KR20230078657A - Methods and compositions for treating autoimmune diseases and cancer - Google Patents
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Abstract
종양 괴사 인자 수용체 1(TNFR1) 및/또는 종양 괴사 인자 수용체 2(TNFR2)를 표적으로 하는 분자 작제물이 제공된다. 작제물은 이들 수용체 및/또는 TNF가 병인에 관여하거나 그의 억제 또는 활성화가 질환, 장애 및 병태 또는 그의 증상을 개선할 수 있는 질환, 장애 및 병태를 치료하기 위한 것이다. 본 명세서에 제공되는 작제물 중에는, TNFR1 기능을 억제하고 임의의 TNFR1 효능적 활성을 제거하도록 조작된 TNFR1 길항제 작제물이 있다. 본 명세서에 제공된 작제물은 TNFR1 및 TNFR2의 효능제 및 길항제를 포함한다. TNFR1 길항제 작제물은 TNFR1 기능을 억제하도록 조작되고, 일부 구현예에서는 효능적 활성을 피하도록 조작된다. 또한 TNFR2의 효능제 및 길항제가 포함된다. TNFR2의 효능제는 조절 T-세포 기능을 증가시켜 급성 또는 만성 염증을 제어한다. TNFR2의 길항제는 조절 T-세포 기능을 감소시켜 면역력을 증가시키고 암 및 특정 면역결핍 질환을 치료하기 위한 것이다. TNF 및 그 수용체가 역할을 하는 다양한 질환의 치료 방법도 제공된다. Molecular constructs that target tumor necrosis factor receptor 1 (TNFR1) and/or tumor necrosis factor receptor 2 (TNFR2) are provided. The constructs are intended to treat diseases, disorders and conditions in which these receptors and/or TNF are involved in pathogenesis or inhibition or activation thereof can ameliorate the disease, disorder and condition or symptoms thereof. Among the constructs provided herein are TNFR1 antagonist constructs engineered to inhibit TNFR1 function and eliminate any TNFR1 agonistic activity. Constructs provided herein include agonists and antagonists of TNFR1 and TNFR2. TNFR1 antagonist constructs are engineered to inhibit TNFR1 function and, in some embodiments, to avoid agonistic activity. Also included are agonists and antagonists of TNFR2. Agonists of TNFR2 control acute or chronic inflammation by increasing regulatory T-cell function. Antagonists of TNFR2 are intended to increase immunity and treat cancer and certain immunodeficiency diseases by reducing regulatory T-cell function. Methods of treating various diseases in which TNF and its receptors play a role are also provided.
Description
관련 출원related application
발명자 H. Michael Shepard와 출원인 Enosi Life Sciences Corp의 "METHODS AND COMPOSITIONS TO TREAT AUTOIMUNE DEASESES AND CANCER"라는 명칭으로 2020년 8월 27일에 출원된 미국 임시 출원 일련 제63/071,313호에 대해 우선권을 주장한다.Priority is claimed on U.S. Provisional Application Serial No. 63/071,313, filed August 27, 2020, entitled "METHODS AND COMPOSITIONS TO TREAT AUTOIMUNE DEASESES AND CANCER" by inventor H. Michael Shepard and applicant Enosi Life Sciences Corp. .
본 출원은 발명자 H. Michael Shepard 및 출원인 Enosi Life Sciences Corp.의 "ANTIBODIES AND ENONOMERS"라는 명칭으로 국제 PCT 공개 번호 WO 2020/172218로 2020년 2월 19일에 출원되고 2020년 8월 27일에 공개된 국제 PCT 출원 번호 PCT/US2020/018739와 관련이 있다. 본 출원은 또한 2019년 2월 21일에 출원된 임시 출원 일련 제62/808,635호의 이익을 주장하는, 2020년 2월 19일에 출원된 PCT/US2020/018739의 미국 국내 단계 출원인 2021년 8월 20일에 출원된 미국 출원 일련 제17/432,720호과 관련이 있다. This application is filed on February 19, 2020 and published on August 27, 2020 under International PCT Publication No. WO 2020/172218 entitled "ANTIBODIES AND ENONOMERS" by inventor H. Michael Shepard and applicant Enosi Life Sciences Corp. Published International PCT Application No. PCT/US2020/018739. This application also claims the benefit of Provisional Application Serial No. 62/808,635, filed on February 21, 2019, filed on February 19, 2020, and filed on August 20, 2021 in the United States National Phase of PCT/US2020/018739. It is related to US Application Serial No. 17/432,720, filed on
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본 출원은 항-TNF 요법으로 사용하기 위한 핵산 작제물 및 인코딩된 생성물에 관한 것이다. 치료되는 질환은 TNF 수용체 및/또는 TNF 또는 TNF/TNF 수용체(들) 경로가 관련되거나 이의 병인에서 역할을 하는 질환이다.This application relates to nucleic acid constructs and encoded products for use in anti-TNF therapy. The disease being treated is a disease in which the TNF receptor and/or the TNF or TNF/TNF receptor(s) pathway is involved or plays a role in its pathogenesis.
항-TNF 요법/TNF-차단제(생물학적 질환 변형 항-류마티스 약물의 유형; DMARD)는 전형적으로 종래의 DMARD가 실패한 후 처방된다. 이러한 요법은 키메라 mAb 인플릭시맙(Remicade®)과 같은 단클론성 항체(mAbs); 뮤린 가변 영역 및 인간 IgG1 불변 영역, 및 완전 인간화 mAb(IgG1s) 아달리무맙(예를 들어 상표명 Humira®로 판매됨) 및 골리무맙(Simponi® 항체)을 함유함; TNF를 표적으로 하는 mAb의 PEG화 인간화 Fab' 단편, 세르톨리주맙 페골(Cimzia® 항체); 및 인간 IgG1의 Fc에 융합된 인간 TNFR2의 결합 부위를 함유하는 세포외 수용체 영역을 함유하는 TNFR2-Fc 융합 단백질 에타네르셉트(상표 Enbrel®로 판매됨)와 같은 TNFR2 융합 단백질을 포함한다. 상표 Remsima® 및 Inflectra®로 판매되는 약물은 다양한 자가면역 및 만성 염증성 질환 및 장애의 치료를 위해 유럽 연합에서 사용이 승인된 인플릭시맙의 바이오시밀러이다. TNF를 격리시키는 이러한 TNF 억제제는 예를 들어 RA, 건선, 건선성 관절염, 강직 척추염, 소아 특발성 관절염 (JIA), 및/또는 염증성 장 질환 (IBD; 예컨대, 크론병 및 궤양성 대장염)을 포함하는 다양한 질환 및 병태의 치료에 사용된다. Anti-TNF therapy/TNF-blockers (a type of biological disease modifying anti-rheumatic drug; DMARD) are typically prescribed after conventional DMARDs have failed. Such therapies include monoclonal antibodies (mAbs) such as the chimeric mAb infliximab ( Remicade® ); contains a murine variable region and a human IgG1 constant region, and fully humanized mAbs (IgG1s) adalimumab (eg sold under the trade names Humira® ) and golimumab ( Simponi® antibody); PEGylated humanized Fab' fragment of a mAb targeting TNF, certolizumab pegol ( Cimzia® antibody); and TNFR2 fusion proteins such as the TNFR2-Fc fusion protein etanercept (sold under the trademark Enbrel ® ), which contains an extracellular receptor region containing the binding site of human TNFR2 fused to the Fc of human IgG1. The drug marketed under the trademarks Remsima ® and Inflectra ® are biosimilars of infliximab approved for use in the European Union for the treatment of a variety of autoimmune and chronic inflammatory diseases and disorders. Such TNF inhibitors that sequester TNF include, for example, RA, psoriasis, psoriatic arthritis, ankylosing spondylitis, juvenile idiopathic arthritis (JIA), and/or inflammatory bowel disease (IBD; such as Crohn's disease and ulcerative colitis). It is used in the treatment of various diseases and conditions.
그러나 이러한 요법은 예를 들어 패혈증 및 심각한 감염, 예컨대 리스테리아증, 결핵의 재활성화, B형/C형 간염의 재활성화, 대상포진, 및 침습성 진균의 재활성화 및 M. 투베르쿨로시스(M. tuberculosis) 감염의 재활성화를 포함하는 다른 기회 감염의 위험 증가를 포함하는 심한 부작용과 연관된다. 이러한 요법은 류마티스 활막에서 대식세포 세포자멸을 유도하는 것으로 밝혀졌다. 인플릭시맙은 크론병 환자의 소화관에 침윤된 염증 세포의 세포자멸 증가와 연관이 있다. 메토트렉세이트 및 글루코코르티코이드와 같은 다른 항-류마티스 약물도 면역 세포에서 세포자멸을 유도할 수 있다 (예를 들어, 문헌[Vigna-Pιrez 등 (2005) Clin. Exp. Immunol. 141(2):372-380] 참조). 이러한 치료제는 또한 중증 울혈성 심부전, 약물 유발성 루푸스, 탈수초 중추신경계(CNS) 질환뿐만 아니라 림프종 및 비-흑색종 피부암의 악화를 유발할 수 있다 (예를 들어, 문헌[Benjamin 등 Disease Modifying Anti-Rheumatic Drugs (DMARDs) [2020년 2월 27일 업데이트]. In: StatPearls [인터넷]. Treasure Island (FL): StatPearls Publishing; 2020 Jan. 출처: (ncbi.nlm.nih.gov/books/NBK507863/] 참조). 다른 유해한 부작용은 간 손상, 탈수초 질환/CNS 장애, 루푸스, 건선, 유육종증, 림프종 및 고형 악성종양을 포함한 암뿐만 아니라 추가 자가면역 질환의 발병에 대한 감수성 증가를 포함한다 (예를 들어, 문헌[Dong 등 (2016) Proc . Natl . Acad . Sci . U.S.A . 113(43):12304-12309; Zalevsky 등 (2007) J. Immunol . 179:1872-1883; Zoran 등 (2019) Sci . Rep. 9:17231] 참조). 따라서, 특히 관절염 및 염증성 장 질환(IBD)과 같은 장기간 투여를 필요로 하는 만성 질환/병태에 대한 이들 치료제의 사용은 제한적이다. RA 환자의 약 30%는 항-TNF 요법을 사용하여 무반응이거나 치료적 이점이 지속되지 않는다 (예를 들어, 문헌[McCann 등 (2014) Arthritis & Rheumatology 66(10):2728-2738] 참조). 무반응은 항-TNF 치료제를 받는 비-RA 환자에서도 발생한다. 항-TNF 제제에 따라, 치료된 환자의 13-33%가 치료에 반응하지 않고, 최대 46%가 반응을 중단하여 치료를 중단하거나 용량을 증가시킨다 (예를 들어, 문헌[Richter 등 (2019) MABS 11(4):653-665] 참조). 따라서, 치료 효능 및 안전성이 개선된 요법이 필요하다.However, such therapies are, for example, septicemia and serious infections such as listeriosis, reactivation of tuberculosis, reactivation of hepatitis B/C, herpes zoster, and reactivation of invasive fungi and M. tuberculosis ( M. tuberculosis ) is associated with severe side effects including an increased risk of other opportunistic infections, including reactivation of the infection. This therapy has been shown to induce macrophage apoptosis in rheumatoid synovial membranes. Infliximab is associated with increased apoptosis of inflammatory cells infiltrating the digestive tract of patients with Crohn's disease. Other anti-rheumatic drugs such as methotrexate and glucocorticoids can also induce apoptosis in immune cells (see, eg, Vigna-Pιrez et al. (2005) Clin. Exp. Immunol. 141(2):372-380). These treatments may also cause exacerbation of severe congestive heart failure, drug-induced lupus, demyelinated central nervous system (CNS) disease, as well as lymphomas and non-melanoma skin cancers (see, e.g., Benjamin et al., Disease Modifying Anti- Rheumatic Drugs (DMARDs) [updated 27 February 2020].In: StatPearls [Internet].Treasure Island (FL): StatPearls Publishing;2020 Jan. Source: (ncbi.nlm.nih.gov/books/NBK507863/] Other adverse side effects include increased susceptibility to liver damage, demyelinating disease/CNS disorders, cancer including lupus, psoriasis, sarcoidosis, lymphoma and solid malignancies, as well as further autoimmune diseases (e.g. , Dong et al. (2016) Proc . Natl . Acad . Sci . USA . 113(43):12304-12309; Zalevsky et al. (2007) J. Immunol . 179:1872-1883; Zoran et al. (2019) Sci . Rep. 9:17231]). Thus, the use of these therapeutics is limited, especially for chronic diseases/conditions requiring long-term administration, such as arthritis and inflammatory bowel disease (IBD). About 30% of RA patients are unresponsive or do not receive sustained therapeutic benefit with anti-TNF therapy (see, e.g., McCann et al. (2014) Arthritis & Rheumatology 66(10):2728-2738). Failure to respond also occurs in non-RA patients receiving anti-TNF therapy. Depending on the anti-TNF agent, 13-33% of treated patients do not respond to treatment, and up to 46% stop responding, prompting treatment to be discontinued or dose increased (see, e.g., Richter et al. (2019) MABS 11(4):653-665). Therefore, there is a need for therapies with improved therapeutic efficacy and safety.
종양 괴사 인자 수용체 1(TNFR1) 및/또는 종양 괴사 인자 수용체 2(TNFR2)를 표적으로 하는 분자 작제물 및 이를 인코딩하는 핵산이 제공된다. 작제물은 이들 수용체 및/또는 TNF가 병인에 관여하거나 억제 또는 활성화가 질환, 장애 및 병태 또는 그의 증상을 개선할 수 있는 질환, 장애 및/또는 병태를 치료하기 위한 것이다. 본 명세서에 제공된 작제물은 TNFR1 및 TNFR2의 효능제 및 길항제를 포함한다. TNFR1 길항제 작제물은 TNFR1 기능을 억제하고 TNFR1 효능적 활성을 피하도록 조작된다. 또한 TNFR2의 효능제 및 길항제가 포함된다. TNFR2의 효능제는 조절 T-세포 기능을 증가시켜 급성 또는 만성 염증을 제어한다. TNFR2의 길항제는 조절 T-세포 기능을 감소시켜 면역력을 증가시키고 암 및 특정 면역결핍 질환을 치료하기 위한 것이다.Molecular constructs targeting tumor necrosis factor receptor 1 (TNFR1) and/or tumor necrosis factor receptor 2 (TNFR2) and nucleic acids encoding the same are provided. The constructs are intended to treat diseases, disorders and/or conditions in which these receptors and/or TNF are involved in pathogenesis or inhibition or activation can ameliorate the disease, disorder and condition or symptoms thereof. Constructs provided herein include agonists and antagonists of TNFR1 and TNFR2. TNFR1 antagonist constructs are engineered to inhibit TNFR1 function and avoid TNFR1 agonistic activity. Also included are agonists and antagonists of TNFR2. Agonists of TNFR2 control acute or chronic inflammation by increasing regulatory T-cell function. Antagonists of TNFR2 are intended to increase immunity and treat cancer and certain immunodeficiency diseases by reducing regulatory T-cell function.
세포에는 TNFR1과 TNFR2의 두 가지 TNF 수용체가 있다. 이러한 경로는 정상적인 생리학에서 서로 균형을 이룬다. TNF/TNFR1은 염증을 유발하고 TNF/TNFR2는 항-염증성이다. TNFR2는 일반적으로 TNFR1보다 늦게 활성화되므로 유용한 TNF 유발 염증에 즉시 영향을 미치지는 않지만 염증 경로의 과활성화를 억제하기 위해 나중에 활성화된다. 두 경로의 동시 억제는 TNFR2의 염증 약화 효과를 제거한다. 기존 TNF 차단제는 항염성인 Treg 생성기(TNFR2)가 꺼지기 때문에 자체 효능이 제한된다. Cells have two TNF receptors, TNFR1 and TNFR2. These pathways balance each other in normal physiology. TNF/TNFR1 causes inflammation and TNF/TNFR2 is anti-inflammatory. TNFR2 is usually activated later than TNFR1, so it does not immediately affect useful TNF-induced inflammation, but it is activated later to suppress overactivation of inflammatory pathways. Simultaneous inhibition of both pathways abolishes the inflammatory attenuating effects of TNFR2. Existing TNF blockers have limited efficacy because they turn off the anti-inflammatory Treg generator (TNFR2).
TNF/TNFR을 표적으로 하는 이전 치료제와 다른 다른 특성 중에서 본 명세서에 제공된 작제물은 기회 감염에 맞서 싸우는 치료된 대상체의 능력을 손상시키지 않으면서 TNFR1 신호전달 또는 활성을 억제한다. 본 명세서에 제공되는 작제물 중에는, TNFR1을 특이적으로 표적화하고 억제하지만 TNFR2를 길항하지 않음으로써 수용체 클러스터링을 통한 TNFR1의 일시적인 활성화를 방지하는 변형된 단쇄 항체인 한 유형이 있다. 본 명세서에 제공되는 작제물은 TNFR1에 의해 매개되는 TNF 염증 경로를 침묵시키지만, TNFR2의 치유 경로를 유지하고, 일부 구현예에서는 강화시킨다. 이러한 작제물은 TNF 차단제가 실패한 적응증을 치료하기 위해 투여될 수 있다. 본 명세서에 제공되는 작제물 중에는 종양 괴사 인자 수용체 유형 1을 특이적으로 억제하는 작제물; TNF 또는 그의 수용체가 병인 또는 증상에서 역할을 하는 질환, 장애 및 병태를 치료하기 위한 방법 및 작제물의 용도가 제공된다. Among other properties that differ from prior therapies targeting TNF/TNFR, the constructs provided herein inhibit TNFR1 signaling or activity without compromising the ability of the treated subject to fight opportunistic infections. Among the constructs provided herein is one type, a modified single chain antibody that specifically targets and inhibits TNFR1 but does not antagonize TNFR2, thereby preventing transient activation of TNFR1 through receptor clustering. Constructs provided herein silence the TNF inflammatory pathway mediated by TNFR1, but retain and, in some embodiments, enhance the healing pathway of TNFR2. Such constructs can be administered to treat indications in which TNF blockers have failed. Among the constructs provided herein are constructs that specifically inhibit tumor necrosis
기존 항-TNF 약물은 류마티스성 관절염, 다수관절 소아 특발성 관절염, 축 척추관절염, 강직 척추염, 건선성 관절염, 건선, 크론병, 소아 크론병, 및 궤양성 대장염을 포함하는 자가면역 질환에서 발생하는 과도한 염증을 차단한다. 본 발명의 작제물은 동일한 질환을 치료하는 데 사용될 수 있지만 유해하거나 불리한 부작용을 피한다. 본 명세서에 제공되는 작제물은 TNFR2-Fc 융합 단백질 에타네르셉트(상표 Enbrel®로 판매됨)와 같은 이전 치료제보다 생체 내에서 염증성 사이토카인을 억제하는 데 더 효과적이며 조절 T-세포 기능을 보존한다. 작제물은 혈청 반감기를 증가시키기 위한 활성 변형제 또는 특성 개질제를 포함할 수 있고, 아달리무맙 및/또는 에타네르셉트와 활성을 비교하는 TNF 검정에서와 같이 TNFR1 신호전달의 차단에서 활성을 입증하였다. Existing anti-TNF drugs are used to treat excessive use in autoimmune diseases, including rheumatoid arthritis, polyarticular juvenile idiopathic arthritis, axial spondyloarthritis, ankylosing spondylitis, psoriatic arthritis, psoriasis, Crohn's disease, juvenile Crohn's disease, and ulcerative colitis. block inflammation; The constructs of the present invention can be used to treat the same disease but avoid harmful or adverse side effects. Constructs provided herein are more effective at inhibiting inflammatory cytokines in vivo than previous therapeutic agents such as the TNFR2-Fc fusion protein etanercept (sold under the trademark Enbrel® ) and preserve regulatory T-cell function. . The constructs may include activity modifiers or property modifiers to increase serum half-life and have demonstrated activity in blocking TNFR1 signaling as in a TNF assay comparing activity with adalimumab and/or etanercept .
마우스 모델에서 확립된 바와 같이, 작제물은 아달리무맙보다 대식세포 기능을 더 잘 보존하여 기회 감염으로 이어지지 않는다는 것을 보여주고; 또한 아달리무맙이나 에타네르셉트보다 실질적으로 더 나은 Treg 기능을 보존하고 류마티스성 관절염과 같은 질환, 장애 및 병태를 치료하는 데 치료적으로 효과적이다. 일부 구현예에서, Kd는 1 nM 이하이고, 생체내 t1/2는 약 10-12일이다. 작제물은 특정 적응증에 대한 임의의 적합한 경로에 의해 투여될 수 있다. 경로는 피하, 정맥내, 종양내, 간내, 국소, 점막, 진피내 및 임의의 다른 적합한 경로를 포함하지만 이에 제한되지 않는다.As established in the mouse model, the construct shows that it preserves macrophage function better than adalimumab and does not lead to opportunistic infection; It also preserves Treg function substantially better than adalimumab or etanercept and is therapeutically effective in treating diseases, disorders and conditions such as rheumatoid arthritis. In some embodiments, the Kd is less than 1 nM and the in vivo t 1/2 is about 10-12 days. The constructs may be administered by any suitable route for a particular indication. Routes include, but are not limited to, subcutaneous, intravenous, intratumoral, intrahepatic, topical, mucosal, intradermal and any other suitable route.
본 명세서에 제공된 작제물은 다음과 같다. 식 1의 종양 괴사 인자 수용체 1(TNFR1) 길항제 작제물인 작제물이 제공된다: (TNFR1 억제제)n-링커p-(활성 변형제)q(여기서: 각각의 n 및 q는 정수이고, 각각 독립적으로 1, 2 또는 3이고; p는 0, 1, 2 또는 3임); TNFR1 억제제는 TNFR1에 결합하여 TNFR1의 활성을 억제(길항)하는 분자이고; 활성 변형제는 활성 변형제가 없는 작제물과 비교하여 작제물의 활성 또는 약리학적 특성을 조절하거나 변경하는 모이어티이고; 링커는 작제물의 가요성을 증가시키고/시키거나 작제물의 입체 효과 또는 수용체와의 상호작용을 조절하거나 감소시키고/시키거나 작제물의 수성 매질에서 용해도를 증가시킨다. 링커는 복수의 성분을 함유할 수 있다. 링커는 화학 링커, 폴리펩티드 링커 및 이들의 조합을 포함한다. 작제물은 화학적 및/또는 물리적 결합을 통해 연결될 수 있다. 작제물은 융합 단백질일 수 있다. The constructs provided herein are as follows. Provided are constructs that are tumor necrosis factor receptor 1 (TNFR1) antagonist constructs of formula 1: (TNFR1 inhibitor) n -linker p- (active modifier) q , wherein: each n and q is an integer, and each independently is 1, 2 or 3; p is 0, 1, 2 or 3; A TNFR1 inhibitor is a molecule that binds to and inhibits (antagonizes) the activity of TNFR1; An active modifier is a moiety that modulates or alters the activity or pharmacological properties of a construct compared to a construct without the active modifier; The linker increases the flexibility of the construct, modulates or reduces the steric effect or interaction of the construct with a receptor, and/or increases the solubility of the construct in aqueous media. A linker may contain multiple components. Linkers include chemical linkers, polypeptide linkers, and combinations thereof. The constructs may be linked through chemical and/or physical bonds. The construct may be a fusion protein.
TNFR1 억제제는 도메인 항체(dAb) 또는 단쇄 항체를 포함할 수 있다. 작제물은 TNFR1 억제제가 도메인 항체(dAb)인 경우, 활성 변형제는 비변형 단일 Fc 영역 또는 인간 혈청 알부민 항체가 아닌 것을 포함한다. 예를 들어, 활성 변형제 (또는 특성 개질제)는 변형된 Fc 영역이거나 인간 혈청 알부민이다. 작제물에서, TNFR1 억제제는 TNFR1 신호전달을 억제하는 것일 수 있고/있거나 활성 변형제는 작제물의 혈청 반감기를 증가시킨다. 예를 들어, 작제물은 활성 변형제가 ADCC(항체 의존적 세포 독성) 활성이 감소되거나 없고/거나 CDC(보체 의존성 세포 독성) 활성이 감소되거나 없도록 변형된 Fc 또는 알부민인 것을 포함한다. TNFR1 억제제는 TNFR1 활성을 억제하지만 종양 괴사 인자 수용체 2(TNFR2) 활성을 길항하지 않는 것일 수 있다. TNFR1 억제제는 TNFR1 신호전달을 억제하는 것일 수 있다.TNFR1 inhibitors may include domain antibodies (dAbs) or single chain antibodies. The construct includes an active modifier that is not a single unmodified Fc region or human serum albumin antibody, where the TNFR1 inhibitor is a domain antibody (dAb). For example, the activity modifier (or property modifier) is a modified Fc region or human serum albumin. In the construct, the TNFR1 inhibitor can be one that inhibits TNFR1 signaling and/or the active modifier increases the serum half-life of the construct. For example, the constructs include those in which the activity modifier is an Fc or albumin that has been modified with reduced or no ADCC (antibody dependent cytotoxicity) activity and/or reduced or no CDC (complement dependent cytotoxicity) activity. A TNFR1 inhibitor may be one that inhibits TNFR1 activity but does not antagonize tumor necrosis factor receptor 2 (TNFR2) activity. A TNFR1 inhibitor may be one that inhibits TNFR1 signaling.
또한 다중특이적 작제물이 제공된다. 예를 들어, TNFR1 억제제 및 Treg 확장제를 포함하는 다중특이적 작제물인 작제물이 제공되고, 이중특이적 작제물은 2개의 상이한 표적 수용체 또는 항원 또는 수용체 상의 에피토프와 상호작용한다. 다중특이적 작제물 중에는 TFNR1 및 Treg 확장제에 대해 이중특이적인 것이 있다. Treg 확장제는 TNFR2 효능제일 수 있다.Multispecific constructs are also provided. For example, constructs are provided that are multispecific constructs comprising a TNFR1 inhibitor and a Treg expander, the bispecific constructs interacting with two different target receptors or antigens or epitopes on the receptors. Among the multispecific constructs are bispecific for TFNR1 and Treg expanders. Treg expanders can be TNFR2 agonists.
작제물은 가요성을 제공하거나, 용해도를 증가시키고/거나, 입체 장애 및/또는 반 데르 발스 상호작용을 완화시키고/거나 감소시키기 위한 링커를 포함할 수 있다. 작제물은 선택적으로 그러나 일반적으로 작제물의 활성 또는 특성을 변경하거나 조절하기 위한 활성 변형제를 포함한다. 식 2를 갖는 작제물이 제공된다: (TNFR1 억제제)n ― (활성 변형제)r1 ― (링커(L))p ― (활성 변형제)r2 ― (TNFR2 효능제)q 또는 (TNFR1 억제제)n ― (활성 변형제)r1 ― (링커(L))p ― (활성 변형제)r2 ― (Treg 확장제)q (여기서: n= 1, 2 또는 3, p= 1, 2 또는 3, q= 0, 1 또는 2, 그리고 r1 및 r2 각각은 독립적으로 0, 1 또는 2임); 성분은 작제물이 TNFR1 및 TNFR2와 상호작용하여 TNFR1을 길항하고 TNFR2를 작용하거나 Treg 확장제 활성을 갖는 한 명시된 순서 또는 임의의 다른 순서일 수 있다. 예를 들어, TNFR1 억제제 모이어티가 TNFR1에 결합하는 TNFα의 결합을 억제하고/하거나 신호전달을 억제하는, 본 명세서에 제공된 임의의 것 중에서 작제물이 포함된다.The construct may include linkers to provide flexibility, increase solubility, mitigate and/or reduce steric hindrance and/or van der Waals interactions. The construct optionally but generally includes active modifiers to alter or modulate the activity or properties of the construct. A construct having formula 2 is provided: (TNFR1 inhibitor) n - (active modifier) r1 - (linker (L)) p - (active modifier) r2 - (TNFR2 agonist) q or (TNFR1 inhibitor) n - (active modifier) r1 - (linker (L)) p - (active modifier) r2 - (Treg extender) q where: n = 1, 2 or 3, p = 1, 2 or 3, q = 0 , 1 or 2, and r1 and r2 are each independently 0, 1 or 2; The components may be in the order specified or in any other order as long as the construct interacts with and antagonizes TNFR1 and TNFR2, agonizes TNFR2, or has Treg expander activity. For example, constructs from any of those provided herein that inhibit the binding and/or signal transduction of TNFα to which the TNFR1 inhibitor moiety binds to TNFR1 are included.
또한 식 3a 또는 3b의 작제물이 제공된다: (TNFR2 효능제 또는 Treg 확장제)n ― 링커p ― (활성 변형제)q, 식 3a, 또는 (활성 변형제)q ― 링커p ― (TNFR2 효능제 또는 Treg 확장제)n, 식 3b (여기서: 각각의 n 및 q는 정수이고, 그리고 각각은 독립적으로 1, 2, 또는 3이고; p는 0, 1, 2 또는 3임); 활성 변형제는 작제물의 약리학적 특성 또는 활성을 변경하는 모이어티이고; TNFR2 효능제는 TNRFR2와 상호작용하여 TNFR2 활성을 초래하고; Treg 확장제는 TNFR2 효능제를 포함하고 Treg 세포를 증가시키는 분자이고; 링커는 가요성을 증가시키고/시키거나 작제물의 입체 효과 또는 수용체와의 상호작용을 조절하거나 감소시키고/거나; 작제물의 용해도를 변경한다. 일부 구현예에서, 활성 변형제는 Fc 영역 또는 변형된 Fc 영역 또는 짧은 FcRnBP이고; 링커는 힌지 영역을 포함하거나 G 및 S 잔기를 포함하는 링커이다. 예시적인 링커는 작제물의 혈청 반감기를 증가시키는 것들이다. 예를 들어, 링커는 서열번호: 812-834 중 어느 하나에 제시된 서열을 갖거나 PEG 모이어티 링커이다. 일부 구현예에서, 작제물은 작제물의 혈청 반감기를 증가시키는 변형된 Fc 영역 또는 펩티드인 활성 변형제를 포함한다. Fc 영역은 Fc 이량체일 수 있으며; Fc 영역은 감소된 ADCC 및/또는 CDC 활성을 갖도록 변형될 수 있는데, 예를 들어 ADCC 활성이 감소되거나 전혀 없도록 변형된 Fc와 같다. Also provided are constructs of formula 3a or 3b: (TNFR2 agonist or Treg expander) n - linkerp - (active modifier)q, formula 3a, or (active modifier) q - linker p - (TNFR2 agonist or a Treg expander) n , formula 3b, wherein: each n and q is an integer, and each is independently 1, 2, or 3; p is 0, 1, 2, or 3; Active modifiers are moieties that alter the pharmacological properties or activity of a construct; TNFR2 agonists interact with TNRFR2 to result in TNFR2 activity; Treg expanders are molecules that include TNFR2 agonists and increase Treg cells; The linker increases flexibility and/or modulates or reduces the steric effect of the construct or its interaction with a receptor; alter the solubility of the construct. In some embodiments, the active modifier is an Fc region or modified Fc region or short FcRnBP; A linker is a linker comprising a hinge region or comprising G and S residues. Exemplary linkers are those that increase the serum half-life of the construct. For example, the linker has a sequence set forth in any one of SEQ ID NOs: 812-834 or is a PEG moiety linker. In some embodiments, the construct comprises an active modifier, which is a modified Fc region or peptide that increases the serum half-life of the construct. The Fc region may be an Fc dimer; An Fc region may be modified to have reduced ADCC and/or CDC activity, such as an Fc modified to have reduced or no ADCC activity.
본 명세서에 제공되는 작제물에는, TNFR1 억제제는 하기 열거된 서열 목록에 정의되거나 당업계에 공지된 임의의 것이고; Treg 확장제는 당업계에 공지된 임의의 것, TNFR2 효능제, 또는 서열 목록에 제시되거나 당업계에 공지된 임의의 Treg 확장제이고; 링커는 서열 목록 또는 하기 서열 목록에 열거되거나 당업계에 공지된 임의의 것이고; 활성 변형제는 당업계에 공지되고/거나 아래에 제시된 서열 목록에 제시된 임의의 것이다.In the constructs provided herein, the TNFR1 inhibitor is any defined in the sequence listing listed below or known in the art; The Treg expander is any known in the art, a TNFR2 agonist, or any Treg expander shown in the Sequence Listing or known in the art; The linker is any listed in the Sequence Listing or Sequence Listing below or known in the art; Active modifiers are any known in the art and/or set forth in the Sequence Listing provided below.
TNFR1을 특이적으로 표적화하고 억제하지만 TNFR2를 길항하지 않아 수용체 클러스터링을 통한 TNFR1의 일시적인 활성화를 방지하는 단쇄 항체 또는 그의 항원 결합 부분인 TNFR1 억제제를 포함하는 TNFR1 길항제 작제물인 작제물이 제공된다. 이러한 작제물에서 항체 또는 그의 항원 결합 부분은 작제물의 약리학적 특성 및/또는 구조를 개선하는 변형을 포함한다. Constructs are provided that are TNFR1 antagonist constructs, including single chain antibodies, or antigen-binding portions thereof, TNFR1 inhibitors that specifically target and inhibit TNFR1 but do not antagonize TNFR2, thereby preventing transient activation of TNFR1 through receptor clustering. The antibody or antigen-binding portion thereof in such constructs contains modifications that improve the pharmacological properties and/or structure of the construct.
본 명세서에 제공된 임의의 작제물에서, 작제물은 TNFR2 신호전달을 작용시켜 조절 T 세포(Treg)의 발현을 증가시켜 TNFR1 길항작용 및 Treg 발현의 수반되는(또는 실질적으로 수반되는) 증가를 제공하는 성분(들)을 포함한다. 본 명세서에 제공된 작제물에서, TNFR1 억제제는 예를 들어 작제물의 항체 부분 또는 항원 결합 부분이 TNFR1에 결합하는 TNFα의 결합을 억제하는 경우와 같이 TNFR1 신호전달을 억제함으로써 TNFR1을 억제하는 단쇄 항체일 수 있다. 작제물 중에는, TNFR1 억제제가 TNFα와 TNFR1의 결합을 억제하지 않지만 TNFR1 신호전달을 억제하는 항체 또는 항원 결합 부분인 것들이 있다. 조절/변경될 수 있는 특성 또는 활성은 혈청 반감기일 수 있다. In any of the constructs provided herein, the construct agonizes TNFR2 signaling to increase expression of regulatory T cells (Treg), thereby providing TNFR1 antagonism and concomitant (or substantially concomitant) increase in Treg expression. contains the ingredient(s). In the constructs provided herein, the TNFR1 inhibitor is a single chain antibody that inhibits TNFR1 by inhibiting TNFR1 signaling, such as when the antibody portion or antigen binding portion of the construct inhibits binding of TNFα to TNFR1. can Among the constructs, the TNFR1 inhibitor is an antibody or antigen binding portion that does not inhibit the binding of TNFα to TNFR1 but does inhibit TNFR1 signaling. A property or activity that can be modulated/altered may be serum half-life.
작제물은 ADCC 및/또는 CDC 활성을 제거하도록 변형된 Fc를 포함할 수 있다. 작제물은 하나의 Fc 단량체가 홀(hole)을 포함하고 다른 하나가 놉(knob)를 포함하여 이종이량체를 형성하는 것과 같은 Fc 이량체를 포함할 수 있다. 예를 들어 놉 돌연변이(들)는 EU 넘버링에 의해 S354C, T366Y, T366W 및 T394W 중에서 선택되며; 홀 돌연변이(들)는 EU 넘버링에 의해 Y349C, T366S, L368A, F405A, Y407T, Y407A 및 Y407V 중에서 선택되며, Fc 단량체는 이종이량체를 형성한다. 작제물이 Fc를 포함하는 일부 구현예에서, Fc는 트라스투주맙으로부터 유래한다. 작제물은 트라스투주맙의 C-말단과 N-말단의 융합에 의해 이량체화될 수 있다. The construct may include an Fc modified to eliminate ADCC and/or CDC activity. The construct may contain Fc dimers, such that one Fc monomer contains a hole and the other contains a knob to form a heterodimer. For example the knob mutation(s) is selected from among S354C, T366Y, T366W and T394W by EU numbering; The hole mutation(s) are selected from among Y349C, T366S, L368A, F405A, Y407T, Y407A and Y407V by EU numbering, and the Fc monomers form heterodimers. In some embodiments where the construct comprises an Fc, the Fc is from Trastuzumab. The construct can be dimerized by fusion of the C-terminus and the N-terminus of trastuzumab.
작제물이 링커를 포함하는 일부 구현예에서 링커는 Fc 영역으로부터의 힌지 영역이거나 이를 포함한다. 예를 들어, 힌지 영역은 트라스투주맙으로부터의 것이고, Fc 영역에 연결된다. 작제물은 항-TNFR1 길항제 항체 또는 그의 항원 결합 부분에 연결된 링커를 포함하는 것을 포함한다. 링커는 항-TNFR1 길항제 항체 또는 그의 항원 결합부에 연결될 수 있고, Fc 영역에 직접적으로 또는 힌지 영역을 통해 연결될 수 있다. 예를 들어, Fc 영역 또는 변형된 Fc 영역은 서열번호: 10, 12, 14, 16, 27, 30, 1469 및 1470 중 임의의 것에 제시된 아미노산 서열을 포함한다.In some embodiments where the construct comprises a linker, the linker is or comprises a hinge region from an Fc region. For example, the hinge region is from trastuzumab and connects to the Fc region. Constructs include those comprising a linker linked to an anti-TNFR1 antagonist antibody or antigen binding portion thereof. The linker may be linked to the anti-TNFR1 antagonist antibody or antigen-binding portion thereof and may be linked to the Fc region directly or through a hinge region. For example, the Fc region or modified Fc region comprises the amino acid sequence set forth in any of SEQ ID NOs: 10, 12, 14, 16, 27, 30, 1469 and 1470.
또한 신생아 Fc 수용체(FcRn)에 결합하는 작제물이 제공된다. 예를 들어, 짧은 FcRn 결합 펩티드(FcRnBP)를 포함하는 TNFR1 작제물이 제공되며, 짧은 FcRn 결합 펩티드(FcRnBPs)는 작제물과 FcRn과의 상호작용을 제공하고 6-25 또는 10-20개의 아미노산 잔기를 함유한다. 예를 들어, FcRnBP는 12-20개의 잔기 또는 15개의 잔기 또는 16개의 잔기를 포함한다. 이들의 예는 FcRn 결합 펩티드(FcRnBP)가 임의의 서열번호:48-51의 펩티드를 포함하거나 이로 구성된 TNFR1 길항제 작제물이다. 작제물은 Fc 이종이량체를 포함하는 TNFR1 작제물을 포함하고, 여기서 하나의 Fc 단량체는 홀을 포함하고, 다른 하나는 놉을 포함하고, 이로써 생성되는 Fc 이량체는 이종이량체이다. Also provided are constructs that bind to the neonatal Fc receptor (FcRn). For example, TNFR1 constructs are provided that include short FcRn binding peptides (FcRnBPs), wherein the short FcRn binding peptides (FcRnBPs) provide interaction of the construct with FcRn and are 6-25 or 10-20 amino acid residues. contains For example, FcRnBP contains 12-20 residues or 15 residues or 16 residues. Examples of these are TNFR1 antagonist constructs wherein the FcRn binding peptide (FcRnBP) comprises or consists of a peptide of any of SEQ ID NOs:48-51. The construct includes a TNFR1 construct comprising an Fc heterodimer, wherein one Fc monomer comprises a hole and the other comprises a knob, whereby the resulting Fc dimer is a heterodimer.
TNFR1 억제제; Fc 이량체; 및 Treg 확장제를 포함하는 TNFR1 길항제 작제물인 작제물이 제공되고, 여기서: Fc 이량체는 2개의 상보적인 Fc 단량체를 포함하고; TNFR1 억제제는 Fc 단량체 중 하나에 연결되고 Treg 확장제는 다른 Fc 단량체에 연결된다. 그러한 작제물에서 Treg 확장제는 TNFR2 효능제일 수 있다. 작제물은 TNFR1 억제제와 동일한 Fc 단량체에 연결된 제2 Treg 확장제를 추가로 포함하고, 여기서 제1 및 제2 Treg 확장제는 동일하거나 상이하다. 제2 Treg 확장제는 TNFR2 효능제일 수 있다. 일부 구현예에서, Treg 확장제는 동일하다. TNFR1 억제제는 TNFR1 신호전달을 억제하거나 차단하는 것일 수 있다. 일부 구현예에서, TNFR1 억제제는 TNFR1에 결합하고 TNFα 결합 및 TNFR1 신호전달을 차단하거나 억제한다. 일부 구현예에서, TNFR1 억제제는 TNFR1에 결합하고, TNFα 결합을 방해하지 않거나 방해하며, TNFR1 신호전달을 차단하거나 억제한다. 이들 작제물의 일부 구현예에서, Treg 확장제는 TNFR2 효능제이다. TNRF2 효능제는 TNFR2 신호전달을 자극하거나 유도하는 것일 수 있다. Treg 확장제의 예시는 scFv, VHH 단일 도메인 항체, 또는 TNFR2 효능제 단클론성 항체의 Fab인 TNFR2 효능제이다. 이들 작제물에서, Treg 확장제는 소분자, 또는 핵산 압타머, 또는 펩티드 압타머인 TNFR2 효능제일 수 있다. TNFR1 inhibitors; Fc dimer; and a TNFR1 antagonist construct comprising a Treg expander, wherein: the Fc dimer comprises two complementary Fc monomers; The TNFR1 inhibitor is linked to one Fc monomer and the Treg expander is linked to the other Fc monomer. The Treg expander in such a construct may be a TNFR2 agonist. The construct further comprises a second Treg expander linked to the same Fc monomer as the TNFR1 inhibitor, wherein the first and second Treg expanders are the same or different. The second Treg expander may be a TNFR2 agonist. In some embodiments, the Treg expanders are the same. A TNFR1 inhibitor can be one that inhibits or blocks TNFR1 signaling. In some embodiments, a TNFR1 inhibitor binds TNFR1 and blocks or inhibits TNFα binding and TNFR1 signaling. In some embodiments, a TNFR1 inhibitor binds TNFR1, does not interfere with or interferes with TNFα binding, and blocks or inhibits TNFR1 signaling. In some embodiments of these constructs, the Treg expander is a TNFR2 agonist. A TNRF2 agonist can be one that stimulates or induces TNFR2 signaling. An example of a Treg expander is a scFv, a VHH single domain antibody, or a TNFR2 agonist that is a Fab of a TNFR2 agonist monoclonal antibody. In these constructs, the Treg expander can be a TNFR2 agonist that is a small molecule, or a nucleic acid aptamer, or a peptide aptamer.
또한 TNFR2 효능제이거나 또한 그러한 작제물 중 임의의 것이 제공된다. TNFR2 효능제는 식 3a 또는 3b의 작제물이며, 식 3a은 (Treg 확장제)n - 링커p ― 링활성 변형제)q이고, 식 3b은 (활성 변형제)q - 링커p ― 링Treg 확장제)n이다. 이들 식에서, n 및 q는 각각 정수이고, 각각 독립적으로 1, 2 또는 3이고; p는 0, 1, 2 또는 3이고; 활성 변형제는 활성 변형제가 없는 작제물과 비교하여 작제물의 활성 또는 약리학적 특성을 조절하거나 변경하는 모이어티이고; 링커는 작제물의 가요성을 증가시키고/시키거나 작제물의 입체 효과 또는 수용체와의 상호작용을 조절하거나 감소시키고/시키거나 작제물의 수성 매질에서 용해도를 증가시킨다. 이들 작제물 중 임의의 것에서, 작제물의 Treg 확장제는 TNFR2 효능제이다. 예를 들어, TNFR2 효능제는 TNFR2 신호전달을 자극하거나 유도한다. 다른 예에서, Treg 확장제는 scFv, VHH 단일 도메인 항체, 또는 TNFR2 효능제 단클론성 항체의 Fab인 TNFR2 효능제이다. Treg 확장제는 소분자 또는 핵산 또는 펩티드 압타머인 TNFR2 효능제일 수 있다. Fc 부분 및/또는 Fc 및 힌지 영역 또는 그의 변형된 형태와 같은 트라스투주맙의 전부 또는 일부를 포함하는 작제물에서, 작제물은 트라스투주맙의 C-말단과의 N-말단 융합에 의해 이량체화될 수 있다. It is also a TNFR2 agonist or any of such constructs are provided. A TNFR2 agonist is a construct of formula 3a or 3b, where formula 3a is (Treg extender) n - linker p - ring active modifier) q and formula 3b is (active modifier) q - linker p - ring Treg extender) is n . In these formulas, n and q are each an integer and are each independently 1, 2 or 3; p is 0, 1, 2 or 3; An active modifier is a moiety that modulates or alters the activity or pharmacological properties of a construct compared to a construct without the active modifier; The linker increases the flexibility of the construct, modulates or reduces the steric effect or interaction of the construct with a receptor, and/or increases the solubility of the construct in aqueous media. In any of these constructs, the Treg expander of the construct is a TNFR2 agonist. For example, TNFR2 agonists stimulate or induce TNFR2 signaling. In another example, the Treg expander is a scFv, a VHH single domain antibody, or a TNFR2 agonist that is a Fab of a TNFR2 agonist monoclonal antibody. Treg expanders can be TNFR2 agonists that are small molecules or nucleic acids or peptide aptamers. In constructs comprising all or part of Trastuzumab, such as the Fc portion and/or Fc and hinge region or modified forms thereof, the construct dimerizes by N-terminal fusion with the C-terminus of Trastuzumab It can be.
중심 PEG 링커를 통해 하나 이상의 Treg 확장제에 연결된 TNFR1 억제제 모이어티를 포함하거나, 동일하거나 상이한 적어도 2개의 TNFR1 억제제를 포함하거나, 동일하거나 상이한 2개의 Treg 확장제를 포함하는 작제물이 제공된다. 중심 PEG 링커와 같은 PEG 모이어티를 포함하는 작제물은 TNFR1 억제제 및 하나 이상의 Treg 확장제를 연결하는 분지형 PEG 모이어티를 포함할 수 있다. 예시는 식 4A 내지 4D 중에서 선택된 구조를 갖는 것들이다:Constructs comprising a TNFR1 inhibitor moiety linked to one or more Treg expanders via a central PEG linker, comprising at least two identical or different TNFR1 inhibitors, or comprising two identical or different Treg expanders are provided. A construct comprising a PEG moiety, such as a central PEG linker, may include a branched PEG moiety linking a TNFR1 inhibitor and one or more Treg expanders. Examples are those having a structure selected from formulas 4A-4D:
식 4A:Equation 4A:
, 또는 , or
n은 1 내지 5이고;n is 1 to 5;
R1은 H 또는 CH3, 또는 CH2CH3 또는 다른 C1-C5 알킬이고R 1 is H or CH 3 , or CH 2 CH 3 or another C 1 -C 5 alkyl;
는 TNFR1 억제제(TNFR1 길항제)이고; is a TNFR1 inhibitor (TNFR1 antagonist);
는 Treg 확장제이거나; 또는 is a Treg expander; or
식 4B:Equation 4B:
는 TNFR1 억제제(TNFR1 길항제)이고 is a TNFR1 inhibitor (TNFR1 antagonist);
는 Treg 확장제이고; is a Treg expander;
n은 1 내지 5이거나; 또는n is 1 to 5; or
식 4C:Equation 4C:
는 TNFR1 억제제(TNFR1 길항제) 또는 Treg 확장제이고; 그리고 is a TNFR1 inhibitor (TNFR1 antagonist) or Treg expander; and
n은 1 내지 5이고; 또는n is 1 to 5; or
식 4D:Equation 4D:
또는 or
, 여기서 , here
각각의 는 동일하거나 상이하고 각각 독립적으로 TNFR1 억제제(TNFR1 길항제) 및 TNFR2 효능제로부터 선택되며; Each are the same or different and are each independently selected from TNFR1 inhibitors (TNFR1 antagonists) and TNFR2 agonists;
활성 변형제는 선택적이며 분자 내 임의의 적합한 좌위에 연결될 수 있고; 그리고 n은 1 내지 5이다. Active modifiers are optional and may be linked to any suitable locus in the molecule; and n is 1 to 5.
본 명세서에 제공된 TNFR1 길항제 작제물 및 다른 작제물에서, Treg 확장제는 TNFR2 효능제일 수 있다. 이러한 작제물은 예를 들어 활성 변형제가 Fc 영역이거나 힌지 영역 또는 다른 링커를 포함하는 Fc 영역인 경우와 같은 활성 변형제를 포함할 수 있고; Fc 영역 또는 힌지 영역을 갖는 Fc 영역은 ADCC 및/또는 CDC 활성을 감소시키거나 제거하도록 변형된 Fc이다. 그의 예시는 Fc 또는 변형된 Fc가 IgG Fc이거나 IgG1 또는 IgG4 Fc인 작제물 및/또는 신생아 Fc 수용체(FcRn)에 결합하는 작제물이다. 이들 작제물의 예시는 다음과 같은 것들이다: 작제물은 짧은 FcRn 결합 펩티드(FcRnBP)를 포함하고, 여기서 짧은 FcRn 결합 펩티드(FcRnBPs)는 FcRn과 작제물의 상호작용을 제공하고, 6-25, 예를 들어, 10-20개의 아미노산 잔기를 함유하고; 여기서 FcRnBP는 12-20개의 잔기 또는 15개의 잔기 또는 16개의 잔기를 함유하며, 예를 들어 FcRn 결합 펩티드(FcRnBP)는 임의의 서열번호:48-51의 펩티드를 포함하거나 이로 구성된다.In the TNFR1 antagonist constructs and other constructs provided herein, the Treg expander may be a TNFR2 agonist. Such constructs may include an active modifier, such as where the active modifier is an Fc region or an Fc region comprising a hinge region or other linker; An Fc region or Fc region having a hinge region is an Fc that has been modified to reduce or eliminate ADCC and/or CDC activity. Examples are constructs where the Fc or modified Fc is an IgG Fc or an IgG1 or IgG4 Fc and/or a construct that binds to the neonatal Fc receptor (FcRn). Examples of these constructs are the following: the construct comprises short FcRn binding peptides (FcRnBPs), wherein the short FcRn binding peptides (FcRnBPs) provide for interaction of the construct with FcRn, 6-25; For example, it contains 10-20 amino acid residues; wherein the FcRnBP contains 12-20 residues or 15 residues or 16 residues, for example the FcRn binding peptide (FcRnBP) comprises or consists of any of SEQ ID NOs:48-51 peptides.
또한, 또한 a) TNFR1 선택적인 TNFR1 억제제 모이어티; b) 선택적으로 하나 이상의 링커; 및 c) 선택적으로 반감기 연장 모이어티를 포함하는, 상기 및 출원에서 임의의 식의 TNFR1 길항제 작제물이 제공되고, 여기서 길항제 작제물은 b) 및 c) 중 적어도 하나를 포함한다. 이러한 작제물에서, TNFR1 선택적 길항제는 TNFR1 신호전달에 선택적으로 결합하고 억제하지만 TNFR2 신호전달에는 그렇지 않은 것이다. 상기 작제물에 대해 기재된 바와 같이, TNFR1 억제제, 링커 및 다른 성분은 전술된 것일 수 있다. 이들은 선택적 길항제인 TNFR1 억제제가 TNFR1 신호전달에 선택적으로 결합하고 억제하지만, TNFR2 신호전달에는 그렇지 않은 항원 결합 단편을 포함하는 작제물을 포함한다. 예를 들어, TNFR1 신호전달에 선택적으로 결합하고 억제하지만 TNFR2 신호전달은 그렇지 않은 항원 결합 단편은 도메인 항체(dAb), scFv 또는 Fab 단편을 포함할 수 있다. 본 명세서에 기재된 임의의 작제물에서, TNFR1 억제제는 인간 항-TNFR1 길항제 단클론성 항체의 항원 결합 단편을 포함한다. 예를 들어, 인간 항-TNFR1 길항제 단클론성 항체는 서열번호: 678을 포함하는 H398, ATROSAB, 또는 그의 항원 결합 부분, 서열번호: 31 또는 32 또는 673 또는 678과 적어도 95% 서열 동일성을 갖는 서열 또는 TNFR1에 결합하는 그의 항원 결합 부분이다. 예시적인 TNFR1 억제제는 도메인 항체 (dAb) 또는 그의 항원 결합 부분을 포함하거나 서열번호: 52-672 중 임의의 것에 제시된 아미노산의 서열 또는 TNFR1 억제제 활성을 유지하는 것과 적어도 95% 서열 동일성을 갖는 서열을 포함하고/하거나; 서열번호:673-678 중 임의의 것에 제시된 scFv 또는 TNFR1 억제제 활성을 유지하는 것과 적어도 90% 또는 95% 서열 동일성을 갖는 이들 폴리펩티드의 변이체을 포함하고/하거나; 서열번호:679-682 중 임의의 것에 제시된 Fab 또는 TNFR1 억제제 또는 결합 활성을 유지하는 것과 적어도 90% 또는 95% 서열 동일성을 갖는 서열을 포함하고/하거나; 서열이 서열번호: 683 또는 684에 제시되거나 TNFR1 억제제 또는 결합 활성을 유지하는 적어도 90% 또는 95% 서열 동일성을 갖는 나노바디를 포함하는 것이다. TNFR1 억제제 중에는 예를 들어 우성-음성 종양 괴사 인자(DN-TNF) 또는 TNF 뮤테인을 포함하는 것들이 있으며, 예를 들어 DN-TNF 또는 TNF 뮤테인은 TNFR1의 선택적 억제를 부여하고 하기 중에서 선택되는 하나 이상의 아미노산 치환을 포함하는 가용성 TNF 분자이다: In addition, also a) a TNFR1 selective TNFR1 inhibitor moiety; b) optionally one or more linkers; and c) optionally comprising a half-life extending moiety. In this construct, the TNFR1 selective antagonist is one that selectively binds and inhibits TNFR1 signaling but not TNFR2 signaling. As described for the constructs above, the TNFR1 inhibitor, linker and other components may be those previously described. These include constructs comprising antigen-binding fragments in which a selective antagonist, a TNFR1 inhibitor, selectively binds to and inhibits TNFR1 signaling, but not TNFR2 signaling. For example, an antigen-binding fragment that selectively binds to and inhibits TNFR1 signaling but not TNFR2 signaling may include a domain antibody (dAb), scFv or Fab fragment. In any of the constructs described herein, the TNFR1 inhibitor comprises an antigen-binding fragment of a human anti-TNFR1 antagonist monoclonal antibody. For example, a human anti-TNFR1 antagonist monoclonal antibody may comprise H398 comprising SEQ ID NO: 678, ATROSAB, or an antigen binding portion thereof, a sequence having at least 95% sequence identity to SEQ ID NO: 31 or 32 or 673 or 678, or It is an antigen binding portion thereof that binds to TNFR1. An exemplary TNFR1 inhibitor comprises a domain antibody (dAb) or antigen binding portion thereof or comprises a sequence of amino acids set forth in any of SEQ ID NOs: 52-672 or a sequence having at least 95% sequence identity to a sequence that retains TNFR1 inhibitor activity. and/or; and/or comprises a scFv set forth in any of SEQ ID NOs:673-678 or variants of these polypeptides that have at least 90% or 95% sequence identity to those that retain TNFR1 inhibitor activity; and/or comprises a sequence having at least 90% or 95% sequence identity to a Fab or TNFR1 inhibitor set forth in any of SEQ ID NOs:679-682 or that retains binding activity; The sequence is set forth in SEQ ID NO: 683 or 684 or comprises a Nanobody having at least 90% or 95% sequence identity that retains a TNFR1 inhibitor or binding activity. Among the TNFR1 inhibitors are those comprising, for example, dominant-negative tumor necrosis factor (DN-TNF) or TNF muteins, for example, DN-TNF or TNF muteins confer selective inhibition of TNFR1 and are selected from one of the following: A soluble TNF molecule comprising the above amino acid substitutions:
V1M, L29S, L29G, L29Y, R31C, R31E, R31N, R32Y, R32W, C69V, A84S, V85T, S86T, Y87H, Q88N, T89Q, I97T, C101A, A145R, E146R, L29S/R32W, L29S/S86T, R32W/S86T, L29S/R32W/S86T, R31N/R32T, R31E/S86T, R31N/R32T/S86T, I97T/A145R, V1M/R31C/C69V/Y87H/C101A/A145R, 및 A84S/V85T/S86T/Y87H/Q88N/T89Q. 예를 들어, TNFR1 억제제는 서열번호: 701-703 중 어느 하나에 제시된 잔기의 서열, 또는 서열번호: 701-703 중 어느 하나에 제시된 잔기의 서열에 대해 적어도 또는 적어도 약 90% 또는 95% 서열 동일성을 갖는 서열 또는 TNFR1 억제제 활성을 유지하는 그의 단편을 포함하는 TNF 뮤테인이다. V1M, L29S, L29G, L29Y, R31C, R31E, R31N, R32Y, R32W, C69V, A84S, V85T, S86T, Y87H, Q88N, T89Q, I97T, C101A, A145R, E146R, L29S/R32W, L29S/S86T, R32W/ S86T, L29S/R32W/S86T, R31N/R32T, R31E/S86T, R31N/R32T/S86T, I97T/A145R, V1M/R31C/C69V/Y87H/C101A/A145R, and A84S/V85T/S86T/Y87H/Q88N /T89Q . For example, the TNFR1 inhibitor has at least or at least about 90% or 95% sequence identity to the sequence of residues set forth in any one of SEQ ID NOs: 701-703, or to the sequence of residues set forth in any one of SEQ ID NOs: 701-703 It is a TNF mutein comprising a sequence having or a fragment thereof that retains TNFR1 inhibitory activity.
본 명세서에 제공되는 임의의 전술한 작제물은 링커를 포함할 수 있으며, 링커는 트라스투주맙의 힌지 서열의 전부 또는 일부, 서열번호: 26의 잔기 222-227에 상응하는 SCDKTH 또는 서열 EPKSCDKTHTCPPCP (서열번호: 26의 잔기 219-233에 상응함), 또는 그의 적어도 5, 6, 7, 8, 9, 10, 또는 11개의 인접 잔기, 또는 서열번호:29의 잔기 ESKYGPPCPPCP 잔기 212-223, 또는 링커인 그에 대해 적어도 98% 또는 99% 서열 동일성을 갖는 서열을 함유하거나 갖는 트라스투주맙의 힌지 영역의 전체 서열까지를 포함한다. 예를 들어, 작제물은 링커를 포함할 수 있으며, 링커는 서열번호: 26의 잔기 222-227에 상응하는 서열 SCDKTH를 포함한다. 작제물은 다른 링커 대신에 또는 이에 추가하여 글리신 및 세린(GS) 잔기를 포함하는 링커, GS 링커를 포함할 수 있다. 본 명세서에 제공된 임의의 작제물에 대한 예시적인 GS 링커는 (GlySer)n (여기서 n= 1-10); (GlySer2); (Gly4Ser)n(여기서 n= 1-10); (Gly3Ser)n(여기서 n= 1-5); (SerGly4)n(여기서 n= 1-5); (GlySerSerGly)n(여기서 n= 1-5); GSGGSSGG; GSSSGSGSGSSG; GSSSGSGSGSSGG; GGSSGG; GGSSGGSGGSSSG; GSSSGSGSGGSSSGSGSG; GGSSGGSSGGGSSGGSSG; 및 GSSSGS 중에서 선택되는 것을 포함한다. 또한, 잔기 EPKSCDKTHTCPPCP(서열번호: 26의 잔기 219-233)에 상응하는 GS 링커 및 트라스투주맙의 힌지 서열의 전부 또는 일부를 포함하는 링커가 포함되며, 예를 들어 링커는 GS 링커를 포함할 수 있고 또는 힌지 서열로부터 서열번호: 31의 잔기 217-222에 상응하는 서열 SCDKTH만을 포함하거나 함유한다. 이러한 링커는 예를 들어 GS 링커 및 서열번호: 29의 잔기 212-223에 상응하는 니볼루맙의 힌지 서열의 전부 또는 일부를 포함하는 것들을 포함한다.Any of the foregoing constructs provided herein may include a linker, wherein the linker comprises all or part of the hinge sequence of trastuzumab, SCDKTH corresponding to residues 222-227 of SEQ ID NO: 26 or the sequence EPKSCDKTHTCPPCP (sequence corresponding to residues 219-233 of SEQ ID NO: 26), or at least 5, 6, 7, 8, 9, 10, or 11 contiguous residues thereof, or residues ESKYGPPCPPCP residues 212-223 of SEQ ID NO: 29, or a linker up to the entire sequence of the hinge region of trastuzumab that contains or has a sequence having at least 98% or 99% sequence identity thereto. For example, the construct can include a linker, wherein the linker includes the sequence SCDKTH corresponding to residues 222-227 of SEQ ID NO:26. The construct may include a linker comprising glycine and serine (GS) residues, a GS linker, in place of or in addition to other linkers. Exemplary GS linkers for any of the constructs provided herein include (GlySer) n where n=1-10; (GlySer 2 ); (Gly 4 Ser) n (where n=1-10); (Gly 3 Ser) n (where n= 1-5); (SerGly 4 ) n (where n=1-5); (GlySerSerGly) n (where n= 1-5); GSGGSSGG; GSSSGSGSGSSG; GSSSGSGSGSSGG; GGSSGG; GGSSGGSGGSSSG; GSSSGSGSGGSSSGSGSG; GGSSGGSSGGGSSGGSSG; and GSSSGS. Also included are GS linkers corresponding to residues EPKSCDKTHTCPPCP (residues 219-233 of SEQ ID NO: 26) and linkers comprising all or part of the hinge sequence of Trastuzumab, for example the linker may comprise a GS linker. or contains or contains only the sequence SCDKTH corresponding to residues 217-222 of SEQ ID NO: 31 from the hinge sequence. Such linkers include, for example, those comprising the GS linker and all or part of the hinge sequence of nivolumab corresponding to residues 212-223 of SEQ ID NO:29.
본 명세서의 작제물은 활성 변형제를 포함할 수 있다. 활성 변형제는 상기 및 하기에 기술된 것을 포함하는 본 명세서에 기재된 임의의 것 및 당업자에게 공지된 다른 것을 포함하고; 활성 변형제는 작제물의 활성 또는 특성을 변경한다. 변형된 활성은 IgG Fc, 폴리에틸렌 글리콜(PEG) 분자 또는 인간 혈청 알부민(HSA)인 반감기 연장 부분인 것일 수 있다. IgG Fc의 예는 IgG1 또는 IgG4 Fc이다. IgG1 Fc는 서열번호: 27에 제시된 트라스투주맙의 Fc 또는 그와 적어도 95% 서열 동일성을 갖는 아미노산의 서열일 수 있고; IgG4 Fc는 서열번호: 30에 제시된 니볼루맙의 Fc 또는 그와 적어도 95% 서열 동일성을 갖는 아미노산 서열일 수 있다. 예를 들어, IgG1 Fc는 서열번호: 10에 제시된 인간 IgG1의 Fc이고, IgG4 Fc는 서열번호: 16에 제시된 인간 IgG4의 Fc이다.The constructs herein may include active modifiers. Active modifiers include any described herein, including those described above and below, and others known to those skilled in the art; Active modifiers alter the activity or properties of a construct. The modified activity can be an IgG Fc, a polyethylene glycol (PEG) molecule or a half-life extending moiety that is human serum albumin (HSA). Examples of IgG Fc are IgG1 or IgG4 Fc. The IgG1 Fc may be the Fc of Trastuzumab set forth in SEQ ID NO: 27 or a sequence of amino acids having at least 95% sequence identity therewith; The IgG4 Fc may be the Fc of nivolumab set forth in SEQ ID NO: 30 or an amino acid sequence having at least 95% sequence identity therewith. For example, IgG1 Fc is the Fc of human IgG1 as shown in SEQ ID NO: 10, and IgG4 Fc is the Fc of human IgG4 as shown in SEQ ID NO: 16.
본 명세서에 기재된 작제물은 TNFR1 억제제이거나 TNFR1 억제제(들)을 포함하는 것을 포함한다. 이들은 TNFR1 억제제가 1가인 작제물을 포함한다. 이들은 (Gly4Ser)3을 포함하는 것과 같은 링커 및/또는 (Gly4Ser)3 및 SCDKTH (서열번호:31의 잔기 217-222)을 포함하는 링커; 및/또는 (Gly4Ser)3 및 서열번호: 26의 잔기 219-233에 상응하는 트라스투주맙의 힌지 서열을 포함하는 링커; 및/또는 (Gly4Ser)3 및 서열번호: 29의 잔기 212-223에 상응하는 니볼루맙의 힌지 서열을 포함하는 것을 포함할 수 있다. TNFR1을 억제하는 본 명세서에 제공되는 작제물의 예시는 서열번호: 704-764 중 어느 하나에 제시된 잔기의 서열, 또는 TNFR1을 억제하고 서열번호: 704-764 중 어느 하나에 제시된 잔기의 서열에 대해 적어도 또는 적어도 약 95%의 서열 동일성을 갖는 서열을 갖는 작제물을 포함하는 것이다.Constructs described herein include those that are or include TNFR1 inhibitor(s). These include constructs in which the TNFR1 inhibitor is monovalent. These include linkers such as those comprising (Gly 4 Ser) 3 and/or linkers comprising (Gly 4 Ser) 3 and SCDKTH (residues 217-222 of SEQ ID NO:31); and/or (Gly 4 Ser) 3 and a linker comprising the hinge sequence of Trastuzumab corresponding to residues 219-233 of SEQ ID NO: 26; and/or (Gly 4 Ser) 3 and the hinge sequence of nivolumab corresponding to residues 212-223 of SEQ ID NO:29. Exemplary constructs provided herein that inhibit TNFR1 are directed to the sequence of residues set forth in any one of SEQ ID NOs: 704-764, or to the sequence of residues set forth in any one of SEQ ID NOs: 704-764 that inhibits TNFR1. and constructs having sequences having at least or at least about 95% sequence identity.
TNFR1 길항제 작제물이 본 명세서에 제공된다. 이들은 TNFR1 작제물이 짧은 FcRn 결합 펩티드 (FcRnBP)을 포함하고; 짧은 FcRn 결합 펩티드 (FcRnBPs)가 FcRn과의 작제물의 상호작용을 제공하고, 6-25, 예컨대 10-20개의 아미노산 잔기를 함유하는 것, 예컨대 FcRnBP가 12-20개의 잔기 또는 15개의 잔기 또는 16개의 잔기를 함유하는 것, 예컨대, 예를 들어 FcRn 결합 펩티드 (FcRnBP)가 임의의 서열번호: 48-51의 펩티드 또는 그와 적어도 약 95% 서열 동일성을 갖는 펩티드, 또는 임의의 서열번호: 48-51의 펩티드로 구성된 FcRn 결합 펩티드 (FcRnBP)를 포함하는 것을 포함한다. TNFR1 antagonist constructs are provided herein. These include an FcRn binding peptide (FcRnBP) in which the TNFR1 construct is short; Short FcRn binding peptides (FcRnBPs) provide for the interaction of the construct with FcRn and contain 6-25, such as 10-20 amino acid residues, such as FcRnBPs of 12-20 residues or 15 residues or 16 residues. residues, such as, for example, an FcRn binding peptide (FcRnBP) is any of SEQ ID NOs: 48-51 or a peptide having at least about 95% sequence identity thereto, or any SEQ ID NO: 48- including the FcRn-binding peptide (FcRnBP) composed of 51 peptides.
본 명세서에 제공된 다른 예시적인 TNFR1 억제 작제물은 하기를 포함하는 작제물을 포함한다: a) TNFR1을 억제하는 도메인 항체; b) 가요성을 증가시키고; 입체 효과를 감소시키거나 용해도를 증가시키는 링커; 및 c) 반감기 연장 모이어티. 반감기 연장 모이어티가 인간 혈청 알부민 항체 또는 비변형 Fc가 아닌 그러한 작제물이 포함된다. 이들 작제물은 하기를 포함하는 TNFR1 길항제인 것을 포함한다: a) 서열번호:52-672 중 임의의 것의 도메인 항체 (dAb), 또는 서열번호:673-678 중 임의의 것의 scFv 또는 서열번호:679-682 중 임의의 것의 Fab, 또는 서열번호: 683 또는 684의 나노바디, 또는 서열번호:685-703 중 임의의 것의 TNF 뮤테인; b) (GlySer)n (여기서 n= 1-10); (GlySer2); (Gly4Ser)n (여기서 n= 1-10); (Gly3Ser)n (여기서 n= 1-5); (SerGly4)n (여기서 n= 1-5); (GlySerSerGly)n (여기서 n= 1-5); GSGGSSGG; GSSSGSGSGSSG; GSSSGSGSGSSGG; GGSSGG; GGSSGGSGGSSSG; GSSSGSGSGGSSSGSGSG; GGSSGGSSGGGSSGGSSG; 및 GSSSGS 중으로부터 선택된 GS 링커; 및 c) IgG Fc인 반감기 연장 모이어티. 이들 작제물 또는 이들 성분 중 하나 이상을 포함하는 본 명세서에 제공된 임의의 것에서, GS 링커는 (GGGGS)3일 수 있고; IgG Fc는 트라스투주맙의 Fc 또는 니볼루맙의 Fc일 수 있다.Other exemplary TNFR1 inhibitory constructs provided herein include constructs comprising: a) a domain antibody that inhibits TNFR1; b) increase flexibility; linkers that reduce steric effects or increase solubility; and c) a half-life extending moiety. Constructs in which the half-life extending moiety is not a human serum albumin antibody or an unmodified Fc are included. These constructs include those that are TNFR1 antagonists comprising: a) a domain antibody (dAb) of any of SEQ ID NOs:52-672, or a scFv of any of SEQ ID NOs:673-678 or SEQ ID NO:679 a Fab of any of -682, or a Nanobody of SEQ ID NO: 683 or 684, or a TNF mutein of any of SEQ ID NOs: 685-703; b) (GlySer) n (where n=1-10); (GlySer 2 ); (Gly 4 Ser) n (where n=1-10); (Gly 3 Ser) n (where n= 1-5); (SerGly 4 ) n (where n=1-5); (GlySerSerGly) n (where n= 1-5); GSGGSSGG; GSSSGSGSGSSG; GSSSGSGSGSSGG; GGSSGG; GGSSGGSGGSSSG; GSSSGSGSGGSSSGSGSG; GGSSGGSSGGGSSGGSSG; and a GS linker selected from among GSSSGS; and c) a half-life extending moiety that is an IgG Fc. In any of these constructs or anything provided herein that includes one or more of these components, the GS linker can be (GGGGS) 3 ; The IgG Fc may be the Fc of Trastuzumab or the Fc of Nivolumab.
TNFR1 길항제 작제물인 본 명세서에 제공된 다른 작제물은 하기를 포함하는 작제물을 포함한다: a) 서열번호:52-672 중 임의의 것의 도메인 항체 (dAb), 또는 서열번호:673-678 중 임의?? 것의 scFv 또는 서열번호:679-682 중 임의의 것의 Fab, 또는 서열번호: 683 또는 684의 나노바디, 또는 서열번호:685-703 중 임의의 것의 TNF 뮤테인; b) 트라스투주맙의 힌지 서열의 전부 또는 일부 및 니볼루맙의 힌지 서열의 전부 또는 일부 중에서 선택된 링커; 및 c) IgG Fc인 반감기 연장 모이어티. 이러한 작제물에서, 링커는 트라스투주맙의 힌지 서열의 전부 또는 일부를 포함할 수 있으며, 여기서 IgG Fc는 트라스투주맙의 Fc이다. 다른 구현예에서, 링커는 니볼루맙의 힌지 서열의 전부 또는 일부를 포함할 수 있으며, 여기서 IgG Fc는 니볼루맙의 Fc이다. Other constructs provided herein that are TNFR1 antagonist constructs include constructs comprising: a) a domain antibody (dAb) of any of SEQ ID NOs:52-672, or any of SEQ ID NOs:673-678 ?? a scFv of or a Fab of any of SEQ ID NOs: 679-682, or a nanobody of SEQ ID NOs: 683 or 684, or a TNF mutein of any of SEQ ID NOs: 685-703; b) a linker selected from all or part of the hinge sequence of Trastuzumab and all or part of the hinge sequence of Nivolumab; and c) a half-life extending moiety that is an IgG Fc. In such constructs, the linker may include all or part of the hinge sequence of Trastuzumab, wherein the IgG Fc is the Fc of Trastuzumab. In another embodiment, the linker can include all or part of the hinge sequence of nivolumab, wherein the IgG Fc is the Fc of nivolumab.
하기를 포함하는 TNFR1 길항제 작제물인 본 명세서에 제공된 임의의 작제물이 제공된다:Provided are any constructs provided herein that are TNFR1 antagonist constructs comprising:
a) 서열번호: 52-672 중 어느 하나의 도메인 항체(dAb), 또는 서열번호: 673-678 중 어느 하나의 scFv 또는 서열번호: 679-682 중 어느 하나의 Fab, 또는 서열번호: 683 또는 684의 나노바디, 또는 서열번호: 685-703 중 어느 하나의 TNF 뮤테인; a) a domain antibody (dAb) of any one of SEQ ID NOs: 52-672, or a scFv of any one of SEQ ID NOs: 673-678 or a Fab of any one of SEQ ID NOs: 679-682, or SEQ ID NOs: 683 or 684 or a TNF mutein of any one of SEQ ID NOs: 685-703;
b) (GlySer)n (여기서 n= 1-10); (GlySer2); (Gly4Ser)n(여기서 n= 1-10); (Gly3Ser)n(여기서 n= 1-5); (SerGly4)n(여기서 n= 1-5); (GlySerSerGly)n(여기서 n= 1-5); GSGGSSGG; GSSSGSGSGSSG; GSSSGSGSGSSGG; GGSSGG; GGSSGGSGGSSSG; GSSSGSGSGGSSSGSGSG; GGSSGGSSGGGSSGGSSG; 및 GSSSGS 중에서 선택되는 GS 링커인 제1 링커;b) (GlySer) n (where n=1-10); (GlySer 2 ); (Gly 4 Ser) n (where n=1-10); (Gly 3 Ser) n (where n= 1-5); (SerGly 4 ) n (where n=1-5); (GlySerSerGly) n (where n= 1-5); GSGGSSGG; GSSSGSGSGSSG; GSSSGSGSGSSGG; GGSSGG; GGSSGGSGGSSSG; GSSSGSGSGGSSSGSGSG; GGSSGGSSGGGSSGGSSG; And a first linker that is a GS linker selected from GSSSGS;
c) 트라스투주맙의 힌지 서열의 전부 또는 일부 및 니볼루맙의 힌지 서열의 전부 또는 일부 중에서 선택되는 제2 링커; 및c) a second linker selected from all or part of the hinge sequence of Trastuzumab and all or part of the hinge sequence of Nivolumab; and
d) IgG Fc인 반감기 연장 모이어티. d) a half-life extending moiety that is an IgG Fc.
일부 구현예에서, 이들 작제물은 GS 링커인 제1 링커는 (GGGGS)3이고; 제2 링커는 서열 SCDKTH(서열번호: 31의 잔기 217-222)를 포함하고; IgG Fc는 트라스투주맙의 Fc이다. 다른 구현예에서, 제1 링커는 GS 링커이고 (GGGGS)3이고; 제2 링커는 니볼루맙의 힌지 서열의 전부 또는 일부를 포함하고; IgG Fc는 니볼루맙의 Fc이다.In some embodiments, these constructs are GS linkers, wherein the first linker is (GGGGS) 3 ; the second linker comprises the sequence SCDKTH (residues 217-222 of SEQ ID NO: 31); IgG Fc is the Fc of Trastuzumab. In another embodiment, the first linker is a GS linker and is (GGGGS) 3 ; the second linker comprises all or part of the hinge sequence of nivolumab; IgG Fc is the Fc of nivolumab.
하기를 포함하는 TNFR1 효능제인 작제물이 제공된다:A construct is provided that is a TNFR1 agonist comprising:
a) 서열번호: 52-672 중 어느 하나의 도메인 항체(dAb), 또는 서열번호: 673-678 중 어느 하나의 scFv 또는 서열번호: 679-682 중 어느 하나의 Fab, 또는 서열번호: 683 또는 684의 나노바디, 또는 서열번호: 685-703 중 어느 하나의 TNF 뮤테인;a) a domain antibody (dAb) of any one of SEQ ID NOs: 52-672, or a scFv of any one of SEQ ID NOs: 673-678 or a Fab of any one of SEQ ID NOs: 679-682, or SEQ ID NOs: 683 or 684 or a TNF mutein of any one of SEQ ID NOs: 685-703;
b) (GlySer)n (여기서 n= 1-10); (GlySer2); (Gly4Ser)n(여기서 n= 1-10); (Gly3Ser)n(여기서 n= 1-5); (SerGly4)n(여기서 n= 1-5); (GlySerSerGly)n(여기서 n= 1-5); GSGGSSGG; GSSSGSGSGSSG; GSSSGSGSGSSGG; GGSSGG; GGSSGGSGGSSSG; GSSSGSGSGGSSSGSGSG; GGSSGGSSGGGSSGGSSG; 및 GSSSGS 중에서 선택되는 GS 링커; 및b) (GlySer) n (where n=1-10); (GlySer 2 ); (Gly 4 Ser) n (where n=1-10); (Gly 3 Ser) n (where n= 1-5); (SerGly 4 ) n (where n=1-5); (GlySerSerGly) n (where n= 1-5); GSGGSSGG; GSSSGSGSGSSG; GSSSGSGSGSSGG; GGSSGG; GGSSGGSGGSSSG; GSSSGSGSGGSSSGSGSG; GGSSGGSSGGGSSGGSSG; and a GS linker selected from GSSSGS; and
c) PEG 분자인 반감기 연장 모이어티. GS 링커는 (GGGGS)3과 같이 본 명세서에 기재되거나 당업자에게 공지된 임의의 것일 수 있다. PEG 분자는 적어도 25kDa, 일반적으로 적어도 30 kDa 이상, 예컨대 적어도 40 kDa 또는 50 kDa, 또는 60 kDa, 또는 80 kDa, 또는 그 초과의 분자량을 갖는 것일 수 있다. c) a half-life extending moiety that is a PEG molecule. The GS linker can be any described herein or known to those skilled in the art, such as (GGGGS) 3 . The PEG molecule may have a molecular weight of at least 25 kDa, typically at least 30 kDa or greater, such as at least 40 kDa or 50 kDa, or 60 kDa, or 80 kDa, or greater.
하기를 포함하는 TNFR1 효능제 작제물인 작제물이 제공된다:A construct is provided that is a TNFR1 agonist construct comprising:
a) 서열번호: 52-672 중 어느 하나의 도메인 항체(dAb), 또는 서열번호: 673-678 중 어느 하나의 scFv 또는 서열번호: 679-682 중 어느 하나의 Fab, 또는 서열번호: 683 또는 684의 나노바디, 또는 서열번호: 685-703 중 어느 하나의 TNF 뮤테인;a) a domain antibody (dAb) of any one of SEQ ID NOs: 52-672, or a scFv of any one of SEQ ID NOs: 673-678 or a Fab of any one of SEQ ID NOs: 679-682, or SEQ ID NOs: 683 or 684 or a TNF mutein of any one of SEQ ID NOs: 685-703;
b) (GlySer)n (여기서 n= 1-10); (GlySer2); (Gly4Ser)n(여기서 n= 1-10); (Gly3Ser)n(여기서 n= 1-5); (SerGly4)n(여기서 n= 1-5); (GlySerSerGly)n(여기서 n= 1-5); GSGGSSGG; GSSSGSGSGSSG; GSSSGSGSGSSGG; GGSSGG; GGSSGGSGGSSSG; GSSSGSGSGGSSSGSGSG; GGSSGGSSGGGSSGGSSG; 및 GSSSGS 중에서 선택되는 GS 링커; 및b) (GlySer) n (where n=1-10); (GlySer 2 ); (Gly 4 Ser) n (where n=1-10); (Gly 3 Ser) n (where n= 1-5); (SerGly 4 ) n (where n=1-5); (GlySerSerGly) n (where n= 1-5); GSGGSSGG; GSSSGSGSGSSG; GSSSGSGSGSSGG; GGSSGG; GGSSGGSGGSSSG; GSSSGSGSGGSSSGSGSG; GGSSGGSSGGGSSGGSSG; and a GS linker selected from GSSSGS; and
c) 인간 혈청 알부민인 반감기 연장 모이어티. 예시적인 링커는 GS 링커가 (GGGGS)3인 경우와 같이 본 명세서에 기재된 임의의 것이다.c) a half-life extending moiety that is human serum albumin. Exemplary linkers are any described herein, such as where the GS linker is (GGGGS) 3 .
본 명세서에 제공된 임의의 작제물의 일차 아미노산 서열(상기 및 하기 기재된 것)은 최적화되거나 변형되어 면역원성 서열 또는 면역원성 에피토프를 제거할 수 있다. 예를 들어, IgG Fc를 함유하는 작제물에서, IgG Fc는 하기 변형 중 하나 이상을 포함하도록 변형될 수 있다: a) 놉-인투-홀을 도입하기 위한 변형(들); b) 신생아 Fc 수용체(FcRn) 재순환을 증가시키거나 강화하기 위한 변형(들); 및 c) 면역 이펙터 기능을 감소시키거나 제거하기 위한 변형(들). 그러한 작제물에서 그리고 IgG Fc를 함유하는 임의의 것에서, 놉 돌연변이는 EU 넘버링에 의해 S354C, T366Y, T366W 및 T394W 중에서 선택될 수 있으며; 홀 돌연변이는 EU 넘버링에 의해 Y349C, T366S, L368A, F405A, Y407T, Y407A 및 Y407V 중에서 선택된다. 이들 TNFR1 길항제 작제물은 FcRn 재순환을 증가시키거나 강화하기 위한 변형(들)이 하기 중 하나 이상으로부터 선택되는 것일 수 있다: EU 넘버링에 의해 T250Q, T250R, M252F, M252W, M252Y, S254T, T256D, T256E, T256Q, V259I, V308F, E380A, M428L, H433K, N434F, N434A, N434W, N434S, N434Y, Y436H, M252Y/T256Q, M252F/T256D, M252Y/S254T/T256E, H433K/N434F/Y436H, N434F/Y436H, T250Q/M428L, T250R/M428L, M428L/N434S, V259I/V308F, V259I/V308F/M428L, E294del/T307P/N434Y, 및 T256N/A378V/S383N/N434Y. 보체 의존적 세포독성 (CDC), 항체 의존적 세포 매개 세포독성 (ADCC), 및 항체 의존적 세포 매개 식균작용 (ADCP) 중 하나 이상으로부터 선택되는 면역 이펙터 기능(들)과 같은 면역 이펙터 기능(들)을 감소시키거나 제거하도록 변형될 수 있는 TNFR1 길항제 작제물. 예를 들어, 이들 TNFR1 길항제 작제물에서, 면역 이펙터 기능을 감소시키거나 제거하기 위한 변형(들)은 하기 중 하나 이상으로부터 선택된다:The primary amino acid sequence of any construct provided herein (as described above and below) may be optimized or modified to remove immunogenic sequences or immunogenic epitopes. For example, in a construct containing an IgG Fc, the IgG Fc may be modified to include one or more of the following modifications: a) modification(s) to introduce a knob-into-hole; b) modification(s) to increase or enhance neonatal Fc receptor (FcRn) recycling; and c) modification(s) to reduce or eliminate immune effector function. In such constructs and in any containing an IgG Fc, the knob mutation may be selected from among S354C, T366Y, T366W and T394W by EU numbering; The hole mutation is selected from among Y349C, T366S, L368A, F405A, Y407T, Y407A and Y407V by EU numbering. These TNFR1 antagonist constructs may have the modification(s) to increase or enhance FcRn recycling selected from one or more of the following: T250Q, T250R, M252F, M252W, M252Y, S254T, T256D, T256E by EU numbering. , T256Q, V259I, V308F, E380A, M428L, H433K, N434F, N434A, N434W, N434S, N434Y, Y436H, M252Y/T256Q, M252F/T256D, M252Y/S254T/T256E, H433K/ N434F/Y436H, N434F/Y436H, T250Q /M428L, T250R/M428L, M428L/N434S, V259I/V308F, V259I/V308F/M428L, E294del/T307P/N434Y, and T256N/A378V/S383N/N434Y. Decrease immune effector function(s), such as immune effector function(s) selected from one or more of complement dependent cytotoxicity (CDC), antibody dependent cell mediated cytotoxicity (ADCC), and antibody dependent cell mediated phagocytosis (ADCP) A TNFR1 antagonist construct that can be modified to eliminate or eliminate. For example, in these TNFR1 antagonist constructs, the modification(s) to reduce or eliminate immune effector function is selected from one or more of the following:
IgG1에서: EU 넘버링에 의해 L235E, L234A/L235A, L234E/L235F/P331S, L234F/L235E/P331S, L234A/L235A/P329G, L234A/L235A/G237A/P238S/H268A/A330S/P331S, G236R/L328R, G237A, E318A, D265A, E233P, N297A, N297Q, N297D, N297G, N297G/D265A, A330L, D270A, P329A, P331A, K322A, V264A, 및 F241A; 및 In IgG1: L235E, L234A/L235A, L234E/L235F/P331S, L234F/L235E/P331S, L234A/L235A/P329G, L234A/L235A/G237A/P238S/H268A/A330S/P331 by EU numbering S, G236R/L328R, G237A , E318A, D265A, E233P, N297A, N297Q, N297D, N297G, N297G/D265A, A330L, D270A, P329A, P331A, K322A, V264A, and F241A; and
IgG4에서: EU 넘버링에 의해 L235E, F234A/L235A, S228P/L235E, 및 S228P/F234A/L235A. In IgG4: L235E, F234A/L235A, S228P/L235E, and S228P/F234A/L235A by EU numbering.
TNFR1 길항제 또는 다중특이적 작제물은 중심 PEG 링커 모이어티를 포함할 수 있으며; 작제물은 전술한 것과 같은 변형된 Fc 영역을 포함할 수 있으며, 여기서 Fc 영역은 변형된 IgG Fc이고 변형된 IgG Fc는 하기 변형 중 하나 이상을 포함한다:A TNFR1 antagonist or multispecific construct may include a central PEG linker moiety; The construct may comprise a modified Fc region as described above, wherein the Fc region is a modified IgG Fc and the modified IgG Fc comprises one or more of the following modifications:
a) 놉-인투-홀을 도입하기 위한 변형(들); 여기서a) deformation(s) to introduce a knob-into-hole; here
놉 돌연변이는 EU 넘버링에 의해 S354C, T366Y, T366W 및 T394W 중에서 선택되며; 그리고Knob mutations are selected from among S354C, T366Y, T366W and T394W by EU numbering; and
홀 돌연변이는 EU 넘버링에 의해 Y349C, T366S, L368A, F405A, Y407T, Y407A 및 Y407V 중에서 선택되는 변형;Hall mutations are variants selected from among Y349C, T366S, L368A, F405A, Y407T, Y407A and Y407V by EU numbering;
b) 신생아 Fc 수용체(FcRn) 재순환을 증가시키거나 강화하기 위한 변형(들)로서, 하기 중 하나 이상으로부터 선택되는 변형:b) modification(s) to increase or enhance neonatal Fc receptor (FcRn) recycling, selected from one or more of the following:
T250Q, T250R, M252F, M252W, M252Y, S254T, T256D, T256E, T256Q, V259I, V308F, E380A, M428L, H433K, N434F, N434A, N434W, N434S, N434Y, Y436H, M252Y/T256Q, M252F/T256D, M252Y/S254T/T256E, H433K/N434F/Y436H, N434F/Y436H, T250Q/M428L, T250R/M428L, M428L/N434S, V259I/V308F, V259I/V308F/M428L, E294del/T307P/N434Y, 및 T256N/A378V/S383N/N434Y; 및T250Q, T250R, M252F, M252W, M252Y, S254T, T256D, T256E, T256Q, V259I, V308F, E380A, M428L, H433K, N434F, N434A, N434W, N434S, N434Y, Y436H, M2 52Y/T256Q, M252F/T256D, M252Y/ S254T/T256E, H433K/N434F/Y436H, N434F/Y436H, T250Q/M428L, T250R/M428L, M428L/N434S, V259I/V308F, V259I/V308F/M428L, E294del/T307P/N4 34Y, and T256N/A378V/S383N/N434Y ; and
c) 하나 이상의 면역 이펙터 기능을 증가시키거나 강화하기 위한 변형(들)로서,c) modification(s) to increase or enhance one or more immune effector functions,
면역 이펙터 기능(들)은 CDC, ADCC 및 ADCP 중 하나 이상 중에서 선택되며; 그리고the immune effector function(s) is selected from one or more of CDC, ADCC and ADCP; and
면역 이펙터 기능을 증가시키거나 강화하기 위해 하기 중 하나 이상으로부터 선택되는 변형(들):Modification(s) selected from one or more of the following to increase or enhance immune effector function:
IgG1에서: 제1 중쇄에서 S239D, I332E, S239D/I332E, S239D/A330L/I332E, S298A/E333A/K334A; F243L/R292P/Y300L/V305I/P396L; L235V/F243L/R292P/Y300L/P396L; F243L/R292P/Y300L; L234Y/G236W/S298A 및 제2 중쇄에서 S239D/A330L/I332E; 제1 중쇄에서 L234Y/L235Q/G236W/S239M/H268D/D270E/S298A 및 제2 중쇄에서 D270E/K326D/A330M/K334E; A327Q/P329A; D265A/S267A/H268A/D270A/K326A/S337A; T256A/K290A/S298A/E333A/K334A; G236A; G236A/I332E; G236A/S239D/I332E; G236A/S239D/A330L/I332E; 잔기 N297에서 바이안테너리 글리칸의 도입; 잔기 N297; K326W; K326A; E333A; K326A/E333A; K326W/E333S; K326M/E333S; K222W/T223W; K222W/T223W/H224W; D221W/K222W; C220D/D221C; C220D/D221C/K222W/T223W; H268F/S324T; S267E; H268F; S324T; S267E/H268F/S324T; G236A/I332E/S267E/H268F/S324T; E345R; 및 E345R/E430G/S440Y에서 비푸코실화된 글리칸의 도입; EU 넘버링에 의해. In IgG1: S239D, I332E, S239D/I332E, S239D/A330L/I332E, S298A/E333A/K334A in the first heavy chain; F243L/R292P/Y300L/V305I/P396L; L235V/F243L/R292P/Y300L/P396L; F243L/R292P/Y300L; L234Y/G236W/S298A and S239D/A330L/I332E in the second heavy chain; L234Y/L235Q/G236W/S239M/H268D/D270E/S298A in the first heavy chain and D270E/K326D/A330M/K334E in the second heavy chain; A327Q/P329A; D265A/S267A/H268A/D270A/K326A/S337A; T256A/K290A/S298A/E333A/K334A; G236A; G236A/I332E; G236A/S239D/I332E; G236A/S239D/A330L/I332E; introduction of a biantennary glycan at residue N297; residue N297; K326W; K326A; E333A; K326A/E333A; K326W/E333S; K326M/E333S; K222W/T223W; K222W/T223W/H224W; D221W/K222W; C220D/D221C; C220D/D221C/K222W/T223W; H268F/S324T; S267E; H268F; S324T; S267E/H268F/S324T; G236A/I332E/S267E/H268F/S324T; E345R; and introduction of afucosylated glycans at E345R/E430G/S440Y; by EU numbering.
일부 구현예에서, Fc 영역을 포함하는 임의의 작제물 중에서, 작제물은 억제성 Fcγ 수용체(FcγR) FcγRIIb에 대한 결합을 증가시키기 위한 하나 이상의 변형을 포함하는 IgG1 Fc를 포함할 수 있다. 예를 들어, FcγRIIb에 대한 결합을 증가시키는 변형 또는 변형들은 EU 넘버링에 의해 S267E, N297A, L328F, L351S, T366R, L368H, P395K, S267E/L328F 및 L351S/T366R/L368H/P395K 중 하나 이상 중에서 선택된다.In some embodiments, of any construct comprising an Fc region, the construct may comprise an IgG1 Fc comprising one or more modifications to increase binding to the inhibitory Fcγ receptor (FcγR) FcγRIIb. For example, the modification or modifications that increase binding to FcγRIIb are selected from one or more of S267E, N297A, L328F, L351S, T366R, L368H, P395K, S267E/L328F and L351S/T366R/L368H/P395K by EU numbering .
Treg 확장제 작제물인 작제물도 제공된다. 이러한 작제물에는 하기를 포함하는 것들이 포함된다: a) Treg 확장제; b) 링커로서, 작제물의 가요성을 증가시키고/시키거나 작제물의 입체 효과 또는 수용체와의 상호작용을 조절하거나 감소시키고/시키거나 작제물의 수성 매질에서 용해도를 증가시키는 링커; 및 c) 활성 변형제로서, 활성 변형제가 없는 작제물과 비교하여 작제물의 활성 또는 약리학적 특성을 조절하거나 변경하는 모이어티인, 활성 변형제. Treg 확장제는 TNFR2 효능제일 수 있다. 이들 작제물은 TNFR1 억제제를 추가로 포함할 수 있다. 일부 구현예에서, TNFR2 효능제는 TNFR2 선택적 효능제이다.Constructs that are Treg expander constructs are also provided. Such constructs include those containing: a) Treg expanders; b) a linker that increases the flexibility of the construct and/or modulates or reduces the steric effect or interaction of the construct with a receptor and/or increases the solubility of the construct in an aqueous medium; and c) an active modifier, wherein the moiety modulates or alters an activity or pharmacological property of the construct compared to a construct without the active modifier. Treg expanders can be TNFR2 agonists. These constructs may further include a TNFR1 inhibitor. In some embodiments, the TNFR2 agonist is a TNFR2 selective agonist.
하기를 포함하는 TNFR2 효능제 작제물인 본 명세서에 기재된 작제물이 제공된다: a) Treg 효능제; b) 링커로서, 작제물의 가요성을 증가시키고/시키거나 작제물의 입체 효과 또는 수용체와의 상호작용을 조절하거나 감소시키고/시키거나 작제물의 수성 매질에서 용해도를 증가시키는 링커; 및 c) 활성 변형제로서, 활성 변형제가 없는 작제물과 비교하여 작제물의 활성 또는 약리학적 특성을 조절하거나 변경하는 모이어티인, 활성 변형제. TNFR2 효능제 작제물에서, TNFR2 효능제는 TNFR2 선택적 효능제일 수 있다. 작제물은 반감기 연장 모이어티인 활성 변형제와 같은 활성 변형제를 포함할 수 있다. 작제물은 TNFR1을 활성화하거나 길항하지 않고 TNFR2를 선택적으로 활성화하거나 길항하는 TNFR2 효능제 작제물일 수 있다. TNFR2 효능제가 TNFR2 내의 하나 이상의 에피토프에 결합하는 TNFR2 효능제 작제물이 포함된다. 본 명세서에는 인간 TNFR2가 포함된다. 이러한 에피토프는 예를 들어 서열번호: 839-865, 1202 및 1204에 제시된 아미노산의 서열을 포함하거나 그로 구성된 하나 이상의 에피토프 중에서 선택되는, 에피토르를 포함한다.Provided are constructs described herein that are TNFR2 agonist constructs comprising: a) a Treg agonist; b) a linker that increases the flexibility of the construct and/or modulates or reduces the steric effect or interaction of the construct with a receptor and/or increases the solubility of the construct in an aqueous medium; and c) an active modifier, wherein the moiety modulates or alters an activity or pharmacological property of the construct compared to a construct without the active modifier. In a TNFR2 agonist construct, the TNFR2 agonist may be a TNFR2 selective agonist. The construct may include an active modifier, such as an active modifier that is a half-life extending moiety. The construct may be a TNFR2 agonist construct that selectively activates or antagonizes TNFR2 without activating or antagonizing TNFR1. Included are TNFR2 agonist constructs wherein the TNFR2 agonist binds to one or more epitopes within TNFR2. Included herein is human TNFR2. Such epitopes include, for example, epitopes selected from one or more epitopes comprising or consisting of the sequences of amino acids set forth in SEQ ID NOs: 839-865, 1202 and 1204.
TNFR2 효능제 작제물이 제공되고, TNFR2 효능제는 효능제 인간 항-TNFR2 항체 또는 인간화 항-TNFR2 항체의 항원 결합 단편, 또는 그의 항원 결합 부분, 또는 그의 단쇄 형태를 포함한다. 이러한 항체의 예는 MR2-1(또한 ab8161로 지정됨; 미국 특허 제9,821,010호) 또는 MAB2261(미국 특허 제9,821,010호)로부터 선택되는 효능제 항-TNFR2 항체이다. TNFR2 효능제는 dAb, scFv 또는 Fab 단편으로부터 선택되는 항원 결합 단편일 수 있다. 일부 구현예에서, TNFR2 효능제는 TNFR2 선택적 효능제이다. 선택적 효능제는 TNFR2 효능제 TNF 뮤테인을 포함할 수 있다. 예시적인 TNFR2 선택적 효능제 뮤테인은 모두 서열번호:2와 관련하여 K65W, D143Y, D143F, D143N, D143E, D143W, D143V, A145R, A145H, A145K, A145F, A145W, E146Q, E146H, E146K, E146N, D143N/A145R, A145R/S147T, Q88N/T89S/A145S/E146A/S147D, Q88N/A145I/E146G/S147D, A145H/E146S/S147D, A145H/S147D, L29V/A145D/E146D/S147D, A145N/E146D/S147D, A145T/E146S/S147D, A145Q/E146D/S147D, A145T/E146D/S147D, A145D/E146G/S147D, A145D/S147D, A145K/E146D/S147T, A145R/E146T/S147D, A145R/S147T, E146D/S147D, D143V/F144L/A145S, S95C/G148C, 및 D143V/A145S, 및 이전 항목의 조합 중에서 선택된 하나 이상의 TNFR2 선택적 돌연변이를 포함하는 가용성 TNF 변이체를 포함하지만 이에 제한되지 않는다. 예를 들어 TNFR2 효능제는 돌연변이 D143N/A145R을 포함하는 TNF 뮤테인이다.A TNFR2 agonist construct is provided, wherein the TNFR2 agonist comprises an agonist human anti-TNFR2 antibody or an antigen-binding fragment of a humanized anti-TNFR2 antibody, or an antigen-binding portion thereof, or a single chain form thereof. An example of such an antibody is an agonist anti-TNFR2 antibody selected from MR2-1 (also designated ab8161; US Pat. No. 9,821,010) or MAB2261 (US Pat. No. 9,821,010). The TNFR2 agonist can be an antigen binding fragment selected from dAb, scFv or Fab fragments. In some embodiments, the TNFR2 agonist is a TNFR2 selective agonist. Selective agonists can include TNFR2 agonist TNF muteins. Exemplary TNFR2 selective effective mutations are all K65W, D143Y, D143F, D143N, D143E, D143W, D143V, A145R, A145H, A145K, A145F, A145W, E146H, E146N, E146N D143N /A145R, A145R/S147T, Q88N/T89S/A145S/E146A/S147D, Q88N/A145I/E146G/S147D, A145H/E146S/S147D, A145H/S147D, L29V/A145D/E146D/S147D , A145N/E146D/S147D, A145T /E146S/S147D, A145Q/E146D/S147D, A145T/E146D/S147D, A145D/E146G/S147D, A145D/S147D, A145K/E146D/S147T, A145R/E146T/S147D, A145R/S 147T, E146D/S147D, D143V/F144L /A145S, S95C/G148C, and D143V/A145S, and soluble TNF variants comprising one or more TNFR2 selective mutations selected from combinations of the foregoing. For example, a TNFR2 agonist is a TNF mutein comprising the mutations D143N/A145R.
TNFR2 효능제 작제물에서, 링커는 링커로서 사용하기 위해 본 명세서에 기재되거나 당업자에게 공지된 임의의 것을 포함한다. 예시적인 링커는 서열번호: 26의 잔기 219-233에 상응하는 트라스투주맙의 힌지 서열의 전부 또는 일부를 포함하거나, 서열번호: 29의 잔기 212-223에 상응하는 니볼루맙의 힌지 서열의 전부 또는 일부, 또는 이와 적어도 95% 서열 동일성을 갖는 서열을 포함한다. 다른 예시적인 링커는 서열번호: 31의 잔기 217-222에 상응하는 서열 SCDKTH를 포함하거나 이로 구성된다. 링커는 글리신-세린(GS) 링커, 예컨대 (GlySer)n (여기서 n= 1-10); (GlySer2); (Gly4Ser)n(여기서 n= 1-10); (Gly3Ser)n(여기서 n= 1-5); (SerGly4)n(여기서 n= 1-5); (GlySerSerGly)n(여기서 n= 1-5); GSGGSSGG; GSSSGSGSGSSG; GSSSGSGSGSSGG; GGSSGG; GGSSGGSGGSSSG; GSSSGSGSGGSSSGSGSG; GGSSGGSSGGGSSGGSSG; 및 GSSSGS 중에서 선택되는 GS 링커로 제한되지 않는 것일 수 있다. 링커는 예를 들어, GS 링커 및 서열번호: 26의 잔기 219-233에 상응하는 트라스투주맙의 힌지 서열의 전부 또는 일부, 또는 GS 링커 및 서열번호: 31의 잔기 217-222에 해당하는 서열 SCDKTH, 또는 GS 링커 및 서열번호: 29의 잔기 212-223에 상응하는 니볼루맙의 힌지 서열의 전부 또는 일부를 포함하는 링커와 같은 링커의 조합을 포함할 수 있다.In TNFR2 agonist constructs, the linker includes any described herein or known to those skilled in the art for use as a linker. Exemplary linkers include all or part of the hinge sequence of trastuzumab corresponding to residues 219-233 of SEQ ID NO: 26, or all or part of the hinge sequence of nivolumab corresponding to residues 212-223 of SEQ ID NO: 29 part, or sequences with at least 95% sequence identity thereto. Another exemplary linker comprises or consists of the sequence SCDKTH corresponding to residues 217-222 of SEQ ID NO:31. Linkers include glycine-serine (GS) linkers such as (GlySer) n where n=1-10; (GlySer 2 ); (Gly 4 Ser) n (where n=1-10); (Gly 3 Ser) n (where n= 1-5); (SerGly 4 ) n (where n=1-5); (GlySerSerGly) n (where n= 1-5); GSGGSSGG; GSSSGSGSGSSG; GSSSGSGSGSSGG; GGSSGG; GGSSGGSGGSSSG; GSSSGSGSGGSSSGSGSG; GGSSGGSSGGGSSGGSSG; And it may be not limited to a GS linker selected from GSSSGS. The linker may be, for example, all or part of the hinge sequence of trastuzumab corresponding to the GS linker and residues 219-233 of SEQ ID NO: 26, or the GS linker and the sequence corresponding to residues 217-222 of SEQ ID NO: 31 SCDKTH , or a combination of linkers, such as a GS linker and a linker comprising all or part of the hinge sequence of nivolumab corresponding to residues 212-223 of SEQ ID NO: 29.
본 명세서에 제공되는 모든 작제물은 작제물의 특성 또는 활성을 변경하거나 조절하는 활성 변형제를 포함할 수 있다. 예를 들어, 반감기 연장 모이어티는 활동 또는 특성 개질제이다. 상기 및 또한 하기에서 논의되는 것과 같은 것의 예는 IgG Fc, 폴리에틸렌 글리콜 (PEG) 분자, 및 인간 혈청 알부민 (HSA), 또는 그의 변이체의 부분 또는 유도체이다. 예를 들어, 일부에서 IgG Fc는 IgG1 또는 IgG4 Fc이다. IgG1 Fc의 예는 서열번호: 27에 제시된 트라스투주맙의 Fc이고; IgG4 Fc의 Fc는 서열번호: 30, 인간 버전에 제시된 니볼루맙의 Fc이고, 여기서 IgG1 Fc는 서열번호: 10에 제시된 인간 IgG1의 Fc이고, 그리고 IgG4 Fc는 서열번호: 16에 제시된 인간 IgG4의 Fc이다.Any construct provided herein may contain active modifiers that alter or modulate the properties or activity of the construct. For example, half-life extending moieties are activity or property modifiers. Examples of those discussed above and also below are portions or derivatives of IgG Fc, polyethylene glycol (PEG) molecules, and human serum albumin (HSA), or variants thereof. For example, in some cases the IgG Fc is an IgG1 or IgG4 Fc. An example of an IgG1 Fc is the Fc of Trastuzumab set forth in SEQ ID NO: 27; The Fc of IgG4 Fc is the Fc of nivolumab as set forth in SEQ ID NO: 30, human version, wherein the IgG1 Fc is the Fc of human IgG1 as set forth in SEQ ID NO: 10, and the IgG4 Fc is the Fc of human IgG4 as set forth in SEQ ID NO: 16 am.
TNFR2 효능제 작제물의 일부 구현예에서, TNFR2 효능제는 1가이고; 다른 경우에는 2가 또는 3가와 같은 다가이다. TNFR2 작제물은 본 명세서에 기재된 바와 같은 링커를 함유할 수 있다. 예를 들어, 링커는 Gly-Ser, 예컨대 (Gly4Ser)3, 또는 (Gly4Ser)3 및 SCDKTH (서열번호:31의 잔기 217-222), 또는 (Gly4Ser)3 및 서열번호: 26의 잔기 219-233에 상응하는 트라스투주맙의 힌지 서열, 또는 (Gly4Ser)3 및 서열번호: 29의 잔기 212-223에 상응하는 니볼루맙의 힌지 서열, 또는 그와 적어도 95% 서열 동일성을 갖는 전술한 것 중 임의의 것의 변이체를 포함할 수 있다. 이들 작제물은 또한 활성 변형제, 예를 들어 전술한 바와 같은 PEG 또는 HSA와 같은 반감기 연장 모이어티인 개질제를 포함할 수 있다. PEG 모이어티는 적어도 20 kDa, 전형적으로 적어도 30 kDa 이상의 크기를 갖는다 (상기 및 하기 기재된 바와 같음). In some embodiments of the TNFR2 agonist construct, the TNFR2 agonist is monovalent; In other cases it is polyvalent, such as divalent or trivalent. TNFR2 constructs may contain linkers as described herein. For example, the linker may be a Gly-Ser, such as (Gly 4 Ser) 3 , or (Gly 4 Ser) 3 and SCDKTH (residues 217-222 of SEQ ID NO:31), or (Gly 4 Ser) 3 and SEQ ID NO: the hinge sequence of Trastuzumab corresponding to residues 219-233 of 26, or the hinge sequence of Nivolumab corresponding to (Gly 4 Ser) 3 and residues 212-223 of SEQ ID NO: 29, or at least 95% sequence identity thereto It may include variants of any of the foregoing with These constructs may also contain an active modifier, for example a modifier that is a half-life extending moiety such as PEG or HSA as described above. The PEG moiety has a size of at least 20 kDa, typically at least 30 kDa or greater (as described above and below).
또한 하기를 포함하는 TNFR2 효능제 작제물이 제공된다:Also provided are TNFR2 agonist constructs comprising:
a) 서열번호: 839-865, 1202 및 1204에 제시된 에피토프 중에서 선택되는 인간 TNFR2 내의 하나 이상의 에피토프에 결합하는 TNFR2 효능제;a) a TNFR2 agonist that binds to one or more epitopes in human TNFR2 selected from among the epitopes set forth in SEQ ID NOs: 839-865, 1202 and 1204;
b) (GlySer)n (여기서 n= 1-10); (GlySer2); (Gly4Ser)n(여기서 n= 1-10); (Gly3Ser)n(여기서 n= 1-5); (SerGly4)n(여기서 n= 1-5); (GlySerSerGly)n(여기서 n= 1-5); GSGGSSGG; GSSSGSGSGSSG; GSSSGSGSGSSGG; GGSSGG; GGSSGGSGGSSSG; GSSSGSGSGGSSSGSGSG; GGSSGGSSGGGSSGGSSG; 및 GSSSGS 중에서 선택되는 GS 링커; 및b) (GlySer) n (where n=1-10); (GlySer 2 ); (Gly 4 Ser) n (where n=1-10); (Gly 3 Ser) n (where n= 1-5); (SerGly 4 ) n (where n=1-5); (GlySerSerGly) n (where n= 1-5); GSGGSSGG; GSSSGSGSGSSG; GSSSGSGSGSSGG; GGSSGG; GGSSGGSGGSSSG; GSSSGSGSGGSSSGSGSG; GGSSGGSSGGGSSGGSSG; and a GS linker selected from GSSSGS; and
c) IgG Fc인 반감기 연장 모이어티인 활성 변형제. c) an activity modifier that is a half-life extending moiety that is an IgG Fc.
상기와 같이, 예시적인 구현예에서, GS 링커는 (GGGGS)3일 수 있고; IgG Fc는 트라스투주맙의 Fc 또는 니볼루맙의 Fc이다.As above, in an exemplary embodiment, the GS linker can be (GGGGS) 3 ; IgG Fc is the Fc of Trastuzumab or the Fc of Nivolumab.
다른 TNFR2 효능제 작제물은 하기를 포함한다:Other TNFR2 agonist constructs include:
a) 서열번호: 839-865, 1202 및 1204에 제시된 에피토프 중에서 선택되는 인간 TNFR2 내의 하나 이상의 에피토프에 결합하는 TNFR2 효능제;a) a TNFR2 agonist that binds to one or more epitopes in human TNFR2 selected from among the epitopes set forth in SEQ ID NOs: 839-865, 1202 and 1204;
b) 트라스투주맙의 힌지 서열의 전부 또는 일부 및 니볼루맙의 힌지 서열의 전부 또는 일부 중에서 선택되는 링커; 및b) a linker selected from all or part of the hinge sequence of Trastuzumab and all or part of the hinge sequence of Nivolumab; and
c) IgG Fc인 반감기 연장 모이어티인 활성 변형제. 링커 및 활성 변형제의 예는 트라스투주맙의 힌지 서열이고; IgG Fc는 트라스투주맙의 Fc, 또는 니볼루맙의 힌지 서열의 전부 또는 일부이며; IgG Fc는 니볼루맙의 Fc이다.c) an activity modifier that is a half-life extending moiety that is an IgG Fc. Examples of linkers and active modifiers are the hinge sequences of trastuzumab; IgG Fc is all or part of the Fc of Trastuzumab, or the hinge sequence of Nivolumab; IgG Fc is the Fc of nivolumab.
다른 구현예에서, TNFR2 작제물은 하기를 포함한다:In another embodiment, the TNFR2 construct comprises:
a) 서열번호: 839-865, 1202 및 1204에 제시된 에피토프 중에서 선택되는 인간 TNFR2 내의 하나 이상의 에피토프에 결합하는 TNFR2 효능제;a) a TNFR2 agonist that binds to one or more epitopes in human TNFR2 selected from among the epitopes set forth in SEQ ID NOs: 839-865, 1202 and 1204;
b) (GlySer)n (여기서 n= 1-10); (GlySer2); (Gly4Ser)n(여기서 n= 1-10); (Gly3Ser)n(여기서 n= 1-5); (SerGly4)n(여기서 n= 1-5); (GlySerSerGly)n(여기서 n= 1-5); GSGGSSGG; GSSSGSGSGSSG; GSSSGSGSGSSGG; GGSSGG; GGSSGGSGGSSSG; GSSGSGSGGSSSGSGSG; GGSSGGSSGGGSSGGSSG; 및 GSSSGS 중에서 선택되는 GS 링커인 제1 링커;b) (GlySer) n (where n=1-10); (GlySer 2 ); (Gly 4 Ser) n (where n=1-10); (Gly 3 Ser) n (where n= 1-5); (SerGly 4 ) n (where n=1-5); (GlySerSerGly) n (where n= 1-5); GSGGSSGG; GSSSGSGSGSSG; GSSSGSGSGSSGG; GGSSGG; GGSSGGSGGSSSG; GSSGSGSGGSSSGSGSG; GGSSGGSSGGGSSGGSSG; And a first linker that is a GS linker selected from GSSSGS;
c) 트라스투주맙의 힌지 서열의 전부 또는 일부 및 니볼루맙의 힌지 서열의 전부 또는 일부 중에서 선택되는 제2 링커; 및c) a second linker selected from all or part of the hinge sequence of Trastuzumab and all or part of the hinge sequence of Nivolumab; and
d) IgG Fc인 반감기 연장 모이어티인 활성 변형제. 이러한 작제물의 예시는 제1 GS 링커는 (GGGGS)3이고, 제2 링커는 서열 SCDKTH(서열 번호 31의 잔기 217-222)를 포함하는 것이고; IgG Fc는 트라스투주맙의 Fc이다. 다른 구현예에서, 제1 링커는 (GGGGS)3이고; 제2 링커는 니볼루맙의 힌지 서열의 전부 또는 일부를 포함하고; IgG Fc는 니볼루맙의 Fc이다.d) an activity modifier that is a half-life extending moiety that is an IgG Fc. An example of such a construct is one in which the first GS linker is (GGGGS)3 and the second linker comprises the sequence SCDKTH (residues 217-222 of SEQ ID NO: 31); IgG Fc is the Fc of Trastuzumab. In another embodiment, the first linker is (GGGGS) 3 ; the second linker comprises all or part of the hinge sequence of nivolumab; IgG Fc is the Fc of nivolumab.
일부 구현예에서, 작제물은 하기를 포함하는 TNFR2 효능제 작제물이다:In some embodiments, the construct is a TNFR2 agonist construct comprising:
a) MR2-1 또는 MAB2261로부터 선택된 효능제 인간 항-TNFR2 항체의 항원 결합 단편을 포함하는 TNFR2 효능제;a) a TNFR2 agonist comprising an antigen-binding fragment of an agonist human anti-TNFR2 antibody selected from MR2-1 or MAB2261;
b) 하기를 포함하는 링커:b) a linker comprising:
i) (GlySer)n (여기서 n= 1-10); (GlySer2); (Gly4Ser)n(여기서 n= 1-10); (Gly3Ser)n(여기서 n= 1-5); (SerGly4)n(여기서 n= 1-5); (GlySerSerGly)n(여기서 n= 1-5); GSGGSSGG; GSSSGSGSGSSG; GSSSGSGSGSSGG; GGSSGG; GGSSGGSGGSSSG; GSSSGSGSGGSSSGSGSG; GGSSGGSSGGGSSGGSSG; 및 GSSSGS 중에서 선택되는 GS 링커; 및/또는i) (GlySer) n (where n = 1-10); (GlySer 2 ); (Gly 4 Ser) n (where n=1-10); (Gly 3 Ser) n (where n= 1-5); (SerGly 4 ) n (where n=1-5); (GlySerSerGly) n (where n= 1-5); GSGGSSGG; GSSSGSGSGSSG; GSSSGSGSGSSGG; GGSSGG; GGSSGGSGGSSSG; GSSSGSGSGGSSSGSGSG; GGSSGGSSGGGSSGGSSG; and a GS linker selected from GSSSGS; and/or
ii) 트라스투주맙의 힌지 서열의 전부 또는 일부 또는 니볼루맙의 힌지 서열의 전부 또는 일부; 및ii) all or part of the hinge sequence of trastuzumab or all or part of the hinge sequence of nivolumab; and
c) IgG1 또는 IgG4 Fc, PEG 분자 및 인간 혈청 알부민(HSA) 중에서 선택되는 반감기 연장 모이어티인 활성 변형제로서,c) an active modifier which is a half-life extending moiety selected from an IgG1 or IgG4 Fc, a PEG molecule and human serum albumin (HSA);
IgG1 Fc는 서열번호: 10에 제시된 인간 IgG1의 Fc이거나 서열번호: 27에 제시된 트라스투주맙의 Fc이고; 그리고IgG1 Fc is the Fc of human IgG1 as shown in SEQ ID NO: 10 or the Fc of Trastuzumab as shown in SEQ ID NO: 27; and
PEG 분자는 적어도 또는 적어도 약 30 kDa의 분자량을 갖는, 활성 변형제. wherein the PEG molecule has a molecular weight of at least or at least about 30 kDa.
일부 구현예에서, 작제물은 하기를 포함하는 TNFR2 효능제 작제물이다:In some embodiments, the construct is a TNFR2 agonist construct comprising:
a) 서열번호: 2와 관련하여 K65W, D143Y, D143F, D143N, D143E, D143W, D143V, A145R, A145H, A145K, A145F, A145W, E146Q, E146H, E146K, E146N, D143N/A145R, A145R/S147T, Q88N/T89S/A145S/E146A/S147D, Q88N/A145I/E146G/S147D, A145H/E146S/S147D, A145H/S147D, L29V/A145D/E146D/S147D, A145N/E146D/S147D, A145T/E146S/S147D, A145Q/E146D/S147D, A145T/E146D/S147D, A145D/E146G/S147D, A145D/S147D, A145K/E146D/S147T, A145R/E146T/S147D, A145R/S147T, E146D/S147D, D143V/F144L/A145S, S95C/G148C, 및 D143V/A145S 중에서 선택된 하나 이상의 TNFR2 선택적 돌연변이를 포함하는 가용성 TNF 변이체인 TNFR2 선택적 TNF 뮤테인;a) K65W, D143Y, D143F, D143N, D143E, D143W, D143V, A145R, A145H, A145K, A145F, A145W, E146Q, E146H, E146K, E146N, D143N/A145R, A145R with reference to SEQ ID NO: 2 /S147T, Q88N /T89S/A145S/E146A/S147D, Q88N/A145I/E146G/S147D, A145H/E146S/S147D, A145H/S147D, L29V/A145D/E146D/S147D, A145N/E146D/S147D, A145 T/E146S/S147D, A145Q/E146D /S147D, A145T/E146D/S147D, A145D/E146G/S147D, A145D/S147D, A145K/E146D/S147T, A145R/E146T/S147D, A145R/S147T, E146D/S147D, D143V/F 144L/A145S, S95C/G148C, and a TNFR2 selective TNF mutein, which is a soluble TNF variant comprising one or more TNFR2 selective mutations selected from D143V/A145S;
b) 하기를 포함하는 링커:b) a linker comprising:
i) (GlySer)n (여기서 n= 1-10); (GlySer2); (Gly4Ser)n(여기서 n= 1-10); (Gly3Ser)n(여기서 n= 1-5); (SerGly4)n(여기서 n= 1-5); (GlySerSerGly)n(여기서 n= 1-5); GSGGSSGG; GSSSGSGSGSSG; GSSSGSGSGSSGG; GGSSGG; GGSSGGSGGSSSG; GSSSGSGSGGSSSGSGSG; GGSSGGSSGGGSSGGSSG; 및 GSSSGS 중에서 선택되는 GS 링커; 및/또는i) (GlySer) n (where n = 1-10); (GlySer 2 ); (Gly 4 Ser) n (where n=1-10); (Gly 3 Ser) n (where n= 1-5); (SerGly 4 ) n (where n=1-5); (GlySerSerGly) n (where n= 1-5); GSGGSSGG; GSSSGSGSGSSG; GSSSGSGSGSSGG; GGSSGG; GGSSGGSGGSSSG; GSSSGSGSGGSSSGSGSG; GGSSGGSSGGGSSGGSSG; and a GS linker selected from GSSSGS; and/or
ii) 트라스투주맙의 힌지 서열의 전부 또는 일부 또는 니볼루맙의 힌지 서열의 전부 또는 일부; 및ii) all or part of the hinge sequence of trastuzumab or all or part of the hinge sequence of nivolumab; and
c) IgG1 또는 IgG4 Fc, PEG 분자 및 인간 혈청 알부민(HSA) 중에서 선택되는 반감기 연장 모이어티인 활성 변형제로서,c) an active modifier which is a half-life extending moiety selected from an IgG1 or IgG4 Fc, a PEG molecule and human serum albumin (HSA);
IgG1 Fc는 서열번호: 10에 제시된 인간 IgG1의 Fc이거나 서열번호: 27에 제시된 트라스투주맙의 Fc이고; 그리고IgG1 Fc is the Fc of human IgG1 as shown in SEQ ID NO: 10 or the Fc of Trastuzumab as shown in SEQ ID NO: 27; and
PEG 분자는 적어도 또는 적어도 약 30 kDa의 분자량을 갖는다. The PEG molecule has a molecular weight of at least or at least about 30 kDa.
일부 구현예에서, 작제물은 하기를 포함하는 TNFR2 효능제 작제물이다:In some embodiments, the construct is a TNFR2 agonist construct comprising:
a) 돌연변이 D143N/A145R을 포함하는 TNFR2 TNF 뮤테인;a) a TNFR2 TNF mutein comprising the mutations D143N/A145R;
b) (GGGGS)3 링커; 및b) (GGGGS) 3 linker; and
c) 트라스투주맙의 Fc 또는 니볼루맙의 Fc인 반감기 연장 모이어티인 활성 변형제.c) an active modifier that is a half-life extending moiety that is the Fc of Trastuzumab or the Fc of Nivolumab.
일부 구현예에서, 작제물은 하기를 포함하는 TNFR2 효능제 작제물이다:In some embodiments, the construct is a TNFR2 agonist construct comprising:
a) 돌연변이 D143N/A145R을 포함하는 TNFR2 TNF 선택적 뮤테인;a) a TNFR2 TNF selective mutein comprising the mutations D143N/A145R;
b) (GGGGS)3 링커 및 서열 SCDKTH(서열번호: 31의 잔기 217-222)를 포함하는 제2 링커; 및b) a second linker comprising the (GGGGS) 3 linker and the sequence SCDKTH (residues 217-222 of SEQ ID NO: 31); and
c) 트라스투주맙의 Fc인 반감기 연장 모이어티인 활성 변형제.c) an active modifier that is the Fc half-life extending moiety of Trastuzumab.
일부 구현예에서, 작제물은 하기를 포함하는 TNFR2 효능제 작제물이다:In some embodiments, the construct is a TNFR2 agonist construct comprising:
a) 돌연변이 D143N/A145R을 포함하는 TNFR2 TNF 선택적 뮤테인;a) a TNFR2 TNF selective mutein comprising the mutations D143N/A145R;
b) (GGGGS)3 링커 및 니볼루맙의 힌지 서열의 전부 또는 일부를 포함하는 제2 링커; 및b) a (GGGGS) 3 linker and a second linker comprising all or part of the hinge sequence of nivolumab; and
c) 니볼루맙의 Fc인 반감기 연장 모이어티인 활성 변형제.c) an active modifier that is a half-life extending moiety that is the Fc of nivolumab.
일부 구현예에서, 작제물은 하기를 포함하는 TNFR2 효능제 작제물이다:In some embodiments, the construct is a TNFR2 agonist construct comprising:
a) 돌연변이 D143N/A145R을 포함하는 TNFR2 TNF 선택적 뮤테인;a) a TNFR2 TNF selective mutein comprising the mutations D143N/A145R;
b) 서열번호: 26의 잔기 219-233에 상응하는 트라스투주맙의 힌지 서열의 전부 또는 일부를 포함하는 링커; 및b) a linker comprising all or part of the hinge sequence of Trastuzumab corresponding to residues 219-233 of SEQ ID NO:26; and
c) 트라스투주맙의 Fc인 반감기 연장 모이어티.c) a half-life extending moiety that is the Fc of Trastuzumab.
일부 구현예에서, 작제물은 하기를 포함하는 TNFR2 효능제 작제물이다:In some embodiments, the construct is a TNFR2 agonist construct comprising:
a) 돌연변이 D143N/A145R을 포함하는 TNFR2 TNF 선택적 뮤테인;a) a TNFR2 TNF selective mutein comprising the mutations D143N/A145R;
b) 서열번호: 29의 잔기 212-223에 상응하는 니볼루맙의 힌지 서열의 전부 또는 일부를 포함하는 링커; 및b) a linker comprising all or part of the hinge sequence of nivolumab corresponding to residues 212-223 of SEQ ID NO:29; and
c) 니볼루맙의 Fc인 반감기 연장 모이어티인 활성 변형제.c) an active modifier that is a half-life extending moiety that is the Fc of nivolumab.
TNFR1 길항제 작제물, TNFR2 효능제 작제물, 및 IgG Fc가 단량체 또는 이량체인 둘 모두가 제공된다. 본 명세서에 제공되는 작제물은 dAb(또는 Vhh)를 포함할 수 있다. 작제물은 dAb를 함유하는 Vhh 단쇄 또는 이중 사슬을 포함할 수 있다. 이러한 작제물은 dAb에 직접 또는 링커를 통해 연결된 HSA를 함유할 수 있다. 이들 HSA 및 dAb는 HSA의 N-말단에 직접적으로 또는 상기 임의의 링커를 통해 연결되는 dAb의 C-말단과 같이 임의의 순서로 연결될 수 있다. 이러한 작제물의 예시는 하기를 포함하는 것들이다: A TNFR1 antagonist construct, a TNFR2 agonist construct, and an IgG Fc are both monomeric or dimer are provided. Constructs provided herein may include dAb (or Vhh). The constructs may include single or double chain Vhh containing dAbs. Such constructs may contain HSA linked to the dAb either directly or through a linker. These HSAs and dAbs can be linked in any order, such as the C-terminus of the dAb linked directly to the N-terminus of the HSA or via any of the linkers above. Examples of such constructs are those including:
a) 서열번호: 1475에 제시된 HSA에 링커를 통해 연결된 서열번호: 59의 dAb Dom1h-131-206인 잔기 20-732를 포함하거나, 서열번호: 1475의 작제물 또는 서열번호: 1475의 잔기 20-732에 대해 적어도 95%, 96%, 97%, 98%, 99% 서열 동일성을 갖고 TNFR1 길항제 활성을 갖는 작제물. a) dAb Dom1h-131-206 of SEQ ID NO: 59 linked via a linker to the HSA set forth in SEQ ID NO: 1475, comprising residues 20-732, or a construct of SEQ ID NO: 1475 or residues 20-73 of SEQ ID NO: 1475 A construct having at least 95%, 96%, 97%, 98%, 99% sequence identity to 732 and having TNFR1 antagonist activity.
b) 서열번호: 53-83 및 503-671 중 어느 하나에 제시된 dAb, 및 그와 적어도 95%, 96%, 97%, 98%, 99% 서열 동일성을 갖는 그의 변이체, 여기서 작제물은 TNFR1 길항제 활성을 가짐; 또는 b) the dAb set forth in any one of SEQ ID NOs: 53-83 and 503-671, and variants thereof having at least 95%, 96%, 97%, 98%, 99% sequence identity therewith, wherein the construct is a TNFR1 antagonist have activity; or
c) 서열번호: 57-59 중 어느 하나에 제시된 서열을 갖고, 그의 변이체는 그와 적어도 95% 서열 동일성을 갖고, 이에 의해 작제물은 TNFR1 길항제 활성을 갖는, dAb; 또는c) a dAb having the sequence set forth in any one of SEQ ID NOs: 57-59, variants thereof having at least 95% sequence identity therewith, whereby the construct has TNFR1 antagonist activity; or
d) dAb는 서열번호: 59의 DOM1h-131-206으로 지정되고 그와 적어도 95%, 96%, 97%, 98%, 99% 서열 동일성을 갖고 TNFR1 길항제 활성을 갖는 그의 변이체; 또는d) the dAb is designated as DOM1h-131-206 of SEQ ID NO: 59 and has at least 95%, 96%, 97%, 98%, 99% sequence identity therewith and a variant thereof having TNFR1 antagonist activity; or
e) a)-d) 중 임의의 조합; 또는e) any combination of a)-d); or
f) a) 내지 f) 중 임의의 것의 인간화 서열 또는 인간에게 투여하기 위한 작제물의 충분한 부분이 인간화되는 경우, 충분한 부분은 인간에게 투여될 때 작제물에 대한 임의의 면역 반응을 제거하거나 감소시키기에 충분하다.f) where a sufficient portion of the humanized sequence of any of a) to f) or construct for administration to a human is humanized, the sufficient portion is sufficient to eliminate or reduce any immune response to the construct when administered to a human. enough for
TNFR1 작제물인 본 명세서에 제공된 작제물은 TNFR2 효능제를 추가로 포함할 수 있거나 작제물은 TNFR2 효능제 작제물일 수 있다. TNFR2 효능제를 포함하는 작제물에서, TNFR2 효능제는 예를 들어 인간 대상체에 투여하기 위해 치료될 대상체에서 면역원성인 아미노산 또는 에피토프의 서열을 제거하도록 변형될 수 있다. TNFR2 효능제를 함유하는 작제물에서 이는 TNFR2 선택적 효능제일 수 있다. 이들 작제물은 변형된 IgG Fc를 포함할 수 있다. 예를 들어, IgG Fc는 하기 변형 중 하나 이상을 포함할 수 있다:A construct provided herein that is a TNFR1 construct may further comprise a TNFR2 agonist or the construct may be a TNFR2 agonist construct. In a construct comprising a TNFR2 agonist, the TNFR2 agonist can be modified to remove sequences of amino acids or epitopes that are immunogenic in the subject to be treated, for example for administration to a human subject. In constructs containing a TNFR2 agonist it may be a TNFR2 selective agonist. These constructs may include modified IgG Fc. For example, an IgG Fc can include one or more of the following modifications:
a) 놉-인투-홀을 도입하기 위한 변형(들);a) deformation(s) to introduce a knob-into-hole;
b) 신생아 Fc 수용체(FcRn) 재순환을 증가시키거나 강화하기 위한 변형(들); 및b) modification(s) to increase or enhance neonatal Fc receptor (FcRn) recycling; and
c) 보체 의존적 세포독성 (CDC), 항체 의존적 세포 매개 세포독성 (ADCC) 및 항체 의존적 세포 매개 식균작용 (ADCP) 중 하나 이상 중에서 선택된, 면역 이펙터 기능을 감소시키거나 제거하기 위한 변형(들). 이러한 변형의 예는 다음과 같다:c) modification(s) to reduce or eliminate an immune effector function selected from one or more of complement dependent cytotoxicity (CDC), antibody dependent cell mediated cytotoxicity (ADCC) and antibody dependent cell mediated phagocytosis (ADCP). Examples of such transformations are:
a) 놉-인투-홀을 도입하기 위한 변형(들)은 하기로부터 선택되고:a) the modification(s) to introduce a knob-into-hole are selected from:
EU 넘버링에 의해 S354C, T366Y, T366W 및 T394W 중에서 선택되는 하나 이상의 놉 돌연변이; 및at least one knob mutation selected from among S354C, T366Y, T366W and T394W by EU numbering; and
EU 넘버링에 의해 Y349C, T366S, L368A, F405A, Y407T, Y407A 및 Y407V 중에서 선택되는 하나 이상의 홀 돌연변이로서, Fc는 이량체를 형성하는, 하나 이상의 홀 돌연변이로서;at least one hole mutation selected from Y349C, T366S, L368A, F405A, Y407T, Y407A and Y407V by EU numbering, wherein Fc forms a dimer;
b) FcRn 재순환을 증가시키거나 강화시키기 위한 변형(들)은 EU 넘버링에 의해 T250Q, T250R, M252F, M252W, M252Y, S254T, T256D, T256E, T256Q, V259I, V308F, E380A, M428L, H433K, N434F, N434A, N434W, N434S, N434Y, Y436H, M252Y/T256Q, M252F/T256D, M252Y/S254T/T256E, H433K/N434F/Y436H, N434F/Y436H, T250Q/M428L, T250R/M428L, M428L/N434S, V259I/V308F, V259I/V308F/M428L, E294del/T307P/N434Y, 및 T256N/A378V/S383N/N434Y 중 하나 이상 중에서 선택되고; 그리고b) the variant(s) to increase or enhance FcRn recycling are, by EU numbering: N434A, N434W, N434S, N434Y, Y436H, M252Y/T256Q, M252F/T256D, M252Y/S254T/T256E, H433K/N434F/Y436H, N434F/Y436H, T250Q/M428L, T250R/M4 28L, M428L/N434S, V259I/V308F, selected from one or more of V259I/V308F/M428L, E294del/T307P/N434Y, and T256N/A378V/S383N/N434Y; and
c) 면역 이펙터 기능을 감소시키거나 제거하기 위한 변형(들)은 하기 중 하나 이상 중으로부터 선택된다:c) the modification(s) to reduce or eliminate immune effector function is selected from one or more of the following:
IgG1에서: EU 넘버링에 의해 L235E, L234A/L235A, L234E/L235F/P331S, L234F/L235E/P331S, L234A/L235A/P329G, L234A/L235A/G237A/P238S/H268A/A330S/P331S, G236R/L328R, G237A, E318A, D265A, E233P, N297A, N297Q, N297D, N297G, N297G/D265A, A330L, D270A, P329A, P331A, K322A, V264A, 및 F241A; 및In IgG1: L235E, L234A/L235A, L234E/L235F/P331S, L234F/L235E/P331S, L234A/L235A/P329G, L234A/L235A/G237A/P238S/H268A/A330S/P331 by EU numbering S, G236R/L328R, G237A , E318A, D265A, E233P, N297A, N297Q, N297D, N297G, N297G/D265A, A330L, D270A, P329A, P331A, K322A, V264A, and F241A; and
IgG4에서: EU 넘버링에 의해 L235E, F234A/L235A, S228P/L235E, 및 S228P/F234A/L235A.In IgG4: L235E, F234A/L235A, S228P/L235E, and S228P/F234A/L235A by EU numbering.
본 명세서에 제공되는 작제물은 변형된 IgG Fc를 포함하는 TNFR2 효능제 작제물을 포함하며, 여기서 IgG Fc는 하기 변형 중 하나 이상을 포함한다:Constructs provided herein include TNFR2 agonist constructs comprising a modified IgG Fc, wherein the IgG Fc comprises one or more of the following modifications:
a) 놉-인투-홀을 도입하기 위한 변형(들); 여기서a) deformation(s) to introduce a knob-into-hole; here
놉 돌연변이는 EU 넘버링에 의해 S354C, T366Y, T366W 및 T394W 중에서 선택되며; 그리고Knob mutations are selected from among S354C, T366Y, T366W and T394W by EU numbering; and
홀 돌연변이는 EU 넘버링에 의해 Y349C, T366S, L368A, F405A, Y407T, Y407A 및 Y407V 중에서 선택되는 변형;Hall mutations are variants selected from among Y349C, T366S, L368A, F405A, Y407T, Y407A and Y407V by EU numbering;
b) 신생아 Fc 수용체(FcRn) 재순환을 증가시키거나 강화하기 위한 변형(들)로서, 하기 중 하나 이상으로부터 선택되는 변형:b) modification(s) to increase or enhance neonatal Fc receptor (FcRn) recycling, selected from one or more of the following:
T250Q, T250R, M252F, M252W, M252Y, S254T, T256D, T256E, T256Q, V259I, V308F, E380A, M428L, H433K, N434F, N434A, N434W, N434S, N434Y, Y436H, M252Y/T256Q, M252F/T256D, M252Y/S254T/T256E, H433K/N434F/Y436H, N434F/Y436H, T250Q/M428L, T250R/M428L, M428L/N434S, V259I/V308F, V259I/V308F/M428L, E294del/T307P/N434Y, 및 T256N/A378V/S383N/N434Y; 및T250Q, T250R, M252F, M252W, M252Y, S254T, T256D, T256E, T256Q, V259I, V308F, E380A, M428L, H433K, N434F, N434A, N434W, N434S, N434Y, Y436H, M2 52Y/T256Q, M252F/T256D, M252Y/ S254T/T256E, H433K/N434F/Y436H, N434F/Y436H, T250Q/M428L, T250R/M428L, M428L/N434S, V259I/V308F, V259I/V308F/M428L, E294del/T307P/N4 34Y, and T256N/A378V/S383N/N434Y ; and
c) 면역 이펙터 기능을 증가시키거나 강화하기 위한 변형(들)로서,c) as modification(s) to increase or enhance immune effector function;
면역 이펙터 기능(들)은 CDC, ADCC 및 ADCP 중 하나 이상 중에서 선택되며; 그리고the immune effector function(s) is selected from one or more of CDC, ADCC and ADCP; and
면역 이펙터 기능을 증가시키거나 강화하기 위한 변형(들)은 하기 중 하나 이상으로부터 선택된다:The modification(s) to increase or enhance immune effector function are selected from one or more of the following:
IgG1에서: 제1 중쇄에서 S239D, I332E, S239D/I332E, S239D/A330L/I332E, S298A/E333A/K334A; F243L/R292P/Y300L/V305I/P396L; L235V/F243L/R292P/Y300L/P396L; F243L/R292P/Y300L; L234Y/G236W/S298A 및 제2 중쇄에서 S239D/A330L/I332E; 제1 중쇄에서 L234Y/L235Q/G236W/S239M/H268D/D270E/S298A 및 제2 중쇄에서 D270E/K326D/A330M/K334E; A327Q/P329A; D265A/S267A/H268A/D270A/K326A/S337A; T256A/K290A/S298A/E333A/K334A; G236A; G236A/I332E; G236A/S239D/I332E; G236A/S239D/A330L/I332E; 잔기 N297에서 바이안테너리 글리칸의 도입; 잔기 N297; K326W; K326A; E333A; K326A/E333A; K326W/E333S; K326M/E333S; K222W/T223W; K222W/T223W/H224W; D221W/K222W; C220D/D221C; C220D/D221C/K222W/T223W; H268F/S324T; S267E; H268F; S324T; S267E/H268F/S324T; G236A/I332E/S267E/H268F/S324T; E345R; 및 E345R/E430G/S440Y에서 비푸코실화된 글리칸의 도입; EU 넘버링에 의해. In IgG1: S239D, I332E, S239D/I332E, S239D/A330L/I332E, S298A/E333A/K334A in the first heavy chain; F243L/R292P/Y300L/V305I/P396L; L235V/F243L/R292P/Y300L/P396L; F243L/R292P/Y300L; L234Y/G236W/S298A and S239D/A330L/I332E in the second heavy chain; L234Y/L235Q/G236W/S239M/H268D/D270E/S298A in the first heavy chain and D270E/K326D/A330M/K334E in the second heavy chain; A327Q/P329A; D265A/S267A/H268A/D270A/K326A/S337A; T256A/K290A/S298A/E333A/K334A; G236A; G236A/I332E; G236A/S239D/I332E; G236A/S239D/A330L/I332E; introduction of a biantennary glycan at residue N297; residue N297; K326W; K326A; E333A; K326A/E333A; K326W/E333S; K326M/E333S; K222W/T223W; K222W/T223W/H224W; D221W/K222W; C220D/D221C; C220D/D221C/K222W/T223W; H268F/S324T; S267E; H268F; S324T; S267E/H268F/S324T; G236A/I332E/S267E/H268F/S324T; E345R; and introduction of afucosylated glycans at E345R/E430G/S440Y; by EU numbering.
TNFR2 효능제 작제물인 본 명세서에 제공되는 작제물은 Fc가 FcγRIIb에 대한 결합을 증가시키는 변형을 포함할 수 있는 억제성 Fcγ 수용체(FcγR) FcγRIIb에 대한 결합을 증가시키기 위해 변형된 경우와 같은 변형된 IgG1 Fc를 포함할 수 있다. 이러한 변형의 예시는 EU 넘버링에 의해 S267E, N297A, L328F, L351S, T366R, L368H, P395K, S267E/L328F 및 L351S/T366R/L368H/P395K 중 하나 이상 중에서 선택되는 것들이다.Constructs provided herein, which are TNFR2 agonist constructs, can include modifications such as when the Fc is modified to increase binding to the inhibitory Fcγ receptor (FcγR) FcγRIIb, which may include modifications that increase binding to FcγRIIb. IgG1 Fc may be included. Examples of such variants are those selected from one or more of S267E, N297A, L328F, L351S, T366R, L368H, P395K, S267E/L328F and L351S/T366R/L368H/P395K by EU numbering.
TNFR1을 활성화시키거나 길항시키지 않으면서 TNFR2를 선택적으로 활성화시키거나 작용시키는 TNFR2 효능제 작제물이거나 이를 포함하는 작제물이 제공된다. 이들 작제물은 a) TNFR2 효능제; b) 하나 이상의 링커; 및 c) 반감기 연장 모이어티인 활성 변형제를 포함하는 것을 포함하고, 여기서:Constructs that are or include TNFR2 agonist constructs that selectively activate or agonize TNFR2 without activating or antagonizing TNFR1 are provided. These constructs are a) TNFR2 agonists; b) one or more linkers; and c) an active modifier that is a half-life extending moiety, wherein:
TNFR2 효능제 작제물은 다량체화 도메인과 융합된 단쇄 TNFR2 선택적 TNF 뮤테인 삼량체를 포함하는 융합 단백질이며, 하기 식을 포함하고:The TNFR2 agonist construct is a fusion protein comprising a single chain TNFR2 selective TNF mutein trimer fused with a multimerization domain, comprising the formula:
MD-L1-TNFmut-L2-TNFmut-L3-TNFmut (식 II); 또는MD-L1-TNFmut-L2-TNFmut-L3-TNFmut (formula II); or
TNFmut-L1-TNFmut-L2-TNFmut-L3-MD (식 III); TNFmut-L1-TNFmut-L2-TNFmut-L3-MD (formula III);
MD는 다량체화 도메인이고 각각은 동일하거나 상이하고; TNFmut은 TNFR2 선택적 TNF 뮤테인이고; 그리고 L1, L2 및 L3은 동일하거나 상이할 수 있는 링커이다. TNF 뮤테인은 서열번호: 2와 관련하여 K65W, D143Y, D143F, D143N, D143E, D143W, D143V, A145R, A145H, A145K, A145F, A145W, E146Q, E146H, E146K, E146N, D143N/A145R, A145R/S147T, Q88N/T89S/A145S/E146A/S147D, Q88N/A145I/E146G/S147D, A145H/E146S/S147D, A145H/S147D, L29V/A145D/E146D/S147D, A145N/E146D/S147D, A145T/E146S/S147D, A145Q/E146D/S147D, A145T/E146D/S147D, A145D/E146G/S147D, A145D/S147D, A145K/E146D/S147T, A145R/E146T/S147D, A145R/S147T, E146D/S147D, D143V/F144L/A145S, S95C/G148C, 및 D143V/A145S, 예를 들어, TNFR2 선택적 돌연변이 D143N/A145R 중에서 선택되는 하나 이상의 TNFR2 선택적 돌연변이를 포함할 수 있다. 이들 작제물에서, 다량체화 도메인은 EHD2 (서열번호: 808), MHD2 (서열번호: 811), 닭 테나스신 C(TNC)의 삼량체화 도메인 (서열번호: 804의 잔기 110-139; 서열번호: 805), 또는 인간 TNC의 삼량체화 도메인 (서열번호: 806의 잔기 110-139, 서열번호: 807), 또는 그와 적어도 95%, 96%, 97%, 98%, 99% 서열 동일성을 갖는 그의 변이체로부터 선택될 수 있다. 예를 들어, 다량체화 도메인은 IgG1 Fc 또는 IgG4 Fc이고 IgG1 Fc 또는 IgG4 Fc는 또한 반감기 연장 모이어티이다. 이들 작제물은 본 명세서에 기재된 임의의 것 및 당업자에게 공지된 임의의 것을 포함하는 링커를 함유한다. 이들 작제물의 예시는 L1, L2 및/또는 L3 링커는 (GGGGS)n (여기서 n = 1-5), 및 TNF (서열번호: 812)의 줄기 영역의 전부 또는 일부 또는 그와 적어도 95%, 96%, 97%, 98%, 99% 서열 동일성을 갖는 그의 변이체 중으로부터 독립적으로 선택된다. 이들 작제물은 TNFR2 효능제와 반감기 연장 모이어티 사이의 링커가 (GlySer)n (여기서 n= 1-10); (GlySer2); (Gly4Ser)n (여기서 n= 1-10); (Gly3Ser)n (여기서 n= 1-5); (SerGly4)n (여기서 n= 1-5); (GlySerSerGly)n (여기서 n= 1-5); GSGGSSGG; GSSSGSGSGSSG; GSSSGSGSGSSGG; GGSSGG; GGSSGGSGGSSSG; GSSSGSGSGGSSSGSGSG; GGSSGGSSGGGSSGGSSG; 및 GSSSGS; 또는 트라스투주맙의 힌지 서열의 전부 또는 일부 및 니볼루맙의 힌지 서열의 전부 또는 일부 중에서 선택된 링커; 또는 이들의 조합 중으로부터 선택된 GS 링커인 것을 포함한다. 반감기 연장 모이어티는 하기 중으로부터 선택될 수 있다: 서열번호: 10에 제시된 인간 IgG1의 Fc, 또는 서열번호: 27에 제시된 트라스투주맙의 Fc인 IgG1 Fc; 인간 IgG4 에 제시된 서열번호: 16의 Fc, 또는 서열번호:30에 제시된 니볼루맙의 Fc인 IgG4 Fc; 크기가 적어도 약 30 kDa인 PEG 분자; 인간 혈청 알부민 (HSA), 및 그와 적어도 95%, 96%, 97%, 98%, 99% 서열 동일성을 갖는 폴리펩티드 부분의 변이체.MD is a multimerization domain, each identical or different; TNFmut is a TNFR2 selective TNF mutein; and L1, L2 and L3 are linkers which may be the same or different. TNF muteins are K65W, D143Y, D143F, D143N, D143E, D143W, D143V, A145R, A145H, A145K, A145F, A145W, E146Q, E146H, E146K, E146N, D143N/A145R, A145R/S147T , Q88N/T89S/A145S/E146A/S147D, Q88N/A145I/E146G/S147D, A145H/E146S/S147D, A145H/S147D, L29V/A145D/E146D/S147D, A145N/E146D/S147 D, A145T/E146S/S147D, A145Q /E146D/S147D, A145T/E146D/S147D, A145D/E146G/S147D, A145D/S147D, A145K/E146D/S147T, A145R/E146T/S147D, A145R/S147T, E146D/S147D, D 143V/F144L/A145S, S95C/G148C , and D143V/A145S, eg, the TNFR2 selective mutations D143N/A145R. In these constructs, the multimerization domains are EHD2 (SEQ ID NO: 808), MHD2 (SEQ ID NO: 811), the trimerization domain of chicken tenascin C (TNC) (residues 110-139 of SEQ ID NO: 804; SEQ ID NO: 804). : 805), or the trimerization domain of human TNC (residues 110-139 of SEQ ID NO: 806, SEQ ID NO: 807), or having at least 95%, 96%, 97%, 98%, 99% sequence identity therewith. variants thereof. For example, the multimerization domain is an IgG1 Fc or IgG4 Fc and the IgG1 Fc or IgG4 Fc is also a half-life extending moiety. These constructs contain linkers, including any described herein and any known to those skilled in the art. Exemplary of these constructs are L1, L2 and/or L3 linkers that are (GGGGS) n (where n = 1-5), and all or part of or at least 95% of the stem region of TNF (SEQ ID NO: 812); independently selected from among variants thereof having 96%, 97%, 98%, 99% sequence identity. These constructs are such that the linker between the TNFR2 agonist and the half-life extending moiety is (GlySer) n (where n=1-10); (GlySer 2 ); (Gly 4 Ser) n (where n=1-10); (Gly 3 Ser) n (where n= 1-5); (SerGly 4 ) n (where n=1-5); (GlySerSerGly) n (where n= 1-5); GSGGSSGG; GSSSGSGSGSSG; GSSSGSGSGSSGG; GGSSGG; GGSSGGSGGSSSG; GSSSGSGSGGSSSGSGSG; GGSSGGSSGGGSSGGSSG; and GSSSGS; or a linker selected from all or part of the hinge sequence of Trastuzumab and all or part of the hinge sequence of Nivolumab; or a GS linker selected from any combination thereof. The half-life extending moiety can be selected from: the IgG1 Fc, which is the Fc of human IgG1 as shown in SEQ ID NO: 10, or the Fc of Trastuzumab as shown in SEQ ID NO: 27; IgG4 Fc, the Fc of SEQ ID NO: 16 as shown in human IgG4, or the Fc of nivolumab as shown in SEQ ID NO: 30; PEG molecules of at least about 30 kDa in size; Human serum albumin (HSA), and variants of a polypeptide portion having at least 95%, 96%, 97%, 98%, 99% sequence identity therewith.
TNFR2 효능제 작제물이거나 이를 포함하는 작제물이 제공된다. 이들 작제물은 하기 식을 포함하는 것들을 포함한다:Constructs that are or include TNFR2 agonist constructs are provided. These constructs include those comprising the formula:
MD-L1-TNFmut-L2-TNFmut-L3-TNFmut (식 II); 또는MD-L1-TNFmut-L2-TNFmut-L3-TNFmut (formula II); or
TNFmut-L1-TNFmut-L2-TNFmut-L3-MD (식 III), 여기서TNFmut-L1-TNFmut-L2-TNFmut-L3-MD (Equation III), where
a) MD는 다량체화 도메인이고; TNFmut은 TNFR2 선택적 TNF 뮤테인이고; 그리고 L1, L2 및 L3은 동일하거나 상이한 링커이고, 여기서a) MD is the multimerization domain; TNFmut is a TNFR2 selective TNF mutein; and L1, L2 and L3 are the same or different linkers, wherein
i) MD는 EHD2 (서열번호: 808), MHD2 (서열번호: 811), 닭 테나스신 C(TNC)의 삼량체화 도메인 (서열번호: 804의 잔기 110-139; 서열번호: 805), 또는 인간 TNC의 삼량체화 도메인 (서열번호: 806의 잔기 110-139, 서열번호: 807)로부터 선택되고;i) MD is EHD2 (SEQ ID NO: 808), MHD2 (SEQ ID NO: 811), the trimerization domain of chicken tenascin C (TNC) (residues 110-139 of SEQ ID NO: 804; SEQ ID NO: 805), or is selected from the trimerization domain of human TNC (residues 110-139 of SEQ ID NO: 806, SEQ ID NO: 807);
ii) L1, L2 및 L3은 각각 (GGGGS)n (여기서 n = 1-5), 또는 TNF(서열번호: 812)의 줄기 영역의 전부 또는 일부, 또는 이들의 혼합물이고; 그리고ii) L1, L2 and L3 are each (GGGGS) n (where n = 1-5), or all or part of the stem region of TNF (SEQ ID NO: 812), or a mixture thereof; and
iii) TNF 뮤테인은 TNFR2 선택적 돌연변이 D143N/A145R을 포함하고;iii) the TNF mutein comprises the TNFR2 selective mutations D143N/A145R;
b) 하기 중에서 선택되는 반감기 연장 모이어티:b) a half-life extending moiety selected from:
서열번호: 10에 제시된 인간 IgG1의 Fc 또는 서열번호: 27에 기재된 트라스투주맙의 Fc인 IgG1 Fc;an IgG1 Fc that is the Fc of human IgG1 shown in SEQ ID NO: 10 or the Fc of trastuzumab described in SEQ ID NO: 27;
서열번호: 16에 제시된 인간 IgG4의 Fc 또는 서열번호: 30에 제시된 니볼루맙의 Fc인 IgG4 Fc;an IgG4 Fc that is the Fc of human IgG4 as shown in SEQ ID NO: 16 or the Fc of nivolumab as shown in SEQ ID NO: 30;
크기가 적어도 또는 적어도 약 30 kDa인 PEG 분자; 및PEG molecules of at least or at least about 30 kDa in size; and
인간 혈청 알부민(HSA); 및human serum albumin (HSA); and
c) TNFR2 선택적 효능제 및 반감기 연장 모이어티 사이의 링커로서, 하기를 포함하는 링커:c) a linker between the TNFR2 selective agonist and the half-life extending moiety comprising:
(GlySer)n (여기서 n= 1-10); (GlySer2); (Gly4Ser)n(여기서 n= 1-10); (Gly3Ser)n(여기서 n= 1-5); (SerGly4)n(여기서 n= 1-5); (GlySerSerGly)n(여기서 n= 1-5); GSGGSSGG; GSSSGSGSGSSG; GSSSGSGSGSSGG; GGSSGG; GGSSGGSGGSSSG; GSSSGSGSGGSSSGSGSG; GGSSGGSSGGGSSGGSSG; 및 GSSSGS 중에서 선택되는 GS 링커; 또는(GlySer) n (where n=1-10); (GlySer 2 ); (Gly 4 Ser) n (where n=1-10); (Gly 3 Ser) n (where n= 1-5); (SerGly 4 ) n (where n=1-5); (GlySerSerGly) n (where n= 1-5); GSGGSSGG; GSSSGSGSGSSG; GSSSGSGSGSSGG; GGSSGG; GGSSGGSGGSSSG; GSSSGSGSGGSSSGSGSG; GGSSGGSSGGGSSGGSSG; and a GS linker selected from GSSSGS; or
트라스투주맙의 힌지 서열의 전부 또는 일부 및 니볼루맙의 힌지 서열의 전부 또는 일부 중에서 선택되는 링커; 또는a linker selected from all or part of the hinge sequence of Trastuzumab and all or part of the hinge sequence of Nivolumab; or
또는 이들의 조합. or a combination thereof.
작제물은 하기 식을 포함하는 TNFR2 효능제 작제물을 포함한다:The construct includes a TNFR2 agonist construct comprising the formula:
MD-L1-TNFmut-L2-TNFmut-L3-TNFmut (식 II); 또는MD-L1-TNFmut-L2-TNFmut-L3-TNFmut (formula II); or
TNFmut-L1-TNFmut-L2-TNFmut-L3-MD (식 III),TNFmut-L1-TNFmut-L2-TNFmut-L3-MD (formula III);
MD는 다량체화 도메인이고; TNFmut은 TNFR2 선택적 TNF 뮤테인이고; 그리고 L1, L2 및 L3은 동일하거나 상이한 링커이고, 여기서MD is the multimerization domain; TNFmut is a TNFR2 selective TNF mutein; and L1, L2 and L3 are the same or different linkers, wherein
i) MD는 IgG1 Fc 또는 IgG4 Fc로부터 선택되고;i) MD is selected from IgG1 Fc or IgG4 Fc;
ii) 식 II에서 L2 및 L3, 및 식 III에서 L1 및 L2는 각각 독립적으로 (GGGGS)n (여기서 n = 1-5), 또는 TNF(서열번호: 812)의 줄기 영역의 전부 또는 일부, 또는 이들의 조합이고; ii) L2 and L3 in formula II, and L1 and L2 in formula III are each independently (GGGGS) n (where n = 1-5), or all or part of the stem region of TNF (SEQ ID NO: 812), or a combination thereof;
iii) 식 II에서 L1 및 식 III에서의 L3 각각은 하기 중에서 독립적으로 선택되고:iii) L1 in Formula II and L3 in Formula III are each independently selected from:
(GlySer)n (여기서 n= 1-10); (GlySer2); (Gly4Ser)n(여기서 n= 1-10); (Gly3Ser)n(여기서 n= 1-5); (SerGly4)n(여기서 n= 1-5); (GlySerSerGly)n(여기서 n= 1-5); GSGGSSGG; GSSSGSGSGSSG; GSSSGSGSGSSGG; GGSSGG; GGSSGGSGGSSSG; GSSSGSGSGGSSSGSGSG; GGSSGGSSGGGSSGGSSG; 및 GSSSGS 중에서 선택되는 GS 링커; 또는(GlySer) n (where n=1-10); (GlySer 2 ); (Gly 4 Ser) n (where n=1-10); (Gly 3 Ser) n (where n= 1-5); (SerGly 4 ) n (where n=1-5); (GlySerSerGly) n (where n= 1-5); GSGGSSGG; GSSSGSGSGSSG; GSSSGSGSGSSGG; GGSSGG; GGSSGGSGGSSSG; GSSSGSGSGGSSSGSGSG; GGSSGGSSGGGSSGGSSG; and a GS linker selected from GSSSGS; or
트라스투주맙의 힌지 서열의 전부 또는 일부 및 니볼루맙의 힌지 서열의 전부 또는 일부 중에서 선택되는 링커; 또는a linker selected from all or part of the hinge sequence of Trastuzumab and all or part of the hinge sequence of Nivolumab; or
또는 이들의 조합.or a combination thereof.
iv) TNF 뮤테인은 TNFR2 선택적 돌연변이 D143N/A145R을 포함한다. 이러한 작제물에서 MD는 하기로부터 선택할 수 있다:iv) the TNF mutein comprises the TNFR2 selective mutations D143N/A145R. The MD in these constructs can be selected from:
서열번호: 10에 제시된 인간 IgG1의 Fc 또는 서열번호: 27에 기재된 트라스투주맙의 Fc인 IgG1 Fc; 또는an IgG1 Fc that is the Fc of human IgG1 shown in SEQ ID NO: 10 or the Fc of trastuzumab described in SEQ ID NO: 27; or
서열번호: 16에 제시된 인간 IgG4의 Fc 또는 서열번호: 30에 제시된 니볼루맙의 Fc인 IgG4 Fc; 또는an IgG4 Fc that is the Fc of human IgG4 as shown in SEQ ID NO: 16 or the Fc of nivolumab as shown in SEQ ID NO: 30; or
적어도 95%, 96%, 97%, 98%, 99% 서열 동일성을 갖는 그의 조합 또는 변이체. Combinations or variants thereof having at least 95%, 96%, 97%, 98%, 99% sequence identity.
예시적인 작제물은 트라스투주맙의 IgG1 Fc인 MD로서, MD와 인접한 TNF 뮤테인 사이의 링커는 서열번호: 26의 잔기 219-233에 상응하는 트라스투주맙의 힌지 서열의 전부 또는 일부인 MD, 또는 트라스투주맙의 IgG1 Fc인 MD로서, MD와 인접한 TNF 뮤테인 사이의 링커는 서열 SCDKTH (서열번호:31의 잔기 217-222)를 포함하는 MD를 포함하는 것이다. 예시적인 작제물은 트라스투주맙의 IgG1 Fc인 MD를 포함하는 것이고, MD와 인접한 TNF 뮤테인 사이의 링커는 (Gly4Ser)3 및 서열번호: 26의 잔기 219-233에 상응하는 트라스투주맙의 힌지 서열을 포함한다. 일부 구현예에서, MD는 트라스투주맙의 IgG1 Fc이고, MD와 인접한 TNF 뮤테인 사이의 링커는 (Gly4Ser)3 및 SCDKTH (서열번호:31의 잔기 222-227)를 포함하고, MD는 니볼루맙의 IgG4 Fc이고, MD와 인접한 TNF 뮤테인 사이의 링커는 서열번호: 29의 잔기 212-223에 상응하는 니볼루맙의 힌지 서열의 전부 또는 일부를 포함하거나,An exemplary construct is an MD that is an IgG1 Fc of Trastuzumab, wherein the linker between the MD and the adjacent TNF mutein is all or part of the hinge sequence of Trastuzumab corresponding to residues 219-233 of SEQ ID NO: 26, or As MD, the IgG1 Fc of Trastuzumab, the linker between the MD and the adjacent TNF mutein is one comprising the MD comprising the sequence SCDKTH (residues 217-222 of SEQ ID NO:31). An exemplary construct is one comprising MD, an IgG1 Fc of Trastuzumab, wherein the linker between the MD and the adjacent TNF mutein is (Gly 4 Ser) 3 and trastuzumab corresponding to residues 219-233 of SEQ ID NO: 26. It includes the hinge sequence of In some embodiments, MD is an IgG1 Fc of Trastuzumab, the linker between MD and adjacent TNF mutein comprises (Gly 4 Ser) 3 and SCDKTH (residues 222-227 of SEQ ID NO:31), and MD is an IgG4 Fc of nivolumab, wherein the linker between the MD and the adjacent TNF mutein comprises all or part of the hinge sequence of nivolumab corresponding to residues 212-223 of SEQ ID NO: 29;
MD는 니볼루맙의 IgG4 Fc이고, MD와 인접한 TNF 뮤테인 사이의 링커는 (Gly4Ser)3 및 서열번호: 29의 잔기 212-223에 상응하는 트라스투주맙의 힌지 서열의 전부 또는 일부를 포함한다. MD is the IgG4 Fc of nivolumab, and the linker between the MD and the adjacent TNF mutein contains (Gly 4 Ser) 3 and all or part of the hinge sequence of Trastuzumab corresponding to residues 212-223 of SEQ ID NO: 29 do.
효능제 작제물을 포함하는 본 명세서의 작제물은 인간에 대한 면역원성 서열과 같은 면역원성 서열을 제거하도록 변형될 수 있다. 본 명세서에서 TNFR2 효능제가 인간 대상체와 같은 대상체에서 면역원성인 에피토프 또는 면역원성 서열을 제거하도록 변형된 TNFR2 효능제 작제물을 제공한다. Constructs herein, including agonist constructs, may be modified to remove immunogenic sequences, such as sequences immunogenic to humans. Provided herein are TNFR2 agonist constructs that have been modified to remove immunogenic epitopes or immunogenic sequences in which the TNFR2 agonist is immunogenic in a subject, such as a human subject.
TNFR2 효능제 작제물이고 변형된 IgG Fc를 포함하는 본 명세서에 제공된 작제물에서, IgG Fc는 하기 변형 중 하나 이상을 포함할 수 있다:In constructs provided herein that are TNFR2 agonist constructs and include modified IgG Fc, the IgG Fc can include one or more of the following modifications:
a) 놉-인투-홀을 도입하기 위한 변형(들); 여기서a) deformation(s) to introduce a knob-into-hole; here
놉 돌연변이는 EU 넘버링에 의해 S354C, T366Y, T366W 및 T394W 중 하나 이상 중에서 선택되며; 그리고the knob mutation is selected from one or more of S354C, T366Y, T366W and T394W by EU numbering; and
홀 돌연변이는 EU 넘버링에 의해 Y349C, T366S, L368A, F405A, Y407T, Y407A 및 Y407V 중 하나 이상 중에서 선택되는 변형;Hall mutations are variants selected from one or more of Y349C, T366S, L368A, F405A, Y407T, Y407A and Y407V by EU numbering;
b) 신생아 Fc 수용체(FcRn) 재순환을 증가시키거나 강화하기 위한 변형(들)로서, 하기 중 하나 이상으로부터 선택되는 변형:b) modification(s) to increase or enhance neonatal Fc receptor (FcRn) recycling, selected from one or more of the following:
T250Q, T250R, M252F, M252W, M252Y, S254T, T256D, T256E, T256Q, V259I, V308F, E380A, M428L, H433K, N434F, N434A, N434W, N434S, N434Y, Y436H, M252Y/T256Q, M252F/T256D, M252Y/S254T/T256E, H433K/N434F/Y436H, N434F/Y436H, T250Q/M428L, T250R/M428L, M428L/N434S, V259I/V308F, V259I/V308F/M428L, E294del/T307P/N434Y, 및 T256N/A378V/S383N/N434Y; 및T250Q, T250R, M252F, M252W, M252Y, S254T, T256D, T256E, T256Q, V259I, V308F, E380A, M428L, H433K, N434F, N434A, N434W, N434S, N434Y, Y436H, M2 52Y/T256Q, M252F/T256D, M252Y/ S254T/T256E, H433K/N434F/Y436H, N434F/Y436H, T250Q/M428L, T250R/M428L, M428L/N434S, V259I/V308F, V259I/V308F/M428L, E294del/T307P/N4 34Y, and T256N/A378V/S383N/N434Y ; and
c) 면역 이펙터 기능을 감소시키거나 제거하기 위한 변형(들), 여기서c) modification(s) to reduce or eliminate immune effector function, wherein
면역 이펙터 기능(들)은 CDC, ADCC 및 ADCP 중 하나 이상 중에서 선택되며; 그리고the immune effector function(s) is selected from one or more of CDC, ADCC and ADCP; and
면역 이펙터 기능을 감소시키거나 제거하기 위한 변형(들)은 하기 중 하나 이상 중으로부터 선택된다:The modification(s) to reduce or eliminate immune effector function is selected from one or more of the following:
IgG1에서: EU 넘버링에 의해 L235E, L234A/L235A, L234E/L235F/P331S, L234F/L235E/P331S, L234A/L235A/P329G, L234A/L235A/G237A/P238S/H268A/A330S/P331S, G236R/L328R, G237A, E318A, D265A, E233P, N297A, N297Q, N297D, N297G, N297G/D265A, A330L, D270A, P329A, P331A, K322A, V264A, 및 F241A; 및In IgG1: L235E, L234A/L235A, L234E/L235F/P331S, L234F/L235E/P331S, L234A/L235A/P329G, L234A/L235A/G237A/P238S/H268A/A330S/P331 by EU numbering S, G236R/L328R, G237A , E318A, D265A, E233P, N297A, N297Q, N297D, N297G, N297G/D265A, A330L, D270A, P329A, P331A, K322A, V264A, and F241A; and
IgG4에서: EU 넘버링에 의해 L235E, F234A/L235A, S228P/L235E, 및 S228P/F234A/L235A.In IgG4: L235E, F234A/L235A, S228P/L235E, and S228P/F234A/L235A by EU numbering.
변형된 IgG Fc를 포함하는 TNFR2 효능제 작제물인 전술한 작제물 중 임의의 것이 제공되며, 여기서 IgG Fc는 하기 변형 중 하나 이상을 포함한다:Any of the aforementioned constructs are provided that are TNFR2 agonist constructs comprising a modified IgG Fc, wherein the IgG Fc comprises one or more of the following modifications:
a) 놉-인투-홀을 도입하기 위한 변형(들); 여기서a) deformation(s) to introduce a knob-into-hole; here
놉 돌연변이는 EU 넘버링에 의해 S354C, T366Y, T366W 및 T394W 중 하나 이상 중에서 선택되며; 그리고the knob mutation is selected from one or more of S354C, T366Y, T366W and T394W by EU numbering; and
홀 돌연변이는 EU 넘버링에 의해 Y349C, T366S, L368A, F405A, Y407T, Y407A 및 Y407V 중 하나 이상 중에서 선택되는 변형;Hall mutations are variants selected from one or more of Y349C, T366S, L368A, F405A, Y407T, Y407A and Y407V by EU numbering;
b) 신생아 Fc 수용체(FcRn) 재순환을 증가시키거나 강화하기 위한 변형(들)로서, 하기 중 하나 이상으로부터 선택되는 변형:b) modification(s) to increase or enhance neonatal Fc receptor (FcRn) recycling, selected from one or more of the following:
T250Q, T250R, M252F, M252W, M252Y, S254T, T256D, T256E, T256Q, V259I, V308F, E380A, M428L, H433K, N434F, N434A, N434W, N434S, N434Y, Y436H, M252Y/T256Q, M252F/T256D, M252Y/S254T/T256E, H433K/N434F/Y436H, N434F/Y436H, T250Q/M428L, T250R/M428L, M428L/N434S, V259I/V308F, V259I/V308F/M428L, E294del/T307P/N434Y, 및 T256N/A378V/S383N/N434Y; 및T250Q, T250R, M252F, M252W, M252Y, S254T, T256D, T256E, T256Q, V259I, V308F, E380A, M428L, H433K, N434F, N434A, N434W, N434S, N434Y, Y436H, M2 52Y/T256Q, M252F/T256D, M252Y/ S254T/T256E, H433K/N434F/Y436H, N434F/Y436H, T250Q/M428L, T250R/M428L, M428L/N434S, V259I/V308F, V259I/V308F/M428L, E294del/T307P/N4 34Y, and T256N/A378V/S383N/N434Y ; and
c) 면역 이펙터 기능을 증가시키거나 강화하기 위한 변형(들)로서,c) as modification(s) to increase or enhance immune effector function;
면역 이펙터 기능(들)은 CDC, ADCC 및 ADCP 중 하나 이상 중에서 선택되며; 그리고the immune effector function(s) is selected from one or more of CDC, ADCC and ADCP; and
면역 이펙터 기능을 증가시키거나 강화하기 위한 변형(들)은 하기 중 하나 이상으로부터 선택된다:The modification(s) to increase or enhance immune effector function are selected from one or more of the following:
IgG1에서: 제1 중쇄에서 S239D, I332E, S239D/I332E, S239D/A330L/I332E, S298A/E333A/K334A; F243L/R292P/Y300L/V305I/P396L; L235V/F243L/R292P/Y300L/P396L; F243L/R292P/Y300L; L234Y/G236W/S298A 및 제2 중쇄에서 S239D/A330L/I332E; 제1 중쇄에서 L234Y/L235Q/G236W/S239M/H268D/D270E/S298A 및 제2 중쇄에서 D270E/K326D/A330M/K334E; A327Q/P329A; D265A/S267A/H268A/D270A/K326A/S337A; T256A/K290A/S298A/E333A/K334A; G236A; G236A/I332E; G236A/S239D/I332E; G236A/S239D/A330L/I332E; 잔기 N297에서 바이안테너리 글리칸의 도입; 잔기 N297; K326W; K326A; E333A; K326A/E333A; K326W/E333S; K326M/E333S; K222W/T223W; K222W/T223W/H224W; D221W/K222W; C220D/D221C; C220D/D221C/K222W/T223W; H268F/S324T; S267E; H268F; S324T; S267E/H268F/S324T; G236A/I332E/S267E/H268F/S324T; E345R; 및 E345R/E430G/S440Y에서 비푸코실화된 글리칸의 도입; EU 넘버링에 의해. In IgG1: S239D, I332E, S239D/I332E, S239D/A330L/I332E, S298A/E333A/K334A in the first heavy chain; F243L/R292P/Y300L/V305I/P396L; L235V/F243L/R292P/Y300L/P396L; F243L/R292P/Y300L; L234Y/G236W/S298A and S239D/A330L/I332E in the second heavy chain; L234Y/L235Q/G236W/S239M/H268D/D270E/S298A in the first heavy chain and D270E/K326D/A330M/K334E in the second heavy chain; A327Q/P329A; D265A/S267A/H268A/D270A/K326A/S337A; T256A/K290A/S298A/E333A/K334A; G236A; G236A/I332E; G236A/S239D/I332E; G236A/S239D/A330L/I332E; introduction of a biantennary glycan at residue N297; residue N297; K326W; K326A; E333A; K326A/E333A; K326W/E333S; K326M/E333S; K222W/T223W; K222W/T223W/H224W; D221W/K222W; C220D/D221C; C220D/D221C/K222W/T223W; H268F/S324T; S267E; H268F; S324T; S267E/H268F/S324T; G236A/I332E/S267E/H268F/S324T; E345R; and introduction of afucosylated glycans at E345R/E430G/S440Y; by EU numbering.
억제성 Fcγ 수용체(FcγR) FcγRIIb에 대한 결합을 증가시키도록 변형된 IgG1 Fc를 포함하는 청구항들 중 임의의 것의 TNFR2 효능제 작제물 중 임의의 것이 제공된다. 이러한 것의 예시는 FcγRIIb에 대한 결합을 증가시키는 변형이 EU 넘버링에 의해 S267E, N297A, L328F, L351S, T366R, L368H, P395K, S267E/L328F 및 L351S/T366R/L368H/P395K 중 하나 이상 중에서 선택되는 것이다.Provided are any of the TNFR2 agonist constructs of any of the claims comprising an IgG1 Fc modified to increase binding to the inhibitory Fcγ receptor (FcγR) FcγRIIb. An example of this is that the modification that increases binding to FcγRIIb is selected from one or more of S267E, N297A, L328F, L351S, T366R, L368H, P395K, S267E/L328F and L351S/T366R/L368H/P395K by EU numbering.
본 명세서에 제공되는 작제물은 2개 이상의 표적과 상호작용한다는 점에서 다중특이적일 수 있다. 이러한 다중특이적 작제물의 예시는 다중특이적 TNFR1 억제제/TNFR2 효능제 작제물이고 다음 식 중 어느 하나이다:Constructs provided herein may be multispecific in that they interact with two or more targets. An example of such a multispecific construct is a multispecific TNFR1 inhibitor/TNFR2 agonist construct and is either of the following formulas:
(TNFR1 억제제)n ― 링커 (L)p ― (TNFR2 효능제)q (식 I), 또는(TNFR1 inhibitor) n - linker (L) p - (TNFR2 agonist) q (Formula I), or
(TNFR1 억제제)n ― 링커 (L)p ― (TNFR2 효능제)q, 또는 (TNFR1 inhibitor) n - Linker (L) p - (TNFR2 agonist) q , or
(TNFR1 억제제)n ― (TNFR2 효능제)q ― 링커 (L)p, 또는(TNFR1 inhibitor) n - (TNFR2 agonist) q - linker (L) p , or
(TNFR2 효능제)q ― (TNFR1 억제제)n ― 링커 (L)p, 또는(TNFR2 agonist) q - (TNFR1 inhibitor) n - Linker (L) p , or
선택적 활성 변형제를 포함하는 상기 중 임의의 것, 여기서: n= 1 또는 2, p= 1, 2 또는 3, 및 q= 1 또는 2; TNFR1 억제제는 TNFR1과 상호작용하여 그 활성을 억제하고; 활성 변형제는 활성 변형제가 없는 작제물과 비교하여 작제물의 활성 또는 약리학적 특성을 조정하거나 변경하는 모이어티이고; 예를 들어 링커는 작제물의 용해도를 증가시키거나 가요성을 증가시키거나 작제물의 입체 효과를 변경한다. 이들 작제물은 다중특이적 TNFR1 억제제/TNFR2 효능제 작제물인 것들을 포함하며, 여기서: TNFR1 억제제는 TNFR2 신호전달을 억제하거나 길항하지 않으면서 TNFR1 신호전달을 선택적으로 억제하거나 길항하고; TNFR1 억제제는 TNFR2의 활성화 또는 작용을 방해하지 않으며; TNFR2 효능제는 TNFR1 신호전달을 활성화하거나 작용하지 않고 TNFR2 신호전달을 선택적으로 활성화하거나 작용하고; TNFR2 효능제는 TNFR1의 억제 또는 길항 작용을 방해하지 않는다. 이러한 작제물의 예시는 다음과 같은 a)-c)의 작제물이다:Any of the above, including a selective active modifier, wherein: n = 1 or 2, p = 1, 2 or 3, and q = 1 or 2; TNFR1 inhibitors interact with TNFR1 to inhibit its activity; An active modifier is a moiety that modulates or alters the activity or pharmacological properties of a construct compared to a construct without the active modifier; For example, the linker increases the solubility of the construct, increases flexibility, or alters the steric effect of the construct. These constructs include those that are multispecific TNFR1 inhibitor/TNFR2 agonist constructs, wherein: the TNFR1 inhibitor selectively inhibits or antagonizes TNFR1 signaling without inhibiting or antagonizing TNFR2 signaling; TNFR1 inhibitors do not interfere with the activation or action of TNFR2; TNFR2 agonists selectively activate or agonize TNFR2 signaling without activating or agonizing TNFR1 signaling; TNFR2 agonists do not interfere with the inhibition or antagonism of TNFR1. An example of such a construct is the construct of a)-c) as follows:
a) TNFR1 억제제는 하기 중에서 선택되고:a) the TNFR1 inhibitor is selected from:
i) H398 또는 ATROSAB로부터 선택된 인간 항-TNFR1 길항제 단클론성 항체의 항원 결합 단편 또는 그와 적어도 95% 서열 동일성을 갖는 서열을 갖는 폴리펩티드; 또는i) an antigen-binding fragment of a human anti-TNFR1 antagonist monoclonal antibody selected from H398 or ATROSAB or a polypeptide having a sequence having at least 95% sequence identity thereto; or
ii) 서열번호: 52-672 중 어느 하나의 도메인 항체(dAb), 또는 서열번호: 673-678 중 어느 하나의 scFv 또는 서열번호: 679-682 중 어느 하나의 Fab, 또는 서열번호: 683 또는 684의 나노바디, 또는 서열번호: 701-703 중 어느 하나의 TNF 뮤테인, 또는 임의의 전술한 폴리펩티드와 적어도 95% 서열 동일성을 갖고 TNFR1 억제제인 서열을 갖는 폴리펩티드; 또는ii) a domain antibody (dAb) of any one of SEQ ID NOs: 52-672, or a scFv of any one of SEQ ID NOs: 673-678 or a Fab of any one of SEQ ID NOs: 679-682, or SEQ ID NOs: 683 or 684 or a TNF mutein of any one of SEQ ID NOs: 701-703, or a polypeptide having a sequence that has at least 95% sequence identity to any of the foregoing polypeptides and is a TNFR1 inhibitor; or
iii) TNFR1의 선택적 억제를 부여하고 하기 중에서 선택되는 하나 이상의 아미노산 치환을 갖는 가용성 TNF 분자를 포함하는 우세한-음성 종양 괴사 인자 (DN-TNF) 또는 TNF 뮤테인:iii) a predominantly-negative tumor necrosis factor (DN-TNF) or TNF mutein comprising a soluble TNF molecule conferring selective inhibition of TNFR1 and having one or more amino acid substitutions selected from:
서열번호: 2에 제시된 가용성 TNF의 서열과 관련하여 V1M, L29S, L29G, L29Y, R31C, R31E, R31N, R32Y, R32W, C69V, A84S, V85T, S86T, Y87H, Q88N, T89Q, I97T, C101A, A145R, E146R, L29S/R32W, L29S/S86T, R32W/S86T, L29S/R32W/S86T, R31N/R32T, R31E/S86T, R31N/R32T/S86T, I97T/A145R, V1M/R31C/C69V/Y87H/C101A/A145R, 및 A84S/V85T/S86T/Y87H/Q88N/T89Q; V1M, L29S, L29G, L29Y, R31C, R31E, R31N, R32Y, R32W, C69V, A84S, V85T, S86T, Y87H, Q88N, T89Q, I97T, C101A, A145R with respect to the sequence of soluble TNF set forth in SEQ ID NO: 2 , E146R, L29S/R32W, L29S/S86T, R32W/S86T, L29S/R32W/S86T, R31N/R32T, R31E/S86T, R31N/R32T/S86T, I97T/A145R, V1M/R31C/C69V/Y87H/C101 A/A145R , and A84S/V85T/S86T/Y87H/Q88N/T89Q;
b) 링커는 하기로부터 선택되고:b) the linker is selected from:
i) (GlySer)n (여기서 n= 1-10); (GlySer2); (Gly4Ser)n(여기서 n= 1-10); (Gly3Ser)n(여기서 n= 1-5); (SerGly4)n(여기서 n= 1-5); (GlySerSerGly)n(여기서 n= 1-5); GSGGSSGG; GSSSGSGSGSSG; GSSSGSGSGSSGG; GGSSGG; GGSSGGSGGSSSG; GSSSGSGSGGSSSGSGSG; GGSSGGSSGGGSSGGSSG; 및 GSSSGS로부터 선택되는 GS 링커; 및/또는i) (GlySer) n (where n = 1-10); (GlySer 2 ); (Gly 4 Ser) n (where n=1-10); (Gly 3 Ser) n (where n= 1-5); (SerGly 4 ) n (where n=1-5); (GlySerSerGly) n (where n= 1-5); GSGGSSGG; GSSSGSGSGSSG; GSSSGSGSGSSGG; GGSSGG; GGSSGGSGGSSSG; GSSSGSGSGGSSSGSGSG; GGSSGGSSGGGSSGGSSG; and a GS linker selected from GSSSGS; and/or
ii) 서열번호: 26의 잔기 219-233에 상응하는 트라스투주맙의 힌지 서열의 전부 또는 일부, 또는 서열번호: 29의 잔기 212-223에 상응하는 니볼루맙의 힌지 서열의 전부 또는 일부; 및ii) all or part of the hinge sequence of Trastuzumab corresponding to residues 219-233 of SEQ ID NO: 26, or all or part of the hinge sequence of Nivolumab corresponding to residues 212-223 of SEQ ID NO: 29; and
iii) IgG1 또는 IgG4 Fc, 여기서: iii) IgG1 or IgG4 Fc, wherein:
IgG1 Fc는 서열번호: 10에 제시된 인간 IgG1의 IgG1 Fc, 또는 서열번호: 27에 기재된 트라스투주맙의 IgG1 Fc로부터 선택되며;the IgG1 Fc is selected from the IgG1 Fc of human IgG1 set forth in SEQ ID NO: 10, or the IgG1 Fc of Trastuzumab set forth in SEQ ID NO: 27;
IgG4 Fc는 서열번호: 16에 제시된 인간 IgG4의 IgG4 Fc 또는 서열번호: 30에 제시된 니볼루맙의 IgG4 Fc로부터 선택되며; 그리고the IgG4 Fc is selected from the IgG4 Fc of human IgG4 set forth in SEQ ID NO: 16 or the IgG4 Fc of nivolumab set forth in SEQ ID NO: 30; and
선택적으로, Fc는 놉-인투-홀을 도입하고/하거나 신생아 Fc 수용체(FcRn) 재순환을 증가 또는 강화하고/하거나 면역 이펙터 기능을 감소 또는 제거하기 위한 하나 이상의 변형을 포함하고; 그리고Optionally, the Fc comprises one or more modifications to introduce a knob-into-hole, increase or enhance neonatal Fc receptor (FcRn) recycling, and/or reduce or eliminate immune effector function; and
c) TNFR2 효능제는 하기로부터 선택되고:c) the TNFR2 agonist is selected from:
i) 서열번호: 839-865, 1202 및 1204에 제시된 에피토프 중에서 선택되는 인간 TNFR2 내의 하나 이상의 에피토프에 결합하는 항원 결합 단편; 또는i) an antigen-binding fragment that binds to one or more epitopes in human TNFR2 selected from among the epitopes set forth in SEQ ID NOs: 839-865, 1202 and 1204; or
ii) MR2-1 또는 MAB2261로부터 선택되는 효능적 인간 항-TNFR2 항체의 항원 결합 단편; 또는ii) an antigen-binding fragment of a potent human anti-TNFR2 antibody selected from MR2-1 or MAB2261; or
iii) 서열번호: 2와 관련하여 K65W, D143Y, D143F, D143N, D143E, D143W, D143V, A145R, A145H, A145K, A145F, A145W, E146Q, E146H, E146K, E146N, D143N/A145R, A145R/S147T, Q88N/T89S/A145S/E146A/S147D, Q88N/A145I/E146G/S147D, A145H/E146S/S147D, A145H/S147D, L29V/A145D/E146D/S147D, A145N/E146D/S147D, A145T/E146S/S147D, A145Q/E146D/S147D, A145T/E146D/S147D, A145D/E146G/S147D, A145D/S147D, A145K/E146D/S147T, A145R/E146T/S147D, A145R/S147T, E146D/S147D, D143V/F144L/A145S, S95C/G148C, 및 D143V/A145S 중에서 선택된 하나 이상의 TNFR2 선택적 돌연변이를 포함하는 가용성 TNF 변이체인 TNFR2 선택적 TNF 뮤테인; 또는iii) K65W, D143Y, D143F, D143N, D143E, D143W, D143V, A145R, A145H, A145K, A145F, A145W, E146Q, E146H, E146K, E146N, D143N/A145R, A145 with respect to SEQ ID NO: 2 R/S147T, Q88N /T89S/A145S/E146A/S147D, Q88N/A145I/E146G/S147D, A145H/E146S/S147D, A145H/S147D, L29V/A145D/E146D/S147D, A145N/E146D/S147D, A145 T/E146S/S147D, A145Q/E146D /S147D, A145T/E146D/S147D, A145D/E146G/S147D, A145D/S147D, A145K/E146D/S147T, A145R/E146T/S147D, A145R/S147T, E146D/S147D, D143V/F 144L/A145S, S95C/G148C, and a TNFR2 selective TNF mutein, which is a soluble TNF variant comprising one or more TNFR2 selective mutations selected from D143V/A145S; or
iv) 돌연변이 D143N/A145R을 포함하는 단쇄 TNFR2 선택적 TNF 뮤테인 삼량체로서, 여기서 TNF 뮤테인은 (GGGGS)n (여기서 n = 1-5) 또는 TNF(서열번호: 812)의 줄기 영역의 전부 또는 일부에 의해 연결되는, 단쇄 TNFR2 선택적 TNF 뮤테인 삼량체; 또는iv) a single chain TNFR2 selective TNF mutein trimer comprising the mutations D143N/A145R, wherein the TNF mutein is (GGGGS) n (where n = 1-5) or all or all of the stem region of TNF (SEQ ID NO: 812) single-chain TNFR2 selective TNF mutein trimers, linked by moieties; or
v) 하기 식을 포함하는 TNFR2 선택적 효능제:v) a TNFR2 selective agonist comprising the formula:
MD-L1-TNFmut-L2-TNFmut-L3-TNFmut (식 II); 또는MD-L1-TNFmut-L2-TNFmut-L3-TNFmut (formula II); or
TNFmut-L1-TNFmut-L2-TNFmut-L3-MD (식 III);TNFmut-L1-TNFmut-L2-TNFmut-L3-MD (formula III);
MD는 다량체화 도메인이고; TNFmut은 TNFR2 선택적 TNF 뮤테인이고; 그리고 L1, L2 및 L3은 동일하거나 상이한 링커이고, 여기서MD is the multimerization domain; TNFmut is a TNFR2 selective TNF mutein; and L1, L2 and L3 are the same or different linkers, wherein
MD는 EHD2 (서열번호: 808), MHD2 (서열번호: 811), 닭 테나스신 C(TNC)의 삼량체화 도메인 (서열번호: 804의 잔기 110-139; 서열번호: 805), 또는 인간 TNC의 삼량체화 도메인 (서열번호: 806의 잔기 110-139, 서열번호: 807)로부터 선택되고;MD is EHD2 (SEQ ID NO: 808), MHD2 (SEQ ID NO: 811), the trimerization domain of chicken tenascin C (TNC) (residues 110-139 of SEQ ID NO: 804; SEQ ID NO: 805), or human TNC is selected from the trimerization domain of (residues 110-139 of SEQ ID NO: 806, SEQ ID NO: 807);
L1, L2 및 L3은 각각 (GGGGS)n (여기서 n = 1-5), 또는 TNF(서열번호: 812)의 줄기 영역의 전부 또는 일부, 또는 이들의 혼합물이고; 그리고L1, L2 and L3 are each (GGGGS) n (where n = 1-5), or all or part of the stem region of TNF (SEQ ID NO: 812), or a mixture thereof; and
TNF 뮤테인은 TNFR2 선택적 돌연변이 D143N/A145R을 포함한다. TNF muteins include the TNFR2 selective mutations D143N/A145R.
다른 이러한 작제물은 다중특이적 TNFR1 길항제/TNFR2 효능제 작제물인 것을 포함하며, 여기서:Other such constructs include those that are multispecific TNFR1 antagonist/TNFR2 agonist constructs, wherein:
a) TNFR1 억제제는 서열번호: 52-672 중 어느 하나의 도메인 항체(dAb), 또는 서열번호: 673-678 중 어느 하나의 scFv 또는 서열번호: 679-682 중 어느 하나의 Fab, 또는 서열번호: 683 또는 684의 나노바디, 또는 서열번호: 701-703 중 어느 하나의 TNF 뮤테인, 또는 그와 적어도 또는 적어도 약 95% 서열 동일성을 갖는 서열을 포함하고;a) the TNFR1 inhibitor is a domain antibody (dAb) of any one of SEQ ID NOs: 52-672, or a scFv of any one of SEQ ID NOs: 673-678 or a Fab of any one of SEQ ID NOs: 679-682, or SEQ ID NO: a Nanobody of 683 or 684, or a TNF mutein of any one of SEQ ID NOs: 701-703, or a sequence having at least or at least about 95% sequence identity therewith;
b) 링커는 (GGGGS)3, 서열 SCDKTH(서열번호: 26의 잔기 222-227)를 포함하는 폴리펩티드, 및 트라스투주맙의 Fc를 포함하고; 그리고b) the linker comprises (GGGGS) 3 , a polypeptide comprising the sequence SCDKTH (residues 222-227 of SEQ ID NO: 26), and the Fc of Trastuzumab; and
c) TNFR2 효능제는 서열번호: 2와 관련하여 K65W, D143Y, D143F, D143N, D143E, D143W, D143V, A145R, A145H, A145K, A145F, A145W, E146Q, E146H, E146K, E146N, D143N/A145R, A145R/S147T, Q88N/T89S/A145S/E146A/S147D, Q88N/A145I/E146G/S147D, A145H/E146S/S147D, A145H/S147D, L29V/A145D/E146D/S147D, A145N/E146D/S147D, A145T/E146S/S147D, A145Q/E146D/S147D, A145T/E146D/S147D, A145D/E146G/S147D, A145D/S147D, A145K/E146D/S147T, A145R/E146T/S147D, A145R/S147T, E146D/S147D, D143V/F144L/A145S, S95C/G148C, 및 D143V/A145S 중에서 선택된 하나 이상의 TNFR2 선택적 돌연변이를 포함하는 가용성 TNF 변이체인 TNFR2 선택적 TNF 뮤테인을 포함한다.c) the TNFR2 agonist is K65W, D143Y, D143F, D143N, D143E, D143W, D143V, A145R, A145H, A145K, A145F, A145W, E146Q, E146H, E146K, E146N, D143N/A145R with respect to SEQ ID NO: 2 , A145R /S147T, Q88N/T89S/A145S/E146A/S147D, Q88N/A145I/E146G/S147D, A145H/E146S/S147D, A145H/S147D, L29V/A145D/E146D/S147D, A145N/E146D /S147D, A145T/E146S/S147D A145Q/E146D/S147D, A145T/E146D/S147D, A145D/E146G/S147D, A145D/S147D, A145K/E146D/S147T, A145R/E146T/S147D, A145R/S147T, E146D S147D, D143V/F144L/A145S, S95C /G148C, and a TNFR2 selective TNF mutein, which is a soluble TNF variant comprising one or more TNFR2 selective mutations selected from D143V/A145S.
다른 다중특이적 작제물은 하기인 것이다:Other multispecific constructs are:
a) TNFR1 억제제는 서열번호: 52-672 중 어느 하나의 도메인 항체(dAb), 또는 서열번호: 673-678 중 어느 하나의 scFv 또는 서열번호: 679-682 중 어느 하나의 Fab, 또는 서열번호: 683 또는 684의 나노바디, 또는 서열번호: 701-703 중 어느 하나의 TNF 뮤테인, 또는 그와 적어도 또는 적어도 약 95% 서열 동일성을 갖는 서열을 포함하고;a) the TNFR1 inhibitor is a domain antibody (dAb) of any one of SEQ ID NOs: 52-672, or a scFv of any one of SEQ ID NOs: 673-678 or a Fab of any one of SEQ ID NOs: 679-682, or SEQ ID NO: a Nanobody of 683 or 684, or a TNF mutein of any one of SEQ ID NOs: 701-703, or a sequence having at least or at least about 95% sequence identity therewith;
b) 링커는 (GGGGS)3, 니볼루맙의 힌지 서열 전부 또는 일부, 및 니볼루맙의 Fc를 포함하고; 그리고b) the linker comprises (GGGGS) 3 , all or part of the hinge sequence of nivolumab, and the Fc of nivolumab; and
c) TNFR2 효능제는 서열번호: 2와 관련하여 K65W, D143Y, D143F, D143N, D143E, D143W, D143V, A145R, A145H, A145K, A145F, A145W, E146Q, E146H, E146K, E146N, D143N/A145R, A145R/S147T, Q88N/T89S/A145S/E146A/S147D, Q88N/A145I/E146G/S147D, A145H/E146S/S147D, A145H/S147D, L29V/A145D/E146D/S147D, A145N/E146D/S147D, A145T/E146S/S147D, A145Q/E146D/S147D, A145T/E146D/S147D, A145D/E146G/S147D, A145D/S147D, A145K/E146D/S147T, A145R/E146T/S147D, A145R/S147T, E146D/S147D, D143V/F144L/A145S, S95C/G148C, 및 D143V/A145S 중에서 선택된 하나 이상의 TNFR2 선택적 돌연변이를 포함하는 가용성 TNF 변이체인 TNFR2 선택적 TNF 뮤테인을 포함한다.c) the TNFR2 agonist is K65W, D143Y, D143F, D143N, D143E, D143W, D143V, A145R, A145H, A145K, A145F, A145W, E146Q, E146H, E146K, E146N, D143N/A145R with respect to SEQ ID NO: 2 , A145R /S147T, Q88N/T89S/A145S/E146A/S147D, Q88N/A145I/E146G/S147D, A145H/E146S/S147D, A145H/S147D, L29V/A145D/E146D/S147D, A145N/E146D /S147D, A145T/E146S/S147D A145Q/E146D/S147D, A145T/E146D/S147D, A145D/E146G/S147D, A145D/S147D, A145K/E146D/S147T, A145R/E146T/S147D, A145R/S147T, E146D S147D, D143V/F144L/A145S, S95C /G148C, and a TNFR2 selective TNF mutein, which is a soluble TNF variant comprising one or more TNFR2 selective mutations selected from D143V/A145S.
다른 다중특이적 작제물은 하기인 것이다:Other multispecific constructs are:
a) TNFR1 억제제는 서열번호: 52-672 중 어느 하나의 도메인 항체(dAb), 또는 서열번호: 673-678 중 어느 하나의 scFv 또는 서열번호: 679-682 중 어느 하나의 Fab, 또는 서열번호: 683 또는 684의 나노바디, 또는 서열번호: 701-703 중 어느 하나의 TNF 뮤테인, 또는 그와 적어도 또는 적어도 약 95% 서열 동일성을 갖는 서열을 포함하고;a) the TNFR1 inhibitor is a domain antibody (dAb) of any one of SEQ ID NOs: 52-672, or a scFv of any one of SEQ ID NOs: 673-678 or a Fab of any one of SEQ ID NOs: 679-682, or SEQ ID NO: a Nanobody of 683 or 684, or a TNF mutein of any one of SEQ ID NOs: 701-703, or a sequence having at least or at least about 95% sequence identity therewith;
b) 링커는 (GGGGS)3 및 트라스투주맙의 Fc를 포함하고; 그리고b) the linker comprises (GGGGS) 3 and the Fc of Trastuzumab; and
c) TNFR2 효능제는 서열번호: 2와 관련하여 K65W, D143Y, D143F, D143N, D143E, D143W, D143V, A145R, A145H, A145K, A145F, A145W, E146Q, E146H, E146K, E146N, D143N/A145R, A145R/S147T, Q88N/T89S/A145S/E146A/S147D, Q88N/A145I/E146G/S147D, A145H/E146S/S147D, A145H/S147D, L29V/A145D/E146D/S147D, A145N/E146D/S147D, A145T/E146S/S147D, A145Q/E146D/S147D, A145T/E146D/S147D, A145D/E146G/S147D, A145D/S147D, A145K/E146D/S147T, A145R/E146T/S147D, A145R/S147T, E146D/S147D, D143V/F144L/A145S, S95C/G148C, 및 D143V/A145S 중에서 선택된 하나 이상의 TNFR2 선택적 돌연변이를 포함하는 가용성 TNF 변이체인 TNFR2 선택적 TNF 뮤테인을 포함한다.c) the TNFR2 agonist is K65W, D143Y, D143F, D143N, D143E, D143W, D143V, A145R, A145H, A145K, A145F, A145W, E146Q, E146H, E146K, E146N, D143N/A145R with respect to SEQ ID NO: 2 , A145R /S147T, Q88N/T89S/A145S/E146A/S147D, Q88N/A145I/E146G/S147D, A145H/E146S/S147D, A145H/S147D, L29V/A145D/E146D/S147D, A145N/E146D /S147D, A145T/E146S/S147D A145Q/E146D/S147D, A145T/E146D/S147D, A145D/E146G/S147D, A145D/S147D, A145K/E146D/S147T, A145R/E146T/S147D, A145R/S147T, E146D S147D, D143V/F144L/A145S, S95C /G148C, and a TNFR2 selective TNF mutein, which is a soluble TNF variant comprising one or more TNFR2 selective mutations selected from D143V/A145S.
다른 다중특이적 작제물은 하기인 것이다:Other multispecific constructs are:
a) TNFR1 억제제는 서열번호: 52-672 중 어느 하나의 도메인 항체(dAb), 또는 서열번호: 673-678 중 어느 하나의 scFv 또는 서열번호: 679-682 중 어느 하나의 Fab, 또는 서열번호: 683 또는 684의 나노바디, 또는 서열번호: 701-703 중 어느 하나의 TNF 뮤테인, 또는 그와 적어도 또는 적어도 약 95% 서열 동일성을 갖는 서열을 포함하고;a) the TNFR1 inhibitor is a domain antibody (dAb) of any one of SEQ ID NOs: 52-672, or a scFv of any one of SEQ ID NOs: 673-678 or a Fab of any one of SEQ ID NOs: 679-682, or SEQ ID NO: a Nanobody of 683 or 684, or a TNF mutein of any one of SEQ ID NOs: 701-703, or a sequence having at least or at least about 95% sequence identity therewith;
b) 링커는 (GGGGS)3 및 니볼루맙의 Fc를 포함하고; 그리고b) the linker comprises (GGGGS) 3 and the Fc of nivolumab; and
c) TNFR2 효능제는 서열번호: 2와 관련하여 K65W, D143Y, D143F, D143N, D143E, D143W, D143V, A145R, A145H, A145K, A145F, A145W, E146Q, E146H, E146K, E146N, D143N/A145R, A145R/S147T, Q88N/T89S/A145S/E146A/S147D, Q88N/A145I/E146G/S147D, A145H/E146S/S147D, A145H/S147D, L29V/A145D/E146D/S147D, A145N/E146D/S147D, A145T/E146S/S147D, A145Q/E146D/S147D, A145T/E146D/S147D, A145D/E146G/S147D, A145D/S147D, A145K/E146D/S147T, A145R/E146T/S147D, A145R/S147T, E146D/S147D, D143V/F144L/A145S, S95C/G148C, 및 D143V/A145S, 및 앞의 돌연변이의 임의의 조합 중에서 선택된 하나 이상의 TNFR2 선택적 돌연변이를 포함하는 가용성 TNF 변이체인 TNFR2 선택적 TNF 뮤테인을 포함한다.c) the TNFR2 agonist is K65W, D143Y, D143F, D143N, D143E, D143W, D143V, A145R, A145H, A145K, A145F, A145W, E146Q, E146H, E146K, E146N, D143N/A145R with respect to SEQ ID NO: 2 , A145R /S147T, Q88N/T89S/A145S/E146A/S147D, Q88N/A145I/E146G/S147D, A145H/E146S/S147D, A145H/S147D, L29V/A145D/E146D/S147D, A145N/E146D /S147D, A145T/E146S/S147D A145Q/E146D/S147D, A145T/E146D/S147D, A145D/E146G/S147D, A145D/S147D, A145K/E146D/S147T, A145R/E146T/S147D, A145R/S147T, E146D S147D, D143V/F144L/A145S, S95C /G148C, and D143V/A145S, and a TNFR2 selective TNF mutein, which is a soluble TNF variant comprising one or more TNFR2 selective mutations selected from any combination of the foregoing mutations.
이들 다중특이적 작제물은 변형된 Fc를 포함할 수 있으며, 여기서 IgG Fc는 하기 변형 중 하나 이상을 포함한다:These multispecific constructs may include a modified Fc, wherein the IgG Fc comprises one or more of the following modifications:
a) 놉-인투-홀을 도입하기 위한 변형(들);a) deformation(s) to introduce a knob-into-hole;
b) 신생아 Fc 수용체(FcRn) 재순환을 증가시키거나 강화하기 위한 변형(들); 및b) modification(s) to increase or enhance neonatal Fc receptor (FcRn) recycling; and
c) 면역 이펙터 기능을 감소시키거나 제거하기 위한 변형(들). 놉-인투-홀 변형을 포함하는 Fc의 예시는 다음과 같다:c) modification(s) to reduce or eliminate immune effector function. An example of an Fc containing a knob-into-hole variant is as follows:
놉 돌연변이는 EU 넘버링에 의해 S354C, T366Y, T366W 및 T394W 중 하나 이상 중에서 선택되며; 그리고the knob mutation is selected from one or more of S354C, T366Y, T366W and T394W by EU numbering; and
홀 돌연변이는 EU 넘버링에 의해 Y349C, T366S, L368A, F405A, Y407T, Y407A 및 Y407V 중 하나 이상 중에서 선택된다.The hole mutation is selected from one or more of Y349C, T366S, L368A, F405A, Y407T, Y407A and Y407V by EU numbering.
다른 예는 Fc가 EU 넘버링에 의해 T250Q, T250R, M252F, M252W, M252Y, S254T, T256D, T256E, T256Q, V259I, V308F, E380A, M428L, H433K, N434F, N434A, N434W, N434S, N434Y, Y436H, M252Y/T256Q, M252F/T256D, M252Y/S254T/T256E, H433K/N434F/Y436H, N434F/Y436H, T250Q/M428L, T250R/M428L, M428L/N434S, V259I/V308F, V259I/V308F/M428L, E294del/T307P/N434Y, 및 T256N/A378V/S383N/N434Y 중 하나 이상 중에서 선택되는, FcRn 재순환을 증가시키거나 강화시키기 위한 변형을 포함하는 것과 같은 Fc를 포함하는 다중특이적 작제물이다. Fc는 보체 의존적 세포독성 (CDC), 항체 의존적 세포 매개 세포독성 (ADCC) 및 항체 의존적 세포 매개 식균작용 (ADCP) 중 하나 이상으로부터 선택되는 면역 이펙터 기능에 대한 변형을 포함한다. Fc는 IgG1 및/또는 IgG4에서 면역 이펙터 기능을 감소시키거나 제거하기 위한 변형(들)을 포함할 수 있다: Another example is that Fc is T250Q, T250R, M252F, M252W, M252Y, S254T, T256D, T256E, T256Q, V259I, V308F, E380A, M428L, H433K, N434F, N434A, N434W, N434S, N4 by EU numbering. 34Y, Y436H, M252Y /T256Q, M252F/T256D, M252Y/S254T/T256E, H433K/N434F/Y436H, N434F/Y436H, T250Q/M428L, T250R/M428L, M428L/N434S, V259I/V308F, V259I/V 308F/M428L, E294del/T307P/N434Y , and T256N/A378V/S383N/N434Y, wherein the Fc comprises a modification to increase or enhance FcRn recycling. The Fc comprises modifications to an immune effector function selected from one or more of complement dependent cytotoxicity (CDC), antibody dependent cell mediated cytotoxicity (ADCC) and antibody dependent cell mediated phagocytosis (ADCP). An Fc may contain modification(s) to reduce or eliminate immune effector functions in IgG1 and/or IgG4:
IgG1에서: EU 넘버링에 의해 L235E, L234A/L235A, L234E/L235F/P331S, L234F/L235E/P331S, L234A/L235A/P329G, L234A/L235A/G237A/P238S/H268A/A330S/P331S, G236R/L328R, G237A, E318A, D265A, E233P, N297A, N297Q, N297D, N297G, N297G/D265A, A330L, D270A, P329A, P331A, K322A, V264A, 및 F241A; 및/또는In IgG1: L235E, L234A/L235A, L234E/L235F/P331S, L234F/L235E/P331S, L234A/L235A/P329G, L234A/L235A/G237A/P238S/H268A/A330S/P331 by EU numbering S, G236R/L328R, G237A , E318A, D265A, E233P, N297A, N297Q, N297D, N297G, N297G/D265A, A330L, D270A, P329A, P331A, K322A, V264A, and F241A; and/or
IgG4에서: EU 넘버링에 의해 L235E, F234A/L235A, S228P/L235E, 및 S228P/F234A/L235A.In IgG4: L235E, F234A/L235A, S228P/L235E, and S228P/F234A/L235A by EU numbering.
IgG Fc는 다음 변형 중 하나 이상을 포함할 수 있다:An IgG Fc can include one or more of the following modifications:
a) 놉-인투-홀을 도입하기 위한 변형(들); 여기서a) deformation(s) to introduce a knob-into-hole; here
놉 돌연변이는 EU 넘버링에 의해 S354C, T366Y, T366W 및 T394W 중 하나 이상 중에서 선택되며; 그리고the knob mutation is selected from one or more of S354C, T366Y, T366W and T394W by EU numbering; and
홀 돌연변이는 EU 넘버링에 의해 Y349C, T366S, L368A, F405A, Y407T, Y407A 및 Y407V 중 하나 이상 중에서 선택되는 변형;Hall mutations are variants selected from one or more of Y349C, T366S, L368A, F405A, Y407T, Y407A and Y407V by EU numbering;
b) 신생아 Fc 수용체(FcRn) 재순환을 증가시키거나 강화하기 위한 변형(들)로서, 하기 중 하나 이상으로부터 선택되는 변형:b) modification(s) to increase or enhance neonatal Fc receptor (FcRn) recycling, selected from one or more of the following:
T250Q, T250R, M252F, M252W, M252Y, S254T, T256D, T256E, T256Q, V259I, V308F, E380A, M428L, H433K, N434F, N434A, N434W, N434S, N434Y, Y436H, M252Y/T256Q, M252F/T256D, M252Y/S254T/T256E, H433K/N434F/Y436H, N434F/Y436H, T250Q/M428L, T250R/M428L, M428L/N434S, V259I/V308F, V259I/V308F/M428L, E294del/T307P/N434Y, 및 T256N/A378V/S383N/N434Y; 및T250Q, T250R, M252F, M252W, M252Y, S254T, T256D, T256E, T256Q, V259I, V308F, E380A, M428L, H433K, N434F, N434A, N434W, N434S, N434Y, Y436H, M2 52Y/T256Q, M252F/T256D, M252Y/ S254T/T256E, H433K/N434F/Y436H, N434F/Y436H, T250Q/M428L, T250R/M428L, M428L/N434S, V259I/V308F, V259I/V308F/M428L, E294del/T307P/N4 34Y, and T256N/A378V/S383N/N434Y ; and
c) 면역 이펙터 기능을 증가시키거나 강화하기 위한 변형(들)로서,c) as modification(s) to increase or enhance immune effector function;
면역 이펙터 기능은 CDC, ADCC 및 ADCP 중 하나 이상 중에서 선택되며; 그리고the immune effector function is selected from one or more of CDC, ADCC and ADCP; and
면역 이펙터 기능을 증가시키거나 강화하기 위한 변형(들)은 하기 중 하나 이상으로부터 선택된다:The modification(s) to increase or enhance immune effector function are selected from one or more of the following:
IgG1에서: 제1 중쇄에서 S239D, I332E, S239D/I332E, S239D/A330L/I332E, S298A/E333A/K334A; F243L/R292P/Y300L/V305I/P396L; L235V/F243L/R292P/Y300L/P396L; F243L/R292P/Y300L; L234Y/G236W/S298A 및 제2 중쇄에서 S239D/A330L/I332E; 제1 중쇄에서 L234Y/L235Q/G236W/S239M/H268D/D270E/S298A 및 제2 중쇄에서 D270E/K326D/A330M/K334E; A327Q/P329A; D265A/S267A/H268A/D270A/K326A/S337A; T256A/K290A/S298A/E333A/K334A; G236A; G236A/I332E; G236A/S239D/I332E; G236A/S239D/A330L/I332E; 잔기 N297에서 바이안테너리 글리칸의 도입; 잔기 N297; K326W; K326A; E333A; K326A/E333A; K326W/E333S; K326M/E333S; K222W/T223W; K222W/T223W/H224W; D221W/K222W; C220D/D221C; C220D/D221C/K222W/T223W; H268F/S324T; S267E; H268F; S324T; S267E/H268F/S324T; G236A/I332E/S267E/H268F/S324T; E345R; 및 E345R/E430G/S440Y에서 비푸코실화된 글리칸의 도입; EU 넘버링에 의해. In IgG1: S239D, I332E, S239D/I332E, S239D/A330L/I332E, S298A/E333A/K334A in the first heavy chain; F243L/R292P/Y300L/V305I/P396L; L235V/F243L/R292P/Y300L/P396L; F243L/R292P/Y300L; L234Y/G236W/S298A and S239D/A330L/I332E in the second heavy chain; L234Y/L235Q/G236W/S239M/H268D/D270E/S298A in the first heavy chain and D270E/K326D/A330M/K334E in the second heavy chain; A327Q/P329A; D265A/S267A/H268A/D270A/K326A/S337A; T256A/K290A/S298A/E333A/K334A; G236A; G236A/I332E; G236A/S239D/I332E; G236A/S239D/A330L/I332E; introduction of a biantennary glycan at residue N297; residue N297; K326W; K326A; E333A; K326A/E333A; K326W/E333S; K326M/E333S; K222W/T223W; K222W/T223W/H224W; D221W/K222W; C220D/D221C; C220D/D221C/K222W/T223W; H268F/S324T; S267E; H268F; S324T; S267E/H268F/S324T; G236A/I332E/S267E/H268F/S324T; E345R; and introduction of afucosylated glycans at E345R/E430G/S440Y; by EU numbering.
이러한 다중특이적 작제물의 다른 것은 다음과 같은 것들이다: 억제성 Fcγ 수용체(FcγR) FcγRIIb에 대한 결합을 증가시키도록 변형된 IgG1 Fc를 포함하는 작제물. 이러한 것의 예시는 FcγRIIb에 대한 결합을 증가시키는 변형이 EU 넘버링에 의해 S267E, N297A, L328F, L351S, T366R, L368H, P395K, S267E/L328F 및 L351S/T366R/L368H/P395K 중 하나 이상 중에서 선택되는 것이다.Other such multispecific constructs are: Constructs comprising an IgG1 Fc that has been modified to increase binding to the inhibitory Fcγ receptor (FcγR) FcγRIIb. An example of this is that the modification that increases binding to FcγRIIb is selected from one or more of S267E, N297A, L328F, L351S, T366R, L368H, P395K, S267E/L328F and L351S/T366R/L368H/P395K by EU numbering.
또한 다중특이적 TNFR1 길항제/TNFR2 효능제인 작제물이 제공되며, TNFR1 길항제는 1가이고; TNFR2 효능제는 1가이다. 또한 다중특이적 TNFR1 길항제/TNFR2 효능제 작제물인 다중특이적 작제물이 제공되며, 여기서 TNFR1 길항제는 1가이고; TNFR2 효능제는 2가이다. Also provided are constructs that are multispecific TNFR1 antagonists/TNFR2 agonists, wherein the TNFR1 antagonists are monovalent; TNFR2 agonists are monovalent. Also provided are multispecific constructs that are multispecific TNFR1 antagonist/TNFR2 agonist constructs, wherein the TNFR1 antagonist is monovalent; TNFR2 agonists are bivalent.
일부 구현예에서, 다중특이적 작제물은 다중특이적 TNFR1 길항제/TNFR2 효능제 작제물이며, 여기에서: In some embodiments, the multispecific construct is a multispecific TNFR1 antagonist/TNFR2 agonist construct, wherein:
a) TNFR1 길항제는 하기로부터 선택된다: a) the TNFR1 antagonist is selected from:
i) H398 또는 ATROSAB로부터 선택되는 인간 항-TNFR1 길항제 단클론성 항체의 항원 결합 단편; 또는i) an antigen-binding fragment of a human anti-TNFR1 antagonist monoclonal antibody selected from H398 or ATROSAB; or
ii) 서열번호: 52-672 중 어느 하나의 도메인 항체(dAb), 또는 서열번호: 673-678 중 어느 하나의 scFv 또는 서열번호: 679-682 중 어느 하나의 Fab, 또는 서열번호: 683 또는 684의 나노바디, 또는 서열번호: 701-703 중 어느 하나의 TNF 뮤테인, 또는 그와 적어도 또는 적어도 약 95% 서열 동일성을 갖는 서열; 또는ii) a domain antibody (dAb) of any one of SEQ ID NOs: 52-672, or a scFv of any one of SEQ ID NOs: 673-678 or a Fab of any one of SEQ ID NOs: 679-682, or SEQ ID NOs: 683 or 684 or a TNF mutein of any one of SEQ ID NOs: 701-703, or a sequence having at least or at least about 95% sequence identity therewith; or
iii) TNFR1의 선택적 억제를 부여하고 하기 중에서 선택되는 하나 이상의 아미노산 치환을 갖는 가용성 TNF 분자를 포함하는 우세한-음성 종양 괴사 인자 (DN-TNF) 또는 TNF 뮤테인:iii) a predominantly-negative tumor necrosis factor (DN-TNF) or TNF mutein comprising a soluble TNF molecule conferring selective inhibition of TNFR1 and having one or more amino acid substitutions selected from:
서열번호: 2에 제시된 가용성 TNF의 서열과 관련하여 V1M, L29S, L29G, L29Y, R31C, R31E, R31N, R32Y, R32W, C69V, A84S, V85T, S86T, Y87H, Q88N, T89Q, I97T, C101A, A145R, E146R, L29S/R32W, L29S/S86T, R32W/S86T, L29S/R32W/S86T, R31N/R32T, R31E/S86T, R31N/R32T/S86T, I97T/A145R, V1M/R31C/C69V/Y87H/C101A/A145R, 및 A84S/V85T/S86T/Y87H/Q88N/T89Q; V1M, L29S, L29G, L29Y, R31C, R31E, R31N, R32Y, R32W, C69V, A84S, V85T, S86T, Y87H, Q88N, T89Q, I97T, C101A, A145R with respect to the sequence of soluble TNF set forth in SEQ ID NO: 2 , E146R, L29S/R32W, L29S/S86T, R32W/S86T, L29S/R32W/S86T, R31N/R32T, R31E/S86T, R31N/R32T/S86T, I97T/A145R, V1M/R31C/C69V/Y87H/C101 A/A145R , and A84S/V85T/S86T/Y87H/Q88N/T89Q;
b) 링커는 크기가 적어도 또는 적어도 약 30 kDa인 분지쇄 PEG 분자이고; 그리고b) the linker is a branched chain PEG molecule of at least or at least about 30 kDa in size; and
c) TNFR2 효능제는 하기로부터 선택되고:c) the TNFR2 agonist is selected from:
i) 서열번호: 839-865, 1202 및 1204에 제시된 에피토프 중에서 선택되는 인간 TNFR2 내의 하나 이상의 에피토프에 결합하는 항원 결합 단편; 또는i) an antigen-binding fragment that binds to one or more epitopes in human TNFR2 selected from among the epitopes set forth in SEQ ID NOs: 839-865, 1202 and 1204; or
ii) MR2-1 또는 MAB2261로부터 선택되는 효능적 인간 항-TNFR2 항체의 항원 결합 단편; 또는ii) an antigen-binding fragment of a potent human anti-TNFR2 antibody selected from MR2-1 or MAB2261; or
iii) 서열번호: 2와 관련하여 K65W, D143Y, D143F, D143N, D143E, D143W, D143V, A145R, A145H, A145K, A145F, A145W, E146Q, E146H, E146K, E146N, D143N/A145R, A145R/S147T, Q88N/T89S/A145S/E146A/S147D, Q88N/A145I/E146G/S147D, A145H/E146S/S147D, A145H/S147D, L29V/A145D/E146D/S147D, A145N/E146D/S147D, A145T/E146S/S147D, A145Q/E146D/S147D, A145T/E146D/S147D, A145D/E146G/S147D, A145D/S147D, A145K/E146D/S147T, A145R/E146T/S147D, A145R/S147T, E146D/S147D, D143V/F144L/A145S, S95C/G148C, 및 D143V/A145S 중에서 선택된 하나 이상의 TNFR2 선택적 돌연변이를 포함하는 가용성 TNF 변이체인 TNFR2 선택적 TNF 뮤테인; 또는iii) K65W, D143Y, D143F, D143N, D143E, D143W, D143V, A145R, A145H, A145K, A145F, A145W, E146Q, E146H, E146K, E146N, D143N/A145R, A145 with respect to SEQ ID NO: 2 R/S147T, Q88N /T89S/A145S/E146A/S147D, Q88N/A145I/E146G/S147D, A145H/E146S/S147D, A145H/S147D, L29V/A145D/E146D/S147D, A145N/E146D/S147D, A145 T/E146S/S147D, A145Q/E146D /S147D, A145T/E146D/S147D, A145D/E146G/S147D, A145D/S147D, A145K/E146D/S147T, A145R/E146T/S147D, A145R/S147T, E146D/S147D, D143V/F 144L/A145S, S95C/G148C, and a TNFR2 selective TNF mutein, which is a soluble TNF variant comprising one or more TNFR2 selective mutations selected from D143V/A145S; or
iv) 돌연변이 D143N/A145R을 포함하는 단쇄 TNFR2 선택적 TNF 뮤테인 삼량체로서, 여기서 TNF 뮤테인은 (GGGGS)n (여기서 n = 1-5) 또는 TNF(서열번호: 812)의 줄기 영역의 전부 또는 일부에 의해 연결되는, 단쇄 TNFR2 선택적 TNF 뮤테인 삼량체; 또는iv) a single chain TNFR2 selective TNF mutein trimer comprising the mutations D143N/A145R, wherein the TNF mutein is (GGGGS) n (where n = 1-5) or all or all of the stem region of TNF (SEQ ID NO: 812) single-chain TNFR2 selective TNF mutein trimers, linked by moieties; or
v) 하기 식을 포함하는 TNFR2 선택적 효능제:v) a TNFR2 selective agonist comprising the formula:
MD-L1-TNFmut-L2-TNFmut-L3-TNFmut (식 II); 또는MD-L1-TNFmut-L2-TNFmut-L3-TNFmut (formula II); or
TNFmut-L1-TNFmut-L2-TNFmut-L3-MD (식 III);TNFmut-L1-TNFmut-L2-TNFmut-L3-MD (formula III);
MD는 다량체화 도메인이고; TNFmut은 TNFR2 선택적 TNF 뮤테인이고; 그리고 L1, L2 및 L3은 동일하거나 상이한 링커이고, 여기서MD is the multimerization domain; TNFmut is a TNFR2 selective TNF mutein; and L1, L2 and L3 are the same or different linkers, wherein
MD는 EHD2 (서열번호: 808), MHD2 (서열번호: 811), 닭 테나스신 C(TNC)의 삼량체화 도메인 (서열번호: 804의 잔기 110-139; 서열번호: 805), 또는 인간 TNC의 삼량체화 도메인 (서열번호: 806의 잔기 110-139, 서열번호: 807)로부터 선택되고;MD is EHD2 (SEQ ID NO: 808), MHD2 (SEQ ID NO: 811), the trimerization domain of chicken tenascin C (TNC) (residues 110-139 of SEQ ID NO: 804; SEQ ID NO: 805), or human TNC is selected from the trimerization domain of (residues 110-139 of SEQ ID NO: 806, SEQ ID NO: 807);
L1, L2 및 L3은 각각 (GGGGS)n (여기서 n = 1-5), 또는 TNF(서열번호: 812)의 줄기 영역의 전부 또는 일부, 또는 이들의 혼합물이고; 그리고L1, L2 and L3 are each (GGGGS) n (where n = 1-5), or all or part of the stem region of TNF (SEQ ID NO: 812), or a mixture thereof; and
TNF 뮤테인은 TNFR2 선택적 돌연변이 D143N/A145R을 포함한다. TNF muteins include the TNFR2 selective mutations D143N/A145R.
또한 TNFR1 길항제 및 TNFR2 효능제 각각이 1가인 다중특이적 작제물이 제공된다. 또한 TNFR1 길항제가 1가이고 TNFR2 효능제가 2가인 작제물이 제공된다. Also provided are multispecific constructs wherein each of the TNFR1 antagonist and the TNFR2 agonist is monovalent. Also provided are constructs wherein the TNFR1 antagonist is monovalent and the TNFR2 agonist is divalent.
본 명세서에 제공된 작제물은 다양한 질환, 장애 및 병태의 치료 및 용도에 사용될 수 있다. 만성 염증성, 자가면역, 신경퇴행, 탈수초 또는 호흡기 질환 또는 장애, 및 TNF의 과발현 또는 그 병인에서 탈조절된 TNFR1 신호전달을 특징으로 하는 질환, 병태 또는 장애의 치료에 사용하기 위한 다중특이적 TNFR1 길항제/TNFR2 효능제인 다중특이적 작제물이 제공된다. TNF의 과발현 또는 그 병인에서 탈조절된 TNFR1 신호전달을 특징으로 하는 만성 염증성, 자가면역, 신경퇴행, 탈수초 또는 호흡기 질환 또는 장애, 또는 질환, 병태 또는 장애의 치료를 위한 다중특이적 TNFR1 길항제/TNFR2 효능제 작제물의 용도가 제공된다. Constructs provided herein may be used for the treatment and use of a variety of diseases, disorders and conditions. Multispecific TNFR1 for use in the treatment of chronic inflammatory, autoimmune, neurodegenerative, demyelinating or respiratory diseases or disorders, and diseases, conditions or disorders characterized by overexpression of TNF or deregulated TNFR1 signaling in its pathogenesis. A multispecific construct that is an antagonist/TNFR2 agonist is provided. Multispecific TNFR1 antagonists/ for the treatment of chronic inflammatory, autoimmune, neurodegenerative, demyelinating or respiratory diseases or disorders, or diseases, conditions or disorders characterized by overexpression of TNF or deregulated TNFR1 signaling in its pathogenesis. Uses of TNFR2 agonist constructs are provided.
또한 약제학적으로 허용 가능한 담체 또는 비히클 중에 본 명세서에 제공된 작제물 중 임의의 것의 작제물을 포함하는 조성물이 제공된다. 이들 조성물은 만성 염증성, 자가면역, 신경퇴행, 탈수초 또는 호흡기 질환 또는 장애, 및 TNF의 과발현 또는 그 병인에서 탈조절된 TNFR1 신호전달을 특징으로 하는 질환, 병태 또는 장애로 제한되지 않는 것과 같은 질환, 장애, 및 병태의 치료를 위해 또는 그 치료 방법에 사용될 수 있다. 예시적인 만성 염증성, 자가면역, 신경퇴행, 탈수초 또는 호흡기 질환 또는 장애, 또는 질환, 병태 또는 장애는 TNF의 과발현 또는 그 병인에서 탈조절된 TNFR1 신호전달을 특징으로 하는 질환, 장애, 및 병태이다. 이들은 하기로부터 선택된 질환, 장애, 및 병태를 포함한다: 류마티스성 관절염 (RA), 건선, 건선성 관절염, 소아 특발성 관절염 (JIA), 척추관절염, 강직 척추염, 크론병, 궤양성 대장염, 염증성 장 질환 (IBD), 포도막염, 섬유성 질환, 자궁내막증, 루푸스, 다발성 경화증 (MS), 울혈성 심부전, 심혈관 질환, 심근경색 (MI), 죽상동맥경화증, 대사성 질환, 사이토카인 방출 증후군, 패혈성 쇼크, 패혈증, 급성 호흡 곤란 증후군 (ARDS), 중증 급성 호흡기 증후군 (SARS), SARS-CoV-2, 인플루엔자, 급성 및 만성 신경퇴행 질환, 탈수초 질환 및 장애, 뇌졸중, 알츠하이머병, 파킨슨병, 베체트병, 듀피트렌병, 종양 괴사 인자 수용체 연관 주기성 증후군 (TRAPS), 췌장염, I형 당뇨병, 만성적 폐쇄성 폐 질환 (COPD), 만성 기관지염, 폐기종, 이식 거부, 이식편대숙주 질환 (GvHD), 폐 염증, 폐 질환 및 병태, 천식, 낭포성 섬유증, 특발성 폐 섬유증, 급성 전격성 바이러스 또는 박테리아 감염, 폐렴, TNF/TNFR1을 원인 병리 매개체로 하는 유전적 유전 질환, 주기성 발열 증후군, 또는 암. 특히, TNFR1 길항제 작제물과 같으나 이에 제한되지 않는 본 명세서에서 제공되는 작제물은 류마티스성 관절염의 치료를 위한 용도, 치료 방법 및 조성물에 사용될 수 있다. Also provided are compositions comprising a construct of any of the constructs provided herein in a pharmaceutically acceptable carrier or vehicle. These compositions can be used to treat chronic inflammatory, autoimmune, neurodegenerative, demyelinating or respiratory diseases or disorders, and diseases, conditions or disorders characterized by overexpression of TNF or deregulated TNFR1 signaling in its etiology, diseases, conditions or disorders thereof. , disorders, and conditions, or in a method of treatment thereof. Exemplary chronic inflammatory, autoimmune, neurodegenerative, demyelinating or respiratory diseases or disorders, or diseases, conditions or disorders are diseases, disorders, and conditions characterized by overexpression of TNF or deregulated TNFR1 signaling in its etiology. . These include diseases, disorders, and conditions selected from: rheumatoid arthritis (RA), psoriasis, psoriatic arthritis, juvenile idiopathic arthritis (JIA), spondyloarthritis, ankylosing spondylitis, Crohn's disease, ulcerative colitis, inflammatory bowel disease (IBD), uveitis, fibrotic disease, endometriosis, lupus, multiple sclerosis (MS), congestive heart failure, cardiovascular disease, myocardial infarction (MI), atherosclerosis, metabolic disease, cytokine release syndrome, septic shock, Sepsis, acute respiratory distress syndrome (ARDS), severe acute respiratory syndrome (SARS), SARS-CoV-2, influenza, acute and chronic neurodegenerative diseases, demyelinating diseases and disorders, stroke, Alzheimer's disease, Parkinson's disease, Behçet's disease, Dupuytren's disease, tumor necrosis factor receptor-associated periodic syndrome (TRAPS), pancreatitis, type I diabetes, chronic obstructive pulmonary disease (COPD), chronic bronchitis, emphysema, graft rejection, graft-versus-host disease (GvHD), lung inflammation, lung disease and conditions, asthma, cystic fibrosis, idiopathic pulmonary fibrosis, acute fulminant viral or bacterial infections, pneumonia, hereditary genetic diseases with TNF/TNFR1 as a causative pathological vector, periodic fever syndrome, or cancer. In particular, constructs provided herein, such as, but not limited to, TNFR1 antagonist constructs, may be used in uses, methods and compositions for the treatment of rheumatoid arthritis.
또한 TNFR2 길항제, 및 선택적으로 링커 및 선택적으로 활성 변형제를 포함하는 TNFR2 길항제 작제물인 작제물이 본 명세서에 제공된다. 예를 들어 이러한 작제물은 식 5를 갖는다:Also provided herein are constructs that are TNFR2 antagonists and, optionally, TNFR2 antagonist constructs comprising a linker and optionally an active modifier. For example such a construct has formula 5:
(TNFR2 길항제)n ― 링커p ― (활성 변형제)q, 또는(TNFR2 antagonist) n - linker p - (active modifier) q , or
링커p ― (활성 변형제)q ― (TNFR2 길항제)n, 여기서: linker p - (active modifier) q - (TNFR2 antagonist) n , where:
n 및 q는 각각 정수이고, 각각 독립적으로 1, 2 또는 3이고; n and q are each an integer and are each independently 1, 2 or 3;
p는 0, 1, 2 또는 3이고; p is 0, 1, 2 or 3;
TNFR2 길항제는 TNFR2와 상호작용하여 TNFR2의 활성을 억제(길항)함으로써 Treg의 증식을 억제 및/또는 그 사멸을 유도하고, 또한 TNFR2 발현 종양 세포의 증식을 억제하고 그 사멸을 유도할 수 있는 분자이고;A TNFR2 antagonist is a molecule capable of inhibiting (antagonizing) the activity of TNFR2 by interacting with TNFR2, thereby inhibiting the proliferation of Treg and/or inducing its death, and also inhibiting the proliferation and inducing the death of TNFR2-expressing tumor cells. ;
활성 변형제는 활성 변형제가 없는 작제물과 비교하여 작제물의 활성 또는 약리학적 특성을 조정하거나 변경하는 모이어티이고; 그리고 An active modifier is a moiety that modulates or alters the activity or pharmacological properties of a construct compared to a construct without the active modifier; and
링커는 작제물의 가요성을 증가시키고/시키거나 작제물의 입체 효과 또는 수용체와의 상호작용을 조절하거나 감소시키고/시키거나 작제물의 수성 매질에서 용해도를 증가시킨다. The linker increases the flexibility of the construct, modulates or reduces the steric effect or interaction of the construct with a receptor, and/or increases the solubility of the construct in aqueous media.
이들 작제물에서, 각각의 활성 변형제 및 링커는 위 및 아래 작제물에 대해 정의되고 기재된 바와 같다. 이들은 치료 방법 및 용도 및 약제학적 조성물에 사용될 수 있다. In these constructs, each active modifier and linker is as defined and described for the constructs above and below. They can be used in therapeutic methods and uses and pharmaceutical compositions.
TNFR2 길항제는 골수 유래 억제 세포(MDSC)의 증식을 감소 및/또는 억제하는 것; 및/또는 종양 미세환경에 존재하는 MDSC의 표면 상에 발현된 TNFR2에 결합함으로써 MDSC 내에서 세포자멸을 유도하는 것; 및/또는 Treg 확대 및 활성의 억제를 통해 세포독성 CD8+ T 세포를 포함하는 T 이펙터 세포의 확대를 유도하는 것과 같은 상이한 질환, 장애 및 병태에 사용할 수 있다. 작제물에서 TNFR2 길항제는 잔기 KCRPG (서열번호: 4의 잔기 142-146에 상응함) 중 하나 이상을 함유하는 인간 TNFR2 내의 에피토프, 또는 예를 들어 잔기 130-149, 137-144 또는 142-149, 또는 이들 에피토프 내에 적어도 5개의 연속 또는 불연속 잔기를 함유하는 더 큰 에피토프에 결합하고, 그리고 잔기 KCSPG (서열번호: 4의 잔기 56-60에 상응함)를 함유하는 에피토프에 결하지 않거나; 또는 TNFR2 에피토프 PECLSCGS (서열번호: 4의 잔기 91-98에 상응함), RICTCRPG 서열번호: 4의 잔기 116-123에 상응함), CAPLRKCR (서열번호: 4의 잔기 137-144에 상응함), LRKCRPGFGVA (서열번호: 4의 잔기 140-150에 상응함), 및/또는 VVCKPCAPGTFSN (서열번호: 4의 잔기 159-171에 상응함), 및/또는 서열번호: 4의 잔기 75-128, 86-103, 111-128, 또는 150-190 내에 적어도 5개의 연속 또는 불연속 잔기를 함유하는 에피토프에 결합하는 항체, 이의 항원 결합 단편, 또는 단쇄 항체를 포함한다. 예를 들어, 항체, 이의 단편 또는 그의 단쇄 형태는 인간 TNFR2의 KCSPG 서열(서열번호: 839)을 함유하는 펩티드에 대한 동일한 항체 또는 항원 결합 단편의 친화도보다 적어도 10-배 더 큰 친화도로 KCRPG 서열(서열번호: 840)의 하나 이상의 잔기를 함유하는 에피토프에 결합한다. TNFR2 길항제 작제물의 일부 구현예에서, TNFR2 길항제는 하기 중에서 선택된 항체 또는 단편 또는 단쇄 형태의 항체이다:TNFR2 antagonists reduce and/or inhibit proliferation of bone marrow derived suppressor cells (MDSCs); and/or inducing apoptosis in MDSCs by binding to TNFR2 expressed on the surface of MDSCs present in the tumor microenvironment; and/or to induce expansion of T effector cells, including cytotoxic CD8 + T cells, through suppression of Treg expansion and activity. The TNFR2 antagonist in the construct is an epitope in human TNFR2 containing one or more of the residues KCRPG (corresponding to residues 142-146 of SEQ ID NO: 4), or for example residues 130-149, 137-144 or 142-149, or binds to a larger epitope containing at least 5 contiguous or discontinuous residues within these epitopes, and does not bind to an epitope containing residues KCSPG (corresponding to residues 56-60 of SEQ ID NO: 4); or the TNFR2 epitopes PECLSCGS (corresponding to residues 91-98 of SEQ ID NO: 4), RICTCRPG corresponding to residues 116-123 of SEQ ID NO: 4), CAPLRKCR (corresponding to residues 137-144 of SEQ ID NO: 4), LRKCRPGFGVA (corresponding to residues 140-150 of SEQ ID NO: 4), and/or VVCKPCAPGTFSN (corresponding to residues 159-171 of SEQ ID NO: 4), and/or residues 75-128, 86- of SEQ ID NO: 4 antibodies, antigen-binding fragments thereof, or single chain antibodies that bind to an epitope containing at least 5 contiguous or discontinuous residues within 103, 111-128, or 150-190. For example, an antibody, fragment thereof, or single-chain form thereof may comprise a KCRPG sequence with an affinity that is at least 10-fold greater than the affinity of the same antibody or antigen-binding fragment for a peptide containing the KCSPG sequence of human TNFR2 (SEQ ID NO: 839). (SEQ ID NO: 840). In some embodiments of the TNFR2 antagonist construct, the TNFR2 antagonist is an antibody or fragment or antibody in single chain form selected from:
TNFRAB1(각각 TNFRAB1의 중쇄 및 경쇄 서열에 대해서는 서열번호: 1212 및 1213 참조), TNFRAB2 및 TNFR2A3(예를 들어, 이들 항체에 대한 설명은 미국 특허 공개 제2019/0144556호 참조); TNFRAB1 (see SEQ ID NOs: 1212 and 1213 for the heavy and light chain sequences of TNFRAB1, respectively), TNFRAB2 and TNFR2A3 (see, eg, US Patent Publication No. 2019/0144556 for a description of these antibodies);
TNFRAB1 (QRVDGYSSYWYFDV; 서열번호: 1212의 잔기 99-112에 상응함), TNFRAB2 (ARDDGSYSPFDYWG; 서열번호: 1217) 또는 TNFR2A3 (ARDDGSYSPFDYFG; 서열번호: 1223), 또는 그와 적어도 약 85% 서열 동일성을 갖는 CDR-H3 서열, 예를 들어, TNFR2의 잔기 KCSPG를 함유하는 잔기 48-67보다 40-배 더 높은 친화도로 TNFR2의 잔기 KCRPG를 함유하는 잔기 130-149에 특이적으로 결합하는 TNFRAB1의 CDR-H3 서열을 함유하는 항체 및 항체 단편 및 단쇄 형태. 일부 구현예에서, TNFR2 길항제는 하기 중에서 선택된 TNFR2 내의 하나 이상의 에피토프에 결합한다: TNFRAB1 (QRVDGYSSYWYFDV; corresponding to residues 99-112 of SEQ ID NO: 1212), TNFRAB2 (ARDDGSYSPFDYWG; SEQ ID NO: 1217) or TNFR2A3 (ARDDGSYSPFDYFG; SEQ ID NO: 1223), or a CDR with at least about 85% sequence identity there - a CDR-H3 sequence of TNFRAB1 that specifically binds to residues 130-149 containing residues KCRPG of TNFR2 with 40-fold higher affinity than H3 sequence, e.g., residues 48-67 containing residues KCSPG of TNFR2. Antibodies and antibody fragments and single chain forms containing In some embodiments, the TNFR2 antagonist binds to one or more epitopes within TNFR2 selected from:
잔기 137-144(CAPLRKCR; 서열번호: 851)를 함유하는 에피토프;an epitope containing residues 137-144 (CAPLRKCR; SEQ ID NO: 851);
인간 TNFR2의 위치 80-86 (DSTYTQL; 서열번호: 1247), 91-98 (PECLSCGS; 서열번호: 1248), 및/또는 116-123 (RICTCRPG; 서열번호: 1249) 내에 하나 이상의 잔기를 포함하는 에피토프; 및an epitope comprising one or more residues within positions 80-86 (DSTYTQL; SEQ ID NO: 1247), 91-98 (PECLSCGS; SEQ ID NO: 1248), and/or 116-123 (RICTCRPG; SEQ ID NO: 1249) of human TNFR2 ; and
제1 에피토프로부터 선택된 TNFR2A3는 인간 TNFR2의 잔기 140-150 (LRKCRPGFGVA; 서열번호: 1463)을 포함하고 KCRPG 모티프를 함유하는 에피토프, 및/또는 인간 TNFR2의 잔기 159-171 (VVCKPCAPGTFSN; 서열번호: 1464)를 함유하는 제2 에피토프. TNFR2A3 selected from the first epitope is an epitope comprising residues 140-150 of human TNFR2 (LRKCRPGFGVA; SEQ ID NO: 1463) and containing a KCRPG motif, and/or residues 159-171 of human TNFR2 (VVCKPCAPGTFSN; SEQ ID NO: 1464) A second epitope containing
일부 구현예에서, 작제물 내의 TNFR2 길항제는 하기 중 하나 이상을 함유하는 항체, 이의 단편, 또는 그의 단쇄 형태이다: 인간화 길항적 TNFR2 항체를 생산하기 위해 서열번호: 1214, 1215, 및 1231-1233 중 임의의 것에 제시된 서열을 갖는 CDR-H1 아미노산, 1216, 1224, 및 1230 중 임의의 것에 제시된 CDR-H2 서열, 서열번호: 1217, 1223, 및 1225-1229 중 임의의 것에 제시된 CDR-H3 서열, 및/또는 서열번호: 1212의 잔기 99-112에 상응하는 TNFRAB1의 CDR-H3; 서열번호: 1218 및 1234-1236 중 임의의 것에 제시된 CDR-L1 서열, 및/또는 서열번호: 1213의 잔기 24-33에 상응하는 TNFRAB1의 CDR-L1 서열; 서열번호: 1219, 1220, 1237 및 1238 중 임의의 것에 제시된 CDR-L2 서열, 또는 서열번호: 1213의 잔기 49-55에 상응하는 TNFRAB1의 CDR-L2 서열; 및/또는 서열번호: 1221, 1222, 및 1241-1244 중 임의의 것에 제시된 CDR-L3 서열, 또는 서열번호: 1213의 잔기 88-96에 상응하는 TNFRAB1의 CDR-L3 서열; 및/또는 표현형 중성 TNFR2 특이적 항체의 상응하는 CDR 서열로 대체된 서열번호: 1245의 인간 항체 중쇄 가변 도메인의 공통 서열의 CDR-H1 및 CDR-H2 서열, 및/또는 표현형 중성 TNFR2 특이적 항체의 상응하는 CDR 서열로 대체된 서열번호: 1246의 인간 항체 경쇄 가변 도메인의 서열의 CDR-L1, CDR-L2 및 CDR-L3 서열. 예를 들어, 작제물은 서열번호: 1247-1464 중 어느 하나에 제시된 TNFR2 내의 에피토프에 특이적으로 결합하는 TNFR2 길항제를 포함한다. 일부 구현예에서, TNFR2 길항제는 하기 중에서 선택된 에피토프(들)에 특이적으로 결합한다:In some embodiments, the TNFR2 antagonist in the construct is an antibody, fragment thereof, or single chain form thereof containing one or more of SEQ ID NOs: 1214, 1215, and 1231-1233 to produce a humanized antagonistic TNFR2 antibody. A CDR-H1 amino acid having the sequence set forth in any, a CDR-H2 sequence set forth in any of 1216, 1224, and 1230, a CDR-H3 sequence set forth in any of SEQ ID NOs: 1217, 1223, and 1225-1229, and /or CDR-H3 of TNFRAB1 corresponding to residues 99-112 of SEQ ID NO: 1212; the CDR-L1 sequence set forth in any of SEQ ID NOs: 1218 and 1234-1236, and/or the CDR-L1 sequence of TNFRAB1 corresponding to residues 24-33 of SEQ ID NO: 1213; the CDR-L2 sequence set forth in any of SEQ ID NOs: 1219, 1220, 1237 and 1238, or the CDR-L2 sequence of TNFRAB1 corresponding to residues 49-55 of SEQ ID NO: 1213; and/or a CDR-L3 sequence set forth in any of SEQ ID NOs: 1221, 1222, and 1241-1244, or a CDR-L3 sequence of TNFRAB1 corresponding to residues 88-96 of SEQ ID NO: 1213; and/or the CDR-H1 and CDR-H2 sequences of the consensus sequence of the human antibody heavy chain variable domain of SEQ ID NO: 1245 replaced by the corresponding CDR sequences of a phenotype neutral TNFR2 specific antibody, and/or of a phenotype neutral TNFR2 specific antibody. CDR-L1, CDR-L2 and CDR-L3 sequences of the sequence of the human antibody light chain variable domain of SEQ ID NO: 1246 replaced by the corresponding CDR sequences. For example, the construct includes a TNFR2 antagonist that specifically binds to an epitope in TNFR2 set forth in any one of SEQ ID NOs: 1247-1464. In some embodiments, the TNFR2 antagonist specifically binds to an epitope(s) selected from:
(a) 서열번호: 4의 잔기 142-146에 상응하는 잔기 KCRPG, 또는 잔기 130-149, 137-144 또는 142-149, 또는 이들 에피토프 내에 적어도 5개의 연속 또는 불연속 잔기를 함유하는 더 큰 에피토프 중 하나 이상을 함유하고, 서열번호: 4의 잔기 56-60에 상응하는 잔기 KCSPG를 함유하는 에피토프에 결합하지 않는 인간 TNFR2 내의 하나 이상의 에피토프; 및/또는(a) residues KCRPG corresponding to residues 142-146 of SEQ ID NO: 4, or residues 130-149, 137-144 or 142-149, or a larger epitope containing at least 5 contiguous or discontinuous residues within these epitopes; at least one epitope in human TNFR2 that contains at least one that does not bind to an epitope containing residues KCSPG corresponding to residues 56-60 of SEQ ID NO:4; and/or
(b) 하기를 포함하는 아미노산 서열을 포함하는 하나 이상의 TNFR2 에피토프:(b) one or more TNFR2 epitopes comprising an amino acid sequence comprising:
서열번호: 4의 잔기 91-98에 상응하는 PECLSCGS, 및/또는 서열번호: 4의 잔기 116-123에 상응하는 RICTCRPG, 및/또는PECLSCGS corresponding to residues 91-98 of SEQ ID NO: 4, and/or RICTCRPG corresponding to residues 116-123 of SEQ ID NO: 4, and/or
CAPLRKCR (서열번호: 4의 잔기 137-144에 상응함), 및/또는 LRKCRPGFGVA (서열번호: 4의 잔기 140-150에 상응함), 및/또는VVCKPCAPGTFSN (서열번호: 4의 잔기 159-171에 상응함), 및/또는 CAPLRKCR (corresponding to residues 137-144 of SEQ ID NO: 4), and/or LRKCRPGFGVA (corresponding to residues 140-150 of SEQ ID NO: 4), and/or VVCKPCAPGTFSN (corresponding to residues 159-171 of SEQ ID NO: 4) equivalent), and/or
서열번호: 4의 잔기 75-128, 86-103, 111-128, 또는 150-190 내에 적어도 5개의 연속 또는 불연속 잔기를 함유하는 에피토프.An epitope containing at least 5 contiguous or discontinuous residues within residues 75-128, 86-103, 111-128, or 150-190 of SEQ ID NO:4.
일부 구현예에서, TNFR2 길항제 작제물은 소분자인 TNFR2 길항제를 포함한다. 예를 들어, TNFR2 길항제는 탈리도마이드 또는 그의 유사체, 예컨대 레날리도마이드 및 포말리도마이드이다. In some embodiments, a TNFR2 antagonist construct comprises a TNFR2 antagonist that is a small molecule. For example, a TNFR2 antagonist is thalidomide or its analogues, such as lenalidomide and pomalidomide.
일부 구현예에서, TNFR2 길항제 작제물은 FoxP3 발현을 감소시키고 Treg의 억제 활성을 억제하는 TNFR2 길항제를 포함한다. 그러한 길항제의 예는 FoxP3 발현을 감소시키고 Treg의 억제 활성을 억제하는 히스톤 탈아세틸화효소 억제제이다. 그러한 억제제의 예는 파노비노스타트 또는 사이클로포스파미드 또는 트립톨리드이다.In some embodiments, the TNFR2 antagonist construct comprises a TNFR2 antagonist that reduces FoxP3 expression and inhibits the suppressive activity of Tregs. An example of such an antagonist is a histone deacetylase inhibitor that reduces FoxP3 expression and inhibits the suppressive activity of Tregs. Examples of such inhibitors are panobinostat or cyclophosphamide or triptolide.
TNFR2 작제물은 감염성 질환의 치료 방법 및 용도, 및 TNFR2를 발현하는 암 치료에 사용될 수 있다. 그러한 암의 예는 하기 중에서 선택되는 암이다: T 세포 림프종, 예컨대 호지킨 림프종 및 피부 비-호지킨 림프종, 난소암, 결장암, 다발성 골수종, 신장 세포 암종, 유방암, 자궁경부암, 자궁내막암, 신경교종, 두경부암, 간암, 및 폐암.TNFR2 constructs can be used in methods and uses for the treatment of infectious diseases, and in the treatment of cancers that express TNFR2. Examples of such cancers are cancers selected from: T cell lymphomas such as Hodgkin's lymphoma and cutaneous non-Hodgkin's lymphoma, ovarian cancer, colon cancer, multiple myeloma, renal cell carcinoma, breast cancer, cervical cancer, endometrial cancer, neurological glioma, head and neck cancer, liver cancer, and lung cancer.
아래 및 우선권 출원에 제시된 청구항 및 그 요지는 본 요약에 참조로 포함된다.The claims set forth below and in the priority applications and their summary are hereby incorporated by reference into this summary.
도 1은 TE19080L이 삽입된 단편인 CMV 프로모터를 함유하는 pCBL-1 발현 플라스미드의 플라스미드 맵(map)을 도시한다.
도 2는 TNFR1 억제제(TNFR1 길항제) 및 TNFR2 효능제와 같은 2개의 리간드를 연결하는 링커(힌지 영역의 일부) 및 활성 변형제를 갖는 예시적인 이중-특이성 작제물을 제시한다.
도 3a 내지 도 3d는 복수의 부위에서 하나 이상의 표적 또는 하나의 표적과 상호작용하는 2개 이상의 모이어티를 제시/제공하기 위한 예시적인 PEG-중심 다중특이적 작제물을 도시한다. 도 3a는 예시적인 2가 작제물을 도시한다. 예를 들어, 원(circle) 내의 하나는 폴리펩티드 효능제, 길항제 또는 결합 단백질, 예를 들어 항체 또는 그의 항원 결합 단편, 또는 압타머(핵산 또는 펩티드)이다. 다른 원은 관심 표적과 상호 작용하는 다당류 또는 수용체 리간드 또는 다른 모이어티를 나타낸다. 2가 특성은 수용체 활성화를 위한 표적의 클러스터링을 제공한다. 본 명세서에 제공된 구현예에서, 표적은 TNFR1 및 TNFR2를 포함하고; 본 명세서 전체에 기재된 바와 같이, 모이어티는 TNFR1 신호전달을 억제하는 모이어티와 같은 TNFR1 억제제, 및 TNFR2 효능제 또는 Treg 확장제인 다른 모이어티를 포함한다. 도 3b는 CD3+와 같은 1가 단일 리간드가 PEG 모이어티를 통해 수용체 클러스터링에 대해 2가인 효능제, 길항제 또는 결합 단백질에 연결된 사이토카인 방출 증후군을 예방하는 것을 보여준다. 다시 예시적인 표적은 TNFR1 및/또는 TNFR2를 포함한다. 도 3c는 2개의 상이한 세포 표적화제, 또는 동일한 수용체 상의 상이한 부위에 결합하는 2개의 제제, 예컨대 트라스투주맙 및 페르투주맙 또는 그의 일부를 가교결합시키기 위한 이종이중작용성 PEG를 도시한다. 이 작제물은 예를 들어 면역 반응의 자극 또는 억제를 위한 체크포인트 제어 수용체를 클러스터링하기 위해, 또는 두 개의 상이한 수용체를 가교하여 수용체 활성(즉, CD3 대 CD450)의 억제를 달성하기 하거나, 또는 자극 및 공동 자극 리간드와 같은 2개의 상이한 리간드를 동일한 세포의 2개의 상이한 수용체에 전달하기 위해 사용될 수 있다. 도 3d는 사슬 길이에 따라 동일하거나 상이한 세포에 동일한 수용체를 클러스터링하거나 TNF와 같은 가용성 수용체 또는 리간드와 같은 순환 질환 표적을 포획하기 위한 동종이중작용성 PEG를 도시한다. 추가로 이들 모든 구현예에서 또 다른 반응성 기 또는 작용기, 예컨대 혈청 반감기 연장 모이어티, 예컨대 HSA, 또는 FcRn 폴리펩티드에 선택적으로 연결된 추가의 PEG 측쇄는 이들 작제물에 포함될 수 있다. PEG 모이어티는 결합 모이어티의 제시를 위해 유사한 특성을 갖는 모이어티로 변형되거나 대체될 수 있다.
도 4는 본 명세서에 기재된 바와 같은 TNFR1 억제제 및/또는 TNFR2 효능제와 같은 결합 모이어티 또는 반응성 모이어티를 표시하거나 제공하기 위한 PEG 중심 작제물의 추가의 예시적인 배열 및 구조를 도시한다.
도 5는 TNFR1 억제제 및/또는 TNFR2 효능제와 같은 결합 모이어티 또는 반응성 모이어티를 표시하거나 제공하기 위한 PEG 중심 작제물의 추가의 예시적인 배열 및 구조를 도시한다. X 및 Y는 리간드 및 반응성 모이어티일 수 있다.Figure 1 shows a plasmid map of the pCBL-1 expression plasmid containing the CMV promoter, a fragment into which TE19080L has been inserted.
Figure 2 shows an exemplary dual-specific construct with a linker (part of the hinge region) and an active modifier connecting two ligands, such as a TNFR1 inhibitor (TNFR1 antagonist) and a TNFR2 agonist.
3A-3D depict exemplary PEG-centric multispecific constructs for presenting/providing one or more targets or two or more moieties that interact with one target at multiple sites. 3A depicts an exemplary bivalent construct. For example, one in the circle is a polypeptide agonist, antagonist or binding protein, such as an antibody or antigen-binding fragment thereof, or an aptamer (nucleic acid or peptide). Other circles represent polysaccharides or receptor ligands or other moieties that interact with the target of interest. The bivalent nature provides clustering of targets for receptor activation. In embodiments provided herein, targets include TNFR1 and TNFR2; As described throughout this specification, moieties include TNFR1 inhibitors, such as moieties that inhibit TNFR1 signaling, and other moieties that are TNFR2 agonists or Treg expanders. 3B shows that monovalent single ligands such as CD3+ prevent cytokine release syndrome linked via PEG moieties to agonists, antagonists or binding proteins that are bivalent for receptor clustering. Again exemplary targets include TNFR1 and/or TNFR2. 3C depicts a heterobifunctional PEG for crosslinking two different cellular targeting agents, or two agents that bind to different sites on the same receptor, such as Trastuzumab and Pertuzumab or portions thereof. This construct can be used, for example, to cluster checkpoint control receptors for stimulation or inhibition of an immune response, or to bridge two different receptors to achieve inhibition of receptor activity (i.e., CD3 versus CD450), or to stimulate and to deliver two different ligands, such as co-stimulatory ligands, to two different receptors on the same cell. Figure 3D depicts homobifunctional PEG for capturing circulatory disease targets such as ligands or soluble receptors such as TNF or clustering the same receptors on the same or different cells depending on the chain length. Additionally in all of these embodiments another reactive group or functional group, such as a serum half-life extending moiety such as HSA, or an additional PEG side chain optionally linked to the FcRn polypeptide may be included in these constructs. The PEG moiety can be modified or replaced by moieties with similar properties to present a binding moiety.
4 depicts additional exemplary configurations and structures of PEG-centric constructs for displaying or providing binding moieties or reactive moieties such as TNFR1 inhibitors and/or TNFR2 agonists as described herein.
5 depicts additional exemplary configurations and structures of PEG-centric constructs for displaying or providing binding moieties or reactive moieties, such as TNFR1 inhibitors and/or TNFR2 agonists. X and Y can be ligands and reactive moieties.
