JP2008224636A - 質量分析システム - Google Patents
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Abstract
本発明の目的は、健常者データのばらつきを考慮した、疾病患者特有の変動タンパク質や代謝物など(マーカ)の探索を、MSを用いて高精度・高スループットに実施するシステムを提供することである。
【解決手段】
本発明では、上記課題を解決するため、取得されたばかりのデータをリアルタイムに解析し、また、すでに取得された複数サンプルのデータを予め統計処理し、その結果をリアルタイム比較することにより、変動成分の可能性があると判定された場合に次の分析内容を最適化する。
【選択図】図1
Description
(1)複数の参照データに対して統計処理し、成分ごとに得られた、代表値や分散値に基づいて、取得されたマススペクトルデータと比較し、その結果に応じて、次の分析内容を最適化する。
(2)複数の参照データに対して、データの類似性などからグループ分けし、取得されたマススペクトルデータが、どのグループのデータ群に近いかを判定し、判定後は、最も近いグループのデータを参照・比較して、その結果に応じて、次の分析内容を最適化する。
(3)複数の参照データに対して、成分間でデータの変動特性が類似のものをグループ分けし、取得されたマススペクトルデータにて検出された成分が、どのグループの成分群に属するかを判定し、その結果に応じて、次の分析内容を最適化する。
(LC)などの前処理系11で前処理される。例えば、元の試料であるタンパク質である場合、前処理系11にて、消化酵素によりポリペプチドの大きさに分解され、ガスクロマトグラフィー(GC)又は液体クロマトグラフィー(LC)により分離・分画される。以下、前処理系11での分離・分画系としてLCを採用した場合の例を示す。
(Electron Capture Dissociation)を採用しても良い。
ΔXi≦Δiである場合は次の通常分析或いは計測終了6へと移行し、ΔXiがΔiよりも大きい場合は変動成分の可能性があるとみなして、その後は、図1と同様に、次の分析内容決定9といった処理の流れになる。
2 ピーク判定(ピーク総数Np)
3 同位体ピーク判定(同位体無しのピーク数Npi)
4 参照データベースとの比較
5 ピーク(成分)iをMSn+1分析の前駆イオンとして選択
6 次の通常分析或いは計測終了
7 MSn+1分析条件設定
8 MSn+1分析
9 次の分析内容決定
10 参照データベース(DB)
11 前処理系
12 イオン化部
13 質量分析部
14 イオン検出部
15 データ処理部(CPU)
16 表示部
17 制御部
18 ユーザ入力部
19 質量分析システム
20 MSn(n≧2)を禁止して、MS1分析を決定
21 MS1分析
22 グループ分けした参照データベースとの比較
24 グループ分けした成分群との比較
25 自動作成ツール
40 質量分析装置
50 制御手段
Claims (17)
- 測定対象となる物質を多段階で解離し、各解離段階で生成したイオン種のマススペクトルを測定するタンデム型質量分析装置と、
複数のイオン種の特性情報を格納したデータベースを有する制御手段と、を有する質量分析システムであり、
前記制御手段は、前記タンデム型質量分析装置により測定されたn(nは1以上の整数)段階目の測定結果の情報と前記データベースの情報とに基づいて、前記タンデム型質量分析装置のn+1段階目の測定対象及び測定条件を決定するものであり、
前記イオン種の特性情報は、複数のサンプルの測定値に対して統計処理を行った情報を含む
質量分析システム。 - 前記統計処理を行った情報は、
前記複数のサンプルの測定値の平均値,最頻値,中央値のいずれか1つである代表値、及び前記複数のサンプルの測定値の分散値を含む
請求項1に記載の質量分析システム。 - 前記複数のサンプルの測定値は、
少なくとも、イオン種の質量数,液体クロマトグラフィー又はガスクロマトグラフィーでの保持時間,検出強度,マスクロマトグラムでの面積、に関する情報を有する
請求項2に記載の質量分析システム。 - 前記制御手段は、前記n段階目の測定結果から得られたイオン種の情報と、前記データベースから選択された対応イオン種の代表値との差を求め、
前記差の値が、前記データベースから選択された対応イオン種の分散値を超えた場合に、
前記イオン種を前記タンデム型質量分析装置のn+1段階目の測定対象とする
請求項2に記載の質量分析システム。 - 前記制御手段による処理は、
前記n+1段階目の測定に移行する準備時間内に行われ、
10msec以内の時間内に行われる
請求項2に記載の質量分析システム。 - 前記制御手段は自動作成ツールを有し、
