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JP2020188760A - 抗pd−1抗体 - Google Patents

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Abstract

【課題】ヒト化抗PD−1抗体及びその使用方法を提供する。【解決手段】ある特定のアミノ酸配列または別のある特定のアミノ酸配列の軽鎖可変領域;及びまた別の特定のアミノ酸配列の重鎖可変領域を含む、前記単離された抗体またはその断片。前記抗体またはその断片は、モノクローナル抗体、scFv、Fab断片、Fab’断片、及びF(ab)’断片から成る群から選択されてよい。前記抗体またはその断片は、治療剤に連結されてよく、または治療剤と複合体化されてよい。【選択図】図1A

Description

関連出願の相互参照
本出願は、2014年7月22日出願の国際出願第PCT/CN2014/082721号明細書の優先権を主張し、その全体があらゆる目的のために参照によって本明細書に組み込まれる。
発明の分野
本発明は、PD−1に結合する抗体及びその抗原結合断片、ならびにこのような抗体及び抗原結合断片を使用する方法に関する。
電子的に提出されたテキストファイルの説明
本明細書と共に電子的に提出されるテキストファイルの内容は、その全体が参照によって本明細書に組み込まれる:配列表のコンピュータ可読形式コピー(ファイル名称:CRBI_006_01WO_SeqList_ST25);記録日:2015年7月14日;ファイルサイズ:147KB)。
背景
プログラム死受容体1(PD−1)は、主としてリンパ球上で発現され、2つのリガンド、すなわちPD−L1及びPD−L2を有する。PD−1は、遺伝子Pdcd1によってコードされる55kDaのタンパク質であり、リガンドとの結合によって抗原受容体シグナル伝達の下方制御が促進されることが示された(Freeman et al.(2000)J Exp Med 192:1027−34(非特許文献1);Latchman,et.al.(2001)Nat Immunol 2:261−8(非特許文献2);Carter et al.(2002)Eur J Immunol 32:634−43(非特許文献3))。PD−1は、CD28、CTLA−4、ICOS及びBTLAなどのメンバーを含む免疫グロブリンスーパーファミリーに属する。PD−1は、リガンド結合のためのIg可変型(V型)ドメイン及びシグナル伝達分子の結合のための細胞質尾部を含有するI型膜貫通糖タンパク質である。PD−1は、2つの細胞質チロシンベースのシグナル伝達モチーフ、すなわち免疫受容体抑制性チロシンモチーフ(ITIM)及び免疫受容体スイッチ性チロシンモチーフ(ITSM)を含有する。T細胞の刺激後、PD−1は、その細胞質尾部内のITSMモチーフにチロシンホスファターゼSHP−2を動員し、CD3T細胞シグナル伝達カスケードに関与するエフェクター分子、例えばCD3ゼータ、PKCシータ及びZAP70などの脱リン酸化をもたらす。対照的に、PD−1のリガンド(PD−L1及びPD−L2)は、未知の機能を有する2つの短い細胞質領域を有する。このリガンドは、IgV様及びIgC様ドメインを含有する細胞外領域を有し、構成的に発現される、または非造血組織に加えて種々の腫瘍型を含む、様々な細胞型で誘導され得る。PD−L1は、B細胞、T細胞、骨髄性細胞及び樹状細胞(DC)上で発現されるだけでなく、微小血管内皮細胞及び心臓、肺などのような非リンパ器官のような末梢細胞上にも発現される。対照的に、PD−L2は、マクロファージ及びDC上でのみ見出される。PD−1リガンドの発現パターンは、末梢寛容の維持におけるPD−1の役割を示唆し、末梢において自己反応性T細胞及びB細胞の応答を制御するのに役立つ場合がある。今日までに、多数の研究が、PD−1とそのリガンドとの相互作用が、インビトロ及びインビボでリンパ球増殖の阻害をもたらすことを示してきた。PD−1/PDL1相互作用を妨げると、T細胞増殖を増加させ、サイトカイン産生を促進することが示されている。
したがって、免疫応答の制御にはPD−1/PD−L1経路の重要な役割が存在する。PD−1/PD−L1シグナル伝達の機能不全は、疾患、例えば癌及びウイルス感染などの開始及び発症と相関するようである。ノックアウト動物の分析は、PD−1が主に末梢性寛容の誘導及び制御において機能するという理解に繋がった。したがって、PD−1経路の治療的遮断は、免疫寛容の克服及び癌または感染症の処置に加えてワクチン接種(予防的または治療的のいずれか)中の免疫を高めることに有益であろう。PD−1経路をブロックする改善された方法が、当該技術分野に必要である。
Freeman et al.(2000)J Exp Med 192:1027−34 Latchman,et.al.(2001)Nat Immunol 2:261−8 Carter et al.(2002)Eur J Immunol 32:634−43
一態様では、本発明は、プログラム死受容体1(PD−1)に結合する抗体及びその抗原結合断片を提供する。いくつかの実施形態では、抗体及びその抗原結合断片は、ヒトPD−1に結合する。いくつかの実施形態では、抗体及びその抗原結合断片はPD−1に結合し、PD−L1及び/またはPD−L2とPD−1との結合をブロックする。さらなる実施形態では、抗PD−1抗体及びその断片はPD−1に結合し、PD−1/PD−L1経路またはPD1/PD−L2経路を妨げる。一実施形態では、抗体またはその断片は、マウス抗体、キメラ抗体、ヒト抗体またはヒト化抗体である。一実施形態では、抗PD−1抗体またはその断片は、モノクローナル抗体、scFv、Fab断片、Fab’断片、F(ab)’断片、二重特異性抗体、免疫複合体、またはこれらの組み合わせである。
一実施形態では、本発明は、配列番号19〜21、24〜26、29〜31、34〜36、40〜42、45〜47、50〜52、55〜57、60〜62、65〜67、70〜72、75〜77、80〜82、85〜87、90〜92、95〜97、100〜102、105〜107、110〜112、及び115〜117から成る群から選択される1つまたは複数のCDRを含む、単離された抗体またはその断片を提供する。
一実施形態では、抗体またはその断片は、配列番号24、34、45、55、65、75、85、95、105、及び115から成る群から選択されるアミノ酸配列と少なくとも80%の相同性、少なくとも81%の相同性、少なくとも82%の相同性、少なくとも83%の相同性、少なくとも84%の相同性、少なくとも85%の相同性、少なくとも86%の相同性、少なくとも87%の相同性、少なくとも88%の相同性、少なくとも89%の相同性、少なくとも90%の相同性、少なくとも91%の相同性、少なくとも92%の相同性、少なくとも93%の相同性、少なくとも94%の相同性、少なくとも95%の相同性、少なくとも96%の相同性、少なくとも97%の相同性、少なくとも98%の相同性、または少なくとも99%の相同性を有する軽鎖CDR1配列を含む。
一実施形態では、抗体またはその断片は、配列番号25、35、46、56、66、76、86、96、106、及び116から成る群から選択されるアミノ酸配列と少なくとも80%の相同性、少なくとも81%の相同性、少なくとも82%の相同性、少なくとも83%の相同性、少なくとも84%の相同性、少なくとも85%の相同性、少なくとも86%の相同性、少なくとも87%の相同性、少なくとも88%の相同性、少なくとも89%の相同性、少なくとも90%の相同性、少なくとも91%の相同性、少なくとも92%の相同性、少なくとも93%の相同性、少なくとも94%の相同性、少なくとも95%の相同性、少なくとも96%の相同性、少なくとも97%の相同性、少なくとも98%の相同性、または少なくとも99%の相同性を有する軽鎖CDR2配列を含む。
一実施形態では、抗体またはその断片は、配列番号26、36、47、57、67、77、87、97、107、及び117から成る群から選択されるアミノ酸配列と少なくとも80%の相同性、少なくとも81%の相同性、少なくとも82%の相同性、少なくとも83%の相同性、少なくとも84%の相同性、少なくとも85%の相同性、少なくとも86%の相同性、少なくとも87%の相同性、少なくとも88%の相同性、少なくとも89%の相同性、少なくとも90%の相同性、少なくとも91%の相同性、少なくとも92%の相同性、少なくとも93%の相同性、少なくとも94%の相同性、少なくとも95%の相同性、少なくとも96%の相同性、少なくとも97%の相同性、少なくとも98%の相同性、または少なくとも99%の相同性を有する軽鎖CDR3配列を含む。
一実施形態では、抗体またはその断片は、配列番号19、29、40、50、60、70、80、90、100、及び110から成る群から選択されるアミノ酸配列と少なくとも80%の相同性、少なくとも81%の相同性、少なくとも82%の相同性、少なくとも83%の相同性、少なくとも84%の相同性、少なくとも85%の相同性、少なくとも86%の相同性、少なくとも87%の相同性、少なくとも88%の相同性、少なくとも89%の相同性、少なくとも90%の相同性、少なくとも91%の相同性、少なくとも92%の相同性、少なくとも93%の相同性、少なくとも94%の相同性、少なくとも95%の相同性、少なくとも96%の相同性、少なくとも97%の相同性、少なくとも98%の相同性、または少なくとも99%の相同性を有する重鎖CDR1配列を含む。
一実施形態では、抗体またはその断片は、配列番号20、30、41、51、61、71、81、91、101、及び111から成る群から選択されるアミノ酸配列と少なくとも80%の相同性、少なくとも81%の相同性、少なくとも82%の相同性、少なくとも83%の相同性、少なくとも84%の相同性、少なくとも85%の相同性、少なくとも86%の相同性、少なくとも87%の相同性、少なくとも88%の相同性、少なくとも89%の相同性、少なくとも90%の相同性、少なくとも91%の相同性、少なくとも92%の相同性、少なくとも93%の相同性、少なくとも94%の相同性、少なくとも95%の相同性、少なくとも96%の相同性、少なくとも97%の相同性、少なくとも98%の相同性、または少なくとも99%の相同性を有する重鎖CDR2配列を含む。
一実施形態では、抗体またはその断片は、配列番号21、31、42、52、62、72、82、92、102、及び112から成る群から選択されるアミノ酸配列と少なくとも80%の相同性、少なくとも81%の相同性、少なくとも82%の相同性、少なくとも83%の相同性、少なくとも84%の相同性、少なくとも85%の相同性、少なくとも86%の相同性、少なくとも87%の相同性、少なくとも88%の相同性、少なくとも89%の相同性、少なくとも90%の相同性、少なくとも91%の相同性、少なくとも92%の相同性、少なくとも93%の相同性、少なくとも94%の相同性、少なくとも95%の相同性、少なくとも96%の相同性、少なくとも97%の相同性、少なくとも98%の相同性、または少なくとも99%の相同性を有する重鎖CDR3配列を含む。一実施形態では、抗体またはその断片は、配列番号24、34、45、55、65、75、85、95、105、及び115から成る群から選択されるアミノ酸配列から成る軽鎖CDR1、配列番号25、35、46、56、66、76、86、96、106、及び116から成る群から選択されるアミノ酸配列から成る軽鎖CDR2、配列番号26、36、47、57、67、77、87、97、107、及び117から成る群から選択されるアミノ酸配列から成る軽鎖CDR3、配列番号19、29、40、50、60、70、80、90、100、及び110から成る群から選択されるアミノ酸配列から成る重鎖CDR1、配列番号20、30、41、51、61、71、81、91、101、及び111から成る群から選択されるアミノ酸配列から成る重鎖CDR2ならびに配列番号21、31、42、52、62、72、82、92、102、及び112から成る群から選択されるアミノ酸配列から成る重鎖CDR3を含む。
一実施形態では、抗体またはその断片はPD−1と結合し、それぞれ配列番号24、25、及び26のアミノ酸配列と少なくとも80%の相同性、少なくとも85%の相同性、少なくとも90%の相同性、少なくとも91%の相同性、少なくとも92%の相同性、少なくとも93%の相同性、少なくとも94%の相同性、少なくとも95%の相同性、少なくとも96%の相同性、少なくとも97%の相同性、少なくとも98%の相同性、または少なくとも99%の相同性を有するアミノ酸配列を含む軽鎖CDR1、CDR2、及びCDR3、ならびにそれぞれ配列番号19、20、及び21のアミノ酸配列と少なくとも80%の相同性、少なくとも85%の相同性、少なくとも90%の相同性、少なくとも91%の相同性、少なくとも92%の相同性、少なくとも93%の相同性、少なくとも94%の相同性、少なくとも95%の相同性、少なくとも96%の相同性、少なくとも97%の相同性、少なくとも98%の相同性、または少なくとも99%の相同性を有するアミノ酸配列を含む重鎖CDR1、CDR2、及びCDR3を含む。さらなる実施形態では、抗体またはその抗体断片は、それぞれ配列番号24、25、及び26の軽鎖CDR1、CDR2、及びCDR3、ならびにそれぞれ配列番号19、20、及び21の重鎖CDR1、CDR2、及びCDR3を含む。
一実施形態では、抗体またはその断片はPD−1と結合し、それぞれ配列番号34、35、及び36のアミノ酸配列と少なくとも80%の相同性、少なくとも85%の相同性、少なくとも90%の相同性、少なくとも91%の相同性、少なくとも92%の相同性、少なくとも93%の相同性、少なくとも94%の相同性、少なくとも95%の相同性、少なくとも96%の相同性、少なくとも97%の相同性、少なくとも98%の相同性、または少なくとも99%の相同性を有するアミノ酸配列を含む軽鎖CDR1、CDR2、及びCDR3;ならびにそれぞれ配列番号29、30、及び31のアミノ酸配列と少なくとも80%の相同性、少なくとも85%の相同性、少なくとも90%の相同性、少なくとも91%の相同性、少なくとも92%の相同性、少なくとも93%の相同性、少なくとも94%の相同性、少なくとも95%の相同性、少なくとも96%の相同性、少なくとも97%の相同性、少なくとも98%の相同性、または少なくとも99%の相同性を有するアミノ酸配列を含む重鎖CDR1、CDR2、及びCDR3を含む。さらなる実施形態では、抗体またはその抗体断片は、それぞれ配列番号34、35、及び36の軽鎖CDR1、CDR2、及びCDR3、ならびにそれぞれ配列番号29、30、及び31の重鎖CDR1、CDR2、及びCDR3を含む。
一実施形態では、抗体またはその断片はPD−1と結合し、それぞれ配列番号45、46、及び47のアミノ酸配列と少なくとも80%の相同性、少なくとも85%の相同性、少なくとも90%の相同性、少なくとも91%の相同性、少なくとも92%の相同性、少なくとも93%の相同性、少なくとも94%の相同性、少なくとも95%の相同性、少なくとも96%の相同性、少なくとも97%の相同性、少なくとも98%の相同性、または少なくとも99%の相同性を有するアミノ酸配列を含む軽鎖CDR1、CDR2、及びCDR3;ならびにそれぞれ配列番号40、41、及び42のアミノ酸配列と少なくとも80%の相同性、少なくとも85%の相同性、少なくとも90%の相同性、少なくとも91%の相同性、少なくとも92%の相同性、少なくとも93%の相同性、少なくとも94%の相同性、少なくとも95%の相同性、少なくとも96%の相同性、少なくとも97%の相同性、少なくとも98%の相同性、または少なくとも99%の相同性を有するアミノ酸配列を含む重鎖CDR1、CDR2、及びCDR3を含む。さらなる実施形態では、抗体またはその抗体断片は、それぞれ配列番号45、46、及び47の軽鎖CDR1、CDR2、及びCDR3、ならびにそれぞれ配列番号40、41、及び42の重鎖CDR1、CDR2、及びCDR3を含む。
一実施形態では、抗体またはその断片はPD−1と結合し、それぞれ配列番号55、56、及び57のアミノ酸配列と少なくとも80%の相同性、少なくとも85%の相同性、少なくとも90%の相同性、少なくとも91%の相同性、少なくとも92%の相同性、少なくとも93%の相同性、少なくとも94%の相同性、少なくとも95%の相同性、少なくとも96%の相同性、少なくとも97%の相同性、少なくとも98%の相同性、または少なくとも99%の相同性を有するアミノ酸配列を含む軽鎖CDR1、CDR2、及びCDR3;ならびにそれぞれ配列番号50、51、及び52のアミノ酸配列と少なくとも80%の相同性、少なくとも85%の相同性、少なくとも90%の相同性、少なくとも91%の相同性、少なくとも92%の相同性、少なくとも93%の相同性、少なくとも94%の相同性、少なくとも95%の相同性、少なくとも96%の相同性、少なくとも97%の相同性、少なくとも98%の相同性、または少なくとも99%の相同性を有するアミノ酸配列を含む重鎖CDR1、CDR2、及びCDR3を含む。さらなる実施形態では、抗体またはその抗体断片は、それぞれ配列番号55、56、及び57の軽鎖CDR1、CDR2、及びCDR3、ならびにそれぞれ配列番号50、51、及び52の重鎖CDR1、CDR2、及びCDR3を含む。
一実施形態では、抗体またはその断片はPD−1と結合し、それぞれ配列番号65、66、及び67のアミノ酸配列と少なくとも80%の相同性、少なくとも85%の相同性、少なくとも90%の相同性、少なくとも91%の相同性、少なくとも92%の相同性、少なくとも93%の相同性、少なくとも94%の相同性、少なくとも95%の相同性、少なくとも96%の相同性、少なくとも97%の相同性、少なくとも98%の相同性、または少なくとも99%の相同性を有するアミノ酸配列を含む軽鎖CDR1、CDR2、及びCDR3;ならびにそれぞれ配列番号60、61、及び62のアミノ酸配列と少なくとも80%の相同性、少なくとも85%の相同性、少なくとも90%の相同性、少なくとも91%の相同性、少なくとも92%の相同性、少なくとも93%の相同性、少なくとも94%の相同性、少なくとも95%の相同性、少なくとも96%の相同性、少なくとも97%の相同性、少なくとも98%の相同性、または少なくとも99%の相同性を有するアミノ酸配列を含む重鎖CDR1、CDR2、及びCDR3を含む。さらなる実施形態では、抗体またはその抗体断片は、それぞれ配列番号65、66、及び67の軽鎖CDR1、CDR2、及びCDR3、ならびにそれぞれ配列番号60、61、及び62の重鎖CDR1、CDR2、及びCDR3を含む。
一実施形態では、抗体またはその断片はPD−1と結合し、それぞれ配列番号75、76、及び77のアミノ酸配列と少なくとも80%の相同性、少なくとも85%の相同性、少なくとも90%の相同性、少なくとも91%の相同性、少なくとも92%の相同性、少なくとも93%の相同性、少なくとも94%の相同性、少なくとも95%の相同性、少なくとも96%の相同性、少なくとも97%の相同性、少なくとも98%の相同性、または少なくとも99%の相同性を有するアミノ酸配列を含む軽鎖CDR1、CDR2、及びCDR3;ならびにそれぞれ配列番号70、71、及び72のアミノ酸配列と少なくとも80%の相同性、少なくとも85%の相同性、少なくとも90%の相同性、少なくとも91%の相同性、少なくとも92%の相同性、少なくとも93%の相同性、少なくとも94%の相同性、少なくとも95%の相同性、少なくとも96%の相同性、少なくとも97%の相同性、少なくとも98%の相同性、または少なくとも99%の相同性を有するアミノ酸配列を含む重鎖CDR1、CDR2、及びCDR3を含む。さらなる実施形態では、抗体またはその抗体断片は、それぞれ配列番号75、76、及び77の軽鎖CDR1、CDR2、及びCDR3、ならびにそれぞれ配列番号70、71、及び72の重鎖CDR1、CDR2、及びCDR3を含む。
