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CN107723275A - 通用型car‑t细胞及其制备方法和应用 - Google Patents

通用型car‑t细胞及其制备方法和应用 Download PDF

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Abstract

本发明属于免疫治疗领域，涉及通用型CAR‑T细胞及其制备方法和应用。本发明的通用型CAR‑T细胞中经过多基因敲除同时抑制了T细胞抗原受体(TCR)和主要组织相容性复合体(MHC Ⅰ,MHC Ⅱ)在T细胞中的功能；编码所述TCR的基因包括TRAC和/或TRBC；编码所述主要组织相容性复合体的基因包括HLA‑A，B2MH和CIITA。本发明的通用型CAR‑T细胞能够靶向特异的肿瘤相关标志并且细胞表面TCR和MHC功能失活，可以降低同种异体细胞治疗引起的免疫排斥反应并且安全有效的清除病人体内的肿瘤细胞，且在使用中不受病人自身病情或治疗方式影响，可以随时制备，在最佳的时机给予治疗，确保治疗的有效性。

Description

通用型CAR-T细胞及其制备方法和应用
技术领域
本发明属于免疫治疗领域，涉及通用型CAR-T细胞及其制备方法和应用，具体涉及一种通用型T细胞和通用型CAR-T细胞及其制备方法和在药物中的应用。
背景技术
过继细胞治疗(adoptive cell therapy，ACT)是生物治疗技术的一种，对自体免疫细胞(主要是T细胞)进行体外扩增，然后将其回输给肿瘤患者以达到治疗目的的方法，被认为是继手术、放、化疗后的第4种治疗方式，在临床治疗中受到广泛应用。
嵌合抗原受体又称CAR，是模拟TCR功能的人工受体。肿瘤细胞表面的抗原(受体)与嵌合抗原受体的抗体(配体)结合时，通过铰链区和跨膜区将信号传递至胞内，胞内信号域再将信号转化为活化信号，激活效应细胞，效应细胞通过分泌穿孔素或者产生细胞因子杀伤肿瘤细胞，同时效应细胞本身也发生扩增，进一步扩大免疫杀伤作用。
近年来随着嵌合抗原受体(CAR)修饰的T细胞在血液病肿瘤治疗上的显著效果，过继细胞治疗的需求不断升高。但是目前过继细胞治疗还是基于自体细胞的回输治疗方式，这种方式在步骤上需要抽取病人一定量的外周血，之后再进行外周血单个核细胞分离，T淋巴细胞分离，进一步对分离的T淋巴细胞进行修饰改造以及体外增殖，修饰的T细胞增殖到一定数目再回输回病人体内才能起到一定的治疗效果。但是大部分病人尤其是肿瘤病人在进行CAR-T细胞过继治疗前均进行过其他方式的治疗，例如：化疗，放射性治疗，这就导致获得的T淋巴细胞较少，甚至由于药物的作用很多病人的T细胞在体外扩增困难并且病人自身来源的T细胞还可能出现功能衰减或缺失，并且对于T细胞基因改造的难度加大并且治疗效果和安全性不易控制，这些障碍均影响着CAT-T细胞治疗和肿瘤临床治疗的应用推广和发展。
同种异体细胞是指属于相同物种但在遗传上有所差异个体的细胞；虽然能够利用健康人外周血分离的T淋巴细胞较多，CAR感染阳性率高并且活力和功能优于病人来源T淋巴细胞的优势进行同种异体细胞治疗，但是同种异体细胞治疗仍然面临诸多障碍：由于供受体之间存在免疫遗传学差异，一方面，具有免疫活性的供体的T淋巴细胞在进入受体病人体内并增殖到一定程度后，将受体病人的正常细胞或组织误认为靶标进行攻击从而产生移植物抗宿主反应(GVHD)，另一方面，作为异体细胞受体体内的正常免疫系统也可能会对其进行清除产生宿主抗移植物反应(HVGR)从而影响治疗效果。针对HVGR临床上主要在治疗前应用免疫抑制类药物抑制受体免疫系统活性，但是在过继细胞治疗时免疫抑制类药物会影响回输细胞的疗效；针对GVHD医学上主要通过HLA配型来进行预防，但是HLA配型成功概率低耗时长而且费用高昂。
因此需要开发一种可以降低同种异体细胞治疗引起的免疫排斥反应并安全有效的通用型CAR-T细胞。
发明内容
有鉴于此，本发明的目的在于提供一种通用型CAR-T细胞，本发明的通用型CAR-T细胞能够靶向特异的肿瘤相关标志并且细胞表面TCR和MHC功能失活，可以降低同种异体细胞治疗引起的免疫排斥反应并且安全有效的清除病人体内的肿瘤细胞。
为实现上述目的，本发明的技术方案为：
通用型CAR-T细胞，所述通用型CAR-T细胞中经过多基因敲除同时抑制了T细胞抗原受体(TCR)和主要组织相容性复合体(MHCⅠ,MHCⅡ)在T细胞中的功能；编码所述TCR的基因包括TRAC和/或TRBC；编码所述主要组织相容性复合体的基因包括HLA-A，B2M和CIITA。
自体细胞的CAR-T治疗需要抽取血液分离病人自身T淋巴细胞制备，一方面由于病人自身病情以及T淋巴细胞状态不同CAR-T生产过程影响因素较多不能标准化生产影响安全性，另一方面有些病人自体T淋巴细胞经过化疗后活性和数量不足，或受到肿瘤环境影响导致T淋巴细胞活性和增殖能力受限，这样的细胞在制备CAR-T时往往难度较大，治疗的安全性和有效性受到影响；或者在CAR-T细胞制备过程中若出现突发状况已准备细胞不能及时回输给病人也会影响治疗效果，甚至于受到自体T淋巴细胞状态影响有些肿瘤患者不能接受自体的CAR-T细胞过继治疗；可用于同种异体治疗的通用型CAR-T或通用型T淋巴细胞治疗的研发技术就显得迫在眉睫。
我们同时敲除基因TRAC，B2M和CIITA或TRAC、HLA-A和CIITA基因，TCR和MHC一、二类分子(主要组织相容性复合体)功能全部失活，获得的通用型CAR-T安全性高，另一方面考虑到体内NK细胞通过MHCI来识别“自体和非自体”并对识别的“非自体”进行攻击，导致病人的NK细胞会识别通用型CAR-T并对其清除，这样该通用型CAR-T在病人体内存活时间短效果差，所以我们进行了改进：同时表达HLA-E或HLA-F可以与NK细胞表面的分子识别，让NK细胞认为该细胞为“自体”细胞不进行攻击。
进一步，所述通用型CAR-T细胞中敲除包括TRAC，B2M和CIITA基因的同时还表达HLA-E或HLA-F。
宿主抗移植物反应(host versus graft reaction,HVGR)与移植物抗宿主反应(graft versus host reaction,GVHR)是除细胞因子释放综合征(Cytokine releasesyndrome,CRS)等以外CAR-T治疗存在的最大难题之一，HVGR与GVHR相关基因包含TCR、MHC一、二类分子(主要组织相容性复合体MHCⅠ、MHCⅡ)相关基因，单个TRAC基因是编码TCRa链的基因与编码TCRβ的两个TRBC基因形成完整的有功能的TCR复合物，敲除TRAC是可以达到致使TCR失活的最优方案，B2M和CIITA分别为MHCⅠ、MHCⅡ相关基因，以上三个基因同时敲除的T淋巴细胞在回输入同种异体病人时不会引起移植物抗宿主病(GVHD)。
但是利用上述构建的通用型CAR-T细胞进行试验时发明人发现：该通用型CAR-T细胞会很快被异体的NK细胞清除，存活时间短。可能是因为B2M干扰后会引起MHCI类家族所有基因的完全失活，虽然这样能够更完全消除GVHD但是MHCI类分子的表达又是NK细胞识别“自体细胞”的关键分子，MHCI类分子完全失活会导致NK细胞将回输细胞认为“异体”对回输细胞进行清除，影响通用型CAR-T细胞针对肿瘤的有效性。
在感染CAR的同时共表达MHCI类亚型中在人类基因组中保守的基因如HLA-E或
HLA-F，再利用CRISPR/Cas9敲除TRAC、B2M和CIITA基因，让通用型CAR-T细胞重新“贴上自体标签”，以达到在减弱GVDH的同时又不引起NK细胞的攻击的目的。
作为一种优选，所述通用型CAR-T细胞中敲除TRAC，B2M和CIITA基因的同时还表达HLA-E或HLA-F。
作为一种优选，所述通用型CAR-T细胞中敲除TRAC，B2M和CIITA基因的同时还表达HLA-E。
