TW202346348A - 作為基因治療所遞送之bbb靶向的gaa在龐貝氏症小鼠模型中治療cns及肌肉 - Google Patents

Abstract

本發明揭示用於將治療性蛋白遞送至中樞神經系統(CNS)以治療損害CNS的疾病和病症，諸如治療溶酶體貯積症的組成物和方法。本發明提供經由治療有效量的核苷酸組成物所遞送的治療性蛋白，該核苷酸組成物編碼結合至穿過血腦屏障(BBB)的細胞表面受體結合蛋白(例如抗TfRCscfv:GAA)的治療性蛋白。

Description

作為基因治療所遞送之BBB靶向的GAA在龐貝氏症小鼠模型中治療CNS及肌肉

相關申請案的交叉引用

根據35 USC §119(e)，本件申請案請求於2022年1月10日提申之美國臨時申請案序號第63/298,018號的權益，該件申請案以全文引用的方式併入。 以 TEXT 檔案經由 EFS-WEB 呈交之序列表的出處

寫入檔案11146TW01.xml的序列表為41個千位元組，創建於2023年1月8日，在此以全文引用的方式併入。

本件申請案大體上是有關用於將治療性蛋白遞送至中樞神經系統(CNS)以治療損害CNS的疾病和病症的組成物以及方法，諸如治療溶酶體貯積症(LSD)。本件申請案是有關提供治療有效量的核苷酸組成物，該核苷酸組成物編碼結合至一或多個穿過血腦屏障(blood brain barrier，BBB)的遞送結構域的治療性蛋白。

已經開發出藥物遞送方法來克服血腦屏障(BBB)，但是許多方法(諸如奈米載體)都有缺點。載體在血液循環中展現出不穩定性和不樂見的生物分佈特徵(Gelperina et al., 2005, Am J Respir Crit Care Med. 172(12):1487-90；該份參考文獻以全文引用的方式併入本文)。取決於BBB處的運輸機制以及CNS疾病狀態是否已經改變了屏障的完整性，靶向效率也有所降低。正確挑選靶向部分或載體必須考慮到影響這些運輸機制的任何神經發炎性病況。

經由在肝臟或其他組織中的DNA表現來遞送治療性蛋白已提供了一種無需單次快速注射(bolus injection)蛋白質的便利方法，因而減少了對免疫原性的擔憂。結合至受體結合蛋白(尤其是細胞特異性受體)的治療性蛋白可以解決與將治療劑靶向至特定組織相關的一些問題。然而，仍然有需要提供有效為CNS提供治療劑的組成物和方法。

申請人已經發現到，當與受體結合蛋白締合時，治療性蛋白(尤其是替代酶(replacement enzyme))可以有效地被遞送到中樞神經系統(CNS)內，而前提是循環血液含量隨時間達到一致的程度。多結構域治療性蛋白可以經由帶有治療性蛋白和結合蛋白複合物之編碼序列的基因治療載體被遞送至肝臟。

在一個態樣中，本發明提供一種將治療性蛋白遞送至個體CNS的方法，包含向個體投與編碼結合至細胞表面受體(CSR)結合蛋白(CSR-BP)的治療性蛋白(tp)的核苷酸組成物(tpCSR-BP)，其是經由在CNS中足以提供治療有效量之tpCSR-BP的肝臟靶向遞送方法。

在一個具體例中，CSR-BP是特異性地結合至CSR的抗體或其抗原結合片段。在另一個具體例中，治療性蛋白是溶酶體酶。

在一個具體例中，該酶具有水解酶活性，諸如糖苷酶(glycosylase)，諸如糖苷酶(glycosidase)，諸如α-葡萄糖苷酶或α-半乳糖苷酶A。在一個具體例中，細胞表面受體(CSR)結合蛋白(CSR-BP)是一種結合至內化受體的抗原結合蛋白。在一個具體例中，內化受體是細胞表面分子，其被內吞並運輸至溶酶體。在一個特定具體例中，內化受體是CD63分子。在一個具體例中，內化受體是TfR分子。在一個特定具體例中，CSR-BP是抗體、抗體片段或單鏈可變片段(scFv)，諸如結合CD63或TfR的scFv。

本發明不限於所描述的特定具體例、組成物、方法以及實驗條件，因為這樣的具體例、組成物、方法和條件可能會有所變化。此處使用的術語僅用於說明特定具體例為目的，並不意欲具限制性，因為本發明的範疇將僅受到隨附申請專利範圍所囿限。

儘管與本文所述那些相似或相當的任何方法和材料都可用於實施或測試本發明，但現將描述一些較佳方法和材料。本文引用的所有出版物均以全文引用的方式併入本文來說明。除非另有定義，否則本文使用的所有技術和科學術語與本發明所屬技藝中具有通常技術者一般所理解的含義相同。

「血腦屏障」(BBB)是指將血液與腦部和中樞神經系統中的細胞外液分隔開的半透膜屏障。屏障阻止某些物質通過或選擇性地運輸某些物質到腦部和脊髓。血腦屏障由腦內皮細胞形成。

「治療有效量」是指載體被遞送給個體的量或劑量，使得個體達到編碼治療性蛋白的一致血液含量(血清/血漿含量)。通常，該方法中可使用濃度為約1x10 ⁹至約1x10 ¹⁶個基因體載體。遞送至肝臟的劑量可為每kg約1x10 ¹⁰至5x10 ¹³個AAV基因體。將調整劑量以平衡穿過血腦屏障的治療益處而對抗任何副作用獲得分子之期望效果，且此類劑量可根據所採用的重組載體而不同。可以藉由抽取血清或血漿來監測血液循環中的轉基因表現程度，以確定將達到循環蛋白穩態的載體劑量頻率。習於技藝者可以藉由例如進行實驗來確定有效量的具體值，以決定在載體遞送後連續數日、數週或數月內治療性蛋白的一致血液含量。測試循環治療性蛋白的合適實驗是本技藝中熟知的，包括但不限於西方墨點法、ELISA、LC-MS等。在一個具體例中，CNS中scFv-GAA融合蛋白的治療有效量是某個產生足量scFv-GAA融合蛋白以減少CNS組織(例如脊髓、小腦或海馬迴組織)中的貯積肝醣的病毒載體數量。亦參見國際公開案第WO 2019/157224號(其以全文引用的方式併入本文)。 CNS 病症

多種腦部病症可能會受益於本文所述的治療性蛋白的遞送模式。適用於蛋白質治療的CNS病症和具有神經學症狀的病症包括但不限於：阿茲海默症、腦癌、Behcet氏病(Behcet’s disease)、腦狼瘡(cerebral lupus)、庫賈氏病(Creutzfeldt-Jakob disease)、癡呆、癲癇、腦炎、Friedreich氏失調症(Friedreich’s ataxia)、格-巴二氏症候群(Guillain-Barre syndrome)、高歇氏病(Gaucher’s disease)、頭痛、腦積水、杭丁頓氏症(Huntington’s disease)、顱內高壓、白質失養症(leukodystrophy)、偏頭痛、重症肌無力、肌肉萎縮症、多發性硬化症、發作性睡病、神經病變、普-威二氏症候群(Prader-Willi syndrome)、帕金森氏症、雷特氏症候群(Rett syndrome)、不寧腿症候群(restless leg syndrome)、睡眠障礙、蛛網膜下出血、中風、創傷性腦損傷、三叉神經痛、短暫性腦缺血發作和Von Hippel-Lindau氏症候群(血管瘤病)。

因為廣泛表現、當作細胞外囊泡(EV；例如外泌體)的膜蛋白的角色以及與整合素締合，抗CD63融合體將治療性蛋白遞送至CNS可能特別有益。與內化效應子具有相似性質的其他細胞表面受體可能是具有組織或細胞類型特異性，以提高期望的攝取位置，如本說明書中所討論的。

抗轉鐵蛋白受體(TfR或TFR)融合體將治療性蛋白遞送至CNS可能特別有益。因此，治療性蛋白的運輸和遞送將透過使用遞送機制得到增強，遞送機制為諸如抗轉鐵蛋白受體融合至特定血腦屏障(BBB)目標。一些BBB目標已被證明對CNS攝取有益(Zuchero, et al., 6 January 2016, Neuron, 89(1): 70-82；Boado, RJ et al, Mol Pharm. 2014 Aug 4; 11(8): 2928–2934；該等參考文獻的各者以全文引用的方式併入本文)。其他與轉鐵蛋白受體具有類似BBB攝取性質的細胞表面受體包括但不限於：胰島素受體、CD98和Basigin (Bsg)。

在一些具體例中，透過使用抗轉鐵蛋白受體或抗胰島素受體，或抗CD98或抗Bsg，採用治療性蛋白靶向遞送至CNS組織(例如腦部)。治療性蛋白也可能融合至另一種內化效應子抗體。 溶酶體貯積症

「酶缺乏症」包括非溶酶體貯積症，諸如克拉培氏病(Krabbe disease) (半乳糖神經醯胺酶(galactosylceramidase))、苯丙酮尿症(phenylketonuria)、半乳糖血症(galactosemia)、楓糖漿尿病(maple syrup urine disease)、粒線體病(mitochondrial disorder)、Friedreich氏失調症、Zellwege氏症候群(Zellweger syndrome)、腎上腺白質失養症(adrenoleukodystrophy)、Wilson氏病(Wilson disease)、血色素沉著症(hemochromatosis)、鳥胺酸轉胺甲醯酶缺乏症(ornithine transcarbamylase deficiency)、甲基丙二酸血症(methylmalonic academia)、丙酸血症(propionic academia)和溶酶體貯積症。「溶酶體貯積症」包括由溶酶體功能缺陷引起的任何病症。目前，已經鑑定出大約50種溶酶體貯積症，其中最著名的包括泰-薩二氏症(Tay-Sachs)、高歇氏病和尼曼-匹克二氏病(Niemann-Pick disease)。這些疾病的發病機制歸因於溶酶體中的不完全降解產物積累，通常是因為喪失了蛋白質功能。溶酶體貯積症是由蛋白質的功能喪失或減弱變體引起的，這些蛋白質的正常功能是降解或協調溶酶體內容物的降解。與溶酶體貯積症相關的蛋白質包括酶、受體和其他跨膜蛋白(例如NPC1)、轉譯後修飾蛋白(例如硫酸酯酶)、膜轉運蛋白以及非酶輔因子以及其他可溶性蛋白(例如GM2神經節苷脂活化因子)。因此，溶酶體貯積症不僅含括由缺陷酶本身引起的那些病症，還包括由任何分子缺陷引起的任何病症。因此，如本文所用，術語「酶」意在含括那些與溶酶體貯積症相關的其他蛋白質。

在許多情況下，分子損傷的性質會影響到疾病的嚴重程度，即功能完全喪失往往與產前或新生兒發病有關，並涉及到嚴重的症狀；部分功能喪失與(相對)較輕和較晚發作的疾病有關。通常，只有一小部分活性需要恢復才能糾正缺陷細胞中的代謝缺失。表1列出了一些更常見的溶酶體貯積症及其相關的功能喪失蛋白。大體上Desnick and Schuchman, 2012中對溶酶體貯積症進行了說明。

溶酶體貯積症是一類在溶酶體中影響無數受質降解的罕見疾病。這些受質包括神經鞘脂質(sphingolipid)、黏多醣(mucopolysaccharide)、醣蛋白、肝醣以及寡醣，它們可以堆積在患有導致細胞死亡的疾病之患者的細胞中。受溶酶體貯積症影響的器官包括中樞神經系統(CNS)、周邊神經系統(PNS)、肺臟、肝臟、骨骼、骨骼肌和心肌，以及網狀內皮系統。

治療溶酶體貯積症的選項包括酶替代療法(enzyme replacement therapy , ERT)、受質減少療法、藥理學伴護蛋白媒介療法(pharmacological chaperone-mediated therapy)、造血幹細胞移植療法以及基因療法。受質減少療法的一個實例包括使用MIGLUSTAT或ELIGLUSTAT治療第1型高歇氏病。這些藥物藉由阻斷合成酶活性而發揮作用，減少之後的受質產生。例如，造血幹細胞療法(HSCT)用於改善和減緩患有某些形式黏多醣貯積症(MPS)之患者的中樞神經系統陰性表型。參見R.M. Boustany, “Lysosomal storage diseases--the horizon expands,” 9(10) Nat. Rev. Neurol. 583-98, Oct. 2013；該份參考文獻以全文引用的方式併入本文。表1列出了一些溶酶體貯積症及其相關的酶或其他蛋白質。 表 1 ：溶酶體貯積症

類別	疾病	涉及的酶 / 蛋白質
神經鞘脂質病(Sphingolipidoses)	法布里氏病(Fabry disease)	α-半乳糖苷酶A (α-Galactosidase A)
法伯脂肪肉芽腫症(Farber lipogranulomatosis)	神經醯胺酶(Ceramidase)
第I型高歇氏病(Gaucher’s disease type I)	β-葡萄糖苷酶(β-Glucosidase)
第II型與第III型高歇氏病(Gaucher’s disease types II and III)	神經鞘脂質活化蛋白-C活化因子(Saposin-C activator)
A型與B型尼曼-匹克二氏病(Niemann-Pick diseases types A and B)	神經磷脂酶(Sphingomyelinase)
GM1-神經節苷脂病	β-半乳糖苷酶 (β-Galactosidase)
GM2-神經節苷脂病(桑德霍夫氏病(Sandhoff))	β-己糖胺酶A與B (β-Hexosaminidase A and B)
GM2-神經節苷脂病(泰-薩二氏病)	β-己糖胺酶A (β-Hexosaminidase A)
GM2-神經節苷脂病(GM2-活化因子缺乏症)	GM2-活化因子蛋白
GM3-神經節苷脂病	GM3合成酶
異染性白質失養症(Metachromatic leukodystrophy)	芳基硫酸酯酶A
神經鞘脂質活化因子缺乏症(Sphingolipid-activator deficiency)	神經鞘脂質活化因子
黏多醣病(Mucopoly-saccharidoses)	MPS I (Scheie氏病、Hurler-Scheie二氏病以及Hurler氏病)	α-艾杜糖醛酸苷酶(α-Iduronidase)
MPS II (Hunter氏病)	艾杜糖醛酸苷酶-2-硫酸酯酶(Iduronidase-2-sulphatase)
MPS IIIA (Sanfilippo氏病A)	肝素 N-硫酸酯酶(Heparan N-sulphatase)
MPS IIIB (Sanfilippo氏病B)	N-乙醯基-α-胺基葡萄糖苷酶( N-acetyl-α-glucosaminidase)
MPS IIIC (Sanfilippo氏病C)	乙醯基-CoA；α-葡萄糖醯胺 N-乙醯基轉移酶(α-glucosamide N-acetyltransferase)
MPS IIID (Sanfilippo氏病D)	N-乙醯基葡萄糖胺-6-硫酸酯酶( N-acetylglucosamine-6- sulphatase)
MPS IVA (Morquio氏症候群A)	N-乙醯基半乳糖胺-6-硫酸硫酸酯酶( N-acetylgalactosamine-6- sulphate sulphatase)
MPS IVB (Morquio氏症候群B)	β-半乳糖苷酶(β-Galactosidase)
MPS VI (Maroteaux-Lamy二氏病)	N-乙醯基半乳糖胺-4-硫酸酯酶( N-acetylgalactosamine-4- sulphatase) (芳基硫酸酯酶B)
MPS VII (Sly氏病)	β-葡萄糖醛酸苷酶 (β-Glucuronidase)
MPS IX	透明質酸酶(Hyaluronidase)
肝醣貯積症(Glycogen storage disease)	龐貝氏症(第II型肝醣貯積症)	α-葡萄糖苷酶2 (α-Glucosidase 2)
脂質代謝	溶酶體酸性脂肪酶缺乏症(LAL-D；Wolman氏病)	溶酶體酸性脂肪酶(Lysosomal acid lipase)

兩種最常見的LSD是龐貝氏症和法布里氏病。龐貝氏症的發病率據估計為10000分之1，它是由溶酶體酶α-葡萄糖苷酶(GAA)缺陷引起的，會導致溶酶體肝醣加工不足。溶酶體肝糖的積累主要發生在骨骼、心臟和肝組織中。嬰兒發病型龐貝氏症會導致心臟肥大、低張症、肝腫大和因心肺功能衰竭而死亡，通常發生在兩歲之前。成人發病型龐貝氏症最晚出現在20歲至60歲之間，通常僅會侵犯骨骼肌。目前可用的治療方法包括Genzyme的MYOZYME®/LUMIZYME® (阿糖苷酶alfa)，其為一種在CHO細胞中產生並藉由靜脈內輸注投藥的重組人類α-葡萄糖苷酶。

法布里氏病，包括輕度/遲發病例，整體估算發病率為3,000分之1；它是由缺陷型溶酶體酶α-半乳糖苷酶A(GLA)引起，其導致血管和其他組織與器官內的球形三醯神經醯胺(globotriaosylceramide)積聚。與法布里氏病相關的症狀包括神經損傷及/或小血管阻塞引起的疼痛、腎功能不全和最終衰竭、心臟併發症(諸如高血壓和心肌病)、皮膚學症狀(諸如形成血管角化瘤、無汗症或多汗症)，以及眼部問題(諸如輪狀角膜、輻條狀白內障以及結膜和視網膜血管異常)。目前可用的治療方法包括Genzyme的FABRAZYME® (無半乳糖苷酶β)，其為一種在CHO細胞中產生並藉由靜脈內輸注投藥的重組人類α-半乳糖苷酶A；Shire的REPLAGAL™ (無半乳糖苷酶α)，其為一種在人類纖維母細胞中產生並藉由靜脈內輸注投藥的重組人類α-半乳糖苷酶A；以及Amicus的GALAFOLD™ (米加司他(migalastat)或1-去氧半乳糖野尻黴素)，一種口服小分子伴護蛋白，可將異常α-半乳糖苷酶A的折疊轉變為功能性構型。

有關溶酶體貯積症的現有治療不甚理想。例如，ERT通常必須以高頻率和高劑量投與，諸如每兩週和高達40 mg/kg。此外，一些被替換的酶可能具有免疫交叉反應性(CRIM)，在個體體內刺激IgG產生，從而阻礙酶經由甘露糖-6-磷酸(M6P)受體遞送至溶酶體。IgG可能會屏蔽替代酶的M6P殘基，而抗原-IgG-抗體複合物可以經由Fc受體進入細胞溶酶體，從而使替代酶優先轉往巨噬細胞。

將替代酶遞送到適當的罹病組織也是效率不彰的(參見表2和Desnick & Schuchman, “Enzyme replacement therapy for lysosomal diseases: lessons from 20 years of experience and remaining challenges,” 13 Annu. Rev. Genomics Hum. Genet. 307-35, 2012，其全部內容以引用的方式併入本文)。例如，因為嬰兒龐貝氏症而接受長期酶替代治療的患者仍可能受到鼻音過重、殘餘肌肉無力、上瞼下垂、骨量減少、聽力喪失、誤吸風險、吞嚥困難、心律不整和難以吞嚥所苦。替代酶的劑量通常必須隨時間增加至每週或每兩週40 mg/kg。 表 2 ： ERT 的效率不彰組織靶向

疾病	亞型	容易到達組織	難以到達組織
高歇氏病	第1型	脾臟、肝臟、骨髓	骨骼
第2型與第3型	脾臟、肝臟、骨髓	骨骼、腦部
法布里氏病	典型與晚發型	血管內皮	腎臟、心臟
黏多醣病(Mucopolysaccharidoses)	全部	脾臟、肝臟、骨髓	骨骼、腦部、軟骨
α-甘露糖貯積症	---	脾臟、肝臟、骨髓	骨骼、腦部
尼曼-匹克二氏病	B型	脾臟、肝臟、骨髓	肺泡巨噬細胞
龐貝氏症	嬰兒	---	心臟、平滑肌與骨骼肌
遲發	---	平滑肌與呼吸骨骼肌

