| dbo:abstract
|
- Die Phosphoramidit-Synthese ist eine Methode der Biochemie zur Herstellung von RNA- oder DNA-Sequenzen aus Nukleosid-Phosphoramiditen. Sie ist eine Methode zur künstlichen DNA-Synthese, die Produkte gehören zur synthetischen DNA. (de)
- La synthèse d'oligonucléotide est la synthèse chimique de fragments relativement courts d'acide nucléique avec une structure définie. (fr)
- La síntesis de oligonucleótidos es la síntesis química de fragmentos relativamente cortos de ácido nucleico con una secuencia estructural química definida. La técnica es extremadamente útil en la práctica actual en laboratorios, porque provee un acceso rápido y barato a oligonucleótidos hechos a la medida con una secuencia deseada. Mientras que las enzimas sintetizan ADN y ARN en una dirección de 5' a 3', la síntesis de oligonucleótidos se lleva a cabo en el sentido opuesto, en la dirección 3' a 5'. Actualmente, el proceso está implementado como una síntesis en fase sólida usando el método de la fosforoamidita y bloques de construcción de fosforoamidita derivados de 2'-deoxinucleósidos (dA, dC, dG y T), ribonucleósidos (A, C, G y U), o nucleósidos químicamente modificados, como los ANB. Para obtener el oligonucleótido deseado, se acoplan secuencialmente los bloques de construcción a la cadena de oligonucleótidos en el orden requerido por la secuencia del producto (ver Ciclo de Síntesis más abajo). El proceso ha sido automatizado completamente desde finales de la década de 1970. Al completarse el ensamblado de la cadena, se libera el producto de la fase sólida a la solución, luego se le desprotege, y finalmente se le recolecta. La existencia de reacciones secundarias establece límites prácticos a la longitud de los oligonucleótidos sintéticos (hasta aproximadamente 200 residuos de nucleótido) debido a que el número de errores se acumulan con la longitud del oligonucleótido sintetizado. Los productos suelen ser aislados mediante HPLC para obtener los oligonucleótidos deseados en una alta pureza. Típicamente, los oligonucleótidos sintéticos son moléculas de DNA o RNA de una sola hebra de aproximadamente 15–25 bases de longitud. Los oligonucleótidos tienen muchas aplicaciones tanto en el campo de biología molecular como en medicina. Son comúnmente utilizados como oligonucleótidos de antisentido, SiRNA, partidores para secuenciación de ADN y amplificación, sonda genética para detectar ADN o ARN complementario vía hibridación molecular, herramientas para la introducción dirigida de mutaciones y sitios de restricción, y para la síntesis artificial de genes. (es)
- Oligonucleotide synthesis is the chemical synthesis of relatively short fragments of nucleic acids with defined chemical structure (sequence). The technique is extremely useful in current laboratory practice because it provides a rapid and inexpensive access to custom-made oligonucleotides of the desired sequence. Whereas enzymes synthesize DNA and RNA only in a 5' to 3' direction, chemical oligonucleotide synthesis does not have this limitation, although it is most often carried out in the opposite, 3' to 5' direction. Currently, the process is implemented as solid-phase synthesis using phosphoramidite method and phosphoramidite building blocks derived from protected 2'-deoxynucleosides (dA, dC, dG, and T), ribonucleosides (A, C, G, and U), or chemically modified nucleosides, e.g. LNA or BNA. To obtain the desired oligonucleotide, the building blocks are sequentially coupled to the growing oligonucleotide chain in the order required by the sequence of the product (see Synthetic cycle below). The process has been fully automated since the late 1970s. Upon the completion of the chain assembly, the product is released from the solid phase to solution, deprotected, and collected. The occurrence of side reactions sets practical limits for the length of synthetic oligonucleotides (up to about 200 nucleotide residues) because the number of errors accumulates with the length of the oligonucleotide being synthesized. Products are often isolated by high-performance liquid chromatography (HPLC) to obtain the desired oligonucleotides in high purity. Typically, synthetic oligonucleotides are single-stranded DNA or RNA molecules around 15–25 bases in length. Oligonucleotides find a variety of applications in molecular biology and medicine. They are most commonly used as antisense oligonucleotides, small interfering RNA, primers for DNA sequencing and amplification, probes for detecting complementary DNA or RNA via molecular hybridization, tools for the targeted introduction of mutations and restriction sites, and for the synthesis of artificial genes. (en)
