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WO2023074642A1 - 免疫グロブリン結合性タンパク質 - Google Patents

免疫グロブリン結合性タンパク質 Download PDF

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Publication number
WO2023074642A1
WO2023074642A1 PCT/JP2022/039585 JP2022039585W WO2023074642A1 WO 2023074642 A1 WO2023074642 A1 WO 2023074642A1 JP 2022039585 W JP2022039585 W JP 2022039585W WO 2023074642 A1 WO2023074642 A1 WO 2023074642A1
Authority
WO
WIPO (PCT)
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amino acid
seq
substitution
acid residue
residue corresponding
Prior art date
Application number
PCT/JP2022/039585
Other languages
English (en)
French (fr)
Inventor
崇俊 長谷見
瑛大 岩瀬
諭 遠藤
亨 田中
Original Assignee
東ソー株式会社
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Priority claimed from JP2022161843A external-priority patent/JP7414106B2/ja
Priority claimed from JP2022161841A external-priority patent/JP2023064059A/ja
Application filed by 東ソー株式会社 filed Critical 東ソー株式会社
Priority to CN202280071649.5A priority Critical patent/CN118159658A/zh
Priority to EP22886969.9A priority patent/EP4424830A1/en
Publication of WO2023074642A1 publication Critical patent/WO2023074642A1/ja

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    • C07—ORGANIC CHEMISTRY
    • C07K—PEPTIDES
    • C07K1/00—General methods for the preparation of peptides, i.e. processes for the organic chemical preparation of peptides or proteins of any length
    • C07K1/14—Extraction; Separation; Purification
    • C07K1/16—Extraction; Separation; Purification by chromatography
    • C07K1/22—Affinity chromatography or related techniques based upon selective absorption processes
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
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    • C07K14/00—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof
    • C07K14/195—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from bacteria
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    • C07K14/195—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from bacteria
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    • C12N11/02—Enzymes or microbial cells immobilised on or in an organic carrier
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
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    • C12N5/00—Undifferentiated human, animal or plant cells, e.g. cell lines; Tissues; Cultivation or maintenance thereof; Culture media therefor
    • C12N5/10—Cells modified by introduction of foreign genetic material
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    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12P—FERMENTATION OR ENZYME-USING PROCESSES TO SYNTHESISE A DESIRED CHEMICAL COMPOUND OR COMPOSITION OR TO SEPARATE OPTICAL ISOMERS FROM A RACEMIC MIXTURE
    • C12P21/00—Preparation of peptides or proteins
    • C12P21/02—Preparation of peptides or proteins having a known sequence of two or more amino acids, e.g. glutathione
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C40—COMBINATORIAL TECHNOLOGY
    • C40B—COMBINATORIAL CHEMISTRY; LIBRARIES, e.g. CHEMICAL LIBRARIES
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    • C40B40/04—Libraries containing only organic compounds
    • C40B40/06—Libraries containing nucleotides or polynucleotides, or derivatives thereof
    • C40B40/08—Libraries containing RNA or DNA which encodes proteins, e.g. gene libraries

Definitions

  • the present invention relates to proteins that specifically bind to immunoglobulins.
  • the present invention relates to an immunoglobulin-binding protein with excellent alkali stability.
  • the invention also relates to immunoglobulin binding proteins that allow antibody elution under mild pH conditions.
  • Antibody drugs are drugs that use antibodies (immunoglobulins), which are molecules responsible for in vivo immune functions. Antibody drugs bind to target molecules with high specificity and affinity due to the diversity of antibody variable regions. Therefore, antibody drugs have few side effects, and in recent years, the market has expanded rapidly partly because of the widening range of diseases for which they are indicated.
  • antibodies immunoglobulins
  • the production of antibody drugs includes a culture process and a purification process, and in the culture process, the modification of antibody-producing cells and the optimization of culture conditions are attempted in order to improve productivity.
  • affinity chromatography is employed for crude purification, followed by intermediate purification, final purification, and virus removal before formulation.
  • an affinity carrier that specifically recognizes the antibody molecule is used in the purification process.
  • the ligand protein used in the carrier Protein A derived from bacteria of the genus Staphylococcus, which has the property of binding to antibodies (immunoglobulins), is often used.
  • Protein A is a protein that specifically binds to the Fc region of antibodies, single-chain Fv (scFv), Fab, F(ab′) 2 , IgA and bispecific T cell inducer (BiTE) antibodies. It was not applicable for purification of antibodies without Fc region.
  • Protein L derived from bacteria of the genus Finegoldia is a protein that binds to the kappa light chain of immunoglobulins. Therefore, by using Protein L as a ligand protein, it is possible to purify antibodies that do not have an Fc region, which cannot be purified with Protein A described above. is also possible.
  • the affinity carrier When manufacturing antibody drugs, the affinity carrier is used multiple times in order to keep the production cost low, and after use, a process is performed to remove impurities remaining in the carrier. In the step of removing impurities, washing in place with sodium hydroxide is usually performed to regenerate the affinity carrier. Therefore, the ligand protein must have chemical stability (especially alkali stability) that allows it to retain its binding property to the antibody even after the refolding step.
  • Protein L disclosed in these documents is used as a ligand protein, it is necessary to perform alkaline washing with a sodium hydroxide aqueous solution of 20 mM to 50 mM (Non-Patent Document 1). Poor stability.
  • the antibody drug purification step includes a step of adsorbing antibody molecules to an affinity carrier under neutral pH conditions and then eluting the antibody molecules from the carrier under acidic pH conditions. It is preferable that the pH during elution is high (that is, close to neutrality), since this damages the molecules and causes aggregation.
  • Non-Patent Document 2 a method of inserting an oligopeptide having a flexible amino acid residue into an immunoglobulin-binding protein
  • Patent Document 5 a method of inserting a specific amino acid residue in an immunoglobulin-binding protein into a histidine residue.
  • Patent Document 5 A method of substituting a group.
  • the methods described in these documents are reported to reduce the chemical stability of immunoglobulin binding proteins. Therefore, an immunoglobulin-binding protein with a high antibody elution pH (that is, the antibody can be eluted under mild pH conditions) is desired without lowering its chemical stability.
  • an object of the present invention is to provide an immunoglobulin-binding protein with improved chemical stability, especially stability against alkali, and an adsorbent on which the protein is immobilized. In one aspect, an object of the present invention is to provide an immunoglobulin-binding protein capable of eluting antibodies under mild pH conditions, and an adsorbent on which the protein is immobilized.
  • the present inventors identified amino acid residues involved in improving the stability of the immunoglobulin-binding domain of Protein L (FpL) derived from bacteria of the genus Finegoldia or involved in antibody elution characteristics, The inventors have found that the above problems can be solved by substituting an amino acid residue with another specific amino acid residue, and have completed the present invention.
  • FpL Protein L
  • the present invention includes the following aspects.
  • the amino acid residue corresponding to the 50th asparagine is substituted with tyrosine
  • (e) comprising the amino acid sequence set forth in SEQ ID NO: 1 or 18, provided that the amino acid sequence has at least the amino acid substitution of (1) above, and one or more at one or several positions other than the amino acid substitution proteins containing substitutions, deletions, insertions and/or additions of several amino acid residues and having immunoglobulin binding activity
  • (f) contains an amino acid sequence having 70% or more homology with the amino acid sequence set forth in SEQ ID NO: 1 or 18 or a partial sequence thereof, but has at least the amino acid substitution of (1) above, and has immunoglobulin
  • a protein according to any of: (I) Lysine residue corresponding to 7th position in SEQ ID NO: 1 (II) Lysine residue corresponding to 13th position in SEQ ID NO: 1 (III) Lysine residue corresponding to 22nd position in SEQ ID NO: 1 (IV) SEQ ID NO: Lysine residue (V) corresponding to position 29 of SEQ ID NO: 1 Lysine residue (VI) corresponding to position 38 of SEQ ID NO: 1 Lysine residue (VII) corresponding to position 48 of SEQ ID NO: 1 (VII) Position 67 of SEQ ID NO: 1 Corresponding lysine residues.
  • substitution of the amino acid residue corresponding to the 49th glutamic acid of SEQ ID NO: 1 to aspartic acid substitution of the amino acid residue corresponding to the 6th proline of SEQ ID NO: 1 to serine, 44th of SEQ ID NO: 1
  • substitution of the amino acid residue corresponding to asparagine to aspartic acid substitution of the amino acid residue corresponding to the 49th glutamic acid of SEQ ID NO: 1 to valine, and tyrosine of the amino acid residue corresponding to the 62nd asparagine of SEQ ID NO: 1 substitution, substitution of the amino acid residue corresponding to the 23rd asparagine of SEQ ID NO: 1 to aspartic acid, and substitution of the amino acid residue corresponding to the 44th asparagine of SEQ ID NO: 1 to aspartic acid
  • [7] having at least any of the following amino acid substitutions (W), (X), (Y), (Z), (AA), (AB), (AC), (AD) and (AE) [1]
  • substitution of the amino acid residue corresponding to the 48th lysine of SEQ ID NO: 1 to histidine, corresponding to the 49th glutamic acid of SEQ ID NO: 1 Substitution of amino acid residues to aspartic acid, substitution of amino acid residues corresponding to 50th and 62nd asparagine of SEQ ID NO:1 to tyrosine, substitution of amino acid residue corresponding to 53rd tyrosine of SEQ ID NO:1 to phenylalanine , the amino acid residue corresponding to isoleucine at position 64 in SEQ ID NO: 1 to leucine, and the amino acid residue corresponding to alanine at position 69 in SEQ ID NO: 1 to valine.
  • the production method of [9] wherein the host is Escherichia coli.
  • a method for separating immunoglobulins contained in the solution comprising:
  • the present invention includes the following aspects.
  • [A3] The protein according to [A1] or [A2], which is the protein according to any one of (d) to (f) below: (d) a protein comprising the amino acid sequence set forth in SEQ ID NO: 1 or 18, provided that said amino acid sequence has at least the following amino acid substitutions of (1) and has immunoglobulin-binding activity (1) of SEQ ID NO: 1
  • the amino acid residue corresponding to the 50th asparagine is substituted with tyrosine
  • (e) comprising the amino acid sequence set forth in SEQ ID NO: 1 or 18, provided that the amino acid sequence has at least the amino acid substitution of (1) above, and one or more at one or several positions other than the amino acid substitution proteins containing substitutions, deletions, insertions and/or additions of several amino acid residues and having immunoglobulin binding activity
  • (f) contains an amino acid sequence having 70% or more homology with the amino acid sequence set forth in SEQ ID NO: 1 or 18 or a partial sequence thereof, but has at least the amino acid substitution of (1) above,
  • substitution of the amino acid residue corresponding to the 49th glutamic acid of SEQ ID NO: 1 to aspartic acid substitution of the amino acid residue corresponding to the 6th proline of SEQ ID NO: 1 to serine, 44th of SEQ ID NO: 1
  • substitution of the amino acid residue corresponding to asparagine to aspartic acid substitution of the amino acid residue corresponding to the 49th glutamic acid of SEQ ID NO: 1 to valine, and tyrosine of the amino acid residue corresponding to the 62nd asparagine of SEQ ID NO: 1 substitution, substitution of the amino acid residue corresponding to the 23rd asparagine of SEQ ID NO: 1 to aspartic acid, and substitution of the amino acid residue corresponding to the 44th asparagine of SEQ ID NO: 1 to aspartic acid
  • [A7] The protein of any of [A1] to [A6], comprising the amino acid sequence of any of SEQ ID NOs: 179, 186, 199, 224, 240, 271 and 275.
  • [A8] A polynucleotide encoding the protein of any one of [A1] to [A7].
  • [A9] An expression vector comprising the polynucleotide of [A8].
  • a genetically modified host comprising (A) or (B) below: (A) a polynucleotide encoding the protein of any one of [A1] to [A7]; (B) An expression vector comprising a polynucleotide encoding the protein of any one of [A1] to [A7].
  • [A12] a step of culturing a genetically modified host containing a polynucleotide encoding the protein according to any one of [A1] to [A7] or a genetically modified host containing an expression vector containing the polynucleotide to express the protein; and recovering the expressed protein.
  • [A13] The production method of [A12], wherein the host is Escherichia coli.
  • An immunoglobulin adsorbent comprising an insoluble carrier and the protein according to any one of [A1] to [A7] immobilized on the insoluble carrier.
  • [A15] A step of adding a solution containing immunoglobulin to the column filled with the adsorbent according to [A13] to adsorb the immunoglobulin to the adsorbent, and eluting the immunoglobulin adsorbed to the adsorbent.
  • a method for separating immunoglobulins contained in the solution A method for separating immunoglobulins contained in the solution.
  • the invention also includes the following aspects: [B1] An immunoglobulin containing an amino acid sequence of an immunoglobulin-binding domain of Protein L derived from a bacterium of the genus Finegoldia, provided that the amino acid sequence has at least one or more amino acid substitutions selected from (54) to (64) below, and an immunoglobulin a protein with binding activity; (54) Substitution of the amino acid residue corresponding to the 7th lysine of SEQ ID NO: 1 with glutamine (55) Substitution of the amino acid residue corresponding to the 13th lysine of SEQ ID NO: 1 with valine (56) 29 of SEQ ID NO: 1 Substitution of valine or isoleucine for the amino acid residue corresponding to lysine (57) Substitution of alanine for the amino acid residue corresponding to proline at position 6 in SEQ ID NO: 1 (58) Corresponding to glutamic acid at position 8 in SEQ ID NO: 1 Substitution of amino acid residue with arginine (59) Substitution of
  • substitution of the amino acid residue corresponding to the 49th glutamic acid of SEQ ID NO: 1 to aspartic acid substitution of the amino acid residue corresponding to the 6th proline of SEQ ID NO: 1 to serine, 44th of SEQ ID NO: 1
  • substitution of the amino acid residue corresponding to asparagine to aspartic acid substitution of the amino acid residue corresponding to the 49th glutamic acid of SEQ ID NO: 1 to valine, and tyrosine of the amino acid residue corresponding to the 62nd asparagine of SEQ ID NO: 1 substitution, substitution of the amino acid residue corresponding to the 23rd asparagine of SEQ ID NO: 1 to aspartic acid, and substitution of the amino acid residue corresponding to the 44th asparagine of SEQ ID NO: 1 to aspartic acid
  • [B6] The protein of any one of [B1] to [B5], having at least the following (X) or (Y) amino acid substitutions: (X) Substitution of the amino acid residue corresponding to the 4th glutamic acid of SEQ ID NO: 1 to glycine, substitution of the amino acid residue corresponding to the 6th proline of SEQ ID NO: 1 to serine, 7th of SEQ ID NO: 1 Substitution of amino acid residues corresponding to lysine with alanine, substitution of amino acid residues corresponding to lysine at positions 13, 22, 48 and 67 of SEQ ID NO: 1 with arginine, isoleucine at position 23 of SEQ ID NO: 1 Substitution of the amino acid residue corresponding to arginine, substitution of the amino acid residue corresponding to the 29th lysine of SEQ ID NO: 1 to isoleucine, substitution of the amino acid residue corresponding to the 38th lysine of SEQ ID NO: 1 to glutamic acid Substitution, substitution of the amino acid residue
  • substitution of the amino acid residue corresponding to the 48th lysine of SEQ ID NO: 1 to histidine, corresponding to the 49th glutamic acid of SEQ ID NO: 1 Substitution of amino acid residues to aspartic acid, substitution of amino acid residues corresponding to 50th and 62nd asparagine of SEQ ID NO:1 to tyrosine, substitution of amino acid residue corresponding to 53rd tyrosine of SEQ ID NO:1 to phenylalanine , the amino acid residue corresponding to isoleucine at position 64 in SEQ ID NO: 1 to leucine, and the amino acid residue corresponding to alanine at position 69 in SEQ ID NO: 1 to valine.
  • [B7] The protein of any one of [B1] to [B6], comprising the amino acid sequence set forth in SEQ ID NO:408 or 413.
  • [B8] A polynucleotide encoding the protein of any one of [B1] to [B7].
  • [B9] An expression vector comprising the polynucleotide of [B8].
  • [B10] A genetically modified host comprising (A) or (B) below: (A) a polynucleotide encoding the protein of any one of [B1] to [B7]; (B) An expression vector comprising a polynucleotide encoding the protein of any one of [B1] to [B7].
  • [B12] a step of culturing a genetically modified host containing a polynucleotide encoding the protein according to any one of [B1] to [B7] or a genetically modified host containing an expression vector containing the polynucleotide to express the protein; and recovering the expressed protein.
  • [B13] The production method of [B12], wherein the host is Escherichia coli.
  • An immunoglobulin adsorbent comprising an insoluble carrier and the protein according to any one of [B1] to [B7] immobilized on the insoluble carrier.
  • [B15] A step of adding a solution containing immunoglobulin to the column filled with the adsorbent according to [B14] to adsorb the immunoglobulin to the adsorbent, and a step of eluting the immunoglobulin adsorbed to the adsorbent by changing the pH.
  • a method for separating immunoglobulins contained in said solution comprising: [B16] The method of [B15], wherein the pH change is a decrease in pH.
  • the protein of the present invention is a specific immunoglobulin-binding protein.
  • immunoglobulin-binding protein means a protein that binds to immunoglobulins. That is, the proteins of the present invention have binding properties for specific immunoglobulins. Specifically, the protein of the present invention may have binding properties to the ⁇ light chain of immunoglobulins. As used herein, binding to immunoglobulins is also referred to as "immunoglobulin binding activity" or "antibody binding activity.” Immunoglobulin binding activity can be measured, for example, by an ELISA (Enzyme-Linked ImmunoSorbent Assay) method. The ELISA method can be performed, for example, under the conditions described in Examples.
  • ELISA Enzyme-Linked ImmunoSorbent Assay
  • the protein of the present invention contains the amino acid sequence of the immunoglobulin-binding domain of Protein L (also referred to as "FpL”) derived from a bacterium of the genus Finegoldia, provided that the amino acid sequence has amino acid substitutions at specific positions.
  • FpL Protein L
  • the amino acid sequence of the immunoglobulin-binding domain of FpL which does not have amino acid substitutions at specific positions, is also referred to as "unmodified amino acid sequence”
  • the amino acid sequence of the immunoglobulin-binding domain of FpL and having an amino acid substitution at a specific position is also referred to as a "modified amino acid sequence”.
  • the modified amino acid sequence may be the same amino acid sequence as the unmodified amino acid sequence except for having amino acid substitutions at specified positions.
  • a protein of the present invention may also be a protein comprising an amino acid sequence identical to an unmodified amino acid sequence, except for, for example, having amino acid substitutions at specific positions.
  • the protein of the present invention may be, for example, a protein containing a modified amino acid sequence.
  • An unmodified amino acid sequence may or may not be an amino acid sequence found in nature.
  • An unmodified amino acid sequence may be modified, for example, to have a desired property.
  • An unmodified amino acid sequence may have, for example, amino acid substitutions other than those at specific positions.
  • the Finegoldia bacterium from which FpL is derived includes Finegoldia magna.
  • domain B1 amino acid residues 104 to 173 of SEQ ID NO: 209 (GenBank No.
  • domain B2 (amino acid residues 176 to 245 of SEQ ID NO: 209), domain B3 (amino acid residues 248 to 317 of SEQ ID NO: 209), domain B4 (amino acid residues 320 to 389 of SEQ ID NO: 209), domain B5 (amino acid residues 393 to 462 of SEQ ID NO: 209), domain C1 (amino acid residues 249 to 317 of SEQ ID NO: 210 (GenBank No.
  • AAA67503 SEQ ID NO: 112), domain C2 (amino acid residues 320 to 389 of SEQ ID NO: 210: SEQ ID NO: 113), Domain C3 (394th to 463rd amino acid residues of SEQ ID NO:210: SEQ ID NO:1) and domain C4 (468th to 537th amino acid residues of SEQ ID NO:210: SEQ ID NO:18).
  • the unmodified amino acid sequence is (i) may be the entire amino acid sequence of the immunoglobulin binding domain of FpL described above, (ii) It may be a partial amino acid sequence of the domain as long as it has binding activity to immunoglobulin.
  • the immunoglobulin-binding domain of FpL is composed of four ⁇ -sheets, one ⁇ -helix, a loop connecting them, and an N-terminal loop region. Amino acid residues in regions irrelevant to binding to may be deleted. As a specific example, it has immunoglobulin-binding ability even when amino acid residues from the 1st glutamic acid to the 9th glutamic acid, which correspond to the N-terminal loop region of the FpL domain C3 (SEQ ID NO: 1), are deleted. (Housden NG et al. Biochemical Society Transaction, 2003, 31, 716-718).
  • the partial amino acid sequence in (ii) above contains at least the amino acid sequence of the immunoglobulin-binding site. That is, the partial amino acid sequence in (ii) above includes a partial sequence containing the amino acid sequence of the immunoglobulin-binding site.
  • Modified amino acid sequences in the present specification specifically include amino acid sequences having amino acid substitutions at specific positions in the amino acid sequence of the immunoglobulin-binding domain described above, such as the amino acid sequence set forth in SEQ ID NO:1. That is, the protein of the present invention specifically includes the amino acid sequence of the immunoglobulin-binding domain described above, such as the amino acid sequence set forth in SEQ ID NO: 1, provided that the amino acid sequence has an amino acid substitution at a specific position. mentioned.
  • a protein of the invention is a protein comprising an amino acid sequence identical to the immunoglobulin binding domain amino acid sequence described above, eg, the amino acid sequence set forth in SEQ ID NO: 1, except with amino acid substitutions at specific positions. you can
  • a protein comprising an amino acid sequence is also referred to as "a protein comprising an amino acid residue consisting of an amino acid sequence", and a protein or an amino acid sequence having an amino acid substitution is referred to as "an amino acid substitution in a protein or an amino acid sequence.” is also said to occur.
  • An amino acid that constitutes a protein or an amino acid sequence is also referred to as an "amino acid residue”.
  • the protein of the present invention may be an immunoglobulin binding protein with improved alkali stability.
  • the protein of the present invention is an immunoglobulin-binding protein that has improved alkali stability compared to an immunoglobulin-binding protein that does not have a modified amino acid sequence (for example, consists of an unmodified amino acid sequence).
  • the protein of the present invention may be an immunoglobulin-binding protein with improved alkali stability compared to an immunoglobulin-binding protein that does not have an amino acid substitution at said specific position.
  • the protein of the present invention may be an immunoglobulin-binding protein having improved alkali stability due to the amino acid substitution at the specific position.
  • the amino acid substitution at the specific position may improve the alkali stability of the immunoglobulin-binding protein.
  • Alkaline stability may mean resistance to deactivation in alkaline conditions. An improvement in alkali stability can be measured, for example, as an improvement in residual activity after alkali treatment. As used herein, "activity” means immunoglobulin binding activity. Alkaline treatment can be carried out, for example, under the conditions described in Examples.
  • the protein of the present invention may be an immunoglobulin-binding protein that allows antibody elution under mild pH conditions.
  • the protein of the present invention is an immunoglobulin-binding protein that allows antibody elution under milder pH conditions than an immunoglobulin-binding protein that does not have a modified amino acid sequence (for example, consists of an unmodified amino acid sequence).
  • the protein of the present invention may be an immunoglobulin-binding protein that allows antibody elution under mild pH conditions compared to an immunoglobulin-binding protein that does not have an amino acid substitution at the specific position.
  • the protein of the present invention may be an immunoglobulin-binding protein that allows antibody elution under mild pH conditions by having an amino acid substitution at the specific position.
  • the amino acid substitution at the specific position may allow antibody elution from the immunoglobulin-binding protein under mild pH conditions.
  • Mild pH conditions may mean pH conditions close to neutrality. That is, the expression “antibody can be eluted under mild conditions” may mean that the antibody can be eluted under near-neutral pH conditions. Further, since the elution pH of a typical antibody can be acidic, "allowing antibody elution under mild conditions” may mean that the elution pH of the antibody is increased. The elution pH of the antibody can be measured, for example, under the conditions described in Examples.
  • the protein of the present invention may be an immunoglobulin-binding protein that has improved alkali stability and allows antibody elution under mild pH conditions.
  • the amino acid substitutions at the specific positions include group 1 mutations and/or group 2 mutations.
  • the amino acid substitution at the specific position may contain only the first group mutation among the first group mutation and the second group mutation, may contain only the second group mutation, the first group mutation and the second group mutation Both groups of mutations may be included.
  • the amino acid substitution at the specific position may contain at least the first group mutation, and may further contain the second group mutation.
  • the amino acid substitutions at the specific positions may contain at least Group 2 mutations, and may further contain Group 1 mutations.
  • the first group mutation may be a mutation that improves the alkaline stability of the immunoglobulin-binding protein.
  • the amino acid substitution at the specified position may be a mutation that improves the alkaline stability of the immunoglobulin binding protein.
  • Amino acid substitutions at said specific positions may comprise Group 1 mutations, for example when the protein of the invention is an immunoglobulin binding protein with improved alkaline stability.
  • Amino acid substitutions at the specific positions for example, when the protein of the present invention is an immunoglobulin-binding protein with improved alkali stability, may contain at least group 1 mutations, and further contains group 2 mutations. You can stay.
  • a protein of the invention having at least group 1 mutations may also be an immunoglobulin binding protein with improved alkaline stability.
  • Group 2 mutations may be mutations that enable antibody elution from immunoglobulin-binding proteins under mild pH conditions. Therefore, when the amino acid substitution at the specific position includes a second group mutation, the amino acid substitution at the specific position may be a mutation that enables antibody elution from immunoglobulin-binding protein under mild pH conditions. Amino acid substitutions at the specific positions may include Group 2 mutations, for example, when the protein of the present invention is an immunoglobulin-binding protein that allows antibody elution under mild pH conditions.
  • Amino acid substitution at the specific position may contain at least second group mutations, furthermore, the first It may contain group mutations.
  • the protein of the present invention having at least group 2 mutations may be an immunoglobulin binding protein that allows antibody elution under mild pH conditions.
  • the amino acid substitution at the specific position improves the alkaline stability of the immunoglobulin binding protein, and is immunized under mild pH conditions. It may be a mutation that allows antibody elution from globulin-binding proteins. Also, the protein of the present invention having both Group 1 mutations and Group 2 mutations may be an immunoglobulin-binding protein that has improved alkali stability and allows antibody elution under mild pH conditions.
  • the first group mutation is Asn50Tyr (this notation indicates that the amino acid residue corresponding to the 50th asparagine of SEQ ID NO: 1 is substituted with tyrosine; hereinafter, other amino acid substitutions shall be interpreted similarly), Glu1Gly, Glu1Val, Pro3Ser, Glu4Lys, Glu4Gly, Glu5Val, Lys7Ala, Glu8Gly, Glu9Val, Ile17Phe, Gly21Arg, Glu27Gly, Glu27Arg, Lys29Pro, Thr31 Leu, Thr36Ala, Ala41Thr, Asn44Ser, Asn44Gly, Glu49Thr, Glu49Ile A sn62Trp, Asn65Tyr, Ala69Thr, Thr2Ser, Thr2Pro, Pro3Arg, Glu5Lys, Glu5Arg, Glu27Val, Glu27Lys, Glu27Ile , Phe32Leu
  • the first group mutation is (1) Asn50Tyr (2) Glu1Gly or Glu1Val (3) Pro3Ser (4) Glu4Lys or Glu4Gly (5) Glu5Val (6) Lys7Ala (7) Glu8Gly (8) Glu9Val (9) Ile17Phe (10) Gly21Arg (11) Glu27Gly or Glu27Arg (12) Lys29Pro (13) Thr31Leu (14) Thr36Ala (15) Ala41Thr (16) Asn44Ser or Asn44Gly (17) Glu49Thr or Glu49Ile (18) any of Asn50Ser, Asn50Lys and Asn50Asp (19) Gly51Val (20) any of Glu52Val, Glu52Gly and Glu52Asp (21) Tyr53Phe (22) Thr54Ile or Thr54Met (23) any of Asn62His, Asn62Arg, Asn62Leu, Asn62Met and Asn62Trp (24) Asn65Ty
  • the protein of the present invention has, for example, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8 or 9 amino acids selected from the above (1) to (53) amino acid substitutions It may have substitutions and may have 10 or more amino acid substitutions.
  • the amino acid substitution (Asn50Tyr) of (1) is an amino acid substitution that particularly improves the stability against alkali. Therefore, an immunoglobulin binding protein having at least the amino acid substitution (Asn50Tyr) of (1) is a preferred example of the protein of the present invention. That is, the protein of the present invention may have, for example, at least (1) amino acid substitution (Asn50Tyr).
  • the protein of the present invention may have, for example, only the (1) amino acid substitution (Asn50Tyr) among the amino acid substitutions (1) to (53), and the amino acid (1) It may have a combination of the substitution (Asn50Tyr) and one or more amino acid substitutions selected from amino acid substitutions (2) to (53). Further, the amino acid substitution at the specific position is, for example, one or more selected from the amino acid substitutions (1) to (53) (e.g., 1, 2, 3, 4, 5, 6 , 7, 8, 9, or 10 or more) amino acid substitutions.
  • the second group mutations are specifically Lys7Gln, Lys13Val, Lys29Val, Lys29Ile, Pro6Ala, Glu8Arg, Asn15Val, Ile23Phe, Ile23Leu, Glu34Asp, Glu34Phe, Glu34Leu, Glu34Val, Lys38Le at least one or more selected from u, Asn50Met and Tyr53Ser Amino acid substitution.
  • the second group mutation is (54) Lys7Gln (55) Lys13Val (56) Lys29Val or Lys29Ile (57) Pro6Ala (58) Glu8Arg (59) Asn15Val (60) Ile23Phe or Ile23Leu (61) any of Glu34Asp, Glu34Phe, Glu34Leu and Glu34Val (62) Lys38Leu (63) Asn50Met (64) Tyr53Ser one or more amino acid substitutions selected from That is, the protein of the present invention may have one or more amino acid substitutions selected from the above amino acid substitutions (54) to (64).
  • the protein of the present invention has, for example, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8 or 9 amino acids selected from the above (54) to (64) amino acid substitutions It may have substitutions and may have 10 or more amino acid substitutions. Further, the amino acid substitution at the specific position is, for example, one or more selected from the amino acid substitutions (54) to (64) (e.g., 1, 2, 3, 4, 5, 6 , 7, 8, 9, or 10 or more) amino acid substitutions.
  • the protein of the present invention has one or more amino acid substitutions selected from the above (1) to (64) amino acid substitutions.
  • the protein of the present invention is selected from one or more amino acid substitutions selected from the above (1) to (53) amino acid substitutions and/or the above (54) to (64) amino acid substitutions. It has one or more amino acid substitutions.
  • the protein of the present invention includes, for example, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9 selected from the amino acid substitutions (1) to (53) above. or 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9 selected from 10 or more amino acid substitutions and/or amino acid substitutions from (54) to (64) above It may have one, ten or more amino acid substitutions.
  • the protein of the present invention has, for example, at least a combination of the amino acid substitution (Asn50Tyr) of (1) and one or more amino acid substitutions selected from the amino acid substitutions of (54) to (64). good.
  • the protein of the present invention having a combination of at least (1) amino acid substitution (Asn50Tyr) and one or more amino acid substitutions selected from (2) to (53) amino acid substitutions has improved alkali stability, and It can be a preferred example of an immunoglobulin-binding protein that allows antibody elution under mild pH conditions.
  • amino acid substitutions (1) to (64) above amino acid substitutions at the same positions are not selected at the same time.
  • amino acid substitution of (3) and the amino acid substitution of (27) are not selected at the same time.
  • the combination of those amino acid substitutions is not particularly limited as long as it includes group 1 mutations and/or group 2 mutations.
  • amino acid substitutions selected from the amino acid substitutions (1) to (53) (also referred to as a "combination of group 1 mutations"), amino acid substitutions of Asn50Tyr and Glu52Gly; Ile17Phe and Asn50Ser amino acid substitutions; Amino acid substitutions of Glu8Gly and Glu52Val; amino acid substitutions of Glu27Gly, Ala41Thr, Asn50Lys and Asn65Tyr; Amino acid substitutions of Pro3Ser, Asn50Asp and Thr54Ile; Amino acid substitutions of Asn44Ser, Asn50Tyr and Glu52Gly; amino acid substitutions of Asn44Ser and Asn50Tyr; amino acid substitutions of Asn50Tyr and Glu52Val; amino acid substitutions of Asn44Gly, Asn50Tyr and Glu52Val; amino acid substitutions of Asn44Gly, Asn50Tyr and Glu52Val; amino acid substitutions of As
  • amino acid substitutions selected from the amino acid substitutions (54) to (64) (also referred to as a "group 2 mutation combination"), Amino acid substitutions of Pro6Ala and Lys29Ile; Amino acid substitutions of Glu8Arg and Lys29Ile; Amino acid substitutions of Ile23Phe and Lys29Ile; Ile23Leu and Lys29Ile amino acid substitutions; amino acid substitutions of Lys29Ile and Lys38Leu; amino acid substitutions of Lys29Ile and Asn50Met; amino acid substitutions of Lys59Ile and Tyr53Ser; Amino acid substitutions of Asn15Val and Lys29Ile; amino acid substitutions of Lys29Ile and Glu34Asp; amino acid substitutions of Lys29Ile and Glu34Phe; amino acid substitutions of Lys29Ile and Glu34Leu; amino acid substitutions of Lys29Ile and Glu34Val; is given.
  • any combination of the first group mutation combination exemplified above and any combination of the second group mutation combination exemplified above is mentioned.
  • amino acid substitutions selected from the amino acid substitutions (1) to (64) (specifically, from the amino acid substitutions (1) to (53) one or more selected amino acid substitutions and/or one or more amino acid substitutions selected from the above (54) to (64) amino acid substitutions) and at least selected from the following (I) to (VII)
  • a basic amino acid other than lysine arginine (Arg) or histidine (His)
  • an amino acid with a hydroxy group seerine (Ser), threonine (Thr) or tyrosine (Tyr)
  • the protein of the present invention may have 1, 2, 3, 4, 5, 6 or 7 lysine residue substitutions selected from (I) to (VII).
  • amino acid substitutions (I) to (VII) amino acid substitutions at the same positions as one or more amino acid substitutions selected from (1) to (64) above may not be selected. That is, for example, when at least (6) Lys7Ala, (38) Lys7Pro or (54) Lys7Gln amino acid substitutions are selected from the amino acid substitutions (1) to (64), the amino acid substitution of (I) is selected. It doesn't have to be.
  • a combination of amino acid substitutions is selected so that at least one or more amino acid substitutions selected from the above amino acid substitutions (1) to (64) remain.
  • amino acid substitution (I) is selected Can not.
  • a combination of amino acid substitutions may be selected such that at least one or more amino acid substitutions selected from the amino acid substitutions (1) to (53) above remain.
  • a combination of amino acid substitutions may be selected such that at least one or more amino acid substitutions selected from the above amino acid substitutions (54) to (64) remain.
  • lysine residues other than lysine residues substituted with basic amino acids or amino acids having a hydroxy group that is, those not selected from among the lysine residues (I) to (VII)
  • It may remain unsubstituted (lysine residue), or may be substituted with an amino acid other than a basic amino acid and an amino acid having a hydroxy group.
  • Examples of the latter include the substitution of lysine residues with glutamine or isoleucine, and the aforementioned (6) Lys7Ala, (12) Lys29Pro, (31) Lys38Ala, (38) Lys7Pro, (41) Lys29Phe, (55) Lys13Val, (56 (partial)) Lys29Val and (62) Lys38Leu amino acid substitutions.
  • amino acid substitutions of Lys7Gln, Lys13Arg, Lys22Arg, Lys29Arg, Lys48Arg and Lys67Arg amino acid substitutions of Lys7Gln, Lys13Arg, Lys22Arg, Lys29Arg, Lys48Arg and Lys67Arg; Amino acid substitutions of Lys7Arg, Lys13Val, Lys22Arg, Lys29Arg, Lys48Arg and Lys67Arg; amino acid substitutions of Lys7Arg, Lys13Arg, Lys22Arg, Lys29Val, Lys48Arg and Lys67Arg; amino acid substitutions of Lys7Arg, Lys13Arg, Lys22Arg, Lys29Ile, Lys48Arg and Lys67Arg; amino acid substitutions of Lys7Ala, Lys13Arg, Lys29Ile, Lys38Arg, Lys48Arg and Lys67Arg; amino acid substitutions of Lys7Ala, Lys13Arg, Lys29Ile, Lys38Arg, Lys48Arg and Lys67Arg
  • amino acid substitutions of Lys7Ala, Lys13Arg, Lys22Gln, Lys29Ile, Lys38Arg, Lys48Arg, Asn50Tyr, Glu52Gly and Lys67Arg among others; amino acid substitutions of Lys7Ala, Lys13Arg, Lys22Arg, Lys29Ile, Lys38Arg, Lys48Arg, Asn50Tyr, Glu52Gly, Tyr53Phe and Lys67Arg; amino acid substitutions of Glu4Gly, Lys7Ala, Lys13Arg, Lys22Arg, Lys29Ile, Lys38Arg, Lys48Arg, Asn50Tyr, Glu52Asp, Tyr53Phe and Lys67Arg; amino acid substitutions of Glu4Gly, Lys7Ala, Lys13Arg, Lys22Arg, Glu27Arg, Lys29Ile, Lys38Arg, Lys48Arg, Asn50Tyr, Glu
  • the protein of the present invention may further have at least one other amino acid substitution.
  • Other amino acid substitutions include Glu49Asp, Pro6Ser, Asn44Asp, Glu49Val, Asn62Tyr, Ile23Thr, Ala41Arg.
  • Other amino acid substitutions may, for example, improve the alkaline stability of the immunoglobulin binding protein.
  • amino acid substitutions of Asn44Asp, Glu49Val, Asn62Tyr, Ile23Thr, and Ala41Arg can all improve the alkaline stability of immunoglobulin binding proteins.
  • a protein of the invention may have, for example, 1, 2, 3, 4, 5, or 6 of said other amino acid substitutions.
  • the amino acid substitution (Glu49Thr or Glu49Ile) of (17) is the amino acid substitution of Glu49Asp
  • the amino acid substitution of Pro6Ser is selected, the amino acid substitution of (37) (either Pro6Leu or Pro6Thr) is the amino acid substitution of Pro6Ser
  • the amino acid substitution of Asn44Asp is selected, the amino acid substitution of (16) (Asn44Ser or Asn44Gly), the amino acid substitution of (32) (Asn44Ile) and the amino acid substitution of (48) (Asn44His or Asn44Arg) are those of Asn44Asp
  • the amino acid substitution of Glu49Val is selected, the amino acid substitution (Glu49Thr or Glu49Ile) of (17) is the amino acid substitution of Glu49Val
  • the amino acid substitution of Asn62Tyr is selected, the amino acid substitution of (23) (any of Asn62His, Asn62Arg, Asn62
  • amino acid substitutions at the same position as one or more amino acid substitutions selected from (1) to (64) above may not be selected. That is, for example, when at least (17) amino acid substitution (Glu49Thr or Glu49Ile) is selected from the amino acid substitutions (1) to (64), the amino acid substitutions of Glu49Asp and Glu49Val may not be selected.
  • a combination of amino acid substitutions is selected so that at least one or more amino acid substitutions selected from (1) to (64) above remain. That is, for example, when the amino acid substitution (17) (Glu49Thr or Glu49Ile) is selected alone from the amino acid substitutions (1) to (64), the amino acid substitutions of Glu49Asp and Glu49Val cannot be selected.
  • a combination of amino acid substitutions may be selected such that at least one or more amino acid substitutions selected from the above amino acid substitutions (1) to (53) remain. Also, the combination of amino acid substitutions may be selected such that at least one or more amino acid substitutions selected from the above amino acid substitutions (54) to (64) remain. That is, modified amino acid sequences also include amino acid sequences having amino acid substitutions at the above specific positions and other amino acid substitutions such as Glu49Asp and Pro6Ser in the non-modified amino acid sequences exemplified above (for example, the amino acid sequence set forth in SEQ ID NO: 1). be done.
  • the protein of the present invention includes the unmodified amino acid sequence exemplified above (for example, the amino acid sequence set forth in SEQ ID NO: 1), provided that amino acid substitutions at the specific positions and other Proteins with amino acid substitutions are also included.
  • the protein of the present invention has, for example, the unmodified amino acid sequences exemplified above (for example, the amino acid sequence set forth in SEQ ID NO: 1), except for having amino acid substitutions at the specific positions and other amino acid substitutions such as Glu49Asp and Pro6Ser. It may be a protein containing the same amino acid sequence as Glu49Asp and Pro6Ser exemplified as other amino acid substitutions above are amino acid substitutions capable of binding to the ⁇ light chain of immunoglobulin regardless of subgroup.
  • Combinations of amino acid substitutions containing the other amino acid substitutions include, among the combinations of amino acid substitutions exemplified above, combinations further containing 1, 2, 3, 4, 5, or 6 of the other amino acid substitutions. mentioned. Combinations of amino acid substitutions including other amino acid substitutions include, in particular, combinations of the above-exemplified amino acid substitution combinations further including at least an Asn62Tyr amino acid substitution.
  • proteins of the present invention further having the other amino acid substitutions include the following proteins. These proteins are preferred in that they have improved alkali stability and can bind to the ⁇ light chain of immunoglobulins regardless of subgroup.
  • an immunoglobulin binding comprising the amino acid sequence set forth in SEQ ID NO: 1, but having the following amino acid substitutions in said amino acid sequence: protein (sequence an immunoglobulin binding protein comprising the amino acid sequence set forth in number 179).
  • an immunoglobulin binding protein comprising the amino acid sequence set forth in SEQ ID NO: 1, wherein Lys7Ala, Lys13Arg, Lys22Arg, Lys29Ile, Lys38Arg, Lys48Arg, Glu49Asp, Asn50Tyr, Glu52Gly, Tyr53Phe, Asn62Tyr and Lys67Arg an immunoglobulin binding protein having an amino acid substitution of (An immunoglobulin binding protein comprising the amino acid sequence set forth in SEQ ID NO: 186).
  • a globulin binding protein (an immunoglobulin binding protein comprising the amino acid sequence set forth in SEQ ID NO:224).
  • a globulin binding protein (an immunoglobulin binding protein comprising the amino acid sequence set forth in SEQ ID NO:240).
  • a globulin binding protein (an immunoglobulin binding protein comprising the amino acid sequence set forth in SEQ ID NO:275).
  • proteins of the present invention further having the other amino acid substitution include the following proteins. These proteins are preferred in that they have improved alkali stability and can bind to the ⁇ light chain of immunoglobulins regardless of subgroup.
  • the immunoglobulin adsorbent of the present invention obtained by immobilizing these proteins on an insoluble carrier, compared with conventional immunoglobulin adsorbents, immunoglobulins (antibodies) having ⁇ light chains, regardless of subgroup, It is preferable in that it can be eluted under mild pH conditions.
  • amino acid substitutions that the proteins of the invention have include the following: Amino acid substitutions of Lys7Ala, Lys13Arg, Lys22Gln, Lys29Ile, Lys38Arg, Lys48Arg, Glu49Asp, Asn50Tyr, Glu52Gly, Asn62Tyr and Lys67Arg; Amino acid substitutions of Lys7Ala, Lys13Arg, Lys22Arg, Lys29Ile, Lys38Arg, Lys48Arg, Glu49Asp, Asn50Tyr, Glu52Gly, Tyr53Phe, Asn62Tyr and Lys67Arg; amino acid substitutions of Glu4Gly, Lys7Ala, Lys13Arg, Lys22Arg, Lys29Ile, Lys38Arg, Lys48Arg, Glu49Asp, Asn50Tyr, Glu52Asp, Tyr53Phe, Asn62Tyr and Lys67Arg; amino acid substitutions of Glu4G
  • an amino acid sequence having the above-exemplified amino acid substitutions in the amino acid sequence set forth in SEQ ID NO: 1 is defined as "derived from SEQ ID NO: 1 Also referred to as "replacement amino acid sequence”.
  • the substituted amino acid sequence derived from SEQ ID NO: 1 is the amino acid sequence set forth in SEQ ID NO: 1 in which the amino acid substitutions exemplified above (i.e., amino acid substitutions at the specific positions and any other amino acid substitutions such as Glu49Asp and Pro6Ser) have occurred. .
  • the substituted amino acid sequence derived from SEQ ID NO: 1 except for having the amino acid substitutions exemplified above (that is, amino acid substitutions at the specific positions and any other amino acid substitutions such as Glu49Asp and Pro6Ser) It is the same amino acid sequence as the amino acid sequence.
  • a substituted amino acid sequence derived from SEQ ID NO: 1 is an example of a modified amino acid sequence herein.
  • Modified amino acid sequences in the present specification also include variant sequences of the above-exemplified modified amino acid sequences (eg, substituted amino acid sequences derived from SEQ ID NO: 1). That is, the protein of the present invention also includes a protein containing a variant sequence of the above-exemplified modified amino acid sequence (for example, a substituted amino acid sequence derived from SEQ ID NO: 1) and having immunoglobulin-binding activity.
  • a variant sequence of the substituted amino acid sequence derived from SEQ ID NO: 1 will be described as an example, but the description can be applied mutatis mutandis to the variant sequence of any modified amino acid sequence.
  • the variant sequence of the substituted amino acid sequence derived from SEQ ID NO: 1 shall be set so that the amino acid substitution at the specific position remains (that is, the protein of the present invention has the amino acid substitution at the specific position).
  • the variant sequence of the substituted amino acid sequence derived from SEQ ID NO: 1 is set so that other amino acid substitutions such as Glu49Asp and Pro6Ser remain (that is, the protein of the present invention has other amino acid substitutions such as Glu49Asp and Pro6Ser).
  • the variant sequence of the substituted amino acid sequence derived from SEQ ID NO: 1 is selected from, for example, the amino acid substitutions exemplified above (that is, amino acid substitutions at the specific positions and other amino acid substitutions such as arbitrary Glu49Asp and Pro6Ser), derived from SEQ ID NO: 1 It may additionally have one or more amino acid substitutions that the replacement amino acid sequence does not have.
  • the substituted amino acid sequence derived from SEQ ID NO:1 does not have other amino acid substitutions such as Glu49Asp or Pro6Ser
  • the variant sequence of the substituted amino acid sequence derived from SEQ ID NO:1 may have the other amino acid substitutions.
  • Variant sequences of the substituted amino acid sequence derived from SEQ ID NO: 1 include substitution, deletion, insertion and/or addition of one or several amino acid residues at one or several positions in the substituted amino acid sequence derived from SEQ ID NO: 1.
  • SEQ ID NO: 1 may contain substitutions, deletions, insertions and/or additions of one or several amino acid residues at one or several positions.
  • the protein of the present invention includes the amino acid sequence shown in SEQ ID NO: 1, provided that the amino acid substitutions exemplified above (that is, amino acid substitutions at the specific positions and other amino acid substitutions such as arbitrary Glu49Asp and Pro6Ser) are substituted in the amino acid sequence. ), further comprising substitutions, deletions, insertions and/or additions of one or several amino acid residues at one or several positions and having immunoglobulin binding activity.
  • the protein of the present invention has, for example, the amino acid substitutions exemplified above (that is, amino acid substitutions at the specific positions and any other amino acid substitutions such as Glu49Asp and Pro6Ser), and further 1 at one or several positions.
  • it may be a protein comprising the same amino acid sequence as SEQ ID NO: 1 except for substitutions, deletions, insertions and/or additions of several amino acid residues and having immunoglobulin binding activity.
  • the substitution, deletion, insertion, and/or addition of the above amino acid residues shall be selected so that the amino acid substitution at the specific position remains. That is, the substitution, deletion, insertion and/or addition of the above amino acid residues may occur, for example, at positions other than the specific positions. Also, the above amino acid residue substitutions, deletions, insertions and/or additions may be selected such that the other amino acid substitutions remain.
  • substitutions, deletions, insertions, and/or additions of the amino acid residues described above may occur, for example, at positions other than the other amino acid substitutions.
  • the substitution, deletion, insertion, and/or addition of the above amino acid residues is, for example, one or more amino acid substitutions selected from the amino acid substitutions exemplified above, which the substituted amino acid sequence derived from SEQ ID NO: 1 does not have may contain
  • the above-mentioned "one or several" varies depending on the position of the amino acid residue in the three-dimensional structure of the protein and the type of the amino acid residue. 9, 1 to 8, 1 to 7, 1 to 6, 1 to 5, 1 to 4, 1 to 3, 1 to 2, or 1.
  • substitution of amino acid residues described above is conservative substitution in which substitution occurs between amino acids having similar physical and/or chemical properties. It is known to those skilled in the art that in the case of conservative substitutions, protein function is generally maintained between those with and without substitutions. Examples of conservative substitutions include substitutions between glycine and alanine, between serine and proline, or between glutamic acid and alanine (Protein Structure and Function, Medical Science International, 9, 2005).
  • conservative substitutions include substitutions between glycine and alanine, between serine and proline, or between glutamic acid and alanine (Protein Structure and Function, Medical Science International, 9, 2005).
  • substitution, deletion, insertion, and/or addition of the above amino acid residues are naturally occurring, for example, based on individual differences in microorganisms and species differences from which proteins or genes encoding them are derived. Also included are those caused by mutations (mutants or variants).
  • Variant sequences of the substituted amino acid sequence derived from SEQ ID NO:1 also include amino acid sequences with high homology to the substituted amino acid sequence derived from SEQ ID NO:1. That is, as the protein of the present invention, an amino acid sequence having the above-exemplified amino acid substitution (that is, amino acid substitution at the specific position and optionally other amino acid substitution such as Glu49Asp or Pro6Ser) in the amino acid sequence shown in SEQ ID NO: 1 Proteins containing amino acid sequences with high homology and having immunoglobulin binding activity are also included. In addition, the amino acid sequence change within the range of homology as described above shall be selected so that the amino acid substitution at the specific position remains.
  • amino acid sequence changes within the range of homology as described above may occur, for example, at positions other than the specific positions.
  • amino acid sequence changes within the range of homology as described above may be selected so that other amino acid substitutions remain. That is, amino acid sequence changes within the range of homology as described above may occur, for example, at positions other than other amino acid substitutions.
  • amino acid sequence changes within the range of homology as described above include, for example, one or more amino acid substitutions selected from the amino acid substitutions exemplified above, which are not present in the substituted amino acid sequence derived from SEQ ID NO: 1. You can Said “homology” may mean similarity or identity, in particular identity. "Homology to an amino acid sequence” means homology to the entire amino acid sequence.
  • the "high homology” may mean 70% or more, 80% or more, 90% or more, or 95% or more homology.
  • Identity between amino acid sequences means the ratio of amino acid residues of the same type in those amino acid sequences (Jikken Igaku February 2013 Vol. 31 No. 3, Yodosha).
  • similarity between amino acid sequences means the sum of the ratio of amino acid residues with the same type and the ratio of amino acid residues with similar side chain properties in those amino acid sequences (experimental medicine February 2013 No. Vol. 31 No. 3, Yodosha). Amino acid residues with similar side chain properties are described above. Amino acid sequence homology can be determined using an alignment program such as BLAST (Basic Local Alignment Search Tool) or FASTA.
  • modified amino acid sequence in the variant sequences exemplified above, one or more selected from the amino acid substitutions exemplified above (that is, amino acid substitutions at the specific positions and optionally other amino acid substitutions such as Glu49Asp and Pro6Ser) Amino acid sequences with amino acid substitutions are also included.
  • the modified amino acid sequence may be an amino acid sequence having another amino acid substitution in at least the variant sequence having the amino acid substitution at the specific position.
  • the non-modified amino acid sequences also include variant sequences of the non-modified amino acid sequences exemplified above (for example, the amino acid sequence set forth in SEQ ID NO: 1). That is, as the modified amino acid sequence, in the variant sequence of the non-modified amino acid sequence exemplified above (for example, the amino acid sequence set forth in SEQ ID NO: 1), the amino acid substitutions exemplified above (that is, amino acid substitutions at the specific positions and optionally Glu49Asp and other amino acid substitutions such as Pro6Ser).
  • the protein of the present invention includes a variant sequence of the above-exemplified non-modified amino acid sequence (for example, the amino acid sequence set forth in SEQ ID NO: 1), provided that the above-exemplified amino acid substitution (i.e., the specific position and optionally other amino acid substitutions such as Glu49Asp and Pro6Ser) and have immunoglobulin binding activity.
  • the protein of the present invention is, for example, a protein comprising an amino acid sequence identical to the variant sequence of the non-modified amino acid sequence exemplified above (for example, the amino acid sequence set forth in SEQ ID NO: 1) except for having the amino acid substitutions exemplified above.
  • variant sequences of the non-modified amino acid sequences exemplified above may or may not actually exist in the bacterium belonging to the genus Finegoldia. That is, the "amino acid sequence of the immunoglobulin-binding domain of Protein L derived from bacteria belonging to the genus Finegoldia (amino acid sequence of the immunoglobulin-binding domain of FpL)" refers to the amino acid sequence of the immunoglobulin-binding domain of Protein L actually present in bacteria belonging to the genus Finegoldia.
  • variant sequence of the same amino acid sequence that does not actually exist in the genus Finegoldia that is, a hypothetical amino acid sequence.
  • variant sequence of the amino acid sequence set forth in SEQ ID NO: 1 will be described as an example, but the description can also be applied mutatis mutandis to the variant sequence of any unmodified amino acid sequence.
  • Variant sequences of the amino acid sequence set forth in SEQ ID NO: 1 include substitution, deletion, insertion and/or substitution of one or several amino acid residues at one or several positions in the amino acid sequence set forth in SEQ ID NO: 1. or amino acid sequences containing additions. That is, the protein of the present invention includes the amino acid sequence set forth in SEQ ID NO: 1, provided that substitution, deletion, insertion, or substitution of one or several amino acid residues at one or several positions in the amino acid sequence and/or additions, further having the amino acid substitutions exemplified above (i.e., amino acid substitutions at specific positions and optionally other amino acid substitutions such as Glu49Asp and Pro6Ser), and having immunoglobulin binding activity.
  • Substitution, deletion, insertion and/or addition of the above amino acid residues may occur, for example, at positions other than the specific positions. Also, the substitution, deletion, insertion and/or addition of the above amino acid residues may occur at positions other than other amino acid substitutions, for example.
  • Variant sequences of the amino acid sequence set forth in SEQ ID NO: 1 also include amino acid sequences with high homology to the amino acid sequence set forth in SEQ ID NO: 1. That is, the protein of the present invention includes an amino acid sequence highly homologous to the amino acid sequence set forth in SEQ ID NO: 1, provided that the amino acid sequence (highly homologous to the amino acid sequence set forth in SEQ ID NO: 1 is Also includes proteins having the above-exemplified amino acid substitutions (that is, amino acid substitutions at specific positions and optionally other amino acid substitutions such as Glu49Asp and Pro6Ser) and having immunoglobulin-binding activity. Amino acid residue changes within the range of homology as described above may occur, for example, at positions other than the specific positions. In addition, amino acid residue changes within the range of homology as described above may occur, for example, at positions other than other amino acid substitutions.
  • variant sequence of the substituted amino acid sequence derived from SEQ ID NO: 1 can be applied mutatis mutandis to the variant sequence of the amino acid sequence set forth in SEQ ID NO: 1.
  • the X-th amino acid in the amino acid sequence set forth in SEQ ID NO: 1 means the amino acid present at position X counting from the N-terminus of the amino acid sequence set forth in SEQ ID NO: 1.
  • the amino acid residue corresponding to the X-th amino acid in the amino acid sequence set forth in SEQ ID NO: 1 in a specific amino acid sequence is an amino acid residue in the specific amino acid sequence, and the specific amino acid sequence and the SEQ ID NO. 1 means an amino acid residue arranged at the same position as the X-th amino acid in the amino acid sequence shown in SEQ ID NO: 1 in alignment with the amino acid sequence of SEQ ID NO: 1.
  • the "amino acid residue corresponding to the 50th asparagine of SEQ ID NO: 1" in a specific amino acid sequence refers to an amino acid residue in the specific amino acid sequence, the specific amino acid It means an amino acid residue arranged at the same position as the 50th asparagine in the amino acid sequence shown in SEQ ID NO:1 in the alignment between the sequence and the amino acid sequence of SEQ ID NO:1.
  • the "amino acid residue corresponding to the Xth amino acid in the amino acid sequence set forth in SEQ ID NO: 1" in the amino acid sequence set forth in SEQ ID NO: 1 refers to the Xth amino acid itself in the amino acid sequence set forth in SEQ ID NO: 1. means.
  • the positions of the amino acid substitutions exemplified above do not necessarily indicate the absolute positions in the protein of the present invention, and the amino acid set forth in SEQ ID NO: 1 It shows the relative position based on the sequence. That is, for example, when the protein of the present invention contains an amino acid residue insertion, deletion, or addition on the N-terminal side of the amino acid substitution positions exemplified above, the absolute position of the amino acid substitution is accordingly can fluctuate.
  • the positions of the above-exemplified amino acid substitutions in the protein of the present invention can be identified, for example, by aligning the amino acid sequence of the protein of the present invention with the amino acid sequence shown in SEQ ID NO:1.
  • the alignment can be performed using an alignment program such as BLAST or FASTA.
  • an alignment program such as BLAST or FASTA.
  • the amino acid residue before substitution of the amino acid substitutions exemplified above is the amino acid residue before substitution in the amino acid sequence shown in SEQ ID NO: 1 It indicates the type of group, and may or may not be conserved in the unmodified amino acid sequence other than the amino acid sequence shown in SEQ ID NO:1.
  • the protein of the present invention may contain only one modified amino acid sequence, or may contain multiple modified amino acid sequences.
  • the protein of the present invention may contain, for example, 2 or more, 3 or more, 4 or more, or 5 or more modified amino acid sequences, and 10 or less, 7 or less, 5 or less, 4 or less. , 3 or less, or 2 or less, or any number of consistent combinations thereof.
  • the amino acid sequences of the multiple modified amino acid sequences may or may not be the same.
  • the plurality of modified amino acid sequences may be directly linked (directly connected), or linked via an appropriate linker (for example, an oligopeptide consisting of 5 or more and 25 or less amino acid residues). It may be an aspect.
  • the protein of the present invention may consist of a modified amino acid sequence, or may further contain other amino acid sequences. That is, the protein of the present invention may further contain other amino acid sequences, for example, at its N-terminus or C-terminus. In other words, in the protein of the present invention, for example, another amino acid sequence may be added to the N-terminal side or C-terminal side of the modified amino acid sequence.
  • Other amino acid sequences include oligopeptides. Oligopeptides used as other amino acid sequences include oligopeptides other than the linker.
  • Other amino acid sequences are not particularly limited as long as they do not impair the immunoglobulin-binding activity or stability of the protein of the present invention. For example, the type and length of other amino acid sequences are not particularly limited as long as they do not impair the immunoglobulin-binding ability or stability of the protein of the present invention.
  • the protein of the present invention may contain, for example, a portion of other immunoglobulin binding domains in addition to the selected immunoglobulin binding domain.
  • the protein of the present invention when the protein of the present invention contains a modified amino acid sequence of domain C3 of FpL, the protein of the present invention further contains a part of the N-terminal region of domain C3 of FpL (domain C1, domain C2). It may contain a part of the C-terminal region (domain C4) of domain C3 of FpL.
  • the protein of the present invention may contain, for example, an oligopeptide on its N-terminal side or C-terminal side, which is useful for the purpose of specifically detecting or separating a target substance.
  • oligopeptides include polyhistidine and polyarginine.
  • the protein of the present invention may also contain, for example, at its N-terminal side or C-terminal side, an oligopeptide that is useful when immobilizing the protein of the present invention on a solid phase such as a support for chromatography.
  • Such oligopeptides include oligopeptides containing lysine and cysteine.
  • the protein of the present invention may be produced, for example, in a form containing the other amino acid sequence in advance, or may be produced separately from the other amino acid sequence as described above. of amino acid sequences may be added.
  • the protein of the invention comprises other amino acid sequences as described above, typically the protein of the invention is a poly(polymethyl amide) encoding the full-length amino acid sequence of the protein of the invention comprising other amino acid sequences such as those described above. It can be produced by expression from nucleotides.
  • a polynucleotide encoding another amino acid sequence and a polynucleotide encoding the protein of the present invention are combined with each other, and the other amino acid sequence is on the N-terminal side of the protein of the present invention.
  • the protein of the present invention may be expressed by linking so as to be added to the C-terminal side.
  • other chemically synthesized amino acid sequences may be chemically bound to the N-terminal side or C-terminal side of the protein of the present invention (for example, one that does not contain other amino acid sequences).
  • the protein of the present invention can be produced, for example, by expressing it from a polynucleotide encoding the protein of the present invention.
  • Polynucleotides encoding the proteins of the present invention are also referred to herein as "polynucleotides of the present invention.”
  • a polynucleotide of the invention may specifically be a polynucleotide comprising a nucleotide sequence encoding a protein of the invention.
  • the polynucleotides of the present invention can be obtained, for example, by DNA amplification methods such as chemical synthesis methods and PCR methods.
  • DNA amplification methods can be performed using, as a template, a polynucleotide containing a nucleotide sequence to be amplified, eg, a nucleotide sequence encoding a protein of the invention.
  • template polynucleotides include genomic DNA of organisms expressing the protein of the present invention, cDNA of the protein of the present invention, and vectors containing the polynucleotide of the present invention.
  • the nucleotide sequence of the polynucleotide of the present invention can be designed, for example, by conversion from the amino acid sequence of the protein of the present invention.
  • a standard codon table can be used when converting an amino acid sequence into a nucleotide sequence, but it is preferable to consider the frequency of codon usage in the host to be transformed with the polynucleotide of the present invention.
  • codon usage frequency can also be analyzed by using a public database (for example, the Codon Usage Database on the website of Kazusa DNA Research Institute, etc.).
  • the polynucleotides of the present invention may be obtained by collectively obtaining the full length of the polynucleotide, or by ligating after obtaining polynucleotides consisting of partial sequences of the polynucleotide.
  • the above explanation of the method for obtaining the polynucleotide of the present invention is not limited to the case of collectively obtaining the full-length sequence, but can also be applied mutatis mutandis to the case of obtaining a partial sequence thereof.
  • polynucleotide of the present invention may be designed to encode a fused amino acid sequence by linking with a polynucleotide encoding the amino acid sequence of any polypeptide.
  • the protein of the present invention can be obtained, for example, by culturing a genetically modified host containing the polynucleotide of the present invention (hereinafter also simply referred to as "genetically modified host of the present invention") to express the protein, and then expressing the expressed protein.
  • a genetically modified host of the present invention can be obtained, for example, by transforming the host using the polynucleotide of the present invention.
  • the host is not particularly limited as long as it can express the protein of the present invention when transformed with the polynucleotide of the present invention. Examples of hosts include animal cells, insect cells, and microorganisms.
  • Animal cells include COS cells, CHO (Chinese Hamster Ovary) cells, Hela cells, NIH3T3 cells, and HEK293 cells; insect cells include Sf9 cells and BTI-TN-5B1-4 cells; Yeast and bacteria can each be exemplified.
  • the yeast includes Saccharomyces genus yeast such as Saccharomyces cerevisiae, Pichia genus yeast such as Pichia Pastoris, and Schizosaccharomyces genus yeast such as Schizosaccharomyces pombe.
  • Escherichia coli includes JM109 strain and BL21(DE3) strain. In terms of productivity, it is preferable to use yeast or Escherichia coli as a host, and it is more preferable to use Escherichia coli as a host.
  • the polynucleotide of the present invention only needs to be retained so as to be expressed in the genetically modified host of the present invention. Specifically, the polynucleotide of the present invention may be maintained so as to be expressed under the control of a promoter that functions in the host.
  • promoters that function in the host include trp promoter, tac promoter, trc promoter, lac promoter, T7 promoter, recA promoter and lpp promoter.
  • the polynucleotide of the present invention may exist on a vector that autonomously replicates outside the genomic DNA. That is, the recombinant host of the present invention may be produced by transforming a host with an expression vector containing the polynucleotide of the present invention (hereinafter also simply referred to as "the expression vector of the present invention").
  • the expression vector of the present invention is obtained, for example, by inserting the polynucleotide of the present invention into an appropriate position of the expression vector.
  • the expression vector is not particularly limited as long as it can stably exist and replicate in the transformed host.
  • examples of the expression vector include pET plasmid vector, pUC plasmid vector, and pTrc plasmid vector.
  • the expression vector of the present invention may have a selection marker such as an antibiotic resistance gene.
  • the above-mentioned appropriate position means a position that does not disrupt the replication function, selectable marker, and transmissibility-related regions of the expression vector.
  • the polynucleotide of the present invention may be introduced onto genomic DNA.
  • Introduction of the polynucleotide of the present invention into genomic DNA can be performed using, for example, a gene transfer method based on homologous recombination.
  • Examples of the gene introduction method by homologous recombination include the Red-driven integration method (Datsenko, KA, and Wanner, BL, Proc. Natl. Acad. Sci. USA., 97: 6640-6645 (2000)).
  • a method using a linear DNA, a method using a vector containing a temperature-sensitive replication origin, a method using a vector having no replication origin that functions in the host, and a transduction method using a phage can be exemplified.
  • Transformation of a host using a polynucleotide such as the expression vector of the present invention can be carried out, for example, by methods commonly used by those skilled in the art. For example, when Escherichia coli is selected as the host, transformation may be performed by a competent cell method, a heat shock method, an electroporation method, or the like.
  • the genetically modified host of the present invention can be obtained by screening the host containing the polynucleotide of the present invention by an appropriate method after transformation.
  • the expression vector of the present invention can be prepared from the genetically modified host of the present invention.
  • the expression vector of the present invention can be prepared from a culture obtained by culturing the genetically modified host of the present invention using an alkaline extraction method or a commercially available extraction kit such as QIAprep Spin Miniprep kit (manufactured by QIAGEN).
  • the protein of the present invention can be expressed.
  • the protein of the present invention can be produced by culturing the genetically modified host of the present invention to express the protein of the present invention and recovering the expressed protein. That is, the present specification provides a method for producing the protein of the present invention, comprising the steps of expressing the protein of the present invention by culturing the genetically modified host of the present invention, and recovering the expressed protein.
  • the medium composition and culture conditions may be appropriately set according to various conditions such as the type of host and the properties of the protein of the present invention.
  • the medium composition and culture conditions may be set, for example, so that the host can proliferate and the protein of the present invention can be expressed.
  • a medium appropriately containing a carbon source, a nitrogen source, inorganic salts, and various other organic and inorganic components can be used.
  • LB Lia-Bertani
  • necessary nutrients 1% tryptone (w/v), yeast extract 0.5% (w/v), 1% ( w/v) NaCl
  • an antibiotic corresponding to the antibiotic resistance gene contained in the expression vector is added to the medium. Culturing is preferred.
  • kanamycin may be added to the medium.
  • the medium may also contain one or more reducing agents selected from the group consisting of glutathione, cysteine, cystatin, thioglycolate and dithiothreitol.
  • the medium may also contain a reagent such as glycine that promotes protein secretion from the transformant into the culture medium. For example, when the host is Escherichia coli, glycine is preferably added to the medium at 2% (w/v) or less.
  • the culture temperature is generally 10°C or higher and 40°C or lower, preferably 20°C or higher and 37°C or lower, more preferably around 25°C.
  • the pH of the medium is pH 6.8 or more and pH 7.4 or less, preferably around pH 7.0.
  • an inducer suitable for the type of promoter can be used. Examples of inducers include IPTG (Isopropyl- ⁇ -D-thiogalactopyranoside).
  • IPTG IPTG
  • turbidity adssorbance at 600 nm
  • IPTG IPTG
  • turbidity absorbance at 600 nm
  • IPTG IPTG
  • expression can be induced.
  • concentration of IPTG added is, for example, 0.005 mM or more and 1.0 mM or less, preferably 0.01 mM or more and 0.5 mM or less.
  • Expression induction such as IPTG induction can be performed, for example, under well-known conditions in the art.
  • the protein of the present invention may be separated and recovered from the culture by a method suitable for its expression form.
  • the term "culture” means the whole or part of the culture solution obtained by culturing. The portion is not particularly limited as long as it contains the protein of the present invention. Examples of the part include cultured cells of the transformant of the present invention, a medium after culture (that is, culture supernatant), and the like. For example, when the protein of the present invention accumulates in the culture supernatant, the cells may be separated by centrifugation, and the protein of the present invention may be recovered from the resulting culture supernatant.
  • the protein of the present invention when the protein of the present invention accumulates in cells (including the periplasm), after collecting the cells by centrifugation, the cells are crushed by adding an enzyme treatment agent, a surfactant, etc.
  • the protein of the invention may be recovered.
  • the protein of the present invention can be recovered from the aforementioned culture supernatant or cell lysate by known methods used for protein separation and purification, for example. Examples of the recovery method include ammonium sulfate fractionation, ion exchange chromatography, hydrophobic chromatography, affinity chromatography, gel filtration chromatography, and isoelectric point precipitation.
  • the protein of the present invention can be used, for example, for the separation or analysis of immunoglobulins (antibodies).
  • immunoglobulins antibodies
  • immunoglobulin adsorbent of the present invention in the form of an immunoglobulin adsorbent containing an insoluble carrier and the protein of the present invention immobilized on the insoluble carrier (hereinafter simply referred to as "immunoglobulin adsorbent of the present invention").
  • immunoglobulins is not limited to isolation of immunoglobulins from a solution in the presence of contaminants, but also includes isolation of immunoglobulins based on structure, property, activity, or the like.
  • the insoluble carrier is not particularly limited as long as it is insoluble in an aqueous solution.
  • insoluble carriers examples include carriers made from polysaccharides such as agarose, alginate (alginate), carrageenan, chitin, cellulose, dextrin, dextran, and starch, polyvinyl alcohol, polymethacrylate, and poly(2-hydroxyethyl methacrylate). , a carrier made of a synthetic polymer such as polyurethane, and a carrier made of a ceramic such as silica as a raw material. Among them, carriers made from polysaccharides and synthetic polymers are preferred as insoluble carriers.
  • the preferred carrier examples include polymethacrylate gels into which hydroxyl groups are introduced such as Toyopearl (manufactured by Tosoh Corporation), agarose gels such as Sepharose (manufactured by Cytiva) and cellulose gels such as Cellufine (manufactured by JNC).
  • the shape of the insoluble carrier is not particularly limited.
  • the insoluble carrier may be, for example, in a shape that can be packed into a column.
  • Insoluble carriers can be, for example, particulate or non-particulate.
  • Insoluble carriers can also be, for example, porous or non-porous.
  • the immunoglobulin (antibody) to be separated or analyzed in the present invention is not particularly limited as long as it has binding properties to the protein of the present invention.
  • An immunoglobulin may specifically have a kappa light chain. Immunoglobulins may or may not contain other regions, such as the Fc region, in addition to the kappa light chain. Immunoglobulins may also be those without an Fc region, eg, single-chain Fv (scFv), Fab, F(ab') 2 , IgA, bispecific T-cell-engineering (BiTE) antibodies, and the like. Immunoglobulins may be monoclonal antibodies or polyclonal antibodies.
  • Immunoglobulins can be, for example, any of IgG, IgM, IgA, IgD, and IgE.
  • IgG can be, for example, any of IgG1, IgG2, IgG3, and IgG4.
  • the origin of the immunoglobulin is not particularly limited.
  • Immunoglobulins may be derived from a single organism or from a combination of two or more organisms. Immunoglobulins include chimeric antibodies, humanized antibodies, human antibodies, and variants thereof (eg, amino acid substitutions).
  • bispecific antibody bispecific antibody
  • fusion antibody of ⁇ light chain and other protein conjugate of ⁇ light chain and drug (ADC), etc.
  • ADC conjugate of ⁇ light chain and drug
  • Antibodies are also available.
  • Immunoglobulin also includes antibody drugs.
  • the protein of the present invention may be immobilized on an insoluble carrier, for example, by covalent bonding.
  • the protein of the present invention can be immobilized on an insoluble carrier by covalently bonding the protein of the present invention to an insoluble carrier via an active group possessed by the insoluble carrier. That is, the insoluble carrier may have an active group on its surface or the like.
  • the active groups include N-hydroxysuccinimide (NHS) activated ester groups, epoxy groups, carboxyl groups, maleimide groups, haloacetyl groups, tresyl groups, formyl groups, and haloacetamide groups.
  • the insoluble carrier having an active group for example, a commercially available insoluble carrier having an active group may be used as it is, or an active group may be introduced into the insoluble carrier.
  • Commercially available carriers having active groups include TOYOPEARL AF-Epoxy-650M, TOYOPEARL AF-Tresyl-650M (both manufactured by Tosoh Corporation), HiTrap NHS-activated HP Columns, NHS-activated Sepharose 4 Fast Flow, Epoxy- activated Sepharose 6B (both manufactured by Cytiva) and SulfoLink Coupling Resin (manufactured by Thermo Fisher Scientific) can be exemplified.
  • Examples of methods for introducing active groups onto the carrier surface include a method of reacting one of compounds having two or more active sites with a hydroxyl group, epoxy group, carboxyl group, amino group, etc. present on the carrier surface. .
  • Epichlorohydrin, ethanediol diglycidyl ether, butanediol diglycidyl ether, and hexanediol diglycidyl ether are examples of compounds that introduce epoxy groups into hydroxyl groups and amino groups present on the carrier surface.
  • Compounds that introduce carboxyl groups into epoxy groups present on the carrier surface include 2-mercaptoacetic acid, 3-mercaptopropionic acid, 4-mercaptobutyric acid, 6-mercaptobutyric acid, glycine, 3-aminopropionic acid, 4- Examples include aminobutyric acid and 6-aminohexanoic acid.
  • Compounds for introducing maleimide groups into hydroxyl groups, epoxy groups, carboxyl groups and amino groups present on the carrier surface include N-( ⁇ -maleimidocaproic acid) hydrazide, N-( ⁇ -maleimidopropionic acid) hydrazide, 4-(4-N-maleimidophenyl)acetic acid hydrazide, 2-aminomaleimide, 3-aminomaleimide, 4-aminomaleimide, 6-aminomaleimide, 1-(4-aminophenyl)maleimide, 1-(3-aminophenyl) ) maleimide, 4-(maleimido)phenyl isocyanate, 2-maleimidoacetic acid, 3-maleimidopropionic acid, 4-maleimidobutyric acid, 6-maleimidohexanoic acid, N-( ⁇ -maleimidoacetoxy) succinimide ester, (m-maleimidobenzoyl ) N-hydroxysuccinimi
  • Compounds that introduce haloacetyl groups into hydroxyl groups and amino groups present on the carrier surface include chloroacetic acid, bromoacetic acid, iodoacetic acid, chloroacetic acid chloride, bromoacetic acid chloride, bromoacetic acid bromide, chloroacetic anhydride, and bromoacetic acid.
  • the ⁇ -alkenyl moiety is halogenated with a halogenating agent.
  • a method of activating with can also be exemplified.
  • Examples of ⁇ -alkenylalkane glycidyl ether include allyl glycidyl ether, 3-butenyl glycidyl ether, and 4-pentenyl glycidyl ether.
  • Halogenating agents include N-chlorosuccinimide, N-bromosuccinimide and N-iodosuccinimide.
  • a method for introducing active groups onto the carrier surface a method of introducing active groups using a condensing agent and an additive to carboxy groups present on the carrier surface can also be exemplified.
  • condensing agents include 1-ethyl-3-(3-dimethylaminopropyl)carbodiimide (EDC), dicyclohexylcarbodiamide, and carbonyldiimidazole.
  • additives include N-hydroxysuccinimide (NHS), 4-nitrophenol, and 1-hydroxybenztriazole.
  • the immobilization of the protein of the present invention on an insoluble carrier can be carried out, for example, in a buffer solution.
  • buffers include acetate buffer, phosphate buffer, MES (2-morpholinoethanesulfonic acid) buffer, HEPES (4-(2-hydroxyethyl)-1-piperazineethanesulfonic acid) buffer, Tris buffer, and borate buffer.
  • the reaction temperature for immobilization can be appropriately set according to various conditions such as the reactivity of the active group and the stability of the protein of the present invention.
  • the reaction temperature for immobilization may be, for example, 5°C or higher and 50°C or lower, preferably 10°C or higher and 35°C or lower.
  • the immunoglobulin adsorbent of the present invention can be used to separate immunoglobulins (antibodies) by, for example, forming a column filled with the adsorbent. For example, by adding a solution containing immunoglobulins to a column packed with the immunoglobulin adsorbent of the present invention to adsorb the immunoglobulin to the adsorbent and eluting the immunoglobulin adsorbed to the adsorbent, immunoglobulin can be separated.
  • the present specification includes a step of adding a solution containing immunoglobulin to a column packed with the immunoglobulin adsorbent of the present invention to adsorb the immunoglobulin to the adsorbent, and immunoglobulin adsorbed to the adsorbent.
  • a method for separating immunoglobulins contained in said solution comprising the step of eluting.
  • a solution containing immunoglobulins can be added to the column using, for example, a liquid delivery means such as a pump.
  • the solution containing immunoglobulin may be previously subjected to solvent replacement using an appropriate buffer solution before being added to the column.
  • the column may also be equilibrated with a suitable buffer prior to loading the immunoglobulin-containing solution onto the column.
  • Phosphate buffers, acetate buffers, and MES buffers can be exemplified as buffers used for solvent replacement and equilibration.
  • an inorganic salt such as sodium chloride at 1 mM or more and 1000 mM or less may be added to such a buffer solution.
  • the buffer used for solvent replacement and the buffer used for equilibration may or may not be the same.
  • components other than immunoglobulins such as contaminants remain in the column after the solution containing immunoglobulins has been passed through the column, before eluting the immunoglobulins adsorbed to the immunoglobulin adsorbent, such Components may be removed from the column.
  • Components other than immunoglobulin can be removed from the column using, for example, a suitable buffer.
  • the buffer used for removing components other than immunoglobulin the description of the buffer used for solvent replacement and equilibration, for example, can be applied mutatis mutandis.
  • Immunoglobulin adsorbed to the immunoglobulin adsorbent can be eluted by, for example, weakening the interaction between the immunoglobulin and the ligand (the protein of the present invention).
  • means for weakening the interaction between immunoglobulin and ligand (protein of the present invention) include pH change, addition of counter peptide, temperature increase, and salt concentration change.
  • pH change can be particularly exemplified.
  • a step of eluting the immunoglobulin adsorbed to the adsorbent by changing the pH can be exemplified.
  • a pH change can be exemplified by a decrease in pH.
  • a decrease in pH can be exemplified by a decrease in pH due to a buffer solution.
  • the immunoglobulin adsorbed on the immunoglobulin adsorbent can be eluted using, for example, an appropriate eluent. Examples of the eluent include buffers that are more acidic than the buffers used for solvent replacement and equilibration.
  • the acidic buffer examples include citrate buffer, glycine hydrochloride buffer, and acetate buffer. That is, the pH can be lowered by using the acidic buffer solution.
  • the pH of the eluate can be set, for example, within a range that does not impair immunoglobulin functions (antigen binding, etc.).
  • the pH of the eluate is, for example, 2 or higher, 2.1 or higher, 2.2 or higher, 2.3 or higher, 2.4 or higher, 2.5 or higher, 2.6 or higher, 2.7 or higher, 2.8 or higher.
  • the pH of the eluate may be, for example, 2 or more and 4 or less, 2.2 or more and 4 or less, or 2.4 or more and 4 or less.
  • the protein of the present invention which is a component of the immunoglobulin adsorbent of the present invention, can be eluted under mild pH conditions.
  • the immunoglobulin-binding protein is a high-quality immunoglobulin-binding protein, the pH of the eluate is made higher than that of an immunoglobulin adsorbent containing an insoluble carrier and an immunoglobulin-binding protein consisting of an unmodified amino acid sequence immobilized on the insoluble carrier ( That is, immunoglobulins can be eluted under conditions of higher pH (close to neutrality).
  • the protein of the present invention having one or more amino acid substitutions selected from at least Gly21Arg, Gly51Val, and any one of Asn62His, Asn62Arg and Asn62Trp is an immunoglobulin-binding protein capable of antibody elution under mild pH conditions.
  • the protein of the present invention having at least group 2 mutations can be an immunoglobulin binding protein that allows antibody elution under mild pH conditions. That is, by using the protein of the present invention, which is an immunoglobulin-binding protein capable of eluting antibodies under mild pH conditions, as an immunoglobulin-binding protein that is a component of an immunoglobulin adsorbent, an unmodified amino acid sequence is used.
  • Immunoglobulins can be eluted under milder pH conditions (ie, near-neutral conditions) than when immunoglobulin-binding proteins are used.
  • the pH of the eluate may be, for example, within the pH range of the eluate illustrated above.
  • the pH of the eluate is, for example, 2.5 or higher, 2.6 or higher, 2.7 or higher, 2.8 or higher, 2.9 or higher, 2.95 or higher, 3 or higher, 3.05 or higher, 3.05 or higher, may be 1 or more, 3.15 or more, or 3.2 or more; may be 4 or less, 3.5 or less, 3.3 or less, 3.2 or less, 3.1 or less, or 3 or less; , any non-contradictory combination thereof.
  • the pH of the eluate may be, for example, 2.5 or more and 4 or less, 2.8 or more and 4 or less, 2.95 or more and 4 or less, 3 or more and 4 or less, or 3.05 or more and 4 or less. good.
  • Separated immunoglobulins can be obtained by separating immunoglobulins (antibodies) by the method described above. That is, in one aspect, the method for isolating immunoglobulins may be a method for producing immunoglobulins, and more specifically, a method for producing isolated immunoglobulins. Immunoglobulins are obtained, for example, as elution fractions containing immunoglobulins. That is, fractions containing the eluted immunoglobulins can be collected. Fractionation may be performed, for example, by a conventional method.
  • Methods for collecting fractions include a method of exchanging the collection container at regular time intervals or a certain volume, a method of changing the collection container according to the shape of the chromatogram of the eluate, and an autosampler.
  • a method of fractionating fractions with an automatic fraction collector or the like can be mentioned.
  • immunoglobulins can also be recovered from a fraction containing immunoglobulins. Immunoglobulin can be recovered from the immunoglobulin-containing fraction by, for example, a known method used for protein separation and purification.
  • Immunoglobulin-binding domain C3 of Protein L derived from Finegoldia magna consisting of the amino acid sequence set forth in SEQ ID NO: 1 (hereinafter referred to as FpL)
  • a polynucleotide (SEQ ID NO: 2) encoding the amino acid sequence of amino acid residues 394 to 463 of GenBank No. AAA67503 (SEQ ID NO: 210) (hereinafter also referred to as "FpL_C3”) was synthesized.
  • the recognition sequence (5'-CCATGG-3') for the restriction enzyme NcoI was placed on the 5' end side, and the nucleotide sequence (5'-CATCACCACCATCACCAC-) encoding 6 histidine residues was placed on the 3' end side.
  • 3′; SEQ ID NO: 232), a termination codon and a recognition sequence for restriction enzyme HindIII (5′-AAGCTT-3′) are added, respectively.
  • the transformant (genetically modified E. coli) obtained in (3) was selected, cultured in LB medium containing 50 ⁇ g/mL kanamycin, and then purified using a QIAprep Spin Miniprep kit (manufactured by QIAGEN) to obtain FpL_C3.
  • a vector (named pET-FpL_C3) capable of expressing was obtained.
  • an oligonucleotide consisting of the sequence set forth in SEQ ID NO: 3 (5'-TAATACGACTCACTATAGGG-3') or SEQ ID NO: 4 (5'-TATGCTAGTTATTGCTCAG-3') was used as a sequencing primer.
  • Example 2 Mutation into FpL_C3 and Library Preparation (Part 1) In the expression vector pET-FpL_C3 prepared in Example 1, mutations were randomly introduced into the polynucleotide portion (SEQ ID NO: 2) encoding an immunoglobulin-binding protein by error-prone PCR.
  • Error-prone PCR was performed using the pET-FpL_C3 prepared in Example 1 as a template DNA.
  • the reaction solution was heat treated at 95 ° C. for 2 minutes, the first step at 95 ° C. for 30 seconds, the second step at 50 ° C. for 30 seconds, the second step at 72 ° C.
  • the reaction was carried out for 30 cycles, one cycle of which was the third step for 90 seconds at , and finally heat-treated at 72°C for 7 minutes.
  • the error-prone PCR successfully introduced mutations into the FpL_C3-encoding polynucleotide (SEQ ID NO: 2), with an average mutation rate of 1.6%.
  • E. coli BL21 (DE3) strain was transformed with the reaction solution, cultured on an LB plate medium containing 50 ⁇ g/mL kanamycin (37° C., 16 hours), and formed on the plate. The resulting colony was used as a random mutant library.
  • Example 3 Screening for FpL_C3 amino acid substitutes (Part 1) (1) Random mutant library (transformant) prepared in Example 2 or transformant expressing FpL_C3 (SEQ ID NO: 1) prepared in Example 1 in 2 x YT liquid medium containing 50 ⁇ g/mL kanamycin (Tryptone 1.6% (w/v), Yeast Extract 1% (w/v), Sodium Chloride 0.5% (w/v)) Inoculate 250 ⁇ L overnight at 37° C. in a 96 deep well plate. Cultured with shaking.
  • the antibody-binding activity of the immunoglobulin-binding protein when subjected to alkali treatment is measured by the ELISA method shown below, and the antibody-binding activity of the immunoglobulin-binding protein when subjected to alkali treatment in (3). was divided by the antibody-binding activity of the immunoglobulin-binding protein when the alkali treatment in (3) was not performed, to calculate the residual activity.
  • washing buffer 0.05M Tris buffer (pH 7.5) containing 0.15M NaCl and 0.05% (w/v) Tween 20 (trade name), hereinafter "washing buffer A"
  • washing buffer A After washing each well of a 96-well microplate with a solution containing immunoglobulin-binding protein for evaluating antibody-binding activity, the immunoglobulin-binding protein and immobilized gamma globulin were allowed to react (30 °C, 1 hour).
  • the selected transformant was cultured, and an expression vector was prepared using the QIAprep Spin Miniprep kit (manufactured by QIAGEN).
  • Transformants expressing immunoglobulin-binding proteins selected in (5) were each inoculated into 2 mL of 2 ⁇ YT liquid medium containing 50 ⁇ g/mL of kanamycin, and aerobically incubated at 37° C. overnight. Preculture was performed by shaking culture.
  • an immunoglobulin-binding protein (SEQ ID NO: 11, named FpL_C32a) having Asn50Tyr and Glu52Gly amino acid substitutions was confirmed to have significantly improved alkali stability (native FpL_C3: 40%, FpL_C32a: 94%).
  • Immunoglobulin-binding protein (SEQ ID NO: 16) having a single amino acid substitution of Glu52Gly is not significantly improved in alkaline stability (native FpL_C3: 40%, SEQ ID NO: 16: 48%), remarkable alkaline stability It is speculated that Asn50Tyr is the amino acid substitution that leads to improved sex.
  • FpL immunoglobulin-binding domain C4 (amino acid residues 468 to 537 of GenBank No. AAA67503 (SEQ ID NO: 210), hereinafter also referred to as "FpL_C4") consisting of the amino acid sequence set forth in SEQ ID NO: 18
  • a polynucleotide encoding the amino acid sequence (SEQ ID NO: 19) was synthesized.
  • the recognition sequence (5'-CCATGG-3') for the restriction enzyme NcoI was placed on the 5'-end side, the nucleotide sequence (SEQ ID NO: 232) encoding 6 histidine residues on the 3'-end side, and the terminator.
  • a codon and a recognition sequence for the restriction enzyme HindIII (5'-AAGCTT-3') are added, respectively.
  • Example 3 In the same manner as in Example 1 (3), after ligating the polynucleotide obtained in (2) and plasmid pET-26b previously digested with restriction enzymes NcoI and HindIII, the ligation product was used to ligate Escherichia coli BL21. (DE3) strain was transformed and cultured.
  • Example 5 Mutagenesis to FpL_C4 and library preparation Of the expression vector pET-FpL_C4 prepared in Example 4, the polynucleotide portion (SEQ ID NO: 19) encoding an immunoglobulin-binding protein was added in the same manner as in Example 2. Random mutations were introduced by error-prone PCR to prepare a library. The mutagenesis rate was 3.5%.
  • Example 6 Screening of FpL_C4 Amino Acid Substitutes (1)
  • the random mutant library (transformant) prepared in Example 5 or the transformant expressing FpL_C4 (SEQ ID NO: 18) prepared in Example 4 was The cells were cultured in the same manner as in 3 (1) to (2).
  • the selected transformant was cultured, and an expression vector was prepared using the QIAprep Spin Miniprep kit (manufactured by QIAGEN).
  • the transformant expressing the immunoglobulin-binding protein selected in (4) is cultured in the same manner as in Examples 3 (8) to (10), and the method described in Example 3 (11) to prepare a protein extract.
  • Immunoglobulin-binding protein having one or more amino acid substitutions selected from at least Glu1Gly and Asn50Asp in the amino acid sequence set forth in SEQ ID NO: 18 has improved alkaline stability compared to native FpL_C4 (SEQ ID NO: 18) It can be said that
  • Example 7 Production of FpL_C3 amino acid substitution aggregate (part 1) (1) Design of FpL_C3 amino acid substitution aggregate By accumulating amino acid substitutions involved in improving the alkaline stability of immunoglobulin-binding proteins, as revealed in Example 3, to FpL_C3 (SEQ ID NO: 1), further An attempt was made to improve the alkali stability. Specifically, 12 types of immunoglobulin-binding proteins shown in (a) to (l) below were designed and produced.
  • FpL_C3 3a This protein was produced by selecting Asn62Tyr from among the amino acid substitutions that improve the alkali stability found in Example 3, and introducing the amino acid substitution into FpL_C3 2a (SEQ ID NO: 11).
  • a polynucleotide containing a nucleotide sequence encoding FpL_C33a was produced by mutagenesis using inverse PCR.
  • Inverse PCR uses an expression vector (hereinafter also referred to as "pET-FpL_C32a") containing a polynucleotide encoding FpL_C32a (SEQ ID NO: 24) as a template DNA, and an oligonucleotide consisting of the sequence set forth in SEQ ID NO: 25.
  • reaction solution having the composition shown in Table 4 with PCR Forward Primer and an oligonucleotide consisting of the sequence set forth in SEQ ID NO: 26 as PCR Reverse Primer
  • the reaction solution was heat-treated at 98°C for 2 minutes and heated at 95°C for 10 minutes. 30 cycles of a first step of 50° C. for 5 seconds, a third step of 72° C. for 6 minutes, and a final heat treatment at 72° C. for 7 minutes.
  • an expression vector (named pET-FpL_C33a) was extracted using a QIAprep Spin Miniprep kit (manufactured by QIAGEN). bottom.
  • FpL_C3 3b This protein was produced by selecting Glu49Val from among the amino acid substitutions that improve the alkali stability found in Example 3, and introducing the amino acid substitution into FpL_C3 2a (SEQ ID NO: 11).
  • (b-1) A polynucleotide containing a nucleotide sequence encoding FpL_C33b (SEQ ID NO: 27) was produced by mutagenesis using inverse PCR. Inverse PCR used pET-FpL_C32a as a template DNA, an oligonucleotide consisting of the sequence set forth in SEQ ID NO: 28 as a PCR forward primer, and an oligonucleotide consisting of the sequence set forth in SEQ ID NO: 29 as a PCR reverse primer. Others were carried out in the same manner as in (a-1).
  • FpL_C3 3c This protein was produced by selecting Asn44Ser from among the amino acid substitutions that improve the alkali stability found in Example 3, and introducing the amino acid substitution into FpL_C3 2a (SEQ ID NO: 11).
  • (c-1) A polynucleotide containing a nucleotide sequence encoding FpL_C33c (SEQ ID NO: 30) was produced by mutagenesis using inverse PCR. Inverse PCR was carried out in the same manner as in (a-1) except that an oligonucleotide consisting of the sequence set forth in SEQ ID NO: 31 was used as a PCR forward primer and an oligonucleotide set forth in SEQ ID NO: 32 was used as a PCR reverse primer. did.
  • FpL_C3 3d This protein was produced by selecting Asn44Asp from among the amino acid substitutions that improve the alkali stability found in Example 3, and introducing the amino acid substitution into FpL_C3 2a (SEQ ID NO: 11).
  • (d-1) A polynucleotide containing a nucleotide sequence encoding FpL_C33d (SEQ ID NO: 33) was produced by mutagenesis using inverse PCR. Inverse PCR was performed in the same manner as in (a-1), except that an oligonucleotide consisting of the sequence set forth in SEQ ID NO: 34 was used as a PCR forward primer, and an oligonucleotide set forth in SEQ ID NO: 35 was used as a PCR reverse primer. did.
  • FpL_C3 3e (e) FpL_C3 3e (e-1) A polynucleotide (SEQ ID NO: 37) encoding FpL_C3 3e (SEQ ID NO: 36) was synthesized. When synthesizing, the recognition sequence (5'-CCATGG-3') for the restriction enzyme NcoI was placed on the 5' end side, and the nucleotide sequence (5'-CATCACCACCATCACCAC-) encoding 6 histidine residues was placed on the 3' end side. 3′; SEQ ID NO: 232), a termination codon and a recognition sequence for restriction enzyme HindIII (5′-AAGCTT-3′) are added, respectively.
  • FpL_C3 4a A transformant and an expression vector ( pET-FpL_C34a) was obtained. Nucleotide sequence analysis of the expression vector pET-FpL_C3 4a confirmed that a polynucleotide (SEQ ID NO: 39) encoding FpL_C3 4a (SEQ ID NO: 38) was inserted into pET-FpL_C3 4a.
  • FpL_C3 4b A transformant and an expression vector ( pET-FpL_C3 4b) was obtained. Nucleotide sequence analysis of the expression vector pET-FpL_C3 4b confirmed that a polynucleotide (SEQ ID NO: 41) encoding FpL_C3 4b (SEQ ID NO: 40) was inserted into pET-FpL_C3 4b.
  • FpL_C3 4c A transformant and an expression vector ( pET-FpL_C3 4c) was obtained. Nucleotide sequence analysis of the expression vector pET-FpL_C3 4c confirmed that a polynucleotide (SEQ ID NO: 43) encoding FpL_C3 4c (SEQ ID NO: 42) was inserted into pET-FpL_C3 4c.
  • FpL_C3 4d A transformant and an expression vector ( pET-FpL_C3 4d) was obtained. Nucleotide sequence analysis of the expression vector pET-FpL_C3 4d confirmed that a polynucleotide (SEQ ID NO: 45) encoding FpL_C3 4d (SEQ ID NO: 44) was inserted into pET-FpL_C3 4d.
  • (l) FpL_C3 5b A transformant and an expression vector ( pET-FpL_C3 5b) was obtained. Nucleotide sequence analysis of the expression vector pET-FpL_C3 5b confirmed that a polynucleotide (SEQ ID NO: 51) encoding FpL_C3 5b (SEQ ID NO: 50) was inserted into pET-FpL_C3 5b.