內源性甘露糖-6磷酸受體(mannose-6 phosphate receptor，MPR)媒介大多數重組酶轉運到溶酶體。存在兩種互補形式的MPR：陽離子非依賴性(CI-MPR)和陽離子依賴性(CD-MPR)。任何一種形式的剔除都具有分類錯誤的溶酶體酶。溶酶體水解酶在內質網中合成並移動到高基氏體網絡順面，在那裡它們藉由添加甘露糖-6-磷酸(M6P)基團進行共價修飾。這個標記的形成取決於兩種溶酶體酶的依序作用：UDP- N-乙醯基葡萄糖胺-1-磷酸轉移酶(G1cNac-磷酸轉移酶)和 N-乙醯基葡萄糖胺-1-磷酸二酯-α- N-乙醯基-胺基葡萄糖苷酶(揭蓋酶)。GlcNac-磷酸轉移酶催化G1cNAc-1-磷酸殘基從UDP-G1cNAc轉移到水解酶的高甘露糖型寡醣中選定甘露糖的C6位置。然後，揭蓋酶移除末端G1cNAc，露出M6P辨識信號。在高基氏體網絡反面處，M6P信號允許溶酶體水解酶透過選擇性結合至M6P受體與所有其他類型的蛋白質分離。產生格形蛋白包覆的囊泡從高基氏體網絡反面出芽並與晚期胞內體融合。在晚期胞內體的低pH下，水解酶自M6P受體解離，而空受體被回收到高基氏體以進行下一輪的運輸。

除了經由甘露糖受體遞送的β-葡萄糖腦苷脂酶(glucocerebrosidase)外，重組溶酶體酶包含M6P醣基化並主要經由CI-MPR/IGF2R被遞送至溶酶體。然而，醣基化/CI-MPR媒介的酶替代遞送並未到達所有臨床相關組織(表2)。酶替代療法的改進著重在藉由以下來增進CI-MPR遞送：(i)使用β2促效劑克崙特羅(clenbuterol)增加CI-MPR的表面表現(Koeberl et al., “Enhanced efficacy of enzyme replacement therapy in Pompe disease through mannose-6-phosphate receptor expression in skeletal muscle,” 103(2) Mol. Genet. Metab. 107-12, 2011)；(ii)增加酶上的M6P殘基數量(Zhu et al., “Conjugation of mannose-6-phosphate-containing oligosaccharides to acid alpha-glucosidase improves the clearance of glycogen in Pompe mice,” 279(48) J. Biol. Chem. 50336-41, 2004)；或(iii)將IGF-II結構域融合至酶(Maga et al., “Glycosylation-independent lysosomal targeting of acid alpha-glucosidase enhances muscle glycogen clearance in Pompe mice,” 288(3) J. Biol. Chem. 1428-38, 2013) (所有前述參考文獻以全文引用的方式併入本文)。

藉由酶替代療法或基因療法，大量溶酶體貯積症並未得到充分治療，主要是由於替代酶對相關組織或器官的靶向性差，受體宿主的免疫學反應陰性，且血清半衰期低。需要改進的酶替代療法，以增強和促進更佳的組織生物分佈和酶的溶酶體攝取，尤其是在腦部和脊髓中，而無需進行不樂見的鞘內注射。申請人已經開發出一種改進的酶替代療法，其使用CI-MPR獨立性結合蛋白引導的酶遞送和肝臟表現，以將酶提供至受目標影響的組織，特別是CNS組織的溶酶體。

溶酶體貯積症可根據在有缺陷的溶酶體內積累的產物類型進行分類。神經鞘脂質病(sphingolipidoses)是一類影響神經鞘脂質代謝的疾病，其為含有連接至脂族胺基醇之脂肪酸的脂質(綜述於S. Hakomori, “Glycosphingolipids in Cellular Interaction, Differentiation, and Oncogenesis,” 50 Annual Review of Biochemistry 733-764, July 1981中；以全文引用的方式併入本文)。神經鞘脂質病的累積產物包括神經節苷脂(例如泰-薩二氏病)、醣脂(例如法布里氏病)以及葡萄糖腦苷脂(例如高歇氏病)。

黏多醣病(mucopolysaccharidoses)是一類影響醣胺聚醣(GAGS或黏多醣)代謝的疾病，其為具有重複性雙醣的無分支長鏈，輔助構建骨骼、軟骨、肌腱、角膜、皮膚和結締組織(綜述於J. Muenzer, “Early initiation of enzyme replacement therapy for the mucopolysaccharidoses,” 111(2) Mol. Genet. Metab. 63-72 (Feb. 2014)；Sasisekharan et al., “Glycomics approach to structure-function relationships of glycosaminoglycans,” 8(1) Ann. Rev. Biomed. Eng. 181-231 (Dec. 2014)；該等參考文獻的各者以全文引用的方式併入本文)。黏多醣病的累積產物包括硫酸乙醯肝素、硫酸皮膚素、硫酸角蛋白、各種形式的硫酸軟骨素，以及透明質酸。例如，Morquio氏病A是因為缺乏溶酶體酶半乳糖-6-硫酸硫酸酯酶，導致硫酸角蛋白和軟骨素6-硫酸積累在溶酶體中。

肝醣貯積症(glycogen storage diseases) (又名肝醣病)是因細胞無法代謝(製造或分解)肝醣所致。肝醣代謝受到各種酶或其他蛋白質調節，包括葡萄糖-6-磷酸酶、酸性α-葡萄糖苷酶、肝醣去分支酶、肝醣分支酶、肌肉肝醣磷酸化酶、肝臟肝醣磷酸化酶、肌肉磷酸果糖激酶、磷酸化酶激酶、葡萄糖轉運蛋白、醛縮酶A、β-烯醇化酶和肝醣合成酶。例示性溶酶體貯積症/肝醣貯積症是龐貝氏症，其中有缺陷的酸性α-葡萄糖苷酶導致肝醣積累在溶酶體中。症狀包括肝腫大、肌肉無力、心臟衰竭，且如果是嬰兒變異型，則會在2歲前死亡(參見DiMauro and Spiegel, “Progress and problems in muscle glycogenosis,” 30(2) Acta Myol. 96-102 (Oct. 2011)；以全文引用的方式併入本文)。

「多結構域治療性蛋白」包括(i)含有超過一個功能結構域的單一蛋白質、(ii)含有超過一條多肽鏈的蛋白質，以及(iii)超過一種蛋白質或超過一條多肽的混合物。術語多肽通常被認為是表示經由肽鍵連接在一起的單鏈胺基酸。術語蛋白質含括術語多肽，但也包括更為複雜的結構。也就是說，單條多肽是蛋白質，而蛋白質可含有以更高級結構締合的一或多條多肽。例如，血紅素是一種含有四條多肽的蛋白質：兩條α球蛋白多肽和兩條β球蛋白多肽。肌紅蛋白也是一種蛋白質，但它只含有單一條肌紅蛋白多肽。

多結構域治療性蛋白包含一或多條多肽以及至少兩個提供兩種功能的結構域。那些結構域的其中一者是「酶結構域」，它提供與酶缺乏症相關的缺陷型蛋白質活性的替代。那些結構域中的另一者是「遞送結構域」，它提供與內化效應子的結合。因此，提供酶替代活性並且能夠結合至內化效應子(也稱為內化效應子結合蛋白(遞送結構域活性))的單一條多肽是多結構域治療性蛋白。其中一種蛋白質提供酶功能而另一種蛋白質提供內化效應子結合活性的蛋白質混合物也是多結構域治療性蛋白。圖1A描繪了多結構域治療性蛋白的各種實例。在一個實例中(圖1A，小圖A)，多結構域治療性蛋白含有一種酶(由六邊形表示)和一種結合該酶(虛線)和內化效應子(實線)的雙特異性抗體(IE-BP)。在此，雙特異性抗體的一臂非共價結合至酶，另一臂非共價結合至內化效應子，從而使替代酶能夠內化到細胞或亞細胞隔室中。在另一個實例中(小圖B)，多結構域治療性蛋白包含含有兩條多肽的單一蛋白質，一條多肽具有酶功能，而另一條具有遞送結構域功能。在此，該酶融合至免疫球蛋白Fc結構域或重鏈恆定區，而重鏈恆定區與酶半抗體的Fc結構域結合形成雙功能多結構域治療性蛋白。小圖B中描述的具體例類似於小圖A中的具體例，但酶共價附接到半抗體之一者，而不是透過抗原-抗體交互作用附接在半抗體的免疫球蛋白可變結構域處。

在其他實例中，多結構域治療性蛋白由共價連接(直接或透過連接子間接連接)至遞送結構域的酶組成。在一個具體例中，酶附接至免疫球蛋白分子(例如重鏈或輕鏈)的C端。在另一個具體例中，酶附接至免疫球蛋白分子(例如重鏈或輕鏈)的N端。在這些實例中，免疫球蛋白分子是遞送結構域。在又另一個具體例中，酶附接至結合內化效應子的scFv分子的C端。

在一個具體例中，多結構域治療性蛋白包含至少兩個且在一些具體例中不超過兩個遞送結構域，其各自針對同一抗原或兩個不同抗原上的不同表位。在一個具體例中，第一遞送結構域結合至溶酶體運輸分子、其他內化效應子或其他類似的細胞表面受體。在另一個具體例中，第二遞送結構域結合至胞吞轉送效應子以促進多結構域治療性蛋白的跨細胞轉運。在一個具體例中，胞吞轉送效應子尤其是LDL受體、IgA受體、轉鐵蛋白受體或新生兒Fc受體(FcRn)。在一個特定具體例中，胞吞轉送遞送結構域包含結合至轉鐵蛋白受體的分子，諸如抗轉鐵蛋白受體抗體或抗轉鐵蛋白受體scFv分子。有關可用於實施本發明之媒介胞吞轉送作用的細胞表面受體，Tuma and Hubbard, “Transcytosis: Crossing Cellular Barriers,” Physiological Reviews, 83(3): 871-935 (1 July 2003)以引用的方式被併入本文。在一個具體例中，第二遞送結構域結合至轉鐵蛋白受體或其他類似的細胞表面蛋白，諸如胰島素受體、CD98或Basigin (Bsg)。包含至少兩個遞送結構域的各個多結構域治療性蛋白還包含至少一個酶結構域，例如，至少兩個遞送結構域中的各者可能或可能不以本文所述方式(例如經由抗原-抗體交互作用、經由直接共價連接、經由間接共價連接等)獨立地與酶結構域締合，其中至少兩個遞送結構域中的至少一個與酶結構域締合。此外，至少兩個遞送結構域中的各者可獨立地包含抗體、半體或scFv(例如，與Fc融合的scFv)。

「酶結構域」或「酶」表示與酶缺乏症的病因或生理學效用相關的任何蛋白質。酶包括實際的酶、轉運蛋白、受體或其他有缺陷的蛋白質，它們被認為是導致疾病的分子損傷。酶還包括可以提供替代或避免疾病的分子損傷的類似或充分生化或生理活性的任何蛋白質。例如，「同功酶」可用作為酶。溶酶體貯積症相關蛋白的實例包括表1中列為「涉及的酶/蛋白質」的那些，以及任何已知或後來發現的蛋白質或其他分子，它們可以避免酶缺乏症的分子缺陷。

在一些具體例中，酶是水解酶，包括酯酶、糖苷酶、作用於醚鍵的水解酶、肽酶、線性醯胺酶、二磷酸酶、酮水解酶、鹵化酶、磷酸醯胺酶、磺基水解酶、亞磺化酶、脫硫酶以及類似者。在一些具體例中，酶是糖苷酶，包括糖苷酶和 N-糖苷酶。在一些具體例中，酶是糖苷酶，包括α-澱粉酶、β-澱粉酶、葡聚糖1,4-α-葡萄糖苷酶、纖維素、內切-1,3(4)-β-葡聚糖酶、菊糖酶、內切-1,4-β-木聚糖酶、內切-1,4-b-木聚糖酶、葡聚糖酶、幾丁質酶、多聚半乳醣醛酸苷酶、溶菌酶、外切-α-唾液酸酶、α-葡萄糖苷酶、β-葡萄糖苷酶、α-半乳糖苷酶、β-半乳糖苷酶、α-甘露糖苷酶、β-甘露糖苷酶、β-呋喃果糖苷酶、α,α-海藻糖、β-葡萄糖醛酸苷酶、木聚糖內切-1,3-β-木糖苷酶、澱粉-α-1,6-葡萄糖苷酶、透明質酸胺基葡萄糖苷酶、透明質酸葡萄糖醛酸苷酶以及類似者。

在龐貝氏症的情況下，分子缺陷是α-葡萄糖苷酶活性缺失，酶包括人類α-葡萄糖苷酶和「同功酶」，諸如其他α-葡萄糖苷酶、經工程改造的重組α-葡萄糖苷酶、其他葡萄糖苷酶、重組葡萄糖苷酶、任何經過工程改造以水解末端非還原1-4連接的α-葡萄糖殘基而釋放單個α-葡萄糖分子的蛋白質、任何EC 3.2.1.20酶、用於肝醣或澱粉的天然或重組低pH碳水化合物水解酶，以及葡萄糖基水解酶，諸如蔗糖酶異麥芽糖酶、麥芽糖酶、葡萄糖澱粉酶、葡萄糖苷酶II和中性α-葡萄糖苷酶。

「內化效應子」包括一種蛋白質，在一些情況下是一種受體蛋白，它能夠被內化到細胞中或以其他方式參與或促進逆行膜運輸。內化效應子(internalization effector)、內化效應子(internalizing effector)、內化受體(internalization receptor)和內化受體(internalizing receptor)在本文中可互換使用。在一些情況下，內化效應子是一種經歷胞吞轉送的蛋白質；也就是說，蛋白質在細胞的一側被內化並轉運到細胞的另一側(例如，頂端到基底)。在一些具體例中，內化效應子蛋白是細胞表面表現的蛋白質或可溶性細胞外蛋白質。本發明還考慮到內化效應子蛋白在細胞內隔室中表現的具體例，細胞內隔室為諸如胞內體、內質網、高基氏體、溶酶體等。例如，參與逆行膜運輸的蛋白質(例如，來自早期/再循環胞內體到高基氏體網絡反面的路徑)可能在本發明的不同具體例中充當內化效應子蛋白。無論如何，遞送結構域與內化效應子蛋白的結合會導致整個多結構域治療性蛋白和與其締合的任何分子(例如一或多種酶)也被內化到細胞中。如下所述，內化效應子蛋白包括直接被內化到細胞中的蛋白質，還有間接被內化到細胞中的蛋白質。

直接被內化到細胞中的內化效應子蛋白包括具有至少一個細胞外結構域的膜締合分子(例如，跨膜蛋白、GPI錨定蛋白等)，它們經歷細胞內化，並且較佳經由細胞內降解及/或回收路徑而進行加工。直接被內化到細胞中的內化效應子蛋白的特定非限制性實例包括：轉鐵蛋白受體(TfR)、CD63、MHC-1(例如HLA-B27)、Kremen-1、Kremen-2、LRP5、LRP6、LRP8、LDL-受體、LDL相關蛋白1受體、ASGR1、ASGR2、澱粉樣前體蛋白樣蛋白2(APLP2)、愛帕琳肽(apelin)受體(APLNR)、MAL(髓磷脂和淋巴細胞蛋白，又名VIP17)、IGF2R、液泡型H+ ATP酶、白喉毒素受體、葉酸受體、麩胺酸受體、麩胺硫受體、瘦素受體、清道夫受體(例如SCARA1-5、SCARB1-3、CD36)以及類似者。

在一個具體例中，內化效應子在幾種組織類型中表現，並且可用於希望同時靶向CNS和周邊細胞類型的治療中。可用於運輸至CNS和周邊細胞類型的內化效應子包括但不限於TfR、CD63、MHC-I、液泡型H+ ATP酶、IGF2R、整合素α-7(ITGA7)、LRP5、LRP6、LRP8、Kremen-2、LDL受體、LDL相關蛋白1受體、澱粉樣前體蛋白樣蛋白-2(APLP2)、愛帕琳肽受體(APLNR)、PRLR、MAL(髓鞘脂和淋巴細胞蛋白(MAL))、白喉毒素受體、HBEGF(肝素結合EGF樣生長因子)、麩胺硫受體、麩胺酸受體、瘦素受體以及葉酸受體。在某些具體例中，內化效應子是泌乳素受體(PRLR)。據發現，PRLR不僅是某些治療應用的目標，而且基於其高內化率和高周轉率，也是一種有效的內化效應子蛋白。

當希望靶向CNS和周邊細胞類型時，靶向由幾種細胞類型表現的內化效應子可能是有用的，例如，在治療諸如法布里氏病、高歇氏病、MPS I、MPS II、MPS IIIA、MPS IIIB、MPS IIID、MPS IVB、MPS VI、MPS VII、MPS IX、龐貝氏症、溶酶體酸性脂肪酶缺乏症、異染性白質失養症、尼曼-匹克二氏病A、B和C2型、α甘露糖貯積症(alpha mannosidosis)、神經胺糖酸苷酶缺乏症(neuraminidase deficiency)、唾液酸貯積症(sialidosis)、天冬胺醯基糖胺尿症(aspartylglycosaminuria)、合併型神經鞘脂質活化蛋白缺乏症(combined saposin deficiency)、非典型高歇氏病、法伯脂肪肉芽腫症、岩藻糖苷貯積症(fucosidosis)和β甘露糖貯積症(beta mannosidosis)的疾病時。

在另一個具體例中，內化效應子在幾種組織類型中表現。在一個實例中，內化效應子可能偏好靶向骨骼和軟骨。可用於運輸至CNS以及骨骼和軟骨之一或兩者的效應子包括但不限於膠原蛋白X、整合素α10(ITGA10)、纖維母細胞生長因子受體3(FGFR3)、纖維母細胞生長因子受體同功型C(FGFR3C)、透明質酸和蛋白聚醣連接蛋白1(CRTL1)、聚集蛋白聚醣(aggrecan)、膠原蛋白II和Kremen-1。此類效應子可用於希望同時靶向CNS和骨骼及軟骨的治療時。

靶向偏好由骨和軟骨表現的內化效應子在希望靶向CNS以及骨骼和軟骨的情況下可能是有用的，例如，在治療諸如MPS I、MPS II、MPS IIIA、MPS IIIB、MPS IIID、MPS IVA、MPS IVB、MPS VI、MPS VII、MPS IX、β甘露糖貯積症、高歇氏病、非典型高歇氏病、合併型神經鞘脂質活化蛋白缺乏症、天冬胺醯基糖胺尿症、法伯脂肪肉芽腫症、唾液酸貯積症、神經胺糖酸苷酶缺乏症、黏多醣貯積症和α甘露糖貯積症的疾病時。

在又另一個具體例中，內化效應子偏好在特定組織或細胞類型中表現，諸如巨噬細胞、單核細胞和小神經膠質細胞。可用於運輸至CNS和巨噬細胞的效應子包括但不限於清道夫受體A1-5(SCARA1-5)、SCARB1-3、CD36、MSR1(巨噬細胞清道夫受體1)、MRC1(巨噬細胞甘露糖受體1)、VSIG4(V組和含有免疫球蛋白結構域的蛋白4)、CD68(巨噬唾液酸蛋白(macrosialin))和CSF1R(巨噬細胞群落刺激因子1受體)。此類效應子可用於希望同時靶向CNS和巨噬細胞的治療中。CNS巨噬細胞可稱為小神經膠質細胞。

靶向偏好由巨噬細胞(單核細胞或小神經膠質細胞)表現的內化效應子在需要同時靶向CNS和巨噬細胞(或小神經膠質細胞)的情況下可能有用，例如在治療諸如溶酶體酸性脂肪酶缺乏症、高歇氏病、非典型高歇氏病、合併型神經鞘脂質活化蛋白缺乏症和法伯脂肪肉芽腫症的疾病時。

在某些具體例中，內化效應子是腎臟特異性內化效應子，例如CDH16(Cadheri-16)、CLDN16(Claudn-16)、KL(Klotho)、PTH1R(副甲狀腺素受體)、SLC22A13(溶質載體家族22成員13)、SLC5A2(鈉/葡萄糖同向轉運蛋白2)和UMOD(尿調節蛋白)。

在希望靶向CNS和腎臟的情況下，靶向偏好在腎臟中表現的內化效應子可能有用，例如在治療諸如法布里氏病、Alport症候群、多囊性腎病和栓塞性血小板減少性紫癜的疾病時。

在又另一個具體例中，內化效應子偏好在特定組織或細胞類型(諸如肝臟)中表現。可用於運輸至CNS和肝臟的效應子包括但不限於ASGR1和ASGR2。此類效應子可用於希望同時靶向CNS和肝臟的治療時。

