CN107614674A - 检查系统、检查装置以及检查方法 - Google Patents
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Abstract
从待测物以光学方式取得多个生物体试样的特征量,将特征量与关于同一待测物的事先的检查信息进行比较,基于比较结果算出指标,该指标判定继续进行供于生物体试样的基因分析的处理、还是从同一待测物进行试样再调整。由此在单一细胞解析或少数的细胞集团的分析中实现抑制分析费用、分析时间、劳力的同时,适当地选择检查试样而确保妥当性,从而能够实现可靠性更高的生物标记检测。
Description
技术领域
本发明涉及生物体试样的检查。特别是涉及包括基因解析、细胞功能解析等在内的生物组织的解析、以及疾病的诊断、药物开发等。
背景技术
蛋白质或mRNA的种类、其量、或基因组基因的变异等的生物标记是表征个体、组织的重要指标。例如,在癌症的诊断中,诊断的主流是由病理医生进行的细胞观察,而利用这些生物标记的显著特征在于:能够提供客观的指标,检测出在以往的图像诊断中无法检测到的细微的变化,例如仅靠细胞图像无法判别的蛋白质分子、核酸分子的局部变化。
特别是,对于也被称为基因组药物开发的、近年来的目标分子特异性的医药品的效果判定、用量确定而言,使用这些生物标记的诊断是重要的。通过以这些生物标记作为指标,可期待能够提供更适合患者个人的医疗,回避不必要的治疗而进行医疗费的削减。生物标记的高灵敏度检测对于早期诊断、检测待测物间的微小的差异是有用的,面向医疗、产业用途的生物标记检测技术的高灵敏度化是重要的。
另一方面,如果从细胞生物学的观点考虑个体、组织,则组织、个体是分化状态、细胞种类的构成不同的、具有多样性的细胞的集合体。例如,血液细胞包含红血球、淋巴球、T细胞等多样的细胞种类,进一步,作为免疫细胞的T细胞各自具有不同的抗原应答性。此外,如果以肿瘤组织为例,则已知癌组织是正常细胞和癌化细胞的集合,在各个癌细胞中基因组异常的状态也不是一样的,其存在多样性。也就是说,从待测物采集试样作为某观察对象时,这些试样是具有多样性的细胞的集合体,此外,这些具有多样性的细胞的构成、状态会根据进行采集的部位、时间而不同。
作为基因表达信息的解析方法,可根据目的使用定量PCR法、微阵列法、或利用超平行测序仪的碱基序列解析等各种技术。然而,尽管基因检测的技术不同,但共通的是,在使用这些以往方法的试样间的比较中,没有考虑到构成试样的细胞的多样性,而是通过从试验对象试样检测到的基因表达量的值、即构成试验对象的细胞集团所具有的平均值进行比较解析,从而进行特征量的提取。在进行分析的试样中作为目标的细胞种类的比例充分高的情况下,用以往方法也能够提取特征量,但在作为目标的细胞的比例低的情况下,其是缺乏妥当性的技术。
更详细而言,使用上述的以往方法对试样之间进行比较时,来自少数的目标细胞的特征量被埋没在来自占多数的其他细胞的特征量中,因而难以进行生物标记的高灵敏度检测。例如,在设想肿瘤组织的情况中,肿瘤组织中的癌细胞的比例为50%以下是普遍的现象。进一步,近年来,得到了显示在这些癌细胞的多样性中推定为以数%以下的比例存在癌干细胞的见解,这样的癌干细胞所具有的生物标记难以检测。此外,作为另一事例,在设想诱导率为数%~20%的iPS细胞的分析、评价的情况中,在通过使用了试样平均值的以往方法来进行分析时,有将存在比例低的iPS细胞的特征量遗漏的危险。
作为解决上述问题的方法,正在推进通过分别解析各个细胞来提取少数细胞所具有的特征的技术研究。它们是在对由多数细胞构成的生物组织进行基因组解析、基因表达解析、蛋白质解析时,着眼于各个细胞的基因组、基因表达、蛋白质量的差异而进行解析的技术,被称为单一细胞解析技术。单一细胞解析技术作为通过将测量对象试样的单位设为一个细胞或数量少的细胞来提高生物标记的检测灵敏度的技术,其重要性开始被认识。