상세한 설명 details
개요 outline
A. 정의A. Definition
B. 작제물 및 방법의 개요B. Overview of Constructs and Methods
C 종양 괴사 인자(TNF) 및 만성 염증성 및 자가면역 질환 및 장애 C Tumor necrosis factor (TNF) and chronic inflammatory and autoimmune diseases and disorders
1. 종양 괴사 인자(1. Tumor necrosis factor ( TNFTNF ))
2. 종양 괴사 인자 수용체(2. Tumor necrosis factor receptor ( TNFRTNFR ))
a. a. TNFR1TNFR1
b. b. TNFR2TNFR2
3. 조절 T 세포(3. Regulatory T cells ( TregTreg ) 및 자가면역 미세환경에서의 역할) and its role in the autoimmune microenvironment
4. TNF에 의해 매개되거나 그를 수반하는 자가면역/염증성 질환 4. Autoimmune/inflammatory diseases mediated by or accompanying TNF
a. 관절염 a. arthritis
i. i. 류마티스성rheumatic 관절염 및 다른 유형의 관절염 arthritis and other types of arthritis
b. 염증성 장 질환(b. inflammatory bowel disease ( IBDIBD ) 및 포도막염 ) and uveitis
c. 섬유성 질환c. fibrotic disease
d. 종양 괴사 인자 수용체 연관 주기성 증후군(TRAPS)d. Tumor Necrosis Factor Receptor Associated Cyclic Syndrome (TRAPS)
e. e. TNF에to TNF 의해 due to 매개되거나mediated 그를 수반하는 다른 질환 other diseases that accompany him
i. 신경퇴행 질환i. neurodegenerative disease
a) 알츠하이머병a) Alzheimer's disease
b) 파킨슨병 b) Parkinson's disease
c) 다발성 경화증(MS)c) multiple sclerosis (MS)
ii. 자궁내막증ii. endometriosis
iii. 심혈관 질환iii. cardiovascular disease
iv. 급성 호흡 곤란 증후군(iv. acute respiratory distress syndrome ( ARDSARDS ))
v. 중증 급성 호흡기 증후군(SARS) 및 v. severe acute respiratory syndrome (SARS) and COVIDCOVID -19-19
D. D. 류마티스성rheumatic 관절염 및 다른 만성 염증성 자가면역 질환 및 장애에 대한 요법 Therapy for arthritis and other chronic inflammatory autoimmune diseases and disorders
1. 종래의 합성 질환 조절 항-1. Conventional synthetic disease modulating anti- 류마티스rheumatism 약물( drug( csDMARDcsDMARD ))
2. 항-2. Anti- TNFTNF 요법/ therapy/ TNFTNF 차단제 blocker
E. TNFR1/TNFR2 표적 치료제E. TNFR1/TNFR2 Targeted Therapies
1. One. TNFR1TNFR1 선택적 길항제 selective antagonist
a. a. TNFR1TNFR1 길항적 항체 antagonistic antibody
b. 1가 b. 1st TNFR1TNFR1 길항적 항체/항체 단편 Antagonistic antibody/antibody fragment
i. i. FabFab 및 and scFvscFv 기반 base TNFR1TNFR1 길항제 antagonist
ii. 도메인 항체(ii. domain antibody ( dAbdAb ) 기반 ) base TNFR1TNFR1 길항제 antagonist
a) 항-a) Anti- TNFR1TNFR1 dAbdAb -항-알부민 -anti-albumin dAbdAb 융합 fusion 작제물construct
b) b) GSK1995057GSK1995057 및 and GSK2862277로with GSK2862277 지정된 도메인 항체 단편 designated domain antibody fragments
iii. iii. 나노바디nanobody (( NbNb ) )
iv. 항-iv. port- TNFR1TNFR1 나노바디nanobody -항-알부민 -anti-albumin 나노바디nanobody 융합 fusion 작제물construct
c. c. TNFTNF (( DNDN -- TNFTNF )/)/ TNFTNF 뮤테인의mutein 우성-음성 억제제 dominant-negative inhibitor
2. 2. TNFR2TNFR2 선택적 optional 효능제agonist
a. a. TNFR2TNFR2 효능적effective 항체 antibody
b. b. TNFR2TNFR2 선택적 optional TNFTNF 뮤테인mutein 및 그의 융합 and fusions thereof
3. 항-3. Anti- TNFR2TNFR2 길항적 항체 및 antagonistic antibodies and 소분자small molecule 억제제 inhibitor
F. TNFR1 및/또는 TNFR2 축의 선택적 표적화F. Selective targeting of the TNFR1 and/or TNFR2 axis
1. One. TNFR1TNFR1 길항제에 의한 by antagonists TNFR1의TNFR1 선택적 차단 selective blocking
2. 2. TNFR2TNFR2 효능제에to agonist 의한 by TNFR2의TNFR2 선택적 활성화 Selective activation
3. 3. TNFR1TNFR1 길항제 antagonist 작제물construct , , TNFR2TNFR2 효능제agonist 작제물construct ; 이중 ; double 특이적을be specific 포함하는 다중특이적, multispecific, including TNFR1TNFR1 길항제 및 antagonist and TNFR2TNFR2 효능제agonist 작제물construct
4. 4. TNFR1TNFR1 길항제 antagonist 작제물construct , , TNFR2TNFR2 효능제agonist 작제물construct ; 및 이중 ; and double 특이적을be specific 포함하는 다중특이적, multispecific, including TNFR1TNFR1 길항제/ antagonist/ TNFR2TNFR2 효능제agonist 작제물의of the construct 성분 ingredient
a. a. TNFR1TNFR1 억제제 inhibitor 모이어티moiety (( TNFR1TNFR1 길항제) antagonist)
b. b. TNFR2TNFR2 효능제agonist 작제물construct 및 and TNFR2TNFR2 길항제 antagonist 작제물construct
c. 링커c. linker
i. 펩티드 링커i. peptide linker
a) a) 가요성flexibility 링커 linker
b) 강직 링커b) rigid linkers
ii. 화학 링커ii. chemical linker
d. 활성 d. activation 변형제modifier
i. i. FcFc 부분에 대한 변형transformation of the part
a) 놉-인-홀a) Knob-in-hole
b) 신생아 b) newborn FcFc 수용체( receptor ( FcRnFcRn ) 재순환을 강화시키는 변형) strains that enhance recirculation
c) c) FcFc 면역 immune 이펙터effector 기능의 강화 또는 감소/제거 Enhancement or reduction/elimination of function
ii. ii. FcFc 부분의 다른 변형 different variations of parts
iii. 인간 혈청 알부민iii. human serum albumin
e. 다중특이적 e. multispecific TNFR1TNFR1 길항제/ antagonist/ TNFR2TNFR2 효능제agonist 작제물construct
이중 특이적, dual specific, TNFR1TNFR1 길항제/ antagonist/ TNFR2TNFR2 효능제agonist 작제물과construct and 같은 다중특이적 작제물, PEG 중심 다중특이적 Same multispecific construct, PEG centered multispecific 작제물의of the construct 성분을 연결하기 위한 to connect the components PEG화PEGization
f. 추가 활성 f. more active 변형제modifier - 혈청 반감기를 증가시키는 부분 또는 전체 폴리펩티드를 포함하는 융합 단백질 - fusion proteins comprising partial or whole polypeptides that increase serum half-life
5. 단백질 치료제의 면역원성의 예측 및 제거5. Prediction and elimination of immunogenicity of protein therapeutics
a. B-세포 및 T-세포 a. B-cells and T-cells 에피토프epitope
b. b. 인실리코in silico 에피토프epitope 예측 방법 Prediction method
i. B-세포 i. B-cell 에피토프의epitope 인실리코in silico 예측 prediction
ii. T-세포 ii. T-cell 에피토프의epitope 인실리코in silico 예측 prediction
iii. 펩티드-iii. peptide- MHCMHC 클래스 II 결합 예측 Class II binding prediction
c. 시험관 내 c. in vitro 에피토프epitope 예측 방법 Prediction method
i. 시험관 내 B-세포 i. B-cells in vitro 에피토프epitope 예측 방법 Prediction method
ii. 시험관 내 T-세포 ii. T-cells in vitro 에피토프epitope 예측 방법 Prediction method
MHCMHC // HLAHLA 결합 검정 combination test
iii. 시험관 내 T-세포 검정iii. In vitro T-cell assay
d. 생체 내 d. in vivo 에피토프epitope 예측 방법 Prediction method
e. 예측된 B-세포 및 T-세포 e. Predicted B-cells and T-cells 에피토프epitope 제거( eliminate( 탈면역화deimmunization ))
G. 범-성장 인자 트랩 폴리펩티드G. pan-growth factor trap polypeptide
1. 수용체 티로신 1. Receptor tyrosine 키나제Kinase (( RTKRTK ))
a. 인간 표피 성장 인자 수용체(HER) a. human epidermal growth factor receptor (HER) 패밀리family
b. 인간 표피 성장 인자 수용체(HER) b. human epidermal growth factor receptor (HER) 패밀리family 및 그의 리간드와 연련된 질환 and diseases associated with its ligands
2. 범-성장 인자 억제2. Pan-growth factor inhibition
a. RB242 리간드 트랩a. RB242 Ligand Trap
b. 자가면역 질환 치료를 위한 RB200 및 RB242b. RB200 and RB242 for the treatment of autoimmune diseases
c. RB242 리간드 트랩c. RB242 Ligand Trap
3. 최적화된 다중특이적, 예컨대 3. Optimized multispecific, such as 이중특이적bispecific , 성장 인자 트랩 , growth factor trap 작제물construct
a. a. 세포외extracellular 도메인( domain( ECDECD ) 폴리펩티드) polypeptide
b. b. 세포외extracellular 도메인에 대한 변형Variations on Domains
c. c. 다량체화multimerization 도메인 domain
d. d. FcFc 도메인에 대한 변형Variations on Domains
i. 놉-인-홀의 도입i. Introduction of knob-in-hole
ii. 신생아 ii. newborn baby FcFc 수용체( receptor ( FcRnFcRn ) 재순환을 강화시키는 변형) strains that enhance recirculation
iii. iii. 이펙터effector 기능 function
4. 조성물, 치료 용도 및 치료 방법4. Compositions, therapeutic uses and methods of treatment
a. 약제학적 조성물a. pharmaceutical composition
b. 치료 용도 및 치료 방법b. Therapeutic uses and methods of treatment
5. 병용 요법5. Combination therapy
H. H. TNFR1TNFR1 길항제 및 antagonist and TNFR1TNFR1 길항제/ antagonist/ TNFR2TNFR2 효능제agonist 작제물construct 활성 및 효능의 평가 Evaluation of activity and efficacy
1. 질환 활성 점수(1. Disease activity score ( DAS28DAS28 ))
2. 2. 피분석물analyte 정량화를 위한 for quantification SOMAscanSOMAscan ®® 단백체prote 분석 및 다른 analysis and other 단백체prote 도구 equipment
3. 요법에 대한 반응성을 예측하고 치료로부터 이익을 얻을 가능성이 있는 3. Predict responsiveness to therapy and are likely to benefit from therapy 대상체를object 선택하기 위한 to choose 전사체transcriptome 분석 analyze
4. L929 세포독성 검정 4. L929 Cytotoxicity Assay
5. 5. HeLaHeLa IL-8 검정 IL-8 assay
6. 6. HUVECHUVEC 검정 black
7. 7. TregTreg 세포 활성의 정량화 및 평가 Quantification and evaluation of cell activity
8. 8. TNFR1TNFR1 길항제/ antagonist/ TNFR2TNFR2 효능제agonist 작제물의of the construct 결합 특성 평가 Bond characterization
9. 항체 의존적 세포독성(9. Antibody-dependent cytotoxicity ( ADCCADCC ) 및 ) and 보체complement 의존적 세포독성( dependent cytotoxicity ( CDCCDC ) 검정) black
10. 질환 모델10. Disease Model
a. 콜라겐 유도 관절염(CIA)a. Collagen Induced Arthritis (CIA)
b. b. 류마티스성rheumatic 관절염 활막 arthritis synovial 단핵mononuclear 세포 배양 cell culture
c. 관절염의 c. arthritic Tg197Tg197 마우스 모델 mouse model
d. 관절염/d. arthritis/ IBD의of IBD Δ Δ AREARE 마우스 모델 mouse model
e. 인간화 e. humanization TNFTNF // TNFR2TNFR2 마우스 mouse
I. I. TNFR1TNFR1 길항제 antagonist 작제물construct 및 and TNFR1TNFR1 길항제/ antagonist/ TNFR2TNFR2 효능제agonist 작제물을construct 인코딩하는 핵산을 생산하는 방법 Methods of producing nucleic acids that encode
1. One. TNFR1TNFR1 길항제 및 antagonist and TNRF2TNRF2 효능제agonist 폴리펩티드를 인코딩하는 핵산의 단리 또는 제조 Isolation or Preparation of Nucleic Acids Encoding Polypeptides
2. 돌연변이체 또는 변형된 핵산 및 인코딩 폴리펩티드의 생성2. Generation of Mutant or Modified Nucleic Acids and Encoding Polypeptides
3. 벡터 및 세포3. Vectors and Cells
4. 발현4. Expression
a. 원핵 세포a. prokaryotic cell
b. 효모 세포b. yeast cells
c. 곤충 및 곤충 세포c. insects and insect cells
d. 포유동물 발현 세포d. mammalian expression cells
e. 식물e. plant
5. 정제5. Refining
6. 추가 변형 6. Additional variations
a. a. PEG화PEGization
b. b. 알부민화albuminization
c. 정제 태그c. tablet tag
7. 핵산 분자 및 유전자 요법7. Nucleic Acid Molecules and Gene Therapy
J. 조성물, 제형 및 복용량 J. Composition, Formulation and Dosage
1. 제형1. Formulation
2. 2. TFNR1TFNR1 길항제 antagonist 작제물construct , , TNFR2TNFR2 효능제agonist 작제물construct , 다중특이적, 예를 들어 , multispecific, for example 이중특이적bispecific , , 작제물construct 및 핵산의 투여 and administration of nucleic acids
3. 폴리펩티드를 인코딩하는 핵산의 투여(유전자 요법)3. Administration of Nucleic Acids Encoding Polypeptides (Gene Therapy)
K. 치료 용도 및 치료 방법K. Therapeutic Uses and Methods of Treatment
1. 만성 염증/자가면역 질환 및 장애의 치료1. Treatment of chronic inflammatory/autoimmune diseases and disorders
2. 신경퇴행 및 2. Neurodegeneration and 탈수초dehydration 질환 및 장애의 치료 Treatment of Diseases and Disorders
3. 암 및 다른 면역억제 질환, 장애 및 3. Cancer and other immunosuppressive diseases, disorders and 병태의pathological 치료 therapy
4. 병용 요법4. Combination therapy
L. 실시예L. Examples
A. 정의A. Definition
달리 정의되지 않는 한, 본 명세서에 사용된 모든 기술적 및 과학적 용어는 본 발명(들)이 속하는 기술 분야의 숙련자가 통상적으로 이해하는 것과 동일한 의미를 갖는다. 모든 특허, 특허 출원, 공개된 출원 및 공보, GenBank 서열, 데이터베이스, 웹사이트 및 본 명세서의 전체 개시 전반에 걸쳐 언급된 다른 공개된 자료는 달리 언급되지 않는 한 그 전체가 참조로 포함된다. 본 명세서에서 용어에 대한 복수의 정의가 있는 경우, 본 섹션의 정의가 우선한다. URL 또는 다른 그러한 식별자 또는 주소에 대한 참조가 있는 경우, 그러한 식별자는 변경될 수 있고, 인터넷 상에서 특정한 정보가 왔다 갔다 할 수 있지만, 인터넷을 검색하면 동등한 정보를 찾을 수 있는 것으로 이해된다. 이에 대한 참조는 그러한 정보의 이용 가능성 및 대중 보급을 입증한다.Unless defined otherwise, all technical and scientific terms used herein have the same meaning as commonly understood by one of ordinary skill in the art to which the invention(s) belong. All patents, patent applications, published applications and publications, GenBank sequences, databases, websites, and other published material referenced throughout the entire disclosure of this specification are incorporated by reference in their entirety unless otherwise indicated. In the event that there are multiple definitions for terms in this specification, the definitions in this section shall prevail. Where reference is made to a URL or other such identifier or address, it is understood that such identifiers may change and certain information may come and go on the Internet, but equivalent information may be found by searching the Internet. Reference thereto demonstrates the availability and public dissemination of such information.
본 명세서에서 사용된 바와 같이, 작제물은 하나 이상의 구성요소, 일반적으로 적어도 2개를 함유하는 생성물이다. 구성요소는 폴리펩티드, 소분자, 압타머, 핵산, 및/또는 본 명세서에 기재되거나 당업자에게 공지된 바와 같은 다른 그러한 구성요소일 수 있다. 다양한 작제물이 본 명세서에 기재되고 예시되며; 이들의 구성요소 및 다양성은 본 명세서의 설명으로부터 명백하다. 설명의 관점에서 당업자는 본 명세서의 개시 및 청구범위 내에 있는 다른 작제물을 구상할 수 있다. 용어 작제물은 생성물이 다양한 상이한 유형의 구성요소를 포함할 수 있기 때문에 이용된다.As used herein, a construct is a product containing one or more components, usually at least two. A component can be a polypeptide, small molecule, aptamer, nucleic acid, and/or other such component as described herein or known to those skilled in the art. A variety of constructs are described and exemplified herein; Their components and variations are apparent from the description herein. In view of the description, one skilled in the art may envision other constructs that are within the scope of the present disclosure and claims. The term construct is used because a product can contain a variety of different types of components.
본 명세서에서 사용된 바와 같이, TNFR1 작제물 또는 TNFR2 길항제 작제물인 작제물은 TNFR1 억제제 모이어티를 포함하는 작제물이고, 이는 TNFR1 활성, 예컨대 신호전달을 억제하거나 감소시키는 모이어티이다.As used herein, a construct that is a TNFR1 construct or a TNFR2 antagonist construct is a construct comprising a TNFR1 inhibitor moiety, which is a moiety that inhibits or reduces TNFR1 activity, such as signaling.
본 명세서에서 사용된 바와 같이, TNFR2 작제물 또는 TNFR2 효능제 작제물인 작제물은 TNFR2 효능제 모이어티를 포함하는 작제물이고, 이는 TNFR2의 활성, 예컨대 Treg 세포를 증가시키는 신호전달 또는 활성을 활성화하거나 유도하는 모이어티이다.As used herein, a construct that is a TNFR2 construct or a TNFR2 agonist construct is a construct comprising a TNFR2 agonist moiety, which activates the activity of TNFR2, such as signaling or activity that increases Treg cells. It is a moiety that induces or induces.
본 명세서에서 사용된 바와 같이, TNFR2 길항제 작제물인 작제물은 TNFR2 길항제를 포함하는 작제물이다.As used herein, a construct that is a TNFR2 antagonist construct is a construct comprising a TNFR2 antagonist.
본 명세서에서 사용된 바와 같이, 다중 특이적 작제물인 작제물은 하나 초과의 길항제 또는 효능제 또는 둘 다의 모이어티, 예컨대 TNFR1 억제제 및 TNFR2 효능제를 함유하는 작제물, 또는 2개의 TNRF1 길항제, 예컨대 각각이 TNFR1 상의 상이한 에피토프와 상호작용하거나 각각이 상이한 TNFR1 길항제 활성을 갖는 길항제, 또는 2개의 TNFR2 효능제, 예컨대 각각이 상이한 TNFR2 에피토프와 상호작용하거나 각각이 상이한 TNFR2 효능제 활성을 갖는 효능제를 함유하는 작제물을 포함하는 작제물이다.As used herein, a construct that is a multispecific construct is a construct containing more than one antagonist or agonist or both moieties, such as a TNFR1 inhibitor and a TNFR2 agonist, or two TNRF1 antagonists, antagonists, each interacting with a different epitope on TNFR1 or each having a different TNFR1 antagonist activity, or two TNFR2 agonists, such as agonists each interacting with a different TNFR2 epitope or each having different TNFR2 agonist activity. It is a construct comprising a construct containing.
본 명세서에서 사용된 바와 같이, "종양 괴사 인자", "종양 괴사 인자 알파", "TNF", "TNF-알파", "TNF-α" 및 "TNFα"는 TNF 슈퍼패밀리의 구성원이고, 종양 형성/암의 조절, 병원성 감염에 대한 숙주 방어, 세포자멸사, 자가면역 및 패혈성 쇼크를 포함하는 염증성 및 면역-조절 활성과 연관되는 다면발현성 염증유발 사이토카인을 지칭하기 위해 상호 교환적으로 사용된다. TNF 슈퍼패밀리의 다른 구성원이 의도될 때, 이는 명칭에 의해 확인될 것이다. TNF는 선천적 및 적응성 면역 반응의 협응뿐만 아니라 기관 형성, 특히 림프양 기관의 형성에 관여한다. TNF는 프로테아제 TACE(TNF 알파 전환 효소; ADAM17로도 알려져 있음)에 의해 절단되어 가용성 TNF(solTNF)를 방출할 수 있는 233개의 아미노산을 함유하는 동종삼량체 막-결합 단백질로서 생산되고, 이는 157개의 아미노산을 함유하며; TNF의 막-결합 및 가용성 형태는 생물학적으로 활성이다. TNF의 동종삼량체는 2개의 고-친화성, 특이적 수용체인 TNFR1 및 TNFR2에 결합하고, 이를 통해 신호를 전달하며; 막-결합 TNF는 주로 TNFR2를 활성화하는 반면, 가용성 TNF는 주로 TNFR1을 활성화한다. TNF의 조절되지 않거나 조절이상 생산은, 예를 들어 패혈성 쇼크, 류마티스성 관절염, 건선, 건선성 관절염, 강직성 척추염, 소아 특발성 관절염 및 염증성 장 질환(IBD)을 포함하지만 이들에 제한되지 않는 몇 개의 만성 염증성 및 자가면역 질환 및 병태뿐만 아니라, 예를 들어 알츠하이머병, 파킨슨병, 뇌졸중 및 다발성 경화증을 포함하지만 이들에 제한되지 않는 신경퇴행성 및 탈수초 질환 및 병태와 연관된다.As used herein, “tumor necrosis factor”, “tumor necrosis factor alpha”, “TNF”, “TNF-alpha”, “TNF-α” and “TNFα” are members of the TNF superfamily and are tumorigenic / are used interchangeably to refer to pleiotropic pro-inflammatory cytokines that are associated with inflammatory and immune-regulatory activities including regulation of cancer, host defense against pathogenic infection, apoptosis, autoimmunity and septic shock . When other members of the TNF superfamily are intended, they will be identified by name. TNF is involved in the coordination of innate and adaptive immune responses as well as in organogenesis, particularly the formation of lymphoid organs. TNF is produced as a homotrimeric membrane-bound protein containing 233 amino acids that can be cleaved by the protease TACE (TNF alpha converting enzyme; also known as ADAM17) to release soluble TNF (solTNF), which has 157 amino acids contains; Membrane-bound and soluble forms of TNF are biologically active. The homotrimer of TNF binds to and signals through two high-affinity, specific receptors, TNFR1 and TNFR2; Membrane-bound TNF primarily activates TNFR2, whereas soluble TNF primarily activates TNFR1. Dysregulated or dysregulated production of TNF is associated with several conditions including but not limited to, for example, septic shock, rheumatoid arthritis, psoriasis, psoriatic arthritis, ankylosing spondylitis, juvenile idiopathic arthritis and inflammatory bowel disease (IBD). It is associated with chronic inflammatory and autoimmune diseases and conditions, as well as neurodegenerative and demyelinating diseases and conditions including, but not limited to, eg, Alzheimer's disease, Parkinson's disease, stroke and multiple sclerosis.
본 명세서에서 사용된 바와 같이, "TNF 뮤테인" 또는 "TNF-α 뮤테인" 또는 "변형된 TNF 폴리펩티드"는 특정 종으로부터의 TNF에 대해 상응하는 야생형 TNF(TNFα)의 아미노산 서열과 하나 이상의 아미노산이 상이한 아미노산 서열을 갖는 폴리펩티드를 지칭한다. 일반적으로, 그러한 변형된 TNF 폴리펩티드는 TNFR1 및/또는 TNFR2를 활성화하거나 억제하는 능력을 유지한다. TNF 내의 특이적 돌연변이는 생성된 TNF 뮤테인이 TNFR1 또는 TNFR2에 결합하는 데 선택적으로 작용하도록 할 수 있고, 길항적 또는 효능적 특성을 갖는 TNF 뮤테인을 야기할 수 있다. 예를 들어, 본 명세서에 기재된 바와 같이, TNFR1-선택적 길항적 TNF 뮤테인 및 TNFR2-선택적 효능적 TNF 뮤테인이 있다.As used herein, "TNF mutein" or "TNF-α mutein" or "modified TNF polypeptide" refers to the amino acid sequence of the corresponding wild-type TNF (TNFα) and one or more amino acids to TNF from a particular species. Refers to polypeptides with these different amino acid sequences. Generally, such modified TNF polypeptides retain the ability to activate or inhibit TNFR1 and/or TNFR2. Specific mutations within TNF can cause the resulting TNF muteins to act selectively in binding to TNFR1 or TNFR2, resulting in TNF muteins with antagonistic or agonistic properties. For example, as described herein, there are TNFR1-selective antagonistic TNF muteins and TNFR2-selective agonistic TNF muteins.
본 명세서에서 사용된 바와 같이, "TNF의 우세한-음성 억제제" 또는 "DN-TNF"는 TNFR1 및/또는 TNFR2에 대한 결합 및 이를 통한 신호전달을 무효화하는 하나 이상의 돌연변이를 갖는 TNF 뮤테인이다. DN-TNF는 천연 TNF 동종삼량체와 서브유닛을 신속하게 교환함으로써 가용성 TNF(sTNF 또는 solTNF)를 선택적으로 억제하고, 수용체 결합 표면이 파괴된 불활성 혼합된 TNF 이종삼량체를 형성하여 TNF 수용체와의 상호작용을 방지한다. DN-TNF는 막관통 TNF(tmTNF)에 영향을 주지 않고, TNFR2를 통한 TNF 신호전달의 보호 역할을 유지한다. DN-TNF의 예에는 TNFR에 대한 결합을 손상시키는 서열번호: 1에 제시된 아미노산의 서열을 참조하여 대체 L133Y, S162Q, Y163H, I173T, Y191Q 및 A221R(서열번호: 2에 제시된 바와 같이, solTNF의 서열을 참조하여 잔기 L57Y, S86Q, Y87H, I97T, Y115Q 및 A145R에 상응함) 중 하나 이상을 함유하는 TNF 돌연변이체가 있다.As used herein, a “dominant-negative inhibitor of TNF” or “DN-TNF” is a TNF mutein that has one or more mutations that abrogate binding to and signaling through TNFR1 and/or TNFR2. DN-TNF selectively inhibits soluble TNF (sTNF or solTNF) by rapidly exchanging subunits with native TNF homotrimers, and forms inactive mixed TNF heterotrimers in which the receptor binding surface is disrupted to interact with TNF receptors. prevent action. DN-TNF does not affect transmembrane TNF (tmTNF) and retains the protective role of TNF signaling through TNFR2. Examples of DN-TNF include substitutions L133Y, S162Q, Y163H, I173T, Y191Q and A221R with reference to the sequence of amino acids set forth in SEQ ID NO: 1 that impairs binding to TNFR (as shown in SEQ ID NO: 2, the sequence of solTNF Corresponding to residues L57Y, S86Q, Y87H, I97T, Y115Q and A145R, see ), there are TNF mutants containing one or more.
본 명세서에서 사용된 바와 같이, "변형"은 폴리펩티드 내의 아미노산 서열 또는 핵산 분자 내의 뉴클레오티드 서열의 변형을 의미하고, 각각 아미노산 또는 뉴클레오티드의 결실, 삽입, 전위, 대체 및 이들의 조합을 포함한다. 폴리펩티드 또는 핵산을 변형시키는 방법은, 예컨대 재조합체 DNA 방법론을 사용함으로써 당업자에게 일상적이다.As used herein, “modification” refers to a modification of a sequence of amino acids within a polypeptide or a sequence of nucleotides within a nucleic acid molecule, and includes deletions, insertions, translocations, substitutions, and combinations thereof of amino acids or nucleotides, respectively. Methods of modifying polypeptides or nucleic acids are routine to those skilled in the art, such as by using recombinant DNA methodologies.
본 명세서에서 사용된 바와 같이, 핵산 또는 폴리펩티드 서열을 언급할 때 "결실"은 서열, 예컨대 표적 폴리뉴클레오티드 또는 폴리펩티드, 또는 천연 또는 야생형 서열과 비교하여 하나 이상의 뉴클레오티드 또는 아미노산의 결실을 지칭한다.As used herein, "deletion" when referring to a nucleic acid or polypeptide sequence refers to a deletion of one or more nucleotides or amino acids compared to a sequence, such as a target polynucleotide or polypeptide, or a native or wild-type sequence.
본 명세서에서 사용된 바와 같이, 핵산 또는 아미노산 서열을 언급할 때 "삽입"은 표적, 천연, 야생형 또는 다른 관련된 서열 내에 하나 이상의 추가의 뉴클레오티드 또는 아미노산을 포함시키는 것을 설명한다. 따라서, 야생형 서열과 비교하여 하나 이상의 삽입을 함유하는 핵산 분자는 서열의 선형 길이 내에 하나 이상의 추가의 뉴클레오티드를 함유한다.As used herein, "insertion" when referring to a nucleic acid or amino acid sequence describes the inclusion of one or more additional nucleotides or amino acids within a target, native, wild-type or other related sequence. Thus, compared to the wild-type sequence, a nucleic acid molecule containing one or more insertions contains one or more additional nucleotides within the linear length of the sequence.
본 명세서에서 사용된 바와 같이, 핵산 또는 아미노산 서열을 언급할 때 "첨가"는 다른 서열과 비교하여 하나 이상의 뉴클레오티드 또는 아미노산을 어느 하나의 말단에 첨가하는 것을 설명한다.As used herein, "addition" when referring to a nucleic acid or amino acid sequence describes the addition of one or more nucleotides or amino acids to either end compared to the other sequence.
본 명세서에서 사용된 바와 같이, "치환" 또는 "대체"는 분자의 길이(잔기의 수에 기재된 바와 같음)를 변경하지 않고 천연, 표적, 야생형 또는 다른 핵산 또는 폴리펩티드 서열에서 하나 이상의 뉴클레오티드 또는 아미노산을 대안적인 뉴클레오티드 또는 아미노산으로 대체하는 것을 지칭한다. 따라서, 분자 내 하나 이상의 치환은 분자의 아미노산 잔기 또는 뉴클레오티드의 수를 변경하지 않는다. 특정 폴리펩티드와 비교하여 아미노산 대체는 폴리펩티드 서열의 길이를 따라 아미노산 잔기의 수로 표현될 수 있다. 예를 들어, 티로신(Tyr; Y)이 글루탐산(Glu; E)으로 치환/대체된 아미노산 서열의 100번째 위치의 아미노산에 변형을 갖는 변형된 폴리펩티드는 Y100E, Tyr100Glu 또는 100E로서 표현될 수 있다. Y100은 변형된 100번째 위치의 아미노산이 티로신인 것을 나타내기 위해 사용될 수 있다. 본 명세서의 목적을 위해 변형은 항체의 중쇄(HC) 또는 경쇄(LC)에 있기 때문에 변형은 또한 폴리펩티드의 사슬을 나타내기 위해 HC- 또는 LC-를 참조로 표시될 수 있다.As used herein, "substitution" or "replacement" refers to the substitution of one or more nucleotides or amino acids in a natural, target, wild-type or other nucleic acid or polypeptide sequence without altering the length of the molecule (as described in number of residues). Refers to replacing with an alternative nucleotide or amino acid. Thus, one or more substitutions in a molecule do not change the number of amino acid residues or nucleotides in the molecule. Amino acid substitutions relative to a particular polypeptide can be expressed as the number of amino acid residues along the length of the polypeptide sequence. For example, a modified polypeptide having a modification at position 100 of an amino acid sequence in which tyrosine (Tyr; Y) is substituted/substituted for glutamic acid (Glu; E) can be expressed as Y100E, Tyr100Glu or 100E. Y100 may be used to indicate that the modified amino acid at position 100 is tyrosine. For purposes of this specification, modifications may also be denoted by reference to HC- or LC- to refer to the chain of a polypeptide, since the modifications are in either the heavy (HC) or light (LC) chain of the antibody.
본 명세서에서 사용된 바와 같이, "~에 상응하는 위치에서" 또는 뉴클레오티드 또는 아미노산 위치가 서열 목록에 제시된 것과 같은 개시된 서열 내의 뉴클레오티드 또는 아미노산 위치"에 상응한다"는 인용은 표준 정렬 알고리즘, 예컨대 GAP 알고리즘을 사용하여 동일성을 최대화하기 위해 참조된 서열과 정렬 시 확인된 뉴클레오티드 또는 아미노산 위치를 지칭한다. 서열을 정렬함으로써 당업자는, 예를 들어 보존되고 동일한 아미노산 잔기를 가이드로서 사용하여 상응하는 잔기를 확인할 수 있다. 일반적으로 상응하는 위치를 확인하기 위해 가장 높은 순위의 일치가 수득되도록 아미노산의 서열이 정렬된다 (예를 들어, 문헌[Computational Molecular Biology, Lesk, A.M., ed., Oxford University Press, New York, 1988; Biocomputing: Informatics and Genome Projects, Smith, D.W., ed., Academic Press, New York, 1993; Computer Analysis of Sequence Data, Part I, Griffin, A.M., and Griffin, H.G., eds., Humana Press, New Jersey, 1994; Sequence Analysis in Molecular Biology, von Heinje, G., Academic Press, 1987; Sequence Analysis Primer, Gribskov, M. and Devereux, J., eds., M Stockton Press, New York, 1991; 및 Carrillo 등 (1988) SIAM J. Applied Math 48:1073] 참조).As used herein, a reference to “at a position corresponding to” or “corresponding to” a nucleotide or amino acid position within a disclosed sequence such that the nucleotide or amino acid position is set forth in a sequence listing is a reference to a standard alignment algorithm, such as the GAP algorithm. Refers to a nucleotide or amino acid position identified when aligned with a referenced sequence to maximize identity using. By aligning the sequences, one skilled in the art can identify corresponding residues, for example using conserved and identical amino acid residues as guides. Generally, sequences of amino acids are aligned such that the highest rank match is obtained to identify corresponding positions (see, e.g., Computational Molecular Biology , Lesk, AM, ed., Oxford University Press, New York, 1988; Biocomputing: Informatics and Genome Projects , Smith, DW, ed., Academic Press, New York, 1993; Computer Analysis of Sequence Data, Part I , Griffin, AM, and Griffin, HG, eds., Humana Press, New Jersey, 1994 Sequence Analysis in Molecular Biology , von Heinje, G., Academic Press, 1987; Sequence Analysis Primer , Gribskov, M. and Devereux, J., eds., M Stockton Press, New York, 1991; and Carrillo et al. (1988) SIAM J. Applied Math 48:1073).
본 명세서에서 사용된 바와 같이, 서열의 정렬은 뉴클레오티드 또는 아미노산의 2개 이상의 서열을 정렬하기 위한 상동성의 사용을 지칭한다. 전형적으로, 50% 이상의 동일성에 의해 관련되는 2개 이상의 서열이 정렬된다. 정렬된 서열의 세트는 상응하는 위치에 정렬되는 2개 이상의 서열을 지칭하고, 게놈 DNA 서열과 정렬된 RNA, 예컨대 EST 및 다른 cDNA로부터 유래된 정렬 서열을 포함할 수 있다. 관련되거나 변이체인 폴리펩티드 또는 핵산 분자는 당업자에게 알려진 임의의 방법에 의해 정렬될 수 있다. 그러한 방법은 전형적으로 일치를 최대화하고, 예를 들어 수동 정렬을 사용하고 이용 가능한 수많은 정렬 프로그램(예를 들어, BLASTP) 및 당업자에게 알려진 다른 프로그램을 사용하는 방법을 포함한다. 폴리펩티드 또는 핵산의 서열을 정렬함으로써 당업자는 보존되고 동일한 아미노산 잔기를 가이드로서 사용하여 유사한 부분 또는 위치를 확인할 수 있다. 또한, 당업자는 보존된 아미노산 또는 뉴클레오티드 잔기를 가이드로서 사용하여 인간과 비인간 서열 사이 및 서열 중에서 상응하는 아미노산 또는 뉴클레오티드 잔기를 찾을 수도 있다. 상응하는 위치는 또한, 예를 들어 단백질 구조의 컴퓨터 시뮬레이션 정렬을 사용함으로써 구조적 정렬에 기반할 수 있다. 다른 사례에서, 상응하는 영역이 확인될 수 있다. 당업자는 또한 보존된 아미노산 잔기를 가이드로서 사용하여 인간과 비인간 서열 사이 및 서열 중에서 상응하는 아미노산 잔기를 찾을 수 있다.As used herein, alignment of sequences refers to the use of homology to align two or more sequences of nucleotides or amino acids. Typically, two or more sequences related by at least 50% identity are aligned. An aligned set of sequences refers to two or more sequences that align in corresponding positions, and may include aligned sequences derived from RNAs such as ESTs and other cDNAs aligned with genomic DNA sequences. Related or variant polypeptides or nucleic acid molecules can be aligned by any method known to those skilled in the art. Such methods typically maximize agreement and include, for example, using manual alignment and using the numerous alignment programs available (eg, BLASTP) and other programs known to those skilled in the art. By aligning the sequences of polypeptides or nucleic acids, one skilled in the art can identify similar portions or positions using conserved and identical amino acid residues as guides. In addition, one skilled in the art may use conserved amino acid or nucleotide residues as a guide to locate corresponding amino acid or nucleotide residues between and among human and non-human sequences. Corresponding positions can also be based on structural alignments, for example by using computer simulation alignments of protein structures. In other instances, corresponding regions can be identified. One skilled in the art can also use conserved amino acid residues as a guide to locate corresponding amino acid residues between and among human and non-human sequences.
본 명세서에서 사용된 바와 같이, 단백질이 "동일한 조건 하에서 비교된다"는 인용은 상이한 단백질이 동일하게 또는 실질적으로 동일하게 처리되어 단백질 또는 제제의 활성 또는 특성에 영향을 미칠 수 있는 임의의 하나 이상의 조건이 시험 제제들 사이에서 변하지 않거나 실질적으로 변하지 않는다는 것을 의미한다. 예를 들어, 항체의 활성이 또 다른 항체와 비교될 때, 임의의 하나 이상의 조건, 예컨대 폴리펩티드의 양 또는 농도; 활성제(예를 들어, 항체) 이외의 제형에서 부형제, 담체 또는 다른 구성요소의 존재(양 포함); 온도; pH; 보관 시간; 보관 용기; 보관 특성(예를 들어, 진탕); 및/또는 노출 또는 사용과 연관된 다른 조건은 비교된 폴리펩티드/항체들 사이 및 중에서 동일하거나 실질적으로 동일하다.As used herein, a reference to proteins being “compared under identical conditions” refers to any one or more conditions under which different proteins may be treated identically or substantially identically to affect the activity or properties of the protein or agent. It means unchanged or substantially unchanged between these test formulations. For example, when the activity of an antibody is compared to another antibody, any one or more conditions, such as the amount or concentration of the polypeptide; the presence (including amounts) of excipients, carriers, or other components in the formulation other than the active agent (eg, antibody); temperature; pH; storage time; storage containers; storage characteristics (eg, shaking); and/or other conditions associated with exposure or use are the same or substantially the same between and among the compared polypeptides/antibodies.
본 명세서에서 사용된 바와 같이, "역효과" 또는 "부작용" 또는 "유해 사건" 또는 "유해한 부작용"은 치료제 투여와 연관된 유해하고/하거나, 유독하고/하거나 바람직하지 않은 효과를 지칭한다. 예를 들어, 항-TNF 항체, 예컨대 아달리무맙(예를 들어, 상표명 Humira®로 판매됨)의 투여와 연관된 부작용은 당업자에게 공지되어 있고, 일부는 본 명세서에 기재되어 있다. 그러한 유해한 부작용은, 예를 들어 결핵과 같은 심각한 감염, 및 상기도 감염을 포함하는 바이러스, 진균 및 박테리아에 의해 유발된 다른 감염뿐만 아니라 발진, 두통 및 메스꺼움과 같은 피부학적 및 피부 독성을 포함한다. 따라서, "역효과" 또는 "부작용"은 치료제 투여의 유해하고/하거나, 유독하고/하거나 바람직하지 않은 효과를 지칭한다. 부작용 또는 역효과는 독성에 따라 등급화되고, 각각의 등급에 대해 정의를 제공하는 다양한 독성 척도가 존재한다. 그러한 척도의 예로는 국립암연구소공통독성기준(National Cancer Institute Common Toxicity Criteria) 버전 2.0의 독성 척도, 및 세계보건기구 또는 유해사례 공통용어기준(CTCAE; Common Terminology Criteria for Adverse Events) 척도가 있다. 중증도의 등급을 지정하는 것은 숙련된 의사 또는 다른 의료 전문가의 기술 범위 내에 있다. 증상의 중증도는 NCI 유해사례 공통용어기준(CTCAE) 등급 체계를 이용하여 정량화될 수 있다. CTCAE는 유해 사건(AE) 보고에 사용된 설명적 전문용어이다. 각각의 AE 용어에 대해 등급(중증도) 척도가 제공된다. CTCAE는 다음의 일반적인 가이드라인에 기초한 각각의 유해 사건의 중증도에 대한 임상적 설명과 함께 1 내지 5등급을 표시한다: 1등급(경미한AE); 2등급(중등 AE); 3등급(중증 AE); 4등급(생명을 위협하거나 장애를 초래하는 AE); 및 5등급(AE 관련 사망/치명적).As used herein, “adverse effect” or “side effect” or “adverse event” or “adverse side effect” refers to a detrimental, toxic and/or undesirable effect associated with administration of a therapeutic agent. For example, side effects associated with administration of an anti-TNF antibody such as adalimumab (eg, sold under the trademark Humira ® ) are known to those skilled in the art, and some are described herein. Such adverse side effects include serious infections, such as, for example, tuberculosis, and other infections caused by viruses, fungi, and bacteria, including upper respiratory tract infections, as well as dermatological and skin toxicities such as rashes, headaches, and nausea. Thus, an “adverse effect” or “side effect” refers to a detrimental, toxic, and/or undesirable effect of administration of a therapeutic agent. Side effects or adverse effects are graded according to toxicity, and there are various toxicity scales that provide definitions for each grade. Examples of such scales include the National Cancer Institute Common Toxicity Criteria version 2.0 toxicity scale, and the World Health Organization or Common Terminology Criteria for Adverse Events (CTCAE) scale. Assigning grading of severity is within the skill of a skilled physician or other healthcare professional. The severity of symptoms can be quantified using the NCI Common Terminology Criteria for Adverse Events (CTCAE) grading system. CTCAE is a descriptive term used for reporting adverse events (AEs). A grading (severity) scale is provided for each AE term. The CTCAE ranks 1 to 5 with a clinical description of the severity of each adverse event based on the following general guidelines: Grade 1 (minor AE); Grade 2 (Intermediate AE); Grade 3 (severe AE); Grade 4 (life-threatening or disabling AE); and Grade 5 (AE-related death/fatal).
본 명세서에서 사용된 바와 같이, 항체와 같은 폴리펩티드의 "특성"은 결합 특이성, 구조적 배열 또는 형태, 단백질 안정성, 단백질분해에 대한 저항성, 형태적 안정성, 내열성 및 pH 조건에 대한 내성을 포함하지만 이들에 제한되지 않는 폴리펩티드에 의해 나타나는 임의의 특성을 지칭한다. 특성의 변화는 폴리펩티드의 "활성"을 변경할 수 있다. 예를 들어, 항체 폴리펩티드의 결합 특이성의 변화는 항원에 결합하는 능력 및/또는 친화성 또는 결합능과 같은 다양한 결합 활성 또는 폴리펩티드의 생체 내 활성을 변경할 수 있다.As used herein, “characteristics” of a polypeptide, such as an antibody, include, but are not limited to, binding specificity, structural arrangement or conformation, protein stability, resistance to proteolysis, conformational stability, heat resistance, and resistance to pH conditions. Refers to any property exhibited by a non-limiting polypeptide. Changes in properties can alter the “activity” of a polypeptide. For example, a change in the binding specificity of an antibody polypeptide can alter various binding activities such as the ability and/or affinity or avidity to bind antigen or activity of the polypeptide in vivo .
본 명세서에서 사용된 바와 같이, 항체와 같은 폴리펩티드의 "활성" 또는 "기능적 활성"은 폴리펩티드에 의해 나타나는 임의의 활성을 지칭한다. 그러한 활성은 경험적으로 결정될 수 있다. 예시적인 활성은, 예를 들어 항원 결합, DNA 결합, 리간드 결합 또는 이량체화를 통해 생체분자와 상호작용하는 능력; 및 효소적 활성, 예를 들어 키나제 활성 또는 단백분해 활성을 포함하지만 이들에 제한되지 않는다. 항체(항체 단편을 포함함)의 경우, 활성에는 특정 항원에 특이적으로 결합하는 능력, 항원 결합의 친화도(예를 들어, 고친화도 또는 저친화도), 항원 결합의 결합능(예를 들어, 고 결합능 또는 저 결합능), 온-레이트, 오프-레이트, 이펙터 기능, 예컨대 항원 중화 또는 청소능을 촉진하는 능력, 바이러스 중화 및 생체 내 활성, 예컨대 병원체의 감염 또는 침습을 방지하거나, 청소능을 촉진하거나, 체내의 특정 조직이나 유체 또는 세포에 침투하는 능력이 포함되지만 이들에 제한되지 않는다. 활성은 인식된 검정, 예컨대 ELISA, 유동 세포측정, 표면 플라즈몬 공명 또는 온- 또는 오프-레이트를 측정하기 위한 등가 검정, 면역조직화학 및 면역형광 조직학 및 현미경 검사, 세포 기반 검정, 유동 세포측정 및 결합 검정(예를 들어, 패닝 검정)을 사용하여 시험관 내 또는 생체 내에서 평가될 수 있다. 예를 들어, 항체 폴리펩티드의 경우, 활성은 결합 친화도, 결합능 및/또는 결합 계수(예를 들어, 온-/오프-레이트) 및 시험관 내 다른 활성을 측정하거나 면역 효과, 예를 들어 항원 청소능; 항체의 조직으로의 침투 또는 국소화; 질환, 예를 들어 감염으로부터의 보호; 혈청 또는 다른 유체 항체 역가; 또는 당업계에 잘 알려진 다른 검정과 같은 생체 내 다양한 효과를 측정함으로써 평가될 수 있다. 폴리펩티드가 활성을 나타내는 것을 보여주는 그러한 검정의 결과는 생체 내 활성이 치료적 활성 또는 생물학적 활성으로서 지칭될 수 있는 생체 내 폴리펩티드의 활성과 상관될 수 있다. 변형된 폴리펩티드의 활성은 비변형된 폴리펩티드와 비교하여 활성의 1%, 2%, 3%, 4%, 5%, 10%, 20%, 30%, 40%, 50%, 60%, 70%, 80%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, 100%, 200%, 300%, 400%, 500% 이상을 포함하지만 이들에 제한되지 않는 비변형된 폴리펩티드의 활성 백분율의 임의의 수준일 수 있다. 변형된(또는 변이체) 항체의 작용성 또는 활성을 측정하기 위한 검정은 당업계에 잘 알려져 있다.As used herein, “activity” or “functional activity” of a polypeptide, such as an antibody, refers to any activity exhibited by the polypeptide. Such activity can be determined empirically. Exemplary activities include, for example, the ability to interact with biomolecules through antigen binding, DNA binding, ligand binding or dimerization; and enzymatic activity, such as kinase activity or proteolytic activity. In the case of antibodies (including antibody fragments), activities include the ability to specifically bind to a particular antigen, the affinity of antigen binding (e.g., high affinity or low affinity), the avidity of antigen binding (e.g., high or low avidity), on-rate, off-rate, effector functions such as ability to neutralize antigens or promote clearance, neutralize viruses and in vivo activities such as prevent infection or invasion of pathogens or promote clearance or the ability to penetrate certain tissues or fluids or cells in the body, but is not limited thereto. Activity is recognized in assays such as ELISA, flow cytometry, surface plasmon resonance or equivalent assays to measure on- or off-rates, immunohistochemistry and immunofluorescence histology and microscopy, cell-based assays, flow cytometry and binding It can be assessed in vitro or in vivo using an assay (eg, a panning assay). For example, in the case of antibody polypeptides, activity measures binding affinity, avidity and/or binding coefficient (eg, on-/off-rate) and other activities in vitro or immune effects, such as antigen scavenging capacity. ; penetration or localization of antibodies into tissues; protection from diseases such as infections; serum or other fluid antibody titer; or by measuring various effects in vivo , such as other assays well known in the art. Results of such assays showing that a polypeptide exhibits activity can be correlated with the activity of the polypeptide in vivo, where activity in vivo can be referred to as therapeutic activity or biological activity. The activity of the modified polypeptide is 1%, 2%, 3%, 4%, 5%, 10%, 20%, 30%, 40%, 50%, 60%, 70% of the activity compared to the unmodified polypeptide. , 80%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, 100%, 200%, 300%, 400%, 500% or more It can be any level of percent activity of the unmodified polypeptide, including but not limited to. Assays for determining the functionality or activity of modified (or variant) antibodies are well known in the art.
본 명세서에서 사용된 바와 같이, "결합하다", "결합된" 및 이들의 문법적 변형은 분자가 또 다른 분자와의 임의의 인력 상호작용에 참여하는 것을 지칭하고, 그 결과 2개의 분자가 서로 매우 근접해 있는 안정한 회합이 이루어진다. 결합 상호작용에는 비-공유 결합, 공유 결합(예컨대, 가역적 및 비가역적 공유 결합)이 포함되지만 이들에 제한되지 않고, 단백질, 핵산, 탄수화물, 지질 및 소분자, 예컨대 약물을 포함한 화합물과 같은 분자들 간의 상호작용을 포함하지만 이들에 제한되지 않는다. 예시적인 결합은 항체-항원 상호작용 및 수용체-리간드 상호작용이다. 항체가 특정 항원에 "결합할" 때, "결합하다"는 항체 결합 부위에서 동족 항체-항원 상호작용을 통해 항체에 의한 항원의 특이적 인식을 지칭한다. 결합은 또한 디설파이드 결합을 통해 상호작용하는 폴리펩티드의 다중 사슬, 예컨대 항체 사슬의 회합을 포함할 수 있다.As used herein, “bind”, “coupled” and grammatical variations thereof refer to the participation of a molecule in any attractive interaction with another molecule, resulting in two molecules being very close to each other. A stable association in close proximity takes place. Binding interactions include, but are not limited to, non-covalent bonds, covalent bonds (eg, reversible and irreversible covalent bonds), and between molecules such as proteins, nucleic acids, carbohydrates, lipids, and small molecules, such as compounds including drugs. Including but not limited to interactions. Exemplary bonds are antibody-antigen interactions and receptor-ligand interactions. When an antibody “binds” a particular antigen, “binding” refers to the specific recognition of the antigen by the antibody through a cognate antibody-antigen interaction at the antibody binding site. Linkage can also include the association of multiple chains of a polypeptide, such as antibody chains, that interact through disulfide bonds.
본 명세서에서 사용된 바와 같이, "결합 활성"은, 예를 들어 폴리펩티드가 하나 이상의 결합 파트너에 결합하는지 여부 및 방법에 관한 분자의 특징을 지칭한다. 결합 활성에는 결합 파트너(들)를 결합하는 능력, 결합 파트너에 결합하는 친화도(예를 들어, 고친화도), 결합 파트너에 결합하는 결합능, 결합 파트너와의 결합 강도, 및/또는 결합 파트너와의 결합에 대한 특이성이 포함된다.As used herein, "binding activity" refers to the characteristic of a molecule, for example, whether and how a polypeptide binds to one or more binding partners. Binding activity may include the ability to bind the binding partner(s), the affinity to bind the binding partner (e.g., high affinity), the ability to bind to the binding partner, the strength of binding to the binding partner, and/or the affinity to bind to the binding partner. Specificity for binding is included.
본 명세서에서 사용된 바와 같이, "친화도" 또는 "결합 친화도"는 2개 이상의 분자, 예컨대 결합 파트너들 간의 상호작용의 강도, 및 전형적으로 2개의 결합 파트너들 간의 비공유 상호작용의 강도를 설명한다. 항원 에피토프에 대한 항체 또는 이의 항원 결합 단편의 친화도는 단일 항체 결합 부위와 에피토프 간의 총 비공유 상호작용의 강도의 측정치이다. 저친화도 항체-항원 상호작용은 약하고 분자가 신속하게 해리되는 경향이 있는 반면, 고친화도 항체-항원 결합은 강하고 분자가 더 긴 기간 동안 결합된 상태를 유지한다. 결합 친화도는, 예컨대 회합(k a 또는 k on ) 및/또는 해리(k d 또는 k off ) 속도, 반수 최대 효과 농도(EC50) 값 및/또는 열역학적 데이터(예를 들어, 깁스 자유 에너지(Gibbs free energy)(ΔG), 엔탈피(ΔH), 엔트로피(-TΔS))를 측정하고/하거나 회합(Ka) 또는 해리(Kd) 상수를 계산함으로써 결합 동역학의 관점에서 결정될 수 있다. 겉보기 Kd라고도 하는 EC50은 항체의 농도(예를 들어, ng/mL)로, 최대 결합의 50%가 고정된 양의 항원에 대해 관찰된다. 전형적으로 EC50 값은 S자형 용량-반응 곡선으로부터 결정되고, 여기서 EC50은 변곡점에서의 농도이다. 그의 기질에 대한 높은 항체 친화도는 낮은 EC50 값과 상관관계가 있고, 낮은 친화도는 높은 EC50 값에 상응한다. 친화도 상수는 항체 반응에 대한 표준 동력학 방법론, 예를 들어 ELISA와 같은 면역검정에 이은 곡선-피팅 분석에 의해 결정될 수 있다. As used herein, "affinity" or "binding affinity" describes the strength of an interaction between two or more molecules, such as binding partners, and typically the strength of a non-covalent interaction between two binding partners. do. The affinity of an antibody or antigen-binding fragment thereof for an antigenic epitope is a measure of the strength of the total non-covalent interactions between a single antibody binding site and the epitope. Low affinity antibody-antigen interactions are weak and the molecules tend to dissociate rapidly, whereas high affinity antibody-antigen bonds are strong and the molecules remain bound for longer periods of time. Binding affinities may be determined by, for example, association ( ka or k on ) and/or dissociation ( k d or k off ) rates, half maximal effect concentration (EC 50 ) values, and/or thermodynamic data (eg, Gibbs free energy ( Gibbs free energy (ΔG), enthalpy (ΔH), entropy (-TΔS)) and/or calculating association (K a ) or dissociation (K d ) constants. The EC 50 , also referred to as the apparent K d , is the concentration of antibody (eg, ng/mL) at which 50% of maximal binding is observed for a fixed amount of antigen. EC 50 values are typically determined from a sigmoidal dose-response curve, where EC 50 is the concentration at the inflection point. High antibody affinity for its substrate correlates with low EC 50 values, and low affinity corresponds to high EC 50 values. Affinity constants can be determined by standard kinetic methodologies for antibody responses, eg, immunoassays such as ELISA followed by curve-fitting analysis.
본 명세서에서 사용된 바와 같이, "친화도 상수"는 항원에 대한 항체의 친화도를 측정하기 위해 사용된 회합 상수(Ka)를 지칭한다. 친화도 상수가 높을수록, 항원에 대한 항체의 친화도가 더 크다. 친화도 상수는 역몰농도(즉, M-1)의 단위로 표현되고, 항체 반응에 대한 표준 동력학 방법론(예를 들어, 면역검정, 표면 플라즈몬 공명, 또는 당업계에 알려진 다른 동력학 상호작용 검정)에 의해 측정된 바와 같이 회합-해리 반응에 대한 속도 상수로부터 계산될 수 있다. 항체의 결합 친화도는 또한 해리 상수 또는 Kd로서 표현될 수 있다. 해리 상수는 회합 상수의 역수, 즉 Kd = 1/Ka이다. 따라서, 친화도 상수는 또한 Kd로 제시될 수 있다. 친화도 상수는 항체 반응에 대한 표준 동력학 방법론, 예를 들어 면역검정, 표면 플라즈몬 공명(SPR)(예를 들어, 문헌[Rich and Myszka (2000) Curr . Opin . Biotechnol 11:54; Englebienne (1998) Analyst. 123:1599] 참조), 등온 적정 열량측정법(ITC) 또는 당업계에 알려진 다른 동력학 상호작용 검정(예를 들어, 문헌[Paul, ed., Fundamental Immunology, 2nd ed., Raven Press, New York, pages 332-336 (1989)] 참조; 또한, 항체의 결합 친화도를 계산하기 위한 예시적인 SPR 및 ITC 방법의 설명에 대해 미국 특허 제7,229,619호 참조)에 의해 결정될 수 있다. 결합률의 실시간 검출 및 모니터링을 위한 기기 및 방법은 공지되어 있고, 상업적으로 입수 가능하다 (예를 들어, BIAcore 2000, BIAcore AB, Upsala, Sweden and GE Healthcare Life Sciences; Malmqvist (2000) Biochem. Soc. Trans. 27:335). As used herein, “affinity constant” refers to the association constant (K a ) used to measure the affinity of an antibody for an antigen. The higher the affinity constant, the greater the affinity of the antibody for its antigen. Affinity constants are expressed in units of inverse molarity (ie, M −1 ) and follow standard kinetic methodologies for antibody responses (eg, immunoassays, surface plasmon resonance, or other kinetic interaction assays known in the art). can be calculated from the rate constants for association-dissociation reactions as measured by The binding affinity of an antibody can also be expressed as the dissociation constant or K d . The dissociation constant is the reciprocal of the association constant, i.e. K d = 1/K a . Thus, the affinity constant can also be given as K d . Affinity constants can be determined using standard kinetic methodologies for antibody responses, such as immunoassays, surface plasmon resonance (SPR) (see, eg, Rich and Myszka (2000)). Curr . Opin . Biotechnol 11:54; Englebienne (1998) Analyst. 123:1599), isothermal titration calorimetry (ITC) or other kinetic interaction assays known in the art (see, for example, Paul, ed., Fundamental Immunology, 2nd ed., Raven Press, New York, pages 332-336 (1989); see also U.S. Patent No. 7,229,619 for a description of exemplary SPR and ITC methods for calculating the binding affinity of antibodies). Instruments and methods for real-time detection and monitoring of binding rates are known and commercially available (e.g., BIAcore 2000, BIAcore AB, Upsala, Sweden and GE Healthcare Life Sciences; Malmqvist (2000) Biochem. Soc. Trans 27 :335).
EC50 값을 결정하는 방법, 또는 회합/해리 상수를 결정하는 방법과 같이 친화도를 계산하는 방법은 잘 알려져 있다. 예를 들어, EC50의 관점에서 높은 결합 친화도는 항체가 약 10 ng/mL 미만, 9 ng/mL, 8 ng/mL, 7 ng/mL, 6 ng/mL, 5 ng/mL, 3 ng/mL, 2 ng/mL, 1 ng/mL 이하인 EC50으로 표적 단백질에 특이적으로 결합한다는 것을 의미한다. 높은 결합 친화도는 또한 10- 6 M 이하, 예컨대 10-7 M, 10-8 M, 10-9 M, 10-10 M, 10-11 M 또는 10-12 M 이하의 평형 해리 상수(Kd)를 특징으로 할 수 있다. 평형 회합 상수(Ka)의 관점에서, 높은 결합 친화도는 일반적으로 약 106 M-1 이상, 약 107 M-1 이상, 약 108 M-1 이상, 또는 약 109 M-1, 1010 M-1, 1011 M-1 또는 1012 M-1 이상의 Ka 값과 연관된다. 친화도는 경험적으로 추정될 수 있거나, 친화도는, 예를 들어 특정 항원에 대한 2개 이상의 항체의 친화도를 비교함으로써, 예를 들어 시험된 항체의 친화도의 쌍별 비를 계산함으로써 비교적으로 결정될 수 있다. 예를 들어, 그러한 친화도는 종래의 기술을 사용하여, 예컨대 ELISA에 의해; 평형 투석; 표면 플라즈몬 공명; 방사선 표지된 표적 항원을 사용하는 방사선면역검정에 의해; 또는 당업자에게 알려진 또 다른 방법에 의해 용이하게 결정될 수 있다. 친화도 데이터는, 예를 들어 문헌[Scatchard 등, (1949) Ann N.Y . Acad . Sci., 51:660]의 방법에 의해 분석되거나, 예를 들어 방정식: y = ((A-D)/(1+((x/C)^B))) + D (여기서, A는 최소 점근선이고, B는 경사 인자이고, C는 변곡점(EC50)이고, D는 최대 점근선임)를 사용한 4개의 파라미터 로지스틱 비선형 회귀 모델을 사용하는 곡선 피팅 분석에 의해 분석될 수 있다.Methods for calculating affinity, such as determining EC 50 values or determining association/dissociation constants, are well known. For example, a high binding affinity in terms of EC 50 indicates that the antibody is less than about 10 ng/mL, 9 ng/mL, 8 ng/mL, 7 ng/mL, 6 ng/mL, 5 ng/mL, 3 ng/mL. /mL, 2 ng/mL, 1 ng/mL or less EC 50 means that it specifically binds to the target protein. A high binding affinity also has an equilibrium dissociation constant ( K d ) can be characterized. In terms of the equilibrium association constant (K a ), a high binding affinity is generally about 10 6 M -1 or greater, about 10 7 M -1 or greater, about 10 8 M -1 or greater, or about 10 9 M -1 , It is associated with K a values greater than 10 10 M -1 , 10 11 M -1 or 10 12 M -1 . Affinity can be estimated empirically, or affinity can be determined relatively, eg by comparing the affinity of two or more antibodies for a particular antigen, eg by calculating the pairwise ratio of the affinity of the tested antibodies. can For example, such affinity can be determined using conventional techniques, such as by ELISA; equilibrium dialysis; surface plasmon resonance; by radioimmunoassay using radiolabeled target antigens; or can be readily determined by another method known to those skilled in the art. Affinity data can be found, for example, in Scatchard et al., (1949) Ann NY . Acad . Sci ., 51:660], or for example by the equation: y = ((AD)/(1+((x/C)^B))) + D, where A is the least asymptotes and , where B is the slope factor, C is the inflection point (EC 50 ), and D is the maximum asymptote) by curve fitting analysis using a four parameter logistic nonlinear regression model.
본 명세서에서 사용된 바와 같이, "항체 결합능"은, 예컨대 반복 에피토프 또는 에피토프 어레이가 있는 항원과 연관된 다중 결합 부위를 함유하는 항체를 갖는 다가 항체와 그의 동족 항원 간의 다중 상호작용의 강도를 지칭한다. 높은 결합능 항체는 낮은 결합능 항체와 비교하여 그러한 상호작용의 강도가 더 높다.As used herein, "antibody-binding capacity" refers to the strength of multiple interactions between a multivalent antibody and its cognate antigen, such as an antibody containing multiple binding sites associated with an antigen with a repeat epitope or epitope array. High avidity antibodies have a higher strength of such interactions compared to low avidity antibodies.
본 명세서에서 사용된 바와 같이, TNFR1과 같은 "표적에 대한 특이성"은 비-표적과 비교하여 표적에 결합하기 위한 선호도, 더 높은 결합 친화도를 지칭한다. 선택적 결합은 일반적으로 적어도 약 107-108 M-1의 친화도로 표적에 결합하는 것을 지칭한다. 또한 하나의 표적 분자에 대한 모이어티 또는 분자의 친화도가 또 다른 분자에 대한 친화도와 비교되는 상대적 활성을 지칭할 수 있고, 그 차이가 특정 크기, 예컨대 약 10-배이면, 모이어티 또는 분자는 제2 표적에 비해 제1 표적에 대한 특이성이 더 크다고 한다.As used herein, “specificity to a target” such as TNFR1 refers to a preference for binding to a target, higher binding affinity, compared to non-targets. Selective binding is typically at least about 10 7 -10 8 It refers to binding to a target with an affinity of M -1 . It can also refer to the relative activity of a moiety or molecule when its affinity for one target molecule is compared to its affinity for another molecule, and the difference is a certain order of magnitude, such as about 10-fold, then the moiety or molecule is It is said to have greater specificity for the first target compared to the second target.
본 명세서에서 사용된 바와 같이, 항체 또는 이의 항원 결합 단편에 관하여 "특이적으로 결합한다" 또는 "면역특이적으로 결합한다"는 본 명세서에서 상호교환적으로 사용되고, 항체의 항체 결합 부위(들)와 항원 간의 비공유 상호작용에 의해 동족 항원과 하나 이상의 비공유 결합을 형성하는 항체 또는 항원 결합 단편의 능력을 지칭한다. 전형적으로, 예를 들어 TNFR1에 면역특이적으로 결합하는(또는 특이적으로 결합하는) 항체는 약 또는 1x 107 M-1 또는 1x 108 M-1 이상의 친화도 상수(Ka)(또는 1x 10-7 M 또는 1x 10-8 M 이하의 해리 상수(Kd))로 TNFR1에 결합하는 항체이다. 특정 항원에 면역특이적으로 결합하는 항체 또는 항원 결합 단편은, 예를 들어 면역검정, 예컨대 방사선면역검정(RIA), 효소-결합 면역흡착 검정(ELISA), 표면 플라즈몬 공명(SPR) 또는 당업자에게 알려진 다른 기술에 의해 확인될 수 있다.As used herein, "specifically binds" or "immunospecifically binds" with respect to an antibody or antigen-binding fragment thereof are used interchangeably herein and refer to the antibody binding site(s) of an antibody. Refers to the ability of an antibody or antigen-binding fragment to form one or more non-covalent bonds with a cognate antigen by non-covalent interaction between the antigen and the antigen. Typically, for example, an antibody that immunospecifically binds ( or specifically binds ) TNFR1 has an affinity constant (K a ) (or 1× It is an antibody that binds to TNFR1 with a dissociation constant (K d ) of 10 −7 M or 1×10 −8 M or less. Antibodies or antigen-binding fragments that immunospecifically bind to a particular antigen are, for example, immunoassays such as radioimmunoassay (RIA), enzyme-linked immunosorbent assay (ELISA), surface plasmon resonance (SPR), or known to those skilled in the art. It can be confirmed by other techniques.
본 명세서에서 사용된 바와 같이, "입체 효과"는 분자에 대한 원자 또는 그룹의 크기 효과를 지칭한다. 입체 효과에는 입체 장애 및 반데르발스 반발이 포함되지만 이들에 제한되지 않는다. 입체 효과는 원자가 공간을 점유한다는 사실에서 비롯된 효과이고; 원자를 서로 가까이 놓으면, 이는 원자 근처의 전자가 서로 반발하므로 에너지를 소모한다.As used herein, "steric effect" refers to the effect of the size of an atom or group on a molecule. Steric effects include, but are not limited to, steric hindrance and van der Waals repulsion. The steric effect is an effect resulting from the fact that atoms occupy space; When atoms are placed close to each other, this consumes energy as the electrons near the atoms repel each other.
본 명세서에서 사용된 바와 같이, "적어도 하나의 활성을 나타낸다" 또는 "적어도 하나의 활성을 유지한다"는 변형을 포함하지 않는 표적 또는 비변형된 폴리펩티드와 비교하여 항체 폴리펩티드, 예컨대 변이체 항체 또는 다른 치료적 폴리펩티드에 의해 나타나는 활성을 지칭한다. 표적 폴리펩티드의 활성을 유지하는 변형된 또는 변이체 폴리펩티드는 개선된 활성, 감소된 활성을 나타내거나, 비변형된 폴리펩티드의 활성을 유지할 수 있다. 일부 경우에, 변형된 또는 변이체 폴리펩티드는 표적 또는 비변형된 폴리펩티드와 비교하여 증가된 활성을 유지할 수 있다. 일부 경우에, 변형된 또는 변이체 폴리펩티드는 비변형된 또는 표적 폴리펩티드와 비교하여 감소된 활성을 유지할 수 있다. 변형된 또는 변이체 폴리펩티드의 활성은 비변형된 또는 표적 폴리펩티드와 비교하여 1%의 활성, 2%, 3%, 4%, 5%, 10%, 20%, 30%, 40%, 50%, 60%, 70%, 80%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, 100%, 200%, 300%, 400%, 500% 이상의 활성을 포함하지만 이들에 제한되지 않는 비변형된 또는 표적 폴리펩티드의 활성 백분율의 임의의 수준일 수 있다. 다른 구현예에서, 활성의 변화는 비변형된 또는 표적 폴리펩티드보다 적어도 약 2배, 3배, 4배, 5배, 6배, 7배, 8배, 9배, 10배, 20배, 30배, 40배, 50배, 60배, 70배, 80배, 90배, 100배, 200배, 300배, 400배, 500배, 600배, 700배, 800배, 900배, 1000배 이상 더 크다. 활성 유지에 대한 검정은 유지될 활성에 따라 달라진다. 그러한 검정은 시험관 내 또는 생체 내에서 수행될 수 있다. 활성은, 예를 들어 ELISA 및 패닝 검정과 같지만 이들에 제한되지 않는 활성에 대해 당업계에 알려지고 하기에 기재된 검정을 사용하여 측정될 수 있다. 비변형된 또는 표적 폴리펩티드와 비교하여 변형된 또는 변이체 폴리펩티드의 활성은 또한 생체 내 치료적 또는 생물학적 활성 또는 폴리펩티드 투여 후 결과의 관점에서 평가될 수 있다.As used herein, “exhibits at least one activity” or “retains at least one activity” refers to an antibody polypeptide, such as a variant antibody or other therapeutic, compared to a target or unmodified polypeptide that does not contain a modification. Refers to the activity exhibited by an enemy polypeptide. Modified or variant polypeptides that retain the activity of the target polypeptide may exhibit improved activity, reduced activity, or retain the activity of the unmodified polypeptide. In some cases, a modified or variant polypeptide may retain increased activity compared to a target or unmodified polypeptide. In some cases, a modified or variant polypeptide may retain a reduced activity compared to an unmodified or target polypeptide. The activity of the modified or variant polypeptide is 1% activity compared to the unmodified or target polypeptide, 2%, 3%, 4%, 5%, 10%, 20%, 30%, 40%, 50%, 60% %, 70%, 80%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, 100%, 200%, 300%, 400%, It can be any level of the percent activity of the unmodified or target polypeptide, including but not limited to an activity greater than or equal to 500%. In other embodiments, the change in activity is at least about 2-fold, 3-fold, 4-fold, 5-fold, 6-fold, 7-fold, 8-fold, 9-fold, 10-fold, 20-fold, 30-fold greater than the unmodified or target polypeptide. , 40x, 50x, 60x, 70x, 80x, 90x, 100x, 200x, 300x, 400x, 500x, 600x, 700x, 800x, 900x, 1000x and more big. Assays for retention of activity depend on the activity to be retained. Such assays can be performed in vitro or in vivo . Activity can be measured using assays known in the art for activity and described below, such as, but not limited to, ELISA and panning assays. The activity of a modified or variant polypeptide compared to an unmodified or target polypeptide can also be evaluated in terms of therapeutic or biological activity in vivo or outcome following administration of the polypeptide.
본 명세서에서 사용된 바와 같이, "표면 플라즈몬 공명"은 바이오센서 매트릭스 내의 단백질 농도의 변경을 검출함으로써 실시간 상호작용의 분석을 가능하게 하는 광학 현상을 지칭한다. 상용 시스템이 이용 가능하다. 예를 들어, BIAcore 시스템(GE Healthcare Life Sciences)은 예시적인 상용 시스템이다.As used herein, “surface plasmon resonance” refers to an optical phenomenon that enables analysis of real-time interactions by detecting changes in protein concentration within a biosensor matrix. Commercial systems are available. For example, the BIAcore system (GE Healthcare Life Sciences) is an exemplary commercial system.
본 명세서에서 사용된 바와 같이, "항체"는 천연 생산되든, 부분적으로 또는 완전히 합성적으로, 예컨대 재조합적으로 생산되든 면역글로불린 및 면역글로불린 단편을 지칭하고, 항원 결합 부위를 형성하기에 충분하고 조립되었을 때 항원에 특이적으로 결합하기에 충분한 면역글로불린 분자의 가변 중쇄 및/또는 가변 경쇄 영역의 적어도 일부를 함유하는 그의 임의의 단편을 포함한다. 따라서, 항체는 면역글로불린 항원 결합 도메인(항체 결합 부위)과 상동이거나 실질적으로 상동인 결합 도메인을 갖는 임의의 단백질을 포함한다. 예를 들어, 항체는 2개의 중쇄(H 및 H'로 표시될 수 있음) 및 2개의 경쇄(L 및 L'로 표시될 수 있음)를 함유하는 항체를 지칭하고, 여기서 각각의 중쇄는 항원 결합 부위를 형성하기에 충분한 전장 면역글로불린 중쇄 또는 그의 일부일 수 있고(예를 들어, 중쇄는 VH 사슬, VH-CH1 사슬 및 VH-CH1-CH2-CH3 사슬을 포함하지만 이들에 제한되지 않음), 각각의 경쇄는 항원 결합 부위를 형성하기에 충분한 전장 경쇄 또는 그의 일부일 수 있다 (예를 들어, 경쇄는 VL 사슬 및 VL-CL 사슬을 포함하지만 이들에 제한되지 않음). 각각의 중쇄(H 및 H')는 하나의 경쇄(각각 L 및 L')와 쌍을 이룬다. 전형적으로, 항체는 가변 중쇄(VH) 및/또는 가변 경쇄(VL)의 전부 또는 적어도 일부를 최소로 포함한다. 항체는 또한, 예를 들어 불변 영역의 전부 또는 일부, 및/또는 힌지 영역의 전부 또는 일부(가요성을 제공하기에 충분함)와 같은 다른 영역을 포함할 수 있다.As used herein, “antibody” refers to immunoglobulins and immunoglobulin fragments, whether produced naturally or partially or completely synthetically, such as recombinantly, and which are sufficient and assembled to form an antigen-binding site. and any fragment thereof that contains at least a portion of the variable heavy and/or variable light chain regions of an immunoglobulin molecule sufficient to specifically bind an antigen when rendered. Thus, an antibody includes any protein having a binding domain that is homologous or substantially homologous to an immunoglobulin antigen binding domain (antibody binding site). For example, an antibody refers to an antibody that contains two heavy chains (which may be denoted H and H') and two light chains (which may be denoted L and L'), wherein each heavy chain binds an antigen. may be a full-length immunoglobulin heavy chain or a portion thereof sufficient to form a site (e.g., the heavy chain may be V H chain, including but not limited to, V H -
본 명세서의 목적을 위해, 용어 "항체"는 달리 명시되지 않는 한, 예를 들어 항-TNFR1 항체 단편과 같은 항체 단편을 포함하는 전장 항체 및 그의 부분을 포함한다. 항체 단편은, 예를 들어 Fab 단편, Fab' 단편, F(ab')2 단편, Fv 단편, 디설파이드 결합 Fv(dsFv), Fd 단편, Fd' 단편, 단쇄 Fv(scFv), 단쇄 Fab(scFab), hsFv(나선-안정화 Fv), 단일 도메인 항체(dAb 또는 sdAb), 미니바디, 디아바디, 항-개체특이형(항-Id) 항체, 나노바디 및 낙타과 항체, 자유 경쇄, VHH 항체(또는 나노바디), 또는 상기 중 임의의 것의 항원 결합 단편을 포함하지만 이들에 제한되지 않는다. 항체 단편은 또한, 예를 들어 탠덤 scFv, Fab-scFv(HC C-말단 또는 LC C-말단), Fab-(scFv)2(C-말단), scFv-Fab-scFv, Fab-CH2-scFv, scFv 융합(C 말단 또는 N 말단), Fab-융합(HC C-말단 또는 LC C-말단), scFv-scFv-dAb, scFv-dAb-scFv, dAb-scFv-scFv 및 트리바디와 같은 상기 단편 중 임의의 것의 조합을 포함할 수 있다. 용어 "항체"는 합성 항체, 재조합적으로 생산된 항체, 다중특이적 및 헤테로콘주게이트 항체(예를 들어, 이중, 삼중 및 사중 특이적 항체, 디아바디, 트리아바디 및 테트라바디), 인간 항체, 비-인간 항체, 인간화된 항체, 키메라 항체 및 인트라바디를 포함한다. 본 명세서에서 제공된 항체는 임의의 면역글로불린 클래스(예를 들어, IgG, IgM, IgD, IgE, IgA 및 IgY), 임의의 아강(예를 들어, IgG1, IgG2, IgG3, IgG4, IgA1 및 IgA2) 또는 하위-아강(예를 들어, IgG2a 및 IgG2b)의 구성원을 포함한다.For purposes of this specification, the term “antibody” includes full-length antibodies and portions thereof, including antibody fragments, such as, for example, anti-TNFR1 antibody fragments, unless otherwise specified. Antibody fragments include, for example, Fab fragments, Fab' fragments, F(ab') 2 fragments, Fv fragments, disulfide bonded Fvs (dsFv), Fd fragments, Fd' fragments, single-chain Fvs (scFv), single-chain Fabs (scFabs) , hsFv (helix-stabilized Fv), single domain antibodies (dAb or sdAb), minibodies, diabodies, anti-idiotype (anti-Id) antibodies, nanobodies and camelid antibodies, free light chains, V HH antibodies (or nanobodies), or antigen-binding fragments of any of the above. Antibody fragments also include, for example, tandem scFv, Fab-scFv (HC C-terminus or LC C-terminus), Fab-(scFv) 2 (C-terminus), scFv-Fab-scFv, Fab- CH 2- scFv, scFv fusion (C-terminus or N-terminus), Fab-fusion (HC C-terminus or LC C-terminus), scFv-scFv-dAb, scFv-dAb-scFv, dAb-scFv-scFv and tribodies. A combination of any of the fragments may be included. The term “antibody” includes synthetic antibodies, recombinantly produced antibodies, multispecific and heteroconjugate antibodies (eg, bi-, tri- and tetraspecific antibodies, diabodies, triabodies and tetrabodies), human antibodies, Includes non-human antibodies, humanized antibodies, chimeric antibodies and intrabodies. Antibodies provided herein may be of any immunoglobulin class (eg, IgG, IgM, IgD, IgE, IgA and IgY), any subclass (eg, IgG1, IgG2, IgG3, IgG4, IgA1 and IgA2) or Includes members of sub-classes (eg, IgG2a and IgG2b).
본 명세서에서 사용된 바와 같이, "항체의 형태"는 항체의 특정 구조를 지칭한다. 본 명세서에서 항체는, 예를 들어 Fab 단편 또는 다른 항체 단편과 같은 전장 항체 및 그의 부분을 포함한다. 따라서, Fab는 항체의 특정 형태이다.As used herein, “form of antibody” refers to the specific structure of an antibody. Antibodies herein include full-length antibodies and portions thereof, such as, for example, Fab fragments or other antibody fragments. Thus, a Fab is a specific form of an antibody.
본 명세서에서 사용된 바와 같이, 항체의 "상응하는 형태"에 대한 언급은 2개의 항체의 특성 또는 활성을 비교할 때 항체의 동일한 형태를 사용하여 특성을 비교한다는 것을 의미한다. 예를 들어, 항체가 제1 항체의 상응하는 형태의 활성과 비교하여 활성이 낮다고 언급되어 있는 경우, 이는 해당 항체의 Fab와 같은 특정 형태가 제1 항체의 Fab 형태와 비교하여 활성이 낮다는 것을 의미한다.As used herein, reference to "corresponding forms" of antibodies means that when comparing the properties or activities of two antibodies, the same forms of the antibodies are used to compare the properties. For example, if an antibody is stated to have a lower activity compared to the activity of the corresponding form of the first antibody, this indicates that the specific form, such as Fab, of the antibody has lower activity compared to the Fab form of the first antibody. it means.
본 명세서에서 사용된 바와 같이, 전장 항체는 2개의 전장 중쇄(예를 들어, VH-CH1-CH2-CH3 또는 VH-CH1-CH2-CH3-CH4), 2개의 전장 경쇄(VL-CL) 및 힌지 영역을 갖는 항체로서, B 세포를 분비하는 항체에 의해 생산된 인간 항체 및 합성적으로 생산되는 동일한 도메인을 갖는 항체이다.As used herein, a full-length antibody has two full-length heavy chains (e.g., V H -C H 1-C H 2-C H 3 or V H -C H 1-C H 2-C H 3- C H 4), two full-length light chains (V L -C L ) and a hinge region, human antibodies produced by antibodies secreting B cells and antibodies with identical domains produced synthetically.
본 명세서에서 사용된 바와 같이, "다중 특이적 작제물"은 작제물, 예컨대 표적과 구체적으로 상호작용할 수 있도록 하나 초과의 표적 항원에 대한 친화도를 나타내는 항체 또는 항체의 부분을 포함하는 작제물을 지칭한다. 본 명세서에서 다중 특이적 작제물은 전체 면역글로불린 분자와 유사한 구조를 가질 수 있고, Fc 영역, 예를 들어 IgG Fc 영역, 및 TNFR1 또는 TNFR2에 특이적으로 결합하는 부분과 같은 항원 결합 영역을 포함할 수 있다.As used herein, a “multispecific construct” refers to a construct, such as a construct comprising an antibody or portion of an antibody that exhibits affinity for more than one target antigen such that it is capable of specifically interacting with a target. refers to The multispecific construct herein may have a structure similar to a whole immunoglobulin molecule and may include an Fc region, eg an IgG Fc region, and an antigen binding region such as a region that specifically binds to TNFR1 or TNFR2. can
본 명세서에서 사용된 바와 같이, "이중특이적 작제물"은 2개의 상이한 항원에 대한 결합 특이성을 갖는 다중 특이적 작제물을 지칭한다. 이중특이적 작제물은, 예를 들어 작제물의 활성을 변형시키는 Fc 또는 변형된 Fc와 같은 폴리펩티드 영역에 연결된 단클론성 항체 또는 그의 항원 결합 단편을 포함한다. 인간 치료제의 경우, 작제물은 인간 공급원들로부터 유래되거나, 인간 공급원으로부터 유래되거나 인간화되고, 작제물은 적어도 2개의 상이한 항원에 대한 결합 특이성을 갖는다. 본 명세서에서 제공된 이중특이적 작제물/분자는 TNFR1 및 TNFR2로 지향되는 결합 특이성을 가질 수 있다. 예를 들어, 이중특이적 작제물은 TNFR1 길항제 및 TNFR2 효능제를 포함한다. 이중특이적 항체 또는 작제물은 2개의 별도의 항원 결합 도메인(예를 들어, 링커에 의해 결합된 2개의 scFv, 또는 2개의 dAb, 또는 2개의 Fab)을 포함하는 항체 및 그의 항원 결합 단편을 포함한다. 항원 결합 도메인은 동일한 항원 또는 상이한 항원에 결합할 수 있다.As used herein, "bispecific construct" refers to a multispecific construct that has binding specificities for two different antigens. Bispecific constructs include, for example, monoclonal antibodies or antigen-binding fragments thereof linked to polypeptide regions such as Fc or modified Fc that modify the activity of the construct. In the case of human therapeutics, the construct is derived from, is derived from, or humanized from human sources, and the construct has binding specificities for at least two different antigens. The bispecific constructs/molecules provided herein may have binding specificities directed towards TNFR1 and TNFR2. For example, a bispecific construct includes a TNFR1 antagonist and a TNFR2 agonist. Bispecific antibodies or constructs include antibodies and antigen-binding fragments thereof comprising two separate antigen-binding domains (e.g., two scFvs, or two dAbs, or two Fabs joined by a linker). do. Antigen binding domains may bind the same antigen or different antigens.
본 명세서에서 사용된 바와 같이, "항체 단편" 또는 "항체부"는 전장 미만이지만 항원 결합 부위를 형성하기에 충분한 항체의 가변 영역(들)(예를 들어, 하나 이상의 상보성-결정 영역(CDR))의 적어도 일부를 함유하므로 결합 특이성 및/또는 전장 항체의 활성을 유지하는 전장 항체의 임의의 부분을 지칭하고; 항체 단편은 전장 항체의 효소적 처리에 의해 생산된 항체 유도체뿐만 아니라 합성적으로, 예를 들어 재조합적으로 생산된 유도체를 포함한다. 항체 단편의 예에는 Fab, Fab', F(ab)2, 단쇄 Fv(scFv), Fv, dsFv, 디아바디, 트리아바디, 아피바디, 나노바디, 압타머, dAb, Fd 및 Fd 단편이 포함되지만 이들에 제한되지 않는다 (예를 들어, 문헌[Methods in Molecular Biology, Vol 207: Recombinant Antibodies for Cancer Therapy Methods and Protocols (2003); Chapter 1; pp. 3-25, Kipriyanov] 참조). 단편은, 예컨대 디설파이드 브릿지 및/또는 펩티드 링커로 함께 연결된 다중 사슬을 포함할 수 있다. 항체 단편은 일반적으로 적어도 약 50개의 아미노산, 예컨대 적어도 약 또는 적어도 100개의 아미노산을 함유하고, 전형적으로 적어도 약 또는 적어도 110, 120, 150, 170, 180 또는 200개의 아미노산을 함유한다.As used herein, “antibody fragment” or “antibody portion” refers to the variable region(s) (e.g., one or more complementarity-determining regions (CDRs)) of an antibody that are less than full length but sufficient to form an antigen binding site. ), and thus retains the binding specificity and/or activity of the full length antibody; Antibody fragments include antibody derivatives produced by enzymatic treatment of full length antibodies as well as derivatives produced synthetically, eg recombinantly. Examples of antibody fragments include Fab, Fab', F(ab) 2 , single chain Fv (scFv), Fv, dsFv, diabodies, triabodies, affibodies, nanobodies, aptamers, dAbs, Fd and Fd fragments, but These are not limited (see, eg, Methods in Molecular Biology , Vol 207: Recombinant Antibodies for Cancer Therapy Methods and Protocols (2003);
본 명세서에서 사용된 바와 같이, "Fv 항체 단편"은 비공유 상호작용에 의해 연결된 하나의 가변 중쇄(VH) 도메인 및 하나의 가변 경쇄(VL) 도메인으로 구성된다.As used herein, an “Fv antibody fragment” is composed of one variable heavy (V H ) chain domain and one variable light (V L ) domain linked by non-covalent interactions.
본 명세서에서 사용된 바와 같이, dsFv(디설파이드-결합 Fv)는 VH-VL 쌍을 안정화시키는 조작된 분자간 디설파이드 결합을 갖는 Fv를 지칭한다.As used herein, dsFv (disulfide-bonded Fv) refers to an Fv with an engineered intermolecular disulfide bond that stabilizes the V H -V L pair.
본 명세서에서 사용된 바와 같이, "scFv 단편"은 임의의 순서로 폴리펩티드 링커에 의해 공유적으로 연결된 가변 경쇄(VL) 및 가변 중쇄(VH)를 함유하는 항체 단편을 지칭한다. 링커는 2개의 가변 도메인이 실질적인 간섭 없이 가교되는 길이이다. 예시적인 링커는 용해도를 증가시키기 위해 일부 Glu 또는 Lys 잔기가 전반에 걸쳐 분산된 (Gly-Ser)n 잔기이다.As used herein, “scFv fragment” refers to an antibody fragment containing a variable light (V L ) chain and a variable heavy (V H ) chain covalently linked by a polypeptide linker in any order. A linker is the length by which the two variable domains are bridged without substantial interference. An exemplary linker is a (Gly-Ser) n residue with some Glu or Lys residues dispersed throughout to increase solubility.
본 명세서에서 사용된 바와 같이, "디아바디"는 이량체 scFv이고; 디아바디는 전형적으로 scFv보다 더 짧은 펩티드 링커를 가지며, 우선적으로 이량체화된다.As used herein, a “diabody” is a dimeric scFv; Diabodies typically have shorter peptide linkers than scFvs and preferentially dimerize.
본 명세서에서 사용된 바와 같이, "트리아바디"는 삼량체 scFv이고; 이는 3개의 펩티드 사슬을 함유하며, 이들의 각각은 짧은 링커(예를 들어, 1개 내지 2개의 아미노산으로 구성된 링커)에 의해 결합된 하나의 VH 도메인 및 하나의 VL 도메인을 함유하여 동일한 펩티드 사슬 내에서 VH 및 VL 도메인의 분자내 회합을 허용하고; 트리아바디는 전형적으로 삼량체화된다.As used herein, a “triabody” is a trimeric scFv; It contains three peptide chains, each of which has one V H linked by a short linker (e.g., a linker consisting of 1 to 2 amino acids). domain and one V L domain to allow intramolecular association of the V H and V L domains within the same peptide chain; Triabodies are typically trimerized.
본 명세서에서 사용된 바와 같이, "Fab 단편"은 전장 면역글로불린을 파파인으로 분해하여 생성되는 항체 단편, 또는 예를 들어 재조합 방법에 의해 합성적으로 생산되는 동일한 구조를 갖는 단편이다. Fab 단편은 경쇄(VL 및 CL 함유), 및 중쇄(VH)의 가변 도메인과 중쇄의 하나의 불변 영역 도메인(CH1)을 함유하는 또 다른 사슬을 함유한다.As used herein, "Fab fragment" refers to an antibody fragment produced by digesting a full-length immunoglobulin with papain, or, for example, A fragment having the same structure that is produced synthetically by recombinant methods. Fab fragments contain a light chain (containing V L and C L ) and another chain containing the variable domain of the heavy chain (V H ) and one constant region domain of the heavy chain (C H 1 ).
본 명세서에서 사용된 바와 같이, "F(ab')2 단편"은 pH 4.0 내지 4.5에서 면역글로불린을 펩신으로 분해하여 생성되는 항체 단편, 또는 예를 들어 재조합 방법에 의해 합성적으로 생산되는 동일한 구조를 갖는 단편이다. F(ab')2 단편은 본질적으로 2개의 Fab 단편을 함유하고, 여기서 각각의 중쇄 부분은, 예를 들어 2개의 단편을 연결하는 디설파이드 결합을 형성하는 시스테인 잔기를 포함하는 힌지 영역의 가요성을 제공하기에 충분한 전부 또는 일부와 같은 추가의 몇 개의 아미노산을 함유한다.As used herein, "F(ab') 2 fragment" refers to an antibody fragment produced by pepsin digestion of an immunoglobulin at pH 4.0 to 4.5, or, for example, A fragment having the same structure that is produced synthetically by recombinant methods. An F(ab') 2 fragment essentially contains two Fab fragments, wherein each heavy chain portion has flexibility in the hinge region, which includes, for example, a cysteine residue that forms a disulfide bond connecting the two fragments. contains several additional amino acids, such as all or some of which are sufficient to provide
본 명세서에서 사용된 바와 같이, Fab' 단편은 F(ab')2 단편의 절반(즉, 하나의 중쇄 및 하나의 경쇄)을 함유하는 단편이다.As used herein, a Fab' fragment is a fragment that contains half of an F(ab') 2 fragment (ie, one heavy chain and one light chain).
본 명세서에서 사용된 바와 같이, Fd 단편은 항체 중쇄의 가변 도메인(VH) 및 하나의 불변 영역 도메인(CH1)을 함유하는 항체의 단편이다.As used herein, an Fd fragment is a fragment of an antibody that contains the variable domain (V H ) and one constant region domain (C H 1 ) of an antibody heavy chain.
본 명세서에서 사용된 바와 같이, Fd' 단편은 F(ab')2 단편의 하나의 중쇄 부분을 함유하는 항체의 단편이다.As used herein, an Fd' fragment is a fragment of an antibody that contains one heavy chain portion of an F(ab') 2 fragment.
본 명세서에서 사용된 바와 같이, Fv' 단편은 항체 분자의 VH 및 VL 도메인만을 함유하는 단편이다.As used herein, an Fv' fragment is a fragment that contains only the V H and V L domains of an antibody molecule.
본 명세서에서 사용된 바와 같이, hsFv(나선-안정화 Fv)는 Fab 단편에 정상적으로 존재하는 불변 도메인이 이종이량체 코일드-코일 도메인으로 치환된 항체 단편을 지칭한다 (예를 들어, 문헌[Arndt 등 (2001) J. Mol . Biol . 7:312:221-228] 참조).As used herein, hsFv (helix-stabilized Fv) refers to an antibody fragment in which the constant domains normally present in Fab fragments have been replaced by heterodimeric coiled-coil domains (see, e.g., Arndt et al. (2001) J. Mol . Biol . 7 :312:221-228).
본 명세서에서 사용된 바와 같이, 상호 교환적으로 사용된 "도메인 항체", "단일 도메인 항체", "sdAb" 또는 "dAb"는 항체의 중쇄(VH) 또는 경쇄(VL)의 가변 도메인을 함유하는 작은 단량체 항체 단편을 지칭한다. dAb는 항체의 최소 항원 결합 단편이고; 이는 크기가 약 대략 11 내지 15 kDa(약 100개 내지 150개의 아미노산)이며, 이는 전체 단클론성 항체(mAb) 크기의 대략 1/10이다. 각각의 VH 및 각각의 VL에는 3개의 상보성 결정 영역(CDR)이 있다. 각각의 dAb는 항체의 VH-VL 쌍으로부터 표적 항원에 결합하는 매우 다양한 루프 영역인 6개의 CDR 중 3개를 함유한다.As used herein, "domain antibody", "single domain antibody", "sdAb" or "dAb", used interchangeably, refers to the variable domain of the heavy (V H ) or light (V L ) chain of an antibody. refers to small monomeric antibody fragments that contain A dAb is the smallest antigen-binding fragment of an antibody; It is about 11 to 15 kDa (about 100 to 150 amino acids) in size, which is about 1/10 the size of all monoclonal antibodies (mAbs). Each V H and each V L have three complementarity determining regions (CDRs). Each dAb contains three of the six CDRs, highly variable loop regions that bind the target antigen from the V H -V L pair of antibodies.
본 명세서에서 사용된 바와 같이, 나노바디 또는 VHH라고도 하는 낙타과 항체는 경쇄가 결여되어 있고, 2개의 동일한 중쇄로 구성되어 있다. 이는 낙타과, 예컨대 낙타 및 알파카에서 자연적으로 발생한다.As used herein, camelid antibodies, also referred to as nanobodies or VHHs, lack a light chain and are composed of two identical heavy chains. It occurs naturally in camelids, such as camels and alpacas.
본 명세서에서 사용된 바와 같이, 폴리펩티드 "도메인"은 구조적으로 및/또는 기능적으로 구별 가능하거나 정의할 수 있는 폴리펩티드(3개 이상, 일반적으로 5개, 10개 이상 아미노산의 서열)의 일부이다. 예시적인 폴리펩티드 도메인은 하나 이상의 구조적 모티프(예를 들어, 루프 영역으로 연결된 알파 나선 및/또는 베타 가닥의 조합)로 구성된 폴리펩티드 내에서 독립적으로 폴딩된 구조를 형성할 수 있고/있거나 특정 기능적 활성, 예컨대 효소적 활성, 이량체화 또는 항원 결합에 의해 인식되는 폴리펩티드의 일부이다. 폴리펩티드는 하나 이상, 전형적으로 하나 초과의 별개의 도메인을 가질 수 있다. 예를 들어, 폴리펩티드는 하나 이상의 구조적 도메인 및 하나 이상의 기능적 도메인을 가질 수 있다. 단일 폴리펩티드 도메인은 구조 및 기능에 기초하여 구별될 수 있다. 도메인은 아미노산의 인접한 선형 서열을 포함할 수 있다. 대안적으로, 도메인은 폴리펩티드의 아미노산의 선형 서열을 따라 비-인접한 복수의 비-인접 아미노산 부분을 포함할 수 있다. 전형적으로, 폴리펩티드는 복수의 도메인을 함유한다. 예를 들어, 항체 분자의 각각의 중쇄 및 각각의 경쇄는 각각의 길이가 약 110개의 아미노산인 복수의 면역글로불린(Ig) 도메인을 함유한다. 당업자는 폴리펩티드 도메인에 익숙하고, 다른 그러한 도메인과의 구조적 및/또는 기능적 상동성으로 인해 이를 확인할 수 있다. 본 명세서에서 예시를 위해 정의가 제공되지만, 특정 도메인을 명칭으로 인식하는 것은 당업계의 기술 범위 내에 있는 것으로 이해된다. 필요한 경우, 적절한 소프트웨어를 이용하여 도메인을 확인할 수 있다.As used herein, a polypeptide "domain" is a structurally and/or functionally distinguishable or definable portion of a polypeptide (a sequence of 3 or more, usually 5, 10 or more amino acids). Exemplary polypeptide domains can form independently folded structures within a polypeptide composed of one or more structural motifs (eg, a combination of alpha helices and/or beta strands connected by loop regions) and/or possess specific functional activities, such as It is the part of a polypeptide that is recognized by enzymatic activity, dimerization or antigen binding. A polypeptide can have one or more, typically more than one distinct domain. For example, a polypeptide can have one or more structural domains and one or more functional domains. Single polypeptide domains can be distinguished based on structure and function. A domain can include a contiguous linear sequence of amino acids. Alternatively, a domain may comprise a plurality of non-contiguous amino acid portions that are non-contiguous along a linear sequence of amino acids of a polypeptide. Typically, a polypeptide contains multiple domains. For example, each heavy chain and each light chain of an antibody molecule contains multiple immunoglobulin (Ig) domains, each about 110 amino acids in length. One skilled in the art is familiar with polypeptide domains and can identify them due to structural and/or functional homology with other such domains. While definitions are provided herein for purposes of illustration, it is understood that recognizing a particular domain by name is within the skill of the art. If necessary, the domain can be verified using appropriate software.
본 명세서에서 사용된 바와 같이, 폴리펩티드의 "기능적 영역"은 적어도 하나의 기능적 도메인(예를 들어, 항원 결합, DNA 결합, 리간드 결합 또는 이량체화를 통해, 또는 효소적 활성, 예를 들어 키나제 활성 또는 단백분해 활성에 의해 생체분자와 상호작용하는 능력과 같은 특정 기능을 부여함)을 함유하는 폴리펩티드의 영역이고; 폴리펩티드의 예시적인 기능적 영역은 VH, VL, CH, CL과 같은 항체 도메인 및 CDR1, CDR2 및 CDR3을 포함하는 CDR과 같은 그의 부분, 또는 항체 결합 부위와 같은 항원 결합 부분이다.As used herein, a “functional region” of a polypeptide refers to at least one functional domain (e.g., through antigen binding, DNA binding, ligand binding or dimerization, or through enzymatic activity, e.g., kinase activity or a region of a polypeptide that contains certain functions, such as the ability to interact with biomolecules by means of proteolytic activity; Exemplary functional regions of a polypeptide are antibody domains such as V H , V L , C H , C L and portions thereof such as CDRs including CDR1 , CDR2 and CDR3, or antigen binding portions such as antibody binding sites.
본 명세서에서 사용된 바와 같이, 폴리펩티드의 "구조적 영역"은 적어도 하나의 구조적 도메인을 함유하는 폴리펩티드의 영역이다.As used herein, a "structural region" of a polypeptide is a region of a polypeptide that contains at least one structural domain.
본 명세서에서 사용된 바와 같이, "Ig 도메인"은 면역글로불린(Ig) 폴드라고 하는 구조에 의해 구별되고, 이는 2개의 베타-주름 시트를 함유하며, 각각의 시트는 루프로 연결된 아미노산의 역병렬 베타 가닥을 함유하는 것으로 당업자에 의해 그 자체로 인식되는 도메인이다. Ig 폴드에 있는 2개의 베타 시트는 소수성 상호작용과 보존된 사슬 내 디설파이드 결합에 의해 함께 사이에 끼워져 있다. 항체 사슬 내의 개별 면역글로불린 도메인은 추가로 기능에 기초하여 구별될 수 있다. 예를 들어, 경쇄는 하나의 가변 영역 도메인(VL) 및 하나의 불변 영역 도메인(CL)을 함유하는 반면, 중쇄는 하나의 가변 영역 도메인(VH) 및 3개 또는 4개의 불변 영역 도메인(CH)을 함유한다. VL, CL, VH 및 CH 도메인 각각은 면역글로불린 도메인의 예이다.As used herein, an "Ig domain" is distinguished by a structure called an immunoglobulin (Ig) fold, which contains two beta-pleated sheets, each sheet containing an antiparallel beta chain of looped amino acids. It is a domain recognized per se by those skilled in the art as containing strands. The two beta sheets in the Ig fold are sandwiched together by hydrophobic interactions and conserved intrachain disulfide bonds. Individual immunoglobulin domains within an antibody chain may further be distinguished based on function. For example, a light chain contains one variable region domain (V L ) and one constant region domain ( CL ), whereas a heavy chain contains one variable region domain (V H ) and three or four constant region domains. (C H ). Each of the V L , C L , V H and C H domains is an example of an immunoglobulin domain.
본 명세서에서 사용된 바와 같이, 항체와 관련하여 "가변 도메인"은 상이한 항체들 사이에서 변하는 아미노산의 서열을 함유하는 항체 중쇄 또는 경쇄의 특이적 면역글로불린(Ig) 도메인이다. 각각의 경쇄 및 각각의 중쇄는 하나의 가변 영역 도메인(각각 VL 및 VH)을 갖는다. 가변 도메인은 항원 특이성을 제공하므로 항원 인식을 담당한다. 각각의 가변 영역은 항원 결합 부위 도메인 및 프레임워크 영역(FR)의 일부인 상보성-결정 영역(CDR)을 함유한다.As used herein, a “variable domain” in the context of an antibody is a specific immunoglobulin (Ig) domain of an antibody heavy or light chain that contains a sequence of amino acids that varies between different antibodies. Each light chain and each heavy chain has one variable region domain (V L and V H , respectively). The variable domain provides antigen specificity and is therefore responsible for antigen recognition. Each variable region contains a complementarity-determining region (CDR) that is part of an antigen binding site domain and a framework region (FR).
본 명세서에서 사용된 바와 같이, "초가변 영역", "HV", "상보성-결정 영역", "CDR" 및 "항체 CDR"은 함께 항체의 항원 결합 부위를 형성하는 각각의 가변 영역 내의 복수의 부분 중 하나를 지칭하기 위해 상호 교환적으로 사용된다. 각각의 가변 영역 도메인은 CDR1, CDR2 및 CDR3으로 명명된 3개의 CDR을 함유한다. 3개의 CDR은 선형 아미노산 서열을 따라 비-인접하지만, 폴딩된 폴리펩티드에서는 근접해 있다. CDR은 가변 도메인의 베타 시트의 병렬 가닥을 결합하는 루프 내에 위치된다.As used herein, “hypervariable regions”, “HVs”, “complementarity-determining regions”, “CDRs” and “antibody CDRs” refer to a plurality of regions within each variable region that together form the antigen binding site of an antibody. Used interchangeably to refer to one of the parts. Each variable region domain contains three CDRs designated CDR1, CDR2 and CDR3. The three CDRs are non-adjacent along the linear amino acid sequence, but contiguous in the folded polypeptide. The CDRs are located within loops that join the parallel strands of the beta sheets of the variable domains.
본 명세서에서 사용된 바와 같이, "항원 결합 도메인", "항원 결합 부위(antigen-binding site)", "항원 결합 단편", "항원 결합 부위(antigen combining site)" 및 "항체 결합 부위"는 동족 항원을 인식하고 물리적으로 상호작용하는 항체 내의 도메인을 지칭하기 위해 동의어로 사용된다. 본래의 통상적인 전장 항체 분자는 2개의 통상적인 항원 결합 부위를 가지며, 각각은 중쇄 가변 영역의 부분 및 경쇄 가변 영역의 부분을 함유한다. 통상적인 항원 결합 부위는 가변 영역 도메인 내에서 역병렬 베타 가닥을 연결하는 루프를 함유한다. 항원 결합 부위는 가변 영역 도메인의 다른 부분을 함유할 수 있다. 각각의 통상적인 항원 결합 부위는 중쇄로부터의 3개의 초가변 영역 및 경쇄로부터의 3개의 초가변 영역을 함유한다. 초가변 영역은 상보성-결정 영역(CDR)이라고도 한다.As used herein, "antigen-binding domain", "antigen-binding site", "antigen-binding fragment", "antigen combining site" and "antibody-binding site" are cognate Used synonymously to refer to the domain within an antibody that recognizes and physically interacts with an antigen. An intact, conventional full-length antibody molecule has two conventional antigen binding sites, each containing a portion of a heavy chain variable region and a portion of a light chain variable region. A typical antigen binding site contains loops connecting anti-parallel beta strands within the variable region domain. The antigen binding site may contain other portions of the variable region domains. Each conventional antigen binding site contains three hypervariable regions from the heavy chain and three hypervariable regions from the light chain. Hypervariable regions are also referred to as complementarity-determining regions (CDRs).
본 명세서에서 사용된 바와 같이, 항체 중쇄 또는 경쇄, 또는 가변 중쇄 또는 경쇄와 관련하여 "그의 일부"는 중쇄 및 경쇄를 함유하는 항체로 조립되었을 때, 모든 6개의 CDR을 함유하는 상응하는 전장 항체의 결합 특이성의 적어도 일부를 유지하기에 충분한 가변 중쇄(VH) 및 가변 경쇄(VL)의 적어도 1개 또는 2개, 전형적으로 3개, 4개, 5개 또는 모든 6개의 CDR을 함유하도록 항원 결합 부위를 형성하기에 충분한 그의 인접한 일부를 지칭한다. 일반적으로 충분한 항원 결합 부위는 중쇄의 CDR3(CDRH3)을 필요로 한다. 이는 전형적으로 경쇄의 CDR3(CDRL3)을 추가로 필요로 한다. 본 명세서에 기재된 바와 같이, 당업자는 Kabat 또는 Chothia 넘버링에 기초한 CDR을 알고 확인할 수 있다 (예를 들어, 문헌[Kabat, E. A. 등 (1991) Sequences of Proteins of Immunological Interest, Fifth Edition, U.S. Department of Health and Human Services, NIH Publication No 91-3242; and Chothia, C. 등 (1987) J. Mol. Biol. 196:901-917] 참조).As used herein, "part thereof" in reference to an antibody heavy or light chain, or variable heavy or light chain, when assembled into an antibody containing heavy and light chains, is the equivalent of a full-length antibody containing all six CDRs. The antigen is such that it contains at least one or two, typically three, four, five or all six CDRs of the variable heavy (V H ) and variable light (V L ) chains sufficient to retain at least some of the binding specificity. refers to an adjacent portion thereof sufficient to form a binding site. Generally, sufficient antigen binding sites require heavy chain CDR3 (CDRH3). This typically requires an additional CDR3 of the light chain (CDRL3). As described herein, one skilled in the art can know and identify CDRs based on Kabat or Chothia numbering (see, e.g., Kabat, EA et al. (1991) Sequences of Proteins of Immunological Interest , Fifth Edition, US Department of Health and Human Services, NIH Publication No 91-3242; and Chothia, C. et al. (1987) J. Mol. Biol . 196:901-917).
본 명세서에서 사용된 바와 같이, "프레임워크 영역" 또는 "FR"은 베타 시트 내에 위치한 항체 가변 영역 도메인 내의 도메인이고; FR 영역은 그의 아미노산 서열의 관점에서 초가변 영역보다 비교적 더 보존되어 있다. 각각의 가변 영역은 3개의 초가변 영역을 분리하는 4개의 프레임워크 영역을 함유한다.As used herein, “framework regions” or “FR” are domains within antibody variable region domains located within the beta sheet; FR regions are relatively more conserved than hypervariable regions in terms of their amino acid sequence. Each variable region contains 4 framework regions separating 3 hypervariable regions.
본 명세서에서 사용된 바와 같이, "불변 영역" 도메인은 가변 영역 도메인보다 항체 중에서 비교적 더 보존되는 아미노산의 서열을 함유하는 항체 중쇄 또는 경쇄 내의 도메인이다. 각각의 경쇄에는 단일 경쇄 불변 영역(CL) 도메인이 있고, 각각의 중쇄는 CH1, CH2, CH3 및 CH4를 포함하는 하나 이상의 중쇄 불변 영역(CH) 도메인을 함유한다. 전장 IgA, IgD 및 IgG 아이소타입은 CH1, CH2 및 CH3 도메인 및 힌지 영역을 함유하는 반면, IgE 및 IgM은 CH1, CH2, CH3 및 CH4 도메인을 함유한다. CH1 및 CL 도메인은 항체 분자의 Fab 아암을 확장시켜 항원과의 상호작용 및 항체 아암의 회전에 기여한다. 항체 불변 영역은, 예를 들어 다양한 세포, 생체분자 및 조직과의 상호작용을 통해 항체가 특이적으로 결합하는 이펙터 기능, 예컨대 항원, 병원체 및 독소의 청소능을 제공할 수 있지만, 이들에 제한되지 않는다.As used herein, a “constant region” domain is a domain within an antibody heavy or light chain that contains a sequence of amino acids that is relatively more conserved among antibodies than variable region domains. Each light chain has a single light-chain constant region (C L ) domain, and each heavy chain contains one or more heavy-chain constant region (CH ) domains, including
본 명세서에서 사용된 바와 같이, "항체 힌지 영역" 또는 "힌지 영역"은 CH1과 CH2 도메인 간에 발생하고, Fab 및 Fc 영역을 연결하며, 다른 항체 도메인과 상동성이 없는 감마, 델타 및 알파 항체 아이소타입의 중쇄에 있는 폴리펩티드 영역을 지칭한다. 이러한 영역은 프롤린 잔기가 풍부하고, IgG, IgD 및 IgA 항체에 가요성을 제공하며, Fab 부분의 2개의 "아암"(각각 하나의 항체 결합 부위를 함유함)이 항원에 결합할 때 서로에 대해 다양한 각도를 가정하여 이동할 수 있도록 한다. 이러한 가요성은 세포 표면 또는 다른 항원 상의 에피토프와 상호작용하도록 항체 결합 부위를 정렬하기 위해 Fab 아암이 움직일 수 있게 한다. 힌지 영역 내의 2개의 사슬 간 디설파이드 결합은 2개의 중쇄 간의 상호작용을 안정화시킨다. 본 명세서에 제공된 일부 구현예에서, 합성적으로 생산된 항체 단편은, 예를 들어 2개의 항체 사슬 간의 상호작용을 통해 안정성을 촉진하기 위해 하나 이상의 힌지 영역을 함유한다. 힌지 영역은 이량체화 도메인의 예시 부분이고, 본 명세서의 목적상 링커의 일부이다.As used herein, an “antibody hinge region” or “hinge region” occurs between the
본 명세서에서 사용된 바와 같이, "단편 결정화 가능 영역" 또는 "Fc" 또는 "Fc 영역" 또는 "Fc 도메인"은 제1 불변 영역 면역글로불린 도메인을 제외한 항체 중쇄의 불변 영역을 함유하는 폴리펩티드를 지칭한다. Fc는 IgA, IgD 및 IgG의 마지막 2개의 불변 영역 면역글로불린 도메인(CH2 및 CH3, Cγ2 및 Cγ3이라고도 함) 또는 IgE 및 IgM의 마지막 3개의 불변 영역 면역글로불린 도메인(CH2, CH3 및 CH4)을 지칭한다. 선택적으로, Fc 도메인은 이들 도메인에 대한 N-말단인 가요성 힌지 영역의 전부 또는 일부를 포함할 수 있다. IgA 및 IgM의 경우, Fc는 J 사슬을 포함할 수 있다. IgG의 예시적인 Fc 도메인의 경우, Fc는 면역글로불린 도메인 CH2 및 CH3, 및 선택적으로 CH1과 CH2 사이의 힌지(Cγ1 및 Cγ2라고도 함)의 전부 또는 일부를 함유한다. Fc 영역의 경계는 다양할 수 있지만, 전형적으로 힌지 영역의 적어도 일부를 포함한다. 본 명세서의 목적을 위해 Fc는 또한 임의의 대립유전자 또는 종 변이체, 또는 임의의 변이체 또는 변형된 형태, 예컨대 Fc 수용체(FcR)에 대한 결합을 변경하거나 Fc 매개 이펙터 기능을 변경시키는 Fc의 임의의 변이체 또는 변형된 형태를 포함한다. Fc 영역에서의 돌연변이 및 그의 효과는 당업계에 잘 문서화되어 있다.As used herein, "fragment crystallizable region" or "Fc" or "Fc region" or "Fc domain" refers to a polypeptide containing the constant region of an antibody heavy chain, excluding the first constant region immunoglobulin domain. . Fc is the last two constant region immunoglobulin domains of IgA, IgD and IgG (also known as CH2 and CH3 , Cγ2 and Cγ3) or the last three constant region immunoglobulin domains of IgE and IgM ( CH2 , CH3). H 3 and C H 4). Optionally, the Fc domains can include all or part of the flexible hinge region that is N-terminal to these domains. For IgA and IgM, Fc may include a J chain. In the case of an exemplary Fc domain of an IgG, the Fc contains all or part of the immunoglobulin domains C H 2 and C H 3 and optionally the hinge between
본 명세서에서 사용된 바와 같이, "Fc 키메라"는 하나 이상의 폴리펩티드가 직접적으로 또는 간접적으로 Fc 영역 또는 이의 유도체에 연결되는 키메라 폴리펩티드를 지칭한다. 전형적으로 Fc 키메라는 면역글로불린의 Fc 영역을 또 다른 폴리펩티드와 결합시킨다. Fc 폴리펩티드의 유도체 또는 변형된 Fc 폴리펩티드는 당업자에게 알려져 있다.As used herein, “Fc chimera” refers to chimeric polypeptides in which one or more polypeptides are directly or indirectly linked to an Fc region or derivative thereof. Typically, an Fc chimera combines the Fc region of an immunoglobulin with another polypeptide. Derivatives of Fc polypeptides or modified Fc polypeptides are known to those skilled in the art.
본 명세서에서 사용된 바와 같이, "Kabat 넘버링"은 IgG1 Kabat 항체의 지표 넘버링을 지칭하고(예를 들어, 문헌[Kabat, E. A. 등 (1991) Sequences of Proteins of Immunological Interest, Fifth Edition, U.S. Department of Health and Human Services, NIH Publication No 91-3242] 참조); 이는 키모트립신 넘버링이 프로테아제들 간의 비교를 허용하는 방식과 유사하게 항체들 간의 쉬운 비교를 허용한다. 당업자는 Kabat 넘버링을 사용하여 불변 영역의 영역을 확인할 수 있다.As used herein, “Kabat numbering” refers to the index numbering of IgG1 Kabat antibodies (see, e.g., Kabat, EA et al. (1991) Sequences of Proteins of Immunological Interest , Fifth Edition, US Department of Health and Human Services, NIH Publication No 91-3242); This allows easy comparison between antibodies similar to the way chymotrypsin numbering allows comparison between proteases. One skilled in the art can use Kabat numbering to identify regions of the constant region.
본 명세서에서 사용된 바와 같이, "EU 넘버링" 또는 "EU 지표"는 문헌[Edelman 등, (1969) Proc . Natl . Acad . Sci . USA 63:78-85]에 기재된 EU 항체의 넘버링 체계를 지칭한다. "Kabat에서와 같은 EU 지표"는 문헌[Kabat, E. A. 등 (1991) Sequences of Proteins of Immunological Interest, Fifth Edition, U.S. Department of Health and Human Services, NIH Publication No 91-3242]에 제시된 바와 같은 인간 IgG1 Kabat 항체의 EU 지표 넘버링을 지칭한다. EU 넘버링, 또는 Kabat에서와 같은 EU 넘버링은 항체 경쇄 및 중쇄의 Fc 영역의 아미노산 잔기를 넘버링하기 위해 당업자에 의해 빈번하게 사용된다. 예를 들어, 당업자는 EU 넘버링을 사용하여 불변 영역의 영역을 확인할 수 있다. 예를 들어, Ig 카파 경쇄의 CL 도메인은 카밧 및 EU 넘버링에 따른 잔기 R108-C214에 상응한다 (예를 들어, 하기 표 2 참조). IgG1의 CH1 도메인은 잔기 118-215(EU 넘버링) 또는 114-223(Kabat 넘버링)에 상응하고; CH2는 잔기 231-340(EU 넘버링) 또는 244-360(Kabat 넘버링)에 상응하고; CH3은 잔기 341-447(EU 넘버링) 또는 361-478(Kabat 넘버링)에 상응한다.As used herein, “EU numbering” or “EU indicator” refers to Edelman et al. (1969) Proc . Natl . Acad . Sci . USA 63:78-85]. "EU indicator as in Kabat" is human IgG1 Kabat as set forth in Kabat, EA et al. (1991) Sequences of Proteins of Immunological Interest , Fifth Edition, US Department of Health and Human Services, NIH Publication No 91-3242 Refers to the EU indicator numbering of antibodies. EU numbering, or EU numbering as in Kabat, is frequently used by those skilled in the art to number amino acid residues in the Fc regions of antibody light and heavy chains. For example, one skilled in the art can use EU numbering to identify regions of constant regions. For example, the CL domain of an Ig kappa light chain corresponds to residues R108-C214 according to Kabat and EU numbering (see eg Table 2 below). The
다음의 표는 EU, 카밧 및 순차적인 넘버링에 의한 IgG1 및 IgG4 중쇄 불변 도메인, 및 Ig 카파 경쇄 불변 도메인에 대한 넘버링을 정의한다. 표 1은 EU, 카밧 및 순차적인 넘버링에 의한 IgG1 중쇄 불변 도메인을 나타내고, 여기서 순차적인 넘버링은 서열번호: 9에 제시된 아미노산의 서열에 관한 것이고, CH1, CH2 및 CH3 도메인 내의 잔기뿐만 아니라 힌지 영역을 확인한다. 표 2는 EU, 카밧 및 순차적인 넘버링에 의한 면역글로불린(Ig) 카파 경쇄 불변 도메인을 나타내고, 여기서 순차적인 넘버링은 서열번호: 17에 제시된 아미노산의 서열에 관한 것이다. 표 2에서, 최상부 행(굵은 글씨)은 아미노산 잔기 번호를 순차적인 넘버링(서열번호: 17을 참조)으로 제시하고; 제2 행(굵은 글씨)은 최상부 행의 숫자로 표시된 위치에 있는 아미노산 잔기에 대한 1-글자 코드를 제공하고; 제3 행(이탤릭체)은 Kabat 넘버링에 따른 상응하는 Kabat 번호를 나타내고; 및 제4 행은 EU 넘버링에 따른 상응하는 EU 지표 번호를 나타낸다. 표 3은 EU, 카밧 및 순차적인 넘버링에 의한 IgG4 중쇄 불변 도메인을 나타내고, 여기서 순차적인 넘버링은 서열번호: 15에 제시된 아미노산의 서열에 관한 것이고, CH1, CH2 및 CH3 도메인 내의 잔기뿐만 아니라 힌지 영역을 확인한다.The following table defines the numbering for the IgG1 and IgG4 heavy chain constant domains, and the Ig kappa light chain constant domains by EU, Kabat and sequential numbering. Table 1 shows the IgG1 heavy chain constant domains by EU, Kabat and sequential numbering, wherein the sequential numbering relates to the sequence of amino acids set forth in SEQ ID NO: 9, within the
본 명세서에서 사용된 바와 같이, 또 다른 항체, 예컨대 단클론성 항체로부터 유래된 항체 단편을 언급할 때, 문구 "~로부터 유래된"은 원래 항체의 결합 특이성을 유지하는 항체 단편(예를 들어, Fab, F(ab'), F(ab')2, 단쇄 Fv(scFv), Fv, dsFv, dAb, 디아바디, Fd 및 Fd' 단편)의 엔지니어링을 지칭한다. 그러한 단편은 효소적 절단, 화학적 가교, 재조합 수단 또는 이들의 조합을 포함하지만 이들에 제한되지 않는 당업계에 알려진 다양한 방법에 의해 유래될 수 있다. 일반적으로, 항체 단편과 모 항체가 동일한 에피토프에 결합하도록 유래된 항체 단편은 모 항체의 중쇄 가변 영역(VH) 및 경쇄 가변 영역(VL)을 동일하거나 실질적으로 동일하게 공유한다.As used herein, when referring to an antibody fragment derived from another antibody, such as a monoclonal antibody, the phrase “derived from” refers to an antibody fragment that retains the binding specificity of the original antibody (e.g., Fab , F(ab'), F(ab') 2 , single-chain Fv (scFv), Fv, dsFv, dAb, diabodies, Fd and Fd' fragments). Such fragments may be derived by a variety of methods known in the art including, but not limited to, enzymatic cleavage, chemical cross-linking, recombinant means, or combinations thereof. Generally, antibody fragments derived such that the antibody fragment and the parent antibody bind to the same epitope share the same or substantially identical heavy chain (V H ) and light chain variable regions (V L ) of the parent antibody.
본 명세서에서 사용된 바와 같이, "모 항체" 또는 "공급원 항체"는 항체 단편(예를 들어, Fab, F(ab'), F(ab)2, 단쇄 Fv(scFv), Fv, dsFv, dAb, 디아바디, Fd 및 Fd' 단편)이 유래되는 항체를 지칭한다.As used herein, "parent antibody" or "source antibody" refers to an antibody fragment (eg, Fab, F(ab'), F(ab) 2 , single chain Fv (scFv), Fv, dsFv, dAb , diabodies, Fd and Fd' fragments) are derived.
본 명세서에서 사용된 바와 같이, 용어 "에피토프"는 항체의 파라토프가 결합할 수 있는 항원 또는 단백질 상의 임의의 항원 결정인자를 지칭한다. 에피토프 결정인자는 전형적으로 아미노산 또는 당 측쇄와 같은 분자의 화학적 활성 표면 그룹화를 포함하고, 전형적으로 특이적 3차원 구조적 특징뿐만 아니라 특이적 전하 특징을 가지고 있다.As used herein, the term "epitope" refers to any antigenic determinant on an antigen or protein to which a paratope of an antibody can bind. Epitopic determinants typically include chemically active surface groupings of molecules such as amino acids or sugar side chains, and typically have specific three-dimensional structural characteristics as well as specific charge characteristics.
본 명세서에서 사용된 바와 같이, "인간화된 항체" 및 인간 치료제는 아미노산의 "인간" 서열을 포함하도록 변형되어 인간에 대한 투여가 면역 반응을 유발하지 않도록 하는 항체 및 다른 단백질 치료제를 지칭한다. 예를 들어, 인간화된 항체는 전형적으로 비-인간 종 면역글로불린으로부터 유래된 상보성 결정 영역(CDR 또는 초가변 루프) 및 주로 인간 면역글로불린으로부터 유래된 나머지 항체 분자를 함유한다. 항체를 포함하는 단백질을 인간화하고 이들을 생산하는 방법은 당업자에게 잘 알려져 있고 용이하게 입수 가능하다. 예를 들어, 단클론성 항체를 암호화하는 DNA는 비-가변 영역의 아미노산 조성물이 인간 항체를 기반으로 하는 항체를 암호화하기 위해 재조합 DNA 기술에 의해 변경될 수 있다. 면역글로불린의 가변 및 비-가변 영역을 확인하기 위해 설계된 컴퓨터 프로그램을 포함하여 그러한 영역을 확인하는 방법이 알려져 있다. 따라서, 일반적으로 인간화된 항체는 적어도 하나, 및 전형적으로 2개의 가변 도메인을 실질적으로 모두 함유하고, 여기서 초가변 루프(예를 들어, CDR)의 모두 또는 실질적으로 모두는 비-인간 면역글로불린의 초가변 루프에 상응하고, 프레임워크 영역(FR)의 모두 또는 실질적으로 모두는 인간 면역글로불린 서열의 프레임워크 영역이다. 인간화된 항체는 또한 면역글로불린 불변 영역(Fc)의 적어도 일부, 전형적으로 인간 면역글로불린의 적어도 일부를 선택적으로 함유한다.As used herein, "humanized antibody" and human therapeutics refer to antibodies and other protein therapeutics that have been modified to include a "human" sequence of amino acids such that administration to humans does not elicit an immune response. For example, humanized antibodies typically contain complementarity determining regions (CDRs or hypervariable loops) derived from non-human species immunoglobulins and the remainder of the antibody molecule derived primarily from human immunoglobulins. Methods for humanizing proteins, including antibodies, and producing them are well known and readily available to those skilled in the art. For example, DNA encoding a monoclonal antibody can be altered by recombinant DNA techniques to encode an antibody in which the amino acid composition of the non-variable region is based on a human antibody. Methods for identifying variable and non-variable regions of immunoglobulins are known, including computer programs designed to identify such regions. Thus, generally a humanized antibody will contain substantially all of at least one, and typically two, variable domains, wherein the hypervariable loops (e.g., All or substantially all of the CDRs correspond to hypervariable loops of a non-human immunoglobulin, and all or substantially all of the framework regions (FRs) are framework regions of human immunoglobulin sequences. The humanized antibody also optionally contains at least a portion of an immunoglobulin constant region (Fc), typically that of a human immunoglobulin.
본 명세서에서 사용된 바와 같이, "다량체화 도메인"은 폴리펩티드 분자와 하나 이상의 추가의 폴리펩티드 분자와의 안정한 상호작용을 촉진하고, 각각은 상보적 다량체화 도메인을 함유하며, 이는 제1 도메인과 안정한 다량체를 형성하기 위해 동일하거나 상이한 다량체화 도메인일 수 있는 아미노산의 서열을 지칭한다. 일반적으로 폴리펩티드는 직접적으로 또는 간접적으로 다량체화 도메인에 결합된다. 예시적인 다량체화 도메인은 면역글로불린 서열 또는 그의 부분, 류신 지퍼, 소수성 영역, 친수성 영역 및 양립가능한 단백질-단백질 상호작용 도메인을 포함한다. 예를 들어, 다량체화 도메인은, 예를 들어 IgG1, IgG2, IgG3 또는 IgG4 하위유형을 포함하는 IgG, IgA, IgE, IgD 및 IgM으로부터의 Fc 도메인 또는 그의 부분, 및 그의 변형된 형태와 같은 면역글로불린 불변 영역 또는 도메인일 수 있다.As used herein, a "multimerization domain" promotes stable interactions of a polypeptide molecule with one or more additional polypeptide molecules, each containing a complementary multimerization domain, which is a stable multimerization domain with the first domain. Refers to a sequence of amino acids that can be the same or different multimerization domains to form a body. Typically the polypeptide is directly or indirectly linked to the multimerization domain. Exemplary multimerization domains include immunoglobulin sequences or portions thereof, leucine zippers, hydrophobic regions, hydrophilic regions and compatible protein-protein interaction domains. For example, the multimerization domain may be an immunoglobulin, such as an Fc domain or portion thereof from IgG, IgA, IgE, IgD and IgM, including, for example, the IgG1, IgG2, IgG3 or IgG4 subtypes, and modified forms thereof. It can be a constant region or domain.
본 명세서에서 사용된 바와 같이, "이량체화 도메인"은 2개의 폴리펩티드 서열(예컨대, 항체 사슬이지만 이에 제한되지 않음) 간의 상호작용을 용이하게 하는 다량체화 도메인이다. 이량체화 도메인은 2개의 폴리펩티드 서열, 예컨대 전장 항체 힌지 영역의 전부 또는 일부, 또는 폴리펩티드들(예를 들어, 류신 지퍼, GCN4 지퍼) 간의 상호작용을 촉진하는 것으로 알려진 아미노산의 서열인 하나 이상의 이량체화 서열 간의 디설파이드 결합의 형성을 용이하게 하는 시스테인 잔기를 함유하는 아미노산 서열을 포함하지만 이에 제한되지 않는다.As used herein, a "dimerization domain" is a multimerization domain that facilitates interaction between two polypeptide sequences (eg, but not limited to, antibody chains). A dimerization domain is one or more dimerization sequences that are sequences of amino acids known to promote interactions between two polypeptide sequences, such as all or part of a full-length antibody hinge region, or polypeptides (eg, leucine zippers, GCN4 zippers) amino acid sequences containing cysteine residues that facilitate the formation of disulfide bonds between the liver.
본 명세서에서 사용된 바와 같이, "키메라 폴리펩티드"는 적어도 2개의 상이한 폴리펩티드 또는 단일 폴리펩티드의 2개의 비-인접 부분으로부터의 부분을 함유하는 폴리펩티드를 지칭한다. 따라서, 키메라 폴리펩티드는 일반적으로 하나의 폴리펩티드의 전부 또는 일부로부터의 아미노산 잔기의 서열, 및 또 다른 상이한 폴리펩티드의 전부 또는 일부로부터의 아미노산의 서열을 포함한다. 2개의 부분은 직접적으로 또는 간접적으로 연결될 수 있고, 등장성 pH 7 완충 식염수와 같은 평형 조건 및 생리적 조건 하에서 키메라 폴리펩티드의 상당한 부분의 무결성을 유지하기에 충분한 강도의 펩티드 결합, 다른 공유 결합 또는 다른 비-공유 상호작용을 통해 연결될 수 있다.As used herein, “chimeric polypeptide” refers to a polypeptide that contains portions from at least two different polypeptides or two non-contiguous portions of a single polypeptide. Thus, a chimeric polypeptide generally comprises a sequence of amino acid residues from all or part of one polypeptide and a sequence of amino acids from all or part of another, different polypeptide. The two moieties may be linked directly or indirectly, peptide bonds, other covalent bonds, or other ratios of sufficient strength to maintain the integrity of a substantial portion of the chimeric polypeptide under physiological conditions and equilibrium conditions such as isotonic pH 7 buffered saline. - Can be connected through shared interactions.
본 명세서에서 사용된 바와 같이, "융합 단백질"은, 예컨대 2개의 폴리펩티드를 암호화하는 2개의 핵산을 함유하는 벡터로부터 융합 단백질을 벡터의 길이를 따라 서로 매우 근접하게, 예를 들어 인접하여 발현시킴으로써 함께 결합된 2개의 별개의 폴리펩티드에 상응하는 아미노산의 서열을 함유하도록 조작된 폴리펩티드이다. 따라서, 융합 단백질은 펩티드 결합을 통해 직접적으로 또는 간접적으로 연결된 2개, 또는 2개 이상의 단백질 또는 펩티드로부터의 부분을 함유하는 키메라 단백질을 지칭한다. 2개의 분자는 작제물에서 인접할 수 있거나, 링커 또는 스페이서 폴리펩티드에 의해 분리될 수 있다.As used herein, a "fusion protein" refers to a fusion protein from a vector containing two nucleic acids encoding two polypeptides together by expressing the fusion protein in close proximity to each other, e.g., adjacent to each other along the length of the vector. A polypeptide engineered to contain a sequence of amino acids corresponding to two separate polypeptides joined. Thus, a fusion protein refers to a chimeric protein containing parts from two, or two or more proteins or peptides linked directly or indirectly through peptide bonds. The two molecules may be adjacent in the construct or may be separated by a linker or spacer polypeptide.
본 명세서에서 사용된 바와 같이, "링커", "링커 단위" 또는 "링크"는 항체 또는 그의 항원 결합 단편을 또 다른 치료적 모이어티 또는 또 다른 항체 또는 그의 단편에 공유적으로 부착시키는 원자의 사슬을 함유하는 펩티드 또는 화학적 모이어티를 지칭한다. 예를 들어, 가요성을 증가시키고, 입체 장애를 포함하는 입체 효과를 변경하고, 수성 매질에서 용해도를 증가시키기 위해 링커가 포함된다.As used herein, "linker", "linker unit" or "link" is a chain of atoms that covalently attaches an antibody or antigen-binding fragment thereof to another therapeutic moiety or another antibody or fragment thereof. Refers to a peptide or chemical moiety containing For example, linkers are included to increase flexibility, alter steric effects including steric hindrance, and increase solubility in aqueous media.
본 명세서에서 사용된 바와 같이, "링커 펩티드" 또는 "스페이서 펩티드"는 2개의 폴리펩티드 서열(또는 아미노산 서열과 같은 암호화 핵산)을 결합하는 아미노산의 짧은 서열을 지칭한다. "펩티드 링커"는 2개의 폴리펩티드 서열을 결합하는 아미노산의 짧은 서열을 지칭한다. 폴리펩티드 링커의 예에는 펩티드 형질도입 도메인을 항체에 결합시키는 링커, 또는 합성 항체 단편, 예컨대 scFv 단편에서 2개의 항체 사슬을 결합시키는 링커가 있다. 링커는 잘 알려져 있고, 임의의 알려진 링커는 제공된 방법에서 사용될 수 있다. 예시적인 폴리펩티드 링커는 (Gly-Ser)n 아미노산 서열을 포함하고, 일부 Glu 또는 Lys 잔기는 용해도를 증가시키기 위해 전반에 걸쳐 분산되어 있다. 다른 예시적인 링커는 본 명세서에 기재되어 있고; 이들 중 임의의 링커 및 다른 알려진 링커는 본 명세서에 제공된 폴리펩티드, 항체, 및 다른 생성물 및 방법과 함께 사용될 수 있다.As used herein, a "linker peptide" or "spacer peptide" refers to a short sequence of amino acids that joins two polypeptide sequences (or encoding nucleic acids, such as amino acid sequences). A "peptide linker" refers to a short sequence of amino acids that joins two polypeptide sequences. Examples of polypeptide linkers are linkers that join a peptide transduction domain to an antibody, or linkers that join two antibody chains in a synthetic antibody fragment, such as a scFv fragment. Linkers are well known, and any known linker can be used in the provided methods. Exemplary polypeptide linkers include the (Gly-Ser) n amino acid sequence, with some Glu or Lys residues dispersed throughout to increase solubility. Other exemplary linkers are described herein; Any of these and other known linkers can be used with the polypeptides, antibodies, and other products and methods provided herein.
본 명세서에서 사용된 바와 같이, "태그" 또는 "에피토프 태그"는 본 명세서에 제공된 폴리펩티드의 N- 또는 C- 말단, 예컨대 항체 및 항체 단편/작제물에 전형적으로 첨가된 아미노산의 서열을 지칭한다. 폴리펩티드에 융합된 태그의 포함은 폴리펩티드 정제 및/또는 검출을 용이하게 할 수 있다. 전형적으로 태그 또는 태그 폴리펩티드는 항체에 의해 인식되는 에피토프를 제공하기에 충분한 잔기를 가지고 있거나, 검출 또는 정제를 위해 제공될 수 있지만, 연결된 폴리펩티드의 활성을 방해하지 않을 정도로 충분히 짧은 폴리펩티드를 지칭한다. 태그 폴리펩티드는 전형적으로 충분히 고유하여 이에 특이적으로 결합하는 항체가 연결된 폴리펩티드의 에피토프와 실질적으로 교차 반응하지 않는다. 적합한 태그 폴리펩티드는 일반적으로 적어도 5개 또는 6개의 아미노산 잔기를 가지며, 통상적으로 약 8개 내지 50개의 아미노산 잔기, 전형적으로 9개 내지 30개의 잔기를 갖는다. 태그는 다량체에서 하나 이상의 키메라 폴리펩티드에 연결될 수 있고, 다량체의 검출, 또는 샘플 또는 혼합물로부터의 그의 회수를 허용할 수 있다. 그러한 태그는 잘 알려져 있고, 용이하게 합성되고 설계될 수 있다. 예시적인 태그 폴리펩티드는 친화성 정제에 사용된 것을 포함하고, 예를 들어 FLAG 태그; 그의 태그; 인플루엔자 혈구응집소(HA) 태그 폴리펩티드 및 그의 항체 12CA5 (예를 들어, 문헌[Field 등 (1988) Mol . Cell. Biol. 8:2159-2165] 참조); c-myc 태그 및 그에 대한 8F9, 3C7, 6E10, G4, B7 및 9E10 항체(예를 들어, 문헌[Evan 등 (1985) Molecular and Cellular Biology 5:3610-3616] 참조); 및 단순 포진 바이러스 당단백질 D(gD) 태그 및 그의 항체(예를 들어, 문헌[Paborsky 등 (1990) Protein Engineering 3:547-553] 참조)를 포함한다. 에피토프-태깅된 항체를 검출하기 위해 사용된 항체는 전형적으로 본 명세서에서 이차 항체로서 지칭된다.As used herein, a “tag” or “epitope tag” refers to a sequence of amino acids typically added to the N- or C-terminus of a polypeptide provided herein, such as antibodies and antibody fragments/constructs. Inclusion of a tag fused to the polypeptide can facilitate purification and/or detection of the polypeptide. Typically, a tag or tag polypeptide refers to a polypeptide having sufficient residues to provide an epitope recognized by an antibody, or short enough to provide for detection or purification, but not interfering with the activity of the linked polypeptide. The tag polypeptide is typically sufficiently unique that an antibody specifically binding thereto does not substantially cross-react with the epitope of the linked polypeptide. Suitable tag polypeptides generally have at least 5 or 6 amino acid residues, usually about 8 to 50 amino acid residues, typically 9 to 30 residues. A tag may be linked to one or more chimeric polypeptides in a multimer and allow for detection of the multimer, or recovery thereof from a sample or mixture. Such tags are well known and can be easily synthesized and designed. Exemplary tag polypeptides include those used for affinity purification, such as the FLAG tag; his tag; Influenza hemagglutinin (HA) tag polypeptide and its antibody 12CA5 (see, eg, Field et al. (1988) Mol . Cell. Biol. 8 :2159-2165); the c-myc tag and the 8F9, 3C7, 6E10, G4, B7 and 9E10 antibodies thereto (see, eg, Evan et al. (1985) Molecular and Cellular Biology 5 :3610-3616); and the herpes simplex virus glycoprotein D (gD) tag and antibodies thereof (see, eg, Paborsky et al. (1990) Protein Engineering 3 :547-553). Antibodies used to detect epitope-tagged antibodies are typically referred to herein as secondary antibodies.
본 명세서에서 사용된 바와 같이, "라벨" 또는 "검출 가능한 모이어티"는 분자(예를 들어, 본 명세서에 제공된 항체 또는 그의 항원 결합 단편, 예컨대 항-TNFR1 항체 또는 그의 항원 결합 단편)에 직접적으로 또는 간접적으로 부착되거나 연결될 수 있거나, 분자와 회합될 수 있고, 생체 내 및/또는 시험관 내에서 검출될 수 있는 검출 가능한 마커(예를 들어, 형광 분자, 화학발광 분자, 생물발광 분자, 조영제(예를 들어, 금속), 방사선 핵종, 발색단, 검출 가능한 펩티드, 또는 검출 가능한 생성물의 형성을 촉매하는 효소)이다. 검출 방법은 알려진 생체 내 및/또는 시험관 내 검출의 방법(예를 들어, 육안 검사, 자기 공명(MR) 분광법, 초음파 신호, X-선, 감마선 분광법(예를 들어, 양전자 방출 단층 촬영(PET) 스캐닝, 단일-광자 방출 컴퓨터 단층 촬영(SPECT)), 형광 분광법 또는 흡수에 의한 이미징)을 포함한 당업계에 공지된 임의의 방법일 수 있다. 간접적인 검출은 검출 가능한 모이어티에 직접적으로 또는 간접적으로 결합하는 물리적 현상, 예컨대 원자, 분자 또는 조성물의 에너지 또는 입자 방출 또는 흡수의 측정(예를 들어, 일차 항체에 결합하는 라벨링된 이차 항체 또는 그의 항원 결합 단편(예를 들어, 본 명세서에 제공된 항-TNFR 항체 또는 그의 항원 결합 단편)의 검출)을 지칭한다.As used herein, a “label” or “detectable moiety” refers to a molecule (e.g., an antibody or antigen-binding fragment thereof provided herein, such as an anti-TNFR1 antibody or antigen-binding fragment thereof), which may be directly or indirectly attached to or linked to, or which may be associated with a molecule, and which may be detected in vivo and/or in vitro (e.g., a fluorescent molecule, a chemical luminescent molecules, bioluminescent molecules, contrast agents (eg, metals), radionuclides, chromophores, detectable peptides, or enzymes that catalyze the formation of detectable products). The detection method may be a method of known in vivo and/or in vitro detection (e.g., visual inspection, magnetic resonance (MR) spectroscopy, ultrasound signal, X-ray, gamma ray spectroscopy (e.g., positron emission tomography (PET)) scanning, single-photon emission computed tomography (SPECT)), fluorescence spectroscopy or imaging by absorption) may be any method known in the art. Indirect detection refers to a physical phenomenon that directly or indirectly binds to a detectable moiety, such as the measurement of energy or particle emission or absorption of an atom, molecule, or composition (e.g., a labeled secondary antibody that binds to a primary antibody or its antigen). detection of a binding fragment (eg, an anti-TNFR antibody or antigen-binding fragment thereof provided herein).
본 명세서에서 사용된 바와 같이, "핵산"은 전형적으로 포스포디에스테르 연결에 의해 함께 결합된 데옥시리보핵산(DNA) 및 리보핵산(RNA)을 포함하는 적어도 2개의 연결된 뉴클레오티드 또는 뉴클레오티드 유도체를 지칭한다. 또한 용어 "핵산"에는 핵산의 유사체, 예컨대 펩티드 핵산(PNA), 포스포로티오에이트 DNA, 및 다른 그러한 유사체 및 유도체 또는 이들의 조합이 포함된다. 핵산은 또한, 예를 들어 포스포디에스테르 결합, 예를 들어 포스포트리에스테르 결합, 포스포르아미데이트 결합, 포스포로티오에이트 결합, 티오에스테르 결합 또는 펩티드 결합(즉, 펩티드 핵산) 이외의 뉴클레오티드 유사체 또는 "백본" 결합을 함유하는 DNA 및 RNA 유도체를 포함한다. 상기 용어는 또한 뉴클레오티드 유사체, 단일(센스 또는 안티센스) 및 이중-가닥 핵산으로부터 만들어진 RNA 또는 DNA의 등가물, 유도체, 변이체 및 유사체를 포함한다. 데옥시리보뉴클레오티드에는 데옥시아데노신, 데옥시시티딘, 데옥시구아노신 및 데옥시티미딘이 포함된다. RNA의 경우, 우라실 염기는 우리딘이다.As used herein, "nucleic acid" refers to at least two linked nucleotides or nucleotide derivatives, including deoxyribonucleic acid (DNA) and ribonucleic acid (RNA), typically linked together by phosphodiester linkages. . Also included within the term "nucleic acid" are analogs of nucleic acids, such as peptide nucleic acids (PNAs), phosphorothioate DNA, and other such analogs and derivatives or combinations thereof. Nucleic acids may also include nucleotide analogs other than, for example, phosphodiester linkages, e.g., phosphotriester linkages, phosphoramidate linkages, phosphorothioate linkages, thioester linkages, or peptide linkages (i.e., peptide nucleic acids) or “peptide nucleic acids”. Includes DNA and RNA derivatives containing "backbone" linkages. The term also includes nucleotide analogues, equivalents, derivatives, variants and analogues of RNA or DNA made from single (sense or antisense) and double-stranded nucleic acids. Deoxyribonucleotides include deoxyadenosine, deoxycytidine, deoxyguanosine and deoxythymidine. For RNA, the uracil base is uridine.
본 명세서에서 사용된 바와 같이, "단리된 핵산 분자"는 핵산 분자의 천연 공급원에 존재하는 다른 핵산 분자로부터 분리된 것이다. "단리된" 핵산 분자, 예컨대 cDNA 분자는 재조합 기술에 의해 생산되었을 때 다른 세포 물질 또는 배양 배지가 실질적으로 없거나, 화학적으로 합성되었을 때 화학적 전구체 또는 다른 화학물질이 실질적으로 없을 수 있다. 본 명세서에 제공된 예시적인 단리된 핵산 분자는 제공된 항체 또는 항원 결합 단편을 암호화하는 단리된 핵산 분자를 포함한다.As used herein, an "isolated nucleic acid molecule" is one that has been separated from other nucleic acid molecules present in the natural source of the nucleic acid molecule. An "isolated" nucleic acid molecule, such as a cDNA molecule, may be substantially free of other cellular material or culture medium when produced by recombinant techniques, or substantially free of chemical precursors or other chemicals when chemically synthesized. Exemplary isolated nucleic acid molecules provided herein include isolated nucleic acid molecules encoding the provided antibodies or antigen-binding fragments.
본 명세서에서 사용된 바와 같이, 핵산 서열, 영역, 요소 또는 도메인과 관련하여 "작동 가능하게 연결된"은 핵산 영역이 서로 기능적으로 관련되어 있다는 것을 의미한다. 예를 들어, 리더 펩티드를 암호화하는 핵산은 폴리펩티드를 암호화하는 핵산에 작동 가능하게 연결될 수 있고, 이에 의해 핵산이 전사되고 번역되어 기능적 융합 단백질을 발현할 수 있으며, 여기서 리더 펩티드는 융합 폴리펩티드의 분비에 영향을 미친다. 일부 경우에, 제1 폴리펩티드(예를 들어, 리더 펩티드)를 암호화하는 핵산은 제2 폴리펩티드를 암호화하는 핵산에 작동 가능하게 연결되고, 핵산은 단일 mRNA 전사체로서 전사되지만, mRNA 전사체의 번역은 발현되는 2개의 폴리펩티드 중 하나를 초래할 수 있다. 예를 들어, 앰버 정지 코돈은 제1 폴리펩티드를 암호화하는 핵산과 제2 폴리펩티드를 암호화하는 핵산 사이에 위치될 수 있으므로 부분적인 앰버 억제 세포에 도입되었을 때, 생성된 단일 mRNA 전사체는 번역되어 제1 및 제2 폴리펩티드를 함유하는 융합 단백질을 생산할 수 있거나, 번역되어 제1 폴리펩티드만 생산할 수 있다. 또 다른 예에서, 프로모터는 폴리펩티드를 암호화하는 핵산에 작동 가능하게 연결될 수 있고, 이에 의해 프로모터는 핵산의 전사를 조절하거나 매개한다.As used herein, “operably linked” with respect to nucleic acid sequences, regions, elements or domains means that the nucleic acid regions are in functional relationship with each other. For example, a nucleic acid encoding a leader peptide can be operably linked to a nucleic acid encoding a polypeptide, whereby the nucleic acid can be transcribed and translated to express a functional fusion protein, wherein the leader peptide is responsible for secretion of the fusion polypeptide. It affects. In some cases, a nucleic acid encoding a first polypeptide (e.g., a leader peptide) is operably linked to a nucleic acid encoding a second polypeptide, and the nucleic acid is transcribed as a single mRNA transcript, but translation of the mRNA transcript is It can result in either of the two polypeptides being expressed. For example, an amber stop codon can be placed between a nucleic acid encoding a first polypeptide and a nucleic acid encoding a second polypeptide so that when introduced into a partial amber suppressor cell, the resulting single mRNA transcript is translated to produce the first and a second polypeptide, or can be translated to produce only the first polypeptide. In another example, a promoter can be operably linked to a nucleic acid encoding a polypeptide, whereby the promoter regulates or mediates transcription of the nucleic acid.
본 명세서에서 사용된 바와 같이, 예를 들어 합성 핵산 분자 또는 합성 유전자 또는 합성 펩티드와 관련하여 "합성"은 재조합 방법 및/또는 화학적 합성 방법에 의해 생산되는 핵산 분자 또는 유전자 또는 폴리펩티드 분자를 지칭한다. As used herein, “synthetic”, e.g., in reference to a synthetic nucleic acid molecule or synthetic gene or synthetic peptide, refers to a nucleic acid molecule or gene or polypeptide molecule produced by recombinant and/or chemical synthetic methods.
본 명세서에서 사용된 바와 같이, 천연 발생 α-아미노산의 잔기는 인간에서 그의 동족 mRNA 코돈을 갖는 충전된 tRNA 분자의 특이적 인식에 의해 단백질에 혼입되는 자연에서 발견된 20개의 α-아미노산의 잔기이다.As used herein, residues of naturally occurring α-amino acids are those of the 20 α-amino acids found in nature that are incorporated into proteins by specific recognition of charged tRNA molecules with their cognate mRNA codons in humans. .
본 명세서에서 사용된 바와 같이, "폴리펩티드"는 공유적으로 결합된 2개 이상의 아미노산을 지칭한다. 용어 "폴리펩티드" 및 "단백질"은 본 명세서에서 상호 교환적으로 사용된다.As used herein, "polypeptide" refers to two or more amino acids covalently linked. The terms "polypeptide" and "protein" are used interchangeably herein.
본 명세서에서 사용된 바와 같이, "펩티드"는 길이가 2개 내지 약 40개의 아미노산인 폴리펩티드를 지칭한다.As used herein, “peptide” refers to a polypeptide that is between 2 and about 40 amino acids in length.
본 명세서에서 사용된 바와 같이, "아미노산"은 아미노 기 및 카복실산 기를 함유하는 유기 화합물이다. 폴리펩티드는 2개 이상의 아미노산을 함유한다. 본 명세서의 목적을 위해, 제공된 항체와 같은 폴리펩티드 내의 아미노산은 20개의 천연 발생 아미노산(표 4), 비-천연 아미노산 및 아미노산 유사체(예를 들어, α-탄소에 측쇄가 있는 아미노산)를 포함한다. 본 명세서에서 사용된 바와 같이, 본 명세서에 나타나는 폴리펩티드의 다양한 아미노산 서열에서 발생하는 아미노산은 그의 잘 알려진 3-문자 또는 1-문자 약어에 따라 확인된다 (표 4 참조). 다양한 핵산 분자 및 단편에서 발생하는 뉴클레오티드는 당업계에서 일상적으로 사용되는 표준 단일 문자 지정으로 지정된다.As used herein, “amino acid” is an organic compound containing an amino group and a carboxylic acid group. Polypeptides contain two or more amino acids. For purposes herein, amino acids in polypeptides such as antibodies provided include the 20 naturally occurring amino acids (Table 4), non-natural amino acids and amino acid analogs (eg, amino acids having a side chain at the α-carbon). As used herein, amino acids occurring in various amino acid sequences of polypeptides appearing herein are identified according to their well-known three-letter or one-letter abbreviations (see Table 4). Nucleotides occurring in various nucleic acid molecules and fragments are designated by standard single-letter designations routinely used in the art.
본 명세서에서 사용된 바와 같이, "아미노산 잔기"는 그의 펩티드 연결에서 폴리펩티드의 화학적 소화(가수분해) 시에 형성된 아미노산을 지칭한다. 본 명세서에 기재된 아미노산 잔기는 일반적으로 "L" 이성질체 형태이다. "D" 이성질체 형태의 잔기는 원하는 기능적 특성이 폴리펩티드에 의해 유지되는 한 임의의 L-아미노산 잔기로 치환될 수 있다. NH2는 폴리펩티드의 아미노 말단에 존재하는 자유 아미노 기를 지칭한다. COOH는 폴리펩티드의 카복실 말단에 존재하는 자유 카복시 기를 지칭한다. 문헌[J. Biol . Chem., 243:3557-59 (1968)]에 기재되고 37 C.F.R. §§ 1.821 - 1.822에서 채택된 표준 폴리펩티드 명명법에 따라 아미노산 잔기에 대한 약어는 표 4에 나타나 있다:As used herein, “amino acid residue” refers to an amino acid formed upon chemical digestion (hydrolysis) of a polypeptide at its peptide linkages. Amino acid residues described herein are generally in the "L" isomeric form. Residues in the "D" isomeric form may be substituted with any L-amino acid residue as long as the desired functional properties are retained by the polypeptide. NH 2 refers to a free amino group present at the amino terminus of a polypeptide. COOH refers to a free carboxy group present at the carboxyl terminus of a polypeptide. See J. Biol . Chem ., 243:3557-59 (1968) and adopted in 37 CFR §§ 1.821 - 1.822, abbreviations for amino acid residues are shown in Table 4:
본 명세서에서 화학식으로 제시된 아미노산 잔기의 모든 서열은 아미노-말단의 카복실-말단으로의 종래의 방향으로 왼쪽에서 오른쪽으로 배향되어 있다. 또한, 문구 "아미노산 잔기"는 대응표(표 4)에 나열된 아미노산, 변형된 비-천연 및 흔치 않은 아미노산을 포함하는 것으로 정의된다. 더욱이, 아미노산 잔기 서열의 시작 또는 말단에 있는 대시는 하나 이상의 아미노산 잔기의 추가 서열, 또는 NH2와 같은 아미노-말단 기, 또는 COOH와 같은 카복실-말단 기에 대한 펩티드 결합을 나타낸다. 펩티드 또는 단백질에서 아미노산의 적합한 보존적 치환은 당업자에게 알려져 있고, 일반적으로 생성된 분자의 생물학적 활성을 변경하지 않고 이루어질 수 있다. 당업자는 일반적으로 폴리펩티드의 비-필수적인 영역에서의 단일 아미노산 치환이 생물학적 활성을 실질적으로 변경하지 않는다는 것을 인식한다 (예를 들어, 문헌[Watson 등, Molecular Biology of the Gene, 4th Edition, 1987, The Benjamin/Cummings Pub. Co., p. 224] 참조).All sequences of amino acid residues presented herein by formulas are oriented from left to right in the conventional orientation of amino-terminus to carboxyl-terminus. The phrase "amino acid residue" is also defined to include the amino acids listed in the correspondence table (Table 4), modified non-natural and uncommon amino acids. Moreover, a dash at the beginning or end of an amino acid residue sequence indicates an additional sequence of one or more amino acid residues, or a peptide bond to an amino-terminal group such as NH 2 , or a carboxyl-terminal group such as COOH. Suitable conservative substitutions of amino acids in a peptide or protein are known to those skilled in the art and can generally be made without altering the biological activity of the resulting molecule. One skilled in the art generally recognizes that single amino acid substitutions in non-essential regions of a polypeptide do not substantially alter biological activity (see, for example, Watson et al., Molecular Biology of the Gene , 4th Edition, 1987, The Benjamin / Cummings Pub. Co., p. 224).
그러한 치환은 아래와 같이 표 5에 제시된 예시적인 치환에 따라 이루어질 수 있다:Such substitutions can be made according to the exemplary substitutions set forth in Table 5 as follows:
다른 치환이 또한 허용되고, 경험적으로 또는 다른 알려진 보존적 또는 비-보존적 치환에 따라 결정될 수 있다.Other substitutions are also permissible and may be determined empirically or according to other known conservative or non-conservative substitutions.
본 명세서에서 사용된 바와 같이, "천연 발생 아미노산"은 폴리펩티드에서 발생하는 20개의 L-아미노산을 지칭한다.As used herein, “naturally occurring amino acids” refers to the 20 L-amino acids that occur in polypeptides.
본 명세서에서 사용된 바와 같이, 용어 "비-천연 아미노산"은 천연 아미노산과 유사한 구조를 갖지만 천연 아미노산의 구조 및 반응성을 모방하도록 구조적으로 변형된 유기 화합물을 지칭한다. 따라서 비-천연 발생 아미노산은, 예를 들어 20개의 천연 발생 아미노산 이외의 아미노산 또는 아미노산의 유사체를 포함하고, 아미노산의 D-입체이성질체를 포함하지만 이에 제한되지 않는다. 예시적인 비-천연 아미노산은 당업자에게 알려져 있고, 2-아미노아디프산(Aad), 3-아미노아디프산(bAad), β-알라닌/β-아미노-프로피온산(Bala), 2-아미노부티르산(Abu), 4-아미노부티르산/피페리딘산(4Abu), 6-아미노카프로산(Acp), 2-아미노헵탄산(Ahe), 2-아미노이소부티르산(Aib), 3-아미노이소부티르산(Baib), 2-아미노피멜산(Apm), 2,4-디아미노부티르산(Dbu), 데스모신(Des), 2,2'-디아미노피멜산(Dpm), 2,3-디아미노프로피온산(Dpr), N-에틸글리신(EtGly), N-에틸아스파라긴(EtAsn), 하이드록시라이신(Hyl), 알로-하이드록시라이신(Ahyl), 3-하이드록시프롤린(3Hyp), 4-하이드록시프롤린(4Hyp), 이소데스모신(Ide), 알로-이소류신(Aile), N-메틸글리신, 사르코신(MeGly), N-메틸이소류신(MeIle), 6-N-메틸라이신(MeLys), N-메틸발린(MeVal), 노르발린(Nva), 노르류신(Nle) 및 오르니틴(Orn)을 포함하지만 이들에 제한되지 않는다.As used herein, the term “non-natural amino acid” refers to an organic compound that has a structure similar to that of a natural amino acid but has been structurally modified to mimic the structure and reactivity of a natural amino acid. Non-naturally occurring amino acids thus include, for example, amino acids or analogs of amino acids other than the 20 naturally occurring amino acids, and include, but are not limited to, D-stereoisomers of amino acids. Exemplary non-natural amino acids are known to those skilled in the art and include 2-aminoadipic acid (Aad), 3-aminoadipic acid (bAad), β-alanine/β-amino-propionic acid (Bala), 2-aminobutyric acid ( Abu), 4-aminobutyric acid/piperidic acid (4Abu), 6-aminocaproic acid (Acp), 2-aminoheptanoic acid (Ahe), 2-aminoisobutyric acid (Aib), 3-aminoisobutyric acid (Baib) , 2-aminopimelic acid (Apm), 2,4-diaminobutyric acid (Dbu), desmosine (Des), 2,2'-diaminopimelic acid (Dpm), 2,3-diaminopropionic acid (Dpr) , N-ethylglycine (EtGly), N-ethylasparagine (EtAsn), hydroxylysine (Hyl), allo-hydroxylysine (Ahyl), 3-hydroxyproline (3Hyp), 4-hydroxyproline (4Hyp) , Isodesmosine (Ide), allo-isoleucine (Aile), N-methylglycine, sarcosine (MeGly), N-methylisoleucine (MeIle), 6-N-methyllysine (MeLys), N-methylvaline (MeVal) ), norvaline (Nva), norleucine (Nle), and ornithine (Orn).
본 명세서에서 사용된 바와 같이, "DNA 작제물"은 자연에서 발견되지 않는 방식으로 조합되고 병치된 DNA의 세그먼트를 함유하는 단일- 또는 이중-가닥 선형 또는 원형 DNA 분자이다. DNA 작제물은 인간 조작의 결과로서 존재하고, 조작된 분자의 클론 및 다른 카피를 포함한다.As used herein, a “DNA construct” is a single- or double-stranded linear or circular DNA molecule that contains segments of DNA combined and juxtaposed in a manner not found in nature. DNA constructs exist as a result of human manipulation, and include clones and other copies of engineered molecules.
본 명세서에서 사용된 바와 같이, "DNA 세그먼트"는 명시된 속성을 갖는 더 긴 DNA 분자의 일부이다. 예를 들어, 명시된 폴리펩티드를 암호화하는 DNA 세그먼트는 5'에서 3' 방향으로 판독되었을 때 명시된 폴리펩티드의 아미노산 서열을 암호화하는 플라스미드 또는 플라스미드 단편과 같은 더 긴 DNA 분자의 일부이다.As used herein, a "DNA segment" is a portion of a longer DNA molecule having specified properties. For example, a DNA segment encoding a specified polypeptide is part of a longer DNA molecule, such as a plasmid or plasmid fragment, that encodes the amino acid sequence of a specified polypeptide when read in 5' to 3' orientation.
본 명세서에서 사용된 바와 같이, 용어 "폴리뉴클레오티드"는 5'에서 3' 말단으로 판독되는 데옥시리보뉴클레오티드 또는 리보뉴클레오티드 염기의 단일- 또는 이중-가닥 중합체를 의미한다. 폴리뉴클레오티드는 RNA 및 DNA를 포함하고, 천연 공급원으로부터 단리되거나, 시험관 내에서 합성되거나, 천연 및 합성 분자의 조합으로부터 제조될 수 있다. 폴리뉴클레오티드 분자의 길이는 본 명세서에서 뉴클레오티드(약어 "nt") 또는 염기쌍(약어 "bp")의 관점에서 제공된다. 용어 뉴클레오티드는 문맥이 허용하는 경우 단일- 및 이중-가닥 분자에 사용된다. 상기 용어가 이중-가닥 분자에 적용될 때 전체 길이를 나타내기 위해 사용되고, 용어 염기쌍과 동등한 것으로 이해된다. 이중-가닥 폴리뉴클레오티드의 2개의 가닥은 길이가 약간 상이할 수 있고, 이의 말단이 스태거링될 수 있다는 것을 당업자는 인식할 것이고; 따라서 이중-가닥 폴리뉴클레오티드 분자 내의 모든 뉴클레오티드는 쌍을 이룰 수 없다. 그러한 쌍을 이루지 않은 말단은 일반적으로 길이가 20개의 뉴클레오티드를 초과하지 않을 것이다.As used herein, the term "polynucleotide" refers to a single- or double-stranded polymer of deoxyribonucleotides or ribonucleotide bases read from the 5' to the 3' end. Polynucleotides include RNA and DNA, and can be isolated from natural sources, synthesized in vitro , or prepared from a combination of natural and synthetic molecules. The length of a polynucleotide molecule is given herein in terms of nucleotides (abbreviated “nt”) or base pairs (abbreviated “bp”). The term nucleotide is used for single- and double-stranded molecules where the context permits. When the term is applied to double-stranded molecules it is used to denote total length and is understood to be equivalent to the term base pair. One skilled in the art will recognize that the two strands of a double-stranded polynucleotide may be slightly different in length and their ends may be staggered; Thus, all nucleotides in a double-stranded polynucleotide molecule are unpairable. Such unpaired ends will generally not exceed 20 nucleotides in length.
본 명세서에서 사용된 바와 같이, 재조합 DNA 방법을 사용하는 재조합 수단에 의한 생산은 클로닝된 DNA에 의해 암호화된 단백질을 발현하기 위한 잘 알려진 분자 생물학 방법의 사용을 지칭한다.As used herein, production by recombinant means using recombinant DNA methods refers to the use of well known molecular biology methods to express proteins encoded by cloned DNA.
본 명세서에서 사용된 바와 같이, "발현"은 폴리펩티드가 폴리뉴클레오티드의 전사 및 번역에 의해 생산되는 공정을 지칭한다. 폴리펩티드의 발현 수준은, 예를 들어 숙주 세포로부터 생산된 폴리펩티드의 양을 결정하는 방법을 포함하는 당업계에 알려진 임의의 방법을 사용하여 평가될 수 있다. 그러한 방법은 ELISA에 의한 세포 용해물 내 폴리펩티드의 정량화, 겔 전기영동 후 쿠마씨 블루 염색(Coomassie blue staining), 로우리 단백질 검정(Lowry protein assay) 및 브래드포드 단백질 검정(Bradford protein assay)을 포함할 수 있지만 이들에 제한되지 않는다.As used herein, "expression" refers to the process by which a polypeptide is produced by transcription and translation of a polynucleotide. The level of expression of a polypeptide can be assessed using any method known in the art, including, for example, determining the amount of polypeptide produced from a host cell. Such methods may include quantification of polypeptides in cell lysates by ELISA, Coomassie blue staining after gel electrophoresis, Lowry protein assay and Bradford protein assay. but not limited to these
본 명세서에서 사용된 바와 같이, "숙주 세포"는 벡터를 수용하고/하거나, 유지하고/하거나, 재생하고/하거나 증폭시키기 위해 사용되는 세포이다. 숙주 세포는 또한 벡터에 의해 암호화된 폴리펩티드를 발현하기 위해 사용될 수 있다. 벡터 내의 핵산은 숙주 세포가 분열할 때 복제되어 핵산을 증폭시킨다.As used herein, a “host cell” is a cell used to receive, maintain, reproduce, and/or amplify a vector. A host cell can also be used to express the polypeptide encoded by the vector. The nucleic acid in the vector is replicated when the host cell divides to amplify the nucleic acid.
본 명세서에서 사용된 바와 같이, "벡터"는 벡터가 적절한 숙주 세포로 형질전환될 때 하나 이상의 이종 단백질이 발현될 수 있는 복제 가능한 핵산이다. 벡터에 대한 언급은 폴리펩티드 또는 그의 단편을 암호화하는 핵산이 전형적으로 제한 소화 및 결찰에 의해 도입될 수 있는 벡터를 포함한다. 벡터에 대한 언급은 또한 변형된 항-TNFR1 항체와 같은 폴리펩티드를 암호화하는 핵산을 함유하는 벡터를 포함한다. 벡터는 핵산의 증폭을 위해, 또는 핵산에 의해 암호화된 폴리펩티드의 발현/전시를 위해 폴리펩티드를 암호화하는 핵산을 숙주 세포로 도입하기 위해 사용된다. 벡터는 전형적으로 에피솜으로 잔류하지만, 게놈의 염색체로 유전자 또는 그의 일부의 통합에 영향을 미치도록 설계될 수 있다. 또한 인공 염색체, 예컨대 효모 인공 염색체 및 포유동물 인공 염색체인 벡터가 고려된다. 그러한 비히클의 선택 및 사용은 당업자에게 잘 알려져 있다. 벡터에는 "바이러스 벡터("virus vector" 또는 "viral vector")"도 포함된다. 바이러스 벡터는 외인성 유전자를 (비히클 또는 셔틀로서) 세포 내로 전달하기 위해 외인성 유전자에 작동적으로 연결되는 조작된 바이러스이다.As used herein, a "vector" is a replicable nucleic acid capable of expressing one or more heterologous proteins when the vector is transformed into an appropriate host cell. Reference to a vector includes vectors into which a nucleic acid encoding a polypeptide or fragment thereof may be introduced, typically by restriction digestion and ligation. Reference to a vector also includes vectors containing nucleic acids encoding polypeptides such as modified anti-TNFR1 antibodies. Vectors are used to introduce a nucleic acid encoding a polypeptide into a host cell for amplification of the nucleic acid or for expression/display of the polypeptide encoded by the nucleic acid. Vectors typically remain episomal, but can be designed to effect integration of a gene or portion thereof into a chromosome of the genome. Also contemplated are vectors that are artificial chromosomes, such as yeast artificial chromosomes and mammalian artificial chromosomes. The selection and use of such vehicles is well known to those skilled in the art. A vector also includes a "virus vector" or "viral vector". A viral vector is an engineered virus that is operatively linked to an exogenous gene to transfer (as a vehicle or shuttle) the exogenous gene into a cell.
본 명세서에서 사용된 바와 같이, "발현 벡터"는 그러한 DNA 단편의 발현에 영향을 미칠 수 있는 조절 서열, 예컨대 프로모터 영역과 작동적으로 연결되는 DNA를 발현할 수 있는 벡터를 포함한다. 그러한 추가의 세그먼트는 프로모터 및 종결자 서열을 포함할 수 있고, 선택적으로 하나 이상의 복제의 기원, 하나 이상의 선택 가능한 마커, 인핸서, 폴리아데닐화 신호 등을 포함할 수 있다. 발현 벡터는 일반적으로 플라스미드 또는 바이러스 DNA로부터 유래되거나, 두 요소를 모두 함유할 수 있다. 따라서, 발현 벡터는 적절한 숙주 세포로의 도입 시, 클로닝된 DNA의 발현을 초래하는 재조합 DNA 또는 RNA 작제물, 예컨대 플라스미드, 파아지, 재조합 바이러스 또는 다른 벡터를 지칭한다. 적절한 발현 벡터는 당업자에게 잘 알려져 있고, 진핵 세포 및/또는 원핵 세포에서 복제 가능한 것과 에피솜으로 잔류하는 것 또는 숙주 세포 게놈에 통합되는 것을 포함한다.As used herein, "expression vector" includes vectors capable of expressing DNA in operative link with regulatory sequences capable of affecting the expression of such DNA fragments, such as promoter regions. Such additional segments may include promoter and terminator sequences, and optionally may include one or more origins of replication, one or more selectable markers, enhancers, polyadenylation signals, and the like. Expression vectors are generally derived from plasmid or viral DNA, or may contain elements of both. Thus, an expression vector refers to a recombinant DNA or RNA construct such as a plasmid, phage, recombinant virus or other vector that, upon introduction into an appropriate host cell, results in the expression of the cloned DNA. Suitable expression vectors are well known to those skilled in the art, and include those replicable in eukaryotic and/or prokaryotic cells, those that remain episomal, or those that integrate into the host cell genome.
본 명세서에서 사용된 바와 같이, "일차 서열"은 폴리펩티드의 아미노산 잔기 서열 또는 핵산 분자의 뉴클레오티드 서열을 지칭한다.As used herein, “primary sequence” refers to the sequence of amino acid residues of a polypeptide or nucleotide sequence of a nucleic acid molecule.
본 명세서에서 사용된 바와 같이, "서열 동일성"은 시험과 기준 폴리펩티드 또는 폴리뉴클레오티드 간의 비교에서 동일하거나 유사한 아미노산 또는 뉴클레오티드 염기의 수를 지칭한다. 서열 동일성은 유사성 또는 동일성의 영역을 확인하기 위해 핵산 또는 단백질 서열의 서열 정렬에 의해 결정될 수 있다. 본 명세서의 목적을 위해 서열 동일성은 일반적으로 동일한 잔기를 확인하기 위한 정렬에 의해 결정된다. 정렬은 국소 또는 글로벌일 수 있다. 일치, 불일치 및 갭은 비교된 서열들 사이에서 확인될 수 있다. 갭은 동일하거나 유사한 특징이 정렬되도록 정렬된 서열의 잔기들 사이에 삽입된 널 아미노산 또는 뉴클레오티드이다. 일반적으로 내부 및 말단 갭이 있을 수 있다. 갭 페널티를 사용할 때 말단 갭에 대한 페널티 없이(예를 들어, 말단 갭은 페널티를 받지 않음) 서열 동일성을 결정할 수 있다. 대안적으로, 서열 동일성은 갭을 고려하지 않고 총 정렬된 서열의 동일한 위치/길이 Х 100의 수로서 결정될 수 있다.As used herein, "sequence identity" refers to the number of identical or similar amino acid or nucleotide bases in a comparison between a test and a reference polypeptide or polynucleotide. Sequence identity can be determined by sequence alignment of nucleic acid or protein sequences to identify regions of similarity or identity. For purposes herein, sequence identity is generally determined by alignment to identify identical residues. Alignment can be local or global. Matches, mismatches and gaps can be identified between the compared sequences. A gap is a null amino acid or nucleotide inserted between residues of an aligned sequence such that identical or similar features align. In general, there may be internal and terminal gaps. When using gap penalties, without penalty for end gaps (e.g. end gaps are not penalized) sequence identity can be determined. Alternatively, sequence identity can be determined as the number of identical positions/length Х 100 of the total aligned sequences without accounting for gaps.
본 명세서에서 사용된 바와 같이, "글로벌 정렬"은 시작부터 말단까지 2개의 서열을 정렬하는 정렬로, 각각의 서열의 각각의 문자를 한 번만 정렬한다. 서열들 간에 유사성 또는 동일성이 있는지 여부에 관계없이 정렬이 생산된다. 예를 들어, "글로벌 정렬"에 기초한 50%의 서열 동일성은 2개의 비교된 서열의 전체 서열의 정렬에서 각각 100개의 뉴클레오티드 길이, 50%의 잔기가 동일하다는 것을 의미한다. 정렬된 서열의 길이가 동일하지 않은 경우에도 글로벌 정렬이 서열 동일성을 결정하는 데 사용될 수도 있다는 것이 이해된다. "말단 갭에 대한 페널티 없음"이 선택되지 않는 한, 서열 말단의 차이가 서열 동일성을 결정할 때 고려된다. 일반적으로 글로벌 정렬은 대부분의 그의 길이에서 상당한 유사성을 공유하는 서열 상에 사용된다. 글로벌 정렬을 수행하기 위한 예시적인 알고리즘에는 니들맨-분쉬(Needleman-Wunsch) 알고리즘이 포함된다 (Needleman 등 (1970) J. Mol . Biol. 48:443). 글로벌 정렬을 수행하기 위한 예시적인 프로그램은 공개적으로 이용 가능하고, 미국 국립생물정보센터(NCBI; National Center for Biotechnology Information) 웹사이트(ncbi.nlm.nih.gov/)에서 이용 가능한 글로벌 서열 정렬 툴과 deepc2.psi.iastate.edu/aat/align/align.html에서 이용 가능한 프로그램을 포함한다.As used herein, a “global alignment” is an alignment that aligns two sequences from start to end, aligning each letter of each sequence only once. An alignment is produced regardless of whether there is similarity or identity between the sequences. For example, 50% sequence identity based on "global alignment" means that 50% of the residues, each 100 nucleotides in length, are identical in the full sequence alignment of the two compared sequences. It is understood that global alignments may be used to determine sequence identity even when the lengths of the aligned sequences are not the same. Differences at the ends of sequences are taken into account when determining sequence identity, unless "no penalty for end gaps" is selected. Global alignments are generally used on sequences that share significant similarity over most of their length. Exemplary algorithms for performing global alignment include the Needleman-Wunsch algorithm (Needleman et al. (1970) J. Mol . Biol . 48:443). Exemplary programs for performing global alignments include the Global Sequence Alignment Tool, which is publicly available and available on the National Center for Biotechnology Information (NCBI) website (ncbi.nlm.nih.gov/). Includes programs available at deepc2.psi.iastate.edu/aat/align/align.html.
본 명세서에서 사용된 바와 같이, "국소 정렬"은 2개의 서열을 정렬하지만, 유사성 또는 동일성을 공유하는 서열의 부분만을 정렬하는 정렬이다. 따라서, 국소 정렬은 하나의 서열의 하위-세그먼트가 또 다른 서열에 존재하는지 여부를 결정한다. 유사성이 없으면 정렬이 반환되지 않을 것이다. 국소 정렬 알고리즘에는 BLAST 또는 스미스-워터맨(Smith-Waterman) 알고리즘(Adv . Appl . Math. 2:482 (1981))이 포함된다. 예를 들어, "국소 정렬"에 기초한 50%의 서열 동일성은 임의의 길이의 2개의 비교된 서열의 전체 서열의 정렬에서 100개의 뉴클레오티드 길이의 유사성 또는 동일성의 영역이 유사성 또는 동일성의 영역에서 동일한 잔기의 50%를 갖는다는 것을 의미한다.As used herein, a "local alignment" is an alignment that aligns two sequences, but only portions of the sequences that share similarity or identity. Thus, local alignment determines whether a sub-segment of one sequence is present in another sequence. If there is no similarity, no sort will be returned. Local alignment algorithms include BLAST or the Smith-Waterman algorithm ( Adv . Appl . Math . 2:482 (1981)). For example, 50% sequence identity based on a "local alignment" means that a region of similarity or identity of 100 nucleotides in length in an alignment of the entire sequence of two compared sequences of any length is the same residue in the region of similarity or identity. means that it has 50% of
본 명세서의 목적을 위해 서열 동일성은 각각의 공급자에 의해 확립된 디폴트 갭 페널티와 함께 사용된 표준 정렬 알고리즘 프로그램에 의해 결정될 수 있다. GAP 프로그램에 대한 디폴트 파라미터에는 다음이 포함될 수 있다: (1) 문헌[Schwartz and Dayhoff, eds., Atlas of Protein Sequence and Structure, National Biomedical Research Foundation, pp. 353-358 (1979)]에 의해 기재된 바와 같이, 단항 비교 매트릭스(동일성의 경우 1 및 비-동일성의 경우 0의 값을 포함) 및 문헌[Gribskov 등 Nucl . Acids Res. 14:6745 (1986)]의 가중된 비교 매트릭스; (2) 각각의 갭에 대해 3.0의 페널티 및 각각의 갭의 각각의 기호에 대해 추가의 0.10 페널티; 및 (3) 말단 갭에 대한 페널티 없음. 임의의 2개의 핵산 분자가 뉴클레오티드 서열을 갖는지, 또는 임의의 2개의 폴리펩티드가 적어도 80%, 85%, 90%, 95%, 96%, 97%, 98% 또는 99%의 "동일한" 아미노산 서열 또는 동일성 퍼센트를 인용하는 다른 유사한 변이를 갖는지 여부는 국소 또는 글로벌 정렬에 기초한 알려진 컴퓨터 알고리즘을 사용하여 결정될 수 있다 (예를 들어, 수십 개의 알려진 그리고 공개적으로 이용 가능한 정렬 데이터베이스 및 프로그램에 대한 링크를 제공하는 wikipedia.org/wiki/Sequence_alignment_software 참조). 일반적으로, 본 명세서의 목적을 위해 서열 동일성은 글로벌 정렬에 기초한 컴퓨터 알고리즘, 예컨대 NCBI/BLAST(blast.ncbi.nlm.nih.gov/Blast.cgi?CMD=Web&Page_TYPE=BlastHome)로부터 이용 가능한 니들맨-분쉬 글로벌 서열 정렬 툴; LAlign(William Pearson implementing the Huang and Miller algorithm (Adv . Appl . Math. (1991) 12:337-357)); 및 deepc2.psi.iastate.edu/aat/align/align.html에서 이용 가능한 Xiaoqui Huang의 프로그램을 사용하여 결정된다. 전형적으로, 각각의 비교된 폴리펩티드 또는 뉴클레오티드의 전장 서열은 글로벌 정렬에서 각각의 서열의 전장에 걸쳐 정렬된다. 비교되는 서열이 실질적으로 동일한 길이일 때 국소 정렬이 또한 사용될 수 있다.For purposes herein, sequence identity may be determined by standard alignment algorithm programs used with default gap penalties established by each supplier. Default parameters for the GAP program may include: (1) Schwartz and Dayhoff, eds., Atlas of Protein Sequence and Structure , National Biomedical Research Foundation, pp. 353-358 (1979), a unary comparison matrix (including values of 1 for identity and 0 for non-identity) and Gribskov et al. Nucl . Acids Res . 14:6745 (1986); the weighted comparison matrix; (2) a penalty of 3.0 for each gap and an additional penalty of 0.10 for each sign of each gap; and (3) no penalty for end gaps. Any two nucleic acid molecules have a nucleotide sequence, or any two polypeptides are at least 80%, 85%, 90%, 95%, 96%, 97%, 98% or 99% “identical” amino acid sequences, or Whether or not it has other similar variances that cite percent identity can be determined using known computer algorithms based on local or global alignments (e.g., providing links to dozens of known and publicly available alignment databases and programs). See wikipedia.org/wiki/Sequence_alignment_software). In general, for purposes herein, sequence identity is determined by a computer algorithm based on global alignment, such as the Needleman- Wunsch Global Sequence Alignment Tool; LAlign (William Pearson implementing the Huang and Miller algorithm ( Adv . Appl . Math . (1991) 12:337-357)); and Xiaoqui Huang's program available at deepc2.psi.iastate.edu/aat/align/align.html. Typically, the full length sequences of each compared polypeptide or nucleotide are aligned over the full length of each sequence in a global alignment. Local alignments can also be used when the sequences being compared are of substantially the same length.
본 명세서에서 사용된 바와 같이, 용어 "동일성"은 시험과 기준 폴리펩티드 또는 폴리뉴클레오티드 간의 비교 또는 정렬을 나타낸다. 하나의 비-제한적인 예에서, "적어도 90% 동일하다"는 기준 폴리펩티드 또는 폴리뉴클레오티드에 비해 90% 내지 100%의 동일성 퍼센트를 지칭한다. 90% 이상의 수준에서의 동일성은 예시 목적으로 가정하면, 길이가 100개의 아미노산 또는 뉴클레오티드인 시험과 기준 폴리펩티드 또는 폴리뉴클레오티드를 비교할 때 시험 폴리펩티드 또는 폴리뉴클레오티드에서의 10% 미만(즉, 100개 중 10개)의 아미노산 또는 뉴클레오티드가 기준 폴리펩티드 또는 폴리뉴클레오티드의 것과 상이하다는 사실을 나타낸다. 유사한 비교가 시험 폴리뉴클레오티드와 기준 폴리뉴클레오티드 간에 이루어질 수 있다. 그러한 차이는 아미노산 서열의 전체 길이에 걸쳐 무작위로 분포된 점 돌연변이로서 제시될 수 있거나, 이는 허용되는 최대값, 예를 들어 10/100 아미노산 차이(대략 90% 동일성)까지 가변 길이의 하나 이상의 위치에 클러스터링될 수 있다. 차이는 또한 아미노산 잔기의 결실 또는 절단으로 인한 것일 수 있다. 차이는 핵산 또는 아미노산 치환, 삽입 또는 결실로서 정의된다. 비교된 서열의 길이에 따라 약 85 내지 90% 초과의 상동성 또는 동일성의 수준에서 결과는 프로그램 및 갭 파라미터 세트와 무관할 수 있고; 그러한 높은 수준의 동일성은 종종 소프트웨어에 의존하지 않고도 용이하게 평가될 수 있다.As used herein, the term "identity" refers to a comparison or alignment between a test and a reference polypeptide or polynucleotide. In one non-limiting example, “at least 90% identical” refers to a percent identity between 90% and 100% relative to a reference polypeptide or polynucleotide. Assuming identity at the level of 90% or greater is for illustrative purposes, less than 10% (i.e., 10 out of 100) in the test polypeptide or polynucleotide when comparing a reference polypeptide or polynucleotide to a test of 100 amino acids or nucleotides in length. ) differs from that of the reference polypeptide or polynucleotide. A similar comparison can be made between a test polynucleotide and a reference polynucleotide. Such differences can be presented as point mutations randomly distributed over the entire length of the amino acid sequence, or they can be represented at one or more positions of variable length up to the maximum allowed, e.g., 10/100 amino acid differences (approximately 90% identity). can be clustered. Differences may also be due to deletion or truncation of amino acid residues. Differences are defined as nucleic acid or amino acid substitutions, insertions or deletions. Results at levels of greater than about 85-90% homology or identity, depending on the length of the compared sequences, can be independent of the program and gap parameter set; Such high-level identity can often be easily evaluated without reliance on software.
본 명세서에서 사용된 바와 같이, "디설파이드 결합"(또한 소위 S-S 결합 또는 디설파이드 브릿지)은 티올 기의 커플링으로부터 유래된 단일 공유 결합이다. 단백질의 디설파이드 결합은 시스테인 잔기의 티올 기들 간에 형성되고, 폴리펩티드 도메인, 예컨대 항체 도메인들 간의 상호작용을 안정화시킨다.As used herein, a “disulfide bond” (also called a S—S bond or disulfide bridge) is a single covalent bond derived from the coupling of thiol groups. Disulfide bonds in proteins are formed between thiol groups of cysteine residues and stabilize interactions between polypeptide domains, such as antibody domains.
본 명세서에서 사용된 바와 같이, "커플링된" 또는 "접합된"은 공유 또는 비공유 상호작용을 통해 부착된 것을 의미한다.As used herein, “coupled” or “conjugated” means attached through covalent or non-covalent interactions.
본 명세서에서 사용된 바와 같이, "항체에 접합된" 또는 "항체에 연결된"이라는 문구 또는 그의 문법적 변형은 항체 또는 이의 항원 결합 단편에 대한 모이어티, 예컨대 진단 또는 치료적 모이어티의 부착을 언급할 때 모이어티가, 예를 들어 재조합 수단에 의한 융합 단백질의 생산에 의해 또는 화학적 수단에 의한 번역 후와 같은 펩티드를 연결하기 위한 임의의 공지된 수단에 의해 항체 또는 이의 항원 결합 단편에 부착된다는 것을 의미한다. 콘주게이션은 다양한 결합제 중 임의의 것을 사용하여 펩티드 또는 화합물 링커, 또는 화학적 가교제를 포함하지만 이들에 제한되지 않는 콘주게이션에 영향을 미칠 수 있다.As used herein, the phrases “conjugated to an antibody” or “linked to an antibody” or grammatical variations thereof may refer to the attachment of a moiety, such as a diagnostic or therapeutic moiety, to an antibody or antigen-binding fragment thereof. when the moiety is attached to the antibody or antigen-binding fragment thereof by any known means for linking peptides, such as post-translational by chemical means or by production of a fusion protein by recombinant means, for example. do. Conjugation can be effected using any of a variety of binding agents, including but not limited to peptide or compound linkers, or chemical crosslinkers.
본 명세서에서 사용된 바와 같이, "항체 의존적 세포 매개 세포독성", "항체 의존적 세포의 세포독성" 및 "ADCC"는 Fc 수용체(FcR)를 발현하는 비특이적 세포독성 세포(예를 들어, 자연 살해(NK) 세포, 호중구 및 대식세포)는 표적 세포 상에 결합된 항체를 인식하고 이후에 표적 세포의 용해를 유발하는 세포 매개 반응을 상호 교환적으로 지칭한다. ADCC를 매개하는 일차 세포인 NK 세포는 FcγRIII만을 발현하는 반면, 단핵구는 FcγRI, FcγRII 및 FcγRIII을 발현한다. 조혈 세포에 대한 FcR 발현은 문헌[Ravetch 등 (1991) Annu . Rev. Immunol, 9:457-492]의 464 페이지의 표 3에 요약되어 있다. 관심 분자의 ADCC 활성을 평가하기 위해 시험관 내 ADCC 검정이 수행될 수 있다 (예를 들어, 미국 특허 제5,500,362호 및 제5,821,337호 참조). 그러한 검정을 위한 예시적인 이펙터 세포는 말초 혈액 단핵 세포(PBMC) 및 자연 살해(NK) 세포를 포함한다. 대안적으로 또는 추가로 관심 분자의 ADCC 활성은, 예를 들어 문헌[Clynes 등 (1998) Proc . Natl . Acad . Sci . USA 95:652-656]에 개시된 것과 같은 동물 모델에서 생체 내에서 평가될 수 있다.As used herein, “antibody-dependent cell-mediated cytotoxicity”, “antibody-dependent cellular cytotoxicity” and “ADCC” refer to non-specific cytotoxic cells that express Fc receptors (FcRs) (e.g., natural killer ( NK) cells, neutrophils, and macrophages) interchangeably refer to a cell-mediated response that recognizes antibodies bound on target cells and subsequently causes lysis of the target cells. NK cells, the primary cells mediating ADCC, express only FcγRIII, whereas monocytes express FcγRI, FcγRII and FcγRIII. FcR expression on hematopoietic cells is described by Ravetch et al. (1991) Annu . Rev. Immunol , 9:457-492], summarized in Table 3 on page 464. An in vitro ADCC assay can be performed to assess the ADCC activity of a molecule of interest (see, eg, US Pat. Nos. 5,500,362 and 5,821,337). Exemplary effector cells for such an assay include peripheral blood mononuclear cells (PBMC) and natural killer (NK) cells. Alternatively or additionally, the ADCC activity of a molecule of interest can be determined, for example, by Clynes et al. (1998) Proc . Natl . Acad . Sci . USA 95: 652-656 ].
본 명세서에서 사용된 바와 같이, 보체 의존적 세포독성(CDC)은 IgG 및 IgM 항체의 이펙터 기능이다. 그러한 항체가 표적 세포, 예컨대 박테리아 세포 또는 바이러스-감염된 세포 상의 표면 항원에 결합될 때, 전통적 보체 경로는 단백질 C1q를 이들 항체에 결합함으로써 촉발되어 그 결과 막 공격 복합체(MAC) 및 후속 세포 용해를 형성한다.As used herein, complement dependent cytotoxicity (CDC) is an effector function of IgG and IgM antibodies. When such antibodies bind to surface antigens on target cells, such as bacterial cells or virus-infected cells, the classical complement pathway is triggered by binding the protein C1q to these antibodies, resulting in the formation of membrane attack complexes (MACs) and subsequent cell lysis. do.
본 명세서에서 사용된 바와 같이, 항체 의존적 세포 식균작용(ADCP)은 식세포 잠재력, 예컨대 단핵구 및 대식세포를 갖는 이펙터 세포가 표적 세포를 내재화하는 세포 과정이다. 일단 포식되면 표적 세포는 산소 의존적 또는 독립적 메커니즘을 통해 표적 세포의 분해를 위해 리소좀과 융합하는 포식소체에 상주한다.As used herein, antibody dependent cellular phagocytosis (ADCP) is a cellular process by which effector cells with phagocytic potential, such as monocytes and macrophages, internalize target cells. Once phagocytosed, target cells reside in phagosomes that fuse with lysosomes for degradation of the target cell through oxygen-dependent or independent mechanisms.
본 명세서에서 사용된 바와 같이, "치료적 활성"은 치료적 폴리펩티드의 생체 내 활성을 지칭한다. 일반적으로 치료적 활성은 질환 또는 병태의 치료와 회합된 활성이다. 변형된 폴리펩티드의 치료적 활성은 비변형된 폴리펩티드와 비교하여 치료적 활성의 1%의 활성, 2%, 3%, 4%, 5%, 10%, 20%, 30%, 40%, 50%, 60%, 70%, 80%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, 100%, 200%, 300%, 400%, 500% 이상을 포함하지만 이들에 제한되지 않는 비변형된 폴리펩티드의 치료적 활성 백분율의 임의의 수준일 수 있다.As used herein, "therapeutic activity" refers to the in vivo activity of a therapeutic polypeptide. In general, therapeutic activity is activity associated with treatment of a disease or condition. The therapeutic activity of the modified polypeptide is 1% activity, 2%, 3%, 4%, 5%, 10%, 20%, 30%, 40%, 50% of the therapeutic activity compared to the unmodified polypeptide. , 60%, 70%, 80%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, 100%, 200%, 300%, 400 %, 500% or more, but is not limited to, any level of the percentage of therapeutic activity of the unmodified polypeptide.
본 명세서에서 사용된 바와 같이, 용어 "평가"는 샘플에 존재하는 단백질, 예컨대 항체 또는 이의 항원 결합 단편의 활성에 대한 절대값을 수득하고, 또한 활성 수준을 나타내는 지표, 비율, 백분율, 시각적 또는 다른 값을 수득한다는 의미에서 정량적 및 정성적 결정을 포함하기 위한 것이다. 평가는 직접적이거나 간접적일 수 있다.As used herein, the term “assess” refers to obtaining an absolute value for the activity of a protein, such as an antibody or antigen-binding fragment thereof, present in a sample, and also an indicator, ratio, percentage, visual or other indication of the level of activity. It is intended to include quantitative and qualitative determinations in the sense of obtaining a value. Evaluation can be direct or indirect.
본 명세서에서 사용된 바와 같이, "질환 또는 장애"는 감염, 후천적 상태 및 유전적 상태를 포함하지만 이들에 제한되지 않는 원인 또는 상태로부터 발생하고, 확인 가능한 증상을 특징으로 하는 유기체의 병리 상태를 지칭한다.As used herein, “disease or disorder” refers to a pathological state of an organism that results from a cause or condition, including but not limited to infections, acquired conditions, and genetic conditions, and is characterized by identifiable symptoms. do.
본 명세서에서 사용된 바와 같이, 질환 또는 병태가 있는 대상체를 "치료하는"은 대상체의 증상이 치료 후 부분적으로 또는 전적으로 완화되거나, 정적 상태로 남아 있다는 것을 의미한다. 따라서, 치료는 예방, 요법 및/또는 치유를 포함한다. 예방은 잠재적 질환을 예방하고/하거나 증상의 악화 또는 질환의 진행을 예방하는 것을 지칭한다. 치료는 또한 본 명세서에 제공된 임의의 항체 또는 이의 항원 결합 단편 또는 조성물의 임의의 약제학적 용도를 포함한다.As used herein, “treating” a subject with a disease or condition means that the subject's symptoms are partially or completely relieved, or remain static, after treatment. Thus, treatment includes prophylaxis, therapy and/or cure. Prevention refers to preventing an underlying disease and/or preventing worsening of symptoms or progression of a disease. Treatment also includes any pharmaceutical use of any antibody or antigen-binding fragment or composition thereof provided herein.
본 명세서에서 사용된 바와 같이, 치료는 질환, 장애 또는 병태의 증상 또는 징후의 개선을 의미한다.As used herein, treatment refers to amelioration of symptoms or signs of a disease, disorder or condition.
본 명세서에서 사용된 바와 같이, "예방(prevention 또는 prophylaxis)"은 질환 또는 병태의 발병 위험을 감소시키는 방법을 지칭한다. 질환을 예방한다는 것은 질환이 발병할 위험을 감소시키는 것을 의미한다.As used herein, “prevention or prophylaxis” refers to a method of reducing the risk of developing a disease or condition. Preventing a disease means reducing the risk of developing the disease.
본 명세서에서 사용된 바와 같이, "약제학적으로 유효 제제"는, 예를 들어 마취제, 혈관수축제, 분산제, 및 소분자 약물 및 치료 단백질을 포함하는 종래의 치료 약물을 포함하지만 이들에 제한되지 않는 임의의 치료제 또는 생체활성제를 포함한다.As used herein, "pharmaceutically effective agent" refers to any anesthetic, vasoconstrictor, dispersing agent, and conventional therapeutic drug including, but not limited to, small molecule drugs and therapeutic proteins, for example. A therapeutic agent or bioactive agent of
본 명세서에서 사용된 바와 같이, "치료 효과"는 질환 또는 병태의 증상을 변경시키거나, 전형적으로 개선시키거나, 완화시키거나, 질환 또는 병태를 치유하는 대상체의 치료로부터 발생하는 효과를 의미한다.As used herein, “therapeutic effect” means an effect resulting from treatment of a subject that alters, typically ameliorates, alleviates the symptoms of a disease or condition, or cures the disease or condition.
본 명세서에서 사용된 바와 같이, "치료 유효량" 또는 "치료적 유효 용량"은 대상체에 투여한 후 치료 효과를 생산하기에 적어도 충분한 화합물을 함유하는 제제, 화합물, 물질 또는 조성물의 양을 지칭한다. 따라서, 이는 질환 또는 장애의 증상을 예방하거나, 치유하거나, 개선시키거나, 저지시키거나, 부분적으로 저지시키는 데 필요한 양이다.As used herein, “therapeutically effective amount” or “therapeutically effective dose” refers to an amount of an agent, compound, material or composition containing at least sufficient compound to produce a therapeutic effect after administration to a subject. Thus, it is the amount necessary to prevent, cure, ameliorate, arrest, or partially arrest the symptoms of a disease or disorder.
본 명세서에서 사용된 바와 같이, "치료적 효능"은 화합물을 함유하는 제제, 화합물, 물질 또는 조성물이 투여된 대상체에서 치료 효과를 생산하는 화합물을 함유하는 제제, 화합물, 물질 또는 조성물의 능력을 지칭한다.As used herein, “therapeutic efficacy” refers to the ability of an agent, compound, material, or composition containing a compound to produce a therapeutic effect in a subject to which the agent, compound, material, or composition containing the compound is administered. do.
본 명세서에서 사용된 바와 같이, "예방적 유효량" 또는 "예방적 유효 용량"은 대상체에 투여될 때, 예를 들어 질환 또는 증상의 개시 또는 재발을 예방하거나 지연시키거나, 질환 또는 증상의 개시 또는 재발 가능성을 감소시키거나, 바이러스 감염의 발병률을 감소시키는 의도된 예방 효과를 가질 화합물을 함유하는 제제, 화합물, 물질 또는 조성물의 양을 지칭한다. 완전한 예방 효과는 반드시 1회 용량의 투여로 발생하는 것은 아니며, 일련의 용량을 투여한 후에만 발생할 수 있다. 따라서, 예방적 유효량은 1회 이상의 투여로 투여될 수 있다.As used herein, "prophylactically effective amount" or "prophylactically effective dose" when administered to a subject, for example, prevents or delays the onset or recurrence of a disease or condition, or prevents or delays the onset or recurrence of a disease or condition Refers to the amount of an agent, compound, substance or composition containing the compound that will have the intended prophylactic effect of reducing the likelihood of recurrence or reducing the incidence of viral infection. A full prophylactic effect does not necessarily occur with administration of a single dose, but may only occur after administration of a series of doses. Thus, a prophylactically effective amount can be administered in one or more administrations.
본 명세서에서 사용된 바와 같이, 치료, 예컨대 약제학적 조성물 또는 다른 치료제의 투여에 의한 특정 질환 또는 장애 증상의 개선은 조성물 또는 치료제의 투여에 기인하거나 이와 회합될 수 있는 증상의 영구적이든 일시적이든, 지속적이든 순간적이든 임의의 감소를 지칭한다.As used herein, the amelioration of the symptoms of a particular disease or disorder by treatment, such as administration of a pharmaceutical composition or other therapeutic agent, refers to the long-term, permanent, temporary, or permanent improvement of symptoms that may be attributed to or associated with administration of the composition or therapeutic agent. refers to any decrease, whether temporary or instantaneous.
본 명세서에서 사용된 바와 같이, "전구약물"은 모체 약물과 비교하여 종양 세포에 대한 세포독성이 덜하고, 효소적으로 활성화되거나 보다 활성인 모체 형태로 전환될 수 있는 약제학적으로 활성 물질의 전구체 또는 유도체 형태이다 (예를 들어, 문헌[Wilman, 1986, Biochemical Society Transactions, 615th Meeting Belfast, 14:375-382; 및 Stella 등, "Prodrugs: A Chemical Approach to Targeted Drug Delivery," Directed Drug Delivery, Borchardt 등, (ed.), pp. 247-267, Humana Press, 1985] 참조).As used herein, "prodrug" is a precursor of a pharmaceutically active substance that is less cytotoxic to tumor cells compared to the parent drug and can be enzymatically activated or converted to a more active parent form. or in derivative form (see, e.g., Wilman, 1986, Biochemical Society Transactions, 615th Meeting Belfast, 14:375-382; and Stella et al., "Prodrugs: A Chemical Approach to Targeted Drug Delivery," Directed Drug Delivery , Borchardt et al., (ed.), pp. 247-267, Humana Press, 1985).
본 명세서에서 사용된 바와 같이, "항암제"는 악성 세포 및 조직에 파괴적이거나 독성이 있는 임의의 제제를 지칭한다. 예를 들어, 항암제에는 암 세포를 죽이거나 다르게는 종양 또는 암 세포의 성장을 억제하거나 손상시키는 제제가 포함된다. 예시적인 항암제는 화학요법제이다.As used herein, “anti-cancer agent” refers to any agent that is destructive or toxic to malignant cells and tissues. For example, anti-cancer agents include agents that kill cancer cells or otherwise inhibit or impair the growth of tumors or cancer cells. An exemplary anti-cancer agent is a chemotherapeutic agent.
본 명세서에서 사용된 바와 같이, "항-혈관신생제" 또는 "혈관신생 억제제"는 혈관의 발달을 차단하거나 방해하는 화합물이다.As used herein, an “anti-angiogenic agent” or “angiogenesis inhibitor” is a compound that blocks or interferes with the development of blood vessels.
본 명세서에서 사용된 바와 같이, TNF 관련 또는 TNF 매개 질환은 TNFR1 또는 TNFR1 신호전달이 병인에서 역할을 하는 질환, 병태 또는 장애를 지칭하고; TNFR1 신호전달의 억제가 질환, 병태 또는 장애의 증상을 개선시킬 수 있는 질환, 장애 및 병태가 포함된다.As used herein, a TNF-related or TNF-mediated disease refers to a disease, condition or disorder in which TNFR1 or TNFR1 signaling plays a role in pathogenesis; Diseases, disorders and conditions in which inhibition of TNFR1 signaling can ameliorate the symptoms of the disease, condition or disorder are included.
본 명세서에서 사용된 바와 같이, "TNFR2 효능제" 또는 "항-TNFR2 효능제"는 TNFR2의 활성화를 개시하거나, 촉진하거나, 증가시키고/시키거나 TNFR2에 의해 매개된 하나 이상의 신호 전달 경로를 강화시키는 소분자 및 TNFR2 항체 또는 이의 항원 결합 단편, 및 다른 폴리펩티드를 포함하는 화합물을 지칭한다. 예를 들어, TNFR2 효능제는 Treg 세포 집단의 증식을 촉진하거나 증가시킬 수 있다. TNFR2 효능제는, 예를 들어 수용체를 생물학적 활성으로 만드는 형태적 변화를 유도하기 위해 TNFR2에 결합함으로써 TNFR2 활성화를 촉진하거나 증가시킬 수 있다. 예를 들어, TNFR2 효능제는 TNFR2와 그의 동족 리간드인 TNF(TNFα) 간의 상호작용과 유사하거나 모방하는 방식으로 TNFR2의 삼량체화를 핵화하여 TNFR2 매개 신호전달을 유도할 수 있다. TNFR2 효능제는 또한 CD4+, CD25+, FOXP3+ Treg 세포의 증식을 유도할 수 있다. TNFR2 효능제는 또한, 예를 들어 면역조절 Treg 세포의 활성화를 통해 또는 자가반응성 세포독성 T-세포의 표면 상의 TNFR2에 직접적으로 결합하고 세포자멸사를 유도함으로써 세포독성 T 림프구(예를 들어, CD8+ T-세포)의 증식을 억제할 수 있다. 본 명세서의 방법에 사용하기 위한 TNFR2 효능제 항체 또는 그의 단편은 TNFR2에 특이적으로 결합할 수 있고, 일반적으로 종양 괴사 인자 수용체(TNFR) 슈퍼패밀리 구성원, 예컨대 TNFR1의 또 다른 수용체에 특이적으로 결합하지 않도록 충분히 특이적이다.As used herein, a “TNFR2 agonist” or “anti-TNFR2 agonist” refers to an agent that initiates, promotes, or increases activation of TNFR2 and/or potentiates one or more signaling pathways mediated by TNFR2. Small molecules and compounds including TNFR2 antibodies or antigen-binding fragments thereof, and other polypeptides. For example, TNFR2 agonists can promote or increase the proliferation of Treg cell populations. A TNFR2 agonist can promote or increase TNFR2 activation, for example by binding to TNFR2 to induce a conformational change that renders the receptor biologically active. For example, a TNFR2 agonist can induce TNFR2-mediated signaling by nucleating trimerization of TNFR2 in a manner that mimics or mimics the interaction between TNFR2 and its cognate ligand, TNF (TNFα). TNFR2 agonists can also induce proliferation of CD4 + , CD25 + , FOXP3 + Treg cells. TNFR2 agonists may also inhibit cytotoxic T lymphocytes (eg, CD8 + ) by directly binding to TNFR2 on the surface of autoreactive cytotoxic T-cells and inducing apoptosis, eg, through activation of immunoregulatory Treg cells. T-cells) can be inhibited. A TNFR2 agonist antibody or fragment thereof for use in the methods herein is capable of specifically binding to TNFR2, and generally specifically binds to another receptor of the tumor necrosis factor receptor (TNFR) superfamily member, such as TNFR1. It's specific enough not to.
본 명세서에서 사용된 바와 같이, TNFR2 선택적 효능제는 TNFR1 신호전달 활성을 유발하지 않거나 실질적으로 유발하지 않는 TNFR2 효능제다.As used herein, a TNFR2 selective agonist is a TNFR2 agonist that does not elicit or substantially elicit no TNFR1 signaling activity.
본 명세서에서 사용된 바와 같이, Treg 확장제는 사이토카인의 생산을 통해 면역억제 특성을 갖는 T 세포의 면역억제 하위집단인 조절 T 세포(Treg 세포 또는 Treg)를 증가시키는 소분자 및 폴리펩티드를 포함하는 분자이다.As used herein, Treg expanders are molecules, including small molecules and polypeptides, that increase regulatory T cells (Treg cells or Tregs), an immunosuppressive subpopulation of T cells that have immunosuppressive properties, through the production of cytokines. .
본 명세서에서 사용된 바와 같이, 용어 "범-성장 인자 트랩 작제물", "범-EGFR 리간드 트랩 작제물", "성장 인자 트랩", "다중특이적 성장 인자 트랩 작제물", "이중특이적 성장 인자 트랩 작제물", "EGFR 리간드 트랩 작제물", "범-HER 리간드 트랩 작제물", "범-HER 치료제", "EGFR 리간드 트랩 작제물", "HER 리간드 트랩 작제물" 및 "성장 인자 트랩 작제물"은 HER 또는 ErbB 수용체라고도 하는 2개 이상의 인간 표피 성장 인자 수용체(EGFR)의 활성을 조절하는 펩티드-기반 화합물을 포함하는 범-세포 표면 수용체 분자를 지칭하기 위해 상호 교환적으로 사용된다. 일반적으로 범-성장 인자 트랩은, 예컨대 리간드 결합 및/또는 수용체와의 상호작용을 통해 적어도 2개의 상이한 HER 수용체를 표적으로 한다.As used herein, the terms "pan-growth factor trap construct", "pan-EGFR ligand trap construct", "growth factor trap", "multispecific growth factor trap construct", "bispecific "Growth Factor Trap Construct", "EGFR Ligand Trap Construct", "Pan-HER Ligand Trap Construct", "Pan-HER Therapeutic", "EGFR Ligand Trap Construct", "HER Ligand Trap Construct" and "Growth "Factor trap construct" is used interchangeably to refer to a pan-cell surface receptor molecule comprising a peptide-based compound that modulates the activity of two or more human epidermal growth factor receptors (EGFRs), also called HER or ErbB receptors. do. Generally, pan-growth factor traps target at least two different HER receptors, such as through ligand binding and/or interaction with the receptors.
본 명세서에서 사용된 바와 같이, "세포외 도메인" 또는 "ECD"는 수용체의 표면 상에서 발생하는 세포 표면 수용체의 부분이고, 리간드-결합 부위(들)를 포함한다. 본 명세서의 목적을 위해 "ECD 폴리펩티드"에 대한 언급은 ECD 폴리펩티드가 동족 수용체의 또 다른 도메인(예를 들어, 막관통 도메인, 단백질 키나제 도메인 또는 기타)과 회합된 임의의 인접 서열을 함유하지 않는 한, 임의의 ECD 함유 분자 또는 그의 일부를 포함한다.As used herein, an “extracellular domain” or “ECD” is the part of a cell surface receptor that occurs on the surface of the receptor and includes the ligand-binding site(s). For purposes of this specification, reference to an "ECD polypeptide" is a reference unless the ECD polypeptide contains any contiguous sequence associated with another domain (e.g., transmembrane domain, protein kinase domain, or the like) of a cognate receptor. , any ECD-containing molecule or portion thereof.
본 명세서에서 사용된 바와 같이, "놉 인투 홀" 또는 "놉인홀"(KIH)은, 다량체화 도메인, 예컨대 면역글로불린 Fc 도메인을 지칭하고, 그러한 도메인들 사이 및/또는 그러한 도메인들 간의 입체 상호작용이 안정한 상호작용을 촉진하고, 단량체의 혼합물로부터 동종이량체(또는 동종다량체)와 비교하여 이종이량체(또는 이종다량체)의 형성을 촉진하도록 조작된다. 이는, 예를 들어 상보적 다량체화 도메인에 놉 또는 돌출부 및 홀 또는 공동을 구성함으로써 달성될 수 있다. "놉"은 제1 다량체화 도메인 폴리펩티드(예를 들어, 제1 Fc 단량체)의 계면으로부터의 작은 아미노산 측쇄를 더 큰 측쇄(예를 들어, 티로신 또는 트립토판)로 대체함으로써 제작될 수 있다. 놉과 동일하거나 유사한 크기의 보상적 "홀"은 큰 아미노산 측쇄를 더 작은 것(예를 들어, 알라닌 또는 트레오닌)으로 대체함으로써 제2 상보적 다량체화 폴리펩티드(예를 들어, 제2 Fc 단량체)의 계면 상에 선택적으로 생성된다.As used herein, “knob into hole” or “knob in hole” (KIH) refers to a multimerization domain, such as an immunoglobulin Fc domain, and a steric interaction between and/or between such domains. It is engineered to promote this stable interaction and promote the formation of heterodimers (or heteromultimers) compared to homodimers (or homomultimers) from mixtures of monomers. This can be achieved, for example, by constructing knobs or protrusions and holes or cavities in the complementary multimerization domains. A "knob" can be constructed by replacing a small amino acid side chain from the interface of a first multimerization domain polypeptide (eg, a first Fc monomer) with a larger side chain (eg, tyrosine or tryptophan). Compensatory "holes" of the same or similar size as the knob replace large amino acid side chains with smaller ones (e.g., alanine or threonine) to form a second complementary multimerizing polypeptide (e.g., a second Fc monomer). It is selectively created on the interface.
본 명세서에서 사용된 바와 같이, "테더링"은 수용체 단량체의 2개의 도메인들 간의 상호작용을 지칭하고, 이에 의해 단량체는 상호작용에 덜 이용 가능하게 만드는 형태로 발생한다. 예를 들어, HER1, HER3 및 HER4의 하위도메인 II는 하위도메인 IV와 상호작용하여 테더링된 불활성 구조를 형성할 수 있다. 테더링된 상태에 있을 때, 수용체 또는 그의 동형은 이량체화 및/또는 리간드 결합에 덜 이용 가능하거나 이용할 수 없다. HER1, HER3 및 HER4의 단량체 형태의 ECD는 테더링되지 않은 형태보다 더 낮은 리간드 친화성을 나타내는 테더링된 형태로 발행한다. 하위도메인 IV에 특정 잔기가 결여된 HER2는 테더링되지 않은 형태로 발생하고, HER1, HER3 및 HER4와의 이량체화를 위해 이용 가능하다. 테더링된(단량체) 형태에 대한 리간드 결합 시, 테더링 상호작용이 해제되고, ECD(또는 수용체)는 2개의 ECD의 도메인 II 사이의 상호작용을 수반하는 이량체화에 이용 가능한 형태가 된다.As used herein, "tethering" refers to an interaction between two domains of a receptor monomer, thereby resulting in a form that makes the monomer less available for interaction. For example, subdomain II of HER1, HER3 and HER4 can interact with subdomain IV to form a tethered inactive structure. When in a tethered state, the receptor or isoform thereof is less or less available for dimerization and/or ligand binding. ECDs of the monomeric forms of HER1, HER3 and HER4 are issued in the tethered form showing lower ligand affinity than the untethered form. HER2 lacking certain residues in subdomain IV occurs in an untethered form and is available for dimerization with HER1, HER3 and HER4. Upon ligand binding to the tethered (monomer) conformation, the tethering interaction is disengaged and the ECD (or receptor) becomes available for dimerization involving interactions between domains II of the two ECDs.
본 명세서에서 사용된 바와 같이, HER(ErbB) 관련 질환, HER 회합 질환 또는 HER 매개 질환은 표피 성장 인자 수용체(HER) 및/또는 리간드가 병인, 그의 병리 발달 또는 그의 증상의 일부 측면에서 연루되어 있는 임의의 질환, 병태 또는 장애이다. 관여에는, 예를 들어 HER 계열 구성원 또는 리간드의 발현, 과발현 또는 활성이 포함된다. 질환에는 암, 예컨대 신경교종 및 췌장암, 위암, 두경부암, 자궁경부암, 폐암, 결장직장암, 자궁내막암, 전립선암, 식도암, 난소암, 자궁암, 방광암 또는 유방암을 포함하지만 이들에 제한되지 않는 증식성 질환을 포함하지만 이에 제한되지 않는다. 다른 병태에는, 병리적 염증 및/또는 자가면역 반응, 예컨대 류마티스성 관절염(RA), 비-악성 과증식성 질환, 안구 병태, 피부 병태(예를 들어, 건선), 평활근 세포 증식 및/또는 이동, 예컨대 재협착증, 죽상동맥경화증, 방광, 심장 또는 다른 근육의 근육 비후화, 또는 자궁내막증을 포함하는 협착으로 인한 병태를 수반하는 것을 포함하는 세포 증식 및/또는 이동과 관련된 병태가 포함된다.As used herein, a HER (ErbB) associated disease, HER associated disease or HER mediated disease is one in which epidermal growth factor receptor (HER) and/or ligands are implicated in some aspect of the pathogenesis, development of its pathology or symptoms thereof. any disease, condition or disorder. Involvement includes, for example, expression, overexpression or activity of a HER family member or ligand. Diseases include but are not limited to cancers such as gliomas and pancreatic, gastric, head and neck, cervical, lung, colorectal, endometrial, prostate, esophageal, ovarian, uterine, bladder, or breast cancers. diseases, including but not limited to. Other conditions include pathological inflammation and/or autoimmune reactions such as rheumatoid arthritis (RA), non-malignant hyperproliferative diseases, ocular conditions, skin conditions (eg psoriasis), smooth muscle cell proliferation and/or migration, conditions associated with cell proliferation and/or migration, including those involving conditions due to strictures including, for example, restenosis, atherosclerosis, muscle thickening of the bladder, heart or other muscles, or endometriosis.
본 명세서에서 사용된 바와 같이, 용어 "대상체"는 포유동물, 예컨대 인간을 포함하는 동물을 지칭한다.As used herein, the term “subject” refers to animals, including mammals, such as humans.
본 명세서에서 사용된 바와 같이, "환자"는 인간 대상체를 지칭한다.As used herein, “patient” refers to a human subject.
본 명세서에서 사용된 바와 같이, "동물"에는 임의의 동물, 예컨대 인간, 고릴라 및 원숭이를 포함하는 영장류; 설치류, 예컨대 마우스 및 랫트; 가금류, 예컨대 닭; 반추동물, 예컨대 염소, 암소, 사슴 및 양; 돼지; 및 다른 동물이 포함되지만 이들에 제한되지 않는다. 비-인간 동물은 고려되는 동물로서 인간을 배제한다. 본 명세서에 제공된 폴리펩티드는 동물, 식물, 원핵 및 진균류의 임의의 공급원으로부터 유래한다. 대부분의 폴리펩티드는 포유동물 기원을 포함하는 동물 기원이고, 일반적으로 치료적 용도로 인간 또는 인간화된다.As used herein, "animal" includes any animal, such as primates, including humans, gorillas, and monkeys; rodents such as mice and rats; poultry, such as chicken; ruminants such as goats, cows, deer and sheep; pig; and other animals, but are not limited thereto. Non-human animals exclude humans as contemplated animals. Polypeptides provided herein are derived from any source of animals, plants, prokaryotes and fungi. Most polypeptides are of animal origin, including mammalian origin, and are usually human or humanized for therapeutic use.
본 명세서에서 사용된 바와 같이, "조성물"은 임의의 혼합물을 지칭한다. 이는 용액, 현탁액, 액체, 파우더, 페이스트, 수성, 비-수성 또는 이들의 임의의 조합일 수 있다.As used herein, “composition” refers to any mixture. It may be a solution, suspension, liquid, powder, paste, aqueous, non-aqueous or any combination thereof.
본 명세서에서 사용된 바와 같이, "안정화제"는, 예컨대 본 명세서의 제형이 저장되거나 사용되는 조건(예를 들어, 온도) 하에서 항체 또는 콘주게이트를 보호하기 위해 제형에 첨가된 화합물을 지칭한다. 따라서, 조성물의 다른 구성요소로부터 단백질 분해를 방지하는 제제가 포함된다. 그러한 제제의 예에는 아미노산, 아미노산 유도체, 아민, 당, 폴리올, 염 및 완충액, 계면활성제, 억제제 또는 기질 및 본 명세서에 기재된 바와 같은 다른 제제가 있다.As used herein, “stabilizer” refers to a compound added to a formulation to protect the antibody or conjugate under conditions (eg, temperature), such as when the formulation of the present disclosure is stored or used. Thus, agents that prevent protein degradation from other components of the composition are included. Examples of such agents are amino acids, amino acid derivatives, amines, sugars, polyols, salts and buffers, surfactants, inhibitors or substrates and other agents as described herein.
본 명세서에서 사용된 바와 같이, "조합"은 2개 이상의 항목들 사이의 또는 항목들 간의 임의의 회합을 지칭한다. 조합은 2개 이상의 개별 항목, 예컨대 2개의 조성물 또는 2개의 수집물, 이들의 혼합물, 예컨대 2개 이상의 항목의 단일 혼합물 또는 그의 임의의 변이일 수 있다. 조합의 요소는 일반적으로 방법에 사용된 요소와 같이 기능적으로 회합되거나 관련된다.As used herein, “combination” refers to any association between two or more items or between items. A combination can be two or more separate items, such as two compositions or two collections, mixtures thereof, such as a single mixture of two or more items, or any variation thereof. The elements of the combination are generally functionally associated or related, such as the elements used in the method.
본 명세서에서 사용된 바와 같이, "병용 요법"은 본 명세서에 제공된 항-TNFR 작제물 또는 항체 또는 이의 항원 결합 단편과 같은 2개 이상의 상이한 치료제 및 하나 이상의 치료제 또는 방사선 및 수술과 같은 다른 치료(들)의 투여를 지칭한다. 다중 치료제가 별도로, 순차적으로, 간헐적으로, 동시에 또는 단일 조성물로 제공되고 투여될 수 있다.As used herein, “combination therapy” refers to two or more different therapeutic agents and one or more therapeutic agents, such as anti-TNFR constructs or antibodies or antigen-binding fragments thereof provided herein, or other treatments such as radiation and surgery (surgery). ) refers to the administration of Multiple therapeutic agents may be provided and administered separately, sequentially, intermittently, simultaneously or in a single composition.
본 명세서에서 사용된 바와 같이, "키트"는 활성화, 투여, 진단, 및 생물학적 활성 또는 특성의 평가를 포함하지만 이들에 제한되지 않는 목적을 위해 다른 요소, 예컨대 추가 시약 및 조합 또는 그 요소의 사용 지침을 선택적으로 포함하는 포장된 조합이다.As used herein, "kit" refers to other elements, such as additional reagents and combinations or instructions for use of the elements, for purposes including, but not limited to, activation, administration, diagnosis, and evaluation of biological activity or properties. It is a packaged combination that optionally includes.
본 명세서에서 사용된 바와 같이, "단위 용량 형태"는 당업계에 공지된 바와 같이 인간 및 동물 대상체에 적합하고 개별적으로 포장된 물리적으로 분리된 단위를 지칭한다.As used herein, “unit dosage form” refers to individually packaged physically discrete units suitable for human and animal subjects, as is known in the art.
본 명세서에서 사용된 바와 같이, "단일 투여 제형"은 직접 투여용 제형을 지칭한다.As used herein, “single dosage form” refers to a form for direct administration.
본 명세서에서 사용된 바와 같이, "다중-용량 제형"은 치료제의 다중 용량을 함유하고, 치료제의 몇 개의 단일 용량을 제공하기 위해 직접적으로 투여될 수 있는 제형을 지칭한다. 용량은 분, 시간, 주, 일 또는 개월의 과정에 걸쳐 투여될 수 있다. 다중-용량 제형은 용량 조정, 용량-풀링 및/또는 용량-분할을 허용할 수 있다. 다중-용량 제형은 시간 경과에 따라 사용되기 때문에 일반적으로 미생물 성장을 방지하기 위해 하나 이상의 보존제를 함유한다.As used herein, “multi-dose formulation” refers to a formulation that contains multiple doses of a therapeutic agent and can be administered directly to provide several single doses of a therapeutic agent. A dose can be administered over the course of minutes, hours, weeks, days or months. Multi-dose formulations may allow for dose adjustment, dose-pooling and/or dose-division. Because multi-dose formulations are used over time, they generally contain one or more preservatives to prevent microbial growth.
본 명세서에서 사용된 바와 같이, "제조 물품"은 제조되고 판매되는 생성물이다. 본원 전반에 걸쳐 사용된 바와 같이, 용어는 포장 물품 또는 포장용 물품에 함유된 본 명세서에 제공된 조성물 중 임의의 것을 포괄하기 위한 것이다.As used herein, an “article of manufacture” is a product that is manufactured and sold. As used throughout this application, the term is intended to encompass any of the packaging articles or compositions provided herein contained in packaging articles.
본 명세서에서 사용된 바와 같이, "유체"는 흐를 수 있는 임의의 조성물을 지칭한다. 따라서 유체는 반고체, 페이스트, 용액, 수성 혼합물, 젤, 로션, 크림 및 다른 이러한 조성물의 형태인 조성물을 포함한다.As used herein, “fluid” refers to any composition that can flow. Fluids thus include compositions in the form of semi-solids, pastes, solutions, aqueous mixtures, gels, lotions, creams and other such compositions.
본 명세서에서 사용된 바와 같이, 단리되거나 정제된 폴리펩티드 또는 단백질(예를 들어, 단리된 항체 또는 이의 항원 결합 단편), 또는 그의 생물학적 활성 부분(예를 들어, 단리된 항원 결합 단편)은 단백질이 유래된 세포 또는 조직으로부터의 세포 물질 또는 다른 오염 단백질이 실질적으로 없거나, 화학적으로 합성되었을 때 화학적 전구체 또는 다른 화학물질이 실질적으로 없다. 제제는 그러한 순도를 평가하기 위해 당업자가 사용하는 분석의 표준 방법, 예컨대 박층 크로마토그래피(TLC), 겔 전기영동 및 고성능 액체 크로마토그래피(HPLC)에 의해 결정된 바와 같이 용이하게 검출 가능한 불순물이 없는 것으로 나타나거나, 추가 정제가 물질의 물리적 및 화학적 특성, 예컨대 효소적 및 생물학적 활성을 검출 가능하게 변경하지 않을 정도로 충분히 순수한 경우 실질적으로 없는 것으로 결정될 수 있다. 실질적으로 화학적으로 순수한 화합물을 생산하기 위한 화합물의 정제 방법은 당업자에게 알려져 있다. 그러나 실질적으로 화학적으로 순수한 화합물은 입체이성질체의 혼합물일 수 있다. 그러한 경우, 추가 정제는 화합물의 특이적 활성을 증가시킬 수 있다.As used herein, an isolated or purified polypeptide or protein (e.g., an isolated antibody or antigen-binding fragment thereof), or a biologically active portion thereof (e.g., An isolated antigen-binding fragment) is substantially free of cellular material or other contaminating proteins from the cell or tissue from which the protein was derived, or substantially free of chemical precursors or other chemicals when chemically synthesized. The preparation appears to be free of readily detectable impurities as determined by standard methods of analysis used by those skilled in the art to assess such purity, such as thin layer chromatography (TLC), gel electrophoresis and high performance liquid chromatography (HPLC). Alternatively, it can be determined to be substantially free if it is sufficiently pure that further purification does not detectably alter the physical and chemical properties of the material, such as enzymatic and biological activity. Methods for purifying compounds to produce substantially chemically pure compounds are known to those skilled in the art. However, substantially chemically pure compounds may be mixtures of stereoisomers. In such cases, further purification may increase the specific activity of the compound.
본 명세서에서 사용된 바와 같이, "세포 추출물" 또는 "용해물"은 용해되거나 파괴된 세포로부터 제조된 제제 또는 분획을 지칭한다.As used herein, "cell extract" or "lysate" refers to a preparation or fraction prepared from lysed or disrupted cells.
본 명세서에서 사용된 바와 같이, "대조군"은 시험 파라미터로 처리되지 않은 것을 제외하고는 시험 샘플과 실질적으로 동일한 샘플을 지칭하거나, 혈장 샘플인 경우, 관심 조건에 영향을 받지 않는 일반 지원자로부터 채취할 수 있다. 대조군은 또한 내부 대조군일 수 있다.As used herein, "control" refers to a sample that is substantially identical to the test sample, except that it has not been treated with a test parameter, or, in the case of a plasma sample, taken from a normal volunteer unaffected by the condition of interest. can A control can also be an internal control.
본 명세서에서 사용된 바와 같이, 단수 형태 "a", "an" 및 "the"는 맥락에서 달리 명확하게 명시되지 않는 한 복수의 지시대상을 포함한다. 따라서, 예를 들어 "면역글로불린 도메인"을 함유하는 폴리펩티드에 대한 언급은 하나 또는 복수의 면역글로불린 도메인을 갖는 폴리펩티드를 포함한다.As used herein, the singular forms “a”, “an” and “the” include plural referents unless the context clearly dictates otherwise. Thus, for example, reference to a polypeptide containing an “immunoglobulin domain” includes polypeptides having one or a plurality of immunoglobulin domains.
본 명세서에서 사용된 바와 같이, 용어 "또는"은 대안만을 지칭하는 것으로 명시적으로 표시되지 않거나, 대안이 상호 배타적이지 않는 한"및/또는"을 의미하기 위해 사용된다.As used herein, the term “or” is used to mean “and/or” unless explicitly indicated to refer only to alternatives or the alternatives are mutually exclusive.
본 명세서에서 사용된 바와 같이, 범위 및 양은 특정 값 또는 범위 "약"으로서 표현될 수 있다. "약"은 또한 정확한 양을 포함한다. 따라서 "약 5개의 아미노산"은 "약 5개의 아미노산"을 의미하고, 또한 "5개의 아미노산"을 의미한다. 특정 파라미터의 경우 약은 실험 오차 내의 범위 또는 특정 파라미터에 대해 당업자에게 허용 가능한 범위이다.As used herein, ranges and amounts can be expressed as “about” a specific value or range. “About” also includes precise amounts. Thus "about 5 amino acids" means "about 5 amino acids" and also means "5 amino acids". For a particular parameter, about is a range within experimental error or acceptable to one skilled in the art for that particular parameter.
본 명세서에서 사용된 바와 같이, "선택적" 또는 "선택적으로"는 이후에 기재된 이벤트 또는 상황이 발생하거나 발생하지 않는다는 것을 의미하고, 설명에는 상기 이벤트 또는 상황이 발생하는 경우와 발생하지 않는 경우가 포함된다는 것을 의미한다. 예를 들어, 선택적으로 변이체 부분은 부분이 변이체 또는 비-변이체인 것을 의미한다.As used herein, “optional” or “optionally” means that the subsequently described event or circumstance does or does not occur, and the description includes instances where said event or circumstance occurs and instances where it does not. means to be For example, optionally a variant portion means that the portion is a variant or non-mutant.
본 명세서에서 사용된 바와 같이, 임의의 보호 기, 아미노산 및 다른 화합물에 대한 약어는 달리 나타내지 않는 한, 그의 일반적인 용법, 인식된 약어 또는 IUPAC-IUB 생화학 명명법 위원회에 따른다 (문헌[Biochem. (1972) 11(9):1726-1732] 참조).As used herein, the abbreviations for any protecting groups, amino acids, and other compounds are in accordance with their common usage, recognized abbreviations, or IUPAC-IUB Committee on Biochemical Nomenclature unless otherwise indicated ( Biochem . (1972)). 11(9):1726-1732).
개시의 명료성을 위해 그리고 제한 없이, 상세한 설명은 다음의 하위 섹션으로 나누어진다.For clarity of disclosure and without limitation, the detailed description is divided into the following subsections.
B. 작제물 및 방법의 개요 B. Overview of Constructs and Methods
자가면역 질환은 신체의 면역체계가 자신을 공격할 때 발생한다. 생성된 염증 및 조직 파괴는 종양 괴사 인자(TNF)라고 하는 염증성 호르몬에 의해 시작된다. 100가지가 넘는 자가면역 질환이 있고; 전반적으로 자가면역 질환을 가진 인간의 약 75%가 여성이다. 자가면역 질환에 대한 이전 약물은 감염, 심장 문제 및 다른 질환 및 장애를 포함한 유해한 부작용이 있다. Autoimmune diseases occur when the body's immune system attacks itself. The resulting inflammation and tissue destruction is initiated by an inflammatory hormone called tumor necrosis factor (TNF). There are over 100 autoimmune diseases; Overall, about 75% of humans with autoimmune diseases are female. Previous drugs for autoimmune diseases have harmful side effects including infections, heart problems and other diseases and disorders.
TNF는 자가면역 질환에서 과활성화되는 TNFR1, 및 자가면역 질환을 억제하지만 TNRF1이 과활성화되면 억제되는 TNFR2의 두 가지 수용체를 통해 면역세포와 상호작용한다. 인플릭시맙(Remicade®로 판매), 아달리무맙(Humira®로 판매) 및 에타네르셉트(Enbrel®로 판매)와 같은 TNF 차단제는 TNFR1 및 TNFR2를 차단하여 유해한 부작용을 일으킨다. 본 명세서에 제공된 작제물은 이 문제를 다룬다. 본 명세서에 제공되는 작제물은 TNFR2 활성을 증가시키는 TNFR1만을 차단하여 자가면역 질환 증상을 치료할 뿐만 아니라 TNFR2 활성이 차단되지 않기 때문에 개선된 치료 및 유해한 부작용 감소 또는 유해한 부작용을 제공하지 않는다. 선행 기술 TNF 차단제의 문제점을 다루는 다양한 작제물이 본 명세서에 제공된다. 활성에 의해 식별되고 본 명세서에 상술되고 제공된 작제물의 유형은 다음 표에 요약되어 있다.TNF interacts with immune cells through two receptors: TNFR1, which is overactivated in autoimmune diseases, and TNFR2, which suppresses autoimmune diseases but is inhibited when TNRF1 is overactivated. TNF blockers such as infliximab (marketed by Remicade ® ), adalimumab (marketed by Humira ® ) and etanercept (marketed by Enbrel ® ) block TNFR1 and TNFR2, causing harmful side effects. The constructs provided herein address this issue. The constructs provided herein not only treat autoimmune disease symptoms by blocking only TNFR1 that increases TNFR2 activity, but also provide improved treatment and reduced or no adverse side effects because TNFR2 activity is not blocked. Various constructs are provided herein that address the problems of prior art TNF blockers. The types of constructs identified by activity and detailed and provided herein are summarized in the following table.
TNF 매개 질환, 장애 및 병태, 또는 TNF가 병인에서 역할을 하거나 TNFR1 신호전달에 대한 간섭이 개선 효과를 갖는 질환, 장애 및 병태의 치료를 위한 작제물이 제공된다. 예를 들어, TNFR1 길항제는 자가면역 장애를 포함하는 다양한 장애, 및 또한 질환 및 병태, 예컨대 자궁내막증, 브레인 포그(brain fog), 예컨대 화학요법 및 COVID로부터의 것, 알츠하이머병, 급성 염증, 예컨대 인플루엔자 바이러스에 의한 감염으로부터 유래된 것, 폐, 신장 및 다른 조직에 오래 지속되거나 영구적인 손상을 초래하는 SARS-COV2의 치료에 사용될 수 있다. 이전 TNF 차단제의 역효과 및 그에 따른 안전성 우려로 인해, 대부분의 적응증에 사용할 수 없다. 본 명세서에 제공된 TNFR1 길항제 작제물을 사용할 수 있다. 본 명세서에 기재된 바와 같은 이러한 작제물은 TNFR1만을 억제하고 수용체 클러스터링을 유발하지 않는다는 점에서 1가이며, 특이적이고 비-면역원성이며 반감기가 적어도 약 3-4주이므로 대략 한 달에 1회의 투약이 허용된다.Constructs for the treatment of TNF-mediated diseases, disorders and conditions, or diseases, disorders and conditions in which TNF plays a role in pathogenesis or in which interference with TNFR1 signaling has an ameliorative effect are provided. For example, TNFR1 antagonists are useful in a variety of disorders, including autoimmune disorders, and also in diseases and conditions, such as endometriosis, brain fog, such as from chemotherapy and COVID, Alzheimer's disease, acute inflammation, such as influenza It can be used in the treatment of SARS-CoV2, which results from infection with the virus, which causes long-lasting or permanent damage to the lungs, kidneys and other tissues. Due to the adverse effects of previous TNF blockers and the resulting safety concerns, they cannot be used for most indications. TNFR1 antagonist constructs provided herein may be used. These constructs as described herein are monovalent in that they inhibit only TNFR1 and do not cause receptor clustering, are specific and non-immunogenic, and have a half-life of at least about 3-4 weeks, so that approximately once a month dosing is sufficient. allowed
따라서, TNFR1 길항제 작제물, TNFR2 효능제 작제물, 및 TNFR1 길항제 및 TNFR2 효능적 활성을 포함하는 이중특이적 작제물과 같은 다중특이성이 제공된다. 작제물은 TNFR1 또는 TNFR2와 특이적으로 상호작용하는 적어도 하나의 모이어티, 및 일반적으로 상호작용을 직간접적으로 조절하거나 작제물에 약리학적(약력학적 또는 약동학적 또는 둘 다) 특성을 제공하는 추가 모이어티를 포함한다. 따라서 본 명세서에서 제공되는 작제물은 적어도 2개의 모이어티를 포함한다: TNFR1 또는 TNFR2와 상호작용하는 결합 모이어티, 및 작제물 또는 결합 모이어티의 약리학적 특성 또는 활성을 조절하거나 변경하는 제2 모이어티.Thus, multispecificities such as TNFR1 antagonist constructs, TNFR2 agonist constructs, and bispecific constructs comprising TNFR1 antagonist and TNFR2 agonistic activity are provided. The construct may include at least one moiety that specifically interacts with TNFR1 or TNFR2, and typically additional moieties that directly or indirectly modulate the interaction or provide pharmacological (pharmacodynamic or pharmacokinetic or both) properties to the construct. contains a moiety Thus, constructs provided herein include at least two moieties: a binding moiety that interacts with TNFR1 or TNFR2, and a second moiety that modulates or alters a pharmacological property or activity of the construct or binding moiety. tea.
본 명세서에 제공되는 작제물 중에는 TNFR1 활성의 길항제인 것들이 있다. TNFR1 길항제 작제물은 TNFR1에 결합하거나 상호작용하고 TNFR1 매개 신호전달을 억제하는 부분, 및 연장된 혈청 반감기, ADCC 및/또는 CDC 활성의 제거, 특정 수용체와의 상호작용의 조절과 같은 추가 특성을 부여하는 제2 부분을 함유한다. TNFR1 길항제 및 작제물은 특히 인간에서 면역원성이 없거나 감소되도록 변형(들)을 포함하고, 또한 기존 항체에 대한 결합을 제거하거나 감소시키기 위한 변형을 포함할 수 있다.Some of the constructs provided herein are antagonists of TNFR1 activity. A TNFR1 antagonist construct imparts a moiety that binds to or interacts with TNFR1 and inhibits TNFR1-mediated signaling, and additional properties such as extended serum half-life, ablation of ADCC and/or CDC activity, and modulation of interaction with specific receptors. It contains a second part that TNFR1 antagonists and constructs may include modification(s) such that they are not immunogenic or reduced, particularly in humans, and may also contain modifications to eliminate or reduce binding to preexisting antibodies.
TNFR1 길항제 작제물은 TNFR1에 특이적으로 결합하고 TNFR2에 대한 결합이 최소이거나 전혀 없거나 TNFR2 길항제 활성이 없도록 선택된다. 따라서 작제물은 TNFR1만 조절한다. 일부 구현예에서, TNFR1 길항제 작제물은 또한 TNFR2 효능적 활성을 갖는 제2 도메인 또는 모이어티를 갖거나 이에 연결되도록 선택된다. TNFR1 작제물은 친화도, 예컨대 Kd < 50 nM 또는 < 10 nM 또는 < 5 nM, 및 특히 더 높은 친화도 (Kd < 1 nM 또는 < 0.1 nM 또는 그 초과의 친화도로) 및/또는 TNFR1 신호전달의 강력한 억제 (예를 들어, IC50 50 nM 또는 < 10 nM 또는 < 5 nM 또는 < 3 nM, 또는 1 nM 또는 < 0.5 nM)로 상호작용하도록 설계되거나 선택되는 것을 포함한다. The TNFR1 antagonist construct is selected to bind specifically to TNFR1 and to have minimal or no binding to TNFR2 or no TNFR2 antagonist activity. Thus, the construct only modulates TNFR1. In some embodiments, the TNFR1 antagonist construct is also selected to have or be linked to a second domain or moiety that has TNFR2 agonistic activity. TNFR1 constructs have an affinity, such as K d < 50 nM or < 10 nM or < 5 nM, and particularly higher affinity (K d < 1 nM or < 0.1 nM or higher affinity) and/or TNFR1 signal those designed or selected to interact with potent inhibition of delivery (eg, IC 50 50 nM or < 10 nM or < 5 nM or < 3 nM, or 1 nM or < 0.5 nM).
또한 TNFR2 효능제 모이어티에 직접적으로 또는 링커를 통해 연결된 TNFR1 길항제 모이어티를 함유하는 이중특이성과 같은 다중특이적 작제물이 제공된다. 링커는 예를 들어 증가된 혈청 반감기, 증가된 안정성, 적절한 3차원 구조 및 가요성, 및 개선된 약리학적 특성과 같은 유리한 특성을 분자에 제공한다. 이러한 작제물은 항-TNF 요법("TNF 차단제"(그 예는 에타네르셉트, 아달리무맙 (Humira®), 인플릭시맙을 포함함)과 같은 다른 요법의 투여와 연관된 문제를 해결하는데, 이는, 이들 작제물이 TNFR1 염증 차단의 특이성을 증가시키고 적어도 부분적으로는 면역억제성 Treg의 상향조절 및 보호 및 항-염증성 신호전달 경로의 유도에 의해 천연 면역억제제인 TNFR2 기능의 보존 또는 증폭을 초래하기 때문이다. 또한, TNFR2 기능의 억제를 초래하는 TNF 차단은 또한 T 세포 유도 단핵구 활성화를 감소시켜 기회 감염의 가능성을 증가시킨다 (예를 들어, 문헌[Rossel 등 (2007) J. Immunol . 179:4239-48] 참조). Also provided are multispecific constructs, such as bispecific, containing a TNFR1 antagonist moiety linked directly or via a linker to a TNFR2 agonist moiety. Linkers provide molecules with advantageous properties such as, for example, increased serum half-life, increased stability, appropriate three-dimensional structure and flexibility, and improved pharmacological properties. Such constructs solve problems associated with the administration of other therapies, such as anti-TNF therapies (“TNF blockers”, examples of which include etanercept, adalimumab (Humira ® ), infliximab), This suggests that these constructs increase the specificity of TNFR1 inflammation blockade and result in preservation or amplification of the natural immunosuppressive TNFR2 function, at least in part by upregulation and protection of immunosuppressive Tregs and induction of anti-inflammatory signaling pathways. In addition, TNF blockade resulting in suppression of TNFR2 function also reduces T cell-induced monocyte activation, increasing the likelihood of opportunistic infections (see, e.g., Rossel et al. (2007) J. Immunol . 179: 4239-48).
본 명세서에 제공된 예시적인 TNFR1 길항제 작제물의 활성과 기존의 승인된 TNF 차단제 사이에는 많은 차이가 있다: TNF 차단제, 예컨대 에타네르셉트, 아달리무맙, 인플릭시맙은 TNFR1에 특이적이지 않다는 것이다. IL6, IL17, IL23과 같은 다른 차단제는 전체가 아닌 사이토카인 캐스케이드의 일부만 차단한다. 기존의 TNF 차단제는 TNFR1과 TNFR2에 대해 동일한 작용 기전을 가지므로 둘 다의 활동을 차단한다. JAK 억제제는 유사한 문제를 제기하고; 그들은 염증 및 항-염증 작용을 한다. 예를 들어, 염증성 사이토카인 Il1은 JAK 억제제에 의해 차단되지 않고, 염증성 사이토카인 IL6은 JAK 억제제(류마티스성 관절염 치료에 2차 사용)에 의해 차단되며, 항-염증제인 IL10은 JAK 억제제에 의해 차단되지 않는다. 대조적으로, 본 명세서에 제공된 작제물은 TNFR1 및 TNF 억제제 요법의 효과를 항-TNFR1/항-TNF 요법의 부작용을 제거하거나 감소시키는 TNFR2 효능제의 이점과 결합하고, 또한 면역억제성 Treg의 상향조절, 보호 및 항-염증성 신호전달 경로의 유도를 포함하여 추가적인 치료 양식 이점에 기여한다.There are many differences between the activity of the exemplary TNFR1 antagonist constructs provided herein and existing approved TNF blockers: TNF blockers such as etanercept, adalimumab, infliximab are not specific for TNFR1 . Other blockers such as IL6, IL17, and IL23 block only parts of the cytokine cascade, but not the whole. Existing TNF blockers have the same mechanism of action for TNFR1 and TNFR2, thus blocking the activity of both. JAK inhibitors pose similar problems; They have inflammatory and anti-inflammatory action. For example, the inflammatory cytokine IL1 is not blocked by JAK inhibitors, the inflammatory cytokine IL6 is blocked by JAK inhibitors (secondary use in rheumatoid arthritis treatment), and the anti-inflammatory drug IL10 is blocked by JAK inhibitors. It doesn't work. In contrast, constructs provided herein combine the effects of TNFR1 and TNF inhibitor therapy with the benefits of TNFR2 agonists that eliminate or reduce the side effects of anti-TNFR1/anti-TNF therapy, and also upregulate immunosuppressive Tregs , contributing to additional therapeutic modality benefits including induction of protective and anti-inflammatory signaling pathways.
TNFR1 길항제 작제물은 하나 이상의 TNFR1 억제제, 하나 이상의 링커 및 하나 이상의 활성 변형제를 함유한다. 예를 들어, 본 명세서에 제공된 TNFR1 길항제 작제물의 구조는 하기 식 1로 나타낼 수 있다:A TNFR1 antagonist construct contains one or more TNFR1 inhibitors, one or more linkers, and one or more active modifiers. For example, the structure of a TNFR1 antagonist construct provided herein can be represented by
(TNFR1 억제제)n - 링커p ― 링활성 변형제)q, 식 1a, 또는 (TNFR1 inhibitor) n - linker p - ring activity modifier) q , Formula 1a, or
(활성 변형제)q - 링커p ― 링TNFR1 억제제)n, 식 1b, 여기서: (active modifier) q - linker p - ring TNFR1 inhibitor) n , Formula 1b, where:
(n 및 q는 각각 정수이고, 각각 독립적으로 1, 2 또는 3이고; p는 0, 1, 2 또는 3임); 활성 변형제는 TNFR1 억제제의 혈청 반감기를 증가시키는 알부민과 같은 폴리펩티드, 또는 ADCC 활성이 감소되거나 전혀 없도록 변형된 Fc와 같은 모이어티이고; TNFR1 억제제는 TNFR1에 결합하고 신호전달 활성과 같은 활성을 억제하는 폴리펩티드 또는 작은 약물 분자와 같은 분자이다. 활성 변형제는 인간 혈청 알부민 항체 또는 비변형 단일 Fc가 아니다. 활성 변형제는 ADCC 및/또는 CDC 활성을 제거하도록 변형된 Fc, Fc 이량체 및 다른 항체 도메인과 같은 변형된 Fc 영역을 포함한다. 링커에는 화학 링커, GS 링커와 같은 폴리펩티드, 항체와 같은 힌지 영역이 포함되어, 작제물이 화학적 접합체, 융합 단백질 및 이들의 조합을 포함한다.(n and q are each an integer, each independently 1, 2 or 3; p is 0, 1, 2 or 3); activity modifiers are polypeptides such as albumin that increase the serum half-life of the TNFR1 inhibitor, or moieties such as Fc modified to have reduced or no ADCC activity; A TNFR1 inhibitor is a molecule, such as a polypeptide or small drug molecule, that binds to TNFR1 and inhibits its activity, such as its signaling activity. The active modifier is not a human serum albumin antibody or an unmodified single Fc. Active modifiers include modified Fc regions such as Fc, Fc dimers and other antibody domains that have been modified to eliminate ADCC and/or CDC activity. Linkers include chemical linkers, polypeptides such as GS linkers, hinge regions such as antibodies, such that constructs include chemical conjugates, fusion proteins, and combinations thereof.
또한 다중특이적 작제물이 제공된다. 본 명세서에 제공되는 다중특이적, 예를 들어 이중특이적 작제물의 구조는 하기 식 (식 2)으로 표시된다: Multispecific constructs are also provided. The structure of a multispecific, e.g., bispecific, construct provided herein is represented by the following formula (Equation 2):
(TNFR1 억제제)n ― (활성 변형제)r1 ― (링커 (L)p ― (활성 변형제)r2 ― (TNFR2 효능제)q, (TNFR1 inhibitor) n - (active modifier) r1 - (linker (L) p - (active modifier) r2 - (TNFR2 agonist) q ,
여기서 n은 1, 2 또는 3이고, p는 1, 2 또는 3이고, q는 0, 1 또는 2이고, r1 및 r2는 각각 독립적으로 0, 1 또는 2이다. 식 1의 작제물과 마찬가지로 성분의 순서는 다양할 수 있으며 필요에 따라 추가 링커가 있을 수 있다. 작제물에는 가요성과 같은 속성을 부여하는 데 필요한 추가 링커는 포함될 수 있다. 각 링커는 복수의 성분을 포함할 수 있다. 식 2는 또한 링커 대신에 또는 링커에 더하여 활성 변형제를 포함할 수 있다. 활성 변형제 및 링커는 Fc 또는 힌지 영역이 있는 Fc, 또는 GS 링커가 있는 Fc, 또는 성분의 다른 조합을 포함한다. 이들 작제물의 Fc는 비변형 Fc 영역을 포함하고; 링커는 전술된 바와 같고, 아래에 상술되어 있다. wherein n is 1, 2 or 3, p is 1, 2 or 3, q is 0, 1 or 2, and r1 and r2 are each independently 0, 1 or 2. As with the constructs of
또한 식 3을 갖는 TNFR2 효능제 작제물이 제공된다:Also provided is a TNFR2 agonist construct having Formula 3:
(TNFR2 효능제)n ― 링커p ― (활성 변형제)q, 식 3a, 또는(TNFR2 agonist) n - linker p - (active modifier) q , Formula 3a, or
(활성 변형제)q ― 링커p ― (TNFR2 효능제)n, 식 3b, (active modifier) q - linker p - (TNFR2 agonist) n , formula 3b,
여기서 n, p 및 q는 식 1에 기재된 바와 같고, 링커 및 활성 변형제는 식 1에 기재된 바와 같다. wherein n, p and q are as described in
다음 섹션에서 상세히 논의되는 식 1-3의 성분은 표적화 수용체에 특이적으로 결합하거나 상호작용하는 작은 약물과 같은 다른 분자 또는 폴리펩티드일 수 있다. 본 명세서에 제공된 작제물/분자의 각 성분은 아래 섹션에서 차례로 설명된다. Components of formulas 1-3, discussed in detail in the next section, may be other molecules or polypeptides such as small drugs that specifically bind or interact with the targeting receptor. Each component of the construct/molecule provided herein is described in turn in the sections below.
본 명세서에 제공된 작제물의 각 성분의 특성은 아래 섹션에서 상세히 논의된다. 따라서 작제물의 성분에는 다음 섹션에서 상세히 설명하는 다음 성분이 포함되지만 이에 제한되지는 않다. The properties of each component of the constructs provided herein are discussed in detail in the sections below. Components of the construct thus include, but are not limited to, the following components detailed in the following sections.
1. TNFR1 길항제 1. TNFR1 antagonists
2. TNFR2 효능제2. TNFR2 agonists
3. 링커 3. Linker
a. 글리신-세린 링커 a. glycine-serine linker
b. 힌지 영역 b. hinge area
c. 화학 링커 c. chemical linker
4. 활성 변형제4. Active modifiers
a. 변형된 Fcs a. Modified Fcs
b. 증가된 혈청 반감기, 내인성 프로테아제에 의한 분해에 대한 저항성 및 다른 이러한 특성과 같은 개선되거나 변경된 약리학적 특성을 부여하는 폴리펩티드 및 다른 모이어티. b. Polypeptides and other moieties that confer improved or altered pharmacological properties such as increased serum half-life, resistance to degradation by endogenous proteases, and other such properties.
다음 섹션에서 상세히 설명하는 다른 작제물도 제공된다.Other constructs are provided, which are detailed in the following sections.
작제물은, TNF가 TNFR1 신호전달 억제가 감소 또는 억제되도록 질환, 병태 또는 장애의 병리학적 변형인자이고/거나 TNF 또는 TNFR1 신호전달의 억제가 질환, 장애 또는 병태의 퇴행을 억제하거나 야기할 수 있고/있거나 억제가 질환, 장애 및/또는 병태의 증상을 개선하는, 질환, 장애, 및 병태의 치료 방법에 사용된다. 자가면역 질환을 포함하는 염증성 질환을 포함하는 이러한 질환, 병태 및 장애는 다음 섹션에서 논의된다. The construct is characterized in that TNF is a pathological modifier of a disease, condition or disorder such that inhibition of TNFR1 signaling is reduced or inhibited and/or inhibition of TNF or TNFR1 signaling can inhibit or cause regression of a disease, disorder or condition; / or inhibition is used in methods of treating diseases, disorders, and conditions, wherein the disease, disorder, and/or condition ameliorates symptoms of the disease, disorder, and/or condition. These diseases, conditions and disorders including inflammatory diseases including autoimmune diseases are discussed in the following sections.
또한 방법 및 용도에 사용하기 위한 약제학적 조성물, 및 폴리펩티드 및 융합 단백질인 것을 포함하는 작제물을 생성하기 위한 핵산 및 벡터가 제공된다. 다음 섹션은 질환, 장애, 및 병태, TNFR1/TNFR2 활성 및 질환, 장애, 및 병태에 대한 그의 역할, 질환, 장애, 및 병태를 위한 기존 치료, 본 명세서에 제공된 작제물 및 그의 성분, 작제물을 생성하는 방법, 작제물을 함유하고/하거나 핵산을 인코딩하는 약제학적 조성물, 및 치료 방법을 기재한다.Also provided are pharmaceutical compositions for use in the methods and uses, and nucleic acids and vectors for generating constructs, including those that are polypeptides and fusion proteins. The following sections cover diseases, disorders, and conditions, TNFR1/TNFR2 activity and its role in diseases, disorders, and conditions, existing treatments for diseases, disorders, and conditions, constructs provided herein and their components, and constructs. Methods of producing, pharmaceutical compositions containing the constructs and/or encoding nucleic acids, and methods of treatment are described.
C 종양 괴사 인자(TNF) 및 만성 염증성 및 자가면역 질환 및 장애C Tumor necrosis factor (TNF) and chronic inflammatory and autoimmune diseases and disorders
이 섹션은 종양 괴사 인자(TNF) 및/또는 그의 수용체가 염증성 및 자가면역 질환, 예시적인 질환의 특정, 및 기존 요법의 문제에서 수행하는 역할을 설명하고, 본 명세서에 제공되는 작제물이 이러한 문제를 해결하는 방법을 보여준다.This section describes the role that tumor necrosis factor (TNF) and/or its receptors play in inflammatory and autoimmune diseases, characterization of exemplary diseases, and problems with existing therapies, and constructs provided herein are useful in these problems. show how to solve
1. 종양 괴사 인자(TNF)1. Tumor Necrosis Factor (TNF)
종양 괴사 인자(TNF; 예를 들어, 서열번호: 1 참조; TNF 알파, TNF-α 또는 TNFα라고도 함)는 종양형성/암의 조절, 병원성 감염에 대한 숙주 방어, 세포자멸, 자가면역 및 패혈성 쇼크를 포함하는 염증 및 면역 조절 활성과 연관되고, 특히 림프양 기관의 기관생성뿐만 아니라 선천 및 적응 면역 반응의 협응에 중요한 역할을 하는 다면발현성, 염증유발 사이토카인이다. 인간에서 TNF는 주로 대식세포에 의해 생성되며 단핵구, 수지상 세포(DC), B-세포, T 세포, 섬유아세포 및 다른 세포 유형에 의해 생성될 수도 있다. 이것은 157개의 아미노산 (17 kDa)을 함유하는 가용성 TNF 를 방출하기 위해 프로테아제 TACE (TNF 알파 전환효소; ADA17로도 알려져 있음)에 의해 절단될 수 있는 233개의 아미노산(26kDa)을 함유하는 동형삼량체 막 결합 단백질로서 생산되며; 막 결합 및 가용성 형태의 TNF는 생물학적으로 활성이다. 막관통 인간 TNF는 233개의 아미노산을 함유하고, 서열번호: 1와 관련하여 잔기 1-35에 상응하는 세포질 도메인, 잔기 36-56에 상응하는 막관통 도메인, 및 잔기 57-233에 상응하는 세포외 도메인을 함유한다. 가용성 형태의 TNF는 서열번호: 1에 제시된 바와 같이 아미노산 잔기 77-233에 상응한다 (가용성 TNF의 아미노산 잔기 서열에 대해서는 서열번호: 2 참조). Tumor necrosis factor (TNF; see eg SEQ ID NO: 1; also referred to as TNF alpha, TNF-α or TNFα) is involved in the regulation of tumorigenesis/cancer, host defense against pathogenic infection, apoptosis, autoimmunity and sepsis. It is a pleiotropic, pro-inflammatory cytokine that is associated with inflammatory and immunomodulatory activities, including shock, and plays an important role in organogenesis, particularly of lymphoid organs, as well as coordination of innate and adaptive immune responses. In humans, TNF is produced primarily by macrophages and may also be produced by monocytes, dendritic cells (DCs), B-cells, T cells, fibroblasts and other cell types. It is a homotrimeric membrane-bound protein containing 233 amino acids (26 kDa) that can be cleaved by the protease TACE (TNF alpha convertase; also known as ADA17) to release soluble TNF containing 157 amino acids (17 kDa). produced as a protein; Both membrane bound and soluble forms of TNF are biologically active. Transmembrane human TNF contains 233 amino acids and, with respect to SEQ ID NO: 1, a cytoplasmic domain corresponding to residues 1-35, a transmembrane domain corresponding to residues 36-56, and an extracellular domain corresponding to residues 57-233 contains a domain. The soluble form of TNF corresponds to amino acid residues 77-233 as set forth in SEQ ID NO: 1 (see SEQ ID NO: 2 for the amino acid residue sequence of soluble TNF).
TNF의 통제되지 않은 생성은 예를 들어, 패혈성 쇼크, 류마티스성 관절염, 건선, 건선성 관절염, 강직 척추염, 소아 특발성 관절염, 및 염증성 장 질환 (IBD)를 포함하는 몇 개의 염증성 및 자가면역 질환 및 병태와 연관된다. TNF의 과발현은 또한 예를 들어 알츠하이머병, 파킨슨병, 뇌졸중 및 다발성 경화증과 같은 신경퇴행 질환 및 병태와 연관이 있다. 또한 TNF는 파골세포생성을 촉진하고 TNF의 과잉 생산은 뼈 손실과 연관이 있다. 류마티스성 관절염(RA)에서 TNF는 활막액과 활막에서 과발현되는 반면, TNF 수용체(TNFR)의 발현은 활막에서 상향 조절된다. 예를 들어, 마우스에서 인간 TNF의 과발현은 과형성 활막의 형성 및 연골 및 뼈의 파괴와 함께 관절에서 자발적인 RA-유사 병변의 발생을 초래한다 (예를 들어, 문헌[Bluml 등 (2010) Arthritis & Rheumatism 62(6):1608-1619; Keffer 등 (1991) EMBO J. 10(13):4025-4031; Esperito Santo 등 (2015) Biochem . Biophys . Res. Commun. 464:1145-1150; Bluml 등 (2012) International Immunology 24(5):275-281; Dong 등 (2016) Proc. Natl. Acad. Sci. USA 113(43):12304-12309] 참조). Uncontrolled production of TNF is associated with several inflammatory and autoimmune diseases including, for example, septic shock, rheumatoid arthritis, psoriasis, psoriatic arthritis, ankylosing spondylitis, juvenile idiopathic arthritis, and inflammatory bowel disease (IBD); and related to the condition Overexpression of TNF is also associated with neurodegenerative diseases and conditions such as, for example, Alzheimer's disease, Parkinson's disease, stroke and multiple sclerosis. TNF also promotes osteoclastogenesis, and overproduction of TNF is associated with bone loss. In rheumatoid arthritis (RA), TNF is overexpressed in the synovial fluid and synovial membrane, whereas the expression of the TNF receptor (TNFR) is upregulated in the synovial membrane. For example, overexpression of human TNF in mice results in the development of spontaneous RA-like lesions in joints with formation of hyperplastic synovium and destruction of cartilage and bone (see, e.g., Bluml et al. (2010) Arthritis & Rheumatism 62(6):1608-1619;Keffer et al. (1991) EMBO J. 10(13):4025-4031; Esperito Santo et al. (2015) Biochem . Biophys . Res. Commun. 464:1145-1150; Bluml et al. (2012) International Immunology 24(5):275-281; Dong et al. (2016) Proc. Natl. Acad. Sci. USA 113(43):12304-12309).
아래에서 더 논의되는 바와 같이, TNF 신호전달은 2개의 고친화성 특정 수용체인 TNFR1 및 TNFR2를 통해 신호를 보내고; TNFR1은 해로운 염증 과정과 연관이 있는 반면, TNFR2는 유익한 면역 조절 과정과 연관이 있다. 막 결합 TNF는 주로 TNFR2를 활성화하는 반면, 가용성 TNF는 주로 TNFR1을 활성화하는 것으로 나타났다 (문헌[Bluml 등 (2010) Arthritis & Rheumatism 62(6):1608-1619]). (주로 TNFR1을 통해) 주변분비 신호전달에 관여하는 가용성 TNF(solTNF; 서열번호: 1의 잔기 77-233에 상응함; 서열번호: 2에 제시된 서열 참조)은 만성 염증과 연관이 있는 반면, 세포 간 접촉을 통해 작용하여 죽스타크린 신호전달(주로 TNFR2를 통해)을 유도하는 막관통 TNF (tmTNF)는 염증 해소 및 병원체, 예컨대 리스테리아 모노사이토게네스(Listeria monocytogenes) 및 마이코박테리움 투베르쿨로시스(Mycobacterium tuberculosis)에 대한 면역 유도와 연관이 있다. 따라서 TNFR1 및 TNFR2를 통한 TNF 신호전달은 수용체 유형에 따라 다른 결과를 초래한다. As discussed further below, TNF signaling signals through two high-affinity specific receptors, TNFR1 and TNFR2; TNFR1 is associated with detrimental inflammatory processes, whereas TNFR2 is associated with beneficial immune regulatory processes. Membrane-bound TNF has been shown to primarily activate TNFR2, whereas soluble TNF has been shown to primarily activate TNFR1 (Bluml et al. (2010) Arthritis & Rheumatism 62(6):1608-1619]). Soluble TNF (solTNF; corresponding to residues 77-233 of SEQ ID NO: 1; see sequence given in SEQ ID NO: 2) involved in paracrine signaling (mainly via TNFR1) is associated with chronic inflammation, whereas cell Transmembrane TNF (tmTNF), which acts through liver contact to induce juxtacrine signaling (mainly through TNFR2), relieves inflammation and kills pathogens such as Listeria monocytogenes and Mycobacterium tuberculosis Rosis ( Mycobacterium tuberculosis ) It is associated with the induction of immunity against. Thus, TNF signaling through TNFR1 and TNFR2 leads to different results depending on the receptor type.