  • Example 8 Alkaline stability evaluation of FpL_C3 amino acid-substituted aggregates (1) Native FpL_C3 (SEQ ID NO: 1) prepared in Example 1, mutant (amino acid-substituted) immunoglobulin-binding protein FpL_C3 obtained in Example 3 2a (SEQ ID NO: 11), and the mutant immunoglobulin-binding proteins FpL_C3 3a (SEQ ID NO: 23), FpL_C3 3b (SEQ ID NO: 27), FpL_C3 3c (SEQ ID NO: 30), FpL_C3 3d (SEQ ID NO: 30) produced in Example 7 33), FpL_C3 3e (SEQ ID NO: 36), FpL_C3 4a (SEQ ID NO: 38), FpL_C3 4b (SEQ ID NO: 40), FpL_C3 4c (SEQ ID NO: 42), FpL_C3 4d (SEQ ID NO: 44), FpL_C3 4e (
  • Example 9 Mutation into FpL_C3 and Library Preparation (Part 2) Based on the results of Example 3, among the mutant immunoglobulin-binding proteins, designed oligonucleotides containing mixed bases so that amino acid residues at specific positions have multiple choices, and ligated them to mutate A body library was created. Details will be specifically described below.
  • the 51st to 53rd amino acids of SEQ ID NO: 56 correspond to the 44th amino acid of SEQ ID NO: 1, and the 66th amino acid is Asn (asparagine), Asp (aspartic acid), Ser (serine) or Gly (glycine).
  • the amino acid corresponding to the 49th of SEQ ID NO: 1 is Glu (glutamic acid) or Val (valine), and from the 69th to the 71st, the amino acid corresponding to the 50th of SEQ ID NO: 1 is Asn, Asp, Mixed bases are introduced so as to become Ser or Cys (cysteine), and from 75th to 77th so that the amino acid corresponding to 52nd of SEQ ID NO: 1 becomes Gly or Val.
  • the expression vector pET-26b was previously digested with restriction enzymes NcoI and HindIII using NEBBBuilder (manufactured by New England Biolabs). Concatenated.
  • reaction solution was used to transform Escherichia coli BL21 (DE3) strain, cultured on an LB plate medium containing 50 ⁇ g/mL kanamycin (37° C., 16 hours), and colonies formed on the plate. was used as a random mutant library.
  • Example 10 Screening for FpL_C3 amino acid substitutes (Part 2) (1) FpL_C3 2a prepared in Example 3 and the mutant library (transformant) prepared in Example 9 were cultured in the same manner as in Examples 3 (1) and (2).
  • the selected transformant was cultured, and an expression vector was prepared using the QIAprep Spin Miniprep kit (manufactured by QIAGEN).
  • Amino acid substitution position for the immunoglobulin binding protein (SEQ ID NO: 1) expressed by the transformant selected in (4), residual activity [%] when treated with alkali, and antibody binding activity (absorbance ) are shown in Table 6.
  • a protein (named FpL_C3 4f, SEQ ID NO: 62) into which amino acid substitutions of Asn44Asp, Asn50Tyr, Glu52Val and Asn62Tyr were introduced into FpL_C3
  • a protein in which amino acid substitutions of Asn44Gly, Glu49Val, Asn50Tyr, Glu52Val and Asn62Tyr were introduced into FpL_C3 (named FpL_C3 5c, SEQ ID NO: 63)
  • a protein (named FpL_C3 5d, SEQ ID NO: 64) into which amino acid substitutions of Asn44Gly, Glu49Val, Asn50Ser, Glu52Val and Asn62Tyr were introduced into
  • the immunoglobulin-binding protein having at least one amino acid substitution selected from Asn44Asp, Asn44Gly, Glu49Val, Asn50Ser, Glu52Val and Asn62Tyr in the amino acid sequence of SEQ ID NO: 1 has improved alkali stability.
  • the immunoglobulin binding protein (FpL_C35d) with the Asn50Ser amino acid substitution was compared to the immunoglobulin binding protein with the Asn50Tyr amino acid substitution (FpL_C32a, FpL_C34f and FpL_C35c) compared to alkali-untreated
  • the antibody binding activity of the protein solution was greatly reduced.
  • Example 11 Mutation into FpL_C3 and Library Preparation (Part 3)
  • a saturated substitution library was prepared for the 21st, 22nd, 31st, 49th, 51st and 62nd amino acid residues.
  • the primer follows the 22c-Trick method (Sabrina Kille et.al., ACS Synthetic Biology, 2013, 2, 83-92), arranges an appropriate mixed base at the site of mutation introduction, and inverses around the site of mutation introduction. It was designed to allow PCR (SEQ ID NOS: 65-100). A set of 6 of these primers was mixed for each substitution with the compositions shown in Tables 7 and 8 to prepare a PCR primer mixture (Forward/Reverse primer mix).
  • E. coli BL21 (DE3) strain was transformed with the reaction solution and cultured on an LB plate medium containing 50 ⁇ g/mL kanamycin (37° C., 16 hours). Colonies formed on the plate were used as a site-specific mutant library.
  • Example 12 Screening for FpL_C3 amino acid substitutes (Part 3) (1) The transformant capable of expressing FpL_C3 prepared in Example 1, and the site-specific amino acid substitution library (transformant) prepared in Example 11 were compared with Example 3 (1) to (2). Cultured in a similar manner.
  • Example 3 After culturing, the culture supernatant obtained by centrifugation was subjected to alkali treatment in the same manner as in Example 3 (3), and residual activity was measured using the ELISA method described in Example 3 (4). was calculated.
  • the selected transformant was cultured, and an expression vector was prepared using the QIAprep Spin Miniprep kit (manufactured by QIAGEN).
  • nucleotide sequence of the polynucleotide region encoding the immunoglobulin-binding protein inserted into the obtained expression vector was analyzed by the method described in Example 1 (5) to identify the amino acid substitution sites.
  • Example 3 The transformant expressing the immunoglobulin-binding protein selected in (3) or the transformant expressing FpL_C3 (SEQ ID NO: 1) prepared in Example 1 was transformed into Example 3 (8) to (10). ), and a protein extract was prepared in the same manner as in Example 3 (11).
  • Table 10 shows a summary of the amino acid substitution positions for the immunoglobulin-binding protein (SEQ ID NO: 1) expressed by the transformant selected in (3) and the residual activity [%] after alkali treatment.
  • 1 or more amino acid substitutions selected from at least Gly21Arg, Lys22Thr, Thr31Leu, Glu49Thr, Glu49Ile, Gly51Val, Asn62His, Asn62Arg, Asn62Leu, Asn62Met, Asn62Tyr and Asn62Trp in the amino acid sequence set forth in SEQ ID NO: 1 immunoglobulin binding with It can be said that the protein has improved alkali stability compared to native FpL_C3 (SEQ ID NO: 1).
  • the 62nd asparagine (Asn62) of SEQ ID NO: 1 can be replaced with relatively It can be seen that substitution with bulky amino acids improves alkali stability.
  • the Asn62Tyr amino acid substitution (SEQ ID NO: 5) has the highest improvement in alkali stability (native FpL_C3: 46%, Asn62Tyr: 66%).
  • the amino acid substitutions of Gly21Arg, Glu49Thr and Gly51Val particularly improved the alkali stability.
  • Reference example 1 Design of immunoglobulin-binding protein (lysine-substituted) WO2017/069158 replaces the lysine residue of the immunoglobulin-binding domain of FpL with an amino acid having a basic amino acid or hydroxy group other than lysine Disclosed are immunoglobulin-binding proteins with improved alkali stability by Therefore, in order to confirm the effect of the literature, an immunoglobulin-binding protein was produced by substituting the lysine residue of the immunoglobulin-binding domain of FpL with an arginine residue, which is a basic amino acid other than lysine. Specifically, four types of immunoglobulin-binding proteins shown in ( ⁇ ) to ( ⁇ ) below were designed.
  • FpL immunoglobulin-binding domain C1 amino acid residues 249 to 317 of GenBank No. AAA67503, SEQ ID NO: 112, hereinafter also referred to as "FpL_C1"
  • FpL_C1KR arginine residues immunoglobulin binding protein
  • FpL immunoglobulin-binding domain C2 amino acid residues 320 to 389 of GenBank No. AAA67503, SEQ ID NO: 113, hereinafter also referred to as "FpL_C2"
  • FpL_C2KR Specifically Immunoglobulin-binding protein
  • FpL_C3KR Immunoglobulin-binding protein substituted with arginine residues
  • FpL_C2KR Transformants and expression vectors (pET -FpL_C2KR) was obtained.
  • Nucleotide sequence analysis of the expression vector pET-FpL_C2KR confirmed that a polynucleotide (SEQ ID NO: 121) encoding FpL_C2KR (SEQ ID NO: 115) was inserted into pET-FpL_C2KR.
  • FpL_C3KR A transformant and an expression vector (pET -FpL_C3KR) was obtained. Nucleotide sequence analysis of the expression vector pET-FpL_C3KR confirmed that a polynucleotide (SEQ ID NO: 122) encoding FpL_C3KR (SEQ ID NO: 116) was inserted into pET-FpL_C3KR.
  • FpL_C4KR Transformants and expression vectors (pET -FpL_C4KR) was obtained.
  • Nucleotide sequence analysis of the expression vector pET-FpL_C4KR confirmed that a polynucleotide (SEQ ID NO: 123) encoding FpL_C4KR (SEQ ID NO: 117) was inserted into pET-FpL_C4KR.
  • FpL_C2 Transformants and expression vectors (pET -FpL_C2) was obtained.
  • Nucleotide sequence analysis of the expression vector pET-FpL_C2 confirmed that a polynucleotide (SEQ ID NO: 119) encoding FpL_C1 (SEQ ID NO: 113) was inserted into pET-FpL_C1.
  • Reference example 2 (1) FpL_C3 (SEQ ID NO: 1) prepared in Example 1, FpL_C4 (SEQ ID NO: 18) prepared in Example 4, and FpL_C1 (SEQ ID NO: 112) and FpL_C2 (SEQ ID NO: 113) prepared in Reference Example 1, Transformants expressing any of FpL_C1KR (SEQ ID NO: 114), FpL_C2KR (SEQ ID NO: 115), FpL_C3KR (SEQ ID NO: 116) and FpL_C4KR (SEQ ID NO: 117) were treated as in Example 3 (8) to (10). A protein extract was prepared in the same manner as in Example 3 (11). The extract was centrifuged, and the resulting supernatant was passed through a filter for clarification.
  • washing buffer B Ni-NTA Sepharose 6 Fast Flow
  • Example 3 (4) Same as Example 3 (13) except that the concentration of NaOH used for the treatment was 1.0 M (final concentration 0.5 M), the treatment temperature was 42 ° C., and the treatment time was 15 minutes. After alkali treatment by a method, residual activity was calculated by the same method as in Example 3 (14), and alkali stability was evaluated.
  • FpL_C2 (SEQ ID NO: 113), FpL_C3 (SEQ ID NO: 1) and FpL_C4 (SEQ ID NO: 18) replace all of the lysine residues with arginine residues (FpL_C2KR (SEQ ID NO: 115), FpL_C3KR (SEQ ID NO: 116) and FpL_C4KR (SEQ ID NO: 116) No. 117)) improved the alkali stability.
  • Example 13 Mutagenesis into FpL_C4KR and Preparation of Library (1) Using pET-FpL_C4KR obtained in Reference Example 1 (2) ( ⁇ ) as a template, a saturated substitution library for the 7th and 29th amino acid residues was prepared. bottom. As in Example 11 (1), the primers followed the 22c-Trick method, arranged appropriate mixed bases at the site of mutation introduction, and were designed to enable inverse PCR centered on the site of mutation introduction (SEQ ID NO: 124 from 135). A set of 6 primers for each substitution was mixed according to the compositions shown in Tables 7 and 12 to prepare a PCR primer mixture (Forward/Reverse primer mix).
  • E. coli BL21 (DE3) strain was transformed with the reaction solution and cultured on an LB plate medium containing 50 ⁇ g/mL kanamycin (37° C., 16 hours). Colonies formed on the plate were used as a site-specific mutant library.
  • Example 14 Screening of FpL_C4KR Amino Acid Substitutes (1) Transformant expressing FpL_C4KR (SEQ ID NO: 117) prepared in Reference Example 1 (2) ( ⁇ ) and site-specific amino acid substitute library prepared in Example 13 (transformant) was cultured in the same manner as in Example 3 (1) to (2).
  • Example 3 After culturing, the culture supernatant obtained by centrifugation was subjected to alkali treatment in the same manner as in Example 3 (3), and residual activity was measured using the ELISA method described in Example 3 (4). was calculated.
  • the selected transformant was cultured, and an expression vector was prepared using the QIAprep Spin Miniprep kit (manufactured by QIAGEN).
  • nucleotide sequence of the polynucleotide region encoding the immunoglobulin-binding protein inserted into the obtained expression vector was analyzed by the method described in Example 1 (5) to identify the amino acid substitution sites.
  • Table 13 shows a summary of the amino acid substitution positions for the immunoglobulin-binding protein (SEQ ID NO: 117) expressed by the transformant selected in (3) and the residual activity [%] after alkali treatment.
  • SEQ ID NO: 117 At least Lys(Arg)7Ala (this notation is the amino acid residue corresponding to the 7th lysine in SEQ ID NO: 1 (the 7th lysine in SEQ ID NO: 18) is once substituted with arginine. and/or Lys(Arg)29Pro amino acid substitutions have improved alkaline stability compared to FpL_C4KR (SEQ ID NO: 117) It can be said that
  • Example 15 Preparation of FpL_C3KR Amino Acid Substitution Aggregates (1) Design of FpL_C3KR Amino Acid Substitution Aggregates (SEQ ID NO: 116) to further improve stability. Specifically, four types of immunoglobulin-binding proteins shown in (m) to (p) below were designed and produced.
  • a protein designated as FpL_C3KR 1a
  • FpL_C3KR 1b A protein (designated as FpL_C3KR 1b) in which an amino acid substitution of Gly51Val was introduced into FpL_C3KR
  • FpL_C3KR 1c A protein (designated as FpL_C3KR 1c) in which Asn62Tyr amino acid substitution was introduced into FpL_C3KR
  • a protein named FpL_C3KR 3a) in which amino acid substitutions of Asn50Tyr, Glu52Gly and Asn62Tyr are introduced into FpL_C3KR
  • FpL_C3KR 1a This protein was produced by selecting Gly21Arg from among the amino acid substitutions that improve alkali stability found in Example 12, and introducing this amino acid residue into FpL_C3KR (SEQ ID NO: 116).
  • a polynucleotide containing a nucleotide sequence encoding FpL_C3KR1a (SEQ ID NO: 138) was produced by mutagenesis using inverse PCR.
  • Inverse PCR used pET-FpL_C3KR as a template DNA, an oligonucleotide consisting of the sequence set forth in SEQ ID NO: 146 as a PCR Forward Primer, and an oligonucleotide consisting of the sequence set forth in SEQ ID NO: 147 as a PCR Reverse Primer. was carried out in the same manner as in Example 7(2)(a-1).
  • Sequence analysis confirmed that a polynucleotide encoding FpL_C3KR1a (SEQ ID NO: 138) was inserted into the expression vector pET-FpL_C3KR1a.
  • FpL_C3KR 1b This protein was prepared by selecting Gly51Val from among the amino acid substitutions that improve alkali stability found in Example 12, and introducing this amino acid residue into FpL_C3KR (SEQ ID NO: 116).
  • a polynucleotide containing a nucleotide sequence encoding FpL_C3KR 1b (SEQ ID NO: 139) was produced by mutagenesis using inverse PCR.
  • Inverse PCR uses a polynucleotide containing pET-FpL_C3KR as a template DNA, an oligonucleotide consisting of the sequence set forth in SEQ ID NO: 148 as a PCR Forward Primer, and an oligonucleotide consisting of the sequence set forth in SEQ ID NO: 149 as a PCR Reverse Primer. , were used in the same manner as in Example 7 (2) (a-1).
  • n-2 The obtained polynucleotide was purified, treated with the restriction enzyme DpnI, and then E. coli BL21 (DE3) strain was transformed with the restriction enzyme-treated product.
  • FpL_C3KR 1c (o-1)
  • the nucleotide sequence of the expression vector pET-FpL_C3KR 1c containing the polynucleotide (SEQ ID NO: 150) encoding pET26b and FpL_C3KR 1c (SEQ ID NO: 140) was designed and divided into the following three regions.
  • nucleotide sequence of pET26b nucleotide sequence encoding amino acid residues 1 to 20 of FpL_C3KR 1c (nucleotide sequence of 1 to 60 of SEQ ID NO: 150), 53 to 70 of FpL_C3KR 1c (nucleotide sequence from 157th to 210th of SEQ ID NO: 150), nucleotide sequence (SEQ ID NO: 232) encoding 6 histidine residues, stop codon and recognition of restriction enzyme HindIII Sequence (5'-TAAGCTT-3')
  • Second region nucleotide sequence encoding amino acid residues 16 to 37 of FpL_C3KR 1c (polynucleotide consisting of the sequences set forth in SEQ ID NOs: 153 [forward] and 154 [reverse])
  • Third region a nucleotide sequence encoding the 33rd to 57th amino acid residues of FpL_C3KR1c (polynucleotide consisting of sequences set forth in SEQ ID NOs: 155 [forward] and 156 [reverse])
  • a polynucleotide of the first region was prepared by inverse PCR.
  • Inverse PCR used pET-FpL_C4KR as a template DNA, an oligonucleotide consisting of the sequence set forth in SEQ ID NO: 151 as a PCR Forward Primer, and an oligonucleotide consisting of the sequence set forth in SEQ ID NO: 152 as a PCR Reverse Primer. was carried out in the same manner as in Example 7(2)(a-1). After inverse PCR, the polynucleotide containing the first region was purified.
  • Example 5 The resulting transformant was cultured and the expression vector was extracted in the same manner as in Example 7 (2) (a-3), and the nucleotide sequence of the expression vector was analyzed in Example 1 ( 5) was carried out in the same manner.
  • FpL_C3KR 3a (p-1)
  • the nucleotide sequence of the expression vector pET-FpL_C3KR 3a containing the polynucleotide (SEQ ID NO: 157) encoding pET26b and FpL_C3KR 3a (SEQ ID NO: 141) was designed and divided into the following three regions.
  • nucleotide sequence of pET26b nucleotide sequence encoding amino acid residues 1 to 20 of FpL_C3KR3a (nucleotide sequence of 1 to 60 of SEQ ID NO: 141), 53 to 70 of FpL_C3KR3a (nucleotide sequence from 157th to 210th of SEQ ID NO: 141), nucleotide sequence (SEQ ID NO: 232) encoding 6 histidine residues, stop codon and recognition of restriction enzyme HindIII Sequence (5'-TAAGCTT-3')
  • Second region nucleotide sequence encoding amino acid residues 16 to 37 of FpL_C3KR3a (polynucleotide consisting of the sequences set forth in SEQ ID NOs: 153 [forward] and 154 [reverse])
  • E. coli BL21 (DE3) strain was transformed with the ligated polynucleotide.
  • Example 5 The resulting transformant was cultured and the expression vector was extracted in the same manner as in Example 7 (2) (a-3), and the nucleotide sequence of the expression vector was analyzed in Example 1 ( 5) was carried out in the same manner.
  • Example 16 Generation of FpL_C3 amino acid substitution aggregates (part 2) (1) Design of FpL_C3 amino acid substitution aggregate In FpL_C3KR (SEQ ID NO: 116), some of the arginine residues substituted from lysine residues were substituted with other amino acid residues (specifically, Lys (Arg) 7Ala , Lys(Arg)22Gln and Lys(Arg)29Ile) immunoglobulin binding protein FpL_C3KX (SEQ ID NO: 142) was generated and demonstrated in Examples 8 and 12, immunoglobulin binding Amino acid substitutions involved in improving the alkaline stability of the human protein were enriched for FpL_C3KX (SEQ ID NO: 142).
  • a protein (named FpL_C3KX 1a) in which an amino acid substitution of Gly21Arg was introduced into FpL_C3KX (r)
  • a protein (named FpL_C3KX 3a) in which amino acid substitutions of Asn50Tyr, Glu52Gly and Asn62Tyr are introduced into FpL_C3KX (s)
  • a protein in which amino acid substitutions of Gly21Arg, Asn50Tyr, Glu52Gly and Asn62Tyr were introduced into FpL_C3KX (named FpL_C3KX 4g)
  • nucleotide sequence of pET26b nucleotide sequence encoding amino acid residues 1 to 20 of FpL_C3KX (nucleotide sequence of 1 to 60 of SEQ ID NO: 161), 53 to 70 of FpL_C3KX
  • Second region nucleotide sequence encoding amino acid residues 16 to 37 of FpL_C3KX (polynucleotide consisting of sequences set forth in SEQ ID NOS: 163 [forward] and 164 [reverse])
  • a polynucleotide containing the first region was prepared by inverse PCR. Inverse PCR was carried out using an expression vector pET-FpL_C4KR containing a polynucleotide (SEQ ID NO: 160) encoding FpL_C4KR K7A (an immunoglobulin-binding protein obtained by introducing an amino acid substitution of Lys(Arg)7Ala into FpL_C4KR, SEQ ID NO: 136) as a template DNA.
  • Example 7 (2) (a -1) was carried out in the same manner. After inverse PCR, the polynucleotide containing the first region was purified.
  • Example 2-5 The resulting transformant was cultured and the expression vector was extracted in the same manner as in Example 7 (2) (a-3), and the nucleotide sequence of the expression vector was analyzed in Example 1 ( 5) was carried out in the same manner.
  • FpL_C3KX 1a (q-1)
  • the nucleotide sequence of the expression vector pET-FpL_C3KX 1a containing the polynucleotide (SEQ ID NO: 165) encoding pET26b and FpL_C3KX 1a (SEQ ID NO: 143) was designed and divided into the following three regions.
  • nucleotide sequence of pET26b nucleotide sequence encoding amino acid residues 1 to 20 of FpL_C3KX1a (nucleotide sequence of 1 to 60 of SEQ ID NO: 165), 53 to 70 of FpL_C3KX1a (nucleotide sequence from 157th to 210th of SEQ ID NO: 165), nucleotide sequence (SEQ ID NO: 232) encoding 6 histidine residues, stop codon and recognition of restriction enzyme HindIII Sequence (5'-TAAGCTT-3')
  • Second region nucleotide sequence encoding amino acid residues 16 to 37 of FpL_C3KX1a (polynucleotide consisting of the sequences set forth in SEQ ID NOS: 166 [forward] and 167 [reverse])
  • nucleotide sequence of pET26b nucleotide sequence encoding amino acid residues 1 to 20 of FpL_C3KX3a (nucleotide sequence of 1 to 60 of SEQ ID NO: 168), 53 to 70 of FpL_C3KX3a (nucleotide sequence from 157th to 210th of SEQ ID NO: 168), nucleotide sequence (SEQ ID NO: 232) encoding 6 histidine residues, stop codon and recognition of restriction enzyme HindIII Sequence (5'-TAAGCTT-3')
  • Second region nucleotide sequence encoding amino acid residues 16 to 37 of FpL_C3KX3a (polynucleotide consisting of the sequences set forth in SEQ ID NOs: 169 [forward] and 170 [reverse])
  • r-2 A polynucleotide of the first region was prepared by inverse PCR.
  • Inverse PCR used pET-FpL_C4KR K7A as a template DNA, an oligonucleotide consisting of the sequence set forth in SEQ ID NO: 151 as a PCR Forward Primer, and an oligonucleotide consisting of the sequence set forth in SEQ ID NO: 152 as a PCR Reverse Primer. The rest was carried out in the same manner as in Example 7(2)(a-1). After inverse PCR, the polynucleotide containing the first region was purified.
  • Example 5 The resulting transformant was cultured and the expression vector was extracted in the same manner as in Example 7 (2) (a-3), and the nucleotide sequence of the expression vector was analyzed in Example 1 ( 5) was carried out in the same manner.
  • FpL_C3KX 4g (s-1)
  • the nucleotide sequence of the expression vector pET-FpL_C3KX 4g containing the polynucleotide (SEQ ID NO: 171) encoding pET26b and FpL_C3KX 4g (SEQ ID NO: 145) was designed and divided into the following three regions.
  • nucleotide sequence of pET26b nucleotide sequence encoding amino acid residues 1 to 20 of FpL_C3KX4g (nucleotide sequence of 1 to 60 of SEQ ID NO: 171), 53 to 70 of FpL_C3KX4g (nucleotide sequence from 157th to 210th of SEQ ID NO: 171), nucleotide sequence (SEQ ID NO: 232) encoding 6 histidine residues, stop codon and recognition of restriction enzyme HindIII Sequence (5'-TAAGCTT-3')
  • Second region nucleotide sequence encoding amino acid residues 16 to 37 of FpL_C3KX4g (polynucleotide consisting of the sequences set forth in SEQ ID NOs: 166 [forward] and 167 [reverse])
  • Example 5 The resulting transformant was cultured and the expression vector was extracted in the same manner as in Example 7 (2) (a-3), and the nucleotide sequence of the expression vector was analyzed in Example 1 ( 5) was carried out in the same manner.
  • Example 17 Alkaline stability evaluation of FpL_C3KX amino acid-substituted aggregates
  • Native FpL_C3 SEQ ID NO: 1 prepared in Example 1
  • mutant (amino acid-substituted) immunoglobulin-binding protein FpL_C3KR prepared in Reference Example 1 (SEQ ID NO: 116), variant immunoglobulin binding protein FpL_C3KR 1a (SEQ ID NO: 138), FpL_C3KR 1b (SEQ ID NO: 139), FpL_C3KR 1c (SEQ ID NO: 140) and FpL_C3KR 3a (SEQ ID NO: 141) made in Example 15 , and any of the mutant immunoglobulin binding proteins FpL_C3KX (SEQ ID NO: 142), FpL_C3KX 1a (SEQ ID NO: 143), FpL_C3KX 3a (SEQ ID NO: 144) and FpL_C3KX 4g
  • immunoglobulin-binding proteins having all amino acid substitutions of Asn50Tyr, Glu52Gly and Asn62Tyr are said to have particularly improved alkali stability (FpL_C3KR: 54%, FpL_C3KR 3a: 86 %) (FpL_C3KX: 10%, FpL_C3KX 3a: 69%).
  • Example 18 Mutagenesis to FpL_C3KX 3a and library preparation Of the expression vector pET-FpL_C3KX 3a prepared in Example 16 (r), the polynucleotide portion (SEQ ID NO: 168) encoding an immunoglobulin-binding protein was added in Example 16 (r).
  • a library was prepared by randomly introducing mutations by error-prone PCR in the same manner as in 2. The average mutagenesis rate was 1.7%.
  • Example 19 Screening for FpL_C3KX 3a amino acid substitutes (Part 1) (1)
  • the pET-FpL_C3KX 3a (transformant) prepared in Example 16 (r) and the random mutant library (transformant) prepared in Example 18 were combined with Example 3 (1) to (2). Cultured in a similar manner.
  • the antibody-binding activity of the immunoglobulin-binding protein when subjected to alkali treatment is measured by the ELISA method described in Example 3 (4), and the antibody of the immunoglobulin-binding protein when alkali treatment is performed.
  • the residual activity was calculated by dividing the binding activity by the antibody binding activity of the immunoglobulin-binding protein without alkali treatment.
  • the selected transformant was cultured, and an expression vector was prepared using the QIAprep Spin Miniprep kit (manufactured by QIAGEN).
  • the transformant expressing the immunoglobulin-binding protein selected in (4) is cultured in the same manner as in Examples 3 (8) to (10), and the same method as in Example 3 (11) is used. to prepare a protein extract.
  • the results are shown in Table 15.
  • the immunoglobulin-binding protein having at least the Glu1Gly or Glu1Val amino acid substitution in the amino acid sequence set forth in SEQ ID NO: 144 is FpL_C3KX3a (SEQ ID NO: 144), which has improved alkaline stability compared to native FpL_C3 (SEQ ID NO: 1). It can be said that the alkali stability is improved even when compared with .
  • Example 20 Screening for FpL_C3KX 3a amino acid substitutes (Part 2) (1) From the random mutant library (transformant) prepared in Example 18, evaluate about 1400 new transformants by the method described in Example 19 (1) to (3), Among them, a transformant expressing an immunoglobulin-binding protein with improved alkali stability compared to the immunoglobulin-binding protein with improved alkali stability (FpL_C3KX 3a) was selected.
  • the transformant expressing the immunoglobulin-binding protein selected in (1) is cultured in the same manner as in Examples 3 (8) to (10), and the same method as in Example 3 (11) is used. to prepare a protein extract.
  • An immunoglobulin-binding protein having at least one or more amino acid substitutions selected from Glu4Lys, Glu27Arg and Thr36Ala in the amino acid sequence of SEQ ID NO: 144 has improved alkaline stability compared to native FpL_C3 (SEQ ID NO: 1). Compared to FpL_C3KX3a (SEQ ID NO: 144), it can be said that the alkali stability is improved.
  • Example 21 Evaluation of Immunoglobulin ⁇ Light Chain Binding of Immunoglobulin-binding Protein (Part 1)
  • the immunoglobulin kappa light chain-binding activity of the mutant immunoglobulin-binding protein was measured by the ELISA method shown below to evaluate the effect of amino acid substitution on the human immunoglobulin kappa light chain-binding activity.
  • the human immunoglobulin ⁇ light chain-binding activity of the mutant immunoglobulin-binding protein was measured by the ELISA method shown below, and the effect of amino acid substitution on the human immunoglobulin ⁇ light chain-binding activity was evaluated.
  • a polyclonal antibody solution adjusted to 10 ⁇ g/mL using TBS was dispensed into wells of a 96-well microplate and immobilized (4° C., 16 hours).
  • the polyclonal antibody used was Herceptin (manufactured by Chugai Pharmaceutical Co., Ltd.) containing human ⁇ light chain subgroup 1 (V ⁇ 1), Human PDGF R alpha antibody (manufactured by R&D Systems) containing human ⁇ light chain subgroup 3 (V ⁇ 3), Human CTLA4 antibody (manufactured by R&D Systems) containing human ⁇ light chain subgroup 3 (V ⁇ 3) and Human PCSK9 antibody (manufactured by R&D Systems) containing human ⁇ light chain subgroup 4 (V ⁇ 4), is either After immobilization, blocking was performed using skimmed milk (manufactured by Becton Dickinson) adjusted to 2% (w/v) using TBS.
  • Washing buffer A (0.05M Tris buffer (pH 7.5) containing 0.15M NaCl and 0.05% (w/v) Tween 20 (trade name)) was used to wash a 96-well microplate. After washing the wells, a solution containing an immunoglobulin-binding protein for evaluating antibody-binding activity diluted to 50 ⁇ g/mL was added, and the immunoglobulin-binding protein and the immobilized polyclonal antibody were allowed to react (30° C., 1 hour ).
  • Example 22 Mutagenesis into FpL_C3KX 4h and library preparation Of the vector pET-FpL_C3KX 4h expressing FpL_C3KX 4h (SEQ ID NO: 179) prepared in Example 20, the polynucleotide portion encoding an immunoglobulin-binding protein (SEQ ID NO: 180) was randomly mutated by error-prone PCR in the same manner as in Example 2 to prepare a library. The average mutagenesis rate was 1.7%.
  • Example 23 Screening for FpL_C3KX 4h Amino Acid Substitutes (1)
  • the random mutant library (transformant) prepared in Example 22 was cultured in the same manner as in Example 3 (1) to (2), followed by centrifugation.
  • the culture supernatant obtained by was subjected to the alkali treatment described in Example 19 (2).
  • the antibody-binding activity of the immunoglobulin-binding protein when subjected to alkali treatment is measured by the ELISA method described in Example 3 (4), and the antibody of the immunoglobulin-binding protein when alkali treatment is performed.
  • the residual activity was calculated by dividing the binding activity by the antibody binding activity of the immunoglobulin-binding protein without alkali treatment.
  • the selected transformant was cultured, and an expression vector was prepared using the QIAprep Spin Miniprep kit (manufactured by QIAGEN).
  • nucleotide sequence of the polynucleotide region encoding the immunoglobulin-binding protein inserted into the obtained expression vector was analyzed by the method described in Example 1 (5) to identify the amino acid mutation sites. .
  • Example 3 The transformant expressing the immunoglobulin-binding protein selected in (5) or the transformant expressing FpL_C3KX4h (SEQ ID NO: 179) prepared in Example 20 was transformed from Example 3 (8) to ( The cells were cultured in the same manner as in 10), and a protein extract was prepared in the same manner as in Example 3 (11). The extract was centrifuged, and the resulting supernatant was passed through a filter for clarification.
  • the results are shown in Table 18.
  • the immunoglobulin-binding protein having at least one or more amino acid substitutions selected from Glu9Val, Tyr53Phe, Thr54Met and Ala69Thr in the amino acid sequence set forth in SEQ ID NO: 179 has more alkaline stability than native FpL_C3 (SEQ ID NO: 1) Compared to FpL_C3KX4h (SEQ ID NO: 179), which has improved , it can be said that the alkali stability is improved.
  • FpL_C3KX4i the immunoglobulin-binding protein in which the Lys(Gln)22Arg amino acid substitution is introduced into FpL_C3KX4h is named FpL_C3KX4i (SEQ ID NO: 182).
  • FpL_C3KX5e (t-1) A polynucleotide containing a nucleotide sequence encoding FpL_C3KX 5e (SEQ ID NO: 186) was generated by mutagenesis using inverse PCR. Inverse PCR uses an expression vector (hereinafter also referred to as "pET-FpL_C3KX 4i") containing a polynucleotide (SEQ ID NO: 188) encoding FpL_C3KX 4i (SEQ ID NO: 182) as a template DNA, described in SEQ ID NO: 189 as a PCR Forward Primer. PCR was performed in the same manner as in Example 7(2)(a-1) except that the oligonucleotide shown in SEQ ID NO: 190 was used as a reverse primer.
  • Sequence analysis confirmed that a polynucleotide encoding FpL_C3KX5e (SEQ ID NO: 186) was inserted into the expression vector pET-FpL_C3KX5e.
  • FpL_C3KX 5f (u-1) A polynucleotide containing a nucleotide sequence encoding FpL_C3KX 5f (SEQ ID NO: 187) was generated by mutagenesis using inverse PCR.
  • pET-FpL_C3KX 4i was used as the template DNA
  • the oligonucleotide set forth in SEQ ID NO: 191 was used as the PCR Forward Primer
  • the oligonucleotide set forth in SEQ ID NO: 192 was used as the PCR Reverse Primer.
  • Sequence analysis confirmed that a polynucleotide encoding FpL_C3KX5f (SEQ ID NO: 187) was inserted into the expression vector pET-FpL_C3KX5f.
  • Example 25 Evaluation of alkaline stability of FpL_C3KX 4h amino acid-substituted product
  • FpL_C3KX 4h (SEQ ID NO: 179) prepared in Example 20, FpL_C3KX 4i (SEQ ID NO: 182) obtained in Example 23 and prepared in Example 24
  • Transformants expressing either FpL_C3KX 5e (SEQ ID NO: 186) or FpL_C3KX 5f (SEQ ID NO: 187) were cultured in the same manner as in Examples 3 (8) to (10), and Example 3 (11)
  • a protein extract was prepared in a similar manner. The extract was centrifuged, and the resulting supernatant was passed through a filter for clarification.
  • Example 3 (4) Same as Example 3 (13) except that the concentration of NaOH used in the treatment was 1.0 M (final concentration 0.5 M), the treatment temperature was 55 ° C., and the treatment time was 15 minutes. After the alkali treatment by the method, the residual activity was calculated in the same manner as in Example 3 (14) to evaluate the alkali stability.
  • FpL_C3KX 5e (SEQ ID NO: 186) and FpL_C3KX 5f (SEQ ID NO: 187) prepared in Example 24 are FpL_C3KX 4h (SEQ ID NO: 179) and FpL_C3KX 4i (SEQ ID NO: 1), which have improved alkali stability compared to native FpL_C3 (SEQ ID NO: 1) No. 182), it can be said that the alkali stability is improved.
  • FpL_C3KX 5e was confirmed to have significantly improved alkali stability (FpL_C3KX 4h: 34%, FpL_C3KX 4i: 48%, FpL_C3KX 5e: 73%).
  • Example 26 Mutagenesis to FpL_C3KX 5e and Library Preparation Of the expression vector pET-FpL_C3KX 5e prepared in Example 24, the polynucleotide portion (SEQ ID NO: 193) encoding an immunoglobulin-binding protein was added in the same manner as in Example 2.
  • a library was prepared by randomly introducing mutations by error-prone PCR by the method of . The average mutagenesis rate was 1.9%.
  • Example 27 Screening for FpL_C3KX 5e Amino Acid Substitutes (1)
  • the random mutant library (transformant) prepared in Example 26 was cultured in the same manner as in Example 3 (1) to (2), and then centrifuged. The resulting culture supernatant was subjected to alkali treatment as described in Example 19(2).
  • the antibody-binding activity of the immunoglobulin-binding protein when subjected to alkali treatment is measured by the ELISA method described in Example 3 (4), and the antibody of the immunoglobulin-binding protein when alkali treatment is performed.
  • the residual activity was calculated by dividing the binding activity by the antibody binding activity of the immunoglobulin-binding protein without alkali treatment.
  • the selected transformant was cultured, and an expression vector was prepared using the QIAprep Spin Miniprep kit (manufactured by QIAGEN).
  • nucleotide sequence of the polynucleotide region encoding the immunoglobulin-binding protein inserted into the obtained expression vector was analyzed by the method described in Example 1 (5) to identify the amino acid mutation sites. .
  • Example 24 The transformant expressing the immunoglobulin-binding protein selected in (3) or the transformant expressing FpL_C3KX5e (SEQ ID NO: 186) prepared in Example 24 was transformed from Example 3 (8) to ( The cells were cultured in the same manner as in 10), and a protein extract was prepared in the same manner as in Example 3 (11). The extract was centrifuged, and the resulting supernatant was passed through a filter for clarification.
  • the immunoglobulin-binding protein having one or more amino acid substitutions selected from at least Glu1Val, Glu4Gly, Gly21Arg and Glu(Gly)52Asp in the amino acid sequence set forth in SEQ ID NO: 186 is native FpL_C3 (SEQ ID NO: 1) It can be said that the alkali stability is improved even when compared with FpL_C3KX5e (SEQ ID NO: 186), which has improved alkali stability.
  • Example 28 Production of FpL_C3KX 5e amino acid substitution aggregate (1)
  • Design of FpL_C3KX 5e amino acid substitution aggregate By accumulating amino acid substitutions involved in improving the alkaline stability of immunoglobulin-binding proteins, which were clarified in Example 27, to FpL_C3KX 5e, further stability improved. Specifically, three types of immunoglobulin-binding proteins shown in (v) to (x) below were designed and produced.
  • a protein (SEQ ID NO: 199, named FpL_C3KX 6a) in which amino acid substitutions of Glu4Gly and Glu(Gly)52Asp were introduced into FpL_C3KX 5e (w) A protein introduced with Lys (Ala) 7Ser and Glu (Gly) 52Asp amino acid substitutions for FpL_C3KX 5e (SEQ ID NO: 200, named FpL_C3KX 5g) (x) A protein (SEQ ID NO: 201, named FpL_C3KX 6b) in which amino acid substitutions of Glu4Gly and Lys(Ala)7Ser were introduced into FpL_C3KX 5e
  • FpL_C3KX 6a (v-1) A polynucleotide containing a nucleotide sequence encoding FpL_C3KX 6a was produced by mutagenesis using inverse PCR. Inverse PCR was performed using an expression vector pET containing a polynucleotide (SEQ ID NO: 202) encoding FpL_C3KX 5e E52D (an immunoglobulin binding protein in which an amino acid substitution of Glu (Gly) 52Asp was introduced into FpL_C3KX 5e, SEQ ID NO: 198) as a template DNA.
  • SEQ ID NO: 202 polynucleotide
  • E52D an immunoglobulin binding protein in which an amino acid substitution of Glu (Gly) 52Asp was introduced into FpL_C3KX 5e, SEQ ID NO: 198
  • Sequence analysis confirmed that a polynucleotide encoding FpL_C3KX6a (SEQ ID NO: 199) was inserted into the expression vector pET-FpL_C3KX6a.
  • FpL_C3KX 5g (w-1) A polynucleotide containing a nucleotide sequence encoding FpL_C3KX 5g was produced by mutagenesis using inverse PCR. Inverse PCR uses pET-FpL_C3KX 5e E52D as a template DNA, an oligonucleotide consisting of the sequence set forth in SEQ ID NO: 205 as a PCR Forward Primer, and an oligonucleotide consisting of the sequence set forth in SEQ ID NO: 206 as a PCR Reverse Primer. The procedure was carried out in the same manner as in Example 7(2)(a-1) except for the above.
  • Sequence analysis confirmed that a polynucleotide encoding FpL_C3KX5g (SEQ ID NO: 200) was inserted into the expression vector pET-FpL_C3KX5g.
  • FpL_C3KX 6b (x-1) A polynucleotide containing a nucleotide sequence encoding FpL_C3KX 6b was generated by mutagenesis using inverse PCR. Inverse PCR was performed using an expression vector pET-FpL_C3KX 5e E4G containing a polynucleotide (SEQ ID NO: 207) encoding FpL_C3KX 5e E4G (an immunoglobulin binding protein in which an amino acid substitution of Glu4Gly was introduced into FpL_C3KX 5e, SEQ ID NO: 195) as a template DNA.
  • Example 7 (2) (a-1) The same method as in Example 7 (2) (a-1) except that the oligonucleotide set forth in SEQ ID NO: 205 was used as the PCR Forward Primer and the oligonucleotide set forth in SEQ ID NO: 208 was used as the PCR Reverse Primer. I did it in
  • Sequence analysis confirmed that a polynucleotide encoding FpL_C3KX6b (SEQ ID NO: 201) was inserted into the expression vector pET-FpL_C3KX6b.
  • Example 29 Alkaline stability evaluation of FpL_C3KX 5e amino acid substitution aggregates (Part 1) (1) FpL_C3KX 5e (SEQ ID NO: 186) prepared in Example 24 and FpL_C3KX 6a (SEQ ID NO: 199) prepared in Example 28, FpL_C3KX 5g (SEQ ID NO: 200) and FpL_C3KX 6b (SEQ ID NO: 201)
  • the expressing transformant was cultured in the same manner as in Examples 3(8) to (10), and a protein extract was prepared in the same manner as in Example 3(11). The extract was centrifuged, and the resulting supernatant was passed through a filter for clarification.
  • FpL_C3KX 6a (SEQ ID NO: 199), FpL_C3KX 5g (SEQ ID NO: 200), and FpL_C3KX 6b (SEQ ID NO: 201) prepared in this example are all FpL_C3KX with improved alkali stability compared to natural FpL_C3 (SEQ ID NO: 1). Compared to 5e (SEQ ID NO: 186), it can be said that the alkali stability is improved. Among them, FpL_C3KX 6a showed the best alkali stability (FpL_C3KX 5e: 55%, FpL_C3KX 6a: 62%).
  • Example 30 Immunoglobulin elution pH evaluation of the protein of the present invention
  • the native FpL_C3 (SEQ ID NO: 1) prepared in Example 1, or the mutant (amino acid substituted) immunoglobulin binding protein FpL_C3 G21R obtained in Example 12 Immunoglobulin-binding protein with Gly21Arg amino acid substitution introduced into FpL_C3, SEQ ID NO: 101), FpL_C3 G51V (immunoglobulin-binding protein with Gly51Val amino acid substitution introduced into FpL_C3, SEQ ID NO: 106), FpL_C3 N62H (Asn62His in FpL_C3 Immunoglobulin binding protein with amino acid substitution introduced, SEQ ID NO: 107), FpL_C3 N62R (Immunoglobulin binding protein with Asn62Arg amino acid substitution introduced into FpL_C3, SEQ ID NO: 108), FpL_C3 N62Y (Introduced Asn62
  • the immunoglobulin-binding protein having at least one or more amino acid substitutions selected from Gly21Arg, Gly51Val, Asn62His, Asn62Arg, Asn62Tyr and Asn62Trp has an elution pH compared to that of native FpL_C3. It can be said to be improved, that is, immunoglobulins (antibodies) bound to immunoglobulin-binding proteins can be eluted under milder conditions.
  • Example 31 Mutagenesis to FpL_C3KX 6a and Library Preparation Of the expression vector pET-FpL_C3KX 6a prepared in Example 28, the polynucleotide portion (SEQ ID NO: 211) encoding an immunoglobulin-binding protein was added in the same manner as in Example 2.
  • a library was prepared by randomly introducing mutations by error-prone PCR by the method of . The average mutagenesis rate was 1.8%.
  • Example 32 Screening for FpL_C3KX 6a amino acid substitutes (1) After culturing the random mutant library (transformant) prepared in Example 31 in the same manner as in Example 3 (1) to (2), centrifugation The obtained culture supernatant was mixed with 1.0 M NaOH in an equal amount and subjected to alkali treatment at 62° C. for 30 minutes.
  • the antibody-binding activity of the immunoglobulin-binding protein when subjected to alkali treatment is measured by the ELISA method described in Example 3 (4), and the antibody of the immunoglobulin-binding protein when alkali treatment is performed.
  • the residual activity was calculated by dividing the binding activity by the antibody binding activity of the immunoglobulin-binding protein without alkali treatment.
  • the selected transformant was cultured, and an expression vector was prepared using the QIAprep Spin Miniprep kit (manufactured by QIAGEN).
  • nucleotide sequence of the polynucleotide region encoding the immunoglobulin-binding protein inserted into the obtained expression vector was analyzed by the method described in Example 1 (5) to identify the amino acid mutation sites. .
  • a transformant expressing the immunoglobulin binding protein selected in (3), a transformant expressing FpL_C3 (SEQ ID NO: 1) prepared in Example 1, FpL_C4KR (SEQ ID NO: 1) prepared in Reference Example 1 117) or the transformant expressing FpL_C3KX6a (SEQ ID NO: 199) produced in Example 28 were cultured in the same manner as in Examples 3 (8) to (10). Then, a protein extract was prepared in the same manner as in Example 3 (11). The extract was centrifuged, and the resulting supernatant was passed through a filter for clarification.
  • Example 33 Evaluation of elution characteristics of FpL_C3KX 6a amino acid-substituted product
  • FpL_C3 SEQ ID NO: 1 prepared in Example 1 or FpL_C3KX 6a E27V obtained in Example 32 (protein in which Glu27Val amino acid substitution was introduced in FpL_C3KX 6a, A transformant expressing SEQ ID NO: 222) was cultured in the same manner as in Examples 3(8) to (10), and a protein extract was prepared in the same manner as in Example 3(11). The extract was centrifuged, and the resulting supernatant was passed through a filter for clarification.
  • Washing buffer A (0.05M Tris buffer (pH 7.5) containing 0.15M NaCl and 0.05% (w/v) Tween 20 (trade name)) was used to wash a 96-well microplate. After washing the wells, a solution containing an immunoglobulin-binding protein for evaluating antibody binding activity diluted to 2 ⁇ g/mL was added, and the immunoglobulin-binding protein and the immobilized monoclonal antibody were allowed to react (30° C., 1 hour ).
  • Sequence analysis confirmed that a polynucleotide encoding FpL_C3KX7b (SEQ ID NO: 224) was inserted into the expression vector pET-FpL_C3KX7b.
  • Example 35 Evaluation of alkaline stability of FpL_C3KX 6a arginine-substituted product (1)
  • FpL_C3KX 6a (SEQ ID NO: 199) prepared in Example 28, and FpL_C3KX 7a (SEQ ID NO: 223) and FpL_C3KX 7b (SEQ ID NO: 223) prepared in Example 34 224) and FpL_C3KX 7c (SEQ ID NO: 225) were cultured in the same manner as in Examples 3 (8) to (10), and cultured in the same manner as in Example 3 (11).
  • a protein extract was prepared. The extract was centrifuged, and the resulting supernatant was passed through a filter for clarification.
  • Example 3 (4) Same as Example 3 (13) except that the concentration of NaOH used for the treatment was 1.0 M (final concentration 0.5 M), the treatment temperature was 25 ° C., and the treatment time was 14 hours. After the alkali treatment by the method, the residual activity was calculated in the same manner as in Example 3 (14) to evaluate the alkali stability.
  • Example 36 Elution Characterization of FpL_C3KX 6a Arginine Substitutes (1) FpL_C3KX 6a (SEQ ID NO: 199) prepared in Example 28, FpL_C3KX 6a E27V (SEQ ID NO: 222) obtained in Example 32, and prepared in Example 34 Transformants expressing either FpL_C3KX 7b (SEQ ID NO: 224) or FpL_C3KX 7c (SEQ ID NO: 225) were cultured in the same manner as in Examples 3 (8) to (10), and cultured in Example 3 (11). ) to prepare a protein extract. The extract was centrifuged, and the resulting supernatant was passed through a filter for clarification.
  • FpL_C3KX6a arginine-substituted FpL_C3KX7b (SEQ ID NO: 224) and FpL_C3KX7c (SEQ ID NO: 225) are different from FpL_KX6a E27V (SEQ ID NO: 222), which has improved acid elution properties compared to native FpL_C3 (SEQ ID NO: 1). It can be seen from the comparison that the acid elution property is improved. In particular, FpL_C3KX 7b was confirmed to have significantly improved acid elution properties (FpL_C3KX 6a E27V: 53%, FpL_C3KX 7b: 61%).
  • Example 37 Evaluation of Immunoglobulin ⁇ Light Chain Binding of Immunoglobulin-binding Protein (Part 2) The effect of the introduction of Pro6Ser amino acid substitutions on human immunoglobulin kappa light chain-binding activity was evaluated. Specifically, an immunoglobulin-binding protein in which a Pro6Ser amino acid substitution was introduced into FpL_C3KX 5e (SEQ ID NO: 186) was prepared and evaluated.
  • a polynucleotide containing a nucleotide sequence encoding an immunoglobulin-binding protein (named FpL_C3KX_5e_P6S, SEQ ID NO: 236) in which a Pro6Ser amino acid substitution was introduced into FpL_C3KX5e (SEQ ID NO: 186) by mutagenesis using inverse PCR Nucleotides were made.
  • FpL_C3KX_5e_P6S SEQ ID NO: 236S
  • SEQ ID NO: 236S an immunoglobulin-binding protein
  • pET-FpL_C3KX5e was used as the template DNA
  • the oligonucleotide set forth in SEQ ID NO: 234 was used as the PCR forward primer
  • the oligonucleotide set forth in SEQ ID NO: 235 was used as the PCR reverse primer.
  • Example 7 (3) The resulting transformant was cultured in the same manner as in Example 7 (2) (a-3) and an expression vector (named pET-FpL_C3KX_5e_P6S) was extracted, and the nucleotide sequence of the expression vector was analyzed. was performed in the same manner as in Example 1 (5). Sequence analysis confirmed that a polynucleotide encoding FpL_C3KX_5e_P6S (SEQ ID NO: 236) was inserted into the expression vector pET-FpL_C3KX_5e_P6S.
  • Example 24 A transformant expressing either FpL_C3KX_5e_P6S (SEQ ID NO: 236) obtained in (2) or FpL_C3KX_5e (SEQ ID NO: 186) prepared in Example 24 was transformed from Example 3 (8) to (10 ), and a protein extract was prepared in the same manner as in Example 3 (11). The extract was centrifuged, and the resulting supernatant was passed through a filter for clarification.
  • the human immunoglobulin ⁇ light chain-binding activity of the immunoglobulin-binding protein was measured in the same manner as in Example 21 (4), and the effect of amino acid substitution on the human immunoglobulin ⁇ light chain-binding activity was evaluated.
  • the polyclonal antibody used for binding activity evaluation Herceptin (manufactured by Chugai Pharmaceutical Co., Ltd.) containing human ⁇ light chain subgroup 1 (V ⁇ 1) and Human CTLA4 antibody (manufactured by R&D Systems) containing human ⁇ light chain subgroup 3 (V ⁇ 3), is either
  • a nucleotide sequence encoding an immunoglobulin-binding protein (named FpL_C3KR_K38E, SEQ ID NO: 239) in which an amino acid substitution of Lys(Arg)38Glu was introduced into FpL_C3KR (SEQ ID NO: 116) by mutagenesis using inverse PCR.
  • the human immunoglobulin ⁇ light chain-binding activity of the immunoglobulin-binding protein was measured in the same manner as in Example 37 (7), and the effect of amino acid substitution on the human immunoglobulin ⁇ light chain-binding activity was evaluated. .
  • Example 37 The results of Example 37 and Comparative Example 3 are shown together in Table 27. It can be seen that the introduction of the amino acid substitution of Pro6Ser (Example 37) or Lys(Arg)38Glu (Comparative Example 3) can impart binding power to V ⁇ 3.
  • Example 38 Production of FpL_C3KX 5e amino acid substitution aggregate (Part 2) The amino acid substitutions that confer the above-described V ⁇ 3-binding ability and the amino acid substitutions that are involved in improving the alkaline stability of the immunoglobulin-binding protein revealed in Example 27 were accumulated for FpL_C3KX 5e. Specifically, immunoglobulin-binding proteins shown in (ab) below were designed and produced. (ab) A protein introduced with amino acid substitutions of Glu4Gly, Lys (Arg) 38Glu, and Glu (Gly) 52Asp to FpL_C3KX 5e (SEQ ID NO: 240, named FpL_C3KX 7d)
  • a polynucleotide (SEQ ID NO: 241) encoding (ab-1) FpL_C3KX7d (SEQ ID NO: 240) was synthesized.
  • the recognition sequence (5'-CCATGG-3') for the restriction enzyme NcoI was placed on the 5'-end side, and the nucleotide sequence (SEQ ID NO: 232) encoding 6 histidine residues was placed on the 3'-end side.
  • a termination codon and a recognition sequence for restriction enzyme HindIII (5'-AAGCTT-3') are added, respectively.
  • Example 39 Alkaline stability evaluation of FpL_C3KX 5e amino acid substitution aggregates (part 2) (1) A transformant expressing either FpL_C3KX 5e (SEQ ID NO: 186) prepared in Example 24 or FpL_C3KX 7d (SEQ ID NO: 240) prepared in Example 38 was transformed from Example 3 (8) to (10 ), and a protein extract was prepared by the method described in Example 3 (11). The extract was centrifuged, and the resulting supernatant was passed through a filter for clarification.
  • FpL_C3KX 7d (SEQ ID NO: 240) evaluated in this example has improved alkali stability compared to FpL_C3KX 5e (SEQ ID NO: 186), which has improved alkali stability over natural FpL_C3 (SEQ ID NO: 1). It can be said that
  • Example 40 Mutation into FpL_C3KX 7d and Library Preparation (Part 1) Of the vector pET-FpL_C3KX 7d expressing FpL_C3KX 7d (SEQ ID NO: 240) prepared in Example 38, the polynucleotide portion (SEQ ID NO: 241) encoding an immunoglobulin binding protein was added in the same manner as in Example 2. A library was prepared by randomly introducing mutations by error-prone PCR. The average mutagenesis rate was 1.9%.
  • Example 41 Screening for FpL_C3KX 7d amino acid substitutes (Part 1) (1)
  • the pET-FpL_C3KX 7d (transformant) prepared in Example 38 and the random mutant library (transformant) prepared in Example 40 were prepared in the same manner as in Example 3 (1) to (2). cultured in
  • the culture supernatant obtained by centrifugation was mixed with an equal amount of 1.0 M NaOH and subjected to alkali treatment at 58°C for 30 minutes.
  • the antibody-binding activity of the immunoglobulin-binding protein when subjected to alkali treatment is measured by the ELISA method described in Example 3 (4), and the antibody of the immunoglobulin-binding protein when alkali treatment is performed.
  • the residual activity was calculated by dividing the binding activity by the antibody binding activity of the immunoglobulin-binding protein without alkali treatment.
  • the selected transformant was cultured, and an expression vector was prepared using the QIAprep Spin Miniprep kit (manufactured by QIAGEN).
  • Example 38 The transformant expressing the immunoglobulin-binding protein selected in (4) or the transformant expressing FpL_C3KX7d (SEQ ID NO: 240) prepared in Example 38 was transformed from Example 3 (8) to ( The cells were cultured in the same manner as in 10), and a protein extract was prepared in the same manner as in Example 3 (11). After the extract was centrifuged, the resulting supernatant was passed through a filter for clarification.
  • the immunoglobulin-binding protein having at least one amino acid substitution selected from Glu8Val, Lys(Ile)29Phe, Glu33Val and Ala69Val in the amino acid sequence set forth in SEQ ID NO: 240 is native FpL_C3 (SEQ ID NO: 1) It can be said that the alkali stability is improved even when compared with FpL_C3KX7d (SEQ ID NO: 240), which has improved alkali stability.
  • Example 42 Mutation into FpL_C3KX 7d and Library Preparation (Part 2) (1) Using the expression vector pET-FpL_C3KX7d prepared in Example 38 as a template, a saturation substitution library was prepared for the 23rd, 41st and 52nd amino acid residues. As in Example 11 (1), the primers followed the 22c-Trick method, arranged appropriate mixed bases at the site of mutation introduction, and were designed to enable inverse PCR centered at the site of mutation introduction (SEQ ID NO: 245 from 250, 252 to 257, and 260 to 265). A set of 6 primers were mixed for each replacement site with the compositions shown in Tables 7 and 30 to prepare a PCR primer mixture (Forward/Reverse primer mix).
  • E. coli BL21 (DE3) strain was transformed with the reaction solution and cultured on an LB plate medium containing 50 ⁇ g/mL kanamycin (37° C., 16 hours). Colonies formed on the plate were used as a site-specific mutant library.
  • Example 43 Screening for FpL_C3KX 7d amino acid substitutes (Part 2) (1)
  • the pET-FpL_C3KX 7d (transformant) prepared in Example 38 and the site-specific amino acid substitution library (transformant) prepared in Example 42 were compared with Example 3 (1) to (2). After culturing in the same manner, the culture supernatant obtained by centrifugation was subjected to alkali treatment as described in Example 41(2).
  • the antibody-binding activity of the immunoglobulin-binding protein when subjected to alkali treatment is measured by the ELISA method described in Example 3 (4), and the antibody of the immunoglobulin-binding protein when alkali treatment is performed.
  • the residual activity was calculated by dividing the binding activity by the antibody binding activity of the immunoglobulin-binding protein without alkali treatment.
  • the selected transformant was cultured, and an expression vector was prepared using the QIAprep Spin Miniprep kit (manufactured by QIAGEN).
  • nucleotide sequence of the polynucleotide region encoding the immunoglobulin-binding protein inserted into the obtained expression vector was analyzed by the method described in Example 1 (5) to identify the amino acid mutation sites. .
  • Example 38 The transformant expressing the immunoglobulin-binding protein selected in (3) or the transformant expressing FpL_C3KX7d (SEQ ID NO: 240) prepared in Example 38 was transformed from Example 3 (8) to ( The cells were cultured in the same manner as in 10), and a protein extract was prepared in the same manner as in Example 3 (11). The extract was centrifuged, and the resulting supernatant was passed through a filter for clarification.
  • Example 44 Preparation of FpL_C3KX 7d Amino Acid Substitution Aggregates (1) Design of FpL_C3KX 7d Amino Acid Substitution Aggregates By accumulating against 7d (SEQ ID NO: 240), further improvement in alkali stability was attempted. Specifically, two types of immunoglobulin-binding proteins shown in (ac) to (ad) below were designed and produced.
  • FpL_C3KX 8b (ad-1)
  • a polynucleotide containing a nucleotide sequence encoding FpL_C3KX 8b (SEQ ID NO: 274) was generated by mutagenesis using inverse PCR.
  • pET-FpL_C3KX8a_A69V was used as the template DNA
  • the oligonucleotide set forth in SEQ ID NO: 272 was used as the PCR Forward Primer
  • the oligonucleotide set forth in SEQ ID NO: 273 was used as the PCR Reverse Primer.
  • Example 3 The resulting transformant was cultured in the same manner as in Example 7 (2) (a-3), and the expression vector (named pET-FpL_C3KX8b) was extracted. Sequence analysis was performed in the same manner as in Example 1(5).
  • Sequence analysis confirmed that a polynucleotide encoding FpL_C3KX8b (SEQ ID NO: 274) was inserted into the expression vector pET-FpL_C3KX8b.
  • Example 45 Alkaline stability evaluation of FpL_C3KX 7d amino acid substitution aggregates (1) FpL_C3KX 7d_A69V (SEQ ID NO: 242) obtained in Example 42, and FpL_C3KX 8a (SEQ ID NO: 271) and FpL_C3KX9b (SEQ ID NO: 271) prepared in Example 44 274) was cultured in the same manner as in Examples 3(8) to (10), and a protein extract was prepared by the method described in Example 3(11). The extract was centrifuged, and the resulting supernatant was passed through a filter for clarification.
  • FpL_C3KX 8a (SEQ ID NO: 271) and FpL_C3KX 8b (SEQ ID NO: 274) have improved alkali stability compared to FpL_C3KX 7d_A69V (SEQ ID NO: 242), which has improved alkali stability over native FpL_C3 (SEQ ID NO: 1). It can be said that
  • Example 46 Mutation into Immunoglobulin-binding Protein of the Present Invention and Library Construction Mutations were randomly introduced by error-prone PCR in the same manner as in Example 2 to prepare a library. The average mutagenesis rate was 1.0%.
  • FpL_C3KX 7e is Glu4Gly, Pro6Ser, Lys7Ala, Lys13Arg, Lys22Arg, Lys29Ile, Lys29Glu, Lys48Arg, Glu49Asp, Asn50Tyr, Tyr52Phe, A Immunizations Introduced with Sn62Tyr, Lys67Arg and Ala69Val Amino Acid Substitutions It is a globulin-binding protein.
  • Example 47 Screening for FpL_C3KX 7e Amino Acid Substitutes (1)
  • a transformant capable of expressing FpL_C3KX 7e and the random mutant library (transformant) prepared in Example 46 were screened in Examples 3 (1) to (2). After culturing in the same manner as above, the culture supernatant obtained by centrifugation was subjected to alkali treatment as described in Example 41(2).
  • the antibody-binding activity of the immunoglobulin-binding protein when subjected to alkali treatment is measured by the ELISA method described in Example 3 (4), and the antibody of the immunoglobulin-binding protein when alkali treatment is performed.
  • the residual activity was calculated by dividing the binding activity by the antibody binding activity of the immunoglobulin-binding protein without alkali treatment.
  • the selected transformant was cultured, and an expression vector was prepared using the QIAprep Spin Miniprep kit (manufactured by QIAGEN).
  • nucleotide sequence of the polynucleotide region encoding the immunoglobulin-binding protein inserted into the obtained expression vector was analyzed by the method described in Example 1 (5) to identify the amino acid mutation sites. .
  • Example 40 The transformant expressing FpL_C3KX7e (SEQ ID NO: 275) prepared in Example 40 or the transformant expressing the immunoglobulin-binding protein selected in (4) was transformed from Example 3 (8) to ( The cells were cultured in the same manner as in 10), and a protein extract was prepared in the same manner as in Example 3 (11). The extract was centrifuged, and the resulting supernatant was passed through a filter for clarification.
  • the immunoglobulin-binding protein having one or more amino acid substitutions is FpL_C3KX7e (SEQ ID NO: 275), which has improved alkali stability compared to native FpL_C3 (SEQ ID NO: 1). It can be said that the alkali stability is improved even when compared with .
  • Example 48 Preparation of FpL_C3KX 7e Amino Acid Substitutes Acquired by a method of introducing substitutions with amino acid residues having different side chain properties, or substitutions with amino acid residues of other domains at positions where the amino acid sequences differ between domains. , which are amino acid substitutions with improved alkali stability, Val14Ala, Gly21Arg, Ile23Thr, Ala41Arg, Asn44Asp, Asn44Arg, Asn44His, Glu52Tyr, Gly60Arg and Ile64Leu, were enriched for FpL_C3KX 7e.
  • An expression vector (hereinafter also referred to as "pET-FpL_C3KX7e") containing a polynucleotide (SEQ ID NO: 276) encoding FpL_C3KX7e (SEQ ID NO: 275) as a template DNA is combined with a PCR Forward Primer and a PCR Reverse Primer Inverse PCR was performed in the same manner as in Example 7(2)(a-1), except that combinations of oligonucleotides consisting of the sequences shown in SEQ ID NOs in Table 34 were used.
  • Example 7 (2) (a-3) The resulting transformant was cultured and the expression vector was extracted in the same manner as in Example 7 (2) (a-3), and the nucleotide sequence of the expression vector was analyzed in Example 1 (5). was done in a similar way. As a result, it was confirmed that the polynucleotide obtained in (1) was inserted into each expression vector.
  • Example 49 Evaluation of alkaline stability of FpL_C3KX 7e amino acid-substituted products (1) Transformants expressing either FpL_C3KX 7e or the FpL_C3KX 7e amino acid-substituted products prepared in Example 48 (total of 10 types) were used in Example 3 ( The cells were cultured in the same manner as in 8) to (10), and a protein extract was prepared by the method described in Example 3 (11). The extract was centrifuged, and the resulting supernatant was passed through a filter for clarification.
  • Example 50 Multimerization of the protein of the present invention (Part 1) A multimer of FpL_C3KX 7e (SEQ ID NO: 275), which is one embodiment of the protein of the present invention, was produced by the method shown below.
  • FpL_C3KX 7e multimer expression vector (1-1) A polypeptide (named (FpL_C3KX7e) 4 -IT-6H3K) consisting of the amino acid sequence of SEQ ID NO: 326 was designed as the FpL_C3KX 7e multimer.
  • polypeptide has four FpL_C3KX 7e (SEQ ID NO: 275) directly linked, and an oligopeptide (WO2017/069158 SEQ ID NO: 36 297th to the 319th amino acid sequence, IT, SEQ ID NO: 324), a histidine tag (6H, SEQ ID NO: 325), which is a purification tag, and a lysine 3 residue for improving the immobilization rate on an insoluble carrier. It is a polypeptide to which a group (3K, hereinafter also referred to as "lysine tag") is added.
  • a polynucleotide (SEQ ID NO: 327) encoding (FpL_C3KX 7e) 4 -IT-6H3K (SEQ ID NO: 326) designed in (1-1) was designed.
  • the polynucleotides consisting of the sequence set forth in SEQ ID NO: 327, 1st to 210th, 211st to 420th, 421st to 630th, and 631st to 840th are FpL_C3KX 7e (SEQ ID NO: 275), 841st to 909th is a polynucleotide (SEQ ID NO: 328) encoding an oligopeptide (IT) consisting of the amino acid sequence set forth in SEQ ID NO: 324, and 910th to 927th is an oligonucleotide encoding a histidine tag (6H, SEQ ID NO:325), 928th to 936th is an oligonucleotide encoding
  • SEQ ID NO: 327 the sequence of the polynucleotide encoding FpL_C3KX 7e (SEQ ID NO: 275) uses SEQ ID NO: 276 in principle. and 607th to 630th are converted from SEQ ID NO:275 using codons different from SEQ ID NO:276 for ease of cloning.
  • a primer (oligonucleotide) for synthesizing a polynucleotide consisting of the sequence shown in SEQ ID NO: 327 designed in (1-2) was designed and synthesized.
  • the primers consisting of the sequences set forth in SEQ ID NO: 329 and SEQ ID NO: 330 were Primers consisting of the sequences set forth in SEQ ID NO: 331 and SEQ ID NO: 332 in order to produce a polynucleotide fragment consisting of the sequence from 187th to 444th of SEQ ID NO: 327, Primers consisting of the sequences set forth in SEQ ID NO: 333 and SEQ ID NO: 334 to produce a polynucleotide fragment consisting of the sequence from 421st to 630th of
  • reaction solution After preparing a reaction solution having the composition shown in Table 36, the reaction solution was subjected to the first step at 98 ° C. for 10 seconds, the second step at 50 ° C. for 5 seconds, and the third step at 68 ° C. for 40 seconds. PCR was performed by repeating 30 cycles of the reaction with one cycle of steps.
  • the combination of template DNA/forward primer/reverse primer in Table 36 is any of the combinations shown in ⁇ 1> to ⁇ 5> in Table 37.
  • Escherichia coli BL21 (DE3) strain was transformed with the ligation product after the reaction in (1-5) and cultured on an LB plate medium containing 50 ⁇ g/mL kanamycin (37° C., 16 hours). .
  • a vector (named pET-(FpL_C3KX 7e) 4 -IT-6H3K) capable of expressing immunoglobulin-binding protein (FpL_C3KX 7e) 4 -IT-6H3K (SEQ ID NO: 326) was obtained by purification using kit (manufactured by QIAGEN). Acquired.
  • Example 51 Multimerization of the protein of the present invention (Part 2) A multimer of FpL_C3KX 6c (SEQ ID NO: 341), another embodiment of the protein of the present invention, was produced by the method shown below.
  • the amino acid sequence of FpL_C3KX 6c (SEQ ID NO: 341)
  • the tyrosine residue at position 50 of the amino acid sequence of FpL_C3KX 7e (SEQ ID NO: 275) is changed back to the asparagine residue, which is the amino acid residue of natural FpL_C3 (SEQ ID NO: 1). is the amino acid sequence.
  • a polypeptide (named (FpL_C3KX 6c) 4 -IT-6H3K) consisting of the amino acid sequence of SEQ ID NO: 343 was designed as an FpL_C3KX 6c multimer.
  • the polypeptide has four FpL_C3KX 6c (SEQ ID NO: 341) directly linked, and an oligopeptide (IT, SEQ ID NO: 324) for improving the immobilization rate to an insoluble carrier on the C-terminal side, and a purification tag.
  • It is a polypeptide added with a histidine tag (6H, SEQ ID NO:325) and a lysine tag (3K) for improving the immobilization rate to an insoluble carrier.
  • SEQ ID NO: 344 a polynucleotide encoding a polypeptide consisting of the amino acid sequence set forth in SEQ ID NO: 343 designed in (1) was designed (SEQ ID NO: 344).
  • SEQ ID NO: 342 is used as the polynucleotide sequence encoding FpL_C3KX6c (SEQ ID NO: 341).
  • E. coli was transformed and cultured in the same manner as in Example 50 (1-6).
  • Example 50 (1-7) After colony PCR in the same manner as in Example 50 (1-7), selection of transformants in the same manner as in Example 50 (1-8), culture of the selected transformants, and plasmid extraction was performed to obtain a vector (named pET-(FpL_C3KX 6c) 4 -IT-6H3K) capable of expressing immunoglobulin-binding protein (FpL_C3KX 6c) 4 -IT-6H3K (SEQ ID NO: 343).
  • Example 52 Preparation of immunoglobulin adsorbent (1) Fraction containing (FpL_C3KX 7e) 4 -IT-6H3K (SEQ ID NO: 326) (SEQ ID NO: 326) prepared in Example 50 or prepared in Example 51 (FpL_C3KX 6c) After concentrating the fraction containing 4 -IT-6H3K (SEQ ID NO: 343) to 1/10 of the original volume with Amicon Ultra (manufactured by Merck Millipore), phosphoric acid of 10 times the amount of the concentrated solution The protein solution was concentrated and buffer-exchanged by adding sodium buffer and concentrating to 1/10 of the original volume with Amicon Ultra (manufactured by Merck Millipore).
  • Amicon Ultra manufactured by Merck Millipore
  • Example 53 Alkaline stability evaluation of immunoglobulin adsorbent (1) A 0.1 M glycine hydrochloride solution (pH 2.0) (hereinafter also referred to as an acidic solution) was added to the column filled with the immunoglobulin adsorbent prepared in Example 52. ), and then 0.02M Tris buffer (pH 7.5) containing 0.15M sodium chloride (hereinafter also referred to as “washing buffer C”) was passed through to wash the column.
  • pH 2.0 0.1 M glycine hydrochloride solution
  • washing buffer C 0.02M Tris buffer
  • Washing buffer solution C was passed through to equilibrate the immunoglobulin adsorbent, then 0.5 M sodium hydroxide solution was passed through, and alkali treatment was carried out by standing still at 25°C for 17 hours. Washing buffer C was passed through the immunoglobulin adsorbent after alkali treatment to neutralize it.
  • the static adsorption amount of the adsorbent was calculated by the same method as (2) and (3), and the ratio of the adsorption amount before and after the alkali treatment (residual activity) was calculated to evaluate the alkali stability.
  • FpL_C3KX 7e and FpL_C3KX 6c are only at the 50th position (FpL_C3KX 7e: tyrosine residue, FpL_C3KX 6c: asparagine residue (same as natural FpL_C3)), so the amino acid substitution of Asn50Tyr It can be seen that this particularly contributes to the improvement of alkali stability.
  • Example 54 Preparation of Protein L immunoglobulin-binding domain C4 (FpL_C4) amino acid substitution (1) Preparation of FpL_C4KR (1-1) 2 mL of 2 ⁇ YT liquid medium containing 50 ⁇ g / mL kanamycin, Reference Example 1 (2 ) ( ⁇ ) containing the pET-FpL_C4KR-containing transformant was inoculated and precultured (30° C., 16 hours).
  • E. coli BL21 (DE3) strain is transformed with the purified product and cultured on an LB plate medium containing 50 ⁇ g/mL kanamycin (37° C., 16 hours). After that, the colonies formed on the plate were used as a saturated substitution library.
  • Example 55 Screening of FpL_C4KR Amino Acid Substitutes (1)
  • the transformant capable of expressing FpL_C4KR prepared in Reference Example 1 (2) ( ⁇ ) and the library of saturated substitutions prepared in Example 54 (2) (character Transformant) was inoculated into 250 ⁇ L of 2 ⁇ YT liquid medium containing 50 ⁇ g/mL of kanamycin, and cultured with shaking at 37° C. overnight using a 96 deep well plate.
  • the antibody-binding activity of the immunoglobulin-binding protein when subjected to alkali treatment is measured by the ELISA method shown in Example 3 (4), and the immunoglobulin-binding activity when subjected to alkali treatment in (3) Residual activity was calculated by dividing the antibody-binding activity of the protein by the antibody-binding activity of the immunoglobulin-binding protein when the alkali treatment in (3) was not performed.
  • the transformant selected in (5) was cultured, and an expression vector was prepared using a QIAprep Spin Miniprep kit (manufactured by QIAGEN).
  • Example 56 Immunoglobulin elution pH evaluation of the protein of the present invention FpL_C3 (SEQ ID NO: 1) prepared in Example 1, FpL_C4KR (SEQ ID NO: 117) prepared in Reference Example 1 (2) ( ⁇ ) or obtained in Example 55
  • the pH at which the immunoglobulin bound to the FpL_C4KR amino acid-substituted product can be eluted was measured by the following method.
  • the expression vector pET-FpL_C3KX7d containing a polynucleotide (SEQ ID NO:241) encoding FpL_C3KX7d (SEQ ID NO:240) as a template DNA is listed in the sequence numbers in Table 43 as a combination of PCR Forward Primer and PCR Reverse Primer. Inverse PCR was carried out in the same manner as in Example 7(2)(a-1), except that a combination of oligonucleotides consisting of the sequences of was used.
  • Example 58 Acid elution evaluation of FpL_C3KX 7d amino acid-substituted products (1) Transformants expressing either FpL_C3KX 7d (SEQ ID NO: 240) or the FpL_C3KX 7d amino acid-substituted products prepared in Example 57 (15 types in total) were , were cultured in the same manner as in Examples 54 (1-1) to (1-2), and a protein extract was prepared by the method described in Example 54 (1-3). The extract was centrifuged, and the resulting supernatant was passed through a filter for clarification.
  • Example 3(4) Diluted with TBS so that the concentration of each protein was equal.
  • the diluted solution was divided into two equal parts, and one part was treated with 0.05 M sodium citrate buffer (pH 3.0) (acid treatment), and the other was treated by the ELISA method (acid elution evaluation) described in Example 3(4).
  • Antibody-binding activity was measured when TBS (untreated with acid) was added to one side. Residual activity was calculated by dividing the antibody-binding activity of the acid-treated immunoglobulin-binding protein by the antibody-binding activity of the acid-untreated immunoglobulin-binding protein. The elution rate was calculated by subtracting the residual activity from 1, and acid elution was evaluated.
  • Example 59 Accumulation of Amino Acid Substitutions in Immunoglobulin-Binding Proteins of the Present Invention (1) Design of Amino Acid Substitution Accumulations Amino acids involved in improving the alkaline stability of immunoglobulin-binding proteins clarified in Examples 43 and 48 Substitutions and/or amino acid substitutions involved in improving immunoglobulin elution of immunoglobulin binding proteins identified in Example 58 were clustered against FpL_C3KX 7e (SEQ ID NO: 275). Specifically, seven types of immunoglobulin-binding proteins shown in ⁇ c> to ⁇ i> below were designed and produced.
  • a polynucleotide (SEQ ID NO:214) encoding ⁇ c-1>FpL_C3KX 9a (SEQ ID NO:408) was synthesized.
  • the recognition sequence (5'-CCATGG-3') for the restriction enzyme NcoI was placed on the 5'-end side, and the nucleotide sequence (SEQ ID NO: 232) encoding 6 histidine residues was placed on the 3'-end side.
  • a termination codon and a recognition sequence for restriction enzyme HindIII (5'-AAGCTT-3') are added, respectively.
  • ⁇ c-2> The polynucleotide synthesized in ⁇ c-1> was purified in the same manner as in Example 1 (2).
  • ⁇ c-3> In the same manner as in Example 1 (3), after ligating the polynucleotide obtained in ⁇ c-2> with plasmid pET-26b previously digested with restriction enzymes NcoI and HindIII, the ligation product was E. coli BL21(DE3) strain was transformed with the cloning agent and cultured.
  • ⁇ c-4> The resulting transformant was cultured and purified in the same manner as in Example 1 (4) to obtain an expression vector (named pET-FpL_C3KX9a). Sequence analysis was performed in the same manner as in Example 1(5). Sequence analysis confirmed that a polynucleotide (SEQ ID NO: 415) encoding FpL_C3KX 9a (SEQ ID NO: 408) was inserted into the expression vector pET-FpL_C3KX 9a.
  • FpL_C3KX 9e A transformant and an expression vector ( pET-FpL_C3KX 9e) was obtained. Nucleotide sequence analysis of the expression vector pET-FpL_C3KX 9e confirmed that a polynucleotide (SEQ ID NO: 419) encoding FpL_C3KX 9e (SEQ ID NO: 412) was inserted into pET-FpL_C3KX 9e.
  • ⁇ i>FpL_C3KX 10b A transformant and an expression vector ( pET-FpL_C3KX 10b) was obtained. Nucleotide sequence analysis of the expression vector pET-FpL_C3KX 10b confirmed that a polynucleotide (SEQ ID NO: 421) encoding FpL_C3KX 10b (SEQ ID NO: 414) was inserted into pET-FpL_C3KX 10b.
  • Example 60 Acid elution evaluation of FpL_C3KX 8b amino acid-substituted product (1) FpL_C3KX 7e (SEQ ID NO: 275) and FpL_C3KX 9a (SEQ ID NO: 408), FpL_C3KX 9b (SEQ ID NO: 409), FpL_C3KX 9c (sequence #410), FpL_C3KX 9c (SEQ ID NO:411), FpL_C3KX 9d (SEQ ID NO:412), FpL_C3KX 10a (SEQ ID NO:413) and FpL_C3KX 10b (SEQ ID NO:414) 1-1) to (1-2) were cultured, and a protein extract was prepared by the method described in Example 54 (1-3). The extract was centrifuged, and the resulting supernatant was passed through a filter for clarification.
  • Example 3(4) Diluted with TBS so that the concentration of each protein was equal.
  • the diluted solution was divided into two halves, and one was acidified with 0.05 M sodium citrate (NaOAc) buffer (pH 3.2) for 5 minutes by the ELISA method (acid elution evaluation) described in Example 3(4).
  • the antibody-binding activity was measured when TBS (acid-untreated) was added to the other. Residual activity was calculated by dividing the antibody-binding activity of the acid-treated immunoglobulin-binding protein by the antibody-binding activity of the acid-untreated immunoglobulin-binding protein.
  • the elution rate was calculated by subtracting the residual activity from 1, and acid elution was evaluated.
  • FpL_C3KX 9a (SEQ ID NO: 408), FpL_C3KX 9b (SEQ ID NO: 409), FpL_C3KX 9c (SEQ ID NO: 410), FpL_C3KX 9d (SEQ ID NO: 411), FpL_C3KX 9e (SEQ ID NO: 412), FpL_C3KX 10a (SEQ ID NO: 413) and FpL_C3 KX 10b (SEQ ID NO: 414) has a higher elution rate than FpL_C3KX7e (SEQ ID NO: 275), confirming that these mutant immunoglobulin-binding proteins have improved acid elution properties.
  • FpL_C3KX 9a (SEQ ID NO: 408) and FpL_C3KX 10a (SEQ ID NO: 413) are found to have particularly improved acid elution properties.
  • Example 61 Mutation into FpL_C3KX 7e and Library Preparation (Part 3) (1) Using the vector pET-FpL_C3KX 7e expressing FpL_C3KX 7e (SEQ ID NO: 275) as a template, a saturation substitution library was prepared for the 15th and 34th amino acid residues. As in Example 11 (1), the primers followed the 22c-Trick method, arranged appropriate mixed bases at the site of mutation introduction, and were designed to enable inverse PCR centered at the site of mutation introduction (SEQ ID NO: 422 to 433). A set of 6 primers were mixed for each replacement site with the compositions shown in Tables 7 and 46 to prepare a PCR primer mixture (Forward/Reverse primer mix).
  • E. coli BL21 (DE3) strain was transformed with the reaction solution and cultured on an LB plate medium containing 50 ⁇ g/mL kanamycin (37° C., 16 hours). Colonies formed on the plate were used as a site-specific mutant library.
  • Example 62 Screening for FpL_C3KX 7e amino acid substitutes (Part 3) (1) pET-FpL_C3KX 7e (transformant) and the site-specific amino acid substitution library (transformant) prepared with the random mutant library (transformant) prepared in Example 61, Example 55 (1 ) to (2), followed by alkali treatment as described in Example 55(3).
  • the antibody-binding activity of the immunoglobulin-binding protein when subjected to alkali treatment is measured by the ELISA method described in Example 2 (4), and the antibody of the immunoglobulin-binding protein when alkali treatment is performed.
  • the residual activity was calculated by dividing the binding activity by the antibody binding activity of the immunoglobulin-binding protein without alkali treatment.
  • the selected transformant was cultured, and an expression vector was prepared using the QIAprep Spin Miniprep kit (manufactured by QIAGEN).
  • nucleotide sequence of the polynucleotide region encoding the immunoglobulin-binding protein inserted into the obtained expression vector was analyzed by the method described in Example 1 (5) to identify the amino acid mutation sites. .
  • Example 54 The transformant expressing the immunoglobulin-binding protein selected in (3) or the transformant expressing pET-FpL_C3KX7e (SEQ ID NO: 275) was transformed from Example 54 (1-1) to (1- It was cultured in the same manner as in 2), and a protein extract was prepared in the same manner as in Example 54 (1-3). The extract was centrifuged, and the resulting supernatant was passed through a filter for clarification.
  • the results are shown in Table 47.
  • the immunoglobulin-binding protein having at least one amino acid substitution selected from Asn15Val, Glu34Asp, Glu34Phe, Glu34Leu and Glu34Val in the amino acid sequence of SEQ ID NO: 275 was compared with FpL_C3KX7e (SEQ ID NO: 275), and the elution rate was It was confirmed that these mutant immunoglobulin-binding proteins have improved acid elution properties.
  • Example 63 Evaluation of Alkaline Stability of FpL_C3KX 9a
  • Transformants expressing either FpL_C3KX 7e (SEQ ID NO: 275) and FpL_C3KX 9a (SEQ ID NO: 408) were isolated from Examples 54 (1-1) to (1). -2), and the protein extract was prepared by the method described in Example 54 (1-3). The extract was centrifuged, and the resulting supernatant was passed through a filter for clarification.
  • FpL_C3KX 9a (SEQ ID NO: 408) evaluated in this example has alkaline stability equivalent to FpL_C3KX 7e (SEQ ID NO: 275), which has improved alkaline stability compared to native FpL_C3 (SEQ ID NO: 1). confirmed.
  • the protein of the invention comprises an amino acid sequence of an immunoglobulin binding domain of Protein L from the genus Finegoldia, provided that the amino acid sequence has at least one amino acid substitution that improves alkaline stability, and It is characterized by having globulin-binding activity.
  • the immunoglobulin adsorbent of the present invention which comprises an insoluble carrier and the protein of the present invention immobilized on the insoluble carrier, has high alkali stability compared to conventional immunoglobulin adsorbents, resulting in repeated use. Therefore, by using the same immunoglobulin adsorbent, immunoglobulin can be produced at a lower cost than before.
  • the protein of the invention comprises the amino acid sequence of the immunoglobulin binding domain of Protein L from the genus Finegoldia, wherein the amino acid sequence has at least one amino acid substitution that improves antibody elution properties, and It is characterized by having globulin-binding activity.
  • immunoglobulin adsorbent of the present invention comprising an insoluble carrier and the protein of the present invention immobilized on the insoluble carrier, immunoglobulins ( antibody) can be eluted, high-quality immunoglobulins can be obtained.

