CN104449669B - 一种多芳基取代咪唑荧光探针及其制备方法和在检测g-四链体结构中的应用 - Google Patents
一种多芳基取代咪唑荧光探针及其制备方法和在检测g-四链体结构中的应用 Download PDFInfo
- Publication number
- CN104449669B CN104449669B CN201410545469.3A CN201410545469A CN104449669B CN 104449669 B CN104449669 B CN 104449669B CN 201410545469 A CN201410545469 A CN 201410545469A CN 104449669 B CN104449669 B CN 104449669B
- Authority
- CN
- China
- Prior art keywords
- tetra
- probe
- fluorogen
- detection
- compound
- Prior art date
- Legal status (The legal status is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the status listed.)
- Expired - Fee Related
Links
- 239000000523 sample Substances 0.000 title claims abstract description 63
- 238000001514 detection method Methods 0.000 title claims abstract description 16
- 238000002360 preparation method Methods 0.000 title claims abstract description 11
- RAXXELZNTBOGNW-UHFFFAOYSA-N imidazole Natural products C1=CNC=N1 RAXXELZNTBOGNW-UHFFFAOYSA-N 0.000 title abstract description 10
- 150000002460 imidazoles Chemical class 0.000 title abstract description 5
- UJOBWOGCFQCDNV-UHFFFAOYSA-N 9H-carbazole Chemical compound C1=CC=C2C3=CC=CC=C3NC2=C1 UJOBWOGCFQCDNV-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 12
- 238000006243 chemical reaction Methods 0.000 claims description 8
- -1 methoxyl group Chemical group 0.000 claims description 8
- 125000000524 functional group Chemical group 0.000 claims description 7
- PVOAHINGSUIXLS-UHFFFAOYSA-N 1-Methylpiperazine Chemical group CN1CCNCC1 PVOAHINGSUIXLS-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 6
- QXAMGWKESXGGNV-UHFFFAOYSA-N 7-(diethylamino)-1-benzopyran-2-one Chemical compound C1=CC(=O)OC2=CC(N(CC)CC)=CC=C21 QXAMGWKESXGGNV-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 4
- LIQLLTGUOSHGKY-UHFFFAOYSA-N [B].[F] Chemical compound [B].[F] LIQLLTGUOSHGKY-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 4
- XJHABGPPCLHLLV-UHFFFAOYSA-N benzo[de]isoquinoline-1,3-dione Chemical compound C1=CC(C(=O)NC2=O)=C3C2=CC=CC3=C1 XJHABGPPCLHLLV-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 4
- 150000003233 pyrroles Chemical class 0.000 claims description 4
- 239000003814 drug Substances 0.000 claims description 3
- HDWLUGYOLUHEMN-UHFFFAOYSA-N Dinobuton Chemical compound CCC(C)C1=CC([N+]([O-])=O)=CC([N+]([O-])=O)=C1OC(=O)OC(C)C HDWLUGYOLUHEMN-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 2
- 241000425573 Talanes Species 0.000 claims description 2
- 239000012467 final product Substances 0.000 claims description 2
- GNBHRKFJIUUOQI-UHFFFAOYSA-N fluorescein Chemical compound O1C(=O)C2=CC=CC=C2C21C1=CC=C(O)C=C1OC1=CC(O)=CC=C21 GNBHRKFJIUUOQI-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 2
- PYWVYCXTNDRMGF-UHFFFAOYSA-N rhodamine B Chemical compound [Cl-].C=12C=CC(=[N+](CC)CC)C=C2OC2=CC(N(CC)CC)=CC=C2C=1C1=CC=CC=C1C(O)=O PYWVYCXTNDRMGF-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 2
- OWBBAPRUYLEWRR-UHFFFAOYSA-N 4-hydroxycoumarin Chemical compound C1=CC=C2OC(O)=CC(=O)C2=C1 OWBBAPRUYLEWRR-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims 1
- VXIXUWQIVKSKSA-UHFFFAOYSA-N benzotetronic acid Natural products C1=CC=CC2=C1OC(=O)C=C2O VXIXUWQIVKSKSA-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims 1
- 108020004707 nucleic acids Proteins 0.000 abstract description 7
- 150000007523 nucleic acids Chemical class 0.000 abstract description 7
- 102000039446 nucleic acids Human genes 0.000 abstract description 7
- 238000004458 analytical method Methods 0.000 abstract description 2
- 238000011895 specific detection Methods 0.000 abstract 1
- QTBSBXVTEAMEQO-UHFFFAOYSA-N Acetic acid Chemical compound CC(O)=O QTBSBXVTEAMEQO-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 51
- HEDRZPFGACZZDS-UHFFFAOYSA-N Chloroform Chemical compound ClC(Cl)Cl HEDRZPFGACZZDS-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 40
- HEMHJVSKTPXQMS-UHFFFAOYSA-M Sodium hydroxide Chemical compound [OH-].[Na+] HEMHJVSKTPXQMS-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 30
- 150000001875 compounds Chemical class 0.000 description 27
- 229960000583 acetic acid Drugs 0.000 description 25
- 239000012362 glacial acetic acid Substances 0.000 description 24
- 239000007787 solid Substances 0.000 description 21
- 239000000243 solution Substances 0.000 description 21
- 108020004414 DNA Proteins 0.000 description 20
- 230000015572 biosynthetic process Effects 0.000 description 14
- 238000005160 1H NMR spectroscopy Methods 0.000 description 12
- HEDRZPFGACZZDS-MICDWDOJSA-N Trichloro(2H)methane Chemical compound [2H]C(Cl)(Cl)Cl HEDRZPFGACZZDS-MICDWDOJSA-N 0.000 description 12
- 238000003786 synthesis reaction Methods 0.000 description 12
