JP2005538366A - 爆発物検出への分析物質の使用 - Google Patents
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Abstract
本発明は爆発物(2)の検出において、核酸(1)が爆発物(2)の分子構造の一部(3)又は全分子構造と特異的に結合し、部分分子構造(3)又は全分子構造と核酸(1)間の結合事象を検出するのに核酸(1)を使用し、そのような使用とその実施用装置のための核酸(1)関する。
Description
本発明は爆発物検出用への分析物質の使用に関連し、この分析物質は少なくとも爆発物の一個の一部分子構造と特異的に結合し且つ一部分子構造と分析物質間の結合事象を検出し且つその使用又は方法における分析物質に関する。
このような分析物質は例えば環境、特に大気、飲料水及び/又は土壌の分析研究、更には生化学分析及び医療診断研究の他分野での爆発物或いはその主化学成分の検出に使用できる。更にセキュリティー対策、例えば航空手荷物や類似物のような運搬物中の爆発物の存在対策に応用できる。
ドイツ連邦規格DIN20163(1985年9月)で定義した爆発物は技術的に爆薬物、推進物或いは黒色火薬、発火剤、開始剤或いは爆薬として使用する爆発性物質である。爆発物の例はTNT(トリニトロトルエン)、ニトラミン(ヘキソーゲン=RDX=ヘキサヒドロ−1,3,5−トリニトロ−1,3,5−トリアジン)、ニトロサミン及びピクリン酸のような有機ニトロ化合物がある。しかし鉛アジドのような無機化合物の名前を挙げることも又出来る。
分析物質は物質の種類と量を決定する分析法に利用され、結合した分析物質量を直接或いは間接的に半定量或いは定量的に決定し、これをもとに爆発物の量或いは濃度を決定表示する物質である。半定量的測定と云う用語は結合した分析物質の規定限界量を上回るか下回るかに関する情報も含みその結果関連爆発物の限界量或いは限界濃度(検出感度で決まる限界量の存在/不在)に関する情報も含む。
結合事象はいかなる種類の(物理)化学的結合/相互作用、即ちイオン結合、共有結合、ファンデルワールス力或いは水素結合型の結合が可能である。
部分分子構造は一個の官能基、数個の官能基、特に隣接基の組み合わせ或いは官能基保有又は非保有の炭素構造が可能である。その特徴は分子或いは化合物の一部であり分子全体では無いことである。同様の考えは無機爆発性分子にも適用される。
結合事象は光学的、化学的、生物的或いはその他の物理的又は物理工学的方法で検出
出来る。
出来る。
爆発物は一面ではその爆発性のため非常に危険であり得る。例えば空港などのようなセキュリティー分野では、例えば爆発物を活用する人間による好ましくない行動を防止するために爆発物は検出されねばならない。他方では爆発物は更に多くの場合人毒性で且つ/又は環境毒性であり、それ故更に好ましくは発見した特定爆発物の検出を含めて最低量でも土壌、水試料、エアロゾル中で検出出来ることが望ましい。後者は例えば放棄軍施設の転用対策に特に重要である。最後に犯罪科学目的で爆発物痕跡の検出及び爆発物タイプの同定がしばしば必要となる。
実際には異なる古典的(湿式)化学分析法が既存技術として知られている。その利用は相当の努力が必要で実験室を必要とし(現場測定は通常不可能)更には迅速な結果が得られない。更に達成可能な検出限界は不満足である。試料はこれら試験システムでの高検出限界以下に入るためにその濃度を高価な方法で前もって濃縮せねばならない。このような試料の濃度濃縮は更に時間がかかり且つ高コストである。更に試験システムは試料に含まれる物質で交差感応性を示す事が既に知られている。
蛍光性検出化合物、即ち抗体使用の免疫学的検定法に基づきTNTを検出する光ファイバーバイオセンサーはエッチ・クレッグ(Craig, H.)等の文献、“地下水中TNT及びRDXの現場分析法の現地実証”(認ield Demonstration of On-site Analytical Methods for TNT and RDX in Ground Water煤j、環境に関するHSRC/WERC共同会議議事録(Proceedings of the HSRC/WERC Joint Conference on the Environment)、1996年、5月で知られている。そこで爆発物の定量的検出に用いた方法は最大限でも不十分であり抗体と他物質との交差反応性は更に問題となる。
更に爆発物検出にガス又は液体クロマートグラフ法が実際には使用することが知られている。このような測定機器は現場では使用できない。