當希望同時靶向CNS和肝臟時，靶向偏好在肝臟中表現的內化效應子可能有用，例如在治療諸如溶酶體酸性脂肪酶缺乏症、高歇氏病、MPS VI、MPS VII、MPS II、尼曼-匹克二氏病A、B和C2型、唾液酸貯積症、神經胺糖酸苷酶缺乏症、非典型高歇氏病、合併型神經鞘脂質活化蛋白缺乏症和法伯脂肪肉芽腫症的疾病時。

在一些具體例中，內化效應子是肌肉特異性內化子，諸如BMPR1A(骨成形性蛋白受體1A)、m-鈣黏蛋白、CD9、MuSK(肌肉特異性激酶)、LGR4/GPR48(G蛋白偶聯受體48)、膽鹼能受體(菸鹼)α1、CDH15(Cadheri-15)、ITGA7(整合素α-7)、CACNG1(L型鈣通道次單位γ-1)、CACNA15(L型鈣通道次單位α-15)、CACNG6(L型鈣通道次單位γ-6)、SCN1B(鈉通道次單位β-1)、CHRNA1(ACh受體次單位α)、CHRND(ACh受體次單位δ)、LRRC14B(含有富含白胺酸重複序列的蛋白14B)、營養不良聚醣(dystroglycan) (DAG1)和POPDC3(含Popeye結構域蛋白3)。

當希望靶向CNS和肌肉組織時，靶向偏好由肌肉表現的內化效應子可能有用，例如在治療諸如龐貝氏症的疾病時。

在一些具體例中，內化效應子是ITGA7、ITGA10、CD9、CD63、ALPL2、MSR1、ASGR1、ASGR2或PRLR。針對ITGA7、ITGA10、CD9、CD63、APLP2、MSR1、ASGR1、ASGR2或PRLR的抗體是本技藝中熟知的。習於技藝者可以容易地將這些熟知的抗體或其抗原結合部分(例如自其衍生而來的scFv)連接至本文所述的治療性蛋白，以製造和使用如本文所述的多結構域治療性蛋白。

在那些內化效應子(IE)被直接內化到細胞中的具體例中，遞送結構域可以是例如特異性地結合IE的抗體或抗體的抗原結合片段，或與IE特異性地交互作用的配體或配體的一部分。例如，如果IE是Kremen-1或Kremen-2，則遞送結構域可包含Kremen配體(例如DKK1)或其Kremen結合部分，或由其組成。作為另一個實例，如果IE是受體分子(諸如ASGR1)，則遞送結構域可包含對受體具有特異性的配體(例如去唾液酸血清類黏蛋白(asialoorosomucoid，ASOR)或β-Ga1NAc)或其受體結合部分，或由其組成。

間接被內化到細胞中的內化效應子蛋白包括本身不內化而是在結合至被內化至細胞中的第二種蛋白質或多肽後，或以其他方式與該第二種蛋白質或多肽締合後才被內化到細胞中。間接被內化至細胞中的蛋白質包括例如能夠結合至內化細胞表面表現的受體分子的可溶性配體。經由其與內化細胞表面表現的受體分子的交互作用而(間接)被內化到細胞中的可溶性配體的非限制性實例是轉鐵蛋白。在具體例中，其中IE是轉鐵蛋白(或另一種間接內化的蛋白質)，遞送結構域與IE的結合，以及IE與轉鐵蛋白受體(或另一種內化細胞表面表現的受體分子)的交互作用導致整個遞送結構域和與其締合的任何分子(例如酶)，與IE及其結合配偶體的內化同時被內化到細胞中。

在IE間接被內化到細胞中的那些具體例中，遞送結構域可以是例如特異性地結合IE的抗體、抗體的抗原結合片段或scFv，或與可溶性效應子蛋白交互作用的受體或受體的一部分。例如，如果IE是細胞因子，則遞送結構域可包含對應的細胞因子受體或其配體結合部分，或由對應的細胞因子受體或其配體結合部分所組成。

如本文所用，「免疫學反應」通常是指患者對外部或「非自身」蛋白質的免疫學反應。這種免疫學反應包括過敏反應和干擾替代酶有效性的抗體生成。一些患者可能不會產生任何無功能的蛋白質，從而使替代酶成為「外來」蛋白質。例如，向那些缺乏GLA的法布里氏病患者重複注射重組GLA(rGLA)經常會導致過敏反應。在其他患者中，已證明抗rGLA抗體的生成會降低替代酶治療疾病的有效性。參見例如Tajima et al. (“Use of a Modified α- N-Acetylgalactosaminidase (NAGA) in the Development of Enzyme Replacement Therapy for Fabry Disease,” 85(5) Am. J. Hum. Genet. 569-580 (2009))，其以全文引用的方式併入本文，其討論了使用經修飾的NAGA作為「同功酶」來替代GLA。經修飾的NAGA與GLA沒有免疫學交叉反應，並且「對來自經重組GLA反複治療的法布里氏病患者的血清沒有反應。」同上註，摘要。

「免疫抑制劑」包括導致一般免疫抑制，並且可用於分別在患有龐貝氏症或法布里氏病的患者中防止針對替代酶(例如GAA或GLA)的交叉反應性免疫材料(CRIM)的藥物及/或蛋白質。免疫抑制劑的非限制性實例包括甲胺蝶呤、黴酚酸酯、環磷醯胺、雷帕黴素DNA烷化劑、抗CD20抗體、抗BAFF抗體、抗CD3抗體、抗CD4抗體，及其任何組合。

對組織(例如肝臟)具特異性的調節元件(例如啟動子)會增強核酸序列(例如基因)的表現，該核酸序列在該調節元件對其具特異性的組織中受到這種調節元件控制。肝臟特異性調節元件的非限制性實例(例如肝臟特異性啟動子)可見於Chuah et al. (2014) Mol. Ther. 22:1605-13，該份參考文獻以全文引用的方式併入本文。

術語「蛋白質」表示具有超過約20個經由醯胺鍵共價連接的胺基酸的任何胺基酸聚合物。蛋白質含有一或多個胺基酸聚合物鏈，在本技藝中通常稱為「多肽」。因此，多肽可能是蛋白質，而蛋白質可能含有多個多肽以形成單一功能性生物分子。一些蛋白質中可能存在雙硫鍵(即半胱胺酸殘基之間形成胱胺酸)。這些共價連接可以在單條多肽鏈內，或在兩條單獨的多肽鏈之間。例如，雙硫鍵對於胰島素、免疫球蛋白、魚精蛋白以及類似物的正確結構和功能必不可少。

如本文所用，「蛋白質」包括生物治療性蛋白、用於研究或治療的重組蛋白、捕獲蛋白和其他Fc融合蛋白、嵌合蛋白、抗體、單株抗體、人類抗體、雙特異性抗體、抗體片段、奈米抗體、重組抗體嵌合體、scFv融合蛋白、細胞因子、趨化因子、肽激素以及類似物。可以使用基於重組細胞的生產系統生產蛋白質，生產系統為諸如昆蟲桿狀病毒系統、酵母系統(例如畢赤酵母屬)、哺乳動物系統(例如CHO細胞和CHO衍生物，像是CHO-K1細胞)。有關最近討論生物治療性蛋白及其生產的綜論，參見Ghaderi et al., “Production platforms for biotherapeutic glycoproteins. Occurrence, impact, and challenges of non-human sialylation,” 28 Biotechnol Genet Eng Rev. 147-75 (2012)，該份參考文獻以全文引用的方式併入本文。

如本文所用，術語「抗體」包括免疫球蛋白分子，其包含藉由雙硫鍵相互連接的四條多肽鏈(兩條重(H)鏈和兩條輕(L)鏈)。每條重鏈包含重鏈可變區(本文縮寫為HCVR或VH)和重鏈恆定區。重鏈恆定區包含三個結構域，CH1、CH2和CH3。每條輕鏈包含輕鏈可變區(本文縮寫為LCVR或VL)和輕鏈恆定區。輕鏈恆定區包含一個結構域CL。VH區和VL區可以進一步細分為高變區，稱為互補決定區(CDR)，散佈著更保守的區域，稱為框架區(FR)。每個VH和VL由三個CDR和四個FR組成，從胺基端到羧基端按以下順序排列：FR1、CDR1、FR2、CDR2、FR3、CDR3、FR4(重鏈CDR可縮寫為HCDR1、HCDR2和HCDR3；輕鏈CDR可縮寫為LCDR1、LCDR2和LCDR3)。術語「高親和力」抗體是指對其目標具有至少10 ^-9M、至少10 ^-10M；至少10 ^-11M；或至少10 ^-12M的結合親和力的那些抗體，如藉由表面電漿共振(例如BIACORE ^TM)或溶液親和ELISA所測量。術語「抗體」可能含括任何類型的抗體，諸如單株抗體或多株抗體。此外，抗體可能是或任何來源，諸如哺乳動物或非哺乳動物。在一個具體例中，抗體可能是哺乳動物的或鳥類的。在進一步的具體例中，抗體可能是人類來源的並且可能進一步是人類單株抗體。

片語「雙特異性抗體」包括能夠選擇性結合兩個或更多個表位的抗體。雙特異性抗體通常包含兩條不同的重鏈，每條重鏈特異性地結合不同的表位-在兩個不同的分子(例如抗原)上或在相同分子(例如在相同的抗原)上。如果雙特異性抗體能夠選擇性結合兩個不同的表位(第一表位和第二表位)，則第一條重鏈對第一表位的親和力通常比第一條重鏈對第二表位的親和力低至少一個、兩個、三個或四個數量級，反之亦然。雙特異性抗體所辯識的表位可以位於相同或不同的目標上(例如在相同或不同蛋白質上)。例如，可以透過合併辨識相同抗原的不同表位的重鏈來製備雙特異性抗體。例如，編碼辨識相同抗原的不同表位的重鏈可變序列的核酸序列可融合至編碼不同重鏈恆定區的核酸序列，且此類序列可在表現免疫球蛋白輕鏈的細胞中表現。典型的雙特異性抗體具有兩條重鏈，各自具有三個重鏈CDR，然後是(N-端到C-端)CH1結構域、鉸鏈、CH2結構域和CH3結構域；以及一條免疫球蛋白輕鏈，其中任何一者都並未賦予抗原結合特異性但可以與每條重鏈締合，或者可以與每條重鏈締合並可以結合由重鏈抗原結合區結合的一或多個表位，或者可以與每條重鏈締合並且能夠使重鏈中的一或兩條結合至一或兩個表位。

片語「重鏈」或「免疫球蛋白重鏈」包括來自任何生物體的免疫球蛋白重鏈恆定區序列，且除非另有說明，否則包括重鏈可變結構域。重鏈可變結構域包括三個重鏈CDR和四個FR區，除非另有說明。重鏈片段包括CDR、CDR和FR，及其組合。典型的重鏈在可變結構域之後(從N-端到C端)具有CH1結構域、鉸鏈、CH2結構域和CH3結構域。重鏈的功能片段包括能夠特異性地辨識抗原(例如以微莫耳、納莫耳或皮莫耳範圍內的KD來辨識抗原)、能夠由細胞表現和分泌的片段，以及包含至少一個CDR的片段。

片語「輕鏈」包括來自任何生物體的免疫球蛋白輕鏈恆定區序列，且除非另有說明，否則包括人類κ和λ輕鏈。除非另有說明，否則輕鏈可變(VL)結構域通常包括三個輕鏈CDR和四個框架(FR)區。通常，全長輕鏈從胺基端到羧基端包括包含FR1-CDR1-FR2-CDR2-FR3-CDR3-FR4的VL結構域；以及輕鏈恆定結構域。可用於本發明的輕鏈包括例如那些並未選擇性結合由抗原結合蛋白選擇性結合的第一抗原或第二抗原的輕鏈。合適的輕鏈包括那些可以藉由篩選現有抗體庫(濕文庫(wet libraries)或電腦)中最常採用的輕鏈來進行鑑定的輕鏈，其中輕鏈基本上不會干擾抗原結合蛋白的抗原結合結構域的親和力及/或選擇性。合適的輕鏈包括那些可以結合一或兩個表位的輕鏈，這些表位由抗原結合蛋白的抗原結合區結合。

片語「可變結構域」包括免疫球蛋白輕鏈或重鏈的胺基酸序列(視需要修飾)，其按N端至C端的次序包含以下胺基酸區域(除非另有說明)：FR1、CDR1、FR2、CDR2、FR3、CDR3、FR4。「可變結構域」包括能夠折疊成具有雙β褶板結構的典型結構域(VH或VL)的胺基酸序列，其中β褶板藉由第一β褶板和第二β褶板的殘基之間的雙硫鍵連接。

片語「互補決定區」或術語「CDR」包括由生物體免疫球蛋白基因的核酸序列所編碼的胺基酸序列，該基因通常(即在野生型動物中)出現在免疫球蛋白分子(例如抗體或T細胞受體)的輕鏈或重鏈的可變區的兩個構架區之間。CDR可由例如生殖系序列或重排或未經重排的序列編碼，並且例如由幼稚或成熟B細胞或T細胞編碼。在一些情況下(例如對於CDR3來說)，CDR可以由兩個或多個不連續(例如在未經重排的核酸序列中)的序列(例如生殖系序列)所編碼，但在B細胞核酸序列中可以由連續的序列所編碼(例如，因為剪接或連接序列(例如V-D-J重組形成重鏈CDR3)。

術語「抗體片段」是指抗體的一或多個片段，其保有特異性地結合至抗原的能力。術語「抗體片段」中所含括的結合片段的實例包括：(i) Fab片段，一種由VL、VH、CL和CH1結構域組成的單價片段；(ii) F(ab')2片段，一種包含在鉸鏈區藉由雙硫鍵連接的兩個Fab片段的二價片段；(iii) Fd片段，由VH和CH1結構域組成；(iv) Fv片段，由抗體單臂的VL結構域和VH結構域組成；(v) dAb片段(Ward et al. (1989) Nature 241:544-546，該份參考文獻以全文引用的方式併入本文)，其由一個VH結構域組成；(vi)經分離的CDR；以及(vii) scFv，其由Fv片段的兩個結構域VL和VH組成，藉由合成連接子連接在一起形成單一條蛋白質鏈，其中VL區和VH區配對形成單價分子。其他形式的單鏈抗體，諸如雙抗體也含括在術語「抗體」中(參見例如，Holliger et al. (1993) PNAS USA 90:6444-6448；Poljak et al. (1994) Structure 2:1121-1123，該等參考文獻的各者以全文引用的方式併入本文)。

片語「含Fc的蛋白質」包括抗體、雙特異性抗體、免疫黏附素，和至少包含免疫球蛋白CH2和CH3區的功能部分的其他結合蛋白。「功能部分」是指可以結合Fc受體(例如，FcγR；或FcRn，即新生兒Fc受體)，及/或可以參與補體活化的CH2區和CH3區。如果CH2區和CH3區含有缺失、替換及/或插入或其他使其不能結合任何Fc受體也無法活化補體的修飾，則CH2區和CH3區不具功能。

含Fc的蛋白質可在免疫球蛋白結構域中包含修飾，包括修飾影響結合蛋白的一或多種效應子功能(例如影響FcγR結合、FcRn結合並因此影響半衰期及/或CDC活性的修飾)之處。此類修飾包括但不限於以下修飾及其組合，參照免疫球蛋白恆定區的EU編號：238、239、248、249、250、252、254、255、256、258、265、267、268、269、270、272、276、278、280、283、285、286、289、290、292、293、294、295、296、297、298、301、303、305、307、308、309、311、312、315、318、320、322、324、326、327、328、329、330、331、332、333、334、335、337、338、339、340、342、344、356、358、359、360、361、362、373、375、376、378、380、382、383、384、386、388、389、398、414、416、419、428、430、433、434、435、437、438，以及439。

例如，但並非限制，結合蛋白是含Fc的蛋白並展現出血清半衰期提高(與沒有所述修飾的相同含Fc的蛋白相比)，且具有在以下位置處的修飾：250(例如E或Q)；250和428(例如L或F)；252(例如L/Y/F/W或T)、254(例如S或T)和256(例如S/R/Q/E/D或T)；或者在428及/或433(例如L/R/SI/P/Q或K)及/或434(例如H/F或Y)處的修飾；或250及/或428處的修飾；或在307或308處的修飾(例如308F、V308F)和434。在另一個實例中，修飾可包含428L(例如M428L)和434S(例如N434S)修飾；428L、2591(例如V259I)和308F(例如V308F)修飾；433K(例如H433K)和434(例如434Y)修飾；252、254和256(例如252Y、254T和256E)修飾；250Q和428L修飾(例如T250Q和M428L)；307及/或308修飾(例如308F或308P)。

如本文所用，術語「抗原結合蛋白」是指特異性地辨識抗原(諸如細胞特異性抗原及/或本發明的目標抗原)上的表位的多肽或蛋白質(在一個功能單位中複合的一或多條多肽)。抗原結合蛋白可能是多特異性的。關於抗原結合蛋白的術語「多特異性」表示該蛋白質辨識同一抗原或不同抗原上的不同表位。本發明的多特異性抗原結合蛋白可以是單一條的多功能多肽，或者它可以是兩條或更多條多肽彼此共價或非共價締合的多聚體複合物。術語「抗原結合蛋白」包括本發明的抗體或其片段，其可能與另一個功能分子(例如另一肽或蛋白質)連接或共表現。例如，抗體或其片段可以在功能上連接(例如藉由化學偶聯、基因融合、非共價締合或其他方式)至一或多個其他分子實體(諸如蛋白質或其片段)，以產生具有第二結合特異性的雙特異性或多特異性抗原結合分子。術語「抗」和「α」可以互換使用並且指結合目標的抗原結合蛋白。作為非限制性實例，「抗TFRC」、「αTFRC」以及類似者是指結合TfR的抗原結合蛋白。

如本文所用，術語「表位」是指被多特異性抗原結合多肽所辨識的抗原部分。單一抗原(諸如抗原性多肽)可能具有超過一個表位。表位可被定義為結構性的或功能性的。功能性表位通常是結構表位的一個子集，並且被定義為直接有助於抗原結合多肽與抗原之間交互作用的親和力的那些殘基。表位也可能是構象性的，即由非線性胺基酸組成。在某些具體例中，表位可能包括抗原決定位，這些抗原決定位是分子的化學活性表面基團，諸如胺基酸、糖側鏈、磷醯基或磺醯基，且在某些具體例中，可能具有特定的三維結構特徵，及/或特定的電荷特徵。由連續胺基酸形成的表位通常在暴露於變性溶劑時仍保留著，而由三級折疊形成的表位通常在用變性溶劑處理時喪失。

術語「結構域」是指具有特定功能或結構的蛋白質或多肽的任何部分。較佳地，本發明的結構域結合至細胞特異性或目標抗原。如本文所用，細胞特異性抗原結合結構域或目標抗原結合結構域以及類似者包括特異性地結合抗原的任何天然存在的、酶促可得的、合成的或經基因改造的多肽或醣蛋白。

可互換使用的術語「半體」或「半抗體」是指抗體的一半，其基本上含有一條重鏈和一條輕鏈。抗體重鏈可以形成二聚體，因此一個半體的重鏈可以與和不同分子(例如另一個半體)或另一個含Fc多肽締合的重鏈締合。兩個略有不同的Fc結構域可能會「異二聚化」，如雙特異性抗體或其他異二聚體、異三聚體、異四聚體以及類似者的形成。參見 Vincent and Murini, “Current strategies in antibody engineering: Fc engineering and pH-dependent antigen binding, bispecific antibodies and antibody drug conjugates,” 7 Biotechnol. J. 1444-1450 (20912)；以及Shimamoto et al., “Peptibodies: A flexible alternative format to antibodies,” 4(5) MAbs 586-91 (2012)，該等參考文獻的各者以全文引用的方式併入本文。