- IAZDPXIOMUYVGZ-UHFFFAOYSA-N Dimethylsulphoxide Chemical compound CS(C)=O IAZDPXIOMUYVGZ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 10
- 230000000694 effects Effects 0.000 description 10
- 238000000034 method Methods 0.000 description 10
- 239000002904 solvent Substances 0.000 description 10
- WEVYAHXRMPXWCK-UHFFFAOYSA-N Acetonitrile Chemical compound CC#N WEVYAHXRMPXWCK-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 9
- USFZMSVCRYTOJT-UHFFFAOYSA-N Ammonium acetate Chemical compound N.CC(O)=O USFZMSVCRYTOJT-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 9
- OKKJLVBELUTLKV-UHFFFAOYSA-N Methanol Chemical compound OC OKKJLVBELUTLKV-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 8
- 239000007832 Na2SO4 Substances 0.000 description 8
- 230000033228 biological regulation Effects 0.000 description 8
- WBLIXGSTEMXDSM-UHFFFAOYSA-N chloromethane Chemical compound Cl[CH2] WBLIXGSTEMXDSM-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 8
- 238000004440 column chromatography Methods 0.000 description 8
- 239000012043 crude product Substances 0.000 description 8
- 238000000605 extraction Methods 0.000 description 8
- 239000012044 organic layer Substances 0.000 description 8
- 229910052938 sodium sulfate Inorganic materials 0.000 description 8
- 238000012360 testing method Methods 0.000 description 8
- 238000001644 13C nuclear magnetic resonance spectroscopy Methods 0.000 description 7
- 238000002189 fluorescence spectrum Methods 0.000 description 6
- BWHMMNNQKKPAPP-UHFFFAOYSA-L potassium carbonate Chemical compound [K+].[K+].[O-]C([O-])=O BWHMMNNQKKPAPP-UHFFFAOYSA-L 0.000 description 6
- SHAHPWSYJFYMRX-GDLCADMTSA-N (2S)-2-(4-{[(1R,2S)-2-hydroxycyclopentyl]methyl}phenyl)propanoic acid Chemical compound C1=CC([C@@H](C(O)=O)C)=CC=C1C[C@@H]1[C@@H](O)CCC1 SHAHPWSYJFYMRX-GDLCADMTSA-N 0.000 description 5
- ZYGHJZDHTFUPRJ-UHFFFAOYSA-N coumarin Chemical compound C1=CC=C2OC(=O)C=CC2=C1 ZYGHJZDHTFUPRJ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 5
- ROSDSFDQCJNGOL-UHFFFAOYSA-N Dimethylamine Chemical compound CNC ROSDSFDQCJNGOL-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 4
- ZHNUHDYFZUAESO-UHFFFAOYSA-N Formamide Chemical compound NC=O ZHNUHDYFZUAESO-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 4
- YNAVUWVOSKDBBP-UHFFFAOYSA-N Morpholine Chemical compound C1COCCN1 YNAVUWVOSKDBBP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 4
- 239000002585 base Substances 0.000 description 4
- WPYMKLBDIGXBTP-UHFFFAOYSA-N benzoic acid Chemical compound OC(=O)C1=CC=CC=C1 WPYMKLBDIGXBTP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 4
- XLYOFNOQVPJJNP-UHFFFAOYSA-N water Substances O XLYOFNOQVPJJNP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 4
- QKNYBSVHEMOAJP-UHFFFAOYSA-N 2-amino-2-(hydroxymethyl)propane-1,3-diol;hydron;chloride Chemical compound Cl.OCC(N)(CO)CO QKNYBSVHEMOAJP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- LFQSCWFLJHTTHZ-UHFFFAOYSA-N Ethanol Chemical compound CCO LFQSCWFLJHTTHZ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- XEKOWRVHYACXOJ-UHFFFAOYSA-N Ethyl acetate Chemical compound CCOC(C)=O XEKOWRVHYACXOJ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- 230000008859 change Effects 0.000 description 3
- 238000012650 click reaction Methods 0.000 description 3
- 238000002330 electrospray ionisation mass spectrometry Methods 0.000 description 3
- UYTPUPDQBNUYGX-UHFFFAOYSA-N guanine Chemical compound O=C1NC(N)=NC2=C1N=CN2 UYTPUPDQBNUYGX-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- 239000007788 liquid Substances 0.000 description 3
- 229910052757 nitrogen Inorganic materials 0.000 description 3
- XHXFXVLFKHQFAL-UHFFFAOYSA-N phosphoryl trichloride Chemical compound ClP(Cl)(Cl)=O XHXFXVLFKHQFAL-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- 150000003053 piperidines Chemical class 0.000 description 3
- 229910000027 potassium carbonate Inorganic materials 0.000 description 3
- 239000002994 raw material Substances 0.000 description 3
- 238000011160 research Methods 0.000 description 3
- 238000003860 storage Methods 0.000 description 3
- 238000006467 substitution reaction Methods 0.000 description 3
- 238000000967 suction filtration Methods 0.000 description 3
- 238000004448 titration Methods 0.000 description 3
- MCTWTZJPVLRJOU-UHFFFAOYSA-N 1-methyl-1H-imidazole Chemical compound CN1C=CN=C1 MCTWTZJPVLRJOU-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- OVDGUTHABMXVMI-UHFFFAOYSA-N 3-nitro-4-(propylamino)benzoic acid Chemical compound CCCNC1=CC=C(C(O)=O)C=C1[N+]([O-])=O OVDGUTHABMXVMI-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- IJGRMHOSHXDMSA-UHFFFAOYSA-N Atomic nitrogen Chemical compound N#N IJGRMHOSHXDMSA-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 239000005711 Benzoic acid Substances 0.000 description 2
