[go: up one dir, main page]
More Web Proxy on the site http://driver.im/

RU2018138639A - Способ, чип и их применение - Google Patents

Способ, чип и их применение Download PDF

Info

Publication number
RU2018138639A
RU2018138639A RU2018138639A RU2018138639A RU2018138639A RU 2018138639 A RU2018138639 A RU 2018138639A RU 2018138639 A RU2018138639 A RU 2018138639A RU 2018138639 A RU2018138639 A RU 2018138639A RU 2018138639 A RU2018138639 A RU 2018138639A
Authority
RU
Russia
Prior art keywords
biomarkers
week
paragraphs
weeks
pancreatic cancer
Prior art date
Application number
RU2018138639A
Other languages
English (en)
Other versions
RU2018138639A3 (ru
Inventor
Карл БОРРЕБАЕК
Анна Сандстрем ГЕРДССОН
Кристер ВИНГРЕН
Original Assignee
Иммуновиа Аб
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Application filed by Иммуновиа Аб filed Critical Иммуновиа Аб
Publication of RU2018138639A publication Critical patent/RU2018138639A/ru
Publication of RU2018138639A3 publication Critical patent/RU2018138639A3/ru

Links

Classifications

    • G—PHYSICS
    • G01—MEASURING; TESTING
    • G01N—INVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
    • G01N33/00—Investigating or analysing materials by specific methods not covered by groups G01N1/00 - G01N31/00
    • G01N33/48—Biological material, e.g. blood, urine; Haemocytometers
    • G01N33/50—Chemical analysis of biological material, e.g. blood, urine; Testing involving biospecific ligand binding methods; Immunological testing
    • G01N33/53—Immunoassay; Biospecific binding assay; Materials therefor
    • G01N33/574—Immunoassay; Biospecific binding assay; Materials therefor for cancer
    • G01N33/57407—Specifically defined cancers
    • G01N33/57438—Specifically defined cancers of liver, pancreas or kidney
    • A—HUMAN NECESSITIES
    • A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61P—SPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P35/00—Antineoplastic agents
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
    • C12Q1/00—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
    • C12Q1/68—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving nucleic acids
    • C12Q1/6813—Hybridisation assays
    • C12Q1/6834—Enzymatic or biochemical coupling of nucleic acids to a solid phase
    • C12Q1/6837—Enzymatic or biochemical coupling of nucleic acids to a solid phase using probe arrays or probe chips
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
    • C12Q1/00—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
    • C12Q1/68—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving nucleic acids
    • C12Q1/6876—Nucleic acid products used in the analysis of nucleic acids, e.g. primers or probes
    • C12Q1/6883—Nucleic acid products used in the analysis of nucleic acids, e.g. primers or probes for diseases caused by alterations of genetic material
    • C12Q1/6886—Nucleic acid products used in the analysis of nucleic acids, e.g. primers or probes for diseases caused by alterations of genetic material for cancer
    • G—PHYSICS
    • G01—MEASURING; TESTING
    • G01N—INVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
    • G01N33/00—Investigating or analysing materials by specific methods not covered by groups G01N1/00 - G01N31/00
    • G01N33/48—Biological material, e.g. blood, urine; Haemocytometers
    • G01N33/50—Chemical analysis of biological material, e.g. blood, urine; Testing involving biospecific ligand binding methods; Immunological testing
    • G01N33/53—Immunoassay; Biospecific binding assay; Materials therefor
    • G01N33/543—Immunoassay; Biospecific binding assay; Materials therefor with an insoluble carrier for immobilising immunochemicals
    • G01N33/5436—Immunoassay; Biospecific binding assay; Materials therefor with an insoluble carrier for immobilising immunochemicals with ligand physically entrapped within the solid phase
    • G—PHYSICS
    • G01—MEASURING; TESTING
    • G01N—INVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
    • G01N33/00—Investigating or analysing materials by specific methods not covered by groups G01N1/00 - G01N31/00
    • G01N33/48—Biological material, e.g. blood, urine; Haemocytometers
    • G01N33/50—Chemical analysis of biological material, e.g. blood, urine; Testing involving biospecific ligand binding methods; Immunological testing
    • G01N33/53—Immunoassay; Biospecific binding assay; Materials therefor
    • G01N33/543—Immunoassay; Biospecific binding assay; Materials therefor with an insoluble carrier for immobilising immunochemicals
    • G01N33/54366—Apparatus specially adapted for solid-phase testing
    • G—PHYSICS
    • G01—MEASURING; TESTING
    • G01N—INVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
    • G01N33/00—Investigating or analysing materials by specific methods not covered by groups G01N1/00 - G01N31/00
    • G01N33/48—Biological material, e.g. blood, urine; Haemocytometers
    • G01N33/50—Chemical analysis of biological material, e.g. blood, urine; Testing involving biospecific ligand binding methods; Immunological testing
    • G01N33/53—Immunoassay; Biospecific binding assay; Materials therefor
    • G01N33/563—Immunoassay; Biospecific binding assay; Materials therefor involving antibody fragments
    • G—PHYSICS
    • G01—MEASURING; TESTING
    • G01N—INVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
    • G01N33/00—Investigating or analysing materials by specific methods not covered by groups G01N1/00 - G01N31/00
    • G01N33/48—Biological material, e.g. blood, urine; Haemocytometers
    • G01N33/50—Chemical analysis of biological material, e.g. blood, urine; Testing involving biospecific ligand binding methods; Immunological testing
    • G01N33/53—Immunoassay; Biospecific binding assay; Materials therefor
    • G01N33/574—Immunoassay; Biospecific binding assay; Materials therefor for cancer
    • G01N33/57484—Immunoassay; Biospecific binding assay; Materials therefor for cancer involving compounds serving as markers for tumor, cancer, neoplasia, e.g. cellular determinants, receptors, heat shock/stress proteins, A-protein, oligosaccharides, metabolites
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
    • C12Q2600/00—Oligonucleotides characterized by their use
    • C12Q2600/158—Expression markers
    • G—PHYSICS
    • G01—MEASURING; TESTING
    • G01N—INVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
    • G01N2800/00—Detection or diagnosis of diseases
    • G01N2800/50—Determining the risk of developing a disease
    • G—PHYSICS
    • G01—MEASURING; TESTING
    • G01N—INVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
    • G01N2800/00—Detection or diagnosis of diseases
    • G01N2800/56—Staging of a disease; Further complications associated with the disease