在一個具體例中，半體可變結構域特異性地辨識內化效應子，且半體Fc結構域與包含替代酶(例如肽體)的Fc融合蛋白二聚化，同上註，586頁。

術語「單鏈可變片段」或「scFv」包括含有免疫球蛋白重鏈可變區(VH)和免疫球蛋白輕鏈可變區(VL)的單鏈融合多肽。在一些具體例中，VH和VL藉由具有10至25個胺基酸的連接子序列連接。ScFv多肽還可包括其他胺基酸序列，諸如CL區或CH1區。ScFv分子可以藉由噬菌體展示來製造，或者藉由直接次選殖融合瘤或B細胞的重鏈和輕鏈來製造。就藉由噬菌體展示和抗體結構域選殖來製造scFv片段的方法，Ahmad et al., Clinical and Developmental Immunology, volume 2012, article ID 98025以引用的方式併入本文。

「阿伐-葡萄糖苷酶」(或「α-葡萄糖苷酶」)、「α-葡萄糖苷酶活性」、「GAA」和「GAA活性」可互換使用，並且指的是任何促進肝醣的1,4-α鍵水解還有澱粉轉化為葡萄糖的蛋白質。GAA還被稱為EC 3.2.1.20、麥芽糖酶、葡萄糖轉化酶(glucoinvertase)、葡萄糖苷蔗糖酶(glucosidosucrase)、麥芽糖酶-葡萄糖澱粉酶、α-吡喃葡萄糖苷酶、葡萄糖苷轉化酶、α-D-葡萄糖苷酶、α-葡萄糖苷水解酶、α-1,4-葡萄糖苷酶和α-D-葡萄糖苷葡萄糖水解酶。GAA存在於溶酶體和小腸刷狀緣中。患有龐貝氏症的患者缺乏功能性溶酶體α-葡萄糖苷酶。參見Chiba, “Molecular mechanism in alpha-glucosidase and glucoamylase,” 61(8) Biosci. Biotechnol. Biochem. 1233-9 (1997)；以及Hesselink et al., “Lysosomal dysfunction in muscle with special reference to glycogen storage disease type II,” 1637(2) Biochim. Biophys. Acta. 164-70 (2003)，該等參考文獻的各者以全文引用的方式併入本文。

「阿伐-半乳糖苷酶A」(或「α-半乳糖苷酶A」)、「α-半乳糖苷酶A活性」、「α-半乳糖苷酶」、「α-半乳糖苷酶活性」、「GLA」和「GLA活性」可互換使用，並指促進末端α-半乳糖基部分從醣脂和醣蛋白水解並且水解α-D-岩藻糖苷的任何蛋白質。GLA還被稱為EC 3.2.1.22、蜜二糖酶(melibiase)、α-D-半乳糖苷酶、α-半乳糖苷酶A、α-半乳糖苷半乳糖水解酶、α-D-半乳糖苷半乳糖水解酶。GLA是一種由X連鎖GLA基因編碼的溶酶體酶。GLA的缺陷可導致法布里氏病，其中被稱為球形三醯神經醯胺(又名Gb3、GL-3或神經醯胺三己糖苷)的醣脂積聚在血管內(即顯著的血管病變)，導致疼痛與腎臟、心臟、皮膚及/或腦血管組織還有其他組織和器官的功能受損。參見例如Prabakaran et al. “Mannose 6-phosphate receptor and sortilin mediated endocytosis of α-galactosidase A in kidney endothelial cells,” 7(6) PLoS One e39975 pp. 1-9 (2012)，該份參考文獻以全文引用的方式併入本文。

在一個態樣中，本發明提供一種透過向患者投與「多結構域治療性蛋白」來治療患有溶酶體貯積症的患者(或個體)的方法。多結構域治療性蛋白進入患者的細胞並向溶酶體遞送酶或酶活性(即「替代酶」)，其替代與LSD相關的酶或酶活性(即「內源性酶」)。在一個具體例中，多結構域治療性蛋白經由基因治療載體被遞送給患者，該載體含有編碼多結構域治療性蛋白的多核苷酸。

LSD包括神經鞘脂質病、黏多醣病和肝醣貯積症。在一些具體例中，LSD是法布里氏病、第I型高歇氏病、第II型高歇氏病、第III型高歇氏病、A型尼曼-匹克二氏病、B型尼曼-匹克二氏病、GM1-神經節苷脂病、桑德霍夫氏病、泰-薩二氏病、GM2-活化因子缺乏症、GM3-神經節苷脂病、異染性白質失養症、神經鞘脂質活化因子缺乏症、Scheie氏病、Hurler-Scheie二氏病、Hurler氏病、Hunter氏病、Sanfilippo氏病A、Sanfilippo氏病B、Sanfilippo氏病C、Sanfilippo氏病D、Morquio氏症候群A、Morquio氏症候群B、Maroteaux-Lamy二氏病、Sly氏病、MPS IX和龐貝氏症中的任一或多者。在一個特定具體例中，LSD是法布里氏病。在另一個特定具體例中，LSD是龐貝氏症。

在一些具體例中，多結構域治療性蛋白包含(a)替代酶以及(b)結合內化效應子的分子實體(遞送結構域)。在一些情況下，替代酶是以下中的任一或多者：α-半乳糖苷酶、β-半乳糖苷酶、α-葡萄糖苷酶、β-葡萄糖苷酶、神經鞘脂質活化蛋白-C活化因子、神經醯胺酶、神經磷脂酶(sphingomyelinase)、β-己糖胺酶、GM2-活化因子、GM3合成酶、芳基硫酸酯酶、神經鞘脂質活化因子、α-艾杜糖醛酸苷酶、艾杜糖醛酸苷酶-2-硫酸酯酶、肝素 N-硫酸酯酶、 N-乙醯基-α-胺基葡萄糖苷酶、α-葡萄糖醯胺 N-乙醯基轉移酶、 N-乙醯基葡萄糖胺-6-硫酸酯酶、 N-乙醯基半乳糖胺-6-硫酸硫酸酯酶、 N-乙醯基半乳糖胺-4-硫酸酯酶、β-葡萄糖醛酸苷酶和透明質酸酶。

在一些情況下，患者可能無法產生足夠的蛋白質，以至於替代酶被患者識別為「非自身」，並且在投與替代酶後會發生免疫反應；這是不樂見的。因此，在一些具體例中，以避免在個體體內誘導免疫學反應的方式來設計或生產替代酶。一種這樣的解決方案是使用「同功酶」作為替代酶。同功酶與患者的「自身」蛋白質足夠相近，但具有足以改善LSD症狀的替代酶活性。

在一個特定具體例中，其中LSD是龐貝氏症而內源性酶是α-葡萄糖苷酶(GAA)，同功酶可以是酸性α-葡萄糖苷酶、蔗糖酶-異麥芽糖酶(SI)、麥芽糖酶-葡萄糖澱粉酶(MGAM)、葡萄糖苷酶II(GANAB)和中性α-葡萄糖苷酶(C GNAC)中的任一者。在另一個特定具體例中，其中LSD是法布里氏病，而內源性酶是α-半乳糖苷酶A(GLA)，同功酶可以是經工程改造成具有GLA活性的α-N-乙醯胺基半乳糖苷酶。

除了使用同功酶以外，本文提供減少針對替代酶的交叉反應性免疫物質(CRIM)的方法。投與包含內化效應子結合結構域和酶結構域的多結構域治療性蛋白(例如經由基因治療載體)降低了針對投與對照治療性蛋白(缺乏內化效應子結構域並且包含一個酶結構域)所具有之替代酶的CRIM程度。因此，在缺乏酶的患者體內減少針對酶的CRIM的一個具體例包含向患者投與多結構域治療性蛋白(或編碼該蛋白的核酸，例如含有編碼多結構域治療性蛋白的基因的基因治療載體)，其中多結構域治療性蛋白包含遞送結構域(例如內化效應子結合蛋白)和酶結構域。

多結構域治療性蛋白具有內化效應子結合蛋白組分，能夠使替代酶攝取到細胞中。因此，在一些具體例中，內化效應子可以是轉鐵蛋白受體(TfR)、CD63、MHC-1、Kremen-1、Kremen-2、LRP5、LRP6、LRP8、LDL-受體、LDL相關蛋白1受體、ASGR1、ASGR2、澱粉樣前體蛋白樣蛋白2(APLP2)、愛帕琳肽受體(APLNR)、PRLR(泌乳素受體)、MAL(髓磷脂和淋巴細胞蛋白，又名VIP17)、IGF2R、液泡型H+ ATP酶、白喉毒素受體、葉酸受體、麩胺酸受體、麩胺硫受體、瘦素受體、清道夫受體、SCARA1-5、SCARB1-3，以及CD36。

在一些具體例中，內化效應子結合蛋白包含抗原結合蛋白，其包括例如受體融合分子、阱分子(trap molecule)、受體-Fc融合分子、抗體、Fab片段、F(ab')2片段、Fd片段、Fv片段、單鏈Fv (scFv)分子、dAb片段、經分離的互補決定區(CDR)、CDR3肽、受限FR3-CDR3-FR4肽、結構域特異性抗體、單結構域抗體、結構域缺失抗體、嵌合抗體、CDR 移植抗體、雙抗體、三抗體、四抗體、微型抗體、奈米抗體、單價奈米抗體、二價奈米抗體、小型模組化免疫藥物(SMIP)、駱駝抗體(VHH重鏈同二聚體抗體)和鯊魚可變IgNAR結構域。

在一個具體例中，結合內化效應子的分子實體是抗體、抗體片段或其他抗原結合蛋白。例如，分子實體可以是雙特異性抗體，其中一個臂結合內化效應子(例如TfR)，而另一個臂結合替代酶。在一個特定具體例中，所治療的疾病是法布里氏病，而多結構域治療性蛋白包含GLA和結合GLA與TfR的雙特異性抗體。在另一個特定具體例中，所治療的疾病是龐貝氏症，而多結構域治療性蛋白包含GAA和結合GAA與TfR的雙特異性抗體。

在另一個具體例中，結合內化效應子的分子實體包含半抗體，而替代酶含有Fc結構域(酶-Fc融合多肽)。在一個具體例中，酶-Fc融合多肽的Fc結構域與內化效應子特異性半體的Fc結構域締合而形成多結構域治療性蛋白(圖1B)。

在其他具體例中，替代酶共價連接至內化效應子結合蛋白。前段中所述的酶-Fc融合體：半體具體例(也參見圖1B)屬於此類，因為Fc二聚體可以經由一或多個雙硫鍵而被固定。酶活性結構域或多肽與內化結合結構域或多肽之間的共價鍵聯可能是任何類型的共價鍵，即涉及電子共用的任何鍵。在一些情況下，共價鍵是兩個胺基酸之間的肽鍵，使得替代酶和內化效應子結合蛋白整體或部分形成連續的多肽鏈，像是在融合蛋白中。在一些情況下，替代酶部分和內化效應子結合蛋白直接連接。在其他情況下，連接子用於連接兩個部分。參見Chen et al., “Fusion protein linkers: property, design and functionality,” 65(10) Adv Drug Deliv Rev. 1357-69 (2013)。

術語「連接子」或「間隔子」是指通常允許融合蛋白的一或多個連接組分正確折疊的短(例如2至25個胺基酸)多肽，例如連接至scFv之VL的VH，連接至如本文所述的多結構域治療性蛋白的遞送結構域(例如抗內化效應子抗體)的治療性蛋白(例如，替代酶)。連接子為融合蛋白的組分提供了一個靈活的接合區，容許分子的兩端獨立移動，並可能在保留兩個實體各自的適當功能方面發揮重要作用。因此，在一些情況下，接合區既充當連接子(將兩個部分合併在一起)，也充當間隔子(允許兩個部分中的各者形成自己的生物結構而不干擾另一個部分)。此外，接合區應該產生不被個體免疫系統辨識為外來的表位，換言之，不會被認為是免疫原性的。連接子挑選也可能對融合分子的結合活性有影響(參見Huston et al, 1988, PNAS, 85:16:5879-83；Robinson & Bates, 1998, PNAS95(11):5929-34；Arai, et al. 2001, PEDS, 14(8):529-32；以及Chen, X. et al., 2013, Advanced Drug Delivery Reviews65:1357–1369)。在一個具體例中，遞送結構域經由一或多個肽連接子被連接至治療性多肽或其片段。在另一個具體例中，scFv抗體的可變區或其片段經由一或多個肽連接子相互連接。

連接子的長度可能是2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15個或更多個胺基酸殘基，但通常是5個到25個殘基之間。連接子的實例包括聚甘胺酸連接子，諸如Gly-Gly、Gly-Gly-Gly (3Gly)、4Gly、5Gly、6Gly、7Gly、8Gly或9Gly。連接子的實例還包括Gly-Ser肽連接子，諸如Ser-Gly、Gly-Ser、Gly-Gly-Ser、Ser-Gly-Gly、Gly-Gly-Gly-Ser、Ser-Gly-Gly-Gly、Gly-Gly-Gly-Gly-Ser、Ser-Gly-Gly-Gly-Gly、Gly-Gly-Gly-Gly-Gly-Ser、Ser-Gly-Gly-Gly-Gly-Gly、Gly-Gly-Gly-Gly-Gly-Gly-Ser、Ser-Gly-Gly-Gly-Gly-Gly-Gly、(Gly-Gly-Gly-Gly-Ser)n和(Ser-Gly-Gly-Gly-Gly)n，其中n = 1到10。(Gly-Gly-Gly-Gly-Ser) _n和(Ser-Gly-Gly-Gly-Gly) _n也分別稱為(G4S) _n和(S4G)n。

在一些具體例中，治療性蛋白(例如替代酶)共價連接至抗內化效應子抗體重鏈的C端(圖1C)或共價連接至輕鏈的C端(圖1E)。在一些具體例中，替代酶共價連接至抗內化效應子抗體重鏈的N端(圖1D)或共價連接至輕鏈的N端(圖1F)。在一些具體例中，酶連接至抗內化效應子scFv結構域的C端(圖1G)。

在一些情況下，特別是當治療性蛋白(例如替代酶)在溶酶體中未正常受到蛋白水解加工時，將可切割連接子添加到包含抗體-酶融合體的多結構域治療性蛋白的那些具體例中。在一些具體例中，在抗體和替代酶之間插入組織蛋白酶可切割連接子以在溶酶體中促進抗體移除，以便(a)可能藉由移除空間上大型的抗體來幫助維持酶活性，以及(b)可能增加酶的溶酶體半衰期。

在一個特定具體例中，多結構域治療性蛋白在基因治療載體中被遞送至患者或細胞，該載體含有編碼多結構域治療性蛋白的多核苷酸。在一個具體例中，多結構域治療性蛋白包含遞送結構域和酶結構域。在一個特定具體例中，遞送結構域結合至內化效應子，諸如TfR、CD63、MHC-1、Kremen-1、Kremen-2、LRP5、LRP6、LRP8、LDL-受體、LDL相關蛋白1受體、ASGR1、ASGR2、澱粉樣前體蛋白樣蛋白2(APLP2)、愛帕琳肽受體(APLNR)、MAL(髓磷脂和淋巴細胞蛋白)、IGF2R、液泡型H+ ATP酶、白喉毒素受體、葉酸受體、麩胺酸受體、麩胺硫受體、瘦素受體、清道夫受體A1-5(SCARA1-5)、SCARB1-3，或CD36。在一個具體例中，遞送結構域是結合至CD63的單鏈可變片段(scFv) (即抗CD63 scFv)。在另一個具體例中，遞送結構域是結合至TfRC的單鏈可變片段(scFv) (即抗TfRC scFv)。

在一個特定具體例中，多結構域治療性蛋白的酶結構域包含水解酶。在一個特定具體例中，酶結構域包含水解酶，其是糖苷酶。在一個更特定的具體例中，酶結構域包含糖苷酶，其為糖苷酶。在一個更特定的具體例中，酶結構域是糖苷酶，其為α-葡萄糖苷酶。

一般而言，本文揭示了包含與使用多核苷酸(例如(m)RNA、DNA及其經修飾形式)的組成物及其用途，該多核苷酸編碼包含內化效應子結構域和酶結構域的多結構域治療性蛋白，供用於治療溶酶體貯積症，例如用於在龐貝氏症患者中減少肝醣及/或增強對GAA的免疫耐受性。

術語「多核苷酸」包括編碼至少一種多肽的核苷酸(例如RNA或DNA)聚合物，多肽包括融合多肽，例如包含內化效應子結構域和酶結構域的多結構域治療性多肽。如本文所用的多核苷酸含括包含經修飾的和未經修飾的核苷酸之聚合物。多核苷酸可含有一或多個編碼區和非編碼區。多核苷酸可以從天然來源純化、使用重組表現系統產生並且視情況純化、化學合成等。在適當的情況下(例如在化學合成分子的情況下)，多核苷酸可以包含核苷類似物，諸如具有經化學修飾的鹼基或糖、主鏈修飾等的類似物。除非另有說明，否則多核苷酸序列以5'到3'方向呈現。在一些具體例中，多核苷酸是或包含天然核苷(例如腺苷、鳥苷、胞苷、尿苷)；核苷類似物(例如2-胺基腺苷、2-硫代胸苷、肌苷、吡咯并嘧啶、3-甲基腺苷、5-甲基胞苷、C-5丙炔基胞苷、C-5丙炔基尿苷、2-胺基腺苷、C5-溴尿苷、C5-氟尿苷、C5-碘尿苷、C5-丙炔尿苷、C5-丙炔胞苷、C5-甲基胞苷、2-胺基腺苷、7-脫氮腺苷、7-脫氮鳥苷、8-氧代腺苷、8-氧代鳥苷、O(6)-甲基鳥嘌呤，和2-硫代胞苷)；經化學修飾的鹼基；經生物修飾的鹼基(例如甲基化鹼基)；嵌入鹼基(intercalated base)；經修飾的糖(例如2'-氟核糖、核糖、2'-去氧核糖、阿拉伯糖和己糖)；及/或經修飾的磷酸酯基團(例如硫代磷酸酯和5'-N-亞磷醯胺鍵聯)。

在一些具體例中，多核苷酸包含一或多個非標準核苷酸殘基。非標準核苷酸殘基可包括例如5-甲基胞苷(「5mC」)、假尿苷(「ψU」)及/或2-硫代-尿苷(「2sU」)。參見，例如，美國專利第8,278,036號或WO2011012316，有關討論此類殘基及其併入多核苷酸，將該等文件的各者以全文引用的方式併入。非標準核苷酸殘基的存在可使多核苷酸比具有相同序列但僅含標準殘基的多核苷酸更為穩定及/或免疫原性更低。在進一步的具體例中，多核苷酸可包含一或多個非標準核苷酸殘基，其選自異胞嘧啶、假異胞嘧啶、5-溴尿嘧啶、5-丙炔基尿嘧啶、6-胺基嘌呤、2-胺基嘌呤、肌苷、二胺基嘌呤和2-氯-6-胺基嘌呤胞嘧啶，以及這些修飾和其他核鹼基修飾的組合。某些具體例可進一步包括對呋喃糖環或核鹼基的額外修飾。額外的修飾可能包括例如糖修飾或替換(例如一或多個2'-O-烷基修飾、鎖核酸(LNA))。在一些具體例中，多核苷酸可以與額外的多核苷酸及/或肽多核苷酸(PNA)複合或雜交。在糖修飾是2'-O-烷基修飾的具體例中，此類修飾可包括但不限於2'-去氧-2'-氟修飾、2'-O-甲基修飾、2'-O-甲氧基乙基修飾和2'-去氧修飾。在某些具體例中，任何這些修飾單獨或組合可能存在於0-100%的核苷酸中，例如超過0%、1%、10%、25%、50%、75%、85%、90%、95%，或100%的組成核苷酸。在一些具體例中，多核苷酸包含信使RNA(mRNA)分子，其可能藉由周知的方法進行修飾或未進行修飾，例如可能包含或不包含經修飾的核苷酸，以增加它們的穩定性及/或降低它們的免疫原性。在一些具體例中，多核苷酸包含DNA分子，其可能藉由周知的方法進行修飾或未進行修飾，例如可能包含或不包含經修飾的核苷酸，以增加它們的穩定性及/或降低它們的免疫原性。

在一些具體例中，多核苷酸還包括「基因座靶向核酸序列」。基因座靶向序列使編碼多結構域治療性蛋白的多核苷酸能夠整合到受體宿主細胞的基因體中。在一些具體例中，基因座靶向序列包括側接同源臂以實現同源重組。在一些具體例中，基因座靶向序列包括引導RNA序列和第II型Cas酶以促進整合(即CRISPR-Cas9方法)。在一些具體例中，基因座靶向序列包括引導鋅指核酸酶(ZFN)辨識序列以促進整合。在一些具體例中，基因座靶向序列包括轉錄活化因子樣效應子核酸酶(TALEN)辨識序列以促進整合。在又其他具體例中，基因座靶向序列包括由BuD衍生的核酸酶用來促進整合的單一殘基-核苷酸編碼。