- RTZKZFJDLAIYFH-UHFFFAOYSA-N Diethyl ether Chemical compound CCOCC RTZKZFJDLAIYFH-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 108091081406 G-quadruplex Proteins 0.000 description 2
- 102100029974 GTPase HRas Human genes 0.000 description 2
- 101000584633 Homo sapiens GTPase HRas Proteins 0.000 description 2
- TZYWCYJVHRLUCT-VABKMULXSA-N N-benzyloxycarbonyl-L-leucyl-L-leucyl-L-leucinal Chemical group CC(C)C[C@@H](C=O)NC(=O)[C@H](CC(C)C)NC(=O)[C@H](CC(C)C)NC(=O)OCC1=CC=CC=C1 TZYWCYJVHRLUCT-VABKMULXSA-N 0.000 description 2
- 229910019213 POCl3 Inorganic materials 0.000 description 2
- VYPSYNLAJGMNEJ-UHFFFAOYSA-N Silicium dioxide Chemical compound O=[Si]=O VYPSYNLAJGMNEJ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- PPBRXRYQALVLMV-UHFFFAOYSA-N Styrene Chemical compound C=CC1=CC=CC=C1 PPBRXRYQALVLMV-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 239000007983 Tris buffer Substances 0.000 description 2
- 235000010233 benzoic acid Nutrition 0.000 description 2
- WTEOIRVLGSZEPR-UHFFFAOYSA-N boron trifluoride Chemical compound FB(F)F WTEOIRVLGSZEPR-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 239000007853 buffer solution Substances 0.000 description 2
- 125000003178 carboxy group Chemical group [H]OC(*)=O 0.000 description 2
- 239000003153 chemical reaction reagent Substances 0.000 description 2
- 229960000956 coumarin Drugs 0.000 description 2
- 235000001671 coumarin Nutrition 0.000 description 2
- 230000006837 decompression Effects 0.000 description 2
- 238000010520 demethylation reaction Methods 0.000 description 2
- HPNMFZURTQLUMO-UHFFFAOYSA-N diethylamine Chemical compound CCNCC HPNMFZURTQLUMO-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 239000000975 dye Substances 0.000 description 2
- 235000019441 ethanol Nutrition 0.000 description 2
- 230000006870 function Effects 0.000 description 2
- 239000003292 glue Substances 0.000 description 2
- 125000003147 glycosyl group Chemical group 0.000 description 2
- 238000010438 heat treatment Methods 0.000 description 2
- 125000002887 hydroxy group Chemical group [H]O* 0.000 description 2
- 238000001727 in vivo Methods 0.000 description 2
- 230000003993 interaction Effects 0.000 description 2
- HAWPXGHAZFHHAD-UHFFFAOYSA-N mechlorethamine Chemical compound ClCCN(C)CCCl HAWPXGHAZFHHAD-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 229960004961 mechlorethamine Drugs 0.000 description 2
- 239000000203 mixture Substances 0.000 description 2
- HDZGCSFEDULWCS-UHFFFAOYSA-N monomethylhydrazine Chemical compound CNN HDZGCSFEDULWCS-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 230000035479 physiological effects, processes and functions Effects 0.000 description 2
- 239000000047 product Substances 0.000 description 2
- 108090000623 proteins and genes Proteins 0.000 description 2
- 239000000376 reactant Substances 0.000 description 2
- 230000027756 respiratory electron transport chain Effects 0.000 description 2
- 238000012546 transfer Methods 0.000 description 2
- 150000003852 triazoles Chemical class 0.000 description 2
- LENZDBCJOHFCAS-UHFFFAOYSA-N tris Chemical compound OCC(N)(CO)CO LENZDBCJOHFCAS-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- VEFLKXRACNJHOV-UHFFFAOYSA-N 1,3-dibromopropane Chemical compound BrCCCBr VEFLKXRACNJHOV-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- LTMRRSWNXVJMBA-UHFFFAOYSA-L 2,2-diethylpropanedioate Chemical compound CCC(CC)(C([O-])=O)C([O-])=O LTMRRSWNXVJMBA-UHFFFAOYSA-L 0.000 description 1
- MFFMQGGZCLEMCI-UHFFFAOYSA-N 2,4-dimethyl-1h-pyrrole Chemical compound CC1=CNC(C)=C1 MFFMQGGZCLEMCI-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- JGMXNNSYEFOBHQ-OWOJBTEDSA-N 2-[(e)-4-morpholin-4-ylbut-2-enyl]-1,1-dioxothieno[3,2-e]thiazine-6-sulfonamide Chemical compound O=S1(=O)C=2SC(S(=O)(=O)N)=CC=2C=CN1C\C=C\CN1CCOCC1 JGMXNNSYEFOBHQ-OWOJBTEDSA-N 0.000 description 1
- BMYNFMYTOJXKLE-UHFFFAOYSA-N 3-azaniumyl-2-hydroxypropanoate Chemical compound NCC(O)C(O)=O BMYNFMYTOJXKLE-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 102100021569 Apoptosis regulator Bcl-2 Human genes 0.000 description 1
- 229910015900 BF3 Inorganic materials 0.000 description 1
- PQMOXTJVIYEOQL-UHFFFAOYSA-N Cumarin Natural products CC(C)=CCC1=C(O)C(C(=O)C(C)CC)=C(O)C2=C1OC(=O)C=C2CCC PQMOXTJVIYEOQL-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- PAPNRQCYSFBWDI-UHFFFAOYSA-N DMP Natural products CC1=CC=C(C)N1 PAPNRQCYSFBWDI-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 241000196324 Embryophyta Species 0.000 description 1