在这样的情况下,例如在非专利文献1中所示那样,研究了将几乎所有的mRNA更换成cDNA,制作保持在珠(beads)上的cDNA文库(将全部cDNA包含在内的cDNA集合体),并用于定量分析的方法。该技术中示出,通过反复利用cDNA文库来防止因试样分割而造成的微量表达基因的分子数降低,能够正确地测量1个细胞中所含的多个基因的表达量。
现有技术文献
非专利文献
非专利文献1:Nature Method vol.6,no.7,503-506(2009)
发明内容
发明所要解决的问题
如上所述,由于组织、待测物由多样的细胞种类的集合构成,因而对于灵敏度高的生物标记检测,有用的是分别测量细胞的单一细胞解析技术。然而,无论精度多么良好地检测一个细胞的生物标记,该检测值对于把握作为原本目标的组织、待测物的状态而言是不足够的。这是因为,一个细胞的分析结果所表示的是该细胞的特征量所示的结果,将一个细胞的分析结果作为直接评价组织即多样的细胞的集团的指标,是非常不合适的。
因此,希望对于尽量多的细胞以1个细胞的水平进行分析,通过将这些分析结果统合来作为具有多样性的组织的特征量。将以往的细胞集团作为对象的分析技术通常所使用的细胞数为10的3次方至6次方个,考虑通过反复进行单一细胞解析直至成为与这些细胞集团解析同等的细胞数来提高单一细胞解析结果的妥当性,但由于单一细胞解析技术是针对各个细胞进行分析的技术,因此细胞数的增加会直接造成解析费用、劳力、解析时间的增大。
本发明鉴于这样的现有技术的问题,目的在于在抑制解析费用、劳力、解析时间的同时,实现高精度的生物标记检测。
用于解决问题的方法
作为用于解决上述问题的至少一个问题的本发明的一个方式,设为如下构成:从待测物以光学方式取得多个生物体试样的特征量,将特征量与关于同一待测物的事先的检查信息比较,基于比较结果算出指标,该指标判定继续进行供于生物体试样的基因分析的处理、还是从同一待测物进行试样再调整。
发明的效果
根据本发明,能够在单一细胞解析或少数的细胞集团的分析中实现分析费用、分析时间、劳力的抑制,并且通过适当地选择检查试样而确保妥当性,从而实现可靠性更高的生物标记检测。
附图说明
图1为表示单一细胞解析检查系统中的处理内容的流程图。
图2为表示试样适用基准数据库中存储的信息的一个例子的图。
图3为表示个体细胞基准数据库中存储的信息的一个例子的图。
图4为表示文库基准数据库中存储的信息的一个例子的图。
图5为表示单一细胞解析检查系统的构成的一个例子的框图结构图。
具体实施方式
以下,参照附图对本发明的实施方式的一个例子进行说明。但是,本实施例只不过是用于实现本发明的一个例子,并不限定本发明。此外,在本实施例中,举出使用新一代测序仪的基因表达解析为例,但采用定量PCR、微阵列等其他方法作为基因检测方法的情况也包含在本发明中。此外,同样地,基因表达解析也是来自各个细胞的生物标记的一个例子,包括检测对象为miRNA、基因组DNA等核酸分子、蛋白质或细胞代谢物的情况。
本实施例中,待测物是来自作为检查对象的特定个人的试样,即便来自同一个人,如果试样采集部位、试样采集时机、试样采集方法等不同,则视为不同的试样。此外,本实施例中特别地将如下的待测物的一部分定义为试验试样:通过由切片制作、激光显微切割法等进行的部分试样的回收,利用细胞分选仪等进行的特定细胞等的浓缩,从而由待测物制得的待测物的一部分。例如通过活组织检查回收的试样是待测物,而对这些待测物进行病理观察时使用的石蜡包埋切片是试验试样。
本实施例的目的在于考虑了上述的细胞和组织的多样性、更准确的生物标记检测,这是与现有的生物标记检测技术显著不同的点之一。即,即使是来自同一待测物的试验试样,不同的试验试样严格来说也是不同的细胞集团,如果是高灵敏度的生物标记检测技术,则尤其重要的是考虑这些试验试样的差异而进行判断。例如,癌症诊断中的组织诊断中,由病理医生实施试验试样的石蜡包埋切片的显微镜观察。当病理医生基于该观察结果判断利用基因解析等来判断生物标记的附加分析时,对待测物实施生物标记检测。此时,生物标记检测中所用的试验试样是与先前进行显微镜观察的石蜡包埋切片连续的切片,因此虽然是来自同一待测物,但是成为试样中的位置空间与先前的观察试样不同的试验试样。
