RU2616899C1 - Противовоспалительная фармацевтическая композиция на основе бактериальных штаммов - Google Patents
Противовоспалительная фармацевтическая композиция на основе бактериальных штаммов Download PDFInfo
- Publication number
- RU2616899C1 RU2616899C1 RU2015144635A RU2015144635A RU2616899C1 RU 2616899 C1 RU2616899 C1 RU 2616899C1 RU 2015144635 A RU2015144635 A RU 2015144635A RU 2015144635 A RU2015144635 A RU 2015144635A RU 2616899 C1 RU2616899 C1 RU 2616899C1
- Authority
- RU
- Russia
- Prior art keywords
- genes
- activity
- rats
- dysbiosis
- probiotics
- Prior art date
Links
- 230000003110 anti-inflammatory effect Effects 0.000 title claims abstract description 8
- 239000008194 pharmaceutical composition Substances 0.000 title claims abstract description 8
- 230000001580 bacterial effect Effects 0.000 title description 5
- 208000027244 Dysbiosis Diseases 0.000 claims abstract description 32
- 230000007140 dysbiosis Effects 0.000 claims abstract description 32
- 241000982579 Enterococcus faecium L3 Species 0.000 claims abstract description 16
- 241000610704 Lactobacillus rhamnosus K32 Species 0.000 claims abstract description 13
- 101100393879 Arabidopsis thaliana GT15 gene Proteins 0.000 claims abstract description 10
- 241001608472 Bifidobacterium longum Species 0.000 claims abstract description 10
- 229940009291 bifidobacterium longum Drugs 0.000 claims abstract description 5
- 230000001747 exhibiting effect Effects 0.000 claims abstract description 3
- 239000006041 probiotic Substances 0.000 claims description 65
- 235000018291 probiotics Nutrition 0.000 claims description 65
- 108090000623 proteins and genes Proteins 0.000 claims description 48
- 230000000529 probiotic effect Effects 0.000 claims description 33
- 230000015572 biosynthetic process Effects 0.000 claims description 15
- 230000002519 immonomodulatory effect Effects 0.000 claims description 11
- 238000003786 synthesis reaction Methods 0.000 claims description 10
- 108010062877 Bacteriocins Proteins 0.000 claims description 7
- 150000004676 glycans Chemical class 0.000 claims description 6
- 229920001282 polysaccharide Polymers 0.000 claims description 6
- 239000005017 polysaccharide Substances 0.000 claims description 6
- 230000007062 hydrolysis Effects 0.000 claims description 5
- 238000006460 hydrolysis reaction Methods 0.000 claims description 5
- 108090000604 Hydrolases Proteins 0.000 claims description 4
- 229920002444 Exopolysaccharide Polymers 0.000 claims description 3
- 230000003217 anti-cancerogenic effect Effects 0.000 claims description 3
- 238000004891 communication Methods 0.000 claims description 3
- 210000002490 intestinal epithelial cell Anatomy 0.000 claims description 3
- 150000002482 oligosaccharides Polymers 0.000 claims description 3
- 230000000694 effects Effects 0.000 abstract description 38
- 208000022559 Inflammatory bowel disease Diseases 0.000 abstract description 24
- 239000000203 mixture Substances 0.000 abstract description 15
- 230000001965 increasing effect Effects 0.000 abstract description 10
- 239000000126 substance Substances 0.000 abstract description 3
- 241000700159 Rattus Species 0.000 description 45
- 241001465754 Metazoa Species 0.000 description 33
- 210000000936 intestine Anatomy 0.000 description 31
- 241000894006 Bacteria Species 0.000 description 27
- 238000012937 correction Methods 0.000 description 20
- 210000001630 jejunum Anatomy 0.000 description 20
- 210000001072 colon Anatomy 0.000 description 18
- 210000003405 ileum Anatomy 0.000 description 16
- 102000002260 Alkaline Phosphatase Human genes 0.000 description 15
- 108020004774 Alkaline Phosphatase Proteins 0.000 description 15
- 210000004913 chyme Anatomy 0.000 description 15
- XKJMBINCVNINCA-UHFFFAOYSA-N Alfalone Chemical compound CON(C)C(=O)NC1=CC=C(Cl)C(Cl)=C1 XKJMBINCVNINCA-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 14
- 239000003814 drug Substances 0.000 description 14
- 210000002966 serum Anatomy 0.000 description 14
- 241000186000 Bifidobacterium Species 0.000 description 12
- 241000736262 Microbiota Species 0.000 description 12
- 229940079593 drug Drugs 0.000 description 12
- 244000005709 gut microbiome Species 0.000 description 12
- 230000000968 intestinal effect Effects 0.000 description 12
- 102000004127 Cytokines Human genes 0.000 description 11
- 108090000695 Cytokines Proteins 0.000 description 11
- 210000004347 intestinal mucosa Anatomy 0.000 description 11
- 210000001035 gastrointestinal tract Anatomy 0.000 description 10
- 210000004400 mucous membrane Anatomy 0.000 description 10
- 241000186660 Lactobacillus Species 0.000 description 9
- 210000004534 cecum Anatomy 0.000 description 9
- 210000004027 cell Anatomy 0.000 description 9
- 230000007423 decrease Effects 0.000 description 9
- 210000003608 fece Anatomy 0.000 description 9
- 244000005700 microbiome Species 0.000 description 9
- 238000002360 preparation method Methods 0.000 description 9
- 238000004458 analytical method Methods 0.000 description 8
- 208000000718 duodenal ulcer Diseases 0.000 description 8
- 238000004519 manufacturing process Methods 0.000 description 8
- LXNHXLLTXMVWPM-UHFFFAOYSA-N pyridoxine Chemical compound CC1=NC=C(CO)C(CO)=C1O LXNHXLLTXMVWPM-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 8
- 102000004190 Enzymes Human genes 0.000 description 7
- 108090000790 Enzymes Proteins 0.000 description 7
- 239000003242 anti bacterial agent Substances 0.000 description 7
- 229940088710 antibiotic agent Drugs 0.000 description 7
- 229940088598 enzyme Drugs 0.000 description 7
- 238000000034 method Methods 0.000 description 7
- 235000018102 proteins Nutrition 0.000 description 7
- 102000004169 proteins and genes Human genes 0.000 description 7
- 238000012163 sequencing technique Methods 0.000 description 7
- YBJHBAHKTGYVGT-ZKWXMUAHSA-N (+)-Biotin Chemical compound N1C(=O)N[C@@H]2[C@H](CCCCC(=O)O)SC[C@@H]21 YBJHBAHKTGYVGT-ZKWXMUAHSA-N 0.000 description 6
- 206010009900 Colitis ulcerative Diseases 0.000 description 6
- 241000699670 Mus sp. Species 0.000 description 6
- 241000700157 Rattus norvegicus Species 0.000 description 6
- 201000006704 Ulcerative Colitis Diseases 0.000 description 6
- 230000003115 biocidal effect Effects 0.000 description 6
- 238000011161 development Methods 0.000 description 6
- 230000018109 developmental process Effects 0.000 description 6
- 238000002474 experimental method Methods 0.000 description 6
- 230000004054 inflammatory process Effects 0.000 description 6
- 238000011160 research Methods 0.000 description 6
- 210000000813 small intestine Anatomy 0.000 description 6
- 206010061218 Inflammation Diseases 0.000 description 5
- 230000009471 action Effects 0.000 description 5
- 102000016679 alpha-Glucosidases Human genes 0.000 description 5
- 108010028144 alpha-Glucosidases Proteins 0.000 description 5
- 239000004599 antimicrobial Substances 0.000 description 5
- 102000038379 digestive enzymes Human genes 0.000 description 5
- 108091007734 digestive enzymes Proteins 0.000 description 5
- 201000010099 disease Diseases 0.000 description 5
- 208000037265 diseases, disorders, signs and symptoms Diseases 0.000 description 5
- 208000002551 irritable bowel syndrome Diseases 0.000 description 5
- 210000003097 mucus Anatomy 0.000 description 5
- 230000000242 pagocytic effect Effects 0.000 description 5
- 230000002265 prevention Effects 0.000 description 5
- 230000000770 proinflammatory effect Effects 0.000 description 5
- 229940011671 vitamin b6 Drugs 0.000 description 5
- 108010049990 CD13 Antigens Proteins 0.000 description 4
- 208000011231 Crohn disease Diseases 0.000 description 4
- 102000004860 Dipeptidases Human genes 0.000 description 4
- 108090001081 Dipeptidases Proteins 0.000 description 4
- DKEXFJVMVGETOO-LURJTMIESA-N Gly-Leu Chemical compound CC(C)C[C@@H](C(O)=O)NC(=O)CN DKEXFJVMVGETOO-LURJTMIESA-N 0.000 description 4
- 241000588769 Proteus <enterobacteria> Species 0.000 description 4
- 230000003042 antagnostic effect Effects 0.000 description 4
- -1 antilysocyme Proteins 0.000 description 4
- 238000006243 chemical reaction Methods 0.000 description 4
- 210000001198 duodenum Anatomy 0.000 description 4
- 230000006870 function Effects 0.000 description 4
- 108010050848 glycylleucine Proteins 0.000 description 4
- 230000036039 immunity Effects 0.000 description 4
- 239000000395 magnesium oxide Substances 0.000 description 4
- CPLXHLVBOLITMK-UHFFFAOYSA-N magnesium oxide Inorganic materials [Mg]=O CPLXHLVBOLITMK-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 4
- AXZKOIWUVFPNLO-UHFFFAOYSA-N magnesium;oxygen(2-) Chemical compound [O-2].[Mg+2] AXZKOIWUVFPNLO-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 4
- 210000004877 mucosa Anatomy 0.000 description 4
- 230000001717 pathogenic effect Effects 0.000 description 4
- 230000007170 pathology Effects 0.000 description 4
- 230000008092 positive effect Effects 0.000 description 4
- 241000894007 species Species 0.000 description 4
- 238000002560 therapeutic procedure Methods 0.000 description 4
- 108020004465 16S ribosomal RNA Proteins 0.000 description 3
- 241000610733 Bifidobacterium longum subsp. longum GT15 Species 0.000 description 3
- FERIUCNNQQJTOY-UHFFFAOYSA-M Butyrate Chemical compound CCCC([O-])=O FERIUCNNQQJTOY-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 3
- FERIUCNNQQJTOY-UHFFFAOYSA-N Butyric acid Natural products CCCC(O)=O FERIUCNNQQJTOY-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- 102100021943 C-C motif chemokine 2 Human genes 0.000 description 3
- 101710155857 C-C motif chemokine 2 Proteins 0.000 description 3
- 241000605980 Faecalibacterium prausnitzii Species 0.000 description 3
- OVBPIULPVIDEAO-LBPRGKRZSA-N Folic acid Natural products C=1N=C2NC(N)=NC(=O)C2=NC=1CNC1=CC=C(C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(O)=O)C=C1 OVBPIULPVIDEAO-LBPRGKRZSA-N 0.000 description 3
- 108090001007 Interleukin-8 Proteins 0.000 description 3
- 241000588748 Klebsiella Species 0.000 description 3
- 206010057249 Phagocytosis Diseases 0.000 description 3
- 241000295644 Staphylococcaceae Species 0.000 description 3
- 108020004566 Transfer RNA Proteins 0.000 description 3
- 239000002253 acid Substances 0.000 description 3
- 238000010171 animal model Methods 0.000 description 3
- 229960002685 biotin Drugs 0.000 description 3
- 235000020958 biotin Nutrition 0.000 description 3
- 239000011616 biotin Substances 0.000 description 3
- 239000003795 chemical substances by application Substances 0.000 description 3
- 210000002919 epithelial cell Anatomy 0.000 description 3
- 235000013305 food Nutrition 0.000 description 3
- 210000000987 immune system Anatomy 0.000 description 3
- 208000027866 inflammatory disease Diseases 0.000 description 3
- 230000002757 inflammatory effect Effects 0.000 description 3
- 210000000265 leukocyte Anatomy 0.000 description 3
- 230000007246 mechanism Effects 0.000 description 3
- 230000002906 microbiologic effect Effects 0.000 description 3
- 244000005706 microflora Species 0.000 description 3
- 230000008782 phagocytosis Effects 0.000 description 3
- 235000008160 pyridoxine Nutrition 0.000 description 3
- 239000011677 pyridoxine Substances 0.000 description 3
- 239000000523 sample Substances 0.000 description 3
- ZRKFYGHZFMAOKI-QMGMOQQFSA-N tgfbeta Chemical compound C([C@H](NC(=O)[C@H](C(C)C)NC(=O)CNC(=O)[C@H](CCC(O)=O)NC(=O)[C@H](CCCNC(N)=N)NC(=O)[C@H](CC(N)=O)NC(=O)[C@H](CC(C)C)NC(=O)[C@H]([C@@H](C)O)NC(=O)[C@H](CCC(O)=O)NC(=O)[C@H]([C@@H](C)O)NC(=O)[C@H](CC(C)C)NC(=O)CNC(=O)[C@H](C)NC(=O)[C@H](CO)NC(=O)[C@H](CCC(N)=O)NC(=O)[C@@H](NC(=O)[C@H](C)NC(=O)[C@H](C)NC(=O)[C@@H](NC(=O)[C@H](CC(C)C)NC(=O)[C@@H](N)CCSC)C(C)C)[C@@H](C)CC)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(=O)N[C@@H](CC=1C=CC=CC=1)C(=O)N[C@@H](C)C(=O)N1[C@@H](CCC1)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](C)C(=O)N[C@@H](CC=1C=CC=CC=1)C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)N[C@@H](C)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N1[C@@H](CCC1)C(=O)N1[C@@H](CCC1)C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(O)=O)C1=CC=C(O)C=C1 ZRKFYGHZFMAOKI-QMGMOQQFSA-N 0.000 description 3
- 238000011287 therapeutic dose Methods 0.000 description 3
- GHOKWGTUZJEAQD-ZETCQYMHSA-N (D)-(+)-Pantothenic acid Chemical compound OCC(C)(C)[C@@H](O)C(=O)NCCC(O)=O GHOKWGTUZJEAQD-ZETCQYMHSA-N 0.000 description 2