在一些具體例中，編碼多結構域治療性蛋白的多核苷酸被整合到其中的基因體基因座是「安全港基因座(safe harbor locus)」。在一個具體例中，「安全港基因座」使多結構域治療性蛋白能夠高度表現，同時不干擾必需基因的表現或促使致癌基因或其他有害基因的表現。在一個具體例中，基因體基因座位於或靠近肝臟表現的白蛋白(Alb)基因座、EESYR基因座、SARS基因座、人類1號染色體或其非人類哺乳動物同系物的位置188,083,272、人類10號染色體或其非人類哺乳動物同系物的位置3,046,320、人類17號染色體或其非人類哺乳動物同系物的位置67,328,980、人類19號染色體或其非人類哺乳動物同系物上的腺相關病毒位點1(AAVS1；AAV病毒整合的天然位點)、趨化因子受體(CCR5)基因、編碼HIV-1輔助受體的趨化因子受體基因，或小鼠Rosa26基因座或其非鼠類哺乳動物同系物。在一個具體例中，基因體基因座是腺相關病毒位點。在一個具體例中，根據Papapetrou and Schambach, J. Molecular Therapy, vol. 24(4):678-684, April 2016的方法挑選整合用的基因體基因座，以供逐步挑出用於基因治療載體整合的安全港基因體基因座，其以全文引用的方式併入本文；另見Barzel et al. Nature, vol. 517:360-364，以供將無啟動子基因靶向到肝臟表現的白蛋白( Alb)基因座，其以全文引用的方式併入本文。

在一些具體例中，多核苷酸(例如DNA)還含有可操作地連接至編碼多結構域治療性蛋白之核酸序列的啟動子。在一個特定具體例中，啟動子是在特定組織中驅動基因表現的組織特異性啟動子。在一個具體例中，組織特異性啟動子是衍生自serpina1(例如SEQ ID NO：9)的肝臟特異性增強子/啟動子及/或是TTR啟動子(SEQ ID NO：8)。在其他具體例中，啟動子是CMV啟動子。在其他具體例中，啟動子是泛素C啟動子。

在一個具體例中，編碼多結構域治療性蛋白的「基因治療載體」是能夠將編碼多結構域治療性蛋白的多核苷酸遞送至宿主(例如患者)的任何載體。在一些具體例中，基因治療載體靶向特定宿主細胞或器官，例如用於局部遞送(例如組織特異性遞送)。通常，局部遞送需要由mRNA編碼的蛋白質(例如多結構域治療性蛋白)，該mRNA主要在器官(例如肝臟)中及/或由器官(例如肝臟)轉譯和表現，從而形成儲庫(例如用於生產(和分泌)蛋白質的肝儲庫)。在一些具體例中，基因治療載體將多結構域治療性蛋白多核苷酸遞送至患者的肝臟而形成肝儲庫。參見例如DeRosa et al. Gene Therapy, vol. 10:699-707，以全文引用的方式併入本文。在一些具體例中，基因治療載體將編碼多結構域治療性蛋白的多核苷酸遞送至患者的肌肉組織。在一些具體例中，基因治療載體將編碼多結構域治療性蛋白的多核苷酸遞送至患者的腦部。

任何目前已知或未來開發的天然或經工程改造的基因治療遞送載體均可用於實施本發明。在一些具體例中，基因治療載體是病毒載體，例如包含病毒、病毒殼、病毒基因組等。在一些具體例中，基因治療載體是裸露多核苷酸，例如游離基因體。在一些具體例中，基因治療載體包含多核苷酸複合物。用作為基因治療載體的例示性非限制性多核苷酸複合物包括脂質複合物、聚合物囊泡(polymersome)、多聚物、樹枝狀聚合物、無機奈米顆粒(例如多核苷酸包覆的金、二氧化矽、氧化鐵、磷酸鈣等)。在一些具體例中，如本文所述的基因治療載體包含病毒載體、裸露多核苷酸和多核苷酸複合物的組合。

在一個具體例中，基因治療載體是病毒，包括逆轉錄病毒、腺病毒、單純皰疹病毒、痘病毒、牛痘病毒、慢病毒或腺相關病毒。在一個具體例中，基因治療載體是腺相關病毒(AAV)，包括血清型AAV1、AAV2、AAV3、AAV4、AAV5、AAV6、AAV7、AAV8、AAV9、AAV10和AAV11，或其經工程改造或自然選擇的變體。

在一個具體例中，多核苷酸還含有腺相關病毒(AAV)核酸序列。在一個具體例中，基因治療載體是嵌合腺相關病毒，其含有來自兩種或更多種血清型的遺傳元件。例如，具有來自AAV1的rep基因和來自AAV2的cap基因的AAV載體(被指定為AAV1/2或AAV RC1/2)可用作為基因治療載體，以將多結構域治療性蛋白多核苷酸遞送至有需要的細胞或患者的細胞。在一個具體例中，基因治療載體是AAV1/2、AAV1/3、AAV1/4、AAV1/5、AAV1/6、AAV1/7、AAV1/8、AAV1/9、AAV1/10、AAV1/11、AAV2/1、AAV2/3、AAV2/4、AAV2/5、AAV2/6、AAV2/7、AAV2/8、AAV2/9、AAV2/10、AAV2/11、AAV3/1、AAV3/2、AAV3/4、AAV3/5、AAV3/6、AAV3/7、AAV3/8、AAV3/9、AAV3/10、AAV3/10、AAV4/1、AAV4/2、AAV4/3、AAV4/5、AAV4/6、AAV4/7、AAV4/8、AAV4/9、AAV4/10、AAV4/11、AAV5/1、AAV5/2、AAV5/3、AAV5/4、AAV5/6、AAV5/7、AAV5/8、AAV5/9、AAV5/10、AAV5/11、AAV6/1、AAV6/2、AAV6/3、AAV6/4、AAV6/5、AAV6/7、AAV6/8、AAV6/9、AAV6/10、AAV6/10、AAV7/1、AAV7/2、AAV7/3、AAV7/4、AAV7/5、AAV7/6、AAV7/8、AAV7/9、AAV7/10、AAV7/11、AAV8/1、AAV8/2、AAV8/3、AAV8/4、AAV8/5、AAV8/6、AAV8/7、AAV8/9、AAV8/10、AAV8/11、AAV9/1、AAV9/2、AAV9/3、AAV9/4、AAV9/5、AAV9/6、AAV9/7、AAV9/8、AAV9/10、AAV9/11、AAV10/1、AAV10/2、AAV10/3、AAV10/4、AAV10/5、AAV10/6、AAV10/7、AAV10/8、AAV10/9、AAV10/11、AAV11/1、AAV11/2、AAV11/3、AAV11/4、AAV11/5、AAV11/6、AAV11/7、AAV11/8、AAV11/9、AAV11/10、嵌合病毒載體或其衍生物。就用做為基因治療載體的AAV載體與嵌合病毒載體及其構建和用途方面，Gao et al.,“Novel adeno-associated viruses from rhesus monkeys as vectors for human gene therapy,” PNAS 99(18): 11854–11859, Sep. 3, 2002以引用的方式併入本文。

在一個更特定的具體例中，基因治療載體是具有血清型2 rep基因序列和血清型8 cap序列的嵌合AAV載體(「AAV2/8」或「AAV RC2/8」)。

在一些具體例中，基因治療載體是已經被假型化(例如經工程改造)以靶向特定細胞(例如肝細胞)的病毒載體。使用病毒載體進行靶向基因治療的許多進展可概括為病毒載體的非重組(非遺傳)或重組(遺傳)修飾，這導致病毒載體自然趨向性的假型化、擴展及/或重定向(在Nicklin and Baker (2002) Curr. Gene Ther. 2:273-93；Verheiji and Rottier (2012) Advances Virol 2012:1-15中綜述；該等參考文獻的各者以全文引用的方式併入本文) 。非遺傳方法通常利用一個轉接子(adaptor)，其會辨識野生型(未經修飾的)病毒表面蛋白和目標細胞。可溶性假受體(就野生型病毒而言)、諸如聚乙二醇的聚合物和抗體或其部分已被用作為轉接子的病毒結合結構域，而天然肽或維生素配體以及抗體及其部分已針對上述轉接子的細胞結合結構域而使用。例如，病毒載體對目標細胞的再靶向可以在載體：轉接子複合物與目標細胞表面上所表現的蛋白質(例如細胞表面蛋白)結合時實現。這種方法已用於：AAV(Bartlett et al. (1999) Nat. Biotechnol. 74: 2777-2785)；腺病毒(Hemminki et al. (2001) Cancer Res. 61: 6377–81；van Beusechem et al. (2003) Gene Therapy 10:1982–1991；Einfeld, et al. (2001) J. Virol. 75:11284–91；Glasgow et al. (2009) PLOS One 4:e8355)；皰疹病毒(Nakano et al. (2005) Mol. Ther. 11:617-24)；副黏液病毒(Bian et al. (2005) Cancer Gene Ther. 12:295-303；Bian et al. (2005) Int. J. Oncol. 29:1359-69)；和冠狀病毒(Haijema et al. (2003) J. Virol. 77:4528–4538；Wurdinger et al. (2005) Gene Therapy 12:1394–1404)；該等參考文獻的各者以全文引用的方式併入本文。

一種更為流行的方法是病毒殼蛋白的重組基因修飾，因此是病毒殼的表面。在間接重組方法中，病毒殼經異源性「支架」修飾，然後該支架連接到轉接子。轉接子結合至支架和目標細胞(Arnold et al. (2006) Mol. Ther. 5:125-132；Ponnazhagen et al. (2002) J. Virol. 76:12900–907；亦見WO 97/05266，該等參考文獻的各者以全文引用的方式併入本文)。支架已被併入Ad，支架為諸如(1) Fc結合分子(例如Fc受體、蛋白A等)，其結合至抗體轉接子的Fc、(2)(鏈黴)抗生物素蛋白，其結合至生物素化轉接子、(3)生物素，其結合至與(鏈黴)抗生物素蛋白融合的轉接子，以及(4)形成等長肽鍵的蛋白質：蛋白質結合對，諸如SpyCatcher，其結合SpyTagged轉接子(Pereboeva et al. (2007) Gene Therapy 14: 627–637；Park et al. (2008) Biochemical and Biophysical Research Communications 366: 769–774；Henning et al. (2002) Human Gene Therapy 13:1427–1439；Banerjee et al. (2011) Bioorganic and Medicinal Chemistry Letters 21:4985–4988)；AAV (Gigout et al. (2005) Molecular Therapy 11:856–865；Stachler et al. (2008) Molecular Therapy 16:1467–1473)；以及披衣病毒(Quetglas et al. (2010) Virus Research 153:179–196；Ohno et al. (1997) Nature Biotechnology 15:763–767；Klimstra et al. (2005) Virology 338:9–21；該等參考文獻的各者以全文引用的方式併入本文)。

在直接重組靶向方法中，靶向配體直接被插入或偶聯至病毒殼，即蛋白質病毒殼被修飾成表現異源性配體。然後，配體重定向(例如結合)偏好或專門在目標細胞上表現的受體或標記(Stachler et al. (2006) Gene Ther. 13:926–931；White et al. (2004) Circulation 109:513–51；該等參考文獻的各者以全文引用的方式併入本文)。直接重組方法已用於AAV (Park et al., (2007) Frontiers in Bioscience 13:2653–59；Girod et al. (1999) Nature Medicine 5:1052–56；Grifman et al. (2001) Molecular Therapy 3:964–75；Shi et al. (2001) Human Gene Therapy 12:1697–1711；Shi and Bartlett (2003) Molecular Therapy 7:515–525，該等參考文獻的各者以全文引用的方式併入本文)；逆轉錄病毒(Dalba et al. Current Gene Therapy 5:655–667；Tai and Kasahara (2008) Frontiers in Bioscience 13:3083‑3095；Russell and Cosset (1999) Journal of Gene Medicine 1:300–311；Erlwein et al. (2002) Virology 302:333–341；Chadwick et al. (1999) Journal of Molecular Biology 285:485–494；Pizzato et al. (2001) Gene Therapy 8:1088–1096)；痘病毒(Guse et al. (2011) Expert Opinion on Biological Therapy 11:595–608；Galmiche et al. (1997) Journal of General Virology 78:3019–3027；Paul et al. (2007) Viral Immunology 20:664–671)；副黏液病毒(Nakamura and Russell (2004) Expert Opinion on Biological Therapy 4:1685–1692；Hammond et al. (2001) Journal of Virology 75:2087–2096；Galanis (2010) Clinical Pharmacology and Therapeutics 88:620–625；Blechacz and Russell (2008) Current Gene Therapy 8:162–175；Russell and Peng (2009) Current Topics in Microbiology and Immunology 330:213–241)；和皰疹病毒(Shah and Breakefield (2006) Current Gene Therapy 6:361‑370；Campadelli-Fiume et al. (2011) Reviews in Medical Virology 21:213–226；該等參考文獻的各者以全文引用的方式併入本文)。

在一些具體例中，對特別適合生成調節反應(例如對例如替代酶的耐受性)的那些組織來假型化如本文所述之基因治療載體。此類組織包括但不限於黏膜組織(例如腸相關淋巴組織(gut‑associated lymphoid tissue，GALT))、造血幹細胞和肝臟。在一些具體例中，如本文所述的基因治療載體或編碼多結構域治療性蛋白的基因受到對那些組織具特異性的啟動子(例如肝特異性啟動子)控制而表現。

在一些具體例中，如本文所述之基因治療載體包含裸露多核苷酸。例如，在一些具體例中，可以將編碼多結構域治療性多肽的多核苷酸直接注射(例如肌肉內、靜脈內注射等)到形成儲庫的器官。用於增強遞送裸露多核苷酸的額外周知方法包括但不限於電穿孔、超音波穿孔(sonoporation)、使用基因槍發射多核苷酸包覆的金顆粒、磁轉染(magnetofection)和流體動力遞送。

在一些具體例中，本文所述之基因治療載體包含多核苷酸複合物，諸如但不限於奈米顆粒(例如多核苷酸自組裝奈米顆粒、基於聚合物的自組裝奈米顆粒、無機奈米顆粒、脂質奈米顆粒、半導體/金屬奈米顆粒)、凝膠和水凝膠、帶有陽離子和陰離子的多核苷酸複合物、微粒，及其任何組合。

在一些具體例中，本文揭示之多核苷酸可配製為自組裝奈米顆粒。作為非限制性實例，多核苷酸可用來製造用於多核苷酸遞送系統中的奈米顆粒(參見例如國際公開第WO 2012/125987號；以全文引用的方式併入本文)。在一些具體例中，多核苷酸自組裝奈米顆粒可能包含本文揭示之多核苷酸核心以及聚合物殼。聚合物殼可能是本文所述的任何聚合物並且是本技藝中已知的。在額外的具體例中，聚合物殼可用於保護核中的多核苷酸。

在一些具體例中，這些自組裝奈米顆粒可以是由多核苷酸髮夾的長聚合物所形成的微海綿，多核苷酸髮夾在自組裝成微海綿之前形成結晶「褶皺」板。這些微海綿是密集堆積的海綿樣微粒，可作為有效的載體，並可將貨物運送到細胞。微海綿的直徑可為1 μm至300 nm。微海綿可與本技藝中已知的其他試劑複合以形成更大的微海綿。作為非限制性實例，微海綿可以與試劑複合以形成促進細胞攝取的外層，試劑為諸如聚陽離子聚乙烯亞胺(PEI)。這個複合物可以形成直徑為250 nm的顆粒，該顆粒在高溫下可保持穩定(150℃；Grabow and Jaegar, Nature Materials 2012, 11:269-269；以引用的方式併入本文)。此外，這些微海綿可能能夠展現出非凡的保護程度，防止被核糖核酸酶降解。在另一個具體例中，基於聚合物的自組裝奈米顆粒(諸如但不限於微海綿)可能是完全可程式化的奈米顆粒。可以精確控制奈米顆粒的幾何形狀、尺寸和化學計量，以創造出用於遞送貨物(諸如但不限於多核苷酸)的最佳奈米顆粒。

在一些具體例中，多核苷酸可以配製在無機奈米顆粒中(美國專利第8,257,745號，以全文引用的方式併入本文)。無機奈米顆粒可包括但不限於遇水可膨脹的黏土物質。作為非限制性實例，無機奈米顆粒可包括由簡單矽酸鹽製成的合成蒙脫石黏土(參見例如美國專利第5,585,108號和第8,257,745號，其各者以全文引用的方式併入本文)。

在一些具體例中，多核苷酸可以配製在包含半導體或金屬材料的水分散性奈米顆粒中(美國公開案第20120228565號；以全文引用的方式併入本文)，或在磁性奈米顆粒中形成(美國公開案第20120265001號和第20120283503號；其各者以全文引用的方式併入本文)。水分散性奈米顆粒可以是疏水性奈米顆粒或親水性奈米顆粒。

在一些具體例中，本文揭示之多核苷酸可被囊封至本技藝中已知的任何水凝膠中，其在注射到個體體內時可形成凝膠。水凝膠是一種親水性聚合物鏈網絡，且有時以水為分散介質的膠體凝膠形式存在。水凝膠是高吸水性(它們可能含有超過99%的水)的天然或合成聚合物。因為水凝膠含有大量的水，它們還具有一定程度的撓性，這與天然組織非常相似。本文所述之水凝膠可用於囊封可生物相容的、可生物降解的及/或多孔的脂質奈米顆粒。

作為非限制性實例，水凝膠可能是經適體功能化的水凝膠(aptamer-functionalized hydrogel)。可以使用多核苷酸雜交對經適體功能化的水凝膠進行程式化以釋放出一或多種多核苷酸。(Battig et al., J. Am. Chem. Society. 2012 134:12410-12413；以全文引用的方式併入本文)。在一些具體例中，多核苷酸可被囊封在脂質奈米顆粒中，而脂質奈米顆粒可囊封至水凝膠中。

在一些具體例中，本文揭示之多核苷酸可被囊封至纖維蛋白凝膠、纖維蛋白水凝膠或纖維蛋白膠中。在另一個具體例中，在被囊封至纖維蛋白凝膠、纖維蛋白水凝膠或纖維蛋白膠之前，多核苷酸可配製在脂質奈米顆粒或快速消除的脂質奈米顆粒中。在又另一個具體例中，在被囊封至纖維蛋白凝膠、纖維蛋白水凝膠或纖維蛋白膠中之前，多核苷酸可被配製為脂質複合物。纖維蛋白凝膠、水凝膠和膠包含兩種組分，即纖維蛋白原溶液和富含鈣的凝血酶溶液(參見例如Spicer and Mikos, Journal of Controlled Release (2010) 148: 49-55；Kidd et al. Journal of Controlled Release (2012) 157:80-85；其各自以全文引用的方式併入本文)。可以改變纖維蛋白凝膠、水凝膠及/或膠的組分的濃度以改變凝膠、水凝膠及/或膠的特徵、網絡網格尺寸及/或降解特徵，諸如但不僅限於改變纖維蛋白凝膠、水凝膠及/或膠的釋放特徵(參見例如Spicer and Mikos, Journal of Controlled Release 2010. 148: 49-55；Kidd et al. Journal of Controlled Release 2012. 157:80-85；Catelas et al. Tissue Engineering 2008. 14:119-128；其各自以全文引用的方式併入本文)。當用於遞送本文揭示之多核苷酸時，該特徵可能是有利的(參見例如Kidd et al. Journal of Controlled Release 2012. 157:80-85；Catelas et al. Tissue Engineering 2008. 14:119-128；其各自以全文引用的方式併入本文)。

在一些具體例中，本文揭示之多核苷酸可包括陽離子或陰離子。在一個具體例中，配製物包括金屬陽離子，諸如但不限於Zn2+、Ca2+、Cu2+、Mg+及其組合。作為非限制性實例，配製物可包括聚合物和與金屬陽離子複合的多核苷酸(參見例如美國專利第6,265,389號和第6,555,525號，其各自以全文引用的方式併入本文)。