TNF 과발현과 염증성 및 자가면역 질환 및 병태의 발달 사이의 연관성으로 인해, TNF의 차단은 류마티스성 관절염 (RA), 건선, 건선성 관절염, 강직 척추염, 소아 특발성 관절염 (JIA), 및 염증성 장 질환 (IBD; 예를 들어, 크론병, 궤양성 대장염)을 포함하지만 이에 제한되지 않는 다양한 그러한 질환 및 병태의 치료에 사용되어 왔다. TNF를 차단하고 TNFR1 및 TNFR2를 통한 신호전달을 방지하는 TNF 차단제의 사용은 면역 억제로 인해 결핵 및 리스테리아증과 같은 심각한 감염 위험 증가와 연관이 있다. TNF 차단제는 TNFR1을 통한 해로운 염증 신호를 차단할 뿐만 아니라 TNFR2를 통한 유익한 면역 조절 신호전달도 차단한다. 그 결과, 특히 관절염이나 IBD와 같이 장기간 투여가 필요한 만성 질환/병태의 경우 TNF 차단제의 사용이 제한될 수 있다. RA 환자의 약 1/3는 항-TNF 요법을 사용하여 무반응이거나 치료적 이점이 지속되지 않는다. 따라서, 개선된 치료 효능 및 안전성을 갖는 요법, 특히 TNFR1 신호전달의 염증 효과를 차단하지만 TNFR2 신호전달의 유익한 항-염증 효과를 유지 또는 증진시키는 요법에 대한 필요성이 존재한다. 이러한 요법이 본 명세서에 제공된다.Because of the association between TNF overexpression and the development of inflammatory and autoimmune diseases and conditions, blockade of TNF is effective in rheumatoid arthritis (RA), psoriasis, psoriatic arthritis, ankylosing spondylitis, juvenile idiopathic arthritis (JIA), and inflammatory bowel disease ( It has been used in the treatment of a variety of such diseases and conditions, including but not limited to IBD; The use of TNF blockers, which block TNF and prevent signaling through TNFR1 and TNFR2, is associated with an increased risk of serious infections such as tuberculosis and listeriosis due to immunosuppression. TNF blockers not only block detrimental inflammatory signaling through TNFR1, but also block beneficial immune regulatory signaling through TNFR2. As a result, the use of TNF blockers may be limited, especially in chronic diseases/conditions requiring long-term administration, such as arthritis or IBD. About one-third of RA patients are unresponsive or do not receive sustained therapeutic benefit with anti-TNF therapy. Thus, there is a need for therapies with improved therapeutic efficacy and safety, particularly those that block the inflammatory effects of TNFR1 signaling while maintaining or enhancing the beneficial anti-inflammatory effects of TNFR2 signaling. Such therapies are provided herein.
2. 종양 괴사 인자 수용체(TNFR)2. Tumor Necrosis Factor Receptor (TNFR)
TNF의 동종삼량체는 두 가지 특이적이고 친화력이 높은 동종삼량체 수용체인 TNFR1(TNF 수용체 유형 1; TNFRI, p55, p60, CD120a, TNF 수용체 슈퍼패밀리 구성원 1A 및 TNFRSF1A로도 알려짐) 및 TNFR2(TNF 수용체 유형 2; TNFRII, p75, p80, CD120b, TNF 수용체 슈퍼패밀리 구성원 1B 및 TNFRSF1B로도 알려짐)를 통해 신호를 전달한다. TNFR1은 모든 유핵 세포 유형에 의해 발현되고; TNFR2 발현은 면역 세포 (예를 들어, 단핵구, 대식세포, 활성화된 T 세포, 조절 T 세포 (Treg), B 세포 및 자연 살해 (NK) 세포), 내피 세포, 특정 중추신경계 (CNS) 세포, 및 특정 심장 세포로 제한된다. Treg에 대한 TNFR2 발현은 T-세포 수용체 활성화 시 유래된다. Homotrimers of TNF form two specific, high affinity homotrimeric receptors, TNFR1 (
생체 내에서, TNFR1 및 TNFR2는 세포 표면으로부터 쉐딩(shedding)한 후, 막 결합 수용체 및 가용성 "미끼"(즉, 비-신호전달) 수용체로 존재한다. 가용성 TNF는 TNFR1에 우선적으로/선택적으로 결합하지만; 막 결합 및 가용성 형태의 TNF의 결합은 TNFR1을 활성화한다. TNFR2의 일차 리간드는 막 결합 TNF이다. 가용성 TNF는 TNFR2를 완전히 활성화시키지 못하지만, 가용성 형태의 TNFR2(TNFR2 쉐딩 후)는 TNF에 대해 높은 결합 친화력을 가지므로, TNFR2의 항-염증 효과에 기여하는 막 결합된 신호전달 수용체에 결합하는 TNF를 제거하고 억제한다. 막 결합 TNFR2는 신속한 온/오프 동역학으로 TNF에 결합하여 TNFR2가 TNF를 세포 표면에 집중시키고 리간드를 TNFR1로 전달하여 TNFR1 신호전달을 매개한다. TNFR1 및 TNFR2 각각은 세포외, 막관통 및 세포질 도메인을 포함한다. TNFR1 및 TNFR2의 세포외 도메인에는 리간드 결합에 필요한 4개의 시스테인 풍부한 도메(CRD)이 포함되어 있다. TNFR1 및 TNFR2의 세포내 도메인은 TNF 리간드 결합에 대한 반응으로 상이한 신호전달 캐스케이드를 시작하고 상이한 이펙터 기능을 매개한다. In vivo, TNFR1 and TNFR2 exist as membrane-bound receptors and soluble "decoy" (ie, non-signaling) receptors after shedding from the cell surface. Soluble TNF binds preferentially/selectively to TNFR1; Binding of membrane-bound and soluble forms of TNF activates TNFR1. The primary ligand of TNFR2 is membrane-bound TNF. Although soluble TNF does not fully activate TNFR2, the soluble form of TNFR2 (after TNFR2 shedding) has a high binding affinity for TNF, thus allowing TNF to bind to membrane-bound signaling receptors contributing to the anti-inflammatory effects of TNFR2. eliminate and suppress Membrane-bound TNFR2 binds to TNF with rapid on/off kinetics, whereby TNFR2 concentrates TNF on the cell surface and transfers its ligand to TNFR1 to mediate TNFR1 signaling. TNFR1 and TNFR2 each contain extracellular, transmembrane and cytoplasmic domains. The extracellular domains of TNFR1 and TNFR2 contain four cysteine-rich domains (CRDs) required for ligand binding. The intracellular domains of TNFR1 and TNFR2 initiate different signaling cascades and mediate different effector functions in response to TNF ligand binding.
TNFR 신호 이상은 여러 자가면역 질환과 연관이 있으며 TNF의 투여는 이러한 질환에 대한 치료 전략으로 사용될 수 있다. 예를 들어, 저용량 TNF는 I형 당뇨병 및 경피증 환자의 혈액 샘플과 쇼그렌 증후군의 동물 모델에서 자가반응성 T 세포를 선택적으로 파괴한다. TNF의 투여는 예를 들어 TNF 수준이 높은 암 환자에서 전신 독성을 유발할 수 있다. 본 명세서에 기재된 바와 같이, 독성은 TNFR1의 편재성 세포 발현으로부터 기인하고; 본 명세서에 기재된 바와 같이, 작용성 TNFR2는 보다 제한된 세포 발현으로 인해 TNF의 투여보다 안전한 치료 옵션이다. TNFR2를 통한 TNF 신호전달의 촉진은 TNFR1 길항제를 투여함으로써 수행될 수 있다 (예를 들어, 문헌[Faustman 등 (2013) Front. Immunol. 4:478] 참조) Abnormalities in TNFR signaling are associated with several autoimmune diseases, and administration of TNF can be used as a therapeutic strategy for these diseases. For example, low-dose TNF selectively destroys autoreactive T cells in blood samples from patients with type I diabetes and scleroderma and in animal models of Sjögren's syndrome. Administration of TNF can cause systemic toxicity, for example in cancer patients with high TNF levels. As described herein, toxicity results from ubiquitous cellular expression of TNFR1; As described herein, functional TNFR2 is a safer treatment option than administration of TNF due to more restricted cellular expression. Promotion of TNF signaling through TNFR2 can be accomplished by administering a TNFR1 antagonist (see, eg, Faustman et al. (2013) Front. Immunol. 4:478])
a. TNFR1a. TNFR1
인간 TNFR1(서열번호: 3 참조)은 주요 염증 수용체이며 TNF에 기인한 염증 유발, 세포독성 및 세포자멸 효과의 대부분을 차지한다. 인간 TNFR1은 동종삼량체 수용체이며, TNF에 의한 그의 결합은 염증유발 반응을 유도한다 (예를 들어, TNFR1 신호전달의 설명을 위해 문헌[Morton 등(2019) Sci Signal. 12(592):eaaw2418] 참조). TNFR1은 455개의 아미노산 잔기를 함유하고; 잔기 1-29는 신호 펩티드에 상응하고, 잔기 30-211은 세포외 도메인에 상응하고, 잔기 212-232는 막관통 도메인에 상응하고, 잔기 233-455는 세포질 도메인에 상응한다. 세포외 도메인 내에서, TNFR1은 각각 서열번호: 3의 아미노산 잔기 43-82, 83-125, 126-166 및 167-196에 상응하는 시스테인 풍부 도메인(CRD) 1-4를 함유한다. CRD 2 및 3은 결합된 TNF와 접촉하고, CRD1, 특히 서열번호: 3과 관련하여 아미노산 잔기 30-82는 리간드 결합 및 수용체 기능에 필요한 혈우병 상호작용 모티프인 프리-리간드 결합 조립 도메인 (PLAD)을 형성한다. 세포질 도메인은 TNF가 TNFR1에 결합한 후 TNFR1 연관 사멸 도메인(TRADD) 및 Fas 연관 사멸 도메인(FADD)에 결합하는 사멸 도메인(서열번호: 3의 잔기 356-441에 상응함)을 함유하고, 카스파제를 활성화하고 세포자멸을 유도하는 신호전달 경로를 생성한다. TNFR1에 대한 TNF의 결합은 또한 MAPK (미토겐 활성화된 단백질 키나제; 예를 들어, p38, JNK, ERK) 및 NF-κB (활성화 B 세포의 핵 인자 카파-경쇄-인핸서) 신호전달 경로를 통해를 통해 염증유발 캐스케이드를 시작한다. TNFR1은 림프 기관생성 및 병원체에 대한 면역 반응에서 역할을 하며 숙주 항-바이러스 방어 메커니즘과 연관된 주요 수용체이다. 마이코박테리아 차단는 TNF 유래 신호에 의존하고 TNF 차단제로 치료받은 환자는 잠복 결핵의 내인성 재활성화로 고통받을 수 있는 것으로 나타났다. Human TNFR1 (see SEQ ID NO: 3) is a major inflammatory receptor and accounts for most of the inflammatory, cytotoxic and apoptotic effects attributed to TNF. Human TNFR1 is a homotrimeric receptor, and its binding by TNF induces pro-inflammatory responses (see, e.g., Morton et al. (2019) for a description of TNFR1 signaling). Sci Signal. 12(592):eaaw2418). TNFR1 contains 455 amino acid residues; Residues 1-29 correspond to the signal peptide, residues 30-211 correspond to the extracellular domain, residues 212-232 correspond to the transmembrane domain and residues 233-455 correspond to the cytoplasmic domain. Within the extracellular domain, TNFR1 contains cysteine rich domains (CRDs) 1-4 corresponding to amino acid residues 43-82, 83-125, 126-166 and 167-196 of SEQ ID NO:3, respectively. CRDs 2 and 3 contact bound TNF, and amino acid residues 30-82 with respect to CRD1, particularly SEQ ID NO: 3, form the pre-ligand binding assembly domain (PLAD), a hemophilia interaction motif required for ligand binding and receptor function. form The cytoplasmic domain contains a death domain (corresponding to residues 356-441 of SEQ ID NO: 3) that binds to TNFR1-associated death domain (TRADD) and Fas-associated death domain (FADD) after TNF binds to TNFR1, and binds caspases to activates and creates signaling pathways that induce apoptosis. Binding of TNF to TNFR1 is also via the MAPK (mitogen activated protein kinases; e.g., p38, JNK, ERK) and NF-κB (nuclear factor kappa-light chain-enhancer of activated B cells) signaling pathways. initiates an inflammatory cascade. TNFR1 plays a role in lymphoid organogenesis and the immune response to pathogens and is a key receptor involved in host anti-viral defense mechanisms. It has been shown that mycobacterial blockade is dependent on TNF-derived signaling and patients treated with TNF blockers may suffer from endogenous reactivation of latent tuberculosis.
주로 염증유발 신호전달에 관여하는 TNFR1은 관절염 발병의 원동력이다. 예를 들어, 마우스에서 TNFR1의 녹아웃과 RNA 간섭에 의한 TNFR1 발현의 침묵은 관절염의 동물 모델인 콜라겐 유도 관절염(CIA)의 약화를 초래한다. TNF를 과발현하는 TNFR1 결핍 마우스는 관절염 발병으로부터 보호되며 중간엽 세포에 대한 TNFR1을 재도입하면 TNF 의존성 관절염이 발병한다. 또한, TNFR1은 파골세포의 생성을 강화하여 국소적 뼈 파괴를 일으키고, 조혈 세포에 대한 TNFR1의 결핍은 미란성 관절염 모델에서 뼈 파괴를 약화시키는 것으로 나타났다. TNFR1은 또한 TNF 유도 심부전 및 심근경색 모델에서 심장독성 효과와 연관이 있으며, 망막 허혈 동물 모델에서 신경퇴행을 촉진하는 것으로 나타났다 (예를 들어, 문헌[Schmidt 등 (2013) Arthritis & Rheumatism 65(9):2262-2273; Goodall 등 (2015) PLoS ONE 10(9):e0137065; McCann 등 (2014) Arthritis & Rheumatology 66(10):2728-2738; Ruspi 등 (2014) Cellular Signaling 26:683-690; Faustman and Davis (2013) Front. Immunol . 4:478; Bluml 등 2012) International Immunology 24(5):275-281; Dong 등 (2016) Proc. Natl. Acad. Sci. USA 113(43):12304-12309] 참조). TNFR1, which is mainly involved in proinflammatory signaling, is a driving force behind the development of arthritis. For example, knockout of TNFR1 in mice and silencing of TNFR1 expression by RNA interference result in attenuation of collagen-induced arthritis (CIA), an animal model of arthritis. TNFR1-deficient mice overexpressing TNF are protected from developing arthritis, and reintroduction of TNFR1 to mesenchymal cells causes TNF-dependent arthritis. In addition, TNFR1 causes local bone destruction by enhancing the production of osteoclasts, and TNFR1 deficiency in hematopoietic cells has been shown to attenuate bone destruction in an erosive arthritis model. TNFR1 has also been associated with cardiotoxic effects in TNF-induced heart failure and myocardial infarction models and has been shown to promote neurodegeneration in animal models of retinal ischemia (see, e.g., Schmidt et al. (2013) Arthritis & Rheumatism 65(9):2262-2273; Goodall et al. (2015) PLoS ONE 10(9):e0137065; McCann et al. (2014) Arthritis & Rheumatology 66(10):2728-2738; Ruspi, etc. (2014) Cellular Signaling 26:683-690; Faustman and Davis (2013) Front. Immunol . 4:478; Bluml et al. 2012) International Immunology 24(5):275-281; Dong et al. (2016) Proc. Natl. Acad. Sci. USA 113(43):12304-12309).
b. TNFR2 b. TNFR2
인간 TNFR2 (참고, 서열번호: 4)은 461개의 아미노산 잔기를 함유하고; 잔기 1-22는 신호 펩티드에 상응하고, 잔기 23-257은 세포외 도메인에 상응하고, 잔기 258-287는 막관통 도메인에 상응하고, 잔기 288-461는 세포질 도메인에 상응한다. TNFR1과 달리 사멸 도메인이 없는 TNFR2는 TNF 수용체 연관 인자 2(TRAF2) 결합 부위를 가지고 있다. TRAF2를 통한 TNFR2 신호전달은 NF-κB 및 활성인자 단백질 1(AP1) 활성화를 통해 세포 생존 및 증식을 촉진하고 PI3K-PKB/Akt 매개 복구 및 이동과 연관이 있다. 본 명세서의 다른 곳에서 논의된 바와 같이, TNFR2를 통한 TNF 신호전달은 또한 염증성 및 자가면역 질환 및 장애의 억제에 중요한 역할을 하는 조절 T 세포(Treg)의 확대 및 활성화를 촉진한다. TNFR2 신호전달은 상처 치유 및 심근경색 모델의 복구 및 재생에 연루된 반면, 미란성 관절염 마우스 모델에서 TNFR2의 녹아웃은 관절 염증 및 뼈 파괴를 초래한다. Human TNFR2 (reference, SEQ ID NO: 4) contains 461 amino acid residues; Residues 1-22 correspond to the signal peptide, residues 23-257 correspond to the extracellular domain, residues 258-287 correspond to the transmembrane domain and residues 288-461 correspond to the cytoplasmic domain. Unlike TNFR1, TNFR2 without a death domain has a TNF receptor-associated factor 2 (TRAF2) binding site. TNFR2 signaling through TRAF2 promotes cell survival and proliferation through NF-κB and activator protein 1 (AP1) activation and is associated with PI3K-PKB/Akt-mediated repair and migration. As discussed elsewhere herein, TNF signaling through TNFR2 also promotes the expansion and activation of regulatory T cells (Tregs), which play an important role in the suppression of inflammatory and autoimmune diseases and disorders. TNFR2 signaling has been implicated in wound healing and repair and regeneration in myocardial infarction models, whereas knockout of TNFR2 in erosive arthritis mouse models results in joint inflammation and bone destruction.
주로 항-염증성 신호전달에 관여하는 TNFR2는 신경, 심장, 장 및 골 보호 효과와 연관이 있다. TNFR2는 항-염증 및 보호 효과를 나타내고; 이러한 효과는 예를 들어 실험적 자가면역 뇌척수염 (EAE), 실험적 결장염, 심부전/심장 질환, 심근경색, 염증성 관절염, 탈수초 및 신경퇴행 장애, 및 감염성 질환에서 입증되었다. 예를 들어, TNF에 의한 TNFR2의 활성화는 발작을 억제하고, 뇌 손상 후 인지 기능장애를 약화시키며, 마우스에서 심근 경색 후 생존을 촉진하고, 심근 허혈/재관류 손상으로부터 보호하고, 심부전 후 재형성 및 비대를 감소시킨다. TNFR2 효능작용은 또한 췌장 재생, 재수초화, 뉴런 아형의 생존 및 줄기 세포 증식과 연관된다. TNFR2 효능작용은 I형 당뇨병, 다발성 경화증, 그레이브스병 및 쇼그렌 증후군 환자의 혈액 샘플에서 건강한 세포가 아닌 자가반응성 T 세포를 선택적으로 파괴한다. I형 당뇨병의 동물 모델에서 저용량 TNF를 사용하여 자가반응성 T 세포를 제거하면 췌장 조직이 재생된다. TNFR2를 통한 TNF 신호전달은 수초에서 희소돌기아교세포 전구체의 재생을 유도하는 것으로 밝혀졌고, 따라서 다발성 경화증(MS)과 같은 탈수초 장애의 치료에 사용될 수 있다. TNFR2는 또한 망막 허혈의 동물 모델에서 신경보호를 촉진하는 것으로 밝혀졌다. TNFR2, which is primarily involved in anti-inflammatory signaling, is associated with neurological, cardiac, intestinal and bone protective effects. TNFR2 exhibits anti-inflammatory and protective effects; This effect has been demonstrated, for example, in experimental autoimmune encephalomyelitis (EAE), experimental colitis, heart failure/heart disease, myocardial infarction, inflammatory arthritis, demyelination and neurodegenerative disorders, and infectious diseases. For example, activation of TNFR2 by TNF inhibits seizures, attenuates cognitive dysfunction after brain injury, promotes survival after myocardial infarction in mice, protects against myocardial ischemia/reperfusion injury, remodels and Reduces hypertrophy. TNFR2 agonism is also associated with pancreatic regeneration, remyelination, survival of neuronal subtypes and stem cell proliferation. TNFR2 agonism selectively destroys autoreactive T cells rather than healthy cells in blood samples from patients with type I diabetes, multiple sclerosis, Graves' disease and Sjogren's syndrome. Depletion of autoreactive T cells using low-dose TNF in animal models of type I diabetes regenerates pancreatic tissue. TNF signaling through TNFR2 has been shown to induce the regeneration of oligodendrocyte precursors in the myelin and can thus be used in the treatment of demyelinating disorders such as multiple sclerosis (MS). TNFR2 has also been shown to promote neuroprotection in animal models of retinal ischemia.
TNFR2는 또한 파골세포생성을 조절한다. 파골세포는 뼈 조직을 분해하는 일종의 뼈 세포이고; 파골세포생성의 조절은 골량을 유지하고 관절 염증 및 미란 파괴로부터 보호하는 데 중요하다. TNFR2가 결핍된 마우스는 파골세포생성이 강화되어 TNF로 인한 관절염이 악화되고 국소 뼈가 파괴된다. 미란성 관절염의 동물 모델에서 TNFR2의 결핍은 질환 진행을 초래하고, TNF를 과발현하는 TNFR2 결핍 마우스는 대조군 마우스에 비해 악화된 관절염 및 관절 파괴를 발생시킨다. 조혈 세포에서 TNFR2의 발현은 TNF 유발 관절염을 약화시키는 반면, 조혈 세포에서 TNFR2의 손실은 염증 세포의 활막으로의 동원을 증가시킨다. 실험적 대장염에서, CD4+ T 세포에 대한 TNFR2 발현 결여는 질환의 시작을 가속화하고 염증의 중증도를 증가시키는 반면, 실험적 자가면역 뇌염(EAE)에서는 증상이 TNFR2 결핍 마우스에서 악화된다 (예를 들어, 문헌[Schmidt 등 (2013) Arthritis & Rheumatism 65(9):2262-2273; Goodall 등 (2015) PLoS ONE 10(9):e0137065; McCann 등 (2014) Arthritis & Rheumatology 66(10):2728-2738; Ruspi 등 (2014) Cellular Signaling 26:683-690; Faustman and Davis (2013) Front. Immunol . 4:478; Bluml 등 (2012) International Immunology 24(5):275-281; Dong 등 (2016) Proc . Natl . Acad . Sci . USA 113(43):12304-12309] 참조). TNFR2 유전자의 다형성은 예를 들어 RA, 크론병, 전신성 홍반성 루푸스, 강직성 척추염, 염증성 장 질환, 궤양성 대장염 및 경피증을 포함하는 다양한 자가면역 질환과 상관관계가 있고; 다형성은 NF-κB의 활성화를 제한하고 Treg에서 TNFR2 신호전달 경로를 방해하는 TNFR2에 대한 TNF의 결합을 방해한다 (예를 들어, 문헌[Yang 등 (2018) Front. Immunol. 9:784] 참조). TNFR2 also regulates osteoclastogenesis. Osteoclast is a type of bone cell that decomposes bone tissue; Regulation of osteoclastogenesis is important for maintaining bone mass and protecting against joint inflammation and erosive destruction. In TNFR2-deficient mice, osteoclastogenesis is enhanced, leading to exacerbation of TNF-induced arthritis and local bone destruction. Deficiency of TNFR2 in animal models of erosive arthritis leads to disease progression, and TNFR2-deficient mice overexpressing TNF develop worse arthritis and joint destruction compared to control mice. Expression of TNFR2 in hematopoietic cells attenuates TNF-induced arthritis, whereas loss of TNFR2 in hematopoietic cells increases recruitment of inflammatory cells to the synovial membrane. In experimental colitis, lack of TNFR2 expression on CD4 + T cells accelerates the onset of disease and increases the severity of inflammation, whereas in experimental autoimmune encephalitis (EAE) symptoms are exacerbated in TNFR2 deficient mice (see, e.g., [Schmidt et al. (2013) Arthritis & Rheumatism 65(9):2262-2273; Goodall et al. (2015) PLoS ONE 10(9):e0137065; McCann et al. (2014) Arthritis & Rheumatology 66(10):2728-2738; Ruspi, etc. (2014) Cellular Signaling 26:683-690; Faustman and Davis (2013) Front. Immunol . 4:478; Bluml et al. (2012) International Immunology 24(5):275-281; Dong et al. (2016) Proc . Natl . Acad . Sci . USA 113(43):12304-12309). Polymorphisms in the TNFR2 gene are correlated with a variety of autoimmune diseases including, for example, RA, Crohn's disease, systemic lupus erythematosus, ankylosing spondylitis, inflammatory bowel disease, ulcerative colitis and scleroderma; The polymorphism prevents the binding of TNF to TNFR2, limiting the activation of NF-κB and interfering with the TNFR2 signaling pathway in Tregs (see, e.g., Yang et al. (2018) Front. Immunol. 9:784]).
TNFR1은 세포내 사멸 도메인을 함유하고 세포자멸 및/또는 염증 경로를 활성화할 수 있는 반면, TNFR2는 TRAF에 결합하고 정규 및 비정규 NF-κB 경로를 활성화하여 세포 생존 및 증식을 제어할 수 있다. 일반적으로 TNFR2를 발현하는 세포는 세포 유형과 기능에 따라 다양한 비율로 TNFR1도 발현한다. TNFR1 신호전달은 일반적으로 세포자멸을 유도하는 반면, TNFR2 신호전달은 일반적으로 세포 생존을 유도하기 때문에, 세포에 대한 이들의 공동 발현 비율은 균형을 세포자멸 또는 세포 생존 쪽으로 이동시킨다. 상기 및 본 명세서의 다른 곳에서 논의된 바와 같이, TNFR1은 RA의 병인에 관여하는 1차 TNF 수용체인 반면, TNFR2는 면역조절 역할을 하는 것으로 나타났다. 그러나 두 수용체 모두 TNF의 항바이러스 활성 매개에 관여한다. 예를 들어, 동물 질환 모델은 TNFR1이 염증성 신경퇴행와 연관이 있는 반면 TNFR2는 신경보호와 연관이 있음을 보여준다. TNFR1 contains an intracellular death domain and can activate apoptotic and/or inflammatory pathways, whereas TNFR2 can bind TRAF and activate canonical and non-canonical NF-κB pathways to control cell survival and proliferation. In general, cells expressing TNFR2 also express TNFR1 in varying proportions depending on the cell type and function. Since TNFR1 signaling generally induces apoptosis, while TNFR2 signaling generally induces cell survival, their co-expression ratio to cells shifts the balance towards either apoptosis or cell survival. As discussed above and elsewhere herein, TNFR1 is the primary TNF receptor involved in the pathogenesis of RA, whereas TNFR2 has been shown to play an immunomodulatory role. However, both receptors are involved in mediating the antiviral activity of TNF. For example, animal disease models show that TNFR1 is associated with inflammatory neurodegeneration, while TNFR2 is associated with neuroprotection.
TNFR1의 선택적인 억제 또는 TNFR2의 선택적인 활성화는 NMDA 유도 급성 신경퇴행의 마우스 모델에서 ATROSAB (길항적 TNF 수용체 단일 특이적 항체), TNFR1 선택적 길항적 IgG1 항체, 또는 EHD2-scTNFR2, 효능적 TNFR2 선택적 TNF 뮤테인(즉, 돌연변이 단백질)에 의해 입증되었다. EHD2-scTNFR2는 이합체화 도메인 EHD2에 융합된 돌연변이 D143N/A145R(서열번호: 2에 제시되고 서열번호: 1과 관련하여 각각 D219N 및 A221R에 해당하는 가용성 TNF에 대한 잔기 넘버링; 이들 돌연변이는 TNFR1에 대한 친화성을 제거함)이 있는 공유적으로 안정화된 인간 TNFR2 선택적 단쇄 TNF 삼량체를 함유하며, 이는 IgE의 중쇄 CH2 도메인으로부터 유래되고 육량체 TNF 도메인을 함유하는 디설파이드 결합된 이량체를 생성한다.Selective inhibition of TNFR1 or selective activation of TNFR2 was achieved by ATROSAB (antagonistic TNF receptor monospecific antibody), TNFR1-selective antagonistic IgG1 antibody, or EHD2-scTNF R2 , an agonistic TNFR2-selective antibody, in a mouse model of NMDA-induced acute neurodegeneration. demonstrated by TNF muteins (i.e., mutant proteins). EHD2-scTNF R2 is the mutation D143N/A145R fused to the dimerization domain EHD2 (residue numbering for soluble TNF shown in SEQ ID NO: 2 and corresponding to D219N and A221R with respect to SEQ ID NO: 1, respectively; these mutations are ), which produces a disulfide-linked dimer derived from the heavy chain C H 2 domain of IgE and containing a hexameric TNF domain. .
NMDA와 ATROSAB, 또는 NMDA와 EHD2-scTNFR2를 핵 기저부 대뇌세포에 동시에 주입하면 생체 내 마우스 모델에서 대조군에 비해 중요하지만 불완전한 신경 보호 효과가 나타난다. 이러한 반응의 불완전한 특성은 비정상적인 수용체 클러스터링 및 활성화를 유도하는 2가 항체의 부산물인 ATROSAB의 효능적 활성 때문이었다 (문헌[Richter 등 (2013) PLoS One 8(8):e72156]). 유사하게, EHD2-scTNFR2는 다중 융합 파트너 때문에 인간에서 면역원성이고 IgE 단편에 대한 면역 반응은 독성 연구에서 자가면역 반응을 초래한다 (예를 들어, 문헌[Weeratna 등 (2016) Immun . Inflamm. Dis . 4(2):135-147] 참조). 따라서, 이러한 한계를 극복하는 개선된 TNFR1 길항제 및 개선된 TNFR2 효능제가 필요하다. Simultaneous injection of NMDA and ATROSAB, or NMDA and EHD2-scTNF R2 into nucleus basal cerebral cells showed a significant but incomplete neuroprotective effect compared to the control group in an in vivo mouse model. The incomplete nature of this response was due to the agonistic activity of ATROSAB, a by-product of the bivalent antibody, which induces aberrant receptor clustering and activation (Richter et al. (2013) PLoS One 8(8):e72156]). Similarly, EHD2-scTNFR2 is immunogenic in humans because of its multiple fusion partners and an immune response to the IgE fragment results in an autoimmune response in toxicity studies (see, e.g., Weeratna et al. (2016) Immun . Inflamm. Dis . 4(2) :135-147). Thus, there is a need for improved TNFR1 antagonists and improved TNFR2 agonists that overcome these limitations.
3. 조절 T 세포(Treg) 및 자가면역 미세환경에서의 역할 3. Regulatory T cells (Tregs) and their role in the autoimmune microenvironment
조절 T 세포(Treg 세포 또는 Treg)는 사이토카인 생산을 통해 면역억제 특성을 가진 T 세포의 면역억제 하위 집단이다. 이들은 변환 성장 인자 베타, 인터루킨 35, 및 인터루킨 10을 포함한다. Treg 기능의 유도는 여러 병리를 억제할 수 있다. 유도는 이식 성공률을 강화시키고, 알러지를 억제하고, 중증 급성 호흡기 증후군과 같은 감염성 질환 및 자가면역에 대한 반응을 조절할 수 있다. Treg는 이펙터 T 세포(Teffs)의 유도 및 증식을 억제 및/또는 하향 조절하고, 면역계를 조절하고, 면역 항상성과 자가 항원에 대한 내성을 유지하고, 자가면역 질환 및 조직 파괴의 발병을 예방할 수 있다. Treg는 다른 마커 중에서 CD4, CTLA-4, CD25 (또한 IL-2 수용체 알파 사슬 또는 IL2RA로 알려져 있음), 및 FOXP3 (전사 인자 포크헤드 박스 P3)을 발현하고 TNFR1을 발현하는 것보다 10배 더 높은 밀도로 TNFR2를 발현한다. TNFR2는 최대 억제 서브세트인 Treg의 하위 집단에 의해서만 표현되고; 이 서브세트에는 TNFR2 발현 CD4+FoxP3+ Treg가 포함되어 있다. TNF는 TNFR2 신호전달을 통해 Treg 세포 증식, FoxP3 발현의 상향 조절 및 Treg 세포 억제 활동/기능을 촉진한다. 자가면역 미세환경은 면역억제성 CD4+ Treg보다 더 많은 자가반응성 CD8+ 이펙터 T 세포를 포함하여 조직 파괴를 일으킨다. 결과적으로 Treg를 확장하고 자가반응성 T 세포를 제거하는 TNFR2 기능의 보존 또는 강화된 TNFR2 기능은 면역 균형을 회복한다 (문헌[Sharma 등 (2018) Front Immunol . 9:883] 참조). 이러한 이유와 아래에 설명된 다른 이유로 인해, TNFR2 자극(효능작용)과 함께 TNFR1의 선택적 억제에 의한 Treg 기능의 약리학적 유지는 많은 급성 및 만성 염증성 병태(중증 급성 호흡기 증후군, 자가면역 질환)에서 결과를 개선할 것이다. Regulatory T cells (Treg cells or Tregs) are an immunosuppressive subpopulation of T cells that possess immunosuppressive properties through cytokine production. These are transforming growth factor beta, interleukins 35, and interleukin 10. Induction of Treg function can suppress several pathologies. Induction can enhance transplant success rates, suppress allergies, and modulate responses to autoimmunity and infectious diseases such as severe acute respiratory syndrome. Tregs can inhibit and/or downregulate the induction and proliferation of effector T cells (Teffs), modulate the immune system, maintain immune homeostasis and tolerance to self antigens, and prevent the development of autoimmune diseases and tissue destruction. . Tregs express CD4, CTLA-4, CD25 (also known as IL-2 receptor alpha chain or IL2RA), and FOXP3 (transcription factor forkhead box P3), among other markers, and express TNFR1 10-fold higher Density expresses TNFR2. TNFR2 is expressed only by a subpopulation of Tregs, the maximally suppressive subset; This subset contains TNFR2 expressing CD4 + FoxP3 + Tregs. TNF promotes Treg cell proliferation, upregulation of FoxP3 expression, and Treg cell suppressive activity/function through TNFR2 signaling. The autoimmune microenvironment contains more autoreactive CD8 + effector T cells than immunosuppressive CD4 + Tregs, resulting in tissue destruction. Consequently, preservation or enhanced TNFR2 function to expand Tregs and eliminate autoreactive T cells restores the immune balance (Sharma et al. (2018) Front Immunol . 9: 883]). For these reasons and others described below, pharmacological maintenance of Treg function by selective inhibition of TNFR1 in combination with TNFR2 stimulation (agonism) results in many acute and chronic inflammatory conditions (severe acute respiratory syndrome, autoimmune diseases). will improve
Treg에서 TNFR2의 발현을 상향 조절하는 것 외에도, TNF는 4-1BB 및 OX40과 같은 TNF 수용체 슈퍼패밀리(TNFRSF)의 다른 공동자극 구성원의 Treg 표면 발현을 상향 조절하여 Treg의 최적 활성화 및 증식을 초래하고 과도한 염증 반응을 약화시킨다. TNF의 중화(TNFR2 차단)는 Treg의 생체 내 확대를 차단한다 (예를 들어, 문헌[Hamano 등 (2011) Eur. J. Immunol. 41:2010-2020]).In addition to upregulating the expression of TNFR2 on Tregs, TNF upregulates Treg surface expression of other costimulatory members of the TNF receptor superfamily (TNFRSF), such as 4-1BB and OX40, resulting in optimal activation and proliferation of Tregs. Attenuates the excessive inflammatory response. Neutralization of TNF (blocking TNFR2) blocks expansion of Tregs in vivo (see, for example, Hamano et al. (2011) Eur. J. Immunol. 41:2010-2020]).
CD4+FoxP3- 기존 T 세포와 비교하여 CD4+FoxP3+ Treg는 구성적으로 TNFR2를 발현하여 Treg 세포 활성화, 확대 및 생존을 촉진한다. TNFR2를 통한 TNF 신호(즉, TNFR2 효능작용)는 Treg의 활성화 및 확대를 촉진하는 반면, TNFR2 길항작용은 Treg 수축을 초래한다. 예를 들어, TNFR2 효능작용은 자가면역 질환이 있는 인간과 자가면역의 동물 모델에서 자가반응성 T 세포를 선택적으로 죽이고 억제성 Treg를 확장한다. TNFR2 신호전달은 실험적 자가면역 뇌척수염(EAE; 다발성 경화증과 같은 염증성 CNS 탈수초 질환의 동물 모델) 및 뮤린 당뇨병 모델에서 Treg 세포 확대 및 억제 활성을 촉진하고 관용원성 수지상 세포에 의해 인간 항원 특이적 Treg 세포를 유도한다. TNFR2 결핍 Treg는 생체 내에서 실험적 결장장염을 예방하는 능력이 감소하고 Treg에서 지속적인 FoxP3 발현에 TNFR2가 필요하며 결과적으로 Treg의 표현형 및 기능적 안정성을 유지하기 위해 Treg의 생체 내 면역억제 기능에 TNFR2가 필요함을 나타낸다 (예를 들어, 문헌[McCann 등 (2014) Arthritis & Rheumatology 66(10):2728-2738; Faustman and Davis (2013) Front. Immunol. 4:478; Schmidt 등 (2013) Arthritis & Rheumatism 65(9):2262-2273; Vanamee 등 (2017) Trends in Molecular Medicine 23(11):P1037-P1046; Chen 등 (2013) J. Immunol . 190(3):1076-1084] 참조). 한 연구에서, 시험관 내에서 생산된 항원 특이적 Treg는 잘 확립된 항원 유도 관절염(AIA) 모델에서 질환을 억제하고 관절 염증과 뼈 파괴를 감소시키는 것으로 나타났고, 여기서 T 세포 매개 조직 손상을 유도하기 위해 메틸화 소 혈청 알부민 (mBSA)로 마우스를 면역화한다 (예를 들어, 문헌[Wright 등 (2009) Proc . Natl . Acad . Sci . USA 106(45):19078-19083] 참조). 세포 요법에 Treg를 사용하는 것은 유망하지만 제조 및 다른 합병증으로 인해 합병증 없이 Treg의 이점을 제공하는 전통적인 생물학적 치료제가 필요하다.Compared to CD4 + FoxP3 − conventional T cells, CD4 + FoxP3 + Tregs constitutively express TNFR2 to promote Treg cell activation, expansion and survival. TNF signaling through TNFR2 (i.e., TNFR2 agonism) promotes activation and expansion of Tregs, whereas TNFR2 antagonism results in Treg contraction. For example, TNFR2 agonism selectively kills autoreactive T cells and expands suppressive Tregs in humans with autoimmune disease and in animal models of autoimmunity. TNFR2 signaling promotes Treg cell expansion and suppressive activity in experimental autoimmune encephalomyelitis (EAE; an animal model of inflammatory CNS demyelinating diseases such as multiple sclerosis) and murine diabetes models and induces human antigen-specific Treg cells by tolerogenic dendritic cells. induce TNFR2-deficient Tregs have a reduced ability to protect against experimental colitis in vivo, and TNFR2 is required for sustained FoxP3 expression in Tregs, and consequently, TNFR2 is required for the immunosuppressive function of Tregs in vivo to maintain their phenotypic and functional stability. (See, for example, McCann et al. (2014) Arthritis & Rheumatology 66(10):2728-2738; Faustman and Davis (2013) Front. Immunol . 4:478; Schmidt et al. (2013) Arthritis & Rheumatism 65(9):2262-2273; Vanamee et al. (2017) Trends in Molecular Medicine 23(11):P1037-P1046; Chen et al. (2013) J. Immunol . 190(3):1076-1084). In one study, antigen-specific Tregs produced in vitro were shown to suppress disease and reduce joint inflammation and bone destruction in a well-established model of antigen-induced arthritis (AIA), where they were shown to induce T cell-mediated tissue damage. To immunize mice with methylated bovine serum albumin (mBSA) (see, e.g., Wright et al. (2009) Proc . Natl . Acad . Sci . USA 106(45):19078-19083). Although the use of Tregs in cell therapy is promising, manufacturing and other complications require traditional biotherapeutic agents that deliver the benefits of Tregs without complications.
본 명세서에 기재되고 제공된 바와 같이, TNFR2 및 Treg에 의한 그의 발현은 염증성 및 자가면역 질환 및 병태의 억제에 필요하다. 예를 들어, 마이코박테리움 보비스 바실러스 칼메트r-Guerin (BCG)은 Treg의 일시적 확대를 유도한다. 임상 시험에서, BCG는 I형 당뇨병 환자에서 Treg 생산을 유발하여 질환을 억제하고 소도 섬세포 기능을 일시적으로 회복시켰으며, 이는 I형 당뇨병 치료에서 Treg 기능을 강화시키는 Treg 및/또는 조절제의 사용을 나타낸다 (예를 들어, 문헌[Spence 등 (2016) Curr Diab Rep 16(11):110. doi: 10.1007/s11892-016-0807-6] 참조). As described and provided herein, TNFR2 and its expression by Tregs are required for the suppression of inflammatory and autoimmune diseases and conditions. For example, Mycobacterium bovis Bacillus calmetr-Guerin (BCG) induces transient expansion of Tregs. In a clinical trial, BCG induced Treg production in patients with type I diabetes, suppressed the disease and temporarily restored islet cell function, indicating the use of Treg and/or modulators to enhance Treg function in the treatment of type I diabetes. (See, e.g., Spence et al. (2016) Curr Diab Rep 16(11):110. doi : 10.1007/s11892-016-0807-6).
Treg 기능의 조절이 염증성 및 자가면역 질환 및 병태의 예방 또는 치료를 위한 치료적 접근법을 제시한다는 것이 본 명세서에 기재되고 확립된다. 그러나 Treg는 혈액 내 총 CD4+ T 세포의 ~1-5%만 구성한다. 그의 낮은 숫자는 그들의 임상적 사용을 방해한다. Treg의 생체 외 생성 및/또는 생체 내 생산 자극은 치료 용도를 제한하는 요인이다. 예를 들어, IL-2, 항-CD3 또는 항-CD28을 사용한 생체 내 자극은 너무 독성이 강한 반면, 이러한 제제를 사용한 생체 외 자극은 염증유발 사이토카인을 방출할 수 있고 길항 특성을 가질 수 있는 이종 CD4+ 집단을 생성한다. 대안적인 접근법은 자연 발생 TNF 수용체 슈퍼패밀리 효능제인 TL1A-Ig 또는 TNFR2 단클론성 항체 효능제를 사용하여 각각 생체 내 및 생체 외에서 Treg를 확장하였다. 본 명세서에 제공되는 TNFR2 효능제 작제물 및 다중특이적 작제물은 항-TNFR1 활성의 치료적 활성을 방해하지 않으면서 생체내에서 Treg 집단을 보존 및/또는 확장할 수 있다. 본 명세서에 기재되고 제공된 바와 같이, 염증성 TNFR1 활성의 선택적 억제는 TNFR2 연관 Treg 억제 활성을 유지 또는 증가시키면서 염증성 및 자가면역 질환 및 병태의 치료에 유익하다. 이러한 질환 및 병태는 RA, I형 당뇨병, 심부전 및 다발성 경화증을 포함하지만 이에 제한되지 않다 (예를 들어, 문헌[Goodall 등 (2015) PLoS ONE 10(9):e0137065] 참조). It is described and established herein that modulation of Treg function represents a therapeutic approach for the prevention or treatment of inflammatory and autoimmune diseases and conditions. However, Tregs constitute only ~1-5% of total CD4+ T cells in the blood. Their low numbers prevent their clinical use. Stimulation of ex vivo and/or in vivo production of Tregs is a limiting factor for their therapeutic use. For example, in vivo stimulation with IL-2, anti-CD3 or anti-CD28 is too toxic, whereas ex vivo stimulation with these agents can release pro-inflammatory cytokines and may have antagonistic properties. Generate a heterogeneous CD4 + population. An alternative approach has been to expand Tregs in vivo and ex vivo using naturally occurring TNF receptor superfamily agonists, TL1A-Ig or TNFR2 monoclonal antibody agonists, respectively. TNFR2 agonist constructs and multispecific constructs provided herein can preserve and/or expand Treg populations in vivo without interfering with the therapeutic activity of anti-TNFR1 activity. As described and provided herein, selective inhibition of inflammatory TNFR1 activity is beneficial in the treatment of inflammatory and autoimmune diseases and conditions while maintaining or increasing TNFR2-associated Treg suppressive activity. Such diseases and conditions include, but are not limited to, RA, type I diabetes, heart failure, and multiple sclerosis (see, e.g., Goodall et al. (2015) PLoS ONE 10(9):e0137065).
종양 미세환경(TME)에서는, TNFR2+ Treg의 확대가 조직 파괴를 방지하는 자가면역 미세환경과 달리, 종양은 많은 수의 면역억제성 TNFR2+ Treg에 의해 침윤되어 종양 사멸 CD8+ 세포독성 T 림프구(CTL)(이펙터 T 세포(Teffs)라고도 함)의 증식을 방지하여 종양 성장을 허용한다. TME에서 림프구에 대한 TNFR2의 길항작용은 Treg를 억제하거나 제거하고 종양 성장이 제어되거나 역전될 수 있는 상태인 이펙터 T 세포의 활성화 및 확대를 허용함으로써 두 가지 유형의 T 세포 사이의 균형을 회복한다. 치료제로 유용하려면, TNFR2 억제제는 다음 두 가지 이유로 ADCC를 통해 면역 세포를 응집시키는 능력을 갖지 않아야 한다: 1) 응집은 일시적으로 TNFR2 매개 면역억제의 '슈퍼 유도'를 야기하고; 2) 결국 Treg의 전신 고갈로 이어지며, 이는 면역 항상성을 유지하기 위해 기저 수준의 Treg 활성을 유지하는 것이 필수적이기 때문에 환자에게 해로울 것이다. 종양 세포 및 골수 유래 억제 세포(MDSC)도 TNFR2를 발현하고 MDSC 내의 TNFR2의 억제는 뮤린의 간암 모델에서 볼 수 있듯이 전이를 제어한다. 따라서, 본 명세서에 제공된 바와 같은 비-응집 길항적 항체 또는 다른 치료제의 사용을 통한 것과 같은 TNFR2의 차단은 면역억제성 Treg의 억제를 통해 특정 유형의 암에 대한 유용한 치료를 제시한다. 그러나 TNFR2 길항제는 면역조직화학으로부터 판단한 바와 같이 인접한 정상 조직에 비해 종양에서 TNFR2가 과발현되는 환자에게만 투여해야 한다. 따라서, 그러한 치료는 과발현을 확인하기 위한 진단을 동반해야 한다 (예를 들어, 예시적인 검정을 위해, 문헌[Zhang 등 (2019) Thorac Cancer 10(3):437-444. doi:10.1111/1759-7714.12948; Yang 등 (2017) Oncol Lett .14(2):2393-2398. doi:10.3892/ol.2017.6410; 및 Yang 등 (2018) Oncol Lett. 16(3):2971-2978. doi:10.3892/ol.2018.8998] 참조). In the tumor microenvironment (TME), unlike the autoimmune microenvironment where expansion of TNFR2 + Tregs prevents tissue destruction, tumors are infiltrated by large numbers of immunosuppressive TNFR2 + Tregs, resulting in tumor-killing CD8 + cytotoxic T lymphocytes ( CTLs) (also called effector T cells (Teffs)) to allow tumor growth. In the TME, TNFR2's antagonism on lymphocytes restores the balance between the two types of T cells by suppressing or eliminating Tregs and allowing the activation and expansion of effector T cells, a condition in which tumor growth can be controlled or reversed. To be useful as therapeutics, TNFR2 inhibitors must not have the ability to aggregate immune cells via ADCC for two reasons: 1) aggregation transiently causes 'super induction' of TNFR2-mediated immunosuppression; 2) eventually leading to systemic depletion of Tregs, which would be detrimental to patients as maintaining basal levels of Treg activity is essential to maintain immune homeostasis. Tumor cells and myeloid-derived suppressor cells (MDSCs) also express TNFR2, and inhibition of TNFR2 in MDSCs controls metastasis as seen in murine liver cancer models. Thus, blockade of TNFR2, such as through the use of non-aggregation antagonistic antibodies or other therapeutic agents as provided herein, through suppression of immunosuppressive Tregs, represents a useful treatment for certain types of cancer. However, TNFR2 antagonists should only be administered to patients with overexpression of TNFR2 in the tumor compared to adjacent normal tissue, as judged by immunohistochemistry. Thus, such treatment should be accompanied by a diagnosis to confirm overexpression (see, e.g., Zhang et al. for an exemplary assay). (2019) Thorac Cancer 10(3): 437-444. doi:10.1111/1759-7714.12948; Yang et al. (2017) Oncol Lett.14 (2) :2393-2398. doi:10.3892/ol.2017.6410; and Yang et al. (2018) Oncol Lett. 16(3) :2971-2978. doi:10.3892/ol.2018.8998).
4. TNF에 의해 매개되거나 그를 수반하는 자가면역/염증성 질환 4. Autoimmune/inflammatory diseases mediated by or accompanying TNF
TNF의 상승된 수준 또는 제어되지 않은 발현 및 TNF 신호전달의 탈조절은 만성 염증을 유발할 수 있으며, 이는 자가면역 질환 및 조직 손상의 발병을 초래할 수 있다. TNF-α는 수많은 질환, 장애 및 병태에 관여한다. 본 명세서에 제공되는 작제물은 이러한 질환, 장애 및 병태의 치료를 위해 사용될 수 있다. 하기 논의는 TNF 차단이 치료 효과를 가질 수 있는 일부 예시적인 질환, 장애 및 병태를 기재한다. 에타네르셉트, 인플릭시맙, 아달리무맙, 세르톨리주맙 및 골리무맙과 같은 TNF 차단제는 이러한 질환, 장애 및 병태의 치료에 사용을 제한할 수 있는 부작용이 있다. 이러한 역효과 중 일부 또는 전부를 피하는 본 명세서에 제공된 작제물은 이러한 질환, 장애 및 병태를 치료하는 데 사용될 수 있다 (예를 들어, 질환에서 TNF의 역할과 그 치료를 위한 TNF 차단제의 사용에 대한 검토를 위해, 문헌[Lis 등 (2014) Arch Med Sci.10(6):1175-1185] 참조). Elevated levels or uncontrolled expression of TNF and deregulation of TNF signaling can lead to chronic inflammation, which can lead to the development of autoimmune diseases and tissue damage. TNF-α is involved in numerous diseases, disorders and conditions. Constructs provided herein can be used for the treatment of these diseases, disorders and conditions. The discussion below describes some exemplary diseases, disorders and conditions for which TNF blockade may have a therapeutic effect. TNF blockers such as etanercept, infliximab, adalimumab, certolizumab and golimumab have side effects that may limit their use in the treatment of these diseases, disorders and conditions. Constructs provided herein that avoid some or all of these adverse effects can be used to treat such diseases, disorders and conditions (e.g., a review of the role of TNF in disease and the use of TNF blockers for its treatment). For, Lis et al. (2014) Arch Med Sci.10(6) :1175-1185).
염증성 질환에는 염증을 특징으로 하는 다수의 장애 및 병태가 포함되며 자가면역 질환이 포함된다. 면역계는 바이러스 및 박테리아와 같은 미생물의 침입에 대한 반응으로 항체를 생성하거나 림프구를 활성화하여 신체를 보호한다. 건강한 개체에서, 면역계는 신체 자체(즉, "자기") 세포에 대한 반응을 유발하지 않고; 자가면역 질환은 면역체가 건강한 비-침습적 자기, 세포 및 조직을 공격할 때 발생한다. 상승된 TNF 수준과 연관된 자가면역/염증성 질환 및 장애는 예를 들어 그 중에서도 예를 들어, 관절염 (예를 들어, 류마티스성 관절염, 건선성 관절염, 소아 특발성 관절염, 척추관절염), 염증성 장 질환 (예를 들어, 크론병 및 궤양성 대장염), 포도막염, 섬유성 질환, 자궁내막증, 루푸스, 강직 척추염, 건선, 다발성 경화증 (MS), 파킨슨병, 및 알츠하이머병을 포함한다. 본 명세서에 제공된 작제물로 치료될 수 있는 예시적인 자가면역 및 염증성 질환 및 장애가 하기에 논의된다. Inflammatory diseases include a number of disorders and conditions characterized by inflammation and include autoimmune diseases. The immune system protects the body by producing antibodies or activating lymphocytes in response to invasion by microorganisms such as viruses and bacteria. In a healthy individual, the immune system does not trigger a response against the body's own (ie, “self”) cells; Autoimmune diseases occur when the immune system attacks healthy non-invasive self, cells and tissues. Autoimmune/inflammatory diseases and disorders associated with elevated TNF levels include, for example, arthritis (eg, rheumatoid arthritis, psoriatic arthritis, juvenile idiopathic arthritis, spondyloarthritis), inflammatory bowel disease (eg, among others) eg, Crohn's disease and ulcerative colitis), uveitis, fibrotic disease, endometriosis, lupus, ankylosing spondylitis, psoriasis, multiple sclerosis (MS), Parkinson's disease, and Alzheimer's disease. Exemplary autoimmune and inflammatory diseases and disorders that can be treated with the constructs provided herein are discussed below.
a. 관절염a. arthritis
류마티스성 관절염 및 다른 유형의 관절염rheumatoid arthritis and other types of arthritis
류마티스성 관절염(RA)은 만성 자가면역 염증성 질환이다. 류마티스성 관절염과 연관된 염증은 관절의 내벽(즉, 활막 내벽)에 영향을 미치며 혈관, 심장 내벽의 막에도 염증이 생길 수 있다. RA는 면역 세포(예를 들어, 활성화 B-세포)의 활막으로의 침윤 및 활막 세포 증식을 특징으로 하며, 이는 활막 내벽을 두껍게 만든다. 판누스(pannus)로 알려진 증식성 덩어리는 연골과 뼈를 침범하고 파괴하여 관절 구조와 기능을 비가역적으로 파괴한다. 이것은 TNF, IL-1 및 IL-6과 같은 염증유발 사이토카인의 유도에 의해 매개된다. 종양 괴사 인자 α(TNFα)는 RA와 연관된 염증유발 활성의 유도 및 지속의 핵심 조절자이다. TNF는 활막액과 활막에서 과발현되며, TNFR의 발현은 활막에서 상향 조절된다 (예를 들어, 문헌[Bluml 등 (2012) International Immunology 24(5):275-281; Schmidt 등 (2013) Arthritis & Rheumatism 65(9):2262-2273; Keffer 등 (1991) EMBO J. 10(13):4025-4031] 참조). 본 명세서의 작제물로 치료될 수 있는 다른 유형의 관절염은 예를 들어 건선성 관절염, 소아 특발성 관절염 및 척추관절염을 포함한다.Rheumatoid arthritis (RA) is a chronic autoimmune inflammatory disease. Inflammation associated with rheumatoid arthritis affects the lining of joints (i.e., the synovial lining) and may also inflame the membranes lining blood vessels and the heart. RA is characterized by infiltration of immune cells (eg, activated B-cells) into the synovial membrane and proliferation of synovial cells, which causes the synovial lining to thicken. A proliferative mass known as a pannus invades and destroys cartilage and bone, irreversibly destroying joint structure and function. This is mediated by the induction of pro-inflammatory cytokines such as TNF, IL-1 and IL-6. Tumor necrosis factor α (TNFα) is a key regulator of the induction and persistence of pro-inflammatory activity associated with RA. TNF is overexpressed in synovial fluid and synovial membrane, and expression of TNFR is upregulated in synovial membrane (see, e.g., Bluml et al. (2012) International Immunology 24(5):275-281; Schmidt et al. (2013) Arthritis & Rheumatism 65(9):2262-2273; Keffer et al. (1991) EMBO J. 10(13):4025-4031). Other types of arthritis that can be treated with the constructs herein include, for example, psoriatic arthritis, juvenile idiopathic arthritis and spondyloarthritis.
b. 염증성 장 질환(IBD) 및 포도막염b. Inflammatory bowel disease (IBD) and uveitis
염증성 장 질환(IBD)에는 장과 결장의 염증성 질환인 크론병과 궤양성 대장염이 포함된다. TNF를 과발현하는 마우스는 크론병과 유사한 장 염증을 일으키는 반면, TNFR1 결핍은 크론병을 보호한다 (예를 들어, 문헌[Fischer 등 (2015) Antibodies 4:48-70] 참조). Inflammatory bowel disease (IBD) includes Crohn's disease and ulcerative colitis, which are inflammatory diseases of the intestine and colon. Mice overexpressing TNF develop intestinal inflammation similar to Crohn's disease, whereas TNFR1 deficiency protects against Crohn's disease (see, e.g., Fischer et al. (2015) Antibodies 4:48-70).
포도막염은 망막과 공막(눈의 흰자위) 사이의 중간층인 안구벽(포도막)에 영향을 미치는 눈 염증의 한 형태이며 시력 상실로 이어질 수 있다. TNF-알파는 그 병리생리학에 관련되어 있으며 TNF 차단제가 치료에 사용되어 왔다.Uveitis is a form of eye inflammation that affects the eye wall (uvea), the middle layer between the retina and the sclera (the white of the eye), and can lead to vision loss. TNF-alpha has been implicated in its pathophysiology and TNF blockers have been used for treatment.
c. 섬유성 질환c. fibrotic disease
본 명세서의 작제물은 섬유성 질환의 치료에 사용될 수 있다. 듀피트렌(Dupuytren)병은 그러한 질환의 예이다. 듀피트렌병(DD)은 손가락의 돌이킬 수 없는 굴곡 구축을 특징으로 하는 손의 일반적인 섬유성 질환이고; 이 병태는 손바닥으로 제한되며 손가락이 돌이킬 수 없이 구부러져 손 기능이 심각하게 손상된다. 초기 단계의 질환에 대해 승인된 요법은 없고, 이 결절은 한동안 정지하였다가 활성화되어 척수 및 손가락의 굴곡 기형으로 진행되어 손 기능의 상실을 초래한다. 치료에는 병든 조직 또는 척수의 외과적 절제(근막절개) 또는 콜라게나제 또는 바늘 근막절개를 사용한 척수 파괴가 포함된다. 외과적 및 비-외과적 치료는 재발률과 합병증이 높다. 질환의 초기 단계에서 척수 발달로의 진행과 그에 따른 손가락의 굴곡 구축을 방지하기 위한 치료적 개입이 유리하다 (예를 들어, 문헌[Nanchahal 등 (2018) EBioMedicine 33:282-288] 참조). The constructs herein may be used for the treatment of fibrotic diseases. Dupuytren's disease is an example of such a disease. Dupuytren's disease (DD) is a common fibrotic disease of the hand characterized by irreversible flexion contractures of the fingers; This condition is limited to the palm and irreversibly bends the fingers, severely impairing hand function. There is no approved therapy for the disease in its early stages, and the nodules become dormant for a time and then become active, progressing to spinal cord and flexion deformities of the fingers, resulting in loss of hand function. Treatment includes surgical removal of the diseased tissue or spinal cord (myofasnotomy) or destruction of the spinal cord using collagenase or needle fasciotomy. Surgical and non-surgical treatments have high rates of recurrence and complications. In the early stages of the disease, therapeutic intervention to prevent progression to spinal cord development and consequent flexion contracture of the fingers is advantageous (see, e.g., Nanchahal et al. (2018) EBioMedicine 33:282-288).
수축성 단백질 α-평활근 액틴(α-SMA)을 발현하고 결절에 응집하는 근섬유아세포는 과도한 콜라겐성 세포외 기질을 축적하고 DD를 포함한 모든 섬유증 병태에서 재형성 및 수축을 담당한다. TNF는 Wnt 신호전달 경로를 통해 DD 환자의 손바닥 섬유아세포를 근섬유아세포로 전환하고, DD 근섬유아세포는 항-TNF 요법으로 치료한 후 용량 의존적 수축성 감소 및 α-SMA 및 프로-콜라겐 발현 감소를 나타낸다. 완전 인간화 IgG mAb인 아달리무맙 및 골리무맙을 사용한 치료가 가장 효과적이었다. 그러나 아달리무맙과 같은 항-TNF 요법의 사용은 감염 위험 증가와 연관이 있으며, DD에서 아달리무맙의 치료 효능을 평가하는 2a상 시험에서 1명의 환자(아달리무맙을 투여받은 21명 중)에서 입원이 필요한 상처 감염이 발생하였다 (예를 들어, 문헌[Nanchahal 등 (2018) EBioMedicine 33:282-288] 참조). 따라서 다른 요법이 필요하다.Myofibroblasts that express the contractile protein α-smooth muscle actin (α-SMA) and aggregate to nodules accumulate excess collagenous extracellular matrix and are responsible for remodeling and contraction in all fibrotic conditions, including DD. TNF converts palmar fibroblasts of DD patients to myofibroblasts through the Wnt signaling pathway, and DD myofibroblasts show a dose-dependent decrease in contractility and decreased expression of α-SMA and pro-collagen after treatment with anti-TNF therapy. Treatment with the fully humanized IgG mAbs adalimumab and golimumab was most effective. However, use of anti-TNF therapies such as adalimumab is associated with an increased risk of infection, and 1 patient (of 21 patients receiving adalimumab) in a phase 2a trial evaluating the therapeutic efficacy of adalimumab in DD developed wound infections requiring hospitalization (see, e.g., Nanchahal et al. (2018) EBioMedicine 33:282-288]). Therefore, other therapies are needed.
d. 종양 괴사 인자 수용체 연관 주기성 증후군(TRAPS)d. Tumor Necrosis Factor Receptor Associated Cyclic Syndrome (TRAPS)
종양 괴사 인자 수용체 연관 주기 증후군(TRAPS)은 제2로 흔한 선천적 상염색체 우성 자가염증성 질환이며 TNFR1을 인코딩하는 TNFRSF1A 유전자의 돌연변이로 인해 발생한다. TRAPS는 이유 없이 주기적으로 오래 지속되는 발열, 전신 염증, 복통, 피부 병변, 결막염, 근육통 및 심막염을 특징으로 하며 염증성 발작은 최대 몇 주 동안 지속된다. TRAPS의 보다 심각한 임상적 표현형과 연관된 합병증은 AA형 혈청 아밀로이드증이며, 이는 신장 손상 및 신부전을 초래할 수 있다. 질환 발병은 일반적으로 초기 소아기에 발생하지만 TRAPS는 성인에게도 나타날 수 있다. TRAPS 연관 돌연변이의 대부분은 리간드 결합에 관여하는 TNFR1의 세포외 도메인에서 발생한다. 가장 심각한 임상적 표현형과 연관된 고침투 돌연변이는 세포외 시스테인 풍부 도메인 (CRD)에서 발생한다. 돌연변이는 TNFR1의 폴딩 및 2차 구조에 영향을 미쳐 결함이 있는 TNFR1 트래피킹, 변경된 리간드 결합 친화도, 감소된 활성화 유도 쉐딩 및 손상된 세포 신호전달을 초래할 수 있다. 예를 들어, TNFR1의 리간드 독립적인 기능 획득은 TRAPS 병태생리학을 유도하고 특정 돌연변이는 TNFR1, NF-κB 및 카스파제 1의 구성적 활성을 초래한다. 에타네르셉트, 인플릭시맙 등을 포함하는 전통적인 항-TNF 요법은 TRAPS 치료에 부분적으로만 효과적이고(예를 들어, 문헌[Greco 등 (2015) Arthritis Research & Therapy 17:93] 참조), 따라서 다른 요법이 필요하다. Tumor necrosis factor receptor-associated periodic syndrome (TRAPS) is the second most common congenital autosomal dominant autoinflammatory disease and is caused by mutations in the TNFRSF1A gene, which encodes TNFR1. TRAPS is characterized by periodic, long-lasting fever, systemic inflammation, abdominal pain, skin lesions, conjunctivitis, myalgia, and pericarditis, inflammatory attacks lasting up to several weeks. A complication associated with the more severe clinical phenotype of TRAPS is type AA serum amyloidosis, which can lead to renal damage and renal failure. Disease onset usually occurs in early childhood, but TRAPS can also appear in adults. Most of the TRAPS-associated mutations occur in the extracellular domain of TNFR1 involved in ligand binding. High penetrance mutations associated with the most severe clinical phenotypes occur in the extracellular cysteine rich domain (CRD). Mutations can affect the folding and secondary structure of TNFR1 resulting in defective TNFR1 trafficking, altered ligand binding affinity, reduced activation-induced shedding and impaired cell signaling. For example, ligand-independent gain of function of TNFR1 leads to TRAPS pathophysiology and certain mutations result in constitutive activity of TNFR1, NF-κB and
e. TNF에 의해 매개되거나 그를 수반하는 다른 질환e. Other diseases mediated by or involving TNF
i. 신경퇴행 질환i. neurodegenerative disease
노화 및 여러 신경퇴행 질환은 중추신경계(CNS)의 TNF 수준 상승과 연관이 있다. TNF는 신경염증을 시작하고 유지하며 시냅스 기능 및 가소성과 같은 다른 신경학적 과정을 조절하는 것과 관련이 있다. 노화된 랫트의 해마에 있는 TNFR1 수준은 TNFR2 수준에 비해 약 3배 더 높다. 질환의 동물 모델에서, TNF는 TNFR1에 대한 작용을 통해 만성 신경교 활성화 및 손상된 신경 생존력에 연루되어 있다. 노화된 동물에서 신경학적 변화에는 시냅스 기능장애 및 Ca2 + 조절 장애가 포함되며, 이는 건강한 어린 동물과 TNF의 인공 상승을 사용한 신경 배양에서 복제될 수 있다. TNF는 또한 L형 전압 민감성 Ca2 + 채널(L-VSCC)의 활성을 강화하고; 유사한 효과가 기억 장애가 있는 노화 랫트의 해마 뉴런에서 관찰된다. 랫트를 대상으로 한 연구에서 소뇌의 TNF 차단이 지연된 눈 깜박임 작업에서 학습을 가속화하는 것으로 나타났다. TNFR1 신호전달을 우선적으로 억제하는 가용성 우성 음성 TNF(DN-TNF)인 XPro1595를 사용하여 TNFR1 신호전달을 선택적으로 차단하면, 결과적으로 모리스 수영 과제에서 행동 수행이 개선되었고 소교세포 활성화가 감소했으며 해마 장기 우울증(LTD)이 예방되었으며 CA1 뉴런에서 L-VSCC의 활성이 감소하였다. 이러한 결과는 TNFR1을 통한 TNF 신호전달이 노화된 동물의 신경학적 표현형을 변형하는 것과 연관되어 있으며 신경적 질환과 연관된 병리학적 변화를 초래할 수 있음을 나타낸다. (예를 들어, 문헌[Sama 등 (2012) PLoS ONE 7(5):e38170] 참조). Aging and several neurodegenerative diseases are associated with elevated levels of TNF in the central nervous system (CNS). TNF is involved in initiating and maintaining neuroinflammation and regulating other neurological processes such as synaptic function and plasticity. The level of TNFR1 in the hippocampus of aged rats is approximately 3-fold higher than that of TNFR2. In animal models of the disease, TNF has been implicated in chronic glial activation and impaired neuronal viability through its action on TNFR1. Neurological changes in aged animals include synaptic dysfunction and Ca 2+ dysregulation, which can be replicated in healthy young animals and in neuronal cultures using artificial elevations of TNF. TNF also enhances the activity of L-type voltage-sensitive Ca 2+ channels (L-VSCC); A similar effect is observed in hippocampal neurons of aging rats with memory impairment. A study in rats showed that TNF blockade in the cerebellum accelerated learning on a delayed eye-blink task. Selective blockade of TNFR1 signaling using XPro1595, a soluble dominant-negative TNF (DN-TNF) that preferentially inhibits TNFR1 signaling, resulted in improved behavioral performance in the Morris swim task, reduced microglia activation, and hippocampal long-term Depression (LTD) was prevented and the activity of L-VSCC in CA1 neurons was reduced. These results indicate that TNF signaling through TNFR1 is involved in modifying the neurological phenotype of aged animals and can lead to pathological changes associated with neurological diseases. (See, e.g., Sama et al. (2012) PLoS ONE 7(5):e38170).
a) 알츠하이머병a) Alzheimer's disease
TNF는 염증 반응의 중심 역할을 하고; TNF 단백질 수준은 건강한 뇌에서는 낮지만 알츠하이머병(AD)을 비롯한 많은 신경염증성 질환에서는 만성적으로 증가한다. AD의 동물 모델에서, TNF는 소교세포 활성화, 시냅스 기능장애, 신경 세포자멸, 플라크 및 엉킴의 축적 및 인지력 감퇴를 촉진한다. 예를 들어, 프레세닐린 1, 아밀로이드 전구체 단백질(APP) 및 타우에 돌연변이가 있는 삼중 형질전환 AD 마우스 모델(3xTg-Ad)에서, TNF 수준은 내후각 피질에서 증가했으며 이는 병리학의 초기 출현과 일치하였다 (예를 들어, 문헌[McCoy 등 (2006) J. Neurosci . 26(37):9365-9375] 참조). TNF 주도 공정은 AD 병리에 연루되어 있으며 인지 기능장애 및 AD 진행 가속화에 기여한다. 염증 및 TNF 생성을 유도하는 박테리아 내독소 지질다당류(LPS)는 AD의 여러 동물 모델에서 AD 병리의 출현 및 중증도를 가속화한다. AD 뇌의 아밀로이드 플라크와 밀접하게 물리적으로 연관되어 있는 소교세포가 만성적으로 활성화될 때 TNF를 포함한 염증유발 매개체의 과잉 생산이 뇌에서 발생한다. 높은 수준의 TNF는 AD 환자의 뇌에서 아밀로이드 베타(Aβ)의 식균작용을 억제하여 소교세포에 의한 효율적인 플라크 제거를 방해한다. XENP345와 같은 DN-TNF 또는 DN-TNF를 인코딩하는 렌티바이러스를 투여하여 solTNF를 만성적으로 억제하면, AD 동물 모델(3xTgAD 마우스)에서 만성 전신 염증에 의해 유발되는 AD 유사 병리학의 가속화를 예방하고, 해마, 피질 및 편도체에서 6E10-면역반응성 단백질, 특히 C-말단 아밀로이드 전구체 단백질(APP) 단편(β-CTF)의 LPS 유래된 신경내 축적을 감소시켰다. 3xTgAD 마우스에서 TNFR1의 유전적 결실은 또한 신경독성인 β-CTF의 LPS 유도 축적을 방지한다. 패밀리성 AD(FAD) 돌연변이를 지닌 신경 세포는 β-CTF를 세포 내로 축적하여 AD의 병인에 관여함을 암시한다. 이러한 결과는 가용성 TNF가 3xTgAD 마우스의 초기 플라크 전 병리에 대한 신경염증 효과의 매개체이며 중추신경계(CNS)에서 solTNF의 표적 억제가 아밀로이드 연관 병리, 인지 결핍 및 AD에서 뉴런의 진행성 손실의 출현을 늦출 수 있다 (예를 들어, 문헌[McAlpine 등 (2009) Neurobiol. Dis. 34(1):163-177] 참조). TNF plays a central role in the inflammatory response; TNF protein levels are low in the healthy brain but are chronically elevated in many neuroinflammatory diseases, including Alzheimer's disease (AD). In animal models of AD, TNF promotes microglial activation, synaptic dysfunction, neuronal apoptosis, accumulation of plaques and tangles, and cognitive decline. For example, in a triple transgenic AD mouse model (3xTg-Ad) harboring mutations in
b) 파킨슨병 b) Parkinson's disease
파킨슨병(PD)은 미국에서 제2로 흔한 신경퇴행 질환으로 65세 이상의 개인에서 발생률이 5%이다. 파킨슨병의 임상 증상은 복측 중뇌 흑질 치밀부(SNpc)에서 도파민성 뉴런의 선택적 손실로 인해 발생하며, 이는 선조체 도파민의 감소를 초래한다. PD 환자의 뇌척수액(CSF) 및 사후 뇌와 PD 동물 모델은 높은 수준의 TNF를 나타낸다. 일본의 초기 발병 PD 환자의 코호트는 TNF 유전자 프로모터에서 다형성 대립유전자(-1031C)의 빈도가 증가하여 더 높은 전사 활성과 높은 TNF 수준을 초래하는 것으로 나타났다. TNFR1은 흑색선조체 도파민성 뉴런에서 고도로 발현되어 TNF 유도 신경염증 및 도파민 뉴런 독성에 대한 취약성을 증가시킨다. 우성 음성 TNF 뮤테인 (XENP345)에 의한 가용성 TNF(solTNF)의 생체 내 중화는 신경보호적이며, 산화성 신경독소 6-하이드록시도파민(6-OHDA)의 선조체 주입으로 유래된 역행성 흑색질 변성을 50%까지 감소시키고, 랫트의 암페타민 유도 회전 행동이 약화되어 선조체 도파민 수준이 보존되었음을 나타낸다. LPS(lipopolysaccharide)에 노출된 배아 뮤린 중뇌 뉴런/교질 세포 배양에서 XENP345의 지연 투여는 지속적인 소교세포 활성화 및 solTNF의 분비에도 불구하고 도파민성 뉴런의 퇴행을 방지하였다. XENP345는 또한 시험관 내에서 6-OHDA로 유래된 도파민성 뉴런 독성을 약화시켰다. 따라서 TNF는 파킨슨병 발병과 관련이 있으며 특히 파킨슨병의 초기 단계에서 TNF 차단 치료제를 사용하여 인간의 흑질선조체 경로의 진행성 퇴행을 지연시키는 것이 가능할 수 있다 (예를 들어, 문헌[McCoy 등 (2006) J. Neurosci . 26(37):9365-9375] 참조). Parkinson's disease (PD) is the second most common neurodegenerative disease in the United States, with an incidence of 5% in individuals over the age of 65. Clinical symptoms of Parkinson's disease result from selective loss of dopaminergic neurons in the ventral midbrain substantia nigra compacta (SNpc), resulting in a decrease in striatal dopamine. Cerebrospinal fluid (CSF) and postmortem brains of PD patients and animal models of PD show high levels of TNF. A cohort of patients with early-onset PD in Japan showed an increased frequency of a polymorphic allele (-1031C) in the TNF gene promoter, resulting in higher transcriptional activity and higher TNF levels. TNFR1 is highly expressed in nigrostriatal dopaminergic neurons, increasing susceptibility to TNF-induced neuroinflammation and dopaminergic neuron toxicity. Neutralization of soluble TNF (solTNF) in vivo by a dominant-negative TNF mutein (XENP345) is neuroprotective and prevents retrograde substantia nigra degeneration induced by striatal injection of the oxidative neurotoxin 6-hydroxydopamine (6-OHDA) 50 %, and amphetamine-induced turning behavior in rats was attenuated, indicating preservation of striatal dopamine levels. In embryonic murine midbrain neuron/glia cultures exposed to LPS (lipopolysaccharide), delayed administration of XENP345 prevented dopaminergic neuron degeneration despite sustained microglia activation and solTNF secretion. XENP345 also attenuated 6-OHDA-induced dopaminergic neuronal toxicity in vitro. Thus, TNF is implicated in the pathogenesis of Parkinson's disease, and it may be possible to delay the progressive degeneration of the nigrostriatal pathway in humans using TNF-blocking therapeutics, particularly in the early stages of Parkinson's disease (see, e.g., McCoy et al. (2006) J. Neurosci . 26(37):9365-9375).
c) 다발성 경화증(MS)c) multiple sclerosis (MS)
형질전환 마우스에서 TNF의 CNS 특이적 과발현은 자발적인 탈수초화를 초래하며, 이는 다발성 경화증(MS)에서 TNF의 역할을 나타낸다. TNFR1을 인코딩하는 유전자의 다형성은 MS 발병의 증가된 감수성과 관련이 있다. TNFR1은 MS의 동물 모델인 실험적 자가면역 뇌척수염(EAE)의 질환 유도에 필요하며 TNFR2 결핍은 질환을 악화시킨다. 절단할 수 없는 막 결합 TNF를 발현하는 마우스는 EAE에 대해 보호되며, 이는 가용성 TNF와 TNFR1과의 상호작용이 질환 병리와 연관됨을 나타낸다 (예를 들어, 문헌[Fischer 등 (2015) Antibodies 4:48-70] 참조). CNS-specific overexpression of TNF in transgenic mice results in spontaneous demyelination, indicating a role for TNF in multiple sclerosis (MS). Polymorphisms in the gene encoding TNFR1 are associated with increased susceptibility to developing MS. TNFR1 is required for disease induction in experimental autoimmune encephalomyelitis (EAE), an animal model of MS, and TNFR2 deficiency exacerbates the disease. Mice expressing non-cleavable membrane-bound TNF are protected against EAE, indicating that the interaction of soluble TNF with TNFR1 is associated with disease pathology (see, e.g., Fischer et al. (2015) Antibodies 4:48-70).
ii. 자궁내막증 ii. endometriosis
TNF-α는 자궁내막증의 병리생리에 연루되어 있다. TNF-α 수준은 자궁내막증이 있는 여성의 복막액에서 증가하며, 수준은 질환의 중증도와 상관관계가 있다 (예를 들어, 문헌[Koninckx (2008) Hum Reprod . 23: 2017-2023] 참조). 복막액 TNF-α는 활성화된 복막 대식세포에 의해 국소적으로 생성되며, TNF-α는 복막 중피 세포에 의한 IL-8 분비를 유도한다. TNF-α 및 IL-8의 복막액 농도는 활성 복막 병변의 크기 및 수와 상관관계가 있다 (문헌[Bullimore, (2003) Med Hypotheses. 60:84-88]). 혈청 TNF-α 수준이 증가하고 자궁내막증 환자의 단핵구는 대조군의 단핵구에 비해 시험관 내에서 더 많은 TNF-α를 방출한다. MCP-1의 복막액 수준은 자궁내막증 환자에서 증가한다. TNF-α, IL-8 및 MCP-1은 자궁내막증 환자의 복막액에서 염증성 Th-1 유형 반응을 유도한다. TNF-α 매개 염증은 자궁내막증과 연관된 통증의 인과적 인자일 수 있다. TNF-α 차단은 동물 모델에서 질환의 발병을 억제하는 것으로 보이며 인간에게도 효과적일 수 있다. 기존 TNF 차단제의 유해한 부작용 때문에 이러한 차단제로 자궁내막증을 치료하는 것은 권장되지 않았다 (문헌[Koninckx (2008) Hum Reprod. 23: 2017-2023] 참조). 그러나 본 명세서에 제공된 작제물은 해로운 영향을 피하도록 설계되었으며 자궁내막증에서 TNF-α 매개 염증을 치료하기 위해 고려될 수 있다.TNF-α has been implicated in the pathophysiology of endometriosis. TNF-α levels are increased in the peritoneal fluid of women with endometriosis, and levels correlate with disease severity (see, eg, Koninckx (2008) Hum Reprod . 23 : 2017-2023). Peritoneal fluid TNF-α is produced locally by activated peritoneal macrophages, and TNF-α induces IL-8 secretion by peritoneal mesothelial cells. Peritoneal fluid concentrations of TNF-α and IL-8 correlate with the size and number of active peritoneal lesions (Bullimore, (2003) Med hypotheses. 60 :84-88]). Serum TNF-α levels are increased and monocytes from endometriosis patients release more TNF-α in vitro compared to monocytes from controls. Peritoneal fluid levels of MCP-1 are increased in endometriosis patients. TNF-α, IL-8 and MCP-1 induce an inflammatory Th-1 type response in the peritoneal fluid of endometriosis patients. TNF-α-mediated inflammation may be a causal factor in the pain associated with endometriosis. TNF-α blockade appears to inhibit the development of the disease in animal models and may be effective in humans as well. Treatment of endometriosis with these blockers is not recommended because of the harmful side effects of existing TNF blockers (Koninckx (2008) Hum Reprod. 23 : 2017-2023). However, the constructs provided herein are designed to avoid deleterious effects and can be considered for treating TNF-a mediated inflammation in endometriosis.
iii. 심혈관 질환iii. cardiovascular disease
TNFα는 인간 죽상경화판에서 확인된 최초의 사이토카인이었고; TNFα는 죽상동맥경화성 질환의 발병 초기에 발생하는 내피의 활성화 및 접착 분자의 상향 조절에 관여한다. TNF는 또한 지질 대사에 영향을 미치고 혈관 염증을 유발함으로써 죽상동맥경화증의 병인에 연루되어 있다. TNF 결합 단백질에 의한 TNFα 차단 또는 IL-1 수용체 길항제에 의한 IL-1 차단은 apoE 녹아웃 마우스를 죽상동맥경화증으로부터 부분적으로 보호한다. 죽종형성은 주로 골수 세포에 의한 TNFα 생산의 결과이다. 고지방 다이어트를 섭취한 apoE-/- 및 TNF-/- 마우스의 플라크 면적은 apoE-/-인 마우스의 플라크 면적 크기의 절반이다. apoE-/- 및 TNF-/- 마우스의 골수를 apoE-/- 마우스로 이식하면 죽상동맥경화성 병변 크기가 83% 감소하였다. 죽상동맥경화성 병변 크기는 또한 재조합 가용성 p55(TNFR1) TNF 차단제로 apoE-/- 마우스를 치료한 후 감소했으며, 이는 TNF가 죽상동맥경화증에서 수행하는 역할을 나타낸다. NF-κB 신호전달은 인간 죽상경화판에서 TNF-α의 생산에 관여한다. 심혈관 질환 환자의 말초 혈액 TNFα 수준도 심근경색의 발병과 관련이 있다. 심장독성은 주로 TNF 유도 심근세포 세포자멸에 기인한다. 심부전 치료를 위한 임상 시험에서 인플릭시맙 및 에타네르셉트와 같은 항-TNF 요법의 사용은 실패했으며 사망률이 증가하였고; 따라서 항-TNF 요법은 심혈관 질환의 치료에 대해 테스트되지 않았다 (예를 들어, 문헌[Udalova 등 (2016) Microbial Spectrum 4(4):MCHD-0022-2015; Kalliolias and Ivashkiv (2016) Nat. Rev. Rheumatol. 12(1):49-62] 참조). TNFα was the first cytokine identified in human atherosclerotic plaque; TNFα is involved in the activation of endothelium and the upregulation of adhesion molecules that occur in the early stages of atherosclerotic disease. TNF has also been implicated in the pathogenesis of atherosclerosis by influencing lipid metabolism and inducing vascular inflammation. Blockade of TNFα by TNF binding protein or IL-1 blockade by IL-1 receptor antagonists partially protects apoE knockout mice from atherosclerosis. Atherogenesis is primarily a result of TNFα production by bone marrow cells. The plaque area of apoE -/- and TNF -/- mice fed a high-fat diet was half the size of the plaque area of apoE -/- mice. Transplantation of bone marrow from apoE -/- and TNF -/- mice into apoE -/- mice reduced the size of atherosclerotic lesions by 83%. Atherosclerotic lesion size was also reduced after treatment of apoE -/- mice with recombinant soluble p55 (TNFR1) TNF blocker, indicating a role that TNF plays in atherosclerosis. NF-κB signaling is involved in the production of TNF-α in human atherosclerotic plaque. Peripheral blood TNFα levels in patients with cardiovascular disease are also associated with the development of myocardial infarction. Cardiotoxicity is primarily due to TNF-induced cardiomyocyte apoptosis. The use of anti-TNF therapies such as infliximab and etanercept in clinical trials for the treatment of heart failure has failed and increased mortality; Accordingly, anti-TNF therapies have not been tested for the treatment of cardiovascular disease (see, e.g., Udalova et al. (2016) Microbial Spectrum 4(4):MCHD-0022-2015; Kalliolias and Ivashkiv (2016) Nat. Rev. Rheumatol. 12(1):49-62]).
결과적으로 대안적인 요법이 필요하다. Consequently, alternative therapies are needed.
iv. 급성 호흡 곤란 증후군(ARDS)iv. Acute Respiratory Distress Syndrome (ARDS)
급성 호흡 곤란 증후군(ARDS)은 미국에서 연간 약 190,000명의 환자에게 영향을 미치며 최대 40%의 사망률을 보인다. ARDS의 기본 병태생리학적 기전을 표적으로 하는 효과적인 치료제는 없다. ARDS는 염증성 사이토카인 및 프로테아제의 방출과 연관된 면역 세포 매개 폐 손상을 특징으로 한다. ARDS에서 제어되지 않는 국소 염증 반응은 폐포-모세혈관 장벽의 손상 및 비-심인성 폐부종을 초래한다. ARDS 병인의 중심인 폐 호중구 동원은 프라이밍 및 활성화된 호중구와 폐 미세혈관 내피의 상호작용에 의해 매개되며, 염증유발 매개체의 작용으로 인한 폐포-모세관 장벽의 손상에 의해 증가된다. TNF-α는 ARDS뿐만 아니라 ARDS의 일반적인 원인인 패혈증에서도 핵심 이펙터 분자로 확인되었다. 예를 들어, TNF-α는 내피 투과성 증가에 기여한다. 패혈증 치료를 위한 비-선택적 항-TNF 항체의 투여와 관련된 임상 시험은 어떠한 생존 이점도 입증하지 못했으며, 한 시험에서는 더 높은 용량이 유해하다고 지적하였다. Acute respiratory distress syndrome (ARDS) affects approximately 190,000 patients per year in the United States and has a mortality rate of up to 40%. There are no effective treatments targeting the underlying pathophysiological mechanisms of ARDS. ARDS is characterized by immune cell-mediated lung injury associated with the release of inflammatory cytokines and proteases. The uncontrolled local inflammatory response in ARDS results in damage to the alveolar-capillary barrier and non-cardiogenic pulmonary edema. The recruitment of pulmonary neutrophils, which is central to the pathogenesis of ARDS, is mediated by the interaction of primed and activated neutrophils with the pulmonary microvascular endothelium and is augmented by damage to the alveolar-capillary barrier due to the action of pro-inflammatory mediators. TNF-α has been identified as a key effector molecule not only in ARDS but also in sepsis, a common cause of ARDS. For example, TNF-α contributes to increased endothelial permeability. Clinical trials involving administration of non-selective anti-TNF antibodies for the treatment of sepsis have not demonstrated any survival benefit, and one trial indicated that higher doses were detrimental.
TNFR1 결핍 마우스는 폐 손상, 패혈증 및 다른 급성 장기 손상으로부터 보호되는 반면, TNFR2 결핍 마우스는 이러한 모델에서 손상에 더 취약하여 TNFR1의 선택적 길항작용이 치료적으로 효과적일 수 있음을 나타낸다. TNFR2가 아닌 TNFR1을 선택적으로 길항시키는 속효성, 완전 인간 도메인 항체 (dAb) 단편인 GSK1995057은 급성 호흡 곤란 증후군 뮤린 모델에서 질환 중증도를 약화시키고 비-인간 영장류에서 염증 및 폐 손상 징후를 약화시켰다. 저용량의 흡입된 내독소로 도전된 37명의 건강한 인간을 대상으로 분무형 GSK1995057의 무작위, 위약 대조 시험에서, GSK1995057로 치료하면 폐 호중구증가, 염증성 사이토카인 방출, 기관지폐포 세척액 및 혈청 샘플에서 내피 손상 징후가 약화되었다. 이러한 결과는 ARDS의 예방 및 치료를 위한 선택적 TNFR1 길항제의 폐 전달 가능성을 나타낸다 (예를 들어, 문헌[Proudfoot 등 (2018) Thorax 73:723-730] 참조). TNFR1-deficient mice are protected from lung injury, sepsis and other acute organ damage, whereas TNFR2-deficient mice are more susceptible to injury in this model, indicating that selective antagonism of TNFR1 may be therapeutically effective. GSK1995057, a short-acting, fully human domain antibody (dAb) fragment that selectively antagonizes TNFR1 but not TNFR2, attenuated disease severity in a murine model of acute respiratory distress syndrome and attenuated signs of inflammation and lung injury in non-human primates. In a randomized, placebo-controlled trial of nebulized GSK1995057 in 37 healthy humans challenged with low doses of inhaled endotoxin, treatment with GSK1995057 resulted in pulmonary neutrophilia, inflammatory cytokine release, and signs of endothelial damage in bronchoalveolar lavage fluid and serum samples. has been weakened These results indicate the potential for pulmonary delivery of selective TNFR1 antagonists for the prevention and treatment of ARDS (see, e.g., Proudfoot et al. (2018) Thorax 73:723-730).
v. 중증 급성 호흡기 증후군(SARS) 및 COVID-19v. Severe Acute Respiratory Syndrome (SARS) and COVID-19
중증 급성 호흡기 증후군 코로나바이러스(SARS-CoV)에 감염된 대상체는 발열 및 호흡기 질병, 전신 권태감, 기침 및 숨가쁨을 포함한 하부 기도 증상을 나타내며 전체 치사율은 ~10%이다. TNF 신호전달은 심각한 조직 손상을 유발하는 과도한 염증을 유발하여 SARS의 병인을 촉진한다. 사이토카인 방출 증후군(CRS)의 발달은 중증 급성 호흡기 증후군 코로나바이러스 2(SARS-CoV-2)로 인한 질환인 중증 COVID-19에서 역할을 한다. 지속적인 바이러스 자극은 일부 대상체에서 IL-6 및 TNFα와 같은 순환 사이토카인의 수준을 증가시켜 림프구 수를 감소시키고 특히 폐 및 혈관에 대한 염증 장기 손상을 유발한다. SARS-CoV-2는 2002년 SARS 범유행의 원인이 된 코로나바이러스 균주인 SARS-CoV와 몇 가지 유사점을 공유한다. SARS-CoV 및 SARS-CoV-2는 스파이크 (S) 단백질을 사용하여 세포 수용체인 ACE2(안지오텐신 전환 효소 2)와 결합하여 세포를 침입한다. ACE2 수용체의 발현은 SARS-CoV-2 감염과 염증성 사이토카인 자극에 의해 상향 조절된다. SARS-CoV 감염에서, S-단백질은 ACE2 엑토도메인의 TNF-α-전환 효소(TACE) 의존성 쉐딩을 유도하며, 이는 TNFα 생산과 엄격하게 커플링된 과정이다. 쉐딩으로 인한 ACE2 활동의 손실은 레닌-안지오텐신 시스템의 활성 증가로 인한 폐 손상과 연관이 있다. ACE2 녹아웃 마우스는 화학적 도전 후 중증 호흡 부전에 걸리기 쉽고 ACE2는 ACE 유래된 세포내 염증을 완화시키는 것으로 밝혀졌다. ACE2 하향 조절은 SARS-CoV 감염과 연관된 심각한 호흡 곤란과 연관이 있다. 따라서 증가된 TNFα 생산은 바이러스 감염을 촉진하고 폐 손상과 같은 장기 손상을 초래할 수 있다. Subjects infected with severe acute respiratory syndrome coronavirus (SARS-CoV) develop lower respiratory tract symptoms including fever and respiratory illness, general malaise, cough and shortness of breath, with an overall mortality rate of -10%. TNF signaling promotes the pathogenesis of SARS by triggering excessive inflammation that causes severe tissue damage. The development of cytokine release syndrome (CRS) plays a role in severe COVID-19, a disease caused by severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 (SARS-CoV-2). Sustained viral stimulation increases the levels of circulating cytokines such as IL-6 and TNFα in some subjects, reducing the number of lymphocytes and causing inflammatory organ damage, particularly to the lungs and blood vessels. SARS-CoV-2 shares some similarities with SARS-CoV, the coronavirus strain responsible for the 2002 SARS pandemic. SARS-CoV and SARS-CoV-2 use the spike (S) protein to bind to the cellular receptor ACE2 (angiotensin converting enzyme 2) to invade cells. Expression of the ACE2 receptor is upregulated by SARS-CoV-2 infection and inflammatory cytokine stimulation. In SARS-CoV infection, the S-protein induces TNF-α-converting enzyme (TACE)-dependent shedding of the ACE2 ectodomain, a process tightly coupled with TNFα production. Loss of ACE2 activity due to shedding is associated with lung damage due to increased activity of the renin-angiotensin system. ACE2 knockout mice are prone to severe respiratory failure after chemical challenge and ACE2 has been shown to ameliorate ACE-induced intracellular inflammation. ACE2 downregulation is associated with severe respiratory distress associated with SARS-CoV infection. Therefore, increased TNFα production can promote viral infection and lead to organ damage such as lung damage.
논의한 바와 같이, 조절 T 세포(Treg)는 이식, 알러지, 감염성 질환, GVHD, 자가면역 및 암에서 다양한 임상 적용을 나타내는 일종의 면역억제 세포이다. Treg는 CD4+와 인터루킨-2 수용체 알파 사슬 CD25hi를 공동 발현하고 유도 가능한 수준의 세포내 전사 인자 포크헤드 박스 P3(FOXP3)를 특징으로 한다. 자연 발생 Treg는 TNFR1보다 높은 밀도로 TNFR2를 발현한다. TNFR2를 통한 TNF 신호전달은 Treg 활동을 촉진한다: TNF 매개 TNFR2는 Treg의 증식을 활성화 및 유도하고(100), TNFR2 발현은 최대 억제 Treg를 나타내고, 따라서 감염(인플루엔자, SARS 유형 바이러스, 내독소혈증)에 대한 반응으로 TNF가 과잉 생산되는 경우 Treg는 염증성 자극에 대한 과잉 반응을 예방할 수 있다.As discussed, regulatory T cells (Tregs) are a class of immunosuppressive cells that have diverse clinical applications in transplantation, allergy, infectious disease, GVHD, autoimmunity and cancer. Tregs co-express the interleukin-2 receptor alpha chain CD25 hi with CD4+ and are characterized by inducible levels of the intracellular transcription factor forkhead box P3 (FOXP3). Naturally occurring Tregs express TNFR2 at higher densities than TNFR1. TNF signaling through TNFR2 promotes Treg activity: TNF-mediated TNFR2 activates and induces the proliferation of Tregs (100), and TNFR2 expression represents maximally suppressive Tregs, thus preventing infection (influenza, SARS type virus, endotoxemia). ), when TNF is overproduced in response to inflammatory stimuli, Tregs can prevent overreaction to inflammatory stimuli.
항-TNF는 SARS 및 COVID-19의 치료제가 될 수 있다. 아달리무맙은 COVID-19 치료에 사용되고 있다 (2020년 2월 중국 임상 시험(ChiCTR2000030089); 예를 들어, 문헌[Lucchino 등 (2020) Rheumatology (Oxford) 59(6):1200-1203; Haga 등 (2008) Proc. Natl . Acad . Sci . U.S.A . 105:7809-7814] 참조). SARS-CoV에 감염된 마우스에서 TNFR2의 녹아웃은 어떠한 보호 효과도 제공하지 않고; TNFR1 및 TNFR2의 이중 녹아웃은 감염과 연관된 체중 감소로부터 감염된 마우스를 보호하였다 (예를 들어, 문헌[McDermott 등 (2016) BMC Systems Biology 10:93] 참조). 이러한 결과는 TNFR1을 통한 TNF 신호전달이 염증유발 과정을 증가시킴으로써 주로 SARS-CoV 감염의 병인에 기여하고 TNF의 억제보다 TNFR1의 선택적 억제가 더 나은 치료적 접근이라는 것을 나타낸다. 본 명세서에 제공된 작제물은 SARS 및 COVID-19의 급성 염증 측면을 치료하는 데 사용될 수 있다. 작제물은 항-감염제와 함께 사용되고; 작제물은 사이토카인 폭풍의 급성 효과를 억제하거나 개선하는 데 사용된다.Anti-TNF could be a treatment for SARS and COVID-19. Adalimumab is being used to treat COVID-19 (China Clinical Trial, February 2020 (ChiCTR2000030089); see, e.g., Lucchino et al. (2020) Rheumatology (Oxford) 59(6) :1200-1203; Haga et al. (2008) Proc. Natl . Acad . Sci . USA . 105 :7809-7814). Knockout of TNFR2 in mice infected with SARS-CoV did not provide any protective effect; Double knockout of TNFR1 and TNFR2 protected infected mice from infection-related weight loss (see, e.g., McDermott et al. (2016) BMC Systems Biology 10:93]). These results indicate that TNF signaling through TNFR1 mainly contributes to the pathogenesis of SARS-CoV infection by increasing the pro-inflammatory process, and that selective inhibition of TNFR1 rather than inhibition of TNF is a better therapeutic approach. Constructs provided herein may be used to treat the acute inflammatory aspects of SARS and COVID-19. The constructs are used with anti-infective agents; The constructs are used to inhibit or ameliorate the acute effects of a cytokine storm.
TNFα 억제는 마우스에서 호흡기 세포융합 바이러스(RSV) 또는 인플루엔자 바이러스로 인한 것과 같은 바이러스로 유발된 폐 질환의 중증도를 감소시킨다. 이러한 마우스 모델에서 항-TNF 항체를 사용하여 TNF를 고갈시키면 염증 세포의 폐 동원이 감소하고 T-세포에 의한 염증유발 사이토카인(예를 들어, IFNγ, IL-4, IL-5, TNF)의 생성이 감소하고 바이러스 청소능을 방해하지 않고 질병의 중증도를 감소시킨다 (예를 들어, 문헌[Hussell 등 (2001) Eur . J. Immunol . 31:2566-2573] 참조). 이러한 결과는 TNF 억제제 및 TNF 수용체 길항제가 TNF 유도 면역 활성화 및 폐 손상을 예방하거나 감소시킴으로써 SARS-CoV 및 SARS-CoV2로 인한 질환과 같은 인간 바이러스성 폐 질환의 치료에 유익할 수 있음을 나타낸다. TNFa inhibition reduces the severity of lung disease caused by viruses, such as those caused by respiratory syncytial virus (RSV) or influenza virus, in mice. In this mouse model, depletion of TNF using an anti-TNF antibody reduces the recruitment of inflammatory cells to the lungs and decreases the production of pro-inflammatory cytokines (e.g., IFNγ, IL-4, IL-5, TNF) by T-cells. production is reduced and reduces disease severity without interfering with viral clearance (see, for example, Hussell et al. (2001) Eur . J. Immunol . 31:2566-2573]). These results indicate that TNF inhibitors and TNF receptor antagonists may be beneficial in the treatment of human viral lung diseases, such as those caused by SARS-CoV and SARS-CoV2, by preventing or reducing TNF-induced immune activation and lung damage.
동종이형 조혈 줄기 세포 이식은 SARS 폐렴과 유사한 급성 폐 기능장애인 비-감염성 특발성 폐렴 증후군(IPS)의 발생으로 인해 복잡해진다. 동종이형 줄기 세포 이식(SCT) 후 폐 손상이 발생한 환자의 혈청에서 높은 수준의 TNFα가 밝혀졌고, 공여자 유래 동종반응성 T-세포가 이 과정과 연관이 있는 것으로 나타났다. 인간에서, 에타네르셉트를 사용한 항-TNF 요법은 동종이형 줄기 세포 이식 후 IPS 치료에 유익하다. 동종이형 줄기 세포 이식편의 수령체는 SCT 조절 레지멘의 면역탈격 효과, 이식편 대 숙주 질환(GvHD)을 예방하거나 치료하기 위한 면역억제 약물의 장기 사용에 대한 요건, 및 숙주 방어를 손상시킬 수 있는 다른 SCT 합병증(급성 GvHD 포함)으로 인해 박테리아 및 진균 감염이 발생할 위험이 높다 (예를 들어, 문헌[Yanik 등 (2002) Biol . Blood Marrow Transplant. 8:395-400] 참조). 본 명세서에 제공되는 작제물에 의해 치료될 수 있는 다른 적응증은 화학요법 동안 및 화학요법 후에 경험되는 병태인 화학 뇌, 특히 유방암 치료를 받는 여성을 포함한다. 또한, 본 명세서의 치료법 및 작제물은 장기 COVID를 치료하는 데 사용될 수 있다. Allogeneic hematopoietic stem cell transplantation is complicated by the occurrence of non-infectious idiopathic pneumonia syndrome (IPS), an acute lung dysfunction similar to SARS pneumonia. High levels of TNFα have been found in the serum of patients with lung injury after allogeneic stem cell transplantation (SCT), and donor-derived alloreactive T-cells have been shown to be involved in this process. In humans, anti-TNF therapy with etanercept is beneficial for IPS treatment after allogeneic stem cell transplantation. Recipients of allogeneic stem cell transplants may be subject to the immunosuppressive effects of SCT control regimens, the requirement for long-term use of immunosuppressive drugs to prevent or treat graft-versus-host disease (GvHD), and other factors that may impair host defenses. There is a high risk of developing bacterial and fungal infections with SCT complications (including acute GvHD) (see, e.g., Yanik et al. (2002) Biol . Blood Marrow Transplant. 8:395-400]). Other indications that can be treated by the constructs provided herein include women undergoing treatment for chemobrain, particularly breast cancer, a condition experienced during and after chemotherapy. In addition, therapies and constructs herein may be used to treat long-term COVID.
결과적으로, TNFR2를 통해 보호 TNF 신호전달을 유지하고, 항-TNF 요법과 달리 심각한 감염의 위험을 증가시키지 않는 선택적 TNFR1 길항제의 사용은 바이러스- 및 비-바이러스 유도 폐 손상의 치료, 예방 또는 개선을 위한 더 안전하고 더 효과적인 치료 옵션을 제공한다. 따라서, 본 명세서에서 제공되는 작제물은 이러한 적응증에 대한 이상적인 치료제이다.As a result, the use of selective TNFR1 antagonists that maintain protective TNF signaling through TNFR2 and, unlike anti-TNF therapies, do not increase the risk of serious infection, can treat, prevent or ameliorate viral- and non-viral induced lung injury. offer safer and more effective treatment options for Thus, the constructs provided herein are ideal therapeutics for these indications.
D. D. 류마티스성rheumatic 관절염 및 다른 만성 염증성 자가면역 질환 및 장애에 대한 요법 Therapy for arthritis and other chronic inflammatory autoimmune diseases and disorders
류마티스성 관절염(RA)에 대한 치유법은 없지만, 치료는 예를 들어 통증과 부종을 최소화하고 뼈 기형을 예방하며 일상적인 기능을 유지함으로써 증상을 개선하고 질환 진행을 늦출 수 있다. RA에 대한 1차 치료법은 질환 변형 항류마티스 약물(DMARD)이며, 이는 다른 만성 염증성 및 자가면역 질환 및 장애, 예를 들어, 건선, 판상 건선, 건선성 관절염, 소아 특발성 관절염, 강직 척추염, 베체트병, 염증성 장 질환 (IBD; 예를 들어, 크론병 및 궤양성 대장염), 다발성 경화증, 및 루푸스의 치료, 뿐만 아니라 일부 암의 치료에 사용된다. Although there is no cure for rheumatoid arthritis (RA), treatment can improve symptoms and slow disease progression, for example by minimizing pain and swelling, preventing bone deformities, and maintaining daily function. The first-line treatment for RA is disease-modifying antirheumatic drugs (DMARDs), which are effective against other chronic inflammatory and autoimmune diseases and disorders, such as psoriasis, plaque psoriasis, psoriatic arthritis, juvenile idiopathic arthritis, ankylosing spondylitis, and Behçet's disease. , inflammatory bowel disease (IBD; eg, Crohn's disease and ulcerative colitis), multiple sclerosis, and lupus, as well as treatment of some cancers.
DMARD는 종래의 합성 DMARD (csDMARD), 또는 생물학적 DMARD (bDMARD; 예를 들어, 항체 및 융합 단백질)로 분류되는 면역억제제 및 면역조절제이다. 종래의 합성 DMARD는 예를 들어, 메토트렉세이트 (MTX), 화학요법 제제 및 면역억제제; 하이드록시클로로퀸 (HCQ; Plaquenil®), 항-말라리아제; 설파살라진 (Azulfidine®), 항-염증성 약물; 및 디하이드로오로테이트 탈수소효소를 억제하는 면역억제제인 레플루노마이드 (Arava®)을 포함한다. 생물학적 DMARD는 예를 들어 T 세포 활성화를 방지하고 CTLA-4의 세포외 도메인에 융합된 IgG1의 Fc 영역을 함유하는 융합 단백질인 아바타셉트(Orencia®); 재조합 인간 IL-1 수용체 길항제인 아나킨라(예를 들어 상표명 Kineret®로 판매됨); B 세포와 같은 CD20+ 세포에서 세포자멸을 유도하는 CD20에 대한 키메라 단클론성 항체인 리툭시맙(Rituxan®, Truxima®, MabThera®를 포함하는 상표로 판매됨); IL-6 수용체(IL-6R)에 대한 인간화 단클론성 항체인 토실리주맙(아틀리주맙, Actemra®, RoActemra®); 코르티코스테로이드; 사이토카인 신호전달 매개에 관여하는 단백질 티로신 키나제인 야누스 키나제(JAK)의 소분자 억제제인 토파시티닙(Xeljanz®); 및 TNF-억제제/항-TNF 제제, 예를 들어, 세르톨리주맙 페골 (Cimzia®), 인플릭시맙 (레미케이드®), 아달리무맙 (Humira®), 골리무맙 (Simponi®), 및 에타네르셉트 (Enbrel®)을 포함한다. 특히 메토트렉세이트와 생물학적 DMARD의 병용 요법은 단독 요법보다 더 효과적이다. 병용 요법은 또한 다중 csDMARD 및 하나의 생물학적 DMARD와 함께 다중 csDMARD를 포함할 수 있다. 심각한 감염을 포함한 심각한 부작용의 위험으로 인해, 다중 생물학적 DMARD, 특히 항-TNF DMARD는 일반적으로 병용 요법 방법에 사용되지 않는다. DMARDs are immunosuppressive and immunomodulatory agents that are classified as conventional synthetic DMARDs (csDMARDs), or biological DMARDs (bDMARDs; eg, antibodies and fusion proteins). Conventional synthetic DMARDs include, for example, methotrexate (MTX), chemotherapeutic agents and immunosuppressive agents; hydroxychloroquine (HCQ; Plaquenil ® ), an anti-malarial agent; sulfasalazine (Azulfidine ® ), an anti-inflammatory drug; and leflunomide ( Arava® ), an immunosuppressive agent that inhibits dihydroorotate dehydrogenase. Biological DMARDs include, for example, abatacept (Orencia ® ), a fusion protein that prevents T cell activation and contains the Fc region of IgG1 fused to the extracellular domain of CTLA-4; anakinra, a recombinant human IL-1 receptor antagonist (sold eg under the trade name Kineret® ); Rituximab, a chimeric monoclonal antibody to CD20 that induces apoptosis in CD20 + cells such as B cells (sold under trademarks including Rituxan ® , Truxima ® , MabThera ® ); tocilizumab (atlizumab, Actemra® , RoActemra® ), a humanized monoclonal antibody to the IL-6 receptor (IL-6R); corticosteroids; tofacitinib (Xeljanz ® ), a small molecule inhibitor of Janus kinase (JAK), a protein tyrosine kinase involved in mediating cytokine signaling; and TNF-inhibitor/anti-TNF agents such as certolizumab pegol ( Cimzia® ), infliximab ( Remicade® ), adalimumab ( Humira® ), golimumab ( Simponi® ), and etaner including sept (Enbrel ® ). In particular, combination therapy of methotrexate and biologic DMARDs is more effective than monotherapy. Combination therapy may also include multiple csDMARDs together with multiple csDMARDs and one biologic DMARD. Due to the risk of serious side effects, including serious infections, multibiological DMARDs, particularly anti-TNF DMARDs, are not generally used in combination therapy regimens.
다음 섹션에서는 기존 요법 및 각각과 연관된 문제를 설명하여 본 명세서에 제공된 요법이 문제를 해결하는 방법을 강조한다. The following sections describe existing therapies and the problems associated with each to highlight how the therapies provided herein address the problems.
1. 종래의 합성 질환 조절 항-류마티스 약물(csDMARD)1. Conventional Synthetic Disease Modifying Anti-Rheumatic Drugs (csDMARDs)
종래의 합성 질환 조절 항류마티스 약물(csDMARD)은 일반적으로 RA 및 다른 자가면역 및 만성 염증성 질환 및 장애에 대한 1차 치료제이다. csDMARDS는 약물 예컨대 메토트렉세이트, 레플루노마이드, 하이드록시클로로퀸, 및 설파살라진을 포함하고, 메토트렉세이트는 초기 치료를 위한 가장 통상적으로 사용된 제제이고, 그 작용 기전은 섬유아세포로부터 아데노신의 방출 자극, 호중구 부착 감소, 호중구에 의한 류코트리엔 B4 합성 억제, 국소 IL-1 생산 억제, IL-6 및 IL-8 수준 감소, 세포 매개 면역 억제, 및 활막 콜라게나제 유전자 발현 억제를 수반한다. 다른 종래의 합성 DMARD는 림프구의 증식을 억제하거나 림프구 기능장애를 유발하여 작용한다. 예를 들어, 레플루노마이드는 디하이드로오로테이트 탈수소효소를 억제하여 피리미딘 합성을 억제하고 림프구 증식을 차단한다. 설파살라진은 산화, 질화 및 질산화 손상을 방지하여 항-염증 효과를 매개하며, 하이드록시클로로퀸은 세포내 톨 유사 수용체 9(TLR9)을 억제하는 약한 면역 조절제이다. Conventional synthetic disease-modifying antirheumatic drugs (csDMARDs) are generally first-line treatments for RA and other autoimmune and chronic inflammatory diseases and disorders. csDMARDS includes drugs such as methotrexate, leflunomide, hydroxychloroquine, and sulfasalazine, and methotrexate is the most commonly used agent for initial treatment, and its mechanism of action is to stimulate the release of adenosine from fibroblasts, reduce neutrophil adhesion , inhibition of leukotriene B4 synthesis by neutrophils, inhibition of local IL-1 production, reduction of IL-6 and IL-8 levels, suppression of cell-mediated immunity, and inhibition of synovial collagenase gene expression. Other conventional synthetic DMARDs act by inhibiting the proliferation of lymphocytes or by causing lymphocyte dysfunction. For example, leflunomide inhibits dihydroorotate dehydrogenase, thereby inhibiting pyrimidine synthesis and blocking lymphocyte proliferation. Sulfasalazine mediates anti-inflammatory effects by preventing oxidative, nitrifying and nitric damage, and hydroxychloroquine is a weak immune modulator that inhibits intracellular Toll-like receptor 9 (TLR9).
종래의 DMARD의 안전성 프로파일이 가장 우수한 하이드록시클로로퀸은 감염 위험을 증가시키지 않으며 간독성이나 신장 기능장애를 일으키지 않고; 하이드록시클로로퀸의 일반적인 부작용으로는 발진과 설사가 있다. 망막병증/황반병증은 하이드록시클로로퀸 요법의 드물지만 심각한 부작용으로 5 mg/kg/일 초과의 용량, 장기간 사용(5년 초과의 요법), 노령 및 만성 신장 질환과 연관이 있다. 하이드록시클로로퀸의 다른 드문 부작용으로는 빈혈, 백혈구감소증, 근병증 및 심근병증이 있다. 메토트렉세이트, 레플루노마이드 및 설파살라진에 의한 요법은 메스꺼움, 복통, 설사, 발진/알러지 반응, 골수 억제, 간독성 및 흔하고 때로는 심각한 감염 발생률 증가와 연관이 있다. 메토트렉세이트 및 레플루노마이드도 탈모증을 일으킨다. 메토트렉세이트 요법과 연관된 다른 부작용으로는 간질성 폐 질환, 엽산 결핍 및 간경변증이 있다. 레플루노마이드는 또한 고혈압, 말초 신경병증 및 체중 감소와 연관이 있다. 설파살라진은 위장 장애 위험이 매우 높으며 드물게 DRESS 증후군(호산구 증가증 및 전신 증상을 동반한 약물 반응)을 유발할 수 있다 (예를 들어, 문헌[Benjamin 등 Disease Modifying Anti-Rheumatic Drugs (DMARD) [2020년 2월 27일 업데이트]. In: StatPearls [인터넷]. Treasure Island (FL): StatPearls Publishing; 2020 Jan. 출처: URL:ncbi.nlm.nih.gov/books/NBK507863/] 참조). 이러한 약물은 면역억제제이기 때문에 효과적이다. TNFR2 면역억제 활성을 유리하게 보존하는 선택적 항-TNFR1 길항제인 본 명세서에 제공된 작제물은 이들 면역억제 약물에 대한 필요성을 피할 수 있다.Hydroxychloroquine, which has the best safety profile of conventional DMARDs, does not increase the risk of infection and does not cause hepatotoxicity or renal dysfunction; Common side effects of hydroxychloroquine include rash and diarrhea. Retinopathy/maculopathy is a rare but serious side effect of hydroxychloroquine therapy and is associated with doses greater than 5 mg/kg/day, long-term use (>5 years of therapy), old age and chronic kidney disease. Other rare side effects of hydroxychloroquine include anemia, leukopenia, myopathy and cardiomyopathy. Therapy with methotrexate, leflunomide, and sulfasalazine is associated with increased rates of nausea, abdominal pain, diarrhea, rash/allergic reactions, bone marrow suppression, hepatotoxicity, and common and sometimes serious infections. Methotrexate and leflunomide also cause alopecia. Other side effects associated with methotrexate therapy include interstitial lung disease, folic acid deficiency and cirrhosis of the liver. Leflunomide has also been associated with hypertension, peripheral neuropathy and weight loss. Sulfasalazine carries a very high risk of gastrointestinal upset and may rarely cause DRESS syndrome (a drug reaction with eosinophilia and systemic symptoms) (see, e.g., Benjamin et al. Disease Modifying Anti-Rheumatic Drugs (DMARD) [February 2020 Updated 27th]. In: StatPearls [Internet]. Treasure Island (FL): StatPearls Publishing; 2020 Jan. Source: URL: ncbi.nlm.nih.gov/books/NBK507863/]). These drugs are effective because they are immunosuppressive. Constructs provided herein that are selective anti-TNFR1 antagonists that advantageously preserve TNFR2 immunosuppressive activity may avoid the need for these immunosuppressive drugs.
2. 항-TNF 요법/TNF 차단제2. Anti-TNF Therapy/TNF Blockers
항-TNF 요법/TNF-차단제(생물학적 DMARD의 일종)는 전형적으로 종래의 DMARD의 실패 후 처방되며, 키메라 mAb 인플릭시맙(Remicade®)과 같은 단클론성 항체(mAbs); 뮤린 가변 영역 및 인간 IgG1 불변 영역, 및 완전 인간화 mAb(IgG1s) 아달리무맙(Humira®) 및 골리무맙(Simponi®)을 함유함; TNF를 표적으로 하는 mAb의 PEG화 인간화 Fab' 단편, 세르톨리주맙 페골(Cimzia®); 및 인간 IgG1의 Fc에 융합된 인간 TNFR2의 결합 부위를 함유하는 세포외 수용체 영역을 함유하는 TNFR2-Fc 융합 단백질 에타네르셉트(Enbrel®)와 같은 TNFR2 융합 단백질을 포함한다. Remsima® 및 Inflectra®은 다양한 자가면역 및 만성 염증성 질환 및 장애의 치료를 위해 유럽 연합에서 사용이 승인된 인플릭시맙의 바이오시밀러이다. TNF를 격리시키는 이러한 TNF 억제제는 예를 들어 RA, 건선, 건선성 관절염, 강직 척추염, 소아 특발성 관절염 (JIA), 및/또는 염증성 장 질환 (IBD; 예를 들어, 크론병 및 궤양성 대장염)을 포함하는 다양한 질환 및 병태의 치료에 사용된다. Anti-TNF therapy/TNF-blockers (a type of biological DMARD) are typically prescribed after failure of conventional DMARDs and include monoclonal antibodies (mAbs) such as the chimeric mAb infliximab ( Remicade® ); contains a murine variable region and a human IgG1 constant region, and fully humanized mAbs (IgG1s) adalimumab ( Humira® ) and golimumab ( Simponi® ); PEGylated humanized Fab' fragment of a mAb targeting TNF, certolizumab pegol ( Cimzia® ); and TNFR2 fusion proteins such as etanercept ( Enbrel® ), a TNFR2-Fc fusion protein containing an extracellular receptor region containing the binding site of human TNFR2 fused to the Fc of human IgG1. Remsima ® and Inflectra ® are biosimilars of infliximab approved for use in the European Union for the treatment of a variety of autoimmune and chronic inflammatory diseases and disorders. Such TNF inhibitors that sequester TNF can treat, for example, RA, psoriasis, psoriatic arthritis, ankylosing spondylitis, juvenile idiopathic arthritis (JIA), and/or inflammatory bowel disease (IBD; eg, Crohn's disease and ulcerative colitis). It is used for the treatment of a variety of diseases and conditions including
TNF를 표적으로 하는 요법의 면역억제 효과 때문에, 이러한 치료법은 예를 들어 패혈증 및 심각한 감염, 예컨대 리스테리아증, 결핵의 재활성화, B형/C형 간염의 재활성화, 대상포진, 및 침습성 진균의 재활성화 및 다른 기회 감염의 위험 증가를 포함하는 심한 부작용과 연관된다. TNF는 감염에 대한 염증 및 면역 반응의 핵심 사이토카인이며, TNF를 제거하는 약물을 사용하면 미생물에 대한 숙주 면역이 손상되어 감염 위험이 증가한다. 예를 들어, TNF 차단제는 M. 투베르쿨로시스(M. tuberculosis) 감염의 재활성화와 연관이 있다. TNF는 마이코박테리움 투베르쿨로시스(Mycobacterium tuberculosis)에 대한 내성에 중요한 역할을 하며, RA 환자의 아달리무맙 요법은 M. 투베르쿨로시스(M. tuberculosis)에 대한 반응성을 유의하게 감소시킨다. 본 명세서에 기재된 바와 같이, 감소된 면역 반응성은 Treg의 활성화 및 이펙터 림프구에서의 세포자멸 유도와 관련될 수 있다. 항-TNF 요법은 류마티스 활막에서 대식세포 세포자멸을 유도하는 것으로 나타났다. 인플릭시맙은 크론병 환자의 소화관에 침윤된 염증 세포의 세포자멸 증가와 연관이 있다. 메토트렉세이트 및 글루코코르티코이드와 같은 다른 항-류마티스 약물도 면역 세포에서 세포자멸을 유도할 수 있다 (예를 들어, 문헌[Vigna-Pιrez 등 (2005) Clin . Exp . Immunol . 141(2):372-380] 참조). TNFR2-Fc 융합 단백질인 에타네르셉트가 아닌 아달리무맙 및 인플릭시맙은 배양된 단핵구에서 카스파제 의존성 세포자멸을 유도하고 단핵구에 의한 IL-10 및 IL-12 생산을 하향 조절한다 (예를 들어, 문헌[Shen 등 (2005) Ailment Pharmacol . Ther . 21:251-258] 참조). TNF 차단제와 연관된 가장 흔한 진균 감염은 히스토플라스마증, 칸디다증 및 아스페르길루스증이다. 항-TNF 제제 또한 중증 울혈성 심부전, 약물 유발성 루푸스, 탈수초 중추신경계(CNS) 질환뿐만 아니라 림프종 및 비-흑색종 피부암의 악화를 유발할 수 있다 (예를 들어, 문헌[Benjamin 등 Disease Modifying Anti-Rheumatic Drugs (DMARD) [2020년 2월 27일 업데이트]. In: StatPearls [인터넷]. Treasure Island (FL): StatPearls Publishing; 2020 Jan. 출처: ncbi.nlm.nih.gov/books/NBK507863/] 참조). Because of the immunosuppressive effect of therapies targeting TNF, these therapies are, for example, sepsis and serious infections such as listeriosis, reactivation of tuberculosis, reactivation of hepatitis B/C, shingles, and reactivation of invasive fungi. It is associated with severe side effects including increased risk of activation and other opportunistic infections. TNF is a key cytokine in the inflammatory and immune response to infection, and the use of drugs that remove TNF impairs host immunity to microorganisms, increasing the risk of infection. For example, TNF blockers have been implicated in reactivation of M. tuberculosis infection. TNF plays an important role in resistance to Mycobacterium tuberculosis , and adalimumab therapy in RA patients significantly reduces responsiveness to M. tuberculosis . As described herein, reduced immune reactivity can be associated with activation of Tregs and induction of apoptosis in effector lymphocytes. Anti-TNF therapy has been shown to induce macrophage apoptosis in rheumatoid synovial membranes. Infliximab is associated with increased apoptosis of inflammatory cells infiltrating the digestive tract of patients with Crohn's disease. Other anti-rheumatic drugs such as methotrexate and glucocorticoids can also induce apoptosis in immune cells (see, eg, Vigna-Pιrez et al. (2005) Clin . Exp . Immunol . 141(2):372-380). The TNFR2-Fc fusion proteins adalimumab and infliximab, but not etanercept, induce caspase-dependent apoptosis in cultured monocytes and downregulate IL-10 and IL-12 production by monocytes (e.g. For example, see Shen et al. (2005) Ailment Pharmacol . Ther . 21:251-258]). The most common fungal infections associated with TNF blockers are histoplasmosis, candidiasis and aspergillosis. Anti-TNF agents can also cause aggravation of severe congestive heart failure, drug-induced lupus, demyelinated central nervous system (CNS) disease, as well as lymphomas and non-melanoma skin cancers (see, e.g., Benjamin et al. Disease Modifying Anti -Rheumatic Drugs (DMARD) [updated 27 Feb 2020].In: StatPearls [Internet].Treasure Island (FL): StatPearls Publishing;Jan 2020. Source: ncbi.nlm.nih.gov/books/NBK507863/] reference).
인플릭시맙은 또한 백혈구감소증, 호중구감소증, 혈소판감소증 및 범혈구감소증(일부 치명적임)의 발생과 연관이 있다. 에타네르셉트는 RA 환자에서 기회 세균 및 바이러스 감염의 발생률 증가와 연관이 있다. 에타네르셉트는 또한 심각한 불응성 이식편대숙주병(GvHD) 치료에도 사용된다. 에타네르셉트로 치료받는 중증 GvHD 대상체는 아스페르길루스 푸미가투스(Aspergillus fumigatus)로 인한 생명 위협 곰팡이(즉, 진균)인 침습성 아스페르길루스증(IA) 발병 위험이 매우 높다 (한 연구에서 100%, 문헌[Zoran 등 (2019) Sci. Rep. 9:17231] 참조). 에타네르셉트로 치료하면 NF-κB 신호전달, 항균 체액 반응 및 세포자멸 과정에 관여하는 유전자를 포함하여 면역 반응 및 TNF 신호전달에 관여하는 유전자의 하향 조절뿐만 아니라 CXCL10, 면역 세포로부터 케모카인, 예컨대 CXCL10의 분비 감소를 초래한다 (예를 들어, 문헌[Zoran 등 (2019) Sci. Rep. 9:17231] 참조). Infliximab has also been associated with the development of leukopenia, neutropenia, thrombocytopenia and pancytopenia (some fatal). Etanercept is associated with an increased incidence of opportunistic bacterial and viral infections in patients with RA. Etanercept is also used to treat severe refractory graft-versus-host disease (GvHD). Severe GvHD subjects treated with etanercept have Aspergillus fumigatus fumigatus ) is very high (100% in one study, see Zoran et al. (2019) Sci. Rep. 9:17231), a life-threatening fungus (i.e., fungus). ). Treatment with etanercept upregulates CXCL10, a chemokine from immune cells, such as CXCL10, as well as downregulation of genes involved in immune response and TNF signaling, including genes involved in NF-κB signaling, antimicrobial humoral response, and apoptotic processes. results in decreased secretion of (see, eg, Zoran et al. (2019) Sci. Rep. 9:17231).
TNF 차단 요법의 사용과 연관된 다른 부작용은 울혈성 심부전, 간 손상, 탈수초 질환/CNS 장애, 루푸스, 건선, 유육종증, 림프종 및 고형 악성종양을 포함한 암뿐만 아니라 추가 자가면역 질환의 발병에 대한 감수성 증가를 포함한다 (예를 들어, 문헌[Dong 등 (2016) Proc . Natl . Acad . Sci . USA. 113(43):12304-12309; Zalevsky 등 (2007) J. Immunol . 179:1872-1883; Zoran 등 (2019) Sci . Rep. 9:17231] 참조). 따라서, TNF를 격리함으로써 모든 TNF 매개 신호전달의 폐기는 심각한, 때때로 치명적인 감염 및 다른 위험한 부작용을 초래할 수 있는 심각한 면역 억제를 초래하기 때문에 이상적인 치료 전략이 아니다.Other side effects associated with the use of TNF blockade therapy are congestive heart failure, liver damage, demyelinating disease/CNS disorders, increased susceptibility to the development of additional autoimmune diseases as well as cancer, including lupus, psoriasis, sarcoidosis, lymphoma and solid malignancies. (see, e.g., Dong et al. (2016) Proc . Natl . Acad . Sci . USA. 113(43):12304-12309; Zalevsky et al. (2007) J. Immunol . 179:1872-1883; Zoran et al. (2019) Sci . Rep. 9:17231]). Therefore, abrogation of all TNF-mediated signaling by sequestering TNF is not an ideal therapeutic strategy as it results in severe immunosuppression that can lead to serious, sometimes fatal infections and other dangerous side effects.
항-TNF 요법은 RA를 개선하지만 치유적이지는 않으며 수년간의 지속적이고 비용이 많이 드는 요법이 필요하다. RA에서 TNF의 억제/차단은 염증 및 관절 파괴를 감소시키지만, 상기에 논의한 바와 같이 면역 억제로 인해 결핵 및 리스테리아증과 같은 심각한 감염 위험 증가와 연관이 있다. 그 결과, 특히 관절염 및 IBD와 같이 장기간 투여가 필요한 만성 질환/병태의 경우 TNF 차단제의 사용이 제한된다. RA 환자의 약 30%는 항-TNF 요법을 사용하여 무반응이거나 치료적 이점이 지속되지 않는다 (예를 들어, 문헌[McCann 등 (2014) Arthritis & Rheumatology 66(10):2728-2738] 참조). 무반응은 항-TNF 치료제를 받는 비-RA 환자에서도 발생한다. 항-TNF 제제에 따라, 치료된 환자의 13-33%가 치료에 반응하지 않고, 최대 46%가 반응을 중단하여 치료를 중단하거나 용량을 증가시킨다 (예를 들어, 문헌[Richter 등 (2019) MABS 11(4):653-665] 참조). 따라서, 치료 효능 및 안전성이 개선된 요법이 필요하다. Anti-TNF therapy improves RA but is not curative and requires years of continuous and costly therapy. Inhibition/blockade of TNF in RA reduces inflammation and joint destruction, but, as discussed above, is associated with an increased risk of serious infections such as tuberculosis and listeriosis due to immunosuppression. As a result, the use of TNF blockers is limited, particularly in chronic diseases/conditions requiring long-term administration, such as arthritis and IBD. About 30% of RA patients are unresponsive or do not receive sustained therapeutic benefit with anti-TNF therapy (see, e.g., McCann et al. (2014) Arthritis & Rheumatology 66(10):2728-2738). Failure to respond also occurs in non-RA patients receiving anti-TNF therapy. Depending on the anti-TNF agent, 13-33% of treated patients do not respond to treatment, and up to 46% stop responding, leading to discontinuation of treatment or increase in dose (see, for example, Richter et al. (2019) MABS 11(4):653-665). Therefore, there is a need for therapies with improved therapeutic efficacy and safety.
항-TNF 치료제는 TNF를 차단/격리하고 각각 TNFR1 및 TNFR2를 통한 가용성 TNF(solTNF) 및 막관통 TNF(tmTNF) 신호전달을 억제하고; solTNF 신호전달은 만성 염증과 관련이 있는 반면, tmTNF 신호전달은 염증 해소 및 병원체 예컨대 리스테리아 모노사이토게네스(Listeria monocytogenes) 및 마이코박테리움 투베르쿨로시스(Mycobacterium tuberculosis)에 대한 면역 유도와 관련이 있다. 항-TNF 요법의 주요 항-염증 효과는 TNFR1을 차단함으로써 달성되는 반면, TNFR2를 차단하면 Treg 세포 활성이 억제된다. 본 명세서의 다른 곳에서 논의된 바와 같이, TNFR1 신호전달은 주로 염증성이며 염증성 및 자가면역 질환 및 병태, 예컨대 RA, 건선, IBD, 및 신경퇴행 장애, 예컨대 MS의 병인에 관여하고; 반면 TNFR2 신호전달은 신경, 심장, 소화관 및 뼈 조직을 포함한 다양한 세포 및 기관 유형에서 항-염증 및 보호 효과를 가지며 병원균 감염에 대한 숙주 방어 메커니즘에도 관여한다. 따라서, 본 명세서에 기재된 바와 같이, TNFR1의 선택적 차단은 TNFR2 신호전달의 유익한 효과를 보존하면서 RA 및 다른 자가면역 및 염증성 질환 및 병태와 관련된 바람직하지 않은 염증유발 신호전달을 제거함으로써 항-TNF 요법과 비교하여 치료 효능을 개선한다 (참조: 예를 들어 문헌[McCann 등 (2014) Arthritis & Rheumatology 66(10):2728-2738; Schmidt 등 (2013) Arthritis & Rheumatism 65(9):2262-2273; Bluml 등(2012) International Immunology 24(5):275-281; Zalevsky 등 (2007) J. Immunol. 179:1872-1883] 참조). Anti-TNF therapeutics block/sequester TNF and inhibit soluble TNF (solTNF) and transmembrane TNF (tmTNF) signaling through TNFR1 and TNFR2, respectively; solTNF signaling is associated with chronic inflammation, whereas tmTNF signaling is associated with resolution of inflammation and pathogens such as Listeria monocytogenes. monocytogenes ) and Mycobacterium tuberculosis ( Mycobacterium tuberculosis ) are associated with the induction of immunity. The major anti-inflammatory effect of anti-TNF therapy is achieved by blocking TNFR1, whereas blocking TNFR2 inhibits Treg cell activity. As discussed elsewhere herein, TNFR1 signaling is primarily inflammatory and is involved in the pathogenesis of inflammatory and autoimmune diseases and conditions such as RA, psoriasis, IBD, and neurodegenerative disorders such as MS; On the other hand, TNFR2 signaling has anti-inflammatory and protective effects in various cell and organ types, including nerve, heart, digestive tract and bone tissue, and is also involved in host defense mechanisms against pathogen infection. Thus, as described herein, selective blockade of TNFR1 can be used with anti-TNF therapy by preserving the beneficial effects of TNFR2 signaling while eliminating undesirable pro-inflammatory signaling associated with RA and other autoimmune and inflammatory diseases and conditions. to improve therapeutic efficacy (see, eg, McCann et al. (2014) Arthritis & Rheumatology 66(10):2728-2738; Schmidt et al. (2013) Arthritis & Rheumatism 65(9):2262-2273; Bluml et al. (2012) International Immunology 24(5):275-281; Zalevsky et al. (2007) J. Immunol. 179:1872-1883]).
항-TNF 요법은 TNF의 과발현과 연관된 알츠하이머병, 파킨슨병, 뇌졸중 및 다발성 경화증(MS)과 같은 신경퇴행 질환의 치료에 실패하였다. 예를 들어, 재발 완화성 MS 치료를 위한 2상 시험에서, TNFR1 수용체-Fc IgG1 융합 단백질 항-TNF 치료제인 레네셉트(Ro 45-2081)가 실패했으며, 증상이 플라시보를 받은 환자와 비교하여 증가/악화되었고, 신경 결핍은 레너셉트 치료 환자에서 더 심각한다. 이러한 결과는 항-TNF 요법이 탈수초 질환을 악화시킬 수 있음을 나타낸다. TNFR1은 염증성 신경퇴행을 매개하는 것으로 나타났지만, TNFR2는 신경보호를 유도하므로 항-TNF 요법에 의한 두 수용체를 통한 신호전달의 차단은 TNFR2 신호전달의 신경보호 효과를 제거한다. TNFR1을 차단하는 인간화 단클론성 항체인 ATROSAB로 TNFR1을 차단하거나 효능적 TNFR2 선택적 TNF 뮤테인인 EHD2-scTNFR2로 TNFR2를 활성화하면 세포자멸에 대해 콜린성 뉴런이 보호되고 NMDA 유도 급성 신경퇴행의 마우스 모델에서 신경퇴행 연관 기억 장애를 되돌린다. 이는 면역원성일 가능성이 높다. ATROSAB는 부분 TNFR1 효능제이고; 당업자는 TNFR1 효능제를 투여하지 않을 것이다. 그러나 TNFR1과 TNFR2의 차단은 치료 효과를 무효화하여 TNFR2가 신경 보호에 필수적인 역할을 하고 TNFR1의 선택적 차단이 항-TNF 요법이 실패한 신경퇴행 질환의 치료에 사용될 수 있음을 나타낸다 (예를 들어 문헌[Dong 등 (2016) Proc . Natl . Acad . Sci. USA 113(43):12304-12309] 참조). Anti-TNF therapy has failed to treat neurodegenerative diseases such as Alzheimer's disease, Parkinson's disease, stroke and multiple sclerosis (MS) associated with overexpression of TNF. For example, in a phase 2 trial for the treatment of relapsing-remitting MS, the TNFR1 receptor-Fc IgG1 fusion protein anti-TNF treatment Renecept (Ro 45-2081) failed, and symptoms increased compared to patients receiving a placebo. / has worsened, and the neurological deficit is more severe in patients treated with Renercept. These results indicate that anti-TNF therapy can exacerbate demyelinating disease. TNFR1 has been shown to mediate inflammatory neurodegeneration, but TNFR2 induces neuroprotection, so blockade of signaling through both receptors by anti-TNF therapy eliminates the neuroprotective effects of TNFR2 signaling. Blocking TNFR1 with ATROSAB, a humanized TNFR1-blocking monoclonal antibody, or activating TNFR2 with EHD2-scTNF R2 , an potent TNFR2-selective TNF mutein, protects cholinergic neurons against apoptosis and in a mouse model of NMDA-induced acute neurodegeneration. Reverse neurodegenerative-associated memory impairment. It is likely to be immunogenic. ATROSAB is a partial TNFR1 agonist; One skilled in the art would not administer a TNFR1 agonist. However, blockade of TNFR1 and TNFR2 negates the therapeutic effect, indicating that TNFR2 plays an essential role in neuroprotection and that selective blockade of TNFR1 can be used in the treatment of neurodegenerative diseases in which anti-TNF therapy has failed (see, for example, Dong etc. (2016) Proc . Natl . Acad . Sci. USA 113(43):12304-12309).
항-TNF 제제 사용과 연관된 부작용, 일부 환자의 무반응, 초기 반응이 있었던 환자의 지속적인 반응 부족, 신경퇴행 질환, 예컨대 MS의 치료 실패 및/또는 악화로 인해, 다른 요법이 필요하다. 이러한 요법이 본 명세서에 제공된다. Due to side effects associated with the use of anti-TNF agents, non-response in some patients, continued lack of response in patients who had an initial response, treatment failure and/or worsening of a neurodegenerative disease such as MS, other therapies are needed. Such therapies are provided herein.
E. TNFR1/TNFR2 표적 치료제E. TNFR1/TNFR2 Targeted Therapies
다음 섹션에서는 TNFR1/TNFR2를 표적으로 하는 예시적인 치료제를 논의하고 이러한 치료제의 일부 문제점 및 제한 사항을 기재한다. 기존 치료제는 섹션 F 및 실시예에 기재된 바와 같이 변형될 수 있거나, 전체적으로 또는 부분적으로 사용되거나, 본 명세서에 제공된 작제물에서 사용하기 위한 특성을 개선하기 위해 변형될 수 있다.The following section discusses exemplary therapeutics targeting TNFR1/TNFR2 and describes some of the problems and limitations of these therapeutics. Existing therapeutics may be modified as described in Section F and the Examples, used in whole or in part, or modified to improve properties for use in the constructs provided herein.
1. TNFR1 선택적 길항제1. TNFR1 selective antagonists
본 명세서에서 논의되고 제공된 바와 같이, 에타네르셉트, 인플릭시맙, 아달리무맙 등과 같은 TNF 차단제를 사용한 요법은 TNFR1 및 TNFR2를 통한 TNF 신호전달을 제거한다. TNFR1 신호전달은 염증, 세포독성 및 세포자멸을 유발하는 반면, TNFR2 신호전달은 자가면역 환경에서 이펙터 T 세포를 파괴하여 조직 파괴 및 질환 진행을 예방하는 면역억제 Treg의 확대 및 활성화로 인해 부분적으로 보호 및 항-염증이다. TNF 차단제를 사용한 치료는, TNFR2 신호전달의 억제 및 면역억제 Treg의 결과적인 고갈을 통해 염증유발 미세환경을 초래하여 자가면역 및 염증성 질환 및 장애를 치료하지 못하거나 악화시킬 수 있다. TNFR1과 TNFR2의 이중 차단은 또한 기회 감염과 암을 유발할 수 있다. As discussed and provided herein, therapy with TNF blockers such as etanercept, infliximab, adalimumab, and the like, abrogates TNF signaling through TNFR1 and TNFR2. TNFR1 signaling induces inflammation, cytotoxicity and apoptosis, whereas TNFR2 signaling protects in part due to expansion and activation of immunosuppressive Tregs that destroy effector T cells in an autoimmune environment, preventing tissue destruction and disease progression. and anti-inflammatory. Treatment with TNF blockers may result in an inflammatory microenvironment through inhibition of TNFR2 signaling and consequent depletion of immunosuppressive Tregs, failing to treat or exacerbating autoimmune and inflammatory diseases and disorders. Double blockade of TNFR1 and TNFR2 can also lead to opportunistic infections and cancer.
본 명세서에 제공되는 바와 같이, TNFR1 신호전달의 특이적 억제는 정상적인 TNFR2 기능을 유지하며, 이는 조절 및 세포독성 T 세포 모두의 서브세트 생성을 통해 염증유발과 항-염증 활성 사이의 평형을 유지하는 데 필요하다. 선택적 TNFR1 억제는 TNFR2 신호전달의 강력한 항-염증 활성을 유지하고, 기회 감염 및 암을 감소시키고, TNF 유도 Treg 기능을 보존한다. As provided herein, specific inhibition of TNFR1 signaling maintains normal TNFR2 function, which maintains an equilibrium between pro-inflammatory and anti-inflammatory activities through the generation of subsets of both regulatory and cytotoxic T cells. needed to Selective TNFR1 inhibition retains the potent anti-inflammatory activity of TNFR2 signaling, reduces opportunistic infections and cancer, and preserves TNF-induced Treg function.
a. TNFR1 길항적 항체a. TNFR1 antagonistic antibody
TNFR1 길항제 항체 중에서 ATROSAB (길항적 TNF 수용체 단일 특이적 항체)가 있다. 최초의 TNFR1 차단 항체인 ATROSAB는 중화 마우스 항-인간 TNFR1 단클론성 항체 H398의 인간화 버전인 전장 IgG1이다. 그것은 TNFR1을 활성화시켜 독성 경로인 TNF 활성을 모방하는 부분 효능적 활성을 가지고 있기 때문에 치료제로서 포기되었다. ATROSAB는 불활성 상태에서 TNFR1의 형태를 유지하고 TNF의 결합을 차단한다. ATROSAB의 Fc 영역은 FCγR 수용체 결합 및 보체 고정을 제거하도록 돌연변이되어, 원하지 않는 면역계 활성화를 회피한다 (예를 들어, 문헌[Kalliolias and Ivashkiv (2016) Nat. Rev. Rheumatol. 12(1):49-62] 참조). Among the TNFR1 antagonist antibodies is ATROSAB (antagonistic TNF receptor monospecific antibody). ATROSAB, the first TNFR1 blocking antibody, is a full-length IgG1 humanized version of the neutralizing mouse anti-human TNFR1 monoclonal antibody H398. It was abandoned as a therapeutic because it has partial agonistic activity to mimic TNF activity, a toxic pathway by activating TNFR1. ATROSAB maintains the TNFR1 conformation in an inactive state and blocks TNF binding. The Fc region of ATROSAB has been mutated to eliminate FCγR receptor binding and complement fixation, thereby avoiding unwanted immune system activation (see, e.g., Kalliolias and Ivashkiv (2016) Nat. Rev. Rheumatol. 12(1):49- 62]).
전장 항체는 증가된 생체내 반감기의 이점을 갖지만, 본 명세서의 다른 곳에서 논의된 바와 같이, TNFR1을 길항하는 대신 작용시키는 경향이 있는 수용체 가교결합으로 인해 TNFR1 길항제의 개발에 적합하지 않는다. 이것은 항체의 Fc와 상호작용하는 부분이 돌연변이에 의해 제거되었기 때문에 Fc 가교에 의한 결과가 아니다. 예를 들어, IgG ATROSAB는 2가 분자 구조로 인해 좁은 농도 범위에서 제한된 정도로 관찰되는 TNF가 없는 상태에서 일부 TNFR1 효능적 활성을 나타내었다. TNFR1의 가교는 FcγR 또는 항-약물 항체(ADA)와의 상호작용과 같은 이차적 사건으로 인해 발생할 수 있으며, 이는 TNFR1 억제제의 길항 특성을 유지하기 위해 피해야 한다. ADA는 인플릭시맙 또는 아달리무맙으로 치료받은 환자에서 각각 50% 및 31%의 비율로 관찰되었다 (예를 들어, 문헌[Richter 등 (2019) mAbs 11(4):653-665; Richter 등, (2019) mAbs 11(1):166-177] 참조). Full-length antibodies have the advantage of increased half-life in vivo, but are not suitable for development of TNFR1 antagonists due to receptor crosslinking, which tends to agonize instead of antagonize TNFR1, as discussed elsewhere herein. This is not a result of Fc cross-linking as the Fc-interacting portion of the antibody has been removed by mutation. For example, IgG ATROSAB exhibited some TNFR1 agonistic activity in the absence of TNF observed to a limited extent over a narrow concentration range due to its bivalent molecular structure. Cross-linking of TNFR1 can occur due to secondary events such as interaction with FcγRs or anti-drug antibodies (ADAs), which should be avoided to maintain the antagonistic properties of TNFR1 inhibitors. ADA was observed at rates of 50% and 31%, respectively, in patients treated with infliximab or adalimumab (see, eg, Richter et al. (2019) mAbs 11(4):653-665; See Richter et al. , (2019) mAbs 11(1):166-177).
b. 1가 TNFR1 길항적 항체/항체 단편b. Monovalent TNFR1 antagonistic antibodies/antibody fragments
작은 항체 단편, 예컨대 도메인 항체 및 유도체 및 그의 변형된 형태가 개발되었으며, 예시적인 항체 단편 및 변형된 형태는 다음 섹션에서 논의된다. 그러나 작은 항체 단편은 의약품으로 성공적으로 개발되지 않았다. 그들은 치료제로서의 사용이 제한적이고; 그들은 짧은 혈청 반감기와 빠른 말초 청소능를 가지며 이는 작은 크기의 결과이다. 예를 들어, 크기가 50-60 kDa 이하인 분자는 신장 여과 대상이고; 크기가 50-60 kDa 미만인 dAb 및 다른 항체 단편은 신장에서 빠르게 제거된다. 예를 들어, DMS5541로 지정된 dAb 및 유사한 분자는 TNFR1에 대한 선택성을 나타내며 잠재적으로 TNFR1 신호전달의 유해한 효과를 억제할 수 있다. 2개의 dAb(항-TNFR1 및 항-인간 혈청 알부민)로 구성된 DMS5541은 크기가 약 25kDa에 불과하고 너무 작아서 치료 목적으로 바람직한 약동학을 갖지 못한다. 반감기 안정화를 의미하는 HSA와의 결합은 34 nM에 불과하며 이는 종종 HSA와 관련하여 해리된 상태에 있음을 의미한다. 지금까지 테스트된 단일 도메인 항체(sdAb)는 E. 콜라이에서 발현되며 제조 과정에서 응집(언폴딩)되기 쉽다. 또한, 세포질로 제조된 sdAb(E. 콜라이에서 직접 발현)는 가변 중쇄 도메인에서 발견되는 보존된 디설파이드 결합이 부족한 경우가 많으며, 이는 융점을 감소시키고 재접힘 능력을 감소시킬 수 있다. 몇 시간 미만일 수 있는 작은 항체 단편의 빠른 청소능 및 짧은 제거 반감기는 생체 내 효능을 감소시키고 빈번한 투여 및/또는 지속적인 주입을 필요로 하여 환자 순응도를 감소시킬 수 있다. 이러한 분자들(예를 들어, 문헌[Holland 등 (2013) J Clin Immunol 33(7):1192-203] 참조)은 E 콜라이에서 생산되었고 종종 정확하게 폴딩되지 않아 용해도 및 면역원성이 불량하여 결과적으로 임상적으로 실패하였다 (예를 들어, 문헌[adisinsight.springer.com/drugs/800037882] 참조). Small antibody fragments such as domain antibodies and derivatives and modified forms thereof have been developed, and exemplary antibody fragments and modified forms are discussed in the following sections. However, small antibody fragments have not been successfully developed as pharmaceuticals. They have limited use as therapeutics; They have a short serum half-life and rapid peripheral clearance, which is a result of their small size. For example, molecules less than 50-60 kDa in size are subject to renal filtration; dAbs and other antibody fragments less than 50-60 kDa in size are rapidly cleared by the kidney. For example, dAb designated DMS5541 and similar molecules exhibit selectivity for TNFR1 and can potentially inhibit the detrimental effects of TNFR1 signaling. DMS5541, composed of two dAbs (anti-TNFR1 and anti-human serum albumin), is only about 25 kDa in size and is too small to have desirable pharmacokinetics for therapeutic purposes. Its binding to HSA, implying half-life stabilization, is only 34 nM, meaning that it is often in a dissociated state with respect to HSA. The single domain antibodies (sdAbs) tested so far are expressed in E. coli and are prone to aggregation (unfolding) during manufacturing. In addition, cytoplasmically produced sdAbs (directly expressed in E. coli ) often lack the conserved disulfide bonds found in the variable heavy chain domain, which can reduce melting point and reduce refolding ability. The rapid clearance and short elimination half-lives of small antibody fragments, which may be less than a few hours, may reduce efficacy in vivo and require frequent dosing and/or continuous infusion, reducing patient compliance. Such molecules (see, for example, Holland et al. (2013) J Clin Immunol 33(7) :1192-203]) was produced in E coli and was often incorrectly folded resulting in poor solubility and immunogenicity, resulting in clinical failure (see, for example, adisinsight.springer.com/ drugs/800037882).
본 명세서에 제공되는 TNFR1 길항제 작제물과 같은 작제물은 이러한 문제뿐만 아니라 면역원성 및 기존 항체와의 반응과 같은 다른 문제를 다룬다. TNFR1 및/또는 TNFR2에 대한 특이성을 갖는 작은 항체 단편, 예컨대 dAb를 함유하는 작제물이 본 명세서에 제공되며, 이는 선행 기술의 dAb에 비해 혈청 반감기 연장, 안정성 증가, 말초 청소율 감소/느림 및 면역원성 감소를 포함하여 약동학적 특성과 같은 개선된 약리학적 특성을 나타낸다. Constructs, such as the TNFR1 antagonist constructs provided herein, address these issues as well as other issues such as immunogenicity and reaction with pre-existing antibodies. Provided herein are constructs containing small antibody fragments, such as dAbs, having specificity for TNFR1 and/or TNFR2, which exhibit prolonged serum half-life, increased stability, reduced/slowed peripheral clearance and immunogenicity compared to prior art dAbs. It exhibits improved pharmacological properties, such as pharmacokinetic properties, including reduction.
다양한 구조의 치료 항체는 강력하고 내약성이 좋은 치료제일 수 있다. 항체는 예를 들어, 류마티스성 관절염 (예를 들어, 아달리무맙, 상표명 Humira®로 판매됨); 암, 예컨대 비-호지킨 림프종 (예를 들어, 리툭시맙 및 이브리투모맙 티욱세탄, 각각 상표명 Rituxan® 및 Zevalin®로 판매됨) 및 유방 및 위암 (예를 들어, 트라스투주맙, 상표명 Herceptin®로 판매됨); 및 호흡기 세포융합 바이러스 감염 (예를 들어, 팔리바주맙, 상표명 Synagis®로 판매됨)을 포함하는 다양한 질환 및 병태의 치료에 사용된다. 완전한 항체의 제조에는 포유동물 세포 발현에 대한 의존과 같은 몇 가지 제한 사항이 있다. 그 결과, Fab(~57kDa) 및 단쇄 Fv 단편(scFv, ~27kDa)과 같은 항체의 항원 결합 단편 및 파아지 디스플레이(동물 면역화 회피)와 같이 시험관 내에서 선택될 수 있고 박테리아 또는 효모 세포 배양을 사용하여 대량으로 제조될 수 있는 다른 구조가 개발되었다. Fab 단편은 디설파이드 결합을 통해 VL-CL 폴리펩티드에 연결된 VH-CH1 폴리펩티드를 함유하고; scFv는 짧은 폴리펩티드 링커에 의해 연결된 VH 도메인 및 VL 도메인을 함유하는 융합 단백질이다. 항체의 작은 단편인 또 다른 종류의 치료제는 도메인 항체(dAb; 단일 도메인 항체 또는 sdAb로도 알려짐)이며, 이는 단량체이고 항체의 중쇄(VH) 또는 경쇄(VL)의 가변 도메인을 함유한다. dAb는 항체의 가장 작은 항원 결합 단편이고; 그것들은 크기가 약 11-15kDa이며, 이는 전체 단클론성 항체(mAb) 크기의 약 1/10이다 (예를 들어, 문헌[Holt 등 (2003) Trends in Biotechnology 21(11):484-490] 참조). dAb와 유사하게, 나노바디(Nb)는 경쇄가 없는 낙타 중쇄 항체에서 유래된 작은 항원 결합 단편이다. 나노바디는 작고(~15kDa), 면역원성이 낮고 친화력이 높으며 가용성이고, 안정적이며 단일 유전자/엑손(VHH)에 의해 인코딩되어, 모듈식이어서 박테리아와 효모에서 고수율 생산이 가능하다. (예를 들어, 문헌[Steeland 등 (2015) J. Biol . Chem . 290(7):4022-4037; Steeland 등 (2017) Sci . Reports 7:13646] 참조). Therapeutic antibodies of various structures can be potent and well-tolerated therapeutics. Antibodies may be used for, for example, rheumatoid arthritis (eg, adalimumab, sold under the trademark Humira® ); cancers such as non-Hodgkin's lymphoma (eg, rituximab and ibritumomab tiuxetan, sold under the tradenames Rituxan® and Zevalin® , respectively) and breast and gastric cancer (eg, trastuzumab, tradename Herceptin sold as ® ); and respiratory syncytial virus infections (eg, palivazumab, sold under the tradename Synagis® ). Preparation of intact antibodies has several limitations, such as reliance on mammalian cell expression. As a result, antigen-binding fragments of antibodies such as Fab (~57 kDa) and single chain Fv fragments (scFv, ~27 kDa) and phage display (escape animal immunization) can be selected in vitro and using bacterial or yeast cell cultures. Other structures have been developed that can be manufactured in large quantities. Fab fragments contain a V H -
i. Fab 및 scFv 기반 TNFR1 길항제i. Fab- and scFv-based TNFR1 antagonists
상기에 논의한 바와 같이, 인간화 반-효능/길항적 TNFR1 특이적 항체인 ATROSAB는 TNFR1 매개 세포 반응을 억제한다. ATROSAB는 2가 분자 구조로 인해 또는 TNF가 없는 경우 TNFR1에 대한 결합으로 인해 일부 TNFR1 효능적 활성을 나타낸다. 모 마우스 항체인 H398은 H398에 비해 ATROSAB의 더 빠른 해리(즉, 더 높은 koff 값)로 인해 더 강한 억제 가능성을 보유한다. 이것은 칩의 항원 밀도가 1가 상호 작용을 선호하도록 감소된 석영 결정 미량천칭 (QCM) 측정을 사용하여 결정되었고; TNFR1에서 1가로 결합된 H398의 더 느린 해리 및 그 결과 더 긴 수용체 점유는 TNFR1의 개선된 차단에 기여한다. 따라서 ATROSAB의 TNFR1 효능적 활성을 제거하고 TNFR1 길항적 활성을 개선하기 위해, ATROSAB의 1가 유도체가 개발되었다. As discussed above, ATROSAB, a humanized semi-agonistic/antagonistic TNFR1 specific antibody, inhibits TNFR1 mediated cellular responses. ATROSAB exhibits some TNFR1 agonistic activity due to its bivalent molecular structure or due to binding to TNFR1 in the absence of TNF. The parental mouse antibody, H398, possesses stronger inhibitory potential due to the faster dissociation of ATROSAB (ie higher k off value) compared to H398. This was determined using quartz crystal microbalance (QCM) measurements where the antigen density of the chip was reduced to favor monovalent interactions; The slower dissociation of monovalently bound H398 from TNFR1 and consequently longer receptor occupancy contributes to improved blockade of TNFR1. Therefore, in order to eliminate the TNFR1 agonistic activity of ATROSAB and improve the TNFR1 antagonistic activity of ATROSAB, monovalent derivatives of ATROSAB have been developed.
ATROSAB의 친화성 및 길항적 활성을 증가시키기 위해, ATROSAB의 단쇄 가변 단편(scFv)은 개별 CDR 또는 CDR 조합 내의 노출된 잔기의 부위 지정 돌연변이유발 및 인간 TNFR1-Fc에 대한 파아지 디스플레이에 의한 선택에 의해 1차 친화성 성숙을 거쳤다. ATROSAB의 scFv는 ATROSAB 경쇄의 잔기 1-113에 상응하는 짧은 펩티드 링커에 의해 VL 도메인에 연결된 ATROSAB 중쇄의 잔기 1-115에 상응하는 VH 도메인(서열번호: 31 참조)을 함유한다 (서열번호: 32 참조). ATROSAB 중쇄, Y52V, Y54T, S55Q, H57E, Y59K 및 E62D의 CDR-H2 내에 6개의 돌연변이를 갖는 클론, scFv IG11(서열번호: 674 참조)은 서열번호: 31과 관련하여 더 느린 수용체 해리 및 인간 TNFR1-Fc에 대한 개선된 평형 결합, 및 TNF-유래된 TNFR1 활성화의 개선된 억제를 나타내었다. 이 클론은 추가로 무작위 돌연변이유발에 적용되어 VH 도메인에서 돌연변이 Q1H, Y52V, Y54S, S55Q, H57E, Y59K, 및 E62D (서열번호:31 참조), 및 VL 도메인에서 S96G (서열번호:32 참조)을 함유하는 클론 scFv T12B (참고, 서열번호:675)을 생성한다. scFv T12B는 ATROSAB의 scFv 및 scFv IG11과 비교하여 고정된 TNFR1-Fc로부터의 해리를 감소시켰고, TNFR1 억제 활성을 증가시켰다 (예를 들어, 문헌[Richter 등 (2019) mAbs 11(1):166-177; 또한, Richter, F. Thesis, entitled "Evolution of the Antagonistic Tumor Necrosis Factor Receptor One-Specific Antibody ATROSAB," Universitδt Stuttgart, 2015; pdfs.semanticscholar.org/d8e7/8b87d76dce36225c1d497939ef37445cfa8a.pdf에서 이용 가능] 참조). To increase the affinity and antagonistic activity of ATROSAB, single-chain variable fragments (scFvs) of ATROSAB are prepared by site-directed mutagenesis of exposed residues within individual CDRs or combinations of CDRs and selection by phage display against human TNFR1-Fc. It has undergone first-order affinity maturation. The scFv of ATROSAB contains a V H domain corresponding to residues 1-115 of the ATROSAB heavy chain (see SEQ ID NO: 31) linked to a VL domain by a short peptide linker corresponding to residues 1-113 of the ATROSAB light chain (SEQ ID NO: 31). 32). A clone with six mutations in CDR-H2 of the ATROSAB heavy chain, Y52V, Y54T, S55Q, H57E, Y59K and E62D, scFv IG11 (see SEQ ID NO: 674) exhibits slower receptor dissociation and human TNFR1 with respect to SEQ ID NO: 31 - Improved equilibrium binding to Fc, and improved inhibition of TNF-induced TNFR1 activation. This clone was further subjected to random mutagenesis to obtain mutations Q1H, Y52V, Y54S, S55Q, H57E, Y59K, and E62D (see SEQ ID NO:31) in the V H domain, and S96G (see SEQ ID NO:32) in the V L domain. ) to create clone scFv T12B (reference, SEQ ID NO: 675) containing. scFv T12B reduced dissociation from immobilized TNFR1-Fc and increased TNFR1 inhibitory activity compared to the scFv of ATROSAB and scFv IG11 (see, e.g., Richter et al. (2019) mAbs 11(1):166-177; See also Richter, F. Thesis, entitled "Evolution of the Antagonistic Tumor Necrosis Factor Receptor One-Specific Antibody ATROSAB," Universitδt Stuttgart, 2015; available at pdfs.semanticscholar.org/d8e7/8b87d76dce36225c1d497939ef37445cfa8a.pdf).
H398의 인간화는 CDR 배열을 최적화하기 위해 H398의 VH 및 VL 프레임워크 영역을 대체 생식계열 유전자와 교환하여 재조작되었다. 짧은 펩티드 링커에 의해 H398의 새로 인간화된 VL 도메인에 연결된 scFV T12B의 VH 도메인을 함유하는 scFv 13.7은 ELISA 및 QCM에서 인간 TNFR1-Fc와 유사한 결합, TNF-유도 TNFR1 활성 억제 개선, 열 안정성 개선, scFv T12B에 비해 10 ℃ 높은 융점을 보였다. scFv 13.7에 기초하여, ATROSAB와 동일한 불변 영역을 갖는 IgG 및 Fab가 생성되었고(각각 IgG 13.7 및 Fab 13.7), 이는 각각 ATROSAB(1.4배) 및 ATROSAB의 Fab(Fab ATR; 8.7-배)에 비해 TNFR1에 대한 결합이 증가하였다. Fab 13.7은 또한 Fab ATR에 비해 고정된 TNFR1-Fc로부터 감소된 해리를 가지며, 18.8배 개선된 1가 친화도를 가진다. 따라서, 친화성 성숙 및 프레임워크 대체는 Fab 13.7에 대한 TNFR1에 대한 개선된 결합을 초래하였다. Fab 13.7 및 IgG 13.7은 TNFR1-Fc에 대한 선택성을 나타내었고 TNFR2-Fc 융합 단백질에 결합하지 않았고; Fab 13.7은 인간 및 레수스 TNFR1-Fc에 결합했지만, 마우스 및 랫트 TNFR1-Fc에는 결합하지 않았으며, 이는 ATROSAB와 유사한 결합 패턴을 나타내었다. 시험관내에서, 1가 Fab ATR 및 Fab 13.7은 TNFR1을 활성화시키지 않은 반면, ATROSAB는 TNFR1 활성의 미미한 활성화를 나타내었고 IgG 13.7은 TNFR1을 강력하게 활성화시켰다. IgG 13.7의 효능적 활성은 TNFR1로부터의 개선된 친화도 및 느린 해리로 인한 것일 수 있으며, 그 결과 안정한 신호전달 적격 수용체-항체 복합체가 형성된다. Fab 13.7은 Fab ATR 및 ATROSAB에 비해 TNFR1 활성의 개선된 억제를 나타냈고, 임의의 효능적 활성이 결여되었다. Fab 13.7 또는 ATROSAB를 가교 항-인간 Fab 혈청과 함께 인큐베이션한 결과, Fab 13.7은 TNFR-1을 활성화시키지 않는 반면 ATROSAB는 활성화한다는 것이 밝혀졌다 (예를 들어, 문헌[Richter 등 (2019) mAbs 11(1):166-177] 참조). The humanization of H398 was reengineered by exchanging the VH and VL framework regions of H398 with alternative germline genes to optimize the CDR arrangement. scFv 13.7 containing the VH domain of scFV T12B linked to the newly humanized VL domain of H398 by a short peptide linker, binding similar to human TNFR1-Fc in ELISA and QCM, improved inhibition of TNF-induced TNFR1 activity, improved thermal stability, scFv It showed 10 ℃ higher melting point than T12B. Based on scFv 13.7, IgGs and Fabs with the same constant region as ATROSAB were generated (IgG 13.7 and Fab 13.7, respectively), compared to ATROSAB (1.4-fold) and the Fab of ATROSAB (Fab ATR; 8.7-fold), respectively, to TNFR1. binding to increased. Fab 13.7 also has reduced dissociation from immobilized TNFR1-Fc compared to Fab ATR and has an 18.8-fold improved monovalent affinity. Thus, affinity maturation and framework replacement resulted in improved binding to TNFR1 for Fab 13.7. Fab 13.7 and IgG 13.7 showed selectivity for TNFR1-Fc and did not bind the TNFR2-Fc fusion protein; Fab 13.7 bound human and rhesus TNFR1-Fc, but not mouse and rat TNFR1-Fc, showing a similar binding pattern to ATROSAB. In vitro, monovalent Fab ATR and Fab 13.7 did not activate TNFR1, whereas ATROSAB showed minor activation of TNFR1 activity and IgG 13.7 strongly activated TNFR1. The potent activity of IgG 13.7 may be due to improved affinity and slow dissociation from TNFR1, resulting in the formation of stable signaling competent receptor-antibody complexes. Fab 13.7 showed improved inhibition of TNFR1 activity compared to Fab ATR and ATROSAB and lacked any agonistic activity. Incubation of Fab 13.7 or ATROSAB with cross-linked anti-human Fab serum has shown that Fab 13.7 does not activate TNFR-1 whereas ATROSAB does (see, for example, Richter et al. (2019) mAbs 11(1):166-177).
초기 반감기가 0.44시간, 말단 반감기가 32.1시간, 곡선하 면적(AUC)이 181μg/ml x h인 ATROSAB와 비교하면, Fab 13.7(분자 질량 ~47 kDa). Fab 13.7은 0.08시간의 초기 반감기, 1.4시간의 최종 반감기 및 4.2 μg/ml x h의 AUC를 나타냈으며, 이는 Fab ATR에 대해 얻은 값과 유사하였다. 반감기를 연장하기 위해, Fab' 단편인 Fab' 13.7은 CH1 도메인의 C-말단에 유리 시스테인 잔기를 도입함으로써 생성되었으며, 이는 분지형 PEG40 kDa 모이어티에 화학적으로 커펄링되어 Fab 13.7PEG를 생성하였다. Fab 13.7은 또한 Fd와 마우스 혈청 알부민(MSA)의 N-말단에 대한 짧은 가요성 링커를 통해 융합되어 Fab13.7-MSA를 생성하였다. 1가 Fab-Fc 융합 단백질은 힌지 영역의 시스테인 잔기가 결여되고 CH3 도메인을 통해 이합체화하는 능력이 결여된 변형된 Fc에 Fab 13.7을 융합하여 생성되어 한팔 절반-IgG 분자(IgG1half13.7)를 생성하였다. 1가 Fv-Fc 분자는 VH 및 VL 도메인을 힌지 영역(Fv13.7-Fckih)에 시스테인 잔기가 결여된 이종이량체화 놉-인투-홀(kih) Fc 사슬에 융합시켜 생성되었다. 유도체 중 어느 것도 임의의 효능적 TNFR1 활성을 나타내지 않았고, Fab 13.7과 비교하여, 인간 TNFR1-Fc에 대한 약간 감소된 결합은 Fab13.7PEG, Fab13.7-MSA 및 IgG1half13.7에 대해 관찰되었고; Fv13.7-Fckih의 결합은 영향을 받지 않았다. TNF 매개 TNFR1 활성의 억제는 Fab 13.7에 비해 1.5-3.3배 감소되었고; Fab13.7PEG는 기능에서 가장 강한 손상을 보였고, Fv13.7-Fckih는 생체 활성에서 가장 낮은 변화를 보였다. IgGhalf13.7은 Fab 13.7과 유사한 반감기를 보였고, AUC 값은 7.1배 증가하였다. Fab13.7PEG, Fab13.7-MSA 및 Fv13.7-Fckih는 말단 반감기가 각각 14.4시간, 9.7시간 및 10.5시간으로 연장되었고 AUC 값이 증가되었다. 따라서, 놉-인투-홀(knobs-into-holes) 기술을 사용하여 2개의 펩티드 사슬의 이형이량체 조립을 위해 조작된 융합 단백질 Fv13.7-Fckih는 개선된 약동학적 특성과 TNFR1 길항 활성의 최상의 조합을 표시하였다 (예를 들어, 문헌[Richter 등 (2019) mAbs 11(1):166-177; 또한 Richter, F. Thesis, entitled "Evolution of the Antagonistic Tumor Necrosis Factor Receptor One-Specific Antibody ATROSAB," Universitδt Stuttgart, 2015; pdfs.semanticscholar.org/d8e7/8b87d76dce36225c1d497939ef37445cfa8a.pdf로부터 이용가능] 참조). Compared to ATROSAB with an initial half-life of 0.44 hours, a terminal half-life of 32.1 hours, and an area under the curve (AUC) of 181 μg/ml xh, Fab 13.7 (molecular mass ~47 kDa). Fab 13.7 exhibited an initial half-life of 0.08 hours, a terminal half-life of 1.4 hours and an AUC of 4.2 μg/ml xh, similar to the values obtained for Fab ATR. To prolong the half-life, a Fab' fragment, Fab' 13.7, was created by introducing a free cysteine residue at the C-terminus of the CH1 domain, which is a branched PEG 40 Chemically coupled to the kDa moiety yielded Fab 13.7PEG. Fab 13.7 was also fused to Fd via a short flexible linker to the N-terminus of mouse serum albumin (MSA) to create Fab13.7-MSA. A monovalent Fab-Fc fusion protein is generated by fusing Fab 13.7 to a modified Fc that lacks the cysteine residues in the hinge region and the ability to dimerize through the CH3 domain, resulting in a one-armed half-IgG molecule (IgG1 half 13.7) did A monovalent Fv-Fc molecule was generated by fusing the VH and VL domains to a heterodimerizing knob-into-hole (kih) Fc chain lacking a cysteine residue in the hinge region (Fv13.7-Fc kih ). None of the derivatives showed any potent TNFR1 activity and compared to Fab 13.7, slightly reduced binding to human TNFR1-Fc was observed for Fab13.7PEG, Fab13.7-MSA and IgG1 half 13.7; The binding of Fv13.7-Fc kih was not affected. Inhibition of TNF-mediated TNFR1 activity was reduced 1.5-3.3 fold compared to Fab 13.7; Fab13.7PEG showed the strongest impairment in function, and Fv13.7-Fc kih showed the lowest change in bioactivity. IgG half 13.7 showed a half-life similar to Fab 13.7, and the AUC value increased 7.1 times. The terminal half-lives of Fab13.7PEG, Fab13.7-MSA and Fv13.7-Fc kih were extended to 14.4 hours, 9.7 hours and 10.5 hours, respectively, and the AUC values were increased. Therefore, the fusion protein Fv13.7-Fc kih engineered for heterodimeric assembly of two peptide chains using the knobs-into-holes technology has improved pharmacokinetic properties and TNFR1 antagonistic activity. The best combination is indicated (see, eg, Richter et al. (2019) mAbs 11(1):166-177; See also Richter, F. Thesis, entitled "Evolution of the Antagonistic Tumor Necrosis Factor Receptor One-Specific Antibody ATROSAB," Universitδt Stuttgart, 2015; available from pdfs.semanticscholar.org/d8e7/8b87d76dce36225c1d497939ef37445cfa8a.pdf).
또 다른 연구에서는 Fab 13.7의 혈청 반감기와 같은 약동학적 특성을 개선하기 위해, 폴리펩티드 사슬의 Fab 유사 이종이량체화를 유지하면서 IgG 유사 Fc를 분자에 통합하였다. 이를 달성하기 위해, Fab 13.7의 중쇄 및 경쇄의 가변 도메인을 Fc-온/카파(Fc1κ)로 알려진 새로 생성된 이종이량체화 Fc 사슬의 N-말단에 융합하였다. Fc 이종이량체화 접근법은 이종이량체화 IgG1 불변 중쇄 도메인(CH1) 및 카파 경쇄 불변 도메인(CLκ)에서 유래된 산재된 Ig 도메인을 기반으로 하며, FcRn 결합을 매개하고 생체 내에서 FcRn 매개 약물 재활용을 가능하게 하는 IgG1 CH3 서열의 섹션을 함유한다. 산재된 Ig 도메인은 CH1 및 CH3의 아미노산 서열 단편을 함유하는 "CH31" 및 CLκ 및 CH3의 아미노산 서열 단편을 포함하는 "CH3카파"(CH3)를 포함한다. IgG1 CH2 도메인은 또한 IgG 분자의 전체 FcRn 결합 영역을 포함하도록 CH31 및 CH3κ 도메인의 N-말단에 융합되었다. CH2 도메인의 N-말단에 IgG1 힌지 영역을 추가하면 Fc1κ로 알려진 공유 결합된 이종이량체화 Fc 모이어티가 생성된다. CH3-CH3 계면에서 하나 이상의 아미노산 대체를 포함하는 놉-인투-홀과 같은 다른 Fc 이종이량체화 기술과 달리, Fc 이종이량체화는 인간 항체 서열에서 얻은 더 큰 아미노산 서열 스트레치를 교환하여 달성되었다. 비대칭 scFv-Fc1κ 융합 단백질을 제조하여 놉-인투-홀을 함유하는 Fcs와의 scFv 융합과 비교하였고, 이종이량체 형성은 놉-인투-홀 기술을 함유하는 융합과 비교하여 유사하거나 개선되었다 (예를 들어, 문헌[Richter 등 (2019) mAbs 11(4):653-665] 참조). In another study, to improve pharmacokinetic properties such as serum half-life of Fab 13.7, an IgG-like Fc was incorporated into the molecule while maintaining the Fab-like heterodimerization of the polypeptide chain. To achieve this, the variable domains of the heavy and light chains of Fab 13.7 were fused to the N-terminus of a newly generated heterodimerizing Fc chain known as Fc-on/kappa (Fc1κ). The Fc heterodimerization approach is based on interspersed Ig domains derived from heterodimerizing IgG1 constant heavy chain domains (CH1) and kappa light chain constant domains (CLκ), mediating FcRn binding and FcRn-mediated drug recycling in vivo. contains a section of the IgG1 CH3 sequence that enables Interspersed Ig domains include “CH31”, which contains amino acid sequence fragments of CH1 and CH3, and “CH3kappa” (CH3), which contains amino acid sequence fragments of CLκ and CH3. The IgG1 CH2 domain was also fused to the N-terminus of the CH31 and CH3κ domains to encompass the entire FcRn binding region of the IgG molecule. Addition of an IgG1 hinge region to the N-terminus of the CH2 domain creates a covalently linked heterodimerizing Fc moiety known as Fc1κ. Unlike other Fc heterodimerization techniques, such as knob-into-hole, which involve one or more amino acid replacements at the CH3-CH3 interface, Fc heterodimerization was achieved by exchanging larger stretches of amino acid sequences obtained from human antibody sequences. . Asymmetric scFv-Fc1κ fusion proteins were prepared and compared to scFv fusions with Fcs containing knob-into-holes, and heterodimer formation was similar or improved compared to fusions containing knob-into-hole technology (e.g. See, eg, Richter et al. (2019) mAbs 11(4):653-665).
TNFR1-특이적 Fab 13.7 분자의 가변 도메인은 VH를 CH2-CH3κ 사슬에 융합시키고 VL을 CH2-CH31 사슬 (VL13.7-CH2-CH31/VH13.7-CH2-CH3κ; VL1C/VHκC)에 융합시켜, generating the 아트로시맙 (크기 72 kDa)로 알려진 1가 TNFR1 특이적 길항적 항체 유래 분자 (Fv-Fc1κ 융합 단백질)을 생성하여 짧은 펩티드 링커로 CH31- 또는 CH3κ 함유 Fc 사슬의 CH2 도메인 N-말단에 융합되었다. 아트로시맙은 Fc1κ에 도입된 돌연변이로 인해 Fc 이펙터 기능을 매개하는 능력이 부족하고; 면역계의 이펙터 분자에 대한 결합 부족은 FcγR을 발현하는 세포에 결합된 아트로시맙의 2차 가교로 인한 TNFR1의 활성화를 방지한다. 고친화도(KD 2.7 nM)로 TNFR1에 결합한 아트로시맙은 다양한 시험관 내 검정에서 16-55 nM의 IC50 값으로 TNFR1의 TNF 유도 활성화를 억제하였고, 항-인간 IgG 항체(즉, 가교 항체)의 존재 하에 개선된 약동학적 특성을 나타내었다. 모 Fab 13.7 분자와 비교하여, TNFR1 결합 및 억제는 약간 감소되었으며, 이는 CH2 도메인에 대한 융합 후 VH 및 VL 쌍 형성의 변경에 기인할 수 있다. 아트로시맙의 초기 및 말기 반감기는 각각 2.2 +/- 1.2 h 및 41.7 +/- 18.1 h로 결정되었으며, AUC는 5856 +/- 1369.9 μg/ml x h였다. 아트로시맙의 말단 반감기는 Fab 13.7에 비해 거의 40배 연장되었고, ATROSAB에 비해 1.3배 연장되었고; 이들 값은 부정확할 수 있지만 Fab 13.7 및 ATROSAB의 주입 용량이 더 낮았기 때문에, 이는 약동학적 특성에 영향을 미칠 수 있다 (예를 들어, 문헌[Richter 등 (2019) mAbs 11(4):653-665] 참조). The variable domains of the TNFR1-specific Fab 13.7 molecule fused VH to the CH2-CH3κ chain and VL to the CH2-CH31 chain (VL13.7-CH2-CH31/VH13.7-CH2-CH3κ; VL1C/VHκC) , generating the monovalent TNFR1-specific antagonistic antibody-derived molecule (Fv-Fc1κ fusion protein) known as atroximab (size 72 kDa), using a short peptide linker as a CH31- or CH2 domain N- of a CH3κ-containing Fc chain. fused at the end. Atroximab lacks the ability to mediate Fc effector function due to mutations introduced into Fc1κ; Lack of binding to effector molecules of the immune system prevents activation of TNFR1 due to secondary cross-linking of atroximab bound to cells expressing FcγRs. Atroximab, which binds TNFR1 with high affinity (K D 2.7 nM), inhibited TNF-induced activation of TNFR1 with IC 50 values of 16-55 nM in various in vitro assays and was compared with anti-human IgG antibodies (i.e., cross-linked antibodies). ) showed improved pharmacokinetic properties in the presence of Compared to the parental Fab 13.7 molecule, TNFR1 binding and inhibition were slightly reduced, which could be attributed to alterations in VH and VL pairing after fusion to the CH2 domain. The early and terminal half-lives of atrosimab were determined to be 2.2 +/- 1.2 h and 41.7 +/- 18.1 h, respectively, with an AUC of 5856 +/- 1369.9 μg/ml xh. The terminal half-life of Atroximab was extended almost 40-fold compared to Fab 13.7 and extended 1.3-fold compared to ATROSAB; These values may be imprecise, but since the infusion doses of Fab 13.7 and ATROSAB were lower, this may affect the pharmacokinetic properties (see, e.g., Richter et al. (2019) mAbs 11(4):653- 665]).
ii. 도메인 항체(dAb) 기반 TNFR1 길항제ii. TNFR1 antagonists based on domain antibodies (dAbs)
항체의 작은 단편인 또 다른 종류의 치료제는 도메인 항체(dAb; 단일 도메인 항체 또는 sdAb로도 알려짐)이며, 이는 단량체이고 항체의 중쇄(VH) 또는 경쇄(VL)의 가변 도메인을 함유한다. dAb는 항체의 가장 작은 항원 결합 단편이고; 그것들은 크기가 약 11-15kDa이며, 이는 전체 단클론성 항체(mAb) 크기의 약 1/10이다. dAb와 유사하게 낙타과에서 발생하는 나노바디는 항원 결합 부위가 VHH로 알려진 단일 짝을 이루지 않은 가변 도메인인 중쇄만을 포함하는 항체를 생산한다. dAb에는, 각 VH 및 각 VL에 3개의 상보성 결정 영역(CDR)이 있고; 따라서 각 dAb는 표적 항원에 결합하는 고도로 다양한 루프 영역인 항체의 VH-VL 쌍으로부터의 6개 CDR 중 3개를 포함한다. Another class of therapeutic agent, which is a small fragment of an antibody, is a domain antibody (dAb; also known as a single domain antibody or sdAb), which is a monomer and contains the variable domain of either the heavy (V H ) or light (V L ) chain of an antibody. dAb is the smallest antigen-binding fragment of an antibody; They are about 11-15 kDa in size, which is about 1/10 the size of all monoclonal antibodies (mAbs). Similar to dAbs, nanobodies originating in Camelidae produce antibodies containing only a heavy chain in which the antigen binding site is a single unpaired variable domain known as VHH . In the dAb, there are three complementarity determining regions (CDRs) in each V H and each V L ; Thus, each dAb contains three of the six CDRs from a V H -V L pair of antibodies, which are highly divergent loop regions that bind the target antigen.
크기가 더 작기 때문에, dAb는 박테리아 배양에서 더 높은 수율로 생산되며 단일 폴리펩티드 사슬만 생산되기 때문에 파아지 디스플레이에 더 적합하다. 친화도와 효능이 높은 특정 dAb는 단백질 공학으로 신속하게 생산할 수 있다. 작은 크기의 dAb는 또한 증가된 조직 침투, 안정성 및 전달 제형의 선택을 허용한다. 크기가 작기 때문에, 상이한 항원/표적에 특이적인 연결된 dAb를 함유하는 분자를 생성할 수 있고, 이는 종래 항체로는 불가능하고 Fab 및 scFv와 같은 다른 항체 단편으로는 달성하기 어렵다. dAb의 단량체 및 1가 결합 양상으로 인해, 이들은 표적이 단클론성 항체로 개입할 수 없는 경우에 사용하기에 적합하다. TNFR1은 그러한 표적 중 하나이고 TNFR1은 항체 유도 수용체 가교에 의해 활성화/효능화된다 (예를 들어, 문헌[Holt 등 (2003) Trends in Biotechnology 21(11):484-490; Schmidt 등 (2013) Arthritis & Rheumatism 65(9):2262-2273; Goodall 등 (2015) PLoS ONE 10(9):e0137065] 참조). Because of their smaller size, dAbs are produced in higher yields in bacterial culture and are better suited for phage display because only a single polypeptide chain is produced. Specific dAbs with high affinity and potency can be rapidly produced by protein engineering. The small size of dAbs also allows for increased tissue penetration, stability and choice of delivery formulation. Because of their small size, it is possible to generate molecules containing linked dAbs specific for different antigens/targets, which is impossible with conventional antibodies and difficult to achieve with other antibody fragments such as Fabs and scFvs. Due to the monomeric and monovalent binding behavior of dAbs, they are suitable for use where the target cannot be intervened with monoclonal antibodies. TNFR1 is one such target and TNFR1 is activated/agonized by antibody-induced receptor cross-linking (see, e.g., Holt et al. (2003) Trends in Biotechnology 21(11):484-490; Schmidt et al. (2013) Arthritis & Rheumatism 65(9):2262-2273; Goodall et al. (2015) PLoS ONE 10(9):e0137065).
작은 크기 항체 단편, 예컨대 dAb, scFv, Fv, 디설파이드 결합된 Fv 및 Fab은 더 큰 분자와 비교하여 생산 및 취급이 더 쉽고 신체 전체에 빠르게 분포되지만; 짧은 생체 내 반감기는 치료 효능을 제한한다. 다른 항체 단편과 마찬가지로, dAb의 혈청 반감기를 증가시키면 치료 효능이 증가하고 투여 빈도가 감소하는데, 특히 류마티스성 관절염이나 암 치료와 같이 혈류에서 결합 항원이 필요한 적용 분야에서 그러하다. 이것은 PEG화, 혈청 알부민에 대한 접합, 혈청 알부민에 특이적으로 결합하는 제2 dAb와의 융합, 또는 Fc 단편 또는 완전한 항체 불변 영역에 대한 융합에 의해 달성될 수 있다. Fc 영역과의 융합은 또한 보체 활성화, 항체 의존성 세포 독성 또는 면역 복합체의 Fc 매개 청소능을 포함하는 Fc 이펙터 기능의 동원을 허용한다 (예를 들어, 문헌[Holt 등 (2003) Trends in Biotechnology 21(11):484-490; Goodall 등 (2015) PLoS ONE 10(9):e0137065] 참조). Small size antibody fragments such as dAbs, scFvs, Fvs, disulfide-linked Fvs and Fabs are easier to produce and handle and rapidly distribute throughout the body compared to larger molecules; The short in vivo half-life limits therapeutic efficacy. As with other antibody fragments, increasing the serum half-life of a dAb increases therapeutic efficacy and reduces dosing frequency, particularly in applications where binding antigen is required in the bloodstream, such as rheumatoid arthritis or cancer treatment. This can be achieved by PEGylation, conjugation to serum albumin, fusion to a second dAb that specifically binds serum albumin, or fusion to an Fc fragment or complete antibody constant region. Fusion to an Fc region also allows recruitment of Fc effector functions, including complement activation, antibody-dependent cytotoxicity or Fc-mediated clearance of immune complexes (see, e.g., Holt et al. (2003) Trends in Biotechnology 21(11):484-490; Goodall et al. (2015) PLoS ONE 10(9):e0137065).
a) 항-TNFR1 dAb-항-알부민 dAb 융합 작제물a) anti-TNFR1 dAb-anti-albumin dAb fusion constructs
DMS5540은 25kDa 마우스 TNFR1 길항제로서, 알부민 결합 dAb (AlbudAb; 혈청 반감기를 연장하기 위해)와 융합된 비경쟁적(TNF 결합을 방해하지 않음) 항-TNFR1 dAb를 함유하는 이중특이적 단일 가변 도메인 항체이다. 인간 TNFR1에 결합하지 않는 DMS5540은 마우스 섬유아세포주 L929(TNFα 매개 세포독성에 매우 민감함)에서 TNFα 매개 세포독성을 억제하는 것으로 밝혀졌다. DMS5540을 마우스에 정맥 주사한 후 4시간 후에 TNFα를 정맥 볼러스 주사하여 혈청 IL-6 수준을 평가하였다. DMS5540은 특정 항원 결합이 없지만 AlbudAb에 융합된 대조군 dAb(DMS5538) 또는 dAb가 없는 대조군 dAb를 투여한 마우스와 비교할 때 감소된 IL-6 반응에 의해 결정된 바와 같이 생체 내에서 TNFα 매개 신호전달 효과의 용량 의존적 억제를 입증하였다. (예를 들어, 문헌[Goodall 등 (2015) PLoS ONE 10(9):e0137065] 참조). DMS5540 is a 25 kDa mouse TNFR1 antagonist, a bispecific single variable domain antibody containing a non-competitive (does not interfere with TNF binding) anti-TNFR1 dAb fused to an albumin binding dAb (AlbudAb; to extend serum half-life). DMS5540, which does not bind human TNFR1, was found to inhibit TNFα-mediated cytotoxicity in the mouse fibroblast cell line L929, which is highly sensitive to TNFα-mediated cytotoxicity. Serum IL-6 levels were evaluated by intravenous bolus injection of TNFα 4 hours after intravenous injection of DMS5540 into mice. DMS5540 lacks specific antigen binding but has a capacity for TNFα-mediated signaling effects in vivo as determined by reduced IL-6 responses when compared to mice dosed with a control dAb fused to AlbudAb (DMS5538) or a control dAb without dAb. Dependent inhibition was demonstrated. (See, e.g., Goodall et al. (2015) PLoS ONE 10(9):e0137065).
또 다른 연구에서 콜라겐 유발 관절염(CIA)이 있는 마우스는 관절염 발병일부터 10일 동안 DMS5540, 아이소타입(음성) 대조군 dAb(DMS5538) 또는 두 수용체(TNFR1 및 TNFR2)를 모두 차단하고 마우스 TNF를 억제하는 마우스 IgG1 Fc와 유전적으로 융합된 뮤린 TNFR2로 처리되었고, 질환 진행은 모니터링되었다. 전신 사이토카인의 농도를 측정하고, 림프절과 비장에서 T 세포 하위 서브세트의 수를 평가하고, 고유 Treg 세포 기능을 평가하였다. 질환 진행은 음성 대조군과 비교하여 DMS5540으로 TNFR1 차단 및 mTNFRII-Fc로 TNFR1/2 차단에 의해 유사하게 억제되었으며, 이는 TNFR1 또는 TNF 차단이 관절염에서 관절 손상을 초래하는 염증 매개체로부터 관절을 보호함을 나타낸다. 염증유발 사이토카인(예를 들어, IFNγ, IL-10 및 RANTES)의 발현 수준으로 측정한 이펙터 T 세포 활성은 mTNFRII-Fc로 TNFR1/2를 차단한 후 증가했지만 DMS5540으로 TNFR1을 선택적으로 차단한 후에는 증가하지 않았고, 이는 TNFR2 신호전달에 대한 면역 조절 역할(예를 들어, T 세포 이펙터 기능 억제)을 나타낸다. 또한, TNFR1/2가 아닌 TNFR1의 차단은 Treg 세포의 확대 및 활성화를 초래하는 반면, Treg에 의해 발현되는 FoxP3 및 TNFR2의 발현 증가는 관해를 거친 관절에서 관찰되었으며, 이는 염증 해소의 역할을 나타낸다. 이러한 결과는 TNFR2가 아닌 TNFR1의 신호전달 억제가 염증을 억제하고 Treg 세포 억제인자 활성을 촉진하여 기존의 TNF 억제 방법과 비교하여 강화된 치료 효능을 가져온다는 것을 나타낸다 (예를 들어, 문헌[McCann 등 (2014) Arthritis & Rheumatology 66(10):2728-2738] 참조). In another study, mice with collagen-induced arthritis (CIA) were treated with DMS5540, an isotype (negative) control dAb (DMS5538), or a drug that blocks both receptors (TNFR1 and TNFR2) and inhibits mouse TNF for 10 days from the onset of arthritis. Treatment with murine TNFR2 genetically fused to mouse IgG1 Fc and disease progression monitored. Concentrations of systemic cytokines were measured, numbers of T cell sub-sets in lymph nodes and spleen were evaluated, and intrinsic Treg cell function was assessed. Disease progression was similarly inhibited by TNFR1 blockade with DMS5540 and TNFR1/2 blockade with mTNFRII-Fc compared to negative controls, indicating that TNFR1 or TNF blockade protects joints from inflammatory mediators that lead to joint damage in arthritis . Effector T cell activity, as measured by expression levels of pro-inflammatory cytokines (e.g., IFNγ, IL-10, and RANTES), increased after TNFR1/2 blockade with mTNFRII-Fc, but not after selective TNFR1 blockade with DMS5540. did not increase, indicating an immune modulatory role for TNFR2 signaling (eg suppression of T cell effector function). In addition, blocking TNFR1 but not TNFR1/2 resulted in expansion and activation of Treg cells, whereas increased expression of FoxP3 and TNFR2 expressed by Treg was observed in joints that went through remission, indicating a role in relieving inflammation. These results indicate that inhibition of signaling of TNFR1, but not TNFR2, inhibits inflammation and promotes Treg cell suppressor activity, resulting in enhanced therapeutic efficacy compared to conventional TNF inhibition methods (see, for example, McCann et al. (2014) Arthritis & Rheumatology 66(10):2728-2738).
DMS5540은 또한 지질다당류 (LPS) 유도 골용해의 생체 내 마우스 모델에서 mTNFR2.Fc(항-TNF)보다 염증에 의해 유발된 파골세포 형성 및 골 손실을 더 효과적으로 예방한다. TNFR2 결핍 마우스는 LPS 유도 뼈 파괴가 증가한 것으로 나타났다. 시험관 내에서, 항인간 TNFR1 dAb를 함유하는 DMS5540, DMS5541의 인간 동등물은 저용량 TNF의 존재 및 부재에서 에타네르셉트보다 더 효과적으로 인간 파골세포생성을 감소시켰다. 이러한 결과는 TNFR2 신호전달에 대한 골 보호 역할을 나타낸다. 결과적으로, TNFR1의 선택적 억제는 골수염 및 인공관절주위 골용해 및 무균성 이완과 같은 염증성 골 손실 장애에서 치료적 개입을 위해 사용될 수도 있다 (예를 들어, 문헌[Esperito Santo 등 Biochem . Biophys . Res. Commun . 464:1145-1150] 참조). DMS5540 also prevents inflammation-induced osteoclastogenesis and bone loss more effectively than mTNFR2.Fc (anti-TNF) in an in vivo mouse model of lipopolysaccharide (LPS) induced osteolysis. TNFR2-deficient mice showed increased LPS-induced bone destruction. In vitro, DMS5540, the human equivalent of DMS5541, containing the anti-human TNFR1 dAb reduced human osteoclastogenesis more effectively than etanercept in the presence and absence of low-dose TNF. These results indicate a bone protective role for TNFR2 signaling. Consequently, selective inhibition of TNFR1 may be used for therapeutic intervention in inflammatory bone loss disorders such as osteomyelitis and periarticular osteolysis and aseptic relaxation (see, for example, Esperito Santo et al. Biochem . Biophys . Res. Commun . 464:1145-1150).
AlbudAb에 융합된 비경쟁적 인간 TNFR1 특이적 dAb를 함유하는 DMS5541(TNFRI-AlbudAb로도 알려짐)은 TNFR1 및 TNFR2를 발현하고 외인성 자극의 부재에서 자발적으로 염증성 사이토카인 및 케모카인을 생성하는 생체외에서 배양된 인간 류마티스성 관절염(RA) 활막 단핵 세포 (MNC)에서 TNFR1을 통한 TNF 신호전달의 선택적 차단에 대해 평가되었다. DMS5541은 TNF 리간드 차단과 유사한 수준으로 에타네르셉트와 함께 염증유발 사이토카인 GM-CSF, IL-10, IL-1 및 IL-6, 케모카인 IL-8, RANTES(CCL5) 및 MCP-1(CCL2)의 생성을 억제하였다. DMS5541이 인간 횡문근육종 KYM-1D4 세포에서 TNFα 유도 세포독성을 에타네르셉트에 의한 TNF 차단과 유사하게 용량 의존적 방식으로 억제했기 때문에 이러한 억제는 세포 독성 때문이 아니다. 또한, DMS5541은 가용성 TNFR2가 아닌 가용성 TNFR1의 생성을 억제하였고, 이는 TNFR1에 대한 선택성을 입증한다. 이러한 결과는 TNFR1 경로가 생체외 배양된 RA 활막 MNC 질환 모델에서 관찰되는 TNF 반응을 담당하는 우세한 염증 경로임을 나타낸다 (예를 들어, 문헌[Schmidt 등 (2013) Arthritis & Rheumatism 65(9):2262-2273] 참조). DMS5541 (also known as TNFRI-AlbudAb), which contains an uncompetitive human TNFR1-specific dAb fused to AlbudAb, is an ex vivo cultured human rheumatoid cell that expresses TNFR1 and TNFR2 and produces inflammatory cytokines and chemokines spontaneously in the absence of exogenous stimuli. Selective blockade of TNF signaling through TNFR1 in rheumatoid arthritis (RA) synovial mononuclear cells (MNC) was evaluated. DMS5541 inhibited the pro-inflammatory cytokines GM-CSF, IL-10, IL-1 and IL-6, chemokines IL-8, RANTES (CCL5) and MCP-1 (CCL2) together with etanercept at levels similar to TNF ligand blockade. inhibited the formation of This inhibition was not due to cytotoxicity, as DMS5541 inhibited TNFα-induced cytotoxicity in human rhabdomyosarcoma KYM-1D4 cells in a dose-dependent manner, similar to TNF blockade by etanercept. In addition, DMS5541 inhibited the production of soluble TNFR1 but not soluble TNFR2, demonstrating selectivity for TNFR1. These results indicate that the TNFR1 pathway is the predominant inflammatory pathway responsible for the TNF response observed in the ex vivo cultured RA synovial MNC disease model (see, e.g., Schmidt et al. (2013) Arthritis & Rheumatism 65(9):2262-2273).
b) GSK1995057 및 GSK2862277로 지정된 도메인 항체 단편 b) domain antibody fragments designated GSK1995057 and GSK2862277
GSK1995057(서열번호: 55 참조)로 지정된 도메인 항체 단편은 TNFR2가 아닌 TNFR1을 통한 TNF 신호전달을 선택적으로 길항하는 단기 작용 완전 인간 도메인 항체(dAb) 단편(VH 사슬 함유)이다. GSK1995057은 크기가 작기 때문에 폐에 직접 분무할 수 있으며 흡입을 통한 급성 호흡 곤란 증후군(ARDS)의 동물 및 인간 모델 치료에 대해 조사되었다. GSK1995057은 비-인간 영장류(사이노몰구스 원숭이) 및 인간 ARDS 모델에서 폐 염증을 감소시킨다. 폐 호중구 침윤은 ARDS의 병인의 중심이며 염증유발 매개체의 작용으로 인한 폐포-모세혈관 장벽의 손상으로 인해 증가한다. TNF-α는 내피 투과성 증가에 기여하고 GSK1995057은 이러한 증가를 방지하여 TNFR1 신호전달이 TNF 유도 내피 투과성을 매개함을 나타낸다 (예를 들어, 문헌[Proudfoot 등 (2018) Thorax 73:723-730] 참조). 고유한 짧은 반감기와 자가항체에 의한 중화로 인해 실험이 실패하였다. GSK1995057의 면역원성은 dAb를 적절하게 인간화하지 못한 것보다 E. 콜라이에서 만들어진 단백질의 부적절한 폴딩 때문일 수 있고; 그것은 인간 항체 단편으로부터 유래되었고, 초가변 서열만이 TNFR1에 대한 특이성을 적응시키기 위해 변경되었다 (예를 들어, 국제 PCT 공개 번호 WO2008/149148A2 참조).The domain antibody fragment designated GSK1995057 (see SEQ ID NO: 55) is a short acting fully human domain antibody (dAb) fragment (containing V H chain) that selectively antagonizes TNF signaling through TNFR1 but not TNFR2. Because of its small size, GSK1995057 can be nebulized directly into the lungs and has been investigated for the treatment of animal and human models of acute respiratory distress syndrome (ARDS) via inhalation. GSK1995057 reduces lung inflammation in non-human primates (cynomolgus monkeys) and human ARDS models. Pulmonary neutrophil infiltration is central to the etiology of ARDS and is increased due to damage to the alveolar-capillary barrier due to the action of proinflammatory mediators. TNF-α contributes to an increase in endothelial permeability and GSK1995057 prevents this increase, indicating that TNFR1 signaling mediates TNF-induced endothelial permeability (see, e.g., Proudfoot et al. (2018) Thorax 73:723-730). The experiment failed due to its inherently short half-life and neutralization by autoantibodies. The immunogenicity of GSK1995057 may be due to improper folding of the protein made in E. coli rather than to the failure to properly humanize the dAb; It was derived from a human antibody fragment, only the hypervariable sequence was altered to adapt specificity to TNFR1 (see, eg, International PCT Publication No. WO2008/149148A2).
준임상 조직 손상을 모델링하는 임상적으로 관련된 염증 반응을 유발하는 잘 확립된 모델인 단일 흡입 리포다당류(LPS) 도전에 노출된 원숭이에서, GSK1995057로 전처리하면 폐 호중구 침윤, 전염증성 케모카인 수준, 내피 손상 지표 및 폐포-모세관 누출이 용량 의존적으로 감소한다. 결과는 흡입된 GSK1995057이 더 높은 용량의 비경구 투여된 항체와 동일한 결과를 가져올 수 있음을 나타낸다. 건강한 인간 대상체를 단일 분무 용량의 GSK1995057로 전처리한 다음 저용량의 흡입 LPS에 노출시킨 임상 시험에서, 전처리된 대상체는 위약을 받은 대상체와 비교하여 LPS 도전에 대한 반응에서 전신 염증과 호중구 폐 염증 및 내피 손상 징후가 적었습니다. 이러한 결과에도 불구하고 임상으로의 번역은 가능성이 없다. 시험에서, GSK1995057은 LPS 도전 이전에 투여되었지만 ARDS 환자는 일반적으로 초기 손상 후 치료가 필요하고 (예를 들어, 문헌[Proudfoot 등 (2018) Thorax 73:723-730] 참조), 전에는 아니다. In monkeys exposed to a single inhaled lipopolysaccharide (LPS) challenge, a well-established model that induces a clinically relevant inflammatory response modeling subclinical tissue damage, pretreatment with GSK1995057 resulted in pulmonary neutrophil infiltration, proinflammatory chemokine levels, and endothelial damage. Indicator and alveolar-capillary leakage are reduced in a dose-dependent manner. The results indicate that inhaled GSK1995057 can produce the same results as higher doses of parenterally administered antibody. In a clinical trial in which healthy human subjects were pretreated with a single nebulized dose of GSK1995057 and then exposed to low doses of inhaled LPS, pretreated subjects showed systemic inflammation and neutrophilic lung inflammation and endothelial damage in response to LPS challenge compared to subjects receiving placebo. There were few signs. Despite these findings, clinical translation is unlikely. In trials, GSK1995057 was administered prior to LPS challenge, but patients with ARDS usually require treatment after an initial injury (e.g., Proudfoot et al. (2018) Thorax 73:723-730]), but not before.
또 다른 어려움은 GSK1995057의 임상 1상 연구에서 관찰된 항-TNFR1 제제에 대한 항-약물 항체(ADA)의 해로운 영향이고, 약 50%의 순진하고 건강한 대상체의 약물에 존재하는 높은 수준의 기존 자연 발생 항-면역글로불린 자가항체(즉, ADA)로 인해 2-10 μg/kg의 용량에서 사이토카인 방출 주입 반응이 관찰되었다. 구체적으로, ADA는 인간 항-VH(HAVH) 자가항체였으며, GSK1995057의 프레임워크 서열을 갖는 HAVH 자가항체의 복합체는 TNFR1 신호전달을 활성화시켰고, HAVH 자가항체 역가가 높은 대상체에서 경증에서 중등도의 주입 반응을 일으켰다 (예를 들어, 문헌[Cordy 등 (2015) Clin. Exp. Immunol. 182:139-148] 참조). Another difficulty is the detrimental effect of anti-drug antibodies (ADAs) to anti-TNFR1 agents observed in the
dAb GSK1995057의 프레임워크 영역에 대한 HAVH 자가항체의 결합은 시험관 내에서 사이토카인 방출을 유도한다. 자가항체에 대한 GSK1995057의 에피토프를 특성화하였다. 기존의 항-약물 항체(ADA)는 dAb GSK1995057을 포함하여 VH dAb의 C-말단 지역에 가까운 에피토프에 결합한다. 이에 대항하기 위해, 변형된 dAb의 C-말단에 단일 알라닌 잔기를 첨가함으로써 GSK2862277(서열번호: 56 참조)로 지정된 변형된 dAb를 생성하였다. 이 변형은 HAVH 자가항체에 대한 결합을 감소시켰다. GSK1995057에 결합하는 HAVH 자가항체에 대해 양성으로 선별된 건강한 대상체의 혈청 샘플에서, 기존 자가항체의 빈도는 GSK1995057 특이적 HAVH 자가항체의 경우 51%에서 GSK2862277 특이적 자가항체의 경우 7%로 감소하였다. 인간 시험관 내 시스템 및 동물 생체 내 실험에서 GSK2862277은 GSK2862277 특이적 자가항체가 존재하는 경우에도 TNFR1 활성화를 유도하지 않으며, 표적 친화성, 시험관 내 효능 및 생체 내 약동학 및 약력학을 포함하는 GSK2862277의 약리학 및 생물물리학적 특성은모 dAb(GSK1995057)의 것과 유사하다. Binding of the HAVH autoantibody to the framework regions of dAb GSK1995057 induces cytokine release in vitro. The epitope of GSK1995057 for the autoantibody was characterized. Existing anti-drug antibodies (ADA) bind epitopes close to the C-terminal region of V H dAbs, including dAb GSK1995057. To combat this, a modified dAb designated GSK2862277 (see SEQ ID NO: 56) was created by adding a single alanine residue to the C-terminus of the modified dAb. This modification reduced binding to the HAVH autoantibody. In serum samples from healthy subjects screened positive for HAVH autoantibodies that bind GSK1995057, the frequency of preexisting autoantibodies decreased from 51% for GSK1995057 specific HAVH autoantibodies to 7% for GSK2862277 specific autoantibodies. In human in vitro systems and animal in vivo experiments, GSK2862277 does not induce TNFR1 activation even in the presence of GSK2862277-specific autoantibodies, and pharmacology and biology of GSK2862277, including target affinity, in vitro potency, and in vivo pharmacokinetics and pharmacodynamics Physical properties are similar to those of the parent dAb (GSK1995057).
흡입(i.h.) 및 정맥(i.v.) GSK2862277의 단일 및 반복 용량의 안전성, 내약성, 약동학 및 약력학을 조사하기 위한 1상 임상 시험은 GSK2862277이 흡입 또는 정맥 내 투여 시 일반적으로 내약성이 우수하다는 사실을 발견하였다. 그러나 한 대상자는 반복적인 IV 투약 후 사이토카인 방출과 함께 가벼운 주입 반응을 보였고; 이 대상체는 GSK2862277에 대한 기존 항체의 혈청 수준가 높았고, 이 대상체의 혈청 항체는 시험관 내 검정에서 TNFR1 신호전달을 활성화하는 것으로 나타났다. GSK2862277과 자가항체 사이의 상호작용은 수용체를 효능시키는 세포 TNFR1의 항체 매개 GSK2862277 의존성 가교를 일으키고 사이토카인 방출을 유도한다. 따라서, 기존 HAVH 자가항체에 대한 GSK2862277의 감소된 결합에도 불구하고, 부작용은 여전히 변형된 dAb 프레임워크에 특이적인 새로운 기존 항체 반응의 존재와 연관이 있었다. 이러한 결과는 TNFR1에 대한 생물학적 길항제 개발의 어려움을 강조한다 (예를 들어, 문헌[Cordy 등 (2015) Clin . Exp . Immunol . 182:139-148] 참조). 따라서, 개선된 TNFR1 길항제가 여전히 필요하다.A
iii. 나노바디(Nb) iii. Nanobody (Nb)
dAb와 유사하게, 나노바디(Nb)는 경쇄가 없는 낙타 중쇄 항체에서 유래된 작은 항원 결합 단편이다. 이들은 작고(15kDa), 면역원성이 낮고 친화력이 높으며 용해성이 있고 안정적이며 단일 유전자/엑손(VHH)에 의해 인코딩되어 모듈화되어 박테리아 또는 효모에서 고수율 생산이 가능하다. Similar to dAbs, nanobodies (Nb) are small antigen-binding fragments derived from camel heavy chain antibodies that lack light chains. They are small (15 kDa), low immunogenic, high affinity, soluble, stable, encoded by a single gene/exon (VHH) and modular, enabling high-yield production in bacteria or yeast.
iv. 항-TNFR1 나노바디-항-알부민 나노바디 융합 작제물iv. Anti-TNFR1 nanobody-anti-albumin nanobody fusion construct
TROS(TNF Receptor One-Silencer; Nb Alb-70-96이라고도 함)는 TNFR1에 결합하기 위해 TNF와 경쟁하는 인간 TNFR1의 3가 고친화성 나노바디 기반 선택적 억제제이다. TROS를 생성하기 위해, 재조합 인간 가용성 TNFR1로 알파카의 면역화에 의해 제작된 VHH 라이브러리로부터 생성된 2개의 항-인간 TNFR1 나노바디(Nb 70 및 Nb 96; 각각 서열번호: 683 및 684 참조)은 연결되고, (Gly4Ser)3 링커를 통해, 항-알부민 나노바디(Nb Alb)에 연결되어 혈청 반감기를 증가시켜 3가 TROS를 생성한다. 생성된 TROS의 혈청 반감기는 ~24시간이고; 1가 Nb의 혈청 반감기는 단지 ~1.5시간이다. TROS를 사용한 치료는 마우스 실험적 자가면역 뇌척수염(EAE; MS의 모델)에서 질환 발병을 지연시키고 확립된 질환을 예방하고; 치료 효과는 TNFR2를 통한 신호로의 TNF 전환 및 그러한 신호의 효과 때문이다. TROS는 또한 크론병 환자의 생체외 배양 결장 생검에서 염증을 억제하고 간 키메라 인간화 마우스에서 급성 TNF 유발 간 염증 모델에서 염증을 길항한다 (예를 들어, 문헌[Steeland 등 (2015) J. Biol . Chem . 290(7):4022-4037; Steeland 등 (2017) Sci . Reports 7:13646] 참조). TROS (TNF Receptor One-Silencer; also known as Nb Alb-70-96) is a trivalent high-affinity nanobody-based selective inhibitor of human TNFR1 that competes with TNF for binding to TNFR1. To generate TROS, two anti-human TNFR1 nanobodies (Nb 70 and Nb 96; see SEQ ID NOS: 683 and 684, respectively) generated from a VHH library constructed by immunization of alpaca with recombinant human soluble TNFR1 are linked , via a (Gly 4 Ser) 3 linker, to an anti-albumin nanobody (Nb Alb) to increase serum half-life to generate trivalent TROS. The serum half-life of TROS produced is -24 hours; The serum half-life of monovalent Nb is only -1.5 hours. Treatment with TROS delays disease onset and prevents established disease in mouse experimental autoimmune encephalomyelitis (EAE; a model of MS); The therapeutic effect is due to the conversion of TNF to signaling through TNFR2 and the effect of such signaling. TROS also inhibits inflammation in ex vivo cultured colon biopsies of patients with Crohn's disease and antagonizes inflammation in an acute TNF-induced liver inflammation model in liver chimeric humanized mice (see, e.g., Steeland et al. (2015) J. Biol . Chem . 290(7):4022-4037; Steeland et al. (2017) Sci . Reports 7:13646]).
c. TNF(DN-TNF)/TNF 뮤테인의 우성-음성 억제제c. Dominant-negative inhibitors of TNF (DN-TNF)/TNF muteins
또 다른 종류의 TNF 억제제는 TNF 뮤테인으로도 알려진 TNF(DN-TNF)의 신호전달 능력이 없는 우성 음성 억제제이다. DN-TNF는 TNFR1 및 TNFR2에 대한 결합 및 신호전달을 무효화하는 돌연변이가 있는 TNF의 조작된 변이체이다. DN-TNF는 천연 TNF 동종삼량체와 서브유닛을 신속하게 교환함으로써 가용성 TNF(sTNF 또는 solTNF)를 선택적으로 억제하고, 수용체 결합 표면이 파괴된 불활성 혼합 TNF 이종삼량체를 형성하여 TNF 수용체와의 상호작용을 방지한다. DN-TNF는 막관통 TNF (tmTNF)에 영향을 주지 않고 TNFR2를 통한 TNF 신호전달의 보호 역할을 유지한다. DN-TNF는 TNF 유도 NF-κB 활성 및 카스파제 매개 세포자멸을 억제하고, 관절염 및 파킨슨병의 동물 모델에서 질환 중증도를 감소시킨다. 구조 때문에 이러한 분자는 면역원성일 가능성이 높다. Another class of TNF inhibitors are dominant-negative inhibitors that lack the signaling ability of TNF (DN-TNF), also known as TNF muteins. DN-TNF is an engineered variant of TNF with mutations that abrogate binding and signaling to TNFR1 and TNFR2. DN-TNF interacts with TNF receptors by selectively inhibiting soluble TNF (sTNF or solTNF) by rapidly exchanging subunits with native TNF homotrimers and forming inactive mixed TNF heterotrimers with disrupted receptor-binding surfaces to prevent DN-TNF retains the protective role of TNF signaling through TNFR2 without affecting transmembrane TNF (tmTNF). DN-TNF inhibits TNF-induced NF-κB activity and caspase-mediated apoptosis and reduces disease severity in animal models of arthritis and Parkinson's disease. Because of their structure, these molecules are likely to be immunogenic.
가용성 TNF의 선택적 억제제로서, DN-TNF는, solTNF 및 tmTNF에 결합하는 항-TNF 요법과 달리 tmTNF 신호전달을 억제하지 않으며 L. 모노사이토게네스(L. monocytogenes)에 의한 감염에 대한 마우스의 저항성을 억제하지 않는다. DN-TNF의 예는 TNFR에 대한 결합을 손상시키는 서열번호: 1에 제시된 아미노산 서열(서열번호: 2에 제시된 solTNF의 서열과 관련하여 잔기 L57Y, S86Q, Y87H, I97T, Y115Q 및 A145R에 상응함)와 관련하여 대체 L133Y, S162Q, Y163H, I173T, Y191Q 및 A221R 중 하나 이상을 함유하는 TNF 돌연변이체이다. 발현을 개선하기 위한 추가 변형, 예를 들어, 부위 특이적 PEG화도 포함될 수 있다 (예를 들어, 문헌[Zalevsky 등 (2007) J. Immunol. 179:1872-1883] 참조). As a selective inhibitor of soluble TNF, DN-TNF does not inhibit tmTNF signaling and, unlike anti-TNF therapies that bind to solTNF and tmTNF, does not inhibit tmTNF signaling and is resistant to infection by L. monocytogenes in mice. do not suppress An example of DN-TNF is the amino acid sequence set forth in SEQ ID NO: 1 that impairs binding to TNFR (corresponding to residues L57Y, S86Q, Y87H, I97T, Y115Q and A145R relative to the sequence of solTNF set forth in SEQ ID NO: 2) is a TNF mutant containing one or more of the substitutions L133Y, S162Q, Y163H, I173T, Y191Q and A221R with respect to. Additional modifications to improve expression may also be included, such as site-specific PEGylation (see, for example, Zalevsky et al. (2007) J. Immunol. 179:1872-1883]).
예를 들어, 서열번호: 2와 관련하여 TNF 돌연변이 R32W 및 S86T는 TNFR2에 대한 친화성에서 수백 배의 손실을 초래하지만 TNFR1에 대한 결합에는 영향을 미치지 않는다. R32W/S86T 이중 돌연변이체는 TNFR1에 대한 결합 손실 없이 TNFR2에 대한 모든 결합을 제거한다. 돌연변이 L29S, L29G, L29Y, R31E, R31N, R32Y, R32W, S86T, L29S/R32W, L29S/S86T, R32W/S86T, L29S/R32W/S86T, R31N/R32T, R31E/S86T, R31N/R32T/S86T, 및 E146R은 서열번호: 2와 관련하여 또한 TNFR1에 대한 선택성을 부여한다. 서열번호: 2와 관련하여 돌연변이 D143N, D143Y, A145R 및 D143N/A145R은 TNFR2에 대해 선택적인 TNF 변이체를 제공한다 (예를 들어, Loetscher 등 (1993) J. Biol. Chem. 268(35):26350-26357; 미국 특허 번호 5,422,104] 참조). For example, the TNF mutations R32W and S86T with respect to SEQ ID NO: 2 result in a multifold loss in affinity for TNFR2 but do not affect binding to TNFR1. The R32W/S86T double mutant eliminates all binding to TNFR2 without loss of binding to TNFR1. Mutation L29S, L29G, L29Y, R31E, R31N, R32Y, R32W, S86T, L29S/R32W, L29S/S86T, R32W/S86T, L29S/R32W/S86T, R31N/R32T, R31E/S86T, R31E/S86T, R31N/R32T , And E146R, in relation to SEQ ID NO: 2, also confers selectivity for TNFR1. The mutations D143N, D143Y, A145R and D143N/A145R with respect to SEQ ID NO: 2 provide TNF variants that are selective for TNFR2 (eg, Loetscher et al. (1993) J. Biol. Chem. 268(35):26350-26357; See U.S. Patent No. 5,422,104).
XPro1595(INmuneBio; 서열번호: 701 참조)로 지정된 변형된 TNF는 TNFR1 신호전달을 우선적으로 억제하는 PEG화된 가용성 DN-TNF 뮤테인이며 서열번호: 2와 관련하여 돌연변이 V1M, R31C, C69V, Y87H, C101A 및 A1456R을 함유한다 (예를 들어, 미국 공개 번호 2015/0239951 참조). XPro1595는 신경 염증을 감소시키고 알츠하이머병의 치료에 대해 연구되고 있다 (예를 들어, 임상 시험 식별 번호 NCT03943264 참조). XPro1595는 알츠하이머병(3xTgAD) 마우스 모델에서 아밀로이드 병리 발달을 차단하고, 알츠하이머병의 상이한 (tgCRND8) 마우스 모델에서 신경 통신 및 인지 장애의 손실을 방지하고, 정상적인 노화된 랫트의 신경 통신 및 인지 결핍의 기능 장애를 약화시키고, 알츠하이머병의 제3 모델(5xFAD)에서 어린 마우스가 아밀로이드 병리, 인지 장애 및 신경 통신의 기능 장애가 발생하는 것을 방지한다. 알츠하이머병과 같은 병리를 가진 나이든 마우스에서, XPro1595는 아밀로이드를 감소시키고, 인지를 개선하고, 신경 통신을 구하고, 선천적 및 적응적 면역 반응을 정상화하였다. The modified TNF designated as XPro1595 (see INmuneBio; SEQ ID NO: 701) is a PEGylated soluble DN-TNF mutein that preferentially inhibits TNFR1 signaling and has mutations V1M, R31C, C69V, Y87H, C101A with respect to SEQ ID NO: 2 and A1456R (see, eg, US Publication No. 2015/0239951). XPro1595 reduces neuroinflammation and is being studied for treatment of Alzheimer's disease (see, eg, clinical trial accession number NCT03943264). XPro1595 Blocks Amyloid Pathology Development in Alzheimer's Disease (3xTgAD) Mouse Model, Prevents Loss of Neuronal Communication and Cognitive Impairment in Different (tgCRND8) Mouse Model of Alzheimer's Disease, and Functions in Neurocommunication and Cognitive Deficits in Normal Aged Rats attenuates disability and prevents juvenile mice from developing amyloid pathology, cognitive impairment and dysfunction of neuronal communication in a third model of Alzheimer's disease (5xFAD). In aged mice with pathologies such as Alzheimer's disease, XPro1595 reduced amyloid, improved cognition, rescued neural communication, and normalized innate and adaptive immune responses.
TNFR1의 수준은 TNFR2와 비교하여 해마에서 더 높으며, 젊은 성체 (6 개월) 피셔(Fischer) 344 랫트에서는 그렇지 않는다. XPro1595로 치료했을 때, 나이든 랫트는 해마 CA1 뉴런에서 Morris Water Maze 성능 개선, 소교세포 활성화 감소, 해마 장기 우울증에 대한 감수성 감소, GluR1 유형 글루타메이트 수용체 수준 증가, 및 L-유형 전압 민감성 Ca2 + 채널(L-VSCC) 감소를 나타내었고, 이는 뇌 노화와 관련된 기능적 변화가 TNF 신호전달의 선택적 변경에서 발생할 수 있음을 나타낸다. 파킨슨병 및 노화 동물 모델에서, XPro1595는 신경염증 및 소교세포 활성화를 억제한다. EAE(MS 모델)에서, XPro1595는 질환을 개선하고 재수초화를 개선하며 CNS 병변 및 신경염증을 감소시킨다. XPro1595는 또한 염증성 관절염을 개선하고 치료받은 동물의 감염에 대한 감수성을 감소시킨다. 치료 효과가 없는 에타네르셉트와 비교하여, XPro1595로 치료하면 EAE 발병이 지연되고 증상이 더 효율적으로 개선된다. XPro1595 투여는 EAE의 병변 영역에서 TNR2 발현 수준을 증가시키며, 이는 TNFR2를 통한 tmTNF 신호전달이 신경 재생에 연루됨을 나타낸다 (예를 들어, 문헌[Yang 등 (2018) Front. Immunol . 9:784; Sama 등 (2012) PLoS ONE 7(5):e38170] 참조). XPro1595는 막관통 TNF(TNFR1 및 TNFR2를 활성화)의 활성을 억제하지 않기 때문에 TNFR1의 염증 효과를 차단할 수 없다. 이는 아래에 설명된 다른 지배적인 음성 TNF 시약에도 적용된다.Levels of TNFR1 are higher in the hippocampus compared to TNFR2, but not in young adult (6 months) Fischer 344 rats. When treated with XPro1595 , aged rats showed improved Morris Water Maze performance, reduced microglia activation, reduced susceptibility to hippocampal long-term depression, increased levels of GluR1 type glutamate receptors, and L-type voltage sensitive Ca 2+ channels ( L-VSCC), indicating that functional changes associated with brain aging may arise from selective alteration of TNF signaling. In animal models of Parkinson's disease and aging, XPro1595 inhibits neuroinflammation and microglia activation. In EAE (MS model), XPro1595 ameliorates disease, improves remyelination, and reduces CNS lesions and neuroinflammation. XPro1595 also improves inflammatory arthritis and reduces the susceptibility of treated animals to infection. Compared to etanercept, which has no therapeutic effect, treatment with XPro1595 delays the onset of EAE and improves symptoms more efficiently. XPro1595 administration increases TNR2 expression levels in the lesional area of EAE, indicating that tmTNF signaling through TNFR2 is implicated in nerve regeneration (see, e.g., Yang et al. (2018) Front. Immunol . 9:784; Sama et al. (2012) PLoS ONE 7(5):e38170). XPro1595 does not inhibit the activity of transmembrane TNF (which activates TNFR1 and TNFR2) and therefore cannot block the inflammatory effects of TNFR1. This also applies to other predominantly negative TNF reagents described below.
XENP345(서열번호: 702 참조)는 서열번호: 2와 관련하여 돌연변이 I97T/A145R을 함유하는 PEG화된 DN-TNF 뮤테인이다. 파킨슨병 및 알츠하이머병의 동물 모델에서 XENP345에 의한 가용성 TNF(solTNF)의 생체 내 중화는 신경보호적이며, 신경 퇴행 및 인지 기능 장애를 감소시키고, 신경퇴행 질환 진행을 늦춘다 (예를 들어, 문헌[McCoy 등 (2006) J. Neurosci . 26(37):9365-9375; McAlpine 등 (2009) Neurobiol. Dis. 34(1):163-177] 참조). XENP345 (see SEQ ID NO: 702) is a PEGylated DN-TNF mutein containing the mutations I97T/A145R with respect to SEQ ID NO:2. In vivo neutralization of soluble TNF (solTNF) by XENP345 in animal models of Parkinson's disease and Alzheimer's disease is neuroprotective, reduces neurodegeneration and cognitive dysfunction, and slows neurodegenerative disease progression (see, e.g., McCoy et al. (2006) J. Neurosci . 26(37):9365-9375; McAlpine et al. (2009) Neurobiol. Dis. 34(1):163-177).
R1antTNF(서열번호: 703 참조)는 구조적 인간 TNF 변이체를 표시하는 파아지 라이브러리에서 확인된 TNFR1 선택적 길항 돌연변이 TNF이며, 여기서 서열번호: 2의 잔기 84-89에 상응하는 수용체 결합 부위의 6개 아미노산 잔기 각각은 돌연변이되었다. 돌연변이 A84S, V85T, S86T, Y87H, Q88N 및 T89Q를 함유하는 R1antTNF는 야생형 인간 TNF와 마찬가지로 TNFR1과 유사한 친화성을 가지며 TNFR2 활성을 방해하지 않는다. R1antTNF는 급성 간염의 두 가지 모델에서 알라닌 아미노트랜스퍼라제 및 염증유발 사이토카인 IL-2 및 IL-6의 혈청 수준 감소로 입증된 바와 같이 간 손상을 개선하였다. 그러나 R1antTNF의 혈장 반감기는 야생형 TNF와 마찬가지로 매우 짧다 (12분). R1antTNF의 생체내 반감기를 증가시키기 위해, PEG가 R1antTNF의 N-말단 부위에 결합된 PEG화된 버전인 PEG-R1antTNF가 생성되었다. PEG-R1antTNF는 이환율을 감소시키고 질환 증상을 개선하며 EAE 마우스 모델에서 탈수초화를 개선하고 척수에서 Th1 및 Th17 세포 활성화 및 염증성 T-세포 침윤을 억제한다. PEG-R1antTNF는 또한 NF-κB를 억제하고 평활근 세포 증식을 억제하며 케모카인 및 접착 분자 발현을 감소시켜 외부 혈관 커프 모델에서 대퇴골 동맥 손상을 유도한 후 IL-1 수용체 길항제 결핍 마우스에서 내막 과다형성 및 동맥 염증을 감소시킨다. 재조합 아데노바이러스 벡터를 사용하여 PEG-R1antTNF와 에타네르셉트의 항바이러스 면역에 대한 효과를 비교한 결과, PEG-R1antTMF는 바이러스 감염을 재활성화하지 않았고 주입된 아데노바이러스의 제거에 영향을 미치지 않았지만, 에타네르셉트 처리 후 바이러스 부하가 증가하였다. PEG-R1antTNF 치료는 또한 예방적 및 치료적 설정에서 CIA 증상을 지연 및 개선하고, 확립된 CIA의 치료에 사용될 때 에타네르셉트보다 더 효과적이었다 (예를 들어, 문헌[Yang 등 (2018) Front. Immunol. 9:784; Shibata 등 (2008) J. Biol. Chem. 283(2):998-1007; Kitagaki 등 (2012) J. Atheroscler. Thromb. 19(1):36-46; Fischer 등 (2015) Antibodies 4:48-70; Horiuchi 등 (2010) Rheumatology (Oxford) 49:1215-1228] 참조). R1antTNF (see SEQ ID NO: 703) is a TNFR1 selective antagonistic mutant TNF identified in a phage library displaying structural human TNF variants, wherein each of the six amino acid residues of the receptor binding site corresponding to residues 84-89 of SEQ ID NO: 2 has been mutated. R1antTNF containing the mutations A84S, V85T, S86T, Y87H, Q88N and T89Q, like wild-type human TNF, has a similar affinity to TNFR1 and does not interfere with TNFR2 activity. R1antTNF ameliorated liver damage as evidenced by reduced serum levels of alanine aminotransferase and pro-inflammatory cytokines IL-2 and IL-6 in two models of acute hepatitis. However, the plasma half-life of R1antTNF is very short (12 minutes), similar to that of wild-type TNF. To increase the half-life of R1antTNF in vivo, PEG-R1antTNF, a PEGylated version in which PEG is linked to the N-terminal region of R1antTNF, was created. PEG-R1antTNF reduces morbidity, ameliorates disease symptoms, ameliorates demyelination in an EAE mouse model, and inhibits Th1 and Th17 cell activation and inflammatory T-cell infiltration in the spinal cord. PEG-R1antTNF also induced femoral artery injury in an external vascular cuff model by inhibiting NF-κB, inhibiting smooth muscle cell proliferation, and reducing chemokine and adhesion molecule expression, followed by intimal hyperplasia and arterial hyperplasia in IL-1 receptor antagonist-deficient mice. Reduces inflammation. As a result of comparing the effects of PEG-R1antTNF and etanercept on antiviral immunity using recombinant adenoviral vectors, PEG-R1antTMF did not reactivate the viral infection and did not affect the clearance of the injected adenovirus. Viral load increased after nercept treatment. PEG-R1antTNF treatment also delayed and ameliorated CIA symptoms in both prophylactic and therapeutic settings and was more effective than etanercept when used in the treatment of established CIA (see, e.g., Yang et al (2018) Front. Immunol.9:784; Shibata et al. (2008) J. Biol. Chem. ) Antibodies 4:48-70; Horiuchi et al (2010) Rheumatology (Oxford) 49:1215-1228).
가용성 TNFR1은 또한 MS 발병 위험 증가와 연관이 있고; 따라서 DN-TNFs/TNF 뮤테인으로 달성할 수 없는 가용성 TNFR1의 중화는 유익할 수 있다. DN-TNF와 같은 solTNF의 억제제와 달리, TNFR1 길항제는 TNF 슈퍼패밀리의 또 다른 구성원인 림포독소-α(LT-α)가 TNFR1에 결합하는 것을 차단할 수 있다. LT-α는 RA 및 CIA 및 EAE와 같은 동물 질환 모델에서 염증유발 역할을 할 수 있고; 따라서 TNFR1 길항제에 의한 TNFR1에 대한 TNF 및 LT-α 결합의 동시 차단은 급성 및 만성 염증성 질환 및 장애에서 solTNF 억제와 비교하여 추가적인 이점을 가질 수 있다 (예를 들어, 문헌[Fischer 등 (2015) Antibodies 4:48-70] 참조). Soluble TNFR1 is also associated with an increased risk of developing MS; Therefore, neutralization of soluble TNFR1, which cannot be achieved with DN-TNFs/TNF muteins, may be beneficial. Unlike inhibitors of solTNF, such as DN-TNF, TNFR1 antagonists can block the binding of another member of the TNF superfamily, lymphotoxin-α (LT-α), to TNFR1. LT-α may play pro-inflammatory roles in RA and animal disease models such as CIA and EAE; Thus, simultaneous blockade of TNF and LT-α binding to TNFR1 by a TNFR1 antagonist may have additional advantages compared to solTNF inhibition in acute and chronic inflammatory diseases and disorders (see, e.g., Fischer et al. (2015) Antibodies 4:48-70).
2. TNFR2 선택적 효능제 2. TNFR2 Selective Agonists
CD4+FoxP3+ 조절 T 세포(Treg)는 면역학적 항상성을 유지하고 자가면역 반응을 억제한다. Treg는 또한 항종양 면역 반응을 조절하여 종양 면역 회피를 허용한다. 따라서 Treg는 예를 들어 자가면역 및 만성 염증성 질환 및 병태, 이식편대숙주병(GvHD), 이식 거부 및 암의 치료에서 치료 표적이다. TNFR2를 통한 TNF 신호전달은 Treg의 기능과 활성을 조절한다. TNFR2 효능제는 Treg 활성을 상향 조절하는 반면, TNFR2 길항제는 Treg 활성을 하향 조절한다. TNF-TNFR2 신호전달 경로의 Treg-자극 효과는 효능작용을 통한 자가면역 및 만성 염증성 질환, 및 길항작용을 통한 암을 포함한 여러 인간 질환 및 장애의 치료에 활용될 수 있다 (예를 들어, 문헌[Zou 등 (2018) Front. Immunol. 9:594] 참조). CD4 + FoxP3 + regulatory T cells (Tregs) maintain immunological homeostasis and suppress autoimmune responses. Tregs also modulate the antitumor immune response, allowing tumor immune evasion. Thus, Tregs are therapeutic targets, for example, in the treatment of autoimmune and chronic inflammatory diseases and conditions, graft versus host disease (GvHD), transplant rejection and cancer. TNF signaling through TNFR2 regulates Treg function and activity. TNFR2 agonists upregulate Treg activity, whereas TNFR2 antagonists downregulate Treg activity. The Treg-stimulating effect of the TNF-TNFR2 signaling pathway can be exploited for the treatment of several human diseases and disorders, including autoimmune and chronic inflammatory diseases through agonism, and cancer through antagonism (see, e.g., Zou et al. (2018) Front. Immunol. 9:594]).
TNFR2 효능제는 단클론성 TNFR2 효능제 항체와 같은 항체 및 그의 항원 결합 단편, 펩티드 및 단백질, 예컨대 TNFR2 선택적 TNF 뮤테인, 융합 단백질, 및 소분자를 포함한다. 본 명세서에 제공되는 바와 같이, TNFR2의 특정 효능작용은 Treg의 확장 및 활성화를 유도하고, 이는 면역계를 조절하고, 조직을 손상시키는 자가 반응성 CD8+ T 세포의 활동을 감소시키며, 신경 보호, 심장 보호, 장 보호 및 골 보호 효과를 포함한 세포 생존, 재생 및 보호 효과뿐만 아니라 항염증으로 신호 경로를 유도한다. 따라서, TNFR2 선택적 효능제에 의한 TNFR2 신호전달의 강화는 특히 항-TNF 요법/TNF-차단제가 실패한 신경퇴행 질환을 포함하는 자가면역 및 만성 염증성 질환 및 장애의 치료에서 TNFR1 특이적 길항작용의 치료 효과를 강화시키기 위해 사용될 수 있다. TNFR2 agonists include antibodies and antigen binding fragments thereof, such as monoclonal TNFR2 agonist antibodies, peptides and proteins, such as TNFR2 selective TNF muteins, fusion proteins, and small molecules. As provided herein, specific agonism of TNFR2 leads to expansion and activation of Tregs, which modulate the immune system, reduce the activity of autoreactive CD8 + T cells that damage tissue, and provide neuroprotective, cardioprotective , induces signaling pathways with cell survival, regeneration and protective effects, including intestinal and osteoprotective effects, as well as anti-inflammatory. Thus, enhancement of TNFR2 signaling by TNFR2 selective agonists may have a therapeutic effect of TNFR1 specific antagonism, particularly in the treatment of autoimmune and chronic inflammatory diseases and disorders, including neurodegenerative diseases where anti-TNF therapy/TNF-blockers have failed. can be used to reinforce
a. TNFR2 효능적 항체a. TNFR2 agonistic antibody
인간 TNFR2 선택적 효능제 항체에는 상업적으로 이용 가능한 MR2-1(인간, 사이노몰구스 원숭이 및 붉은털원숭이 TNFR2에 결합하는 단클론성 마우스 IgG1; Hycult Biotech) 및 클론 MAB2261(인간 TNFR2에 결합하는 단클론성 마우스 IgG2A; R&D Systems)가 포함된다. 항체와 같은 TNFR2 효능제는 CD4 세포 배양에서 FoxP3+ Treg의 균질 집단의 확대를 강력하게 자극하고 TNF, TRAF2, TRAF3, BIRC3(cIAP2) 및 FoxP3 mRNA의 발현을 상향 조절할 수 있다. 표준 시험관 내 인간 Treg 확장 프로토콜(즉, 항-CD3 항체, 항-CD28 항체, IL-2 및 라파마이신 포함)을 사용하여 배양되는 자기 활성화 세포 분류(MACS)-정제 CD4+CD25+ 세포는, TNFR2 효능제의 부재에서와와 비교하여 TNFR2 효능제 항체가 있을 때 확장될 때 더 높은 수준의 FoxP3 (및 기타 특징적인 Treg 마커) 및 더 강력한 억제 능력을 가진 확장된 Treg를 생성한다. 휴지기 표현형을 나타내는 1형 당뇨병 환자로부터 단리된 Treg는 TNFR2 효능제 항체로 시험관내 치료 시 활성화되고 확장되고; 이러한 Treg는 자가 CD8+ T 세포의 억제에 더 강력하다 (예를 들어, 문헌[Zou 등 (2018) Front. Immunol . 9:594] 참조). Human TNFR2 selective agonist antibodies include the commercially available MR2-1 (monoclonal mouse IgG1 binding to human, cynomolgus monkey and rhesus monkey TNFR2; Hycult Biotech) and clone MAB2261 (monoclonal mouse IgG2A binding to human TNFR2). ; R&D Systems). TNFR2 agonists such as antibodies can potently stimulate the expansion of a homogeneous population of FoxP3 + Tregs in CD4 cell culture and upregulate the expression of TNF, TRAF2, TRAF3, BIRC3 (cIAP2) and FoxP3 mRNA. Magnetic Activated Cell Sorting (MACS)-purified CD4 + CD25 + cells cultured using standard in vitro human Treg expansion protocols (i.e., containing anti-CD3 antibody, anti-CD28 antibody, IL-2, and rapamycin), TNFR2 Generates expanded Tregs with higher levels of FoxP3 (and other characteristic Treg markers) and stronger suppressive capacity when expanded in the presence of the TNFR2 agonist antibody compared to in the absence of the agonist. Tregs isolated from
마우스 IgG1을 함유하는 시판되는 효능적 인간 TNFR2 단클론성 항체(mAb)인 MR2-1와 함께 표준 시험관 내 프로토콜을 사용하여 확장된 단리된 Treg의 처리는 FoxP3+Helios+CD127low Treg의 균질한 집단을 생성하고; 이러한 Treg는 인간화 마우스 모델에서 표현형과 높은 억제 활성을 유지한다. 따라서 TNFR2 효능제는 Treg 기반 면역요법에 사용하기 위해 불순한 세포 집단에서 Treg 세포의 생체외 확대를 향상시킬 수 있다 (예를 들어, 문헌[Zou 등 (2018) Front. Immunol. 9:594] 참조). Treatment of the expanded isolated Tregs using standard in vitro protocols with MR2-1, a commercially available potent human TNFR2 monoclonal antibody (mAb) containing mouse IgG1, resulted in a homogeneous population of FoxP3 + Helios + CD127 low Tregs. create; These Tregs retain their phenotype and high suppressive activity in humanized mouse models. Thus, TNFR2 agonists can enhance ex vivo expansion of Treg cells in impure cell populations for use in Treg-based immunotherapy (see, e.g., Zou et al. (2018) Front. Immunol. 9:594]).
b. TNFR2 선택적 TNF 뮤테인 및 그의 융합b. TNFR2 selective TNF muteins and fusions thereof
본 명세서에 기재된 바와 같이, TNF는 TNFR1 또는 TNFR2에 선택적으로 결합하도록 조작될 수 있으며; 예를 들어, TNFR2 선택적 TNF 뮤테인은 TNFR2에 대한 결합을 증가시키고/시키거나 TNFR1에 대한 결합을 감소 또는 제거하는 하나 이상의 돌연변이를 함유하는 TNF의 변이체이다. TNFR2 선택적 돌연변이는 가용성 TNF(서열번호: 2 참조)의 위치 143에서 Asp 잔기의 비-보존적 치환, 예를 들어 D143Y, D143F 또는 D143N, 또는 가용성 TNF의 위치 145에서 Ala 잔기의 비보존적 치환, 예를 들어 A145R을 포함한다 (예를 들어 문헌[미국 특허 번호 9,081,017] 참조). TNFR2에 대한 선택성을 부여하는 TNF의 다른 돌연변이는 예를 들어, 서열번호: 2를 참조하여 K65W, D143E, D143W, D143V, A145H, A145K, A145F, A145W, E146Q, E146H, E146K, E146N, D143N/A145R, A145R/S147T, Q88N/T89S/A145S/E146A/S147D, Q88N/A145I/E146G/S147D, A145H/E146S/S147D, A145H/S147D, L29V/A145D/E146D/S147D, A145N/E146D/S147D, A145T/E146S/S147D, A145Q/E146D/S147D, A145T/E146D/S147D, A145D/E146G/S147D, A145D/S147D, A145K/E146D/S147T, A145R/E146T/S147D, A145R/S147T, E146D/S147D, D143V/F144L/A145S, 및 D143V/A145S를 포함하지만 이에 제한되지 않는다 (예를 들어 [미국 특허 공개 제2020/0102362호] 참조). As described herein, TNF can be engineered to selectively bind to TNFR1 or TNFR2; For example, a TNFR2 selective TNF mutein is a variant of TNF that contains one or more mutations that increase binding to TNFR2 and/or reduce or eliminate binding to TNFR1. A TNFR2 selective mutation is a non-conservative substitution of the Asp residue at position 143 of soluble TNF (see SEQ ID NO: 2), for example D143Y, D143F or D143N, or a non-conservative substitution of the Ala residue at position 145 of soluble TNF; eg A145R (see eg US Pat. No. 9,081,017). Other mutations in TNF conferring selectivity for TNFR2 include, for example, K65W, D143E, D143W, D143V, A145H, A145K, A145F, A145W, E146Q, E146H, E146K, E146N, D143N/A145R, see SEQ ID NO: 2 , A145R/S147T, Q88N/T89S/A145S/E146A/S147D, Q88N/A145I/E146G/S147D, A145H/E146S/S147D, A145H/S147D, L29V/A145D/E146D/S147D, A145 N/E146D/S147D, A145T/E146S /S147D, A145Q/E146D/S147D, A145T/E146D/S147D, A145D/E146G/S147D, A145D/S147D, A145K/E146D/S147T, A145R/E146T/S147D, A145R/S147T, E 146D/S147D, D143V/F144L/A145S , and D143V/A145S (see, eg, [US Patent Publication No. 2020/0102362]).
TNF 리간드 삼량체화는 TNFR을 통한 신호전달에 필수적이다. 혈청과 같은 낮은 농도에서는 삼량체가 해리되어 분해된다. 기능적으로 활성인 수용체 특이적 TNF 뮤테인을 생성하려면 안정한 삼량체를 만드는 것이 필요하다. TNF07은 안정한 TNF 삼량체를 형성하고 TNFR2 효능제로 기능하는 돌연변이 S95C/G148C(서열번호: 2에 제시된 잔기의 서열과 관련하여)를 함유하는 가용성 TNF(sTNF 또는 solTNF) 뮤테인이다.TNF ligand trimerization is essential for signaling through TNFR. At low concentrations, such as in serum, the trimer dissociates and degrades. Generation of functionally active receptor-specific TNF muteins requires the creation of stable trimers. TNF07 is a soluble TNF (sTNF or solTNF) mutein containing the mutation S95C/G148C (with respect to the sequence of residues set forth in SEQ ID NO: 2) that forms stable TNF trimers and functions as a TNFR2 agonist.
S95C/G148C 돌연변이는 분자간 Cys-Cys 공유 결합을 형성하고; 따라서 안정한 삼량체는 TNF 단량체 사이의 전략적 위치에서 sTNF의 공유 내부 디설파이드 가교의 결과로 형성된다. TNF07은 TNFR2 선택적 돌연변이가 없음에도 불구하고 TNFR2 효능제로 작용한다. TNF07은 강력한 TNFR2 신호전달을 유도하고, FoxP3+ Treg 세포를 확장하며, 1형 당뇨병 환자로부터 단리된 자가반응성 CD8+ T 세포의 사멸을 선택적으로 유도한다 (예를 들어, 문헌[Ban 등 (2015) Molecular and Cellular Therapies 3:7; Zou 등 (2018) Front. Immunol. 9:594] 참조). The S95C/G148C mutation forms an intermolecular Cys-Cys covalent bond; Stable trimers are thus formed as a result of covalent internal disulfide bridges of sTNF at strategic locations between TNF monomers. TNF07 acts as a TNFR2 agonist despite the absence of TNFR2 selective mutations. TNF07 induces strong TNFR2 signaling, expands FoxP3 + Treg cells, and selectively induces the death of autoreactive CD8 + T cells isolated from patients with
단쇄 TNFR2 선택적 TNF 뮤테인 삼량체와 다량체화 도메인과의 융합을 함유하는 여러 TNFR2 효능제가 생성되었다. 본 명세서에 기재된 바와 같이, TNFR2에 대한 1차 리간드는 막 결합 TNF(memTNF; 또한 본 명세서에서 막관통 TNF 또는 tmTNF로 지칭됨)이다. 이량체화 또는 삼량체화 도메인과 같은 다량체화 도메인의 추가는 TNF 서브유닛에 대해 각각 6량체 또는 9량체 분자를 생성하고; TNF의 이러한 6량체 및 9량체는 막 결합 TNF 삼량체를 모방하므로 TNFR2 신호전달을 효과적으로 활성화할 수 있다. 일반적으로 사용되는 이량체화 도메인에는 IgE의 중쇄 CH2 도메인으로부터 유래된 EHD2와 IgM의 중쇄 CH2 도메인으로부터 유래된 MHD2가 포함된다. 이량체화 도메인은 또한 Fc 도메인, 예를 들어 면역 이펙터 기능을 변경하는 변형을 선택적으로 포함하는 IgG1 및 IgG4로부터 유래된 것을 포함할 수 있다. 일반적으로 사용되는 삼량체화 도메인에는 닭 테나신 C(TNC) 및 인간 TNC가 포함된다. 이량체화 및 삼량체화는 TNFR2 신호전달을 강화하고, 예를 들어 분자의 분자량을 증가시킴으로써 및/또는 예를 들어 이량체화 도메인이 Fc일 때 FcRn 재순환을 도입함으로써 융합 단백질의 반감기를 개선한다.Several TNFR2 agonists have been created that contain a fusion of a single chain TNFR2 selective TNF mutein trimer with a multimerization domain. As described herein, the primary ligand for TNFR2 is membrane bound TNF (memTNF; also referred to herein as transmembrane TNF or tmTNF). Addition of a multimerization domain, such as a dimerization or trimerization domain, creates a hexameric or 9meric molecule for the TNF subunit, respectively; These hexamers and 9mers of TNF can effectively activate TNFR2 signaling as they mimic membrane-bound TNF trimers. Commonly used dimerization domains include EHD2 derived from the heavy chain C H 2 domain of IgE and MHD2 derived from the heavy chain C H 2 domain of IgM. Dimerization domains may also include Fc domains, such as those derived from IgG1 and IgG4, optionally including modifications that alter immune effector function. Commonly used trimerization domains include chicken tenascin C (TNC) and human TNC. Dimerization and trimerization enhance TNFR2 signaling and improve the half-life of the fusion protein, eg by increasing the molecular weight of the molecule and/or by introducing FcRn recycling, eg when the dimerization domain is Fc.
STAR2(TNC-sc-mTNF(221N/223R)로도 알려짐)는 TNFR1에 결합하지 않는 9량체 효능적 TNFR2 특이적 마우스 TNF 변이체이며, 단일 사슬 마우스 TNF 타이머이며, 여기서 각 TNF 서브유닛은 서열번호: 804의 잔기 110-139에 상응하는 닭 테나신 C(cTNC)의 삼량체화 도메인에 융합된 서열번호: 5의 잔기 91-235이다 (또한, 서열번호: 805 참조). 3개의 단쇄 마우스 TNF 서브유닛은 2개의 (GGGS)4 펩티드 링커에 의해 연결되고(예를 들어 서열번호: 707의 잔기 116-120 참조), TNC 삼량체화 도메인은 단쇄 삼량체에서 제1 TNF 서브유릿의 N-말단에 연결된다. TNFR2에 대한 STAR2의 특이성은 STAR2와 마우스 TNFR1 사이에 입체적 충돌을 생성하는 개별 TNF 서브유닛 내의 돌연변이 D221N 및 A223R(서열번호: 5에 제시된 마우스 TNF의 서열 참조)로부터 기인한다. TNC 삼량체화 도메인에 대한 융합은 자발적인 올리고머 형성을 일으켜 3개의 공유 연결된 TNF 삼량체를 생성하고 막 결합 TNF를 모방한다. STAR2는 TNFR2 의존적, IL-2-독립적 메커니즘에서 Treg의 시험관내 및 생체내 증식을 자극한다. 마우스에 이식하기 전에 STAR2로 동종이형 조혈 줄기 세포를 전처리하면 생존이 연장되고 TNFR-2 및 Treg 의존 방식으로 GvHD의 중증도가 감소한다. 서열번호: 2 (solTNF)를 참조하여 돌연변이 D143N/A145R를 함유하는 가용성 TNF의 잔기 9-157로 만들어진 TNFR2-특이적 STAR2 효능제, TNC-scTNF(143N/145R)의 인간 등가물(서열번호: 2 참조)는, 건강한 공여자로부터 단리된 CD4+ T 세포로부터 시험관 내에서 CD4+FoxP3+ Treg 확장을 강력하게 자극하였다 (예를 들어, 문헌[Chopra 등 (2016) J. Exp . Med . 213(9):1881-1900; Zou 등 (2018) Front. Immunol . 9:594] 참조). STAR2 (also known as TNC-sc-mTNF(221N/223R)) is a 9-mer potent TNFR2 specific mouse TNF variant that does not bind TNFR1 and is a single chain mouse TNF timer, wherein each TNF subunit has SEQ ID NO: 804 are residues 91-235 of SEQ ID NO: 5 fused to the trimerization domain of chicken tenascin C (cTNC), corresponding to residues 110-139 of (see also SEQ ID NO: 805). The three single-chain mouse TNF subunits are linked by two (GGGS) 4- peptide linkers (see for example residues 116-120 of SEQ ID NO: 707), and the TNC trimerization domain is the first TNF subunit in the single-chain trimer. is connected to the N-terminus of The specificity of STAR2 for TNFR2 results from mutations D221N and A223R (see the sequence of mouse TNF set forth in SEQ ID NO: 5) in individual TNF subunits that create steric clashes between STAR2 and mouse TNFR1. Fusion to the TNC trimerization domain causes spontaneous oligomerization to produce three covalently linked TNF trimers and mimics membrane-bound TNF. STAR2 stimulates the proliferation of Tregs in vitro and in vivo in a TNFR2 dependent, IL-2-independent mechanism. Pretreatment of allogeneic hematopoietic stem cells with STAR2 prior to transplantation into mice prolongs survival and reduces the severity of GvHD in a TNFR-2 and Treg dependent manner. The human equivalent of the TNFR2-specific STAR2 agonist, TNC-scTNF (143N/145R) made from residues 9-157 of soluble TNF containing mutations D143N/A145R with reference to SEQ ID NO: 2 (solTNF) (SEQ ID NO: 2 ) potently stimulated CD4 + FoxP3 + Treg expansion in vitro from CD4 + T cells isolated from healthy donors (see, eg, Chopra et al. (2016) J. Exp . Med . 213(9):1881-1900; Zou et al. (2018) Front. Immunol . 9:594]).
TNC-scTNFR2는 TNFR2 선택적 단쇄 TNF 변이체(scTNFR2; 서열번호: 803)의 N-말단에 서열번호: 806의 잔기 110-139(또한, 서열번호 807 참조)를 함유하는 인간 테나신 C(hTNC)의 삼량체화 도메인의 융합이고 2개의 짧은 펩타이드 링커(GGGGS)로 연결된 3개의 TNF 도메인을 함유하는 가용성 인간 TNFR2 효능제이다. TNFR2 선택적 TNF 분자인 scTNFR2는 가용성 삼량체 TNF와 유사하고 각 TNF 서브유닛은 TNFR1에 대한 결합을 제거하는 서열번호: 2를 참조한 돌연변이 D143N/A145R와 함께 서열번호: 1에 제시된 전장 TNF의 아미노산 80-233(서열번호: 2의 잔기 4-157에 상응함)을 포함한다. TNFR2는 가용성 TNF 삼량체가 아닌 막 결합 TNF에 의해서만 완전히 활성화되기 때문에 TNC의 삼량체화 도메인은 scTNFR2의 N-말단에 융합되어 TNC-scTNFR2를 생성한다. TNC-scTNFR2는 단일 가닥 융합 단백질의 삼량체 어셈블리에 존재하며 노나머 TNF 분자와 유사하고; 이 올리고머 TNF 뮤테인은 증가된 결합력으로 인해 막 결합 TNF(memTNF) 활성을 모방하고, TNFR2의 클러스터링 및 TNFR2 신호전달 복합체의 형성을 유도하여 TNFR2를 효율적으로 활성화한다. TNC-scTNFR2는 신경보호 특성을 나타내고; 그것은 초과산화물 유도 세포 사멸로부터 뉴런을 보호하고 카테콜아민성 세포자멸로부터 뉴런을 구출한다. 파킨슨병의 시험관 내 모델에서 TNC-scTNFR2는 6-OHDA에 의한 세포 사멸 유도 후 뉴런을 구조하였다. 이러한 결과는 TNC-scTNFR2가 신경퇴행 과정을 개선할 수 있음을 나타낸다 (예를 들어, 문헌[Fischer 등 2011) PLoS ONE 6(11):e27621] 참조). TNC-scTNF R2 is human tenascin C (hTNC) containing residues 110-139 of SEQ ID NO: 806 (see also SEQ ID NO: 807) at the N-terminus of a TNFR2 selective short-chain TNF variant (scTNF R2 ; SEQ ID NO: 803). ) and is a soluble human TNFR2 agonist containing three TNF domains connected by two short peptide linkers (GGGGS). The TNF R2 selective TNF molecule, scTNF R2 , is similar to soluble trimeric TNF and each TNF subunit contains the amino acids of full-length TNF set forth in SEQ ID NO: 1 together with mutations D143N/A145R referenced to SEQ ID NO: 2 that abolish binding to TNFR1. 80-233 (corresponding to residues 4-157 of SEQ ID NO: 2). Since TNFR2 is fully activated only by membrane-bound TNF and not by soluble TNF trimer, the trimerization domain of TNC is fused to the N-terminus of scTNF R2 , resulting in TNC-scTNF R2 . TNC-scTNF R2 is present in a trimeric assembly of single-stranded fusion proteins and resembles nonameric TNF molecules; This oligomeric TNF mutein mimics the activity of membrane-bound TNF (memTNF) due to its increased avidity and efficiently activates TNFR2 by inducing clustering of TNFR2 and formation of the TNFR2 signaling complex. TNC-scTNF R2 exhibits neuroprotective properties; It protects neurons from superoxide-induced cell death and rescues neurons from catecholamine-induced apoptosis. In an in vitro model of Parkinson's disease, TNC-scTNF R2 rescued neurons after induction of apoptosis by 6-OHDA. These results indicate that TNC-scTNF R2 can ameliorate the neurodegenerative process (see, eg, Fischer et al. 2011 PLoS ONE 6(11):e27621).
EHD2-scTNFR2(서열번호: 810 참조)는 효능적 TNFR2 선택적 TNF 뮤테인 융합 단백질이고, 이는 IgE의 중쇄 CH2 도메인에서 유래되고 육량체 TNF 도메인을 함유하는 디설파이드 결합된 이량체를 생성하는 이량체화 도메인 EHD2(서열번호: 808)에 융합된 TNFR1에 대한 결합을 없는 돌연변이 D143N/A145R(서열번호 2에 제시된 가용성 TNF에 대한 잔기 넘버링)을 갖는 공유적으로 안정화된 인간 TNFR2 선택적 단쇄 TNF 삼량체(scTNFR2; 서열번호 803)를 함유한다. scTNFR2 내의 각 TNF 서브유닛은 서열번호: 2의 잔기 4-157을 함유한다. EHD2는 펩티드 링커(GGGSGGGSGGGSGGGSGGGSGGSEFLA; 서열번호: 809)를 통해 3가 인간 단쇄 scTNFR2의 N-말단에 융합되고, scTNFR2의 3개의 TNF 도메인은 2개의 GGGGS 펩티드 링커를 통해 연결된다. EHD2-scTNFR2는 NMDA 유도 급성 신경퇴행의 마우스 모델에서 신경보호 특성을 나타낸다 (예를 들어, 문헌[Dong 등 (2016) Proc . Natl . Acad . Sci . U.S.A . 113(43):12304-12309; 및 미국 특허 공개 번호 2020/0102362] 참조). EHD2-scTNF R2 (see SEQ ID NO: 810) is a potent TNFR2 selective TNF mutein fusion protein, which is derived from the heavy chain C H 2 domain of IgE and is a dimer producing a disulfide-linked dimer containing a hexameric TNF domain. A covalently stabilized human TNFR2 selective single-chain TNF trimer with mutations D143N/A145R (residue numbering for soluble TNF shown in SEQ ID NO: 2) with no binding to TNFR1 fused to the embodied domain EHD2 (SEQ ID NO: 808) scTNF R2 ; SEQ ID NO: 803). Each TNF subunit within scTNF R2 contains residues 4-157 of SEQ ID NO:2. EHD2 is fused to the N-terminus of trivalent human short chain scTNF R2 via a peptide linker (GGGSGGGSGGGSGGGSGGGSGGSEFLA; SEQ ID NO: 809), and the three TNF domains of scTNF R2 are linked via two GGGGS peptide linkers. EHD2-scTNF R2 exhibits neuroprotective properties in a mouse model of NMDA-induced acute neurodegeneration (see, e.g., Dong et al. (2016) Proc . Natl . Acad . Sci . USA . 113(43):12304-12309; and US Patent Publication No. 2020/0102362).
TNFR2 효능제 융합 단백질은 또한 돌연변이 D143N/A145R(서열번호: 2 참조)을 갖는 3개의 TNF 뮤테인을 함유하는 단쇄 TNFR2 효능제(scTNFR2)를 포함하며, 이는 Fc인 이량체화 도메인과 융합된 TNFR1에 대한 결합을 없애고 결과적으로 TNF 도메인(scTNFR2-Fc)에 대해 육량체인 단백질을 얻는다. Fc는 ADCC 및 CDC와 같은 Fc 이펙터 기능을 제거하는 돌연변이를 선택적으로 함유하는 IgG4 또는 IgG1 Fc일 수 있다. 서열번호: 2의 잔기 12-157을 함유하는 3개의 TNF 뮤테인은 2개의 짧은 펩티드 링커에 의해 함께 연결되고 이량체화 도메인은 제3 짧은 펩티드 링커에 의해 단쇄 삼량체 TNF 분자(scTNFR2)의 N-말단 또는 C-말단에 연결된다. 3개의 링커는 모두 동일하거나 상이할 수 있으며, GS 링커 (예컨대 서열번호:707의 (GGGGS)n 잔기 116-121, 및/또는 Gly 및 Ser의 다른 조합) (여기서 n = 1-5)을 포함할 수 있거나 TNF-α(서열 번호: 1의 잔기 57-87에 상응하는 GPQREEFPRDLSLISPLAQAVRSSSRTPSDK(서열 번호 812))의 줄기 영역의 전체 또는 일부, 적어도 10, 15 또는 20개의 인접 잔기를 포함할 수 있다. 이량체화는 TNFR2 효능제에 의한 신호전달을 강화하고 융합 단백질의 반감기를 개선한다. 융합 단백질에서 사용될 수 있는 대안적인 이량체화 도메인은 다른 이량체화 분자, 예컨대 IgE 중쇄 도메인 2 (EHD2; 서열번호: 808 참조) 및 IgM 중쇄 도메인 2 (MHD2; 서열번호: 811 참조)로부터 유래된 Fc 융합 단백질을 포함한다 (MHD2; 서열번호: 811 참조)(예를 들어, 문헌[국제 출원 공개 번호 WO 2019/226750] 참조).The TNFR2 agonist fusion protein also includes a single chain TNFR2 agonist (scTNF R2 ) containing three TNF muteins with mutations D143N/A145R (see SEQ ID NO: 2), which is TNFR1 fused with a dimerization domain that is Fc. and as a result a protein that is a hexamer for the TNF domain (scTNF R2 -Fc) is obtained. The Fc may be an IgG4 or IgG1 Fc, optionally containing mutations that abolish Fc effector functions such as ADCC and CDC. The three TNF muteins containing residues 12-157 of SEQ ID NO: 2 are linked together by two short peptide linkers and the dimerization domain is linked to the N of a single-chain trimeric TNF molecule (scTNF R2 ) by a third short peptide linker. It is linked to the -terminus or C-terminus. All three linkers can be the same or different, including a GS linker (such as (GGGGS) n residues 116-121 of SEQ ID NO:707, and/or other combinations of Gly and Ser), where n = 1-5 or may contain all or part of the stem region of TNF-α (GPQREEFPRDLSLISLISPLAQAVRSSSRTPSDK (SEQ ID NO: 812) corresponding to residues 57-87 of SEQ ID NO: 1), at least 10, 15 or 20 contiguous residues. Dimerization enhances signaling by TNFR2 agonists and improves the half-life of the fusion protein. Alternative dimerization domains that can be used in the fusion protein are Fc fusions derived from other dimerization molecules, such as IgE heavy chain domain 2 (EHD2; see SEQ ID NO: 808) and IgM heavy chain domain 2 (MHD2; see SEQ ID NO: 811). protein (MHD2; see SEQ ID NO: 811) (see, eg, International Application Publication No. WO 2019/226750).
