ES2938987T3 - Inhibidores de KRAS G12c y métodos de uso de los mismos - Google Patents
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Abstract
En el presente documento se proporcionan inhibidores de KRAS G12C, tales como la composición de los mismos y los métodos de uso de los mismos. Estos inhibidores son útiles para tratar una serie de trastornos, incluidos los cánceres de páncreas, colorrectal y de pulmón. (Traducción automática con Google Translate, sin valor legal)
Description
DESCRIPCIÓN
Inhibidores de KRAS G12c y métodos de uso de los mismos
CAMPO DE LA INVENCIÓN
La presente invención se refiere a compuestos que inhiben la proteína KRAS G12C; a compuestos para utilizar en el tratamiento de enfermedades o afecciones tales como el cáncer; y a composiciones farmacéuticas que contienen los compuestos.
ANTECEDENTES
Mutaciones del gen KRAS son comunes en el cáncer de páncreas, el adenocarcinoma de pulmón, el cáncer colorrectal, el cáncer de la vesícula biliar, el cáncer de tiroides y el cáncer de las vías biliares. Mutaciones de KRAS también se observan en aproximadamente el 25 % de los pacientes con NSCLC, y algunos estudios han indicado que las mutaciones de KRAS son un factor de pronóstico negativo en pacientes con NSCLC. Recientemente, se ha encontrado que mutaciones del homólogo del oncogén viral del sarcoma de rata Kirsten (KRAS) V-Ki-ras2 confieren resistencia a las terapias que fijan como objetivo el receptor del factor de crecimiento epidérmico (EGFR, por sus siglas en inglés) en el cáncer colorrectal; por consiguiente, el estado mutacional de KRAS puede proporcionar información importante antes de la prescripción de la terapia con TKI. En conjunto, existe la necesidad de nuevos tratamientos médicos para pacientes con cáncer de páncreas, adenocarcinoma de pulmón o cáncer colorrectal, especialmente aquellos a quienes se les ha diagnosticado cánceres caracterizados por una mutación KRAS, e incluyendo aquellos que han progresado después de la quimioterapia.
Los compuestos descritos en esta memoria pueden estar en forma de una sal farmacéuticamente aceptable. Los compuestos proporcionados se pueden formular en una formulación farmacéutica que comprende un compuesto descrito en esta memoria y un excipiente farmacéuticamente aceptable.
También se proporciona un método para inhibir KRAS G12C en una célula, que comprende poner en contacto la célula con un compuesto o composición descritos en esta memoria. Además se proporciona un método para tratar el cáncer en un sujeto, que comprende administrar al sujeto una cantidad terapéuticamente eficaz de un compuesto o una composición descritos en esta memoria. En algunas realizaciones, el cáncer es cáncer de pulmón, cáncer de páncreas o cáncer colorrectal.
SUMARIO
En un aspecto de la presente invención, la invención proporciona un compuesto que tiene una estructura de fórmula (I):
en donde
R1 es un grupo -alquilo C1-C6 o -cicloalquilo C3-C6 ;
R1a es un grupo -alquilo C1-C6 -heteroalquilo C1-C6, arilo, heteroarilo, -cicloalquilo C3-C6 o -heterocicloalquilo C3-C6;
R1 y R1a, junto con el átomo de carbono al que están unidos, forman un anillo carbocíclico, en donde el anillo carbocíclico puede estar sin sustituir o condensado con un anillo aromático;
R2 es un arilo sustituido con un halo, -OH o NH2 ;
R3 es halo;
R4 es H o metilo;
R5 es H o metilo; o
un estereoisómero del mismo, un atropisómero del mismo, una sal farmacéuticamente aceptable del mismo, una sal farmacéuticamente aceptable del estereoisómero del mismo o una sal farmacéuticamente aceptable del atropisómero del mismo.
Un aspecto de la presente invención proporciona diversos compuestos, estereoisómeros, atropisómeros, sales farmacéuticamente aceptables, sales farmacéuticamente aceptables de los estereoisómeros y sales farmacéuticamente aceptables de los atropisómeros como se describe en las realizaciones recogidas más adelante.
Otro aspecto de la presente invención proporciona una composición farmacéutica que incluye el compuesto de cualquiera de las realizaciones o la sal farmacéuticamente aceptable del mismo y un soporte o diluyente farmacéuticamente aceptable.
Las referencias a métodos de tratamiento en los párrafos posteriores de esta descripción se han de interpretar como referencias a los compuestos, composiciones farmacéuticas y medicamentos de la presente invención para uso en un método para el tratamiento del cuerpo humano (o animal) mediante terapia (o para el diagnóstico).
Otro aspecto de la presente invención proporciona un método para tratar el cáncer. Métodos de este tipo incluyen: administrar a un paciente que lo necesite una cantidad terapéuticamente eficaz del compuesto de cualquiera de las realizaciones o una sal farmacéuticamente aceptable del mismo. En algunos métodos de este tipo, el cáncer es una neoplasia hematológica. En algunos métodos de este tipo, el cáncer se selecciona del grupo que consiste en cáncer de mama, cáncer colorrectal, cáncer de piel, melanoma, cáncer de ovario, cáncer de riñón, cáncer de pulmón, cáncer de pulmón de células no pequeñas, linfoma, linfoma no Hodgkin, mieloma, mieloma múltiple, leucemia y leucemia mielógena aguda. En algunos otros métodos de este tipo, el cáncer es mieloma múltiple. En algunos otros métodos de este tipo, el cáncer es leucemia mielógena aguda. En algunos otros métodos de este tipo, el cáncer es un linfoma no Hodgkin.
En otro aspecto, el método incluye, además, administrar a un paciente que lo necesite una cantidad terapéuticamente eficaz de uno o más compuestos farmacéuticamente activos adicionales. Por ejemplo, en algunos de métodos de este tipo, el uno o más compuestos farmacéuticamente activos adicionales es carfilzomib. En otros, el uno o más compuestos farmacéuticamente activos adicionales es venetoclax. En aún otros de métodos de este tipo, el uno o más compuestos farmacéuticamente activos adicionales es citarabina. En aún otros de métodos de este tipo, el uno o más compuestos farmacéuticamente activos adicionales es daratumumab. En aún otros métodos de este tipo, el uno o más compuestos farmacéuticamente activos adicionales es un inhibidor de MCl-1. En aún otros métodos de este tipo, el inhibidor de MCl-1 es AMG-176. En aún otros métodos de este tipo, el uno o más compuestos farmacéuticamente activos adicionales es una iMID inmunomoduladora.
A menos que se defina de otro modo, todas las expresiones y términos técnicos y científicos utilizados en esta memoria tienen el mismo significado que comúnmente entiende un experto ordinario en la técnica a la que pertenece esta divulgación. Los métodos y materiales se describen en esta memoria para uso en la presente divulgación; también se pueden utilizar otros métodos y materiales adecuados conocidos en la técnica. Los materiales, métodos y ejemplos son solo ilustrativos y no pretenden ser limitativos.
Otras características y ventajas de la divulgación resultarán evidentes a partir de la siguiente descripción detallada y de las figuras y de las reivindicaciones.
Definiciones
Abreviaturas: En esta memoria se pueden utilizar las siguientes abreviaturas:
El uso de los términos "un", "una", "el", “la” y referencias similares en el contexto de la descripción de la invención (especialmente en el contexto de las reivindicaciones) deben interpretarse para cubrir tanto el singular como el plural, a menos que se indique de otra manera. La enumeración de los intervalos de valores en esta memoria pretende servir simplemente como un método abreviado para referirse individualmente a cada uno de los valores separado que caen dentro del intervalo, a menos que se indique lo contrario en esta memoria, y cada uno de los valores separados se incorpora a la memoria descriptiva como si se mencionara individualmente en esta memoria. El uso de cualquiera y todos los ejemplos, o lenguaje ejemplar (p. ej., "tal como") proporcionado en esta memoria, pretende ilustrar mejor la invención y no es una limitación del alcance de la invención, a menos que se reivindique lo contrario. Ningún lenguaje en la memoria descriptiva debe interpretarse como una indicación de cualquier elemento no reivindicado como esencial para la práctica de la invención.
Tal como se utiliza en esta memoria, el término "alquilo" se refiere a grupos hidrocarbonados C1-C8 de cadena lineal y ramificada , incluyendo, pero no limitados a metilo, etilo, n-propilo, i-propilo, n-butilo, sec.-butilo, t-butilo, n-pentilo, 2-metilbutilo, 3-metilbutilo, 2,2-dimetilpropilo, n-hexilo, 2-metilpentilo, 3-metilpentilo, 4-metilpentilo, 2,2-dimetilbutilo, 2,3-dimetilbutilo, 3,3-dimetilbutilo y 2-etibutilo. El término Cm-n significa que el grupo alquilo tiene "m" a "n" átomos de carbono. El término "alquileno" se refiere a un grupo alquilo que tiene un sustituyente. Un grupo alquilo (p. ej., metilo) o alquileno (p. ej., -CH2-), puede estar sustituido con uno o más, y típicamente uno a tres, seleccionados independientemente, por ejemplo, de halo, trifluorometilo, trifluorometoxi, hidroxi, alcoxi, nitro, ciano, alquilamino, alquilo C1-6, alquenilo C2-6, alquinilo C2-6, -NC, amino, -CO2H, -CC2alquilo C1-C6, -OCOalquilo C1-C6, cicloalquilo C3-C10, heterocicloalquilo C3-C10, arilo C5-C10 y heteroarilo C5-C10. El término "haloalquilo" se refiere específicamente a un grupo alquilo en donde al menos uno, p. ej., uno a seis, o todos los hidrógenos del grupo alquilo están sustituidos con átomos de halógeno.
Los términos "alquenilo" y "alquinilo" indican un grupo alquilo que además incluye un doble enlace o un triple enlace, respectivamente.
Tal como se utiliza en esta memoria, el término "halo" se refiere a flúor, cloro, bromo y yodo. El término "alcoxi" se define como -OR, en donde R es alquilo.
Tal como se utiliza en esta memoria, el término "amino" o "amina" se refiere indistintamente a un grupo -NR2, en donde cada R es, p. ej., H o un sustituyente. En algunas realizaciones, el grupo amino se sustituye adicionalmente para formar
un ion amonio, p. ej., NR3+. Los restos amonio se incluyen específicamente en la definición de "amino" o "amina". Sustituyentes pueden ser, por ejemplo, un alquilo, alcoxi, cicloalquilo, heterocicloalquilo, amida o carboxilato. Un grupo R puede estar sustituido adicionalmente, por ejemplo, con uno o más, p. ej., uno a cuatro grupos seleccionados de halo, ciano, alquenilo, alquinilo, alquilo, cicloalquilo, heterocicloalquilo, arilo, heteroarilo, urea, carbonilo, carboxilato, amina y amida. Un grupo "amida" o "amido" se refiere indistintamente a un grupo similar a un grupo amina o amino, pero que, además, incluye un C(O), p. ej., -C(O)NR2. Algunos grupos amino o amido contemplados (algunos con grupos alquileno opcionales, p. ej., alquileno-amino o alquileno-amido) incluyen CH2NH2 , CH(CH3)NH2, CH(CH3)2NH2, CH2CH2NH2 , CH2CH2N(CH3)2, CH2NHCH3 , C(O)NHCH3, C(O)N(CH3)2, CH2C(O)NHfenilo, CH2NHC(O)CH3, CH2NHCH2CH2OH, CH2NHCH2CO2H, CH2NH(CH3)CH2CO2CH3,CH2NHCH2CH2OCH3, CH2NH(CH3)CH2CH2OCH3, CH2NH(CH3)CH2C(O)N(CH3)2, CH2NH(CH3)CH2C(O)NHCH3, CH2CH2CCH, CH2NMe2 , CH2NH(CH3)CH2CH2OH, CH2NH(CH3)CH2CH2F, CH2N+(CH3)3, CH2NHCH2CHF2, CH2 NHCH2CH3 ,
Tal como se utiliza en esta memoria, el término "arilo" se refiere a un grupo aromático C6-14 monocíclico o policíclico, preferiblemente un grupo aromático C6-10 monocíclico o bicíclico, o un grupo aromático C10-14 policíclico. Ejemplos de grupos arilo incluyen, pero no se limitan a fenilo, naftilo, fluorenilo, azulenilo, antrilo, fenantrilo, pirenilo, bifenilo y terfenilo. Arilo también se refiere a anillos de carbono C10-14 bicíclicos y tricíclicos, en que un anillo es aromático y los otros están saturados, parcialmente insaturados o aromáticos, por ejemplo, dihidronaftilo, indenilo, indanilo o tetrahidronaftilo (tetralinilo). A menos que se indique lo contrario, un grupo arilo puede no estar sustituido o puede estar sustituido con uno
o más y, en particular, uno a cuatro grupos seleccionados independientemente de, por ejemplo, halo, alquilo Ci-6, alquenilo C2-6, alquinilo C2-6, -CF3, -OCF3 , -NO2, -CN, -NC, -OH, alcoxi, amino, -CO2H, -CO2alquilo C1-C6, -OCOalquiloC1-C6 , cicloalquilo C3-C10, heterocicloalquilo C3-C10, arilo C5-C10 y heteroarilo C5-C10.
Tal como se utiliza en esta memoria, la expresión "anillo carbocíclico" se refiere a un anillo monocíclico que solo incluye átomos de carbono como miembros del anillo. Anillos de este tipo pueden estar completamente saturados, parcialmente saturados o aromáticos y pueden incluir 3 a 10 átomos de carbono.
Tal como se utiliza en esta memoria, el término "cicloalquilo" se refiere a un anillo carbocíclico no aromático monocíclico o policíclico, en que el anillo policíclico puede estar condensado, puenteado o espiro. El anillo carbocíclico puede tener 3 a 10 átomos de carbono en el anillo. Anillos carbocíclicos contemplados incluyen, pero no se limitan a ciclopropilo, ciclobutilo, ciclopentilo, ciclohexilo, cicloheptilo, ciclooctilo y ciclononilo.
Tal como se utiliza en esta memoria, el término "heterocicloalquilo" significa un sistema de anillo monocíclico o policíclico (p. ej., bicíclico), saturado o parcialmente insaturado, que contiene 3 o más (p. ej., 3 a 12, 4 a 10, 4 a 8 o 5 a 7) átomos totales, de los cuales uno a cinco (p. ej., 1, 2, 3, 4 o 5) de los átomos se seleccionan independientemente de nitrógeno, oxígeno y azufre. Ejemplos no limitativos de grupos heterocicloalquilo incluyen azetidinilo, pirrolidinilo, piperidinilo, piperazinilo, dihidropirrolilo, morfolinilo, tiomorfolinilo, dihidropiridinilo, oxacicloheptilo, dioxacicloheptilo, tiacicloheptilo y diazacicloheptilo.
A menos que se indique lo contrario, un grupo cicloalquilo o heterocicloalquilo puede estar no sustituido o estar sustituido con uno o más, y en particular uno a cuatro grupos. Algunos sustituyentes contemplados incluyen halo, alquilo C1-6 , alquenilo C2-6, alquinilo C2-6, -OCF3 , -NO2, -CN, -Nc , -OH, alcoxi, amino, -CO2H, -CO2alquilo C1-C6, -OCOalquilo C1-C8, cicloalquilo C3-10, heterocicloalquilo C3 C10, arilo C5-C10 y heteroarilo C5-C10.
Tal como se utiliza en esta memoria, el término "heteroarilo" se refiere a un sistema de anillo monocíclico o policíclico (por ejemplo, bicíclico) que contiene de uno a tres anillos aromáticos y que contiene uno a cuatro (p. ej., 1,2, 3 o 4) heteroátomos seleccionado de nitrógeno, oxígeno y azufre en un anillo aromático. En determinadas realizaciones, el grupo heteroarilo tiene de 5 a 20, de 5 a 15, de 5 a 10 anillos o de 5 a 7 átomos. Heteroarilo también se refiere a anillos C10-14 bicíclicos y tricíclicos, en que un anillo es aromático y los otros son saturados, parcialmente insaturados o aromáticos. Ejemplos de grupos heteroarilo incluyen, pero no se limitan a furanilo, imidazolilo, isotiazolilo, isoxazolilo, oxadiazolilo, oxazolilo, pirazinilo, pirazolilo, piridazinilo, piridilo, pirimidinilo, pirrolilo, tiadiazolilo, tiazolilo, tienilo, tetrazolilo, triazinilo, triazolilo, benzofuranilo, bencimidazolilo, benzoisoxazolilo, benzopiranilo, benzotiadiazolilo, benzotiazolilo, benzotienilo, benzotiofenilo, benzotriazolilo, benzoxazolilo, furopiridilo, imidazopiridinilo, imidazotiazolilo, indolizinilo, indolilo, indazolilo, isobenzofuranilo, isobenzotienilo, isoindolilo, isoquinolinilo, isotiazolilo, naftiridinilo, oxazolopiridinilo, ftalazinilo, pteridinilo, purinilo, piridopiridilo, pirrolopiridilo, quinolinilo, quinoxalinilo, quinazolinilo, tiadiazolopirimidilo y tienopiridilo. A menos que se indique lo contrario, un grupo heteroarilo puede estar no sustituido o estar sustituido con uno o más y, en particular, uno a cuatro o uno o dos sustituyentes. Los sustituyentes contemplados incluyen halo, alquilo C1-6, alquenilo C2-6, alquinilo C2-6, -OCF3, -NO2 , -CN, -NC, -OH, alcoxi, amino, -CO2H, -CO2alquilo C1-C6, -OcOalquilo C1-C6 , cicloalquilo C3-C10, heterocicloalquilo C3-C10, arilo C5- C10 y heteroarilo C5-C10.
Tal como se utiliza en esta memoria, el término Boc se refiere a la estructura
Tal como se utiliza en esta memoria, el término Cbz se refiere a la estructura
Tal como se utiliza en esta memoria, el término Bn se refiere a la estructura
Tal como se utiliza en esta memoria, el término trifluoroacetamida se refiere a la estructura
Tal como se utiliza en esta memoria, el término tritilo se refiere a la estructura
Tal como se utiliza en esta memoria, el término tosilo se refiere a la estructura
Tal como se utiliza en esta memoria, el término Troc se refiere a la estructura
Tal como se utiliza en esta memoria, el término Teoc se refiere a la estructura
Tal como se utiliza en esta memoria, el término Alloc se refiere a la estructura
Tal como se utiliza en esta memoria, el término Fmoc se refiere a la estructura
COMPUESTOS DE LA DIVULGACIÓN
Los compuestos descritos en esta memoria incluyen todos los compuestos marcados isotópicamente, farmacéuticamente aceptables, en donde uno o más átomos de los compuestos descritos en esta memoria están reemplazados por átomos que tienen el mismo número atómico, pero una masa atómica o número de masa diferente de la masa atómica o número de masa que habitualmente se encuentra en la naturaleza. Ejemplos de isótopos que se pueden incorporar en los compuestos descritos incluyen isótopos de hidrógeno, carbono, nitrógeno, oxígeno, fósforo, flúor, cloro y yodo, tales como 2H, 3H, 11C, 13C, 14C, 13N, 15N, 15O, 17O, 18O, 31P, 32P, 35S, 18F, 36Cl, 123I y 125I, respectivamente. Estos compuestos radiomarcados podrían ser útiles para ayudar a determinar o medir la eficacia de los compuestos, caracterizando, por ejemplo, el sitio o el modo de acción, o la afinidad de unión al sitio de acción farmacológicamente importante. Determinados compuestos marcados isotópicamente de la divulgación, por ejemplo, aquellos que incorporan un isótopo radiactivo, son útiles en estudios de distribución de fármacos y/o sustratos en tejidos. Los isótopos radiactivos tritio, es decir, 3H, y carbono-14, es decir, 14C, son particularmente útiles para este fin a la vista de su facilidad de incorporación y sus rápidos medios de detección.
La sustitución con isótopos más pesados tales como el deuterio, es decir, 2H, puede proporcionar determinadas ventajas terapéuticas resultantes de una mayor estabilidad metabólica, por ejemplo, una semivida in vivo incrementada o requisitos de dosificación reducidos y, por lo tanto, se prefieren en algunas circunstancias.
La sustitución con isótopos emisores de positrones, tales como 11C, 18F, 15O y 13N, puede ser útil en estudios de topografía por emisión de positrones (PET, por sus siglas en inglés) para examinar la ocupación del receptor del sustrato. Compuestos de estructura (l) marcados isotópicamente se pueden preparar generalmente mediante técnicas convencionales conocidas por los expertos en la técnica o mediante procedimientos análogos a los descritos en las Preparaciones y los Ejemplos que se recogen más adelante utilizando un reactivo marcado isotópicamente apropiado en lugar del reactivo no marcado empleado previamente.
Compuestos marcados isotópicamente tal como se describe en esta memoria pueden prepararse generalmente mediante técnicas convencionales conocidas por los expertos en la técnica o mediante procedimientos análogos a los descritos en los ejemplos y esquemas adjuntos utilizando un reactivo marcado isotópicamente apropiado en lugar del reactivo no marcado empleado previamente.
Determinados compuestos descritos en esta memoria pueden existir como estereoisómeros (es decir, isómeros que difieren únicamente en la disposición espacial de los átomos), incluyendo los isómeros ópticos y los isómeros conformacionales (o conformadores). Los compuestos descritos en esta memoria incluyen todos los estereoisómeros, tanto como preparaciones de estereoisómeros individuales puros como preparaciones enriquecidas de cada uno, y tanto las mezclas racémicas de estereoisómeros de este tipo como los diastereómeros y enantiómeros individuales que pueden separarse de acuerdo con métodos conocidos por los expertos en la técnica. Adicionalmente, los compuestos descritos en esta memoria incluyen todas las formas tautoméricas de los compuestos.
Algunos de los compuestos descritos en esta memoria pueden existir como atropisómeros, que son estereoisómeros conformacionales que se producen cuando se evita, o se ralentiza mucho la rotación alrededor de un enlace simple en la molécula, como resultado de interacciones estéricas con otras partes de la molécula. Los compuestos descritos en esta memoria incluyen todos los atropisómeros, tanto como preparaciones de atropisómeros individuales puros, preparaciones enriquecidas de cada uno, o una mezcla no específica de cada uno. En los casos en los que la barrera rotacional sobre el enlace simple es lo suficientemente alta y la interconversión entre conformaciones es lo suficientemente lenta, se puede permitir la separación y el aislamiento de las especies isoméricas.
