TW202302125A - 固體劑型 - Google Patents
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Abstract
本文提供了與改善的固體劑型有關之方法和組成物,該固體劑型促進細菌或細菌來源的試劑的口服遞送。
Description
本揭露部分地基於發現某些改善固體劑型,該等固體劑型促進細菌和細菌來源的試劑(例如,微生物胞外囊泡或mEV)之口服遞送。例如,在某些實施方式中,本文揭露的固體劑型包括賦形劑之某些組合和/或量。在某些實施方式中,與具有常規固體劑型的藥物產品相比,本文提供的固體劑型使治療功效和/或生理作用增強。
在某些方面,本文提供了藥物組成物的固體劑型。在某些實施方式中,固體劑型包含藥劑(例如,細菌和/或細菌來源的試劑(如mEV),包含細菌和/或細菌來源的試劑(如mEV)的粉末)和一種或多種賦形劑(例如,一種、兩種或三種賦形劑)。在某些實施方式中,固體劑型包含藥劑(例如,細菌和/或細菌來源的試劑(如mEV),包含細菌和/或細菌來源的試劑(如mEV)的粉末)和兩種賦形劑。在某些實施方式中,藥劑總質量係藥物組成物總質量的至少5%、10%、15%、20%、25%、30%、35%、40%、45%、50%、55%、60%、65%、70%或75%。在一些實施方式中,藥劑總質量不超過藥物組成物總質量的75%、70%、65%、60%、55%、50%、45%、40%、35%、30%或25%。在一些實施方式中,一種或多種賦形劑的總質量為藥物組成物總質量的至少5%、至少10%、至少20%、至少30%、至少35%、至少40%、至少45%、至少50%、至少55%、至少65%、至少70%或至少75%。在一些實施方式中,一種或多種賦形劑的總質量不超過藥物組成物總質量的95%、90%、85%、80%、75%、70%、65%、60%、55%、50%、45%、40%或35%。在一些實施方式中,一種或多種賦形劑包含矽化微晶纖維素。在一些實施方式中,一種或多種賦形劑包含交聚維酮(聚乙烯基聚吡咯啶酮(PVPP),例如科利當(Kollidon)CL-F)。
在某些實施方式中,本文提供的固體劑型包含矽化微晶纖維素。在一些實施方式中,矽化微晶纖維素為HD90級。在某些實施方式中,矽化微晶纖維素總質量為藥物組成物總質量的至少5%、7%、10%、15%、16%、17%、18%、19%、20%、21%、22%、23%、24%、25%、26%、27%、28%、29%、30%、31%、32%、33%、34%、35%、36%、37%、38%、39%、40%、41%、42%、43%、44%、45%、46%、47%、48%、49%、50%、51%、52%、53%、54%、55%、56%、57%、58%、59%、60%、61%、62%、63%、64%、65%、66%、67%、68%、70%、71%、72%、73%、74%、75%、76%、77%、78%、79%、80%、81%、82%、83%、84%、85%、86%、87%、88%、89%或90%。在某些實施方式中,矽化微晶纖維素總質量不超過藥物組成物總質量的5%、7%、10%、15%、16%、17%、18%、19%、20%、21%、22%、23%、24%、25%、26%、27%、28%、29%、30%、31%、32%、33%、34%、35%、36%、37%、38%、39%、40%、41%、42%、43%、44%、45%、46%、47%、48%、49%、50%、51%、52%、53%、54%、55%、56%、57%、58%、59%、60%、61%、62%、63%、64%、65%、66%、67%、68%、70%、71%、72%、73%、74%、75%、76%、77%、78%、79%、80%、81%、82%、83%、84%、85%、86%、87%、88%、89%或90%。在某些實施方式中,矽化微晶纖維素總質量為藥物組成物總質量的約5%、7%、10%、15%、16%、17%、18%、19%、20%、21%、22%、23%、24%、25%、26%、27%、28%、29%、30%、31%、32%、33%、34%、35%、36%、37%、38%、39%、40%、41%、42%、43%、44%、45%、46%、47%、48%、49%、50%、51%、52%、53%、54%、55%、56%、57%、58%、59%、60%、61%、62%、63%、64%、65%、66%、67%、68%、70%、71%、72%、73%、74%、75%、76%、77%、78%、79%、80%、81%、82%、83%、84%、85%、86%、87%、88%、89%或90%。在某些實施方式中,矽化微晶纖維素總質量為藥物組成物總質量的約5%至約77%。在某些實施方式中,矽化微晶纖維素質量為藥物組成物總質量的10%至55%(例如,約10%至約55%)。在某些實施方式中,矽化微晶纖維素總質量為藥物組成物總質量的約10%、約20%、約30%、約40%或約50%。在某些實施方式中,矽化微晶纖維素總質量為藥物組成物總質量的約76.4%。在某些實施方式中,矽化微晶纖維素總質量為藥物組成物總質量的約72.5%。在某些實施方式中,矽化微晶纖維素總質量為藥物組成物總質量的約20%。
在某些實施方式中,本文提供的固體劑型包含交聚維酮(例如PVPP、科利當CL-F、聚乙烯吡咯啶酮(PVP)CL-F)。在某些實施方式中,交聚維酮總質量係藥物組成物總質量的至少5%、6%、7%、8%、9%、10%、11%、12%、13%、14%、15%、16%、17%、18%、19%、20%、21%、22%、23%、24%、25%、26%、27%、28%、29%或30%。在某些實施方式中,交聚維酮總質量不超過藥物組成物總質量的5%、6%、7%、8%、9%、10%、11%、12%、13%、14%、15%、16%、17%18%、19%、20%、21%、22%、23%、24%、25%、26%、27%、28%、29%或30%。在某些實施方式中,交聚維酮總質量為藥物組成物總質量的約5%、6%、7%、8%、9%、10%、11%、12%、13%、14%、15%、16%、17%、18%、19%、20%、21%、22%、23%、24%、25%、26%、27%、28%、29%或30%。在某些實施方式中,交聚維酮總質量為藥物組成物總質量的5%至20%。在某些實施方式中,交聚維酮總質量為藥物組成物總質量的約5%、6%、7%、10%、15%、18%、20%或30%。
在某些實施方式中,本文提供的固體劑型包含:(i) 藥劑,藥劑總質量為藥物組成物總質量的至少5%且不超過75%,和 (ii) 矽化微晶纖維素,矽化微晶纖維素總質量為藥物組成物總質量的至少5%(例如至少5%、7%、10%、15%、16%、17%、18%、19%、20%、21%、22%、23%、24%、25%、26%、27%、28%、29%、30%、31%、32%、33%、34%、35%、36%、37%、38%、39%、40%、41%、42%、43%、44%、45%、46%、47%、48%、49%、50%、51%、52%、53%、54%、55%、56%、57%、58%、59%、60%、61%、62%、63%、64%、65%、66%、67%、68%、70%、71%、72%、73%、74%、75%、76%、77%、78%、79%、80%、81%、82%、83%、84%、85%、86%、87%、88%、89%或90%)且不超過90%(例如不超過5%、7%、10%、15%、16%、17%、18%、19%、20%、21%、22%、23%、24%、25%、26%、27%、28%、29%、30%、31%、32%、33%、34%、35%、36%、37%、38%、39%、40%、41%、42%、43%、44%、45%、46%、47%、48%、49%、50%、51%、52%、53%、54%、55%、56%、57%、58%、59%、60%、61%、62%、63%、64%、65%、66%、67%、68%、70%、71%、72%、73%、74%、75%、76%、77%、78%、79%、80%、81%、82%、83%、84%、85%、86%、87%、88%、89%或90%)。在某些實施方式中,藥劑和矽化微晶纖維素總質量為藥物組成物總質量的至少45%(例如至少45%、46%、47%、48%、49%、50%、51%、52%、53%、54%、55%、56%、57%、58%、59%、60%、61%、62%、63%、64%、65%、66%、67%、68%、70%、71%、72%、73%、74%、75%、76%、77%、78%、79%、80%、81%、82%、83%、84%、85%、86%、87%、88%、89%、90%、91%或92%)且不超過92%(例如不超過45%、46%、47%、48%、49%、50%、51%、52%、53%、54%、55%、56%、57%、58%、59%、60%、61%、62%、63%、64%、65%、66%、67%、68%、70%、71%、72%、73%、74%、75%、76%、77%、78%、79%、80%、81%、82%、83%、84%、85%、86%、87%、88%、89%或90%)。在某些實施方式中,藥劑和矽化微晶纖維素總質量為藥物組成物總質量的約45%。在某些實施方式中,藥劑和矽化微晶纖維素總質量為藥物組成物總質量的約50%-56%。在某些實施方式中,藥劑和矽化微晶纖維素總質量為藥物組成物總質量的約62%-67%。在某些實施方式中,藥劑和矽化微晶纖維素總質量為藥物組成物總質量的約72%-77%。在某些實施方式中,藥劑和矽化微晶纖維素總質量為藥物組成物總質量的約80%-88%。在某些實施方式中,藥劑和矽化微晶纖維素總質量為藥物組成物總質量的約90.5%。
在某些實施方式中,固體劑型進一步包含總交聚維酮,交聚維酮總質量為藥物組成物總質量的至少5%(例如至少5%、6%、7%、8%、9%、10%、11%、12%、13%、14%、15%、16%、17%、18%、19%、20%、21%、22%、23%、24%、25%、26%、27%、28%、29%或30%)且不超過30%(不超過5%、6%、7%、8%、9%、10%、11%、12%、13%、14%、15%、16%、17%、18%、19%、20%、21%、22%、23%、24%、25%、26%、27%、28%、29%或30%)。
在某些實施方式中,矽化微晶纖維素總質量加上交聚維酮總質量為藥物組成物總質量的至少15%、17%、20%、25%、30%、35%、40%、45%、50%、55%、60%、70%、80%、90%或95%。在一些實施方式中,固體劑型包含:矽化微晶纖維素總質量為藥物組成物總質量的約50%,交聚維酮總質量為藥物組成物總質量的約15%。在一些實施方式中,固體劑型包含:矽化微晶纖維素總質量為藥物組成物總質量的約76.4%,交聚維酮總質量為藥物組成物總質量的約15%。在一些實施方式中,固體劑型包含:矽化微晶纖維素總質量為藥物組成物總質量的約72.5%,交聚維酮總質量為藥物組成物總質量的約15%。在一些實施方式中,固體劑型包含:矽化微晶纖維素總質量為藥物組成物總質量的約20%,交聚維酮總質量為藥物組成物總質量的約15%。在一些實施方式中,固體劑型包含:矽化微晶纖維素總質量為藥物組成物總質量的約5%-43%,交聚維酮總質量為藥物組成物總質量的約15%。
在某些實施方式中,本文提供的固體劑型包含硬脂酸鎂(例如Mg s、Mg st或硬脂酸Mg)。在某些實施方式中,硬脂酸鎂總質量為藥物組成物總質量的至少0.01%、0.1%、1%、2%、3%、4%、5%、6%、7%、8%、9%、10%或11%。在某些實施方式中,硬脂酸鎂總質量不超過藥物組成物總質量的0.01%、0.1%、1%、2%、3%、4%、5%、6%、7%、8%、9%、10%或11%。在某些實施方式中,硬脂酸鎂總質量為藥物組成物總質量的約0.01%、0.1%、1%、1.5%、2%、2.5%、3%、3.5%、4%、4.5%、5%、5.5%、6%、6.5%、7%、7.5%、8%、8.5%、9%、9.5%、10%或11%。在某些實施方式中,硬脂酸鎂總質量係藥物組成物總質量的約0.5%至約1.5%。在某些實施方式中,硬脂酸鎂總質量係藥物組成物總質量的約1%至約2%。在某些實施方式中,硬脂酸鎂總質量係藥物組成物總質量的約1%。在某些實施方式中,硬脂酸鎂總質量係藥物組成物總質量的約1.5%。
在某些實施方式中,本文提供的固體劑型包含膠體二氧化矽(colloidal silica)(也稱為膠體二氧化矽(colloidal silicon dioxide)或SiO
2)。在一些實施方式中,膠體二氧化矽係Aerosil 200。在某些實施方式中,膠體二氧化矽總質量係藥物組成物總質量的至少0.01%、0.1%、1%、2%、3%、4%、5%、6%、7%、8%、9%、10%或11%。在某些實施方式中,膠體二氧化矽總質量不超過藥物組成物總質量的0.01%、0.1%、1%、2%、3%、4%、5%、6%、7%、8%、9%、10%或11%。在某些實施方式中,膠體二氧化矽總質量係藥物組成物總質量的約0.01%、0.1%、1%、2%、3%、4%、5%、6%、7%、8%、9%、10%或11%。在某些實施方式中,膠體二氧化矽總質量係藥物組成物總質量的約0.5%至約3%。在某些實施方式中,膠體二氧化矽(例如Aerosil 200)總質量係藥物組成物總質量的約1%。在某些實施方式中,膠體二氧化矽(例如Aerosil 200)總質量係藥物組成物總質量的約3%。
在某些實施方式中,本文提供的固體劑型包含纖維素的低取代羥丙基醚(例如L-HPC級LH-B1)。在某些實施方式中,L-HPC總質量為藥物組成物總質量的至少9%、10%、11%、12%、13%、14%、15%、16%、17%、18%、19%、20%、21%、22%、23%、24%、25%、26%、27%、28%、29%、30%、31%或32%。在某些實施方式中,L-HPC總質量不超過藥物組成物總質量的9%、10%、11%、12%、13%、14%、15%、16%、17%、18%、19%、20%、21%、22%、23%、24%、25%、26%、27%、28%、29%、30%、31%或32%。在某些實施方式中,L-HPC總質量為藥物組成物總質量的約9%、10%、11%、12%、13%、14%、15%、16%、17%、18%、19%、20%、21%、22%、23%、24%、25%、26%、27%、28%、29%、30%、31%或32%。在某些實施方式中,L-HPC總質量為藥物組成物總質量的約9%、14%、17%、22%、27%或32%。
在某些實施方式中,本文提供的固體劑型包含交聯羧甲基纖維素鈉(例如AcDiSol)。在某些實施方式中,交聯羧甲基纖維素鈉總質量為藥物組成物總質量的至少1%、2%、3%、4%、5%、6%或7%。在某些實施方式中,交聯羧甲基纖維素鈉總質量不超過藥物組成物總質量的1%、2%、3%、4%、5%、6%或7%。在某些實施方式中,交聯羧甲基纖維素鈉總質量為藥物組成物總質量的約1%、2%、3%、4%、5%、6%或7%。在某些實施方式中,交聯羧甲基纖維素鈉總質量為藥物組成物總質量的約2%、4%或6%。
在某些實施方式中,本文提供的固體劑型包含碳酸氫鈉。在某些實施方式中,碳酸氫鈉總質量為藥物組成物總質量的至少5%、6%、7%、8%、9%、10%、11%、12%、13%、14%、15%、16%、17%、18%、19%、20%、21%或22%。在某些實施方式中,碳酸氫鈉總質量不超過藥物組成物總質量的5%、6%、7%、8%、9%、10%、11%、12%、13%、14%、15%、16%、17%、18%、19%、20%、21%或22%。在某些實施方式中,碳酸氫鈉總質量為藥物組成物總質量的約5%、6%、7%、8%、9%、10%、11%、12%、13%、14%、15%、16%、17%、18%、19%、20%、21%或22%。在某些實施方式中,碳酸氫鈉總質量為藥物組成物總質量的約6.5%、7.5%、10%、12%、15%、18%或20%。
在某些實施方式中,本文提供的固體劑型包含檸檬酸。在某些實施方式中,檸檬酸總質量為藥物組成物總質量的至少5%、6%、7%、8%、9%、10%、11%、12%、13%、14%、15%、16%、17%、18%、19%、20%、21%或22%。在某些實施方式中,總檸檬酸不超過藥物組成物總質量的5%、6%、7%、8%、9%、10%、11%、12%、13%、14%、15%、16%、17%、18%、19%、20%、21%或22%。在某些實施方式中,檸檬酸總質量為藥物組成物總質量的約5%、6%、7%、8%、9%、10%、11%、12%、13%、14%、15%、16%、17%、18%、19%、20%、21%或22%。在某些實施方式中,檸檬酸總質量為藥物組成物總質量的約5%、7.5%、10%、12%、15%、18%或20%。
在某些實施方式中,本文提供的固體劑型包含交聚維酮(例如聚乙烯吡咯啶酮-乙酸乙烯酯共聚物、PVP 64或科利當VA 64)。在某些實施方式中,交聚維酮總質量為藥物組成物總質量的至少3%、4%、5%、6%、7%、8%、9%或10%。在某些實施方式中,總交聚維酮不超過藥物組成物總質量的3%、4%、5%、6%、7%、8%、9%或10%。在某些實施方式中,交聚維酮總質量為藥物組成物總質量的約3%、4%、5%、6%、7%、8%、9%或10%。在某些實施方式中,檸檬酸總質量為藥物組成物總質量的約3%、3.5%、5%或10%。
在某些實施方式中,本文提供的固體劑型包含矽酸鋁鎂(例如維格姆(Veegum))。在某些實施方式中,矽酸鋁鎂總質量為藥物組成物總質量的至少3%、4%、5%、6%、7%、8%、9%或10%。在某些實施方式中,總矽酸鋁鎂不超過藥物組成物總質量的3%、4%、5%、6%、7%、8%、9%或10%。在某些實施方式中,矽酸鋁鎂總質量為藥物組成物總質量的約3%、4%、5%、6%、7%、8%、9%或10%。在某些實施方式中,矽酸鋁鎂總質量為藥物組成物總質量的約5%或10%。
在某些實施方式中,本文提供的固體劑型包含約5%至約80%藥劑(例如包含細菌和/或細菌來源的試劑(例如mEV)的粉末)。在某些實施方式中,本文提供的固體劑型包含約6%至約75%藥劑(例如包含細菌和/或細菌來源的試劑(例如mEV)的粉末)。在某些實施方式中,本文提供的固體劑型包含約10%至約60%藥劑(例如包含細菌和/或細菌來源的試劑(例如mEV)的粉末)。在某些實施方式中,本文提供的固體劑型包含約25%至約55%藥劑(例如包含細菌和/或細菌來源的試劑(例如mEV)的粉末)。
在某些實施方式中,本文提供的固體劑型包含約5%至約40%藥劑(例如包含細菌和/或細菌來源的試劑(例如mEV)的粉末);約43%至約77%的矽化微晶纖維素(例如,HD90);約15%交聚維酮(例如,PVPP);約1%硬脂酸鎂;和約1%膠體二氧化矽(例如,Aerosil 200)。
在某些實施方式中,本文提供的固體劑型包含約5%至約35%藥劑(例如包含細菌和/或細菌來源的試劑(例如mEV)的粉末);約48%至約77%矽化微晶纖維素(例如,HD90級);約15%交聚維酮(例如,PVPP);約1%硬脂酸鎂;和約1%膠體二氧化矽(例如,Aerosil 200)。
在某些實施方式中,本文提供的固體劑型包含約5%至約10%藥劑(例如包含細菌和/或細菌來源的試劑(例如mEV)的粉末);約70%至約80%的矽化微晶纖維素(例如,HD90);約15%交聚維酮(例如,PVPP);約1%硬脂酸鎂;和約1%膠體二氧化矽(例如,Aerosil 200)。
在某些實施方式中,本文提供的固體劑型包含約30%至約40%藥劑(例如包含細菌和/或細菌來源的試劑(例如mEV)的粉末);約45%至約55%矽化微晶纖維素(例如,HD90級);約15%交聚維酮(例如,PVPP);約1%硬脂酸鎂;和約1%膠體二氧化矽(例如,Aerosil 200)。
在某些實施方式中,本文提供的固體劑型包含約10%至約70%藥劑(例如包含細菌和/或細菌來源的試劑(例如mEV)的粉末);約20%至約73%的矽化微晶纖維素(例如,HD90);約15%交聚維酮(例如,PVPP);約1%硬脂酸鎂;和約1%膠體二氧化矽(例如,Aerosil 200)。
在某些實施方式中,本文提供的固體劑型包含約33%藥劑(例如包含細菌和/或細菌來源的試劑(例如mEV)的粉末);約50%矽化微晶纖維素(例如,HD90);約15%交聚維酮(例如,PVPP);約1%硬脂酸鎂;和約1%膠體二氧化矽(例如,Aerosil 200)。
在某些實施方式中,本文提供的固體劑型包含約6.6%藥劑(例如包含細菌和/或細菌來源的試劑(例如mEV)的粉末);約76.4%矽化微晶纖維素(例如,HD90);約15%交聚維酮;約1%硬脂酸鎂;和約1%膠體二氧化矽(例如Aerosil 200P)。
在某些實施方式中,本文提供的固體劑型包含約10%藥劑(例如包含細菌和/或細菌來源的試劑(例如mEV)的粉末);約72.5%矽化微晶纖維素(例如,HD90);約15%交聚維酮;約1.5%硬脂酸鎂;和約1%膠體二氧化矽(例如Aerosil 200P)。
在某些實施方式中,本文提供的固體劑型包含約62.5%藥劑(例如包含細菌和/或細菌來源的試劑(例如mEV)的粉末);約20%矽化微晶纖維素(例如,HD90);約15%交聚維酮;約1.5%硬脂酸鎂;和約1%膠體二氧化矽(例如Aerosil 200P)。
在某些實施方式中,本文提供的固體劑型包含約40%藥劑(例如包含細菌和/或細菌來源的試劑(例如mEV)的粉末);約43%矽化微晶纖維素(例如,HD90);約15%交聚維酮(例如,PVPP);約1%硬脂酸鎂;和約1%膠體二氧化矽(例如,Aerosil 200)。
在某些實施方式中,本文提供的固體劑型包含約50%藥劑(例如包含細菌和/或細菌來源的試劑(例如mEV)的粉末);約33%矽化微晶纖維素(例如,HD90);約15%交聚維酮(例如,PVPP);約1%硬脂酸鎂;和約1%膠體二氧化矽(例如,Aerosil 200)。
在某些實施方式中,本文提供的固體劑型包含約50%藥劑(例如包含細菌和/或細菌來源的試劑(例如mEV)的粉末);約15.5%矽化微晶纖維素(例如,HD90);約30%交聚維酮(例如,PVPP);約1.5%硬脂酸鎂;和約3%膠體二氧化矽(例如,Aerosil 200)。
在某些實施方式中,本文提供的固體劑型包含約74.5%藥劑(例如包含細菌和/或細菌來源的試劑(例如mEV)的粉末);約16%矽化微晶纖維素(例如,HD90);約7%交聚維酮(例如,PVPP);約1.5%硬脂酸鎂;和約1%膠體二氧化矽(例如,Aerosil 200)。
在某些實施方式中,本文提供的固體劑型包含約50%藥劑(例如包含細菌和/或細菌來源的試劑(例如mEV)的粉末);約37%矽化微晶纖維素(例如,HD90);約7%交聚維酮(例如,PVPP);約4%交聯羧甲基纖維素鈉(例如AcDiSol);約1%硬脂酸鎂;和約1%膠體二氧化矽(例如,Aerosil 200)。
在某些實施方式中,本文提供的固體劑型包含約60%藥劑(例如包含細菌和/或細菌來源的試劑(例如mEV)的粉末);約27%矽化微晶纖維素(例如,HD90);約7%交聚維酮(例如,PVPP);約4%交聯羧甲基纖維素鈉(例如AcDiSol);約1%硬脂酸鎂;和約1%膠體二氧化矽(例如,Aerosil 200)。
在某些實施方式中,本文提供的固體劑型包含約60%藥劑(例如包含細菌和/或細菌來源的試劑(例如mEV)的粉末);約21%矽化微晶纖維素(例如,HD90);約13%交聚維酮(例如,PVPP);約4%交聯羧甲基纖維素鈉(例如AcDiSol);約1%硬脂酸鎂;和約1%膠體二氧化矽(例如,Aerosil 200)。
在某些實施方式中,本文提供的固體劑型包含約8%藥劑(例如包含細菌和/或細菌來源的試劑(例如mEV)的粉末);約42%矽化微晶纖維素(例如,HD90級);約27%低取代的纖維素羥丙基醚(例如,L-HPC級LH-B1);約6%交聯羧甲基纖維素鈉(例如AcDiSol);約15%交聚維酮(PVPP,例如,科利當CL-F);約1%二氧化矽;和約1%硬脂酸鎂。
在某些實施方式中,本文提供的固體劑型包含約23%藥劑(例如包含細菌和/或細菌來源的試劑(例如mEV)的粉末);約27%矽化微晶纖維素(例如,HD90級);約27%低取代的纖維素羥丙基醚(例如L-HPC級LH-B1);約6%交聯羧甲基纖維素鈉(例如AcDiSol);約15%交聚維酮(PVPP,例如,科利當CL-F);約1%二氧化矽;和約1%硬脂酸鎂。
在某些實施方式中,本文提供的固體劑型包含約40%藥劑(例如包含細菌和/或細菌來源的試劑(例如mEV)的粉末);約10%矽化微晶纖維素(例如,HD90級);約27%低取代的纖維素羥丙基醚(例如L-HPC級LH-B1);約6%交聯羧甲基纖維素鈉(例如AcDiSol);約15%交聚維酮(PVPP,例如,科利當CL-F);約1%二氧化矽;和約1%硬脂酸鎂。
在某些實施方式中,本文提供的固體劑型包含約50%藥劑(例如包含細菌和/或細菌來源的試劑(例如mEV)的粉末);約5%矽化微晶纖維素(例如,HD90級);約22%低取代的纖維素羥丙基醚(例如L-HPC級LH-B1);約6%交聯羧甲基纖維素鈉(例如AcDiSol);約15%交聚維酮(PVPP,例如,科利當CL-F);約1%二氧化矽;和約1%硬脂酸鎂。
在某些實施方式中,本文提供的固體劑型包含約10%藥劑(例如包含細菌和/或細菌來源的試劑(例如mEV)的粉末);約40%矽化微晶纖維素(例如,HD90級);約27%低取代的纖維素羥丙基醚(例如,L-HPC級LH-B1);約6%交聯羧甲基纖維素鈉(例如AcDiSol);約15%交聚維酮(PVPP,例如,科利當CL-F);約1%二氧化矽;和約1%硬脂酸鎂。
在某些實施方式中,本文提供的固體劑型包含約20%藥劑(例如包含細菌和/或細菌來源的試劑(例如mEV)的粉末);約30%矽化微晶纖維素(例如,HD90級);約27%低取代的纖維素羥丙基醚(例如,L-HPC級LH-B1);約6%交聯羧甲基纖維素鈉(例如AcDiSol);約15%交聚維酮(PVPP,例如,科利當CL-F);約1%二氧化矽;和約1%硬脂酸鎂。
在某些實施方式中,本文提供的固體劑型包含約40%藥劑(例如包含細菌和/或細菌來源的試劑(例如mEV)的粉末);約5%矽化微晶纖維素(例如,HD90級);約32%低取代的纖維素羥丙基醚(例如,L-HPC級LH-B1);約6%交聯羧甲基纖維素鈉(例如AcDiSol);約15%交聚維酮(PVPP,例如,科利當CL-F);約1%二氧化矽;和約1%硬脂酸鎂。在某些實施方式中,本文提供的固體劑型包含約25%藥劑(例如包含細菌和/或細菌來源的試劑(例如mEV)的粉末);約52%矽化微晶纖維素(例如,HD90級);約20%交聚維酮(PVPP,例如,科利當CL-F);約1%滑石粉;約1%二氧化矽;和約1%硬脂醯富馬酸鈉。
在某些實施方式中,本文提供的固體劑型包含約25%藥劑(例如包含細菌和/或細菌來源的試劑(例如mEV)的粉末);約47%矽化微晶纖維素(例如,HD90級);約20%交聚維酮(PVPP,例如,科利當CL-F);約5%交聚維酮(例如,PVP 64);約1%滑石粉;約1%二氧化矽;和約1%硬脂醯富馬酸鈉。
在某些實施方式中,本文提供的固體劑型包含約25%藥劑(例如包含細菌和/或細菌來源的試劑(例如mEV)的粉末);約42%矽化微晶纖維素(例如,HD90級);約20%交聚維酮(PVPP,例如,科利當CL-F);約10%交聚維酮(例如,PVP 64);約1%滑石粉;約1%二氧化矽;和約1%硬脂醯富馬酸鈉。
在某些實施方式中,本文提供的固體劑型包含約25%藥劑(例如包含細菌和/或細菌來源的試劑(例如mEV)的粉末);約47%矽化微晶纖維素(例如,HD90級);約20%交聚維酮(PVPP,例如,科利當CL-F);約5%矽酸鋁鎂(例如,維格姆);約1%滑石粉;約1%二氧化矽;和約1%硬脂醯富馬酸鈉。
在某些實施方式中,本文提供的固體劑型包含約25%藥劑(例如包含細菌和/或細菌來源的試劑(例如mEV)的粉末);約42%矽化微晶纖維素(例如,HD90級);約20%交聚維酮(PVPP,例如,科利當CL-F);約10%矽酸鋁鎂(例如,維格姆);約1%滑石粉;約1%二氧化矽;和約1%硬脂醯富馬酸鈉。
在某些實施方式中,本文提供的固體劑型包含約30%藥劑(例如包含細菌和/或細菌來源的試劑(例如mEV)的粉末);約22%矽化微晶纖維素(例如,HD90);約20%檸檬酸;約20%碳酸氫鈉;約5%交聚維酮(例如,PVPP);約1.5%硬脂酸鎂;和約1.5%膠體二氧化矽(例如,Aerosil 200)。
在某些實施方式中,本文提供的固體劑型包含約40%藥劑(例如包含細菌和/或細菌來源的試劑(例如mEV)的粉末);約16%矽化微晶纖維素(例如,HD90);約18%檸檬酸;約18%碳酸氫鈉;約5%交聚維酮(例如,PVPP);約1.5%硬脂酸鎂;和約1.5%膠體二氧化矽(例如,Aerosil 200)。
在某些實施方式中,本文提供的固體劑型包含約50%藥劑(例如包含細菌和/或細菌來源的試劑(例如mEV)的粉末);約12%矽化微晶纖維素(例如,HD90);約15%檸檬酸;約15%碳酸氫鈉;約5%交聚維酮(例如,PVPP);約1.5%硬脂酸鎂;和約1.5%膠體二氧化矽(例如,Aerosil 200)。
在某些實施方式中,本文提供的固體劑型包含約50%藥劑(例如包含細菌和/或細菌來源的試劑(例如mEV)的粉末);約17%矽化微晶纖維素(例如,HD90);約10%檸檬酸;約10%碳酸氫鈉;約10%交聚維酮(例如,PVPP);約1.5%硬脂酸鎂;和約1.5%膠體二氧化矽(例如,Aerosil 200)。
在某些實施方式中,本文提供的固體劑型包含約50%藥劑(例如包含細菌和/或細菌來源的試劑(例如mEV)的粉末);約15%矽化微晶纖維素(例如,HD90);約12%檸檬酸;約12%碳酸氫鈉;約4%交聯羧甲基纖維素鈉(例如AcDiSol);約4%羧基乙酸澱粉鈉;約1.5%硬脂酸鎂;和約1.5%膠體二氧化矽(例如,Aerosil 200)。
在某些實施方式中,本文提供的固體劑型包含約55%藥劑(例如包含細菌和/或細菌來源的試劑(例如mEV)的粉末);約7.5%矽化微晶纖維素(例如,HD90);約7.5%檸檬酸;約7.5%碳酸氫鈉;約20%交聚維酮(例如,PVPP);約1%硬脂醯富馬酸鈉;和約1.5%膠體二氧化矽(例如,Aerosil 200);其中藥劑的20%被包衣。
在某些實施方式中,本文提供的固體劑型包含約40%藥劑(例如包含細菌和/或細菌來源的試劑(例如mEV)的粉末);約25.5%矽化微晶纖維素(例如,HD90);約5%檸檬酸;約6.5%碳酸氫鈉;約18%交聚維酮(例如,PVPP);約2%羧基乙酸澱粉鈉;約1%硬脂醯富馬酸鈉;約1%滑石粉;和約1%膠體二氧化矽(例如,Aerosil 200)。
在某些實施方式中,本文提供的固體劑型包含約40%藥劑(例如包含細菌和/或細菌來源的試劑(例如mEV)的粉末);約22%矽化微晶纖維素(例如,HD90);約5%檸檬酸;約6.5%碳酸氫鈉;約20%交聚維酮(例如,PVPP);約3.5%交聚維酮(PVP 64);約1%硬脂醯富馬酸鈉;約1%滑石粉;和約1%膠體二氧化矽(例如,Aerosil 200)。
在一些實施方式中,藥劑的濕法製粒產生包含藥劑的顆粒(例如包含細菌和/或細菌來源的試劑(例如mEV)的粉末的藥物物質顆粒)。在一些實施方式中,顆粒進一步包含一種或多種賦形劑(例如,一種、兩種或三種)。在一些實施方式中,顆粒視需要與一種或多種(例如,一種、兩種或三種)賦形劑組合以製備藥物組成物(例如片劑、膠囊或固體劑型)。
在本文提供的一些實施方式中,顆粒包含60%-100%的藥劑(例如粉末,包含細菌和/或細菌來源的試劑,例如mEV)。在一些實施方式中,顆粒包含約60%、65%、70%、75%、80%、85%、90%、95%或100%的藥劑。在其他實施方式中,顆粒占藥物組成物總質量的35%-85%。在本文提供的一些實施方式中,顆粒占藥物組成物總質量的約40%、50%、55%、60%、70%、75%、80%或85%。
在某些實施方式中,本文提供的固體劑型包含約60%顆粒;約15%矽化微晶纖維素(例如,HD90);約10%交聚維酮(例如,PVPP);約9%低取代的纖維素羥丙基醚(例如L-HPC級LH-B1);約4%交聯羧甲基纖維素鈉(例如AcDiSol);約1%硬脂酸鎂;和約1%膠體二氧化矽(例如,Aerosil 200)。
在某些實施方式中,本文提供的固體劑型包含約60%顆粒;約27%矽化微晶纖維素(例如,HD90);約7%交聚維酮(例如,PVPP);約4%交聯羧甲基纖維素鈉(例如AcDiSol);約1%硬脂酸鎂;和約1%膠體二氧化矽(例如,Aerosil 200)。
在某些實施方式中,本文提供的固體劑型包含約60%顆粒;約27%矽化微晶纖維素(例如,HD90);約13%交聚維酮(例如,PVPP);約4%交聯羧甲基纖維素鈉(例如AcDiSol);約1%硬脂酸鎂;和約1%膠體二氧化矽(例如,Aerosil 200)。
在某些實施方式中,本文提供的固體劑型包含約60%顆粒;約5%矽化微晶纖維素(例如,HD90);約15%交聚維酮(例如,PVPP);約14%低取代的纖維素羥丙基醚(例如L-HPC級LH-B1);約4%交聯羧甲基纖維素鈉(例如AcDiSol);約1%硬脂酸鎂;和約1%膠體二氧化矽(例如,Aerosil 200)。
在某些實施方式中,本文提供的固體劑型包含約60%顆粒;約17%交聚維酮(例如,PVPP);約17%低取代的纖維素羥丙基醚(例如L-HPC級LH-B1);約4%交聯羧甲基纖維素鈉(例如AcDiSol);約1%硬脂酸鎂;和約1%膠體二氧化矽(例如,Aerosil 200)。
在某些實施方式中,本文提供的固體劑型包含約55%顆粒;約25%矽化微晶纖維素(例如,HD90);約15%交聚維酮(例如,PVPP);約1%膠體二氧化矽(例如,Aerosil 200);約1%羧基乙酸澱粉鈉;和約1%硬脂醯富馬酸鈉。
在某些實施方式中,本文提供的固體劑型包含約55%顆粒;約25%矽化微晶纖維素(例如,HD90);約15%交聚維酮(例如,PVPP);約1%膠體二氧化矽(例如,Aerosil 200);約1%羧基乙酸澱粉鈉;和約1%硬脂醯富馬酸鈉。
在某些實施方式中,本文提供的固體劑型包含約50%顆粒;約32%矽化微晶纖維素(例如,HD90);約10%交聚維酮(例如,PVPP);約3%交聚維酮(例如,PVP-64);約2%交聯羧甲基纖維素鈉;約1%膠體二氧化矽(例如,Aerosil 200);約1%滑石粉;和約1%硬脂醯富馬酸鈉。
在某些實施方式中,本文提供的固體劑型包含約40%顆粒;約32%矽化微晶纖維素(例如,HD90);約20%交聚維酮(例如,PVPP);約3%交聚維酮(例如,PVP-64);約2%交聯羧甲基纖維素鈉;約1%膠體二氧化矽(例如,Aerosil 200);約1%滑石粉;和約1%硬脂醯富馬酸鈉。
在某些實施方式中,本文提供的固體劑型包含約70%顆粒;約17%矽化微晶纖維素(例如,HD90);約5%交聚維酮(例如,PVPP);約3%交聚維酮(例如,PVP-64);約2%交聯羧甲基纖維素鈉;約1%膠體二氧化矽(例如,Aerosil 200);約1%滑石粉;和約1%硬脂醯富馬酸鈉。
在某些實施方式中,本文描述的藥劑的固體劑型包括片劑和微型片劑。在一些實施方式中,固體劑型經腸溶包衣(例如,包含腸溶衣;例如,用腸溶衣進行了包衣)。用一層腸溶衣或兩層腸溶衣(例如,內部腸溶衣和外部腸溶衣)包衣片劑或微型片劑。可以將腸溶包衣的微型片劑(具有一層腸溶衣或具有兩層腸溶衣(例如,內部腸溶衣和外部腸溶衣))裝入膠囊中;例如,膠囊不經腸溶包衣。
在一些實施方式中,固體劑型包括片劑。在一些實施方式中,片劑(例如,經腸溶包衣的片劑)係5 mm、5.5 mm、6 mm、6.5 mm、7 mm、7.5 mm、8 mm、8.5 mm、9 mm、9.5 mm、10 mm、11 mm、12 mm、13 mm、14 mm、15 mm、16 mm、17 mm、或18 mm片劑。
在一些實施方式中,固體劑型包含微型片劑。在一些實施方式中,微型片劑(例如,經腸溶包衣的微型片劑)係1 mm微型片劑、1.5 mm微型片劑、2 mm微型片劑、3 mm微型片劑或4 mm微型片劑。在一些實施方式中,在膠囊中包含多個經腸溶包衣的微型片劑(例如0號膠囊可以包含約31至約35(例如33)個微型片劑,其中微型片劑的尺寸為3 mm)。在一些實施方式中,膠囊係00號、0號、1號、2號、3號、4號或5號膠囊。在一些實施方式中,膠囊包含HPMC(羥丙基甲基纖維素)或明膠。
在一些實施方式中,腸溶衣包含一層腸溶衣。
在一些實施方式中,腸溶衣包括內部腸溶衣和外部腸溶衣。在一些實施方式中,腸溶衣包含內部腸溶衣和外部腸溶衣,並且其中內部和外部腸溶衣不相同(例如,內部和外部腸溶衣不包含相同量的相同組分)。
在一些實施方式中,腸溶衣(例如,一層腸溶衣或內部腸溶衣和/或外部腸溶衣)包含基於聚甲基丙烯酸酯的共聚物。
在一些實施方式中,腸溶衣(例如,一層腸溶衣或內部腸溶衣和/或外部腸溶衣)包含甲基丙烯酸丙烯酸乙酯(MAE)共聚物(1:1)。
在一些實施方式中,該一層腸溶衣包含甲基丙烯酸丙烯酸乙酯(MAE)共聚物(1:1)(如Kollicoat MAE 100P)。
在一些實施方式中,該一層腸溶衣包含Eudragit共聚物,例如,Eudragit L(例如,Eudragit L 100-55;Eudragit L 30 D-55)、Eudragit S、Eudragit RL、Eudragit RS、Eudragit E、或Eudragit FS(例如,Eudragit FS 30 D)。
在一些實施方式中,腸溶衣(例如,一層腸溶衣或內部腸溶衣和/或外部腸溶衣)包括鄰苯二甲酸乙酸纖維素(CAP)、偏苯三酸乙酸纖維素(CAT)、聚(醋酸乙烯鄰苯二甲酸酯)(PVAP)、羥丙基甲基纖維素鄰苯二甲酸酯(HPMCP)、脂肪酸、蠟、蟲膠(紫膠桐酸的酯)、塑膠、植物纖維、玉米醇溶蛋白、Aqua-Zein(不含醇的水性玉米醇溶蛋白配製物)、直鏈澱粉、澱粉衍生物、糊精、丙烯酸甲酯-甲基丙烯酸共聚物、醋酸琥珀酸纖維素、羥丙基甲基醋酸琥珀酸纖維素(醋酸琥珀酸羥丙甲纖維素)、甲基丙烯酸甲酯-甲基丙烯酸共聚物、或海藻酸鈉。
在一些實施方式中,腸溶衣(例如,一層腸溶衣或內部腸溶衣和/或外部腸溶衣)包含陰離子聚合物材料。
在一些實施方式中,固體劑型例如除了腸溶衣之外還包含底層包衣,例如,底層包衣在腸溶衣下面(例如,在固體劑型和腸溶衣之間)。在一些實施方式中,底層包衣包含歐巴代(Opadry)QX,例如歐巴代QX藍(Opadry QX Blue)。
藥劑可以是細菌來源的(例如,所選菌株或其試劑(組分)的混合物,例如所選菌株的混合物的微生物胞外囊泡(mEV))。藥劑可以是細菌來源的(例如,單個所選菌株和/或其試劑(組分),例如該單個所選菌株的微生物胞外囊泡(mEV))。藥劑可以是粉末,粉末包含細菌和/或其組分,並且可以包含另外藥劑,例如冷凍保護劑。例如,在一些實施方式中,藥劑係細菌和/或其組分(例如,mEV)的凍乾粉末,凍乾粉末視需要還包含另外的藥劑,例如冷凍保護劑。
在一些實施方式中,藥劑包含細菌。
在一些實施方式中,藥劑包含微生物胞外囊泡(mEV)。
在一些實施方式中,藥劑包含細菌和微生物胞外囊泡(mEV)。
在一些實施方式中,例如當口服施用固體劑型時,藥劑在胃腸道外具有一種或多種有益的免疫作用。
在一些實施方式中,例如當口服施用固體劑型時,藥劑調節受試者的胃腸道外的免疫作用。
在一些實施方式中,例如當口服施用固體劑型時,藥劑引起系統性作用(例如,胃腸道外的作用)。
在一些實施方式中,例如當口服施用固體劑型時,藥劑對小腸中的免疫細胞和/或上皮細胞起作用(例如引起系統性作用(例如,胃腸道外的作用))。
在一些實施方式中,藥劑包含分離的細菌(例如,來自一種或多種細菌菌株(例如,目的細菌)(例如,其治療有效量))。例如,其中藥劑的至少50%、至少75%、至少80%、至少85%、至少90%、至少95%或至少99%的含量係分離的細菌(例如目的細菌)。
在一些實施方式中,藥劑包含細菌,並且該等細菌已經經γ照射、UV照射、熱滅活、酸處理或氧噴射。
在一些實施方式中,藥劑包含活細菌。
在一些實施方式中,藥劑包含死細菌。
在一些實施方式中,藥劑包含非複製型細菌。
在一些實施方式中,藥劑包含來自一種細菌菌株的細菌。
在一些實施方式中,細菌被凍乾(例如,凍乾的產物還包含藥學上可接受的賦形劑)(例如,粉末形式)。
在一些實施方式中,細菌經γ照射。
在一些實施方式中,細菌經UV照射。
在一些實施方式中,細菌經熱滅活(例如,在50°C下兩小時或在90°C下兩小時)。
在一些實施方式中,細菌經酸處理。
在一些實施方式中,細菌經氧噴射(例如,以0.1 vvm持續兩小時)。
在一些實施方式中,細菌來自革蘭氏陽性細菌。
在一些實施方式中,細菌來自革蘭氏陰性細菌。
在一些實施方式中,細菌係需氧細菌。
在一些實施方式中,細菌係厭氧細菌。在一些實施方式中,厭氧細菌包含專性厭氧菌。在一些實施方式中,厭氧細菌包含兼性厭氧菌。
在一些實施方式中,細菌係嗜酸細菌。
在一些實施方式中,細菌係嗜鹼細菌。
在一些實施方式中,細菌係嗜中性細菌。
在一些實施方式中,細菌係難養細菌。
在一些實施方式中,細菌係非難養細菌。
在一些實施方式中,細菌屬於表1、表2、表3或表4中列出的分類學組(例如,綱、目、科、屬、種或菌株)。
在一些實施方式中,藥劑包含分離的小韋榮氏球菌細菌(例如,來自一種或多種細菌菌株(例如,目的細菌)(例如,其治療有效量))。例如,其中藥劑的至少50%、至少75%、至少80%、至少85%、至少90%、至少95%或至少99%的含量係分離的小韋榮氏球菌細菌(例如目的細菌)。
在一些實施方式中,藥劑包含分離的小韋榮氏球菌細菌(例如,來自一種或多種細菌菌株(例如,目的細菌)(例如,其治療有效量))。例如,其中藥劑的至少50%、至少75%、至少80%、至少85%、至少90%、至少95%或至少99%的含量係分離的小韋榮氏球菌細菌(例如目的細菌)。
在一些實施方式中,小韋榮氏球菌細菌來自與小韋榮氏球菌菌株A(ATCC保藏號PTA-125691)的核苷酸序列具有至少90%(或至少97%)基因組、16S和/或CRISPR序列同一性的菌株。在一些實施方式中,小韋榮氏球菌細菌來自與小韋榮氏球菌菌株A(ATCC保藏號PTA-125691)的核苷酸序列具有至少99%基因組、16S和/或CRISPR序列同一性的菌株。在一些實施方式中,韋榮氏球菌屬細菌來自小韋榮氏球菌菌株A(ATCC保藏號PTA-125691)。
在一些實施方式中,藥物組成物中至少50%、60%、70%、80%或90%的細菌係小韋榮氏球菌菌株A。
在一些實施方式中,藥劑包含至少1 x 10
5、5 x 10
5、1 x 10
6、2 x 10
6、3 x 10
6、4 x 10
6、5 x 10
6、6 x 10
6、7 x 10
6、8 x 10
6、9 x 10
6、1 x 10
7、2 x 10
7、3 x 10
7、4 x 10
7、5 x 10
7、6 x 10
7、7 x 10
7、8 x 10
7、9 x 10
7、1 x 10
8、2 x 10
8、3 x 10
8、4 x 10
8、5 x 10
8、6 x 10
8、7 x 10
8、8 x 10
8、9 x 10
8或1 x 10
9個本文所述韋榮氏球菌屬細菌(例如,小韋榮氏球菌菌株A(ATCC保藏號PTA-125691))的總細胞(例如,其中細胞數目由總細胞計數確定(例如,由庫爾特計數器確定)。
根據用於專利程序目的的國際承認的微生物保藏的布達佩斯條約(Budapest Treaty on the International Recognition of the Deposit of Microorganisms for the Purpose of Patent Procedure)的條款,將小韋榮氏球菌菌株A在2019年1月25日保藏於美國典型培養物保藏中心(American Type Culture Collection,ATCC)(美國維吉尼亞州馬納薩斯大學大道10801號,20110-2209(10801 University Boulevard, Manassas, Va. 20110-2209 USA))並且指定ATCC保藏號PTA-125691。
申請人表示,ATCC係保藏處,如果授予專利,則可永久保藏且公眾可隨時訪問。在授予專利後,將不可撤銷地取消對如此保藏材料的公眾可獲得性的所有限制。該材料可在專利申請未決期間提供給由有資格的專員依據37 CFR 1.14及35 U.S.C. 122所決定的人。在謹慎需要保持存活及無污染的情況下將保藏材料在最新請求提供保藏質體樣本之後維持至少五年的時間段,且在任一情形下在保藏日期之後維持至少三十(30)年的時間段或維持專利的可實施壽命(以較長時間段為准)。申請人確認,如果保藏處因保藏條件而不能在請求時提供樣本,則其有責任更換保藏地。
在一些實施方式中,細菌係表1、表2、表3或表4中列出的細菌菌株。
在一些實施方式中,細菌屬於表J中列出的分類學組(例如,綱、目、科、屬、種或菌株)。
在一些實施方式中,細菌係表J中列出的細菌菌株。
在一些實施方式中,革蘭氏陰性細菌屬於
Negativicutes綱。
在一些實施方式中,革蘭氏陰性細菌屬於韋榮氏球菌科(
Veillonellaceae)、月形單胞菌科(
Selenomonadaceae)、胺基酸球菌科(
Acidaminococcaceae)或
Sporomusaceae科。
在一些實施方式中,細菌屬於巨型球菌屬(
Megasphaera)
、月形單胞菌科屬(
Selenomonas)
、 Propionospora屬
、或胺基酸球菌屬(
Acidaminococcus)。
在一些實施方式中,細菌係巨型球菌屬物種(
Megasphaera sp.)、菲利克斯月形單胞菌(
Selenomonas felix)、腸胺基酸球菌(
Acidaminococcus intestine)、或
Propionospora屬物種細菌。
在一些實施方式中,細菌屬於乳球菌屬、普雷沃菌屬、雙歧桿菌屬、或韋榮氏球菌屬。
在一些實施方式中,細菌係乳酸乳球菌乳脂亞種細菌。
在一些實施方式中,細菌係棲組織普雷沃菌(
Prevotella histicola)細菌。
在一些實施方式中,細菌係動物雙歧桿菌細菌。
在一些實施方式中,細菌係小韋榮氏球菌(
Veillonella parvula)細菌。
在一些實施方式中,細菌係乳酸乳球菌乳脂亞種細菌。在一些實施方式中,乳酸乳球菌乳脂亞種細菌係與乳酸乳球菌乳脂亞種菌株A(ATCC指定編號PTA-125368)的核苷酸序列具有至少90%(或至少97%)基因組、16S和/或CRISPR序列同一性的菌株。在一些實施方式中,乳球菌屬細菌係與乳酸乳球菌乳脂亞種菌株A(ATCC指定編號PTA-125368)的核苷酸序列具有至少99%基因組、16S和/或CRISPR序列同一性的菌株。在一些實施方式中,乳球菌屬細菌係乳酸乳球菌乳脂亞種菌株A(ATCC指定編號PTA-125368)。
在一些實施方式中,細菌係普雷沃菌屬細菌。在一些實施方式中,普雷沃菌屬細菌係包含與普雷沃菌屬菌株B 50329(NRRL保藏號B 50329)的核苷酸序列具有至少90%(或至少97%)基因組、16S和/或CRISPR序列同一性的菌株。在一些實施方式中,普雷沃菌屬細菌係包含與普雷沃菌屬菌株B 50329(NRRL保藏號B 50329)的核苷酸序列具有至少99%基因組、16S和/或CRISPR序列同一性的菌株。在一些實施方式中,普雷沃菌屬細菌來自普雷沃菌屬菌株B 50329(NRRL保藏號B 50329)。
在一些實施方式中,藥劑的細菌或藥劑的mEV自其獲得的細菌係普雷沃菌屬細菌,例如包含與普雷沃菌屬菌株C(ATCC保藏號PTA-126140)的核苷酸序列具有至少90%或至少99%基因組、16S和/或CRISPR序列同一性的菌株。在一些實施方式中,藥劑的細菌或藥劑的mEV自其獲得的細菌係普雷沃菌屬細菌,例如普雷沃菌屬菌株C(ATCC保藏號PTA-126140)。
在一些實施方式中,細菌係雙歧桿菌屬細菌。在一些實施方式中,該雙歧桿菌屬細菌來自與雙歧桿菌屬細菌(保藏為ATCC指定編號PTA-125097)的核苷酸序列具有至少90%或至少97%基因組、16S和/或CRISPR序列同一性的菌株。在一些實施方式中,雙歧桿菌屬細菌係與以ATCC指定編號PTA-125097保藏的雙歧桿菌屬細菌的核苷酸序列有至少99%基因組、16S和/或CRISPR序列同一性的菌株。在一些實施方式中,雙歧桿菌屬細菌係以ATCC指定編號PTA-125097保藏的雙歧桿菌屬細菌。
在一些實施方式中,細菌係韋榮氏球菌屬細菌。在一些實施方式中,韋榮氏球菌屬細菌係與以ATCC指定編號PTA-125691保藏的韋榮氏球菌屬細菌的核苷酸序列有至少90%(或至少97%)基因組、16S和/或CRISPR序列同一性的菌株。在一些實施方式中,韋榮氏球菌屬細菌係與以ATCC指定編號PTA-125691保藏的韋榮氏球菌屬細菌的核苷酸序列有至少99%基因組、16S和/或CRISPR序列同一性的菌株。在一些實施方式中,韋榮氏球菌屬細菌係以ATCC指定編號PTA-125691保藏的韋榮氏球菌屬細菌。
在一些實施方式中,細菌來自活潑瘤胃球菌細菌。在一些實施方式中,活潑瘤胃球菌細菌係與以ATCC指定編號PTA-126695保藏的活潑瘤胃球菌細菌的核苷酸序列有至少90%(或至少97%)基因組、16S和/或CRISPR序列同一性的菌株。在一些實施方式中,活潑瘤胃球菌細菌係與以ATCC指定編號PTA-126695保藏的活潑瘤胃球菌細菌的核苷酸序列有至少99%基因組、16S和/或CRISPR序列同一性的菌株。在一些實施方式中,活潑瘤胃球菌細菌係以ATCC指定編號PTA-126695保藏的活潑瘤胃球菌細菌。
在一些實施方式中,細菌係巨型球菌屬物種細菌。在一些實施方式中,巨型球菌屬物種細菌係與以ATCC指定編號PTA-126770保藏的巨型球菌屬物種細菌的核苷酸序列有至少90%(或至少97%)基因組、16S和/或CRISPR序列同一性的菌株。在一些實施方式中,巨型球菌屬物種細菌係與以ATCC指定編號PTA-126770保藏的巨型球菌屬物種細菌的核苷酸序列有至少99%基因組、16S和/或CRISPR序列同一性的菌株。在一些實施方式中,巨型球菌屬物種細菌係以ATCC指定編號PTA-126770保藏的巨型球菌屬物種細菌。
在一些實施方式中,細菌係
Fournierella massiliensis細菌。在一些實施方式中,
Fournierella massiliensis細菌係與以ATCC指定編號PTA-126696保藏的
Fournierella massiliensis細菌的核苷酸序列有至少90%(或至少97%)基因組、16S和/或CRISPR序列同一性的菌株。在一些實施方式中,
Fournierella massiliensis細菌係與以ATCC指定編號PTA-126696保藏的
Fournierella massiliensis細菌的核苷酸序列有至少99%基因組、16S和/或CRISPR序列同一性的菌株。在一些實施方式中,
Fournierella massiliensis細菌係以ATCC指定編號PTA-126696保藏的
Fournierella massiliensis細菌。
在一些實施方式中,細菌係
Harryflintia acetispora細菌。在一些實施方式中,
Harryflintia acetispora細菌係與以ATCC指定編號PTA-126694保藏的
Harryflintia acetispora細菌的核苷酸序列有至少90%(或至少97%)基因組、16S和/或CRISPR序列同一性的菌株。在一些實施方式中,
Harryflintia acetispora細菌係與以ATCC指定編號PTA-126694保藏的
Harryflintia acetispora細菌的核苷酸序列有至少99%基因組、16S和/或CRISPR序列同一性的菌株。在一些實施方式中,
Harryflintia acetispora細菌係以ATCC指定編號PTA-126694保藏的
Harryflintia acetispora細菌。
在一些實施方式中,細菌屬於胺基酸球菌科、產鹼桿菌科、阿克曼氏菌科、擬桿菌科、雙歧桿菌科、伯克霍爾德菌科、
Catabacteriaceae科、克裡斯滕森菌科、梭菌科、紅蝽菌科、腸桿菌科、腸球菌科、梭桿菌科、毛螺菌科、李斯特菌科、分枝桿菌科、奈瑟菌科、臭桿菌科、顫螺旋菌科、消化球菌科、消化鏈球菌科、卟啉單胞菌科、普雷沃菌科、丙酸桿菌科、理研菌科、瘤胃球菌科、月形單胞菌科、
Sporomusaceae科、鏈球菌科、鏈黴菌科、薩特氏菌科、互養菌科、坦納菌科或韋榮氏球菌科。
在一些實施方式中,細菌屬於阿克曼氏菌屬、克裡斯滕森菌屬、布勞特氏菌屬、腸球菌屬、真桿菌屬、羅斯氏菌屬、擬桿菌屬、副擬桿菌屬、或丹毒絲梭菌屬。
在一些實施方式中,細菌係產氫營養型布勞特氏菌、排泄物布勞特氏菌、韋氏布勞特氏菌、糞真桿菌、扭曲真桿菌、直腸真桿菌、糞腸球菌、耐久腸球菌、絨毛腸球菌、鶉雞腸球菌;乳酸雙歧桿菌、兩歧雙歧桿菌、長雙歧桿菌、動物雙歧桿菌或短雙歧桿菌細菌。
在一些實施方式中,細菌係BCG(卡介苗)、副擬桿菌屬、布勞特氏菌屬、韋榮氏球菌屬、唾液乳桿菌、阿加薩桿菌屬(
Agathobaculum)、活潑瘤胃球菌、解苯副梭菌、
Turicibacter sanguinus、伯克霍爾德菌屬、類肺炎克雷伯氏菌擬肺炎亞種、催產克雷伯氏菌、納西利斯泰澤菌(
Tyzerella nexilis)或奈瑟菌屬細菌。
在一些實施方式中,細菌係產氫營養型布勞特氏菌細菌。
在一些實施方式中,細菌係排泄物布勞特氏菌細菌。
在一些實施方式中,細菌係韋氏布勞特氏菌細菌。
在一些實施方式中,細菌係鶉雞腸球菌細菌。
在一些實施方式中,細菌係屎腸球菌細菌。
在一些實施方式中,細菌係兩歧雙歧桿菌細菌。
在一些實施方式中,細菌係短雙歧桿菌細菌。
在一些實施方式中,細菌係長雙歧桿菌細菌。
在一些實施方式中,細菌係人羅斯氏菌細菌。
在一些實施方式中,細菌係多形擬桿菌(
Bacteroides thetaiotaomicron)細菌。
在一些實施方式中,細菌係糞居擬桿菌細菌。
在一些實施方式中,細菌係
Erysipelatoclostridium ramosum細菌。
在一些實施方式中,細菌係馬賽巨型球菌細菌。
在一些實施方式中,細菌係真桿菌屬細菌。
在一些實施方式中,細菌係狄氏副擬桿菌(
Parabacteroides distasonis)細菌。
在一些實施方式中,細菌係植物乳桿菌細菌。
在一些實施方式中,細菌屬於
Negativicutes綱。
在一些實施方式中,細菌屬於韋榮氏球菌科。
在一些實施方式中,細菌屬於月形單胞菌科。
在一些實施方式中,細菌屬於胺基酸球菌科。
在一些實施方式中,細菌屬於
Sporomusaceae科。
在一些實施方式中,細菌屬於巨型球菌屬。
在一些實施方式中,細菌屬於月形單胞菌屬。
在一些實施方式中,細菌屬於Propionospora屬。
在一些實施方式中,細菌屬於胺基酸球菌屬。
在一些實施方式中,細菌係巨型球菌屬物種細菌。
在一些實施方式中,細菌來自菲利克斯月形單胞菌細菌。
在一些實施方式中,細菌係腸胺基酸球菌。
在一些實施方式中,細菌係
Propionospora屬物種細菌。
在一些實施方式中,細菌屬於梭菌綱。
在一些實施方式中,細菌屬於顫螺旋菌科。
在一些實施方式中,細菌屬於糞桿菌屬(
Faecalibacterium)。
在一些實施方式中,細菌屬於
Fournierella屬。
在一些實施方式中,細菌屬於
Harryflintia屬。
在一些實施方式中,細菌屬於阿加薩桿菌屬。
在一些實施方式中,細菌係普氏棲糞桿菌(例如,普氏棲糞桿菌菌株A)細菌。
在一些實施方式中,細菌係
Fournierella massiliensis(例如,
Fournierella massiliensis菌株A)細菌。
在一些實施方式中,細菌係
Harryflintia acetispora(例如,
Harryflintia acetispora菌株A)細菌。
在一些實施方式中,細菌係阿加薩桿菌屬物種(例如,阿加薩桿菌屬物種菌株A)細菌。
在一些實施方式中,細菌係阿加薩桿菌屬物種的菌株。在一些實施方式中,阿加薩桿菌屬物種菌株係與阿加薩桿菌屬物種菌株A(ATCC保藏號PTA-125892)的核苷酸序列(例如,基因組序列、16S序列、CRISPR序列)具有至少95%、至少96%、至少97%、至少98%或至少99%序列同一性(例如,至少99.5%序列同一性、至少99.6%序列同一性、至少99.7%序列同一性、至少99.8%序列同一性、至少99.9%序列同一性)的菌株。在一些實施方式中,阿加薩桿菌屬物種菌株係阿加薩桿菌屬物種菌株A(ATCC保藏號PTA- 125892)細菌。
在一些實施方式中,細菌屬於擬桿菌綱[擬桿菌門]。在一些實施方式中,細菌屬於擬桿菌目。在一些實施方式中,細菌屬於紫單胞菌科。在一些實施方式中,細菌屬於普雷沃菌科。在一些實施方式中,細菌屬於擬桿菌綱,其中細菌的細胞被膜結構係雙層的(diderm)。在一些實施方式中,細菌屬於擬桿菌綱、革蘭氏陰性染色。在一些實施方式中,細菌屬於擬桿菌綱,其中細菌係雙層的並且細菌係革蘭氏陰性染色。
在一些實施方式中,細菌屬於梭菌綱[厚壁菌門]。在一些實施方式中,細菌屬於真細菌目(
Eubacteriales)。在一些實施方式中,細菌屬於顫螺旋菌科。在一些實施方式中,細菌屬於毛螺菌科。在一些實施方式中,細菌屬於消化鏈球菌科。在一些實施方式中,細菌屬於梭菌目XIII科
/地位未定41。在一些實施方式中,細菌屬於梭菌綱,其中細菌的細胞被膜結構係單層的(monoderm)。在一些實施方式中,細菌屬於梭菌綱、革蘭氏陰性染色。在一些實施方式中,細菌屬於梭菌綱、革蘭氏陽性染色。在一些實施方式中,細菌屬於梭菌綱,其中細菌的細胞被膜結構係單層的並且細菌係革蘭氏陰性染色。在一些實施方式中,細菌屬於梭菌綱,其中細菌的細胞被膜結構係單層的並且細菌係革蘭氏陽性染色。
在一些實施方式中,細菌屬於Negativicutes綱[厚壁菌門]。在一些實施方式中,細菌屬於韋榮氏球菌目。在一些實施方式中,細菌屬於韋榮氏球菌科。在一些實施方式中,細菌屬於月形單胞菌目(
Selenomonadales)。在一些實施方式中,細菌屬於月形單胞菌科。在一些實施方式中,細菌屬於
Sporomusaceae科。在一些實施方式中,細菌屬於Negativicutes綱,其中細菌的細胞被膜結構係雙層的。在一些實施方式中,細菌屬於Negativicutes綱、革蘭氏陰性染色。在一些實施方式中,細菌屬於
Negativicutes綱,其中細菌的細胞被膜結構係雙層的並且細菌係革蘭氏陰性染色。
在一些實施方式中,細菌屬於互養菌綱[互養菌門]。在一些實施方式中,細菌屬於互養菌目。在一些實施方式中,細菌屬於互養菌科。在一些實施方式中,細菌屬於互養菌綱,其中細菌的細胞被膜結構係雙層的。在一些實施方式中,細菌屬於互養菌綱、革蘭氏陰性染色。在一些實施方式中,細菌屬於互養菌綱,其中細菌的細胞被膜結構係雙層的並且細菌係革蘭氏陰性染色。
在一些實施方式中,細菌係產生代謝產物的細菌,例如,細菌產生丁酸、肌苷、丙酸、或色胺酸代謝產物。
在一些實施方式中,細菌產生丁酸。在一些實施方式中,細菌來自布勞特氏菌屬
;克裡斯滕森菌屬;糞球菌屬;真桿菌屬;
Lachnosperacea ;巨型球菌屬;或羅斯氏菌屬。
在一些實施方式中,細菌產生肌苷。在一些實施方式中,細菌來自雙歧桿菌屬;乳桿菌屬;或歐陸森氏菌屬。
在一些實施方式中,細菌產生丙酸。在一些實施方式中,細菌來自阿克曼氏菌屬;擬桿菌屬;戴阿利斯特菌屬(
Dialister);真桿菌屬;巨型球菌屬;副擬桿菌屬;普雷沃菌屬;瘤胃球菌屬;或韋榮氏球菌屬。
在一些實施方式中,細菌產生色胺酸代謝產物。在一些實施方式中,細菌來自乳桿菌屬或消化鏈球菌屬。
在一些實施方式中,細菌係產生組蛋白脫乙醯基酶3(HDAC3)的抑制劑的細菌。在一些實施方式中,細菌來自物種
Bariatricus massiliensis、普氏棲糞桿菌、馬賽巨型球菌或腸羅斯氏菌。
在一些實施方式中,細菌來自不動桿菌屬;
異常球菌屬;螺桿菌屬;紅球菌屬;食竇魏斯氏菌;明串珠菌屬;羅氏菌屬;差異球菌屬;芽孢桿菌屬;鏈型桿菌屬;棒狀桿菌屬;貪銅菌屬;水棲菌屬;微小桿菌屬;糞桿菌屬;
土芽孢桿菌屬;甲基桿菌屬;微球菌屬;摩根氏菌屬;變形桿菌屬;假單胞菌屬;根瘤菌屬;或鞘胺醇單胞菌屬。
在一些實施方式中,細菌來自物種鮑曼不動桿菌;
耐輻射異常球菌;幽門螺桿菌;馬紅球菌;食竇魏斯氏菌;耳炎差異球菌;陰道奇異菌;三井鏈型桿菌( Catenibacterium mituokai );麩胺酸棒狀桿菌;金橙黃微小桿菌( Exiguobacterium aurantiacum );嗜熱脂肪地桿菌; Methylobacterium jeotgali ;藤黃微球菌;摩根摩根氏菌;奇異變形桿菌;豌豆根瘤菌;污水溝羅斯氏菌( Rothia amarae );少動鞘胺醇單胞菌;或朝鮮鞘胺醇單胞菌(Sphingomonas koreens)。
在一些實施方式中,細菌來自
Cutibacterium屬。
在一些實施方式中,細菌來自物種
Cutibacterium avidum。
在一些實施方式中,細菌來自乳桿菌屬。
在一些實施方式中,細菌來自物種加氏乳桿菌;
乾酪乳桿菌;副乾酪乳桿菌;鼠李糖乳桿菌;或清酒乳桿菌。
在一些實施方式中,細菌來自
Dysosmobacter屬。
在一些實施方式中,細菌來自物種
Dysosmobacter welbionis。
在一些實施方式中,細菌來自
明串珠菌屬。在一些實施方式中,細菌來自賀氏明串珠菌細菌。在一些實施方式中,細菌來自賀氏明串珠菌Ceb-kc-003(KCCM11830P)。
在一些實施方式中,細菌來自物種耐金屬貪銅菌或釀膿鏈球菌。
在一些實施方式中,細菌來自巨型球菌屬物種細菌(例如,來自保藏號為NCIMB 43385、NCIMB 43386或NCIMB 43387的菌株)。
在一些實施方式中,細菌來自馬賽巨型球菌細菌(例如,來自保藏號為NCIMB 42787、NCIMB 43388或NCIMB 43389的菌株)。
在一些實施方式中,細菌來自馬賽巨型球菌細菌(例如,來自保藏號為DSM 26228的菌株)。
在一些實施方式中,細菌來自狄氏副擬桿菌細菌(例如,來自保藏號為NCIMB 42382的菌株)。
在一些實施方式中,細菌來自馬賽巨型球菌細菌(例如,來自保藏號為NCIMB 43388或NCIMB 43389的菌株)或其衍生物。參見,例如,WO 2020/120714。在一些實施方式中,馬賽巨型球菌細菌係與來自保藏號為NCIMB 43388或NCIMB 43389的菌株的馬賽巨型球菌細菌的核苷酸序列(例如,基因組序列、16S序列、和/或CRISPR序列)包含至少80%、至少85%、至少90%、至少95%、至少96%、至少97%、至少98%或至少99%序列同一性(例如,至少99.5%序列同一性、至少99.6%序列同一性、至少99.7%序列同一性、至少99.8%序列同一性、至少99.9%序列同一性)的菌株。在一些實施方式中,馬賽巨型球菌細菌係保藏號為NCIMB 43388或NCIMB 43389的菌株。
在一些實施方式中,細菌來自保藏號為NCIMB 42787的馬賽巨型球菌細菌菌株,或其衍生物。參見,例如,WO 2018/229216。在一些實施方式中,馬賽巨型球菌細菌係與以保藏號NCIMB 42787保藏的馬賽巨型球菌細菌菌株的核苷酸序列(例如,基因組序列、16S序列、和/或CRISPR序列)包含至少80%、至少85%、至少90%、至少95%、至少96%、至少97%、至少98%或至少99%序列同一性(例如,至少99.5%序列同一性、至少99.6%序列同一性、至少99.7%序列同一性、至少99.8%序列同一性、至少99.9%序列同一性)的菌株。在一些實施方式中,馬賽巨型球菌細菌係以保藏號NCIMB 42787保藏的菌株。
在一些實施方式中,細菌來自保藏號為NCIMB 43385、NCIMB 43386或NCIMB 43387的菌株的巨型球菌屬物種細菌,或其衍生物。參見,例如,WO 2020/120714。在一些實施方式中,巨型球菌屬物種細菌係與來自保藏號為NCIMB 43385,NCIMB 43386或NCIMB 43387的菌株的巨型球菌屬物種的核苷酸序列(例如,基因組序列、16S序列、和/或CRISPR序列)包含至少80%、至少85%、至少90%、至少95%、至少96%、至少97%、至少98%或至少99%序列同一性(例如,至少99.5%序列同一性、至少99.6%序列同一性、至少99.7%序列同一性、至少99.8%序列同一性、至少99.9%序列同一性)的菌株。在一些實施方式中,巨型球菌屬物種細菌係保藏號為NCIMB 43385、NCIMB 43386或NCIMB 43387的菌株。
在一些實施方式中,細菌來自保藏號為NCIMB 42382的狄氏副擬桿菌細菌,或其衍生物。參見,例如,WO 2018/229216。在一些實施方式中,狄氏副擬桿菌細菌係與以保藏號NCIMB 42382保藏的狄氏副擬桿菌細菌的核苷酸序列(例如,基因組序列、16S序列、和/或CRISPR序列)包含至少80%、至少85%、至少90%、至少95%、至少96%、至少97%、至少98%或至少99%序列同一性(例如,至少99.5%序列同一性、至少99.6%序列同一性、至少99.7%序列同一性、至少99.8%序列同一性、至少99.9%序列同一性)的菌株。在一些實施方式中,狄氏副擬桿菌細菌係以保藏號NCIMB 42382保藏的菌株。
在一些實施方式中,細菌來自保藏號為DSM 26228的馬賽巨型球菌細菌,或其衍生物。參見,例如,WO 2018/229216。在一些實施方式中,馬賽巨型球菌細菌係與以保藏號DSM 26228保藏的馬賽巨型球菌細菌的核苷酸序列(例如,基因組序列、16S序列、和/或CRISPR序列)包含至少80%、至少85%、至少90%、至少95%、至少96%、至少97%、至少98%或至少99%序列同一性(例如,至少99.5%序列同一性、至少99.6%序列同一性、至少99.7%序列同一性、至少99.8%序列同一性、至少99.9%序列同一性)的菌株。在一些實施方式中,馬賽巨型球菌細菌係以保藏號DSM 26228保藏的菌株。
在一些實施方式中,藥劑包含分離的mEV(例如,來自一種或多種細菌菌株(例如,目的細菌)(例如,其治療有效量)。例如,其中藥劑的至少50%、至少75%、至少80%、至少85%、至少90%、至少95%或至少99%的含量係細菌(例如,目的細菌)的分離的mEV。
在一些實施方式中,藥劑包含mEV,並且mEV包含分泌型mEV(smEV)。
在一些實施方式中,藥劑包含mEV,並且mEV包含經處理的mEV(pmEV)。
在一些實施方式中,藥劑包含pmEV,並且pmEV由已經經γ照射、UV照射、熱滅活、酸處理或氧噴射的細菌產生。
在一些實施方式中,藥劑包含pmEV,並且pmEV由活細菌產生。
在一些實施方式中,藥劑包含pmEV,並且pmEV產生自死細菌。
在一些實施方式中,藥劑包含pmEV,並且pmEV產生自非複製型細菌。
在一些實施方式中,藥劑包含mEV,並且mEV來自一種細菌菌株。
在一些實施方式中,mEV被凍乾(例如,凍乾的產物進一步包含藥學上可接受的賦形劑)。
在一些實施方式中,mEV被γ照射。
在一些實施方式中,mEV被UV照射。
在一些實施方式中,mEV被熱滅活(例如,在50°C下兩小時或在90°C下兩小時)。
在一些實施方式中,mEV被酸處理。
在一些實施方式中,mEV被噴氧(例如,以0.1 vvm持續兩小時)。
在一些實施方式中,mEV來自革蘭氏陽性細菌。
在一些實施方式中,mEV來自革蘭氏陰性細菌。
在一些實施方式中,mEV來自需氧細菌。
在一些實施方式中,mEV來自厭氧細菌。在一些實施方式中,厭氧細菌包含專性厭氧菌。在一些實施方式中,厭氧細菌包含兼性厭氧菌。
在一些實施方式中,mEV來自嗜酸細菌。
在一些實施方式中,mEV來自嗜鹼細菌。
在一些實施方式中,mEV來自嗜中性細菌。
在一些實施方式中,mEV來自難養細菌。
在一些實施方式中,mEV來自非難養細菌。
在一些實施方式中,mEV來自表1、表2、表3或表4中列出的分類學組(例如,綱、目、科、屬、種或菌株)的細菌。
在一些實施方式中,mEV來自表1、表2、表3或表4中列出的細菌菌株。
在一些實施方式中,mEV來自表J中列出的分類學組(例如,綱、目、科、屬、種或菌株)的細菌。
在一些實施方式中,mEV來自表J中列出的細菌菌株。
在一些實施方式中,革蘭氏陰性細菌屬於
Negativicutes綱。
在一些實施方式中,革蘭氏陰性細菌屬於韋榮氏球菌科(
Veillonellaceae)、月形單胞菌科(
Selenomonadaceae)、胺基酸球菌科(
Acidaminococcaceae)或
Sporomusaceae科。
在一些實施方式中,mEV來自以下屬的細菌:巨型球菌屬
( Megasphaera )、月形單胞菌屬
( Selenomonas )、 Propionospora 、或胺基酸球菌屬(Acidaminococcus)。
在一些實施方式中,mEV係巨型球菌屬物種(
Megasphaera sp.)
