ES2258787T3 - Preparacion microbiana de sustancias del metabolismo aromatico. - Google Patents
Preparacion microbiana de sustancias del metabolismo aromatico.Info
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Abstract
LA INVENCION SE REFIERE A PROCEDIMIENTOS ALTERNATIVOS DE PREPARACION MICROBIANA DE SUSTANCIAS, ESPECIALMENTE DE AMINOACIDOS AROMATICOS, COMO LA L - FENILALANINA, EMPLEANDO UNA PROVISION INCREMENTADA DE INTERMEDIARIOS METABOLICOS, ESPECIALMENTE DE ETITROSA - 4 - FOSFATO. EN DICHOS PROCEDIMIENTOS, SE INCREMENTA LA ACTIVIDAD DE UNA TRANSALDOLASA EN UN MICROORGANISMO QUE PRODUCE DICHAS SUSTANCIAS A PRODUCIR. EN REALIZACIONES PREFERIDAS DE LA INVENCION, SE INCREMENTA ADICIONALMENTE LA ACTIVIDAD DE UNA TRANSCETOLASA O DE UNA PROTEINA DE TRANSPORTE PARA ASEGURAR EL APORTE, INDEPENDIENTE DE FOSFOENOLPIRUVATO (PEP), DE UN AZUCAR Y/O LA ACTIVIDAD DE UNA QUINASA QUE FOSFORILA EL AZUCAR RELEVANTE. LA INVENCION SE REFIERE ASIMISMO A ESTRUCTURAS GENICAS, Y A CELULAS TRANSFORMADAS QUE PORTAN DICHAS ESTRUCTURAS, QUE PERMITEN LLEVAR A CABO DICHOS PROCEDIMIENTOS CON GRAN EXITO.
Description
Preparación microbiana de sustancias del
metabolismo aromático.
La invención se refiere a un proceso para la
preparación microbiana de sustancias, en particular aminoácidos
aromáticos, de acuerdo con las reivindicaciones
1-23, 36 y 37, a estructuras génicas de acuerdo con
las reivindicaciones 24-29, y a células
transformadas de acuerdo con las reivindicaciones
30-35.
Las sustancias preparadas microbialmente, tales
como productos químicos finos, en particular aminoácidos aromáticos,
presentan gran interés económico, continuando en aumento el
requerimiento de aminoácidos, por ejemplo. Así, la
L-fenilalanina, por ejemplo, se utiliza para
preparar medicamentos y, en particular, también en la preparación
del edulcorante aspartamo (éster metílico de
\alpha-L-aspartil-L-fenilalanina,).
El L-triptófano es requerido como medicamento y
como aditivo para piensos animales; existe asimismo necesidad de
L-tirosina como medicamento y asimismo como materia
prima en la industria farmacéutica. Además del aislamiento a partir
de materiales naturales, la preparación biotecnológica es un método
muy importante para la obtención de aminoácidos en la forma
ópticamente activa deseada en condiciones económicamente
justificables. La preparación biotecnológica se efectúa utilizando
enzimas o utilizando microorganismos. La última preparación, es
decir la microbiana, presenta la ventaja de que pueden emplearse
materias primas simples y económicas. Sin embargo, dado que la
biosíntesis de aminoácidos en la célula está controlada en una gran
diversidad de modos, se han hecho ya un gran número de intentos para
aumentar la formación de productos. Así, por ejemplo, se han
empleado análogos de aminoácidos, con objeto de eliminar la
regulación de la biosíntesis. Por ejemplo, mutantes de
Escherichia coli que permiten una producción incrementada de
L-fenilalanina se han obtenido por selección de la
resistencia a análogos de fenilalanina
(GB-2.053.906). Una estrategia similar condujo
también a la superproducción de cepas de Corynebacterium
(JP-19037/1976 y JP-39517/1978) y
Bacillus (EP-0.138.526). Adicionalmente, se
conocen microorganismos que se han construido utilizando técnicas de
DNA recombinante, en los cuales la regulación de la biosíntesis
está eliminada análogamente, siendo clonados y expresados los genes
que codifican enzimas clave que ya no están sometidas a inhibición
de la realimentación. Como prototipo, EP-0.077.196
describe un proceso para producir aminoácidos aromáticos en el cual
una
3-desoxi-D-arabinoheptulosonato-7-fosfato-sintasa
(DAHP-sintasa) que ya no está sometida a inhibición
de la realimentación se sobreexpresa en E. coli.
EP-0.145.156 describe una cepa de E. coli en
la cual se sobreexpresan adicionalmente
corismato-mutasa/prefenato-deshidratasa
para el propósito de producir L-fenilalanina.
Una característica común a las estrategias
mencionadas anteriormente es que la intervención para mejorar la
producción está restringida al camino de biosíntesis que es
específico para los aminoácidos aromáticos. Sin embargo, con objeto
de aumentar todavía más la producción, tienen que realizarse
esfuerzos para mejorar la provisión de los metabolitos primarios,
fosfoenolpiruvato (PEP) y
eritrosa-4-fosfato (Ery4P), que son
necesarios para la producción de los aminoácidos aromáticos.
PEP es un precursor activado del producto de
glicolisis piruvato; Ery4P es un compuesto intermedio en el camino
pentosa-fosfato.
Se han realizado diversos intentos para
conseguir una mejora específica en la provisión de dicho metabolito
primario Ery4P. Un flujo incrementado de carbono a través del camino
pentosa-fosfato fue conseguido en E. coli por
eliminación de la enzima fosfoglucosa-isomerasa;
esto dio como resultado la formación de triptófano (Mascarenhas D.
et al., Appl. Environ. Microbiol. 57 (1991)
2995-99).
US-A-5.168.056 dio a conocer que la
sobreexpresión de una transcetolasa, conseguida por medio de
técnicas de DNA recombinante, hace posible obtener una provisión
incrementada de Ery4P y, como consecuencia, un aumento en la
formación de L-triptófano,
L-tirosina o L-fenilalanina como
productos. Tanto Draths K.M. et al. (J. Am. Chem. Soc. 114
(1992) 3956-62) como Flores N. et al. (Nat.
Biotechnol. 14 (1996) 620-3) demostraron el mismo
efecto. Sin embargo, como ha expuesto Feldmann, el aumento simple
de la actividad de transcetolasa en cepas de Zymomonas
mobilis que carecen de actividad de transaldolasa conduce al
enriquecimiento de metabolitos del camino
pentosa-fosfato en las células y, como
consecuencia, a efectos negativos sobre el crecimiento celular
(Feldmann S.D. et al., Appl. Microbiol. Biotechnol. 38
(1992) 354-61). Este efecto fisiológico puede ser
atribuible posiblemente a una concentración intracelular excesiva
de sedoheptulosa-7-fosfato. Los
autores de la invención han encontrado también una inhibición
correspondiente del crecimiento de la biomasa como consecuencia de
la sobreexpresión de transcetolasas en el caso de cepas tal^{+}
de E. coli.
El objeto de la invención es, por consiguiente,
poner a disposición un proceso alternativo para la producción de
sustancias, en particular aminoácidos aromáticos, proceso que se
distingue por una provisión incrementada de compuestos intermedios
del metabolismo intracelular para la síntesis de estas sustancias
sin presentar las desventajas de los procesos arriba citados,
desventajas que son consecuencia de aumentar únicamente la
actividad de la trascetolasa.
Sorprendentemente, este objeto se consigue, de
acuerdo con la invención, poniendo a disposición un proceso para la
preparación microbiana de sustancias, en cuyo proceso la actividad
de una transaldolasa se incrementa en un
micro-organismo que es productor de estas
sustancias, estando presente, reducida o ausente en este
microorganismo la actividad de un sistema de absorción de azúcares
dependiente del fosfoenolpiruvato (PEP).
Este resultado es particularmente sorprendente
dado que no es en modo alguno evidente en sí mismo que las
transaldolasas jueguen un papel importante en el crecimiento de
microorganismos y en su producción de sustancias. Esto es
particularmente aplicable en el caso del crecimiento sobre hexosas.
Así, se conocen, por ejemplo, cepas de levadura que son capaces
todavía de crecer sobre glucosa a pesar de tener una mutación en el
gen de trans-aldolasa (Schaaff L. et al.,
Eur. J. Biochem. 188 (1990) 597-603). De acuerdo con
ello, una transaldolasa no debería ejercer influencia esencial
alguna sobre el crecimiento celular. Esto está respaldado por el
hecho de que se conocen también especies bacterianas que son
capaces de crecer en ausencia de una transaldolasa (Feldmann S.D.
et al., Appl. Microbiol. Biotechnol. 38 (1992)
354-62).
Adicionalmente, hexosas tales como glucosa, en
contraste con xilosa y otras pentosas, pueden ser metabolizadas
también por caminos de degradación distintos del camino
pentosa-fosfato. Por consiguiente no es evidente en
absoluto en sí mismo que la transaldolasa tenga una función esencial
en la degradación de la glucosa.
Puede indicarse también que un flujo
incrementado por la vía de las enzimas del camino
pentosa-fosfato se midió in vitro en
extractos de células de Saccharomyces cerevisiae en los
cuales la actividad de una transaldolasa se incrementó (Senac T.
et al., Appl. Environ. Microbiol. 57 (1991)
1701-6). Sin embargo, las condiciones
experimentales que se seleccionaron en este estudio no permiten
transferencia alguna de los resultados a los fenómenos naturales de
la fisiología del metabolismo que tienen lugar en los
microorganismos vivos, en particular bacterias. Adicionalmente,
puede indicarse que Liao J.C. et al. Biotechn. Bioeng. 52
(1996) 129-140 han demostrado que cuando las
actividades de una transaldolasa y AroG se incrementan
simultáneamente, aumenta la formación de DAHP. Este efecto debe
adscribirse principalmente al aumento en la actividad de AroG. Un
aumento en la producción de sustancias como resultado de un aumento
en la actividad de transaldolasa como tal no ha sido descrito ni
indicado. Por consiguiente, no debe esperarse en modo alguno que
exista una relación causal entre un aumento en la actividad de
transaldolasa en los microorganismos y la provisión de Ery4P para la
producción incrementada de sustancias. El aumento de la actividad
(sobreexpresión) de una transaldolasa de acuerdo con la presente
invención pone a disposición un proceso alternativo para la
implementación de un flujo incrementado de carbono a través del
camino pentosa-fosfato y la consecución consiguiente
de una provisión incrementada del metabolito primario Ery4P. Una
cantidad incrementada de Ery4P está disponible por tanto para la
síntesis microbiana de sustancias, en cuya síntesis está implicado
al menos un compuesto intermedio del camino
pentosa-fosfato, y en particular Ery4P. Los autores
de la presente invención han demostrado que la disponibilidad
incrementada de Ery4P ocurre tanto en microorganismos en los cuales
la actividad de un sistema de absorción de azúcares dependiente de
PEP está presente o reducida como en microorganismos en los cuales
está ausente dicha actividad. Así pues, de acuerdo con la invención
no sólo pueden utilizarse organismos que tienen todavía sistemas de
fosfotransferasa (PTS) activos o sistemas de fosfotransferasa con
actividad reducida (cepas pts^{+}) sino también organismos en los
cuales la PTS ha sido eliminada
(cepas pts^{-}).