在一些具體例中，多核苷酸可以配製在奈米顆粒及/或微粒中。這些奈米顆粒及/或微粒可以被模製成任何尺寸、形狀和化學性質。例如，奈米顆粒及/或微粒可以使用LIQUIDA TECHNOLOGIES.RTM的PRINT®技術(Morrisville, N.C.)製成。(參見例如國際公開第WO2007024323號；以全文引用的方式併入本文)。

在一些具體例中，本文揭示之多核苷酸可配製在Keystone Nano的NanoJackets and NanoLiposomes (State College, Pa.)中。NanoJackets由體內天然存在的化合物製成，包括鈣和磷酸鹽；它們還可能含有少量矽酸鹽。Nanojackets的尺寸範圍可以從5到50 nm，並且可用於遞送親水性和疏水性化合物，諸如但不限於多核苷酸、初級構建體及/或多核苷酸。NanoLiposomes由脂質製成，諸如但不限於體內天然存在的脂質。NanoLiposomes的尺寸範圍可為60-80 nm，並可用於遞送親水性和疏水性化合物，諸如但不限於多核苷酸、初級構建體及/或多核苷酸。在一個態樣中，本文揭示之多核苷酸配製在NanoLiposomes中，諸如但不限於Ceramide NanoLiposomes。

在一個具體例中，多結構域治療性蛋白是抗CD63 scFv-GAA融合蛋白或抗TfR scFv-GAA融合蛋白。在投與帶有多結構域治療性蛋白的基因治療載體後，經由AAV遞送來投與的抗CD63 scFv-GAA融合蛋白或抗TfR scFv-GAA融合蛋白在患者血清中長期穩定GAA生產。在一個具體例中，在投與帶有多結構域治療性蛋白之基因治療載體後1個月、3個月、4個月、5個月或6個月或更長時間後，受體患者血清中的GAA含量比接受未連接至遞送結構域之GAA的患者的血清含量高≧1.5倍至100倍、≧1.5倍至10倍、≧2.5倍、2.5倍至3倍、2.5倍、2.6倍、2.7倍、2.8倍、2.9倍、3.0倍、3.1倍、3.2倍、3.3倍、3.4倍、3.5倍、3.6倍、3.7倍、3.8倍、3.9倍、4倍、5倍、6倍、7倍、8倍、9倍或10倍。

經由AAV遞送來投與抗CD63 scFv-GAA融合蛋白或抗TfR scFv-GAA融合蛋白在龐貝氏症患者中長期穩定地降低貯積肝醣含量。在一個具體例中，患者心臟、骨骼肌和肝組織中的肝醣含量降低至野生型(非疾病)含量。在一個具體例中，在投與帶有多結構域治療性蛋白的基因治療載體後1個月、2個月、3個月、4個月、5個月或6個月或更長時間，患者心臟、骨骼肌和肝組織中的肝醣含量維持在野生型含量。

在一個具體例中，經由AAV遞送來投與抗CD63 scFv-GAA融合蛋白或抗TfR scFv-GAA融合蛋白為龐貝氏症患者長期恢復肌力。在一個具體例中，在投與帶有多結構域治療性蛋白的基因治療載體後1個月、2個月、3個月、4個月、5個月或6個月或更長時間，如藉由握力測量，患者的力量恢復到正常(即非疾病正常程度)。

在一個具體例中，經由AAV遞送來投與抗TfR scFv-GAA融合蛋白對GAA產生和腦部神經元、寡樹突細胞、小神經膠質細胞和星形細胞中的肝醣貯積有長期效用，並且恢復龐貝氏症患者的正常腦功能。在一個具體例中，這些效用(即非疾病正常程度)在投與帶有多結構域治療性蛋白之基因治療載體後持續1個月、2個月、3個月、4個月、5個月或6個月或更長時間。

在另一個態樣中，本發明提供包含酶活性和抗原結合蛋白的組成物，其中該酶與酶缺乏症(LSD)和內化效應子結合蛋白相關。與溶酶體貯積症相關的酶(其包括本身不具有催化作用的蛋白質)包括例如任何和所有水解酶、α-半乳糖苷酶、β-半乳糖苷酶、α-葡萄糖苷酶、β-葡萄糖苷酶、神經鞘脂質活化蛋白-C活化因子、神經醯胺酶、神經磷脂酶、β-己糖胺酶、GM2-活化因子、GM3合成酶、芳基硫酸酯酶、神經鞘脂質活化因子、α-艾杜糖醛酸苷酶、艾杜糖醛酸苷酶-2-硫酸酯酶、肝素 N-硫酸酯酶、 N-乙醯基-α-胺基葡萄糖苷酶、α-葡萄糖醯胺 N-乙醯基轉移酶、 N-乙醯基葡萄糖胺-6-硫酸酯酶、 N-乙醯基半乳糖胺-6-硫酸硫酸酯酶、 N-乙醯基半乳糖胺-4-硫酸酯酶、β-葡萄糖醛酸苷酶、透明質酸酶，以及類似者。

內化效應子結合蛋白(例如)包括受體融合分子、誘捕分子、受體-Fc融合分子、抗體、Fab片段、F(ab')2片段、Fd片段、Fv片段、單鏈Fv (scFv)分子、dAb片段、經分離的互補決定區(CDR)、CDR3肽、受限FR3-CDR3-FR4肽、結構域特異性抗體、單結構域抗體、結構域缺失抗體、嵌合抗體、CDR 移植抗體、雙抗體、三抗體、四抗體、微型抗體、奈米抗體、單價奈米抗體、二價奈米抗體、小型模組化免疫藥物(SMIP)、駱駝抗體(VHH重鏈同二聚體抗體)、鯊魚可變IgNAR結構域，其他抗原結合蛋白以及類似者。

內化效應子包括(例如) TfR、CD36、MCH-I、Kremen-1、Kremen-2、LRP5、LRP6、LRP8、LDL-受體、LDL相關蛋白1受體、ASGR1、ASGR2、澱粉樣前體蛋白樣蛋白2(APLP2)、愛帕琳肽受體(APLNR)、PRLR、MAL(髓磷脂和淋巴細胞蛋白，又名VIP17)、IGF2R、液泡型H+ ATP酶、白喉毒素受體、葉酸受體、麩胺酸受體、麩胺硫受體、瘦素受體、清道夫受體、SCARA1-5、SCARB1-3，以及CD36。在某些具體例中，內化效應子是腎臟特異性內化子，諸如CDH16(Cadheri-16)、CLDN16(Claudn-16)、KL(Klotho)、PTH1R(副甲狀腺素受體)、SLC22A13(溶質載體家族22成員13)、SLC5A2(鈉/葡萄糖同向轉運蛋白2)和UMOD(尿調節蛋白)。在其他某些具體例中，內化效應子是肌肉特異性內化子，諸如BMPR1A(骨成形性蛋白受體1A)、m-鈣黏蛋白、CD9、MuSK(肌肉特異性激酶)、LGR4/GPR48(G蛋白偶聯受體48)、膽鹼能受體(菸鹼)α1、CDH15(Cadheri-15)、ITGA7(整合素α-7)、CACNG1(L型鈣通道次單位γ-1)、CACNA15(L型鈣通道次單位α-15)、CACNG6(L型鈣通道次單位γ-6)、SCN1B(鈉通道次單位β-1)、CHRNA1(ACh受體次單位α)、CHRND(Ach受體次單位δ)、LRRC14B(含有富含白胺酸重複序列的蛋白14B)、營養不良聚醣(DAG1)和POPDC3(含Popeye結構域蛋白3)。在一些特定的具體例中，內化效應子是TfR、ITGA7、CD9、CD63、ALPL2、ASGR1、ASGR2或PRLR。

在一些具體例中，酶共價連接至抗原結合蛋白。在一個特定具體例中，內化效應子結合蛋白由半體組成，或包含半體；酶融合至Fc融合結構域(例如在C端處)；而共價連接至酶的Fc結構域與抗原結合蛋白的Fc結構域締合，使得締合含有一或多個雙硫鍵聯。圖1A小圖B中示意地描繪了該特定具體例。

在另一個特定的具體例中，內化效應子結合蛋白(遞送結構域)由抗體或抗體片段組成，或含有抗體或抗體片段，且酶共價連接至抗體或抗體片段。在一個特定具體例中，遞送結構域是抗體，而酶共價連接(直接透過肽鍵，或間接經由連接子)至抗體重鏈或輕鏈的C端(圖1A，分別為小圖C或E)。在另一個特定具體例中，遞送結構域是抗體，而酶共價連接(直接透過肽鍵，或間接經由連接子)至抗體重鏈或輕鏈的N端(圖1A，分別為小圖D或F)。

在一些具體例中，酶和遞送結構域並未共價連接，而是於混合物中合併。遞送結構域和酶可以透過非共價力締合而形成複合物。例如，在一個特定具體例中，遞送結構域是雙特異性抗體，其中抗體的一個臂結合內化效應子而另一個臂結合酶。圖1A小圖A中示意地描繪了這個具體例。

在一些具體例中，酶是GAA或包含GAA活性(例如具有GAA活性的同功酶)，而內化效應子是TfR、ITGA7、CDH15、CD9、CD63、APLP2、ASGR1、ASGR2或PRLR。在一個特定具體例中，酶是GAA或包含GAA活性，內化結構域是CD63，而遞送結構域是對CD63和GAA具有特異性的雙特異性抗體。在一個特定具體例中，酶是GAA或包含GAA活性，內化結構域是TfR，而遞送結構域是對TfR和GAA具有特異性的雙特異性抗體。

在一些具體例中，酶是GLA或包含GLA活性(例如具有GAA活性的同功酶)，而內化效應子是TfR、ITGA7、CD9、CD63、APLP2、ASGR1、ASGR2或PRLR。在一個特定具體例中，酶是GLA或包含GLA活性，內化結構域是CD63，而遞送結構域是對CD63和GLA具有特異性的雙特異性抗體。在一個特定具體例中，酶是GLA或包含GLA活性，內化結構域是TfR，而遞送結構域是對TfR和GLA具有特異性的雙特異性抗體。 醫藥組成物及其投與

醫藥調配物可額外包含醫藥上可接受的賦形劑，如本文所用，其包括任何和所有溶劑、分散介質、稀釋劑或其他液體媒液、分散或懸浮助劑、表面活性劑、等滲劑、增稠劑或乳化劑、防腐劑、固體黏合劑、潤滑劑，以及類似者，以適合所需的特定劑型。Remington's The Science and Practice of Pharmacy, 21.sup.st Edition, A. R. Gennaro (Lippincott, Williams & Wilkins, Baltimore, Md., 2006；以全文引用的方式併入本文)揭示用於配製醫藥組成物的各種賦形劑以及用於其製備的已知技術。除非任何常規賦形劑介質與物質或其衍生物不相容，諸如因為產生任何不樂見的生物學效用或以其他方式與醫藥組成物的任何其他成分以有害方式交互作用，否則預期其用途在本發明的範疇內。

在一些具體例中，醫藥上可接受的賦形劑是至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、至少99%或100%純的。在一些具體例中，賦形劑經核准用於人類和獸醫用途。在一些具體例中，賦形劑經美國食品和藥物管理局核准。在一些具體例中，賦形劑是醫藥級的。在一些具體例中，賦形劑符合美國藥典(USP)、歐洲藥典(EP)、英國藥典及/或國際藥典的標準。

用於製造醫藥組成物的醫藥上可接受的賦形劑包括但不限於惰性稀釋劑、分散劑及/或製粒劑、表面活性劑及/或乳化劑、崩解劑、黏合劑、防腐劑、緩衝劑、潤滑劑，及/或油。此等賦形劑可以視情況納入醫藥組成物中。

例示性稀釋劑包括但不限於碳酸鈣、碳酸鈉、磷酸鈣、磷酸氫鈣(dicalcium phosphate)、硫酸鈣、磷酸氫鈣(calcium hydrogen phosphate)、磷酸鈉、乳糖、蔗糖、纖維素、微晶纖維素、高嶺土、甘露糖醇、山梨糖醇、肌醇、氯化鈉、乾澱粉、玉米澱粉、糖粉等，及/或其組合。

例示性製粒劑及/或分散劑包括但不限於馬鈴薯澱粉、玉米澱粉、木薯澱粉、羥乙酸澱粉鈉、黏土、海藻酸、瓜爾膠、柑橘果肉、瓊脂、膨潤土、纖維素和木製品、天然海綿、陽離子交換樹脂、碳酸鈣、矽酸鹽、碳酸鈉、交聯聚(乙烯基吡咯啶酮) (交聚維酮)、羧甲基澱粉鈉(羥乙酸澱粉鈉)、羧甲基纖維素、交聯羧甲基纖維素鈉(交聯羧甲基纖維素(croscarmellose))、甲基纖維素、預糊化澱粉(澱粉1500)、微晶澱粉、水不溶性澱粉、羧甲基纖維素鈣、矽酸鎂鋁(VEEGUM®)、月桂基硫酸鈉、四級銨化合物等，及/或其組合。

例示性表面活性劑及/或乳化劑包括但不限於天然乳化劑(例如阿拉伯膠、瓊脂、海藻酸、海藻酸鈉、黃耆膠、克羅珠克(chondrux)、膽固醇、黃原膠、果膠、明膠、蛋黃、酪蛋白、羊毛脂、膽固醇、蠟和卵磷脂)、膠體黏土(例如膨潤土[矽酸鋁]和VEEGUM® [矽酸鎂鋁])、長鏈胺基酸衍生物、高分子量醇(例如硬脂醇、鯨蠟醇、油醇、三醋精單硬脂酸酯、乙二醇二硬脂酸酯、單硬脂酸甘油酯和丙二醇單硬脂酸酯、聚乙烯醇)、卡波姆(carbomer) (例如羧基聚甲烯、聚丙烯酸、丙烯酸聚合物和羧乙烯基聚合物)、角叉菜膠、纖維素衍生物(例如羧甲基纖維素鈉、粉狀纖維素、羥甲基纖維素、羥丙基纖維素、羥丙基甲基纖維素、甲基纖維素)、去水山梨糖醇脂肪酸酯(例如聚氧乙烯去水山梨糖醇單月桂酸酯[TWEEN® 20]、聚氧乙烯去水山梨糖醇[TWEEN® 60]、聚氧乙烯去水山梨糖醇單油酸酯[TWEEN® 80]、去水山梨糖醇單棕櫚酸酯[SPAN® 40]、去水山梨糖醇單硬脂酸酯[SPAN® 60]、去水山梨糖醇三硬脂酸酯[SPAN® 65]、單油酸甘油酯、去水山梨糖醇單油酸酯[SPAN® 80])、聚氧乙烯酯(例如聚氧乙烯單硬脂酸酯[MYRJ® 45]、聚氧乙烯氫化蓖麻油、聚乙氧基化蓖麻油、聚甲醛硬脂酸酯和SOLUTOL®)、蔗醣脂肪酸酯、聚乙二醇脂肪酸酯(例如CREMOPHOR®)、聚氧乙烯醚(例如聚氧乙烯月桂基醚[BRIJ® 30])、聚(乙烯基吡咯啶酮)、單月桂酸二甘酯、三乙醇胺油酸酯、油酸鈉、油酸鉀、油酸乙酯、油酸、月桂酸乙酯、月桂基硫酸鈉、PLUORINC® F 68、POLOXAMER® 188、西曲溴銨(cetrimonium bromide)、西吡氯銨(cetylpyridinium chloride)、苯扎氯銨(benzalkonium chloride)、多庫酯鈉(docusate sodium)等，及/或其組合。

例示性黏合劑包括但不限於澱粉(例如，玉米澱粉和澱粉糊)；明膠；糖類(例如蔗糖、葡萄糖、葡萄糖(dextrose)、糊精、糖蜜、乳糖、乳糖醇、甘露糖醇)；天然與合成樹膠(例如阿拉伯膠、海藻酸鈉、愛爾蘭苔蘚萃取物、潘瓦爾膠(panwar gum)、甘地膠(ghatti gum)、洋車前子黏質、羧甲基纖維素、甲基纖維素、乙基纖維素、羥乙基纖維素、羥丙基纖維素、羥丙基甲基纖維素、微晶纖維素、乙酸纖維素、聚(乙烯基吡咯啶酮)、矽酸鎂鋁(Veegum®)和落葉松阿拉伯半乳聚醣)；海藻酸鹽；聚環氧乙烷；聚乙二醇；無機鈣鹽；矽酸；聚甲基丙烯酸酯；蠟；水；醇；等等；及其組合。

例示性防腐劑可包括但不限於抗氧化劑、螯合劑、抗微生物防腐劑、抗真菌防腐劑、醇類防腐劑、酸性防腐劑及/或其他防腐劑。例示性抗氧化劑包括但不限於α生育酚、抗壞血酸、抗壞血酸棕櫚酸酯、丁基化羥基甲苯醚、丁基化羥基甲苯、單硫代甘油、偏二亞硫酸鉀、丙酸、沒食子酸丙酯、抗壞血酸鈉、硫酸氫鈉、偏二亞硫酸鈉及/或亞硫酸鈉。例示性螯合劑包括乙二胺四乙酸(EDTA)、檸檬酸單水合物、依地酸二鈉、依地酸二鉀、依地酸、富馬酸、蘋果酸、磷酸、依地酸鈉、酒石酸及/或依地酸三鈉。例示性抗微生物防腐劑包括但不限於苯扎氯銨、芐索氯銨、苯甲醇、溴硝醇(bronopol)、西曲亞胺(cetrimide)、西吡氯銨、氯己定(chlorhexidine)、氯丁醇、氯甲酚、氯二甲苯酚、甲酚、乙醇、甘油、己替丁(hexetidine)、亞胺脲、苯酚、苯氧乙醇、苯乙醇、硝酸苯汞、丙二醇及/或硫柳汞。例示性抗真菌防腐劑包括但不限於對羥基苯甲酸丁酯、對羥基苯甲酸甲酯、對羥基苯甲酸乙酯、對羥基苯甲酸丙酯、苯甲酸、羥基苯甲酸、苯甲酸鉀、山梨酸鉀、苯甲酸鈉、丙酸鈉及/或山梨酸。例示性醇類防腐劑包括但不限於乙醇、聚乙二醇、苯酚、酚類化合物、雙酚、氯丁醇、羥基苯甲酸酯及/或苯乙醇。例示性酸性防腐劑包括但不限於維生素A、維生素C、維生素E、β-胡蘿蔔素、檸檬酸、乙酸、去氫乙酸、抗壞血酸、山梨酸及/或植酸。其他防腐劑包括但不限於生育酚、生育酚乙酸酯、甲磺酸去氧肟、西曲亞胺、丁基化羥基甲苯醚(BHA)、丁基化羥基甲苯(BHT)、乙二胺、月桂基硫酸鈉(SLS)、月桂基醚硫酸鈉(SLES)、亞硫酸氫鈉、偏二亞硫酸鈉、亞硫酸鉀、偏二亞硫酸鉀、GLYDANT PLUS®、PHENONIP®、對羥基苯甲酸甲酯、GERMALL® 115、GERMABEN® II、NEOLONE ^TM、KATHON ^TM及/或EUXYL®。

例示性緩衝劑包括但不限於檸檬酸鹽緩衝溶液、乙酸鹽緩衝溶液、磷酸鹽緩衝溶液、氯化銨、碳酸鈣、氯化鈣、檸檬酸鈣、葡乳醛酸鈣、葡庚酸鈣、葡萄糖酸鈣、D-葡萄糖酸、甘油磷酸鈣、乳酸鈣、丙酸、乙醯基丙酸鈣、戊酸、磷酸氫鈣、磷酸、磷酸鈣、磷酸三鈣、乙酸鉀、氯化鉀、葡萄糖酸鉀、鉀混合物、磷酸氫二鉀、磷酸二氫鉀、磷酸鉀混合物、乙酸鈉、碳酸氫鈉、氯化鈉、檸檬酸鈉、乳酸鈉、磷酸氫二鈉、磷酸二氫鈉、磷酸鈉混合物、三木甲胺、氫氧化鎂、氫氧化鋁、海藻酸、無熱原水、等滲鹽水、林格氏溶液、乙醇等，及/或其組合。

