C~Cアルキル(好ましくはHまたはC~Cアルキル)または-C(O)(C~Cアルキル)であり、これらの基の各々は、1もしくは2個のヒドロキシル基または3個までのハロゲン、好ましくはフッ素基で必要に応じて置換されるか、または必要に応じて置換された複素環、例えば、ピペリジン、モルホリン、ピロリジン、テトラヒドロフラン、テトラヒドロチオフェン、ピペリジン、ピペラジンであり、これらの各々は、必要に応じて置換されており;および
I-G~I-IのYは、NまたはC-RYCであり、RYCは、H、OH、CN、NO、ハロ(好ましくはClまたはF)、必要に応じて置換されたC~Cアルキル(好ましくは、1もしくは2個のヒドロキシル基、または3個までのハロ基(例えば、CF)で置換される)、必要に応じて置換されたO(C~Cアルキル)(好ましくは、1もしくは2個のヒドロキシル基、または3個までのハロ基で置換される)、または必要に応じて置換されたアセチレン基-C≡C-Rであり、Rは、HまたはC~Cアルキル基(好ましくはC~Cアルキル)である。当該ヘテロアリール基の各々は、必要に応じて、リンカー基を介してPB基(E3LB基を含む)に連結されていてもよい。
I-G~I-IのR3’に対する好ましい複素環基には、テトラヒドロキノリン、ピペリジン、ピペラジン、ピロリジン、モルホリン、テトラヒドロフラン、テトラヒドロチオフェン、オキサン、およびチアンが含まれ、これらの基の各々は、必要に応じて置換されていてもよく、または以下の化学構造による基であり得る。
Figure 2022505450000084
好ましくは、
Figure 2022505450000085
式中:
I-G~I-IのRPROは、H、必要に応じて置換されたC~Cアルキルまたは必要に応じて置換されたアリール(フェニルまたはナフチル)、オキサゾール、イソオキサゾール、チアゾール、イソチアゾール、イミダゾール、ジアゾール、オキシイミダゾール、ピロール、ピロリジン、フラン、ジヒドロフラン、テトラヒドロフラン、チエン、ジヒドロチエン、テトラヒドロチエン、ピリジン、ピペリジン、ピペラジン、モルホリン、キノリン、(それぞれ好ましくはC~Cアルキル基、好ましくはメチルまたはハロ基、好ましくはFまたはClで置換される)、ベンゾフラン、インドール、インドリジン、アザインドリジンからなる群から選択されるヘテロアリールまたは複素環基であり;
I-G~I-IのRPRO1およびRPRO2は、それぞれ独立して、H、必要に応じて置換されたC~Cアルキル基であるか、または、一緒に、ケト基を形成し;および
I-G~I-Iの各nは、0、1、2、3、4、5または6(好ましくは、0または1)であり、当該複素環基の各々は、必要に応じてリンカー基を介してPB基(E3LB基を含む)に連結されていてもよい。
特定の代替的な好ましい実施形態において、I-G~I-IのR2’は、必要に応じて置換された-NR-XR2’-アルキル基、-NR-XR2’-アリール基;必要に応じて置換された-NR-XR2’-HET、必要に応じて置換された-NR-XR2’-アリール-HETまたは必要に応じて置換された-NR-XR2’-HET-アリールであり、
式中:
I-G~I-IのRは、HまたはC~Cアルキル基(好ましくはH)であり;
I-G~I-IのXR2’は、必要に応じて置換された-CH-、-CH-CH(X)-CH(X)-(シスまたはトランス)、-(CH-CH-CH-、-(CHCHO)-またはC~Cシクロアルキル基であり;および
I-G~I-IのXは、H、ハロ、または1もしくは2個のヒドロキシル基もしくは3個までのハロゲン基で場合により必要に応じて置換されたC1~アルキル基)であり;
I-G~I-Iのアルキルは、必要に応じて置換されたC1~C10アルキル(好ましくはC~Cアルキル)基(特定の実施形態において、アルキル基はClまたはBrでエンドキャップされている)であり;
I-G~I-Iのアリールは、必要に応じて置換されたフェニルまたはナフチル基である(好ましくは、フェニル基)であり;および
I-G~I-IのHETは、必要に応じて置換されたオキサゾール、イソオキサゾール、チアゾール、イソチアゾール、イミダゾール、ジアゾール、オキシイミダゾール、ピロール、ピロリジン、フラン、ジヒドロフラン、テトラヒドロフラン、チエン、ジヒドロチエン、テトラヒドロチエン、ピリジン、ピペリジン、ピペラジン、モルホリン、ベンゾフラン、インドール、インドリジン、アザインドリジン、キノリン(置換される場合、それぞれ好ましくはC~Cアルキル基、好ましくはメチルまたはハロ基、好ましくはFまたはClで置換される)であるか、または以下の化学構造による基である:
Figure 2022505450000086
I-G~I-IのSは、CHRSS、NRURE、またはOであり;
I-G~I-IのRHETは、H、CN、NO、ハロ(好ましくはClまたはF)、必要に応じて置換されたC~Cアルキル(好ましくは、1もしくは2個のヒドロキシル基、または3個までのハロ基(例えば、CF)で置換される)、必要に応じて置換されたO(C~Cアルキル)(好ましくは、1もしくは2個のヒドロキシル基、または3個までのハロ基で置換される)、または必要に応じて置換されたアセチレン基-C≡C-Rであり、Rは、HまたはC~Cアルキル基(好ましくはC~Cアルキル)であり;
I-G~I-IのRSSは、H、CN、NO、ハロ(好ましくはFまたはCl)、必要に応じて置換されたC~Cアルキル(好ましくは、1もしくは2個のヒドロキシル基、または3個までのハロ基で置換される)、必要に応じて置換されたO(C~Cアルキル)(好ましくは、1もしくは2個のヒドロキシル基、または3個までのハロ基で置換される)、または必要に応じて置換された-C(O)(C~Cアルキル)(好ましくは1または2個のヒドロキシル基、または3個までのハロ基)であり;
I-G~I-IのRUREは、H、C~Cアルキル(好ましくはHまたはC~Cアルキル)または-C(O)(C~Cアルキル)であり、これらの基の各々は、1もしくは2個のヒドロキシル基または3個までのハロゲン、好ましくはフッ素基で必要に応じて置換されるか、または必要に応じて置換された複素環、例えば、ピペリジン、モルホリン、ピロリジン、テトラヒドロフラン、テトラヒドロチオフェン、ピペリジン、ピペラジンであり、これらの各々は、必要に応じて置換されており;
I-G~I-IのYは、NまたはC-RYCであり、RYCは、H、OH、CN、NO、ハロ(好ましくはClまたはF)、必要に応じて置換されたC~Cアルキル(好ましくは、1もしくは2個のヒドロキシル基、または3個までのハロ基(例えば、CF)で置換される)、必要に応じて置換されたO(C~Cアルキル)(好ましくは、1もしくは2個のヒドロキシル基、または3個までのハロ基で置換される)、または必要に応じて置換されたアセチレン基-C≡C-Rであり、Rは、HまたはC~Cアルキル基(好ましくはC~Cアルキル)であり;
I-G~I-IのRPROは、H、必要に応じて置換されたC~Cアルキルまたは必要に応じて置換されたアリール(フェニルまたはナフチル)、オキサゾール、イソオキサゾール、チアゾール、イソチアゾール、イミダゾール、ジアゾール、オキシイミダゾール、ピロール、ピロリジン、フラン、ジヒドロフラン、テトラヒドロフラン、チエン、ジヒドロチエン、テトラヒドロチエン、ピリジン、ピペリジン、ピペラジン、モルホリン、キノリン、(それぞれ好ましくはC~Cアルキル基、好ましくはメチルまたはハロ基、好ましくはFまたはClで置換される)、ベンゾフラン、インドール、インドリジン、アザインドリジンからなる群から選択されるヘテロアリールまたは複素環基であり;
I-G~I-IのRPRO1およびRPRO2は、それぞれ独立して、H、必要に応じて置換されたC~Cアルキル基であるか、または、一緒に、ケト基を形成し;および
I-G~I-Iの各nは、独立して、0、1、2、3、4、5もしくは6(好ましくは0もしくは1)である。
当該基の各々は、必要に応じて、リンカー基を介してPB基(E3LB基を含む)に連結されていてもよい。
本開示の代替的な好ましい実施形態において、I-G~I-IのR3’は、必要に応じて置換された-(CH-(V)n’-(CH-(V)n’-RS3’基、必要に応じて置換された-(CH-N(R1’)(C-O)m’-(V)n’-RS3’基、必要に応じて置換された-XR3’-アルキル基、必要に応じて置換された-XR3’-アリール基;必要に応じて置換された-XR3’-HET基、必要に応じて置換された-XR3’-アリール-HET基または必要に応じて置換された-XR3’-HET-アリール基であり、
式中:
S3’は、必要に応じて置換されたアルキル基(C~C10、好ましくはC~Cアルキル)、必要に応じて置換されたアリール基またはHET基であり;
1’は、HまたはC~Cアルキル基(好ましくはH)であり;
Vは、O、SまたはNR1’であり;
R3’は、-(CH-、-(CHCHO)-、-CH-CH(X)-CH(X)-(シスまたはトランス)、-CH-CH-CH-、またはC~Cシクロアルキル基であり、これらはすべて必要に応じて置換されており;
は、H、ハロ、または1個もしくは2個のヒドロキシル基もしくは3個までのハロゲン基で場合により必要に応じて置換されたC1~アルキル基である;
アルキルは、必要に応じて置換されたC~C10アルキル(好ましくはC~Cアルキル)基(特定の実施形態において、アルキル基はClまたはBrでエンドキャップされている)であり;
アリールは、必要に応じて置換されたフェニルまたはナフチル基である(好ましくは、フェニル基)であり;および
HETは、必要に応じて置換されたオキサゾール、イソオキサゾール、チアゾール、イソチアゾール、イミダゾール、ジアゾール、オキシイミダゾール、ピロール、ピロリジン、フラン、ジヒドロフラン、テトラヒドロフラン、チエン、ジヒドロチエン、テトラヒドロチエン、ピリジン、ピペリジン、ピペラジン、モルホリン、ベンゾフラン、インドール、インドリジン、アザインドリジン、キノリン(置換される場合、それぞれ好ましくはC~Cアルキル基、好ましくはメチルまたはハロ基、好ましくはFまたはClで置換される)であるか、または以下の化学構造による基である:
Figure 2022505450000087
I-G~I-IのSは、CHRSS、NRURE、またはOであり;
I-G~I-IのRHETは、H、CN、NO、ハロ(好ましくはClまたはF)、必要に応じて置換されたC~Cアルキル(好ましくは、1もしくは2個のヒドロキシル基、または3個までのハロ基(例えば、CF)で置換される)、必要に応じて置換されたO(C~Cアルキル)(好ましくは、1もしくは2個のヒドロキシル基、または3個までのハロ基で置換される)、または必要に応じて置換されたアセチレン基-C≡C-Rであり、Rは、HまたはC~Cアルキル基(好ましくはC~Cアルキル)であり;
I-G~I-IのRSSは、H、CN、NO、ハロ(好ましくはFまたはCl)、必要に応じて置換されたC~Cアルキル(好ましくは、1もしくは2個のヒドロキシル基、または3個までのハロ基で置換される)、必要に応じて置換されたO(C~Cアルキル)(好ましくは、1もしくは2個のヒドロキシル基、または3個までのハロ基で置換される)、または必要に応じて置換された-C(O)(C~Cアルキル)(好ましくは1または2個のヒドロキシル基、または3個までのハロ基)であり;
I-G~I-IのRUREは、H、C~Cアルキル(好ましくはHまたはC~Cアルキル)または-C(O)(C~Cアルキル)であり、これらの基の各々は、1もしくは2個のヒドロキシル基または3個までのハロゲン、好ましくはフッ素基で必要に応じて置換されるか、または必要に応じて置換された複素環、例えば、ピペリジン、モルホリン、ピロリジン、テトラヒドロフラン、テトラヒドロチオフェン、ピペリジン、ピペラジンであり、これらの各々は、必要に応じて置換されており;
I-G~I-IのYは、NまたはC-RYCであり、RYCは、H、OH、CN、NO、ハロ(好ましくはClまたはF)、必要に応じて置換されたC~Cアルキル(好ましくは、1もしくは2個のヒドロキシル基、または3個までのハロ基(例えば、CF)で置換される)、必要に応じて置換されたO(C~Cアルキル)(好ましくは、1もしくは2個のヒドロキシル基、または3個までのハロ基で置換される)、または必要に応じて置換されたアセチレン基-C≡C-Rであり、Rは、HまたはC~Cアルキル基(好ましくはC~Cアルキル)であり;
I-G~I-IのRPROは、H、必要に応じて置換されたC~Cアルキルまたは必要に応じて置換されたアリール(フェニルまたはナフチル)、オキサゾール、イソオキサゾール、チアゾール、イソチアゾール、イミダゾール、ジアゾール、オキシイミダゾール、ピロール、ピロリジン、フラン、ジヒドロフラン、テトラヒドロフラン、チエン、ジヒドロチエン、テトラヒドロチエン、ピリジン、ピペリジン、ピペラジン、モルホリン、キノリン、(それぞれ好ましくはC~Cアルキル基、好ましくはメチルまたはハロ基、好ましくはFまたはClで置換される)、ベンゾフラン、インドール、インドリジン、アザインドリジンからなる群から選択されるヘテロアリールまたは複素環基であり;
I-G~I-IのRPRO1およびRPRO2は、それぞれ独立して、H、必要に応じて置換されたC~Cアルキル基であるか、または、一緒に、ケト基を形成し;
I-G~I-Iの各nは、独立して、0、1、2、3、4、5もしくは6(好ましくは0もしくは1)であり;
I-G~I-Iの各m’は0または1であり;および
I-G~I-Iの各n’は0または1であり;および
当該化合物の各々が、好ましくはアルキル基、アリール、またはHet基上で、リンカーを介してPB基(E3LB基を含む)に必要に応じて連結されている。
代替的な実施形態において、I-G~I-IのR3’は、-(CH-アリール、-(CHCH2O-アリール、-(CH-HET、または-(CHCHO)-HETであり;
式中:
I-G~I-Iの当該アリールは、1個または2個の置換基で必要に応じて置換されたフェニルであり、当該置換基(複数の場合がある)は、好ましくは、-(CHOH、それ自体がCNでさらに必要に応じて置換されたC~Cアルキル、ハロ(3個までのハロ基)、OH、-(CHO(C~C)アルキル、アミン、モノ-またはジ-(C~Cアルキル)アミンから選択され、アミン上のアルキル基は、1個または2個のヒドロキシル基または3個までのハロ(好ましくはF、Cl)基で必要に応じて置換されており、あるいは
I-G~I-Iの当該アリール基は、-(CHOH、-(CH-O-(C~C)アルキル、-(CH-O-(CH-(C~C)アルキル、-(CH-C(O)(C~C)アルキル、-(CH-C(O)O(C~C)アルキル、-(CH-OC(O)(C~C)アルキル、アミン、モノ-またはジ-(C~Cアルキル)アミンで置換されており、アミン上のアルキル基は、1もしくは2個のヒドロキシル基または3個までのハロ(好ましくはF、Cl)基で必要に応じて置換される、CN、NO、必要に応じて置換された-(CH-(V)m’-CH-(V)m’-(C~C)アルキル基、-(V)m’-(CHCHO)-RPEG基であり、VはO、SまたはNR1’であり、R1’はHまたはC~Cアルキル基(好ましくはH)およびRPEGはHまたは必要に応じて置換された(カルボキシル基で必要に応じて置換されることを含む)C~Cアルキル基であるか、あるいは
I-G~I-Iの当該アリール基は、オキサゾール、イソオキサゾール、チアゾール、イソチアゾール、イミダゾール、ジアゾール、オキシイミダゾール、ピロール、ピロリジン、フラン、ジヒドロフラン、テトラヒドロフラン、チエン、ジヒドロチエン、テトラヒドロチエン、ピリジン、ピペリジン、ピペラジン、モルホリン、キノリン、ベンゾフラン、インドール、インドリジン、アザインドリジン、(置換される場合、それぞれ好ましくはC~Cアルキル基、好ましくはメチルまたはハロ基、好ましくはFまたはClで置換される)からなる群から選択されるヘテロアリールを含む複素環で必要に応じて置換されるか、または以下の化学構造による基である:
Figure 2022505450000088
I-G~I-IのSは、CHRSS、NRURE、またはOであり;
I-G~I-IのRHETは、H、CN、NO、ハロ(好ましくはClまたはF)、必要に応じて置換されたC~Cアルキル(好ましくは、1もしくは2個のヒドロキシル基、または3個までのハロ基(例えば、CF)で置換される)、必要に応じて置換されたO(C~Cアルキル)(好ましくは、1もしくは2個のヒドロキシル基、または3個までのハロ基で置換される)、または必要に応じて置換されたアセチレン基-C≡C-Rであり、Rは、HまたはC~Cアルキル基(好ましくはC~Cアルキル)であり;
I-G~I-IのRSSは、H、CN、NO、ハロ(好ましくはFまたはCl)、必要に応じて置換されたC~Cアルキル(好ましくは、1もしくは2個のヒドロキシル基、または3個までのハロ基で置換される)、必要に応じて置換されたO(C~Cアルキル)(好ましくは、1もしくは2個のヒドロキシル基、または3個までのハロ基で置換される)、または必要に応じて置換された-C(O)(C~Cアルキル)(好ましくは1または2個のヒドロキシル基、または3個までのハロ基)であり;
I-G~I-IのRUREは、H、C~Cアルキル(好ましくはHまたはC~Cアルキル)または-C(O)(C~Cアルキル)であり、これらの基の各々は、1もしくは2個のヒドロキシル基または3個までのハロゲン、好ましくはフッ素基で必要に応じて置換されるか、または必要に応じて置換された複素環、例えば、ピペリジン、モルホリン、ピロリジン、テトラヒドロフラン、テトラヒドロチオフェン、ピペリジン、ピペラジンであり、これらの各々は、必要に応じて置換されており;
I-G~I-IのYは、NまたはC-RYCであり、RYCは、H、OH、CN、NO、ハロ(好ましくはClまたはF)、必要に応じて置換されたC~Cアルキル(好ましくは、1もしくは2個のヒドロキシル基、または3個までのハロ基(例えば、CF)で置換される)、必要に応じて置換されたO(C~Cアルキル)(好ましくは、1もしくは2個のヒドロキシル基、または3個までのハロ基で置換される)、または必要に応じて置換されたアセチレン基-C≡C-Rであり、Rは、HまたはC~Cアルキル基(好ましくはC~Cアルキル)であり;
I-G~I-IのRPROは、H、必要に応じて置換されたC~Cアルキルまたは必要に応じて置換されたアリール(フェニルまたはナフチル)、オキサゾール、イソオキサゾール、チアゾール、イソチアゾール、イミダゾール、ジアゾール、オキシイミダゾール、ピロール、ピロリジン、フラン、ジヒドロフラン、テトラヒドロフラン、チエン、ジヒドロチエン、テトラヒドロチエン、ピリジン、ピペリジン、ピペラジン、モルホリン、キノリン、(それぞれ好ましくはC~Cアルキル基、好ましくはメチルまたはハロ基、好ましくはFまたはClで置換される)、ベンゾフラン、インドール、インドリジン、アザインドリジンからなる群から選択されるヘテロアリールまたは複素環基であり;
I-G~I-IのRPRO1およびRPRO2は、それぞれ独立して、H、必要に応じて置換されたC~Cアルキル基であるか、または、一緒に、ケト基を形成し;
I-G~I-IのHETは、好ましくは、オキサゾール、イソオキサゾール、チアゾール、イソチアゾール、イミダゾール、ジアゾール、オキシイミダゾール、ピロール、ピロリジン、フラン、ジヒドロフラン、テトラヒドロフラン、チエン、ジヒドロチエン、テトラヒドロチエン、ピリジン、ピペリジン、ピペラジン、モルホリン、キノリン(それぞれ好ましくはC~Cアルキル基、好ましくはメチルまたはハロ基、好ましくはFまたはClで置換される)、ベンゾフラン、インドール、インドリジン、アザインドリジンであるか、または以下の化学構造による基である:
Figure 2022505450000089
I-G~I-IのSは、CHRSS、NRURE、またはOであり;
I-G~I-IのRHETは、H、CN、NO、ハロ(好ましくはClまたはF)、必要に応じて置換されたC~Cアルキル(好ましくは、1もしくは2個のヒドロキシル基、または3個までのハロ基(例えば、CF)で置換される)、必要に応じて置換されたO(C~Cアルキル)(好ましくは、1もしくは2個のヒドロキシル基、または3個までのハロ基で置換される)、または必要に応じて置換されたアセチレン基-C≡C-Rであり、Rは、HまたはC~Cアルキル基(好ましくはC~Cアルキル)であり;
I-GからI-IのRSSは、H、CN、NO、ハロ(好ましくはFまたはCl)、必要に応じて置換されたC~Cアルキル(好ましくは、1もしくは2個のヒドロキシル基、または3個までのハロ基で置換される)、必要に応じて置換されたO(C~Cアルキル)(好ましくは、1もしくは2個のヒドロキシル基、または3個までのハロ基で置換される)、または必要に応じて置換された-C(O)(C~Cアルキル)(好ましくは1または2個のヒドロキシル基、または3個までのハロ基)であり;
I-G~I-IのRUREは、H、C~Cアルキル(好ましくはHまたはC~Cアルキル)または-C(O)(C~Cアルキル)であり、これらの基の各々は、1もしくは2個のヒドロキシル基または3個までのハロゲン、好ましくはフッ素基で必要に応じて置換されるか、または必要に応じて置換された複素環、例えば、ピペリジン、モルホリン、ピロリジン、テトラヒドロフラン、テトラヒドロチオフェン、ピペリジン、ピペラジンであり、これらの各々は、必要に応じて置換されており;
I-G~I-IのYは、NまたはC-RYCであり、RYCは、H、OH、CN、NO、ハロ(好ましくはClまたはF)、必要に応じて置換されたC~Cアルキル(好ましくは、1もしくは2個のヒドロキシル基、または3個までのハロ基(例えば、CF)で置換される)、必要に応じて置換されたO(C~Cアルキル)(好ましくは、1もしくは2個のヒドロキシル基、または3個までのハロ基で置換される)、または必要に応じて置換されたアセチレン基-C≡C-Rであり、Rは、HまたはC~Cアルキル基(好ましくはC~Cアルキル)であり;
I-G~I-IのRPROは、H、必要に応じて置換されたC~Cアルキルまたは必要に応じて置換されたアリール、ヘテロアリールもしくは複素環基であり;
I-G~I-IのRPRO1およびRPRO2は、それぞれ独立して、H、必要に応じて置換されたC~Cアルキル基であるか、または、一緒に、ケト基を形成し;
I-G~I-Iの各m’は独立して0または1であり;および
I-G~I-Iの各nは、独立して、0、1、2、3、4、5もしくは6(好ましくは0もしくは1)であり、
当該化合物の各々が、好ましくは当該アリール基またはHET基上で、リンカー基を介してPB基(E3LB基を含む)に必要に応じて連結されている。
さらに追加の実施形態において、好ましい化合物には、以下の化学構造:
Figure 2022505450000090
式中:
I-IのR2’は、-NH-CH-アリール-HET(好ましくは、メチル置換チアゾールに直接結合したフェニル)であり;
I-IのR3’は、-CHRCR3’-NH-C(O)-R3P1基または-CHRCR3’-R3P2基であり;
I-IのRCR3’は、C~Cアルキル基、好ましくはメチル、イソプロピルまたはtert-ブチルであり;
I-IのR3P1は、C~Cアルキル(好ましくはメチル)、必要に応じて置換されたオキセタン基(好ましくはメチル置換、-(CHOCH基(nは1または2(好ましくは2)である)であるか、または

Figure 2022505450000091
(エチルエーテル基は好ましくはフェニル部分でメタ置換される)、モルホリノ基(2位または3位でカルボニルに連結されている;
I-IのR3P2は、
Figure 2022505450000092
であり;
I-Iのアリールはフェニルであり;
I-IのHETは、必要に応じて置換されたチアゾールまたはイソチアゾールであり;および
I-IのRHETは、Hまたはハロ基(好ましくはH)である、
によるもの、またはその薬学的に許容可能な塩、立体異性体、溶媒和物もしくは多形が含まれ、ここで、当該化合物の各々は、必要に応じて、リンカー基を介してPB基(E3LB基を含む)に連結されている。
特定の態様において、ユビキチンE3リガーゼ結合部分(E3LB)を含む二官能性化合物であって、E3LBは以下の化学構造による基:
Figure 2022505450000093
式中:
I-Jの各RおよびRは、独立して、OH、SHもしくは必要に応じて置換されたアルキルであるか、またはR、Rあり、それらが結合している炭素原子は、カルボニルを形成し;
I-JのRは、Hまたは必要に応じて置換されたアルキルであり;
I-JのEは、結合、C=O、またはC=Sであり;
I-JのGは、結合、必要に応じて置換されたアルキル、-COOHまたはC=Jあり;
I-JのJはOまたはN-Rであり;
I-JのRは、H、CN、必要に応じて置換されたアルキルまたは必要に応じて置換されたアルコキシであり;
I-JのMは、必要に応じて置換されたアリール、必要に応じて置換されたヘテロアリール、必要に応じて置換された複素環であるか、または
Figure 2022505450000094
I-Jの各RおよびR10は独立してHであり、必要に応じて置換されたアルキル、必要に応じて置換されたシクロアルキル、必要に応じて置換されたヒドロキシアルキル、必要に応じて置換されたチオアルキル、ジスルフィド結合I-J、必要に応じて置換されたヘテロアリール、もしくはハロアルキルある;またはR、R10およびそれらが結合している炭素原子は、必要に応じて置換されたシクロアルキルを形成し;
I-JのR11は、必要に応じて置換された複素環、必要に応じて置換されたアルコキシ、必要に応じて置換されたヘテロアリール、必要に応じて置換されたアリールであるか、または
Figure 2022505450000095
I-JのR12は、Hもしくは必要に応じて置換されたアルキルであり;
I-JのR13は、H、必要に応じて置換されたアルキル、必要に応じて置換されたアルキルカルボニル、必要に応じて置換された(シクロアルキル)アルキルカルボニル、必要に応じて置換されたアラルキルカルボニル、必要に応じて置換されたアリールカルボニル、必要に応じて置換された(複素環)カルボニル、または必要に応じて置換されたアラルキル;必要に応じて置換された(オキソアルキル)カルバメートであり、
I-Jの各R14は、独立して、H、ハロアルキル、必要に応じて置換されたシクロアルキル、必要に応じて置換されたアルキル、アゼチジン、必要に応じて置換されたアルコキシ、または必要に応じて置換された複素環であり;
I-JのR15は、H、CN、必要に応じて置換されたヘテロアリール、ハロアルキル、必要に応じて置換されたアリール、必要に応じて置換されたアルコキシ、または必要に応じて置換された複素環であり;
I-Jの各R16は、独立して、ハロ、必要に応じて置換されたアルキル、必要に応じて置換されたハロアルキル、必要に応じて置換されたCN、または必要に応じて置換されたハロアルコキシであり;
I-Jの各R25は、独立して、Hもしくは必要に応じて置換されたアルキルであり、または両方のR25基と一緒に、オキソもしくは必要に応じて置換されたシクロアルキル基を形成することができ;
I-JのR23はHまたはOHであり;
23、R、またはRは、O-L1であり、。
I-JのZ、Z、ZおよびZは、独立して、CまたはNであり;および
I-Jのoは、0、1、2、3もしくは4である、
またはその薬学的に許容可能な塩、立体異性体、溶媒和物もしくは多形である。
特定の実施形態において、I-JのGがC=Jであり、JがOであり、RがHであり、各R14がHであり、oが0である。
特定の実施形態において、I-JのGはC=Jであり、JはOであり、RはHであり、各R14はHであり、R15は必要に応じて置換されたヘテロアリールであり、oは0である。他の場合では、EはC=Oであり、Mは
Figure 2022505450000096
である。
特定の実施形態において、I-JのEはC=Oであり、R11は必要に応じて置換された複素環であるか、または
Figure 2022505450000097
であり、
Mは、
Figure 2022505450000098
である。
特定の実施形態において、I-JのEは、C=Oであり、Mは、
Figure 2022505450000099
であり、
11は、
Figure 2022505450000100
であり、
各R18は、独立して、H、ハロ、必要に応じて置換されたアルコキシ、シアノ、必要に応じて置換されたアルキル、ハロアルキル、またはハロアルコキシであり、pは、0、1、2、3、または4である。
特定の実施形態において、各R14は、H、ヒドロキシル、ハロ、アミン、アミド、アルコキシ、アルキル、ハロアルキル、または複素環の少なくとも1つで独立して置換される。
特定の実施形態において、I-JのR15は以下の基である:
Figure 2022505450000101
CNまたはハロアルキルであり、各R18は、独立して、H、ハロ、必要に応じて置換されたアルコキシ、シアノ、アミノアルキル、アミドアルキル、必要に応じて置換されたアルキル、ハロアルキルまたはハロアルコキシであり;およびpは、0、1、2、3、または4である。
特定の実施形態において、E3LBは、以下の化学構造である:
Figure 2022505450000102
式中:
I-KのGはC=Jであり、JはOであり;
I-KのRはHであり;
I-Kの各R14は、独立して、H、アミド、アルキル、例えば、メチルであり、1つまたは複数のC~Cアルキル基またはC(O)NR’R’’で必要に応じて置換される;
R’およびR’’は、それぞれ独立して、H、必要に応じて置換されたアルキルまたはシクロアルキルであり;
I-Kのoは0であり;
I-KのR15は、I-Jについて上記のように定義され;
I-KのR16は、I-Jについて上記のように定義され;および
I-KのR17は、H、ハロ、必要に応じて置換されたシクロアルキル、必要に応じて置換されたアルキル、必要に応じて置換されたアルケニルおよびハロアルキルである。
他の場合において、I-KのR17は、アルキル(例えば、メチル)またはシクロアルキル(例えば、シクロプロピル)である。
他の実施形態において、E3LBは、以下の化学構造による:
Figure 2022505450000103
式中:
I-KのGはC=Jであり、JはOであり;
I-KのRはHであり;
I-Kの各R14はHであり;
I-Kのoは0であり;および
I-KのR15は、必要に応じて置換されたものからなる群から選択される:
Figure 2022505450000104
Figure 2022505450000105
I-KのR30は、Hまたは必要に応じて置換されたアルキルである。
他の実施形態において、E3LBは、以下の化学構造による基である:
Figure 2022505450000106
式中:
I-KのEはC=Oであり;
I-KのMは以下のとおりであり
Figure 2022505450000107
および、
I-KのR11は、必要に応じて置換されたものからなる群から選択される:
Figure 2022505450000108
Figure 2022505450000109
さらに他の実施形態において、以下の化学構造の化合物、
Figure 2022505450000110
式中:
I-KのEはC=Oであり;
I-KのR11は以下のとおりであり
Figure 2022505450000111
および、
I-KのMは以下のとおりであり
Figure 2022505450000112
I-Kのqは1または2であり;
I-KのR20は、H、必要に応じて置換されたアルキル、必要に応じて置換されたシクロアルキル、必要に応じて置換されたアリールであるか、または
Figure 2022505450000113
I-KのR21は、Hまたは必要に応じて置換されたアルキルであり;および
I-KのR22は、H、必要に応じて置換されたアルキル、必要に応じて置換されたアルコキシまたはハロアルキルである。
本明細書に記載される任意の実施形態において、I-JまたはI-KのR11は、以下からなる群から選択される:
Figure 2022505450000114
Figure 2022505450000115
Figure 2022505450000116
Figure 2022505450000117
Figure 2022505450000118
Figure 2022505450000119
特定の実施形態において、I-JまたはI-KのR11は、以下からなる群から選択される:
Figure 2022505450000120
Figure 2022505450000121
Figure 2022505450000122
特定の実施形態において、E3LBは、以下の化学構造による基である:
Figure 2022505450000123
式中:
I-LのXはOまたはSであり;
I-LのYは、H、メチルまたはエチルであり;
I-LのR17は、H、メチル、エチル、ヒドロキシメチルまたはシクロプロピルであり;
I-LのMは、必要に応じて置換されたアリール、必要に応じて置換されたヘテロアリールであるか、または
Figure 2022505450000124
はHであり;
I-LのR10は、H、必要に応じて置換されたアルキル、必要に応じて置換されたハロアルキル、必要に応じて置換されたヘテロアリール、必要に応じて置換されたアリール、必要に応じて置換されたヒドロキシアルキル、必要に応じて置換されたチオアルキルまたはシクロアルキルであり;
I-LのR11は、必要に応じて置換されたヘテロ芳香族、必要に応じて置換された複素環、必要に応じて置換されたアリールであるか、または
Figure 2022505450000125
I-LのR12は、Hまたは必要に応じて置換されたアルキルであり;および
I-LのR13は、H、必要に応じて置換されたアルキル、必要に応じて置換されたアルキルカルボニル、必要に応じて置換された(シクロアルキル)アルキルカルボニル、必要に応じて置換されたアラルキルカルボニル、必要に応じて置換されたアリールカルボニル、必要に応じて置換された(複素環)カルボニル、または必要に応じて置換されたアラルキル;必要に応じて置換された(オキソアルキル)カルバメートである。
いくつかの実施形態において、E3LBは、以下の化学構造による基である:
Figure 2022505450000126
式中:
I-MのYは、H、メチオールまたはエチルであり;
はHであり;
10は、イソプロピル、tert-ブチル、sec-ブチル、シクロペンチルまたはシクロヘキシルであり;
I-MのR11は、必要に応じて置換されたアミド、必要に応じて置換されたイソインドリノン、必要に応じて置換されたイソオキサゾール、必要に応じて置換された複素環である。
本開示の他の好ましい実施形態において、E3LBは、以下の化学構造による基である:
Figure 2022505450000127
式中:
I-NのR17は、メチル、エチルまたはシクロプロピルであり;ならびに
I-NのR、R10およびR11は上に定義したとおりである。他の場合において、RはHであり;および
I-NのR10は、H、アルキルまたはシクロアルキル(好ましくは、イソプロピル、tert-ブチル、sec-ブチル、シクロペンチルまたはシクロヘキシル)である。
本開示の他の好ましい実施形態において、E3LBは、以下の化学構造による基:
Figure 2022505450000128
、または
Figure 2022505450000129
またはその薬学的に許容可能な塩であって、式中、
は、H、必要に応じて置換されたアルキルまたは必要に応じて置換されたシクロアルキルであり;
は、必要に応じて置換された5~6員ヘテロアリールであり:
は、必要に応じて置換されたフェニル、必要に応じて置換されたナフチルまたは必要に応じて置換されたピリジニルであり;
14aおよびR14bの一方は、H、必要に応じて置換されたアルキル、必要に応じて置換されたハロアルキル(例えば、フルオロアルキル)、必要に応じて置換されたアルコキシ、必要に応じて置換されたヒドロキシルアルキル、必要に応じて置換されたアルキルアミン、必要に応じて置換されたヘテロアルキル、必要に応じて置換されたアルキル-ヘテロシクロアルキル、必要に応じて置換されたアルコキシ-ヘテロシクロアルキル、COR26、CONR27a27b、NHCOR26、もしくはNHCHCOR26であり;R14a、R14bの他方はHであり;またはR14aおよびR14bは、それらが結合している炭素原子と一緒に、必要に応じて置換された3~6員のシクロアルキル、ヘテロシクロアルキル、スピロシクロアルキルまたはスピロ複素環を形成し、スピロ複素環はエポキシドまたはアジリジンではない;
15は、CN、必要に応じて置換されたフルオロアルキルであり;
Figure 2022505450000130
必要に応じて置換された
Figure 2022505450000131
28aは、ハロ、必要に応じて置換されたアルキルもしくはフルオロアルキルであるか、または
Figure 2022505450000132
各R16は、ハロ、CN、必要に応じて置換されたアルキル、必要に応じて置換されたハロアルキル、ヒドロキシ、もしくはハロアルコキシから独立して選択され;
各R26は、独立して、H、必要に応じて置換されたアルキルまたはNR27a27bであり;
各R27aおよびR27bは、独立して、H、必要に応じて置換されたアルキル、必要に応じて置換されたシクロアルキルであるか、またはR27aおよびR27bは、それらが結合している窒素原子と一緒に、4~6員複素環を形成し;
各R28は、独立して、H、ハロゲン、CN、必要に応じて置換されたアミノアルキル、必要に応じて置換されたアミドアルキル、必要に応じて置換されたハロアルキル、必要に応じて置換されたアルキル、必要に応じて置換されたアルコキシ、必要に応じて置換されたヘテロアルキル、必要に応じて置換されたアルキルアミン、必要に応じて置換されたヒドロキシアルキル、アミン、必要に応じて置換されたアルキニル、または必要に応じて置換されたシクロアルキルであり;
oは、0、1、または2であり、
pは0、1、2、3、または4である。
本明細書に記載の態様または実施形態のいずれかにおいて、E3LBは下記式のものである:
Figure 2022505450000133
式中:
、X、およびXの各々はCHおよびNから選択され、2以下はNであり;
は、C1~6アルキルであり;
は、I-OおよびIPについて定義されるものと同じであり、
14aおよびR14bの一方は、H、必要に応じて置換されたアルキル、必要に応じて置換されたハロアルキル、必要に応じて置換されたアルコキシ、必要に応じて置換されたヒドロキシルアルキル、必要に応じて置換されたアルキルアミン、必要に応じて置換されたヘテロアルキル、必要に応じて置換されたアルキル-ヘテロシクロアルキル、必要に応じて置換されたアルコキシ-ヘテロシクロアルキル、COR26、CONR27a27b、NHCOR26、もしくはNHCHCOR26であり;R14aおよびR14bの他方はHであり;またはR14aおよびR14bは、それらが結合している炭素原子と一緒に、必要に応じて置換された3~5員のシクロアルキル、ヘテロシクロアルキル、スピロシクロアルキルまたはスピロ複素環を形成し、スピロ複素環はエポキシドまたはアジリジンではない;
各R27aおよびR27bは、独立して、H C1~6-アルキルまたはシクロアルキルであり;
qは、1、2、3、または4であり;
15は必要に応じて置換されるか、
Figure 2022505450000134
またはCNであり;
28は、H、メチル、CHN(Me)、CHOH、CHO(C1~4アルキル)、CHNHC(O)C1~4アルキル、NH
Figure 2022505450000135
である。
本明細書に記載の任意の態様または実施形態において、R14aおよびR14bは、以下から選択される:H、C1~4アルキル、C1~4シクロアルキル、C1~4ハロアルキル、C1~4ヒドロキシアルキル、C1~4アルキルオキシアルキル、C1~4アルキル-NR27a27bおよびCONR27a27b
本明細書に記載の任意の態様または実施形態において、R14aおよびR14bの少なくとも1つはH(例えば、R14aおよびR14bの両方がHである)である。
本明細書に記載の任意の態様または実施形態において、R14aおよびR14bの少なくとも1つは、必要に応じて置換されたアルキル、必要に応じて置換されたハロアルキル、必要に応じて置換されたアルコキシ、必要に応じて置換されたヒドロキシルアルキル、必要に応じて置換されたアルキルアミン、必要に応じて置換されたヘテロアルキル、必要に応じて置換されたアルキル-ヘテロシクロアルキル、必要に応じて置換されたアルコキシ-ヘテロシクロアルキル、COR26、CONR27a27b、NHCOR26、またはNHCHcOR26である。あるいは、本明細書に記載の任意の態様または実施形態において、R14aおよびR14bの一方は、必要に応じて置換されたアルキル、必要に応じて置換されたハロアルキル、必要に応じて置換されたアルコキシ、必要に応じて置換されたヒドロキシルアルキル、必要に応じて置換されたアルキルアミン、必要に応じて置換されたヘテロアルキル、必要に応じて置換されたアルキル-ヘテロシクロアルキル、必要に応じて置換されたアルコキシ-ヘテロシクロアルキル、COR26、CONR27a27b、NHCOR26、またはNHCHCOR26であり;R14aおよびR14bの他方はHである。
本明細書に記載の任意の態様または実施形態において、R14aおよびR14bは、それらが結合している炭素原子と一緒に、以下
Figure 2022505450000136
を形成し、
23は、H、C1~4アルキルおよび-C(O)C1~4アルキルから選択される。
本開示の他の好ましい実施形態において、E3LBは、以下の化学構造による基:
Figure 2022505450000137
またはその薬学的に許容可能な塩であって、
式中、
XはCHまたはNであり;および
I-QおよびI-RのR、R、R14a、R14bおよびR15は、I-OおよびI-Pについて定義したものと同じである。
本明細書に記載の態様または実施形態のいずれかでは、本明細書に記載のE3LBは、その薬学的に許容可能な塩、エナンチオマー、ジアステレオマー、溶媒和物または多形であり得る。加えて、本明細書に記載の態様または実施形態のいずれかでは、本明細書に記載のE3LBは、結合を介してまたは化学リンカーによってPBに直接結合されてもよい。
b.BRD4またはERαタンパク質結合基(PB)
PB成分は、分解を目的とする標的タンパク質に結合する基である。PB基は、例えば、タンパク質に特異的に結合する(標的タンパク質に結合する)任意の部分を含む。したがって、CIDEのPB成分は、ERαおよびBRD4からなる群から選択されるタンパク質標的に結合する任意のペプチドまたは小分子であり、列挙されたこれらの標的タンパク質のすべての変異体、突然変異、スプライス変異体、インデルおよび融合物を含む。PBは、小分子標的タンパク質結合部分から選択される。そのような小分子標的タンパク質結合部分には、これらの組成物の薬学的に許容可能な塩、エナンチオマー、溶媒和物および多形、ならびに目的のタンパク質を標的とし得る他の小分子も含まれる。
i.BRD4
1.四環
実施形態において、CIDEは、米国特許出願公開第2016/0039821号に記載されている阻害剤などの四環式ブロモドメイン阻害剤の残基を含む。阻害剤は、下記一般式を有する。
Figure 2022505450000138
式(I)の特定の実施形態において、YはNまたはCHである。
特定の実施形態において、YはNである。
特定の実施形態において、YはCHである。
式(I)の特定の実施形態において、Rは、CD、C~Cアルキル、またはC~Cハロアルキルである。
特定の実施形態において、RはC~Cアルキルである。いくつかのそのような実施形態において、Rはメチルである。
式(I)の特定の実施形態において、Rは、HまたはC~Cアルキルである。
特定の実施形態において、Rは、Hまたはメチルである。
特定の実施形態において、RはHである。
特定の実施形態において、Rは、C~Cアルキルである。いくつかのそのような実施形態において、Rはメチルである。
式(I)の特定の実施形態において、YはNまたはCRである。
特定の実施形態において、YはNである。
特定の実施形態において、YはCRである。
式(I)の特定の実施形態において、RはH、-CN、C~Cアルキル、C~Cアルケニル、C~Cアルキニル、ハロゲン、C~Cハロアルキル、-(O)R3a,-C(O)OR3a、-C(O)NR3b3c、-S(O)R3d、-S(O)3a、-S(O)NR3b3c、またはGであり;C~Cアルキル、C~Cアルケニル、およびC~Cアルキニル、それぞれ独立して、非置換であるか、またはG、-CN、-C(O)R3a、-C(O)OR3a、-C(O)NR3b3c、-C(O)N(R3b)NR3b3c、-S(O)R3d、-S(O)3a、-S(O)NR3b3c、-OR3a、-OC(IO)R3d、-NR3b3c、N(R3b)C(O)R3d、N(R3a)SO3d、N(R3b)C(O)OR3d、N(R3b)C(O)NR3b3c、N(R3b)SONR3b3c、およびN(R3b)C(NR3b3c)-NR3b3cからなる群から独立して選択される1もしくは2個の置換基で置換される。
特定の実施形態において、Rは、H、-CN、-C(O)R3c、-C(O)OR3a、-C(O)NR3b3c、またはC~Cアルキルであり、C~Cアルキルは、G、-NR3b3c、N(R3b)C(O)R3d、N(R3b)SO3d、N(R3b)C(O)OR3d、N(R3b)C(O)NR3b3c、およびN(R3b)SONR3b3cからなる群から選択される置換基で必要に応じて置換される。いくつかのこのような実施形態において、G基は、必要に応じて置換された複素環である。いくつかのこのような実施形態において、C~Cアルキルは、G基で置換されており、G基は、ピペリジニル、ピペラジニルまたはモルホリニルであり、これらはそれぞれ、1または2個のC~Cアルキルで必要に応じて置換される。いくつかのこのような実施形態において、C~CアルキルはG基で置換されており、G基ピペラジニルまたはモルホリニルであり、これらのそれぞれは、1または2個のC~Cアルキルで必要に応じて置換される。
特定の実施形態において、Rは、H、-C(O)NR3b3c、-CN、またはG基で置換されたC~Cアルキルである。いくつかのこのような実施形態において、C~CアルキルはG基で置換されており、G基は、C~C複素環で必要に応じて置換さている。いくつかのこのような実施形態において、C~CアルキルG基で置換されており、G基はピリジニル、ピペラジニル、またはモルホリニルであり、これらのそれぞれは、1または2個のC~Cアルキルで必要に応じて置換される。
特定の実施形態において、Rは、H、-C(O)R3aまたは-C(O)NR3b3cである。いくつかのこのような実施形態において、R3AはGである。いくつかのこのような実施形態において、R3AはGであり、Gは必要に応じて置換された複素環である。いくつかのこのような実施形態において、R3BはGであり、Gはピペリジニル、ピペラジニルまたはモルホリニルであり、これらのそれぞれは、1または2個のC~Cアルキルで必要に応じて置換される。いくつかのこのような実施形態において、R3AはGであり、Gは、ピペラジニル、1または2個のC~Cアルキルで必要に応じて置換される。
特定の実施形態において、RはHまたは-C(O)NR3b3cである。いくつかのこのような実施形態において、R3BおよびR3Cは、それぞれ独立して、HまたはC~Cアルキルである。
特定の実施形態において、Rは、Hである。
特定の実施形態において、Rは-C(O)NR3b3cである。いくつかのこのような実施形態において、R3BおよびR3Cは、それぞれ独立して、HまたはC~Cアルキルである。
特定の実施形態において、RはGである。いくつかのこのような実施形態において、Gは、必要に応じて置換された単環式ヘテロアリールである。いくつかのこのような実施形態において、Gは必要に応じて置換されたピラゾリルである。いくつかのこのような実施形態において、Gは、1または2個のC~Cアルキルで置換されたピラゾリルである。
式(I)の特定の実施形態において、Yは、C(O)、S(O)、またはCRである。
特定の実施形態において、Yは、C(O)である。
特定の実施形態において、Yは、S(O)である。
特定の実施形態において、Yは、CRである。
式(I)の特定の実施形態において、Rは、H、重水素、C~Cアルキル、ハロゲン、またはC~Cハロアルキルである。
特定の実施形態において、Rは、Hまたは重水素である。
特定の実施形態において、Rは、Hである。
式(I)の特定の実施形態において、Rは、H、重水素、C~Cアルキル、C~Cアルケニル、C~Cアルキニル、ハロゲン、C~Cハロアルキル、-C(O)R5a、-C(O)OR5a、-C(O)NR5b5c、-S(O)R5d、-S(O)5a、-S(O)NR5b5c、またはGであり;C~Cアルキル、C~Cアルケニル、およびC~Cアルキニルは、それぞれ独立して、非置換であるか、またはG、-CN、-C(O)R5a、-C(O)OR5a、-C(O)NR5b5c、-C(O)N(R5b)C(O)R5d、N(R5b)SO5d、N(R5b)C(O)OR5d、N(R5b)C(O)NR5b5c、N(R5b)SONR5b5c、N(R5b)C(O)R5d、N(R5b)SO5d、N(R5b)C(O)OR5d、N(R5b)C(O)NR5b5c、N(R5b)SONR5b5c、およびN(R5b)C(NR5b5c)-NR5b5cからなる群から独立して選択される1または2個の置換基で置換される。
特定の実施形態において、Rは、H、重水素、C~Cアルキル、C~Cアルケニル、C~Cアルキニル、C~Cハロアルキル、-C(O)R5a、-C(O)OR5a、またはGであり;C~Cアルキル、C~Cアルケニル、およびC~Cアルキニルは、それぞれ独立して、非置換であるか、またはG、-C(O)R5a、-C(O)OR5a、-C(O)NR5b5c、-C(O)N(R5b)NR3b4c、-OR5a、-OC(O)R5d、-NR5b5c、N(R5b)C(O)R5d、N(R5b)SO5d、N(R5b)C(O)OR5d、N(R5b)C(O)NR5b5c、およびN(R5b)SONR5b5cからなる群から独立して選択される1または2個の置換基で置換される。
特定の実施形態において、Rは、G基で必要に応じて置換されたC~Cアルケニルであるか、またはRは、H、重水素、C~Cアルキル、-C(O)R5a、-C(O)OR5a、-C(O)OR5a、またはGであり;C~Cアルキルは、非置換であるか、またはG、-C(O)R5c、-C(O)OR5a、-C(O)NR5b5c、-C(O)N(R5b)NR5b5c、-OR5a、-OC(O)R5d、-NR5b5c、およびN(R5b)C(NR5b5c)-NR5b5cからなる群から独立して選択される1または2個の置換基で置換される。
特定の実施形態において、Rは、H、重水素、または、-C(O)OR5aまたはOR5aからなる群から選択される置換基で必要に応じて置換されたC~Cアルキルである。いくつかの実施形態において、R5aはC~Cアルキルである。
特定の実施形態において、Rは、Hである。
式(I)の特定の実施形態において、Rは、H、C~Cアルキル、C~Cアルケニル、C~Cアルキニル、ハロゲン、C~Cハロアルキル、-C(O)R6a、-C(O)OR6a、-C(O)NR6b6c、-S(O)6c、-S(O)NR6b6c、またはGであり;C~Cアルキル、C~Cアルケニル、およびC~Cアルキニルは、それぞれ独立して、非置換であるか、またはG,-CN、-C(O)R6a、-C(O)OR6a、-C(O)NR6b6c、-C(O)N(R6b)NR6b6c、-S(O)R6d、-S(O)6a、-S(O)NR6b6c、-OR6a、-OC(O)R6d、-NR6b6c、N(R6b)C(O)R6d、N(R6b)SO6d、N(R6b)C(O)OR6d、N(R6b)C(O)NR6b6c、N(R6b)SONR6b6c、およびN(R6b)C(NR6b6c)-NR6b6cからなる群から独立して選択される1または2個の置換基で置換される。
特定の実施形態において、Rは、H、C~Cアルキル、C~Cアルケニル、-C(O)R6c、-C(O)OR6c、-C(O)NR6b6c、-S(O)6a、またはGであり;C~CアルキルおよびC~Cアルケニルは、それぞれ独立して、非置換であるか、またはG、-CN、-C(O)OR6a、-NR6b6c、N(R6b)C(O)R6d、N(R6b)SO6d、N(R6b)C(O)OR6d、N(R6c)C(O)NR6b6c、およびN(R6c)SONR6b6cからなる群から独立して選択される1または2個の置換基で置換される。
特定の実施形態において、Rは、H、C~Cアルキル、-C(O)R6a、-C(O)OR6a、-C(O)NR6b6c、-S(O)6a、またはGであり、C~Cアルキルは、非置換であるか、またはGおよび-C(O)OR6aからなる群から独立して選択される1または2個の置換基で置換される。
特定の実施形態において、Rは。-C(O)R6a、-C(O)OR6a、-C(O)NR6b6c,G、または非置換であるかもしくはG基で置換されたC~Cアルキルである。特定の実施形態において、R6aはG、または非置換のC~Cアルキルである。
特定の実施形態において、Rは-C(O)OR6cである。いくつかの実施形態において、R6aはC~Cアルキルである。
特定の実施形態において、RはG、または非置換であるかもしくはG基で置換されたC~Cアルキルである。いくつかのこのような実施形態において、Rは、必要に応じて置換されたアリール、必要に応じて置換されたヘテロアリール、必要に応じて置換された複素環、または必要に応じて置換されたシクロアルキルであり;またはRは、非置換であるか、またはヘテロアリール、シクロアルキルおよび複素環からなる群から選択される置換基で置換されたC~Cアルキル、それぞれが必要に応じて置換される。いくつかのこのような実施形態において、Rは、必要に応じて置換されたアリール、必要に応じて置換されたヘテロアリール、または必要に応じて置換されたシクロアルキルであり;またはRは、非置換であるか、またはシクロアルキルおよび複素環からなる群から選択される置換基で置換されたC~Cアルキルであり、それぞれが必要に応じて置換される。いくつかのこのような実施形態において、Rは、フェニル、ピリジニル、ピリミジニル、ピラジニル、ピリダジニル、インダゾリル、シクロヘキシル、テトラヒドロフラニル、テトラヒドロピラニル、ピロリジニル、ピペリジニルもしくはアゼパニルであり、これらのそれぞれは必要に応じて置換される;またはRは、非置換であるかもしくはG基で置換されたC~Cアルキルであり、G基は、シクロプロピル、シクロヘキシル、ピルノリジニル、ピペリジニル、モルホリニル、テトラヒドロフラニル、テトラヒドロピラニル、1,3ジオキソリルもしくはピラゾリルであり、これらのそれぞれは必要に応じて置換される。いくつかのこのような実施形態において、Rは、必要に応じて置換されたフェニル、必要に応じて置換されたピリジニルまたは必要に応じて置換されたシクロヘキシルであり;またはRは、非置換であるか、またはシクロプロピルおよびテトラヒドロフラニルからなる群から選択される置換基で置換されており、それぞれが必要に応じて置換されたC~Cアルキルである。いくつかのこのような実施形態において、当該任意の置換基は、ハロゲン、-O(C~Cアルキル)、-O(C~Cハロアルキル)、-N(H)C(O)O(C~Cアルキル)、C~Cアルキル、およびC~Cハロアルキルからなる群から独立して選択される。いくつかのこのような実施形態において、当該任意の置換基はハロゲンである。いくつかのこのような実施形態において、当該ハロゲンはFまたはClの場合である。
式(I)の特定の実施形態において、Aは、C(R)またはNであり;Aは、C(R)またはNであり;Aは、C(R)またはNであり;およびAは、C(R10)またはNであり;0、1もしくは2、またはA、A、A、およびAはNである。
特定の実施形態において、AはC(R)であり、AはC(R)であり、AはC(R)であり、AはC(R10)である。
特定の実施形態において、A、A、AおよびAのうち1つはNである。いくつかのこのような実施形態において、AはNであり;AはC(R)であり;AはC(R)であり;およびAはC(R10)である。
特定の実施形態において、A、A、AおよびAのうち2つはNである。いくつかのこのような実施形態において、AはNであり;AはC(R)であり;AはNであり;およびAはC(R10)である。
特定の実施形態において、AはC(R)であり、AはC(R)であり、AはC(R)であり、AはC(R10)であり;またはAはNであり;AはC(R)であり;AはC(R)であり;およびAはC(R10)であり;またはAはNであり;AはC(R)であり;AはNであり;およびAは、C(R10)である。
式(I)の特定の実施形態において、R、R、およびRは、それぞれ独立して、H、C~Cアルキル、C~Cアルケニル、C~Cアルキニルハロゲン、C~Cハロアルキル、-CN、NO、-ORγ1、-OC(O)Rγ2、-OC(O)NRγ3γ4、-SRγ1、-S(O)γ1、-S(O)NRγ3γ4、-C(O)Rγ1、-C(O)ORγ1、-C(O)NRγ3γ4、-NRγ3γ4、-N(Rγ3)C(O)Rγ2、-N(Rγ3)S(O)γ2、-N(Rγ3)C(O)O(Rγ2)、-N(Rγ3)C(O)NRγ3γ4、-N(Rγ3)S(O)NRγ3γ4,G、-(C~Cアルキレニル)-CN、-(C~Cアルキレニル)-ORγ1、-(C~Cアルキレニル)-OC(O)Rγ2、-(C~Cアルキレニル)-OC(O)NRγ3γ4、-(C~Cアルキレニル)-S(O)γ1、-(C~Cアルキレニル)-S(O)NRγ3γ4、-(C~Cアルキレニル)-C(O)Rγ1、-(C~Cアルキレニル)-C(O)ORγ1、-(C~Cアルキレニル)-C(O)NRγ3γ4、-(C~Cアルキレニル)-NRγ3γ4、-(C~Cアルキレニル)-N(Rγ3)C(O)Rγ2、-(C~Cアルキレニル)-N(Rγ3)S(O)γ2、-(C~Cアルキレニル)-N(Rγ3)C(O)O(Rγ2)、-(C~Cアルキレニル)-N(Rγ3)C(O)NRγ3γ4、-(C~Cアルキレニル)-N(Rγ3)S(O)NRγ3γ4、-(C~Cアルキレニル)-CN、または(C~Cアルキレニル)-Gである。
特定の実施形態において、Rは、H、ハロゲン、-CN、C~Cアルキル、または必要に応じて置換されたシクロプロピルである。
特定の実施形態において、Rは、H、ハロゲン、C~Cアルキル、または必要に応じて置換されたシクロプロピルである。いくつかのこのような実施形態において、シクロプロピルは、1、2、3、4、または5個のR4g基必要に応じて置換されており、R4gは、C~Cアルキル、ハロゲン、またはC~Cハロアルキルである。
一実施形態において、RはHまたはハロゲンである。いくつかのこのような実施形態において、ハロゲンはFまたはClである。いくつかのこのような実施形態において、ハロゲンはFである。
特定の実施形態において、Rは、H、C~Cアルキル、ハロゲン、C~Cハロアルキル、-CN、必要に応じて置換された複素環、-C(O)NRγ3γ4、-(C~Cアルキレニル)-NRγ3γ4、-(C~Cアルキレニル)-N(Rγ3)C(O)Rγ2、-(C~Cアルキレニル)-N(Rγ3)S(O)γ2、-(C~Cアルキレニル)-N(Rγ3)C(O)O(Rγ2)、-(C~Cアルキレニル)-N(Rγ3)C(O)NRγ3γ4、-(C~Cアルキレニル)-N(Rγ3)S(O)NRγ3γ4、または-(C~Cアルキレニル)-Gであり、Gは必要に応じて置換された複素環である。
特定の実施形態において、Rは、Hである。
特定の実施形態において、Rは、H、C~Cアルキル、ハロゲン、C~Cハロアルキル、-CN、-S(O)γ1、-S(O)NRγ3,Rγ4、-C(O)NRγ3γ4、-NRγ3γ4、-N(Rγ3)C(O)Rγ2、-N(Rγ3)S(O)γ2、-N(Rγ3)C(O)O(Rγ2)、-N(Rγ3)C(O)NRγ3γ4、-N(Rγ3)S(O)NRγ3γ4、-(C~Cアルキレニル)-CN、-(-(C~Cアルキレニル)-S(O)γ1、-(C~Cアルキレニル)-S(O)NRγ3γ4、-(C~Cアルキレニル)-C(O)NRγ3γ4、-(C~Cアルキレニル)-NRγ3γ4、-(C~Cアルキレニル)-N(Rγ3)C(O)Rγ2、-(C~Cアルキレニル)-N(Rγ3)S(O)γ2、-(C~Cアルキレニル)-N(Rγ3)C(O)O(Rγ2)、-(C~Cアルキレニル)-N(Rγ3)C(O)NRγ3γ4、または-(C~Cアルキレニル)-N(Rγ3)S(O)NRγ3γ4である。
特定の実施形態において、Rは、H、C~Cアルキル、ハロゲン、-S(O)γ1、-S(O)NRγ3γ4、-NRγ3γ4、-N(Rγ3)S(O)γ2、-(C~Cアルキレニル)-CN、または-(C~Cアルキレニル)-S(O)γ1である。
特定の実施形態において、Rは、H、C~Cアルキル、ハロゲン、-S(O)γ1、-S(O)NRγ3γ4、-NRγ3γ4、-N(Rγ3)S(O)γ2、または-(C~Cアルキレニル)-S(O)γ1である。いくつかの実施形態において、Rγ1、Rγ3、およびRγ4は、各出現において、それぞれ独立して、HまたはC~Cアルキル、およびRγ2は、C~Cアルキルである。いくつかの実施形態において、Rγ1およびRγ2は、C~Cアルキルであり、Rγ3およびRγ4は水素である。
特定の実施形態において、Rは、ハロゲン、-NRγ3γ4、-N(Rγ3)C(O)Rγ2、-N(Rγ3)S(O)γ2、または-(C~Cアルキレニル)-S(O)γ1である。
特定の実施形態において、Rは、ハロゲン、-NR(Rγ3)S(O)γ2、または-(C~Cアルキレニル)-S(O)γ1である。いくつかのこのような実施形態において、Rγ1およびRγ2はC~Cアルキルであり、Rγ2はHである。いくつかのこのような実施形態において、ハロゲンはFである。いくつかのこのような実施形態において、Rγ1およびRγ2は、それぞれ独立して、メチルまたはエチルであり、Rγ3はHである。
特定の実施形態において、Rは-(CH)-S(O)γ1である。いくつかの実施形態において、Rγ1は、C~Cアルキルである。いくつかのそのような施形態では、Rγ1はメチルである。
式(I)の特定の実施形態において、R10は、H、C~Cアルキル ハロゲン、C~Cハロアルキル、または-CNである。
特定の実施形態において、R10はH、C~Cアルキルまたはハロゲンである。
特定の実施形態において、R10は、Hである。
置換基R、R、R、Y、Y、Y、A、A、AおよびAの様々な実施形態を上記で検討した。これらの置換基の実施形態を組み合わせて、式(I)の化合物の様々な実施形態を形成することができる。上述の置換基の実施形態を組み合わせることによって形成される式(I)の化合物の全ての実施形態は、主題の範囲内であり、式(I)の化合物のいくつかの例示的な実施形態を以下に提供する:
特定の実施形態において、YはCHであり;YはCRであり;およびYはCRである。
特定の実施形態において、YはCHであり;YはCRであり;YはCRであり;およびRはH、-CN、-C(O)R3a、-C(O)OR3a、-C(O)NR3b3c、またはC~Cアルキルであり、C~Cアルキルは、G、-NR3b3c、N(R3b)C(O)R3d、N(R3b)SO3d、N(R3b)C(O)OR3d、N(R3b)C(O)NR3b3c、およびN(R3b)SONR3b3cからなる群から独立して選択される1または2個の置換基で必要に応じて置換される。
いくつかの更なる実施形態において、Aは、C(R)、Aは、C(R)、Aは、C(R)、およびAは、C(R10)であり;またはAはNであり、AはC(R)であり、AはC(R)であり、AはC(R10)であり;またはAはNであり、AはC(R)であり、AはNであり、AはC(R10)である。
いくつかの更なる実施形態において、AはC(R)であり、AはC(R)であり、AはC(R)であり、AはC(R10)である。
いくつかの更なる実施形態において、AはNであり、AはC(R)であり、AはC(R)であり、AはC(R10)である。
いくつかの更なる実施形態において、AはNであり、AはC(R)であり、AはNであり、AはC(R10)である。