、菲利克斯新月形單胞菌(Selenomonas felix)、腸胺基酸球菌(Acidaminococcus intestine)、或Propionospora屬物種細菌。
在一些實施方式中,mEV來自乳球菌屬、普雷沃菌屬、雙歧桿菌屬、或韋榮氏球菌屬的細菌。
在一些實施方式中,mEV來自乳酸乳球菌乳脂亞種細菌。
在一些實施方式中,mEV來自棲組織普雷沃菌(
Prevotella histicola)細菌。
在一些實施方式中,mEV來自動物雙歧桿菌細菌。
在一些實施方式中,mEV來自小韋榮氏球菌細菌。
在一些實施方式中,mEV來自乳酸乳球菌乳脂亞種細菌。在一些實施方式中,該乳酸乳球菌乳脂亞種細菌來自與乳酸乳球菌乳脂亞種菌株A(ATCC指定編號PTA-125368)的核苷酸序列具有至少90%或至少97%基因組、16S和/或CRISPR序列同一性的菌株。在一些實施方式中,該乳球菌屬細菌來自與乳酸乳球菌乳脂亞種菌株A(ATCC指定編號PTA-125368)的核苷酸序列具有至少99%基因組、16S和/或CRISPR序列同一性的菌株。在一些實施方式中,該乳球菌屬細菌來自乳酸乳球菌乳脂亞種菌株A(ATCC指定編號PTA-125368)。
在一些實施方式中,mEV來自普雷沃菌屬細菌。在一些實施方式中,該普雷沃菌屬細菌來自包含與該普雷沃菌菌株B 50329 (NRRL保藏號B 50329)的核苷酸序列有至少90%(或至少97%)基因組、16S和/或CRISPR序列同一性的菌株。在一些實施方式中,該普雷沃菌屬細菌來自包含與該普雷沃菌菌株B 50329 (NRRL保藏號B 50329)的核苷酸序列有至少99%基因組、16S和/或CRISPR序列同一性的菌株。在一些實施方式中,該普雷沃菌屬細菌來自普雷沃菌菌株B 50329 (NRRL保藏號B 50329)。
在一些實施方式中,藥劑的細菌或藥劑的mEV自其獲得的細菌係普雷沃菌屬細菌,例如包含與普雷沃菌屬菌株C(ATCC保藏號PTA-126140)的核苷酸序列具有至少90%或至少99%基因組、16S和/或CRISPR序列同一性的菌株。在一些實施方式中,藥劑的細菌或藥劑的mEV自其獲得的細菌係普雷沃菌屬細菌,例如普雷沃菌屬菌株C(ATCC保藏號PTA-126140)。
在一些實施方式中,mEV來自雙歧桿菌屬細菌。在一些實施方式中,該雙歧桿菌屬細菌來自與雙歧桿菌屬細菌(保藏為ATCC指定編號PTA-125097)的核苷酸序列具有至少90%或至少97%基因組、16S和/或CRISPR序列同一性的菌株。在一些實施方式中,該雙歧桿菌屬細菌來自與雙歧桿菌屬細菌(保藏為ATCC指定編號PTA-125097)的核苷酸序列具有至少99%基因組、16S和/或CRISPR序列同一性的菌株。在一些實施方式中,該雙歧桿菌屬細菌來自雙歧桿菌屬細菌(保藏為ATCC指定編號PTA-125097)。
在一些實施方式中,mEV來自韋榮氏球菌屬細菌。在一些實施方式中,該韋榮氏球菌屬細菌來自與韋榮氏球菌屬細菌(保藏為ATCC指定編號PTA-125691)的核苷酸序列具有至少90%或至少97%基因組、16S和/或CRISPR序列同一性的菌株。在一些實施方式中,該韋榮氏球菌屬細菌來自與韋榮氏球菌屬細菌(保藏為ATCC指定編號PTA-125691)的核苷酸序列具有至少99%基因組、16S和/或CRISPR序列同一性的菌株。在一些實施方式中,該韋榮氏球菌屬細菌來自韋榮氏球菌屬細菌(保藏為ATCC指定編號PTA-125691)。
在一些實施方式中,mEV來自活潑瘤胃球菌細菌。在一些實施方式中,該活潑瘤胃球菌細菌來自與活潑瘤胃球菌細菌(保藏為ATCC指定編號PTA-126695)的核苷酸序列具有至少90%或至少97%基因組、16S和/或CRISPR序列同一性的菌株。在一些實施方式中,該活潑瘤胃球菌細菌來自與活潑瘤胃球菌細菌(保藏為ATCC指定編號PTA-126695)的核苷酸序列具有至少99%基因組、16S和/或CRISPR序列同一性的菌株。在一些實施方式中,該活潑瘤胃球菌細菌來自活潑瘤胃球菌細菌(保藏為ATCC指定編號PTA-126695)。
在一些實施方式中,mEV來自巨型球菌屬物種細菌。在一些實施方式中,巨型球菌屬物種細菌來自與以ATCC指定編號PTA-126770保藏的巨型球菌屬物種細菌的核苷酸序列有至少90%(或至少97%)基因組、16S和/或CRISPR序列同一性的菌株。在一些實施方式中,該巨型球菌屬物種細菌來自與巨型球菌屬物種細菌(保藏為ATCC指定編號PTA-126770)的核苷酸序列具有至少99%基因組、16S和/或CRISPR序列同一性的菌株。在一些實施方式中,該巨型球菌屬物種細菌來自巨型球菌屬物種細菌(保藏為ATCC指定編號PTA-126770)。
在一些實施方式中,mEV來自
Fournierella massiliensis細菌。在一些實施方式中,
Fournierella massiliensis細菌來自與以ATCC指定編號PTA-126696保藏的
Fournierella massiliensis細菌的核苷酸序列有至少90%(或至少97%)基因組、16S和/或CRISPR序列同一性的菌株。在一些實施方式中,
Fournierella massiliensis細菌來自與以ATCC指定編號PTA-126696保藏的
Fournierella massiliensis細菌的核苷酸序列有至少99%基因組、16S和/或CRISPR序列同一性的菌株。在一些實施方式中,
Fournierella massiliensis細菌來自以ATCC指定編號PTA-126696保藏的
Fournierella massiliensis細菌。
在一些實施方式中,mEV來自
Harryflintia acetispora細菌。在一些實施方式中,
Harryflintia acetispora細菌來自與以ATCC指定編號PTA-126694保藏的
Harryflintia acetispora細菌的核苷酸序列有至少90%(或至少97%)基因組、16S和/或CRISPR序列同一性的菌株。在一些實施方式中,
Harryflintia acetispora細菌來自與以ATCC指定編號PTA-126694保藏的
Harryflintia acetispora細菌的核苷酸序列有至少99%基因組、16S和/或CRISPR序列同一性的菌株。在一些實施方式中,
Harryflintia acetispora細菌來自以ATCC指定編號PTA-126694保藏的
Harryflintia acetispora細菌。
在一些實施方式中,mEV來自以下科的細菌:胺基酸球菌科、產鹼桿菌科、阿克曼氏菌科、擬桿菌科、雙歧桿菌科、伯克霍爾德菌科、
Catabacteriaceae科、克裡斯滕森菌科、梭菌科、紅蝽菌科、腸桿菌科、腸球菌科、梭桿菌科、毛螺菌科、李斯特菌科、分枝桿菌科、奈瑟菌科、臭桿菌科、顫螺旋菌科、消化球菌科、消化鏈球菌科、卟啉單胞菌科、普雷沃菌科、丙酸桿菌科、理研菌科、瘤胃球菌科、月形單胞菌科、
Sporomusaceae科、鏈球菌科、鏈黴菌科、薩特氏菌科、互養菌科、坦納菌科或韋榮氏球菌科。
在一些實施方式中,mEV來自阿克曼氏菌屬、克裡斯滕森菌屬、布勞特氏菌屬、腸球菌屬、真桿菌屬、羅斯氏菌屬、擬桿菌屬、副擬桿菌屬、或丹毒絲梭菌屬的細菌。
在一些實施方式中,mEV來自產氫營養型布勞特氏菌
、排泄物布勞特氏菌、韋氏布勞特氏菌、糞真桿菌、扭曲真桿菌、直腸真桿菌、糞腸球菌、耐久腸球菌、 Enterococcus villorum 、鶉雞腸球菌;乳酸雙歧桿菌、兩歧雙歧桿菌、長雙歧桿菌、動物雙歧桿菌或短雙歧桿菌細菌。
在一些實施方式中,mEV來自
BCG (卡介苗),副擬桿菌屬、布勞特氏菌屬、韋榮氏球菌屬、唾液乳桿菌、阿加薩桿菌屬( Agathobaculum )、活潑瘤胃球菌、解苯副梭菌、 Turicibacter sanguinus 、伯克霍爾德菌屬、類肺炎克雷白氏菌擬肺炎亞種、催產克雷白氏菌、納西利斯泰澤菌( Tyzerella nexilis )或奈瑟菌屬細菌。
在一些實施方式中,mEV來自產氫營養型布勞特氏菌(
Blautia hydrogenotrophica )細菌。
在一些實施方式中,mEV來自排泄物布勞特氏菌(
Blautia stercoris)細菌。
在一些實施方式中,mEV來自韋氏布勞特氏菌(
Blautia wexlerae)細菌。
在一些實施方式中,mEV來自鶉雞腸球菌(
Enterococcus gallinarum)細菌。
在一些實施方式中,mEV來自屎腸球菌(
Enterococcus faecium)細菌。
在一些實施方式中,mEV來自兩歧雙歧桿菌
( Bifidobacterium bifidium )細菌。
在一些實施方式中,mEV來自短雙歧桿菌(
Bifidobacterium breve)細菌。
在一些實施方式中,mEV來自長雙歧桿菌(
Bifidobacterium longum)細菌。
在一些實施方式中,mEV來自人羅斯拜瑞氏菌(
Roseburia hominis)細菌。
在一些實施方式中,mEV來自多形擬桿菌(
Bacteroides thetaiotaomicron)細菌。
在一些實施方式中,mEV來自糞居擬桿菌(
Bacteroides coprocola)細菌。
在一些實施方式中,mEV來自
Erysipelatoclostridium ramosum細菌。
在一些實施方式中,mEV來自馬賽巨型球菌(
Megasphera massiliensis)細菌。
在一些實施方式中,mEV來自真桿菌屬(
Eubacterium)細菌。
在一些實施方式中,mEV來自狄氏副擬桿菌(
Parabacteroides distasonis)細菌。
在一些實施方式中,mEV來自植物乳桿菌細菌。
在一些實施方式中,mEV來自
Negativicutes綱的細菌。
在一些實施方式中,mEV來自韋榮氏球菌科的細菌。
在一些實施方式中,mEV來自月形單胞菌科的細菌。
在一些實施方式中,mEV來自胺基酸球菌科的細菌。
在一些實施方式中,mEV來自
Sporomusaceae科的細菌。
在一些實施方式中,mEV來自巨型球菌屬的細菌。
在一些實施方式中,mEV來自月形單胞菌屬的細菌。
在一些實施方式中,mEV來自
Propionospora屬的細菌。
在一些實施方式中,mEV來自胺基酸球菌屬的細菌。
在一些實施方式中,mEV來自巨型球菌屬物種細菌。
在一些實施方式中,mEV來自菲利克斯月形單胞菌細菌。
在一些實施方式中,mEV來自腸胺基酸球菌細菌。
在一些實施方式中,mEV來自
Propionospora屬物種細菌。
在一些實施方式中,mEV來自梭菌綱的細菌。
在一些實施方式中,mEV來自顫螺旋菌科的細菌。
在一些實施方式中,mEV來自糞桿菌屬的細菌。
在一些實施方式中,mEV來自
Fournierella屬的細菌。
在一些實施方式中,mEV來自
Harryflintia屬的細菌。
在一些實施方式中,mEV來自阿加薩桿菌屬的細菌。
在一些實施方式中,mEV來自普氏棲糞桿菌(例如,普氏棲糞桿菌菌株A)細菌。
在一些實施方式中,mEV來自
Fournierella massiliensis(例如,
Fournierella massiliensis菌株A)細菌。
在一些實施方式中,mEV來自Harryflintia acetispora(例如,
Harryflintia acetispora菌株A)細菌。
在一些實施方式中,mEV來自阿加薩桿菌屬物種(例如,阿加薩桿菌屬物種菌株A)細菌。
在一些實施方式中,mEV來自阿加薩桿菌屬物種的菌株。在一些實施方式中,阿加薩桿菌屬物種菌株係與阿加薩桿菌屬物種菌株A(ATCC保藏號PTA-125892)的核苷酸序列(例如,基因組序列、16S序列、CRISPR序列)具有至少95%、至少96%、至少97%、至少98%或至少99%序列同一性(例如,至少99.5%序列同一性、至少99.6%序列同一性、至少99.7%序列同一性、至少99.8%序列同一性、至少99.9%序列同一性)的菌株。在一些實施方式中,阿加薩桿菌屬物種菌株係阿加薩桿菌屬物種菌株A(ATCC保藏號PTA- 125892)細菌。
在一些實施方式中,mEV來自擬桿菌綱[擬桿菌門]的細菌。在一些實施方式中,mEV來自擬桿菌目的細菌。在一些實施方式中,mEV來自紫單胞菌科的細菌。在一些實施方式中,mEV來自普雷沃菌科的細菌。在一些實施方式中,mEV來自擬桿菌綱的細菌,其中細菌的細胞被膜結構係雙層的。在一些實施方式中,mEV來自擬桿菌綱、革蘭氏陰性染色的細菌。在一些實施方式中,mEV來自擬桿菌綱的細菌,其中細菌係雙層的並且該細菌係革蘭氏陰性染色。
在一些實施方式中,mEV來自梭菌綱[厚壁菌門]的細菌。在一些實施方式中,mEV來自真細菌目的細菌。在一些實施方式中,mEV來自顫螺旋菌科的細菌。在一些實施方式中,mEV來自毛螺菌科的細菌。在一些實施方式中,mEV來自消化鏈球菌科的細菌。在一些實施方式中,mEV來自梭菌目XIII科/地位未定41的細菌。在一些實施方式中,mEV來自梭菌綱的細菌,其中細菌的細胞被膜結構係單層的。在一些實施方式中,mEV來自梭菌綱、革蘭氏陰性染色的細菌。在一些實施方式中,mEV來自梭菌綱、革蘭氏陽性染色的細菌。在一些實施方式中,mEV來自梭菌綱的細菌,其中細菌的細胞被膜結構係單層的並且該細菌係革蘭氏陰性染色。在一些實施方式中,mEV來自梭菌綱的細菌,其中細菌的細胞被膜結構係單層的並且該細菌係革蘭氏陽性染色。
在一些實施方式中,mEV來自
Negativicutes綱[厚壁菌門]的細菌。在一些實施方式中,mEV來自韋榮氏球菌目的細菌。在一些實施方式中,mEV來自韋榮氏球菌科的細菌。在一些實施方式中,mEV來自月形單胞菌目的細菌。在一些實施方式中,mEV來自月形單胞菌科的細菌。在一些實施方式中,mEV來自
Sporomusaceae科的細菌。在一些實施方式中,mEV來自
Negativicutes綱的細菌,其中細菌的細胞被膜結構係雙層的。在一些實施方式中,mEV來自
Negativicutes綱、革蘭氏陰性染色的細菌。在一些實施方式中,mEV來自
Negativicutes綱的細菌,其中細菌的細胞被膜結構係雙層的並且該細菌係革蘭氏陰性染色。
在一些實施方式中,mEV來自互養菌綱[互養菌門]的細菌。在一些實施方式中,mEV來自互養菌目的細菌。在一些實施方式中,mEV來自互養菌科的細菌。在一些實施方式中,mEV來自互養菌綱的細菌,其中細菌的細胞被膜結構係雙層的。在一些實施方式中,mEV來自互養菌綱、革蘭氏陰性染色的細菌。在一些實施方式中,mEV來自互養菌綱的細菌,其中細菌的細胞被膜結構係雙層的並且該細菌係革蘭氏陰性染色。
在一些實施方式中,mEV來自產生代謝產物的細菌,例如,細菌產生丁酸、肌苷、丙酸、或色胺酸代謝產物。
在一些實施方式中,mEV來自產生丁酸鹽的細菌。在一些實施方式中,mEV來自以下屬的細菌:布勞特氏菌屬
;克裡斯滕森菌屬;糞球菌屬;真桿菌屬;
Lachnosperacea ;巨型球菌屬;或羅斯氏菌屬。
在一些實施方式中,mEV來自產生肌苷的細菌。在一些實施方式中,mEV來自以下屬的細菌:雙歧桿菌屬
;乳桿菌屬;或歐陸森氏菌屬。
在一些實施方式中,mEV來自產生丙酸鹽的細菌。在一些實施方式中,mEV來自以下屬的細菌:阿克曼氏菌屬;擬桿菌屬;戴阿利斯特菌屬;真桿菌屬;巨型球菌屬;副擬桿菌屬;普雷沃菌屬;瘤胃球菌屬;或韋榮氏球菌屬。
在一些實施方式中,mEV來自產生色胺酸代謝物的細菌。在一些實施方式中,mEV來自乳桿菌屬或消化鏈球菌屬的細菌。
在一些實施方式中,mEV來自產生組蛋白脫乙醯基酶3(HDAC3)的抑制劑的細菌。在一些實施方式中,mEV來自物種
Bariatricus massiliensis、普氏棲糞桿菌、馬賽巨型球菌或腸羅斯氏菌的細菌。
在一些實施方式中,mEV來自以下屬的細菌:
不動桿菌屬;異常球菌屬;螺桿菌屬;紅球菌屬;食竇魏斯氏菌;明串珠菌屬;羅氏菌屬;差異球菌屬;芽孢桿菌屬;鏈型桿菌屬;棒狀桿菌屬;貪銅菌屬;水棲菌屬;微小桿菌屬;糞桿菌屬;
土芽孢桿菌屬;甲基桿菌屬;微球菌屬;摩根氏菌屬;變形桿菌屬;假單胞菌屬;根瘤菌屬;或鞘胺醇單胞菌屬。
在一些實施方式中,mEV來自物種鮑曼不動桿菌;
耐輻射異常球菌;幽門螺桿菌;馬紅球菌;食竇魏斯氏菌;耳炎差異球菌;陰道奇異菌;三井鏈型桿菌( Catenibacterium mituokai );麩胺酸棒狀桿菌;金橙黃微小桿菌( Exiguobacterium aurantiacum );嗜熱脂肪地桿菌; Methylobacterium jeotgali ;藤黃微球菌;摩根摩根氏菌;奇異變形桿菌;豌豆根瘤菌;污水溝羅斯氏菌( Rothia amarae );少動鞘胺醇單胞菌;或朝鮮鞘胺醇單胞菌(Sphingomonas koreens)。
在一些實施方式中,mEV來自
Cutibacterium屬的細菌。
在一些實施方式中,mEV來自物種
Cutibacterium avidum的細菌。
在一些實施方式中,mEV來自乳桿菌屬屬的細菌。
在一些實施方式中,mEV來自物種加氏乳桿菌;
乾酪乳桿菌;副乾酪乳桿菌;鼠李糖乳桿菌;或清酒乳桿菌。
在一些實施方式中,mEV來自
Dysosmobacter屬的細菌。
在一些實施方式中,mEV來自物種
Dysosmobacter welbionis的細菌。
在一些實施方式中,mEV來自明串珠菌屬的細菌。
在一些實施方式中,mEV來自賀氏明串珠菌細菌。在一些實施方式中,mEV來自賀氏明串珠菌Ceb-kc-003(KCCM11830P)細菌。
在一些實施方式中,mEV來自物種耐金屬貪銅菌或釀膿鏈球菌。
在一些實施方式中,mEV來自巨型球菌屬物種細菌(例如,來自保藏號為NCIMB 43385、NCIMB 43386或NCIMB 43387的菌株)。
在一些實施方式中,mEV來自馬賽巨型球菌細菌(例如,來自保藏號為NCIMB 42787、NCIMB 43388或NCIMB 43389的菌株)。
在一些實施方式中,mEV來自馬賽巨型球菌細菌(例如,來自保藏號為DSM 26228的菌株)。
在一些實施方式中,mEV來自狄氏副擬桿菌細菌(例如,來自保藏號為NCIMB 42382的菌株)。
在一些實施方式中,mEV來自馬賽巨型球菌細菌(例如,來自保藏號為NCIMB 43388或NCIMB 43389的菌株)或其衍生物。參見,例如,WO 2020/120714。在一些實施方式中,馬賽巨型球菌細菌係與來自保藏號為NCIMB 43388或NCIMB 43389的菌株的馬賽巨型球菌細菌的核苷酸序列(例如,基因組序列、16S序列、和/或CRISPR序列)包含至少80%、至少85%、至少90%、至少95%、至少96%、至少97%、至少98%或至少99%序列同一性(例如,至少99.5%序列同一性、至少99.6%序列同一性、至少99.7%序列同一性、至少99.8%序列同一性、至少99.9%序列同一性)的菌株。在一些實施方式中,馬賽巨型球菌細菌係保藏號為NCIMB 43388或NCIMB 43389的菌株。
在一些實施方式中,mEV來自保藏號為NCIMB 42787的馬賽巨型球菌細菌菌株,或其衍生物。參見,例如,WO 2018/229216。在一些實施方式中,馬賽巨型球菌細菌係與以保藏號NCIMB 42787保藏的馬賽巨型球菌細菌菌株的核苷酸序列(例如,基因組序列、16S序列、和/或CRISPR序列)包含至少80%、至少85%、至少90%、至少95%、至少96%、至少97%、至少98%或至少99%序列同一性(例如,至少99.5%序列同一性、至少99.6%序列同一性、至少99.7%序列同一性、至少99.8%序列同一性、至少99.9%序列同一性)的菌株。在一些實施方式中,馬賽巨型球菌細菌係以保藏號NCIMB 42787保藏的菌株。
在一些實施方式中,mEV來自來自保藏號為NCIMB 43385、NCIMB 43386或NCIMB 43387的菌株的巨型球菌屬物種細菌,或其衍生物。參見,例如,WO 2020/120714。在一些實施方式中,巨型球菌屬物種細菌係與來自保藏號為NCIMB 43385,NCIMB 43386或NCIMB 43387的菌株的巨型球菌屬物種的核苷酸序列(例如,基因組序列、16S序列、和/或CRISPR序列)包含至少80%、至少85%、至少90%、至少95%、至少96%、至少97%、至少98%或至少99%序列同一性(例如,至少99.5%序列同一性、至少99.6%序列同一性、至少99.7%序列同一性、至少99.8%序列同一性、至少99.9%序列同一性)的菌株。在一些實施方式中,巨型球菌屬物種細菌係保藏號為NCIMB 43385、NCIMB 43386或NCIMB 43387的菌株。
在一些實施方式中,mEV來自保藏號為NCIMB 42382的狄氏副擬桿菌細菌,或其衍生物。參見,例如,WO 2018/229216。在一些實施方式中,狄氏副擬桿菌細菌係與以保藏號NCIMB 42382保藏的狄氏副擬桿菌細菌的核苷酸序列(例如,基因組序列、16S序列、和/或CRISPR序列)包含至少80%、至少85%、至少90%、至少95%、至少96%、至少97%、至少98%或至少99%序列同一性(例如,至少99.5%序列同一性、至少99.6%序列同一性、至少99.7%序列同一性、至少99.8%序列同一性、至少99.9%序列同一性)的菌株。在一些實施方式中,狄氏副擬桿菌細菌係以保藏號NCIMB 42382保藏的菌株。
在一些實施方式中,mEV來自保藏號為DSM 26228的馬賽巨型球菌細菌,或其衍生物。參見,例如,WO 2018/229216。在一些實施方式中,馬賽巨型球菌細菌係與以保藏號DSM 26228保藏的馬賽巨型球菌細菌的核苷酸序列(例如,基因組序列、16S序列、和/或CRISPR序列)包含至少80%、至少85%、至少90%、至少95%、至少96%、至少97%、至少98%或至少99%序列同一性(例如,至少99.5%序列同一性、至少99.6%序列同一性、至少99.7%序列同一性、至少99.8%序列同一性、至少99.9%序列同一性)的菌株。在一些實施方式中,馬賽巨型球菌細菌係以保藏號DSM 26228保藏的菌株。
在一些實施方式中,藥劑包含細菌並且細菌的劑量為約1 x 10
7至約2 x 10
12(例如,約3 x 10
10或約1.5 x 10
11或約1.5 x 10
12)細胞(例如,其中藉由Coulter計數器確定的總細胞計數來確定細胞數),其中劑量係按每膠囊或片劑計或按膠囊中的微型片劑的總數計。在一些實施方式中,藥劑包含細菌並且細菌的劑量為約1 x 10
10至約2 x 10
12(例如,約1.6 x 10
11或約8 x 10
11或約9.6 x 10
11約12.8 x 10
11或約1.6 x 10
12)細胞(例如,其中藉由Coulter計數器確定的總細胞計數來確定細胞數),其中劑量係按每膠囊或片劑計或按膠囊中的微型片劑的總數計。
在一些實施方式中,藥劑包含細菌並且細菌的劑量為約1 x 10
9、約3 x 10
9、約5 x 10
9、約1.5 x 10
10、約3 x 10
10、約5 x 10
10、約1.5 x 10
11、約1.5 x 10
12或約2 x 10
12細胞,其中劑量係按每膠囊或片劑計或按膠囊中的微型片劑的總數計。
在一些實施方式中,藥劑包含mEV並且mEV的劑量為約1 x 10
5至約7 x 10
13個顆粒(例如,其中藉由NTA(奈米顆粒跟蹤分析)確定顆粒計數),其中該劑量按每膠囊或片劑計或按膠囊中微型片劑的總數計。在一些實施方式中,藥劑包含mEV並且mEV的劑量為約1 x 10
10至約7 x 10
13個顆粒(例如,其中藉由NTA(奈米顆粒跟蹤分析)確定顆粒計數),其中該劑量按每膠囊或片劑計或按膠囊中微型片劑的總數計。
在一些實施方式中,藥劑包括粉末,該粉末包含細菌和/或mEV,並且該藥劑(例如,包含細菌和/或mEV的粉末)的劑量為約10 mg至約3500 mg,其中該劑量按每膠囊或片劑計或按膠囊中微型片劑的總數計。
在一些實施方式中,藥劑包括粉末,該粉末包含細菌和/或mEV,並且該藥劑(例如,包含細菌和/或mEV的粉末)的劑量為約10 mg至約1500 mg,其中該劑量按每膠囊或片劑計或按膠囊中微型片劑的總數計。
在一些實施方式中,藥劑包括粉末,該粉末包含細菌和/或mEV,並且該藥劑(例如,包含細菌和/或mEV的粉末)的劑量為約30 mg至約1300 mg(按細菌和/或mEV粉末的重量計)(約25、約30、約35、約50、約75、約100、約120、約150、約250、約300、約350、約400、約500、約600、約700、約750、約800、約900、約1000、約1100、約1200、約1250、約1300、約2000、約2500、約3000、或約3500 mg),其中該劑量按每膠囊或片劑計或按膠囊中微型片劑的總數計。
在一些實施方式中,藥劑包含細菌和/或mEV,並且該藥劑(例如,細菌和/或mEV)的劑量為約2x10
6至約2x10
16個顆粒(例如,其中藉由NTA(奈米顆粒跟蹤分析)確定顆粒計數),其中該劑量按每膠囊或片劑計或按膠囊中微型片劑的總數計。
在一些實施方式中,藥劑包含細菌和/或mEV,並且該藥劑(例如,細菌和/或mEV)的劑量為約5 mg至約900 mg總蛋白(例如,其中總蛋白藉由布拉德福測定法(Bradford assay)或BCA確定),其中該劑量按每膠囊或片劑計或按膠囊中微型片劑的總數計。
在一些實施方式中,固體劑型還包含一種或多種另外的治療劑。
在一些方面,本揭露提供了治療受試者(例如人)(例如需要治療的受試者)之方法,該方法包括向受試者施用本文提供的固體劑型。在一些方面,本揭露提供了本文提供的固體劑型,其用於治療受試者(例如人)(例如需要治療的受試者)。在一些方面,本揭露提供了本文提供的固體劑型在製備用於治療受試者(例如人)(例如需要治療的受試者)的藥物中的用途。
在一些實施方式中,固體劑型經口服施用(例如用於口服施用)。
在一些實施方式中,將固體劑型施用給處於進食或禁食狀態的受試者。在一些實施方式中,將固體劑型施用給空腹(例如,進食前一小時或進食後兩小時)受試者。在一些實施方式中,固體劑型在進食前一小時施用給受試者。在一些實施方式中,固體劑型在進食後兩小時施用給受試者。
在一些實施方式中,固體劑型(例如,片劑或多個微型片劑(例如,包含在膠囊中))被施用(例如,用於施用)每天1、2、3或4次。在一些實施方式中,固體劑型包含片劑或多個微型片劑(例如,包含在膠囊中)並且每天1、2、3或4次施用(例如,用於施用)1、2、3或4個固體劑型(例如,片劑或多個微型片劑(例如,包含在膠囊中)。
在一些實施方式中,固體劑型提供了藥劑在小腸中例如包含在固體劑型中的藥劑在小腸上部中的釋放。
在一些實施方式中,固體劑型將藥劑遞送至小腸,其中藥劑可作用於小腸中(例如在小腸上部)的免疫細胞和/或上皮細胞,以在整個身體引起作用(例如系統性作用)。
在一些實施方式中,例如當口服施用時,藥劑在胃腸道外提供一種或多種有益的免疫作用。
在一些實施方式中,例如當口服施用時,藥劑調節受試者的胃腸道外的免疫作用。
在一些實施方式中,例如當口服施用時,藥劑引起系統性作用(例如,胃腸道外的作用)。
在一些實施方式中,例如當口服施用時,藥劑對小腸中(例如在小腸上部)的免疫細胞和/或上皮細胞起作用,例如引起系統性作用(例如,胃腸道外的作用)。
在一些實施方式中,固體劑型經口服施用並且在胃腸道外具有一種或多種有益的免疫作用(例如,藥劑與小腸中的細胞之間的相互作用調節系統性免疫應答)。
在一些實施方式中,固體劑型經口服施用並且在胃腸道外調節免疫作用(例如,藥劑與小腸中(例如在小腸上部)的細胞之間的相互作用調節系統性免疫應答)。
在一些實施方式中,固體劑型經口服施用並激活先天抗原呈遞細胞(例如在小腸中,例如在小腸上部)。
在一些實施方式中,受試者需要治療(和/或預防)癌症。
在一些實施方式中,受試者需要治療(和/或預防)自體免疫性疾病。
在一些實施方式中,受試者需要治療(和/或預防)炎性疾病。
在一些實施方式中,受試者需要治療(和/或預防)代謝性疾病。
在一些實施方式中,受試者需要治療(和/或預防)生態失調(dysbiosis)。
在一些實施方式中,固體劑型與治療劑(例如,另外的治療劑)組合施用。
在某些方面,本文提供了製備藥物組成物的固體劑型之方法,該方法包括將藥劑(例如,本文公開的細菌和/或細菌來源的試劑,例如本文公開的mEV)和一種或多種(例如一種、兩種或三種)賦形劑組合成藥物組成物。在某些實施方式中,藥劑總質量係藥物組成物總質量的至少5%、10%、15%、20%、25%、30%、35%、40%、45%、50%、55%、60%、65%、70%或75%。在一些實施方式中,藥劑總質量不超過藥物組成物總質量的75%、70%、65%、60%、55%、50%、45%、40%、35%、30%或25%。在一些實施方式中,一種或多種賦形劑的總質量為藥物組成物總質量的至少5%、至少10%、至少20%、至少30%、至少35%、至少40%、至少45%或至少50%。在一些實施方式中,一種或多種賦形劑的總質量不超過藥物組成物總質量的95%、90%、85%、80%、75%、70%、65%、60%或55%。
在一些實施方式中,一種或多種賦形劑包含矽化微晶纖維素。在一些實施方式中,一種或多種賦形劑包括交聚維酮(PVPP)。在某些實施方式中,本文提供的固體劑型包含矽化微晶纖維素。在一些實施方式中,矽化微晶纖維素為HD90級。在某些實施方式中,矽化微晶纖維素總質量為藥物組成物總質量的至少5%、7%、10%、15%、16%、17%、18%、19%、20%、21%、22%、23%、24%、25%、26%、27%、28%、29%、30%、31%、32%、33%、34%、35%、36%、37%、38%、39%、40%、41%、42%、43%、44%、45%、46%、47%、48%、49%、50%、51%、52%、53%、54%、55%、56%、57%、58%、59%、60%、61%、62%、63%、64%、65%、66%、67%、68%、70%、71%、72%、73%、74%、75%、76%、77%、78%、79%、80%、81%、82%、83%、84%、85%、86%、87%、88%、89%或90%。在某些實施方式中,矽化微晶纖維素總質量不超過藥物組成物總質量的5%、7%、10%、15%、16%、17%、18%、19%、20%、21%、22%、23%、24%、25%、26%、27%、28%、29%、30%、31%、32%、33%、34%、35%、36%、37%、38%、39%、40%、41%、42%、43%、44%、45%、46%、47%、48%、49%、50%、51%、52%、53%、54%、55%、56%、57%、58%、59%、60%、61%、62%、63%、64%、65%、66%、67%、68%、70%、71%、72%、73%、74%、75%、76%、77%、78%、79%、80%、81%、82%、83%、84%、85%、86%、87%、88%、89%或90%。在某些實施方式中,矽化微晶纖維素總質量為藥物組成物總質量的約5%、7%、10%、15%、16%、17%、18%、19%、20%、21%、22%、23%、24%、25%、26%、27%、28%、29%、30%、31%、32%、33%、34%、35%、36%、37%、38%、39%、40%、41%或42%、43%、44%、45%、46%、47%、48%、49%、50%、51%、52%、53%、54%、55%、56%、57%、58%、59%、60%、61%、62%、63%、64%、65%、66%、67%、68%、70%、71%、72%、73%、74%、75%、76%、77%、78%、79%、80%、81%、82%、83%、84%、85%、86%、87%、88%、89%或90%。在某些實施方式中,本文提供的固體劑型包含交聚維酮。在某些實施方式中,交聚維酮總質量係藥物組成物總質量的至少5%、6%、7%、8%、9%、10%、11%、12%、13%、14%、15%、16%、17%、18%、19%、20%、21%、22%、23%、24%、25%、26%、27%、28%、29%或30%。在某些實施方式中,交聚維酮總質量不超過藥物組成物總質量的5%、6%、7%、8%、9%、10%、11%、12%、13%、14%、15%、16%、17%18%、19%、20%、21%、22%、23%、24%、25%、26%、27%、28%、29%或30%。在某些實施方式中,交聚維酮總質量為藥物組成物總質量的約5%、6%、7%、8%、9%、10%、11%、12%、13%、14%、15%、16%、17%、18%、19%、20%、21%、22%、23%、24%、25%、26%、27%、28%、29%或30%。
在某些實施方式中,本文提供的固體劑型包含:(i) 藥劑,藥劑總質量為藥物組成物總質量的至少5%且不超過75%,和 (ii) 矽化微晶纖維素,矽化微晶纖維素總質量為藥物組成物總質量的至少5%(例如至少5%、7%、10%、15%、16%、17%、18%、19%、20%、21%、22%、23%、24%、25%、26%、27%、28%、29%、30%、31%、32%、33%、34%、35%、36%、37%、38%、39%、40%、41%、42%、43%、44%、45%、46%、47%、48%、49%、50%、51%、52%、53%、54%、55%、56%、57%、58%、59%、60%、61%、62%、63%、64%、65%、66%、67%、68%、70%、71%、72%、73%、74%、75%、76%、77%、78%、79%、80%、81%、82%、83%、84%、85%、86%、87%、88%、89%或90%)且不超過90%(例如不超過5%、7%、10%、15%、16%、17%、18%、19%、20%、21%、22%、23%、24%、25%、26%、27%、28%、29%、30%、31%、32%、33%、34%、35%、36%、37%、38%、39%、40%、41%、42%、43%、44%、45%、46%、47%、48%、49%、50%、51%、52%、53%、54%、55%、56%、57%、58%、59%、60%、61%、62%、63%、64%、65%、66%、67%、68%、70%、71%、72%、73%、74%、75%、76%、77%、78%、79%、80%、81%、82%、83%、84%、85%、86%、87%、88%、89%或90%)。在某些實施方式中,固體劑型進一步包含總交聚維酮,交聚維酮總質量為藥物組成物總質量的至少5%(例如至少5%、6%、7%、8%、9%、10%、11%、12%、13%、14%、15%、16%、17%、18%、19%、20%、21%、22%、23%、24%、25%、26%、27%、28%、29%或30%)且不超過30%(不超過5%、6%、7%、8%、9%、10%、11%、12%、13%、14%、15%、16%、17%、18%、19%、20%、21%、22%、23%、24%、25%、26%、27%、28%、29%或30%)。在某些實施方式中,矽化微晶纖維素總質量加上交聚維酮總質量為藥物組成物總質量的至少60%、70%、80%或90%。在一些實施方式中,固體劑型包含:矽化微晶纖維素總質量為藥物組成物總質量的約50%,交聚維酮總質量為藥物組成物總質量的約15%。在一些實施方式中,固體劑型包含:矽化微晶纖維素總質量為藥物組成物總質量的約76.4%,交聚維酮總質量為藥物組成物總質量的約15%。在一些實施方式中,固體劑型包含:矽化微晶纖維素總質量為藥物組成物總質量的約72.5%,交聚維酮總質量為藥物組成物總質量的約15%。在一些實施方式中,固體劑型包含:矽化微晶纖維素總質量為藥物組成物總質量的約20%,交聚維酮總質量為藥物組成物總質量的約15%。
在一些實施方式中,固體劑型包含一定量(例如,劑量)的活性成分(例如,細菌和細菌來源的試劑(例如,組分)(例如,微生物胞外囊泡或mEV))。在一些實施方式中,可以根據在藥劑的給定製劑(例如批次)中包含的活性成分的量來調節摻入固體劑型中的藥劑(包含活性成分)的量。在一些實施方式中,然後相應地調整矽化微晶纖維素的量。在一些實施方式中,當藥劑的量增加時,矽化微晶纖維素的量減少;並且反之亦然。在一些實施方式中,可以對藥劑和矽化微晶纖維素的量進行調整,但一種或多種賦形劑(例如,一種、兩種或三種賦形劑)的量保持不變,例如,對於給定的固體劑型配方的批次之間。在一些實施方式中,硬脂酸鎂和膠體二氧化矽的量也可以保持恒定,例如,對於給定的固體劑型配方的批次之間。例如,在本文提供的工作實例中,使用含有小韋榮氏球菌粉末的藥劑來製備兩種片劑固體劑型。兩種製劑都含有15%交聚維酮。另外,兩種製劑中的硬脂酸鎂和膠體二氧化矽分別分別為1%和1%。然而在一種製劑中,使用了33%藥劑。在另一種製劑中,使用了6.6%藥劑。為了針對不同的藥劑量進行調節,矽化微晶纖維素的量也不同:當使用33%藥劑時,50%矽化微晶纖維素;當使用6.6%藥劑時,76.4%矽化微晶纖維素。
在某些實施方式中,該方法進一步包括壓製藥物組成物,從而形成片劑或微型片劑。在一些實施方式中,該方法進一步包括對片劑或微型片劑進行腸溶包衣,從而製備經腸溶包衣的片劑。在某些實施方式中,該方法進一步包括將微型片劑裝載到膠囊中。
在某些實施方式中,該方法包括在將藥劑(例如,細菌(例如,本文揭露的細菌)和/或細菌來源的試劑,例如mEV(例如,本文揭露的mEV))和一種或多種(例如,一種、兩種或三種)賦形劑組合成藥物組成物之前對藥劑進行濕法製粒。在一些實施方式中,濕法製粒包括 (i) 將藥劑與製粒流體(例如,水、乙醇或異丙醇,單獨或組合)混合。在一些實施方式中,濕法製粒包括將藥劑與水混合。在一些實施方式中,濕法製粒包括 (ii) 乾燥混合的藥劑和製粒流體(例如,在流化床乾燥器上乾燥)。在一些實施方式中,濕法製粒包括 (iii) 研磨乾燥的藥劑和製粒流體。然後將研磨的藥劑和製粒流體與一種或多種(例如,一種、兩種或三種)賦形劑組合以製備藥物組成物。
在一些方面,本文提供包含藥劑的顆粒,例如,其中藥劑包含細菌(例如,本文揭露的細菌)和/或細菌來源的試劑,例如mEV(例如,本文揭露的mEV)(例如,藥劑可以是。該粉末包含細菌和/或細菌來源的試劑,例如mEV)。
相關申請的交叉引用
本申請要求2021年3月5日提交的美國臨時申請案號63/157,138以及2021年8月18日提交的美國臨時申請案號63/234,490之權益,將其各自的全部內容藉由引用併入本文。
定義
「佐劑」或「輔助療法」在廣義上係指影響受試者(例如人類)中的免疫學或生理學應答的藥劑。例如,佐劑可增加抗原隨時間或在目的區域(如腫瘤)中的存在,幫助吸收抗原呈遞細胞抗原,活化巨噬細胞及淋巴細胞並且支持細胞介素的產生。藉由改變免疫應答,佐劑可允許使用較小劑量的免疫相互作用劑以增加特定劑量的免疫相互作用劑的有效性或安全性。例如,佐劑可預防T細胞耗竭且因此增加特定免疫相互作用劑的有效性或安全性。
「施用」廣義上係指將組成物(例如,藥物組成物,例如本文描述的藥劑的固體劑型)施用給受試者的途徑。施用途徑的實例包含口服施用、直腸施用、局部施用、吸入(經鼻)或注射。注射施用包括靜脈內(IV)、肌內(IM)、腫瘤內(IT)及皮下(SC)施用。本文描述的藥物組成物可以任何形式藉由任何有效途徑施用,包括(但不限於)瘤內、經口、非經腸、腸內、靜脈內、腹膜內、局部、經皮(例如,使用任何標準貼劑)、皮內、經眼、經鼻(鼻內)、局部、非經口(諸如噴霧)、吸入、皮下、肌內、頰、舌下、(經)直腸、陰道、動脈內及鞘內、經黏膜(例如,舌下、經舌、(經)頰、(經)尿道、陰道(例如,經陰道及陰道周圍)、植入、膀胱內、肺內、十二指腸內、胃內及支氣管內。在較佳的實施方式中,藉由以下形式施用本文所述之藥物組成物:經口、經直腸、經腫瘤內、經局部、經膀胱內、藉由注射至引流淋巴結中或毗鄰引流淋巴結處、經靜脈內、藉由吸入或氣溶膠或經皮下。在另一個較佳的實施方式中,本文所述之藥物組成物口服、瘤內或靜脈內施用。在另一個實施方式中,本文所述之藥物組成物經口服施用。
如本文所用,術語「抗體」可指完整抗體及其抗原結合片段二者。完整抗體係包含由二硫鍵相互連接的至少兩條重(H)鏈及兩條輕(L)鏈的糖蛋白。每條重鏈包含重鏈可變區(在本文中縮寫為V
H)及重鏈恒定區。每條輕鏈包含輕鏈可變區(在本文中縮寫為V
L)及輕鏈恒定區。V
H及V
L區可進一步細分成超變區(稱為互補決定區(CDR))及更保守區(稱為框架區(FR)),二者散佈排列。每個V
H及V
L由三個CDR及四個FR構成,其自胺基-末端至羧基-末端按下列順序排列:FR1、CDR1、FR2、CDR2、FR3、CDR3、FR4。重鏈及輕鏈的可變區含有與抗原相互作用的結合結構域。術語「抗體」包含例如單株抗體、多株抗體、嵌合抗體、人類源化抗體、人類抗體、多特異性抗體(例如雙特異性抗體)、單鏈抗體及抗原結合抗體片段。
如本文所用,術語抗體的「抗原結合片段」及「抗原結合部分」係指抗體中保留結合抗原的能力的一個或多個片段。術語抗體的「抗原結合片段」內所涵蓋結合片段的實例包含Fab、Fab'、F(ab')
2、Fv、scFv、二硫化物連接的Fv、Fd、雙抗體、單鏈抗體、NANOBODIES®、經分離CDRH3及其他保留完整抗體的至少一部分可變區的抗體片段。該等抗體片段可使用常規重組和/或酶促技術來獲得且可以與完整抗體相同的方式針對抗原結合進行篩選。
「癌症」在廣義上係指宿主自有細胞的不受控、異常生長,這種生長導致對周圍組織及潛在地遠離宿主異常細胞生長初始位點的組織的侵襲。主要種類包括係上皮組織(例如皮膚、鱗狀細胞)癌症的癌;係結締組織(例如骨、軟骨、脂肪、肌肉、血管等)癌症的肉瘤;係血液形成組織(例如骨髓組織)癌症的白血病;係免疫細胞癌症的淋巴瘤及骨髓瘤;及包括腦及脊柱組織癌症的中樞神經系統癌症。「一種或多種癌症」和「一種或多種贅瘤」在本文中可互換使用。如本文所用,「癌症」係指所有類型的新發或復發癌症或贅瘤或惡性腫瘤,包括白血病、癌及肉瘤。癌症的具體實例係:癌、肉瘤、骨髓瘤、白血病、淋巴瘤及混合型腫瘤。癌症的非限制性實例係以下新發或復發癌症:腦癌、黑色素瘤、膀胱癌、乳癌、宮頸癌、大腸癌、頭頸癌、腎癌、肺癌、非小細胞肺癌、間皮瘤、卵巢癌、前列腺癌、肉瘤、胃癌、子宮癌及髓母細胞瘤。在一些實施方式中,癌症包括實性瘤。在一些實施方式中,癌症包括轉移。
「碳水化合物」係指糖或糖聚合物。術語「糖」、「多糖」、「碳水化合物」及「寡糖」可互換使用。大部分碳水化合物係具有許多羥基的醛或酮,通常在分子的每一碳原子上具有一個羥基。碳水化合物通常具有分子式C
nH
2nO
n。碳水化合物可為單糖、二糖、三糖、寡糖或多糖。最基本的碳水化合物係單糖,如葡萄糖、蔗糖、半乳糖、甘露糖、核糖、阿拉伯糖、木糖及果糖。二糖係兩個接合的單糖。示例性二糖包括蔗糖、麥芽糖、纖維二糖及乳糖。通常,寡糖包含三至六個單糖單元(例如棉子糖、水蘇糖),且多糖包含六個或更多個單糖單元。示例性多糖包含澱粉、糖原及纖維素。碳水化合物可含有經修飾糖單元,例如2’-去氧核糖,其中去除羥基,2’-氟核糖,其中羥基經氟代替;或N-乙醯基葡萄糖胺,其為葡萄糖的含氮形式(例如2’-氟核糖、去氧核糖及己糖)。碳水化合物可以許多不同形式存在,例如構象異構物、環狀形式、非環狀形式、立體異構物、互變異構物、端基差向異構物及異構物。
「細胞增強」在廣義上指細胞的流入或細胞在環境中的擴增,該等細胞在施用組成物之前基本上不存在於該環境中且不存在於該組成物本身中。增強環境的細胞包括免疫細胞、基質細胞、細菌及真菌細胞。特別受關注的環境係其中癌細胞駐留或定位的微環境。在一些情況下,該微環境係腫瘤微環境或腫瘤引流淋巴結。在其他情況下,該微環境係癌前組織位點或組成物的局部施用位點或其中該組成物在遠端施用後將積聚的位點。
「進化枝」指系統發育樹的OTU或成員,它們係系統發育樹中的統計有效節點的下游。進化枝包含系統發育樹中的一組末端葉,其係不同的單系進化單元且在某種程度上共用序列相似性。
來自兩種或更多種菌株的細菌的「組合」包括細菌在相同材料或產品中或在物理上連接的產品中的物理共存,及來自兩種或更多種菌株的細菌的在時間上的共施用或共定位。
來自兩個或更多個微生物(如細菌)菌株的mEV(如smEV和/或pmEV)的「組合」包括作為mEV(如smEV和/或pmEV)的獲得來源的微生物在相同材料或產品中或在物理上連接的產品中的物理共存,以及來自兩種或更多種菌株的mEV(如smEV和/或pmEV)在時間上的共施用或共定位。
術語「降低」或「消耗」意指變化,該變化使治療後與治療前狀態相比的差異(視情況而定)為至少10%、20%、30%、40%、50%、60%、70%、80%、90%、1/100、1/1000、1/10,000、1/100,000、1/1,000,000或不可檢測。可降低的性質包括免疫細胞、細菌細胞、基質細胞、髓源性抑制細胞、成纖維細胞、代謝物的數量;細胞介素的水平;或另一物理參數(如耳厚度(例如,在DTH動物模型中)或腫瘤的大小)。
「生態失調」係指腸道或其他身體區域的微生物群或微生物組的狀態,其他身體區域包括例如,黏膜或皮膚表面(或任何其他微生物組生態位),在該狀態下宿主腸道微生物組生態網路「微生物組」的正常的多樣性和/或功能被破壞。生態失調的狀態可能導致疾病狀態,或者僅在某些條件下或只有長期存在時可能是不健康的。生態失調可能是由於多種因素引起的,包括環境因素、感染原、宿主基因型、宿主飲食和/或壓力。生態失調可能導致:一個或多個細菌類型(例如,厭氧菌)、物種和/或菌株的普遍度發生變化(例如,增加或減少),宿主微生物組群體組成的多樣性發生變化(例如,增加或減少);導致一個或多個有益效應減少或喪失的一個或多個共生生物群體的變化(例如,增加或減少);一個或多個病原體(例如,病原細菌)群體的過度生長;和/或僅當存在某些條件時引起疾病的共生生物的存在、和/或過度生長。
術語「生態聚生體(ecological consortium)」係交換代謝物且彼此正性共調控的一組細菌,這與經由激活互補宿主通路來誘導宿主協同作用以改進功效的兩種細菌形成對比。
術語「有效劑量」或「有效量」係對於特定的藥用劑、組成物和施用方式有效地在受試者中實現期望的治療反應的藥劑的量。
如本文所用,「工程化細菌」係藉由人類活動已在遺傳上自天然狀態改變的任何細菌及任何這種細菌的子代。工程化細菌包括例如靶向遺傳修飾的產物、隨機誘變篩選的產物及定向演化的產物。
術語「表位」意指能夠特異性結合至抗體或T細胞受體的蛋白質決定子。表位通常由如胺基酸或糖側鏈等分子的化學活性表面分組組成。某些表位可藉由抗體能夠結合的胺基酸的特定序列來定義。
術語「基因」在廣義上用於指與生物功能有關的任一核酸。術語「基因」適用於特定基因組序列以及由該基因組序列編碼的cDNA或mRNA。
兩種核酸分子的核酸序列間「同一性」可使用已知電腦演算法(如「FASTA」程式)使用例如Pearson等人 (1988) Proc. Natl. Acad. Sci. USA [美國國家科學院院刊] 85:2444中的預設參數測定為同一性百分比(其他程式包括GCG套裝程式(Devereux, J.等人, Nucleic Acids Research [核酸研究] 12(I): 387 (1984))、BLASTP、BLASTN、FASTA Atschul, S. F.等人, J Molec Biol [分子生物學雜誌] 215:403 (1990);Guide to Huge Computers [巨型電腦指南], Mrtin J. Bishop編輯, Academic Press [學術出版社], San Diego [聖地牙哥], 1994及Carillo等人(1988) SIAM J Applied Math [工業和應用數學學會應用數學雜誌] 48:1073)。例如,可使用國家生物技術資訊中心資料庫(National Center for Biotechnology Information database)的BLAST功能來測定同一性。其他可商業或公開獲得的程式包括DNAStar 「MegAlign」程式(威斯康辛州麥迪森市(Madison, Wis.))及威斯康辛大學遺傳學電腦集團(University of Wisconsin Genetics Computer Group)(UWG)「Gap」程式(威斯康辛州麥迪森市)。
如本文所用,術語「免疫障礙」係指由免疫系統的活動引起的任何疾病、障礙或疾病症狀,包括自體免疫性疾病、炎性疾病及過敏。免疫障礙包括(但不限於)自體免疫性疾病(例如,牛皮癬、特應性皮炎、狼瘡、硬皮病、溶血性貧血、血管炎、一型糖尿病、格雷夫病(Grave’s disease)、類風濕性關節炎、多發性硬化、古德帕斯雷綜合症(Goodpasture’s syndrome)、惡性貧血和/或肌病)、炎性疾病(例如,尋常型痤瘡、氣喘、乳糜瀉、慢性前列腺炎、腎小球性腎炎、炎性腸病、盆腔炎、再灌注損傷、類風濕性關節炎、肉狀瘤病、移植排斥、血管炎和/或間質性膀胱炎),和/或過敏(例如,食物過敏、藥物過敏和/或環境過敏)。
「免疫療法」係使用受試者的免疫系統以治療疾病(例如,免疫疾病、炎性疾病、代謝性疾病、癌症)的治療且包括(例如)檢查點抑制劑、癌症疫苗、細胞介素、細胞療法、CAR-T細胞及樹突細胞療法。
術語「增加」意指變化,該變化使治療後與治療前狀態相比的差異(視情況而定)為至少高10%、20%、30%、40%、50%、60%、70%、80%、90%、2倍、4倍、10倍、100倍、10^3倍、10^4倍、10^5倍、10^6倍和/或10^7倍。可增加的性質包括免疫細胞、細菌細胞、基質細胞、髓源性抑制細胞、成纖維細胞、代謝物的數量;細胞介素的水平;或另一物理參數(如耳厚度(例如,在DTH動物模型中)或腫瘤的大小)。
「先天免疫促効劑」或「免疫佐劑」係特異性靶向先天免疫受體(包括Toll樣受體(TLR)、NOD受體、RLR、C型凝集素受體、STING-cGAS途徑組分、炎性體複合物)的小分子、蛋白質或其他藥劑。例如,LPS係細菌源的或合成的TLR-4促効劑且可使用鋁作為免疫刺激佐劑。免疫佐劑係特定類別的更廣泛的佐劑或輔助療法。STING促効劑的實例包括但不限於2'3'-cGAMP、3'3'-cGAMP、c-di-AMP、c-di-GMP、2'2'-cGAMP及2'3'-cGAM(PS)2(Rp/Sp)(2'3'-cGAMP的雙硫代磷酸酯類似物的Rp、Sp異構物)。TLR促効劑的實例包括但不限於TLRl、TLR2、TLR3、TLR4、TLR5、TLR6、TLR7、TLR8、TLR9、TLR10和TLR11。NOD促効劑的實例包括但不限於N-乙醯基胞壁醯基-L-丙胺醯基-D-異麩醯胺酸(胞壁醯二肽(MDP))、γ-D-麩胺醯基-內消旋-二胺基庚二酸(iE-DAP)及去胞壁醯肽(desmuramylpeptide(DMP))。
「內轉錄間隔區」或「ITS」係位於通常用於識別真核物種(特別地,真菌)的共同先質轉錄本上的結構核糖體RNA(rRNA)之間的一段非功能性RNA。形成核糖體的核的真菌的rRNA經轉錄為信號基因且由8S、5.8S及28S區域及分別在8S與5.8S之間及5.8S與28S區域之間的ITS4及5組成。如先前描述,在18S與5.8S之間及5.8S與28S區域之間的這類兩個雙譯基因嵌段(intercistronic segment)藉由剪接去除且出於條碼的目的在物種之間含有顯著變化(Schoch等人, Nuclear ribosomal internal transcribed spacer (ITS) region as a universal DNA barcode marker for Fungi [核糖體內轉錄間隔區(ITS)係真菌的通用DNA條碼標誌物].PNAS [美國國家科學院院刊] 109:6241-6246.2012)。18S rDNA傳統上用於系統發育重建,然而ITS可發揮此功能,因為其通常是高度保守的,但含有高變區,該等高變區具有足夠的核苷酸多樣性來區分大多數真菌的屬及物種。
術語「分離的」或「富集的」涵蓋具有以下特徵的微生物(如細菌)、mEV(如smEV和/或pmEV)或其他實體或物質:(1) 已與在最初產生(不論在自然界中或在實驗環境中)時與其締合的至少一些組分分離,和/或 (2) 係人工產生、製備、純化和/或製造的。分離的微生物或mEV可與至少約10%、約20%、約30%、約40%、約50%、約60%、約70%、約80%、約90%或更多的其最初締合的其他組分分離。在一些實施方式中,分離的微生物或mEV係大於約80%、約85%、約90%、約91%、約92%、約93%、約94%、約95%、約96%、約97%、約98%、約99%或大於約99%純的。如本文所用,物質基本上不含其他組分時係「純的」。術語「純化(purify、purifying及purified)」係指已與在最初產生或生成(例如不論在自然界中或在實驗環境中)時或在其最初產生之後的任一時間期間與其締合的至少一些組分分離的微生物或mEV或其他材料。如果微生物或微生物群體或mEV在產生時或在產生之後如從含有該微生物或微生物群體的材料或環境中分離,則可將該微生物或微生物群體或mEV視為經純化的,且經純化的微生物或微生物群體或mEV可含有高達約10%、約20%、約30%、約40%、約50%、約60%、約70%、約80%、約90%或高於約90%的其他材料且仍將其視為「分離的」。在一些實施方式中,經純化的微生物或微生物群體或mEV係大於約80%、約85%、約90%、約91%、約92%、約93%、約94%、約95%、約96%、約97%、約98%、約99%或大於約99%純的。在本文提供的微生物組成物的情況下,存在於組成物中的一種或多種微生物類型可從含有該微生物類型的材料或環境中產生和/或存在的一種或多種其他微生物中獨立地純化。微生物組成物及其微生物組分(例如mEV)通常從殘餘生境產物中純化。
如本文所用,「脂質」包括脂肪、油、三酸甘油酯、膽固醇、磷脂質、和任何形式的脂肪酸(包括游離脂肪酸)。脂肪、油及脂肪酸可為飽和、不飽和(順式或反式)或部分不飽和(順式或反式)。
術語「LPS突變體或脂多糖突變體」廣義上係指所選的包含LPS損失的細菌。LPS損失可能是由於參與脂質A生物合成的基因如
lpxA、
lpxC和
lpxD的突變或破壞所致。包含LPS突變體的細菌可能對胺基糖苷類和多黏菌素(多黏菌素B和黏菌素)具有抗性。
如本文所用的「代謝物」係指在任何細胞或微生物代謝反應中用作底物或作為產物化合物、組成物、分子、離子、輔助因子、催化劑或營養素產生自任何細胞或微生物代謝反應的任何及所有分子化合物、組成物、分子、離子、輔助因子、催化劑或營養素。
「微生物」係指表徵為古生菌、寄生蟲、細菌、真菌、微觀藻類、原生動物及與該生物體相關的發育階段或生命週期階段(例如,植物、孢子(包括孢子形成、休眠及萌發)、潛伏、生物膜)的任何天然或經改造的生物體。腸道微生物的實例包括:葛氏放線菌(
Actinomyces graevenitzii)、齲齒放線菌(
Actinomyces odontolyticus)、嗜黏蛋白阿克曼氏菌(
Akkermansia muciniphila)、糞擬桿菌(
Bacteroides caccae )、脆弱擬桿菌(
Bacteroides fragilis)、腐敗擬桿菌(
Bacteroides putredinis)、多形擬桿菌(
Bacteroides thetaiotaomicron)、普通擬桿菌(
Bacteroides vultagus)、青春雙歧桿菌(
Bifidobacterium adolescentis)、兩歧雙歧桿菌(
Bifidobacterium bifidum)、對沃氏嗜膽菌(
Bilophila wadsworthia)、布勞特氏菌屬(
Blautia)、丁酸弧菌屬(
Butyrivibrio)、纖細彎曲桿菌(
Campylobacter gracilis)、梭菌群III(
Clostridia cluster III)、梭菌群IV(
Clostridia cluster IV)、梭菌群IX(
Clostridia cluster IX)(胺基酸球菌科群(
Acidaminococcaceae group))、梭菌群XI(
Clostridia cluster XI)、梭菌群XIII(
Clostridia cluster XIII)(消化鏈球菌群(
Peptostreptococcus group))、梭菌群XIV(
Clostridia cluster XIV)、梭菌群XV(
Clostridia cluster XV)、產氣柯林斯菌(
Collinsella aerofaciens)、糞球菌屬(
Coprococcus)、桑氏棒狀桿菌(
Corynebacterium sunsvallense)、豬脫硫單胞菌(
Desulfomonas pigra)、產甲酸多爾氏菌(
Dorea formicigenerans)、長鏈多爾氏菌(
Dorea longicatena)、大腸桿菌(
Escherichia coli)、龐大真桿菌(
Eubacterium hadrum)、直腸真桿菌(
Eubacterium rectale)、普拉梭菌(
Faecalibacteria prausnitzii)、孿生球菌屬(
Gemella)、乳球菌屬(
Lactococcus)、蘭氏螺菌屬(
Lanchnospira)、柔膜細菌群XVI(
Mollicutes cluster XVI)、柔膜細菌群XVIII(
Mollicutes cluster XVIII)、普雷沃菌屬(
Prevotella)、黏滑羅氏菌(
Rothia mucilaginosa)、伶俐瘤胃球菌(
Ruminococcus callidus)、活潑瘤胃球菌(
Ruminococcus gnavus)、扭鏈瘤胃球菌(
Ruminococcus torques)及鏈球菌屬(
Streptococcus)。
「微生物胞外囊泡」(mEV)可從微生物如細菌、古菌、真菌、微觀藻類、原生動物和寄生蟲獲得。在一些實施方式中,mEV從細菌獲得。mEV包括分泌的微生物胞外囊泡(smEV)和經加工的微生物胞外囊泡(pmEV)。「分泌的微生物胞外囊泡」(smEV)係來源於微生物的自然產生的囊泡。smEV由微生物脂質和/或微生物蛋白質和/或微生物核酸和/或微生物碳水化合物部分構成,並從培養上清液中分離。該等囊泡的自然產生可以藉由操縱細菌細胞正在培養的環境(例如,藉由培養基或溫度改變)來人為地增強(例如,增加)或減少。此外,smEV組成物可以被修飾以減少,增加,添加或去除微生物成分或外來物質,以改變功效、免疫刺激、穩定性、免疫刺激能力、穩定性、器官靶向性(例如,淋巴結)、吸收(例如,胃腸道)和/或產率(例如,由此改變功效)。如本文所用,術語「純化的smEV組成物」或「smEV組成物」係指smEV的製劑,其已經從源材料中發現的至少一種相關聯物質(例如,從至少一種其他微生物組分分離)或用於製備該製劑的任何方法中與smEV相關聯的任何材料分離。也可指針對特定組分已顯著富集的組成物。「經加工的微生物胞外囊泡」(pmEV)係從人工裂解的微生物(例如,細菌)純化的微生物膜組分(例如,已與其他胞內微生物細胞組分分離的微生物膜組分)的非天然存在的集合,並且其可包含根據純化方法而具有變化的或選定的尺寸範圍的顆粒。藉由化學破壞(例如,藉由溶菌酶和/或溶葡萄球菌素)和/或物理破壞(例如,藉由機械力)微生物細胞並藉由離心和/或超速離心或其他方法將微生物膜組分與胞內組分分離來獲得pmEV池。所得pmEV混合物含有富集的微生物膜及其組分(例如,外周締合的或完整的膜蛋白、脂質、聚糖、多糖、碳水化合物、其他聚合物),使得相對於完整微生物,微生物膜組分的濃度增加,並且胞內內容物的濃度降低(例如,稀釋)。對於革蘭氏陽性細菌,pmEV可以包括細胞膜或細胞質膜。對於革蘭氏陰性細菌,pmEV可以包括內膜和外膜。pmEV可以被修飾以增加純度,調節組成物中顆粒的尺寸,和/或被修飾以減少、增加、添加或去除微生物組分或外來物質,以改變功效、免疫刺激、穩定性、免疫刺激能力、穩定性、器官靶向性(例如淋巴結)、吸收(例如胃腸道)和/或產率(例如由此改變功效)。pmEV可以藉由添加、去除、富集或稀釋特定組分(包括來自相同或其他微生物的細胞內組分)被修飾。如本文所用,術語「純化的pmEV組成物」或「pmEV組成物」係指pmEV的製劑,其已經從源材料中發現的至少一種相關聯物質(例如,從至少一種其他微生物組分分離)或用於製備該製劑的任何方法中與pmEV相關聯的任何材料分離。也可指針對特定組分已顯著富集的組成物。
「微生物組」在廣義上指棲居於受試者或患者的身體部位上或中的微生物。微生物組中的微生物可包括細菌、病毒、真核微生物和/或病毒。微生物組中的各個微生物可以是有代謝活性的、休眠的、潛伏的或作為孢子存在,可以浮游生物形式存在或存在於生物膜中,或能以可持續或短暫的方式存在於該微生物組中。微生物組可以是共生或健康狀態微生物組或疾病狀態微生物組。微生物組對受試者或患者而言可以是天然的,或微生物組的組分可因健康狀態(例如,癌前狀態或癌狀態)或處理條件(例如,抗生素治療、暴露於不同微生物)的變化而經調整、引入或消除。在一些方面,微生物組出現於黏膜表面。在一些方面,微生物組係腸道微生物組。在一些方面,微生物組係腫瘤微生物組。
組織或樣本的「微生物組譜(microbiome profile)」或「微生物組簽名(microbiome signature)」係指微生物組的細菌組成的至少部分表徵。在一些實施方式中,微生物組譜指示是否至少2、3、4、5、6、7、8、9、10、15、20、25、30、35、40、45、50、55、60、65、70、75、80、85、90、95、100或更多個細菌菌株存在於微生物組中或不存在於微生物組中。在一些實施方式中,微生物組譜指示是否至少2、3、4、5、6、7、8、9、10、15、20、25、30、35、40、45、50、55、60、65、70、75、80、85、90、95、100或更多個癌症相關細菌菌株存在於樣本中。在一些實施方式中,微生物組譜指示樣本中檢測的各細菌菌株的相對量或絕對量。在一些實施方式中,微生物組譜係癌症相關微生物組譜。癌症相關微生物組譜係以比一般群體更大的頻率出現於患有癌症的受試者中的微生物組譜。在一些實施方式中,相較於正常存在於取自未患癌症的個體的在其他方面當量的組織或樣本的微生物組中的細菌,該癌症相關微生物組譜包含更大數量或量的癌症相關細菌。
關於細菌的「經修飾的」在廣義上指自野生型形式已經發生變化的細菌。細菌修飾可以產生自工程菌。細菌修飾的實例包括遺傳修飾、基因表現修飾、表型修飾、配製修飾、化學修飾及劑量或濃度。經改善的性質的實例描述於整個說明書中且包括(例如)減毒、營養缺陷、歸巢或抗原性。表型修飾可包括(以實例說明的)細菌在修飾細菌的表型的培養基中生長以便增加或降低毒力。
如本文所用的「腫瘤生物群系(oncobiome)」包含致腫瘤的和/或癌症相關的微生物群,其中該微生物群包含病毒、細菌、真菌、原生生物、寄生蟲或另一種微生物中的一種或多種。
「腫瘤營養性(Oncotrophic)」或「嗜腫瘤(oncophilic)」微生物及細菌係在癌症微環境中高度相關或存在的微生物。它們可被優先選擇用於該環境中,優先在癌症微環境中生長或適應所述環境。