(cepas pts^{-}).
Dentro del significado de la invención, las
sustancias deben entenderse como, por ejemplo, productos químicos
finos tales como aminoácidos aromáticos, índigo, ácido indolacético,
ácido adípico, melanina, quinonas, y ácido benzoico, así como sus
derivados potenciales y productos secundarios - o bien, de manera
general, productos secundarios de compuestos intermedios del camino
pentosa-fosfato. Sin embargo, esto debería incluir
también todos aquellos compuestos, por ejemplo piridoxina y sus
derivados, cuya síntesis bioquímica esté promovida por la provisión
de eritrosa-4-fosfato. Dentro del
contexto de esta invención, todas estas sustancias se consideran
también como sustancias procedentes del metabolismo aromático. Puede
indicarse en este contexto que se requieren alteraciones genéticas
ulteriores de los microorganismos productores de la sustancia,
además de las nuevas intervenciones, para la preparación de índigo,
ácido adípico y otros productos secundarios no naturales. El
proceso de acuerdo con la invención es particularmente adecuado para
la preparación de sustancias en microorganismos que no han sido
seleccionados, antes del incremento de la actividad de
transaldolasa, como cepas con un sistema de fosfotransferasa
eliminado (cepas pts^{-}) a partir de cepas que albergaban
previamente un sistema de fosfotransferasa (cepas pts^{+}). En
conexión con esto, puede indicarse que la memoria descriptiva de
patente WO-96/34961 no publicada previamente
describe una selección de este tipo a partir de lo que eran
previamente cepas pts^{+}, pero en este estudio dicha selección
precede al aumento de la actividad de transcetolasa o
transaldolasa.
Con relación al aumento de la actividad de una
transaldolasa, se da preferencia a aumentar la actividad de una
transaldolasa de Escherichia coli y, en particular, la
actividad de transaldolasa B (TalB) de Escherichia coli.
Cuando se utiliza el gen talB correspondiente, este gen procede
preferiblemente de Escherichia coli K12 o de una cepa que se
deriva de ella. Aparte de éste, sin embargo, es adecuado también
cualquier gen cuyo producto génico catalice una reacción que
corresponde a la de la una transaldolasa, es decir la conversión de
sedoheptulosa-7-fosfato más
gliceraldehído-3-fosfato en Ery4P y
fructosa-6-fosfato.
En una realización particularmente ventajosa de
la invención, se incrementa la actividad de una transcetolasa
además de aumentar la actividad de una transaldolasa. En presencia
de pentosas, la expresión de un gen de transcetolasa conduce por sí
misma a una acumulación de metabolitos en el camino de fosfato de
pentosa (Feldmann S.D. et al., Appl. Microbiol. Biotechnol.
38 (1992) 354-61). Esto tiene un efecto nocivo sobre
la célula y da como resultado, entre otras cosas, que las células
transformadas crezcan a una tasa disminuida. Los autores de la
invención han observado también un efecto idéntico en el caso de una
cepa de Escherichia coli que estaba creciendo sobre glucosa
y que exhibía actividad incrementada de transcetolasa. Sin embargo,
se ha encontrado ahora que el aumento simultáneo de la actividad de
una transcetolasa además del de una transaldolasa es muy
beneficioso para proporcionar Ery4P y no exhibe los efectos
secundarios negativos de una sobreexpresión exclusiva de una
transcetolasa. La acumulación de metabolitos del camino
pentosa-fosfato que ocurre cuando se incrementa la
actividad de una transcetolasa no se materializa por consiguiente
como resultado del aumento de la actividad de una transaldolasa,
como resultado de lo cual la reducción del crecimiento de las
células no sólo se detiene, sino que incluso se convierte en un
aumento de crecimiento. Resulta, por tanto, que el aumento de la
actividad de una transcetolasa particularmente en cepas que tienen
una actividad incrementada de transaldolasa de acuerdo con la
invención es una medida sensible.
Con relación al aumento de la actividad de una
transcetolasa, se da preferencia a aumentar la actividad de una
transcetolasa de Escherichia coli y, en particular, la
actividad de la transcetolasa A (TktA) de Escherichia coli.
Cuando se utiliza el gen tktA correspondiente, este gen procede
preferiblemente de Escherichia coli K12 o de una cepa que se
deriva de ella. Aparte de esto, sin embargo, es adecuado también
cualquier gen cuyo producto génico catalice una reacción que
corresponde a la de una transcetolasa, es decir la conversión de
ribosa-5-fosfato más
xilulosa-5-fosfato en
sedoheptulosa-7-fosfato más
gliceraldehído-3-fosfato o la
conversión de xilulosa-5-fosfato más
Ery4P en fructosa-6-fosfato más
gliceraldehído-3-fosfato.
En otra realización particularmente preferida de
la invención, la actividad de una proteína de transporte para la
absorción independiente de PEP de un azúcar y/o la actividad de una
quinasa que fosforila el azúcar correspondiente se
incrementa(n) además de aumentar la actividad de una
transaldolasa o aumentar la actividad de una transaldolasa y una
transcetolasa. El caso de la proteína de transporte, la actividad de
esta proteína se entiende como la tasa de absorción mediada por la
proteína. El aumento adicional en la actividad de una de estas
últimas proteínas, es decir la proteína de transporte y la quinasa,
o de ambas proteínas hace posible conseguir una producción todavía
mayor de sustancias, en particular aminoácidos aromáticos, debido al
hecho de que se proporciona PEP en cantidad incrementada para la
condensación con Ery4P para formar el metabolito primario del
camino general para la biosíntesis de compuestos aromáticos, a saber
desoxi-D-arabinoheptulosonato-7-fosfato
(DAHP).
Es aconsejable utilizar un facilitador como la
proteína de transporte para la absorción independiente de PEP de un
azúcar, es decir una proteína de transporte que actúa de acuerdo con
el principio de la difusión facilitada mediada por proteínas. En
particular, es adecuado utilizar la proteína facilitadora de glucosa
(Glf) de Zymomonas mobilis. Cuando se utiliza esta última, el
gen codificante de la proteína, glf, se obtiene, por ejemplo,
a partir de Z. mobilis ATCC 10988, ATCC 29191 o ATCC 31821.
Sin embargo, otros genes bacterianos de transporte de azúcares cuyos
productos génicos transportan glucosa, fructosa o sacarosa, por
ejemplo, y al hacerlo así no utilizan PEP alguno, por ejemplo el
sistema GalP de Escherichia coli, son también adecuados para
el nuevo proceso. Pueden utilizarse también genes para sistemas de
transporte de azúcares, tales como HXT1 a HXT7, procedentes de
microorganismos eucariotas, tales como Saccharomyces cerevisiae,
Pichia stipitis o Kluyveromyces lactis, o genes de
transporte de azúcares procedentes de otros organismos en general,
con tal que los mismos puedan expresarse de manera funcional en los
microorganismos y que los productos génicos puedan, en este
contexto, operar sin utilizar PEP para transportar los azúcares.
Para que ello sea posible, es particularmente aconsejable expresar
los genes de transporte de azúcares en microorganismos que produzcan
aminoácidos (productores de aminoácidos).
Es particularmente adecuado, por tanto, utilizar
el gen facilitador glf, aislado de Z. mobilis ATCC
31821, para absorber azúcares tales como glucosa, fructosa o manosa
cuando se preparan aminoácidos aromáticos de acuerdo con el nuevo
proceso. (Parker C. et al., Mol. Microbiol. 15 (1995)
795-802; Weisser P. et al., J. Bacteriol. 177
(1995) 3351-4). El proceso de acuerdo con la
invención es particularmente adecuado para la preparación de
aminoácidos aromáticos en microorganismos en los cuales el sistema
PTS tiene una actividad reducida o está completamente ausente. En
tales casos, el sistema PTS puede reducirse o suprimirse antes, pero
también después del aumento de la actividad de transaldolasa.
El gen glf, en particular, debería
insertarse preferiblemente con un número de copias bajo del gen a
fin de evitar efectos nocivos sobre la célula debidos a la expresión
excesiva de proteínas de membrana. Así pues, se prefiere un número
de copias del gen comprendido entre 2 y 5, por ejemplo, para el gen
glf. Es particularmente ventajoso insertar el gen glf
en uno de los genes del operón ptsHI-crr, por ejemplo
en el gen ptsI.
Cuando se emplea una quinasa fosforilante de
azúcares, es aconsejable utilizar una quinasa fosforilante de
hexosas, preferiblemente una quinasa, en particular glucoquinasa
(Glk), de Zymomonas mobilis. Cuando se utiliza la última, el
gen codificante de la proteína, glk, se deriva, por ejemplo,
de Z. mobilis ATCC 10988, ATCC 29191 o ATCC 31821. Otros
genes para quinasas fosforilantes de hexosas procedentes de
bacterias cuyos productos génicos fosforilen hexosas al tiempo que
consumen ATP, tales como una fructoquinasa o una manoquinasa, son
adecuados asimismo para el nuevo proceso. Adicionalmente, genes
para, por ejemplo, quinasas procedentes de microorganismos
eucariotas, tales como Saccharomyces cerevisiae, o, de manera
general, genes para quinasas fosforilantes de azúcares procedentes
de otros organismos, son también adecuados, con tal que los mismos
puedan expresarse de una manera funcional en los microorganismos, en
particular productores de aminoácidos, y puedan operar sin utilizar
PEP para fosforilar los azúcares. El gen de glucoquinasa,
glk, para fosforilación de glucosa, gen que se aísla a
partir de Z. mobilis ATCC 29191, es particularmente adecuado
para preparación de aminoácidos aromáticos de acuerdo con el nuevo
proceso.