特定の実施形態において、YはCHであり;YはCRであり;YはCRであり;RはHまたは重水素であり;およびRはH、重水素、C~Cアルキル、C~Cアルケニル、C~Cアルキニル、C~Cハロアルキル、-C(O)R5a、-C(O)OR5a、またはGであり;C~Cアルキル、C~Cアルケニル、およびC~Cアルキニルは、それぞれ独立して、非置換であるか、またはG、-C(O)R5a、-C(O)OR5a、-C(O)NR5b5c、-C(O)N(R4b)NR5b5c、-OR5a、-OC(O)R5d、-NR5b5c、N(R5b)C(O)R5d、N(R5b)SO5d、N(R5b)C(O)OR5d、N(R5b)C(O)NR5b5c、およびN(R5b)SONR5b5cから独立して選択される1または2個の置換基で置換される。
いくつかの更なる実施形態において、AはC(R)であり、AはC(R)であり、AはC(R)であり、AはC(R10)であり;またはAはNであり、AはC(R)であり、AはC(R)であり、AはC(R10)であり;またはAはNであり、AはC(R)であり、AはNであり、AはC(R10)である。
いくつかの更なる実施形態において、AはC(R)であり、AはC(R)であり、AはC(R)であり、AはC(R10)である。
いくつかの更なる実施形態において、AはNであり、AはC(R)であり、AはC(R)であり、AはC(R10)である。
いくつかの更なる実施形態において、AはNであり、AはC(R)であり、AはNであり、AはC(R10)である。
特定の実施形態において、YはCHであり;YはCRであり;YはCRであり;およびRはH、C~Cアルキル、C~Cアルケニル、-C(O)R6a、-C(O)OR6a、-C(O)NR6b6c、-S(O)6a、またはGであり;C~CアルキルおよびC~Cアルケニルは、それぞれ独立して、非置換であるか、または、-CN、-C(O)OR6a、-NR6b6c、N(R6b)C(O)R6d、N(R6b)SO6d、N(R6b)C(O)OR6d、N(R6b)C(O)NR6b6c、およびN(R6b)SONR6b6cからなる群から独立して選択される1または2個の置換基で置換される。
いくつかの更なる実施形態において、AはC(R)であり、AはC(R)であり、AはC(R)であり、AはC(R10)であり;またはAはNであり、AはC(R)であり、AはC(R)であり、AはC(R10)であり;またはAはNであり、AはC(R)であり、AはNであり、AはC(R10)である。
いくつかの更なる実施形態において、AはC(R)であり、AはC(R)であり、AはC(R)であり、AはC(R10)である。
いくつかの更なる実施形態において、AはNであり、AはC(R)であり、AはC(R)であり、AはC(R10)である。
いくつかの更なる実施形態において、AはNであり、AはC(R)であり、AはNであり、AはC(R10)である。
特定の実施形態において、YはCHであり;YはCRであり;YはCRであり;およびRはH、C~Cアルキル、ハロゲン、C~Caハロアルキル、-CN、-S(O)γ1、-S(O)NRγ3γ4、-C(O)NRγ3γ4、-NRγ3γ4、-N(Rγ3)C(O)Rγ2、-N(R≡3)S(O)6652、-N(Rγ3)C(O)O(Rγ2)、-N(Rγ3)CX(O)NRγ3654、-N(Rγ3)S(O)NRγ3654、-(C~Cアルキレニル)-S(O)γ1、-(C~Cアルキレニル)-S(O)NRγ3γ4、-(C~Cアルキレニル)-C(O)NRγ3γ4、-(C~Cアルキレニル)-NRγ3γ4、-(C~Cアルキレニル)-N(Rγ3)C(O)Rγ2、-(C~Cアルキレニル)-N(Rγ3)S(O)γ2、-(C~Cアルキレニル)-N(Rγ3)C(O)O(Rγ2)、-(C~Cアルキレニル)-N(Rγ3)C(O)NRγ3γ4、または-(C~Cアルキレニル)-N(Rγ3)S(O)NRγ3γ4である。
いくつかの更なる実施形態において、AはC(R)であり、AはC(R)であり、AはC(R)であり、AはC(R10)であり;またはAはNであり、AはC(R)であり、AはC(R)であり、AはC(R10)であり;またはAはNであり、AはC(R)であり、AはNであり、AはC(R10)である。
いくつかの更なる実施形態において、AはC(R)であり、AはC(R)であり、AはC(R)であり、AはC(R10)である。
いくつかの更なる実施形態において、AはNであり、AはC(R)であり、AはC(R)であり、AはC(R10)である。
いくつかの更なる実施形態において、AはNであり、AはC(R)であり、AはNであり、AはC(R10)である。
特定の実施形態において、YはCHであり;YはCRであり;YはCRであり;およびAはC(R)であり、AはC(R)であり、AはC(R)であり、AはC(R10)であり;またはAはNであり、AはC(R)であり、AはC(R)であり、AはC(R10)であり;またはAはNであり、AはC(R)であり、AはNであり、AはC(R10)である。
いくつかの更なる実施形態において、AはC(R)であり、AはC(R)であり、AはC(R)であり、AはC(R10)である。
いくつかの更なる実施形態において、AはNであり、AはC(R)であり、AはC(R)であり、AはC(R10)である。
いくつかの更なる実施形態において、AはNであり、AはC(R)であり、AはNであり、AはC(R10)である。
特定の実施形態において、RはC~Cアルキルであり;RはHであり;YはCHであり;YはCRであり;およびYはCRである。
さらに別の態様では、Rはメチルである。
特定の実施形態において、RはC~Cアルキルであり;RはHであり;YはCHであり;YはCRであり;YはCRであり;RはHまたは重水素であり;およびRはG基で必要に応じて置換されたC~Cアルケニルであるか、またはRはH、重水素、C~Cアルキル、-C(O)R5a、-C(O)OR5a、もしくはGであり;C~Cアルキルは、非置換であるか、またはG、-C(O)R5a、-C(O)OR5a、-C(O)NR5b5c、-C(O)N(R5b)NR5b5c、-OR5a、-OC(O)R5d、-NR5b5c、およびN(R5b)C(NR5b5c)-NR5b5cから独立して選択される1または2個の置換基で置換される。
さらに別の態様では、Rはメチルである。
いくつかの更なる実施形態において、AはC(R)であり、AはC(R)であり、AはC(R)であり、AはC(R10)であり;またはAはNであり、AはC(R)であり、AはC(R)であり、AはC(R10)であり;またはAはNであり、AはC(R)であり、AはNであり、AはC(R10)である。
いくつかの更なる実施形態において、AはC(R)であり、AはC(R)であり、AはC(R)であり、AはC(R10)である。
いくつかの更なる実施形態において、AはNであり、AはC(R)であり、AはC(R)であり、AはC(R10)である。
いくつかの更なる実施形態において、AはNであり、AはC(R)であり、AはNであり、AはC(R10)である。
特定の実施形態において、RはC~Cアルキルであり;RはHであり;YはCHであり;YはCRであり;YはCRであり;およびRはH、-C(O)R3a、または-C(O)NR3b3cである。
いくつかの更なる実施形態において、AはC(R)であり、AはC(R)であり、AはC(R)であり、AはC(R10)であり;またはAはNであり、AはC(R)であり、AはC(R)であり、AはC(R10)であり;またはAはNであり、AはC(R)であり、AはNであり、AはC(R10)である。
いくつかの更なる実施形態において、AはC(R)であり、AはC(R)であり、AはC(R)であり、AはC(R10)である。
いくつかのさらなる実施形態において、A1はNであり、A2はC(R8)であり、A3はC(R9)であり、A4はC(R10)である。
いくつかの更なる実施形態において、AはNであり、AはC(R)であり、AはNであり、AはC(R10)である。
さらに別の態様では、Rはメチルである。
いくつかのさらなる実施形態において、Rはメチルであり、R3aはGある。
さらにいくつかの実施形態において、Rメチルであり、R3AはGであり、Gは必要に応じて置換された複素環である。
特定の実施形態において、RはC~Cアルキルであり;RはHであり;YはCHであり;YはCRであり;YはCRであり;およびRはH、C~Cアルキル、-C(O)R6a、-C(O)NR6b6c、-S(O)6a、またはGであり;C~Cアルキルは、非置換であるかまたはGおよび-C(O)OR6aからなる群から独立して選択される1または2個の置換基で置換される。
いくつかの更なる実施形態において、AはC(R)であり、AはC(R)であり、AはC(R)であり、AはC(R10)であり;またはAはNであり、AはC(R)であり、AはC(R)であり、AはC(R10)であり;またはAはNであり、AはC(R)であり、AはNであり、AはC(R10)である。
さらに別の態様では、Rはメチルである。
いくつかの更なる実施形態において、AはC(R)であり、AはC(R)であり、AはC(R)であり、AはC(R10)である。
いくつかの更なる実施形態において、AはNであり、AはC(R)であり、AはC(R)であり、AはC(R10)である。
いくつかの更なる実施形態において、AはNであり、AはC(R)であり、AはNであり、AはC(R10)である。
特定の実施形態において、RはC~Cアルキルであり;RはHであり;YはCHである:YはCRであり;YはCRであり;およびRはH、C~Cアルキル、ハロゲン、-S(O)γ1、-S(O)NRγ3γ4、-N(Rγ3)S(O)γ2、または-(C~Cアルキレニル)-S(O)γ1である。
いくつかの更なる実施形態において、AはC(R)であり、AはC(R)であり、AはC(R)であり、AはC(R10)であり;またはAはNであり、AはC(R)であり、AはC(R)であり、AはC(R10)であり;またはAはNであり、AはC(R)であり、AはNであり、AはC(R10)である。
いくつかの更なる実施形態において、AはC(R)であり、AはC(R)であり、AはC(R)であり、AはC(R10)である。
いくつかの更なる実施形態において、AはNであり、AはC(R)であり、AはC(R)であり、AはC(R10)である。
いくつかの更なる実施形態において、AはNであり、AはC(R)であり、AはNであり、AはC(R10)である。
さらに別の態様では、Rはメチルである。
特定の実施形態において、RはC~Cアルキルであり;RはHであり;YはCHであり;YはCRであり;YはCRであり;およびAはC(R)であり、AはC(R)であり、AはC(R)であり、AはC(R10)であり;またはAはNであり、AはC(R)であり、AはC(R)であり、AはC(R10)であり;またはAはNであり、AはC(R)であり、AはNであり、AはC(R10)である。
いくつかの更なる実施形態において、AはC(R)であり、AはC(R)であり、AはC(R)であり、AはC(R10)である。
いくつかの更なる実施形態において、AはNであり、AはC(R)であり、AはC(R)であり、AはC(R10)である。
いくつかの更なる実施形態において、AはNであり、AはC(R)であり、AはNであり、AはC(R10)である。
さらにいくつかの態様において、Rはメチルである。
特定の実施形態において、Rはメチルであり;RはHであり;YはCHであり;YはCRであり;YはCRであり;AはC(R)であり、AはC(R)であり、AはC(R)であり、AはC(R10)であり;またはAはNであり、AはC(R)であり、AはC(R)であり、AはC(R10)であり;またはAはNであり、AはC(R)であり、AはNであり、AはC(R10であり;RはHまたは重水素であり;RはH、ハロゲン、C~Cアルキル、または必要に応じて置換されたシクロプロピルであり;RはH、C~Cアルキル、ハロゲン、C~Cハロアルキル、-CN、必要に応じて置換された複素環、-C(O)NRγ3654、-(C~Cアルキレニル)-NRγ3γ4、-(C~Cアルキレニル)-N(Rγ3)C(O)Rγ2、-(C~Cアルキレニル)-N(Rγ3)S(O)γ2、-(C~Cアルキレニル)-N(Rγ3)C(O)O(Rγ2)、-(C11~Cアルキレニル)-N(Rγ3)C(O)NRγ3γ4、-(C~Cアルキレニル)-N(Rγ3)S(O)NRγ3γ4、または-(C~Cアルキレニル)-Gであり、Gは必要に応じて置換された複素環であり;およびR10はH、C~Cアルキル、またはハロゲンである。
いくつかの更なる実施形態において、AはC(R)であり、AはC(R)であり、AはC(R)であり、AはC(R10)である。
いくつかの更なる実施形態において、AはNであり、AはC(R)であり、AはC(R)であり、AはC(R10)である。
いくつかの更なる実施形態において、AはNであり、AはC(R)であり、AはNであり、AはC(R10)である。
一実施形態において、本発明は式I)の化合物に関し、式中、Rはメチルであり;RはHであり;YはCHであり;YはCRであり;YはCRであり;AはC(R)であり、AはC(R)であり、AはC(R)であり、AはC(R10)であり;またはAはNであり、AはC(R)であり、AはC(R)であり、AはC(R10)であり;またはAはNであり、AはC(R)であり、AはNであり、AはC(R10であり;RはHまたは重水素であり;RはH、ハロゲン、C~Cアルキル、または必要に応じて置換されたシクロプロピルであり;RはH、C~Cアルキル、ハロゲン、C~Cハロアルキル、-CN、必要に応じて置換された複素環、-C(O)NRγ3γ4、-(C~Cアルキレニル)-NRγ3γ4、-(C~Cアルキレニル)-N(Rγ3)C(O)Rγ2、-(C~Cアルキレニル)-N(Rγ3)S(O)γ2、-(C~Cアルキレニル)-N(Rγ3)C(O)O(Rγ2)、-(C~Cアルキレニル)-N(Rγ3)C(O)NRγ3γ4、-(C~Cアルキレニル)-N(Rγ3)S(O)NRγ3γ4、または-(C~Cアルキレニル)-Gであり、Gは必要に応じて置換された複素環であり;R10はH、C~Cアルキル、またはハロゲンであり;およびRはHまたは-C(O)NR3b3cである。
いくつかのさらなる実施形態において、R3BおよびR3Cは、それぞれ独立して、HまたはC~Cアルキルである。
いくつかの更なる実施形態において、AはC(R)であり、AはC(R)であり、AはC(R)であり、AはC(R10)である。
いくつかの更なる実施形態において、AはNであり、AはC(R)であり、AはC(R)であり、AはC(R10)である。
いくつかの更なる実施形態において、AはNであり、AはC(R)であり、AはNであり、AはC(R10)である。
一実施形態において、本発明は式I)の化合物に関し、式中、Rはメチルであり;RはHであり;YはCHであり;YはCRであり;YはCRであり;AはC(R)であり、AはC(R)であり、AはC(R)であり、AはC(R10)であり;またはAはNであり、AはC(R)であり、AはC(R)であり、AはC(R10)であり;またはAはNであり、AはC(R)であり、AはNであり、AはC(R10であり;RはHまたは重水素であり;RはH、ハロゲン、C~Cアルキル、または必要に応じて置換されたシクロプロピルであり;RはH、C~Cアルキル、ハロゲン、C~Cハロアルキル、-CN、必要に応じて置換された複素環、-C(O)NRγ3γ4、-(C~Cアルキレニル)-NRγ3γ4、-(C~Cアルキレニル)-N(Rγ3)C(O)Rγ2、-(C~Cアルキレニル)-N(Rγ3)S(O)γ2、-(C~Cアルキレニル)-N(Rγ3)C(O)O(Rγ2)、-(C~Cアルキレニル)-N(Rγ3)C(O)NRγ3γ4、-(C~Cアルキレニル)-N(Rγ3)S(O)NRγ3γ4、または-(C~Cアルキレニル)-Gであり、Gは必要に応じて置換された複素環であり;R10はH、C~Cアルキル、またはハロゲンであり;およびRはH、重水素、または-C(O)OR5aおよびOR5aからな~る群から選択される置換基で置換されたC~Cアルキルである。
いくつかの更なる実施形態において、AはC(R)であり、AはC(R)であり、AはC(R)であり、AはC(R10)である。
いくつかの更なる実施形態において、AはNであり、AはC(R)であり、AはC(R)であり、AはC(R10)である。
いくつかの更なる実施形態において、AはNであり、AはC(R)であり、AはNであり、AはC(R10)である。
さらにいくつかの実施形態において、R5aはC~Cアルキルである。
一実施形態において、本発明は式(I)の化合物に関し、式中、Rはメチルであり;RはHであり;YはCHであり;YはCRであり;YはCRであり;AはC(R)であり、AはC(R)であり、AはC(R)であり、AはC(R10)であり;またはAはNであり、AはC(R)であり、AはNであり、AはC(R10)であり;AはNであり、AはC(R)であろ、ANであり、AはC(R10)であり;Rは水素または重水素であり;Rは、H、ハロゲン、C~Cアルキル、または必要に応じて置換されたシクロプロピルであり;RはH、C~Cアルキル、ハロゲン、C~Cハロアルキル、-CN、必要に応じて置換されたた複素環、-C(O)NRγ3γ4、-(C~Cアルキレニル)-NRγ3γ4、-(C~Cアルキレニル)-N(Rγ3)C(O)Rγ2、-(C~Cアルキレニル)-N(Rγ3)S(O)γ2、-(C~Cアルキレニル)-N(Rγ3)C(O)O(Rγ2)、-(C~Cアルキレニル)-N(Rγ3)C(O)NRγ3γ4、-(C~Cアルキレニル)-N(Rγ3)S(O)NRγ3γ4、または-(C~Cアルキレニル)-Gであり、Gは必要に応じて置換された複素環であり;R10はH、C~Cアルキル、またはハロゲンであり;およびRは-C(O)R6a、-C(O)OR6a、-C(O)NR6b6c,G、または非置換もしくはG基で置換されたC~Cアルキルである。
いくつかのさらなる実施形態において、R6aはG、または非置換のC~Cアルキルである。
いくつかの更なる実施形態において、AはC(R)であり、AはC(R)であり、AはC(R)であり、AはC(R10)である。
いくつかの更なる実施形態において、AはNであり、AはC(R)であり、AはNであり、AはC(R10)である。
いくつかの更なる実施形態において、AはNであり、AはC(R)であり、AはNであり、AはC(R10)である。
一実施形態において、本発明は式I)の化合物に関し、式中、Rはメチルであり;RはHであり;YはCHであり;YはCRであり;YはCRであり;AはC(R)であり、AはC(R)であり、AはC(R)であり、AはC(R10)であり;またはAはNであり、AはC(R)であり、AはC(R)であり、AはC(R10)であり;またはAはNであり、AはC(R)であり、AはNであり、AはC(R10であり;RはHまたは重水素であり;RはH、ハロゲン、C~Cアルキル、または必要に応じて置換されたシクロプロピルであり;RはH、C~Cアルキル、ハロゲン、C~Cハロアルキル、-CN、必要に応じて置換された複素環、-C(O)NRγ3γ4、-(C~Cアルキレニル)-NRγ3γ4、-(C~Cアルキレニル)-N(Rγ3)C(O)Rγ2、-(C~Cアルキレニル)-N(Rγ3)S(O)γ2、-(C~Cアルキレニル)-N(Rγ3)C(O)O(Rγ2)、-(C~Cアルキレニル)-N(Rγ3)C(O)NRγ3γ4、-(C~Cアルキレニル)-N(Rγ3)S(O)NRγ3γ4、または-(C~Cアルキレニル)-Gであり、Gは必要に応じて置換された複素環であり;R10はH、C~Cアルキル、またはハロゲンであり;およびRはハロゲン、-NRγ3γ4、-N(Rγ3)C(O)Rγ2、-N(Rγ3)S(O)γ2、または-(C~Cアルケニル)-S(O)γ1である。
いくつかの更なる実施形態において、AはC(R)であり、AはC(R)であり、AはC(R)であり、AはC(R10)である。
いくつかの更なる実施形態において、AはNであり、AはC(R)であり、AはC(R)であり、AはC(R10)である。
いくつかの更なる実施形態において、AはNであり、AはC(R)であり、AはNであり、AはC(R10)である。
特定の実施形態において、Rはメチルであり;RはHであり;YはCHであり;YはCRであり;YはCRであり;AはC(R)であり、AはC(R)であり、AはC(R)であり、AはC(R10)であり;またはAはNであり、AはC(R)であり、AはC(R)であり、AはC(R10)であり;またはAはNであり、AはC(R)であり、AはNであり、AはC(R10)であり;RはHまたは重水素であり;RはHまたはハロゲンであり;RはHであり;およびR10はHである。
いくつかの更なる実施形態において、AはC(R)であり、AはC(R)であり、AはC(R)であり、AはC(R10)である。
いくつかの更なる実施形態において、AはNであり、AはC(R)であり、AはC(R)であり、AはC(R10)である。
いくつかの更なる実施形態において、AはNであり、AはC(R)であり、AはNであり、AはC(R10)である。
特定の実施形態において、Rはメチルであり;RはHであり;YはCHであり;YはCRであり;YはCRであり;AはC(R)であり、AはC(R)であり、AはC(R)であり、AはC(R10)であり;またはAはNであり、AはC(R)であり、AはC(R)であり、AはC(R10)であり;またはAはNであり、AはC(R)であり、AはNであり、AはC(R10)であり;およびRはHまたは重水素であり;RはHまたはハロゲンであり;RはHであり;R10はHであり;およびRはハロゲン、-N(Rγ3)S(O)γ2、または-(C~Cアルキレニル)-S(O)γ1である。
いくつかの更なる実施形態において、AはC(R)であり、AはC(R)であり、AはC(R)であり、AはC(R10)である。
いくつかの更なる実施形態において、AはNであり、AはC(R)であり、AはC(R)であり、AはC(R10)である。
いくつかの更なる実施形態において、AはNであり、AはC(R)であり、AはNであり、AはC(R10)である。
いくつかのさらなる実施形態において、Rγ1およびRγ2はC~Cアルキルであり、Rγ3はHである。
特定の実施形態において、Rはメチルであり;RはHであり;YはCHであり;YはCRであり;YはCRであり;AはC(R)であり、AはC(R)であり、AはC(R)であり、AはC(R10)であり;またはAはNであり、AはC(R)であり、AはC(R)であり、AはC(R10)であり;またはAはNであり、AはC(R)であり、AはNであり、AはC(R10)であり;RはHまたは重水素であり;RはHまたはハロゲンであり;RはHであり;R10はHであり;Rはハロゲン、-N(Rγ3)S(O)γ2、または-(C~Cアルキレニル)-S(O)γ1であり;およびRは-C(O)R6a、-C(O)OR6a、-C(O)NR6b6c、G、または非置換もしくはG基で置換されたC~Cアルキルである。
いくつかのさらなる実施形態において、R6aはG、または非置換のC~Cアルキルである。
いくつかの更なる実施形態において、AはC(R)であり、AはC(R)であり、AはC(R)であり、AはC(R10)である。
いくつかの更なる実施形態において、AはNであり、AはC(R)であり、AはC(R)であり、AはC(R10)である。
いくつかの更なる実施形態において、AはNであり、AはC(R)であり、AはNであり、AはC(R10)である。
いくつかのさらなる実施形態において、Rγ1およびRγ2はC~Cアルキルであり、Rγ3はHである。
特定の実施形態において、Rはメチルであり;RはHであり;YはCHであり;YはCRであり;YはCRであり;AはC(R)であり、AはC(R)であり、AはC(R)であり、AはC(R10)であり;またはAはNであり、AはC(R)であり、AはC(R)であり、Aは(R10)であり;またはAはNであり、AはC(R)であり、AはNであり、AはC(R10)であり;RはHまたは重水素であり;RはHまたはハロゲンであり;RはHであり;R10はHであり;Rはハロゲン、-N(Rγ3)S(O)γ2、または-(C~Cアルキレニル)-S(O)γ1であり;Rは-C(O)R6a、-C(O)OR6a、-C(O)NR6b6c、G、または非置換もしくはG基で置換されたC~Cアルキルであり;およびRはH、重水素、または-C(O)OR5aまたはOR5aからなる群から選択される置換基で必要に応じて置換されたC~Cアルキルである。
いくつかのさらなる実施形態において、R6aはG、または非置換のC~Cアルキルである。
いくつかの更なる実施形態において、AはC(R)であり、AはC(R)であり、AはC(R)であり、AはC(R10)である。
いくつかの更なる実施形態において、AはNであり、AはC(R)であり、AはC(R)であり、AはC(R10)である。
いくつかの更なる実施形態において、AはNであり、AはC(R)であり、AはNであり、AはC(R10)である。
いくつかのさらなる実施形態において、Rγ1およびRγ2はC~Cアルキルであり、Rγ3はHである。
特定の実施形態において、Rはメチルであり;RはHであり;YはCHであり;YはCRであり;YはCRであり;AはC(R)であり、AはC(R)であり、AはC(R)であり、AはC(R10)であり;またはAはNであり、AはC(R)であり、AはC(R)であり、AはC(R10)であり;またはAはNであり、AはC(R)であり、AはNであり、AはC(R10)であり;RはHまたは重水素であり;RはHまたはハロゲンであり;RはHであり;R10はHであり;Rはハロゲン、-N(Rγ3)S(O)652、または-(C~Cアルキレニル)-S(O)γ1であり;
は-C(O)R6a、-C(O)OR6a、-C(O)NR6b6c、G、または非置換もしくはG基で置換されたC~Cアルキルであり;Rは、H、重水素、または-C(O)OR5aおよびOR5aからなる群から選択される置換基で必要に応じて置換されたC~Cアルキルであり;ならびにRはHまたは-C(O)NR3b3cである。
いくつかのさらなる実施形態において、R6aはG、または非置換のC~Cアルキルである。
いくつかの更なる実施形態において、AはC(R)であり、AはC(R)であり、AはC(R)であり、AはC(R10)である。
いくつかの更なる実施形態において、AはNであり、AはC(R)であり、AはC(R)であり、AはC(R10)である。
いくつかの更なる実施形態において、AはNであり、AはC(R)であり、AはNであり、AはC(R10)である。
特定の実施形態において、Rはメチルであり;RはHであり;YはCHであり;YはCRであり;YはCRであり;AはC(R)であり、AはC(R)であり、AはC(R)であり、AはC(R10)であり;またはAはNであり、AはC(R)であり、AはC(R)であり、AはC(R10)であり;またはAはNであり、AはC(R)であり、AはNであり、AはC(R10)であり;RはHまたは重水素であり;RはHまたはハロゲンであり;RはHであり;R10はHであり;Rはハロゲン、-N(Rγ3)S(O)γ2、または-(C~Cアルキレニル)-S(O)γ1であり;Rは-C(O)R6a、-C(O)OR6a、-C(O)NR6b6c、G、または非置換もしくはG基で置換されたC~Cアルキルであり;RはH、重水素、または-C(O)OR5aおよびOR5aからなる群から選択される置換基で必要に応じて置換されたC~Cアルキルであり;RはHまたは-C(O)NR3b3cであり;R3bおよびR3cは、それぞれ独立して、HまたはC~Cアルキルである;R5aはC~Cアルキルである;Rγ1およびRγ2はC~Cアルキルである;ならびにRγ3はHである。
いくつかのさらなる実施形態において、R6aはG、または非置換のC~Cアルキルである。
いくつかの更なる実施形態において、AはC(R)であり、AはC(R)であり、AはC(R)であり、AはC(R10)である。
いくつかの更なる実施形態において、AはNであり、AはC(R)であり、AはC(R)であり、AはC(R10)である。
いくつかの更なる実施形態において、AはNであり、AはC(R)であり、AはNであり、AはC(R10)である。
特定の実施形態において、Rはメチルであり;RはHであり;YはCHであり;YはCRであり;YはCRであり;AはC(R)であり、AはC(R)であり、AはC(R)であり、AはC(R10)であり;またはAはNであり、AはC(R)であり、AはC(R)であり、AはC(R10)であり;またはAはNであり、AはC(R)であり、AはNであり、AはC(R10)であり;RはHまたは重水素であり;RはHまたはハロゲンであり;RはHであり;R10はHであり;Rはハロゲン、-N(Rγ3)S(O)γ2、または-(C~Cアルキレニル)-S(O)γ1であり;RはG、または非置換もしくはG基で置換されたC~Cアルキルであり;Rは、H、重水素、または-C(O)OR5aおよびOR5aからなる群から選択される置換基で必要に応じて置換されたC~Cアルキルであり;RはHまたは-C(O)NR3b3cであり;R3BおよびR3Cは、それぞれ独立して、HまたはC~Cアルキルであり;R5aはC~Cアルキルであり;Rγ1およびRγ2はC~Cアルキルであり;およびRγ3はHである。
いくつかのさらなる実施形態において、Rは、必要に応じて置換されたアリール、必要に応じて置換されたヘテロアリール、または必要に応じて置換されたシクロアルキルであり;またはRは、非置換であるか、またはシクロアルキルおよび複素環からなる群から選択される置換基で置換されたC~Cアルキルであり、それぞれが必要に応じて置換される。
いくつかのさらなる実施形態において、Rは、必要に応じて置換されたフェニル、必要に応じて置換されたシクロヘキシル、必要に応じて置換されたピリジニル、または非置換であるか、GがシクロプロピルまたはテトラヒドロフラニルであるG基で置換されたC~Cアルキルであり、それぞれが必要に応じて置換される。
いくつかの更なる実施形態において、AはC(R)であり、AはC(R)であり、AはC(R)であり、AはC(R10)である。
いくつかの更なる実施形態において、AはNであり、AはC(R)であり、AはC(R)であり、AはC(R10)である。
いくつかの更なる実施形態において、AはNであり、AはC(R)であり、AはNであり、AはC(R10)である。
特定の実施形態において、Rはメチルであり;RはHであり;YはCHであり;YはCRであり;YはCRであり;AはC(R)であり、AはC(R)であり、AはC(R)であり、AはC(R10)であり;またはAはNであり、AはC(R)であり、AはC(R)であり、AはC(R10)であり;またはAはNであり、AはC(R)であり、AはNであり、AはC(R10)であり;RはH、-C(O)NR3b3c、-CN、またはG基で置換されたC~Cアルキルであり;Gは必要に応じて置換されたC~C複素環であり;RはHまたは重水素であり;Rは、H、ハロゲン、-CN、C~Cアルキル、または必要に応じて置換されたシクロプロピルであり;RはHであり;Rはハロゲン、-N(Rγ3)S(O)γ2、または-(C~Cアルキレニル)-S(O)γ1であり;およびR10はHである。
いくつかの更なる実施形態において、AはC(R)であり、AはC(R)であり、AはC()であり、AはC(R10)である。
いくつかの更なる実施形態において、AはNであり、AはC(R)であり、AはC(R)であり、AはC(R10)である。
いくつかの更なる実施形態において、AはNであり、AはC(R)であり、AはNであり、AはC(R10)である。
いくつかの更なる実施形態において、R3BはHまたはC~Cアルキルであり;およびR3CはH、C~Cアルキル、C~Cハロアルキル、G、または-(C~Cアルキレニル)-Gである。
いくつかのこの実施形態において、R3BおよびR3Cは、それぞれ独立して、HまたはC~Cアルキルである。
いくつかのさらなる実施形態において、Rγ1およびRγ2はC~Cアルキルであり;およびRγ3はHである。
特定の実施形態において、Rはメチルであり;RはHであり;YはCHであり;YはCRであり;YはCRであり;AはC(R)であり、AはC(R)であり、AはC(R)であり、AはC(R10)であり;またはAはNであり、AはC(R)であり、AはC(R)であり、AはC(R10)であり;またはAはNであり、AはC(R)であり、AはNであり、AはC(R10)であり;RはH、-C(O)NR3b3c、-CN、またはG基で置換されたC~Cアルキルであり;Gは必要に応じて置換されたC~C複素環であり;RはHまたは重水素であり;Rは、H、ハロゲン、-CN、C~Cアルキル、または必要に応じて置換されたシクロプロピルであり;RはHであり;Rはハロゲン、-N(Rγ3)S(O)γ2、または-(C~Cアルキレニル)-S(O)γ1であり;R10はHである;およびRはHである。
いくつかの更なる実施形態において、AはC(R)であり、AはC(R)であり、AはC(R)であり、AはC(R10)である。
いくつかの更なる実施形態において、AはNであり、AはC(R)であり、AはC(R)であり、AはC(R10)である。
いくつかの更なる実施形態において、AはNであり、AはC(R)であり、AはNであり、AはC(R10)である。
いくつかのさらなる実施形態において、R3BおよびR3Cは、それぞれ独立して、HまたはC~Cアルキルである。
いくつかのさらなる実施形態において、Rγ1およびRγ2はC~Cアルキルであり;およびRγ3はHである。
特定の実施形態において、Rはメチルであり;RはHであり;YはCHであり;YはCRであり;YはCRであり;AはC(R)であり、AはC(R)であり、AはC(R)であり、AはC(R10)であり;またはAはNであり、AはC(R)であり、AはC(R)であり、AはC(R10)であり;またはAはNであり、AはC(R)であり、AはNであり、AはC(R10)であり;RはH、-C(O)NR3b3c、-CN、またはG基で置換されたC~Cアルキルであり;Gは必要に応じて置換されたC~C複素環であり;RはHまたは重水素であり;Rは、H、ハロゲン、-CN、C~Cアルキル、または必要に応じて置換されたシクロプロピルであり;RはH;Rはハロゲン、-N(Rγ3)S(O)γ2、または-(C~Cアルキレニル)-S(O)γ1であり;R10はHである;RはHである;およびRはフェニルk、ピリジニルまたはシクロヘキシルである;これらのそれぞれは必要に応じて置換される;またはRは-C(O)O(C~Cアルキル)である;またはRは-CH-(必要に応じて置換されたテトラヒドロピラニル)である。
いくつかの更なる実施形態において、AはC(R)であり、AはC(R)であり、AはC(R)であり、AはC(R10)である。
いくつかの更なる実施形態において、AはNであり、AはC(R)であり、AはC(R)であり、AはC(R10)である。
いくつかの更なる実施形態において、AはNであり、AはC(R)であり、AはNであり、AはC(R10)である。
いくつかのさらなる実施形態において、R3BおよびR3Cは、それぞれ独立して、HまたはC~Cアルキルである。
いくつかのさらなる実施形態において、Rγ1およびRγ2はC~Cアルキルであり;およびRγ3はHである。
特定の実施形態において、Rはメチルであり;RはHであり;YはCHであり;YはCRであり;YはCRであり;AはC(R)であり、AはC(R)であり、AはC(R)であり、AはC(R10)であり;またはAはNであり、AはC(R)であり、AはC(R)であり、AはC(R10)であり;またはAはNであり、AはC(R)であり、AはNであり、AはC(R10)であり;RはGである;RはHまたは重水素である;RはH、ハロゲン、-CN、C~Cアルキル、または必要に応じて置換されたシクロプロピルである;RはHである;Rは-S(O)γ1、-N(Rγ3)S(O)γ2、または-(C~Cアルキレニル)-S(O)γ1であり;およびR10はHである。
いくつかの更なる実施形態において、AはC(R)であり、AはC(R)であり、AはC(R)であり、AはC(R10)である。
いくつかの更なる実施形態において、AはNであり、AはC(R)であり、AはC(R)であり、AはC(R10)である。
いくつかの更なる実施形態において、AはNであり、AはC(R)であり、AはNであり、AはC(R10)である。
いくつかのさらなる実施形態において、Rγ1およびRγ2はC~Cアルキルであり;およびRγ3はHである。
特定の実施形態において、Rはメチルであり;RはHであり;YはCHであり;YはCRであり;YはCRであり;AはC(R)であり、AはC(R)であり、AはC(R)であり、AはC(R10)であり;またはAはNであり、AはC(R)であり、AはC(R)であり、AはC(R10)であり;またはAはNであり、AはC(R)であり、AはNであり、AはC(R10)であり;RはGである;Gは必要に応じて置換されたヘテロアリールである;RはHまたは重水素である;RはH、ハロゲン、-CN、C~Cアルキル、または必要に応じて置換されたシクロプロピルである;RはHである;Rは-S(O)γ1-N(Rγ3)S(O)γ2、または-(C~Cアルキレニル)-S(O)γ1;R10はHである;およびRはHである。
いくつかの更なる実施形態において、AはC(R)であり、AはC(R)であり、AはC(R)であり、AはC(R10)である。
いくつかの更なる実施形態において、AはNであり、AはC(R)であり、AはC(R)であり、AはC(R10)である。
いくつかの更なる実施形態において、AはNであり、AはC(R)であり、AはNであり、AはC(R10)である。
いくつかのさらなる実施形態において、Rγ1およびRγ2はC~Cアルキルであり;およびRγ3はHである。
特定の実施形態において、Rはメチルであり;RはHであり;YはCHであり;YはCRであり;YはCRであり;AはC(R)であり、AはC(R)であり、AはC(R)であり、AはC(R10)であり;またはAはNであり、AはC(R)であり、AはC(R)であり、AはC(R10)であり;またはAはNであり、AはC(R)であり、AはNであり、AはC(R10)であり;RはGであり;Gは、必要に応じて置換されたピラゾリルであり;RはHまたは重水素であり;RはH、ハロゲン、-CN、C~Cアルキル、または必要に応じて置換されたシクロプロピルであり;RはHであり;Rは-S(O)γ1であり;R10はHであり;RはHであり;およびRはフェニル、ピリジニル、またはシクロヘキシルであり;これらのそれぞれは、必要に応じて置換される;またはRは-C(O)O(C~Cアルキル)であり;またはRは-CH-(必要に応じて置換されたテトラヒドロピラニル)である。
いくつかの更なる実施形態において、AはC(R)であり、AはC(R)であり、AはC(R)であり、AはC(R10)である。
いくつかの更なる実施形態において、AはNであり、AはC(R)であり、AはC(R)であり、AはC(R10)である。
いくつかの更なる実施形態において、AはNであり、AはC(R)であり、AはNであり、AはC(R10)である。
いくつかのさらなる実施形態において、Rγ1は、C~Cアルキルである。
特定の実施形態において、YはNまたはCHであり;RはCD、C~Cアルキル、またはC~Cハロアルキルであり;RはHまたはC~Cアルキルであり;YはNまたはCRであり;RはH、C~Cアルキル、C~Cアルケニル、C~Cアルキニル、ハロゲン、C~Cハロアルキル、-C(O)R3a、-C(O)OR3a、-C(O)NR3b3c、-S(O)R3d、-S(O)3a、-S(O)NR3b3c、またはGであり;C~Cアルキル、C~Cアルケニル(alkneyl)、およびC~Cアルキニルは、それぞれ独立して、非置換であるか、またはG、-C(O)R3a、-C(O)OR3a、-C(O)NR3b3c、-C(O)N(R3b)NR3b3c、-S(O)R3d、-S(O)3a、-S(O)NR3b3c、-OR3a、-OC(O)R3d、-NR3b3c、N(R3b)C(O)R3d、N(R3b)SO3d、N(R3b)、N(R3b)C(O)OR3d、N(R3b)C(O)NR3b3c、N(R3b)SONR3b3c、およびN(R3b)C(NR3b3c)=NR3b3cからなる群から独立して選択される1もしくは2個の置換基で置換されており;Yは、C(O)S(O)、またはCRであり;Rは、H、重水素、C~Cアルキル、ハロゲン、またはC~Cハロアルキルであり;Rは、H、重水素、C~Cアルキル、C~Cアルケニル、C~Cアルキニル、ハロゲン、C~Cハロアルキル、-C(O)R5a、-C(O)OR5a、-C(O)NR5b5c、-S(O)R5d、-S(O)5a、-S(O)NR5b5c、またはGであり;C~Cアルキル、C~Cアルケニル、およびC~Cアルキニルは、それぞれ独立して、非置換であるか、G、-C(O)R5a、-C(O)OR5a、-C(O)NR5b5c、-C(O)N(R5b5c、-S(O)R5d、-S(O)5a、-S(O)NR5b5c、-OR5a、-OC(O)R5d、-NR5b5c、N(R5b)C(O)R5d、N(R5b)SO5d、N(R5b)C(O)OR5d、N(R5b)C(O)NR5b5c、N(R5b)SONR5b5c、およびN(R5b)C(NR5b5c)=NR5b5cからなる群から独立して選択される1もしくは2個の置換基で置換されており;R3a、R3b、R3c、R5a、R5b、およびR5cは、各存在において、それぞれ独立して、H、C~Cアルキル、C~Cアルケニル、C~Cアルキニル、C~Cハロアルキル、G、または-(C~Cアルキレニル)-Gであり;R3dおよびR5dは、各存在において、独立して、C~Cアルキル、C~Cアルケニル、C~Cアルキニル、C~Cハロアルキル、G、または-(C~Cアルキレニル)-Gであり;R5dは、各存在において、それぞれ独立して、C~Cアルキル、C~Cアルケニル、C~Cアルキニル、C~Cハロアルキル、G、または-(C~Cアルキレニル)-Gであり;Gは、各存在において、独立して、アリール、ヘテロアリール、複素環、シクロアルキル、またはシクロアルケニルであり;および各Gは、1、2、3、4、または5個のR1g基で必要に応じて置換され;Rは、H、C~Cアルキル、C~Cアルケニル、C~Cアルキニル、ハロゲン、C~Cハロアルキル、-C(O)R6a、-C(O)OR6a、-C(O)NR6b6c、-S(O)6a、-S(O)NR6b6c、またはGであり;C~Cアルキル、C~Cアルケニル、およびC~Cアルキニルは、それぞれ独立して、非置換であるか、またはG、-C(O)R6a、-C(O)OR6a、-C(O)NR6b6c、-C(O)N(R6b)NR6b6c、-S(O)R6d、-S(O)6a、-S(O)NR6b6c、-OR6a、-OC(O)R6d、-NR6b6c、N(R6b)C(O)R6d、N(R6a)SO6d、N(R6b)C(O)OR6d、N(R6b)C(O)NR6b6c、N(R6b)SONR6b6c、およびN(R6b)C(NR6b6c)=NR6b6cから独立して選択される1もしくは2個の置換基で置換され;R6a、R6b、およびR6cは、各存在において、それぞれ独立して、H、アルキル、C~Cアルケニル、C~Cアルキニル、ハロアルキル、G、-(C~Cアルキレニル)-G、-(C~Cアルキレニル)-OR、-(C~Cアルキレニル)-S(O)、-(C~Cアルキレニル)-S(O)NR、-(C~Cアルキレニル)-C(O)R、-(C~Cアルキレニル)-C(O)OR、-(C~Cアルキレニル)-C(O)NR、-(C~Cアルキレニル)-NR、-(C~Cアルキレニル)-N(R)C(O)R、-(C~Cアルキレニル)-N(R)S(O)、-(C~Cアルキレニル)-N(R)C(O)O(R)、-(C~Cアルキレニル)-N(R)C(O)NR、または-(C~Cアルキレニル)-N(R)S(O)NRであり;R6dは、各存在において、独立して、アルキル、C~Cアルケニル、C~Cアルキニル、ハロアルキル、G、-(C~Cアルキレニル)-G、-(C~Cアルキレニル)-OR、-(C~Cアルキレニル)-S(O)、-(C~Cアルキレニル)-S(O)NR、-(C~Cアルキレニル)-C(O)R、-(C~Cアルキレニル)-C(O)OR、-(C~Cアルキレニル)-C(O)NR、-(C~Cアルキレニル)-NR、-(C~Cアルキレニル)-N(R)C(O)R、-(C~Cアルキレニル)-N(R)S(O)、-(C~Cアルキレニル)-N(R)C(O)O(R)、-(C~Cアルキレニル)-N(R)C(O)NR、または-(C~Cアルキレニル)-N(R)S(O)NRであり;Gは、各存在において、独立して、アリール、ヘテロアリール、複素環、シクロアルキル、またはシクロアルケニルであり;および各Gは、1、2、3、4、または5個のR2g基で必要に応じて置換されており;AはC(R)またはNであり;AはC(R)またはNであり;AはC(R)またはNであり;およびAはC(R10)またはNであり;0、1、または2個のA、A
およびAはNであり;R、R、およびRは、それぞれ独立して、H、C~Cアルキル、C~Cアルケニル、C~Cアルキニル、ハロゲン、C~Cハロアルキル、-CN、NO、-ORγ1、-OC(O)Rγ2、-OC(O)NRγ3γ4、-SRγ1、-S(O)γ1、-S(O)NRγ3γ4、-C(O)Rγ1、-C(O)ORγ1、-C(O)NRγ3γ4、-NRγ3γ4、-N(Rγ3)C(O)Rγ2、-N(Rγ3)S(O)γ2、-N(Rγ3)C(O)O(Rγ1)、-N(Rγ3)C(O)NRγ3γ4、-N(Rγ3)S(O)NRγ3γ4、G、-(C~Cアルキレニル)-CN、-(C~Cアルキレニル)-ORγ1、-(C~Cアルキレニル)-OC(O)Rγ2、-(C~Cアルキレニル)-OC(O)NRγ3γ4、-(C~Cアルキレニル)-S(O)γ1、-(C~Cアルキレニル)-S(O)NRγ3γ4、-(C~Cアルキレニル)-C(O)Rγ1、-(C~Cアルキレニル)-C(O)ORγ1、-(C~Cアルキレニル)-C(O)NRγ3γ4、-(C~Cアルキレニル)-NRγ3γ4、-(C~Cアルキレニル)-N(Rγ3)C(O)Rγ2、-(C~Cアルキレニル)-N(Rγ3)S(O)γ2、-(C~Cアルキレニル)-N(Rγ3)C(O)O(Rγ2)、-(C~Cアルキレニル)-N(Rγ3)C(O)NRγ3γ4、-(C~Cアルキレニル)-N(Rγ3)S(O)NRγ3γ4、-(C~Cアルキレニル)-CN、または-(C~Cアルキレニル)-Gであり;Rγ1、Rγ3、およびRγ4は、各存在において、それぞれ独立して、H、C~Cアルキル、C~Cアルケニル、C~Cアルキニル、C~Cハロアルキル、G、-(C~Cアルキレニル)-G、-(C~Cアルキレニル)-OR、-(C~Cアルキレニル)-S(O)、-(C~Cアルキレニル)-S(O)NR、-(C~Cアルキレニル-C(O)R、-(C~Cアルキレニル)-C(O)OR、-(C~Cアルキレニル)-C(O)NR、-(C~Cアルキレニル)-NR、-(C~Cアルキレニル)-N(R)C(O)R、-(C~Cアルキレニル)-N(R)S(O)、-(C~Cアルキレニル)-N(R)C(O)O(R)、-(C~Cアルキレニル)-N(R)C(O)NR、または-(C~Cアルキレニル)-N(R)S(O)NRであり;Rγ2は、各存在において、独立して、C~Cアルキル、C~Cアルケニル、C~Cアルキニル、C~Cハロアルキル、G、-(C~Cアルキレニル)-G、-(C~Cアルキレニル)-OR、-(C~Cアルキレニル)-S(O)、-(C~Cアルキレニル)-S(O)NR、-(C~Cアルキレニル)-C(O)R、-(Cアルキレニル)-C(O)OR、-(C~Cアルキレニル)-C(O)NR、-(C~Cアルキレニル)-NR、-(C~Cアルキレニル)-N(R)C(O)R、-(C~Cアルキレニル)-N(R)S(O)、-(C~Cアルキレニル)-N(R)C(O)O(R)、-(C~Cアルキレニル)-N(R)C(O)NR、または-(C~Cアルキレニル)-N(R)S(O)NRであり;Gは、各存在において、独立して、アリール、ヘテロアリール、シクロアルキル、シクロアルケニル、または複素環であり;および各G基は、1、2、3、4、または5個のR6g基で必要に応じて置換されており;R10は、H、C~Cアルキル、ハロゲン、C~Cハロアルキル、または-CNであり;R1g、R2g、およびR4gは、各存在において、独立して、オキソ、C~Cアルキル、C~Cアルケニル、C~Cアルキニル、ハロゲン、C~Cハロアルキル、-CN、NO,G3a、-OR、-OC(O)R、-OC(O)NR、-SR、-S(O)、-S(O)NR、-C(O)R、-C(O)OR、-C(O)NR、-NR、-(RC(O)R、-N(R)S(O)、-N(R)C(O)O(R)、-N(R)C(O)NR、-N(R)S(O)NR、-(C~Cアルキレニル)-CN、-(C~Cアルキレニル)-G2a、-(C~Cアルキレニル)-OR、-(C~Cアルキレニル)-OC(O)R、-(C~Cアルキレニル)-OC(O)NR、-(C~Cアルキレニル)-S(O)、-(C~Cアルキレニル)-S(O)NR、-(C~Cアルキレニル)-C(O)R、-(C~Cアルキレニル)-C(O)OR、-(C~Cアルキレニル)-C(O)NR、-(C~Cアルキレニル)-NR、-(C~Cアルキレニル)-N(R)C(O)R、-(C~Cアルキレニル)-N(R)S(O)、-(C~Cアルキレニル)-N(RC(O)O(R)、-(C~Cアルキレニル)-N(R)C(O)NR、-(C~Cアルキレニル)-N(R)S(O)NR、または-(C~Cアルキレニル)-CNからなる群から選択され;R、R、R、およびRは、各存在において、それぞれ独立して、H、C~Cアルキル、C~Cアルケニル、C~Cアルキニル、C~Cハロアルキル、G2a、または-(C~Cアルキレニル)-G2aであり;Rは、各存在において、独立して、C~Cアルキル、C~Cアルケニル、C~Cアルキニル、C~Cハロアルキル、G3a、または-(C~Cアルキレニル)-G2aであり;G2aは、各存在において、それぞれ独立して、アリール、ヘテロアリール、複素環、シクロアルキル、またはシクロアルケニルであり;および各G2a基は、1、2、3、4、または5個のR3g基で必要に応じて置換されており;R3gは、各存在において、独立して、オキソ、C~Cアルキル、C~Cアルケニル、C~Cアルキニル、ハロゲン、C~Cハロアルキル、
-CN、NO、-ORx1、-OC(O)Rx2、-OC(O)NRx1x1、-SRx1、-S(O)x1、-S(O)NRx3x4、-C(O)Rx1、-C(O)ORx1、-C(O)NRx3x4、-NRx3x4、-N(Rx3)C(O)Rx2、-N(Rx1)S(O)x2、-N(Rx1)C(O)O(Rx2)、-N(Rx1)C(O)NRx3x4、-N(Rx3)S(O)NRx3x4、-(C~Cアルキレニル)-ORx1、-(C~Cアルキレニル)-OC(O)Rx2、-(C~Cアルキレニル)-OC(O)NRx3x4、-(C~Cアルキレニル)-S(O)x1、-(C~Cアルキレニル)-S(O)NRx3x4、-(C~Cアルキレニル)-C(O)Rx1、-(C~Cアルキレニル)-C(O)ORx1、-(C~Cアルキレニル)-C(O)NRx3x4、-(C~Cアルキレニル)-NRx3x4、-(C~Cアルキレニル)-N(Rx3)C(O)Rx2、-(C~Cアルキレニル)-N(Rx3)S(O)x2、-(C~Cアルキレニル)-N(Rx3)C(O)O(Rx2)、-(C~Cアルキレニル)-N(Rx3)C(O)NRx3x4、-(C~Cアルキレニル)-N(Rx3)S(O)NRx3x4、または-(C~Cアルキレニル)-CNであり;Rx1,Rx3、およびRx4は、各存在において、それぞれ独立して、H、C~Cアルキル、C~Cアルケニル、C~Cアルキニル、またはC~Cハロアルキルであり;およびRx2は、各存在において、独立して、C~Cアルキル、C~Cアルケニル、C~Cアルキニル、またはC~Cハロアルキルである。
特定の実施形態において、YはNまたはCHであり;RはCD、C~Cアルキル、またはC~Cハロアルキルであり;RはHまたはC~Cアルキルであり;YはNまたはCRであり;RはH、C~Cアルキル、C~Cアルケニル、C~Cアルキニル、ハロゲン、C~Cハロアルキル、-CN、-C(O)R3a、-C(O)OR3a、-C(O)NR3b3c、-S(O)R3d、-SO)3a、-S(O)NR3b3c、またはGであり;C~Cアルキル、C~Cアルケニル、およびC~Cアルキニルは、それぞれ独立して、非置換であるか、またはG、-CN、-C(O)R3a、-C(O)OR3a、-C(O)NR3b3c、-C(O)N(R3b)NR3b3c、-S(O)R3d、-S(O)3a、-S(O)NR3b3c、-OR3a、-OC(O)R3d、-NR3b3c、N(R3b)C(O)R3d、N(R3b)SO3d、N(R3b)C(O)OR3d、N(R3b)C(O)NR3b3c、N(R3b)SONR3b3c、およびN(R3b)C(NR3b3c)’NR3b3cからなる群から独立して選択される1もしくは2個の置換基で置換されており;YはC(O)、S(O)、またはCRであり;Rは、H、重水素、C~Cアルキル、ハロゲン、またはC~Cハロアルキルであり;Rは、H、重水素、C~Cアルキル、C~Cアルケニル、C~Cアルキニル、ハロゲン、C~Cハロアルキル、-C(O)R5a、-C(O)OR5a、-C(O)NR5b5c、-S(O)R5d、-S(O)5a、-S(O)NR5b5c、またはGであり;C~Cアルキル、C~Cアルケニル、およびC~Cアルキニルは、それぞれ独立して、非置換であるか、G、-C(O)R5a、-C(O)OR5a、-C(O)NR5b5c、-C(O)N(R5b)NR5b5c、-S(O)R5d、-S(O)5a、-S(O)NR5b5c、-OR5a、-OC(O)R5d、-NR5b5c、N(R5b)C(O)R5d、N(R5b)SO5d、N(R5b)C(O)OR5d、N(R5b)C(O)NR5b5c、N(R5b)SONR5b5c、およびN(R5b)C(NR5b5c)-NR5b5cからなる群から独立して選択される1もしくは2個の置換基で置換されており;R3a、R3b、R3c、R5a、およびR5bは、各存在において、それぞれ独立して、H、C~Cアルキル、C~Cアルケニル、C~Cアルキニル、C~Cハロアルキル、G、または-(C~Cアルキレニル)-Gであり;R5cは、各存在において、独立して、H、C~Cアルキル、C~Cアルケニル、C~Cアルキニル、C~Cハロアルキル、G、-(C~Cアルキレニル)-G、-(C~Cアルキレニル)-CN、-(C~Cアルキレニル)-OR、または-(C~Cアルキレニル)-C(O)ORであり;R3dは、各存在において、独立して、C~Cアルキル、C~Cアルケニル、C~Cアルキニル、C~Cハロアルキル、G、または-(C~Cアルキレニル)-Gであり;R5dは、各存在において、独立して、C~Cアルキル、C~Cアルケニル、C~Cアルキニル、C~Cハロアルキル、G、-(C~Cアルキレニル)-G、-(C~Cアルキレニル)-NR、または-(C~Cアルキレニル)-N(R)C(O)O(R)であり;Gは、各存在において、独立して、アリール、ヘテロアリール、複素環、シクロアルキル、またはシクロアルケニルであり;および各Gは、1、2、3、4、または5個のR1g基で必要に応じて置換され;
は、H、C~Cアルキル、C~Cアルケニル、C~Cアルキニル、ハロゲン、C~Cハロアルキル、-C(O)R6a、-C(O)OR6a、-C(O)NR6b6c、-S(O)6a、-S(O)NR6b6c、またはGであり;C~Cアルキル、C~Cアルケニル、およびC~Cアルキニルは、それぞれ独立して、非置換であるか、またはG、-C(O)R6a、-C(O)OR6a、-C(O)NR6b6c、-C(O)N(R6b)NR6b6c、-S(O)R6d、-S(O)6a、-S(O)NR6b6c、-OR6a、-OC(O)R6d、-NR6b6c、N(R6b)C(O)R6d、N(R6a)SO6d、N(R6b)C(O)OR6d、N(R6b)C(O)NR6b6c、N(R6b)SONR6b6c、およびN(R6b)C(NR6b6c)-NR6b6cから独立して選択される1もしくは2個の置換基で置換されており;R6a、R6b、およびR6cは、各存在において、それぞれ独立して、H、アルキル、C~Cアルケニル、C~Cアルキニル、ハロアルキル、G、-(C~Cアルキレニル)-G、-(C~Cアルキレニル)-OR、-(C~Cアルキレニル)-S(O)、-(C~Cアルキレニル)-S(O)NR、-(C~Cアルキレニル)-C(O)R、-(C~Cアルキレニル)-C(O)OR、-(C~Cアルキレニル)-C(O)NR、-(C~Cアルキレニル)-NR、-(C~Cアルキレニル)-N(R)C(O)R、-(C~Cアルキレニル)-N(RS(O)、-(C~Cアルキレニル)-N(R)C(O)O(R)、-(C~Cアルキレニル)-N(R)C(O)NR、または-(C~Cアルキレニル)-N(R)S(O)NRであり;R6dは、各存在において、独立して、アルキル、C~Cアルケニル、C~Cアルキニル、ハロアルキル、G、-(C~Cアルキレニル)-G、-(C~Cアルキレニル)-OR、-(C~Cアルキレニル)-S(O)、-(C~Cアルキレニル)-S(O)NR、-(C~Cアルキレニル)-C(O)R、-(C~Cアルキレニル)-C(O)OR、-(C~Cアルキレニル)-C(O)NR、-(C~Cアルキレニル)-NR、-(C~Cアルキレニル)-N(R)C(O)R、-(C~Cアルキレニル)-N(R)S(O)、-(C~Cアルキレニル)-N(R)C(O)O(R)、-(C~Cアルキレニル)-N(R)C(O)NR、または-(C~Cアルキレニル)-N(R)S(O)NRであり;Gは、各存在において、独立して、アリール、ヘテロアリール、複素環、シクロアルキル、またはシクロアルケニルであり;および各Gは、1、2、3、4、または5個のR2g基で必要に応じて置換されており;AはC(R)またはNであり;AはC(R)またはNであり;AはC(R)またはNであり;およびAはC(R10)またはNであり;0、1、または2個のA、A、A、およびAはNであり;R、R、およびRは、それぞれ独立して、H、C~Cアルキル、C~Cアルケニル、C~Cアルキニル、ハロゲン、C~Cハロアルキル、-CN、NO、-ORγ1、-OC(O)Rγ2、-OC(O)NRγ3γ4、-SRγ1、-S(O)γ1、-S(O)NRγ3γ4、-C(O)Rγ1、-C(O)ORγ1、-C(O)NRγ3γ4、-NRγγ4、-N(Rγ3)C(O)Rγ2、-N(Rγ3)S(O)γ2、-N(Rγ3)C(O)O(Rγ2)、-N(Rγ3)C(O)NRγ3γ4、-N(Rγ3)S(O)NRγ3γ4,G、-(C~Cアルキレニル)-CN、-(C~Cアルキレニル)-ORγ1、-(C~Cアルキレニル)-OC(O)Rγ2、-(C~Cアルキレニル)-OC(O)NRγ3γ4、-(C~Cアルキレニル)-S(O)γ1、-(C~Cアルキレニル)-S(O)NRγ3γ4、-(C~Cアルキレニル)-C(O)Rγ1、-(C~Cアルキレニル)-C(O)ORγ1、-(C~Cアルキレニル)-C(O)NRγ3γ4、-(C~Cアルキレニル)-NRγ3γ4、-(C~Cアルキレニル)-N(Rγ3)C(O)Rγ2、-(C~Cアルキレニル)-N(Rγ3)S(O)γ2、-(C~Cアルキレニル)-N(Rγ3)C(O)O(Rγ2)、-(C~Cアルキレニル)-N(Rγ3)C(O)NRγ3γ4、-(C~Cアルキレニル)-N(Rγ3)S(O)NRγ3γ4、-(C~Cアルキレニル)-CN、または-(C~Cアルキレニル)-Gであり;
γ1、Rγ3、およびRγ4は、各存在において、それぞれ独立して、H、C~Cアルキル、C~Cアルケニル、C~Cアルキニル、C~Cハロアルキル、G、-(C~Cアルキレニル)-G、-(C~Cアルキレニル)-OR、-(C~Cアルキレニル)-S(O)、-(C~Cアルキレニル)-S(O)NR、-(C~Cアルキレニル-C(O)R、-(C~Cアルキレニル)-C(O)OR、-(C~Cアルキレニル)-C(O)NR、-(C~Cアルキレニル)-NR、-(C~Cアルキレニル)-N(R)C(O)(R)、-(C~Cアルキレニル)-N(R)S(O)、-(C~Cアルキレニル)-N(R)C(O)O(R)、-(C~Cアルキレニル)-N(R)C(O)NR、または-(C~Cアルキレニル)-N(R)S(O)NRであり;Rγ2は、各存在において、独立して、C~Cアルキル、C~Cアルケニル、C~Cアルキニル、C~Cハロアルキル、G、-(C~Cアルキレニル)-G、-(C~Cアルキレニル)-OR、-(C~Cアルキレニル)-S(O)、-(C~Cアルキレニル)-S(O)NR、-(C~Cアルキレニル)-C(O)R、-(Cアルキレニル)-C(O)OR、-(C~Cアルキレニル)-C(O)NR、-(C~Cアルキレニル)-NR、-(C~Cアルキレニル)-N(R)C(O)R、-(C~Cアルキレニル)-N(R)S(O)、-(C~Cアルキレニル)-N(R)C(O)O(R)、-(C~Cアルキレニル)-N(R)S(O)、-(C~Cアルキレニル)-N(R)S(O)NRであり;Gは、各存在において、独立して、アリール、ヘテロアリール、シクロアルキル、シクロアルケニル、または複素環であり;および各G基は、1、2、3、4、または5個のR4g基で必要に応じて置換されており;R10は、H、C~Cアルキル、ハロゲン、C~Cハロアルキル、または-CNであり;R1g、R2g、およびR4gは、各存在において、独立して、オキソ、C~Cアルキル、C~Cアルケニル、C~Cアルキニル、ハロゲン、C~Cハロアルキル、-CN、NO,G2a、-OR、-OC(O)R、-OC(O)NR、-SR、-S(O)、-S(O)NR、-C(O)R、-C(O)OR、-C(O)NR、-NR、-N(R)C(O)R、-N(R)S(O)、-N(R)C(O)O(R)、-N(R)C(O)NR、-N(R)S(O)NR、-(C~Cアルキレニル)-CN、-(C~Cアルキレニル)-G2a、-(C~Cアルキレニル)-OR、-(C~Cアルキレニル)-OC(O)R、-(C~Cアルキレニル)-OC(O)NR、-(C~Cアルキレニル)-S(O)、-(C~Cアルキレニル)-S(O)NR、-(C~Cアルキレニル)-C(O)R、-(C~Cアルキレニル)-C(O)OR、-(C~Cアルキレニル)-C(O)NR、-(C~Cアルキレニル)-NR、-(C~Cアルキレニル)-N(R)C(O)R、-(C~Cアルキレニル)-N(R)S(O)、-(C~Cアルキレニル)-N(R)C(O)O(R)、-(C~Cアルキレニル)-N(R)C(O)NR、-(C~Cアルキレニル)-N(R)S(O)NR、または-(C~Cアルキレニル)-CNからなる群から選択され;R、R、R、およびRは、各存在において、それぞれ独立して、H、C~Cアルキル、C~Cアルケニル、C~Cアルキニル、C~Cハロアルキル、G2a、または-(C~Cアルキレニル)-G2aであり;Rは、各存在において、独立して、C~Cアルキル、C~Cアルケニル、C~Cアルキニル、C~Cハロアルキル、G2a、または-(C~Cアルキレニル)-G2aであり;G2aは、各存在において、それぞれ独立して、アリール、ヘテロアリール、複素環、シクロアルキル、またはシクロアルケニルであり;および各G2a基は、1、2、3、4、または5個のR3g基で必要に応じて置換されており;R3gは、各存在において、独立して、オキソ、C~Cアルキル、C~Cアルケニル、C~Cアルキニル、ハロゲン、C~Cハロアルキル、-CN、NO、-ORx1、-OC(O)Rx2、-OC(O)NRx3x4、-SRx1、-S(O)x1、-S(O)NRx3x4、-C(O)Rx1、-C(O)ORx1、-C(O)NRx3x4、-NRx3x4、-N(Rx3)C(O)Rx2、-N(Rx3)S(O)x2、-N(Rx3)C(O)O(Rx2)、-N(Rx3)C(O)NRx3x4、-N(Rx3)S(O)NRx3x4、-(C~Cアルキレニル)-ORx1、-(C~Cアルキレニル)-OC(O)Rx2、-(C~Cアルキレニル)-OC(O)NRx3x4、-(C~Cアルキレニル)-S(O)x1、-(C~Cアルキレニル)-S(O)NRx3x4、-(C~Cアルキレニル)-C(O)Rx1、-(C~Cアルキレニル)-C(O)ORx1、-(C~Cアルキレニル)-C(O)NRx3x4、-(C~Cアルキレニル)-NRx3x4、-(C~Cアルキレニル)-n(Rx3)C(O)Rx2、-(C~Cアルキレニル)-N(Rx3)S(O)x2、-(C~Cアルキレニル)-N(Rx3)C(O)O(Rx2)、-(C~Cアルキレニル)-N(Rx3)C(O)NRx3x4、-(C~Cアルキレニル)-N(Rx3)S(O)NRx3x4、または-(C~Cアルキレニル)-CNであり;Rx1,Rx3、およびRx4は、各存在において、それぞれ独立して、H、C~Cアルキル、C~Cアルケニル、C~Cアルキニル、またはC~Cハロアルキルであり;およびRx2は、各存在において、独立して、C~Cアルキル、C~Cアルケニル、C~Cアルキニル、またはC~Cハロアルキルである。