- 102100036475 Alanine aminotransferase 1 Human genes 0.000 description 2
- 108010082126 Alanine transaminase Proteins 0.000 description 2
- 102100022749 Aminopeptidase N Human genes 0.000 description 2
- 208000023275 Autoimmune disease Diseases 0.000 description 2
- 241000222122 Candida albicans Species 0.000 description 2
- 108010078791 Carrier Proteins Proteins 0.000 description 2
- 238000001712 DNA sequencing Methods 0.000 description 2
- 241000194033 Enterococcus Species 0.000 description 2
- 241000194031 Enterococcus faecium Species 0.000 description 2
- 241001360526 Escherichia coli ATCC 25922 Species 0.000 description 2
- MHAJPDPJQMAIIY-UHFFFAOYSA-N Hydrogen peroxide Chemical compound OO MHAJPDPJQMAIIY-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- XEEYBQQBJWHFJM-UHFFFAOYSA-N Iron Chemical compound [Fe] XEEYBQQBJWHFJM-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 108090000301 Membrane transport proteins Proteins 0.000 description 2
- 102000003939 Membrane transport proteins Human genes 0.000 description 2
- OVBPIULPVIDEAO-UHFFFAOYSA-N N-Pteroyl-L-glutaminsaeure Natural products C=1N=C2NC(N)=NC(=O)C2=NC=1CNC1=CC=C(C(=O)NC(CCC(O)=O)C(O)=O)C=C1 OVBPIULPVIDEAO-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 108091028043 Nucleic acid sequence Proteins 0.000 description 2
- 241000283973 Oryctolagus cuniculus Species 0.000 description 2
- NBIIXXVUZAFLBC-UHFFFAOYSA-N Phosphoric acid Chemical compound OP(O)(O)=O NBIIXXVUZAFLBC-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 241000589516 Pseudomonas Species 0.000 description 2
- 241000589517 Pseudomonas aeruginosa Species 0.000 description 2
- AUNGANRZJHBGPY-SCRDCRAPSA-N Riboflavin Natural products OC[C@@H](O)[C@@H](O)[C@@H](O)CN1C=2C=C(C)C(C)=CC=2N=C2C1=NC(=O)NC2=O AUNGANRZJHBGPY-SCRDCRAPSA-N 0.000 description 2
- 240000004808 Saccharomyces cerevisiae Species 0.000 description 2
- 210000001744 T-lymphocyte Anatomy 0.000 description 2
- 238000008050 Total Bilirubin Reagent Methods 0.000 description 2
- 108060008682 Tumor Necrosis Factor Proteins 0.000 description 2
- 102000000852 Tumor Necrosis Factor-alpha Human genes 0.000 description 2
- 238000010521 absorption reaction Methods 0.000 description 2
- 238000009825 accumulation Methods 0.000 description 2
- 230000004913 activation Effects 0.000 description 2
- 229960000723 ampicillin Drugs 0.000 description 2
- AVKUERGKIZMTKX-NJBDSQKTSA-N ampicillin Chemical compound C1([C@@H](N)C(=O)N[C@H]2[C@H]3SC([C@@H](N3C2=O)C(O)=O)(C)C)=CC=CC=C1 AVKUERGKIZMTKX-NJBDSQKTSA-N 0.000 description 2
- 230000000845 anti-microbial effect Effects 0.000 description 2
- 230000001857 anti-mycotic effect Effects 0.000 description 2
- 239000000427 antigen Substances 0.000 description 2
- 108091007433 antigens Proteins 0.000 description 2
- 102000036639 antigens Human genes 0.000 description 2
- 238000013459 approach Methods 0.000 description 2
- 230000001363 autoimmune Effects 0.000 description 2
- 230000000721 bacterilogical effect Effects 0.000 description 2
- 230000037396 body weight Effects 0.000 description 2
- 239000002775 capsule Substances 0.000 description 2
- 230000034994 death Effects 0.000 description 2
- 230000003247 decreasing effect Effects 0.000 description 2
- 238000013461 design Methods 0.000 description 2
- 238000001514 detection method Methods 0.000 description 2
- 238000003745 diagnosis Methods 0.000 description 2
- 230000029087 digestion Effects 0.000 description 2
- 230000001079 digestive effect Effects 0.000 description 2
- 238000001493 electron microscopy Methods 0.000 description 2
- 239000002158 endotoxin Substances 0.000 description 2
- 238000005516 engineering process Methods 0.000 description 2
- 210000000981 epithelium Anatomy 0.000 description 2
- 229960000304 folic acid Drugs 0.000 description 2
- 235000019152 folic acid Nutrition 0.000 description 2
- 239000011724 folic acid Substances 0.000 description 2
- 230000002068 genetic effect Effects 0.000 description 2
- 230000012010 growth Effects 0.000 description 2
- 230000028993 immune response Effects 0.000 description 2
- 230000002134 immunopathologic effect Effects 0.000 description 2
- 230000003993 interaction Effects 0.000 description 2
- 210000005027 intestinal barrier Anatomy 0.000 description 2
- 230000007358 intestinal barrier function Effects 0.000 description 2
- JVTAAEKCZFNVCJ-UHFFFAOYSA-N lactic acid Chemical compound CC(O)C(O)=O JVTAAEKCZFNVCJ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 229940039696 lactobacillus Drugs 0.000 description 2
- 230000003902 lesion Effects 0.000 description 2
- 101150114896 lipA2 gene Proteins 0.000 description 2
- 229920006008 lipopolysaccharide Polymers 0.000 description 2
- 210000004698 lymphocyte Anatomy 0.000 description 2
- HQKMJHAJHXVSDF-UHFFFAOYSA-L magnesium stearate Chemical compound [Mg+2].CCCCCCCCCCCCCCCCCC([O-])=O.CCCCCCCCCCCCCCCCCC([O-])=O HQKMJHAJHXVSDF-UHFFFAOYSA-L 0.000 description 2
- 210000001161 mammalian embryo Anatomy 0.000 description 2
- 239000003550 marker Substances 0.000 description 2
- 230000004060 metabolic process Effects 0.000 description 2
- 229960000282 metronidazole Drugs 0.000 description 2
- VAOCPAMSLUNLGC-UHFFFAOYSA-N metronidazole Chemical compound CC1=NC=C([N+]([O-])=O)N1CCO VAOCPAMSLUNLGC-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 244000000010 microbial pathogen Species 0.000 description 2
- 210000000110 microvilli Anatomy 0.000 description 2
- 238000012986 modification Methods 0.000 description 2
- 230000004048 modification Effects 0.000 description 2
- 230000000877 morphologic effect Effects 0.000 description 2
- 210000000214 mouth Anatomy 0.000 description 2
- 238000010606 normalization Methods 0.000 description 2
- 239000002773 nucleotide Substances 0.000 description 2
- 125000003729 nucleotide group Chemical group 0.000 description 2
- 230000008506 pathogenesis Effects 0.000 description 2
- 230000007918 pathogenicity Effects 0.000 description 2
- 230000035515 penetration Effects 0.000 description 2
- 210000005259 peripheral blood Anatomy 0.000 description 2
- 239000011886 peripheral blood Substances 0.000 description 2
- 238000007747 plating Methods 0.000 description 2
- 230000008569 process Effects 0.000 description 2
- RADKZDMFGJYCBB-UHFFFAOYSA-N pyridoxal hydrochloride Natural products CC1=NC=C(CO)C(C=O)=C1O RADKZDMFGJYCBB-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 210000000664 rectum Anatomy 0.000 description 2
- 230000001105 regulatory effect Effects 0.000 description 2
- 238000012552 review Methods 0.000 description 2
- 210000002784 stomach Anatomy 0.000 description 2
- 238000003860 storage Methods 0.000 description 2
- 239000000758 substrate Substances 0.000 description 2
- 208000024891 symptom Diseases 0.000 description 2
- 230000009897 systematic effect Effects 0.000 description 2
- 230000001225 therapeutic effect Effects 0.000 description 2
- 231100000331 toxic Toxicity 0.000 description 2
- 230000002588 toxic effect Effects 0.000 description 2
- 239000003053 toxin Substances 0.000 description 2
- 231100000765 toxin Toxicity 0.000 description 2
- 108700012359 toxins Proteins 0.000 description 2
- 235000019156 vitamin B Nutrition 0.000 description 2
- 239000011720 vitamin B Substances 0.000 description 2
- 235000019158 vitamin B6 Nutrition 0.000 description 2
- 239000011726 vitamin B6 Substances 0.000 description 2
- CTBBEXWJRAPJIZ-VHPBLNRZSA-N (1S,2S,3S,6R,8R,9S,10R)-2-benzoyl-1,3,8,10-tetrahydroxy-9-(4-methoxy-6-oxopyran-2-yl)-5-oxatricyclo[4.3.1.03,8]decan-4-one Chemical group O1C(=O)C=C(OC)C=C1[C@H]1[C@]([C@@H]2O)(O)[C@H](C(=O)C=3C=CC=CC=3)[C@@]3(O)C(=O)O[C@@H]2C[C@]31O CTBBEXWJRAPJIZ-VHPBLNRZSA-N 0.000 description 1
- MZOFCQQQCNRIBI-VMXHOPILSA-N (3s)-4-[[(2s)-1-[[(2s)-1-[[(1s)-1-carboxy-2-hydroxyethyl]amino]-4-methyl-1-oxopentan-2-yl]amino]-5-(diaminomethylideneamino)-1-oxopentan-2-yl]amino]-3-[[2-[[(2s)-2,6-diaminohexanoyl]amino]acetyl]amino]-4-oxobutanoic acid Chemical compound OC[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@H](CC(C)C)NC(=O)[C@H](CCCN=C(N)N)NC(=O)[C@H](CC(O)=O)NC(=O)CNC(=O)[C@@H](N)CCCCN MZOFCQQQCNRIBI-VMXHOPILSA-N 0.000 description 1
- 108091032973 (ribonucleotides)n+m Proteins 0.000 description 1
- OWEGMIWEEQEYGQ-UHFFFAOYSA-N 100676-05-9 Natural products OC1C(O)C(O)C(CO)OC1OCC1C(O)C(O)C(O)C(OC2C(OC(O)C(O)C2O)CO)O1 OWEGMIWEEQEYGQ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 208000004998 Abdominal Pain Diseases 0.000 description 1
- 206010000060 Abdominal distension Diseases 0.000 description 1
- 241000589291 Acinetobacter Species 0.000 description 1
- 101100511537 Aeropyrum pernix (strain ATCC 700893 / DSM 11879 / JCM 9820 / NBRC 100138 / K1) lplA gene Proteins 0.000 description 1
- 101150036945 Ahcyl1 gene Proteins 0.000 description 1
- 239000005995 Aluminium silicate Substances 0.000 description 1
- 102000044503 Antimicrobial Peptides Human genes 0.000 description 1
- 108700042778 Antimicrobial Peptides Proteins 0.000 description 1
- 108010003415 Aspartate Aminotransferases Proteins 0.000 description 1
- 102000004625 Aspartate Aminotransferases Human genes 0.000 description 1
- 244000063299 Bacillus subtilis Species 0.000 description 1
- 101100381793 Bacillus subtilis (strain 168) bioK gene Proteins 0.000 description 1
- 101100170444 Bacillus subtilis (strain 168) dhbA gene Proteins 0.000 description 1
- 101100226150 Bacillus subtilis (strain 168) estA gene Proteins 0.000 description 1
- 101100226155 Bacillus subtilis (strain 168) estB gene Proteins 0.000 description 1
- 101100120324 Bacillus subtilis (strain 168) fmnP gene Proteins 0.000 description 1
- 101100325906 Bacillus subtilis (strain 168) ganA gene Proteins 0.000 description 1
- 101100174784 Bacillus subtilis (strain 168) ganR gene Proteins 0.000 description 1
- 101100455969 Bacillus subtilis (strain 168) mdxK gene Proteins 0.000 description 1
- 101100186385 Bacillus subtilis (strain 168) naiP gene Proteins 0.000 description 1
- 101100433014 Bacillus subtilis (strain 168) yttB gene Proteins 0.000 description 1
- 231100000699 Bacterial toxin Toxicity 0.000 description 1
- 238000011749 CBA mouse Methods 0.000 description 1
- OYPRJOBELJOOCE-UHFFFAOYSA-N Calcium Chemical compound [Ca] OYPRJOBELJOOCE-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 241000222120 Candida <Saccharomycetales> Species 0.000 description 1
- 102000005367 Carboxypeptidases Human genes 0.000 description 1
- 108010006303 Carboxypeptidases Proteins 0.000 description 1
- 206010057248 Cell death Diseases 0.000 description 1
- GHOKWGTUZJEAQD-UHFFFAOYSA-N Chick antidermatitis factor Natural products OCC(C)(C)C(O)C(=O)NCCC(O)=O GHOKWGTUZJEAQD-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 241000700112 Chinchilla Species 0.000 description 1
- 101100412905 Chloroflexus aurantiacus (strain ATCC 29366 / DSM 635 / J-10-fl) ribX gene Proteins 0.000 description 1
- 101100412913 Chloroflexus aurantiacus (strain ATCC 29366 / DSM 635 / J-10-fl) ribY gene Proteins 0.000 description 1
- 208000031404 Chromosome Aberrations Diseases 0.000 description 1
- 206010009944 Colon cancer Diseases 0.000 description 1
- 241001337994 Cryptococcus <scale insect> Species 0.000 description 1
- AUNGANRZJHBGPY-UHFFFAOYSA-N D-Lyxoflavin Natural products OCC(O)C(O)C(O)CN1C=2C=C(C)C(C)=CC=2N=C2C1=NC(=O)NC2=O AUNGANRZJHBGPY-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- HMFHBZSHGGEWLO-SOOFDHNKSA-N D-ribofuranose Chemical compound OC[C@H]1OC(O)[C@H](O)[C@@H]1O HMFHBZSHGGEWLO-SOOFDHNKSA-N 0.000 description 1
- 108020004414 DNA Proteins 0.000 description 1
- 238000007399 DNA isolation Methods 0.000 description 1
- 101710088194 Dehydrogenase Proteins 0.000 description 1
- 206010012735 Diarrhoea Diseases 0.000 description 1
- 101100438359 Dictyostelium discoideum captC gene Proteins 0.000 description 1
- 238000002965 ELISA Methods 0.000 description 1
- 241000196324 Embryophyta Species 0.000 description 1
- 241000305071 Enterobacterales Species 0.000 description 1
- CTBBEXWJRAPJIZ-UHFFFAOYSA-N Enterocin Natural products O1C(=O)C=C(OC)C=C1C1C(C2O)(O)C(C(=O)C=3C=CC=CC=3)C3(O)C(=O)OC2CC31O CTBBEXWJRAPJIZ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 241000943303 Enterococcus faecalis ATCC 29212 Species 0.000 description 1
- 241000588724 Escherichia coli Species 0.000 description 1
- 101100218845 Escherichia coli (strain K12) bioH gene Proteins 0.000 description 1
- 101100494110 Escherichia coli (strain K12) birA gene Proteins 0.000 description 1
