WO2020241816A1 - 新規な消化器がん治療剤およびそのスクリーニング方法 - Google Patents
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Definitions
- the present invention relates to a novel therapeutic agent for gastrointestinal cancer and a screening method thereof.
- Pancreatic cancer is extremely difficult to detect early, and in many cases, local progression or distant metastasis is observed at the time of diagnosis, and the prognosis is extremely poor.
- radiation therapy and anticancer drugs such as gemcitabine are used, but the effects of both are limited.
- Pancreatic cancer is often derived from the pancreatic duct epithelium, and the subgroup showing the epithelial-mesenchymal transition (EMT) gene profile has been shown to have a poor prognosis.
- EMT epithelial-mesenchymal transition
- angiogenesis is suppressed due to enhanced interstitial reaction (fibrosis) in the tumor tissue, the patient is in a hypoxic and hypoxic state, and there is little infiltration of cytotoxic T cells, CD4 + Th1 helper T cells, natural killer cells, etc. has been reported. Therefore, the therapeutic effect of immune checkpoint-inhibiting antibodies, which have been attracting attention in recent years, for pancreatic cancer is low. CAR-T therapy targeting MUC1 or mesothelin has also been attempted, but no significant antitumor effect has been obtained.
- pancreatic cancer model mice and the like that the IL-6 signal is involved in the development and progression of pancreatic cancer. Therefore, it is expected to create a method for diagnosing and treating pancreatic cancer targeting a group of molecules involved in IL-6 signal or IL-6 production enhancement, but it has not yet been developed.
- AT-rich interactive domain 5A (AT Rich Interactive Domain 5A, hereinafter abbreviated as "Arid5A") has been reported as a stabilizing protein for IL-6 mRNA (see, for example, Non-Patent Document 1).
- the present inventors have found that an Arid5A inhibitor is effective in treating sepsis and is effective in treating lung disease (Patent Documents 1 and 2).
- the expression level of Arid5A fluctuates in some cancer types, suggesting that it may be one of the candidate genes for detecting or diagnosing cancer. (Patent Documents 3 to 6).
- In prostate cancer cell lines it is known that knockdown of the expression of the Arid5A gene suppresses cell proliferation (Non-Patent Document 2).
- An object of the present invention is to provide a novel therapeutic agent for gastrointestinal cancer and a screening method for a candidate substance useful for the treatment of gastrointestinal cancer.
- the present invention includes the following inventions in order to solve the above problems.
- a gastrointestinal cancer therapeutic agent containing an Arid5A inhibitor as an active ingredient.
- the nucleic acid oligo is selected from the group consisting of siRNA, shRNA, antisense nucleic acid, decoy nucleic acid, nucleic acid aptamer and ribozyme.
- pancreatic cancer therapeutic agent according to the above [3], wherein the polypeptide is a cyclic polypeptide.
- the Arid5A inhibitor suppresses epithelial-mesenchymal transition of cancer cells.
- the Arid5A inhibitor suppresses infiltration of cancer cells.
- a method comprising (1) detecting the effect of a test substance on the expression of Arid5A, and (2) selecting a substance that reduces the expression of Arid5A as compared with the case where the test substance is not used.
- a screening method for candidate substances useful for the treatment of gastrointestinal cancer comprising (a) detecting the effect of a test substance on the function of Arid5A, and (b) selecting a substance that reduces the function of Arid5A as compared with the case where the test substance is not used.
- the present invention further includes the following inventions.
- a screening method for candidate substances useful for the treatment of pancreatic cancer A method comprising (1) detecting the effect of a test substance on the expression of Arid5A, and (2) selecting a substance that reduces the expression of Arid5A as compared with the case where the test substance is not used. [108] A screening method for candidate substances useful for the treatment of pancreatic cancer.
- a method comprising (a) detecting the effect of a test substance on the function of Arid5A, and (b) selecting a substance that reduces the function of Arid5A as compared with the case where the test substance is not used.
- the present invention it is possible to provide a novel therapeutic agent for gastrointestinal cancer.
- the present invention can provide a novel screening method for candidate substances useful for the treatment of gastrointestinal cancer.
- results of Western blot analysis of Arid5a expression in KPC cells derived from normal mouse embryonic fibroblasts (MEF), metastatic mouse melanoma cells (B16 / F10) and human pancreatic duct adenocarcinoma model mice (KPC mice) It is a figure which shows. It is a figure which shows the exon 2 and the exon 5 deletion region of Arid5a when Arid5a-deficient KPC cells were prepared using the CRISPR / Cas9 system. It is a figure which shows the result of having verified the deletion of exon 2 and exon 5 of the Arid5a gene in the prepared Arid5a-deficient KPC cells (KO4 and KO5) by PCR.
- FIG. 1 It is a figure showing the result of subcutaneously administering Arid5a-deficient KPC cells and wild-type KPC cells to the left and right flanks of female BALB / c nude mice aged 5 to 7 weeks, and measuring the volume of the formed tumor over time. .. It is a figure which shows the result of having cultured Arid5a-deficient KPC cells and wild-type KPC cells in the presence or absence of IL-6 for 48 hours, respectively, and analyzing the cell morphology with a microscope. It is a figure which shows the result of having cultured Arid5a-deficient KPC cells and wild-type KPC cells in the presence or absence of TGF ⁇ for 48 hours, respectively, and analyzing the cell morphology with a microscope. FIG.
- FIG. 5 shows the results of culturing Arid5a-deficient KPC cells and wild-type KPC cells in the presence or absence of IL-6 or TGF ⁇ for 48 hours, and analyzing the expression of E-cadherin by Western blot analysis.
- It is a schematic diagram of the IL-6 induction Matrigel infiltration assay. It is a figure which shows the result of performing the IL-6 induction Matrigel infiltration assay about Arid5a deficient KPC cell, Arid5a deficient KPC cell which introduced Arid5a expression vector, and wild type KPC cell.
- FIG. 1 It is a figure which shows the result of having analyzed the Cancer Genome Atlas (TCGA) dataset about the survival probability of the group of patients with high expression of IDO1 mRNA and the group of patients with low expression of IDO1 mRNA in patients with primary pancreatic ductal adenocarcinoma (PDAC). It is a figure which shows the result of having cultured Arid5a-deficient KPC cells and wild-type KPC cells in the presence or absence of IFN- ⁇ for 48 hours, respectively, and measuring the expression level of Ido1 mRNA by qRT-PCR.
- TCGA Cancer Genome Atlas
- FIG. 5 shows the results of culturing Arid5a-deficient KPC cells and wild-type KPC cells in the presence or absence of IFN- ⁇ for 24, 48, and 72 hours, respectively, and measuring Arid5a protein and Ido1 protein by Western blot analysis.
- Arid5a-deficient KPC cells introduced with the Arid5a expression vector and Arid5a-deficient KPC cells introduced with the empty vector were cultured for 48 hours in the presence or absence of IFN- ⁇ , respectively, and the Arid5a protein and Ido1 protein were measured by Western blot analysis. It is a figure which shows the result.
- FIG. 5 shows the results of culturing Arid5a-deficient KPC cells and wild-type KPC cells in the presence or absence of IFN- ⁇ for 24, 48, and 72 hours, and measuring the kynurenine level in the supernatant by ELISA. It is a figure which shows the result of performing the 3'-UTR luciferase assay by transfecting Arid5a cDNA3-Flag overexpression vector or empty pcDNA3-Flag vector into Arid5a deficient KPC cells. It is a figure which shows the result of having introduced the siRNA of Arid5a into the human glioblastoma cell lines A172 and T98G, and measuring the expression level of Arid5a mRNA.
- FIG. 1 It is a figure which shows the result of having introduced the siRNA of Arid5a into the human glioblastoma cell lines A172 and T98G, and measured the expression level of Iod1 mRNA.
- Arid5a-deficient KPC cells and wild-type KPC cells were cultured in the presence or absence of IFN- ⁇ for 10 minutes, 1, 6, 12, 24, 48, 72 hours, respectively, and Stat1 and pStat1 were measured by Western blot analysis. It is a figure which shows the result of this.
- Stat1 silencing KPC cells (# 1, # 5) prepared by introducing Stat1 shRNA into KPC cells using lentivirus and control cells (Scr) prepared by introducing scrambled shRNA into KPC cells were treated with IFN- ⁇ .
- FIG. 5 shows the results of an analysis of the Cancer Genome Atlas (TCGA) dataset on the correlation between chemokine (CXCL3, CCL2, CCL7, and CCL8) expression and ARID5a expression in patients with primary pancreatic ductal adenocarcinoma (PDAC). ..
- FIG. 1 It is a figure which shows the result of having cultured Arid5a-deficient KPC cells and wild-type KPC cells for 48 hours each, and measuring the mRNA expression level of chemokines (CXCL3, CCL2, CCL7, and CCL8) by qRT-PCR. It is a figure which shows the result of performing the 3'-UTR luciferase assay by transfecting Arid5a pcDNA3-Flag overexpression vector or empty pcDNA3-Flag vector into Arid5a deficient KPC cells.
- the luciferase activity is normalized by using the activity of Renilla luciferase as an internal control, and then further normalized by the luciferase activity in an empty vector.
- the present invention provides a gastrointestinal cancer therapeutic agent containing an Arid5A inhibitor as an active ingredient.
- Arid5A is involved in immune evasion of pancreatic cancer cells and colon cancer cells, and confirmed that inhibition of Arid5A suppresses the growth of pancreatic cancer and colon cancer. did. Therefore, Arid5A inhibitors may be useful in the treatment of gastrointestinal cancer.
- the gastrointestinal cancer represents, for example, esophageal cancer, stomach cancer, liver cancer, biliary tract cancer, pancreatic cancer, duodenal cancer, small intestine cancer, colon cancer and the like.
- gastrointestinal cancer refers to pancreatic or colon cancer.
- the pancreatic cancer may be pancreatic ductal adenocarcinoma (PDAC).
- PDAC pancreatic ductal adenocarcinoma
- the present invention is for the treatment of gastrointestinal cancer, including administration of an Arid5A inhibitor, the use of an Arid5A inhibitor in the manufacture of a therapeutic agent for gastrointestinal cancer, and its use in the treatment of gastrointestinal cancer.
- Arid5A in the present invention refers to AT-rich interactive domain 5A (AT Rich Interactive Domain 5A), and has been reported as a stabilizing protein for IL-6 mRNA.
- human Arid5A also includes various isoforms (NCBI accession numbers NP9974626.1, XP0067122666.1, XP006712265.1, XP00526368.1, XP00526363.13.1, XP00526369.11, etc.).
- various isoforms are also included in the mouse Arid5A (NCBI accession numbers NP00165676.1, NP00165677.1, NP00127755.1, NP00127756.1, NP666108.2, etc.).
- the "Arid5A inhibitor” in the present invention refers to a substance that inhibits the expression of Arid5A and / or a substance that inhibits the function of Arid5A.
- the Arid5A inhibitor may be a substance that directly inhibits the expression of Arid5A itself, or may be a substance that binds to Arid5A and inhibits the biological function of Arid5A. Alternatively, it may be a substance that binds to a molecule affected by Arid5A (IL-6 mRNA, IDO1 mRNA, CXCL3 mRNA, CCL2 mRNA, CCL5 mRNA, CCL7 mRNA, CCL8 mRNA, etc.) and indirectly inhibits the biological function of Arid5A.
- IL-6 mRNA, IDO1 mRNA, CXCL3 mRNA, CCL2 mRNA, CCL5 mRNA, CCL7 mRNA, CCL8 mRNA, etc. indirectly inhibits the biological function of Arid5A
- Inhibiting the expression of Arid5A also leads to inhibiting the function of Arid5A as a result, so that the former can be considered as one of the embodiments included in the latter.
- the expression "inhibiting the expression and / or function of Arid5A” can also be rephrased as "reducing the expression and / or function of Arid5A”.
- the Arid5A inhibitor may be a substance that inhibits the stabilization of IL-6 mRNA by competitively binding to IL-6 mRNA with Arid5A.
- human IL-6 mRNA also includes various isoforms (NCBI Accession No. NM_0000600.3, XM_00524945-2, etc.).
- various isoforms of mouse IL-6 mRNA are also included (NCBI accession number NM_031168.1, etc.).
- the Arid5A inhibitor may be a substance that inhibits the stabilization of IDO1 mRNA by binding to IDO1 mRNA competitively with Arid5A.
- human IDO1 mRNA also includes various isoforms (NCBI accession number NM_002164.5, AK313259.1, etc.).
- various isoforms of mouse IDO1 mRNA are also included (NCBI accession number NM_001293690.1, NM_008324.2, etc.).
- the Arid5A inhibitor may be a substance that inhibits the stabilization of CXCL3 mRNA by binding to CXCL3 mRNA competitively with Arid5A.
- human CXCL3 mRNA also includes various isoforms (NCBI accession number NM_0020900.3, etc.).
- various isoforms of mouse CXCL3 mRNA are also included (NCBI accession number NM_203320.3, etc.).
- the Arid5A inhibitor may be a substance that inhibits the stabilization of CCL2 mRNA by binding to CCL2 mRNA competitively with Arid5A.
- human CCL2 mRNA also includes various isoforms (NCBI accession number NM_002982.4, etc.).
- various isoforms of mouse CCL2 mRNA are also included (NCBI accession number NM_11333.3, etc.).
- the Arid5A inhibitor may be a substance that inhibits the stabilization of CCL7 mRNA by competitively binding to CCL7 mRNA with Arid5A.
- human CCL7 mRNA also includes various isoforms (NCBI accession number NM_006273.4, etc.).
- various isoforms of mouse CCL7 mRNA are also included (NCBI accession number NM_013654.3, etc.).
- the Arid5A inhibitor may be a substance that inhibits the stabilization of CCL8 mRNA by binding to CCL8 mRNA competitively with Arid5A.
- human CCL8 mRNA also includes various isoforms (NCBI accession number NM_005623.3, etc.).
- various isoforms of mouse CCL8 mRNA are also included (NCBI accession number NM_021443.3, etc.).
- the Arid5A inhibitor may be a substance that inhibits the stabilization of CCL5 mRNA by binding to CCL5 mRNA competitively with Arid5A.
- human CCL5 mRNA also includes various isoforms (NCBI Accession No. NM_0012778736.2, NM_002985.3, etc.).
- various isoforms of mouse CCL5 mRNA are also included (NCBI accession number NM_013653.3, etc.).
- the Arid5A inhibitor may be a substance that inhibits the stabilization of any one mRNA selected from the group consisting of IL-6 mRNA, IDO1 mRNA, CXCL3 mRNA, CCL2 mRNA, CCL5 mRNA, CCL7 mRNA, and CCL8 mRNA, or a plurality (1). It may be a substance that inhibits the stabilization of mRNA (at least two or more).
- Examples of the Arid5A inhibitor in the present invention include, but are not limited to, proteins such as anti-Arid5A antibody, and low molecular weight compounds such as polypeptides, nucleic acid oligos, and chlorpromazine.
- Preferred examples of the Arid5A inhibitor of the present invention include proteins, and more preferably antibodies (anti-Arid5A antibodies).
- Preferred examples of the Arid5A inhibitor of the present invention include nucleic acid oligos, more preferably siRNA.
- preferred examples of the Arid5A inhibitor of the present invention include polypeptides, and more preferably cyclic polypeptides.
- Examples of low molecular weight compounds that serve as Arid5A inhibitors include chlorpromazine (PNAS, 110, 23, 9409-9414 (2013)).
- RNA interference is a method reported as a method of suppressing gene expression using RNA (Genes and Development, 16, 948-958 (2002)), and two genes having the same or similar sequence as the target gene.
- RNA interference is a method of suppressing gene expression using RNA (Genes and Development, 16, 948-958 (2002)), and two genes having the same or similar sequence as the target gene.
- strand RNA is introduced into cells, the expression of both the introduced foreign gene and the target endogenous gene is suppressed.
- siRNA or an antisense nucleic acid that exhibits an RNA interference effect on the expression of the Arid5A gene.
- nucleic acid oligo in the present invention means an oligomer of a nucleic acid that controls the function of the Arid5A gene or protein.
- Nucleic acid oligos may be oligos consisting of natural and unnatural RNA or DNA.
- Nucleic acid oligos in the present invention include siRNA, shRNA, antisense nucleic acid, decoy nucleic acid, nucleic acid aptamer, and ribozyme.
- the nucleic acid oligo in the present invention include siRNA and shRNA.
- the siRNA means a double-stranded RNA consisting of short strands in a range that does not show toxicity in cells, and is, for example, 15 to 49 base pairs, preferably 15 to 35 base pairs, and more preferably 21 to 30 base pairs. be able to.
- shRNA is RNA in which a single-stranded RNA constitutes a double strand via a hairpin structure.
- siRNA and shRNA do not have to be exactly the same as the target gene, but have at least 70% or more, preferably 80% or more, more preferably 90% or more, and most preferably 95% or more sequence homology.
- the parts of double-stranded RNA in which RNAs are paired with each other in siRNA and shRNA are not limited to those that are completely paired, but are mismatched (corresponding bases are not complementary) and bulge (base corresponding to one strand).
- the non-matching part may be included due to (there is no) or the like.
- the portion of double-stranded RNA in which RNAs are paired with each other in siRNA and shRNA may contain both bulge and mismatch.
- antisense nucleic acid in the present invention is an antisense nucleic acid complementary to a transcript of DNA encoding Arid5A.
- the action of antisense nucleic acid to suppress the expression of a target gene has the following multiple factors. That is, degradation by RNase activity by RNA double-strand recognition, transcription initiation inhibition by triple-strand formation, transcription inhibition by hybrid formation with a site where an open loop structure is locally formed by RNA polymerase, and RNA whose synthesis is progressing.
- Transcription inhibition by hybridization with mRNA Transcription inhibition by hybridization with mRNA, splicing inhibition by hybrid formation at the junction of intron and exson, splicing inhibition by hybrid formation with splicome formation site, translocation inhibition from nucleus to cytoplasm by hybridization with mRNA, translation initiation Transcription suppression by hybrid formation with factor binding sites, inhibition of peptide chain elongation by hybrid formation with mRNA translation regions and polysomal binding sites, and suppression of gene expression by hybrid formation between nucleic acid-protein interaction sites.
- it inhibits transcription, splicing, or translation processes and suppresses the expression of target genes.
- the antisense sequence used in the present invention may suppress the expression of the target gene by any of the above actions.
- designing an antisense sequence complementary to the untranslated region near the 5'end of the Arid5A mRNA is considered to be effective in inhibiting the translation of the gene.
- sequences complementary to the coding region or the untranslated region on the 3'side can also be used.