一実施形態では、抗体またはその断片はPD−1と結合し、それぞれ配列番号85、86、及び87のアミノ酸配列と少なくとも80%の相同性、少なくとも85%の相同性、少なくとも90%の相同性、少なくとも91%の相同性、少なくとも92%の相同性、少なくとも93%の相同性、少なくとも94%の相同性、少なくとも95%の相同性、少なくとも96%の相同性、少なくとも97%の相同性、少なくとも98%の相同性、または少なくとも99%の相同性を有するアミノ酸配列を含む軽鎖CDR1、CDR2、及びCDR3、ならびにそれぞれ配列番号80、81、及び82のアミノ酸配列と少なくとも80%の相同性、少なくとも85%の相同性、少なくとも90%の相同性、少なくとも91%の相同性、少なくとも92%の相同性、少なくとも93%の相同性、少なくとも94%の相同性、少なくとも95%の相同性、少なくとも96%の相同性、少なくとも97%の相同性、少なくとも98%の相同性、または少なくとも99%の相同性を有するアミノ酸配列を含む重鎖CDR1、CDR2、及びCDR3を含む。さらなる実施形態では、抗体またはその抗体断片は、それぞれ配列番号85、86、及び87の軽鎖CDR1、CDR2、及びCDR3、ならびにそれぞれ配列番号80、81、及び82の重鎖CDR1、CDR2、及びCDR3を含む。
一実施形態では、抗体またはその断片はPD−1と結合し、それぞれ配列番号95、96、及び97のアミノ酸配列と少なくとも80%の相同性、少なくとも85%の相同性、少なくとも90%の相同性、少なくとも91%の相同性、少なくとも92%の相同性、少なくとも93%の相同性、少なくとも94%の相同性、少なくとも95%の相同性、少なくとも96%の相同性、少なくとも97%の相同性、少なくとも98%の相同性、または少なくとも99%の相同性を有するアミノ酸配列を含む軽鎖CDR1、CDR2、及びCDR3;ならびにそれぞれ配列番号90、91、及び92のアミノ酸配列と少なくとも80%の相同性、少なくとも85%の相同性、少なくとも90%の相同性、少なくとも91%の相同性、少なくとも92%の相同性、少なくとも93%の相同性、少なくとも94%の相同性、少なくとも95%の相同性、少なくとも96%の相同性、少なくとも97%の相同性、少なくとも98%の相同性、または少なくとも99%の相同性を有するアミノ酸配列を含む重鎖CDR1、CDR2、及びCDR3を含む。さらなる実施形態では、抗体またはその抗体断片は、それぞれ配列番号95、96、及び97の軽鎖CDR1、CDR2、及びCDR3、ならびにそれぞれ配列番号90、91、及び92の重鎖CDR1、CDR2、及びCDR3を含む。
一実施形態では、抗体またはその断片はPD−1と結合し、それぞれ配列番号105、106、及び107のアミノ酸配列と少なくとも80%の相同性、少なくとも85%の相同性、少なくとも90%の相同性、少なくとも91%の相同性、少なくとも92%の相同性、少なくとも93%の相同性、少なくとも94%の相同性、少なくとも95%の相同性、少なくとも96%の相同性、少なくとも97%の相同性、少なくとも98%の相同性、または少なくとも99%の相同性を有するアミノ酸配列を含む軽鎖CDR1、CDR2、及びCDR3;ならびにそれぞれ配列番号100、101、及び102のアミノ酸配列と少なくとも80%の相同性、少なくとも85%の相同性、少なくとも90%の相同性、少なくとも91%の相同性、少なくとも92%の相同性、少なくとも93%の相同性、少なくとも94%の相同性、少なくとも95%の相同性、少なくとも96%の相同性、少なくとも97%の相同性、少なくとも98%の相同性、または少なくとも99%の相同性を有するアミノ酸配列を含む重鎖CDR1、CDR2、及びCDR3を含む。さらなる実施形態では、抗体またはその抗体断片は、それぞれ配列番号105、106、及び107の軽鎖CDR1、CDR2、及びCDR3、ならびにそれぞれ配列番号100、101、及び102の重鎖CDR1、CDR2、及びCDR3を含む。
一実施形態では、抗体またはその断片はPD−1と結合し、それぞれ配列番号115、116、及び117のアミノ酸配列と少なくとも80%の相同性、少なくとも85%の相同性、少なくとも90%の相同性、少なくとも91%の相同性、少なくとも92%の相同性、少なくとも93%の相同性、少なくとも94%の相同性、少なくとも95%の相同性、少なくとも96%の相同性、少なくとも97%の相同性、少なくとも98%の相同性、または少なくとも99%の相同性を有するアミノ酸配列を含む軽鎖CDR1、CDR2、及びCDR3;ならびにそれぞれ配列番号110、111、及び112のアミノ酸配列と少なくとも80%の相同性、少なくとも85%の相同性、少なくとも90%の相同性、少なくとも91%の相同性、少なくとも92%の相同性、少なくとも93%の相同性、少なくとも94%の相同性、少なくとも95%の相同性、少なくとも96%の相同性、少なくとも97%の相同性、少なくとも98%の相同性、または少なくとも99%の相同性を有するアミノ酸配列を含む重鎖CDR1、CDR2、及びCDR3を含む。さらなる実施形態では、抗体またはその抗体断片は、それぞれ配列番号115、116、117の軽鎖CDR1、CDR2、及びCDR3、ならびにそれぞれ配列番号110、111、及び112の重鎖CDR1、CDR2、及びCDR3を含む。
一実施形態では、抗体またはその断片はPD−1と結合し、配列番号23、33、44、54、64、74、84、94、104、114、133、143、及び152から成る群から選択されるアミノ酸配列と少なくとも80%の相同性、少なくとも85%の相同性、少なくとも90%の相同性、少なくとも91%の相同性、少なくとも92%の相同性、少なくとも93%の相同性、少なくとも94%の相同性、少なくとも95%の相同性、少なくとも96%の相同性、少なくとも97%の相同性、少なくとも98%の相同性、または少なくとも99%の相同性を有するアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域;ならびに配列番号18、28、39、49、59、69、79、89、99、109、131、及び141から成る群から選択されるアミノ酸配列と少なくとも80%の相同性、少なくとも85%の相同性、少なくとも90%の相同性、少なくとも91%の相同性、少なくとも92%の相同性、少なくとも93%の相同性、少なくとも94%の相同性、少なくとも95%の相同性、少なくとも96%の相同性、少なくとも97%の相同性、少なくとも98%の相同性、または少なくとも99%の相同性を有するアミノ酸配列を含む重鎖可変領域を含む。さらなる実施形態では、単離された抗体またはその断片はPD−1と結合し、配列番号23、33、44、54、64、74、84、94、104、114、133、143、及び152から成る群から選択されるアミノ酸配列を含む、そのアミノ酸配列から本質的に成る、またはそのアミノ酸配列から成る軽鎖可変領域、ならびに配列番号18、28、39、49、59、69、79、89、99、109、131、及び141から成る群から選択されるアミノ酸配列を含む、そのアミノ酸配列から本質的に成る、またはそのアミノ酸配列から成る重鎖可変領域を含む。
一実施形態では、本発明は、10D1、4C10、7D3、13F1、15H5、14A6、22A5、6E1、5A8、7A4、及び7A4Dから成る群から選択される抗体の可変軽鎖ならびに10D1、4C10、7D3、13F1、15H5、14A6、22A5、6E1、5A8、及び7A4から成る群から選択される抗体の可変重鎖を含む抗PD−1抗体を提供する。したがって、一実施形態では、本発明は、配列番号23を含む軽鎖可変領域及び配列番号18を含む重鎖可変領域、配列番号33を含む軽鎖可変領域及び配列番号28を含む重鎖可変領域、配列番号44を含む軽鎖可変領域及び配列番号39を含む重鎖可変領域、配列番号54を含む軽鎖可変領域及び配列番号49を含む重鎖可変領域、配列番号64を含む軽鎖可変領域及び配列番号59を含む重鎖可変領域、配列番号74を含む軽鎖可変領域及び配列番号69を含む重鎖可変領域、配列番号84を含む軽鎖可変領域及び配列番号79を含む重鎖可変領域、配列番号94を含む軽鎖可変領域及び配列番号89を含む重鎖可変領域、配列番号104を含む軽鎖可変領域及び配列番号99を含む重鎖可変領域、配列番号114を含む軽鎖可変領域及び配列番号109を含む重鎖可変領域、配列番号133を含む軽鎖可変領域及び配列番号131を含む重鎖可変領域、配列番号143を含む軽鎖可変領域及び配列番号141を含む重鎖可変領域、または配列番号152を含む軽鎖可変領域及び配列番号131を含む重鎖可変領域を含む抗体またはその断片を提供する。
一実施形態では、本発明はキメラ抗PD−1抗体を提供し、この抗体は、配列番号119、121、125、及び127から成る群から選択されるアミノ酸配列と少なくとも80%の相同性、少なくとも85%の相同性、少なくとも90%の相同性、少なくとも91%の相同性、少なくとも92%の相同性、少なくとも93%の相同性、少なくとも94%の相同性、少なくとも95%の相同性、少なくとも96%の相同性、少なくとも97%の相同性、少なくとも98%の相同性、または少なくとも99%の相同性を有するアミノ酸配列を有する重鎖;ならびに配列番号123及び129から成る群から選択されるアミノ酸配列と少なくとも80%の相同性、少なくとも85%の相同性、少なくとも90%の相同性、少なくとも91%の相同性、少なくとも92%の相同性、少なくとも93%の相同性、少なくとも94%の相同性、少なくとも95%の相同性、少なくとも96%の相同性、少なくとも97%の相同性、少なくとも98%の相同性、または少なくとも99%の相同性を有するアミノ酸配列を有する軽鎖を含む。
一実施形態では、本発明はヒト化抗PD−1抗体を提供し、この抗体は、配列番号131及び141から成る群から選択されるアミノ酸配列と少なくとも80%の相同性、少なくとも85%の相同性、少なくとも90%の相同性、少なくとも91%の相同性、少なくとも92%の相同性、少なくとも93%の相同性、少なくとも94%の相同性、少なくとも95%の相同性、少なくとも96%の相同性、少なくとも97%の相同性、少なくとも98%の相同性、または少なくとも99%の相同性を有するアミノ酸配列を有する重鎖可変領域を含む。別の実施形態では、本発明はヒト化抗PD−1抗体を提供し、この抗体は、配列番号133、143及び152から成る群から選択されるアミノ酸配列と少なくとも80%の相同性、少なくとも85%の相同性、少なくとも90%の相同性、少なくとも91%の相同性、少なくとも92%の相同性、少なくとも93%の相同性、少なくとも94%の相同性、少なくとも95%の相同性、少なくとも96%の相同性、少なくとも97%の相同性、少なくとも98%の相同性、または少なくとも99%の相同性を有するアミノ酸配列を有する軽鎖可変領域を含む。
別の実施形態では、本発明はヒト化抗PD−1抗体を提供し、この抗体は、配列番号131と少なくとも80%の相同性、少なくとも85%の相同性、少なくとも90%の相同性、少なくとも91%の相同性、少なくとも92%の相同性、少なくとも93%の相同性、少なくとも94%の相同性、少なくとも95%の相同性、少なくとも96%の相同性、少なくとも97%の相同性、少なくとも98%の相同性、または少なくとも99%の相同性を有する重鎖可変領域及び配列番号133または152と少なくとも80%の相同性、少なくとも85%の相同性、少なくとも90%の相同性、少なくとも91%の相同性、少なくとも92%の相同性、少なくとも93%の相同性、少なくとも94%の相同性、少なくとも95%の相同性、少なくとも96%の相同性、少なくとも97%の相同性、少なくとも98%の相同性、または少なくとも99%の相同性を有する軽鎖可変領域を含む。別の実施形態では、本発明はヒト化抗PD−1抗体を提供し、この抗体は、配列番号141と少なくとも80%の相同性、少なくとも85%の相同性、少なくとも90%の相同性、少なくとも91%の相同性、少なくとも92%の相同性、少なくとも93%の相同性、少なくとも94%の相同性、少なくとも95%の相同性、少なくとも96%の相同性、少なくとも97%の相同性、少なくとも98%の相同性、または少なくとも99%の相同性を有する重鎖可変領域及び配列番号143と少なくとも80%の相同性、少なくとも85%の相同性、少なくとも90%の相同性、少なくとも91%の相同性、少なくとも92%の相同性、少なくとも93%の相同性、少なくとも94%の相同性、少なくとも95%の相同性、少なくとも96%の相同性、少なくとも97%の相同性、少なくとも98%の相同性、または少なくとも99%の相同性を有する軽鎖可変領域を含む。
一実施形態では、本発明はヒト化抗PD−1抗体を提供し、この抗体は、配列番号135、137、145、及び147から成る群から選択されるアミノ酸配列と少なくとも80%の相同性、少なくとも85%の相同性、少なくとも90%の相同性、少なくとも91%の相同性、少なくとも92%の相同性、少なくとも93%の相同性、少なくとも94%の相同性、少なくとも95%の相同性、少なくとも96%の相同性、少なくとも97%の相同性、少なくとも98%の相同性、または少なくとも99%の相同性を有するアミノ酸配列を有する完全重鎖を含む。別の実施形態では、本発明はヒト化抗PD−1抗体を提供し、この抗体は、配列番号139、149、及び153から成る群から選択されるアミノ酸配列と少なくとも80%の相同性、少なくとも85%の相同性、少なくとも90%の相同性、少なくとも91%の相同性、少なくとも92%の相同性、少なくとも93%の相同性、少なくとも94%の相同性、少なくとも95%の相同性、少なくとも96%の相同性、少なくとも97%の相同性、少なくとも98%の相同性、または少なくとも99%の相同性を有するアミノ酸配列を有する完全軽鎖を含む。
一実施形態では、本発明はヒト化抗PD−1抗体を提供し、この抗体は、配列番号135の重鎖及び配列番号139の軽鎖を含む。別の実施形態では、本発明はヒト化抗PD−1抗体を提供し、この抗体は、配列番号137の重鎖及び配列番号139の軽鎖を含む。別の実施形態では、本発明はヒト化抗PD−1抗体を提供し、この抗体は、配列番号135の重鎖及び配列番号153の軽鎖を含む。別の実施形態では、本発明はヒト化抗PD−1抗体を提供し、この抗体は、配列番号137の重鎖及び配列番号153の軽鎖を含む。別の実施形態では、本発明はヒト化抗PD−1抗体を提供し、この抗体は、配列番号145の重鎖及び配列番号149の軽鎖を含む。別の実施形態では、本発明はヒト化抗PD−1抗体を提供し、この抗体は、配列番号147の重鎖及び配列番号149の軽鎖を含む。一実施形態では、本発明は、本明細書で提供される例示的な抗体のいずれかと、PD−1上の同じエピトープに結合する抗PD−1抗体またはその断片を提供する。一実施形態では、抗体またはその断片は、PD−1への結合について本明細書で提供される例示的な抗体のいずれかと競合する。PD−1への結合は、ELISA、フローサイトメトリー、表面プラズモン共鳴(SPR)アッセイ、または当該技術分野において既知の、任意のその他の方法により測定されてもよい。
一実施形態では、本発明は、約1nM〜約0.01nMの親和性でPD−1に結合する抗PD−1抗体及びその断片を提供する。さらなる実施形態では、本明細書で提供される抗PD−1抗体及びその断片は、約0.5nM〜約0.1nMの親和性でPD−1に結合する。別の実施形態では、本明細書で提供される抗PD−1抗体及びその断片は、約1nM以下の親和性でPD−1に結合する。さらなる実施形態では、本明細書で提供される抗PD−1抗体及びその断片は、約0.75nM以下の親和性でPD−1に結合する。さらなる実施形態では、本明細書で提供される抗PD−1抗体及びその断片は、約0.5nM以下の親和性でPD−1に結合する。さらなる実施形態では、本明細書で提供される抗PD−1抗体及びその断片は、約0.25nM以下の親和性でPD−1に結合する。さらなる実施形態では、本明細書で提供される抗PD−1抗体及びその断片は、約0.2nM以下の親和性でPD−1に結合する。さらなる実施形態では、本明細書で提供される抗PD−1抗体及びその断片は、約0.15nM以下の親和性でPD−1に結合する。さらなる実施形態では、本明細書で提供される抗PD−1抗体及びその断片は、約0.1nM以下の親和性でPD−1に結合する。さらなる実施形態では、本明細書で提供される抗PD−1抗体及びその断片は、約0.075nM以下の親和性でPD−1に結合する。さらなる実施形態では、本明細書で提供される抗PD−1抗体及びその断片は、約0.05nM以下の親和性でPD−1に結合する。さらなる実施形態では、本明細書で提供される抗PD−1抗体及びその断片は、約0.025nM以下の親和性でPD−1に結合する。さらなる実施形態では、本明細書で提供される抗PD−1抗体及びその断片は、約0.02nM以下の親和性でPD−1に結合する。さらなる実施形態では、本明細書で提供される抗PD−1抗体及びその断片は、約0.015nM以下の親和性でPD−1に結合する。さらなる実施形態では、本明細書で提供される抗PD−1抗体及びその断片は、約0.01nM以下の親和性でPD−1に結合する。さらなる実施形態では、本明細書で提供される抗PD−1抗体及びその断片は、約0.0075以下の親和性でPD−1に結合する。さらなる実施形態では、本明細書で提供される抗PD−1抗体及びその断片は、約0.005以下の親和性でPD−1に結合する。
一実施形態では、本明細書で提供される抗PD−1抗体及びその断片は、PD−1に対して約1ng/mL〜約2000ng/mLの結合EC50を有する。さらなる実施形態では、本明細書で提供される抗PD−1抗体及びその断片は、PD−1に対して約1ng/mL〜約1500ng/mLの結合EC50を有する。さらなる実施形態では、本明細書で提供される抗PD−1抗体及びその断片は、PD−1に対して約1ng/mL〜約1000ng/mLの結合EC50を有する。さらなる実施形態では、本明細書で提供される抗PD−1抗体及びその断片は、PD−1に対して約2ng/mL〜約500ng/mLの結合EC50を有する。さらなる実施形態では、本明細書で提供される抗PD−1抗体及びその断片は、PD−1に対して約2ng/mL〜約200ng/mLの結合EC50を有する。さらなる実施形態では、本明細書で提供される抗PD−1抗体及びその断片は、PD−1に対して約5ng/mL〜約100ng/mLの結合EC50を有する。さらなる実施形態では、本明細書で提供される抗PD−1抗体及びその断片は、PD−1に対して約5ng/mL〜約50ng/mLの結合EC50を有する。一実施形態では、本明細書で提供される抗PD−1抗体及びその断片は、PD−1に対して約500ng/mL以下、約400ng/mL以下、約300ng/mL以下、約250ng/mL以下、約200ng/mL以下、約150ng/mL以下、約100ng/mL以下、約75ng/mL以下、約60ng/mL以下、約50ng/mL以下、約40ng/mL以下、または約30ng/mL以下の結合EC50を有する。
一実施形態では、本明細書で提供される抗PD−1抗体及びその断片は、約1ng/mL〜約1000ng/mLのIC50でPD−L1結合を阻害する。さらなる実施形態では、本明細書で提供される抗PD−1抗体及びその断片は、約2ng/mL〜約800ng/mLのIC50でPD−L1結合を阻害する。さらなる実施形態では、本明細書で提供される抗PD−1抗体及びその断片は、約5ng/mL〜約500ng/mLのIC50でPD−L1結合を阻害する。さらなる実施形態では、本明細書で提供される抗PD−1抗体及びその断片は、約5ng/mL〜約100ng/mLのIC50でPD−L1結合を阻害する。さらなる実施形態では、本明細書で提供される抗PD−1抗体及びその断片は、約10ng/mL〜約50ng/mLのIC50でPD−L1結合を阻害する。一実施形態では、本明細書で提供される抗PD−1抗体及びその断片は、約800ng/mL以下、約400ng/mL以下、約300ng/mL以下、約250ng/mL以下、約200ng/mL以下、約150ng/mL以下、約100ng/mL以下、約75ng/mL以下、約60ng/mL以下、約50ng/mL以下、約40ng/mL以下、または約30ng/mL以下のIC50でPD−L1結合を阻害する。