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Abstract

【課題】　化学的安定性、特にアルカリに対する安定性が向上した免疫グロブリン結合性タンパク質、または温和なｐＨ条件で抗体溶出が可能な免疫グロブリン結合性タンパク質、および当該タンパク質を固定化した吸着剤を提供すること。 【解決手段】　Ｆｉｎｅｇｏｌｄｉａ菌属細菌由来Ｐｒｏｔｅｉｎ　Ｌの免疫グロブリン結合ドメインのアミノ酸配列を含み、ただし当該アミノ酸配列において当該ドメインにおいて特定位置のアミノ酸残基を他の特定のアミノ酸残基に置換し、アルカリに対する安定性または抗体溶出特性を向上させることで、前記課題を解決する。

Description

免疫グロブリン結合性タンパク質
　本発明は免疫グロブリンに特異的に結合するタンパク質に関する。一態様において、本発明はアルカリに対する安定性に優れた免疫グロブリン結合性タンパク質に関する。また、一態様において、本発明は温和なｐＨ条件で抗体溶出が可能な免疫グロブリン結合性タンパク質に関する。
　抗体医薬は生体内の免疫機能を担う分子である抗体（免疫グロブリン）を利用した医薬である。抗体医薬は抗体が有する可変領域の多様性により標的分子に対し高い特異性と親和性をもって結合する。そのため抗体医薬は副作用が少なく、また、近年では適応疾患が広がってきていることもあり市場が急速に拡大している。
　抗体医薬の製造は培養工程と精製工程を含み、培養工程では生産性を向上させるために抗体産生細胞の改質や培養条件の最適化が図られている。また、精製工程では粗精製としてアフィニティークロマトグラフィーが採用され、その後の中間精製、最終精製、およびウイルス除去を経て製剤化される。
　精製工程では抗体分子を特異的に認識するアフィニティー担体が用いられる。前記担体で用いられるリガンドタンパク質として、抗体（免疫グロブリン）に結合する性質を有した、ブドウ球菌（Ｓｔａｐｈｙｌｏｃｏｃｃｕｓ）属細菌由来Ｐｒｏｔｅｉｎ　Ａが多く用いられている。しかしながら、Ｐｒｏｔｅｉｎ　Ａは抗体のＦｃ領域に特異的に結合するタンパク質であるため、シングルチェーンＦｖ（ｓｃＦｖ）、Ｆａｂ、Ｆ（ａｂ’）２、ＩｇＡおよび二重特異性Ｔ細胞誘導（ＢｉＴＥ）抗体といったＦｃ領域を有しない抗体の精製には適用できなかった。一方、Ｆｉｎｅｇｏｌｄｉａ属細菌由来Ｐｒｏｔｅｉｎ　Ｌは、免疫グロブリンのκ軽鎖に結合するタンパク質であるため、Ｐｒｏｔｅｉｎ　Ｌをリガンドタンパク質とすることで、前述したＰｒｏｔｅｉｎ　Ａでは精製できない、Ｆｃ領域を有しない抗体の精製も可能となる。
　抗体医薬を製造する際、その生産コストを低く保つため、アフィニティー担体は複数回使用され、使用後は当該担体に残存した不純物を除去する工程を行なう。前記不純物を除去する工程では、通常、水酸化ナトリウムを用いた定置洗浄を行ない、アフィニティー担体を再生させる。従って前記リガンドタンパク質は、前記再生工程を行なっても、抗体への結合性が維持されるだけの化学的安定性（特にアルカリ安定性）を有する必要がある。
　アルカリ安定性が向上したＰｒｏｔｅｉｎ　Ｌの例として、
特許文献１に記載の特定位置のアスパラギンをグルタミンに置換したＰｒｏｔｅｉｎ　Ｌ、
特許文献２に記載のプロリンを含むＮ末端側アミノ酸残基の一部欠失や、アルカリにより加水分解を受けやすい、アスパラギンとグリシンの連続部位に対する他のアミノ酸への置換を含むＰｒｏｔｅｉｎ　Ｌ、
特許文献３に記載のリジンをリジン以外の塩基性アミノ酸またはヒドロキシ基を有するアミノ酸に置換したＰｒｏｔｅｉｎ　Ｌ、
特許文献４に記載のアスパラギンとグリシンの連続部位を含まないドメインを利用したＰｒｏｔｅｉｎ　Ｌ、
があげられる。しかしながら、これら文献で開示したＰｒｏｔｅｉｎ　Ｌをリガンドタンパク質として利用したとき、アルカリ洗浄を２０ｍＭから５０ｍＭの水酸化ナトリウム水溶液で行なう必要があり（非特許文献１）、プロセススケールでの精製に用いるにはアルカリ安定性が不十分であった。
　また、抗体医薬の精製工程では、中性ｐＨ条件下で抗体分子をアフィニティー担体に吸着させた後、酸性ｐＨ条件下で抗体分子を前記担体から溶出させる工程を含むが、当該酸性ｐＨ条件は抗体分子にダメージを与え、凝集の原因となるため、溶出時のｐＨは高い（つまり中性に近い）ほうが好ましい。
　抗体溶出ｐＨを高める方法として、フレキシブルなアミノ酸残基を有したオリゴペプチドを免疫グロブリン結合性タンパク質に挿入する方法（非特許文献２）や、免疫グロブリン結合性タンパク質中の特定アミノ酸残基をヒスチジン残基に置換する方法（特許文献５）が知られている。しかしながら、これらの文献に記載の方法では免疫グロブリン結合性タンパク質の化学的安定性が低下することが報告されている。そのため、化学的安定性を低下させることなく、抗体溶出ｐＨが高い（すなわち温和なｐＨ条件での抗体溶出が可能な）免疫グロブリン結合性タンパク質が求められている。
ＷＯ２０１６／０９６６４３号 ＷＯ２０１７／１９１７４８号 ＷＯ２０１７／０６９１５８号 特開２０１６－０７９１４９号公報 ＷＯ２０１９／０５９４００号
Ｒｏｄｒｉｇｏ　Ｇ．ｅｔ．ａｌ．，Ａｎｔｉｂｏｄｉｅｓ，２０１５，４，２５９－２７７ Ｓｕｓａｎｎｅ　Ｇｕｌｉｃｈ他，Ｊｏｕｒｎａｌ　ｏｆ　Ｂｉｏｔｅｃｈｎｏｌｏｇｙ，２０００，７６，２３３－２４４
　一態様において、本発明の課題は、化学的安定性、特にアルカリに対する安定性が向上した免疫グロブリン結合性タンパク質、および当該タンパク質を固定化した吸着剤を提供することにある。また、一態様において、本発明の課題は、温和なｐＨ条件で抗体溶出が可能な免疫グロブリン結合性タンパク質、および当該タンパク質を固定化した吸着剤を提供することにある。
　本発明者らは、前記課題を解決するため鋭意検討した結果、Ｆｉｎｅｇｏｌｄｉａ属細菌由来Ｐｒｏｔｅｉｎ　Ｌ（ＦｐＬ）の免疫グロブリン結合ドメインにおける安定性向上または抗体溶出特性に関与したアミノ酸残基を特定し、当該アミノ酸残基を他の特定のアミノ酸残基に置換することで前記課題を解決できることを見出し、本発明を完成するに至った。
　すなわち、一態様において、本発明は以下の態様を包含する。
［１］
　Ｆｉｎｅｇｏｌｄｉａ属細菌由来Ｐｒｏｔｅｉｎ　Ｌの免疫グロブリン結合ドメインのアミノ酸配列を含み、ただし当該アミノ酸配列において、少なくとも以下の（１）から（５３）より選択される１つ以上のアミノ酸置換を有し、かつ免疫グロブリン結合活性を有するタンパク質：
（１）配列番号１の５０番目のアスパラギンに相当するアミノ酸残基がチロシンに置換
（２）配列番号１の１番目のグルタミン酸に相当するアミノ酸残基がグリシンまたはバリンに置換
（３）配列番号１の３番目のプロリンに相当するアミノ酸残基がセリンに置換
（４）配列番号１の４番目のグルタミン酸に相当するアミノ酸残基がリジンまたはグリシンに置換
（５）配列番号１の５番目のグルタミン酸に相当するアミノ酸残基がバリンに置換
（６）配列番号１の７番目のリジンに相当するアミノ酸残基がアラニンに置換
（７）配列番号１の８番目のグルタミン酸に相当するアミノ酸残基がグリシンに置換
（８）配列番号１の９番目のグルタミン酸に相当するアミノ酸残基がバリンに置換
（９）配列番号１の１７番目のイソロイシンに相当するアミノ酸残基がフェニルアラニンに置換
（１０）配列番号１の２１番目のグリシンに相当するアミノ酸残基がアルギニンに置換
（１１）配列番号１の２７番目のグルタミン酸に相当するアミノ酸残基がグリシンまたはアルギニンに置換
（１２）配列番号１の２９番目のリジンに相当するアミノ酸残基がプロリンに置換
（１３）配列番号１の３１番目のスレオニンに相当するアミノ酸残基がロイシンに置換
（１４）配列番号１の３６番目のスレオニンに相当するアミノ酸残基がアラニンに置換
（１５）配列番号１の４１番目のアラニンに相当するアミノ酸残基がスレオニンに置換
（１６）配列番号１の４４番目のアスパラギンに相当するアミノ酸残基がセリンまたはグリシンに置換
（１７）配列番号１の４９番目のグルタミン酸に相当するアミノ酸残基がスレオニンまたはイソロイシンに置換
（１８）配列番号１の５０番目のアスパラギンに相当するアミノ酸残基がセリン、リジンおよびアスパラギン酸のいずれかに置換
（１９）配列番号１の５１番目のグリシンに相当するアミノ酸残基がバリンに置換
（２０）配列番号１の５２番目のグルタミン酸に相当するアミノ酸残基がバリン、グリシンおよびアスパラギン酸のいずれかに置換
（２１）配列番号１の５３番目のチロシンに相当するアミノ酸残基がフェニルアラニンに置換
（２２）配列番号１の５４番目のスレオニンに相当するアミノ酸残基がイソロイシンまたはメチオニンに置換
（２３）配列番号１の６２番目のアスパラギンに相当するアミノ酸残基がヒスチジン、アルギニン、ロイシン、メチオニンおよびトリプトファンのいずれかに置換
（２４）配列番号１の６５番目のアスパラギンに相当するアミノ酸残基がチロシンに置換
（２５）配列番号１の６９番目のアラニンに相当するアミノ酸残基がスレオニンに置換
（２６）配列番号１の２番目のスレオニンに相当するアミノ酸残基がセリンまたはプロリンに置換
（２７）配列番号１の３番目のプロリンに相当するアミノ酸残基がアルギニンに置換
（２８）配列番号１の５番目のグルタミン酸に相当するアミノ酸残基がリジンまたはアルギニンに置換
（２９）配列番号１の２７番目のグルタミン酸に相当するアミノ酸残基がバリン、リジンおよびイソロイシンのいずれかに置換
（３０）配列番号１の３２番目のフェニルアラニンに相当するアミノ酸残基がロイシンに置換
（３１）配列番号１の３８番目のリジンに相当するアミノ酸残基がアラニンに置換
（３２）配列番号１の４４番目のアスパラギンに相当するアミノ酸残基がイソロイシンに置換、
（３３）配列番号１の４７番目のアラニンに相当するアミノ酸残基がスレオニンまたはアルギニンに置換
（３４）配列番号１の５２番目のグルタミン酸に相当するアミノ酸残基がアスパラギンに置換
（３５）配列番号１の２番目のスレオニンに相当するアミノ酸残基がアラニンに置換
（３６）配列番号１の５番目のグルタミン酸に相当するアミノ酸残基がアスパラギン酸に置換
（３７）配列番号１の６番目のプロリンに相当するアミノ酸残基がロイシンまたはスレオニンに置換
（３８）配列番号１の７番目のリジンに相当するアミノ酸残基がプロリンに置換
（３９）配列番号１の１４番目のバリンに相当するアミノ酸残基がアラニンに置換
（４０）配列番号１の２３番目のイソロイシンに相当するアミノ酸残基がアルギニンまたはバリンに置換
（４１）配列番号１の２９番目のリジンに相当するアミノ酸残基がフェニルアラニンに置換
（４２）配列番号１の３１番目のスレオニンに相当するアミノ酸残基がメチオニンに置換
（４３）配列番号１の３３番目のグルタミン酸に相当するアミノ酸残基がアスパラギン酸、グリシンおよびバリンのいずれかに置換
（４４）配列番号１の３５番目のアラニンに相当するアミノ酸残基がスレオニンに置換
（４５）配列番号１の３６番目のスレオニンに相当するアミノ酸残基がセリンに置換
（４６）配列番号１の３７番目のアラニンに相当するアミノ酸残基がスレオニンに置換
（４７）配列番号１の４１番目のアラニンに相当するアミノ酸残基がイソロイシンまたはチロシンに置換
（４８）配列番号１の４４番目のアスパラギンに相当するアミノ酸残基がヒスチジンまたはアルギニンに置換
（４９）配列番号１の５２番目のグルタミン酸に相当するアミノ酸残基がロイシンまたはチロシンに置換
（５０）配列番号１の６０番目のグリシンに相当するアミノ酸残基がアルギニンに置換
（５１）配列番号１の６４番目のイソロイシンに相当するアミノ酸残基がロイシンに置換
（５２）配列番号１の６６番目のイソロイシンに相当するアミノ酸残基がバリンに置換
（５３）配列番号１の６９番目のアラニンに相当するアミノ酸残基がロイシンまたはバリンに置換。
［２］
　以下の（ａ）から（ｃ）のいずれかに記載のタンパク質である、［１］に記載のタンパク質：
（ａ）配列番号１または１８に記載のアミノ酸配列を含み、ただし当該アミノ酸配列において、少なくとも以下の（１）から（５３）より選択される１つ以上のアミノ酸置換を有し、かつ免疫グロブリン結合活性を有するタンパク質：
（１）配列番号１の５０番目のアスパラギンに相当するアミノ酸残基がチロシンに置換
（２）配列番号１の１番目のグルタミン酸に相当するアミノ酸残基がグリシンまたはバリンに置換
（３）配列番号１の３番目のプロリンに相当するアミノ酸残基がセリンに置換
（４）配列番号１の４番目のグルタミン酸に相当するアミノ酸残基がリジンまたはグリシンに置換
（５）配列番号１の５番目のグルタミン酸に相当するアミノ酸残基がバリンに置換
（６）配列番号１の７番目のリジンに相当するアミノ酸残基がアラニンに置換
（７）配列番号１の８番目のグルタミン酸に相当するアミノ酸残基がグリシンに置換
（８）配列番号１の９番目のグルタミン酸に相当するアミノ酸残基がバリンに置換
（９）配列番号１の１７番目のイソロイシンに相当するアミノ酸残基がフェニルアラニンに置換
（１０）配列番号１の２１番目のグリシンに相当するアミノ酸残基がアルギニンに置換
（１１）配列番号１の２７番目のグルタミン酸に相当するアミノ酸残基がグリシンまたはアルギニンに置換
（１２）配列番号１の２９番目のリジンに相当するアミノ酸残基がプロリンに置換
（１３）配列番号１の３１番目のスレオニンに相当するアミノ酸残基がロイシンに置換
（１４）配列番号１の３６番目のスレオニンに相当するアミノ酸残基がアラニンに置換
（１５）配列番号１の４１番目のアラニンに相当するアミノ酸残基がスレオニンに置換
（１６）配列番号１の４４番目のアスパラギンに相当するアミノ酸残基がセリンまたはグリシンに置換
（１７）配列番号１の４９番目のグルタミン酸に相当するアミノ酸残基がスレオニンまたはイソロイシンに置換
（１８）配列番号１の５０番目のアスパラギンに相当するアミノ酸残基がセリン、リジンおよびアスパラギン酸のいずれかに置換
（１９）配列番号１の５１番目のグリシンに相当するアミノ酸残基がバリンに置換
（２０）配列番号１の５２番目のグルタミン酸に相当するアミノ酸残基がバリン、グリシンおよびアスパラギン酸のいずれかに置換
（２１）配列番号１の５３番目のチロシンに相当するアミノ酸残基がフェニルアラニンに置換
（２２）配列番号１の５４番目のスレオニンに相当するアミノ酸残基がイソロイシンまたはメチオニンに置換
（２３）配列番号１の６２番目のアスパラギンに相当するアミノ酸残基がヒスチジン、アルギニン、ロイシン、メチオニンおよびトリプトファンのいずれかに置換
（２４）配列番号１の６５番目のアスパラギンに相当するアミノ酸残基がチロシンに置換
（２５）配列番号１の６９番目のアラニンに相当するアミノ酸残基がスレオニンに置換
（２６）配列番号１の２番目のスレオニンに相当するアミノ酸残基がセリンまたはプロリンに置換
（２７）配列番号１の３番目のプロリンに相当するアミノ酸残基がアルギニンに置換
（２８）配列番号１の５番目のグルタミン酸に相当するアミノ酸残基がリジンまたはアルギニンに置換
（２９）配列番号１の２７番目のグルタミン酸に相当するアミノ酸残基がバリン、リジンおよびイソロイシンのいずれかに置換
（３０）配列番号１の３２番目のフェニルアラニンに相当するアミノ酸残基がロイシンに置換
（３１）配列番号１の３８番目のリジンに相当するアミノ酸残基がアラニンに置換
（３２）配列番号１の４４番目のアスパラギンに相当するアミノ酸残基がイソロイシンに置換、
（３３）配列番号１の４７番目のアラニンに相当するアミノ酸残基がスレオニンまたはアルギニンに置換
（３４）配列番号１の５２番目のグルタミン酸に相当するアミノ酸残基がアスパラギンに置換
（３５）配列番号１の２番目のスレオニンに相当するアミノ酸残基がアラニンに置換
（３６）配列番号１の５番目のグルタミン酸に相当するアミノ酸残基がアスパラギン酸に置換
（３７）配列番号１の６番目のプロリンに相当するアミノ酸残基がロイシンまたはスレオニンに置換
（３８）配列番号１の７番目のリジンに相当するアミノ酸残基がプロリンに置換
（３９）配列番号１の１４番目のバリンに相当するアミノ酸残基がアラニンに置換
（４０）配列番号１の２３番目のイソロイシンに相当するアミノ酸残基がアルギニンまたはバリンに置換
（４１）配列番号１の２９番目のリジンに相当するアミノ酸残基がフェニルアラニンに置換
（４２）配列番号１の３１番目のスレオニンに相当するアミノ酸残基がメチオニンに置換
（４３）配列番号１の３３番目のグルタミン酸に相当するアミノ酸残基がアスパラギン酸、グリシンおよびバリンのいずれかに置換
（４４）配列番号１の３５番目のアラニンに相当するアミノ酸残基がスレオニンに置換
（４５）配列番号１の３６番目のスレオニンに相当するアミノ酸残基がセリンに置換
（４６）配列番号１の３７番目のアラニンに相当するアミノ酸残基がスレオニンに置換
（４７）配列番号１の４１番目のアラニンに相当するアミノ酸残基がイソロイシンまたはチロシンに置換
（４８）配列番号１の４４番目のアスパラギンに相当するアミノ酸残基がヒスチジンまたはアルギニンに置換
（４９）配列番号１の５２番目のグルタミン酸に相当するアミノ酸残基がロイシンまたはチロシンに置換
（５０）配列番号１の６０番目のグリシンに相当するアミノ酸残基がアルギニンに置換
（５１）配列番号１の６４番目のイソロイシンに相当するアミノ酸残基がロイシンに置換
（５２）配列番号１の６６番目のイソロイシンに相当するアミノ酸残基がバリンに置換
（５３）配列番号１の６９番目のアラニンに相当するアミノ酸残基がロイシンまたはバリンに置換；
（ｂ）配列番号１または１８に記載のアミノ酸配列を含み、ただし当該アミノ酸配列において、少なくとも前記（１）から（５３）より選択される１つ以上のアミノ酸置換を有し、さらに前記（１）から（５３）以外に１もしくは数個の位置での１もしくは数個のアミノ酸残基の置換、欠失、挿入、および／または付加を含み、かつ免疫グロブリン結合活性を有するタンパク質；
（ｃ）配列番号１または１８に記載のアミノ酸配列またはその部分配列と７０％以上の相同性を有するアミノ酸配列を含み、ただし当該アミノ酸配列において、少なくとも前記（１）から（５３）より選択される１つ以上のアミノ酸置換を有し、かつ免疫グロブリン結合活性を有するタンパク質。
［３］
　以下の（ｄ）から（ｆ）のいずれかに記載のタンパク質である、［１］または［２］に記載のタンパク質：
（ｄ）配列番号１または１８に記載のアミノ酸配列を含み、ただし当該アミノ酸配列において、少なくとも以下の（１）のアミノ酸置換を有し、かつ免疫グロブリン結合活性を有するタンパク質
（１）配列番号１の５０番目のアスパラギンに相当するアミノ酸残基がチロシンに置換；
（ｅ）配列番号１または１８に記載のアミノ酸配列を含み、ただし当該アミノ酸配列において、少なくとも前記（１）のアミノ酸置換を有し、さらに前記アミノ酸置換以外の１もしくは数個の位置での１もしくは数個のアミノ酸残基の置換、欠失、挿入、および／または付加を含み、かつ免疫グロブリン結合活性を有するタンパク質；
（ｆ）配列番号１または１８に記載のアミノ酸配列またはその部分配列と７０％以上の相同性を有するアミノ酸配列を含み、ただし少なくとも前記（１）のアミノ酸置換を有し、かつ免疫グロブリン結合活性を有するタンパク質。
［４］
　さらに、少なくとも以下の（５４）から（６４）より選択される１つ以上のアミノ酸置換を有する、［１］から［３］のいずれかに記載のタンパク質：
（５４）配列番号１の７番目のリジンに相当するアミノ酸残基がグルタミンに置換
（５５）配列番号１の１３番目のリジンに相当するアミノ酸残基がバリンに置換
（５６）配列番号１の２９番目のリジンに相当するアミノ酸残基がバリンまたはイソロイシンに置換
（５７）配列番号１の６番目のプロリンに相当するアミノ酸残基がアラニンに置換
（５８）配列番号１の８番目のグルタミン酸に相当するアミノ酸残基がアルギニンに置換
（５９）配列番号１の１５番目のアスパラギンに相当するアミノ酸残基がバリンに置換
（６０）配列番号１の２３番目のイソロイシンに相当するアミノ酸残基がフェニルアラニンまたはロイシンに置換
（６１）配列番号１の３４番目のグルタミン酸に相当するアミノ酸残基がアスパラギン酸、フェニルアラニン、ロイシンおよびバリンのいずれかに置換
（６２）配列番号１の３８番目のリジンに相当するアミノ酸残基がロイシンに置換
（６３）配列番号１の５０番目のアスパラギンに相当するアミノ酸残基がメチオニンに置換
（６４）配列番号１の５３番目のチロシンに相当するアミノ酸残基がセリンに置換。
［５］
　さらに、少なくとも以下の（Ｉ）から（ＶＩＩ）より選択される１つ以上のリジン残基がリジン以外の塩基性アミノ酸またはヒドロキシ基を有するアミノ酸残基に置換した、［１］から［４］のいずれかに記載のタンパク質：
（Ｉ）配列番号１の７番目に相当するリジン残基
（ＩＩ）配列番号１の１３番目に相当するリジン残基
（ＩＩＩ）配列番号１の２２番目に相当するリジン残基
（ＩＶ）配列番号１の２９番目に相当するリジン残基
（Ｖ）配列番号１の３８番目に相当するリジン残基
（ＶＩ）配列番号１の４８番目に相当するリジン残基
（ＶＩＩ）配列番号１の６７番目に相当するリジン残基。
［６］
　さらに、配列番号１の４９番目のグルタミン酸に相当するアミノ酸残基のアスパラギン酸への置換、配列番号１の６番目のプロリンに相当するアミノ酸残基のセリンへの置換、配列番号１の４４番目のアスパラギンに相当するアミノ酸残基のアスパラギン酸への置換、配列番号１の４９番目のグルタミン酸に相当するアミノ酸残基のバリンへの置換、配列番号１の６２番目のアスパラギンに相当するアミノ酸残基のチロシンへの置換、配列番号１の２３番目のアスパラギンに相当するアミノ酸残基のアスパラギン酸への置換、および配列番号１の４４番目のアスパラギンに相当するアミノ酸残基のアスパラギン酸への置換より選択される１つ以上のアミノ酸置換を有する、［１］から［５］のいずれかに記載のタンパク質。
［７］
　少なくとも以下の（Ｗ）、（Ｘ）、（Ｙ）、（Ｚ）、（ＡＡ）、（ＡＢ）、（ＡＣ）、（ＡＤ）および（ＡＥ）のいずれかのアミノ酸置換を有する、［１］から［６］のいずれかに記載のタンパク質：
（Ｗ）配列番号１の７番目のリジンに相当するアミノ酸残基のアラニンへの置換、配列番号１の１３番目、３８番目、４８番目および６７番目のリジンに相当するアミノ酸残基のアルギニンへの置換、配列番号１の２２番目のリジンに相当するアミノ酸残基のグルタミンへの置換、配列番号１の２９番目のリジンに相当するアミノ酸残基のイソロイシンへの置換、配列番号１の４９番目のグルタミン酸に相当するアミノ酸残基のアスパラギン酸への置換、配列番号１の５０番目および６２番目のアスパラギンに相当するアミノ酸残基のチロシンへの置換、ならびに配列番号１の５２番目のグルタミン酸に相当するアミノ酸残基のグリシンへの置換；
（Ｘ）配列番号１の７番目のリジンに相当するアミノ酸残基のアラニンへの置換、配列番号１の１３番目、２２番目、３８番目、４８番目および６７番目のリジンに相当するアミノ酸残基のアルギニンへの置換、配列番号１の２９番目のリジンに相当するアミノ酸残基のイソロイシンへの置換、配列番号１の４９番目のグルタミン酸に相当するアミノ酸残基のアスパラギン酸への置換、配列番号１の５０番目および６２番目のアスパラギンに相当するアミノ酸残基のチロシンへの置換、配列番号１の５２番目のグルタミン酸に相当するアミノ酸残基のグリシンへの置換、ならびに配列番号１の５３番目のチロシンに相当するアミノ酸残基のフェニルアラニンへの置換；
（Ｙ）配列番号１の４番目のグルタミン酸に相当するアミノ酸残基のグリシンへの置換、配列番号１の７番目のリジンに相当するアミノ酸残基のアラニンへの置換、配列番号１の１３番目、２２番目、３８番目、４８番目および６７番目のリジンに相当するアミノ酸残基のアルギニンへの置換、配列番号１の２９番目のリジンに相当するアミノ酸残基のイソロイシンへの置換、配列番号１の４９番目のグルタミン酸に相当するアミノ酸残基のアスパラギン酸への置換、配列番号１の５０番目および６２番目のアスパラギンに相当するアミノ酸残基のチロシンへの置換、配列番号１の５２番目のグルタミン酸に相当するアミノ酸残基のアスパラギン酸への置換、ならびに配列番号１の５３番目のチロシンに相当するアミノ酸残基のフェニルアラニンへの置換；
（Ｚ）配列番号１の４番目のグルタミン酸に相当するアミノ酸残基のグリシンへの置換、配列番号１の７番目のリジンに相当するアミノ酸残基のアラニンへの置換、配列番号１の１３番目、２２番目、３８番目、４８番目および６７番目のリジンに相当するアミノ酸残基のアルギニンへの置換、配列番号１の２７番目のグルタミン酸に相当するアミノ酸残基のアルギニンへの置換、配列番号１の２９番目のリジンに相当するアミノ酸残基のイソロイシンへの置換、配列番号１の４９番目のグルタミン酸に相当するアミノ酸残基のアスパラギン酸への置換、配列番号１の５０番目および６２番目のアスパラギンに相当するアミノ酸残基のチロシンへの置換、配列番号１の５２番目のグルタミン酸に相当するアミノ酸残基のアスパラギン酸への置換、ならびに配列番号１の５３番目のチロシンに相当するアミノ酸残基のフェニルアラニンへの置換；
（ＡＡ）配列番号１の４番目のグルタミン酸に相当するアミノ酸残基のグリシンへの置換、配列番号１の６番目のプロリンに相当するアミノ酸残基のセリンへの置換、配列番号１の７番目のリジンに相当するアミノ酸残基のアラニンへの置換、配列番号１の１３番目、２２番目、４８番目および６７番目のリジンに相当するアミノ酸残基のアルギニンへの置換、配列番号１の２９番目のリジンに相当するアミノ酸残基のイソロイシンへの置換、配列番号１の３８番目のリジンに相当するアミノ酸残基のグルタミン酸への置換、配列番号１の４９番目のグルタミン酸に相当するアミノ酸残基のアスパラギン酸への置換、配列番号１の５０番目および６２番目のアスパラギンに相当するアミノ酸残基のチロシンへの置換、配列番号１の５２番目のグルタミン酸に相当するアミノ酸残基のアスパラギン酸への置換、ならびに配列番号１の５３番目のチロシンに相当するアミノ酸残基のフェニルアラニンへの置換；
（ＡＢ）配列番号１の４番目のグルタミン酸に相当するアミノ酸残基のグリシンへの置換、配列番号１の６番目のプロリンに相当するアミノ酸残基のセリンへの置換、配列番号１の７番目のリジンに相当するアミノ酸残基のアラニンへの置換、配列番号１の１３番目、２２番目、４８番目および６７番目のリジンに相当するアミノ酸残基のアルギニンへの置換、配列番号１の２９番目のリジンに相当するアミノ酸残基のイソロイシンへの置換、配列番号１の３８番目のリジンに相当するアミノ酸残基のグルタミン酸への置換、配列番号１の４９番目のグルタミン酸に相当するアミノ酸残基のアスパラギン酸への置換、配列番号１の５０番目および６２番目のアスパラギンに相当するアミノ酸残基のチロシンへの置換、配列番号１の５２番目のグルタミン酸に相当するアミノ酸残基のバリンへの置換、配列番号１の５３番目のチロシンに相当するアミノ酸残基のフェニルアラニンへの置換ならびに配列番号１の６９番目のアラニンに相当するアミノ酸残基のバリンへの置換；
（ＡＣ）配列番号１の４番目のグルタミン酸に相当するアミノ酸残基のグリシンへの置換、配列番号１の６番目のプロリンに相当するアミノ酸残基のセリンへの置換、配列番号１の７番目のリジンに相当するアミノ酸残基のアラニンへの置換、配列番号１の１３番目、２２番目、４８番目および６７番目のリジンに相当するアミノ酸残基のアルギニンへの置換、配列番号１の２９番目のリジンに相当するアミノ酸残基のイソロイシンへの置換、配列番号１の３８番目のリジンに相当するアミノ酸残基のグルタミン酸への置換、配列番号１の４９番目のグルタミン酸に相当するアミノ酸残基のアスパラギン酸への置換、配列番号１の５０番目および６２番目のアスパラギンに相当するアミノ酸残基のチロシンへの置換、配列番号１の５３番目のチロシンに相当するアミノ酸残基のフェニルアラニンへの置換ならびに配列番号１の６９番目のアラニンに相当するアミノ酸残基のバリンへの置換；
（ＡＤ）配列番号１の４番目のグルタミン酸に相当するアミノ酸残基のグリシンへの置換、配列番号１の６番目のプロリンに相当するアミノ酸残基のセリンへの置換、配列番号１の７番目のリジンに相当するアミノ酸残基のアラニンへの置換、配列番号１の１３番目、２２番目、４８番目および６７番目のリジンに相当するアミノ酸残基のアルギニンへの置換、配列番号１の２３番目のイソロイシンに相当するアミノ酸残基のアルギニンへの置換、配列番号１の２９番目のリジンに相当するアミノ酸残基のイソロイシンへの置換、配列番号１の３８番目のリジンに相当するアミノ酸残基のグルタミン酸への置換、配列番号１の４４番目のアスパラギンに相当するアミノ酸残基のアルギニンへの置換、配列番号１の４９番目のグルタミン酸に相当するアミノ酸残基のアスパラギン酸への置換、配列番号１の５０番目および６２番目のアスパラギンに相当するアミノ酸残基のチロシンへの置換、配列番号１の５３番目のチロシンに相当するアミノ酸残基のフェニルアラニンへの置換ならびに配列番号１の６９番目のアラニンに相当するアミノ酸残基のバリンへの置換；
（ＡＥ）配列番号１の４番目のグルタミン酸に相当するアミノ酸残基のグリシンへの置換、配列番号１の６番目のプロリンに相当するアミノ酸残基のセリンへの置換、配列番号１の７番目のリジンに相当するアミノ酸残基のアラニンへの置換、配列番号１の１３番目、２２番目および６７番目のリジンに相当するアミノ酸残基のアルギニンへの置換、配列番号１の２３番目のイソロイシンに相当するアミノ酸残基のアルギニンへの置換、配列番号１の２９番目のリジンに相当するアミノ酸残基のイソロイシンへの置換、配列番号１の３８番目のリジンに相当するアミノ酸残基のグルタミン酸への置換、配列番号１の４４番目のアスパラギンに相当するアミノ酸残基のアルギニンへの置換、配列番号１の４８番目のリジンに相当するアミノ酸残基のヒスチジンへの置換、配列番号１の４９番目のグルタミン酸に相当するアミノ酸残基のアスパラギン酸への置換、配列番号１の５０番目および６２番目のアスパラギンに相当するアミノ酸残基のチロシンへの置換、配列番号１の５３番目のチロシンに相当するアミノ酸残基のフェニルアラニンへの置換、配列番号１の６４番目のイソロイシンに相当するアミノ酸残基のロイシンへの置換ならびに配列番号１の６９番目のアラニンに相当するアミノ酸残基のバリンへの置換。
［８］
　配列番号１７９、１８６、１９９、２２４、２４０、２７１、２７５、４０８および４１３のいずれかに記載のアミノ酸配列を含む、［１］から［７］のいずれかに記載のタンパク質。
［９］
　［１］から［８］のいずれかに記載のタンパク質をコードするポリヌクレオチドを含む遺伝子組換え宿主または該ポリヌクレオチドを含む発現ベクターを含む遺伝子組換え宿主を培養し該タンパク質を発現させる工程と、発現した前記タンパク質を回収する工程とを含む、免疫グロブリン結合活性を有するタンパク質の製造方法。
［１０］
　宿主がエシェリヒア・コリ（Ｅｓｃｈｅｒｉｃｈｉａ　ｃｏｌｉ）である、［９］に記載の製造方法。
［１１］
　免疫グロブリン吸着剤を充填したカラムであって、
　前記免疫グロブリン吸着剤が、不溶性担体と、当該不溶性担体に固定化した［１］から［８］のいずれかに記載のタンパク質とを含む、カラム。
［１２］
　［１１］に記載のカラムに免疫グロブリンを含む溶液を添加し当該免疫グロブリンを前記カラムに充填された免疫グロブリン吸着剤に吸着させる工程と、前記免疫グロブリン吸着剤に吸着した免疫グロブリンを溶出させる工程とを含む、前記溶液中に含まれる免疫グロブリンの分離方法。
　また、一態様において、本発明は以下の態様を包含する。
［Ａ１］
　Ｆｉｎｅｇｏｌｄｉａ属細菌由来Ｐｒｏｔｅｉｎ　Ｌの免疫グロブリン結合ドメインのアミノ酸配列を含み、ただし当該アミノ酸配列において、少なくとも以下の（１）から（５３）より選択される１つ以上のアミノ酸置換を有し、かつ免疫グロブリン結合活性を有するタンパク質：
（１）配列番号１の５０番目のアスパラギンに相当するアミノ酸残基がチロシンに置換
（２）配列番号１の１番目のグルタミン酸に相当するアミノ酸残基がグリシンまたはバリンに置換
（３）配列番号１の３番目のプロリンに相当するアミノ酸残基がセリンに置換
（４）配列番号１の４番目のグルタミン酸に相当するアミノ酸残基がリジンまたはグリシンに置換
（５）配列番号１の５番目のグルタミン酸に相当するアミノ酸残基がバリンに置換
（６）配列番号１の７番目のリジンに相当するアミノ酸残基がアラニンに置換
（７）配列番号１の８番目のグルタミン酸に相当するアミノ酸残基がグリシンに置換
（８）配列番号１の９番目のグルタミン酸に相当するアミノ酸残基がバリンに置換
（９）配列番号１の１７番目のイソロイシンに相当するアミノ酸残基がフェニルアラニンに置換
（１０）配列番号１の２１番目のグリシンに相当するアミノ酸残基がアルギニンに置換
（１１）配列番号１の２７番目のグルタミン酸に相当するアミノ酸残基がグリシンまたはアルギニンに置換
（１２）配列番号１の２９番目のリジンに相当するアミノ酸残基がプロリンに置換
（１３）配列番号１の３１番目のスレオニンに相当するアミノ酸残基がロイシンに置換
（１４）配列番号１の３６番目のスレオニンに相当するアミノ酸残基がアラニンに置換
（１５）配列番号１の４１番目のアラニンに相当するアミノ酸残基がスレオニンに置換
（１６）配列番号１の４４番目のアスパラギンに相当するアミノ酸残基がセリンまたはグリシンに置換
（１７）配列番号１の４９番目のグルタミン酸に相当するアミノ酸残基がスレオニンまたはイソロイシンに置換
（１８）配列番号１の５０番目のアスパラギンに相当するアミノ酸残基がセリン、リジンおよびアスパラギン酸のいずれかに置換
（１９）配列番号１の５１番目のグリシンに相当するアミノ酸残基がバリンに置換
（２０）配列番号１の５２番目のグルタミン酸に相当するアミノ酸残基がバリン、グリシンおよびアスパラギン酸のいずれかに置換
（２１）配列番号１の５３番目のチロシンに相当するアミノ酸残基がフェニルアラニンに置換
（２２）配列番号１の５４番目のスレオニンに相当するアミノ酸残基がイソロイシンまたはメチオニンに置換
（２３）配列番号１の６２番目のアスパラギンに相当するアミノ酸残基がヒスチジン、アルギニン、ロイシン、メチオニンおよびトリプトファンのいずれかに置換
（２４）配列番号１の６５番目のアスパラギンに相当するアミノ酸残基がチロシンに置換
（２５）配列番号１の６９番目のアラニンに相当するアミノ酸残基がスレオニンに置換
（２６）配列番号１の２番目のスレオニンに相当するアミノ酸残基がセリンまたはプロリンに置換
（２７）配列番号１の３番目のプロリンに相当するアミノ酸残基がアルギニンに置換
（２８）配列番号１の５番目のグルタミン酸に相当するアミノ酸残基がリジンまたはアルギニンに置換
（２９）配列番号１の２７番目のグルタミン酸に相当するアミノ酸残基がバリン、リジンおよびイソロイシンのいずれかに置換
（３０）配列番号１の３２番目のフェニルアラニンに相当するアミノ酸残基がロイシンに置換
（３１）配列番号１の３８番目のリジンに相当するアミノ酸残基がアラニンに置換
（３２）配列番号１の４４番目のアスパラギンに相当するアミノ酸残基がイソロイシンに置換、
（３３）配列番号１の４７番目のアラニンに相当するアミノ酸残基がスレオニンまたはアルギニンに置換
（３４）配列番号１の５２番目のグルタミン酸に相当するアミノ酸残基がアスパラギンに置換
（３５）配列番号１の２番目のスレオニンに相当するアミノ酸残基がアラニンに置換
（３６）配列番号１の５番目のグルタミン酸に相当するアミノ酸残基がアスパラギン酸に置換
（３７）配列番号１の６番目のプロリンに相当するアミノ酸残基がロイシンまたはスレオニンに置換
（３８）配列番号１の７番目のリジンに相当するアミノ酸残基がプロリンに置換
（３９）配列番号１の１４番目のバリンに相当するアミノ酸残基がアラニンに置換
（４０）配列番号１の２３番目のイソロイシンに相当するアミノ酸残基がアルギニンまたはバリンに置換
（４１）配列番号１の２９番目のリジンに相当するアミノ酸残基がフェニルアラニンに置換
（４２）配列番号１の３１番目のスレオニンに相当するアミノ酸残基がメチオニンに置換
（４３）配列番号１の３３番目のグルタミン酸に相当するアミノ酸残基がアスパラギン酸、グリシンおよびバリンのいずれかに置換
（４４）配列番号１の３５番目のアラニンに相当するアミノ酸残基がスレオニンに置換
（４５）配列番号１の３６番目のスレオニンに相当するアミノ酸残基がセリンに置換
（４６）配列番号１の３７番目のアラニンに相当するアミノ酸残基がスレオニンに置換
（４７）配列番号１の４１番目のアラニンに相当するアミノ酸残基がイソロイシンまたはチロシンに置換
（４８）配列番号１の４４番目のアスパラギンに相当するアミノ酸残基がヒスチジンまたはアルギニンに置換
（４９）配列番号１の５２番目のグルタミン酸に相当するアミノ酸残基がロイシンまたはチロシンに置換
（５０）配列番号１の６０番目のグリシンに相当するアミノ酸残基がアルギニンに置換
（５１）配列番号１の６４番目のイソロイシンに相当するアミノ酸残基がロイシンに置換
（５２）配列番号１の６６番目のイソロイシンに相当するアミノ酸残基がバリンに置換
（５３）配列番号１の６９番目のアラニンに相当するアミノ酸残基がロイシンまたはバリンに置換
［Ａ２］
　以下の（ａ）から（ｃ）のいずれかに記載のタンパク質である、［Ａ１］に記載のタンパク質：
（ａ）配列番号１または１８に記載のアミノ酸配列を含み、ただし当該アミノ酸配列において、少なくとも以下の（１）から（５３）より選択される１つ以上のアミノ酸置換を有し、かつ免疫グロブリン結合活性を有するタンパク質：
（１）配列番号１の５０番目のアスパラギンに相当するアミノ酸残基がチロシンに置換
（２）配列番号１の１番目のグルタミン酸に相当するアミノ酸残基がグリシンまたはバリンに置換
（３）配列番号１の３番目のプロリンに相当するアミノ酸残基がセリンに置換
（４）配列番号１の４番目のグルタミン酸に相当するアミノ酸残基がリジンまたはグリシンに置換
（５）配列番号１の５番目のグルタミン酸に相当するアミノ酸残基がバリンに置換
（６）配列番号１の７番目のリジンに相当するアミノ酸残基がアラニンに置換
（７）配列番号１の８番目のグルタミン酸に相当するアミノ酸残基がグリシンに置換
（８）配列番号１の９番目のグルタミン酸に相当するアミノ酸残基がバリンに置換
（９）配列番号１の１７番目のイソロイシンに相当するアミノ酸残基がフェニルアラニンに置換
（１０）配列番号１の２１番目のグリシンに相当するアミノ酸残基がアルギニンに置換
（１１）配列番号１の２７番目のグルタミン酸に相当するアミノ酸残基がグリシンまたはアルギニンに置換
（１２）配列番号１の２９番目のリジンに相当するアミノ酸残基がプロリンに置換
（１３）配列番号１の３１番目のスレオニンに相当するアミノ酸残基がロイシンに置換
（１４）配列番号１の３６番目のスレオニンに相当するアミノ酸残基がアラニンに置換
（１５）配列番号１の４１番目のアラニンに相当するアミノ酸残基がスレオニンに置換
（１６）配列番号１の４４番目のアスパラギンに相当するアミノ酸残基がセリンまたはグリシンに置換
（１７）配列番号１の４９番目のグルタミン酸に相当するアミノ酸残基がスレオニンまたはイソロイシンに置換
（１８）配列番号１の５０番目のアスパラギンに相当するアミノ酸残基がセリン、リジンおよびアスパラギン酸のいずれかに置換
（１９）配列番号１の５１番目のグリシンに相当するアミノ酸残基がバリンに置換
（２０）配列番号１の５２番目のグルタミン酸に相当するアミノ酸残基がバリン、グリシンおよびアスパラギン酸のいずれかに置換
（２１）配列番号１の５３番目のチロシンに相当するアミノ酸残基がフェニルアラニンに置換
（２２）配列番号１の５４番目のスレオニンに相当するアミノ酸残基がイソロイシンまたはメチオニンに置換
（２３）配列番号１の６２番目のアスパラギンに相当するアミノ酸残基がヒスチジン、アルギニン、ロイシン、メチオニンおよびトリプトファンのいずれかに置換
（２４）配列番号１の６５番目のアスパラギンに相当するアミノ酸残基がチロシンに置換
（２５）配列番号１の６９番目のアラニンに相当するアミノ酸残基がスレオニンに置換
（２６）配列番号１の２番目のスレオニンに相当するアミノ酸残基がセリンまたはプロリンに置換
（２７）配列番号１の３番目のプロリンに相当するアミノ酸残基がアルギニンに置換
（２８）配列番号１の５番目のグルタミン酸に相当するアミノ酸残基がリジンまたはアルギニンに置換
（２９）配列番号１の２７番目のグルタミン酸に相当するアミノ酸残基がバリン、リジンおよびイソロイシンのいずれかに置換
（３０）配列番号１の３２番目のフェニルアラニンに相当するアミノ酸残基がロイシンに置換
（３１）配列番号１の３８番目のリジンに相当するアミノ酸残基がアラニンに置換
（３２）配列番号１の４４番目のアスパラギンに相当するアミノ酸残基がイソロイシンに置換、
（３３）配列番号１の４７番目のアラニンに相当するアミノ酸残基がスレオニンまたはアルギニンに置換
（３４）配列番号１の５２番目のグルタミン酸に相当するアミノ酸残基がアスパラギンに置換
（３５）配列番号１の２番目のスレオニンに相当するアミノ酸残基がアラニンに置換
（３６）配列番号１の５番目のグルタミン酸に相当するアミノ酸残基がアスパラギン酸に置換
（３７）配列番号１の６番目のプロリンに相当するアミノ酸残基がロイシンまたはスレオニンに置換
（３８）配列番号１の７番目のリジンに相当するアミノ酸残基がプロリンに置換
（３９）配列番号１の１４番目のバリンに相当するアミノ酸残基がアラニンに置換
（４０）配列番号１の２３番目のイソロイシンに相当するアミノ酸残基がアルギニンまたはバリンに置換
（４１）配列番号１の２９番目のリジンに相当するアミノ酸残基がフェニルアラニンに置換
（４２）配列番号１の３１番目のスレオニンに相当するアミノ酸残基がメチオニンに置換
（４３）配列番号１の３３番目のグルタミン酸に相当するアミノ酸残基がアスパラギン酸、グリシンおよびバリンのいずれかに置換
（４４）配列番号１の３５番目のアラニンに相当するアミノ酸残基がスレオニンに置換
（４５）配列番号１の３６番目のスレオニンに相当するアミノ酸残基がセリンに置換
（４６）配列番号１の３７番目のアラニンに相当するアミノ酸残基がスレオニンに置換
（４７）配列番号１の４１番目のアラニンに相当するアミノ酸残基がイソロイシンまたはチロシンに置換
（４８）配列番号１の４４番目のアスパラギンに相当するアミノ酸残基がヒスチジンまたはアルギニンに置換
（４９）配列番号１の５２番目のグルタミン酸に相当するアミノ酸残基がロイシンまたはチロシンに置換
（５０）配列番号１の６０番目のグリシンに相当するアミノ酸残基がアルギニンに置換
（５１）配列番号１の６４番目のイソロイシンに相当するアミノ酸残基がロイシンに置換
（５２）配列番号１の６６番目のイソロイシンに相当するアミノ酸残基がバリンに置換
（５３）配列番号１の６９番目のアラニンに相当するアミノ酸残基がロイシンまたはバリンに置換；
（ｂ）配列番号１または１８に記載のアミノ酸配列を含み、ただし当該アミノ酸配列において、少なくとも前記（１）から（５３）より選択される１つ以上のアミノ酸置換を有し、さらに前記（１）から（５３）以外に１もしくは数個の位置での１もしくは数個のアミノ酸残基の置換、欠失、挿入、および／または付加を含み、かつ免疫グロブリン結合活性を有するタンパク質；
（ｃ）配列番号１または１８に記載のアミノ酸配列またはその部分配列と７０％以上の相同性を有するアミノ酸配列を含み、ただし当該アミノ酸配列において、少なくとも前記（１）から（５３）より選択される１以上のアミノ酸置換を有し、かつ免疫グロブリン結合活性を有するタンパク質。
［Ａ３］
　以下の（ｄ）から（ｆ）のいずれかに記載のタンパク質である、［Ａ１］または［Ａ２］に記載のタンパク質：
（ｄ）配列番号１または１８に記載のアミノ酸配列を含み、ただし当該アミノ酸配列において、少なくとも以下の（１）のアミノ酸置換を有し、かつ免疫グロブリン結合活性を有するタンパク質
（１）配列番号１の５０番目のアスパラギンに相当するアミノ酸残基がチロシンに置換；
（ｅ）配列番号１または１８に記載のアミノ酸配列を含み、ただし当該アミノ酸配列において、少なくとも前記（１）のアミノ酸置換を有し、さらに前記アミノ酸置換以外の１もしくは数個の位置での１もしくは数個のアミノ酸残基の置換、欠失、挿入、および／または付加を含み、かつ免疫グロブリン結合活性を有するタンパク質；
（ｆ）配列番号１または１８に記載のアミノ酸配列またはその部分配列と７０％以上の相同性を有するアミノ酸配列を含み、ただし少なくとも前記（１）のアミノ酸置換を有し、かつ免疫グロブリン結合活性を有するタンパク質。
［Ａ４］
　さらに、少なくとも以下の（Ｉ）から（ＶＩＩ）より選択される１つ以上のリジン残基がリジン以外の塩基性アミノ酸またはヒドロキシ基を有するアミノ酸残基に置換した、［Ａ１］から［Ａ３］のいずれかに記載のタンパク質：
（Ｉ）配列番号１の７番目に相当するリジン残基
（ＩＩ）配列番号１の１３番目に相当するリジン残基
（ＩＩＩ）配列番号１の２２番目に相当するリジン残基
（ＩＶ）配列番号１の２９番目に相当するリジン残基
（Ｖ）配列番号１の３８番目に相当するリジン残基
（ＶＩ）配列番号１の４８番目に相当するリジン残基
（ＶＩＩ）配列番号１の６７番目に相当するリジン残基。
［Ａ５］
　さらに、配列番号１の４９番目のグルタミン酸に相当するアミノ酸残基のアスパラギン酸への置換、配列番号１の６番目のプロリンに相当するアミノ酸残基のセリンへの置換、配列番号１の４４番目のアスパラギンに相当するアミノ酸残基のアスパラギン酸への置換、配列番号１の４９番目のグルタミン酸に相当するアミノ酸残基のバリンへの置換、配列番号１の６２番目のアスパラギンに相当するアミノ酸残基のチロシンへの置換、配列番号１の２３番目のアスパラギンに相当するアミノ酸残基のアスパラギン酸への置換、および配列番号１の４４番目のアスパラギンに相当するアミノ酸残基のアスパラギン酸への置換より選択される１つ以上のアミノ酸置換を有する、［Ａ１］から［Ａ４］のいずれかに記載のタンパク質。
［Ａ６］
　少なくとも以下の（Ｗ）、（Ｘ）、（Ｙ）、（Ｚ）、（ＡＡ）、（ＡＢ）および（ＡＣ）のいずれかのアミノ酸置換を有する、［Ａ１］から［Ａ５］のいずれかに記載のタンパク質：
（Ｗ）配列番号１の７番目のリジンに相当するアミノ酸残基のアラニンへの置換、配列番号１の１３番目、３８番目、４８番目および６７番目のリジンに相当するアミノ酸残基のアルギニンへの置換、配列番号１の２２番目のリジンに相当するアミノ酸残基のグルタミンへの置換、配列番号１の２９番目のリジンに相当するアミノ酸残基のイソロイシンへの置換、配列番号１の４９番目のグルタミン酸に相当するアミノ酸残基のアスパラギン酸への置換、配列番号１の５０番目および６２番目のアスパラギンに相当するアミノ酸残基のチロシンへの置換、ならびに配列番号１の５２番目のグルタミン酸に相当するアミノ酸残基のグリシンへの置換；
（Ｘ）配列番号１の７番目のリジンに相当するアミノ酸残基のアラニンへの置換、配列番号１の１３番目、２２番目、３８番目、４８番目および６７番目のリジンに相当するアミノ酸残基のアルギニンへの置換、配列番号１の２９番目のリジンに相当するアミノ酸残基のイソロイシンへの置換、配列番号１の４９番目のグルタミン酸に相当するアミノ酸残基のアスパラギン酸への置換、配列番号１の５０番目および６２番目のアスパラギンに相当するアミノ酸残基のチロシンへの置換、配列番号１の５２番目のグルタミン酸に相当するアミノ酸残基のグリシンへの置換、ならびに配列番号１の５３番目のチロシンに相当するアミノ酸残基のフェニルアラニンへの置換；
（Ｙ）配列番号１の４番目のグルタミン酸に相当するアミノ酸残基のグリシンへの置換、配列番号１の７番目のリジンに相当するアミノ酸残基のアラニンへの置換、配列番号１の１３番目、２２番目、３８番目、４８番目および６７番目のリジンに相当するアミノ酸残基のアルギニンへの置換、配列番号１の２９番目のリジンに相当するアミノ酸残基のイソロイシンへの置換、配列番号１の４９番目のグルタミン酸に相当するアミノ酸残基のアスパラギン酸への置換、配列番号１の５０番目および６２番目のアスパラギンに相当するアミノ酸残基のチロシンへの置換、配列番号１の５２番目のグルタミン酸に相当するアミノ酸残基のアスパラギン酸への置換、ならびに配列番号１の５３番目のチロシンに相当するアミノ酸残基のフェニルアラニンへの置換；
（Ｚ）配列番号１の４番目のグルタミン酸に相当するアミノ酸残基のグリシンへの置換、配列番号１の７番目のリジンに相当するアミノ酸残基のアラニンへの置換、配列番号１の１３番目、２２番目、３８番目、４８番目および６７番目のリジンに相当するアミノ酸残基のアルギニンへの置換、配列番号１の２７番目のグルタミン酸に相当するアミノ酸残基のアルギニンへの置換、配列番号１の２９番目のリジンに相当するアミノ酸残基のイソロイシンへの置換、配列番号１の４９番目のグルタミン酸に相当するアミノ酸残基のアスパラギン酸への置換、配列番号１の５０番目および６２番目のアスパラギンに相当するアミノ酸残基のチロシンへの置換、配列番号１の５２番目のグルタミン酸に相当するアミノ酸残基のアスパラギン酸への置換、ならびに配列番号１の５３番目のチロシンに相当するアミノ酸残基のフェニルアラニンへの置換；
（ＡＡ）配列番号１の４番目のグルタミン酸に相当するアミノ酸残基のグリシンへの置換、配列番号１の６番目のプロリンに相当するアミノ酸残基のセリンへの置換、配列番号１の７番目のリジンに相当するアミノ酸残基のアラニンへの置換、配列番号１の１３番目、２２番目、４８番目および６７番目のリジンに相当するアミノ酸残基のアルギニンへの置換、配列番号１の２９番目のリジンに相当するアミノ酸残基のイソロイシンへの置換、配列番号１の３８番目のリジンに相当するアミノ酸残基のグルタミン酸への置換、配列番号１の４９番目のグルタミン酸に相当するアミノ酸残基のアスパラギン酸への置換、配列番号１の５０番目および６２番目のアスパラギンに相当するアミノ酸残基のチロシンへの置換、配列番号１の５２番目のグルタミン酸に相当するアミノ酸残基のアスパラギン酸への置換、ならびに配列番号１の５３番目のチロシンに相当するアミノ酸残基のフェニルアラニンへの置換；
（ＡＢ）配列番号１の４番目のグルタミン酸に相当するアミノ酸残基のグリシンへの置換、配列番号１の６番目のプロリンに相当するアミノ酸残基のセリンへの置換、配列番号１の７番目のリジンに相当するアミノ酸残基のアラニンへの置換、配列番号１の１３番目、２２番目、４８番目および６７番目のリジンに相当するアミノ酸残基のアルギニンへの置換、配列番号１の２９番目のリジンに相当するアミノ酸残基のイソロイシンへの置換、配列番号１の３８番目のリジンに相当するアミノ酸残基のグルタミン酸への置換、配列番号１の４９番目のグルタミン酸に相当するアミノ酸残基のアスパラギン酸への置換、配列番号１の５０番目および６２番目のアスパラギンに相当するアミノ酸残基のチロシンへの置換、配列番号１の５２番目のグルタミン酸に相当するアミノ酸残基のバリンへの置換、配列番号１の５３番目のチロシンに相当するアミノ酸残基のフェニルアラニンへの置換ならびに配列番号１の６９番目のアラニンに相当するアミノ酸残基のバリンへの置換；
（ＡＣ）配列番号１の４番目のグルタミン酸に相当するアミノ酸残基のグリシンへの置換、配列番号１の６番目のプロリンに相当するアミノ酸残基のセリンへの置換、配列番号１の７番目のリジンに相当するアミノ酸残基のアラニンへの置換、配列番号１の１３番目、２２番目、４８番目および６７番目のリジンに相当するアミノ酸残基のアルギニンへの置換、配列番号１の２９番目のリジンに相当するアミノ酸残基のイソロイシンへの置換、配列番号１の３８番目のリジンに相当するアミノ酸残基のグルタミン酸への置換、配列番号１の４９番目のグルタミン酸に相当するアミノ酸残基のアスパラギン酸への置換、配列番号１の５０番目および６２番目のアスパラギンに相当するアミノ酸残基のチロシンへの置換、配列番号１の５３番目のチロシンに相当するアミノ酸残基のフェニルアラニンへの置換ならびに配列番号１の６９番目のアラニンに相当するアミノ酸残基のバリンへの置換。
［Ａ７］
　配列番号１７９、１８６、１９９、２２４、２４０、２７１および２７５のいずれかに記載のアミノ酸配列を含む、［Ａ１］から［Ａ６］のいずれかに記載のタンパク質。
［Ａ８］
　［Ａ１］から［Ａ７］のいずれかに記載のタンパク質をコードするポリヌクレオチド。
［Ａ９］
　［Ａ８］に記載のポリヌクレオチドを含む発現ベクター。
［Ａ１０］
　以下の（Ａ）または（Ｂ）を含む、遺伝子組換え宿主：
（Ａ）［Ａ１］から［Ａ７］のいずれかに記載のタンパク質をコードするポリヌクレオチド；
（Ｂ）［Ａ１］から［Ａ７］のいずれかに記載のタンパク質をコードするポリヌクレオチドを含む発現ベクター。
［Ａ１１］
　宿主がエシェリヒア・コリ（Ｅｓｃｈｅｒｉｃｈｉａ　ｃｏｌｉ）である、［Ａ１０］に記載の遺伝子組換え宿主。
［Ａ１２］
　［Ａ１］から［Ａ７］のいずれかに記載のタンパク質をコードするポリヌクレオチドを含む遺伝子組換え宿主または該ポリヌクレオチドを含む発現ベクターを含む遺伝子組換え宿主を培養し該タンパク質を発現させる工程と、発現した前記タンパク質を回収する工程とを含む、免疫グロブリン結合活性を有するタンパク質の製造方法。
［Ａ１３］
　宿主がエシェリヒア・コリ（Ｅｓｃｈｅｒｉｃｈｉａ　ｃｏｌｉ）である、［Ａ１２］に記載の製造方法。
［Ａ１４］
　不溶性担体と、当該不溶性担体に固定化した［Ａ１］から［Ａ７］のいずれかに記載のタンパク質とを含む、免疫グロブリン吸着剤。
［Ａ１５］
　［Ａ１３］に記載の吸着剤を充填したカラムに免疫グロブリンを含む溶液を添加し当該免疫グロブリンを前記吸着剤に吸着させる工程と、前記吸着剤に吸着した免疫グロブリンを溶出させる工程とを含む、前記溶液中に含まれる免疫グロブリンの分離方法。
　また、一態様において、本発明は以下の態様を包含する：
［Ｂ１］
　Ｆｉｎｅｇｏｌｄｉａ属細菌由来Ｐｒｏｔｅｉｎ　Ｌの免疫グロブリン結合ドメインのアミノ酸配列を含み、ただし当該アミノ酸配列において、少なくとも以下の（５４）から（６４）より選択される１つ以上のアミノ酸置換を有し、かつ免疫グロブリン結合活性を有するタンパク質；
（５４）配列番号１の７番目のリジンに相当するアミノ酸残基がグルタミンに置換
（５５）配列番号１の１３番目のリジンに相当するアミノ酸残基がバリンに置換
（５６）配列番号１の２９番目のリジンに相当するアミノ酸残基がバリンまたはイソロイシンに置換
（５７）配列番号１の６番目のプロリンに相当するアミノ酸残基がアラニンに置換
（５８）配列番号１の８番目のグルタミン酸に相当するアミノ酸残基がアルギニンに置換
（５９）配列番号１の１５番目のアスパラギンに相当するアミノ酸残基がバリンに置換
（６０）配列番号１の２３番目のイソロイシンに相当するアミノ酸残基がフェニルアラニンまたはロイシンに置換
（６１）配列番号１の３４番目のグルタミン酸に相当するアミノ酸残基がアスパラギン酸、フェニルアラニン、ロイシンおよびバリンのいずれかに置換
（６２）配列番号１の３８番目のリジンに相当するアミノ酸残基がロイシンに置換
（６３）配列番号１の５０番目のアスパラギンに相当するアミノ酸残基がメチオニンに置換
（６４）配列番号１の５３番目のチロシンに相当するアミノ酸残基がセリンに置換。
［Ｂ２］
　以下の（ａ）から（ｃ）のいずれかに記載のタンパク質である、［Ｂ１］に記載のタンパク質：
（ａ）配列番号１または１８に記載のアミノ酸配列を含み、ただし当該アミノ酸配列において、少なくとも前記（５４）から（６４）より選択される１つ以上のアミノ酸置換を有し、かつ免疫グロブリン結合活性を有するタンパク質；
（ｂ）配列番号１または１８に記載のアミノ酸配列を含み、ただし当該アミノ酸配列において、少なくとも前記（５４）から（６４）より選択される１つ以上のアミノ酸置換を有し、さらに前記（５４）から（６４）以外に１もしくは数個の位置での１もしくは数個のアミノ酸残基の置換、欠失、挿入、および／または付加を含み、かつ免疫グロブリン結合活性を有するタンパク質；
（ｃ）配列番号１または１８に記載のアミノ酸配列またはその部分配列と７０％以上の相同性を有するアミノ酸配列を含み、ただし当該アミノ酸配列において、少なくとも前記（５４）から（６４）より選択される１つ以上のアミノ酸置換を有し、かつ免疫グロブリン結合活性を有するタンパク質。
［Ｂ３］
　さらに、少なくとも以下の（１）から（６３）より選択される１つ以上のアミノ酸置換を有する、［Ｂ１］または［Ｂ２］に記載のタンパク質：
（１）配列番号１の５０番目のアスパラギンに相当するアミノ酸残基がチロシンに置換
（２）配列番号１の１番目のグルタミン酸に相当するアミノ酸残基がグリシンまたはバリンに置換
（３）配列番号１の３番目のプロリンに相当するアミノ酸残基がセリンに置換
（４）配列番号１の４番目のグルタミン酸に相当するアミノ酸残基がリジンまたはグリシンに置換
（５）配列番号１の５番目のグルタミン酸に相当するアミノ酸残基がバリンに置換
（６）配列番号１の７番目のリジンに相当するアミノ酸残基がアラニンに置換
（７）配列番号１の８番目のグルタミン酸に相当するアミノ酸残基がグリシンに置換
（８）配列番号１の９番目のグルタミン酸に相当するアミノ酸残基がバリンに置換
（９）配列番号１の１７番目のイソロイシンに相当するアミノ酸残基がフェニルアラニンに置換
（１０）配列番号１の２１番目のグリシンに相当するアミノ酸残基がアルギニンに置換
（１１）配列番号１の２７番目のグルタミン酸に相当するアミノ酸残基がグリシンまたはアルギニンに置換
（１２）配列番号１の２９番目のリジンに相当するアミノ酸残基がプロリンに置換
（１３）配列番号１の３１番目のスレオニンに相当するアミノ酸残基がロイシンに置換
（１４）配列番号１の３６番目のスレオニンに相当するアミノ酸残基がアラニンに置換
（１５）配列番号１の４１番目のアラニンに相当するアミノ酸残基がスレオニンに置換
（１６）配列番号１の４４番目のアスパラギンに相当するアミノ酸残基がセリンまたはグリシンに置換
（１７）配列番号１の４９番目のグルタミン酸に相当するアミノ酸残基がスレオニンまたはイソロイシンに置換
（１８）配列番号１の５０番目のアスパラギンに相当するアミノ酸残基がセリン、リジンおよびアスパラギン酸のいずれかに置換
（１９）配列番号１の５１番目のグリシンに相当するアミノ酸残基がバリンに置換
（２０）配列番号１の５２番目のグルタミン酸に相当するアミノ酸残基がバリン、グリシンおよびアスパラギン酸のいずれかに置換
（２１）配列番号１の５３番目のチロシンに相当するアミノ酸残基がフェニルアラニンに置換
（２２）配列番号１の５４番目のスレオニンに相当するアミノ酸残基がイソロイシンまたはメチオニンに置換
（２３）配列番号１の６２番目のアスパラギンに相当するアミノ酸残基がヒスチジン、アルギニン、ロイシン、メチオニンおよびトリプトファンのいずれかに置換
（２４）配列番号１の６５番目のアスパラギンに相当するアミノ酸残基がチロシンに置換
（２５）配列番号１の６９番目のアラニンに相当するアミノ酸残基がスレオニンに置換
（２６）配列番号１の２番目のスレオニンに相当するアミノ酸残基がセリンまたはプロリンに置換
（２７）配列番号１の３番目のプロリンに相当するアミノ酸残基がアルギニンに置換
（２８）配列番号１の５番目のグルタミン酸に相当するアミノ酸残基がリジンまたはアルギニンに置換
（２９）配列番号１の２７番目のグルタミン酸に相当するアミノ酸残基がバリン、リジンおよびイソロイシンのいずれかに置換
（３０）配列番号１の３２番目のフェニルアラニンに相当するアミノ酸残基がロイシンに置換
（３１）配列番号１の３８番目のリジンに相当するアミノ酸残基がアラニンに置換
（３２）配列番号１の４４番目のアスパラギンに相当するアミノ酸残基がイソロイシンに置換、
（３３）配列番号１の４７番目のアラニンに相当するアミノ酸残基がスレオニンまたはアルギニンに置換
（３４）配列番号１の５２番目のグルタミン酸に相当するアミノ酸残基がアスパラギンに置換
（３５）配列番号１の２番目のスレオニンに相当するアミノ酸残基がアラニンに置換
（３６）配列番号１の５番目のグルタミン酸に相当するアミノ酸残基がアスパラギン酸に置換
（３７）配列番号１の６番目のプロリンに相当するアミノ酸残基がロイシンまたはスレオニンに置換
（３８）配列番号１の７番目のリジンに相当するアミノ酸残基がプロリンに置換
（３９）配列番号１の１４番目のバリンに相当するアミノ酸残基がアラニンに置換
（４０）配列番号１の２３番目のイソロイシンに相当するアミノ酸残基がアルギニンまたはバリンに置換
（４１）配列番号１の２９番目のリジンに相当するアミノ酸残基がフェニルアラニンに置換
（４２）配列番号１の３１番目のスレオニンに相当するアミノ酸残基がメチオニンに置換
（４３）配列番号１の３３番目のグルタミン酸に相当するアミノ酸残基がアスパラギン酸、グリシンおよびバリンのいずれかに置換
（４４）配列番号１の３５番目のアラニンに相当するアミノ酸残基がスレオニンに置換
（４５）配列番号１の３６番目のスレオニンに相当するアミノ酸残基がセリンに置換
（４６）配列番号１の３７番目のアラニンに相当するアミノ酸残基がスレオニンに置換
（４７）配列番号１の４１番目のアラニンに相当するアミノ酸残基がイソロイシンまたはチロシンに置換
（４８）配列番号１の４４番目のアスパラギンに相当するアミノ酸残基がヒスチジンまたはアルギニンに置換
（４９）配列番号１の５２番目のグルタミン酸に相当するアミノ酸残基がロイシンまたはチロシンに置換
（５０）配列番号１の６０番目のグリシンに相当するアミノ酸残基がアルギニンに置換
（５１）配列番号１の６４番目のイソロイシンに相当するアミノ酸残基がロイシンに置換
（５２）配列番号１の６６番目のイソロイシンに相当するアミノ酸残基がバリンに置換
（５３）配列番号１の６９番目のアラニンに相当するアミノ酸残基がロイシンまたはバリンに置換。
［Ｂ４］
　さらに、少なくとも以下の（Ｉ）から（ＶＩＩ）より選択される１つ以上のリジン残基がリジン以外の塩基性アミノ酸またはヒドロキシ基を有するアミノ酸残基に置換した、［Ｂ１］から［Ｂ３］のいずれかに記載のタンパク質：
（Ｉ）配列番号１の７番目に相当するリジン残基
（ＩＩ）配列番号１の１３番目に相当するリジン残基
（ＩＩＩ）配列番号１の２２番目に相当するリジン残基
（ＩＶ）配列番号１の２９番目に相当するリジン残基
（Ｖ）配列番号１の３８番目に相当するリジン残基
（ＶＩ）配列番号１の４８番目に相当するリジン残基
（ＶＩＩ）配列番号１の６７番目に相当するリジン残基。
［Ｂ５］
　さらに、配列番号１の４９番目のグルタミン酸に相当するアミノ酸残基のアスパラギン酸への置換、配列番号１の６番目のプロリンに相当するアミノ酸残基のセリンへの置換、配列番号１の４４番目のアスパラギンに相当するアミノ酸残基のアスパラギン酸への置換、配列番号１の４９番目のグルタミン酸に相当するアミノ酸残基のバリンへの置換、配列番号１の６２番目のアスパラギンに相当するアミノ酸残基のチロシンへの置換、配列番号１の２３番目のアスパラギンに相当するアミノ酸残基のアスパラギン酸への置換、および配列番号１の４４番目のアスパラギンに相当するアミノ酸残基のアスパラギン酸への置換より選択される１つ以上のアミノ酸置換を有する、［Ｂ１］から［Ｂ４］のいずれかに記載のタンパク質。
［Ｂ６］
　少なくとも以下の（Ｘ）または（Ｙ）のアミノ酸置換を有する、［Ｂ１］から［Ｂ５］のいずれかに記載のタンパク質：
（Ｘ）配列番号１の４番目のグルタミン酸に相当するアミノ酸残基のグリシンへの置換、配列番号１の６番目のプロリンに相当するアミノ酸残基のセリンへの置換、配列番号１の７番目のリジンに相当するアミノ酸残基のアラニンへの置換、配列番号１の１３番目、２２番目、４８番目および６７番目のリジンに相当するアミノ酸残基のアルギニンへの置換、配列番号１の２３番目のイソロイシンに相当するアミノ酸残基のアルギニンへの置換、配列番号１の２９番目のリジンに相当するアミノ酸残基のイソロイシンへの置換、配列番号１の３８番目のリジンに相当するアミノ酸残基のグルタミン酸への置換、配列番号１の４４番目のアスパラギンに相当するアミノ酸残基のアルギニンへの置換、配列番号１の４９番目のグルタミン酸に相当するアミノ酸残基のアスパラギン酸への置換、配列番号１の５０番目および６２番目のアスパラギンに相当するアミノ酸残基のチロシンへの置換、配列番号１の５３番目のチロシンに相当するアミノ酸残基のフェニルアラニンへの置換ならびに配列番号１の６９番目のアラニンに相当するアミノ酸残基のバリンへの置換；
（Ｙ）配列番号１の４番目のグルタミン酸に相当するアミノ酸残基のグリシンへの置換、配列番号１の６番目のプロリンに相当するアミノ酸残基のセリンへの置換、配列番号１の７番目のリジンに相当するアミノ酸残基のアラニンへの置換、配列番号１の１３番目、２２番目および６７番目のリジンに相当するアミノ酸残基のアルギニンへの置換、配列番号１の２３番目のイソロイシンに相当するアミノ酸残基のアルギニンへの置換、配列番号１の２９番目のリジンに相当するアミノ酸残基のイソロイシンへの置換、配列番号１の３８番目のリジンに相当するアミノ酸残基のグルタミン酸への置換、配列番号１の４４番目のアスパラギンに相当するアミノ酸残基のアルギニンへの置換、配列番号１の４８番目のリジンに相当するアミノ酸残基のヒスチジンへの置換、配列番号１の４９番目のグルタミン酸に相当するアミノ酸残基のアスパラギン酸への置換、配列番号１の５０番目および６２番目のアスパラギンに相当するアミノ酸残基のチロシンへの置換、配列番号１の５３番目のチロシンに相当するアミノ酸残基のフェニルアラニンへの置換、配列番号１の６４番目のイソロイシンに相当するアミノ酸残基のロイシンへの置換ならびに配列番号１の６９番目のアラニンに相当するアミノ酸残基のバリンへの置換。
［Ｂ７］
　配列番号４０８または４１３に記載のアミノ酸配列を含む、［Ｂ１］から［Ｂ６］のいずれかに記載のタンパク質。
［Ｂ８］
　［Ｂ１］から［Ｂ７］のいずれかに記載のタンパク質をコードするポリヌクレオチド。
［Ｂ９］
　［Ｂ８］に記載のポリヌクレオチドを含む発現ベクター。
［Ｂ１０］
　以下の（Ａ）または（Ｂ）を含む、遺伝子組換え宿主：
（Ａ）［Ｂ１］から［Ｂ７］のいずれかに記載のタンパク質をコードするポリヌクレオチド；
（Ｂ）［Ｂ１］から［Ｂ７］のいずれかに記載のタンパク質をコードするポリヌクレオチドを
含む発現ベクター。
［Ｂ１１］
　宿主がエシェリヒア・コリ（Ｅｓｃｈｅｒｉｃｈｉａ　ｃｏｌｉ）である、［Ｂ１０］に記載の遺伝子組換え宿主。
［Ｂ１２］
　［Ｂ１］から［Ｂ７］のいずれかに記載のタンパク質をコードするポリヌクレオチドを含む遺伝子組換え宿主または該ポリヌクレオチドを含む発現ベクターを含む遺伝子組換え宿主を培養し該タンパク質を発現させる工程と、発現した前記タンパク質を回収する工程とを含む、免疫グロブリン結合性タンパク質の製造方法。
［Ｂ１３］
　宿主がエシェリヒア・コリ（Ｅｓｃｈｅｒｉｃｈｉａ　ｃｏｌｉ）である、［Ｂ１２］に記載の製造方法。
［Ｂ１４］
　不溶性担体と、当該不溶性担体に固定化した［Ｂ１］から［Ｂ７］のいずれかに記載のタンパク質とを含む、免疫グロブリン吸着剤。
［Ｂ１５］
　［Ｂ１４］に記載の吸着剤を充填したカラムに免疫グロブリンを含む溶液を添加し当該免疫グロブリンを前記吸着剤に吸着させる工程と、前記吸着剤に吸着した免疫グロブリンをｐＨ変化で溶出させる工程とを含む、前記溶液中に含まれる免疫グロブリンの分離方法。
［Ｂ１６］
　前記ｐＨ変化が、ｐＨの低下である、［Ｂ１５］に記載の方法。
　以下、本発明を詳細に説明する。
　本発明のタンパク質は、特定の免疫グロブリン結合性タンパク質である。本明細書において「免疫グロブリン結合性タンパク質」とは、免疫グロブリンに対する結合性を有するタンパク質を意味する。すなわち、本発明のタンパク質は、特定の免疫グロブリンに対する結合性を有する。本発明のタンパク質は、具体的には、免疫グロブリンのκ軽鎖に対する結合性を有するものであってもよい。本明細書では、免疫グロブリンに対する結合性を、「免疫グロブリン結合活性」または「抗体結合活性」ともいう。免疫グロブリン結合活性は、例えば、ＥＬＩＳＡ（Ｅｎｚｙｍｅ－Ｌｉｎｋｅｄ　ＩｍｍｕｎｏＳｏｒｂｅｎｔ　Ａｓｓａｙ）法で測定できる。ＥＬＩＳＡ法は、例えば、実施例に記載の条件で実施できる。
　本発明のタンパク質は、Ｆｉｎｅｇｏｌｄｉａ属細菌由来Ｐｒｏｔｅｉｎ　Ｌ（「ＦｐＬ」ともいう）の免疫グロブリン結合ドメインのアミノ酸配列を含み、ただし当該アミノ酸配列において、特定位置におけるアミノ酸置換を有したタンパク質である。以降、本明細書において、ＦｐＬの免疫グロブリン結合ドメインのアミノ酸配列であって、特定位置におけるアミノ酸置換を有さないものを「非改変型アミノ酸配列」ともいい、ＦｐＬの免疫グロブリン結合ドメインのアミノ酸配列であって、特定位置におけるアミノ酸置換を有するものを「改変型アミノ酸配列」ともいう。すなわち、改変型アミノ酸配列は、特定位置におけるアミノ酸置換を有すること以外は非改変型アミノ酸配列と同一のアミノ酸配列であってよい。また、本発明のタンパク質は、例えば、特定位置におけるアミノ酸置換を有すること以外は非改変型アミノ酸配列と同一のアミノ酸配列を含むタンパク質であってよい。また、本発明のタンパク質は、例えば、改変型アミノ酸配列を含むタンパク質であってよい。非改変型アミノ酸配列は、天然に見出されるアミノ酸配列であってもよく、そうでなくてもよい。非改変型アミノ酸配列は、例えば、所望の性質を有するように改変されていてもよい。非改変型アミノ酸配列は、例えば、特定位置におけるアミノ酸置換以外のアミノ酸置換を有していてもよい。
　ＦｐＬの由来であるＦｉｎｅｇｏｌｄｉａ属細菌としては、Ｆｉｎｅｇｏｌｄｉａ　ｍａｇｎａが挙げられる。Ｆｉｎｅｇｏｌｄｉａ　ｍａｇｎａ由来Ｐｒｏｔｅｉｎ　Ｌの免疫グロブリン結合ドメインとしては、
ドメインＢ１（配列番号２０９（ＧｅｎＢａｎｋ　Ｎｏ．ＡＡＡ２５６１２）の１０４番目から１７３番目までのアミノ酸残基）、
ドメインＢ２（配列番号２０９の１７６番目から２４５番目までのアミノ酸残基）、
ドメインＢ３（配列番号２０９の２４８番目から３１７番目までのアミノ酸残基）、
ドメインＢ４（配列番号２０９の３２０番目から３８９番目までのアミノ酸残基）、
ドメインＢ５（配列番号２０９の３９３番目から４６２番目までのアミノ酸残基）、
ドメインＣ１（配列番号２１０（ＧｅｎＢａｎｋ　Ｎｏ．ＡＡＡ６７５０３）の２４９番目から３１７番目までのアミノ酸残基：配列番号１１２）、
ドメインＣ２（配列番号２１０の３２０番目から３８９番目までのアミノ酸残基：配列番号１１３）、