- sequences complementary to the untranslated region as well as the translated region of the gene can be used.
- the nucleic acid containing the antisense sequence of the sequence of the untranslated region as well as the translated region of the gene is included in the antisense nucleic acid used in the present invention.
- the antisense nucleic acid has preferably 90% or more, most preferably 95% or more complementarity to the transcript of the target gene.
- the length of the antisense RNA that effectively inhibits the expression of the target gene by using the antisense sequence is not particularly limited.
- the "decoy nucleic acid” in the present invention is a nucleic acid oligo homologous to the IL-6 mRNA sequence recognized by Arid5A. It binds to Arid5A instead of the IL-6 mRNA sequence and inhibits the function of Arid5A.
- the "decoy nucleic acid” in the present invention is a nucleic acid oligo homologous to the IDO1 mRNA sequence recognized by Arid5A. It binds to Arid5A instead of the IDO1 mRNA sequence and inhibits the function of Arid5A.
- the "decoy nucleic acid" in the present invention is a nucleic acid oligo that is homologous to any of the mRNA sequences of CXCL3 mRNA, CCL2 mRNA, CCL5 mRNA, CCL7 mRNA, or CCL8 mRNA recognized by Arid5A. It binds to Arid5A instead of the mRNA sequence and inhibits the function of Arid5A.
- the ribozyme in the present invention refers to, for example, one that cleaves the mRNA of the Arid5A and inhibits the translation of the protein.
- the ribozyme can be designed from the gene sequence encoding the protein. For example, as the hammerhead ribozyme, the method described in FEBS Letter, Vol. 228, pp. 228-230 (1988) should be used. Can be done. Further, regardless of the type of ribozyme such as hairpin type ribozyme and delta type ribozyme as well as hammerhead type ribozyme, it is described herein as long as it cleaves the mRNA of the protein and inhibits the translation of the protein. It is included in the ribozyme.
- the "cyclic polypeptide” in the present invention means a polypeptide containing a cyclic structure formed by four or more amino acids and / or amino acid analogs.
- the cyclic polypeptide may have a linear moiety in addition to the cyclic moiety.
- the bonding mode of the cyclization portion is not particularly limited, and a bond other than an amide bond or an ester bond may be used. Examples of the bonding mode of the cyclization site include amide bond, carbon-carbon bond, disulfide bond, ester bond, thioester bond, thioether bond, lactam bond, azoline skeleton-mediated bond, triazole structure-mediated bond, and fluorophore. Covalent bonds such as structural bonds are preferably exemplified.
- the position of the functional group such as a carboxy group or an amino group used for cyclization may be on the main chain or on the side chain, and is not particularly limited as long as it is in a cyclizable position.
- the "bonding mode of the cyclized portion" is the binding mode of the site where cyclization is formed by the cyclization reaction.
- amino acid analogs herein include hydroxycarboxylic acids (hydroxy acids).
- the Arid5A inhibitor in the present invention may be a polypeptide and the polypeptide may be a cyclic polypeptide.
- the molecular weight of the cyclic polypeptide in the present invention may be 500-4000, 500-3000, or 500-2000.
- the cyclic polypeptide of the invention may include at least one selected from the group consisting of natural amino acids, unnatural amino acids, and amino acid analogs.
- the ratio of these amino acids is not particularly limited.
- the total number of amino acids and amino acid analogs contained in the cyclic polypeptide of the invention is 4-20, 4-15, 6-15, 8-15, 9-13, or 10-13. You can.
- the cyclic polypeptide of the invention may have a total number of amino acids and amino acid analogs contained in the cyclic moiety of 5-15, 7-12, or 9-11.
- the number of amino acids and / or amino acid analogs of the linear moiety is preferably 0-8, more preferably 0-5. , 0 to 3 are more preferable.
- the "linear moiety" in the present specification may include natural amino acids, unnatural amino acids (including chemically modified or skeletal-converted amino acids), and amino acid analogs.
- the polypeptide of the present invention may be modified to enhance intracellular translocation ability.
- modification is not particularly limited as known methods can be used, and examples thereof include methods for binding a cell membrane penetrating peptide.
- a known sequence can be used as the cell membrane penetrating peptide.
- a Tat peptide derived from the HIV Tat protein (Brooks, H. et al. Advanced Drug Delivery Reviews, Vol 57, Issue 4, 2005, p.559-577).
- polyarginine consisting of 6 to 12 residues of arginine (Nakase, I. et al. Advanced Drug Delivery Reviews, Vol 60, 2008, p.598-607).
- a cyclic polypeptide library may be used to identify a cyclic polypeptide that binds to Arid5A.
- identification method is known in, for example, WO2013 / 100132 and WO2012 / 033154.
- the cyclic polypeptide may be produced by a chemical synthesis method, and examples thereof include a liquid phase synthesis method, a solid phase synthesis method using Fmoc, Boc and the like, and a combination thereof.
- the gastrointestinal cancer therapeutic agent of the present invention may contain a formulationally acceptable material such as a preservative or a stabilizer.
- a material that is pharmaceutically acceptable may be a material that itself has a therapeutic effect on gastrointestinal cancer, or a material that does not have a therapeutic effect on gastrointestinal cancer, and the digestion of the present invention Means a formulationally acceptable material that can be administered with a therapeutic agent for organ cancer. Further, a material having no therapeutic effect and having a synergistic effect or an additive stabilizing effect when used in combination with an Arid5A inhibitor may be used.
- Examples of materials that are acceptable for formulation include sterilized water, physiological saline, stabilizers, excipients, buffers, preservatives, surfactants, chelating agents (EDTA, etc.), binders, and the like.
- examples of the surfactant include nonionic surfactants, for example, sorbitan fatty acid esters such as sorbitan monocaprelate, sorbitan monolaurate, and sorbitan monopalmitate; glycerin monocaprelate and glycerin monomitate.
- nonionic surfactants for example, sorbitan fatty acid esters such as sorbitan monocaprelate, sorbitan monolaurate, and sorbitan monopalmitate; glycerin monocaprelate and glycerin monomitate.
- sorbitan fatty acid esters such as sorbitan monocaprelate, sorbitan monolaurate, and sorbitan monopalmitate
- glycerin monocaprelate and glycerin monomitate Those having HLB 6 to 18 such as glycerin fatty acid ester such as glycerin monostearate, and the like can be mentioned as typical examples.
- surfactant examples include anionic surfactants, for example, alkyl sulfates having an alkyl group having 10 to 18 carbon atoms such as sodium cetyl sulfate, sodium lauryl sulfate and sodium oleyl sulfate; polyoxyethylene.
- alkyl sulfates having an alkyl group having 10 to 18 carbon atoms such as sodium cetyl sulfate, sodium lauryl sulfate and sodium oleyl sulfate
- polyoxyethylene Polyoxyethylene alkyl ether sulfate having an average addition molar number of 2 to 4 and an alkyl group having 10 to 18 carbon atoms such as sodium lauryl sulfate; carbon atoms of an alkyl group such as sodium lauryl sulfosuccinate.
- alkyl sulfosuccinate salts having a number of 8 to 18; natural surfactants such as lecithin and glycerophospholipids; fingering lipids such as sphingomyelin; sucrose fatty acid esters of fatty acids having 12 to 18 carbon atoms. Can be mentioned as.
- Preferred surfactants used in the formulations of the present invention are polyoxyethylene sorbitan fatty acid esters such as polysorbate 20, 40, 60, 80, with polysorbate 20 and 80 being particularly preferred. Further, polyoxyethylene polyoxypropylene glycol represented by poloxamer (Pluronic F-68 (registered trademark), etc.) is also preferable.
- the buffers include phosphate buffer, citrate buffer, acetate buffer, malic acid buffer, tartrate buffer, succinate buffer, lactic acid buffer, potassium phosphate buffer, and gluconate buffer.
- the solution preparation may be prepared by dissolving in an aqueous buffer solution known in the field of solution preparation.
- concentration of the buffer is generally 1 to 500 mM, preferably 5 to 100 mM, more preferably 10 to 20 mM.
- agent in the present invention may contain other low molecular weight polypeptides, serum albumin, proteins such as gelatin and immunoglobulin, sugars such as amino acids, polysaccharides and monosaccharides, carbohydrates, and sugar alcohols.
- sugars and carbohydrates such as polysaccharides and monosaccharides include dextran, glucose, fructose, lactose, xylose, mannose, maltose, sucrose, trehalose, and raffinose.
- examples of the sugar alcohol include mannitol, sorbitol, inositol and the like.
- an aqueous solution for injection examples include physiological saline, isotonic solutions containing glucose and other adjuvants, such as D-sorbitol, D-mannose, D-mannitol, sodium chloride, and suitable dissolution.
- Ad-sorbitol such as D-sorbitol, D-mannose, D-mannitol, sodium chloride, and suitable dissolution.
- Auxiliary agents such as alcohol (ethanol, etc.), polyalcohol (propylene glycol, PEG, etc.), nonionic surfactant (polysorbate 80, HCO-50), etc. may be used in combination.
- a diluent, a solubilizing agent, a pH adjusting agent, a soothing agent, a sulfur-containing reducing agent, an antioxidant and the like may be further contained.
- microcapsules such as hydroxymethylcellulose, gelatin, poly [methylmethacrylic acid]
- colloidal drug delivery system liposomes, albumin microspheres, microemulsions, nanoparticles, nanocapsules, etc.
- a method for making a drug a sustained-release drug is also known and can be applied to the present invention (Langer et al., J. Biomed. Mater. Res. 1981, 15: 167-277; Langer, Chem. Tech. 1982, 12: 98-105; U.S. Patent No. 3,773,919; European Patent Application Publication (EP) No. 58,481; Sidman et al., Biopolymers 1983, 22: 547-556; EP No. 133,988).
- the carrier that is acceptable for the formulation to be used is appropriately or in combination selected from the above depending on the dosage form, but is not limited thereto.
- the Arid5A inhibitor of the present invention When the Arid5A inhibitor of the present invention is used as a medicine for humans and other animals, it is possible to formulate and administer these substances by a known pharmaceutical method, in addition to directly administering these substances to patients. Is. In the case of formulation, the above-mentioned materials that are acceptable for formulation may be added.
- the therapeutic agent for gastrointestinal cancer of the present invention can be administered in the form of a pharmaceutical product, and can be administered orally or parenterally systemically or topically.
- intravenous injection such as infusion, intramuscular injection, intraperitoneal injection, subcutaneous injection, suppository, enema, oral enteric solvent, etc. can be selected, and the administration method should be appropriately selected according to the patient's age and symptoms. Can be done.
- the effective dose is selected in the range of 0.001 mg to 100 mg / kg body weight at a time.
- a dose of 0.1 to 1,000 mg, preferably 0.1 to 50 mg per patient can be selected.
- 0.1 mg to 40 mg preferably 1 mg to 20 mg per kg of body weight per 1 kg per month (4 weeks) is divided into 1 to several times, for example, 2 times / week, 1 time / week.
- It is a method of administration by a method such as intravenous injection such as infusion or subcutaneous injection according to an administration schedule such as once / two weeks or once / four weeks.
- the administration schedule is such as twice / week or once / week to once / two weeks, once / three weeks, once / four weeks while observing the condition after administration and the trend of blood test values. It is also possible to make adjustments such as extending the administration interval.
- the Arid5A inhibitor of the present invention suppresses epithelial-mesenchymal transition of cancer cells.
- Inhibition of epithelial-mesenchymal conversion also includes reduction of epithelial-mesenchymal conversion.
- the epithelial-mesenchymal transition of cancer cells can be measured, for example, by the method described in Example 4 described later.
- the Arid5A inhibitor of the present invention suppresses the infiltration of cancer cells. Suppression of cancer cell infiltration also includes reduction of infiltration.
- the infiltration of cancer cells can be measured, for example, by the method described in Example 4 described later.
- the gastrointestinal cancer therapeutic agent of the present invention may be used in combination with other cancer therapeutic agents or cancer therapeutic methods. When used in combination, it means that the application time of the gastrointestinal cancer therapeutic agent of the present invention overlaps with the application time of other cancer therapeutic agents or cancer therapeutic methods, and it means that they are administered or treated at the same time. It's not necessary.
- Other cancer therapeutic agents or cancer therapeutic methods used in combination with the gastrointestinal cancer therapeutic agent of the present invention are not particularly limited, but for example, chemotherapy (chemotherapeutic agent), immunotherapy (immunotherapeutic agent, immune checkpoint). Inhibitors, CAR-T therapeutic agents, etc.), hormone therapy (hormone therapeutic agents), and the like.
- the present invention provides a method for screening candidate substances useful for the treatment of gastrointestinal cancer.
- the present inventors have found that Arid5A is involved in immune evasion of pancreatic cancer cells and colon cancer cells, and confirmed that inhibition of Arid5A suppresses the growth of pancreatic cancer and colon cancer. did. Therefore, by selecting a test substance that reduces the expression and / or function of Arid5A, a candidate substance useful for the treatment of gastrointestinal cancer can be provided.
- the screening method of the present invention It is a method including (1) a step of detecting the influence of a test substance on the expression of Arid5A, and (2) a step of selecting a substance that reduces the expression of Arid5A as compared with the case where the test substance is not used. May be good.
- the screening method of the present invention It is a method including (a) a step of detecting the influence of a test substance on the function of Arid5A, and (b) a step of selecting a substance that reduces the function of Arid5A as compared with the case where the test substance is not used. May be good.
- the "test substance” is not particularly limited, and for example, a single substance such as a natural compound, an organic compound, an inorganic compound, a nucleic acid oligo, a protein, a polypeptide, a compound library, or a nucleic acid oligolive.
- a single substance such as a natural compound, an organic compound, an inorganic compound, a nucleic acid oligo, a protein, a polypeptide, a compound library, or a nucleic acid oligolive.
- Larry polypeptide library, gene library expression product, cell extract, cell culture supernatant, fermenting microbial product, marine organism extract, plant extract, prokaryotic cell extract, eukaryotic single cell extract or animal cell extract Things can be mentioned.
- the above-mentioned test substance can be appropriately labeled and used as needed. Examples of the label include a radial label, a fluorescent label and the like.
- a mixture of a plurality of these test substances is also included.
- the test substance is first brought into contact with Arid5A.
- the Arid5A used in the screening method of the present invention may be a human Arid5A or a non-human (eg, monkey, mouse, rat, guinea pig, pig, cow, yeast, insect, etc.) Arid5A. ..
- the amino acid sequence of human Arid5A is as described above.
- the Arid5A used in the screening method of the present invention contains a protein functionally equivalent to the known Arid5A.
- proteins include, but are not limited to, for example, variants of Arid5A, alleles, variants, homologues, partial peptides of Arid5A, or fusion proteins with other proteins.
- a variant of Arid5A is a naturally occurring protein consisting of an amino acid sequence in which one or more amino acids are substituted, deleted, inserted, and / or added in a known amino acid sequence of Arid5A, from the above-mentioned amino acid sequence.
- a protein that is functionally equivalent to the above-mentioned protein can be mentioned. Further, it is a protein encoded by a naturally occurring DNA that hybridizes with a DNA having a known base sequence encoding Arid5A under strigant conditions, and is functionally equivalent to the protein having the above-mentioned amino acid sequence. Proteins can also be mentioned as variants of Arid5A.
- the number of amino acids to be mutated is not particularly limited, but is usually 30 amino acids or less, preferably 15 amino acids or less, and more preferably 5 amino acids or less (for example, 3 amino acids or less). It is desirable that the mutated amino acid residue be mutated to another amino acid whose side chain properties are conserved (conservative substitution).
- the properties of the amino acid side chain include hydrophobic amino acids (A, I, L, M, F, P, W, Y, V) and hydrophilic amino acids (R, D, N, C, E, Q, G).
- Arid5A results in stabilization of IL-6 mRNA by specifically binding to the stem-loop of IL-6 mRNA and antagonistically inhibiting the action of Regnase-1, which specifically disrupts IL-6 mRNA.
- the biological and biochemical functions of Arid5A include stabilization of IL-6 mRNA.
- the biological function and biochemical function of Arid5A include stabilization of IDO1 mRNA.
- the biological and biochemical functions of Arid5A include stabilization of CXCL3 mRNA, CCL2 mRNA, CCL5 mRNA, CCL7 mRNA, or CCL8 mRNA.
- Methods well known to those of skill in the art for preparing DNA encoding a "functionally equivalent protein" to the protein of interest include methods that utilize hybridization techniques or polymerase chain reaction (PCR) techniques. Be done. That is, for those skilled in the art, it is usual practice to isolate DNA having high homology with Arid5A by using the base sequence of Arid5A or a part thereof as a probe and an oligonucleotide that specifically hybridizes to Arid5A as a primer. It is to be told.
- PCR polymerase chain reaction
- a hybridization reaction is preferably carried out under stringent conditions.
- stringent hybridization conditions refer to hybridization of 6M urea, 0.4% SDS, 0.5 ⁇ SSC or equivalent stringency. Isolation of DNA with higher homology can be expected by using conditions with higher stringency, such as 6M urea, 0.4% SDS, and 0.1 ⁇ SSC.
- the DNA isolated thereby is considered to have high homology with the amino acid sequence of the target protein at the amino acid level.
- High homology means a sequence of at least 50% or more, more preferably 70% or more, still more preferably 90% or more (eg, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% or more) of the entire amino acid sequence. Refers to the identity of.
- the identity of the amino acid sequence and the base sequence is determined by the algorithm BLAST (Proc. Natl. Acad. Sci. ISA 87: 2264-2268, 1990, Proc. Natl. Acad. Sci. ISA 90: 5873, 1993) by Carlin and Arthur. Can be determined using.
- Programs called BLASTN and BLASTX based on the BLAST algorithm have been developed (Altschul SF, et al: J Mol Biol 215: 403, 1990).
- BLAST and Gapped BLAST programs use the default parameters of each program. Specific methods of these analysis methods are known.
- the state of Arid5A used in the first aspect is not particularly limited, and may be, for example, a purified state, a state expressed in cells, a state expressed in a cell extract, or the like.
- Arid5A Purification of Arid5A can be performed by a well-known method.
- examples of cells expressing Arid5A include cells expressing endogenous Arid5A and cells expressing exogenous Arid5A.
- examples of cells expressing the endogenous Arid5A include, but are not limited to, cells derived from animal tissues and cultured cells.
- the cultured cells are not particularly limited, and for example, commercially available cells can be used.
- the species from which the cells expressing endogenous Arid5A are derived is not particularly limited, and examples thereof include humans, monkeys, mice, rats, guinea pigs, pigs, cows, yeasts, and insects.