即,本实施例中对充分考虑了如下的可能性的单一细胞解析检查系统、单一细胞解析检查装置、单一细胞解析检查方法进行说明,该可能性为,由于使用不同的试验试样,因而在进行显微镜观察的试验试样与进行生物标记检测的试验试样之间,癌细胞的比例、癌细胞的多样性存在差异的可能性。
作为生物标记检测对象的试样的选定是很大的问题。如果考虑组织、细胞的多样性,则组织的采集场所、采集时机不同的待测物具有不同的多样性,因而考虑这些多样性而对适当的试样进行分析是重要的。首先,在说明本实施例的系统构成例之前,以癌组织为例说明试样选定的重要性。
癌组织是正常的细胞和癌化的细胞集合而成的组织,此外,已知在癌细胞之间也存在多样性。进一步,即使在一个肿瘤组织中,正常细胞和癌细胞的比例等也根据肿瘤的部位不同而呈多样。因此,在以详细地掌握某癌组织的性质为目的时,要求i)从肿瘤组织的多个部位调制试样、ii)针对各试样片以单一细胞水平进行分析、iii)将这些组织片的分析结果统合,但当作为分析对象的试样缺乏妥当性时,例如是在肿瘤组织中癌细胞比例极其低的区域,那么该分析结果成为误判的原因。也就是说,如果考虑到细胞、组织本质上是多样的集团,则在使用单一细胞解析技术的生物标记的高灵敏度检测中,检查试样的妥当性判定极为重要。
基于这样的检查试样的妥当性判定的重要性,使用图5对本实施例中的单一细胞解析检查系统的构成例进行说明。本系统具备:试样适用基准数据库501、个体细胞基准数据库502、文库基准数据库503、进行细胞观察的显微镜观察部504、调制个体化细胞的单一细胞解析处理部505、进行定量PCR的定量PCR装置506、对所制作的DNA文库进行碱基序列解析的DNA测序仪507、以及能够与它们连接的单一细胞检查装置200。
此外,单一细胞检查装置200具备运算部608以及判定结果显示部609。如使用图1在后描述的那样,运算部608参照试样适用基准数据库501、个体细胞基准数据库502和文库基准数据库503中的至少一个,通过将所参照的基准数据库与各检查值比较而进行运算处理和判定处理。此外,判定结果显示部609显示由运算部608产生的运算和判定的结果。
如图2中详述,试样适用基准数据库501存储有:以使用来自同一待测物的试验试样事先实施的精密检查判定102的结果为参照基准的基准值、试样适用判定201的结果、以及根据所适用的生物标记检查技术而确定的试样条件。
如图3中详述,个体细胞基准数据库502存储有:以个体细胞评价204的结果为参照基准的基准值、以及根据所适用的生物标记检查技术而确定的试样条件。
如图4中详述,文库基准数据库503存储有:以个体细胞评价204的结果为参照基准的基准值、以及根据所适用的生物标记检查技术而确定的试样条件。
需要说明的是,本实施例中将试样适用基准数据库501、个体细胞基准数据库502、文库基准数据库503作为个体的数据库而进行例示,但也可以将这些数据库构成于一个存储介质中。
本系统实现了以往难以实现的考虑了组织和细胞多样性的待测物评价/解析,也能够设置将这些装置、数据库的一部分或多个连结而成的系统。
接着,使用图1对本系统的处理流程的一个例子进行说明。本系统中,为了高度考虑细胞和组织的多样性并基于高灵敏度生物标记检测解析的结果进行待测物的评价,进行以下处理。进一步,根据需要实施对工序进行了追加或削减的处理。
在通过本系统进行处理之前,事先从待测物调制试验试样(101),由病理医生、检查者等根据该试验试样的检查结果判定是否需要精密检查(102),并且调制供精密检查用的试验试样(103)。然后,由本系统进行以下的处理。
首先,对于通过单一细胞解析检查装置200进行的试样适用判定201进行说明。如上所述,在是否需要精密检查的判定102中所用的试验试样与供生物标记检测用的检查试样并不相同,因此单一细胞检查装置200对于在精密检查判定102后的试验试样调整103中调整的试样,重新实施试样适用判定201。试样适用判定201中,对于在供生物标记检查用的试验试样调整103中调整的试样,通过例如显微镜504等实施观察,对于该观察结果,由运算部608参照试样适用基准数据库501,与先前实施的是否需要精密检查的判定102的检查结果进行核对,从而确认其适用性,在判定结果显示部609中提示继续进行处理或进行试验试样再调制的指标。