3. 항-TNFR2 길항적 항체 및 소분자 억제제3. Anti-TNFR2 Antagonistic Antibodies and Small Molecule Inhibitors
TNFR2 길항제는 Treg의 증식을 억제하고 Treg의 사멸을 유도하며, 또한 TNFR2 발현 종양 세포의 증식을 억제하고 사멸을 유도할 수 있다. TNFR2 길항제는 종양 미세환경에 존재하는 MDSC의 표면에 발현된 TNFR2에 결합함으로써 골수 유래 억제 세포 (MDSC)의 증식을 감소 또는 억제하고/하거나 MDSC 내에서 세포자멸을 유도할 수 있다. TNFR2 길항제 Treg 확대 및 활성의 억제를 통해 세포독성 CD8+ T 세포를 포함한 T 이펙터 세포의 확대를 유도한다. 그 결과, TNFR2 길항제는 감염성 질환 및 TNFR2를 발현하는 특정 암, 예를 들어, T 세포 림프종 (예를 들어, 호지킨 림프종 및 피부 비-호지킨 림프종), 난소암, 결장암, 다발성 골수종, 신장 세포 암종, 유방암, 자궁경부암, 자궁내막암, 신경교종, 두경부암, 간암, 및 폐암의 치료에 유용할 수 있다 (예를 들어, 문헌[미국 특허 공개 번호 2019/0144556; Torrey 등 (2017) Sci. Signal. 10:eaaf8608] 참조). TNFR2 antagonists can inhibit Treg proliferation and induce Treg apoptosis, and also inhibit proliferation and induce apoptosis of TNFR2-expressing tumor cells. TNFR2 antagonists can reduce or inhibit the proliferation of myeloid-derived suppressor cells (MDSCs) and/or induce apoptosis within MDSCs by binding to TNFR2 expressed on the surface of MDSCs present in the tumor microenvironment. TNFR2 antagonists induce expansion of T effector cells, including cytotoxic CD8 + T cells, through suppression of Treg expansion and activity. As a result, TNFR2 antagonists are effective against infectious diseases and certain cancers that express TNFR2, such as T-cell lymphoma (eg, Hodgkin's lymphoma and cutaneous non-Hodgkin's lymphoma), ovarian cancer, colon cancer, multiple myeloma, renal cell may be useful in the treatment of carcinoma, breast, cervical, endometrial, glioma, head and neck, liver, and lung cancers (see, e.g., U.S. Patent Publication No. 2019/0144556; Torrey et al. (2017) Sci. Signal. 10:eaaf8608]).
본 명세서에서 논의된 바와 같이, TNFR2의 발현은 Treg 및 MDSC를 포함하는 특정 면역 세포, 내피 세포, 및 특정 뉴런 및 심장 세포로 제한된다. TNFR2의 제한된 발현은 항-TNFR2 치료제로 인한 전신 독성이 발생할 가능성이 적기 때문에 이상적인 약물 표적이 된다. As discussed herein, expression of TNFR2 is restricted to certain immune cells, including Tregs and MDSCs, endothelial cells, and certain neurons and cardiac cells. Restricted expression of TNFR2 makes it an ideal drug target because systemic toxicity from anti-TNFR2 therapeutics is less likely to occur.
TNFR2 길항제 항체 및 그의 항원 결합 단편은 예를 들어 (서열번호: 4의 잔기 142-146에 상응하는) 잔기 KCRPG, 또는 잔기 130-149, 137-144 또는 142-149, 또는 이들 에피토프 내에 적어도 5개의 연속 또는 불연속 잔기를 함유하는 더 큰 에피토프 중 하나 이상을 함유하고, (서열번호: 4의 잔기 56-60에 상응하는) 잔기 KCSPG를 함유하는 에피토프에 결합하지 않는 인간 TNFR2 내의 하나 이상의 에피토프에 결합한다. TNFR2 길항제는 또한 TNFR2 에피토프 PECLSCGS (서열번호: 4의 잔기 91-98에 상응함), RICTCRPG 서열번호: 4의 잔기 116-123에 상응함), CAPLRKCR (서열번호: 4의 잔기 137-144에 상응함), LRKCRPGFGVA (서열번호: 4의 잔기 140-150에 상응함), 및/또는 VVCKPCAPGTFSN (서열번호: 4의 잔기 159-171에 상응함), 및 서열번호: 4의 잔기 75-128, 86-103, 111-128, 또는 150-190 내에 적어도 5개의 연속 또는 불연속 잔기를 함유하는 에피토프에 결합하는 항체, 이의 항원 결합 단편, 또는 단쇄 항체를 포함한다 (예를 들어, 미국 특허 공개 번호 2019/0144556 참조. TNFR2 antagonist antibodies and antigen-binding fragments thereof, for example, residues KCRPG (corresponding to residues 142-146 of SEQ ID NO: 4), or residues 130-149, 137-144 or 142-149, or at least five residues within these epitopes. Binds to at least one epitope in human TNFR2 that contains at least one of the larger epitopes containing contiguous or discontinuous residues and does not bind to an epitope containing residues KCSPG (corresponding to residues 56-60 of SEQ ID NO: 4) . TNFR2 antagonists also include the TNFR2 epitopes PECLSCGS (corresponding to residues 91-98 of SEQ ID NO: 4), RICTCRPG corresponding to residues 116-123 of SEQ ID NO: 4), CAPLRKCR (corresponding to residues 137-144 of SEQ ID NO: 4) ), LRKCRPGFGVA (corresponding to residues 140-150 of SEQ ID NO: 4), and/or VVCKPCAPGTFSN (corresponding to residues 159-171 of SEQ ID NO: 4), and residues 75-128, 86 of SEQ ID NO: 4 -103, 111-128, or 150-190 include antibodies, antigen-binding fragments thereof, or single chain antibodies that bind to an epitope containing at least 5 contiguous or discontinuous residues (see, e.g., U.S. Patent Publication No. 2019/ See 0144556.
일반적으로, 길항적 TNFR2 항체 또는 그의 항원 결합 단편은 인간 TNFR2의 KCSPG 서열(서열번호: 839)을 함유하는 펩티드에 대한 동일한 항체 또는 항원 결합 단편의 친화도보다 예를 들어 적어도 10-배 더 큰 친화도로 KCRPG 서열(서열번호: 840)의 하나 이상의 잔기를 함유하는 에피토프에 결합한다. KCRPG 서열의 하나 이상의 잔기를 함유하는 에피토프 및 유사한 친화도(예를 들어, 친화도의 10배 미만의 차이)로 KCSPG 모티프를 함유하는 에피토프에 결합하는 항체 또는 항체 단편은 길항적 TNFR2 항체가 아니다. 길항적 TNFR2 항체는 TNFRAB1(각각 TNFRAB1의 중쇄 및 경쇄 서열에 대해서는 서열번호: 1213 및 1213 참조), TNFRAB2 및 TNFR2A3를 포함한다 (예를 들어, 이들 항체에 대한 설명은 미국 특허 공개 제2019/0144556호 참조). TNFR2 길항제는 또한 TNFRAB1 (QRVDGYSSYWYFDV; 서열번호: 1212의 잔기 99-112에 상응함), TNFRAB2 (ARDDGSYSPFDYWG; 서열번호: 1217) 또는 TNFR2A3 (ARDDGSYSPFDYFG; 서열번호: 1223)의 CDR-H3 서열, 또는 그와 적어도 약 85% 서열 동일성을 갖는 CDR-H3 서열을 함유하는 항체 및 항체 단편을 포함한다. 예를 들어, TNFRAB1은 TNFR2의 잔기 KCSPG를 함유하는 잔기 48-67보다 40-배 더 높은 친화도로 TNFR2의 잔기 KCRPG를 함유하는 잔기 130-149에 특이적으로 결합한다 (예를 들어, [미국 특허 공개 번호 2019/0144556]참조). Generally, an antagonistic TNFR2 antibody or antigen-binding fragment thereof exhibits, for example, at least 10-fold greater affinity than the affinity of the same antibody or antigen-binding fragment for a peptide containing the KCSPG sequence of human TNFR2 (SEQ ID NO: 839). It also binds to an epitope containing one or more residues of the KCRPG sequence (SEQ ID NO: 840). An antibody or antibody fragment that binds an epitope containing one or more residues of a KCRPG sequence and an epitope containing a KCSPG motif with similar affinity (eg, less than a 10-fold difference in affinity) is not a antagonistic TNFR2 antibody. Antagonistic TNFR2 antibodies include TNFRAB1 (see SEQ ID NOs: 1213 and 1213 for the heavy and light chain sequences of TNFRAB1, respectively), TNFRAB2 and TNFR2A3 (see, e.g., U.S. Patent Publication No. 2019/0144556 for descriptions of these antibodies). reference). The TNFR2 antagonist may also be a CDR-H3 sequence of TNFRAB1 (QRVDGYSSYWYFDV; corresponding to residues 99-112 of SEQ ID NO: 1212), TNFRAB2 (ARDDGSYSPFDYWG; SEQ ID NO: 1217) or TNFR2A3 (ARDDGSYSPFDYFG; SEQ ID NO: 1223), or antibodies and antibody fragments containing CDR-H3 sequences having at least about 85% sequence identity. For example, TNFRAB1 specifically binds residues 130-149 containing residue KCRPG of TNFR2 with 40-fold higher affinity than residues 48-67 containing residue KCSPG of TNFR2 (see, e.g., [U.S. Patent Publication No. 2019/0144556).
NFRAB1(각각 중쇄 및 경쇄에 대한 서열번호: 1212 및 1213 참조)은 TNF-TNFR2 상호작용을 길항하는 뮤린 항체이고, TNFR2의 KCRPG 서열에 결합하는 것 외에도, TNFR2(서열번호: 4)의 잔기 161-169(CKPCAPGTF; 서열번호: 1258) 내의 에피토프에도 결합한다. 또 다른 TNFR2 길항적 항체인 TNFRAB2는 잔기 137-144 (CAPLRKCR; 서열번호: 851)를 함유하는 에피토프, 뿐만 아니라 인간 TNFR2의 위치 80-86 (DSTYTQL; 서열번호: 1247), 91-98 (PECLSCGS; 서열번호: 1248), 및 116-123 (RICTCRPG; 서열번호: 1249) 내에 하나 이상의 잔기를 포함하는 에피토프에 결합한다. TNFR2A3은 마우스를 인간 TNFR2로 면역화한 후 CDR 돌연변이유발에 의해 발견된 뮤린 길항적 인간 TNFR2 항체이며, 여기에서 생성된 전구체 항체의 CDR-H3는 CDR-H3 서열 ARDDGSYSPFDYFG(서열번호: 1223)로 대체되었다. TNFR2A3는 인간 TNFR2 내의 두 가지 별개의 에피토프에 결합하고; 제1 에피토프는 인간 TNFR2의 잔기 140-150 (LRKCRPGFGVA; 서열번호: 1463)을 포함하고 KCRPG 모티프를 함유하고, 제2 에피토프는 인간 TNFR2의 잔기 159-171 (VVCKPCAPGTFSN; 서열번호: 1464)를 함유하는 다운스트림 서열이다. 이들 데이터는 길항적 TNFR2 항체의 CDR-H3 서열이 주로 항원 결합 특성을 지시하고, CDR-H3 모티프는 이러한 항체 또는 이의 항원 결합 단편에 TNFR2 우세한 길항 특징을 부여하기 위해 길항 활성을 나타내지 않는 항-TNFR2 항체로 치환될 수 있는 모듈 도메인임을 나타낸다. 예를 들어, TNFRAB1, TNFRAB2 또는 TNFR2A3의 CDR-H3 서열과 같은 길항적 TNFR2 항체의 CDR-H3으로 중성 항-TNFR2 항체(즉, 길항적도 효능적도 아닌 항체)의 CDR-H3 서열을 대체하는 것은 표현형-중성 항체를 TNF 또는 IL-2와 같은 TNFR2 효능제의 존재 하에서도 TNFR2 활성화를 억제하는 길항제인 길항적 TNFR2 항체, 예컨대 우세한 길항적 TNFR2 항체로 변환한다 (예를 들어, [미국 특허 공개 번호 2019/0144556] 참조). NFRAB1 (see SEQ ID NOs: 1212 and 1213 for heavy and light chains, respectively) is a murine antibody that antagonizes the TNF-TNFR2 interaction and, in addition to binding to the KCRPG sequence of TNFR2, binds to residues 161- of TNFR2 (SEQ ID NO: 4). 169 (CKPCAPGTF; SEQ ID NO: 1258). Another TNFR2 antagonistic antibody, TNFRAB2, has an epitope containing residues 137-144 (CAPLRKCR; SEQ ID NO: 851), as well as positions 80-86 of human TNFR2 (DSTYTQL; SEQ ID NO: 1247), 91-98 (PECLSCGS; SEQ ID NO: 1248), and one or more residues within 116-123 (RICTCRPG; SEQ ID NO: 1249). TNFR2A3 is a murine antagonistic human TNFR2 antibody discovered by CDR mutagenesis after immunization of mice with human TNFR2, wherein the CDR-H3 of the resulting precursor antibody was replaced with the CDR-H3 sequence ARDDGSYSPFDYFG (SEQ ID NO: 1223) . TNFR2A3 binds to two distinct epitopes in human TNFR2; The first epitope comprises residues 140-150 of human TNFR2 (LRKCRPGFGVA; SEQ ID NO: 1463) and contains the KCRPG motif, and the second epitope contains residues 159-171 of human TNFR2 (VVCKPCAPGTFSN; SEQ ID NO: 1464) is the downstream sequence. These data suggest that the CDR-H3 sequence of an antagonistic TNFR2 antibody primarily directs its antigen-binding properties, and that the CDR-H3 motif is an anti-TNFR2 that does not exhibit antagonistic activity to confer TNFR2-dominant antagonistic characteristics to such antibody or antigen-binding fragment thereof. Indicates a modular domain that can be substituted into an antibody. For example, replacement of the CDR-H3 sequence of a neutral anti-TNFR2 antibody (i.e., an antibody that is neither antagonistic nor agonistic) with a CDR-H3 from an antagonistic TNFR2 antibody, such as the CDR-H3 sequence of TNFRAB1, TNFRAB2 or TNFR2A3, may alter the phenotype. -conversion of the neutral antibody to an antagonistic TNFR2 antibody, such as a predominantly antagonistic TNFR2 antibody, which is an antagonist that inhibits TNFR2 activation even in the presence of a TNFR2 agonist such as TNF or IL-2 (see, e.g., [U.S. Patent Publication No. 2019 /0144556]).
TNFR2 길항제 항체 또는 그의 항원 결합 단편은 서열번호: 1214, 1215, 및 1231-1233; 1216, 1224, 및 1230 중 임의의 것에 제시된 CDR-H2 서열; 서열번호: 1217, 1223, 및 1225-1229 중 임의의 것에 제시된 CDR-H3 서열, 또는 서열번호: 1212의 잔기 99-112에 상응하는 TNFRAB1의 CDR-H3; 서열번호: 1218 및 1234-1236 중 임의의 것에 제시된 CDR-L1 서열, 또는 서열번호: 1213의 잔기 24-33에 상응하는 TNFRAB1의 CDR-L1 서열; 서열번호: 1219, 1220, 1237 및 1238 중 임의의 것에 제시된 CDR-L2 서열, 또는 서열번호: 1213의 잔기 49-55에 상응하는 TNFRAB1의 CDR-L2 서열; 또는 서열번호: 1221, 1222, 및 1241-1244 중 임의의 것에 제시된 CDR-L3 서열, 또는 서열번호: 1213의 잔기 88-96에 상응하는 TNFRAB1의 CDR-L3 서열 중 임의의 것에 제시된 CDR-H1 서열을 함유할 수 있다. 상기 CDR 중 하나 이상을 함유하는 인간화 항-TNFR2 항체의 발달에 사용될 수 있는 예시적인 프레임워크 영역은 제한 없이 미국 특허 번호 7,732,578 및 8,093,068, 및 국제 출원 공개 번호 WO 2003/105782에 기재된 것을 포함한다. 인간화 항-TNFR2 길항적 항체를 조작하는 또 다른 접근법은 TNFRAB1, TNFRAB2 또는 TNFR2A3와 같은 길항적 TNFR2 항체의 중쇄 가변 영역 및 경쇄 가변 영역의 서열을 공통 인간 항체의 중쇄 가변 영역 및 경쇄와 정렬하는 것이다. 공통 인간 항체 중쇄 및 경쇄 서열는 당해 기술에 알려져 있다 (예를 들어, "VBASE" 인간 생식계열 서열 데이터베이스 참조; 또한 문헌[Kabat, 등, Sequences of Proteins of Immunological Interest, Fifth Edition, U.S. Department of Health and Human Services, NIH Publication No 91-3242, (1991); Tomlinson 등, (1992) J. Mol . Biol. 227:776-798; 및 Cox 등, (1994) Eur. J. Immunol. 24:827-836] 참조). 이러한 방식으로, 가변 도메인 프레임워크 잔기 및 CDR은 서열 정렬에 의해 식별될 수 있다. 예를 들어 공통 인간 항체의 CDR-H3을 TNFRAB1, TNFRAB2 또는 TNFR2A3의 CDR-H3과 같은 길항적 TNFR2 항체의 CDR-H3으로 대체하여 인간화 TNFR2 길항제 항체를 생산할 수 있다. 공통 인간 항체의 예시적인 가변 도메인은 미국 특허 6,054,297에서 확인된 서열번호: 1245에 제시된 중쇄 가변 도메인 및 서열번호: 1246에 제시된 경쇄 가변 도메인을 포함한다 (예를 들어, [미국 특허 공개 번호 2019/0144556] 참조). 서열번호: 1245의 인간 항체 중쇄 가변 도메인의 예시적인 공통 서열의 CDR-H1 및 CDR-H2 서열은 예를 들어 표현형-중성, TNFR2 특이적 항체의 상응하는 CDR 서열로 대체될 수 있고, 서열번호: 1246의 인간 항체 경쇄 가변 도메인의 예시적인 공통 서열의 CDR-L1, CDR-L2 및 CDR-L3 서열은 표현형-중성, TNFR2 특이적 항체의 상응하는 CDR 서열로 대체되어 인간화 길항적 TNFR2 항체를 생산할 수 있다. TNFR2 antagonist antibodies or antigen-binding fragments thereof include SEQ ID NOs: 1214, 1215, and 1231-1233; CDR-H2 sequences set forth in any of 1216, 1224, and 1230; the CDR-H3 sequence set forth in any of SEQ ID NOs: 1217, 1223, and 1225-1229, or the CDR-H3 of TNFRAB1 corresponding to residues 99-112 of SEQ ID NO: 1212; the CDR-L1 sequence set forth in any of SEQ ID NOs: 1218 and 1234-1236, or the CDR-L1 sequence of TNFRAB1 corresponding to residues 24-33 of SEQ ID NO: 1213; the CDR-L2 sequence set forth in any of SEQ ID NOs: 1219, 1220, 1237 and 1238, or the CDR-L2 sequence of TNFRAB1 corresponding to residues 49-55 of SEQ ID NO: 1213; or a CDR-L3 sequence as presented in any of SEQ ID NOs: 1221, 1222, and 1241-1244, or a CDR-L3 sequence as presented in any of the CDR-L3 sequences of TNFRAB1 corresponding to residues 88-96 of SEQ ID NO: 1213 may contain. Exemplary framework regions that can be used in the development of humanized anti-TNFR2 antibodies containing one or more of the above CDRs include, without limitation, those described in U.S. Patent Nos. 7,732,578 and 8,093,068, and International Application Publication No. WO 2003/105782. Another approach to engineering humanized anti-TNFR2 antagonistic antibodies is to align the sequences of the heavy chain variable region and light chain variable region of an antagonistic TNFR2 antibody, such as TNFRAB1, TNFRAB2 or TNFR2A3, with the heavy chain variable region and light chain of a common human antibody. Common human antibody heavy and light chain sequences are known in the art (see, eg, the "VBASE" human germline sequence database; see also Kabat, et al., Sequences of Proteins of Immunological Interest, Fifth Edition, US Department of Health and Human Services, NIH Publication No 91-3242, (1991) Tomlinson et al., (1992) J. Mol . Biol . 227:776-798 and Cox et al., (1994) Eur. J. Immunol . reference). In this way, variable domain framework residues and CDRs can be identified by sequence alignment. For example, a humanized TNFR2 antagonist antibody can be produced by replacing the CDR-H3 of a consensus human antibody with the CDR-H3 of an antagonistic TNFR2 antibody, such as the CDR-H3 of TNFRAB1, TNFRAB2 or TNFR2A3. Exemplary variable domains of common human antibodies include the heavy chain variable domain set forth in SEQ ID NO: 1245 and the light chain variable domain set forth in SEQ ID NO: 1246 identified in U.S. Patent No. 6,054,297 (see, e.g., [U.S. Patent Publication No. ] reference). The CDR-H1 and CDR-H2 sequences of the exemplary consensus sequence of the human antibody heavy chain variable domain of SEQ ID NO: 1245 can be replaced with the corresponding CDR sequences of, for example, a phenotype-neutral, TNFR2 specific antibody, SEQ ID NO: The CDR-L1, CDR-L2 and CDR-L3 sequences of the exemplary consensus sequence of the human antibody light chain variable domain of 1246 can be replaced with the corresponding CDR sequences of a phenotype-neutral, TNFR2 specific antibody to produce a humanized antagonistic TNFR2 antibody. there is.
다른 TNFR2 길항제는 당업계에서 알려진 기술, 예를 들어, 파지 디스플레이, 박테리아 디스플레이, 효모 디스플레이, 포유동물 디스플레이, 리보솜 디스플레이, mRNA 디스플레이 및 cDNA 디스플레이, 또는 미국 특허 공개 번호 2019/0144556에 기술된 것과 같은 당업계에 공지된 임의의 다른 방법을 사용함으로써 서열번호: 1247-1464 중 어느 하나에 제시된 것과 같은 TNFR2 내의 에피토프에 결합하는 펩티드에 대한 스크리닝에 의해 확인될 수 있다.Other TNFR2 antagonists include techniques known in the art, such as phage display, bacterial display, yeast display, mammalian display, ribosome display, mRNA display and cDNA display, or sugars such as those described in US Patent Publication No. 2019/0144556. It can be identified by screening for peptides that bind to an epitope in TNFR2 such as set forth in any one of SEQ ID NOs: 1247-1464 using any other method known in the art.
인간 TNFR2 길항제 mAb는 표준 Treg 확대 배양 조건에 추가될 때 Treg의 확대를 억제하고 억제 활성을 감소시킨다 (예를 들어, 문헌[Zou 등 (2018) Front. Immunol. 9:594] 참조). TNF(TNFR2의 자연 효능제)를 능가하고, TNF에 의해 유래된 인간 Treg의 TNF 유도 시험관 내 확대를 억제하는 2개의 강력하고 우세한 항-인간 TNFR2 길항적 항체는 시험관 내에서 Treg의 사멸을 유도할 수 있다. TNFR2 길항제는 Fc 영역 또는 항체의 가교와 독립적으로 F(ab) 영역을 통해 TNFR2에 특이적으로 결합하고, TNFR2의 역평행 이량체에 결합하여 TNF가 TNFR2에 결합하는 것을 차단한다. 그 결과, Treg에서 NF-κB 경로의 TNF 유도 활성화가 억제되고 막관통 TNFR2(tmTNFR2)가 가용성 TNFR2(sTNFR2)로 전환되는 것이 억제된다. 난소암 조직에서 단리된 Treg는 종양 침윤 Treg에서 TNFR2 발현 수준이 높기 때문에 TNFR2 길항제 mAb 유도 세포 사멸에 더 민감한 것으로 나타났다. TNFR2 길항제는 또한 TNFR2를 발현하는 TNFR2+ OVCAR3(난소암) 종양 세포의 사멸을 유도하였다. 이러한 결과는 종양 세포뿐만 아니라 종양 침윤 Treg를 표적화함으로써 종양 치료에서 TNFR2 길항제의 치료 가능성을 나타낸다 (예를 들어, 문헌[Zou 등 (2018) Front. Immunol . 9:594; Torrey 등 (2017) Sci. Signal. 10:eaaf8608] 참조). Human TNFR2 antagonist mAb inhibits expansion of Tregs and reduces suppressive activity when added to standard Treg expansion culture conditions (see, e.g., Zou et al. (2018) Front. Immunol. 9:594]). Two potent, predominantly anti-human TNFR2 antagonistic antibodies that surpass TNF (a natural agonist of TNFR2) and inhibit the TNF-induced in vitro expansion of human Tregs derived by TNF are capable of inducing apoptosis of Treg in vitro. can The TNFR2 antagonist specifically binds to TNFR2 through the F(ab) region independently of cross-linking of the Fc region or antibody, binds to the antiparallel dimer of TNFR2, and blocks TNF from binding to TNFR2. As a result, TNF-induced activation of the NF-κB pathway in Tregs is inhibited and the conversion of transmembrane TNFR2 (tmTNFR2) to soluble TNFR2 (sTNFR2) is inhibited. Tregs isolated from ovarian cancer tissue were shown to be more susceptible to TNFR2 antagonist mAb-induced apoptosis due to higher levels of TNFR2 expression in tumor-infiltrating Tregs. TNFR2 antagonists also induced the death of TNFR2 + OVCAR3 (ovarian cancer) tumor cells expressing TNFR2. These results indicate the therapeutic potential of TNFR2 antagonists in tumor treatment by targeting tumor cells as well as tumor-infiltrating Tregs (see, e.g., Zou et al. (2018) Front. Immunol . 9:594; Torrey et al. (2017) Sci. Signal. 10:eaaf8608]).
항-TNFR2 길항제 mAb 외에도, 소분자는 TNFR2를 억제할 수 있다. 예를 들어, 탈리도마이드는 면역 조절 및 항-염증 특성을 지닌 소분자 합성 글루탐산 유도체이고; 탈리도마이드 및 그의 구조적 유사체, 레날리도마이드 및 포말리도마이드가 면역조절 약물로 분류된다. 탈리도마이드와 그 유사체는 NF-κB를 하향 조절하고, TNF mRNA를 파괴하고, 활성 산소 종과 α1-산 당단백질을 표적으로 하여 TNF 합성을 억제하고, 또한 세포 표면으로의 세포내 TNFR2 수송을 억제하여 T 세포에서 TNFR2의 표면 발현을 억제한다. 탈리도마이드는 만성 림프구성 백혈병 환자에서 Treg의 수와 기능을 감소시키고, 급성 골수성 백혈병 환자에서 레날리도마이드 및 아자시티딘의 병용 요법은 CD4+ T 세포의 TNFR2 발현을 하향 조절하고 TNFR2+ Treg의 수를 줄여 이펙터 면역 기능을 강화시키는 것으로 보여졌다. 그러나 다발성 골수종 환자에서, 탈리도마이드 및 그 유사체를 사용한 치료는 Treg의 수를 증가시켰는데, 이는 치료 후 TNF의 혈청 수준이 높아졌기 때문일 가능성이 높으며, 이는 TNFR2+ Treg에 대한 탈리도마이드의 효과가 질환 특이적임을 나타낸다 (예를 들어, 문헌[Zou 등 (2018) Front. Immunol. 9:594] 참조). In addition to anti-TNFR2 antagonist mAbs, small molecules can inhibit TNFR2. For example, thalidomide is a small molecule synthetic glutamic acid derivative with immune modulatory and anti-inflammatory properties; Thalidomide and its structural analogues, lenalidomide and pomalidomide are classified as immunomodulatory drugs. Thalidomide and its analogs down-regulate NF-κB, destroy TNF mRNA, inhibit TNF synthesis by targeting reactive oxygen species and α1-acid glycoprotein, and also inhibit intracellular TNFR2 transport to the cell surface. Inhibits the surface expression of TNFR2 on T cells. Thalidomide reduces the number and function of Tregs in patients with chronic lymphocytic leukemia, and the combination of lenalidomide and azacitidine in patients with acute myeloid leukemia downregulates TNFR2 expression on CD4 + T cells and decreases the number of TNFR2 + Tregs. has been shown to enhance effector immune function by reducing However, in patients with multiple myeloma, treatment with thalidomide and its analogues increased the number of Tregs, most likely due to elevated serum levels of TNF after treatment, suggesting that the effect of thalidomide on TNFR2 + Tregs is disease-specific. indicates (see, e.g., Zou et al. (2018) Front. Immunol. 9:594]).
TNFR2의 또 다른 소분자 억제제는 FoxP3 발현을 감소시키고 Treg의 억제 활성을 억제할 수 있는 히스톤 탈아세틸화효소 억제제인 파노비노스타트이다. 파노비노스타트와 아자시티딘의 병용 요법은 급성 골수성 백혈병 환자의 혈액과 골수에서 TNFR2+ Treg의 수를 감소시키고 결과적으로 이펙터 T 세포에 의한 IFNγ 및 IL-2 생산의 증가는 이러한 환자에서 치료 효과를 나타낸다 (예를 들어, 문헌[Zou 등 (2018) Front. Immunol . 9:594] 참조). 암 치료에서 세포독성 화학요법제로 일반적으로 사용되는 DNA 알킬화제인 사이클로포스파미드는 저용량에서 Treg의 면역억제 기능을 억제할 수 있으며 단일 용량 투여 후 PROb 결장암이 있는 마우스에서 최대로 억제하는 Treg를 고갈시켜 항 종양 면역 반응의활성화를 초래한다. 중피종의 마우스 모델에서, 사이클로포스파미드 치료는 TNFR2hi Treg를 고갈시켰다. 사이클로포스파미드와 에타네르셉트와의 조합은 TNF-TNFR2 상호작용을 차단하고 TNFR2-발현 Treg 활성을 제거함으로써 마우스에서 확립된 CT26 종양의 성장을 억제하였다 (예를 들어, 문헌[Zou 등 (2018) Front. Immunol . 9:594] 참조). 중국 약초 트립테리기움 윌포르디(Tripterygium wilfordii)에서 단리한 면역억제 분자인 트립톨리드는 마우스 대장염 모델의 결장에서 TNF 및 TNFR2 발현을 억제하고 또한 흑색종이 있는 마우스에서 Treg의 수를 감소시키고 종양 성장을 억제한다 (예를 들어, 문헌[Zou 등 (2018) Front. Immunol. 9:594] 참조). Another small molecule inhibitor of TNFR2 is panobinostat, a histone deacetylase inhibitor that can reduce FoxP3 expression and inhibit the suppressive activity of Tregs. Combination therapy of panobinostat and azacytidine reduces the number of TNFR2 + Tregs in the blood and bone marrow of patients with acute myeloid leukemia, and consequently increases the production of IFNγ and IL-2 by effector T cells, resulting in a therapeutic effect in these patients. indicates (see, e.g., Zou et al. (2018) Front. Immunol . 9:594]). Cyclophosphamide, a DNA alkylating agent commonly used as a cytotoxic chemotherapeutic agent in cancer treatment, is capable of suppressing the immunosuppressive function of Tregs at low doses and depletes maximally suppressive Tregs in mice with PROb colon cancer after a single dose administration, resulting in an anti-inflammatory effect. resulting in activation of the tumor immune response. In a mouse model of mesothelioma, cyclophosphamide treatment depleted TNFR2 hi Tregs. Combination of cyclophosphamide with etanercept inhibited the growth of established CT26 tumors in mice by blocking the TNF-TNFR2 interaction and abolishing TNFR2-expressing Treg activity (see, e.g., Zou et al. (2018) Front. Immunol . 9:594]). Chinese herbal medicine Tripterygium Wilfordi triptolide, an immunosuppressive molecule isolated from wilfordii ) suppresses TNF and TNFR2 expression in the colon of a mouse colitis model and also reduces the number of Tregs and inhibits tumor growth in mice with melanoma (see, e.g., [ Zou et al. (2018) Front. Immunol. 9:594]).
F. TNFR1 및/또는 TNFR2 축의 선택적 표적화F. Selective targeting of the TNFR1 and/or TNFR2 axis
본 명세서에 기재된 바와 같이, TNF를 차단하고 TNFR1 및 TNFR2를 통한 신호전달을 억제하는 기존의 항-TNF 요법은 치료 효능, 내약성 및 안전성에 제한이 있다. 항-TNF 요법은 TNFR1을 통한 TNF 신호전달을 방지하고 세포자멸 및 염증 경로를 차단함으로써 RA 및 다른 자가면역 및 염증성 질환 및 병태를 개선한다. 그러나 이러한 항-TNF 요법은 보호, 생존촉진, 재생 촉진 및 항-염증성 신호전달 경로를 포함하는 TNFR2 신호전달, 뿐만 아니라 면역억제 Treg의 TNFR2 연관 확대의 유익한 효과를 차단하여 심각한 감염을 포함하는 심각한, 때때로 치명적, 부작용을 초래한다. TNF 차단 요법의 사용과 연관된 다른 부작용은 울혈성 심부전, 간 손상, 탈수초 질환/CNS 장애, 루푸스, 건선, 유육종증, 림프종 및 고형 악성종양을 포함한 암뿐만 아니라 추가 자가면역 질환의 발병에 대한 감수성 증가를 포함한다. 항-TNF 요법은 탈수초 및 신경퇴행 질환의 치료에 실패했으며 질환 증상을 악화시킬 수 있다. As described herein, existing anti-TNF therapies that block TNF and inhibit signaling through TNFR1 and TNFR2 have limited therapeutic efficacy, tolerability and safety. Anti-TNF therapy ameliorates RA and other autoimmune and inflammatory diseases and conditions by preventing TNF signaling through TNFR1 and blocking apoptotic and inflammatory pathways. However, these anti-TNF therapies block the beneficial effects of TNFR2 signaling, including protective, pro-survival, regenerative and anti-inflammatory signaling pathways, as well as TNFR2-associated expansion of immunosuppressive Tregs, resulting in severe, including severe infections. Sometimes fatal, side effects result. Other side effects associated with the use of TNF blockade therapy are congestive heart failure, liver damage, demyelinating disease/CNS disorders, increased susceptibility to the development of additional autoimmune diseases as well as cancer, including lupus, psoriasis, sarcoidosis, lymphoma and solid malignancies. includes Anti-TNF therapy has failed to treat demyelination and neurodegenerative diseases and may exacerbate disease symptoms.
TNFR1 길항제 작제물, TNFR2 효능제 작제물, 다중특이적, 예컨대 이중특이적, TNFR1 길항제/TNFR2 효능제 작제물을 포함하는 작제물, 및 TNFR1을 통한 TNF 신호전달의 선택적 억제를 위한 핵산 및 방법이 본 명세서에 제공된다 (예를 들어, 도 2, 이는 예시적인 이중특이 작제물을 도시함). 또한 TNFR2 신호전달을 유지하거나 강화하는 것을 포함하여 TNFR1을 통한 TNF 신호전달의 선택적 억제를 위한 작제물 및 방법이 제공된다. 이들 작제물 및 방법은 TNF/TNFR1 축의 질환 및 장애의 치료를 위한 개선된 치료적 접근법을 제공한다. 이러한 치료적 접근법은 자가면역, 만성 염증성, 신경퇴행, 및 탈수초, 질환, 장애 및 병태, 및 염증 요인이 있는 암의 치료를 포함하지만 이에 제한되지 않는다. 본 명세서에 기재된 바와 같이, TNFR1 길항작용과 함께 TNFR2의 동시 또는 순차적 선택적 효능작용은 세포 생존 및 증식을 제어하는 항염증 경로 및 NF-κB 경로와 같은 바람직한 신호 경로를 활성화함으로써, 그리고 자가면역 미세환경에서 조직 파괴를 초래하는 과도한 자가반응성/이펙터 T 세포를 제거하는 면역억제성 Treg의 확장을 유도함으로써 치료 효과를 가지며 선택적 TNFR1 길항제의 치료 지수를 강화시킬 수 있다. TNFR1 antagonist constructs, TNFR2 agonist constructs, constructs including multispecific, such as bispecific, TNFR1 antagonist/TNFR2 agonist constructs, and nucleic acids and methods for selective inhibition of TNF signaling through TNFR1 provided herein (eg, FIG. 2 , which depicts exemplary bispecific constructs). Also provided are constructs and methods for selective inhibition of TNF signaling through TNFR1, including maintaining or enhancing TNFR2 signaling. These constructs and methods provide improved therapeutic approaches for the treatment of diseases and disorders of the TNF/TNFR1 axis. Such therapeutic approaches include, but are not limited to, treatment of autoimmune, chronic inflammatory, neurodegenerative, and demyelinating, diseases, disorders and conditions, and cancers with inflammatory factors. As described herein, simultaneous or sequential selective agonism of TNFR2 together with TNFR1 antagonism activates desirable signaling pathways such as the anti-inflammatory pathway and the NF-κB pathway that control cell survival and proliferation, and the autoimmune microenvironment. It has a therapeutic effect and can enhance the therapeutic index of selective TNFR1 antagonists by inducing expansion of immunosuppressive Tregs that eliminate excessive autoreactive/effector T cells that lead to tissue destruction in .
섹션 1과 2는 각각 TNRF1과 TNRF2를 표적으로 하는 방법을 기재하고; 섹션 3은 이전 접근법, 특히 TNFR1을 표적으로 하는 접근법의 문제를 해결하는 본 명세서에 제공된 작제물의 개요를 제공하고; 섹션 4는 본 명세서에 제공된 구조 및 성분을 기재한다.
1. TNFR1 길항제에 의한 TNFR1의 선택적 차단1. Selective blockade of TNFR1 by TNFR1 antagonists
그러나 TNFR1에 대한 항체와 같은 다가 제제의 사용은 실현 가능하지 않다. TNF 삼량체는 각 단량체 TNFR의 프리리간드 조립 도메인(플래드)에 의해 매개되는 프리리간드 어셈블리 복합체로서 3개의 TNFR1 사슬에 결합한다. 이것은 클러스터가 세포 표면에 형성되기 전에 리간드 결합이 필요한 대부분의 수용체 시스템과 다르다. TNF 수용체는 4개의 일렬로 반복되는 시스테인 풍부 모티프를 함유하는 두 수용체를 갖는 대부분의 세포외 도메인에서 약 28% 상동성을 갖는 단일 막관통 당단백질이다. 이들의 세포내 서열은 거의 관련이 없으며 서로 상동성이 거의 없으며, 초기 연구에서는 이들의 신호전달 기능에 대한 설명을 제시하였다 (문헌[Grell 등 (1994) J. Immol . 153(5):1963-72]). 기능적 중요성이 알려진 여러 모티프가 포함되어 있다. 각각의 TNFR1 및 TNFR2는 수용체를 미리 복합체화하는 세포외 프리-리간드 결합 조립 도메인(PLAD) 도메인(리간드 결합 영역과 구별됨)을 함유한다. 형태적 변화는 삼량체 TNF 리간드가 세포막에서 TNFR 삼량체에 결합하여 신호 활성화를 야기할 때 유래된다 (문헌[MacEwan (2002) Br J Pharmacol . 135(4):855-875; 및 Lo 등 (2019) Sci Signal. 12(592):eaav5637]). However, the use of multivalent agents such as antibodies against TNFR1 is not feasible. The TNF trimer binds to the three TNFR1 chains as a pre-ligand assembly complex mediated by the pre-ligand assembly domain (PLADD) of each monomeric TNFR. This differs from most receptor systems, which require ligand binding before clusters form on the cell surface. The TNF receptor is a single transmembrane glycoprotein with about 28% homology in most of its extracellular domain with both receptors containing four tandem repeating cysteine rich motifs. Their intracellular sequences are largely unrelated and show little homology to each other, and early studies provided an explanation for their signaling function (Grell et al. (1994) J. Immol . 153(5):1963- 72]). It contains several motifs of known functional significance. Each TNFR1 and TNFR2 contains an extracellular pre-ligand binding assembly domain (PLAD) domain (distinct from the ligand binding domain) that pre-complexes the receptor. The conformational change results when the trimeric TNF ligand binds to the TNFR trimer at the cell membrane, resulting in signal activation (MacEwan (2002) Br J Pharmacol . 135(4) :855-875; and Lo et al. (2019) Sci Signal. 12(592) :eaav5637]).
그 결과, TNFR1에 결합하는 항체 및 다른 다가 제제는 TNFR 신호전달의 활성화로 이어지는 수퍼클러스터링을 유발할 수 있기 때문에 길항제로 사용하기에 적합하지 않을 수 있다. 반면에 1가 길항제, 예컨대 단일 도메인 항체 (dAb 또는 sdAb), 나노바디 (Nb; 낙타과 단일 도메인 항체), scFv 단편, 및 Fab 단편은 하나의 TNFR1 분자에 결합하고 세포 표면에서 수용체의 가교 또는 클러스터링을 유도하지 않아 TNFR1 신호 전달의 활성화를 차단한다. 1가 길항제는 TNFR1 세포외 도메인의 도메인 1, 2, 3 또는 4 또는 에피토프 스패닝 다중 도메인에 결합할 수 있다 (예를 들어, 문헌[미국 특허 번호 9,028,817 및 9,028,822] 참조), 이들 기존의 길항제는 효과가 없는 치료제였다. 다양한 문제 중에는 짧은 혈청 반감기, 면역원성 및 다른 문제가 이었다. TNFR1의 선택적 차단은 본 명세서에 기재되고 제공된 특성을 갖는 TNFR1 길항제로 달성될 수 있다.As a result, antibodies and other multivalent agents that bind to TNFR1 may not be suitable for use as antagonists because they may cause superclustering leading to activation of TNFR signaling. On the other hand, monovalent antagonists such as single domain antibodies (dAb or sdAb), nanobodies (Nb; camelid single domain antibodies), scFv fragments, and Fab fragments bind to one TNFR1 molecule and inhibit cross-linking or clustering of receptors at the cell surface. block the activation of TNFR1 signaling. Monovalent antagonists can bind
2. TNFR2 효능제에 의한 TNFR2의 선택적 활성화 2. Selective activation of TNFR2 by TNFR2 agonists
본 명세서에 기재된 바와 같이, TNFR2의 선택적 활성화는 예를 들어, TNFR2 효능적 항체 및 그의 항원 결합 단편, 및 TNFR2 선택적 TNF 뮤테인 및 그의 융합 단백질을 포함할 수 있는 TNFR2 특이적 효능제를 사용하여 달성될 수 있다. 인간 TNFR2의 제1 및/또는 제2 에피토프에 결합하는 항체의 항원 결합 단편이 사용될 수 있다. TNFR2의 제1 에피토프는 서열번호: 4의 아미노산 잔기 48-67을 포함하고, 제2 에피토프는 예를 들어, 서열번호: 4의 잔기 128-147, 130-149, 135-147, 또는 135-153을 포함하여 서열번호: 4의 위치 135를 포함한다 (예를 들어, 문헌[국제 출원 공개 번호 WO 2014/124134; 및 미국 특허 번호 9,821,010] 참조). TNFR2의 다른 에피토프가 확인되었으며 아래에서 논의되는 바와 같이 TNFR2 선택성을 갖는 항원 결합 단편을 설계하는 데 사용할 수 있다. As described herein, selective activation of TNFR2 is achieved using TNFR2 specific agonists, which can include, for example, TNFR2 agonistic antibodies and antigen-binding fragments thereof, and TNFR2 selective TNF muteins and fusion proteins thereof. It can be. Antigen-binding fragments of antibodies that bind to the first and/or second epitopes of human TNFR2 may be used. A first epitope of TNFR2 comprises amino acid residues 48-67 of SEQ ID NO:4, and a second epitope comprises, for example, residues 128-147, 130-149, 135-147, or 135-153 of SEQ ID NO:4 and position 135 of SEQ ID NO: 4 (see, eg, International Application Publication No. WO 2014/124134; and US Patent No. 9,821,010). Other epitopes of TNFR2 have been identified and can be used to design antigen-binding fragments with TNFR2 selectivity, as discussed below.
TNFR1의 길항작용과는 대조적으로, TNFR2를 효능시키기 위해, TNFR2를 활성화시키는 1차 리간드인 막 결합 TNF의 작용을 모방하는 이량체 및 삼량체 분자가 사용된다. 이와 같이, TNFR2 효능제는 TNFR2 선택적 TNF 뮤테인 및 항체 단편을 포함한다. 예는 하기 논의된 바와 같이 다량체화 도메인, 특히 이량체화 또는 삼량체화 도메인과 융합된 TNF 뮤테인 및 항체 단편이다. 이러한 분자의 반감기를 연장하기 위해, 이들은 절단 가능한 링커가 있거나 없는 폴리에틸렌 글리콜과 회합하거나 커플링될 수 있거나(예를 들어 문헌[Santi 등 (2012) Proc . Natl . Acad . Sci . U.S.A. 109:6211-6216)] 참조), 인간 혈청 알부민(FcRn 최적화를 포함하거나 포함하지 않고, 자체가 PEG화되거나 포함되지 않음)과 같은 반감기 연장 단백질 또는 펩티드; PEGylation이 있거나 없는 항체의 ADCC-불활성화/FcRn 최적화된 Fc 도메인에 융합 또는 결합할 수 있다 (예를 들어 문헌[Strohl (2015) BioDrugs 29(4):215-239]에서 검토됨). 반감기 연장제는 예를 들어 PEG화, 글리코실화의 변형, 시알화, PAS화(길이가 약 100-200 잔기인 PAS 아미노산의 중합체), ELP화(예를 들어 문헌[Floss 등 (2010) J. Trends Biotechnol .28(1):37-45] 참조), 하필레이션(Hapylation)(글리신 단독중합체), 인간 혈청 알부민에 대한 융합, GLK에 대한 융합, CTP에 대한 융합, GLP 융합, 인간 면역글로불린(IgG)의 불변 단편(Fc) 도메인에 대한 융합, 트랜스페린에 대한 융합, XTEN(rPEG라고도 함, A, E, G, P, S 및 T를 함유하는 정확하지 않은 반복 펩티드 서열의 유전적 융합, 예를 들어, 문헌[Schellenberger 등(2009) Nat Biotechnol . 27(12):1186-90] 참조), 및 크기를 증가시키고, 유체역학적 반경을 증가시키고, 전하를 변경하거나 청소능보다는 재활용을 위해 수용체를 표적으로 하는 다른 그러한 변형 및 융합, 및 그러한 변형의 조합을 포함할 수 있다. 반감기 연장제의 특정 예는 아래에서 상세히 논의되고 예시된다.In contrast to the antagonism of TNFR1, to agonize TNFR2, dimeric and trimeric molecules are used that mimic the action of membrane bound TNF, the primary ligand that activates TNFR2. As such, TNFR2 agonists include TNFR2 selective TNF muteins and antibody fragments. Examples are TNF muteins and antibody fragments fused with a multimerization domain, particularly a dimerization or trimerization domain, as discussed below. To extend the half-life of these molecules, they can be associated with or coupled to polyethylene glycol with or without a cleavable linker (see, for example, Santi et al. (2012) Proc . Natl . Acad . Sci . USA 109 :6211-6216)), half-life extending proteins or peptides such as human serum albumin (with or without FcRn optimization, itself PEGylated or not); Can be fused or linked to the ADCC-inactivated/FcRn optimized Fc domain of an antibody with or without PEGylation (see e.g. Strohl (2015) BioDrugs 29(4):215-239). Half-life extenders include, for example, PEGylation, modification of glycosylation, sialylation, PASylation (polymers of PAS amino acids of about 100-200 residues in length), ELPylation (see, for example, Floss et al. (2010) J. Trends Biotechnol.28 (1): 37-45), Hapylation (glycine homopolymer), fusion to human serum albumin, fusion to GLK, fusion to CTP, fusion to GLP , fusions to constant fragment (Fc) domains of human immunoglobulin (IgG), fusions to transferrin, XTEN (also known as rPEG, of incorrectly repeating peptide sequences containing A, E, G, P, S and T). Genetic fusion, e.g., see Schellenberger et al. (2009) Nat Biotechnol . 27(12):1186-90), and to increase size, increase hydrodynamic radius, alter charge or rather than clearance other such modifications and fusions that target receptors for recycling, and combinations of such modifications. Specific examples of half-life extenders are discussed and exemplified in detail below.
3. 3. TNFR1TNFR1 길항제 antagonist 작제물construct , , TNFR2TNFR2 효능제agonist 작제물construct ; 이중 ; double 특이적을be specific 포함하는 다중 특이적, TNFR1 길항제 및 TNFR2 효능제 작제물 Multispecific, TNFR1 antagonist and TNFR2 agonist constructs comprising
따라서, 본 명세서에서 TNRFR1 신호전달/활성을 억제하고/하거나 TNFR2를 효능시키기 위한 작제물을 제공한다. TNFR1 신호전달을 억제하고 TNFR2를 효능시키는 이중특이성과 같은 다중특이성인 아래에서 논의되는 작제물이 본 명세서에 제공되는 작제물에 포함된다. 이중특이적 길항제 TNFR1 또는 TNFR2는 TNF가 휴지 삼량체 TNFR의 형태에서 활성화 변화를 유도하는 능력을 억제하여 신호전달을 방지할 수 있기 때문에 이러한 작제물을 설계할 때 주의를 기울여야 한다. 다른 다량체 분자는 수용체의 응집을 위험에 빠뜨리므로 TNFR이 세포 염증 및 세포자멸에 대한 신호를 보내도록 한다. 본 명세서에서 다중특이적 작제물은 일반적으로 각각의 TNFR1 및 TNFR2와 같은 상이한 수용체를 표적으로 한다. TNFR1 신호전달을 억제하고 유리하게는 TNFR2 활성을 효능시킴으로써 이것은 TNF가 관련된 질환, 병태 및 장애의 개선된 치료를 제공한다. Accordingly, provided herein are constructs for inhibiting TNRFR1 signaling/activity and/or agonizing TNFR2. Constructs discussed below that are multispecific, such as bispecific, that inhibit TNFR1 signaling and agonize TNFR2, are included in the constructs provided herein. Bispecific antagonists TNFR1 or TNFR2 should be used with care when designing such constructs, as they can prevent signaling by inhibiting the ability of TNF to induce an activation change in the conformation of the resting trimeric TNFR. Other multimeric molecules risk receptor aggregation, allowing TNFR to signal for cell inflammation and apoptosis. Multispecific constructs herein generally target different receptors, such as TNFR1 and TNFR2, respectively. By inhibiting TNFR1 signaling and advantageously agonizing TNFR2 activity, this provides improved treatment of diseases, conditions and disorders in which TNF is involved.
본 명세서에 제공되는 작제물 중에는 TNFR1 길항제 작제물이 있다. 본 명세서에는 TNFR1 길항제-Fc 융합 작제물과 같은 융합 단백질 작제물이 포함된다. 본 명세서에 기재되고 실시예에 예시된 바와 같이, TNFR2를 길항하지 않거나 실질적으로 길항하지 않고 TNFR1을 특이적으로 표적화하거나 TNFR2 효능적 활성을 포함하거나 나타내는 TNFR1 길항제가 선택, 생성 또는 설계될 수 있다. TNFR1 길항제 작제물은 dAb, scFv 및 Fab와 같은 1가 길항제를 포함하여 이전 TNFR1 길항제의 치료 효능 및 안전성을 개선한다. Among the constructs provided herein are TNFR1 antagonist constructs. Included herein are fusion protein constructs such as TNFR1 antagonist-Fc fusion constructs. As described herein and exemplified in the Examples, TNFR1 antagonists can be selected, created, or designed that specifically target TNFR1 or contain or exhibit TNFR2 agonistic activity without antagonizing or substantially antagonizing TNFR2. TNFR1 antagonist constructs improve the therapeutic efficacy and safety of previous TNFR1 antagonists, including monovalent antagonists such as dAbs, scFvs and Fabs.
또한, 이전의 TNFR2 효능제의 치료 효능을 개선하는 TNFR2-Fc 융합 작제물과 같은 선택적 TNFR2 효능제 작제물이 제공된다. 예를 들어, 본 명세서에 나타낸 바와 같이, Fc 융합 작제물의 반감기는 이전의 TNFR1 길항제 또는 TNFR2 효능제의 반감기를 증가시키며, 이는 예를 들어 투약 빈도를 감소시키고, 환자 순응도를 개선하고, 치료 지수를 개선시킨다. 또한, 이전의 TNFR2 효능제의 치료 효능을 개선하는 TNFR2-Fc 융합 작제물과 같은 선택적 TNFR2 효능제 작제물이 제공된다. 예를 들어, 본 명세서에 나타낸 바와 같이, Fc 융합 작제물의 반감기는 이전의 TNFR1 길항제 또는 TNFR2 효능제의 반감기를 증가시키며, 이는 예를 들어 투약 빈도를 감소시키고, 환자 순응도를 개선하고, 치료 지수를 개선시킨다. PEG화 및 펩티드에 대한 융합을 포함하는 대안적인 후보 반감기 연장제는 위에서 논의되었고, 예시적인 연장제는 아래에 상세히 기재되어 있지만(문헌[Strohl (2015) BioDrugs 29(4):215-239]에서 검토됨, 또한 문헌[Tan 등 (2018) Current Pharmaceutical Design 24:4932-4946] 참조), 선형 또는 분지형 PEG를 사용한 PEG화도 포함한다 (예를 들어, 문헌[Swierczewska 등 (2015) Expert Opin Emerg Drugs 20(4):531-536] 참조). Also provided are selective TNFR2 agonist constructs such as TNFR2-Fc fusion constructs that improve the therapeutic efficacy of previous TNFR2 agonists. For example, as shown herein, the half-life of an Fc fusion construct increases the half-life of a previous TNFR1 antagonist or TNFR2 agonist, which, for example, reduces dosing frequency, improves patient compliance, and improves therapeutic index improve Also provided are selective TNFR2 agonist constructs such as TNFR2-Fc fusion constructs that improve the therapeutic efficacy of previous TNFR2 agonists. For example, as shown herein, the half-life of an Fc fusion construct increases the half-life of a previous TNFR1 antagonist or TNFR2 agonist, which, for example, reduces dosing frequency, improves patient compliance, and improves therapeutic index improve Alternative candidate half-life extenders, including PEGylation and fusions to peptides, are discussed above, and exemplary extenders are described in detail below (Strohl (2015) BioDrugs 29(4) :215-239). Reviewed, also see Tan et al. (2018) Current Pharmaceutical Design 24 :4932-4946), including PEGylation with linear or branched PEGs (see, e.g., Swierczewska et al. (2015) Expert Opin Emerg Drugs 20(4) :531-536).
TNFR1 효능제 작제물은 선택적인 링커와 선택적인 활성 변형제를 포함한다. 어떤 순서로든 조립할 수 있다. TNFR1 길항제 작제물의 구조는 하기 식 1로 제시될 수 있다:A TNFR1 agonist construct includes an optional linker and an optional active modifier. Can be assembled in any order. The structure of the TNFR1 antagonist construct can be shown in
(TNFR1 억제제)n - 링커p ― 링활성 변형제)q, 식 1a, 또는 (TNFR1 inhibitor) n - linker p - ring activity modifier) q , Formula 1a, or
(활성 변형제)q - 링커p ― 링TNFR1 억제제)n, 식 1b, 여기서: (active modifier) q - linker p - ring TNFR1 inhibitor) n , Formula 1b, where:
(n 및 q는 각각 정수이고, 각각 독립적으로 1, 2 또는 3이고; p는 0, 1, 2 또는 3임); 활성 변형제는 TNFR1 억제제의 혈청 반감기를 증가시키는 알부민과 같은 폴리펩티드, 또는 ADCC 활성이 감소되거나 전혀 없도록 변형된 Fc와 같은 모이어티이고; TNFR1 억제제는 TNFR1에 결합하고 활성을 억제하는 폴리펩티드 또는 작은 약물 분자와 같은 분자이다. 활성 변형제는 인간 혈청 알부민 항체 또는 비변형 Fc가 아니다. 또한 식 3의 TNFR2 효능제가 제공된다: (TNFR2 효능제)n-링커p― 링활성 변형제)q, 여기서 n, p 및 q, 링커, 및 활성 변형제는 식 1에 제시된 바와 같다. (n and q are each an integer, each independently 1, 2 or 3; p is 0, 1, 2 or 3); activity modifiers are polypeptides such as albumin that increase the serum half-life of TNFR1 inhibitors, or moieties such as Fc that have been modified to have reduced or no ADCC activity; TNFR1 inhibitors are molecules such as polypeptides or small drug molecules that bind to and inhibit the activity of TNFR1. Active modifiers are not human serum albumin antibodies or unmodified Fc. Also provided are TNFR2 agonists of formula 3: (TNFR2 agonist) n -linker p -ring activity modifier) q , where n, p and q, linker, and activity modifier are as shown in
또한 직접적으로 또는 링커를 통해 연결된 TNFR1 길항제(TNFR1 억제제) 및 TNFR2 효능제를 함유하는 이중특이적 포함 다중특이적 작제물이 제공된다. 이러한 작제물은 상기 식의 TNFR1 길항제를 포함할 수 있거나 하기 식 2에 제시된 바와 같은 구조를 가질 수 있다. 이중특이적 및 다중특이적 작제물은 염증성 및 유해한 TNFR1 신호전달을 선택적으로 억제하고 보호 및 항-염증성 TNRFR2 신호전달을 강화한다. 이들은 이전 TNFR1 길항제 및 TNFR2 효능제와 비교하여 증가된 혈청 반감기 및 안정성, 및 감소된 말초 청소능을 포함하는 유리한 약동학적 특성을 제공하는 모이어티를 포함한다. Also provided are bispecific, including multispecific constructs containing a TNFR1 antagonist (TNFR1 inhibitor) and a TNFR2 agonist linked either directly or via a linker. Such constructs may include a TNFR1 antagonist of the formula above or may have a structure as set forth in formula 2 below. Bispecific and multispecific constructs selectively inhibit inflammatory and deleterious TNFR1 signaling and enhance protective and anti-inflammatory TNRFR2 signaling. They contain moieties that provide advantageous pharmacokinetic properties, including increased serum half-life and stability, and reduced peripheral clearance compared to previous TNFR1 antagonists and TNFR2 agonists.
본 명세서에 제공되는 다중특이적, 예를 들어 이중특이적 분자/작제물의 구조는 하기 식 (식 2)으로 표시된다:The structure of a multispecific, e.g., bispecific, molecule/construct provided herein is represented by the following formula (Equation 2):
(TNFR1 억제제)n ― (활성 변형제)r1 ― 링커 (L)p ― (활성 변형제)r2 ― (TNFR2 효능제)q, (TNFR1 inhibitor) n - (active modifier) r1 - linker (L) p - (active modifier) r2 - (TNFR2 agonist) q ,
여기서 n= 1, 2, 또는 3, p= 1, 2, 또는 3, r1 및 r2 각각의 독립적으로 = 0, 1, 2, 및 q= 0, 1 또는 2. where n = 1, 2, or 3, p = 1, 2, or 3, r1 and r2 each independently = 0, 1, 2, and q = 0, 1 or 2.
식 1과 마찬가지로 성분의 순서가 다를 수 있다. 링커는 복수의 성분, 예컨대 GS 링커, 중합체성 모이어티, 예컨대 PEG, 또는 다른 이러한 링커, 또는 힌지 영역, 또는 성분의 다른 조합을 함유할 수 있고, 활성 변형제는 Fc 영역, 또는 변형된 Fc 영역, 또는 반감기 또는 내인성 억제제에 대한 내성을 증가시키는 폴리펩티드와 같은 작제물의 활성을 변형시키는 모이어티이다. 식 1 및 2의 성분은 폴리펩티드일 수 있거나, 특이적으로 결합하는 작은 약물 또는 화학 링커 또는 비-펩티드 활성 변형제와 같은 다른 분자를 함유할 수 있다. 각 성분의 아래에 기재되어 있다.As in
또한 하기를 함유하는 작제물이 제공된다 (식 5).Also provided are constructs containing (Equation 5).
(TNFR2 효능제)n ― 링커p ― (활성 변형제)q, 식 5a, 또는(TNFR2 agonist) n - linker p - (active modifier) q , Formula 5a, or
(활성 변형제)q ― 링커p ― (TNFR2 효능제)n, 식 5b, (active modifier) q - linker p - (TNFR2 agonist) n , formula 5b,
여기서 각 성분은 상기 식 1에서 정의된 바와 같고, TNFR2 효능제는 소분자, 또는 폴리펩티드, 예컨대 TNFR2 단쇄 항체 효능제 또는 그의 일부일 수 있다.wherein each component is as defined in
4. 4. TNFR1TNFR1 길항제 antagonist 작제물construct , , TNFR2TNFR2 효능제제Efficacy agent 작제물construct , 및 , and 이중특이적bispecific , , TNFR1TNFR1 길항제/TNFR2 효능제 작제물을 포함하는 다중특이적 성분 Multispecific Components Containing Antagonist/TNFR2 Agonist Constructs
본 명세서에 제공된 작제물의 설명 및 예, 및 작제물의 각 성분은 아래 섹션에 기재되어 있다. 각각의 작제물의 예시적인 형태는 상기 식 1 및 2, 및 하기 식 3 및 4에 의해 도시되고 기재된다.Descriptions and examples of the constructs provided herein, and each component of the constructs, are described in the sections below. Exemplary forms of each construct are shown and described by
a. TNFR1 억제제 모이어티(TNFR1 길항제) a. TNFR1 inhibitor moiety (TNFR1 antagonist)
상기 식 1 및 본 명세서에 제공된 다중특이적 분자/작제물(상기 식 2)에서 TNFR1 억제제 모이어티는 TNFR1 신호전달을 억제하는 폴리펩티드 또는 소분자를 포함하는 임의의 분자이다. 본 명세서에는 TNFR2 신호전달을 억제하지 않고 TNFR1 신호전달을 선택적으로 억제하는 TNFR1 억제제가 포함된다. A TNFR1 inhibitor moiety in
TNFR1을 효능시키는 수용체 클러스터링을 피하기 위해, TNFR1 길항제 작제물은 일반적으로 단량체/1가이다. 작제물의 TNFR1 길항제 억제제 성분은 TNFR1 길항제 활성을 갖는 것으로 알려진 것일 수 있거나, 예를 들어 라이브러리, 예컨대 파아지 라이브러리, 항체 라이브러리, 또는 압타머 라이브러리로부터 선택함으로써 확인될 수 있다. TNFR1 억제제 모이어티는 TNFR1에 대해 증가된 특이성 또는 친화성을 갖도록 변형되거나 선택된 것들이고 (그러한 활성으로 인한 부작용은 등급 2 미만이며 일반적으로 NCI 유해 사례 공통 용어 기준 (CTCAE) 등급 체계에 따라 등급 1 이하임), TNFR1에 대한 효능제 활성이 없거나 거의 없으며, 선택적으로 TNFR2에 대한 효능제 활성을 갖는다.To avoid receptor clustering that agonizes TNFR1, TNFR1 antagonist constructs are usually monomeric/monovalent. The TNFR1 antagonist inhibitor component of the construct may be one known to have TNFR1 antagonist activity or may be identified, for example, by selection from a library such as a phage library, an antibody library, or an aptamer library. TNFR1 inhibitor moieties are those that have been modified or selected to have increased specificity or affinity for TNFR1 (adverse effects resulting from such activity are less than Grade 2 and are generally
그러한 경우에, TNFR1 억제제 모이어티는 단쇄 항체로서 또는 본 명세서에 기재된 임의의 다른 형태로 제공될 수 있으며, 이는 예를 들어 상기 및 하기 기재된 임의의 것과 같은 반감기 연장제, 변형된 Fc 영역 또는 Fc 이량체, 또는 혈청 반감기를 증가시키는 다른 부분 또는 부분들에 연결된 것을 포함한다. In such cases, the TNFR1 inhibitor moiety may be provided as a single chain antibody or in any other form described herein, including, for example, a half-life extender such as any described above and below, a modified Fc region or an Fc dimer. sieve, or other part or parts that increase serum half-life.
예를 들어, 본 명세서에 제공된 바와 같이, TNFR1 길항제 작제물의 TNFR1 억제제 성분은 TNFR1에 특이적으로 결합하는 인간 도메인 항체(dAb)일 수 있거나 이를 포함할 수 있다. dAb는 가변 영역 중쇄(VH) 또는 경쇄(VL) 도메인을 함유할 수 있다. 본 명세서에서 사용하기 위한 dAb는 예를 들어 하기를 포함한다: DOM1h-574-208 (서열번호: 54)로 지정된 dAb (DMS5541로부터; 서열번호:38 참조), GSK1995057 (서열번호: 55 참조) 및 GSK2862277 (서열번호: 56 참조), 뿐만 아니라 서열번호: 57-672 중 임의의 것에 제시된 dAb; 예를 들어 하기 참조: 미국 특허 번호: 9,028,817 및 9,028,822; 미국 공개 번호: 2006/0083747, 2010/0034831, 및 2012/0107330; 및 국제 출원 공개 번호: WO 2004/058820, WO 2004/081026, WO 2005/035572, WO 2006/038027, WO 2007/049017, WO 2008/149144, WO 2008/149148, WO 2010/094720, WO 2011/051217, WO 2011/006914, WO 2012/172070, WO 2012/104322, 및 WO 2015/104322, 및 다른 관련된 패밀리 구성원 출원 및 특허; 또한 서열 및 논의 of 다양한 dAb의 서열 및 논의를 제공하는 문헌[Enever 등, (2015) Protein Engineering, Design & Selection 28(3):59-66] 참조). 중쇄를 함유하는 Vhh dAb가 제공된다. 이들 dAb는 Fc 또는 HSA와 같은 모이어티에 직간접적으로 연결될 수 있으며, 이는 혈청 반감기를 증가시키고 또한 작제물에 다른 특성 또는 활성을 부여할 수 있다.For example, as provided herein, the TNFR1 inhibitor component of a TNFR1 antagonist construct may be or include a human domain antibody (dAb) that specifically binds to TNFR1. A dAb may contain a variable region heavy (V H ) or light (V L ) chain domain. dAbs for use herein include, for example: the dAb designated DOM1h-574-208 (SEQ ID NO: 54) (from DMS5541; see SEQ ID NO: 38), GSK1995057 (see SEQ ID NO: 55) and GSK2862277 (see SEQ ID NO: 56), as well as the dAb set forth in any of SEQ ID NOs: 57-672; See, for example, US Pat. Nos.: 9,028,817 and 9,028,822; US Publication Nos.: 2006/0083747, 2010/0034831, and 2012/0107330; and International Application Publication Numbers: WO 2004/058820, WO 2004/081026, WO 2005/035572, WO 2006/038027, WO 2007/049017, WO 2008/149144, WO 2008/149148, WO 2010/094720, WO 20 11/051217 , WO 2011/006914, WO 2012/172070, WO 2012/104322, and WO 2015/104322, and other related family member applications and patents; See also Enever et al., (2015) Protein Engineering, Design & Selection 28(3) :59-66, which provides sequences and discussion of various dAbs. Vhh dAbs containing heavy chains are provided. These dAbs can be directly or indirectly linked to moieties such as Fc or HSA, which can increase serum half-life and also confer other properties or activities to the construct.
항-TNFR1 억제제 성분은 나노바디일 수 있거나 나노바디를 포함할 수 있다. 이들의 예시는 (Nb) Nb 70 및/또는 Nb 96 (각각 서열번호: 683 및 684 참조)이다. 이들 dAb 및 Nb는 면역원성에 대해 조사되고, 필요한 경우 분자 모델링 및 돌연변이유발을 사용하여 예측된 면역원성 서열을 제거하도록 변형된다. 면역원성 서열은 당업계에 공지된 표준 방법에 의해 제거될 수 있다. 예를 들어, 잠재적으로 항원성 펩티드를 식별하고 항원성이지 않고 활성을 유지하는 것을 식별하기 위해 각 아미노산을 보존적으로 대체한다. 다른 방법이 공지되어 있다 (예를 들어, 단백질을 탈면역화하는 방법을 기재하는 문헌[Schubert 등 (2018) PLoS Comput Biol.14(3):e1005983)] 참조). The anti-TNFR1 inhibitor component may be or may include a Nanobody. Examples of these are (Nb) Nb 70 and/or Nb 96 (see SEQ ID NOs: 683 and 684, respectively). These dAbs and Nbs are investigated for immunogenicity and, if necessary, modified to remove predicted immunogenic sequences using molecular modeling and mutagenesis. Immunogenic sequences can be removed by standard methods known in the art. For example, each amino acid is conservatively replaced to identify potentially antigenic peptides and to identify those that are not antigenic and retain activity. Other methods are known (see, for example, Schubert et al., which describe methods for deimmunizing proteins). (2018) PLoS Comput Biol.14(3) :e1005983)]).
따라서, 예를 들어, TNFR1 길항제 dAb 부분은 서열번호: 54-672 중 임의의 것에 제시된 dAb, 또는 서열번호: 54-672 중 임의의 것에 제시된 dAb와 약 또는 적어도 약 85%, 90%, 95%, 98%, 99%, 또는 그 초과의 서열 동일성을 갖는 dAb, 또는 당업자에게 알려진 TNFR1 길항제 dAb일 수 있다. Thus, for example, the TNFR1 antagonist dAb portion is about or at least about 85%, 90%, 95% of the dAb set forth in any of SEQ ID NOs: 54-672, or the dAb set forth in any of SEQ ID NOs: 54-672. , a dAb with 98%, 99%, or greater sequence identity, or a TNFR1 antagonist dAb known to those skilled in the art.
다른 TNFR1 길항제는 예를 들어 항원 결합 항체 단편을 포함한다. 예를 들어, TNFR1 길항제는 Fab 단편, Fab' 단편, 단쇄 Fv (scFv), 디설파이드 연결된 Fv (dsFv), Fd 단편, Fd' 단편, 단쇄 Fab (scFab), hsFv (나선-안정화된 Fv), 유리 경쇄, 또는 상기 중 임의의 것의 항원 결합 단편일 수 있다. 또한 예를 들어 가요성을 높이기 위해 작제물 내에 GS 링커와 같은 링커를 포함할 수 있다.Other TNFR1 antagonists include, for example, antigen-binding antibody fragments. For example, a TNFR1 antagonist may be a Fab fragment, Fab' fragment, single chain Fv (scFv), disulfide linked Fv (dsFv), Fd fragment, Fd' fragment, single chain Fab (scFab), hsFv (helix-stabilized Fv), free light chain, or an antigen-binding fragment of any of the above. It is also possible to include a linker, such as a GS linker, in the construct to increase flexibility, for example.
예를 들어, 길항제의 TNFR1 억제제 부분은 ATROSAB로 지정된 TNFR1 길항적 항체의 항원 결합 단편을 함유할 수 있다. 상기 단편은 그와 적어도 85%, 90%, 95% 또는 그 초과의 서열 동일성 (예를 들어, 85%, 90%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% 또는 그 초과의 서열 동일성)을 나타내는 ATROSAB의 중쇄 또는 경쇄 CDR, 또는 CDR 중 하나 이상 (또는 모두)를 포함한다. TNFR1 길항제는 ATROSAB의 VH(서열번호: 31의 잔기 1-115) 및/또는 VL(서열번호: 32의 잔기 1-113), 또는 ATROSAB의 VH 또는 VL과 적어도 85%, 90%, 95%, 또는 그 초과의 서열 동일성을 함유하는 VH 또는 VL을 함유할 수 있다. 예를 들어, ATROSAB에서 유래된 dAb를 함유할 수 있다. TNFR1 길항제는 예를 들어, Fab 또는 scFv 단편, 예컨대 각각 서열번호: 679 및 680에 제시된 ATROSAB Fab (FabATR) 경쇄 및 중쇄, 또는 서열번호:673에 제시된 ATROSAB scFv (scFv IZI06.1)를 포함하는 ATROSAB의 다른 1가 항체 단편을 함유할 수 있다. 예를 들어, scFv는 ATROSAB 경쇄의 잔기 1-113에 상응하는 짧은 펩티드 링커(예를 들어, 서열번호:673에서와 같은 GGGGSGGGGSGGSAQ, 또는 서열번호: 813-834 중 임의의 것에 제시된 링커)에 의해 VL 도메인에 연결된 ATROSAB 중쇄의 잔기 1-115에 상응하는 VH 도메인(서열번호: 31 참조)을 함유한다 (서열번호: 32 참조). TNFR1 길항제는 scFv IG11을 포함하여 TNFR1에 대해 증가된 친화성 또는 선택성 또는 둘 모두를 갖는 ATROSAB scFV의 변이체를 함유할 수 있고, 이는 서열번호: 674에 기재된 서열, 서열번호: 675에 기재된 서열을 함유하는 scFv T12B, 또는 서열번호: 676에 기재된 서열을 함유하는 scFv 13.7, 또는 scFv IG11, scFv T12B, 및 scFv 13.7의 서열과 적어도 90% 서열 동일성을 함유하는 변이체을 포함하거나 그것을 갖는다. TNFR1 길항제는 또한 각각 서열번호: 681 및 682에 제시된 Fab 13.7 경쇄 및 중쇄(scFV 13.7로부터 유도됨)로부터의 아미노산 잔기의 서열을 포함할 수 있다. For example, the TNFR1 inhibitor portion of an antagonist may contain an antigen-binding fragment of an antagonistic TNFR1 antibody designated ATROSAB. The fragment has at least 85%, 90%, 95% or more sequence identity therewith (e.g., 85%, 90%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% or more sequence identity) of the heavy or light chain CDRs of ATROSAB, or one or more (or all) of the CDRs. The TNFR1 antagonist is at least 85%, 90% of V H of ATROSAB (residues 1-115 of SEQ ID NO: 31) and/or V L (residues 1-113 of SEQ ID NO: 32), or V H or V L of ATROSAB , V H or V L containing 95%, or greater, sequence identity. For example, it may contain a dAb derived from ATROSAB. TNFR1 antagonists include, for example, Fab or scFv fragments such as ATROSAB Fab (FabATR) light and heavy chains set forth in SEQ ID NOs: 679 and 680, respectively, or ATROSAB including the ATROSAB scFv (scFv IZI06.1) set forth in SEQ ID NO:673. may contain other monovalent antibody fragments of For example, the scFv can be linked to the VL by a short peptide linker corresponding to residues 1-113 of the ATROSAB light chain (eg, GGGGSGGGGSGGSAQ as in SEQ ID NO:673, or the linker set forth in any of SEQ ID NOs: 813-834). It contains a V H domain (see SEQ ID NO: 31) corresponding to residues 1-115 of the ATROSAB heavy chain linked to the domain (see SEQ ID NO: 32). A TNFR1 antagonist may contain a variant of ATROSAB scFV with increased affinity or selectivity for TNFR1 or both, including scFv IG11, which contains the sequence set forth in SEQ ID NO: 674, the sequence set forth in SEQ ID NO: 675 or scFv 13.7 containing the sequence set forth in SEQ ID NO: 676, or variants containing at least 90% sequence identity to the sequences of scFv IG11, scFv T12B, and scFv 13.7. The TNFR1 antagonist may also include sequences of amino acid residues from Fab 13.7 light and heavy chains (derived from scFV 13.7) set forth in SEQ ID NOs: 681 and 682, respectively.
TNFR1 길항제 작제물 내의 TNFR1 억제제는 또한 TNFR1에 결합하여 신호전달을 감소시키거나 억제하는 TNF 변이체(뮤테인)를 포함한다. 이들은 예를 들어, TNF 변이체 (뮤테인), 예컨대, TNFR1에 대한 선택성을 부여하는, 서열번호: 2를 참조한 돌연변이 L29S, L29G, L29Y, R31E, R31N, R32Y, R32W, S86T, L29S/R32W, L29S/S86T, R32W/S86T, L29S/R32W/S86T, R31N/R32T, R31E/S86T, R31N/R32T/S86T, 및 E146R 중 하나 이상을 함유하는 TNF 변이체로 제한되지 않는 것을 포함한다. TNFR1 길항제는 예를 들어 XPro1595(서열번호: 701 참조)로 지정된 뮤테인으로부터 유래된 TNFR1 선택적 길항제 TNF 뮤테인을 함유할 수 있다. XPro1595는 서열번호: 2를 참조하여 돌연변이 V1M, R31C, C69V, Y87H, C101A 및 A1456R을 함유한다. 다른 예시적인 TNFR1 선택적 길항적 TNF 뮤테인은 서열번호: 2와 관련하여 돌연변이 I97T/A145R을 함유 XENP345(서열번호: 702 참조)으로부터 유래되고; TNFR1 선택적 길항적 TNF 뮤테인은 서열번호: 2를 참조하여 돌연변이 A84S, V85T, S86T, Y87H, Q88N 및 T89Q를 함유하는 R1antTNF(서열번호: 703 참조)로 지정된다. TNFR1 길항제에 사용되는 TNFR1 억제제는 또한 링커에 화학적으로 접합될 수 있는 소분자 억제제를 포함한다.TNFR1 inhibitors within a TNFR1 antagonist construct also include TNF variants (muteins) that bind to TNFR1 and reduce or inhibit signaling. These are, for example, TNF variants (muteins), such as the mutations L29S, L29G, L29Y, R31E, R31N, R32Y, R32W, S86T, L29S/R32W, L29S with reference to SEQ ID NO: 2, which confer selectivity for TNFR1. /S86T, R32W/S86T, L29S/R32W/S86T, R31N/R32T, R31E/S86T, R31N/R32T/S86T, and TNF variants containing one or more of E146R. A TNFR1 antagonist may contain, for example, the TNFR1 selective antagonist TNF mutein derived from the mutein designated XPro1595 (see SEQ ID NO: 701). XPro1595, with reference to SEQ ID NO: 2, contains the mutations V1M, R31C, C69V, Y87H, C101A and A1456R. Another exemplary TNFR1 selective antagonistic TNF mutein is derived from XENP345 (see SEQ ID NO: 702) containing the mutations I97T/A145R with respect to SEQ ID NO: 2; The TNFR1 selective antagonistic TNF mutein is designated R1antTNF (see SEQ ID NO: 703) containing the mutations A84S, V85T, S86T, Y87H, Q88N and T89Q with reference to SEQ ID NO: 2. TNFR1 inhibitors for use in TNFR1 antagonists also include small molecule inhibitors that can be chemically conjugated to a linker.
본 명세서에 기재된 바와 같이, 예를 들어 실시예를 참조하면, TNFR1 억제제(길항제) 모이어티는 TNFR1에 대한 그의 특이성/선택성을 개선하도록 변형될 수 있고, 또한 선택적으로 TNFR2 효능적 활성을 갖도록 변형될 수 있다. TNF는 낮은 pM 친화도(Kd 19 pM)으로 TNFR1에 결합하고; 일반적으로 본 명세서의 길항제는 TNF와 적어도 동일한 친화도를 가지며, 그 활성이 불활성 형태의 수용체 '잠금(locking)'으로 인한 것이 아니라면 수용체가 잠기게 되므로 필요하지 않는다. 본 명세서에서 제공되는 TNFR1 길항제 작제물은 약 100 nM 이하(예를 들어, 95 nM, 90 nM, 85 nM, 80 nM, 75 nM, 70 nM, 65 nM, 60 nM, 55 nM, 50 nM, 45 nM, 40 nM, 35 nM, 30 nM, 25 nM, 20 nM, 15 nM, 10 nM, 5 nM, 4 nM, 3 nM, 2 nM, 또는 1 nM 이하)의 KD 값으로 TNFR1에 특이적으로 결합하는 것을 포함한다. 특정 구현예에서, TNFR1 길항제는 1 nM 이하(예를 들어, 990 pM, 980 pM, 970 pM, 960 pM, 950 pM, 940 pM, 930 pM, 920 pM, 910 pM, 900 pM, 890 pM, 880 pM, 870 pM, 860 pM, 850 pM, 840 pM, 830 pM, 820 pM, 810 pM, 800 pM, 790 pM, 780 pM, 770 pM, 760 pM, 750 pM, 740 pM, 730 pM, 720 pM, 710 pM, 700 pM, 690 pM, 680 pM, 670 pM, 660 pM, 650 pM, 640 pM, 630 pM, 620 pM, 610 pM, 600 pM, 590 pM, 580 pM, 570 pM, 560 pM, 550 pM, 540 pM, 530 pM, 520 pM, 510 pM, 500 pM, 490 pM, 480 pM, 470 pM, 460 pM, 450 pM, 440 pM, 430 pM, 420 pM, 410 pM, 400 pM, 390 pM, 380 pM, 370 pM, 360 pM, 350 pM, 340 pM, 330 pM, 320 pM, 310 pM, 300 pM, 290 pM, 280 pM, 270 pM, 260 pM, 250 pM, 240 pM, 230 pM, 220 pM, 210 pM, 200 pM, 190 pM, 180 pM, 170 pM, 160 pM, 150 pM, 140 pM, 130 pM, 120 pM, 110 pM, 100 pM, 90 pM, 80 pM, 70 pM, 60 pM, 50 pM, 40 pM, 30 pM, 20 pM, 10 pM, 5 pM, 또는 1 pM 이하)의 KD 값으로 TNFR1에 특이적으로 결합한다. As described herein, and referring to the Examples, for example, a TNFR1 inhibitor (antagonist) moiety can be modified to improve its specificity/selectivity for TNFR1, and also optionally to have TNFR2 agonistic activity. can TNF binds to TNFR1 with low pM affinity (K d 19 pM); In general, the antagonists herein have at least the same affinity as TNF, and unless their activity is due to 'locking' the inactive form of the receptor, it will lock the receptor and is therefore not required. A TNFR1 antagonist construct provided herein can be about 100 nM or less (e.g., 95 nM, 90 nM, 85 nM, 80 nM, 75 nM, 70 nM, 65 nM, 60 nM, 55 nM, 50 nM, 45 nM, 40 nM, 35 nM, 30 nM, 25 nM, 20 nM, 15 nM, 10 nM, 5 nM, 4 nM, 3 nM, 2 nM, or a KD value of 1 nM or less) specifically for TNFR1 including bonding In certain embodiments, the TNFR1 antagonist is 1 nM or less (e.g., 990 pM, 980 pM, 970 pM, 960 pM, 950 pM, 940 pM, 930 pM, 920 pM, 910 pM, 900 pM, 890 pM, 880 pM, 870 pM, 860 pM, 850 pM, 840 pM, 830 pM, 820 pM, 810 pM, 800 pM, 790 pM, 780 pM, 770 pM, 760 pM, 750 pM, 740 pM, 730 pM, 720 pM, 710 pM, 700 pM, 690 pM, 680 pM, 670 pM, 660 pM, 650 pM, 640 pM, 630 pM, 620 pM, 610 pM, 600 pM, 590 pM, 580 pM, 570 pM, 560 pM, 550 pM , 540 pM, 530 pM, 520 pM, 510 pM, 500 pM, 490 pM, 480 pM, 470 pM, 460 pM, 450 pM, 440 pM, 430 pM, 420 pM, 410 pM, 400 pM, 390 pM, 380 pM, 370 pM, 360 pM, 350 pM, 340 pM, 330 pM, 320 pM, 310 pM, 300 pM, 290 pM, 280 pM, 270 pM, 260 pM, 250 pM, 240 pM, 230 pM, 220 pM, 210 pM, 200 pM, 190 pM, 180 pM, 170 pM, 160 pM, 150 pM, 140 pM, 130 pM, 120 pM, 110 pM, 100 pM, 90 pM, 80 pM, 70 pM, 60 pM, 50 pM , 40 pM , 30 pM, 20 pM, 10 pM, 5 pM, or 1 pM or less) and binds specifically to TNFR1.
본 명세서에 제공된 TNFR1 길항제 작제물은 또한 다른 TNFR 슈퍼패밀리 구성원에 대한 결합이 결여되거나 감소되도록 선택되거나 설계된다. 예를 들어, 이들은 임의의 적합한 시험관내 결합 검정을 사용하여 TNFR2와 같은 다른 TNFR 슈퍼패밀리 구성원에 특이적으로 결합하지 않는 것을 확인하기 위해 평가된다. 검정에는 예를 들어 ELISA 기반 방법이 포함된다. 예를 들어, TNFR1 길항제 작제물은 다른 패밀리 구성원 또는 그의 상응하는 펩티드에 대한 친화도보다 더 큰 친화도로 인간 TNFR1 또는 TNFR1 유래 펩티드에 특이적으로 결합할 수 있다. 증가된 친화도는 TNFR2와 같은 다른 TNFR 슈퍼패밀리 구성원에 대한 TNFR1 길항제의 친화도보다 예를 들어, 적어도 또는 적어도 약 5-배 이상 (예를 들어, 적어도 또는 5-배 이상, 6-배 이상, 7-배 이상, 8-배 이상, 9-배 이상, 10-배 이상, 20-배 이상, 30-배 이상, 40-배 이상, 50-배 이상, 60-배 이상, 70-배 이상, 80-배 이상, 90-배 이상, 100-배 이상, 200-배 이상, 300-배 이상, 400-배 이상, 500-배 이상, 600-배 이상, 700-배 이상, 800-배 이상, 900-배 이상, 1,000-배 이상, 2,000-배 이상, 3,000-배 이상, 4,000-배 이상, 5,000-배 이상, 6,000-배 이상, 7,000-배 이상, 8,000-배 이상, 9,000-배 이상, 10,000-배 또는 그초과)이다.TNFR1 antagonist constructs provided herein are also selected or designed to lack or have reduced binding to other TNFR superfamily members. For example, they are evaluated to confirm that they do not specifically bind to other TNFR superfamily members, such as TNFR2, using any suitable in vitro binding assay. Assays include, for example, ELISA-based methods. For example, a TNFR1 antagonist construct may specifically bind to human TNFR1 or a TNFR1 derived peptide with greater affinity than it does to other family members or their corresponding peptides. The increased affinity is, for example, at least or at least about 5-fold greater than the affinity of a TNFR1 antagonist for another TNFR superfamily member, such as TNFR2 (eg, at least or 5-fold or greater, 6-fold or greater, 7-fold, 8-fold, 9-fold, 10-fold, 20-fold, 30-fold, 40-fold, 50-fold, 60-fold, 70-fold, 80-times or more, 90-times or more, 100-times or more, 200-times or more, 300-times or more, 400-times or more, 500-times or more, 600-times or more, 700-times or more, 800-times or more, 900-fold, 1,000-fold, 2,000-fold, 3,000-fold, 4,000-fold, 5,000-fold, 6,000-fold, 7,000-fold, 8,000-fold, 9,000-fold, 10,000-fold or more).
본 명세서에 제공되는 TNFR1 길항제 작제물 중에는 고친화성 수용체 결합과 일치하는 TNFR1과의 상호작용 시 높은 kon 및 낮은 koff 값을 나타내는 것들이 있다. 예를 들어, 본 명세서에 제공된 TNFR1 길항제 작제물은 TNFR1의 존재 하에 약 104 M-1s-1 이상(예를 들어, 1.0 x 104 M-1s-1, 1.5 x 104 M-1s-1, 2.0 x 104 M-1s-1, 2.5 x 104 M-1s-1, 3.0 x 104 M-1s-1, 3.5 x 104 M-1s-1, 4.0 x 104 M-1s-1, 4.5 x 104 M-1s-1, 5.0 x 104 M-1s-1 , 5.5 x 104 M-1s-1, 6.0 x 104 M-1s-1, 6.5 x 104 M-1s-1, 7.0 x 104 M-1s-1, 7.5 x 104 M-1s-1, 8.0 x 104 M-1s-1, 8.5 x 104 M-1s-1, 9.0 x 104 M-1s-1, 9.5 x 104 M-1s-1, 1.0 x 105 M-1s-1, 1.5 x 105 M-1s-1, 2.0 x 105 M-1s-1, 2.5 x 105 M-1s-1, 3.0 x 105 M-1s-1, 3.5 x 105 M-1s-1, 4.0 x 105 M-1s-1, 4.5 x 105 M-1s-1, 5.0 x 105 M-1s-1, 5.5 x 105 M-1s-1, 6.0 x 105 M-1s-1, 6.5 x 105 M-1s-1, 7.0 x 105 M-1s-1, 7.5 x 105 M-1s-1, 8.0 x 105 M-1s-1, 8.5 x 105 M-1s-1, 9.0 x 105 M-1s-1, 9.5 x 105 M-1s-1, 1.0 x 106 M-1s-1 이상)의 kon 값을 나타낼 수 있다. 예를 들어, 본 명세서에 제공되는 TNFR1 길항제는 TNFR1과 복합체화될 때 약 10-3 s-1 이하(예를 들어, 약 1.0 x 10-3 s-1, 9.5 x 10-4 s-1, 9.0 x 10-4 s-1, 8.5 x 10-4 s-1, 8.0 x 10-4 s-1, 7.5 x 10-4 s-1, 7.0 x 10-4 s-1, 6.5 x 10-4 s-1, 6.0 x 10-4 s-1, 5.5 x 10-4 s-1, 5.0 x 10-4 s-1, 4.5 x 10-4 s-1, 4.0 x 10-4 s-1, 3.5 x 10-4 s-1, 3.0 x 10-4 s-1, 2.5 x 10-4 s-1, 2.0 x 10-4 s-1, 1.5 x 10-4 s-1, 1.0 x 10-4 s-1, 9.5 x 10-5 s-1, 9.0 x 10-5 s-1, 8.5 x 10-5 s-1, 8.0 x 10-5 s-1, 7.5 x 10-5 s-1, 7.0 x 10-5 s-1, 6.5 x 10-5 s-1, 6.0 x 10-5 s-1, 5.5 x 10-5 s-1, 5.0 x 10-5 s-1, 4.5 x 10-5 s-1, 4.0 x 10-5 s-1, 3.5 x 10-5 s-1, 3.0 x 10-5 s-1, 2.5 x 10-5 s-1, 2.0 x 10-5 s-1, 1.5 x 10-5 s-1, 또는 1.0 x 10-5 s-1 이하)의 koff 값을 나타낼 수 있다.Among the TNFR1 antagonist constructs provided herein are those that exhibit high k on and low k off values upon interaction with TNFR1 consistent with high affinity receptor binding. For example, a TNFR1 antagonist construct provided herein may have a TNFR1 expression of about 10 4 M -1 s -1 or higher (eg, 1.0 x 10 4 M -1 s -1 , 1.5 x 10 4 M -1 s -1 , 1.5 x 10 4 M -1 s -1 in the presence of TNFR1). s -1 , 2.0 x 10 4 M -1 s -1 , 2.5 x 10 4 M -1 s -1 , 3.0 x 10 4 M -1 s -1 , 3.5 x 10 4 M -1 s -1 , 4.0 x 10 4 M -1 s -1 , 4.5 x 10 4 M -1 s -1 , 5.0 x 10 4 M -1 s -1 , 5.5 x 10 4 M -1 s -1 , 6.0 x 10 4 M -1 s -1 , 6.5 x 10 4 M -1 s -1 , 7.0 x 10 4 M -1 s -1 , 7.5 x 10 4 M -1 s -1 , 8.0 x 10 4 M -1 s -1 , 8.5 x 10 4 M -1 s -1 , 9.0 x 10 4 M -1 s -1 , 9.5 x 10 4 M -1 s -1 , 1.0 x 10 5 M -1 s -1 , 1.5 x 10 5 M -1 s -1 , 2.0 x 10 5 M -1 s -1 , 2.5 x 10 5 M -1 s -1 , 3.0 x 10 5 M - 1 s -1 , 3.5 x 10 5 M -1 s -1 , 4.0 x 10 5 M -1 s -1 , 4.5 x 10 5 M -1 s -1 , 5.0 x 10 5 M -1 s -1 , 5.5 x 10 5 M -1 s -1 , 6.0 x 10 5 M -1 s -1 , 6.5 x 10 5 M -1 s -1 , 7.0 x 10 5 M -1 s -1 , 7.5 x 10 5 M -1 s -1 , 8.0 x 10 5 M -1 s -1 , 8.5 x 10 5 M -1 s -1 , 9.0 x 10 5 M -1 s -1 , 9.5 x 10 5 M -1 s -1 , 1.0 x 10 6 M -1 s -1 or more) may indicate a k on value. For example, a TNFR1 antagonist provided herein, when complexed with TNFR1, has about 10 −3 s −1 or less (eg, about 1.0 x 10 −3 s −1 , 9.5 x 10 −4 s −1 , 9.0 x 10 -4 s -1 , 8.5 x 10 -4 s -1 , 8.0 x 10 -4 s -1 , 7.5 x 10 -4 s -1 , 7.0 x 10 -4 s -1 , 6.5 x 10 -4 s -1 , 6.0 x 10 -4 s -1 , 5.5 x 10 -4 s -1 , 5.0 x 10 -4 s -1 , 4.5 x 10 -4 s -1 , 4.0 x 10 -4 s -1 , 3.5 x 10 -4 s -1 , 3.0 x 10 -4 s -1 , 2.5 x 10 -4 s -1 , 2.0 x 10 -4 s -1 , 1.5 x 10 -4 s -1 , 1.0 x 10 -4 s -1 , 9.5 x 10 -5 s -1 , 9.0 x 10 -5 s -1 , 8.5 x 10 -5 s -1 , 8.0 x 10 -5 s -1 , 7.5 x 10 -5 s -1 , 7.0 x 10 -5 s -1 , 6.5 x 10 -5 s -1 , 6.0 x 10 -5 s -1 , 5.5 x 10 -5 s -1 , 5.0 x 10 -5 s -1 , 4.5 x 10 -5 s - 1 , 4.0 x 10 -5 s -1 , 3.5 x 10 -5 s -1 , 3.0 x 10 -5 s -1 , 2.5 x 10 -5 s -1 , 2.0 x 10 -5 s -1 , 1.5 x 10 -5 s -1 , or 1.0 x 10 -5 s -1 or less) may indicate a k off value.
본 명세서에 기재된 임의의 TNFR1 길항제 작제물과 같은 TNFR1 길항제(식 1 및 또한 식 2의 작제물의 TNFR1 억제제 부분)의 C-말단은 직접적으로, 또는 보다 일반적으로는 링커 또는 링커의 요소의 조합을 통해 활성 변형제에 연결되거나, 아래 및 본 명세서의 다른 곳에서 논의되는 바와 같이, 하나 이상의 링커를 통해 TNFR2 효능제의 N-말단과 (또는 소분자 TNFR2 효능제에) 융합될 수 있다. 대안적으로, TNFR1 억제제 모이어티의 N-말단은 TNFR2 효능제의 C-말단에 융합될 수 있거나, TNFR1 억제제 모이어티(또는 소분자 TNFR2 효능제에)의 C-말단은 직접 또는 링커를 통해 활성 변형제 또는 링커에 융합될 수 있다.The C-terminus of a TNFR1 antagonist (the TNFR1 inhibitor portion of a construct of
아래에서 더 상세히 논의되는 링커(L)는 안정성 및 가요성 증가 및 입체 장애 감소를 포함하는 약리학적 특성을 개선하고 선택적으로 작제물에 추가 특성을 부여하는 임의의 것이다. 링커는 하나 초과의 성분를 포함할 수 있으며, 여기서 각 성분은 특정 특성을 부여하고, 예를 들어, TNFR1 길항제는 Ig Fc 영역, 및/또는 항체 힌지 영역, 및/또는 짧은 펩티드 링커, 예컨대 글리신-세린 링커 중 임의의 하나 이상을 포함할 수 있다. Fc 영역은 예를 들어 ADCC 활성을 제거 또는 감소시키기 위해 및/또는 수용체 결합을 변경하기 위해 및/또는 다른 이러한 활성 및 특성을 위해 변형된다. 아래에서 논의되는 바와 같이 링커에는 화학 링커도 포함된다. 예를 들어, 일부 구현예에서, 링커는 폴리(에틸렌 글리콜)(PEG) 분자, 또는 분지형 PEG 분자, 예컨대 분자량이 약 30 kDa 이상인 것이다. Linker (L), discussed in more detail below, is any that improves pharmacological properties, including increased stability and flexibility and reduced steric hindrance, and optionally imparts additional properties to the construct. A linker may comprise more than one component, where each component confers a particular characteristic, e.g., a TNFR1 antagonist may comprise an Ig Fc region, and/or an antibody hinge region, and/or a short peptide linker such as glycine-serine. Any one or more of the linkers may be included. The Fc region is modified, for example, to eliminate or reduce ADCC activity and/or to alter receptor binding and/or for other such activities and properties. As discussed below, linkers also include chemical linkers. For example, in some embodiments, the linker is a poly(ethylene glycol) (PEG) molecule, or a branched PEG molecule, such as having a molecular weight of about 30 kDa or greater.
b. TNFR2 효능제 작제물 및 TNFR2 길항제 작제물b. TNFR2 Agonist Constructs and TNFR2 Antagonist Constructs
TNFR2 효능제(조절 T 세포 생성기) 작제물은 특히 질환, 장애 및 병태 중에서 염증성 및 자가면역 질환, 및 또한 고형 종양을 치료하는 데 사용될 수 있다. 조절 T 세포(Treg)는 자가면역을 억제하고 종양 미세환경과 같은 면역억제 효과가 있다. Treg의 증식은 TNFR2에 의해 긍정적으로 조절되며, TNFR2의 부재는 감소된 Treg 수 및 악화된 실험적 관절염과 상관관계가 있다. 따라서 TNFR2 효능제 작제물은 많은 자가면역 질환, 다른 만성 염증, 및 다른 급성 염증성 병태 (예를 들어, SARS, COVID-19)의 치료에 사용될 수 있다.TNFR2 agonist (regulatory T cell generator) constructs can be used to treat inflammatory and autoimmune diseases, and also solid tumors, among others diseases, disorders and conditions. Regulatory T cells (Treg) suppress autoimmunity and have immunosuppressive effects such as the tumor microenvironment. Treg proliferation is positively regulated by TNFR2, and the absence of TNFR2 correlates with reduced Treg numbers and exacerbated experimental arthritis. Thus, TNFR2 agonist constructs can be used in the treatment of many autoimmune diseases, other chronic inflammatory, and other acute inflammatory conditions (eg, SARS, COVID-19).
TNFR2 길항제 작제물은 조절 T 세포를 억제하고 암 및 다른 과증식성 질환의 치료에 사용된다 (TNFR2는 '체크포인트 수용체'임). 조절 T 세포는 종양 미세환경에 축적되며 항종양 면역 반응을 억제하는 역할을 한다. TNFR2 길항제 작제물은 암 및 및 다른 과증식성 질환, 예컨대 듀피트렌 구축, 및 특발성 폐 섬유증의 치료를 위한 것이다. TNFR2 antagonist constructs inhibit regulatory T cells and are used in the treatment of cancer and other hyperproliferative diseases (TNFR2 is a 'checkpoint receptor'). Regulatory T cells accumulate in the tumor microenvironment and play a role in suppressing antitumor immune responses. TNFR2 antagonist constructs are for the treatment of cancer and other hyperproliferative diseases such as Dupuytren's contracture, and idiopathic pulmonary fibrosis.
상기 논의된 바와 같이, TNFR2 효능제를 함유하는 TNFR2 효능제 작제물도 제공된다. 이들은 직접적으로 또는 링커를 통해 활성 변형제에 연결된 TNFR2 효능제를 포함하고, 또한 적절한 구조 및 특성을 갖는 링커와 함께 다양한 배열로 TNRF1 길항제 및 TNFR2 효능제를 함유하는 이중특이적 작제물과 같은 다중특이적 작제물을 포함한다. 일부 구현예에서, TNFR2 효능제는 이중특이적 작제물에 있다. TNFR2 효능제는 특히 이중특이성과 같은 다중특이적 분자/작제물에서 TNFR1을 활성화하지 않거나 실질적으로 활성화하지 않고/거나 다중특이성, 예컨대 이중특이적 분자의 TNFR1 길항제 부분을 통한 TNFR1 신호전달의 억제를 방해하지 않고 TNFR2를 활성화 또는 효능화한다.As discussed above, TNFR2 agonist constructs containing TNFR2 agonists are also provided. They include a TNFR2 agonist linked to an active modifier, either directly or via a linker, and also contain multispecific constructs, such as bispecific constructs containing a TNFR1 antagonist and a TNFR2 agonist in various configurations with a linker having the appropriate structure and properties. including enemy constructs. In some embodiments, the TNFR2 agonist is in a bispecific construct. A TNFR2 agonist does not or does not activate TNFR1, particularly in a multispecific molecule/construct, such as a bispecific, and/or interferes with inhibition of TNFR1 signaling through a multispecific, eg, TNFR1 antagonist portion of a bispecific molecule. activating or agonizing TNFR2 without
TNFR2 효능제는 효능제 항체 및 그의 항원 결합 부분 및 항체의 단쇄 및 다른 배열 유도체를 포함하는 당업자에게 공지된 임의의 것일 수 있고, 또한 소분자 효능제일 수 있다. TNFR2 효능제는 또한 인실리코 디자인 및/또는 후보 준비 및 라이브러리 스크리닝을 통해 생성될 수 있다. 예를 들어 파아지 라이브러리 또는 항체 라이브러리 또는 압타머 라이브러리를 스크리닝하여 TNFR2 효능제를 확인할 수 있다. TNFR2 효능제 항체 또는 그의 항원 결합 단편은 TNFR2 내의 에피토프에 결합하고 수용체 활성화를 선택적으로 촉진하는 기능성 분자에 대한 항체 및 그의 항원 결합 단편의 라이브러리를 스크리닝함으로써 생성될 수 있다. 그러한 방법 및 분자의 예시는 국제 출원 공개 번호 WO 2017/040312에 기재된 것들이다. The TNFR2 agonist can be anything known to those of skill in the art, including agonist antibodies and antigen binding portions thereof and single chain and other arrangement derivatives of antibodies, and can also be small molecule agonists. TNFR2 agonists can also be generated through in silico design and/or candidate preparation and library screening. For example, TNFR2 agonists can be identified by screening phage libraries or antibody libraries or aptamer libraries. TNFR2 agonist antibodies or antigen-binding fragments thereof can be generated by screening libraries of antibodies and antigen-binding fragments thereof for functional molecules that bind to epitopes within TNFR2 and selectively promote receptor activation. Examples of such methods and molecules are those described in International Application Publication No. WO 2017/040312.
TNFR2 선택적 효능제의 개발은 효능제 수용체 결합을 촉진하는 TNFR2 내의 에피토프의 설명을 포함할 수 있다. TNFR2의 다양한 영역에서 유래된 선형 펩티드, 구속된 고리형 및 이환형 펩티드를 사용한 에피토프 맵핑 분석은 효능적 TNFR2 항체가 형태 의존적 방식으로 TNFR2 폴리펩티드의 별개 영역으로부터의 에피토프에 결합함을 나타낸다. 예를 들어, TNFR2의 확인된 하나의 에피토프는 서열번호: 4의 잔기 56-60(KCSPG)을 포함한다. 효능적 TNFR2 항체 MR2-1은 이 에피토프에 결합하고; 이는 서열번호: 4의 잔기 142-146(KCRPG)을 함유하는 에피토프에 결합하지 않는다. 인간 TNFR2는 에피토프(예를 들어 서열번호: 4의 잔기 56-60 포함)에 결합하도록 선택될 수 있다. 일반적으로, 인간 TNFR2 효능제는 서열번호: 4의 잔기 96-154 (CGSRCSSDQVETQACTREQNRICTCRPGWYCALSKQEGCRLCAPLRKCRPGFGVARPGT; 서열번호: 841) 내에 적어도 5개의 불연속적 또는 연속적 잔기를 함유하는 인간 TNFR2 내의 에피토프에 결합하도록 선택되거나 설계될 수 있고/거나 MR2-1이 추가로 결합하는 서열번호: 4의 잔기 111-150 (TREQNRICTCRPGWYCALSKQEGCRLCAPLRKCRPGFGVA; 서열번호: 842) 내에 에피토프에 결합할 수 있다. 인간 TNFR2 효능제는 또한 서열번호: 4의 잔기 115-142 (NRICTCRPGWYCALSKQEGCRLCAPLRK; 서열번호: 843), 및/또는 서열번호: 4의 잔기 122-136 (PGWYCALSKQEGCRL; 서열번호: 844), 및/또는 서열번호: 4의 잔기 96-122 (CGSRCSSDQVETQACTR; 서열번호: 845) 내의 에피토프, 및/또는 서열번호: 4의 잔기 101-107 (SSDQVET; 서열번호: 846; 이에 MR2-1가 추가로 결합함) 내의 에피토프, 및/또는 서열번호: 4의 아미노산 48-67 (QTAQMCCSKCSPGQHAKVFC; 서열번호: 847) 내의 에피토프, 및/또는 서열번호: 4의 잔기 130-149 (KQEGCRLCAPLRKCRPGFGV; 서열번호: 848), 및/또는 서열번호: 4의 잔기 110-147 (CTREQNRICTCRPGWYCALSKQEGCRLCAPLRKCRPGF; 서열번호: 849)를 함유하는 에피토프, 및/또는 서열번호: 4의 위치 106-155 (ETQACTREQNRICTCRPGWYCALSKQEGCRLCAPLRKCRPGFGVARPGTE; 서열번호: 850), 및/또는 서열번호: 4의 잔기 137-144 (CAPLRKCR; 서열번호: 851), 및/또는 서열번호: 4의 잔기 141-149 (RKCRPGFGV; 서열번호: 852)로부터 적어도 5개의 연속 또는 불연속 잔기를 함유하는 에피토프에 결합할 수 있다.Development of TNFR2 selective agonists may involve elucidation of epitopes within TNFR2 that promote agonist receptor binding. Epitope mapping analyzes using linear, constrained cyclic and bicyclic peptides from various regions of TNFR2 indicate that potent TNFR2 antibodies bind epitopes from distinct regions of the TNFR2 polypeptide in a conformation dependent manner. For example, one identified epitope of TNFR2 includes residues 56-60 of SEQ ID NO:4 (KCSPG). The potent TNFR2 antibody MR2-1 binds to this epitope; It does not bind to the epitope containing residues 142-146 of SEQ ID NO:4 (KCRPG). Human TNFR2 can be selected to bind to an epitope (eg comprising residues 56-60 of SEQ ID NO:4). In general, human TNFR2 agonists can be selected or designed to bind to an epitope in human TNFR2 containing at least 5 discontinuous or contiguous residues within residues 96-154 of SEQ ID NO: 4 (CGSRCSSDQVETQACTREQNRICTCRPGWYCALSKQEGCRLCAPLRKCRPGFGVARPGT; SEQ ID NO: 841); / or may bind to an epitope within residues 111-150 of SEQ ID NO: 4 (TREQNRICTCRPGWYCALSKQEGCRLCAPLRKCRPGFGVA; SEQ ID NO: 842) to which MR2-1 further binds. The human TNFR2 agonist may also comprise residues 115-142 of SEQ ID NO: 4 (NRICTCRPGWYCALSKQEGCRLCAPLRK; SEQ ID NO: 843), and/or residues 122-136 of SEQ ID NO: 4 (PGWYCALSKQEGCRL; SEQ ID NO: 844), and/or SEQ ID NO: : an epitope within residues 96-122 of SEQ ID NO: 4 (CGSRCSSDQVETQACTR; SEQ ID NO: 845), and/or an epitope within residues 101-107 of SEQ ID NO: 4 (SSDQVET; SEQ ID NO: 846; to which MR2-1 further binds) , and/or an epitope within amino acids 48-67 of SEQ ID NO: 4 (QTAQMCCSKCSPGQHAKVFC; SEQ ID NO: 847), and/or residues 130-149 of SEQ ID NO: 4 (KQEGCRLCAPLRKCRPGFGV; SEQ ID NO: 848), and/or SEQ ID NO: : an epitope containing residues 110-147 of 4 (CTREQNRICTCRPGWYCALSKQEGCRLCAPLRKCRPGF; SEQ ID NO: 849), and/or positions 106-155 of SEQ ID NO: 4 (ETQACTREQNRICTCRPGWYCALSKQEGCRLCAPLRKCRPGFGVARPGTE; SEQ ID NO: 850), and/or SEQ ID NO: 4 residues 137-144 (CAPLRKCR; SEQ ID NO: 851), and/or residues 141-149 of SEQ ID NO: 4 (RKCRPGFGV; SEQ ID NO: 852).
또 다른 측면에서, TNFR2 효능제 항체 및 그의 항원 결합 단편은 서열번호: 853-1211 중 어느 하나의 아미노산 잔기 내에 있거나 아미노산 잔기를 함유하는 에피토프에 특이적으로 결합하며, 이로써 항체 또는 항원 결합 단편은 인간 TNFR2에 특이적으로 결합하지만, 다른 TNFR 수퍼패밀리 구성원, 특히 TNFR1에 특이적으로 결합하지 않는다. 인간 TNFR2 효능제 항체 또는 그의 항원 결합 단편은 결합하지 않거나, TNFR1을 포함하는 TNFR 슈퍼패밀리의 다른 구성원에 대한 결합을 손상/감소시켰다 (예를 들어, 국제 출원 공개 번호 WO 2017/040312 참조). In another aspect, the TNFR2 agonist antibody and antigen-binding fragment thereof specifically binds an epitope within or containing an amino acid residue of any one of SEQ ID NOs: 853-1211, such that the antibody or antigen-binding fragment is human It binds specifically to TNFR2, but not to other TNFR superfamily members, particularly TNFR1. Human TNFR2 agonist antibodies or antigen-binding fragments thereof do not bind or have impaired/reduced binding to other members of the TNFR superfamily, including TNFR1 (see, eg, International Application Publication No. WO 2017/040312).
TNFR2 효능제를 스크리닝하는데 사용될 수 있는 TNFR2 내의 에피토프는 그의 서열이 서열번호: 853-1211 중 어느 하나에 제시된 펩티드를 포함한다. 이러한 펩티드는 TNFR2의 구조적으로 고정된 프레임워크와 TNFR2 내에서 펩티드 단편의 구조적 제약을 모방하여 펩티드 단편을 별개의 3차원 형태로 제한하기 위해 (예를 들어, 시스테인 잔기를 N- 및 C-말단 위치 또는 펩티드 사슬 내의 다양한 내부 위치에 통합함으로써) 사이클릭 및 폴리사이클릭 형식으로 전환될 수 있다. 그 다음 사이클릭 및 폴리사이클릭 펩티드 단편을 고체 표면에 고정하고 ELISA를 사용하여 예를 들어 TNFR2 효능적 항체 MR2-1과 결합하는 분자에 대해 스크리닝할 수 있다. 이 검정을 사용하여, 수용체 활성화를 촉진하는 TNFR2의 에피토프 내에 잔기를 함유하는 펩티드는 이러한 아미노산을 구조적으로 사전 구성하여 천연 단백질에서 해당 펩티드의 형태와 유사하도록 할 수 있다. 이렇게 얻어진 사이클릭 및 폴리사이클릭 펩티드(예를 들어, 서열번호: 853-1194 중 어느 하나의 서열을 갖는 펩티드, 특히 서열번호: 905, 921, 927, 970 및 1085와 같이 KCSPG 모티프를 함유하는 것)는 본 명세서에서 사용하기 위한 TNFR2 효능제를 확인하기 위해 항체 및 그의 항원 결합 단편의 라이브러리를 스크리닝하는 데 사용될 수 있다. 구속된 펩티드는 수용체 활성화를 촉진하는 TNFR2 내의 에피토프에 대한 대용물로서 작용하고, 따라서 이 스크리닝 기술을 사용하여 생성된 항체 또는 항원 결합 단편은 TNFR2의 상응하는 에피토프에 결합하고 수용체 활성의 효능제이다 (예를 들어, 국제 출원 공개 번호 WO 2017/040312 참조). TNFR2 효능제를 생성하기 위해, 파아지 디스플레이가 사용된다. 파아지 디스플레이 라이브러리는 특이적 결합이 일어나는 조건 하에서 접촉된다. TNFR2 유래 펩티드(들)(예를 들어, 서열번호: 853-1194 중 임의의 펩티드)는 고체 지지체 상에 또는 파아지 내에 고정된다. TNFR2 결합 모이어티를 함유하는 파아지는 고체 지지체 상의 표적과 복합체를 형성하고 비결합 파아지는 세척된다. 그 다음 결합된 파아지는 완충액을 극한 pH(pH 2 또는 10)로 변경하거나, 완충액의 이온 강도를 변경하거나, 변성제를 추가하거나, 다른 알려진 방법을 사용하여 표적에서 분리된다. 결합 파아지를 단리하기 위해, 단백질 용출을 수행할 수 있다 (예를 들어, 국제 출원 공개 번호 WO 2017/040312 참조). Epitopes within TNFR2 that can be used to screen for TNFR2 agonists include peptides whose sequences are set forth in any one of SEQ ID NOs: 853-1211. These peptides mimic the structurally fixed framework of TNFR2 and the structural constraints of the peptide fragments within TNFR2 to constrain the peptide fragments into distinct three-dimensional conformations (e.g., cysteine residues in N- and C-terminal positions). or by incorporating at various internal positions in the peptide chain) into cyclic and polycyclic forms. Cyclic and polycyclic peptide fragments can then be immobilized on a solid surface and screened for molecules that bind to, for example, the TNFR2 agonistic antibody MR2-1 using ELISA. Using this assay, peptides containing residues within an epitope of TNFR2 that promote receptor activation can be structurally preconfigured with these amino acids to mimic the conformation of that peptide in native proteins. Cyclic and polycyclic peptides thus obtained (e.g. peptides having the sequence of any one of SEQ ID NOs: 853-1194, in particular those containing a KCSPG motif such as SEQ ID NOs: 905, 921, 927, 970 and 1085) ) can be used to screen libraries of antibodies and antigen-binding fragments thereof to identify TNFR2 agonists for use herein. The constrained peptide acts as a surrogate for an epitope within TNFR2 that promotes receptor activation, and thus antibodies or antigen-binding fragments generated using this screening technique bind to the corresponding epitope of TNFR2 and are agonists of receptor activity ( See, eg, International Application Publication No. WO 2017/040312). To generate TNFR2 agonists, phage display is used. Phage display libraries are contacted under conditions that allow specific binding to occur. The TNFR2 derived peptide(s) (eg, any of SEQ ID NOs: 853-1194) are immobilized on a solid support or within the phage. Phage containing the TNFR2 binding moiety are complexed with the target on a solid support and unbound phage are washed away. The bound phage are then separated from the target by changing the buffer to an extreme pH (pH 2 or 10), changing the ionic strength of the buffer, adding a denaturant, or using other known methods. To isolate bound phage, protein elution can be performed (see, eg, International Application Publication No. WO 2017/040312).
MR2-1은 TNFR2에 결합하고 TNFR2 매개 Treg 세포 증식을 강화시키는 예시적인 효능적 TNFR2 항체이다. MR2-1은 오스테오프로테게린에 결합하지만, 이 항체의 중쇄 및/또는 경쇄 가변 영역, 또는 특히 MR2-1의 중쇄 및/또는 경쇄 CDR은 변형되어 생성된 항체 또는 단편의 능력을 제거하여 TNFR2 이외의 TNFR 슈퍼패밀리 구성원에 결합하여 효능적 TNFR2 항체 또는 그의 항원 결합 단편을 생성한다. 이것은 예를 들어 국제 출원 공개 번호 WO 2017/040312에 기재된 바와 같은 유전 공학 및/또는 항체 라이브러리 스크리닝 기술을 사용하여 달성될 수 있다. MR2-1 is an exemplary potent TNFR2 antibody that binds to TNFR2 and enhances TNFR2-mediated Treg cell proliferation. Although MR2-1 binds osteoprotegerin, the heavy and/or light chain variable regions of this antibody, or particularly the heavy and/or light chain CDRs of MR2-1, are modified to eliminate the ability of the resulting antibody or fragment to bind to other than TNFR2. to a member of the TNFR superfamily of to generate an agonistic TNFR2 antibody or antigen-binding fragment thereof. This can be achieved using genetic engineering and/or antibody library screening techniques as described, for example, in International Application Publication No. WO 2017/040312.
본 명세서에 제공되는 바와 같이, TNFR2 효능제는 효능적 인간 항-TNFR2 항체의 항원 결합 단편, 예컨대 MR2-1 및 MAB2261, 예컨대 Hycult Biotech로부터 시판되는 MR2-1; 및 R&D Systems의 MAB2261을 함유한다. 예를 들어, MR2-1 또는 MAB2261의 VH 및 VL 도메인, 또는 그 안에 함유된 하나 이상의 CDR을 사용하여 TNFR2 효능제를 생성한다. 이러한 효능제는 TNFR2에 특이적인 인간 도메인 항체(dAb)를 함유할 수 있으며; dAb는 MR2-1 또는 MAB2261의 가변 영역 중쇄(VH) 또는 경쇄(VL) 도메인, 또는 VH 또는 VL 또는 MR2-1 또는 MAB2261에 대한 서열 동일성이 적어도 또는 적어도 약 85%, 90%, 95% 이상인 VH 또는 VL을 함유하고, 단,As provided herein, TNFR2 agonists include antigen-binding fragments of potent human anti-TNFR2 antibodies, such as MR2-1 and MAB2261, such as MR2-1 commercially available from Hycult Biotech; and MAB2261 from R&D Systems. For example, the V H and V L domains of MR2-1 or MAB2261, or one or more CDRs contained therein, are used to create TNFR2 agonists. Such agonists may contain human domain antibodies (dAbs) specific for TNFR2; The dAb has at least or at least about 85%, 90% sequence identity to the variable region heavy (V H ) or light chain (V L ) domain of MR2-1 or MAB2261, or to V H or V L or MR2-1 or MAB2261; contains at least 95% of V H or V L , with the proviso that
생성된 TNFR2가 TNFR2 효능제 활성을 유지한다. TNFR2 효능제는 또한 MR2-1 또는 MAB2261 항체로부터 유래된 다른 항원 결합 단편, 또는 그에 대해 적어도 또는 적어도 약 85%, 90%, 95%, 또는 그 초과의 서열 동일성을 갖는 아미노산 서열, 예를 들어, Fab 단편, Fab' 단편, F(ab')2 단편, Fv 단편, 디설파이드-연결된 Fv (dsFv), Fd 단편, Fd' 단편, 단쇄 Fv (scFv), 단쇄 Fab (scFab), hsFv (나선-안정화된 Fv), 미니바디, 디아바디, 항-개체특이형 (항-Id) 항체, 유리 경쇄, 또는 상기 중 임의의 것의 항원 결합 단편을 함유할 수 있다. 항체 단편은 상기 단편 중 임의의 것, 예를 들어, 탠덤 scFv, Fab-scFv (HC C-말단, 또는 LC C-말단), Fab-(scFv)2 (C-말단), scFv-Fab-scFv, Fab-CH2-scFv, scFv 융합 (C 말단, 또는 N 말단), Fab-융합 (HC C-말단, 또는 LC C-말단), scFv-scFv-dAb, scFv-dAb-scFv, dAb-scFv-scFv, 및 트리바디의 조합을 포함한다. TNFR2 효능제는 그와 약 또는 적어도 약 85%, 90%, 95% 또는 그 초과의 서열 동일성 및 TNFR2 효능제 활성을 갖는 본 명세서에 제공되거나 당업계에 공지된 임의의 dAb를 포함한다.The resulting TNFR2 retains TNFR2 agonist activity. A TNFR2 agonist may also be MR2-1 or another antigen-binding fragment derived from the MAB2261 antibody, or an amino acid sequence having at least or at least about 85%, 90%, 95%, or greater sequence identity thereto, e.g., Fab fragment, Fab' fragment, F(ab')2 fragment, Fv fragment, disulfide-linked Fv (dsFv), Fd fragment, Fd' fragment, single-chain Fv (scFv), single-chain Fab (scFab), hsFv (helix-stabilized Fv), minibodies, diabodies, anti-individual (anti-Id) antibodies, free light chains, or antigen-binding fragments of any of the foregoing. Antibody fragments can be any of the above fragments, e.g., tandem scFv, Fab-scFv (HC C-terminus, or LC C-terminus), Fab-(scFv) 2 (C-terminus), scFv-Fab-scFv , Fab- CH 2 -scFv, scFv fusion (C-terminus, or N-terminus), Fab-fusion (HC C-terminus, or LC C-terminus), scFv-scFv-dAb, scFv-dAb-scFv, dAb- scFv-scFv, and combinations of tribodies. A TNFR2 agonist includes any dAb provided herein or known in the art that has about or at least about 85%, 90%, 95% or more sequence identity thereto and TNFR2 agonist activity.
일부 구현예에서, TNFR2 효능제는 당업계에 공지된 임의의 것을 포함하는 TNFR2 효능적 단클론성 항체의 scFv, 또는 이러한 scFv에 대해 약 또는 적어도 약 85%, 90%, 95% 또는 95% 초과의 서열 동일성을 갖는 scFv일 수 있고, 단 생성된 작제물은 TNFR2 효능제 활성을 유지한다. 일부 구현예에서, TNFR2 효능제는 TNFR2 효능적 단클론성 항체의 Fab 단편 또는 그의 Fab 또는 약 또는 적어도 약 85%, 90%, 95% 이상의 서열 동일성 및 TNFR2 효능적 활성을 갖는 Fab일 수 있다. In some embodiments, the TNFR2 agonist is a scFv of a TNFR2 agonistic monoclonal antibody, including any known in the art, or about or at least about 85%, 90%, 95%, or greater than 95% of such a scFv. scFvs with sequence identity, provided that the resulting construct retains TNFR2 agonist activity. In some embodiments, a TNFR2 agonist can be a Fab fragment of a TNFR2 agonistic monoclonal antibody or a Fab thereof or a Fab having at least about 85%, 90%, 95% or greater sequence identity and TNFR2 agonistic activity.
TNFR2 효능제는 또한 TNFR2에 결합하고 효능제 활성을 갖도록 변형된 TNF 뮤테인일 수 있거나 이를 포함할 수 있다 (예를 들어, 서열번호: 765-800 참조). 이러한 구현예의 예시는 서열번호: 2와 관련하여 예를 들어 TNFR2 선택적 돌연변이 K65W, D143Y, D143F, D143N, D143E, D143W, D143V, A145R, A145H, A145K, A145F, A145W, E146Q, E146H, E146K, E146N, D143N/A145R, A145R/S147T, Q88N/T89S/A145S/E146A/S147D, Q88N/A145I/E146G/S147D, A145H/E146S/S147D, A145H/S147D, L29V/A145D/E146D/S147D, A145N/E146D/S147D, A145T/E146S/S147D, A145Q/E146D/S147D, A145T/E146D/S147D, A145D/E146G/S147D, A145D/S147D, A145K/E146D/S147T, A145R/E146T/S147D, A145R/S147T, E146D/S147D, D143V/F144L/A145S, 및 D143V/A145S, 및 이들의 조합, 예컨대 D143V/A145S와 S95C/G148C와의 조합 중 하나 이상을 갖는 TNF 변이체와 같은 TNFR2 선택적 TNF 뮤테인을 함유하는 TNFR2 효능제다.A TNFR2 agonist can also be or include a TNF mutein that has been modified to bind TNFR2 and have agonist activity (see, eg, SEQ ID NOs: 765-800). Examples of such embodiments are for example the TNFR2 selective mutations K65W, D143Y, D143F, D143N, D143E, D143W, D143V, A145R, A145H, A145K, A145F, A145W, E146Q, E146H, E146K, E146N, with respect to SEQ ID NO: 2; D143N/A145R, A145R/S147T, Q88N/T89S/A145S/E146A/S147D, Q88N/A145I/E146G/S147D, A145H/E146S/S147D, A145H/S147D, L29V/A145D/E146D/ S147D, A145N/E146D/S147D, A145T/E146S/S147D, A145Q/E146D/S147D, A145T/E146D/S147D, A145D/E146G/S147D, A145D/S147D, A145K/E146D/S147T, A145R/E146T/S147D, A1 45R/S147T, E146D/S147D, D143V/ A TNFR2 agonist containing a TNFR2 selective TNF mutein such as a TNF variant having one or more of F144L/A145S, and D143V/A145S, and combinations thereof, such as a combination of D143V/A145S and S95C/G148C.
예를 들어, 돌연변이 D143N/A145R(서열번호: 781)을 갖는 TNF 변이체는 TNFR2에 결합하고 TNFR2를 효능시키며, 본 명세서에 제공된 작제물에서 사용될 수 있다. 돌연변이 S95C/G148C를 갖는 TNF 뮤테인, 및 서열번호: 2와 관련하여 열거되거나 공지되거나 확인된 임의의 다른 것들과의 조합은 또한 본 명세서에 제공된 작제물에 포함될 수 있는 TNFR2 선택적 효능제이다. For example, a TNF variant with mutations D143N/A145R (SEQ ID NO: 781) binds to and agonizes TNFR2 and can be used in the constructs provided herein. The combination of the TNF mutein with the mutation S95C/G148C and any others listed, known or identified with respect to SEQ ID NO: 2 is also a TNFR2 selective agonist that can be included in the constructs provided herein.
TNFR2 효능제는 단쇄 TNFR2 선택적 TNF 뮤테인 삼량체와 다량체화 도메인의 융합을 함유할 수 있다. 본 명세서에 기재된 바와 같이, TNFR2에 대한 1차 리간드는 막 결합 TNF(memTNF; 또한 본 명세서에서 막관통 TNF 또는 tmTNF로 지칭됨)이다. 이량체화 또는 삼량체화 도메인과 같은 다량체화 도메인의 추가는 TNF 서브유닛에 대해 각각 6량체 또는 9량체 분자를 생성하고; TNF의 이러한 6량체 및 9량체는 막 결합 TNF 삼량체를 모방하므로 TNFR2 신호전달을 활성화한다. 이량체화 도메인은 예를 들어 상기 논의된 EHD2(서열번호: 808)를 포함한다. EHD2는 IgE의 중쇄 CH2 도메인 및 IgM의 중쇄 CH2 도메인으로부터 유래된 MHD2(서열번호: 811)로부터 유래된다. 이량체화 도메인은 또한 Fc 도메인, 예컨대 IgG1(서열번호: 10 참조) 및 IgG4(서열번호: 16 참조)로부터 유래된 Fc 도메인을 포함하며, 선택적으로 면역 이펙터 기능을 변경하고/하거나 FcRn 재순환을 강화시키는 것과 같은 변형을 포함한다. 삼량체화 도메인은 예를 들어, 닭 테나스신 C(TNC)의 삼량체화 도메인 (서열번호: 805) 및 인간 TNC의 삼량체화 도메인 (서열번호: 807)을 포함한다. 이량체화 및 삼량체화는 TNFR2 신호전달을 강화시키고 작제물의 약리학적 특성을 개선한다. 예를 들어, 융합 단백질의 반감기는 분자의 분자량을 증가시킴으로써 및/또는 FcRn 재순환을 도입함으로써, 예를 들어 이량체화 도메인이 Fc일 때 증가된다.A TNFR2 agonist may contain a fusion of a single chain TNFR2 selective TNF mutein trimer with a multimerization domain. As described herein, the primary ligand for TNFR2 is membrane bound TNF (memTNF; also referred to herein as transmembrane TNF or tmTNF). Addition of a multimerization domain, such as a dimerization or trimerization domain, results in a hexameric or 9meric molecule for the TNF subunit, respectively; These hexamers and 9mers of TNF mimic membrane-bound TNF trimers and thus activate TNFR2 signaling. The dimerization domain includes, for example, EHD2 (SEQ ID NO: 808) discussed above. EHD2 is derived from MHD2 (SEQ ID NO: 811) derived from the heavy chain C H 2 domain of IgE and the heavy chain C H 2 domain of IgM. The dimerization domain also includes Fc domains derived from IgG1 (see SEQ ID NO: 10) and IgG4 (see SEQ ID NO: 16), optionally altering immune effector function and/or enhancing FcRn recycling. including variations such as The trimerization domain includes, for example, the trimerization domain of chicken tenascin C (TNC) (SEQ ID NO: 805) and the trimerization domain of human TNC (SEQ ID NO: 807). Dimerization and trimerization enhance TNFR2 signaling and improve the pharmacological properties of the construct. For example, the half-life of the fusion protein is increased by increasing the molecular weight of the molecule and/or introducing FcRn recycling, eg when the dimerization domain is Fc.
본 명세서에 제공된 바와 같이, TNFR2 효능제는 TNFR2에 대한 선택성을 부여하고/하거나 TNFR1에 대한 결합을 감소 또는 제거하는 본 명세서에 기재된 임의의 돌연변이와 함께 TNF 뮤테인(TNFmut) 삼량체 사슬을 함유할 수 있다. 이러한 돌연변이의 예는 이량체화 또는 삼량체화 도메인과 같은 다량체화 도메인(MD)과 융합된 서열번호: 2와 관련하여 대체 D143N/A145R이다. 다량체화 도메인은 TNF 뮤테인 삼량체 사슬의 N- 또는 C-말단에 융합될 수 있으며, 링커는 각각의 TNF 뮤테인 사이, 및 TNF 뮤테인 삼량체 사슬과 다량체화 도메인 사이에 포함된다. 이러한 TNFR2 효능제는 하기 식 4 및 5를 갖는다:As provided herein, a TNFR2 agonist may contain a TNF mutein (TNFmut) trimeric chain together with any of the mutations described herein that confer selectivity for TNFR2 and/or reduce or eliminate binding to TNFR1. can An example of such a mutation is the replacement D143N/A145R with respect to SEQ ID NO: 2 fused to a multimerization domain (MD) such as a dimerization or trimerization domain. The multimerization domain may be fused to the N- or C-terminus of the TNF mutein trimeric chain, and a linker is included between each TNF mutein and between the TNF mutein trimeric chain and the multimerization domain. These TNFR2 agonists have formulas 4 and 5:
MD-L1-TNFmut-L2-TNFmut-L3-TNFmut (식 4); 또는MD-L1-TNFmut-L2-TNFmut-L3-TNFmut (Equation 4); or
TNFmut-L1-TNFmut-L2-TNFmut-L3-MD (식 5);TNFmut-L1-TNFmut-L2-TNFmut-L3-MD (Equation 5);
여기서 MD는 다량체화 도메인(활성 변형제)이고; TNFmut은 돌연변이 D143N/A145R을 가진 뮤테인과 같은 TNFR2 선택적 TNF 뮤테인이고; L1, L2 및 L3은 동일하거나 상이할 수 있는 Gly-Ser 링커와 같은 하기 기술된 링커이다. where MD is the multimerization domain (active modifier); TNFmut is a TNFR2 selective TNF mutein such as the mutein with mutations D143N/A145R; L1, L2 and L3 are linkers described below, such as the Gly-Ser linker, which may be the same or different.
특정 구현예에서, 다량체화 도메인은 EHD2(서열번호: 808), MHD2(서열번호: 811), 닭 TNC의 삼량체화 도메인(서열번호: 805), 인간 TNC의 삼량체화 도메인(서열번호: 807), IgG1 Fc 또는 IgG4 Fc이다. 이량체화 도메인이 IgG1 Fc 또는 IgG4 Fc인 경우, TNFR1 길항제를 TNFR2 효능제에 연결하는 데 사용되는 동일한 Fc이며 추가 Fc는 아니다. IgG1 또는 IgG4 Fc는 ADCC, ADCP 및/또는 CDC 활성과 같은 면역 이펙터 기능을 강화 또는 제거하고/하거나 FcRn 결합을 강화시키기 위해 변형될 수 있다. Fc 영역과 같은 다량체화 도메인은 작제물의 생체 내 안정성과 혈청 반감기를 증가시킨다. 본 명세서의 목적을 위해, 식 1-5의 작제물 또는 그의 변형물에서 Fc 영역은 일반적으로 작제물의 약리학적 특성 또는 활성을 변경하거나 조절하도록 변형된다. Fc 변형은 아래에서 더 자세히 논의된다. 당업계에 공지된 임의의 다량체화 도메인도 본 명세서의 TNFR2 효능제에 사용하기 위해 고려된다. In certain embodiments, the multimerization domain is EHD2 (SEQ ID NO: 808), MHD2 (SEQ ID NO: 811), the trimerization domain of chicken TNC (SEQ ID NO: 805), the trimerization domain of human TNC (SEQ ID NO: 807) , IgG1 Fc or IgG4 Fc. If the dimerization domain is an IgG1 Fc or an IgG4 Fc, it is the same Fc used to link the TNFR1 antagonist to the TNFR2 agonist and not an additional Fc. An IgG1 or IgG4 Fc can be modified to enhance or eliminate immune effector functions such as ADCC, ADCP and/or CDC activity and/or to enhance FcRn binding. The multimerization domain, such as the Fc region, increases the in vivo stability and serum half-life of the construct. For purposes herein, the Fc region in a construct of Formulas 1-5 or variations thereof is generally modified to alter or modulate the pharmacological properties or activity of the construct. Fc modifications are discussed in more detail below. Any multimerization domain known in the art is also contemplated for use in the TNFR2 agonists herein.
TNF 뮤테인은 TNFR2-선택성을 부여하는 임의의 하나 이상의 돌연변이를 갖는 TNF 변이체일 수 있다. 돌연변이는 예를 들어 서열번호: 2와 관련하여 K65W, D143Y, D143F, D143N, D143E, D143W, D143V, A145R, A145H, A145K, A145F, A145W, E146Q, E146H, E146K, E146N, D143N/A145R, A145R/S147T, Q88N/T89S/A145S/E146A/S147D, Q88N/A145I/E146G/S147D, A145H/E146S/S147D, A145H/S147D, L29V/A145D/E146D/S147D, A145N/E146D/S147D, A145T/E146S/S147D, A145Q/E146D/S147D, A145T/E146D/S147D, A145D/E146G/S147D, A145D/S147D, A145K/E146D/S147T, A145R/E146T/S147D, A145R/S147T, E146D/S147D, D143V/F144L/A145S, 및 D143V/A145S를 포함한다. 돌연변이 D143N/A145R을 갖는 TNF 변이체가 본 명세서에서 사용되는 것으로 고려된다. 당업계에 공지된 TNFR2-선택성을 부여하는 임의의 다른 돌연변이도 본 명세서에서 사용하기 위해 고려된다. TNF 뮤테인은 가용성 TNF의 전체 서열(즉, 서열번호: 2의 잔기 1-157)을 함유할 수 있거나, 예를 들어, TNFR2에 결합하고/하거나 효능시키기에 충분한 길이의, 가용성 TNF의 부분 서열, 예를 들어 서열번호: 2의 잔기 4-157, 9-157 또는 12-157을 함유할 수 있다. A TNF mutein can be a TNF variant having any one or more mutations conferring TNFR2-selectivity. Mutations are for example K65W, D143Y, D143F, D143N, D143E, D143W, D143V, A145R, A145H, A145K, A145F, A145W, E146Q, E146H, E146K, E146N, D143N/A145R, A1 with respect to SEQ ID NO: 2 45R/ S147T, Q88N/T89S/A145S/E146A/S147D, Q88N/A145I/E146G/S147D, A145H/E146S/S147D, A145H/S147D, L29V/A145D/E146D/S147D, A145N/E146D/ S147D, A145T/E146S/S147D, A145Q/E146D/S147D, A145T/E146D/S147D, A145D/E146G/S147D, A145D/S147D, A145K/E146D/S147T, A145R/E146T/S147D, A145R/S147T, E146D/S1 47D, D143V/F144L/A145S, and D143V Include /A145S. TNF variants with the mutations D143N/A145R are contemplated for use herein. Any other mutation conferring TNFR2-selectivity known in the art is also contemplated for use herein. A TNF mutein may contain the entire sequence of soluble TNF (i.e., residues 1-157 of SEQ ID NO: 2), or a partial sequence of soluble TNF, e.g., of sufficient length to bind and/or agonize TNFR2. , for example residues 4-157, 9-157 or 12-157 of SEQ ID NO:2.
L1, L2 또는 L3 링커는 동일하거나 다를 수 있다. 특히, 링커는 GS 링커와 같은 짧은 펩티드 링커를 함유할 수 있다. 예를 들어, 링커는 (GGGGS)n (여기서 n = 1-5) (서열번호: 1471)을 함유할 수 있다. 링커는 또한 서열번호: 1에 제시된 TNF (막관통 TNF)의 전장 서열의 잔기 57-87에 상응하는 아미노산 GPQREEFPRDLSLISPLAQAVRSSSRTPSDK (서열번호: 812)의 서열을 함유하는 TNF-α의 줄기 영역의 전부 또는 일부 (적어도 10, 15, 또는 20개의 인접 잔기)를 함유할 수 있다. 예를 들어, 줄기 영역의 적어도 10, 15 또는 20개의 인접 아미노산 잔기를 포함하는 전부 또는 일부를 함유하는 링커는 N- 또는 C-말단 TNF 뮤테인과 다량체화 도메인 사이에 있을 수 있다. 3개의 링커 모두 (GGGGS)n (n은 일반적으로 1-10임) (서열번호: 1472), 또는 다른 조합 of Gly-Ser의 다른 조합일 수 있거나 (GGGGS)n과 같은 Gly-Ser 잔기 및 TNF의 줄기 영역의 적어도 10, 15 또는 20개의 인접 아미노산 잔기를 함유하는 전부 또는 일부의 혼합물을 함유할 수 있다. 예시적인 링커는 서열번호: 813-834, 1471 및 1472에 제시되어 있다. The L1, L2 or L3 linkers may be the same or different. In particular, the linker may contain a short peptide linker such as a GS linker. For example, the linker may contain (GGGGS) n (where n = 1-5) (SEQ ID NO: 1471). The linker may also include all or part of the stem region of TNF-α containing the sequence of amino acids GPQREEFPRDLSLISLISPLAQAVRSSSSRTPSDK (SEQ ID NO: 812) corresponding to residues 57-87 of the full-length sequence of TNF (transmembrane TNF) set forth in SEQ ID NO: 1 ( at least 10, 15, or 20 contiguous residues). For example, a linker containing all or part of the stem region, including at least 10, 15 or 20 contiguous amino acid residues, may be between the N- or C-terminal TNF mutein and the multimerization domain. All three linkers (GGGGS) n (n is usually 1-10) (SEQ ID NO: 1472), or other combinations of Gly-Ser (GGGGS) Gly-Ser residues such as n and TNF may contain a mixture of all or part of the stem region of at least 10, 15 or 20 contiguous amino acid residues. Exemplary linkers are set forth in SEQ ID NOs: 813-834, 1471 and 1472.
본 명세서에 제공되는 TNFR2 효능제는 약 100 nM 미만 또는 이하(예를 들어, 95 nM, 90 nM, 85 nM, 80 nM, 75 nM, 70 nM, 65 nM, 60 nM, 55 nM, 50 nM, 45 nM, 40 nM, 35 nM, 30 nM, 25 nM, 20 nM, 15 nM, 10 nM, 5 nM, 4 nM, 3 nM, 2 nM, 또는 1 nM)의 KD 값으로 TNFR2에 특이적으로 결합하는 것을 포함한다. 특정 경우에, TNFR2 효능제는 1 nM 이하(예를 들어, 990 pM, 980 pM, 970 pM, 960 pM, 950 pM, 940 pM, 930 pM, 920 pM, 910 pM, 900 pM, 890 pM, 880 pM, 870 pM, 860 pM, 850 pM, 840 pM, 830 pM, 820 pM, 810 pM, 800 pM, 790 pM, 780 pM, 770 pM, 760 pM, 750 pM, 740 pM, 730 pM, 720 pM, 710 pM, 700 pM, 690 pM, 680 pM, 670 pM, 660 pM, 650 pM, 640 pM, 630 pM, 620 pM, 610 pM, 600 pM, 590 pM, 580 pM, 570 pM, 560 pM, 550 pM, 540 pM, 530 pM, 520 pM, 510 pM, 500 pM, 490 pM, 480 pM, 470 pM, 460 pM, 450 pM, 440 pM, 430 pM, 420 pM, 410 pM, 400 pM, 390 pM, 380 pM, 370 pM, 360 pM, 350 pM, 340 pM, 330 pM, 320 pM, 310 pM, 300 pM, 290 pM, 280 pM, 270 pM, 260 pM, 250 pM, 240 pM, 230 pM, 220 pM, 210 pM, 200 pM, 190 pM, 180 pM, 170 pM, 160 pM, 150 pM, 140 pM, 130 pM, 120 pM, 110 pM, 100 pM, 90 pM, 80 pM, 70 pM, 60 pM, 50 pM, 40 pM, 30 pM, 20 pM, 10 pM, 5 pM, 또는 1 pM)의 KD 값으로 TNFR2에 특이적으로 결합한다.A TNFR2 agonist provided herein is less than or equal to about 100 nM (e.g., 95 nM, 90 nM, 85 nM, 80 nM, 75 nM, 70 nM, 65 nM, 60 nM, 55 nM, 50 nM, 45 nM, 40 nM, 35 nM, 30 nM, 25 nM, 20 nM, 15 nM, 10 nM, 5 nM, 4 nM, 3 nM, 2 nM, or 1 nM) specifically for TNFR2 . including bonding In certain instances, the TNFR2 agonist is 1 nM or less (e.g., 990 pM, 980 pM, 970 pM, 960 pM, 950 pM, 940 pM, 930 pM, 920 pM, 910 pM, 900 pM, 890 pM, 880 pM, 870 pM, 860 pM, 850 pM, 840 pM, 830 pM, 820 pM, 810 pM, 800 pM, 790 pM, 780 pM, 770 pM, 760 pM, 750 pM, 740 pM, 730 pM, 720 pM, 710 pM, 700 pM, 690 pM, 680 pM, 670 pM, 660 pM, 650 pM, 640 pM, 630 pM, 620 pM, 610 pM, 600 pM, 590 pM, 580 pM, 570 pM, 560 pM, 550 pM , 540 pM, 530 pM, 520 pM, 510 pM, 500 pM, 490 pM, 480 pM, 470 pM, 460 pM, 450 pM, 440 pM, 430 pM, 420 pM, 410 pM, 400 pM, 390 pM, 380 pM, 370 pM, 360 pM, 350 pM, 340 pM, 330 pM, 320 pM, 310 pM, 300 pM, 290 pM, 280 pM, 270 pM, 260 pM, 250 pM, 240 pM, 230 pM, 220 pM, 210 pM, 200 pM, 190 pM, 180 pM, 170 pM, 160 pM, 150 pM, 140 pM, 130 pM, 120 pM, 110 pM, 100 pM, 90 pM, 80 pM, 70 pM, 60 pM, 50 pM , 40 pM, 30 pM, 20 pM, 10 pM, 5 pM, or 1 pM) and binds specifically to TNFR2 .
TNFR2 효능제는 예를 들어, 효능제가 투여되는 피험자의 생체 내에서, 또는 시험 목적을 위해 TNFR2 효능제와 접촉하는 Treg를 함유하는 샘플에서 시험관 내에서 Treg(예를 들어, CD4+, CD25+ FOXP3+)의 증식을 유도할 수 있는 것이다. Treg의 증식은 예를 들어 TNFR2 효능제로 처리되지 않은 세포 집단을 함유하는 대상체 또는 샘플에 대해 FACS 분석에 의해 측정된 바와 같이, 예를 들어 0.00001% 내지 100.0% (예를 들어, 0.00001%, 0.00002%, 0.00003%, 0.00004%, 0.00005%, 0.00006%, 0.00007%, 0.00008%, 0.00009%, 0.0001%, 0.0002%, 0.0003%, 0.0004%, 0.0005%, 0.0006%, 0.0007%, 0.0008%, 0.0009%, 0.001%, 0.002%, 0.003%, 0.004%, 0.005%, 0.006%, 0.007%, 0.008%, 0.009%, 0.01%, 0.02%, 0.03%, 0.04%, 0.05%, 0.06%, 0.07%, 0.08%, 0.09%, 0.1%, 0.2 %, 0.3%, 0.4%, 0.5%, 0.6%, 0.7%, 0.8%, 0.9%, 1.0%, 2.0%, 3.0%, 4.0%, 5.0%, 6.0%, 7.0%, 8.0%, 9.0%, 10.0%, 20.0%, 30.0%, 40.0%, 50.0%, 60.0%, 70.0%, 80.0%, 90.0%, 또는 100%)까지 유래될 수 있다. The TNFR2 agonist can be administered to Tregs (e.g., CD4 + , CD25 + FOXP3, CD4 + , CD25 + FOXP3) in vivo, for example, in a subject to whom the agonist is administered, or in vitro in a sample containing Tregs that come into contact with the TNFR2 agonist for testing purposes. + ) can induce proliferation. Proliferation of Tregs is, for example, between 0.00001% and 100.0% (eg, 0.00001%, 0.00002%) as measured by FACS analysis on subjects or samples containing cell populations not treated with a TNFR2 agonist. , 0.00003%, 0.00004%, 0.00005%, 0.00006%, 0.00007%, 0.00008%, 0.00009%, 0.0001%, 0.0002%, 0.0003%, 0.0004%, 0.0005%, 0.00 06%, 0.0007%, 0.0008%, 0.0009%, 0.001 %, 0.002%, 0.003%, 0.004%, 0.005%, 0.006%, 0.007%, 0.008%, 0.009%, 0.01%, 0.02%, 0.03%, 0.04%, 0.05%, 0.06%, 0.07%, 0.08%, 0.09%, 0.1%, 0.2%, 0.3%, 0.4%, 0.5%, 0.6%, 0.7%, 0.8%, 0.9%, 1.0%, 2.0%, 3.0%, 4.0%, 5.0%, 6.0%, 7.0% , 8.0%, 9.0%, 10.0%, 20.0%, 30.0%, 40.0%, 50.0%, 60.0%, 70.0%, 80.0%, 90.0%, or 100%).
따라서, TNFR2 효능제는 Treg 세포 증식을 촉진하는 데 사용될 수 있고, 자가면역 또는 만성 염증성 질환 또는 장애가 있는 인간 환자와 같은 포유동물 대상체에게 투여되어 환자의 면역 반응(예를 들어, 자가 또는 위협적이지 않은 외래 항원에 대한 반응으로 생체 내에서 생성된 CD8+ 세포독성 T 림프구의 양)의 크기와 지속 시간을 약화시킨다. 예를 들어, 인간 환자에게 TNFR2 효능제를 투여하거나 TNFR2 효능제로 치료하여 생체 외에서 증식된 Treg 세포 집단은 NFR2 효능제로 치료받지 않은 대상체에 대해, 예를 들어, 약 0.00001 mg/mL 내지 10.0 mg/mL (예를 들어, 0.00001 mg/mL, 0.0001 mg/mL, 0.001 mg/mL, 0.01 mg/mL, 0.1 mg/mL, 1.0 mg/mL, 또는 10.0 mg/mL), 또는 0. 001 내지 1.0 mg/mL (예를 들어, 0.001 mg/mL, 0.005 mg/mL, 0.010 mg/mL, 0.050 mg/mL, 0.10 mg/mL, 0.20 mg/mL, 0.30 mg/mL, 0.40 mg/mL, 0.50 mg/mL, 0.60 mg/mL, 0.70 mg/mL, 0.80 mg/mL, 0.90 mg/mL, 또는 1.0 mg/mL)까지 자가 또는 비-위협 항원과 교차 반응하는 분비된 면역글로불린(예를 들어, IgG)의 양을 감소시킬 수 있다. 추가로 또는 대안적으로, TNFR2 효능제는 예를 들어 TNFR2 효능제로 처리되지 않은 대상체에 대해 FACS 분석에 의해 측정된 바와 같이, 세포독성 T 세포 수(예를 들어, CD8+ T 세포의 수준)를 예를 들어, 약 0.00001 내지 100.0% (예를 들어, 0.00001%, 0.00002 %, 0.00003%, 0.00004 %, 0.00005%, 0.00006%, 0.00007%, 0.00008%, 0.00009%, 0.0001%, 0.0002%, 0.0003%, 0.0004%, 0.0005%, 0.0006%, 0.0007%, 0.0008%, 0.0009%, 0.001%, 0.002%, 0.003%, 0.004%, 0.005%, 0.006%, 0.007%, 0.008%, 0.009%, 0.01%, 0.02%, 0.03%, 0.04%, 0.05%, 0.06%, 0.07%, 0.08%, 0.09%, 0.1%, 0.2%, 0.3%, 0.4%, 0.5%, 0.6%, 0.7%, 0.8%, 0.9%, 1.0%, 2.0%, 3.0%, 4.0%, 5.0%, 6.0%, 7.0%, 8.0%, 9.0%, 10.0%, 20.0%, 30.0%, 40.0%, 50.0%, 60.0%, 70.0%, 80.0%, 90.0%, 또는 100%)까지 감소시킬 수 있다. 예를 들어, TNFR2 효능제는 본 명세서에 기재된 것과 같은 자가면역 또는 만성 염증성 질환 또는 장애를 치료하기 위해 대상체(예를 들어, 인간과 같은 포유동물 대상체)에게 투여될 수 있다. 이러한 방식으로 대상체를 치료하면 대상체 내의 자가반응성 CD8+ T-세포의 양이 감소한다.Thus, TNFR2 agonists can be used to promote Treg cell proliferation and can be administered to a mammalian subject, such as a human patient with an autoimmune or chronic inflammatory disease or disorder, to elicit an immune response in the patient (e.g., an autoimmune or non-threatening disease or disorder). Attenuates the size and duration of CD8 + cytotoxic T lymphocytes produced in vivo in response to foreign antigens. For example, a population of Treg cells expanded ex vivo by administration of a TNFR2 agonist or treatment with a TNFR2 agonist to a human patient is, for example, about 0.00001 mg/mL to 10.0 mg/mL, relative to a subject not treated with a NFR2 agonist. (e.g., 0.00001 mg/mL, 0.0001 mg/mL, 0.001 mg/mL, 0.01 mg/mL, 0.1 mg/mL, 1.0 mg/mL, or 10.0 mg/mL), or 0.001 to 1.0 mg/mL mL (eg, 0.001 mg/mL, 0.005 mg/mL, 0.010 mg/mL, 0.050 mg/mL, 0.10 mg/mL, 0.20 mg/mL, 0.30 mg/mL, 0.40 mg/mL, 0.50 mg/mL , 0.60 mg/mL, 0.70 mg/mL, 0.80 mg/mL, 0.90 mg/mL, or 1.0 mg/mL) of secreted immunoglobulins (e.g., IgG) that cross-react with self or non-threat antigens. quantity can be reduced. Additionally or alternatively, the TNFR2 agonist increases cytotoxic T cell numbers (eg, the level of CD8+ T cells), eg, as measured by FACS analysis on subjects not treated with the TNFR2 agonist. For example, from about 0.00001 to 100.0% (e.g., 0.00001%, 0.00002%, 0.00003%, 0.00004%, 0.00005%, 0.00006%, 0.00007%, 0.00008%, 0.00009%, 0.000 1%, 0.0002%, 0.0003%, 0.0004 %, 0.0005%, 0.0006%, 0.0007%, 0.0008%, 0.0009%, 0.001%, 0.002%, 0.003%, 0.004%, 0.005%, 0.006%, 0.007%, 0.008%, 0.009%, 0. 01%, 0.02%, 0.03%, 0.04%, 0.05%, 0.06%, 0.07%, 0.08%, 0.09%, 0.1%, 0.2%, 0.3%, 0.4%, 0.5%, 0.6%, 0.7%, 0.8%, 0.9%, 1.0% , 2.0%, 3.0%, 4.0%, 5.0%, 6.0%, 7.0%, 8.0%, 9.0%, 10.0%, 20.0%, 30.0%, 40.0%, 50.0%, 60.0%, 70.0%, 80.0%, 90.0 %, or 100%). For example, a TNFR2 agonist can be administered to a subject (eg, a mammalian subject such as a human) to treat an autoimmune or chronic inflammatory disease or disorder as described herein. Treating a subject in this manner reduces the amount of autoreactive CD8 + T-cells in the subject.
본 명세서에 제공되는 TNFR2 효능제는 또 다른 TNFR 슈퍼패밀리 구성원, 특히 TNFR1에 대한 특이적 결합이 결여된 것을 확인하기 위해 평가될 수 있다. 이는 당업자에게 공지된 ELISA 기반 방법과 같은 임의의 다양한 시험관내 결합 검정을 사용하여 달성될 수 있다. 예를 들어, TNFR2 효능제는 TNFR1과 같은 다른 TNFR 슈퍼패밀리 구성원에 대한 효능제의 친화도보다 친화도 즉, 예를 들어, 적어도 또는 적어도 약 2-, 3-, 4-, 또는 5-배 이상 (예를 들어, 5-배 이상, 6-배 이상, 7-배 이상, 8-배 이상, 9-배 이상, 10-배 이상, 20-배 이상, 30-배 이상, 40-배 이상, 50-배 이상, 60-배 이상, 70-배 이상, 80-배 이상, 90-배 이상, 100-배 이상, 200-배 이상, 300-배 이상, 400-배 이상, 500-배 이상, 600-배 이상, 700-배 이상, 800-배 이상, 900-배 이상, 1,000-배 이상, 2,000-배 이상, 3,000-배 이상, 4,000-배 이상, 5,000-배 이상, 6,000-배 이상, 7,000-배 이상, 8,000-배 이상, 9,000-배 이상, 10,000-배 이상)로 인간 TNFR2 또는 TNFR2 유래 펩티드, 예컨대 인간 TNFR2 (QTAQMCCSKCSPGQHAKVFC, 서열번호: 847) 내의 서열번호: 4의 잔기 48-67을 함유하는 펩티드 단편에 특이적으로 결합하는 것을 포함한다.TNFR2 agonists provided herein can be evaluated to confirm that they lack specific binding to another TNFR superfamily member, particularly TNFR1. This can be accomplished using any of a variety of in vitro binding assays, such as ELISA-based methods known to those skilled in the art. For example, a TNFR2 agonist has an affinity greater than that of the agonist for other TNFR superfamily members, such as TNFR1, i.e., at least or at least about 2-, 3-, 4-, or 5-fold greater. (e.g., 5-fold or more, 6-fold or more, 7-fold or more, 8-fold or more, 9-fold or more, 10-fold or more, 20-fold or more, 30-fold or more, 40-fold or more, 50-times or more, 60-times or more, 70-times or more, 80-times or more, 90-times or more, 100-times or more, 200-times or more, 300-times or more, 400-times or more, 500-times or more, 600-fold, 700-fold, 800-fold, 900-fold, 1,000-fold, 2,000-fold, 3,000-fold, 4,000-fold, 5,000-fold, 6,000-fold, at least 7,000-fold, at least 8,000-fold, at least 9,000-fold, at least 10,000-fold) human TNFR2 or a TNFR2-derived peptide, such as residues 48-67 of SEQ ID NO: 4 in human TNFR2 (QTAQMCCSKCSPGQHAKVFC, SEQ ID NO: 847) It includes specifically binding to a peptide fragment containing
본 명세서에 제공되는 TNFR2 효능제는 고친화성 수용체 결합과 일치하는 TNFR2와의 상호작용 시 높은 kon 및 낮은 koff 값을 나타내는 것들을 포함한다. 예를 들어, 본 명세서에 제공된 TNFR2 효능제는 TNFR2의 존재 하에 약 104 M-1s-1 이상(예를 들어, 약 1.0 x 104 M-1s-1, 1.5 x 104 M-1s-1, 2.0 x 104 M-1s-1, 2.5 x 104 M-1s-1, 3.0 x 104 M-1s-1, 3.5 x 104 M-1s-1, 4.0 x 104 M-1s-1, 4.5 x 104 M-1s-1, 5.0 x 104 M-1s-1 , 5.5 x 104 M-1s-1, 6.0 x 104 M-1s-1, 6.5 x 104 M-1s-1, 7.0 x 104 M-1s-1, 7.5 x 104 M-1s-1, 8.0 x 104 M-1s-1, 8.5 x 104 M-1s-1, 9.0 x 104 M-1s-1, 9.5 x 104 M-1s-1, 1.0 x 105 M-1s-1, 1.5 x 105 M-1s-1, 2.0 x 105 M-1s-1, 2.5 x 105 M-1s-1, 3.0 x 105 M-1s-1, 3.5 x 105 M-1s-1, 4.0 x 105 M-1s-1, 4.5 x 105 M-1s-1, 5.0 x 105 M-1s-1, 5.5 x 105 M-1s-1, 6.0 x 105 M-1s-1, 6.5 x 105 M-1s-1, 7.0 x 105 M-1s-1, 7.5 x 105 M-1s-1, 8.0 x 105 M-1s-1, 8.5 x 105 M-1s-1, 9.0 x 105 M-1s-1, 9.5 x 105 M-1s-1, 또는 1.0 x 106 M-1s-1 초과)의 kon 값을 나타낼 수 있다. 예를 들어, 본 명세서에 제공되는 TNFR2 길항제는 TNFR2와 복합체화될 때 약 10-3 s-1 이하(예를 들어, 약 1.0 x 10-3 s-1, 9.5 x 10-4 s-1, 9.0 x 10-4 s-1, 8.5 x 10-4 s-1, 8.0 x 10-4 s-1, 7.5 x 10-4 s-1, 7.0 x 10-4 s-1, 6.5 x 10-4 s-1, 6.0 x 10-4 s-1, 5.5 x 10-4 s-1, 5.0 x 10-4 s-1, 4.5 x 10-4 s-1, 4.0 x 10-4 s-1, 3.5 x 10-4 s-1, 3.0 x 10-4 s-1, 2.5 x 10-4 s-1, 2.0 x 10-4 s-1, 1.5 x 10-4 s-1, 1.0 x 10-4 s-1, 9.5 x 10-5 s-1, 9.0 x 10-5 s-1, 8.5 x 10-5 s-1, 8.0 x 10-5 s-1, 7.5 x 10-5 s-1, 7.0 x 10-5 s-1, 6.5 x 10-5 s-1, 6.0 x 10-5 s-1, 5.5 x 10-5 s-1, 5.0 x 10-5 s-1, 4.5 x 10-5 s-1, 4.0 x 10-5 s-1, 3.5 x 10-5 s-1, 3.0 x 10-5 s-1, 2.5 x 10-5 s-1, 2.0 x 10-5 s-1, 1.5 x 10-5 s-1, 또는 1.0 x 10-5 s-1 이하)의 koff 값을 나타낼 수 있다. TNFR2 agonists provided herein include those that exhibit high k on and low k off values upon interaction with TNFR2 consistent with high affinity receptor binding. For example, a TNFR2 agonist provided herein may be about 10 4 M -1 s -1 or greater (eg, about 1.0 x 10 4 M -1 s -1 , 1.5 x 10 4 M -1 s -1 , 1.5 x 10 4 M -1 s -1 in the presence of TNFR2). s -1 , 2.0 x 10 4 M -1 s -1 , 2.5 x 10 4 M -1 s -1 , 3.0 x 10 4 M -1 s -1 , 3.5 x 10 4 M -1 s -1 , 4.0 x 10 4 M -1 s -1 , 4.5 x 10 4 M -1 s -1 , 5.0 x 10 4 M -1 s -1 , 5.5 x 10 4 M -1 s -1 , 6.0 x 10 4 M -1 s -1 , 6.5 x 10 4 M -1 s -1 , 7.0 x 10 4 M -1 s -1 , 7.5 x 10 4 M -1 s -1 , 8.0 x 10 4 M -1 s -1 , 8.5 x 10 4 M -1 s -1 , 9.0 x 10 4 M -1 s -1 , 9.5 x 10 4 M -1 s -1 , 1.0 x 10 5 M -1 s -1 , 1.5 x 10 5 M -1 s -1 , 2.0 x 10 5 M -1 s -1 , 2.5 x 10 5 M -1 s -1 , 3.0 x 10 5 M - 1 s -1 , 3.5 x 10 5 M -1 s -1 , 4.0 x 10 5 M -1 s -1 , 4.5 x 10 5 M -1 s -1 , 5.0 x 10 5 M -1 s -1 , 5.5 x 10 5 M -1 s -1 , 6.0 x 10 5 M -1 s -1 , 6.5 x 10 5 M -1 s -1 , 7.0 x 10 5 M -1 s -1 , 7.5 x 10 5 M -1 s -1 , 8.0 x 10 5 M -1 s -1 , 8.5 x 10 5 M -1 s -1 , 9.0 x 10 5 M -1 s -1 , 9.5 x 10 5 M -1 s -1 , or 1.0 Exceeding x 10 6 M -1 s -1 ) may indicate a k on value. For example, a TNFR2 antagonist provided herein, when complexed with TNFR2, exhibits about 10 −3 s −1 or less (eg, about 1.0 x 10 −3 s −1 , 9.5 x 10 −4 s −1 , 9.0 x 10 -4 s -1 , 8.5 x 10 -4 s -1 , 8.0 x 10 -4 s -1 , 7.5 x 10 -4 s -1 , 7.0 x 10 -4 s -1 , 6.5 x 10 -4 s -1 , 6.0 x 10 -4 s -1 , 5.5 x 10 -4 s -1 , 5.0 x 10 -4 s -1 , 4.5 x 10 -4 s -1 , 4.0 x 10 -4 s -1 , 3.5 x 10 -4 s -1 , 3.0 x 10 -4 s -1 , 2.5 x 10 -4 s -1 , 2.0 x 10 -4 s -1 , 1.5 x 10 -4 s -1 , 1.0 x 10 -4 s -1 , 9.5 x 10 -5 s -1 , 9.0 x 10 -5 s -1 , 8.5 x 10 -5 s -1 , 8.0 x 10 -5 s -1 , 7.5 x 10 -5 s -1 , 7.0 x 10 -5 s -1 , 6.5 x 10 -5 s -1 , 6.0 x 10 -5 s -1 , 5.5 x 10 -5 s -1 , 5.0 x 10 -5 s -1 , 4.5 x 10 -5 s - 1 , 4.0 x 10 -5 s -1 , 3.5 x 10 -5 s -1 , 3.0 x 10 -5 s -1 , 2.5 x 10 -5 s -1 , 2.0 x 10 -5 s -1 , 1.5 x 10 -5 s -1 , or 1.0 x 10 -5 s -1 or less) may indicate a k off value.
본 명세서에 제공되는 바와 같이, TNFR2 효능제는 임의의 순서 또는 적합한 배열로 상기 기재된 임의의 것과 같은 TNFR1 길항제에 링커를 통해 직접적으로 또는 간접적으로 연결된다. 예를 들어, 본 명세서에 기재된 임의의 TNFR2 효능제와 같은 TNFR2 효능제의 N-말단은 하기 및 본 명세서의 다른 곳에서 논의되는 바와 같이 하나 이상의 링커를 통해 TNFR1 길항제의 C-말단과 융합된다. 대안적으로, TNFR2 효능제의 C-말단은 TNFR1 길항제의 N-말단과 융합될 수 있다. TNFR2 효능제가 식 3에 제시된 구조를 갖는 경우, 다량체화 도메인의 N-말단은 TNFR1 길항제의 C-말단에 연결되고, TNFR2 효능제가 식 4에 제시된 구조를 갖는 경우, 다량체화 도메인의 C-말단은 항-TNFR1 길항제의 N-말단에 연결된다. TNFR1 길항제와 TNFR2 효능제 사이의 링커(L)는 임의의 적합한 링커 및 이들의 조합, 예컨대 Ig Fc 영역, 및/또는 항체 힌지 영역, 및/또는 짧은 펩티드 링커, 예컨대 글리신-세린 링커 중 하나 이상을 포함할 수 있다. 일부 구현예에서, 링커는 30 kDa 이상의 폴리(에틸렌 글리콜)(PEG) 분자 또는 분지형 PEG 분자이다. 상기에 논의한 바와 같이, TNFR2 효능제가 식 3 또는 4에 제시된 구조를 갖는 경우, 다량체화 도메인이 Fc이면 TNFR1 길항제를 TNFR2 효능제에 연결하는 데 사용되는 동일한 Fc이다. As provided herein, a TNFR2 agonist is directly or indirectly linked through a linker to a TNFR1 antagonist, such as any of those described above, in any order or suitable arrangement. For example, the N-terminus of a TNFR2 agonist, such as any TNFR2 agonist described herein, is fused to the C-terminus of a TNFR1 antagonist via one or more linkers as discussed below and elsewhere herein. Alternatively, the C-terminus of a TNFR2 agonist may be fused to the N-terminus of a TNFR1 antagonist. When the TNFR2 agonist has the structure shown in Formula 3, the N-terminus of the multimerization domain is linked to the C-terminus of the TNFR1 antagonist, and when the TNFR2 agonist has the structure shown in Formula 4, the C-terminus of the multimerization domain is It is linked to the N-terminus of the anti-TNFR1 antagonist. The linker (L) between the TNFR1 antagonist and the TNFR2 agonist can be any suitable linker and combination thereof, such as one or more of an Ig Fc region, and/or an antibody hinge region, and/or a short peptide linker, such as a glycine-serine linker. can include In some embodiments, the linker is a poly(ethylene glycol) (PEG) molecule or a branched PEG molecule of 30 kDa or greater. As discussed above, when a TNFR2 agonist has the structure shown in Formula 3 or 4, if the multimerization domain is an Fc then it is the same Fc used to link the TNFR1 antagonist to the TNFR2 agonist.
c. 링커 c. linker
상기 TNFR1 길항제 작제물(예컨대, 식 1), 다중특이적 TNFR1 길항제-TNFR2 효능제 작제물(예컨대, 식 2) 및 TNFR2 효능제 작제물(예컨대, 식 3-5)은 선택적으로 링커, 뿐만 아니라 활성 변형제를 포함한다. 링커는 추가적인 또는 개선된 생물학적 및 약리학적 특성의 제공을 포함하는 다양한 기능을 가지며, 상이한 분자를 연결하기 위한 구조적 목적을 위해 사용된다. 예시적인 링커는 Gly-Ser 폴리펩티드, 힌지 영역(예를 들어, 다양한 힌지 영역의 서열 및 이들의 조합을 제시하는 상기 표 1-4 참조)이다. The TNFR1 antagonist constructs (eg Formula 1), multispecific TNFR1 antagonist-TNFR2 agonist constructs (eg Formula 2) and TNFR2 agonist constructs (eg Formulas 3-5) optionally comprise a linker, as well as Contains active modifiers. Linkers have a variety of functions, including providing additional or improved biological and pharmacological properties, and are used for structural purposes to link different molecules. An exemplary linker is a Gly-Ser polypeptide, hinge region (eg, see Tables 1-4 above which set forth sequences of various hinge regions and combinations thereof).
폴리펩티드 링커 및 또한 화학적 접합을 위한 화학 링커는 포함된다. 링커 펩티드는 폴리펩티드 사이의 공간으로 포함되며 적절한 단백질 접힘 및 폴리펩티드의 안정성을 촉진하고 단백질 발현을 개선하며 작제물의 성분의 생체활성을 강화할 수 있다. 펩티드 링커는 주로 구조화되지 않은 가요성 펩티드로 설계되었다. 링커는 상기 예시적인 식 1-4에 기재된 바와 같이 포함될 수 있다. 예를 들어, 제공된 이중특이적 작제물에서, 성분은 링커(L)를 통해 N-말단에서 C-말단으로, 또는 C-말단에서 N-말단 배열로 융합된다. 링커는 일반적으로 단독으로 또는 예를 들어, 짧은 펩티드 링커, 예컨대 글리신-세린 (GS) 링커, 및/또는 면역글로불린 (Ig)의 힌지 영역을 포함하는 하나 이상의 다른 링커와 조합하여 Fc 영역과 같은 폴리펩티드를 포함하는 펩티드 링커이다. 본 명세서의 구현예에서, 예를 들어, TNFR1 길항제의 C-말단은 펩티드 링커(들)의 N-말단에 융합되고, 펩티드 링커(들)의 C-말단은 TNFR2 효능제의 N-말단과 융합된다. 다른 구현예에서, TNFR2의 C-말단은 펩티드 링커(들)의 N-말단에 융합되고, 펩티드 링커(들)의 C-말단은 TNFR1 길항제의 N-말단과 융합된다. 링커는 증가된 분자량을 제공하고, 안정성 및 혈청 반감기를 증가시키고, 조직 보유를 강화시키고, 말초 제거를 감소 또는 감소시켜 분자의 치료 지수를 향상시킨다. 링커는 또한 분자의 가요성을 증가시켜 분자의 각 부분이 본 명세서에 제공된 바와 같이 TNFR1 및 TNFR2와 같은 표적 항원/에피토프와 상호작용할 수 있도록 한다. 아래 및 본 명세서의 다른 곳에서 논의된 바와 같이, 링커가 면역글로불린의 Fc 영역, 일반적으로 변형된 Fc 영역을 함유하는 구현예에서, 예를 들어 신생아 Fc 수용체(FcRn) 재순환을 포함하는 추가 특성이 부여될 수 있으며, 이는 혈청 안정성 및 반감기를 추가로 증가시키고/시키거나 면역 이펙터 기능의 강화 또는 제거를 증가시킨다. Polypeptide linkers and also chemical linkers for chemical conjugation are included. Linker peptides are incorporated into the space between polypeptides and can promote proper protein folding and stability of the polypeptides, improve protein expression, and enhance the bioactivity of components of the construct. Peptide linkers are designed primarily as unstructured flexible peptides. A linker may be included as described in Exemplary Formulas 1-4 above. For example, in a provided bispecific construct, the components are fused via a linker (L) in an N-terminus to C-terminus or C-terminus to N-terminus arrangement. The linker is usually alone or in combination with one or more other linkers, including, for example, a short peptide linker, such as a glycine-serine (GS) linker, and/or the hinge region of an immunoglobulin (Ig) polypeptide, such as an Fc region. It is a peptide linker containing In embodiments herein, for example, the C-terminus of the TNFR1 antagonist is fused to the N-terminus of the peptide linker(s) and the C-terminus of the peptide linker(s) is fused to the N-terminus of the TNFR2 agonist do. In another embodiment, the C-terminus of TNFR2 is fused to the N-terminus of the peptide linker(s) and the C-terminus of the peptide linker(s) is fused to the N-terminus of the TNFR1 antagonist. The linker improves the therapeutic index of the molecule by providing increased molecular weight, increasing stability and serum half-life, enhancing tissue retention, and reducing or reducing peripheral clearance. The linker also increases the flexibility of the molecule, allowing each part of the molecule to interact with target antigens/epitopes such as TNFR1 and TNFR2 as provided herein. As discussed below and elsewhere herein, in embodiments where the linker contains an Fc region of an immunoglobulin, usually a modified Fc region, additional properties including, for example, neonatal Fc receptor (FcRn) recycling are present. may be conferred, which further increases serum stability and half-life and/or increases the enhancement or elimination of immune effector functions.
i. 펩티드 링커i. peptide linker
융합 단백질에 대한 링커는 당업자에게 잘 알려져 있다. 예를 들어, 문헌[Chen et al (2013) Adv . Drug. Deliv . Rev. 65:1357-1369, entitled "Fusion Protein Linkers: Property, Design and Functionality] 참조. 링커는 설계될 수 있거나 자연 발생 다중 도메인 단백질의 링커로부터 또는 기반일 수 있다. 연구자에 의해 설계된 경험적 링커는 일반적으로 그 구조에 따라 3가지 범주로 분류된다: 가요성 링커, 강직 링커 및 예를 들어 인시투 링커의 절단에 의해 활성화되는 전구약물을 전달하기 위해 사용되는 생체내 절단 가능한 링커. Linkers for fusion proteins are well known to those skilled in the art. See, eg, Chen et al (2013) Adv . Drug. Deliv . Rev. 65 :1357-1369, entitled " Fusion Protein Linkers: Property, Design and Functionality . Linkers may be designed or may be based on or from linkers of naturally occurring multi-domain proteins. Empirical linkers designed by researchers are generally classified into three categories according to their structure: flexible linkers, rigid linkers, and in vivo cleavage used to deliver prodrugs that are activated, for example, by cleavage of the linker in situ. Possible linker.
기능적 도메인을 함께 연결하는 역할(가요성 및 강직 링커에서와 같이) 또는 생체 내에서 자유 기능적 도메인을 방출하는 역할(생체 내에서 절단 가능한 링커에서와 같이) 외에도, 링커는 연결된 모이어티의 특성을 개설할 수 있다. 본 명세서에는 예를 들어 생물학적 활성 개선, 발현 수율 증가 및 바람직한 약동학 프로파일 달성이 포함된다. 링커를 선택하기 위한 데이터베이스 및 방법은 당업자에게 공지되어 있다 (예를 들어, 문헌[George 등 (2002) "An analysis of protein domain linkers: their classification and role in protein folding," Protein Eng . 15:871-879] 참조). In addition to their role in linking functional domains together (as in flexible and rigid linkers) or releasing free functional domains in vivo (as in in vivo cleavable linkers), linkers outline the properties of the linked moieties. can do. Included herein are, for example, improving biological activity, increasing expression yield, and achieving a desirable pharmacokinetic profile. Databases and methods for selecting linkers are known to those skilled in the art (see, e.g., George et al. (2002) " An analysis of protein domain linkers: their classification and role in protein folding ," Protein Eng . 15 :871-879]).
a) 가요성 링커a) a flexible linker
가요성 링커는 일반적으로 결합된 도메인이 어느 정도의 이동이나 상호 작용을 필요로 할 때 적용된다. 가요성 링커는 일반적으로 우수한 가요성과 용해도를 제공하기 위해 Gly 및 Ser과 같은 작은 또는 극성 아미노산이 풍부하다. 융합 단백질 도메인에 특정 움직임 또는 상호작용(예를 들어, scFv에서)이 필요할 때 적합한 선택이다. 또한 가요성 링커는 견고한 구조가 아니지만 기능적 도메인 간의 거리를 유지하는 수동 링커 역할을 할 수 있다. 가요성 링커의 길이는 적절한 폴딩을 허용하거나 융합 단백질의 최적의 생물학적 활성을 달성하도록 조정될 수 있다.Flexible linkers are generally applied when the linked domains require some degree of movement or interaction. Flexible linkers are usually enriched with small or polar amino acids such as Gly and Ser to provide good flexibility and solubility. It is a suitable choice when a specific motion or interaction (eg in scFv) is required for the fusion protein domain. In addition, the flexible linker is not a rigid structure, but can act as a passive linker that maintains the distance between functional domains. The length of the flexible linker can be adjusted to allow for proper folding or to achieve optimal biological activity of the fusion protein.
유연한 링커는 일반적으로 문헌[Argos (1990) J. Mol . Biol . 211(4):943-958]에 암시된 바와 같이 작은, 무극성 (예를 들어 Gly) 또는 극성 (예를 들어, Ser 또는 Thr) 아미노산으로 구성된다. 이러한 아미노산의 작은 크기는 가요성을 제공하고 연결 기능 도메인의 이동성을 허용한다. Ser 또는 Thr의 혼입은 물 분자와 수소 결합을 형성하여 수용액에서 링커의 안정성을 유지할 수 있으므로 링커와 단백질 부분 사이의 바람직하지 않은 상호작용을 감소시킨다.Flexible linkers are generally described in Argos (1990) J. Mol . Biol . 211(4):943-958] consists of small, non-polar (eg Gly) or polar (eg Ser or Thr) amino acids. The small size of these amino acids provides flexibility and allows mobility of the linking functional domains. Incorporation of Ser or Thr can form hydrogen bonds with water molecules to maintain the stability of the linker in aqueous solution, thereby reducing undesirable interactions between the linker and the protein moiety.
예시적인 가요성 링커는 주로 또는 Gly 및 Ser 잔기의 스트레치만을 함유하는 링커("GS" 링커)이다. 예는 (Gly-Gly-Gly-Gly-Ser)n의 서열을 갖는 가요성 링커이다. 카피 수 "n"을 조정함으로써, 이 GS 링커의 길이를 선택하거나 기능적 도메인의 적절한 분리를 달성하거나 필요한 도메인 간 상호 작용을 유지하도록 선택할 수 있다. 가요성 링커는 또한 Gly 및 Ser과 같은 작거나 극성인 아미노산이 풍부하고 가요성을 유지하기 위해 Thr 및 Ala와 같은 추가 아미노산을 포함할 수 있으며 용해도의 개선을 위해 Lys 및 Glu와 같은 극성 아미노산도 포함할 수 있다.An exemplary flexible linker is a linker containing primarily or only stretches of Gly and Ser residues ("GS" linkers). An example is a flexible linker with the sequence of (Gly-Gly-Gly-Gly-Ser) n . By adjusting the copy number “n”, one can choose the length of this GS linker to achieve proper separation of the functional domains or to maintain the necessary inter-domain interactions. Flexible linkers are also rich in small or polar amino acids, such as Gly and Ser, and can contain additional amino acids, such as Thr and Ala, to maintain flexibility, and polar amino acids, such as Lys and Glu, to improve solubility. can do.
프로테아제 저항성을 부여하고 융합 단백질의 가요성을 증가시키기 위해, SCDKTH 힌지 서열 및 다른 힌지 서열은 짧은 폴리펩티드 링커로 대체되거나 선행될 수 있다. 폴리펩티드 링커의 예시는 (Gly-Ser)n 아미노산 서열(GS 링커)이며, 용해도를 증가시키기 위해 일부 Glu 또는 Lys 잔기가 전체적으로 분산되어 있다. 예를 들어, 폴리펩티드 링커는 (GlySer)n (여기서 n= 1-10); (GlySer2); (Gly4Ser)n(여기서 n= 1-10); (Gly3Ser)n(여기서 n= 1-5); (SerGly4)n(여기서 n= 1-5); (GlySerSerGly)n(여기서 n= 1-5); GSGGSSGG; GSSSGSGSGSSG; GSSSGSGSGSSGG; GGSSGG; GGSSGGSGGSSSG; GSSSGSGSGGSSSGSGSG; GGSSGGSSGGGSSGGSSG; 및 GSSSGS (GS 링커에 대한 서열번호: 816-827 참조)을 포함하지만 이에 제한되지 않는다. 링커는 길이가 적어도 2-18개 잔기이거나 더 긴 폴리-Gly 펩티드이거나, 동일한 길이 및 가요성의 유사한 링커일 수 있다. 본 명세서에 제공된 분자 내의 예시적인 폴리펩타이드 링커는 예를 들어 GSGS, GGGGS 또는 GGGGSGGGGSGGGGS를 포함하나 이에 제한되지 않는다 (Gly-Ser 링커에 대한 서열번호: 816-827 참조). 유사한 성능을 제공하는 또 다른 링커는 (GGGGS)4(서열번호: 819) 링커이다. 또 다른 Gly 및 Ser이 풍부한 가요성 링커는 GSAGSAAGSGEF(서열번호: 828)이다. 이 링커는 수용액에서 우수한 용해도를 유지하는 것으로 나타났다. 글리신만 함유하는 링커를 사용할 수 있다. 예를 들어, (Gly)6(서열번호: 1473) 및 (Gly)8(서열번호: 1474) 링커는 공지되어 있으며 발현 유기체로부터 단백질 정제 동안 단백질 분해 효소 소화에 대해 안정한 것으로 나타났다.To confer protease resistance and increase the flexibility of the fusion protein, the SCDKTH hinge sequence and other hinge sequences can be replaced or preceded by a short polypeptide linker. An example of a polypeptide linker is the (Gly-Ser) n amino acid sequence (GS linker), with some Glu or Lys residues dispersed throughout to increase solubility. For example, a polypeptide linker can be (GlySer) n (where n=1-10); (GlySer 2 ); (Gly 4 Ser) n (where n=1-10); (Gly 3 Ser) n (where n= 1-5); (SerGly 4 ) n (where n=1-5); (GlySerSerGly) n (where n= 1-5); GSGGSSGG; GSSSGSGSGSSG; GSSSGSGSGSSGG; GGSSGG; GGSSGGSGGSSSG; GSSSGSGSGGSSSGSGSG; GGSSGGSSGGGSSGGSSG; and GSSSGS (see SEQ ID NOs: 816-827 for the GS linker). The linker can be a poly-Gly peptide of at least 2-18 residues in length or longer, or a similar linker of the same length and flexibility. Exemplary polypeptide linkers in molecules provided herein include, but are not limited to, eg, GSGS, GGGGS or GGGGSGGGGSGGGGS (see SEQ ID NOs: 816-827 for Gly-Ser linkers). Another linker that provides similar performance is the (GGGGS) 4 (SEQ ID NO: 819) linker. Another flexible linker rich in Gly and Ser is GSAGSAAGSGEF (SEQ ID NO: 828). This linker has been shown to maintain good solubility in aqueous solutions. Linkers containing only glycine may be used. For example, (Gly) 6 (SEQ ID NO: 1473) and (Gly) 8 (SEQ ID NO: 1474) linkers are known and have been shown to be stable against protease digestion during protein purification from the expressing organism.
KESGSVSSEQLAQFRSLD(서열번호: 829) 및 EGKSSGSGSESKST(서열번호: 830)를 포함하는 몇 가지 다른 유형의 가요성 링커. 링커의 Gly 및 Ser 잔기는 가요성을 제공하고 Glu 및 Lys는 용해도를 개선한다. Several other types of flexible linkers including KESGSVSSEQLAQFRSLD (SEQ ID NO: 829) and EGKSSGSGSESKST (SEQ ID NO: 830). The linker's Gly and Ser residues provide flexibility and Glu and Lys improve solubility.
b) 강직 링커b) rigid linkers
가요성 링커는 기능적 도메인을 수동적으로 연결하고 어느 정도의 움직임을 허용하는 이점이 있지만 이러한 링커의 강성 부족은 제한적일 수 있다. 강직 링커는 융합 단백질의 안정성 또는 생체 활성을 보존하기 위해 도메인의 공간적 분리가 필요할 때 선택된다. 강직 링커는 α-나선 구조를 채택하거나 여러 개의 Pro 잔기를 함유함으로써 상대적으로 강성 구조를 나타낸다. 링커의 길이는 도메인 간 최적의 거리를 달성하기 위해 카피 수를 변경하여 쉽게 조정할 수 있다. Flexible linkers have the advantage of passively connecting functional domains and allowing some movement, but the lack of rigidity of such linkers can be limiting. Rigid linkers are selected when spatial separation of domains is required to preserve the stability or bioactivity of the fusion protein. Rigid linkers exhibit relatively rigid structures by adopting an α-helical structure or by containing several Pro residues. The length of the linker can be easily tuned by changing the copy number to achieve an optimal distance between domains.
(EAAAK)n(서열번호: 831)의 서열을 갖는 알파 나사선구조 형성 링커는 많은 재조합 융합 단백질의 구축에 적용되어 왔다. α-나선 구조는 단단하고 안정적이며 세그먼트 내 수소 결합과 밀집된 포장된 백본이 있다. 강성 α-나선형 링커는 단백질 도메인 사이에서 강성 스페이서 역할을 할 수 있다. 강직 링커의 예는 A(EAAAK)nA(서열번호: 832)이며, 여기서 n = 2-5이다. 이 링커는 세그먼트 내의 GluLys+ 염다리에 의해 안정화된 α-나선 형태를 나타낸다. 또 다른 유형의 강직 링커는 Pro 풍부 서열인 (XP)n을 가지며, 여기서 X는 임의의 아미노산을 나타내며 일반적으로 Ala, Lys 또는 Glu이다. 비-나선형 링커에 Pro가 존재하면 강직이 증가하고 단백질 도메인을 효과적으로 분리할 수 있다. 이러한 링커의 예는 -Glu-Pro- 및 -Lys-Pro-를 반복하는 33개 잔기 펩티드이다.(EAAAK) The alpha helix forming linker with the sequence of n (SEQ ID NO: 831) has been applied to the construction of many recombinant fusion proteins. The α-helical structure is rigid and stable, with intrasegmental hydrogen bonds and a densely packed backbone. Rigid α-helical linkers can serve as rigid spacers between protein domains. An example of a rigid linker is A(EAAAK) n A (SEQ ID NO: 832), where n = 2-5. This linker exhibits an α-helical conformation stabilized by GluLys + salt bridges within the segment. Another type of rigid linker has a Pro-rich sequence, (XP) n , where X represents any amino acid and is usually Ala, Lys or Glu. The presence of Pro in the non-helical linker increases stiffness and effectively separates the protein domains. An example of such a linker is a 33 residue peptide repeating -Glu-Pro- and -Lys-Pro-.
당업자는 공지된 링커 또는 설계 링커로부터 선택할 수 있다. 바람직한 특성 및 이에 대한 요건은 알려져 있다. 다음 논의는 일부 예시적인 링커를 요약한다 (문헌[Chen 등 (2013) Adv . Drug. Deliv . Rev. 65:1357-1369] 참조, 이는 가요성이고 강성이며 절단 가능한 링커의 세부사항을 제공하고 사용될 수 있음). 가요성 링커는 Gly 또는 Ser과 같은 작은 및/또는 친수성 아미노산이 풍부하여 구조적 가요성을 제공하고 도메인 간 상호작용 또는 이동을 선호하는 기능적 도메인을 연결하는 데 사용되었다. 단백질 도메인의 충분한 분리가 필요한 경우 강직 링커를 사용할 수 있다. 강직 링커는 α-나선 구조를 채택하거나 프롤린을 포함하도록 설계되거나 선택된다. 강직 링커는 단백질 모이어티를 멀리 떨어뜨릴 수 있다. 가요성 및 강직 링커는 생체 내에서 안정적이며 결합된 단백질의 분리를 허용하지 않는다. 절단 가능한 링커는 환원 또는 단백분해 절단을 통해 생체 내에서 자유 기능성 도메인의 방출을 허용한다. 이들은 일반적으로 전구약물을 표적 부위로 전달하는 데 사용된다. One skilled in the art can select from known linkers or designed linkers. Desirable properties and requirements for them are known. The following discussion summarizes some exemplary linkers (Chen et al. (2013) Adv . Drug. Deliv . Rev. 65 :1357-1369], which provides details of flexible, rigid, cleavable linkers and may be used). Flexible linkers have been used to link functional domains that are enriched in small and/or hydrophilic amino acids such as Gly or Ser, providing structural flexibility and favoring interactions or movement between domains. Rigid linkers can be used if sufficient separation of protein domains is desired. Rigid linkers are designed or selected to adopt an α-helical structure or to contain proline. Rigid linkers can distance protein moieties. Flexible and rigid linkers are stable in vivo and do not allow separation of bound proteins. The cleavable linker allows release of the free functional domain in vivo via reductive or proteolytic cleavage. They are generally used to deliver prodrugs to the target site.
상기 식 2에서, TNFR1 길항제 및/또는 TNFR2 효능제 부분과 Fc 부분과 같은 활성-변형 부분 사이와 같은 추가 링커는 포함될 수 있으며; 그러한 링커는 적어도 잔기 SCDKTH(서열번호: 26의 잔기 222-227에 상응함)를 포함하는 트라스투주맙의 가요성을 제공하기에 충분한 힌지 서열의 전부 또는 일부, 또는 니볼루맙의 힌지 영역의 가요성을 서열 ESKYGPPCPPCP(서열번호: 29의 잔기 212-223에 상응함) 또는 이와 적어도 98% 또는 99% 서열 동일성을 갖는 서열, 또는 당업계에 공지된 임의의 다른 적합한 항체 힌지 영역 또는 서열에 제공하기에 충분한 부분을 포함하는 전부 또는 일부를 함유할 수 있다. In Formula 2 above, additional linkers such as between a TNFR1 antagonist and/or TNFR2 agonist portion and an active-modifying portion such as an Fc portion may be included; Such a linker may include all or part of the hinge sequence sufficient to provide flexibility of trastuzumab, including at least residues SCDKTH (corresponding to residues 222-227 of SEQ ID NO: 26), or flexibility of the hinge region of nivolumab. To provide the sequence ESKYGPPCPPCP (corresponding to residues 212-223 of SEQ ID NO: 29) or a sequence having at least 98% or 99% sequence identity thereto, or any other suitable antibody hinge region or sequence known in the art It may contain all or part, including sufficient portions.
특정 구현예에서, GS 링커만이 포함된다. 당업계에 공지된 다른 짧은 펩티드 링커도 본 명세서에 제공된 이중특이적 분자에서 사용하기 위해 고려된다. 예를 들어, Fc의 N- 또는 C-말단 확장을 링커로 사용할 수 있다. 인간 IgG, ELQLEESSAEAQDGELDG (서열번호: 833) 또는 이와 적어도 98% 또는 99% 서열 동일성을 갖는 서열, 또는 서열 ELQLEESSAEAQGG (서열번호: 834)를 함유하는 변이체 또는 이와 적어도 98% 또는 99% 서열 동일성을 갖는 서열로부터의 C-말단 확장은 또한 링커로 사용될 수 있다. In certain embodiments, only the GS linker is included. Other short peptide linkers known in the art are also contemplated for use in the bispecific molecules provided herein. For example, N- or C-terminal extensions of Fc can be used as linkers. Human IgG, ELQLEESSAEAQDGELDG (SEQ ID NO: 833) or a sequence having at least 98% or 99% sequence identity thereto, or a variant containing the sequence ELQLEESSAEAQGG (SEQ ID NO: 834) or a sequence having at least 98% or 99% sequence identity thereto A C-terminal extension from can also be used as a linker.
융합 단백질이거나 융합 단백질이 아닌 제2 Fc 서브유닛이 포함될 수 있다 (예를 들어, 도 2 참조, 놉-인-홀을 포함하도록 변형될 수 있음(아래 논의 참조). 그것은 포유동물 세포 발현 시스템 내에서 조립되어 놉-인-홀 매개 Fc 이량체를 형성하여 Fc 이량체를 생성하며, 이는 분자의 혈청 반감기와 안정성을 추가로 증가시킨다. 특정 구현예에서, 제2 Fc 서브유닛은 제2 TNFR2 효능제와 융합되어 2가 항체 유사 구조를 생성한다. 다른 구현예에서, 단 하나의 Fc 서브유닛(Fc 단량체)이 포함된다.A second Fc subunit, either a fusion protein or not a fusion protein, may be included (see, eg, FIG. 2 , may be modified to include a knob-in-hole (see discussion below). It may be used within mammalian cell expression systems. assembles to form a knob-in-hole mediated Fc dimer to produce an Fc dimer, which further increases the serum half-life and stability of the molecule In certain embodiments, the second Fc subunit has a second TNFR2 potency fused with an antibody to create a bivalent antibody-like structure, in another embodiment, only one Fc subunit (Fc monomer) is included.
ii. 화학 링커ii. chemical linker
일부 구현예에서, 링커는 화학 링커이다. 본 명세서에는 절단할 수 없는 모이어티인 링커, 화학적 가교 시약 및 PEG화 모이어티를 포함하는 중합체 분자와 같은 폴리펩티드 변형제가 포함된다. 화학 링커는 펩티드 링커로는 달성할 수 없는 분지 작제물 및 다른 구조의 생성에 더 적합하다.In some embodiments, a linker is a chemical linker. Included herein are polypeptide modifiers such as linkers that are non-cleavable moieties, chemical cross-linking reagents, and polymeric molecules that include PEGylated moieties. Chemical linkers are better suited for the creation of branched constructs and other structures that cannot be achieved with peptide linkers.
예시적인 링커는 절단 불가능한 링커를 포함한다. 절단 불가능한 링커는 예를 들어 아미드 링커 및 석시네이트 스페이서를 갖는 아미드 및 에스테르 결합을 포함한다 (예를 들어, 문헌[Dosio 등, (2010) Toxins 3:848-883] 참조). 예시적인 화학적 가교 링커는 SMCC (석신이미딜-4-(N-말레이미도메틸)사이클로헥산-1-카복실레이트) 및 SIAB (석신이미딜 (4-요오드아세틸)아미노벤조에이트)을 포함하지만 이에 제한되지 않는다. SMCC는 중간 길이의 사이클로헥산 안정화 스페이서 아암의 반대쪽 끝에 NHS-에스테르 및 말레이미드 반응성 기를 함유하는 아민-대-설프하이드릴 가교제이다. SIAB는 아민-대-설프하이드릴 접합을 위한 짧은 NHS-에스테르 및 요오도아세틸 가교제이다. 다른 예시적인 가교 시약은 티오에테르 링커, 화학적으로 불안정한 하이드라존 링커, 4-머캅토발레르산, BMPEO, BMPS, EMCS, GMBS, HBVS, LC-SMCC, MBS, MPBH, SBAP, SIA, SMPB, SMPH, 설포-EMCS, 설포-GMBS, 설포-KMUS, 설포-MBS, 설포-SIAB, 설포-SMCC, 및 설포-SMPB, 및 SVSB (석신이미딜-(4-비닐설포닐)벤조에이트), 및 비스-말레이미드 시약, 예컨대 DTME, BMB, BMDB, BMH, BMOE, BM(PEO)3, 및 BM(PEO)4(이는 상업적으로 입수 가능함 (Pierce Biotechnology, Inc.))을 포함하지만 이에 제한되지 않는다. 비스-말레이미드 시약은 항체의 시스테인 잔기의 유리 티올 기를 티올 함유 표적 제제 또는 링커 중간체에 순차적 또는 동시 방식으로 부착할 수 있게 한다. 말레이미드 외에 다른 티올-반응성 작용기는 요오드아세트아미드, 브로모아세트아미드, 비닐 피리딘, 디설파이드, 피리딜 디설파이드, 이소시아네이트, 및 이소티오시아네이트를 포함한다. 다른 예시적인 링커 및 사용 방법은 당업자에게 잘 알려져 있으며, 예를 들어 문헌[미국 특허 공개 제2005/0276812호 및 Ducry 등 (2010) Bioconjug. Chem. 21:5-13]에 기재되어 있다. Exemplary linkers include non-cleavable linkers. Non-cleavable linkers include, for example, amide linkers and amide and ester linkages with succinate spacers (see, eg, Dosio et al., (2010) Toxins 3:848-883). Exemplary chemical cross-linking linkers include but are not limited to SMCC (succinimidyl-4-(N-maleimidomethyl)cyclohexane-1-carboxylate) and SIAB (succinimidyl (4-iodoacetyl)aminobenzoate) It doesn't work. SMCC is an amine-to-sulfhydryl crosslinker containing NHS-ester and maleimide reactive groups at opposite ends of a mid-length cyclohexane stabilized spacer arm. SIAB is a short NHS-ester and iodoacetyl crosslinker for amine-to-sulfhydryl conjugation. Other exemplary cross-linking reagents include thioether linkers, chemically labile hydrazone linkers, 4-mercaptovaleric acid, BMPEO, BMPS, EMCS, GMBS, HBVS, LC-SMCC, MBS, MPBH, SBAP, SIA, SMPB, SMPH , sulfo-EMCS, sulfo-GMBS, sulfo-KMUS, sulfo-MBS, sulfo-SIAB, sulfo-SMCC, and sulfo-SMPB, and SVSB (succinimidyl-(4-vinylsulfonyl)benzoate), and bis -maleimide reagents such as DTME, BMB, BMDB, BMH, BMOE, BM(PEO) 3 , and BM(PEO) 4 (which are commercially available from Pierce Biotechnology, Inc.). Bis-maleimide reagents allow for sequential or simultaneous attachment of the free thiol groups of cysteine residues of antibodies to thiol-containing targeting agents or linker intermediates. Other thiol-reactive functional groups besides maleimide include iodoacetamide, bromoacetamide, vinyl pyridine, disulfide, pyridyl disulfide, isocyanates, and isothiocyanates. Other exemplary linkers and methods of use are well known to those skilled in the art and are described in, for example, US Patent Publication No. 2005/0276812 and Ducry et al. (2010) Bioconjug. Chem. 21:5-13].
링커는 선택적으로 용해도 및 반응성과 같은 특성을 조절하는 기로 대체될 수 있다. 예를 들어, 술포네이트 치환기는 시약의 수용성을 증가시키고 링커 시약과 항체 또는 약물 모이어티과의 커플링 반응을 용이하게 하고/하거나 커플링 반응을 용이하게 할 수 있다. 링커 시약은 또한 Molecular Biosciences Inc.(Boulder, CO.)와 같은 상업적 공급원을 통해 얻거나, 문헌[Toki 등 (2002) J. Org . Chem . 67:1866-1872; 미국 특허 번호 6,214,345; 미국 공개 번호 2003/130189, 및 2003/096743; 및 국제 출원 공개 번호 WO 02/088172, WO 03/026577, WO 03/043583, 및 WO 04/032828]에 기재된 절차에 따라 합성된다. 예를 들어, 링커 시약 예컨대 DOTA-말레이미드 (4-말레이미도부티르아미도벤질-DOTA)은 문헌[Axworthy 등 (2000) Proc. Natl . Acad . Sci . U.S.A . 97(4):1802-1807]의 절차에 따라 아미노벤질-DOTA와 이소프로필클로로포르메이트 (Aldrich)로 활성화된 4-말레이미도부티르산 (Fluka)과의 반응에 의해 제조될 수 있다. DOTA-말레이미드 시약은 시스테인 조작된 항체의 유리 시스테인 아미노산과 반응하고 항체에 금속 복합 리간드를 제공한다 (문헌[Lewis 등 (1998) Bioconj . Chem . 9:72-86]). 킬레이트화 링커 라벨링 시약, 예컨대 DOTA-NHS (1,4,7,10-테트라아자사이클로도데칸-1,4,7,10-테트라아세트산 모노 (N-하이드록시석신이미드 에스테르)는 상업적으로 입수 가능하다 (Macrocyclics, Dallas, TX.).Linkers may optionally be replaced with groups that modulate properties such as solubility and reactivity. For example, a sulfonate substituent can increase the water solubility of a reagent, facilitate a coupling reaction between a linker reagent and an antibody or drug moiety, and/or facilitate a coupling reaction. Linker reagents may also be obtained from commercial sources such as Molecular Biosciences Inc. (Boulder, CO.) or as described in Toki et al. (2002) J. Org . Chem . 67:1866-1872; U.S. Patent No. 6,214,345; US Publication Nos. 2003/130189, and 2003/096743; and International Application Publication Nos. WO 02/088172, WO 03/026577, WO 03/043583, and WO 04/032828. For example, a linker reagent such as DOTA-maleimide (4-maleimidobutyramidobenzyl-DOTA) is described in Axworthy et al. (2000) Proc. Natl . Acad . Sci . USA . 97(4):1802-1807] by the reaction of aminobenzyl-DOTA with 4-maleimidobutyric acid (Fluka) activated with isopropylchloroformate (Aldrich). The DOTA-maleimide reagent reacts with the free cysteine amino acid of the cysteine engineered antibody and gives the antibody a metal complex ligand (Lewis et al. (1998) Bioconj . Chem . 9:72-86]). Chelating linker labeling reagents such as DOTA-NHS (1,4,7,10-tetraazacyclododecane-1,4,7,10-tetraacetic acid mono (N-hydroxysuccinimide ester) are commercially available. Possible (Macrocyclics, Dallas, TX.).
링커는 항체에 대한 분지형 다작용성 링커 모이어티를 통한 하나 초과의 모이어티의 공유 부착을 위한 수지상 유형 링커일 수 있다 (예를 들어, 문헌[Sun 등 (2002) Bioorganic & Medicinal Chemistry Letters 12:2213-2215; Sun 등 (2003) Bioorganic & Medicinal Chemistry 11:1761-1768; King 등 (2002) Tetrahedron Letters 43:1987-1990] 참조). 항체가 단 하나의 반응성 시스테인 티올 기를 보유하는 경우, 수지상 링커를 통해 다수의 다른 모이어티가 부착될 수 있다. 예시적인 수지상 링커 시약은 알려져 있다 (예를 들어, 미국 특허 공개 번호 2005/0276812 참조). The linker can be a dendritic type linker for covalent attachment of more than one moiety to an antibody via a branched multifunctional linker moiety (see, e.g., Sun et al. (2002) Bioorganic & Medicinal Chemistry Letters 12:2213-2215; Sun et al. (2003) Bioorganic & Medicinal Chemistry 11:1761-1768; King et al. (2002) Tetrahedron Letters 43:1987-1990). Where an antibody possesses only one reactive cysteine thiol group, multiple other moieties may be attached via the dendritic linker. Exemplary dendritic linker reagents are known (see, eg, US Patent Publication No. 2005/0276812).
화학 링커(본 명세서의 작제물에서 사용하기 위한 활성 변형제일 수도 있음)의 또 다른 예는 PEG 분자 및 분지형 PEG 분자, 특히 분자량이 30 kDa 이상인 분자이다. PEG 링커는 다중특이적 및 2가(수용체 클러스터링이 신호전달을 강화시키는 TNFR2 효능제의 경우)의 도입을 제공하고 분자의 분자량을 증가시켜 생체 내 혈청 반감기를 증가시킨다. PEG 링커는 또한 예를 들어 신속하게 분해 및 제거되고/되거나 면역원성을 유발하는 비-천연 구조의 도입을 피함으로써 항체의 리엔지니어링의 어려움을 개선한다.Other examples of chemical linkers (which may also be active modifiers for use in the constructs herein) are PEG molecules and branched PEG molecules, particularly molecules having a molecular weight greater than 30 kDa. The PEG linker provides for multispecific and bivalent (in the case of TNFR2 agonists where receptor clustering enhances signaling) incorporation and increases the molecular weight of the molecule, thereby increasing serum half-life in vivo. PEG linkers also ameliorate the difficulty of reengineering antibodies, for example by avoiding the introduction of non-native structures that are rapidly degraded and removed and/or cause immunogenicity.
d. 활성 변형제d. active modifier
작제물의 성분 중에는, 작제물의 활성 및/또는 약리학적 특성을 조절하거나 변경하는 부분 또는 영역이 있다 (상기 식 1 및 2 참조). 이러한 것의 예는 Fc 영역, 변형된 Fc 영역, 다른 다량체화 도메인, Fc 및 변형된 Fc의 이량체, 및 다른 모이어티, 예컨대 폴리펩티드, 예컨대 반감기 연장 폴리펩티드를 포함하는 중합체성 모이어티, 알부민, 예컨대 인간 혈청 알부민 (HSA), 및 트랜스페린, 및 중합체, 예컨대 혈청 반감기를 증가시킬 수 있는 본원의 다른 곳에서 논의된 PEG이다. 활성 변형제는 프로테아제에 대한 접근 감소, 신장 여과 감소 및/또는 수용체 매개 재순환을 통한 세포내 라우팅 변경에 의한 혈장 반감기 연장; 통과세포외배출을 겪는 수용체에 결합함으로써 상피 이중층을 가로질러 흡수를 제공하는 것; 특정 수용체 또는 항원을 과발현하거나 고유하게 발현하는 생체내 부위를 표적화하는 것; 및 하기 논의에서 예시되고 또한 당업계에 공지된 바와 같은 다른 특성으로 제한되지 않는 것과 같은 특성을 부여할 수 있다.Among the components of the construct are portions or regions that modulate or alter the activity and/or pharmacological properties of the construct (see
본 명세서에 제공되는 바와 같이, 작제물은 활성 변형제로서 인간 면역글로불린의 Fc 영역, 예컨대 IgG, 예를 들어, IgG1 Fc (서열번호: 10), IgG2 Fc (서열번호: 12), IgG3 Fc (서열번호: 14), 또는 IgG4 Fc (서열번호: 16)을 포함할 수 있다. 특히 Fc는 IgG1 또는 IgG4 항체에서 유래된다. 예를 들어, 링커는 트라스투주맙 중쇄의 CH2 및 CH3 도메인을 함유하는 트라스투주맙으로부터 유래된 IgG1 Fc와 같은 IgG1 카파 Fc 영역을 포함할 수 있다 (예를 들어, 서열번호: 26의 잔기 234-450 참조; 또한, 서열번호: 27 참조). 본 명세서에 제공되는 이중특이적 분자의 Fc 서브유닛은 또한 예를 들어 니볼루맙 중쇄의 CH2 및 CH3 도메인을 함유하는 니볼루맙(Opdivo®)으로부터 유래된 IgG4 Fc와 같은 IgG4 Fc일 수 있다 (예를 들어, 서열번호: 29의 잔기 224-440 참조; 또한 서열번호: 30 참조). As provided herein, the construct is an Fc region of a human immunoglobulin as an active modifier, such as an IgG, e.g., an IgG1 Fc (SEQ ID NO: 10), an IgG2 Fc (SEQ ID NO: 12), an IgG3 Fc ( SEQ ID NO: 14), or IgG4 Fc (SEQ ID NO: 16). In particular Fc is derived from IgG1 or IgG4 antibodies. For example, the linker can include an IgG1 kappa Fc region, such as an IgG1 Fc derived from Trastuzumab that contains the C H 2 and C H 3 domains of Trastuzumab heavy chain (eg, SEQ ID NO: 26 See also residues 234-450 of SEQ ID NO: 27). The Fc subunit of the bispecific molecules provided herein may also be an IgG4 Fc, such as, for example, an IgG4 Fc derived from nivolumab ( Opdivo® ) that contains the C H 2 and C H 3 domains of the nivolumab heavy chain. (See eg residues 224-440 of SEQ ID NO: 29; see also SEQ ID NO: 30).
Fc 영역은 예를 들어, 항체 의존적 세포 세포독성 (ADCC; 항체 의존적 세포 매개 세포독성으로도 알려져 있음), 항체 의존적 세포 매개 식균작용 (ADCP), 및 보체 의존적 세포독성 (CDC) 중 임의의 하나 이상을 포함하는 면역 이펙터 기능을 제거, 감소 또는 강화시키기 위해 하기 논의되는 바와 같이 돌연변이되거나 변형될 수 있다. 본 명세서의 일부 구현예에서, 예를 들어, 작제물이 염증성 및 자가면역 질환 및 병태를 치료하기 위해 사용되는 이중특이적 분자인 경우, 면역 이펙터 기능이 제거되거나 감소된다. 치료제가 종양 또는 암의 치료에 사용되는 경우, 항종양 면역 반응 및 치료 효능을 개선하기 위해 면역 이펙터 기능이 강화될 수 있다. 추가로 또는 대안적으로, Fc 영역은 FcRn 재순환을 강화하도록 변형되어 본 명세서에 제공된 분자의 생체내 혈청 안정성 및 반감기를 증가시킨다.An Fc region can, for example, inhibit any one or more of antibody-dependent cellular cytotoxicity (ADCC; also known as antibody-dependent cell-mediated cytotoxicity), antibody-dependent cell-mediated phagocytosis (ADCP), and complement dependent cytotoxicity (CDC). It can be mutated or modified as discussed below to eliminate, reduce or enhance immune effector function, including. In some embodiments herein, immune effector function is eliminated or reduced, for example when the construct is a bispecific molecule used to treat inflammatory and autoimmune diseases and conditions. When a therapeutic agent is used in the treatment of a tumor or cancer, the immune effector function can be enhanced to improve the anti-tumor immune response and therapeutic efficacy. Additionally or alternatively, the Fc region can be modified to enhance FcRn recycling to increase serum stability and half-life in vivo of the molecules provided herein.
여기서 목적을 위해, Fc 영역 또는 도메인은 특히 ADCC를 감소시키거나 제거하기 위해 변형된다. 항체 단편(예를 들어, Fab, scFv, dAb)과 같은 소분자 치료제가 유리하다. 그들은 높은 수율로 생산될 수 있고 다른 유리한 특성을 가지고 있다. 이들은 단클론성 항체(mAb)에 비해 강화된 조직 침투 및 표적 접근성을 나타내며, 예를 들어 수용체 클러스터링, 면역 이펙터 기능의 활성화, 불량한 조직 침투 및 혈관이 잘 형성되지 않은 부위의 표적에 대한 접근 부족과 같은 mAbs의 바람직하지 않은 영향을 예방할 수 있다. 그러나 작은 항체 단편은 약동학적 특성이 좋지 않는다. 예를 들어, 크기가 작기 때문에, 크기가 50-60 kDa 이하인 분자는 신장 여과를 받기 때문에 dAb 및 다른 항체 단편은 신장에서 빠르게 제거된다. 몇 시간 미만일 수 있는 작은 항체 단편의 빠른 청소능 및 짧은 제거 반감기는 생체 내 효능을 감소시키고 빈번한 투여 및/또는 지속적인 주입을 필요로 할 수 있다. For purposes herein, the Fc region or domain is specifically modified to reduce or eliminate ADCC. Small molecule therapeutics such as antibody fragments (eg Fab, scFv, dAb) are advantageous. They can be produced in high yield and have other advantageous properties. They exhibit enhanced tissue penetration and target accessibility compared to monoclonal antibodies (mAbs), such as receptor clustering, activation of immune effector functions, poor tissue penetration, and lack of access to targets in poorly vascularized areas. Undesirable effects of mAbs can be prevented. However, small antibody fragments have poor pharmacokinetic properties. For example, because of their small size, dAbs and other antibody fragments are rapidly cleared by the kidneys as molecules less than 50-60 kDa in size undergo renal filtration. The rapid clearance and short elimination half-life of small antibody fragments, which may be less than a few hours, may reduce efficacy in vivo and require frequent dosing and/or continuous infusion.
dAb와 같은 작은 항체 단편의 유지 및 생체내 반감기를 증가시키기 위해 여러 가지 방법을 사용할 수 있다. 예를 들어, 본 명세서에 제공되는 바와 같이, TNFR1 길항제, TNFR2 효능제 및 조합/다중특이적 작제물 내의 dAb(들)는 반감기 연장제이거나 이를 포함하는 링커, 예를 들어, IgG, 예컨대 IgG1 또는 IgG4의 Fc 영역에 융합된다. Fc는 단량체 또는 이량체일 수 있다. dAb와 같은 작은 항체 단편을 IgG 분자의 Fc 영역에 융합하면 분자의 크기가 증가하여 신체에서 제거/배설되는 것을 방지하고 내피 세포에서 발현되는 신생아 Fc 수용체(FcRn)에 대한 결합을 매개하여 리소좀 분해로부터 항체를 보호하고 생체 내 반감기를 연장한다. 그러나 Fc의 추가는 보체 활성화, 염증유발 사이토카인의 방출 및 세포독성을 초래할 수 있는 면역 이펙터 기능의 유도와 같은 원치 않는 특성을 도입할 수 있다. TNFR1은 거의 보편적으로 발현되고 TNFR2는 많은 조직에서 발현되기 때문에, 일반적으로 ADCC-강화 항체를 사용하는 것이 바람직하지 않고 효능을 위해 항체의 길항제 활성에 의존한다.Several methods can be used to increase the retention and in vivo half-life of small antibody fragments, such as dAbs. For example, as provided herein, the dAb(s) in a TNFR1 antagonist, TNFR2 agonist, and combination/multispecific construct are half-life extenders or linkers comprising them, e.g., IgG, such as IgG1 or It is fused to the Fc region of IgG4. Fc can be monomeric or dimeric. Fusing a small antibody fragment, such as a dAb, to the Fc region of an IgG molecule increases the size of the molecule, preventing clearance/excretion from the body and mediating binding to the neonatal Fc receptor (FcRn) expressed on endothelial cells to protect it from lysosomal degradation. Protects antibodies and prolongs half-life in vivo. However, the addition of Fc may introduce undesirable properties such as complement activation, release of pro-inflammatory cytokines and induction of immune effector functions that can lead to cytotoxicity. Because TNFR1 is almost universally expressed and TNFR2 is expressed in many tissues, it is generally undesirable to use ADCC-enhancing antibodies and rely on the antagonist activity of the antibody for efficacy.
본 명세서에 기재된 바와 같이, TNFR1 길항제, TNFR2 효능제 및 다중특이적, 예컨대 이중특이적 작제물에서 Fc 영역은 약동학 및 약력학(즉, 약리학적) 특성을 개선하고 바람직하지 않은 특성을 제거하기 위해 변형된다. 예를 들어, Fc 영역은 생체 내 반감기를 증가시키기 위해 신생아 FcR 재순환을 이용/강화하도록 변형되고/되거나 Fc 관련 면역 이펙터 기능, 예컨대 항체 의존적 세포 세포독성 (ADCC; 항체 의존적 세포 매개 세포독성으로도 알려져 있음), 항체 의존적 세포 매개 식균작용 (ADCP), 및 보체 의존적 세포독성 (CDC)를 제거하도록 돌연변이된다. 추가로, 작제물이 TNFR1 길항제 및 TNFR2 효능제를 함유하고 Fc 이량체를 함유하는 구현예와 같이 다중특이적, 예컨대 이중특이적인 구현예에서, 이량체는 놉-인-홀을 도입하도록 돌연변이되어 동종이량체화를 방지한다. Fc 부분(또는 영역)에 대한 수많은 변형이 당업자에게 공지되어 있다 (예를 들어, 문헌[Li 등, (2014) Expert Opin Ther Targets 18:335-350] 참조). As described herein, the Fc region in TNFR1 antagonists, TNFR2 agonists and multispecific, such as bispecific, constructs can be modified to improve pharmacokinetic and pharmacodynamic (i.e., pharmacological) properties and to eliminate undesirable properties. do. For example, the Fc region is modified to utilize/enhance neonatal FcR recycling to increase half-life in vivo and/or Fc-related immune effector functions such as antibody-dependent cellular cytotoxicity (ADCC; also known as antibody-dependent cell-mediated cytotoxicity). ), antibody-dependent cell-mediated phagocytosis (ADCP), and complement-dependent cytotoxicity (CDC). Additionally, in embodiments where the construct contains a TNFR1 antagonist and a TNFR2 agonist and is multispecific, such as bispecific, such as embodiments containing an Fc dimer, the dimer is mutated to introduce a knob-in-hole Prevent homodimerization. Numerous modifications to the Fc portion (or region) are known to those skilled in the art (see, eg, Li et al., (2014) Expert Opin Ther Targets 18 :335-350).
i. Fc 부분에 대한 변형 i. Variations on the Fc part
a) 놉-인-홀a) knob-in-hole
이중특이적 항체(bsAb)는 2개의 별개의 항원 결합 부위를 포함하여 종래의 치료용 단클론성 항체(mAb)에 대한 대안적인 치료적 접근을 허용하여 수용체 공동 클러스터링과 같은 mAb와 연관된 제한을 피할 수 있다. 작은 항체 단편은 높은 수율로 생산하기 쉽고 저렴하며 조직에 쉽게 침투할 수 있지만 안정성, 용해도 및 약동학적 특성이 좋지 않은 것과 같은 제한 사항과 연관이 있다. 예를 들어, 크기가 작기 때문에 혈청 반감기가 짧아지고 조직 유지가 감소하며 혈액에서 신장을 통해 신속하게 제거된다. 결과적으로 동일한 제한이 없는 IgG 유사 이중특이적 (bs) Ab가 유리하다. 예를 들어 bsAb는 Fc 영역을 포함하여 혈청 반감기를 증가시키고 또한 필요한 경우 이펙터 기능을 허용할 수 있다. 그러나 높은 수율의 정제된 bsAb 생산은 중쇄의 동종이량체화를 방지해야 하기 때문에 어려울 수 있다. "놉-인-홀"(KiH; "놉-인-홀"로도 알려져 있음) 접근법은 이 문제에 대한 해결책을 제공한다. 항체(IgG) 중쇄의 CH3 도메인은 이종이량체화를 위해 조작되어 자가 결합하지 않는 Fc 함유 이중 기능성 치료 분자를 구축할 수 있다.Bispecific antibodies (bsAbs) can contain two distinct antigen binding sites, allowing an alternative therapeutic approach to conventional therapeutic monoclonal antibodies (mAbs), avoiding the limitations associated with mAbs such as receptor co-clustering. there is. Small antibody fragments are easy to produce in high yield, inexpensive, and readily penetrate tissues, but are associated with limitations such as poor stability, solubility and pharmacokinetic properties. For example, because of their small size, they have a short serum half-life, reduced tissue retention, and are rapidly eliminated from the blood by the kidneys. Consequently, IgG-like bispecific (bs) Abs without the same limitations are advantageous. For example, a bsAb may include an Fc region to increase serum half-life and also allow effector function if desired. However, production of purified bsAb in high yield can be difficult because homodimerization of the heavy chain must be avoided. The “knob-in-hole” (KiH; also known as “knob-in-hole”) approach provides a solution to this problem. The C H 3 domains of antibody (IgG) heavy chains can be engineered for heterodimerization to construct Fc-containing bifunctional therapeutic molecules that do not self-associate.
놉-인-홀 접근법은 상보적인 방식으로 2개의 모 중쇄의 CH3 도메인에서 비대칭적으로 돌연변이하는 계면 잔기를 수반한다. "놉(knob)"은 CH3 도메인 사이의 계면에서 작은 측쇄를 갖는 아미노산을 티로신 또는 트립토판과 같은 더 큰 측쇄를 갖는 아미노산으로 대체함으로써 생성되며, "홀(hole)"은 아미노산을 큰 측쇄로 대체하고 아미노산을 알라닌이나 트레오닌과 같은 더 작은 아미노산으로 대체하여 생성된다. 놉 및 홀 변이체는 파트너 CH3 도메인의 상응하게 설계된 홀에 놉이 삽입됨으로써 이종이량체화된다. 입체적 반발로 인해 놉-놉 결합이 방지되고 홀-홀 동종이량체가 불안정해진다. 예를 들어, 놉 돌연변이는 S354C, T366Y, T366W 또는 T394W일 수 있고 홀 돌연변이는 Y349C, T366S, L368A, F405A, Y407T, Y407A 또는 Y407V(모두 EU 넘버링에 의함)일 수 있다. 잔기 T366과 같이 이량체 계면의 중심을 향해 생성된 놉은 이량체 계면의 가장자리 근처에 위치한 놉보다 동종이량체 형성에 더 파괴적인 것으로 나타났다. 제1 CH3 도메인 상의 잔기 T366은 제2 또는 파트너 CH3 도메인 상의 잔기 Y407의 수소 결합 거리 내에 있으므로, T366Y 및 Y407T는 일반적인 놉-인-홀(knob-in-hole) 쌍을 나타내고; 이 쌍은 90% 초과의 수율로 이종이량체를 생성하는 것으로 밝혀졌다 (예를 들어, 문헌[Ridgway 등 (1996) Protein Eng. 9(7):617-621] 참조). The knob-in-hole approach involves interfacial residues asymmetrically mutating in the C H 3 domains of the two parental heavy chains in a complementary manner. A "knob" is created by replacing an amino acid with a small side chain at the interface between the CH3 domains with an amino acid with a larger side chain such as tyrosine or tryptophan, and a "hole" is created by replacing an amino acid with a large side chain. It is produced by replacing an amino acid with a smaller amino acid such as alanine or threonine. Knob and hole variants are heterodimerized by insertion of the knob into a correspondingly designed hole in the partner C H 3 domain. The steric repulsion prevents knob-knob association and destabilizes the hole-hole homodimer. For example, a knob mutation can be S354C, T366Y, T366W or T394W and a hole mutation can be Y349C, T366S, L368A, F405A, Y407T, Y407A or Y407V (all by EU numbering). Knobs generated towards the center of the dimer interface, such as residue T366, appeared to be more disruptive to homodimer formation than knobs located near the edge of the dimer interface. Residue T366 on the first C H 3 domain is within hydrogen bonding distance of residue Y407 on the second or partner C H 3 domain, so T366Y and Y407T represent a common knob-in-hole pair; This pair has been found to produce heterodimers in greater than 90% yield (see, e.g., Ridgway et al. (1996) Protein Eng. 9(7):617-621]).
예를 들어, 본 명세서에 제공된 이중특이적 TNFR1 길항제/TNFR2 효능제 작제물에서 IgG Fc 영역은 고 수율로 이종이량체화된 분자를 생성하기 위해 놉-인-홀 접근법을 사용하여 변형될 수 있다. 하기 표 6은 서열번호: 9에 제시된 IgG 중쇄 불변 도메인의 서열과 관련하여 카밧 넘버링 및 순차적 넘버링에 의한 상응하는 놉 및 홀 돌연변이를 보여준다. 놉-인-홀(knob-in-hole)을 도입하는 당업자에게 공지된 임의의 돌연변이가 본 명세서의 작제물에 사용될 수 있다. For example, the IgG Fc region in the bispecific TNFR1 antagonist/TNFR2 agonist construct provided herein can be modified using a knob-in-hole approach to generate heterodimerized molecules in high yield. . Table 6 below shows the corresponding knob and hole mutations by Kabat numbering and sequential numbering with respect to the sequence of the IgG heavy chain constant domain set forth in SEQ ID NO:9. Any mutation known to one skilled in the art that introduces a knob-in-hole can be used in the constructs herein.
리간드 트랩 작제물Ligand Trap Construct
전술한 바와 같이 "놉-인-홀"을 갖도록 변형된 Fc는 또한 이종이량체를 생성하기 위해 다른 이중특이적 분자와 함께 사용될 수 있다. 예를 들어, 문헌[미국 특허 공개 번호 2010/0055093 및 Jin 등 (2009) Mol . Med . 15:11-20]은 RB200으로 지정된 하나와 RB242로 지정된 다른 하나를 포함하여 EGF 수용체 패밀리 리간드를 표적으로 하는 이중특이적 "리간드" 트랩 작제물을 기재하고 있다. 이러한 작제물의 문제점은 이들이 이종이고, 동종이량체 및 이종이량체를 함유하고 있으며, 후자는 의도된 치료제라는 점이다. RB200 및 RB242는 Fc 부분을 상보적인 놉 및 홀을 갖는 변형된 Fc 영역으로 대체함으로써 변형될 수 있는 리간드 트랩의 예시이며, 따라서 생성된 이량체는 모두 이종이량체이다. RB242는 HER1 (EGFR), HER2, 및 HER3 리간드, 및 일부 HER4 리간드를 표적으로 한다. HER4는 EGFR 패밀리의 다른 구성원이 공유하지 않는 신경 발달에서 역할을 하기 때문에 HER4 특정 리간드를 포획하지 않도록 설계되었다. RB242는 인간 면역글로불린 G1 (IgG1)의 Fc 도메인 (HER1-HER3/Fc)과 융합된 HER1/ErbB1(서열번호: 41의 아미노산 1-621) 및 HER3/ErbB3(서열번호: 45의 아미노산 1-621)의 세포외 도메인(ECD)으로 구성되고, 키메라 이중특이적 리간드 트랩으로 작용한다. RB242의 HER3/Fc 성분은 COOH 말단에 6Υ히스티딘 태그를 포함한다 (예를 들어, 문헌[Jin 등 (2009) Mol . Med . 15:11-20] 참조). RB200은 HER1/ErbB1 리간드 (EGF, TGF-α, HB-EGF, AR, BTC, EPR 및 EPG) 및 HER3/ErbB3 리간드 (NRG1-α 및 NRG1-β3)에 고친화도로 결합한다. RB242는 HER 패밀리 단백질(HER1, HER2 및 HER3)의 EGF 자극 및 NRG1-1 자극 티로신 인산화를 억제하고 다양한 세포 증식 검정에서 효능을 보여주었다. RB200은 생체 내 동물 모델에서 종양 성장을 억제한다. Fc modified to have a “knob-in-hole” as described above can also be used with other bispecific molecules to create heterodimers. See, eg, US Patent Publication No. 2010/0055093 and Jin et al. (2009) Mol . Med . 15 :11-20] describe bispecific “ligand” trap constructs that target EGF receptor family ligands, including one designated RB200 and the other designated RB242. A problem with these constructs is that they are heterogeneous and contain homodimers and heterodimers, the latter being the intended therapeutic. RB200 and RB242 are examples of ligand traps that can be modified by replacing the Fc region with a modified Fc region with complementary knobs and holes, so the resulting dimers are all heterodimers. RB242 targets HER1 (EGFR), HER2, and HER3 ligands, and some HER4 ligands. HER4 was designed not to capture HER4-specific ligands because it plays a role in neurodevelopment not shared by other members of the EGFR family. RB242 is HER1/ErbB1 (amino acids 1-621 of SEQ ID NO: 41) and HER3/ErbB3 (amino acids 1-621 of SEQ ID NO: 45) fused to the Fc domain of human immunoglobulin G1 (IgG1) (HER1-HER3/Fc). ) and acts as a chimeric bispecific ligand trap. The HER3/Fc component of RB242 contains a 6Υ histidine tag at the COOH terminus (see, e.g., Jin et al. (2009) Mol . Med . 15 :11-20]). RB200 binds with high affinity to HER1/ErbB1 ligands (EGF, TGF-α, HB-EGF, AR, BTC, EPR and EPG) and HER3/ErbB3 ligands (NRG1-α and NRG1-β3). RB242 inhibited EGF-stimulated and NRG1-1-stimulated tyrosine phosphorylation of HER family proteins (HER1, HER2 and HER3) and showed efficacy in various cell proliferation assays. RB200 inhibits tumor growth in an in vivo animal model.
표피 성장 인자(EGF) 리간드/수용체 패밀리은 류마티스성 관절염(RA)을 비롯한 다양한 질환, 장애 및 병태에서 역할을 한다. 세포 표면 수용체의 EGF 패밀리(ErbB 및 인간 표피 성장 인자 수용체(HER))은 수용체 티로신 키나제(RTK) 슈퍼패밀리에 속하며 세포외 도메인(ECD) 및 세포내 티로신 키나제 신호전달 도메인을 함유한다. EGF 패밀리는 구성원을 포함한다: EGF, 형질전환 성장 인자 α (TGF-α), 헤파린 결합 EGF 유사 성장 인자 (HB-EGF), 암피레굴린 (AR), β-셀룰린 (BTC), 에피레굴린 (EPR), 에피겐 (EPG) 및 뉴레굴린 (NRG)를 포함하는 대규모 리간드 패밀리에 의해 활성화되는, EGF 수용체 (EGFR)/HER1/ErbB1, HER2/ErbB2, HER3/ErbB3, 및 HER4/ErbB4. EGFR 내에는 4개의 ECD가 있고; 도메인 I 및 III은 리간드 결합 도메인이고, 도메인 II 및 IV는 서로 및 이 수용체 패밀리의 다른 구성원에 대한 결합을 매개한다. 리간드 결합은 수용체 사이에 동종이량체 또는 이종이량체의 형성을 유도한다. 예를 들어, TGF-α 및 EGF는 EGFR/HER1/ErbB1에 결합하는 반면 NRG4는 HER4/ErbB4에 결합한다. 형성된 이량체에 따라, 세포 내 영역의 인산화 전이가 일어나 수많은 하류 신호전달 경로의 활성화를 유도하여 세포 증식, 생존 및 분화를 초래한다 (예를 들어, 문헌[Jin 등 (2009) Mol. Med. 15:11-20] 참조). The epidermal growth factor (EGF) ligand/receptor family plays a role in a variety of diseases, disorders and conditions including rheumatoid arthritis (RA). The EGF family of cell surface receptors (ErbB and human epidermal growth factor receptor (HER)) belong to the receptor tyrosine kinase (RTK) superfamily and contain an extracellular domain (ECD) and an intracellular tyrosine kinase signaling domain. The EGF family includes members: EGF, transforming growth factor α (TGF-α), heparin-binding EGF-like growth factor (HB-EGF), amphiregulin (AR), β-cellulin (BTC), epiure. EGF receptor (EGFR)/HER1/ErbB1, HER2/ErbB2, HER3/ErbB3, and HER4/ErbB4, activated by a large family of ligands, including gulin (EPR), epigen (EPG) and neuregulin (NRG). There are 4 ECDs within EGFR; Domains I and III are the ligand binding domains, and domains II and IV mediate binding to each other and to other members of this receptor family. Ligand binding leads to the formation of homodimers or heterodimers between receptors. For example, TGF-α and EGF bind EGFR/HER1/ErbB1 whereas NRG4 binds HER4/ErbB4. Depending on the dimer formed, phosphorylation translocation of intracellular regions occurs leading to activation of numerous downstream signaling pathways resulting in cell proliferation, survival and differentiation (see, e.g., Jin et al. (2009) Mol. Med. 15 :11-20]).
표피 성장 인자 수용체 패밀리는 밀접하게 관련된 4개의 수용체 티로신 키나제로 구성된다: EGFR(ErbB-1), HER2(Erb-B2), HER3(ErbB-3) 및 HER 4(ErbB-4). 많은 암 유형에서, 패밀리 구성원 중 하나의 돌연변이 또는 증폭은 암 환자의 생존 악화와 연관이 있다. 자가면역 질환에서 TNF 신호전달은 대식세포에서 에피레귤린과 헤파린 결합 EGF(HB-EGF)의 합성을 유도하여 EGFR 신호전달 경로를 전사 활성화하고, 두 성장 인자는 EGFR을 활성화시킨다. The epidermal growth factor receptor family consists of four closely related receptor tyrosine kinases: EGFR (ErbB-1), HER2 (Erb-B2), HER3 (ErbB-3) and HER 4 (ErbB-4). In many cancer types, mutations or amplifications in one of the family members are associated with poor survival of cancer patients. In autoimmune diseases, TNF signaling induces the synthesis of epiregulin and heparin-binding EGF (HB-EGF) in macrophages to transcriptionally activate the EGFR signaling pathway, and both growth factors activate EGFR.
상보적인 방식으로, EGFR과 HER2는 활막 섬유아세포에서 상향 조절되어 증식을 유도한다. EGFR, HER2(ErbB2) 및 EGF 유사 성장 인자는 예를 들어 RA 활막 섬유아세포 및 대식세포에서 과발현된다. 따라서 TNF와 EGFR 경로는 루푸스, 류마티스성 관절염 및 다른 자가면역 질환의 진행에 협력한다. 본 명세서에 제공되는 작제물 중에는 "리간드 트랩"으로 지정된 작제물이 있다. 리간드 트랩 작제물은 EGFR 패밀리의 대부분의 염증성 성장 인자를 차단하여 영향을 받은 RA 관절에서 빠르게 성장하는 활막 섬유아세포의 성장을 억제한다. 이들 리간드 트랩은 본 명세서에 제공된 TNFR1- 및/또는 TNFR2-표적화 작제물인 TNF 차단제 작제물과 병용 요법 프로토콜로 투여하기 위한 것이다. 류마티스성 관절염과 같은 이 병용 요법은 상승적으로 조합하여 질환 퇴행을 달성할 수 있다. In a complementary manner, EGFR and HER2 are upregulated in synovial fibroblasts, leading to proliferation. EGFR, HER2 (ErbB2) and EGF-like growth factors are overexpressed, for example, in RA synovial fibroblasts and macrophages. Thus, the TNF and EGFR pathways cooperate in the progression of lupus, rheumatoid arthritis and other autoimmune diseases. Among the constructs provided herein are those designated as “ligand traps”. Ligand trap constructs inhibit the growth of rapidly growing synovial fibroblasts in affected RA joints by blocking most inflammatory growth factors of the EGFR family. These ligand traps are intended for administration in combination therapy protocols with TNF blocker constructs, which are TNFR1- and/or TNFR2-targeting constructs provided herein. This combination therapy, such as rheumatoid arthritis, can be combined synergistically to achieve disease regression.
성장 인자의 EGFR 패밀리는 RA와 같은 과증식성/염증성 질환에서 과발현되며, 난소암 및 다른 암에서도 과발현된다. EGFR 패밀리 및/또는 동족의 상승된 수준은 여러 유형의 암의 일반적인 성분이다. 과발현(또는 때때로 돌연변이)될 때, 이러한 수용체는 많은 종류의 악성 종양에서 더 짧은 생존 기간과 인과적으로 연관된다. EGFR 패밀리를 통해 작용하는 표적 치료제의 예는 세툭시맙(Erbitux®), 파니투무맙(Vectibix®), 트라스투주맙(Herceptin®) 및 페르투주맙(Perjeta®)이다 (일반명 및 예시적인 상표 제공 소스와 함께 나열됨). 소분자 억제제는 또한 EGFR 패밀리의 세포내 티로신 키나제 활성을 표적으로 한다. 소분자의 예로는 라파티닙(Tykerb®), 에를로티닙(Iressa®) 및 네라티닙(Nerlynx®)이 있다. 이 약물은 EGFR 패밀리 구성원 중 하나만을 표적으로 하므로 패밀리의 다른 구성원이 종양 성장을 상향 조절하고 보상할 수 있다. 마찬가지로 항체 대 단일 성장 인자(예를 들어, TGF-α, EGF, HB-EGF 등)는 해당 성장 인자만 억제하고 종양 세포는 다른 성장 인자를 상향 조절함으로써 보상한다. 본 명세서에 제공된 리간드 트랩 작제물은 HER1, HER2 및 HER3을 함께 차단하여 이를 해결한다. 이는 암세포에 대한 EGFR 패밀리의 범 억제를 초래한다. 난소암은 치료가 필요한 암 중 하나이다. The EGFR family of growth factors is overexpressed in hyperproliferative/inflammatory diseases such as RA, and is also overexpressed in ovarian cancer and other cancers. Elevated levels of the EGFR family and/or cognate are common components of many types of cancer. When overexpressed (or sometimes mutated), these receptors are causally associated with shorter survival in many types of malignancies. Examples of targeted therapeutics that act through the EGFR family are cetuximab (Erbitux ® ), panitumumab (Vectibix ® ), trastuzumab (Herceptin ® ) and pertuzumab (Perjeta ® ) (generic and exemplary trademarks listed with the serving source). Small molecule inhibitors also target intracellular tyrosine kinase activity of the EGFR family. Examples of small molecules are lapatinib (Tykerb ® ), erlotinib (Iressa ® ) and neratinib (Nerlynx ® ). Because the drug targets only one member of the EGFR family, other members of the family can upregulate and compensate for tumor growth. Likewise, an antibody versus a single growth factor (eg, TGF-α, EGF, HB-EGF, etc.) inhibits only that growth factor, and tumor cells compensate by upregulating other growth factors. The ligand trap constructs provided herein address this by blocking HER1, HER2 and HER3 together. This results in global inhibition of the EGFR family on cancer cells. Ovarian cancer is one of the cancers that require treatment.
본 명세서에 제공되는 리간드 트랩 작제물은 TNFR1/TNFR2 작제물에 대해 본 명세서에서 하기 기재된 바와 같이 변형된 Fc 영역을 사용하여 이종이량체 생산 및 FcRn 재순환을 최적화함으로써 개선된다. 리간드 트랩 작제물은 TNFR1 길항제 작제물, 및/또는 TNFR2 효능제 작제물, 및/또는 다중특이적 TNFR1 길항제/이중특이적 작제물, 및/또는 TNF가 본 명세서에 기재되고/되거나 당업자에게 공지된 역할을 하는 질환, 장애 및 병태의 치료를 위해 본 명세서에 제공된 임의의 다른 구축과 병용 요법 프로토콜로 투여된다. The ligand trap constructs provided herein are improved by optimizing heterodimer production and FcRn recycling using modified Fc regions as described herein below for TNFR1/TNFR2 constructs. A ligand trap construct may be a TNFR1 antagonist construct, and/or a TNFR2 agonist construct, and/or a multispecific TNFR1 antagonist/bispecific construct, and/or a TNF described herein and/or known to those skilled in the art. It is administered in combination therapy protocols with any of the other constructs provided herein for the treatment of diseases, disorders and conditions for which they play a role.
b) 신생아 Fc 수용체(FcRn) 재순환을 향상시키는 변형b) Modifications that Enhance Neonatal Fc Receptor (FcRn) Recycling
작은 폴리펩티드 또는 단백질 치료제의 짧은 혈청 반감기를 증가시키기 위한 수많은 접근법이 있다. 작은 단백질 치료제의 혈청 반감기를 증가시키는 PEG화는 단점이 있다. PEG화는 단백질 치료제의 효능 또는 활성을 감소시킬 수 있고, 이종성을 초래할 수 있으며, 단백질의 면역반응성을 초래할 수 있다. 다른 접근법은 분자량을 증가시키고 신장 청소능을 감소시켜 단백질 순환을 개선할 수 있는 알부민과의 융합을 수반한다. There are numerous approaches to increasing the short serum half-life of small polypeptide or protein therapeutics. PEGylation, which increases the serum half-life of small protein therapeutics, has its drawbacks. PEGylation can reduce the efficacy or activity of a protein therapeutic, can lead to heterogeneity, and can lead to immunoreactivity of the protein. Another approach involves fusing with albumin, which can improve protein circulation by increasing molecular weight and reducing kidney clearance.
혈청 반감기는 또한 IgG의 Fc 부분과의 융합에 의해 증가될 수 있다. 약 2-3주의 긴 순환 반감기와 IgG의 느린 청소능은 산성 pH에서 높은 친화력으로 IgG에 결합하고 중성 이상의 pH에서 방출하는 적어도 부분적으로 신생아 Fc 수용체(FcRn)와의 상호작용으로 인해 발생한다. FcRn은 2:1 FcRn:IgG 배열(2가 상호작용)으로 산성(~pH 6) 엔도좀에 있는 피노사이토화된 IgG의 Fc 부분(CH2-CH3 도메인 내)에 결합하고, 리소좀 분해 경로로부터 이들을 수송하고 Fc-FcRn 복합체가 해리되는 세포외 생리학적 pH(~7.4)에 노출된 후 다시 순환계로 재순환한다. 산성 pH에서 FcRn에 대한 불량한 결합은 항체가 분해되는 리소좀으로 이동하는 결과를 초래한다. FcRn과 같은 재순환 수용체는 또한 IgG가 상피를 가로질러((통과세포외배출)) 혈류로 이동하는 경로를 제공한다. FcRn과의 상호작용을 활용하면 장과 폐와 같은 상피 장벽을 가로질러 단백질 수송을 개선할 수 있어 비침습적 투여가 가능하다. Fc CH2 및 CH3 도메인 내의 잔기는 FcRn 결합에 관여하며, mAb의 돌연변이는 생체 내 혈청 반감기에 영향을 미치는 것으로 나타났다. 작은 단백질 치료제의 순환 및 전달은 이들을 IgG의 Fc 도메인에 융합함으로써 개선될 수 있으며, 생성된 융합 단백질은 FcRn에 결합하고 IgG 혈청 안정화 경로를 이용한다. Fc 도메인과의 융합은 또한 치료제의 분자량을 증가시켜 신장 청소능을 감소시키지만 잠재적으로 감소된 조직 침투 및 융합 단백질의 특이적 활성으로 인해 바람직하지 않을 수 있다. 대안적으로, 짧은 FcRn 결합 펩티드(FcRnBPs)가 FcRn과 작은 단백질의 상호작용을 허용하여 중합체량 Fc 도메인에 융합할 필요가 없다는 연구 결과가 있다. 예를 들어 FcRnBP와의 융합은 분자량을 약 50-70 kDa 증가시키는 Fc 또는 알부민과의 융합에 비해 분자량을 약 3 kDa 증가시킨다 (예를 들어, 문헌[Datta-Mannan 등 (2019) Biotechnol . J. 14:1800007; Sockolosky 등 (2012) Proc . Natl . Acad . Sci . USA 109(40):16095-16100] 참조). Serum half-life can also be increased by fusion with the Fc portion of an IgG. The long circulating half-life of about 2-3 weeks and the slow clearance of IgG are due at least in part to its interaction with the neonatal Fc receptor (FcRn), which binds IgG with high affinity at acidic pH and releases it at above-neutral pH. FcRn binds in a 2:1 FcRn:IgG configuration (bivalent interaction) to the Fc portion of pinocytosylated IgG (within the CH 2- CH 3 domain) in acidic (~pH 6) endosomes and lysosomes. They transport them from the degradation pathway and are recycled back into the circulation after exposure to the extracellular physiological pH (~7.4) at which the Fc-FcRn complex dissociates. Poor binding to FcRn at acidic pH results in migration of the antibody to lysosomes where it is degraded. Recycling receptors, such as FcRn, also provide a route for IgG to move across the epithelium (transexocytosis) into the bloodstream. Utilizing interactions with FcRn can improve protein transport across epithelial barriers such as the gut and lung, allowing for non-invasive administration. Residues within the Fc CH 2 and CH 3 domains are involved in FcRn binding, and mutations in mAbs have been shown to affect serum half-lives in vivo. Circulation and delivery of small protein therapeutics can be improved by fusing them to the Fc domain of an IgG, and the resulting fusion protein binds FcRn and utilizes the IgG serum stabilization pathway. Fusion with the Fc domain also increases the molecular weight of the therapeutic and reduces renal clearance, but may be undesirable due to potentially reduced tissue penetration and specific activity of the fusion protein. Alternatively, studies have shown that short FcRn binding peptides (FcRnBPs) allow interaction of FcRn with small proteins so that they do not need to be fused to high molecular weight Fc domains. For example, fusion with FcRnBP increases the molecular weight by about 3 kDa compared to fusion with Fc or albumin, which increases the molecular weight by about 50-70 kDa (see, for example, Datta-Mannan et al. (2019) Biotechnol . J. 14:1800007; Sockolosky et al. (2012) Proc . Natl . Acad . Sci . USA 109(40):16095-16100).
예를 들어, 짧은(16개 잔기) 선형 및 환형 FcRnBP(예를 들어 서열번호: 48-51)는 Fab 중쇄 및 경쇄(FcRnBP-Fab 작제물)의 C-말단, N-말단 또는 둘 다에 Fab당 1-4개의 FcRnBP로 융합되었다. 사이노몰구스 원숭이의 약동학 연구는 Fab에 융합된 펩티드의 수가 증가함에 따라 FcRnBP-Fab 작제물의 FcRn 결합이 증가함을 보여주었다. 이는 Fab의 중쇄 및 경쇄의 N- 및 C-말단에 융합된 4개의 선형 FcRnBP를 함유하는 작제물이 모 Fab에 비해 사이노몰구스 원숭이에서 약동학에서 가장 큰 개선을 나타내는 증가된 결합능으로부터 기인한다. 예를 들어, 반감기는 모 Fab의 경우 3.7시간에서 다양한 FcRnBP-Fab 작제물의 경우 15-60시간으로 개선되었다 (예를 들어, 문헌[Datta-Mannan 등 (2019) Biotechnol . J. 14:1800007]). 이러한 결과는 혈청 반감기의 개선을 나타내지만, 여전히 약 2-3주인 IgG의 반감기보다 훨씬 낮다. FcRnBP의 사용은 또한 치료제의 분자량을 크게 증가시키지 않기 때문에 신장 청소능을 감소시키지 않는다. For example, short (16 residues) linear and cyclic FcRnBPs (e.g. SEQ ID NOs: 48-51) are placed at the C-terminus, N-terminus or both of the Fab heavy and light chains (FcRnBP-Fab constructs), or both Fabs. fused to 1-4 FcRnBPs per. Pharmacokinetic studies in cynomolgus monkeys showed that the FcRn binding of the FcRnBP-Fab constructs increased as the number of peptides fused to the Fab increased. This is due to the increased avidity that constructs containing four linear FcRnBPs fused to the N- and C-terminus of the heavy and light chains of the Fab show the greatest improvement in pharmacokinetics in cynomolgus monkeys compared to the parental Fab. For example, the half-life improved from 3.7 hours for the parental Fab to 15-60 hours for the various FcRnBP-Fab constructs (see, e.g., Datta-Mannan et al. (2019) Biotechnol . J. 14:1800007]). These results indicate an improvement in serum half-life, but still much lower than that of IgG, which is about 2-3 weeks. The use of FcRnBP also does not significantly increase the molecular weight of the therapeutic and therefore does not reduce renal clearance.
상기에 논의한 바와 같이, IgG Fc와의 융합은 FcRn 결합을 이용하고 또한 치료제의 분자량을 증가시켜 신장에 의해 체내에서 덜 빠르게 제거되도록 함으로써 작은 단백질 치료제의 반감기를 증가시킨다. 약동학 및 전반적인 약리학을 개선하기 위해, Fc 영역 내의 잔기를 돌연변이시켜 FcRn에 대한 친화도를 일반적으로 30배 초과 증가시켜 생체 내 반감기를 추가로 증가시킬 수 있다. CH2 및 CH3 도메인의 계면에 걸친 Fc 영역은 FcRn과 상호 작용한다. FcRn 결합에서 역할을 하는 것으로 확인된 인간 Fc 잔기는 예를 들어 L251, M252, I253, S254, L309, H310, Q311, L314, E380, N434, H435 및 Y436(EU 넘버링에 의함, 표 1 참조)을 포함한다. M252, S254, T256, H433, N434 및 Y436(EU 넘버링에 의함)을 포함하여 Fc-FcRn 계면에 위치한 잔기의 돌연변이는 인간 FcRn-IgG1 복합체의 안정성을 향상시킨다. 예를 들어, 대체 M252Y/S254T/T256E 및 H433K/N434F/Y436H는 pH 7.4에서 효율적인 방출과 함께 야생형 IgG1에 비해 pH 6.0에서 인간 FcRn에 대한 결합을 각각 11배 및 6.5배 개선한다. 이러한 대체의 조합은 FcRn에 대한 결합 친화도를 57배 증가시킨다. FcRn에 대한 결합의 개선을 나타낸 IgG1 Fc의 추가 돌연변이는 예를 들어 M252W, M252Y, M252Y/T256Q, M252F/T256D, E380A 및 N434F/Y436H를 포함한다 (예를 들어 문헌[Dall'Acqua 등 (2002) J. Immunol. 169:5171-5180] 참조). As discussed above, fusion with an IgG Fc increases the half-life of a small protein therapeutic by taking advantage of FcRn binding and also increasing the molecular weight of the therapeutic so that it is less rapidly cleared from the body by the kidneys. To improve pharmacokinetics and overall pharmacology, residues within the Fc region can be mutated to increase the affinity for FcRn, typically more than 30-fold, further increasing the half-life in vivo. The Fc region spanning the interface of the CH 2 and CH 3 domains interacts with FcRn. Human Fc residues identified that play a role in FcRn binding include, for example, L251, M252, I253, S254, L309, H310, Q311, L314, E380, N434, H435 and Y436 (by EU numbering, see Table 1). include Mutations of residues located at the Fc-FcRn interface, including M252, S254, T256, H433, N434 and Y436 (by EU numbering), enhance the stability of the human FcRn-IgG1 complex. For example, the replacements M252Y/S254T/T256E and H433K/N434F/Y436H improve binding to human FcRn by 11-fold and 6.5-fold, respectively, at pH 6.0 compared to wild-type IgG1 with efficient release at pH 7.4. The combination of these replacements increases the binding affinity for FcRn 57-fold. Additional mutations of IgG1 Fc that have shown improved binding to FcRn include, for example, M252W, M252Y, M252Y/T256Q, M252F/T256D, E380A and N434F/Y436H (see for example Dall'Acqua et al. (2002) J. Immunol. 169:5171-5180]).
삼중 치환 M252Y/S254T/T256E는, 인간화 항호흡기 세포융합 바이러스(RSV) mAb인 MEDI-524의 CH2 도메인에 도입되었을 때, 비변형된 MEDI-524와 비교하여 사이노몰구스 원숭이에서 mAb의 혈청 반감기를 약 4배 증가시켰다. 인간 αv3 인테그린 복합체에 대한 인간화 친화도 최적화 mAb인 MEDI-522의 Fc 부분에 도입되었을 때, 대체 M252Y/S254T/T256E(YTE)는 ADCC 활성과 인간 FcγRIIIA(F158 동종이형)에 대한 결합을 감소시켰다. MEDI-522-YTE의 ADCC 활성은 복원될 수 있으며 비변형 MEDI-522에 비해 ADCC 강화 대체 S239D/A330L/I332E(EU 넘버링에 의함)를 도입하여 증가할 수 있고, 이는 대체 YTE가 인간 IgG1의 ADCC 기능을 조절하는 가역적 메커니즘을 제공함을 나타낸다 (예를 들어, 문헌[Dall'Acqua 등 (2006) J. Biol. Chem . 281(33):23514-23524] 참조).The triple substitutions M252Y/S254T/T256E, when introduced into the CH 2 domain of MEDI-524, a humanized antirespiratory syncytial virus (RSV) mAb, compared to unmodified MEDI-524, significantly improved the serum efficiency of the mAb in cynomolgus monkeys. The half-life was increased about 4-fold. When introduced into the Fc portion of MEDI-522, a humanized affinity-optimized mAb for the human α v 3 integrin complex, the alternative M252Y/S254T/T256E (YTE) reduces ADCC activity and binding to human FcγRIIIA (F158 allotype) made it The ADCC activity of MEDI-522-YTE can be restored and increased by introducing the ADCC-enhanced substitutes S239D/A330L/I332E (by EU numbering) compared to unmodified MEDI-522, which suggests that the substitute YTE can reduce the ADCC of human IgG1. indicate that it provides a reversible mechanism to modulate function (see, e.g., Dall'Acqua et al. (2006) J. Biol. Chem . 281(33):23514-23524).
4개의 모든 인간 IgG 하위 유형 중에서 보존되는 인간 IgG 중쇄의 위치 250, 314 및 428(EU 넘버링에 의함)에 있는 잔기도 Fc-FcRn 계면 근처에 위치한다. 돌연변이 T250Q, M428L 및 T250Q/M428L은, 인간 IgG2 mAb의 Fc에 도입되었을 때 pH 6.0에서 각각 ~3배, 7배 및 28배의 FcRn에 대한 결합을 증가시켰고 결합은 pH 7.5에서 관찰되지 않았다. 붉은 털 원숭이에서 돌연변이체의 약동학을 평가했을 때, 평균 청소능, 즉 단위 시간당 제거된 혈청 항체의 부피는 M428L 돌연변이체에 대해 ~1.8배 더 낮고 T250Q/M428L 돌연변이체에 대해 ~2.8배 더 낮은 것으로 밝혀졌지만, 제거 반감기가 비변형 항체에 비해 M428L 돌연변이의 경우 ~1.8배, T250Q/M428L 돌연변이의 경우 ~1.9배 더 길었다. 이들 잔기는 IgG 하위유형 사이에서 보존되기 때문에, 돌연변이 M428L 및 T250Q/M428L은 인간 IgG1, IgG3 및 IgG4 항체에서 유사한 효과를 가질 것으로 예상된다 (예를 들어, 문헌[Hinton 등 (2004) J. Biol . Chem . 279(8):6213-6216] 참조). 변형 T250R/M428L은 pH 6.0에서 FcRn에 대한 선택적인 결합 및 붉은털원숭이에서 혈청 IgG2 및 IgG1의 분해를 2.8배 감소시키는 것으로 나타났다 (예를 들어, 문헌[Saxena 등 (2016) Front. Immunol. 7:580] 참조). Residues at positions 250, 314 and 428 (by EU numbering) of the human IgG heavy chain, which are conserved among all four human IgG subtypes, are also located near the Fc-FcRn interface. Mutations T250Q, M428L and T250Q/M428L, when introduced to the Fc of human IgG2 mAb, increased binding to FcRn by ~3-fold, 7-fold and 28-fold respectively at pH 6.0 and no binding was observed at pH 7.5. When the pharmacokinetics of the mutants were evaluated in rhesus monkeys, the average clearance, i.e., the volume of serum antibody cleared per unit time, was found to be ~1.8-fold lower for the M428L mutant and ~2.8-fold lower for the T250Q/M428L mutant. However, the elimination half-life was ~1.8-fold longer for the M428L mutant and ~1.9-fold longer for the T250Q/M428L mutant compared to the unmodified antibody. As these residues are conserved between IgG subtypes, the mutations M428L and T250Q/M428L are expected to have similar effects in human IgG1, IgG3 and IgG4 antibodies (see, for example, Hinton et al. (2004) J. Biol . Chem . 279(8):6213-6216). The variant T250R/M428L has been shown to reduce selective binding to FcRn at pH 6.0 and degradation of serum IgG2 and IgG1 in rhesus monkeys by 2.8-fold (see, e.g., Saxena et al. (2016) Front. Immunol. 7:580]).
돌연변이 N434A(EU 넘버링에 의함)는, 인간 항-HER2 IgG1 트라스투주맙에 도입되었을 때 pH 6에서 비변형 항체에 비해 인간 FcRn에 대해 약 4배 더 높은 친화도를 나타내었지만 pH 7.4에서는 무시할 수 있는 결합이었다. N434A 변이체는 사이노몰구스 원숭이에서 생체 내 시험 시 야생형 항체에 비해 노출 증가, 청소능 감소(~2배) 및 반감기 증가(~2배)를 보였다. 대조적으로, pH 6에서 FcRn에 대한 ~80배 증가된 결합을 야기하는 돌연변이 N434W는 야생형과 유사한 청소능을 나타내었고; 이 돌연변이체는 또한 pH 7.4에서 FcRn에 상당한 결합을 나타냈으며, 이는 Fc 돌연변이체의 FcRn에 대한 pH 의존적 결합을 유지하는 것이 생체 내 약동학을 개선하는 데 중요하다는 것을 나타낸다 (Yeung 등 (2009) J. Immunol . 182:7663-7671). N434A 돌연변이는 또한 FcγR에 대한 결합을 증가시키는 돌연변이의 도입으로 인해 발생할 수 있는 불량한 FcRn 친화도에 대응하고; N434A는 전형적으로 돌연변이 S298A/E333A/K333A에 추가되어 강화된 FcγR 결합 및 정상 또는 개선된 FcRn 결합을 갖는 변이체를 생성한다. FcRn 결합을 개선하는 Fc 돌연변이는 또한 N434Y, E294del/T307P/N434Y 및 T256N/A378V/S383N/N434Y를 포함한다. E294 결실은 Fc에서 N297 글리칸의 더 높은 시알릴화를 초래하여 생체 내에서 항체 반감기를 증가시킨다. 시알릴화는 또한 혈청 반감기를 조절하는 역할을 한다는 것을 나타낸다 (예를 들어, 문헌[Saunders, K. O. (2019) Front. Immunol. 10:1296] 참조). Mutation N434A (by EU numbering), when incorporated into human anti-HER2 IgG1 trastuzumab, exhibited approximately 4-fold higher affinity for human FcRn compared to the unmodified antibody at pH 6, but negligible at pH 7.4. it was a bond The N434A variant showed increased exposure, decreased clearance (~2-fold) and increased half-life (~2-fold) compared to the wild-type antibody when tested in vivo in cynomolgus monkeys. In contrast, mutant N434W, which resulted in ∼80-fold increased binding to FcRn at pH 6, showed clearance similar to wild type; This mutant also showed significant binding to FcRn at pH 7.4, indicating that maintaining the pH-dependent binding of the Fc mutant to FcRn is important to improve pharmacokinetics in vivo (Yeung et al. (2009) J. Immunol . 182:7663-7671). The N434A mutation also corresponds to poor FcRn affinity that may arise due to the introduction of mutations that increase binding to FcγR; N434A is typically added to mutations S298A/E333A/K333A to create variants with enhanced FcγR binding and normal or improved FcRn binding. Fc mutations that improve FcRn binding also include N434Y, E294del/T307P/N434Y and T256N/A378V/S383N/N434Y. E294 deletion results in higher sialylation of the N297 glycan in the Fc, increasing antibody half-life in vivo. Sialylation has also been shown to play a role in regulating serum half-life (see, eg, Saunders, KO (2019) Front. Immunol . 10:1296).
대체 M428L/N434S(EU 넘버링에 의함)는, 인간화 항-VEGF IgG1 항체 베바시주맙(Avastin®)에 도입되었을 때 pH 6.0에서 FcRn에 대한 친화도가 11배 증가했으며 사이노몰구스 원숭이의 생체 내 혈청 반감기를 9.7일에서 31.1일로 연장하여 3.2배 개선되었다. M428L/N434S 변형은 수용체 매개 내재화로 인해 빠르게 제거되는 항-EGFR 항체 세툭시맙에 도입되었을 때 FcRn 결합 및 반감기 연장에서 유사한 증가를 초래하였다. 이러한 항종양 항체의 반감기 연장은 마우스 모델에서 강화된 생체 내 종양 감소와 관련이 있으며, 이는 청소능과 같은 약동학이 개선될 때 항체의 생체 내 치료 효능이 증가함을 나타낸다. 베바시주맙 Fc로 조작된 다른 돌연변이는 하기를 포함한다 (EU 넘버링에 의함): 마우스에서 FcRn 결합이 ~3배 개선되고 혈청 반감기가 ~2.8배 증가된 N434S; 마우스 및 사이노몰구스 원숭이에서 각각 FcRn 결합이 약 ~6배 개선되고 혈청 반감기가 ~약 3배 및 약 ~2배 증가된 V259I/V308F; 마우스 및 사이노몰구스 원숭이 각각 FcRn 결합이 ~7배 개선되고, 혈청 반감기가 ~4배 및 2.5배 증가된 M252Y/S254T/T256E; 및 마우스 및 사이노몰구스 원숭이에서 각각 FcRn 결합이 ~20배 개선되고, 혈청 반감기가 ~4-5배 및 2.6배 증가된 V259I/V308F/M428L (Zalevsky 등 (2010) Nat. Biotechnol. 28(2):157-159). Alternate M428L/N434S (by EU numbering), when incorporated into the humanized anti-VEGF IgG1 antibody bevacizumab (Avastin ® ), showed an 11-fold increase in affinity for FcRn at pH 6.0 and in vivo serum of cynomolgus monkeys. The half-life was extended from 9.7 days to 31.1 days, a 3.2-fold improvement. The M428L/N434S variant resulted in a similar increase in FcRn binding and half-life extension when introduced to the anti-EGFR antibody cetuximab, which is rapidly cleared due to receptor-mediated internalization. The half-life extension of these antitumor antibodies is associated with enhanced in vivo tumor reduction in mouse models, indicating that the in vivo therapeutic efficacy of the antibodies increases when pharmacokinetics, such as clearance, are improved. Other mutations engineered into the bevacizumab Fc include (by EU numbering): N434S with -3-fold improvement in FcRn binding and -2.8-fold increase in serum half-life in mice; V259I/V308F with about -6-fold improvement in FcRn binding and -about 3-fold and -2-fold increases in serum half-life in mice and cynomolgus monkeys, respectively; M252Y/S254T/T256E with -7-fold improvement in FcRn binding and -4-fold and 2.5-fold increase in serum half-life in mice and cynomolgus monkeys, respectively; and V259I/V308F/M428L with ~20-fold improvement in FcRn binding and ~4-5-fold and 2.6-fold increases in serum half-life in mice and cynomolgus monkeys, respectively (Zalevsky et al. (2010) Nat. Biotechnol. 28(2):157-159).