- the cell expressing the exogenous Arid5A can be prepared, for example, by introducing a vector containing a DNA encoding Arid5A into the cell.
- the introduction of the vector into cells can be carried out by a general method, for example, a calcium phosphate precipitation method, an electric pulse perforation method, a lipofectamine method, a microinjection method or the like.
- the cells having the exogenous Arid5A can be prepared, for example, by inserting the DNA encoding Arid5A into the chromosome by a gene transfer method using homologous recombination.
- the species from which such exotic Arid5A-introduced cells are derived is not limited to mammals, and may be any species for which a technique for expressing a foreign protein into cells has been established.
- the cell extract expressing Arid5A for example, a cell extract contained in an in vitro transcription translation system to which a vector containing DNA encoding Arid5A is added can be mentioned.
- the in vitro transcription / translation system is not particularly limited, and a commercially available in vitro transcription / translation kit or the like can be used.
- the "contact" in the first aspect may be performed according to the state of Arid5A.
- Arid5A if Arid5A is in a purified state, it can be carried out by adding a test substance to the purified preparation.
- the test substance if it is expressed in cells or in a cell extract, the test substance is added to the cell culture medium or the cell extract, or the test substance is directly administered to an experimental animal. By doing so, it can be done.
- the test substance is a protein, for example, by introducing a vector containing DNA encoding the protein into cells expressing Arid5A, or by adding the vector to a cell extract expressing Arid5A. It is also possible to do. It is also possible to use, for example, a two-hybrid method using yeast or animal cells.
- the expression and / or function of Arid5A is then measured.
- the function of Arid5A may include stabilization of IL-6 mRNA.
- the function of Arid5A can be indirectly measured by coexisting Arid5A and the test substance and measuring the degradation inhibitory effect of IL-6 mRNA.
- the test substance with reduced or increased expression and / or function is then selected as compared to the case where the test substance is not contacted.
- tissues such as the spleen are excised, and the expression and / or function of Arid5A and the expression level of IL-6 mRNA in specific cells such as macrophages are measured.
- PCR in the present specification includes a method for measuring various DNAs, RNAs, etc. by a technique based on PCR and amplification derived from the PCR. Since Arid5A is a protein that contributes to the stabilization of IL-6 mRNA, when the expression of Arid5A is inhibited in cells, the expression of IL-6 mRNA is suppressed, but the expression of TNF- ⁇ mRNA is increased. Is known to have no effect.
- test substance affects the expression of IL-6 mRNA but not the expression of TNF- ⁇ mRNA
- substance that affects the expression of Arid5A that is, As a result, it is possible to screen for candidate substances that are useful for the treatment of gastrointestinal cancer.
- Selected test substances include substances that reduce the expression and / or function of Arid5A, and by suppressing the expression and / or function of Arid5A, the effect of treating gastrointestinal cancer is exhibited as a result. it is conceivable that.
- IDO1 mRNA can be used in the same manner as IL-6 mRNA.
- CXCL3 mRNA, CCL2 mRNA, CCL5 mRNA, CCL7 mRNA, and CCL8 mRNA can be used in the same manner as IL-6 mRNA.
- the test substance is brought into contact with Arid5A, and then the binding between Arid5A and the test substance is detected.
- the detection method is not particularly limited.
- the binding between Arid5A and the test substance can be detected, for example, by a label attached to the test substance bound to Arid5A (for example, a label capable of quantitative measurement such as a radiolabel or a fluorescent label).
- a labeling agent can be bound to Arid5A.
- the test substance or Arid5A can also be immobilized on a resin, a chip, or the like to detect the bond. It is also possible to detect the functional change of Arid5A caused by the binding of the test substance to Arid5A as an index.
- the test substance that binds to Arid5A is then selected.
- the selected substances include substances that reduce the expression or function of Arid5A, and it is considered that by suppressing the expression or function of Arid5A, the effect of treating gastrointestinal cancer is exhibited as a result.
- the test substance is brought into contact with the cells expressing Arid5A, and then the expression level of Arid5A is measured.
- the expression level of Arid5A can be measured by a method known to those skilled in the art.
- the transcription level of the Arid5A gene can be measured by extracting the mRNA of the Arid5A gene according to a conventional method and performing a Northern hybridization method or an RT-PCR method using this mRNA as a template.
- the translation level of the gene can be measured by recovering the fraction containing Arid5A encoded by the Arid5 gene according to a conventional method and detecting the expression of Arid5A by an electrophoresis method such as SDS-PAGE. It is also possible to measure the translation level of a gene by performing a western blotting method using an antibody against Arid5A and detecting the expression of Arid5A. As the antibody against Arid5A, those described above can be used.
- the test substance whose expression level of Arid5A is decreased or increased is selected as compared with the case where the test substance is not in contact with the test substance.
- the selected substance contains a substance that reduces the expression of Arid5A, and it is considered that the substance that suppresses the expression of Arid5A eventually exhibits an effect of treating gastrointestinal cancer.
- a cell or cell extract having a DNA in which a reporter gene is functionally bound downstream of the promoter region of the DNA encoding Arid5A is provided.
- “functionally bound” means that the promoter region of the Arid5A gene and the reporter gene are induced so that the expression of the reporter gene is induced by the binding of the transcription factor to the promoter region of the Arid5A gene. Means that they are combined. Therefore, even when the reporter gene is bound to another gene and forms a fusion protein with another gene product, the expression of the fusion protein is caused by the binding of a transcription factor to the promoter region of the Arid5A gene. If is induced, it is included in the above meaning of "functionally combined”.
- the reporter gene is not particularly limited as long as its expression can be detected.
- a CAT gene, a lacZ gene, a luciferase gene, a ⁇ -glucuronidase gene (GUS), and GFP commonly used in those skilled in the art are used. Genes and the like can be mentioned.
- the reporter gene also includes DNA encoding Arid5A.
- a cell or cell extract having a DNA in which a reporter gene is functionally bound downstream of the promoter region of the DNA encoding Arid5A can be prepared by the method described above.
- the test substance is then brought into contact with the cells or the cell extract. Then, the expression level of the reporter gene in the cells or the cell extract is measured.
- the expression level of the reporter gene can be measured by a method known to those skilled in the art, depending on the type of reporter gene used. For example, when the reporter gene is a CAT gene, the expression level of the reporter gene can be measured by detecting the acetylation of chloramphenicol by the gene product.
- the reporter gene is a lacZ gene, it detects the color development of the pigment compound by the catalytic action of the gene expression product, and when it is a luciferase gene, it emits luciferin by the catalytic action of the gene product.
- the test substance whose expression level of the reporter gene is reduced or increased is selected as compared with the case where the test substance is not in contact with the test substance.
- the selected substance contains a substance that reduces the expression of Arid5A, and it is considered that the substance that suppresses the expression of Arid5A eventually exhibits an effect of treating gastrointestinal cancer.
- the test substance is first contacted with IL-6 mRNA, and then the binding between IL-6 mRNA and the test substance is detected.
- the detection method is not particularly limited.
- the binding between the IL-6 mRNA and the test substance can be detected, for example, by a label attached to the test substance bound to the IL-6 mRNA (for example, a label capable of quantitative measurement such as a radiolabel or a fluorescent label). It is also possible to bind a labeling agent to IL-6 mRNA. Binding can also be detected by immobilizing the test substance or IL-6 mRNA on a resin, chip, or the like.
- Changes in the activity of IL-6 mRNA caused by binding of the test substance to IL-6 mRNA can also be detected as an index.
- IDO1 mRNA can be used in the same manner as IL-6 mRNA.
- CXCL3 mRNA, CCL2 mRNA, CCL5 mRNA, CCL7 mRNA, and CCL8 mRNA can be used in the same manner as IL-6 mRNA.
- the test substance that binds to IL-6 mRNA is then selected.
- the selected substances include substances that reduce the expression and / or function of Arid5A, and it is considered that by suppressing the expression or function of Arid5A, the effect of treating gastrointestinal cancer is exhibited as a result.
- IDO1 mRNA can be used in the same manner as IL-6 mRNA.
- CXCL3 mRNA, CCL2 mRNA, CCL5 mRNA, CCL7 mRNA, and CCL8 mRNA can be used in the same manner as IL-6 mRNA.
- the test substance is first contacted with IL-6 mRNA, then Arid5A is further contacted, and then the function of Arid5A is measured.
- a function of Arid5A it can be measured in the above-mentioned form.
- a test substance having a reduced or increased function is selected as compared with the case where the test substance is not brought into contact with the test substance.
- the selected test substance contains a substance that lowers the function of Arid5A, and it is considered that the substance that suppresses the function of Arid5A eventually exhibits an effect of treating gastrointestinal cancer.
- IDO1 mRNA can be used in the same manner as IL-6 mRNA.
- CXCL3 mRNA, CCL2 mRNA, CCL5 mRNA, CCL7 mRNA, and CCL8 mRNA can be used in the same manner as IL-6 mRNA.
- KPC cells are cells prepared from KPC (LSL-KrasG12D / +; LSL-Trp53R172H / +; Pdx-1-Cre) mice, which have been established as a human pancreatic duct adenocarcinoma model.
- Lysates of each cell were prepared according to a conventional method, subjected to SDS-PAGE, transferred to a PVDF membrane, and Western blot analysis was performed.
- Anti-human Arid5a antibody (clone P18112, Thermo Fisher) was used as the primary antibody, and Amersham ECL anti-mouse IgG HRP conjugate (GE Healthcare) was used as the secondary antibody.
- the blot was developed using a chemiluminescence detection system (Chemi-lumi one ultra, Nacalai Tesque), and the image was taken with Image Quant LAS 500 (GE Healthcare).
- KPC cells were shown to express high levels of Arid5a compared to MEF and B16 / F10 cells.
- Arid5a-deficient KPC cells The CRISPR / Cas9 system (Santa Cruz) was used according to the instructions to delete the Arid5a gene in KPC cells.
- a single guide RNA (sgRNA) designed to delete 28 base pairs around the 3'region of exon 2 of the Arid5a gene and 70 base pairs around the 3'region of exon 5 of the Arid5a gene are deleted.
- the sgRNA designed for was used.
- the outline of the exon 2 and the deletion region of exon 5 of the Arid5a gene is shown in FIG. (A) is a schematic diagram of Exxon 2 and (B) is a schematic diagram of Exxon 5.
- the lower arrow indicates the position of the PCR primer.
- Figure 3 shows the results of PCR verification of exon 2 and exon 5 deletions in the Arid5a gene.
- (A) is the result of Exxon2 and
- (B) is the result of Exxon5.
- Two Arid5a-deficient cell clones (KO4 and KO5) were obtained.
- the Arid5a mRNA and Arid5a protein of the obtained Arid5a-deficient cells were measured by qRT-PCR and Western blot analysis, respectively, and compared with wild-type (WT) KPC cells not deficient in Arid5a.
- the results of Arid5a mRNA in Arid5a-deficient KPC cell clone KO4 and wild-type (WT) KPC cells are shown in FIG. 4, and the results of Arid5a protein are shown in FIG. 5, respectively.
- Arid5a-deficient KPC cell tumors formed subcutaneously in mice 5-7 week old female BALB / c nude mice and 5-7 week old female C57BL / 6 were used.
- WT wild-type KPC cells
- Arid5a-/- Arid5a-deficient KPC cells
- mice The results of C57BL / 6 mice are shown in FIG. 6, and the results of BALB / c nude mice are shown in FIG.
- the data are representative of three independent experiments and are presented with a mean ⁇ SD. Student t-teat is used for statistical analysis, ns indicates no significant difference, * indicates P ⁇ 0.05, ** indicates P ⁇ 0.01.
- FIG. 6 when a tumor was formed subcutaneously in C57BL / 6 mice, the tumor volume of Arid5a ⁇ / ⁇ showed a significant decrease after the 17th day as compared with the tumor volume of WT. .. On the other hand, as shown in FIG.
- Arid5a ⁇ / ⁇ and WT showed similar growth. That is, the tumor volume of Arid5a ⁇ / ⁇ decreased in C57BL / 6 mice having normal immunity, but the tumor volume of Arid5a ⁇ / ⁇ did not decrease in immunodeficient mice (BALB / c nude mice). From this result, it was clarified that Arid5a is involved in immune evasion of KPC cells. Therefore, it was considered that inhibition of Arid5a could suppress the growth of pancreatic cancer and treat pancreatic cancer.
- Arid5a involvement in epithelial to mesenchymal transition (EMT) of KPC cells (4-1) Morphological changes of KPC cells WT and Arid5a-/-, IL-6 (10 ng / mL) or TGF ⁇ ( The cells were cultured in the presence or absence of 5 ng / mL) for 48 hours, and the cell morphology was analyzed under a microscope. DMEM medium (Sigma) containing 10% FCS was used for cell culture.
- FIG. 8b The result of processing with IL-6 is shown in FIG. As is clear from FIG. 8b, the morphology of the IL-6 treated WT changed to a tubular structure. On the other hand, Arid5a ⁇ / ⁇ showed no morphological change even when treated with IL-6 (Fig. 8d). The results of treatment with TGF ⁇ are shown in FIG. Arid5a ⁇ / ⁇ showed no morphological change when treated with TGF ⁇ (Fig. 9d). From these results, it was shown that inhibition of Arid5a can suppress epithelial-mesenchymal conversion of KPC cells.
- E-cadherin expression is known to be a prominent feature of epithelial-mesenchymal transition. Therefore, E-cadherin expression in KPC cells (WT and Arid5a-/-) was tested. WT and Arid5a ⁇ / ⁇ were cultured for 48 hours in the presence or absence of IL-6 (10 ng / mL) or TGF ⁇ (5 ng / mL), respectively, and the expression of E-cadherin was analyzed by Western blot analysis.
- IL-6-induced Matrigel was investigated to determine whether Arid5a plays a role in the infiltration activity of KPC cells.
- An infiltration assay was performed. Three types of cells were used, in which the Arid5a expression vector was introduced into WT, Arid5a-/-and Arid5a-/-. Each 1 ⁇ 10 5 cell was incubated in the presence or absence of IL-6 (10 ng / mL) for 48 hours. Cells were then seeded in the upper wells of the chamber membrane of the Biocoat Matrigel chamber (BD Biosciences) in the absence of serum.
- the lower well was filled with NIH3T3 conditioned medium in which NIH3T3 cells were cultured for 24 hours in the absence of serum. After incubation for 12 hours, the cells infiltrated Matrigel and migrated to the underside of the membrane. The membrane was then fixed in 4% paraformaldehyde and the number of cells transferred to the underside was recorded (see Figure 11).
- the results are shown in FIG.
- the data are representative of three independent experiments and are presented with a mean ⁇ SD.
- Student t-teat is used for statistical analysis, ns indicates no significant difference, * indicates P ⁇ 0.05, ** indicates P ⁇ 0.01.
- the IL-6-induced infiltration activity of WT was significantly reduced in Arid5a-/-.
- the decrease in infiltration activity in Arid5a-/- was rescued by Arid5a expression.
- Arid5a is involved in maintenance of mesenchymal phenotype and IL-6-induced infiltration in pancreatic ductal adenocarcinoma (PDAC).
- RNA expression analysis of WT and Arid5a-/- was performed to identify the molecular mechanism of immune evasion mediated by Arid5a . .. The results are shown in FIG. We found that in Arid5a-/-, the expression of Ido1 was significantly reduced, whereas Ido2 and Tod2 were unaffected.
- Ido1 mRNA The results of Ido1 mRNA are shown in FIG. In the absence of IFN- ⁇ , the expression of Ido1 mRNA in Arid5a-/-was substantially abolished.
- the results of the Ido1 protein are shown in FIG. In WT, Arid5a expression increased in 48 hours in response to IFN- ⁇ . In addition, IFN- ⁇ -induced Ido1 was expressed at 24 hours and increased at 48 hours. This indicates that there may be a correlation between Arid5a expression and Ido1 expression. However, despite IFN- ⁇ stimulation, Ido1 expression was substantially reduced in Arid5a-/-KPC.
- Ido1 expression in Arid5a-/-overexpressing HA-Arid5a Arid5a-/-transfected with HA-Arid5a expression vector and Arid5a-/-transfected with empty vector (HA-EV) , Arid5a protein and Ido1 protein were measured by Western blot analysis after culturing for 48 hours in the presence or absence of IFN- ⁇ (5 ng / mL), respectively. The results are shown in FIG. The expression level of IFN- ⁇ -induced Ido1 protein in Arid5a-/-overexpressing HA-Arid5a was increased as compared with the empty vector (HA-EV) Arid5a-/-.
- 3'-UTR luciferase assay in Arid5a-/-Arid5a has been identified as a post-transcriptional regulator and stabilizes target mRNAs such as IL-6 and Stat3 by binding to 3'-UTR. It is known.
- a 3'-UTR luciferase assay was performed with Arid5a-/-KPC to determine whether Arid5a regulates Ido1 expression through mRNA stabilization.
- Arid5a-/-cultured in a 24-well plate was transfected with either the pGL3-luciferase plasmid encoding the Ido1 3'-UTR region or the pGL3-luciferase control plasmid (Promega).
- FIG. 22 shows the expression level of Arid5a mRNA in cells into which Arid5a siRNA has been introduced. In both cells, a decrease in the expression level of Arid5a mRNA was shown, confirming that siRNA was functioning.
- FIG. 23 shows the expression level of Iod1 mRNA in cells into which Arid5a siRNA was introduced. A decrease in the expression level of Iod1 mRNA was shown in both cells. That is, an interesting result was shown that silencing of Arid5a suppressed the expression of Iod1 mRNA. Taken together, these results suggest that Arid5a regulates Ido1 expression between mouse and human malignant tumor cells.
- Arid5a-deficient MC38 cells which are mouse colorectal cancer cell lines, were purchased from Kerafast, Inc. (Boston, USA). Arid5a-deficient MC38 cells were produced using a method similar to that used in the production of Arid5a-deficient KPC cells described in Example 2.
- mice The results of C57BL / 6 mice are shown in FIG. 30, and the results of BALB / c nude mice are shown in FIG.
- the data are representative of three independent experiments and are presented with a mean ⁇ SD. Student t-teat is used for statistical analysis, and ** indicates P ⁇ 0.01.
- FIG. 30 when a tumor was formed subcutaneously in C57BL / 6 mice, the tumor volume of MC38_Arid5a ⁇ / ⁇ showed a significant decrease as compared with the tumor volume of MC38_WT.
- FIG. 31 MC38_Arid5a-/-and MC38_WT showed similar proliferation when tumors were formed subcutaneously in BALB / c nude mice.
