[go: up one dir, main page]
More Web Proxy on the site http://driver.im/

WO2022009595A1 - 情報処理装置、情報処理方法、及びプログラム - Google Patents

情報処理装置、情報処理方法、及びプログラム Download PDF

Info

Publication number
WO2022009595A1
WO2022009595A1 PCT/JP2021/021999 JP2021021999W WO2022009595A1 WO 2022009595 A1 WO2022009595 A1 WO 2022009595A1 JP 2021021999 W JP2021021999 W JP 2021021999W WO 2022009595 A1 WO2022009595 A1 WO 2022009595A1
Authority
WO
WIPO (PCT)
Prior art keywords
container image
cell
detected
container
detection process
Prior art date
Application number
PCT/JP2021/021999
Other languages
English (en)
French (fr)
Inventor
努 井上
裕也 渡辺
康介 黒田
Original Assignee
富士フイルム株式会社
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Application filed by 富士フイルム株式会社 filed Critical 富士フイルム株式会社
Publication of WO2022009595A1 publication Critical patent/WO2022009595A1/ja

Links

Images

Classifications

    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12M—APPARATUS FOR ENZYMOLOGY OR MICROBIOLOGY; APPARATUS FOR CULTURING MICROORGANISMS FOR PRODUCING BIOMASS, FOR GROWING CELLS OR FOR OBTAINING FERMENTATION OR METABOLIC PRODUCTS, i.e. BIOREACTORS OR FERMENTERS
    • C12M1/00—Apparatus for enzymology or microbiology
    • C12M1/34—Measuring or testing with condition measuring or sensing means, e.g. colony counters
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
    • C12Q1/00—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
    • C12Q1/02—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving viable microorganisms
    • G—PHYSICS
    • G06—COMPUTING; CALCULATING OR COUNTING
    • G06T—IMAGE DATA PROCESSING OR GENERATION, IN GENERAL
    • G06T7/00—Image analysis