ドメインＣ３（配列番号２１０の３９４番目から４６３番目までのアミノ酸残基：配列番号１）、および
ドメインＣ４（配列番号２１０の４６８番目から５３７番目までのアミノ酸残基：配列番号１８）があげられる。
　本明細書において非改変型アミノ酸配列とは、
（ｉ）前述したＦｐＬの免疫グロブリン結合ドメインの全アミノ酸配列であってもよく、
（ｉｉ）免疫グロブリンへの結合活性を有している限り、前記ドメインの部分アミノ酸配列であってもよい。
　なお、前記（ｉｉ）に関して、ＦｐＬの免疫グロブリン結合ドメインは四つのβシートと一つのαヘリックス、それらをつなぐループ部分とＮ末端ループ領域で構成されているが、Ｎ末端ループ領域など、免疫グロブリンへの結合とは無関係の領域のアミノ酸残基は欠損してもよい。具体例として、ＦｐＬのドメインＣ３（配列番号１）のＮ末端ループ領域に相当する、１番目のグルタミン酸から９番目のグルタミン酸までのアミノ酸残基を欠損させても免疫グロブリン結合能を有していることが知られている（Ｈｏｕｓｄｅｎ　Ｎ．Ｇ．ｅｔ．ａｌ．Ｂｉｏｃｈｅｍｉｃａｌ　Ｓｏｃｉｅｔｙ　Ｔｒａｎｓａｃｔｉｏｎ，２００３，３１，７１６－７１８）。すなわち、前記（ｉｉ）における部分アミノ酸配列は、少なくとも免疫グロブリンへの結合部位のアミノ酸配列を含んでいればよいといえる。すなわち、前記（ｉｉ）における部分アミノ酸配列としては、免疫グロブリンへの結合部位のアミノ酸配列を含む部分配列があげられる。
　本明細書における改変型アミノ酸配列として、具体的には、配列番号１に記載のアミノ酸配列など、前述した免疫グロブリン結合ドメインのアミノ酸配列において特定位置におけるアミノ酸置換を有するアミノ酸配列が挙げられる。すなわち、本発明のタンパク質として、具体的には、配列番号１に記載のアミノ酸配列など、前述した免疫グロブリン結合ドメインのアミノ酸配列を含み、ただし当該アミノ酸配列において、特定位置におけるアミノ酸置換を有するタンパク質が挙げられる。言い換えると、本発明のタンパク質は、例えば、特定位置におけるアミノ酸置換を有すること以外は配列番号１に記載のアミノ酸配列など、前述した免疫グロブリン結合ドメインのアミノ酸配列と同一のアミノ酸配列を含むタンパク質であってよい。
　本明細書において、タンパク質がアミノ酸配列を含むことを、「タンパク質がアミノ酸配列からなるアミノ酸残基を含む」ともいい、タンパク質またはアミノ酸配列がアミノ酸置換を有することを、「タンパク質またはアミノ酸配列においてアミノ酸置換が生じる」ともいう。またタンパク質またはアミノ酸配列を構成するアミノ酸を、「アミノ酸残基」ともいう。
　一態様において、本発明のタンパク質は、アルカリ安定性が向上した免疫グロブリン結合性タンパク質であってよい。本発明のタンパク質は、具体的には、改変型アミノ酸配列を有しない（例えば非改変型アミノ酸配列からなる）免疫グロブリン結合性タンパク質と比較してアルカリ安定性が向上した免疫グロブリン結合性タンパク質であってよい。本発明のタンパク質は、具体的には、前記特定位置におけるアミノ酸置換を有しない免疫グロブリン結合性タンパク質と比較してアルカリ安定性が向上した免疫グロブリン結合性タンパク質であってよい。言い換えると、本発明のタンパク質は、前記特定位置におけるアミノ酸置換を有することによりアルカリ安定性が向上した免疫グロブリン結合性タンパク質であってよい。また、言い換えると、前記特定位置におけるアミノ酸置換は、免疫グロブリン結合性タンパク質のアルカリ安定性を向上させるものであってよい。
　「アルカリ安定性」とは、アルカリ条件における失活に対する耐性を意味してよい。アルカリ安定性の向上は、例えば、アルカリ処理後の残存活性の向上として測定できる。ここでいう「活性」とは、免疫グロブリン結合活性を意味する。アルカリ処理は、例えば、実施例に記載の条件で実施できる。
　一態様において、本発明のタンパク質は、温和なｐＨ条件で抗体溶出が可能な免疫グロブリン結合性タンパク質であってよい。本発明のタンパク質は、具体的には、改変型アミノ酸配列を有しない（例えば非改変型アミノ酸配列からなる）免疫グロブリン結合性タンパク質と比較して温和なｐＨ条件で抗体溶出が可能な免疫グロブリン結合性タンパク質であってよい。本発明のタンパク質は、具体的には、前記特定位置におけるアミノ酸置換を有しない免疫グロブリン結合性タンパク質と比較して温和なｐＨ条件で抗体溶出が可能な免疫グロブリン結合性タンパク質であってよい。言い換えると、本発明のタンパク質は、前記特定位置におけるアミノ酸置換を有することにより温和なｐＨ条件で抗体溶出が可能となった免疫グロブリン結合性タンパク質であってよい。また、言い換えると、前記特定位置におけるアミノ酸置換は、温和なｐＨ条件で免疫グロブリン結合性タンパク質からの抗体溶出を可能とするものであってよい。
　「温和なｐＨ条件」とは、中性に近いｐＨ条件を意味してよい。すなわち、「温和な条件で抗体溶出が可能」とは、中性に近いｐＨ条件で抗体溶出が可能であることを意味してよい。また、典型的な抗体の溶出ｐＨは酸性であり得るため、「温和な条件で抗体溶出が可能」とは、抗体の溶出ｐＨが増大していることを意味してもよい。抗体の溶出ｐＨは、例えば、実施例に記載の条件で測定できる。
　一態様において、本発明のタンパク質は、アルカリ安定性が向上し、且つ温和なｐＨ条件で抗体溶出が可能な、免疫グロブリン結合性タンパク質であってよい。
　前記特定位置におけるアミノ酸置換は、第１グループ変異および／または第２グループ変異を含む。前記特定位置におけるアミノ酸置換は、第１グループ変異および第２グループ変異の内、第１グループ変異のみを含んでいてもよく、第２グループ変異のみを含んでいてもよく、第１グループ変異および第２グループ変異の両方を含んでいてもよい。前記特定位置におけるアミノ酸置換は、少なくとも第１グループ変異を含んでいてよく、さらに、第２グループ変異を含んでいてもよい。前記特定位置におけるアミノ酸置換は、少なくとも第２グループ変異を含んでいてよく、さらに、第１グループ変異を含んでいてもよい。
　第１グループ変異は、免疫グロブリン結合性タンパク質のアルカリ安定性を向上させる変異であってよい。よって、前記特定位置におけるアミノ酸置換が第１グループ変異を含む場合、前記特定位置におけるアミノ酸置換は、免疫グロブリン結合性タンパク質のアルカリ安定性を向上させる変異であってよい。前記特定位置におけるアミノ酸置換は、例えば、本発明のタンパク質がアルカリ安定性が向上した免疫グロブリン結合性タンパク質である場合に、第１グループ変異を含んでいてよい。前記特定位置におけるアミノ酸置換は、例えば、本発明のタンパク質がアルカリ安定性が向上した免疫グロブリン結合性タンパク質である場合に、少なくとも第１グループ変異を含んでいてよく、さらに、第２グループ変異を含んでいてもよい。また、少なくとも第１グループ変異を有する本発明のタンパク質は、アルカリ安定性が向上した免疫グロブリン結合性タンパク質であってよい。
　第２グループ変異は、温和なｐＨ条件で免疫グロブリン結合性タンパク質からの抗体溶出を可能とする変異であってよい。よって、前記特定位置におけるアミノ酸置換が第２グループ変異を含む場合、前記特定位置におけるアミノ酸置換は、温和なｐＨ条件で免疫グロブリン結合性タンパク質からの抗体溶出を可能とする変異であってよい。前記特定位置におけるアミノ酸置換は、例えば、本発明のタンパク質が温和なｐＨ条件で抗体溶出が可能な免疫グロブリン結合性タンパク質である場合に、第２グループ変異を含んでいてよい。前記特定位置におけるアミノ酸置換は、例えば、本発明のタンパク質が温和なｐＨ条件で抗体溶出が可能な免疫グロブリン結合性タンパク質である場合に、少なくとも第２グループ変異を含んでいてよく、さらに、第１グループ変異を含んでいてもよい。また、少なくとも第２グループ変異を有する本発明のタンパク質は、温和なｐＨ条件で抗体溶出が可能な免疫グロブリン結合性タンパク質であってよい。
　前記特定位置におけるアミノ酸置換が第１グループ変異および第２グループ変異の両方を含む場合、前記特定位置におけるアミノ酸置換は、免疫グロブリン結合性タンパク質のアルカリ安定性を向上させ、且つ温和なｐＨ条件で免疫グロブリン結合性タンパク質からの抗体溶出を可能とする変異であってよい。また、第１グループ変異および第２グループ変異の両方を有する本発明のタンパク質は、アルカリ安定性が向上し、且つ温和なｐＨ条件で抗体溶出が可能な、免疫グロブリン結合性タンパク質であってよい。
　第１グループ変異は、具体的には、Ａｓｎ５０Ｔｙｒ（この表記は、配列番号１の５０番目のアスパラギンに相当するアミノ酸残基がチロシンに置換されていることを表す；以下、他のアミノ酸置換についても同様に解釈するものとする）、Ｇｌｕ１Ｇｌｙ、Ｇｌｕ１Ｖａｌ、Ｐｒｏ３Ｓｅｒ、Ｇｌｕ４Ｌｙｓ、Ｇｌｕ４Ｇｌｙ、Ｇｌｕ５Ｖａｌ、Ｌｙｓ７Ａｌａ、Ｇｌｕ８Ｇｌｙ、Ｇｌｕ９Ｖａｌ、Ｉｌｅ１７Ｐｈｅ、Ｇｌｙ２１Ａｒｇ、Ｇｌｕ２７Ｇｌｙ、Ｇｌｕ２７Ａｒｇ、Ｌｙｓ２９Ｐｒｏ、Ｔｈｒ３１Ｌｅｕ、Ｔｈｒ３６Ａｌａ、Ａｌａ４１Ｔｈｒ、Ａｓｎ４４Ｓｅｒ、Ａｓｎ４４Ｇｌｙ、Ｇｌｕ４９Ｔｈｒ、Ｇｌｕ４９Ｉｌｅ、Ａｓｎ５０Ｓｅｒ、Ａｓｎ５０Ｌｙｓ、Ａｓｎ５０Ａｓｐ、Ｇｌｙ５１Ｖａｌ、Ｇｌｕ５２Ｖａｌ、Ｇｌｕ５２Ｇｌｙ、Ｇｌｕ５２Ａｓｐ、Ｔｙｒ５３Ｐｈｅ、Ｔｈｒ５４Ｉｌｅ、Ｔｈｒ５４Ｍｅｔ、Ａｓｎ６２Ｈｉｓ、Ａｓｎ６２Ａｒｇ、Ａｓｎ６２Ｌｅｕ、Ａｓｎ６２Ｍｅｔ、Ａｓｎ６２Ｔｒｐ、Ａｓｎ６５Ｔｙｒ、Ａｌａ６９Ｔｈｒ、Ｔｈｒ２Ｓｅｒ、Ｔｈｒ２Ｐｒｏ、Ｐｒｏ３Ａｒｇ、Ｇｌｕ５Ｌｙｓ、Ｇｌｕ５Ａｒｇ、Ｇｌｕ２７Ｖａｌ、Ｇｌｕ２７Ｌｙｓ、Ｇｌｕ２７Ｉｌｅ、Ｐｈｅ３２Ｌｅｕ、Ｌｙｓ３８Ａｌａ、Ａｓｎ４４Ｉｌｅ、Ａｌａ４７Ｔｈｒ、Ａｌａ４７Ａｒｇ、Ｇｌｕ５２Ａｓｎ、Ｔｈｒ２Ａｌａ、Ｇｌｕ５Ａｓｐ、Ｐｒｏ６Ｌｅｕ、Ｐｒｏ６Ｔｈｒ、Ｌｙｓ７Ｐｒｏ、Ｖａｌ１４Ａｌａ、Ｉｌｅ２３Ａｒｇ、Ｉｌｅ２３Ｖａｌ、Ｌｙｓ２９Ｐｈｅ、Ｔｈｒ３１Ｍｅｔ、Ｇｌｕ３３Ａｓｐ、Ｇｌｕ３３Ｇｌｙ、Ｇｌｕ３３Ｖａｌ、Ａｌａ３５Ｔｈｒ、Ｔｈｒ３６Ｓｅｒ、Ａｌａ３７Ｔｈｒ、Ａｌａ４１Ｉｌｅ、Ａｌａ４１Ｔｙｒ、Ａｓｎ４４Ｈｉｓ、Ａｓｎ４４Ａｒｇ、Ｇｌｕ５２Ｌｅｕ、Ｇｌｕ５２Ｔｙｒ、Ｇｌｙ６０Ａｒｇ、Ｉｌｅ６４Ｌｅｕ、Ｉｌｅ６６Ｖａｌ、Ａｌａ６９Ｌｅｕ、Ａｌａ６９Ｖａｌから選ばれる少なくとも１つ以上のアミノ酸置換である。
　言い換えると第１グループ変異は、
（１）Ａｓｎ５０Ｔｙｒ
（２）Ｇｌｕ１ＧｌｙまたはＧｌｕ１Ｖａｌ
（３）Ｐｒｏ３Ｓｅｒ
（４）Ｇｌｕ４ＬｙｓまたはＧｌｕ４Ｇｌｙ
（５）Ｇｌｕ５Ｖａｌ
（６）Ｌｙｓ７Ａｌａ
（７）Ｇｌｕ８Ｇｌｙ
（８）Ｇｌｕ９Ｖａｌ
（９）Ｉｌｅ１７Ｐｈｅ
（１０）Ｇｌｙ２１Ａｒｇ
（１１）Ｇｌｕ２７ＧｌｙまたはＧｌｕ２７Ａｒｇ
（１２）Ｌｙｓ２９Ｐｒｏ
（１３）Ｔｈｒ３１Ｌｅｕ
（１４）Ｔｈｒ３６Ａｌａ
（１５）Ａｌａ４１Ｔｈｒ
（１６）Ａｓｎ４４ＳｅｒまたはＡｓｎ４４Ｇｌｙ
（１７）Ｇｌｕ４９ＴｈｒまたはＧｌｕ４９Ｉｌｅ
（１８）Ａｓｎ５０Ｓｅｒ、Ａｓｎ５０ＬｙｓおよびＡｓｎ５０Ａｓｐのいずれか
（１９）Ｇｌｙ５１Ｖａｌ
（２０）Ｇｌｕ５２Ｖａｌ、Ｇｌｕ５２ＧｌｙおよびＧｌｕ５２Ａｓｐのいずれか
（２１）Ｔｙｒ５３Ｐｈｅ
（２２）Ｔｈｒ５４ＩｌｅまたはＴｈｒ５４Ｍｅｔ
（２３）Ａｓｎ６２Ｈｉｓ、Ａｓｎ６２Ａｒｇ、Ａｓｎ６２Ｌｅｕ、Ａｓｎ６２ＭｅｔおよびＡｓｎ６２Ｔｒｐのいずれか
（２４）Ａｓｎ６５Ｔｙｒ
（２５）Ａｌａ６９Ｔｈｒ
（２６）Ｔｈｒ２ＳｅｒまたはＴｈｒ２Ｐｒｏ
（２７）Ｐｒｏ３Ａｒｇ
（２８）Ｇｌｕ５ＬｙｓまたはＧｌｕ５Ａｒｇ
（２９）Ｇｌｕ２７Ｖａｌ、Ｇｌｕ２７ＬｙｓおよびＧｌｕ２７Ｉｌｅのいずれか
（３０）Ｐｈｅ３２Ｌｅｕ
（３１）Ｌｙｓ３８Ａｌａ
（３２）Ａｓｎ４４Ｉｌｅ
（３３）Ａｌａ４７ＴｈｒおよびＡｌａ４７Ａｒｇ
（３４）Ｇｌｕ５２Ａｓｎ
（３５）Ｔｈｒ２Ａｌａ
（３６）Ｇｌｕ５Ａｓｐ
（３７）Ｐｒｏ６ＬｅｕまたはＰｒｏ６Ｔｈｒ
（３８）Ｌｙｓ７Ｐｒｏ
（３９）Ｖａｌ１４Ａｌａ
（４０）Ｉｌｅ２３ＡｒｇまたはＩｌｅ２３Ｖａｌ
（４１）Ｌｙｓ２９Ｐｈｅ
（４２）Ｔｈｒ３１Ｍｅｔ
（４３）Ｇｌｕ３３Ａｓｐ、Ｇｌｕ３３ＧｌｙおよびＧｌｕ３３Ｖａｌのいずれか
（４４）Ａｌａ３５Ｔｈｒ
（４５）Ｔｈｒ３６Ｓｅｒ
（４６）Ａｌａ３７Ｔｈｒ
（４７）Ａｌａ４１ＩｌｅまたはＡｌａ４１Ｔｙｒ
（４８）Ａｓｎ４４ＨｉｓまたはＡｓｎ４４Ａｒｇ
（４９）Ｇｌｕ５２ＬｅｕまたはＧｌｕ５２Ｔｙｒ
（５０）Ｇｌｙ６０Ａｒｇ
（５１）Ｉｌｅ６４Ｌｅｕ
（５２）Ｉｌｅ６６Ｖａｌ
（５３）Ａｌａ６９ＬｅｕまたはＡｌａ６９Ｖａｌ
より選択される１つ以上のアミノ酸置換である。すなわち、本発明のタンパク質は、前記（１）から（５３）のアミノ酸置換より選択される１つ以上のアミノ酸置換を有していてよい。本発明のタンパク質は、例えば、前記（１）から（５３）のアミノ酸置換から選択される１つ、２つ、３つ、４つ、５つ、６つ、７つ、８つまたは９つのアミノ酸置換を有してよいし、１０個以上のアミノ酸置換を有してもよい。中でも（１）のアミノ酸置換（Ａｓｎ５０Ｔｙｒ）は、アルカリに対する安定性が特に向上したアミノ酸置換である。そのため、（１）のアミノ酸置換（Ａｓｎ５０Ｔｙｒ）を少なくとも有する免疫グロブリン結合性タンパク質は、本発明のタンパク質の好ましい例である。すなわち、本発明のタンパク質は、例えば、少なくとも（１）のアミノ酸置換（Ａｓｎ５０Ｔｙｒ）を有していてよい。本発明のタンパク質は、具体的には、例えば、（１）から（５３）のアミノ酸置換の内、（１）のアミノ酸置換（Ａｓｎ５０Ｔｙｒ）のみを有していていてもよく、（１）のアミノ酸置換（Ａｓｎ５０Ｔｙｒ）と（２）から（５３）のアミノ酸置換から選択される１つ以上のアミノ酸置換との組み合わせを有していてもよい。また、前記特定位置におけるアミノ酸置換は、例えば、前記（１）から（５３）のアミノ酸置換より選択される１つ以上（例えば、１つ、２つ、３つ、４つ、５つ、６つ、７つ、８つ、９つ、または１０個以上）のアミノ酸置換を含んでいてよい。
　第２グループ変異は、具体的には、Ｌｙｓ７Ｇｌｎ、Ｌｙｓ１３Ｖａｌ、Ｌｙｓ２９Ｖａｌ、Ｌｙｓ２９Ｉｌｅ、Ｐｒｏ６Ａｌａ、Ｇｌｕ８Ａｒｇ、Ａｓｎ１５Ｖａｌ、Ｉｌｅ２３Ｐｈｅ、Ｉｌｅ２３Ｌｅｕ、Ｇｌｕ３４Ａｓｐ、Ｇｌｕ３４Ｐｈｅ、Ｇｌｕ３４Ｌｅｕ、Ｇｌｕ３４Ｖａｌ、Ｌｙｓ３８Ｌｅｕ、Ａｓｎ５０ＭｅｔおよびＴｙｒ５３Ｓｅｒから選ばれる少なくとも１つ以上のアミノ酸置換である。
　言い換えると、第２グループ変異は、
（５４）Ｌｙｓ７Ｇｌｎ
（５５）Ｌｙｓ１３Ｖａｌ
（５６）Ｌｙｓ２９ＶａｌまたはＬｙｓ２９Ｉｌｅ
（５７）Ｐｒｏ６Ａｌａ
（５８）Ｇｌｕ８Ａｒｇ
（５９）Ａｓｎ１５Ｖａｌ
（６０）Ｉｌｅ２３ＰｈｅまたはＩｌｅ２３Ｌｅｕ
（６１）Ｇｌｕ３４Ａｓｐ、Ｇｌｕ３４Ｐｈｅ、Ｇｌｕ３４ＬｅｕおよびＧｌｕ３４Ｖａｌのいずれか
（６２）Ｌｙｓ３８Ｌｅｕ
（６３）Ａｓｎ５０Ｍｅｔ
（６４）Ｔｙｒ５３Ｓｅｒ
より選択される１つ以上のアミノ酸置換である。すなわち、本発明のタンパク質は、前記（５４）から（６４）のアミノ酸置換より選択される１つ以上のアミノ酸置換を有していてよい。本発明のタンパク質は、例えば、前記（５４）から（６４）のアミノ酸置換より選択される１つ、２つ、３つ、４つ、５つ、６つ、７つ、８つまたは９つのアミノ酸置換を有してよいし、１０個以上のアミノ酸置換を有してもよい。また、前記特定位置におけるアミノ酸置換は、例えば、前記（５４）から（６４）のアミノ酸置換より選択される１つ以上（例えば、１つ、２つ、３つ、４つ、５つ、６つ、７つ、８つ、９つ、または１０個以上）のアミノ酸置換を含んでいてよい。
　言い換えると、本発明のタンパク質は、前記（１）から（６４）のアミノ酸置換より選択される１つ以上のアミノ酸置換を有する。本発明のタンパク質は、具体的には、前記（１）から（５３）のアミノ酸置換から選択される１つ以上のアミノ酸置換および／または前記（５４）から（６４）のアミノ酸置換より選択される１つ以上のアミノ酸置換を有する。本発明のタンパク質は、例えば、前記（１）から（５３）のアミノ酸置換から選択される１つ、２つ、３つ、４つ、５つ、６つ、７つ、８つ、９つ、または１０個以上のアミノ酸置換および／または前記（５４）から（６４）のアミノ酸置換より選択される１つ、２つ、３つ、４つ、５つ、６つ、７つ、８つ、９つ、または１０個以上のアミノ酸置換を有していてよい。本発明のタンパク質は、例えば、少なくとも、前記（１）のアミノ酸置換（Ａｓｎ５０Ｔｙｒ）と前記（５４）から（６４）のアミノ酸置換より選択される１つ以上のアミノ酸置換との組み合わせを有していてよい。少なくとも（１）のアミノ酸置換（Ａｓｎ５０Ｔｙｒ）と（２）から（５３）のアミノ酸置換から選択される１つ以上のアミノ酸置換との組み合わせを有する本発明のタンパク質は、アルカリ安定性が向上し、且つ温和なｐＨ条件で抗体溶出が可能な、免疫グロブリン結合性タンパク質の好ましい例であり得る。
　なお、前記（１）から（６４）のアミノ酸置換の内、同位置のアミノ酸置換は同時には選択されない。例えば、（３）のアミノ酸置換と（２７）のアミノ酸置換は同時には選択されない。
　本発明のタンパク質が２つまたはそれ以上のアミノ酸置換を有する場合、それらアミノ酸置換の組み合わせは、第１グループ変異および／または第２グループ変異を含む限り、特に制限されない。
　前記（１）から（５３）のアミノ酸置換より選択されるアミノ酸置換の組み合わせ（「第１グループ変異の組み合わせ」ともいう）の一態様として、
Ａｓｎ５０ＴｙｒおよびＧｌｕ５２Ｇｌｙのアミノ酸置換；
Ｉｌｅ１７ＰｈｅおよびＡｓｎ５０Ｓｅｒのアミノ酸置換；
Ｇｌｕ８ＧｌｙおよびＧｌｕ５２Ｖａｌのアミノ酸置換；
Ｇｌｕ２７Ｇｌｙ、Ａｌａ４１Ｔｈｒ、Ａｓｎ５０ＬｙｓおよびＡｓｎ６５Ｔｙｒのアミノ酸置換；
Ｐｒｏ３Ｓｅｒ、Ａｓｎ５０ＡｓｐおよびＴｈｒ５４Ｉｌｅのアミノ酸置換；
Ａｓｎ４４Ｓｅｒ、Ａｓｎ５０ＴｙｒおよびＧｌｕ５２Ｇｌｙのアミノ酸置換；
Ａｓｎ４４ＳｅｒおよびＡｓｎ５０Ｔｙｒのアミノ酸置換；
Ａｓｎ５０ＴｙｒおよびＧｌｕ５２Ｖａｌのアミノ酸置換；
Ａｓｎ４４Ｇｌｙ、Ａｓｎ５０ＴｙｒおよびＧｌｕ５２Ｖａｌのアミノ酸置換；
Ａｓｎ４４Ｇｌｙ、Ａｓｎ５０ＳｅｒおよびＧｌｕ５２Ｖａｌのアミノ酸置換；
Ｌｙｓ７ＡｌａおよびＧｌｙ２１Ａｒｇのアミノ酸置換；
Ｌｙｓ７Ａｌａ、Ａｓｎ５０ＴｙｒおよびＧｌｕ５２Ｇｌｙのアミノ酸置換；
Ｌｙｓ７Ａｌａ、Ｇｌｙ２１Ａｒｇ、Ａｓｎ５０ＴｙｒおよびＧｌｕ５２Ｇｌｙのアミノ酸置換；
Ｇｌｕ１Ｇｌｙ、Ｌｙｓ７Ａｌａ、Ａｓｎ５０ＴｙｒおよびＧｌｕ５２Ｇｌｙのアミノ酸置換；
Ｇｌｕ１Ｖａｌ、Ｌｙｓ７Ａｌａ、Ａｓｎ５０ＴｙｒおよびＧｌｕ５２Ｇｌｙのアミノ酸置換；
Ｇｌｕ４Ｌｙｓ、Ｌｙｓ７Ａｌａ、Ａｓｎ５０ＴｙｒおよびＧｌｕ５２Ｇｌｙのアミノ酸置換；
Ｌｙｓ７Ａｌａ、Ｇｌｕ２７Ａｒｇ、Ａｓｎ５０ＴｙｒおよびＧｌｕ５２Ｇｌｙのアミノ酸置換；
Ｌｙｓ７Ａｌａ、Ｔｈｒ３６Ａｌａ、Ａｓｎ５０ＴｙｒおよびＧｌｕ５２Ｇｌｙのアミノ酸置換；
Ｌｙｓ７Ａｌａ、Ｇｌｕ９Ｖａｌ、Ａｓｎ５０ＴｙｒおよびＧｌｕ５２Ｇｌｙのアミノ酸置換；
Ｌｙｓ７Ａｌａ、Ａｓｎ５０Ｔｙｒ、Ｇｌｕ５２ＧｌｙおよびＴｙｒ５３Ｐｈｅのアミノ酸置換；
Ｌｙｓ７Ａｌａ、Ａｓｎ５０Ｔｙｒ、Ｇｌｕ５２ＧｌｙおよびＴｈｒ５４Ｍｅｔのアミノ酸置換；
Ｌｙｓ７Ａｌａ、Ａｓｎ５０Ｔｙｒ、Ｇｌｕ５２ＧｌｙおよびＡｌａ６９Ｔｈｒのアミノ酸置換；
Ｇｌｕ１Ｖａｌ、Ｌｙｓ７Ａｌａ、Ａｓｎ５０Ｔｙｒ、Ｇｌｕ５２ＧｌｙおよびＴｙｒ５３Ｐｈｅのアミノ酸置換；
Ｇｌｕ４Ｇｌｙ、Ｌｙｓ７Ａｌａ、Ａｓｎ５０Ｔｙｒ、Ｇｌｕ５２ＧｌｙおよびＴｙｒ５３Ｐｈｅのアミノ酸置換；
Ａｓｎ５０Ｔｙｒ、Ｇｌｕ５２ＧｌｙおよびＴｙｒ５３Ｐｈｅのアミノ酸置換；
Ｌｙｓ７Ａｌａ、Ｇｌｙ２１Ａｒｇ、Ａｓｎ５０Ｔｙｒ、Ｇｌｕ５２ＧｌｙおよびＴｙｒ５３Ｐｈｅのアミノ酸置換；
Ｌｙｓ７Ａｌａ、Ａｓｎ５０Ｔｙｒ、Ｇｌｕ５２ＡｓｐおよびＴｙｒ５３Ｐｈｅのアミノ酸置換；
Ｇｌｕ４Ｇｌｙ、Ｌｙｓ７Ａｌａ、Ａｓｎ５０Ｔｙｒ、Ｇｌｕ５２ＡｓｐおよびＴｙｒ５３Ｐｈｅのアミノ酸置換；
Ａｓｎ５０Ｔｙｒ、Ｇｌｕ５２ＡｓｐおよびＴｙｒ５３Ｐｈｅのアミノ酸置換；
Ｇｌｕ４Ｇｌｙ、Ａｓｎ５０Ｔｙｒ、Ｇｌｕ５２ＧｌｙおよびＴｙｒ５３Ｐｈｅのアミノ酸置換；
Ｇｌｕ４Ｇｌｙ、Ｌｙｓ７Ａｌａ、Ｌｙｓ３８Ａｌａ、Ａｓｎ５０Ｔｙｒ、Ｇｌｕ５２ＡｓｐおよびＴｙｒ５３Ｐｈｅのアミノ酸置換；
Ｇｌｕ４Ｇｌｙ、Ｌｙｓ７Ａｌａ、Ｐｈｅ３２Ｌｅｕ、Ａｌａ４７Ｔｈｒ、Ａｓｎ５０Ｔｙｒ、Ｇｌｕ５２ＡｓｐおよびＴｙｒ５３Ｐｈｅのアミノ酸置換；
Ｔｈｒ２Ｓｅｒ、Ｇｌｕ４Ｇｌｙ、Ｌｙｓ７Ａｌａ、Ａｓｎ５０Ｔｙｒ、Ｇｌｕ５２ＡｓｐおよびＴｙｒ５３Ｐｈｅのアミノ酸置換；
Ｇｌｕ４Ｇｌｙ、Ｌｙｓ７Ａｌａ、Ｇｌｕ２７Ｌｙｓ、Ａｓｎ５０Ｔｙｒ、Ｇｌｕ５２ＡｓｐおよびＴｙｒ５３Ｐｈｅのアミノ酸置換；
Ｔｈｒ２Ｐｒｏ、Ｐｒｏ３Ａｒｇ、Ｇｌｕ４Ｇｌｙ、Ｌｙｓ７Ａｌａ、Ｇｌｕ９Ｖａｌ、Ａｓｎ５０Ｔｙｒ、Ｇｌｕ５２ＡｓｎおよびＴｙｒ５３Ｐｈｅのアミノ酸置換；
Ｇｌｕ４Ｇｌｙ、Ｌｙｓ７Ａｌａ、Ｇｌｕ２７Ｉｌｅ、Ａｓｎ５０Ｔｙｒ、Ｇｌｕ５２ＡｓｐおよびＴｙｒ５３Ｐｈｅのアミノ酸置換；
Ｇｌｕ４Ｇｌｙ、Ｌｙｓ７Ａｌａ、Ａｓｎ４４Ｉｌｅ、Ａｓｎ５０Ｔｙｒ、Ｇｌｕ５２ＡｓｐおよびＴｙｒ５３Ｐｈｅのアミノ酸置換；
Ｇｌｕ４Ｇｌｙ、Ｇｌｕ５Ｌｙｓ、Ｌｙｓ７Ａｌａ、Ａｓｎ４４Ｉｌｅ、Ａｓｎ５０Ｔｙｒ、Ｇｌｕ５２ＡｓｐおよびＴｙｒ５３Ｐｈｅのアミノ酸置換；
Ｐｒｏ３Ａｒｇ、Ｇｌｕ４Ｇｌｙ、Ｌｙｓ７Ａｌａ、Ａｓｎ５０Ｔｙｒ、Ｇｌｕ５２ＡｓｐおよびＴｙｒ５３Ｐｈｅのアミノ酸置換；
Ｇｌｕ４Ｇｌｙ、Ｇｌｕ５Ｌｙｓ、Ｌｙｓ７Ａｌａ、Ａｓｎ５０Ｔｙｒ、Ｇｌｕ５２ＡｓｐおよびＴｙｒ５３Ｐｈｅのアミノ酸置換；
Ｇｌｕ４Ｇｌｙ、Ｌｙｓ７Ａｌａ、Ｇｌｕ２７Ｖａｌ、Ａｓｎ５０Ｔｙｒ、Ｇｌｕ５２ＡｓｐおよびＴｙｒ５３Ｐｈｅのアミノ酸置換；
Ｇｌｕ４Ｇｌｙ、Ｇｌｕ５Ａｒｇ、Ｌｙｓ７Ａｌａ、Ａｓｎ５０Ｔｙｒ、Ｇｌｕ５２ＡｓｐおよびＴｙｒ５３Ｐｈｅのアミノ酸置換；
Ｇｌｕ４Ｇｌｙ、Ｌｙｓ７Ａｌａ、Ｇｌｕ２７Ａｒｇ、Ａｓｎ５０Ｔｙｒ、Ｇｌｕ５２ＡｓｐおよびＴｙｒ５３Ｐｈｅのアミノ酸置換；
Ｇｌｕ４Ｇｌｙ、Ｌｙｓ７Ａｌａ、Ａｌａ４７Ａｒｇ、Ａｓｎ５０Ｔｙｒ、Ｇｌｕ５２ＡｓｐおよびＴｙｒ５３Ｐｈｅのアミノ酸置換；
Ｇｌｕ４Ｇｌｙ、Ｌｙｓ７Ａｌａ、Ａｓｎ５０Ｔｙｒ、Ｇｌｕ５２Ａｓｐ、Ｔｙｒ５３ＰｈｅおよびＡｌａ６９Ｖａｌのアミノ酸置換；
Ｇｌｕ４Ｇｌｙ、Ｌｙｓ７Ａｌａ、Ｌｙｓ２９Ｐｈｅ、Ａｓｎ５０Ｔｙｒ、Ｇｌｕ５２ＡｓｐおよびＴｙｒ５３Ｐｈｅのアミノ酸置換；
Ｇｌｕ４Ｇｌｙ、Ｌｙｓ７Ａｌａ、Ｇｌｕ８Ｇｌｙ、Ｇｌｕ３３Ｖａｌ、Ａｓｎ５０Ｔｙｒ、Ｇｌｕ５２ＡｓｐおよびＴｙｒ５３Ｐｈｅのアミノ酸置換；
Ｇｌｕ４Ｇｌｙ、Ｌｙｓ７Ａｌａ、Ｉｌｅ２３Ａｒｇ、Ａｓｎ５０Ｔｙｒ、Ｇｌｕ５２ＡｓｐおよびＴｙｒ５３Ｐｈｅのアミノ酸置換；
Ｇｌｕ４Ｇｌｙ、Ｌｙｓ７Ａｌａ、Ａｌａ４１Ｉｌｅ、Ａｓｎ５０Ｔｙｒ、Ｇｌｕ５２ＡｓｐおよびＴｙｒ５３Ｐｈｅのアミノ酸置換；
Ｇｌｕ４Ｇｌｙ、Ｌｙｓ７Ａｌａ、Ａｌａ４１Ｔｙｒ、Ａｓｎ５０Ｔｙｒ、Ｇｌｕ５２ＡｓｐおよびＴｙｒ５３Ｐｈｅのアミノ酸置換；
Ｇｌｕ４Ｇｌｙ、Ｌｙｓ７Ａｌａ、Ａｓｎ５０Ｔｙｒ、Ｇｌｕ５２ＬｅｕおよびＴｙｒ５３Ｐｈｅのアミノ酸置換；
Ｇｌｕ４Ｇｌｙ、Ｌｙｓ７Ａｌａ、Ａｓｎ５０Ｔｙｒ、Ｇｌｕ５２ＶａｌおよびＴｙｒ５３Ｐｈｅのアミノ酸置換；
Ｇｌｕ４Ｇｌｙ、Ｌｙｓ７Ａｌａ、Ａｓｎ５０Ｔｙｒ、Ｇｌｕ５２Ｖａｌ、Ｔｙｒ５３ＰｈｅおよびＡｌａ６９Ｖａｌのアミノ酸置換；
Ｇｌｕ４Ｇｌｙ、Ｌｙｓ７Ａｌａ、Ａｓｎ５０Ｔｙｒ、Ｇｌｕ５２Ｌｅｕ、Ｔｙｒ５３ＰｈｅおよびＡｌａ６９Ｖａｌのアミノ酸置換；
Ｇｌｕ４Ｇｌｙ、Ｌｙｓ７Ａｌａ、Ａｓｎ５０Ｔｙｒ、Ｔｙｒ５３ＰｈｅおよびＡｌａ６９Ｖａｌのアミノ酸置換；
Ｐｒｏ３Ａｒｇ、Ｇｌｕ４Ｇｌｙ、Ｌｙｓ７Ａｌａ、Ａｓｎ５０Ｔｙｒ、Ｔｙｒ５３ＰｈｅおよびＡｌａ６９Ｖａｌのアミノ酸置換；
Ｐｒｏ３Ａｒｇ、Ｇｌｕ４Ｇｌｙ、Ｌｙｓ７Ａｌａ、Ａｓｎ５０Ｔｙｒ、Ｔｙｒ５３Ｐｈｅ、Ｉｌｅ６６ＶａｌおよびＡｌａ６９Ｖａｌのアミノ酸置換；
Ｐｒｏ３Ａｒｇ、Ｇｌｕ４Ｇｌｙ、Ｌｙｓ７Ａｌａ、Ｔｈｒ３１Ｍｅｔ、Ａｓｎ５０Ｔｙｒ、Ｔｙｒ５３ＰｈｅおよびＡｌａ６９Ｖａｌのアミノ酸置換；
Ｇｌｕ４Ｇｌｙ、Ｐｒｏ６Ｌｅｕ、Ｌｙｓ７Ａｌａ、Ａｓｎ５０Ｔｙｒ、Ｔｙｒ５３ＰｈｅおよびＡｌａ６９Ｖａｌのアミノ酸置換；
Ｇｌｕ４Ｇｌｙ、Ｌｙｓ７Ａｌａ、Ａｌａ３５Ｔｈｒ、Ａｓｎ５０Ｔｙｒ、Ｔｙｒ５３ＰｈｅおよびＡｌａ６９Ｖａｌのアミノ酸置換；
Ｇｌｕ４Ｇｌｙ、Ｌｙｓ７Ａｌａ、Ｇｌｕ３３Ｇｌｙ、Ａｓｎ５０Ｔｙｒ、Ｔｙｒ５３ＰｈｅおよびＡｌａ６９Ｖａｌのアミノ酸置換；
Ｇｌｕ４Ｇｌｙ、Ｇｌｕ５Ａｓｐ、Ｐｒｏ６Ｌｅｕ、Ｌｙｓ７Ａｌａ、Ａｓｎ５０Ｔｙｒ、Ｔｙｒ５３ＰｈｅおよびＡｌａ６９Ｖａｌのアミノ酸置換；
Ｇｌｕ４Ｇｌｙ、Ｌｙｓ７Ａｌａ、Ａｓｎ５０Ｔｙｒ、Ｔｙｒ５３ＰｈｅおよびＡｌａ６９Ｌｅｕのアミノ酸置換；
Ｇｌｕ４Ｇｌｙ、Ｌｙｓ７Ａｌａ、Ａｌａ３７Ｔｈｒ、Ａｓｎ５０Ｔｙｒ、Ｔｙｒ５３ＰｈｅおよびＡｌａ６９Ｖａｌのアミノ酸置換；
Ｇｌｕ４Ｇｌｙ、Ｌｙｓ７Ａｌａ、Ｇｌｕ３３Ａｓｐ、Ａｓｎ５０Ｔｙｒ、Ｇｌｕ５２Ｇｌｙ、Ｔｙｒ５３ＰｈｅおよびＡｌａ６９Ｖａｌのアミノ酸置換；
Ｔｈｒ２Ａｌａ、Ｇｌｕ４Ｇｌｙ、Ｌｙｓ７Ｐｒｏ、Ａｓｎ５０Ｔｙｒ、Ｔｙｒ５３ＰｈｅおよびＡｌａ６９Ｖａｌのアミノ酸置換；
Ｇｌｕ４Ｇｌｙ、Ｌｙｓ７Ａｌａ、Ｉｌｅ２３Ｖａｌ、Ａｓｎ５０Ｔｙｒ、Ｔｙｒ５３ＰｈｅおよびＡｌａ６９Ｖａｌのアミノ酸置換；
Ｇｌｕ４Ｇｌｙ、Ｐｒｏ６Ｔｈｒ、Ｌｙｓ７Ａｌａ、Ａｓｎ５０Ｔｙｒ、Ｔｙｒ５３ＰｈｅおよびＡｌａ６９Ｖａｌのアミノ酸置換；
Ｇｌｕ４Ｇｌｙ、Ｌｙｓ７Ａｌａ、Ｔｈｒ３６Ｓｅｒ、Ａｓｎ５０Ｔｙｒ、Ｔｙｒ５３ＰｈｅおよびＡｌａ６９Ｖａｌのアミノ酸置換；
Ｇｌｕ４Ｇｌｙ、Ｌｙｓ７Ａｌａ、Ｖａｌ１４Ａｌａ、Ａｓｎ５０Ｔｙｒ、Ｔｙｒ５３ＰｈｅおよびＡｌａ６９Ｖａｌのアミノ酸置換；
Ｇｌｕ４Ｇｌｙ、Ｌｙｓ７Ａｌａ、Ｇｌｙ２１Ａｒｇ、Ａｓｎ５０Ｔｙｒ、Ｔｙｒ５３ＰｈｅおよびＡｌａ６９Ｖａｌのアミノ酸置換；
Ｇｌｕ４Ｇｌｙ、Ｌｙｓ７Ａｌａ、Ａｓｎ４４Ａｒｇ、Ａｓｎ５０Ｔｙｒ、Ｔｙｒ５３ＰｈｅおよびＡｌａ６９Ｖａｌのアミノ酸置換；
Ｇｌｕ４Ｇｌｙ、Ｌｙｓ７Ａｌａ、Ａｓｎ４４Ｈｉｓ、Ａｓｎ５０Ｔｙｒ、Ｔｙｒ５３ＰｈｅおよびＡｌａ６９Ｖａｌのアミノ酸置換；
Ｇｌｕ４Ｇｌｙ、Ｌｙｓ７Ａｌａ、Ａｓｎ５０Ｔｙｒ、Ｇｌｕ５２Ｔｙｒ、Ｔｙｒ５３ＰｈｅおよびＡｌａ６９Ｖａｌのアミノ酸置換；
Ｇｌｕ４Ｇｌｙ、Ｌｙｓ７Ａｌａ、Ａｓｎ５０Ｔｙｒ、Ｔｙｒ５３Ｐｈｅ、Ｇｌｙ６０ＡｒｇおよびＡｌａ６９Ｖａｌのアミノ酸置換；
Ｇｌｕ４Ｇｌｙ、Ｌｙｓ７Ａｌａ、Ａｓｎ５０Ｔｙｒ、Ｔｙｒ５３Ｐｈｅ、Ｉｌｅ６４ＬｅｕおよびＡｌａ６９Ｖａｌのアミノ酸置換；
があげられる。
　前記（５４）から（６４）のアミノ酸置換より選択されるアミノ酸置換の組み合わせ（「第２グループ変異の組み合わせ」ともいう）の一態様として、
Ｐｒｏ６ＡｌａおよびＬｙｓ２９Ｉｌｅのアミノ酸置換；
Ｇｌｕ８ＡｒｇおよびＬｙｓ２９Ｉｌｅのアミノ酸置換；
Ｉｌｅ２３ＰｈｅおよびＬｙｓ２９Ｉｌｅのアミノ酸置換；
Ｉｌｅ２３ＬｅｕおよびＬｙｓ２９Ｉｌｅのアミノ酸置換；
Ｌｙｓ２９ＩｌｅおよびＬｙｓ３８Ｌｅｕのアミノ酸置換；
Ｌｙｓ２９ＩｌｅおよびＡｓｎ５０Ｍｅｔのアミノ酸置換；
Ｌｙｓ５９ＩｌｅおよびＴｙｒ５３Ｓｅｒのアミノ酸置換；
Ａｓｎ１５ＶａｌおよびＬｙｓ２９Ｉｌｅのアミノ酸置換；
Ｌｙｓ２９ＩｌｅおよびＧｌｕ３４Ａｓｐのアミノ酸置換；
Ｌｙｓ２９ＩｌｅおよびＧｌｕ３４Ｐｈｅのアミノ酸置換；
Ｌｙｓ２９ＩｌｅおよびＧｌｕ３４Ｌｅｕのアミノ酸置換；
Ｌｙｓ２９ＩｌｅおよびＧｌｕ３４Ｖａｌのアミノ酸置換；
があげられる。
　前記（１）から（６４）のアミノ酸置換より選択されるアミノ酸置換の組み合わせの一態様として、上記例示した第１グループ変異の組み合わせのいずれかと上記例示した第２グループ変異の組み合わせのいずれかの組み合わせが挙げられる。
　またアミノ酸置換の組み合わせの別態様として、少なくとも前記（１）から（６４）のアミノ酸置換より選択される１つ以上のアミノ酸置換（具体的には、前記（１）から（５３）のアミノ酸置換より選択される１つ以上のアミノ酸置換および／または前記（５４）から（６４）のアミノ酸置換より選択される１つ以上のアミノ酸置換）と、少なくとも以下の（Ｉ）から（ＶＩＩ）より選択される１つ以上のリジン（Ｌｙｓ）残基のリジン以外の塩基性アミノ酸（アルギニン（Ａｒｇ）もしくはヒスチジン（Ｈｉｓ））またはヒドロキシ基を有するアミノ酸（セリン（Ｓｅｒ）、スレオニン（Ｔｈｒ）もしくはチロシン（Ｔｙｒ））への置換との組み合わせがあげられる。
（Ｉ）配列番号１の７番目に相当するリジン残基
（ＩＩ）配列番号１の１３番目に相当するリジン残基
（ＩＩＩ）配列番号１の２２番目に相当するリジン残基
（ＩＶ）配列番号１の２９番目に相当するリジン残基
（Ｖ）配列番号１の３８番目に相当するリジン残基
（ＶＩ）配列番号１の４８番目に相当するリジン残基
（ＶＩＩ）配列番号１の６７番目に相当するリジン残基
　本発明のタンパク質は、前記（Ｉ）から（ＶＩＩ）より選択される１つ、２つ、３つ、４つ、５つ、６つまたは７つのリジン残基の置換を有してよい。
　ただし、
前記（Ｉ）のリジン残基の置換を選択した場合は（６）Ｌｙｓ７Ａｌａおよび（３８）Ｌｙｓ７Ｐｒｏのアミノ酸置換が前記（Ｉ）のリジン残基の置換で、
前記（ＩＶ）のリジン残基の置換を選択した場合は（１２）Ｌｙｓ２９Ｐｒｏおよび（４１）Ｌｙｓ２９Ｐｈｅのアミノ酸置換が前記（ＩＶ）のリジン残基の置換で、
前記（Ｖ）のリジン残基の置換を選択した場合は（３１）Ｌｙｓ３８Ａｌａのアミノ酸置換が前記（Ｖ）のリジン残基の置換で、
それぞれ上書きされる。
　また、
前記（Ｉ）のリジン残基の置換を選択した場合は（５４）Ｌｙｓ７Ｇｌｎのアミノ酸置換が前記（Ｉ）のリジン残基の置換で、
前記（ＩＩ）のリジン残基の置換を選択した場合は（５５）Ｌｙｓ１３Ｖａｌのアミノ酸置換が前記（ＩＩ）のリジン残基の置換で、
前記（ＩＶ）のリジン残基の置換を選択した場合は（５６）Ｌｙｓ２９ＶａｌまたはＬｙｓ２９Ｉｌｅのアミノ酸置換が前記（ＩＶ）のリジン残基の置換で、
前記（Ｖ）のリジン残基の置換を選択した場合は（６２）Ｌｙｓ３８Ｌｅｕのアミノ酸置換が前記（Ｖ）のリジン残基の置換で、
それぞれ上書きされる。
　あるいは、前記（Ｉ）から（ＶＩＩ）のアミノ酸置換の内、前記（１）から（６４）より選択される１つ以上のアミノ酸置換と同位置のアミノ酸置換は選択されなくてもよい。すなわち、例えば、前記（１）から（６４）のアミノ酸置換から少なくとも（６）Ｌｙｓ７Ａｌａ、（３８）Ｌｙｓ７Ｐｒｏまたは（５４）Ｌｙｓ７Ｇｌｎのアミノ酸置換を選択した場合は、前記（Ｉ）のアミノ酸置換は選択されなくてもよい。また、アミノ酸置換の組み合わせは、少なくとも前記（１）から（６４）のアミノ酸置換より選択される１つ以上のアミノ酸置換が残存するように選択される。すなわち、例えば、前記（１）から（６４）のアミノ酸置換から（６）Ｌｙｓ７Ａｌａ、（３８）Ｌｙｓ７Ｐｒｏまたは（５４）Ｌｙｓ７Ｇｌｎのアミノ酸置換を単独で選択した場合は、前記（Ｉ）のアミノ酸置換は選択できない。また、アミノ酸置換の組み合わせは、少なくとも前記（１）から（５３）のアミノ酸置換より選択される１つ以上のアミノ酸置換が残存するように選択されてもよい。また、アミノ酸置換の組み合わせは、少なくとも前記（５４）から（６４）のアミノ酸置換より選択される１つ以上のアミノ酸置換が残存するように選択されてもよい。
　なお、塩基性アミノ酸またはヒドロキシ基を有するアミノ酸に置換されたリジン残基以外のリジン残基（すなわち、前記（Ｉ）～（ＶＩＩ）のリジン残基の内の選択されなかったもの）については、未置換（リジン残基）のままでもよいし、塩基性アミノ酸およびヒドロキシ基を有するアミノ酸以外のアミノ酸に置換されてもよい。後者の例としては、リジン残基のグルタミンまたはイソロイシンへの置換や、前述した（６）Ｌｙｓ７Ａｌａ、（１２）Ｌｙｓ２９Ｐｒｏ、（３１）Ｌｙｓ３８Ａｌａ、（３８）Ｌｙｓ７Ｐｒｏ、（４１）Ｌｙｓ２９Ｐｈｅ、（５５）Ｌｙｓ１３Ｖａｌ、（５６（一部））Ｌｙｓ２９Ｖａｌおよび（６２）Ｌｙｓ３８Ｌｅｕのアミノ酸置換があげられる。
　第１グループ変異を含むアミノ酸置換の組み合わせの別態様の具体例として、
Ｌｙｓ７Ａｒｇ、Ｌｙｓ１３Ａｒｇ、Ｇｌｙ２１Ａｒｇ、Ｌｙｓ２２Ａｒｇ、Ｌｙｓ２９Ａｒｇ、Ｌｙｓ３８Ａｒｇ、Ｌｙｓ４８ＡｒｇおよびＬｙｓ６７Ａｒｇのアミノ酸置換；
Ｌｙｓ７Ａｒｇ、Ｌｙｓ１３Ａｒｇ、Ｌｙｓ２２Ａｒｇ、Ｌｙｓ２９Ａｒｇ、Ｌｙｓ３８Ａｒｇ、Ｌｙｓ４８Ａｒｇ、Ｇｌｙ５１ＶａｌおよびＬｙｓ６７Ａｒｇのアミノ酸置換；
Ｌｙｓ７Ａｒｇ、Ｌｙｓ１３Ａｒｇ、Ｌｙｓ２２Ａｒｇ、Ｌｙｓ２９Ａｒｇ、Ｌｙｓ３８Ａｒｇ、Ｌｙｓ４８Ａｒｇ、Ａｓｎ５０Ｔｙｒ、Ｇｌｕ５２ＧｌｙおよびＬｙｓ６７Ａｒｇのアミノ酸置換；
Ｌｙｓ７Ａｌａ、Ｌｙｓ１３Ａｒｇ、Ｇｌｙ２１Ａｒｇ、Ｌｙｓ２２Ｇｌｎ、Ｌｙｓ２９Ｉｌｅ、Ｌｙｓ３８Ａｒｇ、Ｌｙｓ４８ＡｒｇおよびＬｙｓ６７Ａｒｇのアミノ酸置換；
Ｌｙｓ７Ａｌａ、Ｌｙｓ１３Ａｒｇ、Ｌｙｓ２２Ｇｌｎ、Ｌｙｓ２９Ｉｌｅ、Ｌｙｓ３８Ａｒｇ、Ｌｙｓ４８Ａｒｇ、Ａｓｎ５０Ｔｙｒ、Ｇｌｕ５２ＧｌｙおよびＬｙｓ６７Ａｒｇのアミノ酸置換；
Ｌｙｓ７Ａｌａ、Ｌｙｓ１３Ａｒｇ、Ｇｌｙ２１Ａｒｇ、Ｌｙｓ２２Ｇｌｎ、Ｌｙｓ２９Ｉｌｅ、Ｌｙｓ３８Ａｒｇ、Ｌｙｓ４８Ａｒｇ、Ａｓｎ５０Ｔｙｒ、Ｇｌｕ５２ＧｌｙおよびＬｙｓ６７Ａｒｇのアミノ酸置換；
Ｇｌｕ１Ｇｌｙ、Ｌｙｓ７Ａｌａ、Ｌｙｓ１３Ａｒｇ、Ｌｙｓ２２Ｇｌｎ、Ｌｙｓ２９Ｉｌｅ、Ｌｙｓ３８Ａｒｇ、Ｌｙｓ４８Ａｒｇ、Ａｓｎ５０Ｔｙｒ、Ｇｌｕ５２ＧｌｙおよびＬｙｓ６７Ａｒｇのアミノ酸置換；
Ｇｌｕ１Ｖａｌ、Ｌｙｓ７Ａｌａ、Ｌｙｓ１３Ａｒｇ、Ｌｙｓ２２Ｇｌｎ、Ｌｙｓ２９Ｉｌｅ、Ｌｙｓ３８Ａｒｇ、Ｌｙｓ４８Ａｒｇ、Ａｓｎ５０Ｔｙｒ、Ｇｌｕ５２ＧｌｙおよびＬｙｓ６７Ａｒｇのアミノ酸置換；
Ｌｙｓ７Ａｌａ、Ｌｙｓ１３Ａｒｇ、Ｌｙｓ２２Ａｒｇ、Ｌｙｓ２９Ｉｌｅ、Ｌｙｓ３８Ａｒｇ、Ｌｙｓ４８Ａｒｇ、Ａｓｎ５０Ｔｙｒ、Ｇｌｕ５２ＧｌｙおよびＬｙｓ６７Ａｒｇのアミノ酸置換；
Ｇｌｕ４Ｌｙｓ、Ｌｙｓ７Ａｌａ、Ｌｙｓ１３Ａｒｇ、Ｌｙｓ２２Ｇｌｎ、Ｌｙｓ２９Ｉｌｅ、Ｌｙｓ３８Ａｒｇ、Ｌｙｓ４８Ａｒｇ、Ａｓｎ５０Ｔｙｒ、Ｇｌｕ５２ＧｌｙおよびＬｙｓ６７Ａｒｇのアミノ酸置換；
Ｌｙｓ７Ａｌａ、Ｌｙｓ１３Ａｒｇ、Ｌｙｓ２２Ｔｈｒ、Ｌｙｓ２９Ｉｌｅ、Ｌｙｓ３８Ａｒｇ、Ｌｙｓ４８Ａｒｇ、Ａｓｎ５０Ｔｙｒ、Ｇｌｕ５２ＧｌｙおよびＬｙｓ６７Ａｒｇのアミノ酸置換；
Ｌｙｓ７Ａｌａ、Ｌｙｓ１３Ａｒｇ、Ｌｙｓ２２Ｇｌｎ、Ｇｌｕ２７Ａｒｇ、Ｌｙｓ２９Ｉｌｅ、Ｌｙｓ３８Ａｒｇ、Ｌｙｓ４８Ａｒｇ、Ａｓｎ５０Ｔｙｒ、Ｇｌｕ５２ＧｌｙおよびＬｙｓ６７Ａｒｇのアミノ酸置換；
Ｌｙｓ７Ａｌａ、Ｌｙｓ１３Ａｒｇ、Ｌｙｓ２２Ｇｌｎ、Ｌｙｓ２９Ｉｌｅ、Ｔｈｒ３６Ａｌａ、Ｌｙｓ３８Ａｒｇ、Ｌｙｓ４８Ａｒｇ、Ａｓｎ５０Ｔｙｒ、Ｇｌｕ５２ＧｌｙおよびＬｙｓ６７Ａｒｇのアミノ酸置換；
Ｌｙｓ７Ａｌａ、Ｇｌｕ９Ｖａｌ、Ｌｙｓ１３Ａｒｇ、Ｌｙｓ２２Ｇｌｎ、Ｌｙｓ２９Ｉｌｅ、Ｌｙｓ３８Ａｒｇ、Ｌｙｓ４８Ａｒｇ、Ａｓｎ５０Ｔｙｒ、Ｇｌｕ５２ＧｌｙおよびＬｙｓ６７Ａｒｇのアミノ酸置換；
Ｌｙｓ７Ａｌａ、Ｌｙｓ１３Ａｒｇ、Ｌｙｓ２２Ａｒｇ、Ｌｙｓ２９Ｉｌｅ、Ｌｙｓ３８Ａｒｇ、Ｌｙｓ４８Ａｒｇ、Ａｓｎ５０Ｔｙｒ、Ｇｌｕ５２ＧｌｙおよびＬｙｓ６７Ａｒｇのアミノ酸置換；
Ｌｙｓ７Ａｌａ、Ｌｙｓ１３Ａｒｇ、Ｌｙｓ２２Ｇｌｎ、Ｌｙｓ２９Ｉｌｅ、Ｌｙｓ３８Ａｒｇ、Ｌｙｓ４８Ａｒｇ、Ａｓｎ５０Ｔｙｒ、Ｇｌｕ５２Ｇｌｙ、Ｔｙｒ５３ＰｈｅおよびＬｙｓ６７Ａｒｇのアミノ酸置換；
Ｌｙｓ７Ａｌａ、Ｌｙｓ１３Ａｒｇ、Ｌｙｓ２２Ｇｌｎ、Ｌｙｓ２９Ｉｌｅ、Ｌｙｓ３８Ａｒｇ、Ｌｙｓ４８Ａｒｇ、Ａｓｎ５０Ｔｙｒ、Ｇｌｕ５２Ｇｌｙ、Ｔｈｒ５４ＭｅｔおよびＬｙｓ６７Ａｒｇのアミノ酸置換；
Ｌｙｓ７Ａｌａ、Ｌｙｓ１３Ａｒｇ、Ｌｙｓ２２Ｇｌｎ、Ｌｙｓ２９Ｉｌｅ、Ｌｙｓ３８Ａｒｇ、Ｌｙｓ４８Ａｒｇ、Ａｓｎ５０Ｔｙｒ、Ｇｌｕ５２Ｇｌｙ、Ｌｙｓ６７ＡｒｇおよびＡｌａ６９Ｔｈｒのアミノ酸置換；
Ｌｙｓ７Ａｌａ、Ｌｙｓ１３Ａｒｇ、Ｌｙｓ２２Ａｒｇ、Ｌｙｓ２９Ｉｌｅ、Ｌｙｓ３８Ａｒｇ、Ｌｙｓ４８Ａｒｇ、Ａｓｎ５０Ｔｙｒ、Ｇｌｕ５２Ｇｌｙ、Ｔｙｒ５３ＰｈｅおよびＬｙｓ６７Ａｒｇのアミノ酸置換；
Ｌｙｓ７Ａｌａ、Ｌｙｓ１３Ａｒｇ、Ｌｙｓ２２Ａｒｇ、Ｌｙｓ２９Ｉｌｅ、Ｌｙｓ３８Ａｒｇ、Ｌｙｓ４８Ａｒｇ、Ａｓｎ５０Ｔｙｒ、Ｇｌｕ５２Ｇｌｙ、Ｔｈｒ５４ＭｅｔおよびＬｙｓ６７Ａｒｇのアミノ酸置換；
Ｇｌｕ１Ｖａｌ、Ｌｙｓ７Ａｌａ、Ｌｙｓ１３Ａｒｇ、Ｌｙｓ２２Ａｒｇ、Ｌｙｓ２９Ｉｌｅ、Ｌｙｓ３８Ａｒｇ、Ｌｙｓ４８Ａｒｇ、Ａｓｎ５０Ｔｙｒ、Ｇｌｕ５２Ｇｌｙ、Ｔｙｒ５３ＰｈｅおよびＬｙｓ６７Ａｒｇのアミノ酸置換；
Ｇｌｕ４Ｇｌｙ、Ｌｙｓ７Ａｌａ、Ｌｙｓ１３Ａｒｇ、Ｌｙｓ２２Ａｒｇ、Ｌｙｓ２９Ｉｌｅ、Ｌｙｓ３８Ａｒｇ、Ｌｙｓ４８Ａｒｇ、Ａｓｎ５０Ｔｙｒ、Ｇｌｕ５２Ｇｌｙ、Ｔｙｒ５３ＰｈｅおよびＬｙｓ６７Ａｒｇのアミノ酸置換；
Ｌｙｓ７Ｓｅｒ、Ｌｙｓ１３Ａｒｇ、Ｌｙｓ２２Ａｒｇ、Ｌｙｓ２９Ｉｌｅ、Ｌｙｓ３８Ａｒｇ、Ｌｙｓ４８Ａｒｇ、Ａｓｎ５０Ｔｙｒ、Ｇｌｕ５２Ｇｌｙ、Ｔｙｒ５３ＰｈｅおよびＬｙｓ６７Ａｒｇのアミノ酸置換；
Ｌｙｓ７Ａｌａ、Ｌｙｓ１３Ａｒｇ、Ｇｌｙ２１Ａｒｇ、Ｌｙｓ２２Ａｒｇ、Ｌｙｓ２９Ｉｌｅ、Ｌｙｓ３８Ａｒｇ、Ｌｙｓ４８Ａｒｇ、Ａｓｎ５０Ｔｙｒ、Ｇｌｕ５２Ｇｌｙ、Ｔｙｒ５３ＰｈｅおよびＬｙｓ６７Ａｒｇのアミノ酸置換；
Ｌｙｓ７Ａｌａ、Ｌｙｓ１３Ａｒｇ、Ｌｙｓ２２Ａｒｇ、Ｌｙｓ２９Ｉｌｅ、Ｌｙｓ３８Ａｒｇ、Ｌｙｓ４８Ａｒｇ、Ａｓｎ５０Ｔｙｒ、Ｇｌｕ５２Ａｓｐ、Ｔｙｒ５３ＰｈｅおよびＬｙｓ６７Ａｒｇのアミノ酸置換；
Ｇｌｕ４Ｇｌｙ、Ｌｙｓ７Ａｌａ、Ｌｙｓ１３Ａｒｇ、Ｌｙｓ２２Ａｒｇ、Ｌｙｓ２９Ｉｌｅ、Ｌｙｓ３８Ａｒｇ、Ｌｙｓ４８Ａｒｇ、Ａｓｎ５０Ｔｙｒ、Ｇｌｕ５２Ａｓｐ、Ｔｙｒ５３ＰｈｅおよびＬｙｓ６７Ａｒｇのアミノ酸置換；
Ｌｙｓ７Ｓｅｒ、Ｌｙｓ１３Ａｒｇ、Ｌｙｓ２２Ａｒｇ、Ｌｙｓ２９Ｉｌｅ、Ｌｙｓ３８Ａｒｇ、Ｌｙｓ４８Ａｒｇ、Ａｓｎ５０Ｔｙｒ、Ｇｌｕ５２Ａｓｐ、Ｔｙｒ５３ＰｈｅおよびＬｙｓ６７Ａｒｇのアミノ酸置換；
Ｇｌｕ４Ｇｌｙ、Ｌｙｓ７Ｓｅｒ、Ｌｙｓ１３Ａｒｇ、Ｌｙｓ２２Ａｒｇ、Ｌｙｓ２９Ｉｌｅ、Ｌｙｓ３８Ａｒｇ、Ｌｙｓ４８Ａｒｇ、Ａｓｎ５０Ｔｙｒ、Ｇｌｕ５２Ｇｌｙ、Ｔｙｒ５３ＰｈｅおよびＬｙｓ６７Ａｒｇのアミノ酸置換；
Ｇｌｕ４Ｇｌｙ、Ｌｙｓ７Ａｌａ、Ｌｙｓ１３Ａｒｇ、Ｌｙｓ２２Ａｒｇ、Ｌｙｓ２９Ｉｌｅ、Ｌｙｓ３８Ａｌａ、Ｌｙｓ４８Ａｒｇ、Ａｓｎ５０Ｔｙｒ、Ｇｌｕ５２Ａｓｐ、Ｔｙｒ５３ＰｈｅおよびＬｙｓ６７Ａｒｇのアミノ酸置換；
Ｇｌｕ４Ｇｌｙ、Ｌｙｓ７Ａｌａ、Ｌｙｓ１３Ａｒｇ、Ｌｙｓ２２Ａｒｇ、Ｌｙｓ２９Ｉｌｅ、Ｐｈｅ３２Ｌｅｕ、Ｌｙｓ３８Ａｒｇ、Ａｌａ４７Ｔｈｒ、Ｌｙｓ４８Ａｒｇ、Ａｓｎ５０Ｔｙｒ、Ｇｌｕ５２Ａｓｐ、Ｔｙｒ５３ＰｈｅおよびＬｙｓ６７Ａｒｇのアミノ酸置換；
Ｔｈｒ２Ｓｅｒ、Ｇｌｕ４Ｇｌｙ、Ｌｙｓ７Ａｌａ、Ｌｙｓ１３Ａｒｇ、Ｌｙｓ２２Ａｒｇ、Ｌｙｓ２９Ｉｌｅ、Ｌｙｓ３８Ａｒｇ、Ｌｙｓ４８Ａｒｇ、Ａｓｎ５０Ｔｙｒ、Ｇｌｕ５２Ａｓｐ、Ｔｙｒ５３ＰｈｅおよびＬｙｓ６７Ａｒｇのアミノ酸置換；
Ｇｌｕ４Ｇｌｙ、Ｌｙｓ７Ａｌａ、Ｌｙｓ１３Ａｒｇ、Ｌｙｓ２２Ａｒｇ、Ｇｌｕ２７Ｌｙｓ、Ｌｙｓ２９Ｉｌｅ、Ｌｙｓ３８Ａｒｇ、Ｌｙｓ４８Ａｒｇ、Ａｓｎ５０Ｔｙｒ、Ｇｌｕ５２Ａｓｐ、Ｔｙｒ５３ＰｈｅおよびＬｙｓ６７Ａｒｇのアミノ酸置換；
Ｔｈｒ２Ｐｒｏ、Ｐｒｏ３Ａｒｇ、Ｇｌｕ４Ｇｌｙ、Ｌｙｓ７Ａｌａ、Ｇｌｕ９Ｖａｌ、Ｌｙｓ１３Ａｒｇ、Ｌｙｓ２２Ａｒｇ、Ｌｙｓ２９Ｉｌｅ、Ｌｙｓ３８Ａｒｇ、Ｌｙｓ４８Ａｒｇ、Ａｓｎ５０Ｔｙｒ、Ｇｌｕ５２Ａｓｎ、Ｔｙｒ５３ＰｈｅおよびＬｙｓ６７Ａｒｇのアミノ酸置換；
Ｇｌｕ４Ｇｌｙ、Ｌｙｓ７Ａｌａ、Ｌｙｓ１３Ａｒｇ、Ｌｙｓ２２Ａｒｇ、Ｇｌｕ２７Ｉｌｅ、Ｌｙｓ２９Ｉｌｅ、Ｌｙｓ３８Ａｒｇ、Ｌｙｓ４８Ａｒｇ、Ａｓｎ５０Ｔｙｒ、Ｇｌｕ５２Ａｓｐ、Ｔｙｒ５３ＰｈｅおよびＬｙｓ６７Ａｒｇのアミノ酸置換；
Ｇｌｕ４Ｇｌｙ、Ｌｙｓ７Ａｌａ、Ｌｙｓ１３Ａｒｇ、Ｌｙｓ２２Ａｒｇ、Ｌｙｓ２９Ｉｌｅ、Ｌｙｓ３８Ａｒｇ、Ａｓｎ４４Ｉｌｅ、Ｌｙｓ４８Ａｒｇ、Ａｓｎ５０Ｔｙｒ、Ｇｌｕ５２Ａｓｐ、Ｔｙｒ５３ＰｈｅおよびＬｙｓ６７Ａｒｇのアミノ酸置換；
Ｇｌｕ４Ｇｌｙ、Ｇｌｕ５Ｌｙｓ、Ｌｙｓ７Ａｌａ、Ｌｙｓ１３Ａｒｇ、Ｌｙｓ２２Ａｒｇ、Ｌｙｓ２９Ｉｌｅ、Ｌｙｓ３８Ａｒｇ、Ａｓｎ４４Ｉｌｅ、Ｌｙｓ４８Ａｒｇ、Ａｓｎ５０Ｔｙｒ、Ｇｌｕ５２Ａｓｐ、Ｔｙｒ５３ＰｈｅおよびＬｙｓ６７Ａｒｇのアミノ酸置換；
Ｐｒｏ３Ａｒｇ、Ｇｌｕ４Ｇｌｙ、Ｌｙｓ７Ａｌａ、Ｌｙｓ１３Ａｒｇ、Ｌｙｓ２２Ａｒｇ、Ｌｙｓ２９Ｉｌｅ、Ｌｙｓ３８Ａｒｇ、Ｌｙｓ４８Ａｒｇ、Ａｓｎ５０Ｔｙｒ、Ｇｌｕ５２Ａｓｐ、Ｔｙｒ５３ＰｈｅおよびＬｙｓ６７Ａｒｇのアミノ酸置換；
Ｇｌｕ４Ｇｌｙ、Ｇｌｕ５Ｌｙｓ、Ｌｙｓ７Ａｌａ、Ｌｙｓ１３Ａｒｇ、Ｌｙｓ２２Ａｒｇ、Ｌｙｓ２９Ｉｌｅ、Ｌｙｓ３８Ａｒｇ、Ｌｙｓ４８Ａｒｇ、Ａｓｎ５０Ｔｙｒ、Ｇｌｕ５２Ａｓｐ、Ｔｙｒ５３ＰｈｅおよびＬｙｓ６７Ａｒｇのアミノ酸置換；
Ｇｌｕ４Ｇｌｙ、Ｌｙｓ７Ａｌａ、Ｌｙｓ１３Ａｒｇ、Ｌｙｓ２２Ａｒｇ、Ｇｌｕ２７Ｖａｌ、Ｌｙｓ２９Ｉｌｅ、Ｌｙｓ３８Ａｒｇ、Ｌｙｓ４８Ａｒｇ、Ａｓｎ５０Ｔｙｒ、Ｇｌｕ５２Ａｓｐ、Ｔｙｒ５３ＰｈｅおよびＬｙｓ６７Ａｒｇのアミノ酸置換；
Ｇｌｕ４Ｇｌｙ、Ｇｌｕ５Ａｒｇ、Ｌｙｓ７Ａｌａ、Ｌｙｓ１３Ａｒｇ、Ｌｙｓ２２Ａｒｇ、Ｌｙｓ２９Ｉｌｅ、Ｌｙｓ３８Ａｒｇ、Ｌｙｓ４８Ａｒｇ、Ａｓｎ５０Ｔｙｒ、Ｇｌｕ５２Ａｓｐ、Ｔｙｒ５３ＰｈｅおよびＬｙｓ６７Ａｒｇのアミノ酸置換；
Ｇｌｕ４Ｇｌｙ、Ｌｙｓ７Ａｌａ、Ｌｙｓ１３Ａｒｇ、Ｌｙｓ２２Ａｒｇ、Ｇｌｕ２７Ａｒｇ、Ｌｙｓ２９Ｉｌｅ、Ｌｙｓ３８Ａｒｇ、Ｌｙｓ４８Ａｒｇ、Ａｓｎ５０Ｔｙｒ、Ｇｌｕ５２Ａｓｐ、Ｔｙｒ５３ＰｈｅおよびＬｙｓ６７Ａｒｇのアミノ酸置換；
Ｇｌｕ４Ｇｌｙ、Ｌｙｓ７Ａｌａ、Ｌｙｓ１３Ａｒｇ、Ｌｙｓ２２Ａｒｇ、Ｌｙｓ２９Ｉｌｅ、Ｌｙｓ３８Ａｒｇ、Ａｌａ４７Ａｒｇ、Ｌｙｓ４８Ａｒｇ、Ａｓｎ５０Ｔｙｒ、Ｇｌｕ５２Ａｓｐ、Ｔｙｒ５３ＰｈｅおよびＬｙｓ６７Ａｒｇのアミノ酸置換；
Ｇｌｕ４Ｇｌｙ、Ｌｙｓ７Ａｌａ、Ｌｙｓ１３Ａｒｇ、Ｌｙｓ２２Ａｒｇ、Ｌｙｓ２９Ｉｌｅ、Ｌｙｓ４８Ａｒｇ、Ａｓｎ５０Ｔｙｒ、Ｇｌｕ５２Ａｓｐ、Ｔｙｒ５３ＰｈｅおよびＬｙｓ６７Ａｒｇのアミノ酸置換；
Ｇｌｕ４Ｇｌｙ、Ｌｙｓ７Ａｌａ、Ｌｙｓ１３Ａｒｇ、Ｌｙｓ２２Ａｒｇ、Ｌｙｓ２９Ｉｌｅ、Ｌｙｓ３８Ｇｌｕ、Ｌｙｓ４８Ａｒｇ、Ａｓｎ５０Ｔｙｒ、Ｇｌｕ５２Ａｓｐ、Ｔｙｒ５３ＰｈｅおよびＬｙｓ６７Ａｒｇのアミノ酸置換；
Ｇｌｕ４Ｇｌｙ、Ｌｙｓ７Ａｌａ、Ｌｙｓ１３Ａｒｇ、Ｌｙｓ２２Ａｒｇ、Ｌｙｓ２９Ｉｌｅ、Ｌｙｓ４８Ａｒｇ、Ａｓｎ５０Ｔｙｒ、Ｇｌｕ５２Ａｓｐ、Ｔｙｒ５３Ｐｈｅ、Ｌｙｓ６７ＡｒｇおよびＡｌａ６９Ｖａｌのアミノ酸置換；
Ｇｌｕ４Ｇｌｙ、Ｌｙｓ７Ａｌａ、Ｌｙｓ１３Ａｒｇ、Ｌｙｓ２２Ａｒｇ、Ｌｙｓ２９Ｐｈｅ、Ｌｙｓ４８Ａｒｇ、Ａｓｎ５０Ｔｙｒ、Ｇｌｕ５２Ａｓｐ、Ｔｙｒ５３ＰｈｅおよびＬｙｓ６７Ａｒｇのアミノ酸置換；
Ｇｌｕ４Ｇｌｙ、Ｌｙｓ７Ａｌａ、Ｇｌｕ８Ｇｌｙ、Ｌｙｓ１３Ａｒｇ、Ｌｙｓ２２Ａｒｇ、Ｌｙｓ２９Ｉｌｅ、Ｇｌｕ３３Ｖａｌ、Ｌｙｓ４８Ａｒｇ、Ａｓｎ５０Ｔｙｒ、Ｇｌｕ５２Ａｓｐ、Ｔｙｒ５３ＰｈｅおよびＬｙｓ６７Ａｒｇのアミノ酸置換；
Ｇｌｕ４Ｇｌｙ、Ｌｙｓ７Ａｌａ、Ｌｙｓ１３Ａｒｇ、Ｌｙｓ２２Ａｒｇ、Ｉｌｅ２３Ａｒｇ、Ｌｙｓ２９Ｉｌｅ、Ｌｙｓ４８Ａｒｇ、Ａｓｎ５０Ｔｙｒ、Ｇｌｕ５２Ａｓｐ、Ｔｙｒ５３ＰｈｅおよびＬｙｓ６７Ａｒｇのアミノ酸置換；
Ｇｌｕ４Ｇｌｙ、Ｌｙｓ７Ａｌａ、Ｌｙｓ１３Ａｒｇ、Ｌｙｓ２２Ａｒｇ、Ｌｙｓ２９Ｉｌｅ、Ａｌａ４１Ｉｌｅ、Ｌｙｓ４８Ａｒｇ、Ａｓｎ５０Ｔｙｒ、Ｇｌｕ５２Ａｓｐ、Ｔｙｒ５３ＰｈｅおよびＬｙｓ６７Ａｒｇのアミノ酸置換；
Ｇｌｕ４Ｇｌｙ、Ｌｙｓ７Ａｌａ、Ｌｙｓ１３Ａｒｇ、Ｌｙｓ２２Ａｒｇ、Ｌｙｓ２９Ｉｌｅ、Ａｌａ４１Ｔｙｒ、Ｌｙｓ４８Ａｒｇ、Ａｓｎ５０Ｔｙｒ、Ｇｌｕ５２Ａｓｐ、Ｔｙｒ５３ＰｈｅおよびＬｙｓ６７Ａｒｇのアミノ酸置換；
Ｇｌｕ４Ｇｌｙ、Ｌｙｓ７Ａｌａ、Ｌｙｓ１３Ａｒｇ、Ｌｙｓ２２Ａｒｇ、Ｌｙｓ２９Ｉｌｅ、Ｌｙｓ４８Ａｒｇ、Ａｓｎ５０Ｔｙｒ、Ｇｌｕ５２Ｌｅｕ、Ｔｙｒ５３ＰｈｅおよびＬｙｓ６７Ａｒｇのアミノ酸置換；
Ｇｌｕ４Ｇｌｙ、Ｌｙｓ７Ａｌａ、Ｌｙｓ１３Ａｒｇ、Ｌｙｓ２２Ａｒｇ、Ｌｙｓ２９Ｉｌｅ、Ｌｙｓ４８Ａｒｇ、Ａｓｎ５０Ｔｙｒ、Ｇｌｕ５２Ｖａｌ、Ｔｙｒ５３ＰｈｅおよびＬｙｓ６７Ａｒｇのアミノ酸置換；
Ｇｌｕ４Ｇｌｙ、Ｌｙｓ７Ａｌａ、Ｌｙｓ１３Ａｒｇ、Ｌｙｓ２２Ａｒｇ、Ｌｙｓ２９Ｉｌｅ、Ｌｙｓ４８Ａｒｇ、Ａｓｎ５０Ｔｙｒ、Ｇｌｕ５２Ｖａｌ、Ｔｙｒ５３Ｐｈｅ、Ｌｙｓ６７ＡｒｇおよびＡｌａ６９Ｖａｌのアミノ酸置換；
Ｇｌｕ４Ｇｌｙ、Ｌｙｓ７Ａｌａ、Ｌｙｓ１３Ａｒｇ、Ｌｙｓ２２Ａｒｇ、Ｌｙｓ２９Ｉｌｅ、Ｌｙｓ３８Ｇｌｕ、Ｌｙｓ４８Ａｒｇ、Ａｓｎ５０Ｔｙｒ、Ｇｌｕ５２Ｖａｌ、Ｔｙｒ５３Ｐｈｅ、Ｌｙｓ６７ＡｒｇおよびＡｌａ６９Ｖａｌのアミノ酸置換；
Ｇｌｕ４Ｇｌｙ、Ｌｙｓ７Ａｌａ、Ｌｙｓ１３Ａｒｇ、Ｌｙｓ２２Ａｒｇ、Ｌｙｓ２９Ｉｌｅ、Ｌｙｓ４８Ａｒｇ、Ａｓｎ５０Ｔｙｒ、Ｇｌｕ５２Ｌｅｕ、Ｔｙｒ５３Ｐｈｅ、Ｌｙｓ６７ＡｒｇおよびＡｌａ６９Ｖａｌのアミノ酸置換；
Ｇｌｕ４Ｇｌｙ、Ｌｙｓ７Ａｌａ、Ｌｙｓ１３Ａｒｇ、Ｌｙｓ２２Ａｒｇ、Ｌｙｓ２９Ｉｌｅ、Ｌｙｓ４８Ａｒｇ、Ａｓｎ５０Ｔｙｒ、Ｔｙｒ５３Ｐｈｅ、Ｌｙｓ６７ＡｒｇおよびＡｌａ６９Ｖａｌのアミノ酸置換；
Ｇｌｕ４Ｇｌｙ、Ｌｙｓ７Ａｌａ、Ｌｙｓ１３Ａｒｇ、Ｌｙｓ２２Ａｒｇ、Ｌｙｓ２９Ｉｌｅ、Ｌｙｓ３８Ｇｌｕ、Ｌｙｓ４８Ａｒｇ、Ａｓｎ５０Ｔｙｒ、Ｔｙｒ５３Ｐｈｅ、Ｌｙｓ６７ＡｒｇおよびＡｌａ６９Ｖａｌのアミノ酸置換；
Ｐｒｏ３Ａｒｇ、Ｇｌｕ４Ｇｌｙ、Ｌｙｓ７Ａｌａ、Ｌｙｓ１３Ａｒｇ、Ｌｙｓ２２Ａｒｇ、Ｌｙｓ２９Ｉｌｅ、Ｌｙｓ４８Ａｒｇ、Ａｓｎ５０Ｔｙｒ、Ｔｙｒ５３Ｐｈｅ、Ｌｙｓ６７ＡｒｇおよびＡｌａ６９Ｖａｌのアミノ酸置換；
Ｐｒｏ３Ａｒｇ、Ｇｌｕ４Ｇｌｙ、Ｌｙｓ７Ａｌａ、Ｌｙｓ１３Ａｒｇ、Ｌｙｓ２２Ａｒｇ、Ｌｙｓ２９Ｉｌｅ、Ｌｙｓ３８Ａｒｇ、Ｌｙｓ４８Ａｒｇ、Ａｓｎ５０Ｔｙｒ、Ｔｙｒ５３Ｐｈｅ、Ｌｙｓ６７ＡｒｇおよびＡｌａ６９Ｖａｌのアミノ酸置換；
Ｐｒｏ３Ａｒｇ、Ｇｌｕ４Ｇｌｙ、Ｌｙｓ７Ａｌａ、Ｌｙｓ１３Ａｒｇ、Ｌｙｓ２２Ａｒｇ、Ｌｙｓ２９Ｉｌｅ、Ｌｙｓ４８Ａｒｇ、Ａｓｎ５０Ｔｙｒ、Ｔｙｒ５３Ｐｈｅ、Ｉｌｒ６６Ｖａｌ、Ｌｙｓ６７ＡｒｇおよびＡｌａ６９Ｖａｌのアミノ酸置換；
Ｐｒｏ３Ａｒｇ、Ｇｌｕ４Ｇｌｙ、Ｌｙｓ７Ａｌａ、Ｌｙｓ１３Ａｒｇ、Ｌｙｓ２２Ａｒｇ、Ｌｙｓ２９Ｉｌｅ、Ｔｈｒ３１Ｍｅｔ、Ｌｙｓ４８Ａｒｇ、Ａｓｎ５０Ｔｙｒ、Ｔｙｒ５３Ｐｈｅ、Ｌｙｓ６７ＡｒｇおよびＡｌａ６９Ｖａｌのアミノ酸置換；
Ｇｌｕ４Ｇｌｙ、Ｐｒｏ６Ｌｅｕ、Ｌｙｓ７Ａｌａ、Ｌｙｓ１３Ａｒｇ、Ｌｙｓ２２Ａｒｇ、Ｌｙｓ２９Ｉｌｅ、Ｌｙｓ４８Ａｒｇ、Ａｓｎ５０Ｔｙｒ、Ｔｙｒ５３Ｐｈｅ、Ｌｙｓ６７ＡｒｇおよびＡｌａ６９Ｖａｌのアミノ酸置換；
Ｇｌｕ４Ｇｌｙ、Ｌｙｓ７Ａｌａ、Ｌｙｓ１３Ａｒｇ、Ｌｙｓ２２Ａｒｇ、Ｌｙｓ２９Ｉｌｅ、Ａｌａ３５Ｔｈｒ、Ｌｙｓ４８Ａｒｇ、Ａｓｎ５０Ｔｙｒ、Ｔｙｒ５３Ｐｈｅ、Ｌｙｓ６７ＡｒｇおよびＡｌａ６９Ｖａｌのアミノ酸置換；
Ｇｌｕ４Ｇｌｙ、Ｌｙｓ７Ａｌａ、Ｌｙｓ１３Ａｒｇ、Ｌｙｓ２２Ａｒｇ、Ｌｙｓ２９Ｉｌｅ、Ｇｌｕ３３Ｇｌｙ、Ｌｙｓ４８Ａｒｇ、Ａｓｎ５０Ｔｙｒ、Ｔｙｒ５３Ｐｈｅ、Ｌｙｓ６７ＡｒｇおよびＡｌａ６９Ｖａｌのアミノ酸置換；
Ｇｌｕ４Ｇｌｙ、Ｇｌｕ５Ａｓｐ、Ｐｒｏ６Ｌｅｕ、Ｌｙｓ７Ａｌａ、Ｌｙｓ１３Ａｒｇ、Ｌｙｓ２２Ａｒｇ、Ｌｙｓ２９Ｉｌｅ、Ｌｙｓ４８Ａｒｇ、Ａｓｎ５０Ｔｙｒ、Ｔｙｒ５３Ｐｈｅ、Ｌｙｓ６７ＡｒｇおよびＡｌａ６９Ｖａｌのアミノ酸置換；
Ｇｌｕ４Ｇｌｙ、Ｌｙｓ７Ａｌａ、Ｌｙｓ１３Ａｒｇ、Ｌｙｓ２２Ａｒｇ、Ｌｙｓ２９Ｉｌｅ、Ｌｙｓ４８Ａｒｇ、Ａｓｎ５０Ｔｙｒ、Ｔｙｒ５３Ｐｈｅ、Ｌｙｓ６７ＡｒｇおよびＡｌａ６９Ｌｅｕのアミノ酸置換；
Ｇｌｕ４Ｇｌｙ、Ｌｙｓ７Ａｌａ、Ｌｙｓ１３Ａｒｇ、Ｌｙｓ２２Ａｒｇ、Ｌｙｓ２９Ｉｌｅ、Ａｌａ３７Ｔｈｒ、Ｌｙｓ４８Ａｒｇ、Ａｓｎ５０Ｔｙｒ、Ｔｙｒ５３Ｐｈｅ、Ｌｙｓ６７ＡｒｇおよびＡｌａ６９Ｖａｌのアミノ酸置換；
Ｇｌｕ４Ｇｌｙ、Ｌｙｓ７Ａｌａ、Ｌｙｓ１３Ａｒｇ、Ｌｙｓ２２Ａｒｇ、Ｌｙｓ２９Ｉｌｅ、Ｇｌｕ３３Ａｓｐ、Ｌｙｓ４８Ａｒｇ、Ａｓｎ５０Ｔｙｒ、Ｇｌｕ５２Ｇｌｙ、Ｔｙｒ５３Ｐｈｅ、Ｌｙｓ６７ＡｒｇおよびＡｌａ６９Ｖａｌのアミノ酸置換；
Ｔｈｒ２Ａｌａ、Ｇｌｕ４Ｇｌｙ、Ｌｙｓ７Ｐｒｏ、Ｌｙｓ１３Ａｒｇ、Ｌｙｓ２２Ａｒｇ、Ｌｙｓ２９Ｉｌｅ、Ｌｙｓ４８Ａｒｇ、Ａｓｎ５０Ｔｙｒ、Ｔｙｒ５３Ｐｈｅ、Ｌｙｓ６７ＡｒｇおよびＡｌａ６９Ｖａｌのアミノ酸置換；
Ｇｌｕ４Ｇｌｙ、Ｌｙｓ７Ａｌａ、Ｌｙｓ１３Ａｒｇ、Ｌｙｓ２２Ａｒｇ、Ｉｌｅ２３Ｖａｌ、Ｌｙｓ２９Ｉｌｅ、Ｌｙｓ４８Ａｒｇ、Ａｓｎ５０Ｔｙｒ、Ｔｙｒ５３Ｐｈｅ、Ｌｙｓ６７ＡｒｇおよびＡｌａ６９Ｖａｌのアミノ酸置換；
Ｇｌｕ４Ｇｌｙ、Ｐｒｏ６Ｔｈｒ、Ｌｙｓ７Ａｌａ、Ｌｙｓ１３Ａｒｇ、Ｌｙｓ２２Ａｒｇ、Ｌｙｓ２９Ｉｌｅ、Ｌｙｓ４８Ａｒｇ、Ａｓｎ５０Ｔｙｒ、Ｔｙｒ５３Ｐｈｅ、Ｌｙｓ６７ＡｒｇおよびＡｌａ６９Ｖａｌのアミノ酸置換；
Ｇｌｕ４Ｇｌｙ、Ｌｙｓ７Ａｌａ、Ｌｙｓ１３Ａｒｇ、Ｌｙｓ２２Ａｒｇ、Ｌｙｓ２９Ｉｌｅ、Ｔｈｒ３６Ｓｅｒ、Ｌｙｓ４８Ａｒｇ、Ａｓｎ５０Ｔｙｒ、Ｔｙｒ５３Ｐｈｅ、Ｌｙｓ６７ＡｒｇおよびＡｌａ６９Ｖａｌのアミノ酸置換；
Ｇｌｕ４Ｇｌｙ、Ｌｙｓ７Ａｌａ、Ｌｙｓ１３Ａｒｇ、Ｖａｌ１４Ａｌａ、Ｌｙｓ２２Ａｒｇ、Ｌｙｓ２９Ｉｌｅ、Ｌｙｓ４８Ａｒｇ、Ａｓｎ５０Ｔｙｒ、Ｔｙｒ５３Ｐｈｅ、Ｌｙｓ６７ＡｒｇおよびＡｌａ６９Ｖａｌのアミノ酸置換；
Ｇｌｕ４Ｇｌｙ、Ｌｙｓ７Ａｌａ、Ｌｙｓ１３Ａｒｇ、Ｇｌｙ２１Ａｒｇ、Ｌｙｓ２２Ａｒｇ、Ｌｙｓ２９Ｉｌｅ、Ｌｙｓ４８Ａｒｇ、Ａｓｎ５０Ｔｙｒ、Ｔｙｒ５３Ｐｈｅ、Ｌｙｓ６７ＡｒｇおよびＡｌａ６９Ｖａｌのアミノ酸置換；
Ｇｌｕ４Ｇｌｙ、Ｌｙｓ７Ａｌａ、Ｌｙｓ１３Ａｒｇ、Ｌｙｓ２２Ａｒｇ、Ｌｙｓ２９Ｉｌｅ、Ａｓｎ４４Ａｒｇ、Ｌｙｓ４８Ａｒｇ、Ａｓｎ５０Ｔｙｒ、Ｔｙｒ５３Ｐｈｅ、Ｌｙｓ６７ＡｒｇおよびＡｌａ６９Ｖａｌのアミノ酸置換；
Ｇｌｕ４Ｇｌｙ、Ｌｙｓ７Ａｌａ、Ｌｙｓ１３Ａｒｇ、Ｌｙｓ２２Ａｒｇ、Ｌｙｓ２９Ｉｌｅ、Ａｓｎ４４Ｈｉｓ、Ｌｙｓ４８Ａｒｇ、Ａｓｎ５０Ｔｙｒ、Ｔｙｒ５３Ｐｈｅ、Ｌｙｓ６７ＡｒｇおよびＡｌａ６９Ｖａｌのアミノ酸置換；
Ｇｌｕ４Ｇｌｙ、Ｌｙｓ７Ａｌａ、Ｌｙｓ１３Ａｒｇ、Ｌｙｓ２２Ａｒｇ、Ｌｙｓ２９Ｉｌｅ、Ｌｙｓ４８Ａｒｇ、Ａｓｎ５０Ｔｙｒ、Ｇｌｕ５２Ｔｙｒ、Ｔｙｒ５３Ｐｈｅ、Ｌｙｓ６７ＡｒｇおよびＡｌａ６９Ｖａｌのアミノ酸置換；
Ｇｌｕ４Ｇｌｙ、Ｌｙｓ７Ａｌａ、Ｌｙｓ１３Ａｒｇ、Ｌｙｓ２２Ａｒｇ、Ｌｙｓ２９Ｉｌｅ、Ｌｙｓ４８Ａｒｇ、Ａｓｎ５０Ｔｙｒ、Ｔｙｒ５３Ｐｈｅ、Ｇｌｙ６０Ａｒｇ、Ｌｙｓ６７ＡｒｇおよびＡｌａ６９Ｖａｌのアミノ酸置換；
Ｇｌｕ４Ｇｌｙ、Ｌｙｓ７Ａｌａ、Ｌｙｓ１３Ａｒｇ、Ｌｙｓ２２Ａｒｇ、Ｌｙｓ２９Ｉｌｅ、Ｌｙｓ４８Ａｒｇ、Ａｓｎ５０Ｔｙｒ、Ｔｙｒ５３Ｐｈｅ、Ｉｌｅ６４Ｌｅｕ、Ｌｙｓ６７ＡｒｇおよびＡｌａ６９Ｖａｌのアミノ酸置換；
があげられる。
　第２グループ変異を含むアミノ酸置換の組み合わせの別態様の具体例として、
Ｌｙｓ７Ｇｌｎ、Ｌｙｓ１３Ａｒｇ、Ｌｙｓ２２Ａｒｇ、Ｌｙｓ２９Ａｒｇ、Ｌｙｓ４８ＡｒｇおよびＬｙｓ６７Ａｒｇのアミノ酸置換；
Ｌｙｓ７Ａｒｇ、Ｌｙｓ１３Ｖａｌ、Ｌｙｓ２２Ａｒｇ、Ｌｙｓ２９Ａｒｇ、Ｌｙｓ４８ＡｒｇおよびＬｙｓ６７Ａｒｇのアミノ酸置換；
Ｌｙｓ７Ａｒｇ、Ｌｙｓ１３Ａｒｇ、Ｌｙｓ２２Ａｒｇ、Ｌｙｓ２９Ｖａｌ、Ｌｙｓ４８ＡｒｇおよびＬｙｓ６７Ａｒｇのアミノ酸置換；
Ｌｙｓ７Ａｒｇ、Ｌｙｓ１３Ａｒｇ、Ｌｙｓ２２Ａｒｇ、Ｌｙｓ２９Ｉｌｅ、Ｌｙｓ４８ＡｒｇおよびＬｙｓ６７Ａｒｇのアミノ酸置換；
Ｌｙｓ７Ａｌａ、Ｌｙｓ１３Ａｒｇ、Ｌｙｓ２９Ｉｌｅ、Ｌｙｓ３８Ａｒｇ、Ｌｙｓ４８ＡｒｇおよびＬｙｓ６７Ａｒｇのアミノ酸置換；
Ｌｙｓ７Ａｌａ、Ｌｙｓ１３Ａｒｇ、Ｌｙｓ２９Ｉｌｅ、Ｌｙｓ３８Ａｒｇ、Ｌｙｓ４８Ａｒｇ、Ａｓｎ５０Ｔｙｒ、Ｇｌｕ５２ＧｌｙおよびＬｙｓ６７Ａｒｇのアミノ酸置換；
Ｌｙｓ７Ａｌａ、Ｇｌｕ９Ｖａｌ、Ｌｙｓ２９Ｉｌｅ、Ｌｙｓ３８Ａｒｇ、Ｌｙｓ４８Ａｒｇ、Ａｓｎ５０Ｔｙｒ、Ｇｌｕ５２ＧｌｙおよびＬｙｓ６７Ａｒｇのアミノ酸置換；
Ｌｙｓ７Ａｌａ、Ｌｙｓ１３Ａｒｇ、Ｌｙｓ２２Ａｒｇ、Ｌｙｓ２９Ｉｌｅ、Ｌｙｓ３８Ａｒｇ、Ｌｙｓ４８Ａｒｇ、Ａｓｎ５０Ｔｙｒ、Ｇｌｕ５２ＧｌｙおよびＬｙｓ６７Ａｒｇのアミノ酸置換；
Ｌｙｓ７Ａｌａ、Ｌｙｓ１３Ａｒｇ、Ｌｙｓ２９Ｉｌｅ、Ｌｙｓ３８Ａｒｇ、Ｌｙｓ４８Ａｒｇ、Ａｓｎ５０Ｔｙｒ、Ｇｌｕ５２Ｇｌｙ、Ｔｙｒ５３ＰｈｅおよびＬｙｓ６７Ａｒｇのアミノ酸置換；
Ｌｙｓ７Ａｌａ、Ｌｙｓ１３Ａｒｇ、Ｌｙｓ２９Ｉｌｅ、Ｌｙｓ３８Ａｒｇ、Ｌｙｓ４８ｒｇ、Ａｓｎ５０Ｔｙｒ、Ｇｌｕ５２Ｇｌｙ、Ｔｈｒ５４ＭｅｔおよびＬｙｓ６７Ａｒｇのアミノ酸置換；
Ｌｙｓ７Ａｌａ、Ｌｙｓ１３Ａｒｇ、Ｌｙｓ２９Ｉｌｅ、Ｌｙｓ３８Ａｒｇ、Ｌｙｓ４８ｒｇ、Ａｓｎ５０Ｔｙｒ、Ｇｌｕ５２Ｇｌｙ、Ｌｙｓ６７ＡｒｇおよびＡｌａ６９Ｔｈｒのアミノ酸置換；
Ｌｙｓ７Ａｌａ、Ｌｙｓ１３Ａｒｇ、Ｌｙｓ２２Ａｒｇ、Ｌｙｓ２９Ｉｌｅ、Ｌｙｓ３８Ａｒｇ、Ｌｙｓ４８Ａｒｇ、Ａｓｎ５０Ｔｙｒ、Ｇｌｕ５２Ｇｌｙ、Ｔｙｒ５３ＰｈｅおよびＬｙｓ６７Ａｒｇのアミノ酸置換；
Ｇｌｕ１Ｖａｌ、Ｌｙｓ７Ａｌａ、Ｌｙｓ１３Ａｒｇ、Ｌｙｓ２２Ａｒｇ、Ｌｙｓ２９Ｉｌｅ、Ｌｙｓ３８Ａｒｇ、Ｌｙｓ４８Ａｒｇ、Ａｓｎ５０Ｔｙｒ、Ｇｌｕ５２Ｇｌｙ、Ｔｙｒ５３ＰｈｅおよびＬｙｓ６７Ａｒｇのアミノ酸置換；
Ｇｌｕ４Ｇｌｙ、Ｌｙｓ７Ａｌａ、Ｌｙｓ１３Ａｒｇ、Ｌｙｓ２２Ａｒｇ、Ｌｙｓ２９Ｉｌｅ、Ｌｙｓ３８Ａｒｇ、Ｌｙｓ４８Ａｒｇ、Ａｓｎ５０Ｔｙｒ、Ｇｌｕ５２Ｇｌｙ、Ｔｙｒ５３ＰｈｅおよびＬｙｓ６７Ａｒｇのアミノ酸置換；
Ｌｙｓ７Ｓｅｒ、Ｌｙｓ１３Ａｒｇ、Ｌｙｓ２２Ａｒｇ、Ｌｙｓ２９Ｉｌｅ、Ｌｙｓ３８Ａｒｇ、Ｌｙｓ４８Ａｒｇ、Ａｓｎ５０Ｔｙｒ、Ｇｌｕ５２Ｇｌｙ、Ｔｙｒ５３ＰｈｅおよびＬｙｓ６７Ａｒｇのアミノ酸置換；
Ｌｙｓ７Ａｌａ、Ｌｙｓ１３Ａｒｇ、Ｇｌｙ２１Ａｒｇ、Ｌｙｓ２２Ａｒｇ、Ｌｙｓ２９Ｉｌｅ、Ｌｙｓ３８Ａｒｇ、Ｌｙｓ４８Ａｒｇ、Ａｓｎ５０Ｔｙｒ、Ｇｌｕ５２Ｇｌｙ、Ｔｙｒ５３ＰｈｅおよびＬｙｓ６７Ａｒｇのアミノ酸置換；
Ｌｙｓ７Ａｌａ、Ｌｙｓ１３Ａｒｇ、Ｌｙｓ２２Ａｒｇ、Ｌｙｓ２９Ｉｌｅ、Ｌｙｓ３８Ａｒｇ、Ｌｙｓ４８Ａｒｇ、Ａｓｎ５０Ｔｙｒ、Ｇｌｕ５２Ａｓｐ、Ｔｙｒ５３ＰｈｅおよびＬｙｓ６７Ａｒｇのアミノ酸置換；
Ｇｌｕ４Ｇｌｙ、Ｌｙｓ７Ａｌａ、Ｌｙｓ１３Ａｒｇ、Ｌｙｓ２２Ａｒｇ、Ｌｙｓ２９Ｉｌｅ、Ｌｙｓ４８Ａｒｇ、Ａｓｎ５０Ｔｙｒ、Ｇｌｕ５２Ａｓｐ、Ｔｙｒ５３ＰｈｅおよびＬｙｓ６７Ａｒｇのアミノ酸置換；
Ｇｌｕ４Ｇｌｙ、Ｌｙｓ７Ａｌａ、Ｌｙｓ１３Ａｒｇ、Ｌｙｓ２２Ａｒｇ、Ｌｙｓ２９Ｉｌｅ、Ｌｙｓ３８Ｇｌｕ、Ｌｙｓ４８Ａｒｇ、Ａｓｎ５０Ｔｙｒ、Ｇｌｕ５２Ａｓｐ、Ｔｙｒ５３ＰｈｅおよびＬｙｓ６７Ａｒｇのアミノ酸置換；
Ｇｌｕ４Ｇｌｙ、Ｌｙｓ７Ａｌａ、Ｌｙｓ１３Ａｒｇ、Ｌｙｓ２２Ａｒｇ、Ｌｙｓ２９Ｉｌｅ、Ｌｙｓ４８Ａｒｇ、Ａｓｎ５０Ｔｙｒ、Ｇｌｕ５２Ａｓｐ、Ｔｙｒ５３Ｐｈｅ、Ｌｙｓ６７ＡｒｇおよびＡｌａ６９Ｖａｌのアミノ酸置換；
Ｇｌｕ４Ｇｌｙ、Ｌｙｓ７Ａｌａ、Ｇｌｕ８Ｇｌｙ、Ｌｙｓ１３Ａｒｇ、Ｌｙｓ２２Ａｒｇ、Ｌｙｓ２９Ｉｌｅ、Ｇｌｕ３３Ｖａｌ、Ｌｙｓ４８Ａｒｇ、Ａｓｎ５０Ｔｙｒ、Ｇｌｕ５２Ａｓｐ、Ｔｙｒ５３ＰｈｅおよびＬｙｓ６７Ａｒｇのアミノ酸置換；
Ｇｌｕ４Ｇｌｙ、Ｌｙｓ７Ａｌａ、Ｌｙｓ１３Ａｒｇ、Ｌｙｓ２２Ａｒｇ、Ｉｌｅ２３Ａｒｇ、Ｌｙｓ２９Ｉｌｅ、Ｌｙｓ４８Ａｒｇ、Ａｓｎ５０Ｔｙｒ、Ｇｌｕ５２Ａｓｐ、Ｔｙｒ５３ＰｈｅおよびＬｙｓ６７Ａｒｇのアミノ酸置換；
Ｇｌｕ４Ｇｌｙ、Ｌｙｓ７Ａｌａ、Ｌｙｓ１３Ａｒｇ、Ｌｙｓ２２Ａｒｇ、Ｌｙｓ２９Ｉｌｅ、Ａｌａ４１Ｉｌｅ、Ｌｙｓ４８Ａｒｇ、Ａｓｎ５０Ｔｙｒ、Ｇｌｕ５２Ａｓｐ、Ｔｙｒ５３ＰｈｅおよびＬｙｓ６７Ａｒｇのアミノ酸置換；
Ｇｌｕ４Ｇｌｙ、Ｌｙｓ７Ａｌａ、Ｌｙｓ１３Ａｒｇ、Ｌｙｓ２２Ａｒｇ、Ｌｙｓ２９Ｉｌｅ、Ａｌａ４１Ｔｙｒ、Ｌｙｓ４８Ａｒｇ、Ａｓｎ５０Ｔｙｒ、Ｇｌｕ５２Ａｓｐ、Ｔｙｒ５３ＰｈｅおよびＬｙｓ６７Ａｒｇのアミノ酸置換；
Ｇｌｕ４Ｇｌｙ、Ｌｙｓ７Ａｌａ、Ｌｙｓ１３Ａｒｇ、Ｌｙｓ２２Ａｒｇ、Ｌｙｓ２９Ｉｌｅ、Ｌｙｓ４８Ａｒｇ、Ａｓｎ５０Ｔｙｒ、Ｇｌｕ５２Ｌｅｕ、Ｔｙｒ５３ＰｈｅおよびＬｙｓ６７Ａｒｇのアミノ酸置換；
Ｇｌｕ４Ｇｌｙ、Ｌｙｓ７Ａｌａ、Ｌｙｓ１３Ａｒｇ、Ｌｙｓ２２Ａｒｇ、Ｌｙｓ２９Ｉｌｅ、Ｌｙｓ４８Ａｒｇ、Ａｓｎ５０Ｔｙｒ、Ｇｌｕ５２Ｖａｌ、Ｔｙｒ５３ＰｈｅおよびＬｙｓ６７Ａｒｇのアミノ酸置換；
Ｇｌｕ４Ｇｌｙ、Ｐｒｏ６Ａｌａ、Ｌｙｓ７Ａｌａ、Ｌｙｓ１３Ａｒｇ、Ｌｙｓ２２Ａｒｇ、Ｌｙｓ２９Ｉｌｅ、Ｌｙｓ４８Ａｒｇ、Ａｓｎ５０Ｔｙｒ、Ｇｌｕ５２Ａｓｐ、Ｔｙｒ５３ＰｈｅおよびＬｙｓ６７Ａｒｇのアミノ酸置換；
Ｇｌｕ４Ｇｌｙ、Ｌｙｓ７Ａｌａ、Ｇｌｕ８Ｇｌｙ、Ｌｙｓ１３Ａｒｇ、Ｌｙｓ２２Ａｒｇ、Ｌｙｓ２９Ｉｌｅ、Ｌｙｓ４８Ａｒｇ、Ａｓｎ５０Ｔｙｒ、Ｇｌｕ５２Ａｓｐ、Ｔｙｒ５３ＰｈｅおよびＬｙｓ６７Ａｒｇのアミノ酸置換；
Ｇｌｕ４Ｇｌｙ、Ｌｙｓ７Ａｌａ、Ｇｌｕ８Ａｒｇ、Ｌｙｓ１３Ａｒｇ、Ｌｙｓ２２Ａｒｇ、Ｌｙｓ２９Ｉｌｅ、Ｌｙｓ４８Ａｒｇ、Ａｓｎ５０Ｔｙｒ、Ｇｌｕ５２Ａｓｐ、Ｔｙｒ５３ＰｈｅおよびＬｙｓ６７Ａｒｇのアミノ酸置換；
Ｇｌｕ４Ｇｌｙ、Ｌｙｓ７Ａｌａ、Ｌｙｓ１３Ａｒｇ、Ｇｌｙ２１Ａｒｇ、Ｌｙｓ２２Ａｒｇ、Ｌｙｓ２９Ｉｌｅ、Ｌｙｓ４８Ａｒｇ、Ａｓｎ５０Ｔｙｒ、Ｇｌｕ５２Ａｓｐ、Ｔｙｒ５３ＰｈｅおよびＬｙｓ６７Ａｒｇのアミノ酸置換；
Ｇｌｕ４Ｇｌｙ、Ｌｙｓ７Ａｌａ、Ｌｙｓ１３Ａｒｇ、Ｌｙｓ２２Ａｒｇ、Ｉｌｅ２３Ｐｈｅ、Ｌｙｓ２９Ｉｌｅ、Ｌｙｓ４８Ａｒｇ、Ａｓｎ５０Ｔｙｒ、Ｇｌｕ５２Ａｓｐ、Ｔｙｒ５３ＰｈｅおよびＬｙｓ６７Ａｒｇのアミノ酸置換；
Ｇｌｕ４Ｇｌｙ、Ｌｙｓ７Ａｌａ、Ｌｙｓ１３Ａｒｇ、Ｌｙｓ２２Ａｒｇ、Ｉｌｅ２３Ｌｅｕ、Ｌｙｓ２９Ｉｌｅ、Ｌｙｓ４８Ａｒｇ、Ａｓｎ５０Ｔｙｒ、Ｇｌｕ５２Ａｓｐ、Ｔｙｒ５３ＰｈｅおよびＬｙｓ６７Ａｒｇのアミノ酸置換；
Ｇｌｕ４Ｇｌｙ、Ｌｙｓ７Ａｌａ、Ｌｙｓ１３Ａｒｇ、Ｌｙｓ２２Ａｒｇ、Ｌｙｓ２９Ｉｌｅ、Ｇｌｕ３３Ｖａｌ、Ｌｙｓ４８Ａｒｇ、Ａｓｎ５０Ｔｙｒ、Ｇｌｕ５２Ａｓｐ、Ｔｙｒ５３ＰｈｅおよびＬｙｓ６７Ａｒｇのアミノ酸置換；
Ｇｌｕ４Ｇｌｙ、Ｌｙｓ７Ａｌａ、Ｌｙｓ１３Ａｒｇ、Ｌｙｓ２２Ａｒｇ、Ｌｙｓ２９Ｉｌｅ、Ｌｙｓ３８Ｈｉｓ、Ｌｙｓ４８Ａｒｇ、Ａｓｎ５０Ｔｙｒ、Ｇｌｕ５２Ａｓｐ、Ｔｙｒ５３ＰｈｅおよびＬｙｓ６７Ａｒｇのアミノ酸置換；
Ｇｌｕ４Ｇｌｙ、Ｌｙｓ７Ａｌａ、Ｌｙｓ１３Ａｒｇ、Ｌｙｓ２２Ａｒｇ、Ｌｙｓ２９Ｉｌｅ、Ｌｙｓ３８Ｌｅｕ、Ｌｙｓ４８Ａｒｇ、Ａｓｎ５０Ｔｙｒ、Ｇｌｕ５２Ａｓｐ、Ｔｙｒ５３ＰｈｅおよびＬｙｓ６７Ａｒｇのアミノ酸置換；
Ｇｌｕ４Ｇｌｙ、Ｌｙｓ７Ａｌａ、Ｌｙｓ１３Ａｒｇ、Ｌｙｓ２２Ａｒｇ、Ｌｙｓ２９Ｉｌｅ、Ａｓｎ４４Ｈｉｓ、Ｌｙｓ４８Ａｒｇ、Ａｓｎ５０Ｔｙｒ、Ｇｌｕ５２Ａｓｐ、Ｔｙｒ５３ＰｈｅおよびＬｙｓ６７Ａｒｇのアミノ酸置換；
Ｇｌｕ４Ｇｌｙ、Ｌｙｓ７Ａｌａ、Ｌｙｓ１３Ａｒｇ、Ｌｙｓ２２Ａｒｇ、Ｌｙｓ２９Ｉｌｅ、Ａｓｎ４４Ａｒｇ、Ｌｙｓ４８Ａｒｇ、Ａｓｎ５０Ｔｙｒ、Ｇｌｕ５２Ａｓｐ、Ｔｙｒ５３ＰｈｅおよびＬｙｓ６７Ａｒｇのアミノ酸置換；
Ｇｌｕ４Ｇｌｙ、Ｌｙｓ７Ａｌａ、Ｌｙｓ１３Ａｒｇ、Ｌｙｓ２２Ａｒｇ、Ｌｙｓ２９Ｉｌｅ、Ａｓｎ４４Ｈｉｓ、Ｌｙｓ４８Ａｒｇ、Ａｓｎ５０Ｔｙｒ、Ｇｌｕ５２Ａｓｐ、Ｔｙｒ５３ＰｈｅおよびＬｙｓ６７Ａｒｇのアミノ酸置換；
Ｇｌｕ４Ｇｌｙ、Ｌｙｓ７Ａｌａ、Ｌｙｓ１３Ａｒｇ、Ｌｙｓ２２Ａｒｇ、Ｌｙｓ２９Ｉｌｅ、Ｌｙｓ４８Ａｒｇ、Ａｓｎ５０Ｍｅｔ、Ｇｌｕ５２Ａｓｐ、Ｔｙｒ５３ＰｈｅおよびＬｙｓ６７Ａｒｇのアミノ酸置換；
Ｇｌｕ４Ｇｌｙ、Ｌｙｓ７Ａｌａ、Ｌｙｓ１３Ａｒｇ、Ｌｙｓ２２Ａｒｇ、Ｌｙｓ２９Ｉｌｅ、Ｌｙｓ４８Ａｒｇ、Ａｓｎ５０Ｔｙｒ、Ｇｌｕ５２Ｔｙｒ、Ｔｙｒ５３ＰｈｅおよびＬｙｓ６７Ａｒｇのアミノ酸置換；
Ｇｌｕ４Ｇｌｙ、Ｌｙｓ７Ａｌａ、Ｌｙｓ１３Ａｒｇ、Ｌｙｓ２２Ａｒｇ、Ｌｙｓ２９Ｉｌｅ、Ｌｙｓ４８Ａｒｇ、Ａｓｎ５０Ｔｙｒ、Ｇｌｕ５２Ａｓｐ、Ｔｙｒ５３ＳｅｒおよびＬｙｓ６７Ａｒｇのアミノ酸置換；
Ｇｌｕ４Ｇｌｙ、Ｌｙｓ７Ａｌａ、Ｌｙｓ１３Ａｒｇ、Ｌｙｓ２２Ａｒｇ、Ｌｙｓ２９Ｉｌｅ、Ｌｙｓ４８Ａｒｇ、Ａｓｎ５０Ｔｙｒ、Ｇｌｕ５２Ｖａｌ、Ｔｙｒ５３Ｐｈｅ、Ｌｙｓ６７ＡｒｇおよびＡｌａ６９Ｖａｌのアミノ酸置換；
Ｇｌｕ４Ｇｌｙ、Ｌｙｓ７Ａｌａ、Ｌｙｓ１３Ａｒｇ、Ｌｙｓ２２Ａｒｇ、Ｌｙｓ２９Ｉｌｅ、Ｌｙｓ３８Ｇｌｕ、Ｌｙｓ４８Ａｒｇ、Ａｓｎ５０Ｔｙｒ、Ｇｌｕ５２Ｖａｌ、Ｔｙｒ５３Ｐｈｅ、Ｌｙｓ６７ＡｒｇおよびＡｌａ６９Ｖａｌのアミノ酸置換；
Ｇｌｕ４Ｇｌｙ、Ｌｙｓ７Ａｌａ、Ｌｙｓ１３Ａｒｇ、Ｌｙｓ２２Ａｒｇ、Ｌｙｓ２９Ｉｌｅ、Ｌｙｓ４８Ａｒｇ、Ａｓｎ５０Ｔｙｒ、Ｇｌｕ５２Ｌｅｕ、Ｔｙｒ５３Ｐｈｅ、Ｌｙｓ６７ＡｒｇおよびＡｌａ６９Ｖａｌのアミノ酸置換；
Ｇｌｕ４Ｇｌｙ、Ｌｙｓ７Ａｌａ、Ｌｙｓ１３Ａｒｇ、Ｌｙｓ２２Ａｒｇ、Ｌｙｓ２９Ｉｌｅ、Ｌｙｓ４８Ａｒｇ、Ａｓｎ５０Ｔｙｒ、Ｔｙｒ５３Ｐｈｅ、Ｌｙｓ６７ＡｒｇおよびＡｌａ６９Ｖａｌのアミノ酸置換；
Ｇｌｕ４Ｇｌｙ、Ｌｙｓ７Ａｌａ、Ｌｙｓ１３Ａｒｇ、Ｌｙｓ２２Ａｒｇ、Ｌｙｓ２９Ｉｌｅ、Ｌｙｓ３８Ｇｌｕ、Ｌｙｓ４８Ａｒｇ、Ａｓｎ５０Ｔｙｒ、Ｔｙｒ５３Ｐｈｅ、Ｌｙｓ６７ＡｒｇおよびＡｌａ６９Ｖａｌのアミノ酸置換；
Ｇｌｕ４Ｇｌｙ、Ｌｙｓ７Ａｌａ、Ｌｙｓ１３Ａｒｇ、Ｖａｌ１４Ａｌａ、Ｌｙｓ２２Ａｒｇ、Ｌｙｓ２９Ｉｌｅ、Ｌｙｓ４８Ａｒｇ、Ａｓｎ５０Ｔｙｒ、Ｔｙｒ５３Ｐｈｅ、Ｌｙｓ６７ＡｒｇおよびＡｌａ６９Ｖａｌのアミノ酸置換；
Ｇｌｕ４Ｇｌｙ、Ｌｙｓ７Ａｌａ、Ｌｙｓ１３Ａｒｇ、Ｇｌｙ２１Ａｒｇ、Ｌｙｓ２２Ａｒｇ、Ｌｙｓ２９Ｉｌｅ、Ｌｙｓ４８Ａｒｇ、Ａｓｎ５０Ｔｙｒ、Ｔｙｒ５３Ｐｈｅ、Ｌｙｓ６７ＡｒｇおよびＡｌａ６９Ｖａｌのアミノ酸置換；
Ｇｌｕ４Ｇｌｙ、Ｌｙｓ７Ａｌａ、Ｌｙｓ１３Ａｒｇ、Ｌｙｓ２２Ａｒｇ、Ｌｙｓ２９Ｉｌｅ、Ａｓｎ４４Ａｒｇ、Ｌｙｓ４８Ａｒｇ、Ａｓｎ５０Ｔｙｒ、Ｔｙｒ５３Ｐｈｅ、Ｌｙｓ６７ＡｒｇおよびＡｌａ６９Ｖａｌのアミノ酸置換；
Ｇｌｕ４Ｇｌｙ、Ｌｙｓ７Ａｌａ、Ｌｙｓ１３Ａｒｇ、Ｌｙｓ２２Ａｒｇ、Ｌｙｓ２９Ｉｌｅ、Ａｓｎ４４Ｈｉｓ、Ｌｙｓ４８Ａｒｇ、Ａｓｎ５０Ｔｙｒ、Ｔｙｒ５３Ｐｈｅ、Ｌｙｓ６７ＡｒｇおよびＡｌａ６９Ｖａｌのアミノ酸置換；
Ｇｌｕ４Ｇｌｙ、Ｌｙｓ７Ａｌａ、Ｌｙｓ１３Ａｒｇ、Ｌｙｓ２２Ａｒｇ、Ｌｙｓ２９Ｉｌｅ、Ｌｙｓ４８Ａｒｇ、Ａｓｎ５０Ｔｙｒ、Ｇｌｕ５２Ｔｙｒ、Ｔｙｒ５３Ｐｈｅ、Ｌｙｓ６７ＡｒｇおよびＡｌａ６９Ｖａｌのアミノ酸置換；
Ｇｌｕ４Ｇｌｙ、Ｌｙｓ７Ａｌａ、Ｌｙｓ１３Ａｒｇ、Ｌｙｓ２２Ａｒｇ、Ｌｙｓ２９Ｉｌｅ、Ｌｙｓ４８Ａｒｇ、Ａｓｎ５０Ｔｙｒ、Ｔｙｒ５３Ｐｈｅ、Ｇｌｙ６０Ａｒｇ、Ｌｙｓ６７ＡｒｇおよびＡｌａ６９Ｖａｌのアミノ酸置換；
Ｇｌｕ４Ｇｌｙ、Ｌｙｓ７Ａｌａ、Ｌｙｓ１３Ａｒｇ、Ｌｙｓ２２Ａｒｇ、Ｌｙｓ２９Ｉｌｅ、Ｌｙｓ４８Ａｒｇ、Ａｓｎ５０Ｔｙｒ、Ｔｙｒ５３Ｐｈｅ、Ｉｌｅ６４Ｌｅｕ、Ｌｙｓ６７ＡｒｇおよびＡｌａ６９Ｖａｌのアミノ酸置換；
Ｇｌｕ４Ｇｌｙ、Ｌｙｓ７Ａｌａ、Ｌｙｓ１３Ａｒｇ、Ｌｙｓ２２Ａｒｇ、Ｉｌｅ２３Ａｒｇ、Ｌｙｓ２９Ｉｌｅ、Ａｓｎ４４Ａｒｇ、Ｌｙｓ４８Ａｒｇ、Ａｓｎ５０Ｔｙｒ、Ｔｙｒ５３Ｐｈｅ、Ｌｙｓ６７ＡｒｇおよびＡｌａ６９Ｖａｌのアミノ酸置換；
Ｇｌｕ４Ｇｌｙ、Ｌｙｓ７Ａｌａ、Ｌｙｓ１３Ａｒｇ、Ｌｙｓ２２Ａｒｇ、Ｉｌｅ２３Ａｒｇ、Ｌｙｓ２９Ｉｌｅ、Ａｓｎ４４Ｈｉｓ、Ｌｙｓ４８Ａｒｇ、Ａｓｎ５０Ｔｙｒ、Ｔｙｒ５３Ｐｈｅ、Ｌｙｓ６７ＡｒｇおよびＡｌａ６９Ｖａｌのアミノ酸置換；
Ｇｌｕ４Ｇｌｙ、Ｌｙｓ７Ａｌａ、Ｌｙｓ１３Ａｒｇ、Ｌｙｓ２２Ａｒｇ、Ｉｌｅ２３Ａｒｇ、Ｌｙｓ２９Ｉｌｅ、Ｌｙｓ４８Ａｒｇ、Ａｓｎ５０Ｔｙｒ、Ｔｙｒ５３Ｐｈｅ、Ｉｌｅ６４Ｌｅｕ、Ｌｙｓ６７ＡｒｇおよびＡｌａ６９Ｖａｌのアミノ酸置換；
Ｇｌｕ４Ｇｌｙ、Ｌｙｓ７Ａｌａ、Ｌｙｓ１３Ａｒｇ、Ｌｙｓ２２Ａｒｇ、Ｌｙｓ２９Ｉｌｅ、Ａｓｎ４４Ａｒｇ、Ｌｙｓ４８Ａｒｇ、Ａｓｎ５０Ｔｙｒ、Ｔｙｒ５３Ｐｈｅ、Ｉｌｅ６４Ｌｅｕ、Ｌｙｓ６７ＡｒｇおよびＡｌａ６９Ｖａｌのアミノ酸置換；
Ｇｌｕ４Ｇｌｙ、Ｌｙｓ７Ａｌａ、Ｌｙｓ１３Ａｒｇ、Ｌｙｓ２２Ａｒｇ、Ｌｙｓ２９Ｉｌｅ、Ａｓｎ４４Ｈｉｓ、Ｌｙｓ４８Ａｒｇ、Ａｓｎ５０Ｔｙｒ、Ｔｙｒ５３Ｐｈｅ、ＩＩｌｅ６４Ｌｅｕ、Ｌｙｓ６７ＡｒｇおよびＡｌａ６９Ｖａｌのアミノ酸置換；
Ｇｌｕ４Ｇｌｙ、Ｌｙｓ７Ａｌａ、Ｌｙｓ１３Ａｒｇ、Ｌｙｓ２２Ａｒｇ、Ｉｌｅ２３Ａｒｇ、Ｌｙｓ２９Ｉｌｅ、Ａｓｎ４４Ａｒｇ、Ｌｙｓ４８Ｈｉｓ、Ａｓｎ５０Ｔｙｒ、Ｔｙｒ５３Ｐｈｅ、Ｉｌｅ６４Ｌｅｕ、Ｌｙｓ６７ＡｒｇおよびＡｌａ６９Ｖａｌのアミノ酸置換；
Ｇｌｕ４Ｇｌｙ、Ｌｙｓ７Ａｌａ、Ｌｙｓ１３Ａｒｇ、Ｌｙｓ２２Ａｒｇ、Ｌｙｓ２９Ｉｌｅ、Ａｓｎ４４Ｈｉｓ、Ｌｙｓ４８Ｈｉｓ、Ａｓｎ５０Ｔｙｒ、Ｔｙｒ５３Ｐｈｅ、Ｉｌｅ６４Ｌｅｕ、Ｌｙｓ６７ＡｒｇおよびＡｌａ６９Ｖａｌのアミノ酸置換；
Ｇｌｕ４Ｇｌｙ、Ｌｙｓ７Ａｌａ、Ｌｙｓ１３Ａｒｇ、Ａｓｎ１５Ｖａｌ、Ｌｙｓ２２Ａｒｇ、Ｌｙｓ２９Ｉｌｅ、Ｌｙｓ４８Ａｒｇ、Ａｓｎ５０Ｔｙｒ、Ｇｌｕ５２Ａｓｐ、Ｔｙｒ５３ＰｈｅおよびＬｙｓ６７Ａｒｇのアミノ酸置換；
Ｇｌｕ４Ｇｌｙ、Ｌｙｓ７Ａｌａ、Ｌｙｓ１３Ａｒｇ、Ｌｙｓ２２Ａｒｇ、Ｌｙｓ２９Ｉｌｅ、Ｇｌｕ３４Ａｓｐ、Ｌｙｓ４８Ａｒｇ、Ａｓｎ５０Ｔｙｒ、Ｇｌｕ５２Ａｓｐ、Ｔｙｒ５３ＰｈｅおよびＬｙｓ６７Ａｒｇのアミノ酸置換；
Ｇｌｕ４Ｇｌｙ、Ｌｙｓ７Ａｌａ、Ｌｙｓ１３Ａｒｇ、Ｌｙｓ２２Ａｒｇ、Ｌｙｓ２９Ｉｌｅ、Ｇｌｕ３４Ｐｈｅ、Ｌｙｓ４８Ａｒｇ、Ａｓｎ５０Ｔｙｒ、Ｇｌｕ５２Ａｓｐ、Ｔｙｒ５３ＰｈｅおよびＬｙｓ６７Ａｒｇのアミノ酸置換；
Ｇｌｕ４Ｇｌｙ、Ｌｙｓ７Ａｌａ、Ｌｙｓ１３Ａｒｇ、Ｌｙｓ２２Ａｒｇ、Ｌｙｓ２９Ｉｌｅ、Ｇｌｕ３４Ｌｅｕ、Ｌｙｓ４８Ａｒｇ、Ａｓｎ５０Ｔｙｒ、Ｇｌｕ５２Ａｓｐ、Ｔｙｒ５３ＰｈｅおよびＬｙｓ６７Ａｒｇのアミノ酸置換；
Ｇｌｕ４Ｇｌｙ、Ｌｙｓ７Ａｌａ、Ｌｙｓ１３Ａｒｇ、Ｌｙｓ２２Ａｒｇ、Ｌｙｓ２９Ｉｌｅ、Ｇｌｕ３４Ｖａｌ、Ｌｙｓ４８Ａｒｇ、Ａｓｎ５０Ｔｙｒ、Ｇｌｕ５２Ａｓｐ、Ｔｙｒ５３ＰｈｅおよびＬｙｓ６７Ａｒｇのアミノ酸置換；
があげられる。
　アミノ酸置換の組み合わせの別態様の具体例として、特に
Ｌｙｓ７Ａｌａ、Ｌｙｓ１３Ａｒｇ、Ｌｙｓ２２Ｇｌｎ、Ｌｙｓ２９Ｉｌｅ、Ｌｙｓ３８Ａｒｇ、Ｌｙｓ４８Ａｒｇ、Ａｓｎ５０Ｔｙｒ、Ｇｌｕ５２ＧｌｙおよびＬｙｓ６７Ａｒｇのアミノ酸置換；
Ｌｙｓ７Ａｌａ、Ｌｙｓ１３Ａｒｇ、Ｌｙｓ２２Ａｒｇ、Ｌｙｓ２９Ｉｌｅ、Ｌｙｓ３８Ａｒｇ、Ｌｙｓ４８Ａｒｇ、Ａｓｎ５０Ｔｙｒ、Ｇｌｕ５２Ｇｌｙ、Ｔｙｒ５３ＰｈｅおよびＬｙｓ６７Ａｒｇのアミノ酸置換；
Ｇｌｕ４Ｇｌｙ、Ｌｙｓ７Ａｌａ、Ｌｙｓ１３Ａｒｇ、Ｌｙｓ２２Ａｒｇ、Ｌｙｓ２９Ｉｌｅ、Ｌｙｓ３８Ａｒｇ、Ｌｙｓ４８Ａｒｇ、Ａｓｎ５０Ｔｙｒ、Ｇｌｕ５２Ａｓｐ、Ｔｙｒ５３ＰｈｅおよびＬｙｓ６７Ａｒｇのアミノ酸置換；
Ｇｌｕ４Ｇｌｙ、Ｌｙｓ７Ａｌａ、Ｌｙｓ１３Ａｒｇ、Ｌｙｓ２２Ａｒｇ、Ｇｌｕ２７Ａｒｇ、Ｌｙｓ２９Ｉｌｅ、Ｌｙｓ３８Ａｒｇ、Ｌｙｓ４８Ａｒｇ、Ａｓｎ５０Ｔｙｒ、Ｇｌｕ５２Ａｓｐ、Ｔｙｒ５３ＰｈｅおよびＬｙｓ６７Ａｒｇのアミノ酸置換；
Ｇｌｕ４Ｇｌｙ、Ｌｙｓ７Ａｌａ、Ｌｙｓ１３Ａｒｇ、Ｌｙｓ２２Ａｒｇ、Ｌｙｓ２９Ｉｌｅ、Ｌｙｓ３８Ｇｌｕ、Ｌｙｓ４８Ａｒｇ、Ａｓｎ５０Ｔｙｒ、Ｇｌｕ５２Ａｓｐ、Ｔｙｒ５３ＰｈｅおよびＬｙｓ６７Ａｒｇのアミノ酸置換；
Ｇｌｕ４Ｇｌｙ、Ｌｙｓ７Ａｌａ、Ｌｙｓ１３Ａｒｇ、Ｌｙｓ２２Ａｒｇ、Ｌｙｓ２９Ｉｌｅ、Ｌｙｓ３８Ｇｌｕ、Ｌｙｓ４８Ａｒｇ、Ａｓｎ５０Ｔｙｒ、Ｇｌｕ５２Ｖａｌ、Ｔｙｒ５３Ｐｈｅ、Ｌｙｓ６７ＡｒｇおよびＡｌａ６９Ｖａｌのアミノ酸置換；
Ｇｌｕ４Ｇｌｙ、Ｌｙｓ７Ａｌａ、Ｌｙｓ１３Ａｒｇ、Ｌｙｓ２２Ａｒｇ、Ｌｙｓ２９Ｉｌｅ、Ｌｙｓ３８Ｇｌｕ、Ｌｙｓ４８Ａｒｇ、Ａｓｎ５０Ｔｙｒ、Ｔｙｒ５３Ｐｈｅ、Ｌｙｓ６７ＡｒｇおよびＡｌａ６９Ｖａｌのアミノ酸置換；
Ｇｌｕ４Ｇｌｙ、Ｌｙｓ７Ａｌａ、Ｌｙｓ１３Ａｒｇ、Ｌｙｓ２２Ａｒｇ、Ｉｌｅ２３Ａｒｇ、Ｌｙｓ２９Ｉｌｅ、Ｌｙｓ３８Ｇｌｕ、Ａｓｎ４４Ａｒｇ、Ｌｙｓ４８Ａｒｇ、Ａｓｎ５０Ｔｙｒ、Ｔｙｒ５３Ｐｈｅ、Ｌｙｓ６７ＡｒｇおよびＡｌａ６９Ｖａｌのアミノ酸置換；
Ｇｌｕ４Ｇｌｙ、Ｌｙｓ７Ａｌａ、Ｌｙｓ１３Ａｒｇ、Ｌｙｓ２２Ａｒｇ、Ｉｌｅ２３Ａｒｇ、Ｌｙｓ２９Ｉｌｅ、Ｌｙｓ３８Ｇｌｕ、Ａｓｎ４４Ａｒｇ、Ｌｙｓ４８Ｈｉｓ、Ａｓｎ５０Ｔｙｒ、Ｔｙｒ５３Ｐｈｅ、Ｉｌｅ６４Ｌｅｕ、Ｌｙｓ６７ＡｒｇおよびＡｌａ６９Ｖａｌのアミノ酸置換；
があげられる。
　なお、本発明のタンパク質は、少なくとも１つのその他のアミノ酸置換をさらに有してもよい。他のアミノ酸置換としては、Ｇｌｕ４９Ａｓｐ、Ｐｒｏ６Ｓｅｒ、Ａｓｎ４４Ａｓｐ、Ｇｌｕ４９Ｖａｌ、Ａｓｎ６２Ｔｙｒ、Ｉｌｅ２３Ｔｈｒ、Ａｌａ４１Ａｒｇがあげられる。他のアミノ酸置換は、例えば、免疫グロブリン結合性タンパク質のアルカリ安定性を向上させるものであってよい。例えば、Ａｓｎ４４Ａｓｐ、Ｇｌｕ４９Ｖａｌ、Ａｓｎ６２Ｔｙｒ、Ｉｌｅ２３Ｔｈｒ、およびＡｌａ４１Ａｒｇのアミノ酸置換は、いずれも、免疫グロブリン結合性タンパク質のアルカリ安定性を向上させるものであり得る。本発明のタンパク質は、例えば、前記他のアミノ酸置換を１つ、２つ、３つ、４つ、５つ、または６つ有してよい。
　ただし、
Ｇｌｕ４９Ａｓｐのアミノ酸置換を選択した場合は（１７）のアミノ酸置換（Ｇｌｕ４９ＴｈｒまたはＧｌｕ４９Ｉｌｅ）がＧｌｕ４９Ａｓｐのアミノ酸置換で、
Ｐｒｏ６Ｓｅｒのアミノ酸置換を選択した場合は（３７）のアミノ酸置換（Ｐｒｏ６ＬｅｕおよびＰｒｏ６Ｔｈｒのいずれか）がＰｒｏ６Ｓｅｒのアミノ酸置換で、
Ａｓｎ４４Ａｓｐのアミノ酸置換を選択した場合は（１６）のアミノ酸置換（Ａｓｎ４４ＳｅｒまたはＡｓｎ４４Ｇｌｙ）、（３２）のアミノ酸置換（Ａｓｎ４４Ｉｌｅ）および（４８）のアミノ酸置換（Ａｓｎ４４ＨｉｓまたはＡｓｎ４４Ａｒｇ）がＡｓｎ４４Ａｓｐのアミノ酸置換で、
Ｇｌｕ４９Ｖａｌのアミノ酸置換を選択した場合は（１７）のアミノ酸置換（Ｇｌｕ４９ＴｈｒまたはＧｌｕ４９Ｉｌｅ）がＧｌｕ４９Ｖａｌのアミノ酸置換で、