異なる技術分野ではトロンビン検出に固定化蛍光標識化アプタマーを用いるバイオセンサーが記載されている。(アールエイ.ポチライロ等(Potyrailo, RA. et al)、“精選核酸リガンド(アプタマー)のバイオセンサーへの応用”(Adapting Selected Nucleic Acid Ligands (Aptamers) to Biosensors)、分析化学(Analytical Chemistry)、70巻、3419−3425頁、1998年)。他のトロンビン検出用バイオセンサーはエム.リー等(Lee, M. et al.)による“受容体としてのアプタマー使用の光ファイバーミクロアレイバイオセンサー”(A Fiber-Optic Microarray Biosensor Using Aptamers as Receptors煤A分析生化学(Analytical Biochemistry)、282巻、142−146頁、2000年に記述されている。この文献ではトロンビン検出にガラスマイクロボールに固定したアプタマーの使用が記載されている。
本発明の技術目的は爆発物検出方法を提供し、この方法により爆発物が改良した感度及び特異性で検出でき、現場での爆発物測定を可能にし、そのための分析物質を特定する事である。
本技術目的達成のため本発明は合成爆発物検出に核酸の使用を教示し、この核酸は爆発物の分子構造の一部又は全分子構造と特異的に結合し、且つ分子構造の一部又は全分子構造と核酸間の結合事象を検出する。
本発明で意味する核酸はヌクレオチッド配列としてリボ核酸、DNA又はペプチド核酸を含み、誘導化非天然ヌクレオチッドを含んでも良い。このヌクレオチッド配列に加えて、この核酸は例えばヌクレオチッドを含有しないヌクレオチッド配列末端で結合した分子も又含む。核酸は特にアプタマーであっても良い。アプタマーは抗体/抗原親和性(“鍵/錠”)と類似し、或いは誘導適合性結合モデルから分子レベルでの一定標的構造への結合親和性を含む核酸の一つである。オリゴヌクレオチッドは又スピゲルマーでも良い。スピゲルマーはL−リボース又はL−2‘−デゾキシリボース単位からなる高親和性鏡像核酸である。
古典的分析法に比べ本発明により爆発物検出に関し非常に低い検出限界が得られ、爆発物検出用試験システムの感度は増加する。この高検出感度のため測定前の爆発物濃度増加のための濃縮は不必要でありその必要性はない。抗体技術による利点は(より高感度で且つ現場利便性に加えて)アプタマーが完全に生体外で同定でき(例えば理論的三次元構造計算により)且つ生産可能であり、その結果免疫目的での実験動物を必要としない。それにもかかわらず少なくとも抗体技術の特異性と同等の特異性が得られ、古典的分析法より遙かに優れている。
本発明は更に本発明の方法を用いて実行する実施例に記載の手順を教示する。
本発明は核酸が標的分子に対し選択性或いは親和性を示す事を見いだした事に基づく。発見したヌクレオチッド配列は特に小さな標的分子の場合いわば一部分子構造の周りに、更には全分子構造の周りに折り畳まれるのに対し、他のヌクレオチッド配列はこの性質を有さないかあってもわずかでスクリーニングにより排除される。
爆発物の部分分子構造は窒素原子と直接結合した利用可能な酸素を有し、“亜硝酸エステル、硝酸エステル、ニトロ化合物及びニトロソ化合物”からなる一群から選ばれる。この爆発物は“ニトロベンゼン誘導体、TNT、2,4−DNT、2,6−DNT,2−NT、ピクリン酸、ヘキソーゲン、オクトーゲン、ヘクシール、テトリル、エチレングリコール二硝酸エステル、ジチレングリコール二硝酸エステル、ニトログリセリン、ニトロペンタ及びこれら化合物の誘導体“からなる一群から選ばれる。
核酸は“図8又は図9の配列或いはこれら断片が少なくともこの配列の6個、10個或いは15個の連続ヌクレオチッドからなる限りいかなるこれら配列の断片”からなる一群から選ばれる。好ましいものは共通配列含有のしるし付き(図8で下線を引いた)核酸である。核酸は固体担体表面に直接固定するか代わりにスペーサー化合物を通して間接的に固体担体表面に固定出来る。スペーサー化合物は例えば固体担体表面と核酸或いはアプタマーとを連結する分子である。スペーサー化合物はリンカー核酸、例えば短鎖合成二重鎖DNAでも良い。しかしその他のいかなる細長い有機分子、典型的にはオリゴマー又はポリマーも又適する。更にビオチン/ストレプトアビジンのような通常の親和対による結合も又可能で、親和対分子は核酸と結合し補完分子を固定する。固体担体表面は光ファイバーとして備えることも出来る。幾つかの異なる核酸種をこの表面やファイバー上に固定できると考えられる。この場合には各核酸種と特異的に結合した異なるタイプの各爆発物が同時に検出できる。