REALIZACIONES
Realización 1
En una realización de la presente invención, la presente invención comprende un compuesto que tiene la fórmula (I):
en donde
R1 es un grupo -alquilo C1-C6 o -cicloalquilo C3-C6 ;
R1a es un grupo -alquilo C1-C6 -heteroalquilo C1-C6, arilo, heteroarilo, -cicloalquilo C3-C6 o -heterocicloalquilo C3-C6;
R1 y R1a, junto con el átomo de carbono al que están unidos, forman un anillo carbocíclico, en donde el anillo carbocíclico puede estar sin sustituir o condensado con un anillo aromático;
R2 es un arilo sustituido con un halo, -OH o NH2 ;
R3 es halo;
R4 es H o metilo;
R5 es H o metilo; o
un estereoisómero del mismo, un atropisómero del mismo, una sal farmacéuticamente aceptable del mismo, una sal farmacéuticamente aceptable del estereoisómero del mismo o una sal farmacéuticamente aceptable del atropisómero del mismo.
Realización 2
En otra realización de la presente invención, la presente invención comprende un compuesto de la realización 1, en donde R1 es un grupo -alquilo C1-C6 o -cicloalquilo C3-C6.
Realización 3
En otra realización de la presente invención, la presente invención comprende un compuesto de la realización 1, en donde R1 es metilo.
Realización 4
En otra realización de la presente invención, la presente invención comprende el compuesto de la realización 1, en donde R1 es un grupo ciclopropilo.
Realización 5
En otra realización de la presente invención, la presente invención comprende el compuesto de la realización 1, en donde R1a es un grupo -alquilo C1-C6, arilo o -cicloalquilo C3-C6.
Realización 6
En otra realización de la presente invención, la presente invención comprende el compuesto de la realización 5, en donde R1a es un grupo etilo.
Realización 7
En otra realización de la presente invención, la presente invención comprende el compuesto de la realización 5, en donde R1a es un grupo alquilo C4 ramificado.
Realización 8
En otra realización de la presente invención, la presente invención comprende el compuesto de la realización 5, en donde R1a es un grupo ciclopropilo.
Realización 9
En otra realización de la presente invención, la presente invención comprende el compuesto de la realización 5, en donde R1a es un grupo ciclobutilo.
Realización 10
En otra realización de la presente invención, la presente invención comprende el compuesto de la realización 5, en donde R1a es un grupo ciclopentilo.
Realización 11
En otra realización de la presente invención, la presente invención comprende el compuesto de la realización 5, en donde R1a es un grupo fenilo.
Realización 12
En otra realización de la presente invención, la presente invención comprende el compuesto de la realización 1, en donde R1 y R1a, junto con el átomo de carbono al que están unidos, forman un anillo de 4-10 miembros.
Realización 13
En otra realización de la presente invención, la presente invención comprende el compuesto de la realización 12, en donde R1 y R1a, junto con el átomo de carbono al que están unidos, forman un ciclopentano.
Realización 14
En otra realización de la presente invención, la presente invención comprende el compuesto de la realización 13, en donde R1 y R1a, junto con el átomo de carbono al que están unidos, forman un ciclohexano.
Realización 15
En otra realización de la presente invención, la presente invención comprende el compuesto de la realización 12, en donde R1 y R1a, junto con el átomo de carbono al que están unidos, forman un anillo carbocíclico de 5 miembros, en donde el anillo carbocíclico puede estar no sustituido o estar condensado con un anillo aromático.
Realización 16
En otra realización de la presente invención, la presente invención comprende el compuesto de la realización 1, en donde R2 es un fenilo fluorado.
Realización 17
En otra realización de la presente invención, la presente invención comprende el compuesto de la realización 1, en donde R3 es Cl.
Realización 18
En otra realización de la presente invención, la presente invención comprende el compuesto de la realización 1, en donde R4 es H.
Realización 19
En otra realización de la presente invención, la presente invención comprende el compuesto de la realización 1, en donde R4 es metilo.
Realización 20
En otra realización de la presente invención, la presente invención comprende un compuesto que tiene una estructura seleccionada de la fórmula
o un estereoisómero del mismo, un atropisómero del mismo, una sal farmacéuticamente aceptable del mismo, una sal farmacéuticamente aceptable del estereoisómero del mismo o una sal farmacéuticamente aceptable del atropisómero del mismo.
Realización 21
En otra realización de la presente invención, la presente invención comprende el compuesto de una cualquiera de las realizaciones 1-20 en forma de una sal farmacéuticamente aceptable.
Realización 22
En otra realización de la presente invención, la presente invención comprende una composición farmacéutica que comprende el compuesto de una cualquiera de las realizaciones 1-21 y un excipiente farmacéuticamente aceptable. Realización 23
En otra realización de la presente invención, la presente invención comprende un método para inhibir KRAS G12C en una célula, que comprende poner en contacto la célula con el compuesto de una cualquiera de las realizaciones 1-21 o la composición de la realización 22.
Realización 24
En otra realización de la presente invención, la presente invención comprende un método para tratar el cáncer en un sujeto que comprende administrar al sujeto una cantidad terapéuticamente eficaz del compuesto de una cualquiera de las realizaciones 1-21 o la composición de la realización 22.
Realización 25
En otra realización de la presente invención, la presente invención comprende el método de la realización 24, en el que el cáncer es cáncer de pulmón, cáncer de páncreas o cáncer colorrectal.
Realización 26
En otra realización de la presente invención, la presente invención comprende el método de la realización 25, en el que el cáncer es cáncer de pulmón.
Realización 27
En otra realización de la presente invención, la presente invención comprende el método de la realización 25, en el que el cáncer es cáncer de páncreas.
Realización 28
En otra realización de la presente invención, la presente invención comprende el método de la realización 25, en el que el cáncer es cáncer colorrectal.
Realización 29
En otra realización de la presente invención, la presente invención comprende el método de la realización 24, que comprende, además, administrar al paciente que lo necesite una cantidad terapéuticamente eficaz de uno o más compuestos farmacéuticamente activos adicionales.
Realización 30
En otra realización de la presente invención, la presente invención comprende el método de la realización 29, en el que uno o más compuestos farmacéuticamente activos adicionales son un anticuerpo anti-PD-1.
Realización 31
En otra realización de la presente invención, la presente invención comprende el método de la realización 29, en el que uno o más compuestos farmacéuticamente activos adicionales es pembrolizumab.
Realización 32
En otra realización de la presente invención, la presente invención comprende el método de la realización 29, en el que uno o más compuestos farmacéuticamente activos adicionales son niolumab.
Realización 33
En otra realización de la presente invención, la presente invención comprende el método de la realización 29, en el que uno o más compuestos farmacéuticamente activos adicionales son un inhibidor de MCI-1.
Realización 34
En otra realización de la presente invención, la presente invención comprende el método de la realización 33, en el que el inhibidor de MCI-1 es a Mg -176.
Realización 35
En otra realización de la presente invención, la presente invención comprende el método de la realización 29, en el que el uno o más compuestos farmacéuticamente activos adicionales son daratumumab.
Realización 36
En otra realización de la presente invención, la presente invención comprende el método de la realización 29, en el que el uno o más compuestos farmacéuticamente activos adicionales es una iMID inmunomoduladora.
Realización 37
En otra realización de la presente invención, la presente invención comprende el uso de un compuesto de acuerdo con una cualquiera de las reivindicaciones 1 -22 para tratar el cáncer en un sujeto.
Realización 38
En otra realización de la presente invención, la presente invención comprende un compuesto de acuerdo con la reivindicación 1 en la preparación de un medicamento para tratar el cáncer.
Realización 39
En otra realización de la presente invención, la presente invención comprende el compuesto de acuerdo con la realización 26, en el que el cáncer es cáncer de pulmón de células no pequeñas.
SÍNTESIS DE COMPUESTOS DIVULGADOS
Compuestos descritos en esta memoria se pueden sintetizar a través de un cierto número de métodos específicos. Los ejemplos que describen rutas sintéticas específicas y los esquemas genéricos que figuran más adelante están destinados a proporcionar una guía para el químico de síntesis ordinariamente capacitado, quien apreciará fácilmente que el disolvente, la concentración, el reactivo, el grupo protector, el orden de las etapas de síntesis, el tiempo, la temperatura y similares pueden modificarse según sea necesario, bien dentro de la habilidad y el juicio del artesano ordinariamente capacitado.
Composiciones farmacéuticas, dosificación y vías de administración
También se proporcionan en esta memoria composiciones farmacéuticas que incluyen un compuesto como se describe en esta memoria, junto con un excipiente farmacéuticamente aceptable, tal como, por ejemplo, un diluyente o soporte. Compuestos y composiciones farmacéuticas adecuados para uso en la presente invención incluyen aquellos en los que el compuesto puede administrarse en una cantidad eficaz para lograr el propósito previsto. La administración del compuesto se describe con más detalle más adelante.
El experto puede determinar formulaciones farmacéuticas adecuadas dependiendo de la vía de administración y la dosificación deseada. Véase, p. ej., Remington's Pharmaceutical Sciences, 1435-712 (18a ed., Mack Publishing Co, Easton, Pennsylvania, 1990). Las formulaciones pueden influir en el estado físico, la estabilidad, la tasa de liberación in vivo y la tasa de eliminación in vivo de los agentes administrados. Dependiendo de la vía de administración, se puede calcular una dosis adecuada de acuerdo con el peso corporal, las zonas de superficie corporal o el tamaño de los órganos.
Los expertos ordinarios en la técnica realizan rutinariamente un ajuste adicional de los cálculos necesarios para determinar la dosis de tratamiento adecuada sin experimentación excesiva, especialmente a la vista de la información de dosificación y los ensayos descritos en esta memoria, así como los datos farmacocinéticos que se pueden obtener a través de ensayos clínicos en animales o seres humanos.
Las expresiones "farmacéuticamente aceptable" o "farmacológicamente aceptable" se refieren a entidades y composiciones moleculares que no producen reacciones adversas, alérgicas u otras reacciones adversas cuando se administran a un animal o a un ser humano. Tal como se utiliza en esta memoria, "farmacéuticamente aceptable" incluye cualquiera y todos los disolventes, medios de dispersión, revestimientos, agentes antibacterianos y antifúngicos, agentes isotónicos y agentes retardadores de la absorción y similares. El uso de excipientes de este tipo para sustancias farmacéuticamente activas es bien conocido en la técnica. Excepto en la medida en que cualquier medio o agente convencional sea incompatible con las composiciones terapéuticas, se contempla su uso en composiciones terapéuticas. También se pueden incorporar a las composiciones ingredientes activos complementarios. En realizaciones ejemplares, la formulación puede comprender sólidos de jarabe de maíz, aceite de cártamo de alto contenido en oleico, aceite de coco, aceite de soja, L-leucina, fosfato de calcio tribásico, L-tirosina, L-prolina, acetato de L-lisina, DATEM (un emulsionante) , L-glutamina, L-valina, fosfato de potasio dibásico, L-isoleucina, L-arginina, L-alanina, glicina, L-asparagina monohidrato, L-serina, citrato de potasio, L-treonina, citrato de sodio, cloruro de magnesio, L-histidina, L-metionina, ácido ascórbico, carbonato de calcio, ácido L-glutámico, dihidrocloruro de L-cistina, L-triptófano, ácido L-aspártico, cloruro de colina, taurina, m-inositol, sulfato ferroso, palmitato de ascorbilo, sulfato de zinc, L-carnitina, acetato de alfa-tocoferilo, cloruro de sodio, niacinamida, tocoferoles mixtos, pantotenato de calcio, sulfato cúprico, cloruro hidrocloruro de tiamina, palmitato de vitamina A, sulfato de manganeso, riboflavina, hidrocloruro de piridoxina, ácido fólico, beta-caroteno, yoduro de potasio, filoquinona , biotina, selenato de sodio, cloruro de cromo, molibdato de sodio, vitamina D3 y cianocobalamina.
El compuesto puede estar presente en una composición farmacéutica en forma de una sal farmacéuticamente aceptable. Tal como se utiliza en esta memoria, "sales farmacéuticamente aceptables" incluyen, por ejemplo, sales por adición de bases y sales por adición de ácidos.
Sales por adición de bases farmacéuticamente aceptables se pueden formar con metales o aminas, tales como metales alcalinos y alcalinotérreos o aminas orgánicas. También se pueden preparar sales de compuestos farmacéuticamente aceptables con un catión farmacéuticamente aceptable. Cationes farmacéuticamente aceptables adecuados son bien conocidos por los expertos en la técnica e incluyen cationes alcalinos, alcalinotérreos, amonio y amonio cuaternario. También son posibles carbonatos o hidrógeno-carbonatos. Ejemplos de metales utilizados como cationes son sodio, potasio, magnesio, amonio, calcio o férrico y similares. Ejemplos de aminas adecuadas incluyen isopropilamina, trimetilamina, histidina, N,N'-dibenciletilendiamina, cloroprocaína, colina, dietanolamina, diciclohexilamina, etilendiamina, N-metilglucamina y procaína.
Sales por adición de ácidos farmacéuticamente aceptables incluyen sales de ácidos inorgánicos u orgánicos. Ejemplos de sales de ácidos adecuadas incluyen los hidrocloruros, formiatos, acetatos, citratos, salicilatos, nitratos, fosfatos. Otras sales farmacéuticamente aceptables adecuadas son bien conocidas por los expertos en la técnica e incluyen, por ejemplo, ácidos fórmico, acético, cítrico, oxálico, tartárico o mandélico, ácido clorhídrico, ácido bromhídrico, ácido sulfúrico o ácido fosfórico; con ácidos orgánicos carboxílicos, sulfónicos, sulfo o fosfo o ácidos sulfámicos sustituidos en N, por ejemplo, ácido acético, ácido trifluoroacético (TFA, por sus siglas en inglés), ácido propiónico, ácido glicólico, ácido succínico, ácido maleico, ácido hidroximaleico, ácido metilmaleico, ácido fumárico, ácido málico, ácido tartárico, ácido láctico, ácido oxálico, ácido glucónico, ácido glucárico, ácido glucurónico, ácido cítrico, ácido benzoico, ácido cinámico, ácido mandélico, ácido salicílico, ácido 4-aminosalicílico, ácido 2-fenoxibenzoico, ácido 2-acetoxibenzoico, ácido embónico, ácido nicotínico o ácido isonicotínico; y con aminoácidos, tales como los 20 alfa aminoácidos implicados en la síntesis de proteínas en la naturaleza, por ejemplo ácido glutámico o ácido aspártico, y también con ácido fenilacético, ácido metanosulfónico, ácido etanosulfónico, ácido 2-hidroxietanosulfónico, ácido etano 1,2 -disulfónico, ácido bencenosulfónico, ácido 4-metilbencenosulfónico, ácido naftaleno 2-sulfónico, ácido naftaleno 1,5-disulfónico, 2- o 3-fosfoglicerato, glucosa 6-fosfato, ácido N-ciclohexilsulfámico (con formación de ciclamatos), o con otros compuestos orgánicos ácidos tales como ácido ascórbico.
Composiciones farmacéuticas que contienen los compuestos descritos en esta memoria se pueden fabricar de una manera convencional, p. ej., mediante procedimientos convencionales de mezcla, disolución, granulación, fabricación de grageas, levigación, emulsión, encapsulación, atrapamiento o liofilización. La formulación adecuada depende de la vía de administración elegida.
Para la administración oral, composiciones adecuadas se pueden formular fácilmente combinando un compuesto descrito en esta memoria con excipientes farmacéuticamente aceptables tales como soportes bien conocidos en la técnica. Excipientes y soportes de este tipo permiten que los presentes compuestos se formulen como comprimidos, píldoras, grageas, cápsulas, líquidos, geles, jarabes, suspensiones acuosas, suspensiones y similares, para la ingestión oral por un paciente a tratar. Preparaciones farmacéuticas para uso oral se pueden obtener añadiendo un compuesto como se describe en esta memoria con un excipiente sólido, opcionalmente moliendo una mezcla resultante y procesando la mezcla de gránulos, después de añadir auxiliares adecuados, si se desea, para obtener comprimidos o núcleos de grageas. Excipientes adecuados incluyen, por ejemplo, cargas y preparados de celulosa. Si se desea, se pueden añadir agentes desintegrantes. Ingredientes farmacéuticamente aceptables son bien conocidos para los diversos tipos de formulación y pueden ser, por ejemplo, aglutinantes (p. ej., polímeros naturales o sintéticos), lubricantes, tensioactivos, agentes
edulcorantes y aromatizantes, materiales de recubrimiento, conservantes, colorantes, espesantes, adyuvantes, agentes antimicrobianos, antioxidantes y soportes para los diversos tipos de formulación.
Cuando una cantidad terapéuticamente eficaz de un compuesto descrito en esta memoria se administra por vía oral, la composición está típicamente en forma de una formulación sólida (p. ej., comprimido, cápsula, píldora, polvo o pastilla) o líquida (p. ej., suspensión acuosa, solución, elixir o jarabe).
Cuando se administra en forma de comprimido, la composición puede contener adicionalmente un sólido funcional y/o un soporte sólido tal como una gelatina o un adyuvante. El comprimido, la cápsula y el polvo pueden contener aproximadamente 1 a aproximadamente 95 % del compuesto, y preferiblemente de aproximadamente 15 a aproximadamente 90 % del compuesto.
Cuando se administra en forma líquida o de suspensión, se puede añadir un líquido funcional y/o un soporte líquido, tal como agua, petróleo o aceites de origen animal o vegetal. La forma líquida de la composición puede contener, además, solución salina fisiológica, soluciones de alcohol de azúcar, soluciones de dextrosa u otros sacáridos, o glicoles. Cuando se administra en forma líquida o de suspensión, la composición puede contener aproximadamente 0,5 a aproximadamente 90 % en peso de un compuesto descrito en esta memoria, y preferiblemente aproximadamente 1 a aproximadamente 50 % de un compuesto descrito en esta memoria. En una realización contemplada, el soporte líquido es no acuoso o sustancialmente no acuoso. Para la administración en forma líquida, la composición se puede suministrar como una formulación sólida de disolución rápida para disolución o suspensión inmediatamente antes de la administración.
Cuando una cantidad terapéuticamente eficaz de un compuesto descrito en esta memoria se administra por inyección intravenosa, cutánea o subcutánea, la composición está en forma de una solución acuosa apirógena, parenteralmente aceptable. La preparación de soluciones parenteralmente aceptables de este tipo, teniendo debidamente en cuenta el pH, la isotonicidad, la estabilidad y similares, está dentro de los conocimientos de la técnica. Una composición preferida para inyección intravenosa, cutánea o subcutánea contiene típicamente, además de un compuesto descrito en esta memoria, un vehículo isotónico. Composiciones de este tipo se pueden preparar para su administración en forma de soluciones de base libre o sales farmacológicamente aceptables en agua mezcladas adecuadamente con un tensioactivo tal como hidroxipropilcelulosa. Dispersiones también se pueden preparar en glicerol, polietilenglicoles líquidos y mezclas de los mismos y en aceites. En condiciones ordinarias de almacenamiento y uso, estos preparados pueden contener opcionalmente un conservante para evitar el crecimiento de microorganismos.
Composiciones inyectables pueden incluir soluciones, suspensiones o dispersiones acuosas estériles y polvos estériles para la preparación extemporánea de soluciones, suspensiones o dispersiones inyectables estériles. En todas las realizaciones, la forma debe ser estéril y debe ser fluida en la medida en que exista una fácil jeringabilidad. Debe ser estable en las condiciones de fabricación y almacenamiento y debe resistir la acción contaminante de microorganismos, tales como bacterias y hongos, mediante la inclusión opcional de un conservante. El soporte puede ser un disolvente o medio de dispersión que contenga, por ejemplo, agua, etanol, poliol (p. ej., glicerol, propilenglicol y polietilenglicol líquido y similares), mezclas adecuadas de los mismos y aceites vegetales. En una realización contemplada, el soporte es no acuoso o sustancialmente no acuoso. La fluidez adecuada se puede mantener, por ejemplo, mediante el uso de un recubrimiento tal como lecitina, mediante el mantenimiento del tamaño de partícula requerido del compuesto en la realización de la dispersión y mediante el uso de tensioactivos. La prevención de la acción de los microorganismos puede lograrse mediante diversos agentes antibacterianos y antifúngicos, por ejemplo, parabenos, clorobutanol, fenol, ácido sórbico, timerosal y similares. En muchas realizaciones, será preferible incluir agentes isotónicos, por ejemplo, azúcares o cloruro sódico. La absorción prolongada de las composiciones inyectables puede lograrse mediante el uso en las composiciones de agentes que retrasan la absorción, por ejemplo, monoestearato de aluminio y gelatina.
Soluciones inyectables estériles se preparan incorporando los compuestos activos en la cantidad requerida en el disolvente apropiado con varios de los otros ingredientes arriba enumerados, según se requiera, seguido de esterilización por filtración. Generalmente, las dispersiones se preparan incorporando los diversos ingredientes activos esterilizados en un vehículo estéril que contiene el medio de dispersión básico y los demás ingredientes requeridos entre los arriba enumerados. En la realización de polvos estériles para la preparación de soluciones inyectables estériles, los métodos de preparación preferidos son las técnicas de secado al vacío y liofilización que producen un polvo del ingrediente activo más cualquier ingrediente adicional deseado a partir de una solución previamente filtrada en condiciones estériles del mismo.
También se pueden preparar formulaciones de liberación lenta o liberación sostenida con el fin de lograr una liberación controlada del compuesto activo en contacto con los fluidos corporales en el tracto GI y para proporcionar un nivel sustancialmente constante y eficaz del compuesto activo en el plasma sanguíneo. Por ejemplo, la liberación puede controlarse mediante uno o más de disolución, difusión e intercambio de iones. Además, el enfoque de liberación lenta puede potenciar la absorción a través de vías saturables o limitantes dentro del tracto GI. Por ejemplo, el compuesto puede integrarse para este fin en una matriz polimérica de un polímero biológicamente degradable, un polímero hidrosoluble o una mezcla de ambos y, opcionalmente, tensioactivos adecuados. La integración puede significar en este contexto la incorporación de micropartículas en una matriz de polímeros. Las formulaciones de liberación controlada también se obtienen a través de la encapsulación de micropartículas dispersas o microgotitas emulsionadas a través de tecnologías conocidas de recubrimiento de dispersión o emulsión.
Para la administración por inhalación, compuestos de la presente invención se suministran convenientemente en forma de una presentación de espray de aerosol desde paquetes presurizados o un nebulizador, con el uso de un propulsor adecuado. En la realización de un aerosol presurizado, la unidad de dosificación se puede determinar proporcionando una válvula para suministrar una cantidad medida. Se pueden formular cápsulas y cartuchos de, p. ej., gelatina, para uso en un inhalador o insuflador que contengan una mezcla de polvo del compuesto y una base de polvo adecuada tal como lactosa o almidón.
Los compuestos descritos en esta memoria pueden formularse para la administración parenteral mediante inyección (p. ej., mediante inyección en bolo o infusión continua). Formulaciones para inyección se pueden presentar en forma de dosificación unitaria (p. ej., en ampollas o en envases multidosis), con un conservante añadido. Las composiciones pueden adoptar formas tales como suspensiones, soluciones o emulsiones en vehículos oleosos o acuosos, y pueden contener agentes de formulación tales como agentes de suspensión, estabilización y/o dispersión.