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Abstract
本発明は、Arid5A阻害剤を有効成分とする消化器がん治療剤、ならびに、(1)被験物質のArid5Aの発現に対する影響を検出する工程、および(2)被験物質を用いない場合と比較して、Arid5Aの発現を減少させる物質を選択する工程を含んでなる消化器がんの治療に有用な候補物質のスクリーニング方法を提供する。
Description
本発明は、新規な消化器がん治療剤およびそのスクリーニング方法に関するものである。
膵がんは早期発見が非常に困難な上に、多くの場合、診断時に局所進行や遠隔転移を認め、極めて予後不良である。現行治療として、外科的切除に加え、放射線治療、ゲムシタビンなどの抗がん剤が用いられているが、いずれも効果は限定的である。膵がんは、多くの場合膵管上皮に由来し、上皮間葉転換(Epithelial to mesenchymal transition; EMT)遺伝子プロファイルを示すサブグループが予後不良であることが明らかとなっている。
さらに、腫瘍組織における間質反応(繊維化)亢進のため血管新生が抑制され、低栄養・低酸素状態であり、細胞傷害性T細胞、CD4+Th1ヘルパーT細胞、ナチュラルキラー細胞などの浸潤が少ないことが報告されている。そのため、近年注目されている免疫チェックポイント阻害抗体の膵がんに対する治療効果は低い。また、MUC1あるいはmesothelinを標的としたCAR-T治療も試みられているが、顕著な抗腫瘍効果は得られていない。
一方、膵がん患者の血中IL-6の亢進と予後不良との相関が明らかとなっている。また、膵がんモデルマウス等の解析からIL-6シグナルが膵がんの発生・進行に関与することが報告されている。したがって、IL-6シグナルもしくはIL-6産生亢進に関与する分子群を標的とした膵がんの診断・治療方法の創出が期待されるが、未だ開発には至っていない。
ATリッチインターラクティブドメイン5A(AT Rich Interactive Domain 5A、以下「Arid5A」と略記する)はIL-6mRNAの安定化タンパク質として報告されている(例えば非特許文献1参照)。本発明者らは、Arid5A阻害剤が敗血症の治療に有効であること、および肺疾患の治療に有効であることを見出している(特許文献1、2)。また、Arid5Aは、いくつかのがん種において遺伝子の発現量が変動していることが知られており、がんを検出あるいは診断するための候補遺伝子の一つとなる可能性が示唆されている(特許文献3~6)。前立腺がん細胞株においては、Arid5A遺伝子の発現をノックダウンすることで細胞の増殖が抑制されることが知られている(非特許文献2)。
PNAS,110,23,9404-9414(2013)
Cancer Res,77(13 Suppl),Abstract 4489(2017)
本発明は、新規な消化器がん治療剤および消化器がんの治療に有用な候補物質のスクリーニング方法を提供することを目的とする。
本発明は、上記の課題を解決するために、以下の各発明を包含する。
[1]Arid5A阻害剤を有効成分とする消化器がん治療剤。
[2]Arid5A阻害剤がArid5Aの発現または機能を減少させる物質を含む、前記[1]に記載の治療剤。
[3]Arid5A阻害剤が、核酸オリゴまたはポリペプチドである、前記[1]または [2]に記載の治療剤。
[4]核酸オリゴが、siRNA、shRNA、アンチセンス核酸、デコイ核酸、核酸アプタマーおよびリボザイムからなる群から選択される、前記[3]に記載の治療剤。
[5]ポリペプチドが、環状ポリペプチドである、前記[3]に記載の膵がん治療剤。
[6]Arid5A阻害剤が、がん細胞の上皮間葉転換を抑制する、前記[1]~[5]のいずれかに記載の治療剤。
[7]Arid5A阻害剤が、がん細胞の浸潤を抑制する、前記[1]~[6]のいずれかに記載の治療剤。
[8]消化器がんが、膵がんまたは大腸がんである、前記[1]~[7]のいずれかに記載の治療剤。
[9]消化器がんの治療に有用な候補物質のスクリーニング方法であって、
(1)被験物質のArid5Aの発現に対する影響を検出する工程、および
(2)被験物質を用いない場合と比較して、Arid5Aの発現を減少させる物質を選択する工程を含んでなる方法。
[10]消化器がんの治療に有用な候補物質のスクリーニング方法であって、
(a)被験物質のArid5Aの機能に対する影響を検出する工程、および
(b)被験物質を用いない場合と比較して、Arid5Aの機能を減少させる物質を選択する工程を含んでなる方法。
[11]Arid5Aの機能が、IL-6mRNA、IDO1mRNA、CXCL3mRNA、CCL2mRNA、CCL5mRNA、CCL7mRNAおよびCCL8mRNAからなる群より選択されるいずれか一つのmRNAの安定化である、前記[10]に記載のスクリーニング方法。
[12]消化器がんが、膵がんまたは大腸がんである、前記[9]~[11]のいずれかに記載のスクリーニング方法。
[1]Arid5A阻害剤を有効成分とする消化器がん治療剤。
[2]Arid5A阻害剤がArid5Aの発現または機能を減少させる物質を含む、前記[1]に記載の治療剤。
[3]Arid5A阻害剤が、核酸オリゴまたはポリペプチドである、前記[1]または [2]に記載の治療剤。
[4]核酸オリゴが、siRNA、shRNA、アンチセンス核酸、デコイ核酸、核酸アプタマーおよびリボザイムからなる群から選択される、前記[3]に記載の治療剤。
[5]ポリペプチドが、環状ポリペプチドである、前記[3]に記載の膵がん治療剤。
[6]Arid5A阻害剤が、がん細胞の上皮間葉転換を抑制する、前記[1]~[5]のいずれかに記載の治療剤。
[7]Arid5A阻害剤が、がん細胞の浸潤を抑制する、前記[1]~[6]のいずれかに記載の治療剤。
[8]消化器がんが、膵がんまたは大腸がんである、前記[1]~[7]のいずれかに記載の治療剤。
[9]消化器がんの治療に有用な候補物質のスクリーニング方法であって、
(1)被験物質のArid5Aの発現に対する影響を検出する工程、および
(2)被験物質を用いない場合と比較して、Arid5Aの発現を減少させる物質を選択する工程を含んでなる方法。
[10]消化器がんの治療に有用な候補物質のスクリーニング方法であって、
(a)被験物質のArid5Aの機能に対する影響を検出する工程、および
(b)被験物質を用いない場合と比較して、Arid5Aの機能を減少させる物質を選択する工程を含んでなる方法。
[11]Arid5Aの機能が、IL-6mRNA、IDO1mRNA、CXCL3mRNA、CCL2mRNA、CCL5mRNA、CCL7mRNAおよびCCL8mRNAからなる群より選択されるいずれか一つのmRNAの安定化である、前記[10]に記載のスクリーニング方法。
[12]消化器がんが、膵がんまたは大腸がんである、前記[9]~[11]のいずれかに記載のスクリーニング方法。
本発明は、さらに以下の発明を包含する。
[101]Arid5A阻害剤を有効成分とする膵がん治療剤。
[102]Arid5A阻害剤が、核酸オリゴまたはポリペプチドである、前記[101]に記載の膵がん治療剤。
[103]核酸オリゴが、siRNA、shRNA、アンチセンス核酸、デコイ核酸、核酸アプタマーおよびリボザイムからなる群から選択される、前記[102]に記載の膵がん治療剤。
[104]ポリペプチドが、環状ポリペプチドである、前記[102]に記載の膵がん治療剤。
[105]Arid5A阻害剤が、がん細胞の上皮間葉転換を抑制する、前記[101]~[104]のいずれかに記載の治療剤。
[106]Arid5A阻害剤が、がん細胞の浸潤を抑制する、前記[101]~[105]のいずれかに記載の治療剤。
[107]膵がんの治療に有用な候補物質のスクリーニング方法であって、
(1)被験物質のArid5Aの発現に対する影響を検出する工程、および
(2)被験物質を用いない場合と比較して、Arid5Aの発現を減少させる物質を選択する工程を含んでなる方法。
[108]膵がんの治療に有用な候補物質のスクリーニング方法であって、
(a)被験物質のArid5Aの機能に対する影響を検出する工程、および
(b)被験物質を用いない場合と比較して、Arid5Aの機能を減少させる物質を選択する工程を含んでなる方法。
[109]Arid5Aの機能が、IL-6mRNAの安定化またはIDO1mRNAの安定化である、前記[108]に記載のスクリーニング方法。
[101]Arid5A阻害剤を有効成分とする膵がん治療剤。
[102]Arid5A阻害剤が、核酸オリゴまたはポリペプチドである、前記[101]に記載の膵がん治療剤。
[103]核酸オリゴが、siRNA、shRNA、アンチセンス核酸、デコイ核酸、核酸アプタマーおよびリボザイムからなる群から選択される、前記[102]に記載の膵がん治療剤。
[104]ポリペプチドが、環状ポリペプチドである、前記[102]に記載の膵がん治療剤。
[105]Arid5A阻害剤が、がん細胞の上皮間葉転換を抑制する、前記[101]~[104]のいずれかに記載の治療剤。
[106]Arid5A阻害剤が、がん細胞の浸潤を抑制する、前記[101]~[105]のいずれかに記載の治療剤。
[107]膵がんの治療に有用な候補物質のスクリーニング方法であって、
(1)被験物質のArid5Aの発現に対する影響を検出する工程、および
(2)被験物質を用いない場合と比較して、Arid5Aの発現を減少させる物質を選択する工程を含んでなる方法。
[108]膵がんの治療に有用な候補物質のスクリーニング方法であって、
(a)被験物質のArid5Aの機能に対する影響を検出する工程、および
(b)被験物質を用いない場合と比較して、Arid5Aの機能を減少させる物質を選択する工程を含んでなる方法。
[109]Arid5Aの機能が、IL-6mRNAの安定化またはIDO1mRNAの安定化である、前記[108]に記載のスクリーニング方法。
本発明により、新規な消化器がん治療剤を提供することができる。また、本発明により、消化器がんの治療に有用な候補物質の新規なスクリーニング方法を提供することができる。
〔消化器がん治療剤〕
本発明は、Arid5A阻害剤を有効成分とする消化器がん治療剤を提供する。本発明者らは、Arid5Aが膵がん細胞および大腸がん細胞の免疫回避に関与していることを見出し、Arid5Aを阻害すれば膵がんおよび大腸がんの増殖が抑制されることを確認した。それゆえ、Arid5A阻害剤は消化器がんの治療に有用であると考えられる。本発明の一態様において、消化器がんとは、例えば、食道がん、胃がん、肝臓がん、胆道がん、膵がん、十二指腸がん、小腸がん、大腸がん等を表す。特定の態様において、消化器がんとは、膵がんまたは大腸がんを表す。本発明において膵がんは、膵管腺がん(PDAC:pancreatic ductal adenocarcinoma)であってもよい。同様に、本発明は、Arid5A阻害剤を投与することを含む消化器がんの治療方法、消化器がんの治療薬の製造におけるArid5A阻害剤の使用、消化器がんの治療における使用のためのArid5A阻害剤を提供する。
本発明は、Arid5A阻害剤を有効成分とする消化器がん治療剤を提供する。本発明者らは、Arid5Aが膵がん細胞および大腸がん細胞の免疫回避に関与していることを見出し、Arid5Aを阻害すれば膵がんおよび大腸がんの増殖が抑制されることを確認した。それゆえ、Arid5A阻害剤は消化器がんの治療に有用であると考えられる。本発明の一態様において、消化器がんとは、例えば、食道がん、胃がん、肝臓がん、胆道がん、膵がん、十二指腸がん、小腸がん、大腸がん等を表す。特定の態様において、消化器がんとは、膵がんまたは大腸がんを表す。本発明において膵がんは、膵管腺がん(PDAC:pancreatic ductal adenocarcinoma)であってもよい。同様に、本発明は、Arid5A阻害剤を投与することを含む消化器がんの治療方法、消化器がんの治療薬の製造におけるArid5A阻害剤の使用、消化器がんの治療における使用のためのArid5A阻害剤を提供する。
本発明における「Arid5A」とは、ATリッチインターラクティブドメイン5A(AT Rich Interactive Domain 5A)のことであり、IL-6mRNAの安定化タンパク質として報告されている。例えばヒトArid5Aとしては、各種アイソフォームも含まれる(NCBIアクセッション番号NP997646.1、XP006712266.1、XP006712265.1、XP005263918.1、XP005263913.1、XP005263917.1など)。また、マウスArid5Aについても同様に、各種アイソフォームも含まれる(NCBIアクセッション番号NP00165676.1、NP00165677.1、NP001277655.1、NP001277656.1、NP666108.2など)。
本発明における「Arid5A阻害剤」とは、Arid5Aの発現を阻害する物質および/またはArid5Aの機能を阻害する物質のことをいう。Arid5A阻害剤は、Arid5Aの発現自体を直接阻害する物質でもよいし、Arid5Aに結合してArid5Aの生物学的機能を阻害する物質でもよい。あるいは、Arid5Aにより影響を受ける分子(IL-6mRNA、IDO1mRNA、CXCL3mRNA、CCL2mRNA、CCL5mRNA、CCL7mRNA、CCL8mRNA等)に結合してArid5Aの生物学的機能を間接的に阻害する物質でもよい。Arid5Aの発現を阻害することは、結果的にArid5Aの機能を阻害することにもつながるので、前者は後者に含まれる態様の一つと考えることもできる。本明細書において、「Arid5Aの発現および/または機能を阻害する」との表現は、「Arid5Aの発現および/または機能を減少させる」と言い換えることもできる。
Arid5A阻害剤は、Arid5Aと競合的にIL-6mRNAと結合することによりIL-6mRNAの安定化を阻害する物質であってもよい。例えばヒトIL-6mRNAとしては、各種アイソフォームも含まれる(NCBIアクセッション番号NM_000600.3、XM_005249745.2など)。また、マウスIL-6mRNAについても同様に、各種アイソフォームも含まれる(NCBIアクセッション番号NM_031168.1など)。またArid5A阻害剤は、Arid5Aと競合的にIDO1mRNAと結合することによりIDO1mRNAの安定化を阻害する物質であってもよい。例えばヒトIDO1mRNAとしては、各種アイソフォームも含まれる(NCBIアクセッション番号NM_002164.5、AK313259.1など)。また、マウスIDO1mRNAについても同様に、各種アイソフォームも含まれる(NCBIアクセッション番号NM_001293690.1、NM_008324.2など)。
Arid5A阻害剤は、Arid5Aと競合的にCXCL3mRNAと結合することによりCXCL3mRNAの安定化を阻害する物質であってもよい。例えばヒトCXCL3mRNAとしては、各種アイソフォームも含まれる(NCBIアクセッション番号NM_002090.3など)。また、マウスCXCL3mRNAについても同様に、各種アイソフォームも含まれる(NCBIアクセッション番号NM_203320.3など)。またArid5A阻害剤は、Arid5Aと競合的にCCL2mRNAと結合することによりCCL2mRNAの安定化を阻害する物質であってもよい。例えばヒトCCL2mRNAとしては、各種アイソフォームも含まれる(NCBIアクセッション番号NM_002982.4など)。また、マウスCCL2mRNAについても同様に、各種アイソフォームも含まれる(NCBIアクセッション番号NM_011333.3など)。
Arid5A阻害剤は、Arid5Aと競合的にCCL7mRNAと結合することによりCCL7mRNAの安定化を阻害する物質であってもよい。例えばヒトCCL7mRNAとしては、各種アイソフォームも含まれる(NCBIアクセッション番号NM_006273.4など)。また、マウスCCL7mRNAについても同様に、各種アイソフォームも含まれる(NCBIアクセッション番号NM_013654.3など)。またArid5A阻害剤は、Arid5Aと競合的にCCL8mRNAと結合することによりCCL8mRNAの安定化を阻害する物質であってもよい。例えばヒトCCL8mRNAとしては、各種アイソフォームも含まれる(NCBIアクセッション番号NM_005623.3など)。また、マウスCCL8mRNAについても同様に、各種アイソフォームも含まれる(NCBIアクセッション番号NM_021443.3など)。
Arid5A阻害剤は、Arid5Aと競合的にCCL5mRNAと結合することによりCCL5mRNAの安定化を阻害する物質であってもよい。例えばヒトCCL5mRNAとしては、各種アイソフォームも含まれる(NCBIアクセッション番号NM_001278736.2、NM_002985.3など)。また、マウスCCL5mRNAについても同様に、各種アイソフォームも含まれる(NCBIアクセッション番号NM_013653.3など)。
Arid5A阻害剤は、IL-6mRNA、IDO1mRNA、CXCL3mRNA、CCL2mRNA、CCL5mRNA、CCL7mRNA、およびCCL8mRNAからなる群より選択されるいずれか一つのmRNAの安定化を阻害する物質であってもよいし、あるいは複数(少なくとも二つ以上)のmRNAの安定化を阻害する物質であってもよい。
本発明におけるArid5A阻害剤としては、例えば、抗Arid5A抗体などのタンパク質、ポリペプチド、核酸オリゴ、クロルプロマジンなどの低分子化合物などが挙げられるが、特に限定されるものではない。本発明のArid5A阻害剤の好ましい例として、タンパク質が挙げられ、より好ましくは抗体(抗Arid5A抗体)が挙げられる。本発明のArid5A阻害剤の好ましい例として、核酸オリゴが挙げられ、より好ましくはsiRNAが挙げられる。また、本発明のArid5A阻害剤の好ましい例として、ポリペプチドが挙げられ、より好ましくは環状ポリペプチドが挙げられる。Arid5A阻害剤となる低分子化合物の例としては、例えばクロルプロマジンを挙げることができる(PNAS,110,23,9409-9414(2013))。
Arid5Aの発現阻害は、例えばArid5A遺伝子の発現に対するRNA干渉(RNA interference)効果を利用することによって実現可能である。RNA干渉は、RNAを利用して遺伝子の発現を抑制する方法として報告された方法(Genes and Development,16,948-958(2002))であり、標的遺伝子と同一もしくは類似した配列を有する二本鎖RNAを細胞に導入すると、導入した外来遺伝子および標的内在遺伝子の発現がいずれも抑制される現象である。具体的には、Arid5A遺伝子の発現に対するRNA干渉効果を示すsiRNAやアンチセンス核酸を使用して、Arid5A遺伝子の発現阻害が可能である。
本発明における「核酸オリゴ」は、Arid5A遺伝子もしくはタンパク質の機能を制御する核酸のオリゴマーを意味する。核酸オリゴは、天然および非天然のRNAまたはDNAからなるオリゴであってもよい。本発明における核酸オリゴとしては、siRNA、shRNA、アンチセンス核酸、デコイ核酸、核酸アプタマー、リボザイムが含まれる。