一実施形態では、本明細書で提供される抗PD−1抗体は、配列番号133の軽鎖可変領域アミノ酸配列及び配列番号131の重鎖可変領域アミノ酸を有する、または配列番号143の軽鎖可変領域アミノ酸配列及び配列番号141の重鎖可変領域アミノ酸配列を有する、または配列番号152の軽鎖可変領域アミノ酸配列及び配列番号131の重鎖可変領域アミノ酸配列を有するヒト化抗体であり、この抗PD−1抗体は、ELISAまたはFACSによって測定されるように、約200ng/ml以下または約150ng/mL以下または約100ng/mL以下または約80ng/ml以下または約60ng/mL以下のPD−1結合EC50を有する。別の実施形態では、本明細書で提供される抗PD−1抗体は、配列番号133の軽鎖可変領域アミノ酸配列及び配列番号131の重鎖可変領域アミノ酸を有する、または配列番号143の軽鎖可変領域アミノ酸配列及び配列番号141の重鎖可変領域アミノ酸配列を有する、または配列番号152の軽鎖可変領域アミノ酸配列及び配列番号131の重鎖可変領域アミノ酸配列を有するヒト化抗体であり、この抗PD−1抗体は、ELISAまたはFACSによって測定されるように、約1000ng/mL以下、または約800ng/mL以下、または約600ng/mL以下、または約500ng/mL以下、または約400ng/mL以下、または約300ng/mL以下、または約200ng/mL以下、または約100ng/mL以下、または約60ng/mL以下、または約30ng/mL以下、または約25ng/mL以下、または約20ng/mL以下、または約10ng/mL以下のPD−L1妨害IC50を有する。別の実施形態では、本明細書で提供される抗PD−1抗体は、配列番号133の軽鎖可変領域アミノ酸配列及び配列番号131の重鎖可変領域アミノ酸を有する、または配列番号143の軽鎖可変領域アミノ酸配列及び配列番号141の重鎖可変領域アミノ酸配列を有する、または配列番号152の軽鎖可変領域アミノ酸配列及び配列番号131の重鎖可変領域アミノ酸配列を有するヒト化抗体であり、この抗PD−1抗体は、PD−1に対して約1nM以下、または約0.5nM以下、または約0.1nM以下、または約0.05nM以下の親和性を有する。特定の実施形態では、ヒト化抗PD−1抗体は、PD−1に対して約0.1nMの親和性を有する。
一実施形態では、提供される抗PD−1抗体及びその断片は、T細胞上のPD−1に結合し、PD−1/PD−L1相互作用を妨げ、T細胞活性化の増加をもたらす。さらなる実施形態では、抗体及びその断片はPD−1と結合し、T細胞増殖及び/またはサイトカイン産生の増加をもたらす。またさらなる実施形態では、抗体及びその断片はPD−1と結合し、IL−2、IFNγ、TNF、IL−1、IL−4、IL−5、IL−6、IL−12、IL−13、IL−17、及びGM−CSFから成る群から選択される1種以上のサイトカインの増加をもたらす。したがって、一態様では、本発明は、T細胞を抗PD−1抗体またはその断片と接触させることを含む、免疫応答を調節する方法を提供する。一実施形態では、本明細書で提供される抗PD−1抗体及び断片による免疫応答の調節は、混合リンパ球(MLR)反応で測定されてもよい。一実施形態では、本明細書で提供される抗PD−1抗体は、MLRにおけるリンパ球からのサイトカイン産生レベルを増加させる。さらなる実施形態では、抗PD−1抗体は、MLRにおけるIL−2産生及び/またはIFNγ産生レベルを増加させる。またさらなる実施形態では、抗PD−1抗体は、MLRにおけるIL−2産生及びIFNγ産生レベルを増加させる。一実施形態では、抗PD−1抗体は、メモリーT細胞応答を増強する。さらなる実施形態では、抗PD−1抗体は、メモリーT細胞からのIFNγ産生の増加によって測定されるように、メモリーT細胞応答を増強する。
一実施形態では、本明細書で提供される抗PD−1抗体及びその断片は、制御性T細胞機能を阻害する。さらなる実施形態では、抗PD−1抗体及びその断片は、制御性T細胞によるエフェクターT細胞の抑制を阻害する。別の実施形態では、抗PD−1抗体及びその断片は、制御性T細胞の存在下で、T細胞のエフェクター機能を回復させる。さらなる実施形態では、抗PD−1抗体及びその断片は、制御性T細胞の存在下で、エフェクターT細胞が増殖する及び/またはサイトカインを産生する能力を回復させる。したがって、一実施形態では、本発明は、インビトロまたは制御性T細胞の抑制効果の阻害を必要とする対象において、制御性T細胞の抑制効果を阻害する方法を提供する。
一態様では、PD−1に結合する単離された抗体またはその断片が提供され、この抗体は、本明細書で10D1、4C10、7D3、13F1、15H5、14A6、22A5、6E1、5A8、7A4、及び7A4Dと称されるハイブリドーマから成る群から選択されるハイブリドーマによって産生される。したがって、本発明はまた、ハイブリドーマ10D1、4C10、7D3、13F1、15H5、14A6、22A5、6E1、5A8、7A4、及び7A4D、加えて本明細書で開示される抗体を産生する任意のハイブリドーマを包含する。本発明はまた、本明細書で提供される抗体及びその断片をコードする単離されたポリヌクレオチドを提供する。単離されたポリヌクレオチドを含む発現ベクター、及びこのような発現ベクターを含む宿主細胞もまた、本発明に包含される。
一実施形態では、本発明は、抗PD−1抗体免疫複合体を提供する。したがって、本発明は、PD−1に結合し、かつ治療剤に連結される、または治療剤と複合体化される抗体またはその断片を提供する。抗PD−1抗体に連結されてもよい、または抗PD−1抗体と複合体化されてもよい治療剤としては、細胞傷害性薬物、放射性同位体、免疫調節剤、または抗体を挙げ得るが、これらに限定されない。
一態様では、本発明は、本明細書で提供される1種または複数種の抗PD−1抗体またはその断片、及び薬学的に許容される担体を含む組成物を提供する。
一態様では、本発明は、対象の免疫応答を調節する方法を提供し、この方法は、対象に治療有効量の本明細書で提供される抗PD−1抗体またはその断片を投与することを含む。一実施形態では、本発明は、疾患または障害の処置または予防を必要とする対象の疾患または障害を処置または予防する方法を提供し、この方法は、対象に治療有効量の本明細書で提供される抗PD−1抗体またはその断片を投与することを含む。
一実施形態では、本発明は、抗腫瘍応答の増強を必要とする対象の抗腫瘍応答を増強する方法を提供し、この方法は、対象に治療有効量の本発明の抗PD−1抗体または断片を投与することを含む。別の実施形態では、本発明は、腫瘍の減少または腫瘍細胞の成長阻害を必要とする対象の腫瘍を減少させる方法または腫瘍細胞の成長を阻害する方法を提供し、この方法は、対象に治療有効量の本発明の抗PD−1抗体または断片を投与することを含む。別の実施形態では、本発明は、癌の処置を必要とする対象の癌を処置する方法を提供し、この方法は、対象に治療有効量の本発明の抗PD−1抗体または断片を投与することを含む。さらなる実施形態では、癌は、リンパ腫、白血病、黒色腫、神経膠腫、乳癌、肺癌、結腸癌、骨癌、卵巣癌、膀胱癌、腎臓癌、肝臓癌、胃癌、直腸癌、精巣癌、唾液腺癌、甲状腺癌、胸腺癌、上皮癌、頭頸部癌、胃の癌、膵臓癌、またはこれらの組み合わせから成る群から選択される。
一実施形態では、本発明は、感染症の処置を必要とする対象の感染症を処置する方法を提供し、この方法は、対象に治療有効量の本発明の抗PD−1抗体または断片を投与することを含む。さらなる実施形態では、感染症は、カンジダ症、カンジダ血症、アスペルギルス症、連鎖球菌性肺炎、連鎖球菌性の皮膚及び口咽頭の状態、グラム陰性菌による敗血症、結核、単核球症、インフルエンザ、呼吸器合胞体ウイルスにより引き起こされる呼吸器病、マラリア、住血吸虫症、ならびにトリパノソーマ症から成る群から選択される。
図1A及び図1Bは、FACSにより測定された、PD−1に対するPD−1リガンドPD−L1及びPD−L2結合の、マウス抗PD−1抗体による妨害を示すグラフである。図1Aは、マウス抗PD−1抗体によるPD−L1の結合の妨害を示す。図1A及び図1Bの上部パネルは、抗体濃度の範囲にわたるMFIを示す。抗PD−1抗体の妨害IC50を、図1A及び図1Bの下部パネルに示す。 図1A及び図1Bは、FACSにより測定された、PD−1に対するPD−1リガンドPD−L1及びPD−L2結合の、マウス抗PD−1抗体による妨害を示すグラフである。図1Bは、マウス抗PD−1抗体によるPD−L2の結合の妨害を示す。図1A及び図1Bの上部パネルは、抗体濃度の範囲にわたるMFIを示す。抗PD−1抗体の妨害IC50を、図1A及び図1Bの下部パネルに示す。 異なる濃度のマウス抗PD−1抗体に応答した、MLRにおけるIL−2(pg/mL)産生を示すグラフである。試験した抗PD−1抗体は、左から右へ、対照mIgG1、22A5−mIgG1、6E1−mIgG1、10D1−mIgG1、4C10−mIgG1、7D3−mIgG1、13F1−mIgG1、14A6−mIgG1、15H5−mIgG1、5A8−mIgG1、及び7A4−mIgG1であった。x軸に示されるように、各抗体は、20μg/mL、2μg/mL、0.2μg/mL、0.02μg/mL、及び0.002μg/mLで試験した。 異なる濃度のマウス抗PD−1抗体に応答した、MLRにおけるIFN−γ(pg/mL)産生を示すグラフである。試験した抗PD−1抗体は、左から右へ、対照mIgG1、22A5−mIgG1、6E1−mIgG1、10D1−mIgG1、4C10−mIgG1、7D3−mIgG1、13F1−mIgG1、14A6−mIgG1、15H5−mIgG1、5A8−mIgG1、及び7A4−mIgG1であった。x軸に示されるように、各抗体は、20μg/mL、2μg/mL、0.2μg/mL、0.02μg/mL、及び0.002μg/mLで試験した。 異なる濃度のキメラ抗PD−1抗体に応答した、MLRにおけるIL−2(pg/mL)産生を示すグラフである。試験したキメラ抗PD−1抗体は、左から右へ、対照hIgG4、キメラ4C10−hIgG4、キメラ6E1−hIgG4、キメラ7A4−hIgG4、キメラ13F1−hIgG4、キメラ15H5−hIgG4、キメラ22A5−hIgG4、及びキメラ7D3−hIgG4であった。x軸に示されるように、各抗体は、20μg/mL、2μg/mL、0.2μg/mL、0.02μg/mL、及び0.002μg/mLで試験した。 異なる濃度のキメラ抗PD−1抗体に応答した、MLRにおけるIFN−γ(pg/mL)産生を示すグラフである。試験したキメラ抗PD−1抗体は、左から右へ、対照hIgG4、キメラ4C10−hIgG4、キメラ6E1−hIgG4、キメラ7A4−hIgG4、キメラ13F1−hIgG4、キメラ15H5−hIgG4、キメラ22A5−hIgG4、及びキメラ7D3−hIgG4であった。x軸に示されるように、各抗体は、20μg/mL、2μg/mL、0.2μg/mL、0.02μg/mL、及び0.002μg/mLで試験した。 ELISAにより測定された、ヒト化13F1(図6A)抗PD−1抗体及びヒト化7A4(図6B)抗PD−1抗体の結合EC50を示す。図6Aの上部パネルは、キメラ13F1、ヒト化13F1−hIgG1(h13F1−IgG1)、ヒト化13F1−hIgG4(h13F1−IgG4)、または対照hIgG4の濃度の範囲にわたる吸光度を示す。図6Aの下部パネルは、試験抗体の各々の計算されたEC50を示す。図6Bの上部パネルは、キメラ7A4−hIgG1、キメラ7A4−hIgG4、ヒト化784−hIgG1(h7A4hIgG1)、ヒト化7A4−hIgG4(h7A4hIgG4)、または対照hIgG4の濃度の範囲にわたる吸光度を示す。図6Bの下部パネルは、試験抗体の各々の計算されたEC50を示す。 FACSにより測定された、ヒト化13F1(図7A)抗PD−1抗体及びヒト化7A4(図7B)抗PD−1抗体の結合EC50を示す。図7Aの上部パネルは、対照hIgG4、キメラ13F1−hIgG4、ヒト化13F1−hIgG1(h13F1−hIgG1)、またはヒト化13F1−hIgG4(h13F1−hIgG4)の濃度の範囲にわたる平均蛍光強度(MFI)を示す。図7Aの下部パネルは、試験抗体の各々の計算されたEC50を示す。図7Bの上部パネルは、対照hIgG4、キメラ7A4−hIgG4、キメラ7A4−キメラ−IgG1、ヒト化7A4−IgG4(h7A4−hIgG4)、またはヒト化7A4−IgG1(h7A4−hIgG1)の濃度の範囲にわたるMFIを示す。図7Bの下部パネルは、試験抗体の各々の計算されたEC50を示す。 ELISAにより測定された、ヒト化13F1(図8A)抗PD−1抗体及びヒト化7A4(図8B)抗PD−1抗体によるPD−L1結合の妨害を示す。図8Aは、対照hIgG4、キメラ13F1、ヒト化13F1−hIgG1、またはヒト化13F1−hIgG4の濃度の範囲にわたる吸光度を示す。図8Bは、対照hIgG4、キメラ7A4−hIgG1、キメラ7A4−hIgG4、ヒト化784−hIgG1またはヒト化7A4−hIgG4の濃度の範囲にわたる吸光度を示す。図8Cは、キメラ及びヒト化13F1及び7A4抗体の計算されたPD−L1妨害IC50を示す。 FACSにより測定された、ヒト化13F1及び7A4抗体によるPD−L1結合の妨害を示す。図9の上部パネルは、抗体濃度の範囲にわたるMFIを示す。ヒト化抗体の妨害IC50を、図9の下部パネルに示す。 Biacoreアッセイにより測定された、PD−1ヒト化モノクローナル抗体のh13F1(左上パネル)及びh7A4(右上パネル)の結合データを示す。下部パネルは、Biacoreアッセイにより測定された、定量化結合データを提供する。 次の濃度:20μg/mL、2μg/mL、0.2μg/mL、0.02μg/mL、及び0.002μg/mLでの対照hIgG4、マウス13F1−mIgG1(13F1−mIgG1)、ヒト化13F1−hIgG1、ヒト化13F1−hIgG4、またはキメラ7A4−hIgG4の存在下で、MLR反応におけるIL−2産生(pg/mL)を示すグラフである。 次の濃度:20μg/mL、2μg/mL、0.2μg/mL、0.02μg/mL、及び0.002μg/mLでの対照hIgG4、マウス13F1−mIgG1(13F1−mIgG1)、ヒト化13F1−hIgG1、ヒト化13F1−hIgG4、またはキメラ7A4−hIgG4の存在下で、MLR反応におけるIFN−γ産生(pg/mL)を示すグラフである。 次の濃度:20μg/mL、2μg/mL、0.2μg/mL、0.02μg/mL、及び0.002μg/mLでの対照hIgG4、キメラ7A4−hIgG1、キメラ7A4−hIgG4、ヒト化7A4−hIgG1、またはヒト化7A4−hIgG4の存在下で、MLR反応におけるIL−2産生(pg/mL)を示すグラフである。 次の濃度:20μg/mL、2μg/mL、0.2μg/mL、0.02μg/mL、及び0.002μg/mLでの対照hIgG4、キメラ7A4−hIgG1、キメラ7A4−hIgG4、ヒト化7A4−hIgG1、またはヒト化7A4−hIgG4の存在下で、MLR反応におけるIFN−γ産生(pg/mL)を示すグラフである。 IFN−γ産生(pg/mL)により測定された、破傷風毒素によりリコールされたメモリーT細胞応答に対するヒト化抗PD−1抗体の効果を示す。陰性対照hIgG4抗体、ヒト化13F1−hIgG1抗体、ヒト化13F1−hIgG4抗体、ヒト化7A4−hIgG1抗体、及びヒト化7A4−hIgG4抗体を、次の濃度:20μg/mL、2μg/mL、0.2μg/mL、0.02μg/mL、及び0.002μg/mLで試験した。 10μg/mlのヒト化抗PD−1抗体(h13F1−hIgG1、h13F1−hIgG4、h7A4−hIgG1、またはh7A4−hIgG4)、アイソタイプ対照(hIgG4)抗体の存在下で、または抗体なしで、自己DC及び抗CD3抗体による同時刺激に応答したT細胞からのIFN−γ産生(pg/mL)を示す。 図17A及び図17Bは、PD−1ヒト化モノクローナル抗体のh7A4及びh7A4DについてのBiacoreに基づく結合(図17A)及びFACSに基づく妨害(図17B)のデータを示す。図17Aについて、左上はh7A4を示し、右上は7A4Dを示しており、図17Aの下部パネルは、Biacore分析により測定された定量化結合データを提供する。図17Bは、7A4D−hIgG4抗体による、293T−PD1細胞に対するPD−L1の結合の妨害IC50を示す。 次の濃度:20μg/mL、2μg/mL、0.2μg/mL、0.02μg/mL、及び0.002μg/mLでの対照hIgG4、ヒト化7A4−hIgG4、またはヒト化7A4D−hIgG4の存在下で、MLR反応におけるIL−2産生(pg/mL)を示すグラフである。 次の濃度:20μg/mL、2μg/mL、0.2μg/mL、0.02μg/mL、及び0.002μg/mLでの対照hIgG4、ヒト化7A4−hIgG4、またはヒト化7A4D−hIgG4の存在下で、MLR反応におけるIFN−γ産生(pg/mL)を示すグラフである。
詳細な説明
プログラム死受容体1(PD−1)は、免疫系のチェックポイント受容体である。PD−1は、主として活性化T細胞及びB細胞上で発現され、単球ならびに胸腺発達中にCD4−CD8−ダブルネガティブT細胞及びNK−T細胞上にも生じる(上記のAgata et al.,Okazaki et al.(2002)Curr.Opin.Immunol.14:391779−82;Bennett et al.(2003)J Immunol 170:711−8)。PD−1は、2つのリガンド、すなわちPD−L1及びPD−L2を有する。PD−1と2つのリガンドのいずれかとの相互作用は、インビトロ及びインビボでT細胞応答を減弱させることが示されているが、これはPD−1とPD−L1との局所的相互作用を阻害することにより反転され得、その効果は、PD−1とPD−L2との相互作用も同様にブロックされる場合、相加的である(Iwai et al.(2002)Proc.Nat’l.Acad Sci.USA 99:12293−7;Brown et al.(2003)J.Immunol.170:1257−66)。
PD−1は、効率的な免疫破壊から腫瘍細胞を保護するというその役割により、癌の成長及び発症と相関を有することが見出されている。そのリガンド、すなわちPD−L1は、多数のマウス及びヒト腫瘍上で有意な発現を有することが明らかとなり、これは免疫回避を媒介すると仮定されている(Iwai,Y.et al.,Proc.Natl.Acad.Sci.USA.99:12293−12297(2002);Strome S.E.et al.,Cancer Res.,63:6501−6505(2003);Dong et al.(2002)Nat.Med.8:787−9)。ヒトでは、(腫瘍浸潤リンパ球上の)PD−1及び/または(腫瘍細胞上の)PD−L1の発現は、免疫組織化学によって評価されるような多数の原発腫瘍生検で見出されている。このような組織としては、肺、肝臓、卵巣、子宮頸部、皮膚、結腸、神経膠腫、膀胱、乳房、腎臓、食道、胃、口腔扁平上皮細胞、尿路上皮細胞、及び膵臓の癌に加えて頭頸部の腫瘍が挙げられる(Brown J.A.et al.,J.Immunol.170:1257−1266(2003);Dong H.et al.,Nat.Med.8:793−800(2002);Wintterle et al.,Cancer Res.63:7462−7467(2003);Strome S.E.et al.,Cancer Res.,63:6501−6505(2003);Thompson R.H.et al.,Cancer Res.66:3381−5(2006);Thompson et al.,Clin.Cancer Res.13:1757−61(2007);Nomi T.et al.,Clin.Cancer Res.13:2151−7.(2007))。より著しくは、腫瘍細胞上でのPD−1リガンド発現は、複数の腫瘍型にわたって癌患者の予後不良と相関している(OkaZaki and Honjo,Int.Immunol.19:813−824(2007)で概説されている)。
PD−1とPD−L1との間の相互作用が、腫瘍浸潤リンパ球の低減、T細胞受容体媒介増殖の低減、及び癌性細胞による免疫回避をもたらすが(Dong et al.(2003)J.Mol.Med.81:281−7;Blank et al.(2005)Cancer Immunol.Immunother.54:3 07−3 14;Konishi et al.(2004)Clin.Cancer Res.10:5094−100)、それゆえPD−1/PD−L1相互作用の遮断が、腫瘍特異的T細胞免疫を増強し、免疫系による腫瘍細胞のクリアランスに役立つことが示された。侵襲性膵臓癌のマウスモデルにおいて、例えば、Nomi T., et al.(Clin.Cancer Res.13:2151−2157,2007)は、PD−1/PD−L1遮断の治療有効性を実証した。PD−1またはPD−L1のいずれかを指向する抗体の投与は、腫瘍成長を有意に阻害した。抗体による遮断は、腫瘍への腫瘍反応性CD8+T細胞浸潤を効果的に促進し、IFN−γ、グランザイムB及びパーフォリンを含む抗腫瘍エフェクターの上方制御をもたらした。さらに、著者らは、PD−1遮断を化学療法と効果的に組み合わせて相乗効果を得ることができることを示した。別の研究では、マウスでの扁平上皮癌腫のモデルを使用して、PD−1またはPD−L1の抗体による遮断が腫瘍成長を有意に阻害した(Tsushima F.et al.,Oral Oncol.42:268−274(2006))。