特定の実施形態において、BRD4阻害剤は、以下の構造を有する。
Figure 2022505450000139
複数の実施形態において、BRD4結合断片は、アミド結合を介してL2に共有結合している。実施形態において、BRD4結合断片は、L2中のアミン基および上記構造中の-COOHから形成されたアミド結合を介してL2に共有結合している。したがって、特定の実施形態において、BRD4結合断片をL2に連結するために、AはC(R)であり、Rは-C(O)ORγ1であり、Rγ1は水素である。
実施形態において、BRD4結合断片をL2に結合させるために、以下の構造において、AはC(R)であり、Rは-C(O)NRγ3γ4であり、Rγ3およびRγ4は、それぞれ独立して、水素およびC~Cアルキルからなる群から独立して選択される。
Figure 2022505450000140
2.JQ1阻害剤
諸実施形態において、CIDEがJQ1ブロモドメイン阻害剤の残基(例えば、その全体が本明細書中で参考として援用される米国特許第8,981,083号に記載の阻害剤)を含有するものである。阻害剤は、下記一般式Iを有する:
Figure 2022505450000141
式中、
XはNまたはCRであり;
は、H、アルキル、シクロアルキル、ヘテロシクロアルキル、アリールまたはヘテロアリールであり、これらはそれぞれ、必要に応じて置換されており;
は、H、アルキル、ヒドロキシルアルキル、アミノアルキル、アルコキシアルキル、ハロアルキル、ヒドロキシ、アルコキシ、または-COO-Rであり、これらはそれぞれ、必要に応じて置換されており;
環Aはアリールまたはヘテロアリールであり;
各Rは、独立して、アルキル、シクロアルキル、ヘテロシクロアルキル、アリールまたはヘテロアリールであり、これらはそれぞれ、必要に応じて置換されるか;または任意の2つのRが、それぞれが結合している原子と一緒に、縮合アリール基またはヘテロアリール基を形成することができ;
Rは、アルキル、シクロアルキル、ヘテロシクロアルキル、アリールまたはヘテロアリールであり、これらはそれぞれ、必要に応じて置換されており;
は、-(CH-Lであり、nは0~3であり、LはH、-COO-R、-CO-R、-CO-N(R)、-S(O)-R、-S(O)-N(R)、N(R)、N(R)C(O)R、必要に応じて置換されたアリール、または必要に応じて置換されたヘテロアリールであり;
は、H、D(重水素)、ハロゲン、または必要に応じて置換されたアルキルであり;
は、以下からなる群から独立して選択され;
(i)H、アリール、置換アリール、ヘテロアリールまたは置換ヘテロアリール;
(ii)ヘテロシクロアルキルまたは置換ヘテロシクロアルキル;
(iii)-C~Cアルキル、-C~Cアルケニルまたは-C~Cアルキニル(それぞれ、O、SまたはNから選択される0、1、2、または3個のヘテロ原子を含有する);-C~C12シクロアルキル、置換-C~C12シクロアルキル、-C~C12シクロアルケニル、または置換-C~C12シクロアルケニル(これらはそれぞれ、必要に応じて置換され得る);および
(iv)NH、N-CR
各Rは、独立して、H、アルキル、アルキル、シクロアルキル、ヘテロシクロアルキル、アリールまたはヘテロアリールであり、これらの各々は必要に応じて置換される;または、RおよびRは、それらが結合している窒素原子と一緒に、4~10員環を形成し;
は、アルキル、アルケニル、シクロアルキル、シクロアルケニル、ヘテロシクロアルキル、アリールまたはヘテロアリールであり、これらのそれぞれは必要に応じて置換されており;または、RおよびRは、それらが結合している炭素原子と一緒に、4~10員環を形成し;
mは、0、1、2、または3であり;
但し、
(a)環Aがチエニルであり、XがNであり、Rがフェニルまたは置換フェニルであり、RがHであり、Rがメチルであり、Rが-(CH-L(式中、nは1であり、Lは-CO-N(R)である)である場合、RおよびRは、それらが結合している窒素原子と一緒に、モルホリノ環を形成しない;
(b)環Aがチエニルであり、XがNであり、Rが置換フェニルであり、RがHであり、Rがメチルであり、Rが-(CH-Lであり、式中、nは1であり、Lは-CO-N(R)であり、RおよびRの一方がHである場合、RおよびRの他方はメチル、ヒドロキシエチル、アルコキシ、フェニル、置換フェニル、ピリジルもしくは置換ピリジルではない;ならびに
(c)環Aがチエニルであり、XがNであり、Rが置換フェニルであり、RがHであり、Rがメチルであり、Rが-(CH-Lであり、nが1であり、Lが-COO-Rである場合、Rはメチルまたはエチルではない、
またはその塩、溶媒和物もしくは水和物。
特定の実施形態において、Rは、アリールまたはヘテロアリールであり、その各々は、必要に応じて置換される。
特定の実施形態において、Lは、H、-COO-R、-CO-N(R)、-S(O)-R、-S(O)-N(R)、N(R)、N(R)C(O)Rまたは必要に応じて置換されたアリールである。特定の実施形態において、Rは、以下からなる群から選択される:H、O、S、もしくはNから選択される0、1、2、もしくは3個のヘテロ原子で必要に応じて置換された-C~Cアルキル;またはNH、N-CR
特定の実施形態において、Rは、H、D、ハロゲン、またはメチルである。
特定の実施形態において、Rは、アルキル、ヒドロキシアルキル、ハロアルキルまたはアルコキシであり;これらの各々は。必要に応じて置換される。
特定の実施形態において、Rは、メチル、エチル、ヒドロキシメチル、メトキシメチル、トリフルオロメチル、COOH、COOMe、COOEtまたはCOOCHOC(O)CHである。
特定の実施形態において、環Aは、5または6員のアリールまたはヘテロアリールである。特定の実施形態において、環Aは、チオフラニル、フェニル、ナフチル、ビフェニル、テトラヒドロナフチル、インダニル、ピリジル、フラニル、インドリル、ピリミジニル、ピリジジニル、ピラジニル、イミダゾリル、オキサゾリル、チエニル、チアゾリル、トリアゾリル、イソオキサゾリル、キノリニル、ピロリル、ピラゾリルまたは5,6,7,8-テトラヒドロイソキノリニルである。
特定の実施形態において、環Aは、フェニルまたはチエニルである。
特定の実施形態において、mは、1または2であり、Rの少なくとも1つの存在は、メチルである。
特定の実施形態において、各Rは、独立して、H、必要に応じて置換されたアルキルであるか、または任意の2つのRは、それぞれが結合している原子と一緒に、アリールを形成することができる。
いくつかのさらなる実施形態において、JQ1阻害剤は、式IIの化合物である:
Figure 2022505450000142
式中、
XはNまたはCRであり;
は、H、アルキル、シクロアルキル、ヘテロシクロアルキル、アリールまたはヘテロアリールであり、これらはそれぞれ、必要に応じて置換される;
は、H、アルキル、ヒドロキシルアルキル、アミノアルキル、アルコキシアルキル、ハロアルキル、ヒドロキシ、アルコキシ、または-COO-Rであり、これらはそれぞれ、必要に応じて置換されており;
各Rは、独立して、アルキル、シクロアルキル、ヘテロシクロアルキル、アリールまたはヘテロアリールであり、これらはそれぞれ、必要に応じて置換されるか;または任意の2つのRが、それぞれが結合している原子と一緒に、縮合アリール基またはヘテロアリール基を形成することができ;
Rは、H、アルキル、シクロアルキル、ヘテロシクロアルキル、アリールまたはヘテロアリールでる;これらの各々は、必要に応じて置換されており;
R’は、H、-COO-R、-CO-R、必要に応じて置換されたアリール、または必要に応じて置換されたヘテロアリールであり;
は、以下からなる群から独立して選択され;
(i)H、アリール、置換アリール、ヘテロアリール、置換ヘテロアリール;
(ii)ヘテロシクロアルキルまたは置換ヘテロシクロアルキル;
(iii)-C~Cアルキル、-C~Cアルケニルまたは-C~Cアルキニル(それぞれ、O、SまたはNから選択される0、1、2、または3個のヘテロ原子を含有する);-C~C12シクロアルキル、置換-C~C12シクロアルキル;-C~C12シクロアルケニル、または置換-C~C12シクロアルケニル(これらの各々は、必要に応じて置換され得る);
mは、0、1、2、または3であり、
但し、R’が-COO-Rであり、XがNであり、Rが置換フェニルであり、Rがメチルである場合、Rはメチルまたはエチルではない、
またはその塩、溶媒和物もしくは水和物。
特定の実施形態において、Rは、アリールまたはヘテロアリールであり、その各々は、必要に応じて置換される。特定の実施形態において、Rは、フェニルまたはピリジルであり、その各々は、必要に応じて置換される。特定の実施形態において、Rは、p-Cl-フェニル、O-Cl-フェニル、m-Cl-フェニル、p-F-フェニル、O-F-フェニル、m-F-フェニルまたはピリジニルである。
特定の実施形態において、R’は、-COO-R、必要に応じて置換されたアリール、または必要に応じて置換されたヘテロアリールであり;およびRは-C~Cアルキルであり、O、SまたはNから選択される0、1、2または3個のヘテロ原子を含み、必要に応じて置換される。特定の実施形態において、R’は、-COO-Rであり、Rは、メチル、エチル、プロピル、i-プロピル、ブチル、sec-ブチルまたはt-ブチルであり;またはR’はHまたは必要に応じて置換されたフェニルである。
特定の実施形態において、Rは、メチル、エチル、ヒドロキシメチル、メトキシメチル、トリフルオロメチル、COOH、COOMe、COOEt、COOCHOC(O)CHである。
特定の実施形態において、Rは、メチル、エチル、ヒドロキシメチル、メトキシメチル、トリフルオロメチル、COOH、COOMe、COOEtまたはCOOCHOC(O)CHである。
特定の実施形態において、各Rは、独立して、必要に応じて置換されたアルキルであるか、または任意の2つのRは、それぞれが結合している原子と一緒に、縮合アリールを形成することができる。
特定の実施形態において、各Rはメチルである。
さらなる実施形態において、JQ1阻害剤は、式IVの化合物である:
Figure 2022505450000143
式中、
XはNまたはCRであり;
は、H、アルキル、シクロアルキル、ヘテロシクロアルキル、アリールまたはヘテロアリールであり、これらはそれぞれ、必要に応じて置換されており;
は、H、アルキル、ヒドロキシルアルキル、アミノアルキル、アルコキシアルキル、ハロアルキル、ヒドロキシ、アルコキシ、または-COO-Rであり、これらはそれぞれ、必要に応じて置換されており;
環Aはアリールまたはヘテロアリールであり;
各Rは、独立して、アルキル、シクロアルキル、ヘテロシクロアルキル、アリールまたはヘテロアリールであり、これらはそれぞれ、必要に応じて置換されるか;または任意の2つのRが、それぞれが結合している原子と一緒に、縮合アリール基またはヘテロアリール基を形成することができ;
は、-(CH-Lであり、nは0~3であり、LはH、-COO-R、-CO-R、-CO-N(R)、-S(O)-R、-S(O)-N(R)、N(R)、N(R)C(O)R、必要に応じて置換されたアリール、または必要に応じて置換されたヘテロアリールであり;
は、H、D、ハロゲン、または必要に応じて置換されたアルキルであり;
は、以下からなる群から独立して選択され;
(i)H、アリール、置換アリール、ヘテロアリールまたは置換ヘテロアリール;
(ii)ヘテロシクロアルキルまたは置換ヘテロシクロアルキル;
(iii)-C~Cアルキル、-C~Cアルケニルまたは-C~Cアルキニル(それぞれ、O、SまたはNから選択される0、1、2、または3個のヘテロ原子を含有する);-C~C12シクロアルキル、置換-C~C12シクロアルキル、-C~C12シクロアルケニル、または置換-C~C12シクロアルケニル(これらはそれぞれ、必要に応じて置換され得る);および
(iv)NH、N-CR
各Rは、独立して、H、アルキル、アルキル、シクロアルキル、ヘテロシクロアルキル、アリールまたはヘテロアリールであり、これらの各々は、必要に応じて置換されており;
または、RおよびRが、それらが結合している原子と一緒に、4~10員環を形成し;
は、アルキル、アルケニル、シクロアルキル、シクロアルケニル、ヘテロシクロアルキル、アリールまたはヘテロアリールであり、これらのそれぞれは必要に応じて置換されており;または、RおよびRは、それらが結合している炭素原子と一緒に、4~10員環を形成し;
mは、0、1、2、または3であり、
但し、
(a)環Aがチエニルであり、XがNであり、RがHであり、Rがメチルであり、Rが-(CH-L(式中、nは0であり、Lは-CO-N(R)である)である場合、RおよびRは、それらが結合している窒素原子と一緒に、モルホリノ環を形成しない;
(b)環Aがチエニルであり、XがNであり、RがHであり、Rがメチルであり、Rが-(CH-Lであり、式中、nは0であり、Lは-CO-N(R)であり、RおよびRの一方がHである場合、RおよびRの他方はメチル、ヒドロキシエチル、アルコキシ、フェニル、置換フェニル、ピリジルもしくは置換ピリジルではない;ならびに
(c)環Aがチエニルであり、XがNであり、RがHであり、Rがメチルであり、Rが-(CH-Lであり、nが0であり、Lが-COO-Rである場合、Rはメチルもしくはエチルではない、
またはその塩、溶媒和物または水和物。
特定の実施形態において、JQ1阻害剤は、R’が-COO-Rであり、RがHである上記の化合物である。特定の実施形態において、JQ1阻害剤は、以下の構造を有する:
Figure 2022505450000144
特定の実施形態において、JQ1結合断片は、L2中のアミン基および上記構造中の-COOHから形成されたアミド結合を介してL2に共有結合している。
L1がJQ1結合断片に共有結合している場合、結合点としては、以下の構造に*として示されているものが挙げられ、特定の実施形態は*’として示されている:
Figure 2022505450000145
ii.ERα
いくつかの実施形態において、CIDE部分は、抗エストロゲン化合物の残基、例えば、タモキシフェン代謝産物、4-ヒドロキシタモキシフェン(E異性体とZ異性体の混合物、または単離されたE異性体もしくはZ異性体)およびエンドキシフェン(E異性体とZ異性体の混合物または単離されたE異性体もしくはZ異性体)の残基、例えば、下記式を有する化合物などを含む:
Figure 2022505450000146
式中、Rαは、水素またはメチルであり、R’は、水素、C~Cアルキル、ベンジル、フェニルまたは-(PO)である。
いくつかの実施形態において、CIDE部分は、エンドキシフェン(E異性体とZ異性体との混合物または単離されたE異性体もしくはZ異性体)の残基を含む;
Figure 2022505450000147
c.リンカーL2
本明細書に記載のCIDEのE3LBおよびPB基は、リンカー(L2、リンカーL2、リンカー-2)と連結することができる。特定の実施形態において、リンカーL2は、-NH、-NH、-NHRα、-NHCOOHまたはリンカーL2とアミド結合を形成することができるE3LB部分上の他の部分から形成されるアミド結合を介して、E3LB部分に共有結合される。
特定の実施形態において、リンカー基L2は、Aの1つまたは複数の共有結合した構造単位(例えば、-A)を含む基である。..A-)、式中、Aは、E3LB、PB、またはそれらの組み合わせの少なくとも1つに結合した基である。特定の実施形態において、Aは、E3LB、PB、またはそれらの組み合わせを別のE3LB、PB、またはそれらの組み合わせに直接連結する。他の実施形態において、Aは、EL3B、PB、またはそれらの組み合わせを、Aを介して別のE3LB、PB、またはそれらの組み合わせに間接的に連結する。
特定の実施形態において、A~Aは、それぞれ独立して、結合、CRLaLb、O、S、SO、SO、NRLc、SONRLc、SONRLc、CONRLc、NRLcCONRLd、NRLcSONRLd、CO、CRLa-CRLb、C≡C、SiRLaLb、P(O)RLa、P(O)ORLa、NRLcC(-NCN)NRLd、NRLcC(-NCN)、NRLcC(-CNO)NRLd、0~6RLaおよび/またはRLb基で必要に応じて置換されたC3~11シクロアルキル、0~6RLaおよび/またはRLb基で必要に応じて置換されたC3~11複素環、0~6RLaおよびまたはRLb基で必要に応じて置換されたアリール、0~6RLaおよび/またはRLb基で必要に応じて置換されたヘテロアリール、RLaまたはRLbは、それぞれ独立して、他のA基に連結されてシクロアルキルおよび/または複素環部分を形成することができ、これらは、0~4RLe基でさらに置換され得る;RLa、RLb、RLc、RLdおよびRLeは、それぞれ独立して、H、ハロ、C1-8アルキル、OC1-8アルキル、SC1-8アルキル、NHC1-8アルキル、N(C1-8アルキル)、C3-11シクロアルキル、アリール、ヘテロアリール、C3-11複素環,OC1-8シクロアルキル、SC1-8シクロアルキル、NHC1-8シクロアルキル、N(C1-8シクロアルキル)、N(C1-8シクロアルキル)(C1-8アルキル)、OH、NH、SH、SO1-8アルキル、P(O)(OC1-8アルキル)(C1-8アルキル)、P(O)(OC1-8アルキル)、CC-C1-8アルキル、CCH、CH-CH(C1-8アルキル)、C(C1-8アルキル)-CH(C1-8アルキル)、C(C1-8アルキル)-C(C1-8アルキル)、Si(OH)、Si(C1-8アルキル)、Si(OH)(C1-8アルキル)、COC1-8アルキル、COH、ハロゲン、CN、CF、CHF、CHF、NO、SF、SONHC1-8アルキル、SON(C1-8アルキル)、SONHC1-8アルキル、SON(C1-8アルキル)、CONHC1-8アルキル、CON(C1-8アルキル)、N(C1-8アルキル)CONH(C1-8アルキル)、N(C1-8アルキル)CON(C1-8アルキル)、NHCONH(C1-8アルキル)、NHCON(C1-8アルキル)、NHCONH、N(C1-8アルキル)SONH(C1-8アルキル)、N(C1-8アルキル)SON(C1-8アルキル)、NHSONH(C1-8アルキル)、NHSON(C1-8アルキル)、NHSONHである。
特定の実施形態において、qは0以上の整数である。特定の実施形態において、qは1以上の整数である。
特定の実施形態において、例えば、qが2より大きい場合、AはE3LB部分に結合している基であり、AおよびAはAの構造単位(A:q-2の構造単位の数)を介して結合している。
特定の実施形態において、例えば、qが2である場合、Aは、AおよびE3LB部分に結合している基である。
特定の実施形態において、例えば、qが1である場合、リンカー基L2の構造は-A-であり、AはE3LB部分およびPB部分に結合している基である。
さらなる実施形態において、qは、1~100、1~90、1~80、1~70、1~60、1~50、1~40、1~30、1~20、または1~10の整数である。
特定の実施形態において、(L2)は以下からなる群から選択される:
Figure 2022505450000148
Figure 2022505450000149
Figure 2022505450000150
さらなる実施形態において、リンカー基は、1~約100個のエチレングリコール単位、約1~約50個のエチレングリコール単位、1~約25個のエチレングリコール単位、約1~10個のエチレングリコール単位、1~約8個のエチレングリコール単位および1~6個のエチレングリコール単位、2~4個のエチレングリコール単位、または必要に応じて置換されたO、N、S、PもしくはSi原子と相互分散した必要に応じて置換されたアルキル基を有する必要に応じて置換された(ポリ)エチレングリコールである。特定の実施形態において、リンカーは、アリール、フェニル、ベンジル、アルキル、アルキレンまたは複素環基で置換される。特定の実施形態において、リンカーは非対称または対称であり得る。
本明細書に記載される化合物の実施形態のいずれにおいても、リンカー基は、本明細書に記載される任意の適切な部分であり得る。一実施形態において、リンカーは、約1~約12個のエチレングリコール単位、1~約10個のエチレングリコール単位、約2~約6個のエチレングリコール単位、約2~5個のエチレングリコール単位、約2~4個のエチレングリコール単位のサイズ範囲の置換または非置換ポリエチレングリコール基である。
しかし、E3LB基およびPB基は、リンカーの化学的性質に対して適切かつ安定な任意の基を介してリンカー基に共有結合していてもよい。リンカーは、好ましくはアミド、エステル、チオエステル、ケト基、カルバメート(ウレタン)、炭素またはエーテルを介してE3LB基およびPB基に独立して共有結合しており、これらの基の各々は、E3LB基およびPB基上のどこにでも挿入されて、ユビキチンリガーゼ上のE3LB基および分解される標的タンパク質上のPB基の最大結合を提供し得る。PB基がE3LB基である特定の態様では、分解の標的タンパク質はユビキチンリガーゼ自体であり得る。特定の態様では、リンカーは、E3LBおよび/またはPB基上の必要に応じて置換されたアルキル、アルキレン、アルケンまたはアルキン基、アリール基または複素環基に連結されていてもよい。E3LB基またはPB基は、リンカー上の化学官能基と反応性の化学官能基を作るために誘導体化する必要があり得ることに留意されたい。あるいは、リンカーは、E3LBおよび/またはPBに見られる官能基と反応することができる化学官能基を含むように誘導体化される必要があり得る。
L2を以下の式によって表すこともできる:
Figure 2022505450000151
式中、Zは、E3LBをXに連結する基である。Xは、ZをPB基に連結する基である。
実施形態において、Zは、存在しない(結合)。-(CH)I-O、-(CH)i-S、-(CH)i-N-R,a(CH-X基であり、Xはアミド基、もしくはウレタン基、エステルもしくはチオエステル基、または
Figure 2022505450000152
を形成し、
式中、各RはH、またはC~Cアルキル、アルカノール基もしくは複素環(当該リンカー基の水溶性を促進するために、水溶性複素環、好ましくはモルホリノ、ピペリジンまたはピペラジン基を含む)であり;各Yは独立して、結合、O、SまたはN-Rであり、各iは、独立して、0~100、1~75、1~60、1~55、1~50、1~45、1~40、2~35、3~30、1~15、1~10、1~8、1~6、1、2、3、4または5である。
実施形態において、Xは以下のとおりである:
Figure 2022505450000153
式中、各Vは独立して結合(存在しない)であり、
Figure 2022505450000154
jは、1~100、1~75、1~60、1~55、1~50、1~45、1~40、2~35、3~30、1~15、1~10、1~8、1~6、1、2、3、4、5であり;
kは、1~100、1~75、1~60、1~55、1~50、1~45、1~40、2~35、3~30、1~15、1~10、1~8、1~6、1、2、3、4、5であり、好ましくは1、2、3、4、または5であり;
m’は、1~100、1~75、1~60、1~55、1~50、1~45、1~40、2~35、3~30、1~15、1~10、1~8、1~6、1、2、3、4、5であり;
nは、1~100、1~75、1~60、1~55、1~50、1~45、1~40、2~35、3~30、1~15、1~10、1~8、1~6、1、2、3、4、5であり;
はO、SまたはN-Rであり、好ましくはOであり;
Yは上記のと同じであり;
CONは、リンカー基中に存在する場合、ZをXに接続するコネクター基(結合であってもよい)である。
複数の実施形態において、CONは、結合(存在しない)、ピペラジニルもしくは他の基または以下の基などの水溶性複素環を含む複素環である:
Figure 2022505450000155
式中、XはO、S、NR、S(O)、S(O)、-S(O)O、-OS(O)、またはOS(O)Oであり;
はO、S、CHR、NRであり;および
Rは、H、または1つもしくは2つのヒドロキシル基で必要に応じて置換されたC~Cアルキル基、またはその薬学的に許容可能な塩、エナンチオマーもしくは立体異性体である。
代替的な好ましい態様において、リンカー基は、1~約100個のエチレングリコール単位、約1~約50個のエチレングリコール単位、1~約25個のエチレングリコール単位、約1~10個のエチレングリコール単位、1~約8個のエチレングリコール単位および1~6個のエチレングリコール単位、2~4個のエチレングリコール単位を有する(ポリ)エチレングリコールである。
実施形態において、CONは、
Figure 2022505450000156
またはアミド基を含む。
E3LB基およびPB基は、リンカーの化学的性質に対して適切かつ安定である任意の基を介してリンカー基に共有結合していてもよいが、好ましい態様では、リンカーは、アミド、エステル、チオエステル、ケト基、カルバメート(ウレタン)またはエーテルを介してE3LB基およびPB基に独立して共有結合しており、これらの基の各々は、E3LB基およびPB基のどこかに挿入されて、E3LB基がユビキチンリガーゼに、PB基が標的タンパク質に結合し、PB基が分解されることを可能にし得る。換言すれば、本明細書に示されるように、リンカーは、その存在がE3LBおよびPBのそれぞれの結合パートナーへの結合に及ぼし得るあらゆる影響を最小化、排除、または中和するように設計され、E3LBおよびPBに接続され得る。特定の態様では、分解のための標的タンパク質はユビキチンリガーゼであり得る。
さらなるリンカーL2は、米国特許出願公開第2016/0058872号;2016/0045607;2014/0356322;および2015/0291562、ならびに国際公開第2014/063061号に開示されている。
ここでAb-CIDEを参照すると、Ab-CIDEは単一の抗体を含むことができ、単一の抗体は1つを超えるCIDEを有することができ、各CIDEはリンカーL1を介して抗体に共有結合している。「CIDE負荷」は、抗体あたりのCIDE部分の平均数である。CIDE負荷は、抗体(Ab)あたり1~8個のCIDE(D)の範囲であり得る。すなわち、Ab-(L1-D)のAb-CIDEの式において、pは、約1~約50、約1~約8、約1~約5、約1~約4、または約1~約3の値を有する。リンカーL1を介して抗体に共有結合した各CIDEは、同じまたは異なるCIDEであり得て、抗体に共有結合した任意の他のL1と同じタイプまたは異なるタイプのリンカーを有し得る。一実施形態において、Abはシステイン操作抗体であり、pは約2である。
コンジュゲーション反応からのAb-CIDEの調製物中の抗体あたりのCIDEの平均数は、質量分析、ELISAアッセイ、電気泳動およびHPLCなどの従来の手段によって特性評価され得る。pに関するAb-CIDEの定量的分布も決定され得る。ELISAにより、Ab-CIDEの特定の調製物中のpの平均値を決定することができる(Hamblettら(2004年)「Clin.Cancer Res.」10:7063-7070頁;Sandersonら(2005年)「Clin.Cancer Res.」11:843-852頁)。しかしながら、pの値の分布は、抗体-抗原結合およびELISAの検出限界によって識別できない。また、Ab-CIDEの検出のためのELISAアッセイは、CIDE部分が抗体のどこに結合しているか(重鎖もしくは軽鎖断片、または特定のアミノ酸残基など)を決定しない。いくつかの例では、pが他のCIDE負荷を有するAb-CIDEからの特定の値である均一なAb-CIDEの分離、精製および特徴付けは、逆相HPLCまたは電気泳動などの手段によって達成され得る。
いくつかのAb-CIDEの場合、pは抗体上の結合部位の数によって制限され得る。例えば、抗体は、1個のみもしくはいくつかのシステインチオール基を有し得るか、または、1個のみもしくはいくつかの十分に反応性のチオール基を有し得、それによって、リンカーが結合され得る。L1-Dを接続するためのAb上の別の反応部位は、リジン残基のアミン官能基である。pの値は、約1~約50、約1~約8、約1~約5、約1~約4、約1~約3の値を含み、pは2に等しい。いくつかの実施形態において、本明細書に記載の主題は、pが約1、2、3、4、5、6、7、または8である任意のAb-CIDEに関する。
一般に、コンジュゲーション反応中に抗体にコンジュゲート化されるCIDE部分は理論上の最大値よりも少ない。抗体は、例えば、リンカーL1-CIDE基(L1-D)またはリンカー試薬と反応しない多くのリジン残基を含み得る。最も反応性の高いリジン基のみがアミン反応性リンカー試薬と反応し得る。また、最も反応性のシステインチオール基のみが、チオール反応性リンカー試薬またはリンカーL1-CIDE基と反応してもよい。一般に、抗体は、存在するとしても、CIDE部分に連結され得る多くの遊離および反応性システインチオール基を含有しない。化合物の抗体中のほとんどのシステインチオール残基はジスルフィド架橋として存在し、部分的または完全な還元条件下で、ジチオスレイトール(DTT)またはTCEPなどの還元剤で還元されなければならない。しかしながら、CARのCIDE負荷(CIDE/抗体比、「CAR」)は、以下を含むいくつかの異なる方法で制御され得る:(i)抗体と比較してモル過剰のL1-CIDE基またはリンカー試薬を限定すること、(ii)複合反応時間または温度を限定すること、および(iii)システインチオール修飾のための部分または限定的還元条件によって制御されてもよい。
I.L1-CIDE化合物
本明細書に記載のCIDEは、リンカーL1に共有結合してL1-CIDE基を調製することができる。これらの化合物は、以下の一般式を有する:
(L1-D)
式中、Dは構造E3LB-L2-PBを有するCIDEであり;E3LBは、L2に共有結合したE3リガーゼ結合基であり;L2は、E3LBおよびPBに共有結合したリンカーであり;PBは、L2に共有結合したタンパク質結合基であり;L1はリンカーであり、Dに共有結合されている。これらの各成分の有用な基は上記のとおりである。
特定の実施形態において、L1は、ペプチド模倣リンカーを含む、本明細書の他の箇所に記載されるとおりである。これらの実施形態において、L1-CIDEは下記式を有する:
Figure 2022505450000157
式中、
Strはストレッチャー単位であり;
Spは、結合またはD、すなわちCIDE部分に共有結合したスペーサー単位であり;
は、C~C10アルキル、(C~C10アルキル)NHC(NH)NH、または(C~C10アルキル)NHC(O)NHであり;
およびRは、それぞれ独立して、C~C10アルキル、アリールアルキル、ヘテロアリールアルキル、(C~C10アルキル)OCH-であるか、またはRおよびRはC~Cシクロアルキル環を形成してもよく;
DはCIDE部分である。
L1-CIDE化合物を下記式で表すことができる:
Figure 2022505450000158
式中、は、C~C10アルキレン;RおよびRは、一緒に、C~Cシクロアルキル環を形成し、DはCIDEである。
L1-CIDE化合物を下記式で表すことができる:
Figure 2022505450000159
式中、R、RおよびRは本明細書の他の箇所に記載されるとおりであり、DはCIDE部分である。
L1-CIDE化合物を下記式で表すことができる:
Figure 2022505450000160
式中、
Strはストレッチャー単位であり;
Spは、D、すなわちCIDE部分に共有結合した任意のスペーサー単位であり;
Yは、ヘテロアリール、アリール、-C(O)C~Cアルキレン、C~Cアルキレン-NH、C~Cアルキレン-NH-CH、C~Cアルキレン-N-(CH、C~Cアルケニル、またはC~Cアルキレニルであり;
は、C~C10アルキル、(C~C10アルキル)NHC(NH)NH、または(C~C10アルキル)NHC(O)NHであり;
およびRは、それぞれ独立して、H、C~C10アルキル、アリールアルキル、または、ヘテロアリールアルキルであるか、または、RおよびRは、一緒に、C~Cシクロアルキルを形成してもよく;および
DはCIDE部分である。
L1-CIDE化合物を下記式で表すことができる:
Figure 2022505450000161
式中、Rは、C~C10アルキレンであり、R、RおよびRは本明細書の他の箇所に記載されるとおりであり、DはCIDE部分である。
L1-CIDE化合物を下記式で表すことができる:
Figure 2022505450000162
式中、R、RおよびRは本明細書の他の箇所に記載されるとおりであり、DはCIDE部分である。
上記のL1-CIDE化合物のいずれにおいても、Strは下記式を有することができる:
Figure 2022505450000163
式中、Rは、C~C10アルキレン、C~Cシクロアルキル、O-(C~Cアルキレン)、およびC~C10アルキレン-C(O)N(R)-C~Cアルキレンからなる群から選択され、各アルキレンは、ハロ、トリフルオロメチル、トリフルオロメチル、ジフルオロメチル、アミノ、アルキルアミノ、シアノ、スルホニル、スルホンアミド、スルホキシド、ヒドロキシ、アルコキシ、エステル、カルボン酸、アルキルチオ、C~Cシクロアルキル、C~Cヘテロシクロアルキルアリール、アリールアルキル、ヘテロアリールアルキルおよびヘテロアリールからなる群から選択される1~5個の置換基で置換されていてもよい;各Rは、独立して、HまたはC~Cアルキルであり;Spは、-Ar-R-であり、Arはアリールまたはヘテロアリールであり、Rは(C~C10アルキレン)O-である。
特定のL1-CIDE化合物において、Rは、C~C10アルキレンであり、Spは-Ar-R-であり、Arはアリール Rは(C~Cアルキレン)O-であり;またはRは-(CH)であり、は1~10である。
上記のL1-CIDE化合物のいずれにおいても、Strは下記式を有することができる:
Figure 2022505450000164
式中、
Figure 2022505450000165
は、抗体に結合することができる部分を示し、Rは、C~C10アルキレン、C~C10アルキレン-O、N(R)-(C~Cアルキレン)-N(R)およびN(R)-(C~Cアルキレン)から選択される;各Rは、独立して、HまたはC~Cアルキルであり;
Spは、-Ar-R-であり、Arはアリールもしくはヘテロアリールであり、Rは、(C~C10アルキレン)O-であり;またはRは、C~C10アルキレンであり、Spは-Ar-R-であり、Arはアリール、Rは(C~Cアルキレン)O-である。
L1-CIDEは、下記式を有することができ、式中、各例において、DはCIDE部分である:
Figure 2022505450000166
および
Figure 2022505450000167
ここでCIDEのPB群を参照すると、特定の実施形態において、PBは本明細書の他の箇所に記載されているとおりであり、エストロゲン受容体アルファ(ERα)およびBRD4からなる群から選択される。ここでCIDEのE3LB基を参照すると、E3LBは本明細書の他の箇所に記載されているとおりであり、VHLおよびXIAPからなる群から選択される。Ab-CIDEは、PB、E3LB、Ab、L1およびL2の任意の組み合わせを含むことができ、但し、EL3BがXIAPに結合するリガーゼ結合基である場合、PBはERαを標的とする基以外である。
本明細書に開示される主題を考慮して、当業者は、L1およびL2の結合点が変化し得ることを理解するであろう。さらに、-Str-(PM)-Sp-などのリンカーの部分を交換することができる。さらに、リンカーL1の一部を交換することができる。CIDE、抗体および交換され得る他のリンカーへのL1リンカー結合の非限定的な例としては、表1~L1に示されるものが挙げられるが、これらに限定されない。
Figure 2022505450000168
Figure 2022505450000169
Figure 2022505450000170
Figure 2022505450000171
Figure 2022505450000172
特定の実施形態において、リンカーL1は、T、UおよびVの異なる位置でE3LB残基に共有結合することができる:
Figure 2022505450000173
式中、T、uおよびVのうちの1つはL1-Abであり、L1はリンカー-1であり;但し、TがL1である場合、uは水素であり、Vおよび*は存在しない;またはuがL1である場合、Tは水素であり、Vおよび*は存在しない;または、VがL1である場合、*は
Figure 2022505450000174
であり、Tおよびuの各々は水素であり;L1は本明細書に記載されるとおりである。
リンカーL2は、リンカーL2と抗体との間の共有結合がジスルフィド結合である限り、抗体の任意の位置に結合することができる。開示されるように、L2は、PB残基、E3LB残基および/またはリンカー-L1に共有結合することができる。非限定的な例としては、以下が挙げられる:コンジュゲートL1BQ3の場合のように、PB残基に共有結合したL1;コンジュゲートL1BQ2の場合のように、E3LBのヒドロキシル(T位置)に共有結合したL1;コンジュゲートL1BQ7の場合のように、E3LBのフェニル(U位)に共有結合したL1;コンジュゲートL1BC1の場合のように、E3LBのチアゾールN(V位)に共有結合したL1;およびL1は、L1BQ1の場合と同様にリンカーL2に共有結合していた。
複数の実施形態において、抗体Abは、それぞれリンカーL1を介して、1~8個の化学的分解誘発物質(CIDE)Dにコンジュゲート化される。
Ab-(L1-D)
式中、pは1~8であり、
Dは、以下のように、リンカーL2を介して標的タンパク質結合(PB)リガンドに連結されたE3リガーゼ結合(E3LB)リガンドを含む:
E3LB-L2-PB。
複数の実施形態において、L1は、抗体の操作されたCys残基の硫黄とジスルフィド結合を形成して、CIDEをAbに連結する。
複数の実施形態において、抗体は、L1を介してCIDEのE3LBリガンドに連結される。
複数の実施形態において、L1は、CIDEのE3LBリガンドのE3LBリガンド残基に連結される。
複数の実施形態において、E3LBリガンド残基は、以下を含む。
Figure 2022505450000175
式中、L1は-------で残基に連結される。
実施形態において、L1は、以下からなる群から選択されるリンカーを介してE3LBリガンド残基に連結される:
Figure 2022505450000176
実施形態において、L1は、以下からなる群から選択されるリンカーを介してE3LBリガンド残基に連結される:
Figure 2022505450000177
実施形態において、L1は、以下のようにスペーサー単位(Sp)に連結されたペプチド模倣リンカー(PM)に連結されたストレッチャー単位(Str)を含む:
Str-(PM)-Sp。
実施形態において、Strは、抗体の操作されたCys残基の硫黄に連結され、Spは、以下のようにCIDEのE3LBリガンドに連結される:
Ab-Str-PM-Sp-E3LB-L2-PB。
SpがCIDEのE3LBリガンドに連結される実施形態において、SpはE3LBリガンド残基に連結される。複数の実施形態において、E3LBリガンド残基は、以下を含む。
Figure 2022505450000178
実施形態において、Strは以下のとおりである:
Figure 2022505450000179
実施形態において、L1のStr-PM-Spは以下からなる群から選択される:
Figure 2022505450000180
複数の実施形態において、E3LBリガンド残基は、以下を含む。
Figure 2022505450000181
実施形態において、L1は、以下からなる群から選択されるリンカーを介してE3LBリガンド残基に連結される:
Figure 2022505450000182
複数の実施形態において、E3LBリガンド残基は、以下を含む。
Figure 2022505450000183
実施形態において、L1は、以下からなる群から選択されるリンカーを介してE3LBリガンド残基に連結される:
Figure 2022505450000184
特定の実施形態において、本明細書に開示される主題は、以下の構造を有するコンジュゲートに関する:
Figure 2022505450000185
式中、
Abは、L1へのジスルフィド結合を介して共有結合した抗体であり;
L2は、E3LBに共有結合したリンカーであり、および
E3LBは、E3リガーゼを結合する基であり、当該E3リガーゼはフォンヒッペル・リンドウである。
特定の実施形態において、本明細書に開示される主題は、以下の構造を有するコンジュゲートに関する:
Figure 2022505450000186
式中、
Abは、L1へのジスルフィド結合を介して共有結合した抗体であり;
L2は、E3LBに共有結合したリンカーであり、
E3LBは、E3リガーゼを結合する基であり、当該E3リガーゼはフォンヒッペル・リンドウである。
特定の実施形態において、本明細書に開示される主題は、以下の構造を有するコンジュゲートに関する:
Figure 2022505450000187
式中、
Abは、L1へのジスルフィド結合を介して共有結合した抗体であり;
L1は、E3LBに共有結合したリンカーであり;
E3LBは、E3リガーゼを結合する基であり、当該E3リガーゼはフォンヒッペル・リンドウ、
およびZであり、
L2は、E3LBに共有結合したリンカーである。
本明細書に記載の主題はまた、L1-CIDE化合物からAb-CIDEを調製する方法であって、抗体がL1-CIDE上の任意の利用可能な結合点に共有結合している条件下で、抗体またはその変異体、突然変異体、スプライス変異体、インデルおよび融合体をL1-CIDEと接触させることを含み、Ab-CIDEが調製される方法に関する。本明細書に記載の主題はまた、L1に共有結合したAb-L1部分、すなわち抗体、またはその変異体、突然変異、スプライス変異体、インデルおよび融合体からAb-CIDEを調製する方法であって、Ab-CIDEがAb-L1上の任意の利用可能な結合点に共有結合する条件下でCIDEをAb-L1と接触させることを含み、Ab-CIDEが調製される方法に関する。本方法は、Ab-CIDEの日常的な単離および精製をさらに含むことができる。
ここで、本明細書中に記載されるようなAb-CIDEおよびL1-CIDE化合物を参照すると、これらは固体形態または液体形態で存在することができる。固体状態では、それは結晶形態もしくは非結晶形態で、またはそれらの混合物として存在し得る。当業者は、薬学的に許容可能な溶媒和物が結晶性または非結晶性化合物のために形成され得ることを理解するであろう。結晶性溶媒和物では、結晶化中に溶媒分子が結晶格子に組み込まれる。溶媒和物は、エタノール、イソプロパノール、DMSO、酢酸、エタノールアミン、または酢酸エチルなどであるがこれらに限定されない非水性溶媒を含んでもよく、または結晶格子に組み込まれる溶媒として水を含んでもよい。水が結晶格子に組み込まれる溶媒である溶媒和物は、一般的に水和物と呼ばれる。水和物には、化学量論的な水和物、ならびに様々な量の水を含有する組成物が含まれる。本明細書に記載される主題は、すべてのそのような溶媒和物を含む。
当業者は、その様々な溶媒和物を含む結晶形態で存在する本明細書に記載される特定の化合物およびAb-CIDEが多型(すなわち、異なる結晶構造で生じる能力)を示し得ることをさらに理解するであろう。これらの異なる結晶形態は、典型的には「多形」として知られている。本明細書に開示される主題は、すべてのそのような多形を含む。多形は、同じ化学組成を有するが、充填、幾何学的配置、および結晶性固体状態の他の記述特性が異なる。したがって、多形は、形状、密度、硬度、変形能、安定性、および溶解特性などの異なる物理的特性を有し得る。多形は、典型的には、異なる融点、IRスペクトル、およびX線粉末回折パターンを示し、これを同定に使用することができる。当業者は、例えば、化合物の製造に使用される反応条件または試薬を変更または調整することによって、異なる多形が製造され得ることを理解するであろう。例えば、温度、圧力または溶媒の変化は、多形をもたらし得る。さらに、ある多形は、特定の条件下で別の多形に自発的に変換し得る。
本明細書中に記載される化合物およびAb-CIDEまたはその塩は、立体異性体型(例えば、それは1つまたは複数の不斉炭素原子を含有する)で存在し得る。各立体異性体(鏡像異性体およびジアステレオマー)およびこれらの混合物は、本明細書に開示されている主題の範囲に含まれる。同様に、式(I)の化合物または塩は、その式で示すもの以外の互変異性形態で存在することができ、これらもまた、本明細書にて開示する主題の範囲に含まれると理解されている。本明細書にて開示する主題は、本明細書で記載するすべての具体的な基の組み合わせおよび部分集合を含むものと理解されるべきである。本明細書に開示されている主題の範囲には、立体異性体の混合物の他に、精製された鏡像異性体または鏡像異性体的に/ジアステレオマー的に濃縮された混合物が含まれる。本明細書にて開示する主題は、本明細書で上記に定義されるすべての具体的な基の組み合わせおよび部分集合を含むものと理解されるべきである。
本明細書に開示されている主題には、1つまたは複数の原子が、通常自然に見出される原子質量または質量数とは異なる原子質量または質量数を有する原子により置き換えられているという事実を除いて本明細書に記載されている化合物の同位体標識された形態も含まれる。本明細書に記載されている化合物および薬学的に許容可能なその塩の中に取り込まれることができる同位体の例としては、水素、炭素、窒素、酸素、リン、硫黄、フッ素、ヨウ素および塩素の同位体、例えば、H、H、11C、13C、14C、15N、17O、18O、31P、32P、35S、18F、36Cl、123Iおよび125Iが挙げられる。
上述の同位体および/または他の原子の他の同位体を含有する、本明細書中に開示されるような化合物およびAb-CIDEならびにその薬学的に許容可能な塩は、本明細書中に開示される主題の範囲内である。同位体標識化合物、例えばH、14Cなどの放射性同位体が組み込まれたものが本明細書に開示されており、薬物および/または基質組織分布アッセイに有用である。トリチウム標識(即ち、H)および炭素14(即ち14C)同位体は、調製および検出可能性の容易さから、一般に、使用される。11Cおよび18F同位体はPET(陽電子放出断層撮影)において有用であり、125I同位体はSPECT(単一光子放出コンピュータ断層撮影)において有用であり、これらはすべて脳撮像において有用である。さらに、重水素、すなわちHなどのより重い同位体による置換は、より大きな代謝安定性から生じる特定の治療上の利点、例えばインビボ半減期の増加または必要投与量の減少をもたらすことができ、したがって、いくつかの状況では好ましい場合がある。式Iの同位体標識化合物を、一般に、容易に入手可能な同位体標識試薬を非同位体標識試薬の代わりに用いることによって、以下のスキームおよび/または実施例に開示される手順を行うことによって調製することができる。
本明細書に記載の主題は、以下の実施形態を含む。
実施形態1.下記化学構造:
Ab-(L1-D)
を有するコンジュゲートであって、
式中、
Dは、構造E3LB-L2-PBを有するCIDEであり;
E3LBは、L2に共有結合しており、当該E3LBはE3リガーゼを結合する基であり、当該E3リガーゼはフォンヒッペル・リンドウ(VHL)であり;
L2は、E3LBおよびPBに共有結合したリンカーであり;
PBは、L2に共有結合したタンパク質結合基であり、当該PBは、そのすべての変異体、突然変異、スプライス変異体、インデルおよび融合体を含む、BRD4またはERαを結合する基であり、
Abは、L1に共有結合した抗体であり;
L1は、AbおよびDに共有結合したリンカーであり;および
pは、約1~約8の値を有する、
コンジュゲート。
実施形態2.EL3Bが下記構造:
Figure 2022505450000188
式中、R1’は、必要に応じて置換されたC~Cアルキル基、必要に応じて置換された-(CHOH、必要に応じて置換された-(CHSH、必要に応じて置換された(OH-O-(C~C)アルキル基、エポキシ部分WCOCWを含む必要に応じて置換された(CH-WCOCW-(C~C)アルキル基であり、各Wは、独立して、HまたはC~Cアルキル基、必要に応じて置換された-(CHCOOH、必要に応じて置換された-(CHC(O)-(C~Cアルキル)、必要に応じて置換された-(CHNHC(O)-R、必要に応じて置換された-(CHC(O)-NR、必要に応じて置換された-(CHOC(O)-NR、-(CHO)H、必要に応じて置換された-(CHOC(O)-(C~Cアルキル)、必要に応じて置換された-(CHC(O)-O-(C~Cアルキル)、必要に応じて置換された-(CHO)COOH、必要に応じて置換された-(OCHO-(C~Cアルキル)、必要に応じて置換された--(CHC(O)-O-(C~Cアルキル)、必要に応じて置換された-(OCHNHC(O)-R、必要に応じて置換された-(CHO)C(O)-NR、-(CHCHO)H、必要に応じて置換された-(CHCHO)COOH、必要に応じて置換された-(OCHCHO-(C~Cアルキル)、必要に応じて置換された-(CHCHO)C(O)-(C~Cアルキル)、必要に応じて置換された-(OCHCHNHC(O)-R、必要に応じて置換された-(CHCHO)C(O)-NRiR、必要に応じて置換された-SO、必要に応じて置換されたS(O)R、NO、CNまたはハロゲン(F、Cl、Br、I、好ましくはFまたはCl)であり;
およびRは、それぞれ独立して、H、または1つもしくは2個のヒドロキシル基または最大3個のハロゲン基(好ましくはフッ素)で必要に応じて置換されたC~Cアルキル基であり;
はC~Cアルキル基、必要に応じて置換されたアリール、ヘテロアリールもしくは複素環基、または-(CH)NR基であり;
XおよびX’は、それぞれ独立して、C=O、O=S、-S(O)、S(O)である、(好ましくは、XおよびX’は両方ともC=Oである);
2’は、必要に応じて置換された-(CH-(C=O)(NR(SOアルキル基、必要に応じて置換された-(CH-(C=O)(NR)v(SONR1N2N基、必要に応じて置換された-(CH-(C=O)(NR(SO-アリール、必要に応じて置換された-(CH-(C=O)(NR(SO-ヘテロアリール、必要に応じて置換された-(CH-(C=O)NR(SO-複素環、必要に応じて置換された-NR-(CH-C(O)(NR(SO-アルキル、必要に応じて置換された-NR-(CH-C(O)(NR(SO-NR1N2N、必要に応じて置換された-NR-(CH-C(O)(NR(SO-NRC(O)R1N、必要に応じて置換された-NR-(CH-(C=O)(NR(SO-アリール、必要に応じて置換された-NR-(CH-(C=O)(NR(SO-ヘテロアリール、または必要に応じて置換された-NR-(CH)n-(C=O)NR(SO-複素環、必要に応じて置換された-XR2’-アルキル基;必要に応じて置換された-XR2’-アリール基;必要に応じて置換された-XR2’-ヘテロアリール基;必要に応じて置換された-XR2’-複素環基;必要に応じて置換された;
は、必要に応じて置換されたアルキル、必要に応じて置換された-(CH-C(O)(NR(SO-アルキル、必要に応じて置換された-(CH-C(O)(NR(SO-NR1N2N、必要に応じて置換された-(CH-C(O)(NR(SO-NRC(O)R1N、必要に応じて置換され-(CH-C(O)(NR(SO-C(O)NR、必要に応じて置換された-(CH-C(O)(NR(SO-アリール、必要に応じて置換された-(CH-C(O)u(NR(SO-ヘテロアリール、必要に応じて置換された-(CH-C(O)(NR(SO-複素環、必要に応じて置換された-NR-(CH-C(O)(NR(SO-アルキル、必要に応じて置換された-NR-(CH-C(O)(NR(SO-NR1N2N、必要に応じて置換された-NR-(CH-C(O)(NR(SO-NRC(O)R1N、必要に応じて置換された-NR-(CH-C(O)(NR(SO-アリール、必要に応じて置換された-NR-(CH-C(O)(NR(SO-ヘテロアリール、必要に応じて置換された-NR-(CH-C(O)(NR(SO-複素環、必要に応じて置換された-O-(CH)n-(C=O)(NR(SO-アルキル、必要に応じて置換された-O-(CH)n-(C=O)(NR(SO-NR1N2N、必要に応じて置換された-O-(CH)n-(C=O)(NR(SO-NRC(O)R1N、必要に応じて置換された-O-(CH)n-(C=O)(NR(SO-アリール、必要に応じて置換された-O-(CH-(C=O)(NR(SO-ヘテロアリール、または必要に応じて置換された-O-(CH-(C=O)(NR(SO-複素環;-(CH-(V)n’-(CH-(V)n’-アルキル基、必要に応じて置換された-(CH-(V)n’-(CH-(V)n’-アリール基、必要に応じて置換された-(CH-(V)n’-(CH-(V)n’-ヘテロアリール基、必要に応じて置換された-(CH-(V)n’-(CH-(V)n’-複素環基、必要に応じて置換された-(CH-N(R1’)(C=O)m’-(V)n’-アルキル基、必要に応じて置換された-(CH-N(R1’)(C=O)m’-(V)n’-アリール基、必要に応じて置換された-(CH-N(R1’)(C=O)m’-(V)n’-ヘテロアリール基、必要に応じて置換された-(CH-N(R1’)(C=O)m’-(V)n’-複素環基、必要に応じて置換された-XR3’-アルキル基;必要に応じて置換された-XR3’-アリール基;必要に応じて置換された-XR3’-ヘテロアリール基;必要に応じて置換された-XR3’-複素環基であり;必要に応じて置換された;
1NおよびR2Nは、それぞれ独立して、H、1または2個のヒドロキシル基および3個までのハロゲン基で必要に応じて置換されたC~Cアルキル、または必要に応じて置換された-(CH-アリール、-(CH-ヘテロアリールまたは-(CH-複素環基であり;
およびRは、それぞれ独立して、HまたはC~Cアルキル基であり;
Vは、O、SまたはNRであり;
は上記と同じであり;
およびRは、それぞれ独立して、HまたはC~Cアルキル基であり;
R2’およびXR3’は、それぞれ独立して、必要に応じて置換された-CH-、-CH-CH(X)=CH(X)-(シスまたはトランス)、-CH-CH≡CH-、-(CHCHO)-またはC~Cシクロアルキル基であり、XはH、ハロ、または必要に応じて置換されたC~Cアルキル基であり;
各mは、独立して、0、1、2、3、4、5、6であり;
各m’は、独立して0または1であり;
各nは、独立して、0、1、2、3、4、5、6であり;
各n’は、独立して0または1であり;
各uは、独立して0または1であり;
各vは、独立して0または1であり;
各wは、独立して0または1である、
を有する基の残基である、実施形態1のコンジュゲート。
実施形態3.E3LBが下記構造:
Figure 2022505450000189
式中、Rβは、水素、メチル、エチルまたはプロピルである、
を有する基の残基である、上記いずれかの実施形態のコンジュゲート。
実施形態4.EL3Bが下記構造:
Figure 2022505450000190
式中、Rβは、水素、メチル、エチルまたはプロピルである、
を有する基の残基である、上記いずれかの実施形態のコンジュゲート。
実施形態5.PBがBRD4を結合する基の残基である、上記いずれかの実施形態のコンジュゲート。
実施形態6.当該PBがBRD4を結合する基の残基であり、下記構造:
Figure 2022505450000191
を有する、上記いずれかの実施形態のコンジュゲート。
実施形態7.PBがERαを結合する基の残基であり、抗エストロゲン薬である、上記いずれかの実施形態のコンジュゲート。
実施形態8.PBがERαを結合する基の残基であり、下記構造:
Figure 2022505450000192
式中、R’’は、水素、C~Cアルキル、ベンジル、フェニル、または-(PO)である、
の化合物である、上記いずれかの実施形態のコンジュゲート。
実施形態9.PBが下記構造:
Figure 2022505450000193
の化合物の残基である、上記いずれかの実施形態のコンジュゲート。
実施形態10.Abがシステイン操作抗体またはその変形体である、上記いずれかの実施形態のコンジュゲート。
実施形態11.Abが、DLL3、EDAR、CLL1;BMPR1B;E16;STEAP1;0772P;MPF;NaPi2b;Sema5b;PSCAhlg;ETBR;MSG783;STEAP2;TrpM4;CRIPTO;CD21;CD79b;FcRH2;B7-H4;HER2;NCA;MDP;IL20Rα;Brevican;EphB2R;ASLG659;PSCA;GEDA;BAFF-R;CD22;CD79a;CXCR5;HLA-DOB;P2X5;CD72;LY64;FcRH1;IRTA2;TENB2;PMEL17;TMEFF1;GDNF-Ra1;Ly6E;TMEM46;Ly6G6D;LGR5;RET;LY6K;GPR19;GPR54;ASPHD1;チロシナーゼ;TMEM118;GPR172A;MUC16およびCD33からなる群から選択される1つまたは複数のポリペプチドに結合する、上記いずれかの実施形態のコンジュゲート。
実施形態12.Abが、CLL1、STEAP1、NaPi2b、STEAP2、TrpM4、CRIPTO、CD21、CD79b、FcRH2、B7-H4、HER2、CD22、CD79a、CD72、LY64、Ly6E、MUC16、およびCD33からなる群から選択されるポリペプチドの1つまたは複数に結合する、上記いずれかの実施形態のコンジュゲート。
実施形態13.Abが、HER2、B7-H4、およびCD22からなる群から選択される1つまたは複数のポリペプチドに結合する抗体である、上記いずれかの実施形態のコンジュゲート。
実施形態14.抗体がHER2に結合する、上記いずれかの実施形態のコンジュゲート。
実施形態15.抗体がB7-H4またはCD22に結合する、上記いずれかの実施形態のコンジュゲート。
実施形態16.L1がペプチド模倣リンカーである、上記のいずれかの実施形態のコンジュゲート。
実施形態17.L1が、下記式:
-Str-(PM)-Sp-
式中、
Strは、Abに共有結合したストレッチャー単位であり;
Abは抗体であり;
Spは、結合またはCIDE部分に共有結合したスペーサー単位であり;
PMは、
Figure 2022505450000194
Wは、-NH-ヘテロシクロアルキル-またはヘテロシクロアルキルであり;
Yは、ヘテロアリール、アリール、-C(O)C~Cアルキレン、C~Cアルキレン-NH、C~Cアルキレン-NH-CH、C~Cアルキレン-N-(CH、C~Cアルケニル、またはC~Cアルキレニルであり;
各Rは、独立して、C~C10アルキル、C~C10アルケニル、(C~Cアルキル)NHC(NH)NH、(C~Cアルキル)NHC(O)NH、(C~C10アルキル)NHC(NH)NH、または(C~C10アルキル)NHC(O)NHであり;
およびRは、それぞれ独立して、H、C~C10アルキル、C~C10アルケニル、アリールアルキル、または、ヘテロアリールアルキルであるか、または、RおよびRは、一緒に、C~Cシクロアルキルを形成してもよく;および
およびRは、それぞれ独立して、C~C10アルキル、C~C10アルケニル、アリールアルキル、ヘテロアリールアルキル、(C~C10アルキル)OCH-であるか、または、RおよびRは、C~Cシクロアルキル環を形成してもよい、
からなる群から選択される、非ペプチド化学部分である、
で表されるペプチド模倣リンカーである、上記いずれかの実施形態のコンジュゲート。
実施形態18.
Strが下記式:
Figure 2022505450000195
式中、Rは、C~C10アルキレン、C~C10アルケニル、C~Cシクロアルキル、(C~Cアルキレン)O-、およびC~C10アルキレン-C(O)N(R)-C~Cアルキレンからなる群から選択され、各アルキレンは、ハロ、トリフルオロメチル、ジフルオロメチル、アミノ、アルキルアミノ、シアノ、スルホニル、スルホンアミド、スルホキシド、ヒドロキシ、アルコキシ、エステル、カルボン酸、アルキルチオ、C~Cシクロアルキル、C~Cヘテロシクロアルキル、ヘテロアリールアルキル、アリールアリールアルキル、ヘテロアリールアルキルおよびヘテロアリールからなる群から選択される1~5個の置換基で置換されていてもよく、各Rは、独立して、Hまたは~Cアルキルであり;および
Spは、-C~Cアルキレン-C(O)NH-または-Ar-R-であり、Arはアリールまたはヘテロアリールであり、Rは(C~C10アルキレン)O-である、
で表される化学部分である、上記いずれかの実施形態のコンジュゲート。
実施形態19.Strが下記式:
Figure 2022505450000196
式中、Rは、C~C10アルキレン、C~C10アルケニル、(C~C10アルキレン)O-、N(R)-(C~Cアルキレン)-N(R)およびN(R)-(C~Cアルキレン)から選択され、各Rは、独立して、HまたはC~Cアルキルであり;および
Spは、-C~Cアルキレン-C(O)NH-または-Ar-R-であり、Arはアリールまたはヘテロアリールであり、Rは(C~C10アルキレン)O-である、
を有する、上記いずれかの実施形態のコンジュゲート。
実施形態20.L1が下記式:
Figure 2022505450000197
は、C~Cアルキル、(C~Cアルキル)NHC(NH)NH、または(C~Cアルキル)NHC(O)NHであり;
およびRは、一緒に、C~Cシクロアルキル環を形成する、
を有する、上記いずれかの実施形態のコンジュゲート。
実施形態21.下記式:
Figure 2022505450000198
式中、
Spは、結合またはCIDE部分Dに共有結合したスペーサー単位であり;
およびRは、それぞれ独立して、C~C10アルキル、C~C10アルケニル、アリールアルキル、ヘテロアリールアルキル、(C~C10アルキル)OCH-であるか、または、RおよびRは、一緒に、C~Cシクロアルキル環を形成してもよく、
は、独立して、C~C10アルキル、C~C10アルケニル、(C~Cアルキル)NHC(NH)NH、(C~Cアルキル)NHC(O)NH、(C~C10アルキル)NHC(NH)NH、または(C~C10アルキル)NHC(O)NHであり;
Strは、下記式:
Figure 2022505450000199
は、C~C10アルキレン、およびC~C10アルキレン-C(O)N(R)-C~Cアルキレンからなる群から選択され、各アルキレンは、ハロ、トリフルオロメチル、ジフルオロメチル、アミノ、アルキルアミノ、シアノ、スルホニル、スルホンアミド、スルホキシド、ヒドロキシ、アルコキシ、エステル、カルボン酸、アルキルチオ、C~Cシクロアルキル、C~Cヘテロシクロアルキル、アリール、アリールアルキル、ヘテロアリールアルキル、およびヘテロアリールから選択される1~5個の置換基で置換されてもよく、各Rは、独立して、Hまたは~Cアルキルであり;
pは1、2、3、または4である、
で表される化学部分である、
を有する、上記いずれかの実施形態のコンジュゲート。
実施形態22.RおよびRが、一緒に、C~Cシクロアルキル環を形成してもよく、Rが、C~C10アルキル、または(C~Cアルキル)NHC(O)NHである、上記いずれかの実施形態のコンジュゲート。
実施形態23.RおよびRが、一緒に、シクロブチルを形成する、上記いずれかの実施形態のコンジュゲート。
実施形態24.リンカーの構造が、以下:
Figure 2022505450000200
からなる群から選択される、上記いずれかの実施形態のコンジュゲート。
実施形態25.