试样适用判定201中,使用来自同一待测物的试验试样事先实施的精密检查判定102的结果是重要的指标。这是因为,如果考虑生物组织和细胞的多样性,则由于试验试样各自是具有个体的个性的细胞群,因而合理的是在来自同一待测物的试验试样之间进行比较,而不是在试样适用判定中设定统一的判定基准。此外,在试样适用性判定201中实施的试样的检查有时会与先前的精密检查判定102为相同的方法,但由于希望是不妨碍后续实施的精密的生物标记检测的方法,因而利用不同的方法来实施试样适用判定,例如利用对试样的侵袭性少的相位差显微镜、拉曼图像观察或免疫染色来检测特定抗原的方法。当两个判定方法不同时,设定用于将双方方法的观察结果对应的基准,这些基准作为试样适用判定的参照信息而存储于试样适用基准数据库501。更详细而言,试样适用判定201中,运算部608根据试样适用基准数据库501,参照来自同一待测物的精密检查判定102的结果和与该判定基准对应的试样适用判定201的检查结果,从而实施进行继续检查或进行试验试样调整103中的再调制的判定。
使用图2,对于在试样适用判定201中所用的试样适用基准数据库501中存储的信息的一个例子进行说明。试样适用基准数据库501中,作为基准值2008,存储有使用第一试验试样调制101的检查结果中的癌细胞数2001、癌细胞比例2002、发展程度2003等病理适用性判定的基准。
此外,试样适用基准数据库501中,作为基准值2008,除了病理适用性判定的基准之外,还存储有:试样固定方法2004、试样保管温度2005、试验试样尺寸2006等试验方法适用性的判定基准。它们是对下一工序的细胞分离203中所要求的试样水准进行判断的指标,成为判断对象的试验试样的适用性的基准。
运算部608通过将第二试验试样调制103的检查结果2009与基准值2008进行比较而进行试验试样适用性的判定,记录判定结果2007。
其中,图2中例示了关于肿瘤组织进行记载的项目,但这些项目是一个例子,项目名、项目内容是与对第一试验试样调制101进行的检查相对应的病理适用性判定的基准。试样适用基准数据库501的病理适用性判定基准中,关于精密检查判定102中所用的第一试验试样调制101的试验试样的观察结果、以及对供生物标记检查用的第二试验试样调制103的检查试样实施的例如使用显微镜504等进行观察的结果(2001~2003),是按照能够在基准值2008与检查结果2009之间进行比较的形式存储。
如上所述,对于第二试验试样调制103实施能够进行试样适用判定的检查,其结果被存储至试样适用基准数据库501的检查结果2009,此外通过对2个检查试样的检查结果进行比较,存储检查试样的适用性的判定结果2007。
需要说明的是,以试样适用基准数据库501为首,各数据库501、502、503可以习得性地提高判断基准。例如,可以设为根据图1的各判定、评价(201、204、207)中的评价结果来变更基准值2008的构成。
此外,在第二试验试样调制103中调制的试验试样由于是供精密的生物标记检测用的试样,因而根据试验方法适用性的判定基准,定义了与要实施的检查技术相应的所期望的试样状态。图2中例示的试样固定方法2004、试样保管温度2005、试验试样尺寸2006等是对生物标记检查结果带来很大影响的项目,重要的是,将这些对检查值带来影响的项目的适用性与存储于试样适用基准数据库的指标比较,进行判定。通过判定结果显示部609,将试验试样间的适用性判定中所用的检查的结果、通过生物标记检测技术定义的试验试样的状态以及通过本系统做出的适用性判定结果的一部分或整体以能够比较阅览的状态提示给本系统使用者,以作为处理继续判断的指标。