申请人团队之前进行过不同健康供者的血液的HLA分型检测，HLA是具有高度多态性的同种异体抗原，受控于人类主要组织相容性复合体(MHC)的基因簇，HLA等同于前述MHC分子；发现所检测样本中HLA-A主要集中在8种分型中，8种分型分别为分别为A*02，A*11，A*24，A*30，A*33，A*03，A*01和A*26，对这8种分型进行PCR扩增获得PCR片段进行gRNA设计时又发现其中7种分型可在同一区域设计gRNA，进一步发明人团队利用生物信息技术通过大数据分析不同HLA-A转录本比例发现该8种基因分型在包含90％以上中国人中频率最高。8种频率最高的分型gRNA设计区域基因序列如SEQ ID NO:4，gRNA序列如SEQ ID NO:8-12。
HLA-A基因敲除可以引起HLA功能失活但是对于人类保守的HLA-E，HLA-F功能并不影响(人类保守的HLA分子在所有人类中表型均一致)，选择HLA-A基因替换B2M基因，敲除TRAC、HLA-A和CIITA从而达到既不引起GVHD又不会引起NK特异识别的通用型CAR-T细胞。
进一步，所述通用型CAR-T细胞中敲除TRAC、HLA-A或B2M、CIITA基因。
本发明的目的之二在于提供一种所述通用型CAR-T细胞的制备方法，包括以下步骤：
1)得到活化的T细胞；
2)用编码靶向不同肿瘤相关分子的CAR或CAR与HLA-E或HLA-F共表达的慢病毒载体来转染步骤1)的T细胞，获得靶向不同肿瘤相关分子的CAR-T细胞；
3)将步骤2)获得的CAR-T细胞通过TALEN或锌指方法或CRISPR/Cas9系统的方法进行包括TRAC、HLA-A和CIITA或者TRAC、B2M和CIITA的多基因敲除获得通用型CAR-T细胞。
所述的通用型CAR-T细胞能够靶向特异的肿瘤相关标志并且细胞表面TCR和MHC功能失活，制备方法需要逾越两个技术障碍，一是在T淋巴细胞内同时实现多基因敲除与多基因表达的可行性；二是获得的通用型CAR-T或T淋巴细胞是否能够安全有效的针对特异靶点的肿瘤细胞。
多基因敲除的研究，基本是在T淋巴细胞上完成的，在CAR-T上进行多基因敲除既要完成基因敲除又要实现CAR-T的表达在技术上实现较为困难；一般的基因敲除方法是，利用病毒载体多次感染带有要敲除的目的基因的sgRNA的CRISPR/Cas9载体和CAR载体，并且因多次病毒感染细胞活性降低，而多基因敲除导致载体过大利用病毒或者转染试剂转染效率极低，只能用电转才能实现转染载体的目的，但是申请人发现经过电转的细胞状态较差需要经过一定的恢复期而T淋巴细胞不能在体外长期增值存活(即便使用活化试剂刺激在体外生存时间一般也是最多在2-3周)电转之后再进行CAR的感染效率低并且细胞活性差；
因此，申请人优化感染条件在T细胞活化24小时后先进行CAR感染制备CAR-T细胞，24小时培养后再进行电转，转染带有要敲除的目的基因的sgRNA的CRISPR/Cas9载体，构建通用型CAR-T细胞。该方法敲除效率高，获得的通用型CAR-T细胞异体回输安全性高，感染CAR阳性率稳定具有很好的杀伤活性和特异性。
为了达到治疗的目的，过继转输或者同种异体回输所用的CAR-T或T淋巴细胞(T细胞)均为外周血分离的T细胞制备，但是外周血分离的T细胞是已经成熟的T细胞在体外保持增殖和有效功能时间有限，所以经过基因修饰的通用型细胞需要在体外快速扩增到病人治疗所需数目后回输给病人，发明人通过大量实验摸索，结合病毒感染和电转的方式获得了最优的构建通用型CAR-T或T细胞的方法：1)利用病毒感染的方式进行多基因表达；2)利用CRISPR/Cas9技术进行多基因干扰。但是目前普遍采用的病毒感染表达基因对于单基因感染技术较为成熟，多基因感染往往感染效率不高，并且同时涉及到多基因敲除，CRISPR/Cas9技术虽然可以实现目标基因的稳定敲除，但是多基因干扰采用病毒感染的方式敲除效率低，利用电转的方式对细胞活性影响大并且最佳的电转条件需要大量摸索实验。
步骤2)中先利用含有编码针对特异性肿瘤靶点的CAR和共表达HLA-E或HLA-F的病毒感染T淋巴细胞获得CAR-T细胞，再进一步进行多基因敲除。
进一步，步骤2)中所述CAR识别的靶标分子包括CD19，PSCA，CD123，CD20，CEA(癌胚抗原)，FAP，CD133，EGFR，EGFRVIII，BCMA，PSMA，Her2，CA125，EphA2，C-met，L1CAM，VEGFR，CS1，ROR1，EC，NY-ESO-1，MUC1，MUC16，mesothelin，LewisY，GPC3，GD2，EPG，DLL3，CD99，5T4，CD22，CD30，CD33，CD138，CD171中的一种。
进一步，步骤3)中多基因敲除的方法为CRISPR/Cas9系统的方法。
进一步，所述CRISPR/Cas9系统由gRNA和Cas9核酸酶或内切酶组成。
进一步，通过CRISPR/Cas9系统进行多基因敲除优选电转转染方式，将要敲除的多基因的gRNA构建在同一载体，利用电转的方式转染进行基因敲除。
进一步，靶向B2M，HLA-A，CIITA和TRAC基因的gRNA序列如SEQ ID NO:5-19所示。
进一步，靶向TRAC、B2M和CIITA或者HLA-A，CIITA和TRAC基因的gRNA序列构建在载体PX330A。
表达的HLA-E基因序列为SEQ ID NO:33，蛋白序列为SEQ ID NO:34；表达的HLA-F基因序列为SEQ ID NO:32。
如何选择敲除方式达到转染效率高细胞存活率高这是一个难题。申请人通过多次试验发现多次转染以达到多基因敲除的方法会严重影响细胞活性，申请人设计靶向B2M，CIITA和TRAC或者HLA-A，CIITA和TRAC三种基因的gRNA构建在同一载体，利用电转的方式转染进行基因敲除。在未有更有效的提示技术下，申请人通过大量实验摸索电转条件的优化：在进行电转时所用电转Buffer、电压、脉冲大小以及电击次数的不同都会影响着细胞存活率和电转效率。
作为一种优选，293T细胞进行GFP的转染，电转条件为PBMC或T细胞活化48小时后电压1000V，脉宽为35ms电击次数两次进行电转，细胞总量2×105，电转后用新鲜含IL-2的培养基培养。
本发明的目的之三在于提供一种上述制备方法中所得的CRISPR/Cas9基因敲除的表达载体，所述表达载体包含如SEQ ID NO:26-31所示的基因序列。
本发明的目的还在于提供一种所述通用型CAR-T细胞在异体治疗的药物中的应用。
在所述的方法下得到所述的通用型细胞，可以获得靶向特异性肿瘤并且细胞表面TCR和MHC一、二类分子同时失活的通用型CAR-T细胞，或者细胞表面TCR和MHC一、二类分子同时失活的通用型T淋巴细胞，应用于肿瘤治疗可以提高CAR-T细胞清除肿瘤的安全性和有效性。
本发明的目的还在于提供一种所述通用型CAR-T细胞在用于制备针对恶性肿瘤或感染性疾病的药物中的应用。
进一步，所述恶性肿瘤或感染性疾病的细胞或组织能够表达包括CD19，PSCA，CD123，CD20，CEA(癌胚抗原)，FAP，CD133，EGFR，EGFRVIII，BCMA，PSMA，Her2，CA125，EphA2，C-met，L1CAM，VEGFR，CS1，ROR1，EC，NY-ESO-1，MUC1，MUC16，mesothelin，LewisY，GPC3，GD2，EPG，DLL3，CD99，5T4，CD22，CD30，CD33，CD138，CD171中的一种。所述通用型CAR-T包含UCAR-19和UCAR-PSCA。
进一步，所述恶性肿瘤或感染性疾病包括：血液系统肿瘤、实体瘤、异体移植所引起的免疫排斥反应以及自身免疫性疾病如过敏反应或者系统性红斑狼疮。
本发明的目的还在于提供一种用于同种异体治疗药物中的通用型T细胞，所述通用型T细胞中同时抑制了T细胞抗原受体(TCR)和主要组织相容性复合体(MHCⅠ,MHCⅡ)在T细胞中的功能并且表达识别恶性肿瘤或者感染细胞的嵌合抗原受体。
进一步，编码所述TCR的基因包括TRAC和/或TRBC；编码所述主要组织相容性复合体的基因包括HLA，B2MH和CIITA。
进一步，所述通用型CAR-T细胞中同时敲除了TRAC、HLA-A和CIITA基因或同时敲除TRAC，B2M和CIITA基因还表达HLA-E或HLA-F。
该通用型T细胞可以用于同种异体治疗。