「運算分類單元」及「OTU」係指系統發生樹中的末端葉且藉由核酸序列(例如整個基因組或特定基因序列及所有與此核酸序列在物種層面共用序列同一性的序列)來定義。在一些實施方式中,特定基因序列可為16S序列或16S序列的一部分。在其他實施方式中,對兩種實體的整個基因組進行定序並進行比較。在另一個實施方式中,可以基因方式比較所選區域(例如多基因座序列標籤(MLST)、特定基因或基因集)。對於16S而言,整個16S或一些16S可變區中共有≥ 97%平均核苷酸同一性的OTU可視為相同OTU。參見,例如Claesson MJ, Wang Q, O’Sullivan O, Greene-Diniz R, Cole JR, Ross RP, 和O’Toole PW. 2010. Comparison of two next-generation sequencing technologies for resolving highly complex microbiota composition using tandem variable 16S rRNA gene regions[使用串聯可變16S rRNA基因區解析高度複雜的微生物群組成的兩種下一代定序技術的比較].Nucleic Acids Res[核酸研究] 38: e200.Konstantinidis KT, Ramette A及Tiedje JM.2006.The bacterial species definition in the genomic era[基因組時代的細菌物種類定義].Philos Trans R Soc Lond B Biol Sci[倫敦皇家學會B輯:生物科學哲學學報] 361: 1929-1940。對於完整基因組、MLST、特定基因(除16S外)或基因集而言,共有≥ 95%平均核苷酸同一性的OTU可視為相同OTU。例如參見Achtman M及Wagner M. 2008.Microbial diversity and the genetic nature of microbial species[微生物多樣性和微生物物種的遺傳性質].Nat. Rev. Microbiol.[微生物自然評論] 6: 431–440.Konstantinidis KT, Ramette A及Tiedje JM.2006.The bacterial species definition in the genomic era[基因組時代的細菌物種類定義].Philos Trans R Soc Lond B Biol Sci[倫敦皇家學會B輯:生物科學哲學學報] 361: 1929-1940。通常藉由比較生物體之間的序列來定義OTU。通常,具有不超過95%序列同一性的序列並不視為形成相同OTU的一部分。還可藉由核苷酸標誌或基因、尤其高度保守基因(例如「管家」基因)或其組合的任一組合來表徵OTU。本文提供可分配(例如)屬、物種及系統發育進化枝的運算分類單元(OTU)。
如本文所用,如果基因在至少一些條件下在工程化細菌中的表現水平高於相同物種的野生型細菌在相同條件下的表現水平,則該基因在細菌中「過度表現」。類似地,如果基因在至少一些條件下在工程化細菌中的表現水平低於相同物種的野生型細菌在相同條件下的表現水平,則該基因在細菌中「表現不足」。
術語「多核苷酸」及「核酸」可互換使用。它們係指任何長度的核苷酸的聚合形式(去氧核糖核苷酸或核糖核苷酸)或其類似物。多核苷酸可具有任何三維結構,且可實施任何功能。多核苷酸的非限制性實例如下:基因或基因片段的編碼或非編碼區域、定義自連鎖分析的多個基因座(loci)(基因座(locus))、外顯子、內含子、信使RNA(mRNA)、微小RNA(miRNA)、緘默RNA(siRNA)、轉移RNA、核糖體RNA、核糖酶、cDNA、重組多核苷酸、分支多核苷酸、質體、載體、任何序列的分離的DNA、任何序列的分離的RNA、核酸探針及引物。多核苷酸可包含經修飾的核苷酸,如甲基化核苷酸及核苷酸類似物。如果存在,則可在組裝聚合物之前或之後賦予對核苷酸結構的修飾。多核苷酸可藉由如與標記組分軛合而經進一步修飾。在本文提供的所有核酸序列中,U核苷酸可與T核苷酸互換。
如本文所用,術語「預防」受試者中的疾病或病症係指對受試者施用藥劑治療,例如,施用一種或多種藥劑(例如,藥劑),使得疾病或病症的至少一個症狀的發作被延遲或預防。
如本文所用,物質基本上不含其他組分時係「純的」。術語「純化(purify)」或「進行純化(purifying)」及「純化的(purified)」係指mEV(例如smEV和/或pmEV)製劑或其他材料已與最初產生或形成(例如,無論在自然中或在實驗環境中)時或在初始產生後的任何時間期間與的相關聯的至少一些組分分離。若如果mEV(例如smEV和/或pmEV)製劑或組成物在產生時或產生後與(諸如)一種或多種其他細菌組分分離,則該mEV(例如smEV和/或pmEV)製劑或組成物可被視為純化的,並且純化的微生物或微生物群體可含有其他材料多達約10%、約20%、約30%、約40%、約50%、約60%、約70%、約80%、約90%或超過約90%且仍被視為「純化的」。在一些實施方式中,純化的mEV(例如smEV和/或pmEV)係超過約80%、約85%、約90%、約91%、約92%、約93%、約94%、約95%、約96%、約97%、約98%、約99%、或超過約99%純的。mEV(例如smEV和/或pmEV)組成物(或製劑)例如從殘餘生境產物純化。
如本文所用,術語「經純化的mEV組成物」或「mEV組成物」係指如下的製劑:其包括已與源材料或在用以產生該製劑的任何方法中與mEV(如smEV和/或pmEV)締合的任何材料中發現的至少一種締合物質分離(例如,與至少一種其他細菌組分分離)的mEV(如smEV和/或pmEV)。它還指已經顯著富集或濃縮的組成物。在一些實施方式中,mEV(如smEV和/或pmEV)被濃縮2倍、3倍、4倍、5倍、10倍、100倍、1000倍、10,000倍或超過10,000倍。
「殘餘生境產物」係指自受試者內或受試者上的微生物群生境衍生的材料。例如,微生物的發酵培養物可以含有污染物,例如其他微生物菌株或形式(例如細菌、病毒、支原體和/或真菌)。例如,微生物生存於胃腸道的糞便中、皮膚本身上、唾液中、呼吸道的黏液中或泌尿生殖道的分泌物中(即,與微生物群落相關聯的生物物質)。基本上不含殘餘生境產物意指該微生物組成物不再含有與人或動物受試者上或培養物中或人或動物受試者中的微生物環境相關聯的生物物質且是100%不含、99%不含、98%不含、97%不含、96%不含或95%不含與該微生物群落相關聯的任何污染生物物質。殘餘生境產物可包括非生物材料(包括未經消化的食物)或其可包括非所需的微生物。基本上不含殘餘生境產物亦可意指該微生物組成物不含有來自培養物污染物或人或動物的可檢測細胞且意指僅微生物細胞係可檢測的。在一項實施方式中,大體上不含殘餘生境產物亦可意指該微生物組成物不含有可檢測的病毒(包括細菌、病毒(例如,噬菌體))、真菌、支原體污染物。在另一個實施方式中,這意味著與微生物細胞相比,該微生物組成物中少於1 x 10
-2%、1 x 10
-3%、1 x 10
-4%、1 x 10
-5%、1 x 10
-6%、1 x 10
-7%、1 x 10
-8%的有活力細胞係人或動物細胞。達到此純度之方法有很多,該等方法中無任何一者係限制性的。因此,污染物可經由藉由在固體培養基上對單菌落進行多個畫線步驟,直至來自系列性單菌落的複製(例如但不限於兩個)畫線已顯示僅單一菌落形態來分離所需成分而減少。可替代地,污染物的減少可藉由多輪連續稀釋至單一所需細胞(例如,10
-8或10
-9的稀釋),諸如藉由多個10倍連續稀釋完成。此可藉由顯示多個經分離的菌落具有相似細胞形狀及革蘭氏染色行為進一步證實。用於證實足夠的純度的其他方法包括遺傳分析(例如,PCR、DNA定序)、血清學及抗原分析、酶及代謝分析及使用儀器之方法,諸如使用自污染物區分所需成分的試劑的流動式細胞測量術。
如本文所用,「特異性結合」係指抗體能夠結合至預定抗原或多肽能夠結合至其預定結合配偶體。通常,抗體或多肽以對應於約10
-7M或更小K
D的親和力特異性結合至其預定抗原或結合配偶體,且以相對於結合至非特異性及不相關抗原/結合配偶體(例如BSA、酪蛋白)小至少10倍、小至少100倍或不超過至少1000倍的其親和力的親和力(如藉由K
D所表示)結合至預定抗原/結合配偶體。可替代地,特異性結合在廣義上更適用於二組分系統,其中一種組分係蛋白質、脂質或碳水化合物或其組合且與係蛋白質、脂質、碳水化合物或其組合的第二組分以特定方式接合。
「菌株」係指具有基因特徵的細菌物種的成員,該特徵使該成員可與相同細菌物種的密切相關成員區分開來。基因特徵可為不存在至少一種基因的全部或一部分、不存在至少一個調控區(例如啟動子、終止子、核糖開關、核糖體結合位點)的全部或一部分、不存在(「消除」)至少一種天然質體、存在至少一種重組基因、存在至少一種突變基因、存在至少一種外來基因(衍生自另一物種的基因)、存在至少一種突變調控區(例如啟動子、終止子、核糖開關、核糖體結合位點)、存在至少一種非天然質體、存在至少一種抗生素抗性盒或其組合。可藉由PCR擴增且視需要隨後進行一個或多個目的基因組區域或全基因組的DNA定序來鑒別不同菌株之間的基因簽名。如果一種菌株(與相同物種的另一種菌株相比)已獲得或失去抗生素抗性或獲得或失去生物合成能力(例如營養缺陷型菌株),則可藉由選擇或反選擇分別使用抗生素或營養物/代謝物來區分菌株。
術語「受試者」或「患者」係指任何哺乳動物。描述為「有需要」的受試者或患者係指需要治療(或預防)疾病的人。哺乳動物(即哺乳類動物)包括人、實驗室動物(例如靈長類動物、大鼠、小鼠)、家畜(例如牛、綿羊、山羊、豬)及家庭寵物(例如狗、貓、齧齒類動物)。受試者可以是人。受試者可以是非人哺乳動物,包括但不限於:狗、貓、牛、馬、豬、驢、山羊、駱駝、小鼠、大鼠、天竺鼠、綿羊、美洲駝、猴、大猩猩或黑猩猩。受試者可以是健康的,或可患有任一發展階段的癌症,其中任一階段由癌症相關或致病病原體引起或伺機性地支持該病原體,或受試者可能處於發生癌症或向其他受試者傳播癌症相關或癌症致病病原體的風險中。在一些實施方式中,受試者患有肺癌、膀胱癌、前列腺癌、漿細胞瘤、結直腸癌、直腸癌、梅克爾細胞癌、唾液腺癌、卵巢癌和/或黑色素瘤。受試者可以具有腫瘤。受試者可以具有展示增強的大型胞飲作用的腫瘤,其中該過程的潛在基因組學包括Ras活化。在其他實施方式中,受試者患有另一種癌症。在一些實施方式中,受試者已經接受癌症療法。
如本文所用,在用包含本文所述之細菌或mEV的藥劑(例如,包含細菌或mEV的藥劑)治療的受試者中的「系統性作用」係指在胃腸道外的一個或多個部位發生的生理作用。一種或多種系統性作用可以由免疫調節(例如,藉由增加和/或減少一種或多種免疫細胞類型或亞型(例如,CD8+ T細胞)和/或一種或多種細胞介素)產生。此類一種或多種系統性作用可能是由本文所述之細菌或mEV對胃腸道中的免疫細胞或其他細胞(例如上皮細胞)調節的結果,然後這直接地或間接地導致胃腸道外的一個或多個生物化學途徑的活性改變(活化和/或失活)。系統性作用可包括治療或預防受試者的疾病或病症。
如本文所用,術語「治療」受試者疾病或「治療」患有或懷疑患有疾病的受試者係指向受試者施用藥物治療(例如施用一種或多種藥劑),從而降低至少一種疾病症狀或預防其惡化。因此,在一個實施方式中,「治療」尤其是指延遲進展、促進緩解、誘導緩解、增大緩解、加速恢復、增加功效或降低替代治療的抗性,或其組合。
如本文所使用的,如果一個值高出任何數量,則該值「大於」另一個值(例如,100、50、20、12、11、10.6、10.1、10.01和10.001中的每一個係至少10)。類似地,如本文所使用的,如果一個值低出任何數量,則該值「小於」另一個值(例如,1、2、4、6、8、9、9.2、9.4、9.6、9.8、9.9、9.99、9.999中的每一個係不超過10)。相反,如本文所使用的,當測試值四捨五入到錨定值時,測試值「係」錨定值(例如,如果「成分質量係總質量的10%」(在這種情況下,錨定值係10%),則測試值9.5、9.6、9.7、9.8、9.9、10、10.1、10.2、10.3和10.4也將滿足「成分質量係總質量的10%」特徵。
細菌
本文公開的藥物組成物的藥劑可以包含細菌和/或微生物胞外囊泡(mEV)(例如smEV和/或pmEV)。例如,本文公開的藥物組成物的藥劑可以包含粉末,該粉末包含細菌和/或微生物胞外囊泡(mEV)(例如smEV和/或pmEV)。在包含細菌和mEV的藥劑中,mEV可以與藥劑的細菌來自相同的細菌起源(例如,相同的菌株)。藥劑可以包含來自一個或多個菌株的細菌和/或mEV。
在一些實施方式中,對藥劑的細菌或藥劑的mEV自其獲得的細菌進行修飾以降低毒性或其他不利影響;提高遞送(例如口服遞送)(例如,藉由改良耐酸性、黏液黏著性和/或滲透性和/或對膽汁酸的抗性、消化酶、對抗微生物肽的抗性和/或抗體中和);靶向所需細胞類型(例如,M細胞、杯狀細胞、腸上皮細胞、樹突細胞、巨噬細胞);增強細菌和/或mEV的免疫調節和/或治療效果(例如單獨或與另一治療劑組合);和/或藉由細菌和/或mEV(如smEV和/或pmEV)(例如藉由修飾地產生多糖、纖毛、傘毛、黏附素)增強免疫活化或抑制。在一些實施方式中,本文描述的工程改造的細菌被修飾以改善細菌和/或mEV(例如smEV和/或pmEV)製造(例如,更高的耐氧性、穩定性、改善的凍融耐受性、較短的產生時間)。例如,在一些實施方式中,本文描述的工程改造的細菌包括具有一種或多種遺傳改變的細菌,此改變包含於細菌染色體或內源性質體和/或一或多個外源性質體上的一或多個核苷酸的插入、刪除、易位或取代,或其任何組合,其中該遺傳改變可導致一或多個基因的過表現和/或低表現。工程改造的細菌可使用本領域中已知的任何技術產生,包括(但不限於)定點誘變、轉座子誘變、敲除、敲入、聚合酶鏈反應誘變、化學誘變、紫外線誘變、轉形(化學或藉由電穿孔)、噬菌體轉導、定向演化或其任何組合。
可用作本文描述的藥劑的細菌和/或mEV(例如smEV和/或pmEV)來源的細菌的分類學組(例如,綱、目、科、屬、種或菌株)的實例係本文提供的術語(例如,表1、表2、表3和/或表4和/或說明書中其他地方(例如,表J)列舉的)。在一些實施方式中,細菌菌株係具有與本文列舉的菌株有至少80%、85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%、99.1%、99.2%、99.3%、99.4%、99.5%、99.6%、99.7%、99.8%或99.9%序列同一性的基因組的細菌菌株。在一些實施方式中,藥劑的細菌或藥劑的mEV自其獲得的細菌係腫瘤營養性細菌。在一些實施方式中,藥劑的細菌或藥劑的mEV自其獲得的細菌係免疫調節細菌。在一些實施方式中,藥劑的細菌或藥劑的mEV自其獲得的細菌係免疫刺激細菌。在一些實施方式中,藥劑的細菌或藥劑的mEV自其獲得的細菌係免疫抑制細菌。在一些實施方式中,藥劑的細菌或藥劑的mEV自其獲得的細菌係免疫調節細菌。在某些實施方式中,藥劑的細菌或藥劑的mEV自其獲得的細菌係從本文提供的細菌菌株的組合產生的。在一些實施方式中,該組合係至少2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、20、25、30、35、40、45或50個細菌菌株的組合。在一些實施方式中,組合包括藥劑的細菌或藥劑的mEV自其獲得的細菌,該細菌來自本文列舉的細菌菌株和/或具有與本文列舉的(例如,表1、表2、表3和/或表4中列舉的和/或說明書中其他地方(例如,表J)列舉的)菌株有至少80%、85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%、99.1%、99.2%、99.3%、99.4%、99.5%、99.6%、99.7%、99.8%或99.9%序列同一性的基因組的細菌菌株。在某些實施方式中,藥劑的細菌或藥劑的mEV自其獲得的細菌係從本文提供的細菌菌株產生的。在一些實施方式中,藥劑的細菌或藥劑的mEV自其獲得的細菌來自本文列舉的(例如,表1、表2、表3和/或表4中列舉的和/或說明書中其他地方(例如,表J)列舉的)細菌菌株和/或具有與本文列舉的(例如,表1、表2、表3和/或表4中列舉的和/或說明書中其他地方(例如,表J)列舉的)菌株有至少80%、85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%、99.1%、99.2%、99.3%、99.4%、99.5%、99.6%、99.7%、99.8%或99.9%序列同一性的基因組的細菌菌株。
在一些實施方式中,藥劑包含分離的小韋榮氏球菌細菌(例如,來自一種或多種細菌菌株(例如,目的細菌)(例如,其治療有效量))。例如,其中藥劑的至少50%、至少75%、至少80%、至少85%、至少90%、至少95%或至少99%的含量係分離的小韋榮氏球菌細菌(例如目的細菌)。
在一些實施方式中,藥劑包含分離的小韋榮氏球菌細菌(例如,來自一種或多種細菌菌株(例如,目的細菌)(例如,其治療有效量))。例如,其中藥劑的至少50%、至少75%、至少80%、至少85%、至少90%、至少95%或至少99%的含量係分離的小韋榮氏球菌細菌(例如目的細菌)。
在一些實施方式中,小韋榮氏球菌細菌來自與小韋榮氏球菌菌株A(ATCC保藏號PTA-125691)的核苷酸序列具有至少90%(或至少97%)基因組、16S和/或CRISPR序列同一性的菌株。在一些實施方式中,小韋榮氏球菌細菌來自與小韋榮氏球菌菌株A(ATCC保藏號PTA-125691)的核苷酸序列具有至少99%基因組、16S和/或CRISPR序列同一性的菌株。在一些實施方式中,普雷沃菌屬細菌來自小韋榮氏球菌菌株A(ATCC保藏號PTA-125691)。
在一些實施方式中,藥物組成物中至少50%、60%、70%、80%或90%的細菌係小韋榮氏球菌菌株A。
在一些實施方式中,藥劑包含至少1 x 10
5、5 x 10
5、1 x 10
6、2 x 10
6、3 x 10
6、4 x 10
6、5 x 10
6、6 x 10
6、7 x 10
6、8 x 10
6、9 x 10
6、1 x 10
7、2 x 10
7、3 x 10
7、4 x 10
7、5 x 10
7、6 x 10
7、7 x 10
7、8 x 10
7、9 x 10
7、1 x 10
8、2 x 10
8、3 x 10
8、4 x 10
8、5 x 10
8、6 x 10
8、7 x 10
8、8 x 10
8、9 x 10
8或1 x 10
9個本文所述韋榮氏球菌屬細菌(例如,小韋榮氏球菌菌株A(ATCC保藏號PTA-125691))的菌落形成單位。
在一些實施方式中,藥劑包含至少1 x 10
5、5 x 10
5、1 x 10
6、2 x 10
6、3 x 10
6、4 x 10
6、5 x 10
6、6 x 10
6、7 x 10
6、8 x 10
6、9 x 10
6、1 x 10
7、2 x 10
7、3 x 10
7、4 x 10
7、5 x 10
7、6 x 10
7、7 x 10
7、8 x 10
7、9 x 10
7、1 x 10
8、2 x 10
8、3 x 10
8、4 x 10
8、5 x 10
8、6 x 10
8、7 x 10
8、8 x 10
8、9 x 10
8或1 x 10
9個本文所述韋榮氏球菌屬細菌(例如,小韋榮氏球菌菌株A(ATCC保藏號PTA-125691))的總細胞(例如,其中細胞數目由總細胞計數確定(例如,由庫爾特計數器確定)。
在一些實施方式中,藥劑的細菌或藥劑的mEV自其獲得的細菌係革蘭氏陰性細菌。
在一些實施方式中,革蘭氏陰性細菌屬於
Negativicutes綱。
Negativicutes代表微生物的一個獨特綱,因為它們係厚壁菌門中唯一的雙層成員。該等厭氧生物可以在環境中發現,並且是人口腔和胃腸道的正常共生體。由於該等生物體具有外膜,因此對該綱的EV產率進行了研究。發現在以每個細胞為基礎,該等細菌產生大量的囊泡(10-150 EV/細胞)。來自該等生物的EV在體外測定中具有廣泛的刺激性和高效力。對其在幾種腫瘤學和炎症體內模型中治療性應用的研究顯示了其治療性潛力。
Negativicutes綱包括以下科:韋榮氏球菌科、月形單胞菌科、胺基酸球菌科和
Sporomusaceae科。
Negativicutes綱包括巨型球菌屬、月形單胞菌科屬
、 Propionospora屬和胺基酸球菌屬。示例性Negativicutes物種包括但不限於巨型球菌屬物種、菲利克斯月形單胞菌、腸胺基酸球菌、和
Propionospora屬物種。
在一些實施方式中,藥劑的細菌或藥劑的mEV自其獲得的細菌係革蘭氏陽性細菌。
在一些實施方式中,藥劑的細菌或藥劑的mEV自其獲得的細菌係需氧細菌。
在一些實施方式中,藥劑的細菌或藥劑的mEV自其獲得的細菌係厭氧細菌。在一些實施方式中,厭氧細菌包含專性厭氧菌。在一些實施方式中,厭氧細菌包含兼性厭氧菌。
在一些實施方式中,藥劑的細菌或藥劑的mEV自其獲得的細菌係嗜酸細菌。
在一些實施方式中,藥劑的細菌或藥劑的mEV自其獲得的細菌係嗜鹼細菌。
在一些實施方式中,藥劑的細菌或藥劑的mEV自其獲得的細菌係嗜中性細菌。
在一些實施方式中,藥劑的細菌或藥劑的mEV自其獲得的細菌係難養細菌。
在一些實施方式中,藥劑的細菌或藥劑的mEV自其獲得的細菌係非難養細菌。
在一些實施方式中,藥劑的細菌或藥劑的mEV自其獲得的細菌或mEV自身係經凍乾的。
在一些實施方式中,將藥劑的細菌或藥劑的mEV自其獲得的細菌或mEV自身經γ照射(例如,以17.5或25 kGy)。
在一些實施方式中,藥劑的細菌或藥劑的mEV自其獲得的細菌或mEV自身係經UV照射的。
在一些實施方式中,藥劑的細菌或藥劑的mEV自其獲得的細菌或mEV自身係經熱滅活的(例如,在50°C下持續兩小時或在90°C下持續兩小時)。
在一些實施方式中,藥劑的細菌或藥劑的mEV自其獲得的細菌或mEV自身係經酸處理的。
在一些實施方式中,藥劑的細菌或藥劑的mEV自其獲得的細菌或mEV自身係經氧噴射的(例如,以0.1 vvm進行兩小時)。
生長階段會影響細菌和/或細菌產生的mEV的數量或性質。例如,在本文提供的mEV製備方法中,可以例如在對數生長期開始時、在對數生長期的中間時、和/或一旦達到穩定生長期時從培養物中分離mEV。
在某些實施方式中,藥劑的細菌或藥劑的mEV自其獲得的細菌獲得自專性厭氧細菌。專性厭氧細菌的實例包括革蘭氏陰性桿菌(包括擬桿菌、普雷沃菌、卟啉單胞菌、梭桿菌、嗜膽菌及薩特氏菌屬物種的屬)、革蘭氏陽性球菌(主要為消化鏈球菌屬)、革蘭氏陽性孢子形成菌(梭菌屬)、非孢子形成桿菌(放線菌、丙酸桿菌、真桿菌、乳桿菌及雙歧桿菌屬)及革蘭氏陰性球菌(主要為韋榮氏球菌屬)。在一些實施方式中,專性厭氧細菌係選自由以下組成之群組的屬的細菌:阿加薩桿菌屬、奇異菌屬(Atopobium)、布勞特氏菌屬(Blautia)、伯克霍爾德菌屬(Burkholderia)、迪爾莫菌屬(Dielma)、長鏈菌屬(Longicatena)、副梭菌屬(Paraclostridium)、蘇黎世桿菌屬(Turicibacter)及泰澤菌屬(Tyzzerella)。
Negativicutes綱包括以下科:韋榮氏球菌科、月形單胞菌科、胺基酸球菌科和
Sporomusaceae科。
Negativicutes綱包括巨型球菌屬、月形單胞菌科屬
、 Propionospora屬和胺基酸球菌屬。示例性Negativicutes物種包括但不限於巨型球菌屬物種、菲利克斯月形單胞菌、腸胺基酸球菌、和
Propionospora屬物種。
在一些實施方式中,藥劑的細菌或藥劑的mEV自其獲得的細菌屬於
Negativicutes綱。
在一些實施方式中,藥劑的細菌或藥劑的mEV自其獲得的細菌屬於韋榮氏球菌科。
在一些實施方式中,藥劑的細菌或藥劑的mEV自其獲得的細菌屬於月形單胞菌科。
在一些實施方式中,藥劑的細菌或藥劑的mEV自其獲得的細菌屬於胺基酸球菌科。
在一些實施方式中,藥劑的細菌或藥劑的mEV自其獲得的細菌屬於
Sporomusaceae科。
在一些實施方式中,藥劑的細菌或藥劑的mEV自其獲得的細菌屬於巨型球菌屬。
在一些實施方式中,藥劑的細菌或藥劑的mEV自其獲得的細菌屬於月形單胞菌屬。
在一些實施方式中,藥劑的細菌或藥劑的mEV自其獲得的細菌屬於
Propionospora屬。
在一些實施方式中,藥劑的細菌或藥劑的mEV自其獲得的細菌屬於胺基酸球菌屬。
在一些實施方式中,藥劑的細菌或藥劑的mEV自其獲得的細菌係巨型球菌屬物種細菌。
在一些實施方式中,藥劑的細菌或藥劑的mEV自其獲得的細菌係菲利克斯月形單胞菌細菌。
在一些實施方式中,藥劑的細菌或藥劑的mEV自其獲得的細菌係腸胺基酸球菌細菌。
在一些實施方式中,藥劑的細菌或藥劑的mEV自其獲得的細菌係
Propionospora屬物種細菌。
微生物梭菌綱中的顫螺旋菌科係脊椎動物的常見共生生物。
在一些實施方式中,藥劑的細菌或藥劑的mEV自其獲得的細菌屬於梭菌綱。
在一些實施方式中,藥劑的細菌或藥劑的mEV自其獲得的細菌屬於顫螺旋菌科。
在一些實施方式中,藥劑的細菌或藥劑的mEV自其獲得的細菌屬於糞桿菌屬。
在一些實施方式中,藥劑的細菌或藥劑的mEV自其獲得的細菌屬於
Fournierella屬。
在一些實施方式中,藥劑的細菌或藥劑的mEV自其獲得的細菌屬於
Harryflintia屬。
在一些實施方式中,藥劑的細菌或藥劑的mEV自其獲得的細菌屬於阿加薩桿菌屬。
在一些實施方式中,藥劑的細菌或藥劑的mEV自其獲得的細菌係普氏棲糞桿菌(普氏棲糞桿菌菌株A)細菌。
在一些實施方式中,藥劑的細菌或藥劑的mEV自其獲得的細菌係
Fournierella massiliensis(例如,
Fournierella massiliensis菌株A)細菌。
在一些實施方式中,藥劑的細菌或藥劑的mEV自其獲得的細菌係
Harryflintia acetispora(例如,
Harryflintia acetispora菌株A)細菌。
在一些實施方式中,藥劑的細菌或藥劑的mEV自其獲得的細菌係阿加薩桿菌屬物種(例如,阿加薩桿菌屬物種菌株A)細菌。
在一些實施方式中,藥劑的細菌或藥劑的mEV自其獲得的細菌係選自由以下組成之群組的屬的細菌:大腸桿菌屬、克雷伯氏菌屬、乳桿菌屬、志賀氏菌屬和葡萄球菌屬。
在一些實施方式中,藥劑的細菌或藥劑的mEV自其獲得的細菌係選自由以下組成之群組的物種:馬賽布勞特氏菌(
Blautia massiliensis)、解苯副梭菌(
Paraclostridium benzoelyticum)、
Dielma fastidiosa、
Longicatena caecimuris、乳酸乳球菌乳脂亞種、納西利斯泰澤菌(
Tyzzerella nexilis)、
Hungatella effluvia、類肺炎克雷伯氏菌擬肺炎亞種(
Klebsiella quasipneumoniae subsp. Similipneumoniae)、產酸克雷伯菌(
Klebsiella oxytoca)、和當別町韋榮氏球菌(
Veillonella tobetsuensis)。
在一些實施方式中,藥劑的細菌或藥劑的mEV自其獲得的細菌係普雷沃菌屬細菌,該普雷沃菌屬細菌選自由以下組成之群組:阿爾伯普雷沃菌、羊水普雷沃菌、貝根普雷沃菌、二路普雷沃菌、短普雷沃菌、布氏普雷沃菌、頰普雷沃菌、口頰普雷沃菌、糞便普雷沃菌、牙普雷沃菌、棲牙普雷沃菌、解糖腖普雷沃菌、棲組織普雷沃菌、中間普雷沃菌、小斑點普雷沃菌、馬斯普雷沃菌、產黑普雷沃菌、彩虹普雷沃菌、多形普雷沃菌、變黑普雷沃菌、口腔普雷沃菌、口普雷沃菌、齦炎普雷沃菌、蒼白普雷沃菌、唾液普雷沃菌、斯特塞拉普雷沃菌、坦納普雷沃菌、蒂莫普雷沃菌、空腸普雷沃菌、橙色普雷沃菌、保氏普雷沃菌、著色普雷沃菌、人體普雷沃菌、丹塔普雷沃菌、棲居普雷沃菌、斐氏普雷沃菌、深黑色普雷沃菌、解肝素普雷沃菌、洛氏普雷沃菌、嗜糖普雷沃菌、南錫普雷沃菌、稻普雷沃菌、沼澤普雷沃菌、胸膜炎普雷沃菌、棲瘤胃普雷沃菌、解糖普雷沃菌、靶心普雷沃菌、賽赫普雷沃菌、動膠普雷沃菌和真空腔普雷沃菌。
在一些實施方式中,藥劑的細菌或藥劑的mEV自其獲得的細菌係如下細菌菌株,該細菌菌株包含如下基因組序列,該基因組序列與表3中提供的以ATCC保藏號保藏的細菌菌株的基因組序列具有至少90%、至少91%、至少92%、至少93%、至少94%、至少95%、至少96%、至少97%、至少98%或至少99%序列同一性(例如至少99.5%序列同一性、至少99.6%序列同一性、至少99.7%序列同一性、至少99.8%序列同一性、至少99.9%序列同一性)。在一些實施方式中,藥劑的細菌或藥劑的mEV自其獲得的細菌係如下細菌菌株,該細菌菌株包含如下16S序列,該16S序列與表3中提供的以ATCC保藏號保藏的細菌菌株的16S序列具有至少90%、至少91%、至少92%、至少93%、至少94%、至少95%、至少96%、至少97%、至少98%或至少99%序列同一性(例如至少99.5%序列同一性、至少99.6%序列同一性、至少99.7%序列同一性、至少99.8%序列同一性、至少99.9%序列同一性)。
在一些實施方式中,藥劑的細菌或藥劑的mEV自其獲得的細菌係如下細菌菌株,該細菌菌株包含如下基因組序列,該基因組序列與表4中提供的以保藏號保藏的細菌菌株的基因組序列具有至少90%、至少91%、至少92%、至少93%、至少94%、至少95%、至少96%、至少97%、至少98%或至少99%序列同一性(例如至少99.5%序列同一性、至少99.6%序列同一性、至少99.7%序列同一性、至少99.8%序列同一性、至少99.9%序列同一性)。在一些實施方式中,藥劑的細菌或藥劑的mEV自其獲得的細菌係如下細菌菌株,該細菌菌株包含如下16S序列,該16S序列與表4中提供的以保藏號保藏的細菌菌株的16S序列具有至少90%、至少91%、至少92%、至少93%、至少94%、至少95%、至少96%、至少97%、至少98%或至少99%序列同一性(例如至少99.5%序列同一性、至少99.6%序列同一性、至少99.7%序列同一性、至少99.8%序列同一性、至少99.9%序列同一性)。
Negativicutes綱包括以下科:韋榮氏球菌科、月形單胞菌科、胺基酸球菌科和
Sporomusaceae科。
Negativicutes綱包括巨型球菌屬、月形單胞菌科屬
、 Propionospora屬和胺基酸球菌屬。示例性Negativicutes物種包括但不限於巨型球菌屬物種、菲利克斯月形單胞菌、腸胺基酸球菌、和
Propionospora屬物種。
在一些實施方式中,藥劑的細菌或藥劑的mEV自其獲得的細菌屬於
Negativicutes綱。
在一些實施方式中,藥劑的細菌或藥劑的mEV自其獲得的細菌屬於韋榮氏球菌科。
在一些實施方式中,藥劑的細菌或藥劑的mEV自其獲得的細菌屬於月形單胞菌科。
在一些實施方式中,藥劑的細菌或藥劑的mEV自其獲得的細菌屬於胺基酸球菌科。
在一些實施方式中,藥劑的細菌或藥劑的mEV自其獲得的細菌屬於
Sporomusaceae科。
在一些實施方式中,藥劑的細菌或藥劑的mEV自其獲得的細菌屬於巨型球菌屬。
在一些實施方式中,藥劑的細菌或藥劑的mEV自其獲得的細菌屬於月形單胞菌屬。
在一些實施方式中,藥劑的細菌或藥劑的mEV自其獲得的細菌屬於
Propionospora屬。
在一些實施方式中,藥劑的細菌或藥劑的mEV自其獲得的細菌屬於胺基酸球菌屬。
在一些實施方式中,藥劑的細菌或藥劑的mEV自其獲得的細菌係巨型球菌屬物種細菌。
在一些實施方式中,藥劑的細菌或藥劑的mEV自其獲得的細菌係菲利克斯月形單胞菌細菌。
在一些實施方式中,藥劑的細菌或藥劑的mEV自其獲得的細菌係腸胺基酸球菌細菌。
在一些實施方式中,藥劑的細菌或藥劑的mEV自其獲得的細菌係
Propionospora屬物種細菌。
微生物梭菌綱中的顫螺旋菌科係脊椎動物的常見共生生物。
在一些實施方式中,藥劑的細菌或藥劑的mEV自其獲得的細菌屬於梭菌綱。
在一些實施方式中,藥劑的細菌或藥劑的mEV自其獲得的細菌屬於顫螺旋菌科。
在一些實施方式中,藥劑的細菌或藥劑的mEV自其獲得的細菌屬於糞桿菌屬。
在一些實施方式中,藥劑的細菌或藥劑的mEV自其獲得的細菌屬於
Fournierella屬。
在一些實施方式中,藥劑的細菌或藥劑的mEV自其獲得的細菌屬於
Harryflintia屬。
在一些實施方式中,藥劑的細菌或藥劑的mEV自其獲得的細菌屬於阿加薩桿菌屬。
在一些實施方式中,藥劑的細菌或藥劑的mEV自其獲得的細菌係普氏棲糞桿菌(普氏棲糞桿菌菌株A)細菌。
在一些實施方式中,藥劑的細菌或藥劑的mEV自其獲得的細菌係
Fournierella massiliensis(例如,
Fournierella massiliensis菌株A)細菌。
在一些實施方式中,藥劑的細菌或藥劑的mEV自其獲得的細菌係
Harryflintia acetispora(例如,
Harryflintia acetispora菌株A)細菌。
在一些實施方式中,藥劑的細菌或藥劑的mEV自其獲得的細菌係阿加薩桿菌屬物種(例如,阿加薩桿菌屬物種菌株A)細菌。
在一些實施方式中,藥劑的細菌或藥劑的mEV自其獲得的細菌係阿加薩桿菌屬物種的菌株。在一些實施方式中,阿加薩桿菌屬物種菌株係與阿加薩桿菌屬物種菌株A(ATCC保藏號PTA-125892)的核苷酸序列(例如,基因組序列、16S序列、CRISPR序列)具有至少95%、至少96%、至少97%、至少98%或至少99%序列同一性(例如,至少99.5%序列同一性、至少99.6%序列同一性、至少99.7%序列同一性、至少99.8%序列同一性、至少99.9%序列同一性)的菌株。在一些實施方式中,阿加薩桿菌屬物種菌株係阿加薩桿菌屬物種菌株A(ATCC保藏號PTA- 125892)細菌。
在一些實施方式中,藥劑的細菌或藥劑的mEV自其獲得的細菌屬於擬桿菌綱[擬桿菌門]。在一些實施方式中,藥劑的細菌或藥劑的mEV自其獲得的細菌係擬桿菌目的細菌。在一些實施方式中,藥劑的細菌或藥劑的mEV自其獲得的細菌屬於紫單胞菌科。在一些實施方式中,藥劑的細菌或藥劑的mEV自其獲得的細菌屬於普雷沃菌科。在一些實施方式中,藥劑的細菌或藥劑的mEV自其獲得的細菌係擬桿菌綱的細菌,其中細菌的細胞被膜結構係雙層的。在一些實施方式中,藥劑的細菌或藥劑的mEV自其獲得的細菌係擬桿菌綱、革蘭氏陰性染色的細菌。在一些實施方式中,藥劑的細菌或藥劑的mEV自其獲得的細菌係擬桿菌綱的細菌,其中細菌係雙層的並且該細菌係革蘭氏陰性染色。
在一些實施方式中,藥劑的細菌或藥劑的mEV自其獲得的細菌係梭菌綱[厚壁菌門]的細菌。在一些實施方式中,藥劑的細菌或藥劑的mEV自其獲得的細菌屬於真細菌目。在一些實施方式中,藥劑的細菌或藥劑的mEV自其獲得的細菌屬於顫螺旋菌科。在一些實施方式中,藥劑的細菌或藥劑的mEV自其獲得的細菌屬於毛螺菌科。在一些實施方式中,藥劑的細菌或藥劑的mEV自其獲得的細菌屬於消化鏈球菌科。在一些實施方式中,藥劑的細菌或藥劑的mEV自其獲得的細菌屬於梭菌目XIII科/地位未定41。在一些實施方式中,藥劑的細菌或藥劑的mEV自其獲得的細菌屬於梭菌綱,其中細菌的細胞被膜結構係單層的。在一些實施方式中,藥劑的細菌或藥劑的mEV自其獲得的細菌屬於梭菌綱、革蘭氏陰性染色。在一些實施方式中,藥劑的細菌或藥劑的mEV自其獲得的細菌屬於梭菌綱、革蘭氏陽性染色。在一些實施方式中,藥劑的細菌或藥劑的mEV自其獲得的細菌屬於梭菌綱,其中細菌的細胞被膜結構係單層的並且該細菌係革蘭氏陰性染色。在一些實施方式中,藥劑的細菌或藥劑的mEV自其獲得的細菌屬於梭菌綱,其中細菌的細胞被膜結構係單層的並且該細菌係革蘭氏陽性染色。
在一些實施方式中,藥劑的細菌或藥劑的mEV自其獲得的細菌屬於
Negativicutes綱[厚壁菌門]。在一些實施方式中,藥劑的細菌或藥劑的mEV自其獲得的細菌屬於韋榮氏球菌目。在一些實施方式中,藥劑的細菌或藥劑的mEV自其獲得的細菌屬於韋榮氏球菌科。在一些實施方式中,藥劑的細菌或藥劑的mEV自其獲得的細菌屬於月形單胞菌目。在一些實施方式中,藥劑的細菌或藥劑的mEV自其獲得的細菌係月形單胞菌科的細菌。在一些實施方式中,藥劑的細菌或藥劑的mEV自其獲得的細菌屬於
Sporomusaceae科。在一些實施方式中,藥劑的細菌或藥劑的mEV自其獲得的細菌屬於
Negativicutes綱,其中細菌的細胞被膜結構係雙層的。在一些實施方式中,藥劑的細菌或藥劑的mEV自其獲得的細菌屬於藥劑的細菌或藥劑的mEV自其獲得的細菌係來自
Negativicutes綱的細菌的EV,其中細菌的細胞被膜結構係雙層的並且該細菌係革蘭氏陰性染色。
在一些實施方式中,藥劑的細菌或藥劑的mEV自其獲得的細菌屬於互養菌綱[互養菌門]。在一些實施方式中,藥劑的細菌或藥劑的mEV自其獲得的細菌屬於互養菌目。在一些實施方式中,藥劑的細菌或藥劑的mEV自其獲得的細菌屬於互養菌科。在一些實施方式中,藥劑的細菌或藥劑的mEV自其獲得的細菌屬於互養菌綱,其中細菌的細胞被膜結構係雙層的。在一些實施方式中,藥劑的細菌或藥劑的mEV自其獲得的細菌屬於互養菌綱、革蘭氏陰性染色。在一些實施方式中,藥劑的細菌或藥劑的mEV自其獲得的細菌屬於互養菌綱,其中細菌的細胞被膜結構係雙層的並且該細菌係革蘭氏陰性染色。
在某些實施方式中,藥劑的細菌或藥劑的mEV自其獲得的細菌來自一種細菌菌株,例如本文提供的一種菌株。
在一些實施方式中,藥劑的細菌或藥劑的mEV自其獲得的細菌來自一種細菌菌株(例如本文提供的一種菌株)或來自本文提供的一種以上的菌株。
在一些實施方式中,藥劑的細菌或藥劑的mEV自其獲得的細菌係乳酸乳球菌乳脂亞種細菌,例如與乳酸乳球菌乳脂亞種菌株A(ATCC指定編號PTA-125368)的核苷酸序列有至少90%或至少99%基因組、16S和/或CRISPR序列同一性的菌株。在一些實施方式中,藥劑的細菌或藥劑的mEV自其獲得的細菌係乳球菌屬細菌,例如乳酸乳球菌乳脂亞種菌株A(ATCC指定編號PTA-125368)。
在一些實施方式中,藥劑的細菌或藥劑的mEV自其獲得的細菌係普雷沃菌屬細菌,例如包含與普雷沃菌屬菌株B 50329(NRRL保藏號B 50329)的核苷酸序列具有至少90%或至少99%基因組、16S和/或CRISPR序列同一性的菌株。在一些實施方式中,藥劑的細菌或藥劑的mEV自其獲得的細菌係普雷沃菌屬細菌,例如普雷沃菌屬菌株B 50329(NRRL保藏號B 50329)。
在一些實施方式中,藥劑的細菌或藥劑的mEV自其獲得的細菌係普雷沃菌屬細菌,例如包含與普雷沃菌屬菌株C(ATCC保藏號PTA-126140)的核苷酸序列具有至少90%或至少99%基因組、16S和/或CRISPR序列同一性的菌株。在一些實施方式中,藥劑的細菌或藥劑的mEV自其獲得的細菌係普雷沃菌屬細菌,例如普雷沃菌屬菌株C(ATCC保藏號PTA-126140)。
在一些實施方式中,藥劑的細菌或藥劑的mEV自其獲得的細菌係雙歧桿菌屬細菌,例如與以ATCC指定編號PTA-125097保藏的雙歧桿菌屬細菌的核苷酸序列有至少90%或至少99%基因組、16S和/或CRISPR序列同一性的菌株。在一些實施方式中,藥劑的細菌或藥劑的mEV自其獲得的細菌係雙歧桿菌屬細菌,例如以ATCC指定編號PTA-125097保藏的雙歧桿菌屬細菌。
在一些實施方式中,藥劑的細菌或藥劑的mEV自其獲得的細菌係韋榮球氏菌屬細菌,例如與以ATCC指定編號PTA-125691保藏的韋榮球氏菌屬細菌的核苷酸序列有至少90%或至少99%基因組、16S和/或CRISPR序列同一性的菌株。在一些實施方式中,藥劑的細菌或藥劑的mEV自其獲得的細菌係韋榮球氏菌屬細菌,例如以ATCC指定編號PTA-125691保藏的韋榮球氏菌屬細菌。
在一些實施方式中,藥劑的細菌或藥劑的mEV自其獲得的細菌係活潑瘤胃球菌。在一些實施方式中,活潑瘤胃球菌細菌係與以ATCC指定編號PTA-126695保藏的活潑瘤胃球菌細菌的核苷酸序列有至少90%(或至少97%)基因組、16S和/或CRISPR序列同一性的菌株。在一些實施方式中,活潑瘤胃球菌細菌係與以ATCC指定編號PTA-126695保藏的活潑瘤胃球菌細菌的核苷酸序列有至少99%基因組、16S和/或CRISPR序列同一性的菌株。在一些實施方式中,活潑瘤胃球菌細菌係以ATCC指定編號PTA-126695保藏的活潑瘤胃球菌細菌。
在一些實施方式中,藥劑的細菌或藥劑的mEV自其獲得的細菌係巨型球菌屬物種細菌。在一些實施方式中,巨型球菌屬物種細菌係與以ATCC指定編號PTA-126770保藏的巨型球菌屬物種細菌的核苷酸序列有至少90%(或至少97%)基因組、16S和/或CRISPR序列同一性的菌株。在一些實施方式中,巨型球菌屬物種細菌係與以ATCC指定編號PTA-126770保藏的巨型球菌屬物種細菌的核苷酸序列有至少99%基因組、16S和/或CRISPR序列同一性的菌株。在一些實施方式中,巨型球菌屬物種細菌係以ATCC指定編號PTA-126770保藏的巨型球菌屬物種細菌。
在一些實施方式中,藥劑的細菌或藥劑的mEV自其獲得的細菌係
Fournierella massiliensis細菌。在一些實施方式中,
Fournierella massiliensis細菌係與以ATCC指定編號PTA-126696保藏的
Fournierella massiliensis細菌的核苷酸序列有至少90%(或至少97%)基因組、16S和/或CRISPR序列同一性的菌株。在一些實施方式中,
Fournierella massiliensis細菌係與以ATCC指定編號PTA-126696保藏的
Fournierella massiliensis細菌的核苷酸序列有至少99%基因組、16S和/或CRISPR序列同一性的菌株。在一些實施方式中,
Fournierella massiliensis細菌係以ATCC指定編號PTA-126696保藏的
Fournierella massiliensis細菌。
在一些實施方式中,藥劑的細菌或藥劑的mEV自其獲得的細菌係
Harryflintia acetispora細菌。在一些實施方式中,
Harryflintia acetispora細菌係與以ATCC指定編號PTA-126694保藏的
Harryflintia acetispora細菌的核苷酸序列有至少90%(或至少97%)基因組、16S和/或CRISPR序列同一性的菌株。在一些實施方式中,
Harryflintia acetispora細菌係與以ATCC指定編號PTA-126694保藏的
Harryflintia acetispora細菌的核苷酸序列有至少99%基因組、16S和/或CRISPR序列同一性的菌株。在一些實施方式中,
Harryflintia acetispora細菌係以ATCC指定編號PTA-126694保藏的
Harryflintia acetispora細菌。
在一些實施方式中,藥劑的細菌或藥劑的mEV自其獲得的細菌係產生代謝產物的細菌,例如,細菌產生丁酸、肌苷、丙酸、或色胺酸代謝產物。
在一些實施方式中,藥劑的細菌或藥劑的mEV自其獲得的細菌產生丁酸鹽。在一些實施方式中,細菌來自布勞特氏菌屬
;克裡斯滕森菌屬;糞球菌屬;真桿菌屬;
Lachnosperacea ;巨型球菌屬;或羅斯氏菌屬。
在一些實施方式中,藥劑的細菌或藥劑的mEV自其獲得的細菌產生肌苷。在一些實施方式中,細菌來自雙歧桿菌屬;乳桿菌屬;或歐陸森氏菌屬。
在一些實施方式中,藥劑的細菌或藥劑的mEV自其獲得的細菌產生丙酸鹽。在一些實施方式中,細菌來自阿克曼氏菌屬;擬桿菌屬;戴阿利斯特菌屬;真桿菌屬;巨型球菌屬;副擬桿菌屬;普雷沃菌屬;瘤胃球菌屬;或韋榮氏球菌屬。
在一些實施方式中,藥劑的細菌或藥劑的mEV自其獲得的細菌產生色胺酸代謝物。在一些實施方式中,細菌來自乳桿菌屬或消化鏈球菌屬。
在一些實施方式中,藥劑的細菌或藥劑的mEV自其獲得的細菌係產生組蛋白脫乙醯基酶3(HDAC3)的抑制劑的細菌。在一些實施方式中,細菌來自物種
Bariatricus massiliensis、普氏棲糞桿菌、馬賽巨型球菌或腸羅斯氏菌。
在一些實施方式中,藥劑的細菌或藥劑的mEV自其獲得的細菌屬於差異球菌屬;
芽孢桿菌屬;鏈型桿菌屬;棒狀桿菌屬;貪銅菌屬;水棲菌屬;微小桿菌屬;糞桿菌屬;
土芽孢桿菌屬;甲基桿菌屬;微球菌屬;摩根氏菌屬;變形桿菌屬;假單胞菌屬;根瘤菌屬;或鞘胺醇單胞菌屬。
在一些實施方式中,藥劑的細菌或藥劑的mEV自其獲得的細菌屬於
Cutibacterium屬。在一些實施方式中,藥劑的細菌或藥劑的mEV自其獲得的細菌係
Cutibacterium avidum細菌。
在一些實施方式中,細菌來自乳桿菌屬。在一些實施方式中,細菌來自物種加氏乳桿菌。在一些實施方式中,細菌來自
Dysosmobacter屬。在一些實施方式中,細菌來自物種
Dysosmobacter welbionis。
[
表 1]
:細菌,按綱分
[
表 2]
:示例性細菌菌株
[
表 3]
:示例性細菌菌株
[
表 4]
. 示例性細菌菌株
經修飾的細菌和mEV
綱 | 目 | 科 | 屬 | 物種 |
放線菌綱 | 放線菌屬 | 分枝桿菌科 | 分枝桿菌屬 | |
鏈黴菌科 | 鏈黴菌屬 | 變鉛青鏈黴菌、天藍色鏈黴菌、蘇丹鏈黴菌( Streptomyces sudanesis )、索馬里鏈黴菌 | ||
雙歧桿菌目 | 雙歧桿菌科 | 雙歧桿菌屬 | 青春雙歧桿菌、動物雙歧桿菌、兩歧雙歧桿菌、短雙歧桿菌、乳酸雙歧桿菌、長雙歧桿菌、假雙歧桿菌 | |
紅蝽桿菌目 | 紅蝽菌科 | 柯林斯氏菌屬 | 產氣柯林斯菌 | |
歐陸森氏菌屬 | 糞歐陸森氏菌 | |||
丙酸桿菌目 | 丙酸桿菌科 | 丙酸桿菌 | ||
芽孢桿菌綱( Bacilli ) | 芽孢桿菌目 | 芽孢桿菌目地位未定 XI 科 | 孿生球菌 | 溶血孿生球菌、麻疹孿生球菌 |
李斯特菌科 | 李斯特氏菌 | 單核細胞增多性李斯特氏菌、威氏李斯特氏菌 | ||
乳桿菌目 | 腸球菌科 | 腸球菌屬 | 耐久腸球菌、糞腸球菌、糞腸球菌、鶉雞腸球菌、絨毛腸球菌 | |
乳桿菌屬 | 乾酪乳桿菌、發酵乳桿菌、乳酸乳球菌乳脂亞種、黏膜乳桿菌、植物乳桿菌、羅伊氏乳桿菌、鼠李糖乳桿菌、唾液乳桿菌、格氏乳桿菌 | |||
鏈球菌科 | 乳球菌屬 | 乳酸乳球菌乳脂亞種 | ||
葡萄球菌 | 金黃色葡萄球菌 | |||
鏈球菌 | 無乳鏈球菌,金黃色鏈球菌,澳式鏈球菌,變形鏈球菌,副血鏈球菌,肺炎鏈球菌,化膿性鏈球菌,唾液鏈球菌 | |||
擬桿菌屬 | 擬桿菌目 | 擬桿菌科 | 擬桿菌屬 | 糞便擬桿菌、纖維素分解擬桿菌、糞居擬桿菌、多裡氏擬桿菌、脆弱擬桿菌、卵形擬桿菌、腐敗擬桿菌、薩氏擬桿菌、多形擬桿菌、普通擬桿菌 |
臭桿菌科 | 臭桿菌屬 | 內臟臭桿菌 | ||
卟啉單胞菌科 | 副擬桿菌屬 | 狄氏副擬桿菌、古氏副擬桿菌、屎副擬桿菌 | ||
卟啉單胞菌屬 | 牙齦卟啉單胞菌 | |||
普雷沃菌科 | 普雷沃菌屬 | 阿爾伯斯普雷沃菌、羊水普雷沃菌、橙色普雷沃菌、保氏普雷沃菌、貝根普雷沃菌、二路普雷沃菌、短普雷沃菌、布氏普雷沃菌、頰普雷沃菌、口頰普雷沃菌、著色普雷沃菌、人體普雷沃菌、糞便普雷沃菌、牙普雷沃菌、丹塔普雷沃菌、棲牙普雷沃菌、解糖腖普雷沃菌、棲居普雷沃菌、斐氏普雷沃菌、深黑色普雷沃菌、解肝素普雷沃菌、棲組織普雷沃菌、中間普雷沃菌、空腸普雷沃菌、洛氏普雷沃菌、小斑點普雷沃菌、馬斯普雷沃菌、產黑普雷沃菌、彩虹普雷沃菌、多形普雷沃菌、嗜糖普雷沃菌、南錫普雷沃菌、變黑普雷沃菌、口腔普雷沃菌、口普雷沃菌、稻普雷沃菌、齦炎普雷沃菌、蒼白普雷沃菌、沼澤普雷沃菌、胸膜炎普雷沃菌、棲瘤胃普雷沃菌、解糖普雷沃菌、唾液普雷沃菌、靶心普雷沃菌、賽赫普雷沃菌、 斯特塞拉普雷沃菌、坦納普雷沃菌、蒂莫普雷沃菌、真空腔普雷沃菌、動膠普雷沃菌 | ||
理研菌科 | 另枝菌屬( Alstipes ) | 普通另枝菌、殊異另枝菌、芬戈爾德氏另枝菌、不明顯另枝菌、 Alistipes ihumii 、 Alistipes inops 、馬賽另枝菌、 Alistipes megaguti 、 Alistipes obesi 、奧登多克氏另枝菌、 Alistipes provencensis 、腐敗另枝菌、塞內加爾另枝菌( Alistipes senegalensis )、賽赫另枝菌、蒂莫另枝菌 | ||
β 變形桿菌綱( Betaproteobacteria ) | 霍爾德菌目 | 產鹼桿菌科 | 產鹼菌屬( Paenalcaligenes ) | 人類產鹼菌 |
鮑特氏菌屬( Bordella ) | 百日咳桿菌 | |||
伯克霍爾德菌科 | 伯克霍爾德菌屬 | 鼻疽伯克霍爾德菌、假伯克霍爾德菌 | ||
羅爾斯通菌屬( Ralstonia ) | 青枯羅爾斯通菌( Ralstonia solanacearum ) | |||
奈瑟菌科 | 奈瑟菌屬 | 腦膜炎奈瑟菌 | ||
薩特氏菌科 | 薩特氏菌屬 | Sutterella parvirubra 、 Sutterella stercoricanis 、 Sutterella wadsworthensis | ||
梭菌綱 | 梭菌目 | Catabacteriaceae | 海鷗菌屬( Catabacter ) | 香港海鷗菌 |
梭菌科 | Aminiphila | Anaerosphaera aminiphila | ||
克裡斯滕森菌科( Christensenellaceae) | 馬氏克裡斯滕森菌、蒂莫克裡斯滕森菌 | |||
Hungatella | Hungatella effluvia | |||
真桿菌科 | 真桿菌屬 | 扭曲真桿菌、挑剔真桿菌、糞真桿菌、龐大真桿菌、霍氏真桿菌、黏液真桿菌、細枝真桿菌、直腸真桿菌 | ||
毛螺菌科 | 厭氧棒狀菌屬 ( Anaerostipes ) | 糞厭氧棒狀菌、哈氏厭氧棒狀菌( Anaerostipes hadrus ) | ||
布勞特氏菌屬 | 產氫營養型布勞特氏菌、馬賽布勞特氏菌 、排泄物布勞特氏菌、韋氏布勞特氏菌 | |||
卡托氏菌屬 | 痰卡托氏菌 | |||
糞球菌屬 | 靈巧糞球菌、陪伴糞球菌、一致糞球菌 | |||
戴阿利斯特菌屬 | 渾濁戴阿利斯特菌( Dialister invisus)、微好氣戴阿利斯特菌( Dialister micraeophilus)、嗜琥珀酸戴阿利斯特菌( Dialister succinatiphilus) | |||
多爾氏菌屬 | 產甲酸多爾氏菌、長鏈多爾氏菌、 | |||
Johnsonella | 懶惰約翰森菌( Johnsonella ignava ) | |||
口腔桿菌屬 | 微小口腔桿菌( Oribacterium parvum )、竇菌口腔桿菌( Oribacterium sinus ) | |||
毛形桿菌屬( Lachnobacterium ) | ||||
Lachnoclostridium | ||||
Lacrimispora | Lacrimispora sacchaarolytica | |||
羅斯氏菌屬 | 人羅斯氏菌、腸羅斯氏菌 | |||
泰澤菌屬 | 納西利斯泰澤菌 | |||
顫螺旋菌科 | 顫桿菌屬 | 產戊酸顫桿菌 | ||
Harryflintia屬 | Harryflinta acetispora | |||
消化球菌科 | ||||
消化鏈球菌科 | 副梭菌屬 | 解苯副梭菌 | ||
消化鏈球菌屬 | 羅氏消化鏈球菌 | |||
瘤胃球菌科 | 阿加薩桿菌屬物種 | |||
Fournierella屬 | Fournierella masssiliensis | |||
瘤胃球菌屬 | 白色瘤胃球菌、布氏瘤胃球菌、伶俐瘤胃球菌、活潑瘤胃球菌、食菊糖瘤胃球菌( Ruminococcus inulinivorans )、卵瘤胃球菌、扭鏈瘤胃球菌 | |||
糞桿菌屬 | 普氏棲糞桿菌 | |||
梭菌目XIII科/地位未定 | Intestimonas butyriciproducens | |||
梭桿菌門 | 梭桿菌目 | 梭桿菌科 | 梭桿菌屬 | 核粒梭桿菌、舟形梭桿菌 |
纖毛菌科 ( Leptotrichiaceae ) | 纖發菌屬 | |||
纖毛菌屬 | ||||
丙型變形菌綱 | 腸桿菌目( Enterobacterales ) | 腸桿菌科 | 克雷伯氏菌屬 | 產酸克雷伯菌、肺炎克雷伯菌、類肺炎克雷伯氏菌擬肺炎亞種、 |
埃希氏桿菌屬 | 大腸桿菌菌株 Nissle 1917 ( EcN ) 大腸桿菌菌株 ECOR12 大腸桿菌菌株 ECOR63 | |||
志賀氏菌屬 | ||||
Negativicutes | 胺基酸球菌科( Acidaminococcaceae ) | 胺基酸球菌屬 | 發酵胺基酸球菌、腸胺基酸球菌 | |
考拉桿菌屬( Phascolarctobacterium ) | 糞考拉桿菌、琥珀考拉桿菌 | |||
月形單胞菌科 | 月形單胞菌屬 | 菲利克斯月形單胞菌、地位未定月形單胞菌、生痰月形單胞菌 | ||
Sporomusaceae | 月形單胞菌目 | |||
韋榮氏球菌科 | 阿裡松氏菌屬( Allisonella ) | |||
厭氧球形菌屬 | Anaeroglobus germinatus | |||
Caecibacter | ||||
Colibacter | ||||
巨型球菌屬 | 埃氏巨型球菌( Megasphera elsedenii)、馬賽巨型球菌、微核巨型球菌( Megasphera micronuciformis) 巨型球菌屬物種 | |||
擬芽孢桿菌屬 ( Massilibacillus ) | 馬賽擬芽孢桿菌( Massilibacillus massiliensis ) | |||
丙酸螺菌屬 ( Propionispira ) | ||||
Negativicoccus | Negativicoccus succinicivornas | |||
韋榮氏球菌屬 | 殊異韋榮氏球菌、小韋榮氏球菌、鼠韋榮氏球菌( Veillonella ratti )、當別町韋榮氏球菌 | |||
互養菌目 | 互養菌科 | 胺基桿菌屬 | 移動胺基桿菌 | |
氯酸桿菌屬 ( Cloacibacillus ) | 埃夫裡桿菌 | |||
Rarimicrobium | Rarimicrobium hominis | |||
疣微菌綱 | 疣微菌目 | 阿克曼氏菌科 | 阿克曼氏菌屬 | Akkermansia mucinophila |
OTU | 公開 DB 登錄號 | OTU | 公開 DB 登錄號 |
伴放線放線桿菌 | AY362885 | 鼠乳桿菌 | NR_042231 |
小放線桿菌 | ACFT01000025 | 諾登西絲乳桿菌 | NR_041629 |
胸膜肺炎放線桿菌 | NR_074857 | 酒類乳桿菌 | NR_043095 |
產琥珀酸放線桿菌 | CP000746 | 口乳桿菌 | AEKL01000077 |
脲放線桿菌 | AEVG01000167 | 類短乳桿菌 | NR_042456 |
馬西裡氏放線棒菌 | AF487679 | 類布氏乳桿菌 | NR_041294 |
夏氏放線棒菌 | AY957507 | 副乾酪乳桿菌 | ABQV01000067 |
放線棒菌屬 BM#101342 | AY282578 | 類高加索乳桿菌 | NR_029039 |
放線棒菌屬 P2P_19 P1 | AY207066 | 戊糖乳桿菌 | JN813103 |
嗜黏蛋白阿克曼氏菌 | CP001071 | 惡味乳桿菌 | NR_029360 |
芬戈爾德氏另枝菌 | NR_043064 | 植物乳桿菌 | ACGZ02000033 |
不明顯另枝菌 | AB490804 | 腦橋乳桿菌 | HM218420 |
奧登多克氏另枝菌 | NR_043318 | 羅伊乳桿菌 | ACGW02000012 |
腐敗另枝菌 | ABFK02000017 | 鼠李糖乳桿菌 | ABWJ01000068 |
沙氏另枝菌 | FP929032 | 羅氏乳桿菌 | GU269544 |
另枝菌屬 HGB5 | AENZ01000082 | 瘤胃乳桿菌 | ACGS02000043 |
另枝菌屬物種 JC50 | JF824804 | 清酒乳桿菌 | DQ989236 |
另枝菌屬 RMA 9912 | GQ140629 | 唾液乳桿菌 | AEBA01000145 |
糞厭氧棒狀菌 | ABAX03000023 | 健男乳桿菌( Lactobacillus saniviri ) | AB602569 |
厭氧棒狀菌屬 3_2_56FAA | ACWB01000002 | 老年乳桿菌 | AB602570 |
風化芽孢桿菌 | NR_025557 | 乳桿菌屬 66c | FR681900 |
嗜氣芽孢桿菌 | NR_042339 | 乳桿菌屬物種 BT6 | HQ616370 |
艾氏芽孢桿菌 | GQ980243 | 乳桿菌屬物種 KLDS 1.0701 | EU600905 |
嗜鹼芽孢桿菌 | X76436 | 乳桿菌屬物種 KLDS 1.0702 | EU600906 |
解澱粉芽孢桿菌 | NR_075005 | 乳桿菌屬物種 KLDS 1.0703 | EU600907 |
炭疽芽孢桿菌 | AAEN01000020 | 乳桿菌屬物種 KLDS 1.0704 | EU600908 |
萎縮芽孢桿菌 | NR_075016 | 乳桿菌屬物種 KLDS 1.0705 | EU600909 |
栗褐芽孢桿菌 | NR_036893 | 乳桿菌屬物種 KLDS 1.0707 | EU600911 |
蠟樣芽孢桿菌 | ABDJ01000015 | 乳桿菌屬物種 KLDS 1.0709 | EU600913 |
環狀芽孢桿菌 | AB271747 | 乳桿菌屬物種 KLDS 1.0711 | EU600915 |
克勞氏芽孢桿菌 | FN397477 | 乳桿菌屬物種 KLDS 1.0712 | EU600916 |
凝結芽孢桿菌 | DQ297928 | 乳桿菌屬物種 KLDS 1.0713 | EU600917 |
堅韌芽孢桿菌 | NR_025842 | 乳桿菌屬物種 KLDS 1.0716 | EU600921 |
彎曲芽孢桿菌 | NR_024691 | 乳桿菌屬物種 KLDS 1.0718 | EU600922 |
福氏芽孢桿菌 | NR_025786 | 乳桿菌屬物種 KLDS 1.0719 | EU600923 |
明膠芽孢桿菌 | NR_025595 | 乳桿菌屬口腔植株 HT002 | AY349382 |
鹽沼芽孢桿菌 | NR_026144 | 乳桿菌屬物種口腔植株 HT070 | AY349383 |
耐鹽芽孢桿菌 | AY144582 | 乳桿菌屬口腔分類群 052 | GQ422710 |
黑佈施泰因芽孢桿菌 | NR_042286 | 臘腸乳桿菌 | NR_042194 |
霍爾氏芽孢桿菌 | NR_036860 | 烏蘭乳桿菌 | ACGU01000081 |
病研所芽孢桿菌 | NR_043268 | 陰道乳桿菌 | ACGV01000168 |
遲緩芽孢桿菌 | NR_040792 | 酒乳桿菌 | NR_042196 |
地衣芽孢桿菌 | NC_006270 | 犢乳桿菌 | NR_041305 |
巨大芽孢桿菌 | GU252124 | 玉米乳桿菌 | NR_037122 |
尼氏芽孢桿菌 | NR_044546 | 格氏乳球菌 | AF061005 |
農研所芽孢桿菌 | NR_043334 | 乳酸乳球菌 | CP002365 |
菸酸芽孢桿菌 | NR_024695 | 棉子糖乳球菌 | NR_044359 |
抱川芽孢桿菌 | NR_041377 | 格雷氏李斯特氏菌 | ACCR02000003 |
短小芽孢桿菌 | NR_074977 | 無毒李斯特氏菌 | JF967625 |
沙福芽孢桿菌 | JQ624766 | 伊氏李斯特氏菌 | X56151 |
單純芽孢桿菌 | NR_042136 | 單核球增多性李斯特氏菌 | CP002003 |
索諾氏芽孢桿菌 | NR_025130 | 威氏李斯特氏菌 | AM263198 |
芽孢桿菌屬 10403023 MM10403188 | CAET01000089 | 埃氏巨型球菌 | AY038996 |
芽孢桿菌屬 2_A_57_CT2 | ACWD01000095 | 巨型球菌屬複合群 C1 | AY278622 |
芽孢桿菌屬物種 2008724126 | GU252108 | 巨型球菌屬複合群類型 _1 | ADGP01000010 |
芽孢桿菌屬物種 2008724139 | GU252111 | 微核巨型球菌 | AECS01000020 |
芽孢桿菌屬物種 7_16AIA | FN397518 | 巨型球菌屬 BLPYG_07 | HM990964 |
芽孢桿菌屬物種 9_3AIA | FN397519 | 巨型球菌屬 UPII 199_6 | AFIJ01000040 |
芽孢桿菌屬物種 AP8 | JX101689 | 古本微桿菌 | NR_025098 |
芽孢桿菌屬 B27 ( 2008 ) | EU362173 | 乳酸微桿菌 | EU714351 |
芽孢桿菌屬物種 BT1B_CT2 | ACWC01000034 | 賈氏光岡菌 | NR_028840 |
芽孢桿菌屬物種 GB1.1 | FJ897765 | 多酸光岡菌 | ABWK02000005 |
芽孢桿菌屬物種 GB9 | FJ897766 | 光岡菌屬口腔分類群 521 | GU413658 |
芽孢桿菌屬物種 HU19.1 | FJ897769 | 光岡菌屬口腔分類群 G68 | GU432166 |
芽孢桿菌屬物種 HU29 | FJ897771 | 膿腫分枝桿菌 | AGQU01000002 |
芽孢桿菌屬物種 HU33.1 | FJ897772 | 非洲分枝桿菌 | AF480605 |
芽孢桿菌屬物種 JC6 | JF824800 | Mycobacterium alsiensis | AJ938169 |
芽孢桿菌屬口腔分類群 F26 | HM099642 | 鳥分枝桿菌 | CP000479 |
芽孢桿菌屬口腔分類群 F28 | HM099650 | 龜分枝桿菌 | AB548610 |
芽孢桿菌屬口腔分類群 F79 | HM099654 | 哥倫比亞分枝桿菌 | AM062764 |
芽孢桿菌屬物種 SRC_DSF1 | GU797283 | 象皮病分枝桿菌 | AF385898 |
芽孢桿菌屬物種 SRC_DSF10 | GU797292 | 戈登分枝桿菌 | GU142930 |
芽孢桿菌屬物種 SRC_DSF2 | GU797284 | 胞內分枝桿菌 | GQ153276 |
芽孢桿菌屬物種 SRC_DSF6 | GU797288 | 堪薩斯分枝桿菌 | AF480601 |
芽孢桿菌屬物種 tc09 | HQ844242 | 拉克絲分枝桿菌 | NR_025175 |