さらに、マウス肥満細胞腫株へのPD−L1のトランスフェクションは、腫瘍特異的CTLクローンと共培養した場合に腫瘍細胞の溶解の低減をもたらした。抗PD−L1 mAbを添加した場合、溶解は回復した(Iwai Y.et al.,Proc.Natl.Acad.Sci.USA.99:12293−12297(2002))。インビボで、PD1/PD−L1相互作用をブロックすることは、マウス腫瘍モデルにおける養子T細胞移入療法の有効性を増加させることが示された(Strome S.E.et al.,Cancer Res.63:6501−6505(2003))。癌処置におけるPD−1の役割に関するさらなる証拠は、PD−1ノックアウトマウスで実施された実験からもたらされる。PD−L1発現骨髄腫細胞は、野生型動物においてのみ成長し(腫瘍成長及びそれに伴う動物死をもたらす)、PD−1欠損マウスでは成長しなかった(Iwai Y.,et al.,Proc.Natl.Acad.Sci.USA.99:12293−12297(2002))。ヒトでの研究では、R.M.Wongら(Int.Immunol.19:1223−1234(2007))は、完全ヒト抗PD−1抗体を使用するPD−1遮断が、ワクチン抗原及びワクチン接種された個体由来の細胞を使用するエクスビボ刺激アッセイにおいて、腫瘍特異的CD8+T細胞(CTL)の絶対数を増大させたことを示した。同様の研究では、PD−L1の抗体による遮断は、腫瘍関連抗原特異的細胞傷害性T細胞の細胞溶解活性の増強及び腫瘍特異的TH細胞によるサイトカイン産生の増加をもたらした(Blank C.et al.,Int.J.Cancer 119:317−327(2006))。同著者らは、PD−L1遮断が、抗CTLA−4遮断と組み合わせて使用される場合にインビトロで腫瘍特異的T細胞応答を増大させることを示した。全体として、PD−1/PD−L1経路は、癌処置のための抗体治療薬開発の標的である。抗PD−1抗体はまた、慢性ウイルス感染に有用な場合がある。急性ウイルス感染後に生成されたメモリーCD8+T細胞は、高度に機能的であり、防御免疫の重要な構成要素となる。対照的に、慢性感染は多くの場合、ウイルス特異的T細胞応答の様々な程度の機能障害(疲弊)を特徴とし、この欠陥が、残存する病原体を宿主が排除できない主な理由である。感染の初期段階において最初に機能的エフェクターT細胞が生成されるが、それらは慢性感染の過程において徐々に機能を失う。Barberら(Barber et al.,Nature 439:682−687(2006))は、LCMVの実験室株で感染させたマウスが慢性感染を発症し、血液及びその他の組織において高レベルのウイルスをもたらされたことを示した。これらのマウスは、最初に強力なT細胞応答を発現したが、最終的にはT細胞疲弊により感染に屈した。著者らは、慢性的に感染したマウスにおけるエフェクターT細胞の数及び機能の低下が、PD−1とPD−L1との間の相互作用をブロックする抗体を注入することにより逆転させることができることを見出した。
一態様では、本発明は、プログラム細胞死1(PD−1)に結合する抗体またはその抗原結合断片を提供する。PD−1。一実施形態では、抗体またはその断片は、ヒトPD−1に結合する。別の実施形態では、抗体またはその断片は、ヒト及びカニクイザルPD−1に結合する。別の実施形態では、抗体またはその断片は、T細胞上のPD−1とそのリガンドPD−L1との相互作用をブロックする。一態様では、本発明は、抗PD−1抗体またはその断片を作製及び使用する方法、ならびに医薬組成物を含む、抗PD−1抗体またはその断片を含む組成物を提供する。
本明細書で使用される場合、「抗体」という用語は、少なくとも1つの抗原結合ドメインを有する結合タンパク質を指す。本発明の抗体及びその断片は、全長抗体またはその任意の断片であってもよい。したがって、本発明の抗体及び断片としては、モノクローナル抗体またはその断片及び抗体バリアントまたはその断片、加えて免疫複合体が挙げられる。抗体断片の例としては、Fab断片、Fab’断片、F(ab)’断片、Fv断片、単離されたCDR領域、単鎖Fv分子(scFv)、及び当該技術分野において既知のその他の抗体断片が挙げられる。抗体及びその断片としては、組換えポリペプチド、融合タンパク質、及び二重特異性抗体も挙げ得る。本明細書で開示される抗PD−1抗体及びその断片は、IgG1、IgG2、IgG3、またはIgG4アイソタイプであってもよい。「アイソタイプ」という用語は、重鎖定常領域遺伝子によってコードされる抗体クラスを指す。一実施形態では、本明細書で開示される抗PD−1抗体及びその断片は、IgG1またはIgG4アイソタイプである。本発明のPD−1抗体及びその断片は、マウス、ラット、ウサギ、霊長類、ラマ、及びヒトを含むが、これらに限定されない任意の種に由来してもよい。PD−1抗体及びその断片は、キメラ抗体、ヒト化抗体、または完全ヒト抗体であってもよい。一実施形態では、抗PD−1抗体はマウス抗体である。別の実施形態では、抗PD1抗体はキメラ抗体である。さらなる実施形態では、キメラ抗体は、マウス−ヒトキメラ抗体である。別の実施形態では、抗体はマウスに由来し、ヒト化されている。
「キメラ抗体」は、ある種に由来する重鎖可変領域の少なくとも一部分及び軽鎖可変領域の少なくとも一部分;ならびに別の種に由来する定常領域の少なくとも一部分を有する抗体である。例えば、一実施形態では、キメラ抗体は、マウス可変領域及びヒト定常領域を含んでよい。
「ヒト化抗体」は、非ヒト抗体に由来する相補性決定領域(CDR);及びヒト抗体に由来するフレームワーク領域及び定常領域を含有する抗体である。例えば、本明細書で提供される抗PD−1抗体は、1種または複数種のマウス抗体に由来するCDRならびにヒトフレームワーク及び定常領域を含んでよい。したがって、一実施形態では、本明細書で提供されるヒト化抗体は、抗体のCDRが由来するマウス抗体と、PD−1上の同じエピトープに結合する。例示的なヒト化抗体は、本明細書で提供される。本明細書で提供される重鎖及び軽鎖CDRを含む追加の抗PD−1抗体、またはそのバリアントは、任意のヒトフレームワーク配列を使用して生成されてよく、それらもまた本発明に包含される。一実施形態では、本発明での使用に好適なフレームワーク配列としては、本明細書で提供されるフレームワーク配列に構造的に類似したこれらのフレームワーク配列が挙げられる。フレームワーク領域におけるさらなる修飾が、本明細書で提供される抗体の特性を改善するために行われてもよい。このようなさらなるフレームワーク修飾としては、化学修飾;免疫原性を減少させる、もしくはT細胞エピトープを除去する点突然変異;または本来の生殖細胞系配列における残基への復帰突然変異を挙げ得る。
いくつかの実施形態では、このようなフレームワーク修飾としては、生殖細胞系配列への復帰突然変異を含む、本明細書で例示される突然変異に対応するものが挙げられる。例えば、一実施形態では、本明細書で提供されるヒト化抗体のVH及び/またはVLのヒトフレームワーク領域における1つまたは複数のアミノ酸を、親マウス抗体の対応するアミノ酸に復帰突然変異させる。一例として、7A4及び13F1のVH及びVLに関しては、上述した鋳型ヒト抗体におけるフレームワークアミノ酸のいくつかの部位を、マウス7A4及び13F1抗体の対応するアミノ酸に復帰突然変異させた。一実施形態では、軽鎖可変領域の40位及び/または45位及び/または70位及び/または72位のアミノ酸を、マウス7A4または13F1軽鎖可変領域のそれらの位置で見られる対応するアミノ酸に復帰突然変異させる。別の実施形態では、重鎖可変領域の2位及び/または26位及び/または46位及び/または48位及び/または49位及び/または67位及び/または70位及び/または71位のアミノ酸を、マウス7A4または13F1重鎖可変領域のそれらの位置で見られる対応するアミノ酸に復帰突然変異させる。一実施形態では、ヒト化7A4抗体は軽鎖可変領域を含み、ここで40位のアミノ酸をTyr(Y)からPhe(F)に変異させ、72位のアミノ酸をGly(G)からArg(R)に変異させる;かつヒト化7A4抗体は重鎖可変領域を含み、ここで2位のアミノ酸をVal(V)からIle(I)に変異させ、46位のアミノ酸をGlu(E)からLys(K)に変異させ、70位のアミノ酸をPhe(F)からIle(I)に変異させる。一実施形態では、ヒト化13F1抗体は軽鎖可変領域を含み、ここで45位のアミノ酸をLeu(L)からPro(P)に変異させ、70位のアミノ酸をPhe(F)からTyr(Y)に変異させる;かつヒト化13F1抗体は重鎖可変領域を含み、ここで26位のアミノ酸をGly(G)からTyr(Y)に変異させ、48位のアミノ酸をIle(I)からMet(M)に変異させ、49位のアミノ酸をGly(G)からAla(A)に変異させ、67位のアミノ酸をVal(V)からIle(I)に変異させ、71位のアミノ酸をVal(V)からArg(R)に変異させる。追加の、または代替の復帰突然変異が、抗体の特性を改善するために、本明細書で提供されるヒト化抗体のフレームワーク領域で行われてもよい。
本発明はまた、PD−1に結合し、任意の好適なフレームワーク配列に対する、本明細書に記載される例示的な修飾に対応するフレームワーク修飾、加えてさもなければ抗体の特性を改善するその他のフレームワーク修飾を含むヒト化抗体を包含する。例えば、いくつかの実施形態では、本明細書で提供される抗体は、1つまたは複数の脱アミド部位または1つまたは複数の酸化部位を除去する1つまたは複数の突然変異を含む。例えば、一実施形態では、本明細書で提供される抗体は、1つまたは複数の脱アミド部位を除去する1つまたは複数のアスパラギン残基の突然変異、及び/または1つまたは複数の酸化部位を除去する1つまたは複数のメチオニン残基の突然変異を含む。
その他の実施形態では、本明細書で提供される抗体は、安定性を改善する、溶解度を改善する、グリコシル化を変化させる、及び/または免疫原性を減少させる1つまたは複数の突然変異、例えば、脱アミドもしくは酸化を減少させる、異性化を減少させる、疎水性コア及び/もしくは電荷クラスター残基を最適化する、疎水性表面残基を除去する、可変重鎖と可変軽鎖との間の界面に関与する残基を最適化する、ならびに/または等電点を変更する標的アミノ酸変化などによる突然変異を含む。
本明細書で使用される場合、「由来の」という用語は、参照抗体またはその他の結合タンパク質に関する分子またはポリペプチドを指すために使用される場合、参照抗体またはその他の結合タンパク質と同じエピトープに対して特異性を有する結合ができる分子またはポリペプチドを意味する。
本明細書で開示される抗体及びその抗原結合断片は、PD−1に特異的である。一実施形態では、抗体及びその断片は、ヒトPD−1に特異的である。一実施形態では、本明細書で提供される抗体及び断片は、ヒトまたは霊長類PD−1には結合するが、任意のその他の哺乳動物に由来するPD−1には結合しない。さらなる実施形態では、抗体及びその断片は、マウスPD−1に結合しない。「ヒトPD−1」、「hPD−1」、及び「huPD−1」などの用語は、本明細書では同じ意味で使用され、ヒトPD−1及びヒトPD−1のバリアントまたはアイソフォームを指す。「特異的」とは、抗体及びその断片が、任意のその他の標的よりも高い親和性でPD−1受容体と結合することを意味する。一実施形態では、本明細書で提供されるPD−1抗体及び断片は、PD−1に特異的であり、CTLA4、ICOS、またはCD28とは交差反応しない。本明細書で使用される場合、「EC50」という用語は、抗体の最大の応答の50%を得る有効濃度を指す。本明細書で使用される場合、「IC50」という用語は、抗体の最大の応答の50%を得る阻害濃度を指す。EC50及びIC50の両方とも、ELISAもしくはFACS分析、または当該技術分野において既知の、任意のその他の方法により測定されてもよい。
一実施形態では、抗PD1抗体及びその断片またはバリアントは、約0.001nM〜約100nM、約0.002nM〜約50nM、約0.005nM〜約5nM、約0.01nM〜約1nM、または約0.05nM〜約0.1nMの範囲内でPD−1に対する親和性(KD)を有する。一実施形態では、抗体及びその断片は、約50nM以下、約25nM以下、約20nM以下、約15nM以下、約10nM以下、約8nM以下、約6nM以下、約4nM以下、約2nM以下、約1nM以下、約0.9nM以下、約0.8nM以下、約0.7nM以下、約0.6nM以下、約0.5nM以下、約0.4nM以下、約0.3nM以下、約0.2nM以下、約0.1nM以下、約0.09nM以下、約0.08nM以下、約0.07nM以下、約0.06nM以下、約0.05nM以下、約0.04nM以下、約0.03nM以下、約0.02nM以下、約0.01nM以下、約0.009nM以下、約0.008nM以下、約0.007nM以下、約0.006nM以下、約0.005nM以下、約0.004nM以下、約0.003nM以下、約0.002nM以下、または約0.001nM以下のPD−1に対する親和性(KD)を有する。一実施形態では、抗体及びその断片は、約10nM、約9nM、約8nM、約7nM、約6nM、約5nM、約4nM、約3nM、約2nM、約1nM、約0.9nM、約0.8nM、約0.7nM、約0.6nM、約0.5nM、約0.4nM、約0.3nM、約0.2nM、約0.1nM、約0.09nM、約0.08nM、約0.07nM、約0.06nM、約0.05nM、約0.04nM、約0.03nM、約0.02nM、約0.01nM、約0.009nM、約0.008nM、約0.007nM、約0.006nM、約0.005nM、約0.004nM、約0.003nM、約0.002nM、または約0.001のPD−1に対する親和性(KD)を有する。
一実施形態では、本明細書で提供される抗体及び断片は、軽鎖及び重鎖を含み、その各々が3つのCDR領域を含む。本発明のPD−1抗体に関する例示的な軽鎖CDR配列(LCDR1、LCDR2、及びLCDR3)が、表1で以下に提供される。本発明のPD−1抗体に関する例示的な重鎖CDR配列(HCDR1、HCDR2、及びHCDR3)が、表2で以下に提供される。本発明のPD−1抗体に関する例示的な可変領域及び完全抗体配列が、表3で以下に提供される。
(表1)軽鎖CDR配列
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(表2)重鎖CDR配列
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(表3)軽鎖及び重鎖可変領域配列ならびに完全抗体配列
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一実施形態では、本発明は、抗体10D1、4C10、7D3、13F1、15H5、14A6、22A5、6E1、5A8、及び/または7A4の軽鎖CDR及び重鎖CDRを含む抗PD−1抗体を提供する。当業者は、本明細書で提供される抗体の重鎖及び軽鎖CDRが、本明細書で提供される抗体に由来する任意の軽鎖CDR1、CDR2、及びCDR3;ならびに任意の重鎖CDR1、CDR2、及びCDR3を含む抗体またはその結合断片を形成するために、独立して選択されてもよい、または混合及び適合されてもよいと理解するだろう。したがって、本発明は、配列番号24、34、45、55、65、75、85、95、105、及び115から成る群から選択されるアミノ酸配列を含む軽鎖CDR1、配列番号25、35、46、56、66、76、86、96、106、及び116から成る群から選択されるアミノ酸配列を含む軽鎖CDR2、配列番号26、36、47、57、67、77、87、97、107、及び117から成る群から選択されるアミノ酸配列を含む軽鎖CDR3、配列番号19、29、40、50、60、70、80、90、100、及び110から成る群から選択されるアミノ酸配列を含む重鎖CDR1、配列番号20、30、41、51、61、71、81、91、101、及び111から成る群から選択されるアミノ酸配列を含む重鎖CDR2、ならびに配列番号21、31、42、52、62、72、82、92、102、及び112から成る群から選択されるアミノ酸配列を含む重鎖CDR3を含む抗PD−1抗体を提供する。一実施形態では、本発明は、本明細書で提供される、対応する軽鎖または重鎖CDR1、CDR2、またはCDR3と少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも少なくとも81%、少なくとも82%、少なくとも83%、少なくとも84%、少なくとも85%、少なくとも86%、少なくとも87%、少なくとも88%、少なくとも89%、少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、または少なくとも99%の相同性を有するアミノ酸配列を含む重鎖及び軽鎖CDR領域を含む抗PD−1抗体を提供する。一実施形態では、本発明は、本明細書で提供される、対応する軽鎖または重鎖CDR1、CDR2、またはCDR3と比較して1、2、3、4、5、または6つのアミノ酸置換、欠失、または挿入を有するアミノ酸配列を含む重鎖及び軽鎖CDR領域を含む抗PD−1抗体を提供する。
一実施形態では、本発明は、10D1、4C10、7D3、13F1、15H5、14A6、22A5、6E1、5A8、7A4及び7A4Dから成る群から選択される抗体の可変軽鎖ならびに10D1、4C10、7D3、13F1、15H5、14A6、22A5、6E1、5A8、及び7A4から成る群から選択される抗体の可変重鎖を含む抗PD−1抗体を提供する。一実施形態では、本明細書で提供される抗体及び断片は、配列番号23、33、44、54、64、74、84、94、104、114、133、143及び152の軽鎖可変領域に対して少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも少なくとも81%、少なくとも82%、少なくとも83%、少なくとも84%、少なくとも85%、少なくとも86%、少なくとも87%、少なくとも88%、少なくとも89%、少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、または少なくとも99%の相同性であるアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域を含む。一実施形態では、本明細書で提供される抗体及び断片は、配列番号23、33、44、54、64、74、84、94、104、114、133、143、152、またはそれらのバリアントのアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域を含み、このバリアントは、1、2、3、4、5、6、7、8、9、もしくは10のアミノ酸置換もしくは欠失、またはこれらの組み合わせを含む。さらなる実施形態では、アミノ酸置換は保存的置換である。別の実施形態では、アミノ酸置換は、本明細書で提供されるような抗体の特性を、例えば脱アミド部位を除去することにより改善する。例えば、一実施形態では、アスパラギン(Asn;N)残基を変異させる。さらなる実施形態では、Asnをアスパラギン酸(Asp;D)に変異させる。またさらなる実施形態では、軽鎖可変領域のフレームワーク領域3における85位のAsnを、Aspに変異させる。一実施形態では、本開示はヒト化抗体7A4Dを提供し、これは脱アミド部位を除去するために軽鎖のフレームワーク3(85位)に突然変異を有すること以外は、ヒト化抗体7A4と同じアミノ酸配列を含む。