Definitions

  • the technology of this disclosure relates to an information processing device, an information processing method, and a program.
  • antibody drugs have been attracting attention. Unlike conventional small molecule drugs, antibody drugs are made of complex proteins and the like, so it is difficult to artificially synthesize them. Therefore, antibody drugs are produced by inserting a gene corresponding to a desired protein into cells such as CHO (Chinese Hamster Ovary) cells, producing the desired protein by the function of the cell, and then extracting and purifying the protein. Will be done.
  • CHO Choinese Hamster Ovary
  • a single cell cloning technique for generating cell colonies derived from a single cell by seeding and culturing one cell into which a gene has been inserted into each well (culture container) of a well plate is known. There is.
  • the single cell cloning technique improves the homogeneity of the cells that produce the antibody, thereby improving the quality of the antibody drug produced.
  • the monochromeality is determined by visually observing an image of a well as a culture container (hereinafter referred to as a container image) by an inspector.
  • the examiner counts the number of cells in the well by observing the container image.
  • the monochromeality for the cell colony is guaranteed.
  • Monochromaticity determination needs to be performed on, for example, 3000 wells per project for producing an antibody. Visually checking all such a large number of container images is a heavy burden on the inspector.
  • the well contains a medium, debris (dead cells, cell debris, dust, etc.) or scratches on the well. Therefore, a large number of structures are imaged in one container image. Will be done. Therefore, it is not easy for the inspector to make a monochromeity determination based on one container image, and the load on the inspector is large.
  • the technique of the present disclosure is intended to provide an information processing device, an information processing method, and a program capable of reducing the burden on the inspector in determining monochromeity.
  • the information processing apparatus of the present disclosure supports a monoclonality determination as to whether or not a single cell is seeded in a container based on a container image of a container in which the cells are seeded.
  • the information processing apparatus includes at least one processor, in which the first container image taken immediately after the cells are seeded and the first container image taken after the first container image is taken, and after the cell seeding.
  • Image acquisition processing for acquiring at least three container images of the second container image captured in the first elapsed time and the third container image captured in the second elapsed time longer than the first elapsed time, and the first.
  • the support process that enables the monochromeality determination based on the first container image is executed.
  • the processor determines that the cell colony may be monochrome when the size of the cell colony detected in the second detection process is smaller than the size of the cell colony detected in the first detection process.
  • the processor preferably detects the cell colony from the second container image with the region of the cell colony detected in the first detection process as the detection target range.
  • the processor displays the first region, which is the region of the cell colony detected in the first detection process, and the second region, which is the region of the cell colony detected in the second detection process, on the display. It is preferable to show in one container image.
  • the processor enables the input operation of the determination result of whether or not the object is a cell for the object reflected in the second region in the first container image in the support process.
  • the processor detects a cell candidate region having a high probability of being a cell from the second region in the first container image and indicates the cell candidate region in the second region.
  • the processor detects the number of cells from the second region in the first container image in the support process, and when the number of cells is 1, it indicates that it is monochrome.
  • the processor terminates the process without executing the second detection process, the determination process, and the support process. Moreover, when two or more cell colonies are detected in the second detection process, or when no cell colonies are detected, it is preferable to end the process without executing the determination process and the support process.
  • the processor presents that it is not monochrome when it finishes processing.
  • the first container image is preferably a container image taken on the day or the next day when the cells are seeded.
  • the information processing method of the present disclosure is an information processing method that supports a monochromeity determination as to whether or not a single cell is seeded in a container based on a container image obtained by imaging a container in which the cells are seeded.
  • the second detection process for detecting the presence / absence and the number of cell colonies from the second container image, and the case where one cell colony is detected in the second detection process. Based on the cell colonies detected in the first detection process and the second detection process, the determination process for determining the presence or absence of the possibility of monoclonality and the determination process for determining the possibility of the monoclonality are the first. 1 Perform support processing that enables monochromeity determination based on the container image.
  • the program of the present disclosure is a program for causing a computer to execute a process for supporting a monochromeity determination as to whether or not a single cell is seeded in a container based on a container image of a container in which the cells are seeded.
  • Image acquisition processing for acquiring at least three container images with a third container image captured in a second elapsed time longer than one elapsed time, and first detection for detecting the presence / absence and number of cell colonies from the third container image.
  • one cell colony was detected in the treatment and the first detection process
  • one cell colony was detected in the second detection process for detecting the presence / absence and the number of cell colonies from the second container image, and the second detection process.
  • a determination process for determining the presence or absence of the possibility of monoclonality and a determination process for determining the possibility of the monoclonality are performed.
  • the computer is made to execute a support process that enables monochromeity determination based on the first container image.
  • FIG. 1 schematically shows a determination support system 2 according to an embodiment.
  • the determination support system 2 is a system that supports "monochromality determination" in which an inspector visually determines whether or not a cell colony formed in a well as a culture vessel is derived from a single cell. Monochromaticity determination is made by the examiner based on the image of the well at the time the cells were seeded.
  • a cell colony is a mass of a plurality of cells formed by division of seeded cells.
  • the determination support system 2 includes an image pickup device 3 and an information processing device 4.
  • the information processing device 4 is composed of a computer.
  • a display 5, a keyboard 6, a mouse 7, and the like are connected to the information processing apparatus 4.
  • the keyboard 6 and the mouse 7 constitute an input operation unit 8 for the user to input information.
  • the input operation unit 8 also includes a touch panel and the like.
  • the image pickup device 3 is, for example, a phase-contrast microscope, and optically takes an image of a well plate 10 in which cells are seeded and cultured as an image pickup target.
  • the light source and the like for illuminating the image pickup target are not shown.
  • a plurality of wells 11 are formed on the well plate 10.
  • the well plate 10 for example, a "96-well plate” in which 96 wells 11 are formed is used.
  • Each well 11 is a culture vessel in which one cell is seeded.
  • a “24-well plate” in which 24 wells 11 are formed is shown as the well plate 10.
  • the well 11 is an example of a container according to the technique of the present disclosure.
  • Cell seeding is performed by dispensing droplets 13 into each well 11 using a pipette 12 or the like from a reservoir containing a medium solution containing cells.
  • the droplet 13 contains cells 20.
  • the cell 20 is, for example, a CHO cell that produces an antibody.
  • a gene corresponding to a desired human protein is inserted into the cell 20.
  • the image pickup apparatus 3 takes an image of each well 11 of the well plate 10 as an image pickup target. For example, the image pickup apparatus 3 focuses on the bottom of the well 11 to perform an image pickup.
  • the cells 20 are seeded in the well 11, the cells 20 are imaged by the image pickup apparatus 3 in a state of being settled at the bottom of the medium solution in the well 11.
  • the image of the well 11 (hereinafter referred to as a container image) WP captured by the image pickup device 3 is transmitted to the information processing device 4, respectively.
  • the seeded cells 20 are imaged on the container image WP.
  • FIG. 2 shows the types of container image WP captured by the image pickup device 3.
  • the image pickup apparatus 3 takes an image of the well 11 every time a predetermined time elapses and outputs a container image WP.
  • the container image WP taken immediately after the cells 20 are seeded is referred to as a first container image WP1.
  • the container image WP imaged after the first container image WP1 is imaged and in the first elapsed time after cell seeding is referred to as a second container image WP2.
  • the container image WP captured in the second elapsed time longer than the first elapsed time is referred to as a third container image WP3.
  • the first container image WP1 is, for example, a container image WP taken on the day or the next day when the cells 20 are seeded.
  • the first container image WP1 is a container image WP taken on the day when the cells 20 are seeded.
  • the first elapsed time and the second elapsed time are 7 days and 14 days, respectively. That is, the second container image WP2 is a container image WP taken after 7 days have passed since the cells 20 were seeded.
  • the third container image WP3 is a container image WP taken after 14 days have passed since the cells 20 were seeded.
  • the container image WP acquired by the image pickup apparatus 3 is not limited to the first container image WP1, the second container image WP2, and the third container image WP3, and the container image WP acquired at other elapsed times is used. It may be included.
  • FIG. 2 schematically shows container images WP1 to WP3 in the case where only one cell 20 is seeded in one well 11 and one cell colony 20A is formed (that is, when it has monochromeity). Shown in.
  • the lower part of FIG. 2 shows container images WP1 to WP3 in the case where two cell colonies 20A are formed as a result of erroneously seeding two cells 20 in one well 11 (that is, when they do not have monochromeity). Shown schematically.
  • the well 11 may have a large number of debris (dead cells, cell fragments, dust, etc.), or scratches on the well 11.
  • FIG. 3 shows an example of an image pickup operation by the image pickup device 3.
  • the image pickup operation of the image pickup device 3 is controlled by the information processing device 4.
  • the image pickup apparatus 3 images a plurality of wells 11 formed on the well plate 10 one by one in order. Specifically, the image pickup apparatus 3 generates a container image WP by taking an image of each well 11 while sequentially changing the image pickup region 3A.
  • Ancillary information includes the date and time of imaging, plate ID (identification), and well position.
  • the imaging date and time is information regarding the date and time when the well 11 was imaged.
  • the plate ID is identification information that identifies each well plate 10.
  • the well position is the position information of the well 11 in the well plate 10. For example, in the well position, the position in the vertical direction is represented by an alphabet and the position in the horizontal direction is represented by a number. Well positions are represented by a combination of letters and numbers.
  • the plate ID is obtained, for example, by reading the barcode attached to the well plate 10 with a barcode reader (not shown).
  • the image pickup device 3 takes an image of the well plate 10 at a date and time instructed by the information processing device 4.
  • the image pickup apparatus 3 generates an image file F for each well 11 in the well plate 10 and transmits the image file F to the information processing apparatus 4.
  • FIG. 4 shows the hardware configuration of the information processing apparatus 4.
  • the information processing device 4 includes a CPU (Central Processing Unit) 30, a storage device 31, and a communication unit 32, which are interconnected via a bus line 33. Further, the above-mentioned display 5 and the input operation unit 8 are connected to the bus line 33.
  • a CPU Central Processing Unit
  • the CPU 30 is an arithmetic unit that realizes various functions by reading out the program 31A and various data (not shown) stored in the storage device 31 and executing processing.
  • the CPU 30 is an example of a processor according to the technique of the present disclosure.
  • the storage device 31 includes, for example, a RAM (RandomAccessMemory), a ROM (ReadOnlyMemory), a storage device, or the like.
  • the RAM is, for example, a volatile memory used as a work area or the like.
  • the ROM is, for example, a non-volatile memory such as a flash memory for holding the program 31A and various data.
  • the storage device is, for example, an HDD (Hard Disk Drive) or an SSD (Solid State Drive).
  • the storage stores an OS (Operating System), an application program, image data, various data, and the like.
  • the communication unit 32 is a network interface that controls transmission of various information via a network such as LAN (Local Area Network) or WAN (Wide Area Network).
  • the display 5 displays various screens.
  • the information processing device 4 receives input of an operation instruction from the input operation unit 8 through various screens.
  • FIG. 5 shows the functional configuration of the information processing apparatus 4.
  • the function of the information processing apparatus 4 is realized by the CPU 30 executing the process based on the program 31A.
  • the information processing apparatus 4 includes a main control unit 40, an image pickup control unit 41, an image acquisition unit 42, a determination support unit 43, a display control unit 44, and an aggregation unit 45.
  • the main control unit 40 controls each unit in the information processing device 4 based on the input information 8A input from the input operation unit 8.
  • the image pickup control unit 41 controls the image pickup operation of the image pickup device 3 based on the control from the main control unit 40.
  • the image acquisition unit 42 acquires the image file F output from the image pickup apparatus 3, and inputs the acquired image file F to the determination support unit 43.
  • the image file F includes a first container image WP1, a second container image WP2, or a third container image WP3. That is, the image acquisition unit 42 performs an image acquisition process for acquiring at least three container image WPs of the first container image WP1, the second container image WP2, and the third container image WP3.
  • the determination support unit 43 operates when the inspector makes a monochromeity determination after the first container image WP1, the second container image WP2, and the third container image WP3 are acquired by the image pickup device 3.
  • the determination support unit 43 acquires container images WP1 to WP3 for each well 11 based on each image file F input from the image acquisition unit 42.
  • the determination support unit 43 generates the determination support information 43A for supporting the monochromeity determination by the inspector for each well 11, and inputs the generated determination support information 43A to the display control unit 44.
  • the display control unit 44 generates a judgment support screen 60 for supporting the monochromeity judgment by the inspector based on the image file F and the judgment support information 43A. Further, the display control unit 44 displays the determination support screen 60 as a GUI (Graphical User Interface) so that the inspector can operate the determination support screen 60 using the input operation unit 8.
  • GUI Graphic User Interface
  • the totaling unit 45 receives the determination result CR of the monoclonality input from the input operation unit 8 by the inspector operating the input operation unit 8, via the main control unit 40, and receives the received determination result CR. Tally. Further, the totaling unit 45 generates the totaling result AR by totaling the determination result CR for each well plate 10.
  • the display control unit 44 causes the display 5 to display the aggregation result AR generated by the aggregation unit 45.
  • FIG. 6 shows the details of the configuration of the determination support unit 43.
  • the determination support unit 43 includes a first detection unit 51, a second detection unit 52, a determination unit 53, and a support unit 54.
  • the third container image WP3 is input to the first detection unit 51.
  • the second container image WP2 is input to the second detection unit 52.
  • the first container image WP1 is input to the support unit 54.
  • the first detection unit 51 performs the first detection process of detecting the presence / absence and the number of cell colonies 20A from the third container image WP3 by using, for example, an image recognition technique. Further, when the first detection unit 51 detects only one cell colony 20A from the third container image WP3, the first detection unit 51 identifies the region of the detected cell colony 20A, and the identified region is referred to as the first region R1 (FIG. FIG. 7 (A)) is output to the second detection unit 52, the determination unit 53, and the support unit 54.