위에서 확인된 돌연변이 및 다른 이러한 돌연변이는 본 명세서에 제공되는 작제물에서 IgG Fc 영역으로 도입될 수 있다. 이들은 작제물의 구조에 따라 링커가 Fc 또는 Fc 이량체를 포함하는 식 1 및 2의 것과 같은 작제물을 포함한다. The mutations identified above and other such mutations can be introduced into the IgG Fc region in the constructs provided herein. These include constructs such as those of
일부 구현예에서, 본 명세서에 제공된 이중특이적 TNFR1 길항제/TNFR2 효능제 작제물, 및 TNFR1 길항제 작제물과 같은 본 명세서의 작제물 내의 IgG Fc 영역은 생체내 반감기를 증가시키기 위해 신생아 FcR 재순환을 강화하도록 변형된다. 이것은 FcRn에 대한 결합을 담당하는 IgG Fc의 CH2 및 CH3 도메인의 계면에 있는 잔기를 돌연변이시킴으로써 영향을 미칠 수 있다. 이들은 EU 넘버링에 의해 잔기 T250, L251, M252, I253, S254, T256, V259, T307, V308, L309, H310, L314, Q311, A378, E380, S383, M428, H433, N434, H435 및 Y436 을 포함하지만 이에 제한되지 않는다. FcRn에 대한 결합을 증가시키는 예시적인 Fc 변형은 EU 넘버링에 의해 T250Q, T250R, M252F, M252W, M252Y, S254T, T256D, T256E, T256Q, V259I, V308F, E380A, M428L, H433K, N434F, N434A, N434W, N434S, N434Y, Y436H, M252Y/T256Q, M252F/T256D, M252Y/S254T/T256E, H433K/N434F/Y436H, N434F/Y436H, T250Q/M428L, T250R/M428L, M428L/N434S, V259I/V308F, V259I/V308F/M428L, E294del/T307P/N434Y, T256N/A378V/S383N/N434Y, 및 이들의 조합 중 하나 이상을 포함하지만 이에 제한되지 않는다. 하기 표 7은 서열번호: 9에 제시된 IgG 중쇄 불변 도메인의 서열과 관련하여 카밧 넘버링 및 순차적 넘버링에 의한 상응하는 돌연변이를 보여준다. 강화된 또는 증가된 FcRn 결합을 부여하는 당업계에 공지된 다른 변형이 또한 본 명세서에서 사용하기 위해 고려된다. In some embodiments, the bispecific TNFR1 antagonist/TNFR2 agonist constructs provided herein, and the IgG Fc regions in constructs herein, such as the TNFR1 antagonist constructs, enhance neonatal FcR recycling to increase in vivo half-life. transformed to do This can be effected by mutating residues at the interface of the C H 2 and C H 3 domains of IgG Fc that are responsible for binding to FcRn. These include residues T250, L251, M252, I253, S254, T256, V259, T307, V308, L309, H310, L314, Q311, A378, E380, S383, M428, H433, N434, H435 and Y436 by EU numbering Not limited to this. Exemplary Fc modifications that increase binding to FcRn are T250Q, T250R, M252F, M252W, M252Y, S254T, T256D, T256E, T256Q, V259I, V308F, E380A, M428L, H433K, N434F, N434A, N434 by EU numbering. W, N434S, N434Y, Y436H, M252Y/T256Q, M252F/T256D, M252Y/S254T/T256E, H433K/N434F/Y436H, N434F/Y436H, T250Q/M428L, T250R/M428L, M428L/N4 34S, V259I/V308F, V259I/V308F/ M428L, E294del/T307P/N434Y, T256N/A378V/S383N/N434Y, and combinations thereof. Table 7 below shows the corresponding mutations by Kabat numbering and sequential numbering with respect to the sequence of the IgG heavy chain constant domain set forth in SEQ ID NO:9. Other modifications known in the art that confer enhanced or increased FcRn binding are also contemplated for use herein.
c) Fc 면역 이펙터 기능의 강화 또는 감소/제거c) enhancement or reduction/elimination of Fc immune effector function
이펙터 기능, 순환 반감기 및 안정성이 다른 4개의 인간 IgG 하위 부류가 있다. IgG1은 Fc 이펙터 기능을 가지고 있으며, 가장 풍부한 IgG 하위 부류이며 FDA 승인 치료용 단백질에서 가장 일반적으로 사용되는 하위 부류이다. IgG2는 Fc 이펙터 기능이 부족하지만 다른 IgG2 분자와 이량체화되며 힌지 영역에서 디설파이드 결합의 스크램블링으로 인해 불안정하다. IgG3는 Fc 이펙터 기능과 매우 길고 단단한 힌지 영역을 가지고 있다. IgG4는 Fc 이펙터 기능이 부족하고 다른 하위 부류보다 순환 반감기가 짧으며 IgG4 이량체는 힌지 영역에 단일 디설파이드 결합이 존재하여 생화학적으로 불안정하여 상이한 IgG4 분자 사이의 H 사슬 교환으로 이어진다. 따라서, IgG2 및 IgG4의 Fc 영역은 이펙터 기능을 보유하지 않으며, 이펙터 기능이 필요하지 않거나 유해할 수 있는 경우, 예를 들어 자가면역 및 염증성 질환 및 장애와 관련하여 사용될 수 있다. There are four human IgG subclasses that differ in effector function, circulating half-life and stability. IgG1 has Fc effector functions, is the most abundant IgG subclass and is the most commonly used subclass in FDA-approved therapeutic proteins. IgG2 lacks Fc effector function, but dimerizes with other IgG2 molecules and is unstable due to scrambling of disulfide bonds in the hinge region. IgG3 has Fc effector functions and a very long and tight hinge region. IgG4 lacks Fc effector function, has a shorter circulating half-life than other subclasses, and IgG4 dimers are biochemically unstable due to the presence of a single disulfide bond in the hinge region, leading to H-chain exchange between different IgG4 molecules. Thus, the Fc regions of IgG2 and IgG4 do not possess effector functions and can be used where effector functions are not needed or may be detrimental, for example in the context of autoimmune and inflammatory diseases and disorders.
대부분의 승인된 치료용 mAb는 인간 IgG1 하위 부류에 속하며 면역계의 체액 및 세포 성분과 상호 작용할 수 있다. 예를 들어, 항체는 보체 캐스케이드를 개시하는 보체 단백질 C1q와의 상호작용을 통해 체액성 면역 반응에 관여하고, 그 결과 표적 세포에서 세포용해(즉, 보체 의존성 세포독성(CDC))를 유도하고 Fc 감마 수용체(FcγR)와의 상호작용에 의해 세포 면역 반응에 관여하는 막 공격 복합체가 형성된다. FcγR에는 세포 표면 발현 및 Fc 결합 친화도가 다른 FcγRI(CD64), FcγRII(CD32) 및 FcγRIII(CD16) 부류가 포함된다. 5개의 활성화 FcγR에는 1가 항체에 결합할 수 있는 고친화성 FcγRI와 결합능 기반 상호 작용이 필요한 저친화성 FcγRIIa, FcγRIIc, FcγRIIIa 및 FcγRIIIb가 포함된다. FcγRIIb는 유일한 억제 수용체이다. Fc가 활성화 수용체에 결합하면, 면역수용체 티로신 기반 활성화 모티프(ITAM)의 인산화를 통해 조절되는 세포 내 신호전달 경로는 이펙터 기능, 예컨대 항체 의존적 세포 매개 세포독성 (ADCC; 또한 소위 항체 의존적 세포 세포독성) 및 항체 의존적 세포 매개 식균작용 (ADCP; 또한 소위 항체 의존적 세포 식균작용), 뿐만 아니라 사이토카인 분비의 유도로 인한 염증을 초래한다. 면역수용체 티로신 기반 억제 모티프(ITIM)의 인산화를 통해 조절되는 억제성 FcγRIIb를 통한 신호전달은 활성화 신호 경로의 균형을 맞추는 포스파타제를 모집한다 (예를 들어, 문헌[Wang 등 (2018) Protein Cell 9(1):63-73] 참조). Most approved therapeutic mAbs belong to the human IgG1 subclass and can interact with humoral and cellular components of the immune system. For example, antibodies participate in the humoral immune response through interaction with the complement protein C1q, which initiates the complement cascade, resulting in cytolysis in target cells (i.e., complement dependent cytotoxicity (CDC)) and Fc gamma Membrane attack complexes involved in cellular immune responses are formed by interaction with receptors (FcγR). FcγRs include the FcγRI (CD64), FcγRII (CD32) and FcγRIII (CD16) families, which differ in cell surface expression and Fc binding affinity. The five activating FcγRs include the high-affinity FcγRI, which can bind monovalent antibodies, and the low-affinity FcγRIIa, FcγRIIc, FcγRIIIa, and FcγRIIIb, which require avidity-based interactions. FcγRIIb is the only inhibitory receptor. When Fc binds to an activating receptor, intracellular signaling pathways that are regulated through phosphorylation of immunoreceptor tyrosine-based activation motifs (ITAMs) activate effector functions, such as antibody-dependent cell-mediated cytotoxicity (ADCC; also called antibody-dependent cellular cytotoxicity). and antibody-dependent cell-mediated phagocytosis (ADCP; also called antibody-dependent cellular phagocytosis), as well as inflammation due to induction of cytokine secretion. Signaling through the inhibitory FcγRIIb, regulated through phosphorylation of the immunoreceptor tyrosine-based inhibitory motif (ITIM), recruits phosphatases that balance activation signaling pathways (see, e.g., Wang et al. (2018) Protein Cell 9(1):63-73).
힌지 및 근위 CH2 아미노산 서열(하부 힌지-상부 CH2 도메인 영역), 및 Fc 영역의 CH2 도메인 Asn-X-Ser/Thr 글리코실화 모티프에서 보존된 N297 잔기의 글리코실화(EU 넘버링에 의함)는 항체와 FcγR 및 보체 단백질 C1q의 상호작용을 매개한다. 항체/Fc 조작은 C1q 및 다양한 Fcγ 수용체에 대한 결합을 변경함으로써 항체의 면역 이펙터 기능을 변형하는 데 사용되었다. 따라서 치료용 mAbs의 CDC, ADCC 및 ADCP 활성은 적용 분야에 따라 증가하거나 감소할 수 있다. 예를 들어, 항암 mAb의 효능은 부분적으로 FcγR 이펙터 기능의 유도에 따라 달라진다. 이펙터 기능에는 FcγRIIIa를 통한 자연 살해(NK) 세포의 활성화 및 후속 ADCC 활성 및 염증성 사이토카인의 방출, 다중 FcγR과의 상호작용을 통한 대식세포 매개 ADCP의 유도, 및 다른 면역 세포, 예컨대 NK 세포 매개 ADCC의 주요 수용체인 호중구의 동원 및 활성화를 포함한다. FcγRIIIa에는 두 가지 다형성 변이체가 있다: IgG1에 대해 더 높은 친화도를 갖는 V158을 갖는 것; 및 IgG1에 대한 친화도가 낮은 F158을 갖는 것. 고친화성 V158 다형성을 가진 암 환자는 저친화성 F158 다형성을 가진 환자에 비해 세툭시맙, 트라스투주맙 및 리툭시맙으로 치료한 후 더 나은 결과를 얻을 수 있다. 이와 같은 결과는 FcγR 매개 면역 이펙터 기능이 요법에서 수행하는 역할을 강조하고 FcγR에 대한 증가된 친화도를 갖도록 항체 및 관련 분자를 조작하여 치료 효능을 향상시킬 수 있음을 나타낸다 (예를 들어, 문헌[Wang 등 (2018) Protein Cell 9(1):63-73] 참조). Hinge and proximal C H 2 amino acid sequences (lower hinge-upper C H 2 domain region), and glycosylation of the conserved N297 residue in the C H 2 domain Asn-X-Ser/Thr glycosylation motif of the Fc region (see EU numbering). by) mediates the interaction of the antibody with FcγR and the complement protein C1q. Antibody/Fc engineering has been used to modify the immune effector functions of antibodies by altering binding to C1q and various Fcγ receptors. Therefore, the CDC, ADCC and ADCP activities of therapeutic mAbs may increase or decrease depending on the field of application. For example, the efficacy of anti-cancer mAbs depends in part on induction of FcγR effector function. Effector functions include activation of natural killer (NK) cells via FcγRIIIa and subsequent ADCC activity and release of inflammatory cytokines, induction of macrophage-mediated ADCP through interaction with multiple FcγRs, and other immune cells such as NK cell-mediated ADCC It involves the recruitment and activation of neutrophils, the main receptors for There are two polymorphic variants of FcγRIIIa: the one with V158 with higher affinity for IgG1; and those having F158 with low affinity for IgG1. Cancer patients with the high-affinity V158 polymorphism may have better outcomes after treatment with cetuximab, trastuzumab, and rituximab compared to patients with the low-affinity F158 polymorphism. These results highlight the role FcγR-mediated immune effector functions play in therapy and indicate that antibodies and related molecules can be engineered to have increased affinity for FcγRs to improve therapeutic efficacy (see, e.g., Wang et al. (2018) Protein Cell 9(1):63-73).
IgG의 하부 힌지 및 근위 CH2 영역에 있는 잔기는 FcγR에 대한 결합에 중요한 것으로 결정되었다. FcγRI, FcγRIIa, FcγRIIb 및 FcγRIIIb에 대한 FcγR:Fc 계면으로부터 5 옹스트롬 내에 있는 잔기는 잔기 (EU 넘버링에 의함) P232, E233, L234, L235, G236, G237, P238, S239 (잔기 P115-S122에 상응함, 서열번호: 9 참조), D265, V266, S267, H268, E269, D270 (잔기 D148-D153에 상응함, 서열번호: 9 참조), Y296, N297, S298, T299 (잔기 Y179-T182에 상응함, 서열번호: 9 참조), 및 N325, K326, A327, L328, P329, A330, P331 및 I332 (잔기 N208-I215에 상응함, 서열번호: 9 참조)을 포함한다 (예를 들어, [Wang 등 (2018) Protein Cell 9(1):63-73] 참조). Residues in the lower hinge and proximal CH2 regions of IgG were determined to be important for binding to FcγR. Residues within 5 angstroms of the FcγR:Fc interface for FcγRI, FcγRIIa, FcγRIIb and FcγRIIIb are residues (by EU numbering) P232, E233, L234, L235, G236, G237, P238, S239 (corresponding to residues P115-S122 , see SEQ ID NO: 9), D265, V266, S267, H268, E269, D270 (corresponding to residues D148-D153, see SEQ ID NO: 9), Y296, N297, S298, T299 (corresponding to residues Y179-T182) , see SEQ ID NO: 9), and N325, K326, A327, L328, P329, A330, P331 and I332 (corresponding to residues N208-I215, see SEQ ID NO: 9) (eg, [Wang et al. (2018) Protein Cell 9(1):63-73).
ADCC 활성을 향상시키거나 감소시키고/시키거나 수용체에 대한 친화도/결합을 강화시키는 Fc의 변형은 당업자에게 공지되어 있다. 예를 들어, FcγRIIIa에 대한 IgG1 친화성 및 결합을 증가시키고/시키거나 ADCC 기능을 강화하는 Fc 변형에는 대체(EU 넘버링에 의함)을 포함한다: F243L/R292P/Y300L/V305I/P396L, L235V/F243L/R292P/Y300L/P396L, F243L/R292P/Y300L, S239D, I332E, S239D/I332E, S239D/A330L/I332E, S298A/E333A/K334A, 및 하나의 중쇄 내의 L234Y/L235Q/G236W/S239M/H268D/D270E/S298A 및 대향 중쇄 내의 D270E/K326D/A330M/K334E, 및 하나의 중쇄 내의 L234Y/G236W/S298A 및 대향 중쇄 내의 S239D/A330L/I332E의 조합. 또한 돌연변이 A327Q/P329A(FcγRI와 상호작용), D265A/S267A/H268A/D270A/K326A/S337A(FcγRIIa와 상호작용), G236A(FcγRIIa와 상호작용), T256A/K290A/S298A/E333A/K334A(FcγRIIa와 상호작용) FcγRIIIa)는 FcγR과 고친화도 상호작용을 초래한다. Modifications of Fc that enhance or decrease ADCC activity and/or enhance affinity/binding to a receptor are known to those skilled in the art. For example, Fc modifications that increase IgG1 affinity and binding to FcγRIIIa and/or enhance ADCC function include the replacements (by EU numbering): F243L/R292P/Y300L/V305I/P396L, L235V/F243L /R292P/Y300L/P396L, F243L/R292P/Y300L, S239D, I332E, S239D/I332E, S239D/A330L/I332E, S298A/E333A/K334A, and L234Y/L235Q/G236W/S in one heavy chain 239M/H268D/D270E/ Combinations of S298A and D270E/K326D/A330M/K334E in opposing heavy chains, and L234Y/G236W/S298A in one heavy chain and S239D/A330L/I332E in opposing heavy chains. Also, the mutations A327Q/P329A (interacts with FcγRI), D265A/S267A/H268A/D270A/K326A/S337A (interacts with FcγRIIa), G236A (interacts with FcγRIIa), T256A/K290A/S298A/E333A/K334A (interacts with FcγRIIa) with a Interaction) FcγRIIIa) results in high affinity interactions with FcγR.
FcγRIIa 및 FcγRIIIa에 대한 결합을 증가시키고 ADCC 및 ADCP를 강화하는 Fc 변형은 (EU 넘버링에 의함) G236A/I332E, G236A/S239D/I332E (또한 FcγRI에 대한 결합 증가), 및 G236A/S239D/A330L/I332E을 포함한다 (참조: 예를 들어, 문헌[Wang 등 (2018) Protein Cell 9(1):63-73; Saxena et al (2016) Front. Immunol. 7:580; 및 Saunders, K. O. (2019) Front. Immunol. 10:1296] 참조). Fc modifications that increase binding to FcγRIIa and FcγRIIIa and enhance ADCC and ADCP are (by EU numbering) G236A/I332E, G236A/S239D/I332E (also increased binding to FcγRI), and G236A/S239D/A330L/I332E (See, for example, Wang et al. (2018) Protein Cell 9(1):63-73; Saxena et al (2016) Front. Immunol. 7:580; and Saunders, KO (2019) Front. Immunol . 10:1296]).
CH2 도메인 내의 잔기 N297에 보존된 N-연결 글리코실화 부위를 함유하는 IgG의 글리코-조작은 Fc 이펙터 기능을 강화할 수 있다. N297의 글리코실화는 Fc 형태를 유지하고 FcγR (및 C1q)과의 상호작용을 매개하는 데 필수적이다. 잔기 N297에 존재하는 글리칸은 전형적으로 2개의 N-아세틸글루코사민(GlcNAc), 3개의 만노스 및 2개 초과의 추가 GlcNAc가 만노스에 연결되어 바이안테너리 복합 글리칸을 형성한다. 추가적인 푸코스, 갈락토스, 시알산 및 GlcNAc가 코어 글리칸 구조에 첨가될 수 있다. 인간 혈청에서 순환하는 IgG는 일반적으로 푸코실화되어 있지만, 재조합 IgG 생산은 식물 세포에서 항체를 발현하거나, 특정 글리코시다아제를 녹인 또는 녹아웃하거나, 글리코실화된 IgG의 시험관 내 효소 분해를 통해 글리칸 조성물을 변경할 수 있고; 두 중쇄가 글리코실화되어 있기 때문에 단일 IgG 분자는 글리칸 이종성을 가질 수 있다. 글리칸은 FcγR 결합에 직접적으로 영향을 미친다. 예를 들어, Fc의 N297 글리칸은 FcγRIII 단백질의 글리칸과 충돌하여 ADCC를 매개하는 이펙터 세포의 결합 불량을 초래할 수 있다. N297에서 상이한 글리칸을 함유하는 Fc 영역은 FcγR과 상호 작용하는 Fc의 능력에 영향을 줄 수 있는 다른 힌지 영역 형태를 채택한다. IgG를 발현할 때 β(1,4)-N-아세틸글루코스아미닐트랜스퍼라제 III의 발현은 위치 N297에서 바이안테너리 글리칸으로 글리코실화된 항체를 생성하고; 이 항체는 FcγRIIIa에 대한 결합이 증가하고 ADCC 활성이 강화되었다. 푸코스 결핍(비푸코실화/비-푸코실화) IgG1은 FcγRIIIa에 대한 결합이 최대 50배까지 증가하고 ADCC 활성이 강화된 것으로 입증되었다. 2개의 글리코 조작된(비푸코실화된) mAb, 오비누투주맙(항-CD20) 및 모가물리주맙(항-CCR4)이 임상 용도로 승인되었으며, 이는 강화된 이펙터 기능을 위한 글리코 조작의 가능성과 임상적으로 승인된 치료제로의 번역을 나타낸다 (예를 들어, 문헌[Wang 등 (2018) Protein Cell 9(1):63-73; Saxena 등 (2016) Front. Immunol . 7:580; 및 Saunders, K. O. (2019) Front. Immunol. 10:1296] 참조). Glyco-engineering of IgGs containing a conserved N-linked glycosylation site at residue N297 in the C H 2 domain can enhance Fc effector function. Glycosylation of N297 is essential for maintaining Fc conformation and mediating interactions with FcγR (and C1q). The glycan at residue N297 is typically two N-acetylglucosamines (GlcNAc), three mannoses and more than two additional GlcNAc linked to the mannose to form a biantennary complex glycan. Additional fucose, galactose, sialic acid and GlcNAc can be added to the core glycan structure. IgG circulating in human serum is usually fucosylated, but recombinant IgG production can be achieved by expressing antibodies in plant cells, by knocking down or knocking out specific glycosidases, or by in vitro enzymatic digestion of glycosylated IgG to reduce the glycan composition. can change; Since both heavy chains are glycosylated, a single IgG molecule can have glycan heterogeneity. Glycans directly affect FcγR binding. For example, the N297 glycan of Fc may collide with the glycan of the FcγRIII protein, resulting in poor binding of effector cells mediating ADCC. The Fc region containing different glycans at N297 adopts a different hinge region conformation that may affect the Fc's ability to interact with FcγRs. Expression of β(1,4)-N-acetylglucosaminyltransferase III when expressing IgG produces antibodies glycosylated with biantennary glycans at position N297; This antibody showed increased binding to FcγRIIIa and enhanced ADCC activity. Fucose deficient (non-fucosylated/non-fucosylated) IgG1 demonstrated up to a 50-fold increase in binding to FcγRIIIa and enhanced ADCC activity. Two glycoengineered (afucosylated) mAbs, obinutuzumab (anti-CD20) and mogamulizumab (anti-CCR4), have been approved for clinical use, demonstrating the potential of glycoengineering for enhanced effector function and Indicates translation into clinically approved therapeutics (see, e.g., Wang et al. (2018) Protein Cell 9(1):63-73; Saxena et al. (2016) Front. Immunol . 7:580; and Saunders, KO (2019) Front. Immunol . 10:1296]).
Fc는 또한 더 넓은 범위의 Fc 수용체와 결합하도록 변형될 수 있다. 감마 이외의 아이소타입(즉, IgA, IgM 및 IgE)에 대한 Fc 수용체는 특정 백혈구에 존재하며 Fc 영역을 변형하여 다중 Fc 수용체와 결합함으로써 이펙터 세포와 결합하는 능력이 확장된 항체가 생성된다. 신체에서 가장 풍부한 백혈구인 호중구는 FcαRI 수용체를 통해 IgA 항체의 Fc와 결합한다. 예를 들어, FcγR과 FcαRI를 연결하기 위해, IgA2의 단일 도메인을 IgG1 불변 영역의 끝에 추가하여 4개의 도메인 불변 영역인 CH1g-CH2g-CH3g-CH3a를 생성하였다. IgG1의 CH1 도메인은 알파 1 불변 영역 도메인으로 대체되어 구조상 알파 불변 영역에 더 가까운 불변 영역(CH1a-CH2g-CH3g-CH3a)을 생성하였다. 천연 IgA2와 유사하게 J 사슬에 결합된 이들 4-도메인, 교차-아이소타입 IgGA 키메라 항체은 중합체성 Ig 수용체에 의한 수송이 감소했으며 FcγRI 친화도가 3-5배 감소했으며 IgG1의 지연된 혈청 순환 대신 IgA2의 혈청 반감기가 짧았다. 그러나 4-도메인, 교차-아이소타입 IgGA 키메라 항체인 4-도메인은 양 적혈구의 보체 의존 용해를 매개하는 능력이 있었고 IgG1보다 pH 저항성이 더 컸다. IgA2의 힌지, CH2 및 CH3 도메인이 IgG1의 C-말단에 융합된 탠덤 G1-A Fc 영역을 생성하기 위해 감마 1 및 알파 불변 영역을 함께 융합하여 또 다른 교차-아이소타입 Fc를 생성하였다. 이 탠덤 교차-아이소타입 IgG/IgA 융합체는 IgG1과 유사한 발현 수준, 항원 결합 및 열안정성을 보였고, 시험관 내에서 FcαRI 및 FcγRI, FcγRII, FcγRIIIa 및 FcRn에 각각 야생형 IgA 및 IgG와 유사한 친화도로 결합하였다. 다양한 FcR에 대한 결합은 다형핵 세포 및 NK 세포에 대한 ADCC 활성을 초래하였고; 그러나 C1q 결합은 IgG1에 비해 3배 감소하였다. 탠덤 IgG/IgA는 BALB/c 마우스에서 IgG1과 유사한 생체 내 반감기를 가졌다. 대안적인 교차-아이소타입 항체는 IgG1 불변 영역의 CH3 도메인 및 CH2 α1 루프 잔기 245-258 (EU 넘버링에 의함, 서열 PKPKDTLMISRTPE에 상응함; (서열번호: 9의 잔기 128-141))을 IgA 불변 영역의 구조적으로 유사한 영역으로 대체함으로써 생성된다. 이 키메라 Fc는 FcγRI, FcγRIIa 및 FcαRI, 및 다형핵 세포를 갖는 키메라 Fc 매개된 ADCC 및 대식세포를 갖는 ADCP를 함유하는 항체, 및 활성화된 보체에 결합하였지만, 항체 반감기를 조절하는 FcRn에 대한 결합이 결여되고; 따라서 효과적인 생체 내 사용을 위해서는 추가 최적화가 필요하다 (예를 들어, 문헌[Saunders, K. O. (2019) Front. Immunol. 10:1296] 참조). Fc can also be modified to bind to a wider range of Fc receptors. Fc receptors for isotypes other than gamma (i.e., IgA, IgM, and IgE) are present in certain leukocytes, and by modifying the Fc region to bind multiple Fc receptors, antibodies with expanded ability to bind effector cells are generated. Neutrophils, the most abundant white blood cells in the body, bind to the Fc of IgA antibodies through the FcαRI receptor. For example, to link FcγR and FcαRI, a single domain of IgA2 was added to the end of the IgG1 constant region to create a four domain constant region, CH1g-CH2g-CH3g-CH3a. The
FcγR 결합을 강화하는 또 다른 접근법은 자가면역 질환의 치료에 가능성이 있는 IgG의 다량체화이다. IgG 다량체는 예를 들어 이소류신 지퍼와 같은 이종 다량체화 도메인을 추가하거나 천연 힌지의 N-말단에 또 다른 힌지 영역을 추가하거나 CH3 도메인의 C-말단에 또 다른 힌지 영역을 추가하여 생성된다. IgG 육량체는 IgM 테일피스를 IgG1 Fc의 C-말단에 추가하고 위치 309에서 시스테인 결합을 생성함으로써 생성되고; 이 다량체 IgG는 FcγRI, FcγRIIa 및 FcγRIIIa에 강하게 결합하고 FcγRIIb 및 FcγRIIIb에 약하게 결합한다. 다양한 다량체 IgG는 단량체성 IgG와 비교하여 FcγRI, FcγRIIb 및 FcγRIII에 대한 결합을 증가시켰으며 관절염, 신경병증 및 자가면역 중증 근무력증의 전임상 모델에서 가능성을 보여주었다. 이 다량체 IgG 설계는 FcRn을 포함하는 면역 수용체가 다량체에 결합할 수 있는 미세 조정에 더욱 최적화되고 있다 (예를 들어, 문헌[Saunders, K. O. (2019) Front. Immunol. 10:1296] 참조). Another approach to enhance FcγR binding is the multimerization of IgG with potential for the treatment of autoimmune diseases. IgG multimers are created by adding a heteromultimerization domain, for example an isoleucine zipper, or by adding another hinge region to the N-terminus of the natural hinge or by adding another hinge region to the C-terminus of the CH 3 domain. . An IgG hexamer is created by adding an IgM tailpiece to the C-terminus of an IgG1 Fc and creating a cysteine bond at position 309; This multimeric IgG strongly binds to FcγRI, FcγRIIa and FcγRIIIa and weakly binds to FcγRIIb and FcγRIIIb. Various multimeric IgGs increased binding to FcγRI, FcγRIIb and FcγRIII compared to monomeric IgGs and showed promise in preclinical models of arthritis, neuropathy and autoimmune myasthenia gravis. This multimeric IgG design is being further optimized to fine-tune the ability of immune receptors, including FcRn, to bind multimers (see, e.g., Saunders, KO (2019) Front. Immunol . 10:1296). .
C1q (따라서 CDC)와의 상호작용 및 결합에 관여하는 IgG의 Fc 영역 내 잔기는 (EU 넘버링에 의함) S267, D270, K322, K326, P329, P331 및 E333을 포함한다. C1q 결합을 증가시켜 CDC를 강화하는 것으로 나타난 Fc 변형에는 예를 들어, K326A, E333A, K326A/E333A, K326W, K326W/E333S, K326M/E333S, C220D/D221C, H268F/S324T, S267E, H268F, S324T, S267E/H268F/S324T, 및 G236A/I332E/S267E/H268F/S324T (모두 EU 넘버링에 의함)을 포함한다. IgG1 Fc의 상부 힌지 영역에서 다양한 조합으로 위치 222, 223 및 224(즉, EU 넘버링에 의한 K222W, T223W 및 H224W)에서 Trp를 대체하면, FcγRIIIa 결합 및 ADCC 활성에 영향을 미치지 않으면서 야생형 IgG1에 대한 C1q 결합 및 CDC 활성을 증가시켰다. 구체적으로, 돌연변이는 K222W/T223W, K222W/T223W/H224W 및 D221W/K222W를 포함하였다. 돌연변이 C220D/D221C 및 C220D/D221C/K222W/T223W도 C1q 결합 및 CDC 활성을 증가시켰다 (예를 들어, 문헌[Wang 등 (2018) Protein Cell 9(1):63-73; Saxen 등 (2016) Front. Immunol . 7:580; Saunders, K. O. (2019) Front. Immunol. 10:1296; 및 Dall'Acqua 등 (2006) J. Immunol. 177:1129-1138] 참조). Residues in the Fc region of IgG involved in interaction and binding to C1q (and therefore CDC) include (by EU numbering) S267, D270, K322, K326, P329, P331 and E333. Fc variants that have been shown to enhance CDC by increasing C1q binding include, for example, K326A, E333A, K326A/E333A, K326W, K326W/E333S, K326M/E333S, C220D/D221C, H268F/S324T, S267E, H268F, S324T, S267E/H268F/S324T, and G236A/I332E/S267E/H268F/S324T (all by EU numbering). Replacing Trp at positions 222, 223, and 224 (i.e., K222W, T223W, and H224W by EU numbering) in various combinations in the upper hinge region of IgG1 Fc resulted in no effect on FcγRIIIa binding and ADCC activity against wild-type IgG1. Increased C1q binding and CDC activity. Specifically, mutations included K222W/T223W, K222W/T223W/H224W and D221W/K222W. Mutations C220D/D221C and C220D/D221C/K222W/T223W also increased C1q binding and CDC activity (see, for example, Wang et al. (2018) Protein Cell 9(1):63-73; Saxen et al. (2016) Front. Immunol . 7:580; Saunders, KO (2019) Front. Immunol . 10:1296; and Dall'Acqua et al. (2006) J. Immunol. 177:1129-1138]).
IgG3은 C1q에 대한 시험관내 결합이 가장 우수하고; IgG1의 CH1 및 힌지 영역을 IgG3의 CH2 및 CH3 영역과 조합하여 (IgG1의 ADCC 활성 및 IgG3의 CDC 활성을 유지하고), IgG1/IgG3 교차 하위유형 항체를 생성하고, C1q 결합을 증가시키고 CDC 활성을 강화한다. 증가된 C1q 결합 및 강화된 CDC 활성을 갖는 또 다른 IgG1/IgG3 교차 하위유형 항체는 IgG1의 CH1, 힌지 및 CH3, 및 IgG3의 CH2를 포함하고; 이러한 변형은 C1q가 CH2 도메인에 결합하기 때문에 증가된 Cq1 결합을 허용할 뿐만 아니라 단백질 A가 CH3 도메인에 결합하기 때문에 용이한 정제를 가능하게 한다. 추가로, 변형 E345R/E430G/S440Y는 육량체 C1q 헤드피스와 호의적으로 상호작용하는 위치에 배향된 K322를 갖는 IgG 육량체의 형성을 초래하여 CDC 활성을 강화하였다. 돌연변이 E345R 단독은 또한 증가된 C1q 결합 및 강화된 CDC 활성과 함께 IgG 육량체 형성을 야기한다 (예를 들어, 문헌[Wang 등 (2018) Protein Cell 9(1):63-73; Saxena 등 (2016) Front. Immunol . 7:580; Saunders, K. O. (2019) Front. Immunol. 10:1296] 참조). IgG3 has the best in vitro binding to C1q; The
글리코엔지니어링은 또한 보체 결합을 개선하는 데 사용될 수 있고; Fc의 CH2 도메인 내의 N297 글리칸은 CDC 활성을 개선하기 위해 변형될 수 있다. 예를 들어, IgG1 Fc 내의 과도한 갈락토실화는 비변형 IgG1 글리코형에 비해 C1q 결합 및 CDC 활성을 증가시키고 또한 열안정성을 개선한다. 따라서 Fc의 갈락토실화는 강화된 CDC 활성을 갖는 안정한 생물학적 제제를 생성하는 데 사용될 수 있다 (예를 들어, 문헌[Saunders (2019) Front. Immunol. 10:1296] 참조). Glycoengineering can also be used to improve complement binding; The N297 glycan in the C H 2 domain of Fc can be modified to improve CDC activity. For example, excessive galactosylation in IgG1 Fc increases C1q binding and CDC activity and also improves thermostability compared to unmodified IgG1 glycoforms. Thus, galactosylation of Fc can be used to generate stable biologics with enhanced CDC activity (see, eg, Saunders (2019) Front. Immunol . 10:1296).
하기 표 8은 FcγR 또는 C1q에 대한 결합을 증가시켜 ADCC, ADCP 및 CDC를 포함하는 면역 이펙터 기능을 강화하는 Fc 변형을 요약하고 서열번호: 9에 제시된 IgG1 중쇄 불변 도메인의 서열과 관련하여 카밧 넘버링 및 순차적 넘버링에 의한 상응하는 변형을 제공한다. 이들 변형 중 임의의 하나 이상은 단독으로 또는 다양한 조합으로 본 명세서에 제공된 작제물의 IgG1 Fc 부분에 도입될 수 있다. 강화된 또는 증가된 면역 이펙터 기능을 부여하는 당업계에 공지된 다른 변형이 또한 본 명세서에서 사용하기 위해 고려된다. Table 8 below summarizes Fc modifications that enhance binding to FcγR or C1q, thereby enhancing immune effector functions, including ADCC, ADCP and CDC, and Kabat numbering and Provide corresponding variants by sequential numbering. Any one or more of these modifications, alone or in various combinations, can be introduced into the IgG1 Fc portion of the constructs provided herein. Other modifications known in the art that confer enhanced or increased immune effector function are also contemplated for use herein.
치료 항체는 또한 면역 이펙터 기능을 감소시키거나 제거하도록 조작될 수 있다. 본 명세서의 목적을 위해, 일부 구현예에서, 예를 들어 ADCC 활성을 감소시키거나 제거하는 것이 중요하다. Fc를 포함하는 본 명세서의 작제물은 일반적으로 ADCC 활성을 감소시키거나 제거하기 위해 변형된다. Therapeutic antibodies can also be engineered to reduce or eliminate immune effector function. For purposes herein, in some embodiments it is important to reduce or eliminate, for example, ADCC activity. Constructs herein comprising an Fc are generally modified to reduce or eliminate ADCC activity.
예를 들어, 면역 이펙터 기능을 감소시키거나 제거하는 것이 중요하고, 여기서: 치료 항체는 수용체-리간드 상호작용 및 신호전달을 방지하기 위해 길항적이며; 항체는 수용체를 교차 결합하고 신호전달을 유도하는 수용체 효능제이고; 항체는 항원 발현 표적 세포에 약물을 전달하는 약물 전달 비히클이고; 그리고 이펙터 기능의 감소 또는 제거는 표적 세포자멸 또는 원치 않는 사이토카인 분비를 방지한다. 감소된 이펙터 기능은 또한 항체-약물 접합체가 FcγR과 상호작용하는 것을 방지하여 표적외 세포독성을 감소시킨다. 이펙터 기능을 감소시키거나 제거하는 것의 중요성은 공여자 신장, 폐 또는 심장을 받는 이식 환자에서 T 세포 활성화를 방지하도록 설계된 최초의 승인된 mAb인 무로모납의 투여와 연관된 부작용 이후 명백해졌다. 무로모납를 투여받은 환자는 염증유발 사이토카인(즉, 사이토카인 폭풍)의 위험한 유도를 경험하였고; 이는 부분적으로 무로모납와 FcγR의 상호작용 때문이었다 (예를 들어, 문헌[Wang 등 (2018) Protein Cell 9(1):63-73; 및 Saunders, K. O. (2019) Front. Immunol. 10:1296] 참조). For example, it is important to reduce or eliminate immune effector function, where: the therapeutic antibody is antagonistic to prevent receptor-ligand interaction and signaling; Antibodies are receptor agonists that cross-link receptors and induce signaling; Antibodies are drug delivery vehicles that deliver drugs to antigen-expressing target cells; and reduction or elimination of effector function prevents target apoptosis or unwanted cytokine secretion. Reduced effector function also prevents antibody-drug conjugates from interacting with FcγRs, reducing off-target cytotoxicity. The importance of reducing or eliminating effector function became apparent after the side effects associated with administration of muromonab, the first approved mAb designed to prevent T cell activation in transplant patients receiving donor kidney, lung or heart. Patients receiving muromonab experienced a dangerous induction of pro-inflammatory cytokines (ie, cytokine storm); This was in part due to the interaction of muromonap with FcγR (see, for example, Wang et al. (2018) Protein Cell 9(1):63-73; and Saunders, KO (2019) Front. Immunol . 10:1296]).
수용체 기능을 감소시키거나 제거하는 많은 알려진 돌연변이가 있다. 예를 들어, 인간 IgG4의 대체 L235E 및 F234A/L235A, 및 인간 IgG1의 L235E 및 L234A/L235A(모두 EU 넘버링에 의함)는 FcγR 및 C1q 결합을 감소시키고 염증성 사이토카인 방출과 같은 이펙터 기능을 감소시킨다. 치료 항체에서 염증성 사이토카인이 방출되면 부작용이 발생할 수 있다. 대체 S228P/L235E는, IgG4에 도입될 때 FcγR에 대한 결합도 감소시키고; S228P 돌연변이는 IgG4의 안정성을 개선한다. IgG4 Fc의 돌연변이 S228P/F234A/L235A는 FcγRI, IIa 및 IIIa에 대한 결합을 감소시키고 ADCC 및 CDC를 감소시킨다. IgG1 Fc의 삼중 돌연변이체 L234E/L235F/P331S는 FcγRI, FcγRII, FcγRIII 및 C1q에 대한 결합을 감소시키고 CDC를 감소시키며, IgG1 Fc의 돌연변이 L234A/L235A/P329G는 FcγRI, FcγRII, FcγRIII 및 C1q 결합을 제거하고 ADCP를 감소시킨다. 돌연변이 L234F/L235E/P331S는 또한 FcγR 및 C1q에 대한 결합을 감소시키고 IgG1 Fc의 이펙터 기능을 감소시킨다. IgG1 Fc의 돌연변이 G237A 및 E318A는 각각 FcγRII에 대한 결합을 감소시키고 ADCP를 감소시시키고; 돌연변이 D265A 및 E233P는 FcγRI, FcγRII 및 FcγRIII에 대한 결합을 감소시키고 ADCC 및 ADCP를 감소시키며, 돌연변이 G236R/L328R은 모든 FcγR에 대한 결합을 감소시키고 ADCC를 감소시킨다. 결정 구조 데이터는 모든 FcγR에서 발생하는 2개의 보존된 트립토판 잔기 사이에 패킹되어 "프롤린 샌드위치"를 형성하는 잔기 P329의 형태적 변화가 FcγR과의 상호작용에 해로울 수 있고 잔기 D270의 변형이 C1q와의 상호작용에 부정적인 영향을 미칠 수 있음을 밝혔다 (예를 들어, 문헌[Wang 등 (2018) Protein Cell 9(1):63-73; Saunders, K. O. (2019) Front. Immunol. 10:1296; 국제 출원 공개 번호 WO 2019/226750] 참조). There are many known mutations that reduce or eliminate receptor function. For example, the replacements L235E and F234A/L235A in human IgG4, and L235E and L234A/L235A in human IgG1 (all by EU numbering) reduce FcγR and C1q binding and reduce effector functions such as inflammatory cytokine release. The release of inflammatory cytokines from therapeutic antibodies can cause side effects. Alternate S228P/L235E also reduces binding to FcγR when introduced into IgG4; The S228P mutation improves the stability of IgG4. Mutations S228P/F234A/L235A of IgG4 Fc reduce binding to FcγRI, IIa and IIIa and reduce ADCC and CDC. Triple mutant L234E/L235F/P331S of IgG1 Fc reduces binding to FcγRI, FcγRII, FcγRIII and C1q and reduces CDC, and mutation L234A/L235A/P329G of IgG1 Fc abolishes FcγRI, FcγRII, FcγRIII and C1q binding and decrease ADCP. Mutations L234F/L235E/P331S also reduce binding to FcγR and C1q and reduce effector functions of IgG1 Fc. Mutations G237A and E318A of IgG1 Fc reduce binding to FcγRII and decrease ADCP, respectively; Mutations D265A and E233P reduce binding to FcγRI, FcγRII and FcγRIII and reduce ADCC and ADCP, mutations G236R/L328R reduce binding to all FcγRs and reduce ADCC. Crystal structure data suggest that conformational changes in residue P329, which packs between two conserved tryptophan residues that occur in all FcγRs to form a “proline sandwich,” may be detrimental to interactions with FcγRs and that modifications of residue D270 may be detrimental to interactions with C1q. action (see, for example, Wang et al. (2018) Protein Cell 9(1):63-73; Saunders, KO (2019) Front. Immunol . 10:1296; International Application Publication No. WO 2019/226750).
보체 캐스케이드의 유도는 항체 주사 부위 이상 반응과 연관이 있으며, CDC의 활성화에서도 초기인 Fc에 대한 C1q 결합을 제거한다. C1q 결합을 제거하는 Fc 영역의 변형은 Fc 영역을 함유하는 작제물에서 CDC를 제거하는 데 사용될 수 있다. FcγR 결합을 제거하는 많은 돌연변이는 상기에서 나타낸 바와 같이 C1q 결합도 제거한다. 예를 들어, 돌연변이 A330L은 C1q 결합을 방해하고 CDC를 감소시키며 FcγRIIb 결합도 제거한다. 돌연변이 D270A, P329A, K322A 및 P331A는 또한 감소된 C1q 결합 및 감소된 CDC 활성을 초래한다 (예를 들어, 문헌[Saunders, K. O. (2019) Front. Immunol. 10:1296] 참조). Induction of the complement cascade is associated with abnormal antibody injection site reactions and also eliminates C1q binding to Fc, which is an early stage in CDC activation. Modification of the Fc region that removes C1q binding can be used to remove CDC in constructs containing the Fc region. Many mutations that abolish FcγR binding also ablate C1q binding, as shown above. For example, mutation A330L disrupts C1q binding, reduces CDC and also abolishes FcγRIIb binding. Mutations D270A, P329A, K322A and P331A also result in reduced C1q binding and reduced CDC activity (see, eg, Saunders, KO (2019) Front. Immunol . 10:1296).
글리코-엔지니어링은 FcγR 및 C1q 결합을 제거하는 데 사용될 수 있다. 본 명세서의 다른 곳에서 논의된 바와 같이, 잔기 N297의 글리칸은 복합 바이안테너리 글리칸이다. 이 글리칸의 고 만노스 글리칸으로의 변형(즉, 고 만노스 글리코실화)은 C1q에 대한 IgG1 Fc의 친화성을 감소시키고 CDC 활성을 감소시킨다. C1q 및 FcγRI 결합을 감소시키거나 제거하는 Fc의 돌연변이는 또한 N297 글리칸의 갈락토실화 및 시알릴화를 증가시킬 수 있고; 그러한 돌연변이는 예를 들어 F241A, V264A 및 D265A를 포함한다. EU 넘버링에 의한 돌연변이 N297A, N297Q, N297D 및 N297G는 각각 C1q 및 FcγR과의 Fc 상호작용을 제거함으로써 N297에서 글리코실화 부위를 제거하고 CDC 및 ADCC와 같은 이펙터 기능을 감소시킨다. N297G/D265A 조합은 FcγR 및 C1q에 대한 결합을 거의 완전히 제거한다. 글리코실화가 결여된 IgG3 Fc(아글리콘 Fc)는 FcγRI 및 C1q에 대한 결합을 감소시켰다 (예를 들어, 문헌[Wang 등 (2018) Protein Cell 9(1):63-73; Saunders, K. O. (2019) Front. Immunol. 10:1296] 참조). Glyco-engineering can be used to remove FcγR and C1q binding. As discussed elsewhere herein, the glycan at residue N297 is a complex biantennary glycan. Modification of this glycan to a high mannose glycan (i.e., high mannose glycosylation) reduces the affinity of the IgG1 Fc for C1q and reduces CDC activity. Mutations in Fc that reduce or eliminate C1q and FcγRI binding can also increase galactosylation and sialylation of the N297 glycan; Such mutations include, for example, F241A, V264A and D265A. Mutations N297A, N297Q, N297D and N297G by EU numbering remove the glycosylation site in N297 and reduce effector functions such as CDC and ADCC by removing Fc interactions with C1q and FcγR, respectively. The N297G/D265A combination almost completely abolishes binding to FcγR and C1q. An IgG3 Fc lacking glycosylation (aglycon Fc) has reduced binding to FcγRI and C1q (see, e.g., Wang et al. (2018) Protein Cell 9(1):63-73; Saunders, KO (2019) Front. Immunol . 10:1296]).
Fc 이펙터 기능을 감소시키거나 제거하기 위해, 반대 기능이 결여된 상이한 하위 부류로부터의 Fc 영역의 많은 부분을 교환하여 하위 부류 간 Fc 영역을 생성할 수 있다. 예를 들어, IgG2는 FcγR 결합이 약하지만 C1q에 결합하고, IgG4는 C1q 결합이 없지만 FcγR과 반응하고; 따라서 C1q 및 FcγR 결합이 모두 없는 IgG2 및 IgG4 CH 도메인의 조합이 작제될 수 있다. 일반적으로 IgG1/IgG4 키메라에서 힌지과 CH1 도메인은 IgG2에서 유래되고, CH2 및 CH3 도메인은 IgG4에서 유래한다. IgG1 및 IgG3은 IgG2 및 IgG4보다 더 효과적으로 보체를 모집하고 IgG2 및 IgG4는 ADCC를 유도하는 능력이 제한적이기 때문에 하위 부류 간 접근법은 이펙터 기능을 감소시킬 수 있다. 예를 들어, 항-C5 mAb 에쿨리주맙은 IgG2 잔기 118-260(EU 넘버링에 의함; 카밧 넘버링에 의한 잔기 114-273 및 서열번호: 11과 관련하여 잔기 1-139에 상응함), 및 IgG4 잔기 261- 447(EU 넘버링에 의함; 카밧 넘버링에 의한 잔기 274-478 및 서열번호: 15와 관련하여 잔기 141-327에 상응함)를 함유하고, 제한적이거나 검출 불가능한 이펙터 기능을 갖는다. 유사하게, IgG4로부터 점 돌연변이 H268Q/V309L/A330S/P331S(EU 넘버링에 의함; 카밧 넘버링에 의한 H281Q/V328L/A349S/P350S 및 서열번호: 11에 의한 H147Q/V188L/A209S/P210S에 상함)은 모든 FcγR 및 C1q에 대한 결합이 결여되어 있고 감소된 이펙터 기능을 나타낸다. IgG2 내지 IgG4 교차-하위 부류 돌연변이 V309L/A330S/P331S (EU 넘버링에 의함; 카밧 넘버링에 의한 V328L/A349S/P350S, 및 서열번호: 11을 참조한 V188L/A209S/P210S에 상응함), 및 비-생식계열 돌연변이 V234A/G237A/P238S/H268A (EU 넘버링에 의함; 카밧 넘버링에 의한 V247A/G250A/P251S/H281A, 및 서열번호: 11을 참조한 V114A/G116A/P117S/H147A에 상응함)를 함유하는 변이체 (소위 IgG2σ)는 FcγR 및 C1q에 대한 결합을 제거하고 검출불가능한 CDC, ADCC 및 ADCP 활성을 나타낸다. 돌연변이 L234A/L235A/G237A/P238S/H268A/A330S/P331S를 포함하는 IgG1/IgG4 교차 하위 부류 변이체 IgG1σ는 FcγRI 및 IIIa에 대한 결합이 결여되고 고농도의 항체에서 FcγRIIa 및 IIb에 대한 결합이 매우 약하며, 감소된 ADCC 및 CDC 활성을 초래한다 (예를 들어, 문헌[Wang 등 (2018) Protein Cell 9(1):63-73; Saunders, K. O. (2019) Front. Immunol. 10:1296] 참조). In order to reduce or eliminate Fc effector function, large portions of Fc regions from different subclasses lacking the opposite function can be exchanged to create inter-subclass Fc regions. For example, IgG2 has weak FcγR binding but binds C1q, IgG4 lacks C1q binding but reacts with FcγR; Combinations of IgG2 and IgG4 CH domains lacking both C1q and FcγR binding can thus be constructed. In general, in an IgG1/IgG4 chimera, the
하기 표 9 및 10은 FcγR 및/또는 C1q에 대한 결합을 감소시키거나 제거하여 본 명세서의 작제물에서 Fc 영역으로 도입될 수 있는 ADCC, ADCP 및 CDC를 포함하는 면역 이펙터 기능을 감소시키거나 제거하는 일부 IgG1 및 IgG4 Fc 변형을 요약한다. Tables 9 and 10 below show reduction or elimination of binding to FcγR and/or C1q to reduce or eliminate immune effector functions including ADCC, ADCP and CDC that can be introduced into the Fc region in the constructs herein. Some IgG1 and IgG4 Fc modifications are summarized.
표는 서열번호: 9에 제시된 IgG1 중쇄 불변 도메인 또는 서열번호: 15에 제시된 IgG4 중쇄 불변 도메인의 서열과 관련하여 카밧 넘버링 및 순차 넘버링에 의한 상응하는 변형을 제공한다. 임의의 하나 이상의 이러한 변형은 단독으로 또는 다양한 조합으로 본 명세서에 제공된 작제물의 IgG1 Fc 부분에 도입될 수 있다. 면역 이펙터 기능을 감소시키거나 제거하기 위해 당업계에 공지된 다른 변형도 본 명세서에서 사용하기 위해 고려된다. The table provides the corresponding modifications by Kabat numbering and sequential numbering with respect to the sequence of the IgG1 heavy chain constant domain set forth in SEQ ID NO: 9 or the IgG4 heavy chain constant domain set forth in SEQ ID NO: 15. Any one or more of these modifications, alone or in various combinations, can be introduced into the IgG1 Fc portion of the constructs provided herein. Other modifications known in the art to reduce or eliminate immune effector function are also contemplated for use herein.
ii. ii. FcFc 부분의 다른 변형 different variations of parts
Fc 부분은 또한 억제성 FcγR에 대한 결합을 증가시키도록 변형되어 면역 반응을 억제할 수 있다. 면역억제성 Fc 변형을 갖는 치료 항체는 염증성 질환의 치료에 유리하다. 이들 돌연변이는 염증 요인 또는 병인 또는 관여가 있는 질환 및 병태의 치료를 위한 본 명세서의 작제물의 Fc 부분에 통합될 수 있다. 예를 들어, 돌연변이 S267E/L328F(EU 넘버링에 의함)를 함유하는 항-CD19 항체(XmAb5871; Xencor)의 면역억제 버전은 억제성 FcγRIIb에 약 430배 증가된 친화도로 결합하고 전신 홍반성 낭창 (SLE)이 있는 환자에서 CD19+ B-세포를 고갈시킨다. 동일한 돌연변이가 인간화 항-IgE 항체(XmAb7195; Xencor)에 도입될 때 호염기구 및 비만 세포에 존재하는 고친화성 수용체(FcεRI)에 대한 IgE의 결합을 방지하고 FcγRIIb에 대한 친화도를 ~430-배 증가시키고, 알러지 천식을 포함한 알러지 치료에 사용된다. 비당화 Fc 돌연변이 N297A(EU 넘버링에 의함)를 함유하는 항-CD3 항체 TRX4(Tolerx)는 병원성 T-세포를 억제하고 1형 당뇨병(자가면역) 환자에서 정상 Treg 세포 활성을 회복시킨다 (예를 들어, 문헌[Saxena 등 (2016) Front. Immunol. 7:580] 참조). The Fc portion can also be modified to increase binding to inhibitory FcγRs to suppress the immune response. Therapeutic antibodies with immunosuppressive Fc modifications are beneficial for the treatment of inflammatory diseases. These mutations may be incorporated into the Fc portion of the constructs herein for treatment of diseases and conditions in which an inflammatory factor or pathogenesis or involvement is involved. For example, an immunosuppressive version of the anti-CD19 antibody (XmAb5871; Xencor) containing the mutations S267E/L328F (by EU numbering) binds the inhibitory FcγRIIb with approximately 430-fold increased affinity and prevents systemic lupus erythematosus (SLE). ) depletes CD19 + B-cells in patients with When the same mutation is introduced into a humanized anti-IgE antibody (XmAb7195; Xencor), it prevents binding of IgE to the high-affinity receptor (FcεRI) present on basophils and mast cells and increases the affinity for FcγRIIb ~430-fold. It is used in the treatment of allergies, including allergic asthma. Anti-CD3 antibody TRX4 (Tolerx) containing the aglycosylated Fc mutation N297A (by EU numbering) suppresses pathogenic T-cells and restores normal Treg cell activity in patients with
추가적인 예는 돌연변이 L351S/T366R/L368H/P395K (EU 넘버링에 의함)를 함유하는 단량체성 IgG1 Fc(mFc)이며, 이는 FcRn에 결합하고 이량체성 Fc와 유사한 생체 내 반감기를 나타내고, 고친화도로 FcγRI에 선택적으로 결합하지만, FcγRIIIa에 결합하지 않아 ADCC 및 CDC를 포함한 Fc 매개 세포 독성을 제거한다. FcγRI는 염증성 대식세포와 같은 염증 관련 세포에서 발현된다. 이 수용체를 표적으로 하는 것은 관절염, 다발성 경화증 및 암과 같은 만성 염증성 질환의 치료에 사용될 수 있다. 변이체 mFc는 슈도모나스 외독소 A 단편(PE38)에 융합될 때, FcγRI+ 대식세포 유사 U937 세포를 사멸한다. 변이체 mFc도 융합 단백질도 시험관 내에서 어떠한 세포독성(ADCC 또는 CDC)도 나타내지 않다 (예를 들어, 문헌[Ying 등 (2014) mAbs 6(5):1201-1210] 참조). A further example is a monomeric IgG1 Fc (mFc) containing the mutations L351S/T366R/L368H/P395K (by EU numbering), which binds FcRn, exhibits a half-life in vivo similar to dimeric Fc, and binds to FcγRI with high affinity. It selectively binds, but does not bind FcγRIIIa, eliminating Fc-mediated cytotoxicity including ADCC and CDC. FcγRI is expressed in inflammation-related cells such as inflammatory macrophages. Targeting this receptor can be used for the treatment of chronic inflammatory diseases such as arthritis, multiple sclerosis and cancer. When the variant mFc is fused to the Pseudomonas exotoxin A fragment (PE38), FcγRI+ Kill the macrophage-like U937 cells. Neither the variant mFc nor the fusion protein exhibits any cytotoxicity (ADCC or CDC) in vitro (see, e.g., Ying et al. (2014)mAbs6(5):1201-1210).
FcγRIIIa가 아닌 억제성 FcγRIIb 및/또는 FcγRI에 대한 결합을 증가시키거나 그에 대한 선택적 결합을 부여하는 변형은 본 명세서에 제공된 TNFR1 길항제 및 TNFR1 길항제/TNFR2 효능제 작제물에서 IgG Fc 영역으로 조작될 수 있다. 이러한 변형에는 EU 넘버링에 의해 S267E, N297A, L328F, L351S, T366R, L368H, P395K, S267E/L328F, L351S/T366R/L368H/P395K, 및 이들의 조합 중 하나 이상을 포함하지만 이에 제한되지 않는다. 하기 표 11은 서열번호: 9에 제시된 IgG 중쇄 불변 도메인의 서열과 관련하여 카밧 넘버링 및 순차적 넘버링에 의한 상응하는 대체를 보여준다.Modifications that increase binding to, or confer selective binding to, inhibitory FcγRIIb and/or FcγRI, but not FcγRIIIa, can be engineered into the IgG Fc region in the TNFR1 antagonist and TNFR1 antagonist/TNFR2 agonist constructs provided herein. . Such variations include, but are not limited to, one or more of S267E, N297A, L328F, L351S, T366R, L368H, P395K, S267E/L328F, L351S/T366R/L368H/P395K, and combinations thereof by EU numbering. Table 11 below shows the corresponding replacements by Kabat numbering and sequential numbering with respect to the sequence of the IgG heavy chain constant domain set forth in SEQ ID NO:9.
iii. 인간 혈청 알부민(HSA)iii. Human Serum Albumin (HSA)
이전에 제공된 dAb의 문제점(예를 들어, 국제 PCT 출원 제2008/149144호 참조)은 혈청 반감기가 치료제로 사용하기에 불충분하다는 점이었다. 그들은 HSA에 결합하기 위해 항-HSA 항체에 연결되었고; 반감기가 부족하였다. 여기서 dAb 또는 Vhh 항체는 HSA에 연결된다. HSA에는 33개의 시스테인이 있고; Cys34는 디설파이드 결합에 참여하지 않는 유리 설프하이드릴 기를 가진 유일한 시스테인이다. HSA는 N 또는 C 말단을 통해 dAb에 직접 연결되거나 Gly-Ser 링커와 같은 링커를 통해 연결되어 dAb의 혈청 반감기를 확장할 수 있다. 그것은 또한 유리 시스테인을 통해 연결될 수 있다. 실시예 6은 Gly-Ser 링커를 통해 HSA의 N-말단에 연결된 dAb를 함유하는 작제물을 예시한다.A problem with previously provided dAbs (see, eg, International PCT Application No. 2008/149144) has been that the serum half-life is insufficient for use as a therapeutic agent. They were linked to anti-HSA antibodies to bind HSA; The half-life was insufficient. wherein the dAb or Vhh antibody is linked to HSA. HSA has 33 cysteines; Cys34 is the only cysteine with a free sulfhydryl group that does not participate in disulfide bonds. HSA can be linked directly to the dAb via its N or C terminus or via a linker such as the Gly-Ser linker to extend the serum half-life of the dAb. It can also be linked through free cysteines. Example 6 illustrates a construct containing a dAb linked to the N-terminus of HSA via a Gly-Ser linker.
e. 다중특이적 TNFR1 길항제/TNFR2 효능제 작제물 e. Multispecific TNFR1 antagonist/TNFR2 agonist constructs
TNFR1 신호전달을 선택적으로 억제하기 위해, TNFR2 신호전달의 유익한 효과를 향상시키면서, TNFR1 길항제 및 TNFR2 효능제를 함유하는 다중특이적, 예컨대 이중특이적 작제물이 제공된다 (예를 들어, 상기 식 2 참조). 이러한 다중특이적 작제물은 상기에 논의한 바와 같이 필요에 따라 유리한 특성을 부여하기 위해 링커 및 활성 변형제를 포함할 수 있다.To selectively inhibit TNFR1 signaling, while enhancing the beneficial effects of TNFR2 signaling, multispecific, such as bispecific constructs containing a TNFR1 antagonist and a TNFR2 agonist are provided (e.g., formula 2 above). reference). Such multispecific constructs, as discussed above, may contain linkers and active modifiers to impart advantageous properties as desired.
본 명세서에 제공된 작제물의 TNFR1 억제제 및 TNFR2 효능제 부분은 폴리펩티드 또는 소분자 또는 이들의 조합일 수 있으며; 직접적으로 임의의 순서로 직접적으로, 또는 간접적으로 링커, 예컨대 본 명세서에 기재된 임의의 것을 포함하는 Gly-Ser 링커, 및/또는 힌지 영역을 통해 연결될 수 있거나, 화학 링커를 통해 연결될 수 있다. 작제물은 활성 변형제, 예컨대 Fc 영역 또는 변형된 Fc, 및/또는 다른 활성 변형제, 예컨대 폴리펩티드, 예컨대 반감기를 연장하는 HAS를 함유할 수 있고, 중합체, 예컨대 PEG 또는 중합체성 모이어티일 수 있다. The TNFR1 inhibitor and TNFR2 agonist portions of the constructs provided herein can be polypeptides or small molecules or combinations thereof; Can be linked directly in any order, directly or indirectly via a linker, such as a Gly-Ser linker, including any described herein, and/or a hinge region, or can be linked via a chemical linker. The constructs may contain active modifiers, such as an Fc region or modified Fc, and/or other active modifiers, such as polypeptides, such as HAS, which extend half-life, and may be polymers, such as PEG or polymeric moieties.
서열번호: 54-703 중 어느 하나에 기재된 TNFR1 길항제와 같은 인간 TNFR1 길항제, 또는 서열번호: 54-703 중 임의의 것에 제시된 TNFR1 길항제와 약 또는 적어도 약 95% 서열 동일성을 갖는 TNFR1 길항의 C-말단은 트라스투주맙으로부터 유래된 IgG1 Fc와 같은 제1 IgG1 Fc의 N-말단과 융합된다. 순서는 뒤바뀔 수 있다.A human TNFR1 antagonist, such as a TNFR1 antagonist set forth in any one of SEQ ID NOs: 54-703, or the C-terminus of a TNFR1 antagonist having about or at least about 95% sequence identity to a TNFR1 antagonist set forth in any of SEQ ID NOs: 54-703. is fused to the N-terminus of a first IgG1 Fc, such as an IgG1 Fc derived from Trastuzumab. The order can be reversed.
Fc 영역은 트라스투주맙 중쇄의 CH2 및 CH3 도메인을 함유한다 (예를 들어, 서열번호: 26의 잔기 234-450 참조). 일부 구현예에서, TNFR1 길항제와 제1 Fc 서브유닛 사이의 링커는 트라스투주맙(SCDKTH; 서열번호: 26의 잔기 222-227에 상응함)과 같은 항체의 힌지 서열의 전부 또는 일부를 함유한다. 프로테아제 저항성을 부여하고 융합 단백질의 가요성을 증가시키기 위해, SCDKTH 힌지 서열 또는 프로테아제 절단 부위 또는 둘 다 Gly-Ser 짧은 펩티드 링커, 예를 들어 GSGS, GGGGS 또는 GGGGSGGGGSGGGGS, 및 본 명세서에 기재되고/거나 당업계에 공지된 기타로 대체될 수 있다. 다른 구현예에서, GS 링커만이 포함된다. 또 다른 구현예에서, 링커는 30 kDa 이상의 분자량을 갖는 PEG 또는 분지형 PEG를 함유한다. The Fc region contains the C H 2 and C H 3 domains of Trastuzumab heavy chain (see, eg, residues 234-450 of SEQ ID NO: 26). In some embodiments, the linker between the TNFR1 antagonist and the first Fc subunit contains all or part of the hinge sequence of an antibody such as Trastuzumab (SCDKTH; corresponding to residues 222-227 of SEQ ID NO: 26). To confer protease resistance and increase flexibility of the fusion protein, the SCDKTH hinge sequence or protease cleavage site or both Gly-Ser short peptide linkers such as GSGS, GGGGS or GGGGSGGGGSGGGGS, and/or sugars described herein Others known in the art may be substituted. In other embodiments, only the GS linker is included. In another embodiment, the linker contains a branched PEG or PEG having a molecular weight of 30 kDa or greater.
일부 구현예에서, Fc 서브유닛(영역 또는 도메인으로도 지칭됨)은 다량체화될 수 있다. 제1 Fc 서브유닛은 디설파이드 결합을 통해 제2 Fc 서브유닛에 부착된다. 이중특이적 작제물의 경우, 제2 Fc 서브유닛의 C-말단은 TNFR2 효능제, 예를 들어, 서열번호: 765-801, 803, 및 810 중 임의의 것의 TNFR2 효능제, 또는 서열번호: 765-801, 803, 및 810 중 임의의 것의 TNFR2 효능제, 또는 소분자 TNFR2 효능제와 약 또는 적어도 약 95% 서열 동일성을 갖는 TNFR2 효능제의 N-말단에 연결된다. 제2 Fc 서브유닛 및 TNFR2 효능제는 트라스투주맙의 SCDKTH 힌지 서열과 같은 링커를 통해 단독으로 또는 상기 기재된 바와 같이 짧은 GS 링커와 조합하여 연결된다. 다른 구현예에서, GS 링커만이 포함된다. 대안적인 구현예에서, 단쇄 Fv 단편(scFv), 또는 Fab 영역, 또는 TNFR2 효능적 단클론성 항체의 다른 항원 결합 단편이 사용될 수 있고; scFv 또는 Fab는 Fc의 C-말단과 N-말단 융합에 의해 이량체화된다. 본 명세서에 제공된 바와 같이, 항원 결합 단편은 TNFR2 효능적 mAb MR2-1 및 MAB226으로부터 유래될 수 있다.In some embodiments, Fc subunits (also referred to as regions or domains) can multimerize. The first Fc subunit is attached to the second Fc subunit via a disulfide bond. For the bispecific construct, the C-terminus of the second Fc subunit is a TNFR2 agonist, e.g., a TNFR2 agonist of any of SEQ ID NOs: 765-801, 803, and 810, or SEQ ID NO: 765 -801, 803, and 810, or a TNFR2 agonist having about or at least about 95% sequence identity to the TNFR2 agonist, or a small molecule TNFR2 agonist. The second Fc subunit and the TNFR2 agonist are linked through a linker such as the SCDKTH hinge sequence of Trastuzumab, either alone or in combination with a short GS linker as described above. In other embodiments, only the GS linker is included. In an alternative embodiment, a single chain Fv fragment (scFv), or Fab region, or other antigen binding fragment of a TNFR2 agonistic monoclonal antibody may be used; A scFv or Fab dimerizes by fusion of the C-terminus and the N-terminus of Fc. As provided herein, antigen-binding fragments can be derived from TNFR2 agonizing mAbs MR2-1 and MAB226.
Fc 서브유닛은 그 활성을 변경하도록 변형될 수 있다. 예를 들어, 이량체는 동종이량체화를 방지하고/하거나 면역 이펙터 기능, 예컨대 항체 의존적 세포 세포독성 (ADCC), 항체 의존적 세포 매개 식균작용 (ADCP), 및/또는 보체 의존적 세포독성 (CDC)를 제거하고/하거나 하기에 기재된 바와 같이 재조합 작제물의 생체내 반감기 및 안정성을 증가시키기 위해 신생아 FcR(FcRn) 재순환을 향상시키기 위해 변형된다. An Fc subunit can be modified to alter its activity. For example, dimers prevent homodimerization and/or inhibit immune effector functions such as antibody dependent cellular cytotoxicity (ADCC), antibody dependent cell mediated phagocytosis (ADCP), and/or complement dependent cytotoxicity (CDC). and/or modified to enhance neonatal FcR (FcRn) recycling to increase the in vivo half-life and stability of the recombinant construct, as described below.
작제물이 염증성 질환의 치료를 위한 구현예에서, Fc 부분은 이펙터 기능이 감소되거나 제거되도록 변형된다. 구현예에서, 예를 들어 작제물이 암의 치료를 위한 것인 경우, Fc 이량체는 ADCC, ADCP 및/또는 CDC와 같은 면역 이펙터 기능을 향상시키기 위해 변형된다. 특정 Fc 변형은 의도된 질환 표적에 따라 다르다.In embodiments where the construct is for treatment of an inflammatory disease, the Fc portion is modified such that effector function is reduced or eliminated. In an embodiment, the Fc dimer is modified to enhance immune effector function such as ADCC, ADCP and/or CDC, eg where the construct is for the treatment of cancer. The specific Fc modification depends on the intended disease target.
일부 구현예에서, Fc 서브유닛(들)은 니볼루맙 중쇄의 CH2 및 CH3 도메인을 함유하는 니볼루맙(Opdivo®)으로부터 유래된 IgG4 Fc와 같은 IgG4 Fc 영역을 함유할 수 있다 (예를 들어, 잔기 224-440 서열번호: 29 참조). 가요성을 제공하기에 충분한 니볼루맙 힌지 서열의 전부 또는 일부를 함유하는 짧은 펩티드 링커인 ESKYGPPCPPCP(예를 들어, 서열번호: 29의 잔기 212-223 참조)는 니볼루맙 Fc 영역과 TNFR1 길항제 및/또는 TNFR2 효능제 사이에 포함될 수 있다. 선택적으로 또는 대안적으로 GS 링커도 포함될 수 있다. In some embodiments, the Fc subunit(s) may contain an IgG4 Fc region, such as an IgG4 Fc derived from nivolumab ( Opdivo® ) that contains the C H 2 and C H 3 domains of a nivolumab heavy chain (e.g. See, eg, residues 224-440 SEQ ID NO: 29). ESKYGPPCPPCP (see eg residues 212-223 of SEQ ID NO: 29), a short peptide linker containing all or part of the nivolumab hinge sequence sufficient to provide flexibility, can be used to link the nivolumab Fc region with a TNFR1 antagonist and/or TNFR2 agonists. Optionally or alternatively, a GS linker may also be included.
예시적인 구현예에서, TNFR2는 신호전달을 위해 수용체 응집/클러스터링을 필요로 할 수 있기 때문에, 우수한 효능작용을 달성하기 위해 2가 항체 유사 구조가 생성될 수 있다. 이 구현예에서, 제1 및 제2 Fc 서브유닛 각각의 C-말단은 전술한 바와 같이 TNFR2 효능제의 N-말단에 융합된다. Fc 이량체는 본 명세서의 다른 곳에 기재된 바와 같이 동종이량체화를 방지하고, 항체 의존성 세포 독성(ADCC) 및 보체 의존성 세포 독성(CDC)을 제거하고, 신생아 FcR 재순환을 강화하여 재조합 작제물의 생체 내 반감기를 증가시키도록 변형된다. In exemplary embodiments, since TNFR2 may require receptor aggregation/clustering for signaling, bivalent antibody-like structures can be created to achieve superior agonism. In this embodiment, the C-terminus of each of the first and second Fc subunits is fused to the N-terminus of the TNFR2 agonist as described above. Fc dimers, as described elsewhere herein, prevent homodimerization, eliminate antibody-dependent cytotoxicity (ADCC) and complement-dependent cytotoxicity (CDC), and enhance neonatal FcR recycling to enhance the bioactivity of recombinant constructs. modified to increase my half-life.
이중 특이적, dual specific, TNFR1TNFR1 길항제/ antagonist/ TNFR2TNFR2 효능제agonist 작제물과construct and 같은 다중특이적 same multispecific 작제Composition 물, PEG 중심 다중특이적 작제물의 성분를 연결하기 위한 PEG화PEGylation to Link Components of Water, PEG-Centric Multispecific Constructs
생체적합성이 있고 생물학적으로 불활성인 중합체 폴리(에틸렌 글리콜)(PEG)을 분자, 예컨대 단백질, 펩티드, 약물 및 다른 분자에 공유 부착하는 것을 지칭하는 PEG화는 작제물의 활성의 또 다른 개질제이다. PEG화는 분자의 수용해도를 증가시키고, 상기 분자의 분자량을 증가시키고, 생체 내 순환 시간을 연장시키고, 주변 제거율(clearance rate)을 감소시키고, 비 특이적 섭취를 최소화하고, 강화된 투과성 및 유지(EPR) 효과를 통해 종양을 표적화할 수 있다. 치료제, 예컨대 단백질 치료제의 PEG화는 바람직하지 않은 항원성 표면 마커를 가림으로써 치료제를 항체 및 항원 가공 세포의 작용으로부터 보호할 수 있고, 그럼으로써, 단백분해 효소 및 다른 불활성화 공정에 의한 분해를 감소시킨다. PEG화는 또한 상기 단백질 치료제의 분자량을 증가시킴으로써, 생체 내 반감기를 연장시키고 주변 제거능을 감소시키고, 그래서 덜 빈번한 투여를 가능하게 한다. PEGylation, which refers to the covalent attachment of the biocompatible and biologically inert polymer poly(ethylene glycol) (PEG) to molecules such as proteins, peptides, drugs and other molecules, is another modifier of the activity of a construct. PEGylation increases the water solubility of a molecule, increases the molecular weight of the molecule, prolongs circulation time in vivo , reduces peripheral clearance rate, minimizes non-specific uptake, and enhances permeability and retention (EPR) effect to target tumors. PEGylation of therapeutics, such as protein therapeutics, can protect the therapeutic from the action of antibodies and antigen processing cells by masking undesirable antigenic surface markers, thereby reducing degradation by proteolytic enzymes and other inactivation processes. let it PEGylation also increases the molecular weight of the protein therapeutic, thereby prolonging the half- life in vivo and reducing peripheral clearance, thus allowing for less frequent dosing.
치료 분자와 중합체, 예컨대 PEG와의 화학적 콘주게이션은 디설파이드 결합 뿐만 아니라 안정한 에스테르 또는 아미드 결합을 형성할 수 있다. 관심 대상 분자, 예컨대 본 명세서에 제공된 TNFR1 길항제 및 TNFR2 효능제와 PEG의 콘주게이션은 예를 들어, 예컨대, 디사이클로헥실카보디이미드(DCC), 1-에틸-3-(3-디메틸아미노프로필)카보디이미드(EDC), HATU(1-[비스(디메틸아미노)메틸렌]-1H-1,2,3-트리아졸로[4,5-b]피리디늄 3-옥시드헥사플루오로포스페이트), 또는 기타 당업계에 알려진 커플링제를 사용함으로써, 또는 N-하이드록시석신이미드(NHS) 에스테르, 예컨대 PEG NHS 에스테르를 사용함으로써 달성될 수 있다. 다른 방법에는 단백질 또는 펩티드 상의 설프하이드릴 작용기와 반응하는 PEG 말레이미드, 일차 및 이차 아민과 반응하는 PEG 펜타플루오로페닐(PFP) 에스테르, 시스테인 잔기의 측쇄 상의 티올과 반응하는 티올 PEG, 및 클릭(click) 화학 기술의 사용이 포함된다. PEG 아지드, 프로파르길 PEG, 아미노옥시 PEG, 하이드록시 PEG, 아미노 PEG, PEG 산, 바이오틴 PEG, PEG 토실레이트, 및 다른 작용기를 구비한 PEG가 또한 상업적으로 입수 가능하고, 펩티드 및 다른 치료 분자에 접합을 위해 사용될 수 있다. Chemical conjugation of a therapeutic molecule with a polymer, such as PEG, can form stable ester or amide linkages as well as disulfide linkages. Conjugation of PEG with a molecule of interest, such as a TNFR1 antagonist and a TNFR2 agonist provided herein, can be achieved, for example, with dicyclohexylcarbodiimide (DCC), 1-ethyl-3-(3-dimethylaminopropyl) Carbodiimide (EDC), HATU (1-[bis(dimethylamino)methylene]-1H-1,2,3-triazolo[4,5-b]pyridinium 3-oxidehexafluorophosphate), or This may be achieved by using other art-known coupling agents, or by using N -hydroxysuccinimide (NHS) esters such as PEG NHS esters. Other methods include PEG maleimides that react with sulfhydryl functional groups on proteins or peptides, PEG pentafluorophenyl (PFP) esters that react with primary and secondary amines, thiol PEG that react with thiols on the side chains of cysteine residues, and clicks ( click) involves the use of chemical techniques. PEG azide, propargyl PEG, aminooxy PEG, hydroxy PEG, amino PEG, PEG acid, biotin PEG, PEG tosylate, and PEG with other functional groups are also commercially available, peptides and other therapeutic molecules can be used for bonding.
PEG-단백질 콘주게이트를 제조하는 일반적인 방법은 단백질 상의 -NH2 작용기 및 모노메톡시 PEG(mPEG)를 친전자성 작용기와 체결하는 것인데; 이와 같은 접근법은 코어에 있는 구상 단백질에 공유 연결된 중합체 사슬의 형성을 초래한다. 이와 같은 특성이 본원에서 이용되어 PEG, 또는 화학적으로 유사한 또는 적합한 모이어티가 하나 또는 복수의 상이한 표적에 복수의 결합 모이어티 또는 상호작용 모이어티를 표시하는 PEG-중심 작제물을 제공한다. 약물(결합 모이어티) 실장(loading)을 증가시키기 위해, 다중-팔 또는 분지형 사슬 PEG(또는 유사한 모이어티 또는 분지형 사슬 모이어티)가 사용될 수 있다. 대안적으로, 상기 약물은 작은 PEG 덴드론(예를 들어, broadpharm.com/web/protocols.php에서 이용 가능한 BROADPHARM® 웹사이트에서 PEG 콘주게이션 프로토콜 참조; 또한, Banerjee 등 (2012) Journal of Drug Delivery, Article ID 103973 참조)에 접합될 수 있다. 복수의, 예컨대 2개의 상이한 치료적 모이어티를 부착하기 위해, 예컨대 각각의 단부에 상이한 반응성 작용기를 구비한 이종다작용성, 예컨대 이종이중작용성 PEG 모이어티가 사용될 수 있다. 상기 PEG 모이어티는 2개, 3개, 또는 그 이상의 상이한 반응성 작용기를 가질 수 있다. 이러한 분자는 2개 이상의 상이한 리간드를 전달함으로써, 동일한 세포 또는 본 명세서에 기재된 바와 같이, 상이한 세포, 예컨대 TNFR1 및 TNFR2 상의 2개의 상이한 수용체를 표적화하거나, 또는 동일한 수용체 상의 상이한 부위에 결합되는 2개의 표적화제를 전달하거나, 또는 예를 들어, 수용체를 활성화 또는 억제하기 위해 상기 수용체를 모으거나, 또는 예를 들어, 수용체 활성을 억제하기 위해 2개의 상이한 수용체를 교차연결하는 데 사용될 수 있다. 각각의 단부에 동일한 반응성 작용기를 구비한 동종이중작용성 PEG 분자는 동일한 세포 상의, 또는 상기 PEG 사슬 길이가 허락하는 경우, 상이한 세포 상의 동일한 수용체들을 모으는 데 사용될 수 있다. 이러한 작제물은 순환하는 가용성 수용체, 또는 리간드, 예컨대 TNF를 가두는 데 사용될 수 있다. 본원의 도 3은 약물(결합형 반응성 모이어티)을 표시하기 위해 PEG 모이어티를 활용하는 예시적인 작제물을 제공한다.A common method for preparing PEG-protein conjugates is to associate a -NH 2 functional group and monomethoxy PEG (mPEG) on a protein with an electrophilic functional group; This approach results in the formation of polymer chains covalently linked to globular proteins in the core. This property is used herein to provide PEG-centric constructs in which PEG, or chemically similar or compatible moieties, presents a plurality of binding or interacting moieties to one or a plurality of different targets. To increase drug (binding moiety) loading, multi-arm or branched chain PEG (or similar moieties or branched chain moieties) can be used. Alternatively, the drug is a small PEG dendron (see, eg, the PEG conjugation protocol on the BROADPHARM ® website available at broadpharm.com/web/protocols.php; see also Banerjee et al. (2012) Journal of Drug Delivery , Article ID 103973). To attach a plurality, eg two different therapeutic moieties, heterobifunctional, eg heterobifunctional PEG moieties, eg with different reactive functional groups on each end, can be used. The PEG moiety may have two, three, or more different reactive functional groups. Such molecules target two different receptors on the same cell or, as described herein, on different cells, such as TNFR1 and TNFR2, by delivering two or more different ligands, or two targets that bind to different sites on the same receptor. It can be used to deliver an agent, or to bring together a receptor, eg to activate or inhibit a receptor, or to cross-link two different receptors, eg to inhibit a receptor activity. Homobifunctional PEG molecules with the same reactive functional group at each end can be used to recruit the same receptors on the same cell or, if the PEG chain length permits, on different cells. Such constructs can be used to trap circulating soluble receptors, or ligands such as TNF. Figure 3 herein provides an exemplary construct utilizing a PEG moiety to display a drug (linked reactive moiety).
반응성 및 가요성을 증가시키고, 리간드-단백질 결합을 강화시키고 입체 장애를 감소시키기 위해, 작제물에 본 명세서에 기재된 바와 같이 스페이서 분자와 같은 하나의 링커 분자 또는 그것의 복수를 포함시킬 수 있다. 이러한 스페이서에는 예를 들어, 아미노산 스페이서, 예컨대 알라닌, 글리신, 및 작은 펩티드가 포함된다. 강성 링커뿐만 아니라 GS 링커 및 다른 가요성 링커를 비롯하여, 본원에 기재된 임의의 링커는 반응성 모이어티, 예컨대 본 명세서에 기재된 TNFR1 억제제 모이어티 및/또는 본원에 기재된 TNFR2 효능제를 다작용성 PEG 분자에 접합시키는 데 사용될 수 있다. 이들 작제물은 또한 예컨대 Fc 영역과 같은 활성 변형제를 포함할 수 있다.To increase reactivity and flexibility, enhance ligand-protein binding and reduce steric hindrance, the construct may include one linker molecule, such as a spacer molecule, or a plurality thereof, as described herein. Such spacers include, for example, amino acid spacers such as alanine, glycine, and small peptides. Any of the linkers described herein, including rigid as well as GS linkers and other flexible linkers, can conjugate a reactive moiety, such as a TNFR1 inhibitor moiety described herein and/or a TNFR2 agonist described herein, to a multifunctional PEG molecule. can be used to make These constructs may also include active modifiers, such as an Fc region.
링커의 존재 유무 상태에서 분지형 PEG 모이어티, 또는 본 명세서에 기재된 다중-팔 PEG 모이어티(예를 들어, 도 5 참고)의 사용은 TNFR1 억제제 모이어티 또는 TNFR2 효능제, 또는 둘의 조합을 함유하는 작제물에서의 사용에 제한되지 않으나, 관심대상의 임의의 수용체(들)의 다른 억제제 및/또는 효능제 모이어티를 제공하고/하거나 또한 면역독소 및 다른 독성 콘주게이트를 생산하기 위해 사용될 수 있다. 다수의 PEG 모이어티 및 이것의 변형들의 합성 방법이 알려져 있다 (예를 들어, 미국 특허 공개 제2010/0221213호; Han 등, (2014) Sci Rep 4:4387 참고. The use of a branched PEG moiety, with or without a linker, or a multi-armed PEG moiety described herein (see, e.g., FIG. 5) contains a TNFR1 inhibitor moiety or a TNFR2 agonist, or a combination of both. However, it can be used to provide other inhibitors and/or agonist moieties of any receptor(s) of interest and/or also to produce immunotoxins and other toxic conjugates. . Methods for the synthesis of a number of PEG moieties and variants thereof are known (see, eg, US Patent Publication No. 2010/0221213; Han et al., (2014) Sci Rep 4 :4387.
예를 들어, TNFR1 억제제 및 TNFR2 효능제 모이어티를 함유하는 일부 구현예에서, 작제물은 이중작용성 PEG 모이어티를 포함하고, 또한 상기 PEG 모이어티와 TNFR1 길항제 및 TNFR2 효능제 각각의 사이에 있는 링커를 포함한다. 다중특이적 작제물은 상기 링커가 부착되고, TNFR1 억제제 모이어티 및 TNFR2 모이어티 중 하나 또는 둘 모두가 부착된 분지형 PEG 중합체를 함유한다. 적합한 PEG 모이어티는 분자량이 30 kDa 이상, 예를 들어, 30~40 kDa 이상일 수 있다. 예시적인 분지형 PEG 분자는 예를 들어, 3개의 팔이 있는 이종이중작용성 PEG 분자일 수 있는데, 이것은 한 가지 유형의 반응성 작용기(RG1; 예를 들어, -NH2)를 구비하고 TNFR1 억제제 모이어티에 연결된 1개의 팔과, 상이한 유형의 반응성 작용기(RG2; 예를 들어, -COOH)를 구비하고 각각이 TNFR2 효능제에 연결된 2개의 팔을 함유한다. 이러한 3개의 팔이 있는 이종이중작용성 분지형 PEG 분자는 상업적으로 입수 가능하다 (예를 들어, BROADPHARM®에서 구입 가능). 상기 제1 PEG 팔은 TNFR1 억제제 모이어티의 N-말단 또는 C-말단에 연결될 수 있고, 다른 2개의 팔은, 소분자인 경우, TNFR2 효능제의 N-말단 또는 C-말단에 또는 TNFR2 효능제에 연결될 수 있다. 일부 구현예에서, 작제물은 또한 본 명세서에 기재된 바와 같이 선택적 링커를 포함할 수 있다. 이러한 링커는 PEG 팔들과 TNFR1 억제제 모이어티 및/또는 TNFR2 효능제(들) 사이에 포함될 수 있다. 이러한 PEG-중심 이중특이성 작제물은 TNFR1 길항제 활성에 대해 1가를 제공하는데, 이것은 원하지 않는 효능작용으로 이어지는 TNFR1 수용체 클러스터링을 방지하고 TNFR2 신호전달을 강화시키는 TNFR2 수용체 클러스터링을 위해 2가를 제공한다. 본원에 기재된 PEG-중심 이중특이성 TNFR1 길항제/TNFR2 효능제 작제물에 대한 예시적인 구조가 도 3에 도시된 것들에 속한다.For example, in some embodiments containing a TNFR1 inhibitor and a TNFR2 agonist moiety, the construct comprises a bifunctional PEG moiety, and also intervenes the PEG moiety and the TNFR1 antagonist and TNFR2 agonist, respectively. contains linkers. The multispecific construct contains a branched PEG polymer to which the linker is attached and to which one or both of the TNFR1 inhibitor moiety and the TNFR2 moiety are attached. Suitable PEG moieties may have a molecular weight of greater than 30 kDa, such as greater than 30-40 kDa. An exemplary branched PEG molecule can be, for example, a three-armed heterobifunctional PEG molecule, which has one type of reactive functional group (RG1; eg , -NH 2 ) and is a TNFR1 inhibitor moir. It contains one arm connected to a tee, and two arms with different types of reactive functional groups (RG2; eg , -COOH), each linked to a TNFR2 agonist. Such three-armed heterobifunctional branched PEG molecules are commercially available (eg, available from BROADPHARM® ). The first PEG arm may be linked to the N-terminus or C-terminus of the TNFR1 inhibitor moiety and the other two arms, if small molecules, to the N-terminus or C-terminus of the TNFR2 agonist or to the TNFR2 agonist can be connected In some embodiments, the constructs may also include an optional linker as described herein. Such linkers may be included between the PEG arms and the TNFR1 inhibitor moiety and/or the TNFR2 agonist(s). This PEG-centric bispecific construct provides monovalent for TNFR1 antagonist activity, which prevents TNFR1 receptor clustering leading to undesired agonism and provides bivalent for TNFR2 receptor clustering that enhances TNFR2 signaling. Exemplary structures for the PEG-centric bispecific TNFR1 antagonist/TNFR2 agonist constructs described herein fall within those shown in FIG. 3 .
또 다른 구현예에서, TNFR1 길항제 및 TNFR2 효능제 사이의 링커는 분자량이 30 kDa 이상인 분지형 PEG를 함유한다. 분지형 PEG 분자는 그것이 TNFR1 길항제의 N-말단에 연결시킨 한 분지와 TNFR2 효능제에 각각 연결된 2개의 분지를 함유함으로써, TNFR2 신호전달을 강화시키는 TNFR2 수용체 클러스터링에 대한 2원자가를 제공한다.In another embodiment, the linker between the TNFR1 antagonist and the TNFR2 agonist contains a branched PEG having a molecular weight of 30 kDa or greater. The branched PEG molecule contains one branch linked to the N-terminus of the TNFR1 antagonist and two branches each linked to the TNFR2 agonist, thereby providing a divalence for TNFR2 receptor clustering that enhances TNFR2 signaling.
도 3a~d는 PEG 모이어티가 기능적 모이어티를 연결하는 다중특이적 작제물의 다양한 구성을 도시한다. PEG화 모이어티 및 PEG화 절차는 하기 섹션 H에서 더 상세히 논의된다. 다양한 PEG 링커 및 구성을 제조하는 방법은 당업자에게 잘 알려져있다 (예를 들어, creativepegworks.com/pegylation_literature.php; and broadpharm.com/web/protocols.php 참조). 도 3에서, 각각의 n은 독립적으로 1~10, 예컨대 1~7, 1~5, 및 1~3, 1 또는 2일 수 있다. 도 3a에서, 각각의 n은 표시된 특정 리간드에 따라 일반적으로 1~3이다. 도 3의 다른 부분에서, n은 일반적으로 1 내지 5이다. 모든 구현예에서 N은 1일 수 있다. 당업자는 중심 링커로서 역할을 하는 PEG 모이어티의 다른 일상적인 변화를 인식할 것이고, 유사한 모이어티가 PEG 대신에 사용될 수 있다. 3A-D depict various configurations of multispecific constructs in which PEG moieties link functional moieties. PEGylation moieties and PEGylation procedures are discussed in more detail in Section H below. Methods for preparing various PEG linkers and constructs are well known to those skilled in the art (see, eg, creativepegworks.com/pegylation_literature.php; and broadpharm.com/web/protocols.php). In FIG. 3 , each n may independently be 1 to 10, such as 1 to 7, 1 to 5, and 1 to 3, 1 or 2. In Figure 3a, each n is typically 1-3 depending on the particular ligand indicated. In other parts of Figure 3, n is generally 1 to 5. In all embodiments N may be 1. One skilled in the art will recognize other routine variations of the PEG moiety that serve as the central linker, and similar moieties can be used in place of PEG.
도 3a에서, In Figure 3a,
R1은 H 또는 저급 알킬(C1 내지 C5, 또는 C1 또는 C2), 예컨대 CH3이고, n은 일반적으로 1 내지 5, 예컨대 1 또는 2이다. 도면들은 다중 표적들(즉, 수용체 상의 에피토프, 예컨대 표적들(동그라미) 1 a,b,c는 동일한 수용체 상의 상이한 에피토프를 나타낸다)에 결합되는 리간드 또는 에피토프를 도시한다. 표적 2는 상이한 수용체 상의 에피토프일 수 있다. 도 3b 및 3c에서, 동그라미는 에피토프 또는 수용체를 표적으로 삼는 리간드이고, n은 일반적으로 1~5이고, 전형적으로 n은 1 또는 2이고, 일반적으로는 1이다. 도 3d는 동종이중작용성 작제물을 도시하고, n은 전형적으로은 1~3이고, 일반적으로는 1 또는 2로, 예컨대 1이다. 활성 변형제, 예컨대 Fc 또는 본 명세서에 기재된 바와 같이 또는 당업자에게 알려진 다른 것은 선택적이다. 이들 작제물 전부에서, PEG 부분은 활성 변형시키는 활성, 예컨대 반감기 연장을 제공하거나 또는 의도된 표적(펩티드, 소분자, 압타머, 및 기타)에 결합되는 작동적 조각들을 입체적으로 연결시키는 것을 제외하고는 일반적으로 '불활성'이다.R 1 is H or lower alkyl (C1 to C5, or C1 or C2), such as CH 3 , and n is usually 1 to 5, such as 1 or 2. The figures depict ligands or epitopes that bind to multiple targets ( ie , epitopes on a receptor, e.g., Targets (circled) 1 a,b,c represent different epitopes on the same receptor). Target 2 may be an epitope on a different receptor. In Figures 3b and 3c, circles are epitopes or receptor-targeting ligands, n is usually 1-5, typically n is 1 or 2, and is usually 1. 3D depicts a homobifunctional construct, where n is typically 1-3, usually 1 or 2, such as 1. Active modifiers such as Fc or others as described herein or known to those skilled in the art are optional. In all of these constructs, the PEG moiety provides activity modifying activity, such as half-life extension, or sterically links operative fragments that bind to the intended target (peptides, small molecules, aptamers, and others). It is usually 'inactive'.
도 3a는 PEG이 중심 부분인 예시적인 2가 작제물을 도시한다. 하나의 동그라미는 예를 들어, 폴리펩티드 효능제, 길항제 또는 결합 단백질, 예컨대 항체 또는 이의 항원 결합 단편, 또는 압타머(핵산 또는 펩티드)이다. 다른 동그라미는 상이한 모이어티, 예컨대 다당류 또는 수용체 리간드를 나타낸다. 2가 구조는 수용체 활성화를 위한 표적의 클러스터링을 가능하게 한다. 본 명세서에서 제공된 일부 구현예에서, 표적은 TNFR1 및 TNFR2를 포함하고, 동그라미는 본원의 개시 전체에 걸쳐 기재된 TNFR1 억제제 및 TNFR2 효능제를 나타낸다. 도 3b는 1가 단일 리간드, 예컨대 CD3+를 도시하는데, 이것은 사이토카인 방출 증상을 방지할 수 있고, PEG 모이어티를 통해 효능제, 길항제, 또는 결합 단백질에 연결되어 수용체 클러스터링을 위한 2가가 된다. 도 3c는 동일한 수용체 상의 상이한 부위에 또는 2개의 수용체에 결합되는 2개의 상이한 세포 표적화 제제, 또는 2개의 제제, 예컨대 트라스투주맙 및 페르투주맙을 가교결합시키기 위한 이종이중작용성 PEG(또는 다른 그와 같은 담체)을 도시한다. 도 3b 및 3c의 작제물은 예를 들어, 면역 반응의 자극 또는 억제 중 하나를 위한 체크포인트 제어 수용체를 모으기 위해, 또는 2개의 상이한 수용체를 가교결합하여 수용체 활성의 억제를 달성하기 위해(즉, CD3 vs CD450), 또는 동일한 세포 상의 2개의 상이한 수용체에 2개의 상이한 리간드, 예컨대 자극 및 공동자극 리간드를 전달하기 위해, 사용될 수 있다. 이들 작제물은 또한 연결된 모이어티가 양성자화에 의해 화학적으로 방출될 수 있는 낮은 pH의 저산소성 영역으로 향하거나 또는 그 영역에 축적되는 전구약물로서 역할을 할 수 있다. 예를 들어, 종양의 경우, 이는 독소일 수 있고, 또는 국소적으로 방출되는 TNF 불활성인자(즉, 압타머 또는 펩티드)일 수 있다.3A depicts an exemplary bivalent construct in which PEG is the central moiety. One circle is, for example, a polypeptide agonist, antagonist or binding protein, such as an antibody or antigen-binding fragment thereof, or an aptamer (nucleic acid or peptide). Other circles represent different moieties, such as polysaccharides or receptor ligands. The bivalent structure enables clustering of targets for receptor activation. In some embodiments provided herein, targets include TNFR1 and TNFR2, and circles represent TNFR1 inhibitors and TNFR2 agonists described throughout the disclosure herein. Figure 3b depicts monovalent single ligands, such as CD3+, which can prevent cytokine release symptoms and are linked via PEG moieties to agonists, antagonists, or binding proteins to become bivalent for receptor clustering. FIG. 3C shows heterobifunctional PEG (or other such agents) to cross-link two different cell targeting agents, or two agents, such as Trastuzumab and Pertuzumab, that bind to two receptors or to different sites on the same receptor. Carriers such as) are shown. The constructs of Figures 3B and 3C are used, for example, to recruit checkpoint control receptors for either stimulation or inhibition of an immune response, or to cross-link two different receptors to achieve inhibition of receptor activity ( i.e. , CD3 vs CD450), or to deliver two different ligands, such as stimulatory and costimulatory ligands, to two different receptors on the same cell. These constructs can also serve as prodrugs that are directed to or accumulate in hypoxic regions of low pH where the linked moiety can be chemically released by protonation. For example, in the case of tumors, it may be a toxin, or it may be a locally released TNF inactivator ( ie, an aptamer or peptide).
도 3d는 사슬 길이에 따라 동일하거나 상이한 세포 상의 동일한 수용체들을 모으기 위해, 또는 순환하는 질환 표적, 예컨대 가용성 수용체 또는 리간드, 예컨대 TNF를 가두기 위한 동종이중작용성 PEG을 도시한다. 추가로, 이들 모든 구현예에서, 또 다른 반응성 기 또는 작용기에 선택적으로 연결된 추가의 PEG 측쇄(들), 예컨대 혈청 반감기 연장 모이어티, 예컨대 HSA, 또는 FcRn 폴리펩티드가 이들 작제물에 포함될 수 있다. Figure 3D depicts homobifunctional PEG to recruit the same receptors on the same or different cells depending on the chain length, or to trap circulating disease targets such as soluble receptors or ligands such as TNF. Additionally, in all of these embodiments, additional PEG side chain(s) optionally linked to another reactive group or functional group, such as a serum half-life extending moiety such as HSA, or an FcRn polypeptide may be included in these constructs.
X 및 Y가 반응성 기, 예컨대 결합 모이어티, 표적과 상호작용하는 분자들을 지칭하는 다른 구조 또한 고안된다 (도 4 참고): Other structures are also devised in which X and Y refer to molecules that interact with reactive groups, such as binding moieties, targets (see Figure 4):
다른 예들(예를 들어, 도 5 참고)은 다음과 같아서, 앞서와 마찬가지로, X 및 Y가 표적과 상호작용하는 임의의 표적화 모이어티 또는 결합 모이어티 또는 약물일 수 있다:Other examples (eg, see FIG. 5 ) are as follows, where, as before, X and Y can be any targeting moiety or binding moiety or drug that interacts with the target:
f. 추가의 활성 f. additional activity 변형제modifier - 혈청 반감기를 증가시키는 폴리펩티드 전체 또는 일부분을 포함하는 융합 단백질 - a fusion protein comprising all or part of a polypeptide that increases serum half-life
작제물의 특성은 혈청 반감기를 증가시키면서, 그러나 작제물과 TNFR1 및/또는 TNFR2의 상호작용을 실질적으로 또는 전혀 변화시키지 않는 전장 폴리펩티드 또는 그것의 일부분을 첨가함으로써 변경될 수 있다. 여기에는 알부민화 및 다른 그와 같은 변형(반감기 연장제와 관련하여 앞서 논의된 내용 참고; Strohl (2015) BioDrugs 29(4):215-239 검토됨, 또한, Tan 등 (2018) Current Pharmaceutical Design 24:4932-4946 참고)이 포함된다. The properties of the construct can be altered by adding a full-length polypeptide or portion thereof that increases the serum half-life, but does not substantially or not alter the interaction of the construct with TNFR1 and/or TNFR2. These include albuminization and other such modifications (see previous discussion with respect to half-life extenders; reviewed in Strohl (2015) BioDrugs 29(4) :215-239; also Tan et al. (2018) Current Pharmaceutical Design 24 :4932-4946) are included.
5. 단백질 치료제에서 면역원성의 예측 및 제거 5. Prediction and elimination of immunogenicity in protein therapeutics
인간 생식세포계열 서열, 예컨대 재조합 인간 사이토카인 및 인간 항체를 함유한 것들을 비롯하여 많은 단백질 치료제는 면역원성으로, 상기 치료제에 대한 숙주 면역 반응을 유도한다. 본 명세서에 기재된 바와 같이, 본 명세서에 제공된 작제물, 예컨대 TNFR1 길항제 분자 및 TNFR2 효능제, 및 본원에 기재 및 제공된 다중특이적 작제물은, 필요한 경우, 면역원성이거나 또는 사전에 존재하던 항체와 상호작용하는 에피토프를 제거 또는 삭제하기 위해, 예컨대 아미노산 치환에 의해 변형될 수 있다.Many protein therapeutics, including those containing human germline sequences, such as recombinant human cytokines and human antibodies, are immunogenic, eliciting a host immune response to the therapeutic agent. As described herein, constructs provided herein, such as TNFR1 antagonist molecules and TNFR2 agonists, and multispecific constructs described and provided herein, if desired, are immunogenic or interact with pre-existing antibodies. It may be modified, such as by amino acid substitution, to remove or delete the epitope it functions on.
작제물은 면역원성 B-세포 및/또는 T-세포 에피토프의 예측, 식별 및 제거를 거침으로써, 따라서 임의의 잠재적 면역원성을 감소 또는 삭제시키고 상기 치료 분자의 안전성, 내약성 및 효능을 증가시킨다. 상기 분자는 면역원성 서열의 제거 전과 제거 후의 면역원성을 판단하기 위해 시험관 내 검정 및 생체 내 동물 모델에서 테스트된다. The construct undergoes prediction, identification and elimination of immunogenic B-cell and/or T-cell epitopes, thus reducing or eliminating any potential immunogenicity and increasing the safety, tolerability and efficacy of the therapeutic molecule. The molecule can be tested in vitro to determine immunogenicity before and after removal of immunogenic sequences. and tested in animal models in vivo .
아래에 더 상세히 논의된 바와 같이, 단백질 치료제는 면역원성 B-세포 및/또는 T-세포 에피토프를 함유할 수 있다. 면역계가 단백질 치료제를 외래 제제로 인식할 경우, 상기 치료제에 대한 조직화된 바람직하지 않은 면역 반응이 유도된다. 상기 반응은 임상 합병증, 예컨대 예를 들어, 신속한 약물 제거능, 감소된 약물 작용성 및 효능, 지연된 주입-유사 알러지성 반응, 과민증 및 일부 경우에, 생명 위협 자가면역을 초래할 수 있다. 단백질 치료제에 대한 면역 반응은 2개의 상이한 메커니즘, 즉 전통적 면역 반응 및 내성 파괴에 의해 발생한다. 자가 및 비-자가 단백질 사이의 면역학적 구별은 면역 반응의 기전을 결정하고, 외래 물질로 인식된 단백질은, 종종 단백질 치료제의 단일 주사 후, 며칠 내지 몇 주 내에 항원의 형성을 특징으로 하는 전통적 면역 반응을 유도한다. 이와 같은 반응은 메모리 B-세포가 일단 형성되면 오래 지속되고 되돌리기가 어렵다. 상기 단백질에 대한 후속 노출은 치료요법에 부정적인 영향을 미치는 상당한 양의 IgG를 주요 특징으로 하는 이차 반응을 유도한다. 전통적 면역 반응을 유도하는 치료 단백질은 대체 요법, 예컨대 단클론성 항체(mAb) 치료제뿐만 아니라 rhGAA(재조합 인간 산 알파-글루코시다제) 및 FVIII를 포함하는 반면, 상보성-결정 영역(CDR)은 상당한 면역원성으로 CDR 영역에 대한 중추 내성의 결여로 인한 항-개체특이형 동종항체의 생성으로 이어진다. 내인성 단백질에 상동성인 치료 단백질은 전형적으로 확립된 면역 내성 때문에 면역 반응을 초래하지 않으나, 반복된 투여 후 B-세포 내성을 파괴함으로써 면역원성이 될 수 있는데, 예컨대 IFN-γ, INF-β 및 에리트로포이에틴(EPO)의 경우가 그러하다 (예를 들어, Baker 등 (2010) Self/ Nonself 1(4):314-322; Choi 등 (2017) Methods Mol . Biol . 1529:375-398; Dingman 등 (2019) J. Pharm. Sci. 108(5):1637-1654 참고).As discussed in more detail below, protein therapeutics may contain immunogenic B-cell and/or T-cell epitopes. When the immune system recognizes a protein therapeutic as a foreign agent, an organized, undesirable immune response to the therapeutic agent is induced. Such reactions can lead to clinical complications such as, for example, rapid drug clearance, reduced drug action and efficacy, delayed infusion-like allergic reactions, hypersensitivity and, in some cases, life-threatening autoimmunity. Immune responses to protein therapeutics occur by two different mechanisms: the classical immune response and resistance disruption. The immunological distinction between self and non-self proteins determines the mechanism of the immune response, and proteins recognized as foreign are classical immune responses characterized by the formation of antigens within days to weeks, often after a single injection of a protein therapeutic. elicit a reaction This response, once formed by memory B-cells, is long-lasting and difficult to reverse. Subsequent exposure to this protein induces a secondary response characterized by significant amounts of IgG that negatively impacts therapy. Therapeutic proteins that induce a classical immune response include rhGAA (recombinant human acid alpha-glucosidase) and FVIII, as well as alternative therapies, such as monoclonal antibody (mAb) therapeutics, whereas complementarity-determining regions (CDRs) have significant immunogenic properties. By nature, the lack of central tolerance to the CDR regions leads to the production of anti-subject specific alloantibodies. Therapeutic proteins homologous to endogenous proteins typically do not elicit an immune response because of established immune tolerance, but may become immunogenic by destroying B-cell tolerance after repeated administration, such as IFN-γ, INF-β and erythropoietin. This is the case with poietin (EPO) (e.g. Baker et al. (2010) Self/ Nonself 1(4):314-322; Choi et al. (2017) Methods Mol . Biol . 1529:375-398; Dingman et al (2019) J. Pharm. Sci. 108(5):1637-1654).
단백질 치료제의 면역원성에 영향을 미치는 인자에는, 예를 들어, 치료의 기간 및 투여 경로 및 빈도가 포함되고, 단백질 치료제의 피하 투여는 정맥내 투여보다 면역원성이 좀 더 크고, 연장되고 빈번하게 투여되는 요법이 면역원성이 좀 더 크다. 환자 관련 인자, 예컨대 환자의 면역 상태 및 MHC(또는 인간의 HLA) 분자의 다형성 또한 단백질 면역원성에 영향을 미친다. 예를 들어, MHC 분자는 상당한 다형성으로 MHC II에 대한 몇 개의 상이한 대립유전자가 존재하는데, 여기에는 상이한 서브유닛, 예컨대 DP, DM, DOA, DOB, DQ 및 DR이 포함되고, 이들 수용체 하위유형은 에피토프에 대한 결합 친화도에서 차이가 있고, 따라서, 환자들 간의 MHC 하위유형의 차이가 단백질 치료제에 대한 면역 반응에 영향을 미칠 수 있다. 환자 면역 상태 또한 면역원성에 영향을 미칠 수 있는데, 자가면역 환자는 단백질 치료제에 면역저하된 환자보다 더 강하게 반응한다. 면역원성에 영향을 미치는 다른 인자는 예를 들어, MHC II에 의해 인식되는 면역원성 에피토프의 존재, 최종 생성물 중 응집물의 형성, 단백질의 산화, 제형 중 응집물 및 번역 후 변형, 예컨대 글리코실화를 비롯한, 단백질 산물의 특성을 포함한다. 재조합 단백질은 예를 들어, 박테리아 세포, 예컨대 E. 콜라이, 및 포유동물 세포, 예컨대 CHO 세포를 비롯한 몇 개의 상이한 세포 유형에서 생산될 수 있다. 박테리아에서 발현된 단백질은 번역 후 변형, 예컨대 글리코실화를 거치지 않지만, 포유동물 세포에서 생산된 단백질은 이를 거치고, 이것은 상이한 면역원성을 초래할 수 있다. 예를 들어, 상표명 Betaseron®으로 시판 중인 인터페론인 인터페론 β-1b는 E. 콜라이 세포에서 생산되어 글리코실화되지 않는 반면, 상표명 Avonex®(인터페론 β-1a)로 시판 중인 나중에 개발된 제품은 재조합체 DNA 기술로 CHO 세포에서 생산된다. 베타세론은 면역원성이 Avonex® 인터페론보다 각각 35% 대 5%로 훨씬 높다. 이와 같은 차이는 글리코실화 패턴의 차이에서 부분적으로 기인될 수 있고, 이것은 응집을 초래할 수 있다 (예를 들어, Dingman 등 (2019) J. Pharm. Sci. 108(5):1637-1654 참고). Factors affecting the immunogenicity of protein therapeutics include, for example, the duration of treatment and the route and frequency of administration, and subcutaneous administration of protein therapeutics is more immunogenic than intravenous administration, and prolonged and frequent administration. Therapies used are more immunogenic. Patient-related factors such as the patient's immune status and polymorphisms in MHC (or HLA in humans) molecules also affect protein immunogenicity. For example, MHC molecules are highly polymorphic, with several different alleles for MHC II, including different subunits such as DP, DM, DOA, DOB, DQ and DR, these receptor subtypes There are differences in binding affinity to epitopes, and thus, differences in MHC subtypes between patients may affect the immune response to protein therapeutics. The patient's immune status can also affect immunogenicity, with autoimmune patients responding more strongly to protein therapeutics than immunocompromised patients. Other factors that affect immunogenicity include, for example, the presence of immunogenic epitopes recognized by MHC II, formation of aggregates in the final product, oxidation of proteins, aggregates in formulations and post-translational modifications such as glycosylation, Include the properties of the protein product. Recombinant proteins can be produced in several different cell types, including, for example, bacterial cells such as E. coli , and mammalian cells such as CHO cells. Proteins expressed in bacteria do not undergo post-translational modifications, such as glycosylation, but proteins produced in mammalian cells do, which can lead to different immunogenicity. For example, interferon β-1b, an interferon marketed under the trade name Betaseron ® , is E. coli While produced in cells and not glycosylated, a later developed product marketed under the trade name Avonex ® (interferon β-1a) is produced in CHO cells by recombinant DNA technology. Betaseron has a much higher immunogenicity than Avonex ® interferon, 35% versus 5%, respectively. Such differences may be due in part to differences in glycosylation patterns, which may lead to aggregation (see, eg, Dingman et al. (2019) J. Pharm. Sci. 108(5):1637-1654).
단백질 치료제의 투여 후 효과는 항-약물 항체, 또는 ADA로도 알려진 고-친화성 항-치료적 항체의 발달이다. ADA의 생성은 적응성 및 비-적응성 면역 반응의 자극을 수반하는데, 이것은 주로 다클론성이고 단백질 치료제에 중화 및 비-중화 효과를 일으킬 수 있다. ADA는 중쇄 불변 영역의 하위-클래스(예를 들어, IgG1~4) 뿐만 아니라 다중 아이소타입(예를 들어, IgM, IgE 및 IgG)을 함유할 수 있고, 단백질 치료제에 고친화도로 결합되는 가변 영역을 함유할 수 있고, 따라서, 가변 영역 유전자의 체세포 과돌연변이를 거친 바 있다. 상기 면역 반응은 단백질 치료제에서 면역원성 펩티드 단편, 예컨대 B-세포 및 T-세포 에피토프의 인식에 의해 유도된다. 따라서, 많은 단백질 치료제는 탈면역화를 필요로 하는 한편, 이들이 임상에서 적용될 수 있기 전에 원하는 치료적 활성을 보유한다 (예를 들어, Baker 등 (2010) Self/ Nonself 1(4):314-322; Choi 등 (2017) Methods Mol . Biol . 1529:375-398 참고). The effect following administration of protein therapeutics is the development of high-affinity anti-therapeutic antibodies, also known as anti-drug antibodies, or ADAs. The production of ADA involves the stimulation of adaptive and non-adaptive immune responses, which are predominantly polyclonal and can produce neutralizing and non-neutralizing effects with protein therapeutics. ADAs can contain sub-classes of heavy chain constant regions (eg IgG1-4) as well as multiple isotypes (eg IgM, IgE and IgG), variable regions that bind with high affinity to protein therapeutics and thus have undergone somatic hypermutation of variable region genes. The immune response is induced by the recognition of immunogenic peptide fragments, such as B-cell and T-cell epitopes, in protein therapeutics. Thus, many protein therapeutics require deimmunization while retaining the desired therapeutic activity before they can be applied clinically (e.g., Baker et al. (2010) Self/ Nonself 1(4):314-322; Choi et al. (2017) Methods Mol . Biol . 1529:375-398).
단백질 치료제에 대한 항-약물 항체(ADA)의 형성은 항원 제시 세포(APC), 예컨대 수지상 세포(DC) 및 대식세포에 의해, 그리고 B 및 T 림프구에 의해 매개된다. 단백질 치료제의 서열에 존재하는 MHC 클래스 II-제한 T-세포 에피토프는 단백질 치료제에 대한 체액성 반응의 발달을 초래할 수 있다. 예를 들어, 패턴 인식 수용체(PRR)를 통해 자극된 DC는 T-세포를 자극하고 T-세포 의존 고-친화성 ADA 반응의 생성을 유도한다. T-세포 의존 항체 반응의 제1 단계에서, APC는 단백질 치료제를 식균하고, 항원을 펩티드 에피토프로 가공하고, APC 세포 표면 상에서 에피토프를 주요 조직적합성 착물(MHC) 클래스 II 분자와 체결함으로써 상기 에피토프를 미처리(naive) T 세포에 제공한다. B-세포를 활성화하기 위해 필요한 T-세포를 완전히 활성화하기 위해, T-세포 수용체(TCR)는 MHC II-에피토프 복합체와 상호작용해야하고, 이것은 APC에 의해 제공되는 공동자극 분자, 예컨대 CD80 및 CD86로부터의 추가의 신호에 의해 동반된다. 미처리(naive) B-세포는 B-세포 표면 및 그의 동족 항원 상의 IgM 및 IgD 수용체 사이의 상호작용에 의해 활성화된다. 항원 특이적 T-세포는 이어서 B-세포 증식 및 형질 세포로의 성숙을 자극하는 사이토카인을 분비하고, 이것은 CD40 및 CD40 리간드의 관여를 야기함으로써, B-세포 클론 확대에 의한 항체 생성 및 항체-분비 형질 세포 및 메모리 B-세포로의 분화를 야기하는 추가의 신호를 제공한다. 메모리 B-세포는 치료 단백질에 대한 후속 노출 시기까지 휴면기를 유지하는 반면, 형질 세포는 APC MHC 수용체에 의해 제시되는 치료 단백질 상의 특이적 에피토프를 인식하는 항체를 분비한다. 재조합 인간 단백질을 비롯한 많은 단백질 치료제가 강력한 T-세포 에피토프를 함유한다. 예를 들어, IFNβ1b의 면역원성은 아미노산 돌연변이를 통한 단일 면역우성(하위-우성은 아님) T-세포 에피토프의 맵핑 및 제거 후 개선되었다. Formation of anti-drug antibodies (ADA) to protein therapeutics is mediated by antigen presenting cells (APCs), such as dendritic cells (DCs) and macrophages, and by B and T lymphocytes. MHC class II-restricted T-cell epitopes present in the sequence of protein therapeutics can result in the development of a humoral response to protein therapeutics. For example, DCs stimulated through pattern recognition receptors (PRRs) stimulate T-cells and induce the generation of T-cell dependent high-affinity ADA responses. In the first step of the T-cell dependent antibody response, APCs phagocytose a protein therapeutic, process the antigen into a peptide epitope, and associate the epitope with a major histocompatibility complex (MHC) class II molecule on the APC cell surface to convert the epitope. Provided to naive T cells. To fully activate the T-cell needed to activate the B-cell, the T-cell receptor (TCR) must interact with the MHC II-epitope complex, which is a costimulatory molecule provided by APCs, such as CD80 and CD86. is accompanied by an additional signal from Naive B-cells are activated by interaction between IgM and IgD receptors on the B-cell surface and their cognate antigens. Antigen-specific T-cells then secrete cytokines that stimulate B-cell proliferation and maturation into plasma cells, which result in the engagement of CD40 and CD40 ligands, thereby leading to antibody production and antibody-production by B-cell clonal expansion. It provides additional signals leading to differentiation into secretory plasma cells and memory B-cells. Memory B-cells remain dormant until subsequent exposure to the therapeutic protein, while plasma cells secrete antibodies recognizing specific epitopes on the therapeutic protein presented by the APC MHC receptor. Many protein therapeutics, including recombinant human proteins, contain potent T-cell epitopes. For example, the immunogenicity of IFNβ1b was improved after mapping and elimination of single immunodominant (but not sub-dominant) T-cell epitopes via amino acid mutations.
면역원성은 또한 T-세포-독립 과정에서 일어날 수 있고, 이에 의해 상기 항원은 B-세포와 직접적으로 교전한다. 단백질 치료제의 고분자량 응집체는 DC를 자극함으로써 또는 B-세포 수용체들을 가교결합함으로써 T-세포 의존적 및 독립적 항-약물 항체 반응을 유도할 수 있다. 예를 들어, B-세포의 T-독립적 자극은 ADA 반응을 생성하는데, T-세포로부터 공동-자극의 필요성을 배제하기에 충분히 효과적으로, B-세포 수용체(BCR)를 교차결합할 수 있는 다량체 구조를 형성할 경우 일어날 수 있다. 강화된 면역원성과 응집된 또는 다량체 단백질 사이에 상관관계가 존재한다. 예를 들어, 응집된, 그러나 단량체성이 아닌, 재조합 인간 인터페론(IFN)α는 인간 IFNα 형질전환 마우스에서 IFNα 특이적 항체의 생성을 야기한다. 응집체의 형성은 약물 용해도 및 생산 공정에 따라 달라진다 (예를 들어, Baker 등 (2010) Self/ Nonself 1(4):314-322; Dingman 등 (2019) J. Pharm . Sci . 108(5):1637-1654; De Groot, A. S. and Moise (2007) Curr . Opin . Drug Discov . Devel. 10(3):332-340 참고). Immunogenicity can also occur in a T-cell-independent process, whereby the antigen directly engages B-cells. High molecular weight aggregates of protein therapeutics can induce T-cell dependent and independent anti-drug antibody responses by stimulating DCs or by crosslinking B-cell receptors. For example, T-independent stimulation of B-cells produces an ADA response, where multimers capable of cross-linking the B-cell receptor (BCR) are effective enough to preclude the need for co-stimulation from T-cells. This can happen when building a structure. A correlation exists between enhanced immunogenicity and aggregated or multimeric proteins. For example, aggregated, but not monomeric, recombinant human interferon (IFN)α results in the production of IFNα-specific antibodies in human IFNα transgenic mice. Formation of aggregates is dependent on drug solubility and production process (e.g., Baker et al. (2010) Self/ Nonself 1(4):314-322; Dingman et al (2019) J. Pharm . Sci . 108(5):1637-1654; De Groot, AS and Moise (2007) Curr . Opin . Drug Discov . Devel. 10(3):332-340).
단백질 치료제에 대한 ADA 반응은 중화 또는 결합 항체의 형태일 수 있다. 중화 항체는 단백질 치료제 내에서 생물학적 활성에 필요한 영역을 인식하고, 그것의 활성을 직접적으로 제거한다. 체액성 반응은 단백질 치료제 내의 B-세포 에피토프에 겨냥되는데, 이것은 단백질 치료제를 중성화하는 능력을 야기한다. 예를 들어, 항체 치료제의 개체특이형에 겨냥되는 인간 항-마우스(HAMA) 또는 인간 항-인간(HAHA) 반응은 중화시키는 것이고, 인간화된 및 완전한 인간 항체에 대항하여 생성될 수 있다. 예를 들어, A형 혈우병 환자의 30%에서, 중화시키는 ADA는 투여된 재조합체 FVIII에 대해 발달함으로써, 그것의 지혈 효능을 파기하고, rhGAA를 투여받는 폼페병 환자의 89 ~ 100%에서, 항-rhGAA 중화 항체가 치료적 효능을 파괴한다. 결합 항체는 단백질 치료제의 약동학적 특성을 변화시키고, 예를 들어, 단백질의 신속한 제거능을 촉진함으로써, 전신 노출을 감소시켜 단백질 치료제의 효능에 간접적으로 영향을 미친다. 예를 들어, 아달리무맙의 장기 사용은 환자의 ~28%에서 ADA의 발달을 야기함으로써, 그 결과 더 낮은 아달리무맙 농도 및 더 불량한 임상 결과를 야기한다 (예를 들어, Baker 등 (2010) Self/ Nonself 1(4):314-322; Dingman 등 (2019) J. Pharm. Sci. 108(5):1637-1654 참고).ADA responses to protein therapeutics may be in the form of neutralizing or binding antibodies. Neutralizing antibodies recognize a region required for biological activity within a protein therapeutic and directly ablate its activity. The humoral response is directed at B-cell epitopes within the protein therapeutic, resulting in the ability to neutralize the protein therapeutic. For example, human anti-mouse (HAMA) or human anti-human (HAHA) responses directed against an individual type of antibody therapeutic are neutralizing and can be generated against humanized and fully human antibodies. For example, in 30% of patients with hemophilia A, a neutralizing ADA develops on administered recombinant FVIII, thereby abrogating its hemostatic efficacy, and in 89-100% of patients with Pompe disease receiving rhGAA, anti -rhGAA neutralizing antibodies destroy therapeutic efficacy. Binding antibodies indirectly affect the efficacy of a protein therapeutic by altering the pharmacokinetic properties of the protein therapeutic and reducing systemic exposure, for example, by promoting rapid clearance of the protein. For example, long-term use of adalimumab causes the development of ADA in -28% of patients, resulting in lower adalimumab concentrations and poorer clinical outcomes (e.g., Baker et al. (2010) Self/ Nonself 1(4):314-322; Dingman et al. (2019) J. Pharm. Sci. 108(5):1637-1654).
ADA 수치는 치료 전, 치료 중 및 치료 후에 평가 및 모니터링될 수 있다. 다양한 검정이 이용 가능하다. 이들 검정은 약물을 표지화하는 것을 수반하는, 브릿징 면역검정을 포함하고, 2개의 표지된 약물 분자들 사이에 다리를 형성하는 ADA를 검출하는 단계를 포함한다. 브릿징 검정들은 모든 항체 클래스에 대해, 그리고 임의의 유형의 샘플로 사용될 수 있다. 표적에 대한 결합을 검출하기 위해 사용되는 리간드-결합 검정(LBA)은 표면 플라즈몬 공명(SPR), 전기화학발광, 및 생물층 간섭계를 포함하고, 또한 ADA를 검출하기 위해 사용될 수 있다. 단백질 특이적 검정, 예컨대 중화 항-FVIII 항체의 농도를 측정하는 데 사용되어 온 베데스다 (Bethesda) 검정이 사용될 수 있다. 항-PEG 항체는 또한 바이오틴-PEG가 자성 비드에 접합된 검정에서 측정될 수 있고, 비드에 결합된 항-PEG 항체의 양은 착물의 크기의 변화를 검출하는 센서를 사용하여 측정된다. 약물-내성 검정은 샘플 중 약물의 존재에 의해 유발된 제한을 극복하고, ADA의 정량화를 개선한다. 이들에는, 예를 들어, pH 이동 개체특이형 항원 결합 검정, 산 해리 검정, 온도 이동 검정 및 전기화학발광 검정이 포함된다. ADA를 검출하기 위해 효소-결합 면역흡착 검정(ELISA)이 사용될 수 있는데, 단백질 치료제가 플레이트에 도포되고 샘플과 함께 인큐베이션되어 결합된 ADA가 검출된다. ADA의 검출을 위한 ELISA는 ADA에 대한 표준의 결여 때문에 제한될 수 있다. 다른 방법은 DNA에 접합된 항-바이오틴 항체를 사용하여 검출되는 바이오틴으로 착물이 표지화되는, 브릿징 검정의 확장형인 면역-PCR를 포함한다. 이어서 DNA는 PCR를 사용하여 증폭되고 정량화되어, ADA 수치가 평가된다. 면역-LC/MS는 혈장 샘플에서 ADA를 검출하기 위해 사용될 수 있는데, 샘플은 상기 약물을 바이오틴으로 태깅함으로써, 또는 과잉의 약물을 상기 샘플에 섞음으로써 ADA 결합을 포화시켜서 많은 자극이 제공되어야 한다 (예를 들어, Dingman 등 (2019) J. Pharm . Sci . 108(5):1637-1654 참고).ADA levels can be assessed and monitored before, during, and after treatment. A variety of assays are available. These assays include bridging immunoassays, which involve labeling a drug and detecting an ADA forming a bridge between two labeled drug molecules. Bridging assays can be used for all antibody classes and with any type of sample. Ligand-binding assays (LBAs) used to detect binding to a target include surface plasmon resonance (SPR), electrochemiluminescence, and biolayer interferometry, and can also be used to detect ADAs. Protein specific assays can be used, such as the Bethesda assay, which has been used to determine the concentration of neutralizing anti-FVIII antibodies. Anti-PEG antibodies can also be measured in assays in which biotin-PEG is conjugated to magnetic beads, and the amount of anti-PEG antibodies bound to the beads is measured using a sensor that detects changes in the size of the complex. Drug-resistance assays overcome limitations induced by the presence of drugs in a sample and improve quantification of ADA. These include, for example, pH shift antigen binding assays, acid dissociation assays, temperature shift assays and electrochemiluminescence assays. An enzyme-linked immunosorbent assay (ELISA) can be used to detect ADA, wherein a protein therapeutic is applied to a plate and incubated with the sample to detect bound ADA. ELISA for the detection of ADA may be limited due to the lack of standards for ADA. Other methods include immuno-PCR, an extension of the bridging assay, in which complexes are labeled with biotin, which is detected using an anti-biotin antibody conjugated to DNA. DNA is then amplified using PCR and quantified to assess ADA levels. Immuno-LC/MS can be used to detect ADA in plasma samples, which must be stimulated by tagging the drug with biotin, or by saturating the ADA binding by mixing an excess of drug into the sample ( See, eg, Dingman et al. (2019) J. Pharm . Sci . 108(5):1637-1654).
단백질 치료제로부터 면역원성 에피토프의 예측 및 제거(즉, 탈면역화)는 치료제의 효능 및 안전성을 증가시키고, 임상 시험에서 약물 실패로 이어질 수 있는 부작용을 방지할 수 있다. 예를 들어, 탈면역화에 의한 단백질 치료제로부터의 T-세포 에피토프의 고갈은 단백질 치료제, 특히 항체의 임상 시험 진행에서 성공적이었다. 이들 결과는 ADA 반응의 생성에서 T-세포 에피토프의 중요성을 나타내고, 탈면역화가 더 안전하고, 면역원성이 적은 치료제를 제공함을 나타낸다 (예컨대, Baker 외. (2010) Self/ Nonself 1(4):314-322 참조). 이들 방법은 본 명세서에 제공된 작제물의 면역원성을 검출 또는 식별 또는 예측하기 위해 사용될 수 있고, 아미노산 돌연변이를 식별하여 대상체에서의 면역원성 또는 면역 반응을 제거 또는 감소시키기 위해 사용될 수 있다. 면역원성을 감소 또는 제거하기 위해 변형된 바 있는 작제물이 제공된다. 단백질 치료제의 탈면역화는 면역원성이 높은 B-세포 및/또는 T-세포 에피토프의 식별, 및 주요 아미노산 잔기의 돌연변이유발 치환에 의한 식별된 에피토프의 결실을 수반한다. 아래에 논의된 바와 같이, 단백질 치료제 서열 내의 면역원성 영역의 전임상 예측 및 평가는 동물 모델에서 에피토프 맵핑에 중점을 둔 인실리코 도구, 시험관 내 방법, 예컨대 에피토프 맵핑, MHC/HLA 친화성 검정 및 T-세포 증식 검정, 및 생체 내 검사의 사용을 포함한다. 단백질 치료제 탈면역화의 효율을 증가시키기 위해, 컴퓨터를 사용한 에피토프 예측 도구가 사용된다. 인실리코 도구는 펩티드 라이브러리 중 면역원성 서열을 신속하게 예측하기 위한 데이터베이스 및 알고리즘을 포함한다. 이어서 결과가 확인될 수 있고, B-세포 또는 T-세포 상의 에피토프의 특이적 면역원성 효과는 시험관 내 검정을 사용하여 추가적으로 평가될 수 있다. 단백질 치료제에 대한 면역 반응에 미치는 효과가 동물 모델, 예컨대 형질전환 마우스 및 비-인간 영장류에서 생체 내 검정을 사용하여 평가될 수 있다. Prediction and removal of immunogenic epitopes from protein therapeutics ( i.e. , deimmunization) can increase the efficacy and safety of therapeutics and avoid side effects that can lead to drug failure in clinical trials. For example, depletion of T-cell epitopes from protein therapeutics by deimmunization has been successful in clinical trials of protein therapeutics, particularly antibodies. These results indicate the importance of T-cell epitopes in the generation of the ADA response, and indicate that deimmunization provides safer, less immunogenic therapeutics (e.g., Baker et al . (2010) Self/ Nonself 1(4): 314-322). These methods can be used to detect or identify or predict the immunogenicity of constructs provided herein, and can be used to identify amino acid mutations to eliminate or reduce immunogenicity or immune response in a subject. Constructs that have been modified to reduce or eliminate immunogenicity are provided. Deimmunization of protein therapeutics involves identification of highly immunogenic B-cell and/or T-cell epitopes and deletion of the identified epitopes by mutagenic substitution of key amino acid residues. As discussed below, preclinical prediction and evaluation of immunogenic regions within protein therapeutics sequences can be achieved using in silico tools focused on epitope mapping in animal models, in vitro methods such as epitope mapping, MHC/HLA affinity assays and T- cell proliferation assays, and the use of in vivo assays. To increase the efficiency of protein therapeutics deimmunization, computational epitope prediction tools are used. in silico Tools include databases and algorithms for rapidly predicting immunogenic sequences in peptide libraries. Results can then be ascertained, and the specific immunogenic effect of the epitope on B-cells or T-cells can be further assessed using in vitro assays. The effect on the immune response to protein therapeutics can be evaluated using in vivo assays in animal models such as transgenic mice and non-human primates.
일단 면역원성 에피토프가 식별되면, 치료제의 아미노산 서열은 상기 에피토프를 제거하기 위해 변형될 수 있다. 제거 방법은 면역원성 서열을 제거하기 위한(즉, 에피토프를 탈면역화하기 위한) 무작위 또는 부위 지정 돌연변이유발을 포함한다. 돌연변이유발 후, 더 이상 면역원성이 아님을 확인하기 위해 면역원성 서열은 재평가된다. 이 과정을 간소화하는 인실리코 도구가 있다; 예를 들어, 면역원성 서열 중 각각의 아미노산을 다른 19가지 천연 발생 아미노산(특히 알라닌) 중 하나로 순차적으로 교체한 다음, 상기 서열의 면역원성을 재평가하는 프로그램이 이용 가능하다. 이런 식으로, 비-면역원성 서열은 펩티드 합성 및 면역원성의 시험관 내 및/또는 생체 내 재평가 이전에 가장 유망한 후보로 효율적으로 좁혀진다. 그러나 면역원성 에피토프의 예측 및 돌연변이 유발 결실은, 단백질이 그것의 치료적 효능을 유지하기 위해 접힌 상태의 안정 및 활성 구조를 유지할 것이라서, 단백질 탈면역화를 위해 반드시 충분하지는 않다. 따라서, 반드시 단백질의 구조 및 기능과 양립 가능한 에피토프-결실 돌연변이가 선택되어야 한다.Once an immunogenic epitope is identified, the amino acid sequence of a therapeutic agent can be modified to remove the epitope. Removal methods include random or site-directed mutagenesis to remove immunogenic sequences ( ie , to deimmunize epitopes). After mutagenesis, immunogenic sequences are re-evaluated to confirm that they are no longer immunogenic. Insilico simplifies this process There are tools; For example, programs are available that sequentially replace each amino acid in an immunogenic sequence with one of the other 19 naturally occurring amino acids (particularly alanine) and then re-evaluate the immunogenicity of the sequence. In this way, non-immunogenic sequences are efficiently narrowed down to the most promising candidates prior to peptide synthesis and in vitro and/or in vivo re-evaluation of immunogenicity. However, predictive and mutagenic deletion of immunogenic epitopes is not necessarily sufficient for protein deimmunization, as the protein will retain its folded, stable and active conformation to retain its therapeutic efficacy. Therefore, epitope-deleting mutants that are compatible with the structure and function of the protein must be selected.
하기에 논의된 방법 및 접근법은 본 명세서에 제공된 작제물로부터 에피토프를 예측, 식별 및 제거하기 위해 사용된다.The methods and approaches discussed below are used to predict, identify and remove epitopes from constructs provided herein.
a. B-세포 및 T-세포 a. B-cells and T-cells 에피토프epitope
항원과 항체 사이의 상호작용은 침입하는 병원체에 대한 체액성 면역 반응의 유도에 중요하다. 특이적 항체는 항원 결정인자, 즉 B-세포 에피토프로 알려진 별개의 영역에 존재하는 특정 항원을 인식한다. B-세포 에피토프는 용매에 노출되고 표면 접근이 가능하며, 분비된 항체, 즉 B-세포 수용체(BCR)에 의해 인식되고 결합되는 아미노산의 클러스터를 함유하는데, 이것은 세포 또는 체액성 면역 반응을 유도하는 막-결합 면역글로불린을 함유한다.Interactions between antigens and antibodies are important for the induction of the humoral immune response against invading pathogens. Specific antibodies recognize specific antigens present in distinct regions known as antigenic determinants, ie B-cell epitopes. B-cell epitopes are solvent-exposed and surface-accessible, and contain clusters of amino acids that are recognized and bound by secreted antibodies, the B-cell receptor (BCR), which induces a cellular or humoral immune response. Contains membrane-bound immunoglobulin.
B-세포 에피토프의 식별은 항체 및 다른 단백질계 치료제의 개발의 일부이다. B-세포 에피토프는 공간적 구조를 기반으로, 순차적인 잔기를 함유한 연속(또한 선형으로 알려져있음) 에피토프 및 비선형적이고 형태적(conformational)인 불연속(형태적으로도 알려져 있음) 에피토프로 분류된다. 불연속 B-세포 에피토프는 완전히 순차적이지 않지만, 단백질/항원이 그것의 3차원 형태로 접힌 경우, 매우 근접하게 함께 모인 용매-노출된 아미노산 잔기의 군을 함유한다. 대략 B-세포 에피토프의 90%가 형태적이다. 선형 B-세포 에피토프는 항원 변성 후 항체에 의해 인식될 수 있으나, 형태적 에피토프는 항원이 변성된 경우 더 이상 인식되지 않는다. 불연속 B-세포 에피토프의 적절한 접힘에 필요한 최소 아미노산 서열, 또는 접촉 잔기 폭은 천연 단백질 중 대략 20 내지 400개의 잔기의 범위에 속한다. 대다수의 식별된 선형 B-세포 에피토프는 형태적 B-세포 에피토프의 구성요소라 여겨지고, 불연속 B-세포 에피토프의 70% 이상이 1~5개 선형 세그먼트를 함유하고, 그 길이가 각각 1~6개의 아미노산인 것으로 나타난 바 있다 (예를 들어, Potocnakova 등 (2016) Journal of Immunology Research, Article ID 6760830; Sanchez-Trincado 등 (2017) Journal of Immunology Research, Article ID 2680160 참고).Identification of B-cell epitopes is part of the development of antibodies and other protein-based therapeutics. B-cell epitopes are classified based on their spatial structure into contiguous (also known as linear) epitopes containing sequential residues and discontinuous (also known as conformational) epitopes that are non-linear and conformational. Discontinuous B-cell epitopes contain groups of solvent-exposed amino acid residues that are not completely sequential, but come together in close proximity when the protein/antigen is folded into its three-dimensional form. Approximately 90% of B-cell epitopes are morphological. Linear B-cell epitopes can be recognized by antibodies after antigenic denaturation, but conformational epitopes are no longer recognized when the antigen is denatured. The minimum amino acid sequence, or contact residue width, required for proper folding of a discontinuous B-cell epitope falls in the range of approximately 20 to 400 residues in native proteins. The majority of identified linear B-cell epitopes are considered to be components of morphological B-cell epitopes, and more than 70% of discontinuous B-cell epitopes contain 1-5 linear segments, each 1-6 segments in length. amino acids (see, e.g., Potocnakova et al. (2016) Journal of Immunology Research , Article ID 6760830; Sanchez-Trincado et al. (2017) Journal of Immunology Research , Article ID 2680160).
T-세포 에피토프는 선형이고 MHC 에피토프-결합 홈에서 아미노산 측쇄와 결합 포켓의 상호작용을 통해 주요 조직적합성 착물(MHC) 분자에 결합된다. 특이적 측쇄의 존재 또는 부재가 에피토프가 MHC에 결합되는지 여부를, 그렇다면 얼마나 밀착되는지를 결정한다 (예를 들어, De Groot, A. S. and Moise, L. (2007) Curr . Opin. Drug Discov . Devel . 10(3):332-340 참고). T-세포는 항원 제시 세포(APC)의 표면 상에 표시되고 MHC 분자에 결합되는 항원을 인식하는 T-세포 수용체(TCR)를 구비한다. T-세포 에피토프는 각각 CD8+ 및 CD4+ T-세포에 의해 인식되는 MHC 클래스 I(MHC I) 및 II(MHC II) 분자에 의해 제시되고; 따라서, CD8+ 및 CD4+ T-세포 에피토프가 존재한다. CD8+ T-세포는 CD8+ T-세포 에피토프 인식 후 세포독성 T 림프구(CTL)를 만드는 반면, 프라이밍된 CD4+ T 세포는 면역 반응을 증폭시키는 헬퍼 T(Th) 세포를 만들거나 또는 면역을 억제하는 조절 T(Treg) 세포를 만든다 (예를 들어, Sanchez-Trincado 등 (2017) Journal of Immunology Research, Article ID 2680160 참고). T-cell epitopes are linear and bind to major histocompatibility complex (MHC) molecules through interactions of amino acid side chains with binding pockets in the MHC epitope-binding groove. The presence or absence of a specific side chain determines whether an epitope binds to MHC and, if so, how tightly it adheres (eg, De Groot, AS and Moise, L. (2007) Curr . Opin. Drug Discov . Devel . 10(3):332-340). T-cells have a T-cell receptor (TCR) that recognizes antigens displayed on the surface of antigen presenting cells (APCs) and bound to MHC molecules. T-cell epitopes are presented by MHC class I (MHC I) and II (MHC II) molecules recognized by CD8 + and CD4 + T-cells, respectively; Thus, CD8 + and CD4 + T-cell epitopes exist. CD8 + T-cells recognize CD8 + T-cell epitopes and then make cytotoxic T lymphocytes (CTLs), whereas primed CD4 + T cells make helper T (Th) cells that boost the immune response or suppress immunity Generates regulatory T (Treg) cells (see, eg, Sanchez-Trincado et al. (2017) Journal of Immunology Research , Article ID 2680160).
b. b. 인실리코in silico 에피토프epitope 예측 방법 Prediction method
실험 연구 및 인실리코 분석은 대다수의 에피토프가 그 길이는 15~25개의 잔기이며 면적은 600~1000 2로 고리로 조직됨을 보여주고, 에피토프 서열이 티로신, 트립토판, 노출된 측쇄를 갖는 전하를 띈 극성 아미노산이 풍부하고 또한 특이적 아미노산 쌍이 풍부함을 보여준다. 그러나, 에피토프 및 비-에피토프 잔기 사이의 차이는 유의미하지 않으며, 아미노산 조성물 단독은 에피토프 및 비-에피토프의 차별화에 불충분함이 입증된 바 있다. 에피토프 맵핑 기술 및 생물정보학의 조합이 면역정보학의 발달로 이어져 왔는데, 이것은 항체, B-세포, T-세포 및 알레르기 유발 항원의 구조의 식별, MHC 결합의 예측, 에피토프의 모형화 및 면역 네트워크의 분석을 위해 면역학에서 전산 방법의 사용을 수반한다 (예를 들어, Potocnakova 등 (2016) Journal of Immunology Research, Article ID 6760830 참고).Experimental research and in silico The analysis showed that the majority of epitopes were 15–25 residues in length and 600–1000 in area. 2 shows that it is organized in a ring, and the epitope sequence is rich in tyrosine, tryptophan, charged polar amino acids with exposed side chains, and also rich in specific amino acid pairs. However, it has been demonstrated that the difference between epitope and non-epitope residues is not significant, and amino acid composition alone is insufficient to differentiate between epitope and non-epitope. The combination of epitope mapping techniques and bioinformatics has led to the development of immunoinformatics, which identifies the structure of antibodies, B-cells, T-cells and allergens, predicts MHC binding, models epitopes and analyzes immune networks. (2016) Journal of Immunology Research , Article ID 6760830).
i. B-세포 i. B-cell 에피토프의epitope 인실리코in silico 예측 prediction
B-세포 에피토프 예측은 예를 들어, 치료적 단백질 생산을 위해 면역원성 에피토프가 대체되거나 탈면역화될 수 있게 면역원성 에피토프를 식별한다. 알려진 B-세포 에피토프의 데이터베이스가 개발된 바 있고, 다면화된 데이터베이스, 예컨대 면역 에피토프 데이터베이스(IEDB) 및 IEDB-3D(iedb.org에서 이용 가능) 및 AntiJen(ddg-pharmfac.net/antijen/AntiJen/antijenhomepage.htm에서 이용 가능); B-세포 지향 데이터베이스, 예컨대 BciPep(imtech.res.in/raghava/bcipep/info.html에서 이용 가능), Epitome(rostlab.org/services/epitome/에서 이용 가능) 및 알레르기 유발 항원 단백질의 구조적 데이터베이스(SDAP; fermi.utmb.edu/에서 이용 가능); 및 단일 병원성 유기체 지향 데이터베이스, 예컨대 HIV 분자 면역학 데이터베이스(hiv.lanl.gov/content/immunology/index.html에서 이용 가능), FLAVIdB(cvc.dfci.harvard.edu/flavi/에서 이용 가능) 및 인플루엔자 서열 및 에피토프 데이터베이스(ISED; influenza.cdc.go.kr에서 이용 가능)를 포함한다. 다른 B-세포 에피토프 데이터베이스는 형태적 에피토프 데이터베이스(CED; immunenet.cn/ced/에서 이용 가능), 단백질 데이터 은행(PDB; rcsb.org에서 이용 가능) 및 구조적 에피토프 데이터베이스(SEDB; sedb.bicpu.edu.in에서 이용 가능) (예를 들어, Potocnakova 등 (2016) Journal of Immunology Research, Article ID 6760830 참고)를 포함한다.B-cell epitope prediction identifies immunogenic epitopes so that they can be displaced or de-immunized, for example for therapeutic protein production. Databases of known B-cell epitopes have been developed and multifaceted databases such as the Immune Epitope Database (IEDB) and IEDB-3D (available at iedb.org) and AntiJen (ddg-pharmfac.net/antijen/AntiJen/ available at antijenhomepage.htm); B-cell oriented databases such as BciPep (available at imtech.res.in/raghava/bcipep/info.html), Epitome (available at rostlab.org/services/epitome/) and structural databases of allergenic proteins ( SDAP; available at fermi.utmb.edu/); and single pathogenic organism-oriented databases such as the HIV Molecular Immunology Database (available at hiv.lanl.gov/content/immunology/index.html), FLAVIdB (available at cvc.dfci.harvard.edu/flavi/) and influenza sequences. and epitope database (ISED; available at influenza.cdc.go.kr). Other B-cell epitope databases include the Morphological Epitope Database (CED; available at immunenet.cn/ced/), the Protein Data Bank (PDB; available at rcsb.org) and the Structural Epitope Database (SEDB; sedb.bicpu.edu). available at .in) (see, eg, Potocnakova et al. (2016) Journal of Immunology Research , Article ID 6760830).
서열 또는 구조에서 B-세포 에피토프를 예측하기 위한 몇 개의 알고리즘이 이용가능하다. 경향 규모를 통해 선형 에피토프의 식별에 의존했던 알고리즘이 개발된 바 있으나, 기계 학습, 예컨대 숨겨진 마르코프 모델(HMM), 재발성 신경 네트워크(RNN) 및 서포트 백신 머신(SVM)을 기초로 방법을 개발함으로써 개선되었다. 인실리코 B-세포 에피토프 예측 도구는 연속/선형 B-세포 에피토프를 예측하는 것, 및 불연속/형태적 B-세포 에피토프를 예측하는 것을 포함한다. 불연속 B-세포 에피토프의 예측은 아미노산 통계, 공간적 정보 및 표면 노출에 대한 정보가 필요하다. 연속/선형 B-세포 에피토프 예측을 위한 Web 이용가능 도구는 예를 들어, ABCPred(crdd.osdd.net/raghava/abcpred/에서 이용 가능), APCPred(omictools.com/apcpred-tool에서 이용 가능), BCPRED(BCPred 및 FBCPred, ailab.ist.psu.edu/bcpred/에서 이용 가능), BepiPred(cbs.dtu.dk/services/BepiPred/에서 이용 가능), LBtope(crdd.osdd.net/raghava/lbtope/에서 이용 가능), BcePred(crdd.osdd.net/raghava/bcepred/에서 이용 가능), EPMLR(bioinfo.tsinghua.edu.cn/epitope/EPMLR/에서 이용 가능), BEST(서포트 백신 머신 도구를 사용한 B-세포 에피토프 예측; biomine.cs.vcu.edu/datasets/BEST/에서 이용 가능), COBEpro(scratch.proteomics.ics.uci.edu/에서 이용 가능), PEOPLE (iedb.org/에서 이용 가능) 및 SVMTrip(sysbio.unl.edu/SVMTriP/에서 이용 가능)을 포함한다. 불연속/형태적 B-세포 에피토프 예측을 위한 Web 이용 가능 도구는 예를 들어, CEP(bioinfo.ernet.in/cep.htm에서 이용 가능), DiscoTope(cbs.dtu.dk/services/DiscoTope-2.0/에서 이용 가능), BEpro(예전에 PEPITO로 알려짐; pepito.proteomics.ics.uci.edu/에서 이용 가능), ElliPro(tools.immuneepitope.org/ellipro/에서 이용 가능), SEPPA(단백질 항원 서버의 개선된 공간적 에피토프 예측; badd.tongji.edu.cn/seppa/에서 이용 가능), EPITOPIA(epitopia.tau.ac.il/에서 이용 가능), CBTOPE(crdd.osdd.net/raghava/cbtope/에서 이용 가능), EPCES(sysbio.unl.edu/EPCES/ 이용 가능), EPSVR(서포트 벡터 회귀 서버를 이용한 항원성 에피토프 예측; sysbio.unl.edu/EPSVR/에서 이용 가능), EPMeta(sysbio.unl.edu/EPMeta/에서 이용 가능), PEASE(항체 서열을 사용한 에피토프 예측하기; ofranlab.org/PEASE에서 이용 가능), EpiPred(opig.stats.ox.ac.uk/webapps/sabdab-sabpred/EpiPred.php에서 이용 가능), 3DEX(3D-에피토프-익스플로어; 온라인에서 이용 불가능), PEPOP(pepop.sys2diag.cnrs.fr/에서 이용 가능), PEPOP 2.0(sys2diag.cnrs.fr/index.php?page=pepop에서 이용 가능) 및 EpiSearch(curie.utmb.edu/episearch.html에서 이용 가능) (예를 들어, Potocnakova 등 (2016) Journal of Immunology Research, Article ID 6760830; Sanchez-Trincado 등 (2017) Journal of Immunology Research, Article ID 2680160; Sun 등 (2013) Comput . Math Method M., Article ID 943636 참고). Several algorithms are available for predicting B-cell epitopes in sequence or structure. Algorithms have been developed that have relied on the identification of linear epitopes via trend scales, but by developing methods based on machine learning, such as hidden Markov models (HMMs), recurrent neural networks (RNNs) and support vaccine machines (SVMs), Improved. In silico B-cell epitope prediction tools include predicting continuous/linear B-cell epitopes, and predicting discontinuous/morphological B-cell epitopes. Prediction of discrete B-cell epitopes requires information on amino acid statistics, spatial information and surface exposure. Web-available tools for continuous/linear B-cell epitope prediction include, for example, ABCPred (available at crdd.osdd.net/raghava/abcpred/), APCPred (available at omictools.com/apcpred-tool), BCPRED (BCPred and FBCPred, available at ailab.ist.psu.edu/bcpred/), BepiPred (available at cbs.dtu.dk/services/BepiPred/), LBtope (crdd.osdd.net/raghava/lbtope/ (available at crdd.osdd.net/raghava/bcepred/), BcePred (available at crdd.osdd.net/raghava/bcepred/), EPMLR (available at bioinfo.tsinghua.edu.cn/epitope/EPMLR/), BEST (available at support vaccine machine tool B -Cellular epitope prediction; available at biomine.cs.vcu.edu/datasets/BEST/), COBEpro (available at scratch.proteomics.ics.uci.edu/), PEOPLE (available at iedb.org/) and Includes SVMTrip (available at sysbio.unl.edu/SVMTriP/). Web-enabled tools for discrete/conformational B-cell epitope prediction include, for example, CEP (available at bioinfo.ernet.in/cep.htm), DiscoTope (cbs.dtu.dk/services/DiscoTope-2.0/ ), BEpro (formerly known as PEPITO; available at pepito.proteomics.ics.uci.edu/), ElliPro (available at tools.immuneepitope.org/ellipro/), SEPPA (improvements of the Protein Antigen Server) spatial epitope predictions; available at badd.tongji.edu.cn/seppa/), EPITOPIA (available at epitopia.tau.ac.il/), CBTOPE (available at crdd.osdd.net/raghava/cbtope/) ), EPCES (available at sysbio.unl.edu/EPCES/), EPSVR (Antigenic Epitope Prediction Using Support Vector Regression Server; available at sysbio.unl.edu/EPSVR/), EPMeta (available at sysbio.unl.edu/ Available at EPMeta/), PEASE (Predicting Epitopes Using Antibody Sequences; available at ofranlab.org/PEASE), EpiPred (available at opig.stats.ox.ac.uk/webapps/sabdab-sabpred/EpiPred.php) available), 3DEX (3D-Epitope-Explorer; not available online), PEPOP (available at pepop.sys2diag.cnrs.fr/), PEPOP 2.0 (available at sys2diag.cnrs.fr/index.php?page=pepop (available at curie.utmb.edu/episearch.html) and EpiSearch (available at curie.utmb.edu/episearch.html) (e.g., Potocnakova et al. (2016) Journal of Immunology Research , Article ID 6760830; Sanchez-Trincado et al. (2017) Journal of Immunology Research , Article ID 2680160; Sun et al. (2013) Comput . Math Method M. , Article ID 943636).
서열-기반 및 결합 부위 예측 방법이 또한 B-세포 에피토프를 예측하기 위해 사용될 수 있다. 서열-기반 예측 도구는 항원의 일차 서열에 의존하고, 에피토프의 일부인 각각의 잔기의 확률을 측정하기 위해 경향 척도를 활용한다. 서열-기반 예측 도구는 형태적 B-세포 에피토프를 예측하는 BEST를 포함한다. 항체 상에서 형태적 B-세포 에피토프의 결합 부위를 식별하는 것을 목표로 하는 결합 부위 예측 도구는 예를 들어, ProMate, ConSurf, PINUP 및 PIER를 포함한다 (예를 들어, Sun 등 (2013) Comput . Math Method M., Article ID 943636 참고). Sequence-based and binding site prediction methods can also be used to predict B-cell epitopes. Sequence-based prediction tools rely on the primary sequence of an antigen and utilize a tendency measure to measure the probability of each residue being part of an epitope. Sequence-based prediction tools include BEST, which predicts morphological B-cell epitopes. Binding site prediction tools that aim to identify binding sites for conformational B-cell epitopes on antibodies include, for example, ProMate, ConSurf, PINUP, and PIER (see, e.g., Sun et al. (2013) Comput . Math See Method M. , Article ID 943636).
알려진 3D-구조를 가진 단백질 또는 항원 중 형태적 B-세포 에피토프는 미모토프-기반 에피토프 예측 방법을 사용하여 확인될 수 있다. 미모토프는 천연 항원에 대해 상승된 항체에 결합되는 능력에 대해 무작위로 선택된 펩티드 라이브러리에서 선택된 펩티드이다. 미모토프-기반 방법은 항체 친화성-선택 펩티드(즉, 미모토프)의 입력 및 상기 선택된 항원의 3D-구조를 요구한다. 파아지 디스플레이 실험에서 유래된 미모토프에 기초한 에피토프 예측 방법은 이용 가능하고, 미모토프의 통계적 특색을 사용하여 항원 표면 상의 중첩 위치 패치에 미모토프를 맵핑하거나, 또는 정렬을 통해 항원 서열로의 미모토프 맵핑을 사용하는데, 이것은 B-세포 에피토프 위치를 나타낼 수 있다. 친화성-선택 펩티드, 즉 미모토프를 식별하기 위해, 무작위 펩티드가 섬유상 파아지의 표면 상에 표시되고, 특정 정도의 친화성으로 단클론성 항체에 결합되는 펩티드가 선별, 용리 및 증폭된다. 이와 같은 선택 공정이총 3~5회 반복되어, 펩티드를 최고의 친화성을 가진 것으로 좁혀간다. 미모토프 및 에피토프는 단클론성 항체의 동일한 파라토프를 조합하여 면역 반응을 유발할 수 있고, 따라서 유사한 작용성을 갖는다. 상기 선택된 미모토프들은 높은 서열 유사성을 공유하는데, 이는 항체와의 상호작용 중에 특정한 주요 결합 모티프 및 물리화학 선호가 존재함을 나타낸다. 따라서, 미모토프를 다시 공급원 항원에 맵핑하는 것은 진짜 에피토프를 좀 더 정확하게 찾는 데 일조할 수 있다. 미모토프는 천연 항원과 유사한 물리화학 특성 및 공간적 조직화를 갖지만, 서열 유사성을 거의 보이지 않는다. 미모토프에 대한 정보를 제공하는 데이터베이스는 예를 들어, ASPD (mgs.bionet.nsc.ru/mgs/gnw/aspd에서 이용 가능), RELIC 펩티드(요청 시 이용 가능), PepBank(pepbank.mgh.harvard.edu에서 이용 가능) 및 MimoDB(immunet.cn/mimodb에서 이용 가능)를 포함한다. 인실리코 미모토프-기반 예측 도구는 최상의 정렬 서열의 위치를 찾고 가능한 에피토프 영역을 예측하기 위해, 공급원 항원의 표면에 다시 미모토프를 맵핑하는 데 필수적이다. 미모토프 분석에 기초한 인실리코 B-세포 에피토프 예측 도구는, 예를 들어, MIMOX(immunet.cn/mimox/에서 이용 가능), MimoPro(informatics.nenu.edu.cn/MimoPro에서 이용 가능), Pep-3D-Search(kyc.nenu.edu.cn/Pep3DSearch에서 이용 가능), MIMOP/MimCons(요청 시 이용 가능), MIMOP/MimAlign(요청 시 이용 가능), LocaPep(atenea.monstes.upm.es/#soft에서 이용 가능), EpiSearch(curie.utmb.edu/episearch.html에서 이용 가능), PepMapper(informatics.nenu.edu.cn/PepMapper/에서 이용 가능), FINDMAP(온라인에서 이용 불가능), EPIMAP(온라인에서 이용 불가능), MEPS(capsur.it/meps에서 이용 가능, 3DEX(3D-에피토프-익스플로러; 온라인에서 이용 불가능), Mapitope(pepitope.tau.ac.il에서 이용 가능) 및 SiteLight(온라인에서 이용 불가능)(예를 들어, Potocnakova 등 (2016) Journal of Immunology Research, Article ID 6760830; Sanchez-Trincado 등 (2017) Journal of Immunology Research, Article ID 2680160; Sun 등 (2013) Comput . Math Method M., Article ID 943636 참고).Conformational B-cell epitopes in proteins or antigens with known 3D-structures can be identified using mimotope-based epitope prediction methods. Mimotopes are peptides selected from a library of peptides randomly selected for their ability to bind antibodies elevated against native antigens. Mimotope-based methods require input of antibody affinity-selective peptides ( ie , mimotopes) and the 3D-structure of the selected antigen. Epitope prediction methods based on mimotopes derived from phage display experiments are available, using statistical features of mimotopes to map mimotopes to overlapping localized patches on the antigenic surface, or mapping mimotopes to antigenic sequences via alignment. , which can indicate B-cell epitope locations. To identify affinity-selective peptides, ie mimotopes, random peptides are displayed on the surface of filamentous phage, and peptides that bind monoclonal antibodies with a certain degree of affinity are selected, eluted and amplified. This selection process is repeated a total of 3 to 5 times to narrow down the peptides to those with the highest affinity. Mimotopes and epitopes can elicit an immune response by combining the same paratope of a monoclonal antibody and thus have similar functionality. The selected mimotopes share high sequence similarity, indicating the presence of specific key binding motifs and physiochemical preferences during interaction with the antibody. Thus, mapping the mimotope back to the source antigen may help to more accurately locate the genuine epitope. Mimotopes have similar physicochemical properties and spatial organization to native antigens, but show little sequence similarity. Databases providing information on mimotopes include, for example, ASPD (available at mgs.bionet.nsc.ru/mgs/gnw/aspd), RELIC peptides (available on request), PepBank (pepbank.mgh.harvard edu) and MimoDB (available at immunet.cn/mimodb). in silico Mimotope-based prediction tools are essential for mapping mimotopes back to the surface of source antigens in order to locate the best aligned sequences and predict possible epitope regions. In silico based on mimotope analysis B-cell epitope prediction tools include, for example, MIMOX (available at immunet.cn/mimox/), MimoPro (available at informatics.nenu.edu.cn/MimoPro), Pep-3D-Search (available at kyc.nenu .edu.cn/Pep3DSearch), MIMOP/MimCons (available on request), MIMOP/MimAlign (available on request), LocaPep (available at atenea.monstes.upm.es/#soft), EpiSearch (available on request) (available at curie.utmb.edu/episearch.html), PepMapper (available at informatics.nenu.edu.cn/PepMapper/), FINDMAP (available online), EPIMAP (available online), MEPS (available capsur Available at .it/meps, 3DEX (3D-Epitope-Explorer; not available online), Mapitope (available at pepitope.tau.ac.il) and SiteLight (not available online) (e.g. Potocnakova, etc. (2016) Journal of Immunology Research , Article ID 6760830; Sanchez-Trincado et al. (2017) Journal of Immunology Research , Article ID 2680160; Sun et al. (2013) Comput . Math Method M. , Article ID 943636).
ii. T-세포 ii. T-cell 에피토프의epitope 인실리코in silico 예측 prediction
선형 T-세포 에피토프는 그것의 아미노산 측쇄와 MHC 에피토프-결합 홈 중 결합 포켓과 상호작용을 통해 MHC에 결합되고, 특이적 측쇄의 존재 또는 부재는 T-세포 에피토프가 MHC에 결합되는지, 그리고 얼마나 단단히 결합되는지를 결정한다. 인실리코 예측의 경우, 기존 에피토프, 예컨대, 예를 들어, IEDB, Epitome, 및 SEDB의 라이브러리를 제공하는 데이터베이스가 존재하는데, 이것은 2차원 T-세포 에피토프에 대한 정보를 제공한다. 다른 인실리코 T-세포 에피토프 데이터베이스는 CED, AntiJen, Bcipep, 및 HLA 에피토프 레지스트리를 포함한다. 단백질 치료제 후보 상의 서열을 분석하고, 면역원성 에피토프를 예측하기 위해 사용될 수 있는 이용 가능한 여러 가지 웹페이지 및 프로그램이 존재한다. 예를 들어, 잠재적 T-세포 에피토프에 대한 단백질 서열을 스캐닝하는 다수의 MHC-결합 모티프-기반 도구가 이용가능하다. 이들 T-세포 에피토프 맵핑 도구는 예를 들어, EpiMatrix, IEDB, SYFPEITHI, MHC Thread, MHCPred, MHCPred 2.0, EpiJen, NetMHC, NetCTL, nHLAPred, SVMHC, 및 Bimas(예를 들어, De Groot, A. S. and Moise, L. (2007) Curr. Opin . Drug Discov . Devel . 10(3):332-340 참고)를 포함한다. 예를 들어, MHCPred 알고리즘은 다양한 대립유전자에 대한 아미노산 서열의 MHC 결합 잠재력에 대한 정보를 제공하고, EpiMatrix/JanusMatrix는 MHC 클래스 II 수용체에 대한 단백질 치료제의 대립유전자 특이적 결합을 예측하고, T-세포 수용체 계면에서 결합을 평가할 수 있다. 에피토프 예측을 위한 다른 알고리즘 및 프로그램은 예를 들어, ProPred, MMBPred 및 Protean 3D를 포함한다. 에피토프 예측은 면역원성 서열을 제거하기 위한 임의의 변형이 치료 단백질의 활성을 유지하도록, 시험관 내 방법 및 활성 평가와 조합되어야 한다 (예를 들어, Dingman 등 (2019) J. Pharm . Sci. 108(5):1637-1654 참고).Linear T-cell epitopes bind to MHC through interactions with their amino acid side chains and binding pockets in the MHC epitope-binding groove, and the presence or absence of specific side chains determines whether a T-cell epitope binds to MHC and how tightly it binds. decide whether to combine For in silico predictions, databases exist that provide libraries of existing epitopes, such as, for example, IEDB, Epitome, and SEDB, which provide information on 2D T-cell epitopes. other in silico T-cell epitope databases include the CED, AntiJen, Bcipep, and HLA epitope registries. There are several webpages and programs available that can be used to analyze sequences on protein therapeutic candidates and predict immunogenic epitopes. For example, a number of MHC-binding motif-based tools are available that scan protein sequences for potential T-cell epitopes. These T-cell epitope mapping tools include, for example, EpiMatrix, IEDB, SYFPEITHI, MHC Thread, MHCPred, MHCPred 2.0, EpiJen, NetMHC, NetCTL, nHLAPred, SVMHC, and Bimas (e.g., De Groot, AS and Moise, L. (2007) Curr. Opin . Drug Discov . Devel . 10(3):332-340). For example, the MHCPred algorithm provides information on the MHC binding potential of amino acid sequences for various alleles, EpiMatrix/JanusMatrix predicts allele-specific binding of protein therapeutics to MHC class II receptors, and T-cell Binding at the receptor interface can be assessed. Other algorithms and programs for epitope prediction include, for example, ProPred, MMBPred and Protean 3D. Epitope prediction should be combined with in vitro methods and activity assessments such that any modification to remove immunogenic sequences retains the activity of the therapeutic protein (see, e.g., Dingman et al. (2019) J. Pharm . Sci. 108( 5):1637-1654).
iii. 펩티드-iii. peptide- MHCMHC 클래스 II 결합 예측 Class II binding prediction
T-세포 에피토프를 식별하기 위한 구조-기반 방법은 펩티드-MHC 구조를 모델링하고, 예를 들어, 분자 동적 시뮬레이션을 사용하여 상호작용을 평가하는 것에 의존한다. 구조-기반 방법은 전산 집중적이고, 데이터-구동 방법보다 예측 성능이 낮다. 구조-기반 T-세포 에피토프 예측 도구는 EpiDOCK(epidock.ddg-pharmfac.net에서 이용 가능)를 포함한다. 펩티드-MHC 결합 예측에 대한 데이터-구동 방법은 MHC 분자에 결합되는 것으로 알려진 펩티드 서열에 기초하고; 펩티드 서열은 예컨대 IEDB, EPIMHC, AntiJen 및 기타 본원에 기재된 및 당업계에서 알려진 다른 것들을 포함하는 에피토프 데이터베이스에서 이용 가능하다. 펩티드-MHC 결합 예측은 서열 모티프(SM)에 기반할 수 있는데, 이것은 MHC 분자와 결합하는 것으로 알려진 특정 위치에서의 빈번하게 발생하는 아미노산(고정 잔기)을 포함한다. 모티프 매트릭스(MM)는 MHC 분자의 결합에 대한 모든 잔기, 예컨대 비-고정 잔기의 기여를 평가하지만, 결합 친화도를 설명하지는 않는다. 정량적 친화성 매트릭스(QAM)가 결합 친화도 뿐만아니라 펩티드-MHC 결합을 예측한다. 정량적 구조-활성 관계(QSAR) 첨가 모델이 각각의 위치에서의 아미노산 기여와 인접한 측쇄 상호작용의 기여를 합한 합계로서 MHC에 대한 펩티드의 결합 친화도를 예측한다. 가장 대중적이고 강력한 접근법인 기계 학습(ML)은 MHC 분자와 결합하거나 또는 결합하지 않는 펩티드들로 이루어진 데이터 세트에 대해 훈련받은 알고리즘을 사용하고, ML-기반 구별 모델의 예들은 인공 신경 네트워크(ANN), 서포트 백신 머신(SVM), 결정 트리(DT) 및 숨겨진 마르코프(Markov) 모델(HMM)에 기초한 것들을 포함한다 (예를 들어, Sanchez-Trincado 등 (2017) Journal of Immunology Research, Article ID 2680160 참고).Structure-based methods for identifying T-cell epitopes rely on modeling peptide-MHC structures and evaluating interactions using, for example, molecular dynamics simulations. Structure-based methods are computationally intensive and have lower predictive performance than data-driven methods. Structure-based T-cell epitope prediction tools include EpiDOCK (available at epidock.ddg-pharmfac.net). Data-driven methods for peptide-MHC binding prediction are based on peptide sequences known to bind MHC molecules; Peptide sequences are available in epitope databases including, for example, IEDB, EPIMHC, AntiJen and others described herein and known in the art. Peptide-MHC binding predictions can be based on sequence motifs (SMs), which contain frequently occurring amino acids (fixed residues) at specific positions known to bind MHC molecules. Motif matrices (MM) assess the contribution of all residues, such as non-fixed residues, to the binding of MHC molecules, but do not account for binding affinity. A quantitative affinity matrix (QAM) predicts binding affinity as well as peptide-MHC binding. A quantitative structure-activity relationship (QSAR) additive model predicts the binding affinity of peptides to MHC as the sum of the amino acid contributions at each position plus the contributions of adjacent side chain interactions. Machine learning (ML), the most popular and powerful approach, uses algorithms trained on datasets of peptides that either bind or do not bind MHC molecules, and examples of ML-based discrimination models include artificial neural networks (ANNs). , including those based on support antivirus machines (SVMs), decision trees (DTs) and hidden Markov models (HMMs) (see e.g. Sanchez-Trincado et al. (2017) Journal of Immunology Research , Article ID 2680160) .
단백질 치료제의 면역원성을 예측하는 모델은 인실리코 펩티드-MHC 클래스 II 알고리즘을 포함하고, 이것은 합리적인 정확도로, MHC 클래스 II에 결합되는 펩티드 서열의 능력을 예측한다. 이러한 알고리즘은 서열의 라이브러리의 신속한 선별을 허용한다. 그러나, 인실리코 및 시험관 내 MHC 클래스 II 결합 분석은 식별된 면역원성 펩티드가 시험관 내 및 생체 내에서 T-세포 반응을 자극하는 데 실패한 높은 수준의 거짓 양성으로 이어진다. 이러한 분석은 에피토프의 형성에 영향을 미치는 다른 인자들, 예컨대 단백질 프로세싱, T-세포 수용체(TCR)에 의한 인식 및 펩티드에 대한 T-세포 내성을 고려하지 않는다. 이것을 다루기 위해, 시험관 내 T-세포 검정이 사용된다. 인실리코 분석 및 시험관 내 검정의 조합은 에피토프의 식별과 MHC 결합에 대한 능력이 감소된 에피토프-고갈 단백질 서열을 갖는 펩티드 변이체의 설계에 매우 유용하다 (예를 들어, Baker 등 (2010) Self/ Nonself 1(4):314-322 참고). In silico model to predict immunogenicity of protein therapeutics Includes a peptide-MHC class II algorithm, which predicts, with reasonable accuracy, the ability of a peptide sequence to bind to MHC class II. This algorithm allows rapid selection of libraries of sequences. However, in silico and in vitro MHC class II binding assays lead to high levels of false positives in which the identified immunogenic peptides fail to stimulate T-cell responses in vitro and in vivo . This assay does not take into account other factors that influence the formation of epitopes, such as protein processing, recognition by the T-cell receptor (TCR) and T-cell resistance to peptides. To address this, in vitro T-cell assays are used. in silico The combination of assays and in vitro assays is very useful for the identification of epitopes and the design of peptide variants with epitope-depleted protein sequences with reduced ability for MHC binding (e.g., Baker et al. (2010) Self/ Nonself 1(4):314-322).
펩티드-MHC 결합 모델을 통한 T-세포 에피토프의 예측은 또한 MHC 다형성 때문에 복잡하고; 인간의 경우, MHC 분자는 인간 백혈구 항원(HLA)으로 알려져 있고, 상이한 펩티드와 결합하고 펩티드-MHC 결합의 예측을 위한 특이적 모델을 요구하는 클래스 I 및 클래스 II HLA 분자의 수백 개의 대립유전자 변이체(예를 들어, Sanchez-Trincado 등 (2017) Journal of Immunology Research, Article ID 2680160 참고)가 존재한다. 펩티드-MHC 결합 모델에 기초한 T-세포 에피토프 예측 도구는 예를 들어, EpiDOCK, MotifScan, Rankpep, SYFPEITHI, MAPPP, PREDIVAC, PEPVAC, EPISOPT, Vaxign, MHCPred, EpiTOP, BIMAS, TEPITOPE, Propred, Propred-1, EpiJen, IEDB-MHCI, IEDB-MHCII, IL4pred, MULTIPRED2, MHC2PRED, NetMHC, NetMHCII, NetMHCpan, NetMCHIIpan, nHLApred, SVMHC, SVRMHC, NetCTL 및 WAPP(예를 들어, Sanchez-Trincado 등 (2017) Journal of Immunology Research, Article ID 2680160 참고)를 포함한다. Prediction of T-cell epitopes through peptide-MHC binding models is also complicated by MHC polymorphisms; In humans, MHC molecules are known as human leukocyte antigens (HLA), and there are hundreds of allelic variants of class I and class II HLA molecules that bind different peptides and require specific models for the prediction of peptide-MHC binding ( For example, see Sanchez-Trincado et al. (2017) Journal of Immunology Research , Article ID 2680160). T-cell epitope prediction tools based on the peptide-MHC binding model include, for example, EpiDOCK, MotifScan, Rankpep, SYFPEITHI, MAPPP, PREDIVAC, PEPVAC, EPISOPT, Vaxign, MHCPred, EpiTOP, BIMAS, TEPITOPE, Propred, Propred-1, EpiJen, IEDB-MHCI, IEDB-MHCII, IL4pred, MULTIPRED2, MHC2PRED, NetMHC, NetMHCII, NetMHCpan, NetMCHIIpan, nHLAPred, SVMHC, SVRMHC, NetCTL and WAPP (e.g. Sanchez-Trincado et al. (2017) Journal of Immunology Research , Article ID 2680160).
EpiSweep은 면역원성 T-세포 에피토프의 전산 예측을 단백질 안정성, 구조 및 기능에 미치는 에피토프-결실 돌연변이의 효과의 서열-기반 또는 구조-기반 평가와 통합하는 단백질 설계 알고리즘의 모음으로, 낮은 면역원성 및 높은 활성 및 안정성을 위해 단백질 치료제를 최적화하는 돌연변이의 조합의 선택을 가능하게 한다 (예를 들어, 탈면역화 알고리즘의 EpiSweep 모음의 적용에 대한 단계별 가이드를 위한 Choi 등 (2017) Methods Mol . Biol . 1529:375-398, 참고).EpiSweep is a collection of protein design algorithms that integrate computational prediction of immunogenic T-cell epitopes with sequence-based or structure-based evaluation of the effects of epitope-deleting mutations on protein stability, structure and function, resulting in low immunogenicity and high immunogenicity. Enable selection of combinations of mutations that optimize protein therapeutics for activity and stability (e.g. Choi et al. for a step-by-step guide to application of the EpiSweep suite of deimmunization algorithms). (2017) Methods Mol . Biol . 1529:375-398, cf.).
c. c. 시험관 내 in vitro 에피토프epitope 예측 방법 Prediction method
시험관 내 방법은 면역 반응의 세포 기전을 결정하고, 면역원성 에피토프를 식별하며, 전체의 단백질 치료제 전체의 MHC 친화성, T-세포 증식 및 면역원성 효과를 평가하기 위해 사용될 수 있다. 예를 들어, 에피토프 맵핑은 펩티드 단편을 개별적으로 분석함으로써 면역원성 에피토프를 식별한다. 펩티드 단편은 면역 세포에 노출되고, 면역원성은 염증성 면역 반응의 지표인 사이토카인 및 표면 마커를 측정함으로써 결정된다. 단백질 전체의 에피토프 맵핑은 노동 집약적이고, 인실리코 프로그램은 면역원성일 수 있는 영역을 식별하기 위해 그리고 에피토프 후보를 좁혀가기 위해 맵핑과 병합하여 사용된다. 시험관 내 에피토프 예측 방법은 예를 들어, 구조적 에피토프 맵핑 방법, 예컨대 X-선 결정학, 핵자기 공명 및 전자 현미경 검사 방법 및 기능적 에피토프 맵핑, 예컨대 항원 단편화/항원 결합 검정, 경쟁적 결합 검정, 변형 테스팅/돌연변이 유발, 디스플레이 기술, 예컨대 파아지 디스플레이 및 효모 디스플레이, 및 미모토프 분석을 포함한다. In vitro methods can be used to determine the cellular mechanisms of the immune response, identify immunogenic epitopes, and evaluate the MHC affinity, T-cell proliferation, and immunogenic effects of all protein therapeutics. For example, epitope mapping identifies immunogenic epitopes by individually analyzing peptide fragments. The peptide fragments are exposed to immune cells and immunogenicity is determined by measuring cytokines and surface markers that are indicative of an inflammatory immune response. Epitope mapping across proteins is labor intensive, and in silico programs are used in conjunction with mapping to identify regions that may be immunogenic and to narrow down epitope candidates. In vitro epitope prediction methods include, for example, structural epitope mapping methods such as X-ray crystallography, nuclear magnetic resonance and electron microscopy methods and functional epitope mapping such as antigen fragmentation/antigen binding assays, competitive binding assays, variant testing/mutation triggering, display techniques such as phage display and yeast display, and mimotope assays.
i. i. 시험관 내 in vitro B-세포B-cell 에피토프epitope 예측 방법 Prediction method
B-세포 에피토프를 식별하기 위한 실험 방법은 예를 들어, 항원-항체 착물의 3D 구조를 해결하는 단계, 항체 결합을 위한 펩티드 라이브러리를 선별하는 단계, 또는 항원이 돌연변이되는 기능 검정을 수행하는 단계를 포함하고, 항원-항체 상호작용에 미치는 영향이 분석된다. 항체-생산 B-세포는 크기가 약 16 내지 22개의 잔기이고 상기 항체와 접촉하는 아미노산을 함유하는 구조적 에피토프 및 크기가 약 3 내지 5개의 잔기이고 단백질 및 항체 사이의 친화도에 영향을 미치는 기능적 에피토프를 인식한다. 구조적 에피토프를 식별하는 가장 정확한 방법은 항원-항체 착물의 X-선 결정학에 의한 것인데, 이것은 항체에 결합되는 서열을 식별하고, 단백질 구조 내의 에피토프의 정확한 위치를 찾기 위해 사용될 수 있고, 연속 및 불연속 에피토프 모두를 식별할 수 있고, 결합의 강도에 대한 정보를 제공한다. 구조적 에피토프 맵핑은 항체와 직접 접촉하는 잔기를 식별하지만, 결합 강도에 기여하는 잔기에 대한 정보를 항상 제공하지는 않는다. 자유롭게 이용 가능한 FTProd 프로그램은 X-선 결정학의 전산적 대안으로 사용될 수 있다. 핵자기 공명(NMR)은 결정을 생산할 필요 없이 구조적 에피토프를 식별하지만, 그것의 사용은 크기가 <25 kDa인 작은 단백질 및 펩티드에 국한된다. NMR는 항원-항체 착물의 구조, 역학 및 결합 에너지에 대한 데이터를 제공하고, 용액에서 수행되어, 결정 생성의 필요성을 제거한다. 해상도(resolution)가 적당한 에피토프 맵핑을 위한 두 가지 추가의 방법은 포화 전이 차이 NMR 및 항원에서 수소-중수소 교환의 항체 억제를 포함한다. 전자현미경 검사 또한 에피토프 맵핑을 위해 사용될 수 있으나, 이것은 더 큰 항원, 예컨대 전체의 바이러스 입자 또는 바이러스 캡시드에 전형적으로 사용되는 낮은 해상도 구조적 방법이다. 전자현미경 검사는 접촉 잔기를 검출할 수 없지만, 에피토프의 표면 접근성을 확인하기 위해 사용될 수 있다. 저온전자현미경 검사는 신속하게 냉동된 항원-항체 착물이 생리학적 완충액에서 관찰되는 대안적인 방법으로, 이것은 염색 및 정착액의 필요성을 제거한다 (예를 들어, Dingman 등 (2019) J. Pharm. Sci . 108(5):1637-1654; Potocnakova 등 (2016) Journal of Immunology Research, Article ID 6760830 참고). Experimental methods for identifying B-cell epitopes include, for example, resolving the 3D structure of antigen-antibody complexes, screening peptide libraries for antibody binding, or performing functional assays in which antigens are mutated. and the effect on antigen-antibody interactions is analyzed. Antibody-producing B-cells have a structural epitope of about 16 to 22 residues in size and containing amino acids that contact the antibody, and a functional epitope of about 3 to 5 residues in size and influencing the affinity between the protein and the antibody. recognize The most accurate method for identifying structural epitopes is by X-ray crystallography of antigen-antibody complexes, which can be used to identify the sequence that binds to the antibody and to locate the precise location of the epitope within the protein structure, both contiguous and discontinuous epitopes. All can be identified and provide information about the strength of the bond. Structural epitope mapping identifies residues that directly contact the antibody, but does not always provide information about residues that contribute to binding strength. The freely available FTProd program can be used as a computational alternative to X-ray crystallography. Nuclear magnetic resonance (NMR) identifies structural epitopes without the need to produce crystals, but its use is limited to small proteins and peptides <25 kDa in size. NMR provides data on the structure, kinetics and binding energy of antigen-antibody complexes and is performed in solution, eliminating the need for crystal formation. Two additional methods for epitope mapping with adequate resolution include saturation transition differential NMR and antibody inhibition of hydrogen-deuterium exchange in the antigen. Electron microscopy can also be used for epitope mapping, but this is a low resolution structural method typically used for larger antigens, such as whole viral particles or viral capsids. Electron microscopy cannot detect contact residues, but can be used to confirm surface accessibility of epitopes. Cryo-electron microscopy is an alternative method in which rapidly frozen antigen-antibody complexes are observed in physiological buffer, which obviates the need for staining and fixative (eg, Dingman et al. (2019) J. Pharm. Sci . 108(5):1637-1654; Potocnakova et al. (2016) Journal of Immunology Research , Article ID 6760830).
기능적 에피토프는 항원 단편화, 경쟁적 결합 및 변형 테스트를 비롯한 다양한 방법에 의해 확인될 수 있다. 예를 들어, 기능적 B-세포 에피토프 맵핑 방법은 일반적으로 항원 유래 단백분해 단편 또는 항체 결합을 위한 펩티드의 선별 단계 및 부위 지정 또는 무작위 돌연변이 유발을 거친 바 있는 돌연변이체 단백질의 항원-항체 반응성을 테스트하는 단계를 포함한다. 따라서, 기능적 에피토프 맵핑 도구는 항체 결합에 중요한 에피토프 내의 잔기를 식별하고 특징짓기 위해 사용된다. 대다수의 기능적 방법은 항원 단편, 합성 펩티드, 또는 재조합체 항원, 예컨대 돌연변이된 변이체, 제자리 무세포 번역에 의해 배열된 항원들에 대한 항체의 결합을 검출하고/하거나 선택 가능한 시스템, 예컨대 파아지 디스플레이를 사용하여 표현된다. 예를 들어, 항원 단편화 및 결합 검정은 고체 지지체 상에서 펩티드의 고정화 및 에피토프 단편이 항체와 결합하는지 여부를 결정하기 위해 웨스턴 블롯, 도트 블롯 및/또는 ELISA의 사용을 수반하고, 결합은 펩티드 단편이 면역원성일 수 있음을 나타낸다. 낮은 해상도 맵핑을 제공하는 경쟁적 결합 검정은 다중 항체들이 단백질 상의 에피토프들에 동시에 결합될 수 있는지 여부 또는 동일한 에피토프에 결합하기 위해 서로 경쟁하는지 여부를 평가함으로써, 단백질 상의 잠재적 면역원성 에피토프의 개수에 대한 정보를 제공한다 (예를 들어, Dingman 등 (2019) J. Pharm. Sci . 108(5):1637-1654; Potocnakova 등 (2016) Journal of Immunology Research, Article ID 6760830 참고).Functional epitopes can be identified by a variety of methods including antigen fragmentation, competitive binding and transformation tests. For example, functional B-cell epitope mapping methods generally involve screening of antigen-derived proteolytic fragments or peptides for antibody binding and testing of antigen-antibody reactivity of mutant proteins that have been subjected to site-directed or random mutagenesis. Include steps. Thus, functional epitope mapping tools are used to identify and characterize residues within epitopes that are important for antibody binding. The majority of functional methods detect binding of antibodies to antigen fragments, synthetic peptides, or recombinant antigens, such as mutated variants, antigens arranged by in situ cell-free translation, and/or use selectable systems, such as phage display. It is expressed by For example, antigen fragmentation and binding assays involve the immobilization of peptides on a solid support and the use of Western blot, dot blot and/or ELISA to determine whether an epitope fragment binds to an antibody, wherein binding indicates that the peptide fragment is an immunogen. indicates that it may be Competitive binding assays that provide low-resolution mapping information about the number of potentially immunogenic epitopes on a protein by assessing whether multiple antibodies can simultaneously bind to epitopes on a protein or compete with each other for binding to the same epitope (See, eg, Dingman et al. (2019) J. Pharm. Sci . 108(5):1637-1654; Potocnakova et al. (2016) Journal of Immunology Research , Article ID 6760830).
변형 테스트, 즉 돌연변이 유발은 기능적 에피토프 중 개별 잔기(과열점)가 치환되는 에피토프 맵핑 방법이고, 면역원성 서열에 대한 항체의 결합에 변형이 미치는 영향이 평가된다. 가장 빈번하게 Tyr, Arg 및 Trp 잔기를 포함하는 과열점은완전한 단백질-단백질 계면 영역의 분획을 함유하는 활동적인 중요 잔기이다. 개별 잔기의 돌연변이는, 단백질이 그것의 구조 및 활성을 유지하는 한, 대체될 수 있는 해로운 잔기의 식별을 허용한다. 돌연변이 유발을 통한 에피토프 맵핑의 경우, 펩티드 라이브러리는 무작위 또는 부위 지정 돌연변이 유발에 의해 생성되고, 디스플레이 기술과 돌연변이 유발의 조합은 다수의 돌연변이된 단백질의 선별을 허용한다. 포화 돌연변이 유발은 에피토프 맵핑을 위한 또 다른 방법으로, 여기서 에피토프 내 특정 위치에 있는 아미노산 잔기는 모두 20개 천연 발생 아미노산으로 대체되고, 항체 결합의 손실은 모니터링된다. 이 방법의 단점은 면역반응성의 손실이 항원성 구조의 파괴에 의한 것 일 수 있다는 점으로, 이것은 결과의 해석을 어렵게 만든다. 에피토프와 항체 사이에 이루어지는 대부분의 접촉은 아미노산 측쇄를 통해 발생되고, 알라닌 스캐닝 돌연변이 유발은 각각의 잔기 측쇄가 항체 결합에 미치는 기여를 정의하기 위해 사용될 수 있다. 이는 단백질 백본에 가요성을 첨가하지 않으면서 β-탄소에 대한 측쇄를 자르는, 각각의 비-알라닌 잔기의 순차적인 알라닌 치환에 의해 한 번에 하나씩 수행된다. 이와 같은 방법은 파라토프-에피토프 상호작용에 가장 활동적인 기여를 하는 측쇄를 구비한 임계 잔기를 식별한다. 전산 알라닌 스캐닝 또한 간단한 자유 에너지 기능을 사용함으로써 단백질-단백질 착물 내 결합 자유 에너지에 알라닌 돌연변이가 미치는 효과를 신속하게 결정하기 위해 사용될 수 있다. 조합 돌연변이 유발은 인접하는 잔기에 의해 매개된 조합된 효과를 식별할 기회를 최대화하기 위해 별개의 항원성 영역의 조합 무작위화 및 돌연변이된 잔기(일차 서열 근접)의 분류를 기반으로 하고; 이것은 결합을 위해 중요하지 않으나 에피토프의 형성에 기여하거나, 또는 개별적으로 약한 파라토프와의 다중 상호작용을 형성하는 잔기의 식별을 가능하게 한다. 샷건(shotgun) 돌연변이 유발은 대규모 돌연변이 유발에 기초한 고처리량 방법으로, 여기서 각각의 클론은 정의된 아미노산 돌연변이(예를 들어, 알라닌 치환)를 갖고 천연적으로 접힌 단백질의 mAb 반응성에 대한 직접적인 세포 테스팅을 수반한다. 샷건 돌연변이 유발은 20개 에피토프/개월 이상의 맵핑 속도로 선형 및 형태적 에피토프 모두의 식별을 가능하게 한다 (예를 들어, Potocnakova 등 (2016) Journal of Immunology Research, Article ID 6760830 참고). Alteration testing, ie mutagenesis, is an epitope mapping method in which individual residues (hot spots) of a functional epitope are substituted, and the effect of the alteration on binding of the antibody to immunogenic sequences is evaluated. Hot spots, most frequently comprising Tyr, Arg and Trp residues, are active key residues that contain a fraction of the complete protein-protein interface region. Mutation of individual residues allows identification of deleterious residues that can be replaced, as long as the protein retains its structure and activity. In the case of epitope mapping via mutagenesis, peptide libraries are generated by random or site-directed mutagenesis, and the combination of display techniques and mutagenesis allows the selection of large numbers of mutated proteins. Saturation mutagenesis is another method for epitope mapping, in which amino acid residues at specific positions within the epitope are replaced with all 20 naturally occurring amino acids, and loss of antibody binding is monitored. A disadvantage of this method is that loss of immunoreactivity may be due to disruption of antigenic structures, which makes interpretation of the results difficult. Since most contacts between epitopes and antibodies occur through amino acid side chains, alanine scanning mutagenesis can be used to define the contribution of each residue side chain to antibody binding. This is done one at a time by sequential alanine substitution of each non-alanine residue, cutting the side chain to the β-carbon without adding flexibility to the protein backbone. This method identifies critical residues with side chains that make the most active contributions to paratope-epitope interactions. Computational alanine scanning can also be used to rapidly determine the effect of alanine mutations on the binding free energy in protein-protein complexes by using a simple free energy function. Combinatorial mutagenesis is based on the combinatorial randomization of distinct antigenic regions and classification of mutated residues (primary sequence proximity) to maximize the chance of identifying combined effects mediated by adjacent residues; This allows the identification of residues that are not critical for binding, but contribute to the formation of an epitope, or form multiple interactions with individually weak paratopes. Shotgun mutagenesis is a high-throughput method based on large-scale mutagenesis in which each clone carries a defined amino acid mutation (e.g., an alanine substitution) and allows direct cellular testing of naturally folded proteins for mAb reactivity. accompanies Shotgun mutagenesis allows the identification of both linear and conformational epitopes at mapping rates of 20 epitopes/month or greater (see, eg, Potocnakova et al. (2016) Journal of Immunology Research , Article ID 6760830).
에피토프 맵핑에 대한 다른 기술은 디스플레이 기술 및 미모토프 분석을 포함하는데, 이들은 저렴하고, 유연하고 빠르다. 디스플레이 기술, 예컨대 파아지 디스플레이 및 효모 디스플레이는 바이오패닝의 친화성 선택 방법을 통해 관심대상 mAb에 대한 디스플레이 플랫폼 상에 표시된 다양한 펩티드의 결합능을 테스트(예를 들어, 테더링 펩티드를 리보솜-mRNA 착물, 또는 파아지, 박테리아, 포유동물, 곤충 또는 효모 세포의 표면에 묶음)한 것에 기초한다 (예를 들어, Potocnakova 등 (2016) Journal of Immunology Research, Article ID 6760830 참고). Other techniques for epitope mapping include display techniques and mimotope analysis, which are inexpensive, flexible and fast. Display technologies, such as phage display and yeast display, test the binding ability of various peptides displayed on a display platform to a mAb of interest via the affinity selection method of biopanning (e.g., tethering peptides to ribosome-mRNA complexes, or bound to the surface of phage, bacterial, mammalian, insect or yeast cells) (see e.g. Potocnakova et al. (2016) Journal of Immunology Research , Article ID 6760830).
ii. ii. 시험관 내 in vitro T-세포T-cell 에피토프epitope 예측 방법 Prediction method
시험관 내 방법, 예컨대 MHC 또는 HLA 결합 검정 및 T-세포 검정은 T-세포 에피토프를 예측하고 단백질 치료체 항원에 대한 T-세포 반응을 평가하기 위해 사용될 수 있다. 시험관 내 검정을 위한 수백 또는 수천의 중첩 펩티드의 합성은 정확하게 MHC:에피토프 계면을 모델링하고 면역원성 펩티드 서열을 예측할 수 있는 인실리코 에피토프 예측 도구의 사용에 의해 극복될 수 있는 제한 인자이다 (예를 들어, De Groot, A. S. and Moise, L. (2007) Curr . Opin . Drug Discov . Devel . 10(3):332-340 참고) In vitro methods such as MHC or HLA binding assays and T-cell assays can be used to predict T-cell epitopes and assess T-cell responses to protein therapeutic antigens. The synthesis of hundreds or thousands of overlapping peptides for in vitro assays is an in silico epitope that can accurately model the MHC:epitope interface and predict immunogenic peptide sequences. is a limiting factor that can be overcome by the use of predictive tools (see, eg, De Groot, AS and Moise, L. (2007) Curr . Opin . Drug Discov . Devel . 10(3):332-340)
MHCMHC // HLAHLA 결합 검정 combination test
T-세포 에피토프 예측은 CD8+ 또는 CD4+ T 세포를 자극하는 항원 내의 가장 짧은 펩티드 서열들을 식별하는데, 이들은 따라서 면역원성이다. T-세포 에피토프의 면역원성은 항원 가공, MHC 분자에 대한 펩티드 결합 및 동족 TCR에 의한 인식에 따라 달라지고; MHC-펩티드 결합은 T-세포 에피토프를 예측하기 위한 가장 선택적인 공정이고 일차적인 기반이다. MHC 결합 검정은 고친화도 펩티드를 검출하기 위해 사용될 수 있고, 종종 면역원성일 가능성이 있는 단백질의 영역을 식별하기 위해 에피토프 맵핑과 공조하여 적용된다. 시험관 내 MHC 클래스 II 결합 검정은 세포 기반 결합 검정 및 가용성 HLA 결합 검정을 포함한다. 고처리량 MHC 결합 검정은 다양한 용량의 관심대상 펩티드를 대조군 펩티드 및 가용성 MHC 단백질로 배양하여 결합 친화도를 평가하는 단계를 수반하는데, 고친화도 펩티드는 MHC에 더 강하게 결합되고 에피토프는 T-세포에 의해 인식될 가능성이 더 높다. 예를 들어, MHC II:에피토프 결합은 MHC 클래스 II 대립유전자를 발현하는 림프모구양 세포주 B-세포의 표면에 외인성으로 첨가된 펩티드의 결합 능력을 측정함으로써 평가될 수 있고, 경쟁-기반 HLA 검정은 고처리량 선별을 위해 조정될 수 있다. 잠재적 면역원성 에피토프를 식별하기 위한 MHC 결합 검정은 예를 들어, ProImmune에서 상업적으로 입수 가능하다 (예를 들어, Dingman 등 (2019) J. Pharm . Sci . 108(5):1637-1654; De Groot, A. S. and Moise, L. (2007) Curr . Opin . Drug Discov. Devel . 10(3):332-340; Sanchez-Trincado 등 (2017) Journal of Immunology Research, Article ID 2680160 참고).T-cell epitope prediction identifies the shortest peptide sequences within the antigen that stimulate CD8 + or CD4 + T cells, which are therefore immunogenic. The immunogenicity of T-cell epitopes depends on antigen processing, peptide binding to MHC molecules and recognition by cognate TCRs; MHC-peptide binding is the most selective process and primary basis for predicting T-cell epitopes. MHC binding assays can be used to detect high affinity peptides and are often applied in conjunction with epitope mapping to identify regions of a protein that are likely to be immunogenic. In vitro MHC class II binding assays include cell-based binding assays and soluble HLA binding assays. High-throughput MHC binding assays involve incubating various doses of a peptide of interest with a control peptide and soluble MHC protein to assess binding affinity, with high affinity peptides binding more strongly to MHC and epitopes being expressed by T-cells. more likely to be recognized. For example, MHC II:epitope binding can be assessed by measuring the binding ability of a peptide exogenously added to the surface of a lymphoblastoid cell line B-cell expressing an MHC class II allele, a competition-based HLA assay It can be tailored for high-throughput screening. MHC binding assays to identify potential immunogenic epitopes are commercially available, eg, from ProImmune (see, eg, Dingman et al. (2019) J. Pharm . Sci . 108(5):1637-1654; De Groot , AS and Moise, L. (2007) Curr . Opin . Drug Discov. Devel . 10(3):332-340;
iii. iii. 시험관 내 in vitro T-세포 검정T-cell assay
단백질 치료제 중 T-세포 에피토프의 존재는 T-세포 검정에서 시험관 내 T-세포 반응을 평가함으로써 검출될 수 있다. T-세포는 면역원성 단백질에 의한 자극 시 증식하고 사이토카인을 방출한다. T-세포 에피토프는 이펙터 T-세포에 의한 사이토카인, 예컨대 IL-2, IL-4, IL-5 및 IFNγ의 분비를 유도하고, 조절 T-세포(Tregs)에 의한 사이토카인 TGFβ 및 TNFα 및 케모카인, 예컨대 MIP1α/1β의 분비를 유도한다. 면역원성 펩티드/에피토프에 반응한 T-세포의 증식은 티미딘을 이용한 방사선표지화 또는 형광 염료, 예컨대 카복시플루오레세인 석신이미딜 에스테르(CFSE)를 이용한 표지화에 의해 측정될 수 있다. 유동 세포 측정뿐만 아니라 ELISA 또는 ELISpot 방법은 면역원성을 결정하기 위해 T-세포에 의해 분비된 사이토카인, 예컨대 IL-2 및 IFN-γ의 수준을 측정하기 위해 사용될 수 있다. ELISpot 방법은 상당히 민감하고 비장 세포 또는 말초 혈액에서 직접적으로 유래된 개별 T-세포를 검출할 수 있을 뿐만 아니라, 특이적 사이토카인을 분비하는 항원 특이적 T-세포의 개수를 측정할 수 있다. 예를 들어, IL-2 및 IL-4를 측정하기 위한 ELISpot 검정은 상업적으로 입수 가능하다. 유동 세포측정 또한 T-세포 반응을 측정하기 위해 사용될 수 있는데, 이로써 특정 에피토프에 반응하는 T-세포는 사량체(MHC 클래스 II:에피토프 복합체)를 사용하여 직접적으로 표지된다. T-세포 증식 및 사이토카인 방출 검정은 발생하는 T-세포 반응의 유형을 분류하기 위해 T-세포 표현형과 조합될 수 있다. 항원에 반응하는 T-세포의 개수 및 표현형은 세포 표면 마커, 예컨대 이펙터 T-세포의 경우 CD25 및 Tregs의 경우 FoxP3을 식별함으로써, 및/또는 세포내 사이토카인 발현을 식별함으로써 유동 세포측정과 같은 방법을 사용하여 결정될 수 있다. 따라서, T-세포 에피토프의 식별은 표현형 연구와 체결되어 면역 반응이 염증성일지 또는 억제성일지를 평가할 수 있다. PBMC 제제를 사용하는 말초 혈액 단핵 세포(PBMC) 검정은 몇 가지 유형의 면역 세포(예를 들어, CD4+ 및 CD8+ T-세포)를 포함하고, 생체 내 면역계를 보다 더 잘 모방하고, 단백질의 면역원성과, 인간 대상 테스트 없이, 잠재적 면역 반응을 평가하기 위해 사용될 수 있다. PBMC는 시험관 내 배양물에서 전체의 치료 단백질로 또는 치료 단백질에서 유래된 펩티드로 자극된다. 선천적 세포 시스템, 예컨대 CD8+ 반응성 T 세포가 결핍된 PBMC 제제 또는 선천적 림프양 세포(ILC)를 사용하는 선천적 면역스크리닝은 면역원성 단백질에 대한 선천적 및 적응성 면역 반응을 구별하기 위해 사용될 수 있다. 시험관 내 T-세포 검정은 유용하기 위해서는 광범위한 MHC 클래스 II 동종이형을 가진 대규모 공여자 코호트에서 유래된 PBMC에 대해 펩티드를 시험해야 한다. 시험관 내 T-세포 검정은 T-세포 에피토프의 개수 및 효능에 대한 정보를 제공할 수 있는데, 이것은 전임상 개발 중에 면역원성의 위험도를 판단하고 표적화된 아미노산 치환에 의한 그와 같은 에피토프의 제거를 유도하기 위해 사용될 수 있다 (예를 들어, Baker 등 (2010) Self/ Nonself 1(4):314-322; Dingman 등 (2019) J. Pharm. Sci . 108(5):1637-1654; De Groot, A. S. and Moise, L. (2007) Curr . Opin. Drug Discov. Devel. 10(3):332-340 참고). The presence of T-cell epitopes in protein therapeutics can be detected by assessing T-cell responses in vitro in a T-cell assay. T-cells proliferate and release cytokines when stimulated by immunogenic proteins. T-cell epitopes induce the secretion of cytokines such as IL-2, IL-4, IL-5 and IFNγ by effector T-cells, and the cytokines TGFβ and TNFα and chemokines by regulatory T-cells (Tregs). , eg induces secretion of MIP1α/1β. Proliferation of T-cells in response to immunogenic peptides/epitopes can be measured by radiolabeling with thymidine or labeling with a fluorescent dye such as carboxyfluorescein succinimidyl ester (CFSE). Flow cytometry as well as ELISA or ELISpot methods can be used to measure levels of cytokines such as IL-2 and IFN-γ secreted by T-cells to determine immunogenicity. The ELISpot method is highly sensitive and can detect individual T-cells directly derived from spleen cells or peripheral blood, as well as measure the number of antigen-specific T-cells that secrete specific cytokines. For example, ELISpot assays for measuring IL-2 and IL-4 are commercially available. Flow cytometry can also be used to measure T-cell responses, whereby T-cells that respond to specific epitopes are directly labeled with tetramers (MHC class II:epitope complexes). T-cell proliferation and cytokine release assays can be combined with T-cell phenotypes to classify the type of T-cell response that occurs. The number and phenotype of T-cells responding to an antigen can be determined by methods such as flow cytometry by identifying cell surface markers such as CD25 for effector T-cells and FoxP3 for Tregs, and/or by identifying intracellular cytokine expression. can be determined using Thus, identification of T-cell epitopes can be coupled with phenotypic studies to assess whether the immune response will be inflammatory or suppressive. Peripheral blood mononuclear cell (PBMC) assays using PBMC preparations involve several types of immune cells (e.g., CD4 + and CD8 + T-cells), better mimic the immune system in vivo , and produce protein It can be used to evaluate immunogenicity and potential immune responses without testing in humans. PBMCs are stimulated in in vitro culture with the whole Therapeutic protein or with peptides derived from the Therapeutic protein. Innate immune screening using innate lymphoid cells (ILCs) or PBMC preparations deficient in innate cell systems such as CD8 + reactive T cells can be used to distinguish between innate and adaptive immune responses to immunogenic proteins. For an in vitro T-cell assay to be useful, peptides must be tested against PBMCs derived from a large donor cohort with a wide range of MHC class II allotypes. In vitro T-cell assays can provide information on the number and potency of T-cell epitopes, which can be used during preclinical development to determine the risk of immunogenicity and to induce elimination of such epitopes by targeted amino acid substitutions. (e.g. Baker et al. (2010) Self/ Nonself 1(4):314-322; Dingman et al (2019) J. Pharm. Sci . 108(5):1637-1654; De Groot, AS and Moise, L. (2007) Curr . Opin. Drug Discov. Devel. 10(3):332-340).
d. d. 생체 내 in vivo 에피토프epitope 예측 방법 Prediction method
인간에서 단백질 치료제의 면역원성의 생체 내 평가는 동물 모델, 예컨대 마우스를 사용한다. 일반적으로, 임의의 인간 또는 인간화된 단백질 치료제는 비-인간 동물에 투여되는 경우 면역원성일 수 있다. 그러나, 동물 모델은 면역원성의 예측, 생성물들 사이의 상대적 면역원성, 약물 제형 또는 투여 경로의 비교, 응집체의 면역원성의 판단 및 면역 메커니즘의 설명을 위해 유용하다. 동물 모델에서 적응성 이전(adoptive transfer) 및 T-세포 증식 연구는 단백질 면역원성에서 T-세포 및 B-세포의 역할을 결정하는 데 사용될 수 있다. 인간 단백질 치료제의 면역원성은 동물에서 평가하기 어려울 수 있는데, 그 이유는 동물 MHC 수용체가 인간 HLA 수용체를 직접적으로 모방하지 않고, HLA 및 MHC 유전자가 HLA/MHC 발현에서 대상체간 가변성이 높고 상당히 다형성이기 때문이다. 이들 제한을 극복하기 위해서 인간 대상체를 모방하고 특정 단백질에 면역관용을 보일 수 있는 HLA 형질전환 마우스가 생성된 바 있는데, 마우스는 평가되는 단백질 치료제를 용인할 것이고, 발달되는 임의의 면역원성은 자가-내성의 파괴 때문이지 외래 항원에 대한 전통적 면역 반응 때문이 아니다. 단백질 치료제의 면역원성을 판단하기 위한 생체 내 방법은 단백질 전체 또는 에피토프 펩티드에 HLA-형질전환 마우스의 노출을 포함한다. 공통 HLA 유전자 산물, 예컨대 HLA-A, HLA-B 및 HLA-DR 분자를 발현하는 몇 개의 형질전환 마우스 균주가 생성된 바 있는데, ELISA 및 중화 항체 검정에 의해, 단백질 치료제에 대한 노출로 유도된 항체뿐만 아니라 T-세포 반응을 측정하기 위해 사용될 수 있다. 단백질 치료제 중 B-세포 에피토프는 또한 HLA 형질전환 마우스를 상기 단백질로 면역화함으로써 식별될 수 있다 (예를 들어, Dingman 등 (2019) J. Pharm. Sci . 108(5):1637-1654; De Groot, A. S. and Moise, L. (2007) Curr . Opin. Drug Discov . Devel . 10(3):332-340 참고). In vivo assessment of the immunogenicity of protein therapeutics in humans uses animal models, such as mice. In general, any human or humanized protein therapeutic can be immunogenic when administered to a non-human animal. However, animal models are useful for predicting immunogenicity, relative immunogenicity between products, comparison of drug formulations or routes of administration, determination of immunogenicity of aggregates, and elucidation of immune mechanisms. Adaptive transfer and T-cell proliferation studies in animal models can be used to determine the role of T-cells and B-cells in protein immunogenicity. Immunogenicity of human protein therapeutics can be difficult to evaluate in animals because animal MHC receptors do not directly mimic human HLA receptors and HLA and MHC genes have high inter-subject variability in HLA/MHC expression and are highly polymorphic. Because. To overcome these limitations, HLA transgenic mice have been generated that mimic human subjects and are capable of showing immunotolerance to specific proteins, which mice will tolerate the protein therapeutic being evaluated and any immunogenicity that develops is self- This is because of the destruction of tolerance and not because of the traditional immune response to foreign antigens. In vivo methods for determining the immunogenicity of protein therapeutics involve exposure of HLA-transgenic mice to either the entire protein or an epitope peptide. Several transgenic mouse strains have been generated that express common HLA gene products, such as HLA-A, HLA-B and HLA-DR molecules, and by ELISA and neutralizing antibody assays, antibodies induced by exposure to protein therapeutics. as well as to measure T-cell responses. B-cell epitopes in protein therapeutics can also be identified by immunizing HLA transgenic mice with the protein (see, eg, Dingman et al. (2019) J. Pharm. Sci . 108(5):1637-1654; De Groot , AS and Moise, L. (2007) Curr . Opin. Drug Discov . Devel . 10(3):332-340).
상당히 면역저하되고 보체 및 사이토카인 신호전달뿐만 아니라 면역 세포 대부분이 결핍된 NOD scid 감마(NSG) 마우스는 생체 내 모델에서 인간 면역계를 조사하기 위해 형질감염될 수 있다. 예를 들어, 정상적인 T-세포 및 염증 기능이 있는 기능적 면역계를 발달시키기 위해 제대혈 유래 조혈 줄기세포가 CD34+ 인간화된 NSG 마우스 모델에 이식된다. 동물 모델은 또한 비-인간 영장류, 예컨대 붉은털원숭이 및 침팬지를 포함하여, 단백질 면역원성을 예측하는 데 좀 더 유용한데, 그 이유는 그들의 단백질이 인간 단백질과 더 높은 수준의 상동성을 보이기 때문이고, 그들의 면역 기전이 인간의 것과 유사하기 때문이다 (예를 들어, Dingman 등 (2019) J. Pharm. Sci . 108(5):1637-1654 참고). NOD scid that is significantly immunocompromised and lacks complement and cytokine signaling as well as most immune cells Gamma (NSG) mice can be transfected to investigate the human immune system in an in vivo model. For example, cord blood-derived hematopoietic stem cells are transplanted into a CD34 + humanized NSG mouse model to develop a functional immune system with normal T-cell and inflammatory functions. Animal models are also more useful for predicting protein immunogenicity, including non-human primates, such as rhesus monkeys and chimpanzees, because their proteins show a higher degree of homology to human proteins and , because their immune mechanisms are similar to those of humans (see, eg, Dingman et al. (2019) J. Pharm. Sci . 108(5):1637-1654).
e. 예측된 B-세포 및 T-세포 e. Predicted B-cells and T-cells 에피토프의epitope 제거( eliminate( 탈면역화deimmunization ))
본 명세서에 기재된 바와 같이, 단백질 치료제의 면역원성 에피토프의 예측 및 제거(즉, 탈면역화)는 본 명세서에 제공된 작제물의 효능 및 안전성을 증가시킬 수 있고, 역효과의 가능성을 감소시키거나 또는 역효과를 방지할 수 있다. 예를 들어,식별된 에피토프, 예컨대 B-세포 에피토프의 제거는 ADA의 형성을 방지할 수 있어서, 치료제를 중화시키고/시키거나 신체에서 빠른 제거를 유도함으로써 투여된 단백질 치료제의 효능을 감소시킨다. As described herein, prediction and elimination ( i.e. , deimmunization) of immunogenic epitopes of protein therapeutics can increase the efficacy and safety of constructs provided herein, reduce the likelihood of adverse effects, or eliminate adverse effects. It can be prevented. For example, removal of an identified epitope, such as a B-cell epitope, can prevent the formation of ADA, thereby reducing the efficacy of an administered protein therapeutic by neutralizing the therapeutic and/or inducing rapid elimination from the body.
단백질 치료제의 탈면역화는 면역원성이 높은 B-세포 및/또는 T-세포 에피토프의 식별 및 주요 아미노산 잔기의 돌연변이 유발 치환에 의한 식별된 에피토프의 결실을 수반한다. 상기에 논의된 바와 같이, 단백질 치료제 서열 내 면역원성 영역의 예측 및 평가는 다양한 인실리코, 시험관 내, 및 생체 내 방법의 사용을 포함한다. 면역원성 에피토프의 식별 시, 에피토프의 아미노산 서열은 무작위 또는 부위 지정 돌연변이유발에 의해 변형되어 면역원성 서열이 제거되고, 에피토프가 탈면역화된다. 예를 들어, 에피토프 및 항체 사이에 형성된 대부분의 접촉은 아미노산 측쇄를 통해 발생하고, 알라닌 스캐닝 돌연변이 유발은 각각의 잔기 측쇄가 항체 결합에 미치는 기여도를 정의하기 위해 사용될 수 있다. 이는 측쇄가 파라토프-에피토프 상호작용에 최고의 활동적인 기여를 하는 임계 잔기를 식별하기 위해, 한 번에 하나씩 각각의 비-알라닌 잔기의 순차적 알라닌 치환에 의해 수행된다. 그러나, 면역원성 에피토프의 예측 및 돌연변이 유발 결실은 단백질이 그것의 치료적 효능을 유지하기 위해 그것의 접히고 안정된 활성 구조를 반드시 유지하기 때문에 단백질 탈면역화에 충분하지 않고, 단백질의 구조 및 기능과 양립가능한 에피토프-결실 돌연변이가 선택되어야 한다. Deimmunization of protein therapeutics involves the identification of highly immunogenic B-cell and/or T-cell epitopes and deletion of the identified epitopes by mutagenic substitution of key amino acid residues. As discussed above, the prediction and evaluation of immunogenic regions within a protein therapeutic sequence involves the use of a variety of in silico , in vitro , and in vivo methods. Upon identification of an immunogenic epitope, the amino acid sequence of the epitope is modified by random or site-directed mutagenesis to remove the immunogenic sequence and deimmunize the epitope. For example, most contacts formed between epitopes and antibodies occur through amino acid side chains, and alanine scanning mutagenesis can be used to define the contribution of each residue side chain to antibody binding. This is done by sequential alanine substitution of each non-alanine residue, one at a time, to identify the critical residue whose side chain makes the most active contribution to the paratope-epitope interaction. However, predictive and mutagenic deletion of immunogenic epitopes is not sufficient for protein deimmunization because the protein must retain its folded and stable active conformation to maintain its therapeutic efficacy and is compatible with the protein's structure and function. Possible epitope-deleting mutations should be selected.
본 공정의 효율을 높이는 인실리코 도구가 존재한다. 예를 들어, 면역원성 서열 중 각각의 아미노산을 다른 19개 천연 발생 아미노산 중 하나로 순차적으로 대체하고, 그 다음 새로운 서열의 면역원성을 재평가하는 프로그램이 사용 가능하다. 예를 들어, OptiMatrix은 펩티드 서열의 임의의 소정의 위치에서 20개 아미노산 전부를 반복적으로 대체하고, 그 다음 변형된 서열의 예측된 면역원성을 재분석하는 도구이다 (예를 들어, De Groot, A. S. and Moise, L. (2007) Curr . Opin . Drug Discov . Devel . 10(3):332-340De Groot, A. S. and Moise, L. (2007) Curr . Opin. Drug Discov . Devel . 10(3):332-340 참고). EpiSweep은 면역원성 T-세포 에피토프의 전산 예측들을 에피토프-결실 돌연변이가 단백질 안정성, 구조 및 기능에 미치는 영향의 서열-기반 또는 구조-기반 평가와 통합하는 단백질 설계 알고리즘의 모음으로서, 이것은 낮은 면역원성 및 높은 활성 및 안정성으로 단백질 치료제를 최적화하는 돌연변이의 조합의 선택을 가능하게 한다 (예를 들어, 탈면역화 알고리즘의 EpiSweep 모음의 적용에 대한 단계별 가이드에 대해, Choi 등 (2017) Methods Mol. Biol . 1529:375-398 참고). 전산 알라닌 스캐닝은 또한 단순한 자유 에너지 기능을 사용함으로써 단백질-단백질 착물 중 결합 자유 에너지에 대해 알라닌 돌연변이가 미치는 효과를 신속하게 결정하기 위해 사용될 수 있다 (예를 들어, Potocnakova 등 (2016) Journal of Immunology Research, Article ID 6760830 참고). Insilico, which increases the efficiency of this process tools exist. For example, programs are available that sequentially replace each amino acid in an immunogenic sequence with one of the other 19 naturally occurring amino acids, and then re-evaluate the immunogenicity of the new sequence. For example, OptiMatrix is a tool that iteratively replaces all 20 amino acids at any given position in a peptide sequence, and then reanalyzes the predicted immunogenicity of the modified sequence (e.g., De Groot, AS and Moise , L. ( 2007 ) Curr . _ _ _ _ _ _ -340). EpiSweep is a suite of protein design algorithms that integrate computational predictions of immunogenic T-cell epitopes with sequence-based or structure-based assessments of the effects of epitope-deleting mutations on protein stability, structure, and function, which result in low immunogenicity and Enable selection of combinations of mutations that optimize protein therapeutics with high activity and stability (e.g., for a step-by-step guide to the application of the EpiSweep suite of deimmunization algorithms, Choi et al. (2017) Methods Mol. Biol . 1529:375-398). Computational alanine scanning can also be used to rapidly determine the effect of alanine mutations on the binding free energy in protein-protein complexes by using a simple free energy function (e.g. Potocnakova et al. (2016) Journal of Immunology Research , see Article ID 6760830).
G. 범-성장 인자 트랩 G. pan-growth factor trap 작제물construct ..
1. 수용체 티로신 1. Receptor tyrosine 키나제Kinase (( RTKRTK ))
수용체 티로신 키나제(RTK)는 많은 폴리펩티드 성장 인자, 사이토카인 및 호르몬에 대한 고친화성 세포 표면 수용체이다. RTK는 많은 신호전달 경로에 관여하며 세포 분열, 증식, 분화, 이동 및 대사를 포함한 다양한 세포 과정에서 역할을 한다. RTK는 동족 수용체에 특이적으로 결합하는 리간드에 의해 활성화될 수 있다. 이러한 활성화는 결과적으로 예를 들어 자가분비 또는 주변분비 세포 신호전달 경로를 촉발함으로써 신호전달 경로에서 이벤트를 활성화하며, 이는 특정 생물학적 효과를 초래하는 2차 메신저의 활성화이다. 대략 20가지의 RTK 클래스가 확인되었으며, 그 중에서도 예를 들어, 표피 성장 인자 수용체 (EGFR) 패밀리 (클래스 I, ErbB 패밀리로도 알려져 있음); 인슐린 수용체 패밀리 (클래스 II); 혈소판 유래 성장 인자 수용체 (PDGFR) 패밀리 (클래스 III); 혈관 내피 성장 인자 수용체 (VEGFR) 패밀리 (클래스 IV); 섬유아세포 성장 인자 수용체 (FGFR) 패밀리 (클래스 V); 간세포 성장 인자 수용체 (HGFR) 패밀리 (클래스 VIII); 및 Eph 수용체 패밀리 (Ephs, 에리트로포이에틴 생성 인간 간세포 수용체 후; 클래스 IX)을 포함한다. Receptor tyrosine kinases (RTKs) are high affinity cell surface receptors for many polypeptide growth factors, cytokines and hormones. RTKs are involved in many signaling pathways and play roles in a variety of cellular processes including cell division, proliferation, differentiation, migration and metabolism. RTKs can be activated by ligands that specifically bind to their cognate receptors. This activation in turn activates an event in a signaling pathway, for example by triggering an autocrine or paracrine cell signaling pathway, which is the activation of a second messenger that results in a specific biological effect. Approximately 20 classes of RTKs have been identified, including, for example, the epidermal growth factor receptor (EGFR) family (class I, also known as the ErbB family); insulin receptor family (class II); platelet derived growth factor receptor (PDGFR) family (class III); vascular endothelial growth factor receptor (VEGFR) family (class IV); fibroblast growth factor receptor (FGFR) family (class V); hepatocyte growth factor receptor (HGFR) family (class VIII); and the Eph receptor family (Ephs, post erythropoietin-producing human hepatocyte receptor; class IX).
RTK는 생리학적 및 종양 혈관 형성을 포함한 혈관형성에 관여하는 조절 경로와 관련이 있으며 세포 증식, 이동 및 생존의 조절과 연관이 있다. RTK는 유방암 및 결장직장암, 위 암종, 신경교종 및 중배엽 유래 종양과 같은 자가면역 질환 및 암을 비롯한 여러 질환에 연루되어 있다. RTK의 조절장애는 여러 암과 연관이 있다. 예를 들어, 유방암은 p185-HER2의 증폭된 발현과 연관이 있다. RTK는 또한 당뇨병성 망막병증 및 황반 변성을 비롯한 안구 질환과 연관이 있다. 또한 EGF 유사 성장 인자(리간드)뿐만 아니라 표피 성장 인자 수용체(EGFR) 패밀리의 구성원이 류마티스성 관절염(RA) 환자의 활막 섬유아세포 및 대식세포에서 과발현되는 것으로 나타났다. RTKs are involved in regulatory pathways involved in angiogenesis, including physiological and tumor angiogenesis, and have been implicated in the regulation of cell proliferation, migration and survival. RTKs have been implicated in several diseases, including cancer and autoimmune diseases such as breast and colorectal cancers, gastric carcinomas, gliomas and mesoderm-derived tumors. Dysregulation of RTKs is associated with several cancers. For example, breast cancer is associated with amplified expression of p185-HER2. RTKs have also been implicated in eye diseases including diabetic retinopathy and macular degeneration. It has also been shown that members of the epidermal growth factor receptor (EGFR) family, as well as EGF-like growth factors (ligands), are overexpressed in synovial fibroblasts and macrophages from patients with rheumatoid arthritis (RA).
a. 인간 표피 성장 인자 수용체(HER) a. human epidermal growth factor receptor (HER) 패밀리family
질환과 연관된 RTK 중에는, HER1/EGFR (ErbB1), HER2 (ErbB2/Neu), HER3 (ErbB3) 및 HER4 (ErbB4)를 포함하는 클래스 I 인간 EGFR(HER; ErbB라고도 함) 패밀리의 수용체가 있다. HER1, HER3 및 HER4는 표피 성장 인자 (EGF), 형질전환 성장 인자 (TGF)-α, 헤파린 결합 (HB)-EGF, 암피레굴린, β-셀룰린 (BTC), 에피레굴린, 에피겐, 및 뉴레굴린 (NRG)1-4를 비롯하여 11개 이상의 표준 리간드에 집합적으로 결합한다. HER2는 이러한 리간드 중 어느 것도 결합하지 않지만 HER3 및 HER4와 같은 다른 HER 패밀리 구성원과의 이종이량체화에 의해 신호 증폭기 역할을 한다 (예를 들어, 문헌[Jin 등 (2009) Mol . Med . 15(1-2):11-20] 참조). HER1, HER2 및 HER4는 티로신 키나제로서 활성인 반면, HER3는 키나제(키나제 도메인이 있음에도 불구하고)로서 불활성이며 포스파티딜이노시톨 3-키나제 경로를 통해 신호를 보낸다. Among the RTKs associated with disease are the class I human EGFR (HER; also known as ErbB) family of receptors, which include HER1/EGFR (ErbB1), HER2 (ErbB2/Neu), HER3 (ErbB3) and HER4 (ErbB4). HER1, HER3 and HER4 are epidermal growth factor (EGF), transforming growth factor (TGF)-α, heparin-binding (HB)-EGF, amphiregulin, β-cellulin (BTC), epiregulin, epigen, and neuregulin (NRG) 1-4. HER2 does not bind any of these ligands but acts as a signal amplifier by heterodimerization with other HER family members such as HER3 and HER4 (see, for example, Jin et al. (2009) Mol . Med . 15(1-2):11-20]). HER1, HER2 and HER4 are active as tyrosine kinases, whereas HER3 is inactive as a kinase (despite having a kinase domain) and signals through the phosphatidylinositol 3-kinase pathway.
HER 패밀리의 모든 구성원은 세포외 리간드 결합 도메인, 단일 막통과 도메인 및 세포질 티로신-키나제 함유 도메인을 가지고 있다. 각 HER 패밀리 구성원의 세포외 영역은 4개의 하위도메인, L1, CR1, L2 및 CR2를 포함하며, 여기서 "L"은 류신 풍부 반복 도메인을 지칭하고 "CR"은 시스테인 풍부 영역/도메인 (퓨린 유사 반복 도메인으로도 알려져 있음)을 지칭하고; 4개의 하위도메인은 각각 도메인 I-IV라고도 한다. 도메인 I 및 III은 리간드 결합 도메인이고, 도메인 II 및 IV는 서로 및 수용체 패밀리의 다른 구성원에 대한 결합을 매개한다. 도메인 II는 이량체화 아암으로 알려진 이량체화에 필요한 서열을 함유하고, 도메인 IV는 테더링된 형태를 겪지 않는 HER2를 제외하고 도메인 II/IV 테더링을 허용하는 서열을 함유한다. 리간드의 부재에서, EGFR, HER3 및 HER4 하위도메인 II 및 IV는 분자내 자동 억제 테더를 형성한다. 리간드 결합 시, 하위도메인은 형태적 변화를 겪어 하위도메인 I 및 III이 고친화성 리간드 결합 포켓을 형성할 수 있도록 한다. 하위도메인 II 및 IV에 의해 형성된 테더의 돌연변이유발 파괴 또는 하위도메인 IV의 C-말단 결실은 리간드 결합 친화성을 최대 15배까지 증가시키는 것으로 나타났다 (예를 들어, 문헌[Jin 등 (2009) Mol . Med . 15(1-2):11-20] 참조). All members of the HER family have an extracellular ligand binding domain, a single transmembrane domain and a cytoplasmic tyrosine-kinase containing domain. The extracellular region of each HER family member contains four subdomains, L1, CR1, L2 and CR2, where “L” refers to the leucine-rich repeat domain and “CR” refers to the cysteine-rich region/domain (purine-like repeat also known as a domain); The four subdomains are also referred to as domains I-IV, respectively. Domains I and III are the ligand binding domains, and domains II and IV mediate binding to each other and to other members of the receptor family. Domain II contains sequences necessary for dimerization, known as dimerization arms, and domain IV contains sequences allowing for domains II/IV tethering, except for HER2, which does not undergo tethered conformation. In the absence of ligand, EGFR, HER3 and HER4 subdomains II and IV form an intramolecular auto-inhibitory tether. Upon ligand binding, the subdomain undergoes a conformational change allowing subdomains I and III to form a high affinity ligand binding pocket. Mutagenic disruption of the tether formed by subdomains II and IV or C-terminal deletion of subdomain IV has been shown to increase ligand binding affinity up to 15-fold (see, for example, Jin et al. (2009) Mol . Med . 15(1-2):11-20]).
HER 패밀리 구성원은 상피, 중간엽 및 신경 기원의 다양한 조직에서 발현된다. 정상적인 생리학적 조건에서, HER의 활성화는 성장 인자의 EGF 패밀리 구성원인 리간드의 공간적 및 시간적 표현에 의해 제어된다. 리간드 결합은 수용체 동종이량체 및 이종이량체의 다중 조합의 형성을 유도하여, 고유 키나제 도메인의 활성화, 세포질 꼬리의 특정 티로신 잔기의 자가 인산화, 여러 세포내 단백질의 모집 및 인산화, 다중 다운스트림 신호전달 캐스케이드에 대한 결합을 유도한다. 활성화된 신호 경로는 Ras-Raf-미토겐 활성화 단백질 키나제 유사분열 경로, 포스파티딜이노시톨 3-키나제-AKT 세포 생존 경로, 및 스트레스 활성화 단백질 키나제 C 및 Jak/Stat 경로를 포함한다. 유래된 신호전달 경로는 예를 들어 세포 이동, 침입, 증식, 생존 및 분화를 포함하는 다양한 세포 반응을 초래한다 (예를 들어, 문헌[Sarup 등 (2008) Mol . Cancer Ther . 7(10):3223-3236] 참조). HER family members are expressed in a variety of tissues of epithelial, mesenchymal and neural origin. Under normal physiological conditions, the activation of HER is controlled by the spatial and temporal expression of its ligand, a member of the EGF family of growth factors. Ligand binding induces the formation of multiple combinations of receptor homodimers and heterodimers, resulting in activation of native kinase domains, autophosphorylation of specific tyrosine residues in the cytoplasmic tail, recruitment and phosphorylation of several intracellular proteins, and multiple downstream signaling. induce binding to the cascade. Activated signaling pathways include the Ras-Raf-mitogen activated protein kinase mitotic pathway, the phosphatidylinositol 3-kinase-AKT cell survival pathway, and the stress activated protein kinase C and Jak/Stat pathways. Derived signaling pathways result in a variety of cellular responses including, for example, cell migration, invasion, proliferation, survival and differentiation (see, e.g., Sarup et al. (2008) Mol . Cancer Ther . 7(10):3223-3236).
b. 인간 표피 성장 인자 수용체(HER) b. human epidermal growth factor receptor (HER) 패밀리family 및 그의 리간드와 and its ligand 연련된Associated 질환 disease
과발현 또는 돌연변이로 인한 HER 패밀리 구성원 및 이들의 리간드의 조절장애는 암 및 다른 질환에서 중요한 역할을 하는 것으로 나타났다. 예를 들어, HER1 및 HER2는 많은 인간 암의 발병 및 병리학에 연루되어 있으며, 이러한 수용체의 변경은 보다 공격적인 질환 및 불량한 임상 결과와 연관이 있다. TGF-α 과발현은 전립선암, 췌장암, 폐암, 난소암 및 결장암과 연관이 있는 반면, NRG1 과발현은 유방 선암종과 연관이 있다. HER1 과발현은 신경교종, 두경부암, 유방암, 방광암, 전립선암, 신장암, 비-소세포 폐암과 연관이 있으며, HER1의 돌연변이는 신경교종, 뿐만 아니라 폐, 유방 및 난소암과 연관이 있다. HER2 과발현은 유방암, 폐암, 췌장암, 결장암, 식도암, 자궁내막암 및 자궁경부암과 연관이 있고; HER3는 유방암, 결장암, 위암, 전립선암 및 경구 편평 세포암과 연관이 있고; HER4는 유방암 및 전립선암 뿐만 아니라 소아기 수모세포종과 연관이 있다 (예를 들어, 문헌[Yarden 등 (2001) Nat. Rev. Mol . Cell Biol . 2:127-137] 참조) Dysregulation of HER family members and their ligands due to overexpression or mutation has been shown to play an important role in cancer and other diseases. For example, HER1 and HER2 have been implicated in the pathogenesis and pathology of many human cancers, and alterations in these receptors are associated with more aggressive disease and poor clinical outcomes. TGF-α overexpression is associated with prostate, pancreatic, lung, ovarian and colon cancer, while NRG1 overexpression is associated with breast adenocarcinoma. HER1 overexpression is associated with glioma, head and neck, breast, bladder, prostate, kidney, and non-small cell lung cancer, and mutations in HER1 are associated with glioma, as well as lung, breast and ovarian cancer. HER2 overexpression is associated with breast, lung, pancreatic, colon, esophageal, endometrial and cervical cancer; HER3 is associated with breast, colon, gastric, prostate, and oral squamous cell carcinoma; HER4 is associated with breast and prostate cancer as well as childhood medulloblastoma (see, eg, Yarden et al. (2001) Nat. Rev. Mol . Cell Biol . 2:127-137])
리간드 및 수용체의 EGF 패밀리은 염증성 관절염의 발달에 중요한 역할을 하는 것으로 나타났다. 예를 들어, HER2의 발현, EGFR 리간드 EGF, 암피레굴린 및 TGF-α의 존재가 RA 활막에서 검출되었다. HER2의 대안적 스플라이스 변형인 인간 EGFR 패밀리 억제제 헤르스타틴의 아데노바이러스 전달은 마우스에서 콜라겐 유도 관절염(CIA)의 모든 임상 징후를 없애는 것으로 나타났다. 헤르스타틴은 이량체화를 방해하고 천연 HER1, HER2 및 HER3의 천연 억제제로 작용한다. 이전에 리툭시맙과 아달리무맙으로 치료받은 적이 있는 오래된 RA가 있는 환자는 두경부암에 대한 항-EGFR/HER1 항체 세툭시맙으로 치료한 후 관절 통증이 상당히 감소하였다. 이러한 결과는 HER 표적화 치료가 류마티스성 관절염(RA)과 같은 자가면역 및 염증성 병태의 치료에 치료적으로 유용할 수 있음을 나타낸다 (예를 들어, 문헌[Gompels 등 (2011) Arthritis Research & Therapy 13:R161] 참조). The EGF family of ligands and receptors has been shown to play an important role in the development of inflammatory arthritis. For example, expression of HER2 and the presence of the EGFR ligands EGF, amphiregulin and TGF-α have been detected in RA synovial membranes. Adenoviral delivery of the human EGFR family inhibitor herstatin, an alternative splice variant of HER2, has been shown to abolish all clinical signs of collagen-induced arthritis (CIA) in mice. Herstatin interferes with dimerization and acts as a natural inhibitor of native HER1, HER2 and HER3. Patients with long-standing RA who had been previously treated with rituximab and adalimumab had a significant reduction in joint pain after treatment with the anti-EGFR/HER1 antibody cetuximab for head and neck cancer. These results indicate that HER-targeted therapy may be therapeutically useful in the treatment of autoimmune and inflammatory conditions such as rheumatoid arthritis (RA) (see, e.g., Gompels et al. (2011) Arthritis Research & Therapy 13:R161).
대식세포는 만성 염증성 RA 관절 조직에서 TNF의 공급원이다. RA 환자의 활막 조직에서 채취한 대식세포의 표현형 분석은 HBEGF+(헤파린 결합 EGF-유사 성장 인자+) 염증성 대식세포가 풍부함을 밝혔으며, 이는 염증유발 유전자 NR43A(핵 수용체 서브패밀리 4 그룹 A 구성원 3), PLAUR (플라스미노겐 활성자, 유로키나제 수용체), 및 CXCL2, 및 성장 인자 HB-EGF 및 에피레굴린 (EGFR 패밀리 리간드)을 과발현한다. HBEGF+ 염증성 대식세포는 또한 염증유발 사이토카인 IL-1을 생성하고 표피 성장 인자 수용체 의존적 방식으로 활막 섬유아세포 침습을 촉진하였다. 생체 외 활막 조직 검정에서 RA 표적화 HBEGF+ 대식세포를 치료하는 데 사용되는 대부분의 약물처리와 EGFR 억제제는 생체 외 검정에서 RA 조직에서 대식세포 유도 섬유아세포 반응을 효과적으로 차단하는 것으로 나타났고, 이는 RA에 대한 비-면역억제 치료 접근법을 제공할 수 있다 (예를 들어, 문헌[Kuo 등 (2019) Sci . Transl . Med . 11(491)] 참조). 이러한 접근법은 면역억제제이며 종종 결핵과 같은 심각한 감염의 발병과 연관된 전통적인 항-TNF 요법의 사용에 비해 유리하다. Macrophages are a source of TNF in chronic inflammatory RA joint tissue. Phenotypic analysis of macrophages taken from synovial tissues of RA patients revealed an abundance of HBEGF + (heparin-binding EGF-like growth factor + ) inflammatory macrophages, which express the pro-inflammatory gene NR43A (nuclear receptor subfamily 4 group A member 3 ), PLAUR (plasminogen activator, urokinase receptor), and CXCL2 , and the growth factors HB-EGF and epiregulin (EGFR family ligands). HBEGF + inflammatory macrophages also produced the pro-inflammatory cytokine IL-1 and promoted synovial fibroblast invasion in an epidermal growth factor receptor-dependent manner. Most drug treatments and EGFR inhibitors used to treat RA-targeting HBEGF + macrophages in ex vivo synovial tissue assays have been shown to effectively block macrophage-induced fibroblast responses in RA tissues in ex vivo assays, suggesting that they are not effective against RA. may provide a non-immunosuppressive treatment approach for (2019) Sci . Transl . Med . 11(491)]). This approach is advantageous over the use of traditional anti-TNF therapies, which are immunosuppressive and are often associated with the development of serious infections such as tuberculosis.
HER 패밀리 신호전달은 또한 동맥 내막에서 혈관 평활근 세포의 이동을 포함하는 관상동맥 죽상동맥경화증과 연관되어 있다. 트롬빈 수용체의 활성화는 평활근 세포 이동 및 증식에 필요하며, 이 G-단백질 결합 수용체의 활성화는 HB-EGF에 대한 반응으로 HER1/EGFR에 의한 전사활성화에 의존한다. EGFR 발현은 또한 건선과 연관이 있고; 정상 피부에서 EGFR의 발현은 기저층으로 제한되는 반면, 건선 환자에서는 EGFR 및 그 리간드 암피레귤린이 전체 표피층에서 높게 발현된다 (예를 들어, 문헌[Yarden 등 (2001) Nat. Rev. Mol . Cell Biol . 2:127-137] 참조) HER family signaling has also been implicated in coronary atherosclerosis, which involves migration of vascular smooth muscle cells in the intima of the arteries. Activation of the thrombin receptor is required for smooth muscle cell migration and proliferation, and activation of this G-protein coupled receptor is dependent on transactivation by HER1/EGFR in response to HB-EGF. EGFR expression is also associated with psoriasis; Expression of EGFR in normal skin is restricted to the basal layer, whereas in patients with psoriasis, EGFR and its ligand amphiregulin are highly expressed in the entire epidermal layer (see, e.g., Yarden et al. (2001) Nat. Rev. Mol . Cell Biol . 2:127-137])
다른 HER 매개 질환 및 병태는 다발성 경화증, 파킨슨병, 정신분열증 및 알츠하이머병과 같은 신경퇴행 질환 및 병태를 포함한다. 예를 들어, 여러 질환 및 병태는 예를 들어 유형 I, II, 및 III, NRG2, NRG3, 및/또는 NRG4을 포함하는 NRG1과 같은 하나 이상의 뉴레굴린(NRG) 리간드에 대한 노출에 의해 유발되거나 악화되는 것과 연관이 있다. NRG 연관 질환의 예는 정신분열증 및 알츠하이머병을 포함하는 신경 또는 신경근 질환을 포함한다 (예를 들어, 미국 공개 제2010/0055093호). Other HER-mediated diseases and conditions include neurodegenerative diseases and conditions such as multiple sclerosis, Parkinson's disease, schizophrenia and Alzheimer's disease. For example, several diseases and conditions are caused or exacerbated by exposure to one or more neuregulin (NRG) ligands, such as NRG1, including types I, II, and III, NRG2, NRG3, and/or NRG4. related to becoming Examples of NRG associated diseases include neurological or neuromuscular diseases including schizophrenia and Alzheimer's disease (eg, US Publication No. 2010/0055093).
암 및 다른 증식성 질환, 류마티스성 관절염, 신경퇴행 질환 및 자가면역 질환에서의 역할로 인해, HER은 치료적 개입의 표적이다. 항-HER 치료제는 본 명세서 ECD로 지칭되는 세포외 도메인 (또는 엑토도메인)을 표적으로 하는 항체 및 소분자 티로신 키나제 억제제를 포함한다. HER 단백질 패밀리에 의해 유발되는 암 치료용으로 승인된 치료제는 단클론성 항체, 예컨대 트라스투주맙 (HER2 지향), 페르투주맙 (HER2 지향), 파니투무맙 (HER1/EGFR 지향) 및 세툭시맙 (HER1/EGFR 지향), 및 소분자 티로신 키나제 억제제, 예컨대 HER1 키나제 억제제 게피티닙 및 에를로티닙, 및 이중 HER2 키나제 및 HER1 키나제 억제제 라파티닙을 포함한다. 예를 들어, 트라스투주맙은 HER2 과발현 결절 양성 또는 결절 음성 유방암의 치료에 사용되고; 세툭시맙은 전이성 결장직장암과 두경부암의 치료에 사용되고; 파니투무맙은 전이성 대장암 치료에 사용되고; 라파티닙은 삼중 양성 유방암에 대한 최일선 요법 및 트라스투주맙으로 진행된 환자를 위한 보조 요법으로 사용되고; 에를로티닙은 비-소세포 폐암과 췌장암 치료에 사용된다. Because of its role in cancer and other proliferative diseases, rheumatoid arthritis, neurodegenerative diseases and autoimmune diseases, HER is a target for therapeutic intervention. Anti-HER therapeutics include antibodies targeting the extracellular domain (or ectodomain) referred to herein as ECD and small molecule tyrosine kinase inhibitors. Approved therapeutics for the treatment of cancers caused by the HER protein family include monoclonal antibodies such as trastuzumab (directed HER2), pertuzumab (directed HER2), panitumumab (directed HER1/EGFR) and cetuximab (directed HER2). directed against HER1/EGFR), and small molecule tyrosine kinase inhibitors such as the HER1 kinase inhibitors gefitinib and erlotinib, and the dual HER2 kinase and HER1 kinase inhibitor lapatinib. For example, Trastuzumab is used in the treatment of HER2 overexpressing node-positive or node-negative breast cancer; Cetuximab is used for the treatment of metastatic colorectal cancer and head and neck cancer; Panitumumab is used to treat metastatic colorectal cancer; Lapatinib is used as first-line therapy for triple positive breast cancer and adjuvant therapy for patients who progressed to Trastuzumab; Erlotinib is used to treat non-small cell lung cancer and pancreatic cancer.
항-HER 치료제는 제한된 효능 및 제한된 반응 기간을 나타낸다. 트라스투자맙(예를 들어, Herceptin®으로 판매됨)은 뮤린 단클론성 항체의 인간화 버전이며 HER2의 세포외 도메인을 표적으로 한다. 그러나 트라스투주맙의 효과는 HER2의 높은 발현(적어도 3배 내지 5배 과발현)을 필요로 하며, 그 결과 유방암 환자의 25% 미만이 치료 대상이 된다. 이 인구 중, 많은 비율이 치료에 반응하지 않는다. 또한, 소분자 티로신 키나제 억제제는 종종 특이성이 부족하다. HER2를 고도로 발현하고 화학요법과 함께 트라스투주맙으로 치료받는 환자를 제외하고, 단일 표적화 항-HER 항체 또는 소분자 티로신 키나제 억제제로 관찰된 효능은 10-15% 범위이다. 치료, 특히 단 하나의 HER 패밀리 구성원에 대한 치료는 또한 다른 RTK, 특히 다른 HER 패밀리 구성원의 공동 발현 및 리간드 활성화와 연관된 내인성 또는 후천성 저항을 겪는다. 예를 들어, 약물 내성은 종종 HER3 및 HER4와 같은 다른 HER 패밀리 구성원의 상향 조절 또는 이에 대한 보상 또는 종양 세포에 의한 HER1 또는 HER3 리간드의 증가된 발현과 연관이 있다. 수용체의 HER 패밀리의 구성원 간의 동종이량체화 및 이종이량체화는 또한 단일 HER 패밀리 수용체에 대한 요법에 대한 의미를 갖는다. 이용 가능한 요법의 효과가 제한적이기 때문에 대체 항HER 요법이 필요하다. RTK의 HER 패밀리 및 그의 리간드를 표적화하기 위한 대안적이고 보다 효과적인 요법이 본 명세서에 제공된다. Anti-HER therapeutics show limited efficacy and limited duration of response. Trastuzumab (eg marketed as Herceptin® ) is a humanized version of a murine monoclonal antibody and targets the extracellular domain of HER2. However, the effect of trastuzumab requires high expression (at least 3-fold to 5-fold overexpression) of HER2, which results in less than 25% of breast cancer patients being treated. Of this population, a large proportion does not respond to treatment. Additionally, small molecule tyrosine kinase inhibitors often lack specificity. Except for patients who highly express HER2 and are treated with trastuzumab in combination with chemotherapy, the observed efficacy with single targeting anti-HER antibodies or small molecule tyrosine kinase inhibitors ranges from 10-15%. Treatments, particularly those directed against only one HER family member, also suffer from endogenous or acquired resistance associated with ligand activation and co-expression of other RTKs, particularly other HER family members. For example, drug resistance is often associated with upregulation of, or compensation for, other HER family members, such as HER3 and HER4, or increased expression of HER1 or HER3 ligands by tumor cells. Homodimerization and heterodimerization between members of the HER family of receptors also have implications for therapy against a single HER family receptor. Because of the limited effectiveness of available therapies, alternative anti-HER therapies are needed. Alternative and more effective therapies for targeting the HER family of RTKs and their ligands are provided herein.
2. 범-성장 인자 억제 2. Pan-growth factor inhibition
본 명세서에 기재된 바와 같이, 단일 표적화된 항-HER 요법, 예컨대 트라스투주맙 세툭시맙, 게피티닙 및 에를로티닙에 대한 내성은 종종 다른 HER 패밀리 구성원의 공동 발현 및/또는 상향조절 및/또는 그의 리간드의 과발현과 연관이 있다. 이 내성을 줄이거나 극복하고 HER 표적화 요법의 효능을 개선하기 위한 한 가지 전략은 다중 리간드 유도 HER 패밀리 구성원을 동시에 억제하는 것이다. 이는 예를 들어 수용체 유인처럼 행동하고 다중 HER 패밀리 리간드를 격리하여 리간드 의존성 수용체 활성화를 방지하고 비정상적인 HER 패밀리 활동을 하향 조절하는 키메라 HER 리간드 결합 분자에 의해 달성될 수 있다. As described herein, resistance to single targeted anti-HER therapies, such as trastuzumab, cetuximab, gefitinib, and erlotinib, often results from co-expression and/or upregulation of other HER family members and/or It is associated with overexpression of its ligand. One strategy to reduce or overcome this resistance and improve the efficacy of HER-targeted therapies is to simultaneously inhibit multiple ligand-induced HER family members. This can be achieved, for example, by chimeric HER ligand binding molecules that act like receptor attractors and sequester multiple HER family ligands to prevent ligand dependent receptor activation and downregulate aberrant HER family activity.
a. RB242 리간드 트랩a. RB242 Ligand Trap
EGFR(HER1) 및 HER3 리간드 결합 도메인의 Fc 매개 이종이량체인 키메라 이중특이적 리간드 트랩인 RB242로 지정된 길항제는 EGFR/HER 패밀리의 4개 구성원 모두를 표적으로 한다. EGFR 및 HER3 리간드 결합 도메인은 각각의 리간드 결합 도메인과 인간 IgG1의 Fc 도메인과의 융합에 의해 이량체화된다. RB200에서, EGFR(서열번호: 41에 제시된 성숙한 EGFR 단백질의 잔기 1-621에 상응함) 및 HER3(서열번호: 45에 제시된 성숙한 HER3 단백질의 잔기 1-621에 상응함)의 세포외 도메인 (ECD)의 C-말단은 각각 인간 IgG1(서열번호: 9의 잔기 P100-K330에 상응함)의 Fc 단편의 N-말단에 융합되고, Gly-Arg-Met-Asp (GRMD) 링커는 Fc 단편의 N-말단에 추가된다. RB200의 HER3/Fc 성분은 정제를 위해 COOH 말단에 6xHis 태그를 함유한다. The antagonist, designated RB242, a chimeric bispecific ligand trap that is an Fc-mediated heterodimer of EGFR (HER1) and HER3 ligand binding domains, targets all four members of the EGFR/HER family. The EGFR and HER3 ligand binding domains are dimerized by fusion of each ligand binding domain with the Fc domain of human IgG1. In RB200, the extracellular domains (ECD ) is fused to the N-terminus of the Fc fragment of human IgG1 (corresponding to residues P100-K330 of SEQ ID NO: 9), respectively, and the Gly-Arg-Met-Asp (GRMD) linker is the N-terminus of the Fc fragment. - added at the end The HER3/Fc component of RB200 contains a 6xHis tag at the COOH end for purification.
RB200은 EGFR 및 HER3 리간드(각각 EGF, TGF-α, HB-EGF, 암피레굴린, 베타-셀룰린, 에피레굴린, 및 에피겐, 및 NRG1-α, NRG1-β1 및 NRG1-β3 포함)에 고친화도로 결합하고, HER 패밀리 구성원 (HER1, HER2 및 HER3)의 리간드 유도 티로신 인산화를 억제하고, 시험관 내에서 다양한 범위의 종양 세포의 증식을 억제하고, 누드 마우스 모델에서 종양 이종이식편 (표피모양 암종 및 비-소세포 폐암)의 성장을 억제하는 것으로 밝혀졌다. RB200은 또한 시험관 내에서 종양 세포 증식 억제에서 EGFR/HER1 및 HER2 키나제, 예컨대 AG-825, 에를로티닙, 게피티닙, 또는 라파티닙에 대한 티로신 키나제 억제제와 시너지 효과를 나타내었다. HER1, HER2 및 HER3의 리간드 자극 인산화 억제는 HER1(C225) 또는 HER2(트라스투주맙 및 2C4)를 표적으로 하는 단클론성 항체와 비교하여 RB200에 의해 더 효과적이었다 (예를 들어, 문헌[Sarup 등 (2008) Mol . Cancer Ther . 7(10):3223-3236; Gompels 등 (2011) Arthritis Research & Therapy 13:R161] 참조). RB200 is effective for EGFR and HER3 ligands (including EGF, TGF-α, HB-EGF, amphiregulin, beta-cellulin, epiregulin, and epigen, and NRG1-α, NRG1-β1, and NRG1-β3, respectively). binds with high affinity, inhibits ligand-induced tyrosine phosphorylation of HER family members (HER1, HER2 and HER3), inhibits the proliferation of a wide range of tumor cells in vitro, and induces tumor xenografts in a nude mouse model (epidermoid carcinoma). and non-small cell lung cancer). RB200 also showed synergy with tyrosine kinase inhibitors for EGFR/HER1 and HER2 kinases such as AG-825, erlotinib, gefitinib, or lapatinib in inhibiting tumor cell proliferation in vitro. Inhibition of ligand-stimulated phosphorylation of HER1, HER2 and HER3 was more effective with RB200 compared to monoclonal antibodies targeting HER1 (C225) or HER2 (Trastuzumab and 2C4) (see, e.g., Sarup et al. (2008) Mol . Cancer Ther . 7(10):3223-3236; Gompels, etc. (2011) Arthritis Research & Therapy 13:R161).
RB200 및 RB242 이종이량체 키메라 융합 단백질을 발현하기 위해, HER1/Fc 및 HER3/Fc 작제물을 인코딩하는 벡터를 1:3(HER1/Fc:HER3/Fc)의 비율로 HEK293T 세포에 공동 형질감염시켰다. 그 결과 관심 있는 HER1/Fc:HER3/Fc 이종이량체 외에도 HER1/Fc 및 HER3/Fc 동종이량체가 발현된다. 발현된 단백질은 단백질-A, Ni-세파로스 및 EGFR-아피바디 컬럼 크로마토그래피 방법의 조합으로 정제되었다. 분석 역상 고성능 액체 크로마토그래피(HPLC)는 RB242 이종이량체가 2개의 동종이량체와 약 10%의 결합된 오염을 함유하고 있음을 밝혔다 (예를 들어, 문헌[Sarup 등 (2008) Mol. Cancer Ther . 7(10):3223-3236] 참조). 따라서, 이종이중체의 수율 및 순도를 향상시키기 위한 개선된 방법이 요구된다. To express the RB200 and RB242 heterodimeric chimeric fusion proteins, vectors encoding the HER1/Fc and HER3/Fc constructs were co-transfected into HEK293T cells at a ratio of 1:3 (HER1/Fc:HER3/Fc) . This results in the expression of HER1/Fc and HER3/Fc homodimers in addition to the HER1/Fc:HER3/Fc heterodimer of interest. The expressed protein was purified by a combination of Protein-A, Ni-Sepharose and EGFR-Affibody column chromatography methods. Analytical reverse-phase high performance liquid chromatography (HPLC) revealed that the RB242 heterodimer contained two homodimers and approximately 10% bound contamination (see, e.g., Sarup et al. (2008) Mol. Cancer Ther . 7(10):3223-3236). Therefore, improved methods for improving the yield and purity of heterodimers are needed.
b. 자가면역 질환 치료를 위한 RB200 및 RB242 b. RB200 and RB242 for the treatment of autoimmune diseases
본 명세서의 다른 곳에서 논의된 바와 같이, RA 환자의 상당한 비율이 결핵을 비롯한 심각한 감염의 위험 증가와 연관된 항-TNF 항체와 같은 항-TNF 요법을 사용한 치료에 반응하지 않거나 반응을 멈춘다. 따라서 대안적인 치료가 필요하다. EGF 리간드 및 수용체(HER)의 발현 증가는 류마티스성 관절염(RA) 환자의 활막 및 활막액에서 기록되었으며, 이는 EGFR을 표적으로 하는 요법이 RA 및 다른 자가면역 및 염증성 질환 및 장애를 치료하는 데 사용될 수 있음을 나타낸다. As discussed elsewhere herein, a significant proportion of RA patients do not respond or stop responding to treatment with anti-TNF therapies, such as anti-TNF antibodies, associated with an increased risk of serious infections, including tuberculosis. Therefore, an alternative treatment is needed. Increased expression of EGF ligand and receptor (HER) has been documented in the synovial membrane and synovial fluid of patients with rheumatoid arthritis (RA), suggesting that therapies targeting EGFR will be used to treat RA and other autoimmune and inflammatory diseases and disorders. indicates that it can
이중특이적 EGFR 리간드 트랩 RB200 (및 그의 유도체 RB242)은 콜라겐 유발 관절염(CIA)에서 질환 중증도의 용량 의존적 감소를 나타낸다. CIA가 있는 마우스에게 RB200(또는 RB242)을 0.1 mg/kg, 1 mg/kg 또는 10 mg/kg의 용량으로 질환 발병일(1일째)과 발병 4일째 및 7일째에 복강내 투여하였다. 1 mg/kg 또는 10 mg/kg RB200을 사용한 치료는 용량 의존적 방식으로 임상 점수 및 발 부종의 증가를 억제하였다. EGF는 혈관형성을 촉진하는 것으로 나타났으며, RB200 처리된 마우스는 CD31-면역양성 염색의 감소를 보여, 활막 혈관의 감소와 활막 혈관형성의 억제를 반영하였다. PBS 대조군으로 처리된 마우스의 관절 절편은 염증성 활막에서 높은 수의 침윤 세포뿐만 아니라 상당한 CD31 발현과 연관된 활막에 의한 뼈의 침습 및 미란을 보여주었다. 1 mg/kg 또는 10 mg/kg RB200으로 처리된 마우스의 관절은 정상적인 외관, 잘 보존된 관절 구조 및 소수의 CD31 양성 혈관으로 보호되었다. 이들 결과는 EGFR 매개 반응의 억제가 RA의 치료에서 치료 용도를 위한 것일 수 있음을 나타낸다 (예를 들어, 문헌[Gompels 등 (2011) Arthritis Research & Therapy 13:R161] 참조). The bispecific EGFR ligand trap RB200 (and its derivative RB242) shows a dose-dependent reduction in disease severity in collagen-induced arthritis (CIA). Mice with CIA were intraperitoneally administered with RB200 (or RB242) at a dose of 0.1 mg/kg, 1 mg/kg or 10 mg/kg on the day of disease onset (day 1) and on the 4th and 7th days of onset. Treatment with 1 mg/kg or 10 mg/kg RB200 inhibited the increase in clinical scores and paw edema in a dose-dependent manner. EGF was shown to promote angiogenesis, and RB200-treated mice showed a decrease in CD31-immunopositive staining, reflecting a decrease in synovial blood vessels and inhibition of synovial angiogenesis. Joint sections from mice treated with the PBS control showed invasion and erosion of bone by the synovium associated with significant CD31 expression as well as high numbers of infiltrating cells in the inflamed synovium. The joints of mice treated with 1 mg/kg or 10 mg/kg RB200 were protected with normal appearance, well-preserved joint structures and few CD31 positive blood vessels. These results indicate that inhibition of the EGFR mediated response may be of therapeutic use in the treatment of RA (see, e.g., Gompels et al. (2011) Arthritis Research & Therapy 13:R161).