本系统的单一细胞解析检查装置200所进行的试样适用判定201中,对于供作为精密检查而实施的生物标记检测用的试样的适用性判定,通过参照来自同一待测物的试验试样的结果来实施,从而判断试验试样的适用基准,在不满足适用基准的情况下,反复给出进行试样再调制的指示直至其满足适用基准,从而能够保证所调制的试样的妥当性、即检查结果的妥当性。
此外,由于试验试样是从有限的待测物调制,因而可以设想得不到满足所有适用基准的试验试样的情况。在该情况下,也可以妥协为一个或多个适用指标而实施后续的检查。就本系统而言,即使在这样的情况下,通过明确超出供检查用的试验试样的适用基准状态或基准的适用指标,也能够有助于提高检查结果的判定精度。
接着,对于图1中的由单一细胞解析检查装置200进行的个体细胞评价204进行说明。个体细胞评价204中,单一细胞解析检查装置200对经过细胞分离203的个体细胞进行评价。关于作为个体细胞评价204的对象的细胞,对通过试样适用性判定201确定继续处理的试验试样进行细胞分离203,将通过进行细胞分离203调制得到的细胞作为对象。
其中,细胞分离203是为了能够对各个细胞进行检查而进行的预处理。因此,就细胞分离203而言,可以是仅通过剥离细胞间的粘接来进行的细胞个体化的技术、或利用细胞分选仪或激光显微切割等进行的特定细胞的分离技术中的任一种技术,可通过适合于所实施的生物标记检测的方法来调制。
由本系统进行的个体细胞评价204中包含经分离的各个细胞的观察和该观察结果的评价,细胞的观察可以由单一细胞解析处理部505进行,也可以由显微镜观察部504进行,是通过运算部608针对细胞分离工序实施结果进行各个细胞的评价的处理。
使用图3,对于由运算部608参照并用于个体细胞评价204的个体细胞基准数据库502中存储的检查项目信息的一个例子进行说明。个体细胞基准数据库502中存储有使用了第一试验试样调制101的检查结果以及试样适用判定201的检查结果。图3中例示了关于肿瘤组织而记载的项目,但这些项目是一个例子,项目名、项目内容与对第一试验试样调制101进行的检查相对应。需要说明的是,本实施例中,将试样适用基准数据库501和个体细胞基准数据库502作为独立的数据库来进行说明,但这些基准数据库也可以在同一个存储介质上。
本系统的单一细胞解析检查装置200所进行的个体细胞评价204中,对于细胞分离后的试样,通过运算部608,在评价试样适用性判定201结果的妥当性的同时,对后续工序中实施的个体细胞的生物标记检测结果进行分析时所必须的检查试样的状态进行评价。
若例示个体细胞基准数据库502中存储的成为个体细胞评价204的基准的信息,则有回收细胞数3001、细胞个体化率3002、目标细胞率3003。这些指标中,细胞的大小2006等是根据试验试样并参照试样适用性判定的结果而确定的判定基准。此外,在个体细胞基准数据库502存储有如细胞个体化率3002、目标细胞率3003那样的、在个体的生物标记检测中通过检查技术确定的判定基准,例如“细胞数为1000个以上且个体化不充分的细胞的比例小于5%”这样的基准。
个体细胞基准数据库502中,对于回收细胞数3001、细胞个体化率3002、目标细胞率3003等基准信息的评价结果2010,以能够与基准值2008之间进行比较的形式存储。运算部608针对回收细胞数3001、细胞个体化率3002、目标细胞率3003等基准信息,将个体细胞评价结果2010与基准值2008进行比较,从而进行适用性的判定,并记录判定结果2007。
判定结果显示部609向本系统使用者提示使用了如图3所示那样的基准信息且由运算部608做出的判定结果。个体细胞评价204中,在满足如图3所示那样的回收细胞数3001、细胞个体化率3002、目标细胞率3003等判定基准的情况下,显示建议继续处理的信息。另一方面,在不适用于判定基准的情况下,由判定结果显示部609显示需要对满足试样适用判定201的试样进行供于细胞分离工序203的再调制这样的信息。通过该处理,反复实施个体细胞评价直至满足个体细胞评价基准为止,从而能够保证检查整体的可靠性。