芽孢桿菌屬物種 zh168 | FJ851424 | 麻風分枝桿菌 | FM211192 |
球形芽孢桿菌 | DQ286318 | 彌漫型麻風分枝桿菌 | EU203590 |
產孢芽孢桿菌 | NR_026010 | 麥氏分枝桿菌 | FR798914 |
枯草芽孢桿菌 | EU627588 | 曼氏分枝桿菌 | FJ042897 |
嗜熱澱粉芽孢桿菌 | NR_029151 | 海分枝桿菌 | NC_010612 |
魏氏芽孢桿菌 | NR_074926 | 田鼠分枝桿菌 | NR_025234 |
擬桿菌目細菌 ph8 | JN837494 | 新金分枝桿菌 | AF268445 |
擬桿菌屬複合群 P1 | AY341819 | 副瘰鬁分枝桿菌 | ADNV01000350 |
擬桿菌屬複合群 P2 口腔植株 MB1_G13 | DQ003613 | 副土分枝桿菌 | EU919229 |
擬桿菌屬複合群 P3 口腔植株 MB1_G34 | DQ003615 | 草分枝桿菌 | GU142920 |
擬桿菌屬複合群 P4 口腔植株 MB2_G17 | DQ003617 | 恥垢分枝桿菌 | DQ536403 |
擬桿菌屬複合群 P5 口腔植株 MB2_P04 | DQ003619 | 包皮垢分枝桿菌 | CP000480 |
擬桿菌屬複合群 P6 口腔植株 MB3_C19 | DQ003634 | 分枝桿菌屬物種 1761 | EU703150 |
擬桿菌屬複合群 P7 口腔植株 MB3_P19 | DQ003623 | 分枝桿菌屬物種 1776 | EU703152 |
擬桿菌屬複合群 P8 口腔植株 MB4_G15 | DQ003626 | 分枝桿菌屬物種 1781 | EU703147 |
生酸擬桿菌 | NR_028607 | 分枝桿菌屬物種 1791 | EU703148 |
巴氏桿菌擬桿菌 | NR_041446 | 分枝桿菌屬物種 1797 | EU703149 |
人糞擬桿菌 | EU136686 | 分枝桿菌屬 AQ1GA4 | HM210417 |
解纖維素擬桿菌 | ACCH01000108 | 分枝桿菌屬物種 B10_07.09.0206 | HQ174245 |
克拉氏擬桿菌 | AFBM01000011 | 分枝桿菌屬物種 GN_10546 | FJ497243 |
凝固擬桿菌 | AB547639 | 分枝桿菌屬物種 GN_10827 | FJ497247 |
糞居擬桿菌 | ABIY02000050 | 分枝桿菌屬物種 GN_11124 | FJ652846 |
嗜糞擬桿菌 | ACBW01000012 | 分枝桿菌屬物種 GN_9188 | FJ497240 |
多裡氏擬桿菌 | ABWZ01000093 | 分枝桿菌屬物種 GR_2007_210 | FJ555538 |
埃氏擬桿菌 | ACWG01000065 | 分枝桿菌屬物種 HE5 | AJ012738 |
糞便擬桿菌 | GQ496624 | 分枝桿菌屬物種 NLA001000736 | HM627011 |
芬戈爾德氏擬桿菌 | AB222699 | 分枝桿菌屬 W | DQ437715 |
麯黴擬桿菌 | AFBN01000029 | 結核分枝桿菌 | CP001658 |
脆弱擬桿菌 | AP006841 | 潰瘍分枝桿菌 | AB548725 |
半乳糖醛酸擬桿菌 | DQ497994 | 脆弱分枝桿菌 | EU834055 |
潰瘍擬桿菌 | CP002352 | 無乳支原體 | AF010477 |
解肝素擬桿菌 | JN867284 | 兩形支原體 | AY531656 |
腸擬桿菌 | ABJL02000006 | 關節炎支原體 | NC_011025 |
馬賽擬桿菌 | AB200226 | 牛眼支原體 | NR_025987 |
諾德擬桿菌 | NR_043017 | 咽支原體 | NR_024983 |
擬南芥擬桿菌( Bacteroides oleiciplenus ) | AB547644 | 發酵支原體 | CP002458 |
卵形擬桿菌 | ACWH01000036 | 絮狀支原體 | X62699 |
果膠擬桿菌 | ABVQ01000036 | 生殖器支原體 | L43967 |
平常擬桿菌 | AB200218 | 人型支原體 | AF443616 |
化膿性擬桿菌 | NR_041280 | 口腔支原體 | AY796060 |
Bacteroides salanitronis | CP002530 | 綿羊肺炎支原體 | NR_025989 |
薩利爾斯氏擬桿菌( Bacteroides salyersiae ) | EU136690 | 穿透支原體 | NC_004432 |
擬桿菌屬 1_1_14 | ACRP01000155 | 肺炎支原體 | NC_000912 |
擬桿菌屬 1_1_30 | ADCL01000128 | 腐敗支原體 | U26055 |
擬桿菌屬 1_1_6 | ACIC01000215 | 唾液支原體 | M24661 |
擬桿菌屬 2_1_22 | ACPQ01000117 | 支原體科複合群 P1 口腔植株 MB1_G23 | DQ003614 |
擬桿菌屬 2_1_56FAA | ACWI01000065 | 桿狀奈瑟菌 | AFAY01000058 |
擬桿菌屬 2_2_4 | ABZZ01000168 | 灰色奈瑟菌 | ACDY01000037 |
擬桿菌屬 20_3 | ACRQ01000064 | 長形奈瑟菌 | ADBF01000003 |
擬桿菌屬 3_1_19 | ADCJ01000062 | 淺黃奈瑟菌 | ACQV01000025 |
擬桿菌屬 3_1_23 | ACRS01000081 | 奈瑟菌屬複合群 P2 口腔植株 MB5_P15 | DQ003630 |
擬桿菌屬物種 3_1_33FAA | ACPS01000085 | 淋病奈瑟菌 | CP002440 |
擬桿菌屬物種 3_1_40A | ACRT01000136 | 乳糖奈瑟菌 | ACEQ01000095 |
擬桿菌屬 3_2_5 | ACIB01000079 | 獼猴奈瑟菌 | AFQE01000146 |
擬桿菌屬 315_5 | FJ848547 | 腦膜炎奈瑟菌 | NC_003112 |
擬桿菌屬物種 31SF15 | AJ583248 | 黏膜奈瑟菌 | ACDX01000110 |
擬桿菌屬物種 31SF18 | AJ583249 | 咽奈瑟菌 | AJ239281 |
擬桿菌屬物種 35AE31 | AJ583244 | 多糖奈瑟菌 | ADBE01000137 |
擬桿菌屬物種 35AE37 | AJ583245 | 乾燥奈瑟菌 | ACKO02000016 |
擬桿菌屬物種 35BE34 | AJ583246 | 奈瑟菌屬 KEM232 | GQ203291 |
擬桿菌屬物種 35BE35 | AJ583247 | 奈瑟菌屬口腔植株 AP132 | AY005027 |
擬桿菌屬 4_1_36 | ACTC01000133 | 奈瑟菌屬物種口腔植株 JC012 | AY349388 |
擬桿菌屬物種 4_3_47FAA | ACDR02000029 | 奈瑟菌屬口腔菌株 B33KA | AY005028 |
擬桿菌屬物種 9_1_42FAA | ACAA01000096 | 奈瑟菌屬口腔分類群 014 | ADEA01000039 |
擬桿菌屬物種 AR20 | AF139524 | 奈瑟菌屬物種 SMC_A9199 | FJ763637 |
擬桿菌屬物種 AR29 | AF139525 | 奈瑟菌屬物種 TM10_1 | DQ279352 |
擬桿菌屬物種 B2 | EU722733 | 淡黃色奈瑟菌 | ACEO01000067 |
擬桿菌屬物種 D1 | ACAB02000030 | 紋臭桿菌 | AB490805 |
擬桿菌屬物種 D2 | ACGA01000077 | 內臟臭桿菌 | CP002544 |
擬桿菌屬物種 D20 | ACPT01000052 | 顫桿菌屬 G2 | HM626173 |
擬桿菌屬物種 D22 | ADCK01000151 | 產戊酸顫桿菌 | NR_074793 |
擬桿菌屬物種 F_4 | AB470322 | 克魯斯顫螺菌 | AB040495 |
擬桿菌屬物種 NB_8 | AB117565 | 巴賽隆納類芽孢桿菌 | NR_042272 |
擬桿菌屬物種 WH2 | AY895180 | 巴倫葛茲類芽孢桿菌 | NR_042756 |
擬桿菌屬物種 XB12B | AM230648 | 千葉類芽孢桿菌 | NR_040885 |
擬桿菌屬物種 XB44A | AM230649 | 庫氏類芽孢桿菌 | NR_025372 |
排泄物擬桿菌 | ABFZ02000022 | 堅韌類芽孢桿菌 | NR_037017 |
多形擬桿菌 | NR_074277 | 解葡聚糖類芽孢桿菌 | D78470 |
單形擬桿菌 | AB050110 | 乳酸類芽孢桿菌 | NR_025739 |
解尿素擬桿菌 | GQ167666 | 燦爛類芽孢桿菌 | NR_040882 |
普通擬桿菌 | CP000139 | 飼料類芽孢桿菌 | NR_040853 |
木聚糖酶擬桿菌 | ADKP01000087 | 多黏類芽孢桿菌 | NR_037006 |
擬桿菌門細菌口腔分類群 D27 | HM099638 | 金龜子類芽孢桿菌 | NR_040888 |
擬桿菌門細菌口腔分類群 F31 | HM099643 | 類芽孢桿菌屬 CIP 101062 | HM212646 |
擬桿菌門細菌口腔分類群 F44 | HM099649 | 狄氏副擬桿菌 | CP000140 |
腸道巴氏桿菌 | AB370251 | 古氏副擬桿菌 | AY974070 |
雙歧桿菌屬複合群 C1 | AY278612 | 戈登氏副擬桿菌 | AB470344 |
青春雙歧桿菌 | AAXD02000018 | 約氏副擬桿菌 | ABYH01000014 |
角雙歧桿菌 | ABYS02000004 | 屎副擬桿菌 | EU136685 |
動物雙歧桿菌 | CP001606 | 副擬桿菌屬 D13 | ACPW01000017 |
兩歧雙歧桿菌 | ABQP01000027 | 副擬桿菌屬物種 NS31_3 | JN029805 |
短雙歧桿菌 | CP002743 | 黑色消化球菌 | NR_029221 |
鏈狀雙歧桿菌 | ABXY01000019 | 消化球菌屬口腔植株 JM048 | AY349389 |
牙雙歧桿菌 | CP001750 | 消化球菌屬口腔分類群 167 | GQ422727 |
沒食子雙歧桿菌 | ABXB03000004 | 不解糖嗜腖菌 | D14145 |
嬰兒雙歧桿菌 | AY151398 | 杜爾丹尼氏嗜腖菌 | EU526290 |
卡氏雙歧桿菌 | AB491757 | 海氏嗜腖菌 | NR_026358 |
長雙歧桿菌 | ABQQ01000041 | 吲哚嗜腖菌 | AY153431 |
假鏈狀雙歧桿菌 | ABXX02000002 | 艾弗嗜腖菌 | Y07840 |
偽長雙歧桿菌 | NR_043442 | 淚腺嗜腖菌 | ADDO01000050 |
斯氏雙歧桿菌 | AJ307005 | 嗜腖菌屬 gpac007 | AM176517 |
雙歧桿菌屬 HM2 | AB425276 | 嗜腖菌屬物種 gpac018A | AM176519 |
雙歧桿菌屬物種 HMLN12 | JF519685 | 嗜腖菌屬物種 gpac077 | AM176527 |
雙歧桿菌屬物種 M45 | HM626176 | 嗜腖菌屬物種 gpac148 | AM176535 |
雙歧桿菌屬物種 MSX5B | HQ616382 | 嗜腖菌屬物種 JC140 | JF824803 |
雙歧桿菌屬物種 TM_7 | AB218972 | 嗜腖菌屬物種口腔分類群 386 | ADCS01000031 |
嗜熱雙歧桿菌 | DQ340557 | 嗜腖菌屬物種口腔分類群 836 | AEAA01000090 |
尿雙歧桿菌 | AJ278695 | 消化鏈球菌科細菌 ph1 | JN837495 |
球形布勞特氏菌 | AB571656 | 厭氧消化鏈球菌 | AY326462 |
格魯氏布勞特氏菌( Blautia glucerasea ) | AB588023 | 微小消化鏈球菌 | AM176538 |
格魯斯布勞特氏菌( Blautia glucerasei ) | AB439724 | 消化鏈球菌屬 9succ1 | X90471 |
漢森布勞特氏菌 | ABYU02000037 | 消化鏈球菌屬口腔植株 AP24 | AB175072 |
產氫營養型布勞特氏菌 | ACBZ01000217 | 消化鏈球菌屬物種口腔植株 FJ023 | AY349390 |
盧氏布勞特氏菌 | AB691576 | 消化鏈球菌屬 P4P_31 P3 | AY207059 |
生產性布勞特氏菌 | AB600998 | 口炎消化鏈球菌 | ADGQ01000048 |
申克布勞特氏菌 | NR_026312 | 卟啉單胞菌科細菌 NML 060648 | EF184292 |
布勞特氏菌屬 M25 | HM626178 | 不解糖卟啉單胞菌 | AENO01000048 |
排泄物布勞特氏菌 | HM626177 | 牙髓卟啉單胞菌 | ACNN01000021 |
韋氏布勞特氏菌 | EF036467 | 牙齦卟啉單胞菌 | AE015924 |
支氣管炎鮑特氏菌 | NR_025949 | 利氏卟啉單胞菌 | NR_025907 |
霍爾氏鮑特氏菌 | AB683187 | 獼猴卟啉單胞菌 | NR_025908 |
副百日咳鮑特氏菌 | NR_025950 | 索拉卟啉單胞菌 | AB547667 |
百日咳鮑特氏菌 | BX640418 | 卟啉單胞菌屬口腔植株 BB134 | AY005068 |
阿氏螺旋體 | ABCU01000001 | 卟啉單胞菌屬物種口腔植株 F016 | AY005069 |
伯氏螺旋體 | ABGI01000001 | 卟啉單胞菌屬口腔植株 P2PB_52 P1 | AY207054 |
麝鼠勺螺旋體 | DQ057990 | 卟啉單胞菌屬物種口腔植株 P4GB_100 P2 | AY207057 |
達頓螺旋體 | NC_011229 | 卟啉單胞菌屬 UQD 301 | EU012301 |
伽氏螺旋體 | ABJV01000001 | 上野卟啉單胞菌 | ACLR01000152 |
赫氏螺旋體 | AY597657 | 阿爾伯斯普雷沃菌 | NR_025300 |
西班牙螺旋體 | DQ057988 | 安氏普雷沃菌 | AB547670 |
伊朗包柔氏螺旋體 | HM161645 | 伯氏普雷沃菌 | ACKS01000100 |
回歸熱包柔氏螺旋體 | AF107367 | 二路普雷沃菌 | ADFO01000096 |
螺旋體屬 NE49 | AJ224142 | 短雷沃菌 | NR_041954 |
斯皮爾曼螺旋體 | ABKB01000002 | 頰普雷沃菌 | ACRB01000001 |
墨西哥包柔氏螺旋體 | NC_008710 | 口頰普雷沃菌 | JN867261 |
法雷斯螺旋體 | ABCY01000002 | 糞便普雷沃菌 | ACBX02000014 |
綿羊布氏桿菌 | NC_009504 | 人體普雷沃菌 | L16465 |
布氏桿菌屬 83_13 | ACBQ01000040 | 牙普雷沃菌 | AB547678 |
布氏桿菌屬 BO1 | EU053207 | 棲牙普雷沃菌 | CP002589 |
豬布氏桿菌 | ACBK01000034 | 解糖腖普雷沃菌 | AEDO01000026 |
須芒草伯克霍爾德菌 | AAUZ01000009 | 普雷沃菌屬複合群 C1 | AY278624 |
新洋蔥伯克霍爾德菌 | AAHI01000060 | 普雷沃菌屬複合群 C2 | AY278625 |
洋蔥伯克霍爾德菌 | NR_041719 | 普雷沃菌屬複合群 P7 口腔植株 MB2_P31 | DQ003620 |
鼻疽伯克霍爾德菌 | CP000547 | 普雷沃菌屬複合群 P8 口腔植株 MB3_P13 | DQ003622 |
多食伯克霍爾德菌 | NC_010086 | 普雷沃菌屬複合群 P9 口腔植株 MB7_G16 | DQ003633 |
俄克拉何馬伯克霍爾德菌 | DQ108388 | 解肝素普雷沃菌 | GQ422742 |
類鼻疽伯克霍爾德菌 | CP001408 | 棲組織普雷沃菌 | JN867315 |
產根黴素伯克霍爾德菌 | HQ005410 | 中間普雷沃菌 | AF414829 |
伯克霍爾德菌屬 383 | CP000151 | 洛氏普雷沃菌 | JN867231 |
食異生素伯克霍爾德菌 | U86373 | 斑狀普雷沃菌 | AGEK01000035 |
伯克霍爾德菌細菌 1_1_47 | ADCQ01000066 | 馬氏普雷沃菌 | AEEI01000070 |
穗狀丁酸弧菌 | ABWN01000012 | 產黑色素普雷沃菌 | CP002122 |
溶纖維丁酸弧菌 | U41172 | 彩虹普雷沃菌 | AGWK01000061 |
鼠衣原體 | AE002160 | 多形普雷沃菌 | AEWX01000054 |
鸚鵡熱衣原體 | NR_036864 | 食多糖普雷沃菌 | AFJE01000016 |
沙眼衣原體 | U68443 | 南錫普雷沃菌 | JN867228 |
衣原體目細菌 NS11 | JN606074 | 變黑普雷沃菌 | AFPX01000069 |
無丙二酸檸檬酸桿菌 | FR870441 | 口腔普雷沃菌 | AEPE01000021 |
布氏檸檬酸桿菌 | NR_028687 | 口普雷沃菌 | ADDV01000091 |
法氏檸檬酸桿菌 | AF025371 | 齦炎普雷沃菌 | L16472 |
弗氏檸檬酸桿菌 | NR_028894 | 蒼白普雷沃菌 | AFPY01000135 |
吉利檸檬酸桿菌 | AF025367 | 棲瘤胃普雷沃菌 | CP002006 |
柯氏檸檬酸桿菌 | NC_009792 | 唾液普雷沃菌 | AB108826 |
莫林檸檬酸桿菌 | AF025369 | 普雷沃菌屬 BI_42 | AJ581354 |
鼠檸檬酸桿菌 | NR_074903 | 普雷沃菌屬物種 CM38 | HQ610181 |
塞氏檸檬酸桿菌 | AF025364 | 普雷沃菌屬物種 ICM1 | HQ616385 |
檸檬酸桿菌屬 30_2 | ACDJ01000053 | 普雷沃菌屬物種 ICM55 | HQ616399 |
檸檬酸桿菌屬 KMSI_3 | GQ468398 | 普雷沃菌屬 JCM 6330 | AB547699 |
沃克曼檸檬酸桿菌 | AF025373 | 普雷沃菌屬口腔植株 AA020 | AY005057 |
楊氏檸檬酸桿菌 | ABWL02000011 | 普雷沃菌屬物種口腔植株 ASCG10 | AY923148 |
埃夫裡桿菌 | GQ258966 | 普雷沃菌屬物種口腔植株 ASCG12 | DQ272511 |
梭菌科細菌 END_2 | EF451053 | 普雷沃菌屬物種口腔植株 AU069 | AY005062 |
梭菌科細菌 JC13 | JF824807 | 普雷沃菌屬物種口腔植株 CY006 | AY005063 |
梭菌屬細菌 1_7_47FAA | ABQR01000074 | 普雷沃菌屬物種口腔植株 DA058 | AY005065 |
梭菌屬細菌 9400853 | HM587320 | 普雷沃菌屬物種口腔植株 FL019 | AY349392 |
梭菌屬細菌 9403326 | HM587324 | 普雷沃菌屬物種口腔植株 FU048 | AY349393 |
梭菌屬細菌口腔植株 P4PA_66 P1 | AY207065 | 普雷沃菌屬物種口腔植株 FW035 | AY349394 |
梭菌屬細菌口腔分類群 093 | GQ422712 | 普雷沃菌屬物種口腔植株 GI030 | AY349395 |
梭菌屬細菌口腔分類群 F32 | HM099644 | 普雷沃菌屬物種口腔植株 GI032 | AY349396 |
梭菌屬細菌 ph2 | JN837487 | 普雷沃菌屬物種口腔植株 GI059 | AY349397 |
梭菌屬細菌 SY8519 | AB477431 | 普雷沃菌屬物種口腔植株 GU027 | AY349398 |
梭菌屬複合群 BVAB3 | CP001850 | 普雷沃菌屬物種口腔植株 HF050 | AY349399 |
梭菌屬 SM4_1 | FP929060 | 普雷沃菌屬物種口腔植株 ID019 | AY349400 |
梭菌屬物種 SS3_4 | AY305316 | 普雷沃菌屬物種口腔植株 IDR_CEC_0055 | AY550997 |
梭菌屬物種 SSC_2 | FP929061 | 普雷沃菌屬物種口腔植株 IK053 | AY349401 |
丙酮丁醇梭酸 | NR_074511 | 普雷沃菌屬物種口腔植株 IK062 | AY349402 |
耐氧梭酸 | X76163 | 普雷沃菌屬口腔植株 P4PB_83 P2 | AY207050 |
阿爾登氏梭菌 | NR_043680 | 普雷沃菌屬物種口腔分類群 292 | GQ422735 |
奧德里奇氏梭菌 | NR_026099 | 普雷沃菌屬物種口腔分類群 299 | ACWZ01000026 |
藻狀梭菌 | NR_041746 | 普雷沃菌屬物種口腔分類群 300 | GU409549 |
解藻木聚糖梭菌 | NR_028726 | 普雷沃菌屬物種口腔分類群 302 | ACZK01000043 |
胺基戊酸梭菌 | NR_029245 | 普雷沃菌屬物種口腔分類群 310 | GQ422737 |
苦杏仁梭菌 | AY353957 | 普雷沃菌屬物種口腔分類群 317 | ACQH01000158 |
阿根廷梭菌 | NR_029232 | 普雷沃菌屬物種口腔分類群 472 | ACZS01000106 |
天門冬形梭菌 | ACCJ01000522 | 普雷沃菌屬物種口腔分類群 781 | GQ422744 |
巴氏梭菌 | NR_029229 | 普雷沃菌屬物種口腔分類群 782 | GQ422745 |
巴特氏梭菌 | ABEZ02000012 | 普雷沃菌屬口腔分類群 F68 | HM099652 |
拜氏梭菌 | NR_074434 | 普雷沃菌屬物種口腔分類群 G60 | GU432133 |
雙酵素梭菌 | X73437 | 普雷沃菌屬物種口腔分類群 G70 | GU432179 |
鮑氏梭菌 | ABCC02000039 | 普雷沃菌屬物種口腔分類群 G71 | GU432180 |
肉毒梭菌 | NC_010723 | 普雷沃菌屬物種 SEQ053 | JN867222 |
丁酸梭菌 | ABDT01000017 | 普雷沃菌屬物種 SEQ065 | JN867234 |
屍毒梭菌 | AB542932 | 普雷沃菌屬物種 SEQ072 | JN867238 |
食氧化碳梭菌 | FR733710 | 普雷沃菌屬物種 SEQ116 | JN867246 |
肉梭菌 | NR_044716 | 普雷沃菌屬物種 SG12 | GU561343 |
隱藏梭菌 | X77844 | 普雷沃菌屬物種 sp24 | AB003384 |
速生梭菌 | JQ246092 | 普雷沃菌屬物種 sp34 | AB003385 |
纖維素梭菌 | NR_044624 | 糞普雷沃菌 | AB244774 |
肖沃氏梭菌 | EU106372 | 譚氏普雷沃菌 | ACIJ02000018 |
香茅梭菌 | ADLJ01000059 | 蒂蒙斯普雷沃菌 | ADEF01000012 |
澄清梭菌 | NR_041235 | 真口普雷沃菌 | ACVA01000027 |
梭狀梭菌 | M59089 | 普雷沃菌科細菌 P4P_62 P1 | AY207061 |
梭形梭菌 | NR_044715 | 丙酸桿菌科細菌 NML 02_0265 | EF599122 |
球形梭菌 | EF025906 | 產丙酸丙酸桿菌 | NC_019395 |
匙形梭菌 | NR_044717 | 痤瘡丙酸桿菌 | ADJM01000010 |
耳蝸形梭菌 | NR_026495 | 貪婪丙酸桿菌 | AJ003055 |
犬腸梭菌 | FJ957863 | 費氏丙酸桿菌 | NR_036972 |
鷓鴣梭菌 | NR_026151 | 顆粒丙酸桿菌 | FJ785716 |
難辨梭菌 | NC_013315 | 詹森丙酸桿菌 | NR_042269 |
雙孢梭菌 | NR_026491 | 丙酸丙酸桿菌 | NR_025277 |
酯化梭菌 | NR_042153 | 丙酸桿菌屬 434_HC2 | AFIL01000035 |
福氏梭菌 | NR_044714 | 丙酸桿菌屬物種 H456 | AB177643 |
Clostridium favososporum | X76749 | 丙酸桿菌屬 LG | AY354921 |
費新尼亞梭菌 | AF270502 | 丙酸桿菌屬口腔分類群 192 | GQ422728 |
寒冷梭菌 | NR_024919 | 丙酸桿菌屬物種 S555a | AB264622 |
產氣梭菌 | NR_024945 | 特恩氏丙酸桿菌 | NR_042270 |
戈氏梭菌 | AB542933 | 銅綠假單胞菌 | AABQ07000001 |
乙二醇梭菌 | FJ384385 | 螢光假單胞菌 | AY622220 |
人糞梭菌 | AB233029 | 蓋氏假單胞菌 | FJ943496 |
溶血梭菌 | NR_024749 | 門多薩假單胞菌 | AAUL01000021 |
哈氏梭菌 | AY552788 | 蒙氏假單胞菌 | NR_024910 |
平野氏梭菌 | AB023970 | 草假單胞菌 | GU188951 |
溶組織梭菌 | HF558362 | 類產鹼假單胞菌 | NR_037000 |
海氏梭菌 | AB023973 | 惡臭假單胞菌 | AF094741 |
吲哚梭菌 | AF028351 | 假單胞菌屬 2_1_26 | ACWU01000257 |
無害梭菌 | M23732 | 假單胞菌屬 G1229 | DQ910482 |
不規則梭菌 | NR_029249 | 假單胞菌屬物種 NP522b | EU723211 |
板藍根梭菌 | NR_026347 | 施氏假單胞菌 | AM905854 |
克氏梭菌 | NR_074165 | 托拉假單胞菌 | AF320988 |
發酵乳糖梭菌 | NR_025651 | 綠黃假單胞菌 | NR_042764 |
拉瓦勒塞梭菌 | EF564277 | 皮氏羅爾斯通氏菌 | NC_010682 |
柔嫩梭菌 | AJ305238 | 羅爾斯通氏菌屬 5_7_47FAA | ACUF01000076 |
泥渣梭菌 | FR870444 | 盲腸羅斯拜瑞氏菌 | GU233441 |
大梭菌 | X77835 | 糞羅斯拜瑞氏菌 | AY804149 |
惡名梭菌 | FR749893 | 糞便羅斯拜瑞氏菌 | AY305310 |
馬約貝梭菌 | FR733682 | 人羅斯拜瑞氏菌 | AJ270482 |
甲基戊糖梭菌 | ACEC01000059 | 腸道羅斯拜瑞氏菌 | FP929050 |
系結梭菌 | X73443 | 食菊糖羅斯拜瑞氏菌 | AJ270473 |
諾維氏梭菌 | NR_074343 | 羅斯拜瑞氏菌屬 11SE37 | FM954975 |
酪酸梭菌 | Y18187 | 羅斯拜瑞氏菌屬物種 11SE38 | FM954976 |
乳清酸梭菌 | FR749922 | 天空羅氏菌 | DQ673320 |
副腐敗梭菌 | AB536771 | 齲齒羅氏菌 | ADDW01000024 |
產氣莢膜梭菌 | ABDW01000023 | 黏滑羅氏菌 | ACVO01000020 |
植物發酵梭菌 | NR_074652 | 鼠鼻羅氏菌 | NR_025310 |
毛髮狀梭菌 | D14639 | 羅氏菌屬口腔分類群 188 | GU470892 |
腐敗梭菌 | NR_024995 | 嗜澱粉反芻桿菌 | NR_026450 |
奎尼梭菌 | NR_026149 | 瘤胃球菌科細菌 D16 | ADDX01000083 |
多枝梭菌 | M23731 | 白色瘤胃球菌 | AY445600 |
直腸梭菌 | NR_029271 | 布氏瘤胃球菌 | EU266549 |
噬糖梭菌 | DQ100445 | 伶俐瘤胃球菌 | NR_029160 |
化糖梭菌 | CP002109 | Ruminococcus champanellensis | FP929052 |
薩丁島梭菌 | NR_041006 | 生黃瘤胃球菌 | NR_025931 |
煎盤梭菌 | NR_026490 | 活潑瘤胃球菌 | X94967 |
裂解梭菌 | AF262238 | 漢森瘤胃球菌 | M59114 |
敗血梭菌 | NR_026020 | 乳酸瘤胃球菌 | ABOU02000049 |
索氏梭菌 | AB448946 | 卵瘤胃球菌 | AY169419 |
梭菌屬 7_2_43FAA | ACDK01000101 | 瘤胃球菌屬 18P13 | AJ515913 |
梭菌屬物種 D5 | ADBG01000142 | 瘤胃球菌屬物種 5_1_39BFAA | ACII01000172 |
梭菌屬物種 HGF2 | AENW01000022 | 瘤胃球菌屬物種 9SE51 | FM954974 |
梭菌屬物種 HPB_46 | AY862516 | 瘤胃球菌屬物種 ID8 | AY960564 |
梭菌屬物種 JC122 | CAEV01000127 | 瘤胃球菌屬物種 K_1 | AB222208 |
梭菌屬物種 L2_50 | AAYW02000018 | 扭鏈瘤胃球菌 | AAVP02000002 |
梭菌屬 LMG 16094 | X95274 | 邦戈爾沙門氏菌 | NR_041699 |
梭菌屬物種 M62_1 | ACFX02000046 | 腸炎沙門氏菌 | NC_011149 |
梭菌屬物種 MLG055 | AF304435 | 腸炎沙門氏菌 | NC_011205 |
梭菌屬 MT4 E | FJ159523 | 腸炎沙門氏菌 | DQ344532 |
梭菌屬物種 NMBHI_1 | JN093130 | 腸炎沙門氏菌 | ABEH02000004 |
梭菌屬 NML 04A032 | EU815224 | 腸炎沙門氏菌 | ABAK02000001 |
梭菌屬物種 SS2_1 | ABGC03000041 | 腸炎沙門氏菌 | NC_011080 |
梭菌屬物種 SY8519 | AP012212 | 腸炎沙門氏菌 | EU118094 |
梭菌屬物種 TM_40 | AB249652 | 腸炎沙門氏菌 | NC_011094 |
梭菌屬物種 YIT 12069 | AB491207 | 腸炎沙門氏菌 | AE014613 |
梭菌屬物種 YIT 12070 | AB491208 | 腸炎沙門氏菌 | ABFH02000001 |
楔樣梭菌 | X73449 | 腸炎沙門氏菌 | ABEM01000001 |
螺狀梭菌 | X73441 | 腸炎沙門氏菌 | ABAM02000001 |
生孢梭菌 | ABKW02000003 | 鼠傷寒沙門氏菌 | DQ344533 |
球孢梭菌 | NR_044835 | 鼠傷寒沙門氏菌 | AF170176 |
糞堆梭菌 | NR_025100 | 蛛形月形單胞菌 | HM596274 |
斯蒂克蘭德氏梭菌 | L04167 | 魚月形單胞菌 | GQ422719 |
斯特拉文斯梭菌 | NR_024829 | 福氏月形單胞菌 | AF287803 |
近端梭菌 | NR_041795 | 月形單胞菌屬複合群 C1 | AY278627 |
產硫梭菌 | NR_044161 | 月形單胞菌屬複合群 C2 | AY278628 |
共生梭菌 | ADLQ01000114 | 月形單胞菌屬複合群 P5 | AY341820 |
第三梭菌 | Y18174 | 月形單胞菌屬複合群 P6 口腔植株 MB3_C41 | DQ003636 |
破傷風梭菌 | NC_004557 | 月形單胞菌屬複合群 P7 口腔植株 MB5_C08 | DQ003627 |
嗜熱纖維梭菌 | NR_074629 | 月形單胞菌屬複合群 P8 口腔植株 MB5_P06 | DQ003628 |
酪丁酸梭菌 | NR_044718 | 損傷新月形單胞菌 | AF287802 |
綠色梭菌 | NR_026204 | 有害月形單胞菌 | GU470909 |
解木聚糖梭菌 | NR_037068 | 反芻動物月形單胞菌 | NR_075026 |
產氣柯林斯菌 | AAVN02000007 | 月形單胞菌屬 FOBRC9 | HQ616378 |
腸柯林斯菌 | ABXH02000037 | 月形單胞菌屬口腔植株 FT050 | AY349403 |
排泄物柯林斯菌 | ABXJ01000150 | 月形單胞菌屬物種口腔植株 GI064 | AY349404 |
田中氏柯林斯菌 | AB490807 | 月形單胞菌屬物種口腔植株 GT010 | AY349405 |
鏈型糞芽孢菌 | AB030218 | 月形單胞菌屬物種口腔植株 HU051 | AY349406 |
糞芽孢菌屬 29_1 | ADKX01000057 | 月形單胞菌屬物種口腔植株 IK004 | AY349407 |
糞芽孢菌屬 D7 | ACDT01000199 | 月形單胞菌屬物種口腔植株 IQ048 | AY349408 |
靈巧糞球菌 | EU266552 | 月形單胞菌屬物種口腔植株 JI021 | AY349409 |
陪伴糞球菌 | ABVR01000038 | 月形單胞菌屬物種口腔植株 JS031 | AY349410 |
一致糞球菌 | EF031543 | 月形單胞菌屬物種口腔植株 OH4A | AY947498 |
糞球菌屬 ART55_1 | AY350746 | 月形單胞菌屬口腔植株 P2PA_80 P4 | AY207052 |
渾濁戴阿利斯特菌 | ACIM02000001 | 月形單胞菌屬物種口腔分類群 137 | AENV01000007 |
微好氣戴阿利斯特菌 | AFBB01000028 | 月形單胞菌屬物種口腔分類群 149 | AEEJ01000007 |
微嗜氣戴阿利斯特菌 | AENT01000008 | 生痰月形單胞菌 | ACKP02000033 |
侵肺戴阿利斯特菌 | HM596297 | 居泉沙雷菌 | NR_025339 |
產丙酸戴阿利斯特菌 | NR_043231 | 液化沙雷菌 | NR_042062 |
戴阿利斯特菌屬口腔分類群 502 | GQ422739 | 黏質沙雷菌 | GU826157 |
嗜琥珀酸戴阿利斯特菌 | AB370249 | 臭味沙雷菌 | ADBY01000001 |
產甲酸多爾氏菌 | AAXA02000006 | 變形班沙雷菌 | AAUN01000015 |
長鏈多爾氏菌 | AJ132842 | 波伊德氏志賀氏菌 | AAKA01000007 |
氣囊棲水菌 | ACYI01000081 | 痢疾志賀氏菌 | NC_007606 |
產氣腸桿菌 | AJ251468 | 福氏志賀氏菌 | AE005674 |
阿氏腸桿菌 | NR_024640 | 宋內志賀氏菌 | NC_007384 |
生癌腸桿菌 | Z96078 | 糞鞘胺醇桿菌 | NR_025537 |
陰溝腸桿菌 | FP929040 | 水氏鞘胺醇桿菌 | JF708889 |
考氏腸桿菌 | NR_025566 | 多食鞘胺醇桿菌 | NR_040953 |
霍氏腸桿菌 | AFHR01000079 | 食神鞘胺醇桿菌 | ACHA02000013 |
腸桿菌屬 247BMC | HQ122932 | 刺狀鞘胺醇單胞菌 | NR_024700 |
腸桿菌屬 638 | NR_074777 | 鞘胺醇單胞菌屬口腔植株 FI012 | AY349411 |
腸桿菌屬物種 JC163 | JN657217 | 鞘胺醇單胞菌屬物種口腔植株 FZ016 | AY349412 |
腸桿菌屬 SCSS | HM007811 | 鞘胺醇單胞菌屬口腔分類群 A09 | HM099639 |
腸桿菌屬物種 TSE38 | HM156134 | 鞘胺醇單胞菌屬物種口腔分類群 F71 | HM099645 |
腸桿菌科細菌 9_2_54FAA | ADCU01000033 | 葡萄球菌科細菌 NML 92_0017 | AY841362 |
腸桿菌科細菌 CF01Ent_1 | AJ489826 | 金黃色葡萄球菌 | CP002643 |
腸桿菌科細菌 Smarlab 3302238 | AY538694 | 耳葡萄球菌 | JQ624774 |
鳥腸球菌 | AF133535 | 頭狀葡萄球菌 | ACFR01000029 |
人糞腸球菌 | AY943820 | 山羊葡萄球菌 | ACRH01000033 |
酪黃腸球菌 | AEWT01000047 | 肉葡萄球菌 | NR_075003 |
耐久腸球菌 | AJ276354 | 科氏葡萄球菌 | JN175375 |
糞腸球菌 | AE016830 | 香料葡萄球菌 | NR_029345 |
屎腸球菌 | AM157434 | 表皮葡萄球菌 | ACHE01000056 |
鶉雞腸球菌 | AB269767 | 馬胃葡萄球菌 | NR_027520 |
灰黃腸球菌 | AY033814 | 弗氏葡萄球菌 | NR_041326 |
夏威夷腸球菌 | AY321377 | 溶血性葡萄球菌 | NC_007168 |
希氏腸球菌 | AF061011 | 人葡萄球菌 | AM157418 |
義大利腸球菌 | AEPV01000109 | 路鄧葡萄球菌 | AEQA01000024 |
蒙氏腸球菌 | NR_024906 | 巴氏葡萄球菌 | FJ189773 |
棉子糖腸球菌 | FN600541 | 假中間葡萄球菌 | CP002439 |
腸球菌屬 BV2CASA2 | JN809766 | 解糖葡萄球菌 | NR_029158 |
腸球菌屬物種 CCRI_16620 | GU457263 | 腐生性葡萄球菌 | NC_007350 |
腸球菌屬物種 F95 | FJ463817 | 松鼠葡萄球菌 | NR_025520 |
腸球菌屬物種 RfL6 | AJ133478 | 葡萄球菌屬植株 bottae7 | AF467424 |
泰國腸球菌 | AY321376 | 葡萄球菌屬 H292 | AB177642 |
丹毒絲菌科細菌 3_1_53 | ACTJ01000113 | 葡萄球菌屬物種 H780 | AB177644 |
丹毒絲菌科細菌 5_2_54FAA | ACZW01000054 | 琥珀酸葡萄球菌 | NR_028667 |
艾伯氏大腸桿菌 | ABKX01000012 | 小牛葡萄球菌 | NR_024670 |
大腸桿菌 | NC_008563 | 瓦氏葡萄球菌 | ACPZ01000009 |
弗格森氏大腸桿菌 | CU928158 | 木糖葡萄球菌 | AY395016 |
赫爾曼氏大腸桿菌 | HQ407266 | 念珠狀鏈桿菌 | NR_027615 |
大腸桿菌屬 1_1_43 | ACID01000033 | 無乳鏈球菌 | AAJO01000130 |
大腸桿菌屬 4_1_40B | ACDM02000056 | 非解乳鏈球菌 | NR_041781 |
大腸桿菌屬物種 B4 | EU722735 | 咽峽炎鏈球菌 | AECT01000011 |
傷口埃希菌 | NR_041927 | 澳大利亞鏈球菌 | AEQR01000024 |
真桿菌科細菌 P4P_50 P4 | AY207060 | 牛鏈球菌 | AEEL01000030 |
巴克氏真桿菌 | NR_044661 | 犬鏈球菌 | AJ413203 |
兩形真桿菌 | ABYT01000002 | 星座鏈球菌 | AY277942 |
短真桿菌 | U13038 | 脊鏈球菌 | AEVC01000028 |
布氏真桿菌 | NR_024682 | 道恩鏈球菌 | AEKN01000002 |
卡氏真桿菌 | NR_026330 | 停乳鏈球菌 | AP010935 |
溶纖維素真桿菌 | AY178842 | 馬鏈球菌 | CP001129 |
扭曲真桿菌 | FR749946 | 馬腸鏈球菌 | AEVB01000043 |
產糞甾醇真桿菌 | HM037995 | 解沒食子酸鏈球菌 | FR824043 |
圓柱狀真桿菌 | FP929041 | 鏈球菌屬複合群 C1 | AY278629 |
鏈狀真桿菌 | NR_044644 | 鏈球菌屬複合群 C2 | AY278630 |
細長真桿菌 | L34682 | 鏈球菌屬複合群 C3 | AY278631 |
挑剔真桿菌 | CP001104 | 鏈球菌屬複合群 C4 | AY278632 |
斷鏈真桿菌 | FR749935 | 鏈球菌屬複合群 C5 | AY278633 |
龐大真桿菌 | FR749933 | 鏈球菌屬複合群 C6 | AY278634 |
霍氏真桿菌 | L34621 | 鏈球菌屬複合群 C7 | AY278635 |
嬌弱真桿菌 | U13039 | 鏈球菌屬複合群 C8 | AY278609 |
淤泥真桿菌 | CP002273 | 戈登氏鏈球菌 | NC_009785 |
串珠狀真桿菌 | HF558373 | 小兒鏈球菌 | ABJK02000017 |
多形真桿菌 | NR_024683 | 嬰兒鏈球菌 | AFNN01000024 |
產亞硝酸真桿菌 | NR_024684 | 中間鏈球菌 | NR_028736 |
糾纏真桿菌 | U13041 | 巴黎鏈球菌 | NR_037096 |
細枝真桿菌 | AJ011522 | 馬賽鏈球菌 | AY769997 |
直腸真桿菌 | FP929042 | 米勒鏈球菌 | X81023 |
反芻真桿菌 | NR_024661 | 緩症鏈球菌 | AM157420 |
口臭真桿菌 | AB525414 | 突變鏈球菌 | AP010655 |
隱枝真桿菌 | NR_026031 | 寡發酵鏈球菌 | AY099095 |
惰性真桿菌 | ABCA03000054 | 口腔鏈球菌 | ADMV01000001 |
真桿菌屬 3_1_31 | ACTL01000045 | 副血鏈球菌 | AEKM01000012 |
真桿菌屬 AS15b | HQ616364 | 巴氏鏈球菌 | AP012054 |
真桿菌屬物種 OBRC9 | HQ616354 | 泛口腔鏈球菌 | AEVF01000016 |
真桿菌屬口腔植株 GI038 | AY349374 | 肺炎鏈球菌 | AE008537 |
真桿菌屬物種口腔植株 IR009 | AY349376 | 豕鏈球菌 | EF121439 |
真桿菌屬物種口腔植株 JH012 | AY349373 | 假性肺炎鏈球菌 | FJ827123 |
真桿菌屬物種口腔植株 JI012 | AY349379 | 假豕鏈球菌 | AENS01000003 |
真桿菌屬物種口腔植株 JN088 | AY349377 | 釀膿鏈球菌 | AE006496 |
真桿菌屬物種口腔植株 JS001 | AY349378 | 鼠鏈球菌 | X58304 |
真桿菌屬物種口腔植株 OH3A | AY947497 | 唾液鏈球菌 | AGBV01000001 |
真桿菌屬 WAL 14571 | FJ687606 | 血鏈球菌 | NR_074974 |
纖細真桿菌 | M59118 | 中華鏈球菌 | AF432857 |
多曲真桿菌 | NR_044648 | 鏈球菌屬物種 16362 | JN590019 |
凸腹真桿菌 | L34421 | 鏈球菌屬 2_1_36FAA | ACOI01000028 |
嗜木聚糖真桿菌 | L34628 | 鏈球菌屬 2285_97 | AJ131965 |
尤氏真桿菌 | AEES01000073 | 鏈球菌屬物種 69130 | X78825 |
犬貓科梭桿菌 | AY162222 | 鏈球菌屬物種 AC15 | HQ616356 |
梭桿菌屬複合群 C1 | AY278616 | 鏈球菌屬物種 ACS2 | HQ616360 |
梭桿菌屬複合群 C2 | AY278617 | 鏈球菌屬物種 AS20 | HQ616366 |
微生子梭桿菌 | ACET01000043 | 鏈球菌屬物種 BS35a | HQ616369 |
死亡梭桿菌 | ACDB02000034 | 鏈球菌屬物種 C150 | ACRI01000045 |
舟形梭桿菌 | HQ223106 | 鏈球菌屬物種 CM6 | HQ616372 |
壞疽梭桿菌 | X55408 | 鏈球菌屬物種 CM7 | HQ616373 |
壞死梭桿菌 | AM905356 | 鏈球菌屬物種 ICM10 | HQ616389 |
核粒梭桿菌 | ADVK01000034 | 鏈球菌屬物種 ICM12 | HQ616390 |
牙周梭桿菌 | ACJY01000002 | 鏈球菌屬物種 ICM2 | HQ616386 |
拉氏梭桿菌 | NR_044687 | 鏈球菌屬物種 ICM4 | HQ616387 |
梭桿菌屬 1_1_41FAA | ADGG01000053 | 鏈球菌屬物種 ICM45 | HQ616394 |
梭桿菌屬 11_3_2 | ACUO01000052 | 鏈球菌屬物種 M143 | ACRK01000025 |
梭桿菌屬物種 12_1B | AGWJ01000070 | 鏈球菌屬物種 M334 | ACRL01000052 |
梭桿菌屬 2_1_31 | ACDC02000018 | 鏈球菌屬物種 OBRC6 | HQ616352 |
梭桿菌屬 3_1_27 | ADGF01000045 | 鏈球菌屬物種口腔植株 ASB02 | AY923121 |
梭桿菌屬 3_1_33 | ACQE01000178 | 鏈球菌屬物種口腔植株 ASCA03 | DQ272504 |
梭桿菌屬物種 3_1_36A2 | ACPU01000044 | 鏈球菌屬物種口腔植株 ASCA04 | AY923116 |
梭桿菌屬物種 3_1_5R | ACDD01000078 | 鏈球菌屬物種口腔植株 ASCA09 | AY923119 |
梭桿菌屬物種 AC18 | HQ616357 | 鏈球菌屬物種口腔植株 ASCB04 | AY923123 |
梭桿菌屬物種 ACB2 | HQ616358 | 鏈球菌屬物種口腔植株 ASCB06 | AY923124 |
梭桿菌屬物種 AS2 | HQ616361 | 鏈球菌屬物種口腔植株 ASCC04 | AY923127 |
梭桿菌屬物種 CM1 | HQ616371 | 鏈球菌屬物種口腔植株 ASCC05 | AY923128 |
梭桿菌屬物種 CM21 | HQ616375 | 鏈球菌屬物種口腔植株 ASCC12 | DQ272507 |
梭桿菌屬物種 CM22 | HQ616376 | 鏈球菌屬物種口腔植株 ASCD01 | AY923129 |
梭桿菌屬物種 D12 | ACDG02000036 | 鏈球菌屬物種口腔植株 ASCD09 | AY923130 |
梭桿菌屬口腔植株 ASCF06 | AY923141 | 鏈球菌屬物種口腔植株 ASCD10 | DQ272509 |
梭桿菌屬物種口腔植株 ASCF11 | AY953256 | 鏈球菌屬物種口腔植株 ASCE03 | AY923134 |
潰瘍梭桿菌 | ACDH01000090 | 鏈球菌屬物種口腔植株 ASCE04 | AY953253 |
變形梭桿菌 | ACIE01000009 | 鏈球菌屬物種口腔植株 ASCE05 | DQ272510 |
溶血孿生球菌 | ACDZ02000012 | 鏈球菌屬物種口腔植株 ASCE06 | AY923135 |
麻疹孿生球菌 | NR_025904 | 鏈球菌屬物種口腔植株 ASCE09 | AY923136 |
麻疹孿生球菌 | ACRX01000010 | 鏈球菌屬物種口腔植株 ASCE10 | AY923137 |
血孿生球菌 | ACRY01000057 | 鏈球菌屬物種口腔植株 ASCE12 | AY923138 |
孿生球菌屬口腔植株 ASCE02 | AY923133 | 鏈球菌屬物種口腔植株 ASCF05 | AY923140 |
孿生球菌屬物種口腔植株 ASCF04 | AY923139 | 鏈球菌屬物種口腔植株 ASCF07 | AY953255 |
孿生球菌屬物種口腔植株 ASCF12 | AY923143 | 鏈球菌屬物種口腔植株 ASCF09 | AY923142 |
孿生球菌屬 WAL 1945J | EU427463 | 鏈球菌屬物種口腔植株 ASCG04 | AY923145 |
催產克雷白氏菌 | AY292871 | 鏈球菌屬物種口腔植株 BW009 | AY005042 |
肺炎克雷白氏菌 | CP000647 | 鏈球菌屬物種口腔植株 CH016 | AY005044 |
克雷白氏菌屬 AS10 | HQ616362 | 鏈球菌屬物種口腔植株 GK051 | AY349413 |
克雷白氏菌屬物種 Co9935 | DQ068764 | 鏈球菌屬物種口腔植株 GM006 | AY349414 |
克雷白氏菌屬富集培養植株 SRC_DSD25 | HM195210 | 鏈球菌屬口腔植株 P2PA_41 P2 | AY207051 |
克雷白氏菌屬物種 OBRC7 | HQ616353 | 鏈球菌屬物種口腔植株 P4PA_30 P4 | AY207064 |
克雷白氏菌屬 SP_BA | FJ999767 | 鏈球菌屬口腔分類群 071 | AEEP01000019 |
克雷白氏菌屬物種 SRC_DSD1 | GU797254 | 鏈球菌屬口腔分類群 G59 | GU432132 |
克雷白氏菌屬物種 SRC_DSD11 | GU797263 | 鏈球菌屬物種口腔分類群 G62 | GU432146 |
克雷白氏菌屬物種 SRC_DSD12 | GU797264 | 鏈球菌屬物種口腔分類群 G63 | GU432150 |
克雷白氏菌屬物種 SRC_DSD15 | GU797267 | 鏈球菌屬物種 SHV515 | Y07601 |
克雷白氏菌屬物種 SRC_DSD2 | GU797253 | 豬鏈球菌 | FM252032 |
克雷白氏菌屬物種 SRC_DSD6 | GU797258 | 嗜熱鏈球菌 | CP000419 |
變異克雷白氏菌 | CP001891 | 乳房鏈球菌 | HQ391900 |
牛毛桿菌 | GU324407 | 尿鏈球菌 | DQ303194 |
多產毛螺菌 | FR733699 | 前庭鏈球菌 | AEKO01000008 |
裂果膠毛螺菌 | L14675 | 綠色鏈球菌 | AF076036 |
毛螺菌科細菌 1_1_57FAA | ACTM01000065 | 莫比利尼薩特菌 | AJ832129 |
毛螺菌科細菌 1_4_56FAA | ACTN01000028 | 帕維魯布拉柴維爾特菌 | AB300989 |
毛螺菌科細菌 2_1_46FAA | ADLB01000035 | 血根薩特菌 | AJ748647 |
毛螺菌科細菌 2_1_58FAA | ACTO01000052 | 薩特菌屬 YIT 12072 | AB491210 |
毛螺菌科細菌 3_1_57FAA_CT1 | ACTP01000124 | 犬糞薩特菌 | NR_025600 |
毛螺菌科細菌 4_1_37FAA | ADCR01000030 | 華德薩特菌 | ADMF01000048 |
毛螺菌科細菌 5_1_57FAA | ACTR01000020 | 互養菌屬複合群 C1 | AY278615 |
毛螺菌科細菌 5_1_63FAA | ACTS01000081 | 互養菌屬 RMA 14551 | DQ412722 |
毛螺菌科細菌 6_1_63FAA | ACTV01000014 | 互養菌門細菌 ADV897 | GQ258968 |
毛螺菌科細菌 8_1_57FAA | ACWQ01000079 | 互養菌門細菌 LBVCM1157 | GQ258969 |
毛螺菌科細菌 9_1_43BFAA | ACTX01000023 | 互養菌門細菌口腔分類群 362 | GU410752 |
毛螺菌科細菌 A4 | DQ789118 | 互養菌門細菌口腔分類群 D48 | GU430992 |
毛螺菌科細菌 DJF VP30 | EU728771 | Turicibacter sanguinis | AF349724 |
毛螺菌科細菌 ICM62 | HQ616401 | 非典型韋榮氏球菌 | AEDS01000059 |
毛螺菌科細菌 MSX33 | HQ616384 | 殊異韋榮氏球菌 | ACIK02000021 |
毛螺菌科細菌口腔分類群 107 | ADDS01000069 | 韋榮氏球菌屬複合群 P1 口腔植株 MB5_P17 | DQ003631 |
毛螺菌科細菌口腔分類群 F15 | HM099641 | 蒙皮立韋榮氏球菌 | AF473836 |
毛螺菌科複合群 C1 | AY278618 | 小韋榮氏球菌 | ADFU01000009 |
酸魚乳桿菌 | NR_024718 | 韋榮氏球菌屬 3_1_44 | ADCV01000019 |
嗜酸乳桿菌 | CP000033 | 韋榮氏球菌屬 6_1_27 | ADCW01000016 |
食品乳桿菌 | NR_044701 | 韋榮氏球菌屬 ACP1 | HQ616359 |
解澱粉乳桿菌 | ADNY01000006 | 韋榮氏球菌屬物種 AS16 | HQ616365 |
噬澱粉乳桿菌 | CP002338 | 韋榮氏球菌屬物種 BS32b | HQ616368 |
胃竇乳桿菌 | ACLL01000037 | 韋榮氏球菌屬物種 ICM51a | HQ616396 |
短乳桿菌 | EU194349 | 韋榮氏球菌屬物種 MSA12 | HQ616381 |
布赫內氏乳桿菌 | ACGH01000101 | 韋榮氏球菌屬 NVG 100cf | EF108443 |
乾酪乳桿菌 | CP000423 | 韋榮氏球菌屬物種 OK11 | JN695650 |
鏈狀乳桿菌 | M23729 | 韋榮氏球菌屬口腔植株 ASCA08 | AY923118 |
人陰道乳桿菌 | ACOH01000030 | 韋榮氏球菌屬物種口腔植株 ASCB03 | AY923122 |
棒狀乳桿菌 | NR_044705 | 韋榮氏球菌屬物種口腔植株 ASCG01 | AY923144 |
捲曲乳桿菌 | ACOG01000151 | 韋榮氏球菌屬物種口腔植株 ASCG02 | AY953257 |
彎曲乳桿菌 | NR_042437 | 韋榮氏球菌屬物種口腔植株 OH1A | AY947495 |
戴耳布呂克氏乳桿菌 | CP002341 | 韋榮氏球菌屬口腔分類群 158 | AENU01000007 |
糊精乳桿菌 | NR_036861 | 韋榮氏球菌科細菌口腔分類群 131 | GU402916 |
香腸乳桿菌 | NR_044707 | 韋榮氏球菌科細菌口腔分類群 155 | GU470897 |
發酵乳桿菌 | CP002033 | 霍亂弧菌 | AAUR01000095 |
加氏乳桿菌 | ACOZ01000018 | 河流弧菌 | X76335 |
胃乳桿菌 | AICN01000060 | 弗氏弧菌 | CP002377 |
乳桿菌屬複合群 C1 | AY278619 | 擬態弧菌 | ADAF01000001 |
乳桿菌屬複合群 C2 | AY278620 | 副溶血性弧菌 | AAWQ01000116 |
瑞士乳桿菌 | ACLM01000202 | 弧菌屬 RC341 | ACZT01000024 |
希氏乳桿菌 | ACGP01000200 | 創傷弧菌 | AE016796 |
人乳桿菌 | FR681902 | 阿氏耶爾森氏菌 | AJ871363 |
惰性乳桿菌 | AEKJ01000002 | 阿裡克謝耶爾森氏菌 | AJ627597 |
詹氏乳桿菌 | ACQD01000066 | 貝氏耶爾森氏菌 | AF366377 |
約氏乳桿菌 | AE017198 | 小腸結腸炎耶爾森菌 | FR729477 |
卡裡乳桿菌 | NR_029083 | 弗氏耶爾森氏菌 | AF366379 |
馬乳酒樣乳桿菌 | NR_042440 | 中間耶爾森氏菌 | AF366380 |
高加索乳桿菌 | NR_042230 | 克裡斯滕耶爾森氏菌 | ACCA01000078 |
泡菜乳桿菌 | NR_025045 | 莫氏耶爾森氏菌 | NR_027546 |
萊希曼氏乳桿菌 | JX986966 | 鼠疫耶爾森氏菌 | AE013632 |
黏膜乳桿菌 | FR693800 | 假結核耶爾森氏菌 | NC_009708 |
羅氏耶爾森氏菌 | ACCD01000071 |
菌株 | 保藏號 |
古氏副擬桿菌 | PTA-126574 |
動物雙歧桿菌乳酸亞種菌株 A | PTA-125097 |
馬賽布勞特氏菌菌株 A | PTA-125134 |
普雷沃菌屬菌株 B | NRRL保藏號B 50329 |
棲組織普雷沃菌 | PTA-126140 |
布勞特氏菌菌株 A | PTA-125346 |
乳酸乳球菌乳脂亞種菌株 A | PTA-125368 |
唾液乳桿菌 | PTA-125893 |
活潑瘤胃球菌菌株 | PTA-125706 |
納西利斯泰澤菌菌株 | PTA-125707 |
解苯副梭菌 | PTA-125894 |
活潑瘤胃球菌(又稱 Mediterraneibacter gnavus ) | PTA-126695 |
小韋榮氏球菌 | PTA-125710 |
非典型韋榮氏球菌菌株 A | PTA-125709 |
非典型韋榮氏球菌菌株 B | PTA-125711 |
小韋榮氏球菌菌株 A | PTA-125691 |
小韋榮氏球菌菌株 B | PTA-125711 |
當別町韋榮氏球菌菌株 A | PTA-125708 |
阿加薩桿菌屬物種 | PTA-125892 |
Turicibacter sanguinis | PTA-125889 |
類肺炎克雷白氏菌擬肺炎亞種 | PTA-125891 |
催產克雷白氏菌 | PTA-125890 |
巨型球菌屬物種菌株 A | PTA-126770 |
巨型球菌屬物種 | PTA-126837 |
Harryflintia acetispora | PTA-126694 |
Fournierella massiliensis | PTA-126696 |
大腸桿菌 | NCIMB 12210 |
糞腸球菌 | NCIMB 13280 |
脆弱擬桿菌 | DSM 2151 |
普通擬桿菌 | DSM 1447 |
卵形擬桿菌 | DSM 1896 |
馬賽巨型球菌 | DSM 26228 |
埃氏巨型球菌 | NCIMB 8927 |
馬賽巨型球菌 | NCIMB 42787 |
短雙歧桿菌 | DSM 20213 |
長雙歧桿菌長亞種( Bifidobacterium longum subsp. longum ) | DSM 20219 |
普氏糞桿菌 | DSM 17677 |
丁酸厭氧棒桿菌 | DSM 3319 |
球形布勞特氏菌 | DSM 935 |
長鏈多爾氏菌 | DSM 13814 |
狄氏副擬桿菌 | DSM 20701 |
扭曲真桿菌 f ( Faecalicatena contorta ) | DSM 3982 |
活潑瘤胃球菌 | ATCC 29149 |
馬賽巨型球菌 | NCIMB 43388 |
馬賽巨型球菌 | NCIMB 43389 |
巨型球菌屬物種 | NCIMB 43385 |
巨型球菌屬物種 | NCIMB 43386 |
巨型球菌屬物種 | NCIMB 43387 |
狄氏副擬桿菌(也稱為「副擬桿菌屬物種 755 」) | NCIMB 42382 |
在一些方面,本文所述之細菌和/或mEV(如smEV和/或pmEV)經修飾,使得它們包含、連接至和/或結合治療性部分。
在一些實施方式中,治療性部分係癌症特異性部分。在一些實施方式中,該癌症特異性部分對癌細胞具有結合特異性(例如對癌症特異性抗原具有結合特異性)。在一些實施方式中,該癌症特異性部分包含抗體或其抗原結合片段。在一些實施方式中,該癌症特異性部分包含T細胞受體或嵌合抗原受體(CAR)。在一些實施方式中,該癌症特異性部分包含表現於癌細胞表面上受體的配位基或其受體結合片段。在一些實施方式中,該癌症特異性部分係二分(bipartite)融合蛋白,其具有兩個部分:結合至和/或連接至細菌的第一部分及可結合至癌細胞(例如藉由對癌症特異性抗原具有結合特異性)的第二部分。在一些實施方式中,第一部分係全長肽聚糖識別蛋白(諸如PGRP)的片段或全長肽聚糖識別蛋白。在一些實施方式中,該第一部分對mEV具有結合特異性(例如藉由對細菌抗原具有結合特異性)。在一些實施方式中,該第一和/或第二部分包含抗體或其抗原結合片段。在一些實施方式中,該第一和/或第二部分包含T細胞受體或嵌合抗原受體(CAR)。在一些實施方式中,該第一和/或第二部分包含表現於癌細胞表面上受體的配位基或其受體結合片段。在某些實施方式中,癌症特異性部分與藥劑的共施用(組合施用或分開施用)增加藥劑對癌細胞的靶向。