一実施形態では、本明細書で提供される抗体及び断片は、配列番号18、28、39、49、59、69、79、89、99、109、131、及び141、または84の軽鎖可変領域に対して少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも少なくとも81%、少なくとも82%、少なくとも83%、少なくとも84%、少なくとも85%、少なくとも86%、少なくとも87%、少なくとも88%、少なくとも89%、少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、または少なくとも99%の相同性であるアミノ酸配列を含む重鎖可変領域を含む。一実施形態では、本明細書で提供される抗体及び断片は、配列番号18、28、39、49、59、69、79、89、99、109、131、141、またはそれらのバリアントのアミノ酸配列を含む重鎖可変領域を含み、このバリアントは、1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、もしくはそれを超えるアミノ酸置換、挿入、もしくは欠失、またはこれらの組み合わせを含む。さらなる実施形態では、アミノ酸置換は保存的置換である。別の実施形態では、アミノ酸置換は、本明細書で提供されるような抗体の特性を、例えば脱アミド部位を除去することにより改善する。例えば、一実施形態では、アスパラギン(Asn;N)残基を変異させる。さらなる実施形態では、Asnをアスパラギン酸(Asp;D)に変異させる。
CDR領域または可変軽鎖もしくは重鎖領域に、1つまたは複数のアミノ酸置換、挿入、欠失、またはこれらの組み合わせを有する、本明細書で開示される抗PD−1抗体は、アミノ酸置換、挿入、または欠失を有しない対応する抗PD−1抗体の生物活性を保持する。したがって、本明細書で提供されるバリアント抗PD−1抗体は、PD−1への結合を保持する。パーセント相同性は、本明細書で使用される場合、2つの参照配列により共有される同一のアミノ酸配列数を、アミノ酸位置の総数で割って100を掛けた数を指す。
いくつかの実施形態では、本明細書で提供される抗PD−1抗体は、保存的アミノ酸置換を含む。当業者は、保存的アミノ酸置換とは、1つのアミノ酸と、類似した構造的または化学的特性、例えば類似した側鎖などを有する別のアミノ酸との置換であると認識するだろう。例示的な保存的置換は、当該技術分野において、例えば、Watson et al.,Molecular Biology of the Gene,The Bengamin/Cummings Publication Company,4th Ed.(1987)に記載されている。
当業者は、可変軽鎖及び可変重鎖が、本明細書で提供される抗体から独立して選択されてもよい、または混合及び適合されてもよいと理解するだろう。したがって、本発明は、配列番号23、33、44、54、64、74、84、94、104、114、133、143、及び152から成る群から選択されるアミノ酸配列と少なくとも80%の相同性を有する軽鎖可変領域、ならびに配列番号18、28、39、49、59、69、79、89、99、109、131、及び141から成る群から選択されるアミノ酸配列と少なくとも80%の相同性を有する重鎖可変領域を含む抗PD−1抗体を提供する。
一実施形態では、本発明は、本明細書で開示される例示的な抗体のいずれか1つと同じエピトープに結合する抗体を提供する。したがって、一実施形態では、本発明は、本明細書で提供される例示的な抗体と、PD−1への結合について競合する抗体を提供する。
本明細書で提供される抗PD−1抗体及びその断片は、エフェクター機能を変化させるFc領域修飾をさらに含んでよい。Fc修飾は、アミノ酸挿入、欠失、もしくは置換であってもよく、または化学修飾であってもよい。例えば、Fc領域修飾は、補体結合を増加もしくは低減させる、抗体依存性細胞傷害を増加もしくは低減させる、または抗体の半減期を増加もしくは低減させるように行われてもよい。いくつかのFc修飾は、Fcγ受容体、例えばFcγRI、FcγRII、FcγRIII、またはFcRnなどに対する抗体の親和性を増加または低減させる。種々のFc修飾が、当該技術分野において、例えば、Shields et al.,J Biol.Chem 276;6591(2001);Tai et al.Blood 119;2074(2012);Spiekermann et al.J Exp.Med 196;303(2002);Moore et al.mAbs 2:2;181(2010);Medzihradsky Methods in Molecular Biology 446;293(2008);Mannan et al.Drug Metabolism and Disposition 35;86(2007);及びIdusogie et al.J Immunol 164;4178(2000)に記載されている。いくつかの実施形態では、Fc領域グリコシル化パターンを変化させる。その他の実施形態では、Fc領域をPEG化により(例えば、抗体またはその断片をポリエチレングリコール(PEGと反応させることにより)修飾する。
一実施形態では、本明細書で提供される抗体またはその断片は、抗PD−1抗体またはその断片を含み、追加の治療剤、細胞傷害剤、イムノアドヘシン分子、及び造影剤を含む群から選択される薬剤をさらに含む免疫複合体である。いくつかの実施形態では、造影剤は、放射性標識、酵素、蛍光標識、発光標識、生物発光標識、磁気標識、及びビオチンから成る群から選択される。いくつかの実施形態では、造影剤は、H、14C、35S、6264Cu、89Zr、90Y、99Tc、111In、125I、131I、177Lu、166Ho、及び153Smから成る群から選択される放射性標識である。いくつかの実施形態では、治療剤または細胞傷害剤は、化学療法剤、免疫抑制剤、免疫刺激剤、代謝拮抗剤、アルキル化剤、抗生物質、成長因子、サイトカイン、抗血管新生剤、抗有糸分裂剤、アントラサイクリン、毒素、及びアポトーシス剤を含む群から選択される。いくつかの実施形態では、結合タンパク質は、薬剤と直接複合体化される。その他の実施形態では、結合タンパク質は、リンカーにより薬剤と複合体化される。好適なリンカーとしては、本明細書で開示されるアミノ酸及びポリペプチドリンカーが挙げられるが、これらに限定されない。リンカーは、開裂可能であっても、または開裂不可能であってもよい。
一実施形態では、本発明は、PD−1及び少なくとも1つのその他の抗原またはエピトープに特異的な二重特異性または多重特異性抗体を提供する。本明細書で提供される抗PD−1抗体及びその断片は、本明細書で提供される結合アッセイ、または当該技術分野において既知の、任意のその他の結合アッセイを使用して、PD−1への結合について試験されてもよい。
別段の記載がない限り、本発明の実施には、当該技術分野において周知であって、例えば、Methods in Molecular Biology,Humana Press;Molecular Cloning:A Laboratory Manual,second edition(Sambrook et al.,1989),Current Protocols in Immunology(J.E.Coliganet al.,eds.,1991);Immunobiology(C.A.Janeway and P.Travers,1997);Antibodies(P.Finch,1997);Antibodies:a practical approach(D.Catty.,ed.,IRL Press,1988−1989);Monoclonal antibodies:a practical approach(P.Shepherd and C.Dean,eds.,Oxford University Press,2000);Phage display:a laboratory manual(C.Barbas III et al,Cold Spring Harbor Laboratory Press,2001);及びUsing antibodies:a laboratory manual(E.Harlow and D.Lane(Cold Spring Harbor Laboratory Press,1999)に記載されている従来の分子生物学、細胞生物学、生化学、及び免疫学技術を用いる。
一態様では、本発明は、免疫応答の増強、刺激、または誘発に応答する疾患または状態について、対象を処置する方法を提供する。本明細書で使用される場合、「処置」または「処置すること」という用語は、治療的処置及び予防的または防止的手段の両方を指す。処置を必要とする対象としては、既に疾患または状態を有するこれらの対象、加えて疾患または状態を発症する可能性があって、その疾患または状態を予防する、遅延させる、または減少させることを目的とする対象が挙げられる。本明細書で使用される場合、「対象」という用語は、げっ歯類、ネコ科、イヌ科、及び霊長類などの哺乳動物を示す。好ましくは、本発明による対象はヒトである。
「治療有効量」という用語は、本明細書で使用される場合、治療的及び/または予防的有益性を対象に提供するために必要な化合物または組成物の量を指す。
一態様では、抗体及びその抗原結合断片は、固形または非固形腫瘍の処置に有用である。したがって、一態様では、本発明は、癌の処置方法を提供する。「癌」は、本明細書で使用される場合、典型的には無秩序な細胞成長を特徴とする哺乳動物の生理学的状態を指す。癌の例としては、癌腫、リンパ腫、芽細胞腫、肉腫(脂肪肉腫、骨原性肉腫、血管肉腫、内皮肉腫、平滑筋肉腫、脊索腫、リンパ管肉腫、リンパ管内皮肉腫、横紋筋肉腫、線維肉腫、粘液肉腫、軟骨肉腫を含む)、神経内分泌腫瘍、中皮腫、滑膜腫、神経鞘腫、髄膜腫、腺癌、黒色腫、及び白血病またはリンパ性悪性腫瘍が挙げられるが、これらに限定されない。このような癌のより詳細な例としては、扁平上皮細胞癌(例えば、上皮扁平上皮細胞癌)、ホジキンリンパ腫;非ホジキンリンパ腫(バーキットリンパ腫、小リンパ球性リンパ腫/慢性リンパ性白血病、菌状息肉腫、マントル細胞リンパ腫、濾胞性リンパ腫、びまん性大細胞型B細胞リンパ腫、辺縁帯リンパ腫、有毛細胞白血病及びリンパ形質細胞性白血病)、B細胞急性リンパ芽球性白血病/リンパ腫、及びT細胞急性リンパ芽球性白血病/リンパ腫を含むリンパ球前駆細胞の腫瘍、胸腺腫、末梢T細胞白血病、成人T細胞白血病/T細胞リンパ腫及び大顆粒リンパ球性白血病を含む成熟T細胞及びNK細胞の腫瘍、ランゲルハンス細胞組織球症、骨髄性腫瘍、例えば、分化型AML、非分化型AML、急性前骨髄球性白血病、急性骨髄性単球性白血病、及び急性単球性白血病を含む急性骨髄性白血病、骨髄異形成症候群、ならびに慢性骨髄性白血病を含む慢性骨髄増殖性疾患、B細胞急性リンパ芽球性白血病/リンパ腫、T細胞急性リンパ芽球性白血病/リンパ腫など、小細胞肺癌、非小細胞肺癌、肺の腺癌及び肺の扁平上皮癌を含む肺癌、小細胞肺癌腫、腹膜の癌、肝細胞癌、胃腸癌を含む胃の癌または胃癌、膵臓癌、膠芽腫、子宮頸癌、卵巣癌、肝臓癌、膀胱癌、ヘパトーマ、乳癌、結腸癌、直腸癌、結腸直腸癌、子宮内膜癌腫または子宮癌腫、唾液腺癌腫、腎臓癌または腎癌、前立腺癌、外陰癌、甲状腺癌、肝臓癌腫、肛門癌腫、陰茎癌腫、精巣癌、食道癌、胆道の腫瘍、ユーイング腫瘍、基底細胞癌腫、腺癌、汗腺癌腫、脂腺癌腫、乳頭状癌腫、乳頭状腺癌、嚢胞腺癌、髄様癌腫、気管支原性癌腫、腎細胞癌腫、ヘパトーマ、胆管癌腫、絨毛癌、精上皮腫、胎児性癌腫、ウィルムス腫瘍、精巣腫瘍、肺癌腫、膀胱癌腫、上皮癌腫、神経膠腫、星細胞腫、髄芽腫、頭蓋咽頭腫、上衣腫、松果体腫、血管芽細胞腫、聴神経腫、乏突起膠腫、髄膜腫、黒色腫、神経芽細胞腫、網膜芽細胞腫、白血病、リンパ腫、多発性骨髄腫、ワルデンシュトレームマクログロブリン血症、骨髄異形成疾患、重鎖病、神経内分泌腫瘍、神経鞘腫、ならびにその他の癌腫、加えて頭頸部癌が挙げられる。
一実施形態では、本明細書で提供される抗体及びその断片は、感染因子により引き起こされる疾患の処置に有用である。感染因子としては、細菌因子、菌類因子、寄生因子、及びウイルス因子が挙げられるが、これらに限定されない。このような感染因子の例としては、以下のものが挙げられる:ブドウ球菌属、メチシリン耐性スタフィロコッカス アウレウス(Staphylococcus aureus)、大腸菌(Escherichia coli)、連鎖球菌科、ナイセリア科、球菌、腸内細菌科、腸球菌、バンコマイシン耐性腸球菌、クリプトコッカス、ヒストプラスマ症、アスペルギルス、シュードモナス科、ビブリオ科、カンピロバクター、パスツレラ科、ボルデテラ、フランシセラ、ブルセラ、レジオネラ科、バクテロイデス科、グラム陰性桿菌、クロストリジウム、コリネバクテリウム、プロピオニバクテリウム、グラム陽性桿菌、炭疽菌、アクチノマイセス、ノカルジア、マイコバクテリウムトレポネーマ、ボレリア、レプトスピラ、マイコプラズマ、ウレアプラズマ、リケッチア、クラミジア門、カンジダ、全身性真菌症、日和見真菌症、原虫、線虫、吸虫、条虫、アデノウイルス、ヘルペスウイルス(例えば、単純ヘルペスウイルス及びエプスタインバーウイルス、ならびに帯状疱疹ウイルスを含む)、ポックスウイルス、パポーバウイルス、肝炎ウイルス、(例えば、B型肝炎ウイルス及びC型肝炎ウイルスを含む)、パピローマウイルス、オルトミクソウイルス(例えば、インフルエンザA型、インフルエンザB型、及びインフルエンザC型を含む)、パラミクソウイルス、コロナウイルス、ピコルナウイルス、レオウイルス、トガウイルス、フラビウイルス、ブニヤウイルス科、ラブドウイルス、ロタウイルス、呼吸器合胞体ウイルス、ヒト免疫不全ウイルス及びレトロウイルス。例示的な感染症としては、カンジダ症、カンジダ血症、アスペルギルス症、連鎖球菌性肺炎、連鎖球菌性の皮膚及び口咽頭の状態、グラム陰性菌による敗血症、結核、単核球症、インフルエンザ、呼吸器合胞体ウイルスにより引き起こされる呼吸器病、マラリア、住血吸虫症、ならびにトリパノソーマ症が挙げられるが、これらに限定されない。
一実施形態では、本明細書で提供される抗体及びその断片は、Tヘルパー2型(Th2)T細胞により媒介される疾患、例えば、喘息、アレルギー、または移植片対宿主病などの処置に有用である。
一実施形態では、本明細書で提供される抗体及びその断片は、免疫応答の刺激を必要とする対象の免疫応答の刺激に有用である。例えば、一実施形態では、抗PD−1抗体及びその断片は、関心対象の抗原に対する免疫応答を誘発する目的で、この抗原と組み合わせて投与されてもよい。関心対象の抗原は、病原体、例えばウイルスまたは細菌などに関連した抗原であってもよい。したがって、一実施形態では、本発明は、抗PD−1抗体及び抗原を含むワクチンを提供し、このワクチンは抗原特異的免疫応答を誘発する。
一実施形態では、本明細書で提供される抗PD−1抗体は、制御性T細胞機能を調節する。CD4+CD25+制御性T細胞は、エフェクターT細胞機能の効果を抑制する、または減少させるリンパ球である。「制御性T細胞」及び「Treg」という用語は、本明細書では同じ意味で使用される。一実施形態では、本明細書で提供される抗PD−1抗体は、エフェクターT細胞のサイトカイン産生に対する制御性T細胞の阻害効果を予防する、または反転させる。例えば、一実施形態では、本明細書で提供される抗PD−1抗体は、制御性T細胞と接触したエフェクターT細胞にIFNγ産生能力を回復させる。
一実施形態では、本明細書で開示される抗体及びその断片は、非経口、皮下、筋肉内、静脈内、関節内、気管支内、腹内、嚢内、軟骨内、洞内、腔内、小脳内、脳室内、結腸内、頸管内、胃内、肝内、心筋内、骨内、骨盤内、心膜内、腹腔内、胸膜内、前立腺内、肺内、直腸内、腎内、網膜内、脊髄内、滑液嚢内、胸内、鼓室内、子宮内、膀胱内、硝子体内、ボーラス、結膜下、膣、直腸、頬、舌下、鼻腔内、腫瘍内、及び経皮から選択される少なくとも1つの経路により対象に投与されてもよい。
一実施形態では、本明細書で開示される抗体及びその断片は、1種または複数種の追加の治療剤と組み合わされて、抗体及びその断片を必要とする対象に投与されてもよい。一実施形態では、抗体及びその断片は、追加の治療剤の、対象への投与前、投与中、及び/または投与後に対象に投与されてもよい。一実施形態では、追加の治療剤は、化学療法剤、放射線療法剤、サイトカイン、抗体もしくはその断片、または疾患を処置するために必要な任意の、その他の追加の治療薬である。一実施形態では、抗PD−1抗体及び追加の治療剤は、同時にまたは逐次的投与に関わらず、一緒に投与される場合に治療的相乗効果を示す。一実施形態では、抗PD−1抗体及び追加の治療剤は、別個の製剤で投与される。別の実施形態では、抗PD−1抗体及び追加の治療剤は、同じ製剤で投与される。一実施形態では、本明細書で提供される抗PD−1抗体及び断片は、1種または複数種の追加の治療剤が持つ免疫調節効果を増強する。別の実施形態では、1種または複数種の追加の治療剤は、抗PD−1抗体またはその断片の効果を増強する。
本発明は、単離された抗体及びその抗原結合断片、ならびにこのような抗体及び断片をコードする核酸、加えてこのような単離された抗体、断片、及び核酸を含む組成物を提供する。「単離された」という用語は、その自然環境から分離されている関心対象の化合物(例えば、抗体または核酸)を指す。本発明は、単離された抗体もしくはその断片、またはこのような抗体もしくは断片をコードする核酸を含み、1種または複数種の薬学的に許容される担体をさらに含む医薬組成物をさらに提供する。薬学的に許容される担体としては、例えば、賦形剤、希釈剤、封入材料、充填剤、緩衝剤、またはその他の薬剤が挙げられる。
単数形の使用には、別段の具体的な記載がない限り、複数形が含まれる。「1つの(a)」または「1つの(an)」という単語は、別段の具体的な記載がない限り、「少なくとも1つの(at least one)」を意味する。「または(or)」の使用は、別段の記載がない限り、「及び/または(and/or)」を意味する。「少なくとも1つの(at least one)」という語句の意味は、「1つまたは複数の(one or more)」という語句の意味と同等である。さらに、「を含むこと(including)」という用語に加えて、その他の形態、例えば「〜を含む(includes)」及び「〜を含んだ(included)」などの使用に制限はない。また、「要素」または「構成要素」などの用語は、別段の具体的な記載がない限り、1つの単位を含む要素または構成要素及び2つ以上の単位を含む要素または構成要素の両方を包含する。
前述の本発明を、理解の明確化を目的として例証及び例示によってある程度詳細に記載してきたが、本発明の教示に照らして、添付の特許請求の趣旨または範囲から逸脱することなく、本明細書に一定の変更及び修正が加えられてもよいことが、当業者には容易に明らかとなるであろう。以下の実施例は、例証として提供されているにすぎず、制限として提供されるのではない。当業者は、変更または修正しても、本質的に類似した結果を得ることができる様々な重要でないパラメータを容易に認識するだろう。
実施例1−マウス免疫化及びヒトPD−1に対するマウス抗体の産生
ヒトPD−1に対する抗体を生成するために、hPD−1をヒスチジンタグ(hPD−1−Hisタグ、配列番号1)、マウスFc(hPD−L1−mFc、配列番号13)、及びヒトFcタグ(hPD−1−hFc、配列番号5)と融合して、その細胞外ドメインのオープンリーディングフレームをコードするcDNAをPCRにより得て、それぞれ発現ベクターのpcDNA3.1(Invitrogenカタログ番号V−790)にサブクローニングした。freestyle293細胞での一過性発現後、hPD−1−HisタグをNTAカラム(GE healthcare)で精製し、hPD−1−mFc及びhPD−1−hFcをプロテインGカラム(GE healthcare)で精製した。
ハイブリドーマ細胞株の生成に必要なマウスを免疫化するために、100μgのヒトPD−1−マウスFc融合タンパク質または及び同量の完全フロイントアジュバントを混合し、その混合物を5匹の6〜7週齢BALB/cマウスの各々に皮下注射により投与した。2週後、上記と同じ方法を使用して、抗原(先に注射した量の半分)を不完全フロイントアジュバントと混合し、その混合物を各マウスに皮下注射により投与した。1週後、最後の追加免疫化を実施し、3日後に各マウスの尾部から血液を採取して血清を得た。次いで、血清をPBSで1/1000に希釈し、ELISAを実施してヒトPD−1−mFcを認識する抗体の力価が増加したかどうかを分析した。その後、十分な量の抗体を得たマウスを選択し、選択したマウスで細胞融合プロセスを実施した。