Ａｓｎ６２Ｔｙｒのアミノ酸置換を選択した場合は（２３）のアミノ酸置換（Ａｓｎ６２Ｈｉｓ、Ａｓｎ６２Ａｒｇ、Ａｓｎ６２Ｌｅｕ、Ａｓｎ６２ＭｅｔおよびＡｓｎ６２Ｔｒｐのいずれか）がＡｓｎ６２Ｔｙｒのアミノ酸置換で、
Ｉｌｅ２３Ｔｈｒのアミノ酸置換を選択した場合は（４０）のアミノ酸置換（Ｉｌｅ２３ＡｒｇまたはＩｌｅ２３Ｖａｌ）および（６０）のアミノ酸置換（Ｉｌｅ２３ＰｈｅまたはＩｌｅ２３Ｌｅｕ）がＩｌｅ２３Ｔｈｒのアミノ酸置換で、
Ａｌａ４１Ａｒｇのアミノ酸置換を選択した場合は（１５）のアミノ酸置換（Ａｌａ４１Ｔｈｒ）および（４７）のアミノ酸置換（Ａｌａ４１ＩｌｅまたはＡｌａ４１Ｔｙｒ）がＡｌａ４１Ａｒｇのアミノ酸置換で、
それぞれ上書きされる。
　あるいは、他のアミノ酸置換の内、前記（１）から（６４）より選択される１つ以上のアミノ酸置換と同位置のアミノ酸置換は選択されなくてもよい。すなわち、例えば、前記（１）から（６４）のアミノ酸置換から少なくとも（１７）のアミノ酸置換（Ｇｌｕ４９ＴｈｒまたはＧｌｕ４９Ｉｌｅ）を選択した場合は、Ｇｌｕ４９ＡｓｐおよびＧｌｕ４９Ｖａｌのアミノ酸置換は選択されなくてもよい。また、アミノ酸置換の組み合わせは、少なくとも前記（１）から（６４）より選択される１つ以上のアミノ酸置換が残存するように選択される。すなわち、例えば、前記（１）から（６４）のアミノ酸置換から（１７）のアミノ酸置換（Ｇｌｕ４９ＴｈｒまたはＧｌｕ４９Ｉｌｅ）を単独で選択した場合は、Ｇｌｕ４９ＡｓｐおよびＧｌｕ４９Ｖａｌのアミノ酸置換は選択できない。また、アミノ酸置換の組み合わせは、少なくとも前記（１）から（５３）のアミノ酸置換より選択される１つ以上のアミノ酸置換が残存するように選択されてもよい。また、アミノ酸置換の組み合わせは、少なくとも前記（５４）から（６４）のアミノ酸置換より選択される１つ以上のアミノ酸置換が残存するように選択されてもよい。すなわち、改変型アミノ酸配列としては、上記例示した非改変型アミノ酸配列（例えば配列番号１に記載のアミノ酸配列）において前記特定位置におけるアミノ酸置換およびＧｌｕ４９ＡｓｐやＰｒｏ６Ｓｅｒなど他のアミノ酸置換を有するアミノ酸配列も挙げられる。すなわち、本発明のタンパク質としては、上記例示した非改変型アミノ酸配列（例えば配列番号１に記載のアミノ酸配列）を含み、ただし当該アミノ酸配列において、前記特定位置におけるアミノ酸置換およびＧｌｕ４９ＡｓｐやＰｒｏ６Ｓｅｒなど他のアミノ酸置換を有するタンパク質も挙げられる。言い換えると、本発明のタンパク質は、例えば、前記特定位置におけるアミノ酸置換およびＧｌｕ４９ＡｓｐやＰｒｏ６Ｓｅｒなど他のアミノ酸置換を有すること以外は上記例示した非改変型アミノ酸配列（例えば配列番号１に記載のアミノ酸配列）と同一のアミノ酸配列を含むタンパク質であってもよい。なお、前記他のアミノ酸置換として例示したＧｌｕ４９ＡｓｐやＰｒｏ６Ｓｅｒは、ｓｕｂｇｒｏｕｐに関係なく免疫グロブリンのκ軽鎖に結合可能な、アミノ酸置換である。
　前記他のアミノ酸置換を含むアミノ酸置換の組み合わせとしては、上記例示したアミノ酸置換の組み合わせにおいてさらに前記他のアミノ酸置換を１つ、２つ、３つ、４つ、５つ、または６つ含む組み合わせが挙げられる。前記他のアミノ酸置換を含むアミノ酸置換の組み合わせとしては、特に、上記例示したアミノ酸置換の組み合わせにおいてさらに少なくともＡｓｎ６２Ｔｙｒのアミノ酸置換を含む組み合わせが挙げられる。
　前記他のアミノ酸置換をさらに有した、本発明のタンパク質の一例として、以下のタンパク質が挙げられる。これらのタンパク質はアルカリ安定性が向上し、かつｓｕｂｇｒｏｕｐに関係なく免疫グロブリンのκ軽鎖に結合できる点で好ましい。
配列番号１に記載のアミノ酸配列を含み、ただし当該アミノ酸配列において、Ｌｙｓ７Ａｌａ、Ｌｙｓ１３Ａｒｇ、Ｌｙｓ２２Ｇｌｎ、Ｌｙｓ２９Ｉｌｅ、Ｌｙｓ３８Ａｒｇ、Ｌｙｓ４８Ａｒｇ、Ｇｌｕ４９Ａｓｐ、Ａｓｎ５０Ｔｙｒ、Ｇｌｕ５２Ｇｌｙ、Ａｓｎ６２ＴｙｒおよびＬｙｓ６７Ａｒｇのアミノ酸置換を有する免疫グロブリン結合性タンパク質（配列番号１７９に記載のアミノ酸配列を含む免疫グロブリン結合性タンパク質）。
配列番号１に記載のアミノ酸配列を含み、ただし当該アミノ酸配列において、Ｌｙｓ７Ａｌａ、Ｌｙｓ１３Ａｒｇ、Ｌｙｓ２２Ａｒｇ、Ｌｙｓ２９Ｉｌｅ、Ｌｙｓ３８Ａｒｇ、Ｌｙｓ４８Ａｒｇ、Ｇｌｕ４９Ａｓｐ、Ａｓｎ５０Ｔｙｒ、Ｇｌｕ５２Ｇｌｙ、Ｔｙｒ５３Ｐｈｅ、Ａｓｎ６２ＴｙｒおよびＬｙｓ６７Ａｒｇのアミノ酸置換を有する免疫グロブリン結合性タンパク質（配列番号１８６に記載のアミノ酸配列を含む免疫グロブリン結合性タンパク質）。
配列番号１に記載のアミノ酸配列を含み、ただし当該アミノ酸配列において、Ｇｌｕ４Ｇｌｙ、Ｌｙｓ７Ａｌａ、Ｌｙｓ１３Ａｒｇ、Ｌｙｓ２２Ａｒｇ、Ｌｙｓ２９Ｉｌｅ、Ｌｙｓ３８Ａｒｇ、Ｌｙｓ４８Ａｒｇ、Ｇｌｕ４９Ａｓｐ、Ａｓｎ５０Ｔｙｒ、Ｇｌｕ５２Ａｓｐ、Ｔｙｒ５３Ｐｈｅ、Ａｓｎ６２ＴｙｒおよびＬｙｓ６７Ａｒｇのアミノ酸置換を有する免疫グロブリン結合性タンパク質（配列番号１９９に記載のアミノ酸配列を含む免疫グロブリン結合性タンパク質）。
配列番号１に記載のアミノ酸配列を含み、ただし当該アミノ酸配列において、Ｇｌｕ４Ｇｌｙ、Ｌｙｓ７Ａｌａ、Ｌｙｓ１３Ａｒｇ、Ｌｙｓ２２Ａｒｇ、Ｇｌｕ２７Ａｒｇ、Ｌｙｓ２９Ｉｌｅ、Ｌｙｓ３８Ａｒｇ、Ｌｙｓ４８Ａｒｇ、Ｇｌｕ４９Ａｓｐ、Ａｓｎ５０Ｔｙｒ、Ｇｌｕ５２Ａｓｐ、Ｔｙｒ５３Ｐｈｅ、Ａｓｎ６２ＴｙｒおよびＬｙｓ６７Ａｒｇのアミノ酸置換を有する免疫グロブリン結合性タンパク質（配列番号２２４に記載のアミノ酸配列を含む免疫グロブリン結合性タンパク質）。
配列番号１に記載のアミノ酸配列を含み、ただし当該アミノ酸配列において、Ｇｌｕ４Ｇｌｙ、Ｐｒｏ６Ｓｅｒ、Ｌｙｓ７Ａｌａ、Ｌｙｓ１３Ａｒｇ、Ｌｙｓ２２Ａｒｇ、Ｌｙｓ２９Ｉｌｅ、Ｌｙｓ３８Ｇｌｕ、Ｌｙｓ４８Ａｒｇ、Ｇｌｕ４９Ａｓｐ、Ａｓｎ５０Ｔｙｒ、Ｇｌｕ５２Ａｓｐ、Ｔｙｒ５３Ｐｈｅ、Ａｓｎ６２ＴｙｒおよびＬｙｓ６７Ａｒｇのアミノ酸置換を有する免疫グロブリン結合性タンパク質（配列番号２４０に記載のアミノ酸配列を含む免疫グロブリン結合性タンパク質）。
配列番号１に記載のアミノ酸配列を含み、ただし当該アミノ酸配列において、Ｇｌｕ４Ｇｌｙ、Ｐｒｏ６Ｓｅｒ、Ｌｙｓ７Ａｌａ、Ｌｙｓ１３Ａｒｇ、Ｌｙｓ２２Ａｒｇ、Ｌｙｓ２９Ｉｌｅ、Ｌｙｓ３８Ｇｌｕ、Ｌｙｓ４８Ａｒｇ、Ｇｌｕ４９Ａｓｐ、Ａｓｎ５０Ｔｙｒ、Ｇｌｕ５２Ｖａｌ、Ｔｙｒ５３Ｐｈｅ、Ａｓｎ６２Ｔｙｒ、Ｌｙｓ６７ＡｒｇおよびＡｌａ６９Ｖａｌのアミノ酸置換を有する免疫グロブリン結合性タンパク質（配列番号２７１に記載のアミノ酸配列を含む免疫グロブリン結合性タンパク質）。
配列番号１に記載のアミノ酸配列を含み、ただし当該アミノ酸配列において、Ｇｌｕ４Ｇｌｙ、Ｐｒｏ６Ｓｅｒ、Ｌｙｓ７Ａｌａ、Ｌｙｓ１３Ａｒｇ、Ｌｙｓ２２Ａｒｇ、Ｌｙｓ２９Ｉｌｅ、Ｌｙｓ３８Ｇｌｕ、Ｌｙｓ４８Ａｒｇ、Ｇｌｕ４９Ａｓｐ、Ａｓｎ５０Ｔｙｒ、Ｔｙｒ５３Ｐｈｅ、Ａｓｎ６２Ｔｙｒ、Ｌｙｓ６７ＡｒｇおよびＡｌａ６９Ｖａｌのアミノ酸置換を有する免疫グロブリン結合性タンパク質（配列番号２７５に記載のアミノ酸配列を含む免疫グロブリン結合性タンパク質）。
　前記他のアミノ酸置換をさらに有した、本発明のタンパク質の一例として、以下のタンパク質もあげられる。これらのタンパク質はアルカリ安定性が向上し、かつｓｕｂｇｒｏｕｐに関係なく免疫グロブリンのκ軽鎖に結合できる点で好ましい。また、これらのタンパク質を不溶性担体に固定化して得られる本発明の免疫グロブリン吸着剤は、従来の免疫グロブリン吸着剤と比較し、κ軽鎖を有する免疫グロブリン（抗体）を、ｓｕｂｇｒｏｕｐに関係なく、温和なｐＨ条件で溶出できる点で好ましい。
配列番号１に記載のアミノ酸配列を含み、ただし当該アミノ酸配列において、Ｇｌｕ４Ｇｌｙ、Ｐｒｏ６Ｓｅｒ、Ｌｙｓ７Ａｌａ、Ｌｙｓ１３Ａｒｇ、Ｌｙｓ２２Ａｒｇ、Ｉｌｅ２３Ａｒｇ、Ｌｙｓ２９Ｉｌｅ、Ｌｙｓ３８Ｇｌｕ、Ａｓｎ４４Ａｒｇ、Ｌｙｓ４８Ａｒｇ、Ｇｌｕ４９Ａｓｐ、Ａｓｎ５０Ｔｙｒ、Ｔｙｒ５３Ｐｈｅ、Ａｓｎ６２Ｔｙｒ、Ｌｙｓ６７ＡｒｇおよびＡｌａ６９Ｖａｌのアミノ酸置換を有する免疫グロブリン結合性タンパク質（配列番号４０８に記載のアミノ酸配列を含む免疫グロブリン結合性タンパク質）。
配列番号１に記載のアミノ酸配列を含み、ただし当該アミノ酸配列において、Ｇｌｕ４Ｇｌｙ、Ｐｒｏ６Ｓｅｒ、Ｌｙｓ７Ａｌａ、Ｌｙｓ１３Ａｒｇ、Ｌｙｓ２２Ａｒｇ、Ｉｌｅ２３Ａｒｇ、Ｌｙｓ２９Ｉｌｅ、Ｌｙｓ３８Ｇｌｕ、Ａｓｎ４４Ａｒｇ、Ｌｙｓ４８Ｈｉｓ、Ｇｌｕ４９Ａｓｐ、Ａｓｎ５０Ｔｙｒ、Ｔｙｒ５３Ｐｈｅ、Ａｓｎ６２Ｔｙｒ、Ｉｌｅ６４Ｌｅｕ、Ｌｙｓ６７ＡｒｇおよびＡｌａ６９Ｖａｌのアミノ酸置換を有する免疫グロブリン結合性タンパク質（配列番号４１３に記載のアミノ酸配列を含む免疫グロブリン結合性タンパク質）。
　言い換えると、本発明のタンパク質が有するアミノ酸置換の一例として、以下のものが挙げられる：
Ｌｙｓ７Ａｌａ、Ｌｙｓ１３Ａｒｇ、Ｌｙｓ２２Ｇｌｎ、Ｌｙｓ２９Ｉｌｅ、Ｌｙｓ３８Ａｒｇ、Ｌｙｓ４８Ａｒｇ、Ｇｌｕ４９Ａｓｐ、Ａｓｎ５０Ｔｙｒ、Ｇｌｕ５２Ｇｌｙ、Ａｓｎ６２ＴｙｒおよびＬｙｓ６７Ａｒｇのアミノ酸置換；
Ｌｙｓ７Ａｌａ、Ｌｙｓ１３Ａｒｇ、Ｌｙｓ２２Ａｒｇ、Ｌｙｓ２９Ｉｌｅ、Ｌｙｓ３８Ａｒｇ、Ｌｙｓ４８Ａｒｇ、Ｇｌｕ４９Ａｓｐ、Ａｓｎ５０Ｔｙｒ、Ｇｌｕ５２Ｇｌｙ、Ｔｙｒ５３Ｐｈｅ、Ａｓｎ６２ＴｙｒおよびＬｙｓ６７Ａｒｇのアミノ酸置換；
Ｇｌｕ４Ｇｌｙ、Ｌｙｓ７Ａｌａ、Ｌｙｓ１３Ａｒｇ、Ｌｙｓ２２Ａｒｇ、Ｌｙｓ２９Ｉｌｅ、Ｌｙｓ３８Ａｒｇ、Ｌｙｓ４８Ａｒｇ、Ｇｌｕ４９Ａｓｐ、Ａｓｎ５０Ｔｙｒ、Ｇｌｕ５２Ａｓｐ、Ｔｙｒ５３Ｐｈｅ、Ａｓｎ６２ＴｙｒおよびＬｙｓ６７Ａｒｇのアミノ酸置換；
Ｇｌｕ４Ｇｌｙ、Ｌｙｓ７Ａｌａ、Ｌｙｓ１３Ａｒｇ、Ｌｙｓ２２Ａｒｇ、Ｇｌｕ２７Ａｒｇ、Ｌｙｓ２９Ｉｌｅ、Ｌｙｓ３８Ａｒｇ、Ｌｙｓ４８Ａｒｇ、Ｇｌｕ４９Ａｓｐ、Ａｓｎ５０Ｔｙｒ、Ｇｌｕ５２Ａｓｐ、Ｔｙｒ５３Ｐｈｅ、Ａｓｎ６２ＴｙｒおよびＬｙｓ６７Ａｒｇのアミノ酸置換；
Ｇｌｕ４Ｇｌｙ、Ｐｒｏ６Ｓｅｒ、Ｌｙｓ７Ａｌａ、Ｌｙｓ１３Ａｒｇ、Ｌｙｓ２２Ａｒｇ、Ｌｙｓ２９Ｉｌｅ、Ｌｙｓ３８Ｇｌｕ、Ｌｙｓ４８Ａｒｇ、Ｇｌｕ４９Ａｓｐ、Ａｓｎ５０Ｔｙｒ、Ｇｌｕ５２Ａｓｐ、Ｔｙｒ５３Ｐｈｅ、Ａｓｎ６２ＴｙｒおよびＬｙｓ６７Ａｒｇのアミノ酸置換；
Ｇｌｕ４Ｇｌｙ、Ｐｒｏ６Ｓｅｒ、Ｌｙｓ７Ａｌａ、Ｌｙｓ１３Ａｒｇ、Ｌｙｓ２２Ａｒｇ、Ｌｙｓ２９Ｉｌｅ、Ｌｙｓ３８Ｇｌｕ、Ｌｙｓ４８Ａｒｇ、Ｇｌｕ４９Ａｓｐ、Ａｓｎ５０Ｔｙｒ、Ｇｌｕ５２Ｖａｌ、Ｔｙｒ５３Ｐｈｅ、Ａｓｎ６２Ｔｙｒ、Ｌｙｓ６７ＡｒｇおよびＡｌａ６９Ｖａｌのアミノ酸置換；
Ｇｌｕ４Ｇｌｙ、Ｐｒｏ６Ｓｅｒ、Ｌｙｓ７Ａｌａ、Ｌｙｓ１３Ａｒｇ、Ｌｙｓ２２Ａｒｇ、Ｌｙｓ２９Ｉｌｅ、Ｌｙｓ３８Ｇｌｕ、Ｌｙｓ４８Ａｒｇ、Ｇｌｕ４９Ａｓｐ、Ａｓｎ５０Ｔｙｒ、Ｔｙｒ５３Ｐｈｅ、Ａｓｎ６２Ｔｙｒ、Ｌｙｓ６７ＡｒｇおよびＡｌａ６９Ｖａｌのアミノ酸置換。
Ｇｌｕ４Ｇｌｙ、Ｐｒｏ６Ｓｅｒ、Ｌｙｓ７Ａｌａ、Ｌｙｓ１３Ａｒｇ、Ｌｙｓ２２Ａｒｇ、Ｉｌｅ２３Ａｒｇ、Ｌｙｓ２９Ｉｌｅ、Ｌｙｓ３８Ｇｌｕ、Ａｓｎ４４Ａｒｇ、Ｌｙｓ４８Ａｒｇ、Ｇｌｕ４９Ａｓｐ、Ａｓｎ５０Ｔｙｒ、Ｔｙｒ５３Ｐｈｅ、Ａｓｎ６２Ｔｙｒ、Ｌｙｓ６７ＡｒｇおよびＡｌａ６９Ｖａｌのアミノ酸置換；
Ｇｌｕ４Ｇｌｙ、Ｐｒｏ６Ｓｅｒ、Ｌｙｓ７Ａｌａ、Ｌｙｓ１３Ａｒｇ、Ｌｙｓ２２Ａｒｇ、Ｉｌｅ２３Ａｒｇ、Ｌｙｓ２９Ｉｌｅ、Ｌｙｓ３８Ｇｌｕ、Ａｓｎ４４Ａｒｇ、Ｌｙｓ４８Ｈｉｓ、Ｇｌｕ４９Ａｓｐ、Ａｓｎ５０Ｔｙｒ、Ｔｙｒ５３Ｐｈｅ、Ａｓｎ６２Ｔｙｒ、Ｉｌｅ６４Ｌｅｕ、Ｌｙｓ６７ＡｒｇおよびＡｌａ６９Ｖａｌのアミノ酸置換。
　本明細書では、配列番号１に記載のアミノ酸配列において上記例示したアミノ酸置換（すなわち前記特定位置におけるアミノ酸置換および任意のＧｌｕ４９ＡｓｐやＰｒｏ６Ｓｅｒなど他のアミノ酸置換）を有するアミノ酸配列を、「配列番号１由来置換アミノ酸配列」ともいう。配列番号１由来置換アミノ酸配列は、言い換えると、上記例示したアミノ酸置換（すなわち前記特定位置におけるアミノ酸置換および任意のＧｌｕ４９ＡｓｐやＰｒｏ６Ｓｅｒなど他のアミノ酸置換）が生じた配列番号１に記載のアミノ酸配列である。また、配列番号１由来置換アミノ酸配列は、言い換えると、上記例示したアミノ酸置換（すなわち前記特定位置におけるアミノ酸置換および任意のＧｌｕ４９ＡｓｐやＰｒｏ６Ｓｅｒなど他のアミノ酸置換）を有すること以外は配列番号１に記載のアミノ酸配列と同一のアミノ酸配列である。配列番号１由来置換アミノ酸配列は、本明細書における改変型アミノ酸配列の一例である。
　本明細書における改変型アミノ酸配列としては、上記例示した改変型アミノ酸配列（例えば配列番号１由来置換アミノ酸配列）のバリアント（ｖａｒｉａｎｔ）配列も挙げられる。すなわち、本発明のタンパク質としては、上記例示した改変型アミノ酸配列（例えば配列番号１由来置換アミノ酸配列）のバリアント配列を含み、かつ、免疫グロブリン結合活性を有するタンパク質も挙げられる。以下、配列番号１由来置換アミノ酸配列のバリアント配列の場合を例示して説明するが、当該説明は任意の改変型アミノ酸配列のバリアント配列にも準用できる。
　配列番号１由来置換アミノ酸配列のバリアント配列は、前記特定位置におけるアミノ酸置換が残存するように（すなわち、本発明のタンパク質が前記特定位置におけるアミノ酸置換を有するように）設定されるものとする。また、配列番号１由来置換アミノ酸配列のバリアント配列は、Ｇｌｕ４９ＡｓｐやＰｒｏ６Ｓｅｒなど他のアミノ酸置換が残存するように（すなわち、本発明のタンパク質がＧｌｕ４９ＡｓｐやＰｒｏ６Ｓｅｒなど他のアミノ酸置換を有するように）設定されてもよい。また、配列番号１由来置換アミノ酸配列のバリアント配列は、例えば、上記例示したアミノ酸置換（すなわち前記特定位置におけるアミノ酸置換および任意のＧｌｕ４９ＡｓｐやＰｒｏ６Ｓｅｒなど他のアミノ酸置換）から選択される、配列番号１由来置換アミノ酸配列が有さない１つ以上のアミノ酸置換を追加的に有していてもよい。例えば、配列番号１由来置換アミノ酸配列がＧｌｕ４９ＡｓｐやＰｒｏ６Ｓｅｒなど他のアミノ酸置換を有さない場合に、配列番号１由来置換アミノ酸配列のバリアント配列が前記他のアミノ酸置換を有していてもよい。
　配列番号１由来置換アミノ酸配列のバリアント配列としては、配列番号１由来置換アミノ酸配列において、１もしくは数個の位置での１もしくは数個のアミノ酸残基の置換、欠失、挿入、および／または付加を含むアミノ酸配列が挙げられる。すなわち、本発明のタンパク質は、免疫グロブリン結合活性を有する限り、上記例示したアミノ酸置換（すなわち前記特定位置におけるアミノ酸置換および任意のＧｌｕ４９ＡｓｐやＰｒｏ６Ｓｅｒなど他のアミノ酸置換）に加えて、さらに、配列番号１に記載のアミノ酸配列において、１もしくは数個の位置での１もしくは数個のアミノ酸残基の置換、欠失、挿入、および／または付加を含んでいてもよい。すなわち、本発明のタンパク質としては、配列番号１に記載のアミノ酸配列を含み、ただし当該アミノ酸配列において、上記例示したアミノ酸置換（すなわち前記特定位置におけるアミノ酸置換および任意のＧｌｕ４９ＡｓｐやＰｒｏ６Ｓｅｒなど他のアミノ酸置換）を有し、さらに１もしくは数個の位置での１もしくは数個のアミノ酸残基の置換、欠失、挿入、および／または付加を含み、かつ、免疫グロブリン結合活性を有するタンパク質も挙げられる。言い換えると、本発明のタンパク質は、例えば、上記例示したアミノ酸置換（すなわち前記特定位置におけるアミノ酸置換および任意のＧｌｕ４９ＡｓｐやＰｒｏ６Ｓｅｒなど他のアミノ酸置換）を有し、さらに１もしくは数個の位置での１もしくは数個のアミノ酸残基の置換、欠失、挿入、および／または付加を含むこと以外は配列番号１と同一のアミノ酸配列を含み、かつ、免疫グロブリン結合活性を有するタンパク質であってもよい。なお、上記のアミノ酸残基の置換、欠失、挿入、および／または付加は、前記特定位置におけるアミノ酸置換が残存するように選択されるものとする。すなわち、上記のアミノ酸残基の置換、欠失、挿入、および／または付加は、例えば、前記特定位置以外の位置に生じてよい。また、上記のアミノ酸残基の置換、欠失、挿入、および／または付加は、前記他のアミノ酸置換が残存するように選択されてもよい。すなわち、上記のアミノ酸残基の置換、欠失、挿入、および／または付加は、例えば、前記他のアミノ酸置換以外の位置に生じてもよい。また、上記のアミノ酸残基の置換、欠失、挿入、および／または付加は、例えば、上記例示したアミノ酸置換から選択される、配列番号１由来置換アミノ酸配列が有さない１つ以上のアミノ酸置換を含んでいてもよい。前記「１もしくは数個」とは、アミノ酸残基のタンパク質の立体構造における位置やアミノ酸残基の種類によっても異なるが、具体的には、例えば、１から２０個、１から１０個、１から９個、１から８個、１から７個、１から６個、１から５個、１から４個、１から３個、１から２個、１個のいずれかを意味する。上記のアミノ酸残基の置換の一例としては、物理的性質および／または化学的性質が類似したアミノ酸間で置換が生じる保守的置換が挙げられる。保守的置換の場合、一般に、置換が生じているものと置換が生じていないものとの間でタンパク質の機能が維持されることが当業者において知られている。保守的置換の一例としては、グリシンとアラニン間、セリンとプロリン間、またはグルタミン酸とアラニン間での置換があげられる（タンパク質の構造と機能，メディカル・サイエンス・インターナショナル社，９，２００５）。また、上記のアミノ酸残基の置換、欠失、挿入、および／または付加には、例えば、タンパク質またはそれをコードする遺伝子が由来する微生物の個体差や種の違いに基づく場合などの天然に生じる変異（ミュータント（ｍｕｔａｎｔ）またはバリアント）によって生じるものも含まれる。
　また、配列番号１由来置換アミノ酸配列のバリアント配列としては、配列番号１由来置換アミノ酸配列に対して高い相同性を有するアミノ酸配列も挙げられる。すなわち、本発明のタンパク質としては、配列番号１に記載のアミノ酸配列において上記例示したアミノ酸置換（すなわち前記特定位置におけるアミノ酸置換および任意でＧｌｕ４９ＡｓｐやＰｒｏ６Ｓｅｒなど他のアミノ酸置換）を有するアミノ酸配列に対して高い相同性を有するアミノ酸配列を含み、かつ、免疫グロブリン結合活性を有するタンパク質も挙げられる。なお、上記のような相同性の範囲でのアミノ酸配列の変化は、前記特定位置におけるアミノ酸置換が残存するように選択されるものとする。すなわち、上記のような相同性の範囲でのアミノ酸配列の変化は、例えば、前記特定位置以外の位置に生じてよい。また、上記のような相同性の範囲でのアミノ酸配列の変化は、他のアミノ酸置換が残存するように選択されてもよい。すなわち、上記のような相同性の範囲でのアミノ酸配列の変化は、例えば、他のアミノ酸置換以外の位置に生じてもよい。また、上記のような相同性の範囲でのアミノ酸配列の変化は、例えば、上記例示したアミノ酸置換から選択される、配列番号１由来置換アミノ酸配列が有さない１つ以上のアミノ酸置換を含んでいてもよい。前記「相同性」とは、類似性（ｓｉｍｉｌａｒｉｔｙ）または同一性（ｉｄｅｎｔｉｔｙ）を意味してよく、特に同一性を意味してもよい。「アミノ酸配列に対する相同性」とは、アミノ酸配列全体に対する相同性を意味する。前記「高い相同性」とは、７０％以上、８０％以上、９０％以上、または９５％以上の相同性を意味してよい。アミノ酸配列間の「同一性」とは、それらアミノ酸配列における種類が同一であるアミノ酸残基の比率を意味する（実験医学　２０１３年２月号　Ｖｏｌ．３１　Ｎｏ．３、羊土社）。アミノ酸配列間の「類似性」とは、それらアミノ酸配列における種類が同一であるアミノ酸残基の比率と側鎖の性質が類似したアミノ酸残基の比率の合計を意味する（実験医学　２０１３年２月号　Ｖｏｌ．３１　Ｎｏ．３、羊土社）。側鎖の性質が類似したアミノ酸残基については上述の通りである。アミノ酸配列の相同性は、ＢＬＡＳＴ（Ｂａｓｉｃ　Ｌｏｃａｌ　Ａｌｉｇｎｍｅｎｔ　Ｓｅａｒｃｈ　Ｔｏｏｌ）やＦＡＳＴＡ等のアラインメントプログラム（ａｌｉｇｎｍｅｎｔ　ｐｒｏｇｒａｍ）を利用して決定できる。
　また改変型アミノ酸配列としては、上記例示したバリアント配列において、さらに、上記例示したアミノ酸置換（すなわち前記特定位置におけるアミノ酸置換および任意でＧｌｕ４９ＡｓｐやＰｒｏ６Ｓｅｒなど他のアミノ酸置換）から選択される１つ以上のアミノ酸置換を有するアミノ酸配列も挙げられる。例えば、改変型アミノ酸配列は、少なくとも前記特定位置におけるアミノ酸置換を有するバリアント配列において、さらに他のアミノ酸置換を有するアミノ酸配列であってよい。
　また非改変型アミノ酸配列としては、上記例示した非改変型アミノ酸配列（例えば配列番号１に記載のアミノ酸配列）のバリアント配列も挙げられる。すなわち、改変型アミノ酸配列としては、上記例示した非改変型アミノ酸配列（例えば配列番号１に記載のアミノ酸配列）のバリアント配列において、上記例示したアミノ酸置換（すなわち前記特定位置におけるアミノ酸置換および任意でＧｌｕ４９ＡｓｐやＰｒｏ６Ｓｅｒなど他のアミノ酸置換）を有するアミノ酸配列も挙げられる。すなわち、本発明のタンパク質としては、上記例示した非改変型アミノ酸配列（例えば配列番号１に記載のアミノ酸配列）のバリアント配列を含み、ただし当該バリアント配列において、上記例示したアミノ酸置換（すなわち前記特定位置におけるアミノ酸置換および任意でＧｌｕ４９ＡｓｐやＰｒｏ６Ｓｅｒなど他のアミノ酸置換）を有し、かつ免疫グロブリン結合活性を有するタンパク質も挙げられる。言い換えると本発明のタンパク質は、例えば、上記例示したアミノ酸置換を有すること以外は上記例示した非改変型アミノ酸配列（例えば配列番号１に記載のアミノ酸配列）のバリアント配列と同一のアミノ酸配列を含むタンパク質であってもよい。なお、上記例示した非改変型アミノ酸配列（例えば配列番号１に記載のアミノ酸配列）のバリアント配列は、Ｆｉｎｅｇｏｌｄｉａ属細菌において実際に存在していてもよく、いなくてもよい。すなわち、「Ｆｉｎｅｇｏｌｄｉａ属細菌由来Ｐｒｏｔｅｉｎ　Ｌの免疫グロブリン結合ドメインのアミノ酸配列（ＦｐＬの免疫グロブリン結合ドメインのアミノ酸配列）」とは、Ｆｉｎｅｇｏｌｄｉａ属細菌に実際に存在するＰｒｏｔｅｉｎ　Ｌの免疫グロブリン結合ドメインのアミノ酸配列に限られず、同アミノ酸配列のバリアント配列であってＦｉｎｅｇｏｌｄｉａ属細菌に実際に存在しない（すなわち仮想の）アミノ酸配列も包含する。以下、配列番号１に記載のアミノ酸配列のバリアント配列の場合を例示して説明するが、当該説明は任意の非改変型アミノ酸配列のバリアント配列にも準用できる。
　配列番号１に記載のアミノ酸配列のバリアント配列としては、配列番号１に記載のアミノ酸配列において、１もしくは数個の位置での１もしくは数個のアミノ酸残基の置換、欠失、挿入、および／または付加を含むアミノ酸配列が挙げられる。すなわち、本発明のタンパク質としては、配列番号１に記載のアミノ酸配列を含み、ただし当該アミノ酸配列において、１もしくは数個の位置での１もしくは数個のアミノ酸残基の置換、欠失、挿入、および／または付加を含み、さらに上記例示したアミノ酸置換（すなわち前記特定位置におけるアミノ酸置換および任意でＧｌｕ４９ＡｓｐやＰｒｏ６Ｓｅｒなど他のアミノ酸置換）を有し、かつ、免疫グロブリン結合活性を有するタンパク質も挙げられる。上記のアミノ酸残基の置換、欠失、挿入、および／または付加は、例えば、前記特定位置以外の位置に生じてよい。また、上記のアミノ酸残基の置換、欠失、挿入、および／または付加は、例えば、他のアミノ酸置換以外の位置に生じてもよい。
　配列番号１に記載のアミノ酸配列のバリアント配列としては、配列番号１に記載のアミノ酸配列に対して高い相同性を有するアミノ酸配列も挙げられる。すなわち、本発明のタンパク質としては、配列番号１に記載のアミノ酸配列に対して高い相同性を有するアミノ酸配列を含み、ただし当該アミノ酸配列（配列番号１に記載のアミノ酸配列に対して高い相同性を有するアミノ酸配列）において、上記例示したアミノ酸置換（すなわち前記特定位置におけるアミノ酸置換および任意でＧｌｕ４９ＡｓｐやＰｒｏ６Ｓｅｒなどの他のアミノ酸置換）を有し、かつ、免疫グロブリン結合活性を有するタンパク質も挙げられる。上記のような相同性の範囲でのアミノ酸残基の変化は、例えば、前記特定位置以外の位置に生じてよい。また、上記のような相同性の範囲でのアミノ酸残基の変化は、例えば、他のアミノ酸置換以外の位置に生じてもよい。
　その他、配列番号１に記載のアミノ酸配列のバリアント配列については、配列番号１由来置換アミノ酸配列のバリアント配列についての記載を準用できる。
　本明細書において「配列番号１に記載のアミノ酸配列におけるＸ番目のアミノ酸」とは、配列番号１に記載のアミノ酸配列のＮ末端から数えてＸ位の位置に存在するアミノ酸を意味する。特定のアミノ酸配列における「配列番号１に記載のアミノ酸配列におけるＸ番目のアミノ酸に相当するアミノ酸残基」とは、当該特定のアミノ酸配列におけるアミノ酸残基であって、当該特定のアミノ酸配列と配列番号１のアミノ酸配列とのアライメント（ａｌｉｇｎｍｅｎｔ）において配列番号１に示すアミノ酸配列におけるＸ番目のアミノ酸と同一の位置に配列されるアミノ酸残基を意味する。例えば、Ａｓｎ５０Ｔｙｒのアミノ酸置換の場合、特定のアミノ酸配列における「配列番号１の５０番目のアスパラギンに相当するアミノ酸残基」とは、当該特定のアミノ酸配列におけるアミノ酸残基であって、当該特定のアミノ酸配列と配列番号１のアミノ酸配列とのアライメントにおいて配列番号１に示すアミノ酸配列における５０番目のアスパラギンと同一の位置に配列されるアミノ酸残基を意味する。なお、配列番号１に記載のアミノ酸配列における「配列番号１に記載のアミノ酸配列におけるＸ番目のアミノ酸に相当するアミノ酸残基」とは、配列番号１に記載のアミノ酸配列におけるＸ番目のアミノ酸そのものを意味する。すなわち、上記例示したアミノ酸置換（すなわち前記特定位置におけるアミノ酸置換および任意で他のアミノ酸置換）の位置は、必ずしも本発明のタンパク質における絶対的な位置を示すものではなく、配列番号１に記載のアミノ酸配列に基づく相対的な位置を示すものである。すなわち、例えば、本発明のタンパク質が、上記例示したアミノ酸置換の位置よりもＮ末端側にアミノ酸残基の挿入、欠失、または付加を含む場合、それに応じて当該アミノ酸置換の絶対的な位置は変動し得る。本発明のタンパク質における上記例示したアミノ酸置換の位置は、例えば、本発明のタンパク質のアミノ酸配列と配列番号１に記載のアミノ酸配列とのアライメントで特定できる。前記アライメントは、例えば、ＢＬＡＳＴやＦＡＳＴＡ等のアライメントプログラムを利用して実施できる。配列番号１に記載のアミノ酸配列のバリアント配列等の任意のアミノ酸配列における上記例示したアミノ酸置換の位置についても同様である。また、上記例示したアミノ酸置換（すなわち前記特定位置におけるアミノ酸置換および任意でＧｌｕ４９ＡｓｐやＰｒｏ６Ｓｅｒなど他のアミノ酸置換）の置換前のアミノ酸残基は、配列番号１に記載のアミノ酸配列における置換前のアミノ酸残基の種類を示すものであって、配列番号１に記載のアミノ酸配列以外の非改変型アミノ酸配列においては保存されていてもよく、いなくてもよい。
　本発明のタンパク質は、改変型アミノ酸配列を１個のみ含んでいてもよく、改変型アミノ酸配列を複数個含んでいてもよい。本発明のタンパク質は、例えば、改変型アミノ酸配列を２個以上、３個以上、４個以上、または５個以上含んでいてもよく、１０個以下、７個以下、５個以下、４個以下、３個以下、または２個以下含んでいてもよく、それらの矛盾しない組み合わせの個数含んでいてもよい。本発明のタンパク質が複数個の改変型アミノ酸配列を含む場合、それら複数個の改変型アミノ酸配列のアミノ酸配列は同一であってもよく、そうでなくてもよい。それら複数個の改変型アミノ酸配列は、直接連結（直結）させた態様であってもよいし、適切なリンカー（例えば、５以上２５以下のアミノ酸残基からなるオリゴペプチド）を介して連結させた態様であってもよい。
　本発明のタンパク質は、改変型アミノ酸配列からなるものであってもよく、他のアミノ酸配列をさらに含んでいてもよい。すなわち、本発明のタンパク質は、例えば、そのＮ末端側またはＣ末端側に他のアミノ酸配列をさらに含んでいてもよい。言い換えると、本発明のタンパク質においては、例えば、改変型アミノ酸配列のＮ末端側またはＣ末端側に、他のアミノ酸配列が付加されていてもよい。他のアミノ酸配列としては、オリゴペプチドがあげられる。他のアミノ酸配列として用いられるオリゴペプチドとしては、前記リンカー以外のオリゴペプチドがあげられる。他のアミノ酸配列は、本発明のタンパク質の免疫グロブリン結合活性や安定性を損なわない限り、特に制限されない。例えば、他のアミノ酸配列の種類や長さは、本発明のタンパク質の免疫グロブリン結合性や安定性を損なわない限り、特に制限されない。
　本発明のタンパク質は、例えば、選択した免疫グロブリン結合ドメインに加えて、他の免疫グロブリン結合ドメインの一部を含んでいてもよい。例えば、本発明のタンパク質がＦｐＬのドメインＣ３の改変型アミノ酸配列を含む場合、本発明のタンパク質は、さらに、ＦｐＬのドメインＣ３のＮ末端側領域（ドメインＣ１、ドメインＣ２）の一部を含んでいてもよく、ＦｐＬのドメインＣ３のＣ末端側領域（ドメインＣ４）の一部を含んでいてもよい。
　本発明のタンパク質は、例えば、そのＮ末端側またはＣ末端側に、目的物を特異的に検出または分離する目的で有用なオリゴペプチドを含んでいてもよい。そのようなオリゴペプチドとしては、ポリヒスチジンやポリアルギニンが挙げられる。また本発明のタンパク質は、例えば、そのＮ末端側またはＣ末端側に、本発明のタンパク質をクロマトグラフィー用の支持体等の固相に固定化する際に有用なオリゴペプチドを含んでいてもよい。そのようなオリゴペプチドとしては、リジンやシステインを含むオリゴペプチドが挙げられる。
　本発明のタンパク質が上記のような他のアミノ酸配列を含む場合、本発明のタンパク質は、例えば、あらかじめ他のアミノ酸配列を含む形態で製造されてもよいし、別途製造された上記のような他のアミノ酸配列が付加されてもよい。本発明のタンパク質が上記のような他のアミノ酸配列を含む場合、典型的には、本発明のタンパク質は、上記のような他のアミノ酸配列を含む本発明のタンパク質の全長アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドから発現させることで製造できる。すなわち、例えば、他のアミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドと本発明のタンパク質（例えば他のアミノ酸配列を含まないもの）をコードするポリヌクレオチドとを、他のアミノ酸配列が本発明のタンパク質のＮ末端側またはＣ末端側に付加されるように連結し、本発明のタンパク質を発現させてもよい。また例えば、化学的に合成した他のアミノ酸配列を本発明のタンパク質（例えば他のアミノ酸配列を含まないもの）のＮ末端側またはＣ末端側に化学的に結合させてもよい。
　本発明のタンパク質は、例えば、本発明のタンパク質をコードするポリヌクレオチドから発現させることで製造できる。本明細書では、本発明のタンパク質をコードするポリヌクレオチドを、「本発明のポリヌクレオチド」ともいう。本発明のポリヌクレオチドは、具体的には、本発明のタンパク質をコードするヌクレオチド配列を含むポリヌクレオチドであってよい。
　本発明のポリヌクレオチドは、例えば、化学合成法やＰＣＲ法等によるＤＮＡ増幅法で取得できる。ＤＮＡ増幅法は、例えば、本発明のタンパク質をコードするヌクレオチド配列といった、増幅すべきヌクレオチド配列を含むポリヌクレオチドを鋳型とし実施できる。鋳型とするポリヌクレオチドは、本発明のタンパク質を発現する生物のゲノムＤＮＡ、本発明のタンパク質のｃＤＮＡ、本発明のポリヌクレオチドを含むベクターが例示できる。
　本発明のポリヌクレオチドのヌクレオチド配列は、例えば、本発明のタンパク質のアミノ酸配列からの変換で設計できる。アミノ酸配列からヌクレオチド配列に変換する際には、標準のコドンテーブルを使用できるが、本発明のポリヌクレオチドで形質転換する宿主におけるコドンの使用頻度を考慮して変換するのが好ましい。一例として、宿主がＥｓｃｈｅｒｉｃｈｉａ　ｃｏｌｉ（大腸菌）の場合は、アルギニン（Ａｒｇ）ではＡＧＡ／ＡＧＧ／ＣＧＧ／ＣＧＡが、イソロイシン（Ｉｌｅ）ではＡＴＡが、ロイシン（Ｌｅｕ）ではＣＴＡが、グリシン（Ｇｌｙ）ではＧＧＡが、プロリン（Ｐｒｏ）ではＣＣＣが、それぞれ使用頻度が少ないため（いわゆるレアコドンであるため）、それらのコドンを避けるように変換してよい。コドンの使用頻度の解析は公的データベース（例えば、かずさＤＮＡ研究所のウェブサイトにあるＣｏｄｏｎ　Ｕｓａｇｅ　Ｄａｔａｂａｓｅなど）を利用することでも可能である。
　本発明のポリヌクレオチドは、当該ポリヌクレオチドの全長を一括取得してもよく、当該ポリヌクレオチドの部分配列からなるポリヌクレオチドを取得後連結することで取得してもよい。上記のような本発明のポリヌクレオチドを取得する手法についての説明は、その全長配列を一括して取得する場合に限られず、その部分配列を取得する場合にも準用できる。
　なお、本発明のポリヌクレオチドは、任意のポリペプチドのアミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドと連結し、融合型アミノ酸配列をコードするように設計してもよい。
　本発明のタンパク質は、例えば、本発明のポリヌクレオチドを含む遺伝子組換え宿主（以下、単に「本発明の遺伝子組換え宿主」ともいう）を培養し前記タンパク質を発現させた後、発現した前記タンパク質を回収することで製造できる。本発明の遺伝子組換え宿主は、例えば、本発明のポリヌクレオチドを用いて宿主を形質転換することで得られる。宿主は、本発明のポリヌクレオチドで形質転換されることで本発明のタンパク質を発現可能なものであれば特に制限されない。宿主の例として、動物細胞、昆虫細胞、微生物が挙げられる。このうち動物細胞としては、ＣＯＳ細胞、ＣＨＯ（Ｃｈｉｎｅｓｅ　Ｈａｍｓｔｅｒ　Ｏｖａｒｙ）細胞、Ｈｅｌａ細胞、ＮＩＨ３Ｔ３細胞、ＨＥＫ２９３細胞が、昆虫細胞としては、Ｓｆ９細胞、ＢＴＩ－ＴＮ－５Ｂ１－４細胞が、微生物としては、酵母や細菌が、それぞれ例示できる。さらに酵母としては、Ｓａｃｃｈａｒｏｍｙｃｅｓ　ｃｅｒｅｖｉｓｉａｅ等のＳａｃｃｈａｒｏｍｙｃｅｓ属酵母、Ｐｉｃｈｉａ　Ｐａｓｔｏｒｉｓ等のＰｉｃｈｉａ属酵母、Ｓｃｈｉｚｏｓａｃｃｈａｒｏｍｙｃｅｓ　ｐｏｍｂｅ等のＳｃｈｉｚｏｓａｃｃｈａｒｏｍｙｃｅｓ属酵母が、細菌としては、大腸菌（Ｅｓｃｈｅｒｉｃｈｉａ　ｃｏｌｉ）等のＥｓｃｈｅｒｉｃｈｉａ属細菌が挙げられる。大腸菌としては、ＪＭ１０９株、ＢＬ２１（ＤＥ３）株が挙げられる。なお、酵母や大腸菌を宿主として用いると生産性の面で好ましく、大腸菌を宿主として用いるとさらに好ましい。
　本発明の遺伝子組換え宿主において、本発明のポリヌクレオチドは、発現可能に保持されていればよい。具体的には、本発明のポリヌクレオチドは、前記宿主で機能するプロモーターの制御下で発現するように保持されていればよい。前記宿主が大腸菌の場合、宿主で機能するプロモーターの一例として、ｔｒｐプロモーター、ｔａｃプロモーター、ｔｒｃプロモーター、ｌａｃプロモーター、Ｔ７プロモーター、ｒｅｃＡプロモーター、ｌｐｐプロモーターが挙げられる。
　また本発明の遺伝子組換え宿主において、本発明のポリヌクレオチドは、ゲノムＤＮＡ外で自律複製するベクター上に存在していてよい。すなわち、本発明のポリヌクレオチドを含む発現ベクター（以下、単に「本発明の発現ベクター」ともいう）で宿主を形質転換して本発明の遺伝子組換え宿主を作製してもよい。本発明の発現ベクターは、例えば、発現ベクターの適切な位置に本発明のポリヌクレオチドを挿入して得られる。なお、発現ベクターは、形質転換する宿主内で安定に存在し複製できるものであれば特に制限されない。前記宿主が大腸菌の場合、発現ベクターとしては、ｐＥＴプラスミドベクター、ｐＵＣプラスミドベクター、ｐＴｒｃプラスミドベクターが例示できる。なお、本発明の発現ベクターは、抗生物質耐性遺伝子等の選択マーカーを備えていてよい。また、前記適切な位置とは、発現ベクターの複製機能、選択マーカー、伝達性に関わる領域を破壊しない位置を意味する。前記発現ベクターに本発明のポリヌクレオチドを挿入する際は、発現に必要なプロモーター等の機能性ポリヌクレオチドに連結された状態で挿入すると好ましい。
　また本発明の遺伝子組換え宿主において、本発明のポリヌクレオチドは、ゲノムＤＮＡ上に導入されてもよい。ゲノムＤＮＡへの本発明のポリヌクレオチドの導入は、例えば、相同組み換えによる遺伝子導入法を利用して実施できる。相同組み換えによる遺伝子導入法としては、Ｒｅｄ－ｄｒｉｖｅｎ　ｉｎｔｅｇｒａｔｉｏｎ法（Ｄａｔｓｅｎｋｏ，Ｋ．Ａ，ａｎｄ　Ｗａｎｎｅｒ，Ｂ．Ｌ．，Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．ＵＳＡ．，９７：６６４０－６６４５（２０００））等の直鎖状ＤＮＡを用いる方法、温度感受性複製起点を含むベクターを用いる方法、宿主内で機能する複製起点を持たないベクターを用いる方法、ファージを用いたｔｒａｎｓｄｕｃｔｉｏｎ法が例示できる。
　本発明の発現ベクター等のポリヌクレオチドを用いた宿主の形質転換は、例えば、当業者が通常用いる方法で実施できる。例えば、宿主として大腸菌を選択した場合は、コンピテントセル法、ヒートショック法、エレクトロポレーション法等で形質転換すればよい。形質転換後に適切な方法で本発明のポリヌクレオチドを含む宿主をスクリーニングすることで、本発明の遺伝子組換え宿主を取得できる。
　なお、各種微生物において利用可能な発現ベクターやプロモーター等の遺伝子工学的手法に関する情報は、例えば「微生物学基礎講座８　遺伝子工学、共立出版、１９８７年」などの公知文献を利用し、取得すればよい。
　本発明の遺伝子組換え宿主が本発明の発現ベクターを含む場合、本発明の遺伝子組換え宿主から本発明の発現ベクターを調製できる。例えば、本発明の遺伝子組換え宿主を培養して得られる培養物からアルカリ抽出法またはＱＩＡｐｒｅｐ　Ｓｐｉｎ　Ｍｉｎｉｐｒｅｐ　ｋｉｔ（ＱＩＡＧＥＮ社製）等の市販の抽出キットを用いて本発明の発現ベクターを調製できる。
　本発明の遺伝子組換え宿主を培養することで、本発明のタンパク質を発現できる。また、本発明の遺伝子組換え宿主を培養することで、本発明のタンパク質を発現させ、発現した前記タンパク質を回収することで、本発明のタンパク質を製造できる。すなわち、本明細書は、本発明の遺伝子組換え宿主を培養することで本発明のタンパク質を発現させる工程と、発現された前記タンパク質を回収する工程とを含む、本発明のタンパク質の製造方法を開示する。培地組成や培養条件は、宿主の種類や本発明のタンパク質の特性等の諸条件に応じて適宜設定すればよい。培地組成や培養条件は、例えば、宿主が増殖でき、かつ、本発明のタンパク質を発現可能な条件に設定すればよい。培地は、例えば、炭素源、窒素源、無機塩、その他の各種有機成分や無機成分を適宜含む培地を使用できる。具体的には、宿主が大腸菌の場合、必要な栄養源を補ったＬＢ（Ｌｕｒｉａ－Ｂｅｒｔａｎｉ）培地（トリプトン１％（ｗ／ｖ）、酵母エキス０．５％（ｗ／ｖ）、１％（ｗ／ｖ）ＮａＣｌ）が好ましい培地の一例として挙げられる。なお、本発明の発現ベクターの導入の有無により、本発明の遺伝子組換え宿主を選択的に増殖させるために、培地に当該発現ベクターに含まれる抗生物質耐性遺伝子に対応した抗生物質を添加して培養すると好ましい。例えば、当該発現ベクターがカナマイシン耐性遺伝子を含んでいる場合は培地にカナマイシンを添加すればよい。本発明のポリヌクレオチドがゲノムＤＮＡ上に導入されている場合も同様である。また、培地は、グルタチオン、システイン、シスタチン、チオグリコレートおよびジチオスレイトールからなる群から選択される一種類以上の還元剤を含んでいてもよい。また培地は、グリシン等の前記形質転換体から培養液へのタンパク質分泌を促す試薬を含んでいてもよい。例えば、宿主が大腸菌の場合、培地に対してグリシンを２％（ｗ／ｖ）以下で添加すると好ましい。培養温度は、例えば、宿主が大腸菌の場合、一般に１０℃以上４０℃以下、好ましくは２０℃以上３７℃以下、より好ましくは２５℃前後である。培地のｐＨは、例えば、宿主が大腸菌の場合、ｐＨ６．８以上ｐＨ７．４以下、好ましくはｐＨ７．０前後である。また、本発明のタンパク質を誘導性のプロモーターの制御下で発現する場合は、本発明のタンパク質が良好に発現できるように誘導をかけると好ましい。発現誘導には、例えば、プロモーターの種類に応じた誘導剤を用いることができる。誘導剤としては、ＩＰＴＧ（Ｉｓｏｐｒｏｐｙｌ－β－Ｄ－ｔｈｉｏｇａｌａｃｔｏｐｙｒａｎｏｓｉｄｅ）を例示できる。宿主が大腸菌の場合、例えば、培養液の濁度（６００ｎｍにおける吸光度）が約０．５から１．０となったときに適当量のＩＰＴＧを添加し、引き続き培養することで、本発明のタンパク質の発現を誘導できる。ＩＰＴＧの添加濃度は、例えば、０．００５ｍＭ以上１．０ｍＭ以下、好ましくは０．０１ｍＭ以上０．５ｍＭ以下である。ＩＰＴＧ誘導等の発現誘導は、例えば、当該技術分野において周知の条件で行なえる。
　本発明のタンパク質は、その発現形態に適した方法で培養物から分離し回収すればよい。なお、本明細書において「培養物」とは、培養で得られた培養液の全体またはその一部を意味する。当該一部は、本発明のタンパク質を含む部分であれば特に制限されない。当該一部としては、培養された本発明の形質転換体の細胞や培養後の培地（すなわち培養上清）などが挙げられる。例えば、本発明のタンパク質が培養上清に蓄積する場合、細胞を遠心分離操作で分離し、得られる培養上清から本発明のタンパク質を回収すればよい。また、本発明のタンパク質が細胞内（ペリプラズムを含む）に蓄積する場合、細胞を遠心分離操作で回収後、酵素処理剤や界面活性剤等を添加して細胞を破砕し、当該破砕物から本発明のタンパク質を回収すればよい。前述した培養上清や細胞破砕物からの、本発明のタンパク質の回収は、例えば、タンパク質の分離精製に用いられる公知の方法で実施できる。前記回収方法の一例として、硫安分画、イオン交換クロマトグラフィー、疎水クロマトグラフィー、アフィニティークロマトグラフィー、ゲルろ過クロマトグラフィー、等電点沈殿が挙げられる。
　本発明のタンパク質は、例えば、免疫グロブリン（抗体）の分離または分析に使用できる。前記目的で使用する際は、例えば、不溶性担体と当該不溶性担体に固定化した本発明のタンパク質とを含む免疫グロブリン吸着剤（以下、単に「本発明の免疫グロブリン吸着剤」ともいう）の態様で使用できる。なお、本明細書において、「免疫グロブリンの分離」とは、夾雑物質共存下の溶液からの免疫グロブリンの分離に限らず、構造、性質、または活性等に基づく免疫グロブリン間の分離も含む。不溶性担体は、水溶液に対して不溶性の担体であれば特に制限されない。不溶性担体としては、アガロース、アルギネート（アルギン酸塩）、カラゲナン、キチン、セルロース、デキストリン、デキストラン、デンプン等の多糖質を原料とした担体や、ポリビニルアルコール、ポリメタクレート、ポリ（２－ヒドロキシエチルメタクリレート）、ポリウレタン等の合成高分子を原料とした担体や、シリカ等のセラミックスを原料とした担体が例示できる。中でも、多糖質を原料とした担体や合成高分子を原料とした担体が不溶性担体として好ましい。前記好ましい担体の一例として、トヨパール（東ソー社製）等のヒドロキシ基を導入したポリメタクリレートゲル、Ｓｅｐｈａｒｏｓｅ（Ｃｙｔｉｖａ社製）等のアガロースゲル、セルファイン（ＪＮＣ社製）等のセルロースゲルが挙げられる。不溶性担体の形状は特に制限されない。不溶性担体は、例えば、カラムに充填できる形状であってよい。不溶性担体は、例えば、粒状物または非粒状物であってよい。また、不溶性担体は、例えば、多孔性または非多孔性であってもよい。
　本発明における分離または分析対象の免疫グロブリン（抗体）は、本発明のタンパク質が結合性を有するものであれば、特に制限されない。免疫グロブリンは、具体的には、κ軽鎖を有するものであってよい。免疫グロブリンは、κ軽鎖に加えて、Ｆｃ領域等の他の領域を含んでいてもよく、いなくてもよい。免疫グロブリンは、例えば、シングルチェーンＦｖ（ｓｃＦｖ）、Ｆａｂ、Ｆ（ａｂ’）２、ＩｇＡ、二重特異性Ｔ細胞誘導（ＢｉＴＥ）抗体等の、Ｆｃ領域を有しないものであってもよい。免疫グロブリンは、モノクローナル抗体であってもよく、ポリクローナル抗体であってもよい。免疫グロブリンは、例えば、ＩｇＧ、ＩｇＭ、ＩｇＡ、ＩｇＤ、およびＩｇＥのいずれであってもよい。ＩｇＧは、例えば、ＩｇＧ１、ＩｇＧ２、ＩｇＧ３、およびＩｇＧ４のいずれであってもよい。免疫グロブリンの由来は、特に制限されない。免疫グロブリンは、単一の生物に由来するものであってもよく、２種またはそれ以上の生物の組み合わせに由来するものであってもよい。免疫グロブリンとしては、キメラ抗体、ヒト化抗体、ヒト抗体、それらのバリアント（例えばアミノ酸置換体）があげられる。また、免疫グロブリンとしては、二重特異性抗体（バイスペシフィック抗体）、κ軽鎖と他のタンパク質との融合抗体、κ軽鎖と薬物との複合体（ＡＤＣ）等の人工的に構造改変した抗体もあげられる。なお、「免疫グロブリン」には、抗体医薬も包含される。
　本発明のタンパク質は、例えば、共有結合により不溶性担体に固定化してもよい。具体例として、不溶性担体が有する活性基を介して、本発明のタンパク質と不溶性担体とを共有結合させることで、不溶性担体に前記タンパク質を固定化できる。すなわち、前記不溶性担体は、その表面などに活性基を有していてよい。前記活性基の一例として、Ｎ－ヒドロキシコハク酸イミド（ＮＨＳ）活性化エステル基、エポキシ基、カルボキシ基、マレイミド基、ハロアセチル基、トレシル基、ホルミル基、ハロアセトアミドが挙げられる。活性基を有する不溶性担体としては、例えば、活性基を有する市販の不溶性担体をそのまま用いてもよいし、不溶性担体に活性基を導入して用いてもよい。活性基を有する市販の担体としては、ＴＯＹＯＰＥＡＲＬ　ＡＦ－Ｅｐｏｘｙ－６５０Ｍ、ＴＯＹＯＰＥＡＲＬ　ＡＦ－Ｔｒｅｓｙｌ－６５０Ｍ（いずれも東ソー社製）、ＨｉＴｒａｐ　ＮＨＳ－ａｃｔｉｖａｔｅｄ　ＨＰ　Ｃｏｌｕｍｎｓ、ＮＨＳ－ａｃｔｉｖａｔｅｄ　Ｓｅｐｈａｒｏｓｅ　４　Ｆａｓｔ　Ｆｌｏｗ、Ｅｐｏｘｙ－ａｃｔｉｖａｔｅｄ　Ｓｅｐｈａｒｏｓｅ　６Ｂ（いずれもＣｙｔｉｖａ社製）、ＳｕｌｆｏＬｉｎｋ　Ｃｏｕｐｌｉｎｇ　Ｒｅｓｉｎ（サーモフィッシャーサイエンティフィック社製）が例示できる。
　担体表面に活性基を導入する方法としては、担体表面に存在するヒドロキシ基、エポキシ基、カルボキシ基、アミノ基等に対して２個以上の活性部位を有する化合物の一方を反応させる方法が例示できる。
　担体表面に存在するヒドロキシ基やアミノ基にエポキシ基を導入する化合物としては、エピクロロヒドリン、エタンジオールジグリシジルエーテル、ブタンジオールジグリシジルエーテル、ヘキサンジオールジグリシジルエーテルを例示できる。
　また、担体表面に存在するエポキシ基にカルボキシ基を導入する化合物としては、２－メルカプト酢酸、３－メルカプトプロピオン酸、４－メルカプト酪酸、６－メルカプト酪酸、グリシン、３－アミノプロピオン酸、４－アミノ酪酸、６－アミノヘキサン酸を例示できる。
　また、担体表面に存在するヒドロキシ基、エポキシ基、カルボキシ基、アミノ基にマレイミド基を導入する化合物としては、Ｎ－（ε－マレイミドカプロン酸）ヒドラジド、Ｎ－（ε－マレイミドプロピオン酸）ヒドラジド、４－（４－Ｎ－マレイミドフェニル）酢酸ヒドラジド、２－アミノマレイミド、３－アミノマレイミド、４－アミノマレイミド、６－アミノマレイミド、１－（４－アミノフェニル）マレイミド、１－（３－アミノフェニル）マレイミド、４－（マレイミド）フェニルイソシアナート、２－マレイミド酢酸、３－マレイミドプロピオン酸、４－マレイミド酪酸、６－マレイミドヘキサン酸、Ｎ－（α－マレイミドアセトキシ）スクシンイミドエステル、（ｍ－マレイミドベンゾイル）Ｎ－ヒドロキシスクシンイミドエステル、スクシンイミジル－４－（マレイミドメチル）シクロヘキサン－１－カルボニル－（６－アミノヘキサン酸）、スクシンイミジル－４－（マレイミドメチル）シクロヘキサン－１－カルボン酸、（ｐ－マレイミドベンゾイル）Ｎ－ヒドロキシスクシンイミドエステル、（ｍ－マレイミドベンゾイル）Ｎ－ヒドロキシスクシンイミドエステルを例示できる。
　また、担体表面に存在するヒドロキシ基やアミノ基にハロアセチル基を導入する化合物としては、クロロ酢酸、ブロモ酢酸、ヨード酢酸、クロロ酢酸クロリド、ブロモ酢酸クロリド、ブロモ酢酸ブロミド、クロロ酢酸無水物、ブロモ酢酸無水物、ヨード酢酸無水物、２－（ヨードアセトアミド）酢酸－Ｎ－ヒドロキシスクシンイミドエステル、３－（ブロモアセトアミド）プロピオン酸－Ｎ－ヒドロキシスクシンイミドエステル、４－（ヨードアセチル）アミノ安息香酸－Ｎ－ヒドロキシスクシンイミドエステルを例示できる。
　また、担体表面に活性基を導入する方法としては、担体表面に存在するヒドロキシ基やアミノ基にω－アルケニルアルカングリシジルエーテルを反応させた後、ハロゲン化剤でω－アルケニル部位をハロゲン化することで活性化する方法も例示できる。ω－アルケニルアルカングリシジルエーテルとしては、アリルグリシジルエーテル、３－ブテニルグリシジルエーテル、４－ペンテニルグリシジルエーテルを例示できる。ハロゲン化剤としては、Ｎ－クロロスクシンイミド、Ｎ－ブロモスクシンイミド、Ｎ－ヨードスクシンイミドを例示できる。
　また、担体表面に活性基を導入する方法としては、担体表面に存在するカルボキシ基に対して縮合剤と添加剤を用いて活性基を導入する方法も例示できる。縮合剤としては、１－エチル－３－（３－ジメチルアミノプロピル）カルボジイミド（ＥＤＣ）、ジシクロヘキシルカルボジアミド、カルボニルジイミダゾールを例示できる。添加剤としては、Ｎ－ヒドロキシコハク酸イミド（ＮＨＳ）、４－ニトロフェノール、１－ヒドロキシベンズトリアゾールを例示できる。
　本発明のタンパク質の不溶性担体への固定化は、例えば、緩衝液中で実施できる。緩衝液としては、酢酸緩衝液、リン酸緩衝液、ＭＥＳ（２－Ｍｏｒｐｈｏｌｉｎｏｅｔｈａｎｅｓｕｌｆｏｎｉｃ　ａｃｉｄ）緩衝液、ＨＥＰＥＳ（４－（２－Ｈｙｄｒｏｘｙｅｔｈｙｌ）－１－ｐｉｐｅｒａｚｉｎｅｅｔｈａｎｅｓｕｌｆｏｎｉｃ　ａｃｉｄ）緩衝液、トリス緩衝液、ホウ酸緩衝液を例示できる。固定化させるときの反応温度は、例えば、活性基の反応性や本発明のタンパク質の安定性等の諸条件に応じて適宜設定できる。固定化させるときの反応温度は、例えば、５℃以上５０℃以下であってよく、好ましくは１０℃以上３５℃以下である。
　本発明の免疫グロブリン吸着剤は、例えば、前記吸着剤を充填したカラムの態様にすることで、免疫グロブリン（抗体）の分離に使用できる。例えば、本発明の免疫グロブリン吸着剤を充填したカラムに免疫グロブリンを含む溶液を添加して当該免疫グロブリンを前記吸着剤に吸着させ、前記吸着剤に吸着した免疫グロブリンを溶出させることで、免疫グロブリンを分離できる。すなわち、本明細書は、本発明の免疫グロブリン吸着剤を充填したカラムに免疫グロブリンを含む溶液を添加して当該免疫グロブリンを前記吸着剤に吸着させる工程と、前記吸着剤に吸着した免疫グロブリンを溶出させる工程とを含む、前記溶液中に含まれる免疫グロブリンの分離方法を開示する。免疫グロブリンを含む溶液は、例えば、ポンプ等の送液手段を用いてカラムに添加できる。なお、免疫グロブリンを含む溶液は、カラムに添加する前に予め適切な緩衝液を用いて溶媒置換してよい。また、免疫グロブリンを含む溶液をカラムに添加する前に、適切な緩衝液を用いてカラムを平衡化してよい。カラムの平衡化により、例えば、免疫グロブリンをより高純度に分離できると期待される。溶媒置換や平衡化に用いる緩衝液としては、リン酸緩衝液、酢酸緩衝液、ＭＥＳ緩衝液が例示できる。そのような緩衝液には、例えば、さらに、１ｍＭ以上１０００ｍＭ以下の塩化ナトリウム等の無機塩を添加してもよい。溶媒置換に用いる緩衝液と平衡化に用いる緩衝液は、同一であってもよく、同一でなくてもよい。また、免疫グロブリンを含む溶液のカラムへの通液後に夾雑物質等の免疫グロブリン以外の成分がカラムに残存している場合、免疫グロブリン吸着剤に吸着した免疫グロブリンを溶出する前に、そのような成分をカラムから除去してよい。免疫グロブリン以外の成分は、例えば、適切な緩衝液を用いてカラムから除去できる。免疫グロブリン以外の成分の除去に用いる緩衝液については、例えば、溶媒置換や平衡化に用いる緩衝液についての記載を準用できる。免疫グロブリン吸着剤に吸着した免疫グロブリンは、例えば、免疫グロブリンとリガンド（本発明のタンパク質）との相互作用を弱めることで溶出できる。免疫グロブリンとリガンド（本発明のタンパク質）との相互作用を弱める手段としては、ｐＨ変化、カウンターペプチドの添加、温度上昇、塩濃度変化が例示できる。免疫グロブリンとリガンド（本発明のタンパク質）との相互作用を弱める手段としては、特に、ｐＨ変化が例示できる。すなわち、前記吸着剤に吸着した免疫グロブリンを溶出させる工程としては、特に、前記吸着剤に吸着した免疫グロブリンをｐＨ変化で溶出させる工程が例示できる。ｐＨ変化としては、ｐＨの低下が例示できる。ｐＨの低下としては、緩衝液によるｐＨの低下が例示できる。免疫グロブリン吸着剤に吸着した免疫グロブリンは、具体的には、例えば、適切な溶出液を用いて溶出できる。溶出液としては、溶媒置換や平衡化に用いる緩衝液よりも酸性側の緩衝液が挙げられる。前記酸性側の緩衝液としては、クエン酸緩衝液、グリシン塩酸緩衝液、酢酸緩衝液を例示できる。すなわち、前記酸性側の緩衝液を利用することで、ｐＨを低下させることができる。溶出液のｐＨは、例えば、免疫グロブリンの機能（抗原への結合性等）を損なわない範囲で設定できる。溶出液のｐＨは、例えば、２以上、２．１以上、２．２以上、２．３以上、２．４以上、２．５以上、２．６以上、２．７以上、２．８以上、２．９以上、３以上、３．１以上、または３．２以上であってもよく、４以下、３．５以下、３．２以下、３．１以下、３以下、２．９以下、２．８以下、２．７以下、２．６以下、または２．５以下であってもよく、それらの矛盾しない組み合わせであってもよい。溶出液のｐＨは、具体的には、例えば、２以上４以下、２．２以上４以下、または２．４以上４以下であってもよい。
　なお、免疫グロブリン吸着剤に吸着した免疫グロブリンの溶出を緩衝液によるｐＨの低下で行なう場合、本発明の免疫グロブリン吸着剤の構成要素である本発明のタンパク質が温和なｐＨ条件で抗体溶出が可能な免疫グロブリン結合性タンパク質であると、不溶性担体と当該不溶性担体に固定化した非改変型アミノ酸配列からなる免疫グロブリン結合性タンパク質とを含む免疫グロブリン吸着剤よりも、溶出液のｐＨを高くする（すなわち、よりｐＨの高い（中性に近い）条件で免疫グロブリンを溶出する）ことができる。例えば、少なくともＧｌｙ２１Ａｒｇ、Ｇｌｙ５１Ｖａｌ、ならびにＡｓｎ６２Ｈｉｓ、Ａｓｎ６２ＡｒｇおよびＡｓｎ６２Ｔｒｐのいずれか、より選択される１つ以上のアミノ酸置換を有する本発明のタンパク質は、温和なｐＨ条件で抗体溶出が可能な免疫グロブリン結合性タンパク質であり得る。また、例えば、少なくとも第２グループ変異を有する本発明のタンパク質は、温和なｐＨ条件で抗体溶出が可能な免疫グロブリン結合性タンパク質であり得る。すなわち、免疫グロブリン吸着剤の構成要素である免疫グロブリン結合性タンパク質として温和なｐＨ条件で抗体溶出が可能な免疫グロブリン結合性タンパク質である本発明のタンパク質を用いることで、非改変型アミノ酸配列からなる免疫グロブリン結合性タンパク質を用いたときよりも、より温和なｐＨ条件（すなわち中性に近い条件）で免疫グロブリンを溶出できる。この場合の溶出液のｐＨは、例えば、上記例示した溶出液のｐＨの範囲であってよい。また、溶出液のｐＨは、例えば、２．５以上、２．６以上、２．７以上、２．８以上、２．９以上、２．９５以上、３以上、３．０５以上、３．１以上、３．１５以上、または３．２以上であってもよく、４以下、３．５以下、３．３以下、３．２以下、３．１以下、または３以下であってもよく、それらの矛盾しない組み合わせであってもよい。溶出液のｐＨは、具体的には、例えば、２．５以上４以下、２．８以上４以下、２．９５以上４以下、３以上４以下、または３．０５以上４以下であってもよい。
　前述した方法で免疫グロブリン（抗体）を分離することで、分離された免疫グロブリンが得られる。すなわち、免疫グロブリンの分離方法は、その一態様において、免疫グロブリンの製造方法であってよく、具体的には、分離された免疫グロブリンの製造方法であってよい。免疫グロブリンは、例えば、免疫グロブリンを含む溶出画分として得られる。すなわち、溶出された免疫グロブリンを含む画分を分取できる。画分の分取は、例えば、常法により行なえばよい。画分を分取する方法としては、一定の時間ごとや、一定の容量ごとに回収容器を交換する方法や、溶出液のクロマトグラムの形状に合わせて回収容器を換える方法や、オートサンプラー等の自動フラクションコレクター等で画分を分取する方法が挙げられる。さらに、免疫グロブリンを含む画分から免疫グロブリンを回収することもできる。免疫グロブリンを含む画分からの免疫グロブリンの回収は、例えば、タンパク質の分離精製に用いられる公知の方法により行なえばよい。
　以下、実施例を用いて本発明をさらに具体的に説明するが、本発明は実施例に限定されるものではない。なお、参考例は本発明を構成しない。
　実施例１　Ｐｒｏｔｅｉｎ　Ｌ免疫グロブリン結合ドメインＣ３発現ベクターの作製
　（１）配列番号１に記載のアミノ酸配列からなるＦｉｎｅｇｏｌｄｉａ属菌（Ｆｉｎｅｇｏｌｄｉａ　ｍａｇｎａ）由来のＰｒｏｔｅｉｎ　Ｌ（以下、ＦｐＬ）の免疫グロブリン結合ドメインＣ３（ＧｅｎＢａｎｋ　Ｎｏ．ＡＡＡ６７５０３（配列番号２１０）の３９４番目から４６３番目までのアミノ酸残基、以下「ＦｐＬ＿Ｃ３」とも表記）のアミノ酸配列をコードするポリヌクレオチド（配列番号２）を合成した。なお、合成する際、５’末端側には制限酵素ＮｃｏＩの認識配列（５’－ＣＣＡＴＧＧ－３’）を、３’末端側にはヒスチジン６残基をコードするヌクレオチド配列（５’－ＣＡＴＣＡＣＣＡＣＣＡＴＣＡＣＣＡＣ－３’；配列番号２３２）、終止コドンおよび制限酵素ＨｉｎｄＩＩＩの認識配列（５’－ＡＡＧＣＴＴ－３’）を、それぞれ付加している。
　（２）合成により得た配列番号２を含むポリヌクレオチドを制限酵素ＮｃｏＩおよびＨｉｎｄＩＩＩで処理後、アガロースゲル電気泳動により目的物のサイズのバンドを確認した。目的バンドを切り出したのち、ＱＩＡｑｕｉｃｋ　Ｇｅｌ　Ｅｘｔｒａｃｔｉｏｎ　ｋｉｔ（ＱＩＡＧＥＮ社製）によりポリヌクレオチドを精製した。
　（３）（２）で得たポリヌクレオチドと、予め制限酵素ＮｃｏＩとＨｉｎｄＩＩＩで消化したプラスミドｐＥＴ－２６ｂをＤＮＡ　Ｌｉｇａｔｉｏｎ　Ｋｉｔ（タカラバイオ社製）を用いてライゲーションを行なった。当該ライゲーション産物を用いて大腸菌ＢＬ２１（ＤＥ３）株を形質転換し、５０μｇ／ｍＬのカナマイシンを含むＬＢ（Ｌｕｒｉａ－Ｂｅｒｔａｎｉ）プレート培地で培養（３７℃、１６時間）した。
　（４）（３）で取得した形質転換体（遺伝子組換え大腸菌）を選択し、５０μｇ／ｍＬのカナマイシンを含むＬＢ培地にて培養後、ＱＩＡｐｒｅｐ　Ｓｐｉｎ　Ｍｉｎｉｐｒｅｐ　ｋｉｔ（ＱＩＡＧＥＮ社製）による精製で、ＦｐＬ＿Ｃ３を発現可能なベクター（ｐＥＴ－ＦｐＬ＿Ｃ３と命名）を取得した。
　（５）（４）で取得した発現ベクターｐＥＴ－ＦｐＬ＿Ｃ３のうち、ＦｐＬ＿Ｃ３をコードするポリヌクレオチドおよびその周辺領域について、チェーンターミネータ法に基づくＢｉｇ　Ｄｙｅ　Ｔｅｒｍｉｎａｔｏｒ　Ｃｙｃｌｅ　Ｓｅｑｕｅｎｃｉｎｇ　ｒｅａｄｙ　Ｒｅａｃｔｉｏｎ　ｋｉｔ（サーモフィッシャーサイエンティフィック社製）を用いてサイクルシークエンス反応に供し、全自動ＤＮＡシークエンサーＡＢＩ　Ｐｒｉｓｍ　３７００　ＤＮＡ　ａｎａｌｙｚｅｒ（サーモフィッシャーサイエンティフィック社製）にてヌクレオチド配列を解析した。なお、当該解析の際、配列番号３（５’－ＴＡＡＴＡＣＧＡＣＴＣＡＣＴＡＴＡＧＧＧ－３’）または配列番号４（５’－ＴＡＴＧＣＴＡＧＴＴＡＴＴＧＣＴＣＡＧ－３’）に記載の配列からなるオリゴヌクレオチドをシークエンス用プライマーとして使用した。
　配列解析の結果、発現ベクターｐＥＴ－ＦｐＬ＿Ｃ３に、配列番号２に記載の配列からなるポリヌクレオチドが挿入されていることを確認した。
　実施例２　ＦｐＬ＿Ｃ３への変異導入およびライブラリ作製（その１）
　実施例１で作製した発現ベクターｐＥＴ－ＦｐＬ＿Ｃ３のうち、免疫グロブリン結合性タンパク質をコードするポリヌクレオチド部分（配列番号２）にエラープローンＰＣＲによりランダムに変異を導入した。
　（１）実施例１で作製したｐＥＴ－ＦｐＬ＿Ｃ３を鋳型ＤＮＡとして用い、エラープローンＰＣＲを行なった。エラープローンＰＣＲは表１に示す組成の反応液を調製後、当該反応液を９５℃で２分間熱処理し、９５℃で３０秒間の第１ステップ、５０℃で３０秒間の第２ステップ、７２℃で９０秒間の第３ステップを１サイクルとする反応を３０サイクル行ない、最後に７２℃で７分間熱処理することで行なった。前記エラープローンＰＣＲによりＦｐＬ＿Ｃ３をコードするポリヌクレオチド（配列番号２）に良好に変異が導入され、その平均変異導入率は１．６％であった。
Figure JPOXMLDOC01-appb-T000001
　（２）得られたＰＣＲ産物を精製後、制限酵素ＮｃｏＩとＨｉｎｄＩＩＩで消化し、あらかじめ制限酵素ＮｃｏＩとＨｉｎｄＩＩＩで消化した発現ベクターｐＥＴ－２６ｂにライゲーションした。
　（３）ライゲーション反応終了後、反応液を用いて大腸菌ＢＬ２１（ＤＥ３）株を形質転換し、５０μｇ／ｍＬのカナマイシンを含むＬＢプレート培地で培養（３７℃、１６時間）した後、プレート上に形成したコロニーをランダム変異体ライブラリとした。
　実施例３　ＦｐＬ＿Ｃ３アミノ酸置換体のスクリーニング（その１）
　（１）実施例２で作製したランダム変異体ライブラリ（形質転換体）または実施例１で作製したＦｐＬ＿Ｃ３（配列番号１）を発現する形質転換体を５０μｇ／ｍＬのカナマイシンを含む２×ＹＴ液体培地（トリプトン　１．６％（ｗ／ｖ）、酵母エキス　１％（ｗ／ｖ）、塩化ナトリウム　０．５％（ｗ／ｖ））２５０μＬに接種し、９６ディープウェルプレートを用いて３７℃で終夜振とう培養した。
　（２）培養後、５０μｇ／ｍＬのカナマイシン、０．３％（ｗ／ｖ）のグリシン、および０．０１ｍＭのＩＰＴＧ（Ｉｓｏｐｒｏｐｙｌ－β－Ｄ－ｔｈｉｏｇａｌａｃｔｏｐｙｒａｎｏｓｉｄｅ）を含む２×ＹＴ液体培地５００μＬに（１）の培養液５μＬを植え継ぎ、９６ディープウェルプレートを用いてさらに２０℃で終夜振とう培養した。
　（３）培養後、遠心操作によって得られた培養上清と１．０Ｍ　ＮａＯＨとを等量混合し、３８℃で１５分間アルカリ処理を行なった。
　（４）アルカリ処理を行なった時の免疫グロブリン結合性タンパク質の抗体結合活性を下記に示すＥＬＩＳＡ法にて測定し、（３）のアルカリ処理を行なった時の免疫グロブリン結合性タンパク質の抗体結合活性を、（３）のアルカリ処理を行わなかった時の免疫グロブリン結合性タンパク質の抗体結合活性で除することで残存活性を算出した。
（４－１）Ｔｒｉｓ－Ｂｕｆｆｅｒｅｄ　Ｓａｌｉｎｅ（ＴＢＳ）を用いて１０μｇ／ｍＬに調製したヒト抗体（ガンマグロブリン製剤、化学及血清療法研究所製）を９６ウェルマイクロプレートの各ウェルに分注し固定化した（４℃、１６時間）。固定化後、ＴＢＳを用いて２％（ｗ／ｖ）に調製したスキムミルク（ベクトン・ディッキンソン社製）を用いてブロッキングした。
（４－２）洗浄緩衝液（０．１５Ｍ　ＮａＣｌおよび０．０５％（ｗ／ｖ）Ｔｗｅｅｎ　２０（商品名）を含む０．０５Ｍ　Ｔｒｉｓ緩衝液（ｐＨ７．５）、以下「洗浄緩衝液Ａ」とも表記）で９６ウェルマイクロプレートの各ウェルを洗浄後、抗体結合活性を評価する免疫グロブリン結合性タンパク質を含む溶液を添加し、免疫グロブリン結合性タンパク質と固定化ガンマグロブリンとを反応させた（３０℃、１時間）。
（４－３）反応終了後、洗浄緩衝液Ａで洗浄し、１００ｎｇ／ｍＬに希釈したＡｎｔｉ－６－Ｈｉｓ　Ａｎｔｉｂｏｄｙ（ＢＥＴＨＹＬ　ＬＡＢＯＲＡＴＯＲＩＥＳ社製）を１００μＬ／ｗｅｌｌ添加し反応させた（３０℃、１時間）。
（４－４）反応終了後、洗浄緩衝液Ａで洗浄し、ＴＭＢ　Ｐｅｒｏｘｉｄａｓｅ　Ｓｕｂｓｔｒａｔｅ（ＫＰＬ社製）を５０μＬ／ｗｅｌｌで添加した。次に１Ｍリン酸を５０μＬ／ｗｅｌｌ添加することで反応を停止し、マイクロプレートリーダー（テカン社製）にて４５０ｎｍの吸光度を測定した。
　（５）約１６００株の形質転換体を評価し、その中から天然型（アミノ酸置換がない）ＦｐＬ＿Ｃ３（配列番号１）と比較してアルカリ安定性が向上した免疫グロブリン結合性タンパク質を発現する形質転換体を選択した。
　（６）選択した形質転換体を培養し、ＱＩＡｐｒｅｐ　Ｓｐｉｎ　Ｍｉｎｉｐｒｅｐ　ｋｉｔ（ＱＩＡＧＥＮ社製）を用いて発現ベクターを調製した。
　（７）得られた発現ベクターに挿入された免疫グロブリン結合性タンパク質をコードするポリヌクレオチド領域の配列を、実施例１（５）に記載の方法によりヌクレオチド配列を解析し、アミノ酸置換箇所を特定した。
　（８）（５）で選択した免疫グロブリン結合性タンパク質を発現する形質転換体を、それぞれ５０μｇ／ｍＬのカナマイシンを含む２ｍＬの２×ＹＴ液体培地に接種し、３７℃で終夜、好気的に振とう培養することで前培養を行なった。
　（９）５０μｇ／ｍＬのカナマイシンを添加した２０ｍＬの２×ＹＴ液体培地に前培養液を２００μＬ接種し、３７℃で好気的に振とう培養を行なった。
　（１０）培養開始から２時間後、培養温度を２０℃に変更し、終濃度０．０１ｍＭとなるようＩＰＴＧを添加し、２０℃で終夜、好気的に振とう培養した。
　（１１）培養終了後、遠心分離により集菌し、ＢｕｇＢｕｓｔｅｒ　Ｐｒｏｔｅｉｎ　Ｅｘｔｒａｃｔｉｏｎ　Ｒｅａｇｅｎｔ（メルク社製）を用いてタンパク質抽出液を調製した。
　（１２）（１１）で調製したタンパク質抽出液中の免疫グロブリン結合性タンパク質の抗体結合活性を、（４）に記載のＥＬＩＳＡ法を用いて測定した。
　（１３）各タンパク質の濃度が等しくなるよう、ＴＢＳを用いて希釈した。希釈液を二等分し、一方には０．２Ｍ　ＮａＯＨ（アルカリ処理）を、もう一方にはＴＢＳ（アルカリ未処理）を、それぞれ等量添加し混合後、２５℃で５時間静置した。
　（１４）１Ｍトリス緩衝液（ｐＨ７．０）を４倍量加えた後、アルカリ処理（終濃度０．１Ｍ　ＮａＯＨで２５℃、５時間処理）およびアルカリ未処理のタンパク質溶液の抗体結合活性を、（４）に記載のＥＬＩＳＡ法によって測定した。アルカリ処理した免疫グロブリン結合性タンパク質の抗体結合活性を、アルカリ未処理の免疫グロブリン結合性タンパク質の抗体結合活性で除することで残存活性を算出し、アルカリ安定性を評価した。
　結果を表２に示す。配列番号１に記載のアミノ酸配列において、少なくともＰｒｏ３Ｓｅｒ（この表記は配列番号１の３番目のプロリンに相当するアミノ酸残基がセリンに置換されていることを表す、以下同様）、Ｇｌｕ５Ｖａｌ、Ｇｌｕ８Ｇｌｙ、Ｉｌｅ１７Ｐｈｅ、Ｇｌｕ２７Ｇｌｙ、Ａｌａ４１Ｔｈｒ、Ａｓｎ４４Ｓｅｒ、Ｇｌｕ４９Ｖａｌ、Ａｓｎ５０Ｓｅｒ、Ａｓｎ５０Ｔｙｒ、Ａｓｎ５０Ｌｙｓ、Ａｓｎ５０Ａｓｐ、Ｇｌｕ５２Ｖａｌ、Ｇｌｕ５２Ｇｌｙ、Ｔｈｒ５４Ｉｌｅ、Ａｓｎ６２ＴｙｒおよびＡｓｎ６５Ｔｙｒより選択される１以上のアミノ酸置換を有した免疫グロブリン結合性タンパク質は、天然型ＦｐＬ＿Ｃ３（配列番号１）と比較しアルカリ安定性が向上しているといえる。
　中でもＡｓｎ５０ＴｙｒおよびＧｌｕ５２Ｇｌｙのアミノ酸置換を有した免疫グロブリン結合性タンパク質（配列番号１１、ＦｐＬ＿Ｃ３　２ａと命名）は、顕著なアルカリ安定性向上を確認した（天然型ＦｐＬ＿Ｃ３：４０％、ＦｐＬ＿Ｃ３　２ａ：９４％）。Ｇｌｕ５２Ｇｌｙ単独のアミノ酸置換を有した免疫グロブリン結合性タンパク質（配列番号１６）でのアルカリ安定性向上が顕著ではないことから（天然型ＦｐＬ＿Ｃ３：４０％、配列番号１６：４８％）、顕著なアルカリ安定性の向上をもたらすアミノ酸置換はＡｓｎ５０Ｔｙｒのほうであることが推測される。
Figure JPOXMLDOC01-appb-T000002
　実施例４　ＦｐＬ免疫グロブリン結合ドメインＣ４発現ベクターの作製
　（１）配列番号１８に記載のアミノ酸配列からなるＦｐＬの免疫グロブリン結合ドメインＣ４（ＧｅｎＢａｎｋ　Ｎｏ．ＡＡＡ６７５０３（配列番号２１０）の４６８番目から５３７番目までのアミノ酸残基、以下「ＦｐＬ＿Ｃ４」とも表記）のアミノ酸配列をコードするポリヌクレオチド（配列番号１９）を合成した。なお、合成する際、５’末端側には制限酵素ＮｃｏＩの認識配列（５’－ＣＣＡＴＧＧ－３’）を、３’末端側にヒスチジン６残基をコードするヌクレオチド配列（配列番号２３２）、終止コドンおよび制限酵素ＨｉｎｄＩＩＩの認識配列（５’－ＡＡＧＣＴＴ－３’）を、それぞれ付加している。
　（２）実施例１（２）と同様の方法で、（１）で合成した配列番号１９を含むポリヌクレオチドを精製した。
　（３）実施例１（３）と同様な方法で、（２）で得たポリヌクレオチドと予め制限酵素ＮｃｏＩとＨｉｎｄＩＩＩで消化したプラスミドｐＥＴ－２６ｂとをライゲーション後、当該ライゲーション産物を用いて大腸菌ＢＬ２１（ＤＥ３）株を形質転換し、培養した。
　（４）（３）で取得した形質転換体（遺伝子組換え大腸菌）を選択後、実施例１（４）と同様な方法で培養およびプラスミド精製を行ない、ＦｐＬ＿Ｃ４を発現可能なベクター（ｐＥＴ－ＦｐＬ＿Ｃ４と命名）を取得した。
　（５）（４）で取得した発現ベクターｐＥＴ－ＦｐＬ＿Ｃ４のうち、配列番号１９に記載のＦｐＬ＿Ｃ４をコードするポリヌクレオチドおよびその周辺領域について、実施例１（５）と同様な方法で配列解析を行なった。
　配列解析の結果、発現ベクターｐＥＴ－ＦｐＬ＿Ｃ４に、配列番号１９に記載の配列からなるポリヌクレオチドが挿入されていることを確認した。
　実施例５　ＦｐＬ＿Ｃ４への変異導入およびライブラリ作製
　実施例４で作製した発現ベクターｐＥＴ－ＦｐＬ＿Ｃ４のうち、免疫グロブリン結合性タンパク質をコードするポリヌクレオチド部分（配列番号１９）に、実施例２と同様の方法でエラープローンＰＣＲによりランダムに変異を導入し、ライブラリを作製した。変異導入率は、３．５％であった。