- 101100310086 Escherichia coli (strain K12) serC gene Proteins 0.000 description 1
- 241001302654 Escherichia coli Nissle 1917 Species 0.000 description 1
- 208000010201 Exanthema Diseases 0.000 description 1
- 102100031509 Fibrillin-1 Human genes 0.000 description 1
- 241000233866 Fungi Species 0.000 description 1
- 101150102398 Galt gene Proteins 0.000 description 1
- 108020004206 Gamma-glutamyltransferase Proteins 0.000 description 1
- 102000053187 Glucuronidase Human genes 0.000 description 1
- 108010060309 Glucuronidase Proteins 0.000 description 1
- 102000003886 Glycoproteins Human genes 0.000 description 1
- 108090000288 Glycoproteins Proteins 0.000 description 1
- 102000051366 Glycosyltransferases Human genes 0.000 description 1
- 108700023372 Glycosyltransferases Proteins 0.000 description 1
- 208000009889 Herpes Simplex Diseases 0.000 description 1
- 241000282412 Homo Species 0.000 description 1
- 101000846893 Homo sapiens Fibrillin-1 Proteins 0.000 description 1
- 108010003272 Hyaluronate lyase Proteins 0.000 description 1
- 102000001974 Hyaluronidases Human genes 0.000 description 1
- 102000004157 Hydrolases Human genes 0.000 description 1
- 108010002352 Interleukin-1 Proteins 0.000 description 1
- 108090001005 Interleukin-6 Proteins 0.000 description 1
- 101150013996 LIP gene Proteins 0.000 description 1
- 101100454318 Lactobacillus casei lacT gene Proteins 0.000 description 1
- 241000917009 Lactobacillus rhamnosus GG Species 0.000 description 1
- GUBGYTABKSRVRQ-QKKXKWKRSA-N Lactose Natural products OC[C@H]1O[C@@H](O[C@H]2[C@H](O)[C@@H](O)C(O)O[C@@H]2CO)[C@H](O)[C@@H](O)[C@H]1O GUBGYTABKSRVRQ-QKKXKWKRSA-N 0.000 description 1
- 102000003960 Ligases Human genes 0.000 description 1
- 108090000364 Ligases Proteins 0.000 description 1
- 241000186781 Listeria Species 0.000 description 1
- 241000092431 Listeria monocytogenes EGD Species 0.000 description 1
- 241000989747 Maba Species 0.000 description 1
- GUBGYTABKSRVRQ-PICCSMPSSA-N Maltose Natural products O[C@@H]1[C@@H](O)[C@H](O)[C@@H](CO)O[C@@H]1O[C@@H]1[C@@H](CO)OC(O)[C@H](O)[C@H]1O GUBGYTABKSRVRQ-PICCSMPSSA-N 0.000 description 1
- 241000124008 Mammalia Species 0.000 description 1
- 208000001826 Marfan syndrome Diseases 0.000 description 1
- 208000031903 Marfan syndrome type 1 Diseases 0.000 description 1
- 108060004795 Methyltransferase Proteins 0.000 description 1
- 102000016397 Methyltransferase Human genes 0.000 description 1
- 102000014171 Milk Proteins Human genes 0.000 description 1
- 108010011756 Milk Proteins Proteins 0.000 description 1
- 241001430197 Mollicutes Species 0.000 description 1
- 241000699666 Mus <mouse, genus> Species 0.000 description 1
- 101100518566 Oxalobacter formigenes oxlT gene Proteins 0.000 description 1
- 101150016911 PDXK gene Proteins 0.000 description 1
- 229910019142 PO4 Inorganic materials 0.000 description 1
- 108090000279 Peptidyltransferases Proteins 0.000 description 1
- 244000110797 Polygonum persicaria Species 0.000 description 1
- 241000605861 Prevotella Species 0.000 description 1
- 101150071963 RBSK gene Proteins 0.000 description 1
- 102000048125 Riboflavin kinases Human genes 0.000 description 1
- 102000004431 Riboflavin transporter Human genes 0.000 description 1
- PYMYPHUHKUWMLA-LMVFSUKVSA-N Ribose Natural products OC[C@@H](O)[C@@H](O)[C@@H](O)C=O PYMYPHUHKUWMLA-LMVFSUKVSA-N 0.000 description 1
- 241000283984 Rodentia Species 0.000 description 1
- 102000008847 Serpin Human genes 0.000 description 1
- 108050000761 Serpin Proteins 0.000 description 1
- 241000607760 Shigella sonnei Species 0.000 description 1
- 241000191940 Staphylococcus Species 0.000 description 1
- 241000191967 Staphylococcus aureus Species 0.000 description 1
- 241000194017 Streptococcus Species 0.000 description 1
- 101100342648 Streptococcus mutans serotype c (strain ATCC 700610 / UA159) lacD1 gene Proteins 0.000 description 1
- 101100111413 Thermoanaerobacter pseudethanolicus (strain ATCC 33223 / 39E) lacZ gene Proteins 0.000 description 1
- JZRWCGZRTZMZEH-UHFFFAOYSA-N Thiamine Natural products CC1=C(CCO)SC=[N+]1CC1=CN=C(C)N=C1N JZRWCGZRTZMZEH-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 108020004530 Transaldolase Proteins 0.000 description 1
- 102100028601 Transaldolase Human genes 0.000 description 1
- 102000004357 Transferases Human genes 0.000 description 1
- 108090000992 Transferases Proteins 0.000 description 1
- 102000004887 Transforming Growth Factor beta Human genes 0.000 description 1
- 108090001012 Transforming Growth Factor beta Proteins 0.000 description 1
- 206010053613 Type IV hypersensitivity reaction Diseases 0.000 description 1
- 101100128403 Vibrio cholerae serotype O1 (strain ATCC 39315 / El Tor Inaba N16961) hlyC gene Proteins 0.000 description 1
- 229930003316 Vitamin D Natural products 0.000 description 1
- QYSXJUFSXHHAJI-XFEUOLMDSA-N Vitamin D3 Natural products C1(/[C@@H]2CC[C@@H]([C@]2(CCC1)C)[C@H](C)CCCC(C)C)=C/C=C1\C[C@@H](O)CCC1=C QYSXJUFSXHHAJI-XFEUOLMDSA-N 0.000 description 1
- 229930003448 Vitamin K Natural products 0.000 description 1
- 210000000683 abdominal cavity Anatomy 0.000 description 1
- 230000003187 abdominal effect Effects 0.000 description 1
- 230000002378 acidificating effect Effects 0.000 description 1
- 150000007513 acids Chemical class 0.000 description 1
- 230000007059 acute toxicity Effects 0.000 description 1
- 231100000403 acute toxicity Toxicity 0.000 description 1
- 239000000853 adhesive Substances 0.000 description 1
- 230000001070 adhesive effect Effects 0.000 description 1
- 239000011543 agarose gel Substances 0.000 description 1
- 150000001298 alcohols Chemical class 0.000 description 1
- 102000004139 alpha-Amylases Human genes 0.000 description 1
- 108090000637 alpha-Amylases Proteins 0.000 description 1
- HMFHBZSHGGEWLO-UHFFFAOYSA-N alpha-D-Furanose-Ribose Natural products OCC1OC(O)C(O)C1O HMFHBZSHGGEWLO-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 230000004075 alteration Effects 0.000 description 1
- 229910000147 aluminium phosphate Inorganic materials 0.000 description 1
- 235000012211 aluminium silicate Nutrition 0.000 description 1
- 229940024606 amino acid Drugs 0.000 description 1
- 235000001014 amino acid Nutrition 0.000 description 1
- 150000001413 amino acids Chemical class 0.000 description 1
- 229940124599 anti-inflammatory drug Drugs 0.000 description 1
- 230000000890 antigenic effect Effects 0.000 description 1
- 239000003963 antioxidant agent Substances 0.000 description 1
- 230000003078 antioxidant effect Effects 0.000 description 1
- 235000006708 antioxidants Nutrition 0.000 description 1
- 230000036528 appetite Effects 0.000 description 1
- 235000019789 appetite Nutrition 0.000 description 1
- QVGXLLKOCUKJST-UHFFFAOYSA-N atomic oxygen Chemical compound [O] QVGXLLKOCUKJST-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- LMEKQMALGUDUQG-UHFFFAOYSA-N azathioprine Chemical compound CN1C=NC([N+]([O-])=O)=C1SC1=NC=NC2=C1NC=N2 LMEKQMALGUDUQG-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 229960002170 azathioprine Drugs 0.000 description 1
- 239000000688 bacterial toxin Substances 0.000 description 1
- 101150029327 bioB gene Proteins 0.000 description 1
- 101150085692 bioC gene Proteins 0.000 description 1
- 101150023452 bioD gene Proteins 0.000 description 1
- 101150032820 bioF gene Proteins 0.000 description 1
- 101150043536 bioH gene Proteins 0.000 description 1
- 101150026811 bioY gene Proteins 0.000 description 1
- 101150083395 bioZ gene Proteins 0.000 description 1
- 230000032770 biofilm formation Effects 0.000 description 1
- 238000007622 bioinformatic analysis Methods 0.000 description 1
- 230000004071 biological effect Effects 0.000 description 1
- 230000033228 biological regulation Effects 0.000 description 1
- 108010060453 biotin transporter Proteins 0.000 description 1
- 208000024330 bloating Diseases 0.000 description 1
- 210000004369 blood Anatomy 0.000 description 1
- 239000008280 blood Substances 0.000 description 1
- 230000036760 body temperature Effects 0.000 description 1
- 210000001185 bone marrow Anatomy 0.000 description 1
- 229910052791 calcium Inorganic materials 0.000 description 1
- 239000011575 calcium Substances 0.000 description 1
- 201000011510 cancer Diseases 0.000 description 1
- 229940095731 candida albicans Drugs 0.000 description 1
- 150000001720 carbohydrates Chemical class 0.000 description 1
- 235000014633 carbohydrates Nutrition 0.000 description 1
- 210000002421 cell wall Anatomy 0.000 description 1
- 230000001413 cellular effect Effects 0.000 description 1
- 235000013339 cereals Nutrition 0.000 description 1
- 230000008859 change Effects 0.000 description 1
- 238000012512 characterization method Methods 0.000 description 1
- 231100000005 chromosome aberration Toxicity 0.000 description 1
- 230000006020 chronic inflammation Effects 0.000 description 1
- 230000007665 chronic toxicity Effects 0.000 description 1
- 231100000160 chronic toxicity Toxicity 0.000 description 1
- 238000003776 cleavage reaction Methods 0.000 description 1
- 206010009887 colitis Diseases 0.000 description 1
- 208000029742 colonic neoplasm Diseases 0.000 description 1
- 230000000295 complement effect Effects 0.000 description 1
- 239000003246 corticosteroid Substances 0.000 description 1
- 229960001334 corticosteroids Drugs 0.000 description 1
- 235000020247 cow milk Nutrition 0.000 description 1
- 238000012136 culture method Methods 0.000 description 1
- 230000009089 cytolysis Effects 0.000 description 1
- 230000001086 cytosolic effect Effects 0.000 description 1
- 238000007405 data analysis Methods 0.000 description 1
- 235000005911 diet Nutrition 0.000 description 1
- 230000037213 diet Effects 0.000 description 1
- 235000014113 dietary fatty acids Nutrition 0.000 description 1
- 230000004069 differentiation Effects 0.000 description 1
- 210000002249 digestive system Anatomy 0.000 description 1
- 230000008034 disappearance Effects 0.000 description 1
- 101150075463 dltD gene Proteins 0.000 description 1
- 235000013399 edible fruits Nutrition 0.000 description 1
- 239000012636 effector Substances 0.000 description 1
- 230000002708 enhancing effect Effects 0.000 description 1
- 101150032495 entA gene Proteins 0.000 description 1
- 101150094817 entB gene Proteins 0.000 description 1
- 108010049056 enterocin A Proteins 0.000 description 1
- 108010049051 enterocin B Proteins 0.000 description 1
- 208000010227 enterocolitis Diseases 0.000 description 1
- 230000006862 enzymatic digestion Effects 0.000 description 1
- 210000005081 epithelial layer Anatomy 0.000 description 1
- 150000002148 esters Chemical class 0.000 description 1
- 210000003527 eukaryotic cell Anatomy 0.000 description 1
- 201000005884 exanthem Diseases 0.000 description 1
- 229930195729 fatty acid Natural products 0.000 description 1
- 239000000194 fatty acid Substances 0.000 description 1
- 150000004665 fatty acids Chemical class 0.000 description 1
- 230000002349 favourable effect Effects 0.000 description 1
- 230000002550 fecal effect Effects 0.000 description 1
- 230000001605 fetal effect Effects 0.000 description 1
- 210000003754 fetus Anatomy 0.000 description 1
- 210000002950 fibroblast Anatomy 0.000 description 1
- 101150002054 galE gene Proteins 0.000 description 1
- 101150045500 galK gene Proteins 0.000 description 1
- 101150054547 galM gene Proteins 0.000 description 1
- 101150093502 galR gene Proteins 0.000 description 1
- 102000006640 gamma-Glutamyltransferase Human genes 0.000 description 1
- 239000007789 gas Substances 0.000 description 1
- 210000002175 goblet cell Anatomy 0.000 description 1
- 230000036541 health Effects 0.000 description 1
- 230000002489 hematologic effect Effects 0.000 description 1
- 230000002949 hemolytic effect Effects 0.000 description 1
- 210000003494 hepatocyte Anatomy 0.000 description 1
- 238000010562 histological examination Methods 0.000 description 1
- 239000003864 humus Substances 0.000 description 1
- 229960002773 hyaluronidase Drugs 0.000 description 1
- 201000008254 ileocolitis Diseases 0.000 description 1
- 230000005934 immune activation Effects 0.000 description 1
- 230000008105 immune reaction Effects 0.000 description 1
- 229940099472 immunoglobulin a Drugs 0.000 description 1
- 239000002955 immunomodulating agent Substances 0.000 description 1
- 229940121354 immunomodulator Drugs 0.000 description 1