La disponibilidad de PEP para producir el primer
producto intermedio del metabolismo de los aminoácidos aromáticos
puede estar limitada en microorganismos en los cuales está
incrementado el flujo de material hacia Ery4P. En estos casos, puede
ser ventajoso reducir, o eliminar por completo, otras reacciones
consumidoras de PEP en el metabolismo, tales como la reacción del
sistema de fosfotransferasa PEP:azúcar (PTS), que cataliza una
absorción de azúcar dependiente de PEP, si está presente este
sistema. De acuerdo con la invención, puede hacerse uso a la vez de
organismos que poseen todavía genes PTS activos (cepas
pts^{+}) y, para la mejora adicional del proceso, de
mutantes pts en los cuales la actividad del pts está
reducida (que se considerarán también como pts^{+} en el
caso presente) o en los cuales el pts está eliminado (cepas
pts^{-}). Una disminución de esta naturaleza puede
efectuarse o bien al nivel enzimático o por utilización de métodos
genéticos, por ejemplo por inserción de un gen glf y/o un
gen glk en el cromosoma y, en particular, en el locus del gen
ptsI, procedimiento que estabiliza simultáneamente el DNA
recombinante en el cromosoma (estabilidad de segregación) y
significa por consiguiente que puede prescindirse del uso de un
vector. Las experiencias de los autores de la invención han
demostrado que la reducción o eliminación de la actividad del PTS no
debería tener lugar preferiblemente antes de aumentar la actividad
de la transaldolasa.
Dentro del significado de la invención, las
medidas para aumento de la actividad deben entenderse como todas
aquellas medidas que son adecuadas para aumentar la actividad de la
transaldolasa, de la transcetolasa, de la proteína de transporte, y
de la quinasa. Las medidas siguientes son particularmente adecuadas
para este propósito:
- -
- introducción de genes, por ejemplo utilizando vectores o fagos moderados;
- -
- aumento del número de copias del gen, por ejemplo utilizando plásmidos con la finalidad de introducir los genes de acuerdo con la invención en el microorganismo con un número de copias incrementado, es decir con un número de copias que está ligeramente (v.g. de 2 a 5 veces) incrementado hasta fuertemente (v.g. de 15 a 50 veces) incrementado;
- -
- aumento de la expresión génica, por ejemplo por aumento de la tasa de transcripción, por ejemplo por utilización de elementos promotores tales como Ptac, Ptet u otras secuencias nucleotídicas reguladoras, y/o por aumento de la tasa de traducción, por ejemplo por utilización de un sitio de fijación de ribosoma de consenso;
- -
- aumento de la actividad endógena de enzimas que están presentes, por ejemplo por medio de mutaciones que se producen de manera aleatoria por métodos convencionales, utilizando por ejemplo irradiación UV o productos químicos que provocan mutaciones, o por medio de mutaciones, tales como uno(a) o más deleciones, inserciones y/o intercambios de nucleótidos, que se producen de manera específica utilizando métodos de ingeniería genética;
- -
- aumento de la actividad de enzimas por alteración de la estructura de las enzimas, por ejemplo por medio de mutagénesis utilizando métodos físicos, químicos o de biología molecular u otros métodos microbiológicos;
- -
- utilización de enzimas desreguladas, por ejemplo enzimas que ya no están sujetas a inhibición de realimentación;
- -
- introducción de genes correspondientes que codifican las enzimas desreguladas.
Combinaciones de los métodos arriba mencionados
y otros métodos análogos pueden emplearse también para aumentar la
actividad. La actividad endógena o introducida de proteínas de
transporte puede incrementarse, por ejemplo, por clonación del gen
utilizando los métodos mencionados anteriormente, por ejemplo, o por
selección de mutantes que exhiben un transporte de sustratos
incrementado.
Preferiblemente, la actividad se incrementa por
integración del gen, o los genes, en una estructura génica, o en
varias estructuras génicas, introduciéndose cada gen o cada uno de
los genes en la estructura génica como una sola o más copias o en
número de copias incrementado. Dentro del significado de la
invención, una estructura génica debe entenderse como un gen y
cualquier otra secuencia nucleotídica que sea portadora de los genes
de acuerdo con la invención. Secuencias nucleotídicas apropiadas
pueden ser, por ejemplo, plásmidos, vectores, cromosomas, fagos u
otras secuencias nucleotídicas que no están cerradas
circularmente.
Un cromosoma, dentro del significado de la
invención, es un cromosoma en el cual se ha insertado al menos un
gen de acuerdo con la invención, conteniendo la secuencia de ácido
nucleico resultante al menos un gen, o una copia del gen, más que el
que está contenido naturalmente en este cromosoma. Por otra parte,
por ejemplo, la recombinación homóloga dentro de un locus del gen
conduce a un cromosoma que no tiene que diferir necesariamente de
la forma natural. Los cromosomas que se preparan por recombinación
homóloga no deben considerarse, por consiguiente, como de acuerdo
con la invención si el número natural de genes homólogos no se
sobrepasa.
Dentro del significado de la invención, una
estructura génica debe entenderse también como una combinación de
los portadores de genes mencionados anteriormente, tales como
vectores, cromosomas y fagos moderados, en los cuales están
distribuidos los genes de acuerdo con la invención. Por ejemplo, dos
genes tal pueden estar introducidos en la célula en un
vector o dos genes tal pueden estar insertados en un
cromosoma. Además, un gen adicional puede, por ejemplo,
introducirse en la célula utilizando un fago. Esto mismo es
aplicable a los otros genes de acuerdo con la invención. Estos
ejemplos no pretenden excluir otras combinaciones de distribuciones
de los genes de la invención. En cualquier caso, es crucial que el
número de genes contenidos en el microorganismo de acuerdo con la
invención sobrepase el número natural de los genes correspondientes.
Preferiblemente, el número de genes glf, por ejemplo, estará
incrementado en un factor de 2 a 5 a fin de conseguir el aumento de
actividad de acuerdo con la invención. A estas concentraciones no
aparecerá efecto tóxico alguno en las células. Sin embargo, es
imaginable también introducir los genes de acuerdo con la invención
en el microorganismo con un número de copias mayor, de hasta 50
copias del gen de una forma que tenga el mismo efecto.
En el nuevo proceso para producción de
sustancias, se da preferencia al empleo de microorganismos en los
cuales una o más enzimas que están implicadas adicionalmente en la
síntesis de las sustancias están desreguladas y/o tienen una
actividad incrementada.
Estas enzimas son, en particular, las enzimas
del metabolismo de los aminoácidos aromáticos y, especialmente,
DAHP-sintasa, shikimato-quinasa y
corismato-mutasa/prefenato-deshidratasa,
así como todas las restantes enzimas que están implicadas en la
síntesis de compuestos intermedios del metabolismo de los aromáticos
y sus productos secundarios.
Aparte de las enzimas de acuerdo con la
invención, es particularmente importante la desregulación y
sobreexpresión de DAHP-sintasa para preparar
sustancias tales como ácido adípico, ácidos biliares y compuestos
quinónicos y sus derivados. Adicionalmente, la
shikimato-quinasa debería desregularse, e
incrementarse su actividad, a fin de lograr una síntesis
superelevada de, por ejemplo, triptófano, tirosina, índigo y
derivados del ácido hidroxibenzoico y el ácido aminobenzoico y
naftoquinonas y antraquinonas, así como sus productos secundarios.
La
corismato-mutasa/prefenato-deshidratasa
desregulada y sobreexpresada tiene adicionalmente una importancia
particular para la producción eficiente de fenilalanina y ácido
fenilpirúvico y sus derivados. Sin embargo, debe entenderse también
que esto abarca todas las restantes enzimas cuyas actividades
contribuyen a la síntesis bioquímica de sustancias, es decir de
compuestos cuya producción es promovida por la provisión de
eritrosa-4-fosfato, por ejemplo
piridoxina y sus derivados. Puede indicarse que se requieren
alteraciones genéticas adicionales a los microorganismos
productores de sustancias, además de las nuevas intervenciones, para
el propósito de preparación de índigo, ácido adípico y otros
productos secundarios no naturales.
El nuevo proceso es adecuado, en particular,
para la preparación de aminoácidos aromáticos, en particular
fenilalanina. En el último caso, la expresión génica y/o la
actividad enzimática de una DAHP-sintasa desregulada
(v.g. AroF o AroH en E. coli) y/o de una
corismato-mutasa/prefenato-deshidratasa
(PheA) asimismo desregulada está preferiblemente incrementada.
Especies de Escherichia, así como
microorganismos de los géneros Serratia, Bacillus,
Corynebacterium o Brevibacterium, y otras cepas que son
conocidas por métodos convencionales de aminoácidos, son adecuadas
para uso como organismos de producción. Es particularmente adecuado
Escherichia coli.
Otro objeto de la invención es proporcionar
estructuras génicas adecuadas, así como células transformadas
portadoras de estas estructuras génicas, que permiten la
implementación del proceso de una manera particularmente
satisfactoria. Dentro del contexto de esta invención, se ponen ahora
a disposición nuevas estructuras génicas, estructuras génicas que
contienen, de forma recombinante, a) un gen que codifica una
transaldolasa o un gen que codifica una transaldolasa y un gen que
codifica una transcetolasa, y b) al menos un gen que codifica una
proteína de transporte para la absorción independiente de PEP de un
azúcar o que codifica una quinasa que fosforila un azúcar. En estas
estructuras génicas, se prefiere que el gen para la proteína de
transporte codifique un facilitador y el gen para la quinasa
codifique una quinasa fosforilante de hexosas. En particular, los
genes para la transaldolasa y la transcetolasa se derivan de
Escherichia coli y los genes para la proteína de transporte
y la quinasa se derivan de Zymomonas mobilis.
Son particularmente ventajosas estructuras
génicas en las cuales el gen para la transaldolasa es Escherichia
coli talB y el gen para la transcetolasa es
Escherichia coli tktA, mientras que el gen para la
proteína de transporte es Zymomonas mobilis glf y el gen para
la quinasa es Zymomonas mobilis glk.