Landscapes

  • Health & Medical Sciences (AREA)
  • Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
  • Immunology (AREA)
  • Engineering & Computer Science (AREA)
  • Chemical & Material Sciences (AREA)
  • Urology & Nephrology (AREA)
  • Molecular Biology (AREA)
  • Hematology (AREA)
  • Biomedical Technology (AREA)
  • Analytical Chemistry (AREA)
  • General Health & Medical Sciences (AREA)
  • Cell Biology (AREA)
  • Biotechnology (AREA)
  • Microbiology (AREA)
  • Physics & Mathematics (AREA)
  • Pathology (AREA)
  • Biochemistry (AREA)
  • Medicinal Chemistry (AREA)
  • General Physics & Mathematics (AREA)
  • Food Science & Technology (AREA)
  • Organic Chemistry (AREA)
  • Hospice & Palliative Care (AREA)
  • Oncology (AREA)
  • Proteomics, Peptides & Aminoacids (AREA)
  • Wood Science & Technology (AREA)
  • Zoology (AREA)
  • Gastroenterology & Hepatology (AREA)
  • Genetics & Genomics (AREA)
  • Biophysics (AREA)
  • Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
  • General Engineering & Computer Science (AREA)
  • Chemical Kinetics & Catalysis (AREA)
  • General Chemical & Material Sciences (AREA)
  • Nuclear Medicine, Radiotherapy & Molecular Imaging (AREA)
  • Pharmacology & Pharmacy (AREA)
  • Animal Behavior & Ethology (AREA)
  • Public Health (AREA)
  • Veterinary Medicine (AREA)
  • Measuring Or Testing Involving Enzymes Or Micro-Organisms (AREA)
  • Investigating Or Analysing Biological Materials (AREA)

Claims (133)