細胞融合実験の3日前に、50μgのPBSとヒトPD−1−mFc融合タンパク質との混合物を、各マウスに腹腔内注射により投与した。各免疫化マウスを麻酔し、次いで体の左側に位置するその脾臓を摘出してメッシュで粉砕し、細胞を単離して、これを培地(RPMI1640)と混合して脾臓細胞懸濁液を調製した。懸濁液を遠心分離し、細胞層を収集した。得られた1×10個の脾臓細胞を、1.5×10個の骨髄腫細胞(Sp2/0)と混合し、その混合物を遠心分離して細胞を沈殿させた。沈殿物をゆっくりと分散させて、PEG Hybri−Max(Sigma Inc.、カタログ番号7181)で処置した。混合細胞を、96ウェルプレートに1ウェル当たり0.1mlずつ分注し、37℃の5%COインキュベーターでインキュベートした。1日目に、各ウェルに血清及びHATに加えて2倍のメトトレキサートを含有する追加の0.1ml培地の添加により細胞に供給した。3日目及び7日目に、各ウェルの0.1mlの培地を0.1mlの新しいHT培地で置き換えた。スクリーニングは、典型的には9〜14日目に行った。
実施例2−ELISA及びFACS分析に基づいた、ヒトPD−1タンパク質に対するモノクローナル抗体を産生するハイブリドーマ細胞の選択
ELISA結合分析を、ヒトPD−1−hFcタンパク質に基づいて実施した。96ウェルプレート(Costar、カタログ番号9018)を、コーティング緩衝液(PBS、Hyclone、カタログ番号SH30256.01B)中、2μg/mlのPD1−hFc(CrownBio)を100μL用いて4℃で一晩コーティングした。ウェルを吸引し、非特異的結合部位を、1%(w/v)のウシ血清アルブミン(BSA、Roche、カタログ番号738328)を用いた200μLのブロッキング緩衝液を添加して、37℃で1時間インキュベートすることによりブロックした。プレートを洗浄緩衝液(0.05%(v/v)のTween20(Sigma、カタログ番号P1379)を加えたPBSで3回洗浄した後、ブロッキング緩衝液中のハイブリドーマ上清の好適な希釈物を100μL/ウェルで添加し、室温で1時間インキュベートした。プレートを洗浄し、100μL/ウェルの、ブロッキング緩衝液中のヤギ抗マウスIgG(H+L)(Thermo、カタログ番号31432)で60分間インキュベートした。プレートを洗浄した後、100μL/ウェルの基質溶液(TMB(eBioscience、カタログ番号00−4201−56)を添加し、プレートを室温で2分間インキュベートした。100μL/ウェルの停止溶液(2NのH2SO4)を添加して、反応を停止させた。比色シグナルが生じたら、Auto Plate SpectraMax Plus(供給業者:Molecular Devices;モデル:MNR0643;ソフトウェア:SoftMax Pro v5.4)を使用して450nmで読み取った。この方法により、ヒトPD−1タンパク質と高度に特異的に結合する抗体を産生するハイブリドーマ細胞株を、繰り返し選択した。
ELISAに基づくリガンド妨害分析を、ヒトPD−1−hFcへの結合からビオチン化ヒトPD−L1−mFcをブロックすることにより実施した。PD−1−mFc抗原(CrownBio)を、PBS(Hyclone、カタログ番号SH30256.01B)緩衝液中に懸濁し(2ug/ml、100ul/ウェル)、96ウェルプレート(costar、カタログ番号9018)上に4℃で一晩コーティングした。プレートを、洗浄緩衝液:PBS+0.05%のTween20(Sigma、カタログ番号P1379)を使用して3回洗浄した。200ulのブロッキング緩衝液(PBS+1%BSA(Roche、カタログ番号738328))を各ウェルに添加し、37℃で1時間インキュベートして、3回洗浄した。種々の濃度(PBS中のハイブリドーマ上清の好適な希釈物)の抗PD−1抗体をウェルに添加し(100μl/ウェル)、37℃で1時間インキュベートした。リガンドを添加し(0.1ug/mlのPDL−1−mFc−ビオチン、100μl/ウェル)、37℃で2時間インキュベートして、3回洗浄した。二次抗体(アビジンHRP eBioscience カタログ番号E07418−1632、1:500、100ul/ウェル)を添加し、37℃で0.5時間インキュベートして、3回洗浄した。TMB(Sigma、カタログ番号T0440、100ul/ウェル)を添加し、室温で3分間インキュベートした。反応を停止させるために、2NのH2SO4(100ul/ウェル)を添加した。比色シグナルが生じたら、Auto Plate SpectraMax Plus(供給業者:Molecular Devices;モデル:MNR0643;ソフトウェア:SoftMax Pro v5.4)を使用して450nmで読み取った。
抗体の細胞結合分析を、hPD−1−293T細胞株に基づいて実施した。2×10個の293T−PD−1細胞を、96ウェル培養プレートの各ウェルにそれらを置くことにより各反応に使用した。細胞を、示した抗体(1/5希釈で20ug/ml)と共に4℃で1時間インキュベートした。細胞をFACS緩衝液で3回洗浄した。二次抗体(PEヤギ抗マウス:1:200;PEマウス抗ヒト:1:10)を100ul/ウェルで細胞に添加し、4℃で40分間インキュベートした。細胞をFACS緩衝液で3回洗浄し、FACS Arrayによって分析した。
FACSに基づくリガンド妨害分析を、フローサイトメトリーアッセイを使用して、hPD−1−293T細胞に対するビオチン化ヒトPD−L1及びPD−L2結合の妨害における抗PD−1ハイブリドーマ抗体を決定するために実施した。PD−1発現293T細胞を、FACS緩衝液(3%のウシ胎児血清を加えたPBS)中に懸濁した。種々の濃度の試験するハイブリドーマ抗体を細胞懸濁液に添加し、96ウェルプレートにおいて4℃で60分間インキュベートした。ビオチン標識PD−L1タンパク質またはビオチン標識PD−L2タンパク質をウェルに添加し、4℃で60分間インキュベートした。プレートを3回洗浄し、マウス抗ビオチンPE抗体(Biolgend、カタログ番号409004)を添加した。フローサイトメトリー分析を、FACS Arrayを使用して実施した。試験の結果を、図1A(PD−L1)及び図1B(PD−L2)に図示する。抗PD−1モノクローナル抗体は、染色の平均蛍光強度(MFI)によって測定されるように、PD−L1またはPD−L2と、ヒトPD−1をトランスフェクトした293T細胞との結合をブロックした。これらのデータは、抗PD−1抗体が、リガンドPD−L1及びPD−L2と細胞表面PD−1との結合をブロックすることを実証した。
実施例3−モノクローナル抗体クローンを得るためのサブクローニング及び抗hPD−1抗体の精製
サブクローニングは限界希釈法の手順に基づき、モノクローナル抗体を産生する個々のハイブリドーマクローンを得るように設計する。ハイブリドーマの各々を複数回(4回)の限界希釈法に供した。サブクローニングの各回について、クローンをELISA及びFACSに基づく妨害分析により試験した。
抗体精製を、合計で22種の抗hPD−1ハイブリドーマ抗体について実施した。ハイブリドーマ細胞を、10%のウシ胎児血清、1%のペニシリン/ストレプトマイシン、2%のL−グルタミン、及び1%の調整したNaHCO溶液を含有するダルベッコ改変イーグル培地(GIBCO;Invitrogen Corporation、カールスバッド、カリフォルニア州)で培養した。次いで、選択したハイブリドーマ細胞を無血清培地に適合させ、プロテインGカラム(GE healthcare)を使用して上清から抗体を精製した。PBSで洗浄した後、0.1MのグリシンをpH3.0で使用して結合した抗体を溶出し、続いて2.0MのTrisを使用してpHを中和した。ウルトラ−15遠心濃縮器(Amicon)を、緩衝液交換及び抗体濃縮に使用した。
実施例4−ELISA及びFACS分析に基づいた、結合活性及びリガンド妨害活性における精製マウス抗hPD−1抗体の特徴付け
精製したハイブリドーマ抗体を、ELISA及びFACS分析に基づいてさらに特徴付けた。使用した方法は、実施例2で上に記載したものと同様であったが、ただし、この場合は精製抗体を量及び濃度で測定し、その結果を使用してEC50値及びIC50値を計算した。以下の表、すなわち表1〜5は、10種の抗体の結果を示す。
(表1)10種のマウス抗PD−1抗体のELISAに基づく結合EC50
Figure 2020188760
(表2)10種のマウス抗PD−1抗体のELISAに基づく妨害IC50
Figure 2020188760
(表3)10種のマウス抗PD−1抗体のFACSに基づく結合EC50
Figure 2020188760
(表4)選択した10種のマウス抗PD−1抗体のFACSに基づくPD−L1妨害IC50
Figure 2020188760
(表5)選択した10種のマウス抗PD−1抗体のFACSに基づくPD−L2妨害IC50
Figure 2020188760
実施例5:マウス抗PD−1抗体のBiacore分析
抗体の結合特性をさらに特徴付けるために、10種のハイブリドーマ抗体をBiacore(Biacore 3000、GE)を使用して特性を明らかにし、結合速度を明らかにして平衡結合定数を計算した。このアッセイを、mouse antibody capture kit(BR−1008−38、GE)を使用して、捕捉方法により実施した。抗マウスFc mabをpH5.0の固定化緩衝液中で25μg/mlまで希釈した後、5μl/分の流速で表6に示すパラメータを用いて固定化を実施した。速度論的実行は、1)リガンドを典型的には0.5〜1分間、10μl/分の流速で注入し;2)好適な分析物を典型的には3分間注入し、続いて典型的には5〜10分間、30μl/分の流速でのランニング緩衝液(1倍のPBS−P20)中で解離させて;3)再生溶液の10mMのグリシンをpH1.7で典型的には1〜2分間、10μl/分の流速で注入することにより行った。
(表6)Biacoreパラメータ
Figure 2020188760
試験の結果を表7に示す。抗ヒトPD1抗体の各々は、1.11E+05 1/Ms〜8.40E+05 1/Msの範囲の結合速度(ka);2.83E−05 1/s〜7.55E−05 1/sの範囲の解離速度(kd);1.60E+10 1/M〜5.44E+10 1/Mの範囲の平衡結合定数(KA);及び1.84E−11M〜6.23E−11M(0.0184nM〜0.0623nM)の範囲の親和性(KD)を示した。
(表7)抗PD−1ハイブリドーマ抗体のKD値
Figure 2020188760
実施例6:種間の及び類似した分子間の交差反応
抗体の種交差反応を評価するために、マウス及びカニクイザルPD−1受容体をPCRによりクローニングし、安定にトランスフェクトした293T−PD−1細胞を生成した。抗体を、タンパク質に基づくELISAを使用して、カニクイザル受容体への結合について試験した。試験の結果は、抗体がヒト及びカニクイザルPD−1に等しい親和性で結合し、ヒトPD−1と比較した場合に類似した有効性でhPD−L1/Fc及びhPD−L2/Fcと、カニクイザルPD−1との結合をブロックすることを示した。選択した抗体で、使用したアッセイのいずれにおいても、検出可能な親和性でマウスPD−1と結合したものはなかった。ヒトCTLA4、ICOS及びCD28と交差反応するものはない(表8を参照のこと)。
実施例7:混合リンパ球反応におけるサイトカイン産生に対する抗PD−1ハイブリドーマ抗体の効果
混合リンパ球反応を使用して、リンパ球エフェクター細胞に対する、PD−1経路をブロックすることの効果を実証した。アッセイでは、マウス抗ヒトPD−1モノクローナル抗体の存在下または非存在下における増殖、IFN−γ分泌及びIL−2分泌についてT細胞を試験した。アッセイでは、ヒトCD4+T細胞を、CD4+の陰性選択(Miltenyi Biotech、カタログ番号130−091−155)を使用してPBMCから精製した。成熟樹状細胞(DC)は、精製した単球(Miltenyi、Mo−DC Generation Toolbox、カタログ番号130−093−568)をMo−DC分化培地で7日間培養し;次いで、DC成熟をMo−Dc Maturationで2日間誘導して得た。各培養物は、200μlの総体積中、10個の精製T細胞及び10個の同種異系樹状細胞を含有した。抗PD−1モノクローナル抗体の4C10、5A8、6E1、7D3、7A4、10D1、13F1、14A6、15H5、または22A5を各培養物に異なる抗体濃度で添加した。抗体なし、またはアイソタイプ対照抗体のいずれかを陰性対照として使用した。細胞を37℃で5日間培養した。5日目に、50μlの培地をIL−2及びIFN−γの測定のために収集した。培養液中のIFN−γ及びIL−2のレベルを、EIA hIFN−γ ELISA kit(R&D、カタログ番号DY285)及びIL−2 ELISAキット(eBioscience)を使用して測定した。試験の結果を図2(IL−2分泌)及び図3(IFN−γ分泌)に提供し、これは抗ヒトPD−1モノクローナル抗体が、濃度依存的様式でT細胞増殖、IFN−γ分泌及びIL−2分泌を促進したことを示す。対照的に、アイソタイプ対照抗体を含有する培養物は、T細胞増殖、IFN−γまたはIL−2分泌の増加を示さなかった。
実施例8:10種のマウス抗hPD−1抗体の特徴
精製して、特徴付けた10種の抗PD1モノクローナル抗体の特性を表8にまとめる。これらの抗体は、PD−1に(20uM〜3nMの範囲の解離定数で)強力に結合し、異なるIC50値でPD−L1及びPD−L2の両方との相互作用をブロックすることができた。抗体の各々は、IL2及びIFNγ産生を誘導した。10種の抗体には、CTLA4、ICOS、またはCD28と交差反応したものはなかった。抗体の各々は、カニクイザルPD−1と結合した。抗体の各々は、溶液に添加した場合に受容体アンタゴニストとして機能し、最終的にT細胞応答を増強した(実施例5を参照のこと)。
(表8)10種のマウス抗hPD−1抗体の特徴付けした特徴の概要
Figure 2020188760
実施例9:抗PD−1抗体のcDNA配列クローニング及びヒト化
免疫グロブリンcDNAのクローニング
RNeasy Mini Kit(Qiagen、カタログ番号74104)により、hPD−1抗体を産生するハイブリドーマ細胞株から単離した全RNAを鋳型として使用し、SuperScript(登録商標)II Reverse Transcriptase(Life Technology、カタログ番号18064−14)をメーカーの指示に従って用いて第1鎖cDNAを合成した。次いで、cDNA産物を、50μl体積の反応混合物において縮重マウスIgGプライマー(Kettleborough CA,et al,European Journal of Immunology 23:206−211(1993)、Strebe N,et al,Antibody Engineering 1:3−14(2010))を使用してPCRに供した。反応は、S1000(商標)サーマルサイクラー(Bio−Rad、カタログ番号184−2000)において、94℃で1.5分間の変性;50℃で1分間のアニーリング;及び72℃で1分間の合成を30サイクル行って実施した。30回目のサイクルの最後に、反応混合物を伸張するためにさらに7分間72℃でインキュベートした。
PCR混合物を、0.5μg/mlの臭化エチジウムを含有する1%のアガロース/Tris−Borateゲルにおいて電気泳動に供した。予想したサイズ(重鎖及び軽鎖のおよそ400bp)を有するDNA断片をゲルから除去して精製した。3μlの精製したPCR産物をpMD−18Tベクター(タカラ、カタログ番号D101A)にクローニングし、One Shot(登録商標)TOP10 Chemically Competent E.coli(Invitrogen、カタログ番号C4040−03)を形質転換した。クローンを、ユニバーサルM13フォワード及びリバースプライマーを使用してコロニーPCRによりスクリーニングし、M13フォワードプライマー及びM13リバースプライマーを使用した両方向のDNA配列決定のために、各反応物から10個の陽性クローンを選択した。
抗体4C10(配列番号28、33)、5A8(配列番号99、104)、6E1(配列番号89、94)、7D3(配列番号39、44)、7A4(配列番号109、114)、10D1(配列番号18、23)、13F1(配列番号49、54)、14A6(配列番号69、74)、15H5(配列番号59、64)及び22A5(配列番号79、84)の可変領域配列を、対応するハイブリドーマクローンから増幅した。これらの抗体は、所望の機能、例えばPD−L1に対するPD−1結合のブロックならびにT細胞活性化及びサイトカイン放出の増強などを示した。
キメラ7A4及び13F1抗体の構築及び発現
7A4及び13F1キメラ軽鎖(それぞれ配列番号123及び129)は、PCRでクローニングしたマウスVL領域のcDNAを、それぞれヒトカッパ及びIgG1に連結することにより構築した。7A4及び13F1キメラIgG1重鎖(それぞれ配列番号119及び125)は、PCRでクローニングしたマウスVH領域のcDNAをヒトIgG1定常領域に連結することにより構築した。7A4及び13F1キメラIgG4重鎖(それぞれ配列番号121及び127)は、PCRでクローニングしたマウスVH領域のcDNAをヒトIgG4定常領域に連結することにより構築した。マウスcDNA配列の5’末端を、軽鎖及び重鎖の両方にリーダー配列を付加するように設計されたPCRプライマーを使用して修飾した。
Freestyle293細胞(10個/mLで200mL)に、100μgのキメラ重鎖及び軽鎖発現プラスミドの各々をトランスフェクトし、6日間培養した。次いで、上清中のキメラ抗体をプロテインGカラム(GE healthcare)で精製した。キメラ抗体とPD−1との結合を、実施例2及び5で上に記載したようにELISA及びBiacoreにより測定し、マウス親抗体の親和性と同等の親和性でPD−1に結合することを示した。表9は、ELISAにより測定された、キメラ抗PD−1抗体の各々の結合EC50を示す。表10は、ELISAにより測定された、キメラ抗PD−1抗体の各々のPD−L1妨害IC50を示す。表11は、FACSにより測定された、キメラ抗PD−1抗体の各々の結合EC50を示す。表12は、FACSにより測定された、キメラ抗PD−1抗体の各々のPD−L1妨害IC50を示す。
(表9)キメラ抗PD−1抗体のELISAに基づく結合EC50
Figure 2020188760
(表10)キメラ抗PD−1抗体のELISAに基づく妨害IC50
Figure 2020188760
(表11)キメラ抗PD−1抗体のFACSに基づく結合EC50
Figure 2020188760
(表12)キメラ抗PD−1抗体のFACSに基づくPD−L1妨害IC50
Figure 2020188760
実施例7で上に記載したような混合リンパ球反応を使用して、T細胞からのIL−2分泌(図4)及びIFN−γ分泌(図5)に対するキメラ抗PD−1抗体の効果を決定した。キメラ抗PD−1モノクローナル抗体の各々は、MLRアッセイにおいて濃度依存的様式でIL−2分泌及びIFNγ分泌を促進した。対照的に、アイソタイプ対照抗体(hIgG4)は、試験したいずれの濃度でもIL−2分泌またはIFNγ分泌を誘発しなかった。
抗体ヒト化設計
7A4及び13F1抗体を、CDR移植手法(その全体が参照によって本明細書に組み込まれる、米国特許第5,225,539号明細書)を使用してヒト化する。マウス抗体7A4及び13F1の軽鎖及び重鎖可変鎖配列を、NCBIデータベースhttp://www.ncbi.nlm.nih.gov/igblast/igblast.cgiを検索することにより、構造バイオインフォマティクス研究共同体(RCSB)のタンパク質構造データバンクで入手可能な配列と比較した。7A4及び13F1のモデルを、それぞれ最も高い配列相同性を有するVH及びVL構造に基づいて生成した。
マウス7A4及び13F1抗体のVH及びVLの相補性決定領域(CDR)を移植するための鋳型ヒト抗体をIMGT/Domain Gap Align 3D構造データベースhttp://www.imgt.org/3Dstructure-DB/cgi/DomainGapAlign.cgiを検索することにより、マウス7A4及び13F1抗体と高い相同性を有するアミノ酸配列を有するヒト抗体生殖細胞系から選択した。7A4については、選択した鋳型ヒトVHは、IGHV2−510とIGHJ401との組み合わせであって、選択した鋳型ヒトVLは、IGKV1−3301とIGKJ201との組み合わせであった。13F1については、選択した鋳型ヒトVHは、IGHV3−2104とIGHJ401との組み合わせであって、選択した鋳型ヒトVLは、IGKV7−301とIGKJ201との組み合わせであった。