- IYXGSMUGOJNHAZ-UHFFFAOYSA-N Ethyl malonate Chemical class CCOC(=O)CC(=O)OCC IYXGSMUGOJNHAZ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 108700039691 Genetic Promoter Regions Proteins 0.000 description 1
- 101000971171 Homo sapiens Apoptosis regulator Bcl-2 Proteins 0.000 description 1
- VEXZGXHMUGYJMC-UHFFFAOYSA-N Hydrochloric acid Chemical class Cl VEXZGXHMUGYJMC-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 108090001061 Insulin Proteins 0.000 description 1
- FSOGIJPGPZWNGO-UHFFFAOYSA-N Meomammein Natural products CCC(C)C(=O)C1=C(O)C(CC=C(C)C)=C(O)C2=C1OC(=O)C=C2CCC FSOGIJPGPZWNGO-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 101710135898 Myc proto-oncogene protein Proteins 0.000 description 1
- 102100038895 Myc proto-oncogene protein Human genes 0.000 description 1
- TZCCKCLHNUSAMQ-DUGSHLAESA-N NC(=O)C[C@H](NC(=O)[C@H](CCCNC(=N)N)NC(=O)[C@@H]1CCCN1C(=O)[C@H](CCCNC(=N)N)NC(=O)[C@H](Cc2ccc(F)cc2)NC(=O)[C@H](Cc3c[nH]c4ccccc34)NC(=O)Cc5cccs5)C(=O)N Chemical compound NC(=O)C[C@H](NC(=O)[C@H](CCCNC(=N)N)NC(=O)[C@@H]1CCCN1C(=O)[C@H](CCCNC(=N)N)NC(=O)[C@H](Cc2ccc(F)cc2)NC(=O)[C@H](Cc3c[nH]c4ccccc34)NC(=O)Cc5cccs5)C(=O)N TZCCKCLHNUSAMQ-DUGSHLAESA-N 0.000 description 1
- AKQOBHZKBDHWQI-BZEFIUHZSA-N O[C@H]1C[C@@H](CCC1)N1C(C2(C3=C1N=C(N=C3)NC1=CC=C(C=C1)S(=O)(=O)NC([2H])([2H])[2H])CC2)=O Chemical compound O[C@H]1C[C@@H](CCC1)N1C(C2(C3=C1N=C(N=C3)NC1=CC=C(C=C1)S(=O)(=O)NC([2H])([2H])[2H])CC2)=O AKQOBHZKBDHWQI-BZEFIUHZSA-N 0.000 description 1
- 241000736199 Paeonia Species 0.000 description 1
- 235000006484 Paeonia officinalis Nutrition 0.000 description 1
- 102000016971 Proto-Oncogene Proteins c-kit Human genes 0.000 description 1
- 108010014608 Proto-Oncogene Proteins c-kit Proteins 0.000 description 1
- 108010087776 Proto-Oncogene Proteins c-myb Proteins 0.000 description 1
- 102000009096 Proto-Oncogene Proteins c-myb Human genes 0.000 description 1
- KDCGOANMDULRCW-UHFFFAOYSA-N Purine Natural products N1=CNC2=NC=NC2=C1 KDCGOANMDULRCW-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- PMZURENOXWZQFD-UHFFFAOYSA-L Sodium Sulfate Chemical compound [Na+].[Na+].[O-]S([O-])(=O)=O PMZURENOXWZQFD-UHFFFAOYSA-L 0.000 description 1
- 108010017842 Telomerase Proteins 0.000 description 1
- 101710150448 Transcriptional regulator Myc Proteins 0.000 description 1
- 102000005789 Vascular Endothelial Growth Factors Human genes 0.000 description 1
- 108010019530 Vascular Endothelial Growth Factors Proteins 0.000 description 1
- 238000005874 Vilsmeier-Haack formylation reaction Methods 0.000 description 1
- 239000002253 acid Substances 0.000 description 1
- 239000000980 acid dye Substances 0.000 description 1
- 150000001299 aldehydes Chemical class 0.000 description 1
- 230000006907 apoptotic process Effects 0.000 description 1
- 239000011230 binding agent Substances 0.000 description 1
- 230000008827 biological function Effects 0.000 description 1
- 125000002915 carbonyl group Chemical group [*:2]C([*:1])=O 0.000 description 1
- 230000004663 cell proliferation Effects 0.000 description 1
- 229940127108 compound 5g Drugs 0.000 description 1
- 230000001276 controlling effect Effects 0.000 description 1
- 230000004069 differentiation Effects 0.000 description 1
- 125000001891 dimethoxy group Chemical group [H]C([H])([H])O* 0.000 description 1
- 229940079593 drug Drugs 0.000 description 1
- 238000004043 dyeing Methods 0.000 description 1
- 230000005611 electricity Effects 0.000 description 1
- 239000003480 eluent Substances 0.000 description 1
- 230000002708 enhancing effect Effects 0.000 description 1
- 125000005909 ethyl alcohol group Chemical group 0.000 description 1
- 230000005284 excitation Effects 0.000 description 1
- 238000002474 experimental method Methods 0.000 description 1
- 238000001506 fluorescence spectroscopy Methods 0.000 description 1
- 238000007421 fluorometric assay Methods 0.000 description 1
- 229930182478 glucoside Natural products 0.000 description 1
- 238000004128 high performance liquid chromatography Methods 0.000 description 1
- 235000011167 hydrochloric acid Nutrition 0.000 description 1
- 230000007062 hydrolysis Effects 0.000 description 1
- 238000006460 hydrolysis reaction Methods 0.000 description 1
- 238000000338 in vitro Methods 0.000 description 1
- 230000003834 intracellular effect Effects 0.000 description 1
- 229920002521 macromolecule Polymers 0.000 description 1
- 230000014759 maintenance of location Effects 0.000 description 1
- 229910021645 metal ion Inorganic materials 0.000 description 1
- JBLLRCOZJMVOAE-HSQYWUDLSA-N n-[(2s)-1-[[(2s)-1-(1,3-benzothiazol-2-yl)-1-oxo-3-[(3s)-2-oxopyrrolidin-3-yl]propan-2-yl]amino]-4-methyl-1-oxopentan-2-yl]-4-methoxy-1h-indole-2-carboxamide Chemical compound C([C@H](NC(=O)[C@H](CC(C)C)NC(=O)C=1NC=2C=CC=C(C=2C=1)OC)C(=O)C=1SC2=CC=CC=C2N=1)[C@@H]1CCNC1=O JBLLRCOZJMVOAE-HSQYWUDLSA-N 0.000 description 1