Formulaciones farmacéuticas para administración parenteral incluyen soluciones acuosas de los compuestos en forma hidrosoluble. Adicionalmente, suspensiones de los compuestos se pueden preparar como suspensiones de inyección oleosas apropiadas. Disolventes o vehículos lipófilos adecuados incluyen aceites grasos o ésteres de ácidos grasos sintéticos. Suspensiones acuosas para inyección pueden contener sustancias que aumentan la viscosidad de la suspensión. Opcionalmente, la suspensión también puede contener estabilizadores o agentes adecuados que aumenten la solubilidad de los compuestos y permitan la preparación de soluciones altamente concentradas. Alternativamente, la presente composición puede estar en forma de polvo para reconstitución con un vehículo adecuado (p. ej., agua estéril apirógena) antes de su uso.
Compuestos descritos en esta memoria también se pueden formular en composiciones rectales, tales como supositorios o enemas de retención (p. ej., que contienen bases de supositorios convencionales). Además de las formulaciones descritas previamente, los compuestos también se pueden formular como una preparación de depósito. Formulaciones de acción prolongada de este tipo pueden administrarse por implantación (p. ej., por vía subcutánea o intramuscular) o por inyección intramuscular. Así, por ejemplo, los compuestos pueden formularse con materiales poliméricos o hidrófobos adecuados (por ejemplo, en forma de una emulsión en un aceite aceptable) o resinas de intercambio iónico, o como derivados escasamente solubles, por ejemplo, como una sal escasamente soluble.
En particular, un compuesto descrito en esta memoria se puede administrar por vía oral, bucal o sublingual en forma de comprimidos que contienen excipientes, tales como almidón o lactosa, o en cápsulas u óvulos, ya sea solo o mezclado con excipientes, o en la forma de elixires o suspensiones que contengan aromatizantes o colorantes. Preparados líquidos de este tipo se pueden preparar con aditivos farmacéuticamente aceptables, tales como agentes de suspensión. Un compuesto también se puede inyectar por vía parenteral, por ejemplo, por vía intravenosa, intramuscular, subcutánea o intracoronaria. Para la administración parenteral, el compuesto se utiliza mejor en forma de una solución acuosa estéril que puede contener otras sustancias, por ejemplo, sales o alcoholes de azúcar, tales como manitol o glucosa, para hacer que la solución sea isotónica con la sangre.
Para uso veterinario, un compuesto descrito en esta memoria se administra como una formulación aceptable adecuada de acuerdo con la práctica veterinaria habitual. El veterinario puede determinar fácilmente el régimen de dosificación y la vía de administración más apropiada para un animal en particular.
En algunas realizaciones, todos los componentes necesarios para el tratamiento del trastorno relacionado con KRAS utilizando un compuesto como se describe en esta memoria solo o en combinación con otro agente o intervención tradicionalmente utilizado para el tratamiento de una enfermedad de este tipo pueden envasarse en un kit. Específicamente, la presente invención proporciona un kit para uso en la intervención terapéutica de la enfermedad que comprende un conjunto de medicamentos envasados que incluyen el compuesto descrito en esta memoria, así como tampones y otros componentes para preparar formas de administración de dichos medicamentos y/o dispositivos para administrar medicamentos de este tipo, y/o cualesquiera agentes que se utilicen en terapia de combinación con el compuesto descrito en esta memoria, y/o instrucciones para el tratamiento de la enfermedad envasadas con los medicamentos. Las instrucciones pueden fijarse en cualquier medio tangible tal como papel impreso, o un medio magnético u óptico legible por computadora, o instrucciones para hacer referencia a una fuente de datos de computadora remota, tal como una página web accesible a través de Internet.
Una "cantidad terapéuticamente eficaz" significa una cantidad eficaz para tratar o prevenir el desarrollo de, o para aliviar los síntomas existentes del sujeto que se esté tratando. La determinación de las cantidades eficaces está dentro de la capacidad de los expertos en la técnica, especialmente a la vista de la divulgación detallada proporcionada en esta memoria. En general, una "dosis terapéuticamente eficaz" se refiere a la cantidad del compuesto que resulta de lograr el efecto deseado. Por ejemplo, en una realización preferida, una cantidad terapéuticamente eficaz de un compuesto descrito en esta memoria reduce la actividad de KRAS en al menos un 5 %, en comparación con el control, al menos un 10 %, al menos un 15 %, al menos un 20 %, al menos un 25 %, al menos un 30 %, al menos un 35 %, al menos un 40 %, al menos un 45 %, al menos un 50 %, al menos un 55 %, al menos un 60 %, al menos un 65 %, al menos un 70 %, al menos un 75 %, al menos un 80 %, al menos un 85 % o al menos un 90 %.
La cantidad de compuesto administrado puede depender del sujeto que se esté tratando, de la edad, la salud, el sexo y el peso del sujeto, del tipo de tratamiento concurrente (si lo hay), de la gravedad de la afección, de la naturaleza del efecto
deseado, de la forma y frecuencia del tratamiento y del juicio del médico que prescribe. La frecuencia de dosificación también puede depender de los efectos farmacodinámicos sobre las presiones arteriales de oxígeno. Sin embargo, la dosificación más preferida se puede adaptar al sujeto individual, como entiende y puede determinar un experto en la técnica, sin una experimentación excesiva. Esto implica típicamente el ajuste de una dosis estándar (p. ej., reducción de la dosis si el paciente tiene un peso corporal bajo).
Si bien las necesidades individuales varían, la determinación de intervalos óptimos de cantidades eficaces del compuesto está dentro de los conocimientos de la técnica. Para la administración a un ser humano en el tratamiento curativo o profiláctico de las afecciones y trastornos identificados en esta memoria, por ejemplo, las dosificaciones típicas de los compuestos de la presente invención pueden ser de aproximadamente 0,05 mg/kg/día a aproximadamente 50 mg/kg/día, por ejemplo, al menos 0,05 mg/kg, al menos 0,08 mg/kg, al menos 0,1 mg/kg, al menos 0,2 mg/kg, al menos 0,3 mg/kg, al menos 0,4 mg/kg o al menos 0,5 mg/kg , y preferiblemente 50 mg/kg o menos, 40 mg/kg o menos, 30 mg/kg o menos, 20 mg/kg o menos o 10 mg/kg o menos, que puede ser de aproximadamente 2,5 mg/día (0,5 mg/kg x 5 kg) a aproximadamente 5000 mg/día (50 mg/kg x 100 kg), por ejemplo. Por ejemplo, las dosificaciones de los compuestos pueden ser de aproximadamente 0,1 mg/kg/día a aproximadamente 50 mg/kg/día, de aproximadamente 0,05 mg/kg/día a aproximadamente 10 mg/kg/día, de aproximadamente 0,05 mg/kg/día a aproximadamente 5 mg/kg/día, de aproximadamente 0,05 mg/kg/día a aproximadamente 3 mg/kg/día, de aproximadamente 0,07 mg/kg/día a aproximadamente 3 mg/kg/día, de aproximadamente 0,09 mg/kg/día a aproximadamente 3 mg /kg/día, de aproximadamente 0,05 mg/kg/día a aproximadamente 0,1 mg/kg/día, de aproximadamente 0,1 mg/kg/día a aproximadamente 1 mg/kg/día, de aproximadamente 1 mg/kg/día a aproximadamente 10 mg/kg /día, de aproximadamente 1 mg/kg/día a aproximadamente 5 mg/kg/día, de aproximadamente 1 mg/kg/día a aproximadamente 3 mg/kg/día, de aproximadamente 3 mg/día a aproximadamente 500 mg/día, de aproximadamente 5 mg/día a aproximadamente 250 mg/día, de aproximadamente 10 mg/día a aproximadamente 100 mg/día, de aproximadamente 3 mg/día a aproximadamente 10 mg/día o de aproximadamente 100 mg/día a aproximadamente 250 mg/día. Dosis de este tipo pueden administrarse en una dosis única o pueden dividirse en dosis múltiples.
Métodos de uso de los inhibidores de KRAS G12C
La presente divulgación proporciona un método para inhibir la señalización celular mediada por RAS, que comprende poner en contacto una célula con una cantidad eficaz de uno o más compuestos descritos en esta memoria. La inhibición de la transducción de señales mediada por RAS puede evaluarse y demostrarse mediante una amplia diversidad de formas conocidas en la técnica. Ejemplos no limitantes incluyen una demostración de (a) una disminución en la actividad GTPasa de RAS; (b) una disminución en la afinidad de unión a GTP o un aumento en la afinidad de unión a GDP; (c) un aumento de Koff (disociación) de GTP o una disminución de Koff de GDP; (d) una disminución en los niveles de moléculas de transducción de la señalización aguas abajo en la vía RAS, tal como una disminución en los niveles de pMEK, pERK o pAKT; y/o (e) una disminución en la unión del complejo RAS a las moléculas de señalización aguas abajo, que incluyen pero no se limitan a Raf. Se pueden utilizar kits y ensayos comercialmente disponibles para determinar uno o más de los anteriores.
La divulgación también proporciona métodos para usar los compuestos o las composiciones farmacéuticas de la presente divulgación para tratar enfermedades, incluyendo, pero no limitados a afecciones implicadas por la mutación G12C KRAS, HRAS o NRAS (p. ej., cáncer).
En algunas realizaciones, se proporciona un método para el tratamiento del cáncer, comprendiendo el método administrar una cantidad eficaz de cualquiera de las composiciones farmacéuticas anteriores que comprenden un compuesto como se describe en esta memoria a un sujeto que lo necesite. En algunas realizaciones, el cáncer está mediado por una mutación KRAS, HRAS o NRAS G12C. En diversas realizaciones, el cáncer es cáncer de páncreas, cáncer colorrectal o cáncer de pulmón. En algunas realizaciones, el cáncer es cáncer de vesícula biliar, cáncer de tiroides y cáncer de las vías biliares.
En algunas realizaciones, la divulgación proporciona un método para tratar un trastorno en un sujeto que lo necesite, en donde dicho método comprende determinar si el sujeto tiene una mutación KRAS, HRAS o NRAS G12C y si se determina que el sujeto tiene una mutación KRAS, HRAS o NRAS G12C, administrar entonces al sujeto una dosis terapéuticamente eficaz de al menos un compuesto como se describe en esta memoria o una sal farmacéuticamente aceptable del mismo.
Los compuestos descritos inhiben el crecimiento celular independiente del anclaje y, por lo tanto, tienen el potencial de inhibir la metástasis tumoral. Por consiguiente, otra realización de la divulgación proporciona un método para inhibir la metástasis tumoral, comprendiendo el método administrar una cantidad eficaz de un compuesto descrito en esta memoria.
También se han identificado mutaciones de KRAS, HRAS o NRAS G12C en neoplasias hematológicas (p. ej., cánceres que afectan a la sangre, la médula ósea y/o los ganglios linfáticos). Por consiguiente, determinadas realizaciones están dirigidas a la administración de compuestos descritos (p. ej., en forma de una composición farmacéutica) a un paciente que necesite tratamiento de una neoplasia hematológica. Neoplasias de este tipo incluyen, pero no se limitan a leucemias y linfomas. Por ejemplo, los compuestos descritos en esta memoria pueden utilizarse para el tratamiento de enfermedades tales como leucemia linfoblástica aguda (ALL, por sus siglas en inglés), leucemia mielógena aguda (AML, por sus siglas en inglés), leucemia linfocítica crónica (CLL, por sus siglas en inglés), linfoma linfocítico pequeño (SLL, por sus siglas en inglés), leucemia mielógena crónica (CML, por sus siglas en inglés), leucemia monocítica aguda (AMoL, por sus siglas en
inglés) y/u otras leucemias. En otras realizaciones, los compuestos son útiles para el tratamiento de linfomas, tales como todos los subtipos de linfoma de Hodgkin o linfoma no Hodgkin. En diversas realizaciones, los compuestos son útiles para el tratamiento de neoplasias de células plasmáticas tales como mieloma múltiple, linfoma de células del manto y macroglubunemia de Waldenstrom.
La determinación de si un tumor o cáncer comprende una mutación G12C KRAS, HRAS o NRAS se puede realizar evaluando la secuencia de nucleótidos que codifica la proteína KRAS, HRAS o NRAS, evaluando la secuencia de aminoácidos de la proteína KRAS, HRAS o NRAS o evaluando las características de una proteína mutante KRAS, HRAS o NRAS putativa. La secuencia de KRAS, HRAS o NRAS humanas de tipo salvaje se conoce en la técnica (p. ej., N° de acceso NP203524).
Métodos para detectar una mutación en una secuencia de nucleótidos KRAS, HRAS o NRAS son conocidos por los expertos en la técnica. Estos métodos incluyen, pero no se limitan a ensayos de polimorfismo de longitud de fragmentos de restricción de reacción en cadena de la polimerasa (PCR-RFLP, por sus siglas en inglés), ensayos de polimorfismo de conformación de cadena sencilla de reacción en cadena de la polimerasa (PCR-SSCP, por sus siglas en inglés), ensayos de PCR en tiempo real, secuenciación de PCR, ensayos de amplificación por PCR específica de alelo mutante (MASA, por sus siglas en inglés), secuenciación directa, reacciones de extensión de cebadores, electroforesis, ensayos de ligamiento de oligonucleótidos, ensayos de hibridación, ensayos TaqMan, ensayos de genotipado de SNP, ensayos de fusión de alta resolución y análisis de micromatrices. En algunas realizaciones, las muestras se evalúan para detectar mutaciones G12C KRAS, HRAS o NRAS mediante PCR en tiempo real. En la PCR en tiempo real se utilizan sondas fluorescentes específicas para la mutación KRAS, HRAS o NRAS G12C. Cuando está presente una mutación, la sonda se une y se detecta fluorescencia. En algunas realizaciones, la mutación KRAS, HRAS o NRAS G12C se identifica utilizando un método de secuenciación directa de regiones específicas (p. ej., exón 2 y/o exón 3) en el gen KRAS, HRAS o NRAS. Esta técnica permitirá identificar todas las mutaciones posibles en la región secuenciada.
Métodos para detectar una mutación en una proteína KRAS, HRAS o NRAS son conocidos por los expertos en la técnica. Estos métodos incluyen, pero no se limitan a la detección de un mutante KRAS, HRAS o NRAS utilizando un agente de unión (p. ej., un anticuerpo) específico para la proteína mutante, electroforesis de proteínas y transferencia Western, y secuenciación directa de péptidos.
Métodos para determinar si un tumor o cáncer comprende una mutación G12C KRAS, HRAS o NRAS pueden utilizar una diversidad de muestras. En algunas realizaciones, la muestra se toma de un sujeto que tiene un tumor o cáncer. En algunas realizaciones, la muestra es una muestra reciente de tumor/cáncer. En algunas realizaciones, la muestra es una muestra congelada de tumor/cáncer. En algunas realizaciones, la muestra es una muestra embebida en parafina fijada con formalina. En algunas realizaciones, la muestra es una muestra de células tumorales circulantes (CTC). En algunas realizaciones, la muestra se procesa en un lisado celular. En algunas realizaciones, la muestra se procesa a ADN o ARN.
La divulgación también se refiere a un método para tratar un trastorno hiperproliferativo en un mamífero, que comprende administrar a dicho mamífero una cantidad terapéuticamente eficaz de un compuesto como se describe en esta memoria, o una sal farmacéuticamente aceptable del mismo. En algunas realizaciones, dicho método se refiere al tratamiento de un sujeto que padece un cáncer tal como leucemia mieloide aguda, cáncer en adolescentes, carcinoma adrenocortical infantil, cánceres relacionados con el SIDA (p. ej., linfoma y sarcoma de Kaposi), cáncer anal, cáncer de apéndice, astrocitomas, teratoide atípico, carcinoma de células basales, cáncer de las vías biliares, cáncer de vejiga, cáncer de huesos, glioma de tronco encefálico, tumor cerebral, cáncer de mama, tumores bronquiales, linfoma de Burkitt, tumor carcinoide, teratoide atípico, tumores embrionarios, tumor de células germinales, linfoma primario, cáncer de cuello uterino, cánceres infantiles, cordoma, tumores cardíacos, leucemia linfocítica crónica (CLL, por sus siglas en inglés), leucemia mielógena crónica (CML, por sus siglas en inglés), trastornos mieloproliferativos crónicos, cáncer de colon, cáncer colorrectal, craneofaringioma, linfoma cutáneo de células T, carcinoma ductal extrahepático in situ (DCIS, por sus siglas en inglés), tumores embrionarios, cáncer del SNC, cáncer de endometrio, ependimoma, cáncer de esófago, estesioneuroblastoma, sarcoma de Ewing, tumor extracraneal de células germinales, tumor extracraneal de células germinales extragonadales, cáncer de ojo, histiocitoma fibroso de hueso, cáncer de la vesícula biliar, cáncer gástrico, tumor carcinoide gastrointestinal, tumores del estroma gastrointestinal (GIST, por sus siglas en inglés), tumor de células germinales, tumor trofoblástico gestacional, leucemia de células pilosas, cáncer de cabeza y cuello, cáncer de corazón , cáncer de hígado, linfoma de Hodgkin, cáncer de hipofaringe, melanoma intraocular, tumores de células de los islotes, tumores neuroendocrinos pancreáticos, cáncer de riñón, cáncer de laringe, cáncer de labios y cavidad oral, cáncer de hígado, carcinoma lobular in situ (LCIS, por sus siglas en inglés), cáncer de pulmón, linfoma, cáncer metastásico de cuello escamoso con primario oculto, carcinoma del tracto medio, cáncer de boca, síndromes de neoplasia endocrina múltiple, mieloma múltiple/neoplasia de células plasmáticas, micosis fungoide, síndromes mielodisplásicos, neoplasias mielodisplásicas/mieloproliferativas, carcinoma de células de Merkel, mesotelioma maligno, histiocitoma fibroso maligno de hueso y osteosarcoma, cáncer de la cavidad nasal y cáncer de seno paranasal, cáncer nasofaríngeo, neuroblastoma, linfoma no Hodgkin, cáncer de pulmón de células no pequeñas (NSCLC, por sus siglas en inglés), cáncer oral, cáncer de labios y cavidad oral, cáncer de orofaringe, cáncer de ovario, cáncer de páncreas, papilomatosis, paraganglioma, cáncer de seno paranasal y cavidad nasal, cáncer de paratiroides, cáncer de pene, cáncer de faringe, blastoma pleuropulmonar, linfoma primario del sistema nervioso central (SNC), cáncer de próstata, cáncer de recto, cáncer de células de transición, retinoblastoma, rabdomiosarcoma, cáncer de glándulas salivales, cáncer de piel, cáncer de estómago (gástrico), cáncer de pulmón de células pequeñas, cáncer de intestino delgado, sarcoma de tejido blando, linfoma de células T, cáncer testicular, cáncer de garganta, timoma y carcinoma tímico, cáncer de tiroides, cáncer de células de transición de la pelvis renal y uréter, tumor trofoblástico, cánceres inusuales de la
infancia, cáncer de uretra, sarcoma uterino, cáncer de vagina, cáncer de vulva o cáncer inducido por virus. En algunas realizaciones, dicho método se refiere al tratamiento de un trastorno hiperproliferativo no canceroso tal como hiperplasia benigna de la piel (p. ej., psoriasis), restenosis o próstata (p. ej., hipertrofia prostática benigna (BPH, por sus siglas en inglés)).
En algunas realizaciones, los métodos para el tratamiento están dirigidos al tratamiento de cánceres de pulmón, los métodos comprenden administrar una cantidad eficaz de cualquiera de los compuestos arriba descritos (o una composición farmacéutica que comprende los mismos) a un sujeto que lo necesite. En determinadas realizaciones, el cáncer de pulmón es un carcinoma de pulmón de células no pequeñas (NSCLC), por ejemplo, adenocarcinoma, carcinoma de pulmón de células escamosas o carcinoma de pulmón de células grandes. En algunas realizaciones, el cáncer de pulmón es un carcinoma de pulmón de células pequeñas. Otros cánceres de pulmón tratables con los compuestos descritos incluyen, pero no se limitan a tumores glandulares, tumores carcinoides y carcinomas indiferenciados.
La divulgación proporciona, además, métodos para modular la actividad de la proteína KRAS, HRAS o NRAS mutante G12C poniendo en contacto la proteína con una cantidad eficaz de un compuesto de la divulgación. La modulación puede inhibir o activar la actividad de la proteína. En algunas realizaciones, la divulgación proporciona métodos para inhibir la actividad de la proteína poniendo en contacto la proteína KRAS, HRAS o NRAS mutante G12C con una cantidad eficaz de un compuesto de la divulgación en solución. En algunas realizaciones, la descripción proporciona métodos para inhibir la actividad de la proteína KRAS, HRAS o NRAS mutante G12C al ponerse en contacto con una célula, tejido u órgano que expresa la proteína de interés. En algunas realizaciones, la divulgación proporciona métodos para inhibir la actividad de la proteína en sujetos que incluyen, pero no se limitan a roedores y mamíferos (p. ej., seres humanos) mediante la administración al sujeto de una cantidad eficaz de un compuesto de la divulgación. En algunas realizaciones, el porcentaje de modulación supera el 25 %, 30 %, 40 %, 50 %, 60 %, 70 %, 80 % o 90 %. En algunas realizaciones, el porcentaje de inhibición supera el 25 %, 30 %, 40 %, 50 %, 60 %, 70 %, 80 % o 90 %.
En algunas realizaciones, la divulgación proporciona métodos para inhibir la actividad de KRAS, HRAS o NRAS G12C en una célula, poniendo en contacto dicha célula con una cantidad de un compuesto de la divulgación suficiente para inhibir la actividad de KRAS, HRAS o NRAS G12C en dicha célula. En algunas realizaciones, la divulgación proporciona métodos para inhibir la actividad de KRAS, HRAS o NRAS G12C en un tejido, poniendo en contacto dicho tejido con una cantidad de un compuesto de la divulgación suficiente para inhibir la actividad de KRAS, HRAS o NRAS G12C en dicho tejido. En algunas realizaciones, la divulgación proporciona métodos para inhibir la actividad de KRAS, HRAS o NRAS G12C en un organismo, poniendo en contacto dicho organismo con una cantidad de un compuesto de la divulgación suficiente para inhibir la actividad de KRAS, HRAS o NRAS G12C en dicho organismo. En algunas realizaciones, la divulgación proporciona métodos para inhibir la actividad de KRAS, HRAS o NRAS G12C en un animal, poniendo en contacto dicho animal con una cantidad de un compuesto de la divulgación suficiente para inhibir la actividad de KRAS, HRAS o NRAS G12C en dicho animal. En algunas realizaciones, la divulgación proporciona métodos para inhibir la actividad de KRAS, HRAS o NRAS G12C en un mamífero, poniendo en contacto dicho mamífero con una cantidad de un compuesto de la divulgación suficiente para inhibir la actividad de KRAS, HRAS o NRAS G12C en dicho mamífero. En algunas realizaciones, la divulgación proporciona métodos para inhibir la actividad de KRAS, HRAS o NRAS G12C en un ser humano, poniendo en contacto a dicho ser humano con una cantidad de un compuesto de la divulgación suficiente para inhibir la actividad de KRAS, HRAS o NRAS G12C en dicho ser humano. La presente divulgación proporciona métodos para tratar una enfermedad mediada por la actividad de KRAS, HRAS o NRAS G12C en un sujeto que necesita un tratamiento de este tipo.