  • the first region R1 FIG. FIG. 7 (A)
  • the second detection unit 52 detects the presence / absence and the number of cell colonies 20A from the second container image WP2 when only one cell colony 20A is detected in the first detection process by using, for example, an image recognition technique. 2 Perform detection processing. Further, the second detection unit 52 detects the cell colony 20A from the second container image WP2 with the first region R1 detected by the first detection process as the detection target range. When the second detection unit 52 detects only one cell colony 20A from the second container image WP2, the second detection unit 52 identifies the region of the detected cell colony 20A, and the identified region is referred to as the second region R2 (FIG. 7 (FIG. 7). B) It is output to the determination unit 53 and the support unit 54 as (see).
  • the determination unit 53 determines that the cell colony 20A is monochrome based on the cell colony 20A detected in the first detection process and the second detection process. Performs a determination process to determine the presence or absence of a certain possibility. In the present embodiment, the determination unit 53 compares the sizes of the cell colonies 20A detected in the first detection process and the second detection process. The determination unit 53 compares the size of the cell colony 20A by, for example, comparing the areas of the first region R1 and the second region R2.
  • the determination unit 53 may have a monochrome nature in the cell colony 20A. Is determined.
  • the support unit 54 enables monochromeity determination based on the first container image WP1 when it is determined in the determination process that there is a possibility of monochromeity.
  • the support unit 54 displays information representing the positions and sizes of the first region R1 and the second region R2 (see FIG. 7C) in the first container image WP1 as the determination support information 43A.
  • the determination support information 43A may include at least information representing the second region R2.
  • the display control unit 44 shows the first region R1 and the second region R2 on the first container image WP1 displayed on the above-mentioned determination support screen 60 (see FIG. 5) (see FIG. 7 (C)).
  • the inspector makes a monochromeity determination, the inspector performs an operation of inputting the determination result of whether or not the object is a cell for the object reflected in the second region R1 in the first container image WP1. Is possible.
  • the main control unit 40 causes the determination support unit 43 to perform the second detection process and the determination process. , And end the process without executing the support process. Further, the main control unit 40 performs a determination process and a support process on the determination support unit 43 when two or more cell colonies 20A are not detected in the second detection process or when the cell colony 20A is not detected. End the process without executing it.
  • the main control unit 40 presents the reason for termination to the inspector when the processing of the determination support unit 43 is terminated.
  • the main control unit 40 causes the display control unit 44 to display information indicating that the detected cell colony 20A is not monoclonality on the determination support screen 60 as the reason for termination.
  • the main control unit 40 may present the information by sound or the like by a speaker (not shown).
  • FIG. 7 shows an example of the determination support process when the cell colony 20A has a monoclonality.
  • FIG. 7A shows an example in which one cell colony 20A was detected from the third container image WP3 by the first detection process, and the first region R1 containing the detected cell colony 20A was identified.
  • FIG. 7B shows an example in which one cell colony 20A is detected from the first region R1 of the second container image WP2 by the second detection process, and the second region R2 including the detected cell colony 20A is identified. Is shown.
  • the size of the second region R2 is smaller than the size of the first region R1. This indicates that the size of the cell colony 20A increases due to cell division with the passage of time from the time of cell seeding. In this case, since it is presumed that the cell colony 20A is derived from a single cell 20, it is determined in the determination process that the cell colony 20A may be monoclonal.
  • FIG. 7C shows an example of displaying the first region R1 and the second region R2 on the first container image WP1 by the support process.
  • FIG. 8 shows an example of the determination support process when the cell colony 20A does not have monoclonality.
  • FIG. 8A shows an example in which one cell colony 20A was detected from the third container image WP3 by the first detection process, and the first region R1 containing the detected cell colony 20A was identified.
  • FIG. 8B shows an example in which two cell colonies 20A were detected from the first region R1 of the second container image WP2 by the second detection process.
  • the determination support process is terminated by the main control unit 40.
  • FIG. 9 shows an example of a well selection screen 61 for selecting a well position for performing monochromeity determination.
  • the well selection screen 61 is displayed on the display 5 by the display control unit 44 based on the control of the main control unit 40 before starting the monochromeity determination.
  • a selection operation unit 61A for selecting a plate ID and a selection operation unit 61B for selecting a well position are displayed.
  • the inspector can select a desired plate ID by operating the selection operation unit 61A using the input operation unit 8. Further, a desired well position can be selected by operating the selection operation unit 61B using the input operation unit 8.
  • the first container image WP1 of the well 11 corresponding to the well position selected by the selection operation unit 61B is displayed on the determination support screen 60.
  • FIG. 10 shows an example of the determination support screen 60.
  • the first container image WP1 of the well 11 corresponding to the well position selected by the well selection screen 61 is displayed.
  • the first container image WP1 displays the first region R1 and the second region R2 detected by the first detection process and the second detection process. It is sufficient that at least the second region R2 is displayed on the first container image WP1.
  • the determination support screen 60 is an input interface for enabling an operation of inputting a determination result as to whether or not the object is a cell for the object reflected in the second region R2 of the first container image WP1.
  • the display control unit 44 causes the selection box 62 as a GUI to be displayed in the determination support screen 60 in response to an operation using the input operation unit 8 of the inspector.
  • the inspector uses the input operation unit 8 to determine whether the object reflected in the second region R2 of the first container image WP1 is a cell or a non-cell (debris, scratch, etc.). Select.
  • the determination result CR as to whether or not the cell is a cell is input to the above-mentioned aggregation unit 45.
  • the cell colony 20A formed in the well 11 is derived from a single cell and has a monoclonality. Is determined.
  • the display control unit 44 enlarges and displays the portion of the first container image WP1 including the first region R1 and the second region R2 as an enlargement target region.
  • the enlargement target area and the enlargement magnification in the first container image WP1 may be changed according to the operation using the input operation unit 8 of the inspector.
  • FIG. 11 shows an example of the reason for termination presented to the inspector when the processing of the determination support unit 43 is terminated.
  • the determination support screen 60 displays, for example, that the process has been completed and the reason for the end.
  • the reason for termination for example, a message "It is presumed that it is not monochrome because two cell colonies have been detected" is displayed.
  • FIG. 12 shows a display example of the aggregation result AR by the display control unit 44.
  • the display mode shown in FIG. 12 is a so-called heat map, and the user can visually grasp the number and position of the well 11 in which the cell colony 20A having a monoclonality is present.
  • the aggregation result AR is not limited to the heat map, and the cell unity or the number of cells may be listed in a table format for each well 11.
  • the image acquisition unit 42 acquires an image file F including each container image WP after the first container image WP1, the second container image WP2, and the third container image WP3 are acquired by the image pickup device 3. Obtained from (step S10).
  • the main control unit 40 displays, for example, the well selection screen 61 shown in FIG. 9 on the display 5 (step S11).
  • the main control unit 40 uses the input operation unit 8 to determine whether or not one well 11 has been selected by the inspector (step S12).
  • the first detection unit 51 performs the first detection process based on the third container image WP3 of the selected well 11 (step S13).
  • the main control unit 40 determines whether or not only one cell colony 20A is detected in the first detection process (step S14). When only one cell colony 20A is detected in the first detection process (step S14: YES), the main control unit 40 shifts the process to step S15. On the other hand, when two or more cell colonies 20A are detected in the first detection process, or when the cell colonies 20A are not detected (step S14: NO), the main control unit 40 shifts the process to step S23. Let me.
  • step S15 the first detection unit 51 outputs the first region R1, which is the region of the detected cell colony 20A.
  • the second detection process is performed by the second detection unit 52 based on the second container image WP2 (step S16). In the second detection process, the cell colony 20A is detected with the first region R1 as the detection target range.
  • the main control unit 40 determines whether or not only one cell colony 20A is detected in the second detection process (step S17). When only one cell colony 20A is detected in the second detection process (step S17: YES), the main control unit 40 shifts the process to step S18. On the other hand, when two or more cell colonies 20A are detected in the second detection process, or when the cell colonies 20A are not detected (step S17: NO), the main control unit 40 shifts the process to step S23. Let me.
  • step S15 the second detection unit 52 outputs the second region R2, which is the region of the detected cell colony 20A.
  • the determination unit 53 performs a determination process for determining whether or not the detected cell colony 20A may be monoclonality based on the first region R1 and the second region R2 (step S19).
  • the main control unit 40 determines in the determination process whether or not it is determined that there is a possibility of monochromeity (step S19).
  • step S19 determines in the determination process that there is a possibility of monochromeity
  • step S19: NO the main control unit 40 shifts the process to step S23.
  • step S21 the support unit 54 generates the determination support information 43A and outputs it to the display control unit 44.
  • the main control unit 40 Based on the determination support information 43A, the main control unit 40 generates, for example, the determination support screen 60 shown in FIG. 10 and displays it on the display 5 (step S22). The information to be included is output. The information including the reason for termination is displayed on the determination support screen 60 by the display control unit 44, for example, as shown in FIG.
  • step S23 the main control unit 40 shifts the process to step S26.
  • the inspector determines whether or not each object displayed in the second region R2 of the first container image WP1 is a true cell. I do.
  • the main control unit 40 determines whether or not the determination result CR has been input by the inspector using the input operation unit 8 (step S24).
  • the main control unit 40 determines that the determination result CR has been input (step S24: YES)
  • the main control unit 40 outputs the determination result CR to the aggregation unit 45 (step S25).
  • step S26 determines whether or not the determination support process has been completed for all the wells 11 of one well plate 10.
  • step S26 determines that the determination support process has not been completed for all the wells 11 (step S26: NO)
  • step S11 the well selection screen 61 (see FIG. 9) is displayed again, and the inspector selects a new well 11.
  • the processes from step S11 to step S25 are repeatedly executed until the determination in step S26 is affirmed.
  • step S26 When the main control unit 40 determines that the determination support process has been completed for all the wells 11 (step S26: YES), the main control unit 40 causes the aggregation unit 45 to generate the aggregation result AR by totaling the determination result CR (step S27). ). Then, the main control unit 40 displays the aggregation result AR on the determination support screen 60 via the display control unit 44, for example, as shown in FIG. 12 (step S20). The inspector can decide whether or not to continue the culture for each well 11 based on the aggregated result AR.
  • the examiner only needs to perform the monoclonality determination only for the well 11 for which the cell colony 20A is determined to have the possibility of monoclonality.
  • the load can be reduced.
  • the inspector since the inspector only needs to make a determination for the second region R2 of the first container image WP1, the load on the inspector can be further reduced.
  • the cell colony 20A may be monochrome based on the two container image WPs of the third container image WP3 and the second container image WP2 captured in the culture process. There is. Alternatively, it may be determined whether or not the cell colony 20A may be monoclonality based on the three or more container image WPs imaged in the culture process.
  • the cell colony 20A is detected while selecting the container image WP in order from the container image WP having the longest elapsed time from the time of cell seeding to the container image WP having the shortest elapsed time.
  • the process is terminated when two or more cell colonies 20A are detected from the container image WP, or when cell colonies 20A are not detected.
  • the size of the detected cell colony 20A gradually decreases as the elapsed time from the time of cell seeding becomes shorter, it may be determined that the cell colony 20A may be monoclonal.
  • the cell colony 20A can be monochrome based on at least two container image WPs (ie, second container image WP2 and third container image WP3) with different elapsed times from cell seeding. The presence or absence of sex may be determined.
  • the support unit 54 generates the determination support information 43A for supporting the monochromeity determination by the inspector. Further, the support unit 54 detects a cell candidate region having a high probability of being a cell 20 from the second region R2 of the first container image WP1 by using a technique such as object detection by machine learning, and the detected cell candidate. The region may be shown in the second region R2.
  • FIG. 15 shows an example of the determination support screen 60 displaying the cell candidate region 70.
  • the support unit 54 may detect the number of cells 20 from the second region R2 of the first container image WP1 by using a method such as object detection by machine learning. Then, the support unit 54 may present that the cell colony 20A is a monoclonality when the number of detected cells 20 is 1. In this case, the determination result of the monoclonality can be obtained without the inspector visually determining the monochromeality.
  • the main control unit 40 terminates the process when two or more cell colonies 20A are detected in the first detection process and the second detection process, or when the cell colonies 20A are not detected.
  • the timing at which the processing is completed may be recorded. Further, the main control unit 40 may record the above-mentioned reason for termination in addition to the timing at which the processing is terminated.
  • the hardware configuration of the computer that constitutes the information processing device 4 can be modified in various ways.
  • the information processing apparatus 4 may be composed of a plurality of computers separated as hardware for the purpose of improving processing capacity and reliability.
  • a processing unit that executes various processes such as a main control unit 40, an image pickup control unit 41, an image acquisition unit 42, a determination support unit 43, a display control unit 44, and an aggregation unit 45.
  • various processors include CPU30, which is a general-purpose processor that executes software (program 31A) and functions as various processing units, and circuits after manufacturing FPGAs (Field Programmable Gate Arrays) and the like.
  • Dedicated electricity which is a processor with a circuit configuration specially designed to execute specific processing such as programmable logic device (PLD), ASIC (Application Specific Integrated Circuit), which is a processor whose configuration can be changed. Circuits etc. are included.
  • One processing unit may be composed of one of these various processors, or may be a combination of two or more processors of the same type or different types (for example, a combination of a plurality of FPGAs and / or a CPU). It may be configured in combination with FPGA). Further, a plurality of processing units may be configured by one processor.
  • one processor is configured by a combination of one or more CPUs and software, as represented by a computer such as a client and a server.
  • the processor functions as a plurality of processing units.
  • SoC System On Chip
  • the various processing units are configured by using one or more of the above-mentioned various processors as a hardware-like structure.
  • an electric circuit in which circuit elements such as semiconductor elements are combined can be used.