Los genes apropiados se aíslan, y las células se
transforman, de acuerdo con métodos corrientes: las secuencias
nucleotídicas completas de los genes talB y tktA de
Escherichia coli K12 son conocidas (Yura T. et al.,
Nucl. Acid. Res. 20 (1992) 3305-8; Sprenger G.A.,
Biochem. Biophys. Acta 1216 (1993) 307-10; Sprenger
G.A. et al., J. Bacteriol. 177 (1995) 5930-9)
y están depositadas en bases de datos tales como la del EMBL en
Heidelberg. Cuando el gen talB de Escherichia coli se
somete a clonación, es adecuado el método de la reacción en cadena
de la polimerasa (PCR), por ejemplo, para amplificar específicamente
el gen utilizando DNA cromosómico de las cepas K12 de Escherichia
coli (Sprenger G.A. et al., J. Bacteriol. 177 (1995)
5930-9). La complementación homóloga de un mutante
deficiente en transcetolasa es adecuada, por ejemplo, cuando se
somete a clonación el gen tktA de Escherichia coli
(Sprenger G.A. en: Bisswanger H. et al., Biochemistry and
physiology of thiamine diphosphate enzymes, VCH (1991)
322-6).
Cuando se somete a clonación el gen de
transporte glf de Zymomonas mobilis o el gen
glk de glucoquinasa de Zymomonas mobilis, por ejemplo,
es adecuada la PCR, por ejemplo, para amplificar específicamente el
gen utilizando DNA cromosómico de las cepas ATCC 29191 o ATCC 31821
de Zymomonas mobilis, como lo es también la complementación
heteróloga de mutantes de Escherichia coli que son
deficientes en las funciones de PTS y que son por tanto inadecuados
para transportar glucosa, por ejemplo (Snoep J.L. et al., J.
Bacteriol. 174 (1994) 1707-8; Parker C. et
al., Mol. Microbiol. 15 (1995) 795-82; Weisser
P. et al., J. Bacteriol. 177 (1995) 3351-4).
Después de aislar los genes y recombinar los mismos in vitro
con vectores conocidos de bajo número de copias tales como pACYC184,
pACYC177, pSC101 o pZY507 (Weisser P. et al., J. Bacteriol.
177 (1995) 3351-4), la célula hospedadora se
transforma utilizando métodos químicos, electroporación, conjugación
o transducción.
El gen de transaldolasa aislado puede
integrarse, junto con uno o más de los genes descritos dentro del
contexto de la invención, en cualquier combinación, en una
estructura génica o en varias estructuras génicas. Sin considerar la
asignación precisa de las estructuras génicas, esto conduce a
combinaciones tales como talB, talB + tktA,
talB + glf, talB + glk, talB +
glf + glk, talB + tktA + glf,
talB + tktA + glk o talB + tktA +
glf + glk.
Son ventajosas las estructuras génicas que
contienen al menos una secuencia de un gen regulador que está
asignada a uno de los genes. Así, el refuerzo de los elementos
reguladores puede efectuarse preferiblemente al nivel de la
transcripción, particularmente por refuerzo de las señales de
transcripción. Esto puede efectuarse, por ejemplo, aumentando la
actividad del promotor o los promotores por alteración de las
secuencias promotoras que están localizadas aguas arriba de los
genes estructurales o reemplazando por completo los promotores con
promotores más eficaces. La transcripción puede reforzarse también
ejerciendo una influencia apropiada sobre un gen regulador que está
asignado a los genes; además de esto, sin embargo, es también
posible reforzar la traducción mediante, por ejemplo, mejora de la
estabilidad del RNA mensajero (mRNA).
Las estructuras génicas más adecuadas son
aquéllas en las cuales al menos uno de los genes descritos está
incorporado de tal manera que el mismo se encuentra bajo el control
de un promotor inducible. Cuando los genes están dispuestos en una
estructura génica de acuerdo con la invención, un promotor puede
estar localizado aguas arriba de un gen o estar localizado, como un
promotor común, aguas arriba de varios genes, o puede hacerse uso de
dos promotores opuestos entre los cuales están dispuestos los genes
de tal manera que los mismos se leen en direcciones opuestas. En
este contexto, el gen glf, por ejemplo, puede estar
localizado aguas abajo de un promotor relativamente débil (v.g.
Ptet) y otros genes pueden estar bajo el control del promotor
tac. Una o más secuencias de DNA pueden estar localizadas
aguas arriba y/o aguas abajo de los genes contenidos en una
estructura génica, con o sin un promotor aguas arriba o con o sin un
gen regulador asignado. Por medio de la utilización de elementos
promotores inducibles, v.g. lacI^{q}/Ptac, es
posible la puesta en marcha de nuevas funciones (inducción de la
síntesis de enzimas), por ejemplo por adición de inductores químicos
tales como isopropiltiogalactosido (IPTG).
El objeto de la invención se alcanza también
proporcionando células transformadas que albergan una estructura
génica de acuerdo con la invención en forma replicable.
Dentro del significado de la invención, una
célula transformada debe entenderse como cualquier microorganismo
que lleva una estructura génica de acuerdo con la invención,
estructura génica que da lugar a la formación incrementada de
sustancias en la célula. Las células hospedadoras pueden
transformarse por medio de métodos químicos (Hanahan D., J. Mol.
Biol. 166 (1983) 557-580) y también por medio de
electroporación, conjugación o transducción.
Para la transformación, es ventajoso emplear
células hospedadoras en las cuales una o más enzimas que están
involucradas adicionalmente en la síntesis de las sustancias están
desreguladas y/o tienen una actividad incrementada. Una cepa de
microorganismo, en particular Escherichia coli, que es
productora de un aminoácido aromático u otra sustancia de acuerdo
con la invención se transforma con la estructura génica que contiene
los genes relevantes. Para transformación con las estructuras
génicas, es ventajoso emplear células hospedadoras en las cuales la
actividad del sistema de absorción de azúcares dependiente de PEP,
si está presente, está reducida o eliminada.
En particular, se proporcionan las células
transformadas que son capaces de producir un aminoácido aromático,
siendo el aminoácido aromático preferiblemente
L-fenilalanina.
Utilizando el nuevo proceso, y el microorganismo
que se ha transformado de acuerdo con la doctrina de la invención,
pueden emplearse un amplio espectro de sustratos para producción de
sustancias. Dentro del contexto de la invención, se proporciona
también por consiguiente un proceso para la preparación microbiana
de sustancias en el cual se cultivan células que han sido
transformadas de acuerdo con la invención y en las cuales está
presente una estructura génica que contiene al menos una secuencia
génica reguladora que está asignada a uno de los genes,
induciéndose la síntesis enzimática en los microorganismos después
de al menos 2 divisiones celulares (comienzo de la fase de
crecimiento exponencial). Como consecuencia, la producción de los
microorganismos puede incrementarse con independencia de su
crecimiento.
En una realización particularmente preferida del
nuevo proceso, se emplean células transformadas que, además de los
compuestos intermedios del camino pentosa-fosfato,
contienen también una disponibilidad incrementada de otros
metabolitos del metabolismo central. Estos metabolitos incluyen, por
ejemplo, piruvato procedente de la glicólisis o gluconeogénesis, u
oxaloacetato procedente del ciclo del ácido cítrico. Adicionalmente,
el compuesto relevante, o sus precursores, es decir los precursores
del piruvato o de los metabolitos del ciclo del ácido cítrico,
tales como fumarato o malato, pueden ponerse a disposición de las
células en crecimiento por alimentación.
La invención se explica con mayor detalle más
adelante con ayuda de unos cuantos ejemplos de implementación. Las
cepas siguientes se han depositado en el DSM de acuerdo con los
términos del Tratado de Budapest:
DSM 11210 Escherichia coli
AT2471/pZYTT7tal
DSM 11209 Escherichia coli
AT2471/pZY557tkttal
DSM 11206 Escherichia coli
AT2471GP704g1fint PTS^{+}
DSM 11205 Escherichia coli AT2471g1fint
PTS^{-}
El organismo hospedador empleado, a saber
AT2471, ha sido depositado por Taylor y Trotter (Bacteriol. Rev. 13
(1967) 332-353) en el CGSC bajo el número 4510 y
está disponible libremente.
Las características y la procedencia de todos
los microorganismos empleados dentro del contexto de esta solicitud
de patente se describen en detalle en la Tabla 1.
El texto que sigue tiene por objeto indicar los
materiales y métodos empleados y respaldar la invención con
ejemplos experimentales y ejemplos comparativos:
En los estudios genéticos, se cultivaron cepas
de E. coli, a no ser que se indique otra cosa, en medio LB
constituido por bacto-triptona Difco (10
g\cdotl^{-1}), extracto de levadura Difco (5 g\cdotl^{-1}) y
NaCl (10 g\cdotl^{-1}). Dependiendo de las propiedades de
resistencia de las cepas empleadas, se añadió/añadieron al medio
carbenicilina (20-100 mg\cdotl^{-1}) y/o
cloranfenicol (17-34 mg\cdotl^{-1}) en caso
necesario. Para esto, la carbenicilina se disolvió primeramente en
agua, y el cloranfenicol en etanol, y las soluciones se añadieron,
después de haber sido esterilizadas por filtración, al medio tratado
previamente en autoclave. Se añadió bacto-agar
Difco (1,5%) al medio LB para preparación de placas de agar. Se
aisló DNA plasmídico de E. coli por medio de lisis alcalina
utilizando un sistema disponible comercialmente (Quiagen, Hilden).
Se aisló el DNA cromosómico de E. coli y Z. mobilis
como ha sido descrito por Chen y Kuo (Nucl. Acid Res. 21 (1993)
2260).
Se utilizaron enzimas de restricción
(DNA-polimerasa I, fosfatasa alcalina, RNasa y
DNA-ligasa T4 de acuerdo con las instrucciones de
los fabricantes (Boehringer Mannheim, Alemania o Promega,
Heidelberg, Alemania). Para el análisis de restricción, los
fragmentos de DNA se fraccionaron en geles de agarosa (0,8%) y se
aislaron de la agarosa por medio de extracción utilizando un
sistema disponible comercialmente (Jetsorb Genomed, Bad Oeynhausen,
Alemania).
Para los análisis Southern, se digirió el DNA
cromosómico (10 \mug) con enzimas de restricción, se fraccionó por
tamaños mediante electroforesis en gel y se transfirió a una
membrana de nailon (Nytran 13, Schleicher y Schuell, Dassel,
Alemania) por medio de difusión mediada a vacío (VacuGene System,
Pharmacia, Freiburg, Alemania). Se aislaron fragmentos de DNA
apropiados, se marcaron con digoxigenina-dUTP y se
utilizaron como sondas. La marcación, la hibridación, los
procedimientos de lavado y la detección se realizaron con ayuda de
un sistema de marcación y detección disponible comercialmente
(Boehringer Mannheim, Alemania).