Terapia de Combinación:
La presente divulgación también proporciona métodos para terapias de combinación en los que un agente conocido por modular otras vías, u otros componentes de la misma vía, o incluso conjuntos solapantes de enzimas diana se utiliza en combinación con un compuesto de la presente divulgación, o una sal farmacéuticamente aceptable del mismo. En un aspecto, una terapia de este tipo incluye pero no se limita a la combinación de uno o más compuestos de la divulgación con agentes quimioterapéuticos, anticuerpos terapéuticos y tratamiento con radiación, para proporcionar un efecto terapéutico sinérgico o aditivo.
Muchos agentes quimioterapéuticos se conocen actualmente en la técnica y se pueden utilizar en combinación con los compuestos de la divulgación. En algunas realizaciones, el agente quimioterapéutico se selecciona del grupo que consiste en inhibidores mitóticos, agentes alquilantes, anti-metabolitos, antibióticos intercalantes, inhibidores del factor de crecimiento, inhibidores del ciclo celular, enzimas, inhibidores de la topoisomerasa, modificadores de la respuesta biológica, anti-hormonas, inhibidores de la angiogénesis y anti-andrógenos. Ejemplos no limitantes son agentes quimioterapéuticos, agentes citotóxicos y moléculas pequeñas no peptídicas, tales como Gleevec® (Imatinib Mesilato), Kyprolis® (carfilzomib), Velcade® (bortezomib), Casodex (bicalutamida), Iressa® (gefitinib), Venclexta™ (venetoclax) y Adriamycin™ (docorrubicina), así como una serie de agentes quimioterapéuticos. Ejemplos no limitativos de agentes quimioterapéuticos incluyen agentes alquilantes tales como tiotepa y ciclosfosfamida (Cytoxan™); alquilsulfonatos, tales como busulfano, improsulfano y piposulfano; aziridinas, tales como benzodopa, carbocuona, meturedopa y uredopa; etileniminas y metilamelaminas. incluyendo altretamina, trietilenmelamina, trietilenfosforamida, trietilentiofosforamida y trimetilolomelamina; mostazas nitrogenadas, tales como clorambucilo, clormafazina, clorociclofosfamida, estramustina, ifosfamida, mecloretamina, hidrocloruro de óxido de mecloretamina, melfalán, novembiquina, fenesterina, prednimustina, trofosfamida, uracilo mostaza; nitrosureas, tales como carmustina, clorozotocina, fotemustina, lomustina, nimustina, ranimustina; antibióticos,
tales como aclacinomisinas, actinomicina, autramicina, azaserina, bleomicinas, cactinomicina, caliqueamicina, carabicina, carminomicina, carzinofilina, Casodex™, cromomicinas, dactinomicina, daunorrubicina, detorrubicina, 6-diazo-5-oxo-L-norleucina, doxorrubicina, epirrubicina, esorrubicina, idarrubicina, marcelomicina, mitomicinas, ácido micofenólico, nogalamicina, olivomicinas, peplomicina, potfiromicina, puromicina, quelamicina, rodorrubicina, estreptonigrina, estreptozocina, tubercidina, ubenimex, zinostatina, zorrubicina; anti-metabolitos, tales como metotrexato y 5-fluorouracilo (5-FU); análogos de ácido fólico, tales como denopterina, metotrexato, pteropterina, trimetrexato; análogos de purina, tales como fludarabina, 6-mercaptopurina, tiamiprina, tioguanina; análogos de pirimidina, tales como ancitabina, azacitidina, 6-azauridina, carmofur, citarabina, didesoxiuridina, doxifluridina, enocitabina, floxuridina, andrógenos, tales como calusterona, propionato de dromostanolona, epitiostanol, mepitiostano, testolactona; anti-suprarrenales, tales como aminoglutetimida, mitotano, trilostano; reabastecedor de ácido fólico, tal como ácido frolínico; aceglatona; glicósido de aldofosfamida; ácido aminolevulínico; amsacrina; bestrabucilo; bisantreno; edatraxato; defofamina; demecolcina; diazicuona; elfomitina; acetato de eliptinio; etoglucido; nitrato de galio; hidroxiurea; lentinán; lonidamina; mitoguazona; mitoxantrona; mopidamol; nitracrina; pentostatina; fenamet; pirarrubicina; ácido podofilínico; 2-etilhidrazida; procarbazina; PSK; razoxano; sizofirán; espirogermanio; ácido tenuazónico; triazicuona; 2,2',2"-triclorotrietilamina; uretano; vindesina; dacarbazina; manomustina; mitobronitol; mitolactol; pipobroman; gacitosina; arabinósido ("Ara-C"); ciclofosfamida; tiotepa; taxanos, p. ej., paclitaxel y docetaxel; ácido retinoico; esperamicinas, capecitabinas y sales, ácidos o derivados farmacéuticamente aceptables de cualquiera de los anteriores.
También se incluyen como acondicionadores celulares quimioterapéuticos adecuados agentes anti-hormonales que actúan para regular o inhibir la acción hormonal sobre tumores tales como anti-estrógenos, incluyendo, por ejemplo, tamoxifeno, (Nolvadex™), raloxifeno, 4(5)-imidazoles que inhiben la aromatasa, 4-hidroxitamoxifeno, trioxifeno, keoxifeno, LY 117018, onapristona y toremifeno (Fareston); y anti-andrógenos tales como flutamida, nilutamida, bicalutamida, leuprolida y goserelina; clorambucilo; gemcitabina; 6-tioguanina; mercaptopurina; metotrexato; análogos de platino, tales como cisplatino y carboplatino; vinblastina; platino; etopósido (VP-16); ifosfamida; mitomicina C; mitoxantrona; vincristina; vinorelbina; navelbina; novantrona; tenipósido; daunomicina; aminopterina; xeloda; ibandronato; camptotecina-11 (CPT-11); inhibidor de topoisomerasa RFS 2000; difluorometilornitina (DMFO).
En ,los casos en los que se desee, los compuestos o la composición farmacéutica de la presente divulgación se pueden utilizar en combinación con fármacos contra el cáncer recetados comúnmente, tales como Herceptin®, Avastin®, Ertritux®, Rituxan®, Taxol®, Arimidex®, Taxotere®, ABVD, AVICINE, Abagovomab, acridina carboxamida, Adecatumumab, 17-N-alilamino-17-demetoxigeldanamicina, alfaradin, Alvocidib, 3-aminopiridina-2-carboxaldehído tiosemicarbazona, Amonafida, Antracenodiona, inmunotoxinas anti-CD22, antineoplásicos, hierbas antitumorigénicas, Apaziquone, Atiprimod, azatioprina, belotecán, bendamustina, BIBW 2992, biricodar, brostalicina, briostatina, butionina sulfoximina, CBV (quimioterapia), caliculina, agentes antineoplásicos no específicos del ciclo celular, ácido dicloroacético, discodermolida, elsamitrucina, enocitabina, epotilona, eribulina, everolimus, exatecán, exisulind, ferruginol, forodesina, fosfestrol, régimen de quimioterapia ICE, IT-101, Imexon, Imiquimod, Indolocarbazol, Irofulven, Laniquidar, Larotaxel, lenalidomida, lucantona, lurtotecan, mafosfamida, mitozolomida, nafoxidina, nedaplatino, olaparib, ortataxel, PAC-1, papaya, pixantrona, inhibidor de proteasoma, rebecamicina, resiquimod, rubitecan, SN-38, salinosporamida A, sapacitabina, Stanford V, swainsonina, talaporfina , Tariquidar, Tegafururacil, Temodar, Tesetaxel, tetranitrato de triplatino, tris(2-cloroetil)amina, Troxacitabina, Uramustina, Vadimezan, Vinflunina, ZD6126 o Zosuquidar.
Esta divulgación se refiere, además, a un método para utilizar los compuestos o las composiciones farmacéuticas proporcionados en esta memoria, en combinación con radioterapia para inhibir el crecimiento celular anormal o tratar el trastorno hiperproliferativo en el mamífero. Técnicas para administrar radioterapia son conocidas en la técnica, y estas técnicas pueden utilizarse en la terapia de combinación descrita en esta memoria. La administración del compuesto de la divulgación en esta terapia de combinación se puede determinar como se describe en esta memoria.
La radioterapia se puede administrar a través de uno de varios métodos, o una combinación de métodos, incluyendo, sin limitación, terapia de haz externo, radioterapia interna, radiación de implante, radiocirugía estereotáctica, radioterapia sistémica, radioterapia y braquiterapia intersticial permanente o temporal. El término "braquiterapia", tal como se utiliza en esta memoria, se refiere a la radioterapia suministrada por un material radiactivo confinado en el espacio, insertado en el cuerpo en o cerca de un tumor u otro sitio de enfermedad de tejido proliferativo. El término pretende, sin limitación, incluir la exposición a isótopos radiactivos (p. ej., At-211, I-131, I-125, Y-90, Re-186, Re-188, Sm-153, Bi-212, P-32, e isótopos radiactivos de Lu). Fuentes de radiación adecuadas para uso como un acondicionador celular de la presente divulgación incluyen tanto sólidos como líquidos. A modo de ejemplo no limitativo, la fuente de radiación puede ser un radionucleido, tal como I-125, I-131, Yb-169, Ir-192 como fuente sólida, I-125 como fuente sólida, u otros radionucleidos que emiten fotones, partículas beta, radiación gamma u otros rayos terapéuticos. El material radiactivo también puede ser un fluido hecho a partir de cualquier solución de radionucleido(s), p. ej., una solución de I-125 o I-131, o un fluido radiactivo puede producirse utilizando una suspensión de un fluido adecuado que contenga pequeñas cantidades incorporadas en un gel o microesferas radiactivas.
Los compuestos o las composiciones farmacéuticas de la divulgación se pueden utilizar en combinación con una cantidad de una o más sustancias seleccionadas de agentes anti-angiogénesis, inhibidores de la transducción de señales, agentes antiproliferativos, inhibidores de la glicólisis o inhibidores de la autofagia.
Agentes anti-angiogénesis, tales como inhibidores de MMP-2 (metaloproteinasa de la matriz 2), inhibidores de MMP-9 (metaloproteinasa de la matriz 9) e inhibidores de COX-11 (ciclooxigenasa 11) pueden utilizarse junto con un compuesto
de la divulgación y composiciones farmacéuticas descritas en esta memoria. Los agentes anti-angiogénesis incluyen, por ejemplo, rapamicina, temsirolimus (CCI-779), everolimus (RAD001), sorafenib, sunitinib y bevacizumab. Ejemplos de inhibidores de COX-II útiles incluyen alecoxib, valdecoxib y rofecoxib. En los documentos WO 96/33172, WO 96/27583, Publicación de Patente Europea EP0818442, Publicación de Patente Europea EP1004578, documentos WO 98/07697, WO 98/03516, WO 98/34918, WO 98/34915, WO 98/33768, WO 98/30566, Publicación de Patente Europea 606046, Publicación de Patente Europea 931 788, documentos WO 90/05719, WO 99/52910, WO 99/52889, WO 99/29667, WO1999007675, Publicación de Patente Europea EP1786785, Publicación de Patente Europea N° EP1181017, Publicación de Estados Unidos N° US20090012085, Publicación de Estados Unidos US5863949, Publicación de Estados Unidos US5861510 y Publicación de Patente Europea EP0780386. Inhibidores de MMP-2 y MMP-9 preferidos son aquellos que tienen poca o ninguna actividad inhibidora de MMP-1. Más preferidos son aquellos que inhiben selectivamente MMP-2 y/o AMP-9 con respecto a las otras metaloproteinasas de la matriz (es decir, Ma P-1, Mm P-3, MMP-4, MMP-5, MMP-6 , MMP-7, MMP-8 , MMP-10, MMP-11, MMP-12 y MMP-13). Algunos ejemplos específicos de inhibidores de MMP útiles en la divulgación son AG-3340, RO 32-3555 y RS 13-0830.
Los presentes compuestos también se pueden utilizar en terapias conjuntas con otros agentes antineoplásicos, tales como acemanano, aclarubicina, aldesleukina, alemtuzumab, alitretinoina, altretamina, amifostina, ácido aminolevúlico, amrubicina, amsacrina, anagrelida, anastrozol, ANCER, ancestim, ARGLABIN, trióxido de arsénico, BAM 002 (Novelos), bexaroteno, bicalutamida, broxuridina, capecitabina, celmoleucina, cetrorelix, cladribina, clotrimazol, ocfosfato de citarabina, DA 3030 (Dong-A), daclizumab, denileucina diftitox, deslorelina, dexrazoxano, dilazep, docetaxel, docosanol, doxercalciferol, doxifluridina, doxorrubicina, bromocriptina, carmustina, citarabina, fluorouracilo, diclofenaco HIT, interferón alfa, daunorrubicina, doxorrubicina, tretinoína, edelfosina, edrecolomab, eflomitina, emitefur, epirrubicina, epoetina beta, fosfato de etopósido, exemestano, exisulindestano , fadrozol, filgrastim, finasterida, fosfato de fludarabina, formestano, fotemustina, nitrato de galio, gemcitabina, gemtuzumab zogamicina, combinación de gimeracil/oteracil/tegafur, glicopina, goserelina, heptaplatino, gonadotropina coriónica humana, fetoproteína alfa fetal humana, ácido ibandrónico, idarrubicina, (imiquimod, interferón alfa, interferón alfa natural, interferón alfa-2, interferón alfa-2a, interferón alfa-2b, interferón alfa-Nl, interferón alfa-n3, interferón alfacon-1, interferón alfa natural, interferón beta, interferón beta-la, interferón beta-lb, interferón gamma, interferón gamma-la natural, interferón gamma-lb, interleuquina-1 beta, iobenguano, irinotecán, irsogladina, lanreotida, LC 9018 (Yakult), leflunomida, lenograstim, sulfato de lentinano, letrozol, interferón leucocitario alfa, leuprorelina, levamisol fluorouracilo, liarozol, lobaplatino, lonidamina, lovastatina, masoprocol, melarsoprol, metoclopramida, mifepristona, miltefosina, mirimostim, ARN de doble cadena no coincidente, mitoguazona, mitolactol, mitoxantrona, molgramostim, nafarelina, naloxona pentazocina, nartograstim, nedaplatino, nilutamida, noscapina, nueva proteína estimulante de la eritropoyesis, NSC 631570 octreotide, oprelvekina, osaterona, oxaliplatino, paclitaxel, ácido pamidrónico, pegaspargasa, peginterferón alfa-2 b, pentosan polisulfato de sodio, pentostatina, picibanil, pirarrubicina, anticuerpo policlonal antitimocito de conejo, polietilenglicol interferón alfa-2 a, porfímero de sodio, raloxifeno, raltitrexed, rasburiembodiment, renio Re 186 etidronato, retinamida RII, rituximab, romurtida, samario (153 Sm) lexidronam, sargramostim, sizofiran, sobuzoxana, sonermina, cloruro de estroncio-89, suramina, tasonermina, tazaroteno, tegafur, temoporfina, temozolomida, tenipósido, tetraclorodecaóxido, talidomida, timalfasina, tirotropina alfa, topotecán, toremifeno, tositumomab-yodo 131, trastuzumab, treosulfán, tretinoína, trilostano, trimetrexato, triptorelina, factor de necrosis tumoral alfa, natural, ubenimex, vacuna contra el cáncer de vejiga, vacuna Maruyama, vacuna de lisado de melanoma, valrubicina, verteporfina, vinorelbina, VIRULIZIN, zinostatin stimalamer o ácido zoledrónico; abarelix; AE 941 (Aeterna), ambamustina, oligonucleótido antisentido, bcl-2 (Genta), APC 8015 (Dendreon), cetuximab, decitabina, dexaminoglutetimida, diazicuona, EL 532 (Elan), EM 800 (Endorecherche), eniluracilo, etanidazol, fenretinida, filgrastim SD01 (Amgen), fulvestrant, galocitabina, inmunógeno gastrina 17, terapia génica HLA-B7 (Vical), factor estimulante de colonias de granulocitos y macrófagos, dihidrocloruro de histamina, ibritumomab tiuxetan, ilomastat, IM 862 (Cytran), interleuquina-2, iproxifeno, LDI 200 (Milkhaus), leridistim, lintuzumab, MAb (anticuerpo monoclonal) CA 125 (Biomira), MAb contra el cáncer (Japan Pharmaceutical Development), MAb contra HER-2 y Fc (Medarex), MAb 105AD7 idiotípico (tecnología CRC), MAb CEA idiotípico (Trilex), MAb LYM -1-yodo 131 (Techniclone), MAb contra mucina-itrio 90 polimórfico epitelial (Antisoma), marimastat, menogaril, mitumomab, motexafin gadolinio, MX 6 (Galderma), nelarabina, nolatrexed, proteína P 30, pegvisomant, pemetrexed, porfiromicina, prinomastat, RL 0903 (Shire), rubitecán, satraplatino, fenilacetato sódico, ácido esparfósico, SRL 172 (SR Pharma), SU 5416 (SUGEN), TA 077 (Tanabe), tetratiomolibdato, taliblastina, trombopoyetina, estaño etil etiopurpurina, tirapazamina, vacuna contra el cáncer (Biomira), vacuna contra el melanoma (Universidad de Nueva York), vacuna contra el melanoma (Instituto Sloan Kettering), vacuna contra el oncolisado del melanoma (Colegio Médico de Nueva York), vacuna contra el lisado celular del melanoma viral (Royal Newcastle Hospital) o valspodar.
Los compuestos de la invención se pueden utilizar, además, con inhibidores de VEGFR. Otros compuestos descritos en las siguientes patentes y solicitudes de patente pueden utilizarse en terapia combinada: US 6.258.812, US 2003/0105091, WO 01/37820, US 6.235.764, WO 01/32651, US 6.630.500, US 6.515.004, US 6.713.485, US 5.521.184, US 5.770.599, US 5.747.498, WO 02/68406, WO 02/66470, WO 02/55501, WO 04/05279, WO 04/07481, WO 04/07458, WO 04/09784, WO 02/59110, WO 99/45009, WO 00/59509, WO 99/61422, US 5.990.141, WO 00/12089 y WO 00/02871.
En algunas realizaciones, la combinación comprende una composición de la presente invención en combinación con al menos un agente antiangiogénico. Agentes incluyen, pero no se limitan a composiciones químicas preparadas sintéticamente in vitro, anticuerpos, regiones de unión a antígeno, radionucleidos, y combinaciones y conjugados de los mismos. Un agente puede ser un agonista, antagonista, modulador alostérico, toxina o, más generalmente, puede actuar para inhibir o estimular su objetivo (p. ej., activación o inhibición de receptor o enzima) y, por lo tanto, fomentar la muerte de la célula o detener el crecimiento celular.
Agentes anti-angiogénicos ejemplares incluyen ERBITUX™ (IMC-C225), agentes inhibidores de KDR (receptor deñ dominio quinasa) (p. ej., anticuerpos y regiones de unión a antígeno que se unen específicamente al receptor del dominio quinasa), agentes anti-VEGF (p. ej., anticuerpos o regiones de unión a antígeno que se unen específicamente a VEGF, o receptores de VEGF solubles o una región de unión a ligando de los mismos) tales como AVASTEN™ o VEGF-TRAP™, y agentes anti-receptor de VEGF (p. ej., anticuerpos o regiones de unión a antígeno que se unen específicamente a ellos), agentes inhibidores de EGFR (p. ej., anticuerpos o regiones de unión a antígeno que se unen específicamente a ellos), tales como Vectibix (panitumumab), IRESSA™ (gefitinib), TARCEVA™ (erlotinib), agentes anti-Ang1 y anti-Ang2 (p. ej., anticuerpos o regiones de unión a antígenos que se unen específicamente a ellos o a sus receptores, p. ej., Tie2/Tek), y agentes inhibidores de la quinasa anti-Tie2 (p. ej., anticuerpos o regiones de unión a antígenos que se unen específicamente a ellos). Las composiciones farmacéuticas de la presente invención también pueden incluir uno o más agentes (p. ej., anticuerpos, regiones de unión a antígenos o receptores solubles) que se unen específicamente e inhiben la actividad de los factores de crecimiento, tales como antagonistas del factor de crecimiento de hepatocitos (HGF, también conocido como Factor Scatter), y anticuerpos o regiones de unión a antígenos que se unen específicamente a su receptor "c-met".
Otros agentes anti-angiogénicos incluyen Campath, IL-8, B-FGF, antagonistas de Tek (Ceretti et al., Publicación de EE.UU. N° 2003/0162712; Patente de EE.UU. N° 6.413.932), agentes anti-TWEAK (p. ej., anticuerpos que se unen específicamente o regiones de unión a antígenos, o antagonistas solubles del receptor TWEAK; véase, Wiley, Patente de EE.UU. N° 6.727.225), dominio de desintegrina ADAM para antagonizar la unión de integrina a sus ligandos (Fanslow et al., Publicación de EE.UU. N° 2002/0042368), que se unen específicamente a los receptores anti-ef y/o a los anticuerpos anti-efrina o a las regiones de unión a antígenos (Patentes de EE. UU. N°s 5.981.245, 5.728.813, 5.969.110; 6.5986.852, 6.232.447, 6.057.124 y miembros de la familia de patentes de las mismas) y antagonistas anti-PDGF-BB (p. ej., anticuerpos que se unen específicamente o regiones de unión a antígenos), así como anticuerpos o regiones de unión a antígenos que se unen específicamente a ligandos de PDGF-BB y agentes inhibidores de la quinasa de PDGFR (p. ej., anticuerpos o regiones de unión a antígenos que se unen específicamente a los mismos).