Strは、下記式:
Figure 2022505450000201
はC~Cアルキレンであり;
Spは、-C~Cアルキレン-C(O)NH-または-Ar-R-であり、Arはアリール、Rは(C~Cアルキレン)O-である、
で表される化学部分である、上記いずれかの実施形態のコンジュゲート。
実施形態26.下記式:
Figure 2022505450000202
式中、
pは1、2、3、または4であり;
は、C~Cアルキル-NH、(C~Cアルキル)NHC(NH)NH、または(C~Cアルキル)NHC(O)NHであり;
およびRは、それぞれ独立して、C~Cアルキルであり、当該アルキルは、非置換であるか、またはRおよびRはC~Cシクロアルキル環を形成してもよい、
を有する、上記いずれかの実施形態のコンジュゲート。
実施形態27.L1が、以下:
Figure 2022505450000203
式中、RおよびRは、独立して、H、およびC~Cアルキルから独立して選択されるか、または、RおよびRは、3、4、5、もしくは6員のシクロアルキル基または複素環基を形成する、
からなる群から選択される下記式を有する、上記いずれかの実施形態のコンジュゲート。
実施形態28.L1が下記式:
Figure 2022505450000204
を有する、上記いずれかの実施形態のコンジュゲート。
実施形態29.L1が下記式:
Figure 2022505450000205
式中、Aは、「ストレッチャー単位」であり、および、aは0~1の整数であり;Wは「アミノ酸単位」であり、および、wは0~12の整数であり;Yは「スペーサー単位」であり、および、yは0、1、または2である、
を有する、上記いずれかの実施形態のコンジュゲート。
実施形態30.ストレッチャー単位Aが下記式:
Figure 2022505450000206
を含む、上記いずれかの実施形態のコンジュゲート。
実施形態31.リンカーが下記式:
Figure 2022505450000207
を有する、上記いずれかの実施形態のコンジュゲート。
実施形態32.L1が下記式:
-A-Y
式中、AおよびYは上記のように定義される、
を有する、上記いずれかの実施形態のコンジュゲート。
実施形態33.L1が、
Figure 2022505450000208
である、上記いずれかの実施形態のコンジュゲート。
実施形態34.pが約1.0~約3である、上記いずれかの実施形態のコンジュゲート。
実施形態35.pが約2である、上記いずれかの実施形態のコンジュゲート。
実施形態36.DがL1に共有結合した残基であり、以下の構造:
Figure 2022505450000209
のうちの1つから選択される、上記いずれかの実施形態のコンジュゲート。
実施形態37.L1-Dが上記Abに共有結合した残基であり、下記の構造:
Figure 2022505450000210
Figure 2022505450000211
Figure 2022505450000212
Figure 2022505450000213
の1つから選択される、上記いずれかの実施形態のコンジュゲート。
実施形態38.Abが、B7-H4、HER2、およびCD22からなる群から選択される1つまたは複数のポリペプチドを結合する抗体である、上記いずれかの実施形態のコンジュゲート。
実施形態39.PBがBRD4を結合する基の残基であり、下記構造:
Figure 2022505450000214
を有する、上記いずれかの実施形態のコンジュゲート。
実施形態40.L1-Dが上記Abに共有結合した残基であり、下記の構造:
Figure 2022505450000215
Figure 2022505450000216
Figure 2022505450000217
Figure 2022505450000218
Figure 2022505450000219
の1つから選択される、上記いずれかの実施形態のコンジュゲート。
実施形態41.上記いずれかの実施形態のコンジュゲートと、1つまたは複数の薬学的に許容可能な賦形剤と、を含む医薬組成物。
実施形態42.有効量の上記いずれかの実施形態のコンジュゲートまたは実施形態41の組成物をヒトに投与することを含む、治療を必要とする当該ヒトにおいて疾患を治療する方法。
実施形態43.疾患が癌である、実施形態42の方法。
実施形態44.癌が、前立腺、乳房および急性骨髄性白血病からなる群から選択される、実施形態43に記載の方法。
実施形態45.癌が、HER2陽性癌である、実施形態44に記載の方法。
実施形態46.HER2陽性癌が乳癌である、実施形態45に記載の方法。
実施形態47.化学構造:
Ab-(L1-D)
式中、
Dは構造E3LB-L2-PBを有するCIDEであり;
E3LBはL2に共有結合しており、当該E3LBはE3リガーゼを結合する基であり、当該E3リガーゼはフォンヒッペル・リンドウ(VHL)であり;
L2は、E3LBおよびPBに共有結合したリンカーであり;
PBは、L2に共有結合したタンパク質結合基であり、当該PBは、そのすべての変異体、突然変異、スプライス変異体、インデルおよび融合体を含む、BRD4またはERαを結合する基であり、
Abは、L1に共有結合した抗体であり;
L1は、AbおよびDに共有結合したリンカーであり;および
pは、約1~約8の値を有する、
を有するコンジュゲートを調製する方法であって、
第1の溶液を調製するために、L2を第1の溶媒、第1の塩基、および第1のカップリング試薬と接触させる工程;
E3LBを当該第1の溶液と接触させてE3LB-L2中間体を調製する工程;
PBを第2の溶媒、第2の塩基、および第2のカップリング試薬と接触させて第2の溶液を調製する工程;
当該第2の溶液を当該E3LB-L2中間体と接触させてCIDEを調製する工程;
第3の溶媒中で当該CIDEをL1および第3の塩基と接触させてL1-CIDEを調製する工程;ならびに
当該L1-CIDEをチオールおよび第4の溶媒と接触させて第4の溶液を調製する工程;ならびに
当該第4の溶液を抗体と接触させて当該コンジュゲートを調製すること、
を含む、方法。
実施形態48.当該第1の溶媒、第2の溶媒、第3の溶媒、および第4の溶媒が、それぞれ独立して、ジメチルホルムアミド、テトラヒドロフラン、酢酸エチル、アセトン、アセトニトリル、ジメチルスルホキシド、および炭酸プロピレンからなる群から選択される、実施形態47の方法。
実施形態49.当該第1の溶媒、第2の溶媒、第3の溶媒および第4の溶媒がそれぞれジメチルホルムアミドである実施形態47の方法。
実施形態50.当該第1および第2のカップリング試薬がそれぞれ、1-[4,5-b]-1H-1,2,3-トリアゾロピリジニウム3-オキシドヘキサフルオロホスフェート(HATU)である、実施形態47に記載の方法。
実施形態51.当該第1、第2および第3の塩基が、それぞれ独立して、N,N-ジイソプロピルエチルアミン(DIEA)、トリエチルアミンおよび2,2,2,6,6-テトラメチルピペリジンからなる群から選択される、実施形態47に記載の方法。
実施形態52.L1が、以下:
Figure 2022505450000220
式中、RおよびRは、独立して、H、およびC~Cアルキルから独立して選択されるか、または、RおよびRは、3、4、5、もしくは6員のシクロアルキル基または複素環基を形成する、
からなる群から選択される、実施形態47に記載の方法。
実施形態53.DがL1に共有結合した残基であり、以下の構造:
Figure 2022505450000221
のうちの1つから選択される、実施形態47の方法。
実施形態54.L1-Dが当該Abに共有結合した残基であり、以下の構造:
Figure 2022505450000222
Figure 2022505450000223
Figure 2022505450000224
Figure 2022505450000225
のうちの1つから選択される、実施形態47の方法。
実施形態55.実施形態47、48、49、50、51、52、53または54に記載の方法によって作製された抗体コンジュゲート。
実施形態56.実質的に本明細書に記載の抗体コンジュゲート。
実施形態57.下記化学構造:
Ab-(L1-D)
を有するコンジュゲートであって、
式中、
Dは、構造E3LB-L2-PBを有するCIDEであり;
E3LBは、L2に共有結合しており、当該E3LBはE3リガーゼを結合する基であり、当該E3リガーゼはフォンヒッペル・リンドウ(VHL)であり;
L2は、E3LBおよびPBに共有結合したリンカーであり;
PBは、L2に共有結合したタンパク質結合基であり、当該PBは、そのすべての変異体、突然変異、スプライス変異体、インデルおよび融合体を含む、BRD4またはERαを結合する基であり、
Abは、L1に共有結合した抗体であり;
L1は、AbおよびDに共有結合したリンカーであり;および
pは、約1~約8の値を有する、
コンジュゲート。
実施形態58.EL3Bが下記構造:
Figure 2022505450000226
式中、R1’は、必要に応じて置換されたC~Cアルキル基、必要に応じて置換された-(CHOH、必要に応じて置換された-(CHSH、必要に応じて置換された(OH-O-(C~C)アルキル基、エポキシ部分WCOCWを含む必要に応じて置換された(CH-WCOCW-(C~C)アルキル基であり、各Wは、独立して、HまたはC~Cアルキル基、必要に応じて置換された-(CHCOOH、必要に応じて置換された-(CHC(O)-(C~Cアルキル)、必要に応じて置換された-(CHNHC(O)-R、必要に応じて置換された-(CHC(O)-NR、必要に応じて置換された-(CHOC(O)-NR、-(CHO)H、必要に応じて置換された-(CHOC(O)-(C~Cアルキル)、必要に応じて置換された-(CHC(O)-O-(C~Cアルキル)、必要に応じて置換された-(CHO)COOH、必要に応じて置換された-(OCHO-(C~Cアルキル)、必要に応じて置換された--(CHC(O)-O-(C~Cアルキル)、必要に応じて置換された-(OCHNHC(O)-R、必要に応じて置換された-(CHO)C(O)-NR、-(CHCHO)H、必要に応じて置換された-(CHCHO)COOH、必要に応じて置換された-(OCHCHO-(C~Cアルキル)、必要に応じて置換された-(CHCHO)C(O)-(C~Cアルキル)、必要に応じて置換された-(OCHCHNHC(O)-R、必要に応じて置換された-(CHCHO)C(O)-NRiR、必要に応じて置換された-SO、必要に応じて置換されたS(O)R、NO、CNまたはハロゲン(F、Cl、Br、I、好ましくはFまたはCl)であり;
およびRは、それぞれ独立して、H、または1つもしくは2個のヒドロキシル基または最大3個のハロゲン基(好ましくはフッ素)で必要に応じて置換されたC~Cアルキル基であり;
はC~Cアルキル基、必要に応じて置換されたアリール、ヘテロアリールもしくは複素環基、または-(CH)NR基であり;
XおよびX’は、それぞれ独立して、C=O、O=S、-S(O)、S(O)である、(好ましくは、XおよびX’は両方ともC=Oである);
2’は、必要に応じて置換された-(CH-(C=O)(NR(SOアルキル基、必要に応じて置換された-(CH-(C=O)(NR)v(SONR1N2N基、必要に応じて置換された-(CH-(C=O)(NR(SO-アリール、必要に応じて置換された-(CH-(C=O)(NR(SO-ヘテロアリール、必要に応じて置換された-(CH-(C=O)NR(SO-複素環、必要に応じて置換された-NR-(CH-C(O)(NR(SO-アルキル、必要に応じて置換された-NR-(CH-C(O)(NR(SO-NR1N2N、必要に応じて置換された-NR-(CH-C(O)(NR(SO-NRC(O)R1N、必要に応じて置換された-NR-(CH-(C=O)(NR(SO-アリール、必要に応じて置換された-NR-(CH-(C=O)(NR(SO-ヘテロアリール、または必要に応じて置換された-NR-(CH)n-(C=O)NR(SO-複素環、必要に応じて置換された-XR2’-アルキル基;必要に応じて置換された-XR2’-アリール基;必要に応じて置換された-XR2’-ヘテロアリール基;必要に応じて置換された-XR2’-複素環基;必要に応じて置換された;
は、必要に応じて置換されたアルキル、必要に応じて置換された-(CH-C(O)(NR(SO-アルキル、必要に応じて置換された-(CH-C(O)(NR(SO-NR1N2N、必要に応じて置換された-(CH-C(O)(NR(SO-NRC(O)R1N、必要に応じて置換された-(CH-C(O)(NR(SO-C(O)NR、必要に応じて置換された-(CH-C(O)(NR(SO-アリール、必要に応じて置換された-(CH-C(O)u(NR(SO-ヘテロアリール、必要に応じて置換された-(CH-C(O)(NR(SO-複素環、必要に応じて置換された-NR-(CH-C(O)(NR(SO-アルキル、必要に応じて置換された-NR-(CH-C(O)(NR(SO-NR1N2N、必要に応じて置換された-NR-(CH-C(O)(NR(SO-NRC(O)R1N、必要に応じて置換された-NR-(CH-C(O)(NR(SO-アリール、必要に応じて置換された-NR-(CH-C(O)(NR(SO-ヘテロアリール、必要に応じて置換された-NR-(CH-C(O)(NR(SO-複素環、必要に応じて置換された-O-(CH)n-(C=O)(NR(SO-アルキル、必要に応じて置換された-O-(CH)n-(C=O)(NR(SO-NR1N2N、必要に応じて置換された-O-(CH)n-(C=O)(NR(SO-NRC(O)R1N、必要に応じて置換された-O-(CH)n-(C=O)(NR(SO-アリール、必要に応じて置換された-O-(CH-(C=O)(NR(SO-ヘテロアリール、または必要に応じて置換された-O-(CH-(C=O)(NR(SO-複素環;-(CH-(V)n’-(CH-(V)n’-アルキル基、必要に応じて置換された-(CH-(V)n’-(CH-(V)n’-アリール基、必要に応じて置換された-(CH-(V)n’-(CH-(V)n’-ヘテロアリール基、必要に応じて置換された-(CH-(V)n’-(CH-(V)n’-複素環基、必要に応じて置換された-(CH-N(R1’)(C=O)m’-(V)n’-アルキル基、必要に応じて置換された-(CH-N(R1’)(C=O)m’-(V)n’-アリール基、必要に応じて置換された-(CH-N(R1’)(C=O)m’-(V)n’-ヘテロアリール基、必要に応じて置換された-(CH-N(R1’)(C=O)m’-(V)n’-複素環基、必要に応じて置換された-XR3’-アルキル基;必要に応じて置換された-XR3’-アリール基;必要に応じて置換された-XR3’-ヘテロアリール基;必要に応じて置換された-XR3’-複素環基であり;必要に応じて置換された;
1NおよびR2Nは、それぞれ独立して、H、1または2個のヒドロキシル基および3個までのハロゲン基で必要に応じて置換されたC~Cアルキル、または必要に応じて置換された-(CH-アリール、-(CH-ヘテロアリールまたは-(CH-複素環基であり;
およびRは、それぞれ独立して、HまたはC~Cアルキル基であり;
Vは、O、SまたはNRであり;
は上記と同じであり;
およびRは、それぞれ独立して、HまたはC~Cアルキル基であり;
R2’およびXR3’は、それぞれ独立して、必要に応じて置換された-CH-、-CH-CH(X)=CH(X)-(シスまたはトランス)、-CH-CH≡CH-、-(CHCHO)-またはC~Cシクロアルキル基であり、XはH、ハロ、または必要に応じて置換されたC~Cアルキル基であり;
各mは、独立して、0、1、2、3、4、5、6であり;
各m’は、独立して0または1であり;
各nは、独立して、0、1、2、3、4、5、6であり;
各n’は、独立して0または1であり;
各uは、独立して0または1であり;
各vは、独立して0または1であり;
各wは、独立して0または1である、
を有する基の残基である、実施形態57のコンジュゲート。
実施形態59.E3LBが下記構造:
Figure 2022505450000227
式中、Rβは、水素、メチル、エチルまたはプロピルである、
を有する基の残基である、実施形態58のコンジュゲート。
実施形態60.E3LBが下記構造:
Figure 2022505450000228
式中、Rβは、水素、メチル、エチルまたはプロピルである、
を有する基の残基である、実施形態58のコンジュゲート。
実施形態61.PBがBRD4を結合する基の残基である、実施形態57のコンジュゲート。
実施形態62.PBが、BRD4を結合し、下記構造:
Figure 2022505450000229
を有する基の残基である、実施形態61のコンジュゲート。
実施形態63.PBがERαを結合する基の残基であり、抗エストロゲン薬である、実施形態57のコンジュゲート。
実施形態64.PBがERαを結合する基の残基であり、下記構造:
Figure 2022505450000230
式中、R’’は、水素、C~Cアルキル、ベンジル、フェニル、または-(PO)である、
の化合物である、実施形態63のコンジュゲート。
実施形態65.PBが下記構造:
Figure 2022505450000231
の化合物の残基である、実施形態64のコンジュゲート。
実施形態66.Abがシステイン操作抗体またはその変形体である、実施形態57のコンジュゲート。
実施形態67.Abが、DLL3、EDAR、CLL1;BMPR1B;E16;STEAP1;0772P;MPF;NaPi2b;Sema 5b;PSCA hlg;ETBR;MSG783;STEAP2;TrpM4;CRIPTO;CD21;CD79b;FcRH2;B7-H4;HER2;NCA;MDP;IL20Rα;Brevican;EphB2R;ASLG659;PSCA;GEDA;BAFF-R;CD22;CD79a;CXCR5;HLA-DOB;P2X5;CD72;LY64;FcRH1;IRTA2;TENB2;PMEL17;TMEFF1;GDNF-Ra1;Ly6E;TMEM46;Ly6G6D;LGR5;RET;LY6K;GPR19;GPR54;ASPHD1;チロシナーゼ;TMEM118;GPR172A;MUC16およびCD33からなる群から選択される1つまたは複数のポリペプチドを結合する、実施形態57のコンジュゲート。
実施形態68.Abが、CLL1、STEAP1、NaPi2b、STEAP2、TrpM4、CRIPTO、CD21、CD79b、FcRH2、B7-H4、HER2、CD22、CD79a、CD72、LY64、Ly6E、MUC16、およびCD33からなる群から選択されるポリペプチドの1つまたは複数を結合する、実施形態66のコンジュゲート。
実施形態69.Abが、HER2、B7-H4、およびCD22からなる群から選択される1つまたは複数のポリペプチドを結合する抗体である、実施形態68のコンジュゲート。
実施形態70.抗体がHER2である、実施形態69のコンジュゲート。
実施形態71.抗体がB7-H4またはCD22に結合する、実施形態69のコンジュゲート。
実施形態72.L1がペプチド模倣リンカーである、実施形態1のコンジュゲート。
実施形態73.L1が、下記式:
-Str-(PM)-Sp-
式中、
Strは、Abに共有結合したストレッチャー単位であり;
Abは抗体であり;
Spは、結合またはCIDE部分に共有結合したスペーサー単位であり;
PMは、
Figure 2022505450000232
Wは、-NH-ヘテロシクロアルキル-またはヘテロシクロアルキルであり;
Yは、ヘテロアリール、アリール、-C(O)C~Cアルキレン、C~Cアルキレン-NH、C~Cアルキレン-NH-CH、C~Cアルキレン-N-(CH、C~Cアルケニル、またはC~Cアルキレニルであり;
各Rは、独立して、C~C10アルキル、C~C10アルケニル、(C~Cアルキル)NHC(NH)NH、(C~Cアルキル)NHC(O)NH、(C~C10アルキル)NHC(NH)NH、または(C~C10アルキル)NHC(O)NHであり;
およびRは、それぞれ独立して、H、C~C10アルキル、C~C10アルケニル、アリールアルキル、または、ヘテロアリールアルキルであるか、または、RおよびRは、一緒に、C~Cシクロアルキルを形成してもよく;および
およびRは、それぞれ独立して、C~C10アルキル、C~C10アルケニル、アリールアルキル、ヘテロアリールアルキル、(C~C10アルキル)OCH-であるか、または、RおよびRは、一緒に、C~Cシクロアルキル環を形成してもよい、
からなる群から選択される、非ペプチド化学部分である、
で表されるペプチド模倣リンカーである、実施形態72のコンジュゲート。
実施形態74.Strが下記式:
Figure 2022505450000233
式中、Rは、C~C10アルキレン、C~C10アルケニル、C~Cシクロアルキル、(C~Cアルキレン)O-、およびC~C10アルキレン-C(O)N(R)-C~Cアルキレンからなる群から選択され、各アルキレンは、ハロ、トリフルオロメチル、ジフルオロメチル、アミノ、アルキルアミノ、シアノ、スルホニル、スルホンアミド、スルホキシド、ヒドロキシ、アルコキシ、エステル、カルボン酸、アルキルチオ、C~Cシクロアルキル、C~Cヘテロシクロアルキル、ヘテロアリールアルキル、アリールアリールアルキル、ヘテロアリールアルキルおよびヘテロアリールからなる群から選択される1~5個の置換基で置換されていてもよく、各Rは、独立して、Hまたは~Cアルキルであり;および
Spは、-C~Cアルキレン-C(O)NH-または-Ar-R-であり、Arはアリールまたはヘテロアリールであり、Rは(C~C10アルキレン)O-である、
で表される化学部分である、実施形態73のコンジュゲート。
実施形態75.Strが下記式:
Figure 2022505450000234
式中、Rは、C~C10アルキレン、C~C10アルケニル、(C~C10アルキレン)O-、N(R)-(C~Cアルキレン)-N(R)およびN(R)-(C~Cアルキレン)から選択され、各Rは、独立して、HまたはC~Cアルキルであり;および
Spは、-C~Cアルキレン-C(O)NH-または-Ar-R-であり、Arはアリールまたはヘテロアリールであり、Rは(C~C10アルキレン)O-である、
を有する、実施形態73のコンジュゲート。
実施形態76.L1が下記式:
Figure 2022505450000235
は、C~Cアルキル、(C~Cアルキル)NHC(NH)NH、または(C~Cアルキル)NHC(O)NHであり;
およびRは、一緒に、C~Cシクロアルキル環を形成する、
を有する、実施形態73のコンジュゲート。
実施形態77.下記式:
Figure 2022505450000236
式中、
Spは、結合またはCIDE部分Dに共有結合したスペーサー単位であり;
およびRは、それぞれ独立して、C~C10アルキル、C~C10アルケニル、アリールアルキル、ヘテロアリールアルキル、(C~C10アルキル)OCH-であるか、または、RおよびRは、一緒に、C~Cシクロアルキル環を形成してもよく;
は、独立して、C~C10アルキル、C~C10アルケニル、(C~Cアルキル)NHC(NH)NH、(C~Cアルキル)NHC(O)NH、(C~C10アルキル)NHC(NH)NH、または(C~C10アルキル)NHC(O)NHであり;
Strが下記式:
Figure 2022505450000237
は、C~C10アルキレン、およびC~C10アルキレン-C(O)N(R)-C~Cアルキレンからなる群から選択され、各アルキレンは、ハロ、トリフルオロメチル、ジフルオロメチル、アミノ、アルキルアミノ、シアノ、スルホニル、スルホンアミド、スルホキシド、ヒドロキシ、アルコキシ、エステル、カルボン酸、アルキルチオ、C~Cシクロアルキル、C~Cヘテロシクロアルキル、アリール、アリールアルキル、ヘテロアリールアルキル、およびヘテロアリールから選択される1~5個の置換基で置換されてもよく、各Rは、独立して、Hまたは~Cアルキルであり;
pは1、2、3、または4である、
で表される化学部分である、
を有する、実施形態57のコンジュゲート。
実施形態78.RおよびRが、一緒に、C~Cシクロアルキル環を形成してもよく、Rが、C~C10アルキル、または(C~Cアルキル)NHC(O)NHである、実施形態77のコンジュゲート。
実施形態79.RおよびRが、一緒に、シクロブチルを形成する、実施形態78のコンジュゲート。
実施形態80.当該リンカーの構造が、以下:
Figure 2022505450000238
からなる群から選択される、実施形態79のコンジュゲート。
実施形態81.Strが下記式:
Figure 2022505450000239
はC~Cアルキレンであり;
Spは、-C~Cアルキレン-C(O)NH-または-Ar-R-であり、Arはアリール、Rは(C~Cアルキレン)O-である、
で表される化学部分である、実施形態77のコンジュゲート。
実施形態82.下記式:
Figure 2022505450000240
式中、
pは1、2、3、または4であり;
は、C~Cアルキル-NH、(C~Cアルキル)NHC(NH)NH、または(C~Cアルキル)NHC(O)NHであり;
およびRは、それぞれ独立して、C~Cアルキルであり、当該アルキルは、非置換であるか、またはRおよびRはC~Cシクロアルキル環を形成してもよい、
を有する、実施形態57のコンジュゲート。
実施形態83.L1が、以下:
Figure 2022505450000241
式中、RおよびRは、独立して、H、およびC~Cアルキルから独立して選択されるか、または、RおよびRは、3、4、5、もしくは6員のシクロアルキル基または複素環基を形成する、
からなる群から選択される下記式を有する、実施形態57のコンジュゲート。
実施形態84.L1が下記式:
Figure 2022505450000242
を有する、実施形態83のコンジュゲート。
実施形態85.L1が下記式:
Figure 2022505450000243
式中、Aは、「ストレッチャー単位」であり、および、aは0~1の整数であり;Wは「アミノ酸単位」であり、および、wは0~12の整数であり;Yは「スペーサー単位」であり、および、yは0、1、または2である、
を有する、実施形態57のコンジュゲート。
実施形態86.ストレッチャー単位Aが下記式:
Figure 2022505450000244
を含む、実施形態85のコンジュゲート。
実施形態87.リンカーが下記式:
Figure 2022505450000245
を有する、実施形態86のコンジュゲート。
実施形態88.L1が下記式:
-A-Y
式中、AおよびYは上記のように定義される、
を有する、実施形態57のコンジュゲート。
実施形態89.L1が、
Figure 2022505450000246
である、実施形態88のコンジュゲート。
実施形態90.pが約1.0~約3である、実施形態57のコンジュゲート。
実施形態91.pが約2である、実施形態57のコンジュゲート。
実施形態92.DがL1に共有結合した残基であり、以下の構造:
Figure 2022505450000247
のうちの1つから選択される、実施形態57の方法。
実施形態93.L1-Dが当該Abに共有結合した残基であり、以下の構造:
Figure 2022505450000248
Figure 2022505450000249
Figure 2022505450000250
Figure 2022505450000251
のうちの1つから選択される、実施形態57のコンジュゲート。
実施形態94.Abが、B7-H4、HER2、およびCD22からなる群から選択される1つまたは複数のポリペプチドを結合する抗体である、実施形態93のコンジュゲート。
実施形態95.PBが、BRD4を結合し、下記構造:
Figure 2022505450000252
を有する基の残基である、実施形態61のコンジュゲート。
実施形態96.L1-Dが当該Abに共有結合した残基であり、以下の1つから選択される、実施形態95のコンジュゲート:L1BQ1、L1BQ2、L1BQ3、L1BQ4、LIBQ5、L1BQ6、L1BQ7、L1BQ8、L1BQ9、LIBQ10、L1BQ11、L1BQ12、L1BQ13、L1BQ14、LIBQ15、L1BQ16、L1BQ17、L1BQ18、L1BQ19、LIBQ20、L1BQ21、およびL1BQ22。
IV.合成経路
本明細書に記載される、CIDE、L1-CIDEおよびAb-CIDE、ならびにその他の化合物は、特に本明細書に含まれる説明に照らして、化学分野で周知のプロセスに類似するプロセス、および以下に記載される他の複素環のプロセスを含む合成経路によって合成することができる:「Comprehensive Heterocyclic Chemistry II」、KatritzkyおよびRees編、Elsevier(1997年)例として、第3巻;「Liebigs Annalen der Chemie」第9巻1910~16頁(1985年);「Helvetica Chimica Acta」第41巻1052~60頁(1958年);「Arzneimittel-Forschung」第40巻12号第1328~31頁(1990年)。出発材料は、一般に、Aldrich Chemicals(ウィスコンシン州ミルウォーキー)などの商業的供給元から入手可能であるか、または当業者に周知の方法を使用して容易に調製される(例えば、補足を含めて、Louis F.FieserおよびMary Fieser、「Reagents for Organic Synthesis」、1~23巻、Wiley,N.Y.(1967~2006年編)、もしくはBeilsteins Handbuch der organischen Chemie、4,Aufl.ed.Springer-Verlag、ベルリンに一般的に記載される方法によって調整される(Beilsteinオンラインデータベースを介しても入手可能)。
CIDE、L1-CIDEおよびAb-CIDEならびに本明細書に記載の他の化合物ならびに必要な試薬および中間体の合成に有用な合成化学変換および保護基方法論(保護および脱保護)は当技術分野で公知であり、例えば、R.Larock、「Comprehensive Organic Transformations」、VCH Publishers(1989年);T.W.GreeneおよびP.G.M.Wuts、「Protective Groups in Organic Synthesis」、第3版、John WileyおよびSons(1999年);ならびにL.Paquette編、「Encyclopedia of Reagents for Organic Synthesis」、John Wiley and Sons(1995年)およびその後続版に記載されているものが挙げられる。CIDE、L1-CIDEおよびAb-CIDEならびに他の化合物の調製において、中間体の遠隔官能性(例えば、一級アミンまたは二級アミン)の保護が必要な場合がある。このような保護の必要性は、離れている官能基の性質および調製方法の条件に応じて変わってくる。好適なアミノ保護基には、アセチル、トリフルオロアセチル、t-ブトキシカルボニル(BOC)、ベンジルオキシカルボニル(CBzまたはCBZ)、および9-フルオレニルメチレンオキシカルボニル(Fmoc)が含まれる。そのような保護の必要性は、当業者によって容易に決定される。保護基およびその用途の一般的な説明については、T.W.Greene、「Protective Groups in Organic Synthesis」、John Wiley&Sons、ニューヨーク(1991年)を参照されたい。
一般手順および実施例は、CIDE、L1-CIDEおよびAb-CIDEならびに本明細書に記載の他の化合物を調製するための例示的な方法を提供する。当業者は、PACおよび化合物を合成するために他の合成経路が使用され得ることを理解するであろう。特定の出発物質および試薬がスキーム、一般手順および実施例に示され議論されているが、他の出発物質および試薬を容易に置換して、種々の誘導体および/または反応条件を提供することができる。さらに、記載された方法によって調製された例示的な化合物の多くは、当業者に周知の従来の化学を使用して、本開示に照らしてさらに修飾することができる。
一般に、Ab-CIDEは、国際公開第2013/055987号;国際公開第2015/023355号;国際公開第2010/009124号;国際公開第2015/095227号の手順に従って、CIDEをL1リンカー試薬と連結してL1-CIDEを調製し、L1-CIDEを、本明細書に記載のシステイン操作抗体を含む抗体またはその変異体、突然変異、スプライス変異体、インデルおよび融合物のいずれかとコンジュゲートすることによって、調製することができる。あるいは、Ab-CIDEは、最初に、本明細書中に記載されるシステイン操作抗体を含む抗体またはその変異体、突然変異、スプライス変異体、インデルおよび融合体をL1リンカー試薬と結合させ、それを任意のCIDEとコンジュゲートさせることによって調製され得る。
以下の合成経路は、CIDE、L1-CIDEおよびAb-CIDEならびに他の化合物およびその成分を調製する例示的な方法を記載する。CIDE、L1-CIDEおよびAb-CIDEならびに他の化合物およびその成分を調製するための他の合成経路は、本明細書の他の箇所に開示されている。
1.リンカーL1
リンカーL1に関して、スキーム1~4は、抗体Abへのジスルフィド結合のための例示的なリンカーL1への合成経路を示す。Abはジスルフィド結合を介してL1に接続され、CIDEはCIDE上の任意の利用可能な結合を介してL1に接続される。
Figure 2022505450000253
スキーム1
スキーム1を参照して、1,2-ジ(ピリジン-2-イル)ジスルファンおよび2-メルカプトエタノールを室温でピリジンおよびメタノール中で反応させて、2-(ピリジン-2-イルジスルファニル)エタノールを得た。トリエチルアミンおよびアセトニトリル中の4-ニトロフェニルカルボノクロリド酸塩によるアシル化により、4-ニトロフェニル2-(ピリジン-2-イルジスルファニル)エチルカーボネート9を得た。
Figure 2022505450000254
スキーム2
スキーム2を参照して、無水DMF/MeOH(25mL/25mL)中の1,2-ビス(5-ニトロピリジン-2-イル)ジスルファン10(1.0g、3.22mmol)の混合物に、HOAc(0.1mL)を添加し、続いて2-アミノエタンチオール塩酸塩11(183mg、1.61mmol)を添加した。反応混合物を室温で撹拌した後、一晩、これを真空下で濃縮して溶媒を除去し、残渣をDCM(30mL×4)で洗浄すると、2-((5-ニトロピリジン-2-イル)ジスルファニル)エタンアミン塩酸塩12が淡黄色固体(300mg、69.6%)として得られた。HNMR(400MHz,DMSO-d)δ9.28(d,J=2.4Hz,1H),8.56(dd,J=8.8,2.4Hz,1H),8.24(s,4H),8.03(d,J=8.8Hz,1H),3.15-3.13(m,2H),3.08-3.06(m,2H).
Figure 2022505450000255
スキーム3
スキーム3を参照して、無水DCM/CHOH(250mL/250mL)中の1,2-ビス(5-ニトロピリジン-2-イル)ジスルファン10(9.6g、30.97mmol)および2-メルカプトエタノール(1.21g、15.49mmol)の溶液をN下で24時間室温で撹拌した。混合物を真空下で濃縮した後、残渣をDCM(300mL)で希釈した。MnO(10g)を添加し、混合物を室温で撹拌した。さらに0.5時間。混合物をシリカゲルでのカラムクロマトグラフィー(DCM/MeOH=100/1~100/1)により精製して、2-((5-ニトロピリジン-2-イル)ジスルファニル)エタノール13(2.2g、61.1%)を褐色油状物として得た。HNMR(400MHz,CDCl)δ9.33(d,J=2.8Hz,1H),8.38-8.35(dd,J=9.2,2.8Hz,1H),7.67(d,J=9.2Hz,1H),4.10(t,J=7.2Hz,1H),3.81-3.76(q,2H),3.01(t,J=5.2Hz,2H).
13(500mg、2.15mmol)の無水DMF(10mL)溶液に、DIEA(834mg、6.45mmol)を添加し、続いてPNPカーボネート(ビス(4-ニトロフェニル)カーボネート、1.31g、4.31mmol)を添加した。反応溶液を室温で4時間撹拌し、混合物を分取HPLC(FA)によって精製して、4-ニトロフェニル2-((5-ニトロピリジン-2-イル)ジスルファニル)エチルカーボネート14(270mg、33.1%)を淡褐色の油状物として得た。HNMR(400MHz,CDCl)δ9.30(d,J=2.4Hz,1H),8.43-8.40(dd,J=8.8,2.4Hz,1H),8.30-8.28(m,2H),7.87(d,J=8.8Hz,1H),7.39-7.37(m,2H),4.56(t,J=6.4Hz,2H),3.21(t,J=6.4Hz,2H).
Figure 2022505450000256
スキーム4
スキーム4を参照して、塩化スルフリル(DCM中2.35mLの1.0Mの溶液、2.35mmol)を、乾燥DCM(7.5mL)中、5-ニトロピリジン-2-チオール(334mg、2.14mmol)の撹拌懸濁液に、アルゴン雰囲気下、0℃(氷/アセトン)で滴下して加えた。反応混合物は黄色の懸濁液から黄色の溶液となり、それを室温まで温め、その後、2時間撹拌してから、溶媒を真空中蒸発によって除去して、黄色固体を得た。固体をDCM(15mL)中に再溶解し、(R)-2-メルカプトプロパン-1-オール(213mg、2.31mmol)の乾燥DCM溶液(7.5mL)で、アルゴン雰囲気下、0℃で液滴処理した。反応混合物を室温まで温め、20時間撹拌し、この時点でLC/MSによる分析は、保持時間1.41分間(ES+)m/z247([M+H]+.、約100%の相対強度)での実質的な生成物形成を示した。沈殿物をフィルタにかけることによって除去し、濾液を真空中で蒸発させて、橙色固体を得、これをHO(20mL)で処理し、水酸化アンモニウム溶液で塩基性化した。混合物をDCM(3×25mL)で抽出し、合わせた抽出物をHO(20mL)、ブライン(20mL)で洗浄し、乾燥させ(MgSO)、フィルタにかけ、真空中で蒸発させて、粗生成物を得た。フラッシュクロマトグラフィー(1%の増分の勾配溶出:100%のDCMから98:2v/vのDCM/MeOH)による精製によって、(R)-2-((5-ニトロピリジン-2-イル)ジスルファニル)プロパン-1-オール15を油(111mg、21%の収率)として得た。
DCM(10mL)中のトリホスゲン、ClCOCOOCCl、Sigma Aldrich、CAS Reg.番号32315-10-9(241mg、0.812mmol)の溶液に、(R)-2-((5-ニトロピリジン-2-イル)ジスルファニル)プロパン-1-オール15(500mg、2.03mmol)およびピリジン(153mg、1.93mmol)のDCM(10mL)溶液を20℃で滴下した。反応混合物を20℃で30分間撹拌した後、これを濃縮し、(R)-2-((5-ニトロピリジン-2-イル)ジスルファニル)カルボノクロリド酸プロピル16をさらに精製することなく直接使用して、カルボノクロリド酸基を通してCIDE上の任意の利用可能な基を共有結合させることができる。
2.システイン操作抗体
還元および再酸化によるコンジュゲーションのためのシステイン操作抗体に関して、それらは一般に以下のように調製することができる。軽鎖アミノ酸は、Kabatに従って番号付けされる(Kabatら、「Sequences of proteins of immunological interest」、(1991年)、第5版,US Dept of Health and Human Service、National Institutes of Health、メリーランド州ベセスダ)。重鎖アミノ酸は、Kabatシステムとして記載されている場合を除いて、EUナンバリングシステム(Edelmanら(1969年)「Proc.Natl.Acad.of Sci.」、63(1):78~85頁)に従ってナンバリングされる。一文字アミノ酸略号が使用される。
CHO細胞中で発現された完全長のシステイン操作されたモノクローナル抗体(THIOMAB(商標)抗体)は、システイン付加物(シスチン)を有するか、または細胞培養条件のために、操作されたシステイン上でグルタチオン付加される。このように、CHO細胞から精製されたTHIOMAB(商標)抗体は、Cys反応性リンカーL1-CIDE中間体にコンジュゲートすることができない。システイン操作抗体を、DTT(Clelandの試薬、ジチオスレイトール)またはTCEP(トリス(2-カルボキシエチル)ホスフィン塩酸塩;Getzら(1999年)、「Anal.Biochem.」273巻:73~80頁;Soltec Ventures、マサチューセッツ州ビバリー)などの還元剤で処理した後、デヒドロアスコルビン酸などの穏やかな酸化剤で鎖間ジスルフィド結合を再形成(再酸化)することによって、本明細書に記載のL1-CIDE中間体とのコンジュゲーションに対して反応性にすることができる。CHO細胞(Gomezら(2010年)「Biotechnology and Bioeng.」105(4):748~760頁;Gomezら(2010年)「Biotechnol.Prog.」26:1438~1445頁)中で発現される完全長のシステイン操作されたモノクローナル抗体(THIOMAB(商標)抗体)を、例えば、室温で2mM EDTAを含む50mM Tris、pH 8.0中で一晩、約50倍過剰のDTTで還元し、これにより、Cysおよびグルタチオン付加物が除去され、ならびに抗体中の鎖間ジスルフィド結合が還元された。付加物の除去をPLRP-Sカラムを使用する逆相LCMSによって監視した。還元されたTHIOMAB(商標)抗体を希釈し、少なくとも4体積の10mMのコハク酸ナトリウム(pH 5)緩衝液に添加することによって酸性にした。
あるいは、抗体を希釈し、少なくとも4体積の10mMのコハク酸(pH 5)に添加し、pHが約5になるまで10%の酢酸によって滴定することによって酸性にした。pHを下げ、希釈したTHIOMAB(商標)抗体を、その後、HiTrap Sカチオン交換カラムに負荷し、数カラム体積の10mMの酢酸ナトリウム(pH 5)で洗浄し、50mMのトリス(pH 8.0)、150mMの塩化ナトリウムで溶出した。再酸化を実行することによって、親Mab内に存在するシステイン残基間のジスルフィド結合を再度確立した。溶出され、還元された上述のTHIOMAB(商標)抗体を、15×デヒドロアスコルビン酸(DHAA)で約3時間、またはあるいは、200nM~2mMの水性硫酸銅(CuSO)で室温で一晩処理した。当該技術分野において既知である他の酸化体(すなわち、酸化剤)および酸化条件が使用され得る。周囲空気酸化もまた、効果的であり得る。この穏やかな部分的再酸化工程により、高い忠実度で鎖内ジスルフィドを効率的に形成する。再酸化は、PLRP-Sカラムを使用する逆相LCMSによって監視した。再酸化したTHIOMAB(商標)抗体を上述のコハク酸緩衝液で希釈して、約pH 5に到達させ、10mMのコハク酸(pH 5)、10mMのコハク酸(pH 5)(緩衝液A)中300mMの塩化ナトリウム(緩衝液B)の勾配で溶出を実行したことを除いて、上述のようにSカラムで精製を実行した。溶出したTHIOMAB(商標)抗体に、EDTAを最終濃度2mMまで添加し、必要に応じて5mg/mLを超える最終濃度に達するように濃縮した。コンジュゲーションの準備ができた得られたTHIOMAB(商標)抗体をアリコートで-20℃または-80℃で保存した。液体クロマトグラフィー/質量分析を、6200シリーズのTOFまたはQTOF Agilent LC/MSで行った。80℃まで加熱したPRLP-S(登録商標)、1000A、ミクロボアカラム(50mm×2.1mm、Polymer Laboratories、英国シュロップシャー)で試料のクロマトグラフィーを行った。30~40%B(溶媒A:水中0.05%TFA、溶媒B:アセトニトリル中0.04%TFA)の直線勾配を使用し、エレクトロスプレー源を使用して溶離液を直接イオン化した。データを回収し、MassHunterソフトウェア(Agilent)によってデコンボリューションした。LC/MS分析の前に、抗体またはコンジュゲート(50マイクログラム)をPN Gase F(2単位/ml;PROzyme、カリフォルニア州サンリアンドロ)で37℃にて2時間処理して、N結合型炭水化物を除去した。
あるいは、抗体またはコンジュゲートを、37℃で15分間、LysC(0.25μg/50μg(マイクログラム)抗体またはコンジュゲート)で部分的に消化して、LCMSによる分析のためのFabおよびFcフラグメントを得た。デコンボリューションしたLCMSスペクトルのピークを割り当て、定量化した。観察されたすべてのピークに対するCIDE結合抗体に対応する1つまたは複数のピークの強度の比を計算することによって、CIDE対抗体比(CAR)を計算した。
3.リンカーL1-CIDE基の抗体へのコンジュゲーション
リンカーL1-CIDE化合物を抗体にコンジュゲートする1つの方法では、上記の還元および再酸化手順の後、システイン操作抗体(THIOMAB(商標)抗体)を、10mMコハク酸塩、pH 5、150mM NaCl、2mM EDTA中で、1M TrisでpH 7.5~8.5にpH調整する。チオール反応性基(例えば、マレイミドまたは4-ニトロピリジジスルフィド)を有する約3モル~20当量の過剰のリンカー-CIDE中間体をDMF、DMAまたはプロピレングリコールに溶解し、還元、再酸化およびpH調整した抗体に添加する。反応を室温または37℃でインキュベートし、反応混合物のLCMS分析によって決定される完了まで(1~約24時間)監視する。反応が完了すると、コンジュゲートは、残りの未反応L1-CIDE中間体および凝集したタンパク質(有意なレベルで存在する場合)を除去することを目的とする、いくつかの方法の1つまたは任意の組み合わせによって精製される。例えば、コンジュゲートを、最終pHが約5.5になるまで10mMのヒスチジン-酢酸(pH 5.5)で希釈し、Akta精製システムに接続されたHiTrap Sカラム(GE Healthcare)またはSマキシスピンカラム(Pierce)のいずれかを使用するSカチオン交換カラムクロマトグラフィーによって精製し得る。あるいは、コンジュゲートを、Akta精製システムに接続されたS200カラムまたはZebaスピンカラムを使用するゲル濾過クロマトグラフィーによって精製し得る。あるいは、透析を使用してもよい。ゲル濾過または透析のいずれかを使用して、THIOMAB(商標)抗体-薬物コンジュゲートを、240mMのスクロースを有する20mMのHis/酢酸(pH 5)中に製剤化した。精製されたコンジュゲートを、遠心分離限外濾過によって濃縮し、無菌条件下で0.2-μmのフィルタを通してフィルタにかけ、保管のために凍結する。PACをBCAアッセイによって特性評価して、タンパク質濃度を決定し、凝集分析のために分析的SEC(サイズ排除クロマトグラフィー)を行い、リジンCエンドペプチダーゼ(LysC)での処理後にLC-MSを行って、CARを計算した。
0.75ml/分の流量で、0.25mMの塩化カリウムおよび15%のIPAを有する0.2Mのリン酸カリウム(pH 6.2)中、Shodex KW802.5カラムを使用して、コンジュゲートに対してサイズ排除クロマトグラフィーを実施する。コンジュゲートの凝集状態は、280nmの溶出ピーク面積吸光度の積分によって決定した。
Agilent QTOF 6520 ESI機器を使用して、Ab-CIDEに対してLC-MS分析を実行し得る。一例として、CARを、Tris(pH 7.5)中、1:500w/wエンドプロテイナーゼLys C(Promega)で37℃で30分間処理する。結果として得られた切断断片を、80℃に加熱した1000Å(Angstrom)、8μm(ミクロン)PLRP-S(高度架橋ポリスチレン)カラムに負荷し、30%のB~40%のBまでの勾配で5分間溶出する。移動相Aは、0.05%のTFAを有するHOであり、移動相Bは、0.04%のTFAを有するアセトニトリルであった。流量は、0.5ml/分であった。タンパク質溶出を、280nmでのUV吸光度検出によって、エレクトロスプレーイオン化およびMS分析の前に監視した。非コンジュゲートFc断片、残渣非コンジュゲートFab、および薬物化Fabのクロマトグラフィー分解が、通常達成された。得られたm/zスペクトルを、Mass Hunter(商標)ソフトウェア(Agilent Technologies)を用いてデコンボリューションして、抗体断片の質量を算出した。
V.製剤
本明細書に記載される治療用CIDE-抗体-コンジュゲート(PAC)の薬学的製剤は、非経口投与、例えば、薬学的に許容可能な非経口賦形剤を用いたボーラス、静脈内、腫瘍内注射のために、および単位投与量の注射可能な形態で調製することができる。所望の純度を有するPACを、場合により、再構成のための凍結乾燥製剤または水溶液の形態で、1つまたは複数の薬学的に許容可能な賦形剤(「Remington’s Pharmaceutical Sciences」(1980年)第16版、Osol,A.編)と混合する。
PACを、医薬組成物として標準的な製薬慣行に従って製剤化することができる。この態様によれば、1つまたは複数の薬学的に許容可能な賦形剤と会合したPACを含む医薬組成物が提供される。
典型的な製剤は、PACを担体および/または希釈剤などの賦形剤と混合することによって調製される。好適な担体、希釈剤、および他の賦形剤は当業者に周知であり、炭水化物、ワックス、水溶性および/または水膨潤性ポリマー、親水性または疎水性材料、ゼラチン、油、溶媒、ならびに水などの材料を含む。使用される特定の担体、希釈剤、または他の賦形剤は、PACが適用される手段および目的に依存する。溶媒は、一般的に、哺乳動物に投与することが安全(GRAS)であると当業者によって認識されている溶媒に基づいて選択される。
一般に、安全な溶媒は、水および水に可溶性または混和性である他の非毒性溶媒などの非毒性水性溶媒である。好適な水性溶媒としては、水、エタノール、プロピレングリコール、ポリエチレングリコール(例えば、PEG 400、PEG 300)等、およびそれらの混合物を含む。許容される希釈剤、担体、賦形剤および安定化剤は、用いられる投与量および濃度においてレシピエントに対して非毒性であり、ホスフェート、シトレートおよびその他の有機酸などの緩衝剤;アスコルビン酸およびメチオニンを含む抗酸化剤;防腐剤(オクタデシルジメチルベンジル塩化アンモニウム;塩化ヘキサメトニウム;塩化ベンザルコニウム;塩化ベンゼトニウム;フェノール、ブチルまたはベンジルアルコール;メチルまたはプロピルパラベンなどのアルキルパラベン;カテコール;レゾルシノール;シクロヘキサノール;3-ペンタノール;およびm-クレゾールなど);低分子量(約10残基未満)ポリペプチド;血清アルブミン、ゼラチンもしくは免疫グロブリンなどのタンパク質;ポリビニルピロリドンなどの親水性ポリマー;グリシン、グルタミン、アスパラギン、ヒスチジン、アルギニンもしくはリジンなどのアミノ酸;グルコース、マンノースもしくはデキストリンを含む単糖類、二糖類およびその他の炭水化物;EDTAなどのキレート剤;ショ糖、マンニトール、トレハロースもしくはソルビトールなどの糖;ナトリウムなどの塩形成対イオン;金属錯体(例えば、Zn-タンパク質錯体);ならびに/またはTWEEN(商標)、PLURONICS(商標)もしくはポリエチレングリコール(PEG)などの非イオン性界面活性剤を含む。
製剤はまた、PACの的確な提示を提供するか、または医薬品の製造を補助するために、1つまたは複数の緩衝剤、安定化剤、界面活性剤、湿潤剤、潤滑剤、乳化剤、懸濁化剤、防腐剤、抗酸化剤、オペーク剤(opaquing agent)、流動促進剤、加工助剤、着色剤、甘味剤、芳香剤、香味剤および他の既知の添加剤も含み得る。製剤は、従来の溶解および混合手順を使用して調製されてもよい。
製剤は、周囲温度で、適切なpHで、および所望の度合いの純度で、生理学的に許容される担体、すなわち、用いられる用量および濃度においてレシピエントに対して非毒性である担体と混合することによって行われてもよい。製剤のpHは、具体的な用途および化合物の濃度に主に依存するが、約3~約8の範囲であってもよい。pH 5の酢酸塩緩衝液中の製剤は、適切な態様である。
PAC製剤は無菌であり得る。特に、インビボ投与用に使用される製剤は、滅菌性でなければならない。かかる無菌化は、無菌濾過膜を通じた濾過によって容易に達成される。
PACは、通常、固体組成物、凍結乾燥製剤として、または水溶液として保管され得る。
PACを含む医薬組成物は、充分な医学的実用性に合わせた様式で、すなわち、量、濃度、スケジュール、コース、賦形剤、および投与経路で製剤化され、処方され、投与され得る。これに関連して考慮すべき要因としては、治療される特定の障害、治療される特定の哺乳動物、個々の患者の臨床症状、障害の原因、薬剤の送達部位、投与方法、投与スケジュール、および医療従事者に既知である他の要因が挙げられる。投与されるべき化合物の「治療的有効量」は、このような考慮によって管理され、凝固因子によって媒介される障害を予防、軽減または治療するために必要な最小の量である。そのような量は、好ましくは、宿主に対して毒性である量、または宿主を出血に対して著しくより感受性にする量を下回る。
PACは、容易に制御可能な薬物用量を提供し、所定のレジメンで患者コンプライアンスを可能にするように薬学的剤形に製剤化され得る。適用のための薬学的組成物(または製剤)は、薬物を投与するために使用される方法に応じて、多様な様式で包装されてもよい。一般的に、分配用物品は、薬学的製剤をその中に適した形態で配置した容器を含む。好適な容器は、当業者に周知であり、瓶(プラスチックおよびガラス)、小袋(sachets)、アンプル、プラスチックバッグ、金属シリンダーなどの材料が挙げられる。容器は、パッケージの内容物への不用意なアクセスを防止するための不正開封防止アセンブリを含んでもよい。それに加えて、容器は、容器の内容物を説明するラベルをその上に配置している。ラベルは、適切な注意書きも含み得る。
医薬組成物は、水性または油性の減菌注射用懸濁液などの減菌注射用調製物の形態であってもよい。この懸濁液は、上述されているこれらの好適な分散剤または湿潤剤および懸濁化剤を使用して、既知の技術に従って製剤化され得る。無菌注射可能調製物は、1,3-ブタンジオールなどの非毒性の非経口的に許容される希釈剤または溶媒中の無菌注射可能溶液または懸濁液でもあり得る。無菌注射可能調製物は、凍結乾燥された粉末としても調製され得る。利用され得る許容される賦形剤および溶媒には、水、リンゲル液および等張性塩化ナトリウム溶液がある。加えて、無菌の不揮発性油が、溶媒または懸濁媒として慣習的に用いられ得る。この目的のために、合成モノグリセリドまたは合成ジグリセリドを含むいかなる無刺激の不揮発性油も採用され得る。加えて、オレイン酸などの脂肪酸が、注射剤の調製において同様に使用され得る。
単一剤形を作製するために担体材料と組み合わせることができるPACの量は、治療される宿主および特定の投与様式に依存して変化し得る。例えば、ヒトへの経口投与を意図した徐放性製剤は、総組成物の約5~約95%(重量:重量)まで変化し得る、適切かつ都合の良い量の担体材料と配合される、およそ1~1000mgの活性材料を含有し得る。医薬組成物は、投与のために容易に測定可能な量を提供するように調製され得る。例えば、静脈内注入が意図される水溶液は、約30mL/時間の速度での好適な容量の注入が起こり得るように、1ミリリットルの溶液あたり約3~500μgの活性成分を含有し得る。
非経口投与に適した製剤には、抗酸化剤、緩衝剤、静菌剤、および製剤を対象とするレシピエントの血液と等張にする溶質を含有し得る水性および非水性の無菌注射溶液、ならびに懸濁化剤および増粘剤を含み得る水性および非水性の無菌懸濁液が含まれる。
製剤は、単位用量または複数回の用量容器、例えば、密封アンプルおよびバイアルに包装されてもよく、使用直前に注射するために、例えば、水等の滅菌液体担体を添加するだけでよいフリーズドライ(凍結乾燥)状態で保管されてもよい。即席の注射溶液および懸濁液を、前述の種類の滅菌粉末、顆粒および錠剤から調製する。好ましい単位投与量製剤は、活性成分の本明細書に上記した一日用量または一日単位副用量、またはその適切な画分を含有するものである。
主題は更に、上で定義した少なくとも1つの活性成分と、活性成分用の獣医用の担体を共に含む、獣医用組成物を提供する。獣医用担体は、本組成物の投与の目的に有用な材料であり、またさもければ不活性であるか、または獣医学の技術分野において許容され、活性成分と両立可能な固体、液体、または気体材料であってもよい。これらの獣医用組成物は、非経口で、または任意の他の所望の経路によって投与されてもよい。
VI.適応症および治療方法
本明細書に開示されるCIDE-抗体コンジュゲート(PAC)は、様々な疾患または障害を治療するために使用され得ることが企図される。例示的な過剰増殖性障害としては、良性または悪性の固形腫瘍、ならびに白血病およびリンパ系腫瘍などの血液疾患が挙げられる。他には、ニューロン性、膠細胞性、星状細胞性、視床下部性、腺性、マクロファージ性、上皮性、間質性、胞胚腔性、炎症性、血管新生性、および免疫性(自己免疫性を含む)障害が挙げられる。
治療に使用するためのPACまたはPACを含む組成物も本明細書で提供される。いくつかの実施形態において、標的タンパク質を分解することが望ましい疾患または障害(例えば癌)などの本明細書に開示される疾患および障害を治療または予防するためのPACまたはPACを含む組成物が本明細書で提供される。治療におけるPACまたはPACを含む組成物の使用も本明細書で提供される。いくつかの実施形態において、本明細書に開示される疾患および障害を治療または予防するためのPACの使用が本明細書で提供される。本明細書で開示される疾患および障害を治療または予防するための医薬品の製造におけるPACまたはPACを含む組成物の使用も本明細書で提供される。
一般に、治療される疾患または障害は、癌などの過剰増殖性疾患である。本発明で治療される癌の例としては、癌腫、リンパ腫、芽細胞腫、肉腫、および白血病またはリンパ性悪性腫瘍が挙げられるが、これらに限定されない。そのような癌のより具体的な例としては、扁平上皮細胞癌(例えば、上皮性扁平上皮細胞癌)、肺癌(小細胞肺癌、非小細胞肺癌、肺の腺癌、および肺の扁平上皮癌を含む)、腹膜の癌、肝細胞癌、胃癌(gastric cancer)または胃癌(stomach cancer)(消化管癌を含む)、膵臓癌、膠芽腫、子宮頸癌、卵巣癌、肝臓癌、膀胱癌、肝細胞癌、乳癌、結腸癌、直腸癌、結腸直腸癌、子宮内膜癌または子宮癌、唾液腺癌、腎臓癌(kidney cancer)または腎臓癌(renal cancer)、前立腺癌、外陰部癌、甲状腺癌、肝癌、肛門癌、陰茎癌、ならびに頭頸部癌が挙げられる。
PACを治療に使用することができる自己免疫疾患としては、リウマチ性障害(例えば、関節リウマチ、シェーグレン症候群、強皮症、全身性エリテマトーデス(SLE)およびループス腎炎などの狼瘡、多発性筋炎/皮膚筋炎、クリオグロブリン血症、抗リン脂質抗体症候群、ならびに乾癬性関節炎など)、骨関節炎、自己免疫性胃腸および肝障害(例えば、炎症性腸疾患(例えば、潰瘍性大腸炎およびクローン病)、自己免疫性胃炎および悪性貧血、自己免疫性肝炎、原発性胆汁性肝硬変、原発性硬化性胆管炎およびセリアック病など)、血管炎(例えば、ANCA関連血管炎、例えば、チャーグ・ストラウス血管炎、ウェゲナー肉芽腫症および多発性動脈炎など)、自己免疫性神経障害(例えば、多発性硬化症、眼球クローヌス・ミオクローヌス運動失調、重症筋無力症、視神経脊髄炎、パーキンソン病、アルツハイマー病、および自己免疫性多発ニューロパチー)、腎障害(例えば、糸球体腎炎、グッドパスチャー症候群、およびベルガー病)、自己免疫性皮膚疾患(例えば、乾癬、蕁麻疹(urticaria)、蕁麻疹(hives)、尋常性天疱瘡、水疱性類天疱瘡、および皮膚エリテマトース)、血液疾患(例えば、血小板減少性紫斑病、血小板減少性紫斑病、血栓性血小板減少性紫斑病、輸血後紫斑、および自己免疫性血球溶解性貧血など)、アテローム性動脈硬化症、ブドウ膜炎、自己免疫性の難聴疾患(例えば、内耳疾患および難聴など)、ベケット病、レイノー症候群、臓器移植、ならびに自己免疫性内分泌疾患(例えば、インスリン依存性糖尿病(IDDM)などの糖尿病関連の自己免疫疾患、アジソン病、自己免疫甲状腺疾患(例えば、Graves病および甲状腺炎)が挙げられる。より好ましいそのような疾患としては、例えば、関節リウマチ、潰瘍性大腸炎、ANCA関連血管炎、狼瘡、多発性硬化症、シェーグレン症候群、グレーブス病、IDDM、悪性貧血、甲状腺炎および糸球体腎炎が挙げられる。
特定の実施形態において、上記のものなどの抗NaPi2b抗体を含むPACは、固形腫瘍、例えば卵巣を治療する方法で使用される。
別の実施形態において、PACおよび抗CD33抗体(本明細書に記載されるものなど)は、非ホジキンリンパ腫(NHL)、びまん性大細胞型造血リンパ腫、濾胞性リンパ腫、マントル細胞リンパ腫、慢性リンパ性白血病、多発性骨髄腫、急性骨髄性白血病(AML)、および骨髄性細胞白血病(MCL)など、ならびにB細胞関連癌および増殖性障害を治療する方法に使用される。参照:米国特許第8226945号;Liら(2013)「Mol.Cancer.Ther.」12(7):1255-1265;Polsonら(2010)「Leukemia」24:1566-1573;Polsonら(2011)「Expert Opin.Investig.Drugs」20(1):75-85。
別の実施形態において、本明細書に記載されるものなどの抗MUC16抗体を含むPACが、卵巣癌、乳癌および膵癌を治療する方法で使用される。癌は、MUC16/CA125/O772Pポリペプチドの発現または活性に関連し得る。参照:国際公開第2007/001851号;米国特許第7989595号;米国特許第8449883号;米国特許第7723485号;Chenら(2007年)「Cancer Res.」67(10):4924~4932頁;Junutulaら(2008年)「Nature Biotech」、26(8):925~932頁。
特定の実施形態において、抗HER2抗体、例えば上記のものを含むPACは、癌、例えば乳癌または胃癌、より具体的にはHER2+乳癌または胃癌を治療する方法で使用され、この方法は、そのような治療を必要とする患者にそのようなPACを投与することを含む。そのような一実施形態において、PACは抗HER2抗体トラスツズマブまたはペルツズマブを含む。
PACは、治療される症状に適した任意の経路によって投与され得る。PACは、典型的には非経口的に、すなわち注入、皮下、筋肉内、静脈内、皮内、髄腔内および硬膜外に投与される。
PACは、単独で、または治療において他の薬剤と組み合わせて使用することができる。例えば、PACを少なくとも1種のさらなる治療薬と同時投与することができる。上述のかかる併用療法は、併用投与(2つ以上の治療剤が同じまたは別個の製剤中に含まれる)、および個別投与を包含するが、この場合、PACの投与は、追加の治療剤および/またはアジュバントの投与の前に、それと同時に、かつ/またはその後に行われ得る。PACはまた、放射線療法と組み合わせて使用することもできる。
PAC(および任意の追加の治療剤)は、非経口、肺内、および鼻腔内を含み、局所治療に所望される場合、病巣内投与を含む、任意の好適な手段によって投与され得る。非経口輸注としては、筋肉内、静脈内、動脈内、腹腔内、または皮下投与が挙げられる。投薬は、任意の適切な経路によるもの、例えば、一部には、投与が一時的であるか慢性的であるかに依存して、注射によって、例えば、静脈または皮下への注射によるものであってもよい。限定されないが、種々の時間点にわたる単回または複数回の投与、ボーラス投与、パルス注入を含む種々の投薬計画が本明細書で想定される。
疾患の予防または治療のために、PACの適切な投与量(単独でまたは1つまたは複数の他の追加の治療剤と組み合わせて使用される場合)は、治療される疾患の種類、PACの種類、疾患の重症度および経過、PACが予防目的で投与されるか治療目的で投与されるか、以前の治療法、患者の病歴およびPACに対する応答、ならびに主治医の裁量に依存する。PACは、好適には、患者に一度にまたは一連の治療にわたって投与される。疾患の種類および重症度に応じて、約1μg/kg~15mg/kg(例えば、0.1mg/kg~10mg/kg)のPACが、例えば、1回以上の別個の投与によるか、または連続注入によるかにかかわらず、患者への投与のための初期候補投薬量であり得る。典型的な1日投薬量は、上述の因子に依存して、約1μg/kg~100mg/kgの範囲であってもよい。数日間またはそれ以上にわたる反復投与において、症状に応じ、治療は通常、疾患症状の所望の抑制が生じるまで続けられる。PACの1つの例示的な投与量は、約0.05mg/kgから約10mg/kgの範囲であろう。したがって、約0.5mg/kg、2.0mg/kg、4.0mg/kg、または10mg/kg(またはこれらの任意の組合せ)のうちの1つまたは複数の用量が、患者に投与され得る。かかる用量は、間欠的に、例えば、毎週または3週間に1回(例えば、患者が約2~約20回、または例えば約6回の用量を受けるように)投与され得る。最初の多めの投与量、それに続く1回以上の量の少ない用量を投与してよい。しかしながら、他の投薬レジメンが有用であってもよい。この治療の進行は、従来の技術およびアッセイによって容易にモニタリングされる。
本明細書に記載の方法は、標的タンパク質を分解する方法を含む。特定の実施形態において、本方法が、対象にPACを投与することを含み、標的タンパク質が分解される。タンパク質の分解レベルは、約1%~約5%;または約1%~約10%;または約1%~約15%;または約1%~約20%;約1%~約30%;または約1%~約40%;約1%~約50%;または約10%~約20%;または約10%~約30%;または約10%~約40%;または約10%~約50%;または少なくとも約1%;または少なくとも約10%;または少なくとも約20%;または少なくとも約30%;または少なくとも約40%;または少なくとも約50%;または少なくとも約60%;または少なくとも約70%;または少なくとも約80%;または少なくとも約90%;または少なくとも約95%;または少なくとも約99%であり得る。
本明細書に記載の方法は、新生物組織の増殖を減少させる方法を含む。特定の実施形態において、本方法が、PACを対象に投与することを含み、新生物組織の増殖が低下する。低下のレベルは、約1%~約5%;または約1%~約10%;または約1%~約15%;または約1%~約20%;約1%~約30%;または約1%~約40%;約1%~約50%;または約10%~約20%;または約10%~約30%;または約10%~約40%;または約10%~約50%;または少なくとも約1%;または少なくとも約10%;または少なくとも約20%;または少なくとも約30%;または少なくとも約40%;または少なくとも約50%;または少なくとも約60%;または少なくとも約70%;または少なくとも約80%;または少なくとも約90%;または少なくとも約95%;または少なくとも約99%であり得る。
VII.製造物品
別の態様では、本明細書に記載されるのは、製造品であり、例えば、上記の疾患および障害の治療に有用な材料を含む「キット」が提供される。キットは、PACを含む容器を備える。本キットは、容器上の、または容器に関連したラベルまたは添付文書をさらに含んでもよい。「添付文書」という用語は、かかる治療薬の適応症、使用法、投薬量、投与、禁忌症についての情報、および/またはその使用に関する警告を含む、治療薬の商用のパッケージに通例含まれる説明書を指すように使用される。
適切な容器としては、例えば、ボトル、バイアル、シリンジ、ブリスターパックなどが挙げられる。「バイアル」は、液体または凍結乾燥調製物を保持するのに適した容器である。一実施形態において、バイアルは、単回使用バイアル、例えば、栓を有する20ccの単回使用バイアルである。容器は、ガラスまたはプラスチックなどの様々な材料から形成され得る。容器は、症状を治療するのに有効なPACまたはその製剤を保持してもよく、滅菌アクセスポートを有してもよい(例えば、容器は、静注溶液バッグ、または皮下注射針によって穿刺可能なストッパーを有するバイアルであってもよい)。
組成物中の少なくとも1つの活性物質はPACである。ラベルまたは添付文書は、本組成物が癌等の選択された症状を治療するために使用されることを示す。さらに、ラベルまたは添付文書は、治療される患者が、過剰増殖性障害、神経変性、心肥大、疼痛、片頭痛、または神経外傷性疾患もしくは事象などの障害を有する患者であることを示すことができる。一実施形態において、ラベルまたは添付文書は、PACを含む組成物を使用して、異常な細胞増殖に起因する障害を治療できることを示す。ラベルまたは添付文書はまた、該組成物が他の障害を治療するために使用され得ることも示してもよい。これに代えて、またはこれに加えて、製造物品は、薬学的に許容可能な緩衝液、例えば、注射用静菌水(BWFI)、リン酸緩衝化生理食塩水、リンゲル液およびデキストロース溶液を含む第2の容器を更に備えていてもよい。他の緩衝液、希釈剤、フィルタ、ニードルおよびシリンジを含め、商業的およびユーザの観点から望ましい他の材料を更に含んでいてもよい。
キットは、PACおよび存在する場合には第2の医薬製剤の投与のための指示書をさらに含み得る。例えば、キットがPACを含む第1の組成物と第2の薬学的製剤とを含む場合、キットは、キットを必要とする患者に対する、第1および第2の薬学的組成物の同時の、連続した、または別個の投与に関する指示書をさらに含んでもよい。
別の実施形態において、キットは、PACの固体経口用形態(例えば錠剤またはカプセル)の送達に好適である。かかるキットは好ましくは、いくつかの単位投薬量を含む。かかるキットは、それらの意図される使用の順序で配置された投薬量を有するカードを含み得る。そのようなキットの例は「ブリスターパック」である。ブリスターパックは包装業界において既知であり、薬学単位用量剤形の包装に幅広く使用されている。所望される場合、治療スケジュール中の投薬量が投与され得る日を指定する、例えば数字、文字、もしくは他の印の形態での、またはカレンダインサートを用いた記憶補助機構が提供され得る。
一実施形態によれば、キットは、(a)PACを含む第1の容器と、必要に応じて(b)第2の医薬製剤を含有する第2の容器であって、該第2の医薬製剤が抗過剰増殖活性を有する第2の化合物を含む、第2の容器と、を含むことができる。代替的または追加的に、本キットは、注射用静菌水(BWFI)、リン酸緩衝食塩水、リンガー溶液、およびデキストロース溶液等の薬学的に許容可能な緩衝液を含む第3の容器をさらに備えてもよい。他の緩衝液、希釈剤、フィルタ、ニードルおよびシリンジを含め、商業的およびユーザの観点から望ましい他の材料を更に含んでいてもよい。
キットがPACと第2の治療剤を含む特定の他の実施形態において、キットは、分けられたボトルまたは分けられたホイルパケット等の、別個の組成物を含有するための容器を備えてもよいが、しかしながら、その別個の組成物はまた、単一の分けられていない容器に含有されてもよい。典型的には、本キットは、別個の成分の投与のための指示書を備える。キット形態は、別個の構成要素が好ましくは異なる剤形(例えば、経口および非経口)で投与される場合、異なる投薬間隔で投与される場合、または組合せの個々の構成成分の滴定が処方医師によって望まれる場合に、特に有利である。
一般的な合成方法
化学構造Ab-(L1-D)を有するコンジュゲートを調製するための一般的な方法を以下に記載する。
1.1 E3LB-L2中間体を調製するためにL2をE3LBにカップリングする一般的な合成方法
特定の実施形態において、L2を最初に第1の適切な溶媒、第1の塩基および第1のカップリング試薬と接触させて、第1の溶液を調製する。特定の実施形態において、L2と、第1の適切な溶媒、第1の塩基、および第1のカップリング試薬との接触は、室温(約25℃)で約15分間進行する。次いで、E3LBを当該第1の溶液と接触させる。特定の実施形態において、E3LBと第1の溶液との接触は、室温(約25℃)で約1時間進行する。次いで、溶液を濃縮し、必要に応じて精製する。
特定の実施形態において、第1のカップリング試薬に対するL2の第1の塩基に対するモル比は、約1:4:1.19である。特定の実施形態において、第1のカップリング試薬に対するL2の第1の塩基に対するモル比は、約1:2:0である。5、約1:3:1、約1:4:2、約1:5:3、または約1:6:4である。
特定の実施形態において、L2対E3LBのモル比は約1:1である。特定の実施形態において、L2対E3LBのモル比は、約1:0.5、約1:0.75、約1:2、または約0.5:1である。
1.2 E3LB-L2中間体をPBにカップリングしてCIDEを調製するための一般的な合成方法
特定の実施形態において、E3LB-L2中間体をPBに結合させてCIDEを調製する。特定の実施形態において、PBを最初に、第2の適切な溶媒、第2の塩基、および第2のカップリング試薬と接触させる。特定の実施形態において、接触は、室温(約25℃)で約10分間進行する。次いで、溶液をE3LB-L2中間体と接触させる。特定の実施形態において、第2の溶液とE3LB-L2中間体との接触は、室温(約25℃)で約1時間進行する。次いで、溶液を濃縮し、必要に応じて精製してCIDEを調製する。
特定の実施形態において、PB対第2の塩基対第2のカップリング試薬のモル比は、約1:4:1.2である。特定の実施形態において、PB対第2の塩基対第2のカップリング試薬のモル比は、約1:3:0である。75、約1:5:1、約1:3:2、または約1:5:3である。
特定の実施形態において、PB対E3LB-L2中間体のモル比は約1:1である。特定の実施形態において、PB対E3LB-L2中間体のモル比は、約1:0.5、約1:0.75、約1:2、または約0.5:1である。
1.3 L1-CIDEを調製するためにCIDEをL1に結合する一般的な合成方法
特定の実施形態において、CIDEを第3の適切な溶媒中でL1および第3の塩基と接触させて溶液を調製する。特定の実施形態において、接触は、約(約25℃)で約2時間進行する。次いで、必要に応じて精製してL1-CIDEを調製することができる。
特定の実施形態において、L1に対するCIDEのモル比は、約1:4である。特定の実施形態において、L1に対するCIDEのモル比は、約1:1、1:2、1:3、1:5、1:6、1:7、または約1:8である。
1.4 L1-CIDEを抗体にカップリングするための一般的な合成方法
特定の実施形態において、L1-CIDEをチオールおよび第4の適切な溶媒と接触させて、第4の溶液を形成する。次いで、この溶液を抗体と接触させてコンジュゲートを調製する。特定の実施形態において,
特定の実施形態において、チオールは、マレイミドまたは4-ニトロピリジジスルフィドである。特定の実施形態において、適切な溶媒は、ジメチルホルムアミド、ジメチルアセトアミド、およびプロピレングリコールからなる群から選択される。
特定の実施形態において、L1-CIDE対チオール反応性基のモル比は、約3:1~約20:1である。
特定の実施形態において、L1-CIDE、チオール反応性基および適切な溶媒を含む溶液と抗体との接触は、約1~約24時間進行する。特定の実施形態において、L1-CIDE、チオール反応性基および適切な溶媒を含む溶液と抗体との接触は、約室温(約25℃)~約37℃で進行する。
上記の一般的方法の特定の実施形態において、適切な溶媒は、ジメチルホルムアミド、テトラヒドロフラン、酢酸エチル、アセトン、アセトニトリル、ジメチルスルホキシドおよび炭酸プロピレンからなる群から選択される極性非プロトン性溶媒である。
上記一般的方法の特定の実施形態において、塩基は、N,N-ジイソプロピルエチルアミン(DIEA)、トリエチルアミン、および2,2,2,6,6-テトラメチリピペリジンからなる群から選択される。特定の実施形態において、カップリング試薬は、1-[ビス(ジメチルアミノ)メチレン]-1H-1,2,3-トリアゾロ[4,5-b]ピリジニウム3-オキシドヘキサフルオロホスフェート(HATU)、(ベンゾトリアゾール-1-イルオキシ)トリス(ジメチルアミノ)ホスホニウムヘキサフルオロホスフェート(BOP),(7-アザベンゾトリアゾール-1-イルオキシ)トリピロリジノホスホニウムヘキサフルオロホスフェート(PyAOP)、O-(ベンゾトリアゾール-1-イル)-N,N,N’、N’-テトラメチルウロニウムヘキサフルオロホスフェート(HBTU)、O-(ベンゾトリアゾール-1-イル)-N,N,N’,N’-テトラメチルウロニウムテトラフルオロボレート(TBTU)、O-(6-クロロベンゾトリアゾール-1-イル)-N,N’,N’-テトラメチルウロニウムヘキサフルオロホスフェート(HCTU)、O-(N-スク-シンイミジル)-1、1,3,3-テトラメチル-ウロニウムテトラフルオロボレート(TSTU)、O-(5-ノルボルネン-2,3-ジカルボキシイミド)-N,N,N’,N’-テトラメチルウロニウムテトラフルオロボレート(TNTU)、O-(1,2-ジヒドロ-2-オキソ-1-ピリジル-N,N,N’,N’-テトラメチルウロニウムテトラフルオロボレート(TPTU)、およびカルボニルジイミダゾール(CDI)からなる群から選択される。
好ましい実施形態において、溶媒はジメチルホルムアミドであり、塩基はN,N-ジイソプロピルエチルアミンであり、カップリング試薬はHATUである。
上記の一般的方法の特定の実施形態において、接触は、約30秒、1分、2分、3分、4分、5分、6分、7分、8分、9分、10分、11分、12分、13分、14分、15分、16分、17分、18分、19分、20分、30分、60分、90分、120分、180分、4時間、5時間、6時間、7時間、8時間、9時間、10時間、20時間、40時間、60時間または72時間にわたり進行する。
上記の一般的方法の特定の実施形態において、接触は、約20℃、21℃、22℃、23℃、24℃、25℃、26℃、27℃、28℃、29℃、30℃、31℃、32℃、33℃、34℃、35℃、36℃、37℃、38℃、39℃、40℃、41℃、42℃、43℃、44℃、45℃、46℃、47℃、48℃、49℃、50℃、60℃、70℃、80℃、90℃、または100℃で進行する。
以下の実施例は、限定するものではなく、例証として提供されている。
実施例1
CIDEの合成
A.CIDEの一般化学合成:
i.E3リガーゼ結合基(E3LB)へのリンカー(L2)の結合
Figure 2022505450000257
メチル4-[[(2S,3S)-3-[(2S)-2-[[(tert-ブトキシ)カルボニル](メチル)アミノ]プロパンアミド]-8-シアノ-5-[(2-メトキシナフタレン-1-イル)メチル]-2-メチル-4-オキソ-2,3,4,5-テトラヒドロ-1H-1,5-ベンゾジアゼピン-1-イル]カルボニル]ベンゾエート
tert-ブチルN-[(1S)-1-[[(3S,4S)-7-シアノ-1-[(2-メトキシナフタレン-1-イル)メチル]-4-メチル-2-オキソ-2,3,4,5-テトラヒドロ-1H-1,5-ベンゾジアゼピン-3-イル]カルバモイル]エチル]-N-メチルカルバメート(3.00g、5.25mmol)の1,2-ジクロロエタン(50mL)中溶液に、トリエチルアミン(2.6g、25.7mmol)およびメチル4-(カルボノクロリドイル)ベンゾエート(3.10g、15.61mmol)を窒素下で添加した。得られた溶液を80℃で5時間撹拌し、室温まで冷却した。水(100mL)を加えた。得られた溶液をジクロロメタン3×100mLで抽出し、有機層を合わせ、無水硫酸ナトリウムで乾燥させ、高減圧下で濃縮した。残渣を、酢酸エチル/石油エーテル(1:1)で溶出するシリカゲルのフラッシュクロマトグラフィーによって精製した。これにより、3.10g(81%)のメチル4-[[(2S,3S)-3-[(2S)-2-[[(tert-ブトキシ)カルボニル](メチル)アミノ]プロパンアミド]-8-シアノ-5-[(2-メトキシナフタレン-1-イル)メチル]-2-メチル-4-オキソ-2,3,4,5-テトラヒドロ-1H-1,5-ベンゾジアゼピン-1-イル]カルボニル]ベンゾエートを褐色固体として得た。MS(ESI):[M+H]=734.4.
Figure 2022505450000258
4-[[(2S,3S)-3-[(2S)-2-[[(tert-ブトキシ)カルボニル](メチル)アミノ]プロパンアミド]-8-シアノ-5-[(2-メトキシナフタレン-1-イル)メチル]-2-メチル-4-オキソ-2,3,4,5-テトラヒドロ-1H-1,5-ベンゾジアゼピン-1-イル]カルボニル]安息香酸
LiOH水溶液(30mL、1M)を、テトラヒドロフラン(30mL)中のメチル4-[[(2S,3S)-3-[(2S)-2-[[(tert-ブトキシ)カルボニル](メチル)アミノ]プロパンアミド]-8-シアノ-5-[(2-メトキシナフタレン-1-イル)メチル]-2-メチル-4-オキソ-2,3,4,5-テトラヒドロ-1H-1,5-ベンゾジアゼピン-1-イル]カルボニル]ベンゾエート(3.10g、4.22mmol)の溶液に室温で加えた。得られた溶液を室温で5時間撹拌した。エチルエーテル(20mL)を添加した。相を分離した。水相を1NHCl溶液でpH約7になるまで酸性化した。得られた混合物を酢酸エチル2×80mLで抽出し、有機層を合わせ、無水硫酸ナトリウムで乾燥させ、高減圧下で濃縮した。これにより、2.5gの4-[[(2S,3S)-3-[(2S)-2-[[(tert-ブトキシ)カルボニル](メチル)アミノ]プロパンアミド]-8-シアノ-5-[(2-メトキシナフタレン-1-イル)メチル]-2-メチル-4-オキソ-2,3,4,5-テトラヒドロ-1H-1,5-ベンゾジアゼピン-1-イル]カルボニル]安息香酸を褐色固体として得た。MS(ESI):[M+H]=720.5.
Figure 2022505450000259
メチル2-(2-(2-アミノエトキシ)エトキシ)アセタート塩酸塩
2,2-ジメトキシプロパン(5mL、40.327mmol)中の2-[2-(2-アミノエトキシ)エトキシ]酢酸塩酸塩(500mg、2.505mmol)の溶液に、室温で濃HCl(0.2mL)を滴下した。反応混合物を25℃で15時間撹拌し、真空下で濃縮した。残渣をさらに精製することなく直接使用した。
Figure 2022505450000260
メチル2-(2-[2-[(4-[[(2S,3S)-3-[(2S)-2-[[(tert-ブトキシ)カルボニル](メチル)アミノ]プロパンアミド]-8-シアノ-5-[(2-メトキシナフタレン-1-イル)メチル]-2-メチル-4-オキソ-2,3,4,5-テトラヒドロ-1H-1,5-ベンゾジアゼピン-1-イル]カルボニル]フェニル)ホルムアミド]エトキシ]エトキシ)アセタート
N,N-ジメチルホルムアミド(6mL)中の[(2S,3S)-3-[(2S)-2-[[(tert-ブトキシ)カルボニル](メチル)アミノ]プロパンアミド]-8-シアノ-5-[(2-メトキシナフタレン-1-イル)メチル]-2-メチル-4-オキソ-2,3,4,5-テトラヒドロ-1H-1,5-ベンゾジアゼピン-1-イル]カルボニル]安息香酸(500mg、0.695mmol)の溶液に、窒素下室温で前の工程からの粗メチル2-[2-(2-アミノエトキシ)エトキシ]酢酸HCl塩(500mg)、HATU(528mg、1.389mmol)およびDIPEA(897mg、6.94mmol)を添加した。得られた溶液を25℃で1時間撹拌し、水でクエンチした。得られた溶液をジクロロメタンで抽出し、有機層を合わせた。有機相をブラインで洗浄し、無水硫酸ナトリウムで乾燥させ、真空下で濃縮した。残渣を、ジクロロメタン/メタノール(20:1)で溶出するシリカゲルフラッシュクロマトグラフィーによって精製した。これにより、550mg(90%)のメチル2-(2-[2-[(4-[[(2S,3S)-3-[(2S)-2-[[(tert-ブトキシ)カルボニル](メチル)アミノ]プロパンアミド]-8-シアノ-5-[(2-メトキシナフタレン-1-イル)メチル]-2-メチル-4-オキソ-2,3,4,5-テトラヒドロ-1H-1,5-ベンゾジアゼピン-1-イル]カルボニル]フェニル)ホルムアミド]エトキシ]エトキシ)アセタートを黄色固体として得た。MS(ESI):[M+H]=879.5.