本发明的目的还在于提供一种上述的通用型T细胞在用于制备针对恶性肿瘤或感染性疾病的药物中的应用。
进一步，所述恶性肿瘤或感染性疾病包括：血液系统肿瘤、实体瘤、异体移植所引起的免疫排斥反应以及自身免疫性疾病如过敏反应或者系统性红斑狼疮。
申请人在与HVGR和GVHR相关的基因中，通过基因编辑技术设计不同的研究方案对健康供着的T淋巴细胞进行基因编辑改造，最终获得排斥反应低在病人体内长期存活并且安全性高的同种异体通用T细胞，通用型T细胞的获得使得同种异体细胞治疗获得更广泛的应用空间促进细胞治疗的标准化生产；申请人进一步利用通用型的T淋巴细胞成功进行CAR-T改造获得同种异体通用型CAR-T细胞，让CAR-T治疗的安全性和有效性进一步提升。
总的来说，本发明所述的通用型T细胞和通用型CAR-T细胞可以通过同种异体回输的方式应用于恶性肿瘤或感染性疾病的治疗，并且排斥反应低在病人体内可以长期存活安全性高，促进了大部分病人尤其是肿瘤病人经过化疗，放射性治疗导致自体T细胞较少甚至由于病情T胞功能衰减或缺失进而影响细胞治疗的治疗效果和安全性问题的解决，为CAR-T细胞治疗的推广和发展提供帮助。
本发明的有益效果在于：
1)本发明提供的制备通用型CAR-T细胞的方法能够获得CAR表达率高TCR和MHC同时失活的通用型CAR-T细胞，所述通用型CAR-T细胞应用于恶性肿瘤或感染性疾病的治疗排斥反应低并且在病人体内有效性安全性高。
2)本发明提供的通用型CAR-T细胞应用于异体的过继细胞治疗不受病人自身病情或治疗方式影响通用型CAR-T细胞的制备，可以随时制备所需通用型CAR-T，在最佳的时机给予病人进行治疗，确保治疗的有效性。
3)本发明提供的通用型T细胞能够应用于同种异体回输的免疫治疗的T细胞，所述通用型T细胞便于程序化制备异体回输后排斥反应小。
附图说明
图1为中国人群HLA-A分型频率检测结果。
图2为利用CRISPR/Cas9系统敲除TCR和MHC一、二类分子相关基因载体设计。
图3为设计的gRNA靶向位点检测。
图4为CRISPR/Cas9系统敲除后CAR-T细胞表面B2M，CIITA和TRAC表达检测。
图5为CAR表达检测。
图6为CRISPR/Cas9系统敲除后CAR-T细胞TCR和MHC一、二类分子同时失活效率以及分选后获得三阴性CAR-T表型检测。
图7为CRISPR/Cas9脱靶检测。
图8为三阴性CAR-T细胞对异体NK细胞反应性检测。
图9为通用型CAR-T HLA-E表达检测。
图10为通用型CAR-T杀伤肿瘤细胞能力检测。
图11为通用型CAR-T细胞异体NK反应性检测。
具体实施方式
以下将参照附图，对本发明的优选实施例进行详细描述。优选实施例中未注明具体条件的实验方法，通常按照常规条件，例如分子克隆实验指南(第三版，J.萨姆布鲁克等著)中所述的条件，或按照制造厂商所建议的条件。所举实施例是为了更好地对本发明的内容进行说明，但并不是本发明的内容仅限于所举实施例。所以熟悉本领域的技术人员根据上述发明内容对实施方案进行非本质的改进和调整，仍属于本发明的保护范围。
实施例1、中国人群HLA-A分型频率检测
1.SBT(Sequenced Based Typing)检测：
该方法属于HLA高分辨率分型技术。
EDTA抗凝管(血常规管)抽取受检者静脉血4ml，4°冷藏暂存，-20°长期冻存。然后送华大进行HLA分型检测。
2.生物信息学方法：参考Boegel,Sebastian,Valesca et al.(2013)
利用seq2HLA软件，直接从RNA-Seq测序的原始数据(fastq格式)中计算该样本的HLA高分辨率分型(MHC-I和MHC-II，4位)及相应的表达值和p值。
实验结果如图1所示获得8种中国人频率最高的8种HLA-A分型，分别为A*02，A*11A*24，A*30，A*33，A*03，A*01和A*26，分别针对这8种亚型设计gRNA分子，gRNA序列如SEQID NO:8-12。
实施例2、敲除TCR和MHC一、二类分子相关基因载体构建
1.sgRNA分子设计：
确认与TCR和MHC一、二类分子相关的基因：B2M、CIITA以及TRAC基因与TCR和MHC一、二类分子相关的基因功能密切相关确认敲除B2M、CIITA以及TRAC基因。在NCBI分别获得B2M、CIITA以及TRAC基因序列号获得CDS序列，B2M序列号AH002619.2，CIITA在NCBI基因ID：4261，TRAC在NCBI基因ID：28755，如SEQ ID NO：1-3所示。分别针对CDS区的确定靶向的SEQID NO：1-3区域设计gRNA，gRNA序列如表1。
表1：gRNA序列
2.构建CRISPR/Cas9基因敲除的表达载体
设计如下引物，并将其由南京金斯瑞生物科技公司合成，具体引物如下：
引物sg-B2M-3-up：5’-CACCGGCCGAGATGTCTCGCTCCG-3’；SEQ ID NO:20；
引物sg-B2M-3-down：5’-AAACCGGAGCGAGACATCTCGGCC-3’；SEQ ID NO:21；
引物sg-CIITA2-up：5’-CACCGATATTGGCATAAGCCTCCC-3’；SEQ ID NO:22；
引物sg-CIITA2-down：5’-AAACGGGAGGCTTATGCCAATATC-3’；SEQ ID NO:23；
引物sg-TRAC-1-up：5’-CACCAGAGTCTCTCAGCTGGTACA-3’；SEQ ID NO:24；
引物sg-TRAC-1-down：5’-AAACTGTACCAGCTGAGAGACTCT-3’；SEQ ID NO:25。
然后以上述所示序列为引物，将两条上下游引物退火成三条双链的gRNA序列，反应体系按Annealing Buffer for DNA Oligos(5X)(购自碧云天公司)说明书加样。
用限制性内切酶BbsI(购自NEB公司)分别酶切PX330A-1X3,PX330S-2，PX330S-3(均购自Addgene Plasmid)，酶切反应按说明书进行。酶切产物经琼脂糖凝胶电泳分离后进行DNA片段回收，然后分别将对应退火后的引物片段和纯化后载体片段通过T4连接酶(购自Promega公司)进行连接，获得只带一个gRNA的表达载体。大肠杆菌表达后用质粒抽提试剂盒(Invitrogen公司)抽提质粒，具体方法见说明书。
3.参照Golden gate cloning技术，用限制性内切酶BsaI(购自NEB公司)分别酶切上述构建的只带一个gRNA的表达载体。利用快速连接酶Quick LigationTMKit(购自NEB)进行连接反应，按照说明书加样。用X-gal和IPTG(均购自生工生物工程股份有限公司)进行蓝白斑筛选得到六个包含三个不同gRNA表达框的组合载体：
PX330A-1X3-B2M-3-CIITA2-TRAC-1，PX330-A-1X3-B2M-3-TRAC-1-CIITA2，
PX330A-1X3-CIITA2-B2M-3-TRAC-1，PX330A-1X3-CIITA2-TRAC-1-B2M-3，
PX330A-1X3-TRAC-1-B2M-3-CIITA2，PX330A-1X3-TRAC-1-CIITA2-B2M-3；大肠杆菌表达后用质粒抽提试剂盒(Invitrogen公司)抽提质粒，具体方法见说明书。载体图谱及PCR结果如图2所示。
4.检测构建的载体是否正确
将步骤3中获得的载体分别转染感受态利用小抽质粒PCR验证序列正确性，具体步骤见分子克隆实验指南(第三版，J.萨姆布鲁克等著)，实验结果见图2可见有三条带并且进行测序结果正确。
实施例3、通用型CAR-T细胞构建以及表型检测
1.电转条件确认
在不同的条件下利用293T细胞进行GFP的转染进行电转条件的优化确认较好的电转条件后进一步进行PBMC转染，实验结果见表2，表3，优选的电转条件为PBMC或T细胞活化48小时后电压1000V，脉宽为35ms电击次数两次进行电转，细胞总量2×105，电转后用新鲜含IL-2的培养基培养。
表2：不同电转条件下转染293T细胞转染效率以及细胞活性比较
序号 效率％ 存活率％ 电压/V 脉宽/ms 电击次数