1. Способ диагностики или определения патологического состояния, ассоциированного с раком поджелудочной железы, включающий стадии или состоящий из таковых:
(a) получения образца от индивидуума, подлежащего исследованию; и
(b) определения характеристики по биомаркерам исследуемого образца путем измерения наличия и/или количества одного или нескольких биомаркеров в исследуемом образце, выбранных из группы, определенной в Таблице А;
причем наличие и/или количество в исследуемом образце одного или нескольких биомаркеров, выбранных из группы, определенной в Таблице А, указывает на заболевание, ассоциированное у индивидуума с раком поджелудочной железы.
2. Способ по п. 1, в котором патологическое состояние, ассоциированное с раком поджелудочной железы, выбирают из группы, состоящей из:
(i) диагностики и/или определения стадии раннего рака поджелудочной железы;
(ii) диагностики и/или определения стадии рака поджелудочной железы; и
3. Способ по любому из пп. 1-2, в котором стадия (b) включает или состоит из измерения наличия и/или количества 1 или более биомаркеров, приведенных в Таблице А, например, по меньшей мере 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23, 24, 25, 26, 27, 28, 29, 30, 31, 32, 33, 34, 35, 36, 37, 38, 39, 40, 41, 42, 43, 44, 45, 46, 47, 48, 49, 50, 51, 52, 53, 54, 55, 56, 57, 58, 59, 60, 61, 62, 63, 64, 65, 66, 67, 68, 69, 70, 71, 72, 73, 74, 75, 76, 77, 78, 79, 80, 81, 82, 83, 84 или 85 биомаркеров, приведенных в таблице А.
4. Способ по любому из предшествующих пунктов, в котором патологическим состоянием, ассоциированным с раком поджелудочной железы, является ранний рак поджелудочной железы.
5. Способ по п. 4, в котором способ предназначен для диагностики рака поджелудочной железы I стадии или II стадии.
6. Способ по п. 5, в котором стадия (b) включает или состоит из измерения наличия и/или количества 1 или более биомаркеров, приведенных в:
(i) Таблице А (I), например, по меньшей мере 2, 3, 4 или 5 биомаркеров, приведенных в Таблице А (I);
(ii) Таблице А (III), например, по меньшей мере 2, 3, 4, 5 или 6 биомаркеров, приведенных в Таблице А (III);
(iii) Таблице А (V), например, по меньшей мере 2, 3, 4, 5 или 6 биомаркеров, приведенных в Таблице А (V); и
(iv) Таблице А (XI), например, по меньшей мере, 2 или 3 биомаркеров, приведенных в Таблице А (XI).
7. Способ по п. 5 или 6, в котором стадия (b) включает или состоит из измерения наличия и/или количества 1 или более биомаркеров, приведенных в:
(i) Таблице А (II), например, по меньшей мере, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15 или 16 биомаркеров, приведенных в Таблице А (II);
(ii) Таблице А (IV), например, по меньшей мере, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11 или 12 биомаркеров, приведенных в Таблице А (IV);
(iii) Таблице А (VI), например, по меньшей мере, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12 или 13 биомаркеров, приведенных в Таблице А (VI); и
(iv) Таблице А (XII), например, по меньшей мере 2, 3, 4, 5 или 6 биомаркеров, приведенных в Таблице А (ХII).
8. Способ по п. 4, в котором указанный способ предназначен для диагностики рака поджелудочной железы I стадии.
9. Способ по п. 8, в котором стадия (b) включает или состоит из измерения наличия и/или количества 1 или более биомаркеров, приведенных в:
(i) Таблице A (I), например, по меньшей мере 2, 3, 4 или 5 биомаркеров, приведенных в Таблице А (I);
(ii) Таблице А (III), например, по меньшей мере 2, 3, 4, 5 или 6 биомаркеров, приведенных в Таблице А (III);
(iii) Таблице А (VII).
10. Способ по п. 8 или 9, в котором стадия (b) включает или состоит из измерения наличия и/или количества 1 или более биомаркеров, приведенных в:
(i) Таблице А (II), например, по меньшей мере, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15 или 16 биомаркеров, приведенных в Таблице А (II);
(ii) Таблице А (IV), например, по меньшей мере, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11 или 12 биомаркеров, приведенных в Таблице А (IV); и
(iii) Таблице А (VIII), например, по меньшей мере 2, 3, 4, 5 или 6 биомаркеров, приведенных в Таблице А (VIII).
11. Способ по п. 4, в котором указанный способ предназначен для диагностики рака поджелудочной железы II стадии.
12. Способ по п. 11, в котором стадия (b) включает или состоит из измерения наличия и/или количества 1 или более биомаркеров, приведенных в:
(iv) Таблице А (I), например, по меньшей мере 2, 3, 4 или 5 биомаркеров, приведенных в Таблице А (I);
(v) Таблице А (V), например, по меньшей мере 2, 3, 4, 5 или 6 биомаркеров, приведенных в Таблице А (V);
(vi) Таблице А (IX).
13. Способ по п. 11 или 12, в котором стадия (b) включает или состоит из измерения наличия и/или количества 1 или более биомаркеров, приведенных в:
(iv) Таблице А (II), например, по меньшей мере, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15 или 16 биомаркеров, приведенных в Таблице А (II);
(v) Таблице A (VI), например, по меньшей мере, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12 или 13 биомаркеров, приведенных в Таблице А (VI); и
(vi) Таблице А (X), например, по меньшей мере 2, 3 или 4 биомаркеров, приведенных в Таблице А (X).
14. Способ по любому из предшествующих пунктов, в котором патологическим состоянием, ассоциированным с раком поджелудочной железы, является рак поджелудочной железы.
15. Способ по п. 14, в котором стадия (b) включает или состоит из измерения наличия и/или количества 1 или большего количества биомаркеров, выбранных из группы, состоящей из СНР-1, МАРKK 2, UBP7, PRD14, STAT1, AGAP-2, PGAM5, LUM, PTPRO и USP07, например, по меньшей мере 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9 или 10 из этих биомаркеров.
