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KR930004477A - 미코박테리아 프라이머 및 탐침 - Google Patents

미코박테리아 프라이머 및 탐침 Download PDF

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KR930004477A
KR930004477A KR1019920014555A KR920014555A KR930004477A KR 930004477 A KR930004477 A KR 930004477A KR 1019920014555 A KR1019920014555 A KR 1019920014555A KR 920014555 A KR920014555 A KR 920014555A KR 930004477 A KR930004477 A KR 930004477A
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Abstract

내용 없음.

Description

미코박테리아 프라이머 및 탐침
본 내용은 요부공개 건이므로 전문내용을 수록하지 않았음
제1도는 본 발명의 속(genus)특이적 탐침과 종(species)특이적 탐칩 모두를 사용한 하이브리드화 시험의 결과를 나타낸 것이다.

Claims (27)

  1. 하이브리드화 서열로서 KY18(SEQ ID NO.1)또는 KY75(SEQ ID no.2)의 14개 이상의 뉴클레오타이드를 포함하는 서열을 함유하는, 마코박테리아 종(mycobacterial species)의 16S 리보좀성 RNA 유전자의 표적용역 또는 상응하는 RNA가 하이브리드화되는 올리고뉴클레오타이드 프라이머.
  2. 제1프라이머는 하이브리드화 서열로서 서열 KY18(SEQ ID NO.1)을 함유하고 제2프라이머는 하이브리드화 서욜로서 KY75(SEQ ID NO.2)를 함유하는 미코박테리아종의 16S 리보좀성 RNA 유전자의 표적 영역 또는 상응하는 RNA를 증폭시킬 수 있는 올리고뉴클레오타이드 프라이머 쌍.
  3. 제2항에 따르는 프라이머 쌍에 의해 증폭된 미코박테리아종의 16S리보좀성 RNA유전자의 표적 영역 또는 상응하는 RNA와 하이브리드화할 수 있는 핵산서열을 함유하는 올리고뉴클레오 타이드 탐침.
  4. 제3항에 있어서, 표적 영역내에 보존되는 특정 영여과 하이브리드화할 수 있는 올리고뉴클레오타이드 탐침.
  5. 제4항에 있어서, 서열 KY101(SEQ ID NO.3)또는 이의 상보물의 14개 이상의 뉴클레오타이드를 포함하는 서열을 함유하는 올리고뉴클레오타이드 탐침.
  6. 제4항에 있어서, 서열 KY102(SEQ ID NO.4)또는 이의 상보물의 14개 이상의 뉴클레오타이드를 포함하는 서열을 함유하는 올리고뉴클레오타이드 탐침.
  7. 제4항에 있어서, 탐침 하이브리드화 서열이 검출할 미코박테리아 종의 16S 리보좀 RNA 유전자 서열과 동일 하지 않은(여기서, 하이브리드화 서열을 동일하지 않은 유전자 서열과 하이브리드화할 수 있다) 올리고뉴클레오타이드 탐침.
  8. 제7항에 있어서, 탐침 하이브리드화 서열이 서열 KY165(SEQ ID NO.13)또는 이의 상보물의 14개 이상의 뉴클레오 타이드를 포함하는 서열을 함유하는 올리고뉴클레오타이드 탐침.
  9. 제7항에 있어서, 탐침 하이브리드화 서열이 서열 KY166(SEQ ID NO.4)또는 이의 상보물의 14개 이상의 뉴클레오 타이드를 포함하는 서열을 함유하는 올리고뉴클레오타이드 탐침.
  10. 재3항에 있어서, 탐침 하이브리드화 서열이 표적 영역내에서 변화가능한 영여과 하이브리드화할 수 있는 올리고 뉴클레오타이드 탐침.
  11. 제10항에 있어서, 탐침 하이브리드화 서열이 서열 KY21(SEQ ID NO.5), KY25(SEQ ID NO.6), KY26(SEQ ID NO.7), KY63(SEQ ID NO.8), KY151(SEQ ID NO.9), KY106(SEQ ID NO.10), KY126(SEQ ID NO11), KY139(SEQ ID NO.12), KY157(SEQ ID NO.16), KY167(SEQ ID NO.17), KY168(SEQ ID NO.18), KY169(SEQ ID NO.19), KY170(SEQ ID NO.20), KY171(SEQ ID NO.21), KY172(SEQ ID NO.22), KY173(SEQ ID NO23) 및 이에 상보성인 서욜로 이루어진 그룹중에서 선택된 서열의 14개 이상의 뉴클레오타이드를 포함하는 서열은 함유하는 올리고 뉴클레오타이드 탐침.
  12. 제11항에 따르는 2개 이상의 올리로뉴클레오타이드 탐침을 포함하는 올리고뉴클레오타이드 탐침 패널.
  13. (a)16S 리보좀 성 RNA 유전자로부터의 핵산 영역을 증폭시키고, (b)단계 (a)에서 증폭된 핵산을 제3항으로부터이 서열 특이적 올리고뉴클레오타이드 탐침과 혼합하며, (c)핵산과 탐침 사이에 형성된 하이브리드를 검출함을 포함하여, 샘플중에 함유된 미코박테리아성 핵산을 검출하는 방법.
  14. (a)미코박테리아로부터의 16S 리보좀성 RNA 유전자의 핵산 영역을 증폭시키고 (b)단계(a)에서 증폭된 핵산을 제12항의 서열-특이적 올리고뉴클레오타이드 탐침 패널과 혼합한 다음 (c)이러한 핵산과 탐침 사이에 형성된 하이브리드를 검출함을 포함하여 미코박테리아를 분류하는 방법.