本発明における核酸オリゴとして好ましくは、siRNAまたはshRNAを挙げることができる。siRNAは、細胞で毒性を示さない範囲の短鎖からなる二本鎖RNAを意味し、例えば15~49塩基対、好適には15~35塩基対、さらに好適には21~30塩基対とすることができる。また、shRNAは、一本鎖のRNAがヘアピン構造を介して二本鎖を構成しているRNAである。
siRNAおよびshRNAは、標的遺伝子と完全に同一である必要はないが、少なくとも70%以上、好ましくは80%以上、さらに好ましくは90%以上、最も好ましくは95%以上の配列の相同性を有する。
siRNAおよびshRNAにおけるRNA同士が対合した二本鎖RNAの部分は、完全に対合しているものに限らず、ミスマッチ(対応する塩基が相補的でない)、バルジ(一方の鎖に対応する塩基がない)などにより不対合部分が含まれていてもよい。本発明においては、siRNAおよびshRNAにおけるRNA同士が対合した二本鎖RNAの部分には、バルジおよびミスマッチの両方が含まれていてもよい。
また、本発明における「アンチセンス核酸」は、Arid5AをコードするDNAの転写産物と相補的なアンチセンス核酸である。アンチセンス核酸が標的遺伝子の発現を抑制する作用としては、以下のような複数の要因が存在する。すなわち、RNA二本鎖認識によるRNase活性による分解、三重鎖形成による転写開始阻害、RNAポリメラーゼによって局部的に開状ループ構造が作られた部位とのハイブリッド形成による転写抑制、合成の進みつつあるRNAとのハイブリッド形成による転写阻害、イントロンとエクソンの接合点でのハイブリッド形成によるスプライシング抑制、スプライソーム形成部位とのハイブリッド形成によるスプライシング抑制、mRNAとのハイブリッド形成による核から細胞質への移行抑制、翻訳開始因子結合部位とのハイブリッド形成による翻訳抑制、mRNAの翻訳領域やポリソーム結合部位とのハイブリッド形成によるペプチド鎖の伸長阻止、核酸とタンパク質との相互作用部位とのハイブリッド形成による遺伝子発現抑制などである。これらの中でも、転写、スプライシング、または翻訳の過程を阻害して、標的遺伝子の発現を抑制する。
本発明で用いられるアンチセンス配列は、上記のいずれの作用で標的遺伝子の発現を抑制してもよい。一つの態様としては、Arid5AのmRNAの5’末端近傍の非翻訳領域に相補的なアンチセンス配列を設計すれば、遺伝子の翻訳阻害に効果的であるものと考えられる。しかし、コード領域もしくは3’側の非翻訳領域に相補的な配列も使用し得る。このように遺伝子の翻訳領域だけでなく非翻訳領域に相補的な配列も使用し得る。このように、遺伝子の翻訳領域だけでなく、非翻訳領域の配列のアンチセンス配列を含む核酸も、本発明で利用されるアンチセンス核酸に含まれる。アンチセンス核酸は標的とする遺伝子の転写産物に対して好ましくは90%以上、最も好ましくは95%以上の相補性を有する。アンチセンス配列を用いて、効果的に標的遺伝子の発現を阻害するアンチセンスRNAの長さは、特に制限されない。
一つの態様として、本発明における「デコイ核酸」はArid5Aが認識するIL-6mRNA配列と相同性がある核酸オリゴである。IL-6mRNA配列の代わりにArid5Aに結合し、Arid5Aの機能を阻害する。別の態様として、本発明における「デコイ核酸」はArid5Aが認識するIDO1mRNA配列と相同性がある核酸オリゴである。IDO1mRNA配列の代わりにArid5Aに結合し、Arid5Aの機能を阻害する。さらに別の態様として、本発明における「デコイ核酸」はArid5Aが認識するCXCL3mRNA、CCL2mRNA、CCL5mRNA、CCL7mRNA、またはCCL8mRNAのいずれかのmRNA配列と相同性がある核酸オリゴである。前記のmRNA配列の代わりにArid5Aに結合し、Arid5Aの機能を阻害する。
本発明におけるリボザイムは、例えば、前記Arid5AのmRNAを切断するものをいい、該タンパク質の翻訳を阻害するものをいう。
リボザイムは該タンパク質をコードする遺伝子配列より設計可能であり、例えば、ハンマーヘッド型リボザイムとしては、フェブス レター(FEBS Letter)、第228巻、第228-230頁(1988)に記載の方法が用いることができる。また、ハンマーヘッド型リボザイムだけでなく、ヘアピン型リボザイム、デルタ型リボザイムなどのリボザイムの種類に関わらず、該タンパク質のmRNAを切断するもので、該タンパク質の翻訳を阻害するものであれば本明細書で言うリボザイムに含まれる。
本発明における「環状ポリペプチド」は、4個以上のアミノ酸および/またはアミノ酸類縁体により形成される環状構造を含むポリペプチドを意味する。環状ポリペプチドは、環状部以外に直鎖部を有してもよい。環化部の結合様式は特に限定されず、アミド結合またはエステル結合以外の結合であってもよい。環化部の結合様式としては、例えば、アミド結合、炭素-炭素結合、ジスルフィド結合、エステル結合、チオエステル結合、チオエーテル結合、ラクタム結合、アゾリン骨格を介した結合、トリアゾール構造を介した結合、フルオロフォア構造を介した結合などの共有結合が好ましく例示される。環化に用いられるカルボキシ基やアミノ基等の官能基の位置は、主鎖上のものでも、側鎖上のものでもよく、環化可能な位置にあれば、特に制限されない。本明細書において「環化部の結合様式」とは、環化反応により環化が形成された部位の結合様式のことである。本明細書におけるアミノ酸類縁体の例として、例えばヒドロキシカルボン酸(ヒドロキシ酸)を挙げることができる。
限定を意図しないが、いくつかの態様において、本発明におけるArid5A阻害剤はポリペプチドであってよく、ポリペプチドは、環状ポリペプチドであってよい。いくつかの態様において、本発明における環状ポリペプチドの分子量は、500~4000、500~3000、または500~2000であってよい。
いくつかの態様において、本発明における環状ポリペプチドには、天然アミノ酸、非天然アミノ酸、およびアミノ酸類縁体からなる群より選択される少なくとも一種が含まれてよい。これらのアミノ酸の比率は特に限定されない。
いくつかの態様において、本発明における環状ポリペプチドに含まれるアミノ酸およびアミノ酸類縁体の総数は、4~20、4~15、6~15、8~15、9~13、または10~13であってよい。ある態様において、本発明における環状ポリペプチドは、環状部に含まれるアミノ酸およびアミノ酸類縁体の総数が5~15、7~12、または9~11であってよい。
いくつかの態様において、本発明における環状ポリペプチドが直鎖部を有する場合、該直鎖部のアミノ酸および/またはアミノ酸類縁体の数は0~8であることが好ましく、0~5がより好ましく、0~3がより好ましい。なお、非限定の一態様において、本明細書における「直鎖部」には天然アミノ酸や非天然アミノ酸(化学修飾や骨格変換されたアミノ酸を含む)、アミノ酸類縁体が含まれる場合がある。
いくつかの局面において、本発明におけるポリペプチドは、細胞内移行能を高めるための修飾がされていてもよい。このような修飾としては、公知の方法が利用できるため特に限定されないが、細胞膜透過性ペプチドを結合する方法が例示される。細胞膜透過性ペプチドとしては、公知の配列が使用できるが、例えばHIV Tatタンパク質に由来するTatペプチド(Brooks, H. et al. Advanced Drug Delivery Reviews, Vol 57, Issue 4, 2005, p.559-577)、または、6~12残基のアルギニンからなるポリアルギニン(Nakase, I. et al. Advanced Drug Delivery Reviews, Vol 60, 2008, p.598-607)が挙げられる。また、脂肪酸またはスチルベン誘導体を連結することにより、ペプチドが細胞質側にアクセスすることが可能になることが報告されている(Covic,L.ら(2002)Nat Med.8:1161;Endres,P.J.ら(2006)Molecular Imaging 4:485;およびGoubaeva,F.ら,J.Biol.Chem.278:19634)。このような方法を用いることで、ポリペプチドを細胞内に移行させることができる。
本発明の環状ポリペプチドを製造する方法は、例えば環状ポリペプチドライブラリーを用いて、Arid5Aに結合する環状ポリペプチドを同定してよい。このような同定方法は、例えばWO2013/100132、WO2012/033154などで公知である。また、環状ポリペプチドは化学合成方法により製造してもよく、例えば液相合成法、FmocやBoc等を用いた固相合成法、及びこれらの組み合わせ等が例示される。
本発明の消化器がん治療剤には、保存剤や安定剤等の製剤上許容しうる材料が添加されていてもよい。製剤上許容しうるとは、それ自体が消化器がんの治療効果を有する材料であってもよいし、消化器がんの治療効果を有さない材料であってもよく、本発明の消化器がん治療剤とともに投与可能な製剤上許容される材料を意味する。また、治療効果を有さない材料であって、Arid5A阻害剤と併用することによって相乗的効果もしくは相加的な安定化効果を有する材料であってもよい。
製剤上許容される材料としては、例えば滅菌水や生理食塩水、安定剤、賦形剤、緩衝剤、防腐剤、界面活性剤、キレート剤(EDTA等)、結合剤等を挙げることができる。
本発明において、界面活性剤としては非イオン界面活性剤を挙げることができ、例えばソルビタンモノカプリレート、ソルビタンモノラウレート、ソルビタンモノパルミテート等のソルビタン脂肪酸エステル;グリセリンモノカプリレート、グリセリンモノミリテート、グリセリンモノステアレート等のグリセリン脂肪酸エステル等のHLB6~18を有するもの、等を典型例として挙げることができる。
また、界面活性剤としては陰イオン界面活性剤も挙げることができ、例えばセチル硫酸ナトリウム、ラウリル硫酸ナトリウム、オレイル硫酸ナトリウム等の炭素原子数10~18のアルキル基を有するアルキル硫酸塩;ポリオキシエチレンラウリル硫酸ナトリウム等の、エチレンオキシドの平均付加モル数が2~4でアルキル基の炭素原子数が10~18であるポリオキシエチレンアルキルエーテル硫酸塩;ラウリルスルホコハク酸エステルナトリウム等の、アルキル基の炭素原子数が8~18のアルキルスルホコハク酸エステル塩;天然系の界面活性剤、例えばレシチン、グリセロリン脂質;スフィンゴミエリン等のフィンゴリン脂質;炭素原子数12~18の脂肪酸のショ糖脂肪酸エステル等を典型的例として挙げることができる。
本発明における薬剤には、これらの界面活性剤の1種または2種以上を組み合わせて添加することができる。本発明の製剤で使用する好ましい界面活性剤は、ポリソルベート20、40、60、80などのポリオキシエチレンソルビタン脂肪酸エステルであり、ポリソルベート20および80が特に好ましい。また、ポロキサマー(プルロニックF-68(登録商標)など)に代表されるポリオキシエチレンポリオキシプロピレングリコールも好ましい。
本発明において緩衝剤としては、リン酸緩衝液、クエン酸緩衝液、酢酸緩衝液、リンゴ酸緩衝液、酒石酸緩衝液、コハク酸緩衝液、乳酸緩衝液、リン酸カリウム緩衝液、グルコン酸緩衝液、カプリル酸緩衝液、デオキシコール酸緩衝液、サリチル酸緩衝液、トリエタノールアミン緩衝液、フマル酸緩衝液等、その他の有機酸緩衝液等、炭酸緩衝液、トリス緩衝液、ヒスチジン緩衝液、イミダゾール緩衝液等を挙げることができる。
また溶液製剤の分野で公知の水性緩衝液に溶解することによって溶液製剤を調製してもよい。緩衝液の濃度は一般には1~500mMであり、好ましくは5~100mMであり、さらに好ましくは10~20mMである。
また、本発明における薬剤は、その他の低分子量のポリペプチド、血清アルブミン、ゼラチンや免疫グロブリン等のタンパク質、アミノ酸、多糖および単糖等の糖類や炭水化物、糖アルコールを含んでいてもよい。
本発明において、多糖および単糖等の糖類や炭水化物としては、例えばデキストラン、グルコース、フラクトース、ラクトース、キシロース、マンノース、マルトース、スクロース、トレハロース、ラフィノース等を挙げることができる。
本発明において、糖アルコールとしては、例えばマンニトール、ソルビトール、イノシトール等を挙げることができる。
注射用の水溶液とする場合には、例えば生理食塩水、ブドウ糖やその他の補助薬を含む等張液、例えば、D-ソルビトール、D-マンノース、D-マンニトール、塩化ナトリウムが挙げられ、適当な溶解補助剤、例えばアルコール(エタノール等)、ポリアルコール(プロピレングリコール、PEG等)、非イオン性界面活性剤(ポリソルベート80、HCO-50)等と併用してもよい。所望によりさらに希釈剤、溶解補助剤、pH調整剤、無痛化剤、含硫還元剤、酸化防止剤等を含有してもよい。
また、必要に応じ、マイクロカプセル(ヒドロキシメチルセルロース、ゼラチン、ポリ[メチルメタクリル酸]等のマイクロカプセル)に封入したり、コロイドドラッグデリバリーシステム(リポソーム、アルブミンミクロスフェア、マイクロエマルジョン、ナノ粒子、ナノカプセル等)としたりすることもできる("Remington's Pharmaceutical Science 16th edition", Oslo Ed., 1980等参照)。さらに、薬剤を徐放性の薬剤とする方法も公知であり、本発明に適用し得る(Langer et al., J.Biomed.Mater.Res. 1981, 15: 167-277; Langer,Chem. Tech. 1982, 12: 98-105;米国特許第3,773,919号; 欧州特許出願公開(EP)第58,481号; Sidman et al., Biopolymers 1983, 22: 547-556;EP第133,988号)。
使用される製剤上許容しうる担体は、剤型に応じて上記の中から適宜あるいは組合せて選択されるが、これらに限定されるものではない。
本発明のArid5A阻害剤をヒトや他の動物の医薬として使用する場合には、これらの物質自体を直接患者に投与する以外に、公知の製剤学的方法により製剤化して投与を行うことも可能である。製剤化する場合には、上記に記載の製剤上許容される材料を添加してもよい。
本発明の消化器がん治療剤は、医薬品の形態で投与することが可能であり、経口的または非経口的に全身あるいは局所的に投与することができる。例えば、点滴などの静脈内注射、筋肉内注射、腹腔内注射、皮下注射、坐薬、注腸、経口性腸溶剤などを選択することができ、患者の年齢、症状により適宜投与方法を選択することができる。有効投与量は、一回につき体重1kgあたり0.001mgから100mgの範囲で選ばれる。あるいは、患者あたり0.1~1,000mg、好ましくは0.1~50mgの投与量を選ぶことができる。具体的には、例えば、体重1kgあたり1か月(4週間)に0.1mgから40mg、好ましくは1mgから20mgを1回から数回に分けて、例えば2回/週、1回/週、1回/2週、1回/4週などの投与スケジュールで点滴などの静脈内注射、皮下注射などの方法で、投与する方法などである。投与スケジュールは、投与後の状態の観察および血液検査値の動向を観察しながら2回/週あるいは1回/週から1回/2週、1回/3週、1回/4週のように投与間隔を延ばしていくなど調整することも可能である。
一態様として、本発明のArid5A阻害剤は、がん細胞の上皮間葉転換を抑制する。上皮間葉転換の抑制には、上皮間葉転換の減少も含まれる。がん細胞の上皮間葉転換は、例えば後述の実施例4に記載の方法などによって測定することができる。
一態様として、本発明のArid5A阻害剤は、がん細胞の浸潤を抑制する。がん細胞の浸潤の抑制には、浸潤の減少も含まれる。がん細胞の浸潤は、例えば後述の実施例4に記載の方法などによって測定することができる。
本発明の消化器がん治療剤は、他のがん治療剤またはがん治療法と組み合わせて使用してもよい。組み合わせて使用するとは、本発明の消化器がん治療剤の適用時期と他のがん治療剤またはがん治療法の適用時期が重複していることを意味し、同時に投与または治療することを要するものではない。本発明の消化器がん治療剤と組み合わせて使用する他のがん治療剤またはがん治療法は特に限定されないが、例えば化学療法(化学療法剤)、免疫療法(免疫療法剤、免疫チェックポイント阻害剤、CAR-T療法剤等)、ホルモン療法(ホルモン療法剤)などが挙げられる。
〔スクリーニング方法〕
本発明は、消化器がんの治療に有用な候補物質のスクリーニング方法を提供する。本発明者らは、Arid5Aが膵がん細胞および大腸がん細胞の免疫回避に関与していることを見出し、Arid5Aを阻害すれば、膵がんおよび大腸がんの増殖を抑制することを確認した。したがって、Arid5Aの発現および/または機能を減少させる被験物質を選択することにより、消化器がんの治療に有用な候補物質を提供することができる。
本発明は、消化器がんの治療に有用な候補物質のスクリーニング方法を提供する。本発明者らは、Arid5Aが膵がん細胞および大腸がん細胞の免疫回避に関与していることを見出し、Arid5Aを阻害すれば、膵がんおよび大腸がんの増殖を抑制することを確認した。したがって、Arid5Aの発現および/または機能を減少させる被験物質を選択することにより、消化器がんの治療に有用な候補物質を提供することができる。
本発明のスクリーニング方法は、
(1)被験物質のArid5Aの発現に対する影響を検出する工程、および
(2)被験物質を用いない場合と比較して、Arid5Aの発現を減少させる物質を選択する工程
を含んでなる方法であってもよい。
また、本発明のスクリーニング方法は、
(a)被験物質のArid5Aの機能に対する影響を検出する工程、および
(b)被験物質を用いない場合と比較して、Arid5Aの機能を減少させる物質を選択する工程
を含んでなる方法であってもよい。
(1)被験物質のArid5Aの発現に対する影響を検出する工程、および
(2)被験物質を用いない場合と比較して、Arid5Aの発現を減少させる物質を選択する工程
を含んでなる方法であってもよい。
また、本発明のスクリーニング方法は、
(a)被験物質のArid5Aの機能に対する影響を検出する工程、および
(b)被験物質を用いない場合と比較して、Arid5Aの機能を減少させる物質を選択する工程
を含んでなる方法であってもよい。
本発明のスクリーニングにおいて、「被験物質」は特に限定されるものではなく、例えば天然化合物、有機化合物、無機化合物、核酸オリゴ、タンパク質、ポリペプチド等の単一物質、並びに化合物ライブラリー、核酸オリゴライブラリー、ポリペプチドライブラリー、遺伝子ライブラリーの発現産物、細胞抽出物、細胞培養上清、発酵微生物産生物、海洋生物抽出物、植物抽出物、原核細胞抽出物、真核単細胞抽出物もしくは動物細胞抽出物等を挙げることができる。上記被験物質は必要に応じて適宜標識して用いることができる。標識としては、例えば、放射標識、蛍光標識等を挙げることができる。また、上記被験物質に加えて、これらの被験物質を複数種混合した混合物も含まれる。