16. Способ по п. 14 или 15, в котором стадия (b) включает или состоит из измерения наличия и/или количества 1 или большего количества биомаркеров, выбранных из группы, состоящей из Аро-А1, ВТК, C1q, С5, CDK-2, IgM, IL-11, IL-12, IL-6, JAK3, МАРК8, МСР-1, MUC-1, пропердина, VEGF, С3, ICAM-1, IL-13, АТР-5 В, С4, Her2/ErB-2, IL-7, IL-3, IL-8, GM-CSF, IL-9, LDL и ORP3, например, по меньшей мере 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23, 24, 25, 26, 27, 28 или 29 из этих биомаркеров.
17. Способ по любому из предшествующих пунктов, в которых стадия (b) включает измерение наличия и/или количества всех биомаркеров, приведенных в Таблице А.
18. Способ по любому из предшествующих пунктов, дополнительно включающий или состоящий из стадий:
c) получения одного или нескольких контрольных образцов от:
i. индивидуума, не страдающего раком поджелудочной железы; и/или
ii. индивидуума, пораженного раком поджелудочной железы, образец которого находился на другой стадии по сравнению с исследуемым образцом;
d) определения характеристики по биомаркерам одного или нескольких контрольных образцов путем измерения наличия и/или количества в контрольном образце одного или большего количества биомаркеров, измеренных на стадии (b);
причем указанное патологическое состояние, ассоциированное с раком поджелудочной железы, идентифицируется в том случае, если наличие и/или количество одного или нескольких биомаркеров в исследуемом образце, измеренных на стадии (b), отличается от наличия и/или количества одного или нескольких биомаркеров в контрольном образце, измеренных на стадии (d).
19. Способ по любому из предшествующих пунктов, дополнительно включающий или состоящий из стадий:
e) получения одного или нескольких контрольных образцов от;
i: индивидуума, пораженного раком поджелудочной железы (т.е., положительного контроля); и/или
ii: индивидуума, пораженного раком поджелудочной железы, образец которого находился на той же стадии, что и исследуемый образец;
f) определения характеристики по биомаркерам контрольного образца путем измерения наличия и/или количества в контрольном образце одного или нескольких биомаркеров, измеренных на стадии (b);
причем патологическое состояние, ассоциированное с раком поджелудочной железы, идентифицируют в том случае, если наличие и/или количество одного или нескольких биомаркеров в исследуемом образце, измеренных на стадии (b), соответствует наличию и/или количеству одного или нескольких биомаркеров в контрольном образце, измеренных на стадии (f).
20. Способ по любому из пп. 18-19, в котором индивидуум, от которого получали один или несколько контрольных образцов, во время получения образца не был поражен нераковым заболеванием или состоянием поджелудочной железы, например, острым панкреатитом, хроническим панкреатитом, аутоиммунным панкреатитом и внутрипротоковой папиллярной муцинозной неоплазией (ВПМН) поджелудочной железы.
21. Способ по любому из пп. 18-20, в котором индивидуум, от которого получали один или несколько контрольных образцов, во время получения образца не был поражен никаким заболеванием или состоянием поджелудочной железы.
22. Способ по п. 18, в котором индивидуум, не пораженный раком поджелудочной железы, во время получения образца не был поражен никаким заболеванием или состоянием.
23. Способ по п. 18, в котором индивидуум, не пораженный раком поджелудочной железы, является здоровым индивидуумом.
24. Способ по любому из пп. 18-23, в котором один или несколько индивидуумов, пораженных раком поджелудочной железы, поражены раком поджелудочной железы, выбранным из группы, состоящей из аденокарциномы (например, протоковой аденокарциномы поджелудочной железы или тубулярной папиллярной аденокарциномы поджелудочной железы), саркомы поджелудочной железы, злокачественной серозной цистаденомы, аденосквамозной карциномы, перстневидно-клеточной карциномы, гепатоидной карциномы, коллоидной карциномы, недифференцированной карциномы и недифференцированных карцином с остеокластподобными гигантскими клетками.
25. Способ по любому из предшествующих пунктов, в котором рак поджелудочной железы представляет собой аденокарциному поджелудочной железы (например, протоковую аденокарциному поджелудочной железы).
26. Способ по любому из предшествующих пунктов, в котором указанный способ повторяют.
27. Способ по любому из предшествующих пунктов, в котором указанный способ повторяют и в котором на стадии (а) образец, подлежащий исследованию, извлекают в другое время по отношению к предыдущему повтору способа.
28. Способ по п. 26 или 27, в котором способ повторяют с использованием исследуемого образца, взятого в другой период времени по отношению к используемому (используемым) предыдущему (предыдущим) исследуемому (исследуемым) образцу (образцам).
29. Способ по п. 27 или 28, в котором способ повторяют с использованием исследуемого образца, взятого между 1-м днем и 104-м неделей по отношению к предыдущему (предыдущим) исследуемому (исследуемым) образцу (образцам), использованному, например, между 1-й неделей и 100-й неделей, между 1-й неделей и 90-й неделей, между 1-й неделей и 80-й неделей, между 1-й неделей и 70-й неделей, между 1-й неделей и 60-й неделей, между 1-й неделей и 50-й неделей, между 1-й неделей и 40-й неделей, между 1-й неделей и 30-й неделей, между 1-й неделей и 20-й неделей, между 1-й неделей и 10-й неделей, между 1-й неделей и 9-й неделей, между 1-й неделей и 8-й неделей, между 1-й неделей и 7-й неделей, между 1-й неделей и 6-й неделей, между 1-й неделей и 5-й неделей, между 1-й неделей и 4-й неделей, между 1-й неделей и 3-й неделей или между 1-й неделей и 2-й неделей.