1 0 100 0 1 1
2 83.1 35.7 1400 20 1
3 89.8 27.9 1500 20 1
4 91.8 21.2 1600 20 1
5 85.4 11.8 1700 20 1
6 60.6 23.2 1100 30 1
7 80.3 27.8 1200 30 1
8 83.9 23.9 1300 30 1
9 90 14.7 1400 30 1
10 48.2 34.8 1000 40 1
11 73.7 22.4 1100 40 1
12 87.4 15.6 1200 40 1
13 65.3 28.6 1100 20 2
14 83.6 22.8 1200 20 2
15 82.6 20.8 1300 20 2
16 94 12.8 1400 20 2
17 20.3 42.1 850 30 2
18 47.3 42.8 950 30 2
19 77.3 32.7 1050 30 2
20 90.6 23.6 1000 30 2
21 78.2 26.3 1300 10 3
22 87.8 23.8 1400 10 3
23 92.3 14.6 1500 10 3
24 89.7 8.9 1600 10 3
表3：PBMC和T淋巴细胞电转条件优化结果
2.包含CAR载体的慢病毒感染T淋巴细胞进行CAR-T细胞制备
1)人外周血单核细胞的分离
用加有抗凝剂的采血管采集外周血约60ml，分装于50ml离心管各30ml，加入7.5ml羟乙基淀粉稀释；室温(18～25℃)自然沉降约30min，收集上层血浆，离心15min；然后用生理盐水重悬沉淀，按体积比为1:1加到淋巴细胞分离液上，梯度离心，离心20min；离心后，取第二层白色淋巴细胞层，并用生理盐水洗涤2次，生理盐水重悬细胞，加入含有10％FBS的RPMI 1640完全培养基培养，得人外周血单核细胞。
2)慢病毒载体感染T淋巴细胞
用含10％FBS的RPMI 1640完全培养基培养新制备的单个核细胞PBMC，抗CD3单克隆抗体活化后进行慢病毒感染；分别加入含有靶向CD19或PSCA的CAR基因和/或编码HLA-E表达基因的慢病毒载体，未感染的外周血淋巴细胞(PBMC)作为空白对照；24小时后收集细胞计数制备通用型CAR-T细胞，24孔板铺板每孔2×105细胞，电转条件电压1000V，电脉冲35ms，电击两次完成电转。具体步骤采用Transfection System详见Transfection System操作说明书。
3.CAR-T细胞表型检测：
以靶向CD19和PSCA为例，利用优选的电转条件：电压1000V，脉宽为35ms电击次数两次进行电转，将含有靶向B2M、CIITA以及TRAC基因的gRNA的CRISPR/Cas9表达载体电转进(2)中靶向CD19或PSCA的CAR-T细胞获得通用型pUCAR-19和pUCAR-PSCA细胞，对培养至10天的已感染包含CAR病毒并通过电转利用CRISPR/Cas9系统敲除TCR和MHC一、二类分子相关基因的T细胞，300g/min，离心5min，弃尽上清以收集细胞；将细胞调整密度为1×106个/ml；将收集的细胞分别分装利用流式细胞术检测Protein-L阳性率以检测通用型CAR-T细胞CAR表达阳性率，PBS清洗2次洗去多余未结合Protein-L抗体后标记HLA-DR，B2M，CIITA，HLA-E以及CD3抗体检测TCR和MHC一、二类分子的表达。检测结果如图4所示，经过修饰的T淋巴细胞存在有30％左右比例的表面B2M，CIITA以及TRAC分子均不表达，如图5所示有43.6％的CAR表达，发明所采用的方法同时敲除3个基因效率高并且不影响CAR表达。
分选B2M，CIITA以及TRAC分子三阴性并且CAR阳性表达的pUCAR-CD19或pUCAR-PSCA细胞，如图6所示为获得的pUCAR-CD19细胞。
分选B2M，CIITA以及TRAC分子三阴性并且CAR和HLA-E阳性表达的pUCAR-CD19细胞，三阴性并共表达CAR和HLA-E的细胞为改进的通用型CAR-T细胞用pUCAR-019HLA-E+表示，如图7所示为HLA-E的表达。
4.gRNA靶向性检测
进一步将步骤3中获得的通用型CAR-T细胞细胞用QIAamp DNA Blood Mini Kit购于Qiagen公司(货号511004)基因组抽提试剂盒抽提基因组。按试剂盒说明书操作，RT-PCR并测序方式验证设计的gRNA靶向的区域，结果见图3，字体加粗或者缺码的区域即为研发人员所设计gRNA所靶向区域，结果显示研究人员所设计的gRNA可以对应的靶向B2M、CIITA以及TRAC基因的目标区域致使B2M、CIITA以及TRAC基因失活，其中—为缺失；+为插入；M为突变。
实施例4、CRISPR/cas9敲除B2M、CIITA以及TRAC脱靶检测
1.将gRNA在设计网站比对，找出预测人全基因组上的脱靶位点，具体基因位点如表4。(http://crispr.mit.edu)
2.在NCBI网站找出脱靶位点所在基因位置。(http://blast.ncbi.nlm.nih.gov)
3.设计相应基因位点PCR引物，进行PCR，连接T载体并测序。
4.根据测序结果分析是否发生脱靶。
表4：预测人全基因组上的脱靶位点
脱靶检测结果如图8所示，off-target-analysis结果均为0/6或0/5，表明分别针对B2M、CIITA以及TRAC设计的gRNA经过多次重复试验均未出现脱靶现象，申请所提及的gRNA序列特异性高稳定性好，在体内更安全。
实施例5、通用型CAR-T细胞抗肿瘤效果验证
1.以PSCA高表达Hela细胞和PSCA不表达的T24细胞作为靶细胞检测构建的通用型CAR-T细胞针对PSCA靶点的有效性和特异性，pUCAR-PSCA作为效应细胞按照1:1效靶比铺板效应细胞，验证pUCAR-PSCA的杀伤效果。杀伤实验通过ACEA xCELLigence RTCA MP仪器完成，实验步骤依据仪器说明书进行；第一天将靶细胞(表达PSCA的肿瘤细胞)以2-5*10^4每孔铺板于仪器配备的96孔板中，附着于孔底的肿瘤细胞以电阻指数为数据每15分钟记录一次，24小时后依据预先设计的效靶比每孔铺入相应的CAR-T细胞，CAR-T细胞铺入后每隔15分钟记录一次电阻指数，通过电阻指数判断贴壁的靶细胞的增殖或者死亡情况，见图9，细胞基数为1当Y轴数字大于1是证明肿瘤细胞增殖了，当Y轴数字小于1时表明肿瘤细胞被杀伤，X轴T-B-C、B-T-C、T-C-B分别表示在PSCA-CAR-T细胞分别转染PX330A-1X3-TRAC-1-B2M-3-CIITA2、PX330-A-1X3-B2M-3-TRAC-1-CIITA2、以及PX330A-1X3-TRAC-1-CIITA2-B2M-3载体的通用型pUCAR-PSCA细胞，PSCA组为未转染敲除系统只感染了CAR的自体CAR-T细胞，Medium为正常培养的肿瘤细胞，PBMC组为未感染CAR也未转染敲除载体的T淋巴细胞，杀伤结果如图9所示：在24小时时通用型CAR-T展现了显著的杀伤作用，尤其是B-T-C(PX330-A-1X3-B2M-3-TRAC-1-CIITA2)组展现了高的杀伤活性和特异性。
2.以稳定表达萤火虫荧光素酶的CD19阳性Raji细胞(简称为Raji-luc)作为靶细胞，UCAR-19作为效应细胞按照1:1效靶比铺效应细胞，验证pUCAR-019的杀伤结果。其中1表示CAR-019细胞感染PX330-A-1X3-B2M-3-TRAC-1-CIITA2的pUCAR-019-1细胞，2表示CAR-019细胞感染PX330A-1X3-TRAC-1-CIITA2-B2M-3的pUCAR-019-2细胞；使用Luciferase Assay System(Promega Cat.#E2520)试剂盒提供的标准方法检测杀伤效果，杀伤率用下列公式计算：
细胞杀伤率＝(1-效应细胞靶细胞共培养孔荧光强度/单独靶细胞孔荧光强度)×100％
杀伤结果如图10所示，1即pUCAR-019-1组的细胞展现了高的杀伤活性。
实施例6、通用型CAR-T细胞对异体NK细胞反应性检测