Para la transformación, las células se incubaron
a 37ºC y 200 rpm durante 2,5-3 h en medio LB (tubos
de 5 ml). A una densidad óptica (620 nm) de aprox. 0,4, las células
se redujeron a un sedimento por centrifugación y se recogieron en
una décima parte de su volumen de TSS (medio LB que contiene 10%
(p/v) de PEG8000, 5% (v/v) de DMSO y MgCl_{2} 50 mM). Después de
una incubación de 30 minutos a 4ºC con 0,1 a 100 ng de DNA, e
incubación subsiguiente a 37ºC durante 1 h, las células se
extendieron en placas sobre medio LB que contenía un antibiótico
apropiado.
El plásmido pZY507 (Weisser et al. 1995
J. Bacteriol 177:3351-3345) se abrió utilizando las
enzimas de restricción BamHI y HindIII y se aisló el
fragmento mayor (10,1 kB de DNA). Una parte del sitio de clonación
múltiple se escindió del vector pUCBM20 (Boehringer Mannheim,
Alemania) utilizando BamHI y HindIII y se ligó al
fragmento grande pZY507BamHI/HindIII, dando como
resultado el vector pZY557, que es similar al vector pZY507 aparte
de los otros sitios de escisión por restricción. Se amplificó el gen
talB a partir del vector pGSJ451 (Sprenger G.A. et al., J.
Bacteriol. 177 (1995) 5930-36) por medio de PCR.
Para esto, se hizo uso del oligonucleótido I: 5'
CCGCATGCTGTTTAAAGAGAAATA 3' (los pares de bases que se han
subrayado aquí corresponden a los pares de bases 84 a 101 de la
secuencia talB de Sprenger G.A. et al., J. Bacteriol.
177 (1995)5930-6), que se proporcionó con un
sitio de restricción para la enzima de restricción SphI, y
del iniciador de secuenciación disponible comercialmente M13/pUC
(No. 1010093, Boehringer Mannheim, Alemania) como oligonucleótido
II. El fragmento de DNA amplificado resultante contiene un sitio de
escisión para SphI en cada extremo y se escindió con la
enzima de restricción SphI. Este fragmento se ligó luego a
los vectores pZY557 y pUCBM20, respectivamente, vectores que habían
sido también linealizados con SphI. Los plásmidos
recombinantes pZY557tal y pBM20tal, respectivamente, se obtuvieron
después de transformar E. coli con las dos soluciones de
ligación y clonación de los transformantes. El gen tktA se
amplificó por PCR a partir del vector pGSJ427 (Sprenger G.A. et
al., Eur. J. Biochem. 230 (1995) 525-32)
insertando un sitio de escisión para la enzima de restricción NotI
en el extremo 5' e insertando un sitio de escisión para la enzima
SphI en el extremo 3'. En este caso se hizo uso de los
oligonucleótidos III: 5' TTAGCGGCCGCCCTTCATCATCCGATCT 3' (los
pares de bases que se han subrayado en este caso corresponden a los
pares de bases 126 a 146 de la secuencia tktA de Sprenger
G.A. et al., Biochem. Biophys. Acta. 1216 (1993)
307-10), que se proporcionó con un sitio de escisión
para la enzima de restricción NotI, y IV: 5'
ATAGCATGCTAATTACAGCAGTTC 3' (los pares de bases que se han
subrayado en este caso corresponden a los pares de bases 2018 a 2036
de la secuencia tktA de Sprenger G.A. Biochem. Biophys. Acta.
1216 (1993) 307-10), que se proporcionó con un sitio
de escisión para SphI. El fragmento PCR resultante se
escindió con NotI y SphI y se ligó al vector
pZY557tkt, que había sido tratado del mismo modo, dando como
resultado el vector pZY557tkt. pZY557tkt se abrió luego con
SphI y se ligó al fragmento PCR escindido con SphI que
contenía talB. Después de la transformación de E. coli
y clonación de los transformantes (véase arriba), se obtuvieron
plásmidos que contenían el gen tktA y el gen talB
orientado en la misma dirección aguas abajo del promotor tac
y que se utilizaron subsiguientemente como la estructura génica
pZY557tkttal.
Los transformantes resultantes se guardaron a
-80ºC en medio LB en la forma de cultivos de glicerol (30%). Cuando
fueron necesarios, los cultivos de glicerol se descongelaron
inmediatamente antes de su utilización.
Se investigó el crecimiento de las cepas de
E. coli AT2471, AT2471/pZY557tkt, AT2471/pZT557tal y
AT2471/
pZY557tkttal en glucosa en medio mineral. Éste estaba constituido por citrato de Na\cdot3H_{2}O (1,0 g\cdotl^{-1}), MgSO_{4}\cdot7H_{2}O (0,3 g\cdotl^{-1}), KH_{2}PO_{4} (3,0 g\cdotl^{-1}), K_{2}HPO_{4} (12,0 g\cdotl^{-1}), NaCl (0,1 g\cdotl^{-1}), (NH_{4})_{2}SO_{4} (5,0 g\cdotl^{-1}), CaCl_{2}\cdot2H_{2}O (15,0 mg\cdotl^{-1}). FeSO_{4}\cdot7H_{2}O (0,75 g\cdotl^{-1}) y L-tirosina (0,04 g\cdotl^{-1}). Se añadieron minerales adicionales en la forma de una solución de elementos traza (1 ml\cdotl^{-1}), que estaba compuesta de Al_{2}(SO_{4})_{3}\cdot18H_{2}O (2,0 g\cdotl^{-1}), CoSO_{4}\cdot6H_{2}O (0,7 g\cdotl^{-1}), CuSO_{4}\cdot5H_{2}O (2,5 g\cdotl^{-1}), H_{3}BO_{3} (0,5 g\cdotl^{-1}), MnCl_{2}\cdot4H_{2}O (20,0 g\cdotl^{-1}), Na_{2}MoO_{4}\cdot2H_{2}O (3,0 g\cdotl^{-1}), NiSO_{4}\cdot3H_{2}O (2,0 g\cdotl^{-1}) y ZnSO_{4}\cdot7H_{2}O (15,0 g\cdotl^{-1}). Se disolvió vitamina B1 (5,0 mg\cdotl^{-1}) en agua y se añadió, después de haber sido esterilizada por filtración, al medio después que se hubo tratado este último en autoclave, al igual que carbenicilina y/o carbenicilina y cloranfenicol en caso necesario. Se trató en autoclave separadamente glucosa (30 g\cdotl^{-1}) y se añadió asimismo al medio después que este último se hubo tratado en autoclave.
pZY557tkttal en glucosa en medio mineral. Éste estaba constituido por citrato de Na\cdot3H_{2}O (1,0 g\cdotl^{-1}), MgSO_{4}\cdot7H_{2}O (0,3 g\cdotl^{-1}), KH_{2}PO_{4} (3,0 g\cdotl^{-1}), K_{2}HPO_{4} (12,0 g\cdotl^{-1}), NaCl (0,1 g\cdotl^{-1}), (NH_{4})_{2}SO_{4} (5,0 g\cdotl^{-1}), CaCl_{2}\cdot2H_{2}O (15,0 mg\cdotl^{-1}). FeSO_{4}\cdot7H_{2}O (0,75 g\cdotl^{-1}) y L-tirosina (0,04 g\cdotl^{-1}). Se añadieron minerales adicionales en la forma de una solución de elementos traza (1 ml\cdotl^{-1}), que estaba compuesta de Al_{2}(SO_{4})_{3}\cdot18H_{2}O (2,0 g\cdotl^{-1}), CoSO_{4}\cdot6H_{2}O (0,7 g\cdotl^{-1}), CuSO_{4}\cdot5H_{2}O (2,5 g\cdotl^{-1}), H_{3}BO_{3} (0,5 g\cdotl^{-1}), MnCl_{2}\cdot4H_{2}O (20,0 g\cdotl^{-1}), Na_{2}MoO_{4}\cdot2H_{2}O (3,0 g\cdotl^{-1}), NiSO_{4}\cdot3H_{2}O (2,0 g\cdotl^{-1}) y ZnSO_{4}\cdot7H_{2}O (15,0 g\cdotl^{-1}). Se disolvió vitamina B1 (5,0 mg\cdotl^{-1}) en agua y se añadió, después de haber sido esterilizada por filtración, al medio después que se hubo tratado este último en autoclave, al igual que carbenicilina y/o carbenicilina y cloranfenicol en caso necesario. Se trató en autoclave separadamente glucosa (30 g\cdotl^{-1}) y se añadió asimismo al medio después que este último se hubo tratado en autoclave.
Para los experimentos, se inocularon matraces de
sacudidas (1000 ml, que contenían 100 ml de medio mineral) con 2 ml
de cultivo de glicerol y se incubaron a 37ºC y 150 rpm durante 72 h
en un agitador de sacudidas orbital. Después de alcanzar una
densidad óptica (620 nm) de \approx 1, las células se indujeron
por adición de 15-100 \mum de IPTG. La densidad
óptica del cultivo se midió a intervalos regulares hasta este
momento. En las condiciones arriba descritas, el organismo
hospedador E. coli AT2471 alcanzó una densidad óptica de 1,2
después de 7,25 h. El aumento en la actividad de la transcetolasa en
el mutante AT2471/pZY557tkt condujo a una reducción acusada en la
tasa de crecimiento; si bien tenía una densidad óptica idéntica al
comienzo del experimento, esta cepa alcanzó sólo una densidad óptica
de 0,49 después de 7,25 h. El efecto inhibidor del crecimiento es
atribuible probablemente a la síntesis de concentraciones
inhibidoras de compuestos intermedios metabólicos del camino
pentosa-fosfato.
El aumento en la actividad de la transaldolasa
en el mutante AT2471/pZY557tal condujo también a una reducción
acusada (casi tan acusada como en el caso de la transcetolasa) en la
tasa de crecimiento; se alcanzó una densidad óptica de 0,52 después
de 7,25 h. Fue posible alcanzar una densidad óptica de 1,1 después
de 7,25 h por aumento de la actividad de transaldolasa además de la
de la transcetolasa, como se efectuó en el caso de E. coli
AT2471/pZY557tkttal. Este resultado establece claramente que el
aumento adicional de la actividad de una transaldolasa en una cepa
que tiene una actividad incrementada de transcetolasa cancela los
efectos negativos del aumento exclusivo de la actividad de la
transcetolasa y permite un crecimiento virtualmente exento de
inhibición.