- 238000011275 oncology therapy Methods 0.000 description 1
- 239000007800 oxidant agent Substances 0.000 description 1
- 230000003647 oxidation Effects 0.000 description 1
- 238000007254 oxidation reaction Methods 0.000 description 1
- 230000001590 oxidative effect Effects 0.000 description 1
- 229920002401 polyacrylamide Polymers 0.000 description 1
- 238000001556 precipitation Methods 0.000 description 1
- 125000000561 purinyl group Chemical group N1=C(N=C2N=CNC2=C1)* 0.000 description 1
- 150000003254 radicals Chemical class 0.000 description 1
- 230000001105 regulatory effect Effects 0.000 description 1
- 230000003252 repetitive effect Effects 0.000 description 1
- 230000004044 response Effects 0.000 description 1
- 239000012488 sample solution Substances 0.000 description 1
- 239000000377 silicon dioxide Substances 0.000 description 1
- 238000001228 spectrum Methods 0.000 description 1
- 238000003756 stirring Methods 0.000 description 1
- 238000005728 strengthening Methods 0.000 description 1
- 238000006557 surface reaction Methods 0.000 description 1
- KUCOHFSKRZZVRO-UHFFFAOYSA-N terephthalaldehyde Chemical compound O=CC1=CC=C(C=O)C=C1 KUCOHFSKRZZVRO-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 238000013518 transcription Methods 0.000 description 1
- 230000035897 transcription Effects 0.000 description 1
- 238000013519 translation Methods 0.000 description 1
- 238000002211 ultraviolet spectrum Methods 0.000 description 1
- 239000000052 vinegar Substances 0.000 description 1
- 235000021419 vinegar Nutrition 0.000 description 1
Landscapes
- Measuring Or Testing Involving Enzymes Or Micro-Organisms (AREA)
Abstract
本发明提供一类多芳基取代咪唑荧光探针的制备方法及其在检测G‑四链体核酸中的应用。该类探针制备简单、易得，并且结构稳定，可用于特异性检测G‑四链体核酸二级结构，通过荧光分光光度计可以快速检测出溶液中的DNA样品的二级结构。该类探针对G‑四链体核酸二级结构的检测方法具有操作简便，选择性好的优点，并且克服了其他检测方法价格昂贵，设备要求高，技术操作相对复杂等缺点。
Description
技术领域
本发明涉及一种荧光探针，更具体地，涉及一种多芳基取代咪唑荧光探针及其制备方法和在检测G-四链体结构中的应用。
背景技术
G-四链体（G-quadruplex）是一种特殊的DNA二级结构。人类基因组中很多富鸟嘌呤区域具有形成这一结构的能力，包括端粒末端鸟嘌呤重复序列，以及多种基因的启动子区域，如c-kit、c-myc、c-myb、bcl-2、PDGF、kRAS、VEGF、Rb和胰岛素基因等。G-四链体结构具有多态性，链的数量和取向、loop的连接方式以及鸟嘌呤的糖苷扭转角以及与羰基负电中心配位的金属离子等多方面决定了G-四链体的类型和构象，这些差异性也为蛋白和小分子化合物提供了多个识别位点。根据链的取向不同，G-四链体分为正平行，反平行与混合型三种构象。
G-四链体结构的形成对于体内的一系列生理过程都存在调控作用。研究证明，某些启动子区域的G-四链体结构会显著影响基因的转录和翻译水平，因此G-四链体结构被认为是起到分子开关的功能，其形成和拆散可能涉及到信号传导、细胞凋亡和细胞增殖等一系列体内重要的生理过程。所以，在体内或者体外试验中，能够特异性地检测出G-四链体结构的存在或者形成，对于研究G-四链体结构的相关生物学功能以及开发以G-四链体结构为靶点的抗癌药物等方面都具有非常重要的作用。
目前，在体内和体外检测G-四链体结构的研究都取得了一些进展。由于体内大大过量的双螺旋DNA的存在，以及复杂的细胞内环境，使得体内的检测相对于体外检测需要解决更多的难题，目前已有一些荧光分子可以实现体内G-四链体结构的检测。申请人实验室前期的工作中合成了一系列的三芳基取代咪唑类的化合物，其对G-四链体具有较好的选择性和结合能力。申请人将多种荧光团结构融合到三芳基咪唑结构当中，得到了新型的G-四链体探针，该探针选择性识别G-四链体，有些可以进一步识别正平行G-四链体。
发明内容
本发明的目的之一是提供一种荧光探针，所述的荧光探针的结构式为：
n 为 2，3，4或5；
R1 为 O或N；
R2 为 O或N；
R3 为 甲氧基，氨基，甲胺，二甲胺，二乙胺，吗啡啉，哌啶，N-甲基哌嗪，羧基，羟基，甲酰胺，苯甲酸，1-甲基咪唑，双氯乙基甲胺，糖基或核酸碱基；
R4 为 甲氧基，氨基，甲胺，二甲胺，二乙胺，吗啡啉，哌啶，N-甲基哌嗪，羧基，羟基，甲酰胺，苯甲酸，1-甲基咪唑，双氯乙基甲胺，糖基或核酸碱基。
所述的R1和R3也可以通过三氮唑连接，所述的R2和R4也可以通过三氮唑连接。
更具需求，再提供一种荧光探针，所述的荧光探针的结构式为
所述的R5和R6为F、-O-CH3、、、、、、、、、、或。
所述的R5和R6也可以同时为F或-O-CH3，也可以不同时为F或-O-CH3。
所述的荧光团为7-二乙胺基香豆素，1,8-萘酰亚胺，氟硼二吡咯，荧光素，罗丹明，咔唑或二苯乙烯。
更进一步的提供一种上述的荧光探针的制备方法，包括以下步骤：
步骤1. 制备获得荧光团，并引入醛基；
步骤2. 在或上引入相关的官能团获得或；
步骤3.将步骤1所述制得的荧光团和步骤2所述的或反应，即得。
更进一步的提供上述的荧光探针在制备检测G-四链体结构的药物中的应用。
为了更好地理解本发明，以下对本发明方案结合反应式作进一步的阐释，所列的反应式仅为理论推导所得，其不能作为本发明保护范围的限制。
本发明同时提供了上述探针的制备方法。用S2代表相关的荧光团。
以香豆素荧光团为例，表示如下：
具体步骤为：先用4-二乙胺基水杨醛与丙二酸二乙酯反应，得到化合物S1，再将S1在POCl3的存在下与DMF反应，得到醛基香豆素中间体S2；将原料脱甲基得到S3 ；在这基础上，通过取代反应引入不同长度的官能团侧链或者通过点击反应引入官能团侧链得到S4，将S4与中间体S2反应，得到最终探针化合物S5。
代表性化合物5a及5b结构如下：
以氟硼二吡咯荧光团为例，表示如下：
具体步骤为：先用对苯二甲醛与2,4-二甲基吡咯反应，得到化合物，再将其用氧化剂DDQ氧化得到化合物S1 ，三氟化硼配位，然后水解得到荧光团中间体S2 ；将原料脱甲基得到S3 ；在这基础上，通过取代反应引入不同长度的官能团侧链或者通过点击反应引入官能团侧链得到S4，将S4与中间体S2反应，得到最终探针化合物S5。
代表性化合物5c：
以咔唑荧光团为例，表示如下：
具体步骤为：从原料咔唑出发，通过维斯迈尔反应得得到荧光团中间体S2；在或者基础上，通过取代反应引入不同长度的官能团侧链或者通过点击反应引入官能团侧链得到S4 ，将S4与中间体S2反应，得到最终探针化合物。
代表性化合物：
以萘酰亚胺荧光团为例，表示如下：
另外，代表性化合物如下：
本发明提供的探针由于具有较大的电子共轭体系和平面，该类探针分子内的电荷转移效应的强弱可以影响分子的荧光发射强度。当探针分子与某种大分子相互作用后，分子内的可转动的双键的柔性受到限制，使分子内电荷转移效应增强，荧光也有明显增强。同时，该类探针的分子结构的柔性的共轭平面，并且具有可以转动的键，使其可以比较容易堆积在G-四连体的G-四分体的平面上，进而与G-四链体具有较强的作用力，同时与其他二级结构的DNA作用较弱。所以，将该探针与不同二级结构的DNA混合时，当该DNA为G-四链体结构时，其与探针分子间的特异性作用，产生荧光光谱的改变。当DNA的二级结构为其他结构时，则不会产生明显的信号变化。
与现有技术相比，本发明具有以下优点：
（1）该类探针制备简单，易得，并且结构稳定，便于储存；
（2）本发明提供的探针可以特异性地检测识别G-四链体结构，实现了G-四链体结构与其他二级结构的区分，用简单的荧光光谱就可以识别出DNA样品的二级结构，快捷，操作简便，成本低廉，并且可以实现实地检测。而且本发明的有些分子能够识别正平行G-四链体。
附图说明
图1为探针5a滴定分子内正平行构象G-四链体DNA (pu22) 的荧光光谱。
图2为探针5a滴定不同DNA（包括G4与其他二级结构）的荧光曲线图。
图3为探针5a Tris-HCl缓冲溶液中滴加不同二级结构的DNA样品，在紫外灯下的荧光变化，探针浓度为1uM，待测样品为10uM。
图4为探针5a用于特异性对G-四链体进行染胶。
图5为探针5b滴定不同DNA（包括G4与其他二级结构）的荧光曲线图。
具体实施方式
下面结合附图和具体实施例进一步详细说明本发明。除非特别说明，本发明采用的试剂、设备和方法为本技术领域常规市购的试剂、设备和常规使用的方法。