前記自動作成ツールは、取得された複数のサンプルの測定値に対し自動的に統計処理を行い、前記データベースへと格納する
請求項1に記載の質量分析システム。 - 前記データベースは、
複数のサンプルの測定値を類似性評価により複数のグループに分類している
請求項1に記載の質量分析システム。 - 前記統計処理を行った情報は、
前記グループごとの測定値の平均値,最頻値,中央値のいずれか1つである代表値、及び前記グループごとの測定値の分散値を含む
請求項7に記載の質量分析システム。 - 前記グループの分類は、複数のサンプルの測定情報のプロファイル傾向の類似性評価により行われる
請求項7に記載の質量分析システム。 - 前記グループの分類は、一種以上のイオン種を選択し、該イオン種の測定情報の類似性評価により行われる
請求項7に記載の質量分析システム。 - 前記制御手段は、
前記データベース内の複数のグループから、前記n段階目の測定結果の情報と最も類似性の高いグループを選択し、
前記選択したグループの情報と前記n段階目の測定結果の情報との比較に基づいて、前記タンデム型質量分析装置のn+1段階目の測定対象及び測定条件を決定する
請求項7に記載の質量分析システム。 - 前記データベースは、
複数のイオン種の測定値を類似性評価により複数のグループに分類している
請求項1に記載の質量分析システム。 - 測定対象となる物質を多段階で解離し、各解離段階で生成したイオン種のマススペクトルを測定するタンデム型質量分析装置と、
複数のイオン種の特性情報を格納したデータベースを有する制御手段と、を有する質量分析システムであり、
前記制御手段は、前記タンデム型質量分析装置により測定されたn(nは1以上の整数)段階目の測定結果の情報と前記データベースの情報とに基づいて、前記タンデム型質量分析装置をn+1段階目の測定へ移行するか否かを決定するものであり、
前記イオン種の特性情報は、複数のサンプルの測定値に対して統計処理を行った情報を含む
質量分析システム。 - 前記統計処理を行った情報は、
前記複数のサンプルの測定値の平均値,最頻値,中央値のいずれか1つである代表値、及び前記複数のサンプルの測定値の分散値である
請求項13に記載の質量分析システム。 - 前記複数のサンプルの測定値は、
少なくとも、イオン種の質量数,液体クロマトグラフィー又はガスクロマトグラフィーでの保持時間,検出強度,マスクロマトグラムでの面積、に関する情報を有する
請求項14に記載の質量分析システム。 - 前記制御手段は、前記n段階目の測定結果から得られたイオン種の情報と前記データベースから選択された対応イオン種の代表値との差を求め、
前記差の値が、前記データベースから選択された対応イオン種の分散値以下となるまで、
前記タンデム型質量分析装置のn+1段階目の測定へ移行せず、n段階目の測定を継続する
請求項14に記載の質量分析システム。 - 測定対象となる物質を多段階で解離し、各解離段階で生成したイオン種のマススペクトルを測定するタンデム型質量分析装置と、
複数のイオン種の特性情報を格納したデータベースと自動作成ツールとを有する制御手段と、を有する質量分析システムであり、
前記制御手段は、前記タンデム型質量分析装置により測定されたn(nは1以上の整数)段階目の測定結果に基づく情報を、前記自動作成ツールで統計処理を行い、前記データベースへと格納する
質量分析システム。
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JP2007067798A JP4839248B2 (ja) | 2007-03-16 | 2007-03-16 | 質量分析システム |
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---|---|---|---|---|
JPH08124519A (ja) * | 1994-10-21 | 1996-05-17 | Shimadzu Corp | Ms/ms質量分析装置用データ処理装置 |
JP2004245699A (ja) * | 2003-02-14 | 2004-09-02 | Hitachi Ltd | 質量分析データ解析システム,質量分析データ解析プログラム及び化合物解析システム |
JP2005091344A (ja) * | 2003-08-13 | 2005-04-07 | Hitachi Ltd | 質量分析システム |
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- 2007-03-16 JP JP2007067798A patent/JP4839248B2/ja not_active Expired - Fee Related
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