Con objeto de determinar la actividad de la
transaldolasa, las células de E. coli AT2471, AT2471/pZY557,
AT2471/
pZY557tal y AT2471/pZY557tkttal se cultivaron como se ha descrito arriba, añadiendo sin embargo ácido 3-
(morfolino)propano-sulfónico (MOPS, 16,7 g\cdotl^{-1}) al medio y reduciendo la concentración de fosfato a una décima parte de la concentración que se empleó en los experimentos de crecimiento. Con objeto de comprobar la inducción de las células, se dispusieron mezclas experimentales paralelas, una de cuyas mezclas se indujo por adición de IPTG (20 \muM) después de 7 divisiones celulares (OD \approx 1). Se retiraron 20 ml del caldo de cultivo de todas las mezclas inmediatamente antes de añadir el inductor a los matraces pertinentes y 3 h después del tiempo de inducción, y las células se sedimentaron a 6000 g durante 10 min a 4ºC.
pZY557tal y AT2471/pZY557tkttal se cultivaron como se ha descrito arriba, añadiendo sin embargo ácido 3-
(morfolino)propano-sulfónico (MOPS, 16,7 g\cdotl^{-1}) al medio y reduciendo la concentración de fosfato a una décima parte de la concentración que se empleó en los experimentos de crecimiento. Con objeto de comprobar la inducción de las células, se dispusieron mezclas experimentales paralelas, una de cuyas mezclas se indujo por adición de IPTG (20 \muM) después de 7 divisiones celulares (OD \approx 1). Se retiraron 20 ml del caldo de cultivo de todas las mezclas inmediatamente antes de añadir el inductor a los matraces pertinentes y 3 h después del tiempo de inducción, y las células se sedimentaron a 6000 g durante 10 min a 4ºC.
Las células cosechadas se lavaron en tampón de
glicilglicina 50 mM, pH 8,5, que contenía ditiotreitol 1 mM,
MgCl_{2} 10 mM y tiamina-difosfato 0,5 mM. Las
células contenidas en el sedimento se disgregaron por tratamiento
ultrasónico (Sonificador Branson 250, provisto de una microboquilla)
en un ciclo de tratamiento por ultrasonidos de 25% y a una
intensidad de 40 vatios durante 4 min por ml de suspensión de
células. Después de centrifugación a 18.000 g durante 30 min a 4ºC,
se utilizó el sobrenadante (extracto bruto) para medir la actividad
de la transaldolasa.
La actividad de la transaldolasa en el extracto
bruto se determinó utilizando un ensayo enzimático que se acopló
ópticamente para la formación de NAD. Para esto, el extracto bruto
se incubó en un volumen total de 1 ml que contenía
fructosa-6-fosfato 0,8 mM,
eritrosa-4-fosfato 4 mM y NADH 0,3
mM en tampón (glicilglicina 50 mM, pH 8,5, ditiotreitol 1 mM,
MgCl_{2} 10 mM y tiamina-difosfato 0,5 mM). El
gliceraldehído-3-fosfato resultante
se hizo reaccionar con las enzimas
triosafosfato-isomerasa (9 U) y
glicerol-3-fosfato-deshidrogenasa
(3 U), enzimas que se añadieron también, con la formación de NAD. La
oxidación de NADH se observó espectrofotométricamente a 340 nm
(\varepsilon = 6,3\cdot10^{3}
l\cdotmol^{-1}\cdotcm^{-1}), siendo la conversión de 1
\mumol de NADH equivalente al consumo de 1 \mumol de
fructosa-6-fosfato. La reposición de
1 \mumol de NADH por min se definió como 1 U.
La concentración de proteína en los extractos
brutos se determinó como ha sido descrito por Bradford (Anal.
Biochem. 72 (1976) 248-254) utilizando un reactivo
colorante disponible comercialmente. Como patrón se utilizó
seroalbúmina bovina.
La Tabla 2 muestra los resultados de las medidas
enzimáticas cuando se utilizó la cepa hospedadora E. coli
AT2471 y sus mutantes que albergan uno de los plásmidos pZY557,
pZY557tal o pZY557tkttal. En el momento de la inducción, se encontró
que la cepa hospedadora y la cepa portadora del vector pZY557 tenían
una actividad de transcetolasa de aproximadamente 0,65 U \cdot (mg
de proteína)^{-1}. Como se demuestra para E. coli
AT2471/pZY557, este valor aumentó en 3 horas, como resultado del
crecimiento fisiológico, a 0,8 U \cdot (mg de
proteína)^{-1}. Debido a la ausencia del gen tal en el
vector empleado, no era de esperar que la inducción que se realizó
en este experimento tuviera efecto
alguno.
alguno.
En mezclas experimentales paralelas, se encontró
que E. coli AT2471/pZY557tal tenía actividades de
transcetolasa de 0,53 y 0,61 U \cdot (mg de
proteína)^{-1}, respectivamente, en el momento de la
inducción. Mientras que el valor de la actividad de transaldolasa
aumentaba en 3 h a sólo 0,6 U \cdot (mg de proteína)^{-1}
cuando no se indujo el cultivo, la actividad de transaldolasa
aumentaba hasta un valor de 1,06 U \cdot (mg de
proteína)^{-1} como resultado de la inducción. En otras
mezclas experimentales, se utilizó E. coli
AT2471/pZY557tkttal en lo que eran por lo demás experimentos
idénticos; en este caso, la actividad de transaldolasa había
aumentado en las 3 primeras horas después de la inducción de las
células desde 0,8 a 1,16 U \cdot (mg de proteína)^{-1},
lo que correspondía a una duplicación de la actividad en comparación
con los experimentos correspondiente que utilizaron la cepa
hospedadora.
El medio que se empleó para los experimentos de
crecimiento se utilizó para determinar la eficiencia de la síntesis.
Los cultivos de E. coli AT2471 y AT2471/pZY557tkttal se
indujeron a una densidad óptica de 1 y el período de cultivo se
prolongó hasta 72 h. Después de 24 y 48 h, se midió el pH de los
cultivos y se llevó de nuevo al valor inicial de 7,2, en caso
requerido, por adición de KOH (45%). Adicionalmente, se tomaron
muestras (2 ml) después de 24, 48 y 72 h para determinar la densidad
óptica así como las concentraciones de glucosa y
L-fenilalanina.
La concentración de fenilalanina se determinó
por medio de cromatografía líquida de alta presión (HPLC, Hewlett
Packard, Munich, Alemania) en combinación con detección de
fluorescencia (extinción 335 nm, emisión 570 nm). Se utilizó como
fase sólida una columna
Nucleosil-120-8-C18
(250 \times 4,6 mm); la columna se eluyó utilizando un gradiente
(eluyente A: 90% ácido fosfórico 50 mM, 10% metanol, pH 2,5;
eluyente B: 20% ácido fosfórico 50 mM, 80% metanol, pH 2,5;
gradiente: 0-8 min 100% A, 8-13 min
0% A, 13-19 min 100% A). La tasa de elución se
ajustó a 1,0 ml\cdotmin^{-1}; la temperatura de la columna se
ajustó a 40ºC. Se llevó a cabo la derivatización después de la
columna utilizando dialdehído o-ftálico en un
capilar de reacción (14 m \times 0,35 mm) a la temperatura
ambiente. Se encontró que la L-fenilalanina tenía un
tiempo de retención de 6,7 min en las condiciones descritas.
La medida de la concentración de glucosa con
tiras de ensayo enzimático (Diabur, Boehringer Mannheim, Alemania)
y, dependiendo de los resultados, la adición subsiguiente de 2 ml de
una solución concentrada de glucosa (500 g\cdotl^{-1}) aseguró
que no se presentaba limitación de glucosa en las mezclas
experimentales. Después de un tiempo de incubación de 48 h, se
alcanzó un valor índice (fenilalanina) de 119 después de inducir la
cepa hospedadora E. coli AT2471; esto se compara con un
valor de fenilalanina de 100 para la cepa hospedadora no inducida.
La simple introducción del plásmido pZY557tkttal de la cepa
hospedadora daba como resultado el incremento de este valor índice,
que describe la concentración de fenilalanina, hasta 167 incluso sin
inducción de las células. Como demuestran los experimentos, la
inducción de la cepa E. coli AT2471/pZY557tkttal daba como
resultado un aumento ulterior hasta un valor de 204. Esto
correspondía a un aumento de 71% en comparación con la cepa
hospedadora
inducida.
inducida.
Este resultado demuestra el efecto positivo de
acuerdo con la invención, efecto que incrementa la síntesis de
compuestos aromáticos, del aumento adicional de la actividad de una
transcetolasa en cepas que tienen ya una actividad de transaldolasa
incrementada, o del aumento adicional de la actividad de la
transaldolasa en cepas que tienen ya una actividad incrementada de
transcetolasa.
El mutante E. coli AT2471/pZY557tal se
cultivó en un experimento que era por lo demás idéntico al descrito
en el Ejemplo 4. Después de 48 h, la inducción de la cepa dio como
resultado un valor índice (fenilalanina) de 131, que se compara
con un valor de fenilalanina de 100 para la cepa no inducida.
Este resultado demuestra claramente el efecto
positivo que ejerce el aumento de la actividad de una transaldolasa
sobre la síntesis de sustancias aromáticas, particularmente después
de inducción de acuerdo con la invención.
Se obtuvo el gen glf, como ha sido
descrito por Weisser P. et al. (J. Bacteriol. 177 (1995)
3351-54) utilizando PCR (Mullis K.B. et al.,
Meth. Enzymol. 155 (1987) 335-50). La secuencia de
nucleótidos completa de este gen está disponible (Barnell W.O. et
al., J. Bacteriol. 172 (1990) 7227-40). El Gen
glf se amplificó utilizando el plásmido pZY600 como molde
(Weisser P. et al., J. Bacteriol 177 (1995)
3351-4).