以下通过具体的实施例进一步说明本发明的技术方案。通过紫外光谱实验证明，本发明涉及的化合物由于具有较大的电子共轭体系和平面，该类探针分子内的电荷转移效应的强弱可以影响分子的荧光发射强度。当探针分子与G-四链体相互作用后，分子内的可转动的双键的柔性受到限制，使分子内电荷转移效应增强，荧光也有明显增强。同时，该类探针的分子结构的柔性的共轭平面，并且具有可以转动的键，使其可以比较容易堆积在G-四链体的G-四分体的平面上，进而与G-四链体具有较强的作用力，同时与其他二级结构的DNA作用较弱，使该类探针具有很好的特异性识别作用。所以，我们将该探针与不同二级结构的DNA混合时，当该DNA为G-四链体结构时，其与探针分子间的特异性作用，产生荧光光谱的改变。当DNA的二级结构为其他结构时，则不会产生明显的信号变化。
以其中化合物5a为例来说明本发明的探针在荧光法检测G-四链体核酸二级结构的应用。
实施例一：化合物S1的合成
将2.01g 4-二乙胺基水杨醛溶于30 mL 无水乙醇，加入3.20 g 丙二酸二乙酯和1mL 哌啶，80℃下反应6 h。然后蒸出溶剂，加入20 mL乙酸和20 mL 浓盐酸，继续回流反应6h，冷至室温后将反应液倒入冰水中，用氢氧化钠溶液调pH至5，析出大量沉淀，减压抽滤干燥得粗品。以石油醚/乙酸乙酯（体积比1/10）作为洗脱剂通过硅胶层析纯化，得到0.81g纯品S1，产率37.3%:1H NMR (400 MHz, CDCl3) δ7.53 (d, J = 9.3 Hz, 1H), 7.24 (d, J =8.8 Hz, 1H), 6.56 (dd, J = 8.8, 2.1 Hz, 1H), 6.49 (d, J = 1.6 Hz, 1H), 6.03(d, J = 9.3 Hz, 1H), 3.41 (q, J = 7.1 Hz, 4H), 1.21 (t, J = 7.1 Hz, 6H). ESI-MS m/z: 218.1 [M+H]+。
实施例二：化合物S2（5a和5b中的使用）的合成
在氮气保护下将1.5 mL POCl3 滴加到1 mL DMF中，室温搅拌20 min。然后将0.77g S1溶于4 mL DMF滴加入到上述混合液中， 60 ºC下反应10 h，冷至室温后，将反应液倒入冰水中，用氢氧化钠溶液调pH 至中性，减压抽滤，用水和乙醇多次冲洗，真空干燥得橙黄色固体S2 0.50 g，产率58.3%: 1H NMR (400 MHz, CDCl3) δ10.13 (s, 1H), 8.26 (s, 1H),7.41 (d, J = 9.0 Hz, 1H), 6.64 (dd, J = 9.0, 2.5 Hz, 1H), 6.49 (d, J = 2.4Hz, 1H), 3.48 (q, J = 7.1 Hz, 4H), 1.26 (t, J = 7.1 Hz, 6H). ESI-MS m/z:246.1 [M+H]+。
实施例三：化合物S3的合成
将2.7 g 4 ,4’-二甲氧基苯偶酰分散在40mL冰醋酸与氢溴酸中（1:1），120℃搅拌50h，反应完毕后倒入冰水中，PH调至3，抽滤得到白色固体2.0g，产率79.5%。1H NMR (400MHz, CDCl3) δ: 10.83 (s, 2H), 7.83 (d, J = 8.8 Hz, 4H), 6.92 (d, J = 8.8 Hz,4H). ESI-MS m/z: 243 [M+H]+。
实施例四：化合物S4的合成
将所得到的S3取1.94 g溶于乙腈，往反应体系中加入1，3-二溴丙烷4.08 mL，并加入3.42 g碳酸钾做缚酸剂，80℃反应8h. 过滤除去碳酸钾，减压除去乙腈。拌样过柱得白色固体。所得固体溶解于乙腈当中，加入3 倍摩尔量的N-甲基哌嗪和 K2CO3，在油浴90 oC下加热反应10 h 后，滤去碳酸钾，减压除去溶剂，拌样过柱，可得白色固体S4 1.2 g，产率40%。1H NMR (400 MHz, CDCl3) δ: 7.85 (d, J = 8.8 Hz, 4H), 6.88 (d, J = 8.8 Hz,4H), 4.07 (t, 4H), 2.78 – 2.41 (m, 20H), 2.29 (s, 6H), 1.92 (m, 4H). ESI-MSm/z: 522 [M+H]+。
实施例五：化合物5a的合成
将0.52 g化合物S4和0.36 g化合物S2溶于10 mL冰醋酸中，加热至140 oC；在另一烧瓶中将20 mmol NH4OAc溶于3 mL冰醋酸中，加热至140 oC。待固体溶解完全后，将NH4OAc的冰醋酸溶液倒入另一烧瓶中， 于140 oC反应2 h。冷至室温后，用3 mol/L 的NaOH 溶液调节pH 值至8，用CH2Cl 2萃取（20 mL×5），合并有机层，用无水Na2SO4干燥。蒸出溶剂，得粗产物，经柱层析（CHCl3/ CH3OH = 30/1）分离纯化，得到深红色固体0.35 g，产率47%。1H NMR(400 MHz, CDCl3) δ: 8.72 (s, 1H), 7.47 (d, J = 8.7 Hz, 4H), 7.43 (d, J = 9.0Hz, 2H), 6.86 (d, J = 8.7 Hz, 4H), 6.66 (d, J = 8.9 Hz, 1H), 6.55 (s, 1H),4.04 (t, J = 6.0 Hz, 4H), 3.45 (q, J = 6.9 Hz, 4H), 2.90 (m, 16H), 2.72(t,4H), 2.58 (s, 1H), 2.05 (m, 4H), 1.24 (t, J = 7.0 Hz, 6H). 13C NMR (101 MHz,DMSO) δ 160.52, 157.62, 155.73, 150.82, 140.77, 139.44, 130.10, 128.98,128.85, 128.81, 114.32, 109.72, 108.87, 108.07, 96.25, 65.52, 53.66, 52.80,50.38, 43.78, 43.40, 25.68, 12.31. Purity: 98.6% by HPLC. HRMS (ESI) m/z:calcd for C44H57N7O4: 374.7309 [M+2H]2+, found 374.7298 [M+2H]2+。
实施例六：化合物5b的合成
与5a方法一样，将首先制备的化合物S4和化合物S2溶于10 mL冰醋酸中，加热至140 oC；在另一烧瓶中将20 mmol NH4OAc溶于3 mL冰醋酸中，加热至140 oC。待固体溶解完全后，将NH4OAc的冰醋酸溶液倒入另一烧瓶中， 于140 oC反应2 h。冷至室温后，用3 mol/L的NaOH 溶液调节pH 值至8，用CH2Cl 2萃取（20 mL×5），合并有机层，用无水Na2SO4干燥。蒸出溶剂，得粗产物，经柱层析（CHCl3/ CH3OH = 30/1）分离纯化，得到深红色固体。1H NMR(400 MHz, Chloroform) δ 8.04 (s, 1H), 7.59 (s, 1H), 7.57 – 7.48 (m, 4H), 7.41(s, 1H), 7.05 – 6.97 (m, 4H), 6.67 (s, 1H), 6.45 (s, 1H), 5.11 (s, 2H), 4.59(s, 1H), 4.40 (s, 1H), 3.97 (s, 2H), 3.67 – 3.55 (m, 2H), 3.31 – 3.15 (m,4H), 3.00 – 2.87 (m, 2H), 2.76 (s, 2H), 2.68 (s, 2H), 1.93 (s, 2H), 1.24 –1.19 (m, 12H). 13C NMR (100 MHz, Chloroform) δ 174.45, 165.98, 159.14, 158.86,155.69, 155.41, 151.94, 144.22, 140.44, 138.82, 131.74, 131.53, 128.57,127.80, 125.63, 124.19, 116.07, 113.97, 111.84, 111.53, 100.99, 67.14, 56.97,50.11, 47.64, 46.34, 46.10, 31.53, 28.05, 13.01, 12.34。
实施例七：化合物5c的合成
与5a方法一样，将首先制备的化合物S4和氟硼二吡咯荧光团反应溶于10 mL冰醋酸中，加热至140 oC；在另一烧瓶中将20 mmol NH4OAc溶于3 mL冰醋酸中，加热至140 oC。待固体溶解完全后，将NH4OAc的冰醋酸溶液倒入另一烧瓶中， 于140 oC反应2 h。冷至室温后，用3 mol/L 的NaOH 溶液调节pH 值至8，用CH2Cl 2萃取（20 mL×5），合并有机层，用无水Na2SO4干燥。蒸出溶剂，得粗产物，经柱层析（CHCl3/ CH3OH = 30/1）分离纯化，得到深红色固体。1H NMR (400 MHz, CDCl3) δ 10.75 (s, 1H), 8.14 (d, J = 8.2 Hz, 2H), 7.81(s, 2H), 7.39 (m, 6H), 6.91 (d, J = 8.8 Hz, 4H), 5.97 (s, 2H), 5.13 (s, 4H),4.46 (t, J = 6.3 Hz, 4H), 3.47 (s, 2H), 2.77 (t, J = 6.3 Hz, 4H), 2.62 – 2.51(m, 6H), 2.49 – 2.35 (m, 8H), 1.61 – 1.51 (8, 2H), 1.43 (m, 10H)。
实施例八：化合物5d的合成
与5a方法一样，将首先制备的化合物S4和咔唑荧光团溶于10 mL冰醋酸中，加热至140 oC；在另一烧瓶中将20 mmol NH4OAc溶于3 mL冰醋酸中，加热至140 oC。待固体溶解完全后，将NH4OAc的冰醋酸溶液倒入另一烧瓶中， 于140 oC反应2 h。冷至室温后，用3 mol/L的NaOH 溶液调节pH 值至8，用CH2Cl 2萃取（20 mL×5），合并有机层，用无水Na2SO4干燥。蒸出溶剂，得粗产物，经柱层析（CHCl3/ CH3OH = 30/1）分离纯化，得到灰白色固体。1H NMR(400 MHz, Chloroform) δ 8.12 (s, 1H), 8.02 (s, 1H), 7.82 (s, 1H), 7.70 – 7.54(m, 8H), 7.45 (s, 1H), 7.28 (s, 1H), 7.13 – 6.99 (m, 4H), 5.15 (s, 4H), 5.06– 5.02 (m, 2H), 4.98 – 4.94 (m, 2H), 4.53 (s, 2H), 3.37 – 3.33 (m, 4H), 2.72– 2.68 (m, 4H), 2.39 – 2.35 (m, 4H), 1.60 – 1.55 (m, 8H), 1.52 – 1.48 (m,4H). 13C NMR (100 MHz, Chloroform) δ 159.44, 158.86, 147.83, 145.66 , 143.33,141.74, 140.44, 137.58, 128.56, 127.86, 127.53, 126.09 , 124.75, 124.19,123.99 , 122.98 , 122.80 , 122.59, 122.03, 120.14, 116.07 , 115.32 , 110.23,109.08 , 56.97 54.81 , 53.75, 47.66 , 42.69 , 24.57, 23.42, 13.33 )。