Landscapes

  • Chemical & Material Sciences (AREA)
  • Engineering & Computer Science (AREA)
  • Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
  • Organic Chemistry (AREA)
  • Health & Medical Sciences (AREA)
  • Wood Science & Technology (AREA)
  • Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
  • Zoology (AREA)
  • Biotechnology (AREA)
  • Genetics & Genomics (AREA)
  • General Health & Medical Sciences (AREA)
  • Microbiology (AREA)
  • Physics & Mathematics (AREA)
  • General Engineering & Computer Science (AREA)
  • Analytical Chemistry (AREA)
  • Biochemistry (AREA)
  • Proteomics, Peptides & Aminoacids (AREA)
  • Immunology (AREA)
  • Molecular Biology (AREA)
  • Biophysics (AREA)
  • Computer Vision & Pattern Recognition (AREA)
  • General Physics & Mathematics (AREA)
  • Theoretical Computer Science (AREA)
  • Medicinal Chemistry (AREA)
  • Biomedical Technology (AREA)
  • Sustainable Development (AREA)
  • Apparatus Associated With Microorganisms And Enzymes (AREA)

Abstract

細胞が播種された直後に撮像された第１容器画像と、細胞播種後の第１経過時間に撮像された第２容器画像と、第２経過時間に撮像された第３容器画像とを取得する画像取得処理と、第３容器画像から細胞コロニーの有無及び個数を検出する第１検出処理と、第１検出処理で１つの細胞コロニーを検出した場合に、第２容器画像から細胞コロニーの有無及び個数を検出する第２検出処理と、第２検出処理で１つの細胞コロニーを検出した場合に、第１検出処理及び第２検出処理で検出した細胞コロニーに基づき、モノクローナリティである可能性の有無を判定する判定処理と、モノクローナリティである可能性がある場合に、第１容器画像に基づくモノクローナリティ判定を可能とする支援処理と、を実行する情報処理装置。