- 230000003308 immunostimulating effect Effects 0.000 description 1
- 230000002625 immunotoxic effect Effects 0.000 description 1
- 230000007688 immunotoxicity Effects 0.000 description 1
- 231100000386 immunotoxicity Toxicity 0.000 description 1
- 230000001771 impaired effect Effects 0.000 description 1
- 238000002513 implantation Methods 0.000 description 1
- 238000000338 in vitro Methods 0.000 description 1
- 238000001727 in vivo Methods 0.000 description 1
- 239000012678 infectious agent Substances 0.000 description 1
- 229960000598 infliximab Drugs 0.000 description 1
- 230000035987 intoxication Effects 0.000 description 1
- 231100000566 intoxication Toxicity 0.000 description 1
- 230000003834 intracellular effect Effects 0.000 description 1
- 238000011835 investigation Methods 0.000 description 1
- 150000002500 ions Chemical class 0.000 description 1
- 229910052742 iron Inorganic materials 0.000 description 1
- 238000002955 isolation Methods 0.000 description 1
- NLYAJNPCOHFWQQ-UHFFFAOYSA-N kaolin Chemical compound O.O.O=[Al]O[Si](=O)O[Si](=O)O[Al]=O NLYAJNPCOHFWQQ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 101150086432 lacA gene Proteins 0.000 description 1
- 101150001540 lacB gene Proteins 0.000 description 1
- 101150062200 lacC gene Proteins 0.000 description 1
- 101150007118 lacD gene Proteins 0.000 description 1
- 101150067584 lacE gene Proteins 0.000 description 1
- 101150009839 lacF gene Proteins 0.000 description 1
- 101150073784 lacG gene Proteins 0.000 description 1
- 101150043267 lacR gene Proteins 0.000 description 1
- 239000004310 lactic acid Substances 0.000 description 1
- 235000014655 lactic acid Nutrition 0.000 description 1
- 239000008101 lactose Substances 0.000 description 1
- 230000001665 lethal effect Effects 0.000 description 1
- 101150005467 lifO gene Proteins 0.000 description 1
- 101150091094 lipA gene Proteins 0.000 description 1
- 101150056138 lipA1 gene Proteins 0.000 description 1
- 101150031897 lipB gene Proteins 0.000 description 1
- 101150061093 lipL gene Proteins 0.000 description 1
- 101150002434 lipM gene Proteins 0.000 description 1
- 150000002632 lipids Chemical class 0.000 description 1
- 235000019136 lipoic acid Nutrition 0.000 description 1
- 210000004185 liver Anatomy 0.000 description 1
- 101150078797 luxS gene Proteins 0.000 description 1
- 101150068528 mabA gene Proteins 0.000 description 1
- 210000002540 macrophage Anatomy 0.000 description 1
- 235000012245 magnesium oxide Nutrition 0.000 description 1
- 235000019359 magnesium stearate Nutrition 0.000 description 1
- 238000012423 maintenance Methods 0.000 description 1
- 101150050107 malF gene Proteins 0.000 description 1
- 101150112360 malG gene Proteins 0.000 description 1
- 101150003248 malK gene Proteins 0.000 description 1
- 229940049920 malate Drugs 0.000 description 1
- BJEPYKJPYRNKOW-UHFFFAOYSA-N malic acid Chemical compound OC(=O)C(O)CC(O)=O BJEPYKJPYRNKOW-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 230000010534 mechanism of action Effects 0.000 description 1
- 229940126601 medicinal product Drugs 0.000 description 1
- KBOPZPXVLCULAV-UHFFFAOYSA-N mesalamine Chemical compound NC1=CC=C(O)C(C(O)=O)=C1 KBOPZPXVLCULAV-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 229960004963 mesalazine Drugs 0.000 description 1
- 238000010197 meta-analysis Methods 0.000 description 1
- 230000000813 microbial effect Effects 0.000 description 1
- 231100000243 mutagenic effect Toxicity 0.000 description 1
- 230000003505 mutagenic effect Effects 0.000 description 1
- 230000007886 mutagenicity Effects 0.000 description 1
- 231100000299 mutagenicity Toxicity 0.000 description 1
- 229960003512 nicotinic acid Drugs 0.000 description 1
- 235000001968 nicotinic acid Nutrition 0.000 description 1
- PVNIIMVLHYAWGP-UHFFFAOYSA-N nicotinic acid Natural products OC(=O)C1=CC=CN=C1 PVNIIMVLHYAWGP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 239000011664 nicotinic acid Substances 0.000 description 1
- 231100000252 nontoxic Toxicity 0.000 description 1
- 230000003000 nontoxic effect Effects 0.000 description 1
- 238000010899 nucleation Methods 0.000 description 1
- 244000039328 opportunistic pathogen Species 0.000 description 1
- 208000023112 overgrowth syndrome Diseases 0.000 description 1
- 229940094443 oxytocics prostaglandins Drugs 0.000 description 1
- 229940055726 pantothenic acid Drugs 0.000 description 1
- 235000019161 pantothenic acid Nutrition 0.000 description 1
- 239000011713 pantothenic acid Substances 0.000 description 1
- 230000001936 parietal effect Effects 0.000 description 1
- 231100000915 pathological change Toxicity 0.000 description 1
- 230000036285 pathological change Effects 0.000 description 1
- 230000037361 pathway Effects 0.000 description 1
- 101150103641 pdxA gene Proteins 0.000 description 1
- 101150037869 pdxB gene Proteins 0.000 description 1
- 101150075473 pdxJ gene Proteins 0.000 description 1
- 210000001986 peyer's patch Anatomy 0.000 description 1
- 239000000546 pharmaceutical excipient Substances 0.000 description 1
- 239000010452 phosphate Substances 0.000 description 1
- SHUZOJHMOBOZST-UHFFFAOYSA-N phylloquinone Natural products CC(C)CCCCC(C)CCC(C)CCCC(=CCC1=C(C)C(=O)c2ccccc2C1=O)C SHUZOJHMOBOZST-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 235000013406 prebiotics Nutrition 0.000 description 1
- 238000004321 preservation Methods 0.000 description 1
- 238000012545 processing Methods 0.000 description 1
- 150000003180 prostaglandins Chemical class 0.000 description 1
- 230000002797 proteolythic effect Effects 0.000 description 1
- 206010037844 rash Diseases 0.000 description 1
- 101150042846 rbsA gene Proteins 0.000 description 1
- 101150092209 rbsB gene Proteins 0.000 description 1
- 101150034471 rbsC gene Proteins 0.000 description 1
- 101150113457 rbsD gene Proteins 0.000 description 1
- 101150015201 rbsR gene Proteins 0.000 description 1
- 238000003753 real-time PCR Methods 0.000 description 1
- 230000009467 reduction Effects 0.000 description 1
- 230000008929 regeneration Effects 0.000 description 1
- 238000011069 regeneration method Methods 0.000 description 1
- 101150116245 rfbX gene Proteins 0.000 description 1
- 101150111905 ribK gene Proteins 0.000 description 1
- 101150055142 ribL gene Proteins 0.000 description 1
- 101150027586 ribU gene Proteins 0.000 description 1
- 229960002477 riboflavin Drugs 0.000 description 1
- 235000019192 riboflavin Nutrition 0.000 description 1
- 239000002151 riboflavin Substances 0.000 description 1
- 108091000042 riboflavin kinase Proteins 0.000 description 1
- 108020001053 riboflavin transporter Proteins 0.000 description 1
- 230000007017 scission Effects 0.000 description 1
- 239000003001 serine protease inhibitor Substances 0.000 description 1
- 229940115939 shigella sonnei Drugs 0.000 description 1
- 231100000046 skin rash Toxicity 0.000 description 1
- 210000001082 somatic cell Anatomy 0.000 description 1
- 238000001228 spectrum Methods 0.000 description 1
- 230000002269 spontaneous effect Effects 0.000 description 1
- 230000006641 stabilisation Effects 0.000 description 1
- 238000011105 stabilization Methods 0.000 description 1
- 238000011272 standard treatment Methods 0.000 description 1
- 239000007858 starting material Substances 0.000 description 1
- 230000000638 stimulation Effects 0.000 description 1
- 231100000456 subacute toxicity Toxicity 0.000 description 1
- 235000000346 sugar Nutrition 0.000 description 1
- 150000008163 sugars Chemical class 0.000 description 1
- 230000004083 survival effect Effects 0.000 description 1
- 235000019722 synbiotics Nutrition 0.000 description 1
- 230000009885 systemic effect Effects 0.000 description 1
- 238000002626 targeted therapy Methods 0.000 description 1
- 238000012360 testing method Methods 0.000 description 1
- 235000019157 thiamine Nutrition 0.000 description 1
- 229960003495 thiamine Drugs 0.000 description 1
- 239000011721 thiamine Substances 0.000 description 1
- 230000008719 thickening Effects 0.000 description 1
- 229960002663 thioctic acid Drugs 0.000 description 1
- 208000037816 tissue injury Diseases 0.000 description 1
- 231100000419 toxicity Toxicity 0.000 description 1
- 230000001988 toxicity Effects 0.000 description 1
- 231100000820 toxicity test Toxicity 0.000 description 1
- 230000002103 transcriptional effect Effects 0.000 description 1
- 230000032258 transport Effects 0.000 description 1
- 230000005951 type IV hypersensitivity Effects 0.000 description 1
- 208000027930 type IV hypersensitivity disease Diseases 0.000 description 1
- 241000712461 unidentified influenza virus Species 0.000 description 1
- 210000001215 vagina Anatomy 0.000 description 1
- 230000035899 viability Effects 0.000 description 1
- 210000001835 viscera Anatomy 0.000 description 1
- 238000012800 visualization Methods 0.000 description 1
- 235000019166 vitamin D Nutrition 0.000 description 1
- 239000011710 vitamin D Substances 0.000 description 1
- 150000003710 vitamin D derivatives Chemical class 0.000 description 1
- 239000011712 vitamin K Substances 0.000 description 1
- 235000019168 vitamin K Nutrition 0.000 description 1
- 150000003721 vitamin K derivatives Chemical class 0.000 description 1
- 229940046008 vitamin d Drugs 0.000 description 1
- 229940046010 vitamin k Drugs 0.000 description 1
- XLYOFNOQVPJJNP-UHFFFAOYSA-N water Substances O XLYOFNOQVPJJNP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 238000005303 weighing Methods 0.000 description 1
- 239000002676 xenobiotic agent Substances 0.000 description 1
- 101150024903 yceI gene Proteins 0.000 description 1
Images
Classifications
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
- A61K39/00—Medicinal preparations containing antigens or antibodies
- A61K39/02—Bacterial antigens
- A61K39/05—Actinobacteria, e.g. Actinomyces, Streptomyces, Nocardia, Bifidobacterium, Gardnerella, Corynebacterium; Propionibacterium
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
- A61K39/00—Medicinal preparations containing antigens or antibodies
- A61K39/02—Bacterial antigens
- A61K39/09—Lactobacillales, e.g. aerococcus, enterococcus, lactobacillus, lactococcus, streptococcus
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
- A61K9/00—Medicinal preparations characterised by special physical form
- A61K9/0012—Galenical forms characterised by the site of application
- A61K9/0019—Injectable compositions; Intramuscular, intravenous, arterial, subcutaneous administration; Compositions to be administered through the skin in an invasive manner
- A61K9/0021—Intradermal administration, e.g. through microneedle arrays, needleless injectors
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
- C12Q1/00—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
- C12Q1/68—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving nucleic acids
- C12Q1/6806—Preparing nucleic acids for analysis, e.g. for polymerase chain reaction [PCR] assay
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
- C12Q1/00—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
- C12Q1/68—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving nucleic acids
- C12Q1/6844—Nucleic acid amplification reactions
- C12Q1/686—Polymerase chain reaction [PCR]
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
- C12Q2531/00—Reactions of nucleic acids characterised by
- C12Q2531/10—Reactions of nucleic acids characterised by the purpose being amplify/increase the copy number of target nucleic acid
- C12Q2531/113—PCR
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
- C12Q2561/00—Nucleic acid detection characterised by assay method
- C12Q2561/113—Real time assay
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
- C12Q2565/00—Nucleic acid analysis characterised by mode or means of detection
- C12Q2565/10—Detection mode being characterised by the assay principle
- C12Q2565/125—Electrophoretic separation
Landscapes
- Medicines Containing Material From Animals Or Micro-Organisms (AREA)
Abstract
Изобретение относится к области медицины. Предложена фармацевтическая композиция, проявляющая специфическую противовоспалительную активность на модели экспериментального дисбиоза, состоящая из штаммов Bifidobacterium longum GT15, Lactobacillus rhamnosus K32, Enterococcus faecium L-3. Изобретение может быть использовано для лечения воспалительных заболеваний кишечника. 18 ил., 7 табл., 5 пр.