- Chemiczna synteza oligonukleotydów – otrzymywanie metodami chemicznymi krótkich (maksymalnie około 200 jednostek nukleotydowych, zwykle około 20) fragmentów DNA lub RNA (oligonukleotydów) o zdefiniowanej sekwencji zasad nukleotydowych. Do reakcji wykorzystuje się zazwyczaj jednostki nukleotydowe posiadające w pozycji 3′-O aktywowaną grupę fosforanową lub jej analog, do której przyłączane są kolejno następne jednostki posiadające wolną grupę 5′-OH. Pozostałe miejsca aktywne niebiorące udziału w danej reakcji są zablokowane grupami ochronnymi. Odpowiedni dobór i manewrowanie grupami ochronnymi pozwala na uzyskanie bardzo wysokiej wydajności tworzenia wiązania internukleotydowego (powyżej 99%). W przeciwieństwie do technik enzymatycznych, metoda chemiczna pozwala na łatwe wprowadzanie różnorodnych modyfikacji we wszystkich elementach syntetyzowanego oligonukleotydu (to znaczy na zasadzie heterocyklicznej, szkielecie cukrowym oraz reszcie fosforanowej). Najczęściej modyfikacje takie stosowane są w celu zwiększenia odporności na enzymy hydrolityczne, polepszenia hybrydyzacji z komplementarną nicią kwasu nukleinowego oraz do wprowadzania znaczników, na przykład fluorescencyjnych. Modyfikowane oligonukleotydy znajdują zastosowanie w . (pl)
- Синтез олигонуклеотидов — это химический синтез относительно коротких фрагментов нуклеиновых кислот с заданной химической структурой (последовательностью). Метод применяется в современной лабораторной практике для получения олигонуклеотидов нужной последовательности быстрым и недорогим способом. Наиболее распространённый способ синтеза олигонуклеотидов основан на использовании амидофосфитов — строительных блоков, которые являются реакционноспособными производными дезоксирибонуклеозидов (dA, dC, dG, T) или (A, C, G, U) и позволяют синтезировать короткие фрагменты ДНК и РНК соответственно. Применяются также и другие амидофосфиты, позволяющие вводить в цепь продукта модифицированные нуклеозиды, различные метки и функциональные группы. В ходе синтеза эти реагенты поочерёдно, в порядке, задаваемом последовательностью целевого продукта, присоединяют к растущей на твердофазном носителе цепи. Этот процесс был полностью автоматизирован в конце 1970-х годов и в настоящее время выполняется в специальных синтезаторах, управляемых компьютерами. После завершения синтеза олигонуклеотид отделяют от носителя, удаляют защитные группы, использовавшиеся во время синтеза и очищают полученный продукт при помощи электрофореза или ВЭЖХ. Синтетические олигонуклеотиды находят широкое применение в молекулярной биологии и медицине, например, как антисмысловые олигонуклеотиды, праймеры для секвенирования и амплификации ДНК, зонды для определения комплементарных последовательностей ДНК и РНК, инструменты для нацеленного введения мутаций и сайтов рестрикции, а также для синтеза искусственных генов. (ru)
|
| rdfs:comment
|
- Die Phosphoramidit-Synthese ist eine Methode der Biochemie zur Herstellung von RNA- oder DNA-Sequenzen aus Nukleosid-Phosphoramiditen. Sie ist eine Methode zur künstlichen DNA-Synthese, die Produkte gehören zur synthetischen DNA. (de)
- La synthèse d'oligonucléotide est la synthèse chimique de fragments relativement courts d'acide nucléique avec une structure définie. (fr)
- La síntesis de oligonucleótidos es la síntesis química de fragmentos relativamente cortos de ácido nucleico con una secuencia estructural química definida. La técnica es extremadamente útil en la práctica actual en laboratorios, porque provee un acceso rápido y barato a oligonucleótidos hechos a la medida con una secuencia deseada. Mientras que las enzimas sintetizan ADN y ARN en una dirección de 5' a 3', la síntesis de oligonucleótidos se lleva a cabo en el sentido opuesto, en la dirección 3' a 5'. Actualmente, el proceso está implementado como una síntesis en fase sólida usando el método de la fosforoamidita y bloques de construcción de fosforoamidita derivados de 2'-deoxinucleósidos (dA, dC, dG y T), ribonucleósidos (A, C, G y U), o nucleósidos químicamente modificados, como los ANB. (es)
- Oligonucleotide synthesis is the chemical synthesis of relatively short fragments of nucleic acids with defined chemical structure (sequence). The technique is extremely useful in current laboratory practice because it provides a rapid and inexpensive access to custom-made oligonucleotides of the desired sequence. Whereas enzymes synthesize DNA and RNA only in a 5' to 3' direction, chemical oligonucleotide synthesis does not have this limitation, although it is most often carried out in the opposite, 3' to 5' direction. Currently, the process is implemented as solid-phase synthesis using phosphoramidite method and phosphoramidite building blocks derived from protected 2'-deoxynucleosides (dA, dC, dG, and T), ribonucleosides (A, C, G, and U), or chemically modified nucleosides, e.g. LNA or (en)
- Chemiczna synteza oligonukleotydów – otrzymywanie metodami chemicznymi krótkich (maksymalnie około 200 jednostek nukleotydowych, zwykle około 20) fragmentów DNA lub RNA (oligonukleotydów) o zdefiniowanej sekwencji zasad nukleotydowych. (pl)
- Синтез олигонуклеотидов — это химический синтез относительно коротких фрагментов нуклеиновых кислот с заданной химической структурой (последовательностью). Метод применяется в современной лабораторной практике для получения олигонуклеотидов нужной последовательности быстрым и недорогим способом. После завершения синтеза олигонуклеотид отделяют от носителя, удаляют защитные группы, использовавшиеся во время синтеза и очищают полученный продукт при помощи электрофореза или ВЭЖХ. (ru)
|