在一些實施方式中,本文描述的細菌和/或mEV可以是經修飾的,使得它們包含、連接至和/或結合磁性和/或順磁性部分(例如磁珠)。在一些實施方式中,磁性和/或順磁性部分包含細菌和/或直接連接至細菌。在一些實施方式中,該磁性和/或順磁性部分連接至結合至細菌或mEV的細菌或mEV結合部分的一部分和/或為結合至細菌或mEV的細菌或mEV結合部分的一部分。在一些實施方式中,細菌或mEV結合部分係全長肽聚糖識別蛋白(諸如PGRP)的片段或全長肽聚糖識別蛋白。在一些實施方式中,細菌或mEV結合部分具有對細菌或mEV的結合特異性(例如藉由對細菌抗原具有結合特異性)。在一些實施方式中,細菌或mEV結合部分包含抗體或其抗原結合片段。在一些實施方式中,細菌或mEV結合部分包含T細胞受體或嵌合抗原受體(CAR)。在一些實施方式中,細菌或mEV結合部分包含表現於癌細胞表面上受體的配位基或其受體結合片段。在某些實施方式中,磁性和/或順磁性部分及細菌或mEV的共施用(一起施用或分開施用)可用以增加mEV靶向(例如靶向癌症細胞和/或受試者存在癌細胞的一部分)。
經加工的微生物胞外囊泡(pmEV)的產生
在某些方面,本文所述之pmEV可以使用本領域已知的任何方法製備。
在一些實施方式中,在沒有pmEV純化步驟的情況下製備pmEV。例如,在一些實施方式中,將釋放本文所述之pmEV的細菌使用使細菌pmEV保持完整之方法殺死,並將所得的細菌組分(包括pmEV)用於本文所述之方法和組成物中。在一些實施方式中,該等細菌藉由使用抗生素(例如,使用本文描述的抗生素)被殺死。在一些實施方式中,該等細菌藉由使用UV輻射被殺死。
在一些實施方式中,本文描述的pmEV純化自一種或多種其他細菌組分。從細菌(和視需要的其他細菌組分)純化pmEV之方法係本領域已知的。在一些實施方式中,pmEV藉由使用Thein,等人.(
J. Proteome Res. [ 蛋白質組學研究雜誌 ]9(12):6135-6147 (2010))或Sandrini, 等人.(
Bio-protocol[生物方案] 4(21): e1287 (2014))中描述之方法從細菌培養物製備,其中每個藉由引用以其全文特此併入。在一些實施方式中,該等細菌經培養至高光密度及然後經離心以使細菌沈澱(例如,在室溫或4°C下10,000- 15,000 x g,持續10-15 min)。在一些實施方式中,丟棄上清液,並將細胞沈澱物在-80°C冷凍。在一些實施方式中,將細胞沈澱物在冰上解凍,並重懸於補充有1 mg/mL DNA酶I的100 mM Tris-HCl(pH 7.5)中。在一些實施方式中,在製造商建議的條件下使用Emulsiflex C-3(奧維斯丁公司(Avestin, Inc.))裂解細胞。在一些實施方式中,藉由在4°C下以10,000 x g離心15 min來沈澱碎片和未裂解的細胞。在一些實施方式中,然後將上清液在4°C下以120,000 x g離心1小時。在一些實施方式中,將沈澱物重懸於冰冷的pH 11的100 mM碳酸鈉中,在4°C下攪拌孵育1小時,然後在4°C下以120,000 x g離心1小時。在一些實施方式中,將沈澱重懸於pH 7.5的100 mM Tris-HCl中,在4°C下以120,000 x g再離心20分鐘,然後重懸於0.1 M Tris-HCl(pH 7.5)中或於PBS中。在一些實施方式中,樣本被存儲在-20°C。
在某些方面,pmEV係藉由改編自Sandrini等人(2014年)之方法獲得的。在一些實施方式中,將細菌培養物在室溫或4°C下以10,000-15,500 x g離心10-15 min。在一些實施方式中,將細胞沈澱物在-80°C冷凍,並丟棄上清液。在一些實施方式中,將細胞沈澱物在冰上解凍,並重懸於10 mM Tris-HCl(pH 8.0)、補充有0.1 mg/mL溶菌酶的1 mM EDTA中。在一些實施方式中,將樣本在室溫或37°C下混合孵育30 min。在一些實施方式中,將樣本在-80°C下重新冷凍,然後再次在冰上解凍。在一些實施方式中,添加DNA酶I至終濃度為1.6 mg/mL,並添加MgCl2至終濃度為100 mM。在一些實施方式中,使用QSonica Q500超音波波儀以30 sec開啟和30 sec關閉的7個循環對樣本進行超音波處理。在一些實施方式中,藉由在4°C下以10,000 x g離心15分鐘來沈澱碎片和未裂解的細胞。在一些實施方式中,然後將上清液在4°C下以110,000 x g離心15 min。在一些實施方式中,將沈澱重懸於10 mM Tris-HCl(pH 8.0)、2% Triton X-100中,並在室溫下混合孵育30-60 min。在一些實施方式中,將樣本在4°C下以110,000 x g離心15 min。在一些實施方式中,將沈澱物重懸於PBS中並儲存在-20°C。
在某些方面,本文描述的形成(例如,製備)分離的細菌pmEV之方法包括以下步驟:(a) 離心細菌培養物,從而形成第一沈澱物和第一上清液,其中該第一沈澱物包含細胞;(b) 丟棄該第一上清液;(c) 將該第一沈澱物重懸於溶液中;(d) 裂解細胞;(e) 對裂解的細胞進行離心,從而形成第二沈澱物和第二上清液;(f) 丟棄該第二沈澱物並對該第二上清液進行離心,從而形成第三沈澱物和第三上清液;(g) 丟棄該第三上清液並將該第三沈澱物重懸於第二溶液中,從而形成分離的細菌pmEV。
在一些實施方式中,該方法進一步包括以下步驟:(h) 對步驟 (g) 的溶液進行離心,從而形成第四沈澱物和第四上清液;(i) 丟棄該第四上清液,並將該第四沈澱物重懸於第三溶液中。在一些實施方式中,該方法進一步包括以下步驟:(j) 對步驟 (i) 的溶液進行離心,從而形成第五沈澱物和第五上清液;以及 (k) 丟棄該第五上清液,並將該第五沈澱物重懸於第四溶液中。
在一些實施方式中,步驟 (a) 的離心係以10,000 x g進行的。在一些實施方式中,步驟 (a) 的離心進行10-15分鐘。在一些實施方式中,步驟 (a) 的離心係在4°C或室溫下進行的。在一些實施方式中,步驟 (b) 還包括將第一沈澱物在-80°C冷凍。在一些實施方式中,步驟 (c) 中的溶液係補充有1mg/ml DNA酶I的100 mM Tris-HCl(pH 7.5)。在一些實施方式中,步驟 (c) 中的溶液係10 mM Tris-HCl(pH 8.0)、1 mM EDTA,補充有0.1 mg/ml溶菌酶。在一些實施方式中,步驟 (c) 進一步包括在37℃或室溫下孵育30分鐘。在一些實施方式中,步驟 (c) 進一步包括將第一沈澱物在-80°C冷凍。在一些實施方式中,步驟 (c) 進一步包括添加DNA酶I至1.6 mg/ml的終濃度。在一些實施方式中,步驟 (c) 進一步包括添加MgCl
2至100 mM的終濃度。在一些實施方式中,在步驟 (d) 中藉由勻漿裂解細胞。在一些實施方式中,在步驟 (d) 中藉由emulsiflex C3裂解細胞。在一些實施方式中,在步驟 (d) 中藉由超音波裂解細胞。在一些實施方式中,將細胞超音波處理7個循環,其中每個循環包括30秒的超音波處理和30秒的無超音波處理。在一些實施方式中,步驟 (e) 的離心係以10,000 x g進行的。在一些實施方式中,步驟 (e) 的離心進行15分鐘。在一些實施方式中,步驟 (e) 的離心係在4℃或室溫下。
在一些實施方式中,步驟 (f) 的離心係以120,000 x g進行的。在一些實施方式中,步驟 (f) 的離心係以110,000 x g進行的。在一些實施方式中,步驟 (f) 的離心進行1小時。在一些實施方式中,步驟 (f) 的離心進行15分鐘。在一些實施方式中,步驟 (f) 的離心係在4°C或室溫下。在一些實施方式中,步驟 (g) 中的第二溶液係pH 11的100 mM碳酸鈉。在一些實施方式中,步驟 (g) 中的第二溶液係10 mM Tris-HCl pH 8.0、2% triton X-100。在一些實施方式中,步驟 (g) 還包括將溶液在4°C下孵育1小時。在一些實施方式中,步驟 (g) 進一步包括將溶液在室溫下孵育30-60分鐘。在一些實施方式中,步驟 (h) 的離心係以120,000 x g進行的。在一些實施方式中,步驟 (h) 的離心係以110,000 x g進行的。在一些實施方式中,步驟 (h) 的離心進行1小時。在一些實施方式中,步驟 (h) 的離心進行15分鐘。在一些實施方式中,步驟 (h) 的離心係在4°C或室溫下。在一些實施方式中,步驟 (i) 中的第三溶液係100 mM Tris-HCl(pH 7.5)。在一些實施方式中,步驟 (i) 中的第三溶液係PBS。在一些實施方式中,步驟 (j) 的離心係以120,000 x g進行的。在一些實施方式中,步驟 (j) 的離心進行20分鐘。在一些實施方式中,步驟 (j) 的離心係在4℃或室溫下。在一些實施方式中,步驟 (k) 中的第四溶液係100 mM Tris-HCl(pH 7.5)或PBS。
藉由本文提供之方法獲得的pmEV可藉由基於尺寸的柱層析法、藉由親和層析法及藉由梯度超速離心,使用可包括但不限於使用蔗糖梯度或Optiprep梯度之方法加以進一步純化。簡言之,在使用蔗糖梯度方法時,如果使用硫酸銨沈澱或超速離心來濃縮經過濾的上清液,則將沈澱物重懸於60%蔗糖、30 mM Tris(pH 8.0)中。如果使用過濾來濃縮經過濾的上清液,則使用Amicon Ultra柱將濃縮物緩衝液交換至60%蔗糖、30 mM Tris(pH 8.0)中。將樣本施加至35%-60%不連續蔗糖梯度中並在4°C下以200,000 × g離心3-24小時。簡言之,在使用Optiprep梯度方法時,如果使用硫酸銨沈澱或超速離心來濃縮經過濾的上清液,則將沈澱物重懸於PBS中的35% Optiprep中。在一些實施方式中,如果使用過濾來濃縮經過濾的上清液,則使用60% Optiprep將濃縮物稀釋至最終濃度為35% Optiprep。將樣本施加至35%-60%不連續蔗糖梯度中並在4°C下以200,000 × g離心3-24小時。
在一些實施方式中,為證實pmEV製劑的無菌性及分離,將pmEV連續稀釋至瓊脂培養基(其用於測試中的細菌的例行培養)上,並使用例行條件進行孵育。使未經滅菌的製劑通過0.22 µm過濾器以去除完整細胞。為進一步增加純度,分離的pmEV可用DNA酶或蛋白酶K處理。
在一些實施方式中,pmEV製劑的無菌性可藉由將一部分pmEV接種至瓊脂培養基(其用於用以產生pmEV的細菌的標準培養)並使用標準條件進行孵育加以證實。
在一些實施方式中,藉由層析法和pmEV上的結合表面部分對所選pmEV進行分離和富集。在其他實施方式中,所選pmEV藉由螢光細胞分選藉由使用親和試劑、化學染料、重組蛋白之方法或熟悉該項技術者已知的其他方法分離和/或富集。
可以對pmEV進行分析,例如,如Jeppesen等人 Cell[細胞] 177:428 (2019)所述。
在一些實施方式中,pmEV的凍乾的。
在一些實施方式中,pmEV經γ照射(例如,以17.5或25 kGy)。
在一些實施方式中,pmEV經UV輻照。
在一些實施方式中,pmEV被熱滅活(例如,在50°C下兩小時或在90°C下兩小時)。
在一些實施方式中,pmEV經酸處理。
在一些實施方式中,pmEV經氧噴射(例如,以0.1 vvm持續兩小時)。
生長階段會影響細菌的量或性質。例如,在本文提供的pmEV製備方法中,可以例如在對數生長期開始時、在對數生長期的中間時、和/或一旦達到穩定生長期時從培養物中分離pmEV。
分泌型微生物胞外囊泡(smEV)的產生
在某些方面,本文所述之smEV可以使用本領域已知的任何方法製備。
在一些實施方式中,在沒有smEV純化步驟的情況下製備smEV。例如,在一些實施方式中,本文描述的細菌藉由使用讓smEV保持完整之方法被殺死且將所得的細菌組分(包括smEV)用於本文描述之方法及組成物中。在一些實施方式中,該等細菌藉由使用抗生素(例如,使用本文描述的抗生素)被殺死。在一些實施方式中,該等細菌藉由使用UV輻射被殺死。在一些實施方式中,細菌被熱殺死。
在一些實施方式中,本文所述之smEV純化自一種或多種其他細菌組分。用於自細菌純化smEV之方法為本領域中已知。在一些實施方式中,smEV藉由使用S. Bin Park等人 PLoS ONE [公共科學圖書館·綜合].6(3): e17629 (2011)或G. Norheim等人 PLoS ONE[公共科學圖書館·綜合].10(9): e0134353 (2015)或Jeppesen等人 Cell [細胞] 177:428 (2019)中所述之方法從細菌培養物製備,其中每個藉由引用以其全文特此併入。在一些實施方式中,該等細菌經培養至高光密度及然後經離心以使細菌沈澱(例如,在4°C下以10,000 x g離心30 min,在4°C下以15,500 x g離心15 min)。在一些實施方式中,然後使培養上清液通過過濾器以排除完整細菌細胞(例如,0.22 µm過濾器)。在一些實施方式中,然後對上清液進行切向流過濾,在此過程中,將上清液濃縮,去除小於100 kDa的種類,並用PBS對培養基進行部分交換。在一些實施方式中,經過濾的上清液經離心以使細菌smEV沈澱(例如,在4°C下以100,000至150,000 x g離心1至3小時,在4°C下以200,000 x g離心1至3小時)。在一些實施方式中,該等smEV藉由重懸所得smEV沈澱物(例如,於PBS中),並將重懸的smEV施用至Optiprep(碘克沙醇)梯度或梯度(例如30%至60%不連續的梯度、0-45%不連續的梯度),接著離心(例如,在4°C下以200,000 x g離心4-20小時)加以進一步純化。可以收集smEV帶,用PBS稀釋並離心以使smEV沈澱(例如,在4°C下以150,000 x g離心3小時,在4°C下以200,000 x g離心1小時)。純化的smEV可經儲存(例如,在-80°C或-20°C下)直至使用。在一些實施方式中,smEV藉由用DNA酶和/或蛋白酶K處理加以進一步純化。
例如,在一些實施方式中,細菌的培養物可在4°C下以11,000 x g離心20至40分鐘以使細菌沈澱。可使培養上清液通過0.22 µm過濾器以排除完整細菌細胞。然後可使用可包括但不限於硫酸銨沈澱、超速離心或過濾之方法濃縮經過濾的上清液。例如,就硫酸銨沈澱而言,可將1.5-3 M硫酸銨緩慢添加至經過濾的上清液,同時在4°C下攪拌。可將沈澱在4°C下孵育8-48小時,然後在4°C下以11,000 x g離心20-40 min。所得沈澱物含有細菌smEV及其他碎片。使用超速離心,將經過濾的上清液在4°C下以100,000-200,000 x g離心1-16小時。此離心的沈澱物含有細菌smEV和其他碎片(例如大蛋白複合物)。在一些實施方式中,使用過濾技術,如藉由使用Amicon超自旋過濾器或藉由切向流過濾,上清液可經過濾以便於保留分子量> 50或100 kDa的物質。
可替代地,例如藉由將生物反應器連接至細胞培養交替切向流(ATF)系統(例如來自Repligen的XCell ATF),可在生長期間或在生長期間的選定時間點,從細菌培養物連續獲得smEV。該ATF系統保留完整細胞(> 0.22 µm)於生物反應器中,及容許較小組分(例如,smEV、游離蛋白質)通過過濾器以供收集。例如,該系統可經結構設計使得< 0.22 µm濾液然後通過100 kDa的第二過濾器,容許收集如在0.22 µm與100 kDa之間的smEV的物質,並將小於100 kDa的種類泵送回生物反應器中。可替代地,該系統可以經結構設計以容許生物反應器中的培養基在培養物的生長期間得到補充和/或修飾。藉由此方法收集的smEV可以藉由如上文描述用於經過濾的上清液的超離心或過濾進行進一步純化和/或濃縮。
藉由本文提供之方法獲得的smEV可藉由基於尺寸的柱層析法、藉由親和層析法、藉由離子交換層析法及藉由梯度超速離心,使用可包括但不限於使用蔗糖梯度或Optiprep梯度之方法加以進一步純化。簡言之,在使用蔗糖梯度方法時,如果使用硫酸銨沈澱或超速離心來濃縮經過濾的上清液,則將沈澱物重懸於60%蔗糖、30 mM Tris(pH 8.0)中。如果使用過濾來濃縮經過濾的上清液,則使用Amicon Ultra柱將濃縮物緩衝液交換至60%蔗糖、30 mM Tris(pH 8.0)中。將樣本施加至35%-60%不連續蔗糖梯度中並在4°C下以200,000 × g離心3-24小時。簡言之,在使用Optiprep梯度方法時,如果使用硫酸銨沈澱或超速離心來濃縮經過濾的上清液,則將沈澱物重懸於PBS中並向樣本中添加3體積的60% Optiprep。在一些實施方式中,如果使用過濾來濃縮經過濾的上清液,則使用60% Optiprep將濃縮物稀釋至最終濃度為35% Optiprep。將樣本施加至0-45%不連續的Optiprep梯度,並在4°C下以200,000 x g離心3至24小時,例如,在4°C下離心4至24小時。
在一些實施方式中,為證實smEV製劑的無菌性及分離,將smEV連續稀釋至瓊脂培養基(其用於測試中的細菌的例行培養)上,並使用例行條件進行孵育。使未經滅菌的製劑通過0.22 µm過濾器以去除完整細胞。為進一步增加純度,分離的smEV可用DNA酶或蛋白酶K處理。
在一些實施方式中,為製備用於體內注射的smEV,經純化的smEV如先前描述進行加工(G. Norheim等人,
PLoS ONE. [公共科學圖書館·綜合]10(9): e0134353 (2015))。簡言之,在蔗糖梯度離心後,將含有smEV的帶於含有3%蔗糖的溶液中或熟悉該項技術者已知的適用於體內注射的其他溶液中重懸至50 µg/mL的終濃度。該溶液還可含有濃度為0-0.5%(w/v)的佐劑(例如氫氧化鋁)。在一些實施方式中,為了製備用於體內注射的smEV,將PBS中的smEV無菌過濾至< 0.22 µm。
在某些實施方式中,為製備與其他測試(例如用以在TEM成像或活體外分析之前去除蔗糖)相容的樣本,使用過濾(例如,Amicon Ultra柱)將樣本緩衝液交換至PBS或30 mM pH 8.0 Tris中,透析,或超離心(200,000 × g,≥ 3小時,4°C)並重懸。
在一些實施方式中,smEV製劑的無菌性可藉由將一部分smEV接種至瓊脂培養基(其用於用以產生smEV的細菌的標準培養)上並使用標準條件進行孵育加以證實。
在一些實施方式中,藉由層析法及smEV上的結合表面部分對所選smEV進行分離和富集。在其他實施方式中,所選smEV藉由螢光細胞分選藉由使用親和試劑、化學染料、重組蛋白之方法或熟悉該項技術者已知的其他方法分離和/或富集。
可以對smEV進行分析,例如,如Jeppesen等人 Cell[細胞] 177:428 (2019) 所述。
在一些實施方式中,smEV係凍乾的。
在一些實施方式中,smEV被γ照射(例如,在17.5或25 kGy下)。
在一些實施方式中,smEV經UV輻照。
在一些實施方式中,smEV被熱滅活(例如,在50°C下兩小時或在90°C下兩小時)。
在一些實施方式中,smEV經酸處理。
在一些實施方式中,smEV被噴氧(例如,以0.1 vvm持續兩小時)。
生長階段會影響細菌和/或細菌產生的smEV的量或性質。例如,在本文提供的smEV製備方法中,可以例如在對數生長期開始時、在對數生長期的中間時、和/或一旦達到穩定生長期時從培養物中分離smEV。
生長環境(如培養條件)可影響細菌產生smEV的量。例如,smEV誘導因子可以增加smEV的產率,如表4所示。
[
表 4]
:增加 smEV 產率的培養技術
smEV誘導 | smEV誘導因子 | 作用於 |
溫度 | ||
加熱 | 應激反應 | |
RT至37°C溫度變化 | 模擬感染 | |
37°C至40°C溫度變化 | 熱性感染 | |
ROS | ||
白花丹素 | 氧化應激反應 | |
氫過氧化物異丙苯 | 氧化應激反應 | |
過氧化氫 | 氧化應激反應 | |
抗生素 | ||
環丙沙星 | 細菌SOS反應 | |
建它黴素 | 蛋白質合成 | |
多黏菌素B | 外膜 | |
D-環絲胺酸 | 細胞壁 | |
滲壓劑 | ||
NaCl | 滲透應激 | |
金屬離子應激 | ||
鐵螯合 | 鐵水平 | |
EDTA | 去除二價陽離子 | |
低氯化血紅素 | 鐵水平 | |
培養基添加劑或去除 | ||
乳酸鹽 | 生長 | |
胺基酸剝奪 | 應激 | |
十六烷 | 應激 | |
葡萄糖 | 生長 | |
碳酸氫鈉 | ToxT誘導 | |
PQS | 水泡劑(vesiculator)(來自細菌) | |
二胺+DFMO | 膜錨定(僅negativicutes) | |
高營養素 | 增強的生長 | |
低營養素 | ||
其他機制 | ||
氧 | 厭氧生物中的氧應激 | |
無半胱胺酸 | 厭氧生物中的氧應激 | |
誘導生物膜或絮凝 | ||
兩階段生長 | ||
噬菌體 | ||
尿素 |
在本文提供的製備smEV之方法中,該方法可視需要包括在從細菌培養物中分離smEV之前,將細菌培養物暴露於smEV誘導因子。細菌培養物可以在對數生長期開始時、在對數生長期的中間時、和/或一旦達到穩定生長期時暴露於smEV誘導因子。
固體劑型組成物
在某些實施方式中,本文提供了包含藥劑的固體劑型(例如,具有固體劑型的藥物產品),該藥劑含有細菌和/或mEV(例如smEV和/或pmEV)。在一些實施方式中,藥劑可以視需要包含一種或多種另外的組分,例如冷凍保護劑。可以將藥劑凍乾(例如,產生粉末)。藥劑可以與固體劑型中的一種或多種賦形劑(例如藥學上可接受的賦形劑)組合。藥劑也稱為原料藥。固體劑型也稱為固體劑量型。
在某些方面,本文提供了藥物組成物的固體劑型。藥物組成物也稱為藥物產品。在某些實施方式中,固體劑型包含藥劑(例如細菌和/或細菌起源的試劑(例如組分),如mEV,包含細菌和/或細菌起源的試劑(例如組分)如mEV的粉末)和一種或多種賦形劑。在某些實施方式中,藥劑總質量係藥物組成物總質量的至少5%、10%、15%、20%、25%、30%、35%、40%、45%、50%、55%、60%、65%、70%或75%。在一些實施方式中,藥劑總質量不超過藥物組成物總質量的75%、70%、65%、60%、55%、50%、45%、40%、35%、30%或25%。在一些實施方式中,一種或多種賦形劑的總質量為藥物組成物總質量的至少30%、至少35%、至少40%、至少45%、或至少50%、至少55%、至少65%、至少70%或至少75%。在一些實施方式中,一種或多種賦形劑的總質量不超過藥物組成物總質量的95%、90%、85%、80%、75%、70%、65%、60%或55%、50%、45%、40%或35%。在一些實施方式中,一種或多種賦形劑包含矽化微晶纖維素。(例如HD90級)。在一些實施方式中,一種或多種賦形劑包含交聚維酮(PVPP,例如科利當CL-F)。
在某些方面,本文提供了藥物組成物的固體劑型。在某些實施方式中,固體劑型包含藥劑(例如,細菌和/或細菌來源的試劑(如mEV),包含細菌和/或細菌來源的試劑(如mEV)的粉末)和一種或多種賦形劑(例如,一種、兩種或三種賦形劑)。在某些實施方式中,固體劑型包含藥劑(例如,細菌和/或細菌來源的試劑(如mEV),包含細菌和/或細菌來源的試劑(如mEV)的粉末)和兩種賦形劑。在某些實施方式中,藥劑總質量係藥物組成物總質量的至少5%、10%、15%、20%、25%、30%、35%、40%、45%、50%、55%、60%、65%、70%或75%。在一些實施方式中,藥劑總質量不超過藥物組成物總質量的75%、70%、65%、60%、55%、50%、45%、40%、35%、30%、25%、20%、15%、10%或5%。在一些實施方式中,一種或多種賦形劑的總質量為藥物組成物總質量的至少5%、至少10%、至少20%、至少30%、至少35%、至少40%、至少45%或至少50%、至少55%、至少65%、至少70%或至少75%。在一些實施方式中,一種或多種賦形劑的總質量不超過藥物組成物總質量的95%、90%、85%、80%、75%、70%、65%、60%或55%、50%、45%、40%或35%。在一些實施方式中,一種或多種賦形劑包含矽化微晶纖維素。在一些實施方式中,一種或多種賦形劑包含交聚維酮(PVPP,例如科利當CL-F)。
在某些實施方式中,本文提供的固體劑型包含矽化微晶纖維素。在一些實施方式中,矽化微晶纖維素為HD90級。在某些實施方式中,矽化微晶纖維素總質量為藥物組成物總質量的至少5%、7%、10%、15%、16%、17%、18%、19%、20%、21%、22%、23%、24%、25%、26%、27%、28%、29%、30%、31%、32%、33%、34%、35%、36%、37%、38%、39%、40%、41%、42%、43%、44%、45%、46%、47%、48%、49%、50%、51%、52%、53%、54%、55%、56%、57%、58%、59%、60%、61%、62%、63%、64%、65%、66%、67%、68%、70%、71%、72%、73%、74%、75%、76%、77%、78%、79%、80%、81%、82%、83%、84%、85%、86%、87%、88%、89%或90%。在某些實施方式中,矽化微晶纖維素總質量不超過藥物組成物總質量的5%、7%、10%、15%、16%、17%、18%、19%、20%、21%、22%、23%、24%、25%、26%、27%、28%、29%、30%、31%、32%、33%、34%、35%、36%、37%、38%、39%、40%、41%、42%、43%、44%、45%、46%、47%、48%、49%、50%、51%、52%、53%、54%、55%、56%、57%、58%、59%、60%、61%、62%、63%、64%、65%、66%、67%、68%、70%、71%、72%、73%、74%、75%、76%、77%、78%、79%、80%、81%、82%、83%、84%、85%、86%、87%、88%、89%或90%。在某些實施方式中,矽化微晶纖維素總質量為藥物組成物總質量的約5%、7%、10%、15%、16%、17%、18%、19%、20%、21%、22%、23%、24%、25%、26%、27%、28%、29%、30%、31%、32%、33%、34%、35%、36%、37%、38%、39%、40%、41%、42%、43%、44%、45%、46%、47%、48%、49%、50%、51%、52%、53%、54%、55%、56%、57%、58%、59%、60%、61%、62%、63%、64%、65%、66%、67%、68%、70%、71%、72%、73%、74%、75%、76%、77%、78%、79%、80%、81%、82%、83%、84%、85%、86%、87%、88%、89%或90%。在某些實施方式中,矽化微晶纖維素總質量為藥物組成物總質量的約5%至約77%。在某些實施方式中,矽化微晶纖維素總質量為藥物組成物總質量的約10%至約55%。在某些實施方式中,矽化微晶纖維素總質量為藥物組成物總質量的約10%、約20%、約30%、約40%或約50%。在某些實施方式中,矽化微晶纖維素總質量為藥物組成物總質量的約76.4%。在某些實施方式中,矽化微晶纖維素總質量為藥物組成物總質量的約72.5%。在某些實施方式中,矽化微晶纖維素總質量為藥物組成物總質量的約20%。
在某些實施方式中,本文提供的固體劑型包含交聚維酮(例如PVPP、科利當CL-F、PVP CL-F)。在某些實施方式中,交聚維酮總質量係藥物組成物總質量的至少5%、6%、7%、8%、9%、10%、11%、12%、13%、14%、15%、16%、17%、18%、19%、20%、21%、22%、23%、24%、25%、26%、27%、28%、29%或30%。在某些實施方式中,交聚維酮總質量不超過藥物組成物總質量的5%、6%、7%、8%、9%、10%、11%、12%、13%、14%、15%、16%、17%18%、19%、20%、21%、22%、23%、24%、25%、26%、27%、28%、29%或30%。在某些實施方式中,交聚維酮總質量為藥物組成物總質量的約5%、6%、7%、8%、9%、10%、11%、12%、13%、14%、15%、16%、17%、18%、19%、20%、21%、22%、23%、24%、25%、26%、27%、28%、29%或30%。在某些實施方式中,交聯維酮總質量係藥物組成物總質量的約5%至約20%。在某些實施方式中,交聚維酮總質量為藥物組成物總質量的約5%、6%、7%、10%、15%、18%、20%或30%。
在某些實施方式中,本文提供的固體劑型包含:(i) 藥劑,藥劑總質量為藥物組成物總質量的至少5%且不超過75%,和 (ii) 矽化微晶纖維素,矽化微晶纖維素總質量為藥物組成物總質量的至少5%(例如至少5%、7%、10%、15%、16%、17%、18%、19%、20%、21%、22%、23%、24%、25%、26%、27%、28%、29%、30%、31%、32%、33%、34%、35%、36%、37%、38%、39%、40%、41%、42%、43%、44%、45%、46%、47%、48%、49%、50%、51%、52%、53%、54%、55%、56%、57%、58%、59%、60%、61%、62%、63%、64%、65%、66%、67%、68%、70%、71%、72%、73%、74%、75%、76%、77%、78%、79%、80%、81%、82%、83%、84%、85%、86%、87%、88%、89%或90%)且不超過90%(例如不超過5%、7%、10%、15%、16%、17%、18%、19%、20%、21%、22%、23%、24%、25%、26%、27%、28%、29%、30%、31%、32%、33%、34%、35%、36%、37%、38%、39%、40%、41%、42%、43%、44%、45%、46%、47%、48%、49%、50%、51%、52%、53%、54%、55%、56%、57%、58%、59%、60%、61%、62%、63%、64%、65%、66%、67%、68%、70%、71%、72%、73%、74%、75%、76%、77%、78%、79%、80%、81%、82%、83%、84%、85%、86%、87%、88%、89%或90%)。在某些實施方式中,固體劑型進一步包含交聚維酮,其具有的交聚維酮總質量係藥物組成物總質量的至少5%(例如,至少5%、6%、7%、8%、9%、10%、11%、12%、13%、14%、15%、16%、17%、18%、19%、20%、21%、22%、23%、24%、或25%)且不超過藥物組成物總質量的25%(例如,不超過5%、6%、7%、8%、9%、10%、11%、12%、13%、14%、15%、16%、17%、18%、19%、20%、21%、22%、23%、24%、或25%)。在某些實施方式中,矽化微晶纖維素總質量加上交聚維酮總質量為藥物組成物總質量的至少60%、70%、80%或90%。在一些實施方式中,固體劑型包含:L-HPC總質量為藥物組成物總質量的約50%,交聚維酮總質量為藥物組成物總質量的約15%。在一些實施方式中,固體劑型包含:L-HPC總質量為藥物組成物總質量的約76.4%,交聚維酮總質量為藥物組成物總質量的約15%。
在某些實施方式中,藥劑和矽化微晶纖維素總質量為藥物組成物總質量的至少45%(例如至少45%、46%、47%、48%、49%、50%、51%、52%、53%、54%、55%、56%、57%、58%、59%、60%、61%、62%、63%、64%、65%、66%、67%、68%、70%、71%、72%、73%、74%、75%、76%、77%、78%、79%、80%、81%、82%、83%、84%、85%、86%、87%、88%、89%、90%、91%或92%)且不超過92%(例如不超過45%、46%、47%、48%、49%、50%、51%、52%、53%、54%、55%、56%、57%、58%、59%、60%、61%、62%、63%、64%、65%、66%、67%、68%、70%、71%、72%、73%、74%、75%、76%、77%、78%、79%、80%、81%、82%、83%、84%、85%、86%、87%、88%、89%或90%)。在某些實施方式中,藥劑和矽化微晶纖維素總質量為藥物組成物總質量的約45%。在某些實施方式中,藥劑和矽化微晶纖維素總質量為藥物組成物總質量的約50%-56%。在某些實施方式中,藥劑和矽化微晶纖維素總質量為藥物組成物總質量的約62%-67%。在某些實施方式中,藥劑和矽化微晶纖維素總質量為藥物組成物總質量的約72%-77%。在某些實施方式中,藥劑和矽化微晶纖維素總質量為藥物組成物總質量的約80%-88%。在某些實施方式中,藥劑和矽化微晶纖維素總質量為藥物組成物總質量的約90.5%。
在某些實施方式中,固體劑型進一步包含總交聚維酮,交聚維酮總質量為藥物組成物總質量的至少5%(例如至少5%、6%、7%、8%、9%、10%、11%、12%、13%、14%、15%、16%、17%、18%、19%、20%、21%、22%、23%、24%、25%、26%、27%、28%、29%或30%)且不超過30%(不超過5%、6%、7%、8%、9%、10%、11%、12%、13%、14%、15%、16%、17%、18%、19%、20%、21%、22%、23%、24%、25%、26%、27%、28%、29%或30%)。
在某些實施方式中,矽化微晶纖維素總質量加上交聚維酮總質量為藥物組成物總質量的至少15%、17%、20%、25%、30%、35%、40%、45%、50%、55%、60%、70%、80%或90%。在一些實施方式中,固體劑型包含:矽化微晶纖維素總質量為藥物組成物總質量的約50%,交聚維酮總質量為藥物組成物總質量的約15%。在一些實施方式中,固體劑型包含:矽化微晶纖維素總質量為藥物組成物總質量的約76.4%,交聚維酮總質量為藥物組成物總質量的約15%。在一些實施方式中,固體劑型包含:矽化微晶纖維素總質量為藥物組成物總質量的約72.5%,交聚維酮總質量為藥物組成物總質量的約15%。在一些實施方式中,固體劑型包含:矽化微晶纖維素總質量為藥物組成物總質量的約20%,交聚維酮總質量為藥物組成物總質量的約15%。在一些實施方式中,固體劑型包含:矽化微晶纖維素總質量為藥物組成物總質量的約5%-43%,交聚維酮總質量為藥物組成物總質量的約15%。
在某些實施方式中,本文提供的固體劑型包含硬脂酸鎂。在某些實施方式中,硬脂酸鎂總質量為藥物組成物總質量的至少0.01%、0.1%、1%、2%、3%、4%、5%、6%、7%、8%、9%、10%或11%。在某些實施方式中,硬脂酸鎂總質量不超過藥物組成物總質量的0.01%、0.1%、1%、2%、3%、4%、5%、6%、7%、8%、9%、10%或11%。在某些實施方式中,硬脂酸鎂總質量為藥物組成物總質量的約0.01%、0.1%、1%、1.5%、2%、2.5%、3%、3.5%、4%、4.5%、5%、5.5%、6%、6.5%、7%、7.5%、8%、8.5%、9%、9.5%、10%或11%。在某些實施方式中,硬脂酸鎂總質量係藥物組成物總質量的約0.5%至約1.5%。在某些實施方式中,硬脂酸鎂總質量係藥物組成物總質量的約1%至約2%。在某些實施方式中,硬脂酸鎂總質量係藥物組成物總質量的約1%。在某些實施方式中,硬脂酸鎂總質量係藥物組成物總質量的約1.5%。
在某些實施方式中,本文提供的固體劑型包含膠體二氧化矽(colloidal silica)(也稱為膠體二氧化矽(colloidal silicon dioxide)或SiO
2)。在一些實施方式中,膠體二氧化矽係Aerosil 200。在某些實施方式中,膠體二氧化矽總質量係藥物組成物總質量的至少0.01%、0.1%、1%、2%、3%、4%、5%、6%、7%、8%、9%、10%或11%。在某些實施方式中,膠體二氧化矽總質量不超過藥物組成物總質量的0.01%、0.1%、1%、2%、3%、4%、5%、6%、7%、8%、9%、10%或11%。在某些實施方式中,膠體二氧化矽總質量係藥物組成物總質量的約0.01%、0.1%、1%、2%、3%、4%、5%、6%、7%、8%、9%、10%或11%。在某些實施方式中,膠體二氧化矽總質量係藥物組成物總質量的約0.5%至約1.5%。在某些實施方式中,膠體二氧化矽(例如Aerosil 200)總質量係藥物組成物總質量的約1%。在某些實施方式中,膠體二氧化矽(例如Aerosil 200)總質量係藥物組成物總質量的約3%。
在某些實施方式中,本文提供的固體劑型包含纖維素的低取代羥丙基醚(例如L-HPC級LH-B1)。在某些實施方式中,L-HPC總質量為藥物組成物總質量的至少9%、10%、11%、12%、13%、14%、15%、16%、17%、18%、19%、20%、21%、22%、23%、24%、25%、26%、27%、28%、29%、30%、31%或32%。在某些實施方式中,L-HPC總質量不超過藥物組成物總質量的9%、10%、11%、12%、13%、14%、15%、16%、17%、18%、19%、20%、21%、22%、23%、24%、25%、26%、27%、28%、29%、30%、31%或32%。在某些實施方式中,L-HPC總質量為藥物組成物總質量的約9%、10%、11%、12%、13%、14%、15%、16%、17%、18%、19%、20%、21%、22%、23%、24%、25%、26%、27%、28%、29%、30%、31%或32%。在某些實施方式中,L-HPC總質量為藥物組成物總質量的約9%、14%、17%、22%、27%或32%。
在某些實施方式中,本文提供的固體劑型包含交聯羧甲基纖維素鈉(例如AcDiSol)。在某些實施方式中,交聯羧甲基纖維素鈉總質量為藥物組成物總質量的至少1%、2%、3%、4%、5%、6%或7%。在某些實施方式中,交聯羧甲基纖維素鈉總質量不超過藥物組成物總質量的1%、2%、3%、4%、5%、6%或7%。在某些實施方式中,交聯羧甲基纖維素鈉總質量為藥物組成物總質量的約1%、2%、3%、4%、5%、6%或7%。在某些實施方式中,交聯羧甲基纖維素鈉總質量為藥物組成物總質量的約2%、4%或6%。
在某些實施方式中,本文提供的固體劑型包含碳酸氫鈉。在某些實施方式中,碳酸氫鈉總質量為藥物組成物總質量的至少5%、6%、7%、8%、9%、10%、11%、12%、13%、14%、15%、16%、17%、18%、19%、20%、21%或22%。在某些實施方式中,碳酸氫鈉總質量不超過藥物組成物總質量的5%、6%、7%、8%、9%、10%、11%、12%、13%、14%、15%、16%、17%、18%、19%、20%、21%或22%。在某些實施方式中,碳酸氫鈉總質量為藥物組成物總質量的約5%、6%、7%、8%、9%、10%、11%、12%、13%、14%、15%、16%、17%、18%、19%、20%、21%或22%。在某些實施方式中,碳酸氫鈉總質量為藥物組成物總質量的約6.5%、7.5%、10%、12%、15%、18%或20%。
在某些實施方式中,本文提供的固體劑型包含檸檬酸。在某些實施方式中,檸檬酸總質量為藥物組成物總質量的至少5%、6%、7%、8%、9%、10%、11%、12%、13%、14%、15%、16%、17%、18%、19%、20%、21%或22%。在某些實施方式中,總檸檬酸不超過藥物組成物總質量的5%、6%、7%、8%、9%、10%、11%、12%、13%、14%、15%、16%、17%、18%、19%、20%、21%或22%。在某些實施方式中,檸檬酸總質量為藥物組成物總質量的約5%、6%、7%、8%、9%、10%、11%、12%、13%、14%、15%、16%、17%、18%、19%、20%、21%或22%。在某些實施方式中,檸檬酸總質量為藥物組成物總質量的約5%、7.5%、10%、12%、15%、18%或20%。
在某些實施方式中,本文提供的固體劑型包含交聚維酮(例如聚乙烯吡咯啶酮-乙酸乙烯酯共聚物、PVP 64或科利當VA 64)。在某些實施方式中,交聚維酮總質量為藥物組成物總質量的至少3%、4%、5%、6%、7%、8%、9%或10%。在某些實施方式中,總交聚維酮不超過藥物組成物總質量的3%、4%、5%、6%、7%、8%、9%或10%。在某些實施方式中,交聚維酮總質量為藥物組成物總質量的約3%、4%、5%、6%、7%、8%、9%或10%。在某些實施方式中,檸檬酸總質量為藥物組成物總質量的約3%、3.5%、5%或10%。
在某些實施方式中,本文提供的固體劑型包含矽酸鋁鎂(例如維格姆(Veegum))。在某些實施方式中,矽酸鋁鎂總質量為藥物組成物總質量的至少3%、4%、5%、6%、7%、8%、9%或10%。在某些實施方式中,總矽酸鋁鎂不超過藥物組成物總質量的3%、4%、5%、6%、7%、8%、9%或10%。在某些實施方式中,矽酸鋁鎂總質量為藥物組成物總質量的約3%、4%、5%、6%、7%、8%、9%或10%。在某些實施方式中,矽酸鋁鎂總質量為藥物組成物總質量的約5%或10%。
在某些實施方式中,本文提供的固體劑型包含約33%藥劑(例如包含細菌和/或細菌來源的試劑(例如mEV)的粉末);約50%矽化微晶纖維素(例如,HD90級);約15%交聚維酮(例如,PVPP);約1%硬脂酸鎂;和約1%膠體二氧化矽(例如,Aerosil 200)。
在某些實施方式中,本文提供的固體劑型包含約6.6%藥劑(例如包含細菌和/或細菌來源的試劑(例如mEV)的粉末);約76.4%矽化微晶纖維素(例如,HD90級);約15%交聚維酮;約1%硬脂酸鎂;和約1%膠體二氧化矽(例如Aerosil 200P)。在某些實施方式中,本文提供的固體劑型包含約10%藥劑(例如包含細菌和/或細菌來源的試劑(例如mEV)的粉末);約72.5%矽化微晶纖維素(例如,HD90級);約15%交聚維酮;約1.5%硬脂酸鎂;和約1%膠體二氧化矽(例如Aerosil 200P)。
在某些實施方式中,本文提供的固體劑型包含約62.5%藥劑(例如包含細菌和/或細菌來源的試劑(例如mEV)的粉末);約20%矽化微晶纖維素(例如,HD90級);約15%交聚維酮;約1.5%硬脂酸鎂;和約1%膠體二氧化矽(例如Aerosil 200P)。
在某些實施方式中,本文提供的固體劑型包含約10%至約70%藥劑(例如包含細菌和/或細菌來源的試劑(例如mEV)的粉末);約20%至約73%矽化微晶纖維素(例如,HD90級);約15%交聚維酮(例如,PVPP);約1%硬脂酸鎂;和約1%膠體二氧化矽(例如,Aerosil 200)。
在某些實施方式中,本文提供的固體劑型包含約33%藥劑(例如包含細菌和/或細菌來源的試劑(例如mEV)的粉末或顆粒);約50%矽化微晶纖維素(例如,HD90級);約15%交聚維酮(例如,PVPP);約1%硬脂酸鎂;和約1%膠體二氧化矽(例如,Aerosil 200)。
在某些實施方式中,本文提供的固體劑型包含約6.6%藥劑(例如包含細菌和/或細菌來源的試劑(例如mEV)的粉末或顆粒);約76.4%矽化微晶纖維素(例如,HD90級);約15%交聚維酮;約1%硬脂酸鎂;和約1%膠體二氧化矽(例如Aerosil 200P)。
在某些實施方式中,本文提供的固體劑型包含約10%藥劑(例如包含細菌和/或細菌來源的試劑(例如mEV)的粉末或顆粒);約72.5%矽化微晶纖維素(例如,HD90級);約15%交聚維酮;約1.5%硬脂酸鎂;和約1%膠體二氧化矽(例如Aerosil 200P)。
在某些實施方式中,本文提供的固體劑型包含約62.5%藥劑(例如包含細菌和/或細菌來源的試劑(例如mEV)的粉末或顆粒);約20%矽化微晶纖維素(例如,HD90級);約15%交聚維酮;約1.5%硬脂酸鎂;和約1%膠體二氧化矽(例如Aerosil 200P)。
在某些實施方式中,本文提供的固體劑型包含約40%藥劑(例如包含細菌和/或細菌來源的試劑(例如mEV)的粉末);約43%矽化微晶纖維素(例如,HD90);約15%交聚維酮(例如,PVPP);約1%硬脂酸鎂;和約1%膠體二氧化矽(例如,Aerosil 200)。
在某些實施方式中,本文提供的固體劑型包含約50%藥劑(例如包含細菌和/或細菌來源的試劑(例如mEV)的粉末);約33%矽化微晶纖維素(例如,HD90);約15%交聚維酮(例如,PVPP);約1%硬脂酸鎂;和約1%膠體二氧化矽(例如,Aerosil 200)。
在某些實施方式中,本文提供的固體劑型包含約50%藥劑(例如包含細菌和/或細菌來源的試劑(例如mEV)的粉末);約15.5%矽化微晶纖維素(例如,HD90);約30%交聚維酮(例如,PVPP);約1.5%硬脂酸鎂;和約3%膠體二氧化矽(例如,Aerosil 200)。
在某些實施方式中,本文提供的固體劑型包含約74.5%藥劑(例如包含細菌和/或細菌來源的試劑(例如mEV)的粉末);約16%矽化微晶纖維素(例如,HD90);約7%交聚維酮(例如,PVPP);約1.5%硬脂酸鎂;和約1%膠體二氧化矽(例如,Aerosil 200)。
在某些實施方式中,本文提供的固體劑型包含約50%藥劑(例如包含細菌和/或細菌來源的試劑(例如mEV)的粉末);約37%矽化微晶纖維素(例如,HD90);約7%交聚維酮(例如,PVPP);約4%交聯羧甲基纖維素鈉(例如AcDiSol);約1%硬脂酸鎂;和約1%膠體二氧化矽(例如,Aerosil 200)。
在某些實施方式中,本文提供的固體劑型包含約60%藥劑(例如包含細菌和/或細菌來源的試劑(例如mEV)的粉末);約27%矽化微晶纖維素(例如,HD90);約7%交聚維酮(例如,PVPP);約4%交聯羧甲基纖維素鈉(例如AcDiSol);約1%硬脂酸鎂;和約1%膠體二氧化矽(例如,Aerosil 200)。
在某些實施方式中,本文提供的固體劑型包含約60%藥劑(例如包含細菌和/或細菌來源的試劑(例如mEV)的粉末);約21%矽化微晶纖維素(例如,HD90);約13%交聚維酮(例如,PVPP);約4%交聯羧甲基纖維素鈉(例如AcDiSol);約1%硬脂酸鎂;和約1%膠體二氧化矽(例如,Aerosil 200)。
在某些實施方式中,本文提供的固體劑型包含約8%藥劑(例如包含細菌和/或細菌來源的試劑(例如mEV)的粉末或顆粒);約42%矽化微晶纖維素(例如,HD90級);約27%低取代的纖維素羥丙基醚(例如,L-HPC級LH-B1);約6%交聯羧甲基纖維素鈉(例如AcDiSol);約15%交聚維酮(PVPP,例如,科利當CL-F);約1%二氧化矽;和約1%硬脂酸鎂。
在某些實施方式中,本文提供的固體劑型包含約23%藥劑(例如包含細菌和/或細菌來源的試劑(例如mEV)的粉末或顆粒);約27%矽化微晶纖維素(例如,HD90級);約27%低取代的纖維素羥丙基醚(例如,L-HPC級LH-B1);約6%交聯羧甲基纖維素鈉(例如AcDiSol);約15%交聚維酮(PVPP,例如,科利當CL-F);約1%二氧化矽;和約1%硬脂酸鎂。
在某些實施方式中,本文提供的固體劑型包含約40%藥劑(例如包含細菌和/或細菌來源的試劑(例如mEV)的粉末或顆粒);約10%矽化微晶纖維素(例如,HD90級);約27%低取代的纖維素羥丙基醚(例如,L-HPC級LH-B1);約6%交聯羧甲基纖維素鈉(例如AcDiSol);約15%交聚維酮(PVPP,例如,科利當CL-F);約1%二氧化矽;和約1%硬脂酸鎂。
在某些實施方式中,本文提供的固體劑型包含約50%藥劑(例如包含細菌和/或細菌來源的試劑(例如mEV)的粉末或顆粒);約5%矽化微晶纖維素(例如,HD90級);約22%低取代的纖維素羥丙基醚(例如L-HPC級LH-B1);約6%交聯羧甲基纖維素鈉(例如AcDiSol);約15%交聚維酮(PVPP,例如,科利當CL-F);約1%二氧化矽;和約1%硬脂酸鎂。
在某些實施方式中,本文提供的固體劑型包含約10%藥劑(例如包含細菌和/或細菌來源的試劑(例如mEV)的粉末);約40%矽化微晶纖維素(例如,HD90級);約27%低取代的纖維素羥丙基醚(例如,L-HPC級LH-B1);約6%交聯羧甲基纖維素鈉(例如AcDiSol);約15%交聚維酮(PVPP,例如,科利當CL-F);約1%二氧化矽;和約1%硬脂酸鎂。
在某些實施方式中,本文提供的固體劑型包含約20%藥劑(例如包含細菌和/或細菌來源的試劑(例如mEV)的粉末);約30%矽化微晶纖維素(例如,HD90級);約27%低取代的纖維素羥丙基醚(例如,L-HPC級LH-B1);約6%交聯羧甲基纖維素鈉(例如AcDiSol);約15%交聚維酮(PVPP,例如,科利當CL-F);約1%二氧化矽;和約1%硬脂酸鎂。
在某些實施方式中,本文提供的固體劑型包含約40%藥劑(例如包含細菌和/或細菌來源的試劑(例如mEV)的粉末);約5%矽化微晶纖維素(例如,HD90級);約32%低取代的纖維素羥丙基醚(例如,L-HPC級LH-B1);約6%交聯羧甲基纖維素鈉(例如AcDiSol);約15%交聚維酮(PVPP,例如,科利當CL-F);約1%二氧化矽;和約1%硬脂酸鎂。在某些實施方式中,本文提供的固體劑型包含約25%藥劑(例如包含細菌和/或細菌來源的試劑(例如mEV)的粉末);約52%矽化微晶纖維素(例如,HD90級);約20%交聚維酮(PVPP,例如,科利當CL-F);約1%滑石粉;約1%二氧化矽;和約1%硬脂醯富馬酸鈉。
在某些實施方式中,本文提供的固體劑型包含約25%藥劑(例如包含細菌和/或細菌來源的試劑(例如mEV)的粉末);約47%矽化微晶纖維素(例如,HD90級);約20%交聚維酮(PVPP,例如,科利當CL-F);約5%交聚維酮(例如,PVP 64);約1%滑石粉;約1%二氧化矽;和約1%硬脂醯富馬酸鈉。
在某些實施方式中,本文提供的固體劑型包含約25%藥劑(例如包含細菌和/或細菌來源的試劑(例如mEV)的粉末);約42%矽化微晶纖維素(例如,HD90級);約20%交聚維酮(PVPP,例如,科利當CL-F);約10%交聚維酮(例如PVP 64);約1%滑石粉;約1%二氧化矽;和約1%硬脂醯富馬酸鈉。
在某些實施方式中,本文提供的固體劑型包含約25%藥劑(例如包含細菌和/或細菌來源的試劑(例如mEV)的粉末);約47%矽化微晶纖維素(例如,HD90級);約20%交聚維酮(PVPP,例如,科利當CL-F);約5%矽酸鋁鎂(例如,維格姆);約1%滑石粉;約1%二氧化矽;和約1%硬脂醯富馬酸鈉。
在某些實施方式中,本文提供的固體劑型包含約25%藥劑(例如包含細菌和/或細菌來源的試劑(例如mEV)的粉末);約42%矽化微晶纖維素(例如,HD90級);約20%交聚維酮(PVPP,例如,科利當CL-F);約10%矽酸鋁鎂(例如,維格姆);約1%滑石粉;約1%二氧化矽;和約1%硬脂醯富馬酸鈉。
在某些實施方式中,本文提供的固體劑型包含約30%藥劑(例如包含細菌和/或細菌來源的試劑(例如mEV)的粉末);約22%矽化微晶纖維素(例如,HD90);約20%檸檬酸;約20%碳酸氫鈉;約5%交聚維酮(例如,PVPP);約1.5%硬脂酸鎂;和約1.5%膠體二氧化矽(例如,Aerosil 200)。
在某些實施方式中,本文提供的固體劑型包含約40%藥劑(例如包含細菌和/或細菌來源的試劑(例如mEV)的粉末);約16%矽化微晶纖維素(例如,HD90);約18%檸檬酸;約18%碳酸氫鈉;約5%交聚維酮(例如,PVPP);約1.5%硬脂酸鎂;和約1.5%膠體二氧化矽(例如,Aerosil 200)。
在某些實施方式中,本文提供的固體劑型包含約50%藥劑(例如包含細菌和/或細菌來源的試劑(例如mEV)的粉末);約12%矽化微晶纖維素(例如,HD90);約15%檸檬酸;約15%碳酸氫鈉;約5%交聚維酮(例如,PVPP);約1.5%硬脂酸鎂;和約1.5%膠體二氧化矽(例如,Aerosil 200)。
在某些實施方式中,本文提供的固體劑型包含約50%藥劑(例如包含細菌和/或細菌來源的試劑(例如mEV)的粉末);約17%矽化微晶纖維素(例如,HD90);約10%檸檬酸;約10%碳酸氫鈉;約10%交聚維酮(例如,PVPP);約1.5%硬脂酸鎂;和約1.5%膠體二氧化矽(例如,Aerosil 200)。
在某些實施方式中,本文提供的固體劑型包含約50%藥劑(例如包含細菌和/或細菌來源的試劑(例如mEV)的粉末);約15%矽化微晶纖維素(例如,HD90);約12%檸檬酸;約12%碳酸氫鈉;約4%交聯羧甲基纖維素鈉(例如AcDiSol);約4%羧基乙酸澱粉鈉;約1.5%硬脂酸鎂;和約1.5%膠體二氧化矽(例如,Aerosil 200)。
在某些實施方式中,本文提供的固體劑型包含約55%藥劑(例如包含細菌和/或細菌來源的試劑(例如mEV)的粉末);約7.5%矽化微晶纖維素(例如,HD90);約7.5%檸檬酸;約7.5%碳酸氫鈉;約20%交聚維酮(例如,PVPP);約1%硬脂醯富馬酸鈉;和約1.5%膠體二氧化矽(例如,Aerosil 200);其中藥劑的20%被包衣。
在某些實施方式中,本文提供的固體劑型包含約40%藥劑(例如包含細菌和/或細菌來源的試劑(例如mEV)的粉末);約25.5%矽化微晶纖維素(例如,HD90);約5%檸檬酸;約6.5%碳酸氫鈉;約18%交聚維酮(例如,PVPP);約2%羧基乙酸澱粉鈉;約1%硬脂醯富馬酸鈉;約1%滑石粉;和約1%膠體二氧化矽(例如,Aerosil 200)。
在某些實施方式中,本文提供的固體劑型包含約40%藥劑(例如包含細菌和/或細菌來源的試劑(例如mEV)的粉末);約22%矽化微晶纖維素(例如,HD90);約5%檸檬酸;約6.5%碳酸氫鈉;約20%交聚維酮(例如,PVPP);約3.5%交聚維酮(PVP 64);約1%硬脂醯富馬酸鈉;約1%滑石粉;和約1%膠體二氧化矽(例如,Aerosil 200)。
在一些實施方式中,藥劑的濕法製粒產生包含藥劑的顆粒(例如包含細菌和/或細菌來源的試劑(例如mEV)的粉末的藥物物質顆粒)。在一些實施方式中,顆粒進一步包含一種或多種賦形劑(例如,一種、兩種或三種)。在一些實施方式中,顆粒視需要與一種或多種(例如,一種、兩種或三種)賦形劑組合以製備藥物組成物(例如片劑、膠囊或固體劑型)。
在本文提供的一些實施方式中,顆粒包含60%-100%的藥劑(例如粉末,包含細菌和/或細菌來源的試劑,例如mEV)。在一些實施方式中,顆粒包含約60%、65%、70%、75%、80%、85%、90%、95%或100%的藥劑。在其他實施方式中,顆粒占藥物組成物總質量的35%-85%。在本文提供的一些實施方式中,顆粒占藥物組成物總質量的約40%、50%、55%、60%、70%、75%、80%或85%。
在某些實施方式中,本文提供的固體劑型包含約60%顆粒;約15%矽化微晶纖維素(例如,HD90);約10%交聚維酮(例如,PVPP);約9%低取代的纖維素羥丙基醚(例如L-HPC級LH-B1);約4%交聯羧甲基纖維素鈉(例如AcDiSol);約1%硬脂酸鎂;和約1%膠體二氧化矽(例如,Aerosil 200)。
在某些實施方式中,本文提供的固體劑型包含約60%顆粒;約27%矽化微晶纖維素(例如,HD90);約7%交聚維酮(例如,PVPP);約4%交聯羧甲基纖維素鈉(例如AcDiSol);約1%硬脂酸鎂;和約1%膠體二氧化矽(例如,Aerosil 200)。
在某些實施方式中,本文提供的固體劑型包含約60%顆粒;約27%矽化微晶纖維素(例如,HD90);約13%交聚維酮(例如,PVPP);約4%交聯羧甲基纖維素鈉(例如AcDiSol);約1%硬脂酸鎂;和約1%膠體二氧化矽(例如,Aerosil 200)。
在某些實施方式中,本文提供的固體劑型包含約60%顆粒;約5%矽化微晶纖維素(例如,HD90);約15%交聚維酮(例如,PVPP);約14%低取代的纖維素羥丙基醚(例如L-HPC級LH-B1);約4%交聯羧甲基纖維素鈉(例如AcDiSol);約1%硬脂酸鎂;和約1%膠體二氧化矽(例如,Aerosil 200)。
在某些實施方式中,本文提供的固體劑型包含約60%顆粒;約17%交聚維酮(例如,PVPP);約17%低取代的纖維素羥丙基醚(例如L-HPC級LH-B1);約4%交聯羧甲基纖維素鈉(例如AcDiSol);約1%硬脂酸鎂;和約1%膠體二氧化矽(例如,Aerosil 200)。
在某些實施方式中,本文提供的固體劑型包含約55%顆粒;約25%矽化微晶纖維素(例如,HD90);約15%交聚維酮(例如,PVPP);約1%膠體二氧化矽(例如,Aerosil 200);約1%羧基乙酸澱粉鈉;和約1%硬脂醯富馬酸鈉。在某些實施方式中,本文提供的固體劑型包含約55%顆粒;約25%矽化微晶纖維素(例如,HD90);約15%交聚維酮(例如,PVPP);約1%膠體二氧化矽(例如,Aerosil 200);約1%羧基乙酸澱粉鈉;和約1%硬脂醯富馬酸鈉。
在某些實施方式中,本文提供的固體劑型包含約50%顆粒;約32%矽化微晶纖維素(例如,HD90);約10%交聚維酮(例如,PVPP);約3%交聚維酮(例如,PVP-64);約2%交聯羧甲基纖維素鈉;約1%膠體二氧化矽(例如,Aerosil 200);約1%滑石粉;和約1%硬脂醯富馬酸鈉。
在某些實施方式中,本文提供的固體劑型包含約40%顆粒;約32%矽化微晶纖維素(例如,HD90);約20%交聚維酮(例如,PVPP);約3%交聚維酮(例如,PVP-64);約2%交聯羧甲基纖維素鈉;約1%膠體二氧化矽(例如,Aerosil 200);約1%滑石粉;和約1%硬脂醯富馬酸鈉。
在某些實施方式中,本文提供的固體劑型包含約70%顆粒;約17%矽化微晶纖維素(例如,HD90);約5%交聚維酮(例如,PVPP);約3%交聚維酮(例如,PVP-64);約2%交聯羧甲基纖維素鈉;約1%膠體二氧化矽(例如,Aerosil 200);約1%滑石粉;和約1%硬脂醯富馬酸鈉。
因此,在某些實施方式中,本文提供了包含含有細菌的藥劑的固體劑型。細菌可以是活細菌(例如,其粉末或生物質);非活(死)細菌(例如,其粉末或生物質);非複製型細菌(例如,其粉末或生物質);經γ輻照的細菌(例如,其粉末或其生物質);和/或凍乾細菌(例如,其粉末或生物質)。
在某些實施方式中,本文提供了包含含有mEV的藥劑的固體劑型。mEV可來自培養基(例如,培養上清液)。mEV可來自活細菌(例如,其粉末或生物質);mEV可來自非活(死)細菌(例如,其粉末或生物質);mEV可來自非複製型細菌(例如其粉末或生物質);mEV可來自經γ輻照的細菌(例如,其粉末或生物質);和/或mEV可來自凍乾細菌(例如,其粉末或生物質)。
在一些實施方式中,藥劑包含基本上或完全不含細菌(例如,整個細菌)、細菌(例如,活細菌、死(例如,被殺死的)細菌、非複製型細菌、減毒細菌)的mEV。在一些實施方式中,藥物組成物包含mEV及細菌(例如,整個細菌)(例如,活細菌、被殺死的細菌、減毒細菌)兩者。在一些實施方式中,藥劑包含來自本文列舉的細菌菌株或物種或分類學組中的一種或多種(例如,1、2、3、4、5、6、7、8、9、10或更多)的細菌和/或mEV。在一些實施方式中,藥劑包含來自本文列舉的細菌菌株或物種或分類學組中的一種的細菌和/或mEV。在一些實施方式中,藥劑包含來自本文描述的細菌菌株或物種中的一種的細菌和/或mEV,例如乳球菌屬、普雷沃菌屬、雙歧桿菌屬、韋榮氏球菌屬、Fournierella屬、Harryflintia屬、巨型球菌屬;
例如,乳酸乳球菌乳脂亞種棲組織普雷沃菌;動物雙歧桿菌乳酸亞種;小韋榮氏球菌; Fournierella massiliensis ; Harryflintia acetispora ;或巨型球菌屬物種。
在一些實施方式中,藥劑包含凍乾的棲組織普雷沃菌細菌。
在一些實施方式中,藥劑包含凍乾的細菌和/或mEV。在一些實施方式中,藥劑包含經γ輻照的細菌和/或mEV。mEV(如smEV和/或pmEV)可以在mEV被分離(例如製備)之後進行γ輻照。
在一些實施方式中,為定量樣本中存在的mEV(如smEV和/或pmEV)和/或細菌的數量,可使用電子顯微術(例如,超薄冷凍切片的EM)以觀測mEV(如smEV和/或pmEV)和/或細菌並計數它們的相對數量。可替代地,可使用奈米顆粒跟蹤分析(NTA)、庫爾特計數或動態光散射(DLS)或該等技術的組合。NTA及庫爾特計數器計數顆粒並顯示它們的大小。DLS給出顆粒的大小分佈,而非濃度。細菌通常具有1-2 µm的直徑。完整範圍係0.2-20 µm。來自庫爾特計數及NTA的組合結果可揭示給定樣本中的細菌和/或mEV(如smEV和/或pmEV)數量。庫爾特計數揭示具有0.7至10 um的直徑的顆粒的數量。對於大多數細菌和/或mEV(如smEV和/或pmEV)樣本,僅庫爾特計數器就可以顯示樣本中細菌和/或mEV(如smEV和/或pmEV)的數量。pmEV的直徑係20 nm-600 nm。對於NTA,可以從瑪律文泛分析公司(Malvern Pananlytical)獲得Nanosight儀器。例如,NS300可以觀測並測量大小在10-2000 nm範圍內的懸浮顆粒。NTA允許計數例如直徑為50-1000 nm的顆粒的數量。DLS揭示具有於1 nm - 3 µm的近似範圍內的不同直徑的顆粒的分佈。
mEV可以藉由本領域已知的分析方法(例如Jeppesen等人 Cell [細胞] 177:428 (2019))來表徵。
在一些實施方式中,可以基於顆粒計數來對細菌和/或mEV進行定量。例如,可以使用NTA測量細菌和/或mEV製劑的總顆粒計數。
在一些實施方式中,可以基於蛋白質、脂質或碳水化合物的量來定量細菌和/或mEV。例如,可以使用布拉德福測定法或BCA來測量細菌和/或製劑的總蛋白含量。
在一些實施方式中,從源細菌或細菌培養物的一種或多種其他細菌組分中分離出mEV。在一些實施方式中,從源細菌培養物的一種或多種其他細菌組分中分離出細菌。在一些實施方式中,藥劑進一步包含其他細菌組分。
在某些實施方式中,從源細菌獲得的mEV製劑可基於亞群的物理性質(例如,大小、密度、蛋白含量、結合親和力)被分級成亞群。然後可以將mEV亞群中的一個或多個併入到本文所述之藥劑中。
在某些方面,本文提供了包含藥劑(其包含細菌和/或mEV(例如smEV和/或pmEV))的固體劑型,可用於治療和/或預防疾病(例如,癌症、自體免疫性疾病、炎性疾病、代謝性疾病或生態失調);或治療和/或預防細菌性敗血症性休克、細胞介素風暴和/或病毒感染(例如冠狀病毒感染、流感感染和/或呼吸道合胞病毒感染);或降低炎性細胞介素表現(例如降低IL-8、IL-6、IL-1β和/或TNFα的表現水平),以及製造和/或鑒定此類細菌和/或mEV之方法,以及和單獨使用或與其他治療劑組合使用藥劑及其固體劑型之方法(例如,用於治療癌症、自體免疫性疾病、炎性疾病或代謝性疾病、生態失調、細菌性敗血症性休克、細胞介素風暴和/或病毒感染,或降低炎性細胞介素表現)。在一些實施方式中,藥劑包含mEV(如smEV和/或pmEV)及細菌(例如,整個細菌)(例如,活細菌、死(例如,被殺死的)細菌、非複製型細菌、減毒細菌)兩者。在一些實施方式中,藥劑包含在不存在mEV(如smEV和/或pmEV)的情況下的細菌。在一些實施方式中,藥劑包含在不存在細菌的情況下的mEV(如smEV和/或pmEV)。在一些實施方式中,藥劑包含來自表1、表2、表3和/或表4中列舉的細菌菌株或物種中的一種或多種的mEV(例如smEV和/或pmEV)和/或細菌。在一些實施方式中,藥物組成物包含來自本文列舉的細菌菌株或物種或分類學組中的一種的mEV(例如smEV和/或pmEV)和/或細菌。在一些實施方式中,藥劑包含來自本文描述的細菌菌株或物種中的一種的細菌和/或mEV,例如乳球菌屬、普雷沃菌屬、雙歧桿菌屬、韋榮氏球菌屬、Fournierella屬、Harryflintia屬、巨型球菌屬;