上述した鋳型ヒト抗体のCDRアミノ酸配列を、マウス7A4及び13F1抗体のCDRのアミノ酸配列で置換した。加えて、上述した鋳型ヒト抗体VH及びVLのフレームワークに、マウス7A4及び13F1抗体のVH及びVLから必要なアミノ酸配列を移植して機能的なヒト化抗体を得た。7A4及び13F1のVH及びVLに関しては、上述した鋳型ヒト抗体におけるフレームワークアミノ酸のいくつかの部位を、マウス7A4及び13F1抗体の対応するアミノ酸配列に復帰突然変異させた。ヒト化7A4抗体の軽鎖可変領域については、40位のアミノ酸をTyr(Y)からPhe(F)に変異させ、72位のアミノ酸をGly(G)からArg(R)に変異させた;ヒト化7A4抗体の重鎖可変領域については、2位のアミノ酸をVal(V)からIle(I)に変異させ、46位のアミノ酸をGlu(E)からLys(K)に変異させ、70位のアミノ酸をPhe(F)からIle(I)に変異させた。ヒト化13F1抗体の軽鎖可変領域については、45位のアミノ酸をLeu(L)からPro(P)に変異させ、70位のアミノ酸をPhe(F)からTyr(Y)に変異させた;ヒト化13F1抗体の重鎖可変領域については、26位のアミノ酸をGly(G)からTyr(Y)に変異させ、48位のアミノ酸をIle(I)からMet(M)に変異させ、49位のアミノ酸をGly(G)からAla(A)に変異させ、67位のアミノ酸をVal(V)からIle(I)に変異させ、71位のアミノ酸をVal(V)からArg(R)に変異させた。
ヒト化13F1抗体の可変軽鎖及び可変重鎖のアミノ酸配列を、それぞれ配列番号143及び141と称した。アミノ酸配列をコードするDNAの塩基配列を設計した(それぞれ配列番号140及び142)。ヒト化7A4抗体の可変軽鎖及び可変重鎖のアミノ酸配列を、それぞれ配列番号133及び131と称した。アミノ酸配列をコードするDNAの塩基配列を設計した(それぞれ配列番号130及び132)。
ヒト化7A4及び13F1抗体のIgG1及びIgG4型を作製した(h13F1−IgG1、h13F1−IgG4、h7A4−IgG1及びh7A4−IgG4)。IgG1定常領域がD265A突然変異(Clynes R,et al,Nature Medicine 6:443−446(2000))を持つ一方で、IgG4定常領域は、F234A及びL235Aの二重突然変異(Xu D,et al,Cellular Immunology 200:16−26(2000))を有する。定常領域配列を配列番号150及び151に開示する。h13F1−IgG1(配列番号149及び145)、h13F1−IgG4(配列番号149及び147)、h7A4−IgG1(配列番号139及び135)、及びh7A4−IgG4(配列番号139及び137)の完全軽鎖及び重鎖アミノ酸配列を、表3で上に提供する。7A4の軽鎖において脱アミド化し得る部位を除去するために、Asn85をAspに変異させた(h7A4D)。軽鎖可変領域(配列番号152)及び完全軽鎖アミノ酸配列(配列番号153)もまた、表3で上に提供する。
ヒト化7A4、7A4D及び13F1抗体の構築及び発現
ヒト化7A4、7A4D及び13F1抗体の軽鎖及び重鎖をコードするDNAを合成し、発現ベクターのpcDNA3.1(Invitrogen、カタログ番号V−790)にクローニングした。Freestyle293細胞(10個/mLで200mL)に、100μgのヒト化重鎖及び軽鎖発現プラスミドの各々をトランスフェクトし、6日間培養した。次いで、上清中のヒト化抗体をプロテインGカラム(GE healthcare)で精製した。
実施例10:結合活性及び特異性、ならびにリガンド(PD−L1)妨害活性におけるヒト化抗PD−1抗体の特徴付け
ヒト化13F1−hIgG1、13F1−hIgG4、7A4−IgG1及び7A4−hIgG4抗体の生成及び精製後、抗体の結合及び特異性を、ELISAに基づく結合及びPD−1妨害分析、加えてFACSに基づく結合及びPD−L1妨害分析に基づいて決定した。使用した方法は、実施例2及び4で上に記載したものと同様であった。
ELISAに基づく結合アッセイでは、ヒト化13F1抗体のhu−13F1−hIgG1及びhu−13F1−hIgG4は、キメラ抗体の13F1−キメラと比較して類似したPD−1への結合を示し(図6A、上部パネル);ヒト化7A4抗体のhu−7A4−D265A−hIgG1及び7A4−huIgG4は、キメラ7A4抗体と比較して類似したPD−1への結合を示した(図6B、上部パネル)。対照的に、アイソタイプ対照hIgG4抗体は、PD−1結合を示さなかった。図6A及び図6Bの下部パネルは、ELISA結合データから計算した、試験した抗体の各々のEC50を示し、ヒト化13F1及び7A4抗体がPD−1結合を示したことを実証している。
同様に、FACSに基づく結合アッセイでは、ヒト化13F1抗体のhu−13F1−hIgG1及びhu−13F1−hIgG4(図7A、上部パネル)ならびにヒト化7A4抗体のhu−7A4−D265A−hIgG1及び7A4−huIgG4(図7B、上部パネル)が、PD−1への結合を示した。ヒト化13F1及び7A4抗体のFACS結合データから計算したEC50を、それぞれ図7A及び図7Bに示す。
図8は、ヒト化13F1抗体及びヒト化7A4抗体のELISAに基づくリガンドブロッキングアッセイの結果を示す。図8A及び図8Bに示すように、それぞれヒト化13F1及び7A4抗体は、対応するキメラ抗体と比較して類似したリガンド妨害活性を示した。ヒト化及びキメラ抗体の各々について、IC50の定量化を図8Cに示す。
図9は、ヒト化13F1抗体及びヒト化7A4抗体の各々が、FACSに基づくリガンド妨害アッセイにより測定されるようにPD−L1結合をブロックしたことを示す。図9の下部パネルは、ヒト化抗体の各々のIC50を提供する。
実施例11:ヒト化13F1、7A4及び7A4D抗PD−1抗体のBiacore速度論的分析
ヒト化抗体の結合特性を特徴付けるために、PD−1とPD−1抗体との間の結合速度をBiacore3000により測定し、1Hzのデータ収集速度で記録した。ポリクローナルウサギ抗マウスIgG(GE、BR−1008−38)を10mMのpH5.0の酢酸ナトリウムで希釈し、およそ15000RUでCM5バイオセンサーチップの参照用及び実験用フローセルにamine coupling kit(GE、BR10050)を使用して固定化した。各サイクルの開始時に、希釈した試験抗体(1.5μg/ml)を、捕捉するために1分間実験フローセルに注入した。PD−1分析物系列は、ストックをランニング緩衝液で100nMまで希釈し、続いて同じ緩衝液中で0.78nMに至るまで連続2倍希釈を行って調製した。分析物を30μL/分の流速で3分間、参照用及び実験用フローセルに連続して注入した。次いで、ランニング緩衝液(0.05%のP20を加えたPBS)を30μL/分の流速で10分間にわたって流した。各サイクルの最後に、バイオセンサー表面を、10μL/分の流速で10mMのpH1.7のグリシン−HCl緩衝液を3分間注入して再生した。各分析物試料の注入(すなわち、各サイクル)について、同時に記録した参照表面での応答を差し引き、続いて単一参照用のランニング緩衝液試料での応答をさらに差し引いて、実験バイオセンサー表面から得られた結合応答を二重参照した。結合及び解離速度定数(ka及びkd)を、Biaevaluation 4.0ソフトウェアを使用して、力価測定系列全体の二重参照したセンサーグラムをラングミュアモデル(1:1)にフィッティングすることにより同時に決定した。解離定数、すなわちKDを、決定した速度定数から関係KD=kd/kaによって計算した。図10及び図17Aに示すように、ヒト化抗PD−1抗体の13F1、7A4、及び7A4Dは、高い親和性でヒトPD−1と結合した。Biocore結合曲線を図10及び図17Aの上部パネルに示し、定量化結合データを図10及び図17Aの下部パネルにまとめる。図17Bは、7A4D−hIgG4抗体による、293T−PD1細胞に対するPD−L1の結合の妨害IC50を示す。
実施例12:混合リンパ球反応(MLR)におけるサイトカイン産生に対するヒト化抗PD−1抗体の効果
混合リンパ球反応(MLR)を用いて、ヒト化抗体がリンパ球エフェクター細胞のPD−1経路をブロックする能力を実証した。アッセイでは、抗PD−1抗体の存在下または非存在下におけるIFNγ及びIL−2分泌についてT細胞を試験した。ヒトCD4T細胞を、CD4の陰性選択アイソレーションキット(Mitenyi Biotech、カタログ番号130−091−155)を使用してヒトPBMCから精製した。未熟樹状細胞(DC)を、Mo−DC Generation Toolbox(Miltenyi、カタログ番号130−093−568)を使用してヒトPBMCから単離した単球から得た。細胞をMo−DC分化培地で7日間培養し、次いで成熟DCとなるようにMo−Dc Maturation mediumで2日間誘導した。MLRを設定するために、10個の精製T細胞及び10個の同種異系成熟DC細胞を各ウェルに添加し、総体積を200μlとした。試験する抗体を、20μg/ml〜0.002μg/mlの濃度範囲でアッセイした。抗体なし、またはアイソタイプ対照抗体(hIgG4)のいずれかを陰性対照として使用した。細胞を37℃で5日間培養した。6日目に、培地中のIFN−γ及びIL−2のレベルを、IL−2 ELISAキット(eBioscience)及びhIFN−γ ELISA kit(R&D、カタログ番号DY285)を使用して測定した。ヒト化13F1抗体について、結果を図11(IL−2産生)及び図12(IFNγ産生)に示す。ヒト化13F1抗体の各々は、濃度依存的様式でIL−2及びIFNγ産生を促進した。同様に、ヒト化7A4及び7A4D抗体は、濃度依存的様式でIL−2(図13及び18)及びIFNγ(図14及び19)産生を促進した。アイソタイプ対照抗体を含有する培養物は、IFN−γ及びIL−2分泌の増加を示さなかった。したがって、試験の結果は、ヒト化PD−1抗体がPD−1経路をブロックし、T細胞免疫応答を刺激することを示した。
実施例13:破傷風トキソイド負荷に対するヒトリコールT細胞応答をヒト化抗PD−1抗体により増強する
抗原特異的T細胞受容体の誘発が、PD−1/PD−L1経路を抗PD−1抗体でブロックすることにより調節されたか否かを調査するために、ヒトT細胞リコールアッセイを用いて、破傷風トキソイド(TT)抗原を使用し、健康なTT免疫化ドナーの血中における既存のメモリーT細胞を刺激した。この目的のために、TT免疫化ドナーから最近採取した新鮮なPBMC(1年未満に採取した試料)を、80U/mlのペニシリン、80g/mlのストレプトマイシン及び30%の自己血清を補充したRPMI1640(Invitrogen、カタログ番号A10491−01)を使用して、4×10個の細胞/ウェルで96ウェル丸底プレート(costar、カタログ番号3799)に播種した。ヒト化13F1または7A4抗体を種々の濃度で添加し、0.1ug/mlのSEB及び1ug/mlのTT(Astarte Biologies)で刺激した。37℃、5%COで7日間の共培養後、上清を採取してIFN−γの濃度を測定した。試験の結果を図15に示し、これはTT抗原単独と比較して、抗PD−1抗体でのPD−L1妨害が、メモリーT細胞によるIFN−γ分泌の増強をもたらしたことを実証する。
実施例14:自己T細胞活性化に対するヒト化抗PD−1抗体の効果
本実施例では、T細胞活性化に対する、ヒト化抗PD−1抗体によりPD−/PD−L1経路をブロックすることの効果を検査した。精製したヒトCD4+T細胞(Mitenyi Biotech、カタログ番号130−091−155)を、自己単球由来樹状細胞(DC)の存在下で1μg/mlの可溶性抗CD3抗体(R&D、カタログ番号MAB100)で活性化した。力価測定用抗PD−1抗体の存在下または非存在下における活性化から3日後、培地を採取してIFNγの濃度をELISAで測定した。結果を図16に示し、これは抗PD−1抗体によるPD−L1妨害が、T細胞によるIFN−γ分泌を増強したことを示している。
一実施形態では、本発明は、感染症の処置を必要とする対象の感染症を処置する方法を提供し、この方法は、対象に治療有効量の本発明の抗PD−1抗体または断片を投与することを含む。さらなる実施形態では、感染症は、カンジダ症、カンジダ血症、アスペルギルス症、連鎖球菌性肺炎、連鎖球菌性の皮膚及び口咽頭の状態、グラム陰性菌による敗血症、結核、単核球症、インフルエンザ、呼吸器合胞体ウイルスにより引き起こされる呼吸器病、マラリア、住血吸虫症、ならびにトリパノソーマ症から成る群から選択される。
[本発明1001]
PD−1に結合する単離された抗体またはその断片であって、
配列番号24、34、45、55、65、75、85、95、105、及び115から成る群から選択されるアミノ酸配列と少なくとも80%の相同性を有する軽鎖CDR1配列;
配列番号25、35、46、56、66、76、86、96、106、及び116から成る群から選択されるアミノ酸配列と少なくとも80%の相同性を有する軽鎖CDR2配列;
配列番号26、36、47、57、67、77、87、97、107、及び117から成る群から選択されるアミノ酸配列と少なくとも80%の相同性を有する軽鎖CDR3配列;
配列番号19、29、40、50、60、70、80、90、100、及び110から成る群から選択されるアミノ酸配列と少なくとも80%の相同性を有する重鎖CDR1配列;
配列番号20、30、41、51、61、71、81、91、101、及び111から成る群から選択されるアミノ酸配列と少なくとも80%の相同性を有する重鎖CDR2配列;及び
配列番号21、31、42、52、62、72、82、92、102、及び112から成る群から選択されるアミノ酸配列と少なくとも80%の相同性を有する重鎖CDR3配列
を含む、前記単離された抗体またはその断片。
[本発明1002]
配列番号24、34、45、55、65、75、85、95、105、及び115から成る群から選択されるアミノ酸配列から成る軽鎖CDR1;
配列番号25、35、46、66、76、86、96、106、及び116から成る群から選択されるアミノ酸配列から成る軽鎖CDR2;
配列番号26、36、47、57、67、77、87、97、107、及び117から成る群から選択されるアミノ酸配列から成る軽鎖CDR3;
配列番号19、29、40、50、60、70、80、90、100、及び110から成る群から選択されるアミノ酸配列から成る重鎖CDR1;
配列番号20、30、41、51、61、71、81、91、101、及び111から成る群から選択されるアミノ酸配列から成る重鎖CDR2;及び
配列番号21、31、42、52、62、72、82、92、102、及び112から成る群から選択されるアミノ酸配列から成る重鎖CDR3
を含む、本発明1001の抗体またはその断片。
[本発明1003]
それぞれ配列番号24、25、及び26のアミノ酸配列と少なくとも80%の相同性を有するアミノ酸配列を含む軽鎖CDR1、CDR2、及びCDR3;及び
それぞれ配列番号19、20、及び21のアミノ酸配列と少なくとも80%の相同性を有するアミノ酸配列を含む重鎖CDR1、CDR2、及びCDR3
を含む、本発明1001の抗体または断片。
[本発明1004]
それぞれ配列番号34、35、及び36のアミノ酸配列と少なくとも80%の相同性を有するアミノ酸配列を含む軽鎖CDR1、CDR2、及びCDR3;及び
それぞれ配列番号29、30、及び31のアミノ酸配列と少なくとも80%の相同性を有するアミノ酸配列を含む重鎖CDR1、CDR2、及びCDR3
を含む、本発明1001の抗体または断片。
[本発明1005]
それぞれ配列番号45、46、及び47のアミノ酸配列と少なくとも80%の相同性を有するアミノ酸配列を含む軽鎖CDR1、CDR2、及びCDR3;及び
それぞれ配列番号40、41、及び42のアミノ酸配列と少なくとも80%の相同性を有するアミノ酸配列を含む重鎖CDR1、CDR2、及びCDR3
を含む、本発明1001の抗体または断片。
[本発明1006]
それぞれ配列番号55、56、及び57のアミノ酸配列と少なくとも80%の相同性を有するアミノ酸配列を含む軽鎖CDR1、CDR2、及びCDR3;及び
それぞれ配列番号50、51、及び52のアミノ酸配列と少なくとも80%の相同性を有するアミノ酸配列を含む重鎖CDR1、CDR2、及びCDR3
を含む、本発明1001の抗体または断片。
[本発明1007]
それぞれ配列番号65、66、及び67のアミノ酸配列と少なくとも80%の相同性を有するアミノ酸配列を含む軽鎖CDR1、CDR2、及びCDR3;及び
それぞれ配列番号60、61、及び62のアミノ酸配列と少なくとも80%の相同性を有するアミノ酸配列を含む重鎖CDR1、CDR2、及びCDR3
を含む、本発明1001の抗体または断片。
[本発明1008]
それぞれ配列番号75、76、及び77のアミノ酸配列と少なくとも80%の相同性を有するアミノ酸配列を含む軽鎖CDR1、CDR2、及びCDR3;及び
それぞれ配列番号70、71、及び72のアミノ酸配列と少なくとも80%の相同性を有するアミノ酸配列を含む重鎖CDR1、CDR2、及びCDR3
を含む、本発明1001の抗体または断片。
[本発明1009]
それぞれ配列番号85、86、及び87のアミノ酸配列と少なくとも80%の相同性を有するアミノ酸配列を含む軽鎖CDR1、CDR2、及びCDR3;及び
それぞれ配列番号80、81、及び82のアミノ酸配列と少なくとも80%の相同性を有するアミノ酸配列を含む重鎖CDR1、CDR2、及びCDR3
を含む、本発明1001の抗体または断片。
[本発明1010]
それぞれ配列番号95、96、及び97のアミノ酸配列と少なくとも80%の相同性を有するアミノ酸配列を含む軽鎖CDR1、CDR2、及びCDR3;及び
それぞれ配列番号90、91、及び92のアミノ酸配列と少なくとも80%の相同性を有するアミノ酸配列を含む重鎖CDR1、CDR2、及びCDR3
を含む、本発明1001の抗体または断片。
[本発明1011]
それぞれ配列番号105、106、及び107のアミノ酸配列と少なくとも80%の相同性を有するアミノ酸配列を含む軽鎖CDR1、CDR2、及びCDR3;及び
それぞれ配列番号100、101、及び102のアミノ酸配列と少なくとも80%の相同性を有するアミノ酸配列を含む重鎖CDR1、CDR2、及びCDR3
を含む、本発明1001の抗体または断片。
[本発明1012]
それぞれ配列番号115、116、及び117のアミノ酸配列と少なくとも80%の相同性を有するアミノ酸配列を含む軽鎖CDR1、CDR2、及びCDR3;及び
それぞれ配列番号110、111、及び112のアミノ酸配列と少なくとも80%の相同性を有するアミノ酸配列を含む重鎖CDR1、CDR2、及びCDR3
を含む、本発明1001の抗体または断片。
[本発明1013]
キメラである、またはヒト化されている、本発明1001〜1012のいずれかの単離された抗体またはその断片。
[本発明1014]
PD−1に結合する単離された抗体またはその断片であって、
配列番号23、33、44、54、64、74、84、94、104、114、133、及び143から成る群から選択されるアミノ酸配列と少なくとも80%の相同性を有するアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域;及び
配列番号18、28、39、49、59、69、79、89、99、109、131、及び141から成る群から選択されるアミノ酸配列と少なくとも80%の相同性を有するアミノ酸配列を含む重鎖可変領域
を含む、前記単離された抗体またはその断片。
[本発明1015]
配列番号23、33、44、54、64、74、84、94、104、114、133、及び143から成る群から選択されるアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域;及び