30. Способ по п. 27 или 28, в котором указанный способ повторяют с использованием исследуемого образца, взятого в каждый период из группы, состоящей из 1 дня, 2 дней, 3 дней, 4 дней, 5 дней, 6 дней, 7 дней, 10 дней, 2 недель, 3 недель, 4 недель, 5 недель, 6 недель, 7 недель, 8 недель, 9 недель, 10 недель, 15 недель, 20 недель, 25 недель, 30 недель, 35 недель, 40 недель, 45 недель, 50 недель, 55 недель, 60 недель, 65 недель, 70 недель, 75 недель, 80 недель, 85 недель, 90 недель, 95 недель, 100 недель, 104 недели, 105 недель, 110 недель, 115 недель, 120 недель, 125 недель и 130 недель.
31. Способ по любому из пп. 26-30, в котором указанный способ повторяют по меньшей мере один раз, например, 2 раза, 3 раза, 4 раза, 5 раз, 6 раз, 7 раз, 8 раз, 9 раз, 10 раз, 11 раз, 12 раз, 13 раз, 14 раз, 15 раз, 16 раз, 17 раз, 18 раз, 19 раз, 20 раз, 21 раз, 22 раза, 23 раза, 24 раза или 25 раз.
32. Способ по любому из пп. 26-30, в котором указанный способ повторяют непрерывно.
33. Способ по любому из пп. 26-30, в котором способ повторяют до тех пор, пока рак поджелудочной железы не диагностируют у индивидуума с помощью стандартных клинических способов.
34. Способ по любому из пп. 26-30, в котором в каждом повторе используют исследуемый образец, взятый у одного и того же индивидуума.
35. Способ по любому из пп. 1-34, в котором стадия (b) включает измерение экспрессии белка или полипептида одного или нескольких биомаркеров.
36. Способ по любому из предшествующих пунктов, в котором стадию (b), (d) и/или стадию (f) осуществляют с помощью одного или нескольких первых связывающих агентов, способных связываться с биомаркером, приведенным в таблице А.
37. Способ по п. 36, в котором указанный первый связывающий агент содержит или состоит из антитела или его антигенсвязывающего фрагмента.
38. Способ по п. 37, в котором указанные антитело или его антигенсвязывающий фрагмент представляет собой рекомбинантное антитело или его антигенсвязывающий фрагмент.
39. Способ по п. 37 или 38, в котором антитело или его антигенсвязывающий фрагмент выбирают из группы, состоящей из: scFv; Fab; связывающего домена иммуноглобулиновой молекулы.
40. Способ по любому из пп. 36-39, в котором первый связывающий агент иммобилизуют на поверхности.
41. Способ по любому из пп. 36-40, в котором один или несколько биомаркеров в исследуемом образце метят детектируемым фрагментом.
42. Способ по любому из пп. 36-41, в котором один или несколько биомаркеров в контрольном (контрольных) образце (образцах) метят детектируемым фрагментом.
43. Способ по п. 41 или 42, в котором детектируемый фрагмент выбирают из группы, состоящей из: флуоресцентного фрагмента; люминесцентного фрагмента; хемилюминесцентного фрагмента; радиоактивного фрагмента; ферментативного фрагмента.
44. Способ по п. 41 или 42, в котором детектируемым фрагментом является биотин.
45. Способ по любому из пп. 36-44, в котором стадию (b), (d) и/или стадию (f) осуществляют с использованием анализа, включающего второй связывающий агент, способный связываться с одним или несколькими биомаркерами, при этом второй связывающий агент содержит детектируемый фрагмент.
46. Способ по п. 45, в котором второй связывающий агент содержит или состоит из антитела или его антигенсвязывающего фрагмента.
47. Способ по п. 46, в котором указанные антитело или его антигенсвязывающий фрагмент представляют собой рекомбинантное антитело или его антигенсвязывающий фрагмент.
48. Способ по п. 46 или 47, в котором указанные антитело или его антигенсвязывающий фрагмент выбирают из группы, состоящей из scFv; Fab; связывающего домена иммуноглобулиновой молекулы.
49. Способ по любому из пп. 46-48, в котором детектируемый фрагмент выбирают из группы, состоящей из: флуоресцентного фрагмента; люминесцентного фрагмента; хемилюминесцентного фрагмента; радиоактивного фрагмента; ферментативного фрагмента.
50. Способ по п. 49, в котором детектируемым фрагментом является флуоресцентный фрагмент (например, краситель Alexa Fluor, например, Аlеха647).
51. Способ по любому из предшествующих пунктов, в котором указанный способ включает или состоит из ИФА (иммуноферментный анализ).
52. Способ по любому из предшествующих пунктов, в котором стадию (b), (d) и/или стадию (f) осуществляют с использованием чипа.
53. Способ по п. 52, в котором чип представляет собой чип на основе гранул.
54. Способ по п. 53, в котором чип представляет собой поверхностный чип.
55. Способ по любому из пп. 52-54, в котором чип выбирают из группы, состоящей из: макрочипа; микрочипа; наночипа.
56. Способ по любому из предшествующих пунктов, в котором указанный способ включает:
(i) маркировку биомаркеров, присутствующих в образце, биотином;
(ii) приведение в контакт меченых биотином белков с чипом, содержащим множество scFv, иммобилизованных в отдельных участках на его поверхности, при этом указанные scFv, имеют специфичность к одному или нескольким белкам в таблице А;
(iii) приведение в контакт иммобилизованного scFv со стрептавидиновым конъюгатом, содержащим флуоресцентный краситель; и
(iv) выявление наличия красителя в отдельных участках на поверхности чипа,
причем экспрессия красителя на поверхности чипа указывает на экспрессию биомаркера из Таблицы III в образце.
57. Способ по любому из пп. 1-34, в котором стадия (b), (d) и/или (f) включает измерение экспрессии молекулы нуклеиновой кислоты, кодирующей один или несколько биомаркеров.
58. Способ по п. 57, в котором молекула нуклеиновой кислоты представляет собой молекулу к ДНК или молекулу мРНК.
59. Способ по п. 58, в котором молекула нуклеиновой кислоты представляет собой молекулу мРНК.