Figure 2022505450000261
2-(2-[2-[(4-[[(2S,3S)-3-[(2S)-2-[[(tert-ブトキシ)カルボニル](メチル)アミノ]プロパナミド]-8-シアノ-5-[(2-メトキシナフタレン-1-イル)メチル]-2-メチル-4-オキソ-2,3,4,5-テトラヒドロ-1H-1,5-ベンゾジアゼピン-1-イル]カルボニル]フェニル)ホルムアミド]エトキシ]エトキシ)酢酸
テトラヒドロフラン(8mL)中のメチル2-(2-[2-[(4-[[(2S,3S)-3-[(2S)-2-[[(tert-ブトキシ)カルボニル](メチル)アミノ]プロパンアミド]-8-シアノ-5-[(2-メトキシナフタレン-1-イル)メチル]-2-メチル-4-オキソ-2,3,4,5-テトラヒドロ-1H-1,5-ベンゾジアゼピン-1-イル]カルボニル]フェニル)ホルムアミド]エトキシ]エトキシ)アセテート(500mg、0.569mmol)の溶液に、水酸化リチウム一水和物(95mg、2.26mmol)の水(1mL)中溶液を室温で添加した。混合物を25℃で1時間撹拌した。混合物を水で希釈し、1Nクエン酸でpH約4に酸性化し、酢酸エチル(2×)で抽出した。有機相を合わせ、ブラインで洗浄し、硫酸ナトリウムで乾燥させ、減圧下で濃縮した。残渣を、C18シリカゲルの移動相:5mM NHHCOおよびCHCN水溶液(0~95%)により、370mg(75%)の2-(2-[2-[(4-[[(2S,3S)-3-[(2S)-2-[[(tert-ブトキシ)カルボニル](メチル)アミノ]プロパンアミド]-8-シアノ-5-[(2-メトキシナフタレン-1-イル)メチル]-2-メチル-4-オキソ-2,3,4,5-テトラヒドロ-1H-1,5-ベンゾジアゼピン-1-イル]カルボニル]フェニル)ホルムアミド]エトキシ]エトキシ)酢酸を白色固体として得た。MS(ESI):[M+H]=865.5.HNMR(400MHz,DMSO-d):δ(ppm)8.70(d,J=8.6Hz,1H),8.46(t,J=5.5Hz,1H),8.21(d,J=8.7Hz,1H),8.10(d,J=8.6Hz,1H),7.95(d,J=9.1Hz,1H),7.89(dd,J=8.6,1.9Hz,1H),7.69(d,J=8.1Hz,1H),7.50(d,J=9.2Hz,1H),7.30(m,1H),7.18(d,J=1.9Hz,1H),7.13(t,J=7.5Hz,1H),7.00(d,J=8.1Hz,2H),6.13(d,J=15.1Hz,1H),5.78(d,J=8.0Hz,2H),5.51(d,J=15.0Hz,1H),5.04(brs,1H),4.61-4.52(m,1H),4.22(dd,J=11.9,8.5Hz,1H),3.99(s,2H),3.96(s,3H),3.68-3.44(m,7H),3.37(s,1H),2.76(s,3H),1.40-1.31(m,12H),1.12(d,J=6.1Hz,3H).
ii.リンカー(L2)を介したPBのE3LBへの結合
Figure 2022505450000262
4-((2S,3S)-8-シアノ-5-((2-メトキシナフタレン-1-イル)メチル)-2-メチル-3-((S)-2-(メチルアミノ)プロパンアミド)-4-オキソ-2,3,4,5-テトラヒドロ-1H-ベンゾ[b][1,4]ジアゼピン-1-カルボニル)-N-(2-(2-(2-((2-(4-(1-(4-ヒドロキシフェニル)-2-フェニルブタ-1-エン-1-イル)フェノキシ)エチル)(メチル)アミノ)-2-オキソエトキシ)エトキシ)エチル)ベンズアミド(「化合物P1」)
2-メチルテトラヒドロフラン(0.855mL)中の2-[2-[2-[[4-[(3S,4S)-3-[[(2S)-2-[tert-ブトキシカルボニル(メチル)アミノ]プロパノイル]アミノ]-7-シアノ-1-[(2-メトキシ-1-ナフチル)メチル]-4-メチル-2-オキソ-3,4-ジヒドロ-1,5-ベンゾジアゼピン-5-カルボニル]ベンゾイル]アミノ]エトキシ]エトキシ]酢酸(74mg、0.0855mmol)の溶液に、HATU(1.1当量、36.5mg、0.0941mmol)およびN,N-ジイソプロピルエチルアミン(3.0当量、0.045mL、0.257mmol)を添加した。混合物を室温で30分間撹拌し、次いで、2-メチルテトラヒドロフラン(60、0.5mL、400mg、5mmol)中の4-[1-[4-[2-(メチルアミノ)エトキシ]フェニル]-2-フェニル-ブタ-1-エニル]フェノール(1.05当量、33.5mg、0.0898mmol)の溶液を加え、続いてDMF 0.2mLを加えた。混合物を室温で22時間撹拌した。水を添加し、溶液をiPrOAcで3回抽出した。有機層を合わせ、次いで、硫酸ナトリウムで乾燥させ、真空中で濃縮した。
粗物質をジクロロメタン(0.85mL)に溶解し、トリフルオロ酢酸(0.26mL)を滴下して加えた。ガス発生が観察されなくなるまで、反応物を室温で撹拌した。1時間後、溶液を真空中で濃縮し、逆相HPLCによって精製すると、所望の生成物45 mg(2工程で収率45%)が得られた。
m+H=560.9,1120.7;δHNMR(400MHz,DMSO-d6)δ9.39,9.14(重複s,1H),8.85-8.70(m,1H),8.44-8.36(m,1H),8.20(d,J=8.8Hz,1H),8.10(d,J=8.6Hz,1H),7.97-7.82(m,2H),7.70-7.64(m,1H),7.50-7.44(m,1H),7.34-7.27(m,1H),7.21-7.04(m,9H),7.03-6.87(m,4H),6.78-6.67(m,2H),6.62-6.54(m,2H),6.44-6.33(m,1H),6.12(d,J=15.1Hz,1H),5.78(d,J=8.0Hz,2H),5.52(d,J=15.0Hz,1H),4.99-4.89(m,1H),4.33-4.04(m,4H),4.00-3.88(m,1H),3.94(s,3H),3.68-3.61(m,1H),3.60-3.42(m,5H),3.38-3.32(m,1H),3.03-2.78(m,3H),2.45-2.35(m,2H),2.32(s,3H),1.23(d,J=6.4Hz,3H),1.11(d,J=6.1Hz,3H),0.89-0.76(m,4H).
B.L1-CIDEの調製
i.リンカーL1のCIDEへの結合
Figure 2022505450000263
N-[(1S)-1-[[(1S)-4-(カルバモイルアミノ)-1-[(4-[4-[(1Z)-1-(4-[2-[2-(2-[2-[(4-[[(2S,3S)-8-シアノ-5-[(2-メトキシナフウタレン-1-イル)メチル]-2-メチル-3-[(2S)-2-(メチルアミノ)プロパナミド]-4-オキソ-2,3,4,5-テトラヒドロ-1H-1,5-ベンゾジアゼピン-1-イル]カルボニル]フェニル)ホルムアミド]エトキシ]エトキシ)-N-メチルアセトアミド]エトキシ]フェニル)-2-フェニルブタ-1-エン-1-yl]フェノキシメチル]フェニル)カルボニル]ブチル]カルバモイル]-2-メチルプロピル]-6-(2,5-ジオキソ-2,5-ジヒドロ-1H-ピロール-1-イル)ヒドロキサンアミド(「化合物LP2」)
DMF(0.9mL)中の(2S)-N-[(3S,4S)-7-シアノ-5-[(4-[[2-(2-[[(2-[4-[(1Z)-1-(4-ヒドロキシフェニル)-2-フェニルブタ-1-エン-1-イル]フェノキシ]エチル)(メチル)カルバモイル]メトキシ]エトキシ)エチル]カルバモイル]フェニル)カルボニル]-1-[(2-メトキシナフタレン-1-イル)メチル]-4-メチル-2-オキソ-2,3,4,5-テトラヒドロ-1H-1,5-ベンゾジアゼピン-3-イル]-2-(メチルアミノ)プロパンアミド(化合物P1、48mg、0.043mmol)および(N-[(1S)-1-{[(1S)-4-(カルバモイルアミノ)-1-{[4-(クロロメチル)フェニル]カルバモイル}ブチル]カルバモイル}-2-メチルプロピル]-6-(2,5-ジオキソ-2,5-ジヒドロ-1H-ピロール-1-イル)ヘキサンアミド(90mg、0.152mmol)の0℃の溶液にKCO(60mg、0.43mmol)を加えた。反応混合物を0°Cで4時間撹拌し、予冷DMF(0.9mL)で希釈した。固体をフィルタにかけて除去した。濾液を以下の条件下で分取HPLCにより精製した。カラム、SunFire Prep C18 OBDカラム、19*150mm 5um、10nm;移動相、水(0.1%TFA)およびCHCN(5%CHCN、10分で最大48%);検出器、UV254/220nmにより、22mg(31%)のN-[(1S)-1-[[(1S)-4-(カルバモイルアミノ)-1-[(4-[4-[(1Z)-1-(4-[2-[2-(2-[2-[(4-[[(2S,3S)-8-シアノ-5-[(2-メトキシナフタレン-1-イル)メチル]-2-メチル-3-[(2S)-2-(メチルアミノ)プロパンアミド]-4-オキソ-2,3,4,5-テトラヒドロ-1H-1,5-ベンゾジアゼピン-1-イル]カルボニル]フェニル)ホルムアミド]エトキシ]エトキシ)-N-メチルアセトアミド]エトキシ]フェニル)-2-フェニルブタ-1-エン-1-イル]フェノキシメチル]フェニル)カルバモイル]ブチル]カルバモイル]-2-メチルプロピル]-6-(2,5-ジオキソ-2,5-ジヒドロ-1H-ピロール-1-イル)ヘキサンアミドを白色固体として得た。MS(ESI):[M+H]+=1675.1;H-NMR(400MHz,DMSO-d):δ(ppm)10.15(s,1H),9.95-9.72(m,1H),9.52-9.41(m,1H),9.31-9.14(m,1H),8.43(brs,1H),8.20-8.18(m,1H),8.17-8.07(m,2H),7.93(m,2H),7.70(d,J=8Hz,1H),7.70-7.65(m,3H),7.48-7.42(m,2H),7.41-7.36(m,1H),7.33-7.28(m,1H),7.23(m,1H),7.18-7.07(m,7H),7.02-7.01(m,1H),6.99(s,3H),6.96-6.92(m,2H),6.76-6.67(m,2H),6.60-6.58(m,2H),6.40(d,J=8.4Hz,1H),6.13-6.08(m,1H),5.99(s,1H),5.80(d,J=7.6Hz,2H),5.55(d,J=15.2Hz,1H),5.44(brs,1H),5.02-4.93(m,1H),7.43-4.36(m,3H),4.26-4.02(m,6H),3.95-3.88(m,4H),3.66-3.63(m,3H),3.57-3.53(m,4H),3.39-3.36(m,4H),3.05-2.81(m,5H),2.68(s,2H),2.42-2.39(m,3H),2.22-2.07(m,2H),2.03-1.91(m,1H),1.71(brs,2H),1.62(brs,3H),1.50-1.36(m,6H),1.21-1.17(m,5H),0.87-0.82(m,10H).
例示的ERα標的化CIDEの合成
全ての化合物は、特に明記しない限り、オレフィン異性体(約1:1)の混合物である。括弧内に列挙されている13C共鳴は、特定の化合物の主要な異性体のオレフィン異性体および/または代替N-Meアミド結合回転異性体を表す。
i.EC1例示的なCIDE、EC1は、以下のスキームによって合成することができる:
Figure 2022505450000264
スキーム5
工程1:(9H-フルオレン-9-イル)メチル(5-アミノ-4-フェニルチアゾール-2-イル)カルバメート(A)。2-アミノ-2-フェニルアセトニトリル塩酸塩(1.20g、7.10mmol)、(iPr)NEt(1.37g、10.6mmol)およびO-((9H-フルオレン-9-イル)メチル)カルボイソチオシアネート(2.00g、7.10mmol)のDCM(10mL)中溶液を0℃で1時間撹拌した。反応混合物を飽和NaHCO溶液に注いだ得られた混合物をEtOAcで抽出した。有機層を合わせ、ブラインで洗浄し、NaSO上で乾燥させ、減圧下で濃縮した。残渣をシリカゲルのフラッシュクロマトグラフィー(勾配:石油エーテル中0%~80%酢酸エチル)によって精製して、996mg(33%)の化合物Aを黄色固体として得た。MS(ESI):[M+H]=414.
工程2:メチル(S)-2-((S)-2-((tert-ブトキシカルボニル)(メチル)アミノ)プロパンアミド)-2-シクロヘキシルアセテート(B)。THF(32mL)中N-(tert-ブトキシカルボニル)-N-メチル-L-アラニン(2.00g、9.90mmol)、4-メチルモルホリン(NMM、1.99g、19.7mmol)およびカルボノクロリド酸イソブチル(1.60g、11.8mmol)の溶液を窒素下、0℃で0.5時間撹拌した。次いで、THF(16mL)およびDCM(16mL)中のメチル(S)-2-アミノ-2-シクロヘキシルアセテート塩酸塩(2.00g、9.70mmol)および4-メチルモルホリン(NMM;1.99g、19.7mmol)の溶液を添加し、得られた溶液を0℃で1時間撹拌した。反応混合物をEtOAcで希釈し、水の添加によってクエンチした。相を分離した。水相をEtOAc(2×)で抽出した。合わせた有機層をブラインで洗浄し、無水NaSO上で乾燥させ、フィルタにかけ、減圧下で濃縮した。残渣をシリカゲルのフラッシュクロマトグラフィー(勾配:石油エーテル中0%-40%酢酸エチル)によって精製して、2.5g(71%)の化合物Bを無色油状物として得た。MS(ESI):[M+H]=357.
工程3:(S)-2-((S)-2-((tert-ブトキシカルボニル)(メチル)アミノ)プロパンアミド)-2-シクロヘキシル酢酸(C)。アセトン/水(30mL、1:1)中のメチル(S)-2-((S)-2-((tert-ブトキシカルボニル)(メチル)アミノ)-プロパンアミド)-2-シクロヘキシルアセテート(B、2.50g、7.00mmol)の溶液に、LiOH-HO(1.20g、28.6mmol)を加えた。反応混合物を0℃で1時間撹拌し、次いで、pHが約4になるまで2N HCl溶液の添加によって酸性化した。混合物を減圧下で体積の約半分まで濃縮し、次いで、EtOAcで希釈した。相を分離した。水溶液をEtOAcで抽出した(2×)。合わせた有機層を5%KHSO水溶液、ブラインおよび水で順次洗浄し、次いで、無水NaSOで乾燥させ、減圧下で濃縮して、2.0g(83%)の化合物Cを無色油状物として得た。MS(ESI):[M+H]=343.
工程4:メチル((S)-2-(S)-2-((tert-ブトキシカルボニル)(メチル)アミノ)プロパンアミド)-2-シクロヘキシルアセチル)-L-プロリネート(D)。THF(50mL)およびDMF(5mL)中の(S)-2-((S)-2-((tert-ブトキシカルボニル)(メチル)アミノ)プロパンアミド)-2-シクロヘキシル酢酸(C、2.00g、5.80mmol)、メチルL-プロリネート塩酸塩(0.96g、5.80mmol)および4-(4,6-ジメトキシ-1,3,5トリアジン-2-イル)-4-メチルモルホリニウムクロリド(DMT-MM;3.20g、11.6mmol)の混合物に、4-メチルモルホリン(NMM;2.4g、23.8mmol)を室温で添加した。反応混合物を室温で一晩撹拌し、次いで、EtOAcで希釈し、引き続いて水を添加した。相を分離した。水相をEtOAc(2×)で抽出した。合わせた有機層を飽和NaHCO水溶液、5%KHSO水溶液およびブラインで順次洗浄し、次いで、無水NaSOで乾燥させ、減圧下で濃縮した。残渣をシリカゲルのフラッシュクロマトグラフィー(勾配:石油エーテル中0%~80%酢酸エチル)によって精製して、1.6g(60%)の化合物Dを白色固体として得た。MS(ESI):[M+H]=454.
工程5:((S)-2-((S)-2-((tert-ブトキシカルボニル)(メチル)アミノ)プロパンアミド)-2-シクロヘキシルアセチル)-L-プロリン(E)。アセトン/水(30mL、1:1)中のメチル((S)-2-((S)-2-((tert-ブトキシカルボニル)(メチル)アミノ)-プロパンアミド)-2-シクロヘキシルアセチル)-L-プロリネート(D、1.60g、3.50mmol)の溶液に、LiOH-HO(588mg、14.0mmol)を加えた。反応混合物を0℃で1時間撹拌し、次いで、pHが約4になるまで2N HCl溶液の添加によって酸性化した。混合物を減圧下で体積の約半分まで濃縮し、次いで、EtOAcで希釈した。相を分離した。水相をEtOAc(2×)で抽出した。合わせた有機層を5%KHSO水溶液、ブラインおよび水で順次洗浄し、次いで、無水NaSOで乾燥させ、減圧下で濃縮して、1.1g(71%)の化合物Eを白色固体として得た。MS(ESI):[M+H]=440.
工程6:tert-ブチル((S)-1-(((S)-1-シクロヘキシル-2-((S)-2-(フルオロカルボニル)ピロリジン-1-イル)-2-オキソエチル)アミノ)-1-オキソプロパン-2-イル)(メチル)カルバメート(F)。DCM(10mL)中の((S)-2-((S)-2-((tert-ブトキシカルボニル)(メチル)アミノ)プロパンアミド)-2-シクロヘキシルアセチル)-L-プロリン(E、1.10g、2.50mmol)およびピリジン(790mg、10.0mmol)の溶液に、0°Cでフッ化シアヌル(507mg、3.80mmol)を添加した。得られた溶液を0℃で1時間撹拌し、次いで、氷水の添加によってクエンチした。相を分離した。水相をDCMで抽出した。合わせた有機層を無水NaSOで乾燥させ、減圧下で濃縮して、1.10gの粗生成物Fを無色油状物として得た。この材料を、さらに精製することなく、次の工程で使用した。MS(ESI):[M+H]=442.
工程7:tert-ブチル((S)-1-(((S)-2-((S)-2-((2-((((9H-フルオレン-9-イル)メトキシ)カルボニル)アミノ)-4-フェニルチアゾール-5-イル)カルバモイル)ピロリジン-1-イル)-1-シクロヘキシル-2-オキソエチル)アミノ)-1-オキソプロパン-2-イル)(メチル)カルバメート(G)。DCM(10mL)中の(9H-フルオレン-9-イル)メチル(5-アミノ-4-フェニルチアゾール-2-イル)カルバメート(A、687mg、1.66mmol)、ピリジン(525mg、6.60mmol)およびtert-ブチル((S)-1-(((S)-1-シクロヘキシル-2-((S)-2-(フルオロカルボニル)ピロリジン-1-イル)-2-オキソエチル)アミノ)-1-オキソプロパン-2-イル)(メチル)カルバメート(F、1.10g,2.50mmol)の混合物を窒素下、室温で1時間撹拌した。次いで、NaHCO水溶液を添加し、得られた混合物をEtOAc(2×)で抽出した。合わせた有機層を無水NaSOで乾燥させ、減圧下で濃縮した。残渣をシリカゲルのフラッシュクロマトグラフィー(勾配:石油エーテル中0%-100%酢酸エチル)によって精製して、845mg(41%)の化合物Gを黄色固体として得た。MS(ESI):[M+H]=835.
工程8:tert-ブチル((S)-1-(((S)-2-((S)-2-((2-アミノ-4-フェニルチアゾール-5-イル)カルバモイル)ピロリジン-1-イル)-1-シクロヘキシル-2-オキソエチル)アミノ)-1-オキソプロパン-2-イル)(メチル)カルバメート(H)。DMF(4.5mL)中のtert-ブチル((S)-1-(((S)-2-((S)-2-((2-((((9H-フルオレン-9-イル)メトキシ)カルボニル)アミノ)-4-フェニルチアゾール-5-イル)カルバモイル)ピロリジン-1-イル)-1-シクロヘキシル-2-オキソエチル)アミノ)-1-オキソプロパン-2-イル)(メチル)カルバメート(G、845mg、1.0mmol)およびピペリジン(0.5mL)の混合物を室温で1時間撹拌した。反応混合物をEtOAcで希釈し、水で洗浄した。有機層を無水NaSO上で乾燥させ、減圧下で濃縮した。残渣をシリカゲルのフラッシュクロマトグラフィー(勾配:石油エーテル中0%~100%酢酸エチル)によって精製して、540mg(87%)の化合物Hを黄色固体として得た。MS(ESI):[M+H]=613.
工程9:エチル3-(2-(3-((5-((S)-1-((S)-2-((S)-2-((tert-ブトキシカルボニル)(メチル)アミノ)プロパンアミド)-2-シクロヘキシルアセチル)ピロリジン-2-カルボキサミド)-4-フェニルチアゾール-2-イル)アミノ)-3-オキソプロポキシ)エトキシ)プロパノエート(I)。DCM(5mL)中の3-(2-(3-エトキシ-3-オキソプロポキシ)エトキシ)プロパン酸(491mg、2.10mmol)の溶液に、窒素下、室温で塩化オキサリル(1.10mL、DCM中2.0M溶液、2.20mmol)および触媒量のDMF(3.8mg、0.05mmol)の溶液を加えた。反応混合物を室温で1時間撹拌した。次いで、得られた溶液を、DCM(3mL)中のtert-ブチル((S)-1-(((S)-2-((S)-2-((2-アミノ-4-フェニルチアゾール-5-イル)カルバモイル)ピロリジン-1-イル)-1-シクロヘキシル-2-オキソエチル)アミノ)-1-オキソプロパン-2-イル)(メチル)カルバメート(H、320mg、0.520mmol)およびピリジン(331mg、4.2mmol)の予備混合溶液に0°Cで添加した。得られた混合物を0℃で1時間撹拌した後、室温まで温め、その温度で一晩撹拌した。得られた溶液を水の添加によってクエンチし、続いてDCMで希釈した。相を分離した。有機層を無水NaSO上で乾燥させ、減圧下で濃縮した。残渣をシリカゲルのフラッシュクロマトグラフィー(勾配:石油エーテル中0%~100%酢酸エチル)によって精製して、370mg(85%)の化合物Iを白色固体として得た。MS(ESI):[M+H]=829.
工程10:3-(2-(3-((5-((S)-1-((S)-2-((S)-2-((S)-2-((tert-ブトキシカルボニル)(メチル)アミノ)プロパンアミド)-2-シクロヘキシルアセチル)ピロリジン-2-カルボキサミド)-4-フェニルチアゾール-2-イル)アミノ)-3-オキソプロポキシ)エトキシ)プロパン酸(J)。THF(3mL)および水(3mL)中のエチル3-(2-(3-((5-((S)-1-((S)-2-((S)-2-((tert-ブトキシカルボニル)(メチル)アミノ)プロパンアミド)-2-シクロヘキシルアセチル)ピロリジン-2-カルボキサミド)-4-フェニルチアゾール-2-イル)アミノ)-3-オキソプロポキシ)エトキシ)プロパノエート(I、370mg、0.450mmol)の混合物に、LiOH-HO(92.4mg、2.20mmol)を室温で加えた。反応混合物を室温で1時間撹拌し、次いで、クエン酸水溶液(1M)でpH約2に酸性化し、続いてEtOAcで希釈した。相を分離した。有機層を水で洗浄し、無水NaSOで乾燥させ、減圧下で濃縮して、345mg(97%)の化合物Jを淡黄色固体として得た。MS(ESI):[M+H]=801.
工程11:tert-ブチル((S)-1-(((S)-1-シクロヘキシル-2-((S)-2-((2-(3-(2-(3-((2-(4-(1-(4-ヒドロキシフェニル)-2-フェニルブタ-1-エン-1-イル)フェノキシ)エチル)(メチル)アミノ)-3-オキソプロポキシ)エトキシ)プロパンアミド)-4-フェニルチアゾール-5-イル)カルバモイル)ピロリジン-1-イル)-2-オキソエチル)アミノ)-1-オキソプロパン-2-イル)(メチル)カルバメート(L)。DMF(4mL)中の3-(2-(3-((5-((S)-1-((S)-2-((S)-2-((tert-ブトキシカルボニル)(メチル)アミノ)-プロパンアミド)-2-シクロヘキシルアセチル)-ピロリジン-2-カルボキサミド)-4-フェニルチアゾール-2-イル)アミノ)-3-オキソプロポキシ)エトキシ)プロパン酸(J、345mg、0.430mmol)、4-(1-(4-(2-(メチルアミノ)エトキシ)フェニル)-2-フェニルブタ-1-エン-1-イル)フェノール(K、Breast Cancer Researchand Treatment2004、85、151に記載されているように調製;179mg、0.48mmol)、(iPr)NEt(224mg、1.74mmol)およびHATU(179mg、0.470mmol)の混合物を室温で1時間撹拌した。反応混合物を、アセトニトリル/水(溶媒勾配:水中5~100%アセトニトリル(0.05%NHHCO)で溶出する充填済C18カラム(40g、C18、20~35μm、100Å、Agela Technologies)に直接ロードし、適切な画分を回収し、減圧下で濃縮した。残渣をシリカゲルのフラッシュクロマトグラフィー(勾配:0%-5%MeOH/DCM)によって再精製して、358mg(72%)の化合物Lを白色固体として得た。MS(ESI):[M+H]=1157.
工程12:(S)-1-((S)-2-シクロヘキシル-2-((S)-2-(メチルアミノ)プロパンアミド)アセチル)-N-(2-(3-(2-(3-((2-(4-(1-(4-ヒドロキシフェニル)-2-フェニルブタ-1-エン-1-イル)フェノキシ)エチル)(メチル)アミノ)-3-オキソプロポキシ)エトキシ)プロパンアミド)-4-フェニルチアゾール-5-イル)ピロリジン-2-カルボキサミド(1)。TFA(1mL)およびDCM(2.5mL)中のtert-ブチル(((S)-1-(((S)-1-シクロヘキシル-2-((S)-2-((2-(3-(2-(3-((2-(4-(1-(4-ヒドロキシフェニル)-2-フェニルブタ-1-エン-1-イル)フェノキシ)エチル)(メチル)アミノ)-3-オキソプロポキシ)-エトキシ)プロパンアミド)-4-フェニルチアゾール-5-イル)カルバモイル)ピロリジン-1-イル)-2-オキソエチル)アミノ)-1-オキソプロパン-2-イル)(メチル)カルバメート(L、350mg、0.30mmol)の溶液を室温で0.5時間撹拌した。反応混合物を減圧下で濃縮し、残渣を逆相フラッシュクロマトグラフィー(溶媒勾配:水中5~100%アセトニトリル(0.05%NHHCO))によって精製して、213.2mg(67%)の化合物1(化合物EC1)を白色固体として得た。HNMR(400MHz,DMSO-d)δ12.07(s,1H),10.30(s,1H),9.41(9.16)(s,1H),7.91(d,J=8.9Hz,1H),7.75(d,J=7.7Hz,2H),7.48-7.39(m,2H),7.34(t,J=7.5Hz,1H),7.23-7.05(m,6H),7.02-6.88(m,2H),6.79-6.67(m,2H),6.63-6.54(m,2H),6.43-6.36(m,1H),4.54(dd,J=8.3,5.1Hz,1H),4.42(t,J=8.2Hz,1H),4.11(4.04,3.95,3.88)(t,J=5.5Hz,2H),3.85-3.75(m,1H),3.75-3.68(m,2H),3.68-3.55(m,4H),3.55-3.40(m,5H),3.05(2.96,2.87,2.80)(s,3H),3.02-2.92(m,1H),2.72-2.60(m,3H),2.60-2.55(m,1H),2.45-2.35(m,2H),2.25-1.96(m,6H),1.95-1.80(m,2H),1.80-1.50(m,6H),1.20-0.89(m,8H),0.89-0.79(m,3H).13CNMR(75MHz,DMSO-d)δ174.8,171.5,171.0(171.0,170.9,170.9),170.4,169.9,157.5(157.3),156.6,156.5,155.7,153.0,142.7,142.7(142.7),140.5(140.3),138.3(138.3),137.4,136.5(136.4,136.3,136.1),134.4(134.4),134.1(134.0),131.9,131.9,130.6,130.6,129.9,128.9,128.3,128.3,128.2,127.9,126.4(126.4),123.9,115.4,114.8,114.5,113.8,70.1,67.5(67.4,67.1,67.1),66.7,66.0(66.0,65.8,65.7),59.8,59.6,54.7,48.8(48.7),47.7,47.0(47.0),36.9(36.8),36.2,34.7,33.8(33.7),33.6(33.5),33.2(33.1),29.6,29.4,29.0(29.0),28.4,26.4,26.1(26.0),25.2,19.6,13.9.HRMS(ESI+):m/z計算値C5974S(M+H)+1056.5269 実測値1056.5249.
ii.EC3例示的なCIDE、EC3は、以下のスキームによって合成することができる:
Figure 2022505450000265
スキーム6
工程1:ジエチル3,3’-(エタン-1,2-ジイルビス(オキシ))ジプロパノエート(AA)。化合物Z(Aldrich、2.0g、11.9mmol)のEtOH(30mL)溶液に、HSO(5.0mL)を滴下して加えた。反応溶液を85℃で16時間撹拌し、次いで、真空中で濃縮してEtOHの大部分を除去した。残渣をHO(30mL)で希釈し、EtOAc(30mL×3)で抽出した。合わせた有機層を食塩水(20mL)で洗浄し、無水NaSO上で乾燥させ、フィルタにかけ、濃縮して粗生成物を得た。この物質をシリカゲルでのフラッシュクロマトグラフィー(石油エーテル中0~30%EtOAc)により精製して、化合物AA(1.40g、収率45%)を無色の油状物として得た。HNMR(400MHz,CDCl)δ4.17-4.11(m,4H),3.74(t,J=6.4Hz,4H),3.60(s,4H),2.58(t,J=6.4Hz,4H),1.25(t,J=6.8Hz,6H).
工程2:3-(2-(3-エトキシ-3-オキソプロポキシ)エトキシ)プロパン酸(BB)。EtOH(20mL)/HO(3.0mL)中の化合物AA(1.30g、4.96mmol)の溶液に、KOH(278mg、4.96mmol)を添加した。反応溶液を80℃で1時間撹拌し、次いで、真空中で濃縮して溶媒を除去した。残渣をHO(20mL)で希釈し、pHを飽和NaHCO溶液で9.0に調整した。混合物をEtOAc(20mL×2)で洗浄し、水相をHCl(2.0M)でpH 3.0に調整した。次いで、酸性化した水相をEtOAc(30mL×3)で抽出した。合わせた有機層をNaSOで乾燥させ、フィルタにかけ、真空中で濃縮して、化合物BB(370mg、32%)を無色油状物として得た。HNMR(400MHz,CDOD)δ4.16-4.13(m,2H),3.75-3.71(m,4H),3.60-3.59(m,4H),2.56-2.52(m,4H),1.25(t,J=7.2Hz,3H).
工程3:エチル3-(2-(3-(((S)-1-((2S,4R)-4-ヒドロキシ-2-((4-(4-メチルチアゾール-5-イル)ベンジル)カルバモイル)ピロリジン-1-イル)-3,3-ジメチル-1-オキソブタン-2-イル)アミノ)-3-オキソプロポキシ)エトキシ)-プロパノエート(DD)DMF(15mL)中の化合物BB(370mg、1.58mmol)の溶液に、(iPr)NEt(816mg、6.32mmol)およびHATU(720.69mg、1.9mmol)を添加した。溶液を25°Cで15分間撹拌し、次いで、VHLリガンドCC(J.Med.Chem.2018、61、599;590mg、1.26mmol)を添加した。反応溶液を25℃でさらに1時間撹拌し、次いで、真空中で濃縮して溶媒を除去した。残渣をEtOAc(40mL)で希釈し、この溶液をブライン(30mL×3)で洗浄し、NaSOで乾燥させ、フィルタにかけ、濃縮した。残渣を分取TLC(DCM中10%MeOH、Rf=0.5)によって精製し、化合物DD(300mg、23%)を黄色油状物として得た。LCMS(5-95,AB,1.5分):RT=0.746分,m/z=669.1[M+Na]+.
工程4:3-(2-(3-(((S)-1-((2S,4R)-4-ヒドロキシ-2-((4-(4-メチルチアゾール-5-イル)ベンジル)カルバモイル)ピロリジン-1-イル)-3,3-ジメチル-1-オキソブタン-2-イル)アミノ)-3-オキソプロポキシ)エトキシ)-プロパン酸(EE)。THF(6.0mL)/HO(2.0mL)中の化合物DD(300mg、0.460mmol)の溶液に、LiOH-HO(97mg、2.3mmol)を加えた。反応溶液を25℃で16時間撹拌し、次いで、真空中で濃縮してTHFの大部分を除去した。残渣をHCl(2.0M)でpH7.0に酸性化し、その後、分取HPLC(XtimateC18150*25mm*5um、アセトニトリル23-53/0.225%FA水溶液)によって精製して、化合物EE(100mg、34%)を白色固体として得た。LCMS(5-95,AB,1.5分):RT=0.72分,m/z=641.1[M+Na]+.
工程5:(2S,4R)-1-((S)-2-(tert-ブチル)-16-(4-1-(4-ヒドロキシフェニル)-2-フェニルブタ-1-エン-1-イル)フェノキシ)-14-メチル-4,13-ジオキソ-7,10-ジオキサ-3,14-ジアザヘキサデカン-1-イル)-4-ヒドロキシ-N-(4-(4-メチルチアゾール-5-イル)ベンジル)ピロリジン-2-カルボキサミド(3)。DMF(4.0mL)中の化合物EE(100mg、0.160mmol)の溶液に、HATU(73mg、0.190mmol)および(iPr)NEt(83mg、0.650mmol)を添加した。混合物を25°Cで10分間撹拌し、次いで、化合物K(「Breast Cancer Research and Treatment」2004年、85、151に記載されているように調製。60mg、0.16mmol)を添加した。反応溶液を25°Cでさらに1時間撹拌し、次いで、分取HPLC(XtimateC18150*25mm*5um、アセトニトリル60-80.6/0.225%FA水溶液)によって精製して、化合物3(化合物EC3)(105mg、65%)を白色固体として得た。LCMS(5-95,AB,1.5分):RT=0.93分,m/z=996.4[M+Na]+.HNMR(400MHz,CDOD):δ8.90(s,1H),7.46-7.38(m,4H).7.13-7.04(m,7H),6.90-6.87(m,2H),6.63(d,J=8.4HZ,2H),6.40(d,J=8.8HZ,2H),4.65-4.48(m,5H),4.38-4.32(m,1H),4.16-4.09(m,2H),3.91-3.88(m,1H),3.80-3.65(m,7H),3.60-3.54(m,4H),3.16(s,1H),2.99-2.97(m,1H),2.78-2.75(m,1H),2.65-2.62(m,1H),2.53-2.51(m,1H),2.47-2.41(m,6H),2.24-2.19(m,1H),2.11-2.06(m,1H),1.02(s,9H),0.88(t,J=7.6HZ,3H).13CNMR(100MHz,CDOD)δ174.6,174.3,174.0,173.8,172.2,158.9,158.7,156.5,153.2,148.7,144.3,141.9,140.5,139.7,133.3,133.2,131.8,131.4,131.0,130.6,130.5,129.1,129.0,127.1,116.1,115.3,114.5,71.6,71.5,71.2,68.5,68.4,66.9,60.9,58.1,43.8,39.0,37.5,36.9,34.6,30.0,27.2,15.9,14.2.HRMS(0-95_1_4分,ESI),m/z 974.4676[M+H]+.
iii.EC4例示的なCIDE、EC4は、以下のスキームによって合成することができる:
Figure 2022505450000266
スキーム7
工程1:4-((4-(tert-ブトキシ)-4-オキソブチル)カルバモイル)安息香酸(FF)。HATU(144mg、0.38mmol)を、テレフタル酸(70mg、0.42mmol)および(iPr)NEt(81mg、0.63mmol)を含むDMF(4mL)の溶液に25℃で添加した。その温度で10分間撹拌した後、tert-ブチル-4-アミノブタノエート(54mg、0.34mmol)を添加し、得られた混合物を25℃で1時間撹拌した。LCMS(5-95AB/1.5分):RT=0.720分,m/z=[M+Na]+329.9}は、40%の所望の生成物を示した。反応物を真空中で濃縮し、分取HPLC(アセトニトリル37~51%/0.225%FA水溶液)によって精製して、化合物FF(50mg、35%)を白色固体として得た。HNMR(400MHz,DMSO-d)δ13.18(brs,1H),8.63(t,J=5.6Hz,1H),8.00(d,J=8.4Hz,2H),7.92(d,J=8.4Hz,2H),3.26-3.21(m,2H),2.23(t,J=7.2Hz,2H),1.74-1.67(m,2H),1.36(s,9H).LCMS(5-95,AB,1.5分):RT=0.72分,m/z=[M+Na]+329.9.
工程2:tert-ブチル4-(4-(((S)-1-((2S,4R)-4-ヒドロキシ-2-((4-(4-メチルチアゾール-5-イル)ベンジル)カルバモイル)ピロリジン-1-イル)-3,3-ジメチル-1-オキソブタン-2-イル)カルバモイル)ベンズアミド)-ブタノエート(GG)。DMF(15mL)中の化合物CC(TFA塩、「J.Med.Chem.」2018年,61,599に記載されるとおりに調製;252mg、0.59mmol)、HATU(278mg、0.73mmol)、EtN(148mg、1.46mmol)および化合物FF(150mg、0.49mmol)の混合物を25°Cで2時間撹拌した。混合物を減圧下で濃縮し、残渣をフラッシュクロマトグラフィー(DCM中0~10%MeOH、Rf=0.5)によって精製して、化合物GG(350mg、90%)を黄色固体として得た。LCMS(5-95,AB,1.5分):RT=0.845分、[M+H]+720.3.
工程3:4-(4-(((S)-1-((2S,4R)-4-ヒドロキシ-2-((4-(4-メチルチアゾール-5-イル)ベンジル)-カルバモイル)ピロリジン-1-イル)-3,3-ジメチル-1-オキソブタン-2-イル)カルバモイル)ベンズアミド)ブタン酸(HH)。25℃のDCM(10mL)中の化合物GG(350mg、0.44mmol)の溶液に、TFA(10.0mL、0.440mmol)を添加した。混合物を25℃で2時間撹拌し、次いで、真空中で濃縮して、粗化合物HH(290mg、99%)を黄色油状物として得た。粗材料を次の工程で直接使用した。LCMS(5-95,AB,1.5分):RT=0.710分、m/z=[M+H]664.3.
工程4:N-((S)-1-((2S,4R)-4-ヒドロキシ-2-((4-(4-メチルチアゾール-5-イル)ベンジル)カルバモイル)ピロリジン-1-イル)-3,3-ジメチル-1-オキソブタン-2-イル)-N-(4-((2-(4-(1-(4-ヒドロキシフェニル)-2-フェニルブタ-1-エン-1-イル)フェノキシ)エチル)(メチル)アミノ)-4-オキソブチル)-テレフタルアミド(4)。DMF(10mL)中の化合物HH(150mg、0.23mmol)、HATU(112mg、0.29mmol)、化合物K(「Breast Cancer Research and Treatment」2004、85、151に記載されているように調製。127mg、0.34mmol)およびEtN(69mg、0.68mmol)の混合物を25℃で2時間撹拌した。その後、混合物を分取HPLC(アセトニトリル51~81%/0.225%FA水溶液)によって精製して、化合物4(化合物EC4)(90mg、39%)を黄色固体として得た。LCMS(5-95,AB,1.5分):RT=0.89分、m/z=[M+H]1019.5.HNMR(400MHz,CDOD)δppm8.93(s,1H),7.99-7.86(m,4H),7.45-7.39(m,4H),7.12-7.05(m,7H),6.88(d,J=8.0Hz,2H),6.61(d,J=8.0Hz,2H),6.38(d,J=8.0Hz,2H),4.92-4.90(m,1H),4.60-4.52(m,3H),4.35-4.31(m,1H),4.14-4.10(m,2H),3.99-3.93(m,1H),3.87-3.83(m,1H),3.79-3.61(m,2H),3.45-3.38(m,2H),3.15(s,1H),3.05-2.84(m,2H),2.62-2.59(m,1H),2.49-2.39(m,6H),2.26-2.20(m,1H),2.13-2.06(m,1H),2.01-1.86(m,2H),1.30-1.27(m,1H),1.09-1.07(m,9H),0.88-0.84(m,3H).13CNMR(100MHz,CDOD)δ175.9,175.5,174.5,172.3,169.2,158.9,158.7,157.3,156.4,153.3,148.6,144.1,142.3,140.5,138.3,138.1,133.2,131.8,131.8,131.0,130.5,129.1,129.0,128.9,128.6,116.0,115.3,114.4,71.3,67.2,66.6,66.3,61.7,59.7,43.8,39.0,37.9,37.4,34.4,32.0,30.0,27.3,25.8,15.9,14.1.HRMS(0-95_1_4分,ESI):m/z 1019.4650[M+H]
例示的ERα標的化L1-CIDESの合成
iv.L1EC8例示的L1-CIDE、L1EC8を以下のとおり合成した:
Figure 2022505450000267
((2S,4R)-1-[(2S)-2-[3-[2-[3-[2-[4-[1-[4-[[4-[[(2S)-2-[[(2S)-2-[6-(2,5-ジオキソピロール-1-イル)ヘキサノイルアミノ]-3-メチル-ブタノイル]アミノ]-5-ウレイド-ペンタノイル]アミノ]-フェニル]メトキシ]フェニル]-2-フェニル-ブタ-1-エニル]フェノキシ]エチル-メチル-アミノ]-3-オキソ-プロポキシ]エトキシ]プロパノイルアミノ]-3,3-ジメチル-ブタノイル]-4-ヒドロキシ-N-[[4-(4-メチルチアゾール-5-イル)フェニル]メチル]ピロリジン-2-カルボキサミド)(8、「L1EC8」)。小型バイアルにおいて、MC-VC-PAB-Cl{N-(1S)-1-[[(1S)-1-[[4-(クロロメチル)フェニル]カルバモイル]-4-ウレイド-ブチル]カルバモイル]-2-メチル-プロピル]-6-(2,5-ジオキソピロール-1-イル)-6-ヘキサンアミド}(「Nat.Chem.」2016年、8、1112に記載されるとおりに調製;35.5mg、0.06mmol)および化合物3(49.5mg、0.051mmol)をDMF(0.1mL)に溶解し、0℃に冷却した。混合物に炭酸カリウム(70mg、0.51mmol)を添加し、反応物を0℃で1時間撹拌し、次いで、25℃で2時間維持した。混合物を冷DMFで希釈し、フィルタにかけた。濾液を、40~80%アセトニトリルの勾配で溶出する28分法を使用するHPLCによって直接精製した:Luna 10u C18、250×30 mm カラムで水中0.01%ギ酸。単離された化合物8(L1EC8)(10.8mg、14%)。[M+H]+=1720.35.HNMR(500MHz,DMSO-d)δ10.08(d,J=16.7Hz,1H),8.98(s,1H),8.59(t,J=6.0Hz,1H),8.17(t,J=7.4Hz,1H),7.94(dd,J=9.5,3.1Hz,1H),7.88-7.83(m,1H),7.64(d,J=8.3Hz,1H),7.59(d,J=8.4Hz,1H),7.45-7.34(m,5H),7.29(d,J=8.5Hz,1H),7.21-7.14(m,2H),7.13-7.04(m,5H),7.00(d,J=3.5Hz,3H),6.93(d,J=8.2Hz,1H),6.74-6.68(m,2H),6.68-6.62(m,1H),6.11-5.99(m,1H),5.45(d,J=4.7Hz,2H),4.85(s,1H),4.56(d,J=9.4Hz,1H),4.47-4.32(m,4H),4.26-4.16(m,2H),4.13(t,J=5.4Hz,1H),4.05(t,J=5.8Hz,1H),3.72(t,J=5.3Hz,1H),3.70-3.50(m,8H),3.50-3.27(m,18H),3.07(s,1H),3.05-2.90(m,3H),2.88(s,1H),2.62-2.47(m,7H),2.44(s,3H),2.43-2.28(m,3H),2.24-1.84(m,6H),1.75-1.64(m,1H),1.64-1.55(m,1H),1.54-1.31(m,7H),1.23(s,1H),1.22-1.13(m,2H),0.93(s,9H),0.88-0.77(m,10H).13CNMR(126MHz,DMSO-d)δ172.7,172.4,171.8,171.5,171.1,171.0,170.4,170.0,159.4,156.8,151.9,148.2,142.5,140.9,140.0,139.2,137.9,134.9,132.1,131.9,131.6,130.7,130.1,129.9,129.3,129.1,129.0,128.4,127.9,126.6,119.5,119.4,114.9,114.6,114.1,113.8,70.1,69.9,69.3,67.4,67.1,59.2,58.0,56.9,56.8,53.6,47.0,42.1,40.5,40.4,40.3,40.2,40.1,40.0,39.8,39.6,39.5,39.4,38.4,37.5,36.9,36.1,35.8,35.4,33.8,33.6,33.2,30.9,29.7,29.0,28.2,27.3,26.8,26.3,25.4,19.7,18.7,16.2,13.9.H NMRピークの帰属(s、d、t、mなど)および積分は、アミド回転異性体およびオレフィン異性体の存在によって複雑になる(全てのピークを表にしている)。13C NMRピークの割り当ても同様に複雑である。
v.L1EC10例示的なL1-CIDE、L1EC10は、以下のスキームによって合成することができる:
Figure 2022505450000268
スキーム8
工程1:エチル2-アセチルスルファニル-2-メチル-プロパノエート(JJ)。カリウムエタンチオエート(5.0g、44mmol)のDMF(50mL)中の溶液に、エチル2-ブロモイソブチレート(25.6g、131mmol)を添加した。反応物を室温で2時間撹拌した後、減圧下で濃縮した。残渣をシリカゲルカラムクロマトグラフィー(石油エーテル中0~10%EtOAc)によって精製して、化合物JJ(7.00g、84%)を無色液体として得た。
工程2:2-メルカプト-2-メチルプロパン-1-オール(KK)。THF(20mL)中の水素化アルミニウムリチウム(2.0g、53mmol)の溶液に、エチル2-アセチルスルファニル-2-メチル-プロパノエート(JJ、2.0g、10.5mmol)のTHF(10mL)溶液に0°Cで滴下した。反応物を75°Cで2時間撹拌し、次いで、0°CでEtOAc(20mL)およびHCl(2.0M、50mL)を添加することによってクエンチした。混合物を分離し、水層をEtOAc(20mL×3)で抽出した。合わせた有機層をブライン(10mL)で洗浄し、無水NaSOで乾燥させ、フィルタにかけた。濾液を濃縮して、粗化合物KK(0.90g)を黄色油状物として得た。この材料を、さらに精製することなく、次の工程で直接使用した。HNMR(400MHz,CDCl)δ4.19-4.09(m,1H),3.43(s,2H),1.63(s,1H),1.35(s,6H).
工程3:2-メチル-2-((5-ニトロピリジン-2-イル)ジスルファニル)プロパン-1-オール(LL)。MeOH(30mL)およびDCM(30mL)中の2-メチル-2-スルファニル-プロパン-1-オール(KK、0.90g、8.40mmol)の溶液に、2,2’-ジチオビス(5-ニトロピリジン)(2.60g、8.50mmol)を添加した。反応混合物を室温で16時間撹拌した。次いで、MnO(0.20g)を添加し、混合物をさらに0.5時間撹拌した。反応混合物をフィルタにかけ、濾液をシリカゲルカラムクロマトグラフィー(石油エーテル中0~50%EtOAc)によって精製して、化合物LL(1.10g、50%)を白色固体として得た。HNMR(400MHz,CDCl)δ9.32(d,J=4.0Hz,1H),8.36-7.34(m,1H),7.60(d,J=8.0Hz,1H),4.70(s,1H),3.32(d,J=8.0Hz,2H),1.37(s,6H).
工程4:S-(1-ヒドロキシ-2-メチルプロパン-2-イル)-メタンスルホノチオエート(MM)。メタンスルフィン酸ナトリウム(2.20g、21mmol)およびヨウ素(2.10g、8.40mmol)を、室温でDCM(20mL)中の2-メチル-2-[(5-ニトロ-2-ピリジル)ジスルファニル]プロパン-1-オール(LL、1.1g、4.2mmol)の溶液に順次加えた。反応混合物を50℃で24時間撹拌した後、これをフィルタにかけ、濾液をシリカゲルカラムクロマトグラフィー(石油エーテル中0~50%EtOAc)によって精製して、化合物MM(660mg、85%)を黄色油状物として得た。HNMR(400MHz,CDCl)δ3.81(s,2H),3.40(s,3H),1.54(s,6H).
工程5:3,3’-(エタン-1,2-ジイルビス(オキシ))ジプロパン酸(II)。エチル3,3’-(エタン-1,2-ジイルビス(オキシ))ジプロパノアート(上記の化合物3の合成に記載されるように調製されたAA;2.30g、8.7mmol)を含むEtOH(40mL)および水(2.0mL)の溶液に、水酸化カリウム(492mg、8.7mmol)を添加した。反応物を85℃で1時間撹拌した後、減圧下で濃縮した。残渣をHO(20mL)で希釈し、飽和NaHCO溶液(10mL)の添加によってpHを約9.0に調整した。混合物をEtOAc(20mL×2)で抽出し、水相をHCl(2.0M)溶液でpH=3.0に調整し、iPrOH/CHCl(1:3)で抽出した。合わせた有機層をNaSOで乾燥させ、フィルタにかけ、濃縮して、化合物NN(1.30g、75%)を無色油状物として得た。HNMR(400MHz,CDOD)δ3.76-3.70(m,4H),3.62-3.58(m,4H),2.58-2.50(m,4H).
工程6:3-(2-(3-((2-(4-(1-(4-ヒドロキシフェニル)-2-フェニルブタ-1-エン-1-イル)フェノキシ)エチル)-(メチル)アミノ)-3-オキソプロポキシ)エトキシ)プロパン酸(OO)。3,3’-(エタン-1,2-ジイルビス(オキシ))ジプロパン酸(NN、828mg、4.0mmol)を含むDMF(13mL)の溶液に、(iPr)NEt(865mg、6.69mmol)およびHATU(559mg、1.47mmol)を添加した。溶液を25°Cで10分間撹拌し、次いで、4-(1-(4-(2-(メチルアミノ)エトキシ)フェニル)-2-フェニルブタ-1-エン-1-イル)フェノール(K、「Breast Cancer Research and Treatment」2004年、85、151頁に記載されているように調製;500mg、1.3mmol)を添加した。反応物を室温で1時間撹拌し、次いで、分取HPLC[Waters Xbridge 150*255u(MeCN 26~46/0.1%NHHCO水溶液)]によって直接精製して、化合物OO(290mg、38%)を白色固体として得た。LCMS(ESI)m/z:562.1[M+H]+.
工程7:S-(1-(((((3R,5S)-1-((S)-2-((tert-ブトキカルボニル)アミノ)-3,3-ジメチルブタノイル)-5-((4-(4-メチルチアゾール-5-イル)ベンジル)カルバモイル)ピロリジン-3-イル)オキシ)カルボニル)オキシ)-2-メチルプロパン-2-イル)メタンスルホノチオエート(QQ)。トリホスゲン(0.050mL、0.30mmol)のDCM(2.0mL)中溶液を、ピリジン(0.040mL、0.50mmol)および2-メチル-2-メチルスルホニルスルファニル-プロパン-1-オール(MM、100mg、0.50mmol)のDCM(2.0mL)中溶液に室温で滴下して加えた。得られた混合物を室温で30分間撹拌した後、DCM(10mL)およびEtN(0.11mL、0.80mmol)中のtert-ブチル((S)-1-((2S,4R)-4-ヒドロキシ-2-((4-(4-メチルチアゾール-5-イル)ベンジル)カルバモイル)ピロリジン-1-イル)-3,3-ジメチル-1-オキソブタン-2-イル)カルバメート(PP、「J.Med.Chem.」2018年、61、599頁に記載されるとおりに調製;220mg、0.40mmol)の溶液を添加した。反応混合物を同温度で2時間撹拌した後、減圧下で濃縮した。残渣をシリカゲルカラムクロマトグラフィー(DCM中0~5%MeOH)によって精製して、化合物QQ(230mg、76%)を黄色油状物として得た。LCMS(ESI)m/z:763.0[M+H]+.
工程8:S-(1-(((((3R,5S)-1-((S)-2-アミノ-3,3-ジメチルブタノイル)-5-((4-(4-メチルチアゾール-5-イル)ベンジル)カルバモイル)ピロリジン-3-イル)オキシ)カルボニル)オキシ)-2-メチルプロパン-2-イル)メタンスルホノチオエート(RR)。トリフルオロ酢酸(0.3mL、0.04mmol)を、1,1,1,3,3,3-ヘキサフルオロ-2-プロパノール(6mL、0.04mmol)中のS-(1-(((((3R,5S)-1-((S)-2-((tert-ブトキシカルボニル)アミノ)-3,3-ジメチルブタノイル)-5-((4-(4-メチルチアゾール-5-イル)ベンジル)カルバモイル)ピロリジン-3-イル)オキシ)カルボニル)オキシ)-2-メチルプロパン-2-イル)メタンスルホノチオエート(QQ、30mg、0.04mmol)の溶液に室温で滴下して加えた。反応混合物を同温度で1時間撹拌した後、減圧下で濃縮した。粗生成物RR(28mg)をさらに精製することなく次の工程に使用した。LCMS(ESI)m/z:641.1[M+H]+.
工程9:S-(1-(((((3R,5S)-1-((S)-2-(tert-ブチル)-16-(4-(1-(4-ヒドロキシフェニル)-2-フェニルブタ-1-エン-1-イル)フェノキシ)-14-メチル-4,13-ジオキソ-7,10-ジオキサ-3,14-ジアザヘキサデカン-1-オイル)-5-((4-(4-メチルチアゾール-5-イル)ベンジル)カルバモイル)ピロリジン-3-イル)オキシ)カルボニル)オキシ)-2-メチルプロパン-2-イル)メタンスルホノチオエート(10)。無水DMF(1.0mL)中の3-(2-(3-((2-(4-(1-(4-ヒドロキシフェニル)-2-フェニルブタ-1-エン-1-イル)フェノキシ)エチル)(メチル)アミノ)-3-オキソプロポキシ)エトキシ)プロパン酸(OO、28mg、0.050mmol)、(iPr)NEt(0.03mL、0.16mmol)およびHATU(19mg、0.05mmol)の溶液を室温で20分間撹拌した。得られた混合物に、S-(1-(((((3R,5S)-1-((S)-2-アミノ-3,3-ジメチルブタノイル)-5-((4-(4-メチルチアゾール-5-イル)ベンジル)カルバモイル)ピロリジン-3-イル)オキシ)カルボニル)オキシ)-2-メチルプロパン-2-イル)メタンスルホノチオエート(RR、25mg、0.040mmol)を添加し、反応物を室温でさらに2時間撹拌した。次いで、混合物をフィルタにかけ、濾液を分取HPLC[Xtimate C18 150*25mm*5um(MeCN 55~85/0.225%ギ酸水溶液)]によって精製して、化合物10(L1EC10)(4.5mg、9.6%)を白色固体として得た。LCMS(ESI)m/z:641.1[M+H]+.HNMR(400MHz,DMSO-d)δ9.42(s,0.3H),9.17(s,0.7H),8.98(s,1H),8.62(t,J=6.0Hz,1H),7.95(d,J=8.8Hz,1H),7.42-7.38(m,4H),7.21-7.14(m,2H),7.13-7.04(m,2H),6.95-6.87(m,2H),6.75-6.69(m,1H),6.65-6.57(m,2H),6.41-6.37(m,1H),5.24(s,1H),4.49-4.37(m,3H),4.36-4.34(m,2H),4.33-4.31(m,1H),4.30(s,3H),4.28-4.21(m,2H),4.20-4.01(m,1H),3.78-3.75(m,1H),3.63-3.57(m,4H),3.54-3.35(m,5H),3.06(s,1H),2.98(s,0.5H),2.87(s,1H),2.80(s,0.5H),2.70-2.52(m,3H),2.43-2.25(m,5H),2.24-1.98(m,1H),1.52(s,3H),1.49(s,3H),1.25-1.22(m,2H),0.94(s,9H),0.85-0.81(m,3H).13CNMR(100MHz,DMSO-d)171.2,170.5,170.4,169.7,163.1,156.9,156.1,156.0,155.9,155.2,153.5,151.5,147.7,142.1,134.0,139.8,139.2,137.8,137.7,135.9,135.6,133.9,133.6,131.4,131.1,130.1,129.7,129.4,128.7,127.9,127.8,127.4,129.6,114.9,114.3,114.0,113.2,77.3,72.7,69.6,69.4,66.9,66.5,65.5,58.2,57.0,55.7,53.4,53.0,48.2,46.5,41.7,36.4,36.3,35.5,34.7,33.3,33.20,33.1,32.6,28.9,28.5,26.2,25.0,15.9,13.4.HRMS(5-95AB_4分_neg,ESI),m/z 1184.4736[M+H]+.
vi.L1EC11例示的L1-CIDE、L1EC11を以下のとおり合成した:
Figure 2022505450000269
S-(1-(((((3R,5S)-1-((S)-2-(tert-ブチル)-14-メチル-4,13ジオキソ-16-(4-(2-フェニル-1-(4-(ホスホノオキシ)フェニル)ブタ-1-エン-1-イル)フェノキシ)-7,10ジオキサ-3,14ジアザヘキサデカン-1-イル)-5-((4-(4-メチルチアゾール-5-イル)ベンジル)カルバモイル)ピロリジン-3-イル)オキシ)カルボニル)オキシ)-2-メチルプロパン-2-イル)メタンスルホノチオエート(11、「L1EC11」)。塩化ピロホスホリル(42mg、0.17mmol)を、THF(1mL)中のS-(1-(((((3R,5S)-1-((S)-2-(tert-ブチル)-16-(4-(1-(4-ヒドロキシフェニル)-2-フェニルブタ-1-エン-1-イル)フェノキシ)-14-メチル-4,13-ジオキソ-7,10-ジオキサ-3,14-ジアザヘキサデカン-1-イル)-5-((4-(4-メチルチアゾール-5-イル)ベンジル)カルバモイル)ピロリジン-3-イル)オキシ)カルボニル)オキシ)-2-メチルプロパン-2-イル)メタンスルホノチオアート(10、80mg、0.070mmol)の溶液に-40°Cで滴下して加えた。反応混合物を-40℃で2時間撹拌し、次いで、氷水(3mL)でクエンチした。混合物を飽和NaHCO水溶液(5.0mL)およびHCl(1.0M、2.0mL)で処理し、次いで、EtOAc(10mL×3)で抽出した。合わせた有機層をブライン(10mL×2)で洗浄し、乾燥させ、濃縮した。残渣を分取HPLC[Waters Xbridge 150*255u(MeCN 25~55/0.01%NHHCO水溶液)]によって精製して、化合物11(L1EC11)(25mg、30%)を白色固体として得た。LCMS(ESI)m/z:632.9[M+H]+.HNMR(400MHz,DMSO-d)δ8.98(s,1H),8.72-8.67(m,1H),8.01-7.92(m,1H),7.49-7.36(m,4H),7.25-7.18(m,5H),7.17-7.09(m,5H),7.08-6.94(m,1H),6.93-6.90(m,1H),6.75-6.67(m,2H),6.65-6.59(m,2H),5.24(s,1H),4.49-4.31(m,6H),4.30-4.21(m,2H),4.20-4.01(m,2H),3.78-3.71(m,1H),3.60-3.57(m,3H),3.56-3.54(m,2H),3.45-3.35(m,6H),3.06(s,1H),2.98(s,0.5H),2.87(s,1H),2.80(s,0.5H),2.70-2.65(m,1H),2.52-2.49(m,1H),2.43(s,3H),2.41-2.28(m,5H),2.22-2.01(m,1H),1.51(s,3H),1.48(s,3H),0.94(s,9H),0.85-0.81(m,3H).13CNMR(100MHz,DMSO-d)δ171.4,170.3,169.7,165.0,160.9,157.7,153.5,153.5,151.5,151.1,147.8,139.3,131.2,129.7,128.7,127.4,113.7,113.4,77.4,72.7,69.4,66.9,65.5,58.2,56.9,55.7,53.0,41.7,40.4,36.2,35.5,34.7,30.3,29.1,29.0,28.8,28.7,28.6,26.6,26.3,25.0,22.1,15.9,13.9.HRMS(50-100AB_4分_neg,ESI),m/z 1262.3861[M-H]-.
vii.L1EC12例示的なL1-CIDE、L1EC12は、以下のスキームによって合成することができる:
Figure 2022505450000270
スキーム9
工程1:アリル((S)-1-((2S,4R)-4-ヒドロキシ-2-((4-(4-メチルチアゾール-5-イル)ベンジル)カルバモイル)ピロリジン-1-イル)-3,3-ジメチル-1-オキソブタン-2-イル)カルバメート(SS).クロロギ酸アリル(440mg、3.60mmol)を、(2S,4R)-1-((S)-2-アミノ-3,3-ジメチルブタノイル)-4-ヒドロキシ-N-(4-(4-メチルチアゾール-5-イル)ベンジル)ピロリジン-2-カルボキサミド(CC、TFA塩、「J.Med.Chem.」2018年、61、599に記載されるとおりに調製;1.50g、3.40mmol)およびNaHCO(1.46g、17.4mmol)を含む水(4.0mL)およびTHF(4mL)の溶液に0°Cで滴下して加えた。混合物を25℃に加温し、その温度で16時間維持した。次いで、反応物を水(10mL)で希釈し、得られた混合物をEtOAc(15mL×3)で抽出した。合わせた有機層をブライン(10mL)で洗浄し、NaSO上で乾燥し、フィルタにかけた。濾液を減圧下で濃縮し、残渣をシリカゲルカラムクロマトグラフィー(DCM中0~5%MeOH)によって精製して、化合物SS(1.40g、78%)を灰色固体として得た。LCMS(ESI)m/z:514.0[M+H]+.
工程2:アリル((2S)-1-((2S,4R)-4-((ヒドロキシヒドロホスホリル)オキシ)-2-((4-(4-メチルチアゾール-5-イル)ベンジル)カルバモイル)ピロリジン-1-イル)-3,3-ジメチル-1-オキソブタン-2-イル)カルバメート(TT)。三塩化リン(373mg、2.72mmol)のTHF(1.0mL)溶液およびEtN(688mg、6.8mmol)のTHF(2.0mL)溶液を、アリル((S)-1-((2S,4R)-4-ヒドロキシ-2-((4-(4-メチルチアゾール-5-イル)ベンジル)カルバモイル)ピロリジン-1-イル)-3,3-ジメチル-1-オキソブタン-2-イル)カルバメート(SS、700mg、1.36mmol)のTHF(12mL)溶液に-78°Cで順次添加した。反応混合物を-78℃で20分間撹拌し、次いで、25℃に加温した。その温度で16時間撹拌した後、水(2.0mL)およびNaHCO水溶液(5.0mL)を添加することによって反応をクエンチした。得られた混合物を25℃で10分間撹拌し、次いで、HCl(1.0M)でpH=3.0に酸性化し、減圧下で濃縮した。残渣を分取TLC(DCM中12%MeOH)によって精製し、化合物TT(400mg、51%)を無色固体として得た。LCMS(ESI)m/z:579.1[M+H]+.
工程3:アリル((2S)-1-((2S,4R)-4-((ヒドロキシ(1H-イミダゾール-1-イル)ホスホリル)オキシ)-2-((4-(4-メチルチアゾール-5-イル)ベンジル)カルバモイル)ピロリジン-1-イル)-3,3-ジメチル-1-オキソブタン-2-イル)カルバメート(UU)。四塩化炭素(4mL)およびMeCN(4.0mL)中のN-トリメチルシリルイミダゾール(727mg、5.2mmol)を、アリル((2S)-1-((2S,4R)-4-((ヒドロキシヒドロホスホリル)オキシ)-2-((4-(4-メチルチアゾール-5-イル)ベンジル)カルバモイル)ピロリジン-1-イル)-3,3-ジメチル-1-オキソブタン-2-イル)カルバメート(TT、750mg、1.3mmol)およびEtN(0.72mL、5.2mmol)の溶液に25°Cで添加した。反応混合物をその温度で50分間撹拌し、次いで、MeOH(0.10mL)で処理し、さらに10分間撹拌した。溶媒を減圧下で除去し、残渣を5/1 MTBE/EtOAc(3.0mL)で洗浄した。得られた沈殿物をフィルタにかけることにより除去し、MTBE(3.0mL)で洗浄した。濾液を濃縮し、洗浄すると、化合物UU(830mg、95%)が得られ、これをさらに精製することなく次の工程に使用した。LCMS(ESI)m/z:645.3[M+H]+.
工程4:9H-フルオレン-9-イルメチルN-[2-[[[(3R,5S)-1-[(2S)-2-(アリルオキシカルボニルアミノ)-3,3-ジメチル-ブタノイル]-5-[[4-(4-メチルチアゾール-5-イル)フェニル]メチルカルバモイル]ピロリジン-3-イル]オキシ-ヒドロキシ-ホスホリル]オキシ-ヒドロキシ-ホスホリル]オキシエチル]カルバメート(WW)。DMF(3.5mL)中のアリル((2S)-1-((2S、4R)-4-((ヒドロキシ(1H-イミダゾール-1-イル)ホスホリル)オキシ)-2-((4-(4-メチルチアゾール-5-イル)ベンジル)カルバモイル)ピロリジン-1-イル)-3,3-ジメチル-1-オキソブタン-2-イル)カルバメート(UU、830mg、1.29mmol)および(9H-フルオレン-9-イル)メチル(2-(ホスホノオキシ)エチル)カルバメート(VV、「J.Am.Chem.Soc.」2016年、138、1430;514mg、1.42mmol)の室温溶液に、トルエン(1.0M、12.8mL、12.8mmol)中の塩化亜鉛溶液を添加した。反応物を室温で12時間撹拌し、次いで、分取HPLC[Waters Xbridge 150*255u(MeCN 20~40/10mM NHHCO水溶液)]によって直接精製して、化合物WW(400mg、33%)を白色固体として得た。LCMS(ESI)m/z:940.1[M+H]+.
工程5:9H-フルオレン-9-イルメチルN-[2-[[[(3R,5S)-1-[(2S)-2-アミノ-3,3-ジメチル-ブタノイル]-5-[[4-(4-メチルチアゾール-5-イル)フェニル]メチルカルバモイル]ピロリジン-3-イル]オキシ-ヒドロキシ-ホスホリル]オキシ-ヒドロキシ-ホスホリル]オキシエチル]カルバメート(XX).DCM(6.0mL)およびMeOH(0.60mL)中の9H-フルオレン-9-イルメチルN-[2-[[[(3R,5S)-1-[(2S)-2-(アリルオキシカルボニルアミノ)-3,3-ジメチル-ブタノイル]-5-[[4-(4-メチルチアゾール-5-イル)フェニル]メチルカルバモイル]ピロリジン-3-イル]オキシ-ヒドロキシ-ホスホリル]-オキシ-ヒドロキシ-ホスホリル]オキシエチル]カルバメート(WW、150mg、0.16mmol)および1,3-ジメチルバルビツール酸(125mg、0.80mmol)の溶液に、テトラキス(トリフェニルホスフィン)パラジウム(37mg、0.030mmol)を25°Cで添加した。反応混合物をその温度で2時間撹拌し、次いで、分取HPLC[Waters Xbridge 150*255u(MeCN 15~45/10mM NHHCO水溶液)]によって直接精製して、化合物XX(78mg、57%)を黄色固体として得た。LCMS(ESI)m/z:856.1[M+H]+.
工程6:9H-フルオレン-9-イルメチルN-[2-[ヒドロキシ-[ヒドロキシ-[(3R,5S)-1-[(2S)-2-[3-[2-[3-[2-[4-[1-(4-ヒドロキシフェニル)-2-フェニル-ブタ-1-エニル]フェノキシ]エチル-メチル-アミノ]-3-オキソ-プロポキシ]エトキシ]プロパノイルアミノ]-3,3-ジメチル-ブタノイル]-5-[[4-(4-メチルチアゾール-5-イル)フェニル]メチルカルバモイル]ピロリジン-3-イル]オキシ-ホスホリル]オキシ-ホスホリル]オキシエチル]カルバメート(YY)。無水DMF(3.0mL)中の3-(2-(3-((2-(4-(1-(4-ヒドロキシフェニル)-2-フェニルブタ-1-エン-1-イル)フェノキシ)エチル)(メチル)アミノ)-3-オキソプロポキシ)エトキシ)プロパン酸(OO、化合物10の合成において上記のように調製;210mg、0.37mmol)、(iPr)NEt(0.12mL、0.75mmol)およびHATU(142mg、0.37mmol)の溶液を25°Cで20分間撹拌した。次いで、9H-フルオレン-9-イルメチルN-[2-[[[(3R,5S)-1-[(2S)-2-アミノ-3,3-ジメチル-ブタノイル]-5-[[4-(4-メチルチアゾール-5-イル)フェニル]メチルカルバモイル]-ピロリジン-3-イル]オキシ-ヒドロキシ-ホスホリル]オキシ-ヒドロキシ-ホスホリル]オキシエチル]カルバメート(XX、80mg、0.09mmol)を添加し、得られた混合物を25℃で2時間撹拌した。その後、反応混合物を分取HPLC[Waters Xbridge 150*255u(MeCN 32~62/10mM NHHCO水溶液)]によって直接精製して、化合物TT(60mg、45%)を白色固体として得た。LCMS(ESI)m/z:1400.2[M+H]+.