  15. 제13항에 있어서, 폴리모라제 연쇄 반응에 의해 증폭이 달성되는 방법.
  16. 제14항에 있어서, 폴리모라제 연쇄 반응에 의해 증폭이 달성되는 방법.
  17. 제15항에 있어서, 폴리머라제 연쇄 반응이 서열 KY18(SEQ ID NO.1) 및 KY75(SEQ ID NO.2)을 포함하는 프라이머 쌍을 사용하여 달성되는 방법.
  18. 제16항에 있어서, 폴리머라제 연쇠 반응이 서열 KY18(SEQ ID NO.1) 및 KY75(SEQ ID NO.2)을 포함하는 프라이머 쌍을 사용하여 달성되는 방법.
  19. 제1프라이머의 하이브리드화 서열이 KY18(SEQ ID NO.1)의 14개 이상의 뉴클레오타이드를 포함하는 서열이고 제2프라이머의 하이브리드화 서열이 KY17(SEQ ID NO.2)의 14개 이상의 뉴클레오타이드를 포함하는 서열인 프라이머 쌍을 포함하는 샘플중의 미코박테리아성 핵산을 검출하고 임의로 동종하기 위한 키트.
  20. 제19항에 있어서, 한쌍의 프리이머 하이브리드화 서열이 KY18(SEQ ID NO.1) 및 KY75(SEQ ID NO.2)에 의해 증폭된 16S 리보좀성 RNA 유전자의 영역과 하이브리드화할 수 있는 핵산 서열은 함유하는 올리고뉴클레오타이드 탐침을 추가로 포함하는 키트.
  21. 제20항에 있어서, 탐침 서열이 검출할 미코박테리아 종의 어떠한 서열과도 동일하지 않은 키트.
  22. 제21항에 있어서, 서열 KY21(SEQ ID NO.5), KY25(SEQ ID NO.6), KY26(SEQ ID NO.7), KY63(SEQ ID NO.8), KY151(SEQ ID NO.9), KY106(SEQ ID NO.10), KY126(SEQ ID NO.11), KY139(SEQ ID NO.12), KY157(SEQ ID NO.16), KY167(SEQ ID NO.17), KY168(SEQ ID NO.18), KY169(SEQ ID NO.19), KY170(SEQ ID NO.20), KY171(SEQ ID NO.21), KY172(SEQ ID NO.22), KY173(SEQ ID NO.23) 및 이에 상보성인 서열의 14개 이상의 뉴클레오타이드를 포함하는 서열로 이루어진 그룹중에서 선택된 하나 이상의 올리고 뉴클레오타이드 탐침을 추가로 포함하는 키트.
  23. 제21항에 있어서, 서열 KY21(SEQ ID NO.5), KY25(SEQ ID NO.6), KY26(SEQ ID NO.7), KY63(SEQ ID NO.8), KY151(SEQ ID NO.9), KY106(SEQ ID NO.10), KY126(SEQ ID NO.11), KY139(SEQ ID NO.12), KY157(SEQ ID NO.16), KY167(SEQ ID NO.17), KY168(SEQ ID NO.18), KY169(SEQ ID NO.19), KY170(SEQ ID NO.20), KY171(SEQ ID NO.21), KY172(SEQ ID NO.22), KY173(SEQ ID NO.23) 및 이에 상보성인 서열의 14개 이상의 뉴클레오타이드를 포함하는 서열로 이루어진 그룹중에서 선택된 2개 이상의 올리고 뉴클레오타이드 탐침을 포함하는 올리고 뉴클레오타이드 탐침 패널을 추가로 포함하는 키트.
  24. 제22항에 있어서 , 프라이머 KY18(SEQ ID NO.1) 및 KY75(SEQ ID NO.2)에 상보성인 상부 및 하부 서열에 의해 플랭크된 내부 대조군 올리고뉴클레오타이드 서열을 추가로 포함하는 키트.
  25. KY18(SEQ ID NO.1)또는 KY75(SEQ ID NO.2)로 이루어진 그룹중에서 선택된 핵산 서열에 의해 플랭크된 합성 올리고 뉴클레오타이드 서열을 포함하는 내부 양성 대조군 올리고 뉴클레오타이드 서열.
  26. 제26항에 있어서, 서열 KY101(SEQ ID NO.3) KY102(SEQ ID NO.4) KY165(SEQ ID NO.13) 및KY166(SEQ ID NO.14)의 14개 이상의 뉴클레오타이드를 포함하는 서열로 이루어진 그룹 중에서 선택된 핵산 서열을 추가로 포함하는 올리고 뉴클레오타이드 서열.
  27. 제26항에 있어서, 서열 KY21(SEQ ID NO.5), KY25(SEQ ID NO.6), KY26(SEQ ID NO.7), KY63(SEQ ID NO.8), KY151(SEQ ID NO.9), KY106(SEQ ID NO.10), KY126(SEQ ID NO.11), KY139(SEQ ID NO.12), KY157(SEQ ID NO.16), KY167(SEQ ID NO.17), KY168(SEQ ID NO.18), KY169(SEQ ID NO.19), KY170(SEQ ID NO.20), KY171(SEQ ID NO.21), KY172(SEQ ID NO.22), KY173(SEQ ID NO.23)의 14개 이상의 뉴클레오타이드를 포함하는 서열로 이루어진 그룹중에서 선택된 핵산 서열을 추가로 포함하는 올리고 뉴클레오타이드 서열.
    ※ 참고사항 : 최초출원 내용에 의하여 공개하는 것임.
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