60. Способ по пп. 57, 58 или 59, в котором измерение экспрессии одного или нескольких указанных биомаркеров на стадии (b), (d) и/или (f) осуществляют с помощью способа, выбранного из группы, состоящей из саузерн-гибридизации, нозерн-гибридизации, полимеразной цепной реакции (ПЦР), ПЦР с обратной транскрипцией (ОТ-ПЦР), количественной ПЦР в реальном времени (qRT-ПЦР), наночипа, микрочипа, макрочипа, авторадиографии и гибридизации in situ.
61. Способ по любому из пп. 57-60, в котором измерение экспрессии одного или нескольких биомаркеров на стадии (b) определяют с использованием ДНК-микрочипа.
62. Способ по любому из пп. 57-61, в котором измерение экспрессии одного или нескольких биомаркеров на стадии (b), (d) и/или (f) осуществляют с использованием одного или нескольких связывающих фрагментов, каждый из которых в отдельности способен избирательно связываться с молекулой нуклеиновой кислоты, кодирующей один из биомаркеров, идентифицированных в таблице А.
63. Способ по п. 62, в котором каждый из указанных одного или несколько связывающих фрагментов содержат или состоят из молекулы нуклеиновой кислоты.
64. Способ по п. 63, в котором каждый из указанных одного или нескольких связывающих фрагментов содержит или состоит из ДНК, РНК, PNA, LNA, GNA, TNA или РМО.
65. Способ по п. 63 или 64, в котором каждый из указанных одного или нескольких связывающих фрагментов содержит или состоит из ДНК.
66. Способ по любому из пп. 63-65, в котором один или несколько связывающих фрагментов составляют от 5 до 100 нуклеотидов в длину.
67. Способ по любому из пп. 63-65, в котором одна или несколько молекул нуклеиновой кислоты составляют от 15 до 35 нуклеотидов в длину.
68. Способ по любому из пп. 63-67, в котором связывающий фрагмент содержит детектируемый фрагмент.
69. Способ по п. 68, в котором детектируемый фрагмент выбирают из группы, состоящей из: флуоресцентного фрагмента; люминесцентного фрагмента; хемилюминесцентного фрагмента; радиоактивного фрагмента (например, радиоактивного атома); или ферментативного фрагмента.
70. Способ по п. 69, в котором детектируемый фрагмент содержит или состоит из радиоактивного атома.
71. Способ по п. 70, в котором радиоактивный атом выбирают из группы, состоящей из технеция-99m, йода-123, йода-125, йода-131, индия-111, фтора-19, углерода-13, азота-15, кислорода-17, фосфора-32, серы-35, дейтерия, трития, рения-186, рения-188 и иттрия-90.
72. Способ по п. 69, в котором детектируемый фрагмент связывающего фрагмента представляет собой флуоресцентный фрагмент.
73. Способ по любому из предшествующих пунктов, в котором образец, полученный на стадии (а), (с) и/или (е), выбирают из группы, состоящей из нефракционированной крови, плазмы, сыворотки, тканевой жидкости, ткани поджелудочной железы, молока, желчи и мочи.
74. Способ по п. 73, в котором образец, полученный на стадии (а), (с) и/или (е), выбирают из группы, состоящей из нефракционированной крови, плазмы и сыворотки.
75. Способ по п. 73 или 74, в котором образец, полученный на стадии (а), (с) и/или (е), представляет собой сыворотку.
76. Способ по любому из предшествующих пунктов, в котором точность прогноза способа, определяемая величиной ROC AUC, составляет по меньшей мере 0,50, например, по меньшей мере 0,55, 0,60, 0,65, 0,70, 0,75, 0,80, 0,85, 0,90, 0,95, 0,96, 0,97, 0,98 или по меньшей мере 0,99.
77. Способ по п. 76, в котором точность прогноза способа, определяемая величиной ROC AUC, составляет по меньшей мере 0,70.
78. Способ по любому из предшествующих пунктов, в котором в случае, когда у человека диагностируют рак поджелудочной железы, способ включает стадию:
(g) предоставления индивидууму терапии рака поджелудочной железы.
79. Способ по п. 78, в котором терапию рака поджелудочной железы выбирают из группы, состоящей из хирургического вмешательства, химиотерапии, иммунотерапии, химиоиммунотерапии и термохимиотерапии.
80. Чип для определения наличия рака поджелудочной железы у индивидуума, содержащий один или несколько связывающих агентов как определено в любом из пп. 36-51 и пп. 64-72.
81. Чип по п. 80, отличающийся тем, что указанные один или несколько связывающих агентов способны связываться со всеми из белков, определенных в Таблице А.
82. Применение одного или нескольких биомаркеров, выбранных из группы, определенной в таблице А, в качестве биомаркера для определения наличия рака поджелудочной железы у индивидуума.
83. Применение по п. 82, в котором все из белков, определенных в таблице А, используют в качестве диагностического маркера для определения наличия рака поджелудочной железы у индивидуума.
84. Применение одного или нескольких связывающих фрагментов как определено в любом из пп. 36-51 и пп. 64-72 для определения наличия рака поджелудочной железы у индивидуума.
85. Применение по п. 84, в котором используют биомаркеры для всех белков, определенных в таблице А.
86. Набор для определения наличия рака поджелудочной железы, содержащий:
A) один или более связывающих агентов, как определено в любом из пп. 36-51 и пп. 64-72, или чип по пп. 80-81;
B) инструкции для осуществления способа, как определено в любом из пп. 1-79.
87. Способ лечения рака поджелудочной железы у индивидуума, включающий стадии:
(a) диагностики рака поджелудочной железы в соответствии со способом, определенным в любом из пп. 1-79; и
(b) предоставления индивидууму терапии рака поджелудочной железы.
88. Способ по п. 87, где терапию рака поджелудочной железы выбирают из группы, состоящей из хирургического вмешательства (например, резекции), химиотерапии, иммунотерапии, химиоиммунотерапии и термохимиотерапии.
RU2018138639A 2016-05-10 2017-05-10 Способ, чип и их применение RU2018138639A (ru)