工程7:[2-[6-(2,5-ジオキソピロール-1-イル)ヘキサノイルアミノ]エトキシ-ヒドロキシ-ホスホリル][(3R,5S)-1-[(2S)-2-[3-[2-[3-[2-[4-[1-(4-ヒドロキシフェニル)-2-フェニル-ブタ-1-エニル]フェノキシ]エチル-メチル-アミノ]-3-オキソ-プロポキシ]エトキシ]プロパノイルアミノ]-3,3-ジメチル-ブタノイル]-5-[[4-(4-メチルチアゾール-5-イル)フェニル]メチルカルバモイル]ピロリジン-3-イル]リン酸水素(12)。A部 ピペリジン(14mg、0.16mmol)を、9H-フルオレン-9-イルメチルN-[2-[ヒドロキシ-[ヒドロキシ-[(3R,5S)-1-[(2S)-2-[3-[2-[3-[2-[4-[1-(4-ヒドロキシフェニル)-2-フェニル-ブタ-1-エニル]フェノキシ]エチル-メチル-アミノ]-3-オキソ-プロポキシ]エトキシ]-プロパノイルアミノ]-3,3-ジメチル-ブタノイル]-5-[[4-(4-メチルチアゾール-5-イル)フェニル]メチル-カルバモイル]ピロリジン-3-イル]オキシ-ホスホリル]オキシ-ホスホリル]オキシエチル]カルバメート(YY、46mg、0.030mmol)を含むDMF(0.50mL)の溶液に25°Cで滴下して加えた。反応混合物をその温度で1時間撹拌した後、減圧下で濃縮した。得られた残渣を分取HPLC[Waters Xbridge 150*255u(MeCN 25~55/10mM NHHCO水溶液)]によって精製して、[2-アミノエトキシ(ヒドロキシ)ホスホリル][(3R,5S)-1-[(2S)-2-[3-[2-[3-[2-[4-[1-(4-ヒドロキシフェニル)-2-フェニル-ブタ-1-エニル]フェノキシ]エチル-メチル-アミノ]-3-オキソ-プロポキシ]エトキシ]プロパノイルアミノ]-3,3-ジメチル-ブタノイル]-5-[[4-(4-メチルチアゾール-5-イル)フェニル]メチルカルバモイル]ピロリジン-3-イル]リン酸水素(スキームには示されていない;30mg、78%)を白色固体として得た。LCMS(ESI)m/z:1177.4[M+H]+.
B部 DMF(1.0mL)中の(iPr)NEt(6.6mg、0.05mmol)および[2-アミノエトキシ(ヒドロキシ)ホスホリル][(3R,5S))-1-[(2S)-2-[3-[2-[3-[2-[4-[1-(4-ヒドロキシフェニル)-2-フェニル-ブタ-1-エニル]フェノキシ]エチル-メチル-アミノ]-3-オキソ-プロポキシ]エトキシ]プロパノイルアミノ]-3,3-ジメチル-ブタノイル]-5-[[4-(4-メチルチアゾール-5-イル)フェニル]メチルカルバモイル]ピロリジン-3-イル]リン酸水素(上記A部で調製;30mg、0.030mmol)の溶液に、6-マレイミドヘキサン酸N-ヒドロキシスクシンイミドエステル(MC-OSu、Aldrich;19.6mg、0.06mmol)を25°Cで添加した。反応混合物をその温度で8時間撹拌した後、フィルタにかけた。濾液を分取HPLC[Waters Xbridge 150*255u(MeCN 25~55%/10mM NHHCO水溶液)]によって精製して、化合物12(「L1EC12」)(9.5mg、26%)を白色固体として得た。LCMS(ESI)m/z:641.5[M+H]+.HNMR(400MHz,DMSO-d)δ8.97(s,1H),8.85(s,1H),8.72(s,1H),7.96(t,J=8.0Hz,1H),7.46-7.36(m,6H),7.18-7.14(m,2H),7.13-7.04(m,5H),6.98(s,2H),6.95-6.92(m,2H),6.76-6.68(m,1H),6.67-6.61(m,1H),6.59-6.55(m,2H),6.42-6.40(m,1H),4.78-4.71(s,1H),4.57-4.52(m,1H),4.51-4.41(m,2H),4.28-4.21(m,1H),4.20-4.01(m,1H),3.78-3.75(m,1H),3.63-3.57(m,5H),3.54-3.49(m,8H),3.48-3.41(m,6H),3.38-3.35(m,2H),3.07(s,1H),2.98(s,1H),2.80(s,1H),2.75(s,1H),2.65-2.62(m,1H),2.44(s,3H),2.05-1.98(m,2H),1.95-1.85(m,1H),1.54-1.43(m,6H),1.26-1.12(m,3H),0.92(s,9H),0.85-0.81(m,3H).13CNMR(100MHz,DMSO-d)δ171.7,171.1,159.3,158.4,155.3,151.5,147.7,142.2,139.4,134.5,131.4,131.2,130.2,130.1,129.7,129.4,128.7,127.8,127.4,115.0,114.3,113.3,69.6,69.4,67.0,66.6,63.5,62.5,59.9,57.6,57.6,56.4,55.1,41.7,36.5,35.7,35.5,34.9,33.1,32.6,30.9,29.1,28.7,28.6,27.8,26.3,25.9,24.8,15.9,15.9,13.4.HRMS(50-100AB_4分_neg,ESI),m/z 1385.4942[M-H+NH3]-.
例示的なBRD4標的化CIDEおよびBRD4標的化L1-CIDEの合成
viii.L1BC1例示的なL1-CIDE、L1BC1は、以下のスキームによって合成することができる:
Figure 2022505450000271
スキーム10
Figure 2022505450000272
化合物1(1.000g、1.66mmol)をHBr/HOAc(10mL)に溶解し、混合物を25°Cで2時間撹拌した。反応混合物を氷水(20mL)に入れた。沈殿物をフィルタにかけ、水(10mL×2)、MTBE(20mL)で洗浄し、真空下で24時間乾燥させて、粗生成物化合物2(1.100g、99.6%)を灰色固体として得、これを次の工程で直接使用した。
Figure 2022505450000273
無水DMF(8.0mL)中の化合物3(500.0mg、0.9400mmol)および化合物2(1.064g、1.6mmol)の溶液を80°Cで2時間撹拌した。反応物をフィルタにかけ、得られた残渣を分取HPLC(アセトニトリル34-64/0.225%FA水溶液)によって精製して、化合物4(150mg、14%)を白色固体として得た。LCMS(5-95,AB,1.5分):R=0.738分、m/z=1114..6[M]
Figure 2022505450000274
化合物4(30.0mg、0.0300mmol)を、TFAのHFIP(5%、1.5mL)溶液に25°Cで溶解し、混合物を25°Cで1時間撹拌した。混合物を濃縮して、粗生成物化合物5(30mg、98.8%)を灰色固体として得、これを次の工程で直接使用した。
Figure 2022505450000275
化合物6(9.8mg、0.0300mmol)、DIEA(10.3mg、0.0800mmol)およびHATU(12.12mg、0.0300mmol)の無水DMF(2.0mL)中溶液を25℃で20分間撹拌し、次いで、化合物5(30.0mg、0.0300mmol)を添加した。得られた混合物を25℃で2時間撹拌した。反応物を濃縮し、得られた残渣をEtOAc(2.0mL×2)で洗浄して、化合物7(34mg、98%)を灰色固体として得、これを次の工程で直接使用した。LCMS(5-95,AB,1.5分):RT=0.848分,m/z=1305.3[M]+.
Figure 2022505450000276
化合物7(34.0mg、0.0300mmol)を、TFAのHFIP(5%、1.5mL)溶液に25℃で溶解し、混合物を25℃で1時間撹拌した。混合物を濃縮し、残渣をEtOAc(1.0mL×2)で洗浄して、粗生成物化合物8(34mg、98.9%)を灰色固体として得、これを次の工程で直接使用した。
Figure 2022505450000277
無水DMF(3.0mL)中の化合物9(15.49mg、0.0300mmol)、HATU(10.79mg、0.0300mmol)およびDIEA(13.33mg、0.1000mmol)の溶液を25℃で20分間撹拌し、化合物8(34.0mg、0.0300mmol)を添加した。得られた混合物を25℃で2時間撹拌した。混合物を濃縮し、残渣をEtOAc(2.0mL×2)で洗浄して、化合物10(43mg、98.8%)を淡黄色固体として得、これを次の工程で直接使用した。LCMS(5-95,AB,1.5分):RT=0.828分,m/z=843.4[M/2+1]+.
Figure 2022505450000278
DMF(1.0mL)中の化合物10(43.0mg、0.0300mmol)の溶液に、ピペリジン(10.85mg、0.1300mmol)を25℃で添加した。混合物を25℃で30分間撹拌した。混合物を濃縮し、残渣をEtOAc(1.0mL×2)で洗浄して、化合物11(37mg、99.1%)を灰色固体として得、これを次の工程で直接使用した。
Figure 2022505450000279
DMF(1.0mL)中の化合物11(「BC1」)、(37.0mg、0.0300mmol)の溶液に、化合物12(11.68mg、0.0400mmol)を25℃で添加した。混合物を25℃で12時間撹拌した。混合物をフィルタにかけ、分取HPLC(アセトニトリル22~52%/0.225%FA水溶液)によって精製して、L1BC1(3.95mg、7.5%)を白色固体として得た。LCMS(5-95,AB,1.5分):RT=0.757分,m/z=828.8[M/2+1]
ix.L1BC2例示的なL1-CIDE、L1BC2は、以下のスキームによって合成することができる:
Figure 2022505450000280
スキーム11
Figure 2022505450000281
TFA(0.30mL)およびHFIP(6.0mL)の混合物中の化合物1(200.0mg、0.2600mmol)の溶液を25℃で1時間撹拌した。溶液を濃縮し、残渣をDMF(5.0mL)で希釈し、再度濃縮して、化合物2(200mg、98%)を無色油状物として得、これを次の工程で直接使用した。
Figure 2022505450000282
DMF(5.0mL)中のBocNH_PEG3-酸(80.0mg、0.2600mmol)の溶液に、DIEA(134.56mg、1.04mmol)およびHATU(118.77mg、0.3100mmol)を添加した。溶液を25℃で15分間撹拌し、次いで、化合物2(200.0mg、0.260mmol)を添加した。この反応溶液を25℃でさらに1時間撹拌した。溶液を濃縮し、残渣を分取TLC(DCM中10%MeOH、R=0.5)によって精製して、化合物3(150mg、収率59%)を黄色油状物として得た。LCMS(5-95,AB,1.5分):R=0.883分,m/z=975.6[M+23]
Figure 2022505450000283
TFA(0.20mL)およびHFIP(4.0mL)の混合物中の化合物3(150.0mg、0.1600mmol)の溶液を25℃で1時間撹拌した。溶液を濃縮し、残渣をDMF(5.0mL)で希釈し、再度濃縮することにより、化合物4(150mg,98.6%)を無色油状物として得、これを次の工程で直接使用した。
Figure 2022505450000284
DMF(5.0mL)の中のスルホンBRD4酸(75.0mg、0.1500mmol)を含む溶液に、DIEA(77.47mg、0.600mmol)およびHATU(68.38mg、0.1800mmol)を添加した。溶液を25°Cで10分間撹拌し、次いで、化合物4(144.92mg、0.1500mmol)を添加した。得られた反応溶液を、25℃で1時間撹拌した。溶液を濃縮し、残渣を分取TLC(DCM中10%MeOH、R=0.5)によって精製して、化合物5(198mg、97.9%)を淡黄色油状物として得た。LCMS(5-95,AB,1.5分):RT=0.847分,m/z=1358.0[M+1]
Figure 2022505450000285
DCM(4.0mL)中の化合物5(160.0mg、0.1200mmol)の溶液に、TMSI(239.72mg、1.2mmol)を添加した。反応混合物を25℃で1時間撹拌した。MeOH(20mL)を添加し、溶液を25°Cでさらに10分間撹拌した。溶液を濃縮し、残渣を分取HPLC(アセトニトリル0~40/0.1%HCl水溶液)によって精製し、BC2(42mg、27%)を白色固体として得た。LCMS(5-95,AB,1.5分):RT=0.773分,m/z=1201.6[M+1]HNMR(400MHz,CDCl)δ8.86(s,1H),8.53(s,1H),7.94(s,1H),7.88(s,1H),7.69(s,1H),7.47(d,J=7.6Hz,1H),7.36(s,1H),7.23-7.21(m,2H),7.05-7.00(m,2H),4.88-4.82(bR,2H),4.69(s,1H),4.60-4.49(m,5H),4.38-4.34(m,1H),4.02-3.98(m,2H),3.88-3.79(m,2H),3.71-3.63(m,13H),3.51-3.44(m,4H),3.24-3.20(m,2H),2.99(s,3H),2.46(s,3H),2.13-2.07(m,6H),1.02(s,9H).
Figure 2022505450000286
DMF(2.0mL)中のBC2(25.0mg、0.0200mmol)およびMC_SQ_Cit_PAB-PNPの溶液に、DIEA(10.36mg、0.0800mmol)を加えた。反応溶液を、25℃で2時間撹拌した。溶液を分取HPLC(XtimateC18150*25mm*5um、アセトニトリル35~65/0.225%FA水溶液)によって精製し、L1BC2(16.89mg、45%)を白色固体として得た。LCMS(5-95,AB,1.5分):RT=0.803分,m/z=900.4[M/2+H]+.HNMR(400MHz,CDCl)δ8.85(s,1H),7.93(s,1H),7.87(s,1H),7.86(s,1H),7.69-7.68(m,3H),7.43(d,J=7.6Hz,1H),7.35(s,1H),7.30(d,J=8.8Hz,2H),7.26(s,1H),7.21(s,1H),7.01-6.94(m,1H),6.75(s,2H),5.06(brs,1H),4.89-4.67(m,12H),4.65-4.61(m,1H),4.01(d,J=4.8Hz,2H),3.71-3.61(m,15H),3.49-3.42(m,5H),3.31-3.22(m,3H),3.25-3.21(m,4H),3.16-3.13(m,2H),2.97(s,3H),2.56-2.51(m,2H),2.45(s,3H),1.94-1.92(m,3H),1.78-1.74(m,2H),1.55-1.51(m,6H),1.28-1.26(m,4H),1.00(s,9H).
x.L1BC3例示的なL1-CIDE、L1BC3は、以下のスキームによって合成することができる:
Figure 2022505450000287
スキーム12
Figure 2022505450000288
DCM(20mL)中の1(2.00g、7.68mmol)の溶液に、MeSONa(3.92g、38.41mmol)およびI(3.90g、15.37mmol)を25℃で添加した。反応混合物を50℃で24時間撹拌した後、フィルタにかけ、濾過物を濃縮した。これをカラムクロマトグラフィー(石油エーテル中0~33%EtOAc、R=0.3)により精製して、2(400mg、28.3%)を黄色油状物として得た。HNMR(400MHz,CDCl)δ3.81(s,2H),3.40(s,3H),1.54(s,6H).
Figure 2022505450000289
トリホスゲン(322.06mg、1.09mmol)のDCM(2.0mL)中の溶液に、ピリジン(171.70mg、2.17mmol)および化合物2(400.00mg、2.17mmol)のDCM(2.0mL)中の溶液を添加した。反応物を25℃で30分間撹拌した後、これを濃縮し、DCM(20mL)に再溶解した。EtN(438.83mg、4.34mmol)および化合物3(1.73g、3.25mmol)の溶液を添加し、反応物を25℃で2時間撹拌した。混合物を真空中で濃縮し、カラムクロマトグラフィー(DCM中0~10%MeOH、R=0.5)により精製して、化合4(100.00mg、6.2%)を黄色油状物として得た。LCMS(5-95,AB,1.5分):R=0.962分、m/z=741.1[M+1]
Figure 2022505450000290
HFIP(6.00mL)中の化合物4(100.00mg、0.13mmol)の溶液に、TFA(0.30mL)を添加した。反応後、溶液を25℃で1時間撹拌し、これを真空中で濃縮して化合物5(TFA塩、101.00mg、99.1%)を無色油状物として得、これを次の工程で直接使用した。
Figure 2022505450000291
DMF(5.0mL)中の化合物6(44.36mg、0.15mmol)およびHATU(67.15mg、0.18mmol)の溶液に、DIEA(86.46mg、0.67mmol)を添加した。混合物を25℃で10分間撹拌した後、化合物5(101.00mg、0.13mmol)を添加した。混合物を25℃で30分間撹拌した。混合物を真空中で濃縮し、カラムクロマトグラフィー(溶媒勾配:DCM中0~10%MeOHRf=0.6)によって、次いで、分取TLC(DCM中10%MeOH、Rf=0.6)によって精製して、化合物7(100.00mg、74.4%)を黄色油状物として得た。LCMS(5-95,AB,1.5分):RT=1.066分,m/z=924.5[M+1]
Figure 2022505450000292
HFIP(6.00mL)中の化合物7(44.36mg、0.05mmol)の溶液に、TFA(0.30mL)を添加した。反応溶液を、25℃で1時間撹拌した。溶液を真空中で濃縮して、化合物8(TFA塩、45.00mg、94%)を無色油状物として得た。
Figure 2022505450000293
DMF(15mL)中の化合物9(20.00mg、0.04mmol)およびHATU(19.75mg、0.05mmol)の溶液に、DIEA(25.82mg、0.20mmol)を添加した。混合物を25℃で10分間撹拌した後、化合物8(45mg、0.05mmol)を添加した。混合物を25℃で30分間撹拌した。混合物を分取HPLC(アセトニトリル50-80/0.225%FA水溶液)によって精製して、L1BC3(35.00mg、67%)を白色固体として得た。LCMS(5-95,AB,1.5分):RT=0.854分,m/z=654.1[M/2+1]HNMR(400MHz,DMSO-d)δ11.92(brs,2H),8.98(s,1H),8.61-8.58(m,1H),8.40-8.36(m,1H),8.06(s,1H),7.89-7.86(m,2H),7.75(s,1H),7.63-7.60(m,2H),7.39-7.33(m,4H),7.26-7.23(m,2H),5.24(brs,2H),4.48-4.39(m,3H),4.37-4.29(m,4H),4.28-4.25(m,1H),4.24-4.08(m,4H),3.84-3.81(m,2H),3.62(s,2H),3.53(s,3H),3.14(brs,3H),2.90(s,3H),2.44(s,2H),1.60-1.48(m,10H),1.21(brs,12H),0.95(s,9H).
xi.L1BC4例示的なL1-CIDE、L1BC4は、以下のスキームによって合成することができる:
Figure 2022505450000294
スキーム13
Figure 2022505450000295
DCM(2.0mL)中のトリホスゲン(88.57mg、0.3000mmol)の溶液に、ピリジン(47.22mg、0.600mmol)溶液を添加し、引き続いて化合物2(110.0mg、0.600mmol)のDCM(2.0mL)溶液を添加した。反応物を25℃で30分間撹拌した。反応混合物を濃縮乾固して、粗生成物(140mg)を白色固体として得た。この粗生成物のDCM(8.0mL)中溶液に、EtN(76.27mg、0.7500mmol)および化合物1(200.0mg、0.380mmol)のDCM(2.0mL)中溶液を添加し、反応物を25℃で2時間撹拌した。混合物を濃縮し、カラムクロマトグラフィー(DCM中0~10%MeOH Rf=0.5)により精製して、化合物3(110mg、36%)を黄色油状物として得た。LCMS(5-95,AB,1.5分):RT=0.955分,m/z=741.3[M+1]
Figure 2022505450000296
HFIP(6.0mL)中の化合物3(55.0mg、0.0700mmol)の溶液に、TFA(0.30mL)を添加した。反応溶液を、25℃で1時間撹拌した。溶液を濃縮して、化合物4TFA塩(56.0mg)溶液を濃縮して、黄色油状物として得、これを次の工程で直接使用した。LCMS(5-95,AB,1.5分):RT=0.697分,m/z=641.1[M+1]
Figure 2022505450000297
DMF(5.0mL)中の化合物5(29.64mg、0.1000mmol)およびHATU(42.31mg、0.1100mmol)の溶液に、DIEA(47.94mg、0.370mmol)を添加した。混合物を25℃で10分間撹拌した。上記反応混合物に、化合物4のTFA塩(56.0mg、0.0700mmol)を添加した。混合物を25℃で1時間撹拌した。混合物を濃縮し、得られた残渣を分取TLC(DCM中5%MeOH、Rf=0.5)によって精製し、化合物6(65mg、82%)を黄色固体として得た。LCMS(5-95,AB,1.5分):R=0.850分、m/z=952.3[M+23]
Figure 2022505450000298
HFIP(6.0mL)中の化合物6(65.0mg、0.0600mmol)の溶液に、TFA(0.30mL)を添加した。反応溶液を、25℃で1時間撹拌した。溶液を濃縮して、化合物7TFA塩(57mg、99.7%)を黄色油状物として得、これを次の工程で直接使用した。LCMS(5-95,AB,1.5分):R=0.720分,m/z=852.2[M+23]
Figure 2022505450000299
DMF(5.0mL)中の化合物8(20.0mg、0.0400mmol)およびHATU(19.75mg、0.0500mmol)の溶液に、DIEA(22.46mg、0.1700mmol)を添加した。混合物を25℃で10分間撹拌した。上記混合物に、化合物7のTFA塩(32.8mg、0.030mmol)を添加し、混合物を25℃で1時間撹拌した。混合物を濃縮し、得られた残渣を分取HPLC(41~71水(0.225%FA)-ACN)によって精製して、所望の生成物L1BC4(21.79mg、収率42%)を白色固体として得た。LCMS(5-95,AB,1.5分):R=0.819分,m/z=1313.6[M+1]HNMR(400MHz,DMSO-d6)δ11.91(s,1H),8.97(s,1H),8.65(brs,1H),8.48(brs,1H),8.06(s,1H),7.92(s,1H),7.76(s,1H),7.62-7.57(m,1H),7.45-7.39(m,5H),7.28(brs,2H),5.95(brs,1H),5.26-5.17(m,2H),4.62-4.26(m,7H),4.07-3.86(m,4H),3.62(brs,5H),3.53(brs,10H),2.90(s,3H),2.43-2.33(m,7H),2.15-2.11(m,1H),1.49(d,J=6.8Hz,6H),1.23(brs,1H),0.91(s,9H).
xii.L1BC5例示的なL1-CIDE、L1BC5は、以下のスキームによって合成することができる:
Figure 2022505450000300
スキーム14
Figure 2022505450000301
TFA(0.2mL)およびHFIP(4.0mL)の混合物中の化合物1(100.0mg、0.1300mmol)の溶液を20℃で1時間撹拌した。溶液を濃縮し、残渣をDMF(8mL)で希釈した。これを再び真空中で濃縮して、化合物2(100mg、98.2%)を粗無色油状物として得、これを次の工程に直接使用した。LCMS(5-95,AB,1.5分):RT=0.705分,m/z=663.1[M+23]
Figure 2022505450000302
DMF(5.0mL)中の2-[2-[2-[2-(tert-ブトキシカルボニルアミノ)エトキシ]エトキシ]酢酸(40.71mg、0.1300mmol)の溶液に、DIEA(68.48mg、0.530mmol)およびHATU(60.45mg、0.1600mmol)を添加した。溶液を25°Cで10分間撹拌し、次いで、化合物2(100.0mg、0.1300mmol)を添加した。得られた反応溶液を、25℃でさらに1時間撹拌した。溶液を濃縮し、残渣を分取TLC(DCM中10%MeOH、R=0.5)によって精製し、化合物3(110mg、77%)を白色固体として得た。LCMS(5-95,AB,1.5分):R=0.942分,m/z=952.4[M+23]
Figure 2022505450000303
TFA(0.20mL)およびHFIP(4.0mL)の混合物中の化合物3(50.0mg、0.0500mmol)の溶液を25℃で1時間撹拌した。溶液を濃縮し、残渣をDMF(6.0mL)で希釈した。これを再度濃縮して、残りのTFAを除去し、化合物4(50mg、98.5%)を粗無色油状物として得た。LCMS(5-95,AB,1.5分):RT=0.740分,m/z=830.3[M+1]
Figure 2022505450000304
DMF(4.0mL)中のスルホンBRD4-酸(20.0mg、0.0400mmol)の溶液に、DIEA(20.66mg、0.1600mmol)およびHATU(18.23mg、0.0500mmol)を添加した。溶液を25°Cで10分間撹拌し、次いで、化合物4(45.27mg、0.0.500mmol)を添加した。反応溶液を25°Cでさらに1時間撹拌した後、これを濃縮し、分取HPLC(XtimateC18150*25mm*5um、アセトニトリル36~66/0.225%FA水溶液)により精製して、L1BC5(15mg、29%)を白色固体として得た。LCMS(5-95,AB,1.5分):R=0.839分,m/z=1334.2[M+23]HNMR(400MHz,CDOD)δ8.87(s,1H),7.94(s,1H),7.88(s,1H),7.69(s,2H),7.62-7.58(m,1H),7.43-7.35(m,3H),7.25-7.22(m,2H),5.29(s,1H),4.62-4.51(m,4H),4.34-4.22(m,4H),4.04-3.92(m,4H),3.71-3.64(m,11H),3.51-3.49(m,2H),3.43-3.38(m,3H),2.98(s,3H),2.47-2.45(m,4H),2.29-2.26(m,2H),1.46-1.43(m,2H),1.38-1.25(m,4H),1.03-1.00(m,9H).
xiii.L1BC6例示的なL1-CIDE、L1BC6は、以下のスキームによって合成することができる:
Figure 2022505450000305
スキーム15
Figure 2022505450000306
DCM(50mL)およびMeOH(10mL)中の化合物1a(5.000g、16.06mmol)の撹拌溶液に、EEDQ(7.943g、32.12mmol)を添加した。それを10分間撹拌した後、化合物2a(2.967g、24.1mmol)をN下、20℃で添加した。混合物を20℃で12時間撹拌した後、これを濃縮し、メチルtert-ブチルエーテル(20mL×3)およびDCM(20mL)で洗浄して、化合物3a(5.000g、75%)を白色固体として得た。LCMS(5-95,AB,1.5分):R=0.876分,m/z=439.2[M+23]HNMR(400MHz,DMSO-d6)δ9.92(s,1H),7.85(d,J=7.6Hz,2H),7.73-7.62(m,3H),7.51(d,J=8.4Hz,2H),7.38-7.19(m,6H),5.08(t,J=5.6Hz,1H),4.39(d,J=5.6Hz,2H),4.29-4.21(m,2H),4.18-4.15(m,2H),1.28-1.23(m,3H).
Figure 2022505450000307
DMF(50mL)中のピペリジン(3.066g、36.02mmol)を含む溶液に、化合物3a(3.000g、7.2mmol)を25℃で添加した。反応混合物を25℃で1時間撹拌し、濃縮して粗生成物を得、これをメチルtert-ブチルエーテル(10mL×3)で洗浄して、化合物4a(1.390g、99.3%)を白色固体として得、これを次の工程で直接使用した。
Figure 2022505450000308
EtOH(100mL)中の化合物4b(20.00g、99.89mmol)の撹拌溶液に、KOH(5.6g、99.89mmol)/水(10mL)を18℃で添加した。反応混合物を80℃で4時間撹拌した。混合物を濃縮乾固し、EtOAc(100mL)とHO(130mL)に分配した。水相をHCl(1.0M)でpH=3.0に酸性化し、EtOAc(120mL×2)で抽出した。有機層をNaSOで乾燥させ、フィルタにかけ、濃縮して、化合物5a(13.5g、78.5%)を無色の油状物として得た。濾液を次の工程で直接使用した。LCMS(5-95,AB,1.5分):R=0.560分,m/z=172.8[M+1]
Figure 2022505450000309
DMF(20mL)中の化合物5a(1.478、8.59mmol)の混合物に、HATU(4.081g、10.73mmol)およびDIEA(4.624g、35.78mmol)を添加した。混合物を30分間撹拌し、次いで、化合物4a(1.390g、7.16mmol)を25℃で添加した。混合物を、2時間撹拌した。混合物を濃縮し、シリカカラムクロマトグラフィー(DCM中0~10%MeOH、R=0.6)により精製して、化合物5(1.900g、70.7%)を白色固体として得た。LCMS(5-95,AB,1.5分):R=0.766分,m/z=371.1[M+23]
Figure 2022505450000310
化合物5a(30.0mg、0.1000mmol)をジオキサン中4MHCl(2.0mL)に25℃で溶解し、混合物を25℃で1時間撹拌した。混合物を濃縮して、粗生成物化合物6a(23.66mg、100%)を灰色固体として得、これを次の工程で直接使用した。
Figure 2022505450000311
化合物7a(25.0mg、0.0500mmol)、DIEA(19.37mg、0.1500mmol)およびHATU(22.79mg、0.0600mmol)の無水DMF(3.0mL)中溶液を25℃で50分間撹拌した。化合物6a(17.82mg、0.0700mmol)を添加し、反応混合物を25℃で2時間撹拌した。反応混合物を濃縮し、残渣を分取TLC(DCM中12%MeOH、Rf=0.4)によって精製して、生成物である化合物8(34mg、99.5%)を灰色固体として得た。LCMS(5-95,AB,1.5分):R=0.817分,m/z=684.3[M+1]
Figure 2022505450000312
NaH(60%、240.95mg、6.02mmol)をTHF(4.0mL)に懸濁し、化合物1(310.0mg、0.600mmol)を含むTHF(3.0mL)を25℃で滴加して加え、反応混合物を25℃で2時間撹拌した。次いで、THF(3.0mL)中の化合物2(125.55mg、0.900mmol)を添加した。得られた反応混合物を25℃で12時間撹拌した後、水(10mL)でクエンチし、EtOAc(10mL)で抽出した。水層を分離し、HCl(2.0M)でpH=3.0に酸性化し、DCM中10%MeOH溶液(10mL×2)で抽出した。DCM層を乾燥させ、濃縮して、粗生成物化合物3(320mg、92.8%)を褐色固体として得、これを次の工程で直接使用した。
Figure 2022505450000313
DMF(2.0mL)中の化合物3(100.0mg、0.1700mmol)およびDPPA(96.11mg、0.350mmol)の溶液に、EtN(70.68mg、0.7000mmol)を加えた。得られた混合物を25℃で1時間撹拌した。混合物を水(5.0mL)で希釈し、トルエン(3.0mL×2)で抽出した。トルエン層をNaSOおよび4Åのモレキュラーシーブで乾燥させ、フィルタにかけ、濾液を次の工程で直接使用した。
Figure 2022505450000314
トルエン(6.0mL)およびDMF(1.0mL)中の化合物4(100.0mg、0.1700mmol)の上記溶液に、化合物5(58.29mg、0.1700mmol)およびジブチルスズジラウレート(10.57mg、0.0200mmol)を添加し、混合物を80°Cで1時間撹拌した。反応混合物をフィルタにかけ、濾液を濃縮し、分取TLC(DCM中8%のMeOH、Rf=0.5)によって精製して、化合物6(100mg、65%)を淡黄色油状物として得た。LCMS(5-95,AB,1.5分):RT=0.769分,m/z=918.4[M+1]]
Figure 2022505450000315
DCM(3.0mL)およびMeOH(0.30mL)中の化合物6(80.0mg、0.0900mmol)の溶液に、Pd(PhP)(10.07mg、0.0100mmol)およびピロリジン(30.99mg、0.440mmol)を添加し、混合物をN下、25°Cで1時間撹拌した。反応混合物を濃縮し、残渣を分取TLC(DCM中12%のMeOH、Rf=0.4)によって精製し、化合物7(46mg、63%)を褐色固体として得た。LCMS(5-95,AB,1.5分):RT=0.671分,m/z=834.2[M+1]
Figure 2022505450000316
化合物8(34.0mg、0.0500mmol)、DIEA(19.28mg、0.150mmol)およびHATU(28.36mg、0.0700mmol)の無水DMF(3.0mL)中溶液を25℃で50分間撹拌し、次いで、化合物7(45.62mg、0.0500mmol)を添加した。得られた混合物を25℃で2時間撹拌した。反応混合物を濃縮し、残渣を分取TLC(DCM中10%MeOH、Rf=0.5)によって精製して、生成物化合物9(60mg、81%)を灰色固体として得た。LCMS(5-95,AB,1.5分):RT=0.814分,m/z=750.7[M/2+1]
Figure 2022505450000317
化合物9(60.0mg、0.0400mmol)をTHF(2.0mL)およびMeOH(1.0mL)に溶解し、LiOHHO(8.39mg、0.200mmol)を含む水(1.0mL)を25℃で添加した。反応混合物を25℃で2時間撹拌した。反応混合物を濃縮し、分取HPLC(アセトニトリル27~47/水)により精製して、化合物10(11mg、19%)を白色固体として得、これを次の工程で直接使用した。LCMS(5-95,AB,1.5分):RT=0.700分,m/z=1097.5[M+1]
Figure 2022505450000318
化合物10(10.0mg、0.010mmol)、DIEA(2.63mg、0.020mmol)およびHATU(3.88mg、0.0100mmol)の無水DMF(3.0mL)中溶液を25℃で20分間撹拌し、次いで、化合物11(1.86mg、0.0100mmol)を添加した。得られた混合物を25℃で2時間撹拌した。反応混合物をフィルタにかけ、得られた残渣を分取HPLC(アセトニトリル45~65/水)によって精製して、生成物L1BC6(2.5mg、23%)を白色固体として得た。LCMS(10-80,CD,3.0分):RT=1.950分,m/z=818.5[M/2+H]
xiv.L1BC8例示的なL1-CIDE、L1BC8は、以下のスキームによって合成することができる:
Figure 2022505450000319
スキーム16
Figure 2022505450000320
DCM(200mL)中の1(25.0g、115.18mmol)の溶液に、BBr(21.45mL、230.35mmol)を0℃で滴下し、混合物を25℃で16時間撹拌した。反応物をMeOH(50mL)でクエンチし、真空下で濃縮して、2(21.7g、99.7%)を赤色油状物として得て、これをさらに精製することなく直接使用した。
Figure 2022505450000321
DMF(150mL)中の2(6.0g、31.74mmol)の溶液に、KCO(8.77g、63.49mmol)およびBnBr(7.55mL、63.49mmol)を添加した。混合物を25℃で16時間撹拌した。混合物をフィルタにかけ、有機層を濃縮し、カラムクロマトグラフィー(石油エーテル中0~10%EtOAc)によって精製して、3(11.0g、94%)を白色固体として得た。HNMR(400MHz,CDCl)δ7.40-7.35(m,10H),6.76(s,4H),6.54(s,1H),5.00(s,4H).
Figure 2022505450000322
1,4-ジオキサン(100mL)および水(20mL)中の3(11.0g、29.79mmol)の溶液に、Pd(dppf)Cl(2.18g、2.98mmol)、CsCO(19.41g、59.58mmol)、ビニルボロン酸ピナコールエステル(6.88g、44.69mmol)を添加し、混合物をN下、100℃で16時間撹拌した。溶液をフィルタにかけ、EtOAc(40mL×3)で抽出し、水(50mL)で洗浄した。有機物をNaSOで乾燥させ、フィルタにかけ、濃縮し、カラムクロマトグラフィー(石油エーテル中0~10%EtOAc)により精製して、4(6.6g、70%)を白色固体として得た。HNMR(400mHZ,CDCl)δ7.44-7.29(m,10H),6.67(s,2H),6.55-6.54(m,1H),5.70(d,J=17.2Hz,1H),5.24(d,J=10.8Hz,1H),5.04(s,4H).
Figure 2022505450000323
THF(20mL)中の4(6.60g、20.86mmol)の溶液に、BH/THF(31.29mL、31.29mmol)をN下、0℃で添加し、混合物を25℃で3時間撹拌した。次いで、NaOH水溶液(3.0M、10.43mL、31.29mmol)を0℃で添加し、続いてH(31.39mL、312.9mmol)を添加した。得られた混合物を25℃で1時間撹拌した。反応物をNaSOの溶液でクエンチし、EtOAc(30mL×3)および水(30mL)で抽出した。有機物をNaSOで乾燥させ、フィルタにかけ、濃縮し、カラムクロマトグラフィー(石油エーテル中0~50%EtOAc)で精製して、5(4.8g、69%)を白色固体として得た。HNMR(400MHz,CDCl)δ7.79(s,1H),7.43-7.32(m,10H),6.52-6.49(m,1H),6.48(s,2H),5.02(s,4H),3.84(t,J=6.4Hz,2H),2.80(d,J=7.6Hz,2H).
Figure 2022505450000324
トルエン(100mL)中の5(4.800g、14.35mmol)の混合物に、水(25mL)中のNaOH(22.965g、574.15mmol)溶液、BuHSO(487.35mg、1.44mmol)および化合物6(5.599g、28.71mmol)を添加した。混合物を25℃で16時間撹拌した。混合物を分離し、水層をEtOAc(30mL×2)で抽出し、水(50mL)およびブライン(20mL×2)で洗浄した。合わせた有機層を濃縮し、得られた残渣をカラムクロマトグラフィー(石油エーテル中0~20%EtOAc)によって精製して、7(4.00g、62.1%)を白色固体として得た。LCMS(5-95,AB,1.5分):R=1.186分,m/z=471[M+23]
Figure 2022505450000325
MeOH(50mL)中の化合物7(4.000g、8.92mmol)の混合物に、10%の炭素上Pd(104.39mg、0.980mmol)を添加した。混合物をH(15psi)下、25℃で16時間撹拌した。溶液をフィルタにかけ、濃縮し、カラムクロマトグラフィー(石油エーテル中0~50%EtOAc)によって精製して、8(2.100g、88%)を無色の油状物として得た。LCMS(5-95,AB,1.5分):R=0.855分,m/z=314k[M+46]
Figure 2022505450000326
アセトニトリル(50mL)中の化合物9(2.222mg、8.61mmol)および化合物8(2.100g、7.83mmol)の溶液に、KCO(1.73g、12.52mmol)およびKI(129.92mg、0.7800mmol)を添加した。混合物を70℃で12時間撹拌した。混合物を濃縮し、EtOAc(40mL)で希釈し、水(20mL×2)で洗浄した。合わせた有機層をNaSO上で乾燥させ、真空中で濃縮した。残渣を分取HPLC(アセトニトリル20~80%/0.225%FA水溶液)により精製して、10(1.100g、32%)を無色油状物として得た。LCMS(5-95,AB,1.5分):R=0.978分,m/Z=468.1[M+23]
Figure 2022505450000327
DCM(10mL)中の化合物10(330.0mg、0.740mmol)の溶液に、ピリジン(0.30mL、3.7mmol)およびTfO(0.25mL、1.48mmol)を添加した。混合物を20℃で1時間撹拌した。混合物をEtOAc(50mL)で希釈し、分配した。有機物をクエン酸(10mL×3)で洗浄し、濃縮して、粗生成物化合物11(427mg、99.8%)を黄色油状物として得、これを次の工程で直接使用した。LCMS(5-95,AB,1.5分):R=0.985分,m/z=600.3[M+23]
Figure 2022505450000328
1,4-ジオキサン(20mL)中の化合物11(427.0mg、0.7400mmol)の溶液に、tert-ブチルカルバメート(129.91mg、1.11mmol)、CsCO(481.8mg、1.48mmol)、XPhos(35.24mg、0.0700mmol)およびPd(OAc)(8.3mg、0.0400mmol)を25℃で添加した。反応混合物をN下、110℃で16時間撹拌した。混合物を濃縮し、カラムクロマトグラフィー(石油エーテル中0~40%EtOAc、Rf=0.5)により精製して、化合物12(220mg、55%)を黄色油状物として得た。LCMS(5-95,AB,1.5分):R=0.948分,m/z=567.1[M+23]
Figure 2022505450000329
DCM(3.0mL)中の化合物12(220.0mg、0.400mmol)の溶液に、TFA(2.0mL)を加えた。混合物を25℃で1時間撹拌した。混合物を濃縮し、分取HPLC(アセトニトリル19~49%/0.225%FA水溶液)によって精製して、生成物である化合物13(110mg、54%)を白色固体として得た。LCMS(5-95,AB,1.5分):RT=0.640分,m/z=389.0[M+1]
Figure 2022505450000330
DMF(5.0mL)中のVHLリガンド(256.07mg、0.590mmol)、化合物13(110.0mg、0.2800mmol)およびHATU(118.45mg、0.3100mmol)の溶液に、DIEA(0.23mL、1.42mmol)を添加した。混合物を25℃で1時間撹拌した。混合物を濃縮し、分取TLC(DCM中10%MeOH、Rf=0.5)によって精製して、生成物である化合物15(120mg、53%)を黄色固体として得た。LCMS(5-95,AB,1.5分):R=0.855分,m/z=823.3[M+23]
Figure 2022505450000331
TMSI(99.93mg、0.50mmol)を、DCM(5.0mL)中の化合物14(80.00mg、0.10mmol)の溶液に25℃で添加し、得られた混合物を25℃で1時間撹拌した。溶媒を除去し、得られた残渣をEtOAc(10mL×3)で洗浄し、次の工程に直接使用した。LCMS(5-95,AB,1.5分):R=0.661分,m/z=667.5[M+1]
Figure 2022505450000332
BRD4酸(50.00mg、0.10mmol)およびHATU(41.79mg、0.11mmol)を含むDMF(8.0mL)の溶液に、DIEA(64.56mg、0.50mmol)を添加した。混合物を25℃で10分間撹拌した。上記溶液に、化合物15の溶液(90.00mg、0.10mmol)を添加した。混合物を25℃で1時間撹拌した。混合物を濃縮し、分取TLC(DCM中10%MeOH、Rf=0.5)により精製して、化合物16(80mg、70%)を黄色固体として得た。LCMS(5-95,AB,1.5分):R=0.750分,m/z=575.8[M/2+H]
Figure 2022505450000333
DMF(10mL)中の化合物15(50.00mg、0.040mmol)およびMC_SQ_Cit_PAB-PNP(96.03mg、0.13mmol)の溶液に、HOBt(11.75mg、0.09mmol)およびピリジン(34.41mg、0.44mmol)を添加した。混合物を38℃で1時間撹拌した。混合物を濃縮し、分取HPLC(アセトニトリル32-62/0.225%FA水溶液)により精製して、L1BC8(15.00mg、19%)を白色固体として得た。LCMS(5-95,AB,1.5分):R=0.706分,m/z=873.8[M/2+H]
xv.L1BC9例示的なL1-CIDE、L1BC9は、以下のスキームによって合成することができる:
Figure 2022505450000334
スキーム17
Figure 2022505450000335
THF(5.0mL)中の化合物1(450.0mg、0.870mmol)の溶液に、THF(2.0mL)中のPCl(500.0mg、3.64mmol)およびTHF(2.0mL)中のEtN(0.73mL、5.25mmol)を-78℃で添加した。反応混合物を-78℃で20分間撹拌し、次いで、25℃に加温した。混合物を25°Cで12時間撹拌した後、水(2.0mL)およびNaHCO水溶液(5.0mL)でクエンチし、混合物を25°Cで10分間撹拌した。これをHCl(1.0M)でpH=3.0に酸性化し、得られた混合物を濃縮し、分取TLC(DCM中12%MeOH、Rf=0.4)によって精製して、化合物2(450mg、89%)を無色結晶として得た。LCMS(0~60,CD,3.0分):RT=1.421分,m/z=579.2[M+1]
Figure 2022505450000336
CCl(4.0mL)およびアセトニトリル(4.0mL)中の化合物2(450.0mg、0.7800mmol)およびEtN(0.43mL、3.11mmol)の溶液に、N-TMS-イミダゾール(436.33mg、3.11mmol)を25℃で添加した。反応混合物を25℃で40分間撹拌した。混合物をMeOH(0.1mL)で処理し、25°Cで10分間撹拌した。溶媒を除去し、残渣をMTBE/EtOAc=5/1(3mL)で洗浄し、沈殿物をフィルタにかけ、MTBE(3mL)で洗浄して、生成物化合物3(450mg、90%)を白色固体として得た。LCMS(5-95,AB,1.5分):RT=0.725分,m/z=645.3[M+1]
Figure 2022505450000337
DMF(5.0mL)中の化合物3(450.0mg、0.700mmol)および化合物4(355.03mg、0.980mmol)の溶液に、ZnCl溶液(トルエン中1.0mol/L、6.98mL、6.98mmol)を25℃で添加した。反応混合物を25℃で12時間撹拌した。反応混合物をHCl(1.0M)でクエンチし、濃縮し、分取HPLC(アセトニトリル22-42/10mM NHHCO水溶液)によって精製して、生成物である化合物5(250mg、38%)を白色固体として得た。LCMS(5-95,AB,1.5分):RT=1.751分,m/z=940.3[M+1]
Figure 2022505450000338
DCM(1.0mL)およびMeOH(0.20mL)中の化合物5(100.0mg、0.1100mmol)および1,3-ジメチルバルビツール酸(83.06mg、0.530mmol)の溶液に、Pd(PhP)(24.59mg、0.0200mmol)を25℃で添加した。反応混合物をN下、25℃で2時間撹拌した。反応混合物を濃縮し、得られた残渣を分取HPLC(アセトニトリル18~48/10mM NHHCO水溶液)によって精製し、化合物6(55mg、60.4%)を白色固体として得た。LCMS(0~60,CD,3.0分):RT=1.450分,m/z=856.1[M+1]
Figure 2022505450000339
化合物7(119.84mg、0.1800mmol)、DIEA(7.55mg、0.0600mmol)およびHATU(22.21mg、0.0600mmol)の無水DMF(2.0mL)中溶液を25℃で20分間撹拌し、次いで、化合物6(50.0mg、0.0600mmol)を添加した。得られた混合物を25℃で2時間撹拌した。反応物をフィルタにかけ、得られた残渣を分取HPLC(アセトニトリル27~57/0.05%NHOH水溶液)によって精製して、化合物8(40mg、45%)を白色固体として得た。LCMS(0~60,CD,3.0分):RT=1.968分,m/z=761.3[M/2+1]
Figure 2022505450000340
化合物8(40.0mg、0.0300mmol)のDMF(1.0mL)中の溶液に、ピペリジン(11.19mg、0.1300mmol)を25℃で添加した。反応混合物を25℃で1時間撹拌した。混合物をフィルタにかけ、濾液を分取HPLC(アセトニトリル23~53%/10mM NHHCO水溶液)によって精製して、化合物9(20mg、59%)を白色固体として得た。LCMS(0~60,CD,3.0分):R=1.729分,m/z=650.3[M/2+1]
Figure 2022505450000341
DMF(1.0mL)中の化合物10(5.93mg、0.0200mmol)およびDIEA(1.99mg、0.0200mmol)の溶液に、化合物9(10.0mg、0.0100mmol)を25℃で添加した。混合物を25℃で6時間撹拌した。混合物をフィルタにかけ、濾液を分取HPLC(アセトニトリル25~55%/0.1%TFA水溶液)によって精製して、L1BC9(2.7mg、24%)を白色固体として得た。LCMS(0~60,CD,3.0分):R=1.635分,m/z=746.8[M/2+1]
xvi.L1BC10例示的なL1-CIDE、L1BC10は、以下のスキームによって合成することができる:
Figure 2022505450000342
スキーム18
Figure 2022505450000343
化合物12(1.000g、1.99mmol)を、HOAc(35%、15.0mL)中のHBr溶液に添加した。混合物を25℃で2時間撹拌した後、氷水(20mL)に注いだ。沈殿物をフィルタにかけ、MTBE(20mL×2)で洗浄して、粗生成物4(1000mg、89%)を灰色固体として得、これを次の工程で直接使用した。LCMS(5-95,AB,1.5分):RT=0.783分,m/z=566.8[M+1+2]
Figure 2022505450000344
THF(15mL)中の化合物1(0.300g、0.6700mmol)の溶液に、Pd/C(359mg)を添加し、H(15psi)下、25℃で2時間撹拌した。固体をフィルタにかけ、濾液を減圧下で濃縮して、粗生成物2(200mg、95%)を黄色固体として得、これを次の工程で直接使用した。
Figure 2022505450000345
DCM(10mL)中の化合物2(200mg、0.64mmol)およびEtN(0.13mL、0.960mmol)の溶液に、BocO(140.19mg、0.640mmol)を25℃で添加した。反応物を25℃で1時間撹拌した後、これを濃縮し、残渣を分取TLC(DCM中5%MeOH、Rf=0.5)によって精製して、化合物3(260mg、87%)を黄色油状物として得た。LCMS(5-95,AB,1.5分):RT 0.933分,m/z=434.2[M+23]
Figure 2022505450000346
無水DMF(5.0mL)中のCsCO(285.05mg、0.870mmol)および化合物3(120.0mg、0.290mmol)の混合物を25℃で10分間撹拌し、次いで、化合物4(494.7mg、0.870mmol)を添加した。得られた混合物を25℃で1時間撹拌した。混合物を水(15mL)で希釈し、EtOAc(10mL×3)で抽出した。有機層をブライン(10mL×2)で洗浄し、NaSOで乾燥させ、濃縮し、分取TLC(DCM中10%MeOH、R5=0.4)によって精製して、化合物5(50mg、19%)を白色固体として得た。LCMS(5-95,AB,1.5分):R=1.021分,m/z=897.4[M+1]
Figure 2022505450000347
HFIP(4.0mL)中の化合物5(50mg、0.0547mmol)の溶液に、TFA(0.20mL)を添加した。反応溶液を、25℃で1時間撹拌した。溶液を濃縮して、化合物6のTFA塩(72mg、99.4%)を黄色油状物として得た。粗生成物を次の工程で直接使用した。LCMS(5-95,AB,1.5分):RT=0.663分,m/z=740.2[M+1]+.
Figure 2022505450000348
無水DMF(5.0mL)中の化合物7(50.0mg、0.1000mmol)、DIEA(0.05mL、0.300mmol)およびHATU(41.79mg、0.1100mmol)の溶液を25℃で10分間撹拌し、次いで、化合物6のTFA塩(68.24mg、0.0800mmol)を添加した。得られた混合物を25℃で1時間撹拌した。反応物を濃縮し、DCM(10mL)を添加し、沈殿物を回収し、DCM(5.0mL)で洗浄し、真空中で乾燥させると、化合物8(50mg、41%)が黄色固体として得られた。粗製物を次の工程で直接使用した。LCMS(5-95,AB,1.5分):RT=0.872分,m/z=1224.3[M+1]
Figure 2022505450000349
DMF(4.0mL)中の化合物8(50.0mg、0.0400mmol)の溶液に、VHLリガンド(21.14mg、0.0500mmol)、HATU(17.11mg、0.0400mmol)およびDIEA(15.86mg、0.1200mmol)を添加した。混合物を25℃で2時間撹拌した。混合物を濃縮し、分取TLC(DCM中10%MeOH R=0.3)によって精製して、化合物9(15mg、22%)を白色固体として得た。LCMS(5-95,AB,1.5分):RT=0.753分,m/z=817.8[M/2+1]
Figure 2022505450000350
DMF(2.0mL)中の化合物9(15.0mg、0.0100mmol)およびピペリジン(0.010mL、0.0200mmol)の混合物を25°Cで2時間撹拌した。混合物を濃縮して、粗化合物10(12mg、収率93%)を白色固体として得、これを次の工程で直接使用した。LCMS(5-95,AB,1.5分):RT=0.769分,m/z=707.0[M/2+1]
Figure 2022505450000351
化合物10(12.0mg、0.0100mmol)のDMF(4.0mL)中の溶液に、化合物11(3.14mg、0.0100mmol)およびHATU(4.85mg、0.0100mmol)およびDIEA(3.29mg、0.0300mmol)を添加した。混合物を25℃で1時間撹拌した。混合物を濃縮し、分取HPLC(37~67水(0.225%FA)-ACN)によって精製して、所望の生成物L1BC10(4.92mg、33%)を白色固体として得た。LCMS(5-95,AB,1.5分):RT=0.839分,m/z=852.3[M/2+1];HRMS(0-95_1_4分):RT=2.561-2.643分,m/z=1702.6758[M+1]
xvii.L1BC11例示的なL1-CIDE、L1BC11は、以下のスキームによって合成することができる:
Figure 2022505450000352
スキーム19
Figure 2022505450000353
DMSO(6.74mL、94.87mmol)中の化合物1(2.4g、3.68mmol)の溶液に、HOAc(6.74mL、117.83mmol)およびAcO(4.51mL、47.67mmol)を加えた。混合物を40℃で48時間撹拌した。混合物に水(30mL)を添加し、NaHCO(50mL)水溶液で処理した。混合物をEtOAc(40mL×3)で抽出し、有機層を濃縮した。残渣をカラムクロマトグラフィー(DCM中0%-5%MeOH、Rf=0.4)によって精製して、化合物2(2.03g、65%)を淡黄色油状物として得た。LCMS(5-95,AB,1.5分):R=1.007分,m/z=713.1[M+1]
Figure 2022505450000354
リン酸(481.12mg、4.91mmol)を120°Cで20分間加熱し、25°Cに冷却した。次いで、モレキュラーシーブ(4A、50mg)およびTHF(10mL)中の化合物2(500.0mg、0.700mmol)の溶液を加えた後、NIS(236.68mg、1.05mmol)を加えた。得られた混合物を25℃で2時間撹拌した。次いで、混合物を濃縮し、得られた残渣を分取HPLC(アセトニトリル22~52/0.05%NHO水溶液)によって精製して、化合物3(200mg、37%)を灰色固体として得、これを次の工程で直接使用した。LCMS(10-80,CD,3.0分):R=1.001分,m/z=763.2[M+1]
Figure 2022505450000355
DMF(3.0mL)中の化合物3(200.0mg、0.2600mmol)の溶液に、DBU(119.75mg、0.790mmol)を添加した。混合物を25℃で30分間撹拌した。次いで、混合物を濃縮し、残渣をEtOAc(2.0mL×2)で洗浄して、粗生成物化合物4(141mg、99.5%)を灰色固体として得、これを次の工程で直接使用した。LCMS(5-95,AB,1.5分):R=0.554分,m/z=541.2[M+1]
Figure 2022505450000356
無水DMF(3.0mL)中の化合物5(178.35mg、0.260mmol)、DIEA(101.13mg、0.780mmol)およびHATU(99.18mg、0.2600mmol)の溶液を25℃で20分間撹拌し、次いで、化合物4(141.0mg、0.260mmol)を添加した。得られた混合物を25℃で2時間撹拌した。反応混合物をフィルタにかけ、濾液を分取HPLC(アセトニトリル20-50/0.05%NHOH水溶液)によって精製して、化合物6(130mg、41%)を白色固体として得た。LCMS(10-80,CD,3.0分):RT=1.144分,m/z=1206.3[M+1]
Figure 2022505450000357
無水DMF(3.0mL)中の化合物7(54.21mg、0.1500mmol)の溶液に、EtN(15.1mg、0.150mmol)およびCDI(30.92mg、0.1900mmol)を25℃で添加した。反応混合物を25℃で20分間撹拌し、次いで、化合物6(100.0mg、0.0800mmol)およびZnCl溶液(0.83mL、トルエン中1.0mol/L、0.830mmol)を添加した。得られた混合物を25℃で12時間撹拌した。反応混合物をフィルタにかけ、濾液を分取HPLC(アセトニトリル25-55/0.05%NHOH水溶液)によって精製して、生成物である化合物8(35mg、27.2%)を白色固体として得た。LCMS(10-80,CD,3.0分):R=1.498分,m/z=776.3[M/2+1]
Figure 2022505450000358
DMF(1.0mL)中の化合物8(35.0mg、0.020mmol)の溶液に、キヌクリジン(12.54mg、0.110mmol)を添加した。混合物を25℃で4時間撹拌した。混合溶液を次の工程で直接使用した。LCMS(10-80,CD,3.0分):R=1.299分,m/z=665.4[M/2+1]
Figure 2022505450000359
無水DMF(2.0mL)中の化合物9(29.0mg、0.020mmol)の溶液に、化合物10(6.73mg、0.0200mmol)を25℃で添加した。反応混合物を25℃で12時間撹拌した後、これをフィルタにかけ、濾液を濃縮した。これを分取HPLCにより2回(水中アセトニトリル18~48/、次いで水中アセトニトリル25~48/10mM NHHCO)精製して、L1BC11(2.4mg、7.2%)を白色固体として得た。LCMS(10-80,CD,3.0分):R=1.202分,m/z=761.8[M/2+1]
xviii.L1BC12例示的なL1-CIDE、L1BC12は、以下のスキームによって合成することができる:
Figure 2022505450000360
スキーム20
Figure 2022505450000361
無水DCM(20mL)中のトリホスゲン(240.45mg、0.810mmol)および4Åモレキュラーシーブ(100mg)の混合物に、ピリジン(256.37mg、3.24mmol)中の化合物2(300.0mg、1.63mmol)の無水DCM(6.0mL)中の溶液を20℃でゆっくり添加した。反応混合物を20℃で0.5時間撹拌した。次いで、混合物を真空中で濃縮し、残渣を無水DCM(25mL)で希釈した。EtN(245.98mg、2.43mmol)を添加した後、無水DCM(8.0mL)中の化合物1(430.0mg、0.810mmol)の溶液を添加した。反応混合物を20℃でさらに16時間撹拌した。混合物をDCM(30mL)で希釈し、HO(20mL×3)で洗浄し、NaSOで乾燥させ、フィルタにかけ、濃縮した。残渣を分取TLC(DCM中7%MeOH、R=0.6)によって精製し、化合物3(480mg、74%)を淡黄色固体として得た。LCMS(5-95,AB,1.5分):R=0.877分,m/z=763.3[M+23]
Figure 2022505450000362
TFA(0.20mL)/HFIP(4.0mL)の混合物中の化合物3(100.0mg、0.1300mmol)の溶液を20℃で1時間撹拌した。溶液を真空中で濃縮し、残渣をDMF(10mL)で希釈し、再び真空中で濃縮すると、化合物4(100mg、98.2%)が粗無色油として得られ、これを次の工程に直接使用した。LCMS(5-95,AB,1.5分):R=0.723分,m/z=641.1[M+1]
Figure 2022505450000363
無水DCM(10mL)中の化合物5(40.0mg、0.1300mmol)の溶液に、HATU(60.55mg、0.1600mmol)およびN,N-ジイソプロピルエチルアミン(68.6mg、0.530mmol)を添加した。混合物を20°Cで15分間撹拌し、次いで、無水DCM(5mL)中の化合物4(100.0mg、0.1300mmol)の溶液を添加した。得られた反応混合物を20℃でさらに1時間撹拌した。混合物を真空中で濃縮し、残渣を分取TLC(DCM中10%MeOH、R=0.5)によって精製して、化合物6(85mg、61%)を白色固体として得た。LCMS(5-95,AB,1.5分):R=0.964分,m/z=946.3[M+23]
Figure 2022505450000364
TFA(0.20mL)/HFIP(4.0mL)の混合物中の化合物6(85.0mg、0.090mmol)の溶液を20℃で1時間撹拌した。溶液を真空中で濃縮し、DMF(10mL)で希釈し、再び真空中で濃縮して、残留TFAを除去して、化合物7(86mg、99.7%)を粗無色油状物として得、これを次の工程で直接使用した。LCMS(5-95,AB,1.5分):R=0.777分,m/z=824.4[M+1]
Figure 2022505450000365
DMF(4.0mL)中の化合物8(20.0mg、0.0400mmol)の溶液に、HATU(19.75mg、0.0500mmol)およびDIEA(25.82mg、0.200mmol)を添加した。溶液を20°Cで10分間撹拌し、次いで、化合物7(48.74mg、0.0.500mmol)を添加した。得られた反応溶液を、20℃で1時間撹拌した。溶液を分取HPLC(Xtimate C18 150*25mm*5um、アセトニトリル50~80/0.225%FA水溶液)によって精製し、L1BC12(23mg、43.2%)を白色固体として得た。LCMS(5-95,AB,1.5分):R=0.892分,m/z=1329.1[M+23]HNMR(400MHz,DMSO-d)δ11.93(s,1H),8.98(s,1H),8.62-8.60(m,1H),8.41-8.39(m,1H),8.06(d,J=2.4Hz,1H),7.91-7.87(m,2H),7.75(s,1H),7.63-7.57(m,2H),7.43-7.37(m,3H),7.27-7.26(m,2H),5.21(d,J=12.0Hz,2H),4.98-4.94(m,2H),4.47-4.35(m,4H),4.27-4.09(m,4H),3.84-3.80(m,2H),3.75-3.70(m,2H),3.62(s,3H),3.54(d,J=2.8Hz,3H),3.13(brs,3H),2.90(s,3H),2.67(brs,1H),2.44(s,3H),2.33-2.09(m,3H),1.45-1.32(m,10H),1.21(s,8H),0.94(s,9H).
xix.L1BQ1例示的なL1-CIDE、L1BQ1は、以下のスキームによって合成することができる:
Figure 2022505450000366
スキーム21
Figure 2022505450000367
化合物1(15.0g、69.11mmol)のDCM(150mL)溶液に、BBr(19.25mL、207.32mmol)を添加した。混合物を20℃で10時間撹拌した。TLC(石油エーテル中10%酢酸エチル、Rf=0.4)は、反応が完了したことを示した。反応物をMeOH(20mL)でクエンチし、次いで、DCM(100mL)を添加した。有機層を水(60mL)およびブライン(60mL)で洗浄した。次いで、有機物を分離し、NaSOで乾燥させ、フィルタにかけ、濃縮して、粗生成物(9.6g、74%)を黄色油状物として得、これをさらに精製することなく直接使用した。HNMR(400MHz,meOD):δ6.37(s,2H),6.14(m,J=2.4Hz,1H).
Figure 2022505450000368
DMF(200mL)中の化合物2(9.6g、50.79mmol)の溶液に、KCO(42.12g、304.75mmol)およびBnBr(34.75g、203.16mmol)を添加した。混合物を20℃で12時間撹拌した。反応混合物をフィルタにかけ、濾液を濃縮して、残渣を得て、カラムクロマトグラフィー(石油エーテル中0~10%酢酸エチル、Rf=0.8)により精製して、化合物3(12.5g、63%)を白色粉末として得た。HNMR(400mHZ,CDCl):δ7.38-7.32(m,10H),6.76(d,J=2.0Hz,2H),6.52(d,J=1.6Hz,1H),4.99(s,4H).
Figure 2022505450000369
1,4-ジオキサン(200mL)および水(50mL)中の化合物3(9.9g、26.81mmol)およびKCO(14.82g、107.24mmol)の溶液に、化合物4(5.78g、37.54mmol)およびPd(dppf)Cl(1.57g、2.14mmol)を添加した。混合物を窒素下にて100℃で15時間撹拌した。混合物をEtOAc(50mL×3)で抽出した。合わせた有機層をNaSOで乾燥させ、濃縮して、残渣が得られ、これをカラムクロマトグラフィー(石油エーテル中10%酢酸エチル、Rf=0.8)により精製して、化合物5(5.6g、66%)を無色油状物として得た。HNMR(400mHZ,CDCl):δ7.44-7.31(m,10H),6.76(d,J=2.0Hz,2H),6.48-6.32(m,1H),6.55(d,J=1.6Hz,1H),5.72(d,J=17.6Hz,1H),5.25(d,J=13.6Hz,1H),5.05(s,4H).
Figure 2022505450000370
化合物5(5.6g、17.7mmol)のTHF(100mL)中溶液に、窒素下0°CでTHF(23.01mL、23.01mmol)中のBHを添加し、混合物を20°Cで1時間撹拌した。次いで、NaOH水溶液(1mL、1mol/L)を添加し、続いてH(26.64mL、265.5mmol)を添加し、得られた混合物を20℃で2時間撹拌した。反応物をNaSO溶液でクエンチし、酢酸エチル(50mL×3回)で抽出し、ブライン(15mL×3回)で洗浄し、NaSOで乾燥させ、フィルタにかけ、濃縮した。得られた残渣をカラムクロマトグラフィー(石油エーテル中25%酢酸エチル、Rf=0.4)で精製し、化合物6(2.9g、49%)を無色油状物として得た。HNMR(400mHZ,CDCl)δ7.41-7.29(m,10H),6.50-6.47(m,3H),5.02(s,4H),3.83(t,J=6.4Hz,2H),2.79(t,J=6.4HZ,2H).
Figure 2022505450000371
トルエン(100mL)中の化合物6(4.1g、12.26mmol)、化合物7(15.81mL、98.08mmol)の溶液に、水(40mL)中のNaOH水溶液(39.2g、980.83mmol)およびnBuNHSO(3.35g、9.81mmol)を20℃で添加した。混合物を20℃で3時間撹拌した。TLC(石油エーテル中の20%酢酸エチル、Rf=0.5)は、出発物質が消費されたことを示した。反応混合物をEtOAc(50mL×3)で抽出した。有機層を合わせ、無水硫酸ナトリウムで乾燥させ、真空下で濃縮し、次いで、シリカでのフラッシュクロマトグラフィー(石油エーテル中0~20%EtOAC)により精製して、化合物8(4840mg、64%)を白色固体として得た。LCMS(5-95,AB,1.5分):RT(220/254nm)=1.064分,m/z=471.0[M+23]HNMR(400MHz,CDCl):δ7.42-7.30(m,10H),6.50-6.47(m,3H),5.00(s,4H),3.94(s,2H),3.72(t,J=7.2Hz,2H),2.88(t,J=7.2Hz,2H),1.46(s,9H).