Description

情報処理装置、情報処理方法、及びプログラム
　本開示の技術は、情報処理装置、情報処理方法、及びプログラムに関する。
　近年、抗体医薬品が注目されている。抗体医薬品は、従来の低分子医薬品と違って複雑なタンパク質等によるものであるので、人工的に合成することは難しい。そのため、抗体医薬品は、ＣＨＯ（Chinese Hamster Ovary）細胞等の細胞に所望のタンパク質に対応する遺伝子を挿入し、細胞の機能によって所望のタンパク質を産生させた後、タンパク質を抽出及び精製することにより製造される。
　また、ウェルプレートの各ウェル（培養容器）に、遺伝子が挿入された細胞を１つずつ播種して培養することにより、単一細胞に由来する細胞コロニーを生成するシングルセルクローニング技術が知られている。シングルセルクローニング技術によれば、抗体を生産する細胞の均一性が向上し、これにより生産される抗体医薬品の品質が向上する。
　しかし、ウェルに細胞を播種する際に、誤って複数の細胞が播種される場合がある。このような場合には、ウェル内で培養された細胞コロニーは、複数の細胞に由来することとなり、細胞の単一性（いわゆるモノクローナリティ）が得られない。ウェル内で培養された細胞コロニーについて、モノクローナリティを保証するためには、ウェルに播種された直後に細胞数が１つであったことを確認する必要がある（例えば、特開２０１９－２０１６６６号公報参照）。
　現在は、培養容器としてのウェルを撮像した画像（以下、容器画像という。）を、検査者が目視で観察することにより、モノクローナリティの判定が行われている。検査者は、容器画像を観察することにより、ウェル内の細胞数をカウントする。細胞コロニーが形成されたウェルについて、播種直後のウェル内の細胞数が１であることが確認された場合には、当該細胞コロニーに対するモノクローナリティが保証される。
　モノクローナリティ判定は、抗体を製造する１プロジェクトにつき、例えば３０００個のウェルに対して行う必要がある。このような多数の容器画像をすべて目視で確認することは、検査者に対する負荷が大きい。
　また、ウェルには、真の細胞の他に、培地、デブリ（死細胞、細胞片、ゴミなど）又はウェルの傷などが存在するため、１枚の容器画像には、多数の構造物が撮像される。このため、検査者が１枚の容器画像に基づいてモノクローナリティ判定を行うことは容易でなく、検査者に対する負荷が大きい。
　本開示の技術は、モノクローナリティ判定における検査者の負荷を軽減することを可能とする情報処理装置、情報処理方法、及びプログラムを提供することを目的とする。
　上記目的を達成するために、本開示の情報処理装置は、細胞が播種された容器を撮像した容器画像に基づき、容器に播種された細胞が単一であったか否かのモノクローナリティ判定を支援する情報処理装置であって、少なくとも１つのプロセッサを備え、プロセッサは、細胞が播種された直後に撮像された第１容器画像と、第１容器画像が撮像された後であって、細胞播種後の第１経過時間において撮像された第２容器画像と、第１経過時間よりも長い第２経過時間において撮像された第３容器画像との少なくとも３つの容器画像を取得する画像取得処理と、第３容器画像から細胞コロニーの有無及び個数を検出する第１検出処理と、第１検出処理で１つの細胞コロニーを検出した場合に、第２容器画像から細胞コロニーの有無及び個数を検出する第２検出処理と、第２検出処理で１つの細胞コロニーを検出した場合に、第１検出処理及び第２検出処理で検出した細胞コロニーに基づき、モノクローナリティである可能性の有無を判定する判定処理と、モノクローナリティである可能性があると判定した場合に、第１容器画像に基づくモノクローナリティ判定を可能とする支援処理とを実行する。
　プロセッサは、第２検出処理で検出した細胞コロニーのサイズが、第１検出処理で検出した細胞コロニーのサイズよりも小さい場合に、モノクローナリティである可能性があると判定することが好ましい。
　プロセッサは、第２検出処理において、第１検出処理で検出した細胞コロニーの領域を検出対象範囲として、第２容器画像から細胞コロニーの検出を行うことが好ましい。
　プロセッサは、支援処理において、第１検出処理で検出した細胞コロニーの領域である第１領域と、第２検出処理で検出した細胞コロニーの領域である第２領域とを、ディスプレイに表示された第１容器画像内に示すことが好ましい。
　プロセッサは、支援処理において、第１容器画像内の第２領域に映っている物体に対して、細胞であるか否かの判定結果の入力操作を可能とすることが好ましい。
　プロセッサは、支援処理において、第１容器画像内の第２領域から細胞であることの確度が高い細胞候補領域を検出し、細胞候補領域を第２領域内に示すことが好ましい。
　プロセッサは、支援処理において、第１容器画像内の第２領域から細胞の個数を検出し、細胞の個数が１である場合に、モノクローナリティであることを提示することが好ましい。
　プロセッサは、第１検出処理で２以上の細胞コロニーを検出した場合、又は細胞コロニーを検出しなかった場合に、第２検出処理、判定処理、及び支援処理を実行せずに処理を終了し、かつ、第２検出処理で２以上の細胞コロニーを検出した場合、又は細胞コロニーを検出しなかった場合に、判定処理及び支援処理を実行せずに処理を終了することが好ましい。
　プロセッサは、処理を終了する場合に、モノクローナリティでないことを提示することが好ましい。
　第１容器画像は、細胞が播種された当日又は翌日に撮像された容器画像であることが好ましい。
　本開示の情報処理方法は、細胞が播種された容器を撮像した容器画像に基づき、容器に播種された細胞が単一であったか否かのモノクローナリティ判定を支援する情報処理方法であって、細胞が播種された直後に撮像された第１容器画像と、第１容器画像が撮像された後であって、細胞播種後の第１経過時間において撮像された第２容器画像と、第１経過時間よりも長い第２経過時間において撮像された第３容器画像との少なくとも３つの容器画像を取得する画像取得処理と、第３容器画像から細胞コロニーの有無及び個数を検出する第１検出処理と、第１検出処理で１つの細胞コロニーを検出した場合に、第２容器画像から細胞コロニーの有無及び個数を検出する第２検出処理と、第２検出処理で１つの細胞コロニーを検出した場合に、第１検出処理及び第２検出処理で検出した細胞コロニーに基づき、モノクローナリティである可能性の有無を判定する判定処理と、モノクローナリティである可能性があると判定した場合に、第１容器画像に基づくモノクローナリティ判定を可能とする支援処理とを実行する。
　本開示のプログラムは、細胞が播種された容器を撮像した容器画像に基づき、容器に播種された細胞が単一であったか否かのモノクローナリティ判定を支援する処理をコンピュータに実行させるプログラムであって、細胞が播種された直後に撮像された第１容器画像と、第１容器画像が撮像された後であって、細胞播種後の第１経過時間において撮像された第２容器画像と、第１経過時間よりも長い第２経過時間において撮像された第３容器画像との少なくとも３つの容器画像を取得する画像取得処理と、第３容器画像から細胞コロニーの有無及び個数を検出する第１検出処理と、第１検出処理で１つの細胞コロニーを検出した場合に、第２容器画像から細胞コロニーの有無及び個数を検出する第２検出処理と、第２検出処理で１つの細胞コロニーを検出した場合に、第１検出処理及び第２検出処理で検出した細胞コロニーに基づき、モノクローナリティである可能性の有無を判定する判定処理と、モノクローナリティである可能性があると判定した場合に、第１容器画像に基づくモノクローナリティ判定を可能とする支援処理とをコンピュータに実行させる。
　本開示の技術によれば、モノクローナリティ判定における検査者の負荷を軽減することを可能とする情報処理装置、情報処理方法、及びプログラムを提供することができる。
判定支援システムの概略図である。 容器画像の種類を示す図である。 撮像装置による撮像動作の一例を示す図である。 情報処理装置のハードウェア構成を示すブロック図である。 情報処理装置の機能構成を示すブロック図である。 判定支援部の構成の詳細を示すブロック図である。 細胞コロニーがモノクローナリティを有する場合における判定支援処理の一例を示す図である。 細胞コロニーがモノクローナリティを有しない場合における判定支援処理の一例を示す。 ウェル選択画面の一例を示す図である。 判定支援画面の一例を示す図である。 終了理由の表示例を示す図である。 集計結果の表示例を示す図である。 判定支援システムの処理の流れの一例を示すフローチャート（前半）である。 判定支援システムの処理の流れの一例を示すフローチャート（後半）である。 細胞候補領域を表示した判定支援画面の一例を示す図である。
　添付図面に従って本開示の技術に係る実施形態の一例について説明する。
　図１は、一実施形態に係る判定支援システム２を概略的に示す。判定支援システム２は、培養容器としてのウェルに形成される細胞コロニーが単一細胞に由来するか否かを、検査者が目視で判定する「モノクローナリティ判定」を支援するシステムである。モノクローナリティ判定は、細胞が播種された時点におけるウェルの画像に基づいて、検査者により行われる。なお、細胞コロニーは、播種された細胞が分裂することにより形成された複数の細胞の塊である。
　判定支援システム２は、撮像装置３と、情報処理装置４とを含む。情報処理装置４は、コンピュータにより構成される。情報処理装置４には、ディスプレイ５、キーボード６、及びマウス７などが接続されている。キーボード６及びマウス７は、ユーザが情報を入力するための入力操作部８を構成する。入力操作部８には、タッチパネル等も含まれる。
　撮像装置３は、例えば位相差顕微鏡であり、細胞が播種されて培養されるウェルプレート１０を撮像対象として光学的に撮像する。図１では、撮像対象を照明するための光源等は、図示を省略している。ウェルプレート１０には、複数のウェル１１が形成されている。ウェルプレート１０として、例えば、９６個のウェル１１が形成された「９６ウェルプレート」が用いられる。各ウェル１１は、１つの細胞が播種される培養容器である。本実施形態では、図示の簡略化のため、ウェルプレート１０として、２４個のウェル１１が形成された「２４ウェルプレート」を示している。なお、ウェル１１は、本開示の技術に係る容器の一例である。
　細胞の播種は、細胞を含む培地溶液が入ったリザーバから、ピペット１２等を用いて各ウェル１１に液滴１３を分注することにより行われる。液滴１３には、細胞２０が含まれている。細胞２０は、例えば、抗体の生産を行うＣＨＯ細胞である。細胞２０には、例えば、所望のヒトタンパク質に対応する遺伝子が挿入されている。
　撮像装置３は、ウェルプレート１０の各ウェル１１を撮像対象として撮像を行う。例えば、撮像装置３は、ウェル１１の底部にフォーカスを合わせて撮像を行う。ウェル１１に細胞２０が播種された場合には、細胞２０は、ウェル１１内の培地溶液の底に沈降した状態で撮像装置３により撮像される。撮像装置３が撮像したウェル１１の画像（以下、容器画像という。）ＷＰは、それぞれ情報処理装置４に送信される。容器画像ＷＰには、播種された細胞２０が撮像される。
　図２は、撮像装置３により撮像される容器画像ＷＰの種類を示す。撮像装置３は、ウェル１１に細胞２０を播種してからの培養過程において、規定の時間が経過するたびにウェル１１を撮像して容器画像ＷＰを出力する。
　以下、細胞２０が播種された直後に撮像された容器画像ＷＰを、第１容器画像ＷＰ１という。また、第１容器画像ＷＰ１が撮像された後であって、細胞播種後の第１経過時間において撮像された容器画像ＷＰを、第２容器画像ＷＰ２という。さらに、第１経過時間よりも長い第２経過時間において撮像された容器画像ＷＰを、第３容器画像ＷＰ３という。
　第１容器画像ＷＰ１は、例えば、細胞２０が播種された当日又は翌日に撮像された容器画像ＷＰである。本実施形態では、第１容器画像ＷＰ１は、細胞２０が播種された当日に撮像された容器画像ＷＰとする。また、本実施形態では、第１経過時間及び第２経過時間を、それぞれ７日及び１４日とする。すなわち、第２容器画像ＷＰ２は、細胞２０が播種されてから７日が経過した後に撮像された容器画像ＷＰである。第３容器画像ＷＰ３は、細胞２０が播種されてから１４日が経過した後に撮像された容器画像ＷＰである。
　なお、撮像装置３が取得する容器画像ＷＰは、第１容器画像ＷＰ１、第２容器画像ＷＰ２、及び第３容器画像ＷＰ３の３種に限られず、その他の経過時間に取得された容器画像ＷＰを含んでいてもよい。
　以下の説明では、第１容器画像ＷＰ１、第２容器画像ＷＰ２、及び第３容器画像ＷＰ３を区別する必要がない場合には、単に容器画像ＷＰという。