例如,乳酸乳球菌乳脂亞種棲組織普雷沃菌;動物雙歧桿菌乳酸亞種;小韋榮氏球菌; Fournierella massiliensis ; Harryflintia acetispora ;或巨型球菌屬物種。
在某些方面,提供了用於向受試者(例如人受試者)施用的藥劑。在一些實施方式中,藥劑與另外的活性和/或非活性材料組合以產生最終產品,其可呈單劑量單位或呈多劑量形式。在一些實施方式中,藥劑與佐劑如免疫佐劑(例如STING促効劑、TLR促効劑或NOD促効劑)組合。
在一些實施方式中,固體劑型包含至少一種碳水化合物。
在一些實施方式中,固體劑型包含至少一種脂質。在一些實施方式中,脂質包含至少一種選自以下的脂肪酸:月桂酸(12:0)、肉豆蔻酸(14:0)、棕櫚酸(16:0)、棕櫚油酸(16:1)、珍珠酸(17:0)、十七碳烯酸(17:1)、硬脂酸(18:0)、油酸(18:1)、亞油酸(18:2)、亞麻酸(18:3)、十八碳四烯酸(18:4)、花生酸(20:0)、二十碳烯酸(20:1)、二十碳二烯酸(20:2)、二十碳四烯酸(20:4)、二十碳五烯酸(20:5)(EPA)、二十二烷酸(22:0)、二十二碳烯酸(22:1)、二十二碳五烯酸(22:5)、二十二碳六烯酸(22:6)(DHA)及二十四烷酸(24:0)。
在一些實施方式中,固體劑型包含至少一種礦物質或礦物質源。礦物質的實例包括但不限於:氯化物、鈉、鈣、鐵、鉻、銅、碘、鋅、鎂、錳、鉬、磷、鉀及硒。任一前述礦物質的合適形式包括可溶性礦物質鹽、微溶性礦物質鹽、不溶性礦物質鹽、螯合礦物質、礦物質複合物、非反應性礦物質(例如羰基礦物質及經還原礦物質)及其組合。
在一些實施方式中,固體劑型包含至少一種維生素。至少一種維生素可為脂肪可溶性或水可溶性維生素。合適維生素包括但不限於維生素C、維生素A、維生素E、維生素B12、維生素K、核黃素、菸酸(niacin)、維生素D、維生素B6、葉酸、吡哆醇(pyridoxine)、硫胺素、泛酸及生物素。任一前述物質的合適形式係維生素鹽、維生素衍生物、與維生素具有相同或類似活性的化合物及維生素代謝物。
在一些實施方式中,固體劑型包含賦形劑。合適的賦形劑的非限制性實例包括稀釋劑、緩衝劑、防腐劑、穩定劑、黏合劑和/或黏結劑、壓實劑、潤滑劑和/或助流劑、分散增強劑、崩散劑、調味劑、甜味劑及著色劑。
可以包括在固體劑型中的合適的賦形劑可以是本領域已知的一種或多種藥學上可接受的賦形劑。例如,參見Rowe, Sheskey, 和Quinn編輯,
Handbook of Pharmaceutical Excipients[
藥物賦形劑手冊 ],第六版; 2009; Pharmaceutical Press and American Pharmacists Association [製藥出版社和美國藥劑師協會]。
固體劑型
本文所述之固體劑型可以是,例如片劑或微型片劑。此外,多個微型片劑可以處於(例如,裝入)膠囊中。
在一些實施方式中,固體劑型包含片劑(> 4 mm)(例如5 mm-17 mm)。例如,片劑係5 mm、5.5 mm、6 mm、6.5 mm、7 mm、7.5 mm、8 mm、8.5 mm、9 mm、9.5 mm、10 mm、11 mm、12 mm、13 mm、14 mm、15 mm、16 mm、17 mm或18 mm片劑。在一些實施方式中,片劑係13 mm、14 mm、15 mm、16 mm、17 mm或18 mm片劑。在一些實施方式中,片劑係17 mm片劑。如本領域中已知的,大小係指片劑的直徑。如本文所用,片劑的大小係指在應用腸溶衣之前的片劑的大小。
在一些實施方式中,固體劑型包含微型片劑。該微型片劑的大小範圍為1 mm-4 mm。例如,微型片劑可以是1 mm微型片劑、1.5 mm微型片劑、2 mm微型片劑、3 mm微型片劑或4 mm微型片劑。如本領域中已知的,大小係指微型片劑的直徑。如本文所用,微型片劑的大小係指在應用腸溶衣之前的微型片劑的大小。
微型片劑可以是在膠囊中。該膠囊可以是00號、0號、1號、2號、3號、4號或5號膠囊。含有微型片劑的膠囊可以包含HPMC(羥丙基甲基纖維素)或明膠。微型片劑可以放在膠囊內:膠囊內的微型片劑的數量將取決於膠囊的大小和微型片劑的大小。例如,0號膠囊可容納31-35(平均33)個微型片劑,該等微型片劑係3 mm微型片劑。在一些實施方式中,膠囊在裝入後封口。在一些實施方式中,將膠囊用基於HPMC的封口溶液封口。
包衣
本文所述之固體劑型(例如片劑或微型片劑)可以用例如一層腸溶衣或兩層腸溶衣(例如內部腸溶衣和外部腸溶衣)進行腸溶包衣。內層腸溶衣和外層腸溶衣不相同(例如,內層腸溶衣和外層腸溶衣不包含相同量的相同組分)。腸溶衣允許藥劑在例如小腸中(例如小腸上段,例如十二指腸和/或空腸)釋放。
藥劑在小腸中(例如小腸上段,例如十二指腸或空腸中)的釋放允許藥劑靶向並影響位於該等特定的位置處的細胞(例如上皮細胞和/或免疫細胞),例如,這可以在小腸中引起局部作用和/或引起系統性作用(例如,胃腸道外的作用)。
EUDRAGIT係各種各樣聚甲基丙烯酸酯基共聚物的品牌名稱。它包括基於甲基丙烯酸和甲基丙烯酸/丙烯酸酯或其衍生物的陰離子、陽離子和中性共聚物。
可用於腸溶衣(例如,一層腸溶衣或內層腸溶衣和/或外層腸溶衣)的其他材料的實例包括鄰苯二甲酸乙酸纖維素(CAP)、偏苯三酸乙酸纖維素(CAT)、聚(鄰苯二甲酸乙酸乙烯酯)(PVAP)、羥丙基甲基纖維素鄰苯二甲酸酯(HPMCP)、脂肪酸、蠟、蟲膠(紫膠桐酸的酯)、塑膠、植物纖維、玉米醇溶蛋白、AQUA-ZEIN®(不含醇的水性玉米醇溶蛋白配製物)、直鏈澱粉、澱粉衍生物、糊精、丙烯酸甲酯-甲基丙烯酸共聚物、乙酸琥珀酸纖維素、乙酸琥珀酸羥丙基甲基纖維素(乙酸琥珀酸羥丙甲纖維素)、甲基丙烯酸甲酯-甲基丙烯酸共聚物、和/或海藻酸鈉。
腸溶衣(例如,一層腸溶衣或內層腸溶衣和/或外層腸溶衣)可以包括甲基丙烯酸丙烯酸乙酯(MAE)共聚物(1:1)。
一層腸溶衣可以包括甲基丙烯酸丙烯酸乙酯(MAE)共聚物(1:1)(如Kollicoat MAE 100P)。
一層腸溶衣可以包括Eudragit共聚物,例如,Eudragit L(例如,Eudragit L 100-55;Eudragit L 30 D-55)、Eudragit S、Eudragit RL、Eudragit RS、Eudragit E、或Eudragit FS(例如,Eudragit FS 30 D)。
可以在腸溶衣(例如,一層腸溶衣或內層腸溶衣和/或外層腸溶衣)中使用的材料的其他實例包括在如下中描述的那些,例如U.S. 6312728;U.S. 6623759;U.S. 4775536;U.S. 5047258;U.S. 5292522;U.S. 6555124;U.S. 6638534;U.S. 2006/0210631;U.S. 2008/200482;U.S. 2005/0271778;U.S. 2004/0028737;WO 2005/044240。
還參見,例如,U.S. 9233074,其提供了可與本文提供的固體劑型一起使用的pH依賴性腸溶聚合物,包括甲基丙烯酸共聚物、鄰苯二甲酸聚乙酸乙烯酯、乙酸琥珀酸羥丙基甲基纖維素、羥丙基甲基纖維素鄰苯二甲酸酯和鄰苯二甲酸乙酸纖維素;合適的甲基丙烯酸共聚物包括:聚(甲基丙烯酸,甲基丙烯酸甲酯)1:1固體,例如以尤特奇L100商品名出售;聚(甲基丙烯酸,丙烯酸乙酯)1:1固體,例如以尤特奇L100-55商品名出售;部分中和的聚(甲基丙烯酸,丙烯酸乙酯)1:1固體,例如以Kollicoat MAE-100P商品名出售;以及聚(甲基丙烯酸,甲基丙烯酸甲酯)1:2固體,例如以尤特奇S100商品名出售。
在某些方面,本文描述的固體劑型(例如片劑或微型片劑)還包含底衣。在一些實施方式中,固體劑型例如除了腸溶衣之外還包含底層包衣,例如,底層包衣在腸溶衣下面(例如,在固體劑型和腸溶衣之間)。在一些實施方式中,底層包衣包含歐巴代(Opadry)QX,例如歐巴代QX藍(Opadry QX Blue)。粉衣層可以例如用於視覺上掩蓋治療劑的外觀。
劑量
藥劑的劑量(例如,對於人受試者)係按每膠囊或片劑計或按膠囊中使用的微型片劑的總數計的劑量。
在藉由總細胞計數(TCC)確定劑量的實施方式中,可以藉由Coulter計數器確定的總細胞計數。
在一些實施方式中,藥劑包含細菌並且細菌的劑量為約1 x 10
7至約2 x 10
12(例如,約3 x 10
10或約1.5 x 10
11或約1.5 x 10
12)細胞(例如,其中藉由Coulter計數器確定的總細胞計數來確定細胞數),其中劑量係按每膠囊或片劑計或按膠囊中的微型片劑的總數計。在一些實施方式中,藥劑包含細菌並且細菌的劑量為約1 x 10
10至約2 x 10
12(例如,約1.6 x 10
11或約8 x 10
11或約9.6 x 10
11約12.8 x 10
11或約1.6 x 10
12)細胞(例如,其中藉由Coulter計數器確定的總細胞計數來確定細胞數),其中劑量係按每膠囊或片劑計或按膠囊中的微型片劑的總數計。
在一些實施方式中,藥劑包含細菌並且細菌的劑量為約1 x 10
9、約3 x 10
9、約5 x 10
9、約1.5 x 10
10、約3 x 10
10、約5 x 10
10、約1.5 x 10
11、約1.5 x 10
12或約2 x 10
12細胞,其中劑量係按每膠囊或片劑計或按膠囊中的微型片劑的總數計。
在一些實施方式中,藥劑包含mEV並且mEV的劑量為約1 x 10
5至約7 x 10
13個顆粒(例如,其中藉由NTA(奈米顆粒跟蹤分析)確定顆粒計數),其中該劑量按每膠囊或片劑計或按膠囊中微型片劑的總數計。在一些實施方式中,藥劑包含mEV並且mEV的劑量為約1 x 10
10至約7 x 10
13個顆粒(例如,其中藉由NTA(奈米顆粒跟蹤分析)確定顆粒計數),其中該劑量按每膠囊或片劑計或按膠囊中微型片劑的總數計。
在其中藥劑包含mEV的一些實施方式中,mEV的劑量為約2 x 10
6至約2 x 10
16個顆粒(例如,其中藉由NTA(奈米顆粒跟蹤分析)確定顆粒計數),其中劑量按每膠囊或片劑計或按膠囊中的微型片劑的總數計。
在一些方面,本揭露提供了治療受試者(例如人)(例如需要治療的受試者)之方法,該方法包括向受試者施用本文提供的固體劑型。
在一些方面,本揭露提供了本文提供的固體劑型在製備用於治療受試者(例如人)(例如需要治療的受試者)的藥物中的用途。
在一些實施方式中,固體劑型經口服施用(例如用於口服施用)。
在一些實施方式中,固體劑型被施用(例如,用於施用)每天1、2、3或4次。在一些實施方式中,1、2、3、4或5個固體劑型(例如,片劑)被施用(例如,用於施用)每天1、2、3或4次。在一些實施方式中,2、4、6、8或10個固體劑型(例如,片劑)被施用(例如,用於施用)每天1、2、3或4次。在一些實施方式中,1個固體劑型(例如,片劑)被施用(例如,用於施用)每天1或2次。在一些實施方式中,2個固體劑型(例如,片劑)被施用(例如,用於施用)每天1或2次。在一些實施方式中,3個固體劑型(例如,片劑)被施用(例如,用於施用)每天1或2次。在一些實施方式中,4個固體劑型(例如,片劑)被施用(例如,用於施用)每天1或2次。在一些實施方式中,5個固體劑型(例如,片劑)被施用(例如,用於施用)每天1或2次。
在一些實施方式中,1個固體劑型(例如,片劑)被施用(例如,用於施用)每天1或2次,其中該固體劑型包含約3.2 × 10
11個細胞的細菌劑量。在一些實施方式中,2個固體劑型(例如,片劑)被施用(例如,用於施用)每天1或2次,其中該固體劑型包含約3.2 × 10
11個細胞的細菌劑量。在一些實施方式中,3個固體劑型(例如,片劑)被施用(例如,用於施用)每天1或2次,其中該固體劑型包含約3.2 × 10
11個細胞的細菌劑量。在一些實施方式中,4個固體劑型(例如,片劑)被施用(例如,用於施用)每天1或2次,其中該固體劑型包含約3.2 × 10
11個細胞的細菌劑量。在一些實施方式中,5個固體劑型(例如,片劑)被施用(例如,用於施用)每天1或2次,其中該固體劑型包含約3.2 × 10
11個細胞的細菌劑量。
在一些實施方式中,1個固體劑型(例如,片劑)被每天施用(例如,用於施用),其中該固體劑型包含約3.2 × 10
11個細胞的細菌劑量(例如,導致總共約3.2 x 10
11個細胞被施用)。在一些實施方式中,2個固體劑型(例如,片劑)被每天施用(例如,用於施用),其中該固體劑型包含約3.2 × 10
11個細胞的細菌劑量(例如,導致在2個片劑情況下總共約6.4 x 10
11個細胞被施用)。在一些實施方式中,3個固體劑型(例如,片劑)被每天施用(例如,用於施用),其中該固體劑型包含約3.2 × 10
11個細胞的細菌劑量(例如,導致在3個片劑情況下總共約9.6 x 10
11個細胞被施用)。在一些實施方式中,4個固體劑型(例如,片劑)被每天施用(例如,用於施用),其中該固體劑型包含約3.2 × 10
11個細胞的細菌劑量(例如,導致在4個片劑情況下總共約12.8 x 10
11個細胞被施用)。在一些實施方式中,5個固體劑型(例如,片劑)被每天施用(例如,用於施用),其中該固體劑型包含約3.2 × 10
11個細胞的細菌劑量(例如,導致在5個片劑情況下總共約16 x 10
11個細胞被施用)。
在一些實施方式中,藥劑劑量可以是按藥劑(例如,包含細菌和/或細菌來源的試劑(如mEV)的粉末)的重量確定的毫克(mg)劑量。藥劑的劑量按每膠囊或片劑計或按例如膠囊中的微型片劑的總數計。
例如,為了施用約400 mg的1x劑量的藥劑,每膠囊存在約200 mg的藥劑並且施用兩個膠囊,則產生約400 mg的劑量。這兩個膠囊可以例如每天1次或2次施用。
例如,對於微型片劑:每微型片劑可以包含約0.1至約3.5 mg(0.1、0.35、1.0、3.5 mg)的藥劑。微型片劑可以放在膠囊內:膠囊內的微型片劑的數量將取決於膠囊的大小和微型片劑的大小。例如,平均33(範圍為31-35)個3 mm微型片劑裝於0號膠囊內。例如,每微型片劑0.1- 3.5 mg的藥劑,劑量範圍將為每膠囊3.3 mg-115.5 mg(針對0號膠囊中33個微型片劑)(針對0號膠囊中31個微型片劑,為3.1 mg-108.5 mg)(針對0號膠囊中35個微型片劑,為3.5 mg- 122.5 mg)。可以施用多個膠囊和/或一個或多個更大的膠囊以增加施用的劑量和/或可以每天施用一次或多次以增加施用的劑量。
在一些實施方式中,劑量可以為按每膠囊或片劑計或按例如膠囊中的微型片劑的總數計的約3 mg至約125 mg的藥劑。
在一些實施方式中,劑量可以為約35 mg至約1200 mg(例如,約35 mg、約125 mg、約350 mg或約1200 mg)的藥劑。
在一些實施方式中,藥劑包括粉末,該粉末包含細菌和/或mEV,並且該藥劑(例如,包含細菌和/或mEV的粉末)的劑量為約10 mg至約1500 mg,其中該劑量按每膠囊或片劑計或按膠囊中微型片劑的總數計。
在一些實施方式中,藥劑的劑量可以是約30 mg至約3500 mg(約25、約50、約75、約100、約150、約250、約300、約350、約400、約500、約600、約750、約1000、約1250、約1300、約2000、約2500、約3000或約3500 mg)。
可以基於對模型生物(例如,小鼠)施用的劑量的異速比例(allometric scaling)來適當地計算人劑量。
在一些實施方式中,一個或兩個片劑膠囊可以一天施用一次或兩次。
在一些實施方式中,可以每天施用一個或兩個片劑。
在一些實施方式中,可以每天一次或兩次施用3、4或5個片劑。
在一些實施方式中,可以每天施用3、4或5個片劑。
在一些實施方式中,可以每天一次或兩次施用4個片劑。
在一些實施方式中,可以每天施用4個片劑。
藥劑包含細菌和/或細菌來源的試劑(如mEV),或包含含有細菌和/或細菌來源的試劑(如mEV)的粉末,並且還可以包含一種或多種另外的組分,如冷凍保護劑等。
在一些實施方式中,藥劑的mg(按重量計)劑量為按每膠囊或每片劑計或按例如膠囊中使用的微型片劑的總數計的例如約1 mg至約500 mg。
使用方法
例如,本文描述的固體劑型允許口服施用其中包含的藥劑。
本文描述的固體劑型可用於治療和/或預防癌症、炎症、自體免疫、代謝病症或生態失調。
本文描述的固體劑型可用於治療和/或預防細菌性敗血症性休克、細胞介素風暴和/或病毒感染(例如冠狀病毒感染、流感感染和/或呼吸道合胞病毒感染)。
本文描述的固體劑型可用於降低炎性細胞介素表現(例如降低IL-8、IL-6、IL-1β和/或TNFα表現水平)。
本文描述了使用包含藥劑(例如其治療有效量)的固體劑型(例如用於口服施用)(例如用於製藥用途)之方法,其中該藥劑包含細菌和/或微生物胞外囊泡(mEV),並且其中該固體劑型還包含揭露的賦形劑。
例如,本文描述之方法和施用的固體劑型允許口服施用其中包含的藥劑。固體劑型可施用給處於進食或禁食狀態的受試者。固體劑型可以例如空腹(例如,進食前一小時或進食後兩小時)施用。固體劑型可在進食前一小時施用。固體劑型可在進食後兩小時施用。
本文提供了用於治療和/或預防癌症、炎症、自體免疫、代謝病症或生態失調的固體劑型。
本文提供了用於治療和/或預防細菌性敗血症性休克、細胞介素風暴和/或病毒感染(例如冠狀病毒感染、流感感染和/或呼吸道合胞病毒感染)的固體劑型。
本文提供了用於降低炎性細胞介素表現(例如降低IL-8、IL-6、IL-1β和/或TNFα表現水平)的固體劑型。
本文提供了固體劑型在製備用於治療和/或預防癌症、炎症、自體免疫、代謝病症或生態失調的藥物中的用途。
本文提供了固體劑型用於製備用於治療和/或預防細菌性感染性休克、細胞介素風暴和/或病毒感染(例如冠狀病毒感染、流感感染和/或呼吸道合胞病毒感染)的藥物的用途。
本文提供了固體劑型用於製備用於治療和/或預防細菌性感染性休克、細胞介素風暴和/或病毒感染(例如冠狀病毒感染、流感感染和/或呼吸道合胞病毒感染)的藥物的用途。
製備固體劑型之方法
在某些方面,本文提供了製備藥物組成物的固體劑型之方法,該方法包括將藥劑(例如,本文公開的細菌和/或細菌來源的試劑,例如本文公開的mEV)和一種或多種(例如一種、兩種或三種)賦形劑組合成藥物組成物。在某些實施方式中,藥劑總質量係藥物組成物總質量的至少5%、10%、15%、20%、25%、30%、35%、40%、45%、50%、55%、60%、65%或70%。在一些實施方式中,藥劑總質量不超過藥物組成物總質量的70%、65%、60%、55%、50%、45%、40%、35%、30%或25%。在一些實施方式中,一種或多種賦形劑的總質量為藥物組成物總質量的至少5%、至少10%、至少20%、至少30%、至少35%、至少40%、至少45%或至少50%。在一些實施方式中,一種或多種賦形劑的總質量不超過藥物組成物總質量的90%、85%、80%、75%、70%、65%、60%或55%。
在一些實施方式中,一種或多種賦形劑包含矽化微晶纖維素。在一些實施方式中,一種或多種賦形劑包括交聚維酮(PVPP)。在某些實施方式中,本文提供的固體劑型包含矽化微晶纖維素。在一些實施方式中,矽化微晶纖維素為HD90級。在某些實施方式中,矽化微晶纖維素總質量為藥物組成物總質量的至少15%、16%、17%、18%、19%、20%、21%、22%、23%、24%、25%、26%、27%、28%、29%、30%、31%、32%、33%、34%、35%、36%、37%、38%、39%、40%、41%、42%、43%、44%、45%、46%、47%、48%、49%、50%、51%、52%、53%、54%、55%、56%、57%、58%、59%、60%、61%、62%、63%、64%、65%、66%、67%、68%、70%、71%、72%、73%、74%、75%、76%、77%、78%、79%、80%、81%、82%、83%、84%、85%、86%、87%、88%、89%或90%。在某些實施方式中,矽化微晶纖維素總質量不超過藥物組成物總質量的15%、16%、17%、18%、19%、20%、21%、22%、23%、24%、25%、26%、27%、28%、29%、30%、31%、32%、33%、34%、35%、36%、37%、38%、39%、40%、41%、42%、43%、44%、45%、46%、47%、48%、49%、50%、51%、52%、53%、54%、55%、56%、57%、58%、59%、60%、61%、62%、63%、64%、65%、66%、67%、68%、70%、71%、72%、73%、74%、75%、76%、77%、78%、79%、80%、81%、82%、83%、84%、85%、86%、87%、88%、89%或90%。在某些實施方式中,矽化微晶纖維素總質量為藥物組成物總質量的約15%、16%、17%、18%、19%、20%、21%、22%、23%、24%、25%、26%、27%、28%、29%、30%、31%、32%、33%、34%、35%、36%、37%、38%、39%、40%、41%或42%、43%、44%、45%、46%、47%、48%、49%、50%、51%、52%、53%、54%、55%、56%、57%、58%、59%、60%、61%、62%、63%、64%、65%、66%、67%、68%、70%、71%、72%、73%、74%、75%、76%、77%、78%、79%、80%、81%、82%、83%、84%、85%、86%、87%、88%、89%或90%。在某些實施方式中,本文提供的固體劑型包含交聚維酮。在某些實施方式中,交聚維酮總質量係藥物組成物總質量的至少5%、6%、7%、8%、9%、10%、11%、12%、13%、14%、15%、16%、17%、18%、19%、20%、21%、22%、23%、24%或25%。在某些實施方式中,交聚維酮總質量不超過藥物組成物總質量的5%、6%、7%、8%、9%、10%、11%、12%、13%、14%、15%、16%、17%、18%、19%、20%、21%、22%、23%、24%或25%。在某些實施方式中,交聚維酮總質量係藥物組成物總質量的約5%、6%、7%、8%、9%、10%、11%、12%、13%、14%、15%、16%、17%、18%、19%、20%、21%、22%、23%、24%或25%。
在某些實施方式中,本文提供的固體劑型包含:(i) 藥劑,藥劑總質量為藥物組成物總質量的至少5%且不超過70%,(ii) 矽化微晶纖維素,矽化微晶纖維素總質量為藥物組成物總質量的至少為15%(例如
,至少15%、16%、17%、18%、19%、20%、21%、22%、23%、24%、25%、26%、27%、28%、29%、30%、31%、32%、33%、34%、35%、36%、37%、38%、39%、40%、41%、42%、43%、44%、45%、46%、47%、48%、49%、50%、51%、52%、53%、54%、55%、56%、57%、58%、59%、60%、61%、62%、63%、64%、65%、66%、67%、68%、70%、71%、72%、73%、74%、75%、76%、77%、78%、79%、80%、81%、82%、83%、84%、85%、86%、87%、88%、89%或90%)且不超過90%(例如不超過30%、31%、32%、33%、34%、35%、36%、37%、38%、39%、40%、41%、42%,43%、44%、45%、46%、47%、48%、49%、50%、51%、52%、53%、54%、55%、56%、57%、58%、59%、60%、61%、62%、63%、64%、65%、66%、67%、68%、70%、71%、72%、73%、74%、75%、76%、77%、78%、79%、80%、81%、82%、83%、84%、85%、86%、87%、88%、89%或90%)。在某些實施方式中,固體劑型進一步包含交聚維酮,其具有的交聚維酮總質量係藥物組成物總質量的至少5%(例如,至少5%、6%、7%、8%、9%、10%、11%、12%、13%、14%、15%、16%、17%、18%、19%、20%、21%、22%、23%、24%、或25%)且不超過藥物組成物總質量的25%(例如,不超過5%、6%、7%、8%、9%、10%、11%、12%、13%、14%、15%、16%、17%、18%、19%、20%、21%、22%、23%、24%、或25%)。在某些實施方式中,矽化微晶纖維素總質量加上交聚維酮總質量為藥物組成物總質量的至少60%、70%、80%或90%。在一些實施方式中,固體劑型包含:矽化微晶纖維素總質量為藥物組成物總質量的約50%,交聚維酮總質量為藥物組成物總質量的約15%。在一些實施方式中,固體劑型包含:矽化微晶纖維素總質量為藥物組成物總質量的約76.4%,交聚維酮總質量為藥物組成物總質量的約15%。在一些實施方式中,固體劑型包含:矽化微晶纖維素總質量為藥物組成物總質量的約72.5%,交聚維酮總質量為藥物組成物總質量的約15%。在一些實施方式中,固體劑型包含:矽化微晶纖維素總質量為藥物組成物總質量的約20%,交聚維酮總質量為藥物組成物總質量的約15%。
在一些實施方式中,固體劑型包含一定量(例如,劑量)的活性成分(例如,細菌和細菌來源的試劑(例如,組分)(例如,微生物胞外囊泡或mEV))。在一些實施方式中,可以根據在藥劑的給定製劑(例如批次)中包含的活性成分的量來調節摻入固體劑型中的藥劑(包含活性成分)的量。在一些實施方式中,然後相應地調節稀釋劑(例如甘露醇)的量。在一些實施方式中,當藥劑的量增加時,稀釋劑的量減少;並且反之亦然。在一些實施方式中,可以對藥劑和稀釋劑的量進行調整,但一種或多種賦形劑(例如,一種、兩種或三種賦形劑)的量保持不變,例如,對於給定的固體劑型配方的批次之間。在一些實施方式中,硬脂酸鎂和膠體二氧化矽的量也可以保持恒定,例如,對於給定的固體劑型配方的批次之間。
在某些實施方式中,該方法進一步包括壓製藥物組成物,從而形成片劑或微型片劑。在一些實施方式中,該方法進一步包括對片劑或微型片劑進行腸溶包衣,從而製備經腸溶包衣的片劑。在某些實施方式中,該方法進一步包括將微型片劑裝載到膠囊中。
在某些實施方式中,該方法包括在將藥劑(例如,細菌(例如,本文揭露的細菌)和/或細菌來源的試劑,例如mEV(例如,本文揭露的mEV))(例如,藥劑可以是粉末,該粉末包含細菌和/或細菌來源的試劑,例如mEV)和一種或多種(例如,一種、兩種或三種)賦形劑組合成藥物組成物之前對藥劑進行濕法製粒。在一些實施方式中,濕法製粒包括將藥劑與製粒流體(例如,水、乙醇或異丙醇,單獨或組合)混合以製備混合組成物。在一些實施方式中,製粒流體包含水。在一些實施方式中,製粒流體由水組成。在一些實施方式中,濕法製粒還包括乾燥混合的組成物(例如,在流化床乾燥器上乾燥)以製備乾燥的組成物。在一些實施方式中,濕法製粒還包括研磨乾燥的組成物以製備經研磨的組成物。經研磨的組成物可以視需要與一種或多種(例如,一種、兩種或三種)賦形劑組合以製備藥物組成物。在一些實施方式中,藥劑的濕法製粒產生包含藥劑的顆粒(例如包含細菌和/或細菌來源的試劑(例如mEV)的粉末的藥物物質顆粒)。在一些實施方式中,顆粒進一步包含一種或多種賦形劑(例如,一種、兩種或三種)。在一些實施方式中,顆粒視需要與一種或多種(例如,一種、兩種或三種)賦形劑組合以製備藥物組成物(例如片劑、膠囊或固體劑型)。
在本文提供的一些實施方式中,顆粒包含60%-100%的藥劑(例如粉末,包含細菌和/或細菌來源的試劑,例如mEV)。在一些實施方式中,顆粒包含約60%、65%、70%、75%、80%、85%、90%、95%或100%的藥劑。在其他實施方式中,顆粒占藥物組成物總質量的35%-85%。在本文提供的一些實施方式中,顆粒占藥物組成物總質量的約40%、50%、55%、60%、70%、75%、80%或85%。
顆粒和濕法製粒
在一些方面,本文提供包含藥劑的顆粒,例如,其中藥劑包含細菌(例如,本文揭露的細菌)和/或細菌來源的試劑,例如mEV(例如,本文揭露的mEV)(例如,藥劑可以是。該粉末包含細菌和/或細菌來源的試劑,例如mEV)。顆粒包含藥劑的團聚(例如,比藥劑顆粒大(例如,比粉末的顆粒大)的顆粒)。顆粒的直徑比藥劑(例如,粉末,例如粉末顆粒)的直徑(例如,平均直徑)大於(例如,約1.5倍至超過4倍)。顆粒可以藉由濕法製粒產生。
例如,對於棲組織普雷沃菌菌株B smEV,濕法製粒後的顆粒直徑比DS粉末的直徑大約1.5倍至4倍以上:
棲組織普雷沃菌smEV | D 10(µm) | D 50(µm) | D 90(µm) |
HS DS顆粒 | 8.22 | 110 | 386 |
HS DS粉末 | 5.61 | 25.4 | 95.3 |
製粒係藉由團聚使顆粒增大的過程。製粒可以將細粉末轉化為易於壓縮的自由流動、無塵顆粒。在製粒過程中,小的細顆粒或粗顆粒被轉化為較大的團聚物,稱為顆粒體。參見例如Shanmugam, Bioimpacts[生物影響] 5:55-63 (2015)。濕法製粒涉及藉由將液體黏合劑(例如製粒流體)添加到粉末(例如,其包含藥劑,例如包含細菌(例如,本文揭露的細菌)和/或細菌來源的試劑,例如mEV(例如,本文揭露的mEV))來產生顆粒。
製粒,例如濕法製粒,可以允許將更高劑量的細菌(例如,本文揭露的細菌)和/或細菌來源的試劑,例如mEV(例如,本文揭露的mEV)配製成固體劑型(例如、片劑、迷你片劑或膠囊)。例如,藉由對包含mEV的粉末進行濕法製粒,0號膠囊中的mEV劑量增加了3倍。
在某些方面,本文提供了對藥劑例如進行濕法製粒之方法,例如,其中藥劑包含細菌(例如,本文揭露的細菌)和/或細菌來源的試劑,例如mEV(例如,本文揭露的mEV)(例如,藥劑可以是。該粉末包含細菌和/或細菌來源的試劑,例如mEV)。
在一些實施方式中,濕法製粒包括將藥劑與製粒流體(例如,水、乙醇或異丙醇,單獨或組合)混合以製備混合組成物。在一些實施方式中,製粒流體包含水。在一些實施方式中,製粒流體由水組成。在一些實施方式中,濕法製粒包括乾燥混合的組成物(例如,在流化床乾燥器上乾燥)以製備乾燥的組成物。在一些實施方式中,濕法製粒包括研磨乾燥的組成物以製備經研磨的組成物。然後經研磨的組成物可以視需要與一種或多種(例如,一種、兩種或三種)賦形劑組合以製備藥物組成物。濕法製粒方法可以生產顆粒。
在一些實施方式中,濕法製粒包括 (i) 將藥劑與製粒流體(例如,水、乙醇或異丙醇,單獨或組合)混合以製備混合組成物和 (ii) 乾燥混合的組成物(例如,在流化床乾燥器上乾燥)以製備乾燥的組成物。
在一些實施方式中,濕法製粒包括 (i) 將藥劑與製粒流體(例如,水、乙醇或異丙醇,單獨或組合)混合以製備混合組成物;(ii) 乾燥混合的組成物(例如,在流化床乾燥器上乾燥)以製備乾燥的組成物;以及 (iii) 研磨乾燥的組成物以製備經研磨的組成物。
在一些實施方式中,濕法製粒包括 (i) 將藥劑與製粒流體(例如,水、乙醇或異丙醇,單獨或組合)混合以製備混合組成物;(ii) 乾燥混合的組成物(例如,在流化床乾燥器上乾燥)以製備乾燥的組成物;(iii) 研磨乾燥的組成物以製備經研磨的組成物;以及 (iv) 將研磨的組成物與一種或多種(例如,一種、兩種或三種)賦形劑組合成藥物組成物。
在一些實施方式中,本文提供的是藉由濕法製粒生產的顆粒。
在一些方面,本文提供的是混合組成物,例如,其包含藥劑和製粒流體(例如水、乙醇或異丙醇,單獨或組合)。
在某些方面,本文提供乾燥的組成物,例如,其包含已乾燥的混合組成物。
在某些方面,本文提供研磨的組成物,例如,其包含已研磨的乾燥組成物。
固體劑型的另外方面
例如,如本文描述的包含藥劑(例如,其治療有效量)的固體劑型(其中藥劑包含細菌和/或微生物胞外囊泡(mEV),並且其中固體劑型還包含所描述的賦形劑)可以向受試者例如人提供治療有效量的藥劑。
例如,如本文描述的包含藥劑(例如,其治療有效量)的固體劑型(其中藥劑包含細菌和/或微生物胞外囊泡(mEV),並且其中固體劑型還包含所描述的賦形劑)可以向受試者例如人提供非天然量的治療有效組分(例如,存在於藥劑中)。
例如,如本文描述的包含藥劑(例如,其治療有效量)的固體劑型(其中藥劑包含細菌和/或微生物胞外囊泡(mEV),並且其中固體劑型還包含所描述的賦形劑)可以向受試者例如人提供非天然數量的治療有效組分(例如,存在於藥劑中)。
例如,如本文描述的包含藥劑(例如,其治療有效量)的固體劑型(其中藥劑包含細菌和/或微生物胞外囊泡(mEV),並且其中固體劑型還包含所描述的賦形劑)可以給受試者例如人帶來一個或多個變化,例如治療或預防疾病或健康失調。
例如,如本文描述的包含藥劑(例如,其治療有效量)的固體劑型(其中藥劑包含細菌和/或微生物胞外囊泡(mEV),並且其中固體劑型還包含所描述的賦形劑)具有潛在的重大效用,例如影響受試者(例如人),例如治療或預防疾病或健康失調。
如本文所述,固體劑型例如的崩散測試以每分鐘30次扣籃的速率進行,例如使用DT50無浴崩散儀(SOTAX集團(SOTAX Group))。
另外的治療劑
在某些方面,本文提供之方法包括向受試者單獨地或與另外的治療劑組合地施用本文描述的固體劑型。在一些實施方式中,另外的治療劑係免疫抑制劑、抗炎劑、類固醇和/或癌症治療劑。
在一些實施方式中,在施用另外的治療劑之前(例如之前至少1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23或24小時或之前至少1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29或30天)向受試者施用固體劑型。在一些實施方式中,在施用另外的治療劑之後(例如之後至少1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23或24小時或之後至少1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29或30天)向受試者施用固體劑型。在一些實施方式中,同時或接近同時(例如,彼此在一小時內施用)向受試者施用固體劑型及另外的治療劑。
在一些實施方式中,在向受試者施用固體劑型之前(例如之前至少1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23或24小時或之前至少1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29或30天)向受試者施用抗生素。在一些實施方式中,在向受試者施用固體劑型之後(例如之前至少1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23或24小時或之後至少1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29或30天)向受試者施用抗生素。在一些實施方式中,向受試者同時或接近同時施用(例如,彼此在一小時內施用)固體劑型及抗生素。
在一些實施方式中,另外的治療劑係癌症治療劑。在一些實施方式中,癌症治療劑係化學治療劑。該等化學治療劑的實例包含(但不限於)烷基化劑,例如噻替哌(thiotepa)及環磷醯胺(cyclosphosphamide);磺酸烷基酯,例如白消安(busulfan)、英丙舒凡(improsulfan)及哌泊舒凡(piposulfan);氮丙啶,例如苯并多巴(benzodopa)、卡波醌(carboquone)、米得哌(meturedopa)及烏得哌(uredopa);乙撐亞胺及甲基密胺,包含六甲密胺(altretamine)、三乙撐密胺(triethylenemelamine)、三乙撐磷醯胺、三乙撐硫化磷醯胺及三羥甲基密胺(trimethylolomelamine);番荔枝內酯(acetogenin)(尤其布拉他辛(bullatacin)及布拉他辛酮(bullatacinone));喜樹鹼(camptothecin)(包含合成類似物托泊替康(topotecan));苔蘚蟲素(bryostatin);卡利抑制素(callystatin);CC-1065(包含其合成類似物阿多來新(adozelesin)、卡折來新(carzelesin)及比折來新(bizelesin));念珠藻素(cryptophycin)(尤其念珠藻素1及念珠藻素8);朵拉司他汀(dolastatin);多卡米星(duocarmycin)(包含合成類似物KW-2189及CB1-TM1);艾榴塞洛素(eleutherobin);水鬼蕉鹼(pancratistatin);匍枝珊瑚醇(sarcodictyin);海綿抑制素(spongistatin);氮芥(nitrogen mustard),例如苯丁酸氮芥(chlorambucil)、萘氮芥(chlornaphazine)、氯磷醯胺(cholophosphamide)、雌氮芥(estramustine)、異環磷醯胺(ifosfamide)、氮芥(mechlorethamine)、鹽酸甲氧氮芥、美法侖(melphalan)、新氮芥(novembichin)、苯乙酸氮芥膽甾醇酯(phenesterine)、潑尼莫司汀(prednimustine)、曲磷胺(trofosfmaide)、尿嘧啶氮芥;亞硝基脲,例如卡莫司汀(carmustine)、氯脲菌素(chlorozotocin)、福莫司汀(fotemustine)、洛莫司汀(lomustine)、尼莫司汀(nimustine)及雷莫司汀(ranimnustine);抗生素,例如烯二炔抗生素(例如卡奇黴素(calicheamicin),尤其卡奇黴素γlI及卡奇黴素Ωl1;達內黴素(dynemicin),包含達內黴素A;雙膦酸鹽類,例如氯膦酸鹽(clodronate);埃斯培拉黴素(esperamicin);以及新製癌菌素發色團(neocarzinostatin chromophore)及相關色蛋白烯二炔抗生素發色團)、阿克拉黴素(aclacinomysin)、放線菌素(actinomycin)、安麯黴素(authramycin)、氮雜絲胺酸、博來黴素(bleomycin)、放線菌素C(cactinomycin)、卡拉黴素(carabicin)、洋紅黴素(caminomycin)、嗜癌素(carzinophilin)、色黴素(chromomycin)、放線菌素D(dactinomycin)、柔紅黴素(daunorubicin)、地托比星(detorubicin)、6-重氮基-5-側氧基-L-正白胺酸、多柔比星(doxorubicin)(包含𠰌啉基-多柔比星、氰𠰌啉基-多柔比星、2-吡咯啉基-多柔比星及去氧多柔比星)、表柔比星(epirubicin)、依索比星(esorubicin)、伊達比星(idarubicin)、麻西羅黴素(marcellomycin)、絲裂黴素(mitomycin)(例如絲裂黴素C)、黴酚酸(mycophenolic acid)、諾拉黴素(nogalamycin)、橄欖黴素(olivomycin)、培洛黴素(peplomycin)、泊非黴素(potfiromycin)、嘌呤黴素(puromycin)、三鐵阿黴素(quelamycin)、羅多比星(rodorubicin)、鏈黑菌素(streptonigrin)、鏈脲菌素(streptozocin)、殺結核菌素(tubercidin)、烏苯美司(ubenimex)、淨司他丁(zinostatin)、佐柔比星(zorubicin);抗代謝物,例如胺甲喋呤和5-氟尿嘧啶(5-FU);葉酸類似物,例如二甲葉酸(denopterin)、胺甲喋呤、蝶羅呤(pteropterin)、曲美沙特(trimetrexate);嘌呤類似物,例如氟達拉濱(fludarabine)、6-巰基嘌呤、硫咪嘌呤(thiamiprine)、硫鳥嘌呤;嘧啶類似物,例如安西他濱(ancitabine)、阿紮胞苷(azacitidine)、6-阿紮尿苷(6-azauridine)、卡莫氟(carmofur)、阿糖胞苷(cytarabine)、二去氧尿苷、去氧氟尿苷(doxifluridine)、依諾他濱(enocitabine)、氟尿苷(floxuridine);雄激素,例如卡普睪酮(calusterone)、丙酸屈他雄酮(dromostanolone propionate)、環硫雄醇(epitiostanol)、美雄烷(mepitiostane)、睪內酯酮(testolactone);抗腎上腺素,例如胺魯米特(aminoglutethimide)、米托坦(mitotane)、曲洛司坦(trilostane);葉酸補充劑,例如亞葉酸;乙醯葡醛酸內酯(aceglatone);醛磷醯胺糖苷(aldophosphamide glycoside);胺基乙醯丙酸(aminolevulinic acid);恩尿嘧啶(eniluracil);安吖啶(amsacrine);百思布希(bestrabucil);比生群(bisantrene);依達曲沙(edatraxate);地磷醯胺(defofamine);秋水仙胺(demecolcine);地吖醌(diaziquone);依氟鳥胺酸(eflornithine);依利乙銨(elliptinium acetate);埃博黴素(epothilone);依託格魯(etoglucid);硝酸鎵;羥基脲;蘑菇多糖(lentinan);氯尼達明(lonidainine);類美坦辛(maytansinoid),例如美坦辛(maytansine)及柄型菌素(ansamitocin);米托胍腙(mitoguazone);米托蒽醌(mitoxantrone);莫哌達醇(mopidanmol);尼群克林(nitraerine);噴托他汀(pentostatin);蛋胺氮芥(phenamet);吡柔比星(pirarubicin);洛索蒽醌(losoxantrone);鬼臼酸(podophyllinic acid);2-乙基醯肼;丙卡巴肼(procarbazine);PSK多糖複合物);雷佐生(razoxane);根黴素(rhizoxin);西佐喃(sizofuran);鍺螺胺(spirogermanium);細交鏈孢菌酮酸(tenuazonic acid);三亞胺醌(triaziquone);2,2',2''-三氯三乙胺;單端孢黴烯(trichothecene)(尤其T-2毒素、疣皰菌素(verrucarin)A、桿孢菌素(roridin)A及蛇形菌素(anguidine));烏拉坦(urethan);長春地辛(vindesine);達卡巴𠯤(dacarbazine);甘露莫司汀(mannomustine);二溴甘露醇(mitobronitol);二溴衛矛醇(mitolactol);哌泊溴烷(pipobroman);噶薩托辛(gacytosine);阿拉伯糖苷(arabinoside)(「Ara-C」);環磷醯胺;噻替派;紫杉烷(taxoid),例如,太平洋紫杉醇(paclitaxel)及多西紫杉醇(doxetaxel);苯丁酸氮芥;吉西他濱(gemcitabine);6-硫鳥嘌呤;巰基嘌呤;胺甲喋呤;鉑配位錯合物,例如順鉑(cisplatin)、奧沙利鉑(oxaliplatin)及卡鉑(carboplatin);長春花鹼(vinblastine);鉑;依託泊苷(etoposide)(VP-16);異環磷醯胺;米托蒽醌(mitoxantrone);長春新鹼(vincristine);長春瑞濱(vinorelbine);諾安托(novantrone);替尼泊苷(teniposide);依達曲沙;道諾黴素(daunomycin);胺蝶呤(aminopterin);希羅達(xeloda);伊班膦酸鹽(ibandronate);伊立替康(irinotecan)(例如,CPT-11);拓撲異構酶抑制劑RFS 2000;二氟甲基鳥胺酸(DMFO);類視黃醇,例如視黃酸;卡培他濱(capecitabine);以及上述任何一種的藥學上可接受的鹽、酸或衍生物。
在一些實施方式中,癌症治療劑係癌症免疫療法藥劑。免疫療法係指使用受試者的免疫系統來治療癌症的治療,例如,檢查點抑制劑、癌症疫苗、細胞介素、細胞療法、CAR-T細胞及樹突細胞療法。檢查點抑制劑免疫療法的非限制性實例包含尼沃魯單抗(Nivolumab)(BMS,抗PD-1)、派姆單抗(Pembrolizumab)(Merck,抗PD-1)、伊匹單抗(Ipilimumab)(BMS,抗CTLA-4)、MEDI4736(阿斯利康公司(AstraZeneca),抗PD-L1)及MPDL3280A(羅氏公司(Roche),抗PD-L1)。其他免疫療法可為腫瘤疫苗,例如Gardail、Cervarix、BCG、西普賽爾-T(sipulencel-T)、Gp100:209-217、AGS-003、DCVax-L、阿爾土賽爾-L(Algenpantucel-L)、特爾土賽爾-L(Tergenpantucel-L)、TG4010、ProstAtak、Prostvac-V/R-TRICOM、林多莫爾(Rindopepimul)、E75乙酸肽、IMA901、POL-103A、貝拉土賽爾-L(Belagenpumatucel-L)、GSK1572932A、MDX-1279、GV1001及替西泰德(Tecemotide)。免疫療法藥劑可經由注射(例如經靜脈內、經腫瘤內、經皮下或注射至淋巴結中)來施用,但還可經口、經局部或經由氣溶膠來施用。免疫療法可包括佐劑(例如細胞介素)。
在一些實施方式中,免疫療法藥劑係免疫檢查點抑制劑。免疫檢查點抑制在廣義上係指抑制癌細胞可產生的檢查點以預防或下調免疫應答。免疫檢查點蛋白的實例包括但不限於CTLA4、PD-1、PD-L1、PD-L2、A2AR、B7-H3、B7-H4、BTLA、KIR、LAG3、TIM-3或VISTA。免疫檢查點抑制劑可為結合至並抑制免疫檢查點蛋白的抗體或其抗原結合片段。免疫檢查點抑制劑的實例包括但不限於尼沃魯單抗、派姆單抗、匹利珠單抗(pidilizumab)、AMP-224、AMP-514、STI-A1110、TSR-042、RG-7446、BMS-936559、MEDI-4736、MSB-0020718C、AUR-012及STI-A1010。
在一些實施方式中,本文提供之方法包括施用本文描述的藥物組成物與一種或多種另外的治療劑的組合。在一些實施方式中,本文揭露之方法包括施用兩種免疫療法藥劑(例如,免疫檢查點抑制劑)。例如,本文提供之方法包括將本文所述之藥物組成物與PD-1抑制劑(例如派姆單抗或尼沃魯單抗或匹利珠單抗)或CLTA-4抑制劑(例如伊匹單抗)或PD-L1抑制劑組合施用。
在一些實施方式中,免疫療法藥劑係(例如)結合至癌症相關抗原的抗體或其抗原結合片段。癌症相關抗原的實例包括但不限於親脂素(adipophilin)、AIM-2、ALDH1A1、α-輔肌動蛋白-4、α-胎蛋白(「AFP」)、ARTC1、B-RAF、BAGE-1、BCLX(L)、BCR-ABL融合蛋白b3a2、β-鏈蛋白、BING-4、CA-125、CALCA、癌胚抗原(「CEA」)、CASP-5、CASP-8、CD274、CD45、Cdc27、CDK12、CDK4、CDKN2A、CEA、CLPP、COA-1、CPSF、CSNK1A1、CTAG1、CTAG2、週期蛋白D1、週期蛋白-A1、dek-can融合蛋白、DKK1、EFTUD2、延長因子2、ENAH(hMena)、Ep-CAM、EpCAM、EphA3、上皮腫瘤抗原(「ETA」)、ETV6-AML1融合蛋白、EZH2、FGF5、FLT3-ITD、FN1、G250/MN/CAIX、GAGE-1,2,8、GAGE-3,4,5,6,7、GAS7、磷脂醯肌醇蛋白聚糖-3、GnTV、gp100/Pmel17、GPNMB、HAUS3、海普森(Hepsin)、HER-2/neu、HERV-K-MEL、HLA-A11、HLA-A2、HLA-DOB、hsp70-2、IDO1、IGF2B3、IL13Rα2、腸羧基酯酶、K-ras、激肽釋放素4、KIF20A、KK-LC-1、KKLC1、KM-HN-1、KMHN1(又稱為CCDC110)、LAGE-1、LDLR-岩藻糖基轉移酶AS融合蛋白、萊格西因(Lengsin)、M-CSF、MAGE-A1、MAGE-A10、MAGE-A12、MAGE-A2、MAGE-A3、MAGE-A4、MAGE-A6、MAGE-A9、MAGE-C1、MAGE-C2、蘋果酸酶、乳腺珠蛋白-A、MART2、MATN、MC1R、MCSP、mdm-2、ME1、Melan-A/MART-1、Meloe、中期因子、MMP-2、MMP-7、MUC1、MUC5AC、黏蛋白、MUM-1、MUM-2、MUM-3、肌凝蛋白、I類肌凝蛋白、N-raw、NA88-A、新-PAP、NFYC、NY-BR-1、NY-ESO-1/LAGE-2、OA1、OGT、OS-9、P多肽、p53、PAP、PAX5、PBF、pml-RARα融合蛋白、多態上皮黏蛋白(「PEM」)、PPP1R3B、PRAME、PRDX5、PSA、PSMA、PTPRK、RAB38/NY-MEL-1、RAGE-1、RBAF600、RGS5、RhoC、RNF43、RU2AS、SAGE、分離蛋白1、SIRT2、SNRPD1、SOX10、Sp17、SPA17、SSX-2、SSX-4、STEAP1、存活蛋白、SYT-SSX1或-SSX2融合蛋白、TAG-1、TAG-2、端粒酶、TGF-βRII、TPBG、TRAG-3、磷酸丙糖異構酶、TRP-1/gp75、TRP-2、TRP2-INT2、酪胺酸酶、酪胺酸酶(「TYR」)、VEGF、WT1、XAGE-1b/GAGED2a。在一些實施方式中,抗原係新抗原。
在一些實施方式中,免疫療法藥劑係癌症疫苗和/或癌症疫苗的組分(例如,抗原性肽和/或蛋白質)。癌症疫苗可為蛋白質疫苗、核酸疫苗或其組合。例如,在一些實施方式中,癌症疫苗包括含有癌症相關抗原的表位的多肽。在一些實施方式中,癌症疫苗包括編碼癌症相關抗原的表位的核酸(例如,DNA或RNA(例如mRNA))。癌症相關抗原的實例包括但不限於親脂素(adipophilin)、AIM-2、ALDH1A1、α-輔肌動蛋白-4、α-胎蛋白(「AFP」)、ARTC1、B-RAF、BAGE-1、BCLX(L)、BCR-ABL融合蛋白b3a2、β-鏈蛋白、BING-4、CA-125、CALCA、癌胚抗原(「CEA」)、CASP-5、CASP-8、CD274、CD45、Cdc27、CDK12、CDK4、CDKN2A、CEA、CLPP、COA-1、CPSF、CSNK1A1、CTAG1、CTAG2、週期蛋白D1、週期蛋白-A1、dek-can融合蛋白、DKK1、EFTUD2、延長因子2、ENAH(hMena)、Ep-CAM、EpCAM、EphA3、上皮腫瘤抗原(「ETA」)、ETV6-AML1融合蛋白、EZH2、FGF5、FLT3-ITD、FN1、G250/MN/CAIX、GAGE-1,2,8、GAGE-3,4,5,6,7、GAS7、磷脂醯肌醇蛋白聚糖-3、GnTV、gp100/Pmel17、GPNMB、HAUS3、海普森(Hepsin)、HER-2/neu、HERV-K-MEL、HLA-A11、HLA-A2、HLA-DOB、hsp70-2、IDO1、IGF2B3、IL13Rα2、腸羧基酯酶、K-ras、激肽釋放素4、KIF20A、KK-LC-1、KKLC1、KM-HN-1、KMHN1(又稱為CCDC110)、LAGE-1、LDLR-岩藻糖基轉移酶AS融合蛋白、萊格西因(Lengsin)、M-CSF、MAGE-A1、MAGE-A10、MAGE-A12、MAGE-A2、MAGE-A3、MAGE-A4、MAGE-A6、MAGE-A9、MAGE-C1、MAGE-C2、蘋果酸酶、乳腺珠蛋白-A、MART2、MATN、MC1R、MCSP、mdm-2、ME1、Melan-A/MART-1、Meloe、中期因子、MMP-2、MMP-7、MUC1、MUC5AC、黏蛋白、MUM-1、MUM-2、MUM-3、肌凝蛋白、I類肌凝蛋白、N-raw、NA88-A、新-PAP、NFYC、NY-BR-1、NY-ESO-1/LAGE-2、OA1、OGT、OS-9、P多肽、p53、PAP、PAX5、PBF、pml-RARα融合蛋白、多態上皮黏蛋白(「PEM」)、PPP1R3B、PRAME、PRDX5、PSA、PSMA、PTPRK、RAB38/NY-MEL-1、RAGE-1、RBAF600、RGS5、RhoC、RNF43、RU2AS、SAGE、分離蛋白1、SIRT2、SNRPD1、SOX10、Sp17、SPA17、SSX-2、SSX-4、STEAP1、存活蛋白、SYT-SSX1或-SSX2融合蛋白、TAG-1、TAG-2、端粒酶、TGF-βRII、TPBG、TRAG-3、磷酸丙糖異構酶、TRP-1/gp75、TRP-2、TRP2-INT2、酪胺酸酶、酪胺酸酶(「TYR」)、VEGF、WT1、XAGE-1b/GAGED2a。在一些實施方式中,抗原係新抗原。在一些實施方式中,將癌症疫苗與佐劑一起施用。佐劑的實例包括但不限於免疫調節蛋白、佐劑65、α-GalCer、磷酸鋁、氫氧化鋁、磷酸鈣、β-葡聚糖肽、CpG ODN DNA、GPI-0100、脂質A、脂多糖、利波夫(Lipovant)、蒙塔尼(Montanide)、N-乙醯基-胞壁醯基-L-丙胺醯基-D-異麩醯胺酸、Pam3CSK4、quil A、霍亂毒素(CT)及來自腸毒性大腸桿菌(
Escherichia coli)的不耐熱毒素(LT),包括這類的衍生物(CTB、mmCT、CTA1-DD、LTB、LTK63、LTR72、dmLT)及海藻糖二黴菌酸酯。
在一些實施方式中,免疫療法藥劑係用於受試者的免疫調節蛋白。在一些實施方式中,該免疫調節蛋白係細胞介素或趨化因子。免疫調節蛋白的實例包括但不限於B淋巴細胞化學引誘物(「BLC」)、C-C模體趨化因子11(「嗜酸性粒細胞趨化因子(Eotaxin)-1」)、嗜酸性粒細胞趨化蛋白2(「嗜酸性粒細胞趨化因子-2」)、粒細胞群落刺激因子(「G-CSF」)、粒細胞巨噬細胞群落刺激因子(「GM-CSF」)、1-309、細胞間黏附分子1(「ICAM-1」)、干擾素α(「IFN-α」)、干擾素β(「IFN-β」)、干擾素γ(「IFN-γ」)、白細胞介素-1α(「IL-1α」)、白細胞介素-1β(「IL-1β」)、白細胞介素1受體拮抗劑(「IL-1 ra」)、白細胞介素-2(「IL-2」)、白細胞介素-4(「IL-4」)、白細胞介素-5(「IL-5」)、白細胞介素-6(「IL-6」)、白細胞介素-6可溶性受體(「IL-6 sR」)、白細胞介素-7(「IL-7」)、白細胞介素-8(「IL-8」)、白細胞介素-10(「IL-10」)、白細胞介素-11(「IL-11」)、白細胞介素-12的亞基β(「IL-12 p40」或「IL-12 p70」)、白細胞介素-13(「IL-13」)、白細胞介素-15(「IL-15」)、白細胞介素-16(「IL-16」)、白細胞介素17A-F(「IL-17A-F」)、白細胞介素-18(「IL-18」)、白細胞介素-21(「IL-21」)、白細胞介素-22(「IL-22」)、白細胞介素-23(「IL-23」)、白細胞介素-33(「IL-33」)、趨化因子(C-C模體)配位基2(「MCP-1」)、巨噬細胞群落刺激因子(「M-CSF」)、由γ干擾素誘導的單核因子(「MIG」)、趨化因子(C-C模體)配位基2(「MIP-1α」)、趨化因子(C-C模體)配位基4(「MIP-1β」)、巨噬細胞炎症蛋白- 1 -δ(「MIP-1δ」)、血小板源生長因子亞基B(「PDGF-BB」)、趨化因子(C-C模體)配位基5、調控活化正常T細胞表現及分泌蛋白(「RANTES」)、TIMP金屬肽酶抑制劑1(「TIMP-1」)、TIMP金屬肽酶抑制劑2(「TIMP-2」)、腫瘤壞死因子、淋巴毒素-α(「TNFα」)、腫瘤壞死因子、淋巴毒素-β(「TNFβ」)、1型可溶性TNF受體(「sTNFRI」)、sTNFRIIAR、腦源神經營養因子(「BDNF」)、鹼性成纖維細胞生長因子(「bFGF」)、骨成形性蛋白4(「BMP-4」)、骨成形性蛋白5(「BMP-5」)、骨成形性蛋白7(「BMP-7」)、神經生長因子(「b-NGF」)、表皮生長因子(「EGF」)、表皮生長因子受體(「EGFR」)、內分泌腺源血管內皮生長因子(「EG-VEGF」)、成纖維細胞生長因子4(「FGF-4」)、角質細胞生長因子(「FGF-7」)、生長分化因子15(「GDF-15」)、神經膠細胞源神經營養因子(「GDNF」)、生長激素、結合肝素的EGF樣生長因子(「HB-EGF」)、肝細胞生長因子(「HGF」)、胰島素樣生長因子結合蛋白1(「IGFBP-1」)、胰島素樣生長因子結合蛋白2(「IGFBP-2」)、胰島素樣生長因子結合蛋白3(「IGFBP-3」)、胰島素樣生長因子結合蛋白4(「IGFBP-4」)、胰島素樣生長因子結合蛋白6(「IGFBP-6」)、胰島素樣生長因子1(「IGF-1」)、胰島素、巨噬細胞群落刺激因子(「M-CSF R」)、神經生長因子受體(「NGF R」)、神經營養因子-3(「NT-3」)、神經營養因子-4(「NT-4」)、破骨細胞發生抑制因子(「護骨素(Osteoprotegerin)」)、血小板源生長因子受體(「PDGF-AA」)、磷脂醯肌醇-聚糖生物合成蛋白(「PIGF」)、Skp、Cullin、含有F-盒的複合物(「SCF」)、幹細胞介素受體(「SCF R」)、轉形生長因子α(「TGFα」)、轉形生長因子β-1(「TGFβ 1」)、轉形生長因子β-3(「TGFβ 3」)、血管內皮生長因子(「VEGF」)、血管內皮生長因子受體2(「VEGFR2」)、血管內皮生長因子受體3(「VEGFR3」)、VEGF-D 6Ckine、酪胺酸蛋白激酶受體UFO(「Axl」)、β細胞素(Betacellulin)(「BTC」)、黏膜相關上皮趨化因子(「CCL28」)、趨化因子(C-C模體)配位基27(「CTACK」)、趨化因子(C-X-C模體)配位基16(「CXCL16」)、C-X-C模體趨化因子5(「ENA-78」)、趨化因子(C-C模體)配位基26(「嗜酸性粒細胞趨化因子-3」)、粒細胞趨化蛋白2(「GCP-2」)、GRO、趨化因子(C-C模體)配位基14(「HCC-l」)、趨化因子(C-C模體)配位基16(「HCC-4」)、白細胞介素-9(「IL-9」)、白細胞介素-17 F(「IL-17F」)、白細胞介素- 18結合蛋白(「IL-18 BPa」)、白細胞介素-28 A(「IL-28A」)、白細胞介素29(「IL-29」)、白細胞介素31(「IL-31」)、C-X-C模體趨化因子10(「IP-10」)、趨化因子受體CXCR3(「I-TAC」)、白血病抑制因子(「LIF」)、Light、趨化因子(C模體)配位基(「淋巴細胞趨化因子(Lymphotactin)」)、單核細胞化學吸引蛋白2(「MCP-2」)、單核細胞化學吸引蛋白3(「MCP-3」)、單核細胞化學吸引蛋白4(「MCP-4」)、巨噬細胞源趨化因子(「MDC」)、巨噬細胞遷移抑制因子(「MIF」)、趨化因子(C-C模體)配位基20(「MIP-3α」)、C-C模體趨化因子19(「MIP-3β」)、趨化因子(C-C模體)配位基23(「MPIF-1」)、巨噬細胞刺激蛋白α鏈(「MSPα」)、核小體組裝蛋白1樣4(「NAP-2」)、分泌磷蛋白1(「骨橋蛋白(Osteopontin)」)、肺及活化調控細胞介素(「PARC」)、血小板因子4(「PF4」)、基質細胞源因子- 1α(「SDF-1α」)、趨化因子(C-C模體)配位基17(「TARC」)、胸腺表現的趨化因子(「TECK」)、胸腺基質淋巴生成素(「TSLP 4- IBB」)、CD 166抗原(「ALCAM」)、分化簇80(「B7-1」)、腫瘤壞死因子受體超家族成員17(「BCMA」)、分化簇14(「CD14」)、分化簇30(「CD30」)、分化簇40(「CD40配位基」)、癌胚抗原相關細胞黏附分子1(膽管糖蛋白)(「CEACAM-1」)、死亡受體6(「DR6」)、去氧胸苷激酶(「Dtk」)、1型膜糖蛋白(「內皮糖蛋白(Endoglin)」)、受體酪胺酸蛋白激酶erbB-3(「ErbB3」)、內皮-白血球黏附分子1(「E-選擇素(Selectin)」)、細胞凋亡抗原1(「Fas」)、Fms樣酪胺酸激酶3(「Flt-3L」)、腫瘤壞死因子受體超家族成員1(「GITR」)、腫瘤壞死因子受體超家族成員14(「HVEM」)、細胞間黏附分子3(「ICAM-3」)、IL-1 R4、IL-1 RI、IL-10 Rβ、IL-17R、IL-2Rγ、IL-21R、溶酶體膜蛋白2(「LIMPII」)、中性粒細胞明膠酶相關脂質運載蛋白(「脂質運載蛋白-2」)、CD62L(「L-選擇素」)、淋巴內皮(「LYVE-1」)、I類MHC多肽相關序列A(「MICA」)、I類MHC多肽相關序列B(「MICB」)、NRGl-βl、β-型血小板源生長因子受體(「PDGF Rβ」)、血小板內皮細胞黏附分子(「PECAM-1」)、RAGE、A型肝炎病毒細胞受體1(「TIM-1」)、腫瘤壞死因子受體超家族成員IOC(「TRAIL R3」)、特拉平(Trappin)蛋白轉麩醯胺酸酶結合結構域(「特拉平-2」)、尿激酶受體(「uPAR」)、血管細胞黏附蛋白1(「VCAM-1」)、XEDAR活化素A、野鼠色相關蛋白(「AgRP」)、核糖核酸酶5(「血管生成素(Angiogenin)」)、血管生成素(Angiopoietin)1、血管抑素(Angiostatin)、卡層析因(Catheprin)S、CD40、隱藏家族蛋白IB(「Cripto-1」)、DAN、Dickkopf相關蛋白1(「DKK-1」)、E-鈣黏蛋白、上皮細胞黏附分子(「EpCAM」)、Fas配位基(FasL或CD95L)、Fcg RIIB/C、卵泡抑素、半乳糖凝集素-7、細胞間黏附分子2(「ICAM-2」)、IL-13 Rl、IL-13R2、IL-17B、IL-2 Ra、IL-2 Rb、IL-23、LAP、神經元細胞黏附分子(「NrCAM」)、纖維蛋白溶酶原活化抑制劑- 1(「PAI-1」)、血小板源生長因子受體(「PDGF-AB」)、抵抗素(Resistin)、基質細胞源因子1(「SDF-1β」)、sgpl30、分泌型捲曲相關蛋白2(「ShhN」)、唾液酸結合免疫球蛋白型凝集素(「Siglec-5」)、ST2、轉形生長因子-β2(「TGFβ 2」)、Tie-2、血小板生成素(「TPO」)、腫瘤壞死因子受體超家族成員10D(「TRAIL R4」)、表現於骨髓性細胞上的觸發受體1(「TREM-1」)、血管內皮生長因子C(「VEGF-C」)、VEGFRl脂聯素、脂素(Adipsin)(「AND」)、α-胎蛋白(「AFP」)、血管生成素樣4(「ANGPTL4」)、β-2-微球蛋白(「B2M」)、基底細胞黏附分子(「BCAM」)、碳水化合物抗原125(「CA125」)、癌症抗原15-3(「CA15-3」)、癌胚抗原(「CEA」)、cAMP受體蛋白(「CRP」)、人表皮生長因子受體2(「ErbB2」)、濾泡抑素、濾泡刺激素(「FSH」)、趨化因子(C-X-C模體)配位基1(「GROα」)、人絨毛膜促性腺激素(「βHCG」)、胰島素樣生長因子1受體(「IGF-1 sR」)、IL-1 sRII、IL-3、IL-18 Rb、IL-21、瘦素(Leptin)、基質金屬蛋白酶-1(「MMP-1」)、基質金屬蛋白酶-2(「MMP-2」)、基質金屬蛋白酶-3(「MMP-3」)、基質金屬蛋白酶-8(「MMP-8」)、基質金屬蛋白酶-9(「MMP-9」)、基質金屬蛋白酶-10(「MMP-10」)、基質金屬蛋白酶-13(「MMP-13」)、神經細胞黏附分子(「NCAM-1」)、巢蛋白(Entactin)(「巢蛋白(Nidogen)-1」)、神經元特異性烯醇酶(「NSE」)、抑瘤素(Oncostatin) M(「OSM」)、原降鈣素(Procalcitonin)、泌乳素(Prolactin)、前列腺特異性抗原(「PSA」)、結合唾液酸的Ig樣凝集素9(「Siglec-9」)、ADAM 17內肽酶(「TACE」)、甲狀腺球蛋白(Thyroglobulin)、金屬蛋白酶抑制劑4(「TIMP-4」)、TSH2B4、含有去整合素(Disintegrin)及金屬蛋白酶結構域的蛋白質9(「ADAM-9」)、血管生成素2、腫瘤壞死因子配位基超家族成員13/富酸性白胺酸核磷蛋白32家族成員B(「APRIL」)、骨成形性蛋白2(「BMP-2」)、骨成形性蛋白9(「BMP-9」)、補體組分5a(「C5a」)、細胞自溶酶L、CD200、CD97、趨化素(Chemerin)、腫瘤壞死因子受體超家族成員6B(「DcR3」)、脂肪酸結合蛋白2(「FABP2」)、成纖維細胞活化蛋白、α(「FAP」)、成纖維細胞生長因子19(「FGF-19」)、半乳糖凝集素-3、肝細胞生長因子受體(「HGF R」)、IFN-γα/β R2、胰島素樣生長因子2(「IGF-2」)、胰島素樣生長因子2受體(「IGF-2 R」)、白細胞介素-1受體6(「IL-1R6」)、白細胞介素24(「IL-24」)、白細胞介素33(「IL-33」)、激肽釋放素(Kallikrein) 14、天門冬醯胺醯基內肽酶(「天門冬醯胺內肽酶(Legumain)」)、氧化型低密度脂蛋白受體1(「LOX-1」)、甘露糖結合凝集素(「MBL」)、腦啡肽酶(Neprilysin)(「NEP」)、Notch同系物1、易位相關(果蠅(Drosophila))(「Notch-1」)、腎胚細胞瘤過度表現的蛋白(「NOV」)、骨活化素(Osteoactivin)、計劃性細胞死亡蛋白1(「PD-1」)、N-乙醯基胞壁醯基-L-丙胺酸醯胺酶(「PGRP-5」)、絲胺酸蛋白酶抑制劑(Serpin) A4、分泌型捲曲相關蛋白3(「sFRP-3」)、血栓調節蛋白(Thrombomodulin)、Toll樣受體2(「TLR2」)、腫瘤壞死因子受體超家族成員10A(「TRAIL Rl」)、運鐵蛋白(「TRF」)、WIF-lACE-2、白蛋白、AMICA、血管生成素4、B細胞活化因子(「BAFF」)、碳水化合物抗原19-9(「CA19-9」)、CD 163、叢生蛋白(Clusterin)、CRT AM、趨化因子(C-X-C模體)配位基14(「CXCL14」)、胱抑素(Cystatin)C、核心蛋白聚糖(Decorin)(「DCN」)、Dickkopf相關蛋白3(「Dkk-3」)、δ樣蛋白質1(「DLL1」)、胎球蛋白(Fetuin)A、肝素結合生長因子1(「aFGF」)、葉酸受體α(「FOLR1」)、弗林蛋白酶(Furin)、GPCR相關分選蛋白1(「GASP-1」)、GPCR相關分選蛋白2(「GASP-2」)、粒細胞群落刺激因子受體(「GCSF R」)、絲胺酸蛋白酶海普森(「HAI-2」)、白細胞介素-17B受體(「IL-17B R」)、白細胞介素27(「IL-27」)、淋巴細胞活化基因3(「LAG-3」)、缺脂脂蛋白A-V(「LDL R」)、胃蛋白酶原I、視黃醇結合蛋白4(「RBP4」)、SOST、類肝素硫酸蛋白聚糖(「共結合蛋白聚糖-1(Syndecan-1)」)、腫瘤壞死因子受體超家族成員13B(「TACI」)、組織因子通路抑制劑(「TFPI」)、TSP-1、腫瘤壞死因子受體超家族成員10b(「TRAIL R2」)、TRANCE、肌鈣蛋白I(Troponin I)、尿激酶纖維蛋白溶酶原活化劑(「uPA」)、鈣黏蛋白5、2型或VE-鈣黏蛋白(血管內皮)(還稱為CD144,「VE-鈣黏蛋白」)、WNTl可誘導型信號傳導通路蛋白1(「WISP-1」)及核因子κ B的受體活化劑(「RANK」)。