1.根据细胞的大小和生长速度将适量同种异体T淋巴细胞或者pUCAR-19细胞接种到96孔细胞培养板中，使待检测时细胞密度不超过80-90％满。
2.吸去培养液，用PBS液洗涤一次。换新鲜培养液。将NK-92细胞依据效靶比1:1比例分别与PBMC或pUCAR-19混合继续按常规培养。共培养24小时前1小时从细胞培养箱里取出细胞培养板，在“样品最大酶活性对照孔”中加入试剂盒提供的LDH释放试剂，加入量为原有培养液体积的10％。加入LDH释放试剂后，反复吹打数次混匀，然后继续在细胞培养箱中孵育。
3.共培养24小时后，将细胞培养板用多孔板离心机400g离心5min。分别取各孔的上清液120μl，加入到一新的96孔板相应孔中，随即进行样品测定。
其中pUCAR-019表示敲除B2M、CIITA和TRAC并靶向CD19的三阴性CAR细胞，pUCAR-019HLA-E+表示敲除B2M、CIITA和TRAC的CAR-T细胞共表达HLA-E。
具体测定方式参考：碧云天的乳酸脱氢酶细胞毒性检测试剂盒(LDHCytotoxicity Assay Kit)，产品编号C0017。
实验结果如图11所示：LDH细胞毒性检测中B2M被敲除后NK细胞对其有明显杀伤，敲除B2M(HLA-I类分子通用亚基)后，保守型HLA-I类分子无法表达，即无法保护其免受NK细胞介导的细胞毒性。未敲除组(PBMC)与表达HLA-E的通用型CAR-T细胞组杀伤基本一致，HLA-E的表达可以弥补保守型HLA-I类分子的功能，抑制NK细胞活化降低对通用型CAR-T细胞的杀伤。表5中列出了细胞毒性检测各细胞的裂解率。
表5：NK细胞介导的细胞毒性裂解异体免疫细胞裂解率
细胞类型 细胞裂解率24h(％) 细胞裂解率48h(％) 重复次数
PBMC 38.95873525 63.3938706 2
pUCAR-019HLA-E+ 39.08128334 57.8858351 2
pUCAR-019 51.00717304 81.0123622 2
最后说明的是，以上实施例仅用以说明本发明的技术方案而非限制，尽管参照较佳实施例对本发明进行了详细说明，本领域的普通技术人员应当理解，可以对本发明的技术方案进行修改或者等同替换，而不脱离本发明技术方案的宗旨和范围，其均应涵盖在本发明的权利要求范围当中。
说 明 书 序 列 表
<110> 重庆精准生物技术有限公司
<120> 通用型CAR-T细胞及其制备方法和应用
<160> 34
<170> PatentIn version 3.3
<210> 1
<211> 449
<212> DNA
<213> Artificial
<220>
<223> B2M-PCR
<400> 1
ccttgtcctg attggctggg cacgcgttta atataagtgg aggcgtcgcg ctggcgggca 60
ttcctgaagc tgacagcatt cgggccgaga tgtctcgctc cgtggcctta gctgtgctcg 120
cgctactctc tctttctggc ctggaggcta tccagcgtga gtctctccta ccctcccgct 180
ctggtccttc ctctcccgct ctgcaccctc tgtggccctc gctgtgctct ctcgctccgt 240
gacttccctt ctccaagttc tccttggtgg cccgccgtgg ggctagtcca gggctggatc 300
tcggggaagc ggcggggtgg cctgggagtg gggaaggggg tgcgcacccg ggacgcgcgc 360
tacttgcccc tttcggcggg gagcagggga gacctttggc ctacggcgac gggagggtcg 420
ggacaaagtt tagggcgtcg ataagcgtc 449
<210> 2
<211> 275
<212>DNA
<213> Artificial
<220>
<223>CIITA2-PCR
<400> 2
caccagccct ctttccagaa atttccttct tcatccaagg gacttttcct cccagaaccc 60
gacacagaca ccatcaactg cgaccagttc agcaggctgt tgtgtgacat ggaaggtgat 120
gaagagacca gggaggctta tgccaatatc ggtgaggaag cacctgagcc cagaaaagga 180
caatcaaggg caagagttct ttgctgccac ttgtcaatat cacccattca tcatgagcca 240
cgtcagtccc ctcccacaga aatcattgca agggg 275
<210> 3
<211>229
<212> DNA
<213> Artificial
<220>
<223> TRAC-PCR
<400> 3
accctgatcc tcttgtccca cagatatcca gaaccctgac cctgccgtgt accagctgag 60
agactctaaa tccagtgaca agtctgtctg cctattcacc gattttgatt ctcaaacaaa 120
tgtgtcacaa agtaaggatt ctgatgtgta tatcacagac aaaactgtgc tagacatgag 180
gtctatggac ttcaagagca acagtgctgt ggcctggagc aacaaatct 229
<210>4
<211> 78
<212>DNA
<213> Artificial
<220>
<223> HLA-A
<400>4
agcaaagtgc gcacccatcc gccgggcctg cgctttagcc cggatgcgga agatggccgc 60
catggcgcgc cgaacccg 78
<210>5
<211>20
<212>RNA
<213> sg-B2M-1
<220>
<223>
<400> 5
cgcgagcaca gctaaggcca 20
<210> 6
<211> 20
<212> RNA
<213>
<220>
<223> sg-B2M-2
<400>6
gagtagcgcg agcacagcta 20
<211> 7
<212> RNA
<213> 20
<220>
<223> sg-B2M-3
<400> 7
ggccgagatg tctcgctccg 20
<210>8
<211> 20
<212> RNA
<213>
<220>
<223> sg-HLA-A1
<400> 8
tgacggccat cctcggcgtc 20
<210> 9
<211>20
<212> RNA
<213>
<220>
<223> sg-HLA-A2
<400> 9
gacgccgagg atggccgtca 20
<210>10
<211> 20
<212> RNA
<213>
<220>
<223> sg-HLA-A3
<400> 10
gacggccatc ctcggcgtct 20
<210> 11
<211>20
<212> RNA
<213> Artificial
<220>
<223> sg-HLA-A11-1
<400> 11
cgccatgacg gccatcctcg 20
< 210 >12
<211>20
<212> RNA
<213> Artificial
<220>
<223> sg-HLA-A11-2
<400>12
gcgccatgac ggccatcctc 20
<210> 13
<211>20
<212> RNA
<213> Artificial
<220>
<223> sg-CIITA-1
<400> 13
gctgaactgg tcgcagttga 20
<210> 14
<211>20
<212> RNA
<213> Artificial
<220>