TNF 억제와 EGFR 매개 신호전달 억제제와의 조합은 항-TNF 요법의 치료 효능을 증가시킬 수 있고 RA의 치료에 유용할 수 있다. 저용량의 RB200(0.5 mg/kg)과 준최적 용량의 에타네르셉트(1 mg/kg)를 병용 투여하면 임상 점수와 발 부종의 증가를 억제하고 최적 용량의 에타네르셉트(5 mg/kg) 단독 투여 시 관찰되는 것과 유사한 효과로 CIA를 완전히 제거한다. 이에 비해 저용량 RB200 단독 투여 또는 저용량 에타네르셉트 단독 투여는 효과가 없었다. E-셀렉틴에 대한 형광 표지된 단클론성 항체는 생체 내 염증 조직에서 내피 활성화를 국소화하는 데 사용할 수 있으며 CIA 평가를 위한 민감하고 구체적이며 정량화할 수 있는 분자 이미징 기술이다. 저용량 RB200과 저용량 에타네르셉트의 조합은 발에서 검출된 E-셀렉틴의 양을 건강한 동물에서 볼 수 있는 수준으로 감소시킨 반면, E-셀렉틴은 저용량 RB200 단독, 또는 저용량 에타네르셉트 단독을 투여한 CIA 마우스의 발에서 검출되었다. 관절 구조에 대한 RB200 단독 및 에타네르셉트 단독의 용량 의존적 효과가 있었고, 심각하게 파괴된 관절이 점진적으로 감소하고 경증 또는 중등도 파괴가 있는 관절이 더 많아졌지만, 저용량 RB200 단독 또는 저용량 에타너셉트 단독으로 처리한 마우스의 0%와 비교하여 관절의 64%가 정상으로 보이는 병용 치료에서 가장 현저한 효과가 관찰되었다. 병용 치료는 또한 고용량 에타네르셉트 단독보다 더 효과적이었으며, 이는 관절 보호를 촉진하는 데 범-EGFR 및 TNF 표적 요법을 병용하는 것이 효과가 있음을 나타낸다 (예를 들어, 문헌[Gompels 등 (2011) Arthritis Research & Therapy 13:R161] 참조). Combination of TNF inhibition with an inhibitor of EGFR mediated signaling may increase the therapeutic efficacy of anti-TNF therapy and may be useful in the treatment of RA. Co-administration of a low dose of RB200 (0.5 mg/kg) with a suboptimal dose of etanercept (1 mg/kg) suppressed the increase in clinical scores and foot edema, and the optimal dose of etanercept (5 mg/kg) alone Complete elimination of CIA with effects similar to those observed upon administration. In contrast, low-dose RB200 alone or low-dose etanercept alone had no effect. Fluorescently labeled monoclonal antibodies against E-selectin can be used to localize endothelial activation in inflamed tissues in vivo and are a sensitive, specific and quantifiable molecular imaging technique for the evaluation of CIA. The combination of low-dose RB200 and low-dose etanercept reduced the amount of E-selectin detected in the paws to levels seen in healthy animals, whereas E-selectin was significantly reduced by CIA with low-dose RB200 alone or low-dose etanercept alone. detected in the paws of mice. There was a dose-dependent effect of RB200 alone and etanercept alone on joint structure, with progressively fewer severely destroyed joints and more joints with mild or moderate destruction, but no treatment with low-dose RB200 alone or low-dose etanercept alone. The most significant effect was observed with the combination treatment, in which 64% of the joints appeared normal compared to 0% of the mice. Combination treatment was also more effective than high-dose etanercept alone, indicating the efficacy of combining pan-EGFR and TNF-targeted therapies in promoting joint protection (see, e.g., Gompels et al. (2011) Arthritis Research & Therapy 13:R161).
c. RB242 리간드 트랩c. RB242 Ligand Trap
RB200에서 유래된 RB242로 지정된 리간드 트랩은 성숙한 HER3 단백질의 서열 (서열번호: 45)와 관련하여 HER3 ECD 하위도메인에서 성숙 EGFR 단백질의 서열 (서열번호: 41), 및 Y246A와 관련하여 각각 EGFR ECD 하위도메인 I 및 IV에서 돌연변이 T15S 및 G564S를 포함하는 친화성 최적화된 Fc-매개 삼중 돌연변이 EGFR:HER3 이종이량체이다. 모분자인 RB200에 비해, RB242는 EGF, TGF-α, HB-EGF 및 NRG1-을 포함한 다양한 리간드에 대한 친화도가 평균 22배 개선되었으며, 세포 및 인간 비-소세포 폐암의 마우스 모델에서 배양된 단일층 BxPC3 췌장암에 대해 개선된 항증식 활성을 나타내었다. RB242는 또한 RB200에 비해 리간드 유도 HER 인산화의 억제에서 10 내지 60배 개선된 것으로 나타났다 (예를 들어, 문헌[Jin 등 (2009) Mol. Med. 15(1-2):11-20] 참조). The ligand trap, designated RB242, derived from RB200, was located in the HER3 ECD subdomain with respect to the sequence of the mature HER3 protein (SEQ ID NO: 45), the sequence of the mature EGFR protein (SEQ ID NO: 41), and the EGFR ECD subdomain with respect to Y246A, respectively. Affinity optimized Fc-mediated triple mutant EGFR:HER3 heterodimer comprising mutations T15S and G564S in domains I and IV. Compared to the parent molecule, RB200, RB242 showed an average 22-fold improvement in affinity for various ligands, including EGF, TGF-α, HB-EGF and NRG1-, and a single cultured cell and mouse model of human non-small cell lung cancer. showed improved antiproliferative activity against layered BxPC3 pancreatic cancer. RB242 also showed a 10- to 60-fold improvement in inhibition of ligand-induced HER phosphorylation compared to RB200 (see, eg, Jin et al. (2009) Mol. Med. 15(1-2):11-20]).
3. 최적화된 다중특이적, 예컨대 이중특이적, 성장 인자 트랩 작제물3. Optimized multispecific, such as bispecific, growth factor trap constructs
본 명세서에서는 다중특이적, 예컨대 이중특이적, 성장 인자 트랩 작제물이 제공되고, 이는 하나 초과의 세포 표면 수용체의 활성이 조절되는 한, 하나 이상의 수용체에 대한 리간드에 결합 및/또는 하나 이상의 세포 표면 수용체와 상호작용하는 것과 같이 하나 초과의 세포 표면 수용체를 특이적으로 표적화함으로써 범세포 표면 수용체 치료제가 되도록 설계되었다. 작제물은 하나 이상의 HER 패밀리 구성원을 표적으로 하는 것뿐만 아니라 하나 이상의 HER 및 항-HER 요법에 대한 내성 발달에 기여하거나 참여하는 HER와 같은 추가 수용체를 표적으로 하는 것을 포함한다. 본 명세서에 제공되는 성장 인자 트랩 작제물은 하나의 수용체, 특히 HER 패밀리의 구성원, 예컨대, 다량체화 도메인, 예컨대 인간 면역글로불린 (Ig)의 Fc, 예컨대 인간 IgG의 Fc에 융합된 EGFR/HER1, HER2, HER3 또는 HER4의 세포외 도메인(ECD)의 전부 또는 일부를 각각 함유하는 다중, 특히 2개의 키메라 융합 폴리펩티드를 함유한다. 키메라 융합 폴리펩티드 내의 ECD 또는 그의 일부는 Fc에 직접 연결되거나, 또는 펩티드 링커와 같은 링커를 통해 간접적으로 연결될 수 있다. 전형적으로, ECD 폴리펩티드의 C-말단은 IgG Fc와 같은 다량체화 도메인의 N-말단에 연결된다. Provided herein are multispecific, such as bispecific, growth factor trap constructs that bind to ligands for one or more receptors and/or so long as the activity of more than one cell surface receptor is modulated. It is designed to be a pan-cell surface receptor therapeutic by specifically targeting more than one cell surface receptor such as one that interacts with the receptor. Constructs include those that target one or more HER family members as well as those that target one or more HER and additional receptors such as HER that contribute to or participate in the development of resistance to anti-HER therapies. The growth factor trap constructs provided herein are fused to one receptor, in particular a member of the HER family, such as a multimerization domain, such as the Fc of a human immunoglobulin (Ig), such as the Fc of a human IgG, EGFR/HER1, HER2 , multiple, in particular two chimeric fusion polypeptides, each containing all or part of the extracellular domain (ECD) of HER3 or HER4. The ECD or portion thereof within the chimeric fusion polypeptide may be linked directly to the Fc or indirectly via a linker such as a peptide linker. Typically, the C-terminus of an ECD polypeptide is linked to the N-terminus of a multimerization domain such as an IgG Fc.
본 명세서의 성장 인자 트랩 작제물은 예를 들어 문헌[Sarup 등 (2008) Mol . Cancer Ther . 7(10):3223-3236; Gompels 등 (2011) Arthritis Research & Therapy 13:R161; Jin 등 (2009) Mol . Med . 15(1-2):11-20; 및 미국 특허 공개 제 2010/0055093호]에 기재된 바와 같이 발현되고 정제된다. 다음 섹션은 본 명세서에 제공된 다중특이적 성장 인자 트랩 작제물의 각 부분을 설명한다. Growth factor trap constructs herein are described, for example, in Sarup et al. (2008) Mol . Cancer Ther . 7(10):3223-3236; Gompels, etc. (2011) Arthritis Research & Therapy 13:R161; Jin et al. (2009) Mol . Med . 15(1-2):11-20; and US Patent Publication No. 2010/0055093]. The following sections describe each part of the multispecific growth factor trap construct provided herein.
a. 세포외 도메인(ECD) 폴리펩티드a. Extracellular Domain (ECD) Polypeptides
2개 이상의 세포 표면 수용체(CSR)의 세포외 도메인(ECD) 또는 그의 부분(들)을 포함하는 다중특이적, 예를 들어 이중 특이적 성장 인자 트랩 작제물이 본 명세서에 제공된다. 특정 구현예에서, 작제물은 2개의 상이한 세포 표면 수용체를 포함하는 이중특이적 이종이량체 작제물이다. 작제물은 각각 직접적으로 또는 간접적으로 링커를 통해 다량체화 도메인에 연결된 제1 ECD 폴리펩티드 및 제2 ECD 폴리펩티드를 포함한다. 일부 구현예에서, 제1 ECD 폴리펩티드는 HER1/EGFR의 ECD(서열번호: 41의 잔기 1-621에 상응함) 또는 그의 일부를 포함하고, 제2 ECD 폴리펩티드는 HER2(서열번호: 43의 잔기 1-628에 상응함), HER3(서열번호: 45의 잔기 1-621에 상응함) 또는 HER4(서열번호: 47의 잔기 1-625에 상응함)의 ECD 또는 그의 일부, 특히 HER3의 ECD 또는 HER4 또는 그 일부를 포함한다. ECD 폴리펩티드가 HER 단백질의 전장 ECD 미만을 포함하는 구현예에서, 이는 리간드 결합 및 수용체 이량체화를 위한 하위도메인 I, II 및 III의 적어도 충분한 부분을 포함한다. 예를 들어, ECD는 리간드 결합을 위한 하위도메인 I 및 III의 충분한 부분을 포함할 수 있고/있거나 하위도메인 II의 충분한 부분을 포함하여 세포 표면 수용체와 이량체화하기에 ECD의 충분한 부분을 포함할 수 있다. 일부 구현예에서, ECD는 하위도메인 I, II 및 III 및 적어도 도메인 IV의 모듈 1을 함유한다. Provided herein are multispecific, eg, bispecific, growth factor trap constructs comprising extracellular domains (ECDs) of two or more cell surface receptors (CSRs) or portion(s) thereof. In certain embodiments, the construct is a bispecific heterodimeric construct comprising two different cell surface receptors. The construct includes a first ECD polypeptide and a second ECD polypeptide, each directly or indirectly linked to the multimerization domain through a linker. In some embodiments, the first ECD polypeptide comprises the ECD of HER1/EGFR (corresponding to residues 1-621 of SEQ ID NO: 41) or a portion thereof, and the second ECD polypeptide comprises HER2 (
일부 예에서, 다중특이적, 예컨대 이중특이적, 성장 인자 트랩 작제물은 HER1/EGFR, HER2, HER3 또는 HER4, 특히 EGFR/HER1의 ECD의 전부 또는 일부를 함유하는 제1 ECD 폴리펩티드, 및 상이한 CSR, 예를 들어, HER2, HER3, HER4, 인슐린 성장 인자-1 수용체 (IGF1-R), 혈관 내피 성장 인자 수용체 (VEGFR, 예를 들어, VEGFR1), 섬유아세포 성장 인자 수용체 (FGFR, 예를 들어, FGFR2 또는 FGFR4), TNFR, 혈소판 유래 성장 인자 수용체 (PDGFR), 간세포 성장 인자 수용체 (HGFR), 면역글로불린 유사 및 EGF 유사 도메인 1을 갖는 티로신 키나제 (TIE, 예를 들어, TIE-1 또는 TEK (TIE-2)), 진행된 당화 최종 산물에 대한 수용체 (RAGE), Eph 수용체, 또는 T-세포 수용체로부터 ECD를 함유하는 제2 키메라 폴리펩티드를 함유한다.In some examples, the multispecific, such as bispecific, growth factor trap construct is a HER1/EGFR, HER2, HER3 or HER4, particularly a first ECD polypeptide containing all or part of the ECD of EGFR/HER1, and a different CSR , eg, HER2, HER3, HER4, insulin growth factor-1 receptor (IGF1-R), vascular endothelial growth factor receptor (VEGFR, eg VEGFR1), fibroblast growth factor receptor (FGFR, eg, FGFR2 or FGFR4), TNFR, platelet-derived growth factor receptor (PDGFR), hepatocyte growth factor receptor (HGFR), tyrosine kinase with immunoglobulin-like and EGF-like domain 1 (TIE, e.g., TIE-1 or TEK (TIE) -2)), a second chimeric polypeptide containing an ECD from the receptor for advanced glycation end products (RAGE), the Eph receptor, or the T-cell receptor.
특정 구현예에서, 제1 ECD 폴리펩티드는 HER1/EGFR의 전장 ECD(서열번호: 41의 잔기 1-621에 상응함) 또는 그의 일부(예를 들어, 하위도메인 I-III 및 도메인 IV의 모듈 1에 상응하는 서열번호: 41의 잔기 1-501)을 포함하고, 제2 ECD 폴리펩티드는 HER3의 전장 ECD(서열번호: 45의 잔기 1-621에 상응함) 또는 그의 일부(예를 들어, 하위도메인 I-III 및 도메인 IV의 모듈 1에 상응하는 서열번호: 45의 잔기 1-500)을 포함하고, 여기서 ECD 부분은 적어도 HER 수용체의 리간드에 결합하기 위한 하위도메인 I 및 III의 충분한 부분, 및 하위도메인 II의 충분한 부분을 포함하여 세포 표면 수용체와 이량체화하기 위해 ECD의 충분한 부분을 함유한다. 제1 및 제2 ECD 폴리펩티드는 그들의 다량체화 도메인의 상호작용을 통해 다량체, 예를 들어 이량체를 형성한다. 본 명세서에 제공되는 생성된 다량체 작제물은 제1 또는 제2 키메라 폴리펩티드 단독 또는 그의 동종이량체와 비교할 때 추가 리간드에 결합하고/하거나 제1 또는 제2 키메라 폴리펩티드 단독 또는 그의 동종이량체보다 더 많은 세포 표면 수용체와 이량체화한다. 예를 들어, 제1 및 제2 ECD 폴리펩티드는 HER1 리간드 및 HER3 리간드에 결합하는 이종이량체를 형성한다. In certain embodiments, the first ECD polypeptide is a full-length ECD of HER1/EGFR (corresponding to residues 1-621 of SEQ ID NO: 41) or a portion thereof (eg, in
b. 세포외 도메인에 대한 변형b. Modifications to the extracellular domain
일부 구현예에서, ECD 도메인 또는 그의 일부 중 적어도 하나는 비변형 ECD 폴리펩티드와 비교하여 리간드 결합, 특이성 또는 다른 활성 또는 특성을 변경하는 변형을 포함한다. 이러한 다량체 작제물에서, 제2 ECD 부분은 동일한 ECD 도메인, 야생형 또는 돌연변이 형태일 수 있거나 임의의 다른 세포 표면 수용체로부터의 ECD일 수 있다. 각 단량체의 ECD 또는 그의 일부는 다량체화 도메인에 직접 또는 링커를 통해 연결되거나, 제2 ECD 또는 그의 일부에 직접 또는 링커를 통해 연결된다. 예를 들어, 변형은 비변형 ECD 또는 전장 수용체와 비교하여 ECD 또는 이러한 ECD를 함유하는 전장 수용체의 리간드 결합, 특이성 또는 또 다른 활성 또는 특성을 변경하며, 이로써 이종다량체는 변경된 활성 또는 특성, 예컨대 변경된 리간드 결합 또는 특이성을 나타낸다. 이러한 변형에는 추가 리간드에 대한 결합과 같은 활성을 제거, 추가 또는 강화시키는 임의의 것이 포함된다. 이러한 다량체 작제물의 예시는 EGF 이외의 리간드에 대한 그의 친화성을 증가시키는 하위도메인 III에 돌연변이를 함유하는 적어도 하나의 HER1 ECD를 함유하는 작제물이다. 이러한 친화도 증가는 적어도 2배 내지 10배, 전형적으로 100, 1000, 104, 105, 106배 또는 그 초과이다. In some embodiments, an ECD domain or at least one portion thereof comprises a modification that alters ligand binding, specificity or other activity or property compared to an unmodified ECD polypeptide. In such multimeric constructs, the second ECD portion may be the same ECD domain, wild-type or mutant form, or may be an ECD from any other cell surface receptor. The ECD or part thereof of each monomer is connected directly or through a linker to the multimerization domain, or directly or through a linker to a second ECD or part thereof. For example, the modification alters the ligand binding, specificity, or another activity or property of the ECD or full-length receptor containing such ECD compared to the unmodified ECD or full-length receptor, whereby the heteromultimer has an altered activity or property, such as Indicates altered ligand binding or specificity. Such modifications include any that remove, add or enhance an activity such as binding to additional ligands. An example of such a multimeric construct is a construct containing at least one HERl ECD containing a mutation in subdomain III that increases its affinity for a ligand other than EGF. This affinity increase is at least 2-fold to 10-fold, typically 100, 1000, 10 4 , 10 5 , 10 6 fold or more.
특정 구현예에서, 성장 인자 트랩 작제물은 HER1(EGFR) 키메라 융합 폴리펩티드 및 HER3 키메라 융합 폴리펩티드를 함유하는 이종이량체이며, 여기서 각각의 키메라 융합 폴리펩티드는 선택적으로 펩티드 링커를 통해 인간 IgG1의 Fc에 연결된 수용체의 ECD를 포함한다. 이러한 키메라 융합 폴리펩티드는 본 명세서에서 HER1/Fc 및 HER3/Fc로 지칭된다. 전형적으로, ECD 폴리펩티드의 C-말단은 IgG1 Fc와 같은 다량체화 도메인의 N-말단에 연결된다. In certain embodiments, the growth factor trap construct is a heterodimer containing a HER1 (EGFR) chimeric fusion polypeptide and a HER3 chimeric fusion polypeptide, wherein each chimeric fusion polypeptide is optionally linked to the Fc of a human IgG1 via a peptide linker. Include the ECD of the receptor. Such chimeric fusion polypeptides are referred to herein as HER1/Fc and HER3/Fc. Typically, the C-terminus of an ECD polypeptide is linked to the N-terminus of a multimerization domain such as an IgG1 Fc.
일부 예에서, HER1 부분은 리간드 결합 및/또는 생물학적 활성에 대해 강화되었다. 다른 예에서, HER3 부분은 리간드 결합 및/또는 생물학적 활성에 대해 강화되었다. 또 다른 예에서, HER1 및 HER3 부분 모두 리간드 결합 및/또는 생물학적 활성에 대해 강화되었다.In some instances, the HERl portion is enriched for ligand binding and/or biological activity. In another example, the HER3 portion is enriched for ligand binding and/or biological activity. In another example, both the HER1 and HER3 portions are enriched for ligand binding and/or biological activity.
예시적인 변형은 예를 들어 HER3 리간드 NRG2-β가 HER1을 자극하도록 하는 HER1의 S418F(서열번호: 41에 제시된 성숙 단백질의 서열 참조)를 포함한다. 생성된 ECD는 적어도 2개의 리간드, 즉 HER1, 예컨대 EGF에 대해 1개, 및 HER3, 예컨대 NRG2-β에 대해 두 번째에 결합하거나 상호작용한다. 다른 변형은 성숙 HER3 단백질의 서열 (서열번호: 45)와 관련하여 HER3 ECD 하위도메인 II에서 성숙 EGFR 단백질의 서열 (서열번호: 41), 및 Y246A와 관련하여 각각 EGFR/HER1 ECD 하위도메인 I 및 IV에서 돌연변이 T15S 및 G564S를 포함하고, 이는 결합하면 EGF, TGF-α, HB-EGF 및 NRG1-β를 포함한 다양한 리간드에 대한 친화도가 평균 22배 개선된다. HER1 ECD의 추가 돌연변이는 서열번호: 41에 제시된 성숙한 HER1 폴리펩타이드의 서열과 관련하여 서열번호: 40에 제시되고 E306D/G564S, S169N/E306D/G564S 및 T19K/S169N/E306D/G564S에 상응하는 전구체 HER1(신호 펩티드 포함)의 서열과 관련하여 E330D/G588S, S193N/E330D/G588S 및 T43K/S193N/E330D/G588S를 포함한다. 이러한 돌연변이는 리간드 EGF, HB-EGF 및 TGF-α에 대한 HER1 결합 친화도를 증가시킨다 (예를 들어, 미국 특허 공개 제2010/0055093호 참조). Exemplary modifications include, for example, S418F of HER1 (see the sequence of the mature protein set forth in SEQ ID NO: 41), which allows the HER3 ligand NRG2-β to stimulate HER1. The resulting ECD binds or interacts with at least two ligands, one for HER1, such as EGF, and a second for HER3, such as NRG2-β. Other modifications include the sequence of the mature EGFR protein (SEQ ID NO: 41) in HER3 ECD subdomain II with respect to the sequence of the mature HER3 protein (SEQ ID NO: 45), and EGFR/HER1 ECD subdomains I and IV with respect to Y246A, respectively. contains mutations T15S and G564S in , which upon binding result in an average 22-fold improvement in affinity for various ligands including EGF, TGF-α, HB-EGF and NRG1-β. Additional mutations of the HER1 ECD are the precursor HER1 shown in SEQ ID NO: 40 and corresponding to E306D/G564S, S169N/E306D/G564S and T19K/S169N/E306D/G564S in relation to the sequence of the mature HER1 polypeptide set forth in SEQ ID NO: 41. (including the signal peptide) include E330D/G588S, S193N/E330D/G588S and T43K/S193N/E330D/G588S. This mutation increases HER1 binding affinity to the ligands EGF, HB-EGF and TGF-α (see, eg, US Patent Publication No. 2010/0055093).
c. 다량체화 도메인c. multimerization domain
특정 구현예에서, 다량체화 도메인은 다량체화를 수행하는 Fc 도메인 또는 그의 변이체이다. Fc 도메인은 IgG, IgM 또는 IgE를 비롯한 임의의 면역글로불린(Ig) 분자에서 유래할 수 있다. 예를 들어, Fc 도메인은 IgG1, IgG2, IgG3 또는 IgG4에서 유래할 수 있으며 CH2 및 CH3 도메인, 및 선택적으로 힌지 영역의 전부 또는 일부를 포함한다. 특정 예에서, Fc 부분은 선택적으로 힌지 영역의 전부 또는 일부를 포함하고, 예를 들어, 서열번호:9의 잔기 99-330, 100-330, 104-330, 109-330, 111-330, 113-330, 또는 114-330에 상응하는 인간 IgG의 Fc1이다. 놉-인-홀(knob-in-holes) 및 변경된 특성을 갖도록 변형된, 상기 섹션에서 기재된 바와 같은 변형된 Fc 도메인도 포함된다.In certain embodiments, the multimerization domain is an Fc domain or variant thereof that undergoes multimerization. The Fc domain can be from any immunoglobulin (Ig) molecule, including IgG, IgM or IgE. For example, the Fc domain can be from IgG1, IgG2, IgG3 or IgG4 and comprises all or part of the C H 2 and C H 3 domains, and optionally the hinge region. In certain instances, the Fc portion optionally comprises all or part of the hinge region, e.g., residues 99-330, 100-330, 104-330, 109-330, 111-330, 113 of SEQ ID NO:9 -330, or Fc1 of human IgG corresponding to 114-330. Also included are modified Fc domains as described in the section above that have been modified to have knob-in-holes and altered properties.
다중특이적 성장 인자 트랩 작제물 내의 각각의 ECD 폴리펩티드는 키메라 융합 폴리펩티드(즉, ECD/Fc 융합 폴리펩티드)를 형성하는 화학적 또는 폴리펩티드 링커와 같은 링커를 통해 간접적으로 Fc에 직접적으로 연결된다. 각각의 키메라 융합 폴리펩티드의 Fc 도메인과 같은 다량체화 도메인은 (Fc 도메인의 경우 디설파이드 결합을 통해) 상호작용하여 이종이량체와 같은 이종다량체를 형성한다. Each ECD polypeptide within the multispecific growth factor trap construct is linked directly to the Fc and indirectly through a linker, such as a chemical or polypeptide linker, to form a chimeric fusion polypeptide (ie, an ECD/Fc fusion polypeptide). The multimerization domains, such as the Fc domain of each chimeric fusion polypeptide, interact (via disulfide bonds in the case of the Fc domain) to form heteromultimers, such as heterodimers.
각각의 키메라 융합 폴리펩티드의 ECD와 Fc 부분 사이의 링커는 다양한 길이 및 조합으로 가요성 펩티드 링커, 예를 들어 IgG의 힌지 영역 또는 작은 아미노산, 예컨대 글리신, 세린, 트레오닌, 및/또는 알라닌으로 구성된 다른 폴리펩티드 링커일 수 있다. 예를 들어, 링커는 (Gly)n, (GGGGS)n, (SSSSG)n, 또는 (AlaAlaProAla)n(여기서 n은 1-6임)일 수 있고, GKSSGSGSESKS, GGSTSGSGKSSEGKG, GSTSGSGKSSSEGSGSTKG, GSTSGSGKPGSGEGSTKG, EGKSSGSGSESKEF, Gly-Arg-Met-Asp (GRMD), Ser-Cys-Asp-Lys-Thr (SCDKT), 또는 Glu-Lys-Thr-Ile-Ser (EKTIS)(서열번호: 816-834 참조) 또는 본원의 다른 곳에서 기술되거나 이러한 목적에 적합한 것으로 당업계에 공지된 임의의 다른 링커일 수 있다. The linker between the ECD and the Fc portion of each chimeric fusion polypeptide can be a flexible peptide linker of various lengths and combinations, such as the hinge region of an IgG or other polypeptide composed of small amino acids such as glycine, serine, threonine, and/or alanine. may be a linker. For example, the linker can be (Gly) n , (GGGGS) n , (SSSSG) n , or (AlaAlaProAla) n where n is 1-6, GKSSGSGSESKS, GGSTSGSGKSSEGKG, GSTSGSGKSSSEGSGSTKG, GSTSGSGKPGSGEGSTKG, EGKSSGSGSESKEF, Gly -Arg-Met-Asp (GRMD), Ser-Cys-Asp-Lys-Thr (SCDKT), or Glu-Lys-Thr-Ile-Ser (EKTIS) (see SEQ ID NOs: 816-834) or elsewhere herein or any other linker known in the art to be suitable for this purpose.
d. Fc 도메인에 대한 변형 d. Modifications to the Fc domain
본 명세서에 제공된 성장 인자 트랩 작제물 내의 Fc 도메인은 단백질 발현 및 순도를 개선하거나 강화할 뿐만 아니라, 예를 들어 생체내 반감기 연장하고/하거나 하기 기재된 바와 같이 면역 이펙터 기능을 변경하여, 우세한 또는 유일한 생성물로서 이종이량체의 생성을 초래한다.The Fc domains in the growth factor trap constructs provided herein can improve or enhance protein expression and purity, as well as, e.g., extend half-life in vivo and/or alter immune effector function as described below, as a dominant or sole product. resulting in the formation of heterodimers.
i. 놉-인-홀의 도입 i. Introduction of knob-in-hole
본 명세서에 제공된 성장 인자 트랩 작제물 내의 Fc 도메인은 입체적 상호작용이 안정한 상호작용을 촉진하고, 키메라 ECD 폴리펩티드 단량체의 혼합물로부터의 동종이량체보다 이종이량체의 형성을 촉진하도록 조작될 수 있다. 본 명세서의 다른 곳에서 논의된 바와 같이, 항체(예를 들어, IgG) 중쇄의 CH3 도메인으로의 "놉-인투-홀"(KiH; "놉-인투-홀"로도 알려짐)의 도입은 이종이량체 생산을 최적화한다. 놉-인-홀 접근법은 상보적인 방식으로 2개의 Fc 단량체의 CH3 도메인에서 비대칭적으로 돌연변이하는 계면 잔기를 수반한다. 일반적으로, "놉(knob)" 또는 돌출부는 CH3 도메인 사이의 계면에서 작은 측쇄를 갖는 아미노산을 티로신 또는 트립토판과 같은 더 큰 측쇄를 갖는 아미노산으로 대체함으로써 생성되며, 보상적 "홀(hole)" 또는 동일한 또는 놉과 비슷한 크기는 아미노산을 큰 측쇄로 대체하고 아미노산을 알라닌이나 트레오닌과 같은 더 작은 아미노산으로 대체하여 생성된다. Fc 단량체의 놉 및 홀 변이체는 파트너 CH3 도메인의 상응하게 설계된 홀에 놉이 삽입됨으로써 이종이량체화된다. 입체적 반발로 인해 놉-놉 결합이 방지되고 홀-홀 동종이량체가 불안정해진다. The Fc domains in the growth factor trap constructs provided herein can be engineered such that steric interactions promote stable interactions and promote the formation of heterodimers rather than homodimers from mixtures of chimeric ECD polypeptide monomers. As discussed elsewhere herein, introduction of a “knob-into-hole” (KiH; also known as “knob-into-hole”) into the C H 3 domain of an antibody (eg, IgG) heavy chain is Optimize heterodimer production. The knob-in-hole approach involves interfacial residues asymmetrically mutating in the C H 3 domains of the two Fc monomers in a complementary manner. Generally, “knobs” or protrusions are created by replacing amino acids with small side chains with amino acids with larger side chains, such as tyrosine or tryptophan, at the interface between the CH 3 domains, forming a compensatory “hole”. "Or identical or knob-like sizes are created by replacing an amino acid with a larger side chain and replacing an amino acid with a smaller amino acid such as alanine or threonine. Knob and hole variants of the Fc monomer are heterodimerized by insertion of the knob into a correspondingly designed hole in the partner C H 3 domain. The steric repulsion prevents knob-knob association and destabilizes the hole-hole homodimer.
일부 구현예에서, 본 명세서에 제공된 이종이량체 성장 인자 트랩 작제물의 Fc 부분은 놉-인-홀을 함유하도록 조작된다. 놉 돌연변이는 예를 들어 EU 넘버링에 의한 S354C, T366Y, T366W 또는 T394W일 수 있으며, 이는 서열번호:9에 제시된 인간 IgG1 중쇄 불변 도메인의 서열과 관련하여 각각 S237C, T249Y, T249W 또는 T277W에 상응한다. 홀 돌연변이는 예를 들어 EU 넘버링에 의한 Y349C, T366S, L368A, F405A, Y407T, Y407A, 또는 Y407V일 수 있으며, 이는 서열번호:9에 제시된 인간 IgG1 중쇄 불변 도메인의 서열과 관련하여 각각 Y232C, T249S, L251A, F288A, Y290T, Y290A, 또는 Y290V에 상응한다. 놉-인-홀의 도입은 관심 있는 이종이량체의 수율을 증가시키고, 동종이량체 불순물의 양을 감소시키며, 예를 들어, RB200 및 RB242와 비교할 때 본 명세서에 제공된 이중특이성, 이종이량체 성장 인자 트랩 작제물에 대한 단백질 정제 공정을 용이하게 한다. In some embodiments, the Fc portion of a heterodimer growth factor trap construct provided herein is engineered to contain a knob-in-hole. The knob mutation can be, for example, S354C, T366Y, T366W or T394W by EU numbering, which in relation to the sequence of the human IgG1 heavy chain constant domain set forth in SEQ ID NO:9 corresponds to S237C, T249Y, T249W or T277W, respectively. The hole mutation may be, for example, Y349C, T366S, L368A, F405A, Y407T, Y407A, or Y407V by EU numbering, which in relation to the sequence of the human IgG1 heavy chain constant domain set forth in SEQ ID NO:9 is Y232C, T249S, respectively; Corresponds to L251A, F288A, Y290T, Y290A, or Y290V. The introduction of the knob-in-hole increases the yield of the heterodimer of interest and reduces the amount of homodimer impurities, e.g., when compared to RB200 and RB242, the bispecific, heterodimer growth factors provided herein Facilitates the protein purification process for trap constructs.
ii. 신생아 Fc 수용체(FcRn) 재순환을 강화시키는 변형ii. Modifications that enhance neonatal Fc receptor (FcRn) recycling
본 명세서의 다른 곳에서 기재된 바와 같이, IgG Fc와의 융합은 신생아 Fc 수용체 (FcRn) 결합을 이용하고 또한 치료제의 분자량을 증가시켜 신장에 의해 체내에서 덜 빠르게 제거되도록 함으로써 작은 단백질 치료제의 반감기를 증가시킨다. 약동학 및 전반적인 약리학을 개선하기 위해, 본 명세서에 제공된 성장 인자 트랩 작제물의 Fc 영역 내의 잔기를 돌연변이시켜 FcRn에 대한 친화도를 일반적으로 30배 초과 증가시켜 생체 내 반감기를 추가로 증가시킬 수 있다. As described elsewhere herein, fusion with an IgG Fc increases the half-life of a small protein therapeutic by taking advantage of neonatal Fc receptor (FcRn) binding and also increasing the molecular weight of the therapeutic so that it is cleared less rapidly from the body by the kidneys. . To improve pharmacokinetics and overall pharmacology, residues within the Fc region of the growth factor trap constructs provided herein can be mutated to increase the affinity for FcRn, typically greater than 30-fold, to further increase the half-life in vivo.
일부 구현예에서, 본 명세서의 성장 인자 트랩 작제물의 Fc 부분은 생체내 반감기를 증가시키기 위해 신생아 FcRn 재순환을 강화하도록 변형된다. 이것은 FcRn에 대한 결합을 담당하는 IgG Fc의 CH2 및 CH3 도메인의 계면에 있는 잔기를 돌연변이시킴으로써 영향을 미칠 수 있다. FcRn에 대한 결합을 증가시키고 본 명세서의 성장 인자 트랩 작제물의 Fc 부분에 도입될 수 있는 예시적인 Fc 변형은 (EU 넘버링에 의해) T250Q, T250R, M252F, M252W, M252Y, S254T, T256D, T256E, T256Q, V259I, V308F, E380A, M428L, H433K, N434F, N434A, N434W, N434S, N434Y, Y436H, M252Y/T256Q, M252F/T256D, M252Y/S254T/T256E, H433K/N434F/Y436H, N434F/Y436H, T250Q/M428L, T250R/M428L, M428L/N434S, V259I/V308F, V259I/V308F/M428L, E294del/T307P/N434Y, 및 T256N/A378V/S383N/N434Y, 및 이들의 조합 중 하나 이상을 포함하지만 이에 제한되지 않는다. 서열번호: 9에 제시된 IgG1 중쇄 불변 도메인의 서열과 관련하여 카밧 넘버링 및 순차적인 넘버링에 의한 상응하는 돌연변이는 Fc 변형을 설명하는 섹션의 표 7(FcRn 결합을 향상시키는 IgG1 Fc 변형)에 제시되어 있다. 강화된 또는 증가된 FcRn 결합을 부여하는 당업계에 공지된 다른 변형이 또한 본원에서 사용하기 위해 고려된다.In some embodiments, the Fc portion of a growth factor trap construct herein is modified to enhance neonatal FcRn recycling to increase half-life in vivo. This can be effected by mutating residues at the interface of the C H 2 and C H 3 domains of IgG Fc that are responsible for binding to FcRn. Exemplary Fc modifications that increase binding to FcRn and can be introduced into the Fc portion of the growth factor trap constructs herein include (by EU numbering) T250Q, T250R, M252F, M252W, M252Y, S254T, T256D, T256E, T256Q, V259I, V308F, E380A, M428L, H433K, N434F, N434A, N434W, N434S, N434Y, Y436H, M252Y/T256Q, M252F/T256D, M252Y/S254T/T256E, H433K/N4 34F/Y436H, N434F/Y436H, T250Q/ M428L, T250R/M428L, M428L/N434S, V259I/V308F, V259I/V308F/M428L, E294del/T307P/N434Y, and T256N/A378V/S383N/N434Y, and combinations thereof. Corresponding mutations by Kabat numbering and sequential numbering with respect to the sequence of the IgG1 heavy chain constant domain set forth in SEQ ID NO: 9 are presented in Table 7 (IgG1 Fc modifications that enhance FcRn binding) in the section describing Fc modifications . Other modifications known in the art that confer enhanced or increased FcRn binding are also contemplated for use herein.
FcRn 결합 및 재순환을 강화시키기 위해 본 명세서에 제공된 성장 인자 트랩 작제물의 Fc 부분의 변형은 RB200 및 RB242에 비해 더 낮은 용량 및/또는 더 적은 빈도의 투약이 필요하고 치료 효능을 개선하여 치료제의 생체 내 반감기를 증가시킨다. Modification of the Fc portion of a growth factor trap construct provided herein to enhance FcRn binding and recycling requires a lower dose and/or less frequent dosing compared to RB200 and RB242 and improves therapeutic efficacy, thereby improving the bioavailability of therapeutics. Increases my half-life.
iii. 이펙터 기능 iii. effector function
본 명세서에 기재된 바와 같이, IgG Fc에 의해 매개되는 면역 이펙터 기능은 보체 의존적 세포독성 (CDC), 항체 의존적 세포 매개 세포독성 (ADCC; 또한 소위 항체 의존적 세포 세포독성), 및 항체 의존적 세포 매개 식균작용 (ADCP; 또한 소위 항체 의존적 세포 식균작용)을 포함한다. 본 명세서의 성장 인자 트랩 작제물의 Fc 영역은 예를 들어 CDC, ADCC 및 ADCP 중 임의의 하나 이상을 포함하는 면역 이펙터 기능을 제거, 감소 또는 강화시키기 위해 하기 및 본 명세서의 다른 곳에서 논의된 바와 같이 돌연변이되거나 변형될 수 있다. As described herein, immune effector functions mediated by IgG Fc include complement dependent cytotoxicity (CDC), antibody dependent cell mediated cytotoxicity (ADCC; also called antibody dependent cell cytotoxicity), and antibody dependent cell mediated phagocytosis. (ADCP; also called antibody-dependent cellular phagocytosis). The Fc region of the growth factor trap constructs herein can be used as discussed below and elsewhere herein to eliminate, reduce or enhance immune effector functions including, for example, any one or more of CDC, ADCC and ADCP. may be mutated or transformed.
성장 인자 트랩 작제물에 의해 표적화된 성장 인자는 막 단백질 및 유리(즉, 가용성) 리간드로 존재하기 때문에, 특정 구현예에서, ECD/Fc 융합 폴리펩티드에서 Fc 부분의 면역 이펙터 기능, 특히 ADCC는 유지된다. 대안적인 구현예에서, 인간 IgG1 Fc에 더하여, 다른 Fc 영역도 본 명세서에 제공된 ECD/Fc 키메라 융합 폴리펩티드에 포함될 수 있다. 예를 들어, Fc/FcγR 상호작용에 의해 매개되는 이펙터 기능이 최소화되어야 하는 경우, 예를 들어 예를 들어, IgG2 또는 IgG4의 Fc와 같이 보체 또는 이펙터 세포를 제대로 모집하지 않고 이펙터 기능을 나타내지 않는 IgG 아이소타입과의 융합이 고려된다. 이 접근법은 이펙터 기능이 필요하지 않거나 유해할 수 있는 경우, 예를 들어 자가면역 및 염증성 질환 및 장애와 관련하여 사용될 수 있다.Because growth factors targeted by growth factor trap constructs exist as membrane proteins and free (i.e., soluble) ligands, in certain embodiments, the immune effector function of the Fc portion in the ECD/Fc fusion polypeptide, particularly ADCC, is maintained. . In an alternative embodiment, in addition to human IgG1 Fc, other Fc regions may also be included in the ECD/Fc chimeric fusion polypeptides provided herein. For example, when effector functions mediated by Fc/FcγR interactions are to be minimized, e.g., IgGs that do not properly recruit complement or effector cells and exhibit no effector functions, such as, for example, the Fc of IgG2 or IgG4. Fusion with the isotype is considered. This approach can be used where effector function is not needed or may be detrimental, for example in the context of autoimmune and inflammatory diseases and disorders.
특정 예에서, Fc 부분은 면역 이펙터 기능을 강화시키거나 증가시키도록 변형될 수 있다. 이는 예를 들어 C1q(CDC의 경우) 및/또는 특정 활성화 FcγR(예를 들어, FcγRI, FcγRIIa, FcγRIIc, FcγRIIIa 및 FcγRIIIb)에 대한 결합을 증가시키는 변형에 의해 달성될 수 있다. Fc 수용체에 대한 증가된 결합을 갖도록 변형된 Fc 영역은 ECD 폴리펩티드와 연결된 경우에도 환자의 암 세포 파괴를 촉진하는 데 더 효과적일 수 있다. 항체는 예를 들어 성장 경로의 차단을 통한 항-증식, 세포자멸사를 유도하는 세포내 신호전달, 수용체의 강화된 하향 조절 및/또는 턴오버, ADCC, ADCP, CDC 및 적응성 면역 반응의 촉진을 포함하는 다수의 가능한 메커니즘을 통해 종양 세포를 파괴한다. 따라서, 본 명세서의 성장 인자 트랩 작제물이 암 치료에 사용되는 구현예에서, 작제물의 Fc 부분은 면역 이펙터 기능을 강화시키거나 증가시키도록 변형될 수 있다. 섹션 F.4.d.i.c (Fc 면역 이펙터 기능의 강화 또는 감소/제거)의 표 8(면역 이펙터 기능을 강화시키는 IgG1 Fc 변형)은 FcγR 또는 C1q에 대한 결합을 증가시켜 ADCC, ADCP 및 CDC를 포함하는 면역 이펙터 기능을 강화하는 Fc 변형을 요약하고 서열번호: 9에 제시된 IgG1 중쇄 불변 도메인의 서열과 관련하여 카밧 넘버링 및 순차적 넘버링에 의한 상응하는 변형을 제공한다. 임의의 하나 이상의 이러한 변형은 단독으로 또는 다양한 조합으로 본 명세서에 제공된 성장 인자 트랩 작제물의 IgG1 Fc 부분에 도입될 수 있다. 강화된 또는 증가된 면역 이펙터 기능을 부여하는 당업계에 공지된 다른 변형이 또한 본원에서 사용하기 위해 고려된다. 면역 이펙터 기능을 강화시키는 IgG1 Fc 변형을 설명하는 상기 섹션의 목록이다. In certain instances, an Fc portion may be modified to enhance or increase immune effector function. This can be achieved, for example, by modifications that increase binding to C1q (for CDC) and/or specific activating FcγRs (eg FcγRI, FcγRIIa, FcγRIIc, FcγRIIIa and FcγRIIIb). An Fc region that has been modified to have increased binding to an Fc receptor may be more effective in promoting destruction of cancer cells in a patient even when linked with an ECD polypeptide. Antibodies include, for example, anti-proliferation by blocking growth pathways, intracellular signaling leading to apoptosis, enhanced downregulation and/or turnover of receptors, ADCC, ADCP, CDC and promotion of the adaptive immune response destroys tumor cells through a number of possible mechanisms. Thus, in embodiments where the growth factor trap constructs herein are used to treat cancer, the Fc portion of the construct can be modified to enhance or increase immune effector function. Table 8 (IgG1 Fc Modifications That Enhance Immune Effector Function) in Section F.4.d.i.c (Enhancement or Decrease/Elimination of Fc Immune Effector Function) include ADCC, ADCP and CDC by increasing binding to FcγR or C1q. Fc modifications that enhance immune effector function are summarized and given in relation to the sequence of the IgGl heavy chain constant domain set forth in SEQ ID NO: 9, Kabat numbering and corresponding modifications by sequential numbering. Any one or more of these modifications, alone or in various combinations, can be introduced into the IgG1 Fc portion of the growth factor trap constructs provided herein. Other modifications known in the art that confer enhanced or increased immune effector function are also contemplated for use herein. A list of the above sections describing IgG1 Fc modifications that enhance immune effector function.
대안적인 구현예에서, 본 명세서에 제공된 성장 인자 트랩 작제물의 Fc 부분은 면역 이펙터 기능을 감소시키거나 제거하도록 변형된다. 이는 예를 들어 C1q(CDC의 경우) 및/또는 특정 활성화 FcγR(예를 들어, FcγRI, FcγRIIa, FcγRIIc, FcγRIIIa 및 FcγRIIIb)에 대한 결합을 감소시키거나 없애는 변형에 의해 달성될 수 있다. 이것은 예를 들어, 표적 항원을 보유하는 세포의 길항작용이 있지만 죽이지는 않는 것이 바람직한 경우, 또는 바람직하지 않거나 유해한 면역 이펙터 기능, 예를 들어 원치 않는 염증유발 사이토카인 방출 및 표적외 세포독성의 감소가 필요한 경우에 바람직하다. 따라서, 본 명세서에 제공된 성장 인자 트랩 작제물이 RA와 같은 만성 염증성 및 자가면역 질환 및 장애의 치료에 사용되는 구현예에서, 작제물의 Fc 부분은 면역 이펙터 기능을 감소시키거나 제거하도록 변형될 수 있다. In an alternative embodiment, the Fc portion of a growth factor trap construct provided herein is modified to reduce or eliminate immune effector function. This can be achieved, for example, by modifications that reduce or abolish C1q (for CDC) and/or binding to specific activating FcγRs (e.g., FcγRI, FcγRIIa, FcγRIIc, FcγRIIIa and FcγRIIIb). This could be, for example, where it is desirable to antagonize, but not kill, cells bearing the target antigen, or where undesirable or detrimental immune effector functions, such as unwanted proinflammatory cytokine release and reduction of off-target cytotoxicity, are desired. Preferable when needed. Thus, in embodiments in which the growth factor trap constructs provided herein are used for the treatment of chronic inflammatory and autoimmune diseases and disorders, such as RA, the Fc portion of the construct can be modified to reduce or eliminate immune effector function. there is.
섹션 F.4.d.i.c (Fc 면역 이펙터 기능을 감소시키거나 제거하는 IgG1 Fc 변형)의 표 9(면역 이펙터 기능을 강화시키는 IgG1 Fc 변형)은 활성화 FcγR 및/또는 C1q에 대한 결합을 감소시키거나 제거하여 ADCC, ADCP 및 CDC를 포함하는 면역 이펙터 기능을 감소시키거나 제거하고 본원에서 성장 인자 트랩 구축물의 Fc 영역으로 도입될 수 있는 예시적인 IgG1 Fc 변형을 요약한다. 표는 서열번호: 9에 제시된 IgG1 중쇄 불변 도메인의 서열과 관련하여 카밧 넘버링 및 순차 넘버링에 의한 상응하는 변형을 제공한다. 임의의 하나 이상의 이러한 변형은 단독으로 또는 다양한 조합으로 본 명세서에 제공된 성장 인자 트랩 작제물의 IgG1 Fc 부분에 도입될 수 있다. 면역 이펙터 기능을 감소시키거나 제거하기 위해 당업계에 공지된 다른 변형도 본 명세서에서 사용하기 위해 고려된다. Table 9 (IgG1 Fc modifications that enhance immune effector function) in section F.4.d.i.c (IgG1 Fc modifications that reduce or eliminate Fc immune effector function) reduce or eliminate binding to activating FcγRs and/or C1q to reduce or eliminate immune effector functions, including ADCC, ADCP and CDC, and summarized herein exemplary IgG1 Fc modifications that can be introduced into the Fc region of a growth factor trap construct. The table provides the corresponding modifications by Kabat numbering and sequential numbering with respect to the sequence of the IgG1 heavy chain constant domain set forth in SEQ ID NO:9. Any one or more of these modifications, alone or in various combinations, can be introduced into the IgG1 Fc portion of the growth factor trap constructs provided herein. Other modifications known in the art to reduce or eliminate immune effector function are also contemplated for use herein.
본 명세서에 제공된 성장 인자 트랩 작제물의 Fc 부분은 또한 억제성 FcγR에 대한 결합을 증가시키도록 변형되어 면역 반응을 억제할 수 있다. 면역억제성 Fc 변형을 갖는 치료적 항체는 염증성 질환의 치료에 유리하다. 이러한 돌연변이는 예를 들어 RA 및 다른 염증성 및 자가면역 질환과 같은 염증 요소 또는 병인 또는 관련이 있는 질환 및 병태의 치료를 위한 본 명세서의 성장 인자 트랩 작제물의 Fc 부분에 통합될 수 있다. The Fc portion of the growth factor trap constructs provided herein can also be modified to increase binding to inhibitory FcγRs to suppress the immune response. Therapeutic antibodies with immunosuppressive Fc modifications are beneficial for the treatment of inflammatory diseases. Such mutations may be incorporated into the Fc portion of the growth factor trap constructs herein for the treatment of diseases and conditions associated with or etiology or an inflammatory component, such as, for example, RA and other inflammatory and autoimmune diseases.
FcγRIIIa가 아닌 억제성 FcγRIIb 및/또는 FcγRI에 대한 결합을 증가시키거나 그에 대한 선택적 결합을 부여하는 변형은 본 명세서에 제공된 성장 인자 트랩 작제물에서 IgG1 Fc 영역으로 조작될 수 있다. 이러한 변형에는 EU 넘버링에 의해 S267E, N297A, L328F, L351S, T366R, L368H, P395K, S267E/L328F, L351S/T366R/L368H/P395K, 및 이들의 조합 중 하나 이상을 포함하지만 이에 제한되지 않는다. 섹션 F.4.d.i.i의 표 11(억제성 FcγRIIb에 대한 결합을 증가시키는 IgG1 Fc 변형)은 서열번호:9에 제시된 IgG1 중쇄 불변 도메인의 서열과 관련하여 카밧 넘버링 및 순차적 넘버링에 의한 상응하는 대체를 보여준다. 이들 변형은 억제성 FcγRIIb에 대한 결합을 증가시키는 IgG1 Fc 변형을 설명하는 상기 섹션에 요약되어 있다.Modifications that increase binding to, or confer selective binding to, inhibitory FcγRIIb and/or FcγRI, but not FcγRIIIa, can be engineered into the IgG1 Fc region in the growth factor trap constructs provided herein. Such variations include, but are not limited to, one or more of S267E, N297A, L328F, L351S, T366R, L368H, P395K, S267E/L328F, L351S/T366R/L368H/P395K, and combinations thereof by EU numbering. Table 11 (IgG1 Fc Modifications That Increase Binding to Inhibitory FcγRIIb) in Section F.4.d.i.i show the corresponding replacement by Kabat numbering and sequential numbering with respect to the sequence of the IgG1 heavy chain constant domain set forth in SEQ ID NO:9. show These modifications are summarized in the section above describing IgG1 Fc modifications that increase binding to inhibitory FcγRIIb.
4. 조성물, 치료 용도 및 치료 방법4. Compositions, therapeutic uses and methods of treatment
키메라 융합 폴리펩티드(즉, ECD/Fc)를 인코딩하는 핵산 분자 및 핵산 분자를 함유하는 벡터인 성장 인자 트랩 작제물이 제공된다. 또한 본 명세서에 기재된 바와 같은 벡터를 함유하는 세포, 및 본 명세서에 기재된 핵산 분자, 벡터 또는 세포를 인코딩하는 성장 인자 트랩 작제물 중 임의의 것을 함유하는 약제학적 조성물이 제공된다. 본 명세서의 성장 인자 트랩 작제물은 이전에, 예를 들어 문헌[Sarup 등 (2008) Mol . Cancer Ther . 7(10):3223-3236; Gompels 등 (2011) Arthritis Research & Therapy 13:R161; Jin 등 (2009) Mol . Med . 15(1-2):11-20; 및 미국 특허 공개 제 2010/0055093호]에 기재된 바와 같이 생성되고 정제된다. Nucleic acid molecules encoding chimeric fusion polypeptides (ie, ECD/Fc) and growth factor trap constructs that are vectors containing the nucleic acid molecules are provided. Also provided are pharmaceutical compositions containing cells containing vectors as described herein, and growth factor trap constructs encoding any of the nucleic acid molecules, vectors or cells described herein. The growth factor trap constructs herein have been previously described, for example in Sarup et al. (2008) Mol . Cancer Ther . 7(10):3223-3236; Gompels, etc. (2011) Arthritis Research & Therapy 13:R161; Jin et al. (2009) Mol . Med . 15(1-2):11-20; and US Patent Publication No. 2010/0055093] and purified.
본 명세서의 이중특이적 포함 다중특이적 성장 인자 트랩 작제물은 동일하거나 상이한 ECD 폴리펩티드 중 2개 이상, 특히 2개를 다량체화 도메인에 직접 또는 간접적으로 연결하여 생성된 2개 이상, 특히 2개의 키메라 단백질을 함유한다. 다량체화 도메인이 면역글로불린 Fc와 같은 폴리펩티드인 일부 예에서, ECD-다량체화 도메인 키메라 폴리펩티드를 인코딩하는 유전자 융합이 적절한 발현 벡터에 삽입된다. 생성된 ECD-다합체화 도메인 키메라 단백질은 재조합 발현 벡터(들)로 형질전환되고, 이합체와 같은 다량체로 어셈블링될 수 있는 숙주 세포, 특히 포유동물 세포(예를 들어, HEK293T 또는 CHO 세포, 또는 본 명세서에 기재되거나 당업계에 공지된 임의의 다른 적합한 포유동물 세포)에서 발현될 수 있고, 여기서 다량체화 도메인은 다가 폴리펩티드를 형성하기 위해 상호작용한다. 생성된 키메라 폴리펩티드 및 그로부터 형성된 다량체는 예를 들어 단백질 A 또는 단백질 G 컬럼에 대한 친화성 크로마토그래피와 같은 당업계에 공지된 임의의 적합한 방법에 의해 정제될 수 있다. 추가로 또는 대안적으로, 예를 들어, 겔 전기영동, 투석, 이온 교환 크로마토그래피, 에탄올 침전, HPLC, 예컨대 역상 HPLC, 실리카 상의 크로마토그래피, 헤파린 세파로스 상의 크로마토그래피, 크로마토포커싱, SDS-PAGE, 및 황산암모늄 침전을 포함하는 단백질 정제용 다른 기술이 사용될 수 있다. 상이한 ECD 키메라 폴리펩티드를 인코딩하는 2개의 핵산 분자가 세포(예를 들어, HER1/Fc 및 HER3/Fc)로 형질전환되는 경우, 동종이량체 및 이종이량체가 형성될 것이다. 발현 조건은 이종이량체 형성이 동종이량체 형성보다 우세하도록 조정될 수 있다. 예를 들어, 상이한 ECD 키메라 폴리펩티드를 인코딩하는 핵산 분자의 비율은 과량의 하나의 핵산 분자가 더 적은 동종이량체를 형성하도록 조정될 수 있다. 추가로, 전술한 바와 같이, Fc 단량체에 놉-인-홀을 도입하면 동종이량체보다 이종이량체의 형성이 유리하다. Bispecific, including multispecific growth factor trap constructs herein are two or more, in particular two chimeras, generated by directly or indirectly linking two or more, in particular two, of the same or different ECD polypeptides to a multimerization domain. Contains protein. In some instances where the multimerization domain is a polypeptide such as an immunoglobulin Fc, a gene fusion encoding the ECD-multimerization domain chimeric polypeptide is inserted into an appropriate expression vector. The resulting ECD-multimerizing domain chimeric proteins are transformed into recombinant expression vector(s) and host cells capable of being assembled into multimers such as dimers, particularly mammalian cells (e.g. HEK293T or CHO cells, or the present described herein or in any other suitable mammalian cell known in the art), wherein the multimerization domains interact to form a multivalent polypeptide. The resulting chimeric polypeptide and the multimers formed therefrom may be purified by any suitable method known in the art, such as, for example, affinity chromatography on a Protein A or Protein G column. Additionally or alternatively, for example, gel electrophoresis, dialysis, ion exchange chromatography, ethanol precipitation, HPLC such as reverse phase HPLC, chromatography on silica, chromatography on heparin sepharose, chromatofocusing, SDS-PAGE, and other techniques for protein purification including ammonium sulfate precipitation may be used. When two nucleic acid molecules encoding different ECD chimeric polypeptides are transformed into cells (eg, HER1/Fc and HER3/Fc), homodimers and heterodimers will form. Expression conditions can be adjusted such that heterodimer formation dominates over homodimer formation. For example, the ratio of nucleic acid molecules encoding different ECD chimeric polypeptides can be adjusted so that an excess of one nucleic acid molecule forms fewer homodimers. Additionally, as described above, introducing a knob-in-hole into an Fc monomer favors the formation of heterodimers over homodimers.
Fc 영역을 함유하는 ECD 키메라 폴리펩티드는 또한 금속 킬레이트 또는 다른 에피토프를 갖는 태그, 예를 들어, 6xHis 태그, c-myc 태그, FLAG 태그, 말토스 결합 단백질 (MBP), 글루타티온-S-트랜스퍼라제 (GST), 또는 티오레독신 (TRX)를 포함하도록 조작될 수 있다. 태깅된 도메인은 금속-킬레이트 크로마토그래피 및/또는 항체에 의한 신속한 정제에 사용될 수 있고, 웨스턴 블롯에서의 검출, 면역침강 또는 생물검정에서의 활성 고갈/차단을 허용하기 위해 사용될 수 있다.ECD chimeric polypeptides containing an Fc region may also have metal chelates or tags with other epitopes, e.g., 6xHis tag, c-myc tag, FLAG tag, maltose binding protein (MBP), glutathione-S-transferase (GST) ), or thioredoxin (TRX). The tagged domains can be used for rapid purification by metal-chelate chromatography and/or antibodies, and can be used to allow detection in Western blots, immunoprecipitation or activity depletion/blocking in bioassays.
a. 약제학적 조성물a. pharmaceutical composition
본 명세서에 제공된 다중특이적, 예컨대 이중특이적 성장 인자 트랩 작제물, 또는 인코딩 핵산 분자(들)를 함유하는 약제학적 조성물이 제공된다. 또한 본 명세서에 제공되는 핵산 분자 또는 벡터를 포함하는 단리된 세포를 포함하는 약제학적 조성물이 제공된다. 이러한 조성물은 치료 유효량의 성장 인자 트랩 작제물을 함유한다. 약제학적 조성물은 선택된 양의 성장 인자 트랩 작제물 또는 핵산 분자를 하나 이상의 생리학적으로 허용되는 담체 또는 부형제와 혼합함으로써 임의의 종래의 방식으로 제형화될 수 있다. 약제학적 조성물은 치료, 예방 및/또는 진단 적용을 위해 사용될 수 있다. 조성물 내의 활성 화합물의 농도는 활성 화합물의 흡수, 불활성화 및 배출 속도, 복용량 스케줄 및 투여량 뿐만 아니라 당업자에게 공지된 다른 인자에 따라 달라질 것이다.Pharmaceutical compositions containing the multispecific, such as bispecific growth factor trap constructs, or encoding nucleic acid molecule(s) provided herein are provided. Also provided are pharmaceutical compositions comprising isolated cells comprising a nucleic acid molecule or vector provided herein. Such compositions contain a therapeutically effective amount of the growth factor trap construct. A pharmaceutical composition may be formulated in any conventional manner by mixing a selected amount of a growth factor trap construct or nucleic acid molecule with one or more physiologically acceptable carriers or excipients. A pharmaceutical composition may be used for therapeutic, prophylactic and/or diagnostic applications. The concentration of active compound in the composition will depend on rates of absorption, inactivation and excretion of the active compound, dosage schedule and dosage, as well as other factors known to those skilled in the art.
본 명세서에 제공된 화합물의 투여에 적합한 약제학적 담체 또는 비히클은 특정 투여 방식에 적합한 것으로 당업자에게 공지된 임의의 이러한 담체를 포함한다. 담체 또는 부형제의 선택은 투여 전문가의 기술 범위 내이며 많은 파라미터에 따라 달라질 수 있다. 이들은 예를 들어 투여 방식(즉, 전신, 경구, 비강, 폐, 국소, 국부 또는 임의의 다른 방식) 및 치료되는 장애를 포함한다. 본 명세서에 기재된 다중특이적, 예컨대 이중특이적, 성장 인자 트랩 작제물 또는 핵산 분자의 치료 유효량을 포함하는 약제학적 조성물은 또한 투여 직전에 멸균수와 같이 재구성되는 동결건조 분말로서 제공될 수 있다.Pharmaceutical carriers or vehicles suitable for administration of the compounds provided herein include any such carrier known to those skilled in the art to be suitable for a particular mode of administration. The choice of carrier or excipient is within the skill of the administering expert and can depend on many parameters. These include, for example, the mode of administration (ie, systemic, oral, nasal, pulmonary, topical, topical or any other mode) and the disorder being treated. A pharmaceutical composition comprising a therapeutically effective amount of a multispecific, such as bispecific, growth factor trap construct or nucleic acid molecule described herein may also be presented as a lyophilized powder to be reconstituted, such as with sterile water, immediately prior to administration.
본 명세서에 제공되는 약제학적 조성물은 다양한 형태, 예를 들어 고체, 반고체, 액체, 분말, 수성 또는 동결건조 형태일 수 있다. 본 명세서에 제공되는 약제학적 조성물은 단일 복용량(직접) 투여, 또는 희석 또는 다른 변형을 위해 제형화될 수 있다. 제형 내의 화합물의 농도는 투여 시 양의 전달에 효과적이고, 즉 의도된 치료에 효과적이다. 전형적으로, 조성물은 단일 복용 투여를 위해 제형화된다. 화합물은 미분화된 형태 또는 다른 적합한 형태로 현탁될 수 있거나, 보다 가용성인 활성 생성물을 생성하기 위해 유도체화될 수 있다. 생성된 혼합물의 형태는 의도된 투여 방식 및 선택된 담체 또는 비히클에서 화합물의 용해도를 비롯한 여러 요인에 따라 달라진다. 유효 농도는 표적 병태를 개선하기에 충분하며 경험적으로 결정할 수 있다. 조성물을 제형화하기 위해, 화합물의 중량 분율을 선택된 비히클에 유효 농도로 용해, 현탁, 분산 또는 혼합하여 표적 병태가 완화되거나 개선되도록 한다. The pharmaceutical compositions provided herein may be in a variety of forms, such as solid, semi-solid, liquid, powder, aqueous or lyophilized form. The pharmaceutical compositions provided herein may be formulated for single dose (direct) administration, or for dilution or other modification. The concentration of the compound in the formulation is effective in delivering the amount upon administration, i.e., effective for the intended treatment. Typically, the composition is formulated for single dose administration. The compounds can be suspended in micronized or other suitable form, or derivatized to produce a more soluble active product. The form of the resulting mixture depends on several factors including the intended mode of administration and the solubility of the compound in the chosen carrier or vehicle. Effective concentrations are sufficient to ameliorate the target condition and can be determined empirically. To formulate a composition, a weight fraction of the compound is dissolved, suspended, dispersed or mixed in an effective concentration with a selected vehicle to alleviate or ameliorate the target condition.
본 명세서에 제공되는 성장 인자 트랩 작제물을 인코딩하는 핵산의 생산 방법은 섹션 H에 기재된 방법을 포함한다. 섹션 H는 또한 사용될 수 있는 벡터 및 세포 뿐만 아니라 단백질 발현 및 정제 방법을 기재한다. 섹션 I에 기술된 조성물, 제형, 복용량 및 투여 방법은 본 명세서에 기재된 성장 인자 트랩 작제물 및 인코딩 핵산 분자를 포함하는 조성물 및 제제의 생산에 적합할 수 있다. 복용량 및 투여 방법은 투여 전문가에 의해 결정될 수 있고, 당업계에 공지되어 있고 본 명세서의 다른 곳에 기재되어 있다. Methods for producing nucleic acids encoding growth factor trap constructs provided herein include those described in Section H. Section H also describes methods of protein expression and purification, as well as vectors and cells that may be used. The compositions, formulations, dosages and methods of administration described in Section I may be suitable for the production of compositions and preparations comprising the growth factor trap constructs and encoding nucleic acid molecules described herein. Dosages and methods of administration can be determined by the administering expert and are known in the art and described elsewhere herein.
b. 치료 용도 및 치료 방법b. Therapeutic uses and methods of treatment
본 명세서에 제공된 이중특이적 포함 다중특이적 성장 인자 트랩 작제물은 이러한 분자의 사용에 대해 당업자에게 공지된 임의의 목적을 위해 사용될 수 있다. 예를 들어, 본 명세서에 제공된 성장 인자 트랩 작제물은 치료, 진단, 산업 및/또는 연구 목적(들) 중 하나 이상에 사용될 수 있다. 특히, 본 명세서에 제공된 다중특이적 성장 인자 트랩 작제물은 RTK를 포함하는 CSR, 특히 본 명세서에 기재된 것을 포함하는 단백질의 HER 패밀리를 수반하는 다양한 질환 및 병태의 치료에 사용될 수 있다. HER 신호전달은 다양한 질환 및 장애의 병인에 관련되며, 임의의 이러한 질환 또는 그의 장애는 본 명세서에 제공되는 성장 인자 트랩 작제물에 의한 치료를 위해 고려된다. The bispecific, including multispecific growth factor trap constructs provided herein can be used for any purpose known to those skilled in the art for the use of such molecules. For example, growth factor trap constructs provided herein may be used for one or more of therapeutic, diagnostic, industrial and/or research purpose(s). In particular, the multispecific growth factor trap constructs provided herein can be used for the treatment of a variety of diseases and conditions involving CSRs, including RTKs, and particularly the HER family of proteins, including those described herein. HER signaling is implicated in the etiology of a variety of diseases and disorders, and any such disease or disorder thereof is contemplated for treatment with the growth factor trap constructs provided herein.
본 명세서에 제공된 성장 인자 트랩 작제물 및 인코딩 핵산 분자 뿐만 아니라 약제학적 조성물은 항-HER 요법 (예를 들어, 트라스투주맙, 세툭시맙, 게피티닙, 에를로티닙, 및 라파티닙, 및 본 명세서에 기재되고/거나 당업계에 공지된 기타)이 암 및 다른 증식성 질환 및 장애, 혈관형성 관련 질환 및 장애, 류마티스성 관절염 및 다른 만성 염증성 및 자가면역 질환 및 장애, 뿐만 아니라 중추신경계 (CNS)의 신경퇴행 질환 및 장애를 포함하지만 이에 제한되지 않는 것을 이용하여 임의의 병태의 치료를 위해 사용될 수 있다. 예를 들어, 본 명세서에 제공된 성장 인자 트랩 작제물을 사용하는 치료는 혈관형성 연관 질환 및 병태, 염증성 질환 및 병태, 자가면역 질환 및 병태, 신경퇴행 질환, 및 세포 증식과 연관된 병태의 치료를 포함하지만 이에 제한되지 않는다. 이러한 질환 및 병태는 예를 들어, 안구 질환, 죽상동맥경화증, 혈관 손상, 알츠하이머병, 암, 평활근 세포 연관 병태, 류마티스성 관절염 (RA), 및 다양한 자가면역 질환을 포함한다.Growth factor trap constructs and encoding nucleic acid molecules provided herein, as well as pharmaceutical compositions, may be used in anti-HER therapies (e.g., trastuzumab, cetuximab, gefitinib, erlotinib, and lapatinib, and herein and/or others known in the art) are cancer and other proliferative diseases and disorders, angiogenesis-related diseases and disorders, rheumatoid arthritis and other chronic inflammatory and autoimmune diseases and disorders, as well as central nervous system (CNS) It can be used for the treatment of any condition, including, but not limited to, neurodegenerative diseases and disorders. For example, treatment using the growth factor trap constructs provided herein includes treatment of angiogenesis-related diseases and conditions, inflammatory diseases and conditions, autoimmune diseases and conditions, neurodegenerative diseases, and conditions associated with cell proliferation. However, it is not limited thereto. Such diseases and conditions include, for example, ocular disease, atherosclerosis, vascular injury, Alzheimer's disease, cancer, smooth muscle cell associated conditions, rheumatoid arthritis (RA), and various autoimmune diseases.
복용량 수준 및 레지멘은 공지된 복용량 및 레지멘에 기초하여 결정될 수 있고, 필요한 경우 본 명세서에 제공된 폴리펩티드 및 작제물의 특성 변화에 기초하여 외삽될 수 있고/있거나 다양한 인자에 기초하여 경험적으로 결정될 수 있다. 이러한 요인은 예를 들어 개체의 체중뿐만 아니라 일반적인 건강, 연령, 성별 및 식이, 사용된 특정 화합물의 활성, 투여 시간, 배출 속도, 약물 조합, 질환의 중증도 및 과정, 질환에 대한 환자의 성향 및 치료하는 의사의 판단을 포함한다. 활성 성분은 일반적으로 약제학적으로 유효한 담체와 조합된다. 단일 복용 형태 또는 다중 복용 형태를 생성하기 위해 담체 물질과 조합될 수 있는 활성 성분의 양은 치료되는 숙주 및 특정 투여 방식에 따라 달라질 수 있다. Dosage levels and regimens can be determined based on known dosages and regimens, extrapolated, if necessary, based on variations in the properties of the polypeptides and constructs provided herein, and/or determined empirically based on a variety of factors. there is. These factors include, for example, the body weight of the individual as well as general health, age, sex and diet, activity of the specific compound used, time of administration, rate of excretion, drug combination, severity and course of the disease, the patient's propensity for the disease and treatment. including the physician's judgment. The active ingredient is usually combined with a pharmaceutically effective carrier. The amount of active ingredient that can be combined with the carrier material to produce a single dosage form or multiple dosage form can vary depending on the host being treated and the particular mode of administration.
복용량은 특정 대상체뿐만 아니라 치료되는 특정 장애, 질환 또는 병태에 따라 다르다. 일반적인 용량은 알려진 항-HER 요법의 것, 예컨대 트라스투주맙, 세툭시맙, 페르투주맙, 및 파니투무맙, 및 소분자 티로신 키나제 억제제, 예컨대 게피티닙, 에를로티닙, 및 라파티닙을 포함하는 항체와 유사하다. 인간 및 다른 동물을 포함하는 대상체에 대한 예시적인 용량은 약 또는 0.1 내지 100 mg/kg, 예컨대 1 mg/kg 내지 약 또는 30 mg/kg, 예컨대 5 mg/kg 내지 25 mg/kg의 범위이다. 용량은 평균적인 인간의 질량이 약 75 kg이라는 가정에 따라 결정될 수 있다. 소아, 유아 및 더 작은 성인을 위해 용량을 조정할 수 있다. Dosages vary depending on the particular subject as well as the particular disorder, disease or condition being treated. Typical doses are those of known anti-HER therapies, such as trastuzumab, cetuximab, pertuzumab, and panitumumab, and antibodies including small molecule tyrosine kinase inhibitors such as gefitinib, erlotinib, and lapatinib. similar to Exemplary dosages for subjects, including humans and other animals, range from about or 0.1 to 100 mg/kg, such as 1 mg/kg to about or 30 mg/kg, such as 5 mg/kg to 25 mg/kg. Doses can be determined based on the assumption that the average human mass is about 75 kg. Dosage may be adjusted for children, infants and smaller adults.
환자의 상태가 개선되면, 필요하다면 유지 용량의 화합물 또는 조성물이 투여될 수 있고; 복용량, 복용 형태, 또는 투여 빈도, 또는 이들의 조합이 변경될 수 있다. 일부 경우에, 대상체는 질환 증상의 임의의 재발에 따라 또는 예정된 복용량에 기초하여 장기간에 걸쳐 간헐적 치료를 필요로 할 수 있다.When the patient's condition improves, a maintenance dose of the compound or composition may be administered, if necessary; The dosage, dosage form, or frequency of administration, or combinations thereof may be varied. In some cases, a subject may require intermittent treatment over an extended period of time following any recurrence of disease symptoms or based on a predetermined dosage.
본 명세서에 제공된 다중특이적 성장 인자 트랩 작제물을 사용하는 질환 및 병태의 치료는 주입, 피하 주사, 및 흡입, 또는 근육내, 진피내, 경구, 국소 및 경피 투여를 포함하지만 이에 제한되지 않는, 본 명세서에 기재된 바와 같은 적합한 제형을 사용하는 임의의 적합한 투여 경로에 의해 달성될 수 있다.Treatment of diseases and conditions using the multispecific growth factor trap constructs provided herein includes, but is not limited to, injection, subcutaneous injection, and inhalation, or intramuscular, intradermal, oral, topical, and transdermal administration, This may be achieved by any suitable route of administration using a suitable formulation as described herein.
HER 매개 또는 HER 연관 질환 또는 병태의 치료 방법이 본 명세서에 제공되며, 이 방법은 HER 수용체가 표현되거나 과발현되고 HER 수용체 중 적어도 1개, 전형적으로 2개를 표적으로 하는 다중특이적 성장 인자 트랩 작제물을 선택하는 결과에 기초하는 지를 확인하기 위해 질환이 있는 대상체를 테스트하는 것을 포함한다. 한 구현예에서, 질환은 암이다. 본 명세서에서 치료를 위한 암의 예는 신경교종, 뿐만 아니라 췌장암, 위암, 두경부암, 자궁경부암, 폐암, 결장직장암, 자궁내막암, 전립선암, 식도암, 난소암, 자궁암, 방광암 또는 유방암을 포함한다. 본 명세서의 성장 인자 (HER 리간드) 트랩 작제물로 치료 가능한 암은 일반적으로 적어도 하나의 HER 수용체, 전형적으로 하나 초과의 HER 수용체를 발현하는 암이다. 이러한 암은 HER 발현을 검출하기 위해 당업계에 공지된 임의의 수단에 의해 확인될 수 있다. 예를 들어, HER2 발현은 HercepTestTM(Dako)와 같은 상업적으로 이용 가능한 진단/예후 검정을 사용하여 평가될 수 있다. 종양 생검의 파라핀 포매 조직 절편은 면역조직화학(IHC) 검정을 받고 HER2 단백질 염색 강도 기준에 따라 결정된다. 역치 점수 미만으로 일치하는 종양은 HER2를 과발현하지 않는 것으로 특징지어지는 반면, 역치 점수보다 크거나 같은 종양은 HER2를 과발현하는 것으로 특징지어진다. 치료의 한 예에서, HER2 과발현 종양은 본 명세서에 제공된 임의의 것과 같은 다중특이적 성장 인자 트랩 작제물로 치료하기 위한 후보로서 평가된다.Provided herein are methods of treating a HER-mediated or HER-associated disease or condition, comprising a multispecific growth factor trap mechanism in which HER receptors are expressed or overexpressed and which target at least one, typically two, of the HER receptors. and testing a subject with a disease to ascertain whether the selection of an agent is based on the results. In one embodiment, the disease is cancer. Examples of cancers for treatment herein include glioma, as well as pancreatic, gastric, head and neck, cervical, lung, colorectal, endometrial, prostate, esophageal, ovarian, uterine, bladder, or breast cancer. . Cancers that are treatable with the growth factor (HER ligand) trap constructs herein are generally cancers that express at least one HER receptor, typically more than one HER receptor. Such cancers can be identified by any means known in the art for detecting HER expression. For example, HER2 expression can be assessed using commercially available diagnostic/prognostic assays such as HercepTest ™ (Dako). Paraffin-embedded tissue sections of tumor biopsies are subjected to immunohistochemistry (IHC) assays and determined according to HER2 protein staining intensity criteria. Tumors matching below the threshold score are characterized as not overexpressing HER2, whereas tumors greater than or equal to the threshold score are characterized as overexpressing HER2. In one example of treatment, a HER2 overexpressing tumor is evaluated as a candidate for treatment with a multispecific growth factor trap construct, such as any of those provided herein.
또 다른 구현예에서, HER 매개 또는 HER 연관 질환 또는 병태는 염증성 또는 자가면역 장애, 특히 류마티스성 관절염이다. 콜라겐 유도 관절염(CIA) 마우스 모델과 같은 관절염의 동물 모델은 본 명세서에 제공되는 성장 인자 트랩 작제물을 시험하기 위해 사용될 수 있다. 예를 들어, 단백질의 국소 주입과 같이 본 발명의 성장 인자 트랩 작제물로 처리된 마우스는 발 부종, 홍반 및 강직증을 포함하는 관절염 증상의 감소를 관찰할 수 있다. 활막 혈관형성 및 활막 염증의 감소도 관찰될 수 있다. In another embodiment, the HER-mediated or HER-associated disease or condition is an inflammatory or autoimmune disorder, particularly rheumatoid arthritis. Animal models of arthritis, such as the Collagen Induced Arthritis (CIA) mouse model, can be used to test the growth factor trap constructs provided herein. For example, mice treated with a growth factor trap construct of the present invention, such as by local injection of protein, can observe a reduction in arthritis symptoms, including paw swelling, erythema, and catalepsy. A reduction in synovial angiogenesis and synovial inflammation can also be observed.
본 명세서에 제공된 이중특이적 포함 다중특이적, 성장 인자 트랩 작제물, 인코딩 핵산 분자 및 약제학적 조성물은 임의의 질환인 HER(ErbB) 관련 질환 또는 HER 수용체 매개 질환의 치료에 사용될 수 있고, 이는 HER 수용체 및/또는 리간드가 병인, 병리 또는 발달의 일부 측면에 연루된 임의의 질환, 병태 또는 장애이다. 치료를 위한 HER 관련 질환은 암, 예를 들어 신경교종, 또는 췌장암, 위암, 두경부암, 자궁경부암, 폐암, 결장직장암, 자궁내막암, 전립선암, 식도암, 난소암, 자궁암, 방광암, 신장암 또는 유방암을 포함한다. 치료될 수 있는 다른 질환은 비-암 증식성 질환, 예를 들어, 평활근 세포, 염증성 또는 자가면역 질환, 피부 장애, 및 안과 장애의 증식 및/또는 이동을 수반하는 것을 포함한다. 치료를 위한 질환 및 병태는 예를 들어, 류마티스성 관절염, 당뇨병성 망막병증, 전방 눈의 질환, 건선, 재협착증, 협착, 죽상동맥경화증, 혈관의 비후화로부터의 고혈압, 방광의 근육 비후화, 심장 또는 다른 근육, 방광 질환, 자궁내막증, 및 폐색성 기도 질환, 뿐만 아니라 하나 이상의 뉴레굴린 (NRG) 리간드, 예컨대 NRG1 (유형 I, II, 및 III 포함), NRG2, NRG3, 및/또는 NRG4, 또는 다른 HER 패밀리 리간드에 대한 노출(예를 들어, 그에 의해 유발되거나 악화됨)과 연관된 질환 또는 병태를 포함한다. NRG 연관 질환 및 다른 HER 패밀리 리간드와 연관된 질환의 예는 정신분열증, 파킨슨병 및 알츠하이머병을 포함하는 신경적 또는 신경근육 질환, 심근병증, 전자간증, 신경계 질환, 및 심부전을 포함한다.Multispecific, including bispecific, growth factor trap constructs, encoding nucleic acid molecules and pharmaceutical compositions provided herein can be used for the treatment of any disease, HER (ErbB) related disease or HER receptor mediated disease, which is Any disease, condition or disorder in which a receptor and/or ligand is implicated in some aspect of pathogenesis, pathology or development. The HER-related disease for treatment is cancer such as glioma, or pancreatic, gastric, head and neck, cervical, lung, colorectal, endometrial, prostate, esophageal, ovarian, uterine, bladder, kidney, or including breast cancer. Other conditions that may be treated include those involving the proliferation and/or migration of non-cancerous proliferative conditions such as smooth muscle cells, inflammatory or autoimmune diseases, skin disorders, and ophthalmic disorders. Diseases and conditions for treatment include, for example, rheumatoid arthritis, diabetic retinopathy, diseases of the anterior eye, psoriasis, restenosis, stenosis, atherosclerosis, hypertension from thickening of blood vessels, muscle thickening of the bladder, heart or other muscle, bladder disease, endometriosis, and obstructive airway disease, as well as one or more neuregulin (NRG) ligands, such as NRG1 (including types I, II, and III), NRG2, NRG3, and/or NRG4, or diseases or conditions associated with (eg, caused or aggravated by) exposure to other HER family ligands. Examples of NRG-associated diseases and diseases associated with other HER family ligands include schizophrenia, neurological or neuromuscular diseases including Parkinson's disease and Alzheimer's disease, cardiomyopathy, pre-eclampsia, neurological disease, and heart failure.
치료될 수 있는 암의 예는 암종, 림프종, 아세포종, 육종, 및 백혈병 또는 림프양 악성종양, 예를 들어, 편평 세포 암 (예를 들어, 상피 편평 세포 암), 폐암 (소세포 폐암, 비-소세포 폐암, 폐의 선암종 및 폐의 편평상피 암종 포함), 복막의 암, 간세포 암, 위암 (위장암 포함), 췌장암, 교모세포종, 자궁경부암, 난소암, 간암, 방광암, 간종양, 유방암, 결장암, 직장암, 신장 세포 암, 식도암, 신경교종, 결장직장암, 자궁내막암, 자궁암, 타액선 암종, 신장암, 전립선암, 갑상선암, 간 암종, 뿐만 아니라 두경부암 을 포함하지만 이에 제한되지 않는다.Examples of cancers that can be treated include carcinomas, lymphomas, blastomas, sarcomas, and leukemias or lymphoid malignancies such as squamous cell carcinoma (eg, epithelial squamous cell carcinoma), lung cancer (small cell lung cancer, non-small cell lung cancer) lung cancer, including adenocarcinoma of the lung and squamous cell carcinoma of the lung), cancer of the peritoneum, hepatocellular carcinoma, stomach cancer (including stomach cancer), pancreatic cancer, glioblastoma, cervical cancer, ovarian cancer, liver cancer, bladder cancer, liver cancer, breast cancer, colon cancer, rectal cancer, renal cell cancer, esophageal cancer, glioma, colorectal cancer, endometrial cancer, uterine cancer, salivary gland carcinoma, kidney cancer, prostate cancer, thyroid cancer, liver carcinoma, as well as head and neck cancer.
본 명세서에 제공된 다중특이적 성장 인자 트랩 작제물은, 투여시 일반적으로 단일 표적화 항-HER 요법, 예컨대 트라스투주맙, 세툭시맙, 및 본 명세서에 기재되거나 당업계에 공지된 다른 항체, 뿐만 아니라 소분자 티로신 키나제 억제제, 예컨대 게피티닙, 에를로티닙 및 라파티닙과 비교하여 증가된 치료 효능 및 감소된 약물 내성을 치료할 수 있다. 본 명세서에 기재된 바와 같이, 단일 표적화된 항-HER 요법에 대한 내성은 종종 다른 HER 패밀리 구성원의 공동 발현 및/또는 상향조절 및 그의 리간드의 과발현과 연관이 있다. 수용체 유인으로서 거동하고 여러 HER 패밀리 리간드를 격리하는 본 명세서에 제공된 HER-리간드 결합 작제물은, 리간드 의존적 수용체 활성화을 방지하고 비정상적인 HER 패밀리 활성를 하향조절하여, 다중 리간드 유도 HER 패밀리 구성원을 동시에 억제한다. 이는 치료 효능을 증가시키고 약물 내성 발생 가능성을 감소시킨다. The multispecific growth factor trap constructs provided herein, upon administration, generally include a single targeted anti-HER therapy, such as trastuzumab, cetuximab, and other antibodies described herein or known in the art, as well as It can treat increased therapeutic efficacy and reduced drug resistance compared to small molecule tyrosine kinase inhibitors such as gefitinib, erlotinib and lapatinib. As described herein, resistance to single targeted anti-HER therapies is often associated with co-expression and/or upregulation of other HER family members and overexpression of their ligands. A HER-ligand binding construct provided herein that behaves as a receptor decoy and sequesters multiple HER family ligands prevents ligand dependent receptor activation and downregulates aberrant HER family activity, thereby simultaneously inhibiting multiple ligand induced HER family members. This increases therapeutic efficacy and reduces the likelihood of developing drug resistance.
5. 병용 요법 5. Combination therapy
병용 요법이 사용될 수 있다. 병용 요법은 방사선 및 수술을 포함하는 또 다른 제제 또는 치료와 함께 본 명세서에 제공된 이중특이적 포함 다중특이적, 성장 인자 트랩 작제물, 핵산 분자 및 약제학적 조성물의 투여를 포함한다. 추가 제제 또는 요법은 본 명세서에 제공된 치료와 동시에, 전, 후 또는 간헐적으로 투여될 수 있다. 그들은 별도의 조성물 또는 공-제형에 있을 수 있다.Combination therapy may be used. Combination therapy includes administration of multispecific, including bispecific, growth factor trap constructs, nucleic acid molecules, and pharmaceutical compositions provided herein with another agent or treatment, including radiation and surgery. Additional agents or therapies may be administered concurrently, before, after, or intermittently with the treatments provided herein. They may be in separate compositions or co-formulations.
본 명세서에 제공된 다중특이적, 예컨대 이중특이적, 이종다량체 성장 인자 트랩 작제물, 핵산 분자 및 약제학적 조성물은 TNF 길항제/차단제, 화학요법제, 단일 표적화 항-HER 요법 (항체 및 티로신 키나제 억제제 포함), 항-혈관신생 제제, 항체, 세포독성제, 항-염증제, 사이토카인, 성장 억제제, 항-호르몬제, 심장보호제, 스테로이드, 면역자극성 제제, 면역억제제, 생물학적 또는 비-생물학적 질환 변형 항-류마티스성 약물 (DMARD), 감염성 질환을 위한 치료제 (항체 포함), 또는 다른 치료제를 포함하지만 이에 제한되지 않는 하나 이상의 다른 치료적 레지멘 또는 제제 전, 후, 간헐적으로 또는 부수적으로 투여될 수 있다. 특히, 성장 인자 트랩 작제물은 본 명세서에 제공된 TNFR1/TNFR2 축 작제물과 함께 투여된다. 이들은 또한 상기 섹션에 기재되거나 당업자에게 공지된 임의의 것을 포함하는 다른 항-TNF 요법과 함께 투여될 수 있다.Multispecific, such as bispecific, heteromultimer growth factor trap constructs, nucleic acid molecules and pharmaceutical compositions provided herein may be used as TNF antagonists/blockers, chemotherapeutic agents, single targeted anti-HER therapies (antibodies and tyrosine kinase inhibitors). including), anti-angiogenic agents, antibodies, cytotoxic agents, anti-inflammatory agents, cytokines, growth inhibitors, anti-hormonal agents, cardioprotective agents, steroids, immunostimulatory agents, immunosuppressive agents, biological or non-biological disease modifying agents -can be administered before, after, intermittently or concomitantly with one or more other therapeutic regimens or agents, including but not limited to rheumatoid drugs (DMARDs), therapeutics (including antibodies) for infectious diseases, or other therapeutic agents. . In particular, growth factor trap constructs are administered in conjunction with the TNFR1/TNFR2 axis constructs provided herein. They may also be administered in conjunction with other anti-TNF therapies, including any described in the section above or known to those skilled in the art.
본 명세서에 제공된 TNFR1 길항제 작제물, TNFR2 효능제 작제물, 다중특이적 작제물, 핵산 및 다른 작제물은 다른 항-TNF 요법과 함께 레지멘로 투여될 수 있다. 본 명세서의 병용 요법에 사용될 수 있는 예시적인 항-TNF 요법은 예를 들어, 종래의 합성 DMARD, 예를 들어 메토트렉세이트 (MTX), 하이드록시클로로퀸 (HCQ; Plaquenil®), 설파살라진 (Azulfidine®), 및 레플루노마이드 (Arava®); 생물학적 DMARD, 예를 들어, 아바타셉트 (Orencia®), 아나킨라 (Kineret®), 리툭시맙 (Rituxan®, Truxima®, MabThera®), 토실리주맙 (아틀리주맙, Actemra®, RoActemra®), 코르티코스테로이드 (예를 들어, 덱사메타손, 메틸프레드니솔론, 프레드니솔론, 프레드니손, 또는 트리암시놀론), 토파시티닙 (Xeljanz®), 및 TNF-억제제/항-TNF 제제, 예를 들어, 세르톨리주맙 페골 (Cimzia®), 인플릭시맙 (Remicade®), 아달리무맙 (Humira®), 골리무맙 (Simponi®), 및 에타네르셉트 (Enbrel®)을 포함한다. 병용 요법은 또한 면역치료 약물, 예를 들어, 사이클로스포린, 메토트렉세이트, 아드리아마이신 또는 시스플라티넘, 및 면역독소를 포함할 수 있다.TNFR1 antagonist constructs, TNFR2 agonist constructs, multispecific constructs, nucleic acids and other constructs provided herein can be administered as a regimen in combination with other anti-TNF therapies. Exemplary anti-TNF therapies that can be used in combination therapy herein include, for example, conventional synthetic DMARDs such as methotrexate (MTX), hydroxychloroquine (HCQ; Plaquenil® ), sulfasalazine ( Azulfidine® ), and leflunomide ( Arava® ); Biological DMARDs such as abatacept ( Orencia® ), anakinra ( Kineret® ), rituximab ( Rituxan® , Truxima® , MabThera® ), tocilizumab (atlizumab, Actemra® , RoActemra® ), corticosteroids steroids (e.g. dexamethasone, methylprednisolone, prednisolone, prednisone, or triamcinolone), tofacitinib ( Xeljanz® ), and TNF-inhibitor/anti-TNF agents such as certolizumab pegol ( Cimzia® ); infliximab ( Remicade® ), adalimumab ( Humira® ), golimumab ( Simponi® ), and etanercept ( Enbrel® ). Combination therapy may also include an immunotherapeutic drug such as cyclosporine, methotrexate, adriamycin or cisplatinum, and an immunotoxin.
특정 예에서, 본 명세서에 제공되는 성장 인자 트랩 작제물은 본 명세서에 기재된 만성 염증성, 자가면역, 및/또는 신경퇴행/탈수초 질환 및 병태 중 임의의 것, 특히 류마티스성 관절염 (RA)의 치료를 위해 본 명세서에 제공된 TNFR1 길항제 작제물, TNFR2 효능제 작제물, 또는 다중특이적, 예컨대 이중특이적, TNFR1 길항제/TNFR2 효능제 작제물 중 임의의 것과 함께 투여된다. In certain instances, growth factor trap constructs provided herein are used for the treatment of any of the chronic inflammatory, autoimmune, and/or neurodegenerative/demyelinating diseases and conditions described herein, particularly rheumatoid arthritis (RA). with any of the TNFR1 antagonist constructs, TNFR2 agonist constructs, or multispecific, such as bispecific, TNFR1 antagonist/TNFR2 agonist constructs provided herein for
일부 예에서, 본 명세서에 제공된 성장 인자 트랩 작제물은 하나 이상의 항-혈관신생 제제와 함께 투여된다. 예를 들어, 항-혈관형성 인자는 혈관형성 촉진에 관여하는 성장인자 또는 성장인자 수용체에 결합하는 소분자 또는 단백질 (예를 들어, 항체, Fc 융합, 또는 사이토카인)일 수 있다. 항-혈관신생 제제의 예는 혈관 내피 성장 인자 (VEGF)에 결합하거나 VEGF-R에 결합하는 항체, VEGF 또는 VEGF-R 발현의 수준 감소시키는 RNA 기반 치료제, VEGF-독소 융합, 레제네론(Regeneron) VEGF-트랩, 안지오스타틴 (플라스미노겐 단편), 항트롬빈 III, 안지오자임, ABT-627, Bay 12-9566, 베네핀, 베바시주맙, 비스포스포네이트, BMS-275291, 연골 유래 억제제 (CDI), CAI, CD59 보체 단편, CEP-7055, Col 3, 콤브레타스타틴 A-4, 엔도스타틴 (콜라겐 XVIII 단편), 파르네실 트랜스퍼라제 억제제, 피브로넥틴 단편, GRO-베타, 할로푸기논, 헤파리나제, 헤파린 헥사사카리이드 단편, HMV833, 인간 융모성 고나도트로핀 (hCG), IM-862, 인터페론 알파, 인터페론 베타, 인터페론 감마, 인터페론 유도성 단백질 10 (IP-10), 인터류킨-12, 크링글 5 (플라스미노겐 단편), 마리마스타트, 메탈로프로테이나제 억제제 (예를 들어, TIMPs), 2-메톡시에스트라디올, MMI 270 (CGS 27023A), 플라스미노겐 활성자 억제제 (PAI), 혈소판 인자-4 (PF4), 프리노마스타트, 프로락틴 16 kDa 단편, 프롤리페린 관련 단백질 (PRP), PTK 787/ZK 222594, 레티노이드, 솔리마스타트, 스쿠알라민, SS3304, SU5416, SU6668, SU11248, 테트라하이드로코르티솔-S, 테트라티오몰리브데이트, 탈리도마이드, 트롬보스폰딘-1 (TSP-1), TNP470, 형질전환 성장 인자 베타 (TGF-β), 바스쿨로스타틴, 바소스타틴 (칼레티큘린 단편), ZS6126, 및 ZD6474를 포함하지만 이에 제한되지 않는다.In some examples, a growth factor trap construct provided herein is administered in conjunction with one or more anti-angiogenic agents. For example, an anti-angiogenic factor can be a growth factor involved in promoting angiogenesis or a small molecule or protein that binds to a growth factor receptor (eg, an antibody, Fc fusion, or cytokine). Examples of anti-angiogenic agents include antibodies that bind vascular endothelial growth factor (VEGF) or that bind VEGF-R, RNA-based therapeutics that reduce the level of VEGF or VEGF-R expression, VEGF-toxin fusions, Regeneron ) VEGF-trap, angiostatin (plasminogen fragment), antithrombin III, angiozyme, ABT-627, Bay 12-9566, benepine, bevacizumab, bisphosphonate, BMS-275291, cartilage derived inhibitor (CDI), CAI, CD59 complement fragment, CEP-7055, Col 3, combretastatin A-4, endostatin (collagen XVIII fragment), farnesyl transferase inhibitor, fibronectin fragment, GRO-beta, halofuginone, heparinase, heparin Hexasaccharide fragment, HMV833, human chorionic gonadotropin (hCG), IM-862, interferon alpha, interferon beta, interferon gamma, interferon inducible protein 10 (IP-10), interleukin-12, Kringle 5 ( plasminogen fragment), marimastat, metalloproteinase inhibitors (eg TIMPs), 2-methoxyestradiol, MMI 270 (CGS 27023A), plasminogen activator inhibitor (PAI), platelet factor -4 (PF4), prinomastat, prolactin 16 kDa fragment, proliferin-related protein (PRP), PTK 787/ZK 222594, retinoid, solimastat, squalamine, SS3304, SU5416, SU6668, SU11248, tetrahydro Cortisol-S, tetrathiomolybdate, thalidomide, thrombospondin-1 (TSP-1), TNP470, transforming growth factor beta (TGF-β), vasculostatin, vasostatin (calreticulin fragment), ZS6126, and ZD6474, but are not limited thereto.
일부 예에서, 본 명세서에 제공되는 성장 인자 트랩 작제물은 하나 이상의 티로신 키나제 억제제 및 선택적으로 본 명세서에 제공되는 TNFR1/TNFR2 축 작제물과 함께 투여된다. 티로신 키나제 억제제의 예는 비제한적으로, 퀴나졸린, 예컨대 PD 153035, 4-(3-클로로아닐리노)퀴나졸린; 피리도피리미딘; 피리미도피리미딘; 피롤로피리미딘, 예컨대 CGP 59326, CGP 60261 및 CGP 62706; 피라졸로피리미딘; 4-(페닐아미노)-7H-피롤로(2,3-d) 피리미딘; 쿠르쿠민 (디페룰로일메탄, 4,5-비스(4-플루오로아닐리노)프탈이미드); 니트로티오펜 모이어티를 함유하는 타이르포스틴; PD-0183805 (Warner-Lambert); 안티센스 분자 (예를 들어, ErbB 인코딩 핵산에 결합하는 것); 퀴녹살린 (참고, 예를 들어, 미국 특허 번호 5,804,396); 타이르포스틴 (참고, 예를 들어, 미국 특허 번호 5,804,396); ZD6474 (Astra Zeneca); PTK-787 (Novartis/Schering A G); 팬-ErbB 억제제, 예컨대 C1-1033 (Pfizer); 아피니탁 (ISIS 3521; Isis/Lilly); 이마티닙 메실레이트 (STI571, Gleevec®; Novartis); PKI 166 (Novartis); GW2016 (Glaxo SmithKline); C1-1033 (Pfizer); EKB-569 (Wyeth); 세막시닙 (Sugen); ZD6474 (AstraZeneca); PTK-787 (Novartis/Schering A G); INC-1 C11 (ImClone); 게피티닙 (Iressa®, ZD1839, AstraZeneca); 및 OSI-774 (상표명 Tarceva®로 시판됨, OSI Pharmaceuticals/Genentech), 또는 다음의 특허 공개 중 임의의 것에 기재된 임의의 것: 미국 특허 번호 5,804,396, 및 국제 출원 공개 번호 WO 99/09016, WO 98/43960, WO 97/38983, WO 99/06378, WO 99/06396, WO 96/30347, WO 96/33978, WO 96/33979, 및 WO 96/33980을 포함한다. In some examples, a growth factor trap construct provided herein is administered in conjunction with one or more tyrosine kinase inhibitors and optionally a TNFR1/TNFR2 axis construct provided herein. Examples of tyrosine kinase inhibitors include, but are not limited to, quinazolines such as PD 153035, 4-(3-chloroanilino)quinazoline; pyridopyrimidines; pyrimidopyrimidines; pyrrolopyrimidines such as CGP 59326, CGP 60261 and CGP 62706; pyrazolopyrimidines; 4-(phenylamino)-7H-pyrrolo(2,3-d) pyrimidine; curcumin (diferuloylmethane, 4,5-bis(4-fluoroanilino)phthalimide); tyrphostin containing a nitrothiophene moiety; PD-0183805 (Warner-Lambert); antisense molecules (eg, those that bind to ErbB encoding nucleic acids); quinoxaline (see, eg, US Pat. No. 5,804,396); Tyrphostine (see, eg, U.S. Patent No. 5,804,396); ZD6474 from Astra Zeneca; PTK-787 (Novartis/Schering AG); pan-ErbB inhibitors such as C1-1033 (Pfizer); Afinitak (ISIS 3521; Isis/Lilly); imatinib mesylate (STI571, Gleevec ® ; Novartis); PKI 166 (Novartis); GW2016 (Glaxo SmithKline); C1-1033 (Pfizer); EKB-569 (Wyeth); cemacinib (Sugen); ZD6474 (AstraZeneca); PTK-787 (Novartis/Schering AG); INC-1 C11 (ImClone); Gefitinib ( Iressa® , ZD1839, AstraZeneca); and OSI-774 (marketed under the trademark Tarceva® , OSI Pharmaceuticals/Genentech), or any described in any of the following patent publications: U.S. Patent No. 5,804,396, and International Application Publication Nos. WO 99/09016, WO 98/ 43960, WO 97/38983, WO 99/06378, WO 99/06396, WO 96/30347, WO 96/33978, WO 96/33979, and WO 96/33980.
병용 요법에 유용한 다른 화합물은 스테로이드, 예컨대 안지오스타틱 4,9(11)-스테로이드 및 C21-산소화된 스테로이드, 안지오스타틴, 엔도스타틴, 바스쿨로스타틴, 칸스타틴 및 마스핀, 안지오포이에틴, 박테리아 다당류 CM101 및 항체 LM609 (참고, 예를 들어, 미국 특허 번호 5,753,230), 트롬보스폰딘 (TSP-1), 혈소판 인자 4 (PF4), 인터페론, 메탈로프로테이나제 억제제, AGM-1470/TNP-470, 탈리도마이드, 및 카복시아미도트리아졸 (CAI)를 포함하는 약리학적 제제, 헤파린 또는 헤파린 단편, 항-침습성 인자, 레티노산 및 파클리탁셀의 존재에서와 같은 코리티손, 상어 연골 추출물, 음이온성 폴리아미드 또는 폴리우레아 올리고머, 옥신돌 유도체, 에스트라디올 유도체 및 티아졸로피리미딘 유도체를 포함한다. Other compounds useful for combination therapy include steroids such as angiostatic 4,9(11)-steroids and C21-oxygenated steroids, angiostatin, endostatin, basculostatin, canstatin and maspin, angiopoietin, bacterial polysaccharides CM101 and antibody LM609 (see, eg, US Pat. No. 5,753,230), thrombospondin (TSP-1), platelet factor 4 (PF4), interferons, metalloproteinase inhibitors, AGM-1470/TNP-470, Thalidomide, and pharmacological agents including carboxyamidotriazole (CAI), heparin or heparin fragments, anti-invasive factors, cortisone such as in the presence of retinoic acid and paclitaxel, shark cartilage extract, anionic polyamide or poly urea oligomers, oxindole derivatives, estradiol derivatives and thiazolopyrimidine derivatives.
본 명세서에 제공된 성장 인자 트랩 작제물과 함께 투여될 수 있는 항암 항체의 예는 항-17-IA 세포 표면 항원 항체, 예컨대 에드레콜로맙 (상표명 (Panorex®)로 시판됨); 항-4-1BB 항체; 항-4Dc 항체; 항-A33 항체, 예컨대 A33 및 CDP-833; 항-α1 인테그린 항체, 예컨대 나탈리주맙; 항-α4β7 인테그린 항체, 예컨대 LDP-02; 항-αVβ1 인테그린 항체, 예컨대 F-200, M-200, 및 SJ-749; 항-αVβ3 인테그린 항체, 예컨대 압식시맙, CNTO-95, Mab-17E6, 및 Medi-523 (상표명 비탁신으로 시판됨); 항-보체 인자 5 (C5) 항체, 예컨대 5G1.1; 항-CA125 항체, 예컨대 오레고보맙(상표명 OvaRex®로 시판됨); 항-CD3 항체, 예컨대 비실리주맙 (Nuvion®), 및 렉소맙; 항-CD4 항체, 예컨대 IDEC-151, MDX-CD4, 및 OKT4A; 항-CD6 항체, 예컨대 온코라이신 B 및 온코라이신 CD6; 항-CD7 항체, 예컨대 HB2; 항-CD19 항체, 예컨대 B43, MT-103, 및 온코라이신 B; 항-CD20 항체, 예컨대 2H7, 2H7.v16, 2H7.v114, 2H7.v115, 토시투모맙 (Bexxar®), 리툭시맙 (Rituxan®), 및 이브리투모맙 티욱세탄 (Zevalin®); 항-CD22 항체, 예컨대 에프라투주맙 (Lymphocide®); 항-CD23 항체, 예컨대 IDEC-152; 항-CD25 항체, 예컨대 바실릭시마맙 및 Zenapax® (다클리주맙); 항-CD30 항체, 예컨대 AC10, MDX-060, 및 SGN-30; 항-CD33 항체, 예컨대 젬투주맙 오조가미신 (Mylotarg®), 온코라이신 M, 및 Smart Ml 95; 항-CD38 항체; 항-CD40 항체, 예컨대 SGN-40 및 토랄리주맙; 항-CD40L 항체, 예컨대 5c8, 루플리주맙 (Antova), 및 IDEC-131; 항-CD44 항체, 예컨대 비바투주맙; 항-CD46 항체; 항-CD52 항체, 예컨대 Campath® (알렘투주맙); 항-CD55 항체, 예컨대 SC-1; 항-CD56 항체, 예컨대 huN901-DM1; 항-CD64 항체, 예컨대 MDX-33; 항-CD66e 항체, 예컨대 XR-303; 항-CD74 항체, 예컨대 IMMU-110; 항-CD80 항체, 예컨대 갈릭시맙 및 IDEC-114; 항-CD89 항체, 예컨대 MDX-214; 항-CD123 항체; 항-CD138 항체, 예컨대 B-B4-DM1; 항-CD146 항체, 예컨대 AA-98; 항-CD148 항체; 항-CEA 항체, 예컨대 cT84.66, 라베투주맙, 및 Pentacea®; 항-CTLA-4 항체, 예컨대 MDX-101; 항-CXCR4 항체; 항-EGFR 항체, 예컨대 ABX-EGF, Erbitux® (세툭시맙), 파니투무맙, IMC-C225, 및 Merck Mab 425; 항-EpCAM 항체, 예컨대 크루셀(Crucell) 항-EpCAM, ING-1, 및 IS-IL-2; 항-에프린 B2/EphB4 항체; 항-HER2 항체, 예컨대 Herceptin® (트라스투주맙), 페르투주맙, 및 MDX-210; 항-FAP (섬유아세포 활성화 단백질) 항체, 예컨대 시브로투주맙; 항-페리딘 항체, 예컨대 NXT-211; 항-FGF-1 항체; 항-FGF-3 항체; 항-FGF-8 항체; 항-FGFR 항체; 항-피브린 항체; 항-G250 항체, 예컨대 WX-G250 및 기렌툭시맙 (Rencarex®); 항-GD2 강글리오사이드 항체, 예컨대 EMD-273063 및 TriGem; 항-GD3 강글리오사이드 항체, 예컨대 BEC2, KW-2871, 및 미투모맙; 항-gpIIb/IIIa 항체, 예컨대 레오프로; 항-헤파리나제 항체; 항-HLA 항체, 예컨대 온콜림, 및 Smart 1D10; 항-HM1.24 항체; 항-ICAM 항체, 예컨대 ICM3; 항-IgA 수용체 항체; 항-IGF-1 항체, 예컨대 CP-751871 및 EM-164; 항-IGF-1R 항체, 예컨대 IMC-A12; 항-IL-6 항체, 예컨대 CNTO-328 및 엘실리모맙; 항-IL-15 항체, 예컨대 HuMax®-IL15 항체; 항-KDR 항체; 항-라미닌 5 항체; 항-루이스 Y 항원 항체, 예컨대 Hu3S193 및 IGN-311; 항-MCAM 항체; 항-Muc1 항체, 예컨대 BravaRex 및 TriAb; 항-NCAM 항체, 예컨대 ERIC-1 및 ICRT; 항-PEM 항원 항체, 예컨대 테라긴 및 테렉스; 항-PSA 항체; 항-PSCA 항체, 예컨대 IG8; 항-Ptk 항체; 항-PTN 항체; 항-RANKL 항체, 예컨대 AMG-162; 항-RLIP76 항체; 항-SK-1 항원 항체, 예컨대 Monopharm C; 항-STEAP 항체; 항-TAG72 항체, 예컨대 CC49-SCA 및 MDX-220; 항-TGF-β 항체, 예컨대 CAT-152; 항-TNF-α 항체, 예컨대 CDP571, CDP870, D2E7, 아달리무맙 (Humira®), 및 인플릭시맙 (Remicade®); 항-TRAIL-R1 및 TRAIL-R2 항체; 항-VE-카드헤린-2 항체; 및 항-VLA-4 항체, 예컨대 Antegren® 항체를 포함하지만 이에 제한되지 않는다. GD3 에피토프 항체 BEC2 및 gp72 에피토프 항체 105AD7을 포함하나 이에 제한되지 않는 항-개체특이형 항체가 사용될 수 있다. 항-CD3/CD20 항체 Bi20을 포함하나 이에 제한되지 않는 이중특이적 항체가 또한 사용될 수 있다. Examples of anticancer antibodies that can be administered with the growth factor trap constructs provided herein include anti-17-IA cell surface antigen antibodies such as edrecolomab (marketed under the trademark Panorex® ); anti-4-1BB antibody; anti-4Dc antibody; anti-A33 antibodies such as A33 and CDP-833; anti-α1 integrin antibodies such as natalizumab; anti-α4β7 integrin antibodies such as LDP-02; anti-αVβ1 integrin antibodies such as F-200, M-200, and SJ-749; anti-αVβ3 integrin antibodies such as apsiximab, CNTO-95, Mab-17E6, and Medi-523 (marketed under the trademark Vitaxin); anti-complement factor 5 (C5) antibodies such as 5G1.1; anti-CA125 antibodies such as oregovomab (marketed under the trademark OvaRex ® ); anti-CD3 antibodies such as visilizumab (Nuvion ® ), and rexomab; anti-CD4 antibodies such as IDEC-151, MDX-CD4, and OKT4A; anti-CD6 antibodies such as oncolysin B and oncolysin CD6; anti-CD7 antibodies such as HB2; anti-CD19 antibodies such as B43, MT-103, and oncolysin B; anti-CD20 antibodies such as 2H7, 2H7.v16, 2H7.v114, 2H7.v115, tositumomab ( Bexxar® ), rituximab ( Rituxan® ), and ibritumomab tiuxetan ( Zevalin® ); anti-CD22 antibodies such as efratuzumab (Lymphocide ® ); anti-CD23 antibodies such as IDEC-152; anti-CD25 antibodies such as basiliximab and Zenapax ® (daclizumab); anti-CD30 antibodies such as AC10, MDX-060, and SGN-30; anti-CD33 antibodies such as gemtuzumab ozogamicin (Mylotarg ® ), oncolysin M, and Smart Ml 95; anti-CD38 antibody; anti-CD40 antibodies such as SGN-40 and toralizumab; anti-CD40L antibodies such as 5c8, luplizumab (Antova), and IDEC-131; anti-CD44 antibodies such as vivatuzumab; anti-CD46 antibody; anti-CD52 antibodies such as Campath® (alemtuzumab); anti-CD55 antibodies such as SC-1; anti-CD56 antibodies such as huN901-DM1; anti-CD64 antibodies such as MDX-33; anti-CD66e antibodies such as XR-303; anti-CD74 antibodies such as IMMU-110; anti-CD80 antibodies such as galiximab and IDEC-114; anti-CD89 antibodies such as MDX-214; anti-CD123 antibody; anti-CD138 antibodies such as B-B4-DM1; anti-CD146 antibodies such as AA-98; anti-CD148 antibody; anti-CEA antibodies such as cT84.66, labetuzumab, and Pentacea ® ; anti-CTLA-4 antibodies such as MDX-101; anti-CXCR4 antibodies; anti-EGFR antibodies such as ABX-EGF, Erbitux® (cetuximab), panitumumab, IMC-C225, and Merck Mab 425; anti-EpCAM antibodies such as Crucell anti-EpCAM, ING-1, and IS-IL-2; anti-ephrin B2/EphB4 antibody; anti-HER2 antibodies such as Herceptin® (trastuzumab), pertuzumab, and MDX-210; anti-FAP (fibroblast activation protein) antibodies such as sibrotuzumab; anti-peridin antibodies such as NXT-211; anti-FGF-1 antibody; anti-FGF-3 antibody; anti-FGF-8 antibody; anti-FGFR antibodies; anti-fibrin antibodies; anti-G250 antibodies such as WX-G250 and girentuximab ( Rencarex® ); anti-GD2 ganglioside antibodies such as EMD-273063 and TriGem; anti-GD3 ganglioside antibodies such as BEC2, KW-2871, and mitumomab; anti-gpIIb/IIIa antibodies such as Reopro; anti-heparinase antibodies; anti-HLA antibodies such as Oncolym, and Smart 1D10; anti-HM1.24 antibody; anti-ICAM antibodies such as ICM3; anti-IgA receptor antibodies; anti-IGF-1 antibodies such as CP-751871 and EM-164; anti-IGF-1R antibodies such as IMC-A12; anti-IL-6 antibodies such as CNTO-328 and elsilimomab; anti-IL-15 antibodies such as HuMax® -IL15 antibody; anti-KDR antibodies; anti-laminin 5 antibody; anti-Lewis Y antigen antibodies such as Hu3S193 and IGN-311; anti-MCAM antibodies; anti-Muc1 antibodies such as BravaRex and TriAb; anti-NCAM antibodies such as ERIC-1 and ICRT; anti-PEM antigen antibodies such as teragin and terex; anti-PSA antibodies; anti-PSCA antibodies such as IG8; anti-Ptk antibodies; anti-PTN antibodies; anti-RANKL antibodies such as AMG-162; anti-RLIP76 antibody; anti-SK-1 antigen antibodies such as Monopharm C; anti-STEAP antibody; anti-TAG72 antibodies such as CC49-SCA and MDX-220; anti-TGF-β antibodies such as CAT-152; anti-TNF-α antibodies such as CDP571, CDP870, D2E7, adalimumab ( Humira® ), and infliximab ( Remicade® ); anti-TRAIL-R1 and TRAIL-R2 antibodies; anti-VE-cadherin-2 antibody; and anti-VLA-4 antibodies, such as Antegren ® antibodies. Anti-subject antibodies may be used including, but not limited to, the GD3 epitope antibody BEC2 and the gp72 epitope antibody 105AD7. Bispecific antibodies may also be used, including but not limited to the anti-CD3/CD20 antibody Bi20.
본 명세서에 제공된 성장 인자 트랩 작제물와 함께 투여할 수 있는 자가면역 또는 염증성 질환, 이식 거부 및/또는 GvHD를 치료할 수 있는 항체의 예는 항-α4β7 인테그린 항체, 예컨대 LDP-02; 항-베타2 인테그린 항체, 예컨대 LDP-01; 항-보체 (C5) 항체, 예컨대 5G1.1; 항-CD2 항체, 예컨대 BTI-322, 및 MEDI-507; 항-CD3 항체, 예컨대 OKT3, 및 SMART 항-CD3; 항-CD4 항체, 예컨대 IDEC-151, MDX-CD4, 및 OKT4A; 항-CD11a 항체; 항-CD14 항체, 예컨대 IC14; 항-CD18 항체; 항-CD23 항체, 예컨대 IDEC-152; 항-CD25 항체, 예컨대 제나팍스; 항-CD40L 항체, 예컨대 5c8, 안토바, 및 IDEC-131; 항-CD64 항체, 예컨대 MDX-33; 항-CD80 항체, 예컨대 IDEC-114; 항-CD147 항체, 예컨대 ABX-CBL; 항-E-셀렉틴 항체, 예컨대 CDP850; 항-gpIIb/IIIa 항체, 예컨대 ReoPro®/압식시맙; 항-ICAM-3 항체, 예컨대 ICM3; 항-ICE 항체, 예컨대 VX-740; 항-FcγR1 항체, 예컨대 MDX-33; 항-IgE 항체, 예컨대 rhuMAb-E25; 항-IL-4 항체, 예컨대 SB-240683; 항-IL-5 항체, 예컨대 SB-240563, 및 SCH55700; 항-IL-8 항체, 예컨대 ABX-IL8; 항-인터페론 감마 항체; 항-TNFα 항체, 예컨대 CDP571, CDP870, D2E7, 아달리무맙, 인플릭시맙, 및 MAK-195F; 및 항-VLA-4 항체, 예컨대 안테그렌을 포함하지만 이에 제한되지 않는다. 자가면역 또는 염증성 질환, 이식 거부 및 GvHD를 치료하기 위해 공동 투여될 수 있는 다른 Fc 함유 분자의 예는 TNFRII 수용체/Fc 융합 Enbrel® (에타네르셉트), 및 Regeneron의 IL-1 트랩을 포함하지만 이에 제한되지 않는다. Examples of antibodies capable of treating autoimmune or inflammatory diseases, transplant rejection and/or GvHD that can be administered with the growth factor trap constructs provided herein include anti-α4β7 integrin antibodies such as LDP-02; anti-beta2 integrin antibodies such as LDP-01; anti-complement (C5) antibodies such as 5G1.1; anti-CD2 antibodies such as BTI-322, and MEDI-507; anti-CD3 antibodies such as OKT3, and SMART anti-CD3; anti-CD4 antibodies such as IDEC-151, MDX-CD4, and OKT4A; anti-CD11a antibody; anti-CD14 antibodies such as IC14; anti-CD18 antibody; anti-CD23 antibodies such as IDEC-152; anti-CD25 antibodies such as Genapax; anti-CD40L antibodies such as 5c8, Antova, and IDEC-131; anti-CD64 antibodies such as MDX-33; anti-CD80 antibodies such as IDEC-114; anti-CD147 antibodies such as ABX-CBL; anti-E-selectin antibodies such as CDP850; anti-gpIIb/IIIa antibodies such as ReoPro®/abxiximab; anti-ICAM-3 antibodies such as ICM3; anti-ICE antibodies such as VX-740; anti-FcγR1 antibodies such as MDX-33; anti-IgE antibodies such as rhuMAb-E25; anti-IL-4 antibodies such as SB-240683; anti-IL-5 antibodies such as SB-240563, and SCH55700; anti-IL-8 antibodies such as ABX-IL8; anti-interferon gamma antibodies; anti-TNFα antibodies such as CDP571, CDP870, D2E7, adalimumab, infliximab, and MAK-195F; and anti-VLA-4 antibodies such as antegren. Examples of other Fc-containing molecules that can be co-administered to treat autoimmune or inflammatory diseases, transplant rejection and GvHD include, but are not limited to, the TNFRII receptor/Fc fusion Enbrel ® (etanercept), and Regeneron's IL-1 trap. Not limited.
감염성 질환을 치료하기 위해 공동 투여될 수 있는 항체의 예는 항-탄저병 항체, 예컨대 ABthrax; 항-CMV 항체, 예컨대 CytoGam 및 세비루맙; 항-크립토스포리디움 항체, 예컨대 CryptoGAM 및 스포리딘-G; 항-헬리코박터 항체, 예컨대 파일로란; 항-간염 B 항체, 예컨대 HepeX-B 및 Nabi-HB; 항-HIV 항체, 예컨대 HRG-214; 항-RSV 항체, 예컨대 펠비주맙, HNK-20, 팔리바주맙, 및 RespiGam; 및 항-스타필로코쿠스 항체, 예컨대 아우렉시스, 아우로그랍, BSYX-A110, 및 SE-Mab 을 포함하지만 이에 제한되지 않는다. Examples of antibodies that can be co-administered to treat infectious diseases include anti-anthrax antibodies such as ABthrax; anti-CMV antibodies such as CytoGam and sevirumab; anti-Cryptosporidium antibodies such as CryptoGAM and sporidin-G; anti-Helicobacter antibodies such as pyloran; anti-hepatitis B antibodies such as HepeX-B and Nabi-HB; anti-HIV antibodies such as HRG-214; anti-RSV antibodies such as felbizumab, HNK-20, palivazumab, and RespiGam; and anti-staphylococcal antibodies such as Aurexis, Aurograb, BSYX-A110, and SE-Mab.
일부 예에서, 본 명세서에 기재된 성장 인자 트랩 작제물은 하나 이상의 화학요법제와 함께 투여된다. 화학요법제의 예는 비제한적으로, 알킬화제, 예컨대 티오테파 및 사이클로포스파미드 (CYTOXAN®); 알킬 설포네이트, 예컨대 부설판, 임프로설판 및 피포설판; 안드로겐, 예컨대 칼루스테론, 드로모스타놀론 프로피오네이트, 에피티오스타놀, 메피티오스탄, 및 테스토락톤; 항아드레날, 예컨대 아미노글루테티미드, 미토탄, 및 트릴로스탄; 항-안드로겐, 예컨대 플루타미드, 닐루타미드, 바이칼루타미드, 류프롤라이드, 및 고세렐린; 항생제, 예컨대 아클라시노마이신, 악티노마이신, 안트라마이신, 아자세린, 블레오마이신, 칵티노마이신, 칼리케아마이신, 카루비신, 카르미노마이신, 카르지노필린, 크로모마이신, 닥티노마이신, 다우노루비신, 데토루비신, 6-디아조-5-옥소-L-노르류신, 독소루비신, 에피루비신, 에소루비신, 이다루비신, 마르셀로마이신, 미토마이신, 마이코페놀산, 노갈라마이신, 올리보마이신, 페플로마이신, 포르피로마이신, 퓨로마이신, 쿠엘라마이신, 로도루비신, 스트렙토니그린, 스트렙토조신, 투베르시딘, 우베니멕스, 지노스타틴, 및 조루비신; 예를 들어, 타목시펜, 랄록시펜, 아로마타제 억제 4(5)-이미다졸, 4-하이드록시타목시펜, 트리옥시펜, 케녹시펜, LY 117018, 오나프리스톤, 및 토레미펜 (파레스톤)을 포함하는 항에스트로겐; 항-대사산물, 예컨대 메토트렉세이트 및 5-플루오로우라실 (5-FU); 엽산 유사체, 예컨대 데노프테린, 메토트렉세이트, 프테로프테린, 및 트리메트렉세이트; 아지리딘, 예컨대 벤조데파, 카보쿠온, 메투레데파, 및 우레데파; 알트레타민, 트리에틸렌멜라민, 트리에틸렌포스포르아미드, 트리에틸렌티오포스포르아미드 및 트리메틸올 멜라민을 포함하는 에틸렌이민 및 메틸멜라민; 엽산 보충물, 예컨대 폴린산; 질소 머스타드, 예컨대 클로르암부실, 클로르나파진, 클로로포스파미드, 에스트라무스틴, 이포스파미드, 메클로르에타민, 메클로르에타민 옥사이드 하이드로클로라이드, 멜팔란, 노벰비친, 펜에스테린, 프레드니무스틴, 트로포스파미드, 및 우라실 머스타드; 니트로소우레아, 예컨대 카무스틴, 클로로조토신, 포테무스틴, 로무스틴, 니무스틴, 및 라니무스틴; 백금 유사체, 예컨대 시스플라틴 및 카보플라틴; 빈블라스틴; 백금; 단백질, 예컨대 아르기닌 탈이민효소 및 아스파라기나제; 퓨린 유사체, 예컨대 플루다라빈, 6-머캅토퓨린, 티아미프린, 및 티오구아닌; 피리미딘 유사체, 예컨대 안시타빈, 아자시티딘, 6-아자우리딘, 카모푸르, 사이타라빈, 디데옥시우리딘, 독시플루리딘, 에노시타빈, 플록수리딘, 및 5-FU; 탁산, 예컨대 파클리탁셀 (TAXOL®, Bristol-Myers Squibb Oncology, Princeton, N.J.) 및 도세탁셀 (TAXOTERE®, Rhone-Poulenc Rorer, Antony, France); 토포이소머라제 억제제, 예컨대 RFS 2000; 타이미딜레이트 합성효소 억제제, 예컨대 토뮤덱스; 아세글라톤을 포함하는 추가의 화학요법제; 알도포스파미드 글리코시드; 아미노레벌린산; 암사크린; 베스트라부실; 비스안트렌; 데다트렉세이트; 데포스파미드; 데메콜신; 디아지쿠온; 디플루오로메틸오르니틴 (DMFO); 에플로니틴; 엘립티늄 아세테이트; 에토글루시드; 갈륨 니트레이트; 하이드록시우레아; 렌티난; 로니다민; 미토구아존; 미톡산트론; 모피다몰; 니트라크린; 펜토스타틴; 페나메트; 피라루비신; 포도필린산; 2-에틸하이드라자이드; 프로카바진; PSK®; 라족산; 시조피란; 스피로게르마늄; 테누아진산; 트리아지쿠온; 2,2',2"-트리클로로트리에틸아민; 우레탄; 빈데신; 다카바진; 만노무스틴; 미토브로니톨; 미토락톨; 피포브로만; 가시토신; 아라비노시드 ("Ara-C"); 사이클로포스파미드; 티오테파; 클로르암부실; 젬시타빈; 6-티오구아닌; 머캅토퓨린; 메토트렉세이트; 에토포시드 (VP-16); 이포스파미드; 미토마이신 C; 미톡산트론; 빈크리스틴; 비노렐빈; 나벨빈; 노반트론; 테니포시드; 다우노마이신; 아미노프테린; 젤로다; 이반드로네이트; CPT-11; 레티노산; 에스페라마이신; 카페시타빈; 및 토포이소머라제 억제제, 예컨대 이리노테칸을 포함한다. 상기 중 임의의 약제학적으로 허용 가능한 염, 산 또는 유도체가 또한 사용될 수 있다. In some instances, a growth factor trap construct described herein is administered in conjunction with one or more chemotherapeutic agents. Examples of chemotherapeutic agents include, but are not limited to, alkylating agents such as thiotepa and cyclophosphamide ( CYTOXAN® ); alkyl sulfonates such as busulfan, improsulfan and piposulfan; androgens such as calosterone, dromostanolone propionate, epithiostanol, mepitiostane, and testolactone; antiadrenergics such as aminoglutethimide, mitotane, and trilostane; anti-androgens such as flutamide, nilutamide, bicalutamide, leuprolide, and goserelin; Antibiotics such as aclasinomycin, actinomycin, anthramycin, azaserin, bleomycin, cactinomycin, calicheamicin, carubicin, carminomycin, carzinophylline, chromomycin, dactinomycin, daunol Bicin, detorubicin, 6-diazo-5-oxo-L-norleucine, doxorubicin, epirubicin, esorubicin, idarubicin, marcellomycin, mitomycin, mycophenolic acid, nogalamycin, olibomycin , peplomycin, porphyromycin, puromycin, quelamycin, rodorubicin, streptonigryn, streptozocin, tubersidin, ubenimex, ginostatin, and zorubicin; For example, tamoxifen, raloxifene, aromatase inhibitor 4(5)-imidazole, 4-hydroxytamoxifen, trioxifene, kenoxyfen, LY 117018, onapristone, and toremifene (Pareston) estrogen; anti-metabolites such as methotrexate and 5-fluorouracil (5-FU); folic acid analogs such as denopterin, methotrexate, pteropterin, and trimetrexate; aziridines such as benzodepa, carboquone, meturedepa, and uredepa; ethylenimine and methylmelamine, including altretamine, triethylenemelamine, triethylenephosphoramide, triethylenethiophosphoramide and trimethylolmelamine; folic acid supplements such as folinic acid; Nitrogen mustards such as chlorambucil, chlornaphazine, chlorophosphamide, estramustine, ifosfamide, mechlorethamine, mechlorethamine oxide hydrochloride, melphalan, nobemvicine, phenesterine, prednimu Steen, Trophosphamide, and Uracil Mustard; nitrosoureas such as carmustine, chlorozotocin, fotemustine, lomustine, nimustine, and ranimustine; platinum analogs such as cisplatin and carboplatin; vinblastine; platinum; proteins such as arginine deiminase and asparaginase; purine analogs such as fludarabine, 6-mercaptopurine, thiamiprine, and thioguanine; pyrimidine analogs such as ancitabine, azacitidine, 6-azauridine, camofur, cytarabine, dideoxyuridine, doxifuridine, enocitabine, floxuridine, and 5-FU; taxanes such as paclitaxel ( TAXOL® , Bristol-Myers Squibb Oncology, Princeton, NJ) and docetaxel ( TAXOTERE® , Rhone-Poulenc Rorer, Antony, France); topoisomerase inhibitors such as RFS 2000; thymidylate synthase inhibitors such as Tomudex; additional chemotherapeutic agents including aceglatone; aldophosphamide glycoside; aminolevulinic acid; amsacrine; bestrabucil; bisantrene; dedatrexate; dephosphamide; demecolsine; diaziquone; difluoromethylornithine (DMFO); eplonithine; elliptinium acetate; Etogluside; gallium nitrate; hydroxyurea; lentinan; Ronidamine; mitoguazone; mitoxantrone; furdamole; nitracrine; pentostatin; phenamet; pirarubicin; pophyllic acid; 2-ethylhydrazide; procarbazine; PSK® ; Razoxic acid; sizopyran; spirogermanium; tenuazinic acid; triaziquone; 2,2′,2″-trichlorotriethylamine; urethane; vindesine; dacarbazine; mannomustine; mitobronitol; mitolactol; pipobroman; gastosine; arabinoside (“Ara-C”); cyclophosphamide; thiotepa; chlorambucil; gemcitabine; 6-thioguanine; mercaptopurine; methotrexate; etoposide (VP-16); ifosfamide; mitomycin C; mitoxantrone; vincristine; vinorelbine; navelbine; novanthrone; teniposide; daunomycin; aminopterin; xeloda; ibandronate; CPT-11; retinoic acid; esperamycin; capecitabine; and topoisomerase inhibitors; eg irinotecan Pharmaceutically acceptable salts, acids or derivatives of any of the above may also be used.
화학요법제는 전구약물로서 투여될 수 있다. 본 명세서에 기재된 성장 인자 트랩 작제물과 함께 투여될 수 있는 전구약물의 예는 예를 들어, 포스페이트 함유 전구약물, 티오포스페이트 함유 전구약물, 설페이트 함유 전구약물, 펩티드 함유 전구약물, D-아미노산 변형된 전구약물, 글리코실화된 전구약물, 베타-락탐 함유 전구약물, 선택적으로 치환된 페녹시 아세트아미드 함유 전구약물, 또는 선택적으로 치환된 페닐아세트아미드 함유 전구약물, 및 5-플루오로시토신 및 5-플루오로시토신 및 보다 활성인 세포독성 유리 약물로 전환될 수 있는 다른 5-플루오로우리딘 전구약물을 포함하지만 이에 제한되지 않는다. Chemotherapeutic agents can be administered as prodrugs. Examples of prodrugs that can be administered with the growth factor trap constructs described herein include, for example, phosphate-containing prodrugs, thiophosphate-containing prodrugs, sulfate-containing prodrugs, peptide-containing prodrugs, D-amino acid modified prodrugs, glycosylated prodrugs, prodrugs containing beta-lactams, prodrugs containing optionally substituted phenoxy acetamides, or prodrugs containing optionally substituted phenylacetamides, and 5-fluorocytosine and 5-fluoro rocytosine and other 5-fluorouridine prodrugs that can be converted to more active cytotoxic free drugs.
일부 예에서, 본 명세서에 기재된 다중특이적 성장 인자 트랩 작제물은 하나 이상의 면역조절 제제와 함께 투여된다. 그러한 제제는 하나 이상의 사이토카인의 생산을 증가 또는 감소시킬 수 있고, 자가 항원 제시를 상향 또는 하향 조절하거나, MHC 항원을 차폐하거나, 하나 이상의 유형의 면역 세포의 증식, 분화, 이동 또는 활성화를 촉진할 수 있다. 면역조절 제제의 예는 비-스테로이드성 항-염증성 약물 (NSAID), 예컨대 아스피린, 이부프로펜, 셀레콕십, 디클로페낙, 에토돌락, 페노프로펜, 인도메타신, 케토록락, 옥사프로진, 나부메톤, 설린닥, 톨메틴, 로페콕십, 나프록센, 케토프로펜, 및 나부메톤; 스테로이드, 예컨대 글루코코르티코이드, 덱사메타손, 코르티손, 하이드록시코르티손, 메틸프레드니솔론, 프레드니손, 프레드니솔론 및 트리암시놀론; 에이코사노이드, 예컨대 프로스타글란딘, 트롬복산, 및 류코트리엔; 국소 스테로이드, 예컨대 안트랄린, 칼시포트리엔, 클로베타솔, 및 타자로텐; 사이토카인, 예컨대 TGFβ, IFNα, IFNβ, IFNγ, IL-2, IL-4, IL-10; 사이토카인, 케모카인, 또는 BAFF, B7, CCR2, CCR5, CD2, CD3, CD4, CD6, CD7, CD8, CD11, CD14, CD15, CD17, CD18, CD20, CD23, CD28, CD40, CD40L, CD44, CD45, CD52, CD64, CD80, CD86, CD147, CD152, 보체 인자 (C5, D) CTLA-4, 에오탁신, Fas, ICAM, ICOS, IFNα, IFNβ, IFNγ, IFNAR, IgE, IL-1, IL-2, IL-2R, IL-4, IL-5R, IL-6, IL-8, IL-9 IL-12, IL-13, IL-13R1, IL-15, IL-18R, IL-23, 인테그린, LFA-1, LFA-3, MHC, 셀렉틴, TGFβ, TNFα, TNFβ, TNFR1, TNFR2, 및 T-세포 수용체에 대한 항체, 가용성 수용체, 및 수용체-Fc 융합을 포함하는 수용체 길항제 (이는 에타네르셉트 (Enbrel®), 아달리무맙 (Humira®), 및 인플릭시맙 (Remicade®)를 포함함); 이종성 항-림프구 글로불린; 및 다른 면역조절 분자, 예컨대 2-아미노-6-아릴-5 치환된 피리미딘, MHC 결합 펩티드 및 MHC 단편을 위한 항-개체특이형 항체, 아자티오프린, 브레퀴나르, 브로모크립틴, 사이클로포스파미드, 사이클로스포린 A, D-페니실아민, 데옥시스페르구알린, FK506, 글루타르알데하이드, 금, 하이드록시클로로퀸, 레플루노마이드, 말로노니트릴로아미드 (예를 들어, 레플루노마이드), 메토트렉세이트, 미노사이클린, 미조리빈, 마이코페놀레이트 모페틸, 라파마이신, 및 설파살라진을 포함하지만 이에 제한되지 않는다. In some instances, multispecific growth factor trap constructs described herein are administered with one or more immunomodulatory agents. Such agents may increase or decrease the production of one or more cytokines, up- or down-regulate self antigen presentation, mask MHC antigens, or promote the proliferation, differentiation, migration, or activation of one or more types of immune cells. can Examples of immunomodulatory agents are non-steroidal anti-inflammatory drugs (NSAIDs) such as aspirin, ibuprofen, celecoxib, diclofenac, etodolac, fenoprofen, indomethacin, ketorolac, oxaprozin, nabumetone , sulindac, tolmetin, rofecoxib, naproxen, ketoprofen, and nabumetone; steroids such as glucocorticoids, dexamethasone, cortisone, hydroxycortisone, methylprednisolone, prednisone, prednisolone and triamcinolone; eicosanoids such as prostaglandins, thromboxanes, and leukotrienes; topical steroids such as anthralin, calcipotriene, clobetasol, and tazarotene; cytokines such as TGFβ, IFNα, IFNβ, IFNγ, IL-2, IL-4, IL-10; cytokines, chemokines, or BAFF, B7, CCR2, CCR5, CD2, CD3, CD4, CD6, CD7, CD8, CD11, CD14, CD15, CD17, CD18, CD20, CD23, CD28, CD40, CD40L, CD44, CD45, CD52, CD64, CD80, CD86, CD147, CD152, Complement Factor (C5, D) CTLA-4, Eotaxin, Fas, ICAM, ICOS, IFNα, IFNβ, IFNγ, IFNAR, IgE, IL-1, IL-2, IL-2R, IL-4, IL-5R, IL-6, IL-8, IL-9 IL-12, IL-13, IL-13R1, IL-15, IL-18R, IL-23, integrin, LFA -1, LFA-3, MHC, selectin, TGFβ, TNFα, TNFβ, TNFR1, TNFR2, and antibodies to T-cell receptors, soluble receptors, and receptor antagonists, including receptor-Fc fusions (which include etanercept (Enbrel ® ), including adalimumab (Humira ® ), and infliximab (Remicade ® ); heterologous anti-lymphocyte globulin; and other immunomodulatory molecules such as 2-amino-6-aryl-5 substituted pyrimidines, anti-substitute antibodies for MHC binding peptides and MHC fragments, azathioprine, brequinar, bromocriptine, cyclo Phosphamide, cyclosporine A, D-penicylamine, deoxyspergualine, FK506, glutaraldehyde, gold, hydroxychloroquine, leflunomide, malononitriloamide (e.g. leflunomide ), methotrexate, minocycline, mizoribine, mycophenolate mofetil, rapamycin, and sulfasalazine.
일부 예에서, 본 명세서에 기재된 다중특이적 성장 인자 트랩 작제물은 하나 이상의 사이토카인과 함께 투여된다. 사이토카인의 예는 림포카인, 모노카인 및 기존의 폴리펩티드 호르몬을 포함하지만 이에 제한되지 않는다. 사이토카인 중에는 인터페론, 예컨대 인터페론-알파, -베타, 및 -감마; 집락 자극 인자 (CSFs), 예컨대 대식세포-CSF (M-CSF), 과립구-대식세포-CSF (GM-CSF), 및 과립구-CSF (G-CSF); 인터류킨 (ILs), 예컨대 IL-1, IL-1알파, IL-2, IL-3, IL-4, IL-5, IL-6, IL-7, IL-8, IL-9, IL-10, IL-11, IL-12 및 IL-15; 종양 괴사 인자, 예컨대 TNF-알파 또는 TNF-베타; 및 키트 리간드(KL)를 비롯한 다른 폴리펩티드 인자가 있다. In some examples, multispecific growth factor trap constructs described herein are administered in conjunction with one or more cytokines. Examples of cytokines include, but are not limited to, lymphokines, monokines, and conventional polypeptide hormones. Among the cytokines are interferons such as interferon-alpha, -beta, and -gamma; colony stimulating factors (CSFs) such as macrophage-CSF (M-CSF), granulocyte-macrophage-CSF (GM-CSF), and granulocyte-CSF (G-CSF); Interleukins (ILs), such as IL-1, IL-1alpha, IL-2, IL-3, IL-4, IL-5, IL-6, IL-7, IL-8, IL-9, IL-10 , IL-11, IL-12 and IL-15; tumor necrosis factors such as TNF-alpha or TNF-beta; and other polypeptide factors including kit ligand (KL).
일부 예에서, 본 명세서에 기재된 다중특이적 성장 인자 트랩 작제물은 하나 이상의 사이토카인 또는 면역계의 세포를 자극하고 원하는 이펙터 기능(들)을 강화시키는 다른 제제와 함께 투여된다. 예를 들어, IL-2를 포함하나 이에 제한되지 않는 자연 살해(NK) 세포를 자극하는 제제는 본 명세서에 기재된 다중특이적 성장 인자 트랩 작제물과 함께 투여될 수 있다. 또 다른 구현예에서, C5a, 및 N-포르밀-메티오닐-류실-페닐알라닌과 같은 포르밀 펩티드를 포함하나 이에 제한되지 않는 대식세포를 자극하는 제제(예를 들어, 문헌[Beigier-Bompadre 등 (2003) Scand . J. Immunol. 57:221-228] 참조)는, 본 명세서에 기재된 다중특이적 성장 인자 트랩 작제물과 함께 투여될 수 있다. G-CSF 및 GM-CSF를 포함하나 이에 제한되지 않는 호중구를 자극하는 제제는 또한 본 명세서에 기재된 다중특이적 성장 인자 트랩 작제물과 함께 투여될 수 있다. 이러한 면역자극성 사이토카인의 이동을 촉진하는 제제는 본 명세서에 기재된 다중특이적 성장 인자 트랩 작제물과 함께 투여될 수 있다. 추가 제제는 하나 이상의 이펙터 기능을 촉진할 수 있는 인터페론 감마, IL-3 및 IL-7을 포함하나 이에 제한되지 않는다. 일부 예에서, 본 명세서에 기재된 다중특이적 성장 인자 트랩 작제물은 이펙터 세포 기능을 억제하는 하나 이상의 사이토카인 또는 다른 제제와 함께 투여된다. In some instances, multispecific growth factor trap constructs described herein are administered in conjunction with one or more cytokines or other agents that stimulate cells of the immune system and enhance desired effector function(s). For example, agents that stimulate natural killer (NK) cells, including but not limited to IL-2, can be administered with the multispecific growth factor trap constructs described herein. In another embodiment, agents that stimulate macrophages, including but not limited to C5a, and formyl peptides such as N-formyl-methionyl-leucyl-phenylalanine (see, for example, Beigier-Bompadre et al. (2003) Scand . J. Immunol . 57:221-228) can be administered with the multispecific growth factor trap constructs described herein. Agents that stimulate neutrophils, including but not limited to G-CSF and GM-CSF, can also be administered with the multispecific growth factor trap constructs described herein. Agents that promote the transport of these immunostimulatory cytokines can be administered with the multispecific growth factor trap constructs described herein. Additional agents include, but are not limited to, interferon gamma, IL-3 and IL-7, which can promote one or more effector functions. In some instances, multispecific growth factor trap constructs described herein are administered with one or more cytokines or other agents that inhibit effector cell function.
일부 예에서, 본 명세서에 기재된 다중특이적 성장 인자 트랩 작제물은 아미노글리코시드 항생제 (예를 들어, 아프라마이신, 아베카신, 밤베르마이신, 부티로신, 디베카신, 겐타마이신, 카나마이신, 네오마이신, 네틸마이신, 파로모마이신, 리보스타마이신, 시소마이신, 및 스펙티노마이신), 아미노사이클리톨 (예를 들어, 스펙티노마이신), 암페니콜 항생제 (예를 들어, 아지드암페니콜, 클로르암페니콜, 플로르페니콜, 및 티암페니콜), 안사마이신 항생제 (예를 들어, 리파미드 및 리팜핀), 케바페넴 (예를 들어, 이미페넴, 메로페넴, 및 파니페넴), 세팔로스포린 (예를 들어, 세파클로르, 세파드록실, 세파만돌, 세파트리진, 세파제돈, 세포조프란, 세프피미졸, 세프피라마이드, 세프피롬, 세프프로질, 세푸록심, 세픽심, 세팔렉신, 및 세프라딘), 세파마이신 (예를 들어, 세프부페라존, 세폭시틴, 세프미녹스, 세프메타졸, 및 세포테탄), 린코사마이드 (예를 들어, 클린다마이신, 및 린코마이신), 매크롤라이드 (예를 들어, 아지트로마이신, 브레펠딘 A, 클라리트로마이신, 에리트로마이신, 록시트로마이신, 및 토브라마이신), 모노박탐 (예를 들어, 아즈트레오남, 카루모남, 및 티게모남), 무피로신, 옥사세펨 (예를 들어, 플로목세프, 라타목세프, 및 목살락탐), 페니실린 (예를 들어, 암디노실린, 암디노실린 피복실, 아목시실린, 바캄피실린, 벤질페니실린난, 벤질페니실린 나트륨, 에피실린, 펜베니실린, 플록사실린, 페나메실린, 페네타메이트 하이드리오다이드, 페니실린 o-베네타민, 페니실린 O, 페니실린 V, 페니실린 V 벤조에이트, 페니실린 V 하이드라바민, 페니메피사이클린, 및 페네티실린 칼륨), 폴리펩티드 (예를 들어, 바시트라신, 콜리스틴, 폴리믹신 B, 테이코플라닌, 및 반코마이신), 퀴놀론 (예를 들어, 아미플록사신, 시녹사신, 시프로플록사신, 에녹사신, 엔로플록사신, 플레록사신, 플루메퀸, 가티플록사신, 제미플록사신, 그레파플록사신, 로메플록사신, 목시플록사신, 날리딕스산, 노르플록사신, 오플록사신, 옥솔린산, 페플록사신, 피페미드산, 로속사신, 루플록사신, 스파르플록사신, 테마플록사신, 토서플록사신, 및 트로바플록사신), 리팜핀, 스트렙토그라민 (예를 들어, 퀴누프리스틴, 및 탈포프리스틴), 설폰아미드 (예를 들어, 설파닐아미드, 및 설파메톡사졸), 및 테트라사이클린 (예를 들어, 클로르테트라사이클린, 데메클로사이클린 하이드로클로라이드, 탈메틸클로르테트라사이클린, 독시사이클린, 듀라마이신, 미노사이클린, 네오마이신, 옥시테트라사이클린, 스트렙토마이신, 테트라사이클린, 및 반코마이신)을 포함하지만 이에 제한되지 않는 하나 이상의 항생제와 함께 투여된다. In some instances, the multispecific growth factor trap constructs described herein are aminoglycoside antibiotics (e.g., apramycin, abecacin, bambermycin, butyrosine, dibecacin, gentamicin, kanamycin, neo amycin, netylmycin, paromomycin, ribostamycin, sisomycin, and spectinomycin), aminocyclitols (e.g. spectinomycin), amphenicol antibiotics (e.g. azideamphenicol, chloramphenicol, florphenicol, and thiamphenicol), ansamycin antibiotics (e.g., lipamide and rifampin), carbapenems (e.g., imipenem, meropenem, and panipenem), cephalosporins (e.g., cefaclor, cefadroxil, cefamandole, ceftrizine, cefazedone, cefozofran, ceffimizole, cefpyramide, cefpyrom, cefprozil, cefuroxime, cefixim, cefalexin, and cefradine), cefamycins (e.g., cefbuperazone, cefoxitin, cefminox, cefmetazole, and cefotetan), lincosamides (e.g., clindamycin, and lincomycin), macrole rides (e.g., azithromycin, brefeldin A, clarithromycin, erythromycin, roxithromycin, and tobramycin), monobactams (e.g., aztreonam, carumonam, and tigemonam); Mupirocin, oxacephem (e.g., plomoxef, latamoxef, and moxalactam), penicillins (e.g., amdinocillin, amdinocillin pyroxyl, amoxicillin, bacampicillin, benzylpenicillinnan, Benzylpenicillin sodium, epicillin, penbenicillin, floxacillin, phenamecillin, phenetamate hydriodide, penicillin o-benetamine, penicillin O, penicillin V, penicillin V benzoate, penicillin V hydrabamine, penicillin mepiccycline, and phenethicillin potassium), polypeptides (e.g., bacitracin, colistin, polymyxin B, teicoplanin, and vancomycin), quinolones (e.g., amifloxacin, cinoxacin, ciprofloxacin) , enoxacin, enrofloxacin, floxacin, flumequin, gatifloxacin, gemifloxacin, grepafloxacin, lomefloxacin, moxifloxacin, nalidixic acid, norfloxacin, ofloxacin, oxol phosphoric acid, pefloxacin, pipemidic acid, losoxacin, lufloxacin, sparfloxacin, temafloxacin, tosofloxacin, and trovafloxacin), rifampin, streptogramins (e.g., quinupristine, and defopristine), sulfonamides (e.g., sulfanilamide, and sulfamethoxazole), and tetracyclines (e.g., chlortetracycline, demeclocycline hydrochloride, demethylchlortetracycline, doxycycline, durama isin, minocycline, neomycin, oxytetracycline, streptomycin, tetracycline, and vancomycin).
일부 예에서, 본 명세서에 제공되는 다중특이적 성장 인자 트랩 작제물은 암포테리신 B, 사이클로피록스, 클로트리마졸, 에코나졸, 플루코나졸, 플루시토신, 이트라코나졸, 케토코나졸, 미코나졸, 나이스타틴, 테르비나핀, 테르코나졸, 및 티오코나졸 을 포함하지만 이에 제한되지 않는 하나 이상의 항진균제와 함께 투여된다. In some examples, multispecific growth factor trap constructs provided herein include amphotericin B, cyclopyrox, clotrimazole, econazole, fluconazole, flucytosine, itraconazole, ketoconazole, miconazole, nystatin, ter It is administered with one or more antifungal agents including, but not limited to, binafine, terconazole, and thioconazole.
일부 예에서, 본 명세서에 기재된 다중특이적 성장 인자 트랩 작제물은 프로테아제 억제제, 역전사효소 억제제, 및 I형 인터페론, 바이러스 융합 억제제, 뉴라미니다제 억제제, 아사이클로비르, 아데포비르, 아만타딘, 암프레나비르, 클레부딘, 엔푸비르타이드, 엔테카비르, 포스카르네트, 강시클로비르, 이독수리딘, 인디나비르, 로피나비르, 플레코나릴, 리바비린, 리만타딘, 리토나비르, 사퀴나비르, 트리플루리딘, 비다라빈, 및 지도부딘을 포함하는 기타를 포함하지만 이에 제한되지 않는 하나 이상의 항바이러스제와 함께 투여된다. In some examples, the multispecific growth factor trap constructs described herein are protease inhibitors, reverse transcriptase inhibitors, and type I interferons, viral fusion inhibitors, neuraminidase inhibitors, acyclovir, adefovir, amantadine, cancer Prenavir, clevudine, enfuvirtide, entecavir, foscarnet, ganciclovir, idoxuridine, indinavir, lopinavir, fleconaril, ribavirin, rimantadine, ritonavir, saquinavir, trifluri Administered with one or more antiviral agents including, but not limited to, others including, but not limited to, din, vidarabine, and zidovudine.
본 명세서에 제공되는 다중특이적 성장 인자 트랩 작제물은 다른 치료 레지멘과 조합될 수 있다. 예를 들어, 한 구현예에서, 본 명세서에 제공된 다중특이적 성장 인자 트랩 작제물로 치료될 환자는 방사선 요법을 받을 수 있다. 방사선 요법은 당업계에서 통상적으로 이용되고 당업자에게 공지된 프로토콜에 따라 투여될 수 있다. 이러한 요법에는 세슘, 이리듐, 요오드 또는 코발트 방사선이 포함되나 이에 제한되지 않는다. 방사선 요법은 전신 조사일 수 있거나 폐, 방광 또는 전립선과 같은 신체 내부 또는 신체 상의 특정 부위 또는 조직에 국소적으로 지향될 수 있다. 방사선 요법은 또한 항체와 같은 동위원소 표지 분자를 사용한 치료를 포함할 수 있다. 방사면역치료제의 예는 상표명 Zevalin® (Y-90 표지된 항-CD20), LymphoCide® (Y-90 표지된 항-CD22), 및 Bexxar® (I-131 표지된 항-CD20)로 판매되는 것을 포함한다. Multispecific growth factor trap constructs provided herein can be combined with other treatment regimens. For example, in one embodiment, a patient to be treated with a multispecific growth factor trap construct provided herein may undergo radiation therapy. Radiation therapy can be administered according to protocols commonly used in the art and known to those skilled in the art. Such therapy includes, but is not limited to, cesium, iridium, iodine or cobalt radiation. Radiation therapy can be systemic or directed locally to a specific area or tissue on or within the body, such as the lungs, bladder or prostate. Radiation therapy may also include treatment with isotopically labeled molecules such as antibodies. Examples of radioimmunotherapeutic agents are those sold under the tradenames Zevalin ® (anti-CD20 labeled Y-90), LymphoCide ® (anti-CD22 labeled Y-90), and Bexxar ® (anti-CD20 labeled I-131). include
전형적으로, 방사선 요법은 약 1 내지 2주에 걸쳐 펄스로 투여된다. 그러나 방사선 요법은 장기간에 걸쳐 투여될 수 있다. 예를 들어, 방사선 요법은 약 6 내지 약 7주 동안 두경부암 환자에게 투여될 수 있다. 선택적으로, 방사선 요법은 단일 용량 또는 다중 순차적 용량으로 투여될 수 있다. 숙련된 의료 종사자는 본 명세서에서 유용한 방사선 요법의 적절한 용량 또는 용량들을 경험적으로 결정할 수 있다. 일부 예에서, 다중특이적 성장 인자 트랩 작제물 및 선택적으로 하나 이상의 다른 항암 요법이 생체외 암 세포를 치료하기 위해 이용된다. 이러한 생체외 치료는 골수 이식, 특히 자가 골수 이식에 유용할 수 있다고 생각된다. 예를 들어, 암 세포를 함유하는 세포 또는 조직(들)을 다중특이적 성장 인자 트랩 작제물 및 본 명세서에 기재된 바와 같은 하나 이상의 항암 요법으로 처리하여 수령체에게 이식하기 전에 암 세포를 고갈시키거나 실질적으로 고갈시킬 수 있다. Typically, radiation therapy is administered in pulses over about 1 to 2 weeks. However, radiation therapy can be administered over an extended period of time. For example, radiation therapy can be administered to patients with head and neck cancer for about 6 to about 7 weeks. Optionally, radiation therapy can be administered as a single dose or multiple sequential doses. A skilled medical practitioner can empirically determine the appropriate dose or doses of radiation therapy useful herein. In some instances, a multispecific growth factor trap construct and optionally one or more other anti-cancer therapies are used to treat cancer cells ex vivo. It is believed that such an ex vivo treatment may be useful for bone marrow transplantation, particularly autologous bone marrow transplantation. For example, treatment of cell or tissue(s) containing cancer cells with a multispecific growth factor trap construct and one or more anti-cancer therapies as described herein to deplete cancer cells prior to transplantation into a recipient; can be practically exhausted.
또한, 본 명세서에 제공된 다중특이적 성장 인자 트랩 작제물은 수술 또는 광선 요법과 같은 다른 치료 기술과 함께 환자 또는 대상체에게 투여될 수 있음이 고려된다. It is also contemplated that the multispecific growth factor trap constructs provided herein may be administered to a patient or subject in conjunction with other treatment techniques such as surgery or phototherapy.
예를 들어, 본 명세서에 제공된 임의의 다중특이적 성장 인자 트랩 작제물, 핵산 분자, 또는 약제학적 조성물을 또 다른 항암제와 조합하여 투여함으로써 암을 치료하는 방법이 본 명세서에 제공된다. 항암제는 방사선 및/또는 화학요법제를 포함할 수 있다. 예를 들어, 항암제는 티로신 키나제 억제제 또는 항체일 수 있다. 예시적인 항암제는 퀴나졸린 키나제 억제제, 안티센스 또는 siRNA 또는 다른 이중 가닥 RNA 분자, HER 패밀리 수용체와 상호작용하는 항체, 및 방사성핵종에 접합된 항체, 또는 세포독소를 포함한다. 다른 예시적인 항암제는 게피티닙, 라파티닙, 에롤티닙, 파니투무맙, 세툭시맙, 트라스투주맙, 이마티닙, 백금 착물 또는 뉴클레오시드 유사체를 포함한다. 세포독성제 또는 화학요법제의 예는 예를 들어 탁산 (예컨대 파클리탁셀 및 도세탁셀) 및 안트라사이클린 항생제, 독소루비신/아드리아마이신, 카르미노마이신, 다우노루비신, 아미노프테린, 메토트렉세이트, 메토프테린, 디클로로-메토트렉세이트, 미토마이신 C, 포르피로마이신, 5-플루오로우라실, 6-머캅토퓨린, 시토신 아라비노시드, 포도필로톡신, 또는 포도필로토신 유도체, 예컨대 에토포시드 또는 에토포시드 포스페이트, 멜팔란, 빈블라스틴, 빈크리스틴, 류로시딘, 빈데신, 류노시든, 메이탄시놀, 에포틸론 A 또는 B, 탁소테르, 탁솔, 에스트라무스틴, 시스플라틴, 콤브레타스타틴 및 유사체, 및 사이클로포스파미드를 포함한다. 본 명세서의 다른 곳에 기재되거나 당업계에 공지된 임의의 다른 항암 항체 및 화학요법제는 또한 본 명세서에 제공되는 다중특이적 성장 인자 트랩 작제물, 핵산 분자, 또는 약제학적 조성물과 조합하여 암 치료에 사용하기 위해 고려된다. Provided herein are methods of treating cancer, eg, by administering any of the multispecific growth factor trap constructs, nucleic acid molecules, or pharmaceutical compositions provided herein in combination with another anti-cancer agent. Anti-cancer agents may include radiation and/or chemotherapeutic agents. For example, the anti-cancer agent may be a tyrosine kinase inhibitor or antibody. Exemplary anti-cancer agents include quinazoline kinase inhibitors, antisense or siRNA or other double-stranded RNA molecules, antibodies that interact with HER family receptors, and antibodies conjugated to radionuclides, or cytotoxins. Other exemplary anticancer agents include gefitinib, lapatinib, eroltinib, panitumumab, cetuximab, trastuzumab, imatinib, platinum complexes or nucleoside analogs. Examples of cytotoxic or chemotherapeutic agents include, for example, taxanes (such as paclitaxel and docetaxel) and anthracycline antibiotics, doxorubicin/adriamycin, carminomycin, daunorubicin, aminopterin, methotrexate, methopterin, dichloro- methotrexate, mitomycin C, porphyromycin, 5-fluorouracil, 6-mercaptopurine, cytosine arabinoside, podophyllotoxin, or podophyllotoxin derivatives such as etoposide or etoposide phosphate, melphalan, vinblastine, vincristine, leucidine, vindesine, leunociden, maytansinol, epothilone A or B, taxotere, taxol, estramustine, cisplatin, combretastatin and analogues, and cyclophospha contains mead. Any other anticancer antibody and chemotherapeutic agent described elsewhere herein or known in the art may also be used in combination with a multispecific growth factor trap construct, nucleic acid molecule, or pharmaceutical composition provided herein to treat cancer. considered for use.
또 다른 예에서, 본 명세서에 제공된 임의의 다중특이적 성장 인자 트랩 작제물, 핵산 분자, 또는 약제학적 조성물을 또 다른 항-류마티스성 약물, 예컨대 항-TNF 요법와 조합하여 투여함으로써 류마티스성 관절염 (RA)을 치료하는 방법이 본 명세서에 제공된다. 본 명세서에 제공된 다중특이적 성장 인자 트랩 작제물, 핵산 분자 또는 약제학적 조성물과 조합하여 사용될 수 있는 항-TNF 요법의 예는 예를 들어, 종래의 합성 DMARD, 예를 들어 메토트렉세이트 (MTX), 하이드록시클로로퀸 (HCQ; Plaquenil®), 설파살라진 (Azulfidine®), 및 레플루노마이드 (Arava®); 생물학적 DMARD, 예를 들어, 아바타셉트 (Orencia®), 아나킨라 (Kineret®), 리툭시맙 (Rituxan®, Truxima®, MabThera®), 토실리주맙 (아틀리주맙, Actemra®, RoActemra®), 코르티코스테로이드 (예를 들어, 덱사메타손, 메틸프레드니솔론, 프레드니솔론, 프레드니손, 또는 트리암시놀론), 토파시티닙 (Xeljanz®), 및 TNF-억제제/항-TNF 제제, 예를 들어, 세르톨리주맙 페골 (Cimzia®), 인플릭시맙 (Remicade®), 아달리무맙 (Humira®), 골리무맙 (Simponi®), 및 에타네르셉트 (Enbrel®)을 포함한다. 병용 요법은 또한 면역치료 약물, 예를 들어, 사이클로스포린, 메토트렉세이트, 아드리아마이신 또는 시스플라티넘, 및 면역독소를 포함할 수 있다. In another example, rheumatoid arthritis (RA) is treated by administering any multispecific growth factor trap construct, nucleic acid molecule, or pharmaceutical composition provided herein in combination with another anti-rheumatic drug, such as an anti-TNF therapy. ) is provided herein. Examples of anti-TNF therapies that can be used in combination with the multispecific growth factor trap constructs, nucleic acid molecules or pharmaceutical compositions provided herein include, for example, conventional synthetic DMARDs such as methotrexate (MTX), hydrochloride oxychloroquine (HCQ; Plaquenil ® ), sulfasalazine (Azulfidine ® ), and leflunomide (Arava ® ); Biological DMARDs such as abatacept ( Orencia® ), anakinra ( Kineret® ), rituximab ( Rituxan® , Truxima® , MabThera® ), tocilizumab (atlizumab, Actemra® , RoActemra® ), corticosteroids steroids (e.g. dexamethasone, methylprednisolone, prednisolone, prednisone, or triamcinolone), tofacitinib ( Xeljanz® ), and TNF-inhibitor/anti-TNF agents such as certolizumab pegol ( Cimzia® ); infliximab ( Remicade® ), adalimumab ( Humira® ), golimumab ( Simponi® ), and etanercept ( Enbrel® ). Combination therapy may also include an immunotherapeutic drug such as cyclosporine, methotrexate, adriamycin or cisplatinum, and an immunotoxin.
또한 본 명세서에 기재된 다중특이적 성장 인자 트랩 작제물 중 임의의 것을 본 명세서에 제공된 TNFR1 길항제, TNFR2 효능제, 또는 이중특이적 TNFR1 길항제/TNFR2 효능제 작제물 중 임의의 것과 함께 투여하여 본 명세서의 다른 곳에 기재된 만성 염증성, 자가면역, 신경퇴행 및/또는 탈수초 질환, 특히 RA의 치료 치료 방법이 본 명세서에 제공된다. 선택적으로, 추가의 항-TNF 요법, 예컨대 메토트렉세이트, 또는 상기 또는 본 명세서의 다른 곳에 기재되거나 당업계에 알려진 임의의 것은, 또한 만성 염증성, 자가면역, 신경퇴행 및/또는 탈수초 질환의 치료에 유용한 임의의 다른 요법, 예컨대 면역억제제, 항-혈관형성 제제, 심장보호제, 항체, 세포독성제, 항-염증제, 사이토카인, 성장 억제제, 화학요법제, 생물학적 또는 비-생물학적 질환 변형 항-류마티스성 약물 (DMARD), 감염성 질환을 위한 치료제 (항체 포함), 또는 본 명세서에 기재되거나 당업계에 공지된 다른 적합한 치료제와 같이 투여될 수 있다. In addition, any of the multispecific growth factor trap constructs described herein may be administered with any of the TNFR1 antagonist, TNFR2 agonist, or bispecific TNFR1 antagonist/TNFR2 agonist constructs provided herein to Provided herein are methods for the treatment of chronic inflammatory, autoimmune, neurodegenerative and/or demyelinating diseases, particularly RA, described elsewhere. Optionally, an additional anti-TNF therapy, such as methotrexate, or any described above or elsewhere herein or known in the art, is also useful in the treatment of chronic inflammatory, autoimmune, neurodegenerative and/or demyelinating diseases. Any other therapy, such as immunosuppressive agents, anti-angiogenic agents, cardioprotective agents, antibodies, cytotoxic agents, anti-inflammatory agents, cytokines, growth inhibitory agents, chemotherapeutic agents, biological or non-biological disease modifying anti-rheumatic drugs (DMARDs), therapeutic agents (including antibodies) for infectious diseases, or other suitable therapeutic agents described herein or known in the art.
혈관형성은 RA에서 판누스의 형성 및 유지에 중요한 역할을 한다. 본 명세서에 제공되는 다중특이적 성장 인자 트랩 작제물은 혈관형성을 조절하기 위해 다른 치료와 함께 사용될 수 있다. 예를 들어, 혈관형성 억제제는 RA를 치료하기 위해 본 명세서에 제공된 다중특이적 성장 인자 트랩 작제물과 함께 사용될 수 있다. 예시적인 혈관형성 억제제는 안지오스타틴, 항혈관형성 항트롬빈 III, 칸스타틴, 연골 유래된 억제제, 피브로넥틴 단편, IL-12, 바스쿨로스타틴, 및 당업계에 공지되고 본 명세서의 다른 곳에 기재된 기타를 포함하지만 이에 제한되지 않는다.Angiogenesis plays an important role in the formation and maintenance of the pannus in RA. Multispecific growth factor trap constructs provided herein can be used in conjunction with other treatments to modulate angiogenesis. For example, angiogenesis inhibitors can be used in conjunction with the multispecific growth factor trap constructs provided herein to treat RA. Exemplary angiogenesis inhibitors include angiostatin, antiangiogenic antithrombin III, canstatin, cartilage derived inhibitor, fibronectin fragment, IL-12, baculostatin, and others known in the art and described elsewhere herein. However, it is not limited thereto.
일부 구현예에서, 본 명세서에 제공된 성장 인자 트랩 작제물은 TNF 차단제 및/또는 다른 DMARD, 예컨대 메토트렉세이트와 함께 사용되며 표준 치료 RA 요법과 비교된다. 예를 들어, 본 명세서에 제공된 성장 인자 트랩 작제물은 에타네르셉트 및/또는 메토트렉세이트, 예를 들어 준최적 용량의 에타네르셉트 및/또는 메토트렉세이트와 조합될 수 있다. 유효성을 평가하기 위해, 병용 요법은 에타네르셉트 및/또는 메토트렉세이트의 최적 및 준최적 용량을 포함하여 에타네르셉트 및/또는 메토트렉세이트 단독 요법일 수 있다. 성장 인자 트랩 작제물은 더 낮은 용량의 다른 치료를 허용하여 불리하거나 바람직하지 않은 부작용을 감소시킨다. In some embodiments, growth factor trap constructs provided herein are used in conjunction with TNF blockers and/or other DMARDs, such as methotrexate, and compared to standard treatment RA regimens. For example, a growth factor trap construct provided herein can be combined with etanercept and/or methotrexate, eg, suboptimal doses of etanercept and/or methotrexate. To evaluate effectiveness, the combination therapy may be etanercept and/or methotrexate monotherapy, including optimal and suboptimal doses of etanercept and/or methotrexate. Growth factor trap constructs allow lower doses of other treatments to reduce adverse or undesirable side effects.
다른 구현예에서, 본 명세서에 제공된 성장 인자 트랩 작제물은 메토트렉세이트 (준최적 용량의 메토트렉세이트 포함)가 있거나 없이 다른 항-TNF 요법, 예컨대 아달리무맙 또는 인플릭시맙 (그의 준최적 용량 포함)와 조합될 수 있고, 치료 효능은 메토트렉세이트가 있거나 없는 항-TNF 요법 단독 치료와 비교된다. 또 다른 실시예에서, 본 명세서에 제공된 성장 인자 트랩 작제물은 TNFR1 길항제, TNFR2 효능제, 또는 본 명세서에 제공된 다중특이적, 예컨대 이중특이적, TNFR1 길항제/TNFR2 효능제 작제물 중 임의의 것과 조합될 수 있고, 메토트렉세이트가 있거나 없이 관리 기준 RA 요법, 예컨대 에타네르셉트, 아달리무맙, 또는 인플릭시맙과 비교된다. In other embodiments, the growth factor trap constructs provided herein are combined with other anti-TNF therapies, such as adalimumab or infliximab (including suboptimal doses thereof) with or without methotrexate (including methotrexate at suboptimal doses thereof). Can be combined, and treatment efficacy is compared to treatment alone with anti-TNF therapy with or without methotrexate. In another embodiment, a growth factor trap construct provided herein is used in combination with a TNFR1 antagonist, a TNFR2 agonist, or any of the multispecific, such as bispecific, TNFR1 antagonist/TNFR2 agonist constructs provided herein. and compared to a standard of care RA regimen, such as etanercept, adalimumab, or infliximab, with or without methotrexate.
H. H. TNFR1TNFR1 길항제 및 antagonists and TNFR1TNFR1 길항제/ antagonist/ TNFR2TNFR2 효능제agonist 작제물construct 활성 및 효능의 평가 Evaluation of activity and efficacy
경우에 따라 또는 필요한 경우, 본 명세서에 제공되는 작제물은 작제물의 특성 및/또는 특정 질환, 장애 또는 병태를 치료하기 위한 적합성을 평가하기 위해 당업자에게 공지된 임의의 생체내 및/또는 시험관내 검정을 사용하여 활성 및 효능에 대해 평가될 수 있다. 이러한 검정은 또한 치료를 모니터링하고/하거나 반응을 예측하거나 치료 대상을 선택하는 데 사용할 수 있다. 예시적인 검정은 다음 섹션에 기재되어 있다. Where appropriate or necessary, constructs provided herein may be tested in any in vivo and/or in vitro assay known to those skilled in the art to evaluate the properties and/or suitability of the constructs for treating a particular disease, disorder or condition. It can be evaluated for activity and efficacy using assays. Such assays can also be used to monitor treatment and/or predict response or select treatment targets. Exemplary assays are described in the next section.
일반적으로, 본 명세서의 길항제 작제물은 비경쟁적이며; 이들은 일반적으로 수용체를 불활성 형태로 잠그는 작제물이며, 이는 상기에 논의한 바와 같이 고친화도를 선택하는 것이 길항제 활성을 선택하는 것보다 덜 중요하다는 것을 의미한다.Generally, the antagonist constructs herein are non-competitive; These are generally constructs that lock the receptor in an inactive form, meaning that selecting high affinity is less important than selecting antagonist activity, as discussed above.
1. 질환 활동 점수(DAS28)1. Disease Activity Score (DAS28)
28개 관절수 질환 활동 점수(DAS28; 또는 28개 관절의 질환 활동 점수)는 류마티스성 관절염(RA)에서 질환 활동의 척도이며, 44개의 관절을 카운드되어야 하는 원래 DAS 점수를 단순화한 것이다. 카운트되는 28개의 관절은 근위 지절간 관절(10관절), 손허리손가락 관절(10관절), 손목(2), 팔꿈치(2), 어깨(2), 무릎(2)이다. DAS28은 RA 질환 활성 및 치료에 대한 반응을 나타내므로 RA에 대한 치료제 평가를 위한 임상 시험에 사용된다. DAS28은 0-10 범위의 점수로 28개의 부종 및 압통 관절 수를 기반으로 하며 값이 높을수록 질환 활성도가 높음을 나타낸다. DAS28은 보종 관절과 압통 관절(28개 중)의 수를 세는 것 외에도, 염증의 급성기 반응물/혈액 지표인 적혈구 침강 속도(ESR) 또는 C 반응성 단백질(CRP)의 측정뿐만 아니라 100mm 시각적 유사 척도(VAS)로 점수를 매긴 질환 활동에 대한 환자의 자가 평가를 나타내는 일반 건강(GH) 평가를 포함하고, 값 0은 "활동 없음"을 의미하고 값 100은 "가장 높은 활동 가능"을 의미한다". DAS28은 일반적으로 통증 및 악력과 같은 질환 중증도의 다른 측정과 결합되며 건강 평가 설문지(HAQ)를 사용하여 신체 기능을 평가한다.The 28-joint disease activity score (DAS28; or disease activity score of 28 joints) is a measure of disease activity in rheumatoid arthritis (RA) and is a simplification of the original DAS score, in which 44 joints were to be counted. The 28 joints to be counted are proximal interphalangeal joints (10 joints), metacarpophalangeal joints (10 joints), wrist (2), elbow (2), shoulder (2), and knee (2). DAS28 is used in clinical trials to evaluate treatments for RA because it shows RA disease activity and response to treatment. The DAS28 is based on the number of 28 swollen and tender joints with a score ranging from 0-10, with higher values indicating higher disease activity. In addition to counting the number of tender joints and tender joints (out of 28), the DAS28 measures erythrocyte sedimentation rate (ESR) or C-reactive protein (CRP), an acute phase reactant/hematologic indicator of inflammation, as well as a 100 mm visual analogue scale (VAS). ), where a value of 0 means “no activity” and a value of 100 means “highest activity possible”. DAS28 is usually combined with other measures of disease severity, such as pain and grip strength, and assesses physical function using the Health Assessment Questionnaire (HAQ).
ESR 또는 CRP 수준을 사용하여 DAS28 값을 계산하기 위해, 각각 다음 식이 사용된다.To calculate DAS28 values using ESR or CRP levels, the following equations are used respectively.
여기서 TJC = 압통 관절 수 및 SJC = 부종 관절 수.where TJC = number of tender joints and SJC = number of swollen joints.
2.6 미만의 값은 관해를 나타내고, 3.2 이하(2.6 초괴 3.2 이하)의 값은 낮은 질환 활성도를 나타내고, 3.2 초과 5.1 이하의 값은 중등도 질환 활성도를 나타내고, 5.1 초과의 값은 높은 질환 활성도(즉, 활동성 질환)를 나타낸다. 1.2 초과의 개선(즉, DAS28 점수/값의 감소)은 우수한 반응/개선을 나타내고; 0.6 초과 내지 1.2 이하의 개선되면 중간 정도의 반응을 나타내고; 0.6 이하의 DAS28 감소는 개선이 없음을 나타낸다 (예를 들어, 문헌[Prevoo 등 (1995) Arthritis & Rheumatism 38(1):44-48; Wells 등 (2009) Ann. Rheum. Dis. 68:954-960] 참조). Values less than 2.6 indicate remission, values less than 3.2 (higher than 2.6, less than 3.2) indicate low disease activity, values greater than 3.2 and less than or equal to 5.1 indicate moderate disease activity, and values greater than 5.1 indicate high disease activity (i.e., active disease). An improvement of greater than 1.2 (i.e., a decrease in DAS28 score/value) indicates a good response/improvement; An improvement of greater than 0.6 and less than or equal to 1.2 indicates a moderate response; A DAS28 decrease of 0.6 or less indicates no improvement (see, e.g., Prevoo et al. (1995) Arthritis & Rheumatism 38(1):44-48; Wells et al. (2009) Ann. Rheum. Dis. 68:954-960]).
본 명세서에 제공되는 선택적 TNFR1 길항제, TNFR2 효능제 및/또는 이들의 조합을 함유하는 이중특이적 작제물의 치료 효능은 치료 전, 치료 중 및 치료 후에 DAS28(ESR) 또는 DAS28(CRP)를 계산함으로써 평가될 수 있다. Therapeutic efficacy of bispecific constructs containing a selective TNFR1 antagonist, TNFR2 agonist and/or combination thereof provided herein can be determined by calculating DAS28 (ESR) or DAS28 (CRP) before, during and after treatment. can be evaluated.
2. 피분석물 정량화를 위한 SOMAscan2. SOMAscan for analyte quantification ®® 단백체 분석 및 다른 단백체 도구 Proteomic analysis and other proteomic tools
SOMAscan® 단백체 검정(SomaLogic, Inc.; Boulder, CO.)는 압타머 기반 다량체화되고 민감하며 정량적이며 재현 가능한 단백체 분석 도구이고, 이는 혈청, 혈장 또는 뇌척수액과 같은 샘플에서 150 μL의 작은 5,000개 초과의 단백질 피분석물의 양을 동시에 측정할 수 있다. 다른 생물학적 매트릭스, 예컨대 세포 배양 상청액, 세포 및 조직 용해물, 활막액, 및 기관지폐포 및 비강 세척도 사용할 수 있다. 광범위한 범위 또는 단백질 표적을 동시에 정량화할 수 있는 능력으로 인해, SOMAscan® 검정은 단백질 바이오마커 발견에 최적화되어 있으며, 예를 들어, 비-소세포 폐암, 알츠하이머병, 심혈관 질환 및 염증성 장 질환을 포함하는 몇 개의 질환과 연관된 바이오마커 서명을 확인하는데 사용되어 왔다. SOMAscan® 검정은 본 명세서에 제공된 TNFR1 길항제, TNFR2 효능제 및 이중특이적 작제물을 사용한 치료 개시 전후에 채취한 샘플을 분석함으로써, 예를 들어 RA 환자의 단백질 서명을 결정하는 데 사용될 수 있다. 이러한 방식으로, 환자의 반응은 치료 초기 및 치료 전반에 걸쳐 모니터링될 수 있다.The SOMAscan ® proteomic assay (SomaLogic, Inc.; Boulder, CO.) is an aptamer-based multimerized, sensitive, quantitative, and reproducible proteomic assay tool that can detect >5,000 cells in as little as 150 μL in samples such as serum, plasma, or cerebrospinal fluid. The amount of protein analyte can be measured simultaneously. Other biological matrices can also be used, such as cell culture supernatants, cell and tissue lysates, synovial fluid, and bronchoalveolar and nasal lavage. Because of its ability to simultaneously quantify a broad range or protein targets, the SOMAscan ® assay is optimized for protein biomarker discovery, and has several applications including, for example, non-small cell lung cancer, Alzheimer's disease, cardiovascular disease and inflammatory bowel disease. It has been used to identify biomarker signatures associated with canine disease. The SOMAscan® assay can be used, for example, to determine the protein signature of RA patients by analyzing samples taken before and after initiation of treatment with a TNFR1 antagonist, TNFR2 agonist, and bispecific construct provided herein. In this way, the patient's response can be monitored at the beginning of treatment and throughout treatment.
SOMAscan® 검정은 Slow Off-rate Modified Aptamer(SOMAmer® aptamers로 판매됨) 시약으로 알려진 단백질 포획 시약을 이용하고, 이 시약은 아미노산 측쇄를 모방하고 느린 오프-레이트를 갖고, 단백질 표적에 특이적이고 높은 친화력 결합을 허용하는 화학적으로 변형된 뉴클레오티드로 작제된 짧은 단일 가닥 DNA 기반 단백질 친화성 시약이다. 이 검정은 원래 접힌 형태(즉, 삼차 구조)의 단백질을 측정하고 접히지 않고 변성된(즉, 불활성) 단백질은 감지하지 않는다. SOMAscan® 검정의 경우, SOMAmer®-단백질 결합 단계 다음에는 일련의 분할 및 세척 단계가 이어지며, 생물학적 샘플의 단백질은 각각의 개별 단백질 농도를 해당 SOMAmer® 시약 농도(SOMAmer® 기반 DNA 신호)로 변환하여, 표준 DNA 검출 기술, 예컨대 마이크로어레이 또는 qPCR로 정량화하였다. 검정은 SOMAmer 시약의 이중 특성을 정의된 3차원 구조를 가진 단백질 친화성 결합 시약으로서 그리고 특정 DNA 혼성화 프로브로 인식할 수 있는 고유한 뉴클레오티드 서열을 함유하는 것으로 활용한다.The SOMAscan® assay utilizes a protein capture reagent known as the Slow Off-rate Modified Aptamer (sold as SOMAmer® aptamers) reagent, which mimics amino acid side chains, has a slow off-rate, is specific to a protein target, and has high affinity. It is a short, single-stranded DNA-based protein affinity reagent constructed with chemically modified nucleotides that permit binding. This assay measures proteins in their original folded form (i.e., tertiary structure) and does not detect proteins that are unfolded and denatured (i.e., inactive). For the SOMAscan ® assay, the SOMAmer ® -protein binding step is followed by a series of partitioning and washing steps, proteins in a biological sample are analyzed by converting each individual protein concentration to a corresponding SOMAmer ® reagent concentration (SOMAmer ® based DNA signal). , quantified by standard DNA detection techniques such as microarray or qPCR. The assay exploits the dual nature of the SOMAmer reagent as a protein affinity binding reagent with a defined three-dimensional structure and as containing a unique nucleotide sequence that can be recognized by specific DNA hybridization probes.
SOMAmer® 시약은 3개의 태그로 준비되며 광분해 가능한 링커를 통해 바이오틴에 연결된 형광단을 함유한다. 간략하게 검정을 위해, 관심 있는 생물학적 시료를 희석한 다음 스트렙타비딘(SA) 코팅된 비드에 미리 고정된 각각의 SOMAmer® 시약 혼합물과 함께 인큐베이션한다. SOMAmer® 시약은 생물학적 샘플의 단백질에 결합하고 비드를 세척하여 결합되지 않은 단백질을 제거한다. 형성되는 모든 비-특이적 복합체는 빠른 오프 속도를 가진다. 동족 SOMAmer® 시약에 결합된 상태로 남아 있는 단백질은 NHS-바이오틴 시약을 사용하여 태그가 지정되고 모든 비-특이적 복합체를 분해하는 다가음이온 경쟁 용액이 추가된다. 단백질-SOMAmer® 복합체 및 비결합(자유) SOMAmer® 시약은 자외선 광을 사용하여 광분해 가능한 링커를 절단하여 스트렙타비딘 비드로부터 방출된다. 모든 SOMAmer® 시약(일부는 바이오틴 표지 단백질에 결합되고 일부는 없음)을 함유하는 광절단 용출액은 바이오틴화된 단백질과 바이오틴화된 단백질-SOMAmer® 복합체를 결합하는 제2 스트렙타비딘 코팅 비드와 함께 인큐베이션되고, 결합되지 않은 물질은 후속 세척 단계에서 제거된다. 최종 용리 단계에서 단백질 결합 SOMAmer® 시약은 변성 조건을 사용하여 동족 단백질로부터 방출되고 SOMAmer® 시약은 맞춤형 DNA 마이크로어레이에 대한 혼성화 및 형광단 태그 측정과 같은 표준 DNA 정량화 기술로 정량화된다. 데이터는 정규화 및 보정 후 상대 형광 단위(RFU)로 보고되며, 측정된 SOMAmer® 시약 신호는 생물학적 샘플에서 발견된 단백질 수준과 상관관계가 있다 (예를 들어, 문헌[Gold 등 (2010) PLoS ONE 5(12):e15004; Candia 등 (2017) Sci . Reports 7:14248; Tanaka 등 (2018) Aging Cell. 17:e12799] 참조). The SOMAmer ® reagent is prepared with three tags and contains a fluorophore linked to biotin via a photocleavable linker. Briefly, for assays, biological samples of interest are diluted and incubated with respective SOMAmer ® reagent mixtures pre-immobilized on streptavidin (SA) coated beads. The SOMAmer ® reagent binds to proteins in the biological sample and the beads are washed to remove unbound proteins. All non-specific complexes that form have fast off rates. Proteins that remain bound to the cognate SOMAmer ® reagent are tagged using the NHS-Biotin reagent and a polyanionic competitive solution is added that dissolves all non-specific complexes. Protein-SOMAmer® complexes and unbound (free) SOMAmer® reagents are released from the streptavidin beads by cleavage of the photocleavable linker using ultraviolet light. The photocleavage eluate containing all SOMAmer ® reagents (some bound to the biotinylated protein and some not) is incubated with the biotinylated protein and a second streptavidin-coated bead that binds the biotinylated protein-SOMAmer ® complex and unbound material is removed in a subsequent washing step. In a final elution step, the protein-bound SOMAmer ® reagent is released from the cognate protein using denaturing conditions and the SOMAmer ® reagent is quantified by standard DNA quantification techniques such as hybridization to custom DNA microarrays and fluorophore tagging. Data are reported as relative fluorescence units (RFU) after normalization and correction, and the measured SOMAmer ® reagent signal correlates with protein levels found in biological samples (see, e.g., Gold et al. (2010) PLoS ONE 5(12):e15004; Candia et al. (2017) Sci . Reports 7:14248; Tanaka et al. (2018) Aging Cell. 17:e12799]).
3. 요법에 대한 반응성을 예측하고 치료로부터 이익을 얻을 가능성이 있는 대상체를 선택하기 위한 전사체 분석3. Transcriptome analysis to predict responsiveness to therapy and select subjects likely to benefit from therapy
기존의 항-TNF 요법, 즉, TNF 차단제, 예컨대 에타네르셉트, 인플릭시맙 및 기타는 RA 환자에서 약 30%의 비-반응성을 보인다. 그러나 이러한 항-TNF 요법의 효능을 예측할 수 있는 임상 마커가 있다. 말초 혈액 단핵 세포(PBMC)에서 RNA 발현 서명을 결정하기 위해 글로벌 전사체 분석을 사용하여 에타네르셉트를 사용한 항-TNF 요법 후에 차등적으로 발현되는 유전자의 분석이 수행되었다. 유사한 전사체 분석을 수행하여 본 명세서의 TNFR1 길항제 및 TNFR1 길항제/TNFR2 효능제 작제물의 효능을 평가하고/하거나 이들에 대한 환자 반응성을 평가할 수 있다. Existing anti-TNF therapies, i.e., TNF blockers such as etanercept, infliximab and others, show non-responsiveness in about 30% of RA patients. However, there are clinical markers that can predict the efficacy of these anti-TNF therapies. Analysis of differentially expressed genes following anti-TNF therapy with etanercept was performed using global transcriptome analysis to determine RNA expression signatures in peripheral blood mononuclear cells (PBMCs). Similar transcriptome analyzes can be performed to evaluate the efficacy and/or evaluate patient responsiveness to the TNFR1 antagonist and TNFR1 antagonist/TNFR2 agonist constructs herein.
예시적인 프로토콜에서, 치료 전후에 환자로부터 혈액 샘플을 얻고, 피콜(Ficoll) 밀도 구배를 사용하여 PBMC를 분리한 후, CD3+, CD14+, CD19+ 및 CD56+ 세포 집단을 유동 세포측정을 사용하여 평가한다. 그 다음 예를 들어 Qiagen RNeasy® 키트를 사용하여 전체 RNA를 추출하고, 반응자/비-반응자의 프로파일을 식별하기 위해 PBMC에서 알려진 수만 개의 유전자의 발현 프로파일을 분석하기 위해 마이크로어레이 분석(예를 들어, Affymetric® 마이크로어레이 기술 사용)을 사용한다. 유전자 발현 프로파일은 비-반응자가 될 인간들을 빠르게 식별하기 위해 치료 초기 단계에서 결정될 수 있다. 예를 들어, 이 방법을 사용하여 RA 환자에서 에타네르셉트의 치료 효능을 예측하기 위한 신뢰할 수 있는 바이오마커를 식별함으로써, 예측 정확도 89% 초과의 유전자 쌍과 예측 정확도 95% 초과의 유전자 삼중체를 식별하였다. 본 명세서에는 예를 들어 NF-κB 경로를 통한 TNF 신호전달에 관여하는 유전자, NF-κB 독립적 신호전달에 관여하는 유전자, 및 세포 및 산화 스트레스 반응 조절에 관여하는 유전자가 포함된다. 예를 들어, 확인된 유전자 삼중체에는 NF-κB 활성화를 억제하는 것으로 나타난 아연 핑거 단백질인 TNFα 유도 단백질 3을 인코딩하는 TNFAIP3; NF-κB 독립적 신호전달에 관여하는 (cAMP) 특이적 사이클릭 뉴클레오티드 포스포디에스테라제를 인코딩하는 PDE4B; 및 RAS 신호전달의 활성자인 Rap 구아닌 뉴클레오티드-교환 인자 1을 인코딩하는 RAPGEF1을 포함한다. 이들 3가지 유전자 모두의 발현은 무반응자에 비해 반응자에서 에타네르셉트 투여 3일 후에 하향조절되었다. 평가된 다른 유전자는 CCL4 , CXCR4 , CCL3 , PIGO , FSD1 , RUNX1 , LGALS13 , PTPRD , IL1B , ADAM12, 및 HCG4P6을 포함한다 (예를 들어, 문헌[Koczan 등 (2008) Arthritis Research & Therapy 10:R50] 참조). In an exemplary protocol, blood samples are obtained from patients before and after treatment, PBMCs are isolated using a Ficoll density gradient, and then CD3 + , CD14 + , CD19 + and CD56 + cell populations are measured using flow cytometry. Evaluate. Total RNA is then extracted, e.g., using the Qiagen RNeasy ® kit, and microarray analysis (e.g., using Affymetric ® microarray technology). Gene expression profiles can be determined at an early stage of treatment to quickly identify those who will be non-responders. For example, by using this method to identify reliable biomarkers for predicting the therapeutic efficacy of etanercept in RA patients, gene pairs with >89% predictive accuracy and gene triplets with >95% predictive accuracy identified. Included herein are genes involved in TNF signaling via, for example, the NF-κB pathway, genes involved in NF-κB independent signaling, and genes involved in cellular and oxidative stress response regulation. For example, gene triplets identified include TNFAIP3, which encodes TNFα-induced protein 3, a zinc finger protein that has been shown to inhibit NF-κB activation; PDE4B, which encodes a specific cyclic nucleotide phosphodiesterase (cAMP) involved in NF-κB independent signaling; and RAPGEF1 encoding Rap guanine nucleotide-
마이크로어레이 분석으로 얻은 결과를 검증하기 위해 사전 설계된 프라이머 및 프로브를 사용하여 정량적 실시간 PCR(RT-PCR)로 관심 있는 유전자 하위 집합의 발현 수준을 측정할 수 있다. 선택된 유전자의 유전자 발현의 변화를 계산하기 위해, ΔΔCT 방법을 사용하여, 샘플의 특정 mRNA 발현에 대한 역치 주기 (CT) 값은 샘플에서 예를 들어 GAPDH mRNA의 CT 값으로 정규화되고, 유전자 발현 변화(ΔΔCT)는 처리 전과 후의 CT 값의 차이로 정의된다 (예를 들어, 문헌[Koczan 등 (2008) Arthritis Research & Therapy 10:R50] 참조). To validate the results obtained by microarray analysis, the expression level of a subset of genes of interest can be measured by quantitative real-time PCR (RT-PCR) using pre-designed primers and probes. To calculate the change in gene expression of a selected gene, using the ΔΔC T method, the threshold cycle (C T ) value for expression of a particular mRNA in a sample is normalized to the C T value of, for example, GAPDH mRNA in the sample, and the gene Expression change (ΔΔCT) is defined as the difference between C T values before and after treatment (see, e.g., Koczan et al. (2008) Arthritis Research & Therapy 10:R50).
4. L929 세포독성 검정 4. L929 Cytotoxicity Assay
예를 들어, TNFR1 길항제가 TNF 유도 세포독성을 억제하는 L929 세포독성 검정으로 TNF 유도 세포자멸을 평가함으로써 TNFR1 매개 과정 및 세포 반응을 결정할 수 있다. 간략하게, L929 마우스 섬유아세포를 미세역가 플레이트에 플레이팅하고 TNFR1 길항제, 100 pg/ml TNF 및 1 mg/ml 악티노마이신 D와 함께 밤새 인큐베이션한다. 세포 생존력은 3-(4,5-디메틸티아졸-2-일)-5-(3-카복시메톡시페닐)-2-(4-설포페닐)-2H-테트라졸륨 (MTS)과의 인큐베이션 후 490nm에서 흡광도를 판독하여 측정된다 TNFR1 길항제는 TNF 매개 세포독성을 감소시켜 TNF 단독 대조군에 비해 흡광도를 증가시킨다. For example, TNFR1-mediated processes and cellular responses can be determined by assessing TNF-induced apoptosis with the L929 cytotoxicity assay, in which a TNFR1 antagonist inhibits TNF-induced cytotoxicity. Briefly, L929 mouse fibroblasts are plated in microtiter plates and incubated overnight with TNFR1 antagonist, 100 pg/ml TNF and 1 mg/ml actinomycin D. Cell viability after incubation with 3-(4,5-dimethylthiazol-2-yl)-5-(3-carboxymethoxyphenyl)-2-(4-sulfophenyl)-2H-tetrazolium (MTS) TNFR1 antagonists reduce TNF-mediated cytotoxicity, increasing absorbance compared to the TNF alone control.
5. HeLa IL-8 검정5. HeLa IL-8 Assay
TNFR1 길항제의 활성은 HeLa IL-8 검정을 사용하여 결정될 수 있으며, 여기에서 HeLa 세포에서 TNF 유래된 IL-8 분비를 중화시키는 길항제의 능력이 평가된다. 요약하면, 다양한 농도의 TNFR1 길항제 및 300 pg/ml TNF의 존재 하에 HeLa 세포를 미세역가 플레이트에 밤새 플레이팅한다. 그 다음 상청액을 흡인하고 샌드위치 ELISA를 사용하여 IL-8의 농도를 측정한다. TNFR1 길항제 활성은 TNF 단독 대조군과 비교하여 상청액으로의 IL-8 분비를 감소시킨다. The activity of a TNFR1 antagonist can be determined using the HeLa IL-8 assay, in which the ability of the antagonist to neutralize TNF-derived IL-8 secretion in HeLa cells is assessed. Briefly, HeLa cells were plated overnight in microtiter plates in the presence of various concentrations of TNFR1 antagonist and 300 pg/ml TNF. The supernatant is then aspirated and the concentration of IL-8 is determined using a sandwich ELISA. TNFR1 antagonist activity reduces IL-8 secretion into the supernatant compared to TNF alone control.
6. HUVEC 검정6. HUVEC Assay
인간 제대 정맥 내피 세포(HUVEC) 검정을 사용하여 본 명세서의 TNFR1 길항제의 활성을 결정정할 수 있다. HUVEC를 TNF로 처리하면 세포에서 VCAM-1 발현이 상향 조절되며, 이는 예를 들어 ELISA에 의해 결정될 수 있다. TNFR1 길항제는 TNF의 작용을 억제하기 때문에 VCAM-1 발현은 길항제의 존재에서 HUVEC에서 감소된다. TNFR1 길항제에 의한 TNF 유도 VCAM-1 발현의 억제 수준은 VCAM-1 발현의 억제 백분율에 대한 길항제의 농도를 플로팅함으로써 결정된다. The human umbilical vein endothelial cell (HUVEC) assay can be used to determine the activity of the TNFR1 antagonists herein. Treatment of HUVECs with TNF results in upregulation of VCAM-1 expression in the cells, which can be determined, for example, by ELISA. Because TNFR1 antagonists inhibit the actions of TNF, VCAM-1 expression is reduced in HUVECs in the presence of antagonists. The level of inhibition of TNF-induced VCAM-1 expression by TNFR1 antagonists is determined by plotting the concentration of antagonist against the percentage inhibition of VCAM-1 expression.
이 검정에 대한 프로토콜에 따라, HUVEC를 밤새 배양한 다음, TNFR1 길항제와 함께 1시간 동안 배양한 다음, TNF(1 ng/mL)로 23시간 동안 자극한다. 배지만 인큐베이션한 세포를 음성 대조군으로 사용하고, TNF만 인큐베이션한 세포를 양성 대조군으로 사용하였다. 그 다음 세포 배양 상청액을 흡인하고 세포를 빙냉된 PBS로 3회 세척하고 빙냉 트리스-글리세롤 용해 완충액 (40 mM Tris, 274 mM NaCl, 2% Triton-X-100, 20% 글리세롤, 50 mM NaF, 1 mM Na3VO4, 10 mL당 1 x 프로테아제 억제제 정제)을 첨가하여 용해시키고, 얼음 위에서 15분 동안 인큐베이션한다. 그 다음 세포 용해물을 VCAM-1 샌드위치 ELISA에 사용한다. TNF 유래된 VCAM-1 발현의 억제를 계산하기 위해, 최대 VCAM-1 발현의 억제율 %(즉, 양성 대조군에서 측정됨) = {100 - [(길항제 농도에서의 OD 값) / (양성 대조군의 OD 값)]} x 100. Following the protocol for this assay, HUVECs are cultured overnight, then with TNFR1 antagonist for 1 hour, then stimulated with TNF (1 ng/mL) for 23 hours. Cells incubated with only medium were used as a negative control, and cells incubated with only TNF were used as a positive control. The cell culture supernatant was then aspirated and the cells were washed three times with ice-cold PBS and lysed in ice-cold Tris-glycerol lysis buffer (40 mM Tris, 274 mM NaCl, 2% Triton-X-100, 20% glycerol, 50 mM NaF, 1 mM Na 3 VO 4 , 1 x protease inhibitor tablet per 10 mL) to dissolve and incubate on ice for 15 minutes. Cell lysates are then used for VCAM-1 sandwich ELISA. To calculate inhibition of TNF-derived VCAM-1 expression, % inhibition of maximal VCAM-1 expression (i.e. measured in positive control) = {100 - [(OD value at antagonist concentration) / (OD of positive control value)]} x 100.
그 다음 EC50 값은 예를 들어 GraphPad Prism 소프트웨어와 같은 사용 가능한 소프트웨어를 사용하여 백분율 억제에 대한 길항제 농도를 플로팅하여 결정된다.EC 50 values are then determined by plotting antagonist concentration against percent inhibition using available software such as, for example, GraphPad Prism software.
7. Treg 세포 활성의 정량화 및 평가7. Quantification and evaluation of Treg cell activity
Treg에 대한 TNFR1 길항제 및 TNFR1 길항제/TNFR2 효능제 작제물의 효과를 결정하기 위해, Treg의 수는 혈액 샘플로부터 말초 혈액 단핵 세포(PBMC)를 단리함으로써, 예컨대 CD4+CD25+ Treg 및 CD4+CD25- 비조절 T 세포를 단리하기 위해 피콜-파크(Ficoll-Paque) 방법에 이어 단클론성 항체(mAb) 및 상자성 비드 또는 당업계에 알려진 다른 유사한 방법을 사용하여 치료 전과 치료 중뿐만 아니라 치료 중 정량화될 수 있다. 유동 세포측정을 사용하고 CD4 및 CD25(Treg의 경우) 또는 CD4 및 CTLA-4(비-조절 T 세포의 경우)에 대한 mAb로 면역염색하여, 각 세포 유형의 수를 정량화할 수 있다 (예를 들어, 문헌[Vigna-Pιrez 등 (2005) Clin . Exp . Immunol . 141(2):372-380] 참조). To determine the effect of TNFR1 antagonist and TNFR1 antagonist/TNFR2 agonist constructs on Tregs, the number of Tregs was determined by isolating peripheral blood mononuclear cells (PBMCs) from blood samples, such as CD4 + CD25 + Tregs and CD4 + CD25 - Unregulated T cells can be quantified before and during treatment as well as during treatment using the Ficoll-Paque method followed by monoclonal antibodies (mAbs) and paramagnetic beads or other similar methods known in the art to isolate unregulated T cells. there is. By using flow cytometry and immunostaining with mAbs against CD4 and CD25 (for Tregs) or CD4 and CTLA-4 (for non-regulatory T cells), the number of each cell type can be quantified (eg For example, see Vigna-Pιrez et al. (2005) Clin . Exp . Immunol . 141(2):372-380).
CD4+CD25+ Treg는 CD4+CD25- T 세포의 증식을 억제한다. 치료받은 환자의 Treg 활성을 테스트하기 위해, Treg 및 T 세포를 식물성혈구응집소(PHA, T 세포 자극)과 함께 48시간 동안 함께 배양하는 세포 증식 검정을 사용할 수 있다. 배양 마지막 12시간 동안 3H-TdR (삼중수소 티미딘)을 첨가한 후 세포를 수확하고 액체 섬광 계수기를 사용하여 증식을 결정한다. 단독으로 배양된 CD4+CD25- T 세포를 대조군으로 사용하고, 결과는 세포 증식의 자극 지수(SI)로 표현되며, 이는 다음 식을 사용하여 계산된다.CD4 + CD25 + Tregs suppress the proliferation of CD4 + CD25 − T cells. To test Treg activity in treated patients, a cell proliferation assay can be used in which Tregs and T cells are co-cultured with phytohemagglutinin (PHA, T cell stimulating) for 48 hours. Harvest cells after addition of 3 H-TdR (tritium thymidine) during the last 12 hours of incubation and determine proliferation using a liquid scintillation counter. CD4 + CD25 - T cells cultured alone were used as a control, and the results are expressed as the stimulation index of cell proliferation (SI), which is calculated using the following equation.
SI = (PHA가 있는 세포의 cpm) ÷ (배지에서만 배양된 세포의 cpm), 여기서 cpm은 계수된 방사능에 의해 결정되는 분당 카운트이다 (예를 들어, 문헌[Vigna-Perez 등 (2005) Clin. Exp. Immunol. 141(2):372-380] 참조). SI = (cpm of cells with PHA) ÷ (cpm of cells cultured in media only), where cpm is the counts per minute determined by counted radioactivity (see, e.g., Vigna-Perez et al. (2005) Clin. Exp. Immunol. 141(2):372-380).
M. 투베르쿨로시스에 대한 면역 반응성을 테스트하기 위해, PBMC는 박테리아의 전체 단백질 추출물의 존재에서 완전 배지에서 72시간 동안 배양된다. 배양 마지막 12시간 동안 3H-TdR (삼중수소 티미딘)을 첨가한 후 세포를 수확하고 액체 섬광 계수기를 사용하여 증식을 결정한다. 결과는 전술한 대로 자극 지수로 표현된다. M. 투베르쿨로시스(M. tuberculosis)에 대한 생체 내 반응성을 위해, 표준 PPD(정제 단백질 유도체) 피부 테스트를 사용할 수 있다 (예를 들어, 문헌[Vigna-Pιrez 등 (2005) Clin. Exp. Immunol. 141(2):372-380] 참조). To test immunoreactivity against M. tuberculosis, PBMCs are cultured for 72 hours in complete medium in the presence of total protein extracts of the bacteria. Harvest cells after addition of 3 H-TdR (tritium thymidine) during the last 12 hours of incubation and determine proliferation using a liquid scintillation counter. Results are expressed as stimulus indices as described above. For in vivo reactivity against M. tuberculosis , a standard PPD (purified protein derivative) skin test can be used (see, eg, Vigna-Pιrez et al. (2005) Clin. Exp. Immunol. 141(2):372-380).
8. TNFR1 길항제/TNFR2 효능제 작제물의 결합 특성 평가 8. Evaluation of binding properties of TNFR1 antagonist/TNFR2 agonist constructs
TNFR1 및/또는 TNFR2(예를 들어, 인간 TNFR1 및/또는 TNFR2)에 대한 항체 또는 항체 단편 또는 다중특이적 작제물, 예컨대 본 명세서에 제공된 작제물의 특이적 결합은 임의의 다양한 공지된 방법에 의해 평가될 수 있다. 친화도는 시험관 내에서 TNFR1 및/또는 TNFR2 신호전달의 반-최대 강화(EC50) 및 길항제-TNFR1 및/또는 효능제-TNFR2 복합체 해리의 평형 상수(KD)를 달성하는 데 필요한 TNFR1 길항제, TNFR2 효능제 또는 다중특이적 작제물의 농도를 포함하는 다양한 메트릭스로 정량적으로 제지될 수 있다. TNFR1 또는 TNFR2와 결합제, 예를 들어 본 명세서에 제공된 작제물(결합제)과의 상호작용을 설명하는 평형 상수 KD는 TNFR1 결합제 작제물 복합체 또는 TNFR2 결합제 복합체가 서로 상호 작용하지 않는 용매 분리 TNFR1 또는 TNFR2 및 결합제 분자로의 해리 반응에 대한 화학적 평형 상수이다.Specific binding of an antibody or antibody fragment or multispecific construct, such as a construct provided herein, to TNFR1 and/or TNFR2 (eg, human TNFR1 and/or TNFR2) can be achieved by any of a variety of known methods. can be evaluated. Affinity is the TNFR1 antagonist required to achieve a half-maximal potentiation of TNFR1 and/or TNFR2 signaling (EC 50 ) and the equilibrium constant of antagonist-TNFR1 and/or agonist-TNFR2 complex dissociation (K D ) in vitro; It can be quantitatively determined by a variety of metrics including the concentration of the TNFR2 agonist or multispecific construct. The equilibrium constant K D that describes the interaction of TNFR1 or TNFR2 with a binding agent, e.g., a construct (binder) provided herein, is a solvent separated TNFR1 or TNFR2 in which the TNFR1 binding agent construct complex or the TNFR2 binding agent complex do not interact with each other. and the chemical equilibrium constant for the dissociation reaction into binder molecules.
TNFR1 길항제, TNFR2 효능제 및 다중특이 작제물은 또한 다양한 시험관내 결합 검정에 의해 특성화될 수 있다. KD 또는 EC50을 결정하는 데 사용할 수 있는 실험의 예는 그 중에서도 예를 들어, 표면 플라즈몬 공명 (SPR, 예를 들어, BIAcoreTM 분석), 등온 적정 열량측정, 형광 이방성, 및 ELISA 기반 검정을 포함한다. ELISA는 일반적으로 최소 농도의 항체가 필요하기 때문에 항체 활성을 분석하는 데 특히 유용한 방법이다. 전형적인 ELISA 검정에서 분석되는 일반적인 신호는 발광이고, 이는 전형적으로 1차 항체(예를 들어, 본 명세서에서 제공되는 TNFR1-길항제 또는 TNR1 효능제TNFR2-효능제 이중특이적 작제물)에 특이적으로 결합하는 이차 항체에 접합된 과산화효소의 활성의 결과이다. TNFR1 antagonists, TNFR2 agonists and multispecific constructs can also be characterized by various in vitro binding assays. Examples of experiments that can be used to determine K D or EC 50 include, for example, surface plasmon resonance (SPR, eg, BIAcore ™ analysis), isothermal titration calorimetry, fluorescence anisotropy, and ELISA-based assays, among others. include ELISA is a particularly useful method for assaying antibody activity because it usually requires minimal concentrations of antibody. A common signal analyzed in a typical ELISA assay is luminescence, which typically binds specifically to a primary antibody (e.g., a TNFR1-antagonist or TNR1 agonist TNFR2-agonist bispecific construct provided herein) It is the result of the activity of peroxidase conjugated to the secondary antibody that
TNFR1에 대한 TNFR1 길항제 또는 TNFR2에 대한 TNFR2 효능제의 회합 및 해리 동역학은 예를 들어 확립된 절차에 따라 항체-항원 복합체 형성 속도를 모니터링함으로써 정량적으로 특성화될 수 있다. 예를 들어, 표면 플라즈몬 공명(SPR)을 사용하여 길항제-TNFR1 또는 효능제-TNFR2 복합체의 형성(kon) 및 해리(koff)에 대한 속도 상수를 결정할 수 있다. 평형 상수(KD)는 이 단분자 해리의 평형 상수가 koff 대 kon 값의 비율로 표현될 수 있기 때문에 이러한 데이터로부터 결정될 수 있다. SPR이 수용체-항체(또는 다른 결합제) 상호 작용의 동역학 및 열역학적 파라미터를 결정하는 데 유리한 기술인 것은, 실험에서 화학 표지 부착으로 한 성분을 변형할 필요가 없기 때문이다. 오히려, 수용체는 전형적으로 증가하는 농도의 항체 또는 결합제(즉, TNFR1 길항제 또는 TNFR2 효능제, 또는 이들의 이중특이적 작제물)의 용액으로 펄스로 처리되는 고체 금속 표면 상에 고정된다. 항체-수용체 결합은 금속 표면에서 입사광의 반사각의 왜곡을 유도하고, 항체가 시스템에 도입됨에 따라 시간 경과에 따라 굴절률의 변화는 항체-수용체 상호작용의 결합 및 해리 속도 상수를 계산하기 위해 당업계에 공지된 확립된 회귀 모델에 맞출 수 있다.The kinetics of association and dissociation of a TNFR1 antagonist to TNFR1 or a TNFR2 agonist to TNFR2 can be characterized quantitatively, for example by monitoring the rate of antibody-antigen complex formation according to established procedures. For example, surface plasmon resonance (SPR) can be used to determine the rate constants for the formation (k on ) and dissociation (k off ) of antagonist-TNFR1 or agonist-TNFR2 complexes. The equilibrium constant (K D ) can be determined from these data since the equilibrium constant of this unimolecular dissociation can be expressed as the ratio of k off to k on value. SPR is an advantageous technique for determining the kinetic and thermodynamic parameters of receptor-antibody (or other binding agent) interactions because it does not require modification of one component by chemical labeling in the experiment. Rather, the receptor is typically immobilized on a solid metal surface that is treated with pulses of solutions of increasing concentrations of the antibody or binding agent (ie, TNFR1 antagonist or TNFR2 agonist, or bispecific constructs thereof). Antibody-receptor binding induces a distortion of the reflection angle of incident light at the metal surface, and the change in refractive index over time as the antibody is introduced into the system is well known in the art to calculate the association and dissociation rate constants of the antibody-receptor interaction. A well-known established regression model can be fitted.
9. 항체 의존적 세포독성(ADCC) 및 보체 의존적 세포독성(CDC) 검정9. Antibody-dependent cytotoxicity (ADCC) and complement-dependent cytotoxicity (CDC) assays
항체 의존적 세포독성(ADCC) 및 보체 의존적 세포독성(CDC) 검정은 TNFR1 길항제, TNFR2 효능제 및 Fc 단량체 또는 이량체를 함유하는 본 명세서에 제공된 다중특이적 작제물의 면역 이펙터 기능/세포독성을 평가하는 데 사용될 수 있다. 일반적으로 Fc 부분(들)은 ADCC 또는 ADCC 및 CDC 이펙터 기능을 제거하거나 실질적으로 감소시키도록(부작용을 제거하거나 허용 가능한 수준으로 감소시키기 도록) 변형된다. 그러한 검정은 당업계에 잘 알려져 있다 (예를 들어, 문헌[Ying 등 (2014) mAbs 6(5):1201-1210] 참조). 예를 들어, 예시적인 ADCC 검정을 위해, 메조텔린-음성 A431 또는 메조텔린-양성 H9 세포는 30분 동안 본 명세서에 제공된 TNFR1 길항제, TNFR2 효능제 또는 다중특이적 작제물과 함께 인큐베이션한 후, 50:1의 이펙터 대 표적 세포 비율로 표적 세포를 이펙터 세포(예를 들어, PBMC) 함유 웰에 첨가한다. 24시간 인큐베이션 후, 제조업체의 프로토콜에 따라 CytoTox-ONE Homogenous Membrane Integrity Assay(Promega)를 사용하여 표적 세포의 용해를 측정한다.Antibody Dependent Cytotoxicity (ADCC) and Complement Dependent Cytotoxicity (CDC) Assays Evaluate Immune Effector Function/Cytotoxicity of Multispecific Constructs Provided herein Containing a TNFR1 antagonist, a TNFR2 agonist and an Fc monomer or dimer can be used to Typically the Fc portion(s) are modified to eliminate or substantially reduce ADCC or ADCC and CDC effector functions (to eliminate or reduce side effects to an acceptable level). Such assays are well known in the art (see, e.g., Ying et al. (2014) mAbs 6(5):1201-1210). For example, for an exemplary ADCC assay, mesothelin-negative A431 or mesothelin-positive H9 cells are incubated with a TNFR1 antagonist, TNFR2 agonist, or multispecific construct provided herein for 30 minutes, followed by 50 Add target cells to wells containing effector cells (eg, PBMCs) at an effector to target cell ratio of :1. After 24 hour incubation, lysis of target cells is measured using the CytoTox-ONE Homogenous Membrane Integrity Assay (Promega) according to the manufacturer's protocol.
예시적인 CDC 검정을 위해, A431 및 H9 세포를 무혈청 RPMI에서 세척하고 밀도를 무혈청 RPMI에서 100만/mL로 조정한다. 그 다음 50μL의 세포 현탁액을 50μL의 TNFR1 길항제, TNFR2 효능제 또는 RPMI에서 다중특이적 작제물 희석액과 함께 인큐베이션한다. 음성 대조군은 50μL의 RPMI와 함께 50μL의 세포 현탁액을 함유하고 양성 대조군은 150μL의 최종 부피에서 1% Triton X-100으로 용해된 표적 세포를 함유한다. 신선한 인간 혈장을 PBS(1:4)로 희석하고 원심분리로 정화한 다음, 50 μL의 희석된 혈장을 각 세포/작제물 혼합물에 첨가하고 37°C에서 96-웰 플레이트에서 인큐베이션하여 보체 매개 세포 용해를 허용한다. 3시간 인큐베이션 후, 100μL의 상청액을 흰색 플레이트로 옮기고 CytoTox-ONE Homogenous Membrane Integrity Assay Kit(Promega)의 기질 100μL를 첨가한다. 그 다음 플레이트를 실온에서 10분 동안 인큐베이션하고 여기 파장이 530nm이고 방출 파장이 590nm인 형광계를 사용하여 형광 신호를 판독한다. 표적 세포의 CDC는 양성 대조군에 대한 실험 샘플의 백분율로 표시된다. For the exemplary CDC assay, A431 and H9 cells are washed in serum-free RPMI and the density is adjusted to 1 million/mL in serum-free RPMI. 50 μL of the cell suspension is then incubated with 50 μL of TNFR1 antagonist, TNFR2 agonist or multispecific construct dilution in RPMI. The negative control contains 50 μL of cell suspension with 50 μL of RPMI and the positive control contains target cells lysed with 1% Triton X-100 in a final volume of 150 μL. Fresh human plasma was diluted with PBS (1:4) and clarified by centrifugation, then 50 μL of diluted plasma was added to each cell/construct mixture and incubated in a 96-well plate at 37 °C to complement-mediated cells. allow dissolution. After 3 hours incubation, 100 μL of the supernatant is transferred to a white plate and 100 μL of substrate from the CytoTox-ONE Homogenous Membrane Integrity Assay Kit (Promega) is added. The plate is then incubated at room temperature for 10 minutes and the fluorescence signal is read using a fluorometer with an excitation wavelength of 530 nm and an emission wavelength of 590 nm. CDC of target cells is expressed as a percentage of the experimental sample relative to the positive control.
10. 질환 모델10. Disease Model
본 명세서에 제공되는 선택적 TNFR1 길항제, TNFR2 효능제 및 다중특이적 작제물은 자가면역 및 염증 및 그의 병인에서 TNF에 의해 매개되거나 관련된 다른 질환 또는 장애에 대한 이들의 효과를 결정하기 위해 당업자에게 공지된 임의의 임상적으로 관련된 질환 모델에서 평가될 수 있다. 예시적인 질환 모델은 콜라겐 유도 관절염(CIA), 류마티스성 관절염 활막 단핵 세포 배양물, 관절염의 Tg197 마우스 모델, 관절염/IBD의 ΔARE 마우스 모델, IBD의 마우스 덱스트란 설페이트 나트륨 (DSS) 유래된 모델, IBD 유도 모델 및 다발성 경화증에 대한 실험적 자가면역 뇌척수염(EAE) 모델을 포함하지만 이에 제한되지 않는다. 다른 모델은 당업자에게 공지되어 있다. 예를 들어, 문헌[Malaviya 등 (2017) Pharmacol Ther. 180:90-98]는 염증성 폐 질환을 치료하기 위한 작제물을 시험하기 위한 수많은 모델을 제공하며; 문헌[Feldmannet al. (2020) Lancet 395:1407-1409]은 COVID-19에 대한 항-TNF 요법 및 모델, 치료의 사용에 관한 것이고; 문헌[Shi 등 (2013) Crit . Care 17(6):R301]은 H1N1 치료를 위한 항-TNF 요법의 사용 및 바이러스 감염 모델에 관한 것이고; 문헌[Orti-Casan 등 (2019) Front. Neurosci .13:49]는 알츠하이머병을 치료하기 위해 TNFR2를 활성화하는 것이 유리하다고 기술하고 있으며, 이는 TNFR1 및 TNFR2를 억제하는 TNF 차단제가 문제가 된다는 본 명세서의 접근법을 입증한다. 다음은 본 명세서에 제공된 작제물 및 각각에 대한 예시적인 모델로 치료될 수 있는 질환, 장애 및 병태에 대한 포괄적이지 않은 논의이다. 이들은 예시적이고; 당업자는 특정 작제물 및 표적 질환, 장애 또는 병태에 대한 적절한 모델을 선택할 수 있다. 본 명세서에 제공되는 항-TNFR1 및 TNFR2 길항제/효능제 작제물은 인간 TNFR1/TNFR2를 표적화하기 위해 사용하기 위한 것이므로, 이들은 비-인간, 특히 비영장류 종으로부터 TNFR1/TNFR2와 반응/상호작용하는데도 작용할 것으로 예상되지 않는다. 시험을 위해, 설치류 모델과 같은 비-인간 모델에서, 마우스 모델과 같은 모델은 인간 TNFR1 및 인간 TNFR2에 대해 형질전환이다. 이들은 염증성 및 자가면역 질환의 생체내 모델을 위한 뮤린 TNFR1/2 녹아웃 마우스의 배경에 대해 사용될 수 있다. 대안적으로, 인간 CD34+ 줄기 세포를 이식한 심하게 면역이 손상된 마우스(예컨대, NOD/NSG 마우스)를 이 목적으로 사용할 수 있다. 또는 인간 류마티스성 관절염 활막 세포를 면역결핍 마우스에 이식하여 RA 유사 염증을 유발할 수 있다 (예를 들어, 그러한 모델의 설명을 위한 문헌[Schinnerling 등 (2019) Front Immunol. 10:203] 참조). Selective TNFR1 antagonists, TNFR2 agonists, and multispecific constructs provided herein can be used to determine their effects on autoimmunity and inflammation and other diseases or disorders mediated by or related to TNF in their pathogenesis, known to those skilled in the art. It can be evaluated in any clinically relevant disease model. Exemplary disease models include collagen induced arthritis (CIA), rheumatoid arthritis synovial mononuclear cell culture, Tg197 mouse model of arthritis, ΔARE mouse model of arthritis/IBD, mouse dextran sulfate sodium (DSS) derived model of IBD, IBD induction model and experimental autoimmune encephalomyelitis (EAE) model for multiple sclerosis. Other models are known to those skilled in the art. See, eg, Malaviya et al. (2017) Pharmacol Ther . 180:90-98] provide numerous models for testing constructs for treating inflammatory lung diseases; See Feldmann et al. (2020) Lancet 395 :1407-1409] about the use of anti-TNF therapies and models, treatments for COVID-19; See Shi et al. (2013) Crit . Care 17(6) :R301] relates to the use of anti-TNF therapy for the treatment of H1N1 and viral infection models; See Orti-Casan et al. (2019) Front. Neurosci . 13:49] describe the benefits of activating TNFR2 to treat Alzheimer's disease, demonstrating our approach that TNF blockers that inhibit TNFR1 and TNFR2 are problematic. The following is a non-exhaustive discussion of the diseases, disorders and conditions that can be treated with the constructs provided herein and exemplary models for each. These are illustrative; One skilled in the art can select an appropriate model for a particular construct and target disease, disorder or condition. Since the anti-TNFR1 and TNFR2 antagonist/agonist constructs provided herein are intended for use in targeting human TNFR1/TNFR2, they will also act to react/interact with TNFR1/TNFR2 from non-human, particularly non-primate species. is not expected to For testing, in non-human models such as rodent models, models such as mouse models are transgenic for human TNFR1 and human TNFR2. They can be used against the background of murine TNFR1/2 knockout mice for in vivo models of inflammatory and autoimmune diseases. Alternatively, severely immunocompromised mice transplanted with human CD34+ stem cells (eg, NOD/NSG mice) can be used for this purpose. Alternatively, human rheumatoid arthritis synovial cells can be transplanted into immunodeficient mice to induce RA-like inflammation (see, eg, Schinnerling et al. for a description of such a model). (2019) Front Immunol. 10 :203]).
a. 콜라겐 유도 관절염(CIA) a. Collagen Induced Arthritis (CIA)
유형 II 콜라겐 유발 관절염(CIA)은 RA와 조직학적으로 유사한 자가면역 염증성 관절 질환의 모델로서 마우스에서 유래될 수 있으며, 염증성 활막염, 판누스 형성 및 연골 및 뼈의 침식을 특징으로 한다. CIA를 유도하기 위해 완전한 프로인트 보조제의 존재 하에 소의 II형 콜라겐(B-CII)을 꼬리의 기저부에 진피내 주사한다. 21일 후 동일한 프로토콜을 사용하여 마우스를 재면역할 수 있다. 본 명세서에 제공된 선택적 TNFR1 길항제, TNFR2 효능제 및 다중특이 작제물의 효과를 조사하기 위해, B-CII로 초기 도전 3주 후 또는 관절염 징후 시, 선택적 TNFR1 길항제, TNFR2 효능제 또는 다중특이적 작제물 또는 대조군을 3주 동안 매주 2회 복강내 투여할 수 있다. 마우스는 조직학적 분석을 위해 초기 면역화 7주 후에 희생될 수 있다.Type II collagen-induced arthritis (CIA) can be derived in mice as a model of an autoimmune inflammatory joint disease histologically similar to RA, and is characterized by inflammatory synovitis, pannus formation, and erosion of cartilage and bone. Bovine type II collagen (B-CII) is injected intradermally into the base of the tail in the presence of complete Freund's adjuvant to induce CIA. Mice can be reimmunized after 21 days using the same protocol. To investigate the effects of the selective TNFR1 antagonists, TNFR2 agonists and multispecific constructs provided herein, 3 weeks after initial challenge with B-CII or at the onset of arthritis, selective TNFR1 antagonists, TNFR2 agonists or multispecific constructs Alternatively, the control group can be administered intraperitoneally twice weekly for 3 weeks. Mice can be sacrificed 7 weeks after initial immunization for histological analysis.
확립된 질환에 대한 작제물의 치료 효과를 평가하기 위해, 하나 이상의 사지에서 임상적 관절염이 시작된 후 총 10일 동안 매일 투여할 수 있다. 캘리퍼스를 사용하여 발 두께를 측정하여 초기에 영향을 받은 관절의 부종 정도를 모니터링할 수 있다. 염증유발 사이토카인 및 케모카인, 예를 들어, 과립구-대식세포 집락 자극 인자 (GM-CSF), 인터류킨-10 (IL-10), IL-1β, IL-6, IL-8, RANTES (CCL5) 및 단핵구 화학유인물질 단백질 1 (MCP-1; CCL2로도 알려져 있음)의 측정을 위해 마우스에서 혈청을 채취할 수 있다. To evaluate the therapeutic effect of the construct on established disease, it can be administered daily for a total of 10 days after the onset of clinical arthritis in one or more limbs. Calipers can be used to measure foot thickness to initially monitor the degree of swelling in the affected joint. proinflammatory cytokines and chemokines such as granulocyte-macrophage colony stimulating factor (GM-CSF), interleukin-10 (IL-10), IL-1β, IL-6, IL-8, RANTES (CCL5) and Serum can be drawn from mice for the measurement of monocyte chemoattractant protein 1 (MCP-1; also known as CCL2).
또 다른 예에서 영장류 모델은 RA 치료에 사용할 수 있다. 압통 및 부종 관절의 반응(예를 들어, 임상적 관절염 점수에 의해 측정됨)은 재조합 치료적 TNFR1 길항제, TNFR2 효능제 또는 이중특이적 작제물 및 대조군으로 치료된 대상체에서 모니터링되어 치료 효능 및 치료를 평가할 수 있다.In another example, primate models can be used to treat RA. Responses of tender and swollen joints (e.g., as measured by clinical arthritis scores) are monitored in subjects treated with a recombinant therapeutic TNFR1 antagonist, TNFR2 agonist or bispecific construct and control to determine treatment efficacy and treatment. can be evaluated
b. 류마티스성 관절염 활막 단핵 세포 배양b. Culture of rheumatoid arthritis synovial mononuclear cells
TNFR1 및 TNFR2를 발현하는 인간 류마티스성 관절염(RA) 활막 단핵 세포(MNC)는 또한 본 명세서에 제공된 작제물의 치료 효능을 시험하기 위해 사용될 수 있다. RA 활막 MNC는 관절 대체 수술을 받는 RA 환자로부터 얻을 수 있으며 RA 활막 세포 사이토카인 생산 및 조절을 평가하기 위해 생체 외에서 배양된다. RA 활막 MNC 배양은 외인성 자극이 없을 때 자발적으로 염증성 사이토카인과 케모카인을 생성하고; 이들 배양물 내의 예컨대 본 명세서에 제공된 작제물에 의한 TNF의 항체 매개 중화 및 TNFR1의 선택적 차단은 염증유발 사이토카인 및 케모카인, 예컨대 GM-CSF, IL-10, IL-1β, IL-6, IL-8, RANTES (CCL5) 및 MCP-1 (CCL2)의 생산을 억제할 수 있다. Human rheumatoid arthritis (RA) synovial mononuclear cells (MNC) expressing TNFR1 and TNFR2 can also be used to test the therapeutic efficacy of constructs provided herein. RA synovial MNCs can be obtained from RA patients undergoing joint replacement surgery and cultured ex vivo to assess RA synovial cell cytokine production and regulation. RA synovial MNC cultures spontaneously produce inflammatory cytokines and chemokines in the absence of exogenous stimuli; Antibody-mediated neutralization of TNF and selective blockade of TNFR1 in these cultures, such as by the constructs provided herein, can inhibit proinflammatory cytokines and chemokines, such as GM-CSF, IL-10, IL-1β, IL-6, IL-6, IL- 8, can inhibit the production of RANTES (CCL5) and MCP-1 (CCL2).
예시적인 검정에서, RA 활막 MNC를 제조하기 위해, RA 활막 조직을 작은 조각으로 절개하고, RPMI 1640에서 5 mg/ml 콜라게나제 A 및 0.15 mg/ml DNase와 함께 37°C에서 1시간 동안 인큐베이션한 후, 분해된 조직을 170 μm 필터에 통과시키고 100 단위/ml의 스트렙토마이신, 100 μg의 페니실린 및 10% FCS를 함유하는 RPMI 1640으로 3회 세척한다. 이종 RA 활막 MNC는 계대 없이 사용된다. 생체 외 세포 배양의 경우, RA 활막 MNC의 단일 세포 현탁액은 TNFR1 길항제, TNFR2 효능제, 또는 이중특이적 작제물 또는 대조군의 존재 또는 부재하에 37°C 및 5% CO2에서 2-5일 동안 96-웰 편평한 바닥 플레이트(2 x 105 세포/웰)에서 5% FCS가 있는 RPMI 1640 배지에서 배양된다. 그 다음 상청액을 수집하여 즉시 사용하거나 사이토카인 및 케모카인 ELISA에 의한 분석을 위해 -20°C에 보관한다 (예를 들어, 문헌[Schmidt 등 (2013) Arthritis & Rheumatism 65(9):2262-2273] 참조). 대안적으로, 배양 상층액의 사이토카인은 사이토카인 비드 배열 분석에 의해 정량화될 수 있다. In an exemplary assay, to prepare RA synovial MNC, RA synovial tissue was dissected into small pieces and incubated in RPMI 1640 with 5 mg/ml collagenase A and 0.15 mg/ml DNase at 37°C for 1 hour. After that, the digested tissue is passed through a 170 μm filter and washed three times with RPMI 1640 containing 100 units/ml of streptomycin, 100 μg of penicillin and 10% FCS. Heterogeneous RA synovial MNCs are used without passaging. For ex vivo cell culture, single cell suspensions of RA synovial MNCs were cultured in the presence or absence of TNFR1 antagonists, TNFR2 agonists, or bispecific constructs or controls at 37°C and 5% CO 2 for 2-5 days at 96 °C. -Well flat bottom plates (2 x 10 5 cells/well) are cultured in RPMI 1640 medium with 5% FCS. The supernatant is then collected and used immediately or stored at -20 °C for analysis by cytokine and chemokine ELISA (see, e.g., Schmidt et al. (2013) Arthritis & Rheumatism 65(9):2262-2273). Alternatively, cytokines in culture supernatants can be quantified by cytokine bead array analysis.
c. 관절염의 Tg197 마우스 모델c. Tg197 mouse model of arthritis
미란성 관절염의 마우스 모델인 Tg197 형질전환 마우스는 RA의 잘 확립된 동물 모델이다. Tg197 마우스는 인간 TNF를 과발현하고 인간 RA의 특징인 판누스 형성, 뼈 파괴 및 연골 손상을 동반한 대칭성 다발관절염을 발생시키는 인간 TNF-형질전환 C57BL/6 마우스이다. 만성 파괴성 관절 질환의 특징을 나타내는 것 외에도, 이 모델은 척추관절염과 같은 다른 염증성 질환의 특징인 골부착염 또는 양측 천장관절염과 같은 증상을 나타낸다 (문헌[Bluml 등 (2010) Arthritis & Rheumatism 62(6):1608-1619]). Tg197 마우스는 100% 침투성으로 관절염을 발생시키고 RA를 표적으로 하는 인간 치료제를 평가하기 위한 빠른 생체 내 모델을 제공한다. 예를 들어, Tg197 마우스 모델은 임상에서 성공적으로 적용된 최초의 항-TNF 치료제인 인플릭시맙(원래 Remicade®로 판매됨)의 치료 효능을 평가하는 데 사용되었으며 잠재적인 항-RA 치료제를 스크리닝하기 위해 FDA에 의해 권장한다. The mouse model of erosive arthritis, the Tg197 transgenic mouse, is a well-established animal model of RA. Tg197 mice are human TNF-transgenic C57BL/6 mice that overexpress human TNF and develop symmetric polyarthritis with pannus formation, bone destruction and cartilage damage characteristic of human RA. In addition to representing features of chronic destructive joint disease, this model exhibits symptoms such as enthesitis or bilateral sacroiliac arthritis that are characteristic of other inflammatory diseases such as spondyloarthritis (Bluml et al. (2010) Arthritis & Rheumatism 62(6). ):1608-1619]). The Tg197 mouse develops arthritis with 100% penetrance and provides a rapid in vivo model for evaluating human therapeutics targeting RA. For example, the Tg197 mouse model was used to evaluate the therapeutic efficacy of infliximab (originally marketed as Remicade®), the first anti-TNF drug successfully applied clinically, and to screen potential anti-RA therapies. recommended by the FDA for
Tg197 마우스는 3'-비번역 및 3'-측접 서열을 함유하는 3'-영역이 인간 β-글로빈 유전자의 3'-영역으로 교환되는 인간 TNF 유전자 작제물의 5개 카피를 가지고 있다. TNF mRNA의 3'-비번역 영역에서 고도로 보존된 일련의 UA 풍부 서열이 mRNA 안정성 및 번역 효율의 조절에 중요하기 때문에 이 유전자 작제물은 마우스 접합체에 미세 주입되어 탈조절된 TNF 유전자 발현의 생체 내 모델을 생성한다 예를 들어, 문헌[Keffer 등 (1991) EMBO J. 10(13):4025-4031] 참조). The Tg197 mouse has 5 copies of the human TNF gene construct in which the 3'-region containing the 3'-untranslated and 3'-flanking sequences is exchanged with the 3'-region of the human β-globin gene. Because a series of highly conserved UA-rich sequences in the 3′-untranslated region of TNF mRNA are important for the regulation of mRNA stability and translational efficiency, this genetic construct was microinjected into mouse zygotes to investigate deregulated TNF gene expression in vivo. create a model see, for example, Keffer et al. (1991) EMBO J. 10(13):4025-4031).
d. 관절염/IBD의 ΔARE 마우스 모델 d. ΔARE mouse model of arthritis/IBD
TNF mRNA(TnfΔ ARE )의 3' AU-풍부 요소(ARE)가 결실된 마우스는 4-8주령에서 TNF를 과잉 생산하고 조직병리학적으로 크론병과 유사한 염증성 장 질환이 발생한다. 마우스는 또한 RA의 임상 징후를 나타낸다. 본 명세서에 제공되는 TNFR1 길항제, TNFR2 효능제 및 이중특이적 작제물의 효능은 복강내 주사 후 TnfΔA RE 마우스에서 크론병 유사 병리 및 관절염에 대한 억제 효과를 평가함으로써 평가될 수 있다 (예를 들어, 문헌[미국 특허 제9,028,822호] 참조). Mice lacking the 3' AU-rich element (ARE) of TNF mRNA (TnfΔ ARE ) overproduce TNF at 4-8 weeks of age and histopathologically develop inflammatory bowel disease similar to Crohn's disease. Mice also show clinical signs of RA. The efficacy of the TNFR1 antagonists, TNFR2 agonists and bispecific constructs provided herein can be evaluated by evaluating the inhibitory effect on Crohn's disease-like pathology and arthritis in TnfΔ A RE mice following intraperitoneal injection (e.g. , see U.S. Patent No. 9,028,822).
e. 인간화 TNF/TNFR2 마우스e. Humanized TNF/TNFR2 mice
TNF/TNFR2 신호전달 경로를 표적으로 하는 치료제 개발의 한계는, 많은 인간 항-TNF 치료제가 뮤린 TNF 또는 TNFR2와 상호 작용하지 않고 인간 TNF가 TNFNR2가 아닌 뮤린 TNFR1에 결합하여 관여할 수 있기 때문에 전임상 동물 모델이 없다는 것이다. 기능적 인간 TNF-TNFR2(hTNF-hTNFR2) 신호전달 모듈을 운반하는 인간화 TNF/TNFR2 마우스는 자가면역의 다양한 모델에서 치료제, 예컨대 효능적 및 길항적 항체 작제물 인간 TNF 또는 인간 TNFR2를 평가하는 데 사용할 수 있다. 이러한 TNF/TNFR2 이중 인간화 마우스는 예를 들어 본 명세서에 제공된 TNFR2 효능제 작제물을 평가하기 위해 사용될 수 있다. A limitation of the development of therapeutics targeting the TNF/TNFR2 signaling pathway is that many human anti-TNF therapeutics do not interact with murine TNF or TNFR2, and human TNF may bind to and engage murine TNFR1, but not TNFNR2, in preclinical animals. that there is no model. Humanized TNF/TNFR2 mice carrying a functional human TNF-TNFR2 (hTNF-hTNFR2) signaling module can be used to evaluate therapeutics such as agonistic and antagonistic antibody constructs human TNF or human TNFR2 in various models of autoimmunity. there is. Such TNF/TNFR2 double humanized mice can be used, for example, to evaluate the TNFR2 agonist constructs provided herein.
인간화 TNF/TNFR2 마우스는 문헌[Atretkhany 등 (2018) Proc . Natl . Acad . Sci. U.S.A . 115(51):13051-13056]에 기재된 바와 같이 생성될 수 있다. 간단히 말해서, 인간 TNFR2 녹-인 (hTNFR2KI) 및 인간 TNF 녹-인 (hTNFKI) 마우스는 표준 유전 공학 기술을 사용하여 생성된다. 인간 TNF 유전자가 마우스 TNF 유전자를 대체한 hTNFKI 마우스를 인간화 TNFR2 리간드 결합 부분을 함유하는 hTNFR2KI 마우스와 교배한 다음, 이중 인간화 이중 동형접합 hTNFKI x hTNFR2KI 마우스를 생성하기 위해 이종 교배한다. 특정 세포, 예를 들어 Treg에서 TNFR2 신호전달의 역할을 평가하기 위해, hTNFR2 유전자좌 내에 두 개의 LoxP 부위가 삽입되어 TNFR2의 세포외 부분의 조건부 Cre 매개 절제가 가능하다. TNFR2의 Treg 특이적 결실을 위해, 이들 마우스는 FoxP3-Cre 형질전환 마우스와 교배된다 (예를 들어, 문헌[Atretkhany 등 (2018) Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 115(51):13051-13056] 참조). Humanized TNF/TNFR2 mice are described by Atretkhany et al. (2018) Proc . Natl . Acad . Sci. USA . 115(51):13051-13056. Briefly, human TNFR2 knock-in (hTNFR2KI) and human TNF knock-in (hTNFKI) mice are generated using standard genetic engineering techniques. hTNFKI mice in which the human TNF gene has replaced the mouse TNF gene are crossed with hTNFR2KI mice containing the humanized TNFR2 ligand binding region and then crossed to generate double humanized double homozygous hTNFKI x hTNFR2KI mice. To assess the role of TNFR2 signaling in specific cells, eg Tregs, two LoxP sites were inserted within the hTNFR2 locus to allow conditional Cre-mediated ablation of the extracellular portion of TNFR2. For Treg-specific deletion of TNFR2, these mice are crossed with FoxP3-Cre transgenic mice (see, for example, Atretkhany et al. (2018) Proc. Natl. Acad. Sci. USA 115(51):13051-13056).
I. I. TNFR1TNFR1 길항제 antagonist 작제물construct 및 and TNFR1TNFR1 길항제/ antagonist/ TNFR2TNFR2 효능제agonist 작제물을construct 인코딩하는 핵산을 생산하는 방법 Methods of producing nucleic acids that encode
펩리펩티드인, 본 명세서에 제공되는 TNFR1 길항제 폴리펩티드, TNFR2 효능제 폴리펩티드, 및 TNFR1 길항제/TNFR2 효능제 폴리펩티드 작제물은 단백질 정제 및 재조합 단백질 발현, 및 또한 재조합 항체 제제를 위해 당업계에 널리 공지된 방법에 의해 수득될 수 있다. 폴리펩티드가 아닌 링커와 같은 부분을 포함하는 본 명세서에서 제공되는 작제물은 적절한 경우 화학적 접합 방법에 의해 제조될 수 있다. 폴리펩티드 부분은 표준 재조합 기술에 의해, 예를 들어 적합한 숙주(글리코실화가 바람직하지 않은 경우 세균성, 또는 글리코실화된 형태가 필요한 경우 HEK293 및 CHO 세포와 같은 진핵 세포에서)에서의 발현에 의해 생성될 수 있다. 활성 항체 및 항체 단편은 E. 콜라이(E. coli)에서 생산되었지만 부적절한 접힘으로 인해 종종 응집 및 용해도 문제가 있으며 이는 코딩 서열의 추가 돌연변이유발에 의해 해결될 수 있다 (예를 들어, 문헌[Kunz 등 (2018) Sci Rep. 8(1):7934] 참조). TNFR1 antagonist polypeptides, TNFR2 agonist polypeptides, and TNFR1 antagonist/TNFR2 agonist polypeptide constructs provided herein, which are peptides, can be used by methods well known in the art for protein purification and recombinant protein expression, and also for recombinant antibody preparation. can be obtained by Constructs provided herein that contain moieties, such as linkers, that are not polypeptides can, where appropriate, be prepared by chemical conjugation methods. The polypeptide portion can be generated by standard recombinant techniques, for example by expression in a suitable host (bacterial if glycosylation is not desired, or in eukaryotic cells such as HEK293 and CHO cells if a glycosylated form is desired). there is. Active antibodies and antibody fragments have been produced in E. coli but often suffer from aggregation and solubility problems due to improper folding, which can be addressed by further mutagenesis of the coding sequence (see, e.g., Kunz et al. (2018) Sci Rep. 8(1) :7934).
폴리펩티드는 또한 화학적으로 합성될 수 있다. 융합 폴리펩티드는 재조합체 생산의 표준 방법에 의해 합성될 수 있다. 상기에 논의한 다양한 작제물의 성분은 개별적으로 합성할 수 있으며 표준 방법을 사용하여 조합하여 작제물을 생성할 수 있다.Polypeptides can also be chemically synthesized. Fusion polypeptides can be synthesized by standard methods of recombinant production. The components of the various constructs discussed above can be synthesized individually and combined using standard methods to create the construct.
말단절단된 형태를 포함하는 변형 또는 변이체를 포함하는 폴리펩티드 작제물 또는 그의 폴리펩티드 부분을 인코딩하는 핵산은 핵산으로부터 제조될 수 있다. 변형된 또는 변이체 폴리펩티드는 표준 재조합 DNA 방법을 사용하여 야생형 폴리펩티드를 인코딩하는 핵산으로부터 조작될 수 있다. 예를 들어, TNFR1 또는 TNFR2에 선택적으로 결합하고/하거나 TNFR1을 선택적으로 길항하거나 TNFR2를 선택적으로 효능시키는 TNF 뮤테인과 같은 변형된 TNF 폴리펩티드는 예컨대 인코딩 DNA의 부위 지정 돌연변이유발에 의해 야생형 TNF로부터 조작될 수 있다. 당업자에게 공지된 임의의 방법이 사용될 수 있다. 실시예에서 하기 논의 및 설명은 예시적이다. Nucleic acids encoding polypeptide constructs or polypeptide portions thereof, including modifications or variants, including truncated forms, can be prepared from nucleic acids. Modified or variant polypeptides can be engineered from nucleic acids encoding wild-type polypeptides using standard recombinant DNA methods. For example, a modified TNF polypeptide such as a TNF mutein that selectively binds TNFR1 or TNFR2 and/or selectively antagonizes TNFR1 or selectively agonizes TNFR2 can be engineered from wild-type TNF, such as by site-directed mutagenesis of the encoding DNA. It can be. Any method known to those skilled in the art may be used. The discussion and explanations below in the examples are illustrative.
1. One. TNFR1TNFR1 길항제 및 antagonist and TNRF2TNRF2 효능제agonist 폴리펩티드를 인코딩하는 핵산의 단리 또는 제조 Isolation or Preparation of Nucleic Acids Encoding Polypeptides
TNFR1 길항제 폴리펩티드, TNFR2 효능제 폴리펩티드 및 TNFR1 길항제/TNFR2 효능제 폴리펩티드 작제물을 인코딩하는 핵산은 핵산 분자를 클로닝 및 분리하기 위해 당업계에 공지된 임의의 이용가능한 방법을 사용하여 클로닝 또는 분리될 수 있다. 이러한 방법에는 핵산의 중합효소 연쇄 반응(PCR) 증폭 및 핵산 혼성화 스크리닝, 항체 기반 스크리닝 및 활성 기반 스크리닝을 포함하는 라이브러리 스크리닝이 포함된다. 예를 들어, 폴리펩티드가 재조합 수단에 의해 생성되는 경우, 원하는 폴리펩티드를 인코딩하는 핵산의 확인을 위해 당업자에게 공지된 임의의 방법이 사용될 수 있다. Nucleic acids encoding TNFR1 antagonist polypeptides, TNFR2 agonist polypeptides and TNFR1 antagonist/TNFR2 agonist polypeptide constructs can be cloned or isolated using any available method known in the art for cloning and isolating nucleic acid molecules. . Such methods include polymerase chain reaction (PCR) amplification of nucleic acids and screening of libraries, including nucleic acid hybridization screening, antibody-based screening and activity-based screening. For example, where the polypeptide is produced by recombinant means, any method known to those skilled in the art can be used for the identification of nucleic acids encoding the desired polypeptide.
본 명세서의 폴리펩티드를 인코딩하는 핵산 분자는 합성으로 생성될 수 있거나, 필요에 따라 (예를 들어, the 항체 단편, 예를 들어, 단일 도메인 항체 (dAb), scFv 단편, 및 Fab 항체 단편의 중쇄 및/또는 경쇄를 인코딩하는 유전자에 특이적으로 결합할 수 있는 올리고뉴클레오티드 프로브를 사용함으로써) 종래 절차를 사용하여 용이하게 단리 및 서열분석될 수 있다 예를 들어, TNFR1 길항제 또는 TNFR2 효능제 항체 또는 그의 단편(들)을 생산하거나 발현하는 것으로 알려진 임의의 세포 공급원은 이러한 DNA의 공급원으로 작용할 수 있다. 또 다른 예에서, 일단 TNFR1 길항제 또는 TNFR2 효능제 항체 또는 그의 단편(들)을 인코딩하는 DNA의 서열이 결정되면, 유전자 합성 기술을 사용하여 핵산 서열을 작제할 수 있다.Nucleic acid molecules encoding the polypeptides herein may be produced synthetically, or as desired (e.g., the heavy chains and can be readily isolated and sequenced using conventional procedures, e.g., TNFR1 antagonist or TNFR2 agonist antibodies or fragments thereof. Any cell source known to produce or express the (s) can serve as a source of such DNA. In another example, once the sequence of DNA encoding the TNFR1 antagonist or TNFR2 agonist antibody or fragment(s) thereof has been determined, gene synthesis techniques can be used to construct a nucleic acid sequence.
예를 들어 중합효소 연쇄 반응(PCR) 방법을 포함하는 핵산 증폭 방법을 사용하여 원하는 폴리펩티드를 인코딩하는 핵산 분자를 분리할 수 있다. 이러한 방법의 예는 Perkin-Elmer Cetus 열주기장치 및 Taq 중합효소(Gene Amp)의 사용을 포함한다. 핵산 함유 물질은 원하는 폴리펩티드 인코딩 핵산 분자가 단리될 수 있는 출발 물질로서 사용될 수 있다. 예를 들어, DNA 및 mRNA 제제, 세포 추출물, 조직 추출물, 유체 샘플(예를 들어, 혈액, 혈청 및 타액), 건강한 및/또는 병든 대상체의 샘플을 증폭 방법에 사용할 수 있다. 일반적으로 인간 공급원일 수 있는 공급원은 적절한 경우 척추동물, 포유동물, 인간, 돼지, 소, 고양이, 조류, 말, 개 및 다른 영장류 공급원을 포함하지만 이에 제한되지 않는 임의의 진핵생물 종으로부터의 것일 수 있다. 핵산 라이브러리는 또한 출발 물질의 공급원으로 사용될 수 있다. 프라이머는 원하는 폴리펩티드를 증폭하도록 설계될 수 있다. 예를 들어, 원하는 폴리펩티드가 생성되는 발현된 서열에 기초하여 프라이머를 설계할 수 있다. 프라이머는 폴리펩티드 아미노산 서열의 역번역을 기반으로 설계될 수 있다. 원하는 경우 축퇴 프라이머를 증폭에 사용할 수 있다. 원하는 서열의 3' 및 5' 말단에서 서열에 혼성화하는 올리고뉴클레오티드 프라이머는 핵산 샘플로부터 PCR에 의해 서열을 증폭하기 위한 프라이머로 사용될 수 있다. 프라이머는 본 명세서에서 제공되는 TNFR1 길항제/TNFR2 효능제 폴리펩티드 작제물뿐만 아니라 임의의 TNFR1 길항제 및 TNFR1 효능제 폴리펩티드를 인코딩하는 핵산과 같은 전체 전장 폴리펩티드 또는 그의 말단절단된 서열을 증폭하는 데 사용될 수 있다. 증폭에 의해 생성된 핵산 분자는 원하는 폴리펩티드 또는 작제물을 인코딩하는 것으로 시퀀싱되고 확인될 수 있다. Nucleic acid amplification methods, including, for example, polymerase chain reaction (PCR) methods, can be used to isolate nucleic acid molecules encoding a desired polypeptide. Examples of such methods include the use of a Perkin-Elmer Cetus thermal cycler and Taq polymerase (Gene Amp). A nucleic acid-containing material can be used as a starting material from which a nucleic acid molecule encoding a desired polypeptide can be isolated. For example, DNA and mRNA preparations, cell extracts, tissue extracts, fluid samples (eg, blood, serum and saliva), samples from healthy and/or diseased subjects can be used in the amplification method. In general, sources that may be human sources may be from any eukaryotic species, including, but not limited to, vertebrate, mammalian, human, porcine, bovine, feline, avian, equine, canine, and other primate sources where appropriate. there is. A nucleic acid library can also be used as a source of starting material. Primers can be designed to amplify a desired polypeptide. For example, primers can be designed based on the expressed sequence resulting in the desired polypeptide. Primers can be designed based on reverse translation of a polypeptide amino acid sequence. Degenerate primers can be used for amplification if desired. Oligonucleotide primers that hybridize to sequences at the 3' and 5' ends of the desired sequence can be used as primers to amplify the sequence by PCR from a nucleic acid sample. Primers can be used to amplify full-length polypeptides or truncated sequences thereof, such as nucleic acids encoding the TNFR1 antagonist/TNFR2 agonist polypeptide constructs provided herein, as well as any TNFR1 antagonist and TNFR1 agonist polypeptides. Nucleic acid molecules produced by amplification can be sequenced and identified as encoding the desired polypeptide or construct.
TNFR1 길항제 또는 TNFR2 효능제 항체 또는 그의 단편(들)의 추가 변형 형태를 생성하고 Fc 및 힌지 영역 및 링커 부분과 같은 활성 변형제의 변형 형태를 생성하기 위해 돌연변이유발 기술을 사용할 수 있다. DNA도 변형될 수 있다. 예를 들어, 유전자 합성 및 일상적인 분자 생물학 기술을 사용하여 뉴클레오티드의 삽입, 결실, 첨가 또는 대체/치환을 수행할 수 있다. 추가의 뉴클레오티드 서열은 합성 유전자를 벡터, 예를 들어, 단백질 발현 벡터 또는 코어 폴리펩티드 코딩 DNA 서열의 증폭을 위해 설계된 벡터에 클로닝할 목적으로 제한 엔도뉴클레아제 부위를 함유하는 링커 서열을 포함하는 폴리펩티드 인코딩 핵산 분자에 결합될 수 있다. 프로모터, 인핸서 및 IRES 서열과 같은 기능적 DNA 요소를 지정하는 추가 뉴클레오티드 서열은 폴리펩티드 인코딩 핵산 분자에 작동 가능하게 연결될 수 있다. 이러한 서열의 예는 세포내 단백질 발현을 촉진하도록 설계된 프로모터 서열 및 분비 서열, 예를 들어 단백질 분비를 촉진하도록 설계된 이종 신호 서열을 포함하지만 이에 제한되지 않는다. 이러한 서열은 당업자에게 공지되어 있다. 단백질 결합 영역을 지정하는 서열과 같은 추가 뉴클레오티드 서열은 또한 연결된 폴리펩티드 인코딩 핵산 분자일 수 있다. 이러한 영역은 특정 표적 세포로의 폴리펩티드의 흡수를 용이하게 하거나 합성 유전자 생성물의 약동학을 변경하거나 강화시키는 서열을 포함하지만 이에 제한되지 않는다.Mutagenesis techniques can be used to generate additional modified forms of TNFR1 antagonist or TNFR2 agonist antibodies or fragment(s) thereof and to create modified forms of active modifiers such as Fc and hinge region and linker portions. DNA can also be modified. For example, insertions, deletions, additions or replacements/substitutions of nucleotides can be performed using gene synthesis and routine molecular biology techniques. The additional nucleotide sequence encodes a polypeptide comprising a linker sequence containing restriction endonuclease sites for the purpose of cloning the synthetic gene into a vector, e.g., a protein expression vector or a vector designed for amplification of a core polypeptide encoding DNA sequence. Can be bound to nucleic acid molecules. Additional nucleotide sequences specifying functional DNA elements such as promoters, enhancers and IRES sequences can be operably linked to the nucleic acid molecule encoding the polypeptide. Examples of such sequences include, but are not limited to, promoter sequences and secretory sequences designed to promote intracellular protein expression, such as heterologous signal sequences designed to promote protein secretion. Such sequences are known to those skilled in the art. Additional nucleotide sequences, such as sequences specifying protein binding regions, may also be linked polypeptide encoding nucleic acid molecules. Such regions include, but are not limited to, sequences that facilitate uptake of the polypeptide into specific target cells or alter or enhance the pharmacokinetics of the synthetic gene product.
태그 및/또는 다른 모이어티는 예를 들어 폴리펩티드의 검출 또는 친화성 정제를 돕기 위해 추가될 수 있다. 예를 들어, 에피토프 태그 또는 다른 검출 가능한 마커를 지정하는 염기 서열과 같은 추가 뉴클레오티드 서열도 폴리펩티드 인코딩 핵산 분자에 연결될 수 있다. 그러한 서열의 예는 SUMO 태그, 또는 His 태그 또는 플래그 태그를 인코딩하는 핵산 서열을 포함한다.Tags and/or other moieties may be added, for example, to aid detection or affinity purification of the polypeptide. Additional nucleotide sequences may also be linked to the polypeptide-encoding nucleic acid molecule, such as, for example, base sequences specifying epitope tags or other detectable markers. Examples of such sequences include nucleic acid sequences encoding SUMO tags, or His tags or Flag tags.
본 명세서에 제공된 임의의 아미노산 서열은 벡터로 클로닝될 수 있고 본 명세서에 제공된 폴리펩티드, 항체 및 항체 단편을 포함하는 작제물을 생성하기 위해 발현될 수 있는 상응하는 인코딩 핵산 서열을 생성하기 위해 당업자에 의해 일반적으로 사용되는 표준 방법을 사용하여 역번역(다시 번역이라고도 함)될 수 있다. 예를 들어, 단백질 서열을 인코딩 DNA 서열로 전환하는 데 사용할 수 있는 여러 온라인 도구, 예컨대 bioinformatics.org/sms2/rev_trans.html; biophp.org/minitools/protein_to_dna/demo.php; vivo.colostate.edu/molkit/rtranslate/; ebi.ac.uk/Tools/st/emboss_backtranseq/; molbiol.ru/eng/scripts/01_19.html; 및 geneinfinity.org/sms/sms_backtranslation.html가 있다. 이러한 역 번역된 서열은 제공된 항체 또는 단편의 발현 및 생성을 위해 본 명세서에 제공된 임의의 발현 벡터에 삽입될 수 있다. 항-TFR1 및 항-TNFR2 항체, 예컨대 TNFR1 길항제 및 TNFR2 효능제 작제물은 전장 단백질 또는 전장 단백질 미만으로 발현될 수 있다. 예를 들어, 단일 도메인 항체(dAb), scFv 단편 및 Fab 단편과 같으나 이에 제한되지 않는 항체 단편이 발현될 수 있다. Any amino acid sequence provided herein can be cloned into a vector and used by those skilled in the art to generate a corresponding encoding nucleic acid sequence that can be expressed to generate constructs comprising the polypeptides, antibodies and antibody fragments provided herein. It can be back-translated (also called back-translation) using standard commonly used methods. For example, there are several online tools that can be used to convert protein sequences into encoding DNA sequences, such as bioinformatics.org/sms2/rev_trans.html; biophp.org/minitools/protein_to_dna/demo.php; vivo.colostate.edu/molkit/rtranslate/; ebi.ac.uk/Tools/st/emboss_backtranseq/; molbiol.ru/eng/scripts/01_19.html; and geneinfinity.org/sms/sms_backtranslation.html. Such reverse translated sequences can be inserted into any of the expression vectors provided herein for expression and production of the provided antibodies or fragments. Anti-TFR1 and anti-TNFR2 antibodies, such as TNFR1 antagonist and TNFR2 agonist constructs, can be expressed as full-length or less than full-length proteins. For example, antibody fragments such as but not limited to single domain antibodies (dAbs), scFv fragments and Fab fragments may be expressed.
식별되고 단리된 핵산은 적절한 클로닝 벡터에 삽입될 수 있다. 당업계에 공지된 다수의 벡터-숙주 시스템이 사용될 수 있다. 가능한 벡터에는 플라스미드 또는 변형된 바이러스가 포함되지만 이에 제한되지는 않지만 벡터 시스템은 사용되는 숙주 세포와 호환되어야 한다. 그러한 벡터는 박테리오파아지 예컨대 람다 유도체, 또는 플라스미드 예컨대 pCMV4, pBR322 또는 pUC 플라스미드 유도체 또는 pBlue스트립트 벡터 (Stratagene, La Jolla, CA)을 포함하지만 이에 제한되지 않는다. 예를 들어, 클로닝 벡터로의 삽입은 DNA 단편을 상보적 응집 말단을 갖는 클로닝 벡터로 결찰함으로써 달성될 수 있다. 삽입은 TOPO 클로닝 벡터(Invitrogen, Carlsbad, CA)를 사용하여 수행할 수 있다.The identified and isolated nucleic acids can be inserted into an appropriate cloning vector. A number of vector-host systems known in the art can be used. Possible vectors include, but are not limited to, plasmids or modified viruses, provided that the vector system is compatible with the host cell used. Such vectors include, but are not limited to, bacteriophages such as lambda derivatives, or plasmids such as pCMV4, pBR322 or pUC plasmid derivatives or the pBlueScript vector (Stratagene, La Jolla, Calif.). For example, insertion into a cloning vector can be accomplished by ligating a DNA fragment into a cloning vector with complementary cohesive ends. Insertion can be performed using the TOPO cloning vector (Invitrogen, Carlsbad, Calif.).
DNA를 단편화하는 데 사용되는 상보적 제한 부위가 클로닝 벡터에 없으면 DNA 분자의 단부가 효소로 변형될 수 있다. 대안적으로, 원하는 부위는 DNA 말단에 뉴클레오티드 서열(링커)을 결찰하여 생성할 수 있고; 이러한 결찰된 링커는 제한 엔도뉴클레아제 인식 서열을 인코딩하는 특정 화학적으로 합성된 올리고뉴클레오티드를 함유할 수 있다. 대안적인 방법에서, 절단된 벡터 및 폴리펩티드 유전자는 단독중합체 테일링에 의해 변형될 수 있다.If the cloning vector does not have complementary restriction sites used to fragment the DNA, the ends of the DNA molecule can be modified with enzymes. Alternatively, the desired site can be created by ligating nucleotide sequences (linkers) to the ends of the DNA; Such ligated linkers may contain specific chemically synthesized oligonucleotides encoding restriction endonuclease recognition sequences. In an alternative method, truncated vectors and polypeptide genes can be modified by homopolymer tailing.
재조합 분자는 예를 들어 형질전환, 형질감염, 감염, 전기천공법 및 초음파천공을 통해 숙주 세포에 도입될 수 있으므로 유전자 서열의 많은 카피가 생성된다. 특정 구현예에서, 단리된 폴리펩티드 유전자, cDNA 또는 합성 DNA 서열을 혼입하는 재조합 DNA 분자로 숙주 세포를 형질전환시키면 유전자의 다중 카피 생성이 가능해진다. 따라서, 형질전환체를 성장시키고, 형질전환체로부터 재조합 DNA 분자를 단리하고, 필요에 따라 단리된 재조합 DNA로부터 삽입된 유전자를 회수함으로써 유전자를 대량으로 얻을 수 있다.Recombinant molecules can be introduced into host cells through, for example, transformation, transfection, infection, electroporation and sonoporation, so that many copies of the gene sequence are produced. In certain embodiments, transformation of a host cell with a recombinant DNA molecule incorporating an isolated polypeptide gene, cDNA or synthetic DNA sequence allows generation of multiple copies of the gene. Therefore, a gene can be obtained in large quantities by growing a transformant, isolating a recombinant DNA molecule from the transformant, and, if necessary, recovering the inserted gene from the isolated recombinant DNA.
항체 및 그 단편의 발현을 위해, 일반적으로 항체의 중쇄를 인코딩하는 핵산 분자가 벡터에 클로닝되고, 항체의 경쇄를 인코딩하는 핵산 분자가 벡터에 클로닝된다. 항체 및 그 부분의 생산 방법은 잘 알려져 있다 (예를 들어, 미국 특허 번호 4,816,567, 6,331,415, 및 7,923,221, 및 수많은 기타 중요 특허 참조). 유전자는 이중 발현을 위한 단일 벡터 또는 별도의 벡터로 클로닝될 수 있다. 원하는 경우, 벡터는 또한 다른 항체 형태를 생성하기 위해 추가적인 불변 영역(들) 또는 힌지 영역을 인코딩하는 추가 서열을 포함할 수 있다. 벡터는 형질감염되어 숙주 세포에서 발현될 수 있다. 발현은 당업자에게 공지된 임의의 세포 발현 시스템일 수 있다. 예를 들어, 숙주 세포는 재조합 숙주 세포에서 항체 합성을 얻기 위해 달리 면역글로불린 단백질을 생산하지 않는 세포를 포함한다. 예를 들어, 숙주 세포는 유인원 COS 세포, 예를 들어, CHO-DG44 (DHFR-) 및 FreeStyleTM CHO-S 세포, Invitrogen)와 같은 차이니즈 햄스터 난소 (CHO) 세포, 293FS 세포, HEK293 세포, NSO 세포 또는 다른 골수종 세포를 포함하지만 이에 제한되지 않는다. 다른 발현 벡터 및 숙주 세포는 본 명세서에 기재되어 있다. For expression of antibodies and fragments thereof, generally a nucleic acid molecule encoding the heavy chain of an antibody is cloned into a vector, and a nucleic acid molecule encoding the light chain of an antibody is cloned into a vector. Methods for producing antibodies and portions thereof are well known (see, eg, US Pat. Nos. 4,816,567, 6,331,415, and 7,923,221, and numerous other important patents). Genes can be cloned into a single vector for dual expression or into separate vectors. If desired, the vectors may also contain additional sequences encoding additional constant region(s) or hinge regions to generate other antibody forms. Vectors can be transfected and expressed in host cells. Expression can be any cellular expression system known to those skilled in the art. For example, host cells include cells that do not otherwise produce immunoglobulin proteins to obtain antibody synthesis in a recombinant host cell. For example, host cells include simian COS cells, such as Chinese Hamster Ovary (CHO) cells such as CHO-DG44 (DHFR-) and FreeStyle ™ CHO-S cells, Invitrogen), 293FS cells, HEK293 cells, NSO cells. or other myeloma cells. Other expression vectors and host cells are described herein.