結合事象は(直接或いは間接的に)核酸との結合を爆発物分子で標識化し且つ置換した検出分子の信号を測定する事より検出できる。特に検出分子の蛍光標識化が使用できる。蛍光標識化は蛍光色素による標識化である。蛍光色素は例えばフルオレセイン、アクリジンオレンジ或いはCy5、Cy3等のようなその他の通常の蛍光色素である。信号は結合検出分子の信号強度低下又は放出(置換)検出分子の信号強度増加により発生する。スタッキングのような協調効果の場合、例えば蛍光共鳴エネルギー移動法のように結合検出分子の信号強度増加が起こる。異なる核酸種の同時使用においては異なる核酸種の信号を区別できるように各核酸種は異なる標識化検出分子を備える事が推奨される。
本発明は更に爆発物検出用装置を教示し、その装置は爆発物の部分分子構造に特異な核酸を備えている。核酸は直接或いは代わりに好ましくは光ファイバーの固体担体表面にスペーサー化合物により固定できる。好ましくはこの装置は部分分子構造と核酸間の結合事象の検出手段、例えば蛍光検出器からなる。この装置は検出分子の蛍光励起用光源を備え、光ファイバーを蛍光検出器に接続する。更に試料の核酸への供給手段を組み込んでも良い。セキュリティー分野での爆発物検出において、例えば大気試料を監視すべき目的環境から採取し分析できる。検出前に大気試料をまず液相に取り込み、上記のように検出される。しかし気相での検出も又可能で、例えば本発明により使用する核酸或いは/又は検出分子をエアロゾルとして気体試料と接触しても良い。核酸は蛍光標識化検出分子と共に取り込んでも良く、核酸と検出分子間結合力は核酸と部分分子構造間結合力より小さく無ければならない。光ファイバーの一部は気体又は液体試料が供給できるように試料気体又は液体空間内に配置する。照射光の波長はマーカーの透過光波長より短波長領域であることが好ましい。これら波長は蛍光領域の波長でも良い。光は光ファイバーを通して、外膜表面を通して、又一正面或いは両面を通して導入する。同じ事が透過光(蛍光信号)の出射にも当てはまる。光ファイバーは回転出来るように支えても良い。一般に透過光は直接検出せず、間接的に分子の発光に続いて透過光で励起して検出すると考えられる。このようにして光増幅が又達成出来る。
マーカーの置換による検出は他の方法、例えば電気化学的センサー法で可能であると考えられる。更に非結合マーカー濃度は被分析体量の直接に比例し例えば電気酵素的増幅システムで定量出来る。これにより試験システム感度の増大が達成できる。
光ファイバーに基づく携帯測定機器は可搬性電源、即ち電池で運転できる。測定信号の記録及び評価のために測定機器は電子部品、例えばコンピューターを備えることができ、気体又は液体試料運搬用の搬送装置、例えばホースポンプを含む事ができる。
以下に実行実施例だけに示した図を参照してより詳細に説明する。
図1に核酸1が爆発物2の分子構造の一部3に特異的に結合した合成爆発物2検出用核酸1を示す。爆発物2はTNTである。適当な核酸1は図8と図9に示す。
図2から図5に爆発物の検出機構を示す。核酸1はスペーサー化合物6により固体担体表面7、例えば光ファイバー表面8に固定する。図2は核酸1の蛍光標識化4検出分子5の取り込みを示し、図3は蛍光標識化4検出分子5の信号測定による結合事象の検出を示す。図4に核酸と結合した検出分子5の爆発物分子2による置換を示す。図5に結合した検出分子5の信号強度低下による信号発生を示す。
図6に図1と図5を組み合わして爆発物2の部分分子構造3に特異的な核酸1による爆発物2の検出装置を示す事が出来る。核酸は固体担体表面7に固定する。核酸1はスペーサー化合物6により光ファイバー8に固定し蛍光標識化4検出分子5を取り込む。検出分子5の蛍光励起用光源11を備え、光ファイバー8を蛍光検出器9と接続し光ファイバー8の一部を気体又は液体試料13が供給出来るように試料気体又は液体空間12に配置する。光ファイバーに基づいた携帯型測定機器は移動型電源14、即ち車用電池で運転できる。測定値の記録及び評価には測定機器に電子部品、例えばコンピューター15を備えることができ、気体又は液体試料運搬用に搬送装置16、例えばホースポンプを含む事が出来る。試料収集には収集容器17を備えることが出来る。
図7に結合強度の比較試験を示す。TNT/抗体と比較した本発明によるTNT/核酸結合検査を示す。アプタマー反応の解離定数は約kD=10−8であるのに対し抗体反応の解離定数はkD=10−5にしかすぎない。