<223> sg-CIITA-2
<400>14
gatattggca taagcctccc 20
<210>15
<211> 20
<212>RNA
<213> Artificial
<220>
<223> sg-CIITA-3
<400> 15
gtcaactgcg accagttcag c 21
<210>16
<211>20
<212> RNA
<213> Artificial
<220>
<223> sg-CIITA-C1
<400>16
ttcctacaca atgcgttgcc 20
<210>17
<211>20
<212> RNA
<213> Artificial
<220>
<223> sg-CIITA-C2
<400>17
agccaggcaa cgcattgtgt 20
<210>18
<211>20
<212>RNA
<213> Artificial
<220>
<223> sg-TRAC-1
<400>18
agagtctctc agctggtaca 20
<210> 19
<211>20
<212>RNA
<213> Artificial
<220>
<223> sg-TRAC-2
<400> 19
tgtgctagac atgaggtcta 20
<210>20
<211> 24
<212> DNA
<213> Artificial
<220>
<223> sg-B2M-3-up引物
<400> 20
caccggccga gatgtctcgc tccg 24
<210>21
<211> 24
<212> DNA
<213> Artificial
<220>
<223> sg-B2M-3-down引物
<400> 21
aaaccggagc gagacatctc ggcc 24
<210>22
<211> 24
<212> DNA
<213> Artificial
<220>
<223> sg-CIITA2-up引物
<400> 22
caccgatatt ggcataagcc tccc 24
<210>23
<211> 24
<212> DNA
<213> Artificial
<220>
<223>sg-CIITA2-down引物
<400> 23
aaacgggagg cttatgccaa tatc 24
<210>24
<211> 24
<212> DNA
<213> Artificial
<220>
<223>sg-TRAC-1-up引物
<400> 24
caccagagtc tctcagctgg taca 24
<210>25
<211> 24
<212> DNA
<213> Artificial
<220>
<223>sg-TRAC-1-down引物
<400> 25
aaactgtacc agctgagaga ctct 24
<210>26
<211> 1381
<212> DNA
<213> Artificial
<220>
<223> PX330A-1X3-B2M-3-CIITA2-TRAC-1
<400> 26
gccttttgct ggccttttgc tcacatgtga gggcctattt cccatgattc cttcatattt 60
gcatatacga tacaaggctg ttagagagat aattggaatt aatttgactg taaacacaaa 120
gatattagta caaaatacgt gacgtagaaa gtaataattt cttgggtagt ttgcagtttt 180
aaaattatgt tttaaaatgg actatcatat gcttaccgta acttgaaagt atttcgattt 240
cttggcttta tatatcttgt ggaaaggacg aaacaccggc cgagatgtct cgctccggtt 300
ttagagctag aaatagcaag ttaaaataag gctagtccgt tatcaacttg aaaaagtggc 360
accgagtcgg tgcttttttg ttttagagct agaaatagca agttaaaata aggctagtcc 420
gtttttagcg cgtgcgccaa ttctgcagac aaatggctct agaggcatgt gagggcctat 480
ttcccatgat tccttcatat ttgcatatac gatacaaggc tgttagagag ataattggaa 540
ttaatttgac tgtaaacaca aagatattag tacaaaatac gtgacgtaga aagtaataat 600
ttcttgggta gtttgcagtt ttaaaattat gttttaaaat ggactatcat atgcttaccg 660
taacttgaaa gtatttcgat ttcttggctt tatatatctt gtggaaagga cgaaacaccg 720
atattggcat aagcctcccg ttttagagct agaaatagca agttaaaata aggctagtcc 780
gttatcaact tgaaaaagtg gcaccgagtc ggtgcttttt tgttttagag ctagaaatag 840
caagttaaaa taaggctagt ccgtttttag cgcgtgcgcc aattctgcag acaaatggct 900
ctagaggcat gtgagggcct atttcccatg attccttcat atttgcatat acgatacaag 960
gctgttagag agataattgg aattaatttg actgtaaaca caaagatatt agtacaaaat 1020
acgtgacgta gaaagtaata atttcttggg tagtttgcag ttttaaaatt atgttttaaa 1080
atggactatc atatgcttac cgtaacttga aagtatttcg atttcttggc tttatatatc 1140
ttgtggaaag gacgaaacac cagagtctct cagctggtac agttttagag ctagaaatag 1200
caagttaaaa taaggctagt ccgttatcaa cttgaaaaag tggcaccgag tcggtgcttt 1260
tttgttttag agctagaaat agcaagttaa aataaggcta gtccgttttt agcgcgtgcg 1320
ccaattctgc agacaaatgg ctctagaggt acccgttaca taacttacgg taaatggccc 1380
g 1381
<210>27
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<212> DNA
<213> Artificial
<220>
<223> PX330-A-1X3-B2M-3-TRAC-1-CIITA2
<400> 27
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gcatatacga tacaaggctg ttagagagat aattggaatt aatttgactg taaacacaaa 120
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<211> 1373
<212> DNA
<213> Artificial
<220>
<223> PX330A-1X3-CIITA2-B2M-3-TRAC-1
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<210>29
<211> 1373
<212> DNA
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<220>