Description
Область техники, к которой относится изобретение
Изобретение относится к фармакологии и медицине, в частности может быть использовано как основа лекарственного средства для лечения и профилактики воспалительных и аутоиммунных заболеваний кишечника, в том числе неспецифического язвенного колита.
Уровень техники
Воспалительные заболевания кишечника (ВЗК, англ. IBD) представляют собой хронический воспалительный процесс, захватывающий весь кишечник или часть желудочно-кишечного тракта (ЖКТ). Проявляются заболевания болям в животе и диарее, иногда могут возникать внекишечные симптомы: воспаление суставов, кожные высыпания, поражения глаз воспалительного характера; являются фактором риска для развития злокачественных образований, в том числе рака толстого кишечника. ВЗК поражено более 1 миллиона человек в США и 2,5-3 миллиона в Европе. Основными воспалительными заболеваниями кишечника являются неспецифический язвенный колит (НЯК) и болезнь Крона. НЯК - воспалительное заболевание толстой кишки, поражающее, как правило, слизистую оболочку прямой и других отделов толстой кишки (рис. 1). Болезнь Крона характеризуется трансмуральным воспалением, то есть затрагиваются все слои пищеварительной трубки; может поражать все отделы ЖКТ, начиная от полости рта и заканчивая прямой кишкой, с преимущественным поражением терминального отрезка подвздошной кишки и илеоколитом. Причины данных патологий до сих пор точно не известны, хотя предполагается участие генетических факторов, инфекционных агентов и иммунной системы; не исключена аутоиммунная природа заболеваний. Возможный механизм нарушений - наличие какого-то специфического антигена в просвете кишки/крови больных, приводящего к активации Т-лимфоцитов, клеточных макрофагов, фибробластов, к выработке антител, цитокинов, простагландинов, свободного атомарного кислорода, которые и вызывают различные тканевые повреждения. У пациентов обнаруживают патологически высокое число Т-лимфоцитов, антитела к кишечной палочке, белку коровьего молока, липополисахаридам, нарушение баланса между про- и противовоспалительными цитокинами в сторону повышения концентрации провоспалительных цитокинов IL-1, IL-6, IL-8, TNF-α. на фоне снижения IL-10. Кроме того, характерно нарушение равновесия между популяциями Th1- и Th2-лимфоцитов. Терапия ВЗК направлена на достижение ремиссии (клинической, эндоскопической, «излечение» слизистой оболочки) и увеличение ее продолжительности. Стандартное лечение включает использование противовоспалительных препаратов (мезаламина) и кортикостероидов, иммуномодуляторов (азатиоприна), а также моноклональных антител к цитокину ФНО-α (инфликсимаба). Нередко лечение оказывается неэффективным, кроме того, применяемые средства обладают рядом побочных эффектов [Khor В., Gardet А., Xavier R.J. Genetics and pathogenesis of inflammatory bowel disease. 2011. Nature. 474: 307-17].
Несмотря на то, что причины возникновения ВЗК различны, важнейшая роль в возникновении заболевания принадлежит кишечной микробиоте [Kostic A.D., Xavier R.J., Gevers D. The microbiome in inflammatory bowel disease: current status and the future ahead. 2014. Gastroenterology. 146(6):1489-99]. На моделях животных показана роль бактерий в возникновении и развитии ВЗК [Sellon R.K., Tonkonogy S., Schultz M. et al. 1998. Resident Enteric Bacteria Are Necessary for Development of Spontaneous Colitis and Immune System Activation in Interleukin-10-Deficient Mice. Inf, Immunity. 66: 5224-5231]. В исследованиях на людях продемонстрировано, что микробиота больных ВЗК значительно отличается от таковой у здоровых людей [Jeffery I.B., O'Toole P.W., L, et al. 2012. An irritable bowel syndrome subtype defined by species-specific alterations in faecal microbiota. Gut 61(7): 997-1006]. Дисбиоз может играть роль триггера или являться фактором поддержания иммунопатологических реакций. Характерным признаком изменения микробиоты кишечника при ВЗК является снижение количественного содержания бактерий, продуцирующих бутират, в частности, Faecalibacterium prausnitzii [Cao Y., Shen J., Ran Z.H. 2014. Association between Faecalibacterium prausnitzii Reduction and Inflammatory Bowel Disease: A Meta-Analysis and Systematic Review of the Literature. Gastroenterology Research and Practice. Volume 2014. Article ID 872725]. Имеющиеся данные о влиянии дисбиотических процессов на течение ВЗК ставят нормализацию кишечного микробиоценоза в ряд необходимых условий адекватной терапевтической тактики. Актуальным является изучение возможности повышения эффективности лечения ВЗК посредством коррекции микробиоты кишечника с восстановлением его морфофункционального состояния, а также местного и системного иммунитета посредством пробиотиков. Механизм развития НЯК представлен на фигуре 1.
Пробиотики - это живые микроорганизмы, оказывающие при естественном способе их введения (per os) в организм человека позитивное воздействие на физиологические, биохимические и иммунологические реакции через стабилизацию функции его микрофлоры [Цышкова О.Н. 2015. Современный пробиотик: новый взгляд на иммуномодуляцию. Практика педиатора. 32-37]. Пробиотики - это микроорганизмы, присутствующие в нормальной микрофлоре человека и способные к культивированию в лабораторных и промышленных условиях. Подавляющее большинство пробиотиков относится к лактобациллам и бифидобактериям, а также энтерококкам. Лактобациллы встречаются во многих отделах тела человека: в ротовой полости, в желудке, кишечнике, во влагалище, где они являются доминирующими микроорганизмами. Бифидобактерии являются одними из наиболее важных представителей микробиоты толстой кишки человека и других млекопитающих. Непатогенные энтерококки (Е. faecium) заселяют преимущественно тонкий кишечник [Turroni F, Ribbera A, Foroni Е, Douwe van Sinderen, Ventura M. 2008. Human gut micribiota and bifidobacteria: from composition to functionality. Antonie van Leeuwenhoek. 94:35-50; Walter J. Ecological role of Lactobacilli in the gastrointestinal tract: implications for fundamental and biomedical research. 2008. Appl. Env. Microbiol. 74:4985-4996]. Также бактерии, относящиеся к указанным родам (Lactobacillus, Bifidobacterium и Enterococcus), нередко выделяют из пищевых продуктов. В организме человека рассматриваемые пробиотические бактерии выполняют следующие функции [Quigley Е.М.М. 2011. Gut microbiota and the role of probiotics in therapy. Current Opinion in Pharmacology 11:593-603]:
- путем ассоциации со слизистой оболочкой кишечника осуществляют физиологическую защиту кишечного барьера от проникновения микробов и токсинов во внутреннюю среду организма;
- обладают высокой антагонистической активностью по отношению к патогенным и условно патогенным микроорганизмам (за счет выработки органических жирных кислот, бактериоцинов, перекиси водорода);
- участвуют в утилизации пищевых субстратов и активизации пристеночного пищеварения;
- синтезируют аминокислоты и белки, витамин К, пантотеновую кислоту, витамины группы В: В1 - тиамин, В2 - рибофлавин, В3 - никотиновую кислоту, В9 - фолиевую кислоту, витамин В6 - пиридоксин;
- способствуют усилению процессов всасывания через стенки кишечника ионов кальция, железа, витамина D.
- проявляют иммуномодулирующие свойства (как правило, увеличивают фагоцитоз и продукцию иммуноглобулина А, оказывают влияние на продукцию цитокинов и кластерную дифференцировку иммунокомпетентных клеток).
Следует подчеркнуть, что пробиотические свойства присущи не виду, а определенным штаммам. Разные штаммы одного и того же вида имеют различный набор пробиотических свойств. При изучении пробиотических бактерий было показано, что наряду с общими биологическими свойствами ряд штаммов обладает узкоспецифическими функциям, что позволило подойти к созданию пробиотических средств для таргетной терапии различных заболеваний с учетом ведущего звена их патогенеза [Borivart М., Strober W. 2007. The mechanism of action of probiotics. 2007. Curr. Opin Gastroenterol. 23(6): 679-692]. Например, пробиотики, обладающие иммуномодулирующими свойствами, могут как стимулировать, так и ингибировать иммунные реакции. Те из них, которые способны супрессировать иммунный ответ при иммунопатологических состояниях, в частности аутоиммунные реакции, являются кандидатами для поддержания ремиссии и предотвращения рецидивов НЯК в комплексной терапии наряду с уже существующими препаратами.
Пробиотики использовались и продолжают использоваться для профилактики и лечения ВЗК [Vergnolle N., Sallenave J.M., Langella P. Recombinant probiotic bacteria for the prevention and treatment of Inflammatory Bowel Disease (IBD) and Irritable Bowel Syndrome (IBS). 2013. US Patent US 20130344033 A1; Israelsen H. Treatment of IBD and IBS using both probiotic bacteria and fermented cereal as treatment effectors. 2014. US Patent US 8900570 B2; Dai C., Zheng C.-Q., Jiang L.-J. Probiotics and irritable bowel syndrome. 2013. Word J Gatroenterol. 19:5973-5380]. Результаты многолетних исследований суммированы в статье Ghouri с соавторами [Ghouri Y.A., Richards D.M., Rahimi E.F., Krill J.T., Jelinek K.A., DuPont A.W. Systematic review of randomized controlled trials of probiotics, prebiotics, and synbiotics in inflammatory bowel disease. 2014. Clin Exp Gastroenterol. 7:473-87]. Авторы делают вывод, что достаточного количества данных для доказательства участия исследованных пробиотиков в лечении болезни Крона нет, однако есть достоверные данные о положительном их влиянии на возникновение и поддержание ремиссии при лечении язвенного колита. Такими лекарственными препаратами являются VSL#3 (поликомпонентный пробиотик, состоит из смеси штаммов трех видов бифидобактерий, четырех - лактобацилл и одного вида стрептококков), E. coli Nissle 1917 и L. rhamnosus GG. Все штаммы этих пробиотических бактерий были выделены вне территории Российской Федерации, их свойства изучены недостаточно, а контроль за их присутствие в препаратах и продуктах невозможен, так как неизвестен их геном и какие-либо маркерные признаки, необходимые для идентификации чистых культур. Следовательно, можно полагать, что импортированные в РФ комплексные пробиотические препараты и продукты могут быть не такими эффективными, как ожидалось, так как они не полностью адаптированы к применению в российской популяции потребителей, а их эффекты, в частности, влияние на пищеварительную и иммунную системы, не предсказуемы.
Необходимость разработки новых отечественных препаратов продиктована современными тенденциями в изучении и использовании пробиотиков:
1. Использование местных пробиотических штаммов. Как было сказано выше, пробиотические свойства присущи определенным штаммам. При этом разные штаммы имеют различный набор пробиотических свойств. При использовании штаммов бактерий в качестве пробиотических средств важно учитывать происхождение штаммов. Состав кишечной микробиоты людей зависит от их образа жизни, характера питания, места проживания [Prideaux L., Kang S., Wagner J. et al. Impact of ethnicity, geography, and disease on the microbiota in health and inflammatory bowel disease. 2013. Inflamm Bowel Dis. 19(13):2906-18]. Поэтому важно, чтобы в качестве пробиотиков использовались штаммы микроорганизмов, выделенные из организма людей и пищевых продуктов именно в том географическом районе, где предполагается использовать лекарственное средство.
2. Использование пробиотиков с установленной последовательностью генома. Видовая характеристика пробиотических штаммов не всегда строго документирована, а штаммовая характеристика практически отсутствует. Для точной идентификации штамма необходимо определение полной нуклеотидной последовательности и аннотация генома. Эти данные нужны также для подтверждения отсутствия у штаммов нежелательных генов (патогенности, мобильных генов антибиотикоустойчивости и т.д.), для доказательства наличия генов, отвечающих за пробиотические свойства, включая иммуномодулирующие, антимикробные и другие, а также для последующих регулярных проверок сохранности пробиотических генов и стабильности штамма.
3. Использование комплексных препаратов, состоящих из нескольких штаммов, приводит к расширению спектра действия, по сравнению с монокомпонентными пробиотиками. Несомненно, при этом должна учитываться совместимость микроорганизмов, составляющих комплексный препарат.
Все сказанное выше указывает на целесообразность создания всесторонне исследованного комплексного ФП - пробиотика с известной структурой генома всех микробных компонентов, выделенных из организма людей - жителей центрального региона России для профилактики и лечения ВЗК в России.
Раскрытие изобретения
Настоящее изобретение раскрывает фармацевтическую композицию, проявляющую специфическую противовоспалительную активность на модели экспериментального дисбиоза, состоящую из штаммов Bifidobacterium longum GT15, Lactobacillus rhamnosus K32, Enterococcus faecium L-3, характеризующуюся наличием следующих пробиотических генов: для L. rhamnosus K32 - генов пилей spaABC и сортазы strC1, обеспечивающих адгезию с клетками кишечного эпителия; для В. longum GT15 - генов иммуномодуляции и коммуникации, в том числе генов адгезии; генов, участвующие в синтезе экзополисахаридов, пилей; генов, определяющих антиканцирогенные свойства; генов гидролаз, участвующих в гидролизе олиго- и полисахаридов; для Е. faecium L-3 - генов 5-ти бактериоцинов - энтероцинов А, В, Х-α, Х-β и лактобина L3.
Композиция может быть использована в качестве лекарственного средства для лечения и профилактики воспалительных и аутоиммунных заболеваний кишечника, в том числе неспецифического язвенного колита.
Краткое описание чертежей
Фигура 1 - Механизмы развития неспецифического язвенного колита
[Fava F., Danese S. Intestinal microbiota in inflammatory bowel disease: friend of foe? World J Gastroenterol. 2011 Feb 7; 17(5):557-66].