例示性潤滑劑包括但不限於硬脂酸鎂、硬脂酸鈣、硬脂酸、二氧化矽、滑石、麥芽、二十二酸甘油酯、氫化植物油、聚乙二醇、苯甲酸鈉、乙酸鈉、氯化鈉、白胺酸、月桂基硫酸鎂、月桂基硫酸鈉等，及其組合。

例示性油包括但不限於杏仁(almond)、杏仁(apricot kernel)、酪梨、棕櫚仁、佛手柑、黑醋栗、琉璃苣、杜松子、洋甘菊、油菜籽、葛縷籽、巴西棕櫚、蓖麻、肉桂、可可脂、椰子、魚肝、咖啡、玉米、棉籽、鴯鶓(emu)、桉樹、月見草、魚、亞麻仁、香葉醇、葫蘆、葡萄籽、榛子、牛膝草、肉荳蔻酸異丙酯、荷荷巴、夏威夷胡桃、薰衣草、薰衣草、檸檬、山蒼子、夏威夷豆、錦葵、芒果籽、白芒花籽、貂、肉荳蔻、橄欖、橙、深海橘鯛(orange roughy)、棕櫚、棕櫚仁、桃仁、花生、罌粟籽、南瓜籽、油菜籽、米糠、迷迭香、紅花、檀香、茶梅(sasquana)、香薄荷、海沙棘、芝麻、乳木果油、矽膠、大豆、向日葵、茶樹、薊、椿、岩蘭草、核桃和小麥胚芽油。例示性油包括但不限於硬脂酸丁酯、辛酸甘油三酯、癸酸甘油三酯、環二甲基矽氧烷、癸二酸二乙酯、二甲基矽氧烷360、肉荳蔻酸異丙酯、礦物油、辛基十二烷醇、油醇、矽油，及/或其組合。

根據調配者的判斷，組成物中可以存在賦形劑(諸如可可脂)和栓劑蠟、著色劑、包衣劑、甜味劑、調味劑，及/或芳香劑。 遞送

在考慮到藥物遞送科學中可能進展的情況下，本發明含括藉由任何適當的路徑遞送基因治療載體(例如多核苷酸)。遞送可能是裸露的或經調配的。 裸露遞送

本發明的多核苷酸可以裸露地遞送至細胞。如本文所用，「裸露」是指遞送不含促進轉染的試劑的多核苷酸。例如，被遞送至細胞的多核苷酸可能不含修飾。可以使用本技藝中已知的和本文描述的投藥路徑將裸露的多核苷酸遞送至細胞。 調配遞送

可以使用本文所述之方法配製多核苷酸。配製物可含有多核苷酸並且可進一步包括(但不限於)細胞滲透劑、醫藥上可接受的載劑、遞送劑、生物可侵蝕的或生物可相容的聚合物、溶劑和持續釋放遞送儲庫。經配製的多核苷酸mRNA可以使用本技藝中已知和本文所述的投藥路徑被遞送至細胞。 投與

本發明的多核苷酸可以藉由造成治療有效結果的任何路徑投與。這些包括但不限於經腸、胃腸、硬膜外、經口、經皮、硬膜外(硬膜外)、腦內(進入大腦)、腦室內(進入腦室)、表皮(施用於皮膚上)、皮內(進入皮膚本身)、皮下(皮膚下)、經鼻投藥(通過鼻子)、靜脈內(進入靜脈)、動脈內(進入動脈)、肌肉內(進入肌肉)、心內(進入心臟)、骨內輸注(進入骨髓)、鞘內(進入椎管)、腹膜內(輸注或注射到腹膜中)、膀胱內輸注、玻璃體內(通過眼睛)、海綿體內注射(進入陰莖根部)、陰道內投藥、子宮內、羊膜外投藥、經皮(擴散通過完整皮膚用於全身分佈)、經黏膜(擴散通過黏膜)、吹氣(鼻吸)、舌下、唇下、灌腸、點眼劑(到結膜上)或滴耳劑。在特定的具體例中，組成物可以按照允許它們穿過血腦屏障、血管屏障或其他上皮屏障的方式投與。下面描述了本發明的多核苷酸、初級構建體或mRNA的非限制性投與路徑。 非經腸以及注射劑 (injectable) 投與

用於非經腸投與的液體劑型包括但不限於醫藥上可接受的乳劑、微乳劑、溶液、懸浮液、糖漿劑及/或酏劑。除了活性成分之外，液體劑型可包含本技藝中常用的惰性稀釋劑，諸如例如水或其他溶劑、增溶劑和乳化劑，諸如乙醇、異丙醇、碳酸乙酯、乙酸乙酯、苯甲醇，苯甲酸苯甲酯、丙二醇、1,3-丁二醇、二甲基甲醯胺、油類(特別是但不限於棉籽油、花生油、玉米油、胚芽油、橄欖油、蓖麻油和芝麻油)、甘油、四氫糠醇、聚乙二醇和去水山梨糖醇脂肪酸酯，及其混合物。除了惰性稀釋劑之外，口服組成物還可以包括佐劑，諸如潤濕劑、乳化劑和懸浮劑、甜味劑、調味劑及/或芳香劑。在用於非經腸投與的某些具體例中，將組成物與增溶劑(諸如如CREMOPHOR®、醇、油、經改質油、二醇、聚山梨糖醇酯、環糊精、聚合物，及/或其組合)混合。

可注射製劑(例如無菌可注射水性或油性懸浮液)可根據已知技術使用合適的分散劑、潤濕劑及/或懸浮劑配製。無菌可注射製劑可以是在無毒非經腸可接受的稀釋劑及/或溶劑中的無菌可注射溶液、懸浮液及/或乳劑，例如在1,3-丁二醇中的溶液。可以採用的可接受媒液和溶劑為水、林格氏溶液、U.S.P.和等滲氯化鈉溶液。無菌的不揮發油通常用作為溶劑或懸浮介質。為此，可以使用任何溫和的不揮發油，包括合成甘油單酯或甘油二酯。脂肪酸(諸如油酸)可用於製備注射劑。

可注射配製物可以是經滅菌的，例如藉由通過細菌截留過濾器進行過濾，及/或藉由摻入呈無菌固體組成物形式的滅菌劑，其可以在使用前溶解或分散在無菌水或其他無菌可注射介質中。

為了延長活性成分的作用，活性成分通常需要減緩皮下或肌肉注射的吸收。這可以透過使用水溶解度不佳的結晶或無定形材料的液體懸浮液來實現。藥物的吸收速率則取決於其溶解速率，而溶解速率復而可能取決於晶體大小和結晶形式。或者，非經腸投與的藥物形式的延遲吸收是藉由將藥物溶解或懸浮在油媒液中來實現的。可注射儲庫形式是透過在生物可降解的聚合物(諸如聚乳酸-聚甘胺酸交酯)中形成藥物的微囊化基質來製造的。根據藥物與聚合物的比例和所採用特定聚合物的性質，可以控制藥物釋放的速率。其他生物可降解聚合物的實例包括聚(原酸酯)和聚(酸酐)。藉由將藥物包埋在與身體組織相容的脂質體或微乳劑中來製備儲庫可注射調配物。 儲庫投與

如本文所述，在一些具體例中，組成物被配製成儲庫以用於延長釋放。通常，靶向特定器官或組織(「目標組織」)供進行投藥。

在本發明的一些態樣中，多核苷酸在空間上維持在目標組織內或靠近目標組織。藉由令目標組織(其含有一或多種目標細胞)與組成物在使得組成物(特別是組成物的核酸組分)基本上滯留在目標組織內的條件下接觸，提供向哺乳動物個體的目標組織供給組成物的方法，意味著至少10、20、30、40、50、60、70、80、85、90、95、96、97、98、99、99.9、99.99或大於99.99%的組成物滯留在目標組織內。有利地，滯留是藉由測量存在於進入一或多個目標細胞的組成物中的核酸量來決定。例如，被投與給個體的至少1、5、10、20、30、40、50、60、70、80、85、90、95、96、97、98、99、99.9、99.99或大於99.99%的核酸在投藥後一段時間存在於細胞內。例如，使用含有多核苷酸和轉染試劑的水性組成物對哺乳動物個體進行肌肉內注射，並且藉由測量肌肉細胞內存在的核糖核酸量來決定組成物的滯留。

本發明的態樣是有關向哺乳動物個體的目標組織提供組成物的方法，其藉由令目標組織(其含有一或多種目標細胞)與組成物在使得組成物基本上滯留在目標組織內的條件下接觸。該組成物包含有效量的多核苷酸，使得感興趣的多肽在至少一種目標細胞中被產生。組成物通常含有細胞滲透劑，儘管也考慮了「裸露」核酸(諸如沒有細胞滲透劑或其他試劑的核酸)，以及醫藥上可接受的載劑。

在一些情況下，希望在組織中增加細胞所產生的蛋白質數量。較佳地，這種蛋白質生產的增加在空間上僅限於目標組織內的細胞。因此，提供了在哺乳動物個體組織中增加感興趣蛋白質生產的方法。提供含有多核苷酸的組成物，其特徵在於已確定單位量的組成物在目標組織的預定體積內所含的相當大百分比細胞中生產感興趣的多肽。

在一些具體例中，組成物包括多種不同的多核苷酸，其中一種或超過一種的多核苷酸編碼感興趣的多肽。視情況，組成物還含有細胞滲透劑以輔助組成物的細胞內遞送。確定在目標組織的預定體積內所含的相當大百分比細胞中生產感興趣多肽所需的組成物劑量(通常，在鄰近預定體積的組織中或在目標組織遠處並未誘導感興趣多肽的顯著生產)。在這樣確定之後，將確定的劑量直接引入哺乳動物個體的組織中。

在一個具體例中，本發明提供多核苷酸以注射超過一次或分次劑量注射遞送。

在一個具體例中，本發明可以使用小型拋棄式藥物儲器、貼片泵或滲透泵而滯留在目標組織附近。貼片泵的非限制性實例包括那些由BD® (Franklin Lakes, N.J.)、Insulet Corporation (Bedford, Mass.)、SteadyMed Therapeutics (San Francisco, Calif.)、Medtronic (Minneapolis, Minn.) (例如MiniMed)、UniLife (York, Pa.)、Valeritas (Bridgewater, N.J.)以及SpringLeaf Therapeutics (Boston, Mass.)所製造及/或販售者。滲透泵的非限制性實例包括那些由DURECT® (Cupertino, Calif.) (例如DUROS® and ALZET®)所製造者。 給藥

本發明提供的方法包含向有需要的個體投與含有編碼多結構域治療性多肽的多核苷酸之基因治療載體和視情況隨後多結構域治療性多肽。在一些具體例中，方法包含以治療有效量向有需要的患者投與包含編碼多結構域治療性多肽的多核苷酸的基因治療載體，其中治療有效量足夠隨後不必要投與多結構域治療性多肽。因此，在一些具體例中，治療有需要的缺乏酶的患者的方法(例如降低龐貝氏症患者的肝醣含量及/或將CRIM降低至GAA)包含以治療有效量向患者投與包含編碼含有替代酶的多結構域治療性蛋白(例如抗TFRCscFv:GAA融合蛋白，例如包含如SEQ ID NO：11所示序列的多結構域治療性蛋白)之多核苷酸的基因治療載體，其中治療有效量之後不需要向患者投與替代酶，例如GAA或其衍生物。在一些具體例中，治療缺乏酶且有需要的患者的方法(例如降低龐貝氏症患者的肝醣含量及/或將CRIM降低至GAA)包含以治療有效量向患者投與包含編碼含有替代酶的多結構域治療性蛋白(例如抗TFRCscFv:GAA融合蛋白，例如包含如SEQ ID NO：11所示序列的多結構域治療性蛋白)之多核苷酸的基因治療載體，並且進一步包含向患者投與治療有效量的替代酶。核酸、蛋白質或複合物，或其醫藥、成像、診斷或預防組成物可以使用任何量和任何投與路徑被投與給個體以有效預防、治療、診斷或成像疾病、病症及/或病況(例如，與工作記憶缺陷有關的疾病、病症及/或病況)。

所需的確切量將因個體而異，這取決於個體的物種、年齡和一般狀況、疾病的嚴重程度、特定組成物、其投藥模式、其活性模式與類似因素。

達到預期效用或「治療效用」(例如，替代酶的某個血清濃度)所需的AAV病毒載體劑量(例如，以載體基因組/每千克體重(vg/kg)計的劑量單位)將根據若干因素而有所不同，包括但不限於：AAV投與路徑、達到治療效用所需的表現量、正在治療的特定疾病或病症，以及多結構域治療性蛋白的表現穩定性。基於上述因素以及本技藝中周知的其他因素，習於技藝者可以容易地確定AAV病毒體劑量範圍以治療患有特定疾病或病症的個體，參見例如CDER “Guidance for Industry Estimating the Maximum Safe Starting Dose in Initial Clinical Trials for Therapeutics in Adult Healthy Volunteers,” July 2005，以全文引用的方式併入本文。AAV的有效量通常在約10 μl至約100 ml溶液含有約10 ⁹至10 ¹⁶個基因組複本/個體的範圍內。可以使用其他體積的溶液。使用的體積通常取決於個體的身材、AAV的劑量和投與路徑。在一些具體例中，約10 ¹⁰至10 ¹²個AAV病毒基因組/個體之間的劑量是合適的。在一些具體例中，以10 ¹⁰、10 ¹¹、10 ¹²、10 ¹³、10 ¹⁴或10 ¹⁵個基因組複本/個體的劑量投與AAV。在一些具體例中，以10 ¹⁰、10 ¹¹、10 ¹²、10 ¹³或10 ¹⁴個基因組/kg的劑量投與AAV。在一些具體例中，投與至少2×10 ¹²個病毒基因組/千克(vg/kg)。在一些具體例中，投與的劑量提供閾值多結構域治療性蛋白血清含量。在一些具體例中，閾值治療性蛋白血清含量為至少0.5 μg/mL。在一些具體例中，閾值治療性蛋白血清含量為至少1 μg/mL。在一些具體例中，投與的劑量提供大於2 μg/mL的多結構域治療性蛋白血清含量。在一些具體例中，投與的劑量提供大於3 μg/mL的多結構域治療性蛋白血清含量。在一些具體例中，投與的劑量提供大於4 μg/mL的多結構域治療性蛋白血清含量。在一些具體例中，投與的劑量提供大於5 μg/mL的多結構域治療性蛋白血清含量。在一些具體例中，投與的劑量提供大於6 μg/mL的多結構域治療性蛋白血清含量。在一些具體例中，投與的劑量提供大於7 μg/mL的多結構域治療性蛋白血清含量。在一些具體例中，投與的劑量提供大於8 μg/mL的多結構域治療性蛋白血清含量。在一些具體例中，投與的劑量提供大於9 μg/mL的多結構域治療性蛋白血清含量。在一些具體例中，投與的劑量提供大於10 μg/mL的多結構域治療性蛋白血清含量。在一些具體例中，投與的劑量提供大於11 μg/mL的多結構域治療性蛋白血清含量。在一些具體例中，投與的劑量提供大於12 μg/mL的多結構域治療性蛋白血清含量。在一些具體例中，投與的劑量提供大於13 μg/mL的多結構域治療性蛋白血清含量。在一些具體例中，投與的劑量提供大於14 μg/mL的多結構域治療性蛋白血清含量。在一些具體例中，投與的劑量提供大於15 μg/mL的多結構域治療性蛋白血清含量。

根據本發明的組成物通常以劑量單位形式調配以便於投與和劑量均一性。然而應當理解，本發明組成物的每日總用量可在合理的醫學判斷範圍內由主治醫師決定。任何特定患者的具體治療有效、預防有效或適當的成像劑量含量將取決於多種因素，包括正在治療的病症和病症的嚴重程度；採用特定化合物的活性；採用的具體組成；患者的年齡、體重、一般健康狀況、性別和飲食；採用特定化合物的投與時間、投與路徑和排泄率；治療的持續時間；與採用特定化合物組合使用或同時使用的藥物；以及醫學領域眾所周知的類似因素。

提供以下實例以進一步說明本發明的方法。這些實例僅是說明性的，並不希望以任何方式限制本發明的範疇。 在序列表中的序列之簡要描述

SEQ ID NO ：	描述
1	人類α葡萄糖苷酶(GAA)蛋白
2	抗人類CD63 scFv蛋白
3	正向ITR引子
4	反向ITR引子
5	AAV2 ITR探針
6	5’ AAV ITR
7	3’ AAV ITR
8	TTR啟動子
9	Serpin1
10	抗hCD63scFv::hGAA融合蛋白
11	抗TFRC scFv:GAA融合蛋白
12	編碼α葡萄糖苷酶(GAA)的人類核酸
13	人類α半乳糖苷酶(GAA)
14	AAV8抗(α)TFRCscfv:GAA質體序列
15	8D3的HCVR胺基酸序列
16	8D3的HCDR1胺基酸序列
17	8D3的HCDR2胺基酸序列
18	8D3的HCDR3胺基酸序列
19	8D3的LCVR胺基酸序列
20	8D3的LCDR1胺基酸序列
21	8D3的LCDR2胺基酸序列
22	8D3的LCDR3胺基酸序列
23	8D3 scFv胺基酸序列

實例 實例 1 ： α TFRCscfv:GAA 劑量反應研究

為了確定αTFRCscfv:GAA在小鼠體內所需的最小AAV劑量，並確定肝醣清除時是否有劑量-反應關係，進行了以下實驗。針對CD63基因進行人源化的 Gaa-/-小鼠經由尾靜脈注射在TTR啟動子的情況下表現抗TFRCscfv:GAA的AAV8。抗TfR抗體是抗小鼠比較純系8D3。GAA是人類蛋白質。病毒劑量是藉由ddPCR確定；指示劑量範圍從2.5e8vg/kg到4e11vg/kg。小鼠在三個月大時接受治療，並在注射後四週時收取。每組N = 4至7隻動物。藉由qPCR分析測量肝臟中hGAA DNA和RNA表現的量化。 圖 8顯示肝臟hGAA DNA的結果，表明hGAA DNA的相對量與最高病毒劑量的量有關。

使用抗hGAA西方墨點法完成進一步的組織分析( 圖 9)。圖9顯示了在這些實驗中所測試的各個劑量結果。腦中( 圖 10)和肌肉組織中( 圖 11)的肝醣量化是使用Glycogen Assay Kit Sigma MAK016(螢光分析)測量的。兩個圖都證明，抗TFRCscfv:GAA使大腦和小腦中( 圖 10)以及心臟和骨骼肌組織中( 圖 11)的肝醣降至接近野生型的量。 實例 2 ： α TFRCscfv:GAA 在腦部中對肝醣含量的影響

為了比較經表現αTfRscfv:GAA、αCD63scfv:GAA和GAA的AAV8治療的小鼠腦部中的肝醣含量，進行以下實驗。針對CD63基因進行人源化的 Gaa-/-小鼠經由尾靜脈注射在TTR啟動子的情況下表現αTfRscfv:GAA、αCD63scfv:GAA和GAA的AAV8。抗TfR抗體是抗小鼠比較純系8D3。抗CD63是抗人類純系12450。GAA是人類蛋白質。病毒劑量是藉由ddPCR確定；以4e11vg/kg向小鼠給藥。小鼠在三個月大時接受治療，並在注射後四週時收取。每組N = 6-10隻動物。藉由qPCR分析測量肝臟中hGAA DNA和RNA表現的量化。圖2顯示肝臟hGAA RNA的結果，表明hGAA RNA的相對量與用 Gaa-/-AAV8 GAA表現的量相關。

使用抗hGAA西方墨點法完成組織分析( 圖 3)。圖3顯示在4e11vg/kg的劑量下，經在TTR啟動子的情況下表現GAA、αCD63scfv:GAA或αTFRCscfv:GAA的AAV8治療的 Gaa-/-小鼠的若干種組織類型的結果。墨點探測了hGAA。每條泳道都是一隻單獨的小鼠。

圖 4顯示對圖3西方墨點法的血清GAA的量化分析。 圖 5顯示對圖3西方墨點法的大腦GAA的量化。量化採用任意單位，相對經AAV8 GAA治療進行常規化。

CNS中(檢查大腦、小腦和脊髓組織； 圖 6)以及心臟和骨骼肌組織中( 圖 7)的肝醣量化是使用Glycogen Assay Kit Sigma MAK016(螢光分析)測量的。 圖 6顯示αTFRCscfv:GAA在測量CNS組織(大腦、小腦和脊髓)中單獨將肝醣含量降低至接近野生型含量。 圖 7顯示αCD63scfv:GAA和αTFRCscfv:GAA在心臟和骨骼肌組織中都會降低肝醣含量。 實例 3 ：免疫螢光成像研究