上記方法のいわば逆も可能で、爆発性分子を固体相に固定し(即ち例えば発光ダイオードにより励起した蛍光色素の透過光検出器に接続したフローセル中に配置した光誘導ファイバーで)且つ標識化した核酸を用いて信号を発生する。この逆転により実際の測定だけでなく(もし爆発性分子が固相又は液相に存在する場合、固相に結合した核酸量はその平衡により減少し)検量線も確立でき又核酸の本発明での妥当性を試験することも出来る。
図8aから図8h及び図9に本発明に適する核酸或いはアプタマー配列を示す。しるし付き部分(下線付きの部分配列)或いは共通部分(それぞれ個別の或いは任意数のヌクレオチッドで連結)はそれぞれ独自の重要性がある。図9にアプタマー−共通配列の変形を示す。ヌクレオチッドに関して置換の可能性を列に記載する。上記配列は又配列プロトコールで表示する。
原理的には本発明による配列或いは部分配列は個別の分子として或いは大きな分子内の一個別として利用出来る。しかしこれらは個別分子内で互いに任意に組み合わす事も出来る。(核酸)分子において本発明の異なる配列を用いて、異なる爆発物或いは特定の爆発物がより高い特異性を持って検出出来る。最初の場合統合配列は異なる爆発性分子の分子構造の一部又は全構造に特異的である。後者の場合統合配列は単一爆発性分子の異なる部分分子構造に特異的(“二重特異的”或いは“多重特異的”)である。しかし本発明の同一配列又は部分配列を統合する事ができ、その結果単一核酸分子が幾つかの(同一)爆発性分子と結合できる。いずれの場合も適当なスペーサー配列を本発明による配列又は部分配列間に挿入する事が推奨される。このようなスペーサー配列は特に二重特異的又は多重特異的核酸の場合例えば細胞核モデリング法により計算でき、更にここで種々な配列に関して必要な三次元結合情報は例えば三次元相関NMR(即ち1H/1H或いは1H/14C)により得られる。
Claims (12)
- 爆発物(2)検出において、核酸(1)が爆発物(2)の分子構造の一部(3)又は全分子構造と特異的に結合し、この部分分子構造(3)或いは全分子構造と核酸(1)間の結合事象を検出するための核酸(1)の使用。
- 部分分子構造(3)が一個の窒素原子又は数個の窒素原子と直接に結合した利用可能な酸素を有してなる請求項1記載の使用。
- 部分分子構造(3)が“亜硝酸エステル、硝酸エステル、ニトロ化合物及びニトロソ化合物”からなる一群から選ばれてなる請求項2記載の使用。
- 爆発物が”ニトロベンゼン誘導体、TNT、2,4−DNT、2,6−DNT,2−NT、ピクリン酸、ヘキソーゲン、オクトーゲン、ヘクシール、テトリル、エチレングリコール二硝酸エステル、ジチレングリコール二硝酸エステル、ニトログリセリン、ニトロペンタ及びこのような化合物の誘導体かなる一群から選ばれてなる請求項1〜3のいずれか記載の使用。
- 核酸(1)が、“図8及び図9の配列或いは長さが少なくとも6個、特に少なくとも10個のヌクレオチッドを有するこれら配列のいかなる断片”からなる一群から選ばれてなる請求項1〜4のいずれか記載の使用。
- 結合事象が、標識化、特に蛍光標識化(4)され、且つ核酸(1)との結合が爆発性分子(2)により競合的に置換された検出分子(5)の信号を測定して検出されてなる請求項1〜5のいずれか記載の使用。
- 核酸(1)が、選択肢としてスペーサー化合物(6)により固体担体表面(7)特に光ファイバー(8)表面に固定されてなる請求項1〜6のいずれか記載の使用。
- 信号が、結合した検出分子(5)の信号強度の減少又は増加により発生する請求項6又は7記載の使用。
- 信号が、放出した検出分子(5)の信号強度の増加により発生する請求項6〜8のいずれか記載の使用。
- 図8及び図9の配列の一つ或いは長さが少なくとも6個、特に少なくとも10個のヌクレオチッドを有するこれら配列の断片を用いる請求項1〜9のいずれか記載の使用のための核酸(1)。
- 好ましくは固体担体表面(7)に固定した爆発物の部分分子構造(3)に特異的な核酸(1)を用いて爆発物(2)を検出し、部分分子構造(3)と核酸(1)間の結合事象(9)を検出する手段を含み且つ試料(10)を核酸(1)に供給する手段からなる装置。
- 核酸(1)を光ファイバー(8)にスペーサー化合物(6)を用いて固定し、核酸(1)を蛍光標識化(4)検出分子(5)と共に取り込み、核酸(1)/検出分子(5)間の結合力が核酸(1)/部分分子構造(3)間の結合力より弱く、検出分子(5)の蛍光励起用光源(11)を備え、光ファイバー(8)を蛍光検出器(9)と接続し、少なくとも光ファイバー(8)の一部が気体又は液体空間(12)内に配置し、その中へ気体又は液体試料(13)を供給できる請求項11記載の装置。
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