　図２の上段は、１つのウェル１１に１つの細胞２０のみが播種された結果、１つの細胞コロニー２０Ａが形成された場合（すなわちモノクローナリティを有する場合）における容器画像ＷＰ１～ＷＰ３を模式的に示す。図２の下段は、１つのウェル１１に誤って２つの細胞２０が播種された結果、２つの細胞コロニー２０Ａが形成された場合（すなわちモノクローナリティを有しない場合）における容器画像ＷＰ１～ＷＰ３を模式的に示す。
　なお、ウェル１１には、細胞２０又は細胞コロニー２０Ａの他、デブリ（死細胞、細胞片、若しくはゴミなど）、又はウェル１１の傷などが多数存在し得る。
　図３は、撮像装置３による撮像動作の一例を示す。撮像装置３は、情報処理装置４により撮像動作が制御される。撮像装置３は、ウェルプレート１０に形成された複数のウェル１１を１つずつ順に撮像する。具体的には、撮像装置３は、撮像領域３Ａを順に変更しながら各ウェル１１を撮像することにより、容器画像ＷＰを生成する。
　また、撮像装置３は、容器画像ＷＰに付帯情報を付加した画像ファイルＦを作成して、情報処理装置４へ送信する。付帯情報には、撮像日時、プレートＩＤ（identification）、及びウェル位置が含まれる。撮像日時は、ウェル１１を撮像した日付及び時間に関する情報である。プレートＩＤは、個々のウェルプレート１０を識別する識別情報である。ウェル位置は、ウェルプレート１０内におけるウェル１１の位置情報である。例えば、ウェル位置は、縦方向に関する位置がアルファベットで表され、かつ横方向に関する位置が数字で表される。ウェル位置は、アルファベットと数字との組み合わせにより表される。
　プレートＩＤは、例えば、ウェルプレート１０に付されたバーコードを、バーコードリーダー（図示せず）で読み取ることにより取得される。
　撮像装置３は、情報処理装置４から指示される日時にウェルプレート１０の撮像を行う。撮像装置３は、ウェルプレート１０内のウェル１１ごとに画像ファイルＦを生成して、情報処理装置４へ送信する。
　図４は、情報処理装置４のハードウェア構成を示す。図４に示すように、情報処理装置４は、ＣＰＵ（Central Processing Unit）３０、記憶装置３１、及び通信部３２を備え、これらはバスライン３３を介して相互接続されている。また、バスライン３３には、前述のディスプレイ５及び入力操作部８が接続されている。
　ＣＰＵ３０は、記憶装置３１に格納されたプログラム３１Ａ及び各種データ（図示せず）を読み出して処理を実行することにより、各種機能を実現する演算装置である。ＣＰＵ３０は、本開示の技術に係るプロセッサの一例である。
　記憶装置３１は、例えば、ＲＡＭ（Random Access Memory）、ＲＯＭ（Read Only Memory）、又はストレージ装置等を含む。ＲＡＭは、例えば、ワークエリア等として用いられる揮発性メモリである。ＲＯＭは、例えば、プログラム３１Ａ及び各種データを保持するフラッシュメモリ等の不揮発性メモリである。ストレージ装置は、例えば、ＨＤＤ（Hard Disk Drive）又はＳＳＤ（Solid State Drive）である。ストレージは、ＯＳ（Operating System）、アプリケーションプログラム、画像データ、及び各種データ等を記憶する。
　通信部３２は、ＬＡＮ（Local Area Network）又はＷＡＮ（Wide Area Network）等のネットワークを介した各種情報の伝送制御を行うネットワークインターフェースである。ディスプレイ５は、各種画面を表示する。情報処理装置４は、各種画面を通じて、入力操作部８からの操作指示の入力を受け付ける。
　図５は、情報処理装置４の機能構成を示す。情報処理装置４の機能は、プログラム３１Ａに基づいてＣＰＵ３０が処理を実行することにより実現される。図５に示すように、情報処理装置４には、主制御部４０、撮像制御部４１、画像取得部４２、判定支援部４３、表示制御部４４、及び集計部４５が構成される。
　主制御部４０は、入力操作部８から入力される入力情報８Ａに基づき、情報処理装置４内の各部を制御する。撮像制御部４１は、主制御部４０からの制御に基づき、撮像装置３の撮像動作を制御する。
　画像取得部４２は、撮像装置３から出力される画像ファイルＦを取得し、取得した画像ファイルＦを判定支援部４３に入力する。画像ファイルＦには、第１容器画像ＷＰ１、第２容器画像ＷＰ２、又は第３容器画像ＷＰ３が含まれる。すなわち、画像取得部４２は、第１容器画像ＷＰ１、第２容器画像ＷＰ２、及び第３容器画像ＷＰ３の少なくとも３つの容器画像ＷＰを取得する画像取得処理を行う。
　判定支援部４３は、撮像装置３により、第１容器画像ＷＰ１、第２容器画像ＷＰ２、及び第３容器画像ＷＰ３が取得された後、検査者がモノクローナリティ判定を行う際に動作する。判定支援部４３は、画像取得部４２から入力される各画像ファイルＦに基づき、ウェル１１ごとに容器画像ＷＰ１～ＷＰ３を取得する。判定支援部４３は、ウェル１１ごとに、検査者によるモノクローナリティ判定を支援するための判定支援情報４３Ａを生成し、生成した判定支援情報４３Ａを表示制御部４４に入力する。
　表示制御部４４は、画像ファイルＦと判定支援情報４３Ａとに基づき、検査者によるモノクローナリティ判定を支援するための判定支援画面６０を生成する。また、表示制御部４４は、判定支援画面６０に対して検査者が入力操作部８を用いて操作することを可能とするように、判定支援画面６０をＧＵＩ（Graphical User Interface）として表示させる。
　集計部４５は、検査者が入力操作部８を操作することにより入力操作部８から入力されるモノクローナリティの判定結果ＣＲを、主制御部４０を介して受信し、受信した判定結果ＣＲを集計する。また、集計部４５は、判定結果ＣＲを、ウェルプレート１０ごとに集計することにより、集計結果ＡＲを生成する。表示制御部４４は、集計部４５により生成された集計結果ＡＲを、ディスプレイ５に表示させる。
　図６は、判定支援部４３の構成の詳細を示す。図６に示すように、判定支援部４３には、第１検出部５１、第２検出部５２、判定部５３、及び支援部５４が含まれる。第１検出部５１には、第３容器画像ＷＰ３が入力される。第２検出部５２には、第２容器画像ＷＰ２が入力される。支援部５４には、第１容器画像ＷＰ１が入力される。
　第１検出部５１は、例えば画像認識技術を用いて、第３容器画像ＷＰ３から細胞コロニー２０Ａの有無及び個数を検出する第１検出処理を行う。また、第１検出部５１は、第３容器画像ＷＰ３から１つの細胞コロニー２０Ａのみを検出した場合には、検出した細胞コロニー２０Ａの領域を特定し、特定した領域を、第１領域Ｒ１（図７（Ａ）参照）として第２検出部５２、判定部５３、及び支援部５４に出力する。
　第２検出部５２は、例えば画像認識技術を用いて、第１検出処理で１つの細胞コロニー２０Ａのみが検出された場合に、第２容器画像ＷＰ２から細胞コロニー２０Ａの有無及び個数を検出する第２検出処理を行う。また、第２検出部５２は、第１検出処理で検出された第１領域Ｒ１を検出対象範囲として、第２容器画像ＷＰ２から細胞コロニー２０Ａの検出を行う。第２検出部５２は、第２容器画像ＷＰ２から１つの細胞コロニー２０Ａのみを検出した場合には、検出した細胞コロニー２０Ａの領域を特定し、特定した領域を、第２領域Ｒ２（図７（Ｂ）参照）として判定部５３及び支援部５４に出力する。
　判定部５３は、第２検出処理で１つの細胞コロニー２０Ａのみが検出された場合に、第１検出処理及び第２検出処理で検出された細胞コロニー２０Ａに基づき、細胞コロニー２０Ａがモノクローナリティである可能性の有無を判定する判定処理を行う。本実施形態では、判定部５３は、第１検出処理及び第２検出処理で検出された細胞コロニー２０Ａのサイズを比較する。判定部５３は、例えば、第１領域Ｒ１と第２領域Ｒ２との面積を比較することにより、細胞コロニー２０Ａのサイズを比較する。
　判定部５３は、第２検出処理で検出した細胞コロニー２０Ａのサイズが、第１検出処理で検出した細胞コロニー２０Ａのサイズよりも小さい場合に、細胞コロニー２０Ａがモノクローナリティである可能性があると判定する。
　支援部５４は、判定処理でモノクローナリティである可能性があると判定された場合に、第１容器画像ＷＰ１に基づくモノクローナリティ判定を可能とする。本実施形態では、支援部５４は、第１容器画像ＷＰ１内における第１領域Ｒ１及び第２領域Ｒ２の位置及び大きさ（図７（Ｃ）参照）を表す情報を、判定支援情報４３Ａとして表示制御部４４に出力する。なお、判定支援情報４３Ａには、少なくとも第２領域Ｒ２を表す情報が含まれていればよい。
　表示制御部４４は、前述の判定支援画面６０（図５参照）に表示される第１容器画像ＷＰ１に第１領域Ｒ１及び第２領域Ｒ２を示す（図７（Ｃ）参照）。これにより、検査者がモノクローナリティ判定を行う際に、第１容器画像ＷＰ１内の第２領域Ｒ１に映っている物体に対して、細胞であるか否かの判定結果の入力操作を行うことを可能とする。
　また、主制御部４０は、第１検出処理で２以上の細胞コロニー２０Ａが検出された場合、又は細胞コロニー２０Ａが検出されなかった場合に、判定支援部４３に、第２検出処理、判定処理、及び支援処理を実行させずに処理を終了させる。また、主制御部４０は、第２検出処理で２以上の細胞コロニー２０Ａが検出されなかった場合、又は細胞コロニー２０Ａが検出されなかった場合に、判定支援部４３に、判定処理及び支援処理を実行させずに処理を終了させる。
　主制御部４０は、判定支援部４３の処理を終了させる場合に、終了理由を検査者に対して提示する。例えば、主制御部４０は、終了理由として、検出された細胞コロニー２０Ａがモノクローナリティでないことを示す情報を、表示制御部４４により判定支援画面６０に表示させる。なお、主制御部４０は、当該情報を、スピーカ（図示せず）により、音等で提示してもよい。
　図７は、細胞コロニー２０Ａがモノクローナリティを有する場合における判定支援処理の一例を示す。図７（Ａ）は、第１検出処理により、第３容器画像ＷＰ３から１つの細胞コロニー２０Ａが検出され、検出された細胞コロニー２０Ａを含む第１領域Ｒ１が特定された例を示している。
　図７（Ｂ）は、第２検出処理により、第２容器画像ＷＰ２の第１領域Ｒ１から１つの細胞コロニー２０Ａが検出され、検出された細胞コロニー２０Ａを含む第２領域Ｒ２が特定された例を示している。
　図７（Ｂ）に示すように、第２領域Ｒ２のサイズは、第１領域Ｒ１のサイズよりも小さい。これは、細胞播種時からの時間の経過に伴って、細胞コロニー２０Ａのサイズが細胞分裂により増大していることを示している。この場合、細胞コロニー２０Ａが単一の細胞２０に由来すると推定されるので、判定処理では、細胞コロニー２０Ａがモノクローナリティである可能性があると判定される。
　図７（Ｃ）は、支援処理により、第１容器画像ＷＰ１に、第１領域Ｒ１及び第２領域Ｒ２を表示する例を示している。
　図８は、細胞コロニー２０Ａがモノクローナリティを有しない場合における判定支援処理の一例を示す。図８（Ａ）は、第１検出処理により、第３容器画像ＷＰ３から１つの細胞コロニー２０Ａが検出され、検出された細胞コロニー２０Ａを含む第１領域Ｒ１が特定された例を示している。
　図８（Ｂ）は、第２検出処理により、第２容器画像ＷＰ２の第１領域Ｒ１から２つの細胞コロニー２０Ａが検出された例を示している。このように、２つの細胞コロニー２０Ａが検出されると、主制御部４０により判定支援処理が終了される。
　図９は、モノクローナリティ判定を行うウェル位置を選択するためのウェル選択画面６１の一例を示す。ウェル選択画面６１は、モノクローナリティ判定を開始する前に、主制御部４０の制御に基づき、表示制御部４４によりディスプレイ５に表示される。
　ウェル選択画面６１には、プレートＩＤを選択するための選択操作部６１Ａと、ウェル位置を選択するための選択操作部６１Ｂとが表示される。検査者は、入力操作部８を用いて選択操作部６１Ａを操作することにより、所望のプレートＩＤを選択することができる。また、入力操作部８を用いて選択操作部６１Ｂを操作することにより、所望のウェル位置を選択することができる。選択操作部６１Ａにより選択されたプレートＩＤを有するウェルプレート１０において、選択操作部６１Ｂにより選択されたウェル位置に対応するウェル１１の第１容器画像ＷＰ１が判定支援画面６０に表示される。
　図１０は、判定支援画面６０の一例を示す。判定支援画面６０には、ウェル選択画面６１により選択されたウェル位置に対応するウェル１１の第１容器画像ＷＰ１が表示される。第１容器画像ＷＰ１には、第１検出処理及び第２検出処理で検出された第１領域Ｒ１及び第２領域Ｒ２が表示される。なお、第１容器画像ＷＰ１には、少なくとも第２領域Ｒ２が表示されていればよい。
　判定支援画面６０は、第１容器画像ＷＰ１の第２領域Ｒ２に映っている物体に対して、細胞であるか否かの判定結果の入力操作を可能とするための入力インタフェースである。例えば、表示制御部４４は、検査者の入力操作部８を用いた操作に応じて、ＧＵＩとしての選択ボックス６２を、判定支援画面６０内に表示させる。