為了證明αTFRCscfv:GAA被遞送到腦部中的相關細胞類型，而不是被留置在BBB內皮細胞中，進行了以下實驗和數據分析。針對CD63基因進行人源化的 Gaa-/-小鼠經由尾靜脈注射在TTR啟動子的情形下表現抗TFRCscfv:GAA的AAV8。抗TfR抗體是抗小鼠比較純系8D3。GAA是人類蛋白質。病毒劑量是藉由ddPCR確定；劑量為3.25e12vg/kg。小鼠在三個月大時接受治療，並在注射後四週時收取。每組N = 3至4隻動物

收取和免疫螢光染色如下進行：犧牲小鼠、灌注，並將大腦的冠狀切片製備為在載玻片上經福馬林固定經石蠟包埋(FFPE)。抗原修復是使用鹼性HIER(熱誘導表位修復)。切片用抗hGAA抗體染色，並針對內皮細胞標記物ZO-1、神經元標記NeuN或寡樹突細胞標記Olig2進行共染色。用於分析的抗體：兔抗GAA R&D systems MAB83291(綠色)；小鼠抗Zo-1 Millipore(紅色)；小鼠抗NeuN Millipore MAB377(紅色)；小鼠抗Olig2 Millipore MABN50(紅色)；和DAPI核標記(藍色)。 圖 12顯示了實驗腦部切片的免疫螢光染色。這些免疫螢光調查結果證實，αTFRCscfv:GAA被遞送到腦部中的相關細胞類型(即神經元和寡樹突細胞)，而不是繼續被留置在BBB的內皮細胞中。 實例 4 ： GAA 活性的量化

為了確定經純化的hGAA蛋白(購自R&D Systems)和經內部純化的αTFRCscfv:GAA的GAA活性的量化，如下進行分析。用螢光基質4-甲基繖形酮-α-D-吡喃葡萄糖苷分析蛋白質的GAA活性。4-甲基繖形酮用作為標準品。經純化的蛋白質GAA活性使用商業螢光分析套組(K187, BioVision, Milpitas, CA, USA)。GAA活性計算為每小時每奈莫耳蛋白質所水解的4-甲基繖形酮-α-D-吡喃葡萄糖苷的奈莫耳數。如 圖 15中所示，αTFRCscfv:GAA展現出與經純化GAA蛋白相似的活性。 實例 5 ：透過成像對腦部的溶酶體面積進行量化

為了確定海馬迴與橫紋肌中的溶酶體面積百分比，面積分率以及積分密度，小鼠經由尾靜脈注射在TTR啟動子的情況下表現抗TFRCscfv: GAA的AAV8。4週後，犧牲小鼠、灌注，並將大腦的冠狀切片製備為在載玻片上經福馬林固定經石蠟包埋樣品。對載玻片進行去石蠟處理，然後對抗體進行染色以對溶酶體和GAA進行成像。關於抗體染色，載玻片用含有0.1% Tx-100和10%正常山羊血清的tris緩衝鹽水阻斷。隨後用大鼠抗Lamp1 1D4B (ab25245, Abcam, Cambridge, MA, USA)和兔抗GAA (MAB83291, R&D systems, Minneapolis, MN, USA)將它們染色，分別標記海馬迴和橫紋肌中的溶酶體和GAA分佈。隨後用二級抗體山羊抗大鼠Alexa568和抗小鼠Alexa488(Thermo Fisher, Waltham, MA, USA)對載玻片進行染色，封片在具有DAPI的Fluoromount-G (Thermo Fisher, Waltham, MA, USA)中，並用Zeiss LSM 710成像。

用ImageJ軟體對影像進行量化。為了測量Lamp1陽性顆粒的溶酶體面積、面積分率和積分密度，每組分析了3-8個影像。總溶酶體面積被確定為Lamp1陽性總面積佔影像總面積的百分比(%)。Lamp1陽性顆粒的積分密度是神經元區域內染色的平均密度和Lamp1陽性總面積的乘積。將結果與檢查野生型小鼠和 GAA ^-/ 未經治療小鼠溶酶體面積的平行實驗進行比較。研究證明，在AAV8抗TfRC:GAA治療後，海馬迴和橫紋肌中的溶酶體面積、面積分率和積分密度均降低了。經治療的GAA-/-小鼠橫紋肌中的Lamp1陽性顆粒的所有參數均接近野生型程度。

實例 6 ：藉由成像對腦部的肝醣貯積進行量化

為了確定大腦神經元區域中的肝醣儲存百分比，小鼠經由尾靜脈注射在TTR啟動子的情況下表現抗TFRCscfv:GAA的AAV8。4週後，犧牲小鼠、灌注，並將大腦的冠狀切片製備為在載玻片上經福馬林固定經石蠟包埋的樣品。對載玻片進行去石蠟處理，然後針對PAS-H進行染色(Epredia™ 87007套組，Sigma Aldrich)以偵測肝醣。然後將蓋玻片蓋到載玻片上並在Ventana載玻片掃描儀(Roche)上掃描。

關於PAS-H染色，藉由形態學識別神經元並在HALO軟體中標記。每個區域描繪了二十個神經元，並在這個區域內量化經PAS染色區域。將結果與檢查野生型、 GAA ^-/- 未經治療和AAV8抗CD63:GAA治療時的肝醣貯積的平行實驗進行比較。研究證明，在AAV8抗TFRCscfv:GAA治療後，神經元中的肝醣貯積減少，接近野生型程度。

在不受到任何一種理論囿限的情況下，如 圖 6所示，AAV8抗TFRCscfv:GAA治療在腦組織中的效用是抗TFRCscfv:GAA通過內皮細胞穿過血腦屏障的結果，如示意性地描繪在 圖 13中。此外，治療性蛋白到達神經元和寡樹突細胞，如依據例如免疫螢光研究所證明的( 圖 12)。

無

圖 1A示意地呈現多結構域治療性蛋白。小圖A描繪了包含雙特異性抗體(ii)和替代酶(i)的多結構域治療性蛋白。小圖B描繪了酶-Fc融合多肽(i)與內化效應子特異性半體(ii)締合而形成多結構域治療性蛋白。小圖C描繪了與抗內化效應子抗體重鏈C端共價連接的替代酶(六邊形)。小圖D描繪了與抗內化效應子抗體重鏈N端共價連接的替代酶(六邊形)。小圖E描繪了與抗內化效應子抗體輕鏈C端共價連接的替代酶(六邊形)。小圖F描繪了與抗內化效應子抗體輕鏈N端共價連接的替代酶(六邊形)。小圖G描繪了與含有VH區(陰影條)和VL區(空心條)的單鏈可變片段(scFv)的C端共價連接的替代酶(六邊形)。小圖H描繪了與兩個scFv結構域共價連接的替代酶(六邊形)，第一個scFv (i)作為第一遞送結構域，而第二個scFv (ii)作為第二遞送結構域。圖1A中未描繪的額外多結構域治療性蛋白包括但不限於包含兩個或更多個遞送結構域和至少一個酶結構域的多結構域治療性蛋白。作為非限制性實例，此圖的小圖A至H中描繪的抗體、半體和scFv結構域可以代表任何類型的遞送結構域，而額外的遞送結構域或替代酶也可以締合以製造出多結構域治療性蛋白。圖1C、1D和1F中進一步描繪包含兩個或更多個遞送結構域的多結構域治療性蛋白的非限制性實例，其包括與第一內化效應子特異性半體共價連接的替代酶(描繪為但不限於GAA)，它與第二內化效應子特異性scFv-Fc融合體締合，可能也可能不與替代酶(描繪為但不限於GAA)共價連接而形成多結構域治療性蛋白(圖1C和1D)；與每個抗內化效應子特異性半體C端共價連接的替代酶(描繪為但不限於GAA)，該抗內化效應子特異性半體作為第一遞送域；以及內化效應子特異性scFv-Fc融合體，其作為第二遞送結構域，其中抗內化效應子特異性半體締合在一起形成多結構域治療性蛋白(圖1D)；以及與第一scFv共價連接的替代酶，它例如經由連接子連接到第二scFv (圖1F)。

圖 1B提供AAV基因治療載體的非限制性例示性說明，每個載體編碼圖1A的小圖G中所呈現的多結構域治療性蛋白，其中scFv是抗人類CD63 scFv，而替代酶是GAA(例如抗hCD63scFv::hGAA；參見例如，如SEQ ID NO：10所示的胺基酸序列)。SEQ ID NO：10的胺基酸1-117提供了H4H12450N抗體的重鏈可變結構域(V _H)的胺基酸序列；SEQ ID NO：10的胺基酸118-132提供H4H12450N的重鏈和輕鏈可變結構域之間的胺基酸連接子序列；SEQ ID NO：10的胺基酸133-240提供了H4H12450N抗體的輕鏈可變結構域(V _L)的胺基酸序列；SEQ ID NO：10的胺基酸241-245提供了抗hCD63scFv和GAA之間的胺基酸連接子序列；而SEQ ID NO：10的胺基酸246-1128提供了替代酶GAA或其生物活性部分的胺基酸序列。例示性5' ITR和3' ITR序列分別如SEQ ID NO：6和SEQ ID NO：7所示。此圖的小圖A提供用於肝臟特異性表現的例示性載體，其包含例示性肝臟特異性增強子(例如但不限於Serpina1；如SEQ ID NO：9所示)、例示性肝臟特異性啟動子(例如但不限於TTR；如SEQ ID NO：8所示)、例示性信號肽；編碼抗hCD63scFv::hGAA多治療結構域(SEQ ID NO：10)的核酸序列和聚A尾。此圖的小圖B提供一個類似於小圖A中所示者的例示性載體，具有例示性廣泛啟動子來代替肝臟特異性增強子和肝臟特異性啟動子序列。此圖的小圖C提供一個類似於小圖A中所示者的例示性載體，具有例示性神經元特異性啟動子代替肝臟特異性增強子(例如SerpinA1)和啟動子(例如TTR)。此圖的小圖D提供一個類似於小圖A中所示者的例示性載體，具有例示性神經元特異性啟動子與肝臟特異性增強子(例如SerpinA1)和啟動子(例如TTR)組合。

圖 1C提供表現載體的非限制性例示性說明，每個表現載體編碼如所示的多結構域治療性蛋白，其中半體是抗CD63抗體，scFv是抗人類轉鐵蛋白受體scFv，且其中替代酶是GAA(例如抗hTfRscFv::hGAA)。

圖 1D提供表現載體的非限制性例示性說明，每個表現載體編碼如所示的多結構域治療性蛋白，其中半體是抗CD63抗體，其中scFv是抗人類轉鐵蛋白受體(TfR) scFv，而Fc結構域是人類IgG4 Fc，且其中替代酶是GAA(例如抗hTFRCscFv:hGAA)。

圖 1E提供表現載體的非限制性例示性說明，每個表現載體編碼圖1A的小圖H中所示的多結構域治療性蛋白，其中兩個scFv之一者是抗人類CD63 scFv，兩個scFv中的另一者是抗人類轉鐵蛋白受體(TfR) scFv，而替代酶是GAA(例如抗hCD63scFv::hGAA::抗TfRscFV)。

圖 1F提供表現載體的非限制性例示性說明，每個表現載體編碼如所示的多結構域治療性蛋白，其中兩個scFv之一者是抗人類CD63 scFv，兩個scFv中的另一者是抗人類轉鐵蛋白受體(TfR) scFv，而替代酶是GAA(例如抗hCD63scFv::抗TfRscFV::GAA或抗TfRscFV::抗hCD63scFv::GAA)。

圖 1G提供表現載體的非限制性例示性說明，每個表現載體編碼如圖1A的小圖G中所示的多結構域治療性蛋白，其中scFv是抗人類轉鐵蛋白受體(TfR) scFv，而替代酶是GAA(例如抗TfRscFV:GAA)。

圖 2提供了以4e11vg/kg的劑量在TTR啟動子的情況下經表現指定構建體之AAV8治療的小鼠肝臟中含有hGAA的RNA表現的RT-qPCR量化。注射後4週收取小鼠。

圖 3提供了以4e11vg/kg的劑量在TTR啟動子的情況下經表現GAA、αCD63scfv:GAA或αTFRCscfv:GAA的AAV8治療的 Gaa ^-/- 小鼠之組織的西方墨點法。針對hGAA探測墨點。每條泳道都是一隻單獨的小鼠。注射後4週收取小鼠。

圖 4提供血清中的GAA量化-參見圖3中的西方墨點法。量化是任意單位。

圖 5提供大腦中的GAA量化-參見圖3中的西方墨點法。量化是任意單位。

圖 6提供了在4e11vg/kg的劑量於TTR啟動子的情況下經表現GAA、αCD63scfvGAA或αTFRCscfv:GAA的AAV8治療的小鼠之大腦、小腦和脊髓中的肝醣量化。注射後4週收集小鼠組織。

圖 7提供了在4e11vg/kg的劑量於TTR啟動子的情況下經表現GAA、αCD63scfvGAA或αTFRCscfv:GAA的AAV8治療的小鼠之心臟、EDL、比目魚肌和腓腸肌中的肝醣量化。注射後4週收集小鼠組織。

圖 8提供了在指定劑量於TTR啟動子的情況下經表現αTFRCscfv:GAA的AAV8治療的 Gaa-/-小鼠在肝臟中的抗TFRCscfv:GAA DNA的qPCR量化。注射後4週收集小鼠組織。

圖 9提供了在指定劑量於TTR啟動子的情況下經表現αTFRCscfv:GAA的AAV8治療的 Gaa-/-小鼠之指定組織中的西方墨點法。針對hGAA探測墨點。注射後4週收集小鼠組織。

圖 10提供了在指定劑量於TTR啟動子的情況下經表現αTFRCscfv:GAA的AAV8治療的 Gaa-/-小鼠在大腦和小腦中的肝醣量化。注射後4週收集小鼠組織。

圖 11提供了在指定劑量於TTR啟動子的情況下經表現αTFRCscfv:GAA的AAV8治療的 Gaa-/-小鼠在心臟、EDL、比目魚肌和四頭肌中的肝醣量化。注射後4週收集小鼠組織。

圖 12提供了在TTR啟動子的情況下經表現αTFRCscfv:GAA的AAV8治療的 Gaa-/-小鼠的腦部切片的免疫螢光染色。以3.25e12vg/kg的劑量治療小鼠，並在注射後4週收集組織。切片用抗hGAA抗體染色，並針對內皮細胞標記ZO-1、神經元標記NeuN或寡樹突細胞標記Olig2進行染色。

圖 13提供跨越血腦屏障(BBB)的胞吞轉送作用圖，將αTFRCscfv:GAA遞送至腦部。αTFRCscfv結合BBB內皮細胞頂端(血液)側的轉鐵蛋白受體，利用TFRC的再循環進入胞吞轉送囊泡，並在基底(腦部)側被釋放。

圖 14提供αTFRCscfv:GAA融合蛋白的簡化圖。scfv和人類GAA被一個2xG4S連接子分隔開。AAV質體AAV8 αTFRCscfv:GAA的完整核苷酸序列以SEQ ID NO：14提供。(有關SEQ ID NO：14的注釋，其中核苷酸位置：左ITR-1-141；肝臟增強子(小鼠serpin A1)-162-233；小鼠TTR啟動子-246-469；mROR信號肽-529-615；8D3scfv (VH-3xG4S-VK)-616-1335；2xG4S連接子-1336-1365；hGAA(胺基酸70-952)-1366-4014；sv40聚A-4026-4255；右ITR-4278-4418)。

圖 15提供經純化hGAA蛋白(購自R&D Systems)和經內部純化αTFRCscfv:GAA的GAA活性量化。

圖 16A 至 16D提供未經治療的野生型(WT)小鼠、未經治療的 Gaa-/-小鼠或用在TTR啟動子的情況下表現抗TFRCscfv:GAA的AAV8治療的 Gaa-/-小鼠的(A)肝臟、(B)海馬迴、(C)心臟和(D)四頭肌的免疫螢光染色。以3.25e12vg/kg的劑量治療小鼠，並在注射後4週收集組織。切片用抗Lamp1抗體、抗hGAA抗體、抗大鼠Alexa568和抗小鼠Alexa488染色，並包埋在具有DAPI的Fluoromount-G中。

圖 17A 至 17B提供了分離自未經治療的野生型(WT)小鼠、未經治療的 Gaa-/-小鼠或用在TTR啟動子的情況下表現抗TFRCscfv:GAA的AAV8治療的 Gaa-/-小鼠的(A)海馬迴或(B)橫紋肌(心臟或四頭肌)組織的總LAMP1+面積(μm ²)的量化。使用ImageJ(顆粒分析)從每組3至8個影像量化LAMP1；面積分率 = LAMP ⁺面積/總面積；積分密度 = 平均密度 x 總LAMP ⁺面積；*p＜0.05，**p＜0.01，***p＜0.001。

無

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Claims (20)

1. 一種特異性地結合至鼠類轉鐵蛋白受體的抗原結合蛋白或其抗原性片段或其變體，包含： (i) HCVR，其包含 HCDR1，其包含SEQ ID NO：16中所示的胺基酸序列， HCDR2，其包含SEQ ID NO：17中所示的胺基酸序列，及/或 HCDR3，其包含SEQ ID NO：18中所示的胺基酸序列；及/或 (ii) LCVR，其包含 LCDR1，其包含SEQ ID NO：20中所示的胺基酸序列， LCDR2，其包含SEQ ID NO：21中所示的胺基酸序列，及 LCDR3，其包含SEQ ID NO：22中所示的胺基酸序列。
2. 如請求項1之抗原結合蛋白，其中HCVR包含SEQ ID NO：15中所示的胺基酸序列，而LCVR包含SEQ ID NO：19中所示的胺基酸序列。
3. 如請求項1或請求項2之抗原結合蛋白，其中該抗原結合蛋白是抗體或其抗原結合片段。
4. 如請求項3之抗原結合蛋白，其中該抗體或抗原結合是Fab。
5. 如請求項3之抗原結合蛋白，其中該抗體或抗原結合是scFv。
6. 如請求項5之抗原結合蛋白，其中該scFv包含如SEQ ID NO：23所示的胺基酸序列。
7. 一種融合蛋白，其包含(i)如請求項1至6中任一項的抗原結合蛋白以及(ii)溶酶體酶。
8. 如請求項7之融合蛋白，其中該溶酶體酶展現出水解酶活性。
9. 如請求項7或請求項8之融合蛋白，其中該溶酶體酶包含α-葡萄糖苷酶(alpha-glucosidase，GAA)或其生物活性部分，或α-半乳糖苷酶A(alpha-galactosidase A)或其生物活性部分。
10. 如請求項7至9中任一項之融合蛋白，其中該溶酶體酶包含GAA或其生物活性部分。
11. 如請求項7至10中任一項之融合，其中該融合蛋白包含如SEQ ID NO：11所示的胺基酸序列。
12. 一種將溶酶體酶遞送至小鼠中樞神經系統的方法，包含向患者投與如請求項7至11中任一項的融合蛋白。
13. 如請求項12之方法，其中投與包含將含有編碼該融合蛋白的序列的核酸投與至小鼠的肝臟。
14. 如請求項13之方法，其中該核酸經由病毒載體投與。
15. 如請求項14之方法，其中該病毒載體是AAV載體，視情況其中該AAV載體以至少2×10 ¹²個病毒基因組/千克(vg/kg)的劑量投與。
16. 如請求項13至15中任一項之方法，其中該核酸進一步包含靶向基因座的核酸序列及/或一或多個組織特異性調節元件。
17. 如請求項16之方法，其中該一或多個組織特異性調節元件是肝臟特異性調節元件，視情況其中該肝臟特異性調節元件包含如SEQ ID NO：8及/或SEQ ID NO：9所示的序列。
18. 如請求項16之方法，其中該一或多個組織特異性調節元件是神經元特異性啟動子。
19. 如請求項15之方法，其中該AAV載體包含如SEQ ID NO：14所示的核酸序列。
20. 一種基因治療載體，其包含如請求項13至19中任一項的核酸。