本発明のスクリーニング方法の第一の態様においては、まずArid5Aに被験物質を接触させる。
本発明のスクリーニング方法に使用されるArid5Aは、ヒトのArid5Aであってもよく、ヒト以外(例えば、サル、マウス、ラット、モルモット、ブタ、ウシ、酵母、昆虫など)のArid5Aであってもよい。ヒトのArid5Aのアミノ酸配列は既述の通りである。本発明のスクリーニング方法に使用されるArid5Aには、公知のArid5Aと機能的に同等なタンパク質が含まれる。このようなタンパク質には、例えば、Arid5Aの変異体、アレル、バリアント、ホモログ、Arid5Aの部分ペプチド、または他のタンパク質との融合タンパク質などが挙げられるがこれらに限定されない。
Arid5Aの変異体としては、Arid5Aの公知のアミノ酸配列において1もしくは複数のアミノ酸が置換、欠失、挿入、および/または付加したアミノ酸配列からなる天然由来のタンパク質であって、既述のアミノ酸配列からなるタンパク質と機能的に同等なタンパク質を挙げることができる。また、Arid5Aをコードする公知の塩基配列からなるDNAとストリジェントな条件下でハイブリダイズする天然由来のDNAよりコードされるタンパク質であって、既述のアミノ酸配列からなるタンパク質と機能的に同等なタンパク質も、Arid5Aの変異体として挙げることができる。
本発明において、変異するアミノ酸数は特に制限されないが、通常、30アミノ酸以内であり、好ましくは15アミノ酸以内であり、さらに好ましくは5アミノ酸以内(例えば、3アミノ酸以内)である。変異するアミノ酸残基においては、アミノ酸側鎖の性質が保存されている別のアミノ酸に変異されること(保存的置換)が望ましい。例えば、アミノ酸側鎖の性質としては、疎水性アミノ酸(A,I,L,M,F,P,W,Y,V)、親水性アミノ酸(R,D,N,C,E,Q,G,H,K,S,T)、脂肪族側鎖を有するアミノ酸(G,A,V,L,I,P)、水酸基含有側鎖を有するアミノ酸(S,T,Y)、硫黄原子含有側鎖を有するアミノ酸(C,M)、カルボン酸およびアミド含有側鎖を有するアミノ酸(D,N,E,Q)、塩基含有側鎖を有するアミノ酸(R,K,H)、芳香族含有側鎖を有するアミノ酸(H,F,Y,W)を挙げることができる(括弧内はいずれもアミノ酸の一文字表記を表す)。あるアミノ酸配列に対する1または複数個のアミノ酸残基の欠失、付加および/または他のアミノ酸配列による置換により修飾されたアミノ酸配列を有するポリペプチドがその生物学的活性を維持することは既に知られている。
本発明において「機能的に同等」とは、対象となるタンパク質が、Arid5Aと同等の生物学的機能や生化学的機能を有することを指す。一つの態様において、Arid5AはIL-6mRNAのステムループに特異的に結合し、IL-6mRNAを特異的に破壊するRegnase-1の作用を拮抗的に阻害することにより、IL-6mRNAの安定化に寄与する。本発明において、Arid5Aの生物学的機能や生化学的機能としてはIL-6mRNAの安定化を挙げることができる。別の態様として、Arid5Aの生物学的機能や生化学的機能としてはIDO1mRNAの安定化を挙げることができる。さらに別の態様として、Arid5Aの生物学的機能や生化学的機能としてはCXCL3mRNA、CCL2mRNA、CCL5mRNA、CCL7mRNA、またはCCL8mRNAのmRNAの安定化を挙げることができる。
目的のタンパク質と「機能的に同等なタンパク質」をコードするDNAを調製するために、当業者によく知られた方法としては、ハイブリダイゼーション技術やポリメラーゼ連鎖反応(PCR)技術を利用する方法が挙げられる。すなわち、当業者にとっては、Arid5Aの塩基配列もしくはその一部をプローブとして、またArid5Aに特異的にハイブリダイズするオリゴヌクレオチドをプライマーとして、Arid5Aと高い相同性を有するDNAを単離することは通常行いうることである。
このようなDNAを単離するためには、好ましくはストリンジェントな条件下でハイブリダイゼーション反応を行う。本発明においてストリンジェントなハイブリダイゼーション条件とは、6M尿素、0.4%SDS、0.5×SSCの条件またはこれと同等のストリンジェンシーのハイブリダイゼーションを指す。よりストリンジェンシーの高い条件、例えば、6M尿素、0.4%SDS、0.1×SSCの条件を用いることにより、より相同性の高いDNAの単離を期待することができる。これにより単離されたDNAは、アミノ酸レベルにおいて、目的タンパク質のアミノ酸配列と高い相同性を有すると考えられる。高い相同性とは、アミノ酸配列全体で、少なくとも50%以上、さらに好ましくは70%以上、さらに好ましくは90%以上(例えば、95%、96%、97%、98%、99%以上)の配列の同一性を指す。アミノ酸配列や塩基配列の同一性は、カーリンおよびアルチュールによるアルゴリズムBLAST(Proc.Natl.Acad.Sci.ISA 87:2264-2268,1990,Proc.Natl.Acad.Sci.ISA 90:5873,1993)を用いて決定できる。BLASTのアルゴリズムに基づいたBLASTNやBLASTXと呼ばれるプログラムが開発されている(Altschul SF,et al:J Mol Biol 215:403,1990)。BLASTNを用いて塩基配列を解析する場合は、パラメーターは、例えばscore=100,wordlength=12とする。また、BLASTXを用いてアミノ酸配列を解析する場合は、パラメーターは、例えばscore=50,wordlength=3とする。BLASTとGapped BLASTプログラムを用いる場合は、各プログラムのデフォルトパラメータを用いる。これらの解析方法の具体的な手法は公知である。
第一の態様に用いられるArid5Aの状態としては、特に制限はなく、例えば精製された状態、細胞内に発現した状態、細胞抽出液内に発現した状態などであってもよい。
Arid5Aの精製は周知の方法で行うことができる。また、Arid5Aが発現している細胞としては、内在性のArid5Aを発現している細胞、または外来性のArid5Aを発現している細胞が挙げられる。上記内在性のArid5Aを発現している細胞としては、動物の組織由来の細胞、培養細胞などを挙げることができるが、これに限定されるものではない。上記培養細胞としては、特に制限はなく、例えば、市販のものを用いることが可能である。内在性のArid5Aを発現している細胞が由来する生物種としては、特に制限はなく、ヒト、サル、マウス、ラット、モルモット、ブタ、ウシ、酵母、昆虫などが挙げられる。また、上記外来性のArid5Aを発現している細胞は、例えば、Arid5AをコードするDNAを含むベクターを細胞に導入することで作製できる。ベクターの細胞への導入は、一般的な方法、例えば、リン酸カルシウム沈殿法、電気パルス穿孔法、リポフェクタミン法、マイクロインジェクション法等によって実施することができる。また、上記外来性のArid5Aを有する細胞は、例えばArid5AをコードするDNAを、相同組み換えを利用した遺伝子導入法により、染色体へ挿入することで作製することができる。このような外来性のArid5Aが導入される細胞が由来する生物種としては、哺乳類に限定されず、外来タンパク質を細胞内に発現させる技術が確立されている生物種であればよい。
また、Arid5Aが発現している細胞抽出液は、例えば試験管内転写翻訳系に含まれる細胞抽出液に、Arid5AをコードするDNAを含むベクターを添加したものを挙げることができる。該試験管内転写翻訳系としては、特に制限はなく、市販の試験管内転写翻訳キットなどを使用することが可能である。
第一の態様における「接触」は、Arid5Aの状態に応じて行えばよい。例えば、Arid5Aが精製された状態であれば、精製標品に被験物質を添加することにより行うことができる。また、細胞内に発現した状態または細胞抽出液内に発現した状態であれば、それぞれ、細胞の培養液または該細胞抽出液に被験物質を添加することにより、もしくは被験物質を実験動物に直接投与することにより、行うことができる。被験物質がタンパク質の場合には、例えば、該タンパク質をコードするDNAを含むベクターをArid5Aが発現している細胞へ導入する、または該ベクターをArid5Aが発現している細胞抽出液に添加することで行うことも可能である。また、例えば、酵母または動物細胞等を用いたツーハイブリッド法を利用することも可能である。
第一の態様では、次いで、Arid5Aの発現および/または機能を測定する。一つの態様において、Arid5Aの機能としては、IL-6mRNAの安定化を挙げることができる。具体的にはArid5Aと被験物質を共存させ、IL-6mRNAの分解抑制効果を測定すること等により間接的にArid5Aの機能を測定することができる。次いで被験物質を接触させない場合と比較して、上記発現および/または機能を低下もしくは増加させた被験物質を選択する。なお、被験物質を実験動物に投与した場合には、脾臓等の組織を摘出し、マクロファージ等の特定の細胞におけるArid5Aの発現および/または機能、IL-6mRNAの発現量等を測定する。発現量の測定はPCR(polymerase chain reaction)やRT-PCR(reverse transcription- polymerase chain reaction)、リアルタイムPCRなどの増幅を基にした技術やハイブリダイゼーションを基にした技術、および/または他の検出技術などを適宜選択できる。本明細書における「PCR」は、PCRおよびそれから派生した増幅を基にした技術による各種DNA、RNA等の測定方法が含まれる。Arid5AはIL-6のmRNAの安定化に寄与するタンパクであるため、細胞内でArid5Aの発現が阻害されると、IL-6のmRNAの発現は抑制されるが、TNF-αのmRNA発現には影響がないことが知られている。そこで、被験物質について、IL-6のmRNAの発現には影響を与えるがTNF-αのmRNAの発現には影響を与えないことを確認することで、Arid5Aの発現に影響を与える物質、すなわち、結果的に消化器がんの治療に有用な候補物質をスクリーニングすることも可能である。選択された被験物質には、Arid5Aの発現および/または機能を低下させる物質が含まれ、Arid5Aの発現および/または機能を抑制することによって、結果的に消化器がんを治療する効果を示すものと考えられる。別の態様として、IDO1mRNAもIL-6mRNAと同様に用いることができる。さらに別の態様として、CXCL3mRNA、CCL2mRNA、CCL5mRNA、CCL7mRNA、およびCCL8mRNAもIL-6mRNAと同様に用いることができる。
本発明のスクリーニング方法の第二の態様においては、まずArid5Aに被験物質を接触させ、次いでArid5Aと被験物質との結合を検出する。検出方法としては、特に制限はない。Arid5Aと被験物質との結合は、例えば、Arid5Aに結合した被験物質に付された標識(例えば、放射標識や蛍光標識など定量的測定が可能な標識)によって検出することができる。また、Arid5Aに標識剤を結合することもできる。被験物質またはArid5Aを樹脂やチップなどに固定化して結合を検出することもできる。Arid5Aへの被験物質の結合により生じるArid5Aの機能変化を指標に検出することもできる。
第二の態様では、次いで、Arid5Aと結合する被験物質を選択する。選択された物質にはArid5Aの発現または機能を減少させる物質が含まれ、Arid5Aの発現または機能を抑制することによって、結果的に消化器がんを治療する効果を示すものと考えられる。
本発明のスクリーニング方法の第三の態様においては、まずArid5Aを発現する細胞に被験物質を接触させ、次いでArid5Aの発現レベルを測定する。Arid5Aの発現レベルの測定は、当業者に公知の方法によって行うことができる。例えばArid5A遺伝子のmRNAを定法に従って抽出し、このmRNAを鋳型としたノーザンハイブリダイゼーション法、またはRT-PCR法を実施することによってArid5A遺伝子の転写レベルの測定を行うことができる。さらに、DNAアレイ技術を用いて、Arid5A遺伝子の発現レベルを測定することも可能である。
また、Arid5遺伝子によりコードされるArid5Aを含む画分を定法に従って回収し、Arid5Aの発現をSDS-PAGE等の電気泳動法で検出することにより、遺伝子の翻訳レベルの測定を行うこともできる。また、Arid5Aに対する抗体を用いて、ウエスタンブロッディング法を実施し、Arid5Aの発現を検出することにより、遺伝子の翻訳レベルの測定を行うことも可能である。Arid5Aに対する抗体については、上記に記載したものを用いることができる。
第三の態様においては、次いで被験物質を接触させていない場合と比較して、Arid5Aの発現レベルを減少または増加させた被験物質を選択する。選択された物質にはArid5Aの発現を減少させる物質が含まれ、Arid5Aの発現を抑制することによって、結果的に消化器がんを治療する効果を示すものと考えられる。
本発明のスクリーニング方法の第四の態様においては、まずArid5AをコードするDNAのプロモーター領域の下流にレポーター遺伝子が機能的に結合したDNAを有する細胞または細胞抽出液を提供する。第四の態様において、「機能的に結合した」とは、Arid5A遺伝子のプロモーター領域に転写因子が結合することにより、レポーター遺伝子の発現が誘導されるように、Arid5A遺伝子のプロモーター領域とレポーター遺伝子とが結合していることをいう。したがって、レポーター遺伝子が他の遺伝子と結合しており、他の遺伝子産物との融合タンパク質を形成する場合であっても、Arid5A遺伝子のプロモーター領域に転写因子が結合することによって、該融合タンパク質の発現が誘導されるものであれば、上記「機能的に結合した」の意に含まれる。
上記レポーター遺伝子としては、その発現が検出可能なものであれば特に制限されず、例えば、当業者において一般的に使用されるCAT遺伝子、lacZ遺伝子、ルシフェラーゼ遺伝子、β-グルクロニダーゼ遺伝子(GUS)、GFP遺伝子等を挙げることができる。また、上記レポーター遺伝子には、Arid5AをコードするDNAもまた含まれる。Arid5AをコードするDNAのプロモーター領域の下流にレポーター遺伝子が機能的に結合したDNAを有する細胞または細胞抽出液は、上述の方法にて調製することが可能である。
第四の態様では、次いで上記細胞または上記細胞抽出液に被験物質を接触させる。次いで、上記細胞または上記細胞抽出液における上記レポーター遺伝子の発現レベルを測定する。レポーター遺伝子の発現レベルは、使用するレポーター遺伝子の種類に応じて、当業者に公知の方法により測定することができる。例えば、レポーター遺伝子がCAT遺伝子である場合には、該遺伝子産物によるクロラムフェニコールのアセチル化を検出することによって、レポーター遺伝子の発現レベルを測定することができる。レポーター遺伝子がlacZ遺伝子である場合には、該遺伝子発現産物の触媒作用による色素化合物の発色を検出することにより、また、ルシフェラーゼ遺伝子である場合には、該遺伝子産物の触媒作用によるルシフェリンの発光を検出することにより、また、β-グルクロニダーゼ遺伝子(GUS)である場合には、該遺伝子発現産物の触媒作用によるGlucuron(ICN社)の発光や5-ブロモ-4-クロロ-3-インドリル-β-グルクロニド(X-Gluc)の発色を検出することにより、レポーター遺伝子の発現レベルを測定することができる。また、Arid5A遺伝子をレポーターとする場合、該遺伝子の発現レベルの測定は、上述した方法で行うことができる。
第四の態様においては、次いで被験物質を接触させていない場合と比較して、該レポーター遺伝子の発現レベルを減少または増加させた被験物質を選択する。選択された物質にはArid5Aの発現を減少させる物質が含まれ、Arid5Aの発現を抑制することによって、結果的に消化器がんを治療する効果を示すものと考えられる。
本発明のスクリーニング方法の第五の態様においては、まずIL-6mRNAに被験物質を接触させ、次いでIL-6mRNAと被験物質との結合を検出する。検出方法としては、特に制限はない。IL-6mRNAと被験物質との結合は、例えば、IL-6mRNAに結合した被験物質に付された標識(例えば、放射標識や蛍光標識など定量的測定が可能な標識)によって検出することができる。また、IL-6mRNAに標識剤を結合することもできる。被験物質またはIL-6mRNAを樹脂やチップなどに固定化して結合を検出することもできる。IL-6mRNAへの被験物質の結合により生じるIL-6mRNAの活性変化を指標に検出することもできる。別の態様として、IDO1mRNAもIL-6mRNAと同様に用いることができる。さらに別の態様として、CXCL3mRNA、CCL2mRNA、CCL5mRNA、CCL7mRNA、およびCCL8mRNAもIL-6mRNAと同様に用いることができる。
第五の態様では、次いで、IL-6mRNAと結合する被験物質を選択する。選択された物質にはArid5Aの発現および/または機能を減少させる物質が含まれ、Arid5Aの発現または機能を抑制することによって、結果的に消化器がんを治療する効果を示すものと考えられる。別の態様として、IDO1mRNAもIL-6mRNAと同様に用いることができる。さらに別の態様として、CXCL3mRNA、CCL2mRNA、CCL5mRNA、CCL7mRNA、およびCCL8mRNAもIL-6mRNAと同様に用いることができる。
本発明のスクリーニング方法の第六の態様においては、まずIL-6mRNAに被験物質を接触させ、さらにArid5Aを接触させ、次いで、Arid5Aの機能を測定する。Arid5Aの機能としては、上述のような形で測定することができる。次いで被験物質を接触させない場合と比較して、上記機能を低下もしくは増加させた被験物質を選択する。選択された被験物質には、Arid5A機能を低下させる物質が含まれ、Arid5Aの機能を抑制することによって、結果的に消化器がんを治療する効果を示すものと考えられる。別の態様として、IDO1mRNAもIL-6mRNAと同様に用いることができる。さらに別の態様として、CXCL3mRNA、CCL2mRNA、CCL5mRNA、CCL7mRNA、およびCCL8mRNAもIL-6mRNAと同様に用いることができる。
以下、実施例により本発明を詳細に説明するが、本発明はこれらに限定されるものではない。
1.MEF(mouse embryonic fibroblast)、B16/F10細胞およびKPC細胞におけるArid5aタンパク質の発現解析
KPC細胞は、京都大学・児玉博士から分与された。B16/F10細胞はAmerican Type Culture Collection(ATCC)から購入した。MEFは発明者らの研究室で作製した。KPC細胞は、ヒト膵管腺がんモデルとして確立されているKPC(LSL-KrasG12D/+; LSL-Trp53R172H/+; Pdx-1-Cre)マウスから調製した細胞である。