<223> PX330A-1X3-CIITA2-TRAC-1-B2M-3
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caagttaaaa taaggctagt ccgtttttag cgcgtgcgcc aattctgcag acaaatggct 900
ctagaggcat gtgagggcct atttcccatg attccttcat atttgcatat acgatacaag 960
gctgttagag agataattgg aattaatttg actgtaaaca caaagatatt agtacaaaat 1020
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<223> PX330A-1X3-TRAC-1-CIITA2-B2M-3
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atattggcat aagcctcccg ttttagagct agaaatagca agttaaaata aggctagtcc 780
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<210>32
<211> 1329
<212> DNA
<213> Artificial
<220>
<223> HLA-F
<400> 32
atggcgcccc gaagcctcct cctgctgctc tcaggggccc tggccctgac cgatacttgg 60
gcgggctccc actccttgag gtatttcagc accgctgtgt cgcggcccgg ccgcggggag 120
ccccgctaca tcgccgtgga gtacgtagac gacacgcaat tcctgcggtt cgacagcgac 180
gccgcgattc cgaggatgga gccgcgggag ccgtgggtgg agcaagaggg gccgcagtat 240
tgggagtgga ccacagggta cgccaaggcc aacgcacaga ctgaccgagt ggccctgagg 300
aacctgctcc gccgctacaa ccagagcgag gctgggtctc acaccctcca gggaatgaat 360
ggctgcgaca tggggcccga cggacgcctc ctccgcgggt atcaccagca cgcgtacgac 420
ggcaaggatt acatctccct gaacgaggac ctgcgctcct ggaccgcggc ggacaccgtg 480
gctcagatca cccagcgctt ctatgaggca gaggaatatg cagaggagtt caggacctac 540
ctggagggcg agtgcctgga gttgctccgc agatacttgg agaatgggaa ggagacgcta 600
cagcgcgcag atcctccaaa ggcacacgtt gcccaccacc ccatctctga ccatgaggcc 660
accctgaggt gctgggccct gggcttctac cctgcggaga tcacgctgac ctggcagcgg 720
gatggggagg aacagaccca ggacacagag cttgtggaga ccaggcctgc aggggatgga 780
accttccaga agtgggccgc tgtggtggtg cctcctggag aggaacagag atacacatgc 840
catgtgcagc acgaggggct gccccagccc ctcatcctga gatgggagca gtctccccag 900
cccaccatcc ccatcgtggg catcgttgct ggccttgttg tccttggagc tgtggtcact 960
ggagctgtgg tcgctgctgt gatgtggagg aagaagagct cagatagaaa cagagggagc 1020
tactctcagg ctgcagccta ctcagtggtc agcggaaact tgatgataac atggtggtca 1080
agcttatttc tcctgggggt gctcttccaa ggatatttgg gctgcctccg gagtcacagt 1140
gtcttgggcc gccggaaggt gggtgacatg tggatcttgt tttttttgtg gctgtggaca 1200
tctttcaaca ctgccttctt ggccttgcaa agccttcgct ttggcttcgg ctttaggagg 1260
ggcaggagct tccttcttcg ttcttggcac catcttatga aaagggtcca gattaagatt 1320
tttgactga 1329
<210>33
<211> 1077
<212> DNA
<213> Artificial
<220>
<223> HLA-E
<400> 33
atggtagatg gaaccctcct tttactcctc tcggaggccc tggcccttac ccagacctgg 60
gcgggctccc actccttgaa gtatttccac acttccgtgt cccggcccgg ccgcggggag 120
ccccgcttca tctctgtggg ctacgtggac gacacccagt tcgtgcgctt cgacaacgac 180
gccgcgagtc cgaggatggt gccgcgggcg ccgtggatgg agcaggaggg gtcagagtat 240
tgggaccggg agacacggag cgccagggac accgcacaga ttttccgagt gaacctgcgg 300
acgctgcgcg gctactacaa tcagagcgag gccgggtctc acaccctgca gtggatgcat 360
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catgtgcagc atgaggggct acccgagccc gtcaccctga gatggaagcc ggcttcccag 900
cccaccatcc ccatcgtggg catcattgct ggcctggttc tccttggatc tgtggtctct 960
ggagctgtgg ttgctgctgt gatatggagg aagaagagct caggtggaaa aggagggagc 1020
tactctaagg ctgagtggag cgacagtgcc caggggtctg agtctcacag cttgtaa 1077
<210>34
<211> 358
<212> Protein
<213> Artificial
<220>
<223> HLA-E
<400> 34
Met Val Asp Gly Thr Leu Leu Leu Leu Leu Ser Glu Ala Leu Ala
5 10 15
Leu Thr Gln Thr Trp Ala Gly Ser His Ser Leu Lys Tyr Phe His
20 25 30
Thr Ser Val Ser Arg Pro Gly Arg Gly Glu Pro Arg Phe Ile Ser
35 40 45
Val Gly Tyr Val Asp Asp Thr Gln Phe Val Arg Phe Asp Asn Asp
50 55 60
Ala Ala Ser Pro Arg Met Val Pro Arg Ala Pro Trp Met Glu Gln
65 70 75