此外,与试样适用判定201同样地,也可以设想得不到满足存储在个体细胞基准数据库502中的所有适用基准的试验试样的情况。在这样的情况下,也可以选择一个或多个适用指标并实施后续的检查。就本系统而言,即使在这样的情况下,通过明确供检查用的试验试样的适用基准状态,也能够有助于提高检查结果的判定精度。
接着,对于由单一细胞解析检查装置200进行的文库评价207进行说明。对于在个体细胞评价204中被判定为“继续”的试验试样,对各个细胞实施生物标记检测的预处理。例如,如果是基因分析,则实施各个细胞的DNA文库的制作206。在文库评价207中,单一细胞解析检查装置200针对所制作的DNA文库实施是否适用于基因分析300所要求的水准的适用性判定。
使用图4,对于在用于文库评价207的文库基准数据库503中存储的检查项目信息的一个例子进行说明。文库基准数据库503存储使用了第一试验试样调制101的检查结果以及试样适用判定201的检查结果、个体细胞评价204的检查结果。在图4中例示关于肿瘤组织而记载的项目,这些项目是一个例子,项目名、项目内容与对第一试验试样调制101做出的检查相对应。
本系统的单一细胞解析检查装置200所进行的文库评价207中,除了上述的试样适用判定201、个体细胞评价204中的判定基准以外,还将根据基因分析300中所用的分析技术而确定的基准作为判定基准。关于根据基因分析300中所用的分析技术而确定的基准,例如,DNA量4001、DNA浓度4002、DNA片段长度4003为判定基准。
利用单一细胞解析处理部505或定量PCR装置506取得这些DAN文库的评价指标,判定结果显示部609根据判定指标向本系统使用者提示其检查结果。
在文库基准数据库503中,针对DNA量4001、DNA浓度4002、DNA片段长度4003等基准信息,评价结果2011按照能够与基准值2008之间进行比较的形式存储。运算部608针对DNA量4001、DNA浓度4002、DNA片段长度4003等基准信息,将个体细胞评价结果2011与基准值2008进行比较从而进行适用性的判定,并记录判定结果2007。
判定结果显示部609向本系统使用者提示使用了如图4所示那样的基准信息并由运算部608做出的判定结果。文库评价207中,在满足如图4所示的DNA量4001、DNA浓度4002、DNA片段长度4003等判定基准的情况下,显示建议继续进行基于基因解析300的待测物评价300的处理的信息。另一方面,在不适用于判定基准的情况下,显示建议对满足试样适用判定201的试样进行供于细胞分离工序203的再调制的信息。
本系统的文库评价207与上述个体细胞评价204同样地,对保证检查的可靠性、降低检查费用、检查劳力、缩短检查时间做出很大贡献。个体细胞的检查中,希望对各个细胞实施文库评价204,但也可以实施以一部分细胞作为代表的抽样检查、或使用整体的平均值来实施文库评价204,从而实现检查成本、检查工序数的降低。
以上,使用图1至图4对于使用一个试验试样的检查进行了说明。如上所述,通过在个体细胞的生物标记检测结果中考虑了精密检查判定102、试样适用判定201、个体细胞评价204、文库评价206而进行分析,从而实现了现有技术难以实现的、考虑到组织和细胞多样性的待测物评价400。
然而,为了了解涵盖了多样性的组织的详细情况,希望将多个试验试样作为检查对象,本系统还可以在适用于各个试验试样后,将它们的评价结果统合而进行提示。可以设为如下的系统:对各个试验试样实施的适用性判定、个体细胞评价如上所述,而单一细胞解析检查装置200的运算部608对n个试验试样分别实施这些检查、评价,由运算部608将这些附有可靠性指标的待测物试样的检查结果统合,作为待测物的检查结果在判定结果显示部608上提示。例如,可以设为如下构成:对于图4的判定结果2007、基准值2008、第二试验试样检查结果2009、个体细胞评价结果2010、文库评价结果2011的至少一部分,在数据库中统合n个试验试样的检查结果并在判定结果显示部608上提示。