TNFR1 길항제, TNFR2 효능제 및 TNFR1 길항제/TNFR2 효능제 작제물을 포함하는 본 명세서에 제공된 작제물은 항원 결합 단편, 예를 들어, 단일 도메인 항체 (dAb), Fab, Fab', Fab 힌지, F(ab')2, 단쇄 Fv (scFv), scFv 탠덤, Fv, dsFv, scFv 힌지, scFv 힌지(ΔE), 디아바디, Fd 및 Fd' 단편을 포함하지만 이에 제한되지 않는 전장 작제물 또는 전장 미만으로 생성되거나 발현될 수 있다. 항체 단편 생산을 위한 다양한 기술이 있다. 예를 들어, 단편은 온전한 항체의 단백분해 소화를 통해 유래될 수 있다 (예를 들어, 문헌[Morimoto and Inouye (1992) Journal of Biochemical and Biophysical Methods 24:107-117; Brennan 등 (1985) Science 229:81-83] 참조). 단편은 또한 재조합 숙주 세포에 의해 직접 생산될 수 있다. 예를 들어, dAb, Fab, Fv 및 scFv 항체 단편은 모두 E. 콜라이(E. coli), CHO 세포 또는 HEK293 세포와 같은 숙주 세포에서 발현되고 분비될 수 있으며, 따라서 이러한 단편의 대량 생산을 촉진한다. F(ab')2 단편은 Fab'-SH 단편을 화학적으로 커플링함으로써 생성될 수 있거나(예를 들어, 문헌[Carter 등 (1992) Bio/Technology, 10:163-167] 참조), 또는 이들은 재조합 숙주 세포 배양물로부터 직접 단리될 수 있다. 일부 예에서, TNFR1 길항제 작제물은 단일 도메인 항체를 포함한다 (dAb; 예를 들어 국제 출원 공개 번호 WO 2004/058820, WO 2004/081026, WO 2005/035572, WO 2006/038027, WO 2007/049017, WO 2008/149144, WO 2008/149148, WO 2010/094720, WO 2011/006914, WO 2011/051217, WO 2012/172070, WO 2012/104322, 및 WO 2015/104322; Enever 등, (2015) Protein Engineering, Design & Selection 28(3):59-66에 기재됨), 미국 출원 공개 번호 2006/0083747, 2010/0034831, 및 2012/0107330; 및 미국 특허 번호 9,028,817 및 9,028,822), 단쇄 Fv 단편 (scFv) (참고, 예를 들어, 국제 출원 공개 번호 WO 2017/174586, 및 WO 2008/113515; 또한, [Richter, F. Thesis, 명칭 ["Evolution of the Antagonistic Tumor Necrosis Factor Receptor One-Specific Antibody ATROSAB," Universitat Stuttgart, 2015] 참조; pdfs.semanticscholar.org/d8e7/8b87d76dce36225c1d497939ef37445cfa8a.pdf로부터 이용가능). dAb, Fv 및 scFv 단편은 온전한 결합 부위를 갖지만 불변 영역이 없고; 따라서 이들은 생체 내 사용 중에 감소된 비-특이적 결합에 적합하다. dAb 및 scFv 융합 단백질은 dAb 또는 scFv의 아미노 말단 또는 카복시 말단에 이펙터 단백질(예를 들어, IgG Fc)을 부착하도록 작제될 수 있다. 항체 단편은 또한 선형 항체일 수 있다 (예를 들어, 미국 특허 제5,641,870호 참조). 이러한 선형 항체 단편은 단일특이성 또는 이중특이성일 수 있다. 항체 단편의 생산을 위한 다른 기술은 당업자에게 공지되어 있다. Constructs provided herein, including TNFR1 antagonist, TNFR2 agonist and TNFR1 antagonist/TNFR2 agonist constructs, can comprise an antigen-binding fragment, e.g., a single domain antibody (dAb), Fab, Fab', Fab hinge, F( ab')2, short-chain Fv (scFv), scFv tandem, Fv, dsFv, scFv hinge, scFv hinge (ΔE), diabodies, Fd and Fd' fragments, including but not limited to full-length constructs or less than full-length can be or manifest. There are a variety of techniques for producing antibody fragments. For example, fragments can be derived through proteolytic digestion of intact antibodies (see, eg, Morimoto and Inouye (1992) Journal of Biochemical and Biophysical Methods 24:107-117; Brennan et al. (1985) Science 229:81-83). Fragments can also be produced directly by recombinant host cells. For example, dAb, Fab, Fv and scFv antibody fragments can all be expressed and secreted in host cells such as E. coli , CHO cells or HEK293 cells, thus facilitating mass production of such fragments. . F(ab') 2 fragments may be generated by chemically coupling Fab'-SH fragments (see, eg, Carter et al. (1992) Bio/Technology , 10:163-167), or they may be It can be isolated directly from recombinant host cell culture. In some instances, the TNFR1 antagonist construct comprises a single domain antibody (dAb; see, eg, International Application Publication Nos. WO 2004/058820, WO 2004/081026, WO 2005/035572, WO 2006/038027, WO 2007/049017, WO 2008/149144, WO 2008/149148, WO 2010/094720, WO 2011/006914, WO 2011/051217, WO 2012/172070, WO 2012/104322, and WO 2015/104322; Enever et al., (2015 ) Protein Engineering, Design & Selection 28(3) :59-66), US Application Publication Nos. 2006/0083747, 2010/0034831, and 2012/0107330; and U.S. Patent Nos. 9,028,817 and 9,028,822), single-chain Fv fragments (scFv) (see, eg, International Application Publication Nos. WO 2017/174586, and WO 2008/113515; also [Richter, F. Thesis, titled ["Evolution of the Antagonistic Tumor Necrosis Factor Receptor One-Specific Antibody ATROSAB," Universitat Stuttgart, 2015; available from pdfs.semanticscholar.org/d8e7/8b87d76dce36225c1d497939ef37445cfa8a.pdf). dAb, Fv and scFv fragments have intact binding sites but no constant regions; They are therefore suitable for reduced non-specific binding during in vivo use. dAb and scFv fusion proteins can be constructed to attach an effector protein (eg, an IgG Fc) to either the amino terminus or the carboxy terminus of the dAb or scFv. Antibody fragments can also be linear antibodies (see, eg, US Pat. No. 5,641,870). Such linear antibody fragments may be monospecific or bispecific. Other techniques for the production of antibody fragments are known to those skilled in the art.
발현 시, 항체 중쇄 및 경쇄, 또는 그의 단편(들)은 사슬간 디설파이드 결합에 의해 쌍을 이루어 전장 항체 또는 그의 단편을 형성한다. 예를 들어, 전장 Ig의 발현을 위해, VH-CH1-힌지-CH2-CH3을 인코딩하는 서열은 제1 발현 벡터에 클로닝될 수 있고, VL-CL 도메인을 인코딩하는 서열은 제2 발현 벡터에 클로닝될 수 있다. 공동 발현시, 전장 중쇄 및 경쇄는 디설파이드 결합에 의해 상호 연결되어 전장 항체를 생성한다. 또 다른 예에서, Fab를 생성하기 위해, VH 및 CH1 영역을 함유하는 단편을 인코딩하는 서열은 제1 발현 벡터로 클로닝될 수 있고, VL-CL 도메인을 인코딩하는 서열은 제2 발현 벡터로 클로닝될 수 있다. 공동 발현 시, 중쇄는 경쇄와 쌍을 이루어 Fab 단량체를 생성한다. 다양한 IgG 하유유형의 CH1, 힌지, CH2 및/또는 CH3 영역의 서열은 당업자에게 공지되어 있다 (예를 들어, 미국 공개 제2008/0248028호 참조; 또한, 서열번호: 9, 11, 13, 및 15 참조). 마찬가지로, CL, 람다 또는 카파의 서열도 알려져 있다 (예를 들어, 미국 공개 제2008/0248028호; 또한, 서열번호: 17-22 참조) Upon expression, the antibody heavy and light chains, or fragment(s) thereof, are paired by interchain disulfide bonds to form a full length antibody or fragment(s) thereof. For example, for expression of a full-length Ig, a sequence encoding V H -C H 1-hinge-C H 2-C H 3 can be cloned into a first expression vector and encodes a V L -C L domain. A sequence may be cloned into a second expression vector. When co-expressed, full-length heavy and light chains are interconnected by disulfide bonds to generate full-length antibodies. In another example, to generate a Fab, sequences encoding fragments containing the V H and
재조합 생산 이외에, 본 명세서에 제공되는 TNFR1 길항제 폴리펩티드, TNFR2 효능제 폴리펩티드 및 TNFR1 길항제/TNFR2 효능제 폴리펩티드 작제물은 널리 공지된 고상 기술을 사용하여 직접 펩티드 합성에 의해 생산될 수 있다. 시험관 내 단백질 합성은 수동 기술 또는 자동화를 사용하여 수행할 수 있다. 자동 합성은 예를 들어 Applied Biosystems 431A Peptide Synthesizer(Perkin Elmer; Foster City, CA)를 사용하여 제조업체에서 제공한 지침에 따라 달성할 수 있다. 폴리펩티드의 다양한 단편은 화학적 방법을 사용하여 개별적으로 화학적으로 합성되고 조합될 수 있다.In addition to recombinant production, the TNFR1 antagonist polypeptides, TNFR2 agonist polypeptides and TNFR1 antagonist/TNFR2 agonist polypeptide constructs provided herein can be produced by direct peptide synthesis using well known solid phase techniques. In vitro protein synthesis can be performed using manual techniques or automation. Automated synthesis can be achieved using, for example, the Applied Biosystems 431A Peptide Synthesizer (Perkin Elmer; Foster City, CA) according to manufacturer-supplied instructions. The various fragments of a polypeptide can be individually chemically synthesized and combined using chemical methods.
2. 돌연변이체 또는 변형된 핵산 및 인코딩 폴리펩티드의 생성2. Generation of Mutant or Modified Nucleic Acids and Encoding Polypeptides
본 명세서에 제공되는 변형은 당업자에게 통상적인 것과 같은 표준 재조합 DNA 기술에 의해 이루어질 수 있다. 표적 단백질 또는 폴리펩티드에서 임의의 하나 이상의 아미노산의 돌연변이를 일으키는 당업계에 공지된 임의의 방법이 사용될 수 있다. 방법은 핵산 분자를 인코딩하는 표준 부위 지정 돌연변이유발 (예를 들어, Stratagene에서 구입 가능한 QuikChange 키트와 같은 키트 사용) 또는 고상 폴리펩티드 합성 방법을 포함한다. Modifications provided herein can be made by standard recombinant DNA techniques, such as are common to those skilled in the art. Any method known in the art for mutating any one or more amino acids in a target protein or polypeptide can be used. Methods include standard site-directed mutagenesis encoding nucleic acid molecules (eg, using kits such as the QuikChange kit available from Stratagene) or solid phase polypeptide synthesis methods.
3. 벡터 및 세포3. Vectors and Cells
원하는 폴리펩티드, 예컨대 본 명세서에 기재된 임의의 TNFR1 길항제 또는 TNFR2 효능제 폴리펩티드, 또는 TNFR1 길항제/TNFR2 효능제 폴리펩티드 작제물 중 하나 이상의 재조합 발현을 위해, 폴리펩티드를 인코딩하는 뉴클레오티드 서열의 전부 또는 일부를 함유하는 핵산 분자는 적절한 발현 벡터, 즉 삽입된 폴리펩티드 코딩 서열의 전사 및 번역에 필요한 요소를 함유하는 벡터에 삽입될 수 있다. 또한 폴리펩티드를 인코딩하는 핵산 분자를 함유하는 벡터가 제공된다. 핵산 분자(들)의 삽입 후, 벡터는 전형적으로 숙주 세포를 형질전환하는데, 예를 들어 복제 및/또는 그의 발현을 위해 핵산을 증폭하는데 사용된다. 이러한 예에서는 높은 수준의 발현에 적합한 벡터가 사용된다. 다른 경우에, 세포 표면에 발현된 폴리펩티드의 디스플레이와 양립가능한 벡터가 선택된다. 벡터의 선택은 원하는 적용에 따라 달라질 수 있다. 항-TNFR1 및 항-TNFR2 항체 또는 그의 부분, 예컨대 항원 결합 단편의 발현을 위해 많은 발현 벡터가 이용가능하고 당업자에게 공지되어 있다. 그러한 선택은 당업자의 기술 수준 내에 있다. 일반적으로, 발현 벡터는 전사 프로모터 및 선택적으로 인핸서, 번역 신호 및 전사 및 번역 종결 신호를 포함할 수 있다. 안정한 형질전환에 사용되는 발현 벡터는 전형적으로 형질전환된 세포의 선택 및 유지를 가능하게 하는 선택가능한 마커를 갖는다. 경우에 따라 높은 복제 수의 복제 기점을 사용하여 세포에서 벡터의 카피 수를 증폭할 수 있다. 벡터는 또한 일반적으로 결찰된 핵산 분자(예를 들어, His 태그, 플래그 태그)에 작동 가능하게 연결된 추가 뉴클레오티드 서열을 함유할 수 있다. 항체를 사용한 적용의 경우, 벡터는 일반적으로 불변 영역을 인코딩하는 서열을 포함한다. 따라서, 항체 또는 그의 부분은 또한 단백질 융합체로서 발현될 수 있다. 예를 들어, 폴리펩티드에 추가 기능을 추가하기 위해 융합 단백질을 생성할 수 있다. 융합 단백질의 예는 신호 서열의 융합, 국소화를 위한 것과 같은 에피토프 태그, 예를 들어 His6 태그 또는 myc 태그, 또는 정제를 위한 태그, 예컨대 GST 태그, 및/또는 단백질 분비 및/또는 막 결합을 지시하는 서열을 포함하지만 이에 제한되지 않는다. 본 명세서의 융합 단백질은 또한 변형된 Fc 영역, IgG의 힌지 영역 및/또는 펩티드 링커, 예컨대 GS 링커에 대한 TNFR1 길항제 및/또는 TNFR2 효능제의 융합을 포함한다. For recombinant expression of one or more of the desired polypeptides, such as any TNFR1 antagonist or TNFR2 agonist polypeptide, or TNFR1 antagonist/TNFR2 agonist polypeptide construct described herein, a nucleic acid containing all or part of the nucleotide sequence encoding the polypeptide The molecule can be inserted into an appropriate expression vector, i.e., a vector containing the necessary elements for transcription and translation of the inserted polypeptide coding sequence. Also provided are vectors containing nucleic acid molecules encoding the polypeptides. After insertion of the nucleic acid molecule(s), the vector is typically used to transform a host cell, eg to amplify the nucleic acid for replication and/or expression thereof. In these examples, vectors suitable for high levels of expression are used. In other cases, a vector is selected that is compatible with the display of the polypeptide expressed on the cell surface. The choice of vector may depend on the desired application. Many expression vectors are available and known to those skilled in the art for the expression of anti-TNFR1 and anti-TNFR2 antibodies or portions thereof, such as antigen-binding fragments. Such selections are within the level of skill of those skilled in the art. In general, expression vectors may include transcriptional promoters and optionally enhancers, translational signals and transcriptional and translational termination signals. Expression vectors used for stable transformation typically have selectable markers that allow selection and maintenance of transformed cells. Optionally, a high copy number origin of replication can be used to amplify the copy number of a vector in a cell. Vectors may also contain additional nucleotide sequences operably linked to nucleic acid molecules (eg, His tags, flag tags) to which they are normally ligated. For applications with antibodies, vectors generally include sequences encoding the constant regions. Thus, antibodies or portions thereof may also be expressed as protein fusions. For example, fusion proteins can be created to add additional functions to a polypeptide. Examples of fusion proteins are the fusion of a signal sequence, an epitope tag such as for localization, e.g. His 6 tag or myc tag, or a tag for purification, e.g. GST tag, and/or directing protein secretion and/or membrane binding. It includes, but is not limited to, sequences that The fusion proteins herein also include the fusion of a TNFR1 antagonist and/or TNFR2 agonist to a modified Fc region, the hinge region of an IgG, and/or a peptide linker, such as a GS linker.
다양한 숙주-벡터 시스템을 사용하여 단백질 코딩 서열을 발현할 수 있다. 이들은 바이러스(예를 들어, 백시니아 바이러스, 아데노바이러스 및 다른 바이러스)에 감염된 포유동물 세포 시스템; 바이러스(예를 들어, 배큘로바이러스)로 감염된 곤충 세포 시스템; 효모 벡터를 함유하는 효모와 같은 미생물; 및 박테리오파아지, DNA, 플라스미드 DNA 또는 코스미드 DNA로 형질전환된 박테리아를 포함하지만 이에 제한되지 않는다. 진핵 발현 시스템과 세균 시스템 사이의 선택은 글리코실화와 같은 원하는 번역 후 변형에 따라 달라진다. 벡터의 발현 요소는 강도와 특이성이 다양하다. 사용된 숙주-벡터 시스템에 따라, 여러 적합한 전사 및 번역 요소 중 하나를 사용할 수 있다.A variety of host-vector systems can be used to express protein coding sequences. These include mammalian cell systems infected with viruses (eg vaccinia virus, adenovirus and other viruses); insect cell systems infected with viruses (eg, baculovirus); microorganisms such as yeast containing yeast vectors; and bacteria transformed with bacteriophage, DNA, plasmid DNA or cosmid DNA. The choice between eukaryotic and bacterial systems depends on the desired post-translational modification, such as glycosylation. The expression elements of vectors vary in intensity and specificity. Depending on the host-vector system used, one of several suitable transcription and translation elements may be used.
DNA 단편을 벡터에 삽입하기 위해 당업자에게 공지된 임의의 방법을 사용하여 폴리펩티드, 예를 들어, 본 명세서에 제공된 항체 단편 또는 TNFR1 길항제, 또는 TNFR2 효능제, 뿐만 아니라 적절한 전사/번역 제어 신호를 인코딩하는 핵산 분자를 함유하는 발현 벡터를 작제할 수 있다. 이들 방법은 시험관내 재조합 DNA 및 합성 기술, 및 생체내 재조합체(유전적 재조합)를 포함할 수 있다. 예를 들어, 클로닝 벡터로의 삽입은 DNA 단편을 상보적 응집 말단을 갖는 클로닝 벡터로 결찰함으로써 달성될 수 있다. DNA를 단편화하는 데 사용되는 상보적 제한 부위가 클로닝 벡터에 없으면 DNA 분자의 단부가 효소로 변형될 수 있다. 대안적으로, 원하는 부위는 DNA 말단에 뉴클레오티드 서열(링커)을 결찰하여 생성할 수 있고; 이러한 결찰된 링커는 제한 엔도뉴클레아제 인식 서열을 인코딩하는 특정 화학적으로 합성된 핵산을 함유할 수 있다.Any method known to those skilled in the art can be used to insert a DNA fragment into a vector that encodes a polypeptide, e.g., an antibody fragment provided herein or a TNFR1 antagonist, or TNFR2 agonist, as well as appropriate transcriptional/translational control signals. Expression vectors containing nucleic acid molecules can be constructed. These methods may include in vitro recombinant DNA and synthetic techniques, and in vivo recombinants (genetic recombination). For example, insertion into a cloning vector can be accomplished by ligating a DNA fragment into a cloning vector with complementary cohesive ends. If the cloning vector does not have complementary restriction sites used to fragment the DNA, the ends of the DNA molecule can be modified with enzymes. Alternatively, the desired site can be created by ligating nucleotide sequences (linkers) to the ends of the DNA; Such ligated linkers may contain specific chemically synthesized nucleic acids encoding restriction endonuclease recognition sequences.
예를 들어, 본 명세서의 TNFR1 길항제, TNFR2 효능제 및 TNFR1 길항제/TNFR2 효능제 작제물과 같은 작제물 폴리펩티드의 발현은 당업계에 공지된 임의의 프로모터/인핸서에 의해 제어될 수 있다. 적합한 박테리아 프로모터는 당업계에 잘 알려져 있으며 본 명세서에서 하기에 기재된다. 포유동물 세포, 효모 세포 및 곤충 세포에 대한 다른 적합한 프로모터는 당업계에 잘 알려져 있으며 일부는 아래에 예시되어 있다. 이종 핵산의 발현을 지시하는 데 사용되는 프로모터의 선택은 특정 적용에 따라 다르다. 사용될 수 있는 프로모터는 하기를 포함하지만 이에 제한되지 않는다: SV40 조기 프로모터를 함유하는 진행생물 발현 벡터 (참고, 예를 들어, Benoist 및 Chambon (1981) Nature 290:304-310), 3' 긴 말단 반복부의 루 육종 바이러스에 함유된 프로모터 (참고, 예를 들어, Yamamoto 등 (1980) Cell 22:787-797), 헤르페스 티미딘 키나제 프로모터 (참고, 예를 들어, Wagner 등 (1981) Proc. Natl . Acad . Sci . U.S.A . 78:1441-1445), 메탈로티오네인 유전자의 조절 서열 (참고, 예를 들어, Brinster 등 (1982) Nature 296:39-42), 및 사이토메갈로바이러스 (CMV) 프로모터; 원핵 발현 벡터 예컨대 β-락타마제 프로모터 (참고, 예를 들어, Jay 등 (1981) Proc . Natl . Acad . Sci . U.S.A . 78:5543), 또는 tac 프로모터 (참고, 예를 들어, DeBoer 등 (1983) Proc . Natl . Acad . Sci . U.S.A . 80:21-25); 또한 문헌["Useful Proteins from Recombinant Bacteria": in Scientific American 242:79-94 (1980)] 참조); 노팔라인 합성효소 프로모터를 식물 발현 벡터 (참고, 예를 들어, Herrara-Estrella 등 (1984) Nature 303:209-213), 꽃양배추 모자이크 바이러스 35S RNA 프로모터 (참고, 예를 들어, Gardner 등 (1981) Nucleic Acids Res. 9(12):2871-2888), 및 광합성 효소 리불로스 비스포스페이트 카복실라제의 프로모터 (참고, 예를 들어, Herrera-Estrella 등 (1984) Nature 310:115-120); 효모 및 다른 진균로부터의 프로모터 요소 예컨대 Gal4 프로모터, 알코올 탈수소효소 프로모터, 포스포글리세롤 키나제 프로모터, 알칼리성 포스파타제 프로모터, 및 조직 특이성을 나타내고 형질전환 동물에서 사용된 다음의 동물 전사 조절 영역: 췌장 샘꽈리 세포에서 활성인 엘라스타제 I 유전자 제어 영역 (참고, 예를 들어, Swift 등 (1984) Cell 38:639-646; Ornitz 등 (1986) Cold Spring Harbor Symp . Quant . Biol . 50:399-409; MacDonald (1987) Hepatology 7:425-515), 췌장 베타 세포에서 활성인 인슐린 유전자 제어 영역 (참고, 예를 들어, Hanahan 등 (1985) Nature 315:115-122), 림프양 세포에서 활성인 면역글로불린 유전자 제어 영역 (참고, 예를 들어, Grosschedl 등 (1984) Cell 38:647-658; Adams 등 (1985) Nature 318:533-538; Alexander 등 (1987) Mol . Cell Biol . 7:1436-1444), 고환, 유방, 림프양 및 비만 세포에서 활성인 마우스 유선 종양 바이러스 대조군 영역 (참고, 예를 들어, Leder 등 (1986) Cell 45:485-495), 간에서 활성인 알부민 유전자 제어 영역 (참고, 예를 들어, Pinckert 등 (1987) Genes and Devel. 1:268-276), 간에서 활성인 알파-태아단백 유전자 제어 영역 (참고, 예를 들어, Krumlauf 등 (1985) Mol . Cell. Biol . 5:1639-1648; Hammer 등 (1987) Science 235:53-58), 간에서 활성인 알파-1 항트립신 유전자 제어 영역 (참고, 예를 들어, Kelsey 등 (1987) Genes and Devel . 1:161-171), 골수 세포에서 활성인 베타 글로빈 유전자 제어 영역 (참고, 예를 들어, Magram 등 (1985) Nature 315:338-340; Kollias 등 (1986) Cell 46:89-94), 뇌의 희소돌기아교세포 세포에서 활성인 수초 염기 단백질 유전자 제어 영역 (참고, 예를 들어, Readhead 등 (1987) Cell 48:703-712), 골격근에서 활성인 미오신 경쇄-2 유전자 제어 영역 (참고, 예를 들어, Shani (1985) Nature 314:283-286), 및 시상하부의 성선자극세포에서 활성인 성선자극세포 방출 호르몬 유전자 제어 영역 (참고, 예를 들어, Mason 등 (1986) Science 234:1372-1378). For example, expression of construct polypeptides such as the TNFR1 antagonist, TNFR2 agonist and TNFR1 antagonist/TNFR2 agonist constructs herein may be controlled by any promoter/enhancer known in the art. Suitable bacterial promoters are well known in the art and are described herein below. Other suitable promoters for mammalian cells, yeast cells and insect cells are well known in the art and some are exemplified below. The choice of promoter used to direct expression of the heterologous nucleic acid depends on the particular application. Promoters that may be used include, but are not limited to: eukaryotic expression vectors containing the SV40 early promoter (see, e.g., Benoist and Chambon (1981) Nature 290:304-310), 3' long terminal repeat The promoters contained in the fetal Lux sarcoma virus (see, e.g., Yamamoto et al. (1980) Cell 22 :787-797), the herpes thymidine kinase promoter (see, eg, Wagner et al. (1981) Proc. Natl . Acad . Sci . USA . 78 :1441-1445), the regulatory sequence of the metallothionein gene (see, eg, Brinster et al. (1982) Nature 296:39-42), and the cytomegalovirus (CMV) promoter; Prokaryotic expression vectors such as the β-lactamase promoter (see, eg, Jay et al. (1981) Proc . Natl . Acad . Sci . USA . 78 :5543), or the tac promoter (see, e.g., DeBoer et al. (1983) Proc . Natl . Acad . Sci . USA . 80 :21-25); See also "Useful Proteins from Recombinant Bacteria": in Scientific American 242 :79-94 (1980); The nopaline synthetase promoter is used in plant expression vectors (see, eg, Herrara-Estrella et al. (1984) Nature 303:209-213), the cauliflower mosaic virus 35S RNA promoter (see, eg, Gardner et al. (1981 ) Nucleic Acids Res . Promoter elements from yeast and other fungi such as the Gal4 promoter, alcohol dehydrogenase promoter, phosphoglycerol kinase promoter, alkaline phosphatase promoter, and the following animal transcriptional regulatory regions that exhibit tissue specificity and are used in transgenic animals: in pancreatic acinar cells The active elastase I gene control region (see, eg, Swift et al. (1984) Cell 38 :639-646; Ornitz et al. (1986) Cold Spring Harbor Symp . Quant . Biol . 50 :399-409; MacDonald (1987) Hepatology 7 :425-515), insulin gene control region active in pancreatic beta cells (see, eg, Hanahan et al. (1985) Nature 315:115-122), immunoglobulins active in lymphoid cells Gene control regions (see e.g. Grosschedl et al. (1984) Cell 38 :647-658; Adams et al. (1985) Nature 318 :533-538; Alexander et al. (1987) Mol . Cell Biol . 7 :1436-1444), mouse mammary tumor virus control region active in testis, mammary, lymphoid and mast cells (see, e.g., Leder et al. (1986) Cell 45 :485-495), the albumin gene control region active in the liver (see, eg, Pinckert et al. (1987) Genes and Devel. 1 :268-276), the alpha-fetoprotein gene control region active in the liver (see, eg, Krumlauf et al. (1985) Mol . Cell. Biol . 5 :1639-1648; Hammer et al. (1987) Science 235:53-58), the alpha-1 antitrypsin gene control region active in the liver (see, eg, Kelsey et al. (1987) Genes and Devel . 1 :161-171), the beta globin gene control region active in myeloid cells (see, e.g., Magram et al. (1985) Nature 315 :338-340; Kollias et al. (1986) Cell 46 :89-94), myelin base protein gene control region active in oligodendrocyte cells of the brain (reference, for example, Readhead et al. (1987) Cell 48 :703-712), active in skeletal muscle the phosphorus myosin light chain-2 gene control region (see, eg, Shani (1985) Nature 314:283-286), and the gonadotropin-releasing hormone gene control region active in hypothalamic gonadotropins (see, eg, For example, Mason et al. (1986) Science 234:1372-1378).
발현 벡터는 전형적으로 숙주 세포에서 작제물 또는 그의 부분(들)의 발현에 필요한 모든 추가 요소를 함유하는 전사 단위 또는 발현 카세트를 함유한다. 전형적인 발현 카세트는 항체 단편, 도메인, 그의 유도체 또는 동족체, 또는 본 명세서에 기재된 다른 폴리펩티드(예를 들어, TNF 뮤테인 및 융합 단백질)와 같은 작제물을 인코딩하는 핵산에 작동 가능하게 연결된 프로모터, 및 전사체의 효율적인 폴리아데닐화, 리보솜 결합 부위 및 번역 종결에 필요한 신호를 함유한다. 카세트의 추가 요소에는 인핸서가 포함될 수 있다. 또한, 카세트는 전형적으로 효율적인 종결을 제공하기 위해 구조 유전자의 하류에 전사 종결 영역을 포함한다. 종결 영역은 프로모터 서열과 동일한 유전자로부터 얻을 수 있거나, 상이한 유전자로부터 얻을 수 있다. 예를 들어, 벡터는 원하는 폴리펩티드, 또는 도메인을 인코딩하는 핵산, 그의 단편, 유도체 또는 동족체, 하나 이상의 복제의 기원, 및 선택적으로, 하나 이상의 선택가능한 마커 (예를 들어, 항생제 내성 유전자)에 작동가능하게 연결된 프로모터를 포함한다. Expression vectors typically contain a transcription unit or expression cassette containing all additional elements necessary for expression of the construct or portion(s) thereof in a host cell. A typical expression cassette includes a promoter operably linked to a nucleic acid encoding a construct such as an antibody fragment, domain, derivative or analog thereof, or other polypeptides described herein (eg, TNF muteins and fusion proteins), and the entire It contains signals necessary for efficient polyadenylation of transcripts, ribosome binding sites, and translational termination. Additional elements of the cassette may include enhancers. Cassettes also typically include transcriptional termination regions downstream of structural genes to provide efficient termination. The termination region may be from the same gene as the promoter sequence or may be from a different gene. For example, a vector is operable for a nucleic acid encoding a desired polypeptide or domain, a fragment, derivative or homologue thereof, one or more origins of replication, and optionally one or more selectable markers (eg, antibiotic resistance genes). contains a promoter linked to the
발현 시스템은 티미딘 키나제 및 디하이드로폴레이트 환원효소와 같은 유전자 증폭을 제공하는 마커를 가질 수 있다. 다면체 프로모터 또는 다른 강력한 바큘로바이러스 프로모터의 지시 하에 폴리펩티드를 인코딩하는 핵산 서열을 갖는 곤충 세포에서 바큘로바이러스 벡터를 사용하는 것과 같이 유전자 증폭을 포함하지 않는 발현 시스템도 적합하다. The expression system can have markers that provide gene amplification, such as thymidine kinase and dihydrofolate reductase. Expression systems that do not involve gene amplification are also suitable, such as using baculovirus vectors in insect cells that have a nucleic acid sequence encoding a polypeptide under the direction of a polyhedral promoter or other strong baculovirus promoter.
본 명세서의 목적을 위해, IgG 항체의 Fc 영역, 일반적으로 TNFR1 길항제 또는 TNFR2 효능제 폴리펩타이드를 인코딩하고 IgG 힌지 서열 및/또는 (Gly4Ser)n(여기서 n은 1-5 이상과 같은 양의 정수임)과 같은 글리신 풍부 가요성 링커를 포함하는 GS 링커와 같은 짧은 펩티드 링커와 같은 사이의 링커 및 본 명세서에 기재되거나 당업자에게 공지된 다른 링커를 인코딩하는 핵산에 작동 가능하게 연결된 변형된 Fc를 인코딩하는 뉴클레오타이드의 서열을 함유하는 벡터가 제공된다. 벡터는 CH1, CH2, 힌지, CH3 또는 CH4 및/또는 CL 중 하나 또는 모두에 대한 서열을 포함할 수 있다. 일반적으로 Fab의 발현과 같이 벡터는 CH1 또는 CL(카파 또는 람다 경쇄)에 대한 서열을 함유한다. 예를 들어, VH-CH1 및 VL-CL 서열은 Fab 분자의 발현을 위해 적합한 발현 벡터에 삽입될 수 있다. 불변 영역 또는 힌지 영역의 서열은 당업자에게 공지되어 있다 (예를 들어, 미국 공개 제2008/0248028호 참조). 이러한 서열의 예가 본 명세서에 제공된다.For purposes herein, the Fc region of an IgG antibody, typically encoding a TNFR1 antagonist or TNFR2 agonist polypeptide and comprising an IgG hinge sequence and/or a (Gly 4 Ser) n , where n is an amount equal to or greater than 1-5 Encoding a modified Fc operably linked to a nucleic acid encoding an interstitial linker such as a short peptide linker such as a GS linker, including a glycine-rich flexible linker such as an integer), and other linkers described herein or known to those skilled in the art. A vector containing a sequence of nucleotides is provided. The vector may include sequences for one or all of
전형적으로, 벡터는 플라스미드, 바이러스 벡터, 또는 생체내 또는 시험관내에서 폴리펩티드의 발현에 사용되는 당업계에 공지된 다른 것일 수 있다. 예를 들어, TNFR1 길항제 및 TNFR2 효능제 폴리펩티드 작제물을 인코딩하는 핵산과 같은 본 명세서에 제공된 작제물은 예를 들어 차이니즈 햄스터 난소 (CHO) 세포를 포함하는 포유동물 세포에서 발현된다. Typically, the vectors will be plasmids, viral vectors, or others known in the art for use in the expression of polypeptides in vivo or in vitro. For example, constructs provided herein, such as nucleic acids encoding TNFR1 antagonist and TNFR2 agonist polypeptide constructs, are expressed in mammalian cells, including, for example, Chinese Hamster Ovary (CHO) cells.
예시적인 진핵 벡터는, 예를 들어 pCMV(Agilent Technologies), pCDNA3.1(Invitrogen(Thermo Fisher Scientific)), pCBL(Creative BioLabs로부터, 예를 들어, 도 1 참조)과 같은 잘 알려진 쉽게 입수 가능한 벡터를 포함한다. 다른 진핵 벡터, 예를 들어 진핵 바이러스로부터의 임의의 조절 요소를 함유하는 것이 진핵생물 발현 벡터로 사용될 수 있다. 본 명세서에는 예를 들어 SV40 벡터, 유두종 바이러스 벡터 및 Epstein-Bar 바이러스에서 유래된 벡터가 포함된다. 예시적인 진핵 벡터는 예를 들어, pMSG, pAV009/A+, pMT010/A+, pMAM네오-5, 배큘로바이러스 pDSCE, 및 CMV 프로모터, SV40 조기 프로모터, SV40 후기 프로모터, 메탈로티오네인 프로모터, 뮤린 유선 종양 바이러스 프로모터, 루 육종 바이러스 프로모터, 다면체 프로모터, 또는 진핵생물에서의 발현에 효과적인 것으로 나타난 다른 프로모터의 지시에 따라 단백질 발현을 허용하는 임의의 다른 벡터를 포함한다. Exemplary eukaryotic vectors include well-known and readily available vectors such as, for example, pCMV (Agilent Technologies), pCDNA3.1 (Invitrogen (Thermo Fisher Scientific)), pCBL (from Creative BioLabs, see, eg, Figure 1). include Other eukaryotic vectors can be used as eukaryotic expression vectors, for example those containing any regulatory elements from eukaryotic viruses. Included herein are vectors derived from, for example, SV40 vectors, papillomavirus vectors, and Epstein-Bar viruses. Exemplary eukaryotic vectors include, for example, pMSG, pAV009/A+, pMT010/A+, pMAMneo-5, baculovirus pDSCE, and the CMV promoter, SV40 early promoter, SV40 late promoter, metallothionein promoter, murine mammary tumor Any other vector that allows protein expression under the direction of a viral promoter, a roux sarcoma virus promoter, a polyhedral promoter, or other promoters shown to be effective for expression in eukaryotes.
아데노바이러스, 레트로바이러스 또는 백시니아 바이러스 벡터와 같은 바이러스 벡터가 사용될 수 있다. 일부 예에서 벡터는 결함이 있거나 약화된 레트로바이러스 또는 다른 바이러스 벡터이다 (예를 들어 미국 특허 제4,980,286호 참조). 예를 들어, 레트로바이러스 벡터가 사용될 수 있다 (예를 들어, 문헌[Miller 등 (1993) Meth . Enzymol . 217:581-599] 참조). 이러한 레트로바이러스 벡터는 바이러스 게놈 패키징 및 숙주 세포 DNA로의 통합에 필요하지 않은 레트로바이러스 서열을 결실하도록 변형되었다. 일부 예에서, 본 명세서의 폴리펩티드를 인코딩하는 핵산으로 무장한 바이러스는 표적 조직 내에서 복제 및 확산을 촉진할 수 있다. 바이러스는 또한 바이러스가 조직 특이적 프로모터 하에서 선택적으로 복제하는 용해 바이러스 또는 비-용해성 바이러스일 수 있다. 바이러스가 복제됨에 따라, 바이러스 유전자와 폴리펩티드의 공동 발현은 생체 내에서 바이러스의 확산을 촉진할 것이다.Viral vectors such as adenovirus, retrovirus or vaccinia virus vectors may be used. In some instances the vector is a defective or attenuated retroviral or other viral vector (see eg US Pat. No. 4,980,286). For example, retroviral vectors can be used (see, e.g., Miller et al. (1993) Meth . Enzymol . 217:581-599]). These retroviral vectors have been modified to delete retroviral sequences that are not required for viral genome packaging and integration into host cell DNA. In some instances, a virus armed with a nucleic acid encoding a polypeptide of the present disclosure is capable of promoting replication and spread within a target tissue. The virus can also be a lytic virus or a non-lytic virus in which the virus selectively replicates under a tissue-specific promoter. As the virus replicates, co-expression of viral genes and polypeptides will facilitate the spread of the virus in vivo.
박테리아 발현을 위한, 벡터는 잘 알려지고 널리 파종성 벡터 pBR322, pUC, pSKF, pET23D, 및 융합 벡터, 예컨대 MBP (Sigma-Aldrich), GST (Sigma-Aldrich) 및 LacZ 함유 벡터를 포함한다. E. 콜라이 세포의 형질전환을 위한 예시적인 플라스미드 벡터는 예를 들어 pQE 발현 벡터(Qiagen®, Valencia, CA에서 입수 가능; 또한 시스템을 설명하는 Qiagen®에 의해 출판된 문헌 참조)를 포함한다. pQE 벡터는 파아지 T5 프로모터(E. 콜라이 RNA 중합체라제에 의해 인식됨)와 이중 lac 오퍼레이터 억제 모듈을 가지고 있어 E. 콜라이 , 효율적인 번역을 합성 리보솜 결합 부위 (RBS II), 6XHis 태그 인코딩 서열, t0 및 T1 전사 종결자, ColE1 복제 기점 및 암피실린 내성을 부여하기 위한 베타-락타마제 유전자에서 재조합 단백질의 엄격하게 조절되는 높은 수준의 발현을 제공한다. pQE 벡터는 재조합 단백질의 N- 또는 C-말단에 6xHis 태그의 배치를 허용한다. 이러한 플라스미드는 pQE 32, pQE 30 및 pQE 31을 포함하며, 이들은 모든 3개의 해독틀에 대한 다중 클로닝 사이트를 제공하고 N-말단 6xHis 태깅된 단백질의 발현을 제공한다. E. 콜라이 세포의 형질전환을 위한 다른 예시적인 플라스미드 벡터는 예를 들어 pET 발현 벡터를 포함한다 (예를 들어, 미국 특허 제4,952,496호 참조; NOVAGEN, Madison, WI에서 입수가능; 또한 시스템을 기재하는 NOVAGEN에서 공개된 문헌 참조). 그러한 플라스미드는 T7lac 프로모터, T7 종결자, 유도성 E. 콜라이 lac 오퍼레이터 및 lac 억제 유전자를 함유하는 pET 11a; T7 프로모터, T7 종결자 및 E. 콜라이 ompT 분비 신호를 포함하는 pET 12a-c; 및 His 컬럼을 사용한 정제에 사용하기 위한 His-TagTM 리더 서열 및 컬럼을 통한 정제 후 절단을 허용하는 트롬빈 절단 부위, T7-lac 프로모터 영역 및 T7 종결자를 함유하는 pET 15b 및 pET19b (NOVAGEN, Madison, WI)를 포함한다.For bacterial expression, vectors include the well known and widely disseminated vectors pBR322, pUC, pSKF, pET23D, and fusion vectors such as MBP (Sigma-Aldrich), GST (Sigma-Aldrich) and LacZ containing vectors. Exemplary plasmid vectors for transformation of E. coli cells include, for example, the pQE expression vector (available from Qiagen® , Valencia, CA; see also literature published by Qiagen® describing the system). The pQE vector has a phage T5 promoter (recognized by E. coli RNA polymerase) and a dual lac operator suppressor module to enable efficient translation in E. coli , a synthetic ribosome binding site (RBS II), a 6XHis tag encoding sequence, t 0 and Provides tightly controlled, high-level expression of recombinant proteins in the T1 transcription terminator, the ColE1 origin of replication and the beta-lactamase gene to confer ampicillin resistance. The pQE vector allows placement of a 6xHis tag at the N- or C-terminus of the recombinant protein. These plasmids include pQE 32, pQE 30 and pQE 31, which provide multiple cloning sites for all three reading frames and expression of N-terminal 6xHis tagged proteins. Other exemplary plasmid vectors for transformation of E. coli cells include, for example, pET expression vectors (see, eg, US Pat. No. 4,952,496; available from NOVAGEN, Madison, WI; also described systems see literature published by NOVAGEN). Such plasmids include pET 11a, which contains a T7lac promoter, a T7 terminator, an inducible E. coli lac operator and a lac suppressor gene; pET 12a-c containing the T7 promoter, T7 terminator and E. coli ompT secretion signal; and pET 15b and pET19b ( NOVAGEN , Madison, WI) included.
벡터를 함유하는 세포도 제공된다. 일반적으로, 이종 DNA를 발현하도록 조작될 수 있고 분비 경로를 갖는 임의의 세포 유형이 적합하다. 세포는 진핵 및 원핵 세포를 포함하며, 벡터는 그 안에 사용하기에 적합한 임의의 것이다. 일반적으로, 세포는 인코딩된 단백질의 글리코실화를 수행할 수 있는 세포이다. 벡터를 포함하는 원핵 및 진핵 세포가 제공된다. 이러한 세포는 박테리아 세포, 효모 세포, 진균 세포, 아케아(Archea), 식물 세포, 곤충 세포 및 동물, 특히 포유동물 세포를 포함한다. 세포는 인코딩된 폴리펩티드가 세포에 의해 발현되는 조건 하에서 전술한 세포를 성장시키고 발현된 폴리펩티드를 회수함으로써 폴리펩티드를 생산하는데 사용된다. 예를 들어 본 명세서의 목적을 위해, 폴리펩티드는 배지로 분비될 수 있다.Cells containing the vectors are also provided. Generally, any cell type that can be engineered to express heterologous DNA and has a secretory pathway is suitable. Cells include eukaryotic and prokaryotic cells, and vectors are any suitable for use therein. Generally, a cell is a cell capable of glycosylation of an encoded protein. Prokaryotic and eukaryotic cells comprising the vectors are provided. Such cells include bacterial cells, yeast cells, fungal cells, Archea, plant cells, insect cells and animal, especially mammalian cells. A cell is used to produce a polypeptide by growing the cell described above under conditions in which the encoded polypeptide is expressed by the cell and recovering the expressed polypeptide. For example, for purposes herein, a polypeptide may be secreted into a medium.
숙주 세포 균주는 삽입된 서열의 발현을 조절하거나 원하는 방식으로 발현된 단백질을 가공하는 능력에 따라 선택될 수 있다. 폴리펩티드의 이러한 변형은 아세틸화, 카복실화, 글리코실화, 인산화, 지질화 및 아실화를 포함하지만 이에 제한되지 않는다. 번역 후 처리는 폴리펩티드의 폴딩 및/또는 기능에 영향을 미칠 수 있다. 차이니즈 햄스터 난소 (CHO) 세포, 예컨대 DG44, FreeStyleTM CHO-S 세포 (Invitrogen), DXB11, CHO-K1), HeLa, MCDK, HEK293 및 WI38 세포로 제한되지 않는 것과 같은 상이한 숙주 세포는 이러한 번역 후 활성 위한 특정 세포 기계 및 특징적인 메커니즘을 가지고 있으며 도입된 단백질의 올바른 변형 및 처리를 보장하기 위해 선택될 수 있다. 일반적으로, 세포의 선택은 N-연결 글리코실화를 발현된 폴리펩티드에 도입할 수 있는 세포이다. 따라서, 벡터를 함유하는 진핵 세포가 제공된다. 진핵 세포의 예시는 포유동물 차이니즈 햄스터 난소(CHO) 세포이다. 예를 들어, DG44 세포와 같은 디하이드로폴레이트 환원효소(DHFR-)가 결핍된 CHO 세포는 본 명세서에 제공되는 폴리펩티드를 생산하는 데 사용된다. The host cell strain may be selected for its ability to control the expression of the inserted sequence or to process the expressed protein in a desired manner. Such modifications of polypeptides include, but are not limited to, acetylation, carboxylation, glycosylation, phosphorylation, lipidation and acylation. Post-translational processing can affect the folding and/or function of a polypeptide. Different host cells, such as but not limited to Chinese Hamster Ovary (CHO) cells, such as DG44, FreeStyle ™ CHO-S cells (Invitrogen), DXB11, CHO-K1), HeLa, MCDK, HEK293 and WI38 cells, have such post-translational activity It has a specific cellular machinery and characteristic mechanism for the protein and can be selected to ensure the correct modification and processing of the introduced protein. Generally, the cell of choice is a cell capable of introducing N-linked glycosylation to the expressed polypeptide. Thus, eukaryotic cells containing the vectors are provided. An example of a eukaryotic cell is the mammalian Chinese Hamster Ovary (CHO) cell. For example, CHO cells deficient in dihydrofolate reductase (DHFR − ), such as DG44 cells, are used to produce the polypeptides provided herein.
4. 발현4. Expression
TNFR1 길항제 작제물, TNFR2 효능제 작제물, TNFR1 길항제/TNFR2 효능제 다중특이적 작제물 및 이들의 일부를 포함하는 본 명세서에 제공된 폴리펩티드 작제물은 생체 내 및 시험관 내 방법, 재조합체 및 합성 및 화학적 방법을 포함하여 단백질 생산을 위해 당업자에게 공지된 임의의 방법에 의해 생산될 수 있다. 원하는 단백질은 예를 들어 투여 및 치료에 필요한 것과 같은 단백질의 필요한 양 및 형태를 생산하기에 적합한 임의의 유기체에서 발현될 수 있다. 발현 숙주는 E. 콜라이와 같은 원핵생물 및 진핵생물 유기체, 효모, 식물, 곤충 세포, 인간 세포주를 포함하는 포유동물 세포 및 형질전환 동물을 포함한다. 발현 숙주는 단백질 생산 수준과 발현된 단백질에 존재하는 번역 후 변형 유형이 다를 수 있다. 발현 숙주의 선택은 이들 및 당업자에게 공지된 다른 인자에 기초하여 이루어질 수 있고; 이들은 조절 및 안전성 고려사항들, 생산 비용 및 정제의 필요성과 방법을 포함한다. 정제 방법 및 성분 조립 방법은 당업자에게 잘 알려져 있다.Polypeptide constructs provided herein, including TNFR1 antagonist constructs, TNFR2 agonist constructs, TNFR1 antagonist/TNFR2 agonist multispecific constructs and portions thereof, can be used in vivo and in vitro methods, recombinant and synthetic and chemical It can be produced by any method known to those skilled in the art for protein production, including methods. The desired protein may be expressed in any organism suitable for producing the required amount and form of the protein, eg, as required for administration and treatment. Expression hosts include prokaryotic and eukaryotic organisms such as E. coli , yeast, plant, insect cells, mammalian cells including human cell lines, and transgenic animals. Expression hosts may differ in the level of protein production and the type of post-translational modifications present in the expressed protein. Selection of an expression host can be made based on these and other factors known to those skilled in the art; These include regulatory and safety considerations, production costs and the need and methods of purification. Purification methods and component assembly methods are well known to those skilled in the art.
진핵 숙주에서의 발현은 효모, 예컨대 사카로마이세스 세레비지아에 및 피치아 파스토리스, 곤충 세포, 예컨대 드로소필라 세포 및 레피돕테란 세포, 식물들 및 식물 세포, 예컨대 담배, 옥수수, 벼, 조류 및 렘나에서의 발현을 포함할 수 있다. 발현을 위한 진핵 세포는 또한 포유동물 세포주, 예컨대 차이니즈 햄스터 난소 (CHO) 세포, 인간 배아 신장 (HEK293) 세포, 또는 어린 햄스터 신장 (BHK) 세포를 포함한다. 진핵생물 발현 숙주는 또한 형질전환 동물에서의 생산, 예를 들어 혈청, 밀크 및 에그에서의 생산을 포함한다. Expression in eukaryotic hosts is yeast, such as Saccharomyces Serrebiziae and Pichia Pasteuris , insect cells such as Drosophila cells and Lepidopteran cells, plants and plant cells such as tobacco, corn, rice, algae and Lemna. Eukaryotic cells for expression also include mammalian cell lines, such as Chinese hamster ovary (CHO) cells, human embryonic kidney (HEK293) cells, or juvenile hamster kidney (BHK) cells. Eukaryotic expression hosts also include production in transgenic animals, such as production in serum, milk and eggs.
많은 발현 벡터가 이용 가능하고 당업자에게 공지되어 있으며 단백질 발현에 사용될 수 있다. 발현 벡터의 선택은 숙주 발현 시스템의 선택에 의해 영향을 받을 것이다. 일반적으로, 발현 벡터는 전사 프로모터 및 선택적으로 인핸서, 번역 신호 및 전사 및 번역 종결 신호를 포함할 수 있다. 안정한 형질전환에 사용되는 발현 벡터는 전형적으로 형질전환된 세포의 선택 및 유지를 가능하게 하는 선택가능한 마커를 갖는다. 경우에 따라 복제 기점을 사용하여 세포에서 벡터의 카피 수를 증폭할 수 있다.Many expression vectors are available and known to those skilled in the art and can be used to express proteins. The choice of expression vector will be influenced by the choice of host expression system. In general, expression vectors may include transcriptional promoters and optionally enhancers, translational signals and transcriptional and translational termination signals. Expression vectors used for stable transformation typically have selectable markers that allow selection and maintenance of transformed cells. Optionally, an origin of replication can be used to amplify the copy number of a vector in a cell.
본 명세서의 TNFR1 길항제, TNFR2 효능제 및 이중특이적 TNFR1 길항제/TNFR2 효능제 작제물은 또한 단백질 융합체로서 발현될 수 있다. 예를 들어, 폴리펩티드에 추가 기능을 추가하기 위해 융합 단백질을 생성할 수 있다. 융합 단백질의 예는 신호 서열의 융합, 국소화를 위한 것과 같은 태그, 예를 들어 his6 태그 또는 myc 태그, 또는 정제를 위한 태그, 예컨대 GST 융합, 및 단백질 분비 및/또는 막 결합을 지시하는 서열을 포함하지만 이에 제한되지 않는다. 융합 단백질은 또한 IgG의 Fc 영역, 및 링커, 예컨대 IgG의 힌지 서열 및/또는 글리신-세린(GS) 펩티드 링커와의 융합을 포함한다. 대안적으로, 일부 구현예에서, 본 명세서의 TNFR1 길항제, TNFR2 효능제 및 이중특이적 TNFR1 길항제/TNFR2 효능제 작제물은 또한 혈청 알부민에 융합될 수 있다. The TNFR1 antagonist, TNFR2 agonist and bispecific TNFR1 antagonist/TNFR2 agonist constructs herein may also be expressed as protein fusions. For example, fusion proteins can be created to add additional functions to a polypeptide. Examples of fusion proteins include the fusion of a signal sequence, a tag such as for localization, such as a his 6 tag or a myc tag, or a tag for purification, such as a GST fusion, and sequences directing protein secretion and/or membrane binding. including but not limited to Fusion proteins also include fusions of an Fc region of an IgG with a linker, such as the hinge sequence of an IgG and/or a glycine-serine (GS) peptide linker. Alternatively, in some embodiments, the TNFR1 antagonist, TNFR2 agonist and bispecific TNFR1 antagonist/TNFR2 agonist constructs of the present disclosure may also be fused to serum albumin.
재조합 단백질의 장기간 고수율 생산을 위해서는, 안정한 발현이 요구된다. 예를 들어, 폴리펩티드를 안정적으로 발현하는 세포주는 바이러스 복제 기점 또는 내인성 발현 요소 및 선택 가능한 마커 유전자를 함유하는 발현 벡터를 사용하여 형질전환될 수 있다. 벡터 도입 후, 세포는 선택 배지로 전환되기 전에 풍부 배지에서 1 내지 2일 동안 성장할 수 있다. 선택 가능한 마커의 목적은 선택에 대한 저항성을 부여하는 것이며, 그 존재는 도입된 서열을 성공적으로 발현하는 세포의 성장 및 회수를 가능하게 한다. 안정적으로 형질전환된 세포의 저항성 세포는 세포 유형에 적합한 조직 배양 기술을 사용하여 증식할 수 있다.For long-term, high-yield production of recombinant proteins, stable expression is required. For example, a cell line stably expressing the polypeptide can be transformed with an expression vector containing a viral origin of replication or endogenous expression element and a selectable marker gene. After vector introduction, cells are allowed to grow for 1-2 days in rich medium before being switched to selective medium. The purpose of the selectable marker is to confer resistance to selection, and its presence enables the growth and recovery of cells that successfully express the introduced sequence. Resistant cells of the stably transformed cells can be propagated using tissue culture techniques appropriate to the cell type.
임의의 수의 선택 시스템을 사용하여 형질전환된 세포주를 회수할 수 있다. 여기에는 단순 포진 바이러스(HSV) 티미딘 키나제(TK)(예를 들어, 문헌[Wigler 등, (1977) Cell 11:223-232] 참조) 및 아데닌 포스포리보실트랜스퍼라제(APRT)(예를 들어, 문헌[Lowy, I. 등(1980) Cell, 22:817-23] 참조) 유전자를 포함하지만 이에 제한되지 않고, 각각 TK- 또는 APRT- 세포에서 사용될 수 있다. 또한 항대사물질, 항생제 또는 제초제 저항성을 선택의 기준으로 사용할 수 있다. 예를 들어, 메토트렉세이트에 대한 내성을 부여하는 디하이드로폴레이트 환원효소(DHFR)(예를 들어, 문헌[Wigler 등 (1980) Proc . Natl . Acad . Sci . U.S.A . 77:3567-70] 참조); 아미노글리코시드 네오마이신 및 G-418에 대한 내성을 부여하는 npt(예를 들어, 문헌[Colbere-Garapin 등 (1981) J. Mol . Biol . 150:1-14] 참조); 클로르설푸론 및 포스피노트리신 아세틸트랜스퍼라제 각각에 대한 내성을 부여하는 als 또는 pat가 사용될 수 있다. 추가의 선택가능한 유전자, 예를 들어 세포가 트립토판 대신에 인돌을 이용하게 하는 trpB, 또는 세포가 히스티딘 대신에 히스티놀을 이용하게 하는 hisD가 기재되었다 (예를 들어, 문헌[Hartman, S. C. and R. C. Mulligan (1988) Proc. Natl . Acad . Sci . U.S.A . 85:8047-8051] 참조). 안토시아닌, 베타 글루쿠로니다제 및 그 기질인 GUS, 루시퍼라제 및 그 기질인 루시페린과 같은(이에 제한되지 않는) 가시적 마커는 또한 형질전환체를 식별하고 특정 벡터 시스템에 기인한 일시적 또는 안정한 단백질 발현의 양을 정량화하는 데 사용할 수 있다 (예를 들어, 문헌[Rhodes 등 (1995) Methods Mol. Biol. 55:121-131] 참조). Any number of selection systems can be used to recover transformed cell lines. These include herpes simplex virus (HSV) thymidine kinase (TK) (see, eg, Wigler et al., (1977) Cell 11:223-232) and adenine phosphoribosyltransferase (APRT) (eg, , see Lowy, I. et al. (1980) Cell, 22:817-23) genes, which may be used in TK - or APRT - cells, respectively. In addition, antimetabolite, antibiotic or herbicide resistance can be used as selection criteria. For example, dihydrofolate reductase (DHFR), which confers resistance to methotrexate (see, for example, Wigler et al. (1980) Proc . Natl . Acad . Sci . USA . 77:3567-70); npt conferring resistance to the aminoglycoside neomycin and G-418 (see, for example, Colbere-Garapin et al. (1981) J. Mol . Biol . 150:1-14]); als or pats conferring resistance to chlorsulfuron and phosphinotricin acetyltransferases, respectively, may be used. Additional selectable genes have been described, such as trpB, which allows cells to utilize indole instead of tryptophan, or hisD, which allows cells to utilize histinol instead of histidine (see, for example, Hartman, SC and RC Mulligan (1988) Proc. Natl . Acad . Sci . USA 85:8047-8051) . Visible markers such as (but not limited to) anthocyanins, beta glucuronidase and its substrate GUS, luciferase and its substrate luciferin can also identify transformants and enable transient or stable protein expression due to specific vector systems. can be used to quantify the amount of (see, for example, Rhodes et al. (1995) Methods Mol. Biol. 55:121-131]).
a. 원핵 세포a. prokaryotic cell
원핵생물, 특히 E. 콜라이는 다량의 단백질을 생산하는 시스템을 제공한다. 원핵 발현 시스템은 일반적으로 글리코실화되지 않은 생성물의 생산에 사용된다. E. 콜라이 프로토콜의 형질전환은 당업자에게 잘 알려져 있다. E. 콜라이용 발현 벡터는 유도성 프로모터를 함유할 수 있고; 이러한 프로모터는 높은 수준의 단백질 발현을 유도하고 숙주 세포에 약간의 독성을 나타내는 단백질을 발현하는 데 유용하다. 유도성 프로모터의 예는 예를 들어 lac 프로모터, trp 프로모터, 하이브리드 tac 프로모터, T7 및 SP6 RNA 프로모터 및 온도 조절된 λPL 프로모터를 포함한다. Prokaryotes, particularly E. coli , provide systems for producing large amounts of protein. Prokaryotic expression systems are generally used for the production of non-glycosylated products. Transformation of E. coli protocols are well known to those skilled in the art. Expression vectors for E. coli may contain an inducible promoter; Such promoters are useful for expressing proteins that drive high levels of protein expression and are slightly toxic to the host cell. Examples of inducible promoters include, for example, the lac promoter, the trp promoter, the hybrid tac promoter, the T7 and SP6 RNA promoters, and the temperature regulated λPL promoter.
본 명세서에 제공되는 폴리펩티드 및 융합 단백질 작제물, 예컨대 본 명세서에 제공되는 임의의 것은 E. 콜라이의 세포질 환경에서 발현될 수 있다. 세포질은 환원 환경이며 일부 분자의 경우 불용성 봉입체가 형성될 수 있다. 환원제, 예컨대 디티오트레이톨 및 β-머캅토에탄올, 및 변성제, 예컨대 구아니딘-HCl 및 우레아를 사용하여 단백질을 재가용화할 수 있다. 또 다른 접근법은 산화 환경과 샤페로닌 유사 및 이황화 이소머라제를 제공하고 가용성 단백질 생산을 유도할 수 있는 박테리아의 주변세포질 공간에서 단백질을 발현하는 것이다. 전형적으로, 리더 서열은 발현될 단백질에 융합되며, 이는 단백질을 주변세포질로 향하게 한다. 그 다음 리더는 주변세포질 내부의 신호 펩티다제에 의해 제거된다. 발현된 단백질을 주변세포질로 전위시키는 예시적인 경로는 Sec 경로, SRP 경로 및 TAT 경로이다. 주변세포질 표적화 리더 서열의 예는 펙테이트 분해효소 유전자로부터의 pelB 리더, StII 리더 서열 및 DsbA 리더 서열, 및 알칼리 포스파타제 유전자로부터 유래된 리더를 포함한다. 일부 경우에는 주변세포질 발현으로 인해 발현된 단백질이 배양 배지로 누출될 수 있다. 단백질 분비를 통해 배양 상청액에서 빠르고 간단하게 정제할 수 있다. 분비되지 않는 단백질은 삼투 용해에 의해 주변세포질로부터 얻을 수 있다. 세포질 발현과 유사하게, 일부 경우에는 단백질이 불용성이 될 수 있으며 변성제와 환원제를 사용하여 가용화 및 재접힘을 촉진할 수 있다. 유도 및 성장 온도는 또한 발현 수준 및 용해도에 영향을 미칠 수 있고; 일반적으로 25 °C 내지 37 °C의 온도가 사용된다. 전형적으로, 박테리아는 비-글리코실화 단백질을 생성한다. 따라서 단백질이 기능을 위해 글리코실화가 필요한 경우, 숙주 세포에서 정제한 후 시험관 내에서 글리코실화를 추가할 수 있다.Polypeptides and fusion protein constructs provided herein, such as any provided herein, can be expressed in the cytoplasmic environment of E. coli . The cytoplasm is a reducing environment and for some molecules insoluble inclusion bodies may form. Proteins can be resolubilized using reducing agents such as dithiothreitol and β-mercaptoethanol, and denaturants such as guanidine-HCl and urea. Another approach is to express proteins in the periplasmic space of bacteria that provide an oxidizing environment and chaperonin-like and disulfide isomerases and can induce soluble protein production. Typically, a leader sequence is fused to the protein to be expressed, which directs the protein to the periplasm. The leader is then removed by signal peptidases inside the periplasm. Exemplary pathways that translocate expressed proteins to the periplasm are the Sec pathway, the SRP pathway and the TAT pathway. Examples of periplasmic targeting leader sequences include the pelB leader from the pectate lyase gene, the StII leader sequence and the DsbA leader sequence, and the leader derived from the alkaline phosphatase gene. In some cases, periplasmic expression may result in leakage of the expressed protein into the culture medium. Protein secretion allows quick and simple purification from the culture supernatant. Proteins that are not secreted can be obtained from the periplasm by osmotic lysis. Similar to cytoplasmic expression, in some cases proteins can become insoluble and denaturants and reducing agents can be used to promote solubilization and refolding. Induction and growth temperature can also affect expression levels and solubility; Typically, temperatures between 25 °C and 37 °C are used. Typically, bacteria produce non-glycosylated proteins. Thus, if a protein requires glycosylation for function, glycosylation can be added in vitro after purification from the host cell.
b. 효모 세포b. yeast cells
효모, 예컨대 사카로마이세스 세레비지아에 , 쉬조사카로마이세스 폼베 , 야로위아 리포라이티카 , 클루이베로마이세스 락티스 , 및 피치아 파스토리스는 본 명세서에 기재된 임의의 것과 같은 단백질 생산에 사용할 수 있는 잘 알려진 발현 숙주이다. 효모는 상동 재조합에 의한 안정한 염색체 통합 또는 에피솜 복제 벡터로 형질전환될 수 있다. 일반적으로 유도성 프로모터는 유전자 발현을 조절하는 데 사용된다. 이러한 프로모터의 예는 GAL1, GAL7, 및 GAL5, 및 메탈로티오네인 프로모터, 예컨대 CUP1, AOX1 또는 다른 피치아 또는 다른 효모 프로모터를 포함한다. 발현 벡터는 종종 형질전환된 DNA의 선택 및 유지를 위해 LEU2, TRP1, HIS3 및 URA3와 같은 선택 가능한 마커를 포함한다. 효모에서 발현되는 단백질은 종종 가용성이다. Bip 및 단백질 디설파이드 이소머라제와 같은 샤페로닌과의 공동 발현은 발현 수준과 용해도를 향상시킬 수 있다. 또한, 효모에서 발현된 단백질은 사카로마이세스 세레비지아에(Saccharomyces cerevisiae)로부터 분비 신호 펩티드 융합, 예컨대 효모 교배형 알파-인자 분비 신호 및 효모 세포 표면 단백질, 예컨대 Aga2p 짝짓기 접착 수용체, 또는 아룩술라 아데닌이보란스(Arxula adeninivorans) 글루코아밀라아제와의 융합를 사용하여 분비를 지시할 수 있다. Kex-2 프로테아제와 같은 프로테아제 절단 부위는 이들이 분비 경로를 나갈 때 발현된 폴리펩티드로부터 융합된 서열을 제거하도록 조작될 수 있다. 효모는 또한 Asn-X-Ser/Thr 모티프에서 글리코실화할 수 있다. yeast, such as Saccharomyces cerevisiae , Shizoscaromyces Pombe , Yarrowia lipolytica , Kluyveromyces lactis , and Pichia Pasteuris is a well-known expression host that can be used to produce proteins such as any of those described herein. Yeast can be transformed with stable chromosomal integration or episomal replication vectors by homologous recombination. In general, inducible promoters are used to regulate gene expression. Examples of such promoters include GAL1, GAL7, and GAL5, and metallothionein promoters such as CUP1, AOX1 or other Pichia or other yeast promoters. Expression vectors often include selectable markers such as LEU2, TRP1, HIS3 and URA3 for selection and maintenance of the transformed DNA. Proteins expressed in yeast are often soluble. Co-expression with chaperonins such as Bip and protein disulfide isomerase can improve expression levels and solubility. In addition, proteins expressed in yeast are secretion signal peptide fusions from Saccharomyces cerevisiae , such as yeast mating type alpha-factor secretion signal and yeast cell surface proteins such as Aga2p mating adhesion receptor, or Aluxula Adenine Ivorans ( Arxula fusion with adeninivoran s) glucoamylase can be used to direct secretion. Protease cleavage sites, such as the Kex-2 protease, can be engineered to remove fused sequences from expressed polypeptides as they exit the secretory pathway. Yeast can also glycosylate at Asn-X-Ser/Thr motifs.
c. 곤충 및 곤충 세포c. insects and insect cells
특히 배큘로바이러스 발현을 이용하는 곤충 세포는 항체 또는 그의 단편을 포함하는 폴리펩티드를 발현하는데 유용하다. 곤충 세포는 높은 수준의 단백질을 발현하며 고등 진핵생물이 사용하는 대부분의 번역 후 변형이 가능하다. 바큘로바이러스는 안전성을 향상시키고 진핵생물 발현의 규제 문제를 줄이는 제한적인 숙주 범위를 가지고 있다. 전형적으로, 발현 벡터는 바큘로바이러스의 폴리헤드린 프로모터 및 p10 프로모터와 같은 고수준 발현을 위한 프로모터를 사용한다. 바큘로바이러스 시스템은 배큘로바이러스, 예컨대 오토그라파 칼리포르니카 핵 다각체병 바이러스 (AcNPV), 및 봄빅스 모리 핵 다각체병 바이러스 (BmNPV), 및 곤충 세포주, 예컨대 스포도프테라 프루지페르다로부터 유래된 Sf9, 트리코플러시아 나이로부터 유래된 TN, 슈달레티아 유니펀크타로부터 유래된 A7S, 및 다누스 플렉시푸스로부터 유래된 DpN1을 포함한다. 높은 수준의 발현을 위해, 발현될 분자의 뉴클레오티드 서열은 바이러스의 폴리헤드린 개시 코돈의 바로 하류에 융합된다. 인간 항체를 발현할 수 있는 배큘로바이러스 재조합체를 생성하기 위해, pAcUW51(PharMingen)과 같은 이중 발현 전단을 사용할 수 있다. 포유동물 분비 신호는 곤충 세포에서 정확하게 처리되며 발현된 단백질을 배양 배지로 분비하는 데 사용할 수 있다. 세포주 슈달레티아 유니펀크타 (A7S) 및 다누스 플렉시푸스 (DpN1)는 포유동물 세포 시스템과 유사한 글리코실화 패턴을 갖는 단백질을 생성한다. 예시적인 곤충 세포는 "포유동물화된" 바큘로바이러스 발현 벡터를 갖는 세포 및 효소 FT3가 결여된 세포를 포함하여 면역원성을 감소시키도록 변경된 세포이다.Insect cells, particularly using baculovirus expression, are useful for expressing polypeptides, including antibodies or fragments thereof. Insect cells express high levels of proteins and are capable of most post-translational modifications used by higher eukaryotes. Baculoviruses have a limited host range that improves safety and reduces regulatory problems of eukaryotic expression. Typically, expression vectors use promoters for high-level expression, such as the polyhedrin promoter and the p10 promoter of baculovirus. Baculovirus systems include baculoviruses such as autographa Californica nuclear polyhedron disease virus (AcNPV), and Bombyx mori nuclear polyhedron disease virus (BmNPV), and insect cell lines such as Spodoptera Sf9 from Prugiperda , TN from Trichoplutus age , Pseudaletia A7S derived from Unifuncta , and Danus including DpN1 derived from Flexipus . For high level expression, the nucleotide sequence of the molecule to be expressed is fused immediately downstream of the polyhedrin initiation codon of the virus. To generate baculovirus recombinants capable of expressing human antibodies, dual expression flyers such as pAcUW51 (PharMingen) can be used. Mammalian secretion signals are correctly processed in insect cells and can be used to secrete the expressed proteins into the culture medium. Cell lines Pseudaletia unifuncta (A7S) and Danus Flexipus (DpN1) produces proteins with glycosylation patterns similar to mammalian cell systems. Exemplary insect cells are cells that have been altered to reduce immunogenicity, including cells with "mammalianized" baculovirus expression vectors and cells lacking the enzyme FT3.
곤충 세포의 대안적인 발현 시스템은 안정적으로 형질전환된 세포를 사용하는 것이다. 세포주, 예컨대 슈나이더 2 (S2) 및 Kc 세포 (드로소필라 멜라노가스테르), 및 C7 세포 (아에데스 알보픽투스)를 발현에 사용할 수 있다. 드로소필라 메탈로티오네인 프로모터는 카드뮴 또는 구리로 중금속 유도가 있는 상태에서 높은 수준의 발현을 유도하는 데 사용할 수 있다. 바큘로바이러스 즉시 초기 유전자 프로모터 IE1을 사용하여 일관된 수준의 발현을 유도할 수 있다. 전형적인 발현 벡터는 pIE1-3 및 pI31-4 전달 벡터(Novagen)를 포함한다. 발현 벡터는 전형적으로 네오마이신 및 하이그로마이신과 같은 선택 가능한 마커를 사용하여 유지된다.An alternative expression system for insect cells is to use stably transformed cells. cell lines such as Schneider 2 (S2) and Kc cells ( Drosophila melanogaster ), and C7 cells ( Aedes albopictus ) can be used for expression. The Drosophila metallothionein promoter can be used to drive high-level expression in the presence of heavy metal induction with cadmium or copper. Consistent levels of expression can be induced using the baculovirus immediate early gene promoter IE1. Typical expression vectors include the pIE1-3 and pI31-4 transfer vectors (Novagen). Expression vectors are typically maintained using selectable markers such as neomycin and hygromycin.
d. 포유동물 발현 세포 d. mammalian expression cells
포유동물 발현 시스템은 본 명세서에 제공된 TNFR1 길항제, TNFR2 효능제, 이중특이적 TNFR1 길항제/TNFR2 효능제 작제물 및 그의 융합체를 포함하는 본 명세서의 작제물을 비롯한 폴리펩티드를 발현하는 데 사용될 수 있다. 발현 작제물은 아데노바이러스와 같은 바이러스 감염에 의해, 또는 리포솜, 인산칼슘 및 DEAE-덱스트란을 사용하는 것과 같은 직접적인 DNA 전달에 의해, 그리고 전기천공 및 미세주입과 같은 물리적 수단에 의해 포유동물 세포로 전달될 수 있다. 포유동물 세포용 발현 벡터는 전형적으로 mRNA 캡 부위, TATA 박스, 번역 개시 서열(Kozak 공통 서열) 및 폴리아데닐화 요소를 포함한다. 내부 리보솜 진입 부위 (IRES) 요소를 추가하여 선택 가능한 마커와 같은 다른 유전자와의 바이시스트론 발현을 허용할 수도 있다. 이러한 벡터는 종종 예를 들어 SV40 프로모터-인핸서, 인간 사이토메갈로바이러스(CMV) 프로모터 및 루 육종 바이러스 (RSV)의 긴 말단 반복부와 같은 고수준 발현을 위한 전사 프로모터-인핸서를 포함한다. 이러한 프로모터-인핸서는 많은 세포 유형에서 활성화된다. 조직 및 세포형 프로모터 및 인핸서 영역도 발현에 사용될 수 있다. 예시적인 프로모터/인핸서 영역은 유전자 예컨대 엘라스타제 I, 인슐린, 면역글로불린, 마우스 유선 종양 바이러스, 알부민, 알파-태아단백, 알파-1 항트립신, 베타-글로빈, 수초 염기 단백질, 미오신 경쇄-2, 및 성선자극성 방출 호르몬 유전자 대조군으로부터의 것들을 포함하지만 이에 제한되지 않는다. Mammalian expression systems can be used to express polypeptides, including constructs herein, including TNFR1 antagonists, TNFR2 agonists, bispecific TNFR1 antagonist/TNFR2 agonist constructs, and fusions thereof provided herein. Expression constructs are introduced into mammalian cells by viral infection, such as adenovirus, or by direct DNA transfer, such as using liposomes, calcium phosphate and DEAE-dextran, and by physical means, such as electroporation and microinjection. can be conveyed Expression vectors for mammalian cells typically include an mRNA cap site, a TATA box, a translation initiation sequence (Kozak consensus sequence) and a polyadenylation element. An internal ribosome entry site (IRES) element may be added to allow bicistronic expression with other genes as selectable markers. Such vectors often include transcriptional promoter-enhancers for high-level expression, such as, for example, the SV40 promoter-enhancer, the human cytomegalovirus (CMV) promoter and the long terminal repeats of Roux sarcoma virus (RSV). These promoter-enhancers are active in many cell types. Tissue and cell type promoters and enhancer regions can also be used for expression. Exemplary promoter/enhancer regions include genes such as elastase I, insulin, immunoglobulin, mouse mammary tumor virus, albumin, alpha-fetoprotein, alpha-1 antitrypsin, beta-globin, myelin base protein, myosin light chain-2, and those from the gonadotropin releasing hormone gene control.
선택 가능한 마커는 발현 작제물로 세포를 선택하고 유지하는 데 사용할 수 있다. 선택가능한 마커 유전자의 예는 하이그로마이신 B 포스포트랜스퍼라제, 아데노신 탈아미노효소, 크산틴-구아닌 포스포리보실트랜스퍼라제, 아미노글리코시드 포스포트랜스퍼라제, 디하이드로폴레이트 환원효소 (DHFR), 및 티미딘 키나제 (TK)를 포함하지만 이에 제한되지 않는다. 예를 들어, DHFR 유전자를 발현하는 세포만을 선별하기 위해 메토트렉세이트의 존재 하에 발현을 수행할 수 있다. 변형된 항-TNFR 항체 및 그의 항원 결합 단편은 예를 들어 NEOR/G418 시스템, 디하이드로폴레이트 환원효소 (DHFR) 시스템 또는 글루타민 합성효소 (GS) 시스템을 사용하여 생산될 수 있다. GS 시스템은 pEE12/pEE6와 같은 관절 발현 벡터를 사용하여 중쇄와 경쇄를 모두 발현한다. TCR-ξ 및 FcεRI-γ와 같은 세포 표면 신호전달 분자와의 융합은 세포 표면에서 활성 상태의 단백질 발현을 지시할 수 있다. Selectable markers can be used to select and maintain cells with expression constructs. Examples of selectable marker genes include hygromycin B phosphotransferase, adenosine deaminase, xanthine-guanine phosphoribosyltransferase, aminoglycoside phosphotransferase, dihydrofolate reductase (DHFR), and thymidine kinase (TK). For example, expression can be performed in the presence of methotrexate to select only cells expressing the DHFR gene. Modified anti-TNFR antibodies and antigen-binding fragments thereof can be produced using, for example, the NEO R /G418 system, the dihydrofolate reductase (DHFR) system or the glutamine synthetase (GS) system. The GS system expresses both heavy and light chains using joint expression vectors such as pEE12/pEE6. Fusion with cell surface signaling molecules such as TCR-ξ and Fc ε RI-γ can direct the expression of proteins in an active state at the cell surface.
마우스, 랫트, 인간, 원숭이, 닭 및 햄스터 세포를 포함하여 많은 세포주가 포유동물 발현에 이용 가능하다. 예시적인 세포주는 BHK (예를 들어, BHK-21 세포), 293-F, CHO, CHO Express (CHOX; ExcellGene), Balb/3T3, HeLa, MT2, 마우스 NS0 (비-분비), 및 다른 골수종 세포주, 하이브리도마 및 헤테로하이브리도마 세포주, 림프구, 섬유아세포, Sp2/0, COS, NIH3T3, HEK293, 293S, 2B8, 및 HKB 세포를 포함하지만 이에 제한되지 않는다. 무혈청 배지에 적응된 세포주도 사용할 수 있으며, 이는 세포 배양 배지에서 분비된 단백질의 정제를 용이하게 한다. 예는 CHO-S 세포(Invitrogen®, Carlsbad, CA, cat # 11619-012) 및 무혈청 EBNA-1 세포주(예를 들어, 문헌[Pham 등 (2003) Biotechnol . Bioeng . 84:332-342] 참조)를 포함한다. 최대 발현을 위해 최적화된 특수 배지에서의 성장에 적합한 세포주도 이용할 수 있다. 예를 들어, DG44 CHO 세포는 화학적으로 정의된 동물성 제품이 없는 배지에서 현탁 배양으로 성장하도록 적응된다.Many cell lines are available for mammalian expression, including mouse, rat, human, monkey, chicken and hamster cells. Exemplary cell lines include BHK (eg, BHK-21 cells), 293-F, CHO, CHO Express (CHOX; ExcellGene), Balb/3T3, HeLa, MT2, mouse NS0 (non-secreting), and other myeloma cell lines. , hybridoma and heterohybridoma cell lines, lymphocytes, fibroblasts, Sp2/0, COS, NIH3T3, HEK293, 293S, 2B8, and HKB cells. Cell lines adapted to serum-free media can also be used, which facilitates the purification of secreted proteins from the cell culture media. Examples include CHO-S cells ( Invitrogen® , Carlsbad, CA, cat # 11619-012) and the serum-free EBNA-1 cell line (eg, Pham et al. (2003) Biotechnol . Bioeng . 84:332-342]). Cell lines suitable for growth in special media optimized for maximal expression are also available. For example, DG44 CHO cells are adapted to grow in suspension culture in chemically defined animal product free media.
e. 식물e. plant
형질전환 식물 세포 및 식물은 본 명세서에 기재된 것과 같은 폴리펩티드 및 단백질을 발현하는 데 사용될 수 있다. 발현 작제물은 전형적으로 미세투사물 폭격(microprojectile bombardment) 및 원형질체로의 PEG 매개 전달과 같은 직접적인 DNA 전달을 사용하고 아그로박테리움 매개 형질전환을 사용하여 식물로 전달된다. 발현 벡터는 프로모터 및 인핸서 서열, 전사 종결 요소 및 번역 제어 요소를 포함할 수 있다. 발현 벡터 및 형질전환 기술은 일반적으로 아라비돕시스(Arabidopsis) 및 담배와 같은 쌍자엽 숙주와 옥수수 및 벼와 같은 외떡잎 숙주로 구분된다. 발현에 사용되는 식물 프로모터의 예는, 예를 들어 꽃양배추 모자이크 바이러스 프로모터 (CaMV 35S), 노팔라인 합성효소 프로모터, 리보스 비스포스페이트 카복실라제 프로모터, 및 유비퀴틴 (예를 들어, 옥수수 유비퀴틴-1 (ubi -1)) 및 UBQ3 프로모터를 포함한다. 선택가능한 마커, 예컨대 하이그로마이신, 포스포만노스 이소머라제 및 네오마이신 포스포트랜스퍼라제는 종종 형질전환된 세포의 선택 및 유지를 용이하게 하기 위해 사용된다. 형질전환된 식물 세포는 세포, 응집체(유합 조직)로서 배양에서 유지되거나 전체 식물로 재생될 수 있다. 형질전환 식물 세포는 또한 폴리펩티드를 생산하도록 조작된 조류를 포함할 수 있다. 식물은 포유동물 세포와는 다른 글리코실화 패턴을 가지고 있기 때문에 이러한 숙주에서 생산되는 단백질의 선택에 영향을 줄 수 있다.Transgenic plant cells and plants can be used to express polypeptides and proteins as described herein. Expression constructs are typically delivered to plants using direct DNA transfer, such as microprojectile bombardment and PEG-mediated transfer to protoplasts, and using Agrobacterium-mediated transformation. Expression vectors can include promoter and enhancer sequences, transcriptional termination elements, and translational control elements. Expression vectors and transformation techniques are generally divided into dicotyledonous hosts such as Arabidopsis and tobacco and monocotyledonous hosts such as corn and rice. Examples of plant promoters used for expression include, for example, the cauliflower mosaic virus promoter (CaMV 35S), the nopaline synthetase promoter, the ribose bisphosphate carboxylase promoter, and ubiquitin (e.g., corn ubiquitin-1 ( ubi -1 )) and the UBQ3 promoter. Selectable markers such as hygromycin, phosphomannose isomerase and neomycin phosphotransferase are often used to facilitate selection and maintenance of transformed cells. Transformed plant cells can be maintained in culture as cells, aggregates (callus tissue) or regenerated into whole plants. Transgenic plant cells may also include algae engineered to produce the polypeptide. Plants have different glycosylation patterns than mammalian cells, which can influence the choice of proteins produced in these hosts.
5. 정제5. Refining
본 명세서에 제공된 폴리펩티드 작제물을 인코딩하는 핵산으로 형질전환된 숙주 세포는 세포 배양물로부터의 인코딩된 단백질의 발현 및 회수에 적합한 조건 하에서 배양될 수 있다. 재조합 세포에 의해 생성된 단백질은 일반적으로 분비되지만, 사용된 서열 및/또는 벡터에 따라 세포 내에 함유될 수 있다. 당업자가 이해하는 바와 같이, 본 명세서에 제공된 폴리펩티드를 인코딩하는 핵산 분자를 함유하는 발현 벡터는 원핵 또는 진핵 세포막을 통해 발현된 폴리펩티드의 직접적인 분비를 촉진하는 신호 서열로 설계될 수 있다. Host cells transformed with nucleic acids encoding the polypeptide constructs provided herein can be cultured under conditions suitable for expression and recovery of the encoded protein from cell culture. Proteins produced by recombinant cells are usually secreted, but may be contained within the cell depending on the sequence and/or vector used. As will be appreciated by those skilled in the art, expression vectors containing nucleic acid molecules encoding the polypeptides provided herein can be designed with signal sequences that facilitate direct secretion of the expressed polypeptides across prokaryotic or eukaryotic cell membranes.
숙주 세포로부터 폴리펩티드를 정제하는 방법은 선택한 숙주 세포와 발현 시스템에 따라 다르다. 분비 분자의 경우, 단백질은 일반적으로 세포를 제거한 후 배양 배지에서 정제된다. 세포 내 발현을 위해, 세포를 용해할 수 있으며 추출물에서 단백질을 정제할 수 있다. 형질전환 식물 및 동물과 같은 형질전환 유기체를 발현에 사용하는 경우, 조직 또는 기관을 출발 물질로 사용하여 용해된 세포 추출물을 제조할 수 있다. 추가로, 형질전환 동물 생산은 수집될 수 있는 우유 또는 계란에서의 폴리펩티드 생산을 포함할 수 있고, 필요한 경우 당업계의 표준 방법을 사용하여 단백질을 추출하고 추가로 정제할 수 있다.Methods for purifying the polypeptide from host cells depend on the host cell and expression system chosen. In the case of secreted molecules, the protein is usually purified from the culture medium after removing the cells. For intracellular expression, the cells can be lysed and the protein can be purified from the extract. When transgenic organisms such as transgenic plants and animals are used for expression, lysed cell extracts can be prepared using tissues or organs as starting materials. Additionally, transgenic animal production can include production of the polypeptide in milk or eggs, which can be harvested, and if necessary, the protein can be extracted and further purified using standard methods in the art.
폴리펩티드, 예컨대 TNFR1 길항제 작제물, TNFR2 효능제 작제물, TNFR1 길항제/TNFR2 효능제 이중특이적 작제물, 및 본 명세서에 제공된 다른 작제물, 및 그의 성분은 당업자에게 공지된 단백질 정제 기술을 사용하여 정제될 수 있다. 이들은 SDS-PAGE, 크기 분별화 및 크기 배제 크로마토그래피, 황산암모늄 침전, 킬레이트 크로마토그래피, 컬럼 크로마토그래피, HPLC, 투석, 및 이온 교환 크로마토그래피, 예컨대 음이온 교환, 및 이들의 조합을 포함하지만 이에 제한되지 않는다. 친화성 정제 기술도 사용할 수 있다. 본 명세서의 작제물은 항체 및 항체 단편의 정제를 위해 개발된 방법을 사용하여 정제될 수 있다. 항체 및 항체 단편을 정제하는 방법의 예시는 컬럼 크로마토그래피를 포함하는 방법이고, 여기서 고체 지지 컬럼 물질은 높은 친화력으로 면역글로불린에 결합하는 스트렙토코쿠스(Streptococcus)로부터의 세포 표면 연련 단백질인 단백질 G에 연결된다. 항체 및 항체 단편은 또한 단백질 A 크로마토그래피를 포함하는 방법에 의해 정제될 수 있는데, 여기서 단백질 A는 고친화성으로 IgG와 같은 면역글로불린에 결합하는 스타필로코쿠스 아우레스(Staphylococcus aureus)의 세포 표면 연관 단백질이 고체 지지 컬럼에 결합된다. 항체 및 항체 단편을 정제하는 데 사용할 수 있는 다른 면역글로불린 결합 박테리아 단백질은 단백질 A 및 단백질 G의 IgG 결합 도메인을 결합하는 재조합 융합 단백질인 단백질 A/G; 및 펩토스트렙토코쿠스(Peptostreptococcus)로부터의 표면 단백질인 단백질 L을 포함한다 (예를 들어, 문헌[Bjorck (1988) J. Immunol . 140(4):1194-1197; Kastern 등 (1992) J. Biol . Chem. 267(18):12820-12825; Eliasson 등 (1988) J. Biol . Chem . 263:4323-4327] 참조). 작제물은 실질적으로 순수하며, 전형적으로 적어도 또는 적어도 약 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98% 또는 99% 순도이다. 순도는 SDS-PAGE 및 쿠마시 블루 염색과 같은 표준 방법으로 평가될 수 있다.Polypeptides, such as TNFR1 antagonist constructs, TNFR2 agonist constructs, TNFR1 antagonist/TNFR2 agonist bispecific constructs, and other constructs provided herein, and components thereof, can be purified using protein purification techniques known to those skilled in the art. It can be. These include, but are not limited to, SDS-PAGE, size fractionation and size exclusion chromatography, ammonium sulfate precipitation, chelation chromatography, column chromatography, HPLC, dialysis, and ion exchange chromatography such as anion exchange, and combinations thereof. don't Affinity purification techniques can also be used. Constructs herein may be purified using methods developed for the purification of antibodies and antibody fragments. An example of a method for purifying antibodies and antibody fragments is a method comprising column chromatography, wherein the solid supported column material is conjugated to Protein G, a cell surface associated protein from Streptococcus that binds immunoglobulins with high affinity. Connected. Antibodies and antibody fragments can also be purified by methods comprising Protein A chromatography, wherein Protein A binds immunoglobulins such as IgG with high affinity and is associated with the cell surface of Staphylococcus aureus . Protein is bound to the solid support column. Other immunoglobulin binding bacterial proteins that can be used to purify antibodies and antibody fragments include Protein A/G, a recombinant fusion protein that combines the IgG binding domains of Protein A and Protein G; and protein L, a surface protein from Peptostreptococcus (see, e.g., Bjorck (1988) J. Immunol . 140(4):1194-1197; Kastern et al. (1992) J. Biol . Chem . 267(18):12820-12825; Eliasson et al. (1988) J. Biol . Chem . 263:4323-4327]). The construct is substantially pure, and is typically at least or at least about 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98% or 99% pure. Purity can be assessed by standard methods such as SDS-PAGE and Coomassie blue staining.
항체 및 그의 단편 및 관련 폴리펩티드가 형질전환된 박테리아에 의해 다량으로 발현될 때, 전형적으로 프로모터 유도 후에, 발현이 구성적일 수 있지만, 폴리펩티드는 불용성 응집물을 형성할 수 있다. 폴리펩티드 봉입체의 정제를 위한 프로토콜은 당업자에게 공지되어 있다. 예를 들어, 한 방법에서, 세포 현탁액을 원심분리하여 봉입체를 펠렛화하고, 봉입체를 함유하는 펠렛을 완충액, 예를 들어 20 mM Tris-HCL(pH 7.2), 1 mM EDTA, 150 mM NaCl 및 2% Triton-X 100, 비이온성 세제에 현탁시키고 이는 봉입체에 해를 끼치지 않지만 오염 물질을 용해시킨다. 가능한 한 많은 세포 잔해를 제거하기 위해 세척 단계를 반복할 수 있다. 봉입체의 나머지 펠렛은 20 mM 인산나트륨, pH 6.8, 150 mM NaCl과 같은 적절한 완충액에 재현탁된다. 다른 적절한 완충제 뿐만 아니라 대안적인 정제 프로토콜은 공지되어 있거나 당업자에 의해 개발될 수 있다.When antibodies and fragments thereof and related polypeptides are expressed in large amounts by transformed bacteria, typically after promoter induction, expression may be constitutive, but the polypeptide may form insoluble aggregates. Protocols for purification of polypeptide inclusion bodies are known to those skilled in the art. For example, in one method, the cell suspension is centrifuged to pellet the inclusion bodies, and the pellet containing the inclusion bodies is dissolved in a buffer such as 20 mM Tris-HCL, pH 7.2, 1 mM EDTA, 150 mM NaCl and 2 mM % Triton-X 100, non-ionic detergent, which does not harm the inclusion body but dissolves contaminants. Washing steps can be repeated to remove as much cell debris as possible. The remaining pellet of inclusion bodies is resuspended in an appropriate buffer such as 20 mM sodium phosphate, pH 6.8, 150 mM NaCl. Other suitable buffers as well as alternative purification protocols are known or can be developed by those skilled in the art.
정제를 위한 다른 방법, 항체 및 그의 단편, 및 본 명세서에 제공된 작제물이 사용되거나 개발될 수 있다. 박테리아 주변세포질로부터 정제될 수 있다. 폴리펩티드가 생산되는 박테리아의 주변세포질로 배출된 폴리펩티드의 경우, 박테리아의 주변세포질 분획은 당업자에게 공지된 다른 방법에 더하여 저온 삼투 충격에 의해 단리될 수 있다. 예를 들어, 한 방법에서 주변세포질로부터 재조합 폴리펩티드를 단리하기 위해, 박테리아 세포를 원심분리하여 펠렛을 형성한다. 펠렛은 20% 수크로스를 함유하는 완충액에 재현탁된다. 세포를 용해하기 위해, 박테리아를 원심분리하고 펠렛을 빙냉 5mM MgSO4에 재현탁하고 약 10분 동안 빙욕에 보관한다. 세포 현탁액을 원심분리하고 상층액을 경사분리하여 보관한다. 상청액에 존재하는 재조합 폴리펩티드는 당업자에게 잘 알려진 표준 분리 기술에 의해 숙주 단백질로부터 분리될 수 있다. 이러한 방법에는 다음 단계가 포함되지만 이에 제한되지 않다: 용해도 분변화, 크기 차별 여과 및 컬럼 크로마토그래피. Other methods for purification, antibodies and fragments thereof, and constructs provided herein may be used or developed. It can be purified from bacterial periplasm. For polypeptides exported to the periplasm of the bacteria in which the polypeptide is produced, the periplasmic fraction of the bacteria can be isolated by cold osmotic shock in addition to other methods known to those skilled in the art. For example, in one method, to isolate recombinant polypeptide from the periplasm, bacterial cells are centrifuged to form a pellet. The pellet is resuspended in buffer containing 20% sucrose. To lyse the cells, the bacteria are centrifuged and the pellet is resuspended in ice-cold 5 mM MgSO 4 and kept in an ice bath for about 10 minutes. The cell suspension is centrifuged and the supernatant is decanted and stored. Recombinant polypeptide present in the supernatant can be separated from host proteins by standard separation techniques well known to those skilled in the art. These methods include, but are not limited to, the following steps: solubility fractionation, size differential filtration, and column chromatography.
발현 작제물은 또한 예를 들어 인코딩된 폴리펩티드에 대한 발현 시, 작동가능하게 연결된 발현 생성물의 검출 또는 정제를 위해 친화성 태그를 인코딩하는 핵산을 포함하도록 조작될 수 있다. 친화성 태그는 예를 들어 각각 SUMO, myc 항체, 글루타티온 수지 및 Ni-수지로 친화성 정제를 위해 작은 유비퀴틴 유사 변형인자 (SUMO) 태그, myc 에피토프, GST 융합 또는 His6을 포함한다. 이러한 태그를 인코딩하는 핵산은 본 명세서에 제공되는 폴리펩티드 구성을 인코딩하는 핵산에 연결될 수 있다. 태그는 가용성 단백질의 정제 및/또는 검출을 용이하게 할 수 있다. 예를 들어, TNFR1 길항제 폴리펩티드 작제물 또는 그의 일부는 단백질 정제를 용이하게 하기 위해 추가된 하나 이상의 추가 폴리펩티드 도메인과 함께 재조합 단백질로 발현될 수 있다. 정제 촉진 도메인은 금속 킬레이트화 펩티드, 예를 들어 고정화 금속 상에서 정제를 허용하는 히스티딘-트립토판 모듈, 고정화 면역글로불린 상에서 정제를 허용하는 단백질 A 도메인, 및 FLAGS 연장/친화성 정제 시스템에서 활용되는 도메인을 포함하지만 이에 제한되지 않는다. (Immunex Corp., 워싱턴주 시애틀). 절단 가능한 링커 서열, 예컨대 인자 Xa 절단 가능한 인식 부위(Nru I 제한 부위를 포함하도록 조작된 Ile-Glu-Gly-Arg, 예를 들어 EP 92115607A 참조) 또는 엔테로키나제(Invitrogen (Thermo Fisher Scientific), San Diego, CA)을 인코딩하는 핵산의 포함은 정제 도메인과 인코딩된 발현 폴리펩티드 사이에서 정제를 용이하게 한다. 예시적인 발현 벡터는 TNFR1 길항제 및/또는 TNFR2 효능제 폴리펩티드 및 엔테로키나제 절단 부위를 함유하는 융합 단백질의 발현을 인코딩한다. 작은 유비퀴틴 유사 변형인자 (SUMO) 태그는 고정화 금속 이온 친화성 크로마토그래피(IMIAC)에서 정제를 용이하게 하고 엔테로키나제 절단 부위는 융합 단백질로부터 폴리펩티드를 정제하기 위한 절단 부위를 제공한다.Expression constructs can also be engineered to include nucleic acids encoding affinity tags, for example, for detection or purification of operably linked expression products upon expression of the encoded polypeptide. Affinity tags include, for example, small ubiquitin-like modifier (SUMO) tags, myc epitopes, GST fusions or His 6 for affinity purification with SUMO, myc antibodies, glutathione resins and Ni-resins, respectively. A nucleic acid encoding such a tag can be linked to a nucleic acid encoding a polypeptide construct provided herein. Tags can facilitate purification and/or detection of soluble proteins. For example, a TNFR1 antagonist polypeptide construct or portion thereof can be expressed as a recombinant protein with one or more additional polypeptide domains added to facilitate protein purification. Purification facilitating domains include metal chelating peptides, such as histidine-tryptophan modules allowing purification on immobilized metals, protein A domains allowing purification on immobilized immunoglobulins, and domains utilized in the FLAGS extension/affinity purification system. However, it is not limited thereto. (Immunex Corp., Seattle, WA). A cleavable linker sequence such as a Factor Xa cleavable recognition site (Ile-Glu-Gly-Arg engineered to include a Nru I restriction site, see eg EP 92115607A) or an enterokinase (Invitrogen (Thermo Fisher Scientific), San Diego , CA) facilitates purification between the purification domain and the encoded expression polypeptide. Exemplary expression vectors encode the expression of a fusion protein containing a TNFR1 antagonist and/or TNFR2 agonist polypeptide and an enterokinase cleavage site. A small ubiquitin-like modifier (SUMO) tag facilitates purification in immobilized metal ion affinity chromatography (IMIAC) and an enterokinase cleavage site provides a cleavage site for purification of the polypeptide from the fusion protein.
순도는 겔 전기영동, 직교 HPLC 방법, 염색 및 분광광도법적 기술을 포함하는 당업계에 공지된 임의의 방법에 의해 평가될 수 있다. 발현 및 정제된 폴리펩티드는 당업자에게 공지된 임의의 검정 또는 방법, 예를 들어 본 명세서에 기재된 임의의 방법을 사용하여 분석될 수 있다. 이들은 겔 전기영동에 의한 분석, 면역검정, 결합 검정 및 TNF 매개 TNFR1 및/또는 TNFR2 활성의 검정을 포함하나 이에 제한되지 않는 폴리펩티드의 물리적 및/또는 기능적 특성에 기초한 검정을 포함한다.Purity can be assessed by any method known in the art including gel electrophoresis, orthogonal HPLC methods, staining and spectrophotometric techniques. Expressed and purified polypeptides can be analyzed using any assay or method known to those skilled in the art, for example any of the methods described herein. These include assays based on physical and/or functional properties of the polypeptide, including but not limited to assays by gel electrophoresis, immunoassays, binding assays, and assays of TNF-mediated TNFR1 and/or TNFR2 activity.
6. 추가 변형 6. Additional variations
전술된 바와 같은 변형된 TNFR1 길항제 작제물, TNFR2 효능제 작제물, 이중특이적 TNFR1 길항제/TNFR2 효능제 작제물, 및 다른 작제물 및 이들의 성분은 약동학적 및 약력학적 특성을 포함하는 약리학적 특성을 변경시키는 성분(활성 변형제)을 포함한다. 작제물, 예컨대 TNFR1 억제제 폴리펩티드 및 소분자, 및 TNFR2 효능제 폴리펩티드 및 소분자의 부분은 중합체 또는 중합체성 모이어티, 예컨대, 폴리에틸렌 글리콜 (PEG) 모이어티 또는 덱스트란, 또는 인간 혈청 알부민 (HSA)로 제한되지 않는 것에 접합될 수 있거나, 면역원성을 감소시키고/시키거나 혈청 및 기타 체액에서 반감기를 증가시키기 위해 시알릴화될 수 있다. 폴리펩티드는 또한 His 태그 또는 SUMO 서열과 같은 정제 태그에 연결될 수 있다. 추가적인 변형은 예를 들어 글리코실화, 카복실화, 하이드록실화, 인산화 또는 다른 공지된 변형을 포함한다. 글리코실화는 포유동물 발현 시스템과 같은 적절한 발현 시스템을 사용하여 생체 내에서, 시험관 내에서, 또는 생체 내 및 시험관 내 방법의 조합을 통해 혼입될 수 있고, 예를 들어, 폴리펩티드는 원핵 세포에서 발현되고 효소 트랜스글리코실화를 사용하여 시험관 내에서 추가로 변형된다. 다른 변형은 시험관 내에서 또는 예를 들어 이러한 변형을 생성하는 적합한 숙주에서 변형된 폴리펩티드를 생성함으로써 이루어질 수 있다.Modified TNFR1 antagonist constructs, TNFR2 agonist constructs, bispecific TNFR1 antagonist/TNFR2 agonist constructs, and other constructs and components thereof as described above have pharmacological properties, including pharmacokinetic and pharmacodynamic properties. It contains ingredients that change (active modifiers). Constructs, such as TNFR1 inhibitor polypeptides and small molecules, and portions of TNFR2 agonist polypeptides and small molecules are not limited to polymers or polymeric moieties such as polyethylene glycol (PEG) moieties or dextran, or human serum albumin (HSA). or sialylated to reduce immunogenicity and/or increase half-life in serum and other bodily fluids. A polypeptide may also be linked to a purification tag such as a His tag or SUMO sequence. Additional modifications include, for example, glycosylation, carboxylation, hydroxylation, phosphorylation or other known modifications. Glycosylation can be incorporated in vivo, in vitro, or through a combination of in vivo and in vitro methods using a suitable expression system, such as a mammalian expression system, e.g., the polypeptide is expressed in a prokaryotic cell and It is further modified in vitro using the enzymatic transglycosylation. Other modifications can be made in vitro or by generating the modified polypeptide, for example in a suitable host that produces such modifications.
이러한 변형 또는 활성 변형제 및 변형은 변형된 폴리펩티드가 변형의 기능을 통합하고 비융합 또는 비변형 폴리펩티드와 비교하여 96%, 97%, 98%, 99% 이상의 활성을 포함하는 비융합 또는 비변형 폴리펩티드와 비교하여 적어도 일부, 일반적으로 적어도 50%, 60%, 70%, 80%, 90% 또는 95%를 유지하도록 영향을 미치고 선택된다. 예를 들어, TNFR1 길항제 작제물은 TNFR1을 통한 TNF 매개 신호전달을 억제하는 능력을 유지한다. Such modified or active modifiers and modifications are unfused or unmodified polypeptides in which the modified polypeptide incorporates the function of the modification and contains at least 96%, 97%, 98%, 99% of the activity compared to the unfused or unmodified polypeptide. is affected and selected to retain at least some, typically at least 50%, 60%, 70%, 80%, 90% or 95% compared to For example, a TNFR1 antagonist construct retains the ability to inhibit TNF-mediated signaling through TNFR1.
TNFR1 길항제 또는 TNFR2 효능제와 같은 폴리펩티드와 또 다른 폴리펩티드의 결합은 직접적으로 또는 링커를 통해 간접적으로 수행될 수 있다. 한 예에서, 연결은 이종이작용성 제제, 또는 티올 연결, 또는 다른 이러한 연결을 통한 것과 같은 화학적 연결에 의한 것일 수 있다. 융합은 또한 재조합 발현에 의해 수행될 수 있다. TNFR1 길항제 또는 TNFR2 효능제와 같은 폴리펩티드의 또 다른 폴리펩티드에 대한 융합은 TNFR1 길항제 또는 TNFR2 효능제 폴리펩티드의 N- 또는 C-말단일 수 있다. 본 명세서에 제공된 TNFR1 길항제 또는 TNFR2 효능제 폴리펩티드와 융합 단백질에 사용될 수 있는 폴리펩티드의 비제한적 예는 예를 들어 GST(글루타티온 S-트랜스퍼라제) 폴리펩티드, 면역글로불린 G로부터의 Fc 도메인, 알부민, 이종성 신호 서열 및 이들의 조합을 포함한다. Coupling of a polypeptide, such as a TNFR1 antagonist or TNFR2 agonist, with another polypeptide can be effected either directly or indirectly through a linker. In one example, linking can be by chemical linkage, such as through heterobifunctional agents, or thiol linkages, or other such linkages. Fusions can also be performed by recombinant expression. A fusion of a polypeptide, such as a TNFR1 antagonist or TNFR2 agonist, to another polypeptide may be at the N- or C-terminus of the TNFR1 antagonist or TNFR2 agonist polypeptide. Non-limiting examples of polypeptides that can be used in fusion proteins with TNFR1 antagonist or TNFR2 agonist polypeptides provided herein include, for example, GST (glutathione S-transferase) polypeptides, Fc domains from immunoglobulin G, albumin, heterologous signal sequences and combinations thereof.
인코딩된 작제물은 표준 재조합 기술로 생산할 수 있다. 예를 들어, 상이한 폴리펩티드 부분을 인코딩하는 DNA 단편은 예를 들어, 결찰을 위해 무딘 단부 또는 엇갈린 단부 말단, 적절한 말단을 제공하기 위한 제한 효소 소화, 적절하게 점착성 말단을 채우고, 바람직하지 않은 연결을 피하기 위한 알칼리 포스파타제 처리 및 효소 결찰을 사용하여 종래의 기술에 따라 인-프레임으로 함께 결찰될 수 있다. 융합 유전자는 자동화 DNA 합성기를 포함하는 종래의 기술에 의해 합성될 수 있다. 대안적으로, 유전자 단편의 PCR 증폭은 후속적으로 어닐링되고 재증폭되어 키메라 유전자를 생성할 수 있는 2개의 연속적인 유전자 단편 사이에 상보적 오버행을 발생시키는 앵커 프라이머를 사용하여 수행될 수 있다. 이미 융합 모이어티(예를 들어, GST 폴리펩티드)을 인코딩하는 많은 발현 벡터가 상업적으로 이용 가능하다. 폴리펩티드 인코딩 핵산은 융합 모이어티가 본 명세서에 제공된 TNFR1 길항제, TNFR2 효능제, 및 다중특이적, 예를 들어 이중-특이성 작제물에 인-프레임으로 연결되도록 이러한 발현 벡터로 클로닝될 수 있다.Encoded constructs can be produced by standard recombinant techniques. For example, DNA fragments encoding different polypeptide parts can be prepared by, for example, blunt or staggered ends for ligation, restriction enzyme digestion to provide appropriate ends, appropriately filled in sticky ends, and avoiding undesirable ligation. can be ligated together in-frame according to conventional techniques using alkaline phosphatase treatment and enzymatic ligation. Fusion genes can be synthesized by conventional techniques including automated DNA synthesizers. Alternatively, PCR amplification of gene segments can be performed using anchor primers that create complementary overhangs between two consecutive gene segments that can subsequently be annealed and re-amplified to create chimeric genes. Many expression vectors already encoding fusion moieties (eg, GST polypeptides) are commercially available. A nucleic acid encoding a polypeptide can be cloned into such an expression vector such that the fusion moiety is ligated in-frame to the TNFR1 antagonist, TNFR2 agonist, and multispecific, eg, bispecific, constructs provided herein.
a. PEG화 a. PEGization
폴리에틸렌 글리콜(PEG)은 생체 재료, 생명 공학 및 의약에 사용되고; 일반적으로 비면역원성인 생체 적합성, 무독성, 수용성 중합체이다. 약물 전달 분야에서, PEG 유도체는 면역원성, 단백질 분해 및 신장 청소능을 감소시키고 혈청 반감기를 증가시키고 용해도를 강화하기 위해 단백질에 대한 공유 부착(즉, "PEG화")에 사용된다 (예를 들어, 문헌[Zalipsky (1995) Adv . Drug Del . Rev. 16:157-182] 참조). PEG는 저분자량의 상대적으로 소수성인 약물에 부착되어 용해도를 높이고 독성을 줄이며 생체분포를 변경한다. 선형 또는 분지쇄 PEG 모이어티에 대한 접합은 폴리펩티드의 분자 질량 및 유체역학적 반경을 증가시키고 신장에 의한 사구체 여과 속도를 감소시킨다. 전형적으로, PEG화 약물은 주사와 같이 용액으로서 투여된다. 본 명세서의 작제물에서, PEG화 모이어티 및 다른 이러한 중합체는 작제물의 링커 부분의 일부일 수 있다.Polyethylene glycol (PEG) is used in biomaterials, biotechnology and medicine; It is a biocompatible, non-toxic, water-soluble polymer that is generally non-immunogenic. In the field of drug delivery, PEG derivatives are used for covalent attachment (i.e., "PEGylation") to proteins to reduce immunogenicity, proteolytic and renal clearance, increase serum half-life, and enhance solubility (e.g. , Zalipsky (1995) Adv . Drug Del . Rev. 16:157-182). PEG is attached to low molecular weight, relatively hydrophobic drugs to increase solubility, reduce toxicity and alter biodistribution. Conjugation to a linear or branched chain PEG moiety increases the molecular mass and hydrodynamic radius of the polypeptide and reduces the rate of glomerular filtration by the kidney. Typically, PEGylated drugs are administered as solutions, such as by injection. In the constructs herein, the PEGylation moiety and other such polymers may be part of the linker portion of the construct.
분해 가능한 가용성 약물 운발체의 설계에 사용되는 동일한 화학의 대부분이 분해 가능한 겔의 설계에도 사용될 수 있기 때문에 관련 응용 분야는 약물 전달에 사용하기 위한 가교된 분해성 PEG 네트워크 또는 제형의 합성이다. (예를 들어, 문헌[Sawhney 등 (1993) Macromolecules 26:581-587] 참조). 거대분자간 복합체는 두 개의 상보적인 중합체 용액을 혼합하여 형성될 수 있다. 이러한 복합체는 관여된 중합체 사이의 정전기적 상호작용(다음이온-다가양이온) 및/또는 수소 결합(다중산-다중염기) 및/또는 매질 내 중합체 사이의 소수성 상호작용에 의해 안정화된다 (예를 들어, 문헌[Krupers 등 (1996) Eur . Polym . J. 32:785-790] 참조). 예를 들어 적절한 조건에서 폴리아크릴산(PAAc)과 폴리에틸렌 옥사이드(PEO)의 혼합 용액은 주로 수소 결합을 기반으로 하는 복합체를 형성한다. 생리적 조건에서 이들 복합체의 해리는 유리(즉, PEG화되지 않은) 약물의 전달에 사용되어 왔다. 상보적 중합체의 복합체는 단독 중합체와 공중합체로 형성되었다. A relevant application is the synthesis of cross-linked degradable PEG networks or formulations for use in drug delivery, as many of the same chemistries used in the design of degradable soluble drug vehicles can also be used in the design of degradable gels. (See, e.g., Sawhney et al. (1993) Macromolecules 26:581-587). Intermolecular complexes can be formed by mixing two complementary polymer solutions. These complexes are stabilized by electrostatic interactions (polyanion-polycation) and/or hydrogen bonding (polyacid-polybase) between the polymers involved and/or hydrophobic interactions between the polymers in the medium (e.g. , Krupers et al. (1996) Eur . Polym . J. 32:785-790]). For example, a mixed solution of polyacrylic acid (PAAc) and polyethylene oxide (PEO) under appropriate conditions forms a complex mainly based on hydrogen bonds. Dissociation of these complexes under physiological conditions has been used for delivery of free (i.e., non-PEGylated) drugs. Complexes of complementary polymers were formed from homopolymers and copolymers.
PEG화된 치료 단백질과 마찬가지로 PEG화를 위한 수많은 시약이 알려져 있다. 이러한 시약은 N-하이드록시석신이미딜 (NHS) 활성화된 PEG, 석신이미딜 mPEG, mPEG2-N-하이드록시석신이미드, mPEG 석신이미딜 알파-메틸부타노에이트, mPEG 석신이미딜 프로피오네이트, mPEG 석신이미딜 부타노에이트, mPEG 카복시메틸 3-하이드록시부탄산 석신이미딜 에스테르, 동종이중작용성 PEG-석신이미딜 프로피오네이트, 동종이중작용성 PEG 프로피온알데하이드, 동종이중작용성 PEG 부티르알데하이드, PEG 말레이미드, PEG 하이드라자이드, p-니트로페닐-카보네이트 PEG, mPEG-벤조트리아졸 카보네이트, 프로피온알데하이드 PEG, mPEG butry알데하이드, 분지형 mPEG2 부티르알데하이드, mPEG 아세틸, mPEG 피페리돈, mPEG 메틸케톤, mPEG "링커 없는" 말레이미드, mPEG 비닐 설폰, mPEG 티올, mPEG 오르토피리딜티오에스테르, mPEG 오르토피리딜 디설파이드, Fmoc-PEG-NHS, Boc-PEG-NHS, 비닐설폰 PEG-NHS, 아크릴레이트 PEG-NHS, 플루오레세인 PEG-NHS, 및 바이오틴 PEG-NHS을 포함하지만 이에 제한되지 않는다 (예를 들어, 문헌[Veronese 등 (1997) J. Bioactive Compatible Polymers 12:197-207; 및 수많은 미국 및 전 세계 특허] 참조). 한 예에서, 폴리에틸렌 글리콜은 약 3 kDa 내지 약 50 kDa, 전형적으로 약 5 kDa 내지 약 30 kDa 범위의 분자량을 갖는다. 약물에 대한 PEG의 공유 부착("PEG화"로 알려짐)은 공지된 화학 합성 기술에 의해 달성될 수 있다. 예를 들어, 단백질의 PEG화는 적절한 반응 조건 하에서 NHS 활성화 PEG를 단백질과 반응시킴으로써 달성될 수 있다. As with PEGylated therapeutic proteins, numerous reagents for PEGylation are known. These reagents include N-hydroxysuccinimidyl (NHS) activated PEG, succinimidyl mPEG, mPEG2-N-hydroxysuccinimide, mPEG succinimidyl alpha-methylbutanoate, mPEG succinimidyl propionate , mPEG succinimidyl butanoate, mPEG carboxymethyl 3-hydroxybutanoic acid succinimidyl ester, homodifunctional PEG-succinimidyl propionate, homobifunctional PEG propionaldehyde, homobifunctional PEG moiety Tyraldehyde, PEG maleimide, PEG hydrazide, p-nitrophenyl-carbonate PEG, mPEG-benzotriazole carbonate, propionaldehyde PEG, mPEG butryaldehyde, branched mPEG2 butyraldehyde, mPEG acetyl, mPEG piperidone, mPEG Methylketone, mPEG "linkerless" maleimide, mPEG vinyl sulfone, mPEG thiol, mPEG orthopyridylthioester, mPEG orthopyridyl disulfide, Fmoc-PEG-NHS, Boc-PEG-NHS, vinylsulfone PEG-NHS, acrylic late PEG-NHS, fluorescein PEG-NHS, and biotin PEG-NHS (see, e.g., Veronese et al. (1997) J. Bioactive Compatible Polymers 12:197-207; and numerous US and worldwide patents]). In one example, polyethylene glycol has a molecular weight ranging from about 3 kDa to about 50 kDa, typically from about 5 kDa to about 30 kDa. Covalent attachment of PEG to a drug (known as "PEGylation") can be achieved by known chemical synthesis techniques. For example, PEGylation of a protein can be achieved by reacting NHS activated PEG with the protein under appropriate reaction conditions.
PEG화에 대해 수많은 반응이 기재되었지만, 단백질에 가장 일반적으로 적용 가능한 반응은 방향성을 부여하고 온화한 반응 조건을 사용하며 독성 촉매 또는 부산물을 제거하기 위해 광범위한 다운스트림 처리를 필요로 하지 않는다. 예를 들어, 모노메톡시 PEG(mPEG)는 단 하나의 반응성 말단 하이드록실을 가지므로 그 사용은 생성된 PEG-단백질 산물 혼합물의 이종성의 일부를 제한한다. 말단 메톡시 기 반대편에 있는 중합체 말단의 하이드록실 기의 활성화는 일반적으로 효율적인 단백질 PEG화를 달성하는 데 필요하며, 그 목적은 유도체화된 PEG를 친핵성 공격에 더 취약하게 만드는 것이다. 공격하는 친핵체는 일반적으로 라이실 잔기의 엡실론-아미노 기이지만, 국소 조건이 유리한 경우 다른 아민도 반응할 수 있다 (예를 들어, 히스티딘의 N-말단 알파-아민 또는 고리 아민). 단일 라이신 또는 시스테인을 함유하는 단백질에서 보다 직접적인 부착이 가능하다. 후자의 잔기는 티올 특이적 변형을 위해 PEG-말레이미드에 의해 표적화될 수 있다. 대안적으로, PEG 하이드라지드는 과요오드산염 산화 단백질과 반응할 수 있고 NaCNBH3의 존재 하에서 환원될 수 있다. 보다 구체적으로, PEG화 CMP 당은 적절한 글리코실-트랜스퍼라제의 존재 하에 단백질과 반응할 수 있다. 하나의 기술은 다수의 중합체 분자가 문제의 폴리펩티드에 결합되는 "PEG화" 기술이다. 이 기술을 사용할 때, 면역계는 항체 형성을 담당하는 폴리펩티드 표면의 에피토프를 인식하는 데 어려움을 겪어 면역 반응을 감소시킨다. 특정한 생리적 효과를 주기 위해 인체의 순환계에 직접 도입된 폴리펩티드(즉, 의약품)의 경우, 전형적인 잠재적 면역 반응은 IgG 및/또는 IgM 반응인 반면, 호흡계를 통해 흡입되는 폴리펩티드(즉, 산업용 폴리펩티드)는 잠재적으로 IgE 반응(즉, 알러지 반응)을 유발할 수 있다. 감소된 면역 반응을 설명하는 이론 중 하나는, 중합체 분자(들)가 항체 형성을 유도하는 면역 반응을 담당하는 폴리펩티드 표면의 에피토프(들)를 보호한다는 것이다. 또 다른 이론 또는 적어도 부분적인 요인은 접합체가 무거울수록 면역 반응이 더 많이 감소한다는 것이다. Numerous reactions have been described for PEGylation, but the most commonly applicable reactions to proteins are directed, use mild reaction conditions, and do not require extensive downstream processing to remove toxic catalysts or by-products. For example, monomethoxy PEG (mPEG) has only one reactive terminal hydroxyl, so its use limits some of the heterogeneity of the resulting PEG-protein product mixture. Activation of the hydroxyl group at the end of the polymer, opposite the terminal methoxy group, is usually required to achieve efficient protein PEGylation, the purpose of which is to make the derivatized PEG more susceptible to nucleophilic attack. The attacking nucleophile is usually the epsilon-amino group of the lysyl residue, but other amines may also react if local conditions are favorable (eg, the N-terminal alpha-amine of histidine or a cyclic amine). A more direct attachment is possible in proteins containing a single lysine or cysteine. The latter residue can be targeted by PEG-maleimide for thiol specific modification. Alternatively, PEG hydrazide can react with periodate oxidized protein and be reduced in the presence of NaCNBH 3 . More specifically, PEGylated CMP sugars can react with proteins in the presence of appropriate glycosyl-transferases. One technique is the "PEGylation" technique in which multiple polymer molecules are linked to the polypeptide in question. When using this technique, the immune system has difficulty recognizing the epitopes on the polypeptide surface responsible for antibody formation, reducing the immune response. For polypeptides introduced directly into the body's circulatory system to exert a specific physiological effect (i.e. pharmaceuticals), typical potential immune responses are IgG and/or IgM responses, whereas polypeptides inhaled through the respiratory system (i.e. industrial polypeptides) have potential may cause an IgE response (i.e., an allergic reaction). One of the theories explaining the reduced immune response is that the polymer molecule(s) protect epitope(s) on the polypeptide surface that are responsible for the immune response leading to antibody formation. Another theory, or at least a partial factor, is that the heavier the conjugate, the more the immune response is reduced.
예를 들어, 폴리펩티드 작제물 및 본 명세서에 제공된 폴리펩티드 성분을 PEG화하면, PEG 모이어티는 공유 부착을 통해 폴리펩티드에 접합된다. PEG화를 위한 기술은 특화된 링커 및 커플링 화학의 사용(예를 들어, 문헌[Harris (2002) Adv. Drug Deliv . Rev. 54:459-476] 참조), 단일 접합 부위(예를 들어, 분지형 PEG 사용; 예를 들어 문헌[Veronese 등, (2002) Bioorg . Med . Chem . Lett. 12:177-180] 참조), 부위 특이적 PEG화 및/또는 모노-PEG화 (예를 들어, 문헌[Chapman 등 (1999) Nature Biotech. 17:780-783] 참조), 부위 지정 효소 PEG화(예를 들어 문헌[ Sato (2002) Adv . Drug Deliv . Rev. 54:487-504] 참조)을 포함하지만 이에 제한되지 않는다. 당업계에 기재된 방법 및 기술은 단일 단백질 분자에 부착된 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 또는 10개 초과의 PEG 또는 PEG 유도체를 갖는 단백질을 생성할 수 있다 (예를 들어, 문헌[미국 특허 공개 번호 2006/0104968] 참조). For example, upon PEGylation of a polypeptide construct and a polypeptide component provided herein, the PEG moiety is conjugated to the polypeptide via a covalent attachment. Techniques for PEGylation include the use of specialized linkers and coupling chemistries (see, eg, Harris (2002) Adv. Drug Deliv . Rev. 54:459-476), single conjugation sites (eg, molecules), Use of topographic PEG; see, eg, Veronese et al., (2002) Bioorg . Med . Chem . Lett . 12:177-180), site-specific PEGylation and/or mono-PEGylation (eg, literature [Chapman et al. (1999) Nature Biotech . 17:780-783), site-directed enzyme PEGylation (see, eg, Sato (2002) Adv . Drug Deliv . Rev. 54:487-504). Methods and techniques described in the art can produce proteins with 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, or more than 10 PEG or PEG derivatives attached to a single protein molecule. (See, eg, US Patent Publication No. 2006/0104968).
b. 알부민화b. albuminization
본 명세서에 제공된 폴리펩티드, 예컨대 TNFR1 길항제 작제물, TNFR2 효능제 작제물, 및 다중특이적 TNFR1 길항제/TNFR2 효능제 작제물은 알부민(즉, "알부민화")에 융합될 수 있고, 반감기, 안정성, 생체이용률 및 분포를 증가시키기 위해, 및/또는 폴리펩티드의 약동학과 같은 약리학적 특성을 개선하기 위해 인간 치료를 위해 인간 혈청 알부민(HSA)에 융합될 수 있다. 인간 혈청 알부민(HSA)과 관련된 수많은 제품이 암 치료제 및 2형 당뇨병 치료를 포함하여 치료제로 사용하도록 승인되었다 (예를 들어, 문헌[AlQahtani 등 (2019) Biomed and Pharmacotherapy 113:108750; Roscoe 등 (2018) Mol . Pharmaceutics 151:15046-5047; Strohl, W.R. (2015) BioDrugs 4:215-239] 참조). 일부 예에서, 신호 서열 및 활성화 서열이 결여된 성숙 HSA 단백질은 관심 단백질에 융합된다. 일부 예에서, 인간 혈청 알부민, 예컨대 인간 혈청 알부민 (HSA)은 폴리펩티드에 접합된다. 예시적인 HSA 단백질은 서열번호: 35에 제시되어 있다.Polypeptides provided herein, such as TNFR1 antagonist constructs, TNFR2 agonist constructs, and multispecific TNFR1 antagonist/TNFR2 agonist constructs, can be fused to albumin (i.e., "albuminized") and have properties such as half-life, stability, It can be fused to human serum albumin (HSA) for human therapy to increase bioavailability and distribution and/or to improve pharmacological properties such as pharmacokinetics of the polypeptide. A number of products related to human serum albumin (HSA) have been approved for use as therapeutics, including the treatment of cancer and type 2 diabetes (see, for example, AlQahtani et al. (2019) Biomed and Pharmacotherapy 113:108750; Roscoe et al (2018) Mol . Pharmaceutics 151:15046-5047; Strohl, WR (2015) BioDrugs 4:215-239). In some instances, a mature HSA protein lacking a signal sequence and an activation sequence is fused to a protein of interest. In some instances, human serum albumin, such as human serum albumin (HSA), is conjugated to the polypeptide. An exemplary HSA protein is set forth in SEQ ID NO:35.
HSA와의 융합이 본 명세서에 제공된다. 이들은 일반적으로, 짧은 펩티드 링커, 예컨대, 글리신-세린 (GS) 링커, 예컨대 (GSGS)n 또는 (GGGGS)n (여기서 n = 1-5 또는 6)에 제한되지 않는 것을 통해 TNFR1 길항제(예를 들어, dAb, scFv, Fab 또는 본 명세서에 제공된 바와 같은 다른 항원 결합 단편) 또는 TNFR2 효능제(예를 들어, TNF 뮤테인)의 N- 또는 C-말단에 대한 HSA와의 융합을 포함한다. 예시적인 TNFR1 길항제-HSA 융합체는 서열번호: 709, 713, 717, 721 및 725에 제시되어 있다. Fusions with HSA are provided herein. These are generally via a short peptide linker, such as, but not limited to, a glycine-serine (GS) linker, such as (GSGS) n or (GGGGS) n , where n = 1-5 or 6, to TNFR1 antagonists (e.g., , dAb, scFv, Fab or other antigen binding fragment as provided herein) or fusion to the N- or C-terminus of a TNFR2 agonist (eg, TNF mutein) with HSA. Exemplary TNFR1 antagonist-HSA fusions are set forth in SEQ ID NOs: 709, 713, 717, 721 and 725.
c. 정제 태그c. tablet tag
일부 예에서, 본 명세서에 제공되는 TNFR1 길항제 작제물, TNFR2 효능제 작제물, 다중특이성, 예컨대 이중특이성, TNFR1 길항제/TNFR2 효능제 작제물 및 융합 단백질은 생성물의 정제를 위한 태그를 함유할 수 있다. 정제를 위한 예시적인 태그는 본 문서의 다른 곳에 기재되어 있다. 예를 들어, 본 명세서의 예시적인 폴리펩티드는 정제를 위한 SUMO 또는 His 서열을 함유할 수 있다. 일반적으로 태그는 절단 가능한 태그이다.In some examples, the TNFR1 antagonist constructs, TNFR2 agonist constructs, multispecific, such as bispecific, TNFR1 antagonist/TNFR2 agonist constructs and fusion proteins provided herein may contain tags for purification of the product. . Exemplary tags for purification are described elsewhere in this document. For example, exemplary polypeptides herein may contain SUMO or His sequences for purification. Generally, the tag is a cutable tag.
본 명세서에 제공되는 융합 단백질을 포함하는 폴리펩티드 작제물은 6xHis 태그와 같은 His 정제 태그를 포함할 수 있다. His-태깅된 폴리펩티드는 선택적으로 융합 파트너 및/또는 발현 및 분비 신호를 함유할 수 있다. 예를 들어, 예시적인 His-폴리펩티드 융합 단백질은 인간 면역글로불린 경쇄 카파 (κ) 리더 신호 펩티드 서열 (서열번호: 835), 6xHis 태그 (서열번호: 836), SUMO 서열 (서열번호: 837), 및 HSA (서열번호:35) 중 하나 이상을 함유할 수 있다. 또 다른 예에서, 예시적인 His 태깅된 폴리펩티드 융합 단백질은 인간 면역글로불린 경쇄 카파 (κ) 리더 신호 펩티드 서열 (서열번호: 835), 6xHis 태그 (서열번호: 836), SUMO 서열 (서열번호: 837), 및 IgG Fc (참고, 예를 들어, 서열번호: 10, 12, 14, 16, 27, 및 30)을 함유할 수 있다. Polypeptide constructs comprising fusion proteins provided herein may include a His purification tag, such as a 6xHis tag. His-tagged polypeptides may optionally contain fusion partners and/or expression and secretion signals. For example, an exemplary His-polypeptide fusion protein comprises a human immunoglobulin light chain kappa (κ) leader signal peptide sequence (SEQ ID NO: 835), a 6xHis tag (SEQ ID NO: 836), a SUMO sequence (SEQ ID NO: 837), and HSA (SEQ ID NO:35). In another example, an exemplary His tagged polypeptide fusion protein comprises a human immunoglobulin light chain kappa (κ) leader signal peptide sequence (SEQ ID NO: 835), a 6xHis tag (SEQ ID NO: 836), a SUMO sequence (SEQ ID NO: 837) , and IgG Fc (reference, eg, SEQ ID NOs: 10, 12, 14, 16, 27, and 30).
일부 구현예에서, 본 명세서에 제공된 폴리펩티드 및 융합 단백질은 봉입체에 축적하기 위한 His 태그 및/또는 SUMO 서열을 포함할 수 있다. 예를 들어, 서열번호: 838에 제시된 His-SUMO 서열은 본 명세서에 제공된 폴리펩티드 또는 융합 단백질 중 임의의 것에 연결될 수 있다. His-SUMO 태깅된 폴리펩티드는 선택적으로 융합 파트너 및/또는 발현 및 분비 신호를 함유할 수 있다. 예를 들어, His-SUMO-폴리펩티드 융합 단백질은 인간 면역글로불린 경쇄 카파 (κ) 리더 신호 펩티드 서열 (서열번호: 835), 6xHis 태그 (서열번호: 836), SUMO 서열 (서열번호: 837), 및 HSA (서열번호:35)을 함유할 수 있다. 또 다른 예에서, 예시적인 His-SUMO-폴리펩티드 융합 단백질은 인간 면역글로불린 경쇄 카파 (κ) 리더 신호 펩티드 서열 (서열번호: 835), 6xHis 태그 (서열번호: 836), SUMO 서열 (서열번호: 837), 및 IgG Fc (참고, 예를 들어, 서열번호: 10, 12, 14, 16, 27, 및 30)을 함유할 수 있다. In some embodiments, polypeptides and fusion proteins provided herein may include a His tag and/or SUMO sequence for accumulation in inclusion bodies. For example, the His-SUMO sequence set forth in SEQ ID NO: 838 can be linked to any of the polypeptides or fusion proteins provided herein. His-SUMO tagged polypeptides may optionally contain fusion partners and/or expression and secretion signals. For example, the His-SUMO-polypeptide fusion protein comprises a human immunoglobulin light chain kappa (κ) leader signal peptide sequence (SEQ ID NO: 835), a 6xHis tag (SEQ ID NO: 836), a SUMO sequence (SEQ ID NO: 837), and HSA (SEQ ID NO:35). In another example, an exemplary His-SUMO-polypeptide fusion protein comprises a human immunoglobulin light chain kappa (κ) leader signal peptide sequence (SEQ ID NO: 835), a 6xHis tag (SEQ ID NO: 836), a SUMO sequence (SEQ ID NO: 837 ), and IgG Fc (reference, eg, SEQ ID NOs: 10, 12, 14, 16, 27, and 30).
7. 핵산 분자 및 유전자 요법 7. Nucleic Acid Molecules and Gene Therapy
본 명세서에 제공되는 융합 단백질인 폴리펩티드 작제물을 인코딩하는 핵산 분자는 유전자 요법 벡터에서의 발현 또는 DNA 또는 RNA 작제물로서의 투여와 같은 유전자 요법에 사용될 수 있다. 이들 중, 본 명세서에 제공되는 TNFR1 길항제, TNFR2 효능제 및 이중특이적 TNFR1 길항제/TNFR2 효능제 작제물 중 일부는 융합 단백질로서 제공된다. 벡터 및 다른 전달 비히클 뿐만 아니라 이들 작제물을 인코딩하는 핵산 분자가 본 명세서에 제공된다. 핵산 분자는 본 명세서에 제공되는 임의의 폴리펩티드 또는 작제물과 적어도 80%, 85%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 또는 99% 서열 동일성을 갖는 폴리펩티드를 인코딩할 수 있다. 또 다른 구현예에서, 핵산 분자는 본 명세서에 제공되는 폴리펩티드 또는 작제물 중 임의의 것을 인코딩하는 축퇴 코돈 서열을 갖는 것을 포함할 수 있다.A nucleic acid molecule encoding a polypeptide construct, a fusion protein provided herein, can be used in gene therapy, such as expression in a gene therapy vector or administration as a DNA or RNA construct. Of these, some of the TNFR1 antagonist, TNFR2 agonist and bispecific TNFR1 antagonist/TNFR2 agonist constructs provided herein are provided as fusion proteins. Vectors and other delivery vehicles, as well as nucleic acid molecules encoding these constructs, are provided herein. A nucleic acid molecule is at least 80%, 85%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, or It can encode polypeptides with 99% sequence identity. In another embodiment, nucleic acid molecules can include those with degenerate codon sequences encoding any of the polypeptides or constructs provided herein.
유전자 요법에 사용하기 위한 핵산 분자는 필요에 따라 핵산의 조절 서열에 작동 가능하게 연결된다. 이들은 프로모터, 인핸서, 신호 서열 및 다른 트래피킹 서열, 및 당업자에게 잘 알려진 다른 이러한 조절 서열을 포함한다. 특정 조직 향성이 있는 벡터의 경우, 조절 서열은 장기 유전자 발현을 위한 간 또는 임의의 안과 적용을 위한 눈과 같은 조직에 대해 특이적일 수 있다. 예시적인 프로모터는 포유동물 세포에서의 발현을 위한 유도성 및 구성적 프로모터를 포함한다. 포유동물 대상체와 같은 진핵생물에서 인식되는 그러한 프로모터는 CMV 및 SV40 프로모터; E7 종양 단백질에 반응하는 E2 유전자 프로모터와 같은 아데노바이러스 프로모터; PV E2 단백질에 반응하는 BPV p89 프로모터와 같은 PV 프로모터; 및 다른 적합한 프로모터를 포함하지만 이에 제한되지 않는다. A nucleic acid molecule for use in gene therapy is optionally operably linked to regulatory sequences of the nucleic acid. These include promoters, enhancers, signal sequences and other trafficking sequences, and other such regulatory sequences well known to those skilled in the art. For vectors with specific tissue specificity, regulatory sequences may be specific for tissues such as the liver for long-term gene expression or the eye for any ophthalmic application. Exemplary promoters include inducible and constitutive promoters for expression in mammalian cells. Such promoters recognized in eukaryotes such as mammalian subjects include the CMV and SV40 promoters; adenoviral promoters such as the E2 gene promoter responsive to the E7 oncoprotein; PV promoters such as the BPV p89 promoter that are responsive to the PV E2 protein; and other suitable promoters.
본 명세서에 제공되는 폴리펩티드는 또한 유전자 전달 벡터에서 세포로 전달될 수 있다. 전달 벡터는 또한 폴리펩티드가 투여되는, 본 명세서에 기재되거나 당업계에 공지된 류마티스성 관절염, 또는 임의의 다른 만성 염증성, 자가면역, 신경퇴행 또는 탈수초 질환 또는 장애와 같은 질환 또는 장애의 치료를 위한 추가의 다른 치료제(들)를 인코딩할 수 있다. 본 명세서에 제공된 폴리펩티드를 인코딩하는 전달 벡터는 핵산 분자를 대상체에게 투여함으로써 전신적으로 사용될 수 있다. 예를 들어, 전달 벡터는 아데노바이러스 벡터와 같은 바이러스 벡터일 수 있다. 본 명세서의 폴리펩티드 또는 작제물을 인코딩하는 벡터는 또한 줄기 세포에 혼입될 수 있고, 이러한 줄기 세포는 예를 들어 요법을 위한 부위에 줄기 세포를 이식 또는 생착함으로써 대상체에게 투여될 수 있다. 예를 들어, 중간엽 줄기 세포(MSC)는 치료적 폴리펩티드를 발현하도록 조작될 수 있으며, 이러한 MSC는 요법을 위해 이식 부위에 생착될 수 있다.Polypeptides provided herein can also be delivered into cells in gene transfer vectors. Delivery vectors may also be used for the treatment of a disease or disorder, such as rheumatoid arthritis, or any other chronic inflammatory, autoimmune, neurodegenerative or demyelinating disease or disorder described herein or known in the art, to which the polypeptide is administered. Additional other therapeutic agent(s) may be encoded. Delivery vectors encoding the polypeptides provided herein can be used systemically by administering the nucleic acid molecule to a subject. For example, the transfer vector can be a viral vector, such as an adenoviral vector. Vectors encoding the polypeptides or constructs herein may also be incorporated into stem cells, and such stem cells may be administered to a subject, for example, by transplanting or engrafting the stem cells to a site for therapy. For example, mesenchymal stem cells (MSCs) can be engineered to express therapeutic polypeptides, and such MSCs can be engrafted to the site of transplantation for therapy.
단백질을 전달하기보다는, 핵산은 전신적으로 또는 다른 경로에 의해 생체내 투여되거나, 림프구를 포함하는 세포의 제거, 그 안에 핵산의 도입 및 숙주 또는 양립가능한 수령체로의 재도입에 의해 생체외 투여될 수 있다. Rather than delivering proteins, nucleic acids can be administered systemically or by other routes in vivo, or ex vivo by elimination of cells, including lymphocytes, introduction of the nucleic acid therein, and reintroduction into a host or compatible recipient. there is.
폴리펩티드는 핵산 분자의 발현에 의해 세포 및 조직으로 전달될 수 있다. 폴리펩티드는 생체외 기술 및 직접적인 생체내 발현을 포함하여 폴리펩티드를 인코딩하는 핵산 분자로서 투여될 수 있다. 핵산은 당업자에게 공지된 임의의 방법에 의해 세포 및 조직으로 전달될 수 있다. 단리된 핵산 서열은 추가 조작을 위해 벡터에 혼입될 수 있다. 코딩 핵산 분자의 발현에 의해 폴리펩티드를 투여하는 방법은 재조합 벡터의 투여를 포함한다. 벡터는 복제 기점을 포함하는 것과 같이 에피솜을 유지하도록 설계될 수 있거나 세포의 염색체에 혼입되도록 설계될 수 있다. 본 명세서에 제공된 폴리펩티드를 인코딩하는 핵산 분자는 또한 비-바이러스 벡터를 사용하는 생체외 유전자 발현 요법에 사용될 수 있다. 예를 들어, 세포는 조절 서열에 작동 가능하게 연결되거나 게놈 위치에서 조절 서열에 작동 가능하게 연결된 폴리펩티드를 발현하도록 조작될 수 있다. 그 다음 이러한 세포는 치료가 필요한 환자와 같은 대상체에게 국소적으로 또는 전신적으로 투여될 수 있다.Polypeptides can be delivered to cells and tissues by expression of nucleic acid molecules. Polypeptides can be administered as nucleic acid molecules that encode the polypeptide, including ex vivo techniques and direct in vivo expression. Nucleic acids can be delivered to cells and tissues by any method known to those skilled in the art. The isolated nucleic acid sequence can be incorporated into a vector for further manipulation. Methods of administering a polypeptide by expression of an encoding nucleic acid molecule include administration of a recombinant vector. Vectors may be designed to remain episomal, such as containing an origin of replication, or may be designed to be incorporated into the chromosome of a cell. Nucleic acid molecules encoding the polypeptides provided herein can also be used in ex vivo gene expression therapy using non-viral vectors. For example, a cell can be engineered to express a polypeptide operably linked to regulatory sequences or at a genomic location operably linked to regulatory sequences. These cells can then be administered topically or systemically to a subject, such as a patient in need of treatment.
유전자 요법 벡터는 에피솜으로 남을 수 있거나 치료 대상체의 염색체에 통합될 수 있다. 폴리펩티드는 바이러스에 의해 발현될 수 있으며, 이는 치료를 필요로 하는 대상체에게 투여된다. 유전자 요법에 적합한 바이러스 벡터는 아데노바이러스, 아데노 연관 바이러스 (AAV), 레트로바이러스, 렌티바이러스, 백시니아 바이러스, 및 위에서 언급한 다른 바이러스를 포함한다. 예를 들어, 아데노바이러스, 아데노 연관 바이러스 (AAV), 폭스바이러스, 헤르페스바이러스, 레트로바이러스, 및 유전자 요법을 위해 설계된 기타를 포함하는 바이러스 벡터가 사용될 수 있다. 간 세포와 같이 향성이 변경된 AAV 벡터가 이용 가능하다. AAV 벡터는 향성을 부여하는 캡시드와 ITR에 측접하는 폴리펩티드를 인코딩하는 핵산으로 구성된다. Gene therapy vectors may remain episomal or may be integrated into the chromosome of the treated subject. A polypeptide can be expressed by a virus, which is administered to a subject in need of treatment. Viral vectors suitable for gene therapy include adenovirus, adeno-associated virus (AAV), retrovirus, lentivirus, vaccinia virus, and other viruses mentioned above. Viral vectors can be used, including, for example, adenovirus, adeno-associated virus (AAV), poxvirus, herpesvirus, retrovirus, and others designed for gene therapy. AAV vectors with altered tropism, such as liver cells, are available. AAV vectors consist of a capsid conferring tropism and a nucleic acid encoding a polypeptide flanking an ITR.
예를 들어, 아데노바이러스 발현 기술은 당업계에 잘 알려져 있으며, 아데노바이러스 생산 및 투여 방법도 잘 알려져 있다. 아데노바이러스 혈청형은 예를 들어 미국 종균 협회 (ATCC, Rockville, MD)에서 이용가능하다. 아데노바이러스 벡터는 생체외에서 사용될 수 있는데, 예를 들어 세포는 치료가 필요한 환자로부터 단리되고 폴리펩티드 발현 아데노바이러스 벡터로 형질도입된다. 적절한 배양 기간 후, 형질도입된 세포는 대상체에게 국소적으로 및/또는 전신적으로 투여된다. 대안적으로, 폴리펩티드 아데노바이러스 입자는 대상체의 질환 또는 병태를 예방, 치료 또는 개선하기 위한 치료 유효량의 전달을 위해 약제학적으로 허용 가능한 담체에서 단리되고 제형화된다. 전형적으로, 아데노바이러스 입자는 체중 kg당 1개 내지 1014개 입자, 일반적으로 대상체 체중 kg당 106개 또는 108개 내지 1012개 입자 범위의 용량으로 전달된다. 일부 상황에서, 세포 표면 막 단백질 또는 표적 세포에 특이적인 항체 또는 표적 세포 상의 수용체에 대한 리간드와 같이 세포를 표적으로 하는 제제를 가진 핵산 공급원을 제공하는 것이 바람직하다. 본 명세서에 제공된 폴리펩티드 또는 작제물은 또한 특정 세포 유형으로의 전달을 위해 표적화될 수 있다. 예를 들어, 본 명세서에 제공된 폴리펩티드 또는 작제물을 인코딩하는 아데노바이러스 벡터는 간 세포와 같은 비분열 세포에서 안정한 발현을 위해 사용될 수 있다 (예를 들어, 문헌[Margaritis 등 (2004) J. Clin . Invest. 113:1025-1031] 참조) 또 다른 예에서, 본 명세서의 폴리펩티드 또는 작제물을 인코딩하는 바이러스 또는 비-바이러스 벡터는 후속 전달을 위해 단리된 세포로 형질도입될 수 있다. 발현 및 전달을 위한 추가 세포 유형에는 섬유아세포 및 내피 세포가 포함되나 이에 제한되지 않는다.For example, adenovirus expression techniques are well known in the art, and methods for adenovirus production and administration are also well known. Adenovirus serotypes are available, for example, from the American Breeder Council (ATCC, Rockville, MD). Adenoviral vectors can be used ex vivo, for example cells are isolated from a patient in need of treatment and transduced with a polypeptide expressing adenoviral vector. After an appropriate incubation period, the transduced cells are administered topically and/or systemically to the subject. Alternatively, the polypeptide adenovirus particles are isolated and formulated in a pharmaceutically acceptable carrier for delivery of a therapeutically effective amount to prevent, treat or ameliorate a disease or condition in a subject. Typically, adenoviral particles are delivered at a dose ranging from 1 to 10 14 particles per kg of body weight, generally 10 6 or 10 8 to 10 12 particles per kg of subject body weight. In some circumstances, it is desirable to provide a nucleic acid source with an agent that targets cells, such as cell surface membrane proteins or antibodies specific for target cells or ligands for receptors on target cells. Polypeptides or constructs provided herein can also be targeted for delivery to specific cell types. For example, adenoviral vectors encoding the polypeptides or constructs provided herein can be used for stable expression in non-dividing cells such as liver cells (see, eg, Margaritis et al. (2004) J. Clin . Invest . 113:1025-1031]) In another example, a viral or non-viral vector encoding a polypeptide or construct of the present disclosure may be transduced into an isolated cell for subsequent delivery. Additional cell types for expression and delivery include, but are not limited to, fibroblasts and endothelial cells.
핵산 분자는 인공 염색체 및 다른 비-바이러스 벡터에 도입될 수 있다. ACES(문헌[Lindenbaum 등, (2004) Nucleic Acids Res. 32(21):e172] 참조)와 같은 인공 염색체는 동형을 인코딩하고 발현하도록 조작될 수 있다. 간단히 말해서, 포유동물 인공 염색체(MAC)는 대량의 유전 정보를 자율적으로 복제하고 통합하지 않는 형식으로 세포에 도입하는 수단을 제공한다. MAC 중에서 고유한 포유동물 위성 DNA 기반 인공 염색체 발현(ACE)은 상이한 종의 세포주에서 재현 가능하게 생성되고 숙주 세포의 염색체에서 쉽게 정제될 수 있다. 그 다음 정제된 포유동물 ACE는 ACE 시스템을 사용하여 선택적 압력 없이 오랜 기간 동안 안정적으로 유지되는 다양한 수용 세포주에 다시 도입될 수 있다. 이 접근법을 사용하여 LMTK(-) 및 CHO 세포에서 하나 또는 두 개의 유전자 표적의 특정 부하가 달성되었다. Nucleic acid molecules can be introduced into artificial chromosomes and other non-viral vectors. Artificial chromosomes such as ACES (see Lindenbaum et al., (2004) Nucleic Acids Res . 32(21):e172) can be engineered to encode and express isoforms. Briefly, mammalian artificial chromosomes (MACs) provide a means to introduce large amounts of genetic information into cells in an autonomously replicating, non-integrating format. Mammalian satellite DNA-based artificial chromosome expression (ACE) unique among MACs can be reproducibly generated in cell lines of different species and readily purified from the host cell's chromosome. The purified mammalian ACE can then be re-introduced into a variety of recipient cell lines stably maintained over long periods of time without selective pressure using the ACE system. Using this approach, specific loading of one or two gene targets in LMTK(-) and CHO cells was achieved.
폴리펩티드를 인코딩하는 핵산을 도입하는 또 다른 방법은 YAC 클론, 관심 있는 유전자에 대한 발현 카세트 및 양성 및 음성 선별 마커에서 효모 인공 염색체 (YAC)에 클로닝된 완전한 아데노바이러스 게놈(문헌[Ad2; Ketner 등 (1994) Proc . Natl. Acad . Sci . U.S.A . 91: 6186-6190])과 특정 영역을 표적으로 하는 아데노바이러스 서열을 함유하는 플라스미드로 시작하여 효모에서 2-단계 유전자 대체 기술이다. YAC는 더 큰 유전자의 혼입을 허용하기 때문에 특히 중요하다. 이 접근법은 포유동물 세포 또는 전체 동물로의 유전자 전달을 위해 본 명세서에 기재된 임의의 폴리펩티드 또는 작제물을 인코딩하는 핵산을 보유하는 아데노바이러스 기반 벡터의 구축에 사용될 수 있다. Another way to introduce a nucleic acid encoding a polypeptide is to clone a YAC clone, an expression cassette for the gene of interest and a complete adenovirus genome cloned into a yeast artificial chromosome (YAC) in positive and negative selection markers (Ad2; Ketner et al. (1994) Proc . Natl. Acad . Sci . USA . 91: 6186-6190]) and a two-step gene replacement technology in yeast, starting with a plasmid containing adenoviral sequences targeting a specific region. YACs are particularly important because they allow the incorporation of larger genes. This approach can be used to construct adenovirus-based vectors containing nucleic acids encoding any of the polypeptides or constructs described herein for gene transfer into mammalian cells or whole animals.
핵산은 리포솜과 같은 비히클에 캡슐화되거나, 박테리아 세포, 특히 약독화 박테리아와 같은 세포에 도입되거나, 바이러스 벡터에 도입될 수 있다. 예를 들어, 리포솜이 사용되는 경우, 세포내이입과 연관된 세포 표면 막 단백질에 결합하는 단백질은 예를 들어, 특정 세포 유형에 대한 캡시드 단백질 또는 그의 트로픽 단편, 순환에서 내재화를 겪는 단백질에 대한 항체, 및 세포내 국소화를 표적화하고 세포내 반감기를 향상시키는 단백질을 표적화 및/또는 흡수를 용이하게 하기 위해 사용될 수 있다. Nucleic acids can be encapsulated in vehicles such as liposomes, introduced into cells such as bacterial cells, particularly attenuated bacteria, or introduced into viral vectors. For example, when liposomes are used, proteins that bind to cell surface membrane proteins associated with endocytosis include, for example, capsid proteins or tropic fragments thereof for specific cell types, antibodies to proteins that undergo internalization in the circulation, and proteins that target intracellular localization and enhance intracellular half-life and/or facilitate uptake.
생체외 및 생체내 방법의 경우, 본 명세서의 폴리펩티드 또는 작제물을 인코딩하는 핵산 분자는 적합한 공여자 또는 치료 대상체로부터 유래된 세포 내로 도입된다. 요법 목적으로 핵산이 도입될 수 있는 세포는 예를 들어, 상피 세포; 내피 세포; 각질형성세포; 섬유아세포; 근육 세포; 간세포; 혈액 세포, 예컨대 T 림프구, B 림프구, 단핵구, 대식세포, 호중구, 호산구, 거핵구, 및 과립구; 및 다양한 줄기 또는 선조 세포, 특히, 조혈 줄기 또는 선조 세포, 예컨대 골수, 제대혈, 말초 혈액, 태아 간, 및 그의 다른 공급원으로부터의 줄기 세포를 포함하지만 이에 제한되지 않는, 치료할 질환 또는 병태에 적합한 임의의 원하는 이용가능한 세포 유형을 포함한다. For ex vivo and in vivo methods, nucleic acid molecules encoding the polypeptides or constructs herein are introduced into cells derived from a suitable donor or subject to be treated. Cells into which nucleic acids may be introduced for therapeutic purposes include, for example, epithelial cells; endothelial cells; keratinocytes; fibroblasts; muscle cells; hepatocytes; blood cells such as T lymphocytes, B lymphocytes, monocytes, macrophages, neutrophils, eosinophils, megakaryocytes, and granulocytes; and various stem or progenitor cells, particularly hematopoietic stem or progenitor cells such as stem cells from bone marrow, umbilical cord blood, peripheral blood, fetal liver, and other sources thereof, including but not limited to any suitable for the disease or condition being treated. Include any available cell type desired.
생체 외 치료를 위해, 치료될 대상체와 호환되는 공여자로부터의 세포 또는 치료될 대상체로부터의 세포가 제거되고, 핵산이 이들 단리된 세포에 도입되고, 변형된 세포가 대상체에게 투여된다. 치료는 예를 들어 환자에게 이식되는 다공성 막 내에 캡슐화된 것과 같은 직접 투여를 포함한다 (예를 들어, 미국 특허 제4,892,538호 및 제5,283,187호 참조, 이들 각각은 전문이 본 명세서에 참조로 포함됨). 시험관 내에서 핵산을 포유동물 세포로 전달하는 데 적합한 기술에는 리포솜 및 양이온성 지질(예를 들어, DOTMA, DOPE 및 DC-Chol) 전기천공, 미세주입, 세포 융합, DEAE-덱스트란 및 인산칼슘 침전 방법의 사용이 포함된다. DNA 전달 방법은 생체 내에서 본 명세서에 제공된 폴리펩티드 또는 작제물을 발현하기 위해 사용될 수 있다. 이러한 방법은 핵산의 리포솜 전달 및 전기천공법, 초음파 및 인산칼슘 전달을 사용하는 것과 같은 국소 및 전신 전달을 포함하는 네이키드 DNA 전달을 포함한다. 다른 기술은 미세주입, 세포 융합, 염색체 매개 유전자 전달, 미세세포 매개 유전자 전달, 및 스페로플라스트 융합을 포함한다.For ex vivo treatment, cells from a donor compatible with the subject to be treated or cells from the subject to be treated are removed, nucleic acids are introduced into these isolated cells, and the modified cells are administered to the subject. Treatment includes direct administration, e.g., as encapsulated within a porous membrane implanted in a patient (see, e.g., U.S. Pat. Nos. 4,892,538 and 5,283,187, each of which is incorporated herein by reference in its entirety). Techniques suitable for delivering nucleic acids to mammalian cells in vitro include electroporation of liposomes and cationic lipids (e.g., DOTMA, DOPE, and DC-Chol), microinjection, cell fusion, DEAE-dextran and calcium phosphate precipitation. The use of methods is included. DNA delivery methods can be used to express a polypeptide or construct provided herein in vivo. Such methods include liposomal delivery of nucleic acids and naked DNA delivery including local and systemic delivery such as using electroporation, ultrasound and calcium phosphate delivery. Other techniques include microinjection, cell fusion, chromosome-mediated gene transfer, microcell-mediated gene transfer, and spheroplast fusion.
본 명세서에서 폴리펩티드 또는 작제물의 생체내 발현은 추가 분자의 발현과 연결될 수 있다. 예를 들어, 폴리펩티드의 발현은 조작된 바이러스에서와 같이 세포독성 산물의 발현과 연관되거나 세포독성 바이러스에서 발현될 수 있다. 이러한 바이러스는 치료 효과의 표적이 되는 특정 세포 유형을 표적으로 할 수 있다. In vivo expression of a polypeptide or construct herein may be linked to expression of additional molecules. For example, expression of a polypeptide can be associated with expression of a cytotoxic product, such as in an engineered virus, or expressed in a cytotoxic virus. These viruses can target specific cell types that are targeted for therapeutic effects.
본 명세서에 제공된 폴리펩티드 또는 작제물의 생체내 발현은 세포 특이적 또는 조직 특이적 프로모터와 같은 특정 조절 서열에 폴리펩티드 인코딩 핵산 분자를 작동가능하게 연결하는 것을 포함할 수 있다. 폴리펩티드는 또한 표적 세포 유형 및/또는 조직에서 특이적으로 감염 및/또는 복제하는 벡터로부터 발현될 수 있다. 유도성 프로모터를 사용하여 폴리펩티드 또는 작제물 발현을 선택적으로 조절할 수 있다. In vivo expression of a polypeptide or construct provided herein may involve operably linking a nucleic acid molecule encoding the polypeptide to a specific regulatory sequence, such as a cell-specific or tissue-specific promoter. Polypeptides can also be expressed from vectors that specifically infect and/or replicate in a target cell type and/or tissue. Inducible promoters can be used to selectively regulate polypeptide or construct expression.
핵산 분자, 예컨대 네이키드 핵산, 또는 벡터, 인공 염색체, 리포솜 및 다른 비히클은 전신 투여, 국소, 국부 및 다른 투여 경로에 의해 대상체에게 투여될 수 있다. 전신 및 생체내일 때, 핵산 분자 또는 핵산 분자를 함유하는 비히클은 세포를 표적으로 할 수 있다. 투여는 간과 같은 구분된 기관 또는 그의 부분으로 직접 주사하는 방법을 포함을 포함하여 정맥내 투여, 및 간으로의 직접 주사와 같은 조직으로의 직접 주사를 포함할 수 있다 (예를 들어, 미국 특허 제9,821,114호). Nucleic acid molecules, such as naked nucleic acids, or vectors, artificial chromosomes, liposomes and other vehicles can be administered to a subject by systemic administration, topical, local and other routes of administration. When systemic and in vivo, the nucleic acid molecule or vehicle containing the nucleic acid molecule can be targeted to cells. Administration can include intravenous administration, including direct injection into a distinct organ or portion thereof, such as the liver, and direct injection into a tissue, such as direct injection into the liver (see, e.g., U.S. Patent No. 9,821,114).
투여는 또한 전형적으로 세포 또는 조직을 표적으로 하는 벡터 또는 세포의 투여와 같이 직접적일 수 있다. 본 명세서의 폴리펩티드 또는 작제물의 생체내 발현에 사용되는 세포는 또한 환자의 자가 세포를 포함한다. 그러한 세포는 환자로부터 제거될 수 있고, 폴리펩티드의 발현을 위한 핵산이 도입된 후, 예를 들어 주사 또는 생착에 의해 환자에게 투여될 수 있다.Administration can also be direct, such as administration of vectors or cells that are typically targeted to cells or tissues. Cells used for in vivo expression of a polypeptide or construct herein also include the patient's autologous cells. Such cells can be removed from the patient, introduced with nucleic acid for expression of the polypeptide, and then administered to the patient, for example by injection or engraftment.
J. 조성물, 제형 및 복용량 J. Composition, Formulation and Dosage
약제학적으로 허용 가능한 비히클에, including the TNFR1 길항제 작제물, TNFR2 효능제 작제물, 및 융합 단백질을 포함하는 다중특이적, 예컨대 이중특이적, TNFR1 길항제/TNFR2 효능제 작제물을 포함하는 본 명세서에 제공된 폴리펩티드 및 작제물 중 임의의 것, 또는 폴리펩티드 또는 작제물을 인코딩하는 핵산 분자를 함유하는 약제학적 조성물이 제공된다. 이러한 조성물은 치료학적 유효량으로 희석될 수 있거나 희석 없이 직접 투여하기 위해 제형화된 폴리펩티드, 작제물 또는 핵산의 양을 함유한다. 작제물 또는 핵산의 특정 농도는 예를 들어 치료되는 적응증, 작제물 또는 핵산, 투여 경로 및 레지멘을 포함하는 당업자의 기술 내의 다양한 파라미터에 따라 달라진다. 투여 경로는 전신 및 국소 경로, 경구, 직장, 정맥내, 근육내, 피하, 점막, 복막 및 당업자에게 공지된 임의의 적합한 경로를 포함한다.A pharmaceutically acceptable vehicle, including a TNFR1 antagonist construct, a TNFR2 agonist construct, and a multispecific, such as bispecific, TNFR1 antagonist/TNFR2 agonist construct comprising a fusion protein, provided herein. Pharmaceutical compositions containing any of the provided polypeptides and constructs, or nucleic acid molecules encoding the polypeptides or constructs, are provided. Such compositions contain an amount of a polypeptide, construct or nucleic acid that can be diluted to a therapeutically effective amount or formulated for direct administration without dilution. The specific concentration of the construct or nucleic acid depends on various parameters within the skill of one of ordinary skill in the art including, for example, the indication being treated, the construct or nucleic acid, the route of administration and regimen. Routes of administration include systemic and topical routes, oral, rectal, intravenous, intramuscular, subcutaneous, mucosal, peritoneal, and any suitable route known to those skilled in the art.
상기에 논의된 바와 같이, TNFR1 길항제 작제물, TNFR2 효능제 작제물, 및 융합 단백질을 포함하는 다중특이적, 예컨대 이중특이적, TNFR1 길항제/TNFR2 효능제 작제물을 포함하는 본 명세서에 제공된 작제물, 또는 작제물을 인코딩하는 핵산 분자의 다양한 파라미터에 따라 선택된 양, 예컨대 치료 유효량은 투여를 위해 적합한 비히클에 제형화된다. 약제학적 조성물은 선택된 양의 작제물 또는 그의 혼합물을 하나 이상의 생리학적으로 허용되는 담체 또는 부형제 또는 비히클과 혼합함으로써 임의의 종래의 방식으로 제형화될 수 있다. 약제학적 조성물은 치료, 예방 및/또는 진단 적용을 위해 사용될 수 있다. 조성물 내의 활성 화합물, 즉 작제물 또는 핵산의 농도는 상기에 언급된 것들, 뿐만 아니라 활성 화합물의 흡수, 불활성화, 및 배출 속도, 복용 스케줄, 및 투여된 양, 대상체의 연령 및 크기, 뿐만 아니라 당업자에게 알려진 다른 인자를 포함하는 다양한 인자에 따라 달라진다.Constructs provided herein, including multispecific, such as bispecific, TNFR1 antagonist/TNFR2 agonist constructs, including TNFR1 antagonist constructs, TNFR2 agonist constructs, and fusion proteins, as discussed above , or an amount selected according to various parameters of the nucleic acid molecule encoding the construct, such as a therapeutically effective amount, is formulated in a suitable vehicle for administration. Pharmaceutical compositions may be formulated in any conventional manner by mixing selected amounts of the construct or mixtures thereof with one or more physiologically acceptable carriers or excipients or vehicles. A pharmaceutical composition may be used for therapeutic, prophylactic and/or diagnostic applications. The concentration of the active compound, i.e. construct or nucleic acid, in the composition is determined by those mentioned above, as well as rates of absorption, inactivation, and excretion of the active compound, dosing schedule, and amount administered, age and size of the subject, as well as those skilled in the art. depends on various factors including other factors known to
본 명세서에 제공된 화합물의 투여에 적합한 약제학적 담체 또는 비히클은 특정 투여 방식에 적합한 것으로 당업자에게 공지된 임의의 이러한 담체를 포함한다. 본 명세서에 기재된 작제물 또는 핵산 분자의 치료 유효량을 포함하는 약제학적 조성물은 또한 투여 직전에 멸균수와 같이 재구성되는 동결건조 분말로서 제공될 수 있다. Pharmaceutical carriers or vehicles suitable for administration of the compounds provided herein include any such carrier known to those skilled in the art to be suitable for a particular mode of administration. A pharmaceutical composition comprising a therapeutically effective amount of a construct or nucleic acid molecule described herein may also be presented as a lyophilized powder to be reconstituted with sterile water immediately prior to administration.
1. 제형1. Formulation
본 명세서에 제공된 임의의 작제물 및 핵산을 함유하는 약제학적 조성물은 선택된 양의 활성 화합물을 하나 이상의 생리학적으로 허용되는 담체 또는 부형제와 혼합함으로써 임의의 종래의 방식으로 제형화될 수 있다. 담체 또는 부형제의 선택은 투여 전문가의 기술 범위 내이며 많은 파라미터에 따라 달라질 수 있다. 이들은 예를 들어 투여 방식(즉, 전신, 경구, 비강, 폐, 국소, 국부 또는 임의의 다른 방식) 및 치료되는 장애를 포함한다. 일반적으로, 약제학적 조성물은 작제물 또는 핵산 또는 인코딩된 폴리펩티드의 생물학적 특성을 상당히 손상시키지 않거나 그의 약리학적 특성을 강화 또는 개선하는 성분을 포함한다. 제형은 또한 병용 요법을 위한 다른 활성제와의 공-제형일 수 있다.Pharmaceutical compositions containing any of the constructs and nucleic acids provided herein may be formulated in any conventional manner by mixing selected amounts of the active compound with one or more physiologically acceptable carriers or excipients. The choice of carrier or excipient is within the skill of the administering expert and can depend on many parameters. These include, for example, the mode of administration (ie, systemic, oral, nasal, pulmonary, topical, topical or any other mode) and the disorder being treated. Generally, a pharmaceutical composition includes components that do not significantly impair the biological properties of, or enhance or improve the pharmacological properties of, the construct or nucleic acid or encoded polypeptide. The formulation may also be co-formulated with other active agents for combination therapy.
본 명세서에 제공되는 약제학적 조성물은 고체, 반고체, 액체, 에멀젼, 분말, 수성 및 동결건조 형태를 포함하나 이에 제한되지 않는 다양한 형태일 수 있다. 본 명세서에 제공되는 약제학적 조성물은 단일 복용량(직접) 투여, 또는 희석 또는 다른 레지멘을 위해 제형화될 수 있다. 제형 내의 화합물의 농도는 희석 또는 다른 조성물과의 혼합 후, 또는 투여시 양의 전단을 위해 직접 투여에 효과적이고, 즉 의도된 치료에 효과적이다. 조성물은 단일 또는 다중 투약량 직접 투여량으로 제형화될 수 있다. 화합물은 미분화된 형태 또는 다른 적합한 형태로 현탁될 수 있거나, 보다 가용성인 활성 생성물을 생성하기 위해 유도체화될 수 있다. 생성된 혼합물의 형태는 의도된 투여 방식 및 선택된 담체 또는 비히클에서 화합물의 용해도를 비롯한 여러 요인에 따라 달라진다. 생성된 혼합물은 용액, 현탁액, 에멀젼 및 다른 그러한 혼합물이며, 비-수성 또는 수성 혼합물, 크림, 겔, 연고, 에멀젼, 용액, 엘릭시르, 로션, 현탁액, 팅쳐, 페이스트, 포움, 에어로졸, 관주, 스프레이, 좌약, 붕대 또는 전신, 국소 또는 국부 투여에 적합한 다른 제형으로서 제형화될 수 있다. 근육내, 비경구 또는 관절내 투여와 같은 국소 내부 투여를 위해, 작제물 및 핵산은 등장 완충 식염수와 같은 수성 기반 매질에서 용액 현탁액으로 제형화되거나 생체적합성 지지체 또는 내부 투여를 위한 생체접착제와 조합될 수 있다. 유효 농도는 표적 병태를 개선하기에 충분하며 경험적으로 결정할 수 있다. 조성물을 제형화하기 위해, 화합물의 중량 분율을 선택된 비히클에 유효 농도로 용해, 현탁, 분산 또는 혼합하여 표적 병태가 완화되거나 개선되도록 한다. The pharmaceutical compositions provided herein can be in a variety of forms, including but not limited to solid, semi-solid, liquid, emulsion, powder, aqueous and lyophilized forms. The pharmaceutical compositions provided herein may be formulated for single dose (direct) administration, or for dilution or other regimen. The concentration of the compound in the formulation is effective for direct administration, i.e., for the intended treatment, after dilution or mixing with other compositions, or for shearing the amount upon administration. Compositions may be formulated as single or multiple dose direct doses. The compounds can be suspended in micronized or other suitable form, or derivatized to produce a more soluble active product. The form of the resulting mixture depends on several factors including the intended mode of administration and the solubility of the compound in the chosen carrier or vehicle. The resulting mixtures are solutions, suspensions, emulsions and other such mixtures, non-aqueous or aqueous mixtures, creams, gels, ointments, emulsions, solutions, elixirs, lotions, suspensions, tinctures, pastes, foams, aerosols, drenches, sprays, It may be formulated as a suppository, bandage or other formulation suitable for systemic, topical or topical administration. For topical internal administration, such as intramuscular, parenteral or intraarticular administration, the constructs and nucleic acids may be formulated as a solution suspension in an aqueous based medium such as isotonic buffered saline or combined with a biocompatible support or bioadhesive for internal administration. can Effective concentrations are sufficient to ameliorate the target condition and can be determined empirically. To formulate a composition, a weight fraction of the compound is dissolved, suspended, dispersed or mixed in an effective concentration with a selected vehicle to alleviate or ameliorate the target condition.
일반적으로, 약제학적으로 허용 가능한 조성물은 규제 기관 또는 다른 기관에 대한 승인의 관점에서 제조되고/되거나 동물 및 인간에서 사용하기 위해 일반적으로 인정되는 약전에 따라 제조된다. 약제학적 조성물은 폴리펩티드와 함께 투여되는 희석제, 보조제, 부형제 또는 비히클과 같은 담체를 포함할 수 있다. 이러한 약제학적 담체는 물과 같은 멸균 액체 및 석유, 동물성, 식물성 또는 합성 기원을 포함하는 오일, 예를 들어 땅콩유, 대두유, 광유, 및 참기름일 수 있다. 약제학적 조성물이 정맥내 투여될 때 물은 전형적인 담체이다. 식염수, 덱스트로스 및 글리세롤 수용액은 특히 주사용 용액의 경우 액체 담체로 사용할 수도 있다. 조성물은 활성 성분과 함께 희석제, 예컨대 락토스, 수크로스, 인산제이칼슘, 및 카복시메틸셀룰로스; 윤활제, 예컨대 스테아르산마그네슘, 칼슘 스테아레이트 및 탈크; 및 결합제, 예컨대 전분, 천연 검, 예컨대 아카시아검, 젤라틴, 글루코스, 당밀, 폴리비닐피롤리돈, 셀룰로스 및 그의 유도체, 포비돈, 크로스포비돈, 및 당업자에게 알려진 다른 그러한 결합제를 함유할 수 있다. 적합한 약제학적 부형제는 전분, 글루코스, 락토스, 수크로스, 젤라틴, 맥아, 쌀, 가루, 백악, 실리카겔, 스테아르산나트륨, 글리세롤 모노스테아레이트, 탈크, 염화나트륨, 탈지분유, 글리세롤, 프로필렌, 글라이콜, 물 및 에탄올을 포함한다. 필요하다면, 조성물은 또한 소량의 습윤 또는 유화제, 또는 pH 완충제, 예를 들어, 아세테이트, 나트륨 시트레이트, 사이클로덱스트린 유도체, 소르비탄 모노라우레이트, 트리에탄올아민 아세트산나트륨, 트리에탄올아민 올레에이트, 및 다른 그러한 제제를 함유할 수 있다. 이러한 조성물은 용액, 현탁액, 에멀젼, 정제, 환제, 캡슐, 분말, 과립, 및 지속 방출 제형의 형태를 취할 수 있다. 예를 들어 흡입기 또는 취입기에 사용하기 위한 젤라틴의 캡슐 및 카트리지는 치료 화합물과 락토스 또는 전분과 같은 적합한 분말 베이스의 분말 혼합물을 함유하여 제형화될 수 있다. 조성물은 트리글리세리드와 같은 전통적인 결합제 및 담체와 함께 좌제로 제형화될 수 있다. 경구 제형은 만니톨, 락토스, 전분, 스테아르산마그네슘, 나트륨 사카린, 셀룰로스, 탄산마그네슘, 및 다른 그러한 제제의 약품 등급과 같은 표준 담체를 포함할 수 있다. 경구 투여를 위한 제제는 또한 프로테아제 억제제, 예컨대 보우만-버크 억제제, 접합된 보우만-버크 억제제, 아프로티닌 및 카모스타트와 함께 적합하게 제형화될 수 있다. 적합한 약제학적 담체의 예는 문헌[E. W. Martin의 "Remington's Pharmaceutical Sciences"]에 기재되어 있다. 이러한 조성물은 대상체 또는 환자에게 적절한 투여를 위한 형태로 화합물을 제공하기 위해 적합한 양의 담체와 함께 일반적으로 정제된 형태의 치료 유효량의 화합물을 함유할 것이다. Generally, pharmaceutically acceptable compositions are prepared in view of approval by regulatory or other authorities and/or in accordance with generally accepted pharmacopeias for use in animals and humans. A pharmaceutical composition may include a carrier such as a diluent, adjuvant, excipient or vehicle with which the polypeptide is administered. Such pharmaceutical carriers can be sterile liquids such as water and oils including petroleum, animal, vegetable or synthetic origin, for example peanut oil, soybean oil, mineral oil, and sesame oil. Water is a typical carrier when the pharmaceutical composition is administered intravenously. Saline, aqueous solutions of dextrose and glycerol may also be employed as liquid carriers, particularly for injectable solutions. The composition may contain diluents such as lactose, sucrose, calcium phosphate, and carboxymethylcellulose along with the active ingredient; lubricants such as magnesium stearate, calcium stearate and talc; and binders such as starch, natural gums such as gum acacia, gelatin, glucose, molasses, polyvinylpyrrolidone, cellulose and its derivatives, povidone, crospovidone, and other such binders known to those skilled in the art. Suitable pharmaceutical excipients are starch, glucose, lactose, sucrose, gelatin, malt, rice, flour, chalk, silica gel, sodium stearate, glycerol monostearate, talc, sodium chloride, skim milk powder, glycerol, propylene, glycol, Contains water and ethanol. If desired, the composition may also contain minor amounts of wetting or emulsifying agents, or pH buffering agents such as acetate, sodium citrate, cyclodextrin derivatives, sorbitan monolaurate, triethanolamine sodium acetate, triethanolamine oleate, and other such agents. may contain. Such compositions may take the form of solutions, suspensions, emulsions, tablets, pills, capsules, powders, granules, and sustained release formulations. For example, capsules and cartridges of gelatin for use in an inhaler or insufflator may be formulated containing a powder mixture of the therapeutic compound and a suitable powder base such as lactose or starch. The composition may be formulated as a suppository with conventional binders and carriers such as triglycerides. Oral dosage forms may include standard carriers such as mannitol, lactose, starch, magnesium stearate, sodium saccharin, cellulose, magnesium carbonate, and pharmaceutical grades of other such agents. Formulations for oral administration may also be suitably formulated with protease inhibitors such as Bowman-Burk inhibitors, conjugated Bowman-Burk inhibitors, aprotinin and camostat. Examples of suitable pharmaceutical carriers are described in E. W. Martin, "Remington's Pharmaceutical Sciences"]. Such compositions will contain a therapeutically effective amount of the compound, usually in purified form, together with a suitable amount of carrier to provide the compound in a form for proper administration to a subject or patient.
본 명세서에 제공되는 약제학적 조성물은 예를 들어, 그 중에서도 항산화제, 보존제, 항균제, 진통제, 결합제, 붕해제, 착색제, 희석제, 부형제, 확장제, 활택제, 가용화제, 안정화제, 등장화제, 비히클, 점도제, 풍미제, 에멀젼, 예컨대 수중유 또는 유중수 에멀젼, 유화제 및 현탁화제, 예컨대 아카시아, 한천, 알긴산, 나트륨 알기네이트, 벤토나이트, 카보머, 카라기난, 카복시메틸셀룰로스, 셀룰로스, 콜레스테롤, 젤라틴, 하이드록시에틸 셀룰로스, 하이드록시프로필 셀룰로스, 하이드록시프로필 메틸셀룰로스, 메틸셀룰로스, 옥톡시놀-9, 올레일 알코올, 포비돈, 프로필렌 글리콜 모노스테아레이트, 나트륨 라우릴 설페이트, 소르비탄 에스테르, 스테아릴 알코올, 트라가칸쓰, 크산탄 검, 및 그의 유도체, 용매, 및 잡다한 성분, 예컨대 결정성 셀룰로스, 미세결정성 셀룰로스, 시트르산, 덱스트린, 덱스트로스, 액체 글루코스, 락트산, 락토스, 마그네슘 클로라이드, 칼륨 메타포스페이트, 및 전분을 포함하는 다른 첨가제를 함유할 수 있다 (일반적으로, 문헌[Alfonso R. Gennaro (2000) Remington : The Science and Practice of Pharmacy, 20th Edition. Baltimore, MD: Lippincott Williams & Wilkins] 참조). 이러한 담체 및/또는 첨가제는 종래의 방법에 의해 제형화될 수 있고 적절한 용량으로 대상체에게 투여될 수 있다. 지질, 뉴클레아제 억제제, 중합체 및 킬레이트제와 같은 안정화제는 체내에서 조성물이 분해되는 것을 방지할 수 있다.The pharmaceutical compositions provided herein may include, for example, antioxidants, preservatives, antibacterial agents, analgesics, binders, disintegrants, colorants, diluents, excipients, extenders, glidants, solubilizers, stabilizers, tonicity agents, vehicles, among others. , viscosity agents, flavoring agents, emulsions such as oil-in-water or water-in-oil emulsions, emulsifiers and suspending agents such as acacia, agar, alginic acid, sodium alginate, bentonite, carbomer, carrageenan, carboxymethylcellulose, cellulose, cholesterol, gelatin, Hydroxyethyl Cellulose, Hydroxypropyl Cellulose, Hydroxypropyl Methylcellulose, Methylcellulose, Octoxynol-9, Oleyl Alcohol, Povidone, Propylene Glycol Monostearate, Sodium Lauryl Sulfate, Sorbitan Ester, Stearyl Alcohol, tragacanth, xanthan gum, and its derivatives, solvents, and miscellaneous ingredients such as crystalline cellulose, microcrystalline cellulose, citric acid, dextrin, dextrose, liquid glucose, lactic acid, lactose, magnesium chloride, potassium metaphosphate, and may contain other additives including starch (see generally Alfonso R. Gennaro (2000) Remington : The Science and Practice of Pharmacy , 20th Edition. Baltimore, MD: Lippincott Williams & Wilkins). Such carriers and/or additives can be formulated by conventional methods and administered to a subject in an appropriate dose. Stabilizers such as lipids, nuclease inhibitors, polymers and chelating agents can prevent degradation of the composition in the body.
제형은 투여 방식에 적합해야 한다. 예를 들어, 활성 화합물은 주사(예를 들어, 볼러스 주사 또는 연속 주입)에 의한 비경구 투여를 위해 제형화될 수 있다. 주사가능한 조성물은 유성 또는 수성 비히클 내의 현탁액, 용액 또는 에멀젼과 같은 형태를 취할 수 있다. 멸균 주사가능 제제는 또한 무독성 비경구적으로 허용되는 희석제 또는 용매 중의 멸균 주사가능 용액, 또는 현탁액, 예를 들어 1,4-부탄디올 중의 용액일 수 있다. 멸균 고정유는 통상적으로 용매 또는 분산매로 사용된다. 이를 위해, 임의의 무자극 고정유는 합성 모노- 또는 디글리세리드, 지방산 (올레산 포함), 천연 발생 식물성 오일, 예컨대 참깨 오일, 코코넛 오일, 땅콩 오일, 면실유, 및 다른 오일, 또는 합성 지방 비히클 예컨대 에틸 올레에이트를 포함하지만 이에 제한되지 않도록 이용될 수 있다. 완충제, 보존제, 항산화제 및 적합한 성분이 필요에 따라 혼입될 수 있거나, 대안적으로 제형을 포함할 수 있다.The formulation should suit the mode of administration. For example, the active compounds may be formulated for parenteral administration by injection (eg, bolus injection or continuous infusion). Injectable compositions may take such forms as suspensions, solutions, or emulsions in oily or aqueous vehicles. The sterile injectable preparation may also be a sterile injectable solution, or suspension, in a non-toxic parenterally acceptable diluent or solvent, for example as a solution in 1,4-butanediol. Sterile fixed oils are commonly used as solvents or dispersion media. To this end, any bland fixed oil may be synthetic mono- or diglycerides, fatty acids (including oleic acid), naturally occurring vegetable oils such as sesame oil, coconut oil, peanut oil, cottonseed oil, and other oils, or synthetic fatty vehicles such as ethyl. oleates, including but not limited to, may be used. Buffers, preservatives, antioxidants and suitable ingredients may be incorporated as needed or alternatively included in the formulation.
본 명세서에 제공되는 작제물 및 핵산과 같은 활성 화합물은 조성물에서 유일한 약제학적 활성 성분으로 제형화되거나 다른 활성 성분과 조합될 수 있다. 활성 화합물은 예를 들어 항체와 같은 표적화제에 대한 접합에 의해 전달을 위해 표적화될 수 있다. 조직 표적화된 리포솜을 포함하는 리포솜 현탁액도 약제학적으로 허용 가능한 담체로서 적합할 수 있다. 이들은 당업자에게 공지된 방법에 따라 제조될 수 있다. 예를 들어, 리포솜 제형은 미국 특허 제4,522,811호에 기술된 것과 같은 당업자에게 잘 알려진 방법에 의해 제조될 수 있다. 리포솜 전달은 또한 콜라겐 겔 및 피브로넥틴으로 변형된 리포솜과 같은 약제학적 매트릭스를 포함하는 느린 방출 제형을 포함할 수 있다 (예를 들어, 문헌[Weiner 등 (1985) J. Pharm . Sci. 74(9):922-925] 참조). 본 명세서에 제공되는 조성물은 불활성 담체 또는 콜로이드 분산 시스템과 같으나 이에 제한되지 않는 전달을 용이하게 하는 하나 이상의 보조제를 추가로 함유할 수 있다. 이러한 불활성 담체의 대표적이고 비제한적인 예는 물, 이소프로필 알코올, 기체 플루오로카본, 에틸 알코올, 폴리비닐피롤리돈, 프로필렌 글리콜, 겔 생성 물질, 스테아릴 알코올, 스테아르산, 경랍, 소르비탄 모노올레에이트, 메틸셀룰로스, 뿐만 아니라 이들 중 둘 이상의 적절한 조합으로부터 선택될 수 있다.Active compounds, such as constructs and nucleic acids provided herein, may be formulated as the sole pharmaceutically active ingredient in a composition or may be combined with other active ingredients. An active compound can be targeted for delivery, for example, by conjugation to a targeting agent such as an antibody. Liposomal suspensions, including tissue-targeted liposomes, may also be suitable as pharmaceutically acceptable carriers. These can be prepared according to methods known to those skilled in the art. For example, liposomal formulations can be prepared by methods well known to those skilled in the art, such as those described in US Pat. No. 4,522,811. Liposomal delivery can also include slow release formulations comprising pharmaceutical matrices such as collagen gels and liposomes modified with fibronectin (see, e.g., Weiner et al. (1985) J. Pharm . Sci . 74(9):922-925). The compositions provided herein may further contain one or more adjuvants to facilitate delivery, such as, but not limited to, an inert carrier or colloidal dispersion system. Representative, non-limiting examples of such inert carriers include water, isopropyl alcohol, gaseous fluorocarbons, ethyl alcohol, polyvinylpyrrolidone, propylene glycol, gel forming substances, stearyl alcohol, stearic acid, spermaceti, sorbitan mono oleate, methylcellulose, as well as suitable combinations of two or more of these.
활성 화합물은 치료 대상체에 대한 바람직하지 않은 부작용 없이 치료적으로 유용한 효과를 발휘하기에 충분한 양으로 약제학적으로 허용 가능한 담체에 포함된다. 치료 유효 농도는 본 명세서에 기재된 검정과 같은 공지된 시험관내 및 생체내 시스템에서 화합물을 시험함으로써 실험적으로 결정될 수 있다. 치료 유효량의 결정은 당업자의 능력 범위 내에 있다. 치료 유효 복용량은 본 명세서에 기재된 바와 같은 시험관내 및 생체내 방법을 사용하여 결정될 수 있다. 따라서, 본 명세서에 제공되는 활성 화합물 또는 그의 혼합물은 약제학적 제제일 때 투여를 위한 단위 복용 형태로 존재할 수 있다. The active compound is included in a pharmaceutically acceptable carrier in an amount sufficient to exert a therapeutically useful effect without undesirable side effects on the subject being treated. Therapeutically effective concentrations can be determined empirically by testing compounds in known in vitro and in vivo systems, such as the assays described herein. Determination of a therapeutically effective amount is within the ability of one skilled in the art. A therapeutically effective dosage can be determined using in vitro and in vivo methods as described herein. Thus, the active compounds or mixtures thereof provided herein may be in unit dosage form for administration as a pharmaceutical preparation.
2. 2. TFNR1TFNR1 길항제 antagonist 작제물construct , , TNFR2TNFR2 효능제agonist 작제물construct , 다중특이적, 예를 들어 , multispecific, for example 이중특이적bispecific , 작제물 및 핵산의 투여, Administration of Constructs and Nucleic Acids
TNFR1 길항제 작제물, TNFR2 효능제 작제물, 및 다중특이적, 예컨대 융합 단백질을 포함하는 이중특이적, TNFR1 길항제/TNFR2 효능제 작제물을 포함하는 본 명세서에 제공된 작제물, 및 작제물을 인코딩하는 핵산 분자를 포함하는 활성 화합물이 임의의 적합한 경로에 의해 투여될 수 있다. 본 명세서에는 체액 또는 다른 조직 샘플과 같은 혼합물을 본 명세서에 제공된 활성 화합물과 접촉시킴으로써 시험관내, 생체외 또는 생체내를 포함한다. 예를 들어, 생체 외에서 화합물을 투여할 때, 유리체와 같은 체액, 또는 대상체로부터의 조직 샘플은 예를 들어 바이패스 기계에서 튜브 또는 필터와 같은 튜브 또는 필터 상에 코팅된 폴리펩티드와 접촉될 수 있다. 생체내 투여 시, 활성 화합물은 액체, 반-액체 또는 고체 형태로 임의의 적절한 경로에 의해, 예를 들어, 경구로, 비강으로, 폐, 비경구로, 정맥내로, 진피내로, 유리체내로, 망막내로, 망막하로, 안구주위로, 피하로, 관절내로, 낭내로, 안구내로, 뇌실내로, 척추강내로, 근육내로, 복강내로, 기관내로, 직장으로, 또는 국소적으로, 또는 기관으로 직적접인 주사에 의해, 뿐만 아니라 by 그의 임의의 2 개 이상의 임의의 조합에 의해 투여될 수 있고, 각각의 투여 경로에 적합한 방식으로 제형화될 수 있다. Constructs provided herein, including TNFR1 antagonist constructs, TNFR2 agonist constructs, and multispecific, such as bispecific, including fusion proteins, TNFR1 antagonist/TNFR2 agonist constructs, and constructs encoding the constructs An active compound comprising a nucleic acid molecule may be administered by any suitable route. This disclosure includes in vitro, ex vivo or in vivo by contacting a mixture, such as a bodily fluid or other tissue sample, with an active compound provided herein. For example, when administering a compound ex vivo, a bodily fluid, such as the vitreous, or a tissue sample from a subject can be contacted with the polypeptide coated on a tube or filter, such as a tube or filter, for example in a bypass machine. For in vivo administration, the active compounds may be administered in liquid, semi-liquid or solid form by any suitable route, for example, orally, nasally, pulmonary, parenterally, intravenously, intradermally, intravitreally, retinally. intraocularly, subretinally, periocularly, subcutaneously, intraarticularly, intracapsularly, intraocularly, intraventricularly, intrathecally, intramuscularly, intraperitoneally, intratracheally, rectally, or topically, or directly into an organ It can be administered by direct injection, as well as by any combination of any two or more thereof, and can be formulated in a manner suitable for each route of administration.
투여 경로는 공지된 방법, 예를 들어 정맥내, 복강내, 대뇌내, 근육내, 피하, 안구내, 동맥내, 척추강내, 흡입 또는 병소내 경로에 의한 주사 또는 주입, 국소 또는 지속 방출 시스템에 따른다. 항체 또는 그의 단편은 전형적으로 주입 또는 볼러스 주사에 의해 연속적으로 투여된다. 본 명세서에 제공되는 활성 화합물은 상기 논의된 바와 같이 약제학적으로 허용 가능한 담체와의 혼합물로 제조될 수 있다. 화합물의 제형화 및 투여 기술은 당업자에게 공지되어 있다. 이 치료 조성물은 액체 또는 분말 에어로졸(동결건조)과 같이 정맥내로 또는 코나 폐를 통해 투여될 수 있다. 조성물은 또한 필요에 따라 비경구적으로 또는 피하로 투여될 수 있다. 전신으로 투여되는 경우, 치료 조성물은 멸균이고, 발열원이 없으며, pH, 등장성 및 안정성, 및 당업자에게 공지된 다른 조건을 적절하게 고려하여 비경구적으로 허용되는 용액이어야 한다.Routes of administration include injection or infusion by known methods, for example intravenous, intraperitoneal, intracerebral, intramuscular, subcutaneous, intraocular, intraarterial, intrathecal, inhalational or intralesional routes, topical or sustained release systems. follow Antibodies or fragments thereof are typically administered continuously by infusion or bolus injection. An active compound provided herein may be prepared in admixture with a pharmaceutically acceptable carrier, as discussed above. Techniques for formulation and administration of compounds are known to those skilled in the art. The therapeutic composition may be administered intravenously or via the nose or lungs as a liquid or powder aerosol (lyophilized). Compositions may also be administered parenterally or subcutaneously as needed. When administered systemically, the therapeutic composition should be a sterile, pyrogen-free, parenterally acceptable solution with due regard to pH, isotonicity and stability, and other conditions known to those skilled in the art.
치료 제형은 많은 종래의 복용 제형으로 투여될 수 있다. 본 명세서에 제공된 활성 화합물의 투여 제형은 원하는 정도의 순도를 갖는 화합물을 생리학적으로 허용되는 담체, 부형제 또는 안정화제와 혼합함으로써 저장 또는 투여를 위해 제조된다. 이러한 물질은 사용된 복용량 및 농도에서 수령체에게 무독성이며 완충액 예컨대 TRIS HCl, 포스페이트, 시트레이트, 아세테이트 및 다른 유기 산 염; 항산화제 예컨대 아스코르브산; 저분자량 (약 10개 미만의 잔기) 펩티드 예컨대 폴리아르기닌; 단백질, 예컨대 혈청 알부민, 젤라틴, 또는 면역글로불린; 친수성 중합체, 예컨대 폴리비닐피롤리돈; 아미노산, 예컨대 글리신, 글루탐산, 아스파르트산, 또는 아르기닌; 단당류, 이당류, 및 셀룰로스 또는 그의 유도체, 글루코스, 만노스, 또는 덱스트린을 포함하는 다른 탄수화물; 킬레이트화제, 예컨대 EDTA; 당 알코올, 예컨대 만니톨 또는 소르비톨; 반대 이온, 예컨대 나트륨 및/또는 비이온성 계면활성제, 예컨대 상표명 TWEEN 및 PLURONICS으로 시판되는 것들, 및 폴리에틸렌 글리콜 (PEG)를 포함할 수 있다.Therapeutic formulations can be administered in many conventional dosage forms. Dosage forms of the active compounds provided herein are prepared for storage or administration by mixing the compound having the desired degree of purity with physiologically acceptable carriers, excipients, or stabilizers. These substances are nontoxic to recipients at the dosages and concentrations employed and are used in buffers such as TRIS HCl, phosphate, citrate, acetate and other organic acid salts; antioxidants such as ascorbic acid; low molecular weight (less than about 10 residues) peptides such as polyarginine; proteins such as serum albumin, gelatin, or immunoglobulins; hydrophilic polymers such as polyvinylpyrrolidone; amino acids such as glycine, glutamic acid, aspartic acid, or arginine; monosaccharides, disaccharides, and other carbohydrates including cellulose or its derivatives, glucose, mannose, or dextrins; chelating agents such as EDTA; sugar alcohols such as mannitol or sorbitol; counterions such as sodium and/or nonionic surfactants such as those sold under the tradenames TWEEN and PLURONICS, and polyethylene glycol (PEG).
약제학적 조성물은 안정화제를 함유할 수 있다. 안정화제는 아미노산, 아미노산 유도체, 아민, 당, 폴리올, 염 또는 계면활성제일 수 있다. 일부 예에서, 안정한 공-제형은 단일 안정화제를 함유한다. 다른 예에서, 안정한 공-제형은 2, 3, 4, 5 또는 6개의 상이한 안정화제를 함유한다. 예를 들어, 안정화제는 글리세롤, 소르비톨, 만니톨, 이노시톨, 수크로스 또는 트레할로스와 같은 당 또는 폴리올일 수 있다. 특정 예에서, 안정화제는 수크로스이다. 다른 예에서, 안정화제는 트레할로스이다. 당 또는 폴리올의 농도는 약 100 mM 내지 500 mM, 100 mM 내지 400 mM, 100 mM 내지 300 mM, 100 mM 내지 200 mM, 200 mM 내지 500 mM, 200 mM 내지 400 mM, 200 mM 내지 300 mM, 250 mM 내지 500 mM, 250 mM 내지 400 mM, 250 mM 내지 300 mM, 300 mM 내지 500 mM, 300 mM 내지 400 mM, 또는 400 mM 내지 500 mM (각각 포함)이다. The pharmaceutical composition may contain a stabilizer. Stabilizers can be amino acids, amino acid derivatives, amines, sugars, polyols, salts or surfactants. In some instances, stable co-formulations contain a single stabilizer. In another example, a stable co-formulation contains 2, 3, 4, 5 or 6 different stabilizers. For example, the stabilizer can be a sugar or polyol such as glycerol, sorbitol, mannitol, inositol, sucrose or trehalose. In certain instances, the stabilizing agent is sucrose. In another example, the stabilizing agent is trehalose. The sugar or polyol concentration is about 100 mM to 500 mM, 100 mM to 400 mM, 100 mM to 300 mM, 100 mM to 200 mM, 200 mM to 500 mM, 200 mM to 400 mM, 200 mM to 300 mM, 250 mM mM to 500 mM, 250 mM to 400 mM, 250 mM to 300 mM, 300 mM to 500 mM, 300 mM to 400 mM, or 400 mM to 500 mM, each inclusive.
예에서, 안정제는 폴리프로필렌 글리콜, 폴리에틸렌 글리콜, 글리세린, 소르비톨, 폴록사머 및 폴리소르베이트인 계면활성제일 수 있다. 예를 들어, 계면활성제는 폴리프로필렌 글리콜, 폴리에틸렌 글리콜, 글리세린, 소르비톨, 폴록사머 또는 폴리소르베이트, 예컨대 폴록사머 188, 폴리소르베이트 20 및 폴리소르베이트 80일 수 있다. 특정 예에서, 안정화제는 폴리소르베이트 80이다. 제형 내의 질량 농도 %(w/v)로서 계면활성제의 농도는 0.005% 내지 1.0%, 0.01% 내지 0.5%, 0.01% 내지 0.1%, 0.01% 내지 0.05%, 또는 0.01% 내지 0.02% (각각 포함)이다.In examples, the stabilizer can be a surfactant that is polypropylene glycol, polyethylene glycol, glycerin, sorbitol, poloxamer, and polysorbate. For example, the surfactant can be polypropylene glycol, polyethylene glycol, glycerin, sorbitol, poloxamer or polysorbates such as poloxamer 188, polysorbate 20 and polysorbate 80. In a specific example, the stabilizing agent is polysorbate 80. The concentration of the surfactant as mass concentration % (w/v) in the formulation is 0.005% to 1.0%, 0.01% to 0.5%, 0.01% to 0.1%, 0.01% to 0.05%, or 0.01% to 0.02%, each inclusive. am.
생체 내 투여를 위해, 제형은 멸균되어야 한다. 이는 동결건조 및 재구성 전 또는 후에 멸균 여과막을 통한 여과와 같이 쉽게 달성된다. 제형은 동결건조된 형태 또는 용액으로 저장될 수 있다. 다른 비히클, 예컨대 천연 발생 식물성 오일, 예컨대 참깨, 땅콩, 또는 면실유, 또는 합성 지방 비히클, 예컨대 에틸 올레에이트 등이 사용될 수 있다. 완충제, 보존제, 항산화제 등은 허용된 약제학적 실시에 따라 혼입될 수 있다.For in vivo administration, the formulation must be sterile. This is easily accomplished, such as filtration through sterile filtration membranes before or after lyophilization and reconstitution. Formulations may be stored in lyophilized form or as a solution. Other vehicles may be used, such as naturally occurring vegetable oils such as sesame, peanut, or cottonseed oil, or synthetic fatty vehicles such as ethyl oleate and the like. Buffers, preservatives, antioxidants and the like may be incorporated according to accepted pharmaceutical practice.
복용량의 결정은 의사의 기술 범위 내에 있으며 특정 장애, 투여 경로 및 대상체의 함수일 수 있다. 예시적인 복용량은 예를 들어 0.1 내지 100 mg/kg, 예를 들어 1 내지 10 mg/kg, 또는 치료 대상체의 질량을 기준으로 적절한 양을 포함하고; 평균적인 인간 대상체의 질량은 약 70-75 kg이다. 폴리펩티드는 1회 또는 1회 초과, 예를 들어 2회, 3회, 4회 또는 치료 효과를 달성하는데 필요한 임의의 횟수로 투여될 수 있다. 다중 투여는 임의의 경로 또는 경로의 조합을 통해 수행될 수 있고, 매시간, 매 2시간, 매 3시간, 매 4시간 또는 그 초과로 투여될 수 있다.Determination of dosage is within the skill of the physician and may be a function of the particular disorder, route of administration, and subject. Exemplary dosages include, for example, 0.1 to 100 mg/kg, such as 1 to 10 mg/kg, or an appropriate amount based on the mass of the subject being treated; The mass of an average human subject is about 70-75 kg. The polypeptide can be administered once or more than once, eg twice, three times, four times or any number of times necessary to achieve a therapeutic effect. Multiple administrations can be performed via any route or combination of routes, and can be administered hourly, every 2 hours, every 3 hours, every 4 hours or more.
활성 화합물은 예를 들어 약 0.1 내지 10 mg/mL, 예를 들어, 적어도 또는 적어도 약 0.1, 0.2, 0.3, 0.4, 0.5, 0.6, 0.7, 0.8, 0.9, 1.0, 1.5, 2.0, 2.5, 3.0, 3.5, 4.0, 4.5, 5.0, 5.5, 6.0, 6.5, 7.0, 7.5, 8.0, 8.5, 9.0, 9.5, 또는 10 mg/mL, 또는 그 초과의 농도의 조성물 내 농도로 제공될 수 있다. 용액의 부피는 약 0.1 내지 100 mL 이상, 예를 들어, 적어도 또는 약 적어도 또는 0.5, 1, 2, 3, 4, 5, 10, 15, 20, 25, 30, 35, 40, 45, 50, 55, 60, 65, 70, 75, 80, 85, 90, 95, 또는 100 mL, 또는 그 초과일 수 있다 . 일부 예에서, 활성 화합물은 인산염 완충 식염수로 공급된다. 예를 들어, 조성물은 인산염 완충 식염수 중 2 mg/mL의 농도로 100 mg의 폴리펩티드 또는 융합 단백질을 함유하는 50 mL의 바이알 또는 다른 용기로서 공급될 수 있다. The active compound may be present at, for example, about 0.1 to 10 mg/mL, such as at least or at least about 0.1, 0.2, 0.3, 0.4, 0.5, 0.6, 0.7, 0.8, 0.9, 1.0, 1.5, 2.0, 2.5, 3.0, 3.5, 4.0, 4.5, 5.0, 5.5, 6.0, 6.5, 7.0, 7.5, 8.0, 8.5, 9.0, 9.5, or 10 mg/mL, or a concentration in the composition of greater concentration. The volume of the solution may be from about 0.1 to about 100 mL or more, for example, at least or about at least or 0.5, 1, 2, 3, 4, 5, 10, 15, 20, 25, 30, 35, 40, 45, 50, 55, 60, 65, 70, 75, 80, 85, 90, 95, or 100 mL, or more. In some instances, the active compound is supplied in phosphate buffered saline. For example, the composition may be supplied as a 50 mL vial or other container containing 100 mg of the polypeptide or fusion protein at a concentration of 2 mg/mL in phosphate buffered saline.
본 명세서에 제공되는 활성 화합물은 저장을 위해 동결건조될 수 있고 사용 전에 적합한 담체에서 재구성될 수 있다. 이 기술은 종래의 면역글로불린 및 단백질 제제에 효과적인 것으로 나타났으며 당업계에 공지된 동결건조 및 재구성 기술을 사용할 수 있다.The active compounds provided herein may be lyophilized for storage and reconstituted in a suitable carrier prior to use. This technique has been shown to be effective for conventional immunoglobulin and protein preparations and lyophilization and reconstitution techniques known in the art can be used.
본 명세서에 제공되는 활성 화합물은 조절 방출 또는 지속 방출 조성물로 제공될 수 있다. 중합체 물질은 제어 또는 지속 방출을 달성할 수 있는 환제 및 캡슐의 제형에 대해 당업계에 공지되어 있다 (예를 들어, 문헌[Controlled Drug Bioavailability, Drug Product Design and Performance, Smolen and Ball (eds.), Wiley, New York (1984); 또한 Levy 등 (1985) Science 228:190; During 등 (1989) Ann. Neurol . 25:351; Howard 등 (1989) J. Neurosurg. 71:105; 미국 특허 번호 5,679,377, 5,916,597, 5,912,015, 5,989,463, 및 5,128,326; 및 국제 출원 공개 번호 WO 99/015154 and WO 99/020253] 참조). 지속 방출 제형에 사용되는 중합체의 예는 폴리(2-하이드록시 에틸 메타크릴레이트), 폴리(메틸 메타크릴레이트), 폴리(아크릴산), 폴리(에틸렌-코-비닐 아세테이트), 폴리(메타크릴산), 폴리글리콜라이드 (PLG), 폴리무수물, 폴리(N-비닐 피롤리돈), 폴리(비닐 알코올), 폴리아크릴아미드, 폴리(에틸렌 글리콜), 폴리락티드 (PLA), 폴리(락티드-코-글리콜라이드) (PLGA), 및 폴리오르토에스테르를 포함하지만 이에 제한되지 않는다. 일반적으로, 지속 방출 제형에 사용되는 중합체는 불활성이고, 침출성 불순물이 없고, 저장시 안정하고, 멸균되고, 생분해성이다. 지속 방출 제형의 생산을 위한 당업계에 공지된 임의의 기술을 사용하여 지속 방출 제형을 생성할 수 있다. An active compound provided herein may be provided as a controlled release or sustained release composition. Polymeric materials are known in the art for formulation of pills and capsules that can achieve controlled or sustained release (see, e.g., Controlled Drug Bioavailability, Drug Product Design and Performance , Smolen and Ball (eds.), Wiley, New York (1984); also Levy et al. (1985) Science 228:190; During etc. (1989) Ann. Neurol . 25:351; Howard et al. (1989) J. Neurosurg . 71:105; U.S. Patent Nos. 5,679,377, 5,916,597, 5,912,015, 5,989,463, and 5,128,326; and International Application Publication Nos. WO 99/015154 and WO 99/020253). Examples of polymers used in sustained release formulations are poly(2-hydroxy ethyl methacrylate), poly(methyl methacrylate), poly(acrylic acid), poly(ethylene-co-vinyl acetate), poly(methacrylic acid) ), polyglycolide (PLG), polyanhydride, poly(N-vinyl pyrrolidone), poly(vinyl alcohol), polyacrylamide, poly(ethylene glycol), polylactide (PLA), poly(lactide- co-glycolide) (PLGA), and polyorthoesters. Generally, the polymers used in sustained-release formulations are inert, free of leachable impurities, stable on storage, sterile, and biodegradable. Sustained release formulations can be produced using any technique known in the art for the production of sustained release formulations.
작제물 및 핵산, 및 그의 생리학적으로 허용되는 형태의 염 및 용매화물은 (입 또는 코를 통한) 흡입에 의한 투여를 위해 또는 예를 들어, 경구, 경피, 폐, 비경구 또는 직장 투여를 포함하는 다른 투여 경로를 위해 제형화될 수 있다. 흡입에 의한 투여를 위해, 활성 화합물은 적합한 추진제, 예를 들어 디클로로디플루오로메탄, 트리클로로플루오로메탄, 디클로로테트라플루오로에탄, 이산화탄소 또는 기타 적절한 가스의 사용과 함께 가압 팩 또는 분무기로부터의 에어로졸 분무 제시의 형태로 편리하게 전달될 수 있다. 가압 에어로졸의 경우 복용량 단위는 계량된 양을 전달하기 위한 밸브를 제공함으로써 결정될 수 있다. 예를 들어 흡입기 또는 취입기에 사용하기 위한 젤라틴의 캡슐 및 카트리지는 치료 화합물과 락토스 또는 전분과 같은 적합한 분말 베이스의 분말 혼합물을 함유하여 제형화될 수 있다.The constructs and nucleic acids, and their physiologically acceptable forms of salts and solvates, are intended for administration by inhalation (orally or nasally) or including, for example, oral, transdermal, pulmonary, parenteral or rectal administration. may be formulated for other routes of administration. For administration by inhalation, the active compounds may be administered in pressurized packs or aerosols from nebulizers with the use of a suitable propellant, for example dichlorodifluoromethane, trichlorofluoromethane, dichlorotetrafluoroethane, carbon dioxide or other suitable gas. It can conveniently be delivered in the form of a spray presentation. For pressurized aerosols, the dosage unit can be determined by providing a valve to deliver a metered amount. For example, capsules and cartridges of gelatin for use in an inhaler or insufflator may be formulated containing a powder mixture of the therapeutic compound and a suitable powder base such as lactose or starch.
폐로의 폐 투여를 위해, 작제물은 적합한 추진제를 사용하여 네뷸라이저, 터보 네뷸라이저, 또는 마이크로프로세서 제어된 정량 경구 흡입기로부터 에어로졸 스프레이 제시의 형태로 전달될 수 있다. 일반적으로 에어로졸의 입자 크기는 0.5 내지 5 마이크론 범위로 작다. 폐 투여용으로 제형화된 약제학적 조성물의 경우, 세제 계면활성제는 일반적으로 사용되지 않는다. 폐 약물 전달은 유망한 비침습적 전신 투여 방법이다. 폐는 주로 흡수를 위한 높은 표면적, 얇은 폐포 상피, 광범위한 혈관형성, 간 초회통과 대사의 부족 및 상대적으로 낮은 대사 활동으로 인해 약물 전달을 위한 매력적인 경로를 나타낸다.For pulmonary administration to the lungs, the constructs may be delivered in the form of an aerosol spray presentation from a nebulizer, turbo nebulizer, or microprocessor controlled metered dose oral inhaler using a suitable propellant. Generally, the particle size of the aerosol is small, in the range of 0.5 to 5 microns. For pharmaceutical compositions formulated for pulmonary administration, detergent surfactants are generally not used. Pulmonary drug delivery is a promising non-invasive systemic administration method. The lung represents an attractive route for drug delivery, primarily due to its high surface area for absorption, thin alveolar epithelium, extensive angiogenesis, lack of hepatic first-pass metabolism, and relatively low metabolic activity.
경구 투여를 위해, 약제학적 조성물은 예를 들어, 약제학적으로 허용 가능한 부형제 예컨대 결합제 (예를 들어, 사전절라틴화된 옥수수 전분, 폴리비닐피롤리돈 또는 하이드록시프로필 메틸셀룰로스); 충전제 (예를 들어, 락토스, 미세결정성 셀룰로스 또는 인산수소칼슘); 윤활제 (예를 들어, 스테아르산마그네슘, 탈크 또는 실리카); 붕해제 (예를 들어, 감자 전분 또는 나트륨 전분 글리콜레이트); 또는 습윤제 (예를 들어, 나트륨 라우릴 설페이트)와 함께 종래의 수단에 의해 제조된 정제, 환제, 액체 현탁액, 또는 캡슐의 형태를 취할 수 있다. 정제는 당업계에 잘 알려진 방법에 의해 코팅될 수 있다. 경구 투여를 위한 액체 제제는 예를 들어 용액, 시럽 또는 현탁액의 형태를 취할 수 있거나, 사용 전에 물 또는 다른 적합한 비히클로 구성하기 위한 건조 생성물로 제공될 수 있다. 이러한 액체 제제는 약제학적으로 허용 가능한 첨가제, 예컨대 현탁화제 (예를 들어, 소르비톨 시럽, 셀룰로스 유도체 또는 수소화 식용 지방); 유화제 (예를 들어, 레시틴 또는 아카시아); 비-수성 비히클 (예를 들어, 아몬드 오일, 오일성 에스테르, 에틸 알코올, 또는 분별화된 식물성 오일); 및 보존제 (예를 들어, 메틸 또는 프로필-p-하이드록시벤조에이트, 또는 소르브산)와 함께 종래의 수단에 의해 제조될 수 있다. 제제에는 또한 완충액 염, 향미제, 착색제 및 감미료가 적절하게 포함될 수 있다.For oral administration, the pharmaceutical composition may contain, for example, pharmaceutically acceptable excipients such as binders (eg, preaged corn starch, polyvinylpyrrolidone or hydroxypropyl methylcellulose); fillers (eg lactose, microcrystalline cellulose or calcium hydrogen phosphate); lubricants (eg magnesium stearate, talc or silica); disintegrants (eg potato starch or sodium starch glycolate); or in the form of tablets, pills, liquid suspensions, or capsules prepared by conventional means with a wetting agent (eg sodium lauryl sulfate). Tablets may be coated by methods well known in the art. Liquid preparations for oral administration may take the form of, for example, solutions, syrups or suspensions, or may be presented as a dry product for constitution with water or other suitable vehicle before use. Such liquid preparations may contain pharmaceutically acceptable additives such as suspending agents (eg sorbitol syrup, cellulose derivatives or hydrogenated edible fats); emulsifiers (eg lecithin or acacia); non-aqueous vehicles (eg, almond oil, oily esters, ethyl alcohol, or fractionated vegetable oils); and preservatives (eg, methyl or propyl-p-hydroxybenzoate, or sorbic acid). The formulation may also include buffer salts, flavoring agents, coloring agents and sweeteners as appropriate.
경구 투여용 제제는 활성 화합물의 조절 방출을 위해 제형화될 수 있다. 협측 투여를 위해, 조성물은 종래의 방식으로 제형화된 정제 또는 로젠지의 형태를 취할 수 있다. 활성 화합물은 데포 제제로 제형화될 수 있다. 이러한 지속성 제형은 이식(예를 들어, 피하 또는 근육내) 또는 근육내 주사에 의해 투여될 수 있다. 따라서, 예를 들어, 치료 화합물은 (예를 들어, 허용 가능한 오일 내의 에멀젼으로서) 또는 이온 교환 수지, 또는 난용성 유도체로서, 예를 들어, 난용성 염로서 적합한 중합체성 또는 소수성 물질과 함께 제형화될 수 있다.Formulations for oral administration may be formulated for controlled release of the active compound. For buccal administration, the compositions may take the form of conventionally formulated tablets or lozenges. The active compound may be formulated as a depot preparation. Such long-acting formulations may be administered by implantation (eg, subcutaneously or intramuscularly) or by intramuscular injection. Thus, for example, the therapeutic compounds may be formulated with suitable polymeric or hydrophobic materials (e.g., as emulsions in acceptable oils) or as ion exchange resins, or sparingly soluble derivatives, e.g., as sparingly soluble salts. It can be.
활성 화합물은 주사(예를 들어, 볼러스 주사 또는 연속 주입)에 의한 비경구 투여를 위해 제형화될 수 있다. 주사용 제형은 보존제가 첨가된 단위 복용 형태(예를 들어, 앰플 또는 다중 투여 용기 내에)로 제공될 수 있다. 조성물은 유성 또는 수성 비히클 중의 현탁액, 용액 또는 에멀젼과 같은 형태를 취할 수 있고, 현탁제, 안정화제 및/또는 분산제와 같은 제형화제를 함유할 수 있다. 대안적으로, 활성 성분은 사용 전에 적합한 비히클, 예를 들어 무균 발열원 없는 물로 구성하기 위한 분말-동결건조된 형태일 수 있다.The active compounds may be formulated for parenteral administration by injection (eg, bolus injection or continuous infusion). Formulations for injection may be presented in unit dosage form (eg, in ampoules or in multi-dose containers) with an added preservative. The composition may take the form of a suspension, solution or emulsion in an oily or aqueous vehicle and may contain formulatory agents such as suspending, stabilizing and/or dispersing agents. Alternatively, the active ingredient may be in powder-lyophilized form for constitution with a suitable vehicle, eg, sterile pyrogen-free water, before use.
약제학적 조성물은 국부 또는 국소 적용을 위해, 예컨대 겔, 크림 및 로션의 형태로 눈과 같은 피부(경피) 및 점막에 대한 국소 적용을 위해 및 눈에 적용하기 위해 또는 낭내 또는 척수내 적용을 위해 제형화될 수 있다 그러한 용액, 특히 안과용으로 의도된 용액은 0.01% - 10% 등장성 용액 및 적절한 염과 함께 약 5-7의 pH로 제형화될 수 있다. 화합물은 흡입과 같은 국소 적용을 위한 에어로졸로 제형화될 수 있다 (예를 들어, 미국 특허 제4,044,126호, 제4,414,209호 및 제4,364,923호를 참조하고, 이는 염증성 질환, 특히 천식의 치료에 유용한 스테로이드의 전달을 위한 에어로졸을 기재함). Pharmaceutical compositions are formulated for topical or topical application, such as for topical application to the skin (dermal) and mucous membranes, such as the eye, in the form of gels, creams and lotions, and for application to the eye or for intracapsular or intraspinal application. Such solutions, particularly those intended for ophthalmic use, may be formulated at a pH of about 5-7 with 0.01% - 10% isotonic solutions and appropriate salts. The compounds may be formulated as an aerosol for topical application such as inhalation (see, eg, U.S. Patent Nos. 4,044,126, 4,414,209 and 4,364,923, which are steroidal agents useful in the treatment of inflammatory diseases, particularly asthma). aerosol for delivery).
약물 조성물 내의 활성 화합물의 농도는 활성 화합물의 흡수, 불활성화 및 배출 속도, 복용량 스케줄 및 투여량 뿐만 아니라 당업자에게 공지된 다른 인자에 따라 달라진다. 본 명세서에 추가로 기재된 바와 같이, 복용량은 특성 및 활성의 비교를 사용하여 경험적으로 결정될 수 있다. 예를 들어, 본 명세서에 제공된 작제물에 의한 TNFR1을 통한 TNF 매개 염증 신호전달의 억제는 아달리무맙과 같은 전통적인 항-TNF 요법과 비교할 수 있다.The concentration of the active compound in the drug composition depends on the rate of absorption, inactivation and excretion of the active compound, the dosage schedule and dosage, as well as other factors known to those skilled in the art. As further described herein, dosage can be determined empirically using comparisons of properties and activities. For example, inhibition of TNF-mediated inflammatory signaling through TNFR1 by a construct provided herein is comparable to traditional anti-TNF therapies such as adalimumab.
원하는 경우, 조성물은 활성 성분을 함유하는 하나 이상의 단위 복용 형태를 함유할 수 있는 패키지, 키트 또는 디스펜서 장치로 제시될 수 있다. 일부 예에서, 조성물은 예를 들어 바이패스 기계의 튜브 또는 필터와 같은 장치 상에 코팅될 수 있다. 예를 들어 패키지에는 블리스터 팩과 같은 금속 또는 플라스틱 호일이 들어 있다. 팩 또는 디스펜서 장치에는 투여 지침이 수반될 수 있다. 활성제를 함유하는 조성물은 포장 재료, 본 명세서에 제공된 제제, 및 제제가 제공되는 장애를 나타내는 라벨을 함유하는 제조 물품으로서 포장될 수 있다. 약제학적 조성물은 단일 용량 또는 다중 용량을 위한 약제학적 조성물의 양을 함유하는 단위 복용 형태로 포장될 수 있다. 포장된 조성물은 투여 전에 (예를 들어, 물 또는 염수로) 재구성될 수 있는, TNFR1 길항제 작제물, TNFR2 효능제 작제물, 및 융합 단백질을 포함하는 다중특이적, 예컨대 이중특이적, TNFR1 길항제/TNFR2 효능제 작제물을 포함하는 본 명세서에 제공된 작제물, 및 본 명세서에 제공된 작제물을 인코딩하는 핵산 분자를 함유하는 약제학적 조성물의 동결건조 분말을 함유한다.If desired, the compositions may be presented in a package, kit, or dispenser device that may contain one or more unit dosage forms containing the active ingredient. In some instances, the composition may be coated onto a device such as, for example, a filter or tube of a bypass machine. For example, the package contains a metal or plastic foil such as a blister pack. The pack or dispenser device may be accompanied by instructions for administration. A composition containing an active agent may be packaged as an article of manufacture containing a packaging material, a formulation provided herein, and a label indicating the disorder in which the formulation is provided. A pharmaceutical composition may be packaged in unit dosage form containing an amount of the pharmaceutical composition for a single dose or multiple doses. The packaged composition is a multispecific, such as a bispecific, TNFR1 antagonist/comprising TNFR1 antagonist construct, a TNFR2 agonist construct, and a fusion protein, which can be reconstituted (eg, with water or saline) prior to administration. A lyophilized powder of a pharmaceutical composition containing a construct provided herein, including a TNFR2 agonist construct, and a nucleic acid molecule encoding the construct provided herein.
본 명세서에 제공된 제조 물품에는 포장 재료가 포함되어 있다. 약제학적 제품 포장에 사용하기 위한 포장 재료는 당업자에게 잘 알려져 있다 (예를 들어, 미국 특허 제5,323,907호, 제5,052,558호 및 제5,033,252호 참조). 약제학적 포장 재료의 예는 블리스터 팩, 병, 튜브, 흡입기 (예를 들어, 가압된 정량 흡입기 (MDI), 건조 분말 흡입기 (DPI), 네뷸라이저 (예를 들어, 제트 또는 초음파 네뷸라이저) 및 다른 단일 호흡 액체 시스템), 펌프, 백, 바이알, 컨테이너, 주사기, 병, 및 투여 및 치료의 선택된 제형 및 의도된 방식에 적합한 임의의 포장 재료를 포함하지만 이에 제한되지 않는다. Articles of manufacture provided herein include packaging materials. Packaging materials for use in packaging pharmaceutical products are well known to those skilled in the art (see, eg, US Pat. Nos. 5,323,907, 5,052,558 and 5,033,252). Examples of pharmaceutical packaging materials are blister packs, bottles, tubes, inhalers (eg pressurized metered dose inhalers (MDI), dry powder inhalers (DPI), nebulizers (eg jet or ultrasonic nebulizers), and other single breath liquid systems), pumps, bags, vials, containers, syringes, bottles, and any packaging material suitable for the selected formulation and intended mode of administration and treatment.
TNFR1 길항제 작제물, TNFR2 효능제 작제물, 및 융합 단백질을 포함하는 다중특이적, 예컨대 이중특이적, TNFR1 길항제/TNFR2 효능제 작제물을 포함하는 본 명세서에 제공된 작제물, 및 작제물을 인코딩하는 핵산 분자를 포함하는 활성 화합물, 약제학적 조성물, 및 다른 치료제를 포함하는 활성제와 다른 조성물의 조합은 키트로서 제공될 수 있다 키트는 방법의 실시를 위한 하나 이상의 구성요소, 예컨대 사용 지침, 디바이스, 추가의 시약 (예를 들어, 조성물의 희석 및/또는 동결건조 단백질의 재구성을 위한 멸균수 또는 식염수), 및 구성요소, 예컨대 튜브, 컨테이너 및 주사기를 선택적으로 포함할 수 있다. 예시적인 키트는 본 명세서에 제공된 작제물 및 인코딩 핵산을 포함할 수 있고, 선택적으로 사용 지침, 대상체에게 화합물을 투여하기 위한 장치, 대상체에서 화합물을 검출하기 위한 장치, 대상체로부터 얻은 샘플에서 화합물 또는 그 대사 산물을 검출하기 위한 장치, 및 대상체에게 추가 치료제를 투여하기 위한 장치를 포함할 수 있다. 선택적으로 키트에는 사용 지침이 포함될 수 있다. 지침은 전형적으로 활성 화합물(들) 및 선택적으로 키트에 포함된 다른 구성요소를 설명하는 유형의 표현, 대상체의 적절한 상태를 결정하는 방법, 적절한 투여량, 투여 레지멘 및 투여 방법을 결정하는 방법을 포함하는 투여를 위한 방법을 포함한다. 지침은 또한 치료 시간 동안 대상체를 모니터링하기 위한 안내를 포함할 수 있다.Constructs provided herein, including TNFR1 antagonist constructs, TNFR2 agonist constructs, and multispecific, such as bispecific, TNFR1 antagonist/TNFR2 agonist constructs, including fusion proteins, and constructs encoding the constructs Active compounds comprising nucleic acid molecules, pharmaceutical compositions, and combinations of active agents and other compositions comprising other therapeutic agents may be provided as a kit. A kit may include one or more components for the practice of a method, such as instructions for use, a device, an additional of reagents (eg, sterile water or saline for dilution of the composition and/or reconstitution of the lyophilized protein), and components such as tubes, containers, and syringes. Exemplary kits may include a construct provided herein and an encoding nucleic acid, optionally instructions for use, a device for administering a compound to a subject, a device for detecting a compound in a subject, a compound or its devices for detecting metabolites, and devices for administering additional therapeutic agents to a subject. Optionally, the kit may include instructions for use. Instructions typically include tangible representations describing the active compound(s) and optionally other components included in the kit, how to determine the appropriate condition of the subject, how to determine the appropriate dosage, administration regimen and method of administration. A method for administration comprising Instructions may also include instructions for monitoring the subject during the treatment session.
키트는 또한 본 명세서에 기재된 약제학적 조성물 및 진단을 위한 항목을 포함할 수 있다. 예를 들어, 이러한 키트는 대상체에서 투여된 활성 화합물의 농도, 양 또는 활성을 측정하기 위한 항목을 포함할 수 있다. 본 명세서에 제공되는 키트는 또한 화합물(들)을 투여하기 위한 장치를 포함할 수 있다. 대상체에게 약물처치를 투여하기 위한 당업계에 공지된 임의의 다양한 장치가 본 명세서에 제공된 키트에 포함될 수 있다. 예시적인 장치는 피하 주사침, 정맥내 바늘 및 카테터를 포함하지만 이에 제한되지 않는다. 전형적으로, 투여용 장치는 활성제의 원하는 투여 방법과 양립할 수 있다.A kit may also include a pharmaceutical composition described herein and items for diagnosis. For example, such kits may include items for measuring the concentration, amount or activity of an active compound administered in a subject. Kits provided herein may also include a device for administering the compound(s). Any of a variety of devices known in the art for administering medication to a subject can be included in the kits provided herein. Exemplary devices include, but are not limited to, hypodermic needles, intravenous needles, and catheters. Typically, the device for administration is compatible with the desired method of administration of the active agent.
3. 폴리펩티드를 인코딩하는 핵산의 투여(유전자 요법) 3. Administration of Nucleic Acids Encoding Polypeptides (Gene Therapy)
약제학적 조성물 중에는 본 명세서에 제공된 폴리펩티드 작제물을 인코딩하는 핵산 분자를 함유하는 것들이 있다. 단백질을 전달하기보다는, 핵산 분자는 전신적으로 또는 다른 경로에 의해 생체내 투여되거나, 림프구를 포함하는 세포의 제거, 그 안에 핵산 분자의 도입 및 숙주 또는 양립가능한 수령체로의 재도입에 의해 생체외 투여될 수 있다. Among the pharmaceutical compositions are those containing nucleic acid molecules encoding the polypeptide constructs provided herein. Rather than delivering proteins, nucleic acid molecules can be administered systemically or by other routes in vivo, or ex vivo by elimination of cells, including lymphocytes, introduction of the nucleic acid molecule therein, and reintroduction into a host or compatible recipient. It can be.
TNFR1 길항제 작제물, TNFR2 효능제 작제물, 및 융합 단백질을 포함하는 다중특이적, 예컨대 이중특이적, TNFR1 길항제/TNFR2 효능제 작제물을 포함하는 본 명세서에 제공된 폴리펩티드 작제물은 핵산 분자의 발현에 의해 세포 및 조직으로 전달될 수 있다. 핵산은 당업자에게 공지된 임의의 방법에 의해 세포 및 조직으로 전달될 수 있다. 단리된 핵산은 추가 조작을 위해 벡터에 혼입될 수 있다. 상기 논의된 바와 같이, 인코딩 핵산 분자의 발현에 의해 폴리펩티드를 투여하는 방법은 재조합 벡터의 투여를 포함한다. 벡터는 복제 기점을 포함하는 것과 같이 에피솜을 유지하도록 설계될 수 있거나 세포의 염색체에 혼입되도록 설계될 수 있다. 폴리펩티드는 또한 비-바이러스 벡터를 사용하는 생체외 유전자 발현 요법에 사용될 수 있다. 적합한 유전자 요법 벡터 및 전달 방법은 당업자에게 공지되어 있고, 상기 섹션에서 논의된다. Polypeptide constructs provided herein, including TNFR1 antagonist constructs, TNFR2 agonist constructs, and multispecific, such as bispecific, TNFR1 antagonist/TNFR2 agonist constructs, including fusion proteins, are useful for the expression of nucleic acid molecules. can be delivered to cells and tissues by Nucleic acids can be delivered to cells and tissues by any method known to those skilled in the art. Isolated nucleic acids can be incorporated into vectors for further manipulation. As discussed above, methods of administering a polypeptide by expression of an encoding nucleic acid molecule include administration of a recombinant vector. Vectors may be designed to remain episomal, such as containing an origin of replication, or may be designed to be incorporated into the chromosome of a cell. Polypeptides can also be used in ex vivo gene expression therapy using non-viral vectors. Suitable gene therapy vectors and delivery methods are known to those skilled in the art and are discussed in the section above.
K. 치료 용도 및 치료 방법K. Therapeutic Uses and Methods of Treatment
상술한 것과 같은 약제학적 조성물을 제조하여 TNFR1 및 TNFR2를 각각 억제 및/또는 작용시키는 작제물로 치료할 수 있는 질환, 장애 또는 병태를 가진 대상체에게 투여한다. 복용량은 특정 대상체뿐만 아니라 치료되는 특정 장애, 질환 또는 병태에 따라 다르다. 전형적인 용량은 에타네르셉트와 같은 알려진 TNF 차단제와 유사한다. 인간 및 다른 동물을 포함하는 대상체에 대한 예시적인 용량은 약 또는 0.1 mg/kg 내지 100 mg/kg, 예컨대 1 mg/kg 내지 약 또는 30 mg/kg, 예컨대 5 mg/kg 내지 25 mg/kg의 범위이다. 용량은 평균적인 인간의 질량이 약 75 kg이라는 가정에 따라 결정될 수 있다. 소아, 유아 및 더 작은 성인을 위해 용량을 조정할 수 있다. A pharmaceutical composition as described above is prepared and administered to a subject having a disease, disorder or condition that can be treated with a construct that inhibits and/or agonizes TNFR1 and TNFR2, respectively. Dosages vary depending on the particular subject as well as the particular disorder, disease or condition being treated. Typical doses are similar to known TNF blockers such as etanercept. Exemplary dosages for subjects, including humans and other animals, are about or 0.1 mg/kg to 100 mg/kg, such as 1 mg/kg to about or 30 mg/kg, such as 5 mg/kg to 25 mg/kg. is the range Doses can be determined based on the assumption that the average human mass is about 75 kg. Dosage may be adjusted for children, infants and smaller adults.
본 명세서에 제공된 TNFR1 길항제, TNFR2 효능제, 이중특이적 TNFR1 길항제/TNFR2 효능제 작제물 및 융합 단백질은 본 명세서에 기재된 임의의 질환, 장애 및 병태의 치료를 포함하여 이러한 분자의 사용에 대해 당업자에게 공지된 임의의 목적을 위해 사용될 수 있다. 예를 들어, 본 명세서에 제공되는 TNFR1 길항제, TNFR2 효능제, 다중특이적 TNFR1 길항제/TNFR2 효능제 작제물 및 융합 단백질은 치료, 진단, 산업 및/또는 연구 목적(들) 중 하나 이상에 사용될 수 있다. 본 명세서에 제공되는 치료 방법은 본 명세서에 제공되는 TNFR1 길항제, TNFR2 효능제, 다중특이적 TNFR1 길항제/TNFR2 효능제 작제물 및 융합 단백질의 치료 용도를 위한 방법을 포함한다. 예를 들어, 본 명세서에 기재된 TNFR1 길항제는 TNFR1을 길항하고/하거나 TNFR1에 대한 TNF의 결합을 억제하고/하거나 TNFR1을 통한 TNF 매개 염증유발 신호전달을 억제하는 데 사용될 수 있다. TNFR2 효능제는 보호/항-염증 TNFR2 신호전달을 유도하고/하거나 면역억제성 TNFR2+ 조절 T-세포(Treg)의 확대, 증식 및 활성화를 유도하기 위해 TNFR2를 효능화하는 데 사용될 수 있다. 일부 구현예에서, 본 명세서에 기재된 바와 같이, TNFR1 길항제 및 TNFR2 효능제의 조합, 또는 본 명세서에 제공된 이중특이적 TNFR1 길항제/TNFR2 효능제 작제물의 사용은 만성 염증성 및 자가면역 질환의 치료, 뿐만 아니라 신경퇴행성 및 탈수초성 질환 및 장애의 치료에 유익한 TNFR2 연관 보호 신호 및 Treg 면역억제 활성을 증가시키면서 염증유발 TNFR1 활성의 선택적 억제를 제공하면서, 염증유발 TNFR1 활성의 선택적 억제를 제공한다. The TNFR1 antagonist, TNFR2 agonist, bispecific TNFR1 antagonist/TNFR2 agonist constructs and fusion proteins provided herein are useful to those skilled in the art for the use of such molecules, including the treatment of any of the diseases, disorders and conditions described herein. It can be used for any known purpose. For example, the TNFR1 antagonist, TNFR2 agonist, multispecific TNFR1 antagonist/TNFR2 agonist constructs and fusion proteins provided herein may be used for one or more of therapeutic, diagnostic, industrial and/or research purpose(s). there is. The treatment methods provided herein include methods for therapeutic use of the TNFR1 antagonists, TNFR2 agonists, multispecific TNFR1 antagonist/TNFR2 agonist constructs and fusion proteins provided herein. For example, a TNFR1 antagonist described herein can be used to antagonize TNFR1, inhibit the binding of TNF to TNFR1, and/or inhibit TNF-mediated proinflammatory signaling through TNFR1. TNFR2 agonists can be used to induce protective/anti-inflammatory TNFR2 signaling and/or to agonize TNFR2 to induce expansion, proliferation and activation of immunosuppressive TNFR2 + regulatory T-cells (Tregs). In some embodiments, the use of a combination of a TNFR1 antagonist and a TNFR2 agonist, or a bispecific TNFR1 antagonist/TNFR2 agonist construct provided herein, as described herein, is used in the treatment of chronic inflammatory and autoimmune diseases, as well as as well as providing selective inhibition of pro-inflammatory TNFR1 activity while increasing TNFR2-associated protective signaling and Treg immunosuppressive activity beneficial for the treatment of neurodegenerative and demyelinating diseases and disorders.
본 명세서에 제공된 TNFR1 길항제, TNFR2 효능제, 다중특이적, 예컨대 이중특이적, TNFR1 길항제/TNFR2 효능제 작제물 및 융합 단백질은 단독으로 또는 다른 제제와 조합하여 치료적 활성을 가질 수 있다. 본 명세서에 제공된 TNFR1 길항제, TNFR2 효능제, 이중특이적 TNFR1 길항제/TNFR2 효능제 작제물 및 융합 단백질, 및 인코딩 핵산 분자는 만성 염증성 및 자가면역 질환 및 장애, 뿐만 아니라 신경퇴행 및 탈수초 질환 및 장애을 포함하지만 이에 제한되지 않고 항-TNF 요법 (예를 들어, 아달리무맙, 인플릭시맙, 에타네르셉트, 및 본 명세서에 기재되고/거나 당업계에 공지된 기타), 또는 다른 질환 변형 항-류마티스성 약물 (DMARD; 예를 들어, 메토트렉세이트, 하이드록시클로로퀸, 설파살라진, 레플루노마이드, 아바타셉트, 아나킨라, 리툭시맙, 토실리주맙, 토파시티닙, 및 본 명세서에 기재되고/거나 당업계에 공지된 기타)가 이용되는 임의의 병태 의 치료를 위해 사용될 수 있다. 예를 들어, 본 명세서에 제공되는 치료 분자가 투여되는 대상체는 관절, 피부, 폐 및/또는 소화관의 급성 또는 만성 염증을 나타내고/보이거나 자가면역 질환, 류마티스성 관절염 (RA), 건선, 건선성 관절염, 소아 특발성 관절염 (JIA), 척추관절염, 강직 척추염, 크론병, 궤양성 대장염, 염증성 장 질환 (IBD), 포도막염, 섬유성 질환, 자궁내막증, 루푸스, 다발성 경화증, 울혈성 심부전, 심혈관 질환, 심근경색 (MI), 죽상동맥경화증, 대사성 질환, 사이토카인 방출 증후군, 패혈성 쇼크, 패혈증, 급성 호흡 곤란 증후군 (ARDS), 중증 급성 호흡기 증후군 (SARS), COVID-19, 인플루엔자, 급성 및 만성 신경퇴행 질환, 탈수초 질환 및 장애, 뇌졸중, 알츠하이머병, 파킨슨병, 베체트병, 듀피트렌병, 종양 괴사 인자 수용체 연관 주기성 증후군 (TRAPS), 췌장염, I형 당뇨병, 만성적 폐쇄성 폐 질환 (COPD), 만성 기관지염, 폐기종, 이식 거부, 이식편대숙주 질환 (GvHD), 호흡기 질환, 폐 염증, 폐 질환 및 병태, 천식, 낭포성 섬유증, 특발성 폐 섬유증, 급성 전격성 바이러스 또는 박테리아 감염, 폐렴, TNF/TNFR1을 원인 병리 매개체로 하는 유전적 유전 질환, 주기성 발열 증후군, 및 암으로 고통받고 있다. The TNFR1 antagonists, TNFR2 agonists, multispecific, such as bispecific, TNFR1 antagonist/TNFR2 agonist constructs and fusion proteins provided herein, alone or in combination with other agents, may have therapeutic activity. The TNFR1 antagonists, TNFR2 agonists, bispecific TNFR1 antagonist/TNFR2 agonist constructs and fusion proteins, and encoding nucleic acid molecules provided herein can be used to treat chronic inflammatory and autoimmune diseases and disorders, as well as neurodegenerative and demyelinating diseases and disorders. anti-TNF therapy (e.g., adalimumab, infliximab, etanercept, and others described herein and/or known in the art), or other disease modifying anti- rheumatic drugs (DMARDs; e.g., methotrexate, hydroxychloroquine, sulfasalazine, leflunomide, abatacept, anakinra, rituximab, tocilizumab, tofacitinib, and those described herein and/or Others known in) can be used for the treatment of any condition for which it is used. For example, a subject to whom a therapeutic molecule provided herein is administered exhibits acute or chronic inflammation of the joints, skin, lungs, and/or digestive tract and/or exhibits an autoimmune disease, rheumatoid arthritis (RA), psoriasis, psoriasis. Arthritis, juvenile idiopathic arthritis (JIA), spondyloarthritis, ankylosing spondylitis, Crohn's disease, ulcerative colitis, inflammatory bowel disease (IBD), uveitis, fibrotic disease, endometriosis, lupus, multiple sclerosis, congestive heart failure, cardiovascular disease, Myocardial infarction (MI), atherosclerosis, metabolic disease, cytokine release syndrome, septic shock, sepsis, acute respiratory distress syndrome (ARDS), severe acute respiratory syndrome (SARS), COVID-19, influenza, acute and chronic neurological Degenerative diseases, demyelinating diseases and disorders, stroke, Alzheimer's disease, Parkinson's disease, Behçet's disease, Dupuytren's disease, tumor necrosis factor receptor-associated periodic syndrome (TRAPS), pancreatitis, type I diabetes, chronic obstructive pulmonary disease (COPD), chronic Bronchitis, emphysema, transplant rejection, graft-versus-host disease (GvHD), respiratory disease, lung inflammation, lung diseases and conditions, asthma, cystic fibrosis, idiopathic pulmonary fibrosis, acute fulminant viral or bacterial infection, pneumonia, TNF/TNFR1 It suffers from hereditary genetic disorders, periodic fever syndrome, and cancer as agents of the causative pathology.
본 명세서에 제공된 작제물은, 투여될 때 일반적으로 항-TNF 요법의 투여 후 관찰될 수 있는 부작용과 비교하여 감소되거나 경감된 부작용을 나타내는 대상체를 초래할 수 있다. TNFR1 길항제, TNFR2 효능제, 및 이중특이적 작제물 및 그의 융합 단백질과 같은 본 명세서에 제공된 폴리펩티드로 질환 및 병태를 치료하는 것은 주입, 피하 주사, 및 흡입, 또는 근육내, 진피내, 경구, 국소 및 경피 투여를 포함하지만 이에 제한되지 않는, 본 명세서에 기재된 바와 같은 적합한 제형을 사용하는 임의의 적합한 투여 경로에 의해 달성될 수 있다.The constructs provided herein, when administered, can generally result in a subject exhibiting reduced or lessened side effects compared to side effects that may be observed following administration of an anti-TNF therapy. Treatment of diseases and conditions with polypeptides provided herein, such as TNFR1 antagonists, TNFR2 agonists, and bispecific constructs and fusion proteins thereof, may be performed by infusion, subcutaneous injection, and inhalation, or intramuscular, intradermal, oral, topical and by any suitable route of administration using a suitable formulation as described herein, including but not limited to transdermal administration.
본 명세서의 다른 곳에서 논의된 바와 같이, 아달리무맙과 같은 기존의 항-TNF 요법은 TNFR1 및 TNFR2를 통한 TNF 신호전달의 차단으로 인해 면역억제제이며 예를 들어 패혈증 및 심각한 감염, 예컨대 리스테리아증, 결핵의 재활성화, B형/C형 간염의 재활성화, 대상포진, 및 침습성 진균의 재활성화 및 다른 기회 감염의 위험 증가를 포함하는 심한 부작용의 위험과 연관된다. 항-TNF 제제는 또한 심각한 울혈성 심부전을 악화시킬 수 있으며, 약물 유도 루푸스, 간 손상, 건선, 유육종증, 및 탈수초 중추신경계 (CNS) 질환, 및 추가 자가면역 질환 발병에 대한 감수성 증가, 뿐만 아니라 림프종 및 고체 악성종양, 예컨대 비-흑색종 피부암을 유발할 수 있다. 항-TNF 제제에 따라, 치료된 환자의 약 3-33%가 치료에 반응하지 않고, 최대 46%가 반응을 중단하여 치료를 중단하거나 용량을 증가시킨다. 항-TNF 요법은 TNF의 과발현과 연관된 알츠하이머병, 파킨슨병, 뇌졸중 및 다발성 경화증(MS)과 같은 신경퇴행 질환 및 CNS 병태의 치료에 실패하였다. 항-TNF 제제 사용과 연관된 부작용, 일부 환자의 무반응, 초기 반응이 있었던 환자의 지속적인 반응 부족, 신경퇴행 질환, 예컨대 MS의 치료 실패 및/또는 악화로 인해, 다른 요법이 필요하다. 이러한 요법이 본 명세서에 제공된다.As discussed elsewhere herein, existing anti-TNF therapies, such as adalimumab, are immunosuppressive due to blockade of TNF signaling through TNFR1 and TNFR2 and are effective against, for example, sepsis and serious infections such as listeriosis, Reactivation of tuberculosis, reactivation of hepatitis B/C, herpes zoster, and reactivation of invasive fungi and increased risk of other opportunistic infections. Anti-TNF agents can also aggravate severe congestive heart failure, increase susceptibility to drug-induced lupus, liver damage, psoriasis, sarcoidosis, and demyelinated central nervous system (CNS) disease, and further development of autoimmune diseases, as well as lymphoma and solid malignancies, such as non-melanoma skin cancer. Depending on the anti-TNF agent, approximately 3-33% of treated patients do not respond to treatment, and up to 46% stop responding, leading to discontinuation of treatment or dose increase. Anti-TNF therapy has failed to treat neurodegenerative diseases and CNS conditions such as Alzheimer's disease, Parkinson's disease, stroke and multiple sclerosis (MS) associated with overexpression of TNF. Due to side effects associated with the use of anti-TNF agents, non-response in some patients, continued lack of response in patients who had an initial response, treatment failure and/or worsening of a neurodegenerative disease such as MS, other therapies are needed. Such therapies are provided herein.
본 명세서에 기재된 바와 같이, TNFR1의 선택적 억제는 TNFR2 신호전달의 강력한 항-염증 및 보호 활성을 유지하고, 기회 감염 및 암을 감소시키고, TNF 유도 Treg 기능을 보존한다. 이전의 선택적 TNFR1 길항제는 항-약물 항체(ADA)의 형성을 포함하는 면역원성, 예를 들어 짧은 혈청 반감기, 빠른 신장 청소능 및/또는 불량한 결합 친화도 및 효능을 포함하는 불량한 약동학 및 약력학을 겪는다. 본 명세서에 제공되는 요법은 이전의 선택적 TNFR1 길항제와 연관된 한계를 극복한다. TNFR1 길항제와 같은 본 명세서에 제공된 폴리펩티드를 사용한 치료적 개선의 예는 더 낮은 복용량, 더 적은 및/또는 더 적은 빈도의 투여, 감소된 부작용 및 증가된 치료 효과를 포함하지만 이에 제한되지 않는다. As described herein, selective inhibition of TNFR1 retains the potent anti-inflammatory and protective activity of TNFR2 signaling, reduces opportunistic infections and cancers, and preserves TNF-induced Treg function. Previous selective TNFR1 antagonists suffer from immunogenicity including formation of anti-drug antibodies (ADA), e.g., short serum half-life, rapid renal clearance, and/or poor pharmacokinetics and pharmacodynamics, including poor binding affinity and potency. . The therapies provided herein overcome limitations previously associated with selective TNFR1 antagonists. Examples of therapeutic improvements using polypeptides provided herein, such as TNFR1 antagonists, include, but are not limited to, lower dosages, lower and/or less frequent administration, reduced side effects, and increased therapeutic effect.
따라서, 본 명세서에 제공되는 선택적 TNFR1 길항제, TNFR2 효능제, 및 다중특이적, 예컨대 이중특이적 TNFR1 길항제/TNFR2 효능제 작제물, 및 융합 단백질은 감소된 부작용과 연관되며, 필요한 경우 더 높은 투약 레지멘으로 사용될 수 있고, 개선된 효능 및 안전성을 가질 수 있다. 기존의 항-TNF 치료제, 예컨대 아달리무맙 및 본 명세서에 기재되고/되거나 당업계에 공지된 다른 것들에 의해 관찰되는 것과 비교하여 감소, 경감 또는 제거될 수 있는 부작용에는 본 명세서에 기재되거나 당업계에 공지된 임의의 바람직하지 않은 비-치료적 효과, 예컨대, 패혈증, 심각한 감염, 울혈성 심부전/심장독성, 항체 생성, 암, 자가면역 질환 및/또는 탈수초 중추신경계(CNS) 질환의 발생 또는 악화로 제한되지 않는 것이 포함된다. 일부 예에서, 기존의 항-TNF 치료제, 예컨대 아달리무맙의 투여에 의해 야기되는 부작용과 비교하여, 본 명세서에 제공된 TNFR1 길항제, 이중특이적 작제물 또는 융합 단백질의 투여는 항-TNF 요법의 하나 이상의 부작용의 중증도에 비해 하나 이상의 부작용의 중증도를 적어도 또는 약 99%, 적어도 또는 약 95%, 적어도 또는 약 90%, 적어도 또는 약 85%, 적어도 또는 약 80%, 적어도 또는 약 75%, 적어도 또는 약 70%, 적어도 또는 약 65%, 적어도 또는 약 60%, 적어도 또는 약 55%, 적어도 또는 약 50%, 적어도 또는 약 45%, 적어도 또는 약 40%, 적어도 또는 약 35%, 적어도 또는 약 30%, 적어도 또는 약 25%, 적어도 또는 약 20%, 적어도 또는 약 15%, 또는 적어도 또는 약 10%까지 감소시킨다. Thus, the selective TNFR1 antagonists, TNFR2 agonists, and multispecific, such as bispecific TNFR1 antagonist/TNFR2 agonist constructs, and fusion proteins provided herein are associated with reduced side effects and, if desired, higher dosing regimens. It can be used as a men, and can have improved efficacy and safety. Side effects that may be reduced, mitigated, or eliminated compared to those observed with existing anti-TNF therapeutics, such as adalimumab and others described herein and/or known in the art, include those described herein or known in the art. development of any undesirable non-therapeutic effect known to, such as sepsis, serious infection, congestive heart failure/cardiotoxicity, antibody production, cancer, autoimmune disease and/or demyelinated central nervous system (CNS) disease; including but not limited to deterioration. In some instances, compared to side effects caused by administration of existing anti-TNF therapeutics, such as adalimumab, administration of a TNFR1 antagonist, bispecific construct or fusion protein provided herein is one of the anti-TNF therapies. At least or about 99%, at least or about 95%, at least or about 90%, at least or about 85%, at least or about 80%, at least or about 75%, at least or about 75%, at least or about 90% About 70%, at least or about 65%, at least or about 60%, at least or about 55%, at least or about 50%, at least or about 45%, at least or about 40%, at least or about 35%, at least or about 30% %, at least or about 25%, at least or about 20%, at least or about 15%, or at least or about 10%.
복용량 수준 및 레지멘은 공지된 복용량 및 레지멘에 기초하여 결정될 수 있고, 필요한 경우 본 명세서에 제공된 폴리펩티드 및 작제물의 특성 변화에 기초하여 외삽될 수 있고/있거나 다양한 인자에 기초하여 경험적으로 결정될 수 있다. 이러한 요인은 예를 들어 개체의 체중뿐만 아니라 일반적인 건강, 연령, 성별 및 식이, 사용된 특정 화합물의 활성, 투여 시간, 배출 속도, 약물 조합, 질환의 중증도 및 과정, 질환에 대한 환자의 성향 및 치료하는 의사의 판단을 포함한다. 활성 성분은 전형적으로 약제학적으로 유효한 담체와 조합된다. 단일 복용 형태 또는 다중 복용 형태를 생성하기 위해 담체 물질과 조합될 수 있는 활성 성분의 양은 치료되는 숙주 및 특정 투여 방식에 따라 달라질 수 있다. Dosage levels and regimens can be determined based on known dosages and regimens, extrapolated, if necessary, based on variations in the properties of the polypeptides and constructs provided herein, and/or determined empirically based on a variety of factors. there is. These factors include, for example, the body weight of the individual as well as general health, age, sex and diet, activity of the specific compound used, time of administration, rate of excretion, drug combination, severity and course of the disease, the patient's propensity for the disease and treatment. including the physician's judgment. The active ingredient is typically combined with a pharmaceutically effective carrier. The amount of active ingredient that can be combined with the carrier material to produce a single dosage form or multiple dosage form can vary depending on the host being treated and the particular mode of administration.
환자의 상태가 개선되면, 필요하다면 유지 용량의 화합물 또는 조성물이 투여될 수 있고; 복용량, 복용 형태, 또는 투여 빈도, 또는 이들의 조합이 변경될 수 있다. 일부 경우에, 대상체는 질환 증상의 임의의 재발에 따라 또는 예정된 복용량에 기초하여 장기간에 걸쳐 간헐적 치료를 필요로 할 수 있다.When the patient's condition improves, a maintenance dose of the compound or composition may be administered, if necessary; The dosage, dosage form, or frequency of administration, or combinations thereof may be varied. In some cases, a subject may require intermittent treatment over an extended period of time following any recurrence of disease symptoms or based on a predetermined dosage.
이 섹션은 본 명세서에 제공된 폴리펩티드 및 인코딩 핵산 분자를 포함하는 작제물에 대한 예시적인 용도 및 투여 방법을 제공한다. 이들 기재된 요법은 단지 예시일 뿐이며 본 명세서에 제공된 분자/작제물의 적용을 제한하지 않는다. 본 명세서에 제공된 TNFR1 길항제, TNFR2 효능제, 이중특이적 TNFR1 길항제/TNFR2 효능제 작제물, 및 융합 단백질, 뿐만 아니라 인코딩 핵산 분자를 사용하여 치료할 수 있는 질환 또는 병태를 확인하는 것은 치료하는 의사의 기술 내에 있다. This section provides exemplary uses and methods of administration for constructs comprising the polypeptides and encoding nucleic acid molecules provided herein. These described regimens are exemplary only and do not limit the application of the molecules/constructs provided herein. Identifying a disease or condition that can be treated using the TNFR1 antagonists, TNFR2 agonists, bispecific TNFR1 antagonist/TNFR2 agonist constructs, and fusion proteins, as well as encoding nucleic acid molecules, provided herein is a skill of the treating physician. is within
1. 만성 염증/자가면역 질환 및 장애의 치료1. Treatment of chronic inflammatory/autoimmune diseases and disorders
본 명세서에 기재된 바와 같이, TNF의 상승된 수준 또는 제어되지 않은 발현 및 TNF 신호전달의 탈조절은 만성 염증을 유발할 수 있으며, 이는 자가면역 질환 및 조직 손상의 발병을 초래할 수 있다. TNFR1을 통한 TNF 신호전달은 주로 염증유발이며 만성 염증성 및 자가면역 질환 및 장애의 발병을 유도한다. 예를 들어, TNFR1 신호전달은 특히 관절염, 염증성 장 질환(IBD) 및 호흡기 질환의 발병과 연관이 있을 뿐만 아니라 심부전 및 심근경색의 TNF 유도 모델에서 국부적 뼈 파괴 및 심장 독성 효과를 초래하는 파골세포의 생성과 연관이 있다. 따라서, TNFR1의 선택적 차단은 만성 염증성 및 자가면역 질환 및 병태의 치료에 유용하다. 주로 항-염증제인 TNFR2를 통한 TNF 신호전달은 신경, 심장, 소화관 및 골 보호 효과와 연관이 있다. TNFR2 신호전달의 항-염증 및 보호 효과는 예를 들어, 실험 결장염, 심부전/심장 질환, 심근경색, 염증성 관절염, 감염성 질환, 췌장 재생, 줄기 세포 증식, 자가반응성 T-세포의 파괴, 및 골량을 유지하고 관절 염증 및 미란성 파괴로부터 보호하기 위한 파골세포생성의 조절에서 입증되었다. TNFR2 효능작용은 또한 면역억제성 TNFR2+ Treg의 증식 및 확대를 초래하고, Treg 세포 억제 활성을 촉진하여 자가반응성/이펙터 T-세포를 제거하고, 조직 파괴를 방지하고, 염증성 및 자가면역 질환 및 병태를 억제한다. 따라서, TNFR2 효능작용은 또한 만성 염증성 및 자가면역 질환 및 병태의 증상을 치료하거나 완화시키는데 사용될 수 있다.As described herein, elevated levels or uncontrolled expression of TNF and deregulation of TNF signaling can lead to chronic inflammation, which can lead to the development of autoimmune diseases and tissue damage. TNF signaling through TNFR1 is primarily proinflammatory and leads to the development of chronic inflammatory and autoimmune diseases and disorders. For example, TNFR1 signaling is specifically associated with the pathogenesis of arthritis, inflammatory bowel disease (IBD), and respiratory diseases, as well as the development of osteoclasts leading to localized bone destruction and cardiotoxic effects in TNF-induced models of heart failure and myocardial infarction. related to creation. Thus, selective blockade of TNFR1 is useful for the treatment of chronic inflammatory and autoimmune diseases and conditions. TNF signaling, mainly through the anti-inflammatory agent TNFR2, is associated with neurological, cardiac, digestive and bone protective effects. The anti-inflammatory and protective effects of TNFR2 signaling include, for example, experimental colitis, heart failure/heart disease, myocardial infarction, inflammatory arthritis, infectious diseases, pancreatic regeneration, stem cell proliferation, destruction of autoreactive T-cells, and bone mass. It has been demonstrated in the regulation of osteoclastogenesis to maintain and protect against joint inflammation and erosive destruction. TNFR2 agonism also results in proliferation and expansion of immunosuppressive TNFR2 + Tregs, promotes Treg cell suppressive activity to eliminate autoreactive/effector T-cells, prevents tissue destruction, and prevents inflammatory and autoimmune diseases and conditions suppress Thus, TNFR2 agonism can also be used to treat or alleviate the symptoms of chronic inflammatory and autoimmune diseases and conditions.
본 명세서에 제공된 TNFR1 길항제, TNFR2 효능제, 다중특이적 TNFR1 길항제/TNFR2 효능제 작제물, 융합 단백질, 및 인코딩 핵산은 상승된 TNF 수준 및 탈조절된 TNF 신호전달과 연관된 자가면역/염증성 질환 및 장애의 증상을 치료하거나 완화하는 데 사용될 수 있다. 본 명세서에 제공되는 작제물, 융합 단백질 및 핵산은 예를 들어, 특히 관절염 (예를 들어, 류마티스성 관절염, 건선성 관절염, 소아 특발성 관절염, 척추관절염), 염증성 장 질환 (예를 들어, 크론병 및 궤양성 대장염), 포도막염, 섬유성 질환 (예를 들어, 듀피트렌병), 베체트병, 자궁내막증, 루푸스, 강직 척추염, 건선, 종양 괴사 인자 수용체 연관 주기성 증후군 (TRAPS), 심혈관 질환, 울혈성 심부전, 심근경색 (MI), 죽상동맥경화증, 호흡기 질환, 천식, 낭포성 섬유증, 만성적 폐쇄성 폐 질환 (COPD), 췌장염, I형 당뇨병, 대사성 질환, 사이토카인 방출 증후군, 패혈성 쇼크, 패혈증, 급성 호흡 곤란 증후군 (ARDS), 중증 급성 호흡기 증후군 (SARS), COVID-19, 인플루엔자, 만성 기관지염, 폐기종, 폐 염증, 특발성 폐 섬유증, 이식 거부, 이식편대숙주 질환 (GvHD), 급성 전격성 바이러스 또는 박테리아 감염, 폐렴, TNF/TNFR1을 원인 병리 매개체로 하는 유전적 유전 질환, 및 주기성 발열 증후군을 포함하지만 이에 제한되지 않는 질환, 장애, 및 병태를 치료하는 데 사용될 수 있다. The TNFR1 antagonists, TNFR2 agonists, multispecific TNFR1 antagonist/TNFR2 agonist constructs, fusion proteins, and encoding nucleic acids provided herein can be used to treat autoimmune/inflammatory diseases and disorders associated with elevated TNF levels and deregulated TNF signaling. It can be used to treat or alleviate the symptoms of Constructs, fusion proteins and nucleic acids provided herein may be used for, for example, arthritis (e.g., rheumatoid arthritis, psoriatic arthritis, juvenile idiopathic arthritis, spondyloarthritis), inflammatory bowel disease (e.g., Crohn's disease), among others. and ulcerative colitis), uveitis, fibrotic disease (eg, Dupuytren's disease), Behcet's disease, endometriosis, lupus, ankylosing spondylitis, psoriasis, tumor necrosis factor receptor associated periodic syndrome (TRAPS), cardiovascular disease, congestive Heart Failure, Myocardial Infarction (MI), Atherosclerosis, Respiratory Disease, Asthma, Cystic Fibrosis, Chronic Obstructive Pulmonary Disease (COPD), Pancreatitis, Type I Diabetes, Metabolic Disease, Cytokine Release Syndrome, Septic Shock, Sepsis, Acute Respiratory distress syndrome (ARDS), severe acute respiratory syndrome (SARS), COVID-19, influenza, chronic bronchitis, emphysema, lung inflammation, idiopathic pulmonary fibrosis, transplant rejection, graft-versus-host disease (GvHD), acute fulminant virus or bacteria infections, pneumonia, hereditary genetic diseases with TNF/TNFR1 as a causative pathological agent, and periodic fever syndrome.