Glu Gly Ser Glu Tyr Trp Asp Arg Glu Thr Arg Ser Ala Arg Asp
80 85 90
Thr Ala Gln Ile Phe Arg Val Asn Leu Arg Thr Leu Arg Gly Tyr
95 100 105
Tyr Asn Gln Ser Glu Ala Gly Ser His Thr Leu Gln Trp Met His
110 115 120
Gly Cys Glu Leu Gly Pro Asp Arg Arg Phe Leu Arg Gly Tyr Glu
125 130 135
Gln Phe Ala Tyr Asp Gly Lys Asp Tyr Leu Thr Leu Asn Glu Asp
140 145 150
Leu Arg Ser Trp Thr Ala Val Asp Thr Ala Ala Gln Ile Ser Glu
155 160 165
Gln Lys Ser Asn Asp Ala Ser Glu Ala Glu His Gln Arg Ala Tyr
170 175 180
Leu Glu Asp Thr Cys Val Glu Trp Leu His Lys Tyr Leu Glu Lys
185 190 195
Gly Lys Glu Thr Leu Leu His Leu Glu Pro Pro Lys Thr His Val
200 205 210
Thr His His Pro Ile Ser Asp His Glu Ala Thr Leu Arg Cys Trp
215 220 225
Ala Leu Gly Phe Tyr Pro Ala Glu Ile Thr Leu Thr Trp Gln Gln
230 235 240
Asp Gly Glu Gly His Thr Gln Asp Thr Glu Leu Val Glu Thr Arg
245 250 255
Pro Ala Gly Asp Gly Thr Phe Gln Lys Trp Ala Ala Val Val Val
260 265 270
Pro Ser Gly Glu Glu Gln Arg Tyr Thr Cys His Val Gln His Glu
275 280 285
Gly Leu Pro Glu Pro Val Thr Leu Arg Trp Lys Pro Ala Ser Gln
290 295 300
Pro Thr Ile Pro Ile Val Gly Ile Ile Ala Gly Leu Val Leu Leu
305 310 315
Gly Ser Val Val Ser Gly Ala Val Val Ala Ala Val Ile Trp Arg
320 325 330
Lys Lys Ser Ser Gly Gly Lys Gly Gly Ser Tyr Ser Lys Ala Glu
335 340 345
Trp Ser Asp Ser Ala Gln Gly Ser Glu Ser His Ser Leu
350 355

Claims (20)

1.通用型CAR-T细胞，其特征在于，所述通用型CAR-T细胞中经过多基因敲除同时抑制了T细胞抗原受体(TCR)和主要组织相容性复合体(MHCⅠ,MHCⅡ)在T细胞中的功能；编码所述TCR的基因包括TRAC和/或TRBC；编码所述主要组织相容性复合体的基因包括HLA-A，B2MH和CIITA。
2.根据权利要求1所述的通用型CAR-T细胞，其特征在于，所述通用型CAR-T细胞中敲除包括TRAC，B2M和CIITA基因的同时还表达HLA-E或HLA-F。
3.根据权利要求1所述的通用型CAR-T细胞，其特征在于，所述通用型CAR-T细胞中敲除包括TRAC、HLA-A或B2M、CIITA基因。
4.权利要求1-3任一项所述通用型CAR-T细胞的制备方法，其特征在于，包括以下步骤：
1)得到活化的T细胞；
2)用编码靶向不同肿瘤相关分子的CAR或CAR与HLA-E或HLA-F共表达的慢病毒载体来转染步骤1)的T细胞，获得靶向不同肿瘤相关分子的CAR-T细胞；
3)将步骤2)获得的CAR-T细胞通过TALEN或锌指方法或CRISPR/Cas9系统的方法进行包括TRAC、HLA-A和CIITA或者TRAC、B2M和CIITA的多基因敲除获得通用型CAR-T细胞。
5.根据权利要求4所述的制备方法，其特征在于，步骤2)中所述CAR识别的靶标分子包括CD19，PSCA，CD123，CD20，CEA(癌胚抗原)，FAP，CD133，EGFR，EGFRVIII，BCMA，PSMA，Her2，CA125，EphA2，C-met，L1CAM，VEGFR，CS1，ROR1，EC，NY-ESO-1，MUC1，MUC16，mesothelin，LewisY，GPC3，GD2，EPG，DLL3，CD99，5T4，CD22，CD30，CD33，CD138，CD171中的一种。
6.根据权利要求4所述的制备方法，其特征在于，步骤3)中多基因敲除的方法为CRISPR/Cas9系统的方法。
7.根据权利要求6所述的制备方法，其特征在于，所述CRISPR/Cas9系统由gRNA和Cas9核酸酶或内切酶组成。
8.根据权利要求7所述的制备方法，其特征在于，通过CRISPR/Cas9系统进行多基因敲除优选电转转染方式，将要敲除的多基因的gRNA构建在同一载体，利用电转的方式转染进行基因敲除。
9.根据权利要求8所述的制备方法，其特征在于，靶向B2M，HLA-A，CIITA和TRAC基因的gRNA序列如SEQ ID NO:5-19所示。
10.根据权利要求9所述的制备方法，其特征在于，靶向TRAC、B2M和CIITA或者HLA-A，CIITA和TRAC基因的gRNA序列构建在载体PX330A。
11.权利要求4的制备方法中所得的CRISPR/Cas9基因敲除的表达载体，其特征在于，所述表达载体包含如SEQ ID NO:26-31所示基因序列。
12.所述通用型CAR-T细胞在异体治疗的药物中的应用。
13.所述通用型CAR-T细胞在用于制备针对恶性肿瘤或感染性疾病的药物中的应用。
14.根据权利要求13所述的应用，其特征在于，所述恶性肿瘤或感染性疾病的细胞或组织能够表达包括CD19，PSCA，CD123，CD20，CEA(癌胚抗原)，FAP，CD133，EGFR，EGFRVIII，BCMA，PSMA，Her2，CA125，EphA2，C-met，L1CAM，VEGFR，CS1，ROR1，EC，NY-ESO-1，MUC1，MUC16，mesothelin，LewisY，GPC3，GD2，EPG，DLL3，CD99，5T4，CD22，CD30，CD33，CD138，CD171中的一种。
15.根据权利要求13所述的应用，其特征在于，所述恶性肿瘤或感染性疾病包括：血液系统肿瘤、实体瘤、异体移植所引起的免疫排斥反应以及自身免疫性疾病如过敏反应或者系统性红斑狼疮。
16.用于同种异体治疗药物中的通用型T细胞，其特征在于，所述通用型T细胞中同时抑制了T细胞抗原受体(TCR)和主要组织相容性复合体(MHCⅠ,MHCⅡ)在T细胞中的功能。
17.根据权利要求16所述的通用型T细胞，其特征在于，编码所述TCR的基因包括TRAC和/或TRBC；编码所述主要组织相容性复合体的基因包括HLA，B2MH和CIITA。
18.根据权利要求16所述的通用型T细胞，其特征在于，所述通用型T细胞中同时敲除了TRAC、HLA-A和CIITA基因或TRAC，B2M和CIITA基因的同时还表达HLA-E或HLA-F。
19.权利要求16-18任一项所述的通用型T细胞在用于制备针对恶性肿瘤或感染性疾病的药物中的应用。
20.根据权利要求19所述的应用，其特征在于，所述恶性肿瘤或感染性疾病包括：血液系统肿瘤、实体瘤、异体移植所引起的免疫排斥反应以及自身免疫性疾病如过敏反应或者系统性红斑狼疮。
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