本系统的适用领域包括癌组织的观察、血细胞的分析、与再生医疗相关的培育细胞的评价等医疗、医药品开发领域,对于这些重要的领域,能够以更高的可靠性提供现有技术所无法实现的新的生物标记信息。此外,在分析的过程中提示对分析对象试样进行继续分析、以及进行试样再调制的指标,从而可防止实施缺乏可靠性的检查,实现检查成本的降低。
以上,如本实施例中所示,在基因分析等个体生物标记检测之前实施为了单一细胞解析而调制的个体细胞的评价,这对于保证检查的可靠性而言是极其重要的,并且对减少检查费用、检查劳力、检查时间做出很大的贡献。这是因为,对各个细胞通过基因解析、免疫分析实施生物标记检测,与以往的针对细胞集团的检查技术相比需要更多的检查费用、检查劳力、检查时间。通过如本实施例那样,在产生最多的费用、劳力、时间的工序之前的阶段判断由同一待测物的检查结果确定的试验试样的妥当性和作为用于生物标记检查的试样的妥当性,从而能够实施有效的检查。
符号说明
200:单一细胞解析检查装置,201:试样适用判定,204:个体细胞评价,206:文库评价,501:试样适用基准数据库,502:个体细胞基准数据库,503:文库基准数据库,504:显微镜观察部,505:单一细胞解析处理部,506:定量PCR装置,507:DNA测序仪,608:运算部,609:判定结果显示部。
Claims (11)
1.一种检查系统,其特征在于,具备:
数据库,存储关于待测物的事先检查信息;
显微镜观察部,以光学方式提取从所述待测物提取的多个生物体试样的特征量;以及
检查装置,将所述特征量与所述检查信息进行比较,根据所述比较的结果提示指标,该指标判定继续进行供于所述生物体试样的基因分析的处理、还是从所述待测物进行试样再调整。
2.根据权利要求1所述的检查系统,其特征在于,所述数据库存储关于所述待测物的病理判定信息作为所述检查信息。
3.根据权利要求2所述的检查系统,其特征在于,所述数据库存储关于所述待测物的癌细胞数、癌细胞比例、癌症发展程度中的至少任一个病理判定信息作为所述检查信息。
4.根据权利要求1所述的检查系统,其特征在于,所述数据库存储关于所述待测物的试样固定方法、试样保管温度、试验试样尺寸中的至少任一个试验方法信息作为所述检查信息。
5.根据权利要求1所述的检查系统,其特征在于,由所述检查装置判定的供于所述生物体试样的基因分析的处理中,包含细胞分离工序和个体DNA文库制作工序。
6.根据权利要求5所述的检查系统,其特征在于,进行所述细胞分离时,所述检查装置针对经分离的个体细胞,基于与所述数据库中存储的信息的比较来提示指标,所述指标判定进行个体DNA文库制作、还是进行个体细胞的再调整。
7.根据权利要求6所述的检查系统,其特征在于,所述数据库存储回收细胞数、细胞个体化率、目标细胞率中的至少任一个作为所述个体细胞的评价信息。
8.根据权利要求5所述的检查系统,其特征在于,进行所述个体DNA文库的制作时,所述检查装置针对所制作的个体DNA文库,基于与所述数据库中存储的信息的比较来提示指标,所述指标判定进行基因分析、还是进行待测物试样的再调整。
9.根据权利要求8所述的检查系统,其特征在于,所述数据库存储DNA量、DNA浓度、DNA片段长度中的至少任一个作为所述个体DNA文库的评价信息。
10.一种检查装置,其特征在于,具备:
运算部,将从待测物以光学方式提取的多个生物体试样的特征量与关于所述待测物的事先检查信息进行比较,基于所述比较的结果算出指标,所述指标判定继续进行供于所述生物体试样的基因分析的处理、还是从所述待测物进行试样再调整;以及
显示部,向使用者提示所述指标。
11.一种检查方法,其特征在于,从待测物以光学方式取得多个生物体试样的特征量,
将所述特征量与关于所述待测物的事先检查信息进行比较,并且
基于所述比较的结果,判定继续进行供于所述生物体试样的基因分析的处理、还是从所述待测物进行试样再调整。
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