Para propósito de integración del gen glf
en genes que codifican componentes del sistema PTS de E.
coli, el plásmido pPTS1 (véase la Tabla 1) se digirió con
BglII y se trató con fragmento Klenow. El sitio de escisión
único está localizado en el gen ptsI. Se aisló el gen
glf, como un fragmento BamHI-KpnI, a partir
del plásmido pBM20glfglk y se trató análogamente con fragmento
Klenow. Se obtuvieron clones que llevaban el glf en la misma
orientación que los genes ptsHI por ligación de extremos romos. Un
fragmento PstI de 4,6 kb que llevaba la región 3' del gen
ptsH y PtsI que contenía glf y crr
integrados se obtuvo a partir del plásmido resultante pPTSglf. Este
fragmento se ligó al sitio de escisión EcoRV del vector pGP704. Dado
que este vector está disponible únicamente para replicación en cepas
\lambdapir, el vector se ha integrado en el cromosoma por
transformantes que no albergan este fago si estos transformantes son
capaces de crecer en carbenicilina. La integración se comprobó por
análisis mediante transferencia Southern (Miller V.L. et al.,
J. Bacteriol. 170 (1988) 2575-83). Los
transformantes resultantes contenían los genes PTS completos además
del gen glf.
El resto vector puede recombinarse en un segundo
cruzamiento homólogo, dando como resultado la pérdida de la
resistencia a la carbenicilina. Dado que, en este caso, los genes
pts están interrumpidos por la inserción del gen glf,
el PTS no se expresa de manera funcional en estos mutantes. Los
mutantes de PTS deseados se seleccionaron como sigue: después de
subcultivar los transformantes, que eran todavía PTS^{+}, varias
veces en medio LB sin antibióticos, partes alícuotas de la
suspensión de células se extendieron en placas LB que contenían 100
\mug\cdotl^{-1} de fosfomicina. Los mutantes PTS^{-} son
capaces de crecer en estas placas. Los clones de crecimiento se
aplicaron en bandas sobre placas LB que contenían fosfomicina o 20
\mug\cdotl^{-1} de carbenicilina. Se aisló DNA cromosómico a
partir de los clones que exhibían todavía crecimiento en las placas
de fosfomicina pero que no eran capaces de crecer en las placas de
carbenicilina. La integración del gen glf en los genes que
codifican el sistema PTS se confirmó por análisis Southern. Los
mutantes correspondientes se identificaron como fenotípicamente
deficientes en PTS. Se seleccionó un clon como el organismo
hospedador E. coli AT2471glfintPTS^{-} y se utilizó para
las transformaciones (véase arriba) con el plásmido pZY557tal.
Siguiendo las condiciones experimentales descritas para los Ejemplos
4 y 5, el mutante PTS-negativo E. coli
AT2471glfintPTS^{-}/pZY557tal, y la cepa hospedadora
correspondiente AT2471glfintPTS^{-}, se cultivaron en cada caso en
dos mezclas paralelas y las células de una mezcla se indujeron en
cada caso después de aprox. 7
divisiones.
divisiones.
La inducción reducía la eficiencia de síntesis
de la cepa hospedadora, que tenía inicialmente un valor índice de
100 sin inducción, hasta un valor de 56. Por comparación, la
inducción aumentaba el valor índice de fenilalanina desde 73 a 103,
y por consiguiente por encima del valor inicial para la cepa
hospedadora, en cultivos de la cepa transformada
AT2471glfintPTS^{-}/pZY557tal.
Este resultado demuestra que el aumento simple
de la actividad de transaldolasa tiene un efecto positivo sobre la
síntesis de fenilalanina incluso en aquellos microorganismos en los
cuales la actividad del sistema PTS está reducida, o este sistema
está completamente eliminado, y en el cual se ha integrado al mismo
tiempo un sistema de absorción de azúcares independiente de PEP.
Se obtuvo E. coli AT2471/pZY557tal como
se describe en el Ejemplo 1. Subsiguientemente, se integró en esta
cepa un gen glf en los genes que codifican los componentes
del sistema PTS de E. coli. Esta integración se llevó a cabo
como se describe en el Ejemplo 6. Utilizando las condiciones
experimentales descritas en los Ejemplos 4 y 5, se cultivaron estos
mutantes de E. coli AT2471glfintPTS^{-}/pZY557tal
PTS-negativos. Se encontró que la eficiencia
biosintética de los mutantes derivados correspondía a la de las
cepas descritas en el Ejemplo 6.
Los mutantes E. coli AT2471, E.
coli AT2471/pZY557tal y E. coli AT2471/pZY557tkttal en un
vaso de fermentación (volumen del reactor 15 l). A este fin, se
utilizaron para precultivo dos matraces de sacudidas (2000 ml) con
el medio mineral descrito en el Ejemplo 2 (250 ml). En este proceso,
la concentración de glucosa se redujo a 5,0 g\cdotl^{-1}. Los
matraces se inocularon con 2 ml de cultivo de glicerol y se
incubaron en un agitador de sacudidas orbital a 37ºC y 150 rpm hasta
que se alcanzó una densidad óptica (600 nm) de 3.
Los precultivos se utilizaron para inocular 4,5
l de medio de producción. Éste contenía MgSO_{4}\cdot7H_{2}O
(0,3 g\cdotl^{-1}), KH_{2}PO_{4} (3,0 g\cdotl^{-1}),
NaCl 0,1 (g\cdotl^{-1}), (NH_{4})_{2}SO_{4} (5,0
g\cdotl^{-1}), CaCl_{2}\cdot2H_{2}O (15,0
mg\cdotl^{-1}), FeSO_{4}\cdot7H_{2}O (0,75
g\cdotl^{-1}) y L-tirosina (0,24
g\cdotl^{-1}). Se añadieron minerales adicionales en la forma de
una solución de elementos traza (1,5 ml\cdot l^{-1}), que estaba
compuesta de Al_{2}(SO_{4})_{3}\cdot18H_{2}O
(2,0 g\cdotl^{-1}), CoSO_{4}\cdot6H_{2}O (0,7
g\cdotl^{-1}), CuSO_{4}\cdot5H_{2}O (2,5
g\cdotl^{-1}), H_{3}BO_{3} (0,5 g\cdotl^{-1}),
MnCl_{2}\cdot4H_{2}O (20,0 g\cdotl^{-1}),
Na_{2}MoO_{4}\cdot2H_{2}O (3,0 g\cdotl^{-1}),
NiSO_{4}\cdot3H_{2}O (2,0 g\cdotl^{-1}) y
ZnSO_{4}\cdot7H_{2}O (15,0 g\cdotl^{-1}). Se disolvió
vitamina B1 (75,0 mg\cdotl^{-1}) en agua y se añadió, después de
haber sido esterilizada por filtración, al medio después que se
hubo tratado este último en autoclave. Se trató glucosa (15
g\cdotl^{-1}) separadamente en autoclave y se añadió
análogamente al medio después que se hubo tratado este último en
autoclave. Por adición de NH_{4}OH (25%), se controló el valor
del pH en el medio a 7, controlándose la presión parcial de oxígeno
a un valor de 20% mediante la velocidad del agitador, el volumen de
aire alimentado y la presión en el interior del vaso de
fermentación. Por adición de una solución de glucosa (700
g\cdotl^{-1}) la concentración de glucosa en el medio de cultivo
se mantuvo en valores de aproximadamente 5 g\cdotl^{-1}.
Dependiendo del tiempo de fermentación, se añadió
L-tirosina a la solución de fermentación en
concentraciones variables a fin de evitar la limitación de
L-tirosina.
En los experimentos en que se efectuó la
inducción de las células, esto se hizo de acuerdo con la invención
después de 6 horas por adición de 50 \muM de IPTG. Después de un
tiempo de incubación de 36 horas, se alcanzó un valor índice
(fenilalanina) de 120 por introducción simple del plásmido
pZY557tal; esto se compara con un valor (fenilalanina) de 100 para
la cepa hospedadora no inducida E. coli AT2471. Por medio de
inducción de acuerdo con la invención, este valor pudo elevarse
ulteriormente hasta 153. Por introducción del plásmido pZY557tkttal
solo y aumentando así la actividad de transcetolasa además de la
actividad de transaldolasa, pudo alcanzarse un valor índice
(fenilalanina) de 130 comparado con la cepa hospedadora. Los
experimentos demostraron adicionalmente que la inducción de la cepa
de E. coli AT2471/pZY557kttal permitía un aumento ulterior en
el valor índice (fenilalanina) a 250. Esto corresponde a un aumento
de 92% comparado con la cepa no inducida.
Este resultado demuestra que incluso en
experimentos realizados en vasos de fermentación puede conseguirse
un aumento en la síntesis de compuestos aromáticos de acuerdo con la
invención por aumento de la actividad de transaldolasa así como por
aumento de la actividad de transcetolasa en cepas que tienen ya una
actividad incrementada de transaldolasa.
Cepas y plásmidos | Genotipo/características | Fuente de referencia |
E. coli AT2471 | tyrA4, relA1, spoT1, thi-1 | Taylor y Trotter, Bacteroil. Rev. 13 (1967) |
332-53 | ||
E. coli SY327 | araD, \Delta(lac-pro), Rif^{r}, recA56, fago \lambda | Miller et al, J. Bacteriol. 170 (1988) 2675-83 |
función pir | ||
E. coli CC118 | \Delta(ara-leu), araD, \DeltalacX74, galE, galk, | Manoil et al., Proc. Natl. Sci. USA 82 (1985) |
phoA20, thi-Acad, rpsE, rpoB, argE | 8129-33 | |
(Am), recA1, lisógeno \lambda pir | ||
pZY507 | Cm^{r} | Weisser et al., J. Bacteriol 177 (1995) 3351-4 |
pZY507 glfglk | genes glf y glk de Z. mobilis en p-ZY607 | Weisser., J. Bacteriol 177 (1995) 3351-4 |
pZY557 | pZY507, sitio de donación múltiple de | Sprenger, no publicado |
PU Cbm20, Cm^{r} | ||
pZY557tkttal | genes tktA y talB de E coli en pZY557 | Esta solicitud de patente |
Cepas y plásmidos | Genotipo/características | Fuente de referencia |
pACYC184 | Cm^{r}, Tet^{r} | Chang y Cohen, J. Bactetiol 134 (1978) |
1141-1156 | ||
pDIA3206 | Ap^{r} inserción de 11,5 kb del cromosoma | DeReuse et al., J. Becteriol. 170 3827-37 (1988) |
de E. coli K12 que incluye los genes | ||
ptsHI-crr | ||
pPTS1 | pACYC184 que contiene un fragmento | Jahreis, universidad de Osnabruck. |
ClaI de 4 kb que contiene los genes | no publicado | |
ptsHI y crr de pDIA3206: Cm^{r} | ||
pGP704 | Amp^{r} | Milter et al., J. Bacteriol. 170 (1988) 2576-83 |
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
Microorganismo | Tiempo después de la | Actividad de transaldolasa/U\cdot(mg de proteína)^{-1} | |
inducción/h | |||
Sin inducción | Con inducción | ||
E. coli AT2471/ | 0 | 0,64 | |
E. coli AT2471/pZY557 | 0 | 0,65 | |
3 | 0,80 | ||
E. coli AT2471/pZY557tal | 0 | 0,53 | 0,61 |
3 | 0,06 | 1,06 | |
E. coli AT2471/pZY557tkttal | 0 | 0,70 | 0,80 |
3 | 0,45 | 0,16 |
Claims (37)
1. Proceso para la preparación microbiana en un
micro-organismo de sustancias del metabolismo
aromático, siendo las sustancias productos secundarios de compuestos
intermedios del camino pentosa-fosfato, que
comprende los pasos de
- (i)
- aumentar la actividad de un transaldolasa en el micro-organismo productor de dichas sustancias, y
- (ii)
- producir una de dichas sustancias en dicho micro-organismo,
con la condición de que dicho
micro-organismo no es uno que, antes del aumento de
dicha actividad de una transaldolasa, se haya seleccionado como una
cepa con un sistema de fosfotransferasa eliminado (cepa pts^{-})
procedente de cepas que albergaban previamente un sistema de
fosfotransferasa (cepas
pts^{+}).