　検査者は、選択ボックス６２に基づき、入力操作部８を用いて、第１容器画像ＷＰ１の第２領域Ｒ２に映っている物体が細胞と非細胞（デブリ又は傷など）とのいずれであるかを選択する。入力操作部８を用いて選択が確定されると、細胞であるか否かの判定結果ＣＲが前述の集計部４５に入力される。集計の結果、第２容器画像ＷＰ２において確認された真の細胞の数が１である場合には、当該ウェル１１に形成された細胞コロニー２０Ａは、単一細胞に由来し、モノクローナリティを有すると判定される。
　なお、図１０では、表示制御部４４は、第１容器画像ＷＰ１の第１領域Ｒ１及び第２領域Ｒ２を含む部分を拡大対象領域として拡大表示している。検査者の入力操作部８を用いた操作に応じて、第１容器画像ＷＰ１内の拡大対象領域、及び拡大倍率を変更可能としてもよい。
　図１１は、判定支援部４３の処理を終了させる場合に、検査者に対して提示される終了理由の一例を示す。図１１に示すように、判定支援画面６０には、例えば、処理が終了したことと、その終了理由が表示される。終了理由として、例えば、「２つの細胞コロニーが検出されたため、モノクローナリティでないと推定される。」とのメッセージが表示される。
　図１２は、表示制御部４４による集計結果ＡＲの表示例を示す。図１２に示すように、集計結果ＡＲに基づき、ウェルプレート１０の各ウェル１１が、「単一細胞」、「２細胞以上」、又は「細胞なし」のいずれであるかが表示される。図１２に示す表示態様は、いわゆるヒートマップと呼ばれるものであり、ユーザは、モノクローナリティを有する細胞コロニー２０Ａが存在するウェル１１の数及び位置を視覚的に把握することができる。なお、集計結果ＡＲは、ヒートマップに限定されず、ウェル１１ごとに、細胞の単一性、又は、細胞の個数が表形式でリスト化されたものであってもよい。
　次に、判定支援システム２の処理の流れの一例を、図１３及び図１４に示すフローチャートを用いて説明する。まず、画像取得部４２は、撮像装置３により、第１容器画像ＷＰ１、第２容器画像ＷＰ２、及び第３容器画像ＷＰ３が取得された後、各容器画像ＷＰを含む画像ファイルＦを撮像装置３から取得する（ステップＳ１０）。
　次に、主制御部４０は、例えば図９に示すウェル選択画面６１をディスプレイ５に表示させる（ステップＳ１１）。主制御部４０は、入力操作部８を用いて検査者により１つのウェル１１が選択されたか否かを判定する（ステップＳ１２）。１つのウェル１１が選択されると（ステップＳ１２：ＹＥＳ）、選択されたウェル１１の第３容器画像ＷＰ３に基づき、第１検出部５１により第１検出処理が行われる（ステップＳ１３）。
　主制御部４０は、第１検出処理で１つの細胞コロニー２０Ａのみが検出されたか否かを判定する（ステップＳ１４）。主制御部４０は、第１検出処理で１つの細胞コロニー２０Ａのみが検出された場合には（ステップＳ１４：ＹＥＳ）、処理をステップＳ１５に移行させる。一方、主制御部４０は、第１検出処理で２以上の細胞コロニー２０Ａが検出された場合、又は細胞コロニー２０Ａが検出されなかった場合には（ステップＳ１４：ＮＯ）、処理をステップＳ２３に移行させる。
　ステップＳ１５では、第１検出部５１は、検出した細胞コロニー２０Ａの領域である第１領域Ｒ１を出力する。次に、第２容器画像ＷＰ２に基づき、第２検出部５２により第２検出処理が行われる（ステップＳ１６）。第２検出処理では、第１領域Ｒ１を検出対象範囲として、細胞コロニー２０Ａの検出が行われる。
　主制御部４０は、第２検出処理で１つの細胞コロニー２０Ａのみが検出されたか否かを判定する（ステップＳ１７）。主制御部４０は、第２検出処理で１つの細胞コロニー２０Ａのみが検出された場合には（ステップＳ１７：ＹＥＳ）、処理をステップＳ１８に移行させる。一方、主制御部４０は、第２検出処理で２以上の細胞コロニー２０Ａが検出された場合、又は細胞コロニー２０Ａが検出されなかった場合には（ステップＳ１７：ＮＯ）、処理をステップＳ２３に移行させる。
　ステップＳ１５では、第２検出部５２は、検出した細胞コロニー２０Ａの領域である第２領域Ｒ２を出力する。次に、判定部５３は、第１領域Ｒ１と第２領域Ｒ２とに基づき、検出した細胞コロニー２０Ａがモノクローナリティである可能性の有無を判定する判定処理を行う（ステップＳ１９）。
　主制御部４０は、判定処理で、モノクローナリティである可能性があると判定されたか否かを判定する（ステップＳ１９）。主制御部４０は、判定処理でモノクローナリティである可能性があると判定された場合には（ステップＳ１９：ＹＥＳ）、処理をステップＳ２１に移行させる。一方、主制御部４０は、判定処理でモノクローナリティである可能性がないと判定された場合には（ステップＳ１９：ＮＯ）、処理をステップＳ２３に移行させる。
　ステップＳ２１では、支援部５４により判定支援情報４３Ａが生成されて表示制御部４４に出力される。主制御部４０は、判定支援情報４３Ａに基づき、例えば図１０に示す判定支援画面６０を生成してディスプレイ５に表示させる（ステップＳ２２）一方、ステップＳ２３では、主制御部４０により、終了理由を含む情報が出力される。終了理由を含む情報は、表示制御部４４により、例えば図１１に示すように判定支援画面６０に表示される。主制御部４０は、ステップＳ２３の後、処理をステップＳ２６に移行させる。
　検査者は、ステップＳ２２で表示された判定支援画面６０（図１０参照）に基づき、第１容器画像ＷＰ１の第２領域Ｒ２に映っている各物体について、真の細胞であるか否かの判定を行う。主制御部４０は、検査者により入力操作部８を用いて判定結果ＣＲが入力されたか否かを判定する（ステップＳ２４）。主制御部４０は、判定結果ＣＲが入力されたと判定すると（ステップＳ２４：ＹＥＳ）、判定結果ＣＲを集計部４５に出力する（ステップＳ２５）。
　次に、主制御部４０は、１つのウェルプレート１０の全てのウェル１１について判定支援処理が終了したか否かを判定する（ステップＳ２６）。主制御部４０は、全てのウェル１１について判定支援処理が終了していないと判定した場合には（ステップＳ２６：ＮＯ）、処理をステップＳ１１に移行させる。ステップＳ１１では、ウェル選択画面６１（図９参照）が再び表示され、検査者により新たなウェル１１が選択される。ステップＳ１１からステップＳ２５までの処理は、ステップＳ２６の判定が肯定されるまでの間、繰り返し実行される。
　主制御部４０は、全てのウェル１１について判定支援処理が終了したと判定すると（ステップＳ２６：ＹＥＳ）、集計部４５に、判定結果ＣＲを集計することにより、集計結果ＡＲを生成させる（ステップＳ２７）。そして、主制御部４０は、表示制御部４４を介して、例えば図１２に示すように、集計結果ＡＲを判定支援画面６０に表示させる（ステップＳ２０）。検査者は、集計結果ＡＲに基づき、ウェル１１ごとに培養を続けるか否かを決定することができる。
　以上のように、本開示の技術によれば、検査者は、細胞コロニー２０Ａがモノクローナリティである可能性があると判定されたウェル１１についてのみモノクローナリティ判定を行えばよいため、検査者の負荷を軽減することができる。また、本開示の技術によれば、検査者は、第１容器画像ＷＰ１の第２領域Ｒ２についてのみ判定を行えばよいため、検査者の負荷をさらに軽減することができる。
　以下に、上記実施形態の各種変形例を示す。
　［第１変形例］
　上記実施形態では、培養過程において撮像された第３容器画像ＷＰ３と第２容器画像ＷＰ２との２つの容器画像ＷＰに基づいて、細胞コロニー２０Ａがモノクローナリティである可能性の有無を判定している。これに代えて、培養過程において撮像された３以上の容器画像ＷＰに基づいて、細胞コロニー２０Ａがモノクローナリティである可能性の有無を判定してもよい。
　例えば、細胞播種時からの経過時間が最も長い容器画像ＷＰから経過時間が短い容器画像ＷＰへ順に容器画像ＷＰを選択しながら細胞コロニー２０Ａを検出する。容器画像ＷＰから２以上の細胞コロニー２０Ａが検出された場合、又は細胞コロニー２０Ａが検出されない場合に処理を終了させる。検出された細胞コロニー２０Ａのサイズが、細胞播種時からの経過時間が短くなるにつれて次第に小さくなる場合に、当該細胞コロニー２０Ａはモノクローナリティである可能性があると判定すればよい。
　本開示の技術では、細胞播種時からの経過時間が異なる少なくとも２つの容器画像ＷＰ（すなわち、第２容器画像ＷＰ２及び第３容器画像ＷＰ３）に基づいて、細胞コロニー２０Ａがモノクローナリティである可能性の有無を判定すればよい。
　［第２変形例］
　上記実施形態では、支援部５４は、検査者によりモノクローナリティ判定を支援するための判定支援情報４３Ａを生成している。さらに、支援部５４は、機械学習による物体検出等の手法を用いて、第１容器画像ＷＰ１の第２領域Ｒ２から細胞２０であることの確度が高い細胞候補領域を検出し、検出した細胞候補領域を第２領域Ｒ２内に示してもよい。
　図１５は、細胞候補領域７０を表示した判定支援画面６０の一例を示す。第１容器画像ＷＰ１の第２領域Ｒ２内に細胞候補領域７０を表示することにより、検査者は、容易にモノクローナリティ判定を行うことができる。
　さらに、支援部５４は、機械学習による物体検出等の手法を用いて、第１容器画像ＷＰ１の第２領域Ｒ２から細胞２０の個数を検出してもよい。そして、支援部５４は、検出した細胞２０の個数が１である場合に、細胞コロニー２０Ａがモノクローナリティであることを提示してもよい。この場合、検査者が目視によるモノクローナリティ判定を行うことなく、モノクローナリティの判定結果が得られる。
　［第３変形例］
　上記実施形態では、主制御部４０は、第１検出処理及び第２検出処理において２以上の細胞コロニー２０Ａが検出された場合、又は細胞コロニー２０Ａが検出されない場合に処理を終了させているが、処理を終了したタイミングを記録してもよい。また、主制御部４０は、処理を終了したタイミングに加えて、前述の終了理由を記録してもよい。
　このように記録したタイミング及び終了理由を、例えば、抗体を製造する１プロジェクトに含まれる多数のウェル全体について統計を取ることにより、細胞培養過程において発生する異常を早期に発見することができる。
　情報処理装置４を構成するコンピュータのハードウェア構成は種々の変形が可能である。例えば、情報処理装置４を、処理能力および信頼性の向上を目的として、ハードウェアとして分離された複数台のコンピュータで構成することも可能である。
　上記実施形態において、例えば、主制御部４０、撮像制御部４１、画像取得部４２、判定支援部４３、表示制御部４４、及び集計部４５といった各種の処理を実行する処理部（Processing Unit）のハードウェア的な構造としては、次に示す各種のプロセッサ（Processor）を用いることができる。各種のプロセッサには、上述したように、ソフトウェア（プログラム３１Ａ）を実行して各種の処理部として機能する汎用的なプロセッサであるＣＰＵ３０に加えて、ＦＰＧＡ（Field Programmable Gate Array）等の製造後に回路構成を変更可能なプロセッサであるプログラマブルロジックデバイス（Programmable Logic Device: PLD）、ＡＳＩＣ（Application Specific Integrated Circuit）等の特定の処理を実行させるために専用に設計された回路構成を有するプロセッサである専用電気回路等が含まれる。
　１つの処理部は、これらの各種のプロセッサのうちの１つで構成されてもよいし、同種または異種の２つ以上のプロセッサの組み合わせ（例えば、複数のＦＰＧＡの組み合わせ、及び／又は、ＣＰＵとＦＰＧＡとの組み合わせ）で構成されてもよい。また、複数の処理部を１つのプロセッサで構成してもよい。
　複数の処理部を１つのプロセッサで構成する例としては、第１に、クライアントおよびサーバ等のコンピュータに代表されるように、１つ以上のＣＰＵとソフトウェアの組み合わせで１つのプロセッサを構成し、このプロセッサが複数の処理部として機能する形態がある。第２に、システムオンチップ（System On Chip: SoC）等に代表されるように、複数の処理部を含むシステム全体の機能を１つのＩＣ（Integrated Circuit）チップで実現するプロセッサを使用する形態がある。このように、各種の処理部は、ハードウェア的な構造として、上記各種のプロセッサの１つ以上を用いて構成される。
　さらに、これらの各種のプロセッサのハードウェア的な構造としては、より具体的には、半導体素子等の回路素子を組み合わせた電気回路（circuitry）を用いることができる。
　本明細書に記載された全ての文献、特許出願および技術規格は、個々の文献、特許出願および技術規格が参照により取り込まれることが具体的かつ個々に記された場合と同程度に、本明細書中に参照により取り込まれる。