实施例九：化合物5e的合成
与5a方法一样，将首先制备的化合物S4和咔唑荧光团溶于10 mL冰醋酸中，加热至140 oC；在另一烧瓶中将20 mmol NH4OAc溶于3 mL冰醋酸中，加热至140 oC。待固体溶解完全后，将NH4OAc的冰醋酸溶液倒入另一烧瓶中， 于140 oC反应2 h。冷至室温后，用3 mol/L的NaOH 溶液调节pH 值至8，用CH2Cl 2萃取（20 mL×5），合并有机层，用无水Na2SO4干燥。蒸出溶剂，得粗产物，经柱层析（CHCl3/ CH3OH = 30/1）分离纯化，得到白色固体。1H NMR (400MHz, Chloroform) δ 8.04 (d, J = 8.5 Hz, 2H), 7.93 (s, 1H), 7.84 – 7.80 (m,2H), 7.66 (d, J = 35.5 Hz, 2H), 7.60 – 7.50 (m, 2H), 7.46 (s, 1H), 7.32 –7.24 (m, 3H), 6.96 – 6.82 (m, 2H), 4.58 (d, J = 9.0 Hz, 2H), 3.66 – 3.62 (m,2H), 3.52 – 3.48 (m, 2H), 2.63 – 2.59 (m, 2H), 2.46 – 2.42 (m, 2H), 2.29 (s,3H), 1.46 (s, 3H). 13C NMR (100 MHz, Chloroform) δ 164.34, 149.73, 147.83,145.66, 143.33, 141.74, 137.58, 130.80, 129.31, 127.93, 127.70, 126.02,123.99, 122.98, 122.80, 122.59, 122.03, 120.14, 114.91, 110.23, 109.70,109.08, 52.73, 50.38, 46.05, 42.69, 13.33。
实施例十：化合物5f的合成
与5a方法一样，将首先制备的化合物S4和萘酰亚胺荧光团溶于10 mL冰醋酸中，加热至140 oC；在另一烧瓶中将20 mmol NH4OAc溶于3 mL冰醋酸中，加热至140 oC。待固体溶解完全后，将NH4OAc的冰醋酸溶液倒入另一烧瓶中， 于140 oC反应2 h。冷至室温后，用3mol/L 的NaOH 溶液调节pH 值至8，用CH2Cl 2萃取（20 mL×5），合并有机层，用无水Na2SO4干燥。蒸出溶剂，得粗产物，经柱层析（CHCl3/ CH3OH = 30/1）分离纯化，得到橙黄色固体。1HNMR (400 MHz, Chloroform) δ 8.66 (s, 1H), 8.46 (d, J = 17.5 Hz, 2H), 8.19 –8.05 (m, 2H), 7.89 (s, 1H), 7.64 – 7.59 (m, 4H), 7.42 (s, 2H), 7.35 – 7.27(m, 1H), 7.01 – 6.87 (m, 4H), 3.76 – 3.72 (m, 2H), 3.67 – 3.63 (m, 4H), 3.56– 3.49 (m, 6H), 2.67 – 2.59 (m, 6H), 2.49 – 2.42 (m, 6H), 2.30 (d, J = 9.0Hz, 9H). 13C NMR (100 MHz, Chloroform) δ 162.96, 152.59, 149.73, 145.76,144.55, 143.33, 141.20, 137.58, 133.16, 131.55, 130.79, 130.56, 127.76,127.47, 126.55, 126.02, 125.49, 124.19, 121.71, 119.27, 110.47, 110.04,109.70, 52.73, 51.05, 50.38, 46.05。
实施例十一：化合物5g的合成
与5a方法一样，将首先制备的化合物S4和香豆素荧光团溶于10 mL冰醋酸中，加热至140 oC；在另一烧瓶中将20 mmol NH4OAc溶于3 mL冰醋酸中，加热至140 oC。待固体溶解完全后，将NH4OAc的冰醋酸溶液倒入另一烧瓶中， 于140 oC反应2 h。冷至室温后，用3 mol/L 的NaOH 溶液调节pH 值至8，用CH2Cl 2萃取（20 mL×5），合并有机层，用无水Na2SO4干燥。蒸出溶剂，得粗产物，经柱层析（CHCl3/ CH3OH = 30/1）分离纯化，得到黄色固体。1H NMR(400 MHz, Chloroform) δ 9.93 (s, 1H), 8.04 (s, 1H), 7.63 (s, 1H), 7.61 – 7.47(m, 4H), 7.45 (s, 1H), 7.17 – 7.02 (m, 2H), 7.02 – 6.93 (m, 2H), 6.70 (s,1H), 6.46 (s, 1H), 5.10 (s, 2H), 5.04 (s, 1H), 4.83 (s, 1H), 3.88 (s, 3H),3.67 – 3.55 (m, 2H), 3.34 (s, 2H), 3.32 – 3.19 (m, 2H), 2.70 – 2.66 (m, 2H),2.38 – 2.34 (m, 2H), 1.60 – 1.49 (m, 6H), 1.23 – 1.19 (m, 6H). 13C NMR (100MHz, Chloroform) δ 165.98, 160.54, 158.86, 155.69, 155.41, 151.94, 144.22,140.44, 138.82, 131.74, 131.53, 128.60, 127.80, 124.72, 124.19, 116.07,114.33, 111.84, 111.53, 100.99, 56.97, 56.04, 54.81, 53.75, 47.66, 46.34,24.57, 23.42, 13.01。
实施例十二：化合物5h的合成
与5a方法一样，将首先制备的化合物S4和苯乙烯荧光团溶于10 mL冰醋酸中，加热至140 oC；在另一烧瓶中将20 mmol NH4OAc溶于3 mL冰醋酸中，加热至140 oC。待固体溶解完全后，将NH4OAc的冰醋酸溶液倒入另一烧瓶中， 于140 oC反应2 h。冷至室温后，用3 mol/L 的NaOH 溶液调节pH 值至8，用CH2Cl 2萃取（20 mL×5），合并有机层，用无水Na2SO4干燥。蒸出溶剂，得粗产物，经柱层析（CHCl3/ CH3OH = 30/1）分离纯化，得到淡绿色固体。1H NMR(400 MHz, Chloroform) δ 8.44 (s, 1H), 7.61 – 7.54 (m, 8H), 7.46 (s, 2H), 7.41– 7.38 (m, 1H), 7.41 – 7.19 (m, 3H), 7.41 – 7.13 (m, 3H), 7.41 – 6.80 (m,8H), 6.39 (s, 1H), 5.14 (s, 4H), 5.07 – 5.03 (m, 2H), 4.86 – 4.82 (m, 2H),3.37 – 3.33 (m, 4H), 2.71 – 2.52 (m, 4H), 2.52 – 2.36 (m, 4H), 1.54 – 1.49(m, 13H). 13C NMR (125 MHz, Chloroform) δ 159.44, 158.86, 155.39, 149.24,145.76, 143.33, 140.44, 139.88, 137.53, 135.65, 129.44, 128.56, 128.13,127.80, 127.49, 127.16, 124.75, 124.19, 123.34, 122.80, 116.07, 115.32,56.97, 54.81, 53.75, 47.66, 24.57, 23.42。
实施例十三：DNA样品的检测
1.制备样品：
DNA样品：DNA样品购自英骏生物技术有限公司。将DNA适量溶于Tris-HCl的缓冲液中（PH 7.4，100 mM Tris，100 mM KCl），超微量紫外测定浓度，在95 ℃下加热5 min 后缓慢冷却退火到室温作为储存液，4 ℃储存。
测试的DNA样品序列包括：
检测G-四链体结构：
探针溶液：以化合物5a为例，先用二甲基亚砜将化合物5a配成10 mM的储存液，再用二甲基亚砜或者在Tris-HCl的缓冲液（PH 7.4，100 mM Tris，100 mM KCl）中分别稀释成1 μM的探针溶液用于测试。
2.检测：
2.1）荧光光谱检测
探针5a的浓度为1uM，往探针溶液中滴加不同的待测样品溶液，吹匀后，稳定1分钟，用荧光光谱测定体系的荧光发射，将450 nm设定为激发波长。如果体系的荧光强度急剧增强，增强范围为30~100，则可判断待测序列形成了G-四链体结构，如果体系只有微弱荧光增强，则可判断待测样品为非G-四链体结构。结果如图1，2所示。
2.2）肉眼检测
将上述试荧光光谱的的样品（5a的浓度为1 μM，待测样品为5 μM）放在紫外灯下，肉眼观察。如果体系发射很强的绿色荧光，则可判断待测样品为G-四链体结构，如果没有明显荧光增强， 则为非G-四链体结构。结果如图3所示，图中5a与Kras、pu22、HRAS、htg22的混合物存在绿色荧光，从而可以判断Kras、pu22、HRAS、htg22为G-四链体结构，而ds26、py22、BSA为非G-四链体结构。
2.3）染胶
5a用于聚丙烯酰胺凝胶的染色，从图5中可以明显看出，5a可以特异性地对G-四链体进行显色，作为对照SYSR Green I 则是一个广谱的核酸染料。在所设计的浓度梯度中，5a能对10ng以下的G-四链体进行染色，是一个高灵敏度的G-四链体染料。
通过以上方法，分别对5b、5c、5d、5e、5f、5g和5h进行G-四链体进行显色实验，均能对10ng以下的G-四链体进行染色，是一个高灵敏度的G-四链体染料。
Claims (3)
1.一种荧光探针，其特征在于，所述的荧光探针的结构式为
所述的R5和R6为F、-O-CH3、、、、
、、、、、、或；
所述的荧光团为7-二乙胺基香豆素，1,8-萘酰亚胺，氟硼二吡咯，荧光素，罗丹明，咔唑或二苯乙烯；
当荧光团为7-二乙胺基香豆素，且当R5为F时，R6不同时为N-甲基哌嗪基；
当荧光团为7-二乙胺基香豆素，当R5为N-甲基哌嗪基时，R6不同时为N-甲基哌嗪基；
当荧光团为4-羟基香豆素时，R5不为甲氧基，且R6不同时为甲氧基。