Фигура 2 - Состав микробиоты крыс после коррекции дисбиоза различными поликомпонентными пробиотиками (культуральное исследование).
Обозначения к рисунку: Ось ординат lg КОЕ/мг; Lb - Lactobacillus spp.; Bf - Bifidobacterium spp.; Pr - Proteus spp.; Rl - Klebsiella spp. Ent - Enterococcus spp.
Фигура 3 - Разнообразие микробиоты кишечника крыс после коррекции дисбиоза различными поликомпонентными пробиотиками по родовому составу бактерий (метод мультилокусного секвенирования гена 16S рРНК).
Фигура 4 - Масса слизистой оболочки кишечника крыс после коррекции дисбиоза различными поликомпонентными пробиотиками (граммы).
Обозначения: Т1 - участок кишки от 12 перегной кишки до тощей, Т2 - тощая кишка, Т3 - подвздошная кишка, ТЛ - толстая кишка (участок после слепой кишки).
Фигура 5 - Ультратонкий срез слизистой оболочки тонкой кишки крыс, получавших ФК после воздействия антимикробными препаратами.
Обозначения: 1 - слой слизи, отделяющий бактерии от поверхности эпителиальных клеток;
2 - микроворсинки; 3 - Тесные межклеточные контакты. Фотографии сделаны на электронном микроскопе JEM-100C, JEOL Ltd., Япония.
Фигура 6 - Ультратонкий срез слизистой оболочки тонкой кишки крыс, не получавших пробиотиков после воздействия антимикробными препаратами. Фотографии сделаны на электронном микроскопе JEM-100C, JEOL Ltd., Япония.
Фигура 7 - Активность щелочной фосфатазы в химусе кишечника крыс после коррекции дисбиоза различными поликомпонентными пробиотиками (мкмоль/мин/ участок).
Обозначения: Т1 - участок кишки от 12 перстной кишки до тощей, Т2 - тощая кишка, Т3 - подвздошная кишка, ТЛ - толстая кишка (участок после слепой кишки).
Фигура 8 - Активность щелочной фосфатазы в слизистой оболочке кишечника крыс после коррекции дисбиоза различными поликомпонентными пробиотиками (мкмоль/мин/участок). Обозначения: Т1 - участок кишки от 12 перстной кишки до тощей, Т2 - тощая кишка, Т3 - подвздошная кишка, ТЛ - толстая кишка (участок после слепой кишки).
Фигура 9 - Полная активность мальтазы в химусе кишечника крыс после коррекции дисбиоза различными поликомпонентными пробиотиками (мкмоль/мин/ участок). Обозначения: Т1 - участок кишки от 12 перстной кишки до тощей, Т2 - тощая кишка, Т3 - подвздошная кишка, ТЛ - толстая кишка (участок после слепой кишки).
Фигура 10 - Полная активность мальтазы в слизистой оболочке кишечника крыс после коррекции дисбиоза различными поликомпонентными пробиотиками (мкмоль/мин/ участок). Обозначения: Т1 - участок кишки от 12 перстной кишки до тощей, Т2 - тощая кишка, Т3 - подвздошная кишка, ТЛ - толстая кишка (участок после слепой кишки).
Фигура 11 - Полная активность аланин аминопептидаза в химусе кишечника крыс после коррекции дисбиоза различными поликомпонентными пробиотиками (мкмоль/мин/участок).
Обозначения: Т1 - участок кишки от 12 перстной кишки до тощей, Т2 - тощая кишка, Т3 - подвздошная кишка, ТЛ - толстая кишка (участок после слепой кишки).
Фигура 12 - Полная активность аланин аминопептидаза в слизистой оболочке кишечника крыс после коррекции дисбиоза различными поликомпонентными пробиотиками (мкмоль/мин/участок).
Обозначения: Т1 - участок кишки от 12 перстной кишки до тощей, Т2 - тощая кишка, Т3 - подвздошная кишка, ТЛ - толстая кишка (участок после слепой кишки).
Фигура 13 - Полная активность глицил-L-лейцин дипептидазы в химусе кишечника крыс после коррекции дисбиоза различными поликомпонентными пробиотиками (мкмоль/мин/участок). Обозначения: Т1 - участок кишки от 12 перстной кишки до тощей, Т2 - тощая кишка, Т3 - подвздошная кишка, ТЛ - толстая кишка (участок после слепой кишки).
Фигура 14 - Полная активность глицил-L-лейцин дипептидазы в слизистой оболочке кишечника крыс после коррекции дисбиоза различными поликомпонентными пробиотиками (мкмоль/мин/участок). Обозначения: Т1 - участок кишки от 12 перстной кишки до тощей, Т2 - тощая кишка, Т3 - подвздошная кишка, ТЛ - толстая кишка (участок после слепой кишки).
Фигура 15 - Содержание цитокина МСР-1 в сыворотке крови крыс после коррекции дисбиоза кишечника различными пробиотиками (пкм/мл).
Фигура 16 - Содержание цитокина TGF β в сыворотке крови крыс после коррекции дисбиоза кишечника различными пробиотиками (пкм/мл).
Фигура 17 - Содержание интерлейкина IL-10 в сыворотке крови крыс после коррекции дисбиоза кишечника различными пробиотиками (пкМ/мл).
Фигура 18 - Содержание интерлейкина IL-17 в сыворотке крови крыс после коррекции дисбиоза кишечника различными пробиотиками (пкм/мл).
Характеристика свойств и источников выделения штаммов-компонентов ФК
L. rhamnosus K32. Выделен из фекалий здоровой девушки 12 лет в 2007 г. (г. Тверь). Проявляет высокую антагонистическую активность по отношению к патогенным и условно-патогенным штаммам микроорганизмов (Staphylococcus aureus АТСС 25923, Pseudomonas aeruginosa АТСС 27853, Shigella sonnei I фазы 941, Bacillus subtillis 534, E. coli ATCC 25922, Klebsiella pneumoniae K1 5054), а также антимикотическую активность (Candida albicans АТСС 885-653). Депонирован в ВКПМ 21.07.2011, № В-11107.
В. longum subsp. longum GT15. Выделен из фекалий взрослого человека (г. Тверь) в 2010 г. Проявляет высокую и среднюю антагонистическую активность по отношению к перечисленным выше бактериальным культурам. Обладает иммуномодулирующей активностью (на модели лабораторных животных было выявлено статистически достоверное увеличение экспрессии IL-10 и уменьшение IL-8 после воздействия бифидобактерий). Депонирован в ВКПМ 08.06.2012, № АС-1928.
Е. faecium L-3. Выделен из молочнокислого продукта, использующегося в РФ. Штамм обладает выраженной антагонистической активностью в отношении: листерий (Listeria monocytogenes EGD), стрептококков (групп А, В, С, G), стафилококков (S. aureus АТСС 25923, S. aureus 209), патогенных энтерококков (E. faecalis АТСС 29212, энтеробактерий (Е. coli АТСС 25922, K. pneumoniae K1 5054, P. vulgaris AS2), псевдомонад (Pseudomonas aeruginosa АТСС 27853, P. aeruginosa AS1) микоплазм (Micoplasma hominis ATCC 15488), а также вирусов гриппа и простого герпеса. Также доказана антимикотическая активность штамма Е. faecium L-3 при использовании в качестве индикаторных культур С. albicans АТСС 885-653 и Cryptococcus neoformens Ei. В то же время доказан его бифидогенный эффект в системах in vitro и in vivo. Штамм отличается способностью синтезировать витамины группы В и фолиевую кислоту, а также бактериоцины. Штамм проявляет иммуномодулирующие свойства (на моделях лабораторных животных увеличивает экспрессию противовоспалительного и регуляторного IL-10 и уменьшает экспрессию провоспалительного IL-8). Штамм также обладает способностью стимулировать выработку слизи клетками слизистой оболочки кишечника, защищающей эпителий от патогенных микроорганизмов. Штамм Е. faecium L-3 депонирован в коллекции Института сельскохозяйственной микробиологии (ВНИИСХМ ВАСХНИЛ, г. Пушкин) и в международной коллекции Laboratorium voor Microbiologic - Universiteit Gent K.L. Ledeganckstraat 35 B-9000 Gent Belgium (Enterococcus faecium L-3 = LMG P-27496).
Выделенные штаммы ферментируют различные сахара и спирты без образования газа; фенотипически апатогенны, т.е. не обладают гемолитической, протеолитической, летициназной, гиалуронидазной, антилизоцимной, ДНК-ной и РНК-ной активностью.
Совместимость штаммов
Штаммы не подавляют роста друг друга.
Химическая структура компонентов фармацевтической композиции представлена известной нуклеотидной последовательностью геномов штаммов. Геномы были секвенированы с использованием технологий нового поколения (Roche 454). Последовательности геномов депонированы в GenBank и имеют следующие идентификационные номера: В. longum GT15 (PRJNA191592), L. rhamnosus K32 (PRJNA191611), Е. faecium L-3 (PRJNA190648). Анализ нуклеотидных последовательностей показал отсутствие генов патогенности и мобильных генов устойчивости к антибиотикам. Было также обнаружено наличие важных пробиотических генов: для L. rhamnosus K-32 - генов пилей spaABC и сортазы strC1, обеспечивающих адгезию с клетками кишечного эпителия; для В. longum GT15 - генов иммуномодуляции и коммуникации, в том числе генов адгезии; генов, участвующие в синтезе экзополисахаридов, пилей; генов, определяющих антиканцирогенные свойства; генов гидролаз, участвующих в гидролизе олиго- и полисахаридов; для Е. faecium L-3 - генов 5-ти бактериоцинов - энтероцинов А, В, Х-α, Х-β и лактобина.
Исследование устойчивости к низким pH
При обработке бактериальных культур - компонентов ФК - низкими значениями pH (рН=2) в течение 60 мин количество жизнеспособных клеток лактобацилл и энтерококков снижалось незначительно, тогда как количество жизнеспособных клеток бифидобактерий резко падало. Для повышения устойчивости бифидобактерий к кислой среде был использован оксид магния в концентрации 1%. После иммобилизации клеток бифидобактерий с оксидом магния устойчивость клеток к кислоте повышалась до уровня контроля (без кислоты). Выживаемость лактобацилл и энтерококков при этом не менялась. Чтобы компоненты ФК сохранялись при прохождении через агрессивно-кислую среду желудка, в состав ФК был введен оксид магния в концентрации 1%.
Биотехнология производства и хранения
Компоненты ФК были выращены в ферментерах, лиофилизированы, смешаны со вспомогательными веществами (магния стеарат, оксида магния и каолин) и стерильно расфасованы в капсулы. Жизнеспособность всех трех компонентов ФК сохранялась неизменной в течение года (108 КОЕ). Более длительное хранение ФК не тестировалось.
Исследование специфической активности
Исследование было проведено на модели экспериментального антибиотико-ассоциированного (ампициллин, метронидазол) дисбиоза кишечника крыс линии Вистар. Изучались изменения в микробиоте кишечника, морфофункциональные характеристики кишечника и состояние иммунитета у животных, получавших фармацевтическую композицию, по сравнению с контрольной группой и группами, получавшими препараты сравнения Бифиформ (Дания) и Линекс (Словения). Были отмечены: быстрая нормализация микробиоты (исчезновение признаков чрезмерного роста клебсиелл, протея, стафилококков и других условно-патогенных бактерий и грибов), увеличение содержания продуцирующих бутират Faecalibacterium prausnitzii; стимуляция синтеза противовоспалительных цитокинов IL-10 и TGFβ, тенденция к уменьшению синтеза провоспалительного цитокина МСР-1; увеличение фагоцитарной активности лейкоцитов; утолщение слоя слизи, отделяющего микробиоту кишечника от поверхности эпителия; увеличение выработки щелочной фосфатазы клетками слизистой оболочки тонкой кишки; быстрая компенсация после токсического действия антимикробных препаратов по биохимическим показателям сыворотки крови; восстановление активности пищеварительных ферментов слизистой оболочки кишечника и химуса. По полученным данным исследуемая фармацевтическая композиция не уступает препаратам сравнения Бифиформу и Линексу, а по ряду параметров даже превосходит их.
Исследование токсичности ФК
Определение острой токсичности было проведено при использовании различных доз на беспородных белых мышах (107-1010 КОЕ), крысах линии Вистар (108-1011 КОЕ) и кроликах породы 1 шиншилла (109-1012 КОЕ). Однократное внутрижелудочное введение ФК всем трем видам животных в максимальных использованных дозах не вызывало гибели животных и проявлений интоксикации. При внутрибрюшинном введении ЛД50 составила 1010 КОЕ для мышей (средний вес 20 гр) и 1011 КОЕ для крыс (средний вес 70 гр). Терапевтические дозы пробиотиков для людей при среднем весе 50 кг составляют 108-1010 КОЕ. Т.е. полученные на мышах и крысах ЛД50 при учете соотношения массы тела человека и грызунов превосходят терапевтические дозы на много порядков.
Исследование подострой токсичности ФК на мышах при внутрижелудочном введении не выявило значимых отклонений в динамике накопления массы тела. Высев фекалий не показал признаков дисбиоза в кишечнике мышей. Исследование хронической токсичности на двух видах животных (кроликах и крысах) при внутрижелудочном введении не выявило значимых отклонений в динамике накопления массы тела, потреблении корма и воды, гематологических и биохимических показателей, морфологии внутренних органов животных, не приводило к повышению температуры тела.
Полученные результаты позволяют отнести ФК на основе пробиотических бактерий (энтерококков, лактобацилл и бифидобактерий) с установленной последовательностью генома при использовании в терапевтических дозах к нетоксичным лекарственным веществам.
Исследование специфических видов токсичности
При изучении иммунотоксичности полученные результаты позволяют сделать вывод о том, что в диапазоне исследованных доз (107 и 108 КОЕ/мышь) ФК не оказывала иммунотоксического действия, а проявляла умеренные иммуностимулирующие (фагоцитоз) и супрессирующие (реакция гиперчувствительности замедленного типа) действия и не отменяла антителообразование, инициированное белковым антигеном.