Claims (12)

  1. 　細胞が播種された容器を撮像した容器画像に基づき、前記容器に播種された細胞が単一であったか否かのモノクローナリティ判定を支援する情報処理装置であって、
    　少なくとも１つのプロセッサを備え、
    　前記プロセッサは、
    　細胞が播種された直後に撮像された第１容器画像と、前記第１容器画像が撮像された後であって、細胞播種後の第１経過時間において撮像された第２容器画像と、前記第１経過時間よりも長い第２経過時間において撮像された第３容器画像との少なくとも３つの前記容器画像を取得する画像取得処理と、
    　前記第３容器画像から細胞コロニーの有無及び個数を検出する第１検出処理と、
    　前記第１検出処理で１つの細胞コロニーを検出した場合に、前記第２容器画像から細胞コロニーの有無及び個数を検出する第２検出処理と、
    　前記第２検出処理で１つの細胞コロニーを検出した場合に、前記第１検出処理及び前記第２検出処理で検出した細胞コロニーに基づき、モノクローナリティである可能性の有無を判定する判定処理と、
    　モノクローナリティである可能性があると判定した場合に、前記第１容器画像に基づくモノクローナリティ判定を可能とする支援処理と、
    　を実行する情報処理装置。
  2. 　前記プロセッサは、
    　前記第２検出処理で検出した細胞コロニーのサイズが、前記第１検出処理で検出した細胞コロニーのサイズよりも小さい場合に、モノクローナリティである可能性があると判定する、
    　請求項１に記載の情報処理装置。
  3. 　前記プロセッサは、
    　前記第２検出処理において、前記第１検出処理で検出した細胞コロニーの領域を検出対象範囲として、前記第２容器画像から細胞コロニーの検出を行う、
    　請求項２に記載の情報処理装置。
  4. 　前記プロセッサは、
    　前記支援処理において、前記第１検出処理で検出した細胞コロニーの領域である第１領域と、前記第２検出処理で検出した細胞コロニーの領域である第２領域とを、ディスプレイに表示された前記第１容器画像内に示す、
    　請求項３に記載の情報処理装置。
  5. 　前記プロセッサは、
    　前記支援処理において、前記第１容器画像内の前記第２領域に映っている物体に対して、細胞であるか否かの判定結果の入力操作を可能とする、
    　請求項４に記載の情報処理装置。
  6. 　前記プロセッサは、
    　前記支援処理において、前記第１容器画像内の前記第２領域から細胞であることの確度が高い細胞候補領域を検出し、前記細胞候補領域を前記第２領域内に示す、
    　請求項５に記載の情報処理装置。
  7. 　前記プロセッサは、
    　前記支援処理において、前記第１容器画像内の前記第２領域から細胞の個数を検出し、細胞の個数が１である場合に、モノクローナリティであることを提示する、
    　請求項４に記載の情報処理装置。
  8. 　前記プロセッサは、
    　前記第１検出処理で２以上の細胞コロニーを検出した場合、又は細胞コロニーを検出しなかった場合に、前記第２検出処理、前記判定処理、及び前記支援処理を実行せずに処理を終了し、
    　かつ、前記第２検出処理で２以上の細胞コロニーを検出した場合、又は細胞コロニーを検出しなかった場合に、前記判定処理及び前記支援処理を実行せずに処理を終了する、
    　請求項１から請求項７のうちいずれか１項に記載の情報処理装置。
  9. 　前記プロセッサは、
    　処理を終了する場合に、モノクローナリティでないことを提示する、
    　請求項８に記載の情報処理装置。
  10. 　前記第１容器画像は、細胞が播種された当日又は翌日に撮像された前記容器画像である、
    　請求項１から請求項９のうちいずれか１項に記載の情報処理装置。
  11. 　細胞が播種された容器を撮像した容器画像に基づき、前記容器に播種された細胞が単一であったか否かのモノクローナリティ判定を支援する情報処理方法であって、
    　細胞が播種された直後に撮像された第１容器画像と、前記第１容器画像が撮像された後であって、細胞播種後の第１経過時間において撮像された第２容器画像と、前記第１経過時間よりも長い第２経過時間において撮像された第３容器画像との少なくとも３つの前記容器画像を取得する画像取得処理と、
    　前記第３容器画像から細胞コロニーの有無及び個数を検出する第１検出処理と、
    　前記第１検出処理で１つの細胞コロニーを検出した場合に、前記第２容器画像から細胞コロニーの有無及び個数を検出する第２検出処理と、
    　前記第２検出処理で１つの細胞コロニーを検出した場合に、前記第１検出処理及び前記第２検出処理で検出した細胞コロニーに基づき、モノクローナリティである可能性の有無を判定する判定処理と、
    　モノクローナリティである可能性があると判定した場合に、前記第１容器画像に基づくモノクローナリティ判定を可能とする支援処理と、
    　を実行する情報処理方法。
  12. 　細胞が播種された容器を撮像した容器画像に基づき、前記容器に播種された細胞が単一であったか否かのモノクローナリティ判定を支援する処理をコンピュータに実行させるプログラムであって、
    　細胞が播種された直後に撮像された第１容器画像と、前記第１容器画像が撮像された後であって、細胞播種後の第１経過時間において撮像された第２容器画像と、前記第１経過時間よりも長い第２経過時間において撮像された第３容器画像との少なくとも３つの前記容器画像を取得する画像取得処理と、
    　前記第３容器画像から細胞コロニーの有無及び個数を検出する第１検出処理と、
    　前記第１検出処理で１つの細胞コロニーを検出した場合に、前記第２容器画像から細胞コロニーの有無及び個数を検出する第２検出処理と、
    　前記第２検出処理で１つの細胞コロニーを検出した場合に、前記第１検出処理及び前記第２検出処理で検出した細胞コロニーに基づき、モノクローナリティである可能性の有無を判定する判定処理と、
    　モノクローナリティである可能性があると判定した場合に、前記第１容器画像に基づくモノクローナリティ判定を可能とする支援処理と、
    　をコンピュータに実行させるプログラム。
PCT/JP2021/021999 2020-07-06 2021-06-09 情報処理装置、情報処理方法、及びプログラム WO2022009595A1 (ja)

Applications Claiming Priority (2)

Application Number Priority Date Filing Date Title
JP2020-116668 2020-07-06
JP2020116668 2020-07-06

Publications (1)

Publication Number Publication Date
WO2022009595A1 true WO2022009595A1 (ja) 2022-01-13

Family

ID=79552450

Family Applications (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
PCT/JP2021/021999 WO2022009595A1 (ja) 2020-07-06 2021-06-09 情報処理装置、情報処理方法、及びプログラム

Country Status (1)

Country Link
WO (1) WO2022009595A1 (ja)

Citations (2)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
US20180106713A1 (en) * 2015-06-02 2018-04-19 Baxalta Incorporat Method for picking a colony of cells
WO2018223142A1 (en) * 2017-06-02 2018-12-06 Molecular Devices, Llc Cell colony picking system

Patent Citations (2)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
US20180106713A1 (en) * 2015-06-02 2018-04-19 Baxalta Incorporat Method for picking a colony of cells
WO2018223142A1 (en) * 2017-06-02 2018-12-06 Molecular Devices, Llc Cell colony picking system

Non-Patent Citations (2)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Title
ANONYMOUS: "MOLECULAR DEVICES", CLONESELECT IMAGER OPERATOR MANUAL, 2011, pages 1 - 5, 49-51, 69, Retrieved from the Internet <URL:http://mdc.custhelp.com/euf/assets/content/Cenetix/CSI/05MAN107O.A5%2OCloneSelect%2OImager%200perator%20Manual%201.3.73.1073.pdf> [retrieved on 20210802] *
SYNENTEC, CELLAVISTA APPLICATION NOTE, 2013, pages 1 - 6, Retrieved from the Internet <URL:https://www.primetech.co.jp/Portals/O/db/product/SynenTec/Cellavista_App_Cell_Line_Development_J_rev00_201303.pdf> [retrieved on 20210802] *

Similar Documents

Publication Publication Date Title
US11901077B2 (en) Multiple instance learner for prognostic tissue pattern identification
JP6816196B2 (ja) 包括的なマルチアッセイ組織分析のためのシステムおよび方法
JP6348504B2 (ja) 生体試料の分割画面表示及びその記録を取り込むためのシステム及び方法
US9891804B2 (en) Selection and display of biomarker expressions
US10643396B2 (en) Methods and software for creating a 3D image from images of multiple histological sections and for mapping anatomical information from a reference atlas to a histological image
AU2014237346B2 (en) System and method for reviewing and analyzing cytological specimens
WO2014103664A1 (ja) 情報処理装置、情報処理方法、およびプログラム
JP4037869B2 (ja) 画像解析支援方法、画像解析支援プログラムおよび画像解析支援装置
CN108140249A (zh) 用于显示生物标本的多个图像的图像处理系统和方法
JP6836994B2 (ja) メソダイセクションのためのシステム及び方法
Kieslich et al. Highly accurate structure-based prediction of HIV-1 coreceptor usage suggests intermolecular interactions driving tropism
Read et al. Automated multi-objective calibration of biological agent-based simulations
JP6355082B2 (ja) 病理診断支援装置及び病理診断支援方法
WO2022009595A1 (ja) 情報処理装置、情報処理方法、及びプログラム
WO2016114009A1 (ja) 融合遺伝子解析装置、融合遺伝子解析方法、及びプログラム
JPWO2018128091A1 (ja) 画像解析プログラム及び画像解析方法
JP2024112965A (ja) 画像解析装置
WO2022004319A1 (ja) 情報処理装置、情報処理方法、及びプログラム
US20230127415A1 (en) Information processing device, information processing method, and program
JP7065422B2 (ja) 表示制御装置、表示制御方法およびプログラム
JP2020113200A (ja) 画像生成装置、撮像装置、培養装置、画像生成方法およびプログラム
Rosa et al. Cinder: keeping crystallographers app-y
JP2015022438A (ja) レポート作成支援装置、その方法、及びプログラム
JP2022040540A (ja) 画像処理方法
WO2024161784A1 (ja) 判定支援装置、判定支援装置の作動方法、および判定支援装置の作動プログラム

Legal Events

Date Code Title Description
121 Ep: the epo has been informed by wipo that ep was designated in this application

Ref document number: 21838467

Country of ref document: EP

Kind code of ref document: A1

NENP Non-entry into the national phase

Ref country code: DE

122 Ep: pct application non-entry in european phase

Ref document number: 21838467

Country of ref document: EP

Kind code of ref document: A1

NENP Non-entry into the national phase

Ref country code: JP