KPC細胞は、京都大学・児玉博士から分与された。B16/F10細胞はAmerican Type Culture Collection(ATCC)から購入した。MEFは発明者らの研究室で作製した。KPC細胞は、ヒト膵管腺がんモデルとして確立されているKPC(LSL-KrasG12D/+; LSL-Trp53R172H/+; Pdx-1-Cre)マウスから調製した細胞である。
定法に従い各細胞のライセートを調製して、SDS-PAGEに供し、PVDF膜に転写してウエスタンブロット分析を行った。一次抗体には抗ヒトArid5a抗体(クローンP18112、ThermoFisher)を使用し、二次抗体にはAmersham ECL抗マウスIgG HRPコンジュゲート(GE Healthcare)を使用した。ブロットを化学発光検出システム(Chemi-lumi one ultra、Nacalai Tesque)を用いて現像し、画像をImage Quant LAS 500(GE Healthcare)で撮影した。
結果を図1に示した。KPC細胞はMEFおよびB16/F10細胞と比較して、高レベルのArid5aを発現することが示された。
2.Arid5a欠損KPC細胞の作製
CRISPR/Cas9システム(Santa Cruz)を説明書に従って使用し、KPC細胞のArid5a遺伝子を欠失させた。Arid5a遺伝子のエクソン2の3'領域周辺の28塩基対が欠失するように設計されたシングルガイドRNA(sgRNA)と、Arid5a遺伝子のエクソン5の3'領域周辺の70塩基対が欠失するように設計されたsgRNAを使用した。Arid5a遺伝子のエクソン2およびエクソン5の欠失領域の概略を図2に示した。(A)はエクソン2、(B)はエクソン5の概略図である。下段の矢印はPCR用プライマーの位置を示す。
CRISPR/Cas9システム(Santa Cruz)を説明書に従って使用し、KPC細胞のArid5a遺伝子を欠失させた。Arid5a遺伝子のエクソン2の3'領域周辺の28塩基対が欠失するように設計されたシングルガイドRNA(sgRNA)と、Arid5a遺伝子のエクソン5の3'領域周辺の70塩基対が欠失するように設計されたsgRNAを使用した。Arid5a遺伝子のエクソン2およびエクソン5の欠失領域の概略を図2に示した。(A)はエクソン2、(B)はエクソン5の概略図である。下段の矢印はPCR用プライマーの位置を示す。
Arid5a遺伝子のエクソン2およびエクソン5の欠失をPCRにより検証した結果を図3示した。(A)はエクソン2、(B)はエクソン5の結果である。2個のArid5a欠損細胞クローン(KO4およびKO5)が得られた。
得られたArid5a欠損細胞のArid5a mRNAおよびArid5a タンパク質を、それぞれqRT-PCRおよびウエスタンブロット分析により測定し、Arid5aを欠損していない野生型(WT)KPC細胞と比較した。
Arid5a欠損KPC細胞クローンKO4および野生型(WT)KPC細胞におけるArid5a mRNAの結果を図4に、Arid5aタンパク質の結果を図5に、それぞれ示した。Arid5a欠損KPC細胞では、mRNAレベルおよびタンパク質レベルでArid5aが検出されないことを確認した。
Arid5a欠損KPC細胞クローンKO4および野生型(WT)KPC細胞におけるArid5a mRNAの結果を図4に、Arid5aタンパク質の結果を図5に、それぞれ示した。Arid5a欠損KPC細胞では、mRNAレベルおよびタンパク質レベルでArid5aが検出されないことを確認した。
3.マウス皮下に形成したArid5a欠損KPC細胞腫瘍の体積測定
5~7週齢の雌BALB/cヌードマウスおよび5~7週齢の雌C57BL/6を使用した。野生型(WT)KPC細胞(以下「WT」と記載する)およびArid5a欠損KPC細胞(以下「Arid5a-/-」と記載する)各2×105個を、等用量のマトリゲルと混合してマウスの左右の脇腹に皮下注射した。5、7、10、14、17、21日目にカリパスを用いて腫瘍の最長寸法(L)と垂直寸法(W)を測定した.腫瘍体積は、式:L×W2×0.5で算出した。
5~7週齢の雌BALB/cヌードマウスおよび5~7週齢の雌C57BL/6を使用した。野生型(WT)KPC細胞(以下「WT」と記載する)およびArid5a欠損KPC細胞(以下「Arid5a-/-」と記載する)各2×105個を、等用量のマトリゲルと混合してマウスの左右の脇腹に皮下注射した。5、7、10、14、17、21日目にカリパスを用いて腫瘍の最長寸法(L)と垂直寸法(W)を測定した.腫瘍体積は、式:L×W2×0.5で算出した。
C57BL/6マウスの結果を図6に示し、BALB/cヌードマウスの結果を図7に示した。データは3つの独立した実験の代表であり、平均値±SDで表示している。統計解析にはstudent t-teatを使用し、n.sは有意差なし、*はP<0.05、**はP<0.01を示す。
図6に示したように、C57BL/6マウスの皮下に腫瘍を形成させた場合、Arid5a-/-の腫瘍体積は、WTの腫瘍体積と比較して17日目以降、有意な減少を示した。一方、図7に示したように、BALB/cヌードマウスの皮下に腫瘍を形成させた場合、Arid5a-/-およびWTは同程度の増殖を示した。すなわち、正常な免疫を有するC57BL/6マウスではArid5a-/-の腫瘍体積が減少したが、免疫不全マウス(BALB/cヌードマウス)ではArid5a-/-の腫瘍体積は減少しなかった。この結果から、Arid5aがKPC細胞の免疫回避に関与していることが明らかになった。したがって、Arid5aを阻害すれば、膵がんの増殖を抑制し、膵がんを治療することができると考えられた。
図6に示したように、C57BL/6マウスの皮下に腫瘍を形成させた場合、Arid5a-/-の腫瘍体積は、WTの腫瘍体積と比較して17日目以降、有意な減少を示した。一方、図7に示したように、BALB/cヌードマウスの皮下に腫瘍を形成させた場合、Arid5a-/-およびWTは同程度の増殖を示した。すなわち、正常な免疫を有するC57BL/6マウスではArid5a-/-の腫瘍体積が減少したが、免疫不全マウス(BALB/cヌードマウス)ではArid5a-/-の腫瘍体積は減少しなかった。この結果から、Arid5aがKPC細胞の免疫回避に関与していることが明らかになった。したがって、Arid5aを阻害すれば、膵がんの増殖を抑制し、膵がんを治療することができると考えられた。
4.KPC細胞の上皮間葉転換(Epithelial to mesenchymal transition; EMT)に対するArid5a関与の検討
(4-1)KPC細胞の形態変化
WTおよびArid5a-/-を、それぞれIL-6(10ng/mL)またはTGFβ(5ng/mL)の存在下または非存在下で48時間培養し、細胞形態を顕微鏡で分析した。細胞の培養には、10%FCSを含有するDMEM培地(Sigma)を用いた。
(4-1)KPC細胞の形態変化
WTおよびArid5a-/-を、それぞれIL-6(10ng/mL)またはTGFβ(5ng/mL)の存在下または非存在下で48時間培養し、細胞形態を顕微鏡で分析した。細胞の培養には、10%FCSを含有するDMEM培地(Sigma)を用いた。
IL-6で処理した結果を図8に示した。図8bから明らかなように、IL-6で処理したWTの形態は管状構造に変化した。一方Arid5a-/-は、IL-6で処理しても形態変化を示さなかった(図8d)。TGFβで処理した結果を図9に示した。Arid5a-/-は、TGFβで処理しても形態変化を示さなかった(図9d)。これらの結果から、Arid5aを阻害すれば、KPC細胞の上皮間葉転換を抑制できることが示された。
(4-2)Eカドヘリン発現
Eカドヘリン発現は、上皮間葉転換の顕著な特徴であることが知られている。そこで、KPC細胞(WTおよびArid5a-/-)のEカドヘリン発現を試験した。
WTおよびArid5a-/-を、それぞれIL-6(10ng/mL)またはTGFβ(5ng/mL)の存在下または非存在下で48時間培養し、ウエスタンブロット分析によりEカドヘリンの発現を解析した。
Eカドヘリン発現は、上皮間葉転換の顕著な特徴であることが知られている。そこで、KPC細胞(WTおよびArid5a-/-)のEカドヘリン発現を試験した。
WTおよびArid5a-/-を、それぞれIL-6(10ng/mL)またはTGFβ(5ng/mL)の存在下または非存在下で48時間培養し、ウエスタンブロット分析によりEカドヘリンの発現を解析した。
結果を図10に示した。WTおよびArid5a-/-とも、IL-6の存在、非存在によるEカドヘリン発現量の変化はなかった。一方、WTおよびArid5a-/-とも、TGFβの存在下では、非存在よりEカドヘリン発現量が抑制された。しかし、いずれの条件においてもEカドヘリン発現量はWTよりArid5a-/-で増加しており、Arid5aが間葉系表現型の維持に関与している可能性があることが示唆された。
(4-3)IL-6誘導マトリゲル浸潤アッセイ
上皮間葉転換は細胞浸潤性と関連しているため、Arid5aがKPC細胞の浸潤活性において役割を果たすかどうかを調べるために、IL-6誘導マトリゲル浸潤アッセイを実施した。
細胞には、WT、Arid5a-/-およびArid5a-/-にArid5a発現ベクターを導入した細胞の3種類を使用した。1×105個の各細胞を、IL-6(10 ng/mL)の存在下または非存在下で48時間インキュベートした。その後、血清の非存在下でBiocoat Matrigelチャンバー(BD Biosciences)のチャンバー膜の上部ウェルに細胞を播種した。下部ウェルには、血清の非存在下でNIH3T3細胞を24時間培養したNIH3T3馴化培地を満たした。12時間インキュベートした後、細胞はマトリゲルに浸潤し、膜の下面に遊走した。次いで膜を4%パラホルムアルデヒド中で固定し、そして下面に移動した細胞の数を記録した(図11参照)。
上皮間葉転換は細胞浸潤性と関連しているため、Arid5aがKPC細胞の浸潤活性において役割を果たすかどうかを調べるために、IL-6誘導マトリゲル浸潤アッセイを実施した。
細胞には、WT、Arid5a-/-およびArid5a-/-にArid5a発現ベクターを導入した細胞の3種類を使用した。1×105個の各細胞を、IL-6(10 ng/mL)の存在下または非存在下で48時間インキュベートした。その後、血清の非存在下でBiocoat Matrigelチャンバー(BD Biosciences)のチャンバー膜の上部ウェルに細胞を播種した。下部ウェルには、血清の非存在下でNIH3T3細胞を24時間培養したNIH3T3馴化培地を満たした。12時間インキュベートした後、細胞はマトリゲルに浸潤し、膜の下面に遊走した。次いで膜を4%パラホルムアルデヒド中で固定し、そして下面に移動した細胞の数を記録した(図11参照)。
結果を図12に示した。データは3つの独立した実験の代表であり、平均値±SDで表示している。統計解析にはstudent t-teatを使用し、n.sは有意差なし、*はP<0.05、**はP<0.01を示す。
WTのIL-6誘導浸潤活性は、Arid5a-/-では有意に減少した。Arid5a-/-における浸潤活性の減少は、Arid5a発現によって救済された。
WTのIL-6誘導浸潤活性は、Arid5a-/-では有意に減少した。Arid5a-/-における浸潤活性の減少は、Arid5a発現によって救済された。
浸潤アッセイの結果が細胞増殖によって影響を受ける可能性を排除するために、WT、Arid5a-/-およびArid5a発現Arid5a-/-における相対的細胞増殖をモニターし、その結果を図13に示した。データは3つの独立した実験の代表であり、平均値±SDで表示している。図13から明らかなように、3つの細胞株間の相対増殖は同程度であった。
以上の結果は、Arid5aが間葉表現型の維持および膵管腺がん(PDAC)におけるIL-6誘導性浸潤に関与していることを示唆している。
5.腫瘍におけるIFN-γが仲介するIdo1発現に対するArid5a関与の検討
(5-1)RNA発現分析
Arid5aを介した免疫回避の分子メカニズムを特定するために、WTおよびArid5a-/-のRNAseq解析を行った。
結果を図14に示した。Arid5a-/-では、Ido1の発現が有意に減少したのに対して、Ido2およびTod2は影響を受けないことを見出した。
(5-1)RNA発現分析
Arid5aを介した免疫回避の分子メカニズムを特定するために、WTおよびArid5a-/-のRNAseq解析を行った。
結果を図14に示した。Arid5a-/-では、Ido1の発現が有意に減少したのに対して、Ido2およびTod2は影響を受けないことを見出した。
(5-2)癌ゲノムアトラス(TCGA)データセット分析
原発性膵管腺がん(PDAC)患者におけるIDO1発現とARID5a発現との間に統計的に有意な正の相関があることを見出した(図15)。さらに、IDO1 mRNAの高発現患者(上位27.5%; 38/138)は、低い生存確率と統計的に相関していることを見出した(図16)。
原発性膵管腺がん(PDAC)患者におけるIDO1発現とARID5a発現との間に統計的に有意な正の相関があることを見出した(図15)。さらに、IDO1 mRNAの高発現患者(上位27.5%; 38/138)は、低い生存確率と統計的に相関していることを見出した(図16)。
(5-3)Arid5a-/-におけるIdo1発現
WTおよびArid5a-/-を、それぞれIFN-γ(5ng/mL)の存在下または非存在下で48時間培養し、Ido1 mRNAの発現量をqRT-PCRで測定した。データは3つの独立した実験の代表であり、平均値±SDで表示している。
また、WTおよびArid5a-/-を、それぞれIFN-γ(5ng/mL)の存在下または非存在下で、0、24、48および72時間培養し、Arid5a タンパク質およびIdo1 タンパク質をウエスタンブロット分析により測定した。
WTおよびArid5a-/-を、それぞれIFN-γ(5ng/mL)の存在下または非存在下で48時間培養し、Ido1 mRNAの発現量をqRT-PCRで測定した。データは3つの独立した実験の代表であり、平均値±SDで表示している。
また、WTおよびArid5a-/-を、それぞれIFN-γ(5ng/mL)の存在下または非存在下で、0、24、48および72時間培養し、Arid5a タンパク質およびIdo1 タンパク質をウエスタンブロット分析により測定した。
Ido1 mRNAの結果を図17に示した。IFN-γ非存在下では、Arid5a-/-におけるIdo1 mRNAの発現は実質的に消失した。
Ido1 タンパク質の結果を図18に示した。WTではIFN-γに応答してArid5a発現は48時間で増加した。また、IFN-γ誘導性Ido1が24時間で発現され、48時間で上昇した。これは、Arid5a発現とIdo1発現との間に相関関係がある可能性を示す。しかし、IFN-γ刺激にもかかわらず、Ido1の発現はArid5a-/-KPCにおいて実質的に減少した。
Ido1 タンパク質の結果を図18に示した。WTではIFN-γに応答してArid5a発現は48時間で増加した。また、IFN-γ誘導性Ido1が24時間で発現され、48時間で上昇した。これは、Arid5a発現とIdo1発現との間に相関関係がある可能性を示す。しかし、IFN-γ刺激にもかかわらず、Ido1の発現はArid5a-/-KPCにおいて実質的に減少した。
(5-4)HA-Arid5aを過剰発現するArid5a-/-におけるIdo1発現
HA-Arid5a発現ベクターをトランスフェクションしたArid5a-/-と、空ベクター(HA-EV)をトランスフェクションしたArid5a-/-を、それぞれIFN-γ(5ng/mL)の存在下または非存在下で48時間培養し、Arid5a タンパク質およびIdo1 タンパク質をウエスタンブロット分析により測定した。結果を図19に示した。HA-Arid5aを過剰発現するArid5a-/-におけるIFN-γ誘導Ido1タンパク質の発現量は、空ベクター(HA-EV)Arid5a-/-と比較して増加した。
HA-Arid5a発現ベクターをトランスフェクションしたArid5a-/-と、空ベクター(HA-EV)をトランスフェクションしたArid5a-/-を、それぞれIFN-γ(5ng/mL)の存在下または非存在下で48時間培養し、Arid5a タンパク質およびIdo1 タンパク質をウエスタンブロット分析により測定した。結果を図19に示した。HA-Arid5aを過剰発現するArid5a-/-におけるIFN-γ誘導Ido1タンパク質の発現量は、空ベクター(HA-EV)Arid5a-/-と比較して増加した。
(5-5)Arid5a-/-におけるキヌレニン発現
Ido1は、トリプトファンをキヌレニンに異化し、これがAhRを活性化し、そしてTreg分化を介して免疫回避を促進することが報告されている。そこで、WTおよびArid5a-/-を、それぞれIFN-γ(5ng/mL)の存在下または非存在下で24、48、72時間培養し、上清中のキヌレニンレベルをELISAにより測定した。
結果を図20に示した。データは3つの独立した実験の代表であり、平均値±SDで表示している。Arid5a-/-は、IFN-γ処理した場合でも、一貫して上清中のキヌレニンレベルは低かった。この結果は、Arid5aがIdo1-キヌレニンアクシスの調節を介した免疫回避の重要な役割を果たしていることを示唆している。
Ido1は、トリプトファンをキヌレニンに異化し、これがAhRを活性化し、そしてTreg分化を介して免疫回避を促進することが報告されている。そこで、WTおよびArid5a-/-を、それぞれIFN-γ(5ng/mL)の存在下または非存在下で24、48、72時間培養し、上清中のキヌレニンレベルをELISAにより測定した。
結果を図20に示した。データは3つの独立した実験の代表であり、平均値±SDで表示している。Arid5a-/-は、IFN-γ処理した場合でも、一貫して上清中のキヌレニンレベルは低かった。この結果は、Arid5aがIdo1-キヌレニンアクシスの調節を介した免疫回避の重要な役割を果たしていることを示唆している。
(5-6)Arid5a-/-における3'-UTRルシフェラーゼアッセイ
Arid5aは転写後調節因子として同定されており、3'-UTRに結合することでIL-6やStat3などの標的mRNAを安定化させることが知られている。Arid5aがmRNAの安定化を介してIdo1の発現を調節しているかどうかを調べるために、Arid5a-/-KPCを用いて3'-UTRルシフェラーゼアッセイを行った。
24ウェルプレートで培養したArid5a-/-に、Ido1 3'-UTR領域をコードするpGL3-ルシフェラーゼプラスミド、またはpGL3-ルシフェラーゼコントロールプラスミド(Promega)のいずれかをトランスフェクションした。全てのトランスフェクションは、Arid5a pcDNA3-Flag過剰発現ベクターまたは空のpcDNA3-Flagベクターと組み合わせて行った。内部標準としてのウミシイタケルシフェラーゼレポータープラスミド(Promega)をトランスフェクションした。24時間後、細胞をpassive lysis bufferを用いて溶解した。ルシフェラーゼ活性は、Dual Luciferase Reporter Assay System(Promega)を用いて測定した。