2.一种权利要求1所述的荧光探针的制备方法，其特征在于，包括以下步骤：
步骤1. 制备获得荧光团，并引入醛基；
步骤2. 在或上引入相关的官能团获得；
步骤3. 将步骤1所述制得的荧光团和步骤2所述的反应，即得。
3.一种权利要求1所述的荧光探针在制备检测G-四链体结构的药物中的应用。
Priority Applications (1)
| Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
|---|---|---|---|
| CN201410545469.3A CN104449669B (zh) | 2014-10-15 | 2014-10-15 | 一种多芳基取代咪唑荧光探针及其制备方法和在检测g-四链体结构中的应用 |
Applications Claiming Priority (1)
| Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
|---|---|---|---|
| CN201410545469.3A CN104449669B (zh) | 2014-10-15 | 2014-10-15 | 一种多芳基取代咪唑荧光探针及其制备方法和在检测g-四链体结构中的应用 |
Publications (2)
| Publication Number | Publication Date |
|---|---|
| CN104449669A CN104449669A (zh) | 2015-03-25 |
| CN104449669B true CN104449669B (zh) | 2016-11-23 |
Family
ID=52896435
Family Applications (1)
| Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
|---|---|---|---|
| CN201410545469.3A Expired - Fee Related CN104449669B (zh) | 2014-10-15 | 2014-10-15 | 一种多芳基取代咪唑荧光探针及其制备方法和在检测g-四链体结构中的应用 |
Country Status (1)
| Country | Link |
|---|---|
| CN (1) | CN104449669B (zh) |
Families Citing this family (8)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| CN104845614B (zh) * | 2015-04-30 | 2016-07-13 | 天津城建大学 | 一种dna标记用荧光探针及其合成方法和用途 |
| CN105367566B (zh) * | 2015-11-30 | 2018-11-16 | 四川大学 | 取代的香豆素-噻唑橙衍生物及其制备方法和用途 |
| WO2018068244A1 (zh) * | 2016-10-12 | 2018-04-19 | 中山大学 | 一种单链抗体及其在特异性检测正平行型g-四链体中的应用 |
| CN106749208B (zh) * | 2016-11-25 | 2019-10-01 | 中山大学 | 一种多芳基取代咪唑荧光探针及其制备方法和在特异性检测g-四链体中的应用 |
| CN107698612B (zh) * | 2017-09-25 | 2019-05-28 | 中国科学院福建物质结构研究所 | 一种鸟嘌呤荧光探针及其制备方法 |
| CN109164066B (zh) * | 2018-09-20 | 2021-03-05 | 湘潭大学 | 一种基于G-wire纳米结构的共振光检测试剂盒及检测miRNA-122的方法 |
| US11981964B2 (en) * | 2020-07-28 | 2024-05-14 | Illumina Cambridge Limited | Substituted coumarin dyes and uses as fluorescent labels |
| CN114540324B (zh) * | 2022-03-10 | 2023-02-17 | 中山大学 | Dna聚合酶、核酸适配体、热启动dna聚合酶及方法和应用 |
Family Cites Families (3)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| CN102408741B (zh) * | 2011-09-15 | 2014-04-23 | 中山大学 | 一种染料及其制备方法与在检测特殊dna二级结构中的应用 |
| CN102719238B (zh) * | 2012-06-21 | 2014-07-02 | 中山大学 | 一种双功能探针及其制备方法与在检测g-四链体结构中的应用 |
| CN104151301B (zh) * | 2014-07-10 | 2016-08-17 | 中山大学 | 一种荧光探针及其制备方法和应用 |
-
2014
- 2014-10-15 CN CN201410545469.3A patent/CN104449669B/zh not_active Expired - Fee Related
Also Published As
| Publication number | Publication date |
|---|---|
| CN104449669A (zh) | 2015-03-25 |
Similar Documents
| Publication | Publication Date | Title |
|---|---|---|
| CN104449669B (zh) | 一种多芳基取代咪唑荧光探针及其制备方法和在检测g-四链体结构中的应用 | |
| CN102719238B (zh) | 一种双功能探针及其制备方法与在检测g-四链体结构中的应用 | |
| CN104151301B (zh) | 一种荧光探针及其制备方法和应用 | |
| Ge et al. | A new fluorescent and colorimetric chemosensor for Cu (II) based on rhodamine hydrazone and ferrocene unit | |
| Li et al. | Benzimidazole-BODIPY as optical and fluorometric pH sensor | |
| CN106147753B (zh) | 噻唑橙苯乙烯类化合物作为g-四链体核酸荧光探针 | |
| CN103728294B (zh) | 二苯并咪唑联咔唑类化合物在用于特异性结合核酸g-四链体结构及在抗肿瘤药物中的应用 | |
| CN104710977B (zh) | 一种双功能探针及其制备方法和在检测正平行构象g-四链体中的应用 | |
| CN107266417A (zh) | 一种吲哚乙烯取代喹啉类衍生物及其制备方法和应用 | |
| CN108191752A (zh) | 一种选择性检测细胞内rna g-四链体的荧光探针及其制备方法和应用 | |
| CN103666452B (zh) | 一种甲基苯并呋喃喹啉类的生物探针及其制备方法和应用 | |
| Bai et al. | Construction of an NIR and lysosome-targeted quinoline-BODIPY photosensitizer and its application in photodynamic therapy for human gastric carcinoma cells | |
| CN111848633B (zh) | 一类香豆素-Tröger’s base类Fe3+荧光探针及其制备方法 | |
| Wei et al. | Interaction of bisbenzimidazole-substituted carbazole derivatives with G-quadruplexes and living cells | |
| CN108864058A (zh) | 一类氧杂蒽酮类荧光染料及应用 | |
| CN111116539B (zh) | 一种双重响应癌细胞内溶酶体粘度和pH的荧光探针、制备方法和应用 | |
| Wang et al. | G-quadruplex DNA fluorescence sensing by a bis-amine-substituted styrylquinolinium dye | |
| CN113087682B (zh) | 苯并噻唑衍生物荧光探针、制备方法、中间体及应用 | |
| CN102408741B (zh) | 一种染料及其制备方法与在检测特殊dna二级结构中的应用 | |
| CN111793371B (zh) | 一种3，5位不对称修饰bodipy类近红外荧光染料及其制备方法 | |
| Zhu et al. | Near-infrared pH probes based on phenoxazinium connecting with nitrophenyl and pyridinyl groups | |
| CN107586292A (zh) | 化合物、其制备方法、荧光染料和荧光探针 | |
| CN104946244B (zh) | 检测o2·‑的荧光分子探针、其合成方法和应用 | |
| CN111909182B (zh) | 色烯并二氮杂萘-Tröger’s base类Fe3+荧光探针及其制备方法与应用 | |
| CN114702447B (zh) | 一种萘酰亚胺衍生物及其制备方法与应用 |
Legal Events
| Date | Code | Title | Description |
|---|---|---|---|
| C06 | Publication | ||
| PB01 | Publication | ||
| SE01 | Entry into force of request for substantive examination | ||
| C14 | Grant of patent or utility model | ||
| GR01 | Patent grant | ||
| CF01 | Termination of patent right due to non-payment of annual fee | ||
| CF01 | Termination of patent right due to non-payment of annual fee |
Granted publication date: 20161123 |