　実施例６　ＦｐＬ＿Ｃ４アミノ酸置換体のスクリーニング
　（１）実施例５で作製したランダム変異体ライブラリ（形質転換体）または実施例４で作製したＦｐＬ＿Ｃ４（配列番号１８）を発現する形質転換体を、実施例３（１）から（２）と同様な方法で培養した。
　（２）培養後、遠心操作によって得られた培養上清を１．０Ｍ　ＮａＯＨと等量混合し４２℃で１５分間アルカリ処理を行なった。
　（３）実施例３（４）に記載のＥＬＩＳＡ法を用いて残存活性を算出した。
　（４）約６００株の形質転換体を評価し、その中から天然型（アミノ酸置換がない）ＦｐＬ＿Ｃ４（配列番号１８）と比較してアルカリ安定性が向上した免疫グロブリン結合性タンパク質を発現する形質転換体を選択した。
　（５）選択した形質転換体を培養し、ＱＩＡｐｒｅｐ　Ｓｐｉｎ　Ｍｉｎｉｐｒｅｐ　ｋｉｔ（ＱＩＡＧＥＮ社製）を用いて発現ベクターを調製した。
　（６）得られた発現ベクターに挿入された免疫グロブリン結合性タンパク質をコードするポリヌクレオチド領域の配列を実施例１（５）に記載の方法によりヌクレオチド配列を解析し、アミノ酸置換箇所を特定した。
　（７）（４）で選択した免疫グロブリン結合性タンパク質を発現する形質転換体を、実施例３（８）から（１０）と同様な方法で培養し、実施例３（１１）に記載の方法でタンパク質抽出液を調製した。
　（８）（７）で調製したタンパク質抽出液中の免疫グロブリン結合性タンパク質の抗体結合活性を、実施例３（４）に記載のＥＬＩＳＡ法を用いて測定した。
　（９）処理時間を１５時間にした他は、実施例３（１３）と同様な方法でアルカリ処理後、実施例３（１４）と同様な方法で残存活性を算出し、アルカリ安定性を評価した。
　結果を表３に示す。配列番号１８に記載のアミノ酸配列において、少なくともＧｌｕ１ＧｌｙおよびＡｓｎ５０Ａｓｐより選択される１以上のアミノ酸置換を有した免疫グロブリン結合性タンパク質は、天然型のＦｐＬ＿Ｃ４（配列番号１８）と比較しアルカリ安定性が向上しているといえる。
Figure JPOXMLDOC01-appb-T000003
　実施例７　ＦｐＬ＿Ｃ３アミノ酸置換集積体の作製（その１）
　（１）ＦｐＬ＿Ｃ３アミノ酸置換集積体の設計
　実施例３で明らかになった、免疫グロブリン結合性タンパク質のアルカリ安定性向上に関与するアミノ酸置換をＦｐＬ＿Ｃ３（配列番号１）に対し集積することで、更なるアルカリ安定性の向上を図った。具体的には、以下の（ａ）から（ｌ）に示す１２種類の免疫グロブリン結合性タンパク質を設計し、作製した。
（ａ）ＦｐＬ＿Ｃ３に対し、Ａｓｎ５０Ｔｙｒ、Ｇｌｕ５２ＧｌｙおよびＡｓｎ６２Ｔｙｒのアミノ酸置換を導入したタンパク質（配列番号２３、ＦｐＬ＿Ｃ３　３ａと命名）
（ｂ）ＦｐＬ＿Ｃ３に対し、Ｇｌｕ４９Ｖａｌ、Ａｓｎ５０ＴｙｒおよびＧｌｕ５２Ｇｌｙのアミノ酸置換を導入したタンパク質（配列番号２７、ＦｐＬ＿Ｃ３　３ｂと命名）
（ｃ）ＦｐＬ＿Ｃ３に対し、Ａｓｎ４４Ｓｅｒ、Ａｓｎ５０ＴｙｒおよびＧｌｕ５２Ｇｌｙのアミノ酸置換を導入したタンパク質（配列番号３０、ＦｐＬ＿Ｃ３　３ｃと命名）
（ｄ）ＦｐＬ＿Ｃ３に対し、Ａｓｎ４４Ａｓｐ、Ａｓｎ５０ＴｙｒおよびＧｌｕ５２Ｇｌｙのアミノ酸置換を導入したタンパク質（配列番号３３、ＦｐＬ＿Ｃ３　３ｄと命名）
（ｅ）ＦｐＬ＿Ｃ３に対し、Ｇｌｕ４９Ｖａｌ、Ａｓｎ５０Ｔｙｒ、Ａｓｎ６２Ｔｙｒのアミノ酸置換を導入したタンパク質（配列番号３６、ＦｐＬ＿Ｃ３　３ｅと命名）
（ｆ）ＦｐＬ＿Ｃ３に対し、Ａｓｎ４４Ｓｅｒ、Ｇｌｕ４９Ｖａｌ、Ａｓｎ５０Ｔｙｒ、Ａｓｎ６２Ｔｙｒのアミノ酸置換を導入したタンパク質（配列番号３８、ＦｐＬ＿Ｃ３　４ａと命名）
（ｇ）ＦｐＬ＿Ｃ３に対し、Ａｓｎ４４Ａｓｐ、Ｇｌｕ４９Ｖａｌ、Ａｓｎ５０Ｔｙｒ、Ａｓｎ６２Ｔｙｒのアミノ酸置換を導入したタンパク質（配列番号４０、ＦｐＬ＿Ｃ３　４ｂと命名）
（ｈ）ＦｐＬ＿Ｃ３に対し、Ｇｌｕ４９Ｖａｌ、Ａｓｎ５０Ｔｙｒ、Ｇｌｕ５２ＧｌｙおよびＡｓｎ６２Ｔｙｒのアミノ酸置換を導入したタンパク質（配列番号４２、ＦｐＬ＿Ｃ３　４ｃと命名）
（ｉ）ＦｐＬ＿Ｃ３に対し、Ａｓｎ４４Ｓｅｒ、Ａｓｎ５０Ｔｙｒ、Ｇｌｕ５２ＧｌｙおよびＡｓｎ６２Ｔｙｒのアミノ酸置換を導入したタンパク質（配列番号４４、ＦｐＬ＿Ｃ３　４ｄと命名）
（ｊ）ＦｐＬ＿Ｃ３に対し、Ａｓｎ４４Ａｓｐ、Ｇｌｕ４９Ｖａｌ、Ａｓｎ５０ＴｙｒおよびＡｓｎ６２Ｔｙｒのアミノ酸置換を導入したタンパク質（配列番号４６、ＦｐＬ４ｅと命名）
（ｋ）ＦｐＬ＿Ｃ３に対し、Ａｓｎ４４Ｓｅｒ、Ｇｌｕ４９Ｖａｌ、Ａｓｎ５０Ｔｙｒ、Ｇｌｕ５２ＧｌｙおよびＡｓｎ６２Ｔｙｒのアミノ酸置換を導入したタンパク質（配列番号４８、ＦｐＬ＿Ｃ３　５ａと命名）
（ｌ）ＦｐＬ＿Ｃ３に対し、Ａｓｎ４４Ａｓｐ、Ｇｌｕ４９Ｖａｌ、Ａｓｎ５０Ｔｙｒ、Ｇｌｕ５２ＧｌｙおよびＡｓｎ６２Ｔｙｒのアミノ酸置換を導入したタンパク質（配列番号５０、ＦｐＬ＿Ｃ３　５ｂと命名）
　（２）ＦｐＬ＿Ｃ３アミノ酸置換集積体の作製
　以下、前記（ａ）から（ｌ）に示す１２種類の免疫グロブリン結合性タンパク質の作製方法について説明する。
　（ａ）ＦｐＬ＿Ｃ３　３ａ
　本タンパク質は、実施例３で判明したアルカリ安定性が向上するアミノ酸置換の中からＡｓｎ６２Ｔｙｒを選択し、当該アミノ酸置換をＦｐＬ＿Ｃ３　２ａ（配列番号１１）に導入することで作製した。
　（ａ－１）インバースＰＣＲを用いた変異導入により、ＦｐＬ＿Ｃ３　３ａ（配列番号２３）をコードするヌクレオチド配列を含むポリヌクレオチドを作製した。インバースＰＣＲは、ＦｐＬ＿Ｃ３　２ａをコードするポリヌクレオチド（配列番号２４）を含む発現ベクター（以下、「ｐＥＴ－ＦｐＬ＿Ｃ３　２ａ」とも表記する）を鋳型ＤＮＡとし、配列番号２５に記載の配列からなるオリゴヌクレオチドをＰＣＲ　Ｆｏｒｗａｒｄ　Ｐｒｉｍｅｒとし、配列番号２６に記載の配列からなるオリゴヌクレオチドをＰＣＲ　Ｒｅｖｅｒｓｅ　Ｐｒｉｍｅｒとして、表４に示す組成の反応液を調製後、当該反応液を９８℃で２分間熱処理し、９５℃で１０秒間の第１ステップ、５０℃で５秒間の第２ステップ、７２℃で６分の第３ステップを１サイクルとする反応を３０サイクル行ない、最後に７２℃で７分間熱処理することで行なった。
Figure JPOXMLDOC01-appb-T000004
　（ａ－２）得られたポリヌクレオチドを精製し、制限酵素ＤｐｎＩで処理後、当該処理産物を用いて大腸菌ＢＬ２１（ＤＥ３）株を形質転換した。
　（ａ－３）得られた形質転換体を５０μｇ／ｍＬのカナマイシンを含むＬＢ培地にて培養後、ＱＩＡｐｒｅｐ　Ｓｐｉｎ　Ｍｉｎｉｐｒｅｐ　ｋｉｔ（ＱＩＡＧＥＮ社製）を用いて発現ベクター（ｐＥＴ－ＦｐＬ＿Ｃ３　３ａと命名）を抽出した。
　（ａ－４）ｐＥＴ－ＦｐＬ＿Ｃ３　３ａのヌクレオチド配列の解析を、実施例１（５）と同様の方法で行なった。
　配列解析の結果、発現ベクターｐＥＴ－ＦｐＬ＿Ｃ３　３ａにＦｐＬ＿Ｃ３　３ａ（配列番号２３）をコードするポリヌクレオチドが挿入されていることを確認した。
　（ｂ）ＦｐＬ＿Ｃ３　３ｂ
　本タンパク質は、実施例３で判明したアルカリ安定性が向上するアミノ酸置換の中からＧｌｕ４９Ｖａｌを選択し、当該アミノ酸置換をＦｐＬ＿Ｃ３　２ａ（配列番号１１）に導入することで作製した。
　（ｂ－１）インバースＰＣＲを用いた変異導入により、ＦｐＬ＿Ｃ３　３ｂ（配列番号２７）をコードするヌクレオチド配列を含むポリヌクレオチドを作製した。インバースＰＣＲは、鋳型ＤＮＡとしてｐＥＴ－ＦｐＬ＿Ｃ３　２ａを、ＰＣＲ　Ｆｏｒｗａｒｄ　Ｐｒｉｍｅｒとして配列番号２８に記載の配列からなるオリゴヌクレオチドを、ＰＣＲ　Ｒｅｖｅｒｓｅ　Ｐｒｉｍｅｒとして配列番号２９に記載の配列からなるオリゴヌクレオチドを、それぞれ用いた他は（ａ－１）と同様な方法で行なった。
　（ｂ－２）得られたポリヌクレオチドを精製し、制限酵素ＤｐｎＩで処理後、当該処理産物を用いて大腸菌ＢＬ２１（ＤＥ３）株を形質転換した。
　（ｂ－３）得られた形質転換体を（ａ－３）と同様な方法で培養および発現ベクター（ｐＥＴ－ＦｐＬ＿Ｃ３　３ｂと命名）の抽出を行ない、当該発現ベクターのヌクレオチド配列の解析を実施例１（５）と同様の方法で行なった。
　配列解析の結果、発現ベクターｐＥＴ－ＦｐＬ＿Ｃ３　３ｂにＦｐＬ＿Ｃ３　３ｂ（配列番号２７）をコードするポリヌクレオチドが挿入されていることを確認した。
　（ｃ）ＦｐＬ＿Ｃ３　３ｃ
　本タンパク質は、実施例３で判明したアルカリ安定性が向上するアミノ酸置換の中からＡｓｎ４４Ｓｅｒを選択し、当該アミノ酸置換をＦｐＬ＿Ｃ３　２ａ（配列番号１１）に導入することで作製した。
　（ｃ－１）インバースＰＣＲを用いた変異導入により、ＦｐＬ＿Ｃ３　３ｃ（配列番号３０）をコードするヌクレオチド配列を含むポリヌクレオチドを作製した。インバースＰＣＲは、ＰＣＲ　Ｆｏｒｗａｒｄ　Ｐｒｉｍｅｒとして配列番号３１に記載の配列からなるオリゴヌクレオチドを、ＰＣＲ　Ｒｅｖｅｒｓｅ　Ｐｒｉｍｅｒとして配列番号３２に記載のオリゴヌクレオチドを、それぞれ用いた他は（ａ－１）と同様な方法で行なった。
　（ｃ－２）得られたポリヌクレオチドを精製し、制限酵素ＤｐｎＩで処理後、当該処理産物を用いて大腸菌ＢＬ２１（ＤＥ３）株を形質転換した。
　（ｃ－３）得られた形質転換体を（ａ－３）と同様な方法で培養および発現ベクター（ｐＥＴ－ＦｐＬ＿Ｃ３　３ｃと命名）の抽出を行ない、当該発現ベクターのヌクレオチド配列の解析を実施例１（５）と同様の方法で行なった。
　配列解析の結果、発現ベクターｐＥＴ－ＦｐＬ＿Ｃ３　３ｃにＦｐＬ＿Ｃ３　３ｃ（配列番号３０）をコードするポリヌクレオチドが挿入されていることを確認した。
　（ｄ）ＦｐＬ＿Ｃ３　３ｄ
　本タンパク質は、実施例３で判明したアルカリ安定性が向上するアミノ酸置換の中からＡｓｎ４４Ａｓｐを選択し、当該アミノ酸置換をＦｐＬ＿Ｃ３　２ａ（配列番号１１）に導入することで作製した。
　（ｄ－１）インバースＰＣＲを用いた変異導入により、ＦｐＬ＿Ｃ３　３ｄ（配列番号３３）をコードするヌクレオチド配列を含むポリヌクレオチドを作製した。インバースＰＣＲは、ＰＣＲ　Ｆｏｒｗａｒｄ　Ｐｒｉｍｅｒとして配列番号３４に記載の配列からなるオリゴヌクレオチドを、ＰＣＲ　Ｒｅｖｅｒｓｅ　Ｐｒｉｍｅｒとして配列番号３５に記載のオリゴヌクレオチドを、それぞれ用いた他は（ａ－１）と同様な方法で行なった。
　（ｄ－２）得られたポリヌクレオチドを精製し、制限酵素ＤｐｎＩで処理後、当該処理産物を用いて大腸菌ＢＬ２１（ＤＥ３）株を形質転換した。
　（ｄ－３）得られた形質転換体を（ａ－３）と同様な方法で培養および発現ベクター（ｐＥＴ－ＦｐＬ＿Ｃ３　３ｄと命名）の抽出を行ない、当該発現ベクターのヌクレオチド配列の解析を実施例１（５）と同様の方法で行なった。
　配列解析の結果、発現ベクターｐＥＴ－ＦｐＬ＿Ｃ３　３ｄにＦｐＬ＿Ｃ３　３ｄ（配列番号３３）をコードするポリヌクレオチドが挿入されていることを確認した。
　（ｅ）ＦｐＬ＿Ｃ３　３ｅ
　（ｅ－１）ＦｐＬ＿Ｃ３　３ｅ（配列番号３６）をコードするポリヌクレオチド（配列番号３７）を合成した。なお、合成する際、５’末端側には制限酵素ＮｃｏＩの認識配列（５’－ＣＣＡＴＧＧ－３’）を、３’末端側にはヒスチジン６残基をコードするヌクレオチド配列（５’－ＣＡＴＣＡＣＣＡＣＣＡＴＣＡＣＣＡＣ－３’；配列番号２３２）、終止コドンおよび制限酵素ＨｉｎｄＩＩＩの認識配列（５’－ＡＡＧＣＴＴ－３’）を、それぞれ付加している。
　（ｅ－２）実施例１（２）と同様の方法で、（ｅ－１）で合成したポリヌクレオチドを精製した。
　（ｅ－３）実施例１（３）と同様な方法で、（ｅ－２）で得たポリヌクレオチドと予め制限酵素ＮｃｏＩとＨｉｎｄＩＩＩで消化したプラスミドｐＥＴ－２６ｂとをライゲーション後、当該ライゲーション産物を用いて大腸菌ＢＬ２１（ＤＥ３）株を形質転換し、培養した。
　（ｅ－４）得られた形質転換体を、実施例１（４）と同様な方法で培養およびプラスミド精製を行ない、発現ベクター（ｐＥＴ－ＦｐＬ＿Ｃ３　３ｅと命名）を取得後、当該発現ベクターのヌクレオチド配列の解析を、実施例１（５）と同様の方法で行なった。
　配列解析の結果、発現ベクターｐＥＴ－ＦｐＬ＿Ｃ３　３ｅにＦｐＬ＿Ｃ３　３ｅ（配列番号３６）をコードするポリヌクレオチド（配列番号３７）が挿入されていることを確認した。
　（ｆ）ＦｐＬ＿Ｃ３　４ａ
　免疫グロブリン結合性タンパク質をコードするポリヌクレオチドとして、ＦｐＬ＿Ｃ３　４ａ（配列番号３８）をコードするポリヌクレオチド（配列番号３９）を用いた他は、（ｅ）と同様な方法で形質転換体および発現ベクター（ｐＥＴ－ＦｐＬ＿Ｃ３　４ａと命名）を取得した。発現ベクターｐＥＴ－ＦｐＬ＿Ｃ３　４ａのヌクレオチド配列解析の結果、ｐＥＴ－ＦｐＬ＿Ｃ３　４ａにＦｐＬ＿Ｃ３　４ａ（配列番号３８）をコードするポリヌクレオチド（配列番号３９）が挿入されていることを確認した。
　（ｇ）ＦｐＬ＿Ｃ３　４ｂ
　免疫グロブリン結合性タンパク質をコードするポリヌクレオチドとして、ＦｐＬ＿Ｃ３　４ｂ（配列番号４０）をコードするポリヌクレオチド（配列番号４１）を用いた他は、（ｅ）と同様な方法で形質転換体および発現ベクター（ｐＥＴ－ＦｐＬ＿Ｃ３　４ｂと命名）を取得した。発現ベクターｐＥＴ－ＦｐＬ＿Ｃ３　４ｂのヌクレオチド配列解析の結果、ｐＥＴ－ＦｐＬ＿Ｃ３　４ｂにＦｐＬ＿Ｃ３　４ｂ（配列番号４０）をコードするポリヌクレオチド（配列番号４１）が挿入されていることを確認した。
　（ｈ）ＦｐＬ＿Ｃ３　４ｃ
　免疫グロブリン結合性タンパク質をコードするポリヌクレオチドとして、ＦｐＬ＿Ｃ３　４ｃ（配列番号４２）をコードするポリヌクレオチド（配列番号４３）を用いた他は、（ｅ）と同様な方法で形質転換体および発現ベクター（ｐＥＴ－ＦｐＬ＿Ｃ３　４ｃと命名）を取得した。発現ベクターｐＥＴ－ＦｐＬ＿Ｃ３　４ｃのヌクレオチド配列解析の結果、ｐＥＴ－ＦｐＬ＿Ｃ３　４ｃにＦｐＬ＿Ｃ３　４ｃ（配列番号４２）をコードするポリヌクレオチド（配列番号４３）が挿入されていることを確認した。
　（ｉ）ＦｐＬ＿Ｃ３　４ｄ
　免疫グロブリン結合性タンパク質をコードするポリヌクレオチドとして、ＦｐＬ＿Ｃ３　４ｄ（配列番号４４）をコードするポリヌクレオチド（配列番号４５）を用いた他は、（ｅ）と同様な方法で形質転換体および発現ベクター（ｐＥＴ－ＦｐＬ＿Ｃ３　４ｄと命名）を取得した。発現ベクターｐＥＴ－ＦｐＬ＿Ｃ３　４ｄのヌクレオチド配列解析の結果、ｐＥＴ－ＦｐＬ＿Ｃ３　４ｄにＦｐＬ＿Ｃ３　４ｄ（配列番号４４）をコードするポリヌクレオチド（配列番号４５）が挿入されていることを確認した。
　（ｊ）ＦｐＬ＿Ｃ３　４ｅ
　免疫グロブリン結合性タンパク質をコードするポリヌクレオチドとして、ＦｐＬ＿Ｃ３　４ｅ（配列番号４６）をコードするポリヌクレオチド（配列番号４７）を用いた他は、（ｅ）と同様な方法で形質転換体および発現ベクター（ｐＥＴ－ＦｐＬ＿Ｃ３　４ｅと命名）を取得した。発現ベクターｐＥＴ－ＦｐＬ＿Ｃ３　４ｅのヌクレオチド配列解析の結果、ｐＥＴ－ＦｐＬ＿Ｃ３　４ｅにＦｐＬ＿Ｃ３　４ｅ（配列番号４６）をコードするポリヌクレオチド（配列番号４７）が挿入されていることを確認した。
　（ｋ）ＦｐＬ＿Ｃ３　５ａ
　免疫グロブリン結合性タンパク質をコードするポリヌクレオチドとして、ＦｐＬ＿Ｃ３　５ａ（配列番号４８）をコードするポリヌクレオチド（配列番号４９）を用いた他は、（ｅ）と同様な方法で形質転換体および発現ベクター（ｐＥＴ－ＦｐＬ＿Ｃ３　５ａと命名）を取得した。発現ベクターｐＥＴ－ＦｐＬ＿Ｃ３　５ａのヌクレオチド配列解析の結果、ｐＥＴ－ＦｐＬ＿Ｃ３　５ａにＦｐＬ＿Ｃ３　５ａ（配列番号４８）をコードするポリヌクレオチド（配列番号４９）が挿入されていることを確認した。
　（ｌ）ＦｐＬ＿Ｃ３　５ｂ
　免疫グロブリン結合性タンパク質をコードするポリヌクレオチドとして、ＦｐＬ＿Ｃ３　５ｂ（配列番号５０）をコードするポリヌクレオチド（配列番号５１）を用いた他は、（ｅ）と同様な方法で形質転換体および発現ベクター（ｐＥＴ－ＦｐＬ＿Ｃ３　５ｂと命名）を取得した。発現ベクターｐＥＴ－ＦｐＬ＿Ｃ３　５ｂのヌクレオチド配列解析の結果、ｐＥＴ－ＦｐＬ＿Ｃ３　５ｂにＦｐＬ＿Ｃ３　５ｂ（配列番号５０）をコードするポリヌクレオチド（配列番号５１）が挿入されていることを確認した。
　実施例８　ＦｐＬ＿Ｃ３アミノ酸置換集積体のアルカリ安定性評価
　（１）実施例１で作製した天然型ＦｐＬ＿Ｃ３（配列番号１）、実施例３で取得した変異型（アミノ酸置換した）免疫グロブリン結合性タンパク質ＦｐＬ＿Ｃ３　２ａ（配列番号１１）、ならびに実施例７で作製した変異型免疫グロブリン結合性タンパク質ＦｐＬ＿Ｃ３　３ａ（配列番号２３）、ＦｐＬ＿Ｃ３　３ｂ（配列番号２７）、ＦｐＬ＿Ｃ３　３ｃ（配列番号３０）、ＦｐＬ＿Ｃ３　３ｄ（配列番号３３）、ＦｐＬ＿Ｃ３　３ｅ（配列番号３６）、ＦｐＬ＿Ｃ３　４ａ（配列番号３８）、ＦｐＬ＿Ｃ３　４ｂ（配列番号４０）、ＦｐＬ＿Ｃ３　４ｃ（配列番号４２）、ＦｐＬ＿Ｃ３　４ｄ（配列番号４４）、ＦｐＬ＿Ｃ３　４ｅ（配列番号４６）、ＦｐＬ＿Ｃ３　５ａ（配列番号４８）およびＦｐＬ＿Ｃ３　５ｂ（配列番号５０）のいずれかを発現する形質転換体を、実施例３（８）から（１０）と同様な方法で培養し、実施例３（１１）に記載の方法でタンパク質抽出液を調製した。
　（２）（１）で調製したタンパク質抽出液中の免疫グロブリン結合性タンパク質の抗体結合活性を、実施例３（４）に記載のＥＬＩＳＡ法を用いて測定した。
　（３）処理に用いたＮａＯＨの濃度を０．４Ｍ（終濃度０．２Ｍ）に、処理時間を１５時間に、それぞれした他は、実施例３（１３）と同様な方法でアルカリ処理後、実施例３（１４）と同様な方法で残存活性を算出し、アルカリ安定性を評価した。
　結果を表５に示す。本実施例で評価した変異型免疫グロブリン結合性タンパク質はいずれも、天然型ＦｐＬ＿Ｃ３（配列番号１）と比較し、残存活性が高くなっており、これら変異型免疫グロブリン結合性タンパク質のアルカリ安定性が向上していることが確認された。また、ＦｐＬ＿Ｃ３　３ａ（配列番号２３）、ＦｐＬ＿Ｃ３　３ｂ（配列番号２７）、ＦｐＬ＿Ｃ３　３ｃ（配列番号３０）、ＦｐＬ＿Ｃ３　３ｄ（配列番号３３）およびＦｐＬ＿Ｃ３　３ｅ（配列番号３６）の結果を比較したところ、Ａｓｎ６２Ｔｙｒのアミノ酸置換を有した変異型免疫グロブリン結合性タンパク質（ＦｐＬ＿Ｃ３　３ａおよびＦｐＬ＿Ｃ３　３ｅ）で特にアルカリ安定性が向上していたことから、Ａｓｎ６２Ｔｙｒのアミノ酸置換が免疫グロブリン結合性タンパク質のアルカリ安定性の向上に大きく寄与することがわかる。
Figure JPOXMLDOC01-appb-T000005
　実施例９　ＦｐＬ＿Ｃ３への変異導入およびライブラリ作製（その２）
　実施例３の結果を踏まえ、変異型免疫グロブリン結合性タンパク質のうち、特定位置のアミノ酸残基が複数の選択肢を持つように混合塩基を含んだオリゴヌクレオチドを設計し、それらを連結することで変異体ライブラリを作製した。以下詳細を具体的に述べる。
　（１）配列番号２に記載の配列からなる天然型ＦｐＬ＿Ｃ３をコードするポリヌクレオチドを５分割し、４４番目のアミノ酸残基、４９番目のアミノ酸残基、５０番目のアミノ酸残基、５２番目のアミノ酸残基および６２番目のアミノ酸残基が複数の選択肢を持つよう、オリゴヌクレオチドを設計した（配列番号５２から６１）。なお、設計したオリゴヌクレオチドの内容は以下の通りである。
［配列番号５２］
１番目から２４番目まで：ｐＥＴ２６ｂとの連結部
２８番目から８０番目まで：配列番号２の１番目から５３番目までに相当する領域
５７番目から８０番目まで：配列番号５４との連結部
［配列番号５３］配列番号５２の相補配列
［配列番号５４］
１番目から７５番目まで：配列番号２の３０番目から１０４番目までに相当する領域
１番目から２４番目まで：配列番号５２との連結部
５１番目から７５番目まで：配列番号５６との連結部
［配列番号５５］配列番号５４の相補配列
［配列番号５６］
１番目から７５番目まで：配列番号２の８０番目から１５６番目までに相当する領域
１番目から２５番目まで：配列番号５４との連結部
５１番目から７７番目まで：配列番号５８との連結部
［配列番号５７］配列番号５６の相補配列
［配列番号５８］
１番目から７６番目まで：配列番号２の１３０番目から２０５番目までに相当する領域
１番目から２７番目まで：配列番号５６との連結部
４７番目から７６番目まで：配列番号６０との連結部
［配列番号５９］配列番号５８の相補配列
［配列番号６０］
１番目から３５番目まで：配列番号２の１７６番目から２１０番目までに相当する領域
１番目から３０番目まで：配列番号５８との連結部
３６番目から５３番目まで：ヒスチジン６残基をコードする領域
５４番目から５６番目まで：終止コドンをコードする領域
５７番目から８０番目まで：ｐＥＴ２６ｂとの連結部
［配列番号６１］配列番号６０の相補配列
　なお、配列番号５６の５１番目から５３番目は配列番号１の４４番目に相当するアミノ酸がＡｓｎ（アスパラギン）、Ａｓｐ（アスパラギン酸）、Ｓｅｒ（セリン）またはＧｌｙ（グリシン）になるように、６６番目から６８番目は配列番号１の４９番目に相当するアミノ酸がＧｌｕ（グルタミン酸）またはＶａｌ（バリン）になるように、６９番目から７１番目は配列番号１の５０番目に相当するアミノ酸がＡｓｎ、Ａｓｐ、ＳｅｒまたはＣｙｓ（システイン）になるように、７５番目から７７番目は配列番号１の５２番目に相当するアミノ酸がＧｌｙまたはＶａｌになるように、それぞれ混合塩基を導入している。
　また、配列番号５８の５５番目から５７番目は配列番号１の６２番目に相当するアミノ酸がＡｓｎまたはＴｙｒ（チロシン）になるように混合塩基を導入している。
　（２）合成したポリヌクレオチド（配列番号５２から６１）を０．０５ｐｍｏｌに希釈後、予め制限酵素ＮｃｏＩとＨｉｎｄＩＩＩで消化した発現ベクターｐＥＴ－２６ｂにＮＥＢＢｕｉｌｄｅｒ（ニュー・イングランド・バイオラボ社製）を用いて連結した。
　（３）反応終了後、反応液を用いて大腸菌ＢＬ２１（ＤＥ３）株を形質転換し、５０μｇ／ｍＬのカナマイシンを含むＬＢプレート培地で培養（３７℃、１６時間）後、プレート上に形成したコロニーをランダム変異体ライブラリとした。
　実施例１０　ＦｐＬ＿Ｃ３アミノ酸置換体のスクリーニング（その２）
　（１）実施例３で作製したＦｐＬ＿Ｃ３　２ａおよび実施例９で作製した変異体ライブラリ（形質転換体）を、実施例３（１）から（２）と同様な方法で培養した。
　（２）培養後、遠心操作によって得られた培養上清を１．０Ｍ　ＮａＯＨと等量混合し４３℃で１５分間アルカリ処理を行なった。
　（３）実施例３（４）に記載のＥＬＩＳＡ法を用いて残存活性を算出した。
　（４）約５４０株の形質転換体を評価し、その中からＦｐＬ＿Ｃ３　２ａ（配列番号１１）と比較してアルカリ安定性が向上した免疫グロブリン結合性タンパク質を発現する形質転換体を選択した。
　（５）選択した形質転換体を培養し、ＱＩＡｐｒｅｐ　Ｓｐｉｎ　Ｍｉｎｉｐｒｅｐ　ｋｉｔ（ＱＩＡＧＥＮ社製）を用いて発現ベクターを調製した。
　（６）得られた発現ベクターに挿入された免疫グロブリン結合性タンパク質をコードするポリヌクレオチド領域の配列を実施例１（５）に記載の方法によりヌクレオチド配列を解析し、アミノ酸置換箇所を特定した。
　（７）（４）で選択した免疫グロブリン結合性タンパク質を発現する形質転換体、実施例１で作製したＦｐＬ＿Ｃ３（配列番号１）を発現する形質転換体および実施例３で取得したＦｐＬ＿Ｃ３　２ａ（配列番号１１）を発現する形質転換体のいずれかを、実施例３（８）から（１０）と同様な方法で培養し、実施例３（１１）と同様な方法でタンパク質抽出液を調製した。
　（８）（７）で調製したタンパク質抽出液中の免疫グロブリン結合性タンパク質の抗体結合活性を、実施例３（４）に記載のＥＬＩＳＡ法を用いて測定した。
　（９）処理時間を１５時間にした他は、実施例３（１３）と同様な方法でアルカリ処理後、実施例３（１４）と同様な方法で残存活性を算出し、アルカリ安定性を評価した。
　（４）で選択した形質転換体が発現する免疫グロブリン結合性タンパク質（配列番号１）に対するアミノ酸置換位置、アルカリ処理したときの残存活性［％］およびアルカリ未処理のタンパク質溶液の抗体結合活性（吸光度）をまとめた結果を表６に示す。本スクリーニングでは、
ＦｐＬ＿Ｃ３に対し、Ａｓｎ４４Ａｓｐ、Ａｓｎ５０Ｔｙｒ、Ｇｌｕ５２ＶａｌおよびＡｓｎ６２Ｔｙｒのアミノ酸置換を導入したタンパク質（ＦｐＬ＿Ｃ３　４ｆと命名、配列番号６２）、
ＦｐＬ＿Ｃ３に対し、Ａｓｎ４４Ｇｌｙ、Ｇｌｕ４９Ｖａｌ、Ａｓｎ５０Ｔｙｒ、Ｇｌｕ５２ＶａｌおよびＡｓｎ６２Ｔｙｒのアミノ酸置換を導入したタンパク質（ＦｐＬ＿Ｃ３　５ｃと命名、配列番号６３）、
ＦｐＬ＿Ｃ３に対し、Ａｓｎ４４Ｇｌｙ、Ｇｌｕ４９Ｖａｌ、Ａｓｎ５０Ｓｅｒ、Ｇｌｕ５２ＶａｌおよびＡｓｎ６２Ｔｙｒのアミノ酸置換を導入したタンパク質（ＦｐＬ＿Ｃ３　５ｄと命名、配列番号６４）、
の３つの変異型免疫グロブリン結合性タンパク質を取得した。
　上記３つの変異型免疫グロブリン結合性タンパク質は、いずれもＦｐＬ＿Ｃ３　２ａに対しアルカリ安定性が向上していた。このことから配列番号１に記載のアミノ酸配列において、少なくともＡｓｎ４４Ａｓｐ、Ａｓｎ４４Ｇｌｙ、Ｇｌｕ４９Ｖａｌ、Ａｓｎ５０Ｓｅｒ、Ｇｌｕ５２ＶａｌおよびＡｓｎ６２Ｔｙｒより選択される１以上のアミノ酸置換を有した免疫グロブリン結合性タンパク質は、アルカリ安定性が向上しているといえる。ただし、Ａｓｎ５０Ｓｅｒのアミノ酸置換を有した免疫グロブリン結合性タンパク質（ＦｐＬ＿Ｃ３　５ｄ）は、Ａｓｎ５０Ｔｙｒのアミノ酸置換を有した免疫グロブリン結合性タンパク質（ＦｐＬ＿Ｃ３　２ａ、ＦｐＬ＿Ｃ３　４ｆおよびＦｐＬ＿Ｃ３　５ｃ）と比較し、アルカリ未処理のタンパク質溶液の抗体結合活性が大きく低下していた。
Figure JPOXMLDOC01-appb-T000006
　実施例１１　ＦｐＬ＿Ｃ３への変異導入およびライブラリ作製（その３）
　（１）実施例１で作製したｐＥＴ－ＦｐＬ＿Ｃ３を鋳型として、２１番目、２２番目、３１番目、４９番目、５１番目および６２番目のアミノ酸残基に対する飽和置換体ライブラリを作製した。プライマーは、２２ｃ－Ｔｒｉｃｋ法（Ｓａｂｒｉｎａ　Ｋｉｌｌｅ　ｅｔ．ａｌ．，ＡＣＳ　Ｓｙｎｔｈｅｔｉｃ　Ｂｉｏｌｏｇｙ，２０１３，２，８３－９２）に倣い、変異導入箇所に適切な混合塩基を配置し、変異導入箇所を中心としたインバースＰＣＲができるように設計した（配列番号６５から１００）。これらのプライマーを一箇所の置換につき６本一組として、表７および表８の組成で混合し、ＰＣＲ　Ｐｒｉｍｅｒ混合液（Ｆｏｒｗａｒｄ／Ｒｅｖｅｒｓｅ　ｐｒｉｍｅｒ　ｍｉｘ）を調製した。
Figure JPOXMLDOC01-appb-T000007
Figure JPOXMLDOC01-appb-T000008
　（２）実施例１で作製したｐＥＴ－ＦｐＬ＿Ｃ３を鋳型ＤＮＡとしてインバースＰＣＲによる部位特異的変異導入を行なった。インバースＰＣＲは表９に示す組成の反応液を調製後、当該反応液を９８℃で２分間熱処理し、９５℃で１０秒間の第１ステップ、５０℃で５秒間の第２ステップ、７２℃で６分の第３ステップを１サイクルとする反応を３０サイクル行ない、最後に７２℃で７分間熱処理することで行なった。
Figure JPOXMLDOC01-appb-T000009
　（３）得られたＰＣＲ産物を精製後、反応液を用いて大腸菌ＢＬ２１（ＤＥ３）株を形質転換し、５０μｇ／ｍＬのカナマイシンを含むＬＢプレート培地で培養（３７℃、１６時間）した後、プレート上に形成したコロニーを部位特異的変異体ライブラリとした。
　実施例１２　ＦｐＬ＿Ｃ３アミノ酸置換体のスクリーニング（その３）
　（１）実施例１で作製したＦｐＬ＿Ｃ３を発現可能な形質転換体、および実施例１１で作製した部位特異的アミノ酸置換体ライブラリ（形質転換体）を、実施例３（１）から（２）と同様な方法で培養した。
　（２）培養後、遠心操作によって得られた培養上清に対し、実施例３（３）と同様な方法でアルカリ処理を行ない、実施例３（４）に記載のＥＬＩＳＡ法を用いて残存活性を算出した。
　（３）約５００株の形質転換体を評価し、その中から天然型ＦｐＬ＿Ｃ３（配列番号１）と比較してアルカリ安定性が向上した免疫グロブリン結合性タンパク質を発現する形質転換体を選択した。
　（４）選択した形質転換体を培養し、ＱＩＡｐｒｅｐ　Ｓｐｉｎ　Ｍｉｎｉｐｒｅｐ　ｋｉｔ（ＱＩＡＧＥＮ社製）を用いて発現ベクターを調製した。
　（５）得られた発現ベクターに挿入された免疫グロブリン結合性タンパク質をコードするポリヌクレオチド領域の配列を実施例１（５）に記載の方法によりヌクレオチド配列を解析し、アミノ酸置換箇所を特定した。
　（６）（３）で選択した免疫グロブリン結合性タンパク質を発現する形質転換体または実施例１で作製したＦｐＬ＿Ｃ３（配列番号１）を発現する形質転換体を、実施例３（８）から（１０）と同様な方法で培養し、実施例３（１１）と同様な方法でタンパク質抽出液を調製した。
　（７）（６）で調製したタンパク質抽出液中の免疫グロブリン結合性タンパク質の抗体結合活性を、実施例３（４）に記載のＥＬＩＳＡ法を用いて測定した。
　（８）実施例３（１３）に記載の方法でアルカリ処理後、実施例３（１４）と同様な方法で残存活性を算出し、アルカリ安定性を評価した。
　（３）で選択した形質転換体が発現する免疫グロブリン結合性タンパク質（配列番号１）に対するアミノ酸置換位置およびアルカリ処理したときの残存活性［％］をまとめた結果を表１０に示す。配列番号１に記載のアミノ酸配列において、少なくともＧｌｙ２１Ａｒｇ、Ｌｙｓ２２Ｔｈｒ、Ｔｈｒ３１Ｌｅｕ、Ｇｌｕ４９Ｔｈｒ、Ｇｌｕ４９Ｉｌｅ、Ｇｌｙ５１Ｖａｌ、Ａｓｎ６２Ｈｉｓ、Ａｓｎ６２Ａｒｇ、Ａｓｎ６２Ｌｅｕ、Ａｓｎ６２Ｍｅｔ、Ａｓｎ６２ＴｙｒおよびＡｓｎ６２Ｔｒｐより選択される１以上のアミノ酸置換を有した免疫グロブリン結合性タンパク質は、天然型のＦｐＬ＿Ｃ３（配列番号１）と比較しアルカリ安定性が向上しているといえる。
　表１０より、配列番号１の６２番目のアスパラギン（Ａｓｎ６２）を、ヒスチジン（Ｈｉｓ）、アルギニン（Ａｒｇ）、ロイシン（Ｌｅｕ）、メチオニン（Ｍｅｔ）、チロシン（Ｔｙｒ）およびトリプトファン（Ｔｒｐ）といった、比較的嵩高いアミノ酸に置換することでアルカリ安定性が向上することがわかる。中でも、Ａｓｎ６２Ｔｙｒのアミノ酸置換（配列番号５）が最もアルカリ安定性が向上（天然型ＦｐＬ＿Ｃ３：４６％、Ａｓｎ６２Ｔｙｒ：６６％）していることがわかる。Ａｓｎ６２以外の箇所については、Ｇｌｙ２１Ａｒｇ、Ｇｌｕ４９ＴｈｒおよびＧｌｙ５１Ｖａｌのアミノ酸置換でアルカリ安定性が特に向上していた。
Figure JPOXMLDOC01-appb-T000010
　参考例１
　（１）免疫グロブリン結合性タンパク質（リジン置換体）の設計
　ＷＯ２０１７／０６９１５８号は、ＦｐＬの免疫グロブリン結合ドメインが有するリジン残基を、リジン以外の他の塩基性アミノ酸またはヒドロキシ基を有するアミノ酸に置換することでアルカリ安定性が向上した、免疫グロブリン結合性タンパク質を開示している。そこで、前記文献による効果を確認すべく、ＦｐＬの免疫グロブリン結合ドメインが有するリジン残基をリジン以外の他の塩基性アミノ酸であるアルギニン残基に置換した、免疫グロブリン結合性タンパク質を作製した。具体的には、以下の（α）から（δ）に示す４種類の免疫グロブリン結合性タンパク質を設計した。
（α）ＦｐＬの免疫グロブリン結合ドメインＣ１（ＧｅｎＢａｎｋ　Ｎｏ．ＡＡＡ６７５０３の２４９番目から３１７番目までのアミノ酸残基、配列番号１１２、以下「ＦｐＬ＿Ｃ１」とも表記）が有する全てのリジン残基（具体的には配列番号１１２の１２番目、２８番目、３３番目、４６番目、４７番目、５９番目および６６番目のリジン残基）をアルギニン残基に置換した免疫グロブリン結合性タンパク質（配列番号１１４、以下「ＦｐＬ＿Ｃ１ＫＲ」とも表記）。
（β）ＦｐＬの免疫グロブリン結合ドメインＣ２（ＧｅｎＢａｎｋ　Ｎｏ．ＡＡＡ６７５０３の３２０番目から３８９番目までのアミノ酸残基、配列番号１１３、以下「ＦｐＬ＿Ｃ２」とも表記）が有する全てのリジン残基（具体的には配列番号１１３の２番目、７番目、１３番目、２２番目、２９番目、３８番目、４８番目および６７番目のリジン残基）をアルギニン残基に置換した免疫グロブリン結合性タンパク質（配列番号１１５、以下「ＦｐＬ＿Ｃ２ＫＲ」とも表記）。
（γ）ＦｐＬ＿Ｃ３（配列番号１）の全てのリジン残基（具体的には配列番号１の７番目、１３番目、２２番目、２９番目、３８番目、４８番目および６７番目のリジン残基）をアルギニン残基に置換した免疫グロブリン結合性タンパク質（配列番号１１６、以下「ＦｐＬ＿Ｃ３ＫＲ」とも表記）
（δ）ＦｐＬ＿Ｃ４（配列番号１８）の全てのリジン残基（具体的には配列番号１８の７番目、１３番目、２２番目、２９番目、４８番目および６７番目のリジン残基）をアルギニン残基に置換した免疫グロブリン結合性タンパク質（配列番号１１７、以下「ＦｐＬ＿Ｃ４ＫＲ」とも表記）
　（２）免疫グロブリン結合性タンパク質（リジン置換体）の作製
　（α）ＦｐＬ＿Ｃ１ＫＲ
　（α－１）ＦｐＬ＿Ｃ１ＫＲ（配列番号１１４）をコードするポリヌクレオチド（配列番号１２０）を合成した。なお、合成する際、５’末端側には制限酵素ＮｃｏＩの認識配列（５’－ＣＣＡＴＧＧ－３’）を、３’末端側にはヒスチジン６残基をコードするヌクレオチド配列（５’－ＣＡＴＣＡＣＣＡＣＣＡＴＣＡＣＣＡＣ－３’；配列番号２３２）、終止コドンおよび制限酵素ＨｉｎｄＩＩＩの認識配列（５’－ＴＡＡＧＣＴＴ－３’）を、それぞれ付加している。
　（α－２）実施例１（２）と同様の方法で、（α－１）で合成したポリヌクレオチドを精製した。
　（α－３）実施例１（３）と同様な方法で、（α－２）で得たポリヌクレオチドと予め制限酵素ＮｃｏＩとＨｉｎｄＩＩＩで消化したプラスミドｐＥＴ－２６ｂとをライゲーション後、当該ライゲーション産物を用いて大腸菌ＢＬ２１（ＤＥ３）株を形質転換し、培養した。
　（α－４）得られた形質転換体を、実施例１（４）と同様な方法で培養およびプラスミド精製を行ない、発現ベクター（ｐＥＴ－ＦｐＬ＿Ｃ１ＫＲと命名）を取得後、当該発現ベクターのヌクレオチド配列の解析を、実施例１（５）と同様の方法で行なった。配列解析の結果、発現ベクターｐＥＴ－ＦｐＬ＿Ｃ１ＫＲに、ＦｐＬ＿Ｃ１ＫＲ（配列番号１１４）をコードするポリヌクレオチド（配列番号１２０）が挿入されていることを確認した。
　（β）ＦｐＬ＿Ｃ２ＫＲ
　免疫グロブリン結合性タンパク質をコードするポリヌクレオチドとして、ＦｐＬ＿Ｃ２ＫＲ（配列番号１１５）をコードするポリヌクレオチド（配列番号１２１）を用いた他は、（α）と同様な方法で形質転換体および発現ベクター（ｐＥＴ－ＦｐＬ＿Ｃ２ＫＲと命名）を取得した。発現ベクターｐＥＴ－ＦｐＬ＿Ｃ２ＫＲのヌクレオチド配列解析の結果、ｐＥＴ－ＦｐＬ＿Ｃ２ＫＲにＦｐＬ＿Ｃ２ＫＲ（配列番号１１５）をコードするポリヌクレオチド（配列番号１２１）が挿入されていることを確認した。
　（γ）ＦｐＬ＿Ｃ３ＫＲ
　免疫グロブリン結合性タンパク質をコードするポリヌクレオチドとして、ＦｐＬ＿Ｃ３ＫＲ（配列番号１１６）をコードするポリヌクレオチド（配列番号１２２）を用いた他は、（α）と同様な方法で形質転換体および発現ベクター（ｐＥＴ－ＦｐＬ＿Ｃ３ＫＲと命名）を取得した。発現ベクターｐＥＴ－ＦｐＬ＿Ｃ３ＫＲのヌクレオチド配列解析の結果、ｐＥＴ－ＦｐＬ＿Ｃ３ＫＲにＦｐＬ＿Ｃ３ＫＲ（配列番号１１６）をコードするポリヌクレオチド（配列番号１２２）が挿入されていることを確認した。
　（δ）ＦｐＬ＿Ｃ４ＫＲ
　免疫グロブリン結合性タンパク質をコードするポリヌクレオチドとして、ＦｐＬ＿Ｃ４ＫＲ（配列番号１１７）をコードするポリヌクレオチド（配列番号１２３）を用いた他は、（α）と同様な方法で形質転換体および発現ベクター（ｐＥＴ－ＦｐＬ＿Ｃ４ＫＲと命名）を取得した。発現ベクターｐＥＴ－ＦｐＬ＿Ｃ４ＫＲのヌクレオチド配列解析の結果、ｐＥＴ－ＦｐＬ＿Ｃ４ＫＲにＦｐＬ＿Ｃ４ＫＲ（配列番号１１７）をコードするポリヌクレオチド（配列番号１２３）が挿入されていることを確認した。
　（３）免疫グロブリン結合性タンパク質（天然型）の作製
　（ε）ＦｐＬ＿Ｃ１
　免疫グロブリン結合性タンパク質をコードするポリヌクレオチドとして、ＦｐＬ＿Ｃ１（配列番号１１２）をコードするポリヌクレオチド（配列番号１１８）を用いた他は、（α）と同様な方法で形質転換体および発現ベクター（ｐＥＴ－ＦｐＬ＿Ｃ１と命名）を取得した。発現ベクターｐＥＴ－ＦｐＬ＿Ｃ１のヌクレオチド配列解析の結果、ｐＥＴ－ＦｐＬ＿Ｃ１にＦｐＬ＿Ｃ１（配列番号１１２）をコードするポリヌクレオチド（配列番号１１８）が挿入されていることを確認した。
　（ζ）ＦｐＬ＿Ｃ２
　免疫グロブリン結合性タンパク質をコードするポリヌクレオチドとして、ＦｐＬ＿Ｃ２（配列番号１１３）をコードするポリヌクレオチド（配列番号１１９）を用いた他は、（α）と同様な方法で形質転換体および発現ベクター（ｐＥＴ－ＦｐＬ＿Ｃ２と命名）を取得した。発現ベクターｐＥＴ－ＦｐＬ＿Ｃ２のヌクレオチド配列解析の結果、ｐＥＴ－ＦｐＬ＿Ｃ１にＦｐＬ＿Ｃ１（配列番号１１３）をコードするポリヌクレオチド（配列番号１１９）が挿入されていることを確認した。
　参考例２
　（１）実施例１で作製したＦｐＬ＿Ｃ３（配列番号１）、実施例４で作製したＦｐＬ＿Ｃ４（配列番号１８）、ならびに参考例１で作製したＦｐＬ＿Ｃ１（配列番号１１２）、ＦｐＬ＿Ｃ２（配列番号１１３）、ＦｐＬ＿Ｃ１ＫＲ（配列番号１１４）、ＦｐＬ＿Ｃ２ＫＲ（配列番号１１５）、ＦｐＬ＿Ｃ３ＫＲ（配列番号１１６）およびＦｐＬ＿Ｃ４ＫＲ（配列番号１１７）のいずれかを発現する形質転換体を、実施例３（８）から（１０）と同様な方法で培養し、実施例３（１１）と同様な方法でタンパク質抽出液を調製した。前記抽出液は遠心分離し、得られた上清をフィルターに通し、清澄化した。
　（２）あらかじめ０．５ＭのＮａＣｌと０．０２Ｍイミダゾールとを含む０．０５Ｍトリス緩衝液（ｐＨ７．５）（以下、洗浄緩衝液Ｂと表記）で平衡化したＮｉ－ＮＴＡ　Ｓｅｐｈａｒｏｓｅ　６　Ｆａｓｔ　Ｆｌｏｗ（Ｃｙｔｉｖａ社製）を充填したカラムに、（１）で清澄化した上清を添加し、前記カラムに充填した担体の１０倍量の洗浄緩衝液Ｂで洗浄後、０．５ＭのＮａＣｌと０．５Ｍイミダゾールとを含む０．０５Ｍトリス緩衝液（ｐＨ７．５）を通液することで、免疫グロブリン結合性タンパク質に相当する画分を回収した。
　（３）回収した画分の吸光度を分光光度計で測定し、当該画分に含まれる免疫グロブリン結合性タンパク質を定量した。またＳＤＳ－ＰＡＧＥ（ＳＤＳ－ポリアクリルアミド電気泳動）も実施し、前記タンパク質が純度よく精製されていることを確認した。
　（４）処理に用いたＮａＯＨの濃度を１．０Ｍ（終濃度０．５Ｍ）に、処理温度を４２℃に、処理時間を１５分に、それぞれした他は、実施例３（１３）と同様な方法でアルカリ処理後、実施例３（１４）と同様な方法で残存活性を算出し、アルカリ安定性を評価した。
　結果を表１１に示す。ＦｐＬ＿Ｃ２（配列番号１１３）、ＦｐＬ＿Ｃ３（配列番号１）およびＦｐＬ＿Ｃ４（配列番号１８）はリジン残基の全てをアルギニン残基に置換（ＦｐＬ＿Ｃ２ＫＲ（配列番号１１５）、ＦｐＬ＿Ｃ３ＫＲ（配列番号１１６）およびＦｐＬ＿Ｃ４ＫＲ（配列番号１１７））することで、アルカリ安定性が向上した。
Figure JPOXMLDOC01-appb-T000011
　実施例１３　ＦｐＬ＿Ｃ４ＫＲへの変異導入およびライブラリ作製
　（１）参考例１（２）（δ）で取得した、ｐＥＴ－ＦｐＬ＿Ｃ４ＫＲを鋳型として、７番目および２９番目のアミノ酸残基に対する飽和置換体ライブラリを作製した。プライマーは、実施例１１（１）と同様、２２ｃ－Ｔｒｉｃｋ法に倣い、変異導入箇所に適切な混合塩基を配置し、変異導入箇所を中心としたインバースＰＣＲができるように設計した（配列番号１２４から１３５）。これらのプライマーを一箇所の置換につき６本一組として、表７および表１２の組成で混合し、ＰＣＲ　Ｐｒｉｍｅｒ混合液（Ｆｏｒｗａｒｄ／Ｒｅｖｅｒｓｅ　ｐｒｉｍｅｒ　ｍｉｘ）を調製した。
Figure JPOXMLDOC01-appb-T000012
　（２）ｐＥＴ－ＦｐＬ＿Ｃ４ＫＲを鋳型ＤＮＡとした他は、実施例１１（２）と同様な方法でインバースＰＣＲによる部位特異的変異導入を行なった。
　（３）得られたＰＣＲ産物を精製後、反応液を用いて大腸菌ＢＬ２１（ＤＥ３）株を形質転換し、５０μｇ／ｍＬのカナマイシンを含むＬＢプレート培地で培養（３７℃、１６時間）した後、プレート上に形成したコロニーを部位特異的変異体ライブラリとした。
　実施例１４　ＦｐＬ＿Ｃ４ＫＲアミノ酸置換体のスクリーニング
　（１）参考例１（２）（δ）で作製したＦｐＬ＿Ｃ４ＫＲ（配列番号１１７）を発現する形質転換体および実施例１３で作製した部位特異的アミノ酸置換体ライブラリ（形質転換体）を実施例３（１）から（２）と同様な方法で培養した。
　（２）培養後、遠心操作によって得られた培養上清に対し、実施例３（３）と同様な方法でアルカリ処理を行ない、実施例３（４）に記載のＥＬＩＳＡ法を用いて残存活性を算出した。
　（３）約２００株の形質転換体を評価し、その中からＦｐＬ＿Ｃ４ＫＲ（配列番号１１７）と比較してアルカリ安定性が向上した免疫グロブリン結合性タンパク質を発現する形質転換体を選択した。
　（４）選択した形質転換体を培養し、ＱＩＡｐｒｅｐ　Ｓｐｉｎ　Ｍｉｎｉｐｒｅｐ　ｋｉｔ（ＱＩＡＧＥＮ社製）を用いて発現ベクターを調製した。
　（５）得られた発現ベクターに挿入された免疫グロブリン結合性タンパク質をコードするポリヌクレオチド領域の配列を実施例１（５）に記載の方法によりヌクレオチド配列を解析し、アミノ酸置換箇所を特定した。
　（６）（３）で選択した免疫グロブリン結合性タンパク質を発現する形質転換体または参考例１で作製したＦｐＬ＿Ｃ４ＫＲ（配列番号１１７）を発現する形質転換体を、実施例３（８）から（１０）と同様な方法で培養し、実施例３（１１）と同様な方法でタンパク質抽出液を調製した。
　（７）（６）で調製したタンパク質抽出液中の免疫グロブリン結合性タンパク質の抗体結合活性を、実施例３（４）に記載のＥＬＩＳＡ法を用いて測定した。
　（８）実施例３（１３）に記載の方法でアルカリ処理後、実施例３（１４）と同様な方法で残存活性を算出し、アルカリ安定性を評価した。
　（３）で選択した形質転換体が発現する免疫グロブリン結合性タンパク質（配列番号１１７）に対するアミノ酸置換位置およびアルカリ処理したときの残存活性［％］をまとめた結果を表１３に示す。配列番号１１７に記載のアミノ酸配列において、少なくともＬｙｓ（Ａｒｇ）７Ａｌａ（この表記は配列番号１の７番目のリジンに相当するアミノ酸残基（配列番号１８では７番目のリジン）が一旦アルギニンに置換後、さらにアラニンに置換されていることを表す、以下同様）および／またはＬｙｓ（Ａｒｇ）２９Ｐｒｏのアミノ酸置換を有した免疫グロブリン結合性タンパク質は、ＦｐＬ＿Ｃ４ＫＲ（配列番号１１７）と比較しアルカリ安定性が向上しているといえる。
Figure JPOXMLDOC01-appb-T000013
　実施例１５　ＦｐＬ＿Ｃ３ＫＲアミノ酸置換集積体の作製
　（１）ＦｐＬ＿Ｃ３ＫＲアミノ酸置換集積体の設計
　実施例８および実施例１２で明らかになった、免疫グロブリン結合性タンパク質のアルカリ安定性向上に関与するアミノ酸置換をＦｐＬ＿Ｃ３ＫＲ（配列番号１１６）に対し集積することで、更なる安定性の向上を図った。具体的には、以下の（ｍ）から（ｐ）に示す４種類の免疫グロブリン結合性タンパク質を設計し、作製した。
（ｍ）ＦｐＬ＿Ｃ３ＫＲに対し、Ｇｌｙ２１Ａｒｇのアミノ酸置換を導入したタンパク質（ＦｐＬ＿Ｃ３ＫＲ　１ａと命名）
（ｎ）ＦｐＬ＿Ｃ３ＫＲに対し、Ｇｌｙ５１Ｖａｌのアミノ酸置換を導入したタンパク質（ＦｐＬ＿Ｃ３ＫＲ　１ｂと命名）
（ｏ）ＦｐＬ＿Ｃ３ＫＲに対し、Ａｓｎ６２Ｔｙｒのアミノ酸置換を導入したタンパク質（ＦｐＬ＿Ｃ３ＫＲ　１ｃと命名）
（ｐ）ＦｐＬ＿Ｃ３ＫＲに対し、Ａｓｎ５０Ｔｙｒ、Ｇｌｕ５２ＧｌｙおよびＡｓｎ６２Ｔｙｒのアミノ酸置換を導入したタンパク質（ＦｐＬ＿Ｃ３ＫＲ　３ａと命名）
　（２）ＦｐＬ＿Ｃ３ＫＲアミノ酸置換集積体の作製
　以下、前記（ｍ）から（ｐ）に示す４種類の免疫グロブリン結合性タンパク質の作製方法について説明する。
　（ｍ）ＦｐＬ＿Ｃ３ＫＲ　１ａ
　本タンパク質は、実施例１２で判明したアルカリ安定性が向上するアミノ酸置換の中からＧｌｙ２１Ａｒｇを選択し、当該アミノ酸残基をＦｐＬ＿Ｃ３ＫＲ（配列番号１１６）に導入することで作製した。
　（ｍ－１）インバースＰＣＲを用いた変異導入により、ＦｐＬ＿Ｃ３ＫＲ　１ａ（配列番号１３８）をコードするヌクレオチド配列を含むポリヌクレオチドを作製した。インバースＰＣＲは、鋳型ＤＮＡとしてｐＥＴ－ＦｐＬ＿Ｃ３ＫＲを、ＰＣＲ　Ｆｏｒｗａｒｄ　Ｐｒｉｍｅｒとして配列番号１４６に記載の配列からなるオリゴヌクレオチドを、ＰＣＲ　Ｒｅｖｅｒｓｅ　Ｐｒｉｍｅｒとして配列番号１４７に記載の配列からなるオリゴヌクレオチドを、それぞれ用いた他は実施例７（２）（ａ－１）と同様な方法で行なった。
　（ｍ－２）得られたポリヌクレオチドを精製し、制限酵素ＤｐｎＩで処理後、当該制限酵素処理産物を用いて大腸菌ＢＬ２１（ＤＥ３）株を形質転換した。
　（ｍ－３）得られた形質転換体を実施例７（２）（ａ－３）と同様な方法で培養および発現ベクター（ｐＥＴ－ＦｐＬ＿Ｃ３ＫＲ　１ａと命名）の抽出を行ない、当該発現ベクターのヌクレオチド配列の解析を実施例１（５）と同様の方法で行なった。
　配列解析の結果、発現ベクターｐＥＴ－ＦｐＬ＿Ｃ３ＫＲ　１ａにＦｐＬ＿Ｃ３ＫＲ　１ａ（配列番号１３８）をコードするポリヌクレオチドが挿入されていることを確認した。
　（ｎ）ＦｐＬ＿Ｃ３ＫＲ　１ｂ
　本タンパク質は、実施例１２で判明したアルカリ安定性が向上するアミノ酸置換の中からＧｌｙ５１Ｖａｌを選択し、当該アミノ酸残基をＦｐＬ＿Ｃ３ＫＲ（配列番号１１６）に導入することで作製した。
　（ｎ－１）インバースＰＣＲを用いた変異導入により、ＦｐＬ＿Ｃ３ＫＲ　１ｂ（配列番号１３９）をコードするヌクレオチド配列を含むポリヌクレオチドを作製した。インバースＰＣＲは、鋳型ＤＮＡとしてｐＥＴ－ＦｐＬ＿Ｃ３ＫＲを含んだポリヌクレオチドを、ＰＣＲ　Ｆｏｒｗａｒｄ　Ｐｒｉｍｅｒとして配列番号１４８に記載の配列からなるオリゴヌクレオチドを、ＰＣＲ　Ｒｅｖｅｒｓｅ　Ｐｒｉｍｅｒとして配列番号１４９に記載の配列からなるオリゴヌクレオチドを、それぞれ用いた他は実施例７（２）（ａ－１）と同様な方法で行なった。
　（ｎ－２）得られたポリヌクレオチドを精製し、制限酵素ＤｐｎＩで処理後、当該制限酵素処理産物を用いて大腸菌ＢＬ２１（ＤＥ３）株を形質転換した。
　（ｎ－３）得られた形質転換体を実施例７（２）（ａ－３）と同様な方法で培養および発現ベクター（ｐＥＴ－ＦｐＬ＿Ｃ３ＫＲ　１ｂと命名）の抽出を行ない、当該発現ベクターのヌクレオチド配列の解析を実施例１（５）と同様の方法で行なった。
　配列解析の結果、発現ベクターｐＥＴ－ＦｐＬ＿Ｃ３ＫＲ　１ｂにＦｐＬ＿Ｃ３ＫＲ　１ｂ（配列番号１３９）をコードするポリヌクレオチドが挿入されていることを確認した。
　（ｏ）ＦｐＬ＿Ｃ３ＫＲ　１ｃ
　（ｏ－１）ｐＥＴ２６ｂおよびＦｐＬ＿Ｃ３ＫＲ　１ｃ（配列番号１４０）をコードするポリヌクレオチド（配列番号１５０）を含む発現ベクターｐＥＴ－ＦｐＬ＿Ｃ３ＫＲ　１ｃのヌクレオチド配列を設計し、以下の３領域に分割した。
第一領域：ｐＥＴ２６ｂのヌクレオチド配列、ＦｐＬ＿Ｃ３ＫＲ　１ｃの１番目から２０番目までのアミノ酸残基をコードするヌクレオチド配列（配列番号１５０の１番目から６０番目までのヌクレオチド配列）、ＦｐＬ＿Ｃ３ＫＲ　１ｃの５３番目から７０番目までのアミノ酸残基をコードするヌクレオチド配列（配列番号１５０の１５７番目から２１０番目までのヌクレオチド配列）、ヒスチジン６残基をコードするヌクレオチド配列（配列番号２３２）、終止コドンおよび制限酵素ＨｉｎｄＩＩＩの認識配列（５’－ＴＡＡＧＣＴＴ－３’）
第二領域：ＦｐＬ＿Ｃ３ＫＲ　１ｃの１６番目から３７番目までのアミノ酸残基をコードするヌクレオチド配列（配列番号１５３［ｆｏｒｗａｒｄ］および１５４［ｒｅｖｅｒｓｅ］に記載の配列からなるポリヌクレオチド）
第三領域：ＦｐＬ＿Ｃ３ＫＲ１ｃの３３番目から５７番目までのアミノ酸残基をコードするヌクレオチド配列（配列番号１５５［ｆｏｒｗａｒｄ］および１５６［ｒｅｖｅｒｓｅ］に記載の配列からなるポリヌクレオチド）
　（ｏ－２）インバースＰＣＲにより、前記第一領域のポリヌクレオチドを調製した。インバースＰＣＲは、鋳型ＤＮＡとしてｐＥＴ－ＦｐＬ＿Ｃ４ＫＲを、ＰＣＲ　Ｆｏｒｗａｒｄ　Ｐｒｉｍｅｒとして配列番号１５１に記載の配列からなるオリゴヌクレオチドを、ＰＣＲ　Ｒｅｖｅｒｓｅ　Ｐｒｉｍｅｒとして配列番号１５２に記載の配列からなるオリゴヌクレオチドを、それぞれ用いた他は実施例７（２）（ａ－１）と同様な方法で行なった。インバースＰＣＲ後、前記第一領域を含むポリヌクレオチドを精製した。
　（ｏ－３）（ｏ－２）で調製した前記第一領域のポリヌクレオチド、ならびに（ｏ－１）で設計した前記第二領域および前記第三領域のポリヌクレオチド（直接化学合成で作製）を、ＮＥＢｕｉｌｄｅｒ（ニュー・イングランド・バイオラボ社製）を用いて連結した。なお、前記三領域（ポリヌクレオチドとしては５種類）のポリヌクレオチドはそれぞれ、反応液中に０．０５ｐｍｏｌ添加した。
　（ｏ－４）連結したポリヌクレオチドを用いて大腸菌ＢＬ２１（ＤＥ３）株を形質転換した。
　（ｏ－５）得られた形質転換体を実施例７（２）（ａ－３）と同様な方法で培養および発現ベクターの抽出を行ない、当該発現ベクターのヌクレオチド配列の解析を実施例１（５）と同様の方法で行なった。
　配列解析の結果、発現ベクターｐＥＴ－ＦｐＬ＿Ｃ３ＫＲ　１ｃにＦｐＬ＿Ｃ３ＫＲ　１ｃ（配列番号１４０）をコードするポリヌクレオチド（配列番号１５０）が挿入されていることを確認した。
　（ｐ）ＦｐＬ＿Ｃ３ＫＲ　３ａ
　（ｐ－１）ｐＥＴ２６ｂおよびＦｐＬ＿Ｃ３ＫＲ　３ａ（配列番号１４１）をコードするポリヌクレオチド（配列番号１５７）を含む発現ベクターｐＥＴ－ＦｐＬ＿Ｃ３ＫＲ　３ａのヌクレオチド配列を設計し、以下の３領域に分割した。
第一領域：ｐＥＴ２６ｂのヌクレオチド配列、ＦｐＬ＿Ｃ３ＫＲ　３ａの１番目から２０番目までのアミノ酸残基をコードするヌクレオチド配列（配列番号１４１の１番目から６０番目までのヌクレオチド配列）、ＦｐＬ＿Ｃ３ＫＲ　３ａの５３番目から７０番目までのアミノ酸残基をコードするヌクレオチド配列（配列番号１４１の１５７番目から２１０番目までのヌクレオチド配列）、ヒスチジン６残基をコードするヌクレオチド配列（配列番号２３２）、終止コドンおよび制限酵素ＨｉｎｄＩＩＩの認識配列（５’－ＴＡＡＧＣＴＴ－３’）
第二領域：ＦｐＬ＿Ｃ３ＫＲ　３ａの１６番目から３７番目までのアミノ酸残基をコードするヌクレオチド配列（配列番号１５３［ｆｏｒｗａｒｄ］および１５４［ｒｅｖｅｒｓｅ］に記載の配列からなるポリヌクレオチド）
第三領域：ＦｐＬ＿Ｃ３ＫＲ　３ａの３３番目から５７番目までのアミノ酸残基をコードするヌクレオチド配列（配列番号１５８［ｆｏｒｗａｒｄ］および１５９［ｒｅｖｅｒｓｅ］に記載の配列からなるポリヌクレオチド）
　（ｐ－２）（ｏ－２）に記載のインバースＰＣＲにより前記第一領域のポリヌクレオチドを調製し、精製した。
　（ｐ－３）（ｐ－２）で調製した前記第一領域のポリヌクレオチド、ならびに（ｐ－１）で設計した前記第二領域および前記第三領域のポリヌクレオチド（直接化学合成で作製）を（ｏ－３）と同様な方法で連結した。
　（ｐ－４）連結したポリヌクレオチドを用いて大腸菌ＢＬ２１（ＤＥ３）株を形質転換した。
　（ｐ－５）得られた形質転換体を実施例７（２）（ａ－３）と同様な方法で培養および発現ベクターの抽出を行ない、当該発現ベクターのヌクレオチド配列の解析を実施例１（５）と同様の方法で行なった。
　配列解析の結果、発現ベクターｐＥＴ－ＦｐＬ＿Ｃ３ＫＲ　３ａにＦｐＬ＿Ｃ３ＫＲ　３ａ（配列番号１４１）をコードするポリヌクレオチド（配列番号１５７）が挿入されていることを確認した。
　実施例１６　ＦｐＬ＿Ｃ３アミノ酸置換集積体の作製（その２）
　（１）ＦｐＬ＿Ｃ３アミノ酸置換集積体の設計
　ＦｐＬ＿Ｃ３ＫＲ（配列番号１１６）において、リジン残基から置換したアルギニン残基の一部を他のアミノ酸残基に置換した（具体的には、Ｌｙｓ（Ａｒｇ）７Ａｌａ、Ｌｙｓ（Ａｒｇ）２２ＧｌｎおよびＬｙｓ（Ａｒｇ）２９Ｉｌｅのアミノ酸置換を有した）免疫グロブリン結合性タンパク質ＦｐＬ＿Ｃ３ＫＸ（配列番号１４２）を作製し、実施例８および実施例１２で明らかになった、免疫グロブリン結合性タンパク質のアルカリ安定性向上に関与するアミノ酸置換をＦｐＬ＿Ｃ３ＫＸ（配列番号１４２）に対し集積した。具体的には、以下の（ｑ）から（ｓ）に示す４種類の免疫グロブリン結合性タンパク質を設計し、作製した。
（ｑ）ＦｐＬ＿Ｃ３ＫＸに対し、Ｇｌｙ２１Ａｒｇのアミノ酸置換を導入したタンパク質（ＦｐＬ＿Ｃ３ＫＸ　１ａと命名）
（ｒ）ＦｐＬ＿Ｃ３ＫＸに対し、Ａｓｎ５０Ｔｙｒ、Ｇｌｕ５２ＧｌｙおよびＡｓｎ６２Ｔｙｒのアミノ酸置換を導入したタンパク質（ＦｐＬ＿Ｃ３ＫＸ　３ａと命名）
（ｓ）ＦｐＬ＿Ｃ３ＫＸに対し、Ｇｌｙ２１Ａｒｇ、Ａｓｎ５０Ｔｙｒ、Ｇｌｕ５２ＧｌｙおよびＡｓｎ６２Ｔｙｒのアミノ酸置換を導入したタンパク質（ＦｐＬ＿Ｃ３ＫＸ　４ｇと命名）
　（２）ＦｐＬ＿Ｃ３　ＫＸの作製
　（２－１）ｐＥＴ２６ｂおよびＦｐＬ＿Ｃ３ＫＸ（配列番号１４２）をコードするポリヌクレオチド（配列番号１６１）を含む発現ベクターｐＥＴ－ＦｐＬ＿Ｃ３ＫＸのヌクレオチド配列を設計し、以下の３領域に分割した。
第一領域：ｐＥＴ２６ｂのヌクレオチド配列、ＦｐＬ＿Ｃ３ＫＸの１番目から２０番目までのアミノ酸残基をコードするヌクレオチド配列（配列番号１６１の１番目から６０番目までのヌクレオチド配列）、ＦｐＬ＿Ｃ３ＫＸの５３番目から７０番目までのアミノ酸残基をコードするヌクレオチド配列（配列番号１６１の１５７番目から２１０番目までのヌクレオチド配列）、ヒスチジン６残基をコードするヌクレオチド配列（配列番号２３２）、終止コドンおよび制限酵素ＨｉｎｄＩＩＩの認識配列（５’－ＴＡＡＧＣＴＴ－３’）
第二領域：ＦｐＬ＿Ｃ３ＫＸの１６番目から３７番目までのアミノ酸残基をコードするヌクレオチド配列（配列番号１６３［ｆｏｒｗａｒｄ］および１６４［ｒｅｖｅｒｓｅ］に記載の配列からなるポリヌクレオチド）
第三領域：ＦｐＬ＿Ｃ３ＫＸの３３番目から５７番目までのアミノ酸残基をコードするヌクレオチド配列（配列番号１５５［ｆｏｒｗａｒｄ］および１５６［ｒｅｖｅｒｓｅ］に記載の配列からなるポリヌクレオチド）
　（２－２）インバースＰＣＲにより、前記第一領域を含むポリヌクレオチドを調製した。インバースＰＣＲは、鋳型ＤＮＡとしてＦｐＬ＿Ｃ４ＫＲ　Ｋ７Ａ（ＦｐＬ＿Ｃ４ＫＲにＬｙｓ（Ａｒｇ）７Ａｌａのアミノ酸置換を導入した免疫グロブリン結合性タンパク質、配列番号１３６）をコードするポリヌクレオチド（配列番号１６０）を含む発現ベクターｐＥＴ－ＦｐＬ＿Ｃ４ＫＲ　Ｋ７Ａを、ＰＣＲ　Ｆｏｒｗａｒｄ　Ｐｒｉｍｅｒとして配列番号１６２に記載の配列からなるオリゴヌクレオチドを、ＰＣＲ　Ｒｅｖｅｒｓｅ　Ｐｒｉｍｅｒとして配列番号１５２に記載の配列からなるオリゴヌクレオチドを、それぞれ用いた他は実施例７（２）（ａ－１）と同様な方法で行なった。インバースＰＣＲ後、前記第一領域を含むポリヌクレオチドを精製した。
　（２－３）（２－２）で調製した前記第一領域のポリヌクレオチド、ならびに（２－１）で設計した前記第二領域および前記第三領域のポリヌクレオチド（直接化学合成で作製）を実施例１５（２）（ｏ－３）と同様な方法で連結した。
　（２－４）連結したポリヌクレオチドを用いて大腸菌ＢＬ２１（ＤＥ３）株を形質転換した。
　（２－５）得られた形質転換体を実施例７（２）（ａ－３）と同様な方法で培養および発現ベクターの抽出を行ない、当該発現ベクターのヌクレオチド配列の解析を実施例１（５）と同様の方法で行なった。
　配列解析の結果、発現ベクターｐＥＴ－ＦｐＬ＿Ｃ３ＫＸにＦｐＬ＿Ｃ３ＫＸ（配列番号１４２）をコードするポリヌクレオチド（配列番号１６１）が挿入されていることを確認した。
　（３）ＦｐＬ＿Ｃ３ＫＸアミノ酸置換集積体の作製
　以下、前記（ｑ）から（ｓ）に示す３種類の免疫グロブリン結合性タンパク質の作製方法について説明する。
　（ｑ）ＦｐＬ＿Ｃ３ＫＸ　１ａ
　（ｑ－１）ｐＥＴ２６ｂおよびＦｐＬ＿Ｃ３ＫＸ　１ａ（配列番号１４３）をコードするポリヌクレオチド（配列番号１６５）を含む発現ベクターｐＥＴ－ＦｐＬ＿Ｃ３ＫＸ　１ａのヌクレオチド配列を設計し、以下の３領域に分割した。
第一領域：ｐＥＴ２６ｂのヌクレオチド配列、ＦｐＬ＿Ｃ３ＫＸ　１ａの１番目から２０番目までのアミノ酸残基をコードするヌクレオチド配列（配列番号１６５の１番目から６０番目までのヌクレオチド配列）、ＦｐＬ＿Ｃ３ＫＸ　１ａの５３番目から７０番目までのアミノ酸残基をコードするヌクレオチド配列（配列番号１６５の１５７番目から２１０番目までのヌクレオチド配列）、ヒスチジン６残基をコードするヌクレオチド配列（配列番号２３２）、終止コドンおよび制限酵素ＨｉｎｄＩＩＩの認識配列（５’－ＴＡＡＧＣＴＴ－３’）
第二領域：ＦｐＬ＿Ｃ３ＫＸ　１ａの１６番目から３７番目までのアミノ酸残基をコードするヌクレオチド配列（配列番号１６６［ｆｏｒｗａｒｄ］および１６７［ｒｅｖｅｒｓｅ］に記載の配列からなるポリヌクレオチド）
第三領域：ＦｐＬ＿Ｃ３ＫＸ　１ａの３３番目から５７番目までのアミノ酸残基をコードするヌクレオチド配列（配列番号１５５［ｆｏｒｗａｒｄ］および１５６［ｒｅｖｅｒｓｅ］に記載の配列からなるポリヌクレオチド）
　（ｑ－２）（２－２）に記載のインバースＰＣＲにより前記第一領域のポリヌクレオチドを調製し、精製した。
　（ｑ－３）（ｑ－２）で調製した前記第一領域のポリヌクレオチド、ならびに（ｑ－１）で設計した前記第二領域および前記第三領域のポリヌクレオチド（直接化学合成で作製）を実施例１５（２）（ｏ－３）と同様な方法で連結した。
　（ｑ－４）連結したポリヌクレオチドを用いて大腸菌ＢＬ２１（ＤＥ３）株を形質転換した。
　（ｑ－５）得られた形質転換体を実施例７（２）（ａ－３）と同様な方法で培養および発現ベクター（ｐＥＴ－ＦｐＬ＿Ｃ３ＫＸ　１ａと命名）の抽出を行ない、当該発現ベクターのヌクレオチド配列の解析を実施例１（５）と同様の方法で行なった。
　配列解析の結果、発現ベクターｐＥＴ－ＦｐＬ＿Ｃ３ＫＸ　１ａにＦｐＬ＿Ｃ３ＫＸ　１ａ（配列番号１４３）をコードするポリヌクレオチド（配列番号１６５）が挿入されていることを確認した。
　（ｒ）ＦｐＬ＿Ｃ３ＫＸ　３ａ
　（ｒ－１）ｐＥＴ２６ｂおよびＦｐＬ＿Ｃ３ＫＸ　３ａ（配列番号１４４）をコードするポリヌクレオチド（配列番号１６８）を含む発現ベクターｐＥＴ－ＦｐＬ＿Ｃ３ＫＸ　３ａのヌクレオチド配列を設計し、以下の３領域に分割した。
第一領域：ｐＥＴ２６ｂのヌクレオチド配列、ＦｐＬ＿Ｃ３ＫＸ　３ａの１番目から２０番目までのアミノ酸残基をコードするヌクレオチド配列（配列番号１６８の１番目から６０番目までのヌクレオチド配列）、ＦｐＬ＿Ｃ３ＫＸ　３ａの５３番目から７０番目までのアミノ酸残基をコードするヌクレオチド配列（配列番号１６８の１５７番目から２１０番目までのヌクレオチド配列）、ヒスチジン６残基をコードするヌクレオチド配列（配列番号２３２）、終止コドンおよび制限酵素ＨｉｎｄＩＩＩの認識配列（５’－ＴＡＡＧＣＴＴ－３’）
第二領域：ＦｐＬ＿Ｃ３ＫＸ　３ａの１６番目から３７番目までのアミノ酸残基をコードするヌクレオチド配列（配列番号１６９［ｆｏｒｗａｒｄ］および１７０［ｒｅｖｅｒｓｅ］に記載の配列からなるポリヌクレオチド）
第三領域：ＦｐＬ＿Ｃ３ＫＸ　３ａの３３番目から５７番目までのアミノ酸残基をコードするヌクレオチド配列（配列番号１５８［ｆｏｒｗａｒｄ］および１５９［ｒｅｖｅｒｓｅ］に記載の配列からなるポリヌクレオチド）
　（ｒ－２）インバースＰＣＲにより、前記第一領域のポリヌクレオチドを調製した。インバースＰＣＲは、鋳型ＤＮＡとしてｐＥＴ－ＦｐＬ＿Ｃ４ＫＲ　Ｋ７Ａを、ＰＣＲ　Ｆｏｒｗａｒｄ　Ｐｒｉｍｅｒとして配列番号１５１に記載の配列からなるオリゴヌクレオチドを、ＰＣＲ　Ｒｅｖｅｒｓｅ　Ｐｒｉｍｅｒとして配列番号１５２に記載の配列からなるオリゴヌクレオチドを、それぞれ用いた他は実施例７（２）（ａ－１）と同様な方法で行なった。インバースＰＣＲ後、前記第一領域を含むポリヌクレオチドを精製した。
　（ｒ－３）（ｒ－２）で調製した前記第一領域のポリヌクレオチド、ならびに（ｒ－１）で設計した前記第二領域および前記第三領域のポリヌクレオチド（直接化学合成で作製）を実施例１５（２）（ｏ－３）と同様な方法で連結した。
　（ｒ－４）連結したポリヌクレオチドを用いて大腸菌ＢＬ２１（ＤＥ３）株を形質転換した。
　（ｒ－５）得られた形質転換体を実施例７（２）（ａ－３）と同様な方法で培養および発現ベクターの抽出を行ない、当該発現ベクターのヌクレオチド配列の解析を実施例１（５）と同様の方法で行なった。
　配列解析の結果、発現ベクターｐＥＴ－ＦｐＬ＿Ｃ３ＫＸ　３ａにＦｐＬ＿Ｃ３ＫＸ　３ａ（配列番号１４４）をコードするポリヌクレオチド（配列番号１６８）が挿入されていることを確認した。
　（ｓ）ＦｐＬ＿Ｃ３ＫＸ　４ｇ
　（ｓ－１）ｐＥＴ２６ｂおよびＦｐＬ＿Ｃ３ＫＸ　４ｇ（配列番号１４５）をコードするポリヌクレオチド（配列番号１７１）を含む発現ベクターｐＥＴ－ＦｐＬ＿Ｃ３ＫＸ　４ｇのヌクレオチド配列を設計し、以下の３領域に分割した。
第一領域：ｐＥＴ２６ｂのヌクレオチド配列、ＦｐＬ＿Ｃ３ＫＸ　４ｇの１番目から２０番目までのアミノ酸残基をコードするヌクレオチド配列（配列番号１７１の１番目から６０番目までのヌクレオチド配列）、ＦｐＬ＿Ｃ３ＫＸ　４ｇの５３番目から７０番目までのアミノ酸残基をコードするヌクレオチド配列（配列番号１７１の１５７番目から２１０番目までのヌクレオチド配列）、ヒスチジン６残基をコードするヌクレオチド配列（配列番号２３２）、終止コドンおよび制限酵素ＨｉｎｄＩＩＩの認識配列（５’－ＴＡＡＧＣＴＴ－３’）
第二領域：ＦｐＬ＿Ｃ３ＫＸ　４ｇの１６番目から３７番目までのアミノ酸残基をコードするヌクレオチド配列（配列番号１６６［ｆｏｒｗａｒｄ］および１６７［ｒｅｖｅｒｓｅ］に記載の配列からなるポリヌクレオチド）
第三領域：ＦｐＬ＿Ｃ３ＫＸ　４ｇの３３番目から５７番目までのアミノ酸残基をコードするヌクレオチド配列（配列番号１５８［ｆｏｒｗａｒｄ］および１５９［ｒｅｖｅｒｓｅ］に記載の配列からなるポリヌクレオチド）
　（ｓ－２）（ｒ－２）に記載のインバースＰＣＲにより前記第一領域のポリヌクレオチドを調製し、精製した。
　（ｓ－３）（ｓ－２）で調製した前記第一領域のポリヌクレオチド、ならびに（ｓ－１）で設計した前記第二領域および前記第三領域のポリヌクレオチド（直接化学合成で作製）を実施例１５（２）（ｏ－３）と同様な方法で連結した。
　（ｓ－４）連結したポリヌクレオチドを用いて大腸菌ＢＬ２１（ＤＥ３）株を形質転換した。
　（ｓ－５）得られた形質転換体を実施例７（２）（ａ－３）と同様な方法で培養および発現ベクターの抽出を行ない、当該発現ベクターのヌクレオチド配列の解析を実施例１（５）と同様の方法で行なった。
　配列解析の結果、発現ベクターｐＥＴ－ＦｐＬ＿Ｃ３ＫＸ　４ｇにＦｐＬ＿Ｃ３ＫＸ　４ｇ（配列番号１４５）をコードするポリヌクレオチド（配列番号１７１）が挿入されていることを確認した。
　実施例１７　ＦｐＬ＿Ｃ３ＫＸアミノ酸置換集積体のアルカリ安定性評価
　（１）実施例１で作製した天然型ＦｐＬ＿Ｃ３（配列番号１）、参考例１で作製した変異型（アミノ酸置換した）免疫グロブリン結合性タンパク質ＦｐＬ＿Ｃ３ＫＲ（配列番号１１６）、実施例１５で作製した変異型免疫グロブリン結合性タンパク質ＦｐＬ＿Ｃ３ＫＲ　１ａ（配列番号１３８）、ＦｐＬ＿Ｃ３ＫＲ　１ｂ（配列番号１３９）、ＦｐＬ＿Ｃ３ＫＲ　１ｃ（配列番号１４０）およびＦｐＬ＿Ｃ３ＫＲ　３ａ（配列番号１４１）、ならびに実施例１６で作製した変異型免疫グロブリン結合性タンパク質ＦｐＬ＿Ｃ３ＫＸ（配列番号１４２）、ＦｐＬ＿Ｃ３ＫＸ　１ａ（配列番号１４３）、ＦｐＬ＿Ｃ３ＫＸ　３ａ（配列番号１４４）およびＦｐＬ＿Ｃ３ＫＸ　４ｇ（配列番号１４５）のいずれかを発現する形質転換体を、実施例３（８）から（１０）と同様な方法で培養し、実施例３（１１）に記載の方法でタンパク質抽出液を調製した。
　（２）（１）で調製したタンパク質抽出液中の免疫グロブリン結合性タンパク質の抗体結合活性を、実施例３（４）に記載のＥＬＩＳＡ法を用いて測定した。
　（３）処理に用いたＮａＯＨの濃度を０．４Ｍ（終濃度０．２Ｍ）に、処理時間を１５時間に、それぞれした他は、実施例３（１３）と同様な方法でアルカリ処理後、実施例３（１４）と同様な方法で残存活性を算出し、アルカリ安定性を評価した。
　結果を表１４に示す。少なくともＧｌｙ２１Ａｒｇ、Ａｓｎ５０Ｔｙｒ、Ｇｌｙ５１Ｖａｌ、Ｇｌｕ５２ＧｌｙおよびＡｓｎ６２Ｔｙｒより選択される１以上のアミノ酸置換を有することで、これらアミノ酸置換を導入しない免疫グロブリン結合性タンパク質（ＦｐＬ＿Ｃ３ＫＲおよびＦｐＬ＿Ｃ３ＫＸ）と比較し、アルカリ安定性が向上しているといえる。特に、Ａｓｎ５０Ｔｙｒ、Ｇｌｕ５２ＧｌｙおよびＡｓｎ６２Ｔｙｒの全てのアミノ酸置換を有した免疫グロブリン結合性タンパク質（ＦｐＬ＿Ｃ３ＫＲ　３ａおよびＦｐＬ＿Ｃ３ＫＸ　３ａ）は、特にアルカリ安定性が向上しているといえる（ＦｐＬ＿Ｃ３ＫＲ：５４％、ＦｐＬ＿Ｃ３ＫＲ　３ａ：８６％）（ＦｐＬ＿Ｃ３ＫＸ：１０％、ＦｐＬ＿Ｃ３ＫＸ　３ａ：６９％）。
Figure JPOXMLDOC01-appb-T000014
　実施例１８　ＦｐＬ＿Ｃ３ＫＸ　３ａへの変異導入およびライブラリ作製
　実施例１６（ｒ）で作製した発現ベクターｐＥＴ－ＦｐＬ＿Ｃ３ＫＸ　３ａのうち、免疫グロブリン結合性タンパク質をコードするポリヌクレオチド部分（配列番号１６８）に、実施例２と同様の方法でエラープローンＰＣＲによりランダムに変異を導入し、ライブラリを作製した。平均変異導入率は１．７％であった。
　実施例１９　ＦｐＬ＿Ｃ３ＫＸ　３ａアミノ酸置換体のスクリーニング（その１）
　（１）実施例１６（ｒ）で作製したｐＥＴ－ＦｐＬ＿Ｃ３ＫＸ　３ａ（形質転換体）と実施例１８で作製したランダム変異体ライブラリ（形質転換体）を、実施例３（１）から（２）と同様な方法で培養した。
　（２）培養後、遠心操作によって得られた培養上清を１．０Ｍ　ＮａＯＨと等量混合し４２℃で３０分間アルカリ処理を行なった。
　（３）アルカリ処理を行なった時の免疫グロブリン結合性タンパク質の抗体結合活性を実施例３（４）に記載のＥＬＩＳＡ法にて測定し、アルカリ処理を行なった時の免疫グロブリン結合性タンパク質の抗体結合活性を、アルカリ処理を行わなかった時の免疫グロブリン結合性タンパク質の抗体結合活性で除することで残存活性を算出した。
　（４）約９００株の形質転換体を評価し、その中からＦｐＬ＿Ｃ３ＫＸ　３ａ（配列番号１４４）と比較してアルカリ安定性が向上した免疫グロブリン結合性タンパク質を発現する形質転換体を選択した。
　（５）選択した形質転換体を培養し、ＱＩＡｐｒｅｐ　Ｓｐｉｎ　Ｍｉｎｉｐｒｅｐ　ｋｉｔ（ＱＩＡＧＥＮ社製）を用いて発現ベクターを調製した。
　（６）得られた発現ベクターに挿入された免疫グロブリン結合性タンパク質をコードするポリヌクレオチド領域の配列を実施例１（５）に記載の方法によりヌクレオチド配列を解析し、アミノ酸の変異箇所を特定した。
　（７）（４）で選択した免疫グロブリン結合性タンパク質を発現する形質転換体を、実施例３（８）から（１０）と同様な方法で培養し、実施例３（１１）と同様な方法でタンパク質抽出液を調製した。
　（８）（７）で調製したタンパク質抽出液中の免疫グロブリン結合性タンパク質の抗体結合活性を、実施例３（４）に記載のＥＬＩＳＡ法を用いて測定した。
　（９）処理に用いたＮａＯＨの濃度を１．０Ｍ（終濃度０．５Ｍ）に、処理時間を１５時間に、それぞれした他は、実施例３（１３）と同様な方法でアルカリ処理後、実施例３（１４）と同様な方法で残存活性を算出し、アルカリ安定性を評価した。
　結果を表１５に示す。配列番号１４４に記載のアミノ酸配列において、少なくともＧｌｕ１ＧｌｙまたはＧｌｕ１Ｖａｌのアミノ酸置換を有した免疫グロブリン結合性タンパク質は、天然型のＦｐＬ＿Ｃ３（配列番号１）よりアルカリ安定性が向上したＦｐＬ＿Ｃ３ＫＸ　３ａ（配列番号１４４）と比較しても、アルカリ安定性が向上しているといえる。
Figure JPOXMLDOC01-appb-T000015
　実施例２０　ＦｐＬ＿Ｃ３ＫＸ　３ａアミノ酸置換体のスクリーニング（その２）
　（１）実施例１８で作製したランダム変異体ライブラリ（形質転換体）の中から、実施例１９（１）から（３）に記載の方法で新たに約１４００株の形質転換体を評価し、その中からアルカリ安定性向上免疫グロブリン結合性タンパク質（ＦｐＬ＿Ｃ３ＫＸ　３ａ）と比較してアルカリ安定性が向上した免疫グロブリン結合性タンパク質を発現する形質転換体を選択した。
　（２）選択した形質転換体または実施例１６（ｒ）で作製したＦｐＬ＿Ｃ３ＫＸ　３ａ（配列番号１４４）を発現する形質転換体を培養し、ＱＩＡｐｒｅｐ　Ｓｐｉｎ　Ｍｉｎｉｐｒｅｐ　ｋｉｔ（ＱＩＡＧＥＮ社製）を用いて発現ベクターを調製した。
　（３）得られた発現ベクターに挿入された免疫グロブリン結合性タンパク質をコードするポリヌクレオチド領域の配列を実施例１（５）に記載の方法によりヌクレオチド配列を解析し、アミノ酸の変異箇所を特定した。
　（４）（１）で選択した免疫グロブリン結合性タンパク質を発現する形質転換体を、実施例３（８）から（１０）と同様な方法で培養し、実施例３（１１）と同様な方法でタンパク質抽出液を調製した。
　（５）（４）で調製したタンパク質抽出液中の免疫グロブリン結合性タンパク質の抗体結合活性を、実施例３（４）に記載のＥＬＩＳＡ法を用いて測定した。
　（６）処理に用いたＮａＯＨの濃度を０．４Ｍ（終濃度０．２Ｍ）に、処理時間を１５時間に、それぞれした他は、実施例３（１３）と同様な方法でアルカリ処理後、実施例３（１４）と同様な方法で残存活性を算出し、アルカリ安定性を評価した。
　結果を表１６に示す。配列番号１４４に記載のアミノ酸配列において、少なくともＧｌｕ４Ｌｙｓ、Ｇｌｕ２７ＡｒｇおよびＴｈｒ３６Ａｌａより選択される１以上のアミノ酸置換を有した免疫グロブリン結合性タンパク質は、天然型のＦｐＬ＿Ｃ３（配列番号１）よりアルカリ安定性が向上したＦｐＬ＿Ｃ３ＫＸ　３ａ（配列番号１４４）と比較しても、アルカリ安定性が向上しているといえる。