Agentes anti-angiogénicos/antitumorales adicionales incluyen: SD-7784 (Pfizer, EE.UU.); cilengitida (Merck KGaA, Alemania, documento EPO 770622); pegaptanib octasodio, (Gilead Sciences, EE.UU.); Alfastatina, (BioActa, Reino Unido); M-PGA, (Celgene, EE.UU., documento US 5712291); ilomastat, (Arriva, EE.UU., documento US 5892112); emaxanib, (Pfizer, EE.UU., documento US 5792783); vatalanib, (Novartis, Suiza); 2-metoxiestradiol, (EntreMed, EE.UU.); TLC ELL-12, (Elan, Irlanda); acetato de anecortave, (Alcon, EE.UU.); MAb alfa-D148, (Amgen, EE.UU.); CEP-7055,(Cephalon, Ee .u U.); MAb anti-Vn, (Crucell, Holanda) DAC:antiangiogénico, (ConjuChem, Canadá); Angiocidina, (InKine Pharmaceutical, EE.UU.); KM-2550, (Kyowa Hakko, Japón); SU-0879, (Pfizer, EE.Uu .); CGP-79787, (Novartis, Suiza, documento EP 970070); tecnología ARGENT, (Ariad, EE.UU.); YIGSR-Stealth, (Johnson & Johnson, EE.UU.); fragmento E de fibrinógeno, (BioActa, Reino Unido); inhibidor de la angiogénesis, (Trigen, Reino Unido); TBC-1635, (Encysive Pharmaceuticals, EE.UU.); SC-236, (Pfizer, EE.UU.); ABT-567, (Abbott, EE.UU.); Metastatina, (EntreMed, EE.UU.); inhibidor de la angiogénesis, (Tripep, Suecia); maspina, (Sosei, Japón); 2-metoxiestradiol, (Oncology Sciences Corporation, EE.UU.); ER-68203-00, (IVAX, EE.UU.); Benefin, (Lane Labs, EE.UU.); Tz-93, (Tsumura, Japón); TAN-1120, (Takeda, Japón); FR-111142, (Fujisawa, Japón, documento JP 02233610); factor 4 plaquetario, (RepliGen, EE.UU., documento Ep 407122); antagonista del factor de crecimiento vascular endotelial, (Borean, Dinamarca); bevacizumab (pINN), (Genentech, EE.UU.); inhibidores de la angiogénesis, (SUGEN, EE.UU.); XL 784, (Exelixis, EE.UU.); XL 647, (Exelixis, EE.UU.); MAb, integrina alfa5beta3, segunda generación, (Applied Molecular Evolution,
EE.UU. y MedImmune, EE.UU.); terapia génica, retinopatía, (Oxford BioMedica, Reino Unido); hidrocloruro de enzastaurina (USAN), (Lilly, EE.UU.); Ce P 7055, (Cephalon, e E.UU. y Sanofi-Synthelabo, Francia); BC 1, (Genoa Institute of Cancer Research, Italia); inhibidor de la angiogénesis, (Alchemia, Australia); antagonista de VEGF, (Regeneron, EE.UU.); antiangiogénico rBPI 21 y derivado de BPI, (XOMA, EE.UU.); PI 88, (Progen, Australia); cilengitida (pINN), (Merck KGaA, Alemania; Munich Technical University, Alemania, Scripps Clinic and Research Foundation, EE.UU.); cetuximab (INN), (Aventis, Francia); AVE 8062, (Ajinomoto, Japón); a S 1404, (Cancer Research Laboratory, Nuva Zelanda); SG 292, (Telios, EE.UU.); Endostatina, (Boston Childrens Hospital, EE.UU.); ATN 161, (Attenuon, EE.UU.); ANGIOSTATINA, (Boston Childrens Hospital, EE.UU.); 2-metoxiestradiol, (Boston Childrens Hospital, EE.UU.); ZD 6474, (AstraZeneca, Reino Unido); ZD 6126, (Angiogene Pharmaceuticals, Reino Unido); PPI 2458, (Praecis, EE.UU.); a ZD 9935, (AstraZeneca, Reino Unido); AZd 2171, (AstraZeneca, Reino Unido); vatalanib (pINN), (Novartis, Suiza y Schering AG, Alemania); inhibidores de la vía del factor tisular, (EntreMed, EE.UU.); pegaptanib (Pinn), (Gilead Sciences, EE.UU.); xantorrizol, (Yonsei University, Corea del Sur); vacuna, basada en genes, VEGF-2, (Scripps Clinic and Research Foundation, EE.UU.); SPV5.2 , (Supratek, Canadá); SDX 103, (University of California en San Diego, EE.UU.); PX 478, (ProlX, EE.UU.); METASTATINA, (EntreMed, EE.UU.); troponina I, (Harvard University, EE.UU.); SU 6668, (SUGEN, EE.UU.); OXI 4503, (OXiGENE, EE.UU.); o-guanidinas, (Dimensional Pharmaceuticals, EE.UU.); motuporamina C, (British Columbia University, Canadá); CDP 791, (Celltech Group, Reino Unido); atiprimod (pINN), (GlaxoSmithKline, Reino Unido); E 7820, (Eisai, Japón); CYC 381, (Harvard University, EE.UU.); AE 941, (Aeterna, Canadá); vacuna, angiogénesis, (EntreMed, EE.UU.); inhibidor del activador del plasminógeno y uroquinasa, (Dendreon, EE.UU.); oglufanida (pINN), (Melmotte, EE.UU.); inhibidores de HIF-lalfa, (Xenova, Reino Unido); CEP 5214, (Cephalon, EE.UU.); BAY Res 2622, (Bayer, Alemania); Angiocidina, (InKine, EE.UU.); A6, (Angstrom, EE.UU.); KR 31372, (Korea Research Institute of Chemical Technology, Corea del Sur); GW 2286, (Glaxo-SmithKline, Reino Unido); EHT 0101, (ExonHit, Francia); CP 868596, (Pfizer, EE.UU.); CP 564959, (OSI, EE.UU.); CP 547632, (Pfizer, EE.UU.); 786034, (GlaxoSmithKline, Reino Unido); KRN 633, (Kirin Brewery, Japón);
sistema de suministro de fármacos, intraocular, 2-metoxiestradiol, (EntreMed, EE.UU.); anginex, (Maastricht University, Holanda y Minnesota University, EE.UU.); ABT 510, (Abbott, EE.UU.); Aa L 993, (Novartis, Suiza); VEGI, (ProteomTech, EE.UU.); inhibidores del factor-alfa de necrosis tumoral, (National Institute on Aging, EE.UU.); SU 11248, (Pfizer, EE.UU. y SUGEN EE.UU.); ABT 518, (Abbott, EE.UU.); YH16, (Yantai Rongchang, China); S-3APG, (Boston Childrens Hospital, EE.UU. y EntreMed, EE.UU.); MAb, KDR, (ImClone Systems, EE.UU.); MAb, alfa5 beta1, (Protein Design, EE.UU.); inhibidor de quinasa KDR, (Celltech Group, Reino Unido y Johnson & Johnson, EE.UU.); GFB 116, (South Florida University, EE.UU. y Yale University, EE.u U.); CS 706, (Sankyo, Japón); combretastatina profármaco A4, (Arizona State University, EE.UU.; condroitinasa AC, (IBEX, Canadá); Ba Y RES 2690, (Bayer, Alemania); Ag M 1470, (Harvard University, EE.UU. Takeda, Japón, y TAP, EE.UU.); AG 13925, (Agouron, e E.UU.); Tetratiomolibdato, (University of Michigan, Ee .UU.); GCS 100, (Wayne State University, EE.UU.) CV 247, (Ivy Medical, Reino Unido); CKD 732, (Chong Kun Dang, Corea del Sur); MAb, factor de crecimiento vascular endotelial, (Xenova, Reino Unido); irsogladine (INN), (Nippon Shinyaku, Japón); RG 13577, (Aventis, Francia); WX 360, (Wilex, Alemania); escualamina (pINN), (Genaera, Ee .Uu .); RPI 4610, (Sirna, EE.UU.); terapia contra el cáncer, (Marinova, Australia); inhibidores de heparanasa, (InSight, Israel); KL 3106, (Kolon, Corea del Sur); Honokiol, (Emory University, EE.UU.); ZK CDK, (Schering AG, Alemania); ZK Angio, (Schering AG, Alemania); ZK 229561, (Novartis, Suiza y Schering AG, Alemania); XMP 300, (Xo MA, EE.UU.); VGA 1102, (Taisho, Japón); moduladores del receptor V eGF, (Pharmacopeia, EE.UU.); antagonistas de VE-caderina-2, (ImClone Systems, EE.UU.); Vasostatina, (National Institutes of Health, EE.UU.);vacuna, Flk-1, (ImClone Systems, EE.UU.); TZ 93, (Tsumura, Japón); TumStatin, (Beth Israel Hospital, EE.UU.); FLT 1 soluble truncado (receptor del factor de crecimiento vascular endotelial 1), (Merck & Co, EE.UU.); ligandos de Tie-2, (Regeneron, EE.UU.); e inhibidor de trombospondina 1, (Allegheny Health, Education and Research Foundation, EE.u U.).
Inhibidores de la autofagia incluyen, pero no se limitan a cloroquina, 3-metiladenina, hidroxicloroquina (Plaquenil™), bafilomicina A1, 5-amino-4-imidazol carboxamida ribósido (AICAR), ácido okadaico, toxinas de algas supresoras de la autofagia que inhiben proteínas fosfatasas de tipo 2A o de tipo 1, análogos de AMPc y fármacos que elevan los niveles de AMPc tales como adenosina, LY204002, ribósido de N6-mercaptopurina y vinblastina. Además, también se puede utilizar ARN antisentido o ARNpi que inhibe la expresión de proteínas, incluyendo, pero no limitadas a ATG5 (que están implicadas en la autofagia).
Compuestos/agentes farmacéuticamente activos adicionales que pueden utilizarse en el tratamiento de cánceres y que pueden utilizarse en combinación con uno o más compuestos de la presente invención incluyen: epoetina alfa; darbepoetina alfa; panitumumab; pegfilgrastim; palifermina; filgrastim; denosumab; ancestim; AMG 102; AMG 176; AMG 386; AMG 479; AMG 655; AMG 745; AMG 951; y AMG 706, o una de sus sales farmacéuticamente aceptable.
En determinadas realizaciones, una composición proporcionada en esta memoria se administra conjuntamente con un agente quimioterapéutico. Agentes quimioterapéuticos adecuados pueden incluir productos naturales tales como alcaloides de la vinca (p. ej., vinblastina, vincristina y vinorelbina), paclitaxel, epidipodofilotoxinas (p. ej., etopósido y tenipósido), antibióticos (p. ej., dactinomicina (actinomicina D), daunorrubicina, doxorrubicina e idarrubicina), antraciclinas, mitoxantrona, bleomicinas, plicamicina (mitramicina), mitomicina, enzimas (p. ej., L-asparaginasa que metaboliza sistemáticamente la L-asparagina y priva a las células que no tienen la capacidad de sintetizar su propia asparagina), agentes antiplaquetarios, agentes antiproliferativos/antimitóticos alquilantes, tales como mostazas nitrogenadas (p. ej., mecloretamina, ciclofosfamida y análogos, melfalán y clorambucilo), etileniminas y metilmelaminas (p. ej., hexametilmelamina y tiotepa), inhibidores de CDK (p. ej., seliciclib, UCN-01, P1446A-05, PD-0332991, dinaciclib, P27-00, AT-7519, RGB286638 y Sc H727965), sulfonatos de alquilo (p. ej., busulfán), nitrosoureas (p. ej., carmustina (BCNU) y análogos, y estreptozocina), trazenos-dacaibazinina (DTIC), antimetabolitos antiproliferativos/antimitóticos, tales como los análogos del ácido fólico (p. ej., metotrexato), análogos de pirimidina (p. ej., fluorouracilo, floxuridina y citarabina), análogos de purina e inhibidores relacionados (p. ej., mercaptopurina, tioguanina, pentostatina y 2-clorodesoxiadenosina), inhibidores de la aromatasa (p. ej., anastrozol, exemestano y letrozol) y complejos de coordinación de platino (p. ej., cisplatino y carboplatino), procarbazina, hidroxiurea, mitotano, aminoglutetimida, inhibidores de histona desacetilasa (HDAC) (p. ej., tricostatina, butirato de sodio, apicidan, suberoil anilida ácido hidroámico, vorinostat, LBH 589, romidepsina, ACY-1215 y panobinostat), inhibidores de mTor (p. ej., temsirolimus, everolimus, ridaforolimus y sirolimus), inhibidores de KSP(Eg5) (p. ej., Array 520 ), agentes de unión a a Dn (p. ej., Zalypsis), inhibidor de PI3K delta (p. ej., GS-1101 y TGR-1202), inhibidor de PI3K delta y gamma (p. ej., CAL-130), inhibidor multi-quinasa (p. ej., TG02 y sorafenib), hormonas (p. ej., estrógeno) y agonistas hormonales tales como los agonistas de la hormona liberadora de la hormona luteinizante (LHRH) (p. ej., goserelina, leuprolida y triptorelina), anticuerpo neutralizante de BAFF (p. ej., LY2127399), inhibidores de IKK, inhibidores de p38MAPK, anti-IL-6 (p. ej., CNTO328), telomerasa (p. ej., GRN 163L), inhibidores de la aurora quinasa (p. ej., MLN8237), anticuerpos monoclonales de superficie celular (p. ej., anti-CD38 (HUMAX-CD38), anti-CSl (p. ej., elotuzumab), inhibidores de HSP90 (p. ej., 17 AAG y KOS 953), inhibidores de P13K / Akt (p. ej., perifosina), inhibidores de Akt (p. ej., GSK-2141795), inhibidores de PKC (p. ej., enzastaurina), FTIs (p. ej., Zarnestra™ ), anti-CD138 (p. ej., BT062), inhibidor de quinasa específico para Torcl/2 (p. ej., INK128), inhibidor de quinasa (p. ej., GS-1101), agente que fija como objetivo ER/UPR (p. ej., MKC-3946), inhibidor de cFMS (p. ej., ARRY-382), inhibidor de JAK1/2 (p. ej., , CYT387), inhibidor de PARP (p. ej., olaparib y veliparib (ABT-888)), antagonista de BCL-2. Otros agentes quimioterapéuticos pueden incluir mecloretamina, camptotecina, ifosfamida, tamoxifeno, raloxifeno, gemcitabina, navelbina, sorafenib o cualquier variante análoga o derivada de los anteriores.
Los compuestos de la presente invención también se pueden utilizar en combinación con radioterapia, terapia hormonal, cirugía e inmunoterapia, terapias que son bien conocidas por los expertos en la técnica.
En determinadas realizaciones, una composición farmacéutica proporcionada en esta memoria se administra conjuntamente con un esteroide. Esteroides adecuados pueden incluir, pero no se limitan a 21-acetoxipregnenolona, alclometasona, algestona, amcinonida, beclometasona, betametasona, budesonida, cloroprednisona, clobetasol, clocortolona, cloprednol, corticosterona, cortisona, cortivazol, deflazacort, desonida, desoximetasona, dexametasona, diflorasona, diflucortolona, difuprednato, enoxolona, fluazacort, flucloronida, flumetasona, flunisolida, fluocinolona acetonida, fluocinonida, butilo de fluocortina, fluocortolona, fluorometolona, acetato de fluperolona, acetato de fluprednideno, fluprednisolona, flurandrenolida, propionato de fluticasona, formocortal, halcinonida, propionato de halobetasol, halometasona, hidrocortisona, etabonato de loteprednol, mazipredona, medrisona, meprednisona, metilprednisolona, furoato de mometasona, parametasona, prednicarbato, prednisolona, dietilaminoacetato de prednisolona 25, fosfato sódico de prednisolona, prednisona, prednival, prednilideno, rimexolona, tixocortol, triamcinolona, triamcinolona acetonida, triamcinolona benetonida, triamcinolona hexacetonida y sales y/o derivados de los mismos. En una realización particular, los compuestos de la presente invención también se pueden utilizar en combinación con agentes farmacéuticamente activos adicionales que tratan las náuseas. Ejemplos de agentes que se pueden utilizar para tratar las náuseas incluyen: dronabinol; granisetrón; metoclopramida; ondansetrón; y proclorperazina; o una sal farmacéuticamente aceptable de los mismos.
Los compuestos de la presente invención también se pueden utilizar en combinación con un compuesto farmacéuticamente activo adicional que altera o inhibe las vías de señalización RAS-RAF-ERK o PI3K-AKT-TOR. En otras combinaciones de este tipo, el compuesto farmacéuticamente activo adicional es un antagonista de PD-1 y PD-L1. Los compuestos o las composiciones farmacéuticas de la divulgación también se pueden utilizar en combinación con una cantidad de una o más sustancias seleccionadas de inhibidores de EGFR, inhibidores de MEK, inhibidores de PI3K, inhibidores de AKT, inhibidores de TOR, inhibidores de Mcl-1, inhibidores de BCL-2, inhibidores de SHP2, inhibidores del proteasoma y terapias inmunitarias, incluyendo anticuerpos monoclonales, imidas inmunomoduladoras (IMiDs), agentes anti-PD-1, anti-PDL-1, anti-CTLA4, anti-LAG1 y anti-OX40, agonistas GITR, células CAR-T y BiTEs.
Inhibidores de EGFR incluyen, pero no se limitan a antagonistas de moléculas pequeñas, inhibidores de anticuerpos o nucleótido antisentido específico o ARNpi. Inhibidores de anticuerpos útiles de EGFR incluyen cetuximab (Erbitux), panitumumab (Vectibix), zalutumumab, nimotuzumab y matuzumab. Antagonistas de moléculas pequeñas de EGFR incluyen gefitinib, erlotinib (Tarceva) y, más recientemente, lapatinib (TykerB). Véase, p. ej., Yan L, et. al., Pharmacogenetics and Pharmacogenomics In Oncology Therapeutic Antibody Development, BioTechniques 2005; 39(4): 565-8, y Paez J G, et. al., EGFR Mutations In Lung Cancer Correlation With Clinical Response To Gefitinib Therapy, Science 2004; 304(5676): 1497-500.
Ejemplos no limitativos de inhibidores de EGFR de moléculas pequeñas incluyen cualquiera de los inhibidores de EGFR descritos en las siguientes publicaciones de patentes y todas las sales y solvatos farmacéuticamente aceptables de dichos inhibidores de EGFR: Solicitud de Patente Europea e P 520722, publicada el 30 de diciembre de 1992; Solicitud de Patente Europea EP 566226, publicada el 20 de octubre de 1993; Publicación Internacional PCT WO 96/33980, publicada el 31 de octubre de 1996; Patente de EE.UU. N° 5.747.498, expedida el 5 de mayo de 1998; Publicación Internacional PCT WO 96/30347, publicada el 3 de octubre de 1996; Solicitud de Patente Europea EP 787772, publicada el 6 de agosto de 1997; Publicación Internacional PCT WO 97/30034, publicada el 21 de agosto de 1997; Publicación Internacional PCT WO 97/30044, publicada el 21 de agosto de 1997; Publicación Internacional PCT WO 97/38994, publicada el 23 de octubre de 1997; Publicación Internacional PCT WO 97/49688, publicada el 31 de diciembre de 1997; Solicitud de Patente Europea EP 837063, publicada el 22 de abril de 1998; Publicación Internacional PCT WO 98/02434, publicada el 22 de enero de 1998; Publicación Internacional PCT WO 97/38983, publicada el 23 de octubre de 1997; Publicación Internacional PCT WO 95/19774, publicada el 27 de julio de 1995; Publicación Internacional PCT WO 95/19970, publicada el 27 de julio de 1995; Publicación Internacional pCt WO 97/13771, publicada el 17 de abril de 1997; Publicación Internacional pCt WO 98/02437, publicada el 22 de enero de 1998; Publicación Internacional PCT WO 98/02438, publicada el 22 de enero de 1998; Publicación Internacional PCT WO 97/32881, publicada el 12 de septiembre de 1997; Solicitud Alemana DE 19629652, publicada el 29 de enero de 1998; Publicación Internacional PCT Wo 98/33798, publicada el 6 de agosto de 1998; Publicación Internacional PCT WO 97/32880, publicada el 12 de septiembre de 1997; Publicación Internacional PCT WO 97/32880 publicada el 12 de septiembre de 1997; Solicitud de Patente Europea EP 682027, publicada el 15 de noviembre de 1995; Publicación Internacional PCT WO 97/02266, publicada el 23 de enero de 1997; Publicación Internacional PCT WO 97/27199, publicada el 31 de julio de 1997; Publicación Internacional PCT WO 98/07726, publicada el 26 de febrero de 1998; Publicación Internacional PCT WO 97/34895, publicada el 25 de septiembre de 1997; Publicación Internacional PCT WO 96/31510, publicada el 10 de octubre de 1996; Publicación Internacional PCT WO 98/14449, publicada el 9 de abril de 1998; Publicación Internacional PCT WO 98/14450, publicada el 9 de abril de 1998; Publicación Internacional PCT WO 98/14451, publicada el 9 de abril de 1998; Publicación Internacional PCT WO 95/09847, publicada el 13 de abril de 1995; Publicación Internacional PCT WO 97/19065, publicada el 29 de mayo de 1997; Publicación Internacional PCT WO 98/17662, publicada el 30 de abril de 1998; Patente de EE.UU. N° 5.789.427, expedida el 4 de agosto de 1998; Patente de EE.UU. N° 5.650.415, expedida el 22 de julio de 1997; Patente de EE.UU. N° 5.656.643, expedida el 12 de agosto de 1997; Publicación Internacional PCT WO 99/35146, publicada el 15 de julio de 1999; Publicación Internacional PCT WO 99/35132, publicada el 15 de julio de 1999; Publicación Internacional PCT WO 99/07701, publicada el 18 de febrero de 1999; y la Publicación Internacional PCT WO 92/20642 publicada el 26 de noviembre de 1992. Ejemplos adicionales no limitativos de inhibidores de EGFR de moléculas pequeñas incluyen cualquiera de los inhibidores de EGFR descritos en Traxler, P., 1998, Exp. Opinión Ther. Patentes 8(12):1599-1625.
Inhibidores de EGFR basados en anticuerpos incluyen cualquier anticuerpo o fragmento de anticuerpo anti-EGFR que pueda bloquear parcial o completamente la activación de EGFR por su ligando natural. Ejemplos no limitativos de inhibidores de EGFR basados en anticuerpos incluyen los descritos en Modjtahedi, H., et al., 1993, Br. J. Cancer 67:247-253; Teramoto, T., et al., 1996, Cancer 77:639-645; Goldstein et al., 1995, Clin. Cancer Res. 1:1311-1318; Huang, S. M., et al., 1999, Cancer Res. 15:59(8):1935-40; y Yang, X., et al., 1999, Cancer Res. 59:1236-1243. Por lo tanto, el inhibidor de EGFR puede ser el anticuerpo monoclonal Mab E7.6.3 (Yang, 1999 supra), o Mab C225 (N° de Acceso ATCC HB-8508), o un anticuerpo o fragmento de anticuerpo que tenga la especificidad de unión del mismo.
Inhibidores de MEK incluyen, pero no se limitan a CI-1040, AZD6244, PD318088, PD98059, PD334581, RDEA119, ARRY-142886, ARRY-438162 y PD-325901.