При изучении мутагенности выявлено, что ФК как в дозе 1010 КОЕ при пероральном введении и 24 ч экспозиции, так и при пятикратном введении в дозе 108 КОЕ, не вызывала статистически достоверного увеличения количества клеток с хромосомными аберрациями в костном мозге мышей линии СВА. Следовательно, ФК не обладает мутагенной активностью в отношении соматических клеток теплокровных животных.
При исследовании терратогенности ФК на крысах линии Вистар (препараты вводили беременным самкам внутрижелудочно) анализ эмбрио/фетолетального действия ФК не выявил превышения уровней до - и постимплантационной гибели плодов, и суммарного эмбрио(фето)летального эффекта, при сравнении с показателями в контроле. Также ни в одной из подопытных групп не были выявлены плоды с макропатологией.
Исследование фармакокинетики ФК
В исследовании использовались крысы линии Вистар. ФК вводили внутрижелудочно в течение 5 дней в дозе 1*108 КОЕ. Наличие компонентов ФК тестировали в фекалиях животных высевом на чашки, а также выделением ДНК и ее анализом реакцией ПЦР в реальном времени. Все компоненты ФК были обнаружены в фекалиях крыс со второго дня и спустя 1 день после окончания введения ФК. Пробиотические бактерии, вводимые в составе ФК здоровым животным (а также людям), как правило, сохраняются в желудочно-кишечном тракте стабильно только во время введения препарата, а затем элиминируют в различные сроки. Следовательно, бактерии исследуемого ФК сохраняются в желудочно-кишечном тракте крыс в процессе введения ФК.
Пример 1
Секвенирование последовательности ДНК геномов
Проведено полногеномное секвенирование ДНК штаммов Bifidobacterium longum GT15, Lactobacillus rhamnosus К32, Enterococcus faecium L3 на секвенаторе GS Junior («Roche»). Результаты проведенного биоинформатического анализа показали:
Bifidobacterium longum GT15:
Размер генома - 2,337,521 пн; G + C состав - 60%;
Количество генов - 1,893 (кодирующих белки);
Количество rRNA оперонов - 5;
Количество tRNAs - 56.
Установлено наличие пробиотических генов/белков, в том числе:
а) важные бактериальные ферменты: (3-глюкозидаза (BLGT_06805 и BLGT_03815), и β-глюкуронидаза (BLGT_03575), данные ферменты участвуют в расщеплении сложных полисахаридов и ксенобиотиков;
б) обуславливающих адгезионные способности микроорганизма: адгезии (BLGT_05875), большие экзопротеины, участвующие в адгезии (BLGT_01370, BLGT_03935), внеклеточный «solute-binding» протеин (BLGT_09945), и трансальдолаза (BLGT_05575);
в) вовлеченные в формирование пилей «flp» (BLGT_00945);
г) вовлеченные в иммуномодуляцию и обуславливающие взаимодействие с клетками-хозяина: гликопротеин-связывающие фимбрии FimA (BLGT 00130) и FimB (BLGT 00135), карбоксипептидаза (BLGT 01045), и 19 гликозил трансфераз;
д) гены модуляция иммунной системы - серпин (BLGT_07170);
е) гены, участвующие в синтезе и транспортировке бактериоцинов - эписидин 280 (BLGT_07605).
Проведено депонирование геномного сиквенса в NCBI:
GenBank accession no. СР006741;
BioProject: PRJNA191592;
Organism name/label: Bifidobacterium longum subsp. longum GT15
Title: Bifidobacterium longum subsp. longum GT15, complete genome
Locus_tag prefix: BLGT
Lactobacillus rhamnosus К32
Размер генома - 3,016,919 пн; G + C состав - 46,7%;
Количество генов - 2,637 (кодирующих белки);
Количество rRNA - 14 (5S, 16S, 23S); Количество tRNAs - 57.
Установлено наличие пробиотических генов, в том числе:
а) обусловливающих устойчивость к стрессорным воздействиям и антигенную активность штамма (dltD - d-аланилирование JITA; rfbX - белок-экспортер полисахарида, о-антигена и тейхоевых кислот; yceI yttB oxlT mdr - пермеазы главного суперсемейства MFS1; ухеА - транспортер антимикробных белков);
б) обусловливающих гидролазную активность (mleP - малат пермеаза; galK, gale, galT, galR, galM - цикл Лелуара; lacC, lacD, lacB, lacA, lacR, lacE, lacT, lacF, lacG - тагатоза-6-фосфатный путь утилизации лактозы; malE, malF, malG, malK - утилизация мальтозы; rbsR, rbsD, rbsA, rbsC, rbsB, rbsK - утилизация рибозы);
в) обусловливающие взаимодействие микроорганизма с эпителиальными клетками человека (luxS - активированный метальный цикл; srtC1 - сортаза; spaABC и spaDEF специфические белки пилей, вовлеченные в процесс адгезии; mabA - модуляция адгезии и образования биопленок; wzb - адгезия и биосинтез полисахарида).
Проведено депонирование геномного сиквенса в NCBI:
Whole genome shotgun (WGS): accession JNNV00000000 (версия проекта 01);
BioProject: PRJNA191611;
Organism name/label: Lactobacillus rhamnosus K32
Title: Lactobacillus rhamnosus K32, whole genome shotgun sequencing project
Locus_tag prefix: LRK
Enterococcus faecium L3
Размер генома - 2642214 пн; G + C состав - 38%;
Количество генов - 2,558
Количество rRNA оперонов - 4; Количество tRNAs - 54.
Установлено наличие пробиотических генов, в том числе:
а), отвечающие за продукцию антиоксиданта - липоевой кислоты (lipA, lipA2 - липоатсинтетаза; lipB, lipM - метилтрансфераза; lipL - липоилтрансфераза);
б) отвечающие за синтез и транспорт рибофлавина (витамин В2): ribU, pnuX, ribY, ribX - трансмембранные транспортеры рибофлавина; ribK, ribL - рибофлавинкиназы, dmrS - 6,7-диметил-8-рибитиллумазинсинтетаза;
в) обуславливающие синтез и метаболизм биотина (bioF, bioB, bioC, bioD, bioH, bioG, bioK, bioZ - гены, отвечающие за синтез биотина; bioY - транспортер биотина; bioR - регуляторный компонент биотинового оперона);
г) синтез пиридоксина (витамина В6): pdxB, serA, pdxA - фосфатдегидрогеназа; pdxF - фосфосеринаминотрансфераза; pdxJ, dxs - пиридоксинсинтетаза; pdxK, pdxU субстрат-специфичный транспортер;
д) кодирующие антимикробные пептиды: энтероцин A (entA), энтероцин В (entB), две субъединицы энтероцина X (entXλ, entXβ) а также ген, кодирующий lactobin - подобный бактериоцин;
е) кодирующие щелочную фосфатазу.
Проведено депонирование геномного сиквенса в NCBI:
NCBI Reference Sequence: NZ_JRGX00000000.1
BioProject ID: PRJNA224116
Organism name/label: Enterococcus faecium L-3
Title: Enterococcus faecium strain L-3, whole genome shotgun sequencing project
Пример 2
Исследование специфической активности
В исследовании использовались крысы линии Вистар, вес 200-240 г (возраст 8 недель). В качестве контролей использовали препараты: Бифиформ, производитель Дания,«Ферросан А/С» и Линекс, производитель Словения ЗАО «Сандоз». ФК вводили животным в концентрации в пересчете на lg КОЕ: ФК по 8 lg КОЕ, Бифиформ® 7-8 lg КОЕ, Линекс® 7 lg КОЕ (Бифиформ и Линекс по капсуле на крысу ежедневно). Было создано 5 групп крыс (в каждую группу входило 10 крыс). Все вводимые препараты вводили внутрижелудочно через зонд в объеме 0,5 мл. Дизайн исследования представлен в таблице 1. В работе использована разработанная нами ранее модель экспериментального дисбиоза [Ермоленко Е.И., Донец В.Н., Дмитриева Ю.В., Ильясов Ю.Ю., Суворова М.А., Громова Л.В. Влияние пробиотических энтерококков на функциональные характеристики кишечника крыс при дисбиозе, индуцированном антибиотиками // Вестн. С.-Петерб. унта. Сер. 11, Медицина. 2009. Вып. 1. С. 157-167.], вызванного внутрижелудочным введением крысам Вистар 75 мг/кг ампицилина (ОАО «Органика», Россия) и метронидазола 50 мг/кг (ОАО «Ирбитский Химико-Фармацевтический завод», Россия). Наличие дисбиоза подтверждалось на основании клинических симптомов и при помощи бактериологического и генетического исследований микробиоты кишечника животных.
1. Влияние фармацевтической композиции (ФК) на миробиоту кишечника крыс при экспериментальном дисбиозе
Микробиоту кишечника крыс при коррекции антибиотико-ассоциированного дисбиоза ФК, Линексом и Бифиформом исследовали при помощи культурального метода и метагеномного агнализа, которые взаимно дополняли друг друга.
1.1. Результаты культурального исследования
Микробиологогическое исследование проводили в соответствии с Методическими указаниями «Бактериологическая диагностика дисбактериоза кишечника», по методу, разработанному Р.В. Эпштейн-Литвак и Ф.Л. Вильшанской (1969) с модификациями и в соответствии с рекомендациями, описанными в руководстве Симаненко В.И. [Симаненков В.И. Клинические аспекты диагностики и лечения дисбиоза кишечника в общетерапевтической практике. Учебно-методическое пособие. - СПб., 2003. - 36 с.]. Результаты культурального исследования представлены на фигуре 2.
Выводы: В результате действия антибиотиков увеличивается количество Ecoli-, клебсиел, стафилококков, дрожжей Candida. У животных, получавших ФК, снижается количество Ecoli-, протея, клебсиел, дрожжей и практически полностью исчезают стафилококки. Таким образом, ФК оказывает заметное положительный эффект на состав микрофлоры фекалий крыс; этот эффект сравним, а по некоторым позициям и превосходит действие Бифиформа и Линекса.
1.2 Результат исследования при помощи мультилокусного секвенирования
Один из существующих методов метагеномного анализа - анализ на основе гена 16S рРНК, который позволяет анализировать состав микробиологического сообщества. В данном эксперименте основной задачей было сравнить влияние на микробиоту кишечника крыс путем мультилокусного секвенирования ФК и препаратов сравнения (Линекса и Бифиформа). На 9 день эксперимента были отобраны фекалии для секвенирования по участку гена 16S рРНК (регион V9-V10) на приборе GS Junior, Roche.
Для анализа брались только те виды бактерий, процентное содержание которых в опытных экспериментах заметно отличалось от контрольных групп. Бактерии, содержание которых в микробиоте было менее 10%, не бралось для анализа данных (для лучшей наглядности результатов). Для укоренения результатов и отличия от контрольных групп использовалась группа крыс «Старт» - микробиота крыс до начала исследования и группа крыс «А/б» - состав микробиоты крыс после приема антибиотиков в течении 3-х дней. Высчитывалось значение среднего процентного содержания бактерий в метагеноме крыс на каждую группу (по результатам секвенирования ДНК из фекалий 10-ти крыс на каждую группу). Результаты представлены на фигуре 3.
После введения антимикробных препаратов в фекальной микробиоте увеличивается количество превотелл и уменьшается - фекалибактерий. Введение крысам ФК увеличивает количество всех трех исследуемых родов бактерий - особенно значительно - фекалибактерий. Это особенно важно, т.к. характерным признаком изменения микробиоты кишечника при ВЗК является снижение количественного содержания бактерий, продуцирующих бутират, в частности, F. prousnitzii. Увеличение количества превотелл и бактероидов также может рассматриваться как положительное действие ФК, т.к. эти бактерии являются непатогенными обычными компонентами микрофлоры кишечника.
2. Изменения морфологии слизистой кишечника при экспериментальном дисбиозе.
Изменения морфологии желудочно-кишечного тракта оценивали, используя гистологические методы и электронную микроскопию.
2.1. Осмотр брюшной полости при вскрытии
При осмотре брюшной полости макроскопические патологические изменения кишечника (вздутие, истончение стенок, увеличение числа Пейеровых бляшек) были выявлены только у животных, получавших антибиотики. Определение массы слизистой оболочки кишечника (после удаления химуса) показало ее увеличение (т.е. наличие воспалительного процесса) в подвздошной и толстой кишках животных, получавших антибиотики. Эти изменения совсем не проявлялись в группе животных, получавших ФК, и слабо проявлялись в группах ЛХ и БФ (фигура 4). Т.е. введение животным ФК снимает признаки воспаления.
2.2. Результаты гистологического исследования
В таблице 2 приведены результаты морфологического анализа слизистой оболочки кишечника, полученные при помощи гистологического исследования участков тонкой кишки крыс после воздействия различными пробиотиками.
Высота ворсин минимальна в группе животных, получавших ФК и Бифиформ, что может свидетельствовать о более выраженной регенерации эпителиального слоя. В этих же группах обнаружена тенденция к увеличению числа бокаловидных клеток, продуцирующих слизь. Для этих двух групп число межэпителиальных лимфоцитов больше, чем у животных, получавших Линекс, или из группы КА (без пробиотикотерапии). Эти данные свидетельствуют о том, что ФК способствовал компенсации местного воспаления. ФК действовал аналогично Бифиформу, но был эффективнее Линекса.
Также было проведено исследование ультратонких срезов слизистой оболочки тонкой кишки при помощи электронной микроскопии. В отличии от группы КА, в группах, получавших пробиотические средства, были не нарушены межклеточные контакты и микроворсинки. Специфической особенность действия ФК являлась способность стимулировать формирования слоя слизи, отделяющего бактерии от поверхности эпителиальных клеток (фигуры 5, 6).
3. Изменение активности пищеварительных ферментов и биохимических показателей сыворотки крови при экспериментальном дисбиозе
Влияние ФК и препаратов на метаболизм проводили, оценивая активность пищеварительных ферментов при помощи классических биохимических исследований химуса и экстракта слизистой оболочки различных участков кишки, а также анализируя биохимические показатели сыворотки крови животных из различных групп.