Applications Claiming Priority (3)

Application Number Priority Date Filing Date Title
GBGB1608192.9A GB201608192D0 (en) 2016-05-10 2016-05-10 Method, array and use thereof
GB1608192.9 2016-05-10
PCT/EP2017/061202 WO2017194613A2 (en) 2016-05-10 2017-05-10 Method, array and use thereof

Publications (2)

Publication Number Publication Date
RU2018138639A true RU2018138639A (ru) 2020-06-10
RU2018138639A3 RU2018138639A3 (ru) 2020-10-30

Family

ID=56297465

Family Applications (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
RU2018138639A RU2018138639A (ru) 2016-05-10 2017-05-10 Способ, чип и их применение

Country Status (13)

Country Link
US (2) US20200011872A1 (ru)
EP (2) EP3455632A2 (ru)
JP (2) JP2019516981A (ru)
KR (1) KR20190005858A (ru)
CN (1) CN109564221A (ru)
AU (1) AU2017261762A1 (ru)
BR (1) BR112018073178A2 (ru)
CA (1) CA3022022A1 (ru)
GB (1) GB201608192D0 (ru)
IL (1) IL262824A (ru)
MX (1) MX2018013621A (ru)
RU (1) RU2018138639A (ru)
WO (1) WO2017194613A2 (ru)

Families Citing this family (9)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
WO2008117067A2 (en) * 2007-03-27 2008-10-02 Carl Arne Krister Borrebaeck Protein signature/markers for the detection of adenocarcinoma
AU2018273914A1 (en) 2017-05-24 2019-11-14 Pandion Operations, Inc. Targeted immunotolerance
US10946068B2 (en) 2017-12-06 2021-03-16 Pandion Operations, Inc. IL-2 muteins and uses thereof
US10174091B1 (en) 2017-12-06 2019-01-08 Pandion Therapeutics, Inc. IL-2 muteins
EP3972992A4 (en) 2019-05-20 2023-07-19 Pandion Operations, Inc. ANTI-MADCAM IMMUNE TOLERANCE
EP4107187A4 (en) 2020-02-21 2024-07-03 Pandion Operations Inc TISSUE-TARGETED IMMUNOTOLERANCE WITH A CD39 EFFECTOR
GB202010970D0 (en) 2020-07-16 2020-09-02 Immunovia Ab Methods, arrays and uses thereof
US20240010722A1 (en) * 2020-11-18 2024-01-11 Pandion Operations, Inc. Madcam targeted therapeutics and uses thereof
WO2022204332A1 (en) * 2021-03-24 2022-09-29 Combangio, Inc. Compositions comprising c-met agonist antibodies and methods for use in ocular treatment

Family Cites Families (22)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
DE3169789D1 (en) 1980-05-02 1985-05-15 Edward P Davis Leg aid device
US4376110A (en) 1980-08-04 1983-03-08 Hybritech, Incorporated Immunometric assays using monoclonal antibodies
US4486530A (en) 1980-08-04 1984-12-04 Hybritech Incorporated Immunometric assays using monoclonal antibodies
US5856090A (en) 1994-09-09 1999-01-05 The Scripps Research Institute DNA-methylase linking reaction
GB9703369D0 (en) 1997-02-18 1997-04-09 Lindqvist Bjorn H Process
ES2318079T3 (es) * 2002-10-31 2009-05-01 F. Hoffmann-La Roche Ag Metodos para el diagnostico del cancer pancreatico y composicones uti les en los mismos.
US9005613B2 (en) * 2003-06-16 2015-04-14 Immunomedics, Inc. Anti-mucin antibodies for early detection and treatment of pancreatic cancer
JP2009505632A (ja) * 2005-07-27 2009-02-12 オンコセラピー・サイエンス株式会社 膵臓癌関連遺伝子であるｃｓｔ６およびｇａｂｒｐ
WO2008117067A2 (en) * 2007-03-27 2008-10-02 Carl Arne Krister Borrebaeck Protein signature/markers for the detection of adenocarcinoma
SG187045A1 (en) * 2010-08-13 2013-02-28 Somalogic Inc Pancreatic cancer biomarkers and uses thereof
GB201103726D0 (en) 2011-03-04 2011-04-20 Immunovia Ab Method, array and use thereof
WO2013052480A1 (en) * 2011-10-03 2013-04-11 The Board Of Regents Of The University Of Texas System Marker-based prognostic risk score in colon cancer
WO2013106844A2 (en) * 2012-01-13 2013-07-18 Oncocyte Corporation Methods and compositions for the treatment and diaginosis of pancreatic cancer
KR20140094180A (ko) * 2013-01-21 2014-07-30 연세대학교 산학협력단 보체인자 b 단백질에 특이적으로 결합하는 폴리펩타이드 또는 항체를 포함하는 췌장암 진단용 조성물
WO2014160499A2 (en) * 2013-03-13 2014-10-02 Creatics Llc Methods and compositions for detecting pancreatic cancer
CN105102637B (zh) * 2013-04-17 2018-05-22 Lg电子株式会社 提取胰腺癌诊断生物标志物的方法、用于该方法的计算装置、胰腺癌诊断生物标志物以及包含该生物标志物的胰腺癌诊断装置
RU2693006C2 (ru) * 2013-10-01 2019-07-01 Торэй Индастриз, Инк. Способ выявления опухоли поджелудочной железы, антитела и набор для выявления опухоли поджелудочной железы
GB201319878D0 (en) * 2013-11-11 2013-12-25 Immunovia Ab Method, Array and use thereof
EP3140426A4 (en) * 2014-05-07 2018-02-21 University of Utah Research Foundation Biomarkers and methods for diagnosis of early stage pancreatic ductal adenocarcinoma
KR20150129932A (ko) * 2014-05-12 2015-11-23 연세대학교 산학협력단 보체인자 b 단백질에 특이적으로 결합하는 항체를 포함하는 췌장암 진단용 키트
CN105092845A (zh) * 2015-07-10 2015-11-25 深圳市贝沃德克生物技术研究院有限公司 胰腺癌蛋白生物标记物、用途及其检测芯片和检测装置
GB201516801D0 (en) * 2015-09-22 2015-11-04 Immunovia Ab Method, array and use thereof