Inhibidores de PI3K incluyen, pero no se limitan a wortmanina, análogos de 17-hidroxiwortmanina descritos en el documento WO 06/044453, 4-[2-(1 H-Indazol-4-il)-6-[[4-(metilsulfonil)piperazin-1 -il]metil]tieno[3,2-d]pirimidin-4-il]morfolina (también conocida como g Dc 0941 y descrita en las Publicaciones pCT N°s WO 09/036.082 y w O 09/055.730), 2-metil-2-[4-[3-metil-2-oxo-8-(quinolin-3-il)-2,3-dihidroimidazo[4,5-c]quinolin-1-il]fenil]propionitrilo (también conocido como BEZ 235 o NVP-BEZ 235, y descrito en la Publicación PCT N° Wo 06/122806), (S)-1 -(4-((2-(2-aminopirimidin-5-il)-7-metil-4-morfolinotieno[3,2-d]pirimidin-6-il)metil)piperazin-1-il)-2-hidroxipropan-1-ona (descrita en la Publicación PCT N° WO 2008/070740), LY294002 (2-(4-morfolinil)-8-fenil-4H-1-benzopiran-4-ona, disponible de Axon Medchem), hidrocloruro de PI 103 hidrocloruro de (3-[4-(4-morfolinilpirido-[3’,2’:4,5]furo[3,2-d]pirimidin-2-il]fenol, disponible de Axon Medchem), PIK 75 hidrocloruro de (N’-[(1E)-(6-bromoimidazo[1,2-a]piridin-3-il)metileno]-N,2-dimetil-5-nitrobencenosulfono-hidrazida, disponible de Axon Medchem), PIK 90 (N-(7,8-dimetoxi-2,3-dihidro-imidazo[1,2-c]quinazolin-5-il)-nicotinamida, diosponible de Axon Medchem), bismesilato de GDC-0941, bismesilato de (2-(1H-indazol-4-il)-6-(4-metanosulfonil-piperazin-1 -ilmetil)-4-morfolin-4-il-tieno[3,2-d]pirimidina, disponible de Axon Medchem), AS-252424 (5-[1-[5-(4-fluoro-2-hidroxi-fenil)-furan-2-il]-met-(Z)-ilideno]-tiazolidina-2,4-diona, disponible de Axon Medchem) y TGX-221 (7-metil-2-(4-morfolinil)-9-[1-(fenilamino)etil]-4H-pirido-[1,2-a]pirimidin-4-ona, disponible de Axon Medchem), XL-765 y XL-147. Otros inhibidores de PI3K incluyen demetoxiviridina, perifosina, CAL101, PX-866, BEZ235, SF1126, INK1117, IPI-145, BKM120, XL147, XL765, Palomid 529, GSK1059615, ZSTK474, PWT33597, IC87114, TG100-115, CAL263, PI-103, GNE-477, CUDC-907 y AEZS-136.
Inhibidores de AKT incluyen, pero no se limitan a Akt-1-1 (inhibe Aktl) (Barnett et al. (2005) Biochem. J., 385 (Pt. 2), 399 408); Akt-1-1,2 (inhibe Akl y 2 ) (Barnett et al. (2005) Biochem. J. 385 (Pt. 2), 399-408); API-59CJ-Ome (p. ej., Jin et al. (2004) Br. J. Cancer 91, 1808-12); compuestos de 1-H- imidazo[ 4,5-c]piridinilo (p. ej., documento WO05011700); indol-3-carbinol y derivados del mismo (p. ej., Patente de EE.UU. N° 6.656.963; Sarkar y Li (2004) J Nutr. 134 (12 Supl), 3493S-3498S); perifosina (p. ej., interfiere en la localización de la membrana de Akt; Dasmahapatra et al. (2004) Clin. Cancer Res.
10(15), 5242-52, 2004); análogos de lípidos de fosfatidilinositol éter (p. ej., Gills y Dennis (2004) Expert. Opin. Investig. Drugs 13, 787-97); y triciribina (TCN o API-2 o identificador NCI: NSC 154020; Yang et al. (2004) Cancer Res. 64, 4394 9).
Inhibidores de TOR incluyen , pero no se limitan a AP-23573, CCI-779, everolimus, RAD-001, rapamicina, temsirolimus, inhibidores de TORC1/TORC2 competitivos con ATP, incluyendo PI-103, PP242, PP30 y Torin 1. Otros inhibidores de TOR en el potenciador FKBP12; rapamicinas y derivados de las mismas, incluyendo: CCI-779 (temsirolimus), RAD001 (Everolimus; documento WO 9409010) y AP23573; rapálogos, p. ej., como se describe en los documentos WO 98/02441 y WO 01/14387, p. ej., AP23573, AP23464 o AP23841; 40-(2-hidroxietil)rapamicina, 40-[propanoato de 3-hidroxi(hidroximetil)metilo]-rapamicina (también denominado CC1779), 40-epi-(tetrazolit)-rapamicina (también denominada ABT578), 32-desoxorrapamicina, 16-pentiniloxi-32(S)-dihidrorrapanicina y otros derivados descritos en el documento WO 05005434; derivados descritos en la Patente de EE.UU. N° 5.258.389, documentos WO 94/090101, WO 92/05179, Patente de EE.UU. N25.118.677, Patente de EE.UU. N25.118.678, Patente de EE.UU. N25.100.883, Patente de EE.UU. N25.151.413, Patente de EE.UU. 5.120.842, documentos WO 93/111130, WO 94/02136, WO 94/02485, WO 95/14023, WO 94/02136, WO 95/16691, WO 96/41807, WO 96/41807 y Patente de EE.UU. N25.256.790; derivados de rapamicina que contienen fósforo (p. ej., documento WO 05016252); derivados de 4H-1 -benzopiran-4-ona (p. ej., Solicitud Provisional de EE.UU. N° 60/528.340).
Inhibidores de MCl-1 incluyen, pero no se limitan a AMG-176, MIK665 y S63845. La proteína de la leucemia de células mieloides-1 (MCL-1) es uno de los miembros antiapoptóticos clave de la familia de proteínas del linfoma de células B-2 (BCL-2). La sobreexpresión de MCL-1 se ha relacionado estrechamente con la progresión del tumor, así como con la resistencia, no solo a las quimioterapias tradicionales, sino también a productos terapéuticos fijados como objetivo, incluyendo inhibidores de BCL-2 tales como ABT-263.
Inhibidores de SHP incluyen, pero no se limitan a SHP099.
Inhibidores del proteasoma incluyen, pero no se limitan a Kyprolis® (carfilzomib), Velcade® (bortezomib) y oprozomib.
Inmunoterapias incluyen, pero no se limitan a agentes anti-PD-1, agentes anti-PDL-1, agentes anti-CTLA-4, agentes anti-LAG1 y agentes anti-OX40.
Anticuerpos monoclonales incluyen, pero no se limitan a Darzalex® (daratumumab), Herceptin® (trastuzumab), Avastin® (bevacizumab), Rituxan® (rituximab), Lucentis® (ranibizumab) y Eylea® (aflibercept).
Fármacos de imida inmunomoduladores (IMiDs) son una clase de fármacos inmunomoduladores (fármacos que ajustan las respuestas inmunitarias) que contienen un grupo imida. La clase IMiD incluye talidomida y sus análogos (lenalidomida, pomalidomida y apremilast).
Anticuerpos anti-PD-1 incluyen, pero no se limitan a pembrolizumab (Keytruda®) y niolumab (Opdivo®). Anticuerpos anti-PD-1 ejemplares y métodos para su uso se describen por Goldberg et al., Blood 110(1 ):186-192 (2007), Thompson et al., Clin. Cáncer Res. 13(6):1757-1761 (2007) y Korman et al., Solicitud Internacional N° PCT/JP2006/309606 (publicación N° WO 2006/121168 A1), Estos incluyen: Yervoy™ (ipilimumab) o Tremelimumab (a CTLA-4), galiximab (a B7.1), BMS-936558 (a PD-1), MK-3475 (a PD-1), AMP224 (a B7DC), BMS-936559 (a B7-H1), MPDL3280A (a B7-H1), MEDI-570 (a ICOS), AMG 404, AMG557 (a B7H2), MGA271 (a B7H3), IMP321 (a LAG-3), BMS-663513 (a CD137), PF-05082566 (a CD137), CDX-1127 (a CD27), anti-Ox40 (Providence Health Services), huMAbOX40L (a OX40L), Atacicept (a TACI), Cp-870893 (a CD40), Lucatumumab (a Cd40), Dacetuzumab (a CD40), Muromonab-CD3 (a CD3), Ipilumumab (a Ct LA-4). Las terapias inmunitarias también incluyen células T modificadas genéticamente (p. ej., células CAR-T) y anticuerpos biespecíficos (p. ej., BiTE).
En una realización particular, los compuestos de la presente invención se utilizan en combinación con un anticuerpo anti-PD-1. En una realización específica, el anticuerpo anti-PD-1 (o fragmento de anticuerpo de unión a antígenos del mismo) comprende 1, 2, 3, 4, 5 o las 6 secuencias de aminoácidos de CDR de SEQ ID NO: 1-6 (que representan HC CDR1, HC CDR2 , HC CDR3, lC CDR1, LC CDR2 y LC CDR3, en ese orden). En realizaciones específicas, el anticuerpo anti-PD-1 (o fragmento de anticuerpo de unión a antígenos del mismo) comprende las 6 secuencias de aminoácidos de CDR de SEQ ID NOs: 1-6. En otras realizaciones, el anticuerpo anti-PD-1 (o su fragmento de anticuerpo de unión a antígenos) comprende (a) la secuencia de aminoácidos de la región variable de la cadena pesada en SEQ ID NO: 7, o una secuencia variante de la misma que difiere solo en uno o dos aminoácidos o que tiene al menos o aproximadamente un 70 % de identidad de secuencia, o (b) la secuencia de aminoácidos de la región variable de la cadena ligera en SEQ ID NO: 8 o una secuencia variante de la misma que difiere en solo uno o dos aminoácidos o que tiene al menos al menos o aproximadamente un 70 % de identidad de secuencia. En una realización ejemplar, el anticuerpo anti-PD-1 (o fragmento de anticuerpo de unión a antígenos del mismo) comprende la secuencia de aminoácidos de la región variable de la cadena pesada en SEQ ID NO: 7 y la secuencia de aminoácidos de la región variable de la cadena ligera en SEQ ID NO: 8 En otras realizaciones, el anticuerpo anti-PD-1 (o fragmento de anticuerpo de unión a antígenos del mismo) comprende (a) la secuencia de aminoácidos de la cadena pesada de SEQ ID NO: 9 o una secuencia variante de la misma que difiere solo en uno o dos aminoácidos o que tiene al menos o aproximadamente un 70 % de identidad de secuencia; o (b) la secuencia de aminoácidos de la cadena ligera de SEQ ID NO: 10 o una secuencia variante de la misma que difiere solo en uno o dos aminoácidos o que tiene al menos o aproximadamente un 70 % de identidad de secuencia. En una realización ejemplar, el anticuerpo anti-PD-1 (o fragmento de anticuerpo de unión a antígenos del mismo) comprende la secuencia de aminoácidos de la cadena pesada de SEQ ID NO: 9 y la secuencia de aminoácidos de la cadena ligera de SEQ ID NO: 10.
La presente divulgación proporciona, además, secuencias de ácidos nucleicos que codifican el anticuerpo anti-PD-1 (o una parte del mismo que se une a antígenos). En aspectos ejemplares, el anticuerpo comprende 1, 2, 3, 4, 5 o las 6 CDRs codificadas por los ácidos nucleicos de s Eq ID NOs: 11-16 (que representan h C CDR1, HC CDR2 , HC CDR3, LC CDR1, LC CDR2 y LC CDR3, en ese orden). En otro aspecto ejemplar, el anticuerpo comprende las 6 CDR codificadas por los ácidos nucleicos de SEQ ID NOs: 11-16. En algunas realizaciones, el anticuerpo anti-PD-1 (o una porción de unión a antígenos del mismo) comprende (a) una región variable de la cadena pesada codificada por SEQ ID NO: 17 o una secuencia variante de la misma que difiere solo en 1, 2, 3, 4, 5 o 6 ácidos nucleicos o que tiene al menos o aproximadamente un 70 %, 85 %, 90 % o 95 % de identidad de secuencia, o (b) una región variable de la cadena ligera codificada por SEQ ID NO: 18 o una secuencia variante de la misma que difiere en solo 1,2, 3, 4, 5 o 6 ácidos nucleicos o que tiene al menos o aproximadamente un 70 %, 85 %, 90 % o 95 % de identidad de secuencia. En una realización ejemplar, el anticuerpo anti-PD-1 (o una porción de unión a antígenos del mismo) comprende una región variable de la cadena pesada codificada por SEQ ID NO: 17 y una región variable de la cadena ligera codificada por SEQ ID NO: 18. En otras realizaciones, el anticuerpo anti-PD-1 (o una porción de unión a antígenos del mismo) comprende (a) una cadena pesada codificada por SEQ ID NO: 19 o una secuencia variante de la misma que difiere solo en 1, 2, 3, 4, 5 o 6 ácidos nucleicos o que tiene al menos o aproximadamente un 70 %, 85 %, 90 % o 95 % de identidad de secuencia, o (b) una cadena ligera codificada por SEQ ID NO: 20 o una secuencia variante de la misma que difiere solo en 1, 2, 3, 4, 5 o 6 ácidos nucleicos o que tiene al menos o aproximadamente un 70 %, 85 %, 90 % o 95 % de identidad de secuencia. En una realización de ejemplo, el anticuerpo anti-PD-1 (o una porción de unión a antígenos del mismo) comprende una cadena pesada codificada por SEQ ID NO: 19 y una cadena ligera codificada por SEQ ID NO: 20.
Agonistas de GITR incluyen, pero no se limitan a proteínas de fusión GITR y anticuerpos anti-GITR (p. ej., anticuerpos anti-GITR bivalentes), tales como una proteína de fusión GITR descrita en la patente de EE.UU. N° 6.111.090box.c, Patente Europea N2: 090505B1, Patente de EE.UU. N28.586.023, Publicaciones PCT N2s: WO 2010/003118 y 2011/090754, o un anticuerpo anti-GITR descrito, p. ej., en la Patente de EE.UU. N° 7.025.962, Patente Europea N°: 1947183B1, Patente de EE.UU. N° 7.812.135, Patente de EE.UU. N° 8.388.967, Patente de EE.UU. N° 8.591.886, Patente Europea N°: EP 1866339, Publicación PCT N2: WO 2011/028683, Publicación PCT N2: WO 2013/039954, Publicación PCT N2: WO2005/007190, Publicación PCT N2: WO 2007/133822 , Publicación PCT N2: WO2005/055808, Publicación PCT N2: WO 99/40196, Publicación PCT N2: WO 2001/03720, Publicación PCT N2: WO99/20758, Publicación PCT N2: WO2006/083289, Publicación PCT N2: WO 2005/115451, Patente de EE.UU. N27.618.632 y Publicación PCT N2: WO 2011/051726.
Los compuestos descritos en esta memoria se pueden utilizar en combinación con los agentes descritos en esta memoria u otros agentes adecuados, dependiendo de la afección que se esté tratando. Por lo tanto, en algunas realizaciones, el uno o más compuestos de la divulgación se administrarán conjuntamente con otros agentes como se describe arriba. Cuando se utilizan en terapia de combinación, los compuestos descritos en esta memoria se administran con el segundo agente simultáneamente o por separado. Esta administración en combinación puede incluir la administración simultánea de los dos agentes en la misma forma de dosificación, la administración simultánea en formas de dosificación separadas y la administración por separado. Es decir, un compuesto descrito en esta memoria y cualquiera de los agentes arriba descritos pueden formularse juntos en la misma forma de dosificación y administrarse simultáneamente. Alternativamente, un compuesto de la divulgación y cualquiera de los agentes arriba descritos pueden administrarse simultáneamente, en donde ambos agentes están presentes en formulaciones separadas. En otra alternativa, un compuesto de la presente divulgación puede administrarse seguido de cualquiera de los agentes arriba descritos, o viceversa. En algunas realizaciones del protocolo de administración por separado, un compuesto de la divulgación y cualquiera de los agentes arriba descritos se administran con una diferencia de unos pocos minutos, o unas pocas horas o unos pocos días.
Como un aspecto de la presente invención contempla el tratamiento de la enfermedad/afecciones con una combinación de compuestos farmacéuticamente activos que pueden administrarse por separado, la invención se refiere, además, a la combinación de composiciones farmacéuticas separadas en forma de kit. El kit comprende dos composiciones farmacéuticas separadas: un compuesto de la presente invención y un segundo compuesto farmacéutico. El kit comprende un recipiente para contener las composiciones separadas, tal como un frasco dividido o un envase de aluminio dividido. Ejemplos adicionales de recipientes incluyen jeringas, cajas y bolsas. En algunas realizaciones, el kit comprende instrucciones para el uso de los componentes separados. La forma de kit es particularmente ventajosa cuando los componentes separados se administran preferiblemente en diferentes formas de dosificación (p. ej., oral y parenteral), se administran en diferentes intervalos de dosificación, o cuando el profesional de la salud que prescribe desea valorar los componentes individuales de la combinación.
EJEMPLOS
Método 1
Ejemplo 1-1
5-((2 S ,S
R
)-4-acriloil-2,5-dimetilpiperazin-1-il)-3-cloro-8-ciclopentil-2-(2-fluorofenil)-8-metil-1,6-naftiridina-7(8H)-ona
1. KHMDS
Etapa 1.3-cloro-8-ciclopentil-2-(2-fluorofenil)-8-metil-1,6-naftiridina-5,7(6H, 8H)-diona. A un matraz de fondo redondo de 100 mL se añadió 2-ciclopentilpropanonitrilo (Compuesto intermedio I-1x, 0,691 g, 5,61 mmol) en tolueno (3,51 mL). La mezcla de reacción se enfrió a 0 °C con un baño de hielo y luego se añadió bis(trimetilsilil)amida de potasio (1,0 M en THF) (6,31 mL, 6,31 mmol, Sigma-Aldrich, St. Louis, MO, EE.Uu .) a la mezcla de reacción. La mezcla de reacción se dejó en agitación a 0 °C bajo una atmósfera inerte (N2) durante 30 min. Luego se añadió a la mezcla de reacción una mezcla heterogénea de 2,5-dicloro-6-(2-fluorofenil)nicotinamida (Compuesto intermedio 99B, 0,400 g, 1,40 mmol) en tolueno (3,51 mL). La mezcla de reacción resultante se dejó en agitación durante 30 min, al tiempo que la temperatura se mantenía a 0 °C, luego se retiró el baño de hielo y la mezcla de reacción se dejó calentar a temperatura ambiente a lo largo de 2 h.
La mezcla de reacción se diluyó con solución sat. ac. de NaHCÜ3 y EtOAc. Las capas se separaron y la capa acuosa se extrajo con EtOAc. Los extractos orgánicos reunidos se secaron sobre MgSO4, se filtraron y se concentraron al vacío.
El residuo bruto se trató con ácido clorhídrico conc., reactivo a.c.s. al 37 % (2,60 mL, 84 mmol) y la mezcla de reacción se calentó y agitó a 70 °C durante 16 h. La mezcla se retiró del baño de calor y se dejó enfriar a temperatura ambiente. La mezcla se hizo básica añadiendo lentamente hielo húmedo a una mezcla fría de NaOH 10 N. Luego se añadió CHCL a la mezcla y se separaron las capas. La capa acuosa se extrajo con CHCL. Los extractos orgánicos reunidos se secaron sobre MgSO4, se filtraron y se concentraron al vacío. El material bruto se absorbió en un tapón de gel de sílice y se purificó por cromatografía a través de una columna de gel de sílice pre-empaquetada Redi-Sep (40 g), eluyendo con un gradiente de 0- 5 % de MeOH en CH2CL, para proporcionar 3 -cloro-8-ciclopentil-2-(2-fluorofenil)-8-metil-1,6-naftiridina-5,7(6H,8H)-diona (0,040 g, 0,10 mmol, 7,65 % de rendimiento) en forma de un sólido amarillo claro. 1H RMN (400 MHz, Dm SO- d 6 ) 511,71 (s, 1 H) 8,49 (s, 1 H) 7,49 - 7,64 (m, 2 H) 7,34 - 7,45 (m, 2 H) 2,34 - 2,42 (m, 1 H) 1,62 (s, 4 H) 1,33 - 1,44 (m, 7 H). m / z (ESI, ión vo): 373,1 (M+H)+.
Etapa 2. 5-((2S,5fl)-4-acr¡lo¡l-2,5-d¡met¡lp¡peraz¡n-1-¡l)-3-cloro-8-c¡clopent¡l-2-(2-fluorofen¡l)-8-met¡l-1,6-naft¡r¡dina-7(8H)-ona. A un matraz de fondo redondo de 50 mL se añadió 3-cloro-8-ciclopentil-2-(2-fluorofenil)-8-metil-1,6-naftiridina-5,7(6H,8H)-diona (0,030 g, 0,08 mmol) en tolueno (0,40 mL). Luego se añadió a la mezcla de reacción N,N’-diisopropiletilamina (0,14 mL, 0,80 mmol) y oxicloruro de fósforo (0,03 mL, 0,40 mmol, Sigma-Aldrich, St. Louis, MO, EE.UU.). La mezcla de reacción resultante se calentó y agitó a 95 °C durante 3 h bajo una atmósfera inerte (N2). El matraz se retiró del baño de calor y la mezcla se dejó enfriar a temperatura ambiente y luego se dejó aparte.
A un matraz de fondo redondo de 50 mL se añadió 2,2,2- trifluoroacetato de 1 -((2R,5S)-2,5-dimetilpiperazin-1 -il)prop-2-en-1- ona (Compuesto ¡ntermed¡o 160, 0,06 g, 0,24 mmol) en EtOAc (1 mL). Luego se añadió DIPEA (1 mL) a la mezcla mientras se agitaba. A esta mezcla se la añadió la mezcla bruta anterior en pequeñas porciones. Después de la adición, la mezcla de reacción se extinguió con NH4Cl sat. ac. y luego la mezcla de reacción se diluyó con EtOAc. Las capas se separaron y la capa acuosa se extrajo con EtOAc. Los extractos orgánicos reunidos se secaron sobre MgSO4, se filtraron y se concentraron al vacío. El material bruto se absorbió en un tapón de gel de sílice y se purificó por cromatografía a través de una columna de gel de sílice Interchim (15 micras) (25 gramos), eluyendo con un gradiente de 0-80 % de EtOAc en DCM, para proporcionar 5-((2S,5fí)-4-acriloil-2,5-dimetilpiperazin-1 -il)-3-cloro-8-ciclopentil-2-(2-fluorofenil)-8-metil-1,6-naftiridin-7(8H)-ona (0,015 g, 0,02 mmol, 35,6 % de rendimiento) en forma de una mezcla diastereoisómera sólida blanca.