在一些實施方式中,癌症治療劑係抗癌症化合物。示例性抗癌症化合物包括但不限於阿侖單抗(Campath®)、阿利維A酸(Panretin®)、阿那曲唑(Arimidex®)、貝伐單抗(Avastin®)、貝沙羅汀(Targretin®)、硼替佐米(Velcade®)、博舒替尼(Bosulif®)、本妥昔單抗(Adcetris®)、卡巴坦尼(Cometriq™)、卡菲佐米(Kyprolis™)、西妥昔單抗(Erbitux®)、克裡唑蒂尼(Xalkori®)、達沙替尼(Sprycel®)、地尼介白素(Ontak®)、鹽酸埃羅替尼(Tarceva®)、依維莫司(Afinitor®)、依西美坦(Aromasin®)、氟維司群(Faslodex®)、吉非替尼(Iressa®)、替坦異貝莫單抗(Zevalin®)、甲磺酸伊馬替尼(Gleevec®)、伊匹單抗(Yervoy™)、二對甲苯磺酸拉帕替尼(Tykerb®)、來曲唑(Femara®)、尼洛替尼(Tasigna®)、奧法木單抗(Arzerra®)、帕尼單抗(Vectibix®)、鹽酸帕唑帕尼(Votrient®)、帕妥珠單抗(Perjeta™)、普拉曲沙(Folotyn®)、瑞戈非尼(Stivarga®)、利妥昔單抗(Rituxan®)、羅米地辛(Istodax®)、甲苯磺酸索拉非尼(Nexavar®)、蘋果酸舒尼替尼(Sutent®)、他莫昔芬、西羅莫司(Torisel®)、托瑞米芬(Fareston®)、托西莫單抗及131I-托西莫單抗(Bexxar®)、曲妥珠單抗(Herceptin®)、維甲酸(Vesanoid®)、凡德他尼(Caprelsa®)、威羅菲尼(Zelboraf®)、伏立諾他(Zolinza®)及阿柏西普(Zaltrap®)。
修飾調節基因表現及其他細胞功能的蛋白質的功能的示例性抗癌症化合物(例如,HDAC抑制劑,類視黃醇受體配位基)係伏立諾他(Zolinza®)、貝沙羅汀(Targretin®)及羅米地辛(Istodax®)、阿利維A酸(Panretin®)及維甲酸(Vesanoid®)。
誘導細胞凋亡的示例性抗癌症化合物(例如,蛋白酶體抑制劑,葉酸拮抗劑)係硼替佐米(Velcade®)、卡菲佐米(Kyprolis™)及普拉曲沙(Folotyn®)。
增加抗腫瘤免疫應答的示例性抗癌化合物(例如抗CD20、抗CD52;抗細胞毒性T淋巴細胞相關抗原-4)為利妥昔單抗(Rituxan®)、阿侖單抗(Campath®)、奧法木單抗(Arzerra®)及伊匹單抗(Yervoy™)。
將毒劑遞送至癌細胞的示例性抗癌症化合物(例如,抗CD20-放射性核素融合物;IL-2-白喉毒素融合物;抗CD30-單甲基澳瑞他汀E(MMAE)-融合物)係托西莫單抗及131I-托西莫單抗(Bexxar®)及替坦異貝莫單抗(Zevalin®)、地尼介白素(Ontak®)及本妥昔單抗(Adcetris®)。
其他示例性抗癌症化合物係小分子抑制劑及其結合物,例如,Janus激酶、ALK、Bcl-2、PARP、PI3K、VEGF受體、Braf、MEK、CDK及HSP90。
示例性基於鉑的抗癌症化合物包括(例如)順鉑、卡鉑、奧沙利鉑、賽特鉑、吡鉑、奈達鉑、三鉑(Triplatin)及脂鉑(Lipoplatin)。適用於治療的其他基於金屬的藥物包括但不限於基於釕的化合物、二茂鐵衍生物、基於鈦的化合物及基於鎵的化合物。
在一些實施方式中,癌症治療劑係包括放射性核素的放射性部分。示例性放射性核素包括但不限於Cr-51、Cs-131、Ce-134、Se-75、Ru-97、I-125、Eu-149、Os-189m、Sb-119、I-123、Ho-161、Sb-117、Ce-139、In-111、Rh-103m、Ga-67、Tl-201、Pd-103、Au-195、Hg-197、Sr-87m、Pt-191、P-33、Er-169、Ru-103、Yb-169、Au-199、Sn-121、Tm-167、Yb-175、In-113m、Sn-113、Lu-177、Rh-105、Sn-117m、Cu-67、Sc-47、Pt-195m、Ce-141、I-131、Tb-161、As-77、Pt-197、Sm-153、Gd-159、Tm-173、Pr-143、Au-198、Tm-170、Re-186、Ag-111、Pd-109、Ga-73、Dy-165、Pm-149、Sn-123、Sr-89、Ho-166、P-32、Re-188、Pr-142、Ir-194、In-114m/In-114及Y-90。
在一些實施方式中,額外治療劑係抗生素。例如,如果檢測疾病相關細菌和/或疾病相關微生物組特徵存在,則可施用抗生素例如以從受試者消除疾病相關細菌。在一些實施方式中,癌症治療劑係抗生素。例如,如果根據本文提供之方法來檢測癌症相關細菌和/或癌症相關微生物組特徵的存在,則可施用抗生素以從受試者消除癌症相關細菌。「抗生素」在廣義上係指能夠抑制或預防細菌感染的化合物。抗生素可以諸多方式(包含根據其用於特定感染的用途、其作用機制、其生物可用性或其靶微生物範圍(例如革蘭氏陰性細菌對革蘭氏陽性細菌、好氧細菌對厭氧細菌等))進行分類且可使用該等方式來殺死宿主的特定區域(「生態位」)中的特定細菌(Leekha等人, 2011.General Principles of Antimicrobial Therapy[抗微生物療法的一般原則].Mayo Clin Proc.[梅歐醫院院刊] 86(2): 156-167)。在某些實施方式中,可使用抗生素來選擇性靶向特定生態位的細菌。在一些實施方式中,可使用已知治療包括疾病(例如癌症)生態位的特定感染的抗生素來靶向疾病相關微生物(包括該生態位中的疾病相關細菌)。在其他實施方式中,在固體劑型之後施用抗生素。在一些實施方式中,在固體劑型之前施用抗生素。
在一些方面,可基於殺細菌或細菌抑制性質來選擇抗生素。殺細菌抗生素包含破壞細胞壁(例如β-內醯胺)、細胞膜(例如達托黴素(daptomycin))或細菌DNA(例如氟喹諾酮(fluoroquinolone))的作用機制。細菌抑制劑抑制細菌複製且包含磺醯胺、四環素(tetracycline)及巨環內酯並藉由抑制蛋白質合成來發揮作用。另外,儘管一些藥物可在某些生物體中具有殺細菌性且在其他生物體中具有細菌抑制性,但知曉靶生物體使得熟悉該項技術者可選擇具有適當性質的抗生素。在某些治療條件中,細菌抑制抗生素抑制殺細菌抗生素的活性。因此,在某些實施方式中,並不組合殺細菌抗生素及細菌抑制抗生素。
抗生素包括但不限於胺基糖苷、安莎黴素(ansamycin)、碳頭孢烯(carbacephem)、碳青黴烯(carbapenem)、頭孢菌素(cephalosporin)、糖肽、林可醯胺(lincosamide)、脂肽、巨環內酯、單醯胺菌素(monobactam)、硝基呋喃、㗁唑烷酮、青黴素(penicillin)、多肽抗生素、喹諾酮(quinolone)、氟喹諾酮、磺醯胺、四環素及抗分枝桿菌化合物及其組合。
胺基糖苷包括但不限於阿米卡星(Amikacin)、建它黴素(Gentamicin)、康黴素(Kanamycin)、新黴素(Neomycin)、奈替米星(Netilmicin)、妥布黴素(Tobramycin)、巴龍黴素(Paromomycin)及大觀黴素(Spectinomycin)。胺基糖苷可有效抵抗例如革蘭氏陰性細菌(例如大腸桿菌、克雷伯氏菌屬、銅綠假單胞菌(
Pseudomonas aeruginosa)及土倫病法蘭西斯氏菌(
Francisella tularensis))且抵抗某些需氧細菌,但對於專性/兼性厭氧菌具有較小有效性。據信,胺基糖苷結合至細菌30S或50S核糖體亞基,由此抑制細菌蛋白合成。
安莎黴素包括但不限於格爾德黴素(Geldanamycin)、除莠黴素(Herbimycin)、利福黴素(Rifamycin)及曲張鏈菌素(Streptovaricin)。據信,格爾德黴素及除莠黴素抑制或改變熱休克蛋白90的功能。
碳頭孢烯包括但不限於氯碳頭孢(Loracarbef)。據信,碳頭孢烯抑制細菌細胞壁合成。
碳青黴烯包括但不限於厄他培南(Ertapenem)、多尼培南(Doripenem)、亞胺培南(Imipenem)/西司他丁(Cilastatin)及美羅培南(Meropenem)。碳青黴烯作為寬譜抗生素對革蘭氏陽性細菌及革蘭氏陰性細菌均具有殺細菌性。據信,碳青黴烯抑制細菌細胞壁合成。
頭孢菌素包括但不限於頭孢羥胺苄(Cefadroxil)、頭孢唑啉(Cefazolin)、頭孢噻吩(Cefalotin)、頭孢金素(Cefalothin)、頭孢胺苄(Cefalexin)、頭孢克洛(Cefaclor)、頭孢孟多(Cefamandole)、頭孢西丁(Cefoxitin)、頭孢丙烯(Cefprozil)、頭孢呋辛(Cefuroxime)、頭孢克肟(Cefixime)、頭孢地尼(Cefdinir)、頭孢托侖(Cefditoren)、頭孢哌酮(Cefoperazone)、頭孢噻肟(Cefotaxime)、頭孢泊肟(Cefpodoxime)、頭孢他啶(Ceftazidime)、頭孢布烯(Ceftibuten)、頭孢唑肟(Ceftizoxime)、頭孢曲松(Ceftriaxone)、頭孢吡肟(Cefepime)、頭孢他洛林酯(Ceftaroline fosamil)及頭孢比普(Ceftobiprole)。所選頭孢菌素可效抵抗(例如)革蘭氏陰性細菌及革蘭氏陽性細菌(包含假單胞菌(
Pseudomonas)),某些頭孢菌素可有效抵抗甲氧西林(methicillin)抗性金黃色葡萄球菌(
Staphylococcus aureus)(MRSA)。據信,頭孢菌素藉由破壞細菌細胞壁的肽聚糖層的合成來抑制細菌細胞壁合成。
糖肽包括但不限於替考拉寧(Teicoplanin)、萬古黴素(Vancomycin)及特拉萬星(Telavancin)。糖肽可有效抵抗(例如)好氧及厭氧革蘭氏陽性細菌(包含MRSA及艱難梭菌(
Clostridium difficile))。據信,糖肽藉由破壞細菌細胞壁的肽聚糖層的合成來抑制細菌細胞壁合成。
林可醯胺包括但不限於克林達黴素(Clindamycin)及林可黴素(Lincomycin)。林可醯胺可有效抵抗(例如)厭氧細菌以及葡萄球菌屬(
Staphylococcus)及鏈球菌屬(
Streptococcus)。據信,林可醯胺結合至細菌50S核糖體亞基,由此抑制細菌蛋白合成。
脂肽包括但不限於達托黴素。脂肽可有效抵抗(例如)革蘭氏陽性細菌。據信,脂肽結合至細菌膜並引起快速去極化。
巨環內酯包括但不限於阿奇黴素(Azithromycin)、克拉黴素(Clarithromycin)、地紅黴素(Dirithromycin)、紅黴素(Erythromycin)、羅紅黴素(Roxithromycin)、醋竹桃黴素(Troleandomycin)、泰利黴素(Telithromycin)及螺旋黴素(Spiramycin)。巨環內酯可有效抵抗例如鏈球菌屬及支原體屬(
Mycoplasma)。據信,巨環內酯結合至細菌或50S核糖體亞基,由此抑制細菌蛋白合成。
單醯胺菌素包括但不限於胺曲南(Aztreonam)。單醯胺菌素可有效抵抗例如革蘭氏陰性細菌。據信,單醯胺菌素藉由破壞細菌細胞壁的肽聚糖層的合成來抑制細菌細胞壁合成。
硝基呋喃包括但不限於呋喃唑酮(Furazolidone)及呋喃妥因(Nitrofurantoin)。
㗁唑烷酮包括但不限於利奈唑胺(Linezolid)、潑斯唑來(Posizolid)、雷得唑來(Radezolid)及特地唑胺(Torezolid)。據信,㗁唑烷酮係蛋白質合成抑制劑。
青黴素包括但不限於阿莫西林(Amoxicillin)、安比西林(Ampicillin)、阿洛西林(Azlocillin)、羧苄青黴素(Carbenicillin)、氯噻青黴素(Cloxacillin)、二氯噻青黴素(Dicloxacillin)、氟氯西林(Flucloxacillin)、美洛西林(Mezlocillin)、甲氧西林、萘夫西林(Nafcillin)、苯唑西林(Oxacillin)、青黴素G、青黴素V、哌拉西林(Piperacillin)、替莫西林(Temocillin)及替凱西林(Ticarcillin)。青黴素可有效抵抗例如革蘭氏陽性細菌、兼性厭氧菌(例如鏈球菌屬、包柔氏螺旋體屬(
Borrelia)及密螺旋體屬(
Treponema))。據信,青黴素藉由破壞細菌細胞壁的肽聚糖層的合成來抑制細菌細胞壁合成。
青黴素組合包括但不限於阿莫西林/克拉維酸鹽(clavulanate)、安比西林/舒巴坦(sulbactam)、哌拉西林/三唑巴坦(tazobactam)及替凱西林/克拉維酸鹽。
多肽抗生素包括但不限於桿菌肽(Bacitracin)、黏菌素(Colistin)及多黏菌素(Polymyxin)B及E。多肽抗生素可有效抵抗例如革蘭氏陰性細菌。據信,某些多肽抗生素抑制涉及細菌細胞壁的肽聚糖層的合成的焦磷酸異戊二烯基酯,而其他多肽抗生素藉由置換細菌相對離子來去穩定細菌外膜。
喹諾酮及氟喹諾酮包括但不限於環丙沙星(Ciprofloxacin)、依諾沙星(Enoxacin)、加替沙星(Gatifloxacin)、吉米沙星(Gemifloxacin)、左氧氟沙星(Levofloxacin)、洛美沙星(Lomefloxacin)、莫西沙星(Moxifloxacin)、萘啶酮酸(Nalidixic acid)、諾氟沙星(Norfloxacin)、氧氟沙星(Ofloxacin)、曲伐沙星(Trovafloxacin)、格帕沙星(Grepafloxacin)、司帕沙星(Sparfloxacin)及替馬沙星(Temafloxacin)。喹諾酮/氟喹諾酮可有效抵抗(例如)鏈球菌及奈瑟菌(
Neisseria)。據信,喹諾酮/氟喹諾酮抑制細菌DNA旋轉酶或拓撲異構酶IV,由此抑制DNA複製及轉錄。
磺醯胺包括但不限於磺胺米隆(Mafenide)、磺胺醋醯(Sulfacetamide)、磺胺嘧啶(Sulfadiazine)、磺胺嘧啶銀、磺胺地索辛(Sulfadimethoxine)、磺胺甲噻二唑(Sulfamethizole)、磺胺甲㗁唑(Sulfamethoxazole)、磺胺亞胺基(Sulfanilimide)、柳氮磺胺吡啶(Sulfasalazine)、磺胺異㗁唑(Sulfisoxazole)、甲氧苄啶-磺胺甲㗁唑(Trimethoprim-Sulfamethoxazole)(複方磺胺甲㗁唑(Co-trimoxazole))及磺醯胺基柯衣汀(Sulfonamidochrysoidine)。據信,磺醯胺藉由競爭性抑制二氫蝶酸合成酶來抑制葉酸合成,由此抑制核酸合成。
四環素類包括但不限於地美環素(Demeclocycline)、強力黴素(Doxycycline)、米諾環素(Minocycline)、土黴素(Oxytetracycline)及四環素。四環素可有效抵抗例如革蘭氏陰性細菌。據信,四環素結合至細菌30S核糖體亞基,由此抑制細菌蛋白合成。
抗分枝桿菌化合物包括但不限於氯法齊明(Clofazimine)、胺苯碸(Dapsone)、卷麯黴素(Capreomycin)、環絲胺酸(Cycloserine)、乙胺丁醇(Ethambutol)、乙硫異菸醯胺(Ethionamide)、異菸酸肼(Isoniazid)、吡𠯤醯胺(Pyrazinamide)、利福平(Rifampicin)、利福布汀(Rifabutin)、利福噴丁(Rifapentine)及鏈黴素(Streptomycin)。
合適的抗生素還包含胂凡納明(arsphenamine)、氯黴素(chloramphenicol)、磷黴素(fosfomycin)、夫西地酸(fusidic acid)、甲硝唑(metronidazole)、莫匹羅星(mupirocin)、平板黴素(platensimycin)、奎奴普汀(quinupristin)/達福普汀(dalfopristin)、替吉環素(tigecycline)、替硝唑(tinidazole)、甲氧苄啶-阿莫西林(trimethoprim amoxicillin)/克拉維酸鹽、安比西林/舒巴坦、安福黴素-利托菌素(amphomycin ristocetin)、阿奇黴素、桿菌肽、卜福林(buforin)II、卡波黴素(carbomycin)、殺菌肽(cecropin)Pl、克拉黴素、紅黴素、呋喃唑酮、夫西地酸、夫西地鈉、短桿菌素(gramicidin)、亞胺培南、吲哚菌素(indolicidin)、交沙黴素(josamycin)、馬蓋納尼(magainan)II、甲硝唑(metronidazole)、硝基咪唑、米卡黴素(mikamycin)、變鏈素(mutacin)B-Ny266、變鏈素B-JHl 140、變鏈素J-T8、乳鏈球菌素(nisin)、乳鏈球菌素A、新生黴素(novobiocin)、竹桃黴素(oleandomycin)、奧斯立星(ostreogrycin)、哌拉西林/三唑巴坦、普那黴素(pristinamycin)、雷莫拉寧(ramoplanin)、牛蛙皮膚抗菌肽(ranalexin)、羅伊氏素(reuterin)、利福昔明(rifaximin)、薔薇黴素(rosamicin)、羅沙米星(rosaramicin)、大觀黴素、螺旋黴素、葡萄黴素(staphylomycin)、鏈黴殺陽素(streptogramin)、鏈黴殺陽素A、協同菌素(synergistin)、牛磺羅定(taurolidine)、替考拉寧、泰利黴素、替凱西林/克拉維酸(clavulanic acid)、三乙醯基竹桃黴素(triacetyloleandomycin)、泰洛星(tylosin)、短桿菌酪肽(tyrocidin)、短桿菌素(tyrothricin)、萬古黴素、維馬黴素(vemamycin)及維吉黴素(virginiamycin)。
在一些實施方式中,另外的治療劑係免疫抑制劑、DMARD、止痛藥、類固醇、非類固醇抗炎藥(NSAID)或細胞介素拮抗劑,及其組合。代表性藥劑包括但不限於環孢素、類視黃醇、皮質類固醇、丙酸衍生物、乙酸衍生物、烯醇酸衍生物、芬那酸衍生物、Cox-2抑制劑、魯美昔布(lumiracoxib)、伊布洛芬(ibuprophen)、水楊酸膽鹼鎂(cholin magnesium salicylate)、非諾洛芬(fenoprofen)、雙水楊酯(salsalate)、二氟苯水楊酸(difunisal)、托美汀(tolmetin)、酮洛芬(ketoprofen)、氟比洛芬(flurbiprofen)、奧沙普秦(oxaprozin)、吲哚美辛(indomethacin)、舒林酸(sulindac)、依託度酸(etodolac)、酮咯酸(ketorolac)、萘丁美酮(nabumetone)、萘普生(naproxen)、伐地考昔(valdecoxib)、依託考昔(etoricoxib)、MK0966;羅非昔布(rofecoxib)、對乙醯胺基酚(acetominophen)、塞來昔布(Celecoxib)、雙氯芬酸(Diclofenac)、曲馬多(tramadol)、吡羅昔康(piroxicam)、美洛昔康(meloxicam)、替諾昔康(tenoxicam)、屈昔康(droxicam)、氯諾昔康(lornoxicam)、伊索昔康(isoxicam)、甲芬那酸(mefanamic acid)、甲氯芬那酸(meclofenamic acid)、氟芬那酸(flufenamic acid)、托芬那酸(tolfenamic)、伐地考昔(valdecoxib)、帕瑞昔布(parecoxib)、依託度酸(etodolac)、吲哚美辛(indomethacin)、阿司匹林(aspirin)、伊布洛芬(ibuprophen)、非羅考昔(firocoxib)、胺甲喋呤(methotrexate(MTX))、抗瘧疾藥物(例如,羥基氯喹(hydroxychloroquine)及氯喹(chloroquine))、柳氮磺胺吡啶(sulfasalazine)、來氟米特(Leflunomide)、硫唑嘌呤(azathioprine)、環孢素(cyclosporin)、金鹽(gold salt)、米諾環素(minocycline)、環磷醯胺(cyclophosphamide)、D-青黴胺(D-penicillamine)、米諾環素(minocycline)、金諾芬(auranofin)、他克莫司(tacrolimus)、硫代苯酸金鈉(myocrisin)、苯丁酸氮芥(chlorambucil)、TNF α拮抗劑(例如,TNF α拮抗劑或TNF α受體拮抗劑),例如,阿達木單抗(Humira®)、依那西普(Enbrel®)、英夫利昔單抗(Remicade®;TA-650)、聚乙二醇賽妥珠單抗(Cimzia®;CDP870)、戈利木單抗(Simpom®;CNTO 148)、阿那白滯素(Kineret®)、利妥昔單抗(Rituxan®;MabThera®)、阿巴西普(Orencia®)、托珠單抗(RoActemra /Actemra®)、整合素拮抗劑(TYSABRI®(那他珠單抗))、IL-1拮抗劑(ACZ885(Ilaris))、阿那白滯素(Kineret®))、CD4拮抗劑、IL-23拮抗劑、IL-20拮抗劑、IL-6拮抗劑、BLyS拮抗劑(例如,阿塞西普、Benlysta®/ LymphoStat-B®(貝利木單抗))、p38抑制劑、CD20拮抗劑(奧瑞珠單抗(Ocrelizumab)、奧法木單抗(Arzerra®))、干擾素γ拮抗劑(芳妥珠單抗(Fontolizumab))、潑尼松龍(prednisolone)、強的松(Prednisone)、地塞米松(dexamethasone)、皮質醇(Cortisol)、可的松(cortisone)、氫化可的松(hydrocortisone)、甲基潑尼松龍(methylprednisolone)、倍他米松(betamethasone)、曲安奈德(triamcinolone)、倍氯米松(beclometasome)、氟氫可的松(fludrocortisone)、去氧皮質酮(deoxycorticosterone)、醛固酮(aldosterone)、強力黴素(Doxycycline)、萬古黴素(vancomycin)、吡格列酮(pioglitazone)、SBI-087、SCIO-469、Cura-100、Oncoxin + Viusid、TwHF、甲氧沙林(Methoxsalen)、維生素D-麥角鈣化醇(Vitamin D - ergocalciferol)、米那普侖(Milnacipran)、紫杉醇(Paclitaxel)、羅西格塔松(rosig tazone)、他克莫司(Tacrolimus)(Prograf®)、RADOOl、拉帕蒙(rapamune)、雷帕黴素(rapamycin)、福斯馬替尼(fostamatinib)、芬太尼(Fentanyl)、XOMA 052、福斯馬替尼二鈉(Fostamatinib disodium)、羅格列酮(rosightazone)、薑黃素(Curcumin)(Longvida™)、瑞舒伐他汀(Rosuvastatin)、馬拉韋羅(Maraviroc)、雷米普利(ramipnl)、米那普侖(Milnacipran)、考前列酮(Cobiprostone)、生長激素(somatropin)、tgAAC94基因治療媒劑、MK0359、GW856553、埃索美拉唑(esomeprazole)、依維莫司(everolimus)、曲妥珠單抗(trastuzumab)、JAKl及JAK2抑制劑、泛JAK抑制劑,例如,四環吡啶酮6(P6)、325、PF-956980、狄諾塞麥(denosumab)、IL-6拮抗劑、CD20拮抗劑、CTLA4拮抗劑、IL-8拮抗劑、IL-21拮抗劑、IL-22拮抗劑、整合素拮抗劑(Tysarbri®(那他珠單抗))、VGEF拮抗劑、CXCL拮抗劑、MMP拮抗劑、防禦素拮抗劑、IL-1拮抗劑(包括IL-1 β拮抗劑),及IL-23拮抗劑(例如,受體誘捕物、拮抗性抗體等)。
在一些實施方式中,另外的療法可以包括JAK抑制劑,例如巴瑞替尼、盧梭替尼、托法替尼和/或帕利替尼。
在一些實施方式中,另外的治療劑係免疫抑制劑。免疫抑制劑的實例包括但不限於皮質類固醇激素、美沙拉𠯤(mesalazine)、美沙拉明(mesalamine)、柳氮磺胺吡啶(sulfasalazine)、柳氮磺胺吡啶衍生物、免疫抑制藥物、環孢素A、巰基嘌呤、硫唑嘌呤(azathiopurine)、強的松、胺甲喋呤、抗組胺藥、糖皮質激素、腎上腺素、茶鹼、色甘酸鈉、抗白三烯、用於鼻炎的抗膽鹼能藥物、TLR拮抗劑、發炎體抑制劑、抗膽鹼能解充血劑、肥大細胞穩定劑、單株抗IgE抗體、疫苗(例如,用於其中使過敏原的量逐漸增加的接種疫苗的疫苗)、細胞介素抑制劑(如抗IL-6抗體)、TNF抑制劑(如英夫利昔單抗、阿達木單抗、聚乙二醇賽妥珠單抗、戈利木單抗或依那西普及其組合)。
在一些實施方式中,另外的治療劑係RNA分子,例如雙股RNA。
在一些實施方式中,另外的治療劑係反義寡核苷酸。
施用
在某些方面中,本文提供向受試者遞送本文描述的固體劑型之方法。在本文提供之方法的一些實施方式中,包含細菌和/或mEV的固體劑型與另外的治療劑的施用一起施用。在一些實施方式中,固體劑型包含與另外的治療劑共同配製的藥劑。在一些實施方式中,固體劑型與另外的治療劑共同施用。在一些實施方式中,在施用固體劑型之前(例如之前約1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、15、20、25、30、35、40、45、50或55分鐘,之前約1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22或23小時,或之前約1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13或14天),向受試者施用另外的治療劑。在一些實施方式中,在施用固體劑型之後(例如之後約1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、15、20、25、30、35、40、45、50或55分鐘,之後約1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22或23小時,或之後約1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13或14天),向受試者施用另外的治療劑。在一些實施方式中,使用相同遞送模式來遞送固體劑型及另外的治療劑。在一些實施方式中,使用不同遞送模式來施用固體劑型及另外的治療劑。例如,在一些實施方式中,經口施用固體劑型,而經由注射(例如靜脈內、肌內和/或腫瘤內注射)施用另外的治療劑。
在某些實施方式中,本文所述之固體劑型可與任一其他常規抗癌治療(例如諸如放射療法及腫瘤手術切除術)聯合施用。該等治療可在需要和/或指示時應用且可發生於施用本文所述之固體劑型之前、同時或之後。
劑量方案可為各種方法及量中的任一者,且可由熟悉該項技術者根據已知臨床因素來確定。如醫學領域中已知,任一患者的劑量可取決於許多因素,包括受試者物種、大小、體表面積、年齡、性別、免疫能力及總體健康狀況、有待施用的特定微生物、持續時間及施用途徑、疾病種類及階段(例如腫瘤大小)及其他化合物(例如同時或近乎同時施用的藥物)。除上述因素外,該等水平可受微生物感染性及微生物性質影響,如可由熟悉該項技術者所確定。在本發明之方法中,微生物的適當最小劑量水平可為足夠使微生物存活、生長及複製的水平。可根據劑型、施用途徑、靶疾病的程度或階段等來適當地設定或調節本文描述的藥劑(例如呈固體劑型)的劑量。例如,藥劑的一般有效劑量範圍可為0.01 mg/kg體重/天至1000 mg/kg體重/天、0.1 mg/kg體重/天至1000 mg/kg體重/天、0.5 mg/kg體重/天至500 mg/kg體重/天、1 mg/kg體重/天至100 mg/kg體重/天或5 mg/kg體重/天至50 mg/kg體重/天。有效劑量可為0.01、0.05、0.1、0.5、1、2、3、5、10、20、30、40、50、60、70、80、90、100、200、500或1000 mg/kg體重/天或更高,但劑量並不限於此。
在一些實施方式中,向受試者施用的劑量足以預防疾病(例如,自體免疫性疾病、炎性疾病、代謝性疾病、生態失調或癌症)、延遲其發作或減緩或停止其進展,或減輕疾病的一個或多個症狀。熟悉該項技術者將認識到,劑量將取決於多種因素,包括所採用特定試劑(例如藥劑)的強度以及受試者的年齡、物種、病症及體重。還根據以下因素來確定劑量大小:施用途徑、時機及頻率以及可伴隨特定藥劑的施用的任何不良副作用的存在、性質及程度及期望的生理學效果。
可藉由熟悉該項技術者已知的常規範圍探測技術來確定合適的劑量及劑量方案。通常,以不超過化合物最佳劑量的較小劑量開始治療。然後,以小增量增加劑量直至達到該狀況下的最佳效果為止。有效劑量及治療方案可藉由常規及常規方式來確定,例如,其中在實驗室動物中以低劑量開始且然後增加劑量,同時監測效果,且還系統地改變劑量方案。通常使用動物研究來測定每公斤重量的生物活性藥劑的最大可耐受劑量(「MTD」)。本領域技術人類員通常在其他物種(包含人類)中外推劑量以達到功效,同時避免毒性。
根據上文,在治療應用中,根據本文所述方法使用的藥劑的劑量取決於以下因素有所變化:活性劑,接受患者的年齡、體重及臨床狀況及施用療法的臨床醫師或從業人員的經歷及判斷,以及影響所選劑量的其他因素。例如,對於癌症治療,劑量應足以導致減緩腫瘤的生長,較佳的是使腫瘤的生長消退,並且最較佳的是使癌症完全消退,或者轉移的大小或數目減小。作為另一個實例,劑量應足以導致減緩受試者正在治療的疾病的進展,較佳的是改善受試者正在治療的疾病的一個或多個症狀。
分開施用可包括任何數量的兩次或更多次施用,包括二、三、四、五或六次施用。熟悉該項技術者可容易地根據本領域中已知的用於監測治療方法之方法及本文提供的其他監測方法確定有待進行的施用次數或進行一次或多次另外的施用的需求性。因此,本文提供之方法包括向受試者提供固體劑型的一次或多次施用之方法,其中可藉由監測受試者且基於監測結果測定是否提供一次或多次另外的施用來確定施用次數。可基於各種監測結果決定是否提供一次或多次另外的施用。
施用間的時間段可為各個時間段中的任一者。施用間的時間段可隨各種因素中的任一者而變化,包括監測步驟(如關於施用次數所描述的)、受試者建立免疫應答的時間段。在一個實例中,時間段可隨受試者建立免疫應答的時間段而變化;例如,時間段可大於受試者建立免疫應答的時間段,如大於約一週、大於約十天、大於約兩週或大於約一個月;在另一個實例中,時間段可不超過受試者建立免疫應答的時間段,如不超過約一週、不超過約十天、不超過約兩週或不超過約一個月。
在一些實施方式中,另外的治療劑與本文描述的固體劑型的組合的遞送減少另外的治療劑的不利影響和/或改善另外的治療劑的功效。
本文所述之另外的治療劑的有效劑量係針對特定受試者、組成物及施用模式有效達成所需治療劑反應且對受試者的毒性最小的另外的治療劑的量。可使用本文所述之方法來鑒別有效劑量水平且將取決於多種藥物動力學因素,包含所施用特定組成物或藥劑的活性、施用途徑、施用時間、所採用特定化合物的排泄速率、治療持續時間、與所採用特定組成物組合使用的其他藥物、化合物和/或材料、所治療受試者的年齡、性別、體重、病症、總體健康狀況及先前醫學史以及醫學技術中熟知的類似因素。一般而言,另外的治療劑的有效劑量將是該另外的治療劑的量,其為有效產生治療效應的最低劑量。通常這樣的有效劑量將取決於上文所述之該等因素。
另外的治療劑的毒性係受試者在治療期間及治療之後經受的不利效應的程度。與另外的治療毒性相關的不良事件可以包括但不限於腹痛、酸消化不良、酸回流、過敏反應、禿髮、全身性過敏性反應、貧血、焦慮、食欲不振、關節痛、無力、運動失調、氮質血症、失去平衡、骨痛、出血、血凝塊、低血壓、血壓升高、呼吸困難、支氣管炎、淤血、白血球計數降低、紅血球計數降低、血小板計數降低、心臟毒性、膀胱炎、出血性膀胱炎、心律不整、心瓣膜疾病、心肌病、冠狀動脈疾病、白內障、中樞神經毒性、認知障礙、意識模糊、結膜炎、便秘、咳嗽、痙攣、膀胱炎、深層靜脈栓塞、脫水、抑鬱、腹瀉、眩暈(dizziness)、口乾、皮膚乾燥、消化不良、呼吸困難(dyspnea)、水腫、電解質不平衡、食道炎、疲乏、生育力喪失、發燒、腸胃氣脹、面紅、胃逆流、胃食道逆流病、生殖器疼痛、粒細胞減少症、男子女性型乳房、青光眼、脫髮、手足綜合症(hand-foot syndrome)、頭痛、聽覺損失、心臟衰竭、心悸、胃灼熱、血腫、出血性膀胱炎、肝毒性、高澱粉酶血症、高鈣血症、高氯血症、高糖血症、高鉀血症、高脂血症、高鎂血症、高鈉血症、高磷血症、色素沈著、高甘三油酯血症、高尿酸血症、低白蛋白血症、低鈣血症、低氯血症、低血糖症、低鉀血症、低鎂血症、低鈉血症、低磷血症、陽萎、感染、注射部位反應、失眠、缺鐵、瘙癢、關節痛、腎衰竭、白血球減少症、肝功能障礙、失憶、閉經、口瘡、黏膜炎、肌肉痛、肌痛、骨髓抑制、心肌炎、嗜中性白血球減少性發熱、噁心、腎毒性、嗜中性白血球減少症、流鼻血、麻木、耳毒性、疼痛、手足綜合症(palmar-plantar erythrodysesthesia)、各類血細胞減少症、心包炎、周邊神經病變、咽炎、畏光、光敏感、肺炎(pneumonia)、肺炎(pneumonitis)、蛋白尿、肺栓塞、肺性纖維化、肺毒性、皮疹、心跳加快、直腸出血、坐立不安、鼻炎、癲癇、呼吸短促、鼻竇炎、血小板減少症、耳鳴、泌尿道感染、陰道出血、陰道乾燥、眩暈(vertigo)、水瀦留(water retention)、虛弱、體重減輕、體重增加及口腔乾燥(xerostomia)。一般而言,如果經由療法所達到的受試者益處勝過受試者因療法所經歷的不良事件,則毒性係可接受的。
免疫障礙
在一些實施方式中,本文描述之方法及固體劑型涉及治療或預防與病理學免疫應答相關的疾病或障礙(如自體免疫性疾病、過敏反應和/或炎性疾病)。在一些實施方式中,疾病或障礙係炎性腸病(例如,克羅恩氏病或潰瘍性結腸炎)。在一些實施方式中,疾病或障礙係牛皮癬。在一些實施方式中,疾病或障礙係特應性皮炎。
本文描述之方法和固體劑型可用以治療有需要的任何受試者。如本文所用,「有需要的受試者」包括患有與病理學免疫應答相關的疾病或病症(例如,炎性腸病)的任何受試者,及獲得此疾病或病症的可能性更大的任何受試者。
本文描述的固體劑型可例如用作預防或治療(部分或完全減少以下疾病的不利影響)自體免疫性疾病,如慢性炎性腸病、全身性紅斑狼瘡、牛皮癬、穆-韋二氏綜合症、類風濕性關節炎、多發性硬化或橋本病(Hashimoto's disease);過敏性疾病,如食物過敏、花粉熱或氣喘;傳染性疾病,如艱難梭菌感染;炎性疾病,如TNF介導的炎性疾病(例如,胃腸道炎性疾病,如結腸袋炎(pouchitis);心血管炎性病症,如動脈粥樣硬化;或炎性肺病,如慢性阻塞性肺疾病)的藥物組成物;用作用於抑制器官移植中的排斥或其中可能發生組織排斥的其他情況的藥物組成物;用作用於改善免疫功能的補充劑、食物或飲料;或用作用於抑制免疫細胞的增殖或功能的試劑。
在一些實施方式中,本文提供之方法和固體劑型適用於治療炎症。在某些實施方式中,身體的任何組織及器官的炎症,包括肌肉骨骼炎症、血管炎症、神經炎症、消化系統炎症、眼部炎症、生殖系統炎症及其他炎症,如下文討論。
肌肉骨骼系統的免疫障礙包括但不限於那些影響骨骼關節(包括手、手腕、肘部、肩部、下巴、脊柱、頸部、臀部、膝蓋、踝部及足部的關節)的病症,及影響將肌肉連接至骨頭的組織(如肌腱)的病症。可用本文所述之方法及組成物治療的此類免疫障礙的實例包括但不限於關節炎(包括,例如,骨關節炎、類風濕性關節炎、牛皮癬關節炎、強直性脊柱炎、急性及慢性感染性關節炎、與痛風和假痛風相關的關節炎及幼年特發性關節炎)、肌腱炎、滑膜炎、腱鞘炎、滑囊炎、纖維組織炎(纖維肌痛)、上髁炎、肌炎及骨炎(包括,例如,佩吉特病(Paget's disease)、恥骨炎及囊性纖維性骨炎)。
眼部免疫障礙係指影響眼睛的任何結構(包括眼瞼)的免疫障礙。可用本文描述之方法及組成物治療的眼部免疫障礙的實例包括但不限於瞼緣炎、眼瞼皮膚松垂症、結膜炎、淚腺炎、角膜炎、乾燥性角膜結膜炎(乾眼症)、鞏膜炎、倒睫及眼色素層炎。
可用本文描述之方法及固體劑型治療的神經系統免疫障礙的實例包括但不限於腦炎、格林-巴厘綜合症(Guillain-Barre syndrome)、腦膜炎、神經性肌強直、發作性睡病、多發性硬化、脊髓炎及精神分裂症。可用本文所述之方法及組成物治療的脈管系統或淋巴系統炎症的實例包括但不限於關節硬化、關節炎、靜脈炎、血管炎及淋巴管炎。
可用本文描述之方法及固體劑型治療的消化系統免疫障礙的實例包括但不限於膽管炎、膽囊炎、腸炎、小腸結腸炎、胃炎、腸胃炎、炎性腸病、回腸炎及直腸炎。炎性腸病包括(例如)一組相關病症的某些本領域公認的形式。已知炎性腸病的幾種主要形式,該等障礙中最常見的為克羅恩氏病(區域性腸病,例如,非活性及活性形式)及潰瘍性結腸炎(例如,非活性及活性形式)。另外,炎性腸病涵蓋腸易激綜合症、顯微鏡下結腸炎、淋巴細胞性-漿細胞性腸炎、乳糜瀉、膠原性結腸炎、淋巴細胞性結腸炎及嗜酸性小腸結腸炎。IBD的其他不常見形式包括未確定型結腸炎、偽膜性結腸炎(壞死性結腸炎)、缺血性炎性腸病、白塞氏病(Behcet's disease)、類肉瘤病、硬皮病、IBD相關性發育不良、發育不良相關性團塊或病變及原發性硬化性膽管炎。
可用本文所述之方法及固體劑型治療的生殖系統免疫障礙的實例包括但不限於宮頸炎、絨毛膜羊膜炎、子宮內膜炎、附睾炎、臍炎、卵巢炎、睾丸炎、輸卵管炎、輸卵管卵巢膿腫、尿道炎、陰道炎、外陰炎及外陰痛。
本文描述之方法及固體劑型可用以治療具有發炎成分的自體免疫性疾病。此病症包括但不限於全身性急性播散性禿頭症、白塞氏病、恰加斯氏病(Chagas' disease)、慢性疲勞綜合症、自主神經失調、腦脊髓炎、強直性脊柱炎、再生障礙性貧血、化膿性汗腺炎、自體免疫性肝炎、自體免疫性卵巢炎、乳糜瀉、克羅恩氏病、1型糖尿病、巨細胞動脈炎、古德帕斯丘綜合症、格雷夫斯病、格林-巴厘綜合症、橋本病、亨諾-許蘭二氏紫斑症(Henoch-Schonlein purpura)、川崎病(Kawasaki's disease)、紅斑狼瘡、顯微鏡下結腸炎、顯微鏡下多動脈炎、混合結締組織病、穆-韋二氏綜合症(Muckle-Wells syndrome)、多發性硬化、重症肌無力、眼陣攣肌陣攣綜合症、視神經炎、奧德氏甲狀腺炎、天皰瘡、結節性多動脈炎、多肌痛、類風濕性關節炎、萊特爾氏綜合症(Reiter's syndrome)、休葛籣氏綜合症(Sjogren's syndrome)、顳動脈炎、韋格納肉芽腫病(Wegener's granulomatosis)、溫熱自體免疫性溶血性貧血、間質性膀胱炎、萊姆病(Lyme disease)、局限性硬皮病、牛皮癬、類肉瘤病、硬皮病、潰瘍性結腸炎及白斑病。
本文描述之方法及固體劑型可用以治療具有發炎成分的T細胞介導的超敏性疾病。此類病症包括但不限於接觸性超敏反應、接觸性皮炎(包括由於毒葛引起的接觸性皮炎)、蕁麻疹、皮膚過敏、呼吸道過敏(花粉症、過敏性鼻炎、屋塵蟎過敏)及麩膠敏感性腸病(乳糜瀉)。
可用本發明之方法及固體劑型治療的其他免疫障礙包括例如闌尾炎、皮炎、皮肌炎、心內膜炎、纖維組織炎、齒齦炎、舌炎、肝炎、化膿性汗腺炎、虹膜炎、喉炎、乳腺炎、心肌炎、腎炎、耳炎、胰臟炎、腮腺炎、心包炎、腹膜炎(peritonoitis)、咽炎、胸膜炎、局限性肺炎、前列腺增生症(prostatistis)、腎盂腎炎及口炎(stomatisi)、移植排斥(涉及如腎、肝、心臟、肺、胰臟(例如,胰島細胞)、骨髓、角膜、小腸的器官,同種異體皮膚移植、皮膚同種移植物及心臟瓣膜異種移植、血清病及移植物抗宿主病)、急性胰臟炎、慢性胰臟炎、急性呼吸窘迫症候群、西紮利氏綜合症(Sexary's syndrome)、先天性腎上腺增生、非化膿性甲狀腺炎、高鈣血症相關癌症、天皰瘡、大皰性皰疹樣皮炎、重度多形紅斑、剝脫性皮炎、脂溢性皮炎、季節性或常年性過敏性鼻炎、支氣管氣喘、接觸性皮炎、特應性皮炎、藥物超敏反應、過敏性結膜炎、角膜炎、眼帶狀皰疹、虹膜炎及虹膜睫狀體炎、脈絡膜視網膜炎、視神經炎、症狀性類肉瘤病、暴發性或散播性肺結核化學療法、成人特發性血小板減少性紫癜、成人繼發性血小板減少症、獲得性(自體免疫性)溶血性貧血症、成人白血病及淋巴瘤、兒童急性白血病、局限性腸炎、自體免疫性血管炎、多發性硬化、慢性阻塞性肺疾病、實體器官移植排斥反應、敗血症。較佳的治療包括以下的治療:移植排斥、類風濕性關節炎、牛皮癬關節炎、多發性硬化、1型糖尿病、氣喘、炎性腸病、全身性紅斑狼瘡、牛皮癬、慢性阻塞性肺疾病及伴隨感染病症的炎症(例如,敗血症)。
代謝失調
在一些實施方式中,本文描述之方法和固體劑型涉及治療或預防代謝性疾病或障礙,例如II型糖尿病、糖耐量受損、胰島素抵抗、肥胖、高血糖、高胰島素血症、脂肪肝、非酒精性脂肪性肝炎、高膽固醇血症、高血壓、高脂蛋白血症、高脂血症、高甘油三酯血症、酮酸中毒、低血糖、血栓性疾病、血脂異常、非酒精性脂肪性肝病(NAFLD)、非酒精性脂肪性肝炎(NASH)或相關疾病。在一些實施方式中,相關疾病係心血管疾病、動脈粥樣硬化、腎臟疾病、腎病、糖尿病性神經病、糖尿病性視網膜病變、性功能障礙、皮膚病、消化不良或水腫。在一些實施方式中,本文所述之方法和藥物組成物涉及非酒精性脂肪性肝病(NAFLD)和非酒精性脂肪性肝炎(NASH)之治療。
本文描述之方法和固體劑型可用以治療有需要的任何受試者。如本文所使用的,「有需要的受試者」包括具有代謝性疾病或障礙的任何受試者,以及具有獲得這種疾病或障礙的增加的可能性的任何受試者。
本文描述的固體劑型可用於例如預防或治療代謝性疾病(部分或完全地減少代謝性疾病的不利影響),該代謝性疾病係例如II型糖尿病、糖耐量受損、胰島素抵抗、肥胖、高血糖、高胰島素血症、脂肪肝、非酒精性脂肪性肝炎、高膽固醇血症、高血壓、高脂蛋白血症、高脂血症、高甘油三酯血症、酮酸中毒、低血糖、血栓性疾病、血脂異常、非酒精性脂肪性肝病(NAFLD)、非酒精性脂肪性肝炎(NASH)或相關疾病。在一些實施方式中,相關疾病係心血管疾病、動脈粥樣硬化、腎臟疾病、腎病、糖尿病性神經病、糖尿病性視網膜病變、性功能障礙、皮膚病、消化不良或水腫。
癌症
在一些實施方式中,本文描述之方法及固體劑型涉及癌症治療。在一些實施方式中,任何癌症可使用本文所述之方法治療。可藉由本文所述之方法及固體劑型治療的癌症的實例包括但不限於來自以下的癌細胞:膀胱、血液、骨頭、骨髓、腦、乳房、結腸、食道、胃腸、牙齦、頭、腎、肝、肺、鼻咽、頸、卵巢、前列腺、皮膚、胃、睪丸、舌頭或子宮。另外,癌症可特定地是下列組織學類型,但其不限於這類類型:贅瘤,惡性;癌;癌,未分化;巨大及梭細胞癌;小細胞癌;乳頭狀癌;鱗狀細胞癌;淋巴上皮癌;基底細胞癌(basal cell carcinoma);毛髮基質(pilomatrix)癌;移行細胞癌;乳頭狀移行細胞癌;腺癌;胃泌素瘤,惡性;膽管癌;肝細胞癌;肝細胞癌合併膽管癌;小梁腺癌;腺樣囊性癌;腺瘤息肉的腺癌;腺癌,家族性結腸息肉;實體癌;類癌瘤,惡性;細支氣管肺泡(branchiolo-alveolar)腺癌;乳頭狀腺癌;嫌色細胞癌;嗜酸性細胞癌;嗜酸性腺癌;嗜鹼性粒細胞癌;透明細胞腺癌;顆粒細胞癌;濾泡性腺癌;乳頭狀及濾泡性腺癌;非包膜性硬化性癌;腎上腺皮質癌;子宮內膜樣癌;皮膚附器癌;頂漿(apocrine)腺癌;皮脂腺癌;耵聹(ceruminous)腺癌;黏液表皮樣癌;囊腺癌;乳頭狀囊腺癌;乳頭狀漿液性囊腺癌;黏液性囊腺癌;黏液性腺癌;戒環細胞癌;浸潤性導管癌;髓樣癌;小葉癌;炎性癌;佩吉特病,乳房;腺泡細胞癌;腺鱗癌;腺癌與鱗狀轉移瘤(adenocarcinoma w/squamous metaplasia);胸腺瘤,惡性;卵巢間質瘤,惡性;卵泡膜細胞瘤(thecoma),惡性;粒層細胞瘤,惡性;及成釉細胞瘤,惡性;賽特利氏(sertoli)細胞癌;睾丸間質細胞(leydig cell)瘤,惡性;脂質細胞瘤,惡性;副神經節瘤,惡性;乳房外副神經節瘤,惡性;嗜鉻細胞瘤;血管球肉瘤(glomangiosarcoma);惡性黑色素瘤;無色素性黑色素瘤;淺表擴散性黑色素瘤;巨大色素痣中的惡性黑色素瘤;上皮樣細胞黑色素瘤;藍痣,惡性;肉瘤;纖維肉瘤;纖維組織細胞瘤,惡性;黏液肉瘤;脂肉瘤(liposarcoma);平滑肌肉瘤;橫紋肌肉瘤;胚胎性橫紋肌肉瘤;肺泡橫紋肌肉瘤;基質肉瘤;混合瘤,惡性;苗勒氏混合瘤(mullerian mixed tumor);腎母細胞瘤;肝母細胞瘤;癌肉瘤;間質瘤,惡性;布倫納瘤(brenner tumor),惡性;葉狀瘤,惡性;滑膜肉瘤;間皮瘤,惡性;無性細胞瘤;胚胎性癌;畸胎瘤,惡性;卵巢甲狀腺瘤,惡性;絨毛膜癌;中腎瘤,惡性;血管肉瘤;血管內皮瘤,惡性;卡波西氏肉瘤;血管外皮細胞瘤,惡性;淋巴管肉瘤;骨肉瘤;近皮質骨肉瘤;軟骨肉瘤;軟骨胚細胞瘤,惡性;間葉細胞軟骨肉瘤;骨巨細胞瘤;尤因肉瘤;齒源性腫瘤,惡性;釉質母細胞齒源性瘤;釉質母細胞瘤,惡性;釉質母細胞纖維肉瘤;松果體瘤,惡性;脊索瘤;神經膠質瘤,惡性;室管膜瘤;星形細胞瘤;原漿性星形細胞瘤;纖維性星形細胞瘤;星形母細胞瘤;膠質母細胞瘤;少突神經膠質瘤;少突膠質母細胞瘤;原始神經外胚葉腫瘤;小腦肉瘤;節細胞母細胞瘤;神經母細胞瘤;視網膜母細胞瘤;嗅神經源性腫瘤;腦膜瘤,惡性;神經纖維肉瘤;神經鞘瘤,惡性;顆粒細胞瘤,惡性;惡性淋巴瘤;霍奇金病;何杰金氏淋巴瘤;副肉芽腫;小淋巴細胞性惡性淋巴瘤;彌漫性大細胞惡性淋巴瘤;濾泡型惡性淋巴瘤;蕈樣真菌病;其他特定的非何杰金氏淋巴瘤;惡性組織細胞增生症;多發性骨髓瘤;肥大細胞肉瘤;免疫增殖性小腸病;白血病;淋巴樣白血病;漿細胞白血病;紅白血病;淋巴肉瘤細胞白血病;髓樣白血病;嗜鹼性白血病;嗜酸性球白血病;單核細胞白血病;肥大細胞白血病;巨核細胞性白血病;髓樣肉瘤;及毛細胞白血病。
在一些實施方式中,癌症包含乳癌(例如三陰性乳癌)。
在一些實施方式中,癌症包含結直腸癌(例如,微衛星穩定(MSS)結直腸癌)。
在一些實施方式中,癌症包含腎細胞癌。
在一些實施方式中,癌症包含肺癌(例如,非小細胞肺癌)。
在一些實施方式中,癌症包含膀胱癌。
在一些實施方式中,癌症包含胃食管癌。
在一些實施方式中,本文提供之方法及固體劑型涉及白血病的治療。術語「白血病」在廣義上包括造血器官/系統的進展性、惡性疾病且其特徵通常在於白血球及其先質在血液及骨髓中的異常增殖及發育。白血病疾病的非限制性實例包括急性非淋巴細胞性白血病、慢性淋巴細胞性白血病、急性粒細胞性白血病、慢性粒細胞性白血病、急性前骨髓細胞性白血病、成人T細胞白血病、非白血性白血病、白血球增多性白血病、嗜鹼粒細胞白血病、胚細胞白血病、牛白血病、慢性骨髓細胞性白血病、皮膚白血病、胚細胞性白血病、嗜酸性粒細胞性白血病、格羅斯氏白血病(Gross' leukemia)、裡德爾細胞白血病(Rieder cell leukemia)、希林氏白血病(Schilling's leukemia)、幹細胞白血病、亞白血病性白血病、未分化細胞白血病、毛細胞白血病、成血細胞性白血病(hemoblastic leukemia)、成血胚細胞性白血病(hemocytoblastic leukemia)、組織細胞性白血病、幹細胞白血病、急性單核細胞性白血病、白血球減少性白血病、淋巴性白血病、淋巴母細胞性白血病、淋巴細胞性白血病、淋巴源性白血病、淋巴樣白血病、淋巴肉瘤細胞白血病、肥大細胞白血病、巨核細胞性白血病、小骨髓母細胞性白血病、單核細胞性白血病、骨髓母細胞性白血病、骨髓細胞性白血病、骨髓性粒細胞性白血病、骨髓單核細胞性白血病、內格利白血病(Naegeli leukemia)、漿細胞白血病、漿細胞性白血病及前骨髓細胞性白血病。
在一些實施方式中,本文提供之方法及固體劑型涉及癌治療。術語「癌」係指上皮細胞的惡性生長,該等上皮細胞往往浸潤環繞組織和/或抑制生理學及非生理學細胞死亡信號並產生轉移。癌的非限制性示例性類型包含腺泡癌、腺泡樣癌、腺囊樣癌、腺樣囊性癌、腺癌(carcinoma adenomatosum)、腎上腺皮質癌、肺泡癌、肺泡細胞癌、基底細胞癌(basal cell carcinoma)、基底細胞癌(carcinoma basocellulare)、基底細胞樣癌、基底鱗狀細胞癌、支氣管肺泡癌、細支氣管癌、支氣管癌、腦狀癌、膽管細胞癌、絨毛膜癌、膠狀癌、粉刺癌、子宮體癌、篩狀癌、鎧甲狀癌、皮膚癌、柱狀癌、柱狀細胞癌、導管癌、硬癌(carcinoma durum)、胚胎性癌、腦狀癌(encephaloid carcinoma)、表皮樣癌、腺樣上皮細胞癌、外植癌、潰瘍性癌、纖維癌、膠狀癌(gelatiniform carcinoma)、膠樣癌(gelatinous carcinoma)、巨細胞癌(giant cell carcinoma)、印戒細胞癌(signet-ring cell carcinoma)、單純癌、小細胞癌、馬鈴薯狀癌、球狀細胞癌、梭形細胞癌、髓狀癌、鱗狀癌、鱗狀細胞癌、繩捆癌(string carcinoma)、毛細管擴張癌(carcinoma telangiectaticum)、毛細管擴張性癌(carcinoma telangiectodes)、移行細胞癌、塊狀癌、結節性皮癌、疣狀癌、絨毛狀癌、巨細胞癌(carcinoma gigantocellulare)、腺體癌(glandular carcinoma)、粒層細胞癌、毛基質細胞癌(hair-matrix carcinoma)、血樣癌、肝細胞癌、許特耳細胞癌(Hurthle cell carcinoma)、玻質狀癌、腎上腺樣癌、幼稚型胚胎性癌、原位癌、表皮內癌、上皮內癌、克羅姆佩柯赫爾氏腫瘤(Krompecher's carcinoma)、庫爾契茨基氏細胞癌(Kulchitzky-cell carcinoma)、大細胞癌、豆狀癌(lenticular carcinoma)、豆樣癌(carcinoma lenticulare)、脂瘤樣癌、淋巴上皮癌、髓樣癌、髓質癌、黑色素癌、軟癌、黏液性癌(mucinous carcinoma)、黏液癌(carcinoma muciparum)、黏液細胞癌(carcinoma mucocellulare)、黏液表皮樣癌、黏膜癌(carcinoma mucosum)、黏膜性癌(mucous carcinoma)、黏液瘤樣癌、鼻咽癌、燕麥狀細胞癌、骨化性癌、骨質癌(osteoid carcinoma)、乳頭狀癌、門靜脈周癌、浸潤前癌、棘細胞癌、糜爛性癌、腎臟的腎細胞癌、儲備細胞癌、肉瘤樣癌、施奈德氏癌(schneiderian carcinoma)、硬性癌(scirrhous carcinoma)及陰囊癌(carcinoma scroti)。
在一些實施方式中,本文提供之方法及固體劑型涉及肉瘤的治療。術語「肉瘤」通常是指如胚胎結締組織等物質組成的腫瘤且通常由包埋於原纖維、異質或均質物質中的緊密堆積細胞構成。肉瘤包括但不限於軟骨肉瘤、纖維肉瘤、淋巴肉瘤、黑色素肉瘤、黏液肉瘤、骨肉瘤、子宮內膜肉瘤、基質肉瘤、尤文氏肉瘤(Ewing' s sarcoma)、筋膜肉瘤、成纖維細胞性肉瘤、巨細胞肉瘤、艾伯內西氏肉瘤(Abemethy's sarcoma)、脂肪肉瘤、脂肉瘤、軟組織腺泡狀肉瘤、釉質母細胞肉瘤、葡萄形肉瘤、綠色肉瘤、絨毛膜癌、胚胎性肉瘤、維爾姆斯氏腫瘤肉瘤(Wilms' tumor sarcoma)、粒細胞肉瘤、何傑金氏肉瘤(Hodgkin's sarcoma)、特發性多發性色素沈著出血性肉瘤、B細胞免疫母細胞肉瘤、淋巴瘤、T細胞免疫母細胞肉瘤、晏森氏肉瘤(Jensen's sarcoma)、卡波西氏肉瘤(Kaposi's sarcoma)、庫普弗細胞肉瘤(Kupffer cell sarcoma)、血管肉瘤、白血病性肉瘤、惡性間葉瘤肉瘤、骨周肉瘤、網狀細胞肉瘤、勞斯肉瘤(Rous sarcoma)、漿液囊性肉瘤、滑膜肉瘤及毛細血管擴張性肉瘤。
可使用本文描述之方法及固體劑型治療的另外的示例性腫瘤包括霍奇金病(Hodgkin’s Disease)、非何杰金氏淋巴瘤、多發性骨髓瘤、神經母細胞瘤、乳癌、卵巢癌、肺癌、橫紋肌肉瘤、原發性血小板增多症、原發性巨球蛋白血症、小細胞肺腫瘤、原發性腦腫瘤、胃癌、大腸癌、惡性胰臟胰島素瘤、惡性類癌、癌前皮膚病變、睪丸癌、淋巴瘤、甲狀腺癌、神經母細胞瘤、食道癌、泌尿生殖道癌、惡性高鈣血症、宮頸癌、子宮內膜癌、漿細胞瘤、結直腸癌、直腸癌及腎上腺皮質癌。
在一些實施方式中,所治療的癌症係黑色素瘤。術語「黑色素瘤」意指源自皮膚及其他器官的黑色素細胞系統的腫瘤。黑色素瘤的非限制性實例係哈-巴二氏黑色素瘤(Harding-Passey melanoma)、幼年型黑色素瘤、惡性小痣性痣黑色素瘤、惡性黑色素瘤、肢端小痣性黑色素瘤、無黑色素性黑色素瘤、良性幼年型黑色素瘤、克勞德曼氏黑色素瘤(Cloudman's melanoma)、S91黑色素瘤、結節性黑色素瘤甲下黑色素瘤及淺表擴展性黑色素瘤。
可使用本文描述之方法及固體劑型治療的腫瘤的特定類別包括淋巴組織增生性疾病、乳癌、卵巢癌、前列腺癌、宮頸癌、子宮內膜癌、骨癌、肝癌、胃癌、大腸癌、胰臟癌、甲狀腺癌、頭頸癌、中樞神經系統的癌症、外周神經系統的癌症、皮膚癌、腎癌、及所有上述的轉移。特定類型的腫瘤包含肝細胞癌、肝細胞瘤、肝母細胞瘤、橫紋肌肉瘤、食管癌、甲狀腺癌、惡性神經節瘤、纖維肉瘤、黏液肉瘤、脂肉瘤、軟骨肉瘤、成骨性肉瘤、脊索瘤、血管肉瘤、內皮肉瘤、尤文氏腫瘤、平滑肌肉瘤、橫紋肌內皮肉瘤、侵襲性導管癌、乳頭狀腺癌、黑色素瘤、肺鱗狀細胞癌、基底細胞癌、腺癌(充分分化、中等分化、分化不良或未分化)、支氣管肺泡癌、腎細胞癌、腎上腺樣瘤、腎上腺樣腺癌、膽管癌、絨毛膜癌、精原細胞瘤、胚胎性癌、維爾姆斯氏腫瘤、睾丸腫瘤、肺癌(包含小細胞肺癌、非小細胞肺癌及大細胞肺癌)、膀胱癌、神經膠質瘤、星形細胞瘤、髓母細胞瘤、顱咽管瘤、室管膜瘤、松果體瘤、視網膜母細胞瘤、神經母細胞瘤、大腸癌、直腸癌、血液系統惡性腫瘤(包含所有類型的白血病及淋巴瘤,包含:急性髓性白血病、急性髓細胞性白血病、急性淋巴細胞性白血病、慢性髓性白血病、慢性淋巴球性白血病、肥大細胞白血病、多發性骨髓瘤、髓樣淋巴瘤、何傑金氏淋巴瘤、非何傑金氏淋巴瘤、漿細胞瘤、結直腸癌及直腸癌。
某些實施方式中所治療的癌症還包括癌前病灶,例如光化性角化病(日光性角化病)、莫耳痣(發育異常痣)、光化性唇炎(農夫唇)、皮角、巴瑞特氏食管症(Barrett's esophagus)、萎縮性胃炎、先天性角化不良、缺鐵性咽下困難、扁平苔蘚、口腔黏膜下纖維化、光化性(日光性)彈性組織變性及宮頸發育不良。
一些實施方式中所治療的癌症包含非癌性或良性腫瘤,例如內胚層、外胚層或間質起源的腫瘤,包括但不限於膽管瘤、結腸息肉、腺瘤、乳頭瘤、囊腺瘤、肝細胞腺瘤、葡萄胎、腎小管腺瘤、鱗狀細胞乳頭瘤、胃息肉、血管瘤、骨瘤、軟骨瘤、脂肪瘤、纖維瘤、淋巴管瘤、平滑肌瘤、橫紋肌瘤、星形細胞瘤、痣、腦膜瘤及神經節瘤。
其他疾病及障礙
在一些實施方式中,本文描述之方法及固體劑型涉及肝疾病的治療。此疾病包括(但不限於)阿拉吉爾綜合症(Alagille Syndrome)、酒精相關肝病、α-1抗胰蛋白酶缺乏症、自體免疫性肝炎、良性肝腫瘤、膽管閉鎖、肝硬化、半乳糖血症、吉伯特綜合症、血色素沈著病、A型肝炎、B型肝炎、C型肝炎、肝性腦病、妊娠期肝內膽汁淤積症(ICP)、溶酶體酸脂肪酶缺乏症(LAL-D)、肝囊腫、肝癌、新生兒黃疸、原發性膽汁性膽管炎(PBC)、原發性硬化性膽管炎(PSC)、雷氏綜合症(Reye Syndrome)、I型糖原貯積病及威爾森病(Wilson Disease)。
本文描述之方法及固體劑型可用以治療神經退化性及神經性疾病。在某些實施方式中,神經退化性和/或神經性疾病係巴金森氏病、阿爾茲海默症、普里昂疾病、亨廷頓病、運動神經元疾病(MND)、脊髓小腦共濟失調、脊髓性肌萎縮症、肌張力障礙、特發性顱內高壓、癲癇、神經系統疾病、中樞神經系統疾病、運動障礙、多發性硬化、腦病、周圍神經病變或術後認知功能障礙。
生態失調
近年來,越來越清楚的是,腸道微生物組(也稱為「腸道微生物群」)可藉由微生物對宿主的免疫細胞和其他細胞的活性以及影響(局部和/或遠端)對個體健康產生顯著影響(Walker, W.A., Dysbiosis[生態失調].The Microbiota in Gastrointestinal Pathophysiology[胃腸道病理生理學中的微生物].第25章.2017;Weiss和Thierry, Mechanisms and consequences of intestinal dysbiosis [腸道生態失調的機制和後果].
Cellular and Molecular Life Sciences[細胞與分子生命科學].(2017) 74(16):2959-2977.Zurich Open Repository and Archive [蘇黎世開放存儲庫和歸檔], doi.org/10.1007/s00018-017-2509-x))。
健康的宿主腸道微生物組穩態有時被稱為「生態平衡」或「正常生態」,而宿主微生物組的組成和/或其多樣性的有害變化可能導致微生物組的不健康失衡,或「生態失調」(Hooks和O'Malley.Dysbiosis and its discontents [生態失調及其缺憾].American Society for Microbiology [美國微生物學會].2017年10月.第8卷.第5期. mBio 8: e01492-17. doi.org/10.1128/mBio.01492-17)。當微生物組穩態喪失或減弱時,可能會發生生態失調以及相關的局部或遠端宿主炎性或免疫效應,從而導致:對病原體的敏感性增加;宿主細菌代謝活性改變;誘導宿主促炎活性和/或降低宿主抗炎活性。此類效應部分地由宿主免疫細胞(例如,T細胞、樹突細胞、肥大細胞、NK細胞、腸上皮淋巴細胞(IEC)、巨噬細胞和吞噬細胞)和細胞介素,以及由此類細胞和其他宿主細胞釋放的其他物質之間的相互作用介導。
生態失調可能發生在胃腸道內(「胃腸道生態失調」或「腸道生態失調」),或者可能發生在胃腸道管腔外(「遠端生態失調」)。胃腸生態失調通常與腸上皮屏障完整性降低、緊密連接完整性降低和腸通透性增加有關。Citi, S. Intestinal Barriers protect against disease [腸屏障可預防疾病],
Science[科學] 359:1098-99 (2018);Srinivasan等人, TEER measurement techniques for in vitro barrier model systems [用於體外屏障模型系統的TEER測量技術].