Figure JPOXMLDOC01-appb-T000016
　実施例２１　免疫グロブリン結合性タンパク質の免疫グロブリンκ軽鎖結合性評価（その１）
　変異型免疫グロブリン結合性タンパク質の免疫グロブリンκ軽鎖結合活性を下記に示すＥＬＩＳＡ法にて測定し、アミノ酸置換によるヒト免疫グロブリンκ軽鎖結合活性への影響を評価した。
　（１）参考例１で作製したＦｐＬ＿Ｃ３ＫＲ（配列番号１１６）およびＦｐＬ＿Ｃ４ＫＲ（配列番号１１７）、実施例１６で作製したＦｐＬ＿Ｃ３ＫＸ　３ａ（配列番号１４４）ならびに実施例２０で取得したＦｐＬ＿Ｃ３ＫＸ　３ａにＧｌｕ４９Ａｓｐのアミノ酸置換を導入した免疫グロブリン結合性タンパク質（配列番号１７９、以下「ＦｐＬ＿Ｃ３ＫＸ　４ｈ」とも表記）のいずれかを発現する形質転換体を、実施例３（８）から（１０）と同様な方法で培養し、実施例３（１１）と同様な方法でタンパク質抽出液を調製した。前記抽出液は遠心分離し、得られた上清をフィルターに通し、清澄化した。
　（２）（１）で清澄化した上清を、参考例２（２）に記載の方法で精製し、免疫グロブリン結合性タンパク質に相当する画分を回収した。
　（３）回収した画分の吸光度を分光光度計で測定し、当該画分に含まれる各変異型免疫グロブリン結合性タンパク質を定量した。またＳＤＳ－ＰＡＧＥも実施し、各変異型免疫グロブリン結合性タンパク質が純度よく精製されていることを確認した。
　（４）変異型免疫グロブリン結合性タンパク質のヒト免疫グロブリンκ軽鎖結合活性を下記に示すＥＬＩＳＡ法にて測定し、アミノ酸置換によるヒト免疫グロブリンκ軽鎖結合活性への影響を評価した。
（４－１）ＴＢＳを用いて１０μｇ／ｍＬに調製したポリクローナル抗体溶液を９６ウェルマイクロプレートのウェルに分注し固定化した（４℃、１６時間）。使用したポリクローナル抗体は、
ヒトκ軽鎖ｓｕｂｇｒｏｕｐ　１（Ｖκ１）を含むハーセプチン（中外製薬社製）、
ヒトκ軽鎖ｓｕｂｇｒｏｕｐ　３（Ｖκ３）を含むＨｕｍａｎ　ＰＤＧＦ　Ｒ　ａｌｐｈａ抗体（Ｒ＆Ｄ　Ｓｙｓｔｅｍｓ社製）、
ヒトκ軽鎖ｓｕｂｇｒｏｕｐ　３（Ｖκ３）を含むＨｕｍａｎ　ＣＴＬＡ４抗体（Ｒ＆Ｄ　Ｓｙｓｔｅｍｓ社製）および、
ヒトκ軽鎖ｓｕｂｇｒｏｕｐ　４（Ｖκ４）を含むＨｕｍａｎ　ＰＣＳＫ９抗体（Ｒ＆Ｄ　Ｓｙｓｔｅｍｓ社製）、
のいずれかである。固定化後、ＴＢＳを用いて２％（ｗ／ｖ）に調製したスキムミルク（ベクトン・ディッキンソン社製）を用いてブロッキングした。
（４－２）洗浄緩衝液Ａ（０．１５Ｍ　ＮａＣｌおよび０．０５％（ｗ／ｖ）Ｔｗｅｅｎ　２０（商品名）を含む０．０５Ｍ　Ｔｒｉｓ緩衝液（ｐＨ７．５））で９６ウェルマイクロプレートのウェルを洗浄後、５０μｇ／ｍＬに希釈した抗体結合活性を評価する免疫グロブリン結合性タンパク質を含む溶液を添加し、免疫グロブリン結合性タンパク質と固定化ポリクローナル抗体とを反応させた（３０℃、１時間）。
（４－３）反応終了後、洗浄緩衝液Ａで洗浄し、１００ｎｇ／ｍＬに希釈したＡｎｔｉ－６－Ｈｉｓ　Ａｎｔｉｂｏｄｙ（ＢＥＴＨＹＬ　ＬＡＢＯＲＡＴＯＲＩＥＳ社製）を１００μＬ／ｗｅｌｌ添加し反応させた（３０℃、１時間）。
（４－４）反応終了後、洗浄緩衝液Ａで洗浄し、ＴＭＢ　Ｐｅｒｏｘｉｄａｓｅ　Ｓｕｂｓｔｒａｔｅ（ＫＰＬ社製）を５０μＬ／ｗｅｌｌで添加した。次に１Ｍ　リン酸を５０μＬ／ｗｅｌｌ添加することで反応を停止し、マイクロプレートリーダー（テカン社製）にて４５０ｎｍの吸光度を測定した。
（４－５）ポリクローナル抗体を固定化したウェルと固定化していないウェルとの吸光度の差を計算し、当該計算した吸光度からポリクローナル抗体と変異型免疫グロブリン結合性タンパク質との結合性を評価した。各ポリクローナル抗体間の吸光度の違いは異なるヒトκ軽鎖との結合性を示しており、この数値がポリクローナル抗体毎にバラツキが大きい場合、特定のヒトκ軽鎖ｓｕｂｇｒｏｕｐとの結合性が低下していることが示される。
　結果を表１７に示す。ＦｐＬ＿Ｃ４ＫＲ（配列番号１１７）およびＦｐＬ＿Ｃ３ＫＸ＿４ｈ（配列番号１７９）は各ポリクローナル抗体間のバラツキが少ないことから、ヒト免疫グロブリンκ軽鎖とｓｕｂｇｒｏｕｐに関係なく結合できるといえる。一方でＦｐＬ＿Ｃ３ＫＲ（配列番号１１６）およびＦｐＬ＿Ｃ３ＫＸ３ａ（配列番号１４４）は、特にヒトＶκ３との結合力が低下していた。以上の結果から、Ｇｌｕ４９Ａｓｐのアミノ酸置換を導入することで、Ｖκ３との結合力を付与できることがわかる。
Figure JPOXMLDOC01-appb-T000017
　実施例２２　ＦｐＬ＿Ｃ３ＫＸ　４ｈへの変異導入およびライブラリ作製
　実施例２０で作製したＦｐＬ＿Ｃ３ＫＸ　４ｈ（配列番号１７９）を発現するベクターｐＥＴ－ＦｐＬ＿Ｃ３ＫＸ　４ｈのうち、免疫グロブリン結合性タンパク質をコードするポリヌクレオチド部分（配列番号１８０）に、実施例２と同様の方法でエラープローンＰＣＲによりランダムに変異を導入し、ライブラリを作製した。平均変異導入率は１．７％であった。
　実施例２３　ＦｐＬ＿Ｃ３ＫＸ　４ｈアミノ酸置換体のスクリーニング
　（１）実施例２２で作製したランダム変異体ライブラリ（形質転換体）を、実施例３（１）から（２）と同様な方法で培養後、遠心操作によって得られた培養上清に対し、実施例１９（２）に記載のアルカリ処理を行なった。
　（２）アルカリ処理を行なった時の免疫グロブリン結合性タンパク質の抗体結合活性を実施例３（４）に記載のＥＬＩＳＡ法にて測定し、アルカリ処理を行なった時の免疫グロブリン結合性タンパク質の抗体結合活性を、アルカリ処理を行わなかった時の免疫グロブリン結合性タンパク質の抗体結合活性で除することで残存活性を算出した。
　（３）約９００株の形質転換体を評価し、その中からアルカリ安定性向上免疫グロブリン結合性タンパク質（ＦｐＬ＿Ｃ３ＫＸ　４ｈ）と比較してアルカリ安定性が向上した免疫グロブリン結合性タンパク質を発現する形質転換体を選択した。
　（４）選択した形質転換体を培養し、ＱＩＡｐｒｅｐ　Ｓｐｉｎ　Ｍｉｎｉｐｒｅｐ　ｋｉｔ（ＱＩＡＧＥＮ社製）を用いて発現ベクターを調製した。
　（５）得られた発現ベクターに挿入された免疫グロブリン結合性タンパク質をコードするポリヌクレオチド領域の配列を実施例１（５）に記載の方法によりヌクレオチド配列を解析し、アミノ酸の変異箇所を特定した。
　（６）（５）で選択した免疫グロブリン結合性タンパク質を発現する形質転換体または実施例２０で作製したＦｐＬ＿Ｃ３ＫＸ　４ｈ（配列番号１７９）を発現する形質転換体を、実施例３（８）から（１０）と同様な方法で培養し、実施例３（１１）と同様な方法でタンパク質抽出液を調製した。前記抽出液は遠心分離し、得られた上清をフィルターに通し、清澄化した。
　（７）（６）で清澄化した上清を、参考例２（２）に記載の方法で精製し、免疫グロブリン結合性タンパク質に相当する画分を回収した。
　（８）回収した画分の吸光度を分光光度計で測定し、当該画分に含まれる免疫グロブリン結合性タンパク質を定量した。またＳＤＳ－ＰＡＧＥも実施し、選択した免疫グロブリン結合性タンパク質が純度よく精製されていることを確認した。
　（９）処理に用いたＮａＯＨの濃度を１．０Ｍ（終濃度０．５Ｍ）に、処理時間を１５時間に、それぞれした他は、実施例３（１３）と同様な方法でアルカリ処理後、実施例３（１４）と同様な方法で残存活性を算出し、アルカリ安定性を評価した。
　結果を表１８に示す。配列番号１７９に記載のアミノ酸配列において、少なくともＧｌｕ９Ｖａｌ、Ｔｙｒ５３Ｐｈｅ、Ｔｈｒ５４ＭｅｔおよびＡｌａ６９Ｔｈｒより選択される１以上のアミノ酸置換を有した免疫グロブリン結合性タンパク質は、天然型のＦｐＬ＿Ｃ３（配列番号１）よりアルカリ安定性が向上したＦｐＬ＿Ｃ３ＫＸ　４ｈ（配列番号１７９）と比較しても、アルカリ安定性が向上しているといえる。
　なお、２０ｍＬ培地で培養したときの精製収量を比較したところ、Ｌｙｓ（Ｇｌｎ）２２Ａｒｇのアミノ酸置換を導入することで、タンパク質精製収量が顕著に向上することを確認した。以降、ＦｐＬ＿Ｃ３ＫＸ　４ｈにＬｙｓ（Ｇｌｎ）２２Ａｒｇのアミノ酸置換を導入した免疫グロブリン結合性タンパク質をＦｐＬ＿Ｃ３ＫＸ　４ｉ（配列番号１８２）と命名する。
Figure JPOXMLDOC01-appb-T000018
　実施例２４　ＦｐＬ＿Ｃ３ＫＸ　４ｉアミノ酸置換集積体の作製
　（１）ＦｐＬ＿Ｃ３ＫＸ　４ｉアミノ酸置換集積体の設計
　実施例２３で明らかになった、免疫グロブリン結合性タンパク質のアルカリ安定性向上に関与するアミノ酸置換をＦｐＬ＿Ｃ３ＫＸ　４ｉ（配列番号１８２）に対し集積することで、更なる安定性の向上を図った。具体的には、以下の（ｔ）および（ｕ）に示す２種類の免疫グロブリン結合性タンパク質を設計し、作製した。
（ｔ）ＦｐＬ＿Ｃ３ＫＸ　４ｉに対し、Ｔｙｒ５３Ｐｈｅのアミノ酸置換を導入したタンパク質（配列番号１８６、ＦｐＬ＿Ｃ３ＫＸ　５ｅと命名）
（ｕ）ＦｐＬ＿Ｃ３ＫＸ　４ｉに対し、Ｔｈｒ５４Ｍｅｔのアミノ酸置換を導入したタンパク質（配列番号１８７、ＦｐＬ＿Ｃ３ＫＸ　５ｆと命名）
　（２）ＦｐＬ＿Ｃ３ＫＸ　４ｉアミノ酸置換集積体の作製
　以下、（ｔ）および（ｕ）に示す２種類の免疫グロブリン結合性タンパク質の作製方法について説明する。
　（ｔ）ＦｐＬ＿Ｃ３ＫＸ　５ｅ
　（ｔ－１）インバースＰＣＲを用いた変異導入により、ＦｐＬ＿Ｃ３ＫＸ　５ｅ（配列番号１８６）をコードするヌクレオチド配列を含むポリヌクレオチドを作製した。鋳型ＤＮＡとしてインバースＰＣＲはＦｐＬ＿Ｃ３ＫＸ　４ｉ（配列番号１８２）をコードするポリヌクレオチド（配列番号１８８）を含む発現ベクター（以下、「ｐＥＴ－ＦｐＬ＿Ｃ３ＫＸ　４ｉ」とも表記）を、ＰＣＲ　Ｆｏｒｗａｒｄ　Ｐｒｉｍｅｒとして配列番号１８９に記載のオリゴヌクレオチドを、ＰＣＲ　Ｒｅｖｅｒｓｅ　Ｐｒｉｍｅｒとして配列番号１９０に記載のオリゴヌクレオチドを、それぞれ用いた他は実施例７（２）（ａ－１）と同様な方法で行なった。
　（ｔ－２）得られたポリヌクレオチドを精製し、制限酵素ＤｐｎＩで処理後、当該制限酵素処理産物を用いて大腸菌ＢＬ２１（ＤＥ３）株を形質転換した。
　（ｔ－３）得られた形質転換体を実施例７（２）（ａ－３）と同様な方法で培養および発現ベクター（ｐＥＴ－ＦｐＬ＿Ｃ３ＫＸ　５ｅと命名）の抽出を行ない、当該発現ベクターのヌクレオチド配列の解析を実施例１（５）と同様の方法で行なった。
　配列解析の結果、発現ベクターｐＥＴ－ＦｐＬ＿Ｃ３ＫＸ　５ｅにＦｐＬ＿Ｃ３ＫＸ　５ｅ（配列番号１８６）をコードするポリヌクレオチドが挿入されていることを確認した。
　（ｕ）ＦｐＬ＿Ｃ３ＫＸ　５ｆ
　（ｕ－１）インバースＰＣＲを用いた変異導入により、ＦｐＬ＿Ｃ３ＫＸ　５ｆ（配列番号１８７）をコードするヌクレオチド配列を含むポリヌクレオチドを作製した。インバースＰＣＲは、鋳型ＤＮＡとしてｐＥＴ－ＦｐＬ＿Ｃ３ＫＸ　４ｉを、ＰＣＲ　Ｆｏｒｗａｒｄ　Ｐｒｉｍｅｒとして配列番号１９１に記載のオリゴヌクレオチドを、ＰＣＲ　Ｒｅｖｅｒｓｅ　Ｐｒｉｍｅｒとして配列番号１９２に記載のオリゴヌクレオチドを、それぞれ用いた他は実施例７（２）（ａ－１）と同様な方法で行なった。
　（ｕ－２）得られたポリヌクレオチドを精製し、制限酵素ＤｐｎＩで処理後、当該制限酵素処理産物を用いて大腸菌ＢＬ２１（ＤＥ３）株を形質転換した。
　（ｕ－３）得られた形質転換体を実施例７（２）（ａ－３）と同様な方法で培養および発現ベクター（ｐＥＴ－ＦｐＬ＿Ｃ３ＫＸ　５ｆと命名）の抽出を行ない、当該発現ベクターのヌクレオチド配列の解析を実施例１（５）と同様の方法で行なった。
　配列解析の結果、発現ベクターｐＥＴ－ＦｐＬ＿Ｃ３ＫＸ　５ｆにＦｐＬ＿Ｃ３ＫＸ　５ｆ（配列番号１８７）をコードするポリヌクレオチドが挿入されていることを確認した。
　実施例２５　ＦｐＬ＿Ｃ３ＫＸ　４ｈアミノ酸置換体のアルカリ安定性評価
　（１）実施例２０で作製したＦｐＬ＿Ｃ３ＫＸ　４ｈ（配列番号１７９）、実施例２３で取得したＦｐＬ＿Ｃ３ＫＸ　４ｉ（配列番号１８２）ならびに実施例２４で作製したＦｐＬ＿Ｃ３ＫＸ　５ｅ（配列番号１８６）およびＦｐＬ＿Ｃ３ＫＸ　５ｆ（配列番号１８７）のいずれかを発現する形質転換体を、実施例３（８）から（１０）と同様な方法で培養し、実施例３（１１）と同様な方法でタンパク質抽出液を調製した。前記抽出液は遠心分離し、得られた上清をフィルターに通し、清澄化した。
　（２）（１）で清澄化した上清を、参考例２（２）に記載の方法で精製し、免疫グロブリン結合性タンパク質に相当する画分を回収した。
　（３）回収した画分の吸光度を分光光度計で測定し、当該画分に含まれる免疫グロブリン結合性タンパク質を定量した。またＳＤＳ－ＰＡＧＥも実施し、選択した免疫グロブリン結合性タンパク質が純度よく精製されていることを確認した。
　（４）処理に用いたＮａＯＨの濃度を１．０Ｍ（終濃度０．５Ｍ）に、処理温度を５５℃、処理時間を１５分に、それぞれした他は、実施例３（１３）と同様な方法でアルカリ処理後、実施例３（１４）と同様な方法で残存活性を算出し、アルカリ安定性を評価した。
　結果を表１９に示す。実施例２４で作製したＦｐＬ＿Ｃ３ＫＸ　５ｅ（配列番号１８６）およびＦｐＬ＿Ｃ３ＫＸ　５ｆ（配列番号１８７）は天然型のＦｐＬ＿Ｃ３（配列番号１）よりアルカリ安定性が向上したＦｐＬ＿Ｃ３ＫＸ　４ｈ（配列番号１７９）およびＦｐＬ＿Ｃ３ＫＸ　４ｉ（配列番号１８２）と比較しても、アルカリ安定性が向上しているといえる。特に、ＦｐＬ＿Ｃ３ＫＸ　５ｅにおいて顕著なアルカリ安定性向上を確認した（ＦｐＬ＿Ｃ３ＫＸ　４ｈ：３４％、ＦｐＬ＿Ｃ３ＫＸ　４ｉ：４８％、ＦｐＬ＿Ｃ３ＫＸ　５ｅ：７３％）。
Figure JPOXMLDOC01-appb-T000019
　実施例２６　ＦｐＬ＿Ｃ３ＫＸ　５ｅへの変異導入およびライブラリ作製
　実施例２４で作製した発現ベクターｐＥＴ－ＦｐＬ＿Ｃ３ＫＸ　５ｅのうち、免疫グロブリン結合性タンパク質をコードするポリヌクレオチド部分（配列番号１９３）に、実施例２と同様の方法でエラープローンＰＣＲによりランダムに変異を導入し、ライブラリを作製した。平均変異導入率は１．９％であった。
　実施例２７　ＦｐＬ＿Ｃ３ＫＸ　５ｅアミノ酸置換体のスクリーニング
　（１）実施例２６で作製したランダム変異体ライブラリ（形質転換体）を実施例３（１）から（２）と同様な方法で培養後、遠心操作によって得られた培養上清に対し、実施例１９（２）に記載のアルカリ処理を行なった。
　（２）アルカリ処理を行なった時の免疫グロブリン結合性タンパク質の抗体結合活性を実施例３（４）に記載のＥＬＩＳＡ法にて測定し、アルカリ処理を行なった時の免疫グロブリン結合性タンパク質の抗体結合活性を、アルカリ処理を行わなかった時の免疫グロブリン結合性タンパク質の抗体結合活性で除することで残存活性を算出した。
　（３）約９００株の形質転換体を評価し、その中からアルカリ安定性向上免疫グロブリン結合性タンパク質（ＦｐＬ＿Ｃ３ＫＸ　５ｅ）と比較してアルカリ安定性が向上した免疫グロブリン結合性タンパク質を発現する形質転換体を選択した。
　（４）選択した形質転換体を培養し、ＱＩＡｐｒｅｐ　Ｓｐｉｎ　Ｍｉｎｉｐｒｅｐ　ｋｉｔ（ＱＩＡＧＥＮ社製）を用いて発現ベクターを調製した。
　（５）得られた発現ベクターに挿入された免疫グロブリン結合性タンパク質をコードするポリヌクレオチド領域の配列を実施例１（５）に記載の方法によりヌクレオチド配列を解析し、アミノ酸の変異箇所を特定した。
　（６）（３）で選択した免疫グロブリン結合性タンパク質を発現する形質転換体または実施例２４で作製したＦｐＬ＿Ｃ３ＫＸ　５ｅ（配列番号１８６）を発現する形質転換体を、実施例３（８）から（１０）と同様な方法で培養し、実施例３（１１）と同様な方法でタンパク質抽出液を調製した。前記抽出液は遠心分離し、得られた上清をフィルターに通し、清澄化した。
　（７）（６）で清澄化した上清を、参考例２（２）に記載の方法で精製し、免疫グロブリン結合性タンパク質に相当する画分を回収した。
　（８）回収した画分の吸光度を分光光度計で測定し、当該画分に含まれる免疫グロブリン結合性タンパク質を定量した。またＳＤＳ－ＰＡＧＥも実施し、選択した免疫グロブリン結合性タンパク質が純度よく精製されていることを確認した。
　（９）処理に用いたＮａＯＨの濃度を２．０Ｍ（終濃度１．０Ｍ）に、処理時間を１７時間に、それぞれした他は、実施例３（１３）と同様な方法でアルカリ処理後、実施例３（１４）と同様な方法で残存活性を算出し、アルカリ安定性を評価した。
　結果を表２０に示す。配列番号１８６に記載のアミノ酸配列において、少なくともＧｌｕ１Ｖａｌ、Ｇｌｕ４Ｇｌｙ、Ｇｌｙ２１ＡｒｇおよびＧｌｕ（Ｇｌｙ）５２Ａｓｐより選択される１以上のアミノ酸置換を有した免疫グロブリン結合性タンパク質は、天然型のＦｐＬ＿Ｃ３（配列番号１）よりアルカリ安定性が向上したＦｐＬ＿Ｃ３ＫＸ　５ｅ（配列番号１８６）と比較しても、アルカリ安定性が向上しているといえる。
Figure JPOXMLDOC01-appb-T000020
　実施例２８　ＦｐＬ＿Ｃ３ＫＸ　５ｅアミノ酸置換集積体作製（その１）
　（１）ＦｐＬ＿Ｃ３ＫＸ　５ｅアミノ酸置換集積体の設計
　実施例２７で明らかになった、免疫グロブリン結合性タンパク質のアルカリ安定性向上に関与するアミノ酸置換をＦｐＬ＿Ｃ３ＫＸ　５ｅに対し集積することで、更なる安定性の向上を図った。具体的には、以下の（ｖ）から（ｘ）に示す３種類の免疫グロブリン結合性タンパク質を設計し、作製した。
（ｖ）ＦｐＬ＿Ｃ３ＫＸ　５ｅに対し、Ｇｌｕ４ＧｌｙおよびＧｌｕ（Ｇｌｙ）５２Ａｓｐのアミノ酸置換を導入したタンパク質（配列番号１９９、ＦｐＬ＿Ｃ３ＫＸ　６ａと命名）
（ｗ）ＦｐＬ＿Ｃ３ＫＸ　５ｅに対し、Ｌｙｓ（Ａｌａ）７ＳｅｒおよびＧｌｕ（Ｇｌｙ）５２Ａｓｐのアミノ酸置換を導入したタンパク質（配列番号２００、ＦｐＬ＿Ｃ３ＫＸ　５ｇと命名）
（ｘ）ＦｐＬ＿Ｃ３ＫＸ　５ｅに対し、Ｇｌｕ４ＧｌｙおよびＬｙｓ（Ａｌａ）７Ｓｅｒのアミノ酸置換を導入したタンパク質（配列番号２０１、ＦｐＬ＿Ｃ３ＫＸ　６ｂと命名）
　（２）ＦｐＬ＿Ｃ３ＫＸ　５ｅアミノ酸置換集積体の作製
　以下、（ｖ）から（ｘ）に示す３種類の免疫グロブリン結合性タンパク質の作製方法について説明する。
　（ｖ）ＦｐＬ＿Ｃ３ＫＸ　６ａ
　（ｖ－１）インバースＰＣＲを用いた変異導入により、ＦｐＬ＿Ｃ３ＫＸ　６ａをコードするヌクレオチド配列を含むポリヌクレオチドを作製した。インバースＰＣＲは、鋳型ＤＮＡとしてＦｐＬ＿Ｃ３ＫＸ　５ｅ　Ｅ５２Ｄ（ＦｐＬ＿Ｃ３ＫＸ　５ｅにＧｌｕ（Ｇｌｙ）５２Ａｓｐのアミノ酸置換を導入した免疫グロブリン結合性タンパク質、配列番号１９８）をコードするポリヌクレオチド（配列番号２０２）を含む発現ベクターｐＥＴ－ＦｐＬ＿Ｃ３ＫＸ　５ｅ　Ｅ５２Ｄを、ＰＣＲ　Ｆｏｒｗａｒｄ　Ｐｒｉｍｅｒとして配列番号２０３に記載の配列からなるオリゴヌクレオチドを、ＰＣＲ　Ｒｅｖｅｒｓｅ　Ｐｒｉｍｅｒとして配列番号２０４に記載の配列からなるオリゴヌクレオチドを、それぞれ用いた他は実施例７（２）（ａ－１）と同様な方法で行なった。
　（ｖ－２）得られたポリヌクレオチドを精製し、制限酵素ＤｐｎＩで処理後、当該制限酵素処理産物を用いて大腸菌ＢＬ２１（ＤＥ３）株を形質転換した。
　（ｖ－３）得られた形質転換体を実施例７（２）（ａ－３）と同様な方法で培養および発現ベクター（ｐＥＴ－ＦｐＬ＿Ｃ３ＫＸ　６ａと命名）の抽出を行ない、当該発現ベクターのヌクレオチド配列の解析を実施例１（５）と同様の方法で行なった。
　配列解析の結果、発現ベクターｐＥＴ－ＦｐＬ＿Ｃ３ＫＸ　６ａにＦｐＬ＿Ｃ３ＫＸ　６ａ（配列番号１９９）をコードするポリヌクレオチドが挿入されていることを確認した。
　（ｗ）ＦｐＬ＿Ｃ３ＫＸ　５ｇ
　（ｗ－１）インバースＰＣＲを用いた変異導入により、ＦｐＬ＿Ｃ３ＫＸ　５ｇをコードするヌクレオチド配列を含むポリヌクレオチドを作製した。インバースＰＣＲは、鋳型ＤＮＡとしてｐＥＴ－ＦｐＬ＿Ｃ３ＫＸ　５ｅ　Ｅ５２Ｄを、ＰＣＲ　Ｆｏｒｗａｒｄ　Ｐｒｉｍｅｒとして配列番号２０５に記載の配列からなるオリゴヌクレオチドを、ＰＣＲ　Ｒｅｖｅｒｓｅ　Ｐｒｉｍｅｒとして配列番号２０６に記載の配列からなるオリゴヌクレオチドを、それぞれ用いた他は実施例７（２）（ａ－１）と同様な方法で行なった。
　（ｗ－２）得られたポリヌクレオチドを精製し、制限酵素ＤｐｎＩで処理後、当該制限酵素処理産物を用いて大腸菌ＢＬ２１（ＤＥ３）株を形質転換した。
　（ｗ－３）得られた形質転換体を実施例７（２）（ａ－３）と同様な方法で培養および発現ベクター（ｐＥＴ－ＦｐＬ＿Ｃ３ＫＸ　５ｇと命名）の抽出を行ない、当該発現ベクターのヌクレオチド配列の解析を実施例１（５）と同様の方法で行なった。
　配列解析の結果、発現ベクターｐＥＴ－ＦｐＬ＿Ｃ３ＫＸ　５ｇにＦｐＬ＿Ｃ３ＫＸ　５ｇ（配列番号２００）をコードするポリヌクレオチドが挿入されていることを確認した。
　（ｘ）ＦｐＬ＿Ｃ３ＫＸ　６ｂ
　（ｘ－１）インバースＰＣＲを用いた変異導入により、ＦｐＬ＿Ｃ３ＫＸ　６ｂをコードするヌクレオチド配列を含むポリヌクレオチドを作製した。インバースＰＣＲは、鋳型ＤＮＡとしてＦｐＬ＿Ｃ３ＫＸ　５ｅ　Ｅ４Ｇ（ＦｐＬ＿Ｃ３ＫＸ　５ｅにＧｌｕ４Ｇｌｙのアミノ酸置換を導入した免疫グロブリン結合性タンパク質、配列番号１９５）をコードするポリヌクレオチド（配列番号２０７）を含む発現ベクターｐＥＴ－ＦｐＬ＿Ｃ３ＫＸ　５ｅ　Ｅ４Ｇを、ＰＣＲ　Ｆｏｒｗａｒｄ　Ｐｒｉｍｅｒとして配列番号２０５に記載のオリゴヌクレオチドを、ＰＣＲ　Ｒｅｖｅｒｓｅ　Ｐｒｉｍｅｒとして配列番号２０８に記載のオリゴヌクレオチドを、それぞれ用いた他は実施例７（２）（ａ－１）と同様な方法で行なった。
　（ｘ－２）得られたポリヌクレオチドを精製し、制限酵素ＤｐｎＩで処理後、当該制限酵素処理産物を用いて大腸菌ＢＬ２１（ＤＥ３）株を形質転換した。
　（ｘ－３）得られた形質転換体を実施例７（２）（ａ－３）と同様な方法で培養および発現ベクター（ｐＥＴ－ＦｐＬ＿Ｃ３ＫＸ　６ｂと命名）の抽出を行ない、当該発現ベクターのヌクレオチド配列の解析を実施例１（５）と同様の方法で行なった。
　配列解析の結果、発現ベクターｐＥＴ－ＦｐＬ＿Ｃ３ＫＸ　６ｂにＦｐＬ＿Ｃ３ＫＸ　６ｂ（配列番号２０１）をコードするポリヌクレオチドが挿入されていることを確認した。
　実施例２９　ＦｐＬ＿Ｃ３ＫＸ　５ｅアミノ酸置換集積体のアルカリ安定性評価（その１）
　（１）実施例２４で作製したＦｐＬ＿Ｃ３ＫＸ　５ｅ（配列番号１８６）ならびに実施例２８で作製したＦｐＬ＿Ｃ３ＫＸ　６ａ（配列番号１９９）、ＦｐＬ＿Ｃ３ＫＸ　５ｇ（配列番号２００）およびＦｐＬ＿Ｃ３ＫＸ　６ｂ（配列番号２０１）のいずれかを発現する形質転換体を、実施例３（８）から（１０）と同様な方法で培養し、実施例３（１１）と同様な方法でタンパク質抽出液を調製した。前記抽出液は遠心分離し、得られた上清をフィルターに通し、清澄化した。
　（２）（１）で清澄化した上清を、参考例２（２）に記載の方法で精製し、免疫グロブリン結合性タンパク質に相当する画分を回収した。
　（３）回収した画分の吸光度を分光光度計で測定し、当該画分に含まれる免疫グロブリン結合性タンパク質を定量した。またＳＤＳ－ＰＡＧＥも実施し、選択した免疫グロブリン結合性タンパク質が純度よく精製されていることを確認した。
　（４）処理に用いたＮａＯＨの濃度を２．０Ｍ（終濃度１．０Ｍ）に、処理時間を１５時間に、それぞれした他は、実施例３（１３）と同様な方法でアルカリ処理後、実施例３（１４）と同様な方法で残存活性を算出し、アルカリ安定性を評価した。
　結果を表２１に示す。本実施例で作製したＦｐＬ＿Ｃ３ＫＸ　６ａ（配列番号１９９）、ＦｐＬ＿Ｃ３ＫＸ　５ｇ（配列番号２００）およびＦｐＬ＿Ｃ３ＫＸ　６ｂ（配列番号２０１）は、いずれも天然型のＦｐＬ＿Ｃ３（配列番号１）よりアルカリ安定性が向上したＦｐＬ＿Ｃ３ＫＸ　５ｅ（配列番号１８６）と比較しても、アルカリ安定性が向上しているといえる。中でもＦｐＬ＿Ｃ３ＫＸ　６ａは最も優れたアルカリ安定性を示した（ＦｐＬ＿Ｃ３ＫＸ　５ｅ：５５％、ＦｐＬ＿Ｃ３ＫＸ　６ａ：６２％）。
Figure JPOXMLDOC01-appb-T000021
　実施例３０　本発明のタンパク質の免疫グロブリン溶出ｐＨ評価
　実施例１で作製した天然型ＦｐＬ＿Ｃ３（配列番号１）、または実施例１２で取得した変異型（アミノ酸置換した）免疫グロブリン結合性タンパク質ＦｐＬ＿Ｃ３　Ｇ２１Ｒ（ＦｐＬ＿Ｃ３にＧｌｙ２１Ａｒｇのアミノ酸置換を導入した免疫グロブリン結合性タンパク質、配列番号１０１）、ＦｐＬ＿Ｃ３　Ｇ５１Ｖ（ＦｐＬ＿Ｃ３にＧｌｙ５１Ｖａｌのアミノ酸置換を導入した免疫グロブリン結合性タンパク質、配列番号１０６）、ＦｐＬ＿Ｃ３　Ｎ６２Ｈ（ＦｐＬ＿Ｃ３にＡｓｎ６２Ｈｉｓのアミノ酸置換を導入した免疫グロブリン結合性タンパク質、配列番号１０７）、ＦｐＬ＿Ｃ３　Ｎ６２Ｒ（ＦｐＬ＿Ｃ３にＡｓｎ６２Ａｒｇのアミノ酸置換を導入した免疫グロブリン結合性タンパク質、配列番号１０８）、ＦｐＬ＿Ｃ３　Ｎ６２Ｙ（ＦｐＬ＿Ｃ３にＡｓｎ６２Ｔｙｒのアミノ酸置換を導入した免疫グロブリン結合性タンパク質、配列番号５）もしくはＦｐＬ＿Ｃ３　Ｎ６２Ｗ（ＦｐＬ＿Ｃ３にＡｓｎ６２Ｔｒｐのアミノ酸置換を導入した免疫グロブリン結合性タンパク質、配列番号１１１）に結合した免疫グロブリンを溶出可能なｐＨ（以下、単に「溶出ｐＨ」とも表記）を以下の方法で測定した。
　（１）免疫グロブリンを固定化した不溶性担体であるＩｇＧ　Ｓｅｐｈａｒｏｓｅ　６　Ｆａｓｔ　Ｆｌｏｗ（Ｃｙｔｉｖａ社製）の５０％（ｗ／ｖ）水スラリーを調製し、当該スラリー０．５ｍＬをＴｒｉｃｏｒｎ　５／５０カラム（内径５ｍｍ×長さ５０ｍｍ：Ｃｙｔｉｖａ社製）に入れた後、ポンプで純水を送液することで、ＩｇＧ　Ｓｅｐｈａｒｏｓｅ充填カラムを作製した。
　（２）（１）で作製したＩｇＧ　Ｓｅｐｈａｒｏｓｅ充填カラムをＡＫＴＡ　ＡＶＡＮＴ　２５（Ｃｙｔｉｖａ社製）に設置した。前記カラムを０．１Ｍクエン酸緩衝液（ｐＨ６．５）（以下Ａ液）で平衡化し、０．１Ｍクエン酸緩衝液（ｐＨ２．２）（以下Ｂ液）で洗浄後、Ａ液で再度平衡化した。
　（３）Ａ液で１ｇ／Ｌに調製した免疫グロブリン結合性タンパク質溶液１００μＬを、ＩｇＧ　Ｓｅｐｈａｒｏｓｅ充填カラムにアプライし、Ａ液を５カラム体積分送液後、１０分間でＢ液が０％から１００％となるリニアグラジエント溶出で免疫グロブリン結合性タンパク質を溶出させた。得られたクロマトグラムを解析し、最も吸光度が高くなる溶出位置でのｐＨを溶出ｐＨとした。
　結果を表２２に示す。配列番号１に記載のアミノ酸配列において、少なくともＧｌｙ２１Ａｒｇ、Ｇｌｙ５１Ｖａｌ、Ａｓｎ６２Ｈｉｓ、Ａｓｎ６２Ａｒｇ、Ａｓｎ６２ＴｙｒおよびＡｓｎ６２Ｔｒｐより選択される１以上のアミノ酸置換を有した免疫グロブリン結合性タンパク質は、天然型ＦｐＬ＿Ｃ３と比較し溶出ｐＨが向上している、すなわち免疫グロブリン結合性タンパク質に結合した免疫グロブリン（抗体）をより温和な条件で溶出できる、といえる。
Figure JPOXMLDOC01-appb-T000022
　実施例３１　ＦｐＬ＿Ｃ３ＫＸ　６ａへの変異導入およびライブラリ作製
　実施例２８で作製した発現ベクターｐＥＴ－ＦｐＬ＿Ｃ３ＫＸ　６ａのうち、免疫グロブリン結合性タンパク質をコードするポリヌクレオチド部分（配列番号２１１）に、実施例２と同様の方法でエラープローンＰＣＲによりランダムに変異を導入し、ライブラリを作製した。平均変異導入率は１．８％であった。
　実施例３２　ＦｐＬ＿Ｃ３ＫＸ　６ａアミノ酸置換体のスクリーニング
　（１）実施例３１で作製したランダム変異体ライブラリ（形質転換体）を実施例３（１）から（２）と同様な方法で培養後、遠心操作によって得られた培養上清を１．０Ｍ　ＮａＯＨと等量混合し６２℃で３０分間アルカリ処理を行なった。
　（２）アルカリ処理を行なった時の免疫グロブリン結合性タンパク質の抗体結合活性を実施例３（４）に記載のＥＬＩＳＡ法にて測定し、アルカリ処理を行なった時の免疫グロブリン結合性タンパク質の抗体結合活性を、アルカリ処理を行わなかった時の免疫グロブリン結合性タンパク質の抗体結合活性で除することで残存活性を算出した。
　（３）約１８００株の形質転換体を評価し、その中からアルカリ安定性向上免疫グロブリン結合性タンパク質（ＦｐＬ＿Ｃ３ＫＸ　６ａ）と比較してアルカリ安定性が向上した免疫グロブリン結合性タンパク質を発現する形質転換体を選択した。
　（４）選択した形質転換体を培養し、ＱＩＡｐｒｅｐ　Ｓｐｉｎ　Ｍｉｎｉｐｒｅｐ　ｋｉｔ（ＱＩＡＧＥＮ社製）を用いて発現ベクターを調製した。
　（５）得られた発現ベクターに挿入された免疫グロブリン結合性タンパク質をコードするポリヌクレオチド領域の配列を実施例１（５）に記載の方法によりヌクレオチド配列を解析し、アミノ酸の変異箇所を特定した。
　（６）（３）で選択した免疫グロブリン結合性タンパク質を発現する形質転換体、実施例１で作製したＦｐＬ＿Ｃ３（配列番号１）を発現する形質転換体、参考例１で作製したＦｐＬ＿Ｃ４ＫＲ（配列番号１１７）を発現する形質転換体、および実施例２８で作製したＦｐＬ＿Ｃ３ＫＸ　６ａ（配列番号１９９）を発現する形質転換体のいずれかを、実施例３（８）から（１０）と同様な方法で培養し、実施例３（１１）と同様な方法でタンパク質抽出液を調製した。前記抽出液は遠心分離し、得られた上清をフィルターに通し、清澄化した。
　（７）（６）で清澄化した上清を、参考例２（２）に記載の方法で精製し、免疫グロブリン結合性タンパク質に相当する画分を回収した。
　（８）回収した画分の吸光度を分光光度計で測定し、当該画分に含まれる免疫グロブリン結合性タンパク質を定量した。またＳＤＳ－ＰＡＧＥも実施し、選択した免疫グロブリン結合性タンパク質が純度よく精製されていることを確認した。
　（９）処理に用いたＮａＯＨの濃度を２．０Ｍ（終濃度１．０Ｍ）に、処理時間を１７時間に、それぞれした他は、実施例３（１３）と同様な方法でアルカリ処理後、実施例３（１４）と同様な方法で残存活性を算出し、アルカリ安定性を評価した。
　結果を表２３に示す。配列番号１９９に記載のアミノ酸配列において、少なくともＴｈｒ２Ｐｒｏ、Ｔｈｒ２Ｓｅｒ、Ｐｒｏ３Ａｒｇ、Ｇｌｕ５Ｌｙｓ、Ｇｌｕ９Ｖａｌ、Ｇｌｕ２７Ｌｙｓ、Ｇｌｕ２７Ｉｌｅ、Ｇｌｕ２７Ｖａｌ、Ｐｈｅ３２Ｌｅｕ、Ｌｙｓ（Ａｒｇ）３８Ａｌａ、Ａｓｎ４４Ｉｌｅ、Ａｌａ４７ＴｈｒおよびＧｌｕ（Ａｓｐ）５２Ａｓｎより選択される１以上のアミノ酸置換を有した免疫グロブリン結合性タンパク質は、天然型のＦｐＬ＿Ｃ３（配列番号１）よりアルカリ安定性が向上したＦｐＬ＿Ｃ３ＫＸ　６ａ（配列番号１９９）と比較しても、アルカリ安定性が向上しているといえる。
Figure JPOXMLDOC01-appb-T000023
　実施例３３　ＦｐＬ＿Ｃ３ＫＸ　６ａアミノ酸置換体の溶出特性評価
　（１）実施例１で作製したＦｐＬ＿Ｃ３（配列番号１）または実施例３２で取得したＦｐＬ＿Ｃ３ＫＸ　６ａ　Ｅ２７Ｖ（ＦｐＬ＿Ｃ３ＫＸ　６ａにおいてＧｌｕ２７Ｖａｌのアミノ酸置換を導入したタンパク質、配列番号２２２）を発現する形質転換体を、実施例３（８）から（１０）と同様な方法で培養し、実施例３（１１）と同様な方法でタンパク質抽出液を調製した。前記抽出液は遠心分離し、得られた上清をフィルターに通し、清澄化した。
　（２）（１）で清澄化した上清を、参考例２（２）に記載の方法で精製し、免疫グロブリン結合性タンパク質に相当する画分を回収した。
　（３）回収した画分の吸光度を分光光度計で測定し、当該画分に含まれる各変異型免疫グロブリン結合性タンパク質を定量した。またＳＤＳ－ＰＡＧＥも実施し、各変異型免疫グロブリン結合性タンパク質が純度よく精製されていることを確認した。
　（４）変異型免疫グロブリン結合性タンパク質のヒト免疫グロブリンκ軽鎖からの酸溶出特性を下記に示すＥＬＩＳＡ法にて測定し、アミノ酸置換による酸溶出特性への影響を評価した。
（４－１）ＴＢＳを用いて１０μｇ／ｍＬに調製したハーセプチン（中外製薬社製）溶液を９６ウェルマイクロプレートのウェルに分注し固定化した（４℃、１６時間）。固定化後、ＴＢＳを用いて２％（ｗ／ｖ）に調製したスキムミルク（ベクトン・ディッキンソン社製）を用いてブロッキングした。
（４－２）洗浄緩衝液Ａ（０．１５Ｍ　ＮａＣｌおよび０．０５％（ｗ／ｖ）Ｔｗｅｅｎ　２０（商品名）を含む０．０５Ｍ　Ｔｒｉｓ緩衝液（ｐＨ７．５））で９６ウェルマイクロプレートのウェルを洗浄後、２μｇ／ｍＬに希釈した抗体結合活性を評価する免疫グロブリン結合性タンパク質を含む溶液を添加し、免疫グロブリン結合性タンパク質と固定化モノクローナル抗体とを反応させた（３０℃、１時間）。
（４－３）反応終了後、洗浄緩衝液Ａで洗浄し、一部のウェルに０．０５Ｍクエン酸溶液（ｐＨ２．７）を１００μＬ／ｗｅｌｌ添加し免疫グロブリン結合性タンパク質を解離させた（２５℃、２分）
（４－４）洗浄緩衝液Ａで洗浄し、１００ｎｇ／ｍＬに希釈したＡｎｔｉ－６－Ｈｉｓ　Ａｎｔｉｂｏｄｙ（ＢＥＴＨＹＬ　ＬＡＢＯＲＡＴＯＲＩＥＳ社製）を１００μＬ／ｗｅｌｌ添加し反応させた（３０℃、１時間）。
（４－５）反応終了後、洗浄緩衝液Ａで洗浄し、ＴＭＢ　Ｐｅｒｏｘｉｄａｓｅ　Ｓｕｂｓｔｒａｔｅ（ＫＰＬ社製）を５０μＬ／ｗｅｌｌで添加した。次に１Ｍリン酸を５０μＬ／ｗｅｌｌ添加することで反応を停止し、マイクロプレートリーダー（テカン社製）にて４５０ｎｍの吸光度を測定した。
（４－６）（４－３）でクエン酸溶液により免疫グロブリン結合性タンパク質を解離させたウェルとさせていないウェルとの吸光度の割合から、モノクローナル抗体に対する変異型免疫グロブリン結合性タンパク質の酸における溶出率（数値が高いほど酸溶出特性に優れる）を評価した。
　結果を表２４に示す。ＦｐＬ＿Ｃ３（配列番号１）と比較して、ＦｐＬ＿Ｃ３ＫＸ　６ａ　Ｅ２７Ｖ（配列番号２２２）は、より酸溶出がしやすいといえる。
Figure JPOXMLDOC01-appb-T000024
　実施例３４　ＦｐＬ＿Ｃ３ＫＸ　６ａアルギニン置換体の作製
　以下の（ｙ）から（ａａ）に示す３種類のＦｐＬ＿Ｃ３ＫＸ　６ａアルギニン置換体を設計し、作製した。
（ｙ）ＦｐＬ＿Ｃ３ＫＸ　６ａに対し、Ｇｌｕ５Ａｒｇのアミノ酸置換を導入したタンパク質（配列番号２２３、ＦｐＬ＿Ｃ３ＫＸ　７ａと命名）
（ｚ）ＦｐＬ＿Ｃ３ＫＸ　６ａに対し、Ｇｌｕ２７Ａｒｇのアミノ酸置換を導入したタンパク質（配列番号２２４、ＦｐＬ＿Ｃ３ＫＸ　７ｂと命名）
（ａａ）ＦｐＬ＿Ｃ３ＫＸ　６ａに対し、Ａｌａ４７Ａｒｇのアミノ酸置換を導入したタンパク質（配列番号２２５、ＦｐＬ＿Ｃ３ＫＸ　７ｃと命名）
　以下、（ｙ）、（ｚ）および（ａａ）に示す３種類の免疫グロブリン結合性タンパク質の作製方法について説明する。
　（ｙ）ＦｐＬ＿Ｃ３ＫＸ　７ａ
　（ｙ－１）インバースＰＣＲを用いた変異導入により、ＦｐＬ＿Ｃ３ＫＸ　７ａ（配列番号２２３）をコードするヌクレオチド配列を含むポリヌクレオチドを作製した。鋳型ＤＮＡとしてインバースＰＣＲはＦｐＬ＿Ｃ３ＫＸ　６ａ（配列番号１９９）をコードするポリヌクレオチド（配列番号２１１）を含む発現ベクター（以下、「ｐＥＴ－ＦｐＬ＿Ｃ３ＫＸ　６ａ」とも表記）を、ＰＣＲ　Ｆｏｒｗａｒｄ　Ｐｒｉｍｅｒとして配列番号２２６に記載のオリゴヌクレオチドを、ＰＣＲ　Ｒｅｖｅｒｓｅ　Ｐｒｉｍｅｒとして配列番号２２７に記載のオリゴヌクレオチドを、それぞれ用いた他は実施例７（２）（ａ－１）と同様な方法で行なった。
　（ｙ－２）得られたポリヌクレオチドを精製し、制限酵素ＤｐｎＩで処理後、当該制限酵素処理産物を用いて大腸菌ＢＬ２１（ＤＥ３）株を形質転換した。
　（ｙ－３）得られた形質転換体を実施例７（２）（ａ－３）と同様な方法で培養および発現ベクター（ｐＥＴ－ＦｐＬ＿Ｃ３ＫＸ　７ａと命名）の抽出を行ない、当該発現ベクターのヌクレオチド配列の解析を実施例１（５）と同様の方法で行なった。
　配列解析の結果、発現ベクターｐＥＴ－ＦｐＬ＿Ｃ３ＫＸ　７ａにＦｐＬ＿Ｃ３ＫＸ　７ａ（配列番号２２３）をコードするポリヌクレオチドが挿入されていることを確認した。
　（ｚ）ＦｐＬ＿Ｃ３ＫＸ　７ｂ
　（ｚ－１）インバースＰＣＲを用いた変異導入により、ＦｐＬ＿Ｃ３ＫＸ　７ｂ（配列番号２２４）をコードするヌクレオチド配列を含むポリヌクレオチドを作製した。インバースＰＣＲは、鋳型ＤＮＡとしてｐＥＴ－ＦｐＬ＿Ｃ３ＫＸ　６ａを、ＰＣＲ　Ｆｏｒｗａｒｄ　Ｐｒｉｍｅｒとして配列番号２２８に記載のオリゴヌクレオチドを、ＰＣＲ　Ｒｅｖｅｒｓｅ　Ｐｒｉｍｅｒとして配列番号２２９に記載のオリゴヌクレオチドを、それぞれ用いた他は実施例７（２）（ａ－１）と同様な方法で行なった。
　（ｚ－２）得られたポリヌクレオチドを精製し、制限酵素ＤｐｎＩで処理後、当該制限酵素処理産物を用いて大腸菌ＢＬ２１（ＤＥ３）株を形質転換した。
　（ｚ－３）得られた形質転換体を実施例７（２）（ａ－３）と同様な方法で培養および発現ベクター（ｐＥＴ－ＦｐＬ＿Ｃ３ＫＸ　７ｂと命名）の抽出を行ない、当該発現ベクターのヌクレオチド配列の解析を実施例１（５）と同様の方法で行なった。
　配列解析の結果、発現ベクターｐＥＴ－ＦｐＬ＿Ｃ３ＫＸ　７ｂにＦｐＬ＿Ｃ３ＫＸ　７ｂ（配列番号２２４）をコードするポリヌクレオチドが挿入されていることを確認した。
　（ａａ）ＦｐＬ＿Ｃ３ＫＸ　７ｃ
　（ａａ－１）インバースＰＣＲを用いた変異導入により、ＦｐＬ＿Ｃ３ＫＸ　７ｃ（配列番号２２５）をコードするヌクレオチド配列を含むポリヌクレオチドを作製した。インバースＰＣＲは、鋳型ＤＮＡとしてｐＥＴ－ＦｐＬ＿Ｃ３ＫＸ　６ａを、ＰＣＲ　Ｆｏｒｗａｒｄ　Ｐｒｉｍｅｒとして配列番号２３０に記載のオリゴヌクレオチドを、ＰＣＲ　Ｒｅｖｅｒｓｅ　Ｐｒｉｍｅｒとして配列番号２３１に記載のオリゴヌクレオチドを、それぞれ用いた他は実施例７（２）（ａ－１）と同様な方法で行なった。
　（ａａ－２）得られたポリヌクレオチドを精製し、制限酵素ＤｐｎＩで処理後、当該制限酵素処理産物を用いて大腸菌ＢＬ２１（ＤＥ３）株を形質転換した。
　（ａａ－３）得られた形質転換体を実施例７（２）（ａ－３）と同様な方法で培養および発現ベクター（ｐＥＴ－ＦｐＬ＿Ｃ３ＫＸ　７ｃと命名）の抽出を行ない、当該発現ベクターのヌクレオチド配列の解析を実施例１（５）と同様の方法で行なった。
　配列解析の結果、発現ベクターｐＥＴ－ＦｐＬ＿Ｃ３ＫＸ　７ｃにＦｐＬ＿Ｃ３ＫＸ　７ｃ（配列番号２２５）をコードするポリヌクレオチドが挿入されていることを確認した。
　実施例３５　ＦｐＬ＿Ｃ３ＫＸ　６ａアルギニン置換体のアルカリ安定性評価
　（１）実施例２８で作製したＦｐＬ＿Ｃ３ＫＸ　６ａ（配列番号１９９）、ならびに実施例３４で作製したＦｐＬ＿Ｃ３ＫＸ　７ａ（配列番号２２３）、ＦｐＬ＿Ｃ３ＫＸ　７ｂ（配列番号２２４）およびＦｐＬ＿Ｃ３ＫＸ　７ｃ（配列番号２２５）のいずれかを発現する形質転換体を、実施例３（８）から（１０）と同様な方法で培養し、実施例３（１１）と同様な方法でタンパク質抽出液を調製した。前記抽出液は遠心分離し、得られた上清をフィルターに通し、清澄化した。
　（２）（１）で清澄化した上清を、参考例２（２）に記載の方法で精製し、免疫グロブリン結合性タンパク質に相当する画分を回収した。
　（３）回収した画分の吸光度を分光光度計で測定し、当該画分に含まれる免疫グロブリン結合性タンパク質を定量した。またＳＤＳ－ＰＡＧＥも実施し、選択した免疫グロブリン結合性タンパク質が純度よく精製されていることを確認した。
　（４）処理に用いたＮａＯＨの濃度を１．０Ｍ（終濃度０．５Ｍ）に、処理温度を２５℃、処理時間を１４時間に、それぞれした他は、実施例３（１３）と同様な方法でアルカリ処理後、実施例３（１４）と同様な方法で残存活性を算出し、アルカリ安定性を評価した。
　結果を表２５に示す。ＦｐＬ＿Ｃ３ＫＸ　７ａ（配列番号２２３）、ＦｐＬ＿Ｃ３ＫＸ　７ｂ（配列番号２２４）およびＦｐＬ＿Ｃ３ＫＸ　７ｃ（配列番号２２５）は天然型のＦｐＬ＿Ｃ３（配列番号１）よりアルカリ安定性が向上したＦｐＬ＿Ｃ３ＫＸ　６ａ（配列番号１９９）と比較しても、アルカリ安定性が向上しているといえる。特に、ＦｐＬ＿Ｃ３ＫＸ　７ｂにおいて顕著なアルカリ安定性向上を確認した（ＦｐＬ＿Ｃ３ＫＸ　６ａ：５２％、ＦｐＬ＿Ｃ３ＫＸ　７ｂ：７０％）。
Figure JPOXMLDOC01-appb-T000025
 　実施例３６　ＦｐＬ＿Ｃ３ＫＸ　６ａアルギニン置換体の溶出特性評価
　（１）実施例２８で作製したＦｐＬ＿Ｃ３ＫＸ　６ａ（配列番号１９９）、実施例３２で取得したＦｐＬ＿Ｃ３ＫＸ　６ａ　Ｅ２７Ｖ（配列番号２２２）、ならびに実施例３４で作製したＦｐＬ＿Ｃ３ＫＸ　７ｂ（配列番号２２４）およびＦｐＬ＿Ｃ３ＫＸ　７ｃ（配列番号２２５）のいずれかを発現する形質転換体を、実施例３（８）から（１０）と同様な方法で培養し、実施例３（１１）と同様な方法でタンパク質抽出液を調製した。前記抽出液は遠心分離し、得られた上清をフィルターに通し、清澄化した。
　（２）（１）で清澄化した上清を、参考例２（２）に記載の方法で精製し、免疫グロブリン結合性タンパク質に相当する画分を回収した。
　（３）回収した画分の吸光度を分光光度計で測定し、当該画分に含まれる各変異型免疫グロブリン結合性タンパク質を定量した。またＳＤＳ－ＰＡＧＥも実施し、各変異型免疫グロブリン結合性タンパク質が純度よく精製されていることを確認した。
　（４）使用する０．０５Ｍクエン酸溶液のｐＨが２．４とした他は、実施例３３（４）と同様の方法で、変異型免疫グロブリン結合性タンパク質の酸における溶出率を評価した。
　結果を表２６に示す。ＦｐＬ＿Ｃ３ＫＸ　６ａアルギニン置換体であるＦｐＬ＿Ｃ３ＫＸ　７ｂ（配列番号２２４）およびＦｐＬ＿Ｃ３ＫＸ　７ｃ（配列番号２２５）は、天然型ＦｐＬ＿Ｃ３（配列番号１）と比較して酸溶出特性が向上したＦｐＬ＿ＫＸ６ａ　Ｅ２７Ｖ（配列番号２２２）と比較しても、酸溶出特性が向上していることがわかる。特に、ＦｐＬ＿Ｃ３ＫＸ　７ｂにおいて顕著な酸溶出特性向上を確認した（ＦｐＬ＿Ｃ３ＫＸ　６ａ　Ｅ２７Ｖ：５３％、ＦｐＬ＿Ｃ３ＫＸ　７ｂ：６１％）。
Figure JPOXMLDOC01-appb-T000026
　実施例３７　免疫グロブリン結合性タンパク質の免疫グロブリンκ軽鎖結合性評価（その２）
　Ｐｒｏ６Ｓｅｒのアミノ酸置換導入による、ヒト免疫グロブリンκ軽鎖結合活性への影響を評価した。具体的には、ＦｐＬ＿Ｃ３ＫＸ　５ｅ（配列番号１８６）に対しＰｒｏ６Ｓｅｒのアミノ酸置換を導入した免疫グロブリン結合性タンパク質を作製し、評価した。
　（１）インバースＰＣＲを用いた変異導入により、ＦｐＬ＿Ｃ３ＫＸ　５ｅ（配列番号１８６）に対しＰｒｏ６Ｓｅｒのアミノ酸置換を導入した免疫グロブリン結合性タンパク質（ＦｐＬ＿Ｃ３ＫＸ＿５ｅ＿Ｐ６Ｓと命名、配列番号２３６）をコードするヌクレオチド配列を含むポリヌクレオチドを作製した。インバースＰＣＲは、鋳型ＤＮＡとしてｐＥＴ－ＦｐＬ＿Ｃ３ＫＸ　５ｅを、ＰＣＲ　Ｆｏｒｗａｒｄ　Ｐｒｉｍｅｒとして配列番号２３４に記載のオリゴヌクレオチドを、ＰＣＲ　Ｒｅｖｅｒｓｅ　Ｐｒｉｍｅｒとして配列番号２３５に記載のオリゴヌクレオチドを、それぞれ用いた他は実施例７（２）（ａ－１）と同様な方法で行なった。
　（２）得られたポリヌクレオチドを精製し、制限酵素ＤｐｎＩで処理後、当該制限酵素処理産物を用いて大腸菌ＢＬ２１（ＤＥ３）株を形質転換した。
　（３）得られた形質転換体を実施例７（２）（ａ－３）と同様な方法で培養および発現ベクター（ｐＥＴ－ＦｐＬ＿Ｃ３ＫＸ＿５ｅ＿Ｐ６Ｓと命名）の抽出を行ない、当該発現ベクターのヌクレオチド配列の解析を実施例１（５）と同様の方法で行なった。配列解析の結果、発現ベクターｐＥＴ－ＦｐＬ＿Ｃ３ＫＸ＿５ｅ＿Ｐ６ＳにＦｐＬ＿Ｃ３ＫＸ＿５ｅ＿Ｐ６Ｓ（配列番号２３６）をコードするポリヌクレオチドが挿入されていることを確認した。
　（４）（２）で得られたＦｐＬ＿Ｃ３ＫＸ＿５ｅ＿Ｐ６Ｓ（配列番号２３６）、および実施例２４で作製したＦｐＬ＿Ｃ３ＫＸ＿５ｅ（配列番号１８６）のいずれかを発現する形質転換体を、実施例３（８）から（１０）と同様な方法で培養し、実施例３（１１）と同様な方法でタンパク質抽出液を調製した。前記抽出液は遠心分離し、得られた上清をフィルターに通し、清澄化した。
　（５）（４）で清澄化した上清を、参考例２（２）に記載の方法で精製し、免疫グロブリン結合性タンパク質に相当する画分を回収した。
　（６）回収した画分の吸光度を分光光度計で測定し、当該画分に含まれる各変異型免疫グロブリン結合性タンパク質を定量した。またＳＤＳ－ＰＡＧＥも実施し、各変異型免疫グロブリン結合性タンパク質が純度よく精製されていることを確認した。
　（７）免疫グロブリン結合性タンパク質のヒト免疫グロブリンκ軽鎖結合活性を、実施例２１（４）と同様な方法で測定し、アミノ酸置換によるヒト免疫グロブリンκ軽鎖結合活性への影響を評価した。ただし、結合活性評価に用いたポリクローナル抗体は、
ヒトκ軽鎖ｓｕｂｇｒｏｕｐ　１（Ｖκ１）を含むハーセプチン（中外製薬社製）および、
ヒトκ軽鎖ｓｕｂｇｒｏｕｐ　３（Ｖκ３）を含むＨｕｍａｎ　ＣＴＬＡ４抗体（Ｒ＆Ｄ　Ｓｙｓｔｅｍｓ社製）、
のいずれかである。
　参考例３　
　Ｌｙｓ３８Ｇｌｕのアミノ酸置換導入による、ヒト免疫グロブリンκ軽鎖結合活性への影響を評価した。具体的には、ＦｐＬ＿Ｃ３ＫＲ（配列番号１１６）に対しＬｙｓ（Ａｒｇ）３８Ｇｌｕのアミノ酸置換を導入した免疫グロブリン結合性タンパク質を作製し、評価した。
　（１）インバースＰＣＲを用いた変異導入により、ＦｐＬ＿Ｃ３ＫＲ（配列番号１１６）に対しＬｙｓ（Ａｒｇ）３８Ｇｌｕのアミノ酸置換を導入した免疫グロブリン結合性タンパク質（ＦｐＬ＿Ｃ３ＫＲ＿Ｋ３８Ｅと命名、配列番号２３９）をコードするヌクレオチド配列を含むポリヌクレオチドを作製した。インバースＰＣＲは、鋳型ＤＮＡとしてｐＥＴ－ＦｐＬ＿Ｃ３ＫＲを、ＰＣＲ　Ｆｏｒｗａｒｄ　Ｐｒｉｍｅｒとして配列番号２３７に記載のオリゴヌクレオチドを、ＰＣＲ　Ｒｅｖｅｒｓｅ　Ｐｒｉｍｅｒとして配列番号２３８に記載のオリゴヌクレオチドを、それぞれ用いた他は実施例７（２）（ａ－１）と同様な方法で行なった。
　（２）得られたポリヌクレオチドを精製し、制限酵素ＤｐｎＩで処理後、当該制限酵素処理産物を用いて大腸菌ＢＬ２１（ＤＥ３）株を形質転換した。
　（３）（２）で得られた形質転換体を実施例７（２）（ａ－３）と同様な方法で培養および発現ベクター（ｐＥＴ－ＦｐＬ＿Ｃ３ＫＸ　５ｅ＿Ｋ３８Ｅと命名）の抽出を行ない、当該発現ベクターのヌクレオチド配列の解析を実施例１（５）と同様の方法で行なった。配列解析の結果、発現ベクターｐＥＴ－ＦｐＬ＿Ｃ３ＫＲ＿Ｋ３８ＥにＦｐＬ＿Ｃ３ＫＲ＿Ｋ３８Ｅ（配列番号２３９）をコードするポリヌクレオチドが挿入されていることを確認した。
　（４）（２）で得られたＦｐＬ＿Ｃ３ＫＲ＿Ｋ３８Ｅ（配列番号２３９）、および参考例１で作製したＦｐＬ＿Ｃ３ＫＲ（配列番号１１６）のいずれかを発現する形質転換体を、実施例３（８）から（１０）と同様な方法で培養し、実施例３（１１）と同様な方法でタンパク質抽出液を調製した。前記抽出液は遠心分離し、得られた上清をフィルターに通し、清澄化した。
　（５）（４）で清澄化した上清を、参考例２（２）に記載の方法で精製し、免疫グロブリン結合性タンパク質に相当する画分を回収した。
　（６）回収した画分の吸光度を分光光度計で測定し、当該画分に含まれる各変異型免疫グロブリン結合性タンパク質を定量した。またＳＤＳ－ＰＡＧＥも実施し、各変異型免疫グロブリン結合性タンパク質が純度よく精製されていることを確認した。
　（７）免疫グロブリン結合性タンパク質のヒト免疫グロブリンκ軽鎖結合活性を、実施例３７（７）と同様な方法で測定し、アミノ酸置換によるヒト免疫グロブリンκ軽鎖結合活性への影響を評価した。
　実施例３７および比較例３の結果を合わせて表２７に示す。Ｐｒｏ６Ｓｅｒ（実施例３７）またはＬｙｓ（Ａｒｇ）３８Ｇｌｕ（比較例３）のアミノ酸置換を導入することで、Ｖκ３との結合力を付与できることがわかる。
Figure JPOXMLDOC01-appb-T000027
　実施例３８　ＦｐＬ＿Ｃ３ＫＸ　５ｅアミノ酸置換集積体作製（その２）
　前述したＶκ３との結合力を付与するアミノ酸置換および実施例２７で明らかとなった免疫グロブリン結合性タンパク質のアルカリ安定性向上に関与するアミノ酸置換をＦｐＬ＿Ｃ３ＫＸ　５ｅに対し集積した。具体的には、以下の（ａｂ）に示す免疫グロブリン結合性タンパク質を設計し、作成した。
　（ａｂ）ＦｐＬ＿Ｃ３ＫＸ　５ｅに対し、Ｇｌｕ４Ｇｌｙ、Ｌｙｓ（Ａｒｇ）３８Ｇｌｕ、Ｇｌｕ（Ｇｌｙ）５２Ａｓｐのアミノ酸置換を導入したタンパク質（配列番号２４０、ＦｐＬ＿Ｃ３ＫＸ　７ｄと命名）
　（ａｂ－１）ＦｐＬ＿Ｃ３ＫＸ　７ｄ（配列番号２４０）をコードするポリヌクレオチド（配列番号２４１）を合成した。なお、合成する際、５’末端側には制限酵素ＮｃｏＩの認識配列（５’－ＣＣＡＴＧＧ－３’）を、３’末端側にはヒスチジン６残基をコードするヌクレオチド配列（配列番号２３２）、終止コドンおよび制限酵素ＨｉｎｄＩＩＩの認識配列（５’－ＡＡＧＣＴＴ－３’）を、それぞれ付加している。
　（ａｂ－２）実施例１（２）と同様の方法で、（ａｂ－１）で合成したポリヌクレオチドを精製した。
　（ａｂ－３）実施例１（３）と同様な方法で、（ａｂ－２）で得たポリヌクレオチドと予め制限酵素ＮｃｏＩとＨｉｎｄＩＩＩで消化したプラスミドｐＥＴ－２６ｂとをライゲーション後、当該ライゲーション産物を用いて大腸菌ＢＬ２１（ＤＥ３）株を形質転換し、培養した。
　（ａｂ－４）得られた形質転換体を、実施例１（４）と同様な方法で培養およびプラスミド精製を行ない、発現ベクター（ｐＥＴ－ＦｐＬ＿Ｃ３ＫＸ　７ｄと命名）を取得後、当該発現ベクターのヌクレオチド配列の解析を、実施例１（５）と同様の方法で行なった。
　配列解析の結果、発現ベクターｐＥＴ－ＦｐＬ＿Ｃ３ＫＸ　７ｄにＦｐＬ＿Ｃ３ＫＸ　７ｄ（配列番号２４０）をコードするポリヌクレオチド（配列番号２４１）が挿入されていることを確認した。
　実施例３９　ＦｐＬ＿Ｃ３ＫＸ　５ｅアミノ酸置換集積体のアルカリ安定性評価（その２）
　（１）実施例２４で作製したＦｐＬ＿Ｃ３ＫＸ　５ｅ（配列番号１８６）および実施例３８で作製したＦｐＬ＿Ｃ３ＫＸ　７ｄ（配列番号２４０）のいずれかを発現する形質転換体を、実施例３（８）から（１０）と同様な方法で培養し、実施例３（１１）に記載の方法でタンパク質抽出液を調製した。前記抽出液は遠心分離し、得られた上清をフィルターに通し、清澄化した。
　（２）（１）で清澄化した上清を、参考例２（２）に記載の方法で精製し、免疫グロブリン結合性タンパク質に相当する画分を回収した。
　（３）回収した画分の吸光度を分光光度計で測定し、当該画分に含まれる免疫グロブリン結合性タンパク質を定量した。またＳＤＳ－ＰＡＧＥも実施し、選択した免疫グロブリン結合性タンパク質が純度よく精製されていることを確認した。
　（４）処理に用いたＮａＯＨの濃度を１．０Ｍ（終濃度０．５Ｍ）に、処理時間を１５時間に、それぞれした他は、実施例３（１３）と同様な方法でアルカリ処理後、実施例３（１４）と同様な方法で残存活性を算出し、アルカリ安定性を評価した。
　結果を表２８に示す。本実施例で評価したＦｐＬ＿Ｃ３ＫＸ　７ｄ（配列番号２４０）は、天然型ＦｐＬ＿Ｃ３（配列番号１）よりもアルカリ安定性が向上したＦｐＬ＿Ｃ３ＫＸ　５ｅ（配列番号１８６）と比較しても、アルカリ安定性が向上しているといえる。
Figure JPOXMLDOC01-appb-T000028
　実施例４０　ＦｐＬ＿Ｃ３ＫＸ　７ｄへの変異導入およびライブラリ作製（その１）
　実施例３８で作製したＦｐＬ＿Ｃ３ＫＸ　７ｄ（配列番号２４０）を発現するベクターｐＥＴ－ＦｐＬ＿Ｃ３ＫＸ　７ｄのうち、免疫グロブリン結合性タンパク質をコードするポリヌクレオチド部分（配列番号２４１）に、実施例２と同様の方法でエラープローンＰＣＲによりランダムに変異を導入し、ライブラリを作製した。平均変異導入率は１．９％であった。
　実施例４１　ＦｐＬ＿Ｃ３ＫＸ　７ｄアミノ酸置換体のスクリーニング（その１）
　（１）実施例３８で作製したｐＥＴ－ＦｐＬ＿Ｃ３ＫＸ　７ｄ（形質転換体）および実施例４０で作製したランダム変異体ライブラリ（形質転換体）を、実施例３（１）から（２）と同様な方法で培養した。
　（２）培養後、遠心操作によって得られた培養上清を１．０Ｍ　ＮａＯＨと等量混合し５８℃で３０分間アルカリ処理を行なった。
　（３）アルカリ処理を行なった時の免疫グロブリン結合性タンパク質の抗体結合活性を実施例３（４）に記載のＥＬＩＳＡ法にて測定し、アルカリ処理を行なった時の免疫グロブリン結合性タンパク質の抗体結合活性を、アルカリ処理を行わなかった時の免疫グロブリン結合性タンパク質の抗体結合活性で除することで残存活性を算出した。
　（４）約１０００株の形質転換体を評価し、その中からＦｐＬ＿Ｃ３ＫＸ　７ｄ（配列番号２４０）と比較してアルカリ安定性が向上した免疫グロブリン結合性タンパク質を発現する形質転換体を選択した。
　（５）選択した形質転換体を培養し、ＱＩＡｐｒｅｐ　Ｓｐｉｎ　Ｍｉｎｉｐｒｅｐ　ｋｉｔ（ＱＩＡＧＥＮ社製）を用いて発現ベクターを調製した。
　（６）得られた発現ベクターに挿入された免疫グロブリン結合性タンパク質をコードするポリヌクレオチド領域の配列を実施例１（５）に記載の方法によりヌクレオチド配列を解析し、アミノ酸の変異箇所を特定した。
　（７）（４）で選択した免疫グロブリン結合性タンパク質を発現する形質転換体または実施例３８で作製したＦｐＬ＿Ｃ３ＫＸ　７ｄ（配列番号２４０）を発現する形質転換体を、実施例３（８）から（１０）と同様な方法で培養し、実施例３（１１）と同様な方法でタンパク質抽出液を調製した。前記抽出液は遠心分離後、得られた上清をフィルターに通し、清澄化した。
　（８）（７）で清澄化した上清を、参考例２（２）に記載の方法で精製し、免疫グロブリン結合性タンパク質に相当する画分を回収した。
　（９）回収した画分の吸光度を分光光度計で測定し、当該画分に含まれる免疫グロブリン結合性タンパク質を定量した。またＳＤＳ－ＰＡＧＥも実施し、選択した免疫グロブリン結合性タンパク質が純度よく精製されていることを確認した。
　（１０）処理に用いたＮａＯＨの濃度を１．０Ｍ（終濃度０．５Ｍ）に、処理時間を１５時間に、それぞれした他は、実施例３（１３）と同様な方法でアルカリ処理後、実施例３（１４）と同様な方法で残存活性を算出し、アルカリ安定性を評価した。
　結果を表２９に示す。配列番号２４０に記載のアミノ酸配列において、少なくともＧｌｕ８Ｖａｌ、Ｌｙｓ（Ｉｌｅ）２９Ｐｈｅ、Ｇｌｕ３３ＶａｌおよびＡｌａ６９Ｖａｌより選択される１以上のアミノ酸置換を有した免疫グロブリン結合性タンパク質は、天然型のＦｐＬ＿Ｃ３（配列番号１）よりアルカリ安定性が向上したＦｐＬ＿Ｃ３ＫＸ　７ｄ（配列番号２４０）と比較しても、アルカリ安定性が向上しているといえる。
Figure JPOXMLDOC01-appb-T000029
　実施例４２　ＦｐＬ＿Ｃ３ＫＸ　７ｄへの変異導入およびライブラリ作製（その２）
　（１）実施例３８で作製した発現ベクターｐＥＴ－ＦｐＬ＿Ｃ３ＫＸ　７ｄを鋳型として、２３番目、４１番目および５２番目のアミノ酸残基に対する飽和置換体ライブラリを作製した。プライマーは、実施例１１（１）と同様、２２ｃ－Ｔｒｉｃｋ法に倣い、変異導入箇所に適切な混合塩基を配置し、変異導入箇所を中心としたインバースＰＣＲができるように設計した（配列番号２４５から２５０、２５２から２５７、ならびに２６０から２６５）。これらのプライマーを一箇所の置換につき６本一組として、表７および表３０の組成で混合し、ＰＣＲ　Ｐｒｉｍｅｒ混合液（Ｆｏｒｗａｒｄ／Ｒｅｖｅｒｓｅ　ｐｒｉｍｅｒ　ｍｉｘ）を調製した。
Figure JPOXMLDOC01-appb-T000030
　（２）ｐＥＴ－ＦｐＬ＿Ｃ３ＫＸ　７ｄを鋳型ＤＮＡとした他は、実施例１１（２）と同様な方法でインバースＰＣＲによる部位特異的変異導入を行なった。
　（３）得られたＰＣＲ産物を精製後、反応液を用いて大腸菌ＢＬ２１（ＤＥ３）株を形質転換し、５０μｇ／ｍＬのカナマイシンを含むＬＢプレート培地で培養（３７℃、１６時間）した後、プレート上に形成したコロニーを部位特異的変異体ライブラリとした。
　実施例４３　ＦｐＬ＿Ｃ３ＫＸ　７ｄアミノ酸置換体のスクリーニング（その２）
　（１）実施例３８で作製したｐＥＴ－ＦｐＬ＿Ｃ３ＫＸ　７ｄ（形質転換体）および実施例４２で作製した部位特異的アミノ酸置換体ライブラリ（形質転換体）を、実施例３（１）から（２）と同様な方法で培養後、遠心操作によって得られた培養上清に対し、実施例４１（２）に記載のアルカリ処理を行なった。
　（２）アルカリ処理を行なった時の免疫グロブリン結合性タンパク質の抗体結合活性を実施例３（４）に記載のＥＬＩＳＡ法にて測定し、アルカリ処理を行なった時の免疫グロブリン結合性タンパク質の抗体結合活性を、アルカリ処理を行わなかった時の免疫グロブリン結合性タンパク質の抗体結合活性で除することで残存活性を算出した。
　（３）約３００株の形質転換体を評価し、その中からＦｐＬ＿Ｃ３ＫＸ　７ｄ（配列番号２４０）と比較してアルカリ安定性が向上した免疫グロブリン結合性タンパク質を発現する形質転換体を選択した。
　（４）選択した形質転換体を培養し、ＱＩＡｐｒｅｐ　Ｓｐｉｎ　Ｍｉｎｉｐｒｅｐ　ｋｉｔ（ＱＩＡＧＥＮ社製）を用いて発現ベクターを調製した。
　（５）得られた発現ベクターに挿入された免疫グロブリン結合性タンパク質をコードするポリヌクレオチド領域の配列を実施例１（５）に記載の方法によりヌクレオチド配列を解析し、アミノ酸の変異箇所を特定した。
　（６）（３）で選択した免疫グロブリン結合性タンパク質を発現する形質転換体または実施例３８で作製したＦｐＬ＿Ｃ３ＫＸ　７ｄ（配列番号２４０）を発現する形質転換体を、実施例３（８）から（１０）と同様な方法で培養し、実施例３（１１）と同様な方法でタンパク質抽出液を調製した。前記抽出液は遠心分離し、得られた上清をフィルターに通し、清澄化した。
　（７）（６）で清澄化した上清を、参考例２（２）に記載の方法で精製し、免疫グロブリン結合性タンパク質に相当する画分を回収した。
　（８）回収した画分の吸光度を分光光度計で測定し、当該画分に含まれる免疫グロブリン結合性タンパク質を定量した。またＳＤＳ－ＰＡＧＥも実施し、選択した免疫グロブリン結合性タンパク質が純度よく精製されていることを確認した。
　（９）処理に用いたＮａＯＨの濃度を１．０Ｍ（終濃度０．５Ｍ）に、処理時間を１５時間に、それぞれした他は、実施例３（１３）と同様な方法でアルカリ処理後、実施例３（１４）と同様な方法で残存活性を算出し、アルカリ安定性を評価した。
　結果を表３１に示す。配列番号２４０に記載のアミノ酸配列において、少なくともＩｌｅ２３Ａｒｇ、Ａｌａ４１Ｉｌｅ、Ａｌａ４１Ｔｙｒ、Ｇｌｕ（Ｇｌｙ，Ａｓｐ）５２Ｌｅｕ（この表記は配列番号１の７番目のグルタミン酸に相当するアミノ酸残基が一旦グリシンに置換し、さらにアスパラギン酸に置換後、ロイシンに置換されたことを表す、以下同様）およびＧｌｕ（Ｇｌｙ，Ａｓｐ）５２Ｖａｌのアミノ酸置換を有した免疫グロブリン結合性タンパク質は、天然型のＦｐＬ＿Ｃ３（配列番号１）よりアルカリ安定性が向上したＦｐＬ＿Ｃ３ＫＸ　７ｄ（配列番号２４０）と比較しても、アルカリ安定性が向上しているといえる。
Figure JPOXMLDOC01-appb-T000031
　実施例４４　ＦｐＬ＿Ｃ３ＫＸ　７ｄアミノ酸置換集積体の作製
　（１）ＦｐＬ＿Ｃ３ＫＸ　７ｄアミノ酸置換集積体の設計
　実施例４１および４３で明らかになった、免疫グロブリン結合性タンパク質のアルカリ安定性向上に関与するアミノ酸置換をＦｐＬ＿Ｃ３ＫＸ　７ｄ（配列番号２４０）に対し集積することで、更なるアルカリ安定性の向上を図った。具体的には、以下の（ａｃ）から（ａｄ）に示す２種類の免疫グロブリン結合性タンパク質を設計し、作製した。
（ａｃ）ＦｐＬ＿Ｃ３ＫＸ　７ｄに対し、Ｇｌｕ（Ｇｌｙ，Ａｓｐ）５２ＶａｌおよびＡｌａ６９Ｖａｌのアミノ酸置換を導入したタンパク質（配列番号２７１、ＦｐＬ＿Ｃ３ＫＸ　８ａと命名）
（ａｄ）ＦｐＬ＿Ｃ３ＫＸ　７ｄに対し、Ｇｌｕ（Ｇｌｙ，Ａｓｐ）５２ＬｅｕおよびＡｌａ６９Ｖａｌのアミノ酸置換を導入したタンパク質（配列番号２７４、ＦｐＬ＿Ｃ３ＫＸ　８ｂと命名）
　（２）ＦｐＬ＿Ｃ３ＫＸ　７ｄアミノ酸置換集積体の作製
　以下、前記（ａｃ）から（ａｄ）に示す２種類の免疫グロブリン結合性タンパク質の作製方法について説明する。
　（ａｃ）ＦｐＬ＿Ｃ３ＫＸ　８ａ
　（ａｃ－１）インバースＰＣＲを用いた変異導入により、ＦｐＬ＿Ｃ３ＫＸ　８ａ（配列番号２７１）をコードするヌクレオチド配列を含むポリヌクレオチドを作製した。インバースＰＣＲは、鋳型ＤＮＡとしてＦｐＬ＿Ｃ３ＫＸ　７ｄ＿Ａ６９Ｖ（ＦｐＬ＿Ｃ３ＫＸ　７ｄにＡｌａ６９Ｖａｌのアミノ酸置換を導入した免疫グロブリン結合性タンパク質、配列番号２４２）をコードするポリヌクレオチド（配列番号２６８）を含む発現ベクター（以下、「ｐＥＴ－ＦｐＬ＿Ｃ３ＫＸ　７ｄ＿Ａ６９Ｖ」とも表記）を、ＰＣＲ　Ｆｏｒｗａｒｄ　Ｐｒｉｍｅｒとして配列番号２６９に記載のオリゴヌクレオチドを、ＰＣＲ　Ｒｅｖｅｒｓｅ　Ｐｒｉｍｅｒとして配列番号２７０に記載のオリゴヌクレオチドを、それぞれ用いた他は実施例７（２）（ａ－１）と同様な方法で行なった。
　（ａｃ－２）得られたポリヌクレオチドを精製し、制限酵素ＤｐｎＩで処理後、当該制限酵素処理産物を用いて大腸菌ＢＬ２１（ＤＥ３）株を形質転換した。
　（ａｃ－３）得られた形質転換体を実施例７（２）（ａ－３）と同様な方法で培養および発現ベクター（ｐＥＴ－ＦｐＬ＿Ｃ３ＫＸ　８ａと命名）の抽出を行ない、当該発現ベクターのヌクレオチド配列の解析を実施例１（５）と同様の方法で行なった。
　配列解析の結果、発現ベクターｐＥＴ－ＦｐＬ＿Ｃ３ＫＸ　８ａにＦｐＬ＿Ｃ３ＫＸ　８ａ（配列番号２７１）をコードするポリヌクレオチドが挿入されていることを確認した。
　（ａｄ）ＦｐＬ＿Ｃ３ＫＸ　８ｂ
　（ａｄ－１）インバースＰＣＲを用いた変異導入により、ＦｐＬ＿Ｃ３ＫＸ　８ｂ（配列番号２７４）をコードするヌクレオチド配列を含むポリヌクレオチドを作製した。鋳型ＤＮＡとしてインバースＰＣＲは、鋳型ＤＮＡとしてｐＥＴ－ＦｐＬ＿Ｃ３ＫＸ８ａ＿Ａ６９Ｖを、ＰＣＲ　Ｆｏｒｗａｒｄ　Ｐｒｉｍｅｒとして配列番号２７２に記載のオリゴヌクレオチドを、ＰＣＲ　Ｒｅｖｅｒｓｅ　Ｐｒｉｍｅｒとして配列番号２７３記載のオリゴヌクレオチドを、それぞれ用いた他は実施例７（２）（ａ－１）と同様な方法で行なった。
　（ａｄ－２）得られたポリヌクレオチドを精製し、制限酵素ＤｐｎＩで処理後、当該制限酵素処理産物を用いて大腸菌ＢＬ２１（ＤＥ３）株を形質転換した。
　（ａｄ－３）得られた形質転換体を実施例７（２）（ａ－３）と同様な方法で培養および発現ベクター（ｐＥＴ－ＦｐＬ＿Ｃ３ＫＸ　８ｂと命名）の抽出を行ない、当該発現ベクターのヌクレオチド配列の解析を実施例１（５）と同様の方法で行なった。
　配列解析の結果、発現ベクターｐＥＴ－ＦｐＬ＿Ｃ３ＫＸ　８ｂにＦｐＬ＿Ｃ３ＫＸ　８ｂ（配列番号２７４）をコードするポリヌクレオチドが挿入されていることを確認した。
　実施例４５　ＦｐＬ＿Ｃ３ＫＸ　７ｄアミノ酸置換集積体のアルカリ安定性評価
　（１）実施例４２で取得したＦｐＬ＿Ｃ３ＫＸ　７ｄ＿Ａ６９Ｖ（配列番号２４２）、ならびに実施例４４で作製したＦｐＬ＿Ｃ３ＫＸ　８ａ（配列番号２７１）およびＦｐＬ＿Ｃ３ＫＸ９ｂ（配列番号２７４）のいずれかを発現する形質転換体を、実施例３（８）から（１０）と同様な方法で培養し、実施例３（１１）に記載の方法でタンパク質抽出液を調製した。前記抽出液は遠心分離し、得られた上清をフィルターに通し、清澄化した。
　（２）（１）で清澄化した上清を、参考例２（２）に記載の方法で精製し、免疫グロブリン結合性タンパク質に相当する画分を回収した。
　（３）回収した画分の吸光度を分光光度計で測定し、当該画分に含まれる免疫グロブリン結合性タンパク質を定量した。またＳＤＳ－ＰＡＧＥも実施し、選択した免疫グロブリン結合性タンパク質が純度よく精製されていることを確認した。
　（４）処理に用いたＮａＯＨの濃度を１．０Ｍ（終濃度０．５Ｍ）に、処理時間を１５時間に、それぞれした他は、実施例３（１３）と同様な方法でアルカリ処理後、実施例３（１４）と同様な方法で残存活性を算出し、アルカリ安定性を評価した。
　結果を表３２に示す。ＦｐＬ＿Ｃ３ＫＸ　８ａ（配列番号２７１）およびＦｐＬ＿Ｃ３ＫＸ　８ｂ（配列番号２７４）は、天然型ＦｐＬ＿Ｃ３（配列番号１）よりアルカリ安定性が向上したＦｐＬ＿Ｃ３ＫＸ　７ｄ＿Ａ６９Ｖ（配列番号２４２）と比較しても、アルカリ安定性が向上しているといえる。
Figure JPOXMLDOC01-appb-T000032
　実施例４６　本発明の免疫グロブリン結合性タンパク質への変異導入およびライブラリ作製
　配列番号２７５に記載のアミノ酸配列からなる本発明の免疫グロブリン結合性タンパク質ＦｐＬ＿Ｃ３ＫＸ　７ｅをコードするポリヌクレオチド（配列番号２７６）に、実施例２と同様の方法でエラープローンＰＣＲによりランダムに変異を導入し、ライブラリを作製した。平均変異導入率は１．０％であった。なおＦｐＬ＿Ｃ３ＫＸ　７ｅは、天然型ＦｐＬ＿Ｃ３（配列番号１）に対し、Ｇｌｕ４Ｇｌｙ、Ｐｒｏ６Ｓｅｒ、Ｌｙｓ７Ａｌａ、Ｌｙｓ１３Ａｒｇ、Ｌｙｓ２２Ａｒｇ、Ｌｙｓ２９Ｉｌｅ、Ｌｙｓ２９Ｇｌｕ、Ｌｙｓ４８Ａｒｇ、Ｇｌｕ４９Ａｓｐ、Ａｓｎ５０Ｔｙｒ、Ｔｙｒ５２Ｐｈｅ、Ａｓｎ６２Ｔｙｒ、Ｌｙｓ６７ＡｒｇおよびＡｌａ６９Ｖａｌのアミノ酸置換を導入した免疫グロブリン結合性タンパク質である。
　実施例４７　ＦｐＬ＿Ｃ３ＫＸ　７ｅアミノ酸置換体のスクリーニング
　（１）ＦｐＬ＿Ｃ３ＫＸ　７ｅを発現可能な形質転換体および実施例４６で作製したランダム変異体ライブラリ（形質転換体）を、実施例３（１）から（２）と同様な方法で培養後、遠心操作によって得られた培養上清に対し、実施例４１（２）に記載のアルカリ処理を行なった。
　（２）アルカリ処理を行なった時の免疫グロブリン結合性タンパク質の抗体結合活性を実施例３（４）に記載のＥＬＩＳＡ法にて測定し、アルカリ処理を行なった時の免疫グロブリン結合性タンパク質の抗体結合活性を、アルカリ処理を行わなかった時の免疫グロブリン結合性タンパク質の抗体結合活性で除することで残存活性を算出した。
　（３）約１８００株の形質転換体を評価し、その中からＦｐＬ＿Ｃ３ＫＸ　７ｅ（配列番号２７５）と比較してアルカリ安定性が向上した免疫グロブリン結合性タンパク質を発現する形質転換体を選択した。
　（４）選択した形質転換体を培養し、ＱＩＡｐｒｅｐ　Ｓｐｉｎ　Ｍｉｎｉｐｒｅｐ　ｋｉｔ（ＱＩＡＧＥＮ社製）を用いて発現ベクターを調製した。
　（５）得られた発現ベクターに挿入された免疫グロブリン結合性タンパク質をコードするポリヌクレオチド領域の配列を実施例１（５）に記載の方法によりヌクレオチド配列を解析し、アミノ酸の変異箇所を特定した。
　（６）実施例４０で作製したＦｐＬ＿Ｃ３ＫＸ　７ｅ（配列番号２７５）を発現する形質転換体または（４）で選択した免疫グロブリン結合性タンパク質を発現する形質転換体を、実施例３（８）から（１０）と同様な方法で培養し、実施例３（１１）と同様な方法でタンパク質抽出液を調製した。前記抽出液は遠心分離し、得られた上清をフィルターに通し、清澄化した。
　（７）（６）で清澄化した上清を、参考例２（２）に記載の方法で精製し、免疫グロブリン結合性タンパク質に相当する画分を回収した。
　（８）回収した画分の吸光度を分光光度計で測定し、当該画分に含まれる免疫グロブリン結合性タンパク質を定量した。またＳＤＳ－ＰＡＧＥも実施し、選択した免疫グロブリン結合性タンパク質が純度よく精製されていることを確認した。
　（９）処理に用いたＮａＯＨの濃度を１．０Ｍ（終濃度０．５Ｍ）に、処理時間を１５時間に、それぞれした他は、実施例３（１３）と同様な方法でアルカリ処理後、実施例３（１４）と同様な方法で残存活性を算出し、アルカリ安定性を評価した。
　結果を表３３に示す。配列番号２７５に記載のアミノ酸配列において、少なくともＴｈｒ２Ａｌａ、Ｐｒｏ３Ａｒｇ、Ｇｌｕ５Ａｓｐ、Ｐｒｏ（Ｓｅｒ）６Ｌｅｕ、Ｐｒｏ（Ｓｅｒ）６Ｔｈｒ、Ｌｙｓ（Ａｌａ）７Ｐｒｏ、Ｉｌｅ２３Ｖａｌ、Ｔｈｒ３１Ｍｅｔ、Ｇｌｕ３３Ａｓｐ、Ｇｌｕ３３Ｇｌｙ、Ａｌａ３５Ｔｈｒ、Ｔｈｒ３６Ｓｅｒ、Ａｌａ３７Ｔｈｒ、Ｇｌｕ５２Ｇｌｙ、Ｉｌｅ６６ＶａｌおよびＡｌａ（Ｖａｌ）６９Ｌｅｕより選択される１以上のアミノ酸置換を有した免疫グロブリン結合性タンパク質は、天然型のＦｐＬ＿Ｃ３（配列番号１）よりアルカリ安定性が向上したＦｐＬ＿Ｃ３ＫＸ　７ｅ（配列番号２７５）と比較しても、アルカリ安定性が向上しているといえる。
Figure JPOXMLDOC01-appb-T000033
　実施例４８　ＦｐＬ＿Ｃ３ＫＸ　７ｅアミノ酸置換体の作製
　側鎖の性質が異なるアミノ酸残基への置換、またはドメイン間でアミノ酸配列が異なる位置における他のドメインのアミノ酸残基への置換を導入する方法で取得した、アルカリ安定性が向上したアミノ酸置換である、Ｖａｌ１４Ａｌａ、Ｇｌｙ２１Ａｒｇ、Ｉｌｅ２３Ｔｈｒ、Ａｌａ４１Ａｒｇ、Ａｓｎ４４Ａｓｐ、Ａｓｎ４４Ａｒｇ、Ａｓｎ４４Ｈｉｓ、Ｇｌｕ５２Ｔｙｒ、Ｇｌｙ６０ＡｒｇおよびＩｌｅ６４ＬｅｕのいずれかをＦｐＬ＿Ｃ３ＫＸ　７ｅに対し集積した。
　（１）鋳型ＤＮＡとしてＦｐＬ＿Ｃ３ＫＸ　７ｅ（配列番号２７５）をコードするポリヌクレオチド（配列番号２７６）を含む発現ベクター（以下、「ｐＥＴ－ＦｐＬ＿Ｃ３ＫＸ　７ｅ」とも表記）を、ＰＣＲ　Ｆｏｒｗａｒｄ　ＰｒｉｍｅｒおよびＰＣＲ　Ｒｅｖｅｒｓｅ　Ｐｒｉｍｅｒの組み合わせとして表３４の配列番号に記載の配列からなるオリゴヌクレオチドの組み合わせを、それぞれ用いた他は実施例７（２）（ａ－１）と同様な方法でインバースＰＣＲを行なった。
Figure JPOXMLDOC01-appb-T000034
　（２）（１）で得られたポリヌクレオチドを精製し、制限酵素ＤｐｎＩで処理後、当該制限酵素処理産物を用いて大腸菌ＢＬ２１（ＤＥ３）株を形質転換した。
　（３）得られた形質転換体を実施例７（２）（ａ－３）と同様な方法で培養および発現ベクターの抽出を行ない、当該発現ベクターのヌクレオチド配列の解析を実施例１（５）と同様の方法で行なった。結果、いずれの発現ベクターも（１）で得られたポリヌクレオチドが挿入されていることを確認した。
　実施例４９　ＦｐＬ＿Ｃ３ＫＸ　７ｅアミノ酸置換体のアルカリ安定性評価
　（１）ＦｐＬ＿Ｃ３ＫＸ　７ｅおよび実施例４８で作製したＦｐＬ＿Ｃ３ＫＸ　７ｅアミノ酸置換体（計１０種類）のいずれかを発現する形質転換体を、実施例３（８）から（１０）と同様な方法で培養し、実施例３（１１）に記載の方法でタンパク質抽出液を調製した。前記抽出液は遠心分離し、得られた上清をフィルターに通し、清澄化した。
　（２）（１）で清澄化した上清を、参考例２（２）に記載の方法で精製し、免疫グロブリン結合性タンパク質に相当する画分を回収した。