1H RMN (400 MHz, DMSO- d 6 ) 58,21 (s ancho, 1 H) 7,46 - 7,57 (m, 2 H) 7,28 - 7,36 (m, 2 H) 6,65 - 6,83 (m, 1 H) 6,11 (d ancho, J =17,21 Hz, 1 H) 5,68 (d ancho, J =9,95 Hz, 1 H) 4,73 - 5,11 (m, 1 H) 4,64 (s ancho, 1 H) 4,31 - 4,51 (m, 1 H) 3,75 - 3,96 (m, 1 H) 3,43 (d ancho, J =12,23 Hz, 1 H) 2,14 (s ancho, 1 H) 1,42 (s ancho, 3 H) 1,24 - 1,38 (m, 10 H) 1,18 (d ancho, J = 6,84 Hz, 3 H) 1,03 - 1,13 (m, 1 H) 0,98 (s ancho, 1 H). m / z (ESI, ión vo): 523,1 (M+H)+.
Tabla 1. Los compuestos 1-2 - 1-8 se prepararon siguiendo el procedimiento descrito en el Método 1, etapas 1-2, arriba como sigue:
Método 2
Ejemplo 2-1
5-((2S,5fi)-4-acriloil-2,5-dimetilpiperazin-1-il)-3-cloro-8,8-diciclopropil-2-(2-fluorofenil)-1,6-naftiridin-7(8H)-ona
Etapa 1. 3-cloro- 8,8-diciclopropil-2-(2-fluorofenil)-1,6-naftiridin-5,7(6S,8H)-diona . A un matraz de fondo redondo de 150 mL se añadió 2,2 - diciclopropilacetonitrilo (Compuesto intermedio I-5x, 0,357 g, 2,95 mmol) en tolueno (5,0 mL). La mezcla de reacción se enfrió a 0 °C en un baño de hielo y luego se añadió bis( trimetilsilil)amida de potasio (1,0 M en THF) (3,31 mL, 3,31 mmol) a la mezcla de reacción. La mezcla de reacción se dejó en agitación a 0 °C bajo una atmósfera inerte (N2) durante 30 min. Luego se añadió a la mezcla de reacción una solución de 2,5-dicloro-6-(2-fluorofenil)nicotinamida (Compuesto intermedio 99B, 0,210 g, 0,73 mmol) en THF (3 mL). La mezcla de reacción resultante se dejó en agitación durante 30 min, al tiempo que la temperatura se mantenía a 0 °C, luego se retiró el baño de hielo y la mezcla de reacción se dejó calentar a temperatura ambiente a lo largo de 30 min. La mezcla se lavó con NaHCO3 sat. y luego la capa acuosa se extrajo con EtOAc. Los extractos orgánicos reunidos se secaron sobre Na2SO4, se filtraron y concentraron al vacío para proporcionar 5-cloro-2-(cianodiciclopropilmetil)-6-(2-fluorofenil)nicotinainida. m/ (ESI, ion ve): 370 (M+H)+.
El residuo bruto se trató con ácido clorhídrico conc., reactivo a.c.s. al 37 % (6,0 mL, 194 mmol) y la mezcla de reacción se calentó y agitó a 70 °C durante 2 h. La mezcla de reacción se dejó enfriar a ta, luego se vertió en hielo, seguido de la
adición cuidadosa de NaOH 5N frío para alcalinizarla. La mezcla se extrajo con DCM y los extractos orgánicos reunidos se purificaron mediante cromatografía en gel de sílice, eluyendo con un gradiente de 0-50 % de EtOAc en heptano para proporcionar 3-cloro-8,8-diciclopropil-2-(2-fluorofenil)-1,6-naftiridina-5,7(6H,8H)-diona (0,130 g, 0,35 mmol, 47,6 % de rendimiento) en forma de un sólido blanquecino. 1 H RMN (400 MHz, DMSO-d 6 ) 511,72 (s ancho, 1 H), 8,51 (s, 1 H), 7,53 - 7,69 (m, 2 H), 7,37 - 7,47 (m, 2 H), 1,49 - 1,59 (m, 2 H), 0,51 (d ancho, J = 5,2 Hz, 4 H), 0,34 - 0,46 (m, 4 H). m / z (ESI, ión vo): 370,6 (M+H)+.
Etapa 2. (2fí,5S>4-(3-cloro-8,8-d¡c¡cloprop¡l-2-(2-fluorofen¡l)-7-oxo-7,8-dih¡dro-1,6-naft¡r¡d¡n-5-¡l)-2,5-dimetilpiperazina-1-carboxilato de ferc.-butilo. A una mezcla de 3-cloro-8,8-diciclopropil-2-(2-fluorofenil)-1,6-naftiridina-5,7(6H,8H)-diona (0,130 g, 0,35 mmol) en tolueno (5,0 mL) se añadió N,A/'-diisopropiletilamina (0,61 mL, 3,51 mmol). Luego se añadió oxicloruro de fósforo (0,16 mL, 1,75 mmol) a la mezcla de reacción. La mezcla resultante se agitó y se calentó a 95 °C durante 4 h. La mezcla de reacción se llevó a ta y después la mezcla se enfrió a 0 °C con un baño de hielo húmedo. Luego se añadió a la mezcla de reacción DIPEA (10 eq) y 2,2,2-trifluoroacetato de (2R,5S)-2,5-dimetilpiperazina-1-carboxilato de terc.-butilo (0,345 g, 1,05 mmol, Asta Tech, Bristol, PA, EE.UU.). La mezcla de reacción se agitó a 0 °C durante 15 min y luego la mezcla de reacción se dejó calentar a ta a lo largo de 15 min. La mezcla de reacción se lavó con NaHCO3 sat. ac. fría y las capas se separaron. La capa acuosa se extrajo con EtOAc. Los extractos orgánicos reunidos se secaron sobre Na2SO4, se filtraron y se concentraron al vacío. El material bruto se purificó mediante cromatografía en gel de sílice, eluyendo con un gradiente de 0-50 % de EtOAc en heptano para proporcionar (2R,5Sj-4-(3-cloro-8,8-diciclopropil-2-(2-fluorofenil)-7-oxo-7,8-dihidro-1,6-naftiridin-5-il)-2,5-dimetilpiperazina-1 -carboxilato de ferc.-butilo (0,162 g, 0,28 mmol, 81 % de rendimiento) en forma de un sólido amarillo. 1H RMN (400 MHz, DMSOd) 58,12 (s, 1 H), 7,55 - 7,65 (m, 2 H), 7,36 - 7,44 (m, 2 H), 4,77 - 4,95 (m, 1 H) , 4,24 - 4,47 (m, 1 H), 3,68 - 3,79 (m, 1 H), 1,43 - 1,49 (m, 9 H), 1,30 -1,36 (m, 4 H), 1,25 - 1,28 (m, 4 H), 1,16 (d ancho, J = 6,4 Hz, 3 H), 0,35 - 0,53 (m, 8 H). m/z (ESI, ión vo): 566,6 (M+H)+.
Etapa 3.5-((2S,5fí)-4-acr¡lo¡l-2,5-d¡met¡lp¡peraz¡n-1-¡l)-3-cloro-8,8-d¡cicloprop¡l-2-(2-fluorofen¡l)-1,6 -naftiridin-7(8H)-ona. A una solución de (2R,5S)-4-(3-cloro-8,8-diciclopropil-2-(2-fluorofenil)-7-oxo-7,8-dihidro-1,6-naftiridin-5-il)-2,5-dimetilpiperazina-1-carboxilato de ferc.-butilo (0,162 g, 0,28 mmol) en DCM (2 mL) se añadió TFA (4,0 mL, 51,9 mmol). La mezcla de reacción resultante se agitó a ta durante 20 min y luego la mezcla se concentró al vacío. El residuo bruto se llevó a la siguiente etapa de la síntesis sin purificación adicional.
3-cloro- 8,8 -diciclopropil-5-((2S,5R)-2,5 -dimetilpiperazin-1-il)-2-(2-fluorofenil)-1,6-naftiridin-7(SH)-ona se disolvió en DCM (5 mL). Luego se añadieron a la mezcla de reacción N,N- diisopropiletilamina (0,24 mL, 1,42 mmol) y cloruro de acriloílo (0,02 mL, 0,31 mmol). La mezcla de reacción resultante se agitó a ta durante 30 min. La mezcla de reacción se lavó con NH4Cl sat. ac., y luego la capa acuosa se extrajo con DCM. Los extractos orgánicos reunidos se secaron sobre Na2SO4, se filtraron y se concentraron al vacío. El material bruto se purificó mediante cromatografía sobre gel de sílice, eluyendo con un gradiente de 0-5 % de MeOH en DCM para proporcionar 5-((2S,5R)-4-acriloil-2,5-dimetilpiperazin-1-il)-3-cloro-8,8-diciclopropil-2-(2-fluorofenil)-1,6-naftiridin-7(8H)-ona (0,112 g, 0,21 mmol, 75 % de rendimiento) en forma de un sólido amarillo. 1H RMN (400 MHz, DMSO-de) 58,08 - 8,20 (m, 1 H), 7,54 - 7,67 (m, 2 H), 7,32 - 7,47 (m, 2 H), 6,74 - 6,93 (m, 1 H), 6,12 - 6,24 (m, 1 H), 5,75 (d ancho, J =10,0 Hz, 1 H), 4,74 - 5,03 (m, 1 H), 4,39 - 4,59 (m, 1 H), 4,12 - 4,30 (m, 1 H), 3,82 - 3,95 (m, 1 H), 3,56 - 3,76 (m, 1 H), 1,29 - 1,41 (m, 5 H), 1,22 - 1,28 (m, 2 H), 1,15 - 1,20 (m, 2 H), 0,32 - 0,60 (m, 8 H). m / z (ESl, ión vo): 520,6 (M+H)+.
Tabla 2. El Compuesto 2-2 se preparó siguiendo el procedimiento descrito en el Método 2, pasos 1-3, arriba como sigue:
Método 3.
Ejemplo 3-1
5-((S)-4-acriloil-2-metilpiperazin-1-il)-3-cloro-2-(2-fluorofenil)-8-isobutil-8-metil-1,6-naftiridin-7(8H)-ona
Etapa 1. 5-((S)-4-acriloil-2-metilpiperazin-1-il)-3-cloro-2-(2-fluorofenil)-8-isobutil-8-metil-1,6-naftiridin-7(8H)-ona. A un matraz de fondo redondo de 50 mL se añadió 2,4-dimetilpentanonitrilo (Compuesto intermedio I-4x, 0,577 g, 5,19 mmol) en tolueno (8,65 mL). La mezcla de reacción se enfrió a 0 °C con un baño de hielo húmedo. Luego se añadió bis(trimetilsilil)amida de potasio (1,0 M en THF) (5,84 mL, 5,84 mmol) a la mezcla de reacción. La mezcla de reacción se dejó en agitación a 0 °C bajo una atmósfera inerte (N2) durante 30 min. Luego se añadió a la mezcla de reacción una mezcla heterogénea de 2,5-dicloro-6-(2-fluorofenil)nicotinamida (Compuesto intermedio 99B, 0,37 g, 1,29 mmol) en tolueno (8,65 mL). La mezcla de reacción resultante se dejó en agitación durante 30 min, al tiempo que la temperatura se mantenía a 0 °C, luego se retiró el baño de hielo y la mezcla de reacción se dejó calentar a temperatura ambiente a lo largo de 30 min. La mezcla de reacción se extinguió con HCl 1 N (2 mL) y luego la mezcla se diluyó con EtOAc. Las capas se separaron y la capa acuosa se extrajo con EtOAc (3 veces). Los extractos orgánicos reunidos se secaron sobre MgSO4, se filtraron y se concentraron al vacío. El material bruto se absorbió en un tapón de gel de sílice y se purificó por cromatografía a través de una columna de gel de sílice pre-empaquetada Redi-Sep (40 g), eluyendo con un gradiente de 0-30% de EtOAc/EtOH 3:1 en heptano, para proporcionar 5-cloro-2-(2-ciano-4-metilpentan-2-il)-6-(2-fluorofenil)nicotinamida (0,325 g, 0,90 mmol, 69,6 % de rendimiento) en forma de un sólido tostado, m/z (ESI, ve ion): 360,2 (M+H)+.
A 5-cloro-2-(2-ciano-4-metilpentan-2-il)-6-(2-fluorofenil)nicotinamida (0,277 g, 0,77 mmol) en un matraz de fondo redondo de 50 mL se añadió gota a gota ácido clorhídrico al 36,5-38,0 % (3,96 mL, 46,2 mmol). La mezcla de reacción se agitó a 70 °C durante 24 h. La mezcla de reacción se dejó enfriar a ta. La mezcla se trató con NaHCO3 sat. ac. Luego se añadió NaOH 5N para neutralizar la mezcla de reacción a pH 6. El precipitado formado se recogió por filtración, se secó en un horno de vacío a 50°C para dar 3-cloro-2-(2-fluorofenil)-8-isobutil-8 -metil-1,6-naftiridina-5,7(6H,8H)-diona (230 mg, 0,63 mmol, 83 % de rendimiento) en forma de un sólido tostado. m/z (ESI, ion ve): 361,3 (M+H)+. El material se utilizó directamente en la siguiente etapa, sin purificación adicional.
Etapa 2. 5-((S)-4-acriloil-2-metilpiperazin-1-il)-3-cloro-2-(2-fluorofenil)-8-isobutil-8-metil-1,6-naftiridin-7(8H)-ona. A un matraz de fondo redondo de 25 mL se añadió 3-cloro-2-(2-fluorofenil)-8-isobutil-8-metil-1,6-naftiridina-5,7(6H,8H)-diona (120 mg, 0,33 mmol) en tolueno (1,66 mL). Luego se añadieron a la mezcla de reacción N,N-diisopropiletilamina (0,58 mL, 3,33 mmol) y oxicloruro de fósforo (0,15 mL, 1,66 mmol). La mezcla de reacción resultante se calentó y se agitó a 80 °C durante 2,5 h, bajo una atmósfera inerte (N2). El matraz se retiró del baño de calor y la mezcla bruta se concentró al vacío. El residuo bruto se diluyó con tolueno (1,5 mL) y se apartó.
A un matraz de fondo redondo de 50 mL se añadió 2,2,2-trifluoroacetato de (S)-1-(3-metilpiperazin-1-il )prop-2-en-1-ona (Compuesto intermedio I-7x , 0,686 g, 0,99 mmol) en tolueno (1 mL). Luego se añadió DIPEA (1,4 mL) a la mezcla de reacción. A esta mezcla se le añadió gota a gota la mezcla bruta anterior. Después de la adición, la mezcla de reacción se extinguió con NH4Cl sat. ac. Las capas se separaron y la capa acuosa se extrajo con EtOAc (3 veces). Los extractos orgánicos reunidos se secaron sobre Na2SO4, se filtraron y se concentraron al vacío. El material bruto se purificó por cromatografía a través de una columna de gel de sílice pre-empaquetada Redi-Sep (40 g), eluyendo con un gradiente de 0-40 % de EtOAc/EtOH 3:1 en heptano, para proporcionar (fí)-5-((S)-4-acriloil-2-metilpiperazin-1-il)-3-cloro-2-(2-fluorofenil)-8-isobutil-8-metil-1,6-naftiridin-7(8 H)-ona y (S)-5-((S)-4-acriloil-2-metilpiperazin-1 -il)-3-cloro-2-(2-fluorofenil)-8
isobutil-8-metil-1,6-naftiridin -7(8H)-ona (50 mg, 0,05 mmol, 15,1 % de rendimiento) en forma de un sólido blanquecino. m/z (ESI, ion ve): 497,3 (M+H)+.
Sección 2. Síntesis de Compuestos Intermedios
Compuestos Intermedios 99 A y B 2,5-dicloro-6-(2-fluorofenil)nicotinamida
Etapa 1: Ácido 2,5 -dicloro-6-(2-fluorofenil)nicotínico. Una mezcla de ácido 2,5,6-triclorónicotínico (1,03 g, 4,54 mmol, Combi-Blocks, San Diego, CA), tetrakis de paladio (0,131 g, 0,114 mmol), ácido (2-fluorofenil)borónico (0,699 g, 5,0 mmol, TCI America, Portland, OR) y carbonato de sodio (2 M en agua, 6,82 mL, 13,6 mmol) en 1,4-dioxano (11 mL) se roció con nitrógeno y se calentó a 80 °C durante 1 h, seguido de 90 °C durante 5 h. La mezcla de reacción se diluyó con EtOAc (150 mL), se lavó con ácido cítrico acuoso 1 N (2 x 100 mL); la capa orgánica se separó, se secó sobre Na2SO4 anhidro y se concentró al vacío para dar ácido 2,5-dicloro-6-(2-fluorofenil)nicotínico (Compuesto intermedio 99A, 1,27 g, 4,43 mmol, 97 % de rendimiento) en forma de un aceite ámbar. m/z (ESI, ion ve): 285,8 (M+H)+.
Etapa 2: 2,5-dicloro-6-(2-fluorofenil)nicotinamida. Una solución de ácido 2,5-dicloro-6-(2-fluorofenil)nicotínico (Compuesto intermedio 99A, 1,27 g, 4,43 mmol) en dicloruro de azufre (13 mL, 177 mmol) se agitó a 70 °C durante 30 min. La mezcla de reacción se concentró al vacío para dar un aceite de color pardo oscuro. El aceite se disolvió en 1,4-dioxano (8,9 mL) y se trató con hidróxido de amonio (ac. al 30 %, 3,5 mL, 89 mmol) y la mezcla se agitó a temperatura ambiente durante 5 min. La mezcla de reacción se diluyó con EtOAc (150 mL), se añadió a un embudo de decantación y se lavó con bicarbonato de sodio acuoso saturado (3 x 100 mL); la capa orgánica se separó, se secó sobre Na2SO4 anhidro y se concentró al vacío. El producto bruto se purificó mediante cromatografía en gel de sílice (eluyente: 0-80 % de EtOAc/heptano) para proporcionar el producto bruto en forma de un sólido blanquecino. El sólido se agitó en EtOH (8 mL) a ta durante 15 min y se filtró para dar 2,5-dicloro-6-(2-fluorofenil)nicotinamida (Compuesto intermedio 99B, 0,449 g, 1,58 mmol, 36 % de rendimiento) en forma de un sólido blanco. m/z (ESI, ion ve): 284,8 (M+H)+.
Compuesto intermedio I-1x
2-ciclopentilpropanonitrilo
2-ciclopentilpropanonitrilo. A un matraz de fondo redondo de 100 mL se añadió 1-ciclopentano-acetonitrilo (1,20 mL, 11,0 mmol, Combi-Blocks, San Diego, CA, EE.UU.) y 2,2'-bipiridina (0,17 g, 1,09 mmol, Stremion Chemicals , Newburyport, MA, EE.UU.) en tetrahidrofurano (18,3 mL). La mezcla de reacción se enfrió a -78 °C con un baño de hielo seco/acetona. Luego se añadió gota a gota diisopropilamida de litio (1,0 M en THF/hexanos) (13,7 mL, 13,7 mmol) a la mezcla de reacción a lo largo de 5 min. La mezcla de reacción se mantuvo fría a -78 °C y se agitó durante 45 min. Luego se añadió gota a gota yodometano (1,36 mL, 22,0 mmol, Sigma-Aldrich, St. Louis, MO, EE.UU.) a la mezcla de reacción. Después de 5 min, se retiró el baño de hielo y la mezcla de reacción se dejó calentar a temperatura ambiente. La mezcla de reacción se extinguió con la adición de HCl 1 N (12 mL) y se agitó durante 10 min adicionales. Luego se añadió EtOAc a la mezcla. Las capas se separaron y la capa acuosa se extrajo con EtOAc. La capa acuosa se diluyó con EtOAc y luego se extrajo con EtOAc (2 veces). Los extractos orgánicos reunidos se secaron sobre MgSO4 y se filtraron. El filtrado se preparó para la destilación con un condensador de recorrido corto. Se eliminaron los disolventes (la temperatura de la placa caliente se fijó en 105 °C; los destilados se evaporaron a 80 °C). El líquido de color canela (Compuesto intermedio-1x; 1,20 g) se utilizó sin purificación adicional. 1H RMN (400 MHz, CLOROFORMO-a) 52,51 - 2,64 (m, 1 H) 1,95 (d ancho, J =7,05 Hz, 2 H) 1,77 -1,89 (m, 3 H) 1,65 - 1,76 (m, 3 H) 1,36 -1,64 (m, 6 H) 1,31 (d, J = 7,05 Hz, 3 H).
Compuesto intermedio I-2x
2-ciclopropilpropanonitrilo
2-ciclopropilpropanonitrilo. A un matraz de fondo redondo de 100 mL se añadió ciclopropilacetonitrilo (2,0 mL, 24,66 mmol, Alfa Acsar, Tcwkbury, MA, EE.UU.) y 2,2' -bipiridina (0,385 g, 2,46 mmol) en tetrahidrofurano (24,6 mL). La mezcla de reacción se enfrió a -78 °C con un baño de hielo seco/acetona. Luego se añadió gota a gota a la mezcla de reacción diisopropilamida de litio (1,0 M en THF/hexanos) (30,8 mL, 30,8 mmol) durante 5 min. La mezcla de reacción se mantuvo fría a -78 °C y se dejó en agitación durante 45 min. Luego se añadió gota a gota yodometano (1,54 mL, 24,7 mmol) a la mezcla de reacción y se dejó que la mezcla de reacción se calentara lentamente a temperatura ambiente durante la noche. La mezcla de reacción se extinguió con la adición de HCl 1 N (25 mL) y la mezcla se agitó durante 10 min adicionales. Luego se añadió EtOAc a la mezcla. Las capas se separaron y la capa acuosa se extrajo con EtOAc. La capa acuosa se diluyó con EtOAc y se extrajo con EtOAc (2 veces). Los extractos orgánicos reunidos se secaron sobre MgSO4 y se filtraron. Los compuestos orgánicos se concentraron * (proceso de evaporación en frío, sacando el matraz de fondo redondo del baño de agua) para dejar el material deseado. La mezcla se filtró a través de un embudo de vidrio sinterizado de frita fina y el filtrado orgánico bruto tostado (Compuesto intermedio - 2x, 2,40 g) se recogió y se utilizó sin purificación adicional.
1H RMN (400 MHz, DMSO-Gfe) 52,41 - 2,49 (m, 1 H) 1,29 (d, J = 7,05 Hz, 3 H) 0,99 - 1,03 (m, 1 H) 0,52 - 0,58 (m, 2 H) 0,24 - 0,34 (m, 2 H).