J. Lab.Autom [ 實驗室自動化雜誌 ].20:107-126 (2015)。胃腸生態失調可以在胃腸道內外產生生理和免疫作用。
生態失調的存在已與多種疾病和病症相關,包括:感染,癌症,自體免疫性疾病(例如全身性紅斑狼瘡(SLE))或炎性疾病(例如功能性胃腸疾病如炎症性腸病(IBD),潰瘍性結腸炎和克羅恩氏病),神經炎性疾病(例如多發性硬化症),移植性疾病(例如移植物抗宿主病),脂肪性肝病,I型糖尿病,類風濕性關節炎,乾燥綜合症,乳糜瀉,囊性纖維化,慢性阻塞性肺疾病(COPD)和其他與免疫功能障礙相關的疾病和病症。Lynch等人, The Human Microbiome in Health and Disease [健康與疾病中的人類微生物組],
N. Engl. J. Med [ 新英格蘭醫學雜誌 ].375:2369-79 (2016),Carding等人, Dysbiosis of the gut microbiota in disease [疾病中腸道微生物群的生態失調].
Microb.Ecol.Health Dis[ 微生物生態與健康疾病 ].(2015); 26: 10: 3402/mehd.v26.2619;Levy等人, Dysbiosis and the Immune System [生態失調和免疫系統], Nature Reviews Immunology [自然評論免疫學] 17:219 (2017年4月)。
本文所揭露的示例性藥物組成物和/或固體劑型可以藉由修飾存在於生態失調部位的免疫活性來治療生態失調及其影響。如本文所述,此類組成物可經由對宿主免疫細胞的作用(導致例如抗炎細胞介素的分泌增加和/或促炎細胞介素的分泌減少,從而減輕受試接受者的炎症)或經由代謝物生產的變化來修飾生態失調。
本文揭露的可用於治療與生態失調相關的障礙的示例性藥物組成物和/或固體劑型包含一種或多種類型的免疫調節細菌(例如抗炎細菌)和/或由此類細菌產生的mEV(微生物胞外囊泡)。此類組成物能夠影響接受者宿主在胃腸道中的免疫功能,和/或在受試者胃腸道外的遠端部位產生系統性作用。
本文揭露的可用於治療與生態失調相關的障礙的示例性藥物組成物和/或固體劑型包含單一細菌物種(例如,單一菌株)的免疫調節細菌(例如,抗炎細菌)的群體和/或由此類細菌產生的mEV。此類組成物能夠影響接受者宿主在胃腸道中的免疫功能,和/或在受試者胃腸道外的遠端部位產生系統性作用。
在一個實施方式中,將包含經分離的免疫調節細菌(例如抗炎細菌細胞)群體或由此類細菌產生的mEV的藥物組成物和/或固體劑型以有效治療哺乳動物接受者的生態失調和其一種或多種影響的量施用(例如口服)給該接受者。該生態失調可以是胃腸道生態失調或遠端生態失調。
在另一個實施方式中,本文所述之藥物組成物和/或固體劑型可以治療胃腸道生態失調及其對宿主免疫細胞的一種或多種影響,導致抗炎細胞介素的分泌增加和/或促炎細胞介素的分泌減少,從而減輕受試接受者的炎症。
在另一個實施方式中,藥物組成物和/或固體劑型可以藉由以下來治療胃腸道生態失調及其一種或多種影響:經由細胞和細胞介素調節來調節接受者的免疫應答,以藉由增加腸上皮屏障的完整性來降低腸道通透性。
在另一個實施方式中,藥物組成物和/或固體劑型可以藉由以下來治療遠端生態失調及其一種或多種影響:經由調節宿主免疫細胞來調節接受者生態失調部位的免疫應答。
其他示例性藥物組成物和/或固體劑型可用於治療與生態失調有關的失調症,該等組成物包含一種或多種類型的細菌或mEV,該等細菌和/或mEV能夠改變接受者中的宿主免疫細胞亞群(例如T細胞、免疫淋巴樣細胞、樹突細胞、NK細胞和其他免疫細胞的亞群)相對比例或其功能。
其他示例性藥物組成物和/或固體劑型可用於治療與生態失調有關的障礙,組成物包含單一細菌物種(例如,單一菌株)的免疫調節細菌和/或mEV的群體,其能夠改變接受者中免疫細胞亞群(例如T細胞亞群、免疫淋巴樣細胞、NK細胞和其他免疫細胞)的相對比例或其功能。
在一個實施方式中,本文提供了藉由以下來治療胃腸生態失調及其一種或多種影響之方法:向有需要的受試者口服施用藥物組成物和/或固體劑型,該等藥物組成物和/或固體劑型改變存在於生態失調部位的微生物組群體。藥物組成物和/或固體劑型可以包含一種或多種類型的免疫調節細菌或mEV或單一細菌物種(例如,單一菌株)的免疫調節細菌和/或mEV的群體。
在一個實施方式中,本文提供了藉由以下來治療遠端生態失調及其一種或多種影響之方法:向有需要的受試者口服施用藥物組成物和/或固體劑型,該等藥物組成物和/或固體劑型改變受試者的胃腸道外的免疫應答。藥物組成物和/或固體劑型可以包含一種或多種類型的免疫調節細菌或mEV或單一細菌物種(例如,單一菌株)的免疫調節細菌和/或mEV的群體。
在示例性實施方式中,可用於治療與生態失調有關的障礙的藥物組成物和/或固體劑型刺激宿主免疫細胞分泌一種或多種抗炎細胞介素。抗炎細胞介素包括但不限於IL-10、IL-13、IL-9、IL-4、IL-5、TGFβ及其組合。在其他示例性實施方式中,可用於治療與生態失調有關的障礙的藥物組成物和/或固體劑型減少(例如抑制)宿主免疫細胞分泌一種或多種促炎細胞介素。促炎細胞介素包括但不限於IFNγ、IL-12p70、IL-1α、IL-6、IL-8、MCP1、MIP1α、MIP1β、TNFα及其組合。其他示例性細胞介素係本領域已知的並且在本文中描述。
在另一方面,本文提供了在有需要的受試者中治療或預防與生態失調有關的障礙之方法,該方法包括向受試者施用(例如口服施用)益生菌食品或醫療食品形式的治療組成物,該治療組成物包含的細菌和/或mEV的量足以改變生態失調部位的微生物組,從而治療與生態失調相關的障礙。
在另一個實施方式中,本文提供的以益生菌食品或醫療食品形式的治療性組成物可用於預防或延遲處於發展為生態失調風險的受試者中生態失調的發作。
製造增強的細菌之方法
在某些方面中,本文提供製造用於產生本文描述的細菌和/或mEV(例如smEV和/或pmEV)的工程改造的細菌之方法。在一些實施方式中,該等工程改造的細菌經修飾以增強某些所需性質。例如,在一些實施方式中,對工程改造的細菌進行修飾以增強細菌和/或mEV(例如smEV和/或pmEV)的免疫調節作用和/或治療效果(例如,單獨或與另一種治療劑組合),以降低毒性和/或改善細菌和/或mEV(例如smEV和/或pmEV)製造(例如更高的耐氧性、更高的抗凍融性、更短的產生時間)。工程改造的細菌可使用本領域中已知的任何技術產生,包括(但不限於)定點誘變、轉座子誘變、敲除、敲入、聚合酶鏈反應誘變、化學誘變、紫外線誘變、轉形(化學或藉由電穿孔)、噬菌體轉導、定向演化、CRISPR/Cas9或其任何組合。
在本文提供之方法的一些實施方式中,細菌藉由定向演化進行修飾。在一些實施方式中,該定向演化包含將細菌暴露於環境條件並選擇在環境條件下具有經改善的存活和/或生長的細菌。在一些實施方式中,該方法包括使用識別增強的細菌的分析篩選誘變細菌。在一些實施方式中,該方法還包括誘變細菌(例如,藉由暴露於化學誘變劑和/或UV輻射),或將它們暴露於治療劑(例如抗生素),接著進行分析以檢測具有所需表型的細菌(例如,體內分析、離體分析或體外分析)。
感染
炎症可以是對有害刺激(例如入侵病原體、受損細胞、有毒化合物或癌細胞)的保護性應答。但是,對這種刺激的過度炎性應答會導致嚴重的不利影響,包括組織損傷甚至死亡。例如,產生促炎性細胞介素(例如白細胞介素8(IL-8)、白細胞介素6(IL-6)、白細胞介素1β(IL-1β)和腫瘤壞死因子α(TNFα))以應答許多病毒感染係與感染相關的不良症狀(在某些情況下包括死亡)的主要原因之一。例如,炎性細胞介素的釋放與多種病毒感染(包括冠狀病毒(例如,SARS-CoV-2、導致冠狀病毒病2019(COVID-19)的病毒、流感病毒和呼吸道合胞病毒)感染)引起的疾病嚴重程度有關。例如,患有嚴重COVID-19的患者經常在肺部表現出升高水平的炎性細胞介素,其促成COVID-19患者經歷的肺損傷。
在一些實施方式中,本文描述之方法和固體劑型涉及細菌性敗血症性休克、細胞介素風暴和/或病毒感染的治療或預防。在一些實施方式中,固體劑型包含棲組織普雷沃菌細菌(例如,普雷沃菌屬菌株B 50329(NRRL保藏號B 50329))。在一些實施方式中,固體劑型包含普雷沃菌屬菌株C(ATCC保藏號PTA-126140)。
在一些實施方式中,本文描述之方法和固體劑型涉及治療或預防病毒感染,例如呼吸道病毒感染,例如冠狀病毒感染(例如,MERS(中東呼吸綜合症),嚴重急性呼吸綜合症(SARS)感染,例如SARS-CoV-2感染),流感感染和/或呼吸道合胞病毒感染。在一些實施方式中,本文提供的本文描述之方法和固體劑型用於治療冠狀病毒感染(例如,MERS感染,嚴重急性呼吸綜合症(SARS)感染,例如SARS-CoV-2感染)。在一些實施方式中,本文提供了用於治療COVID-19之方法和固體劑型。
在一些實施方式中,本文描述之方法和固體劑型涉及病毒感染的治療或預防。在一些實施方式中,感染係冠狀病毒感染、流感感染和/或呼吸道合胞病毒感染。在一些實施方式中,病毒感染係SARS-CoV-2感染。
在一些實施方式中,向受試者施用另外的療法。在一些實施方式中,另外的療法包含抗病毒藥物。在一些實施方式中,另外的療法包含抗病毒藥物,例如利巴韋林、神經胺酸酶抑制劑、蛋白酶抑制劑、重組干擾素、抗體、奧司他韋、紮那米韋、帕拉米韋或巴羅薩韋瑪波酯。在一些實施方式中,另外的療法包含羥氯喹和/或氯喹。在一些實施方式中,另外的療法包含瑞德西韋。在一些實施方式中,另外的療法包含從感染受試者的相同病毒的感染中恢復的受試者的血漿(例如,從SARS-CoV-2感染中恢復的受試者的血漿)。在一些實施方式中,另外的療法包括抗炎劑,例如NSAID或抗炎類固醇。在一些實施方式中,另外的療法包括地塞米松。
在一些實施方式中,另外的療法包含對IL-6和/或IL-6受體具有特異性的抗體。在一些實施方式中,另外的療法包含托珠單抗(Actemra®)。在一些實施方式中,另外的療法包含薩瑞魯單抗(Kevzara®)。
在一些實施方式中,另外的療法可以包含抗病毒療法。例如,抗病毒療法可包含核苷酸類似物,例如瑞德西韋、伽利德韋或克拉夫定;病毒RNA聚合酶抑制劑,例如法匹雷韋或伽利德韋;蛋白酶抑制劑,如利托那韋、達盧那韋或丹諾普韋;病毒膜融合抑制劑,如烏芬諾韋;和/或抗SARS-CoV-2血漿。
在一些實施方式中,另外的療法可以包括抗炎療法。例如,該抗炎療法可以包括皮質類固醇;西羅莫司;阿那白滯素;filamod;或抗體。在一些實施方式中,抗體可以包括GMSF抑制劑,例如侖茲魯單抗或瑾司魯單抗;抗IL1 β抑制劑,例如卡那單抗;IL-6抑制劑,例如托珠單抗或司妥昔單抗;IL-6R抑制劑,例如薩瑞魯單抗;和/或CCR5拮抗劑,例如來羅單抗(leronlimab)。
在一些實施方式中,另外的療法可以包括JAK抑制劑,例如巴瑞替尼、盧梭替尼、托法替尼和/或帕利替尼。
在一些實施方式中,另外的療法可以包含TLR7促効劑,例如咪喹莫特或reisquimod。
在一些實施方式中,另外的療法可以包含基於細胞的療法。例如,基於細胞的療法可以包含Remestemcel-L;骨髓幹細胞療法,例如MultiStem或Bm-Allo-MSC;間充質基質細胞;和/或脂肪衍生的間充質幹細胞,例如AstroStem。
在一些實施方式中,另外的療法可以包含ACE受體抑制劑。
在一些實施方式中,另外的療法可以包含σ1和/或σ2受體的調節劑。
γ 照射:樣本方案:
可以在環境溫度下以17.5 kGy輻射單位對粉末進行γ輻照。可以在乾冰存在下以25 kGy輻射單位對冷凍生物質進行γ輻照。
冷凍生物質製備:樣本方案
在達到所需水平的細菌培養物生長後,離心培養物,棄去上清液,使沈澱盡可能乾燥。渦旋沈澱以使生物質疏鬆。將沈澱重懸於所需的冷凍保護劑溶液中,轉移至低溫管中,並在液氮中速凍。儲存在-80攝氏度的冰箱中。
粉末製備:樣本方案
在達到所需水平的細菌培養物生長後,將培養物離心,棄去上清液,使沈澱盡可能乾燥。將沈澱重懸於所需的冷凍保護劑溶液中,製成配製的細胞糊。冷凍保護劑可包括例如麥芽糊精、抗壞血酸鈉、麩胺酸鈉和/或氯化鈣。將配製的細胞糊裝載到不銹鋼託盤上,然後裝載到冷凍乾燥機中,例如以定義的循環參數在自動模式下運行。將冷凍乾燥的產品送入銑床中,並收集所得的粉末。
將粉末在2-8攝氏度(例如在4攝氏度)下,儲存於例如乾燥器中(例如真空密封袋中)。
實例實例1:作為EV來源的代表性菌株
從表J中列出的菌株中分離出分泌型微生物胞外囊泡(smEV)。表J中還提供了每種菌株的革蘭氏染色、細胞壁結構和分類學分類的資訊。
表J中列出的分類學組(例如,綱、目、科、屬、種或菌株)的細菌可以用於本文描述的固體劑型中。
表J中列出的分類學組(例如,綱、目、科、屬、種或菌株)的細菌的mEV可以用於本文描述的固體劑型中。
[
表 J]
:胞外囊泡( EV )由其分離出的菌株
實例2:製備包含小韋榮氏球菌的固體劑型
菌株 | 革蘭氏染色 | 細胞被膜結構 | 門 | 綱 | 目 | 科 |
狄氏副擬桿菌DRLU022118 A ILEUM-6 | 革蘭氏染色陰性 | 雙層 | 擬桿菌門 | 擬桿菌綱 | 擬桿菌目 | 卟啉單胞菌科 |
古氏副擬桿菌S4 | 革蘭氏染色陰性 | 雙層 | 擬桿菌門 | 擬桿菌綱 | 擬桿菌目 | 卟啉單胞菌科 |
棲組織普雷沃菌 | 革蘭氏染色陰性 | 雙層 | 擬桿菌門 | 擬桿菌綱 | 擬桿菌目 | 普雷沃菌科 |
棲組織普雷沃菌 | 革蘭氏染色陰性 | 雙層 | 擬桿菌門 | 擬桿菌綱 | 擬桿菌目 | 普雷沃菌科 |
Fournierella massiliensisS10 GIMucosa-297 | 革蘭氏染色陰性 | 單層 | 厚壁菌門 | 梭菌綱 | 真細菌目 | 顫螺旋菌科(以前為瘤胃菌科) |
Harryflintia acetisporaS4-M5 | 革蘭氏染色陰性 | 單層 | 厚壁菌門 | 梭菌綱 | 真細菌目 | 顫螺旋菌科 |
馬賽布勞特氏菌S1046-4A5 | 革蘭氏染色陰性 | 單層 | 厚壁菌門 | 梭菌綱 | 真細菌目 | 毛螺菌科 |
地中海桿菌/活潑 [ 瘤胃球菌 ]S10 GIMucosa-412 | 革蘭氏染色陰性 | 單層 | 厚壁菌門 | 梭菌綱 | 真細菌目 | 毛螺菌科 |
艱難梭菌S10 GImucosa-525 | 革蘭氏染色陽性 | 單層 | 厚壁菌門 | 梭菌綱 | 真細菌目 | 消化鏈球菌科 |
Aminipila屬物種S16-M4 | 革蘭氏染色陽性 | 單層 | 厚壁菌門 | 梭菌綱 | 真細菌目 | 梭菌目XIII科/地位未定41/[真細菌目,無科] |
巨型球菌屬物種S29-N3 | 革蘭氏染色陰性 | 雙層 | 厚壁菌門 | Negativicutes | 韋榮球氏菌屬目 | 韋榮氏球菌科 |
巨型球菌屬物種S1007 | 革蘭氏染色陰性 | 雙層 | 厚壁菌門 | Negativicutes | 韋榮球氏菌屬目 | 韋榮氏球菌科 |
菲利克斯月形單胞菌S34N-300R | 革蘭氏染色陰性 | 雙層 | 厚壁菌門 | Negativicutes | 月形單胞菌目 | 月形單胞菌科 |
小韋榮氏球菌S14Ileum-201 | 革蘭氏染色陰性 | 雙層 | 厚壁菌門 | Negativicutes | 韋榮球氏菌屬目 | 韋榮氏球菌科 |
Propionispora屬物種DSM100705-1A | 革蘭氏染色陰性 | 雙層 | 厚壁菌門 | Negativicutes | 月形單胞菌目 | Sporomusaceae |
Rarimicrobium hominisS24RS2-T2-5 | 革蘭氏染色陰性 | 雙層 | 互養菌門 | 互養菌綱 | 互養菌目 | 互養菌科 |
埃夫裡氯酸桿菌S29-M8 | 革蘭氏染色陰性 | 雙層 | 互養菌門 | 互養菌綱 | 互養菌目 | 互養菌科 |
小韋榮氏球菌S14-205 | 革蘭氏染色陰性 | 雙層 | 厚壁菌門 | Negativicutes | 韋榮球氏菌屬目 | 韋榮氏球菌科 |
韋榮氏球菌屬物種/殊異ECD01-DP-201 | 革蘭氏染色陰性 | 雙層 | 厚壁菌門 | Negativicutes | 韋榮球氏菌屬目 | 韋榮氏球菌科 |
小韋榮氏球菌/殊異ECD01-DP-223 | 革蘭氏染色陰性 | 雙層 | 厚壁菌門 | Negativicutes | 韋榮球氏菌屬目 | 韋榮氏球菌科 |
小韋榮氏球菌S16 GIMucosa-95 | 革蘭氏染色陰性 | 雙層 | 厚壁菌門 | Negativicutes | 韋榮球氏菌屬目 | 韋榮氏球菌科 |
製備表K中配方的片劑:
[
表 K]
:兩種活性片劑的組成( 400 mg )
材料 | 高劑量 | 低劑量 | ||
% w/w | mg/ 片 | % w/w | mg/ 片 | |
小韋榮氏球菌(DS(原料藥)/粉末) | 33.0 | 132 | 6.6 | 26.4 |
矽化微晶纖維素(PROSOLV ® SMCC HD90) | 50.0 | 200 | 76.4 | 305.6 |
交聚維酮 | 15.0 | 60 | 15.0 | 60 |
硬脂酸鎂 | 1.0 | 4 | 1.0 | 4 |
膠態二氧化矽 | 1.0 | 4 | 1.0 | 4 |
表K中的小韋榮氏球菌菌株係小韋榮氏球菌菌株A(ATCC保藏號PTA-125691)。在摻入藥物物質之前對細菌進行γ射線照射。
實例3:包衣配製物
包衣溶液組成及製程參數見表L和表M:
[
表 L]
:小韋榮氏球菌單片劑崩散結果
* DND-未崩散
[
表 M]
:包衣懸浮液的配製物組成
批 \r\n 參考 | 儲存條件 | 時間點 (月) | 結果( hh:mm:ss ) | |
0.1 M HCl | 6.8 PH 緩衝液 | |||
小韋榮氏球菌高劑量 | 2°C-8°C | 初始 | DND* | 00:19:08 |
小韋榮氏球菌低劑量 | 2°C-8°C | 初始 | DND* | 00:09:05 |
材料 | 粉衣層 | 頂包衣層( Top-coat ,腸溶的) |
組成成分 % (w/w) | 組成成分 % (w/w) | |
Kollicoat MAE 100P | - | 15.00 |
TEC | - | 2.25 |
滑石粉 | - | 3.00 |
補充水 | - | 79.75 |
歐巴代 II白色 | 15.0 | - |
WFI | 85.0 | - |
總計 | 100.0 | 100.0 |
包衣懸浮液製造程序:
1. 將水分成兩部分,然後將第一部分注射用水分配到去皮不銹鋼容器中。
2. 稱重並分配檸檬酸三乙酯到合適的去皮容器中。
3. 將已分配的檸檬酸三乙酯添加到水中,同時用頂置式攪拌器混合。
4. 稱重滑石並將其分配到合適的去皮容器中。
5. 將已分配的滑石緩慢添加到水/檸檬酸三乙酯溶液中,同時用頂置式攪拌器混合。
6. 滑石完全水合後,將容器轉移到Silverson。均質化至少10分鐘,確保所有滑石已完全分散/均質化,沒有任何結塊並且沒有材料黏附在混合器頭部上。
7. 將第二部分注射用水分配到去皮不銹鋼容器中
8. 稱重並將Kollicoat分配到合適的去皮容器中
9. 將已分配的Kollicoat緩慢添加到步驟7的水中,同時用頂置式攪拌器混合。
10. 繼續混合直到所有的Kollicoat添加完成並完全水合且分散,沒有任何結塊並且沒有材料黏附在槳上。
11. 將水/檸檬酸三乙酯/滑石懸浮液轉移至頂置式攪拌器中並開始混合。
12. 在繼續混合的同時,將Kollicoat懸浮液轉移到容器中。以適當的速度混合至少45分鐘以形成渦流,不進行任何充氣。
13. 使包衣懸浮液通過500 µm的篩進入不銹鋼容器。確保所有固體均通過篩網。
實例4:製備包含棲組織普雷沃菌smEV的固體劑型
製備表N中配方的片劑:
[
表 N]
:活性片劑的組成( 400 mg )
片劑 | 低強度 | 中等強度 | 高強度 |
棲組織普雷沃菌smEV(原料藥/粉末) | 10%(LS DS) | 10%(HS DS) | 62.5%(HS DS) |
SMCC HD90 | 72.5% | 72.5% | 20.0% |
交聚維酮 | 15.0% | 15.0% | 15.0% |
SiO 2 | 1.0% | 1.0% | 1.0% |
硬脂酸鎂 | 1.5% | 1.5% | 1.5% |
片劑重量(mg) | 400 | 400 | 400 |
表N中的棲組織普雷沃菌smEV來自菌株棲組織普雷沃菌菌株B 50329(NRRL保藏號B 50329)。
HS DS:高強度原料藥。
LS DS:低強度原料藥。
LS DS藉由在凍乾前稀釋HS DS 10x(使用凍乾賦形劑)來製備。
為了製備藥物組成物片劑,對含有smEV的原料藥(藥劑)進行濕法製粒。原料藥 (i) 與水混合;(ii) 在流化床乾燥器上乾燥;(iii) 研磨;(iv) 然後與表N中提供的藥品賦形劑共混。
片劑為5.5 mm x 15.8 mm。
10%(LS DS)片劑在6.8 pH下的平均核心崩散時間為00:25(mm:ss)。
然後用下表O中所示的兩種包衣配製物中的一種包衣10%低強度藥物物質(LS DS)片劑。包衣片劑在6.8 pH下的崩散時間見表O。
[
表 O]
:經包衣的 10% 低強度( LS DS )活性片劑的崩散時間
實例5:包含8%、23%、40%和50%質量棲組織普雷沃菌細菌活性物質(DS)的650 mg固體劑型的製備
10% LS DS棲組織普雷沃菌smEV片劑上的包衣 | 酸然後6.8 pH崩散時間(mm:ss) |
Kollicoat MAE 30DP(10.67%) 15% PG和7.5% SiO 2 | 06:54 |
06:58 | |
05:12 | |
05:12 | |
07:34 | |
05:16 | |
Kollicoat MAE 30DP(10.23%) 15% PG和30%滑石粉 | 07:06 |
07:36 | |
07:40 |
製備表P中配方的片劑:
[
表 P]
:活性片劑的組成( 650 mg )
8% 活性 | 23% 活性 | |||
組分 | 質量百分比( % ) | 質量( g ) | 質量百分比( % ) | 質量( g ) |
棲組織普雷沃菌細菌DS | 8 | 8 | 23 | 23 |
SMCC HD90 | 42 | 42 | 27 | 27 |
LH-B1 | 27 | 27 | 27 | 27 |
AcDiSol | 6 | 6 | 6 | 6 |
科利當CL-F | 15 | 15 | 15 | 15 |
二氧化矽 | 1 | 1 | 1 | 1 |
硬脂酸鎂 | 1 | 1 | 1 | 1 |
總和 | 100 | 100 | 100 | 100 |
40% 活性 | 50% 活性 | |||
組分 | 質量百分比( % ) | 質量( g ) | 質量百分比( % ) | 質量( g ) |
棲組織普雷沃菌細菌DS | 40 | 64 | 50 | 85 |
SMCC HD90 | 10 | 16 | 5 | 8.5 |
LH-B1 | 27 | 43.2 | 22 | 37.4 |
AcDiSol | 6 | 9.6 | 6 | 10.2 |
科利當CL-F | 15 | 24 | 15 | 25.5 |
二氧化矽 | 1 | 1.6 | 1 | 1.7 |
硬脂酸鎂 | 1 | 1.6 | 1 | 1.7 |
總和 | 100 | 160 | 100 | 170 |
表P中的棲組織普雷沃菌細菌來自菌株棲組織普雷沃菌菌株B 50329(NRRL保藏號B 50329)。
對於8%、23%、40%和50%活性配製物中的每一種,將除硬脂酸鎂之外的表P的組分在一起混合15分鐘。然後添加硬脂酸鎂,並且將混合物再混合3分鐘。然後將混合粉末壓製成650 mg片劑。將8%和23%活性粉末以約10 kN(壓實力)壓製。將40%活性粉末以約8、10、12或15 kN壓製。將50%活性粉末以約10、12或15 kN壓製。片劑為7.1 mm x 17.4 mm。
崩散時間隨活性和壓實力的百分比而變化,如下表Q所示:
[
表 Q]
:活性片劑( 650 mg )的在 6.8 pH 下的崩散時間相比於壓實力
實例6:包含10%、20%和40%質量棲組織普雷沃菌細菌活性物質(DS)的400 mg和500 mg固體劑型的製備
崩散時間( mm:ss )相比於壓實力 | ||||
8 kN | 10 kN | 12 kN | 15 kN | |
8%活性 | 1:00 | |||
23%活性 | 2:27 | |||
40%活性 | 7:06 | 8:56 | 6:52 | 5:01 |
50%活性 | 14:12 | 11:45 | 11:35 |
製備表R中配方的片劑:
[
表 R]
:活性片劑的組成( 400/500 mg )
組分 | 質量百分比( % ) | ||
棲組織普雷沃菌細菌DS | 10 | 20 | 40 |
SMCC HD90 | 40 | 30 | 10 |
LH-B1 | 27 | 27 | 27 |
AcDiSol | 6 | 6 | 6 |
科利當CL-F | 15 | 15 | 15 |
二氧化矽 | 1 | 1 | 1 |
硬脂酸鎂 | 1 | 1 | 1 |
總和 | 100 | 100 | 100 |
表R中的棲組織普雷沃菌細菌來自菌株棲組織普雷沃菌菌株B 50329(NRRL保藏號B 50329)。
表R中配方的片劑如實例5中上表P形成為具有不同質量百分比的棲組織普雷沃菌細菌DS和SMCC HD90的400 mg和500 mg片劑。
實例7:包含棲組織普雷沃菌細菌的具有低崩散時間的固體劑型的製備
製備表S中配方的片劑:
[
表 S]
:在 6.8 pH 下崩散時間短的活性片劑的組成( 400 mg )
27% LH-B1 配製物 | 32% LH-B1 配製物 | |||
組分 | 質量百分比 | 質量(g) | 質量百分比 | 質量(g) |
棲組織普雷沃菌細菌DS | 40.00% | 20 | 40.00% | 20 |
SMCC HD90 | 10.00% | 5 | 5.00% | 2.5 |
LH-B1 | 27.00% | 13.5 | 32.00% | 16 |
AcDiSol SD-711NF | 6.00% | 3 | 6.00% | 3 |
SiO₂ | 1.00% | 0.5 | 1.00% | 0.5 |
科利當CL-F | 15.00% | 7.5 | 15.00% | 7.5 |
硬脂酸鎂 | 1.00% | 0.5 | 1.00% | 0.5 |
總和 | 100.00% | 50 | 100.00% | 50 |
表S中的棲組織普雷沃菌細菌來自菌株棲組織普雷沃菌菌株B 50329(NRRL保藏號B 50329)。
表S中配方的片劑如實例5中上表P形成為400 mg片劑(9.55 mm直徑)。發現該等片劑在6.8 pH下的崩散時間少於10分鐘。27% LH-B1配製物在6.8 pH下的崩散時間為9:17分鐘。37% LH-B1配製物在6.8 pH下的崩散時間為8:07分鐘。
實例8:包含通過#200篩網的棲組織普雷沃菌細菌DS的固體劑型的製備
製備表T中配方的片劑:
[
表 T]
:具有通過 #200 篩網的 DS 的活性片劑的組成( 400 mg )
20% DS #200 篩網 | 40% DS #200 篩網 | |||
組分 | 質量百分比 | 質量( g ) | 質量百分比 | 質量( g ) |
棲組織普雷沃菌細菌DS(通過#200篩網) | 20.00% | 10 | 40.00% | 20 |
SMCC HD90 | 30.00% | 15 | 10.00% | 5 |
LH-B1 | 27.00% | 13.5 | 27.00% | 13.5 |
AcDiSol SD-711 NF | 6.00% | 3 | 6.00% | 3 |
科利當CL-F | 15.00% | 7.5 | 15.00% | 7.5 |
二氧化矽 | 1.00% | 0.5 | 1.00% | 0.5 |
硬脂酸鎂 | 1.00% | 0.5 | 1.00% | 0.5 |
總和 | 100.00% | 50 | 100.00% | 50 |
表T中的棲組織普雷沃菌細菌來自菌株棲組織普雷沃菌菌株B 50329(NRRL保藏號B 50329)。
棲組織普雷沃菌細菌DS通過75微米篩(#200篩網)進行篩選。然後將其與二氧化矽混合10分鐘。然後添加除硬脂酸鎂外的所有其他組分並混合15分鐘。然後將硬脂酸鎂添加到混合物中並混合3分鐘。然後將粉末混合物壓製成400 mg片劑。將20% DS片劑以4.6-4.9 kN壓製並且產生400 mg片劑,平均厚度為約5.58 mm,平均硬度為約54.6N,在6.8 pH條件下平均崩散時間為2:22分鐘。將40% DS片劑以約6.2 kN壓製並且產生400 mg片劑,平均厚度為約5.84 mm,平均硬度為約58 N,在6.8 pH條件下平均崩散時間為約8分鐘。
實例9:包含通過500微米篩的棲組織普雷沃菌細菌DS的固體劑型的製備
製備表U中配方的片劑:
[
表 U]
:具有通過 500 微米篩的 DS 的活性片劑的組成
400 mg/9.5 mm ( 0.375" ) | ||
組分 | 質量百分比 | 質量( g ) |
棲組織普雷沃菌細菌DS | 40.00% | 20 |
SMCC HD90 | 43.00% | 21.5 |
SiO 2 | 1.00% | 0.5 |
科利當CL-F | 15.00% | 7.5 |
硬脂酸鎂 | 1.00% | 0.5 |
總和 | 100.00% | 50 |
300 mg/8 mm ( 0.3125" ) | ||
組分 | 質量百分比 | 質量( g ) |
棲組織普雷沃菌細菌DS | 50.00% | 25 |
SMCC HD90 | 33.00% | 16.5 |
SiO 2 | 1.00% | 0.5 |
科利當CL-F | 15.00% | 7.5 |
硬脂酸鎂 | 1.00% | 0.5 |
總和 | 100.00% | 50 |
表U中的棲組織普雷沃菌細菌來自菌株棲組織普雷沃菌菌株B 50329(NRRL保藏號B 50329)。
棲組織普雷沃菌細菌DS通過500微米篩進行篩選。將除硬脂酸鎂外的表U的所有組分混合15分鐘。然後將硬脂酸鎂添加到混合物中並混合3分鐘。然後將混合物壓製成片劑,如下表V所示。
[
表 V]
:表 T 片劑的特性
平均片劑特性 | 400 mg/9.5 mm ( 0.375" ) | 300 mg/8 mm ( 0.3125" ) |
壓實力(KN) | 9 | 5.2 |
片劑重量(mg) | 403.52 | 288.98 |
片劑厚度(mm) | 5.85 | 6.07 |
片劑硬度(N) | 163.5 | 101.3 |
崩散時間(mm:ss) | 18:23 | 30:47 |
表V中的崩散時間係在6.8 pH下測量的。
實例10:包含棲組織普雷沃菌細菌的泡騰固體劑型的製備
製備表W中配方的泡騰片劑。
[
表 W]
:活性泡騰片劑的組成
片劑配製物 | ||
配方 1 | 配方 2 | |
組分 | 質量百分比 | 質量百分比 |
棲組織普雷沃菌細菌DS | 40.00% | 40.00% |
SiO 2 | 1.00% | 1.00% |
滑石粉 | 1.00% | 1.00% |
檸檬酸 | 5.00% | 5.00% |
碳酸氫鈉 | 6.50% | 6.50% |
PVP-64 | 3.50% | |
SMCC HD90 | 25.50% | 22.00% |
羧基乙酸澱粉鈉 | 2.00% | - |
交聚維酮-CL-F | 18.00% | 20.00% |
硬脂醯富馬酸鈉 | 1.00% | 1.00% |
總和 | 100.00% | 100.00% |
表W中的棲組織普雷沃菌細菌來自菌株棲組織普雷沃菌菌株B 50329(NRRL保藏號B 50329)。
將除硬脂醯富馬酸鈉外的上表W中列出的所有組分均通過#40篩網。然後將該等組分混合、過篩並共混20分鐘。然後添加硬脂醯富馬酸鈉並將混合物混合3分鐘。然後將配方1的混合物以18 kN壓製以形成片劑。配方1片劑的硬度為130 N。配方2的混合物也被以8.4和14.2 kN壓實力壓製以形成片劑。
形成的片劑可以進一步用下表X-Z中的以下包衣配製物中的任何一種或多種包衣:
[
表 X]
:包衣溶液配製物
[
表 Y]
:彩色包衣溶液配製物
[
表 Z]
:包衣溶液配製物
包衣溶液配製物 | |||
項# | 材料 | w/w% | 數量(g) |
1 | Kollicoat MAE 30DP | 50.00% | 750 |
2 | 丙二醇 | 2.25% | 33.75 |
3 | 純淨水 | 44.75% | 671.25 |
4 | 滑石粉 | 3.00% | 45 |
總計 | 100.00% | 1500 |
歐巴代黃色包衣配製物 | |
組分 | 質量百分比 |
歐巴代黃色 | 15 |
DI水 | 85 |
總和 | 100 |
腸溶衣溶液配製物 | |
組分 | 質量百分比 |
Eudragit L30 D55 | 39.23 |
檸檬酸三乙酯 | 2.35 |
滑石粉 | 5.89 |
DI水 | 52.53 |
總和 | 100 |
在包衣的每個階段測量雙包衣配方1片劑(歐巴代黃色,然後是腸溶衣)在6.8 pH下的崩散時間,並在下表AA中顯示,連同顯示了未包衣配方2片劑的崩散時間。
[
表 AA]
:在 6.8 pH 下的平均崩散時間( mm:ss )
實例11:包含棲組織普雷沃菌細菌的具有不同SMCC、維格姆HD或PVP 64的固體劑型的製備
未包衣的片劑 | 經歐巴代黃色包衣 | 經歐巴代和腸溶包衣 | |
配方1片劑 | 3:02 | 4:04 | 14:07 |
配方2片劑14.2 kN壓實力 | 4:49 | - | - |
配方2片劑8.4 kN壓實力 | 2:17 | - | - |
表AB中的配方係用不同量的維格姆 HD或PVP 64代替等質量百分比的SMCC製備的,如表AC所示。例如,在表AB中的配方中添加5%維格姆HD意味著SMCC減少5%:從52%到47%。
[
表 AB]
:活性片劑的組成
組分 | 質量百分比 | 質量( g ) |
棲組織普雷沃菌細菌DS | 25.00% | 12.5 |
SiO 2 | 1.00% | 0.5 |
滑石粉 | 1.00% | 0.5 |
SMCC HD90 | 52.00% | 26 |
交聚維酮-CL-F | 20.00% | 10 |
硬脂醯富馬酸鈉 | 1.00% | 0.5 |
總和 | 100.00% | 50 |
表AB中的棲組織普雷沃菌細菌來自菌株棲組織普雷沃菌菌株B 50329(NRRL保藏號B 50329)。
將表AB中的成分混合並壓製以形成片劑。
[
表 AC]
:活性片劑的組成
以下壓實力時的硬度: | |||
5 kN | 10 kN | 15 kN | |
表AB | 47.8 | 132.9 | 197.5 |
5% PVP 64 | 58.0 | 153.1 | 218.8 |
10% PVP 64 | 16.8 | 53.7 | 100.1 |
5%維格姆 | 18.6 | 53.0 | 98.1 |
10%維格姆 | 15.3 | 45.0 | 83.1 |
表AC顯示了由以下配方製成的各種片劑的壓實力和硬度:(1) 表AB和 (2) 用PVP 64和維格姆HD替代表AB配方中等質量百分比的SMCC HD90。
[
表 AD]
:活性片劑的特性
以下之後的脆性重量損失( % ): | ||||||
壓實力( kN ) | 硬度( N ) | 最短崩散時間( s ) | 平均崩散時間( s ) | 100 轉 | 200 轉 | |
表AB | 4.9-5.3 | 47.83 | 44 | 59.33 | 0.000 | 0.000 |
5% PVP 64 | 4.7-5.1 | 58.00 | 82 | 107.17 | 0.025 | 0.348 |
10% PVP 64 | 9.7-10.1 | 53.07 | 158 | 762.83 | 0.383 | 0.717 |
5%維格姆 | 9.5-9.8 | 53.00 | 64 | 488.83 | 0.025 | 0.290 |
10%維格姆 | 12.7-13.0 | 67.9 | 254 | 1214.67 | 0.000 | 0.089 |
表AD顯示了由表AB形成的以及維格姆HD或PVP 64配方替代SMCC百分比量後片劑的其他特性。
實例12:製備包含棲組織普雷沃菌細菌的固體劑型
製備表AE中的藥物物質並將其摻入表AF的片劑組成物中:
[
表 AE]
: DS 組成
DS 組成 | 重量( g ) |
棲組織普雷沃菌細菌製備 | 120 |
HP-β-CD | 30 |
表AE中的棲組織普雷沃菌細菌來自菌株棲組織普雷沃菌菌株B 50329(NRRL保藏號B 50329)。
將表AE中的組分混合然後添加到下表AF中的組分中。
[
表 AF]
:片劑配製物
片劑組成 | % | % |
DS | 50.0 | 60.0 |
SMCC HD90 | 37.0 | 27.0 |
PVP CL-F | 7.0 | 7.0 |
AcDiSol SD 711 | 4.0 | 4.0 |
硬脂酸鎂 | 1.0 | 1.0 |
SiO 2 | 1.0 | 1.0 |
總和 | 100.0 | 100.0 |
將表AF中的成分混合並壓製以形成片劑。
實例13:包含棲組織普雷沃菌細菌的濕法製粒固體劑型I的製備
表AG顯示了用於藉由濕法製粒製程形成400 mg片劑的片劑配製物。
[
表 AG]
:濕法製粒活性片的組成
片劑配製物 | |||
片劑組成 | % | % | % |
DS顆粒 | 60.0 | 60.0 | 60.0 |
SMCC HD90 | 27.0 | 21.0 | 15.0 |
PVP CL-F | 7.0 | 13.0 | 10.0 |
AcDiSol SD 711 | 4.0 | 4.0 | 4.0 |
LH-B1 | 9.0 | ||
硬脂酸鎂 | 1.0 | 1.0 | 1.0 |
SiO 2 | 1.0 | 1.0 | 1.0 |
總和 | 100.0 | 100.0 | 100.0 |
表AG中的棲組織普雷沃菌細菌來自菌株棲組織普雷沃菌菌株B 50329(NRRL保藏號B 50329)。
濕法製粒製程(製粒、乾燥和研磨)用於形成DS顆粒。然後將DS顆粒與表AG片劑配製物中的其他組分混合,並將混合物壓製以形成片劑。
實例14:包含棲組織普雷沃菌細菌的濕法製粒固體劑型II的製備
表AH顯示了用於藉由濕法製粒製程形成400 mg片劑的片劑配製物。
[
表 AH]
:濕法製粒活性片的組成
片劑配製物 | |||
片劑組成 | % | % | % |
DS顆粒 | 60 | 60 | 60 |
SMCC HD90 | 15 | 5 | 0 |
PVP CL-F | 10 | 15 | 17 |
AcDiSol SD 711 | 4 | 4 | 4 |
LH-B1 | 9 | 14 | 17 |
硬脂酸鎂 | 1 | 1 | 1 |
SiO 2 | 1 | 1 | 1 |
總和 | 100.0 | 100.0 | 100.0 |
表AH中的棲組織普雷沃菌細菌來自菌株棲組織普雷沃菌菌株B 50329(NRRL保藏號B 50329)。
將藥物物質(DS)顆粒配製物的組分混合以形成粉末。將DS顆粒配製物和黏合劑溶液用於濕法製粒製程(製粒、乾燥和研磨)以形成DS顆粒。然後將DS顆粒與片劑配製物中的其他組分混合,並將混合物壓製以形成片劑。
實例15:製備包含棲組織普雷沃菌細菌的固體劑型
[
表 AJ]
:活性片劑的組成( 400 mg )
片劑配製物 | ||
組分 | 質量百分比 | 重量( g ) |
棲組織普雷沃菌DS顆粒 | 55.00% | 27.5 |
SiO 2 | 1.00% | 0.5 |
羧基乙酸澱粉鈉 | 3.00% | 1.5 |
SMCC HD90 | 25.00% | 12.5 |
交聚維酮-CL-F | 15.00% | 7.5 |
硬脂醯富馬酸鈉 | 1.00% | 0.5 |
總和 | 100.00% | 50 |
表AJ中的棲組織普雷沃菌細菌係普雷沃菌屬菌株B 50329(NRRL保藏號B 50329)。
為了製備藥物組成物片劑,進行濕法製粒以形成藥物物質顆粒。將該等組分(i) 混合;(ii) 在流化床乾燥器上乾燥;(iii) 研磨;(iv) 然後與表AJ中提供的藥品賦形劑共混。
將除硬脂醯富馬酸鈉外的表AJ中的組分混合20分鐘。然後添加硬脂醯富馬酸鈉並將粉末混合物再混合3分鐘。然後將混合粉末壓製成400mg片劑。
藥物組成物400 mg片劑可以進一步用下表AK中所示配方的包衣進行包衣:
[
表 AK]
:片劑包衣組成
實例16:包含棲組織普雷沃菌細菌的具有不同活性DS顆粒百分比的濕法製粒固體劑型的製備
項# | 材料 | w/w% |
1 | Kollicoat MAE 30DP | 50.00% |
2 | 丙二醇 | 2.25% |
3 | 純淨水 | 44.75% |
4 | SiO 2 | 3.00% |
總計 | 100.00% |
製備表AL中配方的片劑。具有不同活性顆粒百分比的組成物如下表AM所示製備。
[
表 AL]
: DS 顆粒片劑的組成
組分 | 質量百分比 | 質量百分比 | 質量百分比 |
棲組織普雷沃菌DS顆粒 | 50.00% (80%活性顆粒) | 40.00% (100%活性顆粒) | 70.00% (60%活性顆粒) |
SiO 2 | 1.00% | 1.00% | 1.00% |
滑石粉 | 1.00% | 1.00% | 1.00% |
PVP-64 | 3.00% | 3.00% | 3.00% |
SMCC HD90 | 32.00% | 32.00% | 17.00% |
交聯羧甲基纖維素鈉 | 2.00% | 2.00% | 2.00% |
交聚維酮 | 10.00% | 20.00% | 5.00% |
硬脂醯富馬酸鈉 | 1.00% | 1.00% | 1.00% |
總和 | 100.00% | 100.00% | 100.00% |
表AL中的棲組織普雷沃菌細菌係普雷沃菌屬菌株B 50329(NRRL保藏號B 50329)。
下面的表AN顯示了由上面表AL中的配方形成的片劑的片劑特性。
[
表 AN]
:表 AL 片劑特性
實例17:製備包含棲組織普雷沃菌smEV的固體劑型
80% 活性顆粒片劑 | |||||
片劑重量(mg) | 厚度(mm) | 硬度(N) | 崩散 時間(h:mm: ss) | 壓實力(kN) | 拉伸強度(MP) |
391 | 5.03 | 147 | 0:04:48 | 10.0 | 1.46 |
392 | 5.03 | 145 | 0:05:00 | ||
292 | 5.02 | 148 | 0:05:06 | ||
390 | 5.43 | 74 | 0:01:17 | 6.0 | 0.65 |
393 | 5.42 | 75 | 0:01:48 | ||
391 | 5.42 | 77 | 0:02:08 | ||
100% 活性顆粒片劑 | |||||
396 | 5.46 | 97 | 0:20:32 | 9.9 | 1.25 |
397 | 5.47 | 99 | 0:20:14 | ||
397 | 5.47 | 94 | 0:19:48 | ||
400 | 5.91 | 54 | 0:09:48 | 6.1 | 0.58 |
399 | 5.9 | 54 | 0:10:18 | ||
396 | 5.95 | 52 | 0:10:28 | ||
390 | 5.43 | 74 | 0:01:17 | 6.0 | 0.65 |
393 | 5.42 | 75 | 0:01:48 | ||
391 | 5.42 | 77 | 0:02:08 | ||
60% 活性顆粒片劑 | |||||
433 | 5.71 | 120 | 0:05:52 | 10.0 | 0.97 |
432 | 5.72 | 119 | 0:05:32 | ||
436 | 5.71 | 126 | 0:05:36 | ||
429 | 6.31 | 54 | 0:01:43 | 5.5 | 0.35 |
429 | 6.3 | 53 | 0:01:26 | ||
431 | 6.31 | 55 | 0:01:54 |
製備表AO中配方的片劑。
[
表 AO]
:活性片劑的組成
組分 | 質量百分比 |
棲組織普雷沃菌smEV DS | 50.00% |
SMCC HD90 | 15.50% |
交聚維酮 | 30.00% |
SiO 2 | 3.00% |
硬脂酸鎂 | 1.50% |
總和 | 100.00% |
表AO中的棲組織普雷沃菌smEV係普雷沃菌屬菌株B 50329(NRRL保藏號B 50329)的smEV。
將除硬脂酸鎂外的表AO中的組成物混合15分鐘。然後將硬脂酸鎂添加到混合物中並混合3分鐘。然後將混合物壓製以形成具有下表AP所示特性的片劑。
[
表 AP]
:表 AN 的活性片劑的特性
實例18:包含棲組織普雷沃菌smEV的泡騰固體劑型的製備
片劑重量( mg ) | 厚度( mm ) | 硬度( N ) | 崩散時間 ( h:mm:ss ) |
403 | 5.56 | 70 | 0:19:19 |
405 | 5.55 | 78 | 0:19:15 |
406 | 5.58 | 77 | 0:20:57 |
405 | 5.57 | 75 | 0:17:37 |
407 | 5.57 | 76 | 0:17:29 |
製備表AQ中配方的片劑。
[
表 AQ]
:崩散劑和泡騰活性片劑( 400 mg )
30% DS | 40% DS | 50% DS I | 50% DS II | 50% DS III | |
組分 | |||||
棲組織普雷沃菌smEV DS | 30.00% | 40.00% | 50.00% | 50.00% | 50.00% |
SMCC HD90 | 22.00% | 16.00% | 12.00% | 17.00% | 15.00% |
檸檬酸 | 20.00% | 18.00% | 15.00% | 10.00% | 12.00% |
碳酸氫鈉 | 20.00% | 18.00% | 15.00% | 10.00% | 12.00% |
交聚維酮 | 5.00% | 5.00% | 5.00% | 10.00% | - |
交聯羧甲基纖維素鈉 | - | - | - | - | 4.00% |
羧基乙酸澱粉鈉 | - | - | - | - | 4.00% |
SiO 2 | 1.50% | 1.50% | 1.50% | 1.50% | 1.50% |
硬脂酸鎂 | 1.50% | 1.50% | 1.50% | 1.50% | 1.50% |
總和 | 100.00% | 100.00% | 100.00% | 100.00% | 100.00% |
表AQ中的棲組織普雷沃菌smEV係普雷沃菌屬菌株B 50329(NRRL保藏號B 50329)的smEV。
將表AQ的組分混合並壓製成400 mg片劑。下表AR顯示了30%和40% DS片劑的某些特性。
[
表 AR]
:表 AP 片劑的特性
實例19:包含
Fournierella massiliensissmEV的固體劑型I的製備
30% DS | 40% DS | |
壓實力(kN) | 23.5 | 29 |
片劑重量(mg) | 394.9 | 404.68 |
片劑厚度(mm) | 4.5 | 4.61 |
片劑硬度(N) | 93.63 | 111.48 |
崩散時間(秒) | 324 | 527.67 |
製備了表AS中配方的微型片劑。微型片劑為1.5 mm,每片3.5 mg。
[
表 AS]
:活性微型片劑的組成
微型片劑配製物 | ||
組分 | 質量百分比 | 製備的質量( g ) |
Fournierella massiliensissmEV顆粒 | 74.50% | 18.625 |
SMCC HD90 | 16.00% | 4 |
二氧化矽 | 1.00% | 0.25 |
交聚維酮 | 7.00% | 1.75 |
硬脂酸鎂 | 1.50% | 0.375 |
總和 | 100.00% | 25 |
表AS中的
Fournierella massiliensissmEV 係
Fournierella massiliensis菌株A(ATCC保藏號PTA-126696)的smEV。
將除硬脂酸鎂外的表AS的所有組分混合15分鐘。然後添加硬脂酸錳,並且將混合物進一步混合3分鐘。然後用0.33 kN的平均壓實力壓製混合物以形成微型片劑。
實例20:包含
Fournierella massiliensissmEV的固體劑型II的製備
製備表AT中配方的片劑。
[
表 AT]
:活性 HS 片劑的組成( 400 mg )
組分 | % |
高強度 Fournierella massiliensissmEV DS顆粒 | 62.5% |
SiO 2 | 1.0% |
SMCC HD90 | 20.0% |
交聚維酮 | 15.0% |
硬脂酸鎂 | 1.5% |
核心崩散時間(平均) | 02:43 |
表AT中的
Fournierella massiliensissmEV 係
Fournierella massiliensis菌株A(ATCC保藏號PTA-126696)的smEV。
將除硬脂酸鎂外的表AT的所有組分混合15分鐘。然後添加硬脂酸錳,並且將混合物進一步混合3分鐘。然後將混合物壓製成400 mg片劑。在6.8 pH下的平均核心崩散時間為02:43(mm:ss)。
然後將該等高強度
Fournierella massiliensissmEV片劑用下表AU中所示的兩種包衣配製物中的一種進行包衣。
[
表 AU]
:包衣配製物和崩散時間
表AL片劑上的包衣 | 酸然後6.8 pH崩散時間(mm:ss) |
Kollicoat MAE 30DP(10.35%) 15% PG和7.5% SiO 2 | 10:22 |
11:42 | |
08:52 | |
11:16 | |
10:40 | |
10:08 | |
Kollicoat MAE 30DP(10.25%) 15% PG和30%滑石粉 | 10:42 |
12:07 | |
10:54 |
表AU顯示了用所示包衣之一進行包衣的表AT片劑的崩散時間。片劑首先暴露於酸,然後是6.8 pH的溶液。
實例21:包含
Fournierella massiliensissmEV的固體劑型III的製備
製備表AV中配方的片劑。
[
表 AV]
:活性片劑的組成
表AV中的
Fournierella massiliensissmEV 係
Fournierella massiliensis菌株A(ATCC保藏號PTA-126696)的smEV。
組分 | 質量百分比 |
HS Fournierella massiliensissmEV顆粒DS | 10.0% |
二氧化矽 | 1.0% |
SMCC HD90 | 72.5% |
交聚維酮 | 15.0% |
硬脂酸鎂 | 1.5% |
總和 | 100.0% |
將除硬脂酸鎂外的表AV的所有組分混合15分鐘。然後添加硬脂酸錳,並且將混合物進一步混合3分鐘。然後將混合物壓製成片劑。
實例22:包含小韋榮氏球菌細菌的具有經包衣的DS的固體劑型的製備
製備表AW中配方的片劑。
[
表 AW]
:具有經包衣的 DS 的活性片劑的組成
組分 | 質量百分比 |
經包衣的小韋榮氏球菌細菌DS(20%經包衣) | 55.00% |
SiO 2 | 1.50% |
檸檬酸 | 7.50% |
碳酸氫鈉 | 7.50% |
SMCC HD90 | 7.50% |
交聚維酮 | 20.00% |
硬脂醯富馬酸鈉 | 1.00% |
總和 | 100.00% |
表AW中的小韋榮氏球菌細菌係小韋榮氏球菌菌株A(ATCC保藏號PTA-125691)。在摻入藥物物質之前對細菌進行γ射線照射。
混合表AW中的組分並將混合物壓製以形成400 mg片劑。
下表AX顯示了表AW片劑的某些特性。
[
表 AX]
:具有經包衣的 DS 的表 AW 片劑的特性
藉由引用併入
片劑重量(mg) | 厚度(mm) | 硬度(N) | 崩散時間(h:mm:ss) |
406 | 5.25 | 142 | 0:04:09 |
405 | 5.26 | 143 | 0:04:05 |
406 | 5.25 | 146 | 0:04:22 |
402 | 5.25 | 141 | 0:04:58 |
在本文中提及的所有出版物、專利申請都藉由引用以其全文特此併入,如同各個單獨的出版物或專利申請被確切地並且單獨地指明為藉由引用併入。如果出現衝突,則以本申請(包含本文的任何定義)為准。
等效形式
熟悉該項技術者僅使用常規實驗將認識到或能確定本文所述本發明之具體實施方式的許多等效形式。此類等效形式旨在被下列請求項所涵蓋。
無
無
國外寄存美國;American Type Culture Collection (ATCC);2018/04/27;PTA-125097
美國;American Type Culture Collection (ATCC);2018/06/07;PTA-125134
美國;American Type Culture Collection (ATCC);2018/10/04;PTA-125346
美國;American Type Culture Collection (ATCC);2018/10/11;PTA-125368
美國;American Type Culture Collection (ATCC);2019/01/25;PTA-125691
美國;American Type Culture Collection (ATCC);2019/09/10;PTA-126140
美國;American Type Culture Collection (ATCC);2020/03/05;PTA-126694
美國;American Type Culture Collection (ATCC);2020/03/05;PTA-126696
美國;American Type Culture Collection (ATCC);2020/06/04;PTA-126770
國內寄存食品工業發展研究所;2018年10月16日;BCRC 910854
食品工業發展研究所;2018年11月27日;BCRC 910863
食品工業發展研究所;2019年02月19日;BCRC 910874
食品工業發展研究所;2019年02月19日;BCRC 910873
食品工業發展研究所;2019年05月07日;BCRC 910892
食品工業發展研究所;2021年10月05日;BCRC 911076
食品工業發展研究所;2021年08月31日;BCRC 911074
食品工業發展研究所;2021年08月31日;BCRC 911072
食品工業發展研究所;2021年08月31日;BCRC 911073
Claims (139)
- 一種藥物組成物的固體劑型,該固體劑型包含: 藥劑,其具有的藥劑總質量係該藥物組成物總質量的至少5%且不超過該藥物組成物總質量的70%,其中該藥劑包含細菌和/或微生物胞外囊泡(mEV);以及 矽化微晶纖維素,其具有的矽化微晶纖維素總質量係該藥物組成物總質量的至少15%且不超過該藥物組成物總質量的85%。
- 如請求項1所述之固體劑型,該固體劑型進一步包含交聚維酮,其具有的交聚維酮總質量係該藥物組成物總質量的至少5%且不超過該藥物組成物總質量的25%。
- 如請求項1或2所述之固體劑型,其中該矽化微晶纖維素總質量加上該交聚維酮總質量係該藥物組成物總質量的至少35%。
- 如請求項1或2所述之固體劑型,其中該矽化微晶纖維素總質量加上該交聚維酮總質量係該藥物組成物總質量的至少70%。
- 如請求項1至4中任一項所述之固體劑型,其中該矽化微晶纖維素為HD90級矽化微晶纖維素。
- 如請求項1至5中任一項所述之固體劑型,其中 該矽化微晶纖維素總質量係該藥物組成物總質量的至少15%且不超過該藥物組成物總質量的80%;並且 該交聚維酮總質量係該藥物組成物總質量的至少10%且不超過該藥物組成物總質量的20%。
- 如請求項1至6中任一項所述之固體劑型,其中 該矽化微晶纖維素總質量係該藥物組成物總質量的至少48%且不超過該藥物組成物總質量的78%;並且 該交聚維酮總質量係該藥物組成物總質量的至少14%且不超過該藥物組成物總質量的16%。
- 如請求項1至7中任一項所述之固體劑型,其中 該矽化微晶纖維素總質量係該藥物組成物總質量的約50%;並且 該交聚維酮總質量係該藥物組成物總質量的約15%。
- 如請求項1至6中任一項所述之固體劑型,其中 該矽化微晶纖維素總質量係該藥物組成物總質量的約20%;並且 該交聚維酮總質量係該藥物組成物總質量的約15%。
- 如請求項1至6中任一項所述之固體劑型,其中 該矽化微晶纖維素總質量係該藥物組成物總質量的約76.4%; 並且 該交聚維酮總質量係該藥物組成物總質量的約15%。
- 如請求項1至6中任一項所述之固體劑型,其中 該矽化微晶纖維素總質量係該藥物組成物總質量的約72.5%; 並且 該交聚維酮總質量係該藥物組成物總質量的約15%。
- 一種藥物組成物的固體劑型,該固體劑型包含藥劑和一種或多種賦形劑,其中該一種或多種賦形劑的總質量係該藥物組成物總質量的至少15%,並且其中該藥劑包含細菌和/或微生物胞外囊泡(mEV)。
- 如請求項12所述之固體劑型,其中該一種或多種賦形劑包含矽化微晶纖維素。
- 如請求項13所述之固體劑型,其中該矽化微晶纖維素為HD90級矽化微晶纖維素。
- 如請求項13或14所述之固體劑型,其中該矽化微晶纖維素總質量係該藥物組成物總質量的至少15%且不超過該藥物組成物總質量的85%。
- 如請求項12至15中任一項所述之固體劑型,其中該一種或多種賦形劑包含交聚維酮。
- 如請求項16所述之固體劑型,其中該交聚維酮總質量係該藥物組成物總質量的至少5%且不超過該藥物組成物總質量的25%。
- 如請求項12至17中任一項所述之固體劑型,其中該藥劑總質量係該藥物組成物總質量的至少5%且不超過該藥物組成物總質量的70%。
- 如請求項1至18中任一項所述之固體劑型,其中該藥劑總質量係該藥物組成物總質量的至少15%且不超過該藥物組成物總質量的40%。
- 如請求項1至16中任一項所述之固體劑型,其中該藥劑總質量係該藥物組成物總質量的至少20%且不超過該藥物組成物總質量的38%。
- 如請求項1至18中任一項所述之固體劑型,其中該藥劑總質量係該藥物組成物總質量的至少24%且不超過該藥物組成物總質量的35%。
- 如請求項1至18中任一項所述之固體劑型,其中該藥劑總質量係該藥物組成物總質量的約26.4%-33%。
- 如請求項1至22中任一項所述之固體劑型,該固體劑型進一步包含硬脂酸鎂,其具有的硬脂酸鎂總質量係該藥物組成物總質量的至少0.01%且不超過該藥物組成物總質量的10%。
- 如請求項1至23中任一項所述之固體劑型,該固體劑型進一步包含膠體二氧化矽,其具有的膠體二氧化矽總質量係該藥物組成物總質量的至少0.01%且不超過該藥物組成物總質量的10%。
- 如請求項1至24中任一項所述之固體劑型,其中該藥劑包含細菌。
- 如請求項25所述之固體劑型,其中該細菌係凍乾的細菌。
- 如請求項1至26中任一項所述之固體劑型,其中該藥劑包含分離的細菌(例如,來自一種或多種細菌菌株(例如,目的細菌)(例如,其治療有效量))。
- 如請求項1至27中任一項所述之固體劑型,其中該藥劑包含細菌,該細菌已經經γ照射、UV照射、熱滅活、酸處理或氧噴射。
- 如請求項1至27中任一項所述之固體劑型,其中該藥劑包含活細菌。
- 如請求項1至27中任一項所述之固體劑型,其中該藥劑包含死細菌。
- 如請求項1至27中任一項所述之固體劑型,其中該藥劑包含非複製型細菌。
- 如請求項1至31中任一項所述之固體劑型,其中該藥劑包含來自一種細菌菌株的細菌。
- 如請求項1至32中任一項所述之固體劑型,其中該細菌被凍乾(例如,凍乾的產物進一步包含藥學上可接受的賦形劑)(例如,粉末形式)。
- 如請求項1至33中任一項所述之固體劑型,其中該細菌經γ照射。
- 如請求項1至33中任一項所述之固體劑型,其中該細菌經UV照射。
- 如請求項1至33中任一項所述之固體劑型,其中該細菌經熱滅活(例如,在50°C下兩小時或在90°C下兩小時)。
- 如請求項1至33中任一項所述之固體劑型,其中該細菌經酸處理。
- 如請求項1至33中任一項所述之固體劑型,其中該細菌經氧噴射(例如,以0.1 vvm持續兩小時)。
- 如請求項1至38中任一項所述之固體劑型,其中該細菌係革蘭氏陽性細菌。
- 如請求項1至38中任一項所述之固體劑型,其中該細菌係革蘭氏陰性細菌。
- 如請求項1至38中任一項所述之固體劑型,其中該細菌係需氧細菌。
- 如請求項1至38中任一項所述之固體劑型,其中該細菌係厭氧細菌。
- 如請求項1至38中任一項所述之固體劑型,其中該細菌係嗜酸細菌。
- 如請求項1至38中任一項所述之固體劑型,其中該細菌係嗜鹼細菌。
- 如請求項1至38中任一項所述之固體劑型,其中該細菌係嗜中性細菌。
- 如請求項1至38中任一項所述之固體劑型,其中該細菌係難養細菌。
- 如請求項1至38中任一項所述之固體劑型,其中該細菌係非難養細菌。
- 如請求項25所述之固體劑型,其中該細菌係小韋榮氏球菌細菌。
- 如請求項48所述之固體劑型,其中該小韋榮氏球菌係與小韋榮氏球菌菌株A(ATCC保藏號PTA-125691)的核苷酸序列包含至少90%的基因組、16S和/或CRISPR序列同一性的菌株。
- 如請求項48所述之固體劑型,其中該小韋榮氏球菌係與小韋榮氏球菌菌株A(ATCC保藏號PTA-125691)的核苷酸序列包含至少95%的基因組、16S和/或CRISPR序列同一性的菌株。
- 如請求項48所述之固體劑型,其中該小韋榮氏球菌係與小韋榮氏球菌菌株A(ATCC保藏號PTA-125691)的核苷酸序列包含至少99%的基因組、16S和/或CRISPR序列同一性的菌株。
- 如請求項48所述之固體劑型,其中該小韋榮氏球菌係與小韋榮氏球菌菌株A(ATCC保藏號PTA-125691)的核苷酸序列包含至少99%的16S序列同一性的菌株。
- 如請求項48所述之固體劑型,其中該小韋榮氏球菌係小韋榮氏球菌菌株A(ATCC保藏號PTA-125691)。
- 如請求項48-53中任一項所述之固體劑型,其中該藥物組成物中的至少50%的細菌係小韋榮氏球菌菌株A。
- 如請求項48-54中任一項所述之固體劑型,其中該藥物組成物中的至少90%的細菌係小韋榮氏球菌菌株A。
- 如請求項48-55中任一項所述之固體劑型,其中該藥物組成物中的基本上全部的細菌係小韋榮氏球菌菌株A。
- 如請求項48-56中任一項所述之固體劑型,其中該藥物組成物包含至少約1 x 10 7至約2 x 10 12(約3 x 10 10或約1.5 x 10 11或約1.5 x 10 12)個小韋榮氏球菌菌株A細胞。
- 如請求項48-57中任一項所述之固體劑型,其中該藥物組成物包含約1.5 x 10 11個小韋榮氏球菌菌株A細胞。
- 如請求項48-57中任一項所述之固體劑型,其中該藥物組成物包含約1.5 x 10 12個小韋榮氏球菌菌株A細胞。
- 如請求項1至25中任一項所述之固體劑型,其中該細菌來自表1、表2、表3或表4中列出的分類學組(例如,綱、目、科、屬、種或菌株)。
- 如請求項1至39中任一項所述之固體劑型,其中該細菌來自表1、表2、表3或表4中列出的細菌菌株。
- 如請求項1至39中任一項所述之固體劑型,其中該細菌來自表J中列出的分類學組(例如,綱、目、科、屬、種或菌株)的細菌。
- 如請求項1至39中任一項所述之固體劑型,其中該細菌來自表J中列出的細菌菌株。
- 如請求項1至63中任一項所述之固體劑型,其中該藥劑包含微生物胞外囊泡(mEV)。
- 如請求項1至64中任一項所述之固體劑型,其中該藥劑包含分離的mEV(例如,來自一種或多種細菌菌株(例如,目的細菌))(例如,其治療有效量)。
- 如請求項1至65中任一項所述之固體劑型,其中該藥劑包含mEV,並且該mEV包含分泌型mEV(smEV)。
- 如請求項1至65中任一項所述之固體劑型,其中該藥劑包含mEV,並且該mEV包含經處理的mEV(pmEV)。
- 如請求項1至65中任一項所述之固體劑型,其中該藥劑包含pmEV,並且該pmEV由已經經γ照射、UV照射、熱滅活、酸處理或氧噴射的細菌產生。
- 如請求項1至65中任一項所述之固體劑型,其中該藥劑包含pmEV,並且該pmEV由活細菌產生。
- 如請求項1至65中任一項所述之固體劑型,其中該藥劑包含pmEV,並且該pmEV由死細菌產生。
- 如請求項1至65中任一項所述之固體劑型,其中該藥劑包含pmEV,並且該pmEV由非複製型細菌產生。
- 如請求項1至71中任一項所述之固體劑型,其中該藥劑包含mEV,並且該mEV來自一種細菌菌株。
- 如請求項1至72中任一項所述之固體劑型,其中該mEV被凍乾(例如,凍乾的產物進一步包含藥學上可接受的賦形劑)。
- 如請求項1至73中任一項所述之固體劑型,其中該mEV經γ照射。
- 如請求項1至73中任一項所述之固體劑型,其中該mEV經UV照射。
- 如請求項1至73中任一項所述之固體劑型,其中該mEV經熱滅活(例如,在50°C下兩小時或在90°C下兩小時)。
- 如請求項1至73中任一項所述之固體劑型,其中該mEV經酸處理。
- 如請求項1至77中任一項所述之固體劑型,其中該mEV經氧噴射(例如,以0.1 vvm持續兩小時)。
- 如請求項1至77中任一項所述之固體劑型,其中該mEV來自革蘭氏陽性細菌。
- 如請求項1至77中任一項所述之固體劑型,其中該mEV來自革蘭氏陰性細菌。
- 如請求項1至77中任一項所述之固體劑型,其中該mEV來自需氧細菌。
- 如請求項1至77中任一項所述之固體劑型,其中該mEV來自厭氧細菌。
- 如請求項1至77中任一項所述之固體劑型,其中該mEV來自嗜酸細菌。
- 如請求項1至77中任一項所述之固體劑型,其中該mEV來自嗜鹼細菌。
- 如請求項1至77中任一項所述之固體劑型,其中該mEV來自嗜中性細菌。
- 如請求項1至77中任一項所述之固體劑型,其中該mEV來自難養細菌。
- 如請求項1至77中任一項所述之固體劑型,其中該mEV來自非難養細菌。
- 如請求項1至77中任一項所述之固體劑型,其中該mEV來自表1、表2、表3或表4中列出的分類學組(例如,綱、目、科、屬、種或菌株)的細菌。
- 如請求項1至77中任一項所述之固體劑型,其中該mEV來自表1、表2、表3或表4中列出的細菌菌株。
- 如請求項1至77中任一項所述之固體劑型,其中該mEV來自表J中列出的分類學組(例如,綱、目、科、屬、種或菌株)的細菌。
- 如請求項1至77中任一項所述之固體劑型,其中該mEV來自表J中列出的細菌菌株。
- 如請求項1至77中任一項所述之固體劑型,其中該mEV來自棲組織普雷沃菌細菌。
- 如請求項92所述之固體劑型,其中該棲組織普雷沃菌係與普雷沃菌屬菌株B 50329(NRRL保藏號B 50329)的核苷酸序列包含至少90%的基因組、16S和/或CRISPR序列同一性的菌株。
- 如請求項92所述之固體劑型,其中該棲組織普雷沃菌係與普雷沃菌屬菌株B 50329(NRRL保藏號B 50329)的核苷酸序列包含至少95%的基因組、16S和/或CRISPR序列同一性的菌株。
- 如請求項92所述之固體劑型,其中該棲組織普雷沃菌係與普雷沃菌屬菌株B 50329(NRRL保藏號B 50329)的核苷酸序列包含至少99%的基因組、16S和/或CRISPR序列同一性的菌株。
- 如請求項92所述之固體劑型,其中該棲組織普雷沃菌係與普雷沃菌屬菌株B 50329(NRRL保藏號B 50329)的核苷酸序列包含至少99%的16S序列同一性的菌株。
- 如請求項92所述之固體劑型,其中該棲組織普雷沃菌係普雷沃菌屬菌株B 50329(NRRL保藏號B 50329)。
- 如請求項92-97中任一項所述之固體劑型,其中該藥物組成物中至少50%的該mEV係普雷沃菌屬菌株B 50329(NRRL保藏號B 50329)。
- 如請求項92-98中任一項所述之固體劑型,其中該藥物組成物中至少90%的該mEV係普雷沃菌屬菌株B 50329(NRRL保藏號B 50329)。
- 如請求項92-99中任一項所述之固體劑型,其中該藥物組成物中基本上全部的該mEV係普雷沃菌屬菌株B 50329(NRRL保藏號B 50329)。
- 如請求項1至63中任一項所述之固體劑型,其中該藥劑包含細菌並且細菌的劑量為約1 x 10 7至約2 x 10 12(約3 x 10 10或約1.5 x 10 11或約1.5 x 10 12)個細胞,其中該劑量係按每膠囊或片劑計或按膠囊中的微型片劑的總數計。
- 如請求項1至63中任一項所述之固體劑型,其中該藥劑包含細菌並且細菌的劑量為約1 x 10 9、約3 x 10 9、約5 x 10 9、約1.5 x 10 10、約3 x 10 10、約5 x 10 10、約1.5 x 10 11、約1.5 x 10 12、或約2 x 10 12個細胞,其中該劑量係按每膠囊或片劑計或按膠囊中的微型片劑的總數計。
- 如請求項1至102中任一項所述之固體劑型,其中該藥劑包含細菌和/或mEV,並且該藥劑(例如細菌和/或mEV)的劑量為約10 mg至約1500 mg,其中該劑量係按每膠囊或片劑計或按膠囊中的微型片劑的總數計。
- 如請求項1至102中任一項所述之固體劑型,其中該藥劑包含細菌和/或mEV,並且該藥劑(例如細菌和/或mEV)的劑量為約30 mg至約1300 mg(按細菌和/或mEV的重量計)(約25、約30、約35、約50、約75、約100、約120、約150、約250、約300、約350、約400、約500、約600、約700、約750、約800、約900、約1000、約1100、約1200、約1250、約1300、約2000、約2500、約3000、或約3500 mg),其中該劑量係按每膠囊或片劑計或按膠囊中的微型片劑的總數計。
- 如請求項1至102中任一項所述之固體劑型,其中該藥劑包含細菌和/或mEV,並且該藥劑(例如細菌和/或mEV)的劑量為約2 x 10 6至約2 x 10 16個顆粒(例如,其中藉由NTA(奈米顆粒跟蹤分析)確定顆粒計數),其中該劑量係按每膠囊或片劑計或按膠囊中的微型片劑的總數計。
- 如請求項1至102中任一項所述之固體劑型,其中該藥劑包含細菌和/或mEV,並且該藥劑(例如細菌和/或mEV)的劑量為約5 mg至約900 mg總蛋白(例如,其中總蛋白藉由布拉德福德測定或BCA確定),其中該劑量係按每膠囊或片劑計或按膠囊中的微型片劑的總數計。
- 如請求項1至106中任一項所述之固體劑型,其中該固體劑型進一步包含一種或多種治療劑。
- 如請求項1至107中任一項所述之固體劑型,其中該固體劑型進一步包含賦形劑(例如,本文所述之賦形劑,例如稀釋劑、黏合劑和/或黏結劑、崩散劑、潤滑劑和/或助流劑、著色劑、調味劑和/或甜味劑)。
- 如請求項1至108中任一項所述之固體劑型,其中該固體劑型係片劑。
- 如請求項109所述之固體劑型,其中片劑係5 mm、5.5 mm、6 mm、6.5 mm、7 mm、7.5 mm、8 mm、8.5 mm、9 mm、9.5 mm、10 mm、11 mm、12 mm、13 mm、14 mm、15 mm、16 mm、17 mm或18 mm片劑。
- 如請求項1至108中任一項所述之固體劑型,其中該固體劑型係微型片劑。
- 如請求項111所述之固體劑型,其中該微型片劑係1 mm微型片劑、1.5 mm微型片劑、2 mm微型片劑、3 mm微型片劑或4 mm微型片劑。
- 如請求項111或112所述之固體劑型,其中多個微型片劑包含於膠囊中。
- 如請求項1至113中任一項所述之固體劑型,該固體劑型進一步包含腸溶衣。
- 如請求項1114所述之固體劑型,其中該腸溶衣係單腸溶衣或多於一個腸溶衣。
- 如請求項114或115所述之固體劑型,其中該腸溶衣包含內部腸溶衣和外部腸溶衣,並且其中該內部和外部腸溶衣不相同。
- 如請求項114至116中任一項所述之固體劑型,其中該腸溶衣包含甲基丙烯酸丙烯酸乙酯(MAE)共聚物(1 : 1)。
- 如請求項112至117中任一項所述之固體劑型,其中該腸溶衣包含鄰苯二甲酸乙酸纖維素(CAP)、偏苯三酸乙酸纖維素(CAT)、聚醋酸乙烯鄰苯二甲酸酯(PVAP)、羥丙基甲基纖維素鄰苯二甲酸酯(HPMCP)、脂肪酸、蠟、蟲膠(紫膠桐酸的酯)、塑膠、植物纖維、玉米醇溶蛋白、Aqua-Zein(不含醇的水性玉米醇溶蛋白配製物)、直鏈澱粉、澱粉衍生物、糊精、丙烯酸甲酯-甲基丙烯酸共聚物、醋酸琥珀酸纖維素、羥丙基甲基醋酸琥珀酸纖維素(醋酸羥丙甲纖維素琥珀酸酯)、甲基丙烯酸甲酯-甲基丙烯酸共聚物、或海藻酸鈉。
- 如請求項114至117中任一項所述之固體劑型,其中該腸溶衣包含陰離子聚合物材料。
- 一種預防或治療受試者的疾病之方法,該方法包括向該受試者施用如請求項1至119中任一項所述之固體劑型。
- 如請求項1至119中任一項所述之固體劑型用於治療或預防受試者的疾病的用途。
- 如請求項1至119中任一項所述之固體劑型用於製備藥物的用途,該藥物用於治療或預防受試者的疾病。
- 如請求項1至119中任一項所述之固體劑型,用於治療或預防受試者的疾病。
- 如請求項120至123中任一項所述之方法/固體劑型/用途,其中該固體劑型經口服施用(例如用於口服施用)。
- 如請求項120至124中任一項所述之方法/固體劑型/用途,其中該固體劑型空腹(例如,進食前一小時或進食後兩小時)施用。
- 如請求項120至125中任一項所述之方法/固體劑型/用途,其中每天1、2、3或4次施用(例如,用於施用)該固體劑型(例如,片劑或多個微型片劑(例如,包含在膠囊中))。
- 如請求項120至126中任一項所述之方法/固體劑型/用途,其中該固體劑型包含片劑或多個微型片劑(例如,包含在膠囊中)並且每天1、2、3或4次施用(例如,用於施用)1、2、3或4個固體劑型(例如,片劑或多個微型片劑(例如,包含在膠囊中)。
- 如請求項120至127中任一項所述之方法/固體劑型/用途,其中該受試者需要治療(和/或預防)癌症。
- 如請求項120至127中任一項所述之方法/固體劑型/用途,其中該受試者需要治療(和/或預防)自體免疫性疾病。
- 如請求項120至127中任一項所述之方法/固體劑型/用途,其中該受試者需要治療(和/或預防)炎性疾病。
- 如請求項120至127中任一項所述之方法/固體劑型/用途,其中該受試者需要治療(和/或預防)代謝性疾病。
- 如請求項120至127中任一項所述之方法/固體劑型/用途,其中該受試者需要治療(和/或預防)生態失調。
- 如請求項120至132中任一項所述之方法/固體劑型/用途,其中該固體劑型與治療劑組合施用。
- 一種製備藥物組成物的固體劑型之方法,該方法包括: (a) 將以下組合成藥物組成物: (i) 藥劑,其具有的藥劑總質量係該藥物組成物總質量的至少5%且不超過該藥物組成物總質量的70%,其中該藥劑包含細菌和/或微生物胞外囊泡(mEV); (ii) 矽化微晶纖維素,其具有的矽化微晶纖維素總質量係該藥物組成物總質量的至少15%且不超過該藥物組成物總質量的85%;以及 (b) 將該藥物組成物壓製成固體劑型。
- 如請求項134所述之方法,該方法進一步將以下組合成藥物組成物:交聚維酮,其具有的交聚維酮總質量係該藥物組成物總質量的至少5%且不超過該藥物組成物總質量的25%。
- 如請求項134或135所述之方法,該方法進一步包括將該固體劑型進行腸溶包衣以獲得經腸溶包衣的固體劑型的步驟。
- 如請求項134至136中任一項所述之方法,其中該固體劑型係片劑。
- 如請求項134或136中任一項所述之方法,其中該固體劑型係微型片劑。
- 如請求項134至138中任一項所述之方法,該方法進一步包括在該組合步驟之前對該藥劑進行濕法製粒的步驟。
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