Also Published As

Publication number Publication date
US20200011872A1 (en) 2020-01-09
AU2017261762A1 (en) 2018-11-15
WO2017194613A2 (en) 2017-11-16
RU2018138639A3 (ru) 2020-10-30
JP2019516981A (ja) 2019-06-20
CA3022022A1 (en) 2017-11-16
JP2021165745A (ja) 2021-10-14
KR20190005858A (ko) 2019-01-16
BR112018073178A2 (pt) 2019-02-19
EP3455632A2 (en) 2019-03-20
WO2017194613A3 (en) 2017-12-21
US20220206004A1 (en) 2022-06-30
GB201608192D0 (en) 2016-06-22
CN109564221A (zh) 2019-04-02
EP3907509A2 (en) 2021-11-10
EP3907509A3 (en) 2021-12-29
IL262824A (en) 2018-12-31
MX2018013621A (es) 2019-04-25

Similar Documents

Publication Publication Date Title
RU2018138639A (ru) Способ, чип и их применение
KR101788414B1 (ko) 간암 조기 진단용 바이오마커 및 그 용도
US8273539B2 (en) Extracellular and membrane-associated prostate cancer markers
RU2019123695A (ru) Способы, массивы и их применение
JP2019516981A5 (ru)
CN105316405A (zh) 用于胃癌检测的标记物
JP6072768B2 (ja) 川崎病の診断マーカーおよび治療標的
KR20210100068A (ko) 췌장암 진단용 바이오마커 패널 및 그 용도
KR101478826B1 (ko) 신규한 대장암 진단용 마커 및 이를 이용한 대장암 진단 키트
WO2012081007A2 (en) Methods of diagnosing and treating pancreatic cancer
EP2784511A1 (en) Integrin alpha-v-beta6 for diagnosis/prognosis of colorectal carcinoma
JP2007263896A (ja) 肺癌患者の術後予後予測のための生物マーカー及びその方法
JP6639408B2 (ja) デオキシハイプシン・シンターゼ遺伝子を指標として用いる動脈硬化及びがんの検出方法
KR101054952B1 (ko) 간암 진단 및 환자 생존기간 예측용 마커인 ｕｑｃｒｈ, 그를 포함하는 키트 및 상기 마커를 이용한 간암 환자 생존기간 예측
KR101995189B1 (ko) 비침습적 체외진단을 위한 간암 진단용 바이오마커 조성물 및 이를 포함하는 키트
US20140248637A1 (en) Composition for diagnosis of lung cancer and diagnosis kit of lung cancer
KR101878974B1 (ko) 신장암 진단용 조성물과 진단 마커 검출 방법
KR102171189B1 (ko) 담도암의 진단 또는 예후 예측용 바이오마커 및 이의 활용
KR101859812B1 (ko) 간암 화학 색전술 치료 예후 예측을 위한 바이오마커 및 그 용도
EP3698138B1 (en) Assay and kit for the diagnosis of ovarian carcinoma
KR102131860B1 (ko) 아르기닌이 메틸화된 ggt1에 특이적으로 결합하는 대장암 진단용 바이오마커 조성물
CN117120847A (zh) 肺癌的检测方法
JPWO2011138955A1 (ja) Ｓｉａα２−８Ｓｉａα２−３Ｇａｌβ−Ｒ糖鎖を持つムチン１の分析方法
US20160069883A1 (en) Biomarkers for detection of breast cancer
JP6769596B2 (ja) 膀胱癌診断薬及び生体試料の判定方法

Legal Events

Date Code Title Description
FA92 Acknowledgement of application withdrawn (lack of supplementary materials submitted)

Effective date: 20211220