　（３）回収した画分の吸光度を分光光度計で測定し、当該画分に含まれる免疫グロブリン結合性タンパク質を定量した。またＳＤＳ－ＰＡＧＥも実施し、選択した免疫グロブリン結合性タンパク質が純度よく精製されていることを確認した。
　（４）処理に用いたＮａＯＨの濃度を１．０Ｍ（終濃度０．５Ｍ）に、処理時間を１５時間に、それぞれした他は、実施例３（１３）と同様な方法でアルカリ処理後、実施例３（１４）と同様な方法で残存活性を算出し、アルカリ安定性を評価した。
　結果を表３５に示す。本実施例で評価したＦｐＬ＿Ｃ３ＫＸ　７ｅアミノ酸置換体はいずれも天然型のＦｐＬ＿Ｃ３（配列番号１）よりアルカリ安定性が向上したＦｐＬ＿Ｃ３ＫＸ８ｂ（配列番号２７５）と比較しても、アルカリ安定性が向上しているといえる。
Figure JPOXMLDOC01-appb-T000035
　実施例５０　本発明のタンパク質の多量体化（その１）
　本発明のタンパク質の一態様である、ＦｐＬ＿Ｃ３ＫＸ　７ｅ（配列番号２７５）の多量体を、以下に示す方法で作製した。
　（１）ＦｐＬ＿Ｃ３ＫＸ　７ｅ多量体発現ベクターの作製
　（１－１）ＦｐＬ＿Ｃ３ＫＸ　７ｅ多量体として配列番号３２６に記載のアミノ酸配列からなるポリペプチド（（ＦｐＬ＿Ｃ３ＫＸ７ｅ）４－ＩＴ－６Ｈ３Ｋと命名）を設計した。なお当該ポリペプチドはＦｐＬ＿Ｃ３ＫＸ　７ｅ（配列番号２７５）を４つ直結し、かつそのＣ末端側に不溶性担体への固定化率を向上させるためのオリゴペプチド（ＷＯ２０１７／０６９１５８号の配列番号３６の２９７番目から３１９番目までのアミノ酸配列からなるオリゴペプチド、ＩＴ、配列番号３２４）、精製用タグであるヒスチジンタグ（６Ｈ、配列番号３２５）、および不溶性担体への固定化率を向上させるためのリジン３残基（３Ｋ、以下「リジンタグ」とも表記）を付加したポリペプチドである。
　（１－２）（１－１）で設計した（ＦｐＬ＿Ｃ３ＫＸ　７ｅ）４－ＩＴ－６Ｈ３Ｋ（配列番号３２６）をコードするポリヌクレオチド（配列番号３２７）を設計した。なお配列番号３２７に記載の配列からなるポリヌクレオチドのうち、１番目から２１０番目まで、２１１番目から４２０番目まで、４２１番目から６３０番目まで、および６３１番目から８４０番目までが、ＦｐＬ＿Ｃ３ＫＸ　７ｅ（配列番号２７５）をコードするポリヌクレオチドであり、８４１番目から９０９番目までは配列番号３２４に記載のアミノ酸配列からなるオリゴペプチド（ＩＴ）をコードするポリヌクレオチド（配列番号３２８）であり、９１０番目から９２７番目まではヒスチジンタグ（６Ｈ、配列番号３２５）をコードするオリゴヌクレオチドであり、９２８番目から９３６番目まではリジンタグ（３Ｋ）をコードするオリゴヌクレオチドであり、９３７番目から９３９番目は終止コドンである。また配列番号３２７のうち、ＦｐＬ＿Ｃ３ＫＸ　７ｅ（配列番号２７５）をコードするポリヌクレオチドの配列は原則配列番号２７６を用いているが、配列番号３２７の１８７番目から２１０番目まで、４２１番目から４４４番目まで、および６０７番目から６３０番目までは、クローニングのしやすさから、配列番号２７６とは異なるコドンを用いて配列番号２７５から変換している。
　（１－３）（１－２）で設計した、配列番号３２７に記載の配列からなるポリヌクレオチドを合成するためのプライマー（オリゴヌクレオチド）を設計し、合成した。具体的には、
ｐＥＴ２６ｂベクターのＮｃｏＩの制限酵素サイト（ＣＣＡＴＧＧ）および配列番号３２７の１番目から２３１番目までの配列からなるポリヌクレオチド断片を作製するために配列番号３２９および配列番号３３０に記載の配列からなるプライマーを、
配列番号３２７の１８７番目から４４４番目までの配列からなるポリヌクレオチド断片を作製するために配列番号３３１および配列番号３３２に記載の配列からなるプライマーを、
配列番号３２７の４２１番目から６３０番目までの配列からなるポリヌクレオチド断片を作製するために配列番号３３３および配列番号３３４に記載の配列からなるプライマーを、
配列番号３２７の６０７番目から８９４番目までの配列からなるポリヌクレオチド断片を作製するために配列番号３３５および配列番号３３６に記載の配列からなるプライマーを、
配列番号３２７の８７１番目から９３６番目までの配列からなるポリヌクレオチド断片を作製するために配列番号３３７および配列番号３３８に記載の配列からなるプライマーを、
インバースＰＣＲ法により配列番号３２７の９１６番目から９３６番目およびｐＥＴ２６ｂベクターのＨｉｎｄＩＩＩの制限酵素サイト（ＡＡＧＧＴＴ）下流とｐＥＴ２６ｂのＮｃｏＩの制限酵素サイトおよびその上流を含むｐＥＴ２６ｂベクターを作製するために配列番号３３９および配列番号３４０に記載の配列からなるプライマーを、
それぞれ設計し、合成した。
　（１－４）表３６に示す組成からなる反応液を調製後、当該反応液を９８℃で１０秒間の第１ステップ、５０℃で５秒間の第２ステップ、６８℃で４０秒間の第３ステップを１サイクルとする反応を３０サイクル繰り返すことでＰＣＲを実施した。なお表３６における、鋳型ＤＮＡ／Ｆｏｒｗａｒｄ　ｐｒｉｍｅｒ／Ｒｅｖｅｒｓｅ　ｐｒｉｍｅｒの組み合わせは、表３７の＜１＞から＜５＞に示す組み合わせのいずれかである。
Figure JPOXMLDOC01-appb-T000036
Figure JPOXMLDOC01-appb-T000037
　（１－５）前記＜１＞から＜５＞の組み合わせを用い、それぞれ得られたＰＣＲ産物（ポリヌクレオチド）計５種類を精製後、各ポリヌクレオチドを０．０５ｐｍｏｌずつ含むＴＥ緩衝液（１ｍＭ　ＥＤＴＡを含む１０ｍＭ　Ｔｒｉｓ緩衝液）（ｐＨ８．０）を調製した。さらに配列番号３３７および配列番号３３８に記載の配列からなるポリヌクレオチドを０．０５ｐｍｏｌずつ添加後、ＮＥＢｕｉｌｄｅｒ　ＨｉＦｉ　ＤＮＡ　Ａｓｓｅｍｂｌｙ　Ｍａｓｔｅｒ　Ｍｉｘ（ニュー・イングランド・バイオラボ社製）を用いたギブソンアッセンブリ（Ｇｉｂｓｏｎ　Ａｓｓｅｍｂｌｙ）反応により、これらポリヌクレオチドを連結させた。
　（１－６）（１－５）の反応後の連結産物を用いて大腸菌ＢＬ２１（ＤＥ３）株を形質転換し、５０μｇ／ｍＬのカナマイシンを含むＬＢプレート培地で培養（３７℃、１６時間）した。
　（１－７）表３８に示す組成からなる反応液を調製後、（１－６）で得られた形質転換体を添加し、（１－４）と同条件でコロニーＰＣＲを行なった。コロニーＰＣＲの結果、１０００から１２００塩基対程度のＰＣＲ産物の増幅が確認できた形質転換体（遺伝子組換え大腸菌）を選択し、５０μｇ／ｍＬのカナマイシンを含むＬＢ培地にて培養後、ＱＩＡｐｒｅｐ　Ｓｐｉｎ　Ｍｉｎｉｐｒｅｐ　ｋｉｔ（ＱＩＡＧＥＮ社製）による精製により、免疫グロブリン結合性タンパク質（ＦｐＬ＿Ｃ３ＫＸ　７ｅ）４－ＩＴ－６Ｈ３Ｋ（配列番号３２６）を発現可能なベクター（ｐＥＴ－（ＦｐＬ＿Ｃ３ＫＸ　７ｅ）４－ＩＴ－６Ｈ３Ｋと命名）を取得した。
Figure JPOXMLDOC01-appb-T000038
　（１－８）（１－７）で取得した発現ベクターｐＥＴ－（ＦｐＬ＿Ｃ３ＫＸ　７ｅ）４－ＩＴ－６Ｈ３Ｋについて実施例１（５）と同様な方法でヌクレオチド配列を解析した。配列解析の結果、前記発現ベクターに、配列番号３２７に記載の配列からなるポリヌクレオチドが挿入されていることを確認した。
　（２）（ＦｐＬ＿Ｃ３ＫＸ　７ｅ）４－ＩＴ－６Ｈ３Ｋの調製
　（２－１）５０μｇ／ｍＬのカナマイシンを含む２×ＹＴ液体培地（トリプトン１．６％（ｗ／ｖ）、酵母エキス１％（ｗ／ｖ）、塩化ナトリウム０．５％（ｗ／ｖ））２０ｍＬに、（１）で作製したｐＥＴ－（ＦｐＬ＿Ｃ３ＫＸ　７ｅ）４－ＩＴ－６Ｈ３Ｋを含む遺伝子組換え大腸菌を接種し、前培養した（３０℃、１６時間）。
　（２－２）前培養後の培養液１０ｍＬを５０μｇ／ｍＬのカナマイシンを含む２×ＹＴ液体培地１Ｌに接種し３７℃で２時間から３時間培養後、０．５ＭのＩＰＴＧを２００μＬ添加し、さらに２０℃で終夜振とう培養した。
　（２－３）培養後の培養液を遠心分離し、培養菌体を回収した（湿重量で８ｇ）。当該培養菌体のうち湿重量で２ｇをＢｕｇＢｕｓｔｅｒ　Ｐｒｏｔｅｉｎ　Ｅｘｔｒａｃｔｉｏｎ　Ｒｅａｇｅｎｔ（メルクミリポア社製）を用いて溶菌し、遠心分離により取得した上清をフィルターに通し、清澄化した。
　（２－４）あらかじめ０．５Ｍの塩化ナトリウムおよび０．０２Ｍのイミダゾールを含む０．０２Ｍ　Ｔｒｉｓ緩衝液（ｐＨ７．５）（以下、単に「平衡化液」とも表記）で平衡化したＮｉ　Ｓｅｐｈａｒｏｓｅ　６　Ｆａｓｔ　Ｆｌｏｗ（Ｃｙｔｉｖａ社製）を充填したカラムに、（２－３）で清澄化した上清を添加し、前記カラムに充填した担体の１０倍量の平衡化液で洗浄後、０．５Ｍの塩化ナトリウムおよび０．５Ｍのイミダゾールを含む０．０２Ｍ　Ｔｒｉｓ緩衝液（ｐＨ７．５）を通液し、免疫グロブリン結合性タンパク質に相当する画分を回収した。
　（２－５）回収した画分の吸光度を分光光度計により測定し、当該画分に含まれるタンパク質量を定量した。またＳＤＳ－ＰＡＧＥも実施し、免疫グロブリン結合性タンパク質が純度よく精製されていることを確認した。
　実施例５１　本発明のタンパク質の多量体化（その２）
　本発明のタンパク質の別の態様である、ＦｐＬ＿Ｃ３ＫＸ　６ｃ（配列番号３４１）の多量体を、以下に示す方法で作製した。なおＦｐＬ＿Ｃ３ＫＸ　６ｃのアミノ酸配列（配列番号３４１）はＦｐＬ＿Ｃ３ＫＸ　７ｅのアミノ酸配列（配列番号２７５）の５０番目にあるチロシン残基を天然型ＦｐＬ＿Ｃ３（配列番号１）のアミノ酸残基であるアスパラギン残基に戻したアミノ酸配列である。
　（１）ＦｐＬ＿Ｃ３ＫＸ　６ｃ多量体として配列番号３４３に記載のアミノ酸配列からなるポリペプチド（（ＦｐＬ＿Ｃ３ＫＸ　６ｃ）４－ＩＴ－６Ｈ３Ｋと命名）を設計した。なお当該ポリペプチドはＦｐＬ＿Ｃ３ＫＸ　６ｃ（配列番号３４１）を４つ直結し、かつそのＣ末端側に不溶性担体への固定化率を向上させるためのオリゴペプチド（ＩＴ、配列番号３２４）、精製用タグであるヒスチジンタグ（６Ｈ、配列番号３２５）、および不溶性担体への固定化率を向上させるためのリジンタグ（３Ｋ）を付加したポリペプチドである。
　（２）実施例５０（１－２）と同様な方法で、（１）で設計した配列番号３４３に記載のアミノ酸配列からなるポリペプチドをコードするポリヌクレオチドを設計した（配列番号３４４）。なおＦｐＬ＿Ｃ３ＫＸ　６ｃ（配列番号３４１）をコードするポリヌクレオチドの配列は、原則配列番号３４２を用いている。
　（３）鋳型ＤＮＡ／Ｆｏｒｗａｒｄ　ｐｒｉｍｅｒ／Ｒｅｖｅｒｓｅ　ｐｒｉｍｅｒの組み合わせとして、表３９の＜５＞から＜９＞に示す組み合わせのいずれかを用いた他は、実施例５０（１－４）と同様の方法でＰＣＲを実施した。
Figure JPOXMLDOC01-appb-T000039
　（５）前記＜５＞から＜９＞の組み合わせを用い、それぞれ得られたＰＣＲ産物（ポリヌクレオチド）５種類を精製後、実施例５０（１－５）と同様の方法でギブソンアッセンブリ反応を行ない、これらポリヌクレオチドの連結を行なった。
　（６）（５）の反応後の連結産物を用いて実施例５０（１－６）と同様な方法で大腸菌を形質転換し培養した。
　（７）実施例５０（１－７）と同様な方法でコロニーＰＣＲ後、実施例５０（１－８）と同様な方法で形質転換体の選択、当該選択した形質転換体の培養およびプラスミド抽出を行ない、免疫グロブリン結合性タンパク質（ＦｐＬ＿Ｃ３ＫＸ　６ｃ）４－ＩＴ－６Ｈ３Ｋ（配列番号３４３）を発現可能なベクター（ｐＥＴ－（ＦｐＬ＿Ｃ３ＫＸ　６ｃ）４－ＩＴ－６Ｈ３Ｋと命名）を取得した。
　（８）（７）で取得した発現ベクターｐＥＴ－（ＦｐＬ＿Ｃ３ＫＸ　６ｃ）４－ＩＴ－６Ｈ３Ｋについて実施例１（５）と同様な方法でヌクレオチド配列を解析した。配列解析の結果、前記発現ベクターに、配列番号３４４に記載の配列からなるポリヌクレオチドが挿入されていることを確認した。
　実施例５２　免疫グロブリン吸着剤の作製
　（１）実施例５０で調製した（ＦｐＬ＿Ｃ３ＫＸ　７ｅ）４－ＩＴ－６Ｈ３Ｋ（配列番号３２６）（配列番号３２６）を含む画分または実施例５１で調製した（ＦｐＬ＿Ｃ３ＫＸ　６ｃ）４－ＩＴ－６Ｈ３Ｋ（配列番号３４３）を含む画分を、Ａｍｉｃｏｎ　Ｕｌｔｒａ（メルクミリポア社製）により元の体積の１０分の１量まで濃縮後、当該濃縮溶液の１０倍量のリン酸ナトリウム緩衝液を加えてＡｍｉｃｏｎ　Ｕｌｔｒａ（メルクミリポア社製）により元の体積の１０分の１量まで濃縮することで、前記タンパク質溶液の濃縮および緩衝液置換を行なった。
　（２）活性基としてホルミル基を有した不溶性担体である、ＴＯＹＯＰＥＡＲＬ　ＡＦ－Ｆｏｒｍｙｌ－６５０（東ソー社製）を純水に置換後、５０％（ｖ／ｖ）スラリーを調製した。調製した５０％（ｖ／ｖ）スラリーを、ミニバイオスピンカラム（ＢＩＯＲＡＤ社製）に１００μＬ添加した。
　（３）実施例５０で調製した（ＦｐＬ＿Ｃ３ＫＸ　７ｅ）４－ＩＴ－６Ｈ３Ｋの濃縮液または実施例５１で調製した（ＦｐＬ＿Ｃ３ＫＸ　６ｃ）４－ＩＴ－６Ｈ３Ｋ（配列番号３４３）の濃縮液を、終濃度が１０ｇ／Ｌとなるよう、不溶性担体を添加したミニバイオスピンカラム（ＢＩＯＲＡＤ社製）に添加後、２５℃で振とうすることで、当該カラム内に入っている不溶性担体とタンパク質とをシッフ塩基（Ｓｃｈｉｆｆ　ｂａｓｅ）形成により結合した。
　（４）１Ｍ水素化ホウ素ナトリウム水溶液を適量加え、室温で２時間振とうすることで、残存シッフ塩基を還元し、免疫グロブリン吸着剤を作製した。作製した吸着剤は水洗後、２０％（ｖ／ｖ）エタノールに置換し保存した。
　実施例５３　免疫グロブリン吸着剤のアルカリ安定性評価
　（１）実施例５２で作製した、免疫グロブリン吸着剤を充填したカラムに、０．１Ｍグリシン塩酸溶液（ｐＨ２．０）（以下、酸性溶液とも表記）を通液後、０．１５Ｍ塩化ナトリウムを含む０．０２Ｍ　Ｔｒｉｓ緩衝液（ｐＨ７．５）（以下、「洗浄緩衝液Ｃ」とも表記）を通液することで、前記カラムを洗浄した。
　（２）洗浄緩衝液Ｃで６０ｍｇ／ｍＬに希釈した免疫グロブリン溶液（日本血液製剤機構社製）を洗浄後の前記カラムに添加後、恒温振とう培養機（ＴＡＩＴＥＣ社製）を用いて２５℃、１０００ｒｐｍで２時間振とうすることで、免疫グロブリンを不溶性担体に吸着させた。
　（３）洗浄緩衝液Ｃを通液することで未吸着の免疫グロブリンを洗浄後、酸性溶液を通液し、吸着剤に吸着した免疫グロブリンを溶出させた。溶出液の吸光度（波長２８０ｎｍ）を分光光度計で測定し、当該溶出液に含まれる免疫グロブリンの量から、吸着剤の静的吸着量を算出した。
　（４）洗浄緩衝液Ｃを通液し免疫グロブリン吸着剤を平衡化後、０．５Ｍの水酸化ナトリウム溶液を通液し、２５℃で１７時間静置することでアルカリ処理を行なった。アルカリ処理後の免疫グロブリン吸着剤は洗浄緩衝液Ｃを通液し中和させた。
　（５）（２）および（３）と同様の方法で吸着剤の静的吸着量を算出し、アルカリ処理前後の吸着量の割合（残存活性）を算出しアルカリ安定性を評価した。
　結果を表４０に示す。多量体を構成する本発明のタンパク質をＦｐＬ＿Ｃ３ＫＸ　７ｅ（配列番号２７５）からＦｐＬ＿Ｃ３ＫＸ　６ｃ（配列番号３４１）に替えるとアルカリ安定性が大きく低下した（（ＦｐＬ＿Ｃ３ＫＸ７ｅ）４－ＩＴ－６Ｈ３Ｋ（配列番号３２６）：６６％、（ＦｐＬ＿Ｃ３ＫＸ　６ｃ）４－ＩＴ－６Ｈ３Ｋ（配列番号３４３）：１５％）。ＦｐＬ＿Ｃ３ＫＸ　７ｅとＦｐＬ＿Ｃ３ＫＸ　６ｃとのアミノ酸配列の違いは、５０番目の位置のみ（ＦｐＬ＿Ｃ３ＫＸ　７ｅ：チロシン残基、ＦｐＬ＿Ｃ３ＫＸ　６ｃ：アスパラギン残基（天然型ＦｐＬ＿Ｃ３と同じ））であることから、Ａｓｎ５０Ｔｙｒのアミノ酸置換がアルカリ安定性の向上に特に貢献していることがわかる。
Figure JPOXMLDOC01-appb-T000040
　実施例５４　Ｐｒｏｔｅｉｎ　Ｌ免疫グロブリン結合性ドメインＣ４（ＦｐＬ＿Ｃ４）アミノ酸置換体の作製
　（１）ＦｐＬ＿Ｃ４ＫＲの調製
　（１－１）５０μｇ／ｍＬのカナマイシンを含む２×ＹＴ液体培地２ｍＬに、参考例１（２）（δ）で作製したｐＥＴ－ＦｐＬ＿Ｃ４ＫＲを含む形質転換体を接種し、前培養した（３０℃、１６時間）。
　（１－２）前培養後の培養液２００μＬを、５０μｇ／ｍＬのカナマイシンを含む２×ＹＴ液体培地２０ｍＬに接種し、３７℃で１．５時間から２時間培養後、０．０５ＭのＩＰＴＧを４μＬ加えて、さらに２０℃で終夜振とう培養した。
　（１－３）培養終了後、遠心分離により培養菌体を回収し、ＢｕｇＢｕｓｔｅｒ　Ｐｒｏｔｅｉｎ　Ｅｘｔｒａｃｔｉｏｎ　Ｒｅａｇｅｎｔ（メルクミリポア社製）を用いてタンパク質抽出液を調製した。前記抽出液は遠心分離し、得られた上清をフィルターに通し、清澄化した。
　（１－４）あらかじめ洗浄緩衝液Ｂ（０．５ＭのＮａＣｌと０．０２Ｍイミダゾールとを含む０．０５Ｍトリス緩衝液（ｐＨ７．５））で平衡化したＮｉ－ＮＴＡ　Ｓｅｐｈａｒｏｓｅ　６　Ｆａｓｔ　Ｆｌｏｗ（Ｃｙｔｉｖａ社製）を充填したカラムに、（１－３）で清澄化した上清を添加し、前記カラムに充填した担体の１０倍量の洗浄緩衝液Ｂで洗浄後、０．５ＭのＮａＣｌと０．５Ｍイミダゾールとを含む０．０５Ｍトリス緩衝液（ｐＨ７．５）を通液することで、ＦｐＬ＿Ｃ４ＫＲに相当する画分を回収した。
　（１－５）回収した画分の吸光度を分光光度計で測定し、当該画分に含まれるＦｐＬ＿Ｃ４ＫＲを定量した。またＳＤＳ－ＰＡＧＥも実施し、ＦｐＬ＿Ｃ４ＫＲ（配列番号１１７）が純度よく精製されていることを確認した。
　（２）ＦｐＬ＿Ｃ４ＫＲへの変異導入およびライブラリ作製
　（２－１）参考例１（２）（δ）で作製したｐＥＴ－ＦｐＬ＿Ｃ４ＫＲを鋳型として、７番目、１３番目、２２番目および２９番目のアミノ酸残基に対する飽和置換体ライブラリを作製した。プライマーは、実施例１１（１）と同様、２２ｃ－Ｔｒｉｃｋ法に倣い、変異導入箇所に適切な混合塩基を配置し、変異導入箇所を中心としたインバースＰＣＲができるように設計した（配列番号１２４から１２９、３４５から３５６、および１３０から１３５）。これらのプライマーを一箇所の置換につき６本一組として、表７および表４１の組成で混合し、ＰＣＲ　Ｐｒｉｍｅｒ混合液（Ｆｏｒｗａｒｄ／Ｒｅｖｅｒｓｅ　ｐｒｉｍｅｒ　ｍｉｘ）を調製した。
Figure JPOXMLDOC01-appb-T000041
　（２－２）参考例１（２）（δ）で作製したｐＥＴ－ＦｐＬ＿Ｃ４ＫＲを鋳型としてインバースＰＣＲによる部位特異的変異導入を行なった。インバースＰＣＲは表９に示す組成の反応液を調製後、当該反応液を９８℃で２分間熱処理し、９５℃で１０秒間の第１ステップ、５０℃で５秒間の第２ステップ、７２℃で６分の第３ステップを１サイクルとする反応を３０サイクル行ない、最後に７２℃で７分間熱処理することで行なった。
　（２－３）得られたＰＣＲ産物を精製後、当該精製物を用いて大腸菌ＢＬ２１（ＤＥ３）株を形質転換し、５０μｇ／ｍＬのカナマイシンを含むＬＢプレート培地で培養（３７℃、１６時間）後、プレート上に形成したコロニーを飽和置換体ライブラリとした。
　実施例５５　ＦｐＬ＿Ｃ４ＫＲアミノ酸置換体のスクリーニング
　（１）参考例１（２）（δ）で作製したＦｐＬ＿Ｃ４ＫＲを発現可能な形質転換体、および実施例５４（２）で作製した飽和置換体ライブラリー（形質転換体）を、５０μｇ／ｍＬのカナマイシンを含む２×ＹＴ液体培地２５０μＬに接種し、９６ディープウェルプレートを用いて３７℃で終夜振とう培養した。
　（２）培養後、５０μｇ／ｍＬのカナマイシン、０．３％（ｗ／ｖ）のグリシン、０．０１ｍＭのＩＰＴＧを含む２×ＹＴ液体培地５００μＬに５μＬの培養液を植え継ぎ、９６ディープウェルプレートを用いてさらに２０℃で終夜振とう培養した。
　（３）培養後、遠心操作によって得られた培養上清と１．０Ｍ　ＮａＯＨとを等量混合し、３８℃で１５分間アルカリ処理を行なった。
　（４）アルカリ処理を行なった時の免疫グロブリン結合性タンパク質の抗体結合活性を実施例３（４）に示すＥＬＩＳＡ法にて測定し、（３）のアルカリ処理を行なった時の免疫グロブリン結合性タンパク質の抗体結合活性を、（３）のアルカリ処理を行なわなかった時の免疫グロブリン結合性タンパク質の抗体結合活性で除することで残存活性を算出した。
　（５）約５００株の形質転換体を評価し、その中からＦｐＬ＿Ｃ４ＫＲ（配列番号１１７）と比較してアルカリ安定性が向上した免疫グロブリン結合性タンパク質を発現する形質転換体を選択した。
　（６）（５）で選択した形質転換体を培養し、ＱＩＡｐｒｅｐ　Ｓｐｉｎ　Ｍｉｎｉｐｒｅｐ　ｋｉｔ（ＱＩＡＧＥＮ社製）を用いて発現ベクターを調製した。
　（７）得られた発現ベクターに挿入された免疫グロブリン結合性タンパク質をコードするポリヌクレオチド領域の配列を実施例１（５）に記載の方法によりヌクレオチド配列を解析し、アミノ酸置換箇所を特定した。
　（８）（５）で選択した免疫グロブリン結合性タンパク質を発現する形質転換体を、実施例５４（１－１）から（１－２）と同様な方法で培養し、実施例５４（１－３）と同様の方法でタンパク質抽出液を調製し、清澄化した。
　（９）（８）で清澄化したタンパク質抽出液を、実施例５４（１－４）に記載の方法で精製し、免疫グロブリン結合性タンパク質に相当する画分を回収した。
　（１０）回収した画分の吸光度を分光光度計で測定し、当該画分に含まれる免疫グロブリン結合性タンパク質を定量した。またＳＤＳ－ＰＡＧＥも実施し、選択した免疫グロブリン結合性タンパク質が純度よく精製されていることを確認した。
　実施例５６　本発明のタンパク質の免疫グロブリン溶出ｐＨ評価
　実施例１で作製したＦｐＬ＿Ｃ３（配列番号１）、参考例１（２）（δ）で作製したＦｐＬ＿Ｃ４ＫＲ（配列番号１１７）または実施例５５で取得したＦｐＬ＿Ｃ４ＫＲアミノ酸置換体に結合した免疫グロブリンを溶出可能なｐＨ（以下、単に「溶出ｐＨ」とも表記）を以下の方法で測定した。
　（１）免疫グロブリンを固定化した不溶性担体であるＩｇＧ　Ｓｅｐｈａｒｏｓｅ　６　Ｆａｓｔ　Ｆｌｏｗ（Ｃｙｔｉｖａ社製）の５０％（ｗ／ｖ）水スラリーを調製し、当該スラリー０．５ｍＬをＴｒｉｃｏｒｎ　５／５０カラム（内径５ｍｍ×長さ５０ｍｍ：Ｃｙｔｉｖａ社製）に入れた後、ポンプで純水を送液することで、ＩｇＧ　Ｓｅｐｈａｒｏｓｅ充填カラムを作製した。
　（２）（１）で作製したＩｇＧ　Ｓｅｐｈａｒｏｓｅ充填カラムをＡＫＴＡ　ＡＶＡＮＴ　２５（Ｃｙｔｉｖａ社製）に設置した。前記カラムを０．１Ｍクエン酸緩衝液（ｐＨ６．５）（以下Ａ液）で平衡化し、０．１Ｍクエン酸緩衝液（ｐＨ２．２）（以下Ｂ液）で洗浄後、Ａ液で再度平衡化した。
　（３）Ａ液で１ｇ／Ｌに調製した各免疫グロブリン結合性タンパク質溶液１００μＬを、ＩｇＧ　Ｓｅｐｈａｒｏｓｅ充填カラムにアプライし、Ａ液を５カラム体積分送液後、１０分間でＢ液が０％から１００％となるリニアグラジエント溶出でＦｐＬ＿Ｃ３を溶出させた。得られたクロマトグラムを解析し、最も吸光度が高くなる溶出位置でのｐＨを溶出ｐＨとした。
　結果を表４２に示す。配列番号１１７に記載のアミノ酸配列において、少なくともＬｙｓ（Ａｒｇ）７Ｇｌｎ（この表記は配列番号１の７番目のリジンに相当するアミノ酸残基（配列番号５では７番目のリジン）が一旦アルギニンに置換後、さらにグルタミンに置換されていることを表す；以下、他のアミノ酸置換についても同様に解釈するものとする）、Ｌｙｓ（Ａｒｇ）１３Ｖａｌ、Ｌｙｓ（Ａｒｇ）２２Ｔｈｒ、Ｌｙｓ（Ａｒｇ）２９Ｐｒｏ、Ｌｙｓ（Ａｒｇ）２９ＶａｌおよびＬｙｓ（Ａｒｇ）２９Ｉｌｅより選択される１つ以上のアミノ酸置換を有した免疫グロブリン結合性タンパク質は、天然型ＦｐＬ＿Ｃ３（配列番号１）やＦｐＬ＿Ｃ４ＫＲ（配列番号１１７）と比較し溶出ｐＨが増大している、すなわち免疫グロブリン結合性タンパク質に結合した免疫グロブリン（抗体）をより温和なｐＨ条件（すなわち中性に近い条件）で溶出できる、といえる。
Figure JPOXMLDOC01-appb-T000042
　実施例５７　ＦｐＬ＿Ｃ３ＫＸ　７ｄアミノ酸置換体の設計と作製
　側鎖の性質が異なるアミノ酸残基への置換、またはドメイン間でアミノ酸配列が異なる位置における他のドメインのアミノ酸残基への置換を導入する方法で取得した、酸溶出性が向上したアミノ酸置換である、Ｐｒｏ（Ｓｅｒ）６Ａｌａ、Ｇｌｕ８Ｇｌｙ、Ｇｌｕ８Ａｒｇ、Ｇｌｙ２１Ａｒｇ、Ｉｌｅ２３Ｐｈｅ、Ｉｌｅ２３Ｌｅｕ、Ｇｌｕ３３Ｖａｌ、Ｌｙｓ（Ａｒｇ，Ｇｌｕ）３８Ｈｉｓ、Ｌｙｓ（Ａｒｇ，Ｇｌｕ）３８Ｌｅｕ、Ａｓｎ４４Ｈｉｓ、Ａｓｎ４４Ａｒｇ、Ｌｙｓ（Ａｒｇ）４８Ｈｉｓ、Ａｓｎ（Ｔｙｒ）５０Ｍｅｔ、Ｇｌｕ（Ｇｌｙ，Ａｓｐ）５２Ｔｙｒ、Ｔｙｒ（Ｐｈｅ）５３ＳｅｒのいずれかをＦｐＬ＿Ｃ３ＫＸ　７ｄ（配列番号２４０）に対し集積した。
　（１）鋳型ＤＮＡとしてＦｐＬ＿Ｃ３ＫＸ　７ｄ（配列番号２４０）をコードするポリヌクレオチド（配列番号２４１）を含む発現ベクターｐＥＴ－ＦｐＬ＿Ｃ３ＫＸ　７ｄを、ＰＣＲ　Ｆｏｒｗａｒｄ　ＰｒｉｍｅｒおよびＰＣＲ　Ｒｅｖｅｒｓｅ　Ｐｒｉｍｅｒの組み合わせとして表４３の配列番号に記載の配列からなるオリゴヌクレオチドの組み合わせを、それぞれ用いた他は実施例７（２）（ａ－１）と同様な方法でインバースＰＣＲを行なった。
Figure JPOXMLDOC01-appb-T000043
　（２）（１）で得られたポリヌクレオチドを精製し、制限酵素ＤｐｎＩで処理後、制限酵素より産物を用いて大腸菌ＢＬ２１（ＤＥ３）株を形質転換した。
　（３）得られた形質転換体を実施例１（４）と同様な方法で培養および発現ベクターの抽出を行ない、当該発現ベクターのヌクレオチド配列の解析を実施例１（５）と同様の方法で行なった。結果、いずれの発現ベクターも（１）で得られたポリヌクレオチドが挿入されていることを確認した。
　実施例５８　ＦｐＬ＿Ｃ３ＫＸ　７ｄアミノ酸置換体の酸溶出性評価
　（１）ＦｐＬ＿Ｃ３ＫＸ　７ｄ（配列番号２４０）および実施例５７で作製したＦｐＬ＿Ｃ３ＫＸ　７ｄアミノ酸置換体（計１５種類）のいずれかを発現する形質転換体を、実施例５４（１－１）から（１－２）と同様な方法で培養し、実施例５４（１－３）に記載の方法でタンパク質抽出液を調製した。前記抽出液は遠心分離し、得られた上清をフィルターに通し、清澄化した。
　（２）（１）で清澄化した上清を、実施例５４（１－４）に記載の方法で精製し、免疫グロブリン結合性タンパク質に相当する画分を回収した。
　（３）回収した画分の吸光度を分光光度計で測定し、当該画分に含まれる免疫グロブリン結合性タンパク質を定量した。またＳＤＳ－ＰＡＧＥも実施し、選択した免疫グロブリン結合性タンパク質が純度よく精製されていることを確認した。
　（４）各タンパク質の濃度が等しくなるよう、ＴＢＳを用いて希釈した。希釈液を二等分し、実施例３（４）に記載のＥＬＩＳＡ法（酸溶出性評価）によって、一方には０．０５Ｍクエン酸ナトリウム緩衝液（ｐＨ３．０）（酸処理）を、もう一方にはＴＢＳ（酸未処理）を添加した際の抗体結合活性を測定した。酸処理した免疫グロブリン結合性タンパク質の抗体結合活性を、酸未処理の免疫グロブリン結合性タンパク質の抗体結合活性で除することで残存活性を算出した。１より残存活性を減ずることで溶出率を算出し、酸溶出性を評価した。
　結果を表４４に示す。本実施例で評価したＦｐＬ＿Ｃ３ＫＸ　７ｄアミノ酸置換体はいずれも天然型のＦｐＬ＿Ｃ３（配列番号１）よりアルカリ安定性が向上したＦｐＬ＿Ｃ３ＫＸ　７ｄ（配列番号２４０）と比較し、溶出率が高くなっており、これら変異型免疫グロブリン結合性タンパク質の酸による溶出性が向上していることが確認された。
Figure JPOXMLDOC01-appb-T000044
　実施例５９　本発明の免疫グロブリン結合性タンパク質へのアミノ酸置換の集積
　（１）アミノ酸置換集積体の設計
　実施例４３および４８で明らかになった免疫グロブリン結合性タンパク質のアルカリ安定性向上に関与するアミノ酸置換、および／または実施例５８で明らかになった免疫グロブリン結合性タンパク質の免疫グロブリン溶出性向上に関与するアミノ酸置換を、ＦｐＬ＿Ｃ３ＫＸ　７ｅ（配列番号２７５）に対し集積した。具体的には、以下の＜ｃ＞から＜ｉ＞に示す７種類の免疫グロブリン結合性タンパク質を設計し、作製した。
＜ｃ＞ＦｐＬ＿Ｃ３ＫＸ　７ｅに対し、Ｉｌｅ２３ＡｒｇおよびＡｓｎ４４Ａｒｇのアミノ酸置換を導入したタンパク質（配列番号４０８、ＦｐＬ＿Ｃ３ＫＸ　９ａと命名）
＜ｄ＞ＦｐＬ＿Ｃ３ＫＸ　７ｅに対し、Ｉｌｅ２３ＡｒｇおよびＡｓｎ４４Ｈｉｓのアミノ酸置換を導入したタンパク質（配列番号４０９、ＦｐＬ＿Ｃ３ＫＸ　９ｂと命名）
＜ｅ＞ＦｐＬ＿Ｃ３ＫＸ　７ｅに対し、Ｉｌｅ２３ＡｒｇおよびＩｌｅ６４Ｌｅｕのアミノ酸置換を導入したタンパク質（配列番号４１０、ＦｐＬ＿Ｃ３ＫＸ　９ｃと命名）
＜ｆ＞ＦｐＬ＿Ｃ３ＫＸ　７ｅに対し、Ａｓｎ４４ＡｒｇおよびＩｌｅ６４Ｌｅｕのアミノ酸置換を導入したタンパク質（配列番号４１１、ＦｐＬ＿Ｃ３ＫＸ　９ｄと命名）
＜ｇ＞ＦｐＬ＿Ｃ３ＫＸ　７ｅに対し、Ａｓｎ４４ＨｉｓおよびＩｌｅ６４Ｌｅｕのアミノ酸置換を導入したタンパク質（配列番号４１２、ＦｐＬ＿Ｃ３ＫＸ　９ｅと命名）
＜ｈ＞ＦｐＬ＿Ｃ３ＫＸ　７ｅに対し、Ｉｌｅ２３Ａｒｇ、Ａｓｎ４４Ａｒｇ、Ｌｙｓ（Ａｒｇ）４８ＨｉｓおよびＩｌｅ６４Ｌｅｕのアミノ酸置換を導入したタンパク質（配列番号４１３、ＦｐＬ＿Ｃ３ＫＸ　１０ａと命名）
＜ｉ＞ＦｐＬ＿Ｃ３ＫＸ　７ｅに対し、Ｉｌｅ２３Ａｒｇ、Ａｓｎ４４Ｈｉｓ、Ｌｙｓ（Ａｒｇ）４８ＨｉｓおよびＩｌｅ６４Ｌｅｕのアミノ酸置換を導入したタンパク質（配列番号４１４、ＦｐＬ＿Ｃ３ＫＸ　１０ｂと命名）
　（２）ＦｐＬ＿Ｃ３ＫＸ　７ｅアミノ酸置換集積体の作製
以下、前記＜ｃ＞から＜ｉ＞に示す７種類の免疫グロブリン結合性タンパク質の作製方法について説明する。
　＜ｃ＞ＦｐＬ＿Ｃ３ＫＸ　９ａ
　＜ｃ－１＞ＦｐＬ＿Ｃ３ＫＸ　９ａ（配列番号４０８）をコードするポリヌクレオチド（配列番号２１４）を合成した。なお、合成する際、５’末端側には制限酵素ＮｃｏＩの認識配列（５’－ＣＣＡＴＧＧ－３’）を、３’末端側にはヒスチジン６残基をコードするヌクレオチド配列（配列番号２３２）、終止コドンおよび制限酵素ＨｉｎｄＩＩＩの認識配列（５’－ＡＡＧＣＴＴ－３’）を、それぞれ付加している。
　＜ｃ－２＞実施例１（２）と同様の方法で、＜ｃ－１＞で合成したポリヌクレオチドを精製した。
　＜ｃ－３＞実施例１（３）と同様な方法で、＜ｃ－２＞で得たポリヌクレオチドと予め制限酵素ＮｃｏＩとＨｉｎｄＩＩＩで消化したプラスミドｐＥＴ－２６ｂとをライゲーション後、当該ライゲーション産物を用いて大腸菌ＢＬ２１（ＤＥ３）株を形質転換し、培養した。
　＜ｃ－４＞得られた形質転換体を、実施例１（４）と同様な方法で培養およびプラスミド精製を行ない、発現ベクター（ｐＥＴ－ＦｐＬ＿Ｃ３ＫＸ　９ａと命名）を取得後、当該発現ベクターのヌクレオチド配列の解析を、実施例１（５）と同様の方法で行なった。
　配列解析の結果、発現ベクターｐＥＴ－ＦｐＬ＿Ｃ３ＫＸ　９ａにＦｐＬ＿Ｃ３ＫＸ　９ａ（配列番号４０８）をコードするポリヌクレオチド（配列番号４１５）が挿入されていることを確認した。
　＜ｄ＞ＦｐＬ＿Ｃ３ＫＸ　９ｂ
　免疫グロブリン結合性タンパク質をコードするポリヌクレオチドとして、ＦｐＬ＿Ｃ３ＫＸ　９ｂ（配列番号４０９）をコードするポリヌクレオチド（配列番号４１６）を用いた他は、（ａ）と同様な方法で形質転換体および発現ベクター（ｐＥＴ－ＦｐＬ＿Ｃ３ＫＸ　９ｂと命名）を取得した。発現ベクターｐＥＴ－ＦｐＬ＿Ｃ３ＫＸ　９ｂのヌクレオチド配列解析の結果、ｐＥＴ－ＦｐＬ＿Ｃ３ＫＸ　９ｂにＦｐＬ＿Ｃ３ＫＸ　９ｂ（配列番号４０９）をコードするポリヌクレオチド（配列番号４１６）が挿入されていることを確認した。
　＜ｅ＞ＦｐＬ＿Ｃ３ＫＸ　９ｃ
　免疫グロブリン結合性タンパク質をコードするポリヌクレオチドとして、ＦｐＬ＿Ｃ３ＫＸ　９ｃ（配列番号４１０）をコードするポリヌクレオチド（配列番号４１７）を用いた他は、（ａ）と同様な方法で形質転換体および発現ベクター（ｐＥＴ－ＦｐＬ＿Ｃ３ＫＸ　９ｃと命名）を取得した。発現ベクターｐＥＴ－ＦｐＬ＿Ｃ３ＫＸ　９ｃのヌクレオチド配列解析の結果、ｐＥＴ－ＦｐＬ＿Ｃ３ＫＸ９ｅにＦｐＬ＿Ｃ３ＫＸ　９ｃ（配列番号４１０）をコードするポリヌクレオチド（配列番号４１７）が挿入されていることを確認した。
　＜ｆ＞ＦｐＬ＿Ｃ３ＫＸ　９ｄ
　免疫グロブリン結合性タンパク質をコードするポリヌクレオチドとして、ＦｐＬ＿Ｃ３ＫＸ　９ｄ（配列番号４１１）をコードするポリヌクレオチド（配列番号４１８）を用いた他は、（ａ）と同様な方法で形質転換体および発現ベクター（ｐＥＴ－ＦｐＬ＿Ｃ３ＫＸ　９ｄと命名）を取得した。発現ベクターｐＥＴ－ＦｐＬ＿Ｃ３ＫＸ　９ｄのヌクレオチド配列解析の結果、ｐＥＴ－ＦｐＬ＿Ｃ３ＫＸ　９ｄにＦｐＬ＿Ｃ３ＫＸ　９ｄ（配列番号４１１）をコードするポリヌクレオチド（配列番号４１８）が挿入されていることを確認した。
　＜ｇ＞ＦｐＬ＿Ｃ３ＫＸ　９ｅ
　免疫グロブリン結合性タンパク質をコードするポリヌクレオチドとして、ＦｐＬ＿Ｃ３ＫＸ　９ｅ（配列番号４１２）をコードするポリヌクレオチド（配列番号４１９）を用いた他は、（ａ）と同様な方法で形質転換体および発現ベクター（ｐＥＴ－ＦｐＬ＿Ｃ３ＫＸ　９ｅと命名）を取得した。発現ベクターｐＥＴ－ＦｐＬ＿Ｃ３ＫＸ　９ｅのヌクレオチド配列解析の結果、ｐＥＴ－ＦｐＬ＿Ｃ３ＫＸ　９ｅにＦｐＬ＿Ｃ３ＫＸ　９ｅ（配列番号４１２）をコードするポリヌクレオチド（配列番号４１９）が挿入されていることを確認した。
　＜ｈ＞ＦｐＬ＿Ｃ３ＫＸ　１０ａ
　免疫グロブリン結合性タンパク質をコードするポリヌクレオチドとして、ＦｐＬ＿Ｃ３ＫＸ　１０ａ（配列番号４１３）をコードするポリヌクレオチド（配列番号４２０）を用いた他は、（ａ）と同様な方法で形質転換体および発現ベクター（ｐＥＴ－ＦｐＬ＿Ｃ３ＫＸ　１０ａと命名）を取得した。発現ベクターｐＥＴ－ＦｐＬ＿Ｃ３ＫＸ　１０ａのヌクレオチド配列解析の結果、ｐＥＴ－ＦｐＬ＿Ｃ３ＫＸ　１０ａにＦｐＬ＿Ｃ３ＫＸ　１０ａ（配列番号４１３）をコードするポリヌクレオチド（配列番号４２０）が挿入されていることを確認した。
　＜ｉ＞ＦｐＬ＿Ｃ３ＫＸ　１０ｂ
　免疫グロブリン結合性タンパク質をコードするポリヌクレオチドとして、ＦｐＬ＿Ｃ３ＫＸ　１０ｂ（配列番号４１４）をコードするポリヌクレオチド（配列番号４２１）を用いた他は、（ａ）と同様な方法で形質転換体および発現ベクター（ｐＥＴ－ＦｐＬ＿Ｃ３ＫＸ　１０ｂと命名）を取得した。発現ベクターｐＥＴ－ＦｐＬ＿Ｃ３ＫＸ　１０ｂのヌクレオチド配列解析の結果、ｐＥＴ－ＦｐＬ＿Ｃ３ＫＸ　１０ｂにＦｐＬ＿Ｃ３ＫＸ　１０ｂ（配列番号４１４）をコードするポリヌクレオチド（配列番号４２１）が挿入されていることを確認した。
　実施例６０　ＦｐＬ＿Ｃ３ＫＸ　８ｂアミノ酸置換体の酸溶出性評価
　（１）ＦｐＬ＿Ｃ３ＫＸ　７ｅ（配列番号２７５）ならびに実施例５９で作製したＦｐＬ＿Ｃ３ＫＸ　９ａ（配列番号４０８）、ＦｐＬ＿Ｃ３ＫＸ　９ｂ（配列番号４０９）、ＦｐＬ＿Ｃ３ＫＸ　９ｃ（配列番号４１０）、ＦｐＬ＿Ｃ３ＫＸ　９ｃ（配列番号４１１）、ＦｐＬ＿Ｃ３ＫＸ　９ｄ（配列番号４１２）、ＦｐＬ＿Ｃ３ＫＸ　１０ａ（配列番号４１３）およびＦｐＬ＿Ｃ３ＫＸ　１０ｂ（配列番号４１４）のいずれかを発現する形質転換体を、実施例５４（１－１）から（１－２）と同様な方法で培養し、実施例５４（１－３）に記載の方法でタンパク質抽出液を調製した。前記抽出液は遠心分離し、得られた上清をフィルターに通し、清澄化した。
　（２）（１）で清澄化した上清を、実施例５４（１－４）に記載の方法で精製し、免疫グロブリン結合性タンパク質に相当する画分を回収した。
　（３）回収した画分の吸光度を分光光度計で測定し、当該画分に含まれる免疫グロブリン結合性タンパク質を定量した。またＳＤＳ－ＰＡＧＥも実施し、選択した免疫グロブリン結合性タンパク質が純度よく精製されていることを確認した。
　（４）各タンパク質の濃度が等しくなるよう、ＴＢＳを用いて希釈した。希釈液を二等分し、実施例３（４）に記載のＥＬＩＳＡ法（酸溶出性評価）によって、一方には０．０５Ｍ　クエン酸ナトリウム（ＮａＯＡｃ）緩衝液（ｐＨ３．２）で５分間酸処理し、もう一方にはＴＢＳ（酸未処理）を添加した際の抗体結合活性を測定した。酸処理した免疫グロブリン結合性タンパク質の抗体結合活性を、酸未処理の免疫グロブリン結合性タンパク質の抗体結合活性で除することで残存活性を算出した。１より残存活性を減ずることで溶出率を算出し、酸溶出性を評価した。
　結果を表４５に示す。ＦｐＬ＿Ｃ３ＫＸ　９ａ（配列番号４０８）、ＦｐＬ＿Ｃ３ＫＸ　９ｂ（配列番号４０９）、ＦｐＬ＿Ｃ３ＫＸ　９ｃ（配列番号４１０）、ＦｐＬ＿Ｃ３ＫＸ　９ｄ（配列番号４１１）、ＦｐＬ＿Ｃ３ＫＸ　９ｅ（配列番号４１２）、ＦｐＬ＿Ｃ３ＫＸ　１０ａ（配列番号４１３）およびＦｐＬ＿Ｃ３ＫＸ　１０ｂ（配列番号４１４）は、ＦｐＬ＿Ｃ３ＫＸ　７ｅ（配列番号２７５）と比較し、溶出率が高くなっており、これら変異型免疫グロブリン結合性タンパク質の酸による溶出性が向上していることが確認された。中でもＦｐＬ＿Ｃ３ＫＸ　９ａ（配列番号４０８）およびＦｐＬ＿Ｃ３ＫＸ　１０ａ（配列番号４１３）は、酸に対する溶出性が特に向上していることがわかる。
Figure JPOXMLDOC01-appb-T000045
　実施例６１　ＦｐＬ＿Ｃ３ＫＸ　７ｅへの変異導入およびライブラリ作製（その３）
　（１）ＦｐＬ＿Ｃ３ＫＸ　７ｅ（配列番号２７５）を発現するベクターｐＥＴ－ＦｐＬ＿Ｃ３ＫＸ　７ｅを鋳型として、１５番目および３４番目のアミノ酸残基に対する飽和置換体ライブラリを作製した。プライマーは、実施例１１（１）と同様、２２ｃ－Ｔｒｉｃｋ法に倣い、変異導入箇所に適切な混合塩基を配置し、変異導入箇所を中心としたインバースＰＣＲができるように設計した（配列番号４２２から４３３）。これらのプライマーを一箇所の置換につき６本一組として、表７および表４６の組成で混合し、ＰＣＲ　Ｐｒｉｍｅｒ混合液（Ｆｏｒｗａｒｄ／Ｒｅｖｅｒｓｅ　ｐｒｉｍｅｒ　ｍｉｘ）を調製した。
Figure JPOXMLDOC01-appb-T000046
　（２）ｐＥＴ－ＦｐＬ＿Ｃ３ＫＸ　７ｅを鋳型ＤＮＡとした他は、実施例２（２－２）と同様な方法でインバースＰＣＲによる部位特異的変異導入を行った。
　（３）得られたＰＣＲ産物を精製後、反応液を用いて大腸菌ＢＬ２１（ＤＥ３）株を形質転換し、５０μｇ／ｍＬのカナマイシンを含むＬＢプレート培地で培養（３７℃、１６時間）した後、プレート上に形成したコロニーを部位特異的変異体ライブラリとした。
　実施例６２　ＦｐＬ＿Ｃ３ＫＸ　７ｅアミノ酸置換体のスクリーニング（その３）
　（１）ｐＥＴ－ＦｐＬ＿Ｃ３ＫＸ　７ｅ（形質転換体）および実施例６１で作製したランダム変異体ライブラリ（形質転換体）で作製した部位特異的アミノ酸置換体ライブラリ（形質転換体）を、実施例５５（１）から（２）と同様な方法で培養後、実施例５５（３）に記載のアルカリ処理を行なった。
　（２）アルカリ処理を行なった時の免疫グロブリン結合性タンパク質の抗体結合活性を実施例２（４）に記載のＥＬＩＳＡ法にて測定し、アルカリ処理を行なった時の免疫グロブリン結合性タンパク質の抗体結合活性を、アルカリ処理を行わなかった時の免疫グロブリン結合性タンパク質の抗体結合活性で除することで残存活性を算出した。
　（３）約２００株の形質転換体を評価し、その中からＦｐＬ＿Ｃ３ＫＸ　７ｅ（配列番号２７５）と比較してアルカリ安定性が向上した免疫グロブリン結合性タンパク質を発現する形質転換体を選択した。
　（４）選択した形質転換体を培養し、ＱＩＡｐｒｅｐ　Ｓｐｉｎ　Ｍｉｎｉｐｒｅｐ　ｋｉｔ（ＱＩＡＧＥＮ社製）を用いて発現ベクターを調製した。
　（５）得られた発現ベクターに挿入された免疫グロブリン結合性タンパク質をコードするポリヌクレオチド領域の配列を実施例１（５）に記載の方法によりヌクレオチド配列を解析し、アミノ酸の変異箇所を特定した。
　（６）（３）で選択した免疫グロブリン結合性タンパク質を発現する形質転換体またはｐＥＴ－ＦｐＬ＿Ｃ３ＫＸ　７ｅ（配列番号２７５）を発現する形質転換体を、実施例５４（１－１）から（１－２）と同様な方法で培養し、実施例５４（１－３）と同様な方法でタンパク質抽出液を調製した。前記抽出液は遠心分離し、得られた上清をフィルターに通し、清澄化した。
　（７）（６）で清澄化した上清を、実施例５４（１－４）に記載の方法で精製し、免疫グロブリン結合性タンパク質に相当する画分を回収した。
　（８）回収した画分の吸光度を分光光度計で測定し、当該画分に含まれる免疫グロブリン結合性タンパク質を定量した。またＳＤＳ－ＰＡＧＥも実施し、選択した免疫グロブリン結合性タンパク質が純度よく精製されていることを確認した。
　（９）実施例６０（４）と同様な方法で酸溶出性を評価した。
　結果を表４７に示す。配列番号２７５記載のアミノ酸配列において、少なくともＡｓｎ１５Ｖａｌ、Ｇｌｕ３４Ａｓｐ、Ｇｌｕ３４Ｐｈｅ、Ｇｌｕ３４ＬｅｕおよびＧｌｕ３４Ｖａｌより選択される１以上のアミノ酸置換を有した免疫グロブリン結合性タンパク質はＦｐＬ＿Ｃ３ＫＸ　７ｅ（配列番号２７５）と比較し、溶出率が高くなっており、これら変異型免疫グロブリン結合性タンパク質の酸による溶出性が向上していることが確認された。
Figure JPOXMLDOC01-appb-T000047
　実施例６３　ＦｐＬ＿Ｃ３ＫＸ　９ａのアルカリ安定性評価
　（１）ＦｐＬ＿Ｃ３ＫＸ　７ｅ（配列番号２７５）およびＦｐＬ＿Ｃ３ＫＸ　９ａ（配列番号４０８）のいずれかを発現する形質転換体を、実施例５４（１－１）から（１－２）と同様な方法で培養し、実施例５４（１－３）に記載の方法でタンパク質抽出液を調製した。前記抽出液は遠心分離し、得られた上清をフィルターに通し、清澄化した。
　（２）（１）で清澄化した上清を、実施例５４（１－４）に記載の方法で精製し、免疫グロブリン結合性タンパク質に相当する画分を回収した。
　（３）回収した画分の吸光度を分光光度計で測定し、当該画分に含まれる免疫グロブリン結合性タンパク質を定量した。またＳＤＳ－ＰＡＧＥも実施し、選択した免疫グロブリン結合性タンパク質が純度よく精製されていることを確認した。
　（４）処理に用いたＮａＯＨの濃度を２．０Ｍ（終濃度１．０Ｍ）に、処理時間を１５時間に、それぞれした他は、実施例２（１３）と同様な方法でアルカリ処理後、実施例２（１４）と同様な方法で残存活性を算出し、アルカリ安定性を評価した。
　結果を表４８に示す。本実施例で評価したＦｐＬ＿Ｃ３ＫＸ　９ａ（配列番号４０８）は天然型のＦｐＬ＿Ｃ３（配列番号１）よりアルカリ安定性が向上したＦｐＬ＿Ｃ３ＫＸ　７ｅ（配列番号２７５）と同等のアルカリ安定性を有していることを確認した。
Figure JPOXMLDOC01-appb-T000048
　一態様において、本発明のタンパク質は、Ｆｉｎｅｇｏｌｄｉａ属由来のプロテインＬの免疫グロブリン結合ドメインのアミノ酸配列を含み、ただし当該アミノ酸配列において、アルカリ安定性が向上したアミノ酸置換を少なくとも一つ有し、かつ免疫グロブリン結合活性を有することを特徴としている。一態様において、不溶性担体と当該不溶性担体に固定化した本発明のタンパク質とを含む本発明の免疫グロブリン吸着剤は、従来の免疫グロブリン吸着剤と比較し、高いアルカリ安定性により、繰返し利用回数が増加するため、同免疫グロブリン吸着剤を利用すれば従来と比べ低コストで免疫グロブリンを生産できる。
　一態様において、本発明のタンパク質は、Ｆｉｎｅｇｏｌｄｉａ属由来のプロテインＬの免疫グロブリン結合ドメインのアミノ酸配列を含み、ただし当該アミノ酸配列において、抗体溶出特性が向上したアミノ酸置換を少なくとも一つ有し、かつ免疫グロブリン結合活性を有することを特徴としている。一態様において、不溶性担体と当該不溶性担体に固定化した本発明のタンパク質とを含む本発明の免疫グロブリン吸着剤によれば、従来の免疫グロブリン吸着剤と比較し、温和なｐＨ条件で免疫グロブリン（抗体）を溶出できることから、高品質の免疫グロブリンが得られる。

Claims (12)

  1. 　Ｆｉｎｅｇｏｌｄｉａ属細菌由来Ｐｒｏｔｅｉｎ　Ｌの免疫グロブリン結合ドメインのアミノ酸配列を含み、ただし当該アミノ酸配列において、少なくとも以下の（１）から（５３）より選択される１つ以上のアミノ酸置換を有し、かつ免疫グロブリン結合活性を有するタンパク質：
    （１）配列番号１の５０番目のアスパラギンに相当するアミノ酸残基がチロシンに置換
    （２）配列番号１の１番目のグルタミン酸に相当するアミノ酸残基がグリシンまたはバリンに置換
    （３）配列番号１の３番目のプロリンに相当するアミノ酸残基がセリンに置換
    （４）配列番号１の４番目のグルタミン酸に相当するアミノ酸残基がリジンまたはグリシンに置換
    （５）配列番号１の５番目のグルタミン酸に相当するアミノ酸残基がバリンに置換
    （６）配列番号１の７番目のリジンに相当するアミノ酸残基がアラニンに置換
    （７）配列番号１の８番目のグルタミン酸に相当するアミノ酸残基がグリシンに置換
    （８）配列番号１の９番目のグルタミン酸に相当するアミノ酸残基がバリンに置換
    （９）配列番号１の１７番目のイソロイシンに相当するアミノ酸残基がフェニルアラニンに置換
    （１０）配列番号１の２１番目のグリシンに相当するアミノ酸残基がアルギニンに置換
    （１１）配列番号１の２７番目のグルタミン酸に相当するアミノ酸残基がグリシンまたはアルギニンに置換
    （１２）配列番号１の２９番目のリジンに相当するアミノ酸残基がプロリンに置換
    （１３）配列番号１の３１番目のスレオニンに相当するアミノ酸残基がロイシンに置換
    （１４）配列番号１の３６番目のスレオニンに相当するアミノ酸残基がアラニンに置換
    （１５）配列番号１の４１番目のアラニンに相当するアミノ酸残基がスレオニンに置換
    （１６）配列番号１の４４番目のアスパラギンに相当するアミノ酸残基がセリンまたはグリシンに置換
    （１７）配列番号１の４９番目のグルタミン酸に相当するアミノ酸残基がスレオニンまたはイソロイシンに置換
    （１８）配列番号１の５０番目のアスパラギンに相当するアミノ酸残基がセリン、リジンおよびアスパラギン酸のいずれかに置換
    （１９）配列番号１の５１番目のグリシンに相当するアミノ酸残基がバリンに置換
    （２０）配列番号１の５２番目のグルタミン酸に相当するアミノ酸残基がバリン、グリシンおよびアスパラギン酸のいずれかに置換
    （２１）配列番号１の５３番目のチロシンに相当するアミノ酸残基がフェニルアラニンに置換
    （２２）配列番号１の５４番目のスレオニンに相当するアミノ酸残基がイソロイシンまたはメチオニンに置換
    （２３）配列番号１の６２番目のアスパラギンに相当するアミノ酸残基がヒスチジン、アルギニン、ロイシン、メチオニンおよびトリプトファンのいずれかに置換
    （２４）配列番号１の６５番目のアスパラギンに相当するアミノ酸残基がチロシンに置換
    （２５）配列番号１の６９番目のアラニンに相当するアミノ酸残基がスレオニンに置換
    （２６）配列番号１の２番目のスレオニンに相当するアミノ酸残基がセリンまたはプロリンに置換
    （２７）配列番号１の３番目のプロリンに相当するアミノ酸残基がアルギニンに置換
    （２８）配列番号１の５番目のグルタミン酸に相当するアミノ酸残基がリジンまたはアルギニンに置換
    （２９）配列番号１の２７番目のグルタミン酸に相当するアミノ酸残基がバリン、リジンおよびイソロイシンのいずれかに置換
    （３０）配列番号１の３２番目のフェニルアラニンに相当するアミノ酸残基がロイシンに置換
    （３１）配列番号１の３８番目のリジンに相当するアミノ酸残基がアラニンに置換
    （３２）配列番号１の４４番目のアスパラギンに相当するアミノ酸残基がイソロイシンに置換、
    （３３）配列番号１の４７番目のアラニンに相当するアミノ酸残基がスレオニンまたはアルギニンに置換
    （３４）配列番号１の５２番目のグルタミン酸に相当するアミノ酸残基がアスパラギンに置換
    （３５）配列番号１の２番目のスレオニンに相当するアミノ酸残基がアラニンに置換
    （３６）配列番号１の５番目のグルタミン酸に相当するアミノ酸残基がアスパラギン酸に置換
    （３７）配列番号１の６番目のプロリンに相当するアミノ酸残基がロイシンまたはスレオニンに置換
    （３８）配列番号１の７番目のリジンに相当するアミノ酸残基がプロリンに置換
    （３９）配列番号１の１４番目のバリンに相当するアミノ酸残基がアラニンに置換
    （４０）配列番号１の２３番目のイソロイシンに相当するアミノ酸残基がアルギニンまたはバリンに置換
    （４１）配列番号１の２９番目のリジンに相当するアミノ酸残基がフェニルアラニンに置換
    （４２）配列番号１の３１番目のスレオニンに相当するアミノ酸残基がメチオニンに置換
    （４３）配列番号１の３３番目のグルタミン酸に相当するアミノ酸残基がアスパラギン酸、グリシンおよびバリンのいずれかに置換
    （４４）配列番号１の３５番目のアラニンに相当するアミノ酸残基がスレオニンに置換
    （４５）配列番号１の３６番目のスレオニンに相当するアミノ酸残基がセリンに置換
    （４６）配列番号１の３７番目のアラニンに相当するアミノ酸残基がスレオニンに置換
    （４７）配列番号１の４１番目のアラニンに相当するアミノ酸残基がイソロイシンまたはチロシンに置換
    （４８）配列番号１の４４番目のアスパラギンに相当するアミノ酸残基がヒスチジンまたはアルギニンに置換
    （４９）配列番号１の５２番目のグルタミン酸に相当するアミノ酸残基がロイシンまたはチロシンに置換
    （５０）配列番号１の６０番目のグリシンに相当するアミノ酸残基がアルギニンに置換
    （５１）配列番号１の６４番目のイソロイシンに相当するアミノ酸残基がロイシンに置換
    （５２）配列番号１の６６番目のイソロイシンに相当するアミノ酸残基がバリンに置換
    （５３）配列番号１の６９番目のアラニンに相当するアミノ酸残基がロイシンまたはバリンに置換。
  2. 　以下の（ａ）から（ｃ）のいずれかに記載のタンパク質である、請求項１に記載のタンパク質：
    （ａ）配列番号１または１８に記載のアミノ酸配列を含み、ただし当該アミノ酸配列において、少なくとも以下の（１）から（５３）より選択される１つ以上のアミノ酸置換を有し、かつ免疫グロブリン結合活性を有するタンパク質：
    （１）配列番号１の５０番目のアスパラギンに相当するアミノ酸残基がチロシンに置換
    （２）配列番号１の１番目のグルタミン酸に相当するアミノ酸残基がグリシンまたはバリンに置換
    （３）配列番号１の３番目のプロリンに相当するアミノ酸残基がセリンに置換
    （４）配列番号１の４番目のグルタミン酸に相当するアミノ酸残基がリジンまたはグリシンに置換
    （５）配列番号１の５番目のグルタミン酸に相当するアミノ酸残基がバリンに置換
    （６）配列番号１の７番目のリジンに相当するアミノ酸残基がアラニンに置換
    （７）配列番号１の８番目のグルタミン酸に相当するアミノ酸残基がグリシンに置換
    （８）配列番号１の９番目のグルタミン酸に相当するアミノ酸残基がバリンに置換
    （９）配列番号１の１７番目のイソロイシンに相当するアミノ酸残基がフェニルアラニンに置換
    （１０）配列番号１の２１番目のグリシンに相当するアミノ酸残基がアルギニンに置換
    （１１）配列番号１の２７番目のグルタミン酸に相当するアミノ酸残基がグリシンまたはアルギニンに置換
    （１２）配列番号１の２９番目のリジンに相当するアミノ酸残基がプロリンに置換
    （１３）配列番号１の３１番目のスレオニンに相当するアミノ酸残基がロイシンに置換
    （１４）配列番号１の３６番目のスレオニンに相当するアミノ酸残基がアラニンに置換
    （１５）配列番号１の４１番目のアラニンに相当するアミノ酸残基がスレオニンに置換
    （１６）配列番号１の４４番目のアスパラギンに相当するアミノ酸残基がセリンまたはグリシンに置換
    （１７）配列番号１の４９番目のグルタミン酸に相当するアミノ酸残基がスレオニンまたはイソロイシンに置換
    （１８）配列番号１の５０番目のアスパラギンに相当するアミノ酸残基がセリン、リジンおよびアスパラギン酸のいずれかに置換
    （１９）配列番号１の５１番目のグリシンに相当するアミノ酸残基がバリンに置換
    （２０）配列番号１の５２番目のグルタミン酸に相当するアミノ酸残基がバリン、グリシンおよびアスパラギン酸のいずれかに置換
    （２１）配列番号１の５３番目のチロシンに相当するアミノ酸残基がフェニルアラニンに置換
    （２２）配列番号１の５４番目のスレオニンに相当するアミノ酸残基がイソロイシンまたはメチオニンに置換
    （２３）配列番号１の６２番目のアスパラギンに相当するアミノ酸残基がヒスチジン、アルギニン、ロイシン、メチオニンおよびトリプトファンのいずれかに置換
    （２４）配列番号１の６５番目のアスパラギンに相当するアミノ酸残基がチロシンに置換
    （２５）配列番号１の６９番目のアラニンに相当するアミノ酸残基がスレオニンに置換
    （２６）配列番号１の２番目のスレオニンに相当するアミノ酸残基がセリンまたはプロリンに置換
    （２７）配列番号１の３番目のプロリンに相当するアミノ酸残基がアルギニンに置換
    （２８）配列番号１の５番目のグルタミン酸に相当するアミノ酸残基がリジンまたはアルギニンに置換
    （２９）配列番号１の２７番目のグルタミン酸に相当するアミノ酸残基がバリン、リジンおよびイソロイシンのいずれかに置換
    （３０）配列番号１の３２番目のフェニルアラニンに相当するアミノ酸残基がロイシンに置換
    （３１）配列番号１の３８番目のリジンに相当するアミノ酸残基がアラニンに置換
    （３２）配列番号１の４４番目のアスパラギンに相当するアミノ酸残基がイソロイシンに置換、
    （３３）配列番号１の４７番目のアラニンに相当するアミノ酸残基がスレオニンまたはアルギニンに置換
    （３４）配列番号１の５２番目のグルタミン酸に相当するアミノ酸残基がアスパラギンに置換
    （３５）配列番号１の２番目のスレオニンに相当するアミノ酸残基がアラニンに置換
    （３６）配列番号１の５番目のグルタミン酸に相当するアミノ酸残基がアスパラギン酸に置換
    （３７）配列番号１の６番目のプロリンに相当するアミノ酸残基がロイシンまたはスレオニンに置換
    （３８）配列番号１の７番目のリジンに相当するアミノ酸残基がプロリンに置換
    （３９）配列番号１の１４番目のバリンに相当するアミノ酸残基がアラニンに置換
    （４０）配列番号１の２３番目のイソロイシンに相当するアミノ酸残基がアルギニンまたはバリンに置換
    （４１）配列番号１の２９番目のリジンに相当するアミノ酸残基がフェニルアラニンに置換
    （４２）配列番号１の３１番目のスレオニンに相当するアミノ酸残基がメチオニンに置換
    （４３）配列番号１の３３番目のグルタミン酸に相当するアミノ酸残基がアスパラギン酸、グリシンおよびバリンのいずれかに置換
    （４４）配列番号１の３５番目のアラニンに相当するアミノ酸残基がスレオニンに置換
    （４５）配列番号１の３６番目のスレオニンに相当するアミノ酸残基がセリンに置換
    （４６）配列番号１の３７番目のアラニンに相当するアミノ酸残基がスレオニンに置換
    （４７）配列番号１の４１番目のアラニンに相当するアミノ酸残基がイソロイシンまたはチロシンに置換
    （４８）配列番号１の４４番目のアスパラギンに相当するアミノ酸残基がヒスチジンまたはアルギニンに置換
    （４９）配列番号１の５２番目のグルタミン酸に相当するアミノ酸残基がロイシンまたはチロシンに置換
    （５０）配列番号１の６０番目のグリシンに相当するアミノ酸残基がアルギニンに置換
    （５１）配列番号１の６４番目のイソロイシンに相当するアミノ酸残基がロイシンに置換
    （５２）配列番号１の６６番目のイソロイシンに相当するアミノ酸残基がバリンに置換
    （５３）配列番号１の６９番目のアラニンに相当するアミノ酸残基がロイシンまたはバリンに置換；
    （ｂ）配列番号１または１８に記載のアミノ酸配列を含み、ただし当該アミノ酸配列において、少なくとも前記（１）から（５３）より選択される１つ以上のアミノ酸置換を有し、さらに前記（１）から（５３）以外に１もしくは数個の位置での１もしくは数個のアミノ酸残基の置換、欠失、挿入、および／または付加を含み、かつ免疫グロブリン結合活性を有するタンパク質；
    （ｃ）配列番号１または１８に記載のアミノ酸配列またはその部分配列と７０％以上の相同性を有するアミノ酸配列を含み、ただし当該アミノ酸配列において、少なくとも前記（１）から（５３）より選択される１つ以上のアミノ酸置換を有し、かつ免疫グロブリン結合活性を有するタンパク質。
  3. 　以下の（ｄ）から（ｆ）のいずれかに記載のタンパク質である、請求項１または２に記載のタンパク質：
    （ｄ）配列番号１または１８に記載のアミノ酸配列を含み、ただし当該アミノ酸配列において、少なくとも以下の（１）のアミノ酸置換を有し、かつ免疫グロブリン結合活性を有するタンパク質
    （１）配列番号１の５０番目のアスパラギンに相当するアミノ酸残基がチロシンに置換；
    （ｅ）配列番号１または１８に記載のアミノ酸配列を含み、ただし当該アミノ酸配列において、少なくとも前記（１）のアミノ酸置換を有し、さらに前記アミノ酸置換以外の１もしくは数個の位置での１もしくは数個のアミノ酸残基の置換、欠失、挿入、および／または付加を含み、かつ免疫グロブリン結合活性を有するタンパク質；
    （ｆ）配列番号１または１８に記載のアミノ酸配列またはその部分配列と７０％以上の相同性を有するアミノ酸配列を含み、ただし少なくとも前記（１）のアミノ酸置換を有し、かつ免疫グロブリン結合活性を有するタンパク質。
  4. 　さらに、少なくとも以下の（５４）から（６４）より選択される１つ以上のアミノ酸置換を有する、請求項１から３のいずれか１項に記載のタンパク質：
    （５４）配列番号１の７番目のリジンに相当するアミノ酸残基がグルタミンに置換
    （５５）配列番号１の１３番目のリジンに相当するアミノ酸残基がバリンに置換
    （５６）配列番号１の２９番目のリジンに相当するアミノ酸残基がバリンまたはイソロイシンに置換
    （５７）配列番号１の６番目のプロリンに相当するアミノ酸残基がアラニンに置換
    （５８）配列番号１の８番目のグルタミン酸に相当するアミノ酸残基がアルギニンに置換
    （５９）配列番号１の１５番目のアスパラギンに相当するアミノ酸残基がバリンに置換
    （６０）配列番号１の２３番目のイソロイシンに相当するアミノ酸残基がフェニルアラニンまたはロイシンに置換
    （６１）配列番号１の３４番目のグルタミン酸に相当するアミノ酸残基がアスパラギン酸、フェニルアラニン、ロイシンおよびバリンのいずれかに置換
    （６２）配列番号１の３８番目のリジンに相当するアミノ酸残基がロイシンに置換
    （６３）配列番号１の５０番目のアスパラギンに相当するアミノ酸残基がメチオニンに置換
    （６４）配列番号１の５３番目のチロシンに相当するアミノ酸残基がセリンに置換。
  5. 　さらに、少なくとも以下の（Ｉ）から（ＶＩＩ）より選択される１つ以上のリジン残基がリジン以外の塩基性アミノ酸またはヒドロキシ基を有するアミノ酸残基に置換した、請求項１から４のいずれか１項に記載のタンパク質：
    （Ｉ）配列番号１の７番目に相当するリジン残基
    （ＩＩ）配列番号１の１３番目に相当するリジン残基
    （ＩＩＩ）配列番号１の２２番目に相当するリジン残基
    （ＩＶ）配列番号１の２９番目に相当するリジン残基
    （Ｖ）配列番号１の３８番目に相当するリジン残基
    （ＶＩ）配列番号１の４８番目に相当するリジン残基
    （ＶＩＩ）配列番号１の６７番目に相当するリジン残基。
  6. 　さらに、配列番号１の４９番目のグルタミン酸に相当するアミノ酸残基のアスパラギン酸への置換、配列番号１の６番目のプロリンに相当するアミノ酸残基のセリンへの置換、配列番号１の４４番目のアスパラギンに相当するアミノ酸残基のアスパラギン酸への置換、配列番号１の４９番目のグルタミン酸に相当するアミノ酸残基のバリンへの置換、配列番号１の６２番目のアスパラギンに相当するアミノ酸残基のチロシンへの置換、配列番号１の２３番目のアスパラギンに相当するアミノ酸残基のアスパラギン酸への置換、および配列番号１の４４番目のアスパラギンに相当するアミノ酸残基のアスパラギン酸への置換より選択される１つ以上のアミノ酸置換を有する、請求項１から５のいずれか１項に記載のタンパク質。
  7. 　少なくとも以下の（Ｗ）、（Ｘ）、（Ｙ）、（Ｚ）、（ＡＡ）、（ＡＢ）、（ＡＣ）、（ＡＤ）および（ＡＥ）のいずれかのアミノ酸置換を有する、請求項１から６のいずれか１項に記載のタンパク質：
    （Ｗ）配列番号１の７番目のリジンに相当するアミノ酸残基のアラニンへの置換、配列番号１の１３番目、３８番目、４８番目および６７番目のリジンに相当するアミノ酸残基のアルギニンへの置換、配列番号１の２２番目のリジンに相当するアミノ酸残基のグルタミンへの置換、配列番号１の２９番目のリジンに相当するアミノ酸残基のイソロイシンへの置換、配列番号１の４９番目のグルタミン酸に相当するアミノ酸残基のアスパラギン酸への置換、配列番号１の５０番目および６２番目のアスパラギンに相当するアミノ酸残基のチロシンへの置換、ならびに配列番号１の５２番目のグルタミン酸に相当するアミノ酸残基のグリシンへの置換；
    （Ｘ）配列番号１の７番目のリジンに相当するアミノ酸残基のアラニンへの置換、配列番号１の１３番目、２２番目、３８番目、４８番目および６７番目のリジンに相当するアミノ酸残基のアルギニンへの置換、配列番号１の２９番目のリジンに相当するアミノ酸残基のイソロイシンへの置換、配列番号１の４９番目のグルタミン酸に相当するアミノ酸残基のアスパラギン酸への置換、配列番号１の５０番目および６２番目のアスパラギンに相当するアミノ酸残基のチロシンへの置換、配列番号１の５２番目のグルタミン酸に相当するアミノ酸残基のグリシンへの置換、ならびに配列番号１の５３番目のチロシンに相当するアミノ酸残基のフェニルアラニンへの置換；
    （Ｙ）配列番号１の４番目のグルタミン酸に相当するアミノ酸残基のグリシンへの置換、配列番号１の７番目のリジンに相当するアミノ酸残基のアラニンへの置換、配列番号１の１３番目、２２番目、３８番目、４８番目および６７番目のリジンに相当するアミノ酸残基のアルギニンへの置換、配列番号１の２９番目のリジンに相当するアミノ酸残基のイソロイシンへの置換、配列番号１の４９番目のグルタミン酸に相当するアミノ酸残基のアスパラギン酸への置換、配列番号１の５０番目および６２番目のアスパラギンに相当するアミノ酸残基のチロシンへの置換、配列番号１の５２番目のグルタミン酸に相当するアミノ酸残基のアスパラギン酸への置換、ならびに配列番号１の５３番目のチロシンに相当するアミノ酸残基のフェニルアラニンへの置換；
    （Ｚ）配列番号１の４番目のグルタミン酸に相当するアミノ酸残基のグリシンへの置換、配列番号１の７番目のリジンに相当するアミノ酸残基のアラニンへの置換、配列番号１の１３番目、２２番目、３８番目、４８番目および６７番目のリジンに相当するアミノ酸残基のアルギニンへの置換、配列番号１の２７番目のグルタミン酸に相当するアミノ酸残基のアルギニンへの置換、配列番号１の２９番目のリジンに相当するアミノ酸残基のイソロイシンへの置換、配列番号１の４９番目のグルタミン酸に相当するアミノ酸残基のアスパラギン酸への置換、配列番号１の５０番目および６２番目のアスパラギンに相当するアミノ酸残基のチロシンへの置換、配列番号１の５２番目のグルタミン酸に相当するアミノ酸残基のアスパラギン酸への置換、ならびに配列番号１の５３番目のチロシンに相当するアミノ酸残基のフェニルアラニンへの置換；
    （ＡＡ）配列番号１の４番目のグルタミン酸に相当するアミノ酸残基のグリシンへの置換、配列番号１の６番目のプロリンに相当するアミノ酸残基のセリンへの置換、配列番号１の７番目のリジンに相当するアミノ酸残基のアラニンへの置換、配列番号１の１３番目、２２番目、４８番目および６７番目のリジンに相当するアミノ酸残基のアルギニンへの置換、配列番号１の２９番目のリジンに相当するアミノ酸残基のイソロイシンへの置換、配列番号１の３８番目のリジンに相当するアミノ酸残基のグルタミン酸への置換、配列番号１の４９番目のグルタミン酸に相当するアミノ酸残基のアスパラギン酸への置換、配列番号１の５０番目および６２番目のアスパラギンに相当するアミノ酸残基のチロシンへの置換、配列番号１の５２番目のグルタミン酸に相当するアミノ酸残基のアスパラギン酸への置換、ならびに配列番号１の５３番目のチロシンに相当するアミノ酸残基のフェニルアラニンへの置換；
    （ＡＢ）配列番号１の４番目のグルタミン酸に相当するアミノ酸残基のグリシンへの置換、配列番号１の６番目のプロリンに相当するアミノ酸残基のセリンへの置換、配列番号１の７番目のリジンに相当するアミノ酸残基のアラニンへの置換、配列番号１の１３番目、２２番目、４８番目および６７番目のリジンに相当するアミノ酸残基のアルギニンへの置換、配列番号１の２９番目のリジンに相当するアミノ酸残基のイソロイシンへの置換、配列番号１の３８番目のリジンに相当するアミノ酸残基のグルタミン酸への置換、配列番号１の４９番目のグルタミン酸に相当するアミノ酸残基のアスパラギン酸への置換、配列番号１の５０番目および６２番目のアスパラギンに相当するアミノ酸残基のチロシンへの置換、配列番号１の５２番目のグルタミン酸に相当するアミノ酸残基のバリンへの置換、配列番号１の５３番目のチロシンに相当するアミノ酸残基のフェニルアラニンへの置換ならびに配列番号１の６９番目のアラニンに相当するアミノ酸残基のバリンへの置換；
    （ＡＣ）配列番号１の４番目のグルタミン酸に相当するアミノ酸残基のグリシンへの置換、配列番号１の６番目のプロリンに相当するアミノ酸残基のセリンへの置換、配列番号１の７番目のリジンに相当するアミノ酸残基のアラニンへの置換、配列番号１の１３番目、２２番目、４８番目および６７番目のリジンに相当するアミノ酸残基のアルギニンへの置換、配列番号１の２９番目のリジンに相当するアミノ酸残基のイソロイシンへの置換、配列番号１の３８番目のリジンに相当するアミノ酸残基のグルタミン酸への置換、配列番号１の４９番目のグルタミン酸に相当するアミノ酸残基のアスパラギン酸への置換、配列番号１の５０番目および６２番目のアスパラギンに相当するアミノ酸残基のチロシンへの置換、配列番号１の５３番目のチロシンに相当するアミノ酸残基のフェニルアラニンへの置換ならびに配列番号１の６９番目のアラニンに相当するアミノ酸残基のバリンへの置換；
    （ＡＤ）配列番号１の４番目のグルタミン酸に相当するアミノ酸残基のグリシンへの置換、配列番号１の６番目のプロリンに相当するアミノ酸残基のセリンへの置換、配列番号１の７番目のリジンに相当するアミノ酸残基のアラニンへの置換、配列番号１の１３番目、２２番目、４８番目および６７番目のリジンに相当するアミノ酸残基のアルギニンへの置換、配列番号１の２３番目のイソロイシンに相当するアミノ酸残基のアルギニンへの置換、配列番号１の２９番目のリジンに相当するアミノ酸残基のイソロイシンへの置換、配列番号１の３８番目のリジンに相当するアミノ酸残基のグルタミン酸への置換、配列番号１の４４番目のアスパラギンに相当するアミノ酸残基のアルギニンへの置換、配列番号１の４９番目のグルタミン酸に相当するアミノ酸残基のアスパラギン酸への置換、配列番号１の５０番目および６２番目のアスパラギンに相当するアミノ酸残基のチロシンへの置換、配列番号１の５３番目のチロシンに相当するアミノ酸残基のフェニルアラニンへの置換ならびに配列番号１の６９番目のアラニンに相当するアミノ酸残基のバリンへの置換；
    （ＡＥ）配列番号１の４番目のグルタミン酸に相当するアミノ酸残基のグリシンへの置換、配列番号１の６番目のプロリンに相当するアミノ酸残基のセリンへの置換、配列番号１の７番目のリジンに相当するアミノ酸残基のアラニンへの置換、配列番号１の１３番目、２２番目および６７番目のリジンに相当するアミノ酸残基のアルギニンへの置換、配列番号１の２３番目のイソロイシンに相当するアミノ酸残基のアルギニンへの置換、配列番号１の２９番目のリジンに相当するアミノ酸残基のイソロイシンへの置換、配列番号１の３８番目のリジンに相当するアミノ酸残基のグルタミン酸への置換、配列番号１の４４番目のアスパラギンに相当するアミノ酸残基のアルギニンへの置換、配列番号１の４８番目のリジンに相当するアミノ酸残基のヒスチジンへの置換、配列番号１の４９番目のグルタミン酸に相当するアミノ酸残基のアスパラギン酸への置換、配列番号１の５０番目および６２番目のアスパラギンに相当するアミノ酸残基のチロシンへの置換、配列番号１の５３番目のチロシンに相当するアミノ酸残基のフェニルアラニンへの置換、配列番号１の６４番目のイソロイシンに相当するアミノ酸残基のロイシンへの置換ならびに配列番号１の６９番目のアラニンに相当するアミノ酸残基のバリンへの置換。
  8. 　配列番号１７９、１８６、１９９、２２４、２４０、２７１、２７５、４０８および４１３のいずれかに記載のアミノ酸配列を含む、請求項１から７のいずれか１項に記載のタンパク質。
  9. 　請求項１から８のいずれか１項に記載のタンパク質をコードするポリヌクレオチドを含む遺伝子組換え宿主または該ポリヌクレオチドを含む発現ベクターを含む遺伝子組換え宿主を培養し該タンパク質を発現させる工程と、発現した前記タンパク質を回収する工程とを含む、免疫グロブリン結合活性を有するタンパク質の製造方法。
  10. 　宿主がエシェリヒア・コリ（Ｅｓｃｈｅｒｉｃｈｉａ　ｃｏｌｉ）である、請求項９に記載の製造方法。
  11. 　免疫グロブリン吸着剤を充填したカラムであって、
    　前記免疫グロブリン吸着剤が、不溶性担体と、当該不溶性担体に固定化した請求項１から８のいずれか１項に記載のタンパク質とを含む、カラム。
  12. 　請求項１１に記載のカラムに免疫グロブリンを含む溶液を添加し当該免疫グロブリンを前記カラムに充填された免疫グロブリン吸着剤に吸着させる工程と、前記免疫グロブリン吸着剤に吸着した免疫グロブリンを溶出させる工程とを含む、前記溶液中に含まれる免疫グロブリンの分離方法。

     
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