Figure 2022505450000372
アセトニトリル(80mL)中の化合物9(2.60g、9.69mmol)および化合物10(2.50g、9.69mmol)の溶液に、KCO(2.14g、15.5mmol)およびKI(160.86mg、0.97mmol)を添加した。混合物を70℃で12時間撹拌した。混合物をEtOAc(250mL)で希釈し、水(50mL×3)で洗浄した。有機層を濃縮し、分取HPLC(アセトニトリル25~70%/0.225%FA水溶液)により精製して、化合物3(2.13g、49%)を無色油状物として得た。LCMS(5-95,AB,1.5分):RT(220/254nm)=0.887分,m/z=468.1[M+23]
Figure 2022505450000373
DCM(20mL)中の化合物11(2.13g、4.78mmol)およびピリジン(1.93mL、23.91mmol)の溶液に、TfO(1.61mL、9.56mmol)を添加した。混合物を20℃で1時間撹拌した。混合物をEtOAc(120mL)で希釈し、クエン酸(30mL×3)で洗浄した。有機層を濃縮して粗生成物12を得、これを次の工程に直接使用した。LCMS(5-95,AB,1.5分):RT(220/254nm)=1.066分,m/z=600.3[M+23]
Figure 2022505450000374
1,4-ジオキサン(50mL)中の化合物12(2.74g、23.37mmol)の溶液に、Pd(OAc)(104.95mg、0.47mmol)、Xphos(445.71mg、0.93mmol)およびCsCO(4.57g、14.02mmol)を添加した。混合物をN下、100℃で12時間撹拌した。混合物を濃縮し、フラッシュカラム(石油エーテル中0~40%EtOAcで溶出)により精製して、化合物13(2.20g、76%)を白色固体として得た。LCMS(5-95,AB,1.5分):RT(220/254nm)=0.971分,m/z=567.1[M+23]
Figure 2022505450000375
THF(80mL)中の化合物13(2.20g、4.04mmol)の溶液に、Pd/C(429.87mg)を添加した。混合物をH下、20℃で2時間撹拌した。混合物をフィルタにかけ、濃縮して粗生成物14を得て、これを次の工程に直接使用した。LCMS(5-95,AB,1.5分):RT(220/254nm)=0.773分,m/z=411.1[M+1]
Figure 2022505450000376
DMF(20mL)中のJQ1(2.20g、5.48mmol)、化合物14(1.50g、3.65mmol)およびHATU(1.81g、4.75mmol)の溶液に、DIEA(2.55mL、14.62mmol)を添加した。混合物を20℃で1時間撹拌した。混合物を逆相クロマトグラフィー(アセトニトリル30~90/0.225%FA水溶液)により精製して、化合物14(1.13g、39%)を黄色固体として得た。LCMS(5-95,AB,1.5分):RT(220/254nm)=0.969分,m/z=815.0[M+23]
Figure 2022505450000377
HCl/EtOAc(10mL)中の化合物15(1.13g、1.42mmol)の混合物を20°Cで1時間撹拌した。混合物を濃縮して、化合物16(959mg、100%)を白色固体として得、これを次の工程に直接使用した。LCMS(5-95,AB,1.5分):RT(220/254nm)=0.786分,m/z=637.3[M+1]
Figure 2022505450000378
DMF(15mL)中の化合物16(959mg、1.42mmol)、VHL(1287mg、2.99mmol)およびDIEA(919.98mg、7.12mmol)の溶液に、HATU(595.46mg、1.57mmol)を添加した。混合物を20℃で1時間撹拌した。その混合物を逆相クロマトグラフィー(アセトニトリル10~50/0.225%FA水溶液)により精製して、化合物17(1.10g、71.4%)を黄色固体として得た。LCMS(5-95,AB,1.5分):RT(220/254nm)=0.817分,m/z=1049.0[M+1]
Figure 2022505450000379
DCM(2mL)中のトリホスゲン(14.13mg、0.05mmol)および4Aモレキュラーシーブの混合物に、DCM(2mL)中の化合物17(50.00mg、0.05mmol)およびEtN(14.46mg、0.14mmol)の溶液を添加した。混合物を20℃で0.5時間撹拌した。混合物を濃縮し、DCM(5mL)に溶解し、次の工程に直接使用した。
上記溶液に、DMF(2mL)中の化合物MC_SQ_Cit_PAB(81.53mg、0.14mmol)およびEtN(14.46mg、0.14mmol)の溶液を添加した。混合物を15℃で12時間撹拌した。混合物を濃縮し、得られた残渣を逆相クロマトグラフィー(アセトニトリル38~68/0.225%FA水溶液)によって精製して、L1BQ1(5.0mg、6%)を白色固体として得た。LCMS(10-80,AB,7.0分):RT(220/254nm)=3.928分,m/z=824.5[M/2+1]
xx.L1BQ2例示的なL1-CIDE、L1BQ2は、以下のスキームによって合成することができる:
Figure 2022505450000380
スキーム22
Figure 2022505450000381
NaH(226.12mg、5.65mmol)をTHF(4.0mL)に懸濁し、THF(3.0mL)中の化合物1(300.0mg、0.5700mmol)を20℃で滴下して加えた。反応混合物を20℃で2時間撹拌した。次いで、THF(3.0mL)中の化合物2(117.83mg、0.8500mmol)を添加した。反応混合物を20℃で2時間撹拌した後、水(10mL)でクエンチし、EtOAc(10mL)で抽出した。水層を分離し、HCl(2.0M)でpH=3.0に酸性化し、DCM中MeOH溶液(10mL×2)で抽出した。合わせた有機層を乾燥させ、濃縮して、粗生成物化合物3(190mg、57%)を褐色油状物として得、これを次の工程で直接使用した。LCMS(5-95,AB,1.5分):RT=0.735分,m/z=589.1[M+1]
Figure 2022505450000382
DCM(5.0mL)中の化合物3(190.0mg、0.3600mmol)の溶液に、EtOAc(4.0M、5.0mL)中のHClの溶液を加えた。反応混合物を20℃で2時間撹拌した後、これを濃縮すると、粗生成物化合物4(120mg、64%)が灰色固体として得られ、これを次の工程で直接使用した。
Figure 2022505450000383
化合物5(151.72mg、0.2600mmol)、DIEA(66.46mg、0.5100mmol)およびHATU(97.76mg、0.2600mmol)の無水DMF(3.0mL)中溶液を20°Cで50分間撹拌し、次いで、化合物4(90.0mg、0.1700mmol)を添加した。得られた混合物を20°Cで2時間撹拌し、フィルタにかけ、濾液を分取HPLC(アセトニトリル40~60/0.225%FA水溶液)によって精製して、化合物6(35mg、19.3%)を灰色固体として得た。LCMS(5-95,AB,1.5分):RT=0.881分,m/z=1060.7[M+1]
Figure 2022505450000384
DMF(2.0mL)中の化合物6(30.0mg、0.0300mmol)およびDPPA(11.68mg、0.0400mmol)の溶液に、EtN(8.59mg、0.0800mmol)を加えた。混合物を20°Cで1時間撹拌した後、水(5.0mL)で希釈し、トルエン(3mL×2)で抽出した。トルエン層をNaSOで乾燥させ、4Aモレキュラーシーブで乾燥させた。トルエン(6.0mL)中の溶液に、DMF(1.0mL)中の化合物8(15.77mg、0.0300mmol)、ジブチルスズジラウレート(1.75mg、0.0028mmol)を加え、混合物を80°Cで1時間撹拌した。反応混合物をフィルタにかけ、濃縮し、分取TLC(DCM中10%のMeOH、Rf=0.3)によって精製して、L1BQ2(2.5mg、5.6%)を灰色固体として得た。LCMS(5-95,AB,1.5分):RT=0.755分,m/z=815.1[M/2+1]
xxi.L1BQ3例示的なL1-CIDE、L1BQ3は、以下のスキームによって合成することができる:
Figure 2022505450000385
スキーム23
Figure 2022505450000386
ピリジン(10.0mL)中の化合物1(100.0mg、0.230mmol)の溶液に、TFAA(144.0mg、0.6900mmol)を添加した。反応混合物を50℃で12時間撹拌した。反応物をEtOAc(20mL)で希釈し、水(20mL×2)およびブライン(20mL)で洗浄した。有機物をNaSOで乾燥させ、フィルタにかけ、濃縮し、分取TLC(DCM中5%MeOH、Rf=0.3)によって精製して、化合物2(65mg、52%)を黄色固体として得た。LCMS(5-95,AB,1.5分):RT(220/254nm)=0.752分,m/z=534.2[M+1]
Figure 2022505450000387
TFA(5mL)/DCM(5mL)中の化合物2(65.0mg、0.1200mmol)の溶液を25℃で0.5時間撹拌した。反応混合物を濃縮して、化合物3(55mg、95%)を黄色固体として得、これを次の工程で直接使用した。
Figure 2022505450000388
化合物3(55.0mg、0.1200mmol)のDMF(5.0mL)中の溶液に、HATU(87.6mg、0.2300mmol)およびDIEA(44.66mg、0.3500mmol)を20℃で添加した。反応混合物を20℃で10分間撹拌した後、化合物4(80.0mg、0.1300mmol)を添加した。反応混合物を20℃で2時間撹拌した。反応混合物を水(10mL)で希釈し、EtOAc(10mL×3)で抽出し、NaSOで乾燥させ、フィルタにかけ、濃縮した。これを分取TLC(DCM中10%MeOH、Rf=0.3)によって精製し、化合物5(100mg、73%)を黄色固体として得た。LCMS(5-95,AB,1.5分):RT(220/254nm)=0.684分,m/z=1101.6[M+23]
Figure 2022505450000389
MeOH(4.0mL)中の化合物5(100.0mg、0.0900mmol)の溶液に、THF(2.0mL)にLiOH(19.44mg、0.4600mmol)を加えた。反応混合物を50℃で12時間撹拌した。反応物を濃縮し、分取HPLC(アセトニトリル20~50%/0.225%EAのACN溶液)により精製して、化合物6(40mg、44%)を黄色固体として得、これを次の工程で直接使用した。LCMS(5-95,AB,1.5分):RT(220/254nm)=0.591分,m/z=1105.6[M+23]
Figure 2022505450000390
DMF(2.0mL)中のFmoc-Cit-OH(18.19mg、0.0500mmol)およびEEDQ(15.09mg、0.0600mmol)の混合物を25℃で30分間撹拌した。混合物を、化合物6(15.0mg、0.0200mmol)のDMF(2.0mL)中の溶液に添加した。反応混合物を25℃で48時間撹拌した。混合物をフィルタにかけ、濾液を分取HLC(アセトニトリル33~63/0.225%FA水溶液)によって精製して、化合物7(10mg、48%)を白色固体として得た。LCMS(10-80,AB,7.0分):RT=3.695分,m/z=682.1[M/2+1]
Figure 2022505450000391
DMF(2.0mL)中の化合物7(10.0mg、0.0100mmol)の溶液に、ピペリジン(2.5mg、0.0300mmol)を25℃で添加した。反応混合物を25℃で2時間撹拌した。混合物を濃縮し、MTBE(2mL×2)で洗浄して、化合物8(8mg、95.6%)を灰色固体として得、これを直接使用した。LCMS(5-95,AB,1.5分):RT=0.611分,m/z=571.1[M/2+1]
Figure 2022505450000392
DIEA(0.95mg、0.0100mmol)および化合物8(10.0mg、0.0100mmol)のDMF(2.0mL)中の溶液に、化合物9(11.9mg、0.0300mmol)を添加した。反応混合物を20℃で12時間撹拌した。混合物をフィルタにかけ、濾液を分取HPLC(アセトニトリル31~51/0.225%FA水溶液)によって精製して、L1BQ3(2.5mg、23.6%)を白色固体として得た。LCMS(5-95,AB,1.5分):RT=0.663分,m/z=716.3[M/2+1]
xxii.L1BQ4例示的なL1-CIDE、L1BQ4は、以下のスキームによって合成することができる:
Figure 2022505450000393
スキーム24
Figure 2022505450000394
DMF(10.0mL)中のFmoc-Cit-OH(30.08mg、0.0800mmol)の溶液に、HATU(47.97mg、0.1300mmol)およびDIEA(20.38mg、0.1600mmol)を20℃で添加した。反応混合物を20℃で10分撹拌した。その後、化合物1(30.0mg、0.0600mmol)を添加した。反応混合物を20℃で12時間撹拌した後、これを水(10mL)で希釈し、EtOAc(10mL)で抽出した。有機層を水(10mL×2)、ブライン(10mL)で洗浄し、NaSOで乾燥させ、フィルタにかけ、濃縮した。これを分取TLC(DCM中10%MeOH、R=0.4)によって精製して、化合物2(45mg、78.4%)を黄色固体として得た。LCMS(5-95,AB,1.5分):RT(220/254nm)=0.885分,m/z=877.1[M+23]
Figure 2022505450000395
DMF(5.0mL)中の化合物2(45.0mg、0.0500mmol)の20℃の溶液に、ピペリジン(0.02mL、0.1600mmol)を添加した。混合物を20℃で2時間撹拌し、濃縮して、化合物3(33mg、99.1%)を黄色固体として得、これを次の工程で直接使用した。LCMS(5-95,AB,1.5分):RT(220/254nm)=0.742分,m/z=655.1[M+23]
Figure 2022505450000396
DMF(2.0mL)中の化合物4(19.3mg、0.0600mmol)の溶液に、HATU(39.66mg、0.1000mmol)およびDIEA(20.22mg、0.1600mmol)を20℃において添加した。反応混合物を20℃で10分間撹拌した。その後、化合物3(33.0mg、0.0500mmol)を添加した。反応混合物を20℃で12時間撹拌した。反応物を水(10mL)でクエンチし、ジクロロメタン(10mL)で希釈した。有機層を水(5mL×2)、ブライン(5mL)で洗浄し、NaSOで乾燥させ、フィルタにかけ、濃縮した。これを分取TLC(DCM中10%MeOH、Rf=0.2)によって精製して、化合物5(30mg、58%)を黄色固体として得た。LCMS(5-95,AB,1.5分):RT(220/254nm)=0.826分,m/z=945.1[M+23]
Figure 2022505450000397
TFA(3mL)/DCM(3mL)中の化合物5(30.0mg、0.0300mmol)の溶液を20°Cで2時間撹拌した。TLC(石油エーテル中50%酢酸エチル、Rf=0.1)は、反応が完了したことを示した。反応混合物を濃縮して、化合物6(28mg、99.4%)を黄色固体として得、これを次の工程で直接使用した。LCMS(5-95,AB,1.5分):RT(220/254nm)=0.601分,m/z=869.5[M+23]
Figure 2022505450000398
DMF(5.0mL)中の化合物6(28.0mg、0.0300mmol)の溶液に、HATU(24.56mg、0.0600mmol)およびDIEA(12.52mg、0.1000mmol)を20℃において添加した。反応混合物を20℃で10分間撹拌した。その後、化合物7(20.0mg、0.0300mmol)を添加した。反応混合物を20℃で12時間撹拌した。反応混合物をEtOAc(15mL)で希釈し、水(5mL×2)およびブライン(5mL)で洗浄した。有機層をNaSO上で乾燥させ、フィルタにかけ、濃縮し、分取TLC(DCM中20%MeOH、Rf=0.5)によって精製して、L1BQ4(20.9mg、42.6%)を白色固体として得た。LCMS(5-95,AB,1.5分):RT(220/254nm)=0.788分,m/z=734.8[M/2+1]+.
xxiii.L1BQ5例示的なL1-CIDE、L1BQ5は、以下のスキームによって合成することができる:
Figure 2022505450000399
スキーム25
Figure 2022505450000400
MC-OSu(38.89mg、0.1300mmol)およびDIEA(0.06mL、0.3400mmol)を含むDMF(2.0mL)の溶液に、化合物1(40.0mg、0.0800mmol)を添加した。混合物を20℃で2時間撹拌した後、これを濃縮し、分取TLC(DCM中10%MeOH、Rf=0.3)によって精製して、化合物2(55mg、94%)を黄色固体として得た。LCMS(5-95,AB,1.5分):RT(220/254nm)=0.863分,m/z=691.1[M+23]
Figure 2022505450000401
TFA(1.0mL)/DCM(3.0mL)中の化合物2(55.0mg、0.0800mmol)の溶液を20℃で0.5時間撹拌した。反応混合物を濃縮して、化合物3(49mg、97%)を無色油状物として得、これを次の工程で直接使用した。LCMS(5-95,AB,1.5分):RT(220/254nm)=0.796分,m/z=613.4[M+1]
Figure 2022505450000402
DMF(5.0mL)中の化合物3(49.0mg、0.0800mmol)の溶液に、HATU(60.82mg、0.1600mmol)およびDIEA(31.01mg、0.2400mmol)を20℃において添加した。反応混合物を20℃で10分間撹拌し、化合物4(55.0mg、0.090mmol)を添加した。反応混合物を20℃で12時間撹拌した。反応混合物を水(5.0mL)で希釈し、EtOAc(10mL×3)を抽出した。有機層をNaSOで乾燥させ、濃縮し、分取TLC(DCM中10%MeOH、Rf=0.2)によって精製して、L1BQ5(33.7mg、33%)を白色固体として得た。HNMR(400mHZ,CDCl)δ11.04(brs,1H),8.60(s,1H),7.85(brs,1H),7.41-7.36(m,1H),7.30-7.25(m,6H),7.19(s,2H),6.59(s,2H),5.87(brs,1H),4.72(t,J=7.50Hz,1H),4.61-4.51(m,2H),4.46-4.38(m,2H),4.25-4.15(m,3H),4.09-4.02(m,1H),3.62-3.51(m,12H),3.43(t,J=7.2Hz,2H),3.38(d,J=8.8Hz,1H),3.38-3.30(m,2H),3.07-3.01(m,3H),2.54(s,2H),2.43(s,2H),2.31(s,2H),2.14(t,J=7.6Hz,2H),1.61-1.49(m,5H),1.41-1.37(m,12H),1.32(d,J=6.8Hz,8H),1.28-1.18(m,4H),0.9(s,9H).LCMS(5-95,AB,1.5分):RT(220/254nm)=0.823分,m/z=1214.6[M+1]
xxiv.L1BQ6例示的なL1-CIDE、L1BQ6は、以下のスキームによって合成することができる:
Figure 2022505450000403
スキーム26
Figure 2022505450000404
THF(5.0mL)中の化合物1(1.0g、4.54mmol)の溶液に、BocO(1.25mL、5.45mmol)を添加した。次いで、混合物を20℃で4時間撹拌した。次いで、混合物を濃縮し、カラムクロマトグラフィー(石油エーテル中30%EtOAc、Rf=0.7)により精製して、化合物2(1.1g、76%)を得た。LCMS(5-95,AB,1.5分):RT(220/254nm)=0.697分,m/z=321.2[M+1]
Figure 2022505450000405
THF(20mL)中の化合物2(600.0mg、1.87mmol)PhP(982.33mg、3.75mmol)および化合物3(210.98mg、2.81mmol)の溶液に、DIAD(757.32mg、3.75mmol)を0℃でゆっくり加えた。反応混合物を70℃で12時間撹拌した後、これをDCM(50mL)で希釈し、水(40mL×2)で洗浄し、無水硫酸ナトリウムで乾燥させ、真空中で濃縮した。残渣をシリカゲルのフラッシュクロマトグラフィー(DCM中0~10%MeOH、Rf=0.5)によって精製して、化合物4(100mg、14%)を黄色固体として得た。LCMS(5-95,AB,1.5分):RT=0.713分,m/z=378.0[M+1]
Figure 2022505450000406
THF(10mL)中の化合物4(100.0mg、0.2600mmol)の溶液に、水(4.0mL)中のNaCO(56.15mg、0.530mmol)およびFmoc-Cl(96.44mg、0.4000mmol)の溶液を添加した。混合物を20℃で8時間撹拌した。反応混合物を水(20mL)で希釈し、EtOAc(20mL×3)で抽出し、無水硫酸ナトリウムで乾燥させ、真空中で濃縮した。その残渣をシリカフラッシュクロマトグラフィー(10%-80%EtOAc/石油エーテル)によって精製して、化合物5(130mg、81%)を白色固体として得た。LCMS(5-95,AB,1.5分):RT(220/254nm)=0.986分,m/z=622.0[M+23]
Figure 2022505450000407
TFA(1.0mL)/DCM(4.0mL)中の化合物5(130.0mg、0.2200mmol)の溶液を20℃で0.5時間撹拌した。反応混合物を濃縮して、化合物6(105mg、97%)を白色固体として得、これを次の工程で直接使用した。
Figure 2022505450000408
DMF(10.0mL)中の化合物7(115.0mg、0.330mmol)の溶液に、HATU(159.8mg、0.420mmol)およびDIEA(81.48mg、0.630mmol)を20℃において添加した。反応混合物を20℃で10分間撹拌した。次いで、化合物6(105.0mg、0.210mmol)を添加した。反応混合物を20℃で2時間撹拌した。この反応混合物を水(30mL)で希釈し、EtOAc(30mL)で抽出した。有機層をNaSOで乾燥させ、フィルタにかけ、濃縮し、分取TLC(DCM中10%メタノール、Rf=0.5)によって精製して、化合物8(170mg、98%)を黄色固体として得、これを次の工程で直接使用した。LCMS(5-95,AB,1.5分):RT(220/254nm)=0.935分,m/z=848.2[M+23]
Figure 2022505450000409
TFA(1.0mL)/DCM(4.0mL)中の化合物8(170.0mg、0.210mmol)の溶液を20℃で0.5時間撹拌した。反応混合物を濃縮して、化合物9(149mg、99.7%)を無色油状物として得、これを次の工程で直接使用した。LCMS(5-95,AB,1.5分):RT(220/254nm)=0.801分,m/z=726.1[M+1]
Figure 2022505450000410
DMF(5.0mL)中の化合物10(75.7mg、0.250mmol)の溶液に、HATU(156.1mg、0.410mmol)およびDIEA(79.58mg、0.6200mmol)を20℃において添加した。反応混合物を20℃で10分間撹拌した。その後、化合物9(149.0mg、0.210mmol)を添加した。反応混合物を20℃で2時間撹拌した。反応を水(10mL)でクエンチし、DCM(10mL×3)で抽出した。有機層をNaSOで乾燥させ、フィルタにかけ、濃縮し、分取TLC(DCM中10%MeOH、Rf=0.4)により精製して、化合物11(208mg、99.8%)を黄色固体として得て、これを次の工程で直接使用した。LCMS(5-95,AB,1.5分):RT(220/254nm)=0.920分,m/z=1037.3[M+23]
Figure 2022505450000411
DCM(1.0mL)中の化合物11(40.0mg、0.0400mmol)の溶液に、HCl/EtOAc(4.0M、2.0mL、8mmol)を添加し、混合物を20℃で2時間撹拌した。反応混合物を濃縮して、化合物12(37.11mg、99%)を黄色固体として得て、これを次の工程で直接使用した。LCMS(5-95,AB,1.5分):RT(220/254nm)=0.685分,m/z=915.3[M+1]
Figure 2022505450000412
DMF(2.0mL)中のJQ1(23.45mg、0.0600mmol)の溶液に、HATU(29.66mg、0.0800mmol)およびDIEA(20.16mg、0.1600mmol)を20℃で添加した。反応混合物を20℃で10分間撹拌した後、化合物12(37.11mg、0.0400mmol)を20℃で2時間添加した。混合物を濃縮し、分取TLC(DCM中10%MeOH、Rf=0.5)により精製して、化合物13(40mg、66%)を黄色固体として得た。LCMS(5-95,AB,1.5分):RT(220/254nm)=0.922分,m/z=1297.2[M+1]
Figure 2022505450000413
DMF(2.0mL)中の化合物13(40.0mg、0.0300mmol)の溶液にピペリジン(13.12mg、0.1500mmol)を添加し、混合物を20℃で1時間撹拌した。混合物を濃縮し、分取HPLC(アセトニトリル33~63/0.225%FA水溶液)により精製して、化合物14(8.4mg、25%)を白色固体として得た。LCMS(5-95,AB,1.5分):RT(220/254nm)=0.773分,m/z=1075.0[M+1]
Figure 2022505450000414
DMF(2.0mL)中のMC_SQ_Cit_PAB-PNP(3.08mg、0.0042mmol)および化合物14(3.0mg、0.0028mmol)の溶液に、DIEA(1.44mg、0.0100mmol)を添加した。混合物を20℃で12時間撹拌した。混合物を分取HPLC(アセトニトリル38~68/0.225%FA水溶液)によって精製して、L1BQ6(2.19mg、46%)を白色固体として得た。LCMS(5-95,AB,1.5分):RT(220/254nm)=0.842分,m/z=858.9[M/2+23].HRMS(0-95_1_4分.M):m/z=1671.66[M+1]
xxv.L1BQ7例示的なL1-CIDE、L1BQ7は、以下のスキームによって合成することができる:
Figure 2022505450000415
スキーム27
DMF(2.0mL)中の化合物2(1.29mg、0.0028mmol)および化合物1(3.0mg、0.0028mmol)の溶液に、DIEA(1.5mg、0.0100mmol)を添加した。混合物を20℃で12時間撹拌した。混合物を分取HPLC(アセトニトリル38~68/0.225%FA水溶液)によって精製して、L1BQ7(2.41mg、68%)を白色固体として得た。LCMS(5-95,AB,1.5分):RT(220/254nm)=0.850分,m/z=1291.7[M+23].HRMS(0-95_1_4分.M):m/z=1290.4777[M+23]
xxvi.L1BQ8例示的なL1-CIDE、L1BQ8は、以下のスキームによって合成することができる:
Figure 2022505450000416
スキーム38
Figure 2022505450000417
THF(50mL)中の化合物10(5.000g、49.43mmol)、NaHCO(10.478g、98.86mmol)の溶液を0℃に冷却し、次いで、Cbz-Cl(9.275g、54.37mmol)を滴下して加えた。この混合物を12時間、20℃まで加熱した。この反応混合物を濃縮し、HO(5%、30mL)で希釈し、EtOAc(100mL×2)で抽出した。有機層をブライン(100mL×3)で洗浄し、NaSO上で乾燥し、フィルタにかけ、濃縮した。これをシリカゲルでのフラッシュクロマトグラフィー(石油エーテル中0~60%EtOAc)により精製して、化合物11(11.00g、95%)を黄色油状物として得た。HNMR(400MHz,CDCl)δ7.37-7.30(m,5H),5.13(s,2H),3.93-3.84(m,3H),3.18-3.11(m,2H),1.87(brs,2H),1.50-1.48(bR,2H).
Figure 2022505450000418
DCM(10mL)中の化合物12(2.260g、10.2mmol)を、DCM(50mL)中の化合物11(2.000g、8.5mmol)およびTEA(2.150g、21.25mmol)、DMAP(51.93mg、0.4300mmol)の溶液に0℃で滴下した。反応混合物を20℃で12時間撹拌した。反応物を濃縮し、シリカゲルでのフラッシュクロマトグラフィー(石油エーテル中0~50%EtOAc、Rf=0.5)により精製して、化合物12(1.300g、36%)を無色油状物として得た。LCMS(5-95,AB,1.5分):RT(220/254nm)=0.888分,m/z=442.9[M+23]
Figure 2022505450000419
CsCO(596.0mg、1.83mmol)、化合物1(500.0mg、0.9100mmol)および化合物2(1.153g、2.74mmol)を含むDMF(20mL)の混合物を50℃で13時間撹拌した。反応溶液を水(10mL)で希釈し、EtOAc(50mL)で抽出した。有機層を濃縮し、シリカゲルでのフラッシュクロマトグラフィー(石油エーテル中0~90%EtOAc)により精製して、化合物3(370mg、53%)を黄色固体として得た。LCMS(5-95,AB,1.5分):RT(220/254nm)=0.897分,m/z=786.1[M+23]
Figure 2022505450000420
TFA(1.0mL)/DCM(5.0mL)の混合物中の化合物3(50.0mg、0.0700mmol)の溶液を20℃で2時間撹拌した。反応混合物を濃縮して、化合物4(50mg、98.2%)を黄色固体として得、これを次の工程で直接使用した。LCMS(5-95,AB,1.5分):RT(220/254nm)=0.763分,m/z=664.1[M+1]
Figure 2022505450000421
DMF(10mL)中の化合物5(23.71mg、0.0800mmol)の溶液に、HATU(48.88mg、0.1300mmol)およびDIEA(24.92mg、0.1900mmol)を20℃において添加した。反応混合物を20℃で10分間撹拌した。その後、化合物4(50.0mg、0.0600mmol)を添加した。反応混合物を20℃で12時間撹拌した。反応混合物を水(5.0mL)に添加し、次いで、EtOAc(30mL)で抽出した。有機物を水(10mL×2)で洗浄し、続いてブライン(10mL)で洗浄した。有機層をNaSOで乾燥させ、フィルタにかけ、濃縮し、分取TLC(DCM中10%MeOH、Rf=0.3)によって精製して、化合物6(60mg、98%)を黄色固体として得た。LCMS(5-95,AB,1.5分):RT(220/254nm)=0.886分,m/z=975.2[M+23]
Figure 2022505450000422
TFA(1.0mL)/DCM(4.0mL)中の化合物6(60.0mg、0.0600mmol)の溶液を20℃で0.5時間撹拌した。反応混合物を濃縮して、化合物7(52mg、85%)を無色油状物として得て、これを次の工程で直接使用した。LCMS(5-95,AB,1.5分):RT(220/254nm)=0.781分,m/z=875.1[M+23]
Figure 2022505450000423
DMF(10mL)中のJQ1(26.46mg、0.0700mmol)の溶液に、HATU(40.89mg、0.1100mmol)およびDIEA(20.85mg、0.1600mmol)を20℃で添加した。反応混合物を20℃で10分間撹拌した。その後、化合物7(52.0mg、0.0500mmol)を添加した。反応混合物を20℃で12時間撹拌した。この反応混合物を水(5mL)で希釈し、EtOAc(10mL×3)で抽出した。有機層を水(10mL×2)およびブライン(10mL)で洗浄した。これをNaSOで乾燥させ、フィルタにかけ、濃縮し、分取TLC(DCM中10%MeOH、Rf=0.2)によって精製して、化合物8(66mg、97%)を黄色固体として得た。LCMS(5-95,AB,1.5分):RT(220/254nm)=0.906分,m/z=1257.9[M+23]
Figure 2022505450000424
TMSI(110.09mg、0.5500mmol)を、DCM(15mL)中の化合物8(68.0mg、0.0600mmol)の溶液に20℃で添加し、得られた混合物を20℃で12時間撹拌した。EtN(2.0mL)を添加し、混合物を20℃で15分間撹拌した。溶媒を除去し、残渣を分取HPLC(アセトニトリル21~51%/0.225%FA水溶液)により精製して、化合物9(15mg、24%)を白色固体として得た。LCMS(5-95,AB,1.5分):RT(220/254nm)=0.792分,m/z=1101.2[M+1]
Figure 2022505450000425
DMF(2.0mL)中のMC_SQ_Cit_PAB-PNP(8.51mg、0.0100mmol)および化合物9(8.5mg、0.0100mmol)の溶液に、DIEA(0.01mL、0.0300mmol)を添加した。混合物を20℃で12時間撹拌した。混合物を分取HPLC(アセトニトリル12-47/0.225%FA水溶液)によって精製して、L1BQ8(1.6mg、12%)を白色固体として得た。LCMS(5-95,AB,1.5分):RT(220/254nm)=0.852分,m/z=850.2[M/2+1]
xxvii.L1BQ9例示的なL1-CIDE、L1BQ9は、以下のスキームによって合成することができる:
Figure 2022505450000426
スキーム29
DMF(2.0mL)中の化合物1(22.0mg、0.0200mmol)およびMC-OSu(9.23mg、0.0300mmol)の溶液に、DIEA(7.74mg、0.0600mmol)を添加した。混合物を20℃で3時間撹拌した。混合物を分取HPLC(アセトニトリル38~68/0.225%FA水溶液)によって精製して、L1BQ9(4.5mg、16.7%)を白色固体として得た。LCMS(5-95,AB,1.5分):RT(220/254nm)=0.867分,m/z=1294.4[M+1]
xxviii.L1BQ10例示的なL1-CIDE、L1BQ10は、以下のスキームによって合成することができる:
Figure 2022505450000427
スキーム30
Figure 2022505450000428
トルエン(20mL)中の化合物1(300.0mg、0.660mmol)、ベンゾフェノンイミン(178.46mg、0.980mmol)、Pd(dba)(60.11mg、0.0700mmol)、S-Phos(26.95mg、0.0700mmol)、CsCO(641.7mg、1.97mmol)の混合物をN下、110℃で16時間撹拌した。溶媒を除去して粗生成物を得、これをフラッシュカラム(石油中0~50%EtOAc)により精製して、化合物2(350mg、60%)を黄色油状物として得た。LCMS(5-95,AB,1.5分):RT(220/254nm)=1.050分,m/z=602.2[M+1]
Figure 2022505450000429
THF(20mL)およびHCl(1.0M、5.0mL)中の化合物2(350.0mg、0.580mmol)の混合物を20℃で3時間撹拌した。混合物をEtOAc(20mL)で希釈し、有機層を分離した。有機層を濃縮し、分取TLC(DCM中5%MeOH、Rf=0.5)により精製して、化合物3(250mg、94.5%)を黄色油状物として得た。LCMS(5-95,AB,1.5分):RT(220/254nm)=0.739分,m/z=460.0[M+23]
Figure 2022505450000430
トリホスゲン(27.13mg、0.0900mmol)のTHF(5.0mL)中の溶液に、化合物3(40.0mg、0.0900mmol)のTHF(5.0mL)中の溶液をN下、20℃で添加した。反応混合物を40℃で2時間撹拌した。この反応混合物を濃縮して、粗生成物(40mg)を黄色固体として得、これを次の工程で直接使用した。LCMS(5-95,AB,1.5分):RT(220/254nm)=0.849分,m/z=496.1[M+1](MeOHでクエンチ).DCM(5.0mL)中の上記生成物(40.0mg、0.0900mmol)の溶液に、MC_SQ_Cit_PAB(59.09mg、0.1000mmol)およびEtN(26.2mg、0.260mmol)のDMF(1mL)中の溶液を20℃で添加した。反応混合物を20℃で4時間撹拌した。この反応物を濃縮し、分取HPLC(アセトニトリル44-74%/0.225%FA水溶液)により精製して、化合物4(7mg、8%)を黄色固体として得た。LCMS(5-95,AB,1.5分):RT(220/254nm)=0.856分,m/z=1056.2[M+23]
Figure 2022505450000431
TFA(2.0mL)/DCM(2mL)中の化合物4(10.0mg、0.0100mmol)の溶液を20℃で2時間撹拌した。反応混合物を濃縮して、化合物5(9.4mg、100%)を黄色固体として得、これを次の工程で直接使用した。LCMS(5-95,AB,1.5分):RT(220/254nm)=0.780分,m/z=978.2[M+1]
Figure 2022505450000432
TFA(1mL)/DCM(5mL)中の化合物6(45.0mg、0.0600mmol)の溶液を20℃で2時間撹拌した。反応混合物を濃縮して、TFA塩(38.7mg、85%)を含む化合物7を黄色固体として得、これを次の工程で直接使用した。LCMS(5-95,AB,1.5分):RT(220/254nm)=0.692分,m/z=620.1[M+1]
Figure 2022505450000433
DMF(5.0mL)中の化合物5(9.4mg、0.0100mmol)の溶液に、HATU(4.39mg、0.0100mmol)およびDIEA(3.73mg、0.0300mmol)を20℃において添加した。反応混合物を20℃で10分撹拌した。次いで、化合物7(8.46mg、0.0100mmol)を添加し、形成された混合物を20℃で12時間撹拌した。混合物を分取HPLC(アセトニトリル30~60%/0.225%FAのMeCN溶液)によって精製し、L1BQ10(1.8mg、12%)を黄色固体として得た。LCMS(5-95,AB,1.5分):RT(220/254nm)=0.823分,m/z=790.6[M/2+1]
xxix.L1BQ11例示的なL1-CIDE、L1BQ11は、以下のスキームによって合成することができる:
Figure 2022505450000434
スキーム31
Figure 2022505450000435
無水DMF(4.0mL)中の化合物1(45.0mg、0.0800mmol)の溶液に、HATU(37.33mg、0.1000mmol)およびDIEA(31.72mg、0.2500mmol)を添加した。溶液を25℃で15分間撹拌し、次いで、VHLリガンド(42.03mg、0.0900mmol)を添加した。得られた反応溶液を、25℃でさらに1時間撹拌した。混合物を分取HPLC(Xtimate C18 150*25mm*5um、アセトニトリル40~70/0.225%FA水溶液)によって精製し、化合物2(46mg、58%)を淡黄色固体として得た。LCMS(5-95,AB,1.5分):RT=0.835分,m/z=962.3[M+1]HNMR(400MHz,DMSO-d6)δ8.98(s,1H),8.78(t,J=4.2Hz,1H),8.60(t,J=6.0Hz,1H),7.55(d,J=9.6Hz,1H),7.49-7.40(m,8H),4.57-4.35(m,6H),4.27-4.21(m,1H),4.11-4.01(m,4H),3.68-3.59(m,3H),3.31-3.19(m,2H),2.59(s,3H),2.52-2.51(m,1H),2.44(m,3H),2.40(s,3H),2.08-2.03(m,1H),1.92-1.86(m,1H),1.61(s,3H),0.93(s,9H).
Figure 2022505450000436
THF(5.0mL)中の化合物2(100.0mg、0.1000mmol)およびNaH(16.62mg、0.420mmol)の混合物を20℃で1時間撹拌し、次いで、THF(1.0mL)中の化合物3(21.65mg、0.1600mmol)を滴下した。混合物を20℃で2時間撹拌した。反応物を飽和NHCl水溶液(10mL)でクエンチし、HCl溶液(2.0M)でpH=4.0に酸性化した。得られた混合物を、MeOHのDCM溶液(10%、20mL×3個)で抽出した。合わせた有機層をブライン(20mL)で洗浄し、NaSO上で乾燥し、フィルタにかけた。濾液を濃縮して、粗化合物4(100mg、94.3%)を淡黄色油状物として得た。LCMS(5-95,AB,1.5分):RT=0.885分,m/z=1042.1[M+23]
Figure 2022505450000437
アセトン(3.0mL)中の化合物4(60.0mg、0.0600mmol)およびEtN(7.14mg、0.0700mmol)の溶液に、20℃で化合物5(9.64mg、0.0700mmol)を加え、混合物を20℃で10分間撹拌し、次いで、水(1.0mL)中のNaN(7.64mg、0.1200mmol)を滴下して加えた。得られた混合物を20℃で1時間撹拌し、水(5.0mL)を添加した。混合物をトルエン(2mL×2)で抽出した。合わせたトルエン層を、NaSO上で乾燥させ、フィルタにかけ、濃縮した。濾液を4Aモレキュラーシーブで処理し、次の工程で直接使用した。
Figure 2022505450000438
上記トルエン溶液に、化合物7(33.29mg、0.0600mmol)を含むDMF(1.0mL)およびジブチルスズジラウレート(3.68mg、0.0100mmol)を20℃で添加した。反応混合物を60℃で1時間撹拌し、濃縮し、分取TLC(DCM中10%MeOH、Rf=0.4)および分取HPLC(アセトニトリル28-53/10mM NHHCO水溶液)によって精製して、L1BQ11(3mg、3.2%)を白色固体として得た。LCMS(5-95,AB,1.5分):RT=0.783分,m/z=794.6[M/2+1]
xxx.L1BQ12例示的なL1-CIDE、L1BQ12は、以下のスキームによって合成することができる:
Figure 2022505450000439
スキーム32
Figure 2022505450000440
CHCN(4.0mL)中の化合物1(45.0mg、0.1100mmol)の混合物に、Pd-Cy*Phine(6.96mg、0.0100mmol)、CsCO(106.01mg、0.3300mmol)および化合物2(97.08mg、0.2200mmol)を添加した。混合物をN下、マイクロ波中、100°Cで1時間撹拌した後、これをフィルタにかけ、濃縮し、シリカでのフラッシュクロマトグラフィー(石油エーテル中0~100%EtOAc、Rf=0.3)により精製して、化合物3(70mg、74%)を茶色固体として得た。LCMS(5-95,AB,1.5分):RT(220/254nm)=1.017分,m/z=848.1[M+23]
Figure 2022505450000441
DCM(4.5mL)中の化合物3(70.0mg、0.0800mmol)の混合物に、0°CでTFA(1.5mL、0.1700mmol)を加え、25°Cで2時間撹拌した。反応混合物を濃縮して、化合物4(56mg、98.7%)を褐色油状物として得た。LCMS(5-95,AB,1.5分):RT(220/254nm)=0.775分,m/z=692.1[M+23]
Figure 2022505450000442
DCM(5.0mL)中の化合物4(40.0mg、0.0600mmol)の溶液に、DIEA(23.15mg、0.1800mmol)およびBocO(26.07mg、0.1200mmol)を添加した。混合物を25℃で16時間撹拌した。混合物を濃縮し、フラッシュカラムクロマトグラフィー(DCM中0~5%MeOH、Rf=0.5)により精製して、化合物5(35mg、62%)を無色油状物として得た。LCMS(5-95,AB,1.5分):RT(220/254nm)=0.908分,m/z=770.1[M+1]
Figure 2022505450000443
DMF(5mL)中の化合物5(35.0mg、0.050mmol)、VHLリガンド(29.36mg、0.0700mmol)およびHATU(20.74mg、0.0500mmol)の溶液に、DIEA(0.04mL、0.230mmol)を添加し、反応溶液を25°Cで2時間撹拌した。反応混合物をフィルタにかけ、濃縮し、分取TLC(DCM中10%MeOH、Rf=0.4)により精製して、化合物6(30mg、48%)を白色固体として得た。LCMS(5-95,AB,1.5分):RT(220/254nm)=0.933分,m/z=1205.1[M+23]
Figure 2022505450000444
THF(3.0mL)および水(0.600mL)中の化合物6(30.0mg、0.0300mmol)およびLiOH(2.43mg、0.1000mmol)の混合物を20°Cで2時間撹拌した。混合物を水(10mL)で希釈し、HCl溶液(2.0M)でpH=5に調整した。混合物をフィルタにかけ、固体を水(10,L)で洗浄し、濃縮して、化合物7(15mg、51%)を黄色固体として得て、これを次の工程で直接使用した。LCMS(5-95,AB,1.5分):RT=0.775分,m/z=[M+1]
Figure 2022505450000445
DMF(3.0mL)中の化合物7(15.0mg、0.0100mmol)の溶液に、2-アミノエタンスルホン酸(3.21mg、0.0300mmol)、DIEA(8.3mg、0.0600mmol)、EDCI(4.92mg、0.0300mmol)およびHOBt(3.47mg、0.0300mmol)を添加した。混合物を20℃で18時間撹拌した。反応混合物を濃縮し、分取HPLC(アセトニトリル35~65%/0.1%TFA水溶液)により精製して、化合物8(8.0mg、47%)を黄色固体として得た。LCMS(5-95,AB,1.5分):RT(220/254nm)=0.738分,m/z=1276.4[M+1]
Figure 2022505450000446
DCM(5.0mL)中の化合物8(8.0mg、0.0100mmol)の混合物に、0°CでTFA(1.0mL)を加え、25°Cで2時間撹拌した。反応混合物を濃縮し、分取HPLC(アセトニトリル19~49%/0.1%TFA水溶液)により精製して、化合物9(6.57mg、80%)を黄色固体として得た。LCMS(5-95,AB,1.5分):RT(220/254nm)=0.662分,m/z=1175.5[M+1]
Figure 2022505450000447
DMF(2.0mL)中の化合物9(7.0mg、0.0100mmol)の溶液に、ピリジン(4.71mg、0.0600mmol)、HOBt(1.05mg、0.0100mmol)およびMC_SQ_Cit_PAB-PNP(5.7mg、0.0100mmol)を添加した。反応溶液を50℃で24時間撹拌した。溶液を濃縮し、分取HPLC(アセトニトリル0~40/0.1%HCl水溶液)によって精製して、淡黄色の固体としてL1BQ12(2.01mg、19%)を得た。LCMS(10-80,AB,7分):R=3.717分,m/z=886.6[M/2+1].HRMS:0~95_1_4分 m、m/Z=1771.70[M+1]
xxxi.L1BQ13例示的なL1-CIDE、L1BQ13は、以下のスキームによって合成することができる:
Figure 2022505450000448
スキーム33
Figure 2022505450000449
THF(75mL)中の化合物1(5.00g、17.01mmol)の混合物に、BH THF(705.76mg、51.03mmol)をN下、25℃で添加した。混合物を20℃で12時間撹拌した。反応をMeOH(10mL)で急冷し、濃縮乾固した。濾液をEtOAc(60mL)で希釈し、ブラインで洗浄した(20mL×3)。次いで、有機層をNaSOで乾燥させ、濃縮し、フラッシュカラムクロマトグラフィー(石油エーテル中0~30%EtOAc、R=0.5)によって精製して、化合物2(4.722g、99%)をオフホワイトの固体として得た。HNMR(400MHz,meOD)δ7.53(s,1H),7.39(s,2H),3.72(t,J=6.8Hz,2H),2.76(t,J=6.8Hz,2H).
Figure 2022505450000450
トルエン(80mL)および水(228mL)中の化合物2(4.00g、14.29mmol)、化合物3(22.294g、114.3mmol)に25℃でTBAI(3.904g、11.43mmol)およびNaOH(45.72g、1143mmol)を加えた。混合物を25℃で3時間撹拌した。反応混合物をMTBE(50mL×3)で抽出した。有機層を合わせ、無水硫酸ナトリウムで乾燥させて濃縮した。粗生成物をフラッシュクロマトグラフィー(石油エーテル中0~10%EtOAC、R=0.6)によって精製して、化合物4(5.550g、98.6%)を無色油状物として得た。HNMR(400MHz,meOD)δ7.51(d,J=1.6Hz,1H),7.42(d,J=2.0Hz,2H),3.93(s,2H),3.70(t,J=6.4Hz,2H),2.84(t,J=6.4Hz,2H),1.44(s,9H).
Figure 2022505450000451
DCM(180mL)中の化合物4(4.500g、11.42mmol)の溶液に、TFA(36.0mL)を添加した。混合物を25℃で16時間撹拌した。混合物を濃縮して粗生成物を得て、これをEtOAc(60mL)で希釈し、水(20mL×8)で洗浄した。有機層をNaSOで乾燥させ、濃縮して、化合物5(3650mg、95%)を黄色油状物として得て、これを次の工程で直接使用した。HNMR(400MHz,CDCl)δ7.54(s,1H),7.32(s,2H),4.24-4.16(m,2H),3.78(t,J=7.2Hz,2H),2.89(t,J=6.8Hz,2H).
Figure 2022505450000452
THF(70mL)中の化合物5(5.300g、15.68mmol)の溶液に、N下、20℃でMeS(10.0M、4.7mL、47.04mmol)中のボランを添加した。混合物を20℃で12時間撹拌した。反応物をMeOH(30mL)で急冷した。混合物を濃縮し、水で希釈した。NaHCO(60mL)で反応停止させ、EtOAc(30mL×3)で抽出し、ブライン(30mL×3)で洗浄した。有機層を分離し、NaSOで乾燥させ、濃縮して、化合物6(4.60g、90.5%)を黄色油状物として得て、これを次の工程で直接使用した。HNMR(400MHz,CDCl)δ7.52(t,J=1.6Hz,1H),7.32(d,J=2.0Hz,2H),3.74-3.67(m,4H),3.56(t,J=4.8Hz,2H),2.85(t,J=6.4Hz,2H).
Figure 2022505450000453
DCM(50mL)中の化合物6(4.600g、14.2mmol)、TBSCl(3.209g、21.3mmol)およびイミダゾール(2.899g、42.59mmol)の混合物を20℃で4時間撹拌した。水(30mL)を添加し、DCM(30mL×3)で抽出し、ブライン(30mL×3)で洗浄した。有機層を分離し、NaSOで乾燥させ、濃縮し、フラッシュカラムクロマトグラフィー(石油エーテル中0~5%EtOAc、Rf=0.6)によって精製して、化合物7(5.200g、84%)を黄色油状物として得た。HNMR(400MHz,meOD)δ7.48(t,J=2.0Hz,1H),7.36(d,J=2.0Hz,2H),3.70-3.63(m,4H),3.45(t,J=4.8Hz,2H),2.79(t,J=6.0Hz,2H),0.84(s,9H),0.00(m,6H).
Figure 2022505450000454
化合物7(1.380g、3.15mmol)のDMF(20mL)中の溶液に、TBAB(1.015g、3.15mmol)、化合物8(605.36mg、4.72mmol)、NaHCO(1.058g、12.59mmol)およびPd(OAc)(70.69mg、0.3100mmol)を添加した。混合物をN下、105℃で24時間撹拌した。混合物をフィルタにかけ、水を添加し、EtOAc(30mL×3)で抽出し、ブライン(30mL×3)で洗浄した。有機層を分離し、NaSOで乾燥させ、濃縮し、分取HPLC(石油エーテル中0~10%EtOAc、R=0.5)により精製して、化合物9(1.230g、81%)を淡黄色油状物として得た。HNMR(400MHz,meOD)δ7.52(d,J=1.6Hz,1H),7.42-7.38(m,3H),6.38(d,J=16Hz,1H),3.71-3.65(m,4H),3.46(t,J=4.8Hz,2H),2.83(t,J=6.4Hz,2H),1.49(s,9H),0.84(s,9H),0.00(s,6H).
Figure 2022505450000455
化合物9(1.230g、2.53mmol)および化合物10(445.17mg、3.8mmol)の1,4-ジオキサン(20mL)中の溶液に、CsCO(1.650g、5.07mmol)、Xphos(120.77mg、0.2500mmol)およびPd(OAc)(28.44mg、0.1300mmol)を添加した。混合物をパージし、N下、100℃で16時間撹拌した。混合物をフィルタにかけ、水(20mL)で洗浄した。これをEtOAc(30mL×3)で抽出し、ブライン(30mL×3)で洗浄した。有機層を分離し、NaSOで乾燥させ、濃縮し、分取HPLC(石油エーテル中0~17%EtOAc、Rf=0.5)により精製して、化合物11(1180mg、89%)を黄色油状物として得た。HNMR(400MHz,meOD)δ7.47-7.43(m,2H),7.30(brs,1H),7.05(s,1H),6.33(d,J=16Hz,1H),3.71-3.65(m,4H),3.47(t,J=4.8Hz,2H),2.82-2.80(m,2H),1.48(s,18H),0.84(s,9H),0.00(m,6H).
Figure 2022505450000456
MeOH(20mL)中の化合物11(2.000g、3.83mmol)の混合物に、10%Pd/C(407.93mg)をN下、20℃で添加した。混合物をH(50psi)下、50℃で16時間撹拌した。混合物をフィルタにかけ、濾液を濃縮して、化合物12(1.750g)を無色油状物として得、これを次の工程で直接使用した。LCMS(5-95,AB,1.5分):R(220/254nm)=0.781分,m/z=432.1[M+23]
Figure 2022505450000457
THF(20mL)中の化合物12(1.560g、3.81mmol)の溶液に、tBuONa(439.29mg、4.57mmol)をN下、0℃で添加した。混合物を0℃で30分間撹拌し、次いで、プロパルギルブロミド(0.51mL、4.57mmol)を滴下した。混合物を、N下、25℃で12時間撹拌した。反応物を水(10mL)でクエンチし、EtOAc(30mL×2)で抽出し、ブライン(20mL×3)で洗浄し、濃縮した。フラッシュカラムクロマトグラフィー(石油エーテル中0~30%EtOAc、R=0.4)により精製して化合物13(1.150g、68%)を薄色油状物として得た。HNMR(400MHz,CDOD)δ7.11-7.09(m,2H),6.74(s,1H),4.15(s,2H),3.65-3.59(m,6H),2.82-2.76(m,5H),2.49(t,J=7.6Hz,2H),1.54(s,9H),1.43(s,9H).LCMS(10-80,AB,7分):R(220/254nm)=4.259分,m/z=470.2[M+23]
Figure 2022505450000458
DMF(20mL)中の化合物15(0.870g、2.11mmol)、NHCl(337.81mg、6.32mmol)およびHATU(1.600g、4.21mmol)の混合物に、DIEA(1.74mL、10.53mmol)を添加した。混合物を、20℃で2時間撹拌した。次いで、混合物を濃縮し、フラッシュカラムクロマトグラフィー(DCM中の0~5%MeOH)によって精製して、黄色固体として化合物16(0.84g、98.5%)を得た。LCMS(5-95,AB,1.5分):R(220/254nm)=0.771分,m/z=421.9[M+23]
Figure 2022505450000459
THF(50mL)中の化合物16(840.00mg、2.10mmol)の溶液に、ローソン試薬(1.700g、4.20mmol)を添加した。混合物を40℃で2時間撹拌した。混合物をEtOAc(250mL)で希釈し、HO(50mL×3)およびブライン(50mL)で洗浄した。混合物を、濃縮し、フラッシュカラムクロマトグラフィー(DCM中の5~10%MeOH)によって精製して、黄色固体として化合物4(630.00mg、71.4%)を得た。LCMS(5-95,AB,1.5分):RT(220/254nm)=0.888分,m/z=416.0[M+1]
Figure 2022505450000460
酢酸(5mL)中の化合物17(630.00mg、1.51mmol)および2-ブロモ-1,1-ジエトキシエタン(447.71mg、2.27mmol)の溶液に、TsOH(26.08mg、0.15mmol)を添加した。混合物を90℃で1時間撹拌した。混合物を濃縮し、5~10%MeOHを含むDCMで溶出するフラッシュカラムクロマトグラフィーによって精製して、化合物18(600mg、87%)を黄色固体として得た。LCMS(5-95,AB,1.5分):R(220/254nm)=0.845分、m/z=461.9[M+23]
Figure 2022505450000461
アセトニトリル(3mL)中の化合物18(30.0mg、0.0700mmol)の混合物に、Pd-Cy*Phine(4.37mg、0.05mmol)、CsCO(66.65mg、0.2000mmol)および化合物13(61.03mg、0.1400mmol)を添加した。混合物をN雰囲気下、マイクロ波中105℃で1時間撹拌した。LCMSは、反応が完了したことを示した。反応混合物をフィルタにかけ、濃縮し、分取TLC(DCM中10%メタノール、Rf=0.3)によって精製して、化合物19(26mg、45%)を黄色固体として得た。LCMS(5-95,AB,1.5分):RT(220/254nm)=1.065分,m/z=851.3[M+1]+
Figure 2022505450000462
DCM(3mL)中の19(47.0mg、0.0600mmol)の溶液に、TFA(0.6mL)を25℃で添加した。混合物を2時間25℃で撹拌した。混合物を濃縮して、20(38mg、99%)を黄色油状物として得、これを次の工程で直接使用した。LCMS(5-95,AB,1.5分):RT(220/254nm)=0.801分,m/z=695.2[M+1]
Figure 2022505450000463
DMF(3.0mL)中の20(21.0mg、0.0300mmol)、21(14.31mg、0.0300mmol)、DIEA(11.72mg、0.0900mmol)およびHATU(12.64mg、0.0300mmol)の混合物を20℃で1時間撹拌した。混合物を濃縮して粗生成物を得、これを分取HPLC(アセトニトリル25~55/0.05%TFA水溶液)によって精製し、生成物画分を水で処理した。HCl水溶液(1.0M、0.10mL)を添加し、次いで、凍結乾燥させて、22(3.82mg、11.1%)を淡黄色固体として得た。LCMS(5-95,AB,1.5分):R(220/254nm)=0.835分、m/Z=1107.7[M+1]HNMR(400MHz,MeOD):δ8.86(s,1H),7.72(d,J=3.6Hz,1H),7.54(d,J=3.2Hz,1H),7.46-7.39(m,10H),6.52-6.46(m,3H),4.65-4.60(m,7H),4.56-4.51(m,2H),4.40(s,1H),4.35-4.26(m,1H),4.25-4.15(m,1H),4.14-4.10(m,1H),3.80-3.76(m,1H),3.73-3.72(m,2H),3.71-3.64(m,5H),2.78-2.75(m,4H),2.71(s,3H),2.55-2.51(m,2H),2.46(s,3H),2.43(s,3H),2.40-2.36(m,1H),2.09-2.07(m,1H),1.64(s,2H),0.95(s,9H).
Figure 2022505450000464
無水DMF(2.0mL)中の22(20.0mg、0.0200mmol)の溶液に、ピリジン(14.29mg、0.1800mmol)、HOBt(3.17mg、0.0200mmol)、およびMC_SQ_Cit_PAB-PNP(17.27mg、0.0200mmol)を添加した。反応溶液を50℃で16時間撹拌した。反応混合物をフィルタにかけ、濾液を分取HPLC(アセトニトリル46-56/0.225%FA水溶液)によって精製して、L1BQ13(8.5mg、27%)を白色固体として得た。LCMS(5-95,AB,1.5分):R(220/254nm)=0.756分、m/z=852.9[M/2+1]
xxxii.L1BQ14例示的なL1-CIDE、L1BQ14は、以下のスキームによって合成することができる:
Figure 2022505450000465
スキーム34
DMF(8.0mL)中の1(15.0mg、0.0100mmol)およびMC_OSu(6.26mg、0.0200mmol)の溶液に、DIEA(5.25mg、0.0400mmol)を添加した。混合物を60℃で48時間撹拌した。混合物を分取HPLC(アセトニトリル38~68/0.225%FA水溶液)によって精製して、L1BQ14(1.68mg、9.4%)を白色固体として得た。LCMS(5~95,AB,7分):RT(220/254nm)=4.218分,m/z=1322.0[M+23]
xxxiii.L1BQ15例示的なL1-CIDE、L1BQ15は、以下のスキームによって合成することができる:
Figure 2022505450000466
スキーム35
Figure 2022505450000467
無水DCM(40mL)中の化合物1(2.000g、18.84mmol)の溶液に、MnO(2.456g、28.25mmol)を添加した。反応混合物を20℃で1時間撹拌した。混合物をフィルタにかけ、濾液を真空中で濃縮して、化合物2(1.970g、99.4%)を無色油状物として得、これを次の工程で直接使用した。
Figure 2022505450000468
無水DCM(50mL)中の化合物2(1.970g、9.36mmol)の溶液に、MeSONa(1.912g、18.73mmol)およびヨウ素(2.376g、9.36mmol)を添加した。反応混合物を20℃で24時間撹拌した。混合物をフィルタにかけ、濾液を濃縮し、シリカクロマトグラフィー(DCM中0~5%MeOH)によって精製すると、化合物3(1.200g、70%)が淡黄色油として得られた。HNMR(400MHz,CDCl)δ4.13-4.11,3.96-3.93(m,1H),3.77-3.70 and 3.51-3.47(m,1H),3.42 and 3.39(s,3H),2.04 and 1.96(s,1H),1.53 and 1.42(d,J=7.2Hz,3H),1.33,and 1.22(d,J=6.0Hz,3H).
Figure 2022505450000469
無水DCM(10mL)中のトリホスゲン(111.84mg、0.3800mmol)および4Åモレキュラーシーブ(100mg)の混合物に、化合物3(138.9mg、0.750mmol)の溶液およびピリジン(178.86mg、2.26mmol)の無水DCM(5.0mL)中溶液を20℃でゆっくり添加した。反応混合物を20℃で0.5時間撹拌した。次いで、混合物を濃縮して粗生成物を得て、これを次の工程で直接使用した。無水DCM(15mL)中の上記生成物に、EtN(114.41mg、1.13mmol)を添加し、化合物4(200.0mg、0.3800mmol)を添加した。反応混合物を20℃でさらに2時間撹拌し、DCM(20mL)で希釈し、HO(20mL×3)で洗浄し、NaSOで乾燥させ、フィルタにかけ、濃縮した。残渣を分取TLC(DCM中8%MeOH、R=0.6)によって精製し、化合物5(100mg、35%)を白色固体として得た。LCMS(5-95,AB,1.5分):R=0.883分,m/z=763.0[M+23]
Figure 2022505450000470
ヘキサフルオロイソプロパノール(6.0mL)中の化合物5(90.0mg、0.1200mmol)の溶液に、TFA(0.30mL、0.1200mmol)を添加した。反応溶液を、20℃で1時間撹拌した。溶液を濃縮して、化合物6(90mg、98.2%)を粗無色油状物として得た。LCMS(5-95,AB,1.5分):RT=0.744分,m/z=641.1[M+1]
Figure 2022505450000471
化合物7(54.97mg、0.1800mmol)のDMF(6mL)中の溶液に、N,N-ジイソプロピルエチルアミン(77.04mg、0.600mmol)およびHATU(90.67mg、0.240mmol)を添加した。溶液を20℃で15分間撹拌し、次いで、化合物6(90.0mg、0.1200mmol)を添加した。反応溶液を、20℃で0.5時間撹拌した。混合物を濃縮し、分取TLC(DCM中10%MeOH、R=0.7)によって精製して、化合物8(100mg、83%)を白色固体として得た。LCMS(10-80,AB,7分):R=4.028分,m/z=952.3[M+23]
Figure 2022505450000472
HFIP(7.0mL)中の化合物8(90.0mg、0.1000mmol)の溶液に、TFA(0.35mL)を添加した。反応溶液を、20℃で1時間撹拌した。混合物を真空中で濃縮して溶媒を除去し、化合物9(90mg、99%)を無色油状物として得た。LCMS(5-95,AB,1.5分):R=0.760分,m/z=830.5[M+1]
Figure 2022505450000473
化合物10(57.32mg、0.1400mmol)のDMF(4.0mL)中の溶液に、DIEA(61.6mg、0.4800mmol)およびHATU(61.62mg、0.1600mmol)を添加した。溶液を20℃で15分間撹拌し、次いで、化合物9(90.0mg、0.1000mmol)を添加した。反応溶液を、20℃で1時間撹拌した。混合物を分取HPLC(Xtimate C18 150*25mm*5um、アセトニトリル56~66/0.225%FA水溶液)によって精製して、L1BQ15(30mg、25%)を白色固体として得た。HNMR(400MHz,DMSO-d)δ8.99-8.98(m,1H),8.64(brs,1H),8.29(t,J=5.6Hz,1H),7.45-7.40(m,9H),5.23(brs,1H),4.98-4.95(m,1H),4.53-4.43(m,4H),4.30-4.24(m,1H),4.07(t,J=12.4Hz,1H),3.96(s,2H),3.86-3.84(m,1H),3.74-3.71(m,1H),3.59-3.53(m,12H),3.31-3.18(m,3H),2.59(s,3H),2.45-2.44(m,3H),2.40(s,3H),2.37-2.33(m,1H),2.17-2.10(m,1H),1.61(s,3H),1.44-1.37(m,3H),1.34-1.25(m,3H),0.95(s,9H).LCMS(10-80,AB,7分):R=4.328分,m/z=607.4[M/2+1]
xxxiv.L1BQ17例示的なL1-CIDE、L1BQ17は、以下のスキームによって合成することができる:
Figure 2022505450000474
スキーム36
Figure 2022505450000475
DCM(20mL)中の2-メチル-2-[(5-ニトロ-2-ピリジル)ジスルファニル]プロパン-1-オール(1.1g、4.2mmol)の溶液に、メタンスルフィン酸ナトリウム(2.20g、21.1mmol)およびヨウ素(2.10g、8.40mmol)を室温で加えた。それを50℃で24時間撹拌した後、反応混合物をフィルタにかけ、濾液をシリカゲルカラムクロマトグラフィー(PE中0~50%EtOAc)によって精製すると、表題化合物(660mg、85%)が黄色油として得られた。HNMR(400MHz,CDCl)δ3.77(s,2H),3.37(s,3H),1.54(s,6H).
Figure 2022505450000476
DCM(2.0mL)中のトリホスゲン(95.01mg、0.3200mmol)の溶液に、
ピリジン(50.65mg、0.6400mmol)および化合物2(118.0mg、0.6400mmol)を含むDCM(2.0mL)を添加し、反応物を15℃で30分間撹拌した。反応混合物を濃縮乾固して、化合物3(156mg、98%)を白色固体として得た。上記生成物(90.66mg、0.370mmol)のDCM(8mL)中の溶液に、EtN(49.58mg、0.490mmol)および化合物1(130.0mg、0.240mmol)のDCM(2.0mL)中の溶液を添加した。反応混合物を20℃で2時間撹拌した。混合物を濃縮し、フラッシュカラム(DCM中0~10%MeOH Rf=0.5)により精製して、化合物3(107mg、44%)を無色油状物として得た。LCMS(5-95,AB,1.5分):RT=0.811分,m/z=741.1[M+1]
Figure 2022505450000477
ヘキサフルオロイソプロパノール(1.9mL)中の化合物3(107.0mg、0.1400mmol)の溶液に、TFA(0.10mL)を添加した。反応溶液を、20℃で1時間撹拌した。混合物を濃縮して、TFA塩(109mg、100%)を含む化合物4を無色油状物として得、これを次の工程に直接使用した。LCMS(5-95,AB,1.5分):RT=0.632分,m/z=641.0[M+1]
Figure 2022505450000478
化合物5(60.0mg、0.1000mmol)、DIEA(39.42mg、0.3100mmol)およびHATU(57.99mg、0.1500mmol)の無水DMF(10mL)中溶液を25℃で10分間撹拌し、次いで、化合物4(99.78mg、0.1300mmol)を添加した。得られた混合物を25℃で2時間撹拌した。混合物を分取HPLC(アセトニトリル39~69%/0.1%TFA水溶液)によって精製して、L1BQ17(43.09mg、32.5%)を白色固体として得た。LCMS(10-80,AB,7分):RT=4.305分,m/z=1212.6[M+1]
xxxv.L1BQ18例示的なL1-CIDE、L1BQ18は、以下のスキームによって合成することができる:
Figure 2022505450000479
スキーム37
無水DMF(2.0mL)中のMC_OSu(6.43mg、0.020mmol)の溶液に、1(15.0mg、0.0100mmol)およびDIEA(8.99mg、0.0700mmol)を添加した。混合物を20℃で12時間撹拌した。溶液を濃縮し、分取HPLC(45-75水(0.225%FA)-ACN)によって精製して、L1BQ18(4.02mg、23%)を白色固体として得た。LCMS(5-95,AB,1.5分):R=0.847分,m/z=1234.4[M+1]
xxxvi.L1BQ19例示的なL1-CIDE、L1BQ19は、以下のスキームによって合成することができる:
Figure 2022505450000480
スキーム38
Figure 2022505450000481
DCM(50mL)中の化合物A(5.0g、25.61mmol)およびDIEA(6.35mL、38.42mmol)の溶液に、TsCl(7.32g、38.42mmol)を0℃で添加した。混合物を25℃に加温し、16時間撹拌した。混合物を水(20mL)でクエンチし、EtOAc(20mL×2)で抽出した。有機層をブライン(20mL)で洗浄し、NaSO上で乾燥し、フィルタにかけ、濃縮した。残渣をカラムクロマトグラフィー(石油エーテル中0~50%EtOAc)によって精製して、所望の生成物B(5.20g、58%)を白色固体として得た。LCMS(5-95,AB,1.5分):RT=0.879分,m/z=371.9[M+23]
Figure 2022505450000482
THF(40mL)中のNaH(480.82mg、12.02mmol)の懸濁液に、化合物B(3.500g、10.02mmol)のTHF(5.0mL)中懸濁液を40℃で添加し、反応混合物を40℃で4.5時間撹拌し、水でクエンチした。EtOAc(10mL)を添加し、有機層を分離し、水(10mL×2)およびブライン(10mL)で洗浄した。有機物をMgSOで乾燥させ、濃縮し、フラッシュカラムクロマトグラフィー(石油エーテル中0~20%EtOAc、Rf=0.4)によって精製して、化合物C(1.200g、68%)を無色の油状物として得た。H NMR(400MHz,CDCl)δ7.40-7.32(m,5H),5.15(s,2H),2.24(s,4H).