3.1. Исследования активности пищеварительных ферментов
Исследовали ряд ферментов, участвующих в заключительных стадиях гидролиза эфиров фосфорной кислоты (щелочная фосфатаза), углеводов (мальтаза) и белков (аминопептидаза М и глицил-L-лейциндипептидаза). Наиболее значимый для течения НЯК показатель - активность щелочной фосфатазы. Этот фермент, вырабатываемый как эукариотическими клетками, так и некоторыми бактериями, участвует в гидролизе и регуляции всасывания липидов, в защите кишечного барьера от проникновения люминальных бактерий, в детоксикации бактериальных токсинов, в частности липополисахаридов, являющихся обязательным компонентов клеточной стенки грамотрицательных бактерий. Следует подчеркнуть, что к числу этих бактерий относятся протей, клебсиеллы, ацинетобактеры и псевдомонады, наиболее часто вызывающие синдром чрезмерного роста в кишечнике, в том числе при НЯК. Высокая активность щелочной фосфатазы в проксимальных отделах кишечника является благоприятным признаком. Наличие щелочной фосфатазы в сыворотке крови может рассматриваться как маркер цитолиза гепатоцитов и нарушения эвакуаторных функций желчных протоков (другие виды патологии в данном эксперименте исключались). У Е. faecium L3 в геноме найдены гены, кодирующие щелочную фосфатазу и, путем транскрипционного анализа, мы доказали их экспрессию. Это важно, так как энтерококки расселяются, в отличии от бифидобактерий, и в проксимальных отделах желудочно-кишечного тракта. Результаты определения активности ключевых пищеварительных ферментов представлены на фигурах 7-14.
Антибиотики снижали активность щелочной фосфатазы (ЩФ) в химусе отделов Т1 и Т3 и в слизистой отделов 12-пк, T1, Т2. После введения пробиотиков, особенно ФК, повышалась активность ЩФ в слизистой оболочке кишечника от 12-перстной до подвздошной кишки (T1, Т2). Активность ЩФ в химусе была повышена в случае ЛС в подвздошной и толстой кишке, Линекса (в тощей, подвздошной и толстой кишке), Бифиформа (в толстой кишке).
Антибиотики увеличивали активность мальтазы в химусе отделов Т1-Т2 и ТЛ и в слизистой отделов 12-пк,-Т1-Т3; несколько снижали в химусе отдела Т3. ФК нормализовал активность мальтазы в химусе отделов Т1 и Т2 и в слизистой кишечника от 12-перстной до подвздошной кишки. ФК, Линекс и Бифиформ действовали практически идентично. Изменение активности аминопептидазы М при действии антибиотиков проявляются в толстой кишке для химуса, в тощей и подвздошной кишках для слизистой оболочки. Введение животным ФК нормализует активность фермента в слизистой оболочке, причем эффективнее, чем Линекс и Бифиформ.
Активность глицил-L-лейцин дипептидазы (ГЛ), цитозольного пищеварительного фермента, харктеризующего внутриклеточное пищеварение, при введении животным антибиотиков меняется в химусе практически во всех отделах кишечника и в слизистой всех отелов, кроме 12-перстной кишки. Введение животным ФК нормализует активность фермента в слизистой оболочке всех отделов и в химусе 12-перстной и толстой кишок.
3.2. Биохимические показатели сыворотки крови
Биохимические показатели сыворотки крови были определены при помощи полностью автоматического биохимического анализатора Aeroset Toshiba (США). Результаты исследования «печеночных ферментов» аспартатаминотрансферазы (ACT), аланинаминотрансферазы (АЛТ), гамма-грутамилтранспептидазы (ГГТП), общего билирубина, щелочной фосфатазы (ЩФ) и панкреатического фермента альфа-амилазы, косвенно свидетельствующие о состоянии гепатобиллиарной системы и функции поджелудочной железы и наличии воспаления, приведены в таблице 3.
По следующим показателям группа ФК приближается к нормальным значениям в отличии от групп БФ, ЛХ и КА: общий билирубин, ACT и гамма-глютамил трансфераза. Следовательно, токсическое действие антимикробных препаратов компенсируется в большей степени под влиянием ФК.
4. Иммуномодулирующие эффекты ФК при коррекции экспериментального дисбиоза кишечника
4.1. Исследование содержание различных цитокинов в сыворотке крови крыс.
Содержание различных цитокинов в сыворотке крови крыс определяли при помощи ИФА, используя тест-системы (Bioscience, Bender MedSvstems, США).
Результаты исследования содержания цитокинов в сыворотке крови крыс после коррекции дисбиоза различными пробиотиками представлены на фигурах 15-18.
В контрольной группе без пробиотической коррекции кишечной патологии были отмечены увеличение провоспалительного цитокина МСР-1 и снижение концентрации IL-17 и TGF β. У животных, получавших ФК, выявлены статистически достоверное увеличение содержания в сыворотке крови IL-10, TGF β и IL-17; особенно значительным (в 2 раза) было увеличение активности противовоспалительного токсина IL-10. У животных, получавших Бифиформ и Линекс, количественные характеристики исследуемых цитокинов больше отличались от таковых у животных из контрольной группы (К).
4.2. Оценка фагоцитарной активности лейкоцитов периферической крови крыс после коррекции дисбиоза различными пробиотиками
Исследование показателей неспецифического иммунитета было проведено при помощи оценки фагоцитарной реакции по методу, описанному в справочнике «Медицинские технологии. Том 2» под редакцией А.И. Карпищенко, Санкт-Петербург, Интермедика, 2002, 600 с. (с. 212-213) с некоторыми модификациями.
Результаты исследования фагоцитарной активности представлены в таблице 4.
Отмечено резкое снижение фагоцитарной активности лейкоцитов периферической крови у животных, не получавших пробиотики после развития кишечной патологии. При введении ФК фагоцитоз усиливался в большей степени, чем в контрольныой группе животных и при введении препаратов сравнения.
Пример 5
Изучение фармакокинетики ФК
В исследовании использовано 60 крыс-самцов Вистар весом 180-220 г и 60 крыс-самок Вистар 220-240 г. ФК вводили внутрижелудочно при помощи специального зонда в течение 5 дней в дозе 1*108 КОЕ, ежедневно в 12 часов дня. Животные в период карантина и во время исследования не претерпевали никаких принципиальных изменений во внешнем виде, аппетите, характере поведения. Дизайн исследования представлен в таблице 5.
На 6-ой день животные были подвергнуты эвтаназии. Исследование проводили, высевая пробиотические бактерии, оценивая их культуральные свойства, а также морфологию и тинкториальные особенности, подсчитывая количество типичных колоний в пробе и в пересчете на 1 г исходного материала. Выявление введенных пробиотических культур было подтверждено методом ПЦР с использованием специфических праймеров (таблица 6) для штаммов L. rhamnosus К32, Е. faecium L-3, В. longum GT15 и последующей электрофоретической детекцией результатов в агарозном геле. Результаты приведены в таблице 7.
Опыт показывает, что на 6-й день эксперимента, через день после окончания введения ФК животным, все компоненты ФК обнаруживались в фекалиях крыс. Т.е. внутрижелудочное введение ФК позволяет его компонентам сохраняться в организме животных в течение 5 дней эксперимента и одного дня после него. Следует отметить различную восприимчивость животных к вводимому препарату.
Claims (1)
- Фармацевтическая композиция, проявляющая специфическую противовоспалительную активность на модели экспериментального дисбиоза, состоящая из штаммов Bifidobacterium longum GT15, Lactobacillus rhamnosus K32, Enterococcus faecium L-3, характеризующихся наличием следующих пробиотических генов: для L. rhamnosus K32 - генов пилей spaABC и сортазы strC1, обеспечивающих адгезию с клетками кишечного эпителия; для В. longum GT15 - генов иммуномодуляции и коммуникации, в том числе генов адгезии; генов, участвующих в синтезе экзополисахаридов, пилей; генов, определяющих антиканцерогенные свойства; генов гидролаз, участвующих в гидролизе олиго- и полисахаридов; для Е. faecium L-3 - генов 5-ти бактериоцинов - энтероцинов А, В, Хα, Хβ и лактобина.
Priority Applications (1)
Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
---|---|---|---|
RU2015144635A RU2616899C1 (ru) | 2015-10-19 | 2015-10-19 | Противовоспалительная фармацевтическая композиция на основе бактериальных штаммов |
Applications Claiming Priority (1)
Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
---|---|---|---|
RU2015144635A RU2616899C1 (ru) | 2015-10-19 | 2015-10-19 | Противовоспалительная фармацевтическая композиция на основе бактериальных штаммов |
Publications (1)
Publication Number | Publication Date |
---|---|
RU2616899C1 true RU2616899C1 (ru) | 2017-04-18 |
Family
ID=58642693
Family Applications (1)
Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
---|---|---|---|
RU2015144635A RU2616899C1 (ru) | 2015-10-19 | 2015-10-19 | Противовоспалительная фармацевтическая композиция на основе бактериальных штаммов |
Country Status (1)
Country | Link |
---|---|
RU (1) | RU2616899C1 (ru) |
Cited By (2)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
RU2766765C1 (ru) * | 2021-05-25 | 2022-03-15 | Федеральное государственное бюджетное учреждение "Детский научно-клинический центр инфекционных болезней Федерального медико-биологического агентства" | Способ лечения функциональных заболеваний желудочно-кишечного тракта у детей |
RU2776223C2 (ru) * | 2017-09-29 | 2022-07-14 | Юниверсити-Индастри Кооперейшн Груп Оф Кюн Хее Юниверсити | Новые молочнокислые бактерии и их применение |
Citations (1)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
WO2015095241A2 (en) * | 2013-12-16 | 2015-06-25 | Seres Health, Inc. | Bacterial compositions and methods of use thereof for treatment of immune system disorders |
-
2015
- 2015-10-19 RU RU2015144635A patent/RU2616899C1/ru not_active IP Right Cessation
Patent Citations (1)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
WO2015095241A2 (en) * | 2013-12-16 | 2015-06-25 | Seres Health, Inc. | Bacterial compositions and methods of use thereof for treatment of immune system disorders |
Non-Patent Citations (1)
Title |
---|
ERMOLENKO E. et al. A015 Influence of different probiotics on immune system and structure of mucosa in the experimental model of dysbiosis. Материалы III Санкт-Петербургского международного экологического форума. Инфекции и иммунитет. 2014; стр.36. КОТЫЛЕВА М.П. и др. Динамика именений микробиоты кишечника крыс на фоне введения антимикробных препаратов и пробиотиков. Фундаментальная наука и клиническая медицина — Человек и его здоровье. Тезисы XVIII Международной медико-биологической конференции молодых исследователей, посвященной двадцатилетию медицинского факультета СпбГУ 18 апреля 2015 г. СПб.: Изд-во СпбГУ; 18: 266-267 [Найдено 14.11.2016] [он-лайн]. Найдено из Интернет: URL: https://med.spbu.ru/conferenceFS&CM/2015/t2015.pdf. * |
Cited By (3)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
RU2776223C2 (ru) * | 2017-09-29 | 2022-07-14 | Юниверсити-Индастри Кооперейшн Груп Оф Кюн Хее Юниверсити | Новые молочнокислые бактерии и их применение |
RU2766765C1 (ru) * | 2021-05-25 | 2022-03-15 | Федеральное государственное бюджетное учреждение "Детский научно-клинический центр инфекционных болезней Федерального медико-биологического агентства" | Способ лечения функциональных заболеваний желудочно-кишечного тракта у детей |
RU2800359C1 (ru) * | 2022-01-25 | 2023-07-20 | Галина Геннадьевна Алехина | Штамм энтерококков Enterococcus faecium L-3 для лечения и профилактики бактериальных и вирусных инфекций с использованием изготовленных на его основе лечебно-профилактических средств и продуктов питания и способ культивирования штамма энтерококков Enterococcus faecium L-3 |
Similar Documents
Publication | Publication Date | Title |
---|---|---|
US20240123000A1 (en) | Treatment of clostridium difficile infection | |
US11701396B2 (en) | Treatment of Clostridium difficile infection | |
JP2022000040A (ja) | 代謝障害を処置するための低温殺菌アッカーマンシアの使用 | |
US11260083B2 (en) | Compositions and methods for treating and preventing graft versus host disease | |
US20240148798A1 (en) | Treatment or prevention of gastrointestinal dysbiosis | |
Chandran et al. | Relative expression of bacterial and host specific genes associated with probiotic survival and viability in the mice gut fed with Lactobacillus plantarum Lp91 | |
AU2022272332A1 (en) | Compositions and methods for treating disease | |
JP2021508462A (ja) | セルピン産生 | |
RU2553372C1 (ru) | Способ профилактики постинфекционного синдрома раздраженной кишки | |
US20240148799A1 (en) | Composition and ameliorating agent having inflammation reducing effect | |
RU2616899C1 (ru) | Противовоспалительная фармацевтическая композиция на основе бактериальных штаммов | |
US20240156879A1 (en) | Composition and ameliorating agent having inflammation reducing effect | |
RU2617946C1 (ru) | Штаммы Lactobacillus brevis и Lactobacillus rhamnosus с установленной последовательностью генома, синтезирующие глутатион и комплекс внутриклеточных антиоксидантов | |
US20200268017A1 (en) | Probiotic compositions and methods | |
Zakharchuk et al. | Gastrointestinal microflora and factors affecting intestinal normal flora in chronic dermatoses | |
HK40007703B (en) | Treatment of clostridium difficile infection | |
HK40007703A (en) | Treatment of clostridium difficile infection | |
Earley | Role of the intestinal microbiota in gut barrier dysfunction following burn injury |
Legal Events
Date | Code | Title | Description |
---|---|---|---|
MM4A | The patent is invalid due to non-payment of fees |
Effective date: 20201020 |