[B! SNP] [9ページ] ma_koのブックマーク

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ma_ko id:ma_ko

SNPに関するma_koのブックマーク (190)

Genome at the University of Utah
ma_ko 2007/04/17
スライドでは良さそうだったが、収録遺伝子が少ないのかあまりヒットしない

SNP
リンク
QuantiSNP: an Objective Bayes Hidden-Markov Model to detect and accurately map copy number variation using SNP genotyping data - PubMed
ma_ko 2007/04/11
えーと illumina 用?

CNV

SNP
リンク
SNP and copy number variation Databases
ma_ko 2007/03/08
SNP系DBのリンク集

SNP
リンク
ryamadaの遺伝学・遺伝統計学メモ
列挙してみる遺伝生殖関係メンデルメンデルの遺伝の法則集団遺伝学木村資生進化解析系統樹連鎖不平衡遺伝的多様性家系解析連鎖解析ゲノム特化事項オミックスマルチオミックス時空間離散化(個人・細胞) 量的生物学統計関係フィッシャー離散変数カテゴリカル変数連続変数多変量解析離散確率過程多重検定多段階解析統合解析 QC 量子確率論尤度ベイズ流ゲノム疫学データサイエンス関係大規模データ解析機械学習深層学習ゲーム理論量子計算量子計算機情報関係マルチバンディットボルツマンマシンエントロピー個人情報数学関係微分積分学線形代数学グラフ理論情報幾何多様体確率微分方程式物理学関係波動関数量子力学医療関係臨床ゲノム学リスク遺伝子責任遺伝子リスクコミュニケーション遺伝子診断予防医学出生前診断個別化医療倫
ma_ko 2007/03/05
Joint analysis is more efficient than replication-based analysis for two-stage genome-wide association studies. 2006 Nat Genet 38(2):209-13

SNP

stat
リンク
http://osceola.cshl.edu/pipermail/announcements/
ma_ko 2007/02/28
HapMapのMLのarchive

SNP
リンク
A genome-wide association study identifies novel risk loci for type 2 diabetes - Nature
ma_ko 2007/02/23
two-stage

SNP
リンク
Variants in common diseases - Nature
ma_ko 2007/02/23
two-stage

SNP
リンク
マイクロアレイ解析 | Thermo Fisher Scientific - JP
日本人に特化したApplied Biosystems™ Axiom™ ジャポニカアレイ🄬 NEO さまざまな人種に対応したAxiom PMDA Arrayなど薬理ゲノミクス用Axiom PharmacoScan, PharmacoFocus Array SARS-CoV-2用ジェノタイピングアレイ Axiom Propel ワークフローソリューション遺伝子発現解析ジャポニカアレイ® は国立大学法人東北大学の登録商標です。ジャポニカアレイ® NEO は、Life Techno logies Corporation, part of Thermo Fisher Scientific Inc. が東北大学よりライセンスを受けて製造・販売しています。ジャポニカアレイ® NEO に搭載されている疾患関連 SNP マーカーはすべて研究用途です。
ma_ko 2007/02/22
SNP Array 5.0／旧来のSNP arrayと異なり、PMのみ搭載／びーりあるむ使うから、うちみたいな少数サンプルは不可かな

bioinformatics

work

SNP
リンク
Visualization of genomic aberrations using Affymetrix SNP arrays
ma_ko 2007/02/19
visualizationの機能のみ？

SNP

CNV
リンク
Welcome to H-GOLD!!
ma_ko 2007/02/19
NEDOより委託を受けた「遺伝子多様性モデル解析事業」で、(社)バイオ産業情報化コンソーシアム(JBiC)はモデル疾患として選択した幾つかの多因子性疾患に関する遺伝子多型情報等を収集／それの公開サイト

bioinformatics

SNP
リンク
HugeDomains.com
ma_ko 2007/02/07
SNP

CNV
リンク
Kardia Web Applications - Kardia Lab Home
ma_ko 2007/02/05
The KGraph is a data visualization system that has been developed to display the complex relationships between both univariate and bivariate associations among an outcome of interest, a set of covariates, and a set of genetic factors such as single nucleotide polymorphisms (SNPs).

bioinformatics

stat

SNP
リンク
Former Gardener's diary(2007-01-28)
ma_ko 2007/01/29
MDR1(ABCB1)のsSNPによるタンパクの活性変化を調べた論文の紹介

bio

work

SNP
リンク
Institutionen för medicinsk epidemiologi och biostatistik | Karolinska Institutet
ma_ko 2007/01/17
いっつも探すGENSTAT／SNPやLDのことなど詳しく書いてある

bioinformatics

stat

SNP

*
リンク
マイクロアレイ解析 | Thermo Fisher Scientific - JP
日本人に特化したApplied Biosystems™ Axiom™ ジャポニカアレイ🄬 NEO さまざまな人種に対応したAxiom PMDA Arrayなど薬理ゲノミクス用Axiom PharmacoScan, PharmacoFocus Array SARS-CoV-2用ジェノタイピングアレイ Axiom Propel ワークフローソリューション遺伝子発現解析ジャポニカアレイ® は国立大学法人東北大学の登録商標です。ジャポニカアレイ® NEO は、Life Techno logies Corporation, part of Thermo Fisher Scientific Inc. が東北大学よりライセンスを受けて製造・販売しています。ジャポニカアレイ® NEO に搭載されている疾患関連 SNP マーカーはすべて研究用途です。
ma_ko 2007/01/15
Copy Number Pipelineっていうのが出ている

SNP

CNV
リンク
SNPchip
ma_ko 2007/01/11
AffyのMapping array／BioCのパッケージ／Visualization寄り？

SNP

R

bioinformatics
リンク
http://combio.kribb.re.kr/FESD/
ma_ko 2007/01/10
promoter regions, CpG islands, 5'UTRs など10の領域にあるSNPを集めたDB

SNP

CNV
リンク
SNP Annotation Platform
ma_ko 2007/01/04
annotationいろいろ見れる／ちょっとごちゃごちゃしすぎだが、更新がきちんとされれば良いかも

bioinformatics

SNP
リンク
SNP Genotype Report Documentation
ma_ko 2007/01/04
rsSNPのgenotypeをexportするためのGUI／PerlでXML取り出しも出来るっぽい（最下段になんか書いてある）

bioinformatics

SNP
リンク
SNiPer-HD: improved genotype calling accuracy by an expectation-maximization algorithm for high-density SNP arrays
ma_ko 2006/12/20
SNP
リンク
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