Figure 2022505450000483
酢酸(50mL)中の化合物1(6.000g、30.74mmol)の溶液に、PtO(698.1mg、3.07mmol)を添加し、得られた懸濁液をH(50psi)下、45℃で12時間撹拌した。触媒をセライトによるフィルタにかけることによって除去した後、濾液を濃縮して、化合物2(6.000g、97%)を無色の油状物として得た。粗物質を更に精製することなく直接使用した。
Figure 2022505450000484
THF(20mL)および水(5.00mL)中の化合物2(6.00g、29.82mmol)の溶液に、NaHCO(10.020g、119.27mmol)およびBocO(10.28mL、44.73mmol)を添加した。混合物を18℃で2時間撹拌した。混合物を水(15mL)で希釈し、EtOAc(15mL×3)で抽出した。有機層を乾燥させ、濃縮し、カラムクロマトグラフィー(石油エーテル中5%~30%EtOAc、Rf=0.5)により精製して、化合物3(7.200g、75%)を白色固体として得た。LCMS(5-95,AB,1.5分):RT(220/254nm)=0.873分、m/z=201.9[M+1-100]
Figure 2022505450000485
化合物3(7.200g、23.89mmol)のTHF(40.0mL)中の溶液に、DIBAL-H(95.57mL、95.57mmol)(トルエン中1.0M)をN下、-78℃で添加し、混合物を-78℃で2時間撹拌した。反応物をMeOH(5.0mL)で-25℃でクエンチし、5分間撹拌した。ロッシェル塩溶液(60mL20%w/w)を添加し、25℃で1時間撹拌した。残渣をEtOAc(15mL×2)で抽出した。合わせた有機層を水(30mL×2)、ブライン(30mL×2)で洗浄し、硫酸ナトリウムで乾燥させた。粗生成物をフラッシュカラムクロマトグラフィー(DCM中0~10%MeOH、Rf=0.5)によって精製して、化合物4(2.70g、38%)を無色油状物として得た。LCMS(5-95,AB,1.5分):RT=0.840分,m/z=268.0[M+23]
Figure 2022505450000486
DCM(40mL)中のRh(OAc)(0.45g、2.04mmol)および化合物4(2.50g、10.19mmol)の溶液に、ジアゾ酢酸エチル(1.07mL、10.19mmol)をN下、0℃で添加した。次いで、混合物を15℃に加温し、12時間撹拌した。混合物を水(10mL)でクエンチし、DCM(10mL×3)で抽出した。有機層を水(10mL×3)、ブライン(10mL×3)で洗浄し、NaSOで乾燥させ、濃縮し、カラムクロマトグラフィー(DCM中0~1%MeOH、Rf=0.3)によって精製して、化合物5(1.00g、30%)を無色油状物として得た。LCMS(5-95,AB,1.5分):RT(220/254nm)=0.805分,m/z=354.1[M+23]
Figure 2022505450000487
DCM(10mL)中の化合物5(1000.0mg、3.02mmol)およびSc(OTf)(148.51mg、0.3000mmol)の混合物をN下、-78℃で撹拌し、次いで、ベンジルアジリジン-1-カルボキシラート(802.05mg、4.53mmol)を含むDCM(3.0mL)の溶液を滴下した。混合物を-78℃で4時間撹拌し、15℃に12時間加温した。混合物を濃縮し、シリカゲルでのフラッシュクロマトグラフィー(DCM中0~5%MeOH、Rf=0.4)および分取HPLC(50%-80%水(10mM NHHCO)-ACN)によって精製して、化合物6(200mg、13%)を褐色油状物として得た。LCMS(5-95,AB,1.5分):RT(220/254nm)=0.896分、m/z=409.0 [M+1-100]
Figure 2022505450000488
Pd/C(35.57mg)のTHF(10mL)中の溶液に、化合物6(170.0mg、0.3300mmol)を添加した。混合物をH(15psi)下、15℃で1時間撹拌した。混合物をフィルタにかけ、MeOH(10mL×3回)で洗浄し、濾液を濃縮すると、化合物7(125mg、99.9%)が黄色油として得られ、これをさらに精製することなく次の工程に使用した。
Figure 2022505450000489
JQ1(160.58mg、0.4000mmol)、HATU(190.38mg、0.5000mmol)およびDIEA(0.17mL、1mmol)のDMF(5.0mL)中の溶液に、化合物7(125.0mg、0.3300mmol)を0℃で添加した。反応混合物を15℃で1時間撹拌した。混合物を濃縮し、分取TLC(DCM中5%MeOH、Rf=0.3)によって精製して、化合物8(240mg、92%)を黄色固体として得た。LCMS(5-95,AB,1.5分):RT=0.920分,m/z=757.0[M+1]
Figure 2022505450000490
THF(5.0mL)、MeOH(1.0mL)および水(1mL)中の化合物8(180.0mg、0.2400mmol)の溶液に、LiOH・HO(49.86mg、1.19mmol)を添加した。混合物を15℃で1時間撹拌した。混合物を水(10mL)でクエンチし、EtOAc(10mL×3)で洗浄した。水層をクエン酸でpH=4に酸性化し、EtOAc(10mL×2)で抽出した。有機層を乾燥させ、濃縮し、分取HPLC(25%-55%水(10mM NH4HCO3)-ACN)によって精製して、化合物9(100mg、58%)を白色固体として得た。LCMS(5-95,AB,1.5分):RT(220/254nm)=0.843分、m/z=751.1[M+23]
Figure 2022505450000491
DMF(4.0mL)中の化合物9(30.0mg、0.0300mmol)、VHL(26.58mg、0.0600mmol)、DIEA(5.31mg、0.0300mmol)およびHATU(15.63mg、0.0300mmol)の溶液を50℃で6時間撹拌した。混合物を濃縮し、分取HPLC(45%の-75%水(10mMおよびNHHCO)-ACN、25ml/分)により精製して、化合物10(25mg、72%)を黄色固体として得た。LCMS(5-95,AB,1.5分):RT=0.894分,m/z=1142.3[M+1]
Figure 2022505450000492
HClのEtOAc溶液(4.0M、9.83mL)中の化合物10(25.0mg、0.0200mmol)の混合物を15℃で1時間撹拌した。混合物を濃縮し、得られた残渣をEtOAc(10mL×2)およびDCM(10mL×2)で洗浄して、GNT_C439_45-1 HCl塩を黄色固体として得た(20mg、85%)。H NMR(400MHz,dO)δ9.56(s,1H),7.43-7.41(m,4H),7.38-7.33(m,4H),4.53-4.46(m,3H),4.38-4.37(m,2H),4.05-3.96(m,2H),3.90-3.87(m,1H),3.77-3.75(m,1H),3.59-3.57(m,3H),3.49-3.32(m,9H),2.69-2.65(m,4H),2.46(s,3H),2.33-1.88(m,10H),1.67-1.63(m,1H),1.52(s,3H),1.19-1.09(m,1H),0.88(s,9H).LCMS(10-80,AB,7分):RT=3.233分,m/z=1041.5[M+1].キラルHPLC(CD-PH_10-80_B_08mL_30分):RT=16.05分、16.44分、所望の生成物の68%および32%を示した。
Figure 2022505450000493
無水DMF(2.0mL)中のMC_SQ_Cit_PAB-PNP(9.11mg、0.0100mmol)の溶液に、11(8.9mg、0.0100mmol)およびDIEA(5.33mg、0.0400mmol)を添加した。反応溶液を20℃で12時間撹拌した。混合物を濃縮し、分取HPLC(38-58水(10mM NHHCO)-ACN)によって精製して生成物(15mg、純度89%)を得、これを分取HPLC(39-59水(0.225%FA)-ACN)によってさらに精製して、2つのL1BQ19生成物を得た:(4.11mg、43%)および(4.62mg、47%)はいずれも白色固体として得られた。LCMS(5-95,AB,1.5分):RT=0.841分,m/z=820.0[M¥2+1];およびLCMS(5-95,AB,1.5分):RT=0.844分,m/z=820.1[M/2+1]
xxxvii.L1BQ20例示的なL1-CIDE、L1BQ20は、以下のスキームによって合成することができる:
Figure 2022505450000494
スキーム39
Figure 2022505450000495
NaH(59.94mg、1.5mmol)のTHF(10mL)中の懸濁液に、化合物1(0.070mL、1mmol)をN下、0℃で添加した。混合物を、0.5時間撹拌した。次いで、THF(5.0mL)中のブロモ酢酸tert-ブチル(0.11mL、0.950mmol)を上記混合物にゆっくり添加した。反応物を水(10mL)でクエンチし、EtOAc(20mL×2)で抽出し、ブライン(10mL×2)で洗浄した。有機層を濃縮し、フラッシュカラムクロマトグラフィー(石油エーテル中20%EtOAc、Rf=0.5)によって精製して、化合物2(90mg、40.2%)を淡黄色油状物として得た。H NMR(400mHz,CDOD)δ4.34(s,2H),4.24(s,2H),4.03(s,2H),1.48(s,9H).
Figure 2022505450000496
化合物2(512.0mg、2.28mmol)、PhthNH(369.51mg、2.51mmol)およびPhP(718.62mg、2.74mmol)のTHF(10mL)中撹拌溶液に、DIAD(554.0mg、2.74mmol)を20℃で添加した。混合物を室温で12時間撹拌した。反応溶媒を除去し、残渣をシリカゲルのフラッシュクロマトグラフィー(石油エーテル中0~30%EtOAc)によって精製して、化合物3(1.1g、>100%)を黄色油状物として得た。H NMR(400MHz,CDCl)δ7.89-7.86(m,2H),7.75-7.73(m,2H),4.52(s,2H),4.32(s,2H),4.01(s,2H),1.45(s,9H).
Figure 2022505450000497
化合物3(200.0mg、0.570mmol)のEtOH(5.0mL)中撹拌溶液にヒドラジン水和物(0.010mL、0.680mmol)を添加し、混合物を80℃で1時間撹拌した。混合物を濃縮し、DCM/MeOH(10:1)(20mL×3)で抽出し、ブライン(10mL)で洗浄した。有機層を濃縮して、化合物4(120mg、95%)を褐色油状物として得、これを次の工程で直接使用した。
Figure 2022505450000498
JQ1(2.05g、5.11mmol)および化合物4(0.95g、4.25mmol)を含むDMF(10mL)の混合物に、DIEA(1.099g、8.51mmol)およびHATU(2.426g、6.38mmol)を25℃で添加した。混合物を、2時間撹拌した。混合物を濃縮し、シリカクロマトグラフィー(DCM中0~10%MeOH Rf=0.6)により精製して、化合物5(1.56g、61%)を黄色油状物として得た。LCMS(5-95,AB,1.5分):RT=0.905分,m/z=606.0[M+1]
Figure 2022505450000499
化合物5(1.37g、2.26mmol)のDCM(20mL)中撹拌溶液に、TFA(20.0mL)を20°Cで添加した。混合物を20℃で2時間撹拌した。溶媒を除去して、化合物6(1.2g、82%)を黄色油状物として得た。LCMS(5-95,AB,1.5分):RT=0.804分,m/z=550.1[M+1]
Figure 2022505450000500
LCMS(5-95,AB,1.5分):RT=0.942分,m/z=727.2[M+1]+.
Figure 2022505450000501
LCMS(5-95,AB,1.5分):RT=0.748分,m/z=627.3[M+1]+.
Figure 2022505450000502
化合物6(96.52mg、0.1800mmol)、DIEA(52.34mg、0.400mmol)およびHATU(66.72mg、0.1800mmol)の無水DMF(5.0mL)中混合物を25℃で10分間撹拌し、化合物7(100.0mg、0.1300mmol)を添加した。混合物を25℃で2時間撹拌した。粗生成物を分取HPLC(アセトニトリル32~62%/0.225%FA水溶液)によって精製して、L1BQ20(18.75mg、12%)を白色固体として得た。LCMS(10-80,AB,7分):RT=4.380分,m/z=1158.2[M+1]
xxxviii.L1BQ21例示的なL1-CIDE、L1BQ21は、以下のスキームによって合成することができる:
Figure 2022505450000503
スキーム40
化合物1(45.0mg、0.0800mmol)のDMF(4.0mL)中の溶液に、HATU(34.22mg、0.0900mmol)およびDIEA(31.72mg、0.2500mmol)を添加した。溶液を25°Cで15分間撹拌し、次いで、化合物2(91.0mg、0.1200mmol)を添加した。得られた反応溶液を25°Cでさらに1時間撹拌し、分取HPLC(Xtimate C18 150*25mm*5um、アセトニトリル54~74/0.225%FA水溶液)によって精製して、L1BQ21(22mg、23%)を白色固体として得た。LCMS(5-95,AB,1.5分):R=0.889分,m/z=1172.2[M+1]H NMR(400MHz,DMSO-d)δ8.98(s,1H),8.78(t,J=5.2Hz,1H),8.64(brs,1H),7.63(t,J=8.8Hz,1H),7.49-7.40(m,8H),5.23(brs,1H),4.97-4.94(m,1H),4.52-4.38(m,4H),4.28-4.23(m,1H),4.16-3.98(m,4H),3.86-3.82(m,2H),3.76-3.71(m,2H),3.55(brs,2H),3.29-3.17(m,1H),2.59(s,3H),2.44(s,3H),2.40(s,3H),2.33(brs,1H),2.17-2.11(m,1H),1.61(s,3H),1.44-1.37(m,3H),1.34-1.23(m,3H),0.95(s,9H).
xxxix.L1BQ22例示的なL1-CIDE、L1BQ22は、以下のスキームによって合成することができる:
Figure 2022505450000504
スキーム41
DMF(5.0mL)中の化合物1(37.71mg、0.0700mmol)およびHATU(29.47mg、0.0800mmol)の溶液に、DIEA(38.52mg、0.3000mmol)を添加した。混合物を25℃で10分間撹拌した。化合物2(45.0mg、0.0600mmol)を添加し、混合物を25℃で1時間撹拌した。混合物を濃縮し、残渣を分取HPLC(51-71水(0.225%FA)-ACN)によって精製し、L1BQ22(20.95mg、30%)を白色固体として得た。H NMR(400MHz,DMSO-d6)δppm8.95(s,1H),8.76-8.73(m,1H),8.63-8.60(m,1H),7.61(d,J=8.8Hz,1H),7.45-7.36(m,8H),4.47-4.20(m,9H),4.06-3.96(m,5H),3.97-3.82(m,1H),3.51(s,3H),3.27-3.23(m,1H),3.18-3.13(m,1H),2.64-2.63(m,1H),2.56(s,3H),2.40(s,3H),2.37(s,3H),2.32-2.29(m,1H),2.18-2.04(m,1H),1.58(s,3H)1.438-1.45(m,6H),0.92(s,9H).LCMS(5-95_1.5分):RT(220/254nm)=0.888分、[M+H]1172.2.
C.Ab-CIDEの調製
i.リンカーL1を介した抗体(Ab)のCIDEへの結合
Ab-CIDEを得るためのL1-CIDEのいくつかの抗体へのコンジュゲーションを以下のように達成した。
抗HER2 7C2 LC-K149CおよびB7-H4 LC K149Cを化合物6~8および抗HER2 7C2 LC-K149Cおよび抗CD22 10F4.v3 LC K149Cに、操作されたLC-K149C、HC-A140、HC-L174Cおよび/またはHC-Y373Cシステイン残基を介して化合物10~12にコンジュゲートした。10mMコハク酸塩、pH 5、150mM NaCl、2mM EDTA中のシステイン操作抗体(THIOMAB(商標))を、1M TrisでpH 7.5~8.5にpH調整した。3~16当量の化合物6~8および10~12(それぞれチオール反応性マレイミド基を含有する)をDMFまたはDMA(濃度=10mM)に溶解し、還元、再酸化およびpH調整した抗体に添加した。反応物を室温または37°Cでインキュベートし、反応混合物のLC-MS分析によって決定される完了(1~約24時間)まで監視した。反応が完了したら、Ab-CIDEを、残りの未反応リンカー-薬物中間体および凝集タンパク質(有意なレベルで存在する場合)を除去することを目的とするいくつかの方法の1つまたは任意の組み合わせによって精製した。一例では、Ab-CIDEを、最終pHが約5.5になるまで10mMヒスチジン-酢酸塩、pH 5.5で希釈し、Akta精製システム(GE Healthcare)に接続されたHiTrap SカラムまたはS最大スピンカラム(Pierce)のいずれかを使用するS陽イオン交換クロマトグラフィーによって精製した。あるいは、Ab-CIDEを、Akta精製システムまたはZebaスピンカラムに接続されたS200カラムを使用するゲル濾過クロマトグラフィーによって精製した。透析を使用してコンジュゲートを精製した。
THIOMAB(商標)Ab-CIDEを、ゲル濾過または透析のいずれかを使用して20mMスクロースを含む240mM His/酢酸塩(pH 5)に製剤化した。精製したAb-CIDEを遠心限外濾過によって濃縮し、滅菌条件下で0.2μmフィルタを通してフィルタの通し、保存のために-20°Cで凍結した。
実施例2
Ab-CIDEの特性評価
Ab-CIDEを特性評価して、タンパク質濃度(例えば、BCAアッセイによって)、凝集レベル(分析SECによる)、CAR(例えば、LC-MS)を決定した。
0.75mL/分の流量で、0.25mMの塩化カリウムおよび15%のIPAを有する0.2Mのリン酸カリウム(pH 6.2)中、Shodex KW802.5カラムを使用して、コンジュゲートに対してサイズ排除クロマトグラフィーを実施した。Ab-CIDEの凝集状態を、280nmでの溶出ピーク面積吸光度の積分によって決定した。Agilent TOF 6530 ESI機器を使用して、コンジュゲートに対してLC-MS分析を実施した。一例として、Ab-CIDEを、トリス(pH 7.5)中、1:500 w/wエンドプロテイナーゼLys C(Promega)で37℃で30分間処理した。結果として得られた切断断片を、80℃に加熱した1000Å(Angstrom)、8μm(ミクロン)PLRP-S(高度架橋ポリスチレン)カラムに負荷し、30%のB~40%のBまでの勾配で10分間溶出した。移動相Aは、0.05%のTFAを有するHOであり、移動相Bは、0.04%のTFAを有するアセトニトリルであった。流量は、0.5mL/分であった。タンパク質溶出は、280nmでのUV吸光度検出により、エレクトロスプレーイオン化およびMS分析の前にモニタリングした。非コンジュゲートFc断片、残渣非コンジュゲートFab、および薬物化Fabのクロマトグラフィー分解が、通常達成された。得られたm/zスペクトルを、Mass Hunter(商標)ソフトウェア(Agilent Technologies)を用いてデコンボリューションして、抗体断片の質量を算出した。いくつかのAb-CIDE結合体の詳細な特性評価データを下記表1に示す。
Figure 2022505450000505
リンカー結合に使用されるCys突然変異の部位。mAb結合部位を示すために使用される命名法は、以下に記載されるものに従う:E.A.Kabat、T.T.Wu、C.Foeller、H.M.Perry、K.S.Gottesman「Sequences of Proteins of Immunological Interest」Diane Publishing、1992年 ISBN 094137565X。CIDE-抗体比。コンジュゲーションプロセス中に観察された凝集した物質の割合。そのような凝集物は、その後の精製プロセス中にコンジュゲートから分離された。精製コンジュゲート中に存在する非コンジュゲート化リンカー-薬物の量。高い凝集および/または低い溶解度は、精製されたコンジュゲートの単離を妨げた。共溶媒としてDMFまたはPGを使用して観察されたリンカー薬物のコンジュゲーションはない。
実施例3
ERαのインビボ分解
図1は、2つのAb-CIDEの活性を示す。結果を表2に示す。
Figure 2022505450000506
図2は、2つのAb-CIDEの活性を示す。結果を表3に示す。
Figure 2022505450000507
図3は、2つのAb-CIDEの活性を示す。結果を表4に示す。
Figure 2022505450000508
実施例4
PC3-Steap 1細胞におけるCIDEによるBRD4分解の定量
PC3 Steap-1過剰発現前立腺癌細胞を、45ul/ウェルのアッセイ培地(RPMI、2mM L-グルタミンを含有する10%FBS)中で組織培養処理したCellCarrier-384 Ultra Microplate(Perkin Elmer#6057300)に、9000細胞/ウェルの密度で-1日目に播種した。2日目に、化合物をジメチルスルホキシド(DMSO)で1/3連続希釈して、384ウェルv底ポリプロピレンマイクロプレート(Greiner#781091)で20点希釈を作成した。連続希釈物からの2ulの各サンプルを、中間希釈物として98ulのアッセイ培地に移した。5ulの中間希釈物を45ulの細胞プレートに添加した。カラム1、2、23および24を、「中性対照」としてのデータ正規化のために0.2%w/vの最終濃度のDMSOのみで処理した。化合物処理後、細胞プレートを37Cのインキュベーター内で4時間保存した。4時間後、15ulの16%w/vパラホルムアルデヒド(Electron Microscopy Sciences#15710-S)を細胞プレート中の50ul培地および化合物に直接添加することによって、細胞を3.7%の最終濃度のパラホルムアルデヒドで固定した。細胞プレートを室温で20時間インキュベートした。ウェルの内容物を吸引し、100ul/ウェルPBSで3回洗浄した。0.5%w/vウシ血清アルブミン、0.5%w/v Triton X-100(抗体希釈緩衝液)を含む50ul/ウェルのリン酸緩衝生理食塩水(PBS)を各ウェルに添加した。サンプルを30分間インキュベートした。サンプルを20分間インキュベートした。ウェルの内容物を吸引し、100ul/ウェルのPBSで3回洗浄した。ウェルからPBSを吸引した。BRD4の免疫蛍光染色を、mAB抗BRD4[EPR5150]抗体(Abcam 128874)1:500を抗体希釈緩衝液(PBS、Triton X 100 0.5%、BSA 0.5%)に希釈することによって行った。緩衝液で希釈した25ul/ウェルのBRD4抗体を添加し、4Cで一晩インキュベートした。
3日目に、サンプルを100ul/ウェルのPBSで3回洗浄した。25ul/ウェルの二次抗体溶液(ヤギ抗ウサギIgG、高度に交差吸着したThermo Fisher#35553とコンジュゲートしたDyLight 488)および抗体希釈緩衝液で希釈したヘキスト33342 1ug/ml)を各ウェルに分注した。ヘキスト33342のみを「阻害剤対照」としてデータ正規化のために下位3列に追加した。競合アッセイを、室温で2時間インキュベーションした。サンプルを100ulのPBSで3回洗浄した。BRD4の定量的蛍光イメージングを、Phenixハイコンテンツスクリーニングシステムを使用して行った。サンプルの蛍光画像を、488nmおよび405nmのチャネルを使用してキャプチャした。ヘキストチャネルを使用して核領域を同定した。BRD4の平均488強度を核領域で定量した。BRD4の0%および100%の変化を定義するために、DMSOおよび一次抗体対照なしで処理したサンプルを使用して、Genedata Screenerを使用してデータ分析を行った。用量応答ログ(阻害剤)対応答を、曲線の変曲点(EC50)および最大効果のプラトーを定義するために使用した。
実施例5
EoL-1細胞におけるCIDEによるBRD4分解の定量
PC3 Steap-1過剰発現前立腺癌細胞を、CellCarrier-384 Ultra Microplateに1ウェルあたり9000細胞の密度で-1日目に播種した。
EoL-1好酸球性白血病細胞を、45ul/ウェルのアッセイ培地(RPMI、L-グルタミンを含有する10%FBS)中、Corning PureCoatアミンマイクロプレート(Corning#354719)に45,000細胞/ウェルの密度で1日目に播種した。細胞が細胞プレートに付着した後、化合物をジメチルスルホキシド(DMSO)で1/3連続希釈して、384ウェルv底ポリプロピレンマイクロプレート(Greiner#781091)で20点希釈を作成した。連続希釈物からの2ulの各サンプルを、中間希釈物として98ulのアッセイ培地に移した。各ウェル5ulの中間希釈物を45ulの細胞プレートに添加した。カラム1、2、23および24を、「中性対照」としてのデータ正規化のために0.2%の最終濃度のDMSOのみで処理した。化合物処理後、細胞プレートを37Cのインキュベーター内で4時間保存した。4時間後、15ulの16%w/vパラホルムアルデヒド(Electron Microscopy Sciences#15710-S)を細胞プレート中の50ul培地および化合物に直接添加することによって、細胞を3.7%w/vの最終濃度のパラホルムアルデヒドで固定した。細胞プレートを室温で20時間インキュベートした。ウェルの内容物を吸引し、100ul/ウェルPBSで3回洗浄した。0.5%w/vウシ血清アルブミン、0.5%w/v Triton X-100(ブロック/透過処理緩衝液)を含む50ul/ウェルのリン酸緩衝生理食塩水(PBS)(pH7.5)を各ウェルに添加した。サンプルを20分間インキュベートした。ウェルの内容物を吸引し、100ul/ウェルのPBSで3回洗浄した。PBSをウェルから吸引し、50ul/ウェルのEoL-1ブロック緩衝液(10%正常ヤギ血清(AbCam#ab7481)を含有するPBS)を各ウェルに添加した。プレートを室温度で30分間インキュベートした。ブロック緩衝液をウェルからデカントした。BRD4の免疫蛍光染色を、mAB抗BRD4[EPR5150]抗体(Abcam 128874)1:500を抗体希釈緩衝液(PBS、2%正常ヤギ血清)に希釈することによって行った。緩衝液で希釈した25ul/ウェルのBRD4抗体を添加し、4Cで一晩インキュベートした。
2日目に、サンプルを100ul/ウェルのPBSで3回洗浄した。25ul/ウェルの二次抗体溶液(ヤギ抗ウサギIgG、高度に交差吸着したThermo Fisher #35553とコンジュゲートしたDyLight 488)および抗体希釈緩衝液で希釈したヘキスト33342 1ug/ml)を各ウェルに分注した。ヘキスト33342のみを「阻害剤対照」としてデータ正規化のために下位3列に追加した。競合アッセイを、室温で2時間インキュベーションした。サンプルを100ulのPBSで3回洗浄した。BRD4の定量的蛍光イメージングを、Phenixハイコンテンツスクリーニングシステムを使用して行った。サンプルの蛍光画像を、488nmおよび405nmのチャネルを使用してキャプチャした。ヘキストチャネルを使用して核領域を同定した。BRD4の平均488強度を核領域で定量した。BRD4の0%および100%の変化を定義するために、DMSOおよび一次抗体対照なしで処理したサンプルを使用して、Genedata Screenerを使用してデータ分析を行った。用量応答ログ(阻害剤)対応答を、曲線の変曲点(EC50)および最大効果のプラトーを定義するために使用した。
実施例6
PC3-Steap 1細胞におけるCIDE抗体コンジュゲートによるBRD4分解の定量
PC3 Steap-1過剰発現前立腺癌細胞を、45ul/ウェルのアッセイ培地(RPMI、50uMシスチンと共に、アッセイの日に10%FBS、1%Glutamax、メチオニンを補足)中で組織培養処理したCellCarrier-384 Ultra Microplate(Perkin Elmer#6057300)に、1000細胞/ウェルの密度で-1日目に播種した。2日目、抗体コンジュゲートを抗体緩衝液(20mM酢酸ヒスチジンpH5.5、240mMスクロース、0.02%Tween20)で1/3連続希釈して、384ウェルv底ポリプロピレンマイクロプレート(Greiner#781091)で20点希釈を作成した。5ulの抗体コンジュゲートの各ウェルを45ulの細胞プレートに移した。カラム1、2、23および24を、「中性対照」としてのデータ正規化のために抗体緩衝液のみで処理した。抗体処理後、細胞プレートを37Cのインキュベーター内で72時間保存した。4時間後、15ulの16%パラホルムアルデヒド(Electron Microscopy Sciences#15710-S)を細胞プレート中の50ul培地および化合物に直接添加することによって、細胞を3.7%の最終濃度のパラホルムアルデヒドで固定した。細胞プレートを室温で20時間インキュベートした。ウェルの内容物を吸引し、100ul/ウェルPBSで3回洗浄した。0.5%w/vウシ血清アルブミン、0.5%v/v Triton X-100(抗体希釈緩衝液)を含む50ul/ウェルのリン酸緩衝生理食塩水(PBS)を各ウェルに添加した。サンプルを30分間インキュベートした。サンプルを20分間インキュベートした。ウェルの内容物を吸引し、100ul/ウェルのPBSで3回洗浄した。ウェルからPBSを吸引した。BRD4の免疫蛍光染色を、mAB抗BRD4[EPR5150]抗体(Abcam 128874)1:500を抗体希釈緩衝液(PBS、Triton X100 0.5%、BSA 0.5%)に希釈することによって行った。緩衝液で希釈した25ul/ウェルのBRD4抗体を添加し、4Cで一晩インキュベートした。
3日目に、サンプルを100ul/ウェルのPBSで3回洗浄した。25ul/ウェルの二次抗体溶液(ヤギ抗ウサギIgG、高度に交差吸着したThermo Fisher #35553とコンジュゲートしたDyLight 488)および抗体希釈緩衝液で希釈したヘキスト33342 1ug/ml)を各ウェルに分注した。ヘキスト33342のみを「阻害剤対照」としてデータ正規化のために下位3列に追加した。競合アッセイを、室温で2時間インキュベーションした。サンプルを100ulのPBSで3回洗浄した。BRD4の定量的蛍光イメージングを、Phenixハイコンテンツスクリーニングシステムを使用して行った。サンプルの蛍光画像を、488nmおよび405nmのチャネルを使用してキャプチャした。ヘキストチャネルを使用して核領域を同定した。BRD4の平均488強度を核領域で定量した。BRD4の0%および100%の変化を定義するために、DMSOおよび一次抗体対照なしで処理したサンプルを使用して、Genedata Screenerを使用してデータ分析を行った。用量応答ログ(阻害剤)対応答を、曲線の変曲点(EC50)および最大効果のプラトーを定義するために使用した。結果を下記表5に示す。
Figure 2022505450000509
Figure 2022505450000510
薬物-抗体比。
BRD4分解効力(コンジュゲートの濃度)。
BRD4分解効力(コンジュゲート化CIDEの濃度)。
観察された最大BRD4分解。
実施例7
EoL-1細胞におけるCIDE抗体コンジュゲートによるBRD4分解の定量
EoL-1好酸球性白血病細胞を、45ul/ウェルのアッセイ培地(RPMI、L-グルタミンを含有する10%FBS)中、Corning PureCoatアミンマイクロプレート(Corning#354719)に45,000細胞/ウェルの密度で1日目に播種した。細胞が細胞プレートに付着した後、抗体コンジュゲートを抗体緩衝液(20mM酢酸ヒスチジンpH 5.5、240mMスクロース、0.02%Tween 20)で1/3連続希釈して、384ウェルv底ポリプロピレンマイクロプレート(Greiner#781091)で20点希釈を作成した。5ulの抗体コンジュゲートの各ウェルを45ulの細胞プレートに移した。カラム1、2、23および24を、「中性対照」としてのデータ正規化のために抗体緩衝液のみで処理した。抗体処理後、プレーティングした細胞を37Cのインキュベーター内で20時間保存した。20時間後、15ulの16%パラホルムアルデヒド(Electron Microscopy Sciences#15710-S)を細胞プレート中の50ul培地および化合物に直接添加することによって、細胞を3.7%の最終濃度のパラホルムアルデヒドで固定した。細胞プレートを室温で20時間インキュベートした。ウェルの内容物を吸引し、100ul/ウェルPBSで3回洗浄した。0.5%w/vウシ血清アルブミン、0.5%v/v Triton X-100(ブロック/透過処理緩衝液)を含む50ul/ウェルのリン酸緩衝生理食塩水(PBS)(pH7.5)を各ウェルに添加した。サンプルを20分間インキュベートした。ウェルの内容物を吸引し、100ul/ウェルのPBSで3回洗浄した。PBSをウェルから吸引し、50ul/ウェルのEoL-1ブロック緩衝液(10%正常ヤギ血清(AbCam#ab7481)を含有するPBS)を各ウェルに添加した。プレートを室温度で30分間インキュベートした。ブロック緩衝液をウェルからデカントした。BRD4の免疫蛍光染色を、mAB抗BRD4[EPR5150]抗体(Abcam 128874)1:500を抗体希釈緩衝液(PBS、Triton X100 0.5%、BSA 0.1%)に希釈することによって行った。緩衝液で希釈した25ul/ウェルのBRD4抗体を添加し、4Cで一晩インキュベートした。
2日目に、サンプルを100ul/ウェルのPBSで3回洗浄した。25ul/ウェルの二次抗体溶液(ヤギ抗ウサギIgG、高度に交差吸着したThermo Fisher #35553とコンジュゲートしたDyLight 488)および抗体希釈緩衝液で希釈したヘキスト33342 1ug/ml)を各ウェルに分注した。ヘキスト33342のみを「阻害剤対照」としてデータ正規化のために下位3列に追加した。競合アッセイを、室温で2時間インキュベーションした。サンプルを100ulのPBSで3回洗浄した。BRD4の定量的蛍光イメージングを、Phenixハイコンテンツスクリーニングシステムを使用して行った。サンプルの蛍光画像を、488nmおよび405nmのチャネルを使用してキャプチャした。ヘキストチャネルを使用して核領域を同定した。BRD4の平均488強度を核領域で定量した。BRD4の0%および100%の変化を定義するために、DMSOおよび一次抗体対照なしで処理したサンプルを使用して、Genedata Screenerを使用してデータ分析を行った。用量応答ログ(阻害剤)対応答を、曲線の変曲点(EC50)および最大効果のプラトーを定義するために使用した。
実施例8
BRD4標的化CIDEについての細胞増殖アッセイ
BRD4の小分子分解物の抗増殖効果を、個別に、または抗体にコンジュゲート化されたペイロードとして決定するために、標準的な細胞生存率評価プロトコルを使用した。抗体コンジュゲートをSTEAP-1抗原またはCLL-1抗原のいずれかに標的化したため、アッセイした細胞株には、LNCaP(クローンFGC)、PC-3-STEAP1(STEAP-1を安定に発現するPC-3細胞)、EOL-1およびHL-60が含まれていた。
すべての細胞株に使用した培養培地は、システイン濃度を低下させたRPM-1640(50uM)+10%FBSおよび抗生物質であった。細胞の過剰増殖を伴わずに試験化合物または抗体による6日間の処理を可能にするために、各株について細胞播種密度を決定した。すべてのインキュベーションは、加湿COインキュベーター内で37℃であった。
1日目に、懸濁細胞の遠心分離または接着細胞のAcutase処理のいずれかによって細胞を回収し、次いで、以下の密度で384ウェル黒色/透明組織培養プレート中の50uLの新鮮な培養培地に播種した:LNCaP(1250細胞/ウェル)、PC-3-STEAP-1(400細胞/ウェル)、EOL-1およびHL-60(2500細胞/ウェル)。エコー音響ディスペンサー(Labcyte)を使用して、DMSOで希釈した小分子または希釈緩衝液(20mM酢酸ヒスチジン、240mMスクロース、0.02%ポリソルベート20、pH 5.5)中の抗体コンジュゲートのいずれかを添加することによって、様々な濃度の試験分子による処理を翌日開始した。
試験分子で6日間処理した後、アッセイプレートを室温に平衡化させ、製造業者の指示に従って40uLのCellTiterGlo(Promega)を添加し、Envision機器(PerkinElmer)で発光を読み取ることによって、生細胞のレベルを評価した。
発光レベルは、溶解された細胞からのATPとの直接的な相関関係であり、生存細胞の数を反映する。対照ウェル(DSMOまたは抗体希釈剤)と比較して低下したシグナルを、BRD4の喪失による増殖の阻害または細胞死の指標として使用した。結果を表6に示す。
Figure 2022505450000511
CIDE-抗体比。
効力(LnCap細胞;コンジュゲートの濃度)。
抗増殖効力(LnCap細胞;コンジュゲート化CIDEの濃度)。
抗増殖効力(PC3細胞;コンジュゲートの濃度)。
抗増殖効力(PC3細胞;コンジュゲート化CIDEの濃度)。
PKおよび腫瘍モデル
実施例9~11
材料および方法
インビボ実験 全ての動物研究は、実験動物の管理および使用に関する国立衛生研究所のガイドラインに準拠して実行し、Genentech,Inc.のInstitutional Animal Care and Use Committee(IACUC)により承認された。
2つのヒトAML細胞株、EOL-1(DSMZ;ドイツ国ブラウンシュヴァイク)およびHL-60(ATCC、バージニア州マナッサス)を使用して、分解物-抗体コンジュゲートの有効性評価のための皮下異種移植モデルを確立した。腫瘍細胞(マトリゲルを補足た0.1mLのハンクス平衡塩類溶液に懸濁した500万個の細胞)を雌CB-17 Fox Chase SCIDマウス(Charles River Lab、カリフォルニア州ホリスター)の側腹部に接種した。平均腫瘍サイズが所望の体積(200~300 mm)に達したら、動物をそれぞれ類似の腫瘍体積分布を有するn=5の群に無作為化し、各動物に過剰量のマウスIgG2a抗ブタクサ抗体(30mg/kg;AML細胞の表面上に頻繁に発現されるFcγ受容体を遮断する)を腹腔内投与した。4時間後、賦形剤または分解物-抗体コンジュゲートを、尾静脈を介した単回静脈内(IV)ボーラス注射によって動物に投与した。腫瘍を、カリパスを使用して2次元(長さおよび幅)で測定し、その腫瘍体積を、以下の式を使用して算出した。腫瘍サイズ(mm)=0.5×(長さ×幅×幅)。結果を、経時的な各群の平均腫瘍体積+/-SEMとしてプロットした。処理群は腫瘍測定中に盲検化しなかった。
インビボでの放出された分解物およびBRD4分解のレベルを評価するために、さらなる異種移植動物からの腫瘍組織(200~300 mm;n=4~5/群)を、上記のような分解物-抗体コンジュゲートおよび抗ブタクサの単回IV用量の投与後4日目に収集した。薬物動態学的およびインビボ安定性分析のため、血漿サンプル(n=3/時点)を、分解物-抗体コンジュゲートの単回IV投与後の指定の時点でナイーブ動物から収集した。全てのサンプルを分析まで-70℃で保存した。
実施例9
以下の構造を有するCLL1標的化Ab-CIDE(PAC)の薬物動態:
Figure 2022505450000512
星形はAbコンジュゲーションの部位(DAR)を表し、以下の構造を有するコンジュゲート化していないCIDEと比較した。
Figure 2022505450000513
非コンジュゲート化CIDEのマウスPKを図6aに示す。CLL1標的化PACに対するマウスPKを図6bに示す。
実施例10
抗体コンジュゲートはマウス異種移植モデルにおいて強力な抗原依存的有効性を示した
以下の構造を有するCLL1標的化PACの単回静脈内(IV)投与:
Figure 2022505450000514
星印はAbコンジュゲーション(DAR)の部位を表し、HL-60 AML異種移植片を有するマウスには、賦形剤対照とは十分に分離された用量依存的な腫瘍成長阻害活性が与えられた(データは示していない)。5mg/kgの適合用量レベルで、CLL1標的化PACは、HER2標的化対照コンジュゲートと比較して有意に強いHL-60有効性結果を示した(HER2-5、データは示していない)。この結果は、CLL1標的PACを介したAML腫瘍への対応するCIDE(非コンジュゲート化)の抗原依存的送達と一致していた。EOL-1 AML異種移植片を有するマウスにおいて、CLL1標的化PACおよびHER2-5を単回IV投与によって評価した場合、同様の用量依存的抗腫瘍活性およびさらに深刻な抗原依存的送達効果が観察された(図7)。別の実験では、CLL1標的化PACを異種移植マウスにIV投与した4日後に、測定可能なレベルの非コンジュゲート化CIDEがEOL-1腫瘍で検出された(データは示していない)。測定された非コンジュゲート化CIDEの腫瘍内量は、CLL1標的化PACの投与用量ならびにコンジュゲートによって示されるEOL-1腫瘍増殖阻害活性と良好に相関した(用量レベル1.5、5.0および10mg/kgを比較する)。CLL1標的化PACについての異種移植片有効性と腫瘍内分解物濃度との間の説明される関係は、細胞傷害性ペイロードを有するいくつかの他の以前に研究されたADCについて観察された関連する結果と一致した。重要なことに、CLL1標的化PACおよびHER2-5コンジュゲートは、これらのインビボ研究のすべてにおいて十分に忍容性であり、関連するマウス体重において検出された減少は最小限であった(データは示していない)。
実施例11
CIDEの抗体コンジュゲーションは、非コンジュゲート化CIDEと比較して有意に改善されたインビボ有効性特性をもたらした
実施例9に示される非コンジュゲート化CIDEのコンジュゲーションが好ましい異種移植片転帰を提供する分子の能力を高めたかどうかを判断するために、単回IV用量(0.4mg/kg)の投与を介してEOL-1腫瘍モデルにおいて非コンジュゲート化化合物を評価した。この実験で使用した非コンジュゲート化非コンジュゲート化CIDEの量は、対応するCLL1標的化PACの10mg/kg用量に関連する量と同等であった(非コンジュゲート化CIDEとCLL1標的化PACとの間の大きな分子量差に留意されたい;それぞれ1096および156,690g/モル)。図8に示すように、非コンジュゲートCIDEの投与は、EOL-1モデルにおいて有効性をもたらさなかった。対照的に、CLL1標的化PACの適合用量(10mg/kg)は、同じ実験で強い抗腫瘍活性を示した(図8)。これらの結果は、キメラ分解物分子のインビボ活性を可能にし、それによって非コンジュゲート化化合物で得られた結果と比較してその有効性の性能を有意に増強する抗体コンジュゲーションの能力を明確に実証した。CLL1標的化PACを実施した安定性および薬物動態分析は、CLL1標的化PACの長期間のインビボ曝露を裏付け、この特性は、コンジュゲートで観察された良好な有効性の結果に寄与した可能性がある。加えて、5および10mg/kgの両方の用量レベルでの非結合CLL1抗体の単回IV投与は、EOL-1インビボ有効性をもたらさなかった(図8)。これらの結果は、EOL-1モデルにおいてCLL1標的化PACについて観察された有効性がコンジュゲートのmAb部分に起因しないことを確認した。
実施例12
CIDEの抗体コンジュゲートは、非コンジュゲート化CIDEと比較してERαレベルのより高い低下を示す
MCF7-neo/HER2細胞を、チャコールでストリッピングしたウシ胎児血清10%を補充したフェノールレッドを含まないRPMI中、12ウェル細胞培養プレートに200,000細胞/ウェルの密度で播種した。16時間後、細胞をコンジュゲートまたは化合物の段階希釈でそれぞれ72時間または4時間処理した。細胞をPBSで一回洗浄し、100uL溶解緩衝液(20mM Tris pH7.5、12.5mM NaCl、2.5mM MgCl、0.1%Triton X-100、6M尿素、プロテアーゼ阻害剤(Roche))に溶解した。総タンパク質濃度をBCAアッセイ(ThermoFisher)によって決定した。各サンプルについて、10μgの総タンパク質を4~12%Bis-Trisゲル上で分離し、PVDF膜に転写した。膜をエストロゲン受容体アルファ(Cell Signaling;8644S)およびGAPDH(Cell Signaling;8884S)に対する抗体とインキュベートし、化学発光(Perkin Elmer)を用いてタンパク質バンドを可視化した。結果を図9に示す。試験化合物の構造は以下のとおりである。
Figure 2022505450000515
Figure 2022505450000516
使用される数字(例えば、量、温度等)に関して正確性を確保するための努力がなされているが、一部の実験上の誤差および偏差が考慮されるべきである。
当業者であれば、本明細書に記載される主題の実施に使用することができる、本明細書に記載されるものに類似または同等である多数の方法および材料を理解するであろう。本開示は、決して記載される方法および材料のみに限定されるものではない。
そうでないと定義しない限り、本明細書で用いる技術的および科学的な用語は、主題が属する分野の当業者により一般的に理解されるのと同じ意味を有し、Singleton et al(1994)Dictionary of Microbiology and Molecular Biology,2nd Ed.,J.Wiley&Sons,New York,NY;and Janeway,C.,Travers,P.,Walport,M.,Shlomchik(2001)Immunobiology,5th Ed.,Garland Publishing,New York.と一致する。
本明細書および特許請求の範囲において、文脈上別の解釈が必要な場合を除き、「含む(comprise)」、「含む(comprises)」、および「含むこと(comprising)」という用語は、非排他的な意味で使用される。本明細書に記載される実施形態は、実施形態「からなる」および/または「から本質的になる」ことを含むことが理解される。
本明細書で使用される場合、値を指すときの用語「約」とは、特定の量から、いくつかの実施形態では±50%、いくつかの実施形態では±20%、いくつかの実施形態では±10%、いくつかの実施形態では±5%、いくつかの実施形態では±1%、いくつかの実施形態では±0.5%、およびいくつかの実施形態では±0.1%の変動を包含することを意味し、それによって、開示された方法を実施するために、または開示された組成物を使用するために適切である。
値の範囲が提供される場合、範囲の上限および下限と、その範囲内に記載された他の任意の値または介在する値との間には、文脈上別段の指示がない限り、下限の単位の10分の1までの各介在値が包含されることが理解される。これらの小さい範囲の上限および下限は、独立してより小さい範囲に含まれてもよく、また、記載された範囲内のいずれかの具体的に除外された制限に従うことを条件として、包含される。記載された範囲が上下限の一方または両方を含む場合、包含された上下限の一方または両方を除いた範囲もまた、含まれる。
本明細書に記載された多くの修正および他の実施形態は、前述の説明および関連する図面に提示された教示の恩恵を受ける、この主題が属する技術分野の当業者には思い浮かぶであろう。したがって、本発明は開示された特定の実施形態に限定されるものではなく、改変および他の実施形態は添付の特許請求の範囲に含まれることが意図されていると理解されよう。本明細書では特定の用語が使用されているが、これらは、一般的で説明的な意味でのみ使用されており、限定を目的とするものではない。

Claims (63)

  1. 化学構造:
    Ab-(L1-D)
    を有するコンジュゲートであって、
    式中、
    Dは、構造E3LB-L2-PBを有するCIDEであり;
    E3LBは、L2に共有結合しており、前記E3LBは、E3リガーゼを結合するリガンドであり、前記E3リガーゼは、フォンヒッペル・リンドウ(VHL)であり;
    L2は、E3LBおよびPBに共有結合したリンカーであり;
    PBは、L2に共有結合しており、前記PBは、タンパク質に結合してプロテアソームによる分解を受けるタンパク質結合リガンドであり;
    Abは、L1に共有結合した抗体であり;
    L1は、AbおよびDに共有結合したリンカーであり;かつ
    pは1~8の値を有し、
    EL3Bは、構造:
    Figure 2022505450000517
    を有する残基を含み、
    式中、
    XおよびX’は、それぞれ独立して、C=O、O=S、-S(O)、S(O)であり;
    2’は、
    必要に応じて置換された-(CH-(C=O)(NR(SOアルキル、
    必要に応じて置換された-(CH-(C=O)(NR)v(SONR1N2N
    必要に応じて置換された-(CH-(C=O)(NR(SO-アリール、
    必要に応じて置換された-(CH-(C=O)(NR(SO-ヘテロアリール、
    必要に応じて置換された-(CH-(C=O)NR(SO-複素環、
    必要に応じて置換された-NR-(CH-C(O)(NR(SO-アルキル、
    必要に応じて置換された-NR-(CH-C(O)(NR(SO-NR1N2N
    必要に応じて置換された-NR-(CH-C(O)(NR(SO-NRC(O)R1N
    必要に応じて置換された-NR-(CH-(C=O)(NR(SO-アリール、
    必要に応じて置換された-NR-(CH-(C=O)(NR(SO-ヘテロアリール、
    必要に応じて置換された-NR-(CH)n-(C=O)NR(SO-複素環;
    必要に応じて置換された-XR2’-アルキル基;
    必要に応じて置換された-XR2’-アリール基;
    必要に応じて置換された-XR2’-ヘテロアリール基;または
    必要に応じて置換された-XR2’-複素環基であり;
    3’は、
    必要に応じて置換されたアルキル、
    必要に応じて置換された-(CH-C(O)(NR(SO-アルキル、
    必要に応じて置換された-(CH-C(O)(NR(SO-NR1N2N
    必要に応じて置換された-(CH-C(O)(NR(SO-NRC(O)R1N
    必要に応じて置換された-(CH-C(O)(NR(SO-C(O)NR
    必要に応じて置換された-(CH-C(O)(NR(SO-アリール、
    必要に応じて置換された-(CH-C(O)u(NR(SO-ヘテロアリール、
    必要に応じて置換された-(CH-C(O)(NR(SO-複素環、
    必要に応じて置換された-NR-(CH-C(O)(NR(SO-アルキル、
    必要に応じて置換された-NR-(CH-C(O)(NR(SO-NR1N2N
    必要に応じて置換された-NR-(CH-C(O)(NR(SO-NRC(O)R1N
    必要に応じて置換された-NR-(CH-C(O)(NR(SO-アリール、
    必要に応じて置換された-NR-(CH-C(O)(NR(SO-ヘテロアリール、
    必要に応じて置換された-NR-(CH-C(O)(NR(SO-複素環、
    必要に応じて置換された-O-(CH)n-(C=O)(NR(SO-アルキル、
    必要に応じて置換された-O-(CH)n-(C=O)(NR(SO-NR1N2N
    必要に応じて置換された-O-(CH)n-(C=O)(NR(SO-NRC(O)R1N
    必要に応じて置換された-O-(CH)n-(C=O)(NR(SO-アリール、
    必要に応じて置換された-O-(CH-(C=O)(NR(SO-ヘテロアリール、
    必要に応じて置換された-O-(CH-(C=O)(NR(SO-複素環;
    必要に応じて置換された-(CH-(V)n’-(CH-(V)n’-アルキル基、
    必要に応じて置換された-(CH-(V)n’-(CH-(V)n’-アリール基、
    必要に応じて置換された-(CH-(V)n’-(CH-(V)n’-ヘテロアリール基、
    必要に応じて置換された-(CH-(V)n’-(CH-(V)n’-複素環基、
    必要に応じて置換された-(CH-N(R1’)(C=O)m’-(V)n’-アルキル基、
    必要に応じて置換された-(CH-N(R1’)(C=O)m’-(V)n’-アリール基、
    必要に応じて置換された-(CH-N(R1’)(C=O)m’-(V)n’-ヘテロアリール基、
    必要に応じて置換された-(CH-N(R1’)(C=O)m’-(V)n’-複素環基、
    必要に応じて置換された-XR3’-アルキル基;
    必要に応じて置換された-XR3’-アリール基;
    必要に応じて置換された-XR3’-ヘテロアリール基;または
    必要に応じて置換された-XR3’-複素環基であり;
    1NおよびR2Nは、それぞれ独立して、H、1もしくは2個のヒドロキシル基、または1、2もしくは3個のハロゲン基で必要に応じて置換されたC~Cアルキル、必要に応じて置換された-(CH-アリール、必要に応じて置換された-(CH-ヘテロアリール、および必要に応じて置換された-(CH-複素環基であり;
    、R、およびRは、それぞれ独立して、H、またはC~Cアルキル基であり;
    Vは、O、SまたはNRであり;
    は、上記と同じであり;
    R2’およびXR3’は、それぞれ独立して、-(CH-、-(CH-CH(X)=CH(X)-(シスまたはトランス)、-CH-CH≡CH-、-(CHCHO)-、またはC~Cシクロアルキルからなる群から選択される1つまたは複数の置換基で必要に応じて置換され、Xは、H、ハロ、または必要に応じて置換されたC~Cアルキル基であり;
    各mは、独立して、0、1、2、3、4、5、6であり;
    各m’は、独立して0または1であり;
    各nは、独立して、0、1、2、3、4、5、6であり;
    各n’は、独立して0または1であり;
    各uは、独立して0または1であり;
    各vは、独立して0または1であり;
    各wは、独立して0または1であり;および
    1’は、-O-L1であり、L1は、
    Figure 2022505450000518
    式中、
    1L1およびR2L1は、独立して、HおよびC~Cアルキルから選択されるか、または、R1L1およびR2L1は、3、4、5、もしくは6員のシクロアルキル基または複素環基を形成する、
    からなる群から選択されるか;または下記式:
    -Str-(PM)-Sp-、
    で表されるペプチド模倣物であり、
    式中:
    Strは、Abに共有結合したストレッチャー単位であり;
    Spは、結合またはCIDE部分に共有結合したスペーサー単位であり;および
    PMは、
    Figure 2022505450000519
    式中、
    Wは、-NH-ヘテロシクロアルキル-またはヘテロシクロアルキルであり;
    Yは、ヘテロアリール、アリール、-C(O)C~Cアルキレン、C~Cアルキレン-NH、C~Cアルキレン-NH-CH、C~Cアルキレン-N-(CH、C~Cアルケニル、またはC~Cアルキレニルであり;
    各Rは、独立して、C~C10アルキル、C~C10アルケニル、(C~C10アルキル)NHC(NH)NH、または(C~C10アルキル)NHC(O)NHであり;
    およびRは、それぞれ独立して、H、C~C10アルキル、C~C10アルケニル、アリールアルキル、または、ヘテロアリールアルキルであるか、または、RおよびRは、一緒に、C~Cシクロアルキルを形成してもよく;および
    およびRは、それぞれ独立して、C~C10アルキル、C~C10アルケニル、アリールアルキル、ヘテロアリールアルキル、(C~C10アルキル)OCH-であるか、または、RおよびRは、C~Cシクロアルキル環を形成してもよい;
    からなる群から選択される、非ペプチド化学部分であるか;
    または式:
    Figure 2022505450000520
    式中、Aは、ストレッチャー単位であり、および、aは、0~1の整数であり;Wは、アミノ酸単位であり、および、wは、0~12の整数であり;Yは、スペーサー単位であり、および、yは0、1、または2である;
    を有するリンカー、
    または式:
    Figure 2022505450000521
    を有するリンカーである、
    コンジュゲート。
  2. L1が、
    Figure 2022505450000522
    式中、R1L1およびR2L1は、独立して、H、およびC~Cアルキルから選択されるか、または、R1L1およびR2L1は、3、4、5、もしくは6員のシクロアルキル基または複素環基を形成する;
    Figure 2022505450000523
    Figure 2022505450000524
    式中、-----は、-Oへの結合点であり、S-----は、Abへのジスルフィド結合点である、
    からなる群から選択される、請求項1に記載のコンジュゲート。
  3. L1が、
    Figure 2022505450000525
    式中、R1L1およびR2L1は、独立して、H、およびC~Cアルキルから選択されるか、または、R1L1およびR2L1は、3、4、5、もしくは6員のシクロアルキル基または複素環基を形成する、
    からなる群から選択される、請求項2に記載のコンジュゲート。
  4. 前記L1が、
    Figure 2022505450000526
    からなる群から選択される、請求項3に記載のコンジュゲート。
  5. Abへの前記ジスルフィド結合点が、構造-S-Cys-を有し、Cysがシステイン残基である、請求項1に記載のコンジュゲート。
  6. XおよびX’が、それぞれC=Oであり、前記EL3Bが、構造:
    Figure 2022505450000527
    を有する残基である、請求項1に記載のコンジュゲート。
  7. 前記EL3Bが、構造:
    Figure 2022505450000528
    式中、
    Gは、
    Figure 2022505450000529
    であり;
    βは、水素、メチル、エチル、またはプロピルである、
    を有する基の残基である、請求項1に記載のコンジュゲート。
  8. 前記EL3Bが、構造:
    Figure 2022505450000530
    式中、
    βは、水素、メチル、エチルまたはプロピルである、
    を有する基の残基である、請求項1に記載のコンジュゲート。
  9. 前記EL3Bが、構造:
    Figure 2022505450000531
    または
    Figure 2022505450000532
    を有する基の残基である、請求項8に記載のコンジュゲート。
  10. βが、水素である、請求項9に記載のコンジュゲート。
  11. 前記PBが、BRD4を結合する基の残基である、請求項1に記載のコンジュゲート。
  12. 前記PBが、BRD4を結合し、構造:
    Figure 2022505450000533
    式中、*は、L2に対する共有結合点を示す、
    を有する基の残基である、請求項11に記載のコンジュゲート。
  13. 前記PBが、ERαを結合する基の残基であり、抗エストロゲン薬である、請求項1に記載のコンジュゲート。
  14. 前記PBが、ERαを結合する基の残基であり、下記構造:
    Figure 2022505450000534
    式中、
    R’’は、水素、C~Cアルキル、ベンジル、フェニル、または-(PO)であり、
    *は、L2に対する共有結合点を示す、
    の化合物である、請求項1に記載のコンジュゲート。
  15. 前記PBが、下記構造:
    Figure 2022505450000535
    式中、
    *は、L2に対する共有結合点を示す
    の化合物の残基である、請求項14に記載のコンジュゲート。
  16. 前記Abが、システイン操作抗体またはその変形体である、請求項1に記載のコンジュゲート。
  17. Abが、DLL3、EDAR、CLL1;BMPR1B;E16;STEAP1;0772P;MPF;NaPi2b;Sema 5b;PSCA hlg;ETBR;MSG783;STEAP2;TrpM4;CRIPTO;CD21;CD79b;FcRH2;B7-H4;HER2;NCA;MDP;IL20Rα;Brevican;EphB2R;ASLG659;PSCA;GEDA;BAFF-R;CD22;CD79a;CXCR5;HLA-DOB;P2X5;CD72;LY64;FcRH1;IRTA2;TENB2;PMEL17;TMEFF1;GDNF-Ra1;Ly6E;TMEM46;Ly6G6D;LGR5;RET;LY6K;GPR19;GPR54;ASPHD1;チロシナーゼ;TMEM118;GPR172A;MUC16およびCD33からなる群から選択される1つまたは複数のポリペプチドに結合する、請求項1に記載のコンジュゲート。
  18. Abが、CLL1、STEAP1、NaPi2b、STEAP2、TrpM4、CRIPTO、CD21、CD79b、FcRH2、B7-H4、HER2、CD22、CD79a、CD72、LY64、Ly6E、MUC16、およびCD33からなる群から選択される1つまたは複数のポリペプチドに結合する、請求項17に記載のコンジュゲート。
  19. Abが、HER2、B7-H4、およびCD22からなる群から選択される1つまたは複数のポリペプチドに結合する抗体である、請求項18に記載のコンジュゲート。
  20. 前記抗体が、HER2に結合する、請求項19に記載のコンジュゲート。
  21. 前記抗体が、B7-H4またはCD22に結合する、請求項19に記載のコンジュゲート。
  22. 構造:
    Figure 2022505450000536
    Figure 2022505450000537
    Figure 2022505450000538
    Figure 2022505450000539
    Figure 2022505450000540
    を有する、請求項1に記載のコンジュゲート。
  23. 構造:
    Figure 2022505450000541
    式中、
    PBは、タンパク質結合基であり;
    L2は、リンカー-2であり;
    Gは、
    Figure 2022505450000542
    であり;および
    T、UおよびVのうちの1つはL1-Abであり、L1はリンカー-1であり;但し、TがL1である場合、Uは水素であり、およびVおよび*は存在しないか;またはUがL1である場合、Tは水素であり、およびVおよび*は存在しないか;または、VがL1である場合、*は
    Figure 2022505450000543
    であり、およびTおよびUの各々は水素である、
    を有するコンジュゲート。
  24. Tが、L1であり、L1が、
    Figure 2022505450000544
    式中、R1L1およびR2L1は、独立して、H、およびC~Cアルキルから選択されるか、または、R1L1およびR2L1は、3、4、5、もしくは6員のシクロアルキル基または複素環基を形成する;
    Figure 2022505450000545
    Figure 2022505450000546
    からなる群から選択される、請求項23に記載のコンジュゲート。
  25. Uが、L1であり、L1が、
    Figure 2022505450000547
    Figure 2022505450000548
    からなる群から選択される、請求項23に記載のコンジュゲート。
  26. Vが、L1であり、L1が、
    Figure 2022505450000549
    からなる群から選択される、請求項23に記載のコンジュゲート。
  27. 構造:
    Figure 2022505450000550
    式中、
    Abは、L1へのジスルフィド結合を介して共有結合した抗体であり;
    L2は、E3LBに共有結合したリンカーであり、および
    E3LBは、E3リガーゼを結合する基であり、前記E3リガーゼは、フォンヒッペル・リンドウである、
    を有するコンジュゲート。
  28. L1が、構造:
    Figure 2022505450000551
    を有する、請求項27に記載のコンジュゲート。
  29. L2が、構造:
    Figure 2022505450000552
    を有する、請求項28に記載のコンジュゲート。
  30. 構造:
    Figure 2022505450000553
    式中、
    Abは、L1へのジスルフィド結合を介して共有結合した抗体であり;
    L2は、E3LBに共有結合したリンカーであり、
    E3LBは、E3リガーゼを結合する基であり、前記E3リガーゼは、フォンヒッペル・リンドウである、
    を有するコンジュゲート。
  31. L1が、
    Figure 2022505450000554
    Figure 2022505450000555
    からなる群から選択される、請求項30に記載のコンジュゲート。
  32. 構造:
    Figure 2022505450000556
    式中、
    Abは、L1へのジスルフィド結合を介して共有結合した抗体であり;
    L1は、E3LBに共有結合したリンカーであり;
    E3LBは、E3リガーゼを結合する基であり、前記E3リガーゼは、フォンヒッペル・リンドウ、
    およびZであり、
    L2は、E3LBに共有結合したリンカーである、
    を有するコンジュゲート。
  33. L1が、
    Figure 2022505450000557
    Figure 2022505450000558
    Figure 2022505450000559
    からなる群から選択される、請求項32に記載のコンジュゲート。
  34. L1が、下記式:
    -Str-(PM)-Sp-
    式中、
    Strは、Abに共有結合したストレッチャー単位であり;
    Abは、抗体であり;
    Spは、結合またはCIDE部分に共有結合したスペーサー単位であり;
    PMは、
    Figure 2022505450000560
    からなる群から選択される非ペプチド化学部分であり、
    Wは、-NH-ヘテロシクロアルキル-またはヘテロシクロアルキルであり;
    Yは、ヘテロアリール、アリール、-C(O)C~Cアルキレン、C~Cアルキレン-NH、C~Cアルキレン-NH-CH、C~Cアルキレン-N-(CH、C~Cアルケニル、またはC~Cアルキレニルであり;
    各Rは、独立して、C~C10アルキル、C~C10アルケニル、(C~Cアルキル)NHC(NH)NH、(C-Cアルキル)NHC(O)NH、(C~C10アルキル)NHC(NH)NH、または(C~C10アルキル)NHC(O)NHであり;
    およびRは、それぞれ独立して、H、C~C10アルキル、C~C10アルケニル、アリールアルキル、または、ヘテロアリールアルキルであるか、またはRおよびRは、一緒に、C~Cシクロアルキルを形成してもよく;および
    およびRは、それぞれ独立して、C~C10アルキル、C~C10アルケニル、アリールアルキル、ヘテロアリールアルキル、(C~C10アルキル)OCH-であるか、または、RおよびRは、一緒に、C~Cシクロアルキル環を形成してもよい、
    で表されるペプチド模倣リンカーである、請求項1、23、27、30、および32のいずれか一項に記載のコンジュゲート。
  35. Strが、下記式:
    Figure 2022505450000561
    式中、Rは、C~C10アルキレン、C~C10アルケニル、C~Cシクロアルキル、(C~Cアルキレン)O-、およびC~C10アルキレン-C(O)N(R)-C~Cアルキレンからなる群から選択され、各アルキレンは、ハロ、トリフルオロメチル、ジフルオロメチル、アミノ、アルキルアミノ、シアノ、スルホニル、スルホンアミド、スルホキシド、ヒドロキシ、アルコキシ、エステル、カルボン酸、アルキルチオ、C~Cシクロアルキル、C~Cヘテロシクロアルキル、ヘテロアリールアルキル、アリールアリールアルキル、ヘテロアリールアルキルおよびヘテロアリールからなる群から選択される1~5個の置換基で置換されていてもよく、各Rは、独立して、Hまたは~Cアルキルであり;および
    Spは、-C~Cアルキレン-C(O)NH-または-Ar-R-であり、Arは、アリールまたはヘテロアリールであり、およびRは(C~C10アルキレン)O-である、
    で表される化学部分である。請求項34に記載のコンジュゲート。
  36. Strが、式:
    Figure 2022505450000562
    式中、Rは、C~C10アルキレン、C~C10アルケニル、(C~C10アルキレン)O-、N(R)-(C~Cアルキレン)-N(R)およびN(R)-(C~Cアルキレン)から選択され、各Rは、独立して、HまたはC~Cアルキルであり;および
    Spは、-C~Cアルキレン-C(O)NH-または-Ar-R-であり、Arは、アリールまたはヘテロアリールであり、およびRは(C~C10アルキレン)O-である、
    を有する、請求項34に記載のコンジュゲート。
  37. L1が、下記式:
    Figure 2022505450000563
    は、C~Cアルキル、(C~Cアルキル)NHC(NH)NH、または(C~Cアルキル)NHC(O)NHであり;
    およびRは、一緒に、C~Cシクロアルキル環を形成する、
    を有する、請求項34に記載のコンジュゲート。
  38. 式:
    Figure 2022505450000564
    式中、
    Spは、結合またはCIDE部分Dに共有結合したスペーサー単位であり;
    およびRは、それぞれ独立して、C~C10アルキル、C~C10アルケニル、アリールアルキル、ヘテロアリールアルキル、(C~C10アルキル)OCH-であるか、またはRおよびRは、一緒に、C~Cシクロアルキル環を形成してもよく;
    は、独立して、C~C10アルキル、C~C10アルケニル、(C~Cアルキル)NHC(NH)NH、(C-Cアルキル)NHC(O)NH、(C~C10アルキル)NHC(NH)NH、または(C~C10アルキル)NHC(O)NHであり;
    Strは、下記式:
    Figure 2022505450000565
    は、C~C10アルキレン、およびC~C10アルキレン-C(O)N(R)-C~Cアルキレンからなる群から選択され、各アルキレンは、ハロ、トリフルオロメチル、ジフルオロメチル、アミノ、アルキルアミノ、シアノ、スルホニル、スルホンアミド、スルホキシド、ヒドロキシ、アルコキシ、エステル、カルボン酸、アルキルチオ、C~Cシクロアルキル、C~Cヘテロシクロアルキル、アリール、アリールアルキル、ヘテロアリールアルキル、およびヘテロアリールから選択される1~5個の置換基で置換されてもよく、各Rは、独立して、Hまたは~Cアルキルである、
    で表される化学部分であり;
    pは1、2、3、または4である、
    を有する、請求項35に記載のコンジュゲート。
  39. およびRが、一緒に、C~Cシクロアルキル環を形成してもよく、Rが、C~C10アルキル、または(C~Cアルキル)NHC(O)NHである、請求項38に記載のコンジュゲート。
  40. およびRが、一緒に、シクロブチルを形成する、請求項39に記載のコンジュゲート。
  41. 前記リンカーの構造が、
    Figure 2022505450000566
    からなる群から選択される、請求項40に記載のコンジュゲート。
  42. Strが、下記式:
    Figure 2022505450000567
    は、C~Cアルキレンであり;
    Spは、-C~Cアルキレン-C(O)NH-または-Ar-R-であり、Arは、アリールであり、およびRは、(C~Cアルキレン)O-である、
    で表される化学部分である、請求項38に記載のコンジュゲート。
  43. 式:
    Figure 2022505450000568
    式中、
    pは、1、2、3、または4であり;
    は、C~Cアルキル-NH、(C~Cアルキル)NHC(NH)NH、または(C~Cアルキル)NHC(O)NHであり;
    およびRは、それぞれ独立して、C~Cアルキルであり、前記アルキルは、非置換であるか、またはRおよびRはC~Cシクロアルキル環を形成してもよい、
    を有する、請求項34に記載のコンジュゲート。
  44. L1が、
    Figure 2022505450000569
    式中、RおよびRは、独立して、HおよびC~Cアルキルから選択されるか、または、RおよびRは、3、4、5、もしくは6員のシクロアルキル基または複素環基を形成する、
    からなる群から選択される式を有する、請求項23、27、30および32のいずれか一項に記載のコンジュゲート。
  45. L1が、下記式:
    Figure 2022505450000570
    を有する、請求項44に記載のコンジュゲート。
  46. L1が、下記式:
    Figure 2022505450000571
    式中、Aは、「ストレッチャー単位」であり、およびaは、0~1の整数であり;Wは、「アミノ酸単位」であり、およびwは、0~12の整数であり;Yは、「スペーサー単位」であり、およびyは、0、1、または2である、
    を有する、請求項1、23、27、30および32のいずれか一項に記載のコンジュゲート。
  47. 前記ストレッチャー単位Aが、下記式:
    Figure 2022505450000572
    を含む、請求項46に記載のコンジュゲート。
  48. リンカーが、下記式:
    Figure 2022505450000573
    を有する、請求項47に記載のコンジュゲート。
  49. L1が、下記式:
    -A-Y
    式中、AおよびYは、上記のように定義される、
    を有する、請求項46に記載のコンジュゲート。
  50. L1が、
    Figure 2022505450000574
    である、請求項49に記載のコンジュゲート。
  51. pが、約1.0~約3である、請求項1に記載のコンジュゲート。
  52. pが、約2である、請求項1に記載のコンジュゲート。
  53. Dが、L1に共有結合した残基であり、以下の構造:
    Figure 2022505450000575
    のうちの1つから選択される、請求項1に記載のコンジュゲート。
  54. L1-Dが、前記Abに共有結合した残基であり、以下の構造:
    Figure 2022505450000576
    Figure 2022505450000577
    Figure 2022505450000578
    Figure 2022505450000579
    Figure 2022505450000580
    Figure 2022505450000581
    のうちの1つから選択される、請求項1に記載のコンジュゲート。
  55. 前記Abが、B7-H4、HER2、およびCD22からなる群から選択される1つまたは複数のポリペプチドに結合する抗体である、請求項54に記載のコンジュゲート。
  56. 前記PBが、BRD4を結合し、構造:
    Figure 2022505450000582
    を有する基の残基である、請求項12に記載のコンジュゲート。
  57. L1-Dが、前記Abに共有結合した残基であり、以下の構造:
    Figure 2022505450000583
    Figure 2022505450000584
    Figure 2022505450000585
    Figure 2022505450000586
    Figure 2022505450000587
    のうちの1つから選択される、請求項56に記載のコンジュゲート。
  58. 請求項1に記載のコンジュゲートと、1つまたは複数の薬学的に許容可能な賦形剤と、を含む医薬組成物。
  59. 有効量の請求項1に記載のコンジュゲートまたは請求項58に記載の組成物をヒトに投与することを含む、治療を必要とするヒトにおいて疾患を治療する方法。
  60. 前記疾患が癌である、請求項59に記載の方法。
  61. 前記癌が、前立腺、乳房および急性骨髄性白血病からなる群から選択される、請求項60に記載の方法。
  62. 前記癌が、HER2陽性癌である、請求項61に記載の方法。
  63. 前記HER2陽性癌が乳癌である、請求項62に記載の方法。
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