Arid5aは転写後調節因子として同定されており、3'-UTRに結合することでIL-6やStat3などの標的mRNAを安定化させることが知られている。Arid5aがmRNAの安定化を介してIdo1の発現を調節しているかどうかを調べるために、Arid5a-/-KPCを用いて3'-UTRルシフェラーゼアッセイを行った。
24ウェルプレートで培養したArid5a-/-に、Ido1 3'-UTR領域をコードするpGL3-ルシフェラーゼプラスミド、またはpGL3-ルシフェラーゼコントロールプラスミド(Promega)のいずれかをトランスフェクションした。全てのトランスフェクションは、Arid5a pcDNA3-Flag過剰発現ベクターまたは空のpcDNA3-Flagベクターと組み合わせて行った。内部標準としてのウミシイタケルシフェラーゼレポータープラスミド(Promega)をトランスフェクションした。24時間後、細胞をpassive lysis bufferを用いて溶解した。ルシフェラーゼ活性は、Dual Luciferase Reporter Assay System(Promega)を用いて測定した。
結果を図21に示した。データは3つの独立した実験の代表であり、平均値±SDで表示している。「mock」は空ベクター細胞、「Arid5a」はHA-Arid5a過剰発現細胞を示す。驚くべきことに、Arid5aを過剰発現させると、Ido1の3'-UTRに対して安定化効果が認められた。
(5-7)Arid5aのノックダウン実験
IFN-γ刺激によりIDO1発現を誘導することが報告されているヒトグリオブラストーマ細胞株A172およびT98Gにおいて、ARID5AおよびIDO1をノックダウンした。
図22にArid5aのsiRNAを導入した細胞におけるArid5a mRNAの発現量を示した。どちらの細胞においても、Arid5a mRNAの発現量の減少が示され、siRNAが機能していることが確認された。図23にArid5aのsiRNAを導入した細胞におけるIod1 mRNAの発現量を示した。どちらの細胞においてもIod1 mRNAの発現量の減少が示された。すなわち、Arid5aのサイレンシングがIod1 mRNAの発現を抑制するという興味深い結果が示された。
まとめると、これらの結果は、Arid5aがマウスおよびヒトの悪性腫瘍細胞間のIdo1発現を調節することを示唆している。
IFN-γ刺激によりIDO1発現を誘導することが報告されているヒトグリオブラストーマ細胞株A172およびT98Gにおいて、ARID5AおよびIDO1をノックダウンした。
図22にArid5aのsiRNAを導入した細胞におけるArid5a mRNAの発現量を示した。どちらの細胞においても、Arid5a mRNAの発現量の減少が示され、siRNAが機能していることが確認された。図23にArid5aのsiRNAを導入した細胞におけるIod1 mRNAの発現量を示した。どちらの細胞においてもIod1 mRNAの発現量の減少が示された。すなわち、Arid5aのサイレンシングがIod1 mRNAの発現を抑制するという興味深い結果が示された。
まとめると、これらの結果は、Arid5aがマウスおよびヒトの悪性腫瘍細胞間のIdo1発現を調節することを示唆している。
6.IFN-γによるIdo1発現の調節におけるStat1およびArid5a関与の検討
(6-1)Arid5a-/-におけるリン酸化Stat1(pStat1)の分析
IFN-γはIFN-受容体を介してJAKを活性化し、活性化JAKは、Stat1の701位のチロシンをリン酸化する。リン酸化Stat1(pStat1)はそのプロモーターに結合することによりIdo1の転写を活性化することが報告されている。そこで、WTおよびArid5a-/-を、それぞれIFN-γ(5ng/mL)の存在下または非存在下で10分、1、6、12、24、48、72時間時間培養し、Stat1およびpStat1をウエスタンブロット分析により測定した。
(6-1)Arid5a-/-におけるリン酸化Stat1(pStat1)の分析
IFN-γはIFN-受容体を介してJAKを活性化し、活性化JAKは、Stat1の701位のチロシンをリン酸化する。リン酸化Stat1(pStat1)はそのプロモーターに結合することによりIdo1の転写を活性化することが報告されている。そこで、WTおよびArid5a-/-を、それぞれIFN-γ(5ng/mL)の存在下または非存在下で10分、1、6、12、24、48、72時間時間培養し、Stat1およびpStat1をウエスタンブロット分析により測定した。
結果を図24に示した。IFN-γ処理を行わない場合(0分)WTおよびArid5a-/-のどちらもStat1を発現していなかった。6時間以上のIFN-γ処理によりW、TおよびArid5a-/-のどちらもStat1を発現した。pStat1のレベルは、WTおよびArid5a-/-において同程度であった。
(6-2)Stat1サイレンシングKPC細胞におけるArid5aおよびIdo1の発現
レンチウイルスを用いてStat1 shRNAをKPC細胞に導入し、Stat1サイレンシングKPC細胞(#1および#5)を構築した。コントロールとしてレンチウイルスを用いてスクランブルshRNAをKPC細胞に導入した(Scr)。Scr、#1および#5をIFN-γ(5ng/mL)で処理し、Arid5aおよびIdo1をウエスタンブロット分析により測定した。
レンチウイルスを用いてStat1 shRNAをKPC細胞に導入し、Stat1サイレンシングKPC細胞(#1および#5)を構築した。コントロールとしてレンチウイルスを用いてスクランブルshRNAをKPC細胞に導入した(Scr)。Scr、#1および#5をIFN-γ(5ng/mL)で処理し、Arid5aおよびIdo1をウエスタンブロット分析により測定した。
結果を図25に示した。Stat1の阻害はArid5aの発現に影響を及ぼさなかったが、Ido1の発現は完全に消失した。この結果から、pStat1がIdo1の転写開始反応を活性化し、続いてArid5aが転写後にIdo1 mRNAを安定化させると考えられた。
7.腫瘍におけるケモカインの発現に対するArid5a関与の検討
(7-1)RNA発現分析
Arid5aを介した免疫回避の分子メカニズムの別の可能性を検討するために、WTおよびArid5a-/-における各種ケモカインの遺伝子発現量の変化をRNAseq解析により検討を行った。遺伝子発現量を表すFPKM(Fragments per kilobase of exon per million mapped fragments)値はCuffLinks(http://cufflinks.cbcb.umd.edu)を用いて算出された。
結果を図26に示した。図中「E103-1」がWT、「E103-2」がArid5a-/-である。Arid5a-/-では、WTに比べて、CXCL10、CXCL3、CCL2、CCL5、CCL7、CCL8、CCL9などのケモカインの発現が有意に減少していることが見出された。
(7-1)RNA発現分析
Arid5aを介した免疫回避の分子メカニズムの別の可能性を検討するために、WTおよびArid5a-/-における各種ケモカインの遺伝子発現量の変化をRNAseq解析により検討を行った。遺伝子発現量を表すFPKM(Fragments per kilobase of exon per million mapped fragments)値はCuffLinks(http://cufflinks.cbcb.umd.edu)を用いて算出された。
結果を図26に示した。図中「E103-1」がWT、「E103-2」がArid5a-/-である。Arid5a-/-では、WTに比べて、CXCL10、CXCL3、CCL2、CCL5、CCL7、CCL8、CCL9などのケモカインの発現が有意に減少していることが見出された。
(7-2)癌ゲノムアトラス(TCGA)データセット分析
原発性膵管腺がん(PDAC)患者におけるケモカイン(CXCL3、CCL2、CCL7、およびCCL8)の発現とARID5aの発現との間に統計的に有意な正の相関があることを見出した(図27)。
原発性膵管腺がん(PDAC)患者におけるケモカイン(CXCL3、CCL2、CCL7、およびCCL8)の発現とARID5aの発現との間に統計的に有意な正の相関があることを見出した(図27)。
(7-3)Arid5a-/-におけるケモカインの発現
WTおよびArid5a-/-を、それぞれ48時間培養し、ケモカイン(CXCL3、CCL2、CCL7、およびCCL8)のmRNAの発現量をqRT-PCRで測定した。
各ケモカイン(CXCL3、CCL2、CCL7、およびCCL8)のmRNAの結果を図28に示した。Arid5a-/-では、WTに比べて、CXCL3、CCL2、CCL7、CCL8の各ケモカインのmRNAの発現が低下しており、これらのケモカインの発現調節にArid5aが関与していることが示された。
WTおよびArid5a-/-を、それぞれ48時間培養し、ケモカイン(CXCL3、CCL2、CCL7、およびCCL8)のmRNAの発現量をqRT-PCRで測定した。
各ケモカイン(CXCL3、CCL2、CCL7、およびCCL8)のmRNAの結果を図28に示した。Arid5a-/-では、WTに比べて、CXCL3、CCL2、CCL7、CCL8の各ケモカインのmRNAの発現が低下しており、これらのケモカインの発現調節にArid5aが関与していることが示された。
(7-4)Arid5a-/-における3'-UTRルシフェラーゼアッセイ
実施例(5-6)に記載されているのと同様の方法により3'-UTRルシフェラーゼアッセイを行い、Arid5aがmRNAの安定化を介してケモカインの発現を調節しているかどうかを調べるための実験を行った。
具体的には、24ウェルプレートで培養したArid5a-/-に、ケモカイン(CCL2またはCCL8)の3'-UTR領域をコードするpGL3-ルシフェラーゼプラスミド、またはpGL3-ルシフェラーゼコントロールプラスミド(Promega)のいずれかをトランスフェクションした。全てのトランスフェクションは、Arid5a pcDNA3-Flag過剰発現ベクターまたは空のpcDNA3-Flagベクターと組み合わせて行った。内部標準としてのウミシイタケルシフェラーゼレポータープラスミド(Promega)をトランスフェクションした。24時間後、細胞をpassive lysis bufferを用いて溶解した。ルシフェラーゼ活性は、Dual Luciferase Reporter Assay System(Promega)を用いて測定した。
実施例(5-6)に記載されているのと同様の方法により3'-UTRルシフェラーゼアッセイを行い、Arid5aがmRNAの安定化を介してケモカインの発現を調節しているかどうかを調べるための実験を行った。
具体的には、24ウェルプレートで培養したArid5a-/-に、ケモカイン(CCL2またはCCL8)の3'-UTR領域をコードするpGL3-ルシフェラーゼプラスミド、またはpGL3-ルシフェラーゼコントロールプラスミド(Promega)のいずれかをトランスフェクションした。全てのトランスフェクションは、Arid5a pcDNA3-Flag過剰発現ベクターまたは空のpcDNA3-Flagベクターと組み合わせて行った。内部標準としてのウミシイタケルシフェラーゼレポータープラスミド(Promega)をトランスフェクションした。24時間後、細胞をpassive lysis bufferを用いて溶解した。ルシフェラーゼ活性は、Dual Luciferase Reporter Assay System(Promega)を用いて測定した。
結果を図29に示した。データは3つの独立した実験の代表であり、平均値±SDで表示している。「Empty」はコントロールルシフェラーゼ、「Ccl2」はCCL2の3'-UTR領域が付加されたルシフェラーゼ、「Ccl8」はCCL8の3'-UTR領域が付加されたルシフェラーゼをそれぞれ用いた場合の結果を表す。また、*はP<0.05、****はP<0.0001をそれぞれ表す。本実験により、Arid5aは、CCL2およびCCL8の3'-UTRに対しても安定化効果を示すことが明らかとなった。
8.大腸がんにおけるArid5a関与の検討
(8-1)Arid5a欠損MC38細胞の作製
マウス大腸がん細胞株であるMC38細胞はKerafast, Inc.(Boston, USA)から購入した。Arid5a欠損MC38細胞は、実施例2に記載されたArid5a欠損KPC細胞の作製において用いられたのと同様の手法を用いて作製された。
(8-1)Arid5a欠損MC38細胞の作製
マウス大腸がん細胞株であるMC38細胞はKerafast, Inc.(Boston, USA)から購入した。Arid5a欠損MC38細胞は、実施例2に記載されたArid5a欠損KPC細胞の作製において用いられたのと同様の手法を用いて作製された。
(8-2)マウス皮下に形成したArid5a欠損MC38細胞腫瘍の体積測定
5~7週齢の雌BALB/cヌードマウスおよび5~7週齢の雌C57BL/6を使用した。野生型MC38細胞(以下「MC38_WT」と記載する)、あるいはArid5a欠損MC38細胞(以下「MC38_Arid5a-/-」と記載する)各2×105個を、等用量のマトリゲルと混合してマウスの左右の脇腹に皮下注射した。6、10、14、18、21、24日目にカリパスを用いて腫瘍の最長寸法(L)と垂直寸法(W)を測定した.腫瘍体積は、式:L×W2×0.5で算出した。
5~7週齢の雌BALB/cヌードマウスおよび5~7週齢の雌C57BL/6を使用した。野生型MC38細胞(以下「MC38_WT」と記載する)、あるいはArid5a欠損MC38細胞(以下「MC38_Arid5a-/-」と記載する)各2×105個を、等用量のマトリゲルと混合してマウスの左右の脇腹に皮下注射した。6、10、14、18、21、24日目にカリパスを用いて腫瘍の最長寸法(L)と垂直寸法(W)を測定した.腫瘍体積は、式:L×W2×0.5で算出した。
C57BL/6マウスの結果を図30に示し、BALB/cヌードマウスの結果を図31に示した。データは3つの独立した実験の代表であり、平均値±SDで表示している。統計解析にはstudent t-teatを使用し、**はP<0.01を示す。
図30に示したように、C57BL/6マウスの皮下に腫瘍を形成させた場合、MC38_Arid5a-/-の腫瘍体積は、MC38_WTの腫瘍体積と比較して有意な減少を示した。一方、図31に示したように、BALB/cヌードマウスの皮下に腫瘍を形成させた場合、MC38_Arid5a-/-およびMC38_WTは同程度の増殖を示した。すなわち、正常な免疫を有するC57BL/6マウスではMC38_Arid5a-/-の腫瘍体積が減少したが、免疫不全マウス(BALB/cヌードマウス)ではMC38_Arid5a-/-の腫瘍体積は減少しなかった。この結果から、Arid5aがMC38細胞の免疫回避に関与していることが明らかになった。したがって、Arid5aは、膵がんに加えて、大腸がんの増殖抑制にも関与しており、Arid5aを阻害すれば、大腸がんも治療することができると考えられた。
図30に示したように、C57BL/6マウスの皮下に腫瘍を形成させた場合、MC38_Arid5a-/-の腫瘍体積は、MC38_WTの腫瘍体積と比較して有意な減少を示した。一方、図31に示したように、BALB/cヌードマウスの皮下に腫瘍を形成させた場合、MC38_Arid5a-/-およびMC38_WTは同程度の増殖を示した。すなわち、正常な免疫を有するC57BL/6マウスではMC38_Arid5a-/-の腫瘍体積が減少したが、免疫不全マウス(BALB/cヌードマウス)ではMC38_Arid5a-/-の腫瘍体積は減少しなかった。この結果から、Arid5aがMC38細胞の免疫回避に関与していることが明らかになった。したがって、Arid5aは、膵がんに加えて、大腸がんの増殖抑制にも関与しており、Arid5aを阻害すれば、大腸がんも治療することができると考えられた。
(8-3)癌ゲノムアトラス(TCGA)データセット分析
大腸がん患者におけるArid5a mRNAの高発現患者は低発現患者群に比べて生存確率が低く、大腸がん患者におけるArid5aの発現は生存確率と統計的に相関していることが見出された(図32)。
大腸がん患者におけるArid5a mRNAの高発現患者は低発現患者群に比べて生存確率が低く、大腸がん患者におけるArid5aの発現は生存確率と統計的に相関していることが見出された(図32)。
なお本発明は上述した各実施形態および実施例に限定されるものではなく、請求項に示した範囲で種々の変更が可能であり、異なる実施形態にそれぞれ開示された技術的手段を適宜組み合わせて得られる実施形態についても本発明の技術的範囲に含まれる。また、本明細書中に記載された学術文献および特許文献の全てが、本明細書中において参考として援用される。
Claims (12)
- Arid5A阻害剤を有効成分とする消化器がん治療剤。
- Arid5A阻害剤がArid5Aの発現または機能を減少させる物質を含む、請求項1に記載の治療剤。
- Arid5A阻害剤が、核酸オリゴまたはポリペプチドである、請求項1または2に記載の治療剤。
- 核酸オリゴが、siRNA、shRNA、アンチセンス核酸、デコイ核酸、核酸アプタマーおよびリボザイムからなる群から選択される、請求項3に記載の治療剤。
- ポリペプチドが、環状ポリペプチドである、請求項3に記載の膵がん治療剤。
- Arid5A阻害剤が、がん細胞の上皮間葉転換を抑制する、請求項1~5のいずれかに記載の治療剤。
- Arid5A阻害剤が、がん細胞の浸潤を抑制する、請求項1~6のいずれかに記載の治療剤。
- 消化器がんが、膵がんまたは大腸がんである、請求項1~7のいずれかに記載の治療剤。
- 消化器がんの治療に有用な候補物質のスクリーニング方法であって、
(1)被験物質のArid5Aの発現に対する影響を検出する工程、および
(2)被験物質を用いない場合と比較して、Arid5Aの発現を減少させる物質を選択する工程を含んでなる方法。 - 消化器がんの治療に有用な候補物質のスクリーニング方法であって、
(a)被験物質のArid5Aの機能に対する影響を検出する工程、および
(b)被験物質を用いない場合と比較して、Arid5Aの機能を減少させる物質を選択する工程を含んでなる方法。 - Arid5Aの機能が、IL-6mRNA、IDO1mRNA、CXCL3mRNA、CCL2mRNA、CCL5mRNA、CCL7mRNAおよびCCL8mRNAからなる群より選択されるいずれか一つのmRNAの安定化である、請求項10に記載のスクリーニング方法。
- 消化器がんが、膵がんまたは大腸がんである、請求項9~11のいずれかに記載のスクリーニング方法。
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