Compuesto intermedio I-3x
2-ciclobutilpropanonitrilo
2-ciclobutilpropanonitrilo. A un matraz de fondo redondo de 100 mL se añadió 2-ciclobutilacetonitrilo (2,00 mL, 21,0 mmol, Enamine Ltd., Monmouth, NJ, EE.UU.) y 2,2'-bipiridina (0,328 g, 2,10 mmol) en tetrahidrofurano (21,0 mL). La mezcla de reacción se enfrió a -78 °C con un baño de hielo seco/acetona. Luego se añadió gota a gota diisopropilamida de litio (1,0 M en THF/hexanos) (26,3 mL, 26,3 mmol) a la mezcla de reacción durante 5 min. La mezcla de reacción se mantuvo fría a -78 °C y luego se dejó en agitación durante 45 min. Luego se añadió gota a gota yodometano (1,31 mL, 21,0 mmol) a la mezcla de reacción y la mezcla de reacción se dejó calentar lentamente a temperatura ambiente durante la noche. La mezcla de reacción se extinguió con la adición de HCl 1 N (22 mL) y se agitó durante 10 min adicionales. Luego se añadió EtOAc a la mezcla. Las capas se separaron y la capa acuosa se extrajo con EtOAc. La capa acuosa se diluyó con EtOAc y se extrajo con EtOAc (2 veces). Los extractos orgánicos reunidos se secaron sobre MgSO4 y se filtraron. Los componentes orgánicos se concentraron * (proceso de evaporación en frío, sacando el matraz de fondo redondo del baño de agua, durante la evaporación) para dejar el material deseado. Se filtró la mezcla a través de un embudo de frita fina y se recogió el filtrado orgánico bruto de color tostado (Compuesto intermedio-3x, 2,10 g) y se utilizó sin purificación adicional. 1H RMN (400 MHz, DMSO-Gfe) 52,81 (quin, J =7,26 Hz, 1 H) 2,26 - 2,45 (m, 1 H) 1,96 - 2,02 (m, 2 H) 1,74 - 1,83 (m, 4 H) 1,09 (d, J = 7,05 Hz, 3 H).
Compuesto intermedio I-4x
2,4-dimetilpentanonitrilo
2,4-dimetilpentanonitrilo. Se añadió una mezcla de isocapronitrilo (2,8 g, 28,8 mmol, TCI America, Portland, OR, EE.UU.) y 2,2'-bipiridina (0,450 g, 2,88 mmol) en tetrahidrofurano (14,4 mL) a una solución agitada de fría (-78 °C) de diisopropilamida de litio (2,0 M en THF/hexanos) (18,0 mL, 36,0 mmol). Una vez completada la adición, la mezcla de reacción se agitó a -78 °C durante 10 min y luego se añadió gota a gota yodometano (3,59 mL, 57,6 mmol). La mezcla de reacción se agitó a -78 °C durante 1 h. La reacción se extinguió con la adición de HCl 1,0 N (50 mL), luego la mezcla se dejó calentar a temperatura ambiente. Luego se evaporó el THF y la mezcla se extrajo con tBuOMe (3 x 50 mL). Los extractos orgánicos reunidos se lavaron con HCl 1,0 N (20 mL) y NaHCO3 sat. (30 mL). La capa orgánica se secó sobre Na2SO4 y se evaporó. El residuo se destiló (150 °C) a presión atmosférica. El material líquido oscuro restante (Compuesto intermedio-4x, 0,582 g) se recogió y se utilizó sin purificación adicional.
Compuesto intermedio I-5x
2,2-diciclopropilacetonitrilo
2.2- diciclopropilacetamida. Una mezcla de ácido 2,2-diciclopropilacético (2,0 g, 14,2 mmol) y cloruro de tionilo (2,60 mL, 35,7 mmol) se calentó a reflujo durante 30 min. El exceso de cloruro de tionilo se eliminó al vacío y el cloruro de acilo se utilizó en la siguiente etapa tal cual.
Una solución de hidróxido de amonio (10 mL, 10,0 mmol) se enfrió a 0 °C con un baño de hielo húmedo/agua y se añadió cuidadosamente gota a gota una solución de cloruro de acilo en THF (6 mL). La mezcla de reacción se agitó a ta en un matraz abierto durante la noche para eliminar el exceso de amoníaco. El precipitado blanco se filtró, se lavó con agua fría y se secó azeotrópicamente con tolueno para proporcionar 2,2-diciclopropilacetamida (1,55 g, 11,4 mmol, 78 % de rendimiento) en forma de un sólido blanquecino que se utilizó sin purificación adicional. 1H RMN (400 MHz, DMSO-ck) 5 6,89 (s ancho, 1 H), 6,49 (s ancho, 1 H), 0,79 (td, J = 8,7, 4,0 Hz, 2 H), 0,65 (d, J = 9,1 Hz, 1 H), 0,24 - 0,34 (m, 2 H), 0,15 (dt, J = 8,4, 4,4 Hz, 2 H), -0,09 - 0,05 (m, 4 H). m/z (ESI, ión vo): 140 (M+H)+.
Etapa 2. 2,2-diciclopropilacetonitrilo. A una solución de 2,2-diciclopropilacetamida (1,55 g, 11,1 mmol) en THF (25 mL), mientras estaba a 0 °C, se añadió piridina (1,80 mL, 22,2 mmol). La mezcla resultante se agitó a 0 °C durante 1 h. Luego se añadió TFAA (7,86 mL, 55,7 mmol) en una porción y después la mezcla se dejó en agitación durante 15 min adicionales, mientras estaba a 0 °C. La mezcla se alcalinizó cuidadosamente con NaHCO3 sat. y se extrajo con DCM. Los extractos orgánicos reunidos se secaron sobre Na2SO4, se filtraron y los disolventes se evaporaron para proporcionar 2,2-diciclopropilacetonitrilo (0,90 g, 7,43 mmol, 66,7% de rendimiento) en forma de un aceite amarillo. 1H r Mn (400 MHz, DMSO-ck) 52,20 (t, J = 8,0 Hz, 1 H), 0,99 - 1,19 (m, 2 H), 0,48 - 0,65 (m, 4 H), 0,24 - 0,42 ( m, 4H).
Compuesto intermedio I-6x
2.3- dihidro-1H-indeno-2-carbonitrilo
Etapa 1. 2,3-dihidro-7W-indeno-2-carboxamida. Una mezcla de ácido 2-indancarboxílico (1,0 g, 6,17 mmol, Oakwood Products, Estill, SC, EE.UU.) y cloruro de tionilo (1,12 mL, 15,4 mmol) se calentó a reflujo durante 30 min. El exceso de cloruro de tionilo se eliminó al vacío y el cloruro de acilo se utilizó en la siguiente etapa tal cual.
Una solución de hidróxido de amonio (5,0 mL, 5,00 mmol) se enfrió a 0 °C y luego se añadió cuidadosamente gota a gota una solución de cloruro de acilo en THF (6 mL). La mezcla de reacción se agitó durante la noche, mientras estaba a ta en un matraz abierto para eliminar el exceso de amoníaco. El precipitado blanco se filtró, se lavó con agua fría y se secó azeotrópicamente con tolueno para proporcionar 2,3-dihidro-7H-indeno-2-carboxamida (0,835 g, 5,18 mmol, 84 % de rendimiento) en forma de un sólido blanco que se utilizó tal cual. 1H RMN (400 MHz, DMSO-afe) 57,40 (s ancho, 1 H), 7,17 - 7,22 (m, 2 H), 7,12 (dd, J = 5,5, 3,2 Hz, 2 H), 6,85 (s ancho, 1 H), 3,10 - 3,19 (m, 1 H), 3,02 - 3,08 (m, 4 H). m / z (ESI, ión vo): 162,0 (M+H)+.
Etapa 2. 2,3-dihidro-7rtLindeno-2-carbonitrilo. A una solución de 2,3-dihidro-1H-indeno-2-carboxamida (0,835 g, 5,18 mmol) en THF (25 mL) a 0 °C se añadió piridina (0,83 mL, 10,3 mmol). La mezcla resultante se agitó a 0 °C durante 1 h. Luego se añadió TFAA (3,66 mL, 25,9 mmol) en una porción y luego se dejó agitar la mezcla durante 15 min adicionales, mientras estaba a 0 °C. La mezcla se alccalinizó cuidadosamente con NaHCO3 sat. y la capa acuosa se extrajo con DCM. Los extractos orgánicos reunidos se lavaron con NH4Cl sat., se secó sobre Na2SO4, se filtró y se concentró al vacío. El material bruto se purificó mediante cromatografía en gel de sílice, con un gradiente de 0-30 % de EtOAc en heptano para proporcionar 2,3-dihidro-1 H -indeno-2-carbonitrilo (0,701 g, 4,90 mmol, 95 % de rendimiento). Era un aceite incoloro, que se secó azeotrópicamente con tolueno. 1H RMN (400 MHz, DMSO-de) 57,24 - 7,32 (m, 2 h ), 7,20 (dd, J = 5,6, 3,3 Hz, 2 H), 3,50 - 3,63 (m, 1 H), 3,33 - 3,37 (m, 1 H), 3,29 (s, 1 H), 3,16 (d, J = 6,8 Hz, 1 H), 3,13 (d, J = 7,0 Hz, 1 H). m / z (ESI, ión vo): 144,0 (M+H)+.
Compuesto intermedio I-7x
2,2,2-trifluoroacetato de (S)-1-(3-metilpiperazin-1-il)prop-2-en-1-ona
Etapa 1.4-acriloil-2-metilpiperazina-1-carboxilato de (S)-terc.-butilo. Cloruro de acriloílo (1,34 mL, 16,5 mmol) se añadió a una solución de (S)-1-Boc-2-metil-piperazina (3,00 g, 15,0 mmol, Boc Sciences, Shirley, NY) en THF (30 mL) a - 10 °C, y la mezcla resultante se agitó a -10 °C durante 5 min. A continuación, se añadió lentamente trietilamina (6,26 mL, 44,9 mmol) y la mezcla resultante se agitó a -10 °C durante 15 min y luego se dejó calentar a ta. La mezcla de reacción se repartió entre EtOAc y NaHCO3 acuoso saturado. La capa acuosa se extrajo con EtOAc (3 veces) y luego las capas orgánicas se combinaron, se secaron sobre MgSO4, se filtraron y se concentraron al vacío. La purificación cromatográfica del residuo (gel de sílice, 0-100 % de EtOAc en heptano) proporcionó 4-acriloil-2-metilpiperazina-1-carboxilato de (S)-terc.-butilo: 1H RMN (400 MHz, DMSO-de) 56,72 - 6,85 (m, 1H) 6,10 - 6,18 (m, 1H) 5,68 - 5,76 (m, 1H) 4,08 - 4,32 (m, 2H) 3,68 - 4,03 (m, 2H) 2,86 - 3,14 (m, 2H) 2,66 - 2,80 (m, 1H) 1,38 - 1,43 (s, 9H) 0,96 - 1,04 (m, 3H). m/z (ESI, ve) 277,3 (M+Na)+.
Etapa2. 2,2,2 -trifluoroacetato de (S)-1-(3-metilpiperazin-1-il )prop-2-en-1-ona. Una mezcla de 4-acriloil-2-metilpiperazina-1-carboxilato de (S)-terc.-butilo (3,21 g, 12,6 mmol) y TFA (4,7 mL, 63,1 mmol) en DCM (16 mL) se agitó a ta durante 24 h. A continuación, la mezcla de reacción se concentró al vacío para dar 2,2,2-trifluoroacetato de (S)-1-(3-metilpiperazin-1-il)prop-2-en-1-ona: 1H RMN (400 MHz, DMSO- d6) 58,70 - 8,99 (m, 1H) 6,74 - 6,91 (m, 1H) 6,12 - 6,26 (m, 1H) 5,70 - 5,84 (m, 1H) 4,25 - 4,44 (m, 1H) 4,07 - 4,25 (m, 1H) ) 3,49 - 3,53 (m, 1H) 3,22 - 3,32 (m, 2H) 2,92 - 3,08 (m, 2H) 1,14 - 1,29 (m, 3H). m/z (ESI, ve) 155,1 (M+H)+.
Compuesto intermedio 160
2,2,2-trifluoroacetato de 1-((2fí,5S)-2,5-dimetilpiperazin-1-il)prop-2-en-1-ona
A una solución de (2S,5R)-1-Boc-2,5-dimetilpiperazina (3,5 g, 16,3 mmol, Astatech) en diclorometano (35 mL) se añadió trietilamina anhidra (4,59 mL, 32,7 mmol) y la mezcla se enfrió a 0 °C en un baño de agua con hielo. Se añadió gota a gota cloruro de acriloílo (1,46 mL, 18,0 mmol) a lo largo de ~ 5 min, momento en el que la mezcla de reacción se volvió amarilla y viscosa y se observó la formación de un precipitado blanco. Se añadió agua (10 mL) y la mezcla se retiró del baño de hielo y se dejó en agitación durante 10 min. La capa orgánica se separó, se lavó rápidamente con HCl 2N (40 mL), agua y salmuera, se filtró a través de una almohadilla de MgSO4 y se concentró para proporcionar (2S,5R)-4-acriloil-2,5-dimetilpiperazina-1 -carboxilato de tero, -butil bruto (4,4 g) en forma de un aceite amarillo. Este material se volvió a disolver en DCM (40 mL) y se añadió TFA (12,6 mL, 163 mmol) y la mezcla se agitó a ta durante 4 h, momento en el que se observó una desprotección completa. La mezcla se concentró a presión reducida y se secó al vacío para proporcionar 2,2,2-trifluoroacetato de 1-((2R,5S)-2,5-dimetilpiperazin-1-il)prop-2-en-1-ona (Compuesto intermedio 160, ~ 9 g) en forma de un aceite. El análisis por qRMN utilizando benzoato de bencilo como patrón interno mostró una pureza del 40,2 % en peso. El material se utilizó sin purificación adicional. 1H RMN (400 MHz, DMSO-cfe) ó 9,03 (s ancho, 1H), 8,95 (s ancho, 1H), 6,77 (dd, J =10,6, 16,8 Hz, 1H), 6,16 (dd, J =2,3,16,8 Hz, 1 H), 5,74 (dd, J =2,3, 10,6 Hz, 1H), 4,69 - 4,56 (m, 1 H), 4,09 - 3,94 (m, 1H), 3,70 - 3,57 (m, 1H), 3,45 - 3,19 (m, 2H), 2,98 - 3,09 (m, 1H), 1,25 (d, J =6,8 Hz, 3H), 1,20 (d, J =6,8 Hz, 3H). m/z (ESI, ión vo): 169,3 (M+H).
Tabla 3: Tabla de Compuestos Separados
Sección 3. Datos justificativos
Tabla 4: Espectroscopia de masas y Datos analíticos de RMN
Análisis biológico
Para los compuestos de la Tabla 5, en los que se enumera una mezcla de atropisómeros e isómeros de fósforo, se emplearon las siguientes condiciones de ensayo:
Ensayo de Intercambio de Nucleótidos Acoplados: la proteína KRAS unida a GDP purificada (aa 1-169), que contiene sustituciones de aminoácidos tanto G12C como C118A y una etiqueta His W-terminal, se preincubó en tampón de ensayo
(HEPES 25 mM pH 7,4, MgCÍ2 10 mM y Tritón X-100 al 0,01 %) con una titulación de dosis-respuesta del compuesto durante 5 min o 2 horas (véase la Tabla 15). Después de la incubación previa del compuesto, se añadieron proteína SOS purificada (aa 564-1049) y GTP (Roche 10106399001) a los pocillos de ensayo y se incubaron durante 30 min adicionales (durante 5 min de preincubación del compuesto) o 1 hora (durante 2 horas de preincubación del compuesto). Para determinar el grado de inhibición del intercambio de nucleótidos mediado por SOS, se añadieron cRAF purificado marcado con GST (aa 1 -149), perlas aceptoras AlphaLISA de quelato de níquel (PerkinElmer AL108R) y perlas donantes de glutatión AlphaScreen (PerkinElmer 6765302) a los pocillos de ensayo y se incubó durante 10 minutos. A continuación, se leyeron las placas de ensayo en un aparato lector EnVision Multilabel de PerkinElmer, utilizando tecnología AlphaScreen®, y los datos se analizaron utilizando un modelo logístico de 4 parámetros para calcular los valores de CI50.
Ensayo Phospho-ERK1/2 MSD: se cultivaron células MIA PaCa-2 (ATCC® CRL-1420™) en medio RPMI 1640 (ThermoFisher Scientific 11875093) que contenía suero bovino fetal al 10 % (ThermoFisher Scientific 16000044) y 1x penicilina-estreptomicina-glutamina (ThermoFisher Scientific 10378016). Dieciséis horas antes del tratamiento con el compuesto, se sembraron células MIA PaCa-2 en placas de cultivo celular de 96 pocillos a una densidad de 25.000 células/pocillo y se incubaron a 37 °C, 5 % de CO2. Se diluyó una titulación dosis-respuesta del compuesto en medio de cultivo, se añadió a pocillos apropiados de una placa de cultivo celular y luego se incubó a 37 °C, 5 % de CO2 durante 2 o 4 horas. Después del tratamiento del compuesto, las células se estimularon con 10 ng/mL de EGF (Roche 11376454001) durante 10 min, se lavaron con solución salina tamponada con fosfato de Dulbecco enfriada con hielo, sin Ca2+ ni Mg2+ (ThermoFisher Scientific 14190144) y luego se lisaron en Tampón RIPA (Tris -HCl 50 mM pH 7,5, Igepal al 1 %, desoxicolato de sodio al 0,5 %, NaCl 150 mM y dodecilsulfato de sodio al 0,5 %) que contiene inhibidores de proteasa (Roche 4693132001) e inhibidores de fosfatasa (Roche 4906837001). La fosforilación de ERK1/2 en lisados tratados con compuesto se ensayó utilizando kits de lisado de células enteras Phospho-ERK1/2 (Meso Scale Discovery K151DWD) de acuerdo con el protocolo del fabricante. Las placas de ensayo se leyeron en un aparato Meso Scale Discovery Sector Imager 6000 y los datos se analizaron usando un modelo logístico de 4 parámetros para calcular los valores de CI50.
Tabla 5: Actividad Bioquímica y Celular de Compuestos (Mezcla de atropisómeros e isómeros simples)
La presente invención se describe en relación con realizaciones preferidas. Sin embargo, debe apreciarse que la invención no se limita a las realizaciones descritas. Se entiende que, dada la descripción de las realizaciones de la presente invención, un experto en la materia puede realizar diversas modificaciones. Dichas modificaciones están abarcadas por las reivindicaciones siguientes.
Claims (23)
1. Un compuesto que tiene una estructura de fórmula (I)
en donde
R1 es un grupo -alquilo C1-C6 o -cicloalquilo C3-C6 ;
R1a es un grupo -alquilo C1-C6 -heteroalquilo C1-C6, arilo, heteroarilo, -cicloalquilo C3-C6 o -heterocicloalquilo C3-C6;
R1 y R1a, junto con el átomo de carbono al que están unidos, forman un anillo carbocíclico, en donde el anillo carbocíclico puede estar sin sustituir o condensado con un anillo aromático;
R2 es un arilo sustituido con un halo, -OH o NH2 ;
R3 es halo;
R4 es H o metilo;
R5 es H o metilo; o
un estereoisómero del mismo, un atropisómero del mismo, una sal farmacéuticamente aceptable del mismo, una sal farmacéuticamente aceptable del estereoisómero del mismo o una sal farmacéuticamente aceptable del atropisómero del mismo.
2. El compuesto de la reivindicación 1, en donde R1 es un grupo -alquilo C1-C6 o -cicloalquilo C3-C6.
3. El compuesto de la reivindicación 2, en donde R1 es un grupo metilo o ciclopropilo.
4. El compuesto de una cualquiera de las reivindicaciones 1 -3, en donde R1a es un grupo -alquilo C1-C6 , arilo o -cicloalquilo C3-C6.
5. El compuesto de la reivindicación 4, en donde R1a es un grupo etilo.
6. El compuesto de la reivindicación 4, en donde R1a es un grupo alquilo C4 ramificado.
7. El compuesto de la reivindicación 4, en donde R1a es un grupo ciclopropilo, ciclobutilo, ciclopentilo o fenilo.
8. El compuesto de la reivindicación 1, en donde R1 y R1a, junto con el átomo de carbono al que están unidos, forman un anillo de 4-10 miembros.
9. El compuesto de la reivindicación 8, en donde R1 y R1a, junto con el átomo de carbono al que están unidos, forman un ciclopentano o ciclohexano.
10. El compuesto de la reivindicación 8, en donde R1 y R1a, junto con el átomo de carbono al que están unidos, forman un anillo carbocíclico de 5 miembros, en donde el anillo carbocíclico puede estar no sustituido o condensado con un anillo aromático.
11. El compuesto de la reivindicación 1, en donde R2 es un fenilo fluorado.
12. El compuesto de la reivindicación 1, en donde R3 es Cl.
13. El compuesto de la reivindicación 1, en donde R4 es H o metilo.
14. El compuesto de la reivindicación 1, en donde el compuesto se selecciona de
o un estereoisómero del mismo, un atropisómero del mismo, una sal farmacéuticamente aceptable del mismo, una sal farmacéuticamente aceptable del estereoisómero del mismo, o una sal farmacéuticamente aceptable del atropisómero del mismo.
15. Una composición farmacéutica que comprende el compuesto de una cualquiera de las reivindicaciones 1-14 y un excipiente farmacéuticamente aceptable.
16. Un método in vitro para inhibir KRAS G12C en una célula, que comprende poner en contacto la célula con el compuesto de una cualquiera de las reivindicaciones 1-14 o la composición de la reivindicación 15.
17. Un compuesto de acuerdo con una cualquiera de las reivindicaciones 1 -14 para uso en el tratamiento del cáncer.
18. El compuesto para uso de acuerdo con la reivindicación 17, en donde el cáncer es cáncer de pulmón de células no pequeñas, cáncer de páncreas, cáncer colorrectal, cáncer de apéndice, cáncer de endometrio, cáncer de esófago, cáncer gástrico, cáncer de intestino delgado, cáncer de cavidad nasal, cáncer de senos paranasales, cáncer de las vías biliares, cáncer de piel o melanoma intraocular.
19. El método de la reivindicación 18, en el que el cáncer es cáncer de pulmón de células no pequeñas.
20. El método de la reivindicación 18, en el que el cáncer es cáncer de páncreas.
21. El método de la reivindicación 18, en el que el cáncer es cáncer colorrectal.
22. El compuesto para uso de acuerdo con una cualquiera de las reivindicaciones 17-21, en donde el cáncer está mediado por una mutación KRAS G12C.
23. Un compuesto de acuerdo con una cualquiera de las reivindicaciones 1-14 o la composición farmacéutica de la reivindicación 15 para uso como medicamento.
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