2. Proceso de acuerdo con la reivindicación 1,
caracterizado porque se preparan sustancias del metabolismo
aromático en cuya síntesis está implicado al menos un compuesto
intermedio del camino pensosa-fosfato.
3. Proceso de acuerdo con la reivindicación 2,
caracterizado porque el compuesto intermedio es
eritrosa-4-fosfato (Ery4P).
4. Proceso de acuerdo con la reivindicación 1 ó
3, caracterizado porque la transaldolasa es una transaldolasa
de Escherichia coli.
5. Proceso de acuerdo con una de las
reivindicaciones 1 a 4, caracterizado porque la transaldolasa
es transaldolasa B (TalB) de Escherichia coli.
6. Proceso de acuerdo con una de las
reivindicaciones 1 a 5, caracterizado porque en el paso (1)
se incrementa adicionalmente la actividad de una transcetolasa en el
micro-organismo productor de dichas sustancias.
7. Proceso de acuerdo con la reivindicación 6,
caracterizado porque la transcetolasa es una transcetolasa de
Escherichia coli.
8. Proceso de acuerdo con una de las
reivindicaciones 6 ó 7, caracterizado porque la transcetolasa
es transcetolasa A (TktA) de Escherichia coli.
9. Proceso de acuerdo con una de las
reivindicaciones 1 a 8, caracterizado porque en el paso (i)
la actividad de un sistema de absorción de azúcares dependiente de
PEP, en caso de estar presente, se reduce o se elimina, y
caracterizado además porque, adicionalmente, la actividad de
una proteína de transporte para la absorción independiente de PEP de
un azúcar se incrementa en el micro-organismo
productor de dichas sustancias.
10. Proceso de acuerdo con una de las
reivindicaciones 1 a 8, caracterizado porque en el paso (i)
la actividad de un sistema de absorción de azúcares dependiente de
PEP, en caso de estar presente, se reduce o se elimina, y
caracterizado además porque, adicionalmente, la actividad de
una quinasa que fosforila un azúcar que es absorbido en una forma no
fosforilada en el micro-organismo se incrementa en
el micro-organismo productor de dichas
sustancias.
sustancias.
11. Proceso de acuerdo con una de las
reivindicaciones 1 a 8, caracterizado porque en el paso (i)
la actividad de un sistema de absorción de azúcares dependiente de
PEP, en caso de estar presente, se reduce o se elimina, y
caracterizado además porque, adicionalmente, la actividad de
una proteína de transporte para la absorción independiente de PEP
de un azúcar y la actividad de una quinasa que fosforila dicho
azúcar se incrementa en el micro-organismo productor
de dichas sustancias.
12. Proceso de acuerdo con la reivindicación 9 ó
11, caracterizado porque la proteína transportadora es un
facilitador.
13. Proceso de acuerdo con la reivindicación 12,
caracterizado porque el facilitador es la proteína
facilitadora de glucosa (Glf) de Zymomonas mobilis.
14. Proceso de acuerdo con una cualquiera de las
reivindicaciones 10 ó 11, caracterizado porque la quinasa es
una quinasa fosforilante de hexosas.
15. Proceso de acuerdo con la reivindicación 14,
caracterizado porque la quinasa se deriva de Zymomonas
mobilis.
16. Proceso de acuerdo con la reivindicación 15,
caracterizado porque la quinasa es glucoquinasa (Glk) de
Zymomonas mobilis.
\newpage
17. Proceso de acuerdo con una de las
reivindicaciones 1 a 16, caracterizado porque en el paso (i)
la actividad de al menos uno de los siguientes componentes, a saber
transaldolasa, transcetolasa, proteína de transporte y quinasa, se
incrementa en el micro-organismo productor de dichas
sustancias:
- a)
- por introducción de los genes,
- b)
- y/o por aumento del número de copias de gen,
- c)
- y/o por aumento de la expresión génica,
- d)
- y/o por aumento de la actividad endógena de dichas enzimas,
- e)
- y/o por alteración de la estructura de las enzimas,
- f)
- y/o por utilización de enzimas desreguladas,
- g)
- y/o por inserción de genes que codifican enzimas desreguladas.
18. Proceso de acuerdo con la reivindicación 17,
caracterizado porque el aumento en la actividad se consigue
por integración del gen o los genes en una estructura génica o en
varias estructuras génicas, introduciéndose el gen o los genes en la
estructura génica como una sola o más copias o en número de copias
incrementado.
19. Proceso de acuerdo con una de las
reivindicaciones 1 a 18, caracterizado porque se emplea un
micro-organismo en el cual una o más enzimas, que
están implicadas adicionalmente en la síntesis de las sustancias,
están desreguladas y/o exhiben actividad incrementada.
20. Proceso de acuerdo con las reivindicaciones
1 a 19, caracterizado porque la sustancia que se prepara es
un aminoácido aromático.
21. Proceso de acuerdo con la reivindicación 20,
caracterizado porque el aminoácido aromático es
L-fenilalanina.
22. Proceso de acuerdo con una de las
reivindicaciones 1 a 21, caracterizado porque el
micro-organismo empleado pertenece a los géneros
Escherichia, Serratia, Bacillus, Corynebacterium o
Brevibacterium.
23. Proceso de acuerdo con la reivindicación 22,
caracterizado porque el micro-organismo es
Escherichia coli.
24. Estructura génica que contiene, en forma
recombinante,
- a)
- un gen que codifica una transaldolasa o un gen que codifica una transcetolasa, y
- b)
- al menos un gen que codifica una proteína de transporte para la absorción independiente de PEP de un azúcar o que codifica una quinasa fosforilante de hexosas.
25. Estructura génica de acuerdo con la
reivindicación 24, caracterizada porque el gen para la
proteína de transporte codifica un facilitador y el gen para la
quinasa codifica una quinasa fosforilante de hexosas.
26. Estructura génica de acuerdo con la
reivindicación 24 ó 25, caracterizada porque los genes para
la transaldolasa y la transcetolasa se derivan de Escherichia
coli y los genes para la proteína de transporte y la quinasa se
derivan de Zymomonas mobilis.
27. Estructura génica de acuerdo con las
reivindicaciones 24 a 26, caracterizada porque el gen para la
transaldolasa de Escherichia coli es talB y el gen
para la transcetolasa de Escherichia coli es tktA, y
el gen para la proteína de transporte de Zymomonas mobilis
es glf y el gen para la quinasa de Zymomonas mobilis
es glk.
28. Estructura génica de acuerdo con una de las
reivindicaciones 24 a 27, caracterizada porque la estructura
génica contiene al menos una secuencia génica reguladora que está
asignada a uno de los genes.
29. Estructura génica de acuerdo con la
reivindicación 28, caracterizada porque al menos uno de los
genes en la estructura génica está incorporado de tal modo que el
mismo se encuentra bajo el control de un promotor inducible.
30. Célula transformada, que alberga, en forma
replicable, una estructura génica de acuerdo con las
reivindicaciones 24 a 29.
31. Célula transformada de acuerdo con la
reivindicación 30, caracterizada porque, en la célula, una o
más enzimas que están implicadas adicionalmente en la síntesis de
las sustancias del metabolismo aromático, que son productos
secundarios de compuestos intermedios del camino
pentosa-fosfato, están desreguladas y/o exhiben
actividad incrementada.
32. Célula transformada de acuerdo con la
reivindicación 30 ó 31, caracterizada porque la célula es una
célula de Escherichia coli.
33. Célula transformada de acuerdo con las
reivindicaciones 30 a 32, caracterizada porque la actividad
del sistema de absorción de azúcares dependiente de PEP, si está
presente este sistema, está reducida o eliminada.
34. Célula transformada de acuerdo con una de
las reivindicaciones 30 a 33, caracterizada porque la misma
es capaz de producir un aminoácido aromático.
35. Célula transformada de acuerdo con la
reivindicación 34, caracterizada porque el aminoácido
aromático es L-fenilalanina.
36. Proceso para la preparación microbiana de
sustancias del metabolismo aromático, siendo dichas sustancias
productos secundarios de compuestos intermedios del camino
pentosa-fosfato, de acuerdo con una de las
reivindicaciones 1 a 23, caracterizado porque se cultivan
células transformadas de acuerdo con una de las reivindicaciones 30
a 35, en las cuales existe una estructura génica de acuerdo con la
reivindicación 29, en el cual durante el cultivo, se efectúa una
inducción lo antes posible después de 2 divisiones celulares, de tal
modo que se obtienen células transformadas que contienen compuestos
intermedios del camino pentosa-fosfato en
disponibilidad incrementada.
37. Proceso de acuerdo con la reivindicación
36, caracterizado porque la célula transformada, además de
contener compuestos intermedios del camino
pentosa-fosfato en disponibilidad incrementada,
contiene también otros metabolitos del metabolismo central en
disponibilidad incrementada.
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