配列番号18、28、39、49、59、69、79、89、99、109、131、及び141から成る群から選択されるアミノ酸配列を含む重鎖可変領域
を含む、本発明1014の単離された抗体またはその断片。
[本発明1016]
PD−1に結合する単離された抗体またはその断片であって、
配列番号133または152の軽鎖可変領域;及び
配列番号131の重鎖可変領域
を含む、前記単離された抗体またはその断片。
[本発明1017]
PD−1に結合する単離された抗体またはその断片であって、
配列番号143の軽鎖可変領域;及び
配列番号141の重鎖可変領域
を含む、前記単離された抗体またはその断片。
[本発明1018]
PD−1に結合する単離された抗体またはその断片であって、
配列番号139または153の軽鎖;及び
配列番号135の重鎖
を含む、前記単離された抗体またはその断片。
[本発明1019]
PD−1に結合する単離された抗体またはその断片であって、
配列番号139または153の軽鎖;及び
配列番号137の重鎖
を含む、前記単離された抗体またはその断片。
[本発明1020]
PD−1に結合する単離された抗体またはその断片であって、
配列番号149の軽鎖;及び
配列番号145の重鎖
を含む、前記単離された抗体またはその断片。
[本発明1021]
PD−1に結合する単離された抗体またはその断片であって、
配列番号149の軽鎖;及び
配列番号147の重鎖
を含む、前記単離された抗体またはその断片。
[本発明1022]
本発明1001〜1021のいずれかの抗体またはその断片と同じエピトープに結合する、単離された抗体またはその断片。
[本発明1023]
本発明1001〜1021のいずれかの抗体またはその断片とPD−1への結合について競合し、前記競合が、ELISA、フローサイトメトリー、または表面プラズモン共鳴(SPR)アッセイにより測定される、単離された抗体またはその断片。
[本発明1024]
モノクローナル抗体、scFv、Fab断片、Fab’断片、及びF(ab)’断片から成る群から選択される、本発明1001〜1021のいずれかの単離された抗体またはその断片。
[本発明1025]
治療剤に連結される、または治療剤と複合体化される、本発明1001〜1021のいずれかの抗体またはその断片。
[本発明1026]
前記治療剤が、細胞傷害性薬物、放射性同位体、免疫調節剤、または抗体である、本発明1025の抗体またはその断片。
[本発明1027]
PD−1に結合する単離された抗体またはその断片であって、PD−1に対して約1nM〜約0.01nMの親和性を有する、前記単離された抗体またはその断片。
[本発明1028]
PD−1に対して約1nM以下の親和性を有する、本発明1027の単離された抗体またはその断片。
[本発明1029]
PD−1に対して約0.1nM以下の親和性を有する、本発明1027の単離された抗体またはその断片。
[本発明1030]
PD−1に結合する単離された抗体またはその断片であって、前記抗体が、約5ng/mL〜約1000ng/mLの結合EC50を有する、前記単離された抗体またはその断片。
[本発明1031]
PD−1に結合する単離された抗体またはその断片であって、前記抗体が、PD−1とPD−L1との結合をブロックする、前記単離された抗体またはその断片。
[本発明1032]
約5ng/mL〜約1000ng/mLのIC50でPD−1とPD−L1またはPD−L2との結合をブロックする、本発明1031の単離された抗体またはその断片。
[本発明1033]
PD−1に結合する単離された抗体またはその断片であって、炎症性サイトカインの産生により測定されるT細胞活性化を増加させる、前記単離された抗体またはその断片。
[本発明1034]
IL−2及びIFNγのT細胞による産生を増加させる、本発明1028の単離された抗体またはその断片。
[本発明1035]
PD−1に結合する単離された抗体またはその断片であって、10D1、4C10、7D3、13F1、15H5、14A6、22A5、6E1、5A8、7A4、及び/または7A4Dから成る群から選択されるハイブリドーマによって産生される、前記単離された抗体またはその断片。
[本発明1036]
本発明1001〜1035のいずれかの抗体またはその断片と、
薬学的に許容される担体と
を含む組成物。
[本発明1037]
本発明1001〜1035のいずれかの抗体またはその断片をコードする、単離されたポリヌクレオチド。
[本発明1038]
本発明1037の単離されたポリヌクレオチドを含む、発現ベクター。
[本発明1039]
本発明1038の発現ベクターを含む、宿主細胞。
[本発明1040]
10D1、4C10、7D3、13F1、15H5、14A6、22A5、6E1、5A8、7A4及び7A4Dから成る群から選択される、単離されたハイブリドーマ細胞株。
[本発明1041]
T細胞活性化を増加させるための方法であって、T細胞を本発明1001〜1035のいずれかの抗体またはその断片と接触させる段階を含む、前記方法。
[本発明1042]
対象における腫瘍を減少させるための方法または腫瘍細胞の増殖を阻害するための方法であって、前記対象に治療有効量の本発明1001〜1035のいずれかの単離された抗体またはその断片を投与する段階を含む、前記方法。
[本発明1043]
癌の処置を必要とする対象において癌を処置するための方法であって、治療有効量の本発明1001〜1035のいずれかの単離された抗体またはその断片を前記対象に投与する段階を含む、前記方法。
[本発明1044]
前記癌が、リンパ腫、白血病、黒色腫、神経膠腫、乳癌、肺癌、結腸癌、骨癌、卵巣癌、膀胱癌、腎臓癌、肝臓癌、胃癌、直腸癌、精巣癌、唾液腺癌、甲状腺癌、胸腺癌、上皮癌、頭頸部癌、胃の癌、膵臓癌、またはこれらの組み合わせから成る群から選択される、本発明1043の方法。
[本発明1045]
感染症の処置を必要とする対象において感染症を処置するための方法であって、治療有効量の本発明1001〜1035のいずれかの単離された抗体またはその断片を前記対象に投与する段階を含む、前記方法。
[本発明1046]
前記感染症が、カンジダ症、カンジダ血症、アスペルギルス症、連鎖球菌性肺炎、連鎖球菌性の皮膚及び口咽頭の状態、グラム陰性菌による敗血症、結核、単核球症、インフルエンザ、呼吸器合胞体ウイルスにより引き起こされる呼吸器病、マラリア、住血吸虫症、ならびにトリパノソーマ症から成る群から選択される、本発明1045の方法。

Claims (46)

  1. PD−1に結合する単離された抗体またはその断片であって、
    配列番号24、34、45、55、65、75、85、95、105、及び115から成る群から選択されるアミノ酸配列と少なくとも80%の相同性を有する軽鎖CDR1配列;
    配列番号25、35、46、56、66、76、86、96、106、及び116から成る群から選択されるアミノ酸配列と少なくとも80%の相同性を有する軽鎖CDR2配列;
    配列番号26、36、47、57、67、77、87、97、107、及び117から成る群から選択されるアミノ酸配列と少なくとも80%の相同性を有する軽鎖CDR3配列;
    配列番号19、29、40、50、60、70、80、90、100、及び110から成る群から選択されるアミノ酸配列と少なくとも80%の相同性を有する重鎖CDR1配列;
    配列番号20、30、41、51、61、71、81、91、101、及び111から成る群から選択されるアミノ酸配列と少なくとも80%の相同性を有する重鎖CDR2配列;及び
    配列番号21、31、42、52、62、72、82、92、102、及び112から成る群から選択されるアミノ酸配列と少なくとも80%の相同性を有する重鎖CDR3配列
    を含む、前記単離された抗体またはその断片。
  2. 配列番号24、34、45、55、65、75、85、95、105、及び115から成る群から選択されるアミノ酸配列から成る軽鎖CDR1;
    配列番号25、35、46、66、76、86、96、106、及び116から成る群から選択されるアミノ酸配列から成る軽鎖CDR2;
    配列番号26、36、47、57、67、77、87、97、107、及び117から成る群から選択されるアミノ酸配列から成る軽鎖CDR3;
    配列番号19、29、40、50、60、70、80、90、100、及び110から成る群から選択されるアミノ酸配列から成る重鎖CDR1;
    配列番号20、30、41、51、61、71、81、91、101、及び111から成る群から選択されるアミノ酸配列から成る重鎖CDR2;及び
    配列番号21、31、42、52、62、72、82、92、102、及び112から成る群から選択されるアミノ酸配列から成る重鎖CDR3
    を含む、請求項1に記載の抗体またはその断片。
  3. それぞれ配列番号24、25、及び26のアミノ酸配列と少なくとも80%の相同性を有するアミノ酸配列を含む軽鎖CDR1、CDR2、及びCDR3;及び
    それぞれ配列番号19、20、及び21のアミノ酸配列と少なくとも80%の相同性を有するアミノ酸配列を含む重鎖CDR1、CDR2、及びCDR3
    を含む、請求項1に記載の抗体または断片。
  4. それぞれ配列番号34、35、及び36のアミノ酸配列と少なくとも80%の相同性を有するアミノ酸配列を含む軽鎖CDR1、CDR2、及びCDR3;及び
    それぞれ配列番号29、30、及び31のアミノ酸配列と少なくとも80%の相同性を有するアミノ酸配列を含む重鎖CDR1、CDR2、及びCDR3
    を含む、請求項1に記載の抗体または断片。
  5. それぞれ配列番号45、46、及び47のアミノ酸配列と少なくとも80%の相同性を有するアミノ酸配列を含む軽鎖CDR1、CDR2、及びCDR3;及び
    それぞれ配列番号40、41、及び42のアミノ酸配列と少なくとも80%の相同性を有するアミノ酸配列を含む重鎖CDR1、CDR2、及びCDR3
    を含む、請求項1に記載の抗体または断片。
  6. それぞれ配列番号55、56、及び57のアミノ酸配列と少なくとも80%の相同性を有するアミノ酸配列を含む軽鎖CDR1、CDR2、及びCDR3;及び
    それぞれ配列番号50、51、及び52のアミノ酸配列と少なくとも80%の相同性を有するアミノ酸配列を含む重鎖CDR1、CDR2、及びCDR3
    を含む、請求項1に記載の抗体または断片。
  7. それぞれ配列番号65、66、及び67のアミノ酸配列と少なくとも80%の相同性を有するアミノ酸配列を含む軽鎖CDR1、CDR2、及びCDR3;及び
    それぞれ配列番号60、61、及び62のアミノ酸配列と少なくとも80%の相同性を有するアミノ酸配列を含む重鎖CDR1、CDR2、及びCDR3
    を含む、請求項1に記載の抗体または断片。
  8. それぞれ配列番号75、76、及び77のアミノ酸配列と少なくとも80%の相同性を有するアミノ酸配列を含む軽鎖CDR1、CDR2、及びCDR3;及び
    それぞれ配列番号70、71、及び72のアミノ酸配列と少なくとも80%の相同性を有するアミノ酸配列を含む重鎖CDR1、CDR2、及びCDR3
    を含む、請求項1に記載の抗体または断片。
  9. それぞれ配列番号85、86、及び87のアミノ酸配列と少なくとも80%の相同性を有するアミノ酸配列を含む軽鎖CDR1、CDR2、及びCDR3;及び
    それぞれ配列番号80、81、及び82のアミノ酸配列と少なくとも80%の相同性を有するアミノ酸配列を含む重鎖CDR1、CDR2、及びCDR3
    を含む、請求項1に記載の抗体または断片。
  10. それぞれ配列番号95、96、及び97のアミノ酸配列と少なくとも80%の相同性を有するアミノ酸配列を含む軽鎖CDR1、CDR2、及びCDR3;及び
    それぞれ配列番号90、91、及び92のアミノ酸配列と少なくとも80%の相同性を有するアミノ酸配列を含む重鎖CDR1、CDR2、及びCDR3
    を含む、請求項1に記載の抗体または断片。
  11. それぞれ配列番号105、106、及び107のアミノ酸配列と少なくとも80%の相同性を有するアミノ酸配列を含む軽鎖CDR1、CDR2、及びCDR3;及び
    それぞれ配列番号100、101、及び102のアミノ酸配列と少なくとも80%の相同性を有するアミノ酸配列を含む重鎖CDR1、CDR2、及びCDR3
    を含む、請求項1に記載の抗体または断片。
  12. それぞれ配列番号115、116、及び117のアミノ酸配列と少なくとも80%の相同性を有するアミノ酸配列を含む軽鎖CDR1、CDR2、及びCDR3;及び
    それぞれ配列番号110、111、及び112のアミノ酸配列と少なくとも80%の相同性を有するアミノ酸配列を含む重鎖CDR1、CDR2、及びCDR3
    を含む、請求項1に記載の抗体または断片。
  13. キメラである、またはヒト化されている、請求項1〜12のいずれか1項に記載の単離された抗体またはその断片。
  14. PD−1に結合する単離された抗体またはその断片であって、
    配列番号23、33、44、54、64、74、84、94、104、114、133、及び143から成る群から選択されるアミノ酸配列と少なくとも80%の相同性を有するアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域;及び
    配列番号18、28、39、49、59、69、79、89、99、109、131、及び141から成る群から選択されるアミノ酸配列と少なくとも80%の相同性を有するアミノ酸配列を含む重鎖可変領域
    を含む、前記単離された抗体またはその断片。
  15. 配列番号23、33、44、54、64、74、84、94、104、114、133、及び143から成る群から選択されるアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域;及び
    配列番号18、28、39、49、59、69、79、89、99、109、131、及び141から成る群から選択されるアミノ酸配列を含む重鎖可変領域
    を含む、請求項14に記載の単離された抗体またはその断片。
  16. PD−1に結合する単離された抗体またはその断片であって、
    配列番号133または152の軽鎖可変領域;及び
    配列番号131の重鎖可変領域
    を含む、前記単離された抗体またはその断片。
  17. PD−1に結合する単離された抗体またはその断片であって、
    配列番号143の軽鎖可変領域;及び
    配列番号141の重鎖可変領域
    を含む、前記単離された抗体またはその断片。
  18. PD−1に結合する単離された抗体またはその断片であって、
    配列番号139または153の軽鎖;及び
    配列番号135の重鎖
    を含む、前記単離された抗体またはその断片。
  19. PD−1に結合する単離された抗体またはその断片であって、
    配列番号139または153の軽鎖;及び
    配列番号137の重鎖
    を含む、前記単離された抗体またはその断片。
  20. PD−1に結合する単離された抗体またはその断片であって、
    配列番号149の軽鎖;及び
    配列番号145の重鎖
    を含む、前記単離された抗体またはその断片。
  21. PD−1に結合する単離された抗体またはその断片であって、
    配列番号149の軽鎖;及び
    配列番号147の重鎖
    を含む、前記単離された抗体またはその断片。
  22. 請求項1〜21のいずれか1項に記載の抗体またはその断片と同じエピトープに結合する、単離された抗体またはその断片。
  23. 請求項1〜21のいずれか1項に記載の抗体またはその断片とPD−1への結合について競合し、前記競合が、ELISA、フローサイトメトリー、または表面プラズモン共鳴(SPR)アッセイにより測定される、単離された抗体またはその断片。
  24. モノクローナル抗体、scFv、Fab断片、Fab’断片、及びF(ab)’断片から成る群から選択される、請求項1〜21のいずれか1項に記載の単離された抗体またはその断片。
  25. 治療剤に連結される、または治療剤と複合体化される、請求項1〜21のいずれか1項に記載の抗体またはその断片。
  26. 前記治療剤が、細胞傷害性薬物、放射性同位体、免疫調節剤、または抗体である、請求項25に記載の抗体またはその断片。
  27. PD−1に結合する単離された抗体またはその断片であって、PD−1に対して約1nM〜約0.01nMの親和性を有する、前記単離された抗体またはその断片。
  28. PD−1に対して約1nM以下の親和性を有する、請求項27に記載の単離された抗体またはその断片。
  29. PD−1に対して約0.1nM以下の親和性を有する、請求項27に記載の単離された抗体またはその断片。
  30. PD−1に結合する単離された抗体またはその断片であって、前記抗体が、約5ng/mL〜約1000ng/mLの結合EC50を有する、前記単離された抗体またはその断片。
  31. PD−1に結合する単離された抗体またはその断片であって、前記抗体が、PD−1とPD−L1との結合をブロックする、前記単離された抗体またはその断片。
  32. 約5ng/mL〜約1000ng/mLのIC50でPD−1とPD−L1またはPD−L2との結合をブロックする、請求項31に記載の単離された抗体またはその断片。
  33. PD−1に結合する単離された抗体またはその断片であって、炎症性サイトカインの産生により測定されるT細胞活性化を増加させる、前記単離された抗体またはその断片。
  34. IL−2及びIFNγのT細胞による産生を増加させる、請求項28に記載の単離された抗体またはその断片。
  35. PD−1に結合する単離された抗体またはその断片であって、10D1、4C10、7D3、13F1、15H5、14A6、22A5、6E1、5A8、7A4、及び/または7A4Dから成る群から選択されるハイブリドーマによって産生される、前記単離された抗体またはその断片。
  36. 請求項1〜35のいずれか1項に記載の抗体またはその断片と、
    薬学的に許容される担体と
    を含む組成物。
  37. 請求項1〜35のいずれか1項に記載の抗体またはその断片をコードする、単離されたポリヌクレオチド。
  38. 請求項37に記載の単離されたポリヌクレオチドを含む、発現ベクター。
  39. 請求項38に記載の発現ベクターを含む、宿主細胞。
  40. 10D1、4C10、7D3、13F1、15H5、14A6、22A5、6E1、5A8、7A4及び7A4Dから成る群から選択される、単離されたハイブリドーマ細胞株。
  41. T細胞活性化を増加させるための方法であって、T細胞を請求項1〜35のいずれか1項に記載の抗体またはその断片と接触させる段階を含む、前記方法。
  42. 対象における腫瘍を減少させるための方法または腫瘍細胞の増殖を阻害するための方法であって、前記対象に治療有効量の請求項1〜35のいずれか1項に記載の単離された抗体またはその断片を投与する段階を含む、前記方法。
  43. 癌の処置を必要とする対象において癌を処置するための方法であって、治療有効量の請求項1〜35のいずれか1項に記載の単離された抗体またはその断片を前記対象に投与する段階を含む、前記方法。
  44. 前記癌が、リンパ腫、白血病、黒色腫、神経膠腫、乳癌、肺癌、結腸癌、骨癌、卵巣癌、膀胱癌、腎臓癌、肝臓癌、胃癌、直腸癌、精巣癌、唾液腺癌、甲状腺癌、胸腺癌、上皮癌、頭頸部癌、胃の癌、膵臓癌、またはこれらの組み合わせから成る群から選択される、請求項43に記載の方法。
  45. 感染症の処置を必要とする対象において感染症を処置するための方法であって、治療有効量の請求項1〜35のいずれか1項に記載の単離された抗体またはその断片を前記対象に投与する段階を含む、前記方法。
  46. 前記感染症が、カンジダ症、カンジダ血症、アスペルギルス症、連鎖球菌性肺炎、連鎖球菌性の皮膚及び口咽頭の状態、グラム陰性菌による敗血症、結核、単核球症、インフルエンザ、呼吸器合胞体ウイルスにより引き起こされる呼吸器病、マラリア、住血吸虫症、ならびにトリパノソーマ症から成る群から選択される、請求項45に記載の方法。
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