TNF 차단은 또한 SARS 바이러스 및 감염 COVID-19와 같은 일부 바이러스 감염에서 관찰되는 사이토카인 폭풍을 감소시킬 수 있다. 이를 통해 SARS-CoV-2 및 다른 SARS 바이러스/코로나바이러스로 인한 것과 같은 중증 급성 호흡기 증후군(SARS) 환자의 벤틸레이터(ventilator) 의존성, 다기관 손상 및 사망을 예방할 수 있다. TNF 유발 바이러스 증후군(TIVS)은 폐 손상뿐만 아니라 다발성 장기 부전도 수반하는 TNF 유발 사이토카인 폭풍에 의해 유발된다. TIVS는 SIRS(중증 염증성 호흡기 증후군), SARS(중증 급성 호흡기 증후군) 및 패혈증(세균에 의해 유발됨)과 유사한다. 이러한 병태는 폐 기능뿐만 아니라 다른 많은 기관에도 영향을 미친다. 중증 급성 호흡기 증후군 코로나바이러스-2(COVID-19를 유발하는 SARS-CoV-2)는 폐의 유형 II 계면활성제 분비 폐포 세포에서 발현되는 안지오텐신 전환효소를 통해 숙주 세포에 접근한다. 중증 COVID-19는 호중구, 림프구, 대식세포 및 면역 매개체가 풍부한 주요 면역 염증 반응과 연관이 있다. COVID-19로 인한 사망은 주로 폐 부종, 하이알린 막 형성, 초기 성인 호흡 곤란 증후군(ARDS)과 호환되는 간질 단핵 염증 침윤을 동반한 미만성 폐포 손상으로 인해 발생한다. TNF는 COVID-19 환자의 혈액 및 질환 조직에 존재하고; TNF는 거의 모든 급성 염증 반응에 관여하며 염증을 증폭시키는 역할을 한다. 따라서, 본 명세서의 작제물을 이용한 치료가 제공된다. TNF blockade can also reduce the cytokine storm observed in some viral infections, such as the SARS virus and the infectious COVID-19. This could prevent ventilator dependence, multi-organ damage and death in patients with severe acute respiratory syndrome (SARS), such as those caused by SARS-CoV-2 and other SARS viruses/coronaviruses. TNF-induced viral syndrome (TIVS) is caused by a TNF-induced cytokine storm that is accompanied by lung damage as well as multiple organ failure. TIVS is similar to SIRS (severe inflammatory respiratory syndrome), SARS (severe acute respiratory syndrome) and sepsis (caused by bacteria). These conditions affect lung function as well as many other organs. Severe acute respiratory syndrome coronavirus-2 (SARS-CoV-2, which causes COVID-19) gains access to host cells through angiotensin-converting enzyme expressed in type II surfactant-secreting alveolar cells of the lung. Severe COVID-19 is associated with a major immune inflammatory response enriched in neutrophils, lymphocytes, macrophages, and immune mediators. Deaths from COVID-19 are primarily due to diffuse alveolar damage with pulmonary edema, hyaline membrane formation, and interstitial mononuclear inflammatory infiltrates compatible with early adult respiratory distress syndrome (ARDS). TNF is present in the blood and diseased tissue of patients with COVID-19; TNF is involved in almost all acute inflammatory reactions and plays a role in amplifying inflammation. Accordingly, treatment using the constructs herein is provided.
2. 신경퇴행 및 탈수초 질환 및 장애의 치료2. Treatment of neurodegenerative and demyelinating diseases and disorders
본 명세서의 다른 곳에서 논의된 바와 같이, 몇몇 신경퇴행 및 탈수초 질환 및 병태는 중추신경계(CNS)에서 만성적으로 상승된 TNF 수준과 연관이 있다. 상승된 수준의 TNF 및 TNFR1을 통한 TNF 신호전달은 신경염증을 시작 및 유지하고 신경 세포자멸, 탈수초화 및 인지력 감퇴를 촉진하는 것과 관련이 있다. 예를 들어, 알츠하이머병(AD) 환자에서, TNF는 소교세포 활성화, 시냅스 기능장애, 신경 세포자멸, 플라크 및 엉킴의 축적을 촉진하고, TNF 수준 상승은 소교세포에 의한 효율적인 플라크 제거를 방해하는 AD 환자의 뇌에서 아밀로이드 베타(Aβ)의 식균작용을 억제한다. 파킨슨병(PD) 환자의 경우, TNF 수준이 높아지면 신경염증 및 도파민 신경 독성이 발생한다. TNFR1을 인코딩하는 유전자의 다형성뿐만 아니라 TNF 수준의 상승은 탈수초화 및 다발성 경화증(MS)과 같은 탈수초 장애의 발병과 관련이 있다. 따라서 TNFR1을 통한 TNF 신호전달의 선택적 차단은 신경퇴행 및 탈수초 질환 및 장애, 및 CNS의 다른 병태의 치료 또는 완화에 사용될 수 있다. As discussed elsewhere herein, several neurodegenerative and demyelinating diseases and conditions are associated with chronically elevated TNF levels in the central nervous system (CNS). Elevated levels of TNF and TNF signaling through TNFR1 have been implicated in initiating and sustaining neuroinflammation and promoting neuronal apoptosis, demyelination and cognitive decline. For example, in patients with Alzheimer's disease (AD), TNF promotes microglia activation, synaptic dysfunction, neuronal apoptosis, and accumulation of plaques and tangles, and elevated TNF levels prevent AD from preventing efficient plaque clearance by microglia. It inhibits the phagocytosis of amyloid beta (Aβ) in the patient's brain. In patients with Parkinson's disease (PD), elevated TNF levels result in neuroinflammation and dopamine neurotoxicity. Polymorphisms in the gene encoding TNFR1 as well as elevated levels of TNF are associated with demyelination and the development of demyelinating disorders such as multiple sclerosis (MS). Thus, selective blockade of TNF signaling through TNFR1 can be used for the treatment or alleviation of neurodegenerative and demyelinating diseases and disorders, and other conditions of the CNS.
TNFR2를 통한 TNF 신호전달은 항-염증 및 신경 보호 효과와 연관이 있다. 예를 들어, TNF에 의한 TNFR2의 활성화는 발작을 억제하고, 뇌 손상 후 인지 기능장애를 약화시키며, 재수초화 및 뉴런의 생존을 촉진한다. TNFR2 효능작용에 따른 면역억제 Treg의 증식, 확대 및 활성화는 또한 신경보호 효과가 있다. 예를 들어, TNFR2 신호전달은 염증성 CNS 탈수초 질환, 예컨대 다발성 경화증의 동물 모델인 실험적 자가면역 뇌척수염(EAE)에서 Treg 세포 확장 및 억제 활성을 촉진한다. 따라서, TNFR2 효능작용은 또한 신경퇴행 및 탈수초 질환 및 장애, 및 CNS의 다른 병태의 치료 또는 완화에 사용될 수 있다. TNF signaling through TNFR2 is associated with anti-inflammatory and neuroprotective effects. For example, activation of TNFR2 by TNF suppresses seizures, attenuates cognitive dysfunction after brain injury, and promotes remyelination and survival of neurons. Proliferation, expansion and activation of immunosuppressive Tregs following TNFR2 agonism also have neuroprotective effects. For example, TNFR2 signaling promotes Treg cell expansion and suppressive activity in inflammatory CNS demyelinating diseases such as experimental autoimmune encephalomyelitis (EAE), an animal model of multiple sclerosis. Thus, TNFR2 agonism may also be used for the treatment or amelioration of neurodegenerative and demyelinating diseases and disorders, and other conditions of the CNS.
본 명세서에 제공된 TNFR1 길항제 작제물, TNFR2 효능제 작제물, 다중특이적, 예컨대 이중특이적, TNFR1 길항제/TNFR2 효능제 작제물, 융합 단백질, 및 핵산은 알츠하이머병, 파킨슨병, 다발성 경화증, 및 뇌졸중을 포함하지만 이에 제한되지 않는 신경퇴행 및 탈수초 질환, 및 다른 CNS 장애 및 병태의 증상을 치료하거나 완화시키기 위해 사용될 수 있다. The TNFR1 antagonist constructs, TNFR2 agonist constructs, multispecific, such as bispecific, TNFR1 antagonist/TNFR2 agonist constructs, fusion proteins, and nucleic acids provided herein are useful in Alzheimer's disease, Parkinson's disease, multiple sclerosis, and stroke. It can be used to treat or alleviate the symptoms of neurodegenerative and demyelinating diseases, including but not limited to, and other CNS disorders and conditions.
3. 암 및 다른 면역억제 질환, 장애 및 병태의 치료3. Treatment of cancer and other immunosuppressive diseases, disorders and conditions
본 명세서에 기재된 바와 같이, 종양은 많은 수의 면역억제성 TNFR2+ Treg에 의해 침윤되어 종양 사멸 CD8+ 세포독성 T 림프구(CTL)(이펙터 T-세포(Teffs)라고도 함)의 증식을 방지하여 종양 성장을 허용한다. 종양 미세환경(TME)에서 림프구에 대한 TNFR2의 길항작용은 Treg를 제거하고 이펙터 T-세포의 활성화 및 확대를 허용함으로써 두 가지 유형의 T-세포 사이의 균형을 회복시켜 종양 세포 용해를 초래한다 (예를 들어, 문헌[Vanamee 등 (2017) Trends in Molecular Medicine 23(11):P1037-P1046] 참조). As described herein, tumors are infiltrated by large numbers of immunosuppressive TNFR2 + Tregs, preventing the proliferation of tumor-killing CD8 + cytotoxic T lymphocytes (CTLs) (also referred to as effector T-cells (Teffs)), resulting in tumor suppression. allow for growth Antagonism of TNFR2 on lymphocytes in the tumor microenvironment (TME) restores the balance between the two types of T-cells by eliminating Tregs and allowing the activation and expansion of effector T-cells, resulting in tumor cell lysis ( See, eg, Vanamee et al. (2017) Trends in Molecular Medicine 23(11):P1037-P1046).
TNFR2는 예를 들어 신장 세포 암종, 결장암, 호지킨 림프종, 다발성 골수종, 피부 비-호지킨 림프종 및 난소암을 포함하는 많은 유형의 인간 암 세포의 표면에서 풍부하게 발현된다. 암에서 TNFR2 돌연변이는 유전자 복제 및 구성적 활성화와 연관이 있다. 뮤린 골수 유래 억제 세포(MDSC)는 또한 TNFR2를 발현하며, 그 억제는 뮤린 간암 모델에서 전이를 조절하는 것으로 나타났다. 또한, 면역 관문 억제제는 종양 침윤 Treg에서 TNFR2의 상향 조절을 일으켜 종양 면역 회피 및 약물 내성을 유도한다. 모든 환자가 면역 관문 억제제 요법에 반응하는 것은 아니며, 환자는 재발할 수 있고 심각한 자가면역 부작용이 관문 억제제 요법에서 관찰되었다 (예를 들어, 문헌[Vanamee 등 (2017) Trends in Molecular Medicine 23(11):P1037-P1046] 참조). 따라서, TNFR2의 차단은 이펙터 T-세포의 증식을 가능하게 하는 면역억제성 Treg의 억제를 통해 종양 세포를 직접 죽이고 전이의 형성을 예방할 수 있는 MDSC의 억제에 의해 특정 유형의 암 치료에 사용될 수 있다. TNFR2는 또한 정상 조직(특히 대식세포; 예를 들어, proteinatlas.org/ensg00000028137-tnfrsf1b/tissue 참조)에서 발현되기 때문에, TNFR2 길항제는 ADCC 활성을 갖지 않지만 FcRn 활성 (또는 향상된 FcRn 활성)을 갖는다. 본 명세서에 기재된 바와 같이 치료를 받기 위해서는 환자의 종양이 인접한 정상 조직보다 상당히 높은 수준의 TNFR2를 가져야 하기 때문에 투여는 개인화된다. 이를 위해, TNFR2 길항제는 다른 요법, 특히 그렇지 않으면 종양에 조절 T-세포의 축적을 유발하는 면역 조절 치료법과 함께 사용될 것이다.TNFR2 is abundantly expressed on the surface of many types of human cancer cells, including, for example, renal cell carcinoma, colon cancer, Hodgkin's lymphoma, multiple myeloma, cutaneous non-Hodgkin's lymphoma, and ovarian cancer. TNFR2 mutations in cancer are associated with gene duplication and constitutive activation. Murine bone marrow-derived suppressor cells (MDSC) also express TNFR2, and its suppression has been shown to regulate metastasis in a murine liver cancer model. In addition, immune checkpoint inhibitors cause upregulation of TNFR2 in tumor-infiltrating Tregs, leading to tumor immune evasion and drug resistance. Not all patients respond to checkpoint inhibitor therapy, patients can relapse and severe autoimmune side effects have been observed with checkpoint inhibitor therapy (see, e.g., Vanamee et al. (2017) Trends in Molecular Medicine 23(11):P1037-P1046). Thus, blockade of TNFR2 can be used in the treatment of certain types of cancer by inhibiting MDSCs, which can directly kill tumor cells and prevent the formation of metastases, through suppression of immunosuppressive Tregs, which enable the proliferation of effector T-cells. . Since TNFR2 is also expressed in normal tissues (particularly macrophages; see eg proteinatlas.org/ensg00000028137-tnfrsf1b/tissue), TNFR2 antagonists do not have ADCC activity but have FcRn activity (or enhanced FcRn activity). Dosing is individualized because a patient's tumor must have significantly higher levels of TNFR2 than adjacent normal tissue in order to receive treatment as described herein. To this end, TNFR2 antagonists will be used in conjunction with other therapies, particularly immunomodulatory therapies that otherwise result in the accumulation of regulatory T-cells in the tumor.
따라서 본 명세서에 제공된 TNFR2 효능제, 이중특이적 TNFR1 길항제/TNFR2 효능제 작제물 및 융합 단백질은 고형 암, 혈액학적 악성종양, 및 예를 들어, 신장 세포 암종, 결장암, 호지킨 림프종, 다발성 골수종, 피부 비-호지킨 림프종, 및 난소암을 포함하지만 이에 제한되지 않는 다른 과증식성 질환 및 장애의 치료에 사용될 수 있다.Thus, the TNFR2 agonist, bispecific TNFR1 antagonist/TNFR2 agonist constructs and fusion proteins provided herein are useful for treating solid cancers, hematological malignancies, and, for example, renal cell carcinoma, colon cancer, Hodgkin's lymphoma, multiple myeloma, cutaneous non-Hodgkin's lymphoma, and other hyperproliferative diseases and disorders including, but not limited to, ovarian cancer.
4. 병용 요법 4. Combination therapy
병용 요법은 방사선 및 수술을 포함하는 또 다른 제제 또는 치료와 조합하여 본 명세서에 제공된 TNFR1 길항제 작제물, TNFR2 효능제 작제물, 다중특이적, 예컨대 이중특이적, TNFR1 길항제/TNFR2 효능제 작제물, 융합 단백질, 및 핵산의 투여를 포함한다. 추가 제제 또는 요법은 본 명세서에 제공된 치료와 동시에, 전, 후 또는 간헐적으로 투여될 수 있다. 그들은 별도의 조성물 또는 공-제형에 있을 수 있다.Combination therapies include TNFR1 antagonist constructs, TNFR2 agonist constructs, multispecific, such as bispecific, TNFR1 antagonist/TNFR2 agonist constructs provided herein in combination with another agent or treatment including radiation and surgery; fusion proteins, and administration of nucleic acids. Additional agents or therapies may be administered concurrently, before, after, or intermittently with the treatments provided herein. They may be in separate compositions or co-formulations.
본 명세서에 제공된 TNFR1 길항제 작제물, TNFR2 효능제 작제물, 다중특이적, 예컨대 이중특이적, TNFR1 길항제/TNFR2 효능제 작제물, 융합 단백질, 및 핵산은 길항제/차단제, 항체, 세포독성제, 항-염증제, 사이토카인, 성장 인자, 성장 억제제, 심장보호제, 면역억제제, 화학요법제, 생물학적 또는 비-생물학적 질환 변형 항-류마티스성 약물 (DMARD), 감염성 질환을 위한 치료제 (항체 포함), 또는 다른 치료제를 포함하지만 이에 제한되지 않는 하나 이상의 다른 치료적 레지멘 또는 제제 전에, 후에 그와 간헌적으로, 또는 그에 부수적으로 투여될 수 있다. 본 명세서에 제공된 TNFR1 길항제 작제물, TNFR2 효능제 작제물, 다중특이적, 예컨대 이중특이적, TNFR1 길항제/TNFR2 효능제 작제물, 및 핵산은 1차 치료로서 또는 항-TNF 치료제가 급성 또는 만성 치료로서 효과적이지 않은 2차 요법으로서 환자에게 투여될 수 있다. 본 명세서의 병용 요법에 사용될 수 있는 예시적인 항-TNF 요법은 예를 들어, 종래의 합성 DMARD, 예를 들어 (일반명 및 예시적인 상표명): 메토트렉세이트 (MTX), 하이드록시클로로퀸 (HCQ; Plaquenil®), 설파살라진 (Azulfidine®), 및 레플루노마이드 (Arava®); 생물학적 DMARD, 예를 들어, 아바타셉트 (Orencia®), 아나킨라 (Kineret®), 리툭시맙 (Rituxan®, Truxima®, MabThera®), 토실리주맙 (아틀리주맙, Actemra®, RoActemra®), 코르티코스테로이드 (예를 들어, 덱사메타손, 메틸프레드니솔론, 프레드니솔론, 프레드니손, 또는 트리암시놀론), 토파시티닙 (Xeljanz®), 및 TNF-억제제/항-TNF 제제, 예를 들어, 세르톨리주맙 페골 (Cimzia®), 인플릭시맙 (Remicade®), 아달리무맙 (Humira®), 골리무맙 (Simponi®), 및 에타네르셉트 (Enbrel®)을 포함한다. 병용 요법은 또한 면역치료 약물, 예를 들어, 사이클로스포린, 메토트렉세이트, 아드리아마이신 또는 시스플라티넘, 및 면역독소를 포함할 수 있다.The TNFR1 antagonist constructs, TNFR2 agonist constructs, multispecific, such as bispecific, TNFR1 antagonist/TNFR2 agonist constructs, fusion proteins, and nucleic acids provided herein are antagonist/blockers, antibodies, cytotoxic agents, anti -Inflammatory agents, cytokines, growth factors, growth inhibitory agents, cardioprotective agents, immunosuppressive agents, chemotherapeutic agents, biological or non-biological disease modifying anti-rheumatic drugs (DMARDs), therapeutic agents (including antibodies) for infectious diseases, or other It may be administered before, after, or concomitantly with one or more other therapeutic regimens or agents, including but not limited to therapeutic agents. The TNFR1 antagonist constructs, TNFR2 agonist constructs, multispecific, such as bispecific, TNFR1 antagonist/TNFR2 agonist constructs, and nucleic acids provided herein may be used as a first-line treatment or as an anti-TNF therapeutic in acute or chronic treatment It can be administered to patients as a second-line therapy that is not as effective as a second-line therapy. Exemplary anti-TNF therapies that can be used in combination therapy herein include, for example, conventional synthetic DMARDs such as (generic and exemplary trade names): methotrexate (MTX), hydroxychloroquine (HCQ; Plaquenil ® ), sulfasalazine ( Azulfidine® ), and leflunomide ( Arava® ); Biological DMARDs such as abatacept ( Orencia® ), anakinra ( Kineret® ), rituximab ( Rituxan® , Truxima® , MabThera® ), tocilizumab (atlizumab, Actemra® , RoActemra® ), corticosteroids steroids (e.g. dexamethasone, methylprednisolone, prednisolone, prednisone, or triamcinolone), tofacitinib ( Xeljanz® ), and TNF-inhibitor/anti-TNF agents such as certolizumab pegol ( Cimzia® ); infliximab ( Remicade® ), adalimumab ( Humira® ), golimumab ( Simponi® ), and etanercept ( Enbrel® ). Combination therapy may also include an immunotherapeutic drug such as cyclosporine, methotrexate, adriamycin or cisplatinum, and an immunotoxin.
병용 요법에 유용한 항-염증 약물 및 제제의 예는 살리실레이트를 포함하는 비-스테로이드성 항-염증성 약물 (NSAID), 예컨대 아스피린, 기존의 NSAID, 예컨대 이부프로펜, 나프록센, 케트로프로펜, 나부메톤, 피록시캄, 디클로페낙, 또는 인도메타신, 및 Cox-2 선택적 억제제, 예컨대 셀레콕십 (상표명 Celebrex®로 시판됨), 또는 로테콕신 (상표명 Vioxx®로 시판됨)를 포함한다. 병용 요법에 유용한 다른 화합물은 항대사물질, 예컨대 메토트렉세이트 및 레플루노마이드; 코르티코스테로이드 또는 다른 스테로이드, 예컨대 코르티손, 덱사메타손, 또는 프레드니손; 진통제, 예컨대 아세트아미노펜; 아미노살리실레이트, 예컨대 메살라민; 및 세포독성제, 예컨대 아자티오프린 (상표명 Imuran®로 시판됨), 사이클로포스파미드 (상표명 Cytoxan®로 시판됨), 및 사이클로스포린 A를 포함한다.Examples of anti-inflammatory drugs and agents useful in combination therapy include non-steroidal anti-inflammatory drugs (NSAIDs) including salicylates, such as aspirin, conventional NSAIDs such as ibuprofen, naproxen, ketroprofen, nabumetone , piroxicam, diclofenac, or indomethacin, and Cox-2 selective inhibitors such as celecoxib (marketed under the trade name Celebrex® ), or rotecoxine (marketed under the trade name Vioxx® ). Other compounds useful for combination therapy include antimetabolites such as methotrexate and leflunomide; corticosteroids or other steroids such as cortisone, dexamethasone, or prednisone; analgesics such as acetaminophen; aminosalicylates such as mesalamine; and cytotoxic agents such as azathioprine (marketed under the trade name Imuran® ), cyclophosphamide (marketed under the trade name Cytoxan® ), and cyclosporine A.
병용 요법에 사용될 수 있는 추가 제제는 예를 들어, 항-염증성 사이토카인을 포함하는 생물학적 반응 조절제, 예컨대 IL-10; B-세포 표적화 제제, 예컨대 항-CD20 항체 (예를 들어, 리툭시맙); 화합물 표적화 T 항원; 접착 분자 차단제; 케모카인 수용체 길항제; 키나제 억제제, 예컨대 미토겐 활성화 단백질 (MAP) 키나제, c-Jun N-말단 키나제 (JNK), 또는 NFκB의 억제제; 및 페록시솜 증식체 활성화 수용체-감마 (PPAR-γ) 리간드를 포함한다. 병용 요법에 사용될 수 있는 추가 제제에는 면역억제제가 포함된다. 면역억제제는 예를 들어 타크롤리무스 또는 FK-506; 마이코페놀산; 칼시뉴린 억제제(CNI); CSA; 및 시롤리무스, 또는 면역계를 억제하는 것으로 알려진 다른 제제를 포함할 수 있다.Additional agents that may be used in combination therapy include, for example, biological response modifiers including anti-inflammatory cytokines such as IL-10; B-cell targeting agents such as anti-CD20 antibodies (eg rituximab); compound targeting T antigen; adhesion molecule blockers; chemokine receptor antagonists; kinase inhibitors such as inhibitors of mitogen activated protein (MAP) kinase, c-Jun N-terminal kinase (JNK), or NFκB; and peroxisome proliferator-activated receptor-gamma (PPAR-γ) ligands. Additional agents that may be used in combination therapy include immunosuppressive agents. Immunosuppressive agents include, for example, tacrolimus or FK-506; mycophenolic acid; calcineurin inhibitor (CNI); CSA; and sirolimus, or other agents known to suppress the immune system.
본 명세서에 제공된 폴리펩티드 및 작제물은 또한 심혈관 질환을 치료하기 위해 투여되고/되거나 심혈관 질환을 치료하기 위한 절차 동안 투여되는 제제, 예를 들어 항응고제와 조합하여 사용될 수 있다. 예시적인 항응고제는 헤파린, 와파린, 아세노쿠마롤, 펜인디온, EDTA, 시트레이트, 옥살레이트, 및 직접적인 트롬빈 억제제, 예컨대 아르가트로반, 레피루딘, 바이발리루딘, 및 크시멜라가트란을 포함하지만 이에 제한되지 않는다.Polypeptides and constructs provided herein can also be used in combination with agents administered to treat cardiovascular disease and/or administered during procedures to treat cardiovascular disease, such as anticoagulants. Exemplary anticoagulants include heparin, warfarin, acenocumarol, phenindione, EDTA, citrate, oxalate, and direct thrombin inhibitors such as argatroban, lepirudin, bivalirudin, and ximelagatran, but Not limited to this.
본 명세서에 제공된 폴리펩티드 및 작제물은 자가면역 또는 염증성 질환, 이식 거부 또는 GvHD의 치료를 위한 항체와 함께 투여될 수 있다. 이러한 항체의 예는 항-α4β7 인테그린 항체, 예컨대 LDP-02; 항-베타2 인테그린 항체, 예컨대 LDP-01; 항-보체 (C5) 항체 예컨대, 5G1.1; 항-CD2 항체, 예컨대 BTI-322 및 MEDI-507; 항-CD3 항체, 예컨대 OKT3 및 SMART 항-CD3; 항-CD4 항체, 예컨대 IDEC-151, MDX-CD4 및 OKT4A; 항-CD11a 항체; 항-CD14 항체, 예컨대 IC14; 항-CD18 항체; 항-CD23 항체, 예컨대 IDEC 152; 항-CD25 항체, 예컨대 다클리주맙; 항-CD40L 항체, 예컨대 5c8, 루플리주맙 및 IDEC-131; 항-CD64 항체, 예컨대 MDX-33; 항-CD80 항체, 예컨대 IDEC-114; 항-CD147 항체, 예컨대 ABX-CBL; 항-E-셀렉틴 항체, 예컨대 CDP850; 항-gpIIb/IIIa 항체, 예컨대 ReoPro®/압식시맙; 항-ICAM-3 항체, 예컨대 ICM3; 항-ICE 항체, 예컨대 VX-740; 항-FcγR1 항체, 예컨대 MDX-33; 항-IgE 항체, 예컨대 rhuMAb-E25; 항-IL-4 항체, 예컨대 SB-240683; 항-IL-5 항체, 예컨대 SB-240563 및 SCH55700; 항-IL-8 항체, 예컨대 ABX-IL8; 항-인터페론 감마 항체; 항-TNFα 항체, 예컨대 CDP571, CDP870, D2E7, 인플릭시맙 및 MAK-195F; 및 항-VLA-4 항체, 예컨대 Antegren®을 포함하지만 이에 제한되지 않는다. 자가면역 또는 염증성 질환, 이식 거부 및 GvHD를 치료하기 위해 공동 투여될 수 있는 다른 Fc 함유 분자의 예는 TNFR2-Fc 융합 단백질 Enbrel® (에타네르셉트), 및 Regeneron의 IL-1 트랩을 포함하지만 이에 제한되지 않는다.Polypeptides and constructs provided herein can be administered with antibodies for the treatment of autoimmune or inflammatory diseases, transplant rejection or GvHD. Examples of such antibodies include anti-α4β7 integrin antibodies such as LDP-02; anti-beta2 integrin antibodies such as LDP-01; anti-complement (C5) antibodies such as 5G1.1; anti-CD2 antibodies such as BTI-322 and MEDI-507; anti-CD3 antibodies such as OKT3 and SMART anti-CD3; anti-CD4 antibodies such as IDEC-151, MDX-CD4 and OKT4A; anti-CD11a antibody; anti-CD14 antibodies such as IC14; anti-CD18 antibody; anti-CD23 antibodies such as IDEC 152; anti-CD25 antibodies such as daclizumab; anti-CD40L antibodies such as 5c8, luplizumab and IDEC-131; anti-CD64 antibodies such as MDX-33; anti-CD80 antibodies such as IDEC-114; anti-CD147 antibodies such as ABX-CBL; anti-E-selectin antibodies such as CDP850; anti-gpIIb/IIIa antibodies such as ReoPro ® /abxiximab; anti-ICAM-3 antibodies such as ICM3; anti-ICE antibodies such as VX-740; anti-FcγR1 antibodies such as MDX-33; anti-IgE antibodies such as rhuMAb-E25; anti-IL-4 antibodies such as SB-240683; anti-IL-5 antibodies such as SB-240563 and SCH55700; anti-IL-8 antibodies such as ABX-IL8; anti-interferon gamma antibodies; anti-TNFα antibodies such as CDP571, CDP870, D2E7, infliximab and MAK-195F; and anti-VLA-4 antibodies such as Antegren® . Examples of other Fc-containing molecules that can be co-administered to treat autoimmune or inflammatory diseases, transplant rejection and GvHD include the TNFR2-Fc fusion protein Enbrel ® (etanercept), and Regeneron's IL-1 trap, but Not limited.
감염성 질환을 치료하기 위해 공동 투여될 수 있는 항체의 예는 항-탄저병 항체, 예컨대 ABthrax; 항-CMV 항체, 예컨대 CytoGam 및 세비루맙; 항-크립토스포리디움 항체, 예컨대 CryptoGAM 및 스포리딘-G; 항-헬리코박터 항체, 예컨대 파일로란; 항-간염 B 항체, 예컨대 HepeX-B 및 Nabi-HB; 항-HIV 항체, 예컨대 HRG-214; 항-RSV 항체, 예컨대 펠비주맙, HNK-20, 팔리바주맙, 및 RespiGam; 및 항-스타필로코쿠스 항체, 예컨대 아우렉시스, 아우로그랍, BSYX-A110, 및 SE-Mab 을 포함하지만 이에 제한되지 않는다. Examples of antibodies that can be co-administered to treat infectious diseases include anti-anthrax antibodies such as ABthrax; anti-CMV antibodies such as CytoGam and sevirumab; anti-Cryptosporidium antibodies such as CryptoGAM and sporidin-G; anti-Helicobacter antibodies such as pyloran; anti-hepatitis B antibodies such as HepeX-B and Nabi-HB; anti-HIV antibodies such as HRG-214; anti-RSV antibodies such as felbizumab, HNK-20, palivazumab, and RespiGam; and anti-staphylococcal antibodies such as Aurexis, Aurograb, BSYX-A110, and SE-Mab.
일부 예에서, 본 명세서에 제공되는 TNFR1 길항제 작제물, TNFR2 효능제 작제물, 다중특이적, 예컨대 이중특이적, TNFR1 길항제/TNFR2 효능제 작제물, 융합 단백질, 및 핵산은 하나 이상의 화학요법제와 함께 투여된다. 화학요법제의 예는 비제한적으로, 알킬화제, 예컨대 티오테파 및 사이클로포스파미드 (CYTOXAN®); 알킬 설포네이트, 예컨대 부설판, 임프로설판 및 피포설판; 안드로겐, 예컨대 칼루스테론, 드로모스타놀론 프로피오네이트, 에피티오스타놀, 메피티오스탄, 및 테스토락톤; 항아드레날, 예컨대 아미노글루테티미드, 미토탄, 및 트릴로스탄; 항-안드로겐, 예컨대 플루타미드, 닐루타미드, 바이칼루타미드, 류프롤라이드, 및 고세렐린; 항생제, 예컨대 아클라시노마이신, 악티노마이신, 안트라마이신, 아자세린, 블레오마이신, 칵티노마이신, 칼리케아마이신, 카루비신, 카르미노마이신, 카르지노필린, 크로모마이신, 닥티노마이신, 다우노루비신, 데토루비신, 6-디아조-5-옥소-L-노르류신, 독소루비신, 에피루비신, 에소루비신, 이다루비신, 마르셀로마이신, 미토마이신, 마이코페놀산, 노갈라마이신, 올리보마이신, 페플로마이신, 포르피로마이신, 퓨로마이신, 쿠엘라마이신, 로도루비신, 스트렙토니그린, 스트렙토조신, 투베르시딘, 우베니멕스, 지노스타틴, 및 조루비신; 예를 들어, 타목시펜, 랄록시펜, 아로마타제 억제 4(5)-이미다졸, 4-하이드록시타목시펜, 트리옥시펜, 케녹시펜, LY 117018, 오나프리스톤, 및 토레미펜 (파레스톤)을 포함하는 항에스트로겐; 항-대사산물, 예컨대 메토트렉세이트 및 5-플루오로우라실 (5-FU); 엽산 유사체, 예컨대 데노프테린, 메토트렉세이트, 프테로프테린, 및 트리메트렉세이트; 아지리딘, 예컨대 벤조데파, 카보쿠온, 메투레데파, 및 우레데파; 알트레타민, 트리에틸렌멜라민, 트리에틸렌포스포르아미드, 트리에틸렌티오포스포르아미드 및 트리메틸올 멜라민을 포함하는 에틸렌이민 및 메틸멜라민; 엽산 보충물, 예컨대 폴린산; 질소 머스타드, 예컨대 클로르암부실, 클로르나파진, 클로로포스파미드, 에스트라무스틴, 이포스파미드, 메클로르에타민, 메클로르에타민 옥사이드 하이드로클로라이드, 멜팔란, 노벰비친, 펜에스테린, 프레드니무스틴, 트로포스파미드, 및 우라실 머스타드; 니트로소우레아, 예컨대 카무스틴, 클로로조토신, 포테무스틴, 로무스틴, 니무스틴, 라니무스틴; 백금 유사체, 예컨대 시스플라틴 및 카보플라틴; 빈블라스틴; 백금; 단백질, 예컨대 아르기닌 탈이민효소 및 아스파라기나제; 퓨린 유사체, 예컨대 플루다라빈, 6-머캅토퓨린, 티아미프린, 및 티오구아닌; 피리미딘 유사체, 예컨대 안시타빈, 아자시티딘, 6-아자우리딘, 카모푸르, 사이타라빈, 디데옥시우리딘, 독시플루리딘, 에노시타빈, 플록수리딘, 및 5-FU; 탁산, 예컨대 파클리탁셀 (TAXOL®, Bristol-Myers Squibb Oncology, Princeton, N.J.) 및 도세탁셀 (TAXOTERE®, Rhone-Poulenc Rorer, Antony, France); 토포이소머라제 억제제, 예컨대 RFS 2000; 타이미딜레이트 합성효소 억제제, 예컨대 토뮤덱스; 아세글라톤을 포함하는 추가의 화학요법제; 알도포스파미드 글리코시드; 아미노레벌린산; 암사크린; 베스트라부실; 비스안트렌; 데다트렉세이트; 데포스파미드; 데메콜신; 디아지쿠온; 디플루오로메틸오르니틴 (DMFO); 에플로니틴; 엘립티늄 아세테이트; 에토글루시드; 갈륨 니트레이트; 하이드록시우레아; 렌티난; 로니다민; 미토구아존; 미톡산트론; 모피다몰; 니트라크린; 펜토스타틴; 페나메트; 피라루비신; 포도필린산; 2-에틸하이드라자이드; 프로카바진; 다당류 K (PSK, 크레스틴); 라족산; 시조피란; 스피로게르마늄; 테누아진산; 트리아지쿠온; 2,2', 2"-트리클로로트리에틸아민; 우레탄; 빈데신; 다카바진; 만노무스틴; 미토브로니톨; 미토락톨; 피포브로만; 가시토신; 아라비노시드 ("Ara-C"); 사이클로포스파미드; 티오테파; 클로르암부실; 젬시타빈; 6-티오구아닌; 머캅토퓨린; 메토트렉세이트; 에토포시드 (VP-16); 이포스파미드; 미토마이신 C; 미톡산트론; 빈크리스틴; 비노렐빈; 나벨빈; 노반트론; 테니포시드; 다우노마이신; 아미노프테린; 젤로다; 이반드로네이트; CPT-11; 레티노산; 에스페라마이신; 카페시타빈; 및 토포이소머라제 억제제, 예컨대 이리노테칸을 포함한다. 상기 중 임의의 약제학적으로 허용 가능한 염, 산 또는 유도체가 또한 사용될 수 있다. In some examples, the TNFR1 antagonist constructs, TNFR2 agonist constructs, multispecific, such as bispecific, TNFR1 antagonist/TNFR2 agonist constructs, fusion proteins, and nucleic acids provided herein are combined with one or more chemotherapeutic agents. are administered together Examples of chemotherapeutic agents include, but are not limited to, alkylating agents such as thiotepa and cyclophosphamide ( CYTOXAN® ); alkyl sulfonates such as busulfan, improsulfan and piposulfan; androgens such as calosterone, dromostanolone propionate, epithiostanol, mepitiostane, and testolactone; antiadrenergics such as aminoglutethimide, mitotane, and trilostane; anti-androgens such as flutamide, nilutamide, bicalutamide, leuprolide, and goserelin; Antibiotics such as aclasinomycin, actinomycin, anthramycin, azaserin, bleomycin, cactinomycin, calicheamicin, carubicin, carminomycin, carzinophylline, chromomycin, dactinomycin, daunol Bicin, detorubicin, 6-diazo-5-oxo-L-norleucine, doxorubicin, epirubicin, esorubicin, idarubicin, marcellomycin, mitomycin, mycophenolic acid, nogalamycin, olibomycin , peplomycin, porphyromycin, puromycin, quelamycin, rodorubicin, streptonigryn, streptozocin, tubersidin, ubenimex, ginostatin, and zorubicin; For example, tamoxifen, raloxifene, aromatase inhibitor 4(5)-imidazole, 4-hydroxytamoxifen, trioxifene, kenoxyfen, LY 117018, onapristone, and toremifene (Pareston) estrogen; anti-metabolites such as methotrexate and 5-fluorouracil (5-FU); folic acid analogs such as denopterin, methotrexate, pteropterin, and trimetrexate; aziridines such as benzodepa, carboquone, meturedepa, and uredepa; ethylenimine and methylmelamine, including altretamine, triethylenemelamine, triethylenephosphoramide, triethylenethiophosphoramide and trimethylolmelamine; folic acid supplements such as folinic acid; Nitrogen mustards such as chlorambucil, chlornaphazine, chlorophosphamide, estramustine, ifosfamide, mechlorethamine, mechlorethamine oxide hydrochloride, melphalan, nobemvicine, phenesterine, prednimu Steen, Trophosphamide, and Uracil Mustard; nitrosoureas such as carmustine, chlorozotocin, fotemustine, lomustine, nimustine, ranimustine; platinum analogs such as cisplatin and carboplatin; vinblastine; platinum; proteins such as arginine deiminase and asparaginase; purine analogs such as fludarabine, 6-mercaptopurine, thiamiprine, and thioguanine; pyrimidine analogs such as ancitabine, azacitidine, 6-azauridine, camofur, cytarabine, dideoxyuridine, doxifuridine, enocitabine, floxuridine, and 5-FU; taxanes such as paclitaxel ( TAXOL® , Bristol-Myers Squibb Oncology, Princeton, NJ) and docetaxel ( TAXOTERE® , Rhone-Poulenc Rorer, Antony, France); topoisomerase inhibitors such as RFS 2000; thymidylate synthase inhibitors such as Tomudex; additional chemotherapeutic agents including aceglatone; aldophosphamide glycoside; aminolevulinic acid; amsacrine; bestrabucil; bisantrene; dedatrexate; dephosphamide; demecolsine; diaziquone; difluoromethylornithine (DMFO); eplonithine; elliptinium acetate; Etogluside; gallium nitrate; hydroxyurea; lentinan; Ronidamine; mitoguazone; mitoxantrone; furdamole; nitracrine; pentostatin; phenamet; pirarubicin; pophyllic acid; 2-ethylhydrazide; procarbazine; polysaccharide K (PSK, crestin); Razoxic acid; sizopyran; spirogermanium; tenuazinic acid; triaziquone; 2,2', 2"-trichlorotriethylamine;urethane;vindesine;dacarbazine;mannomustine;mitobronitol;mitolactol;pipobroman;gastosine; arabinoside ("Ara-C");cyclophosphamide;thiotepa;chlorambucil;gemcitabine;6-thioguanine;mercaptopurine;methotrexate; etoposide (VP-16); ifosfamide; mitomycin C; mitoxantrone; vincristine; vinorelbine; navelbine; novanthrone; teniposide; daunomycin; aminopterin; xeloda; ibandronate; CPT-11; retinoic acid; esperamycin; capecitabine; and topoisomerase inhibitors; eg irinotecan Pharmaceutically acceptable salts, acids or derivatives of any of the above may also be used.
화학요법제는 전구약물로서 투여될 수 있다. 본 명세서에 제공된 TNFR1 길항제 작제물, TNFR2 효능제 작제물, 다중특이적, 예컨대 이중특이적, TNFR1 길항제/TNFR2 효능제 작제물, 융합 단백질, 및 핵산과 함께 투여될 수 있는 전구약물의 예는 예를 들어, 포스페이트 함유 전구약물, 티오포스페이트 함유 전구약물, 설페이트 함유 전구약물, 펩티드 함유 전구약물, D-아미노산 변형된 전구약물, 글리코실화된 전구약물, 베타-락탐 함유 전구약물, 선택적으로 치환된 페녹시 아세트아미드 함유 전구약물, 또는 선택적으로 치환된 페닐아세트아미드 함유 전구약물, 및 5-플루오로시토신 및 5-플루오로시토신 및 보다 활성인 세포독성 유리 약물로 전환될 수 있는 다른 5-플루오로우리딘 전구약물을 포함하지만 이에 제한되지 않는다. TNFR1 길항제 작제물, TNFR2 효능제 작제물, 다중특이적, 예를 들어 이중특이적, TNFR1 길항제/TNFR2 효능제 작제물은 예를 들어 작제물의 활성 형태가 방출되는 생체 내 절단 가능한 링커와 함께 질환의 특정 조직 또는 위치를 표적으로 하는 표적화제에 이들을 연결함으로써 전구약물로서 제공될 수 있다.Chemotherapeutic agents can be administered as prodrugs. Examples of prodrugs that can be administered with the TNFR1 antagonist constructs, TNFR2 agonist constructs, multispecific, such as bispecific, TNFR1 antagonist/TNFR2 agonist constructs, fusion proteins, and nucleic acids provided herein include: For example, a phosphate-containing prodrug, a thiophosphate-containing prodrug, a sulfate-containing prodrug, a peptide-containing prodrug, a D-amino acid modified prodrug, a glycosylated prodrug, a beta-lactam-containing prodrug, an optionally substituted phenox, cyanoacetamide-containing prodrugs, or optionally substituted phenylacetamide-containing prodrugs, and 5-fluorocytosine and other 5-fluorouris that can be converted to 5-fluorocytosine and more active cytotoxic free drugs. Dean prodrugs include, but are not limited to. TNFR1 antagonist constructs, TNFR2 agonist constructs, multispecific, e.g., bispecific, TNFR1 antagonist/TNFR2 agonist constructs, e.g., together with an in vivo cleavable linker from which the active form of the construct is released It can be provided as a prodrug by linking them to a targeting agent that targets a specific tissue or location of
일부 예에서, 본 명세서에 제공되는 TNFR1 길항제 작제물, TNFR2 효능제 작제물, 다중특이적, 예컨대 이중특이적, TNFR1 길항제/TNFR2 효능제 작제물, 융합 단백질, 및 핵산은 하기를 포함하지만 이에 제한되지 않는 하나 이상의 항생제와 함께 투여된다: 아미노글리코시드 항생제 (예를 들어, 아프라마이신, 아베카신, 밤베르마이신, 부티로신, 디베카신, 겐타마이신, 카나마이신, 네오마이신, 네틸마이신, 파로모마이신, 리보스타마이신, 시소마이신, 및 스펙티노마이신), 아미노사이클리톨 (예를 들어, 스펙티노마이신), 암페니콜 항생제 (예를 들어, 아지드암페니콜, 클로르암페니콜, 플로르페니콜, 및 티암페니콜), 안사마이신 항생제 (예를 들어, 리파미드 및 리팜핀), 케바페넴 (예를 들어, 이미페넴, 메로페넴, 및 파니페넴); 세팔로스포린 (예를 들어, 세파클로르, 세파드록실, 세파만돌, 세파트리진, 세파제돈, 세포조프란, 세프피미졸, 세프피라마이드, 세프피롬, 세프프로질, 세푸록심, 세픽심, 세팔렉신, 및 세프라딘), 세파마이신 (예를 들어, 세프부페라존, 세폭시틴, 세프미녹스, 세프메타졸, 및 세포테탄); 린코사마이드 (예를 들어, 클린다마이신, 및 린코마이신); 매크롤라이드 (예를 들어, 아지트로마이신, 브레펠딘 A, 클라리트로마이신, 에리트로마이신, 록시트로마이신, 및 토브라마이신), 모노박탐 (예를 들어, 아즈트레오남, 카루모남, 및 티게모남); 무피로신; 옥사세펨 (예를 들어, 플로목세프, 라타목세프, 및 목살락탐); 페니실린 (예를 들어, 암디노실린, 암디노실린 피복실, 아목시실린, 바캄피실린, 벤질페니실린난, 벤질페니실린 나트륨, 에피실린, 펜베니실린, 플록사실린, 페나메실린, 페네타메이트 하이드리오다이드, 페니실린 o-베네타민, 페니실린 O, 페니실린 V, 페니실린 V 벤조에이트, 페니실린 V 하이드라바민, 페니메피사이클린, 및 페네티실린 칼륨); 폴리펩티드 (예를 들어, 바시트라신, 콜리스틴, 폴리믹신 B, 테이코플라닌, 및 반코마이신); 퀴놀론 (예를 들어, 아미플록사신, 시녹사신, 시프로플록사신, 에녹사신, 엔로플록사신, 플레록사신, 플루메퀸, 가티플록사신, 제미플록사신, 그레파플록사신, 로메플록사신, 목시플록사신, 날리딕스산, 노르플록사신, 오플록사신, 옥솔린산, 페플록사신, 피페미드산, 로속사신, 루플록사신, 스파르플록사신, 테마플록사신, 토서플록사신, 및 트로바플록사신); 리팜핀; 스트렙토그라민 (예를 들어, 퀴누프리스틴, 및 탈포프리스틴); 설폰아미드 (예를 들어, 설파닐아미드, 및 설파메톡사졸); 및 테트라사이클린 (예를 들어, 클로르테트라사이클린, 데메클로사이클린 하이드로클로라이드, 탈메틸클로르테트라사이클린, 독시사이클린, 듀라마이신, 미노사이클린, 네오마이신, 옥시테트라사이클린, 스트렙토마이신, 테트라사이클린, 및 반코마이신). In some examples, TNFR1 antagonist constructs, TNFR2 agonist constructs, multispecific, such as bispecific, TNFR1 antagonist/TNFR2 agonist constructs, fusion proteins, and nucleic acids provided herein include but are not limited to is administered with one or more antibiotics that are not: aminoglycoside antibiotics (e.g., apramycin, abecacin, bambermycin, butyrosin, dibecacin, gentamicin, kanamycin, neomycin, netylmycin, paromo amycin, ribostamycin, sisomycin, and spectinomycin), aminocyclitols (e.g. spectinomycin), amphenicol antibiotics (e.g. azideamphenicol, chloramphenicol, florfe Nicol, and thiamphenicol), ansamycin antibiotics (eg, lipamide and rifampin), carbapenems (eg, imipenem, meropenem, and panipenem); Cephalosporins (e.g., cefaclor, cefadroxil, cefamandole, ceftrizine, cefazedone, cefozofran, ceffimisole, cefpyramide, cefpyrom, cefprozil, cefuroxime, cefixime, cephalexin, and cefradine), cefamycin (eg, cefbuperazone, cefoxitin, cefminox, cefmetazole, and cefotetan); lincosamides (eg, clindamycin, and lincomycin); macrolides (e.g., azithromycin, brefeldin A, clarithromycin, erythromycin, loxithromycin, and tobramycin), monobactams (e.g., aztreonam, carumonam, and tigemonam ); mupirocin; oxacephem (eg, plomoxef, ratamoxef, and moxalactam); Penicillins (e.g. amdinocillin, amdinocillin pyrocyl, amoxicillin, bacampicillin, benzylpenicillinnan, benzylpenicillin sodium, epicillin, penbenicillin, floxacillin, phenamecillin, penetamate hydrioda id, penicillin o-bennetamine, penicillin O, penicillin V, penicillin V benzoate, penicillin V hydrabamine, penimepicyline, and phenethicillin potassium); polypeptides (eg, bacitracin, colistin, polymyxin B, teicoplanin, and vancomycin); Quinolones (e.g., amifloxacin, cinoxacin, ciprofloxacin, enoxacin, enrofloxacin, fleoxacin, flumequin, gatifloxacin, gemifloxacin, grepafloxacin, lomefloxacin, moxifloxacin , nalidixic acid, norfloxacin, ofloxacin, oxolinic acid, pefloxacin, pipemidic acid, losoxacin, lufloxacin, sparfloxacin, temafloxacin, tosafloxacin, and trovafloxacin) ; rifampin; streptogramins (eg, quinupristine, and depopristine); sulfonamides (eg, sulfanilamide, and sulfamethoxazole); and tetracyclines (e.g., chlortetracycline, demeclocycline hydrochloride, demethylchlortetracycline, doxycycline, duramycin, minocycline, neomycin, oxytetracycline, streptomycin, tetracycline, and vancomycin).
일부 예에서, 본 명세서에 제공된 TNFR1 길항제 작제물, TNFR2 효능제 작제물, 다중특이적, 예컨대 이중특이적, TNFR1 길항제/TNFR2 효능제 작제물, 융합 단백질, 및 핵산은 암포테리신 B, 사이클로피록스, 클로트리마졸, 에코나졸, 플루코나졸, 플루시토신, 이트라코나졸, 케토코나졸, 미코나졸, 나이스타틴, 테르비나핀, 테르코나졸, 및 티오코나졸 을 포함하지만 이에 제한되지 않는 하나 이상의 항진균제와 함께 투여될 수 있다. 일부 예에서, 본 명세서에 제공되는 TNFR1 길항제 작제물, TNFR2 효능제 작제물, 다중특이적, 예컨대 이중특이적, TNFR1 길항제/TNFR2 효능제 작제물, 및 핵산은 프로테아제 억제제, 역전사효소 억제제, 및 I형 인터페론, 바이러스 융합 억제제, 뉴라미니다제 억제제, 아사이클로비르, 아데포비르, 아만타딘, 암프레나비르, 클레부딘, 엔푸비르타이드, 엔테카비르, 포스카르네트, 강시클로비르, 이독수리딘, 인디나비르, 로피나비르, 플레코나릴, 리바비린, 리만타딘, 리토나비르, 사퀴나비르, 트리플루리딘, 비다라빈, 및 지도부딘을 포함하는 기타를 포함하지만 이에 제한되지 않는 하나 이상의 항바이러스제와 함께 투여된다. In some examples, the TNFR1 antagonist constructs, TNFR2 agonist constructs, multispecific, such as bispecific, TNFR1 antagonist/TNFR2 agonist constructs, fusion proteins, and nucleic acids provided herein are amphotericin B, ciclopyl can be administered with one or more antifungal agents including but not limited to lox, clotrimazole, econazole, fluconazole, flucytosine, itraconazole, ketoconazole, miconazole, nystatin, terbinafine, terconazole, and thioconazole. can In some examples, the TNFR1 antagonist constructs, TNFR2 agonist constructs, multispecific, such as bispecific, TNFR1 antagonist/TNFR2 agonist constructs, and nucleic acids provided herein are protease inhibitors, reverse transcriptase inhibitors, and I Interferons, viral fusion inhibitors, neuraminidase inhibitors, acyclovir, adefovir, amantadine, amprenavir, clevudine, enfuvirtide, entecavir, foscarnet, ganciclovir, idoxuridine, indinavir is administered with one or more antiviral agents, including but not limited to others including, but not limited to, le, lopinavir, fleconaril, ribavirin, rimantadine, ritonavir, saquinavir, trifluridine, vidarabine, and zidovudine. .
본 명세서에 제공된 TNFR1 길항제 작제물, TNFR2 효능제 작제물, 다중특이적, 예컨대 이중특이적, TNFR1 길항제/TNFR2 효능제 작제물, 융합 단백질, 및 핵산은 하기 기술된 성장 인자 트랩 작제물과 함께 투여될 수 있으며, 또한 또한 성장 인자 트랩 작제물과의 병용 요법을 위해 아래에 제시된 임의의 치료 항-TNF 제제 및 치료 중 임의의 것과 함께 투여될 수 있다. 병용 요법은 또한 본 명세서에 제공된 성장 인자 트랩 작제물을 포함할 수 있다.TNFR1 antagonist constructs, TNFR2 agonist constructs, multispecific, such as bispecific, TNFR1 antagonist/TNFR2 agonist constructs, fusion proteins, and nucleic acids provided herein are administered with the growth factor trap constructs described below It can also be administered with any of the therapeutic anti-TNF agents and treatments set forth below for combination therapy with the growth factor trap construct. Combination therapy can also include the growth factor trap constructs provided herein.
본 명세서에 제공된 TNFR1 길항제 작제물, TNFR2 효능제 작제물, 다중특이적, 예컨대 이중특이적, TNFR1 길항제/TNFR2 효능제 작제물, 융합 단백질, 및 핵산을 함유하는 약제학적 조성물은 본 명세서에 기재되거나 당업계에 알려진 임의의 질환, 장애 및 병태를 치료하기 위해 사용될 수 있다. 질환, 장애 및 병태는 하나 이상의 만성 염증성, 자가면역, 신경퇴행 또는 탈수초 질환 또는 병태를 포함한다. 또한 만성 염증성, 자가면역, 신경퇴행 또는 탈수초 질환 또는 병태의 치료를 위한 본 명세서에 제공된 폴리펩티드 및 작제물의 조합, 및 또 다른 치료 또는 화합물이 제공된다. 본 명세서에 제공된 TNFR1 길항제 작제물, TNFR2 효능제 작제물, 다중특이적, 예컨대 이중특이적, TNFR1 길항제/TNFR2 효능제 작제물, 융합 단백질, 및 핵산, 및 추가 제제(들)는 함께 또는 순차적으로 또는 간헐적으로 투여를 위한 별도의 조성물로서 포장될 수 있다. 대안적으로, 그들은 단일 조성물로서 투여를 위해 단일 조성물로 제공되거나, 투여를 위해 2개의 조성물로 제공될 수 있다. 조합은 선택적으로 추가 시약, 사용 지침, 바이알 및 다른 용기, 주사기 및 치료용 다른 항목과 함께 키트로서 포장될 수 있다.Pharmaceutical compositions containing TNFR1 antagonist constructs, TNFR2 agonist constructs, multispecific, such as bispecific, TNFR1 antagonist/TNFR2 agonist constructs, fusion proteins, and nucleic acids provided herein are provided herein or It can be used to treat any disease, disorder and condition known in the art. Diseases, disorders and conditions include one or more chronic inflammatory, autoimmune, neurodegenerative or demyelinating diseases or conditions. Also provided are combinations of polypeptides and constructs provided herein for the treatment of chronic inflammatory, autoimmune, neurodegenerative or demyelinating diseases or conditions, and another treatment or compound. The TNFR1 antagonist constructs, TNFR2 agonist constructs, multispecific, such as bispecific, TNFR1 antagonist/TNFR2 agonist constructs, fusion proteins, and nucleic acids, and additional agent(s) provided herein may be used together or sequentially or packaged as separate compositions for intermittent administration. Alternatively, they may be provided in a single composition for administration as a single composition, or in two compositions for administration. The combination may be packaged as a kit, optionally with additional reagents, instructions for use, vials and other containers, syringes, and other items for treatment.
L. 실시예L. Examples
하기 실시예는 단지 예시의 목적으로 포함되고 본 발명의 범위를 제한하려는 것은 아니다.The following examples are included for illustrative purposes only and are not intended to limit the scope of the invention.
실시예Example 1 One
후보 1가
항-TNFR1 분자의 발현 및 정제Expression and purification of anti-TNFR1 molecules
후보 1가 TNFR1 길항제 분자는 도 1에 도시된 발현 플라스미드를 사용하여, CMV 프로모터의 제어 하에, 포유동물 세포에서 발현된다 (여기서, TE19080L은 삽입된 단편임). 본원의 작제물과 같은 단백질 치료제의 발현을 위해, 포유동물 세포, 예컨대, 중국 햄스터 난소(CHO) 또는 인간 배아 신장 293(HEK293) 세포를 사용하여 글리코실화를 포함하는, 번역-후 변형을 제공하는데, 이는 적절한 단백질 구조, 기능 및 활성을 위해 중요할 수 있다. 박테리아, 효모 또는 곤충 세포에서의 발현은 글리코실화가 일어나지 않거나(박테리아 세포의 경우), 포유동물 세포에서의 발현과 비교하여 상이한 글리코실화 패턴을 초래한다 (효모 또는 곤충 세포의 경우). 박테리아에서의 발현은 또한 박테리아 내독소로 단백질 치료제를 오염시킬 수 있으며, 이는 선천 면역 세포를 활성화시키고, 세포-기반 검정의 분석을 복잡하게 하고, 생체내 투여시 발열성 효과를 유발할 수 있다. Candidate monovalent TNFR1 antagonist molecules are expressed in mammalian cells, under the control of the CMV promoter, using the expression plasmid shown in Figure 1, where TE19080L is the inserted fragment. For the expression of protein therapeutics such as the constructs herein, mammalian cells such as Chinese Hamster Ovary (CHO) or Human Embryonic Kidney 293 (HEK293) cells are used to provide post-translational modifications, including glycosylation. , which can be important for proper protein structure, function and activity. Expression in bacterial, yeast or insect cells either results in no glycosylation (in the case of bacterial cells) or a different glycosylation pattern compared to expression in mammalian cells (in the case of yeast or insect cells). Expression in bacteria can also contaminate protein therapeutics with bacterial endotoxins, which can activate innate immune cells, complicate analysis of cell-based assays, and cause pyrogenic effects upon administration in vivo.
발현 플라스미드 작제뿐만 아니라 일시적이고 안정적인 세포주 발현은 문헌[Vazquez-Lombardi 등 (2018) Nat. Protoc . 13(1):99-117]에 기술된 방법과 같은, 방법들을 사용하여 수행된다. 초기 평가를 위해 5개의 예시적인 TNFR1 길항제 분자가 생산된다. TNFR1 길항제 분자는 (GGGGS)3 펩타이드 링커에 의해 함께 연결된 H398의 하나의 VL 및 하나의 VH 도메인을 함유하는 H398-유래 scFv(서열번호 678); TNFR1 길항제 도메인 항체(dAb) DOM1h-574-16(서열번호 57); TNFR1 길항제 dAb DOM1h-549(서열번호 58); (GGGGS)3 펩타이드 링커에 의한 DMS5541(DOM7h-11-3; 서열번호 52)의 항-혈청 알부민 dAb(albudAb)에 융합된, DMS5541(본원의 다른 곳에 기술됨)로부터의 TNFR1 길항제 dAb DOM1h-574-208(서열번호 54)을 함유한, 융합 단백질(서열번호 704); 및 (GGGGS)3 펩타이드 링커에 의한 DMS5541의 항-혈청 알부민 dAb(albudAb 또는 DOM7h-11-3; 서열번호 52)에 융합된, 항-TNFR1 dAb 명시된 DOM1h-131-206(서열번호 59)을 함유한, 융합 단백질(서열번호 705)을 포함한다. H398 scFv, 및 DOM1h-574-208 및 DOM1h-131-206 융합 단백질에서의 (GGGGS)3 링커의 삽입은 각각 VH 및 VL 도메인, 및 2개의 dAb 사이에 더 많은 유연성을 제공하고, 분자의 변성에 대한 안정성 및 내성을 증가시켜, 제조 공정을 개선한다. 이러한 TNFR1 길항제 분자 각각의 서열은 하기 표 12에 제공되며, 일부는 다양한 링커 서열을 갖는다 (또한, 문헌[Enever 등, (2015) Protein Engineering, Design & Selection 28(3):59-66] 참조, 이러한 문헌은 링커 및 개질제의 추가 변형 및 첨가에 사용될 수 있는 dAb 및 이의 변형을 기술함).Expression plasmid construction as well as transient and stable cell line expression are described in Vazquez-Lombardi et al. (2018) Nat. Protoc . 13(1):99-117. Five exemplary TNFR1 antagonist molecules are produced for initial evaluation. The TNFR1 antagonist molecule includes (GGGGS) an H398-derived scFv containing one V L and one V H domain of H398 linked together by a three- peptide linker (SEQ ID NO: 678); TNFR1 antagonist domain antibody (dAb) DOM1h-574-16 (SEQ ID NO: 57); TNFR1 antagonist dAb DOM1h-549 (SEQ ID NO: 58); (GGGGS) TNFR1 antagonist dAb DOM1h-574 from DMS5541 (described elsewhere herein) fused to the anti-serum albumin dAb (albudAb) of DMS5541 (DOM7h-11-3; SEQ ID NO: 52) by a three- peptide linker fusion protein (SEQ ID NO: 704), containing -208 (SEQ ID NO: 54); and an anti-TNFR1 dAb specified DOM1h-131-206 (SEQ ID NO: 59) fused to an anti-serum albumin dAb (albudAb or DOM7h-11-3; SEQ ID NO: 52) of DMS5541 by a (GGGGS) three- peptide linker. One, a fusion protein (SEQ ID NO: 705). Insertion of the H398 scFv, and the (GGGGS) three linkers in the DOM1h-574-208 and DOM1h-131-206 fusion proteins, respectively, provide more flexibility between the V H and V L domains, and the two dAbs, and It improves the manufacturing process by increasing stability and resistance to denaturation. The sequences of each of these TNFR1 antagonist molecules are provided in Table 12 below, some with various linker sequences (see also Enever et al., (2015) Protein Engineering, Design & Selection 28(3) :59-66; These documents describe dAbs and variants thereof that can be used for further modifications and additions of linkers and modifiers).
또한, 임의의 서열번호 53 내지 83 및 503 내지 671, 예컨대, 서열번호 57 내지 59에 제시된 것들로부터 선택된 2개의 중쇄, 및 이와 적어도 95%, 96%, 97%, 98%, 99% 서열 동일성을 갖는 이의 변형체를 포함하는 나노바디 및 나노바디를 함유하는 작제물이 제공된다. 동일한 중쇄를 포함하는 작제물이 제공된다. 이들의 예는 DOM1h-131-206으로 명명된 TNFR1 dAb이다. 또한, 인간 혈청 알부민에 직접 또는 보다 일반적으로 링커, 예컨대, GS 링커를 통해, 또는 Fc 융합체로서 또는 본원에 기술된 임의의 다른 작제물에서 제공되는 것들과 같은 임의의 이러한 dAb를 함유하는 작제물이 제공된다.Also, two heavy chains selected from any of SEQ ID NOs: 53-83 and 503-671, such as those set forth in SEQ ID NOs: 57-59, and at least 95%, 96%, 97%, 98%, 99% sequence identity thereto Nanobodies, including variants thereof, and constructs containing the nanobodies are provided. Constructs comprising identical heavy chains are provided. An example of these is the TNFR1 dAb designated DOM1h-131-206. In addition, constructs containing any such dAb, such as those provided directly to human serum albumin or more commonly via a linker such as a GS linker, or as an Fc fusion or in any other construct described herein Provided.
이들 및 다른 이러한 dAb 및 TNFR1 결합 분자는 TNFR2에 대한 임의의 길항 활성을 제거함으로써 TNFR1에 대한 특이성을 증가시키고/시키거나 TNFR2 효능제 활성을 증가 또는 첨가하도록 변형될 수 있고/있거나 면역원성 에피토프를 감소 또는 제거하도록 변형될 수 있고/있거나 활성 개질제, 이러한 Fc 단위 및 변형된 Fc 단위/변형된 Fc 다이머, 및/또는 혈청 반감기 연장 모이어티에 연결될 수 있다.These and other such dAbs and TNFR1 binding molecules can be modified to increase specificity for TNFR1 by eliminating any antagonistic activity to TNFR2, increase or add TNFR2 agonist activity, and/or reduce immunogenic epitopes. or modified to eliminate and/or linked to activity modifiers, such Fc units and modified Fc units/modified Fc dimers, and/or serum half-life extending moieties.
HEK293 세포주는 일시적인 발현에 사용되며, 발현된 길항제의 시험관내 평가 및 TNFR1에 대한 높은 친화성(예를 들어, Kd < 50 nM, 또는 < 10 nM, 또는 < 또는 5 nM)), 및 TNFR1 신호전달의 강력한 억제(예를 들어, IC50 < 50 nM, 또는 < 10 nM, 또는 < 5 nM)와 같은, 원하는 성질을 갖는 분자의 확인 후에, 안정한 세포주는 CHO 세포의 유도체에서 제조된다. 일반적으로, 이는 대략 또는 약 19 pM 친화성 또는 20 pM, 15 pM, 10 pM, 5 pM, 2 pM, 또는 1 pM 친화성과 같은 피코몰(pM) 친화성이다. The HEK293 cell line is used for transient expression, in vitro evaluation of the expressed antagonist and high affinity for TNFR1 (eg, K d < 50 nM, or < 10 nM, or < or 5 nM), and TNFR1 signaling After identification of molecules with desired properties, such as potent inhibition of transduction (eg, IC 50 <50 nM, or <10 nM, or <5 nM), stable cell lines are prepared from the derivatives of CHO cells. Typically, this is a picomolar (pM) affinity, such as about or about 19 pM affinity or 20 pM, 15 pM, 10 pM, 5 pM, 2 pM, or 1 pM affinity.
일시적인 발현은 CHO DG44 세포(예를 들어, CHO-DG44(DHFR-) 및 FreeStyleTM CHO-S 세포, Invitrogen)에서 최적화되어, 고발현 클론을 확인하거나 선택하기 위해 스크리닝되는 트랜스펙션된 풀을 생성한다. 폴리-히스티딘, 또는 다른 정제 태그는 사용되지 않는다. 대신, 스크리닝을 위한 단백질은 다른 잘 알려진 방법과 함께 HPLC에 의해 무혈청 배지로부터 정제된다. HPLC에 사용된 매트릭스는 AmsphereTM A3 단백질 A 크로마토그래피 수지(JSR Life Sciences), 또는 제조업체의 프로토콜에 따른 다른 유사한 수지이다. 단백질이 크기 배제 HPLC에 의해 판단하는 경우, 적어도 95% 순수하지 않은 경우, 추가 정제를 수행한다 (예를 들어, 이온 교환 또는 소수성 크로마토그래피). Transient expression is optimized in CHO DG44 cells (e.g., CHO-DG44 (DHFR - ) and FreeStyle TM CHO-S cells, Invitrogen) to generate transfected pools that are screened to identify or select high expressing clones do. No poly-histidine, or other purification tags are used. Instead, proteins for screening are purified from serum free media by HPLC along with other well known methods. The matrix used for the HPLC is Amsphere ™ A3 Protein A chromatography resin (JSR Life Sciences), or other similar resin according to the manufacturer's protocol. If the protein is not at least 95% pure, as judged by size exclusion HPLC, further purification is performed (eg ion exchange or hydrophobic chromatography).
내독소를 제거한다 (예를 들어, 예시적인 프로토콜에 대해 문헌[Vazquez-Lombardi 등 (2018)] 참조). 단백질 정제 후, 내독소 수준을 검출 키트, 예컨대, QCL-1000 종점 발색성 LAL 검정 키트(Lonza)를 사용하여 결정한다. 내독소 제거를 위해, 정제된 단백질의 이론적 pI를 서열 분석 툴(예를 들어, ExPASy ProtParam)을 사용하여 결정하고, pH 저-내독소 PBS 완충제를 정제된 단백질의 이론적 pI 미만이지만 이에 가까운 pH로 조정한다. 이후, 단백질 샘플을 4℃에서 적어도 2시간 동안 적어도 30 부피의 pH-조정된 PBS에 대해 투석한다. 추가 투석 단계를 밤새 수행하고, 이후, 다음날 적어도 2시간 동안 다시 수행한다. 이후, 샘플을 음이온 교환 친화성 크로마토그래피를 사용하여 정제하고, 내독소 수준을 결정하기 위해 재시험하고, 허용되는 수준의 내독소가 달성될 때까지 공정을 반복한다. 단백질 생성물의 크기 및 순도를 SDS-PAGE 분석 또는 다른 적합한 방법에 의해 결정한다. 대안적으로, 다른 방법, 예컨대, 프로테우스 내독소 제거 키트 및 첨부된 제조사의 핸드북(BIORAD, bio-rad-anti-bodies.com/static/uploads/ifu/pur030.pdf 참조)을 사용할 수 있다. 이러한 단계를 내독소가 바람직한 수준, 통상적으로 > 0.5 내독소 단위/ml(0.5 내독소 단위/ml 이하)에 도달할 때까지 반복할 수 있다.Remove endotoxin (see, eg, Vazquez-Lombardi et al. (2018) for an exemplary protocol). After protein purification, endotoxin levels are determined using a detection kit such as the QCL-1000 endpoint chromogenic LAL assay kit (Lonza). For endotoxin removal, the theoretical pi of the purified protein is determined using a sequence analysis tool (e.g., ExPASy ProtParam) and the pH low-endotoxin PBS buffer is adjusted to a pH less than but close to the theoretical pi of the purified protein. Adjust. The protein sample is then dialyzed against at least 30 volumes of pH-adjusted PBS for at least 2 hours at 4°C. An additional dialysis step is performed overnight and then again for at least 2 hours the next day. The sample is then purified using anion exchange affinity chromatography, retested to determine endotoxin levels, and the process is repeated until an acceptable level of endotoxin is achieved. The size and purity of the protein product is determined by SDS-PAGE analysis or other suitable method. Alternatively, other methods may be used, such as the Proteus Endotoxin Removal Kit and accompanying manufacturer's handbook (BIORAD, see bio-rad-anti-bodies.com/static/uploads/ifu/pur030.pdf). This step can be repeated until the desired level of endotoxin is reached, typically >0.5 endotoxin units/ml (0.5 endotoxin units/ml or less).
정제된 단백질의 스크리닝Screening of purified proteins
정제된 TNFR1 길항제 분자 후보를, 상세한 설명에서 상기 기술된 방법, 또는 예를 들어, 면역검정(예를 들어, ELISA), 표면 플라즈몬 공명(SPR), 등온 적정 열량측정법(ITC), 또는 당 분야에 공지된 다른 동력학적 상호작용 검정과 같은, 당 분야에 공지된 방법을 사용하여, TNFR1의 세포외 도메인에 대한 결합 친화성을 측정하기 위해, 스크리닝한다. SPR은, 예를 들어, BIAcore 시스템(GE Healthcare Life Sciences)과 같은 여러 상업적으로 이용 가능한 플랫폼을 사용하여, 수행할 수 있다. 예시적인 검정은, 예를 들어, 문헌[Lang 등 (2015) J. Biol Chem 291:5022-5037]에 기술되어 있고, 결합 친화성을 평가하기 위한 다양한 검정을 기술하고 비교한다. 선택된 후보는 < 5 nM의 Kd 값을 갖는 것들을 포함한다. Purified TNFR1 antagonist molecule candidates can be prepared by methods described above in the detailed description, or by, for example, immunoassays (eg, ELISA), surface plasmon resonance (SPR), isothermal titration calorimetry (ITC), or methods in the art. Screening is performed to determine binding affinity to the extracellular domain of TNFR1 using methods known in the art, such as other known kinetic interaction assays. SPR can be performed using several commercially available platforms such as, for example, the BIAcore system (GE Healthcare Life Sciences). Exemplary assays are described, eg, in Lang et al (2015) J. Biol Chem 291 :5022-5037, which describes and compares various assays for assessing binding affinity. Selected candidates include those with K d values of <5 nM.
또한, SPR과 같은 당 분야에 공지된 방법을 사용하여, TNFR1에 대한 결합이 TNF에 대해 경쟁적인지 또는 비-경쟁적인지 여부를 결정하기 위해 TNFR1 길항제를 스크리닝한다. 억제제가 수용체(예를 들어, TNFR1)에 결합하고, 예를 들어, 활성 부위에 부착함으로써 리간드(예를 들어, TNF)의 결합을 차단하는 경우, 이는 억제제가 효소를 위한 기질과 "경쟁"하기 때문에 경쟁적 억제이며, 즉, 억제제 또는 기질만이 주어진 순간에 결합될 수 있다. 비경쟁적 억제에서, 억제제는 리간드가 수용체 상의 리간드-결합 부위에 결합하는 것을 차단하지 않는다. 대신, 이는 다른 부위에 부착되어 수용체가 결합된 리간드에 반응하는 것을 차단한다. 이러한 억제는 억제제와 기질 둘 모두가 동시에 결합될 수 있기 때문에 "비-경쟁적"이라고 한다. 따라서, 리간드가 포화 농도로 수용체-결합 검정에 첨가되고 이것이 항체의 결합을 억제하지 않는 경우, 두 분자는 독립적이고 비경쟁적이다. 그 반대도 유효하다. 둘 다 경쟁적이라면, 항체의 농도 증가는 TNF가 수용체에 결합하는 것을 방지할 것이다. 이는 결합 검정이 세포에서 수행되는지, 또는 표면에 결합된 수용체 또는 리간드로 수행되는지에 관계없이 유효하다. 예시적인 검정에 대해서는, 예를 들어, 문헌[Frey 등 (2001) Current Protocols in Neuroscience, "Receptor Binding Techniques", doi.org/10.1002/0471142301.ns0104s00에서 입수 가능]이 참조된다. TNFR1 antagonists are also screened to determine whether their binding to TNFR1 is competitive or non-competitive for TNF, using methods known in the art, such as SPR. When an inhibitor binds to a receptor (eg, TNFR1) and blocks binding of a ligand (eg, TNF) by, for example, attaching to the active site, this prevents the inhibitor from "competing" with the substrate for the enzyme. Because of this, it is competitive inhibition, i.e., only the inhibitor or substrate can be bound at any given moment. In uncompetitive inhibition, the inhibitor does not block binding of the ligand to the ligand-binding site on the receptor. Instead, it attaches to other sites and blocks the receptor from responding to the bound ligand. This inhibition is said to be "non-competitive" because both inhibitor and substrate can bind simultaneously. Thus, if a ligand is added to a receptor-binding assay at a saturating concentration and it does not inhibit binding of the antibody, the two molecules are independent and non-competitive. The reverse is also valid. If both are competitive, increasing the concentration of antibody will prevent TNF from binding to the receptor. This holds true regardless of whether the binding assay is performed in cells or with receptors or ligands bound to a surface. For exemplary assays, see, eg, Frey et al. (2001) Current Protocols in Neuroscience , "Receptor Binding Techniques", available at doi.org/10.1002/0471142301.ns0104s00.
예를 들어, BIAcore 칩 상에 코팅된 인간 TNFR1에 결합하는 TNF의 능력이 먼저 결정된다. 이후, TNFR1 표면은 TNFR1 길항제 분자로 포화되고, 후속하여 TNF가 주사되고, TNFR1에 대한 TNF의 결합이 재평가된다. 결합이 비경쟁적이면, 둘 모두는 TNFR1에 결합하고; 결합이 경쟁적이라면, 그들은 서로 간섭할 것이다. TNF의 결합이 영향을 받지 않거나 단지 약간만 감소되는 경우, TNFR1에 대한 길항제의 결합은 TNF와 관련하여 비경쟁적이며, TNF의 결합이 폐기되거나 유의하게 감소되는 경우, 길항제의 결합이 TNF와 관련하여 경쟁적인 것으로 고려된다. 본원의 목적을 위해, 경쟁적 결합제가 선택된다.For example, the ability of TNF to bind to human TNFR1 coated on a BIAcore chip is first determined. The TNFR1 surface is then saturated with TNFR1 antagonist molecules, followed by injection of TNF, and binding of TNF to TNFR1 is reassessed. If binding is uncompetitive, both bind TNFR1; If the bonds are competitive, they will interfere with each other. If binding of TNF is unaffected or only slightly reduced, binding of the antagonist to TNFR1 is uncompetitive with respect to TNF, and if binding of TNF is abrogated or significantly reduced, binding of the antagonist to competitive with respect to TNF is considered hostile For purposes herein, competitive binders are selected.
TNFR1 길항제 분자는 당 분야에 공지된 방법, 예를 들어, NFκB-루시페라제 발현의 활성화(즉, 유전자 수용체 검정)를 야기시키는, 문헌[McFarlane 등 (2002) FEBS Lett . 515(1-3):119-126]에 기술된 방법을 사용하여, 세포 상에 TNF의 존재 하에 TNFR1 신호전달을 억제하는 이들의 능력을 결정하기 위해 추가로 스크리닝된다. 이러한 실험에 사용된 세포는 TNFR1- 또는 TNFR2-발현 플라스미드로 트랜스펙션되지 않는 한, TNFR1 또는 TNFR2(예를 들어, 골수종 세포주 AMO1, U266, 및 L363; 예를 들어, 문헌[Rauert 등 (2011) Cell Death Dis . 2(8):e194])를 발현하지 않는다. 대안적으로, CRISPR 벡터, 안티센스 RNA 발현, 또는 당 분야에 공지된 다른 방법을 사용하여 TNFR1 및/또는 TNFR2 유전자가 불활성화되거나 녹아웃된 인간 세포주가 사용될 수 있다. 상업적 공급처(예를 들어, Genoway 및 Synthego)로부터 획득될 수 있는, TNFR1- 및/또는 TNFR2- 세포주가 또한 사용될 수 있다. 이후, 이러한 세포주는 TNFR1 및/또는 TNFR2 발현 카세트로 특이적으로 트랜스펙션될 수 있다. 예를 들어, TNFR1, TNFR2, 또는 TNFR1 및 TNFR2를 발현하는 세포는 TNFR1에 대한 길항제의 선택성을 평가하고 TNFR1을 통한 TNF 신호전달의 억제 역가를 결정하는 데 사용될 수 있다. TNFR1 antagonist molecules are described in McFarlane et al. (2002) FEBS , which result in activation of NFκB-luciferase expression (i.e., gene receptor assay) by methods known in the art, for example. Lett . 515(1-3):119-126, to determine their ability to inhibit TNFR1 signaling in the presence of TNF on cells. Cells used in these experiments are TNFR1 or TNFR2 (e.g., myeloma cell lines AMO1, U266, and L363; see, e.g., Rauert et al . (2011)) unless transfected with a TNFR1- or TNFR2-expressing plasmid. Cell Death Dis.2 ( 8):e194]) is not expressed. Alternatively, human cell lines can be used in which the TNFR1 and/or TNFR2 genes have been inactivated or knocked out using CRISPR vectors, antisense RNA expression, or other methods known in the art. TNFR1 - and/or TNFR2 - cell lines, which can be obtained from commercial sources (eg, Genoway and Synthego), can also be used. These cell lines can then be specifically transfected with TNFR1 and/or TNFR2 expression cassettes. For example, cells expressing TNFR1, TNFR2, or TNFR1 and TNFR2 can be used to assess the selectivity of an antagonist for TNFR1 and to determine the potency of inhibition of TNF signaling through TNFR1.
TNFR1 길항제에 의한 TNFR1 신호전달의 억제를 결정하기 위해, 인간 TNFR1을 발현하는 세포를 리포펙타민을 사용하여 NF-κB-루시페라제 리포터 작제물로 일시적으로 트랜스펙션하고, 트랜스펙션 48시간 후에 수용체-자극된 루시페라제 전사를 측정한다. TNFR1 및 NF-κB-루시페라제를 안정적으로 발현하는 세포를 1 Х 105개 세포/ml 배양 배지의 밀도로 24-웰 플레이트에 플레이팅하고, 이들이 80% 컨플루언시에 도달할 때까지(약 24시간) 인큐베이션한다. 이후, 세포를 50 ng/ml의 TNF 및 다양한 농도의 TNFR1 길항제와 함께 6시간 동안 인큐베이션한다. 세포를 빙냉 PBS로 2회 세척하고, 200 μl의 빙냉 용해 완충제(25 mM Tris-포스페이트 pH 7.8, 8 mM MgCl2, 1 mM DTT, 1% Triton X-100, 15% 글리세롤)를 첨가하고, 5분 동안 얼음 상에서 인큐베이션함으로써, NF-κB-자극된 루시페라제 활성을 검출한다. 이후, 세포 추출물을 1.5 ml Eppendorf 튜브 내로 스크랩핑하고, 원심분리하여 세포 파편을 펠렛화하고, 100 μl의 상청액을 사용하여, 발광계를 사용하여 루시페라제 유도를 측정한다. 이후, TNFR1 길항제 농도에 대한 상대 발광 단위(RLU)를 플롯팅하고, GraphPad Prism과 같은 곡선 피팅 소프트웨어를 사용함으로써, IC50을 계산한다. TNFR1 신호전달의 억제를 평가하기 위한 다른 유사한 검정은, TNF로 처리된 TNFR1을 발현하는 세포에서, 고전적인 NF-κB 경로의 활성화를 나타내는, 포스포-IκBα의 유도를 측정하는 검정을 포함한다 (예를 들어, 문헌[Rauert 등 (2011) Cell Death Dis. 2(8):e194] 참조). To determine the inhibition of TNFR1 signaling by TNFR1 antagonists, cells expressing human TNFR1 were transiently transfected with an NF-κB-luciferase reporter construct using lipofectamine and 48 hours after transfection Receptor-stimulated luciferase transcription is then measured. Cells stably expressing TNFR1 and NF-κB-luciferase were plated in 24-well plates at a density of 1 Х 10 5 cells/ml culture medium until they reached 80% confluency. Incubate (approximately 24 hours). Cells are then incubated for 6 hours with 50 ng/ml of TNF and various concentrations of TNFR1 antagonist. Cells were washed twice with ice-cold PBS, 200 μl of ice-cold lysis buffer (25 mM Tris-phosphate pH 7.8, 8 mM MgCl 2 , 1 mM DTT, 1% Triton X-100, 15% glycerol) was added and 5 NF-κB-stimulated luciferase activity is detected by incubation on ice for 10 minutes. The cell extract is then scraped into a 1.5 ml Eppendorf tube, centrifuged to pellet cell debris, and 100 μl of the supernatant is used to measure luciferase induction using a luminometer. The IC 50 is then calculated by plotting relative luminescence units (RLU) versus TNFR1 antagonist concentration and using curve fitting software such as GraphPad Prism. Other similar assays for assessing inhibition of TNFR1 signaling include assays that measure the induction of phospho-IκBα, indicative of activation of the classical NF-κB pathway, in cells expressing TNFR1 treated with TNF ( See, eg, Rauert et al (2011) Cell Death Dis. 2(8):e194).
상기 결정된 바와 같이, 적어도 80%의 TNFR1 신호전달의 억제 및 Kd와 대략 동일한(즉, < 5 nM) IC50 값을 나타내는 TNFR1 길항제 후보가 추가 최적화를 위해 선택된다.As determined above, TNFR1 antagonist candidates exhibiting inhibition of TNFR1 signaling of at least 80% and an IC 50 value approximately equal to K d (ie, <5 nM) are selected for further optimization.
실시예Example 2 2
선택된 후보 1가 TNFR1 길항제 분자의 최적화Optimization of selected candidate monovalent TNFR1 antagonist molecules
TNFR1에 대한 친화성 및 TNFR1 신호전달 억제의 역가 최적화Optimization of affinity for TNFR1 and potency of inhibition of TNFR1 signaling
상기 개요된 선택 기준(즉, Kd 및 IC50 값이 < 5 nM인, TNFR1에 대한 높은 친화성 및 TNFR1 신호전달의 강력한 억제)을 충족하는, 후보 TNFR1 길항제 분자는, TNFR1에 대한 친화성, 및 TNFR1 신호전달 억제의 역가를 증가시키기 위해 최적화된다. 이는 < 1 nM만큼 낮은, 일반적으로, < 100 nM, < 50 nM, < 10 nM, 또는 < 5 nM 이상의 Kd 및 IC50 값을 달성하기 위해 무작위 돌연변이유발, 부위-지정 돌연변이유발, 분자 모델링, 및/또는 오류가 발생하기 쉬운 PCR(error-prone PCR) 중 하나 이상을 포함하는 방법에 의해 달성된다. 예를 들어, 이는, 결합에 가장 중요한 아미노산을 보존하는 반면 VH 도메인의 나머지 아미노산을 돌연변이유발시키고, 파지 라이브러리를 제조하고, 선택되는, TNFR1에 대한 높은 친화성 결합 변이체에 대해 스크리닝하는 방법(문헌[Tiller 등 (2017) Frontiers Immunol . 8:986] 참조)에 의해 달성될 수 있다. 이러한 방법에 따르면, 이러한 변이체를 선택하기 위한 파지 디스플레이 라이브러리를 생산한다. 제1 단계에서, 계산 및 실험 알라닌 스캐닝 돌연변이유발은 항원 결합을 유지하면서 돌연변이유발을 허용하는 상보성-결정 영역(CDR)에서 부위를 확인한다. 다음으로, 가장 허용되는 CDR 위치는, 천연 항체 다양성에 기반하여, 야생형 잔기, 및 각 CDR 위치에서 가장 빈번하게 발생하는 소수의 잔기를 인코딩하기 위해 축퇴 코돈을 사용하여 돌연변이된다. 이러한 돌연변이유발 접근법은 단일 돌연변이를 갖는 항체 도메인 및 수십 개의 돌연변이를 갖는 다른 도메인을 포함하는, 광범위한 수의 CDR 돌연변이를 갖는 변이체를 갖는 항체 라이브러리를 생성한다. 마지막 단계에서, 효모의 표면에 디스플레이된 라이브러리(약 1천만 개의 변이체)를 분류하여 친화도가 가장 크게 증가하는 CDR 돌연변이를 확인한다. A candidate TNFR1 antagonist molecule that meets the selection criteria outlined above (ie, high affinity for TNFR1 and potent inhibition of TNFR1 signaling, with a K d and IC 50 value of <5 nM), has an affinity for TNFR1; and optimized to increase the potency of inhibition of TNFR1 signaling. This includes random mutagenesis, site-directed mutagenesis , molecular modeling , and/or error-prone PCR (PCR). For example, this is done by mutagenizing the remaining amino acids of the VH domain while conserving the amino acids most important for binding, preparing a phage library, and screening for selected, high affinity binding variants to TNFR1 (see (2017) Frontiers Immunol . 8 :986). According to this method, a phage display library for selection of such variants is produced. In a first step, computational and experimental alanine scanning mutagenesis identifies sites in the complementarity-determining regions (CDRs) that allow for mutagenesis while maintaining antigen binding. Next, the most permissive CDR positions are mutated, based on natural antibody diversity, using degenerate codons to encode the wild-type residues and the few most frequently occurring residues at each CDR position. This mutagenesis approach generates antibody libraries with variants with a broad number of CDR mutations, including antibody domains with a single mutation and other domains with dozens of mutations. In a final step, the library (approximately 10 million variants) displayed on the surface of the yeast is sorted to identify the CDR mutations that increase the affinity the most.
반감기 연장 half-life extension
최적화된 분자를, 이후에, 상세한 설명에서 상기 기술된 바와 같이, 예를 들어, IgG Fc 도메인, 특히 변형된 Fc 도메인, 또는 인간 혈청 알부민(HSA)과의 융합에 의해, 또는 PEG화에 의해, 반감기 연장 모이어티에 연결시켜, SCID 마우스에서 약 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10일 이상, 예를 들어, 10 내지 12일의 생체내 혈청 반감기를 달성한다. 이후, 변형된 분자를 상기 기술된 시험관내 검정에서 재시험하여, TNFR1에 대한 높은 친화성 결합 및 TNFR1 신호전달의 강력한 억제가 유지되는 지를 확인한다. 성공적인 후보의 생산을 추가 시험관내 및 생체내 검정을 위해 확대한다. The optimized molecule is then, as described above in the detailed description, for example by fusion with an IgG Fc domain, particularly a modified Fc domain, or human serum albumin (HSA), or by PEGylation, Linked to a half-life extending moiety, an in vivo serum half-life of about 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10 or more, eg, 10-12 days, is achieved in SCID mice. The modified molecule is then retested in the in vitro assay described above to ensure that high affinity binding to TNFR1 and potent inhibition of TNFR1 signaling is maintained. Production of successful candidates is expanded for further in vitro and in vivo assays.
시험관내 검정in vitro assay
식균 작용 검정Phagocytosis Assay
상세한 설명에서 논의되고 기술된 바와 같이, TNFR1 활성을 억제하는 기존의 TNF 차단제는 또한 TNFR2를 억제한다. TNF 차단제에는 규제 기관으로부터의 두 가지 유형의 블랙 박스 경고(black box warning)가 있다. 첫 번째는 항-TNF(TNF 차단제) 치료된 환자의 감염에 대한 감수성이다. 이러한 감염은 박테리아, 마이코박테리아(예를 들어, 결핵), 진균(예를 들어, 히스토플라스마증, 아스페르길루스증, 칸디다증, 콕시디오이데스진균증, 분아균증, 및 뉴모시스티스), 바이러스(예를 들어, B형 간염), 및 다른 기회감염 병원체(일반적으로 건강한 사람에게는 질병을 일으키지 않지만, 사람의 면역 체계(저항)가 약화될 때 심각한 질병을 유발할 수 있는 유기체)로 인한 다양한 기관 시스템 및 부위를 포함할 수 있다. 또 다른 발행된 블랙박스 경고는 소아 악성종양과 관련이 있다 (예를 들어, online.epocrates.com/u/10b3301/Humira/Black+Box+Warnings 참조). 상세한 설명에서 논의된 바와 같이, 이러한 취약성은 이들의 리간드인 TNF가 차단될 때 TNFR1 및 TNFR2에 의한 신호전달의 전체 차단으로부터 발생한다. TNF의 이러한 선천 면역 효과의 억제는 TNFR2에 의해 매개되고(예를 들어, 문헌[Ahmad 등 (2018) Front. Immunol. 9:2572), TNFR2를 우선적으로 활성화시키는 막횡단 형태의 TNF에 의해 주로 매개된다 (예를 들어, 문헌[Miller 등 (2015) Journal of Immunology 195(6):2633-2647] 참조).As discussed and described in the detailed description, existing TNF blockers that inhibit TNFR1 activity also inhibit TNFR2. There are two types of black box warnings from regulatory agencies for TNF blockers. The first is the susceptibility of anti-TNF (TNF blocker) treated patients to infection. These infections include bacteria, mycobacteria (e.g., tuberculosis), fungi (e.g., histoplasmosis, aspergillosis, candidiasis, coccidioidomycosis, blastomycosis, and pneumocystis), viruses (e.g., hepatitis B), and other opportunistic pathogens (organisms that normally do not cause disease in healthy people, but can cause serious illness when a person's immune system (resistance) is weakened). and site. Another issued black box warning relates to pediatric malignancies (eg see online.epocrates.com/u/10b3301/Humira/Black+Box+Warnings). As discussed in the detailed description, this vulnerability results from total blockage of signaling by TNFR1 and TNFR2 when their ligand, TNF, is blocked. Suppression of this innate immune effect of TNF is mediated by TNFR2 (see, for example, Ahmad et al. (2018) Front. Immunol. 9 :2572) and is primarily mediated by transmembrane forms of TNF that preferentially activate TNFR2. (See, eg, Miller et al. (2015) Journal of Immunology 195(6) :2633-2647).
아달리무맙, 인플릭시맙, 및 에타너셉트와 같은 항-TNF 치료제는 포르볼 미리스테이트 아세테이트-분화된 인간 THP-1 세포에서 IFN-γ 유도 식포 성숙에 억제 효과를 갖는 것으로 나타났다. 에타너셉트가 아닌 아달리무맙 및 인플릭시맙은 IFN-γ의 존재 또는 부재 하에 일차 인간 말초 혈액 단핵구-유래 대식세포에서 식포 성숙을 억제한다 (예를 들어, 문헌[Harris 등 (2008) J. Infect. Dis . 198:1842-1850] 참조). 상기의 관점에서, 특정 TNFR1 억제제 작제물의 이점은 TNFR2 기능, 및 이에 따른 대식세포 기능의 보존이며, 대식세포는 기회감염의 유기체를 제거하는 데 중요하다. 기회 감염원은 결핵을 유발하는 마이코박테리아를 포함한다 (예를 들어, 문헌[Fraga 등 (2018) Curr . Issues Mol . Biol . 25:169-198] 참조). 대식세포 기능은 TNF 차단제로 치료된 환자의 자가면역 질환에서 파괴된다. TNFR1-특이적 길항제는 단지 TNFR1 기능을 억제함으로써, 정상 대식세포 기능에 필요한 TNFR2 기능의 파괴를 피한다. 이러한 TNFR1-특이적 길항제는 대식세포 포식작용에 대한 항-TNF 효과에 대한 검정에 의해 확인될 수 있다. 확인된 TNFR1-특이적 길항제 중에는 또한 TNFR2 기능을 자극하여 대식세포 활성을 증가시키는 것들(TNFR1 길항제 및 TNFR2 효능제)이 있다. Anti-TNF therapeutics such as adalimumab, infliximab, and etanercept have been shown to have an inhibitory effect on IFN-γ induced phagocytic maturation in phorbol myristate acetate-differentiated human THP-1 cells. Adalimumab and infliximab, but not etanercept, inhibit phagocytic maturation in primary human peripheral blood monocyte-derived macrophages in the presence or absence of IFN-γ (see, e.g., Harris et al. (2008) J. Infect Dis.198 : 1842-1850) . In view of the foregoing, an advantage of certain TNFR1 inhibitor constructs is the preservation of TNFR2 function, and thus macrophage function, which macrophages are important for eliminating opportunistic organisms. Opportunistic agents include the mycobacteria that cause tuberculosis (see, eg, Fraga et al. (2018) Curr . Issues Mol . Biol . 25 :169-198). Macrophage function is disrupted in autoimmune disease in patients treated with TNF blockers. TNFR1-specific antagonists only inhibit TNFR1 function, thereby avoiding disruption of TNFR2 function required for normal macrophage function. Such TNFR1-specific antagonists can be identified by assays for anti-TNF effects on macrophage phagocytosis. Among the identified TNFR1-specific antagonists are also those that increase macrophage activity by stimulating TNFR2 function (TNFR1 antagonists and TNFR2 agonists).
마이코박테리움 mycobacterium 투베르쿨로시스tuberculosis 감염에 대한 대식세포 반응에 대한 on the macrophage response to infection. TNFR1TNFR1 길항제의 효과를 결정하기 위한 검정 Assays to determine the effect of antagonists
TNF는 마이코박테리움 투베르쿨로시스(Mycobacterium tuberculosis)를 포함하는, 다양한 병원체에 대한 염증성 숙주 반응을 매개하는 데 중요한 역할을 하며, TNF는 또한 결핵(TB)의 면역병리학에서 역할을 한다. 마이코박테리아 감염은 대식세포에 의한 TNF의 분비를 유도한다. TNF는 대식세포가 마이코박테리아를 포식하고 사멸시키는 능력을 향상시킨다. TNF는 또한 대식세포 아폽토시스를 자극하여, 수지상 세포에 의한 마이코박테리아 항원의 사멸 및 제시를 증가시킨다. TNF는 또한 육아종의 형성 및 유지에 필요하며, M. 투베르쿨로시스로 만성적으로 감염된 마우스에서 TNF의 중화는 육아종의 완전성을 파괴하여, 감염을 악화시키고 사망률을 증가시킨다. 아달리무맙 및 인플릭시맙과 같은 TNF 차단제는 M. 투베르쿨로시스를 포함하는, 다양한 병원체로 감염에 대한 감수성을 증가시키고, 인간 대식세포에서 마이코박테리아-함유 식포 성숙을 억제함으로써 잠복 결핵의 재활성화 위험을 증가시킨다. 식포 성숙(즉, 식포 산성화 및 리소좀과의 융합)은 T-세포에 대한 마이코박테리아 항원의 제시, 및 적응 면역 반응의 개시에 필수적이다 (예를 들어, 문헌[Harris 등 (2008) J. Infect. Dis. 198:1842-1850] 참조). TNF plays an important role in mediating inflammatory host responses to various pathogens, including Mycobacterium tuberculosis , and TNF also plays a role in the immunopathology of tuberculosis (TB). Mycobacterial infection induces the secretion of TNF by macrophages. TNF enhances the ability of macrophages to engulf and kill mycobacteria. TNF also stimulates macrophage apoptosis, increasing killing and presentation of mycobacterial antigens by dendritic cells. TNF is also required for granuloma formation and maintenance, and neutralization of TNF in mice chronically infected with M. tuberculosis disrupts granuloma integrity, exacerbating infection and increasing mortality. TNF blockers, such as adalimumab and infliximab, increase susceptibility to infection with various pathogens, including M. tuberculosis, and suppress mycobacteria-containing phagocytic maturation in human macrophages, thereby preventing latent tuberculosis. Increases the risk of reactivation. Vascular maturation (i.e., phagocytic acidification and fusion with lysosomes) is essential for the presentation of mycobacterial antigens to T-cells and initiation of the adaptive immune response (see, eg, Harris et al. (2008) J. Infect. Dis. 198 :1842-1850]).
TNFR1 길항제를 확인 및/또는 특성화하기 위해, M. 투베르쿨로시스로의 감염에 대한 대식세포 반응에 대한 본 명세서에 제공된 TNFR1 길항제의 효과를 평가한다. 인간 대식세포에서 마이코박테리아-함유 식포 성숙을 분석하고, 문헌[Harris 등 (2008) J. Infect. Dis . 198:1842-1850]에 기술된 방법을 이용하여, 아달리무맙과 같은, TNF 차단제에서 식포 성숙과 비교한다. 아달리무맙과 같은, 공지된 TNF 차단제와 비교하여 감염에 대한 감수성을 증가시키지 않는 TNFR1 길항제가 관심 대상이다.To identify and/or characterize a TNFR1 antagonist, the effect of a TNFR1 antagonist provided herein on the macrophage response to infection with M. tuberculosis is evaluated. Mycobacteria-containing phagocytic maturation was assayed in human macrophages and described by Harris et al. (2008) J. Infect. Dis . 198 :1842-1850] compared to phagocytic maturation in TNF blockers, such as adalimumab. Of interest are TNFR1 antagonists that do not increase susceptibility to infection compared to known TNF blockers, such as adalimumab.
THP-1 세포 및 단핵구-유래 대식세포(MDM)의 제조Preparation of THP-1 cells and monocyte-derived macrophages (MDM)
인간 THP-1 세포를 10% 우태아 혈청(FBS; Gibco)과 함께 RPMI 1640(Invitrogen)에서 배양한다. 세포를 24시간 동안 100 nmol/L의 포르볼 미리스테이트 아세테이트(PMA)로 처리함으로써 대식세포-유사 세포로 분화시킨 다음, 정상 배지에서 3일 동안 배양하였다. 인간 단핵구-유래 대식세포(MDM)를 제조하기 위해, Histopaque®-1077(Sigma)에서 밀도 구배 원심분리를 사용하여 건강한 공여자의 혈액으로부터 말초 혈액 단핵 세포(PBMC)를 분리한다. 단핵구를 젤라틴-코팅된 배양 접시에 부착시켜 분리하고, 5% 인간 AB 혈청(Sigma)과 함께 RPMI 1640에서 밤새 배양하였다. 부착성 세포를 PBS 중 10 mmol/L EDTA로 제거하고, 12-웰 플레이트에서 커버슬립 상에서 10일 동안 성장시킨다. THP-1 세포 및 MDM을 커버슬립 상에서 2Х105개 세포/웰의 농도로 성장한다. Human THP-1 cells are cultured in RPMI 1640 (Invitrogen) with 10% fetal bovine serum (FBS; Gibco). Cells were differentiated into macrophage-like cells by treatment with 100 nmol/L of phorbol myristate acetate (PMA) for 24 hours and then cultured in normal medium for 3 days. To prepare human monocyte-derived macrophages (MDM), peripheral blood mononuclear cells (PBMC) are isolated from the blood of healthy donors using density gradient centrifugation in Histopaque ® -1077 (Sigma). Monocytes were isolated by attaching to gelatin-coated culture dishes and cultured overnight in RPMI 1640 with 5% human AB serum (Sigma). Adherent cells are removed with 10 mmol/L EDTA in PBS and grown on coverslips in 12-well plates for 10 days. THP-1 cells and MDM are grown on coverslips at a concentration of 2Х10 5 cells/well.
마이코박테리아의 제조Preparation of mycobacteria
녹색 형광 단백질(GFP)-표지된 마이코박테리움 보비스 바실러스 칼미터-게린(GFP-BCG), 및 약독화된 M. 투베르쿨로시스 균주 H37Ra 및 이의 독성 대응물, H37Rv를 0.5% Tween, 0.2% 글리세롤, 및 10% 알부민-덱스트로스-카탈라제 보충물(BD)을 갖는 Middlebrook 7H9 브로쓰에서 성장시킨다. 마이코박테리아를 사용 전에 대수기로 성장시키고, 감염 전에 10% FBS를 갖는 RPMI 1640에 재현탁시킨다. M. 투베르쿨로시스 균주 H37Ra는 PKH67(Sigma)로 형광 표지되며, 균주 H37Rv를 제조업체의 프로토콜에 따라 플루오레세인 이소티오시아네이트(FITC, 1 mg/mL; Sigma)로 표지한다.Green Fluorescent Protein (GFP)-tagged Mycobacterium bovis Bacillus Calmeter-Guerin (GFP-BCG), and attenuated M. tuberculosis strain H37Ra and its virulent counterpart, H37Rv, were mixed with 0.5% Tween, 0.2 % glycerol, and 10% albumin-dextrose-catalase supplement (BD) in Middlebrook 7H9 broth. Mycobacteria are grown to log phase prior to use and resuspended in RPMI 1640 with 10% FBS prior to infection. M. tuberculosis strain H37Ra is fluorescently labeled with PKH67 (Sigma), and strain H37Rv is labeled with fluorescein isothiocyanate (FITC, 1 mg/mL; Sigma) according to the manufacturer's protocol.
식포 성숙의 결정Determination of phagocytic maturation
마이코박테리아는 식포와 리소좀의 융합을 억제하여 리소좀 하이드롤라제의 산성화 및 동원을 방지할 수 있다. 이러한 식포 성숙의 차단은 대식세포를 IFN-γ로 전처리함으로써 극복될 수 있다. TNF(5 ng/mL)로의 마이코박테리아로 감염된 세포의 처리는 또한 식포 산성화를 향상시킨다. 대식세포에서 마이코박테리아 식포와 리소좀의 융합에 대한 TNFR1 길항제 및 TNF 차단제의 효과를 결정하기 위해, PMA-분화된 THP-1 세포 또는 인간 말초 혈액 MDM을 IFN-γ 처리와 함께 또는 이러한 처리 없이 GFP-BCG, 또는 PKH67-표지된 M. 투베르쿨로시스 균주 H37Ra, 또는 FITC-표지된 M. 투베르쿨로시스 균주 H37Rv로 감염시키고, 식포-리소좀 융합을 산성화된 식포에 대한 마커로서 LysoTracker® Red(LT), 및 포식리소좀 마커로서 CD63 및 카텝신 D를 사용하여, 공초점 현미경에 의해 분석한다. IFN-γ 유도 식포 성숙/산성화의 억제를 표지된 마이코박테리아의 LysoTracker® Red, CD63 또는 카텝신 D의 공동국재화(colocalization)에 의해 결정한다. 예를 들어, 대조군과 비교하여, LT, 또는 CD63, 또는 카텝신 D와 표지된 마이코박테리아의 공동국재화 퍼센트의 감소는 IFN-γ 유도 식포 산성화의 억제를 나타낸다. Mycobacteria can inhibit the fusion of phagosomes with lysosomes, preventing acidification and recruitment of lysosomal hydrolases. This blockage of phagocytic maturation can be overcome by pre-treating macrophages with IFN-γ. Treatment of cells infected with mycobacteria with TNF (5 ng/mL) also enhances phagocytic acidification. To determine the effect of TNFR1 antagonists and TNF blockers on the fusion of mycobacterial phagosomes with lysosomes in macrophages, PMA-differentiated THP-1 cells or human peripheral blood MDMs were treated with or without IFN-γ treatment to GFP- BCG, or PKH67-labeled M. tuberculosis strain H37Ra, or FITC-labeled M. tuberculosis strain H37Rv, and phagosome-lysosomal fusion as a marker for acidified phagocytosis LysoTracker ® Red (LT ), and by confocal microscopy, using CD63 and cathepsin D as phagolysosomal markers. Inhibition of IFN-γ induced phagocytic maturation/acidification is determined by colocalization of LysoTracker® Red, CD63 or cathepsin D of labeled mycobacteria. For example, a decrease in the percent colocalization of LT, or CD63, or cathepsin D with labeled mycobacteria compared to control indicates inhibition of IFN-γ induced phagocytic acidification.
IFN-γ(200 U/mL)와 함께 또는 이의 없이, TNFR1 길항제 또는 TNF 차단제(예를 들어, 아달리무맙, 인플릭시맙, 에타너셉트, 등; 10 μg/mL)를 감염시키기 24시간 전에 THP-1 세포 또는 MDM에 첨가한다. 대조군으로서, 세포를 배지만으로 또는 IgG1을 생산하는 골수종 환자로부터의 10 μg/mL 인간 IgG1(Calbiochem)로 처리한다. 이후 세포를 M. 보비스 GFP-BCG, PKH67-표지된 M. 투베르쿨로시스 H37Ra, 또는 FITC-표지된 M. 투베르쿨로시스 H37Rv로 15분 동안 감염시키고, PBS로 3회 세척하여 결합되지 않은 마이코박테리아를 제거하고, 2시간 동안 인큐베이션한다. 감염 다중도(MOI)를 항산 바실루스 염색(acid-fast bacilli staining)에 의한 대식세포의 감염 15분 후에 현미경으로 기록한다. 세포를 대략 70%의 세포에서 1 내지 5 바실루스의 MOI로 감염시킨다.TNFR1 antagonist or TNF blocker (e.g., adalimumab, infliximab, etanercept, etc; 10 μg/mL) with or without IFN-γ (200 U/mL) THP 24 hours prior to infection -1 Add to cells or MDM. As a control, cells are treated with medium alone or with 10 μg/mL human IgG1 (Calbiochem) from a myeloma patient producing IgG1. Cells were then infected with M. bovis GFP-BCG, PKH67-labeled M. tuberculosis H37Ra, or FITC-labeled M. tuberculosis H37Rv for 15 minutes and washed three times with PBS to remove unbound Remove mycobacteria and incubate for 2 hours. Multiplicity of infection (MOI) is recorded microscopically 15 min after infection of macrophages by acid-fast bacilli staining. Cells are infected with an MOI of 1 to 5 bacilli in approximately 70% of the cells.
2시간 인큐베이션 후, 세포를 실온(RT)에서 20분 동안 2% 파라포름알데하이드에 고정시키고; 균주 H37Rv의 경우, 세포를 4% 파라포름알데하이드에 밤새 고정시켰다. 이후, 세포를 PBS 중 0.1% Triton X-100으로 투과시키고, PBS 중 1% 소 혈청 알부민 및 1% 염소 혈청으로 실온에서 30분 동안 차단한다. 세포를 RT에서 1시간 동안 일차 항체(CD63에 대한 1 μg/mL 마우스 모노클로날 항체(LAMP-3; Santa Cruz Biotechnology); 또는 카텝신 D에 대한 10 μg/mL 마우스 모노클로날 항체(Calbiochem))와 함께 인큐베이션한 다음, RT에서 1시간 동안 이차 항체(4 μg/mL Alexa Fluor 488- 또는 568-표지된 염소 항-마우스 IgG; Invitrogen)와 함께 인큐베이션한다. 대안적으로, 고정 전에, 세포를 마이코박테리아와 함께 인큐베이션의 마지막 60분 동안 LysoTracker® Red DND-99(100 nmol/L; Invitrogen)와 함께 인큐베이션한다. LysoTracker® Red DND-99는 살아있는 세포에서 산성 소기관(예컨대, 산성화된 식포)을 표지화하고 추적하기 위한 적색-형광 염료이다.After 2 h incubation, cells were fixed in 2% paraformaldehyde for 20 min at room temperature (RT); For strain H37Rv, cells were fixed in 4% paraformaldehyde overnight. Cells are then permeabilized with 0.1% Triton X-100 in PBS and blocked with 1% bovine serum albumin and 1% goat serum in PBS for 30 minutes at room temperature. Cells were incubated with primary antibodies (1 μg/mL mouse monoclonal antibody to CD63 (LAMP-3; Santa Cruz Biotechnology); or 10 μg/mL mouse monoclonal antibody to cathepsin D (Calbiochem)) for 1 hour at RT. ), followed by incubation with secondary antibody (4 μg/mL Alexa Fluor 488- or 568-labeled goat anti-mouse IgG; Invitrogen) for 1 hour at RT. Alternatively, prior to fixation, cells are incubated with LysoTracker® Red DND-99 (100 nmol/L; Invitrogen) for the last 60 minutes of incubation with mycobacteria. LysoTracker ® Red DND-99 is a red-fluorescent dye for labeling and tracking acidic organelles (eg, acidified phagocytic cells) in living cells.
커버슬립을 형광 결합 배지(fluorescent mounting medium)(Dako)와 함께 유리 슬라이드에 마운팅하고, 이미지를 Olympus FluoViewTM 1000 및 Zeiss LSM 510 레이저 스캐닝 공초점 현미경과 같은, 레이저 스캐닝 공초점 현미경에 기록한다. 적절한 소프트웨어 및 Adobe Photoshop을 사용하여 이미지를 분석하고 제조한다. Coverslips are mounted on glass slides with fluorescent mounting medium (Dako) and images are recorded on a laser scanning confocal microscope, such as an
TNF의 측정Measurement of TNF
THP-1 세포를 상기 기술된 바와 같이 제조하고, IFN-γ 전처리와 함께 또는 이러한 처리 없이 BCG 또는 M. 투베르쿨로시스 H37Ra로 감염시킨다. (마이코박테리아 감염에 반응하여 분비된) 상청액에서 면역반응성 TNF의 수준을 제조업체의 지침에 따라, 상업적 ELISA 키트(R&D systems)를 사용하여 측정한다.THP-1 cells are prepared as described above and infected with BCG or M. tuberculosis H37Ra with or without IFN-γ pretreatment. Levels of immunoreactive TNF in the supernatant (secreted in response to mycobacterial infection) are measured using commercial ELISA kits (R&D systems) according to the manufacturer's instructions.
TNFTNF 차단(예컨대, block (e.g. 아달리무맙Adalimumab , , 인플릭시맙infliximab 또는 or 에타너셉트로의to etanercept 처리), 및 특이적 TNFR1 억제를 구별하는 조절 T-세포(Treg 세포) 검정 및 사이토카인 검정 treatment), and regulatory T-cell (Treg cell) assays and cytokine assays that distinguish specific TNFR1 inhibition
1. FoxP3 발현의 보존 1. Conservation of FoxP3 expression
TNF 차단(아달리무맙, 리툭시맙, 또는 에타너셉트 사용)을 기능적 조절 T-세포의 대리 마커로서 FoxP3 프로모터의 메틸화에 대한 특정 TNFR1 억제와 비교한다. 인간 TNFR1(HuTNFR1)을 구성적으로 발현하는 형질전환 마우스를 사용하여 FoxP3 프로모터의 메틸화에 대한 TNF 차단 대 특이적 TNFR1 억제의 차별적인 영향을 평가한다. 형질전환 마우스를 표준 방법에 의해 제조하고, 계약자 서비스 또는 임의의 방법, 예컨대, Cyagen, Genoway, 또는 Polygene에 의해 제조할 수 있다.TNF blockade (with adalimumab, rituximab, or etanercept) is compared to specific TNFR1 inhibition for methylation of the FoxP3 promoter as a surrogate marker of functional regulatory T-cells. Transgenic mice constitutively expressing human TNFR1 (HuTNFR1) are used to evaluate the differential effect of TNF blockade versus specific TNFR1 inhibition on methylation of the FoxP3 promoter. Transgenic mice are prepared by standard methods and can be produced by contractor services or any method, such as Cyagen, Genoway, or Polygene.
이러한 효과를 RA의 널리 사용되는 모델인 콜라겐-유도 관절염(CIA)을 갖는 형질전환 마우스에서 평가한다. C57/BL6N.Q;H-2q/HuTNFR1/Hunt 백그라운드를 갖는 마우스를 Genoway 또는 Taconic Labs에 의해 제조할 것이다. 마우스를 문헌[Tseng 등 ((2019) Proc . Natl . Acad . Sci . U.S.A . 116:21666-21672]에 기술된 바와 같이 완전 프로이드 애주번트(CFA) 중에 유화된 소 타입 II 콜라겐으로 면역화할 것이다. FoxP3 메틸화에 대한 검정은 또한 문헌[Tseng 등 ((2019) Proc . Natl . Acad. Sci . U.S.A . 116:21666-21672]에 기술된 바와 같이 수행한다. CD4+CD25+ 세포에서 FoxP3의 중간 형광 강도(MFI) 및 히스토그램에 의해 결정된 바와 같이, TNF 차단 처리된 마우스로부터의 조절 T-세포는 특이적 TNFR1 차단을 갖는 조절 T-세포보다 더 낮은 수준의 FoxP3를 발현한다.These effects are evaluated in transgenic mice with collagen-induced arthritis (CIA), a widely used model of RA. Mice with the C57/BL6N.Q;H-2q/HuTNFR1/Hunt background will be produced by Genoway or Taconic Labs. Mice will be immunized with bovine type II collagen emulsified in complete Freud's adjuvant (CFA) as described by Tseng et al ((2019) Proc . Natl . Acad . Sci . USA . 116 :21666-21672). Assays for FoxP3 methylation are also performed as described by Tseng et al. ((2019) Proc . Natl . Acad. Sci . USA . 116 :21666-21672. Median fluorescence intensity of FoxP3 in CD4 + CD25 + cells Regulatory T-cells from mice treated with TNF blockade express lower levels of FoxP3 than regulatory T-cells with specific TNFR1 blockade, as determined by (MFI) and histograms.
2. TNFR1 대 TNF 차단제의 특이적 억제는 조절 T-세포를 절약한다2. Specific inhibition of TNFR1 versus TNF blockers spares regulatory T-cells
문헌[McCann 등 ((2014) Arthritis & Rheumatology 66(10):2728-2738)]에 기술된 방법을 이용하여, 림프절 및 비장에서 조절 T-세포의 수를 형질전환(C57/BL6N.Q;H-2q/HuTNFR1/Hunt) CIA 마우스를 TNF 차단제 및 TNFR1의 특정 억제제로 처리한 후 비교한다.Using the method described by McCann et al. ((2014) Arthritis & Rheumatology 66(10):2728-2738), the number of regulatory T-cells in the lymph nodes and spleen was transduced (C57/BL6N.Q;H -2q/HuTNFR1/Hunt) CIA mice are treated with a TNF blocker and a specific inhibitor of TNFR1 and then compared.
3. 염증성 사이토카인은 콜라겐-유발 관절염에서 3. Inflammatory cytokines in collagen-induced arthritis TNFTNF 차단 대blocking stand 특정 specific TNFR1TNFR1 억제에서 상향 조절된다 is upregulated in inhibition
콜라겐-유발 관절염(CIA)을 갖는 형질전환 마우스(C57/BL6N.Q;H-2q/HuTNFR1/Hunt)(예를 들어, 문헌[McAnn 등 (2014) Arthritis & Rheumatology 66(10):2728-2738] 참조)를 TNF 차단제 및 TNFR1-특이적 길항제로 처리한다. 혈청 염증성 사이토카인을 평가한다 (IFN-감마, IL-12p70, IL-10, RANTES (CCL5); 예를 들어, 문헌[McCann 등(2014) Arthritis & Rheumatology 66(10):2728-2738] 참조). TNFR1을 차단하는 데 특이적인 길항제는 IFN-감마, IL-12p70, IL-10, 또는 RANTES(CCL5) 중 하나 이상을 유의하게 덜 유도한다. 이는 비장 및 림프절에서 TNFR2 기능 및 조절 T-세포 기능을 보존하기 때문이다.Transgenic mice with collagen-induced arthritis (CIA) (C57/BL6N.Q;H-2q/HuTNFR1/Hunt) (see, e.g., McAnn et al. (2014) Arthritis & Rheumatology 66(10):2728-2738 ]) with a TNF blocker and a TNFR1-specific antagonist. Assess serum inflammatory cytokines (IFN-gamma, IL-12p70, IL-10, RANTES (CCL5); see, eg, McCann et al. (2014) Arthritis & Rheumatology 66(10):2728-2738) . Antagonists specific for blocking TNFR1 induce significantly less of one or more of IFN-gamma, IL-12p70, IL-10, or RANTES (CCL5). This is due to preservation of TNFR2 function and regulatory T-cell function in the spleen and lymph nodes.
생체내 검정 in vivo assay
연구를 인간화(HuTNFR1/HuTNF) 형질전환 마우스로 수행한다. TNFR1 길항제 분자를 다중 자가면역 질환 모델에서의 효능에 대해 평가한다. 이들은 TNFR1 및 TNF에 대한 인간 이식 유전자를 발현하는, 상기 기술된 모델을 포함한다. 자가면역 질환에 대한 대안적인 모델이 알려져 있다. 예를 들어, RA에 대한 것을 포함하는 모델은 문헌[Schinnerling 등 ((2019) Front. Immunol 10:203)]에 상세히 기술되어 있다. 효능을 확립하기 위해, 특정 TNFR1 길항제 작제물뿐만 아니라 본 명세서에 제공된 다른 작제물을 하나 초과의 모델에서 시험한다. 모델 중에는 적어도 류마티스 관절염(RA), 크론병, 및 다발성 경화증(실험적 자가면역 뇌염) 모델(상세한 설명에서 논의됨)이 포함된다.Studies are performed with humanized (HuTNFR1/HuTNF) transgenic mice. TNFR1 antagonist molecules are evaluated for efficacy in multiple autoimmune disease models. These include the models described above expressing human transgenes for TNFR1 and TNF. Alternative models for autoimmune diseases are known. For example, a model including that for RA is described in detail in Schinnerling et al. ((2019) Front. Immunol 10 :203). To establish efficacy, certain TNFR1 antagonist constructs, as well as other constructs provided herein, are tested in more than one model. Included among the models are at least the rheumatoid arthritis (RA), Crohn's disease, and multiple sclerosis (experimental autoimmune encephalitis) models (discussed in the detailed description).
염증성 장 질환(궤양성 대장염 및 크론병을 포함하는 IBD)은 TNF 차단제에 대해 처음으로 승인된 적응증이었다. 이러한 질환의 다수의 마우스 모델이 이용 가능하고, 문헌[Mueller((2002) Immunology 105(1):1-8)]에 기술되었다. 상세한 설명에서 논의된 바와 같이, 다발성 경화증(MS) 및 알츠하이머병을 포함하는, 자가면역 신경퇴행성 질환은 중요한 질병 표적이다. 알츠하이머병(AD)은 전 세계적으로 치매의 주요 원인이고, 노인들에게 가장 심각한 건강 문제 중 하나를 나타낸다. 추정된 540만 명의 미국인이 AD를 갖고 있으며, 이러한 수는 질환을 중지, 예방 또는 늦추는 의학적 돌파구가 없는 경우 2050년까지 3배가 될 것으로 예상된다 (예를 들어, 문헌[Chang 등 (2017) J. Cent. Nerv . Syst. Dis . 9:1179573517709278] 참조). 증거는 본원에서 제공되는 TNFR1 길항제 작제물 및 다른 작제물이 치료 후보물임을 나타내는데, 그 이유는 TNF 차단제를 사용한 연장된 치료를 경험한 대상체가 질환에 걸릴 가능성이 적기 때문이다 (예를 들어, 문헌[Chou 등 (2016) CNS Drugs 30:1111] 참조). 데이터는 상향-조절된 TNF 발현이 알츠하이머병, 파킨슨병, 뇌졸중 및 다발성 경화증과 같은 상이한 신경퇴행성 질환 및 병태와 관련이 있음을 보여준다 (예를 들어, 문헌[McCoy 등 (2008) J. Neuroinflammation 5(1):45] 참조). 그러나, 기존의 TNF 차단제는 질환 진행을 치료, 개선, 예방 또는 지연시키는 데 효과적인 것으로 보이지 않는다 (예를 들어, 문헌[Tortarolo 등(2015) J. Neurochem. 135:109-124] 참조). 본원에 기술된 바와 같이, 다양한 증거 라인은 TNF 차단제가 TNFR1 및 TNFR2의 공동-억제 때문에 이러한 적응증에서 작용하지 않는다는 것을 나타내며; TNFR2는 TNF 차단제에 의한 치료에 의해 손실되는 신경-보호 특성을 갖는다. 다른 사람들은 다양한 형태의 "TNFR1 억제제" 또는 "TNFR2 효능제"로 이러한 문제에 접근하려고 시도하였다. 이들 연구 중 어느 것도 표적화될 수 있는 신체의 많은 에피토프 중 하나인 것과 달리, TNFR1 또는 TNFR2가 선택적으로 표적화되었는 지의 여부를 결정하기 위한 교차-반응성을 포함하지 않았다.Inflammatory bowel disease (IBD, including ulcerative colitis and Crohn's disease) was the first approved indication for a TNF blocker. A number of mouse models of this disease are available and have been described by Mueller ((2002) Immunology 105(1):1-8). As discussed in the detailed description, autoimmune neurodegenerative diseases, including multiple sclerosis (MS) and Alzheimer's disease, are important disease targets. Alzheimer's disease (AD) is a leading cause of dementia worldwide and represents one of the most serious health problems for the elderly. An estimated 5.4 million Americans have AD, and this number is expected to triple by 2050 if there are no medical breakthroughs to stop, prevent, or slow the disease (see, e.g., Chang et al. (2017) J. Cent. Nerv . Syst. Dis . 9:1179573517709278). Evidence indicates that the TNFR1 antagonist constructs and other constructs provided herein are therapeutic candidates because subjects undergoing prolonged treatment with TNF blockers are less likely to develop the disease (see, e.g., [Chou et al. (2016) CNS Drugs 30:1111]). Data show that up-regulated TNF expression is associated with different neurodegenerative diseases and conditions such as Alzheimer's disease, Parkinson's disease, stroke and multiple sclerosis (see, e.g., McCoy et al. (2008) J. Neuroinflammation 5(1):45]). However, existing TNF blockers do not appear to be effective in treating, ameliorating, preventing or delaying disease progression (see, eg, Tortarolo et al. (2015) J. Neurochem. 135:109-124). As described herein, various lines of evidence indicate that TNF blockers do not work in this indication because of co-inhibition of TNFR1 and TNFR2; TNFR2 has neuro-protective properties that are lost by treatment with TNF blockers. Others have attempted to approach this problem with "TNFR1 inhibitors" or "TNFR2 agonists" in various forms. None of these studies involved cross-reactivity to determine whether TNFR1 or TNFR2 were selectively targeted, unlike being one of many epitopes in the body that could be targeted.
이러한 문제는 본원에서 해결된다. 먼저, 항-TNFR1 길항제의 패밀리를 생성하고, 상기 모델에서 시험하여, 이들이 예측된 바와 같이 작용함을 보여준다. 이후, 면역화학을 사용하여 이들이 선택적임을 입증한다. 여러 계약 연구 실험실(예를 들어, Sino Biological, Inc., 및 LSBio)이 이러한 서비스를 제공한다.This problem is addressed herein. First, a family of anti-TNFR1 antagonists was created and tested in the model to show that they act as predicted. Immunochemistry is then used to prove that they are selective. Several contract research laboratories (eg, Sino Biological, Inc., and LSBio) provide these services.
상세한 설명에서 논의된 바와 같이, 다른 자가면역 및 만성 염증성 질환 상태는 TNF의 존재와 관련이 있다. 이들은 II형 당뇨병 및 자궁내막증을 포함한다. 이러한 질환의 마우스 모델은 공지되어 있으며, 이들 마우스의 HuTNFR1/HuTNF 형질전환 버전은 본 명세서에 제공된 특정 항-TNFR1 길항제와의 효능을 입증하기 위해 사용된다.As discussed in the detailed description, other autoimmune and chronic inflammatory disease conditions are associated with the presence of TNF. These include type II diabetes and endometriosis. Mouse models of this disease are known, and HuTNFR1/HuTNF transgenic versions of these mice are used to demonstrate efficacy with specific anti-TNFR1 antagonists provided herein.
급성 호흡 곤란 증후군 acute respiratory distress syndrome
호흡기의 바이러스 병원체(예를 들어, 인플루엔자, SARS 바이러스/코로나바이러스)는 호흡기 상피 세포를 감염시키며, 조직-상주 폐포 대식세포는 폐에서 바이러스 감염에 대한 첫 번째 반응자이다. 이들은 옵소닌화된 바이러스 입자 또는 감염된 아폽토시스 세포의 포식작용 및 과다한 염증성 사이토카인 및 케모카인의 방출을 통한 제거에 영향을 주어 면역 반응을 개시한다 (예를 들어, 문헌[Herold 등 (2015) Eur . Resp . J. 45:1463-1478] 참조). TNF 차단제는 인플루엔자에 감염된 마우스의 생존을 연장시키는 것으로 나타났다 (예를 들어, 문헌[Shi 등 (2013) Crit . Care 17:R301] 참조). TNF 차단제는 SARS-Cov 2를 치료하는 데 사용되었다 (예를 들어, 문헌[Feldmann 등 (2020) Lancet 395:1407-1409] 참조). 상세한 설명에 기술된 바와 같이, TNF 차단제의 공지된 효과는 조절 T-세포(Treg)를 감소시키는 것이며, 이는 Treg가 염증의 천연 억제제이기 때문에 문제가 된다. 따라서, 본원에 기술되고 제공되는 바와 같이, TNFR2와 상호작용하지 않거나 TNFR2를 작용시키는, TNFR1-특이적 억제제는 이러한 목적을 위해 우수하다. 본 명세서에 제공된 작제물을 시험하기 위해, 마우스를 내인성 TNFR1이 결핍되고 HuTNFR1/HuTNF를 발현하도록 조작한다. 이러한 마우스는 인플루엔자 감염 후 HuTNF/HuTNFR1에 의해 유발된 급성 호흡 곤란 증후군을 나타낼 것이다 (문헌[Shi 등 (2013) Crit . Care 17:R301]에 기술된 바와 같음). TNFR2를 길항하지 않는 TNFR1-특이적 길항제 작제물을 투여한다. 효능은 여러 기준 중 임의의 것에 의해 결정된다:Viral pathogens of the respiratory tract (eg, influenza, SARS virus/coronavirus) infect respiratory epithelial cells, and tissue-resident alveolar macrophages are the first responders to viral infection in the lung. They initiate the immune response by affecting clearance of opsonized viral particles or infected apoptotic cells through phagocytosis and release of excess inflammatory cytokines and chemokines (see, e.g., Herold et al. (2015) Eur . Resp . J. 45:1463-1478]). TNF blockers have been shown to prolong the survival of mice infected with influenza (see, eg, Shi et al. (2013) Crit . Care 17:R301). TNF blockers have been used to treat SARS-Cov 2 (see, eg, Feldmann et al. (2020) Lancet 395:1407-1409). As described in the detailed description, a known effect of TNF blockers is to reduce regulatory T-cells (Tregs), which is problematic because Tregs are natural suppressors of inflammation. Thus, TNFR1-specific inhibitors that do not interact with or agonize TNFR2, as described and provided herein, are excellent for this purpose. To test the constructs provided herein, mice are engineered to lack endogenous TNFR1 and express HuTNFR1/HuTNF. Such mice will develop acute respiratory distress syndrome induced by HuTNF/HuTNFR1 after influenza infection (as described by Shi et al. (2013) Crit . Care 17:R301). A TNFR1-specific antagonist construct that does not antagonize TNFR2 is administered. Efficacy is determined by any of several criteria:
1. TNF 차단제에 비해 유의하게 감소된 순환 염증성 사이토카인(예를 들어, IFN-감마, IL-1알파, IL1-베타, 및 IL-17);1. Significantly reduced circulating inflammatory cytokines (eg, IFN-gamma, IL-1 alpha, IL1-beta, and IL-17) compared to TNF blockers;
2. TNF 차단제와 비교하여, 체중 증가에 의해 측정된 상당히 빠른 회복(예를 들어, 문헌[Shi 등 (2013) Crit. Care 17:R301); 및2. Significantly faster recovery as measured by weight gain compared to TNF blockers (eg, Shi et al. (2013) Crit. Care 17:R301); and
3. TNF 차단제와 비교하여, 유의하게 증가된 생존(예를 들어, 문헌[Shi 등 (2013) Crit. Care 17:R301).3. Significantly increased survival compared to TNF blockers (eg, Shi et al. (2013) Crit. Care 17:R301).
질환 모델에 사용하기 위해 인간 TNFR1 및 인간 TNFR2를 발현하는 형질전환 마우스를 문헌[Atretkhany 등 (2018) Proc . Natl . Acad . Sci . U.S.A . 115(51):13051-13056]에 기술된 방법과 같은, 당 분야에 공지된 표준 유전공학 방법에 의해 생성한다. 다양한 질병 및 병태에 대한 특정 생체내 검정은 다음과 같다. 예를 들어, 인간화 RA 마우스 모델, 예컨대, RA의 콜라겐-유발 관절염(CIA) 모델, 또는 당 분야에 공지되고/거나 본원에 기술된 RA의 임의의 다른 동물 모델을 사용하여, 본 명세서에 제공된 TNFR1 길항제 분자의 치료 효과를 평가하고, 이들을 에타너셉트 또는 아달리무맙과 같은 항-TNF 요법의 치료 효과와 비교한다. 본 명세서에 제공된 TNFR1 길항제 분자, 또는 에타너셉트 또는 아달리무맙과 같은 항-TNF 요법을 하나 이상의 사지에서 임상 관절염의 발병 후 총 10일 동안 매일 동물에게 투여한다. 초기 영향을 받은 관절의 팽윤 정도를, 캘리퍼스를 사용하여 발 두께를 측정함으로써 모니터링한다. 전염증성 사이토카인 및 케모카인, 예를 들어, 과립구-대식세포 콜로니 자극 인자(GM-CSF), 인터루킨-10(IL-10), IL-1β, IL-6, IL-8, RANTES(CCL5) 및 단핵구 화학유인 단백질 1(MCP-1; CCL2로도 공지됨)의 측정을 위해 마우스로부터 혈청을 채혈한다. 이후, 마우스 모델에서 RA의 퇴행을 TNFR1 길항제 분자가 투여된 마우스와 에타너셉트 또는 아달리무맙이 투여된 마우스 사이에서 비교한다. Transgenic mice expressing human TNFR1 and human TNFR2 for use in disease models are described in Atretkhany et al. (2018) Proc . Natl . Acad . Sci . USA . 115(51):13051-13056] by standard genetic engineering methods known in the art. Specific in vivo assays for various diseases and conditions are as follows. TNFR1 provided herein using, for example, a humanized RA mouse model, such as the Collagen-Induced Arthritis (CIA) model of RA, or any other animal model of RA known in the art and/or described herein. The therapeutic effects of the antagonist molecules are evaluated and they are compared to the therapeutic effects of anti-TNF therapies such as etanercept or adalimumab. A TNFR1 antagonist molecule provided herein, or an anti-TNF therapy such as etanercept or adalimumab, is administered to the animal daily for a total of 10 days following onset of clinical arthritis in one or more limbs. The degree of swelling of the initially affected joint is monitored by measuring paw thickness using calipers. Proinflammatory cytokines and chemokines such as granulocyte-macrophage colony stimulating factor (GM-CSF), interleukin-10 (IL-10), IL-1β, IL-6, IL-8, RANTES (CCL5) and Serum is drawn from mice for the measurement of monocyte chemoattractant protein 1 (MCP-1; also known as CCL2). The regression of RA in the mouse model is then compared between mice administered with the TNFR1 antagonist molecule and mice administered with etanercept or adalimumab.
본원에서 제공되는 TNFR1 길항제 분자는 또한 중증 급성 호흡기 증후군(SARS) 및 바이러스-유발 사이토카인 폭풍의 인간화된 마우스 모델에서 시험된다. SARS의 마우스 모델은, 다양한 용량, 예를 들어, 102, 103, 104, 및 105 플라크-형성 단위(PFU)의 SARS-CoV로 인간화 hTNFR1(또는 hTNFR1/hTNFR2) 녹-인 마우스를 감염시킴으로써 생성된다. TNFR1 길항제 분자를 감염된 마우스에 투여하고, 생존을 평가하고, 아달리무맙과 같은, 항-TNF 요법이 투여된 마우스의 생존과 비교한다. TNFR1 antagonist molecules provided herein are also tested in humanized mouse models of severe acute respiratory syndrome (SARS) and virus-induced cytokine storms. A mouse model of SARS is humanized hTNFR1 (or hTNFR1/hTNFR2) knock-in mice with SARS-CoV at various doses, eg, 10 2 , 10 3 , 10 4 , and 10 5 plaque-forming units (PFU). created by infection. TNFR1 antagonist molecules are administered to infected mice, survival is assessed, and compared to survival of mice administered an anti-TNF therapy, such as adalimumab.
사이토카인 폭풍의 바이러스-유도 마우스 모델은, 예를 들어, 사이토카인 폭풍 증후군(CSS)의 림프구성 맥락수막염 바이러스(LCMV)-유도 모델을 포함한다. CSS의 LCMV-유도 마우스 모델을, 8 내지 12주령 퍼포린-결핍(Prf -/- ) 또는 Prf - Tmem178 이중 녹아웃 마우스에 2Х105 PFU의 LCMV-Armstrong을 복강내 투여함으로써, 생성한다. 단핵구/대식세포를 고갈시키기 위해, 100 μl의 클로드로네이트-리포솜을 LCMV 감염 2일 전에 및 48 및 96시간 후에 Prf -/- 마우스에 정맥내 주사하였다. 대안적으로, 1 mg의 중화 항-CSF1 항체(클론 5A1, BioXCell)를 감염 2일 전에 투여하고, 0.5 mg의 항체를 48 및 96시간 후에 투여한다. 감염 3일 및 8일에 혈청 사이토카인을 측정하기 위해 턱밑 정맥 천자를 통해 동물을 채혈한다 (예를 들어, 문헌[Mahajan 등 (2019) J. Autoimmun. 100:62-74] 참조).Viral-induced mouse models of cytokine storm include, for example, the lymphocytic choriomeningitis virus (LCMV)-induced model of cytokine storm syndrome (CSS). An LCMV-induced mouse model of CSS is generated by intraperitoneal administration of 2Х10 5 PFU of LCMV-Armstrong to 8-12 week old Perforin-deficient ( Prf -/- ) or Prf - Tmem178 double knockout mice. To deplete monocytes/macrophages, 100 μl of clodronate-liposomes were intravenously injected into Prf −/− mice 2 days before and 48 and 96 hours after LCMV infection. Alternatively, 1 mg of a neutralizing anti-CSF1 antibody (clone 5A1, BioXCell) is administered 2 days prior to infection, and 0.5 mg of the antibody is administered 48 and 96 hours later. On days 3 and 8 of infection, animals are bled via submandibular venipuncture to measure serum cytokines (see, eg, Mahajan et al. (2019) J. Autoimmun. 100:62-74).
실시예Example 3 3
면역원성 서열의 확인 및 제거Identification and removal of immunogenic sequences
본원에 기술된 바와 같이, 단백질 치료제 내의 B-세포 및/또는 T-세포 에피토프와 같은 면역원성 서열은, 예를 들어, 치료제를 중화시키고/시키거나 신체로부터 이의 제거를 촉진하는 항-약물 항체(ADA)의 형성을 통해, 치료제의 활성, 효능, 및 생체내 반감기에 악양향을 미칠수 있다. 면역원성 서열은 또한 지연된 주입-유사 알레르기 반응, 아나필락시스, 및 일부 경우에, 생명을 위협하는 자가면역과 같은, 임상 합병증을 초래하는 바람직하지 않은 면역 반응을 유발할 수 있기 때문에, 단백질 치료제의 안전성 및 내약성에 해롭다. 결과적으로, 후보 단백질 치료제를, 면역원성에 대해, 및 예를 들어, 돌연변이 유발에 의해, 확인된 면역원성 서열을 제거/교체하기 위해, 치료제의 생체내 효능 및 안전성 프로파일을 개선시키기 위해, 및 이들의 성공이 전임상 연구에서 임상으로 옮겨지도록 하기 위해, 스크리닝한다.As described herein, immunogenic sequences, such as B-cell and/or T-cell epitopes within a protein therapeutic, can be, for example, anti-drug antibodies that neutralize the therapeutic agent and/or promote its elimination from the body ( ADA) can adversely affect the activity, efficacy, and in vivo half-life of a therapeutic agent. Safety and tolerability of protein therapeutics, as immunogenic sequences can also induce undesirable immune responses leading to clinical complications, such as delayed infusion-like allergic reactions, anaphylaxis, and, in some cases, life-threatening autoimmunity. harmful to Consequently, candidate protein therapeutics are tested for immunogenicity, and to remove/replace identified immunogenic sequences, for example, by mutagenesis, to improve the in vivo efficacy and safety profile of therapeutics, and for these To ensure that the success of the drug is transferred from preclinical research to clinical practice, screening is performed.
면역원성 서열을, 인실리코(in silico) 면역원성 예측 툴 및 시험관내 면역원성 시험의 사용을 포함하는, 상세한 설명에 기술되거나 당업자에게 공지된 것과 같은 방법을 사용하여 확인한다. 예를 들어, 본원의 다른 곳에 기술된 바와 같이, 선형 B-세포 에피토프를, 예를 들어, ABCPred, APCPred, BCPRED, BepiPred, LBtope, BcePred, EPMLR, BEST, COBEpro, 및 SVMTriP, 또는 본원에 기술되고/되거나 당업자에게 공지된 임의의 다른 이용 가능한 인 실리코 선형 B-세포 에피토프 예측 툴을 사용하여 예측한다. 형태적 B-세포 에피토프를, 예를 들어, CEP, DiscoTope, BEpro, ElliPro, SEPPA, CBTOPE, EPITOPIA, EPCES, EPSVR, EPMeta, PEASE, EpiPred, 3DEX, PEPOP, PEPOP 2.0, 및 EpiSearch, 또는 본원에 기술되고/되거나 당업자에게 공지된 임의의 다른 이용 가능한 인 실리코 형태적 B-세포 에피토프 예측 툴을 사용하여, 예측한다. T-세포 에피토프를, 예를 들어, EpiMatrix, JanusMatrix, IEDB, SYFPEITHI, MHC Thread, MHCPred, MHCPred 2.0, EpiJen, NetMHC, NetCTL, nHLAPred, SVMHC, ProPred, MMBPred, Protean 3D, 및 Bimas, 또는 본원에 기술되고/되거나 당업자에게 공지된 임의의 다른 이용 가능한 인 실리코 T-세포 에피토프 예측 툴을 사용하여 예측한다. 다음은 면역원성, 선형 B-세포 에피토프에 대한 인간 TNFR1 길항제 DMS5541 서열(서열번호 38)의 예시적인 분석이다. Immunogenic sequences are identified using methods such as those described in detail or known to those skilled in the art, including the use of in silico immunogenicity prediction tools and in vitro immunogenicity tests. For example, as described elsewhere herein, a linear B-cell epitope, eg, ABCPred, APCPred, BCPRED, BepiPred, LBtope, BcePred, EPMLR, BEST, COBEpro, and SVMTriP, or as described herein / or using any other available in silico linear B-cell epitope prediction tool known to those skilled in the art. Conformational B-cell epitopes, for example, CEP, DiscoTope, BEpro, ElliPro, SEPPA, CBTOPE, EPITOPIA, EPCES, EPSVR, EPMeta, PEASE, EpiPred, 3DEX, PEPOP, PEPOP 2.0, and EpiSearch, or as described herein and/or using any other available in silico conformational B-cell epitope prediction tool known to those skilled in the art. T-cell epitopes, e.g., EpiMatrix, JanusMatrix, IEDB, SYFPEITHI, MHC Thread, MHCPred, MHCPred 2.0, EpiJen, NetMHC, NetCTL, nHLAPred, SVMHC, ProPred, MMBPred, Protean 3D, and Bimas, or as described herein and/or any other available in silico T-cell epitope prediction tool known to those skilled in the art. The following is an exemplary analysis of the human TNFR1 antagonist DMS5541 sequence (SEQ ID NO: 38) for immunogenic, linear B-cell epitopes.
면역원성 선형 B-세포 에피토프에 대한 DMS5541의 분석 Analysis of DMS5541 for immunogenic linear B-cell epitopes
인간 TNFR1 길항제 DMS5541(서열번호 38)의 서열을, 분자 내의 선형 B-세포 에피토프를 검출하기 위해, SVMTriP 알고리즘을 사용하여 잠재적 면역원성에 대해 분석한다. 알고리즘은 하기 표 13에 제시된 바와 같이, DMS5541의 서열에서 3개의 가능한 에피토프를 확인한다. 결과는 서열번호 38의 잔기 63 내지 82에 상응하는, 서열 AVKGRFTISRDNSKNTLYLQ를 갖는 에피토프가 면역원성에 대해 높은 확률을 갖는다는 것을 나타낸다. 이어서, 확인된 3개의 에피토프를 시험관내 B-세포 검정에서 면역원성에 대해 시험한다. 면역원성에 대해 양성인 임의의 서열은 알라닌 스캔을 거친다. 양성 아미노산/서열을, 면역원성 에피토프가 파괴될 때까지 서열의 각 아미노산을 알라닌 잔기로 하나씩 치환함으로써, 변형한다. 이는 더 안전하고 효과적인 TNFR1 길항제를 생성한다. The sequence of the human TNFR1 antagonist DMS5541 (SEQ ID NO: 38) is analyzed for potential immunogenicity using the SVMTriP algorithm to detect linear B-cell epitopes within the molecule. The algorithm identifies three possible epitopes in the sequence of DMS5541, as shown in Table 13 below. The results indicate that the epitope with the sequence AVKGRFTISRDNSKNTLYLQ, corresponding to residues 63 to 82 of SEQ ID NO: 38, has a high probability for immunogenicity. The three identified epitopes are then tested for immunogenicity in an in vitro B-cell assay. Any sequence positive for immunogenicity is subjected to an alanine scan. Positive amino acids/sequences are modified by substituting each amino acid in the sequence one by one with an alanine residue until the immunogenic epitope is destroyed. This results in safer and more effective TNFR1 antagonists.
양성 대조군으로서, SVMTriP 알고리즘을, 또한 아달리무맙의 공지된 높은 면역원성을 예측하는 데 사용하였으며; 메토트렉세이트 없이 투여되는 아달리무맙은 환자의 대략 50%에서 면역원성이다 (예를 들어, 문헌[Ducourau 등 (2020) RMD Open 6:e001047] 참조). SVMTriP 알고리즘은 아달리무맙의 중쇄에서 적어도 10개의 가능한 에피토프를 확인하였으며, 이 중 4개는 높은 확률이며, 따라서 임상 데이터와 잘 상관관계가 있고 면역원성을 예측하기 위한 이러한 프로그램의 사용을 검증한다.As a positive control, the SVMTriP algorithm was also used to predict the known high immunogenicity of adalimumab; Adalimumab administered without methotrexate is immunogenic in approximately 50% of patients (see, eg, Ducourau et al. (2020) RMD Open 6:e001047). The SVMTriP algorithm identified at least 10 possible epitopes in the heavy chain of adalimumab, 4 of which are of high probability, thus correlating well with clinical data and validating the use of this program to predict immunogenicity.
DMS5541의 SVMTriP 분석으로부터의 결과는 DMS5541의 서열 내에서 면역원성을 예측하는 데 사용된, 제2 알고리즘 ABCPred에 의해 뒷받침된다. SVMTriP에 의해 예측된 모든 3개의 B-세포 에피토프는 또한 ABCPred의 에피토프 예측 결과에 포함되었다. 예를 들어, 하기 표 14에 제시된 바와 같이, 에피토프 AVKGRFTISRDNSKNT, TGRWVPFEYWGQGTLV 및 STDIQMTQSPSSLSAS(서열번호 38에서 각각의 잔기 위치에 대해서는 하기 표 참조)는 SVMTriP에 의해 확인된 3개의 에피토프와 중첩되는 서열을 함유한다. Results from the SVMTriP analysis of DMS5541 are supported by a second algorithm, ABCPred, used to predict immunogenicity within the sequence of DMS5541. All three B-cell epitopes predicted by SVMTriP were also included in ABCPred's epitope prediction results. For example, as shown in Table 14 below, the epitopes AVKGRFTISRDNSKNT, TGRWVPFEYWGQGTLV and STDIQMTQSPSSLSAS (see table below for each residue position in SEQ ID NO: 38) overlap with the three epitopes identified by SVMTriP Contains sequences overlapping.
실시예Example 4 4
인간 human TNFR1TNFR1 길항제 항체 단편( antagonist antibody fragments ( dAbdAb , , scFvscFv , , FabFab )을 함유하는 예시적인 ) Exemplary containing TNFR1TNFR1 길항제 작제물 antagonist construct
본원에는 TNFR2를 억제하지 않으면서, TNFR1을 선택적으로 억제하는 TNFR1 길항제 작제물이 제공된다. TNFR1을 작용시키는, TNFR1 수용체 클러스터링을 피하기 위해, TNFR1 길항제는 모노머 및 1가이다. TNFR1 길항제는 TNFR1에 특이적인 인간 단일 도메인 항체(dAb)를 함유한다. dAb는 가변 영역 중쇄(VH) 또는 가변 영역 경쇄(VL) 도메인을 함유한다. 예를 들어, dAb는 아미노산 서열이 서열번호 54 내지 672 중 어느 하나에 제시된 dAb, 또는 TNFR1에 대한 결합 친화성을 유지하는 서열번호 54 내지 672 중 어느 하나의 dAb와 적어도 또는 적어도 약 90% 또는 95% 서열 동일성 중 임의의 것을 함유한다. 대안적으로, TNFR1 길항제는 scFv, Fab, 또는 다른 항원-결합 단편, 예컨대, H398 또는 ATROSAB와 같은, 인간 TNFR1 길항제 항체로부터 유래된 것들을 함유한다. 예를 들어, TNFR1 길항제는 서열번호 677 또는 678에 제시된 H398-유래 scFv; 또는 서열번호 673 내지 676 중 어느 하나에 제시된 ATROSAB-유래 scFv; 또는 각각 서열번호 679 및 680(FabATR), 또는 각각 서열번호 681 또는 682(Fab 13.7) 중 어느 하나에 제시된 ATROSAB-유래 Fab 단편 경쇄 및 중쇄; 또는 서열번호 673 내지 678 중 어느 하나의 scFv에 대해 적어도 또는 적어도 약 90% 또는 95% 서열 동일성을 갖는 scFv 또는 Fab 단편, 또는 각각 서열번호 679 및 680(FabATR) 또는 각각 서열번호 681 또는 682(Fab 13.7) 중 어느 하나의 Fab 경쇄 및 중쇄(TNFR1에 대한 친화성을 보유함)를 함유한다.Provided herein are TNFR1 antagonist constructs that selectively inhibit TNFR1 without inhibiting TNFR2. To avoid TNFR1 receptor clustering, which agonizes TNFR1, TNFR1 antagonists are monomeric and monovalent. TNFR1 antagonists contain human single domain antibodies (dAbs) specific for TNFR1. dAbs contain variable region heavy (V H ) or variable region light (V L ) domains. For example, the dAb can be at least or at least about 90% or 95% identical to the dAb whose amino acid sequence is set forth in any one of SEQ ID NOs: 54-672, or a dAb of any one of SEQ ID NOs: 54-672 that retains binding affinity for TNFR1. % sequence identity. Alternatively, TNFR1 antagonists contain scFvs, Fabs, or other antigen-binding fragments such as those derived from human TNFR1 antagonist antibodies, such as H398 or ATROSAB. For example, TNFR1 antagonists include the H398-derived scFvs set forth in SEQ ID NOs: 677 or 678; or an ATROSAB-derived scFv as set forth in any one of SEQ ID NOs: 673-676; or an ATROSAB-derived Fab fragment light chain and heavy chain set forth in any one of SEQ ID NOs: 679 and 680 (FabATR), respectively, or SEQ ID NOs: 681 or 682 (Fab 13.7); or a scFv or Fab fragment having at least or at least about 90% or 95% sequence identity to the scFv of any one of SEQ ID NOs: 673 to 678, or SEQ ID NOs: 679 and 680 (FabATR), respectively, or SEQ ID NOs: 681 or 682 (Fab 13.7) of any of the Fab light and heavy chains (which have affinity for TNFR1).
TNFR1 길항제는 혈청 반감기 연장제, 예컨대, IgG Fc, 특히 ADCC, ADCP, 및/또는 CDC, 인간 혈청 알부민(HSA), 및/또는 폴리(에틸렌)글리콜(PEG) 분자를 제거하거나 감소시키도록 변형된 Fc에 융합된다. 예를 들어, 인간 항-TNFR1 dAb, scFV, Fab 또는 다른 항원-결합 단편의 C-말단은 링커를 통해 인간 IgG1 또는 IgG4 항체의 Fc 영역의 N-말단과 융합된다. IgG1 Fc 영역, 예컨대, 트라스투주맙으로부터 유래된 IgG1 Fc(서열번호 27 참조), 또는 IgG4 Fc 영역, 예컨대, 니볼루맙으로부터 유래된 IgG4 Fc(서열번호 30 참조)가 사용된다. 링커는 Fc가 트라스투주맙으로부터 유래된 경우 아미노산 잔기 SCDKTH(서열번호 26의 잔기 222 내지 227에 상응함)의 서열을 함유하는 트라스투주맙의 힌지 서열의 일부를 포함하거나, Fc가 니볼루맙으로부터 유래된 경우, 아미노산 잔기 ESKYGPPCPPCP(서열번호 29의 잔기 212 내지 223에 상응함)의 서열, 또는 유연성 또는 다른 구조적 특성을 제공하는 이의 일부를 함유하는 니볼루맙의 힌지 서열을 함유할 수 있다. 프로테아제 저항성을 부여하고 융합 단백질의 유연성을 증가시키기 위해, SCDKTH 또는 ESKYGPPCPPCP 힌지 서열을, 예를 들어, (GSGS) 또는 (GGGGS)n(예를 들어, 각각 서열번호 707의 잔기 199 내지 202, 및 116 내지 120)(여기서, n은 1 내지 5 또는 1 내지 6임), 또는 예를 들어, GGGGSGGGGSGGGGS와 같은 Gly 및 Ser 잔기의 다른 조합(예를 들어, 잔기 116 내지 130 또는 서열번호 707 참조)과 같은 짧은 글리신-세린(GS) 펩타이드 링커로 대체한다. 다른 구현예에서, 인간 항-TNFR1 dAb, scFv, Fab 또는 다른 항원-결합 단편의 C-말단은 GS 링커에 연결되고, GS 링커는 상응하는 Fc 영역의 N-말단에 연결된, 트라스투주맙 또는 니볼루맙 힌지 서열의 가요성을 제공하기에 충분한, 전부 또는 일부에 연결된다. 일부 구현예에서, 제2 Fc 서브유닛은 제1 Fc 서브유닛에 연결되어 분자의 혈청 반감기 및 안정성을 증가시킨다. 2개의 Fc 영역이 있기 때문에, 임의의 생성된 작제물은 하나의 비-인접한 Fc 영역을 함유하기 때문에 융합 단백질이 아니다. 일부 구현예에서, 인간 TNFR1 길항제 dAb, scFV, Fab 또는 다른 항원-결합 단편의 N-말단은 상기 기술된 바와 같이, 링커를 통해 혈청 반감기 연장제의 C-말단에 융합된다.TNFR1 antagonists are modified to eliminate or reduce serum half-life extenders, such as IgG Fc, particularly ADCC, ADCP, and/or CDC, human serum albumin (HSA), and/or poly(ethylene)glycol (PEG) molecules. fused to Fc. For example, the C-terminus of a human anti-TNFR1 dAb, scFV, Fab or other antigen-binding fragment is fused to the N-terminus of the Fc region of a human IgG1 or IgG4 antibody via a linker. An IgG1 Fc region, such as an IgG1 Fc derived from Trastuzumab (see SEQ ID NO: 27), or an IgG4 Fc region, such as an IgG4 Fc derived from nivolumab (see SEQ ID NO: 30), is used. The linker comprises a portion of the hinge sequence of Trastuzumab containing the sequence of amino acid residue SCDKTH (corresponding to residues 222 to 227 of SEQ ID NO: 26) when the Fc is derived from Trastuzumab, or the Fc is derived from nivolumab. If present, it may contain the hinge sequence of nivolumab, which contains the sequence of amino acid residues ESKYGPPCPPCP (corresponding to residues 212 to 223 of SEQ ID NO: 29), or portions thereof that provide flexibility or other structural properties. To confer protease resistance and increase the flexibility of the fusion protein, an SCDKTH or ESKYGPPCPPCP hinge sequence can be added, for example, to (GSGS) or (GGGGS) n (eg, residues 199 to 202 of SEQ ID NO: 707, and 116, respectively). to 120), where n is 1 to 5 or 1 to 6, or other combinations of Gly and Ser residues such as, for example, GGGGSGGGGSGGGGS (see, for example, residues 116 to 130 or SEQ ID NO: 707). Replace with a short glycine-serine (GS) peptide linker. In another embodiment, the C-terminus of the human anti-TNFR1 dAb, scFv, Fab or other antigen-binding fragment is linked to a GS linker, wherein the GS linker is linked to the N-terminus of the corresponding Fc region, Trastuzumab or Nivol. It is linked to all or part of it sufficient to provide flexibility of the lumab hinge sequence. In some embodiments, the second Fc subunit is linked to the first Fc subunit to increase the serum half-life and stability of the molecule. Because there are two Fc regions, any resulting construct is not a fusion protein because it contains one non-contiguous Fc region. In some embodiments, the N-terminus of the human TNFR1 antagonist dAb, scFV, Fab or other antigen-binding fragment is fused to the C-terminus of the serum half-life extender via a linker, as described above.
또한, 본원에는 (GSGS)n 또는 GGGGS)n(여기서, n = 1 내지 5 또는 6), 예를 들어, GGGGSGGGGSGGGGS와 같은 짧은 펩타이드 링커를 통해, 인간 혈청 알부민(HSA)과 융합된, 항-TNFR1 dAb, scFv, Fab, 또는 다른 항원-결합 단편을 함유하는 TNFR1 길항제 융합 단백질이 제공된다.Also disclosed herein is an anti-TNFR1 antibody fused to human serum albumin (HSA) via a short peptide linker such as (GSGS) n or GGGGS) n (where n = 1 to 5 or 6), eg, GGGGSGGGGSGGGGS. TNFR1 antagonist fusion proteins containing dAbs, scFvs, Fabs, or other antigen-binding fragments are provided.
또한, 본원에는 적어도 30 kDa 크기인 PEG 분자에 연결된, 항-TNFR1 dAb, scFv, Fab, 또는 다른 항원-결합 단편을 함유하는 TNFR1 길항제 분자가 제공된다.Also provided herein are TNFR1 antagonist molecules containing an anti-TNFR1 dAb, scFv, Fab, or other antigen-binding fragment linked to a PEG molecule that is at least 30 kDa in size.
본원에 기술된 바와 같이, 이러한 작제물은 면역원성을 감소시키거나 제거하기 위해 변형될 수 있다. TNFR1 길항제 dAb, scFv, Fab, 또는 다른 항원-결합 단편은 면역원성 서열을 예측하거나 확인하기 위해 인실리코, 시험관내 및/또는 생체내 방법에 의해 분석된다. 면역원성 서열, 예컨대, B-세포 및/또는 T-세포 에피토프의 확인 시, 확인된 서열은 돌연변이유발, 예를 들어, 본원의 다른 곳에 기술된 바와 같이 알라닌 스캐닝에 의해 변형되어 에피토프를 탈면역화/면역원성 서열을 제거 또는 대체한다.As described herein, such constructs may be modified to reduce or eliminate immunogenicity. TNFR1 antagonist dAbs, scFvs, Fabs, or other antigen-binding fragments are analyzed by in silico, in vitro and/or in vivo methods to predict or confirm immunogenic sequences. Upon identification of an immunogenic sequence, such as a B-cell and/or T-cell epitope, the identified sequence can be modified by mutagenesis, eg, alanine scanning as described elsewhere herein, to deimmunize/deimmunize the epitope. Immunogenic sequences are removed or replaced.
하기는 본원에 기술되고 제공되는 TNFR1 길항제 융합 단백질의 예시적인 작제물이다. 트라스투주맙의 Fc 또는 니볼루맙의 Fc를 포함하는 모든 구현예에서, Fc 영역은 선택적으로 ADCC, ADCP, 및 CDC를 포함하는 면역 이펙터 기능을 감소시키거나 제거하도록 변형되고, 또한 선택적으로 FcRn에 대한 결합을 향상시키도록 변형되어, 융합 단백질의 혈청 반감기를 증가시키고, 또한 선택적으로 면역원성 서열을 대체하거나 달리 변형 또는 제거한다.The following are exemplary constructs of TNFR1 antagonist fusion proteins described and provided herein. In all embodiments comprising the Fc of trastuzumab or the Fc of nivolumab, the Fc region is optionally modified to reduce or eliminate immune effector functions, including ADCC, ADCP, and CDC, and optionally also to FcRn. Modified to enhance binding, increase the serum half-life of the fusion protein, and also optionally replace or otherwise modify or remove immunogenic sequences.
면역 이펙터 기능을 감소시키거나 제거하는 Fc 변형은 상기 표 9에 요약되어 있으며, FcRn 결합을 향상시키는 Fc 변형은 상기 표 7에 요약되어 있다. 이러한 변형 중 임의의 하나 또는 조합은 본 명세서에 제공된 융합 단백질의 Fc 영역에 포함된다. 본 명세서에 제공된 모든 예시적인 작제물은 또한 N-말단 대신에, 융합 단백질의 C 말단에서 TNFR1 길항제로 제조된다.Fc modifications that reduce or eliminate immune effector function are summarized in Table 9 above, and Fc modifications that enhance FcRn binding are summarized in Table 7 above. Any one or combination of these modifications are included in the Fc region of the fusion proteins provided herein. All exemplary constructs provided herein are also made with a TNFR1 antagonist at the C terminus of the fusion protein, instead of at the N-terminus.
1a) H398 scFv - SCDKTH - 트라스투주맙 Fc1a) H398 scFv - SCDKTH - Trastuzumab Fc
인간 TNFR1 길항제 항체 H398로부터 유래된 scFv를 함유하는 인간 TNFR1 길항제 융합 단백질이 본 명세서에 제공된다. scFv는 (GGGGS)3 펩티드 링커에 의해 함께 연결된 H398의 VL 및 VH 도메인을 함유한다. H398 scFv(서열 번호: 678)의 C-말단은 트라스투주맙 Fc 영역(서열번호: 26의 잔기 234-450에 상응함; 또한 서열번호: 27 참조)의 N-말단에 융합되는 아미노산 잔기 SCDKTH(서열번호: 26의 잔기 222-227에 상응함)의 서열을 적어도 함유하는 트라스투주맙의 힌지 서열의 일부에 융합된다. H398 scFv-SCDKTH-트라스투주맙 Fc 융합 단백질은 하기 서열을 갖는다 (서열번호: 706):Provided herein are human TNFR1 antagonist fusion proteins containing scFvs derived from human TNFR1 antagonist antibody H398. The scFv contains the V L and V H domains of H398 linked together by a (GGGGS) three- peptide linker. The C-terminus of the H398 scFv (SEQ ID NO: 678) is the amino acid residue SCDKTH (corresponding to residues 234-450 of SEQ ID NO: 26; see also SEQ ID NO: 27) that is fused to the N-terminus of Trastuzumab Fc region. Corresponding to residues 222-227 of SEQ ID NO: 26) is fused to a portion of the hinge sequence of Trastuzumab that contains at least the sequence of The H398 scFv-SCDKTH-trastuzumab Fc fusion protein has the following sequence (SEQ ID NO: 706):
대안적으로, SCDKTH 힌지 서열은 서열 EPKSCDKTHTCPPCP(서열번호: 26의 잔기 219-233에 상응함) 또는 그의 적어도 5, 6, 7, 8, 9, 10, 또는 11개의 인접 잔기를 함유하거나 갖는 트라스투주맙의 힌지 영역의 전체 서열까지로 대체된다.Alternatively, the SCDKTH hinge sequence is a trastu sequence containing or having the sequence EPKSCDKTHTCPPCP (corresponding to residues 219-233 of SEQ ID NO: 26) or at least 5, 6, 7, 8, 9, 10, or 11 contiguous residues thereof. Replaced with up to the entire sequence of the hinge region of zumab.
1b) H398 1b) H398 scFvscFv - - GGGGSGGGGSGGGGSGGGGSGGGGSGGGGS - 트라스투주맙 - Trastuzumab FcFc
인간 TNFR1 길항제 항체 H398로부터 유래된 scFv를 함유하는 TNFR1 길항제 융합 단백질이 본 명세서에 제공된다. scFv는 (GGGGS)3 펩티드 링커에 의해 함께 연결된 H398의 VL 및 VH 도메인을 함유한다. H398 scFv (서열번호: 678)의 C-말단은 GGGGSGGGGSGGGGS 펩티드 링커에 융합되는데, 이 링커는 트라스투주맙 Fc 영역 (서열번호: 26의 잔기 234-450에 상응함; 또한 서열번호: 27 참조)의 N-말단에 융합된다. H398 scFv-GGGGSGGGGSGGGGS-트라스투주맙 Fc 융합 단백질은 하기 서열을 갖는다 (서열번호: 707):Provided herein are TNFR1 antagonist fusion proteins containing scFvs derived from human TNFR1 antagonist antibody H398. The scFv contains the V L and V H domains of H398 linked together by a (GGGGS) three- peptide linker. The C-terminus of the H398 scFv (SEQ ID NO: 678) is fused to the GGGGSGGGGSGGGGS peptide linker, which corresponds to residues 234-450 of the Trastuzumab Fc region (SEQ ID NO: 26; see also SEQ ID NO: 27). fused to the N-terminus. The H398 scFv-GGGGSGGGGSGGGGS-Trastuzumab Fc fusion protein has the following sequence (SEQ ID NO: 707):
대안적으로, GGGGSGGGGSGGGGS 링커는 Gly-Ser 링커, 예컨대 (GSGS)n 또는 (GGGGS)n 링커(여기서 n = 1, 2, 3, 4 또는 5) 또는 본 명세서에 기재되거나 당업계에 공지된 바와 같은 임의의 다른 적합한 짧은 펩티드 링커로 대체된다. Alternatively, the GGGGSGGGGSGGGGS linker can be a Gly-Ser linker, such as a (GSGS) n or (GGGGS) n linker, where n = 1, 2, 3, 4, or 5, or as described herein or known in the art. Replaced with any other suitable short peptide linker.
1c) H398 1c) H398 scFvscFv - - GGGGSGGGGSGGGGSGGGGSGGGGSGGGGS - - SCDKTHSCDKTH - 트라스투주맙 - Trastuzumab FcFc
인간 TNFR1 길항제 항체 H398로부터 유래된 scFv를 함유하는 TNFR1 길항제 융합 단백질이 본 명세서에 제공된다. scFv는 (GGGGS)3 펩티드 링커에 의해 함께 연결된 H398의 VL 및 VH 도메인을 함유한다. H398 scFv(서열 번호: 678)의 C-말단은 트라스투주맙 Fc 영역(서열번호: 6의 잔기 234-450에 상응함; 또한 서열번호: 27 참조)의 N-말단에 융합되는 아미노산 잔기 SCDKTH(서열번호: 26의 잔기 222-227에 상응함)의 서열을 적어도 포함하는 트라스투주맙의 힌지 서열의 일부에 융합되는 GGGGSGGGGSGGGGS 펩티드 링커에 융합된다. H398 scFv-GGGGSGGGGSGGGGS-SCDKTH-트라스투주맙 Fc 융합 단백질은 하기 서열을 갖는다 (서열번호: 708):Provided herein are TNFR1 antagonist fusion proteins containing scFvs derived from human TNFR1 antagonist antibody H398. The scFv contains the V L and V H domains of H398 linked together by a (GGGGS) three- peptide linker. The C-terminus of the H398 scFv (SEQ ID NO: 678) is the amino acid residue SCDKTH (corresponding to residues 234-450 of SEQ ID NO: 6; see also SEQ ID NO: 27) that is fused to the N-terminus of Trastuzumab Fc region. Corresponding to residues 222-227 of SEQ ID NO: 26) is fused to a GGGGSGGGGSGGGGS peptide linker that is fused to a portion of the hinge sequence of Trastuzumab comprising at least the sequence of The H398 scFv-GGGGSGGGGSGGGGS-SCDKTH-trastuzumab Fc fusion protein has the following sequence (SEQ ID NO: 708):
대안적으로, GGGGSGGGGSGGGGS 링커는 Gly-Ser 링커, 예컨대 (GSGS)n 또는 (GGGGS)n 링커(여기서 n = 1, 2, 3, 4 또는 5) 또는 본 명세서에 기재되거나 당업계에 공지된 바와 같은 임의의 다른 적합한 짧은 펩티드 링커로 대체된다. 대안적으로 또는 추가로, SCDKTH 힌지 서열은 서열 EPKSCDKTHTCPPCP (서열번호: 26의 잔기 219-233에 상응함)의 적어도 5, 6, 7, 8, 9, 10, 또는 11개의 인접 잔기를 함유하는 트라스투주맙의 힌지 영역의 전체 서열까지로 대체된다.Alternatively, the GGGGSGGGGSGGGGS linker can be a Gly-Ser linker, such as a (GSGS) n or (GGGGS) n linker, where n = 1, 2, 3, 4, or 5, or as described herein or known in the art. Replaced with any other suitable short peptide linker. Alternatively or additionally, the SCDKTH hinge sequence is a tra containing at least 5, 6, 7, 8, 9, 10, or 11 contiguous residues of the sequence EPKSCDKTHTCPPCP (corresponding to residues 219-233 of SEQ ID NO: 26) Replaced with up to the entire sequence of the hinge region of stuzumab.
1d) H398 1d) H398 scFvscFv - - GGGGSGGGGSGGGGSGGGGSGGGGSGGGGS - - HSAHSA
인간 TNFR1 길항제 항체 H398로부터 유래된 scFv를 함유하는 TNFR1 길항제 융합 단백질이 본 명세서에 제공된다. scFv는 (GGGGS)3 펩티드 링커에 의해 함께 연결된 H398의 VL 및 VH 도메인을 함유한다. H398 scFv (서열번호: 678)의 C-말단은 GGGGSGGGGSGGGGS 펩티드 링커에 융합되는데, 이 링커는 신호 펩티드(서열번호: 35의 잔기 19-609에 상응함) 없이 인간 혈청 알부민(HSA)의 N-말단에 융합된다. H398 scFv-GGGGSGGGGSGGGGS-HSA 융합 단백질은 하기 서열을 갖는다 (서열번호: 709):Provided herein are TNFR1 antagonist fusion proteins containing scFvs derived from human TNFR1 antagonist antibody H398. The scFv contains the V L and V H domains of H398 linked together by a (GGGGS) three- peptide linker. The C-terminus of H398 scFv (SEQ ID NO: 678) is fused to the GGGGSGGGGSGGGGS peptide linker, which is fused to the N-terminus of human serum albumin (HSA) without a signal peptide (corresponding to residues 19-609 of SEQ ID NO: 35). is fused to The H398 scFv-GGGGSGGGGSGGGGS-HSA fusion protein has the following sequence (SEQ ID NO: 709):
대안적으로, GGGGSGGGGSGGGGS 링커는 Gly-Ser 링커, 예컨대 (GSGS)n 또는 (GGGGS)n 링커(여기서 n = 1, 2, 3, 4 또는 5) 또는 본 명세서에 기재되거나 당업계에 공지된 바와 같은 임의의 다른 적합한 짧은 펩티드 링커로 대체된다.Alternatively, the GGGGSGGGGSGGGGS linker can be a Gly-Ser linker, such as a (GSGS) n or (GGGGS) n linker, where n = 1, 2, 3, 4, or 5, or as described herein or known in the art. Replaced with any other suitable short peptide linker.
1e) H398 1e) H398 scFvscFv - - GGGGSGGGGSGGGGSGGGGSGGGGSGGGGS - - PEGPEG 3030 kDakDa
인간 TNFR1 길항제 항체 H398로부터 유래된 scFv를 함유하는 TNFR1 길항제 융합 단백질이 본 명세서에 제공된다. scFv는 (GGGGS)3 펩티드 링커에 의해 함께 연결된 H398의 VL 및 VH 도메인을 함유한다. H398 scFv(서열번호: 678)의 C-말단은 크기가 30 kDa인 PEG 분자에 공유 결합된 GGGGSGGGGSGGGGS 펩티드 링커에 융합된다. Provided herein are TNFR1 antagonist fusion proteins containing scFvs derived from human TNFR1 antagonist antibody H398. The scFv contains the V L and V H domains of H398 linked together by a (GGGGS) three- peptide linker. The C-terminus of the H398 scFv (SEQ ID NO: 678) is fused to a GGGGSGGGGSGGGGS peptide linker covalently linked to a 30 kDa PEG molecule.
대안적으로, GGGGSGGGGSGGGGS 링커는 Gly-Ser 링커, 예컨대 (GSGS)n 또는 (GGGGS)n 링커(여기서 n = 1, 2, 3, 4 또는 5) 또는 본 명세서에 기재되거나 당업계에 공지된 바와 같은 임의의 다른 적합한 짧은 펩티드 링커로 대체된다. 대안적으로 또는 추가로, PEG 분자는 예를 들어 약 35 kDa, 또는 35 kDa, 40 kDa, 45 kDa 또는 50 kDa와 같은 30 kDa 초과의 분자량을 가질 수 있다. Alternatively, the GGGGSGGGGSGGGGS linker can be a Gly-Ser linker, such as a (GSGS) n or (GGGGS) n linker, where n = 1, 2, 3, 4, or 5, or as described herein or known in the art. Replaced with any other suitable short peptide linker. Alternatively or additionally, the PEG molecule may have a molecular weight greater than 30 kDa, such as, for example, about 35 kDa, or 35 kDa, 40 kDa, 45 kDa or 50 kDa.
1f) 1f) DOM1hDOM1h -574-16 - -574-16 - SCDKTHSCDKTH - 트라스투주맙 - Trastuzumab FcFc
인간 TNFR1 길항제 dAb DOM1h-574-16(서열번호: 57)을 함유하는 TNFR1 길항제 융합 단백질이 본 명세서에 제공된다. DOM1h-574-16의 C-말단은 트라스투주맙 Fc 영역(서열번호: 26의 잔기 234-450에 상응함; 또한 서열번호: 27 참조)의 N-말단에 융합되는 아미노산 잔기 SCDKTH(서열번호: 26의 잔기 222-227에 상응함)의 서열을 적어도 함유하는 트라스투주맙의 힌지 서열의 일부에 융합된다. DOM1h-574-16-SCDKTH-트라스투주맙 Fc 융합 단백질은 하기 서열을 갖는다 (서열번호: 710):Provided herein is a TNFR1 antagonist fusion protein containing the human TNFR1 antagonist dAb DOM1h-574-16 (SEQ ID NO: 57). The C-terminus of DOM1h-574-16 is the amino acid residue SCDKTH (SEQ ID NO: Corresponding to residues 222-227 of 26) is fused to a portion of the hinge sequence of Trastuzumab that contains at least the sequence of The DOMlh-574-16-SCDKTH-trastuzumab Fc fusion protein has the following sequence (SEQ ID NO: 710):
대안적으로, SCDKTH 힌지 서열은 서열 EPKSCDKTHTCPPCP(서열번호: 26의 잔기 219-233에 상응함) 또는 그의 적어도 5, 6, 7, 8, 9, 10, 또는 11개의 인접 잔기를 함유하는 트라스투주맙의 힌지 영역의 전체 서열까지로 대체된다. Alternatively, the SCDKTH hinge sequence is trastuzumab containing the sequence EPKSCDKTHTCPPCP (corresponding to residues 219-233 of SEQ ID NO: 26) or at least 5, 6, 7, 8, 9, 10, or 11 contiguous residues thereof. Replaced with up to the entire sequence of the hinge region of
1g) 1g) DOM1hDOM1h -574-16 - -574-16 - GGGGSGGGGSGGGGSGGGGSGGGGSGGGGS - 트라스투주맙 - Trastuzumab FcFc
인간 TNFR1 길항제 dAb DOM1h-574-16(서열번호: 57)을 함유하는 TNFR1 길항제 융합 단백질이 본 명세서에 제공된다. DOM1h-574-16의 C-말단은 GGGGSGGGGSGGGGS 펩티드 링커에 융합되는데, 이 링커는 트라스투주맙 Fc 영역 (서열번호: 26의 잔기 234-450에 상응함; 또한 서열번호: 27 참조)의 N-말단에 융합된다. DOM1h-574-16-GGGGSGGGGSGGGGS-트라스투주맙 Fc 융합 단백질은 하기 서열을 갖는다 (서열번호: 711):Provided herein is a TNFR1 antagonist fusion protein containing the human TNFR1 antagonist dAb DOM1h-574-16 (SEQ ID NO: 57). The C-terminus of DOMlh-574-16 is fused to the GGGGSGGGGSGGGGS peptide linker, which is fused to the N-terminus of the Trastuzumab Fc region (corresponding to residues 234-450 of SEQ ID NO: 26; see also SEQ ID NO: 27). is fused to The DOM1h-574-16-GGGGSGGGGSGGGGS-Trastuzumab Fc fusion protein has the following sequence (SEQ ID NO: 711):
대안적으로, GGGGSGGGGSGGGGS 링커는 Gly-Ser 링커, 예컨대 (GSGS)n 또는 (GGGGS)n 링커(여기서 n = 1, 2, 3, 4 또는 5) 또는 본 명세서에 기재되거나 당업계에 공지된 바와 같은 임의의 다른 적합한 짧은 펩티드 링커로 대체된다.Alternatively, the GGGGSGGGGSGGGGS linker can be a Gly-Ser linker, such as a (GSGS) n or (GGGGS) n linker, where n = 1, 2, 3, 4, or 5, or as described herein or known in the art. Replaced with any other suitable short peptide linker.
1h) DOM1h -574-16 - GGGGSGGGGSGGGGS - SCDKTH - 트라스투주맙 Fc 1h) DOM1h -574-16 - GGGGSGGGGSGGGGS - SCDKTH - Trastuzumab Fc
인간 TNFR1 길항제 dAb DOM1h-574-16(서열번호: 57)을 함유하는 TNFR1 길항제 융합 단백질이 본 명세서에 제공된다. DOM1h-574-16의 C-말단은 트라스투주맙 Fc 영역(서열번호: 26의 잔기 234-450에 상응함; 또한 서열번호: 27 참조)의 N-말단에 융합되는 잔기 SCDKTH(서열번호: 26의 잔기 222-227에 상응함)의 서열을 적어도 함유하는 트라스투주맙의 힌지 서열의 일부에 융합되는 GGGGSGGGGSGGGGS 펩티드 링커에 융합된다. DOM1h-574-16-GGGGSGGGGSGGGGS-SCDKTH-트라스투주맙 Fc 융합 단백질은 하기 서열을 갖는다 (서열번호: 712):Provided herein is a TNFR1 antagonist fusion protein containing the human TNFR1 antagonist dAb DOM1h-574-16 (SEQ ID NO: 57). The C-terminus of DOM1h-574-16 corresponds to residues SCDKTH (SEQ ID NO: 26 Corresponding to residues 222-227 of) is fused to a GGGGSGGGGSGGGGS peptide linker that is fused to a portion of the hinge sequence of Trastuzumab that contains at least the sequence of The DOMlh-574-16-GGGGSGGGGSGGGGS-SCDKTH-trastuzumab Fc fusion protein has the following sequence (SEQ ID NO: 712):
대안적으로, GGGGSGGGGSGGGGS 링커는 Gly-Ser 링커, 예컨대 (GSGS)n 또는 (GGGGS)n 링커(여기서 n = 1, 2, 3, 4 또는 5) 또는 본 명세서에 기재되거나 당업계에 공지된 바와 같은 임의의 다른 적합한 짧은 펩티드 링커로 대체된다. 대안적으로 또는 추가로, SCDKTH 힌지 서열은 서열 EPKSCDKTHTCPPCP (서열번호: 26의 잔기 219-233에 상응함), 또는 그의 적어도 5, 6, 7, 8, 9, 10, 또는 11개의 인접 잔기를 함유하는 트라스투주맙의 힌지 영역의 전체 서열까지로 대체된다. Alternatively, the GGGGSGGGGSGGGGS linker can be a Gly-Ser linker, such as a (GSGS) n or (GGGGS) n linker, where n = 1, 2, 3, 4, or 5, or as described herein or known in the art. Replaced with any other suitable short peptide linker. Alternatively or additionally, the SCDKTH hinge sequence contains the sequence EPKSCDKTHTCPPCP (corresponding to residues 219-233 of SEQ ID NO: 26), or at least 5, 6, 7, 8, 9, 10, or 11 contiguous residues thereof to the entire sequence of the hinge region of trastuzumab.
1i) 1i) DOM1hDOM1h -574-16 - -574-16 - GGGGSGGGGSGGGGSGGGGSGGGGSGGGGS - - HSAHSA
인간 TNFR1 길항제 dAb DOM1h-574-16(서열번호: 57)을 함유하는 TNFR1 길항제 융합 단백질이 본 명세서에 제공된다. DOM1h-574-16의 C-말단은 GGGGSGGGGSGGGGS 펩티드 링커에 융합되는데, 이 링커는 신호 펩티드(서열번호: 35의 잔기 19-609에 상응함) 없이 인간 혈청 알부민(HSA)의 N-말단에 융합된다. DOM1h-574-16-GGGGSGGGGSGGGGS-HSA 융합 단백질은 하기 서열을 갖는다 (서열번호: 713):Provided herein is a TNFR1 antagonist fusion protein containing the human TNFR1 antagonist dAb DOM1h-574-16 (SEQ ID NO: 57). The C-terminus of DOMlh-574-16 is fused to the GGGGSGGGGSGGGGS peptide linker, which is fused to the N-terminus of human serum albumin (HSA) without a signal peptide (corresponding to residues 19-609 of SEQ ID NO: 35). . The DOM1h-574-16-GGGGSGGGGSGGGGS-HSA fusion protein has the following sequence (SEQ ID NO: 713):
대안적으로, GGGGSGGGGSGGGGS 링커는 Gly-Ser 링커, 예컨대 (GSGS)n 또는 (GGGGS)n 링커(여기서 n = 1, 2, 3, 4 또는 5) 또는 본 명세서에 기재되거나 당업계에 공지된 바와 같은 임의의 다른 적합한 짧은 펩티드 링커로 대체된다. Alternatively, the GGGGSGGGGSGGGGS linker can be a Gly-Ser linker, such as a (GSGS) n or (GGGGS) n linker, where n = 1, 2, 3, 4, or 5, or as described herein or known in the art. Replaced with any other suitable short peptide linker.
1j) 1j) DOM1hDOM1h -574-16 - -574-16 - GGGGSGGGGSGGGGSGGGGSGGGGSGGGGS - - PEGPEG 3030 kDakDa
인간 TNFR1 길항제 dAb DOM1h-574-16(서열번호: 57)을 함유하는 TNFR1 길항제 융합 단백질이 본 명세서에 제공된다. DOM1h-574-16의 C-말단은 크기가 30 kDa인 PEG 분자에 공유 결합된 GGGGSGGGGSGGGGS 펩티드 링커에 융합된다. Provided herein is a TNFR1 antagonist fusion protein containing the human TNFR1 antagonist dAb DOM1h-574-16 (SEQ ID NO: 57). The C-terminus of DOM1h-574-16 is fused to a GGGGSGGGGSGGGGS peptide linker covalently linked to a 30 kDa PEG molecule.
대안적으로, GGGGSGGGGSGGGGS 링커는 Gly-Ser 링커, 예컨대 (GSGS)n 또는 (GGGGS)n 링커(여기서 n = 1, 2, 3, 4 또는 5) 또는 본 명세서에 기재되거나 당업계에 공지된 바와 같은 임의의 다른 적합한 짧은 펩티드 링커로 대체된다. 대안적으로 또는 추가로, PEG 분자는 예를 들어 35 kDa, 40 kDa, 45 kDa 또는 50 kDa와 같은 30 kDa 초과의 분자량을 가질 수 있다.Alternatively, the GGGGSGGGGSGGGGS linker can be a Gly-Ser linker, such as a (GSGS) n or (GGGGS) n linker, where n = 1, 2, 3, 4, or 5, or as described herein or known in the art. Replaced with any other suitable short peptide linker. Alternatively or additionally, the PEG molecule may have a molecular weight greater than 30 kDa, such as for example 35 kDa, 40 kDa, 45 kDa or 50 kDa.
1k) 1k) DOM1hDOM1h -549 - -549 - SCDKTHSCDKTH - 트라스투주맙 - Trastuzumab FcFc
인간 TNFR1 길항제 dAb DOM1h-549(서열번호: 58)을 함유하는 TNFR1 길항제 융합 단백질이 본 명세서에 제공된다. DOM1h-549의 C-말단은 트라스투주맙 Fc 영역(서열번호: 26의 잔기 234-450에 상응함; 또한 서열번호: 27 참조)의 N-말단에 융합되는 잔기 SCDKTH(서열번호: 26의 잔기 222-227에 상응함)의 서열을 적어도 함유하는 트라스투주맙의 힌지 서열의 일부에 융합된다. DOM1h-549-SCDKTH-트라스투주맙 Fc 융합 단백질은 하기 서열을 갖는다 (서열번호: 714):Provided herein is a TNFR1 antagonist fusion protein containing the human TNFR1 antagonist dAb DOM1h-549 (SEQ ID NO: 58). The C-terminus of DOM1h-549 corresponds to residues 234-450 of Trastuzumab Fc region (residues 234-450 of SEQ ID NO: 26; see also SEQ ID NO: 27) residue SCDKTH (residues of SEQ ID NO: 26) fused to the N-terminus. 222-227) is fused to a portion of the hinge sequence of Trastuzumab that contains at least the sequence of The DOMlh-549-SCDKTH-trastuzumab Fc fusion protein has the following sequence (SEQ ID NO: 714):
대안적으로, SCDKTH 힌지 서열은 서열 EPKSCDKTHTCPPCP(서열번호: 26의 잔기 219-233에 상응함) 또는 그의 적어도 5, 6, 7, 8, 9, 10, 또는 11개의 인접 잔기를 함유하는 트라스투주맙의 힌지 영역의 전체 서열까지로 대체된다. Alternatively, the SCDKTH hinge sequence is trastuzumab containing the sequence EPKSCDKTHTCPPCP (corresponding to residues 219-233 of SEQ ID NO: 26) or at least 5, 6, 7, 8, 9, 10, or 11 contiguous residues thereof. Replaced with up to the entire sequence of the hinge region of
1l) 1l) DOM1hDOM1h -549 - -549 - GGGGSGGGGSGGGGSGGGGSGGGGSGGGGS - 트라스투주맙 - Trastuzumab FcFc
인간 TNFR1 길항제 dAb DOM1h-549(서열번호: 58)을 함유하는 TNFR1 길항제 융합 단백질이 본 명세서에 제공된다. DOMlh-549의 C-말단은 GGGGSGGGGSGGGGS 펩티드 링커에 융합되는데, 이 링커는 트라스투주맙 Fc 영역 (서열번호: 26의 잔기 234-450에 상응함; 또한 서열번호: 27 참조)의 N-말단에 융합된다. DOM1h-549-GGGGSGGGGSGGGGS-트라스투주맙 Fc 융합 단백질은 하기 서열을 갖는다 (서열번호: 715):Provided herein is a TNFR1 antagonist fusion protein containing the human TNFR1 antagonist dAb DOM1h-549 (SEQ ID NO: 58). The C-terminus of DOMlh-549 is fused to the GGGGSGGGGSGGGGS peptide linker, which is fused to the N-terminus of the Trastuzumab Fc region (corresponding to residues 234-450 of SEQ ID NO: 26; see also SEQ ID NO: 27). do. The DOM1h-549-GGGGSGGGGSGGGGS-Trastuzumab Fc fusion protein has the following sequence (SEQ ID NO: 715):
대안적으로, GGGGSGGGGSGGGGS 링커는 Gly-Ser 링커, 예컨대 (GSGS)n 또는 (GGGGS)n 링커(여기서 n = 1, 2, 3, 4 또는 5) 또는 본 명세서에 기재되거나 당업계에 공지된 바와 같은 임의의 다른 적합한 짧은 펩티드 링커로 대체된다.Alternatively, the GGGGSGGGGSGGGGS linker can be a Gly-Ser linker, such as a (GSGS) n or (GGGGS) n linker, where n = 1, 2, 3, 4, or 5, or as described herein or known in the art. Replaced with any other suitable short peptide linker.
1m) DOM1h -549 - GGGGSGGGGSGGGGS - SCDKTH - 트라스투주맙 Fc 1m) DOM1h -549 - GGGGSGGGGSGGGGS - SCDKTH - Trastuzumab Fc
인간 TNFR1 길항제 dAb DOM1h-549(서열번호: 58)을 함유하는 TNFR1 길항제 융합 단백질이 본 명세서에 제공된다. DOM1h-549의 C-말단은 트라스투주맙 Fc 영역(서열번호: 26의 잔기 234-450에 상응함; 또한 서열번호: 27 참조)의 N-말단에 융합되는 잔기 SCDKTH(서열번호: 26의 잔기 222-227에 상응함)의 서열을 적어도 함유하는 트라스투주맙의 힌지 서열의 일부에 융합되는 GGGGSGGGGSGGGGS 펩티드 링커에 융합된다. DOM1h-549-GGGGSGGGGSGGGGS-SCDKTH-트라스투주맙 Fc 융합 단백질은 하기 서열을 갖는다 (서열번호: 716):Provided herein is a TNFR1 antagonist fusion protein containing the human TNFR1 antagonist dAb DOM1h-549 (SEQ ID NO: 58). The C-terminus of DOM1h-549 corresponds to residues 234-450 of Trastuzumab Fc region (residues 234-450 of SEQ ID NO: 26; see also SEQ ID NO: 27) residue SCDKTH (residues of SEQ ID NO: 26) fused to the N-terminus. 222-227) is fused to a GGGGSGGGGSGGGGS peptide linker that is fused to a portion of the hinge sequence of Trastuzumab that contains at least the sequence of The DOM1h-549-GGGGSGGGGSGGGGS-SCDKTH-trastuzumab Fc fusion protein has the following sequence (SEQ ID NO: 716):
대안적으로, GGGGSGGGGSGGGGS 링커는 Gly-Ser 링커, 예컨대 (GSGS)n 또는 (GGGGS)n 링커(여기서 n = 1, 2, 3, 4 또는 5) 또는 본 명세서에 기재되거나 당업계에 공지된 바와 같은 임의의 다른 적합한 짧은 펩티드 링커로 대체된다. 대안적으로 또는 추가로, SCDKTH 힌지 서열은 서열 EPKSCDKTHTCPPCP (서열번호: 26의 잔기 219-233에 상응함)를 함유하는 트라스투주맙의 힌지 영역의 전체 서열까지 적어도 5, 6, 7, 8, 9, 10 또는 11개의 인접 잔기를 함유하는 부분으로 대체된다.Alternatively, the GGGGSGGGGSGGGGS linker can be a Gly-Ser linker, such as a (GSGS) n or (GGGGS) n linker, where n = 1, 2, 3, 4, or 5, or as described herein or known in the art. Replaced with any other suitable short peptide linker. Alternatively or additionally, the SCDKTH hinge sequence is at least 5, 6, 7, 8, 9 up to the entire sequence of the hinge region of Trastuzumab containing the sequence EPKSCDKTHTCPPCP (corresponding to residues 219-233 of SEQ ID NO: 26). , is replaced with a moiety containing 10 or 11 adjacent residues.
1n) 1n) DOM1hDOM1h -549 - -549 - GGGGSGGGGSGGGGSGGGGSGGGGSGGGGS - - HSAHSA
인간 TNFR1 길항제 dAb DOM1h-549(서열번호: 58)을 함유하는 TNFR1 길항제 융합 단백질이 본 명세서에 제공된다. DOM1h-549의 C-말단은 GGGGSGGGGSGGGGS 펩티드 링커에 융합되는데, 이 링커는 신호 펩티드(서열번호: 35의 잔기 19-609에 상응함) 없이 인간 혈청 알부민(HSA)의 N-말단에 융합된다. DOM1h-549-GGGGSGGGGSGGGGS-HSA 융합 단백질은 하기 서열을 갖는다 (서열번호: 717):Provided herein is a TNFR1 antagonist fusion protein containing the human TNFR1 antagonist dAb DOM1h-549 (SEQ ID NO: 58). The C-terminus of DOM1h-549 is fused to the GGGGSGGGGSGGGGS peptide linker, which is fused to the N-terminus of human serum albumin (HSA) without the signal peptide (corresponding to residues 19-609 of SEQ ID NO: 35). The DOM1h-549-GGGGSGGGGSGGGGS-HSA fusion protein has the following sequence (SEQ ID NO: 717):
대안적으로, GGGGSGGGGSGGGGS 링커는 Gly-Ser 링커, 예컨대 (GSGS)n 또는 (GGGGS)n 링커(여기서 n = 1, 2, 3, 4 또는 5) 또는 본 명세서에 기재되거나 당업계에 공지된 바와 같은 임의의 다른 적합한 짧은 펩티드 링커로 대체된다.Alternatively, the GGGGSGGGGSGGGGS linker can be a Gly-Ser linker, such as a (GSGS) n or (GGGGS) n linker, where n = 1, 2, 3, 4, or 5, or as described herein or known in the art. Replaced with any other suitable short peptide linker.
1o) 1o) DOMlhDOMlh -549 - -549 - GGGGSGGGGSGGGGSGGGGSGGGGSGGGGS - - PEGPEG 3030 kDakDa
인간 TNFR1 길항제 dAb DOM1h-549(서열번호: 58)을 함유하는 TNFR1 길항제 융합 단백질이 본 명세서에 제공된다. DOM1h-549의 C-말단은 크기가 30 kDa인 PEG 분자에 공유 결합된 GGGGSGGGGSGGGGS 펩티드 링커에 융합된다. Provided herein is a TNFR1 antagonist fusion protein containing the human TNFR1 antagonist dAb DOM1h-549 (SEQ ID NO: 58). The C-terminus of DOM1h-549 is fused to a GGGGSGGGGSGGGGS peptide linker covalently linked to a 30 kDa PEG molecule.
대안적으로, GGGGSGGGGSGGGGS 링커는 Gly-Ser 링커, 예컨대 (GSGS)n 또는 (GGGGS)n 링커(여기서 n = 1, 2, 3, 4 또는 5) 또는 본 명세서에 기재되거나 당업계에 공지된 바와 같은 임의의 다른 적합한 짧은 펩티드 링커로 대체된다. 대안적으로 또는 추가로, PEG 분자는 예를 들어 35 kDa, 40 kDa, 45 kDa 또는 50 kDa와 같은 30 kDa 초과의 분자량을 가질 수 있다.Alternatively, the GGGGSGGGGSGGGGS linker can be a Gly-Ser linker, such as a (GSGS) n or (GGGGS) n linker, where n = 1, 2, 3, 4, or 5, or as described herein or known in the art. Replaced with any other suitable short peptide linker. Alternatively or additionally, the PEG molecule may have a molecular weight greater than 30 kDa, such as for example 35 kDa, 40 kDa, 45 kDa or 50 kDa.
1p) 1p) DOM1hDOM1h -574-208 - -574-208 - SCDKTHSCDKTH - 트라스투주맙 - Trastuzumab FcFc
인간 TNFR1 길항제 dAb DOM1h-574-208(서열번호: 54)을 함유하는 TNFR1 길항제 융합 단백질이 본 명세서에 제공된다. DOM1h-574-208의 C-말단은 트라스투주맙 Fc 영역(서열번호: 26의 잔기 234-450에 상응함; 또한 서열번호: 27 참조)의 N-말단에 융합되는 잔기 SCDKTH(서열번호: 26의 잔기 222-227에 상응함)의 서열을 적어도 함유하는 트라스투주맙의 힌지 서열의 일부에 융합된다. DOM1h-574-208-SCDKTH-트라스투주맙 Fc 융합 단백질은 하기 서열을 갖는다 (서열번호: 718):Provided herein is a TNFR1 antagonist fusion protein containing the human TNFR1 antagonist dAb DOM1h-574-208 (SEQ ID NO: 54). The C-terminus of DOM1h-574-208 corresponds to residues SCDKTH (SEQ ID NO: 26 corresponding to residues 222-227 of The DOM1h-574-208-SCDKTH-Trastuzumab Fc fusion protein has the following sequence (SEQ ID NO: 718):
대안적으로, SCDKTH 힌지 서열은 서열 EPKSCDKTHTCPPCP (서열번호: 26의 잔기 219-233에 상응함)를 함유하는 트라스투주맙의 전체 힌지 영역까지 적어도 5, 6, 7, 8, 9, 10 또는 11개의 인접 잔기를 함유하는 적어도 부분으로 대체된다.Alternatively, the SCDKTH hinge sequence is at least 5, 6, 7, 8, 9, 10 or 11 up to the entire hinge region of Trastuzumab containing the sequence EPKSCDKTHTCPPCP (corresponding to residues 219-233 of SEQ ID NO: 26). replaced with at least a moiety containing adjacent residues.
1q) 1q) DOM1hDOM1h -574-208 - -574-208 - GGGGSGGGGSGGGGSGGGGSGGGGSGGGGS - 트라스투주맙 - Trastuzumab FcFc
인간 TNFR1 길항제 dAb DOM1h-574-208(서열번호: 54)을 함유하는 TNFR1 길항제 융합 단백질이 본 명세서에 제공된다. DOM1h-574-208의 C-말단은 GGGGSGGGGSGGGGS 펩티드 링커에 융합되는데, 이 링커는 트라스투주맙 Fc 영역 (서열번호: 26의 잔기 234-450에 상응함; 또한 서열번호: 27 참조)의 N-말단에 융합된다. DOM1h-574-208-GGGGSGGGGSGGGGS-트라스투주맙 Fc 융합 단백질은 하기 서열을 갖는다 (서열번호: 719):Provided herein is a TNFR1 antagonist fusion protein containing the human TNFR1 antagonist dAb DOM1h-574-208 (SEQ ID NO: 54). The C-terminus of DOM1h-574-208 is fused to the GGGGSGGGGSGGGGS peptide linker, which is fused to the N-terminus of the Trastuzumab Fc region (corresponding to residues 234-450 of SEQ ID NO: 26; see also SEQ ID NO: 27). is fused to The DOM1h-574-208-GGGGSGGGGSGGGGS-Trastuzumab Fc fusion protein has the following sequence (SEQ ID NO: 719):
대안적으로, GGGGSGGGGSGGGGS 링커는 Gly-Ser 링커, 예컨대 (GSGS)n 또는 (GGGGS)n 링커(여기서 n = 1, 2, 3, 4 또는 5) 또는 본 명세서에 기재되거나 당업계에 공지된 바와 같은 임의의 다른 적합한 짧은 펩티드 링커로 대체된다.Alternatively, the GGGGSGGGGSGGGGS linker can be a Gly-Ser linker, such as a (GSGS) n or (GGGGS) n linker, where n = 1, 2, 3, 4, or 5, or as described herein or known in the art. Replaced with any other suitable short peptide linker.
1r) DOM1h -574-208 - GGGGSGGGGSGGGGS - SCDKTH - 트라스투주맙 Fc 1r) DOM1h -574-208 - GGGGSGGGGSGGGGS - SCDKTH - Trastuzumab Fc
인간 TNFR1 길항제 dAb DOM1h-574-208(서열번호: 54)을 함유하는 TNFR1 길항제 융합 단백질이 본 명세서에 제공된다. DOM1h-574-208의 C-말단은 트라스투주맙 Fc 영역(서열번호: 26의 잔기 234-450에 상응함; 또한 서열번호: 27 참조)의 N-말단에 융합되는 잔기 SCDKTH(서열번호: 26의 잔기 222-227에 상응함)의 서열을 적어도 함유하는 트라스투주맙의 힌지 서열의 일부에 융합되는 GGGGSGGGGSGGGGS 펩티드 링커에 융합된다. DOM1h-574-208-GGGGSGGGGSGGGGS-SCDKTH-트라스투주맙 Fc 융합 단백질은 하기 서열을 갖는다 (서열번호: 720):Provided herein is a TNFR1 antagonist fusion protein containing the human TNFR1 antagonist dAb DOM1h-574-208 (SEQ ID NO: 54). The C-terminus of DOM1h-574-208 corresponds to residues SCDKTH (SEQ ID NO: 26 Corresponding to residues 222-227 of) is fused to a GGGGSGGGGSGGGGS peptide linker that is fused to a portion of the hinge sequence of Trastuzumab that contains at least the sequence of The DOMlh-574-208-GGGGSGGGGSGGGGS-SCDKTH-trastuzumab Fc fusion protein has the following sequence (SEQ ID NO: 720):
대안적으로, GGGGSGGGGSGGGGS 링커는 Gly-Ser 링커, 예컨대 (GSGS)n 또는 (GGGGS)n 링커(여기서 n = 1, 2, 3, 4 또는 5) 또는 본 명세서에 기재되거나 당업계에 공지된 바와 같은 임의의 다른 적합한 짧은 펩티드 링커로 대체된다. 대안적으로 또는 추가로, SCDKTH 힌지 서열은 서열 EPKSCDKTHTCPPCP (서열번호: 26의 잔기 219-233에 상응함)를 함유하는 트라스투주맙의 힌지 영역의 전체 서열까지 적어도 5, 6, 7, 8, 9, 10 또는 11개의 인접 잔기를 함유하는 적어도 부분으로 대체된다.Alternatively, the GGGGSGGGGSGGGGS linker can be a Gly-Ser linker, such as a (GSGS) n or (GGGGS) n linker, where n = 1, 2, 3, 4, or 5, or as described herein or known in the art. Replaced with any other suitable short peptide linker. Alternatively or additionally, the SCDKTH hinge sequence is at least 5, 6, 7, 8, 9 up to the entire sequence of the hinge region of Trastuzumab containing the sequence EPKSCDKTHTCPPCP (corresponding to residues 219-233 of SEQ ID NO: 26). , at least a moiety containing 10 or 11 contiguous residues.
1s) 1s) DOM1hDOM1h -574-208 - -574-208 - GGGGSGGGGSGGGGSGGGGSGGGGSGGGGS - - HSAHSA
인간 TNFR1 길항제 dAb DOM1h-574-208(서열번호: 54)을 함유하는 TNFR1 길항제 융합 단백질이 본 명세서에 제공된다. DOM1h-574-208의 C-말단은 GGGGSGGGGSGGGGS 펩티드 링커에 융합되는데, 이 링커는 신호 펩티드(서열번호: 35의 잔기 19-609에 상응함) 없이 인간 혈청 알부민(HSA)의 N-말단에 융합된다. DOM1h-574-208-GGGGSGGGGSGGGGS-HSA 융합 단백질은 하기 서열을 갖는다 (서열번호: 721):Provided herein is a TNFR1 antagonist fusion protein containing the human TNFR1 antagonist dAb DOM1h-574-208 (SEQ ID NO: 54). The C-terminus of DOMlh-574-208 is fused to the GGGGSGGGGSGGGGS peptide linker, which is fused to the N-terminus of human serum albumin (HSA) without a signal peptide (corresponding to residues 19-609 of SEQ ID NO: 35). . The DOM1h-574-208-GGGGSGGGGSGGGGS-HSA fusion protein has the following sequence (SEQ ID NO: 721):
대안적으로, GGGGSGGGGSGGGGS 링커는 Gly-Ser 링커, 예컨대 (GSGS)n 또는 (GGGGS)n 링커(여기서 n = 1, 2, 3, 4 또는 5) 또는 본 명세서에 기재되거나 당업계에 공지된 바와 같은 임의의 다른 적합한 짧은 펩티드 링커로 대체된다.Alternatively, the GGGGSGGGGSGGGGS linker can be a Gly-Ser linker, such as a (GSGS) n or (GGGGS) n linker, where n = 1, 2, 3, 4, or 5, or as described herein or known in the art. Replaced with any other suitable short peptide linker.
1t) DOM1h-574-208 - GGGGSGGGGSGGGGS - PEG1t) DOM1h-574-208 - GGGGSGGGGSGGGGS - PEG 30 kDa30 kDa
인간 TNFR1 길항제 dAb DOM1h-574-208(서열번호: 54)을 함유하는 TNFR1 길항제 융합 단백질이 본 명세서에 제공된다. DOM1h-574-208의 C-말단은 크기가 30 kDa인 PEG 분자에 공유 결합된 GGGGSGGGGSGGGGS 펩티드 링커에 융합된다. Provided herein is a TNFR1 antagonist fusion protein containing the human TNFR1 antagonist dAb DOM1h-574-208 (SEQ ID NO: 54). The C-terminus of DOMlh-574-208 is fused to a GGGGSGGGGSGGGGS peptide linker covalently linked to a 30 kDa PEG molecule.
대안적으로, GGGGSGGGGSGGGGS 링커는 Gly-Ser 링커, 예컨대 (GSGS)n 또는 (GGGGS)n 링커(여기서 n = 1, 2, 3, 4 또는 5) 또는 본 명세서에 기재되거나 당업계에 공지된 바와 같은 임의의 다른 적합한 짧은 펩티드 링커로 대체된다. 대안적으로 또는 추가로, PEG 분자는 예를 들어 35 kDa, 40 kDa, 45 kDa 또는 50 kDa와 같은 적어도 또는 30 kDa 초과의 분자량을 가질 수 있다.Alternatively, the GGGGSGGGGSGGGGS linker can be a Gly-Ser linker, such as a (GSGS) n or (GGGGS) n linker, where n = 1, 2, 3, 4, or 5, or as described herein or known in the art. Replaced with any other suitable short peptide linker. Alternatively or additionally, the PEG molecule may have a molecular weight of at least or greater than 30 kDa, such as for example 35 kDa, 40 kDa, 45 kDa or 50 kDa.
1u) DOM1h-131-206 - SCDKTH - 트라스투주맙 Fc 1u) DOM1h-131-206 - SCDKTH - Trastuzumab Fc
인간 TNFR1 길항제 dAb DOM1h-131-206(서열번호: 59)을 함유하는 TNFR1 길항제 융합 단백질이 본 명세서에 제공된다. DOM1h-131-206의 C-말단은 트라스투주맙 Fc 영역(서열번호: 26의 잔기 234-450에 상응함; 또한 서열번호: 27 참조)의 N-말단에 융합되는 잔기 SCDKTH(서열번호: 26의 잔기 222-227에 상응함)의 서열을 적어도 함유하는 트라스투주맙의 힌지 서열의 일부에 융합된다. DOM1h-131-206-SCDKTH-트라스투주맙 Fc 융합 단백질은 하기 서열을 갖는다 (서열번호: 722):Provided herein is a TNFR1 antagonist fusion protein containing the human TNFR1 antagonist dAb DOM1h-131-206 (SEQ ID NO: 59). The C-terminus of DOM1h-131-206 is residue SCDKTH (SEQ ID NO: 26 corresponding to residues 222-227 of The DOM1h-131-206-SCDKTH-Trastuzumab Fc fusion protein has the following sequence (SEQ ID NO: 722):
대안적으로, SCDKTH 힌지 서열은 서열 EPKSCDKTHTCPPCP (서열번호: 26의 잔기 219-233에 상응함)를 함유하는 트라스투주맙의 힌지 영역의 전체 서열까지 적어도 5, 6, 7, 8, 9, 10 또는 11개의 인접 잔기를 함유하는 부분으로 대체된다.Alternatively, the SCDKTH hinge sequence is at least 5, 6, 7, 8, 9, 10 or replaced by a moiety containing 11 adjacent residues.
1v) DOM1h-131-206 - GGGGSGGGGSGGGGS - 트라스투주맙 Fc1v) DOM1h-131-206 - GGGGSGGGGSGGGGS - Trastuzumab Fc
인간 TNFR1 길항제 dAb DOM1h-131-206(서열번호: 59)을 함유하는 TNFR1 길항제 융합 단백질이 본 명세서에 제공된다. DOM1h-131-206의 C-말단은 GGGGSGGGGSGGGGS 펩티드 링커에 융합되는데, 이 링커는 트라스투주맙 Fc 영역 (서열번호: 26의 잔기 234-450에 상응함; 또한 서열번호: 27 참조)의 N-말단에 융합된다. DOM1h-131-206-GGGGSGGGGSGGGGS-트라스투주맙 Fc 융합 단백질은 하기 서열을 갖는다 (서열번호: 723):Provided herein is a TNFR1 antagonist fusion protein containing the human TNFR1 antagonist dAb DOM1h-131-206 (SEQ ID NO: 59). The C-terminus of DOM1h-131-206 is fused to the GGGGSGGGGSGGGGS peptide linker, which is fused to the N-terminus of the trastuzumab Fc region (corresponding to residues 234-450 of SEQ ID NO: 26; see also SEQ ID NO: 27). is fused to The DOM1h-131-206-GGGGSGGGGSGGGGS-Trastuzumab Fc fusion protein has the following sequence (SEQ ID NO: 723):
대안적으로, GGGGSGGGGSGGGGS 링커는 Gly-Ser 링커, 예컨대 (GSGS)n 또는 (GGGGS)n 링커(여기서 n = 1, 2, 3, 4 또는 5) 또는 본 명세서에 기재되거나 당업계에 공지된 바와 같은 임의의 다른 적합한 짧은 펩티드 링커로 대체된다.Alternatively, the GGGGSGGGGSGGGGS linker can be a Gly-Ser linker, such as a (GSGS) n or (GGGGS) n linker, where n = 1, 2, 3, 4, or 5, or as described herein or known in the art. Replaced with any other suitable short peptide linker.
1w) DOM1h-131-206 - GGGGSGGGGSGGGGS - SCDKTH - 트라스투주맙 Fc 1w) DOM1h-131-206 - GGGGSGGGGSGGGGS - SCDKTH - Trastuzumab Fc
인간 TNFR1 길항제 dAb DOM1h-131-206(서열번호: 59)을 함유하는 TNFR1 길항제 융합 단백질이 본 명세서에 제공된다. DOM1h-131-206의 C-말단은 트라스투주맙 Fc 영역(서열번호: 26의 잔기 234-450에 상응함; 또한 서열번호: 27 참조)의 N-말단에 융합되는 잔기 SCDKTH(서열번호: 26의 잔기 222-227에 상응함)의 서열을 적어도 함유하는 트라스투주맙의 힌지 서열의 일부에 융합되는 GGGGSGGGGSGGGGS 펩티드 링커에 융합된다. DOM1h-131-206-GGGGSGGGGSGGGGS-SCDKTH-트라스투주맙 Fc 융합 단백질은 하기 서열을 갖는다 (서열번호: 724):Provided herein is a TNFR1 antagonist fusion protein containing the human TNFR1 antagonist dAb DOM1h-131-206 (SEQ ID NO: 59). The C-terminus of DOM1h-131-206 is residue SCDKTH (SEQ ID NO: 26 Corresponding to residues 222-227 of) is fused to a GGGGSGGGGSGGGGS peptide linker that is fused to a portion of the hinge sequence of Trastuzumab that contains at least the sequence of The DOM1h-131-206-GGGGSGGGGSGGGGS-SCDKTH-Trastuzumab Fc fusion protein has the following sequence (SEQ ID NO: 724):
대안적으로, GGGGSGGGGSGGGGS 링커는 또 다른 Gly-Ser (GS) 링커, 예컨대 (GSGS)n 또는 (GGGGS)n 링커(여기서 n = 1, 2, 3, 4 또는 5) 또는 본 명세서에 기재되거나 당업계에 공지된 바와 같은 임의의 다른 적합한 짧은 펩티드 링커로 대체된다. 대안적으로 또는 추가로, SCDKTH 힌지 서열은 서열 EPKSCDKTHTCPPCP (서열번호: 26의 잔기 219-233에 상응함)를 함유하는 트라스투주맙의 힌지 영역의 전체 서열까지 적어도 5, 6, 7, 8, 9, 10 또는 11개의 인접 잔기를 함유하는 전부 또는 부분으로 대체된다.Alternatively, the GGGGSGGGGSGGGGS linker can be another Gly-Ser (GS) linker, such as a (GSGS) n or (GGGGS) n linker where n = 1, 2, 3, 4, or 5 or as described herein or in the art. Replaced with any other suitable short peptide linker as known in . Alternatively or additionally, the SCDKTH hinge sequence is at least 5, 6, 7, 8, 9 up to the entire sequence of the hinge region of Trastuzumab containing the sequence EPKSCDKTHTCPPCP (corresponding to residues 219-233 of SEQ ID NO: 26). , is replaced in whole or in part with 10 or 11 contiguous residues.
1z) H398 scFv - ESKYGPPCPPCP - 니볼루맙 Fc 1z) H398 scFv - ESKYGPPCPPCP - Nivolumab Fc
인간 TNFR1 길항제 항체 H398로부터 유래된 scFv를 함유하는 인간 TNFR1 길항제 융합 단백질이 본 명세서에 제공된다. scFv는 (GGGGS)3 펩티드 링커에 의해 함께 연결된 H398의 VL 및 VH 도메인을 함유한다. H398 scFv (서열번호:678)의 C-말단은 니볼루맙 Fc 영역 서열번호: 29의 잔기 224-440에 상응함; 참조, 또한, 서열번호:30)의 N-말단에 융합된 서열 ESKYGPPCPPCP (서열번호: 29의 잔기 212-223에 상응함)을 함유하는 니볼루맙의 힌지 서열에 융합된다. H398 scFv-ESKYGPPCPPCP-니볼루맙 Fc 융합 단백질은 하기 서열을 갖는다 (서열번호: 726):Provided herein are human TNFR1 antagonist fusion proteins containing scFvs derived from human TNFR1 antagonist antibody H398. The scFv contains the V L and V H domains of H398 linked together by a (GGGGS) three- peptide linker. The C-terminus of the H398 scFv (SEQ ID NO:678) corresponds to residues 224-440 of the nivolumab Fc region SEQ ID NO:29; reference, also to the hinge sequence of nivolumab containing the sequence ESKYGPPCPPCP (corresponding to residues 212-223 of SEQ ID NO: 29) fused to the N-terminus of SEQ ID NO: 30). The H398 scFv-ESKYGPPCPPCP-nivolumab Fc fusion protein has the following sequence (SEQ ID NO: 726):
대안적으로, ESKYGPPCPPCP 힌지 서열(서열번호: 29의 잔기 212-223에 상응함)의 적어도 5, 6, 7, 8, 9, 10, 또는 11개의 인접 잔기를 함유하는 니볼루맙 힌지 서열의 전부 또는 일부가 사용된다.Alternatively, all or some are used
1aa) H398 scFv - GGGGSGGGGSGGGGS - 니볼루맙 Fc1aa) H398 scFv - GGGGSGGGGSGGGGS - Nivolumab Fc
인간 TNFR1 길항제 항체 H398로부터 유래된 scFv를 함유하는 TNFR1 길항제 융합 단백질이 본 명세서에 제공된다. scFv는 (GGGGS)3 펩티드 링커에 의해 함께 연결된 H398의 VL 및 VH 도메인을 함유한다. H398 scFv(서열번호: 678)의 C-말단은 니볼루맙 Fc 영역 (서열번호: 29의 잔기 224-440에 상응함; 참조, 또한, 서열번호:30)의 N-말단에 융합된 GGGGSGGGGSGGGGS 펩티드 링커에 융합된다. H398 scFv-GGGGSGGGGSGGGGS-니볼루맙 Fc 융합 단백질은 하기 서열을 갖는다 (서열번호: 727):Provided herein are TNFR1 antagonist fusion proteins containing scFvs derived from human TNFR1 antagonist antibody H398. The scFv contains the V L and V H domains of H398 linked together by a (GGGGS) three- peptide linker. The C-terminus of the H398 scFv (SEQ ID NO: 678) is a GGGGSGGGGSGGGGS peptide linker fused to the N-terminus of the nivolumab Fc region (corresponding to residues 224-440 of SEQ ID NO: 29; see also SEQ ID NO:30). is fused to The H398 scFv-GGGGSGGGGSGGGGS-Nivolumab Fc fusion protein has the following sequence (SEQ ID NO: 727):
대안적으로, GGGGSGGGGSGGGGS 링커는 Gly-Ser 링커, 예컨대 (GSGS)n 또는 (GGGGS)n 링커(여기서 n = 1, 2, 3, 4 또는 5) 또는 본 명세서에 기재되거나 당업계에 공지된 바와 같은 임의의 다른 적합한 짧은 펩티드 링커로 대체된다. Alternatively, the GGGGSGGGGSGGGGS linker can be a Gly-Ser linker, such as a (GSGS) n or (GGGGS) n linker, where n = 1, 2, 3, 4, or 5, or as described herein or known in the art. Replaced with any other suitable short peptide linker.
1ab) H398 scFv - GGGGSGGGGSGGGGS- ESKYGPPCPPCP - 니볼루맙 Fc 1ab) H398 scFv - GGGGSGGGGSGGGGS - ESKYGPPCPPCP - Nivolumab Fc
인간 TNFR1 길항제 항체 H398로부터 유래된 scFv를 함유하는 TNFR1 길항제 융합 단백질이 본 명세서에 제공된다. scFv는 (GGGGS)3 펩티드 링커에 의해 함께 연결된 H398의 VL 및 VH 도메인을 함유한다. H398 scFv (서열번호:678)의 C-말단은 니볼루맙 Fc 영역 서열번호: 29의 잔기 224-440에 상응함; 참조, 또한, 서열번호:30)의 N-말단에 융합된 서열 ESKYGPPCPPCP (서열번호: 29의 잔기 212-223에 상응함)을 함유하는 니볼루맙의 힌지 서열에 융합된 GGGGSGGGGSGGGGS 펩티드 링커에 융합된다. H398 scFv-GGGGSGGGGSGGGGS-ESKYGPPCPPCP-니볼루맙 Fc 융합 단백질은 하기 서열을 갖는다 (서열번호: 728):Provided herein are TNFR1 antagonist fusion proteins containing scFvs derived from human TNFR1 antagonist antibody H398. The scFv contains the V L and V H domains of H398 linked together by a (GGGGS) three- peptide linker. The C-terminus of the H398 scFv (SEQ ID NO:678) corresponds to residues 224-440 of the nivolumab Fc region SEQ ID NO:29; Reference, also fused to the GGGGSGGGGSGGGGS peptide linker fused to the hinge sequence of nivolumab containing the sequence ESKYGPPCPPCP (corresponding to residues 212-223 of SEQ ID NO: 29) fused to the N-terminus of SEQ ID NO: 30). The H398 scFv-GGGGSGGGGSGGGGS-ESKYGPPCPPCP-Nivolumab Fc fusion protein has the following sequence (SEQ ID NO: 728):
대안적으로, GGGGSGGGGSGGGGS 링커는 Gly-Ser 링커, 예컨대 (GSGS)n 또는 (GGGGS)n 링커(여기서 n = 1, 2, 3, 4 또는 5) 또는 본 명세서에 기재되거나 당업계에 공지된 바와 같은 임의의 다른 적합한 짧은 펩티드 링커로 대체된다. 대안적으로 또는 추가로, ESKYGPPCPPCP 힌지 서열(서열번호: 29의 잔기 212-223에 상응함)의 적어도 5, 6, 7, 8, 9, 10, 또는 11개의 인접 잔기를 함유하는 니볼루맙 힌지 서열의 전부 또는 일부가 사용된다.Alternatively, the GGGGSGGGGSGGGGS linker can be a Gly-Ser linker, such as a (GSGS) n or (GGGGS) n linker, where n = 1, 2, 3, 4, or 5, or as described herein or known in the art. Replaced with any other suitable short peptide linker. Alternatively or additionally, a nivolumab hinge sequence containing at least 5, 6, 7, 8, 9, 10, or 11 contiguous residues of the ESKYGPPCPPCP hinge sequence (corresponding to residues 212-223 of SEQ ID NO: 29) all or part of is used.
1ac) DOM1h-574-16 - ESKYGPPCPPCP - 니볼루맙 Fc1ac) DOM1h-574-16 - ESKYGPPCPPCP - Nivolumab Fc
인간 TNFR1 길항제 dAb DOM1h-574-16(서열번호: 57)을 함유하는 TNFR1 길항제 융합 단백질이 본 명세서에 제공된다. DOM1h-574-16의 C-말단은 니볼루맙 Fc 영역 서열번호: 29의 잔기 224-440에 상응함; 참조, 또한, 서열번호:30)의 N-말단에 융합된 서열 ESKYGPPCPPCP (서열번호: 29의 잔기 212-223에 상응함)을 함유하는 니볼루맙의 힌지 서열에 융합된다. DOM1h-574-16-ESKYGPPCPPCP-니볼루맙 Fc 융합 단백질은 하기 서열을 갖는다 (서열번호: 729):Provided herein is a TNFR1 antagonist fusion protein containing the human TNFR1 antagonist dAb DOM1h-574-16 (SEQ ID NO: 57). C-terminus of DOM1h-574-16 corresponds to residues 224-440 of nivolumab Fc region SEQ ID NO: 29; reference, also to the hinge sequence of nivolumab containing the sequence ESKYGPPCPPCP (corresponding to residues 212-223 of SEQ ID NO: 29) fused to the N-terminus of SEQ ID NO: 30). The DOM1h-574-16-ESKYGPPCPPCP-Nivolumab Fc fusion protein has the following sequence (SEQ ID NO: 729):
대안적으로, ESKYGPPCPPCP 힌지 서열(서열번호: 29의 잔기 212-223에 상응함)의 적어도 5, 6, 7, 8, 9, 10, 또는 11개의 인접 잔기를 함유하는 니볼루맙 힌지 서열의 전부 또는 일부가 사용된다.Alternatively, all or some are used
1ad) DOM1h-574-16 - GGGGSGGGGSGGGGS - 니볼루맙 Fc1ad) DOM1h-574-16 - GGGGSGGGGSGGGGS - Nivolumab Fc
인간 TNFR1 길항제 dAb DOM1h-574-16(서열번호: 57)을 함유하는 TNFR1 길항제 융합 단백질이 본 명세서에 제공된다. DOM1h-574-16의 C-말단은 GGGGSGGGGSGGGGS 펩티드 링커에 융합되는데, 이 링커는 니볼루맙 Fc 영역 (서열번호: 29의 잔기 224-440에 상응함; 참조, 또한, 서열번호:30)의 N-말단에 융합된다. DOM1h-574-16-GGGGSGGGGSGGGGS-니볼루맙 Fc 융합 단백질은 하기 서열을 갖는다 (서열번호: 730):Provided herein is a TNFR1 antagonist fusion protein containing the human TNFR1 antagonist dAb DOM1h-574-16 (SEQ ID NO: 57). The C-terminus of DOMlh-574-16 is fused to a GGGGSGGGGSGGGGS peptide linker, which corresponds to residues 224-440 of the nivolumab Fc region (SEQ ID NO: 29; see also SEQ ID NO:30). fused at the end The DOM1h-574-16-GGGGSGGGGSGGGGS-Nivolumab Fc fusion protein has the following sequence (SEQ ID NO: 730):
대안적으로, GGGGSGGGGSGGGGS 링커는 Gly-Ser 링커, 예컨대 (GSGS)n 또는 (GGGGS)n 링커(여기서 n = 1, 2, 3, 4 또는 5) 또는 본 명세서에 기재되거나 당업계에 공지된 바와 같은 임의의 다른 적합한 짧은 펩티드 링커로 대체된다.Alternatively, the GGGGSGGGGSGGGGS linker can be a Gly-Ser linker, such as a (GSGS) n or (GGGGS) n linker, where n = 1, 2, 3, 4, or 5, or as described herein or known in the art. Replaced with any other suitable short peptide linker.
1ae) DOM1h-574-16 - GGGGSGGGGSGGGGS - ESKYGPPCPPCP - 니볼루맙 Fc 1ae) DOM1h-574-16 - GGGGSGGGGSGGGGS - ESKYGPPCPPCP - Nivolumab Fc
인간 TNFR1 길항제 dAb DOM1h-574-16(서열번호: 57)을 함유하는 TNFR1 길항제 융합 단백질이 본 명세서에 제공된다. DOM1h-574-16의 C-말단은 니볼루맙 Fc 영역 서열번호: 29의 잔기 224-440에 상응함; 참조, 또한, 서열번호:30)의 N-말단에 융합된 서열 ESKYGPPCPPCP (서열번호: 29의 잔기 212-223에 상응함)을 함유하는 니볼루맙의 힌지 서열에 융합된 GGGGSGGGGSGGGGS 펩티드 링커에 융합된다. DOM1h-574-16-GGGGSGGGGSGGGGS-ESKYGPPCPPCP-니볼루맙 Fc 융합 단백질은 하기 서열을 갖는다 (서열번호: 731):Provided herein is a TNFR1 antagonist fusion protein containing the human TNFR1 antagonist dAb DOM1h-574-16 (SEQ ID NO: 57). C-terminus of DOM1h-574-16 corresponds to residues 224-440 of nivolumab Fc region SEQ ID NO: 29; Reference, also fused to the GGGGSGGGGSGGGGS peptide linker fused to the hinge sequence of nivolumab containing the sequence ESKYGPPCPPCP (corresponding to residues 212-223 of SEQ ID NO: 29) fused to the N-terminus of SEQ ID NO: 30). The DOM1h-574-16-GGGGSGGGGSGGGGS-ESKYGPPCPPCP-Nivolumab Fc fusion protein has the following sequence (SEQ ID NO: 731):
대안적으로, GGGGSGGGGSGGGGS 링커는 Gly-Ser 링커, 예컨대 (GSGS)n 또는 (GGGGS)n 링커(여기서 n = 1, 2, 3, 4 또는 5) 또는 본 명세서에 기재되거나 당업계에 공지된 바와 같은 임의의 다른 적합한 짧은 펩티드 링커로 대체된다. 대안적으로 또는 추가로, ESKYGPPCPPCP 힌지 서열(서열번호: 29의 잔기 212-223에 상응함)의 전체 서열까지 적어도 5, 6, 7, 8, 9, 10, 또는 11개의 인접 잔기를 함유하는 니볼루맙 힌지 서열의 적어도 일부가 포함된다.Alternatively, the GGGGSGGGGSGGGGS linker can be a Gly-Ser linker, such as a (GSGS) n or (GGGGS) n linker, where n = 1, 2, 3, 4, or 5, or as described herein or known in the art. Replaced with any other suitable short peptide linker. Alternatively or additionally, a nibol containing at least 5, 6, 7, 8, 9, 10, or 11 contiguous residues up to the entire sequence of the ESKYGPPCPPCP hinge sequence (corresponding to residues 212-223 of SEQ ID NO: 29) At least a portion of the lumab hinge sequence is included.
1af) DOM1h-549 - ESKYGPPCPPCP - 니볼루맙 Fc1af) DOM1h-549 - ESKYGPPCPPCP - Nivolumab Fc
인간 TNFR1 길항제 dAb DOM1h-549(서열번호: 58)을 함유하는 TNFR1 길항제 융합 단백질이 본 명세서에 제공된다. DOM1h-549의 C-말단은 니볼루맙 Fc 영역 서열번호: 29의 잔기 224-440에 상응함; 참조, 또한, 서열번호:30)의 N-말단에 융합된 서열 ESKYGPPCPPCP (서열번호: 29의 잔기 212-223에 상응함)을 함유하는 니볼루맙의 힌지 서열에 융합된다. DOM1h-549-ESKYGPPCPPCP-니볼루맙 Fc 융합 단백질은 하기 서열을 갖는다 (서열번호: 732):Provided herein is a TNFR1 antagonist fusion protein containing the human TNFR1 antagonist dAb DOM1h-549 (SEQ ID NO: 58). C-terminus of DOM1h-549 corresponds to residues 224-440 of nivolumab Fc region SEQ ID NO: 29; reference, also to the hinge sequence of nivolumab containing the sequence ESKYGPPCPPCP (corresponding to residues 212-223 of SEQ ID NO: 29) fused to the N-terminus of SEQ ID NO: 30). The DOM1h-549-ESKYGPPCPPCP-nivolumab Fc fusion protein has the following sequence (SEQ ID NO: 732):
대안적으로, ESKYGPPCPPCP 힌지 서열(서열번호: 29의 잔기 212-223에 상응함)의 적어도 5, 6, 7, 8, 9, 10, 또는 11개의 인접 잔기를 함유하는 니볼루맙 힌지 서열의 전부 또는 일부가 포함된다.Alternatively, all or some are included
1ag) DOM1h-549 - GGGGSGGGGSGGGGS - 니볼루맙 Fc1ag) DOM1h-549 - GGGGSGGGGSGGGGS - Nivolumab Fc
인간 TNFR1 길항제 dAb DOM1h-549(서열번호: 58)을 함유하는 TNFR1 길항제 융합 단백질이 본 명세서에 제공된다. DOM1h-549의 C-말단은 GGGGSGGGGSGGGGS 펩티드 링커에 융합되는데, 이 링커는 니볼루맙 Fc 영역 (서열번호: 29의 잔기 224-440에 상응함; 참조, 또한, 서열번호:30)의 N-말단에 융합된다. DOM1h-549-GGGGSGGGGSGGGGS-니볼루맙 Fc 융합 단백질은 하기 서열을 갖는다 (서열번호: 733):Provided herein is a TNFR1 antagonist fusion protein containing the human TNFR1 antagonist dAb DOM1h-549 (SEQ ID NO: 58). The C-terminus of DOM1h-549 is fused to the GGGGSGGGGSGGGGS peptide linker, which is fused to the N-terminus of the nivolumab Fc region (corresponding to residues 224-440 of SEQ ID NO: 29; see also SEQ ID NO:30). is fused The DOM1h-549-GGGGSGGGGSGGGGS-Nivolumab Fc fusion protein has the following sequence (SEQ ID NO: 733):
대안적으로, GGGGSGGGGSGGGGS 링커는 Gly-Ser 링커, 예컨대 (GSGS)n 또는 (GGGGS)n 링커(여기서 n = 1, 2, 3, 4 또는 5) 또는 본 명세서에 기재되거나 당업계에 공지된 바와 같은 임의의 다른 적합한 짧은 펩티드 링커로 대체된다.Alternatively, the GGGGSGGGGSGGGGS linker can be a Gly-Ser linker, such as a (GSGS) n or (GGGGS) n linker, where n = 1, 2, 3, 4, or 5, or as described herein or known in the art. Replaced with any other suitable short peptide linker.
1ah) DOM1h-549 - GGGGSGGGGSGGGGS - ESKYGPPCPPCP - 니볼루맙 Fc 1ah) DOM1h-549 - GGGGSGGGGSGGGGS - ESKYGPPCPPCP - Nivolumab Fc
인간 TNFR1 길항제 dAb DOM1h-549(서열번호: 58)을 함유하는 TNFR1 길항제 융합 단백질이 본 명세서에 제공된다. DOM1h-549의 C-말단은 니볼루맙 Fc 영역 서열번호: 29의 잔기 224-440에 상응함; 참조, 또한, 서열번호:30)의 N-말단에 융합된 서열 ESKYGPPCPPCP (서열번호: 29의 잔기 212-223에 상응함)을 함유하는 니볼루맙의 힌지 서열에 융합된 GGGGSGGGGSGGGGS 펩티드 링커에 융합된다. DOM1h-549-GGGGSGGGGSGGGGS-ESKYGPPCPPCP-니볼루맙 Fc 융합 단백질은 하기 서열을 갖는다 (서열번호: 734):Provided herein is a TNFR1 antagonist fusion protein containing the human TNFR1 antagonist dAb DOM1h-549 (SEQ ID NO: 58). C-terminus of DOM1h-549 corresponds to residues 224-440 of nivolumab Fc region SEQ ID NO: 29; Reference, also fused to the GGGGSGGGGSGGGGS peptide linker fused to the hinge sequence of nivolumab containing the sequence ESKYGPPCPPCP (corresponding to residues 212-223 of SEQ ID NO: 29) fused to the N-terminus of SEQ ID NO: 30). DOM1h-549-GGGGSGGGGSGGGGS-ESKYGPPCPPCP-Nivolumab Fc fusion protein has the following sequence (SEQ ID NO: 734):
일부 구현예에서, GGGGSGGGGSGGGGS 링커는 GS 링커, 예컨대 (GSGS)n 또는 (GGGGS)n 링커(여기서 n = 1, 2, 3, 4 또는 5) 또는 본 명세서에 기재되거나 당업계에 공지된 바와 같은 임의의 다른 적합한 짧은 펩티드 링커로 대체된다. 대안적으로 또는 추가로, ESKYGPPCPPCP 힌지 서열(서열번호: 29의 잔기 212-223에 상응함)의 적어도 5, 6, 7, 8, 9, 10, 또는 11개의 인접 잔기를 함유하는 니볼루맙 힌지 서열의 전부 또는 일부가 포함된다.In some embodiments, the GGGGSGGGGSGGGGS linker is a GS linker, such as a (GSGS) n or (GGGGS) n linker, where n = 1, 2, 3, 4, or 5, or any of those described herein or known in the art. is replaced with another suitable short peptide linker of Alternatively or additionally, a nivolumab hinge sequence containing at least 5, 6, 7, 8, 9, 10, or 11 contiguous residues of the ESKYGPPCPPCP hinge sequence (corresponding to residues 212-223 of SEQ ID NO: 29) includes all or part of
1ai) DOM1h-574-208 - ESKYGPPCPPCP - 니볼루맙 Fc1ai) DOM1h-574-208 - ESKYGPPCPPCP - Nivolumab Fc
인간 TNFR1 길항제 dAb DOM1h-574-208(서열번호: 54)을 함유하는 TNFR1 길항제 융합 단백질이 본 명세서에 제공된다. DOM1h-574-208의 C-말단은 니볼루맙 Fc 영역 서열번호: 29의 잔기 224-440에 상응함; 참조, 또한, 서열번호:30)의 N-말단에 융합된 서열 ESKYGPPCPPCP (서열번호: 29의 잔기 212-223에 상응함)을 함유하는 니볼루맙의 힌지 서열에 융합된다. DOM1h-574-208-ESKYGPPCPPCP-니볼루맙 Fc 융합 단백질은 하기 서열을 갖는다 (서열번호: 735):Provided herein is a TNFR1 antagonist fusion protein containing the human TNFR1 antagonist dAb DOM1h-574-208 (SEQ ID NO: 54). C-terminus of DOM1h-574-208 corresponds to residues 224-440 of nivolumab Fc region SEQ ID NO: 29; reference, also to the hinge sequence of nivolumab containing the sequence ESKYGPPCPPCP (corresponding to residues 212-223 of SEQ ID NO: 29) fused to the N-terminus of SEQ ID NO: 30). The DOM1h-574-208-ESKYGPPCPPCP-nivolumab Fc fusion protein has the following sequence (SEQ ID NO: 735):
대안적으로, ESKYGPPCPPCP 힌지 서열(서열번호: 29의 잔기 212-223에 상응함)의 적어도 5, 6, 7, 8, 9, 10, 또는 11개의 인접 잔기를 함유하는 니볼루맙 힌지 서열의 전부 또는 일부가 포함될 수 있다.Alternatively, all or some may be included.
1aj) DOM1h-574-208 - GGGGSGGGGSGGGGS - 니볼루맙 Fc1aj) DOM1h-574-208 - GGGGSGGGGSGGGGS - Nivolumab Fc
인간 TNFR1 길항제 dAb DOM1h-574-208(서열번호: 54)을 함유하는 TNFR1 길항제 융합 단백질이 본 명세서에 제공된다. DOM1h-574-208의 C-말단은 GGGGSGGGGSGGGGS 펩티드 링커에 융합되는데, 이 링커는 니볼루맙 Fc 영역 (서열번호: 29의 잔기 224-440에 상응함; 참조, 또한, 서열번호:30)의 N-말단에 융합된다. DOM1h-574-208-GGGGSGGGGSGGGGS-니볼루맙 Fc 융합 단백질은 하기 서열을 갖는다 (서열번호: 736): Provided herein is a TNFR1 antagonist fusion protein containing the human TNFR1 antagonist dAb DOM1h-574-208 (SEQ ID NO: 54). The C-terminus of DOM1h-574-208 is fused to the GGGGSGGGGSGGGGS peptide linker, which corresponds to residues 224-440 of the nivolumab Fc region (SEQ ID NO: 29; see also SEQ ID NO:30). fused at the end The DOM1h-574-208-GGGGSGGGGSGGGGS-Nivolumab Fc fusion protein has the following sequence (SEQ ID NO: 736):
대안적으로, GGGGSGGGGSGGGGS 링커는 Gly-Ser 링커, 예컨대 (GSGS)n 또는 (GGGGS)n 링커(여기서 n = 1, 2, 3, 4, 또는 5) 또는 본 명세서에 기재되거나 당업계에 공지된 바와 같은 임의의 다른 적합한 짧은 펩티드 링커로 대체된다.Alternatively, the GGGGSGGGGSGGGGS linker can be a Gly-Ser linker, such as a (GSGS) n or (GGGGS) n linker where n = 1, 2, 3, 4, or 5, or as described herein or known in the art. Replaced with any other suitable short peptide linker such as
1ak) DOM1h-574-208 - GGGGSGGGGSGGGGS - ESKYGPPCPPCP - 니볼루맙 Fc1ak) DOM1h-574-208 - GGGGSGGGGSGGGGS - ESKYGPPCPPCP - Nivolumab Fc
인간 TNFR1 길항제 dAb DOM1h-574-208(서열번호: 54)을 함유하는 TNFR1 길항제 융합 단백질이 본 명세서에 제공된다. DOM1h-574-208의 C-말단은 니볼루맙 Fc 영역 서열번호: 29의 잔기 224-440에 상응함; 참조, 또한, 서열번호:30)의 N-말단에 융합된 서열 ESKYGPPCPPCP (서열번호: 29의 잔기 212-223에 상응함)을 함유하는 니볼루맙의 힌지 서열에 융합된 GGGGSGGGGSGGGGS 펩티드 링커에 융합된다. DOM1h-574-208-GGGGSGGGGSGGGGS-ESKYGPPCPPCP-니볼루맙 Fc 융합 단백질은 하기 서열을 갖는다 (서열번호: 737):Provided herein is a TNFR1 antagonist fusion protein containing the human TNFR1 antagonist dAb DOM1h-574-208 (SEQ ID NO: 54). C-terminus of DOM1h-574-208 corresponds to residues 224-440 of nivolumab Fc region SEQ ID NO: 29; Reference, also fused to the GGGGSGGGGSGGGGS peptide linker fused to the hinge sequence of nivolumab containing the sequence ESKYGPPCPPCP (corresponding to residues 212-223 of SEQ ID NO: 29) fused to the N-terminus of SEQ ID NO: 30). The DOM1h-574-208-GGGGSGGGGSGGGGS-ESKYGPPCPPCP-Nivolumab Fc fusion protein has the following sequence (SEQ ID NO: 737):
대안적으로, GGGGSGGGGSGGGGS 링커는 (GSGS)n 또는 (GGGGS)n 링커(여기서 n = 1, 2, 3, 4, 또는 5) 또는 본 명세서에 기재되거나 당업계에 공지된 바와 같은 임의의 다른 적합한 짧은 펩티드 링커로 대체된다. 대안적으로 또는 추가로, ESKYGPPCPPCP 힌지 서열(서열번호: 29의 잔기 212-223에 상응함)의 적어도 5, 6, 7, 8, 9, 10, 또는 11개의 인접 잔기를 함유하는 니볼루맙 힌지 서열의 전부 또는 일부가 포함된다.Alternatively, the GGGGSGGGGSGGGGS linker can be a (GSGS) n or (GGGGS) n linker, where n = 1, 2, 3, 4, or 5, or any other suitable short chain as described herein or known in the art. replaced by a peptide linker. Alternatively or additionally, a nivolumab hinge sequence containing at least 5, 6, 7, 8, 9, 10, or 11 contiguous residues of the ESKYGPPCPPCP hinge sequence (corresponding to residues 212-223 of SEQ ID NO: 29) includes all or part of
1al) DOM1h-131-206 - ESKYGPPCPPCP - 니볼루맙 Fc 1al) DOM1h-131-206 - ESKYGPPCPPCP - Nivolumab Fc
인간 TNFR1 길항제 dAb DOM1h-131-206(서열번호: 59)을 함유하는 TNFR1 길항제 융합 단백질이 본 명세서에 제공된다. DOM1h-131-206의 C-말단은 니볼루맙 Fc 영역 서열번호: 29의 잔기 224-440에 상응함; 참조, 또한, 서열번호:30)의 N-말단에 융합된 서열 ESKYGPPCPPCP (서열번호: 29의 잔기 212-223에 상응함)을 함유하는 니볼루맙의 힌지 서열에 융합된다. DOM1h-131-206-ESKYGPPCPPCP-니볼루맙 Fc 융합 단백질은 하기 서열을 갖는다 (서열번호: 738):Provided herein is a TNFR1 antagonist fusion protein containing the human TNFR1 antagonist dAb DOM1h-131-206 (SEQ ID NO: 59). The C-terminus of DOM1h-131-206 corresponds to residues 224-440 of the nivolumab Fc region SEQ ID NO: 29; Reference, also to the hinge sequence of nivolumab containing the sequence ESKYGPPCPPCP (corresponding to residues 212-223 of SEQ ID NO: 29) fused to the N-terminus of SEQ ID NO: 30). The DOM1h-131-206-ESKYGPPCPPCP-nivolumab Fc fusion protein has the following sequence (SEQ ID NO: 738):
대안적으로, ESKYGPPCPPCP 힌지 서열(서열번호: 29의 잔기 212-223에 상응함)의 적어도 5, 6, 7, 8, 9, 10, 또는 11개의 인접 잔기를 함유하는 니볼루맙 힌지 서열의 전부 또는 일부가 포함된다.Alternatively, all or some are included
1am) DOM1h-131-206 - GGGGSGGGGSGGGGS - 니볼루맙 Fc1am) DOM1h-131-206 - GGGGSGGGGSGGGGS - Nivolumab Fc
인간 TNFR1 길항제 dAb DOM1h-131-206(서열번호: 59)을 함유하는 TNFR1 길항제 융합 단백질이 본 명세서에 제공된다. DOM1h-131-206의 C-말단은 GGGGSGGGGSGGGGS 펩티드 링커에 융합되는데, 이 링커는 니볼루맙 Fc 영역 (서열번호: 29의 잔기 224-440에 상응함; 참조, 또한, 서열번호:30)의 N-말단에 융합된다. DOM1h-131-206-GGGGSGGGGSGGGGS-니볼루맙 Fc 융합 단백질은 하기 서열을 갖는다 (서열번호: 739):Provided herein is a TNFR1 antagonist fusion protein containing the human TNFR1 antagonist dAb DOM1h-131-206 (SEQ ID NO: 59). The C-terminus of DOM1h-131-206 is fused to the GGGGSGGGGSGGGGS peptide linker, which corresponds to residues 224-440 of the nivolumab Fc region (SEQ ID NO: 29; see also SEQ ID NO:30). fused at the end The DOM1h-131-206-GGGGSGGGGSGGGGS-Nivolumab Fc fusion protein has the following sequence (SEQ ID NO: 739):
대안적으로, GGGGSGGGGSGGGGS 링커는 (GSGS)n 또는 (GGGGS)n 링커(여기서 n = 1, 2, 3, 4, 또는 5) 또는 본 명세서에 기재되거나 당업계에 공지된 바와 같은 임의의 다른 적합한 짧은 펩티드 링커로 대체된다.Alternatively, the GGGGSGGGGSGGGGS linker can be a (GSGS) n or (GGGGS) n linker, where n = 1, 2, 3, 4, or 5, or any other suitable short chain as described herein or known in the art. replaced by a peptide linker.
1an) DOM1h-131-206 - GGGGSGGGGSGGGGS - ESKYGPPCPPCP - 니볼루맙 Fc 1an) DOM1h-131-206 - GGGGSGGGGSGGGGS - ESKYGPPCPPCP - Nivolumab Fc
인간 TNFR1 길항제 dAb DOM1h-131-206(서열번호: 59)을 함유하는 TNFR1 길항제 융합 단백질이 본 명세서에 제공된다. DOM1h-131-206의 C-말단은 니볼루맙 Fc 영역 서열번호: 29의 잔기 224-440에 상응함; 참조, 또한, 서열번호:30)의 N-말단에 융합된 서열 ESKYGPPCPPCP (서열번호: 29의 잔기 212-223에 상응함)을 함유하는 니볼루맙의 힌지 서열에 융합된 GGGGSGGGGSGGGGS 펩티드 링커에 융합된다. DOM1h-131-206-GGGGSGGGGSGGGGS-ESKYGPPCPPCP-니볼루맙 Fc 융합 단백질은 하기 서열을 갖는다 (서열번호: 740):Provided herein is a TNFR1 antagonist fusion protein containing the human TNFR1 antagonist dAb DOM1h-131-206 (SEQ ID NO: 59). The C-terminus of DOM1h-131-206 corresponds to residues 224-440 of the nivolumab Fc region SEQ ID NO: 29; Reference, also fused to the GGGGSGGGGSGGGGS peptide linker fused to the hinge sequence of nivolumab containing the sequence ESKYGPPCPPCP (corresponding to residues 212-223 of SEQ ID NO: 29) fused to the N-terminus of SEQ ID NO: 30). The DOM1h-131-206-GGGGSGGGGSGGGGS-ESKYGPPCPPCP-Nivolumab Fc fusion protein has the following sequence (SEQ ID NO: 740):
대안적으로, GGGGSGGGGSGGGGS 링커는 (GSGS)n 또는 (GGGGS)n 링커(여기서 n = 1, 2, 3, 4, 또는 5) 또는 본 명세서에 기재되거나 당업계에 공지된 바와 같은 임의의 다른 적합한 짧은 펩티드 링커로 대체된다. 대안적으로 또는 추가로, ESKYGPPCPPCP 힌지 서열(서열번호: 29의 잔기 212-223에 상응함)의 적어도 5, 6, 7, 8, 9, 10, 또는 11개의 인접 잔기를 함유하는 니볼루맙 힌지 서열의 전부 또는 일부가 포함된다.Alternatively, the GGGGSGGGGSGGGGS linker can be a (GSGS) n or (GGGGS) n linker, where n = 1, 2, 3, 4, or 5, or any other suitable short chain as described herein or known in the art. replaced by a peptide linker. Alternatively or additionally, a nivolumab hinge sequence containing at least 5, 6, 7, 8, 9, 10, or 11 contiguous residues of the ESKYGPPCPPCP hinge sequence (corresponding to residues 212-223 of SEQ ID NO: 29) includes all or part of
또한 DOM1h-131-206과 같은 dAb를 포함하는 HSA에 연결된 Vhh(나노바디), 특히 단쇄 형태가 합성되었다. 예시적인 Vhh 작제물을 TNFR1의 결합 및 억제에 대해 평가하였다. 이들은 아래 실시예에서 기재된다.Also, HSA-linked Vhh (nanobodies) including dAbs such as DOM1h-131-206 have been synthesized, especially in short-chain form. Exemplary Vhh constructs were evaluated for binding and inhibition of TNFR1. These are described in the examples below.
실시예Example 5 5
인간 TNFR1 길항제 TNF 뮤테인을 함유하는 예시적인 TNFR1 길항제 작제물Exemplary TNFR1 antagonist constructs containing human TNFR1 antagonist TNF muteins
본 명세서에서 TNFR2를 억제하지 않으면서 TNFR1을 선택적으로 억제하는 TNFR1 길항제를 제공한다. TNFR1을 작용시키는 TNFR1 수용체 클러스터링을 피하기 위해 TNFR1 길항제는 1가이다. TNFR1 길항제는 TNF 뮤테인으로도 알려진 TNF(DN-TNF)의 신호전달 능력이 없는 우성 음성 억제제를 포함할 수 있으며, 이는 TNFR1을 통한 신호전달을 무효화하는 하나 이상의 돌연변이가 있는 TNF의 조작된 변이체이다. 예를 들어, TNF 뮤테인은 TNFR1에 대한 선택성을 부여하지만 TNFR2에 대한 선택성을 부여하지 않는 하나 이상의 돌연변이를 함유할 수 있다. TNFR1 선택적 TNF 돌연변이는 서열번호: 2에 제시된 가용성 TNF(solTNF)의 서열과 관련하여 L29S, L29G, L29Y, R31E, R31N, R32Y, R32W, S86T, L29S/R32W, L29S/S86T, R32W/S86T, L29S/R32W/S86T, R31N/R32T, R31E/S86T, R31N/R32T/S86T, E146R, V1M, R31C, C69V, Y87H, C101A, A145R, V1M/R31C/C69V/Y87H/C101A/A145R, I97T, I97T/A145R, A84S, V85T, Q88N, T89Q, 및 A84S/V85T/S86T/Y87H/Q88N/T89Q, 및 이들의 조합 중 임의의 하나 이상을 포함한다.Provided herein are TNFR1 antagonists that selectively inhibit TNFR1 without inhibiting TNFR2. TNFR1 antagonists are monovalent to avoid TNFR1 receptor clustering that agonizes TNFR1. TNFR1 antagonists can include dominant negative inhibitors lacking the signaling capacity of TNF (DN-TNF), also known as TNF muteins, which are engineered variants of TNF with one or more mutations that abrogate signaling through TNFR1 . For example, a TNF mutein may contain one or more mutations that confer selectivity for TNFR1 but not selectivity for TNFR2. The TNFR1 selective TNF mutation is L29S, L29G, L29Y, R31E, R31N, R32Y, R32W, S86T, L29S/R32W, L29S/S86T, R32W/S86T, L29S with respect to the sequence of soluble TNF (solTNF) set forth in SEQ ID NO: 2 /R32W/S86T, R31N/R32T, R31E/S86T, R31N/R32T/S86T, E146R, V1M, R31C, C69V, Y87H, C101A, A145R, V1M/R31C/C69V/Y87H/C101A/A145R, I97T, I97 T/A145R , A84S, V85T, Q88N, T89Q, and A84S/V85T/S86T/Y87H/Q88N/T89Q, and combinations thereof.
예를 들어, TNFR1 길항제는 돌연변이 R32W/S86T (서열번호:685), V1M/R31C/C69V/Y87H/C101A/A145R (서열번호:701; XPro1595에서와 같이), A84S/V85T/S86T/Y87H/Q88N/T89Q (서열번호:703; R1antTNF 에서와 같이), 또는 I97T/A145R (서열번호:702; XENP345 에서와 같이)를 갖는 TNF 뮤테인을 함유한다. For example, TNFR1 antagonists include mutations R32W/S86T (SEQ ID NO:685), V1M/R31C/C69V/Y87H/C101A/A145R (SEQ ID NO:701; as in XPro1595), A84S/V85T/S86T/Y87H/Q88N /T89Q (SEQ ID NO:703; as in R1antTNF), or I97T/A145R (SEQ ID NO:702; as in XENP345).
TNFR1 길항제는 IgG Fc와 같은 혈청 반감기 연장제에 융합된다. 예를 들어, 인간 TNFR1 길항적 TNF 뮤테인의 C-말단은 링커를 통해 인간 IgG1 또는 IgG4 항체의 Fc 영역의 N-말단과 융합된다. 트라스투주맙 유래의 IgG1 Fc(서열번호: 27 참조)와 같은 IgG1 Fc 영역 또는 니볼루맙 유래의 IgG4(서열번호: 30 참조)와 같은 IgG4 Fc 영역이 사용된다. 링커는 Fc가 트라스투주맙으로부터 유래될 때 적어도 잔기 SCDKTH(서열번호: 26의 잔기 222-227에 상응함)를 함유하는 트라스투주맙의 힌지 서열의 전부 또는 일부를 함유할 수 있거나, 또는 Fc가 니볼루맙으로부터 유래될 때 니볼루맙의 힌지 서열, ESKYGPPCPPCP (서열번호: 29의 잔기 212-223에 상응함), 또는 그의 일부를 함유할 수 있다. 프로테아제 저항성을 부여하고 융합 단백질의 가요성을 증가시키기 위해, SCDKTH 또는 ESKYGPPCPPCP 힌지 서열 또는 그의 일부는 짧은 글리신-세린 (GS) 펩티드 링커, 예컨대, 예를 들어, (GSGS)n 또는 (GGGGS)n (여기서 n = 1-5), 예를 들어, GGGGSGGGGSGGGGS로 대체된다. 대안적인 구현예에서, 인간 항-TNFR1 TNF 뮤테인의 C-말단은 GS 링커에 연결되고, GS 링커는 가요성을 제공하기에 충분한, 해당 Fc 영역의 N-말단에 연결디는 트라스투주맙 또는 니볼루맙 힌지 서열의 전부 또는 일부에 연결된다. 일부 구현예에서, 제2 Fc 서브유닛은 제1 Fc 영역에 연결되어 분자의 혈청 반감기 및 안정성을 증가시킬 수 있다. 생성된 작제물은 융합 단백질이 아니다.TNFR1 antagonists are fused to serum half-life extenders such as IgG Fc. For example, the C-terminus of a human TNFR1 antagonistic TNF mutein is fused to the N-terminus of the Fc region of a human IgG1 or IgG4 antibody via a linker. An IgG1 Fc region such as the IgG1 Fc from trastuzumab (see SEQ ID NO: 27) or an IgG4 Fc region such as the IgG4 from nivolumab (see SEQ ID NO: 30) is used. The linker may contain all or part of the hinge sequence of Trastuzumab, which contains at least residues SCDKTH (corresponding to residues 222-227 of SEQ ID NO: 26) when the Fc is derived from Trastuzumab, or the Fc is When derived from nivolumab, it may contain the hinge sequence of nivolumab, ESKYGPPCPPCP (corresponding to residues 212-223 of SEQ ID NO: 29), or a portion thereof. To confer protease resistance and increase the flexibility of the fusion protein, the SCDKTH or ESKYGPPCPPCP hinge sequence or part thereof is a short glycine-serine (GS) peptide linker such as, for example, (GSGS) n or (GGGGS) n ( where n = 1-5), eg GGGGSGGGGSGGGGS. In an alternative embodiment, the C-terminus of the human anti-TNFR1 TNF mutein is linked to a GS linker, the GS linker being linked to the N-terminus of the Fc region of interest sufficient to provide flexibility; or linked to all or part of the nivolumab hinge sequence. In some embodiments, the second Fc subunit can be linked to the first Fc region to increase the serum half-life and stability of the molecule. The resulting construct is not a fusion protein.
하기는 본 명세서에 기재되고 제공된 바와 같은 TNFR1 선택적 길항적 TNF 뮤테인을 함유하는 TNFR1 길항제 융합 단백질의 예시적인 작제물이다. 트라스투주맙의 Fc 또는 니볼루맙의 Fc를 함유하는 모든 구현예에서, Fc 영역은 선택적으로 ADCC, ADCP 및 CDC를 포함하는 면역 이펙터 기능을 감소 또는 제거하도록 변형되고, 또한 선택적으로 FcRn에 대한 결합을 강화하도록 변형되어 융합 단백질의 혈청 반감기를 증가시킨다. 면역 이펙터 기능을 감소시키거나 제거하는 Fc 변형은 표 9에 요약되어 있고, FcRn 결합을 강화시키는 Fc 변형은 표 7에 요약되어 있다. 이러한 변형의 임의의 하나 또는 조합은 본 명세서에 제공된 융합 단백질의 Fc 영역에 포함된다. Below are exemplary constructs of TNFR1 antagonist fusion proteins containing TNFR1 selectively antagonistic TNF muteins as described and provided herein. In all embodiments containing the Fc of Trastuzumab or the Fc of Nivolumab, the Fc region is optionally modified to reduce or eliminate immune effector functions, including ADCC, ADCP and CDC, and optionally also inhibits binding to FcRn. modified to enhance the serum half-life of the fusion protein. Fc modifications that reduce or eliminate immune effector function are summarized in Table 9, and Fc modifications that enhance FcRn binding are summarized in Table 7. Any one or combination of these modifications is included in the Fc region of the fusion proteins provided herein.
2a) TNF(R32W/S86T) - SCDKTH - 트라스투주맙 Fc2a) TNF (R32W/S86T) - SCDKTH - Trastuzumab Fc
서열번호: 2에 제시된 가용성 TNF의 서열과 관련하여 돌연변이 R32W/S86T를 갖는 TNFR1 선택적 길항제 TNF 뮤테인을 함유하는 인간 TNFR1 길항제 융합 단백질이 본 명세서에 제공된다. TNF(R32W/S86T) 뮤테인(서열번호: 685)의 C-말단은 트라스투주맙 Fc 영역(서열번호: 26의 잔기 234-450에 상응함; 또한 서열번호: 27 참조)의 N-말단에 융합되는 잔기 SCDKTH(서열번호: 26의 잔기 222-227에 상응함)을 적어도 함유하는 트라스투주맙의 힌지 서열의 전부 또는 일부에 융합된다. TNF(R32W/S86T)-SCDKTH-트라스투주맙 Fc 융합 단백질은 하기 서열을 갖는다 (서열번호: 741):Provided herein is a human TNFR1 antagonist fusion protein containing a TNFR1 selective antagonist TNF mutein having mutations R32W/S86T with respect to the sequence of soluble TNF set forth in SEQ ID NO:2. The C-terminus of the TNF (R32W/S86T) mutein (SEQ ID NO: 685) is at the N-terminus of the trastuzumab Fc region (corresponding to residues 234-450 of SEQ ID NO: 26; see also SEQ ID NO: 27) It is fused to all or part of the hinge sequence of Trastuzumab, which contains at least the residues SCDKTH (corresponding to residues 222-227 of SEQ ID NO: 26) to which it is fused. The TNF(R32W/S86T)-SCDKTH-Trastuzumab Fc fusion protein has the following sequence (SEQ ID NO: 741):
대안적으로, SCDKTH 힌지 서열은 서열 EPKSCDKTHTCPPCP(서열번호: 26의 잔기 219-233에 상응함)를 함유하는 트라스투주맙의 힌지 영역의, 전체 서열까지의 적어도 5, 6, 7, 8, 9, 10, 또는 11개의 인접 잔기로 대체된다.Alternatively, the SCDKTH hinge sequence comprises at least 5, 6, 7, 8, 9, replaced by 10 or 11 adjacent residues.
2b) TNF(R32W/S86T) - GGGGSGGGGSGGGGS - 트라스투주맙 Fc2b) TNF (R32W/S86T) - GGGGSGGGGSGGGGS - Trastuzumab Fc
서열번호: 2에 제시된 가용성 TNF의 서열과 관련하여 돌연변이 R32W/S86T를 갖는 TNFR1 선택적 길항제 TNF 뮤테인을 함유하는 TNFR1 길항제 융합 단백질이 본 명세서에 제공된다. TNF(R32W/S86T) 뮤테인 (서열번호:685)의 C-말단은 GGGGSGGGGSGGGGS 펩티드 링커에 융합되는데, 이 링커는 트라스투주맙 Fc 영역 (서열번호: 26의 잔기 234-450에 상응함; 또한 서열번호: 27 참조)의 N-말단에 융합된다. TNF(R32W/S86T)-GGGGSGGGGSGGGGS-트라스투주맙 Fc 융합 단백질은 하기 서열을 갖는다 (서열번호: 742):Provided herein is a TNFR1 antagonist fusion protein containing a TNFR1 selective antagonist TNF mutein having mutations R32W/S86T with respect to the sequence of soluble TNF set forth in SEQ ID NO:2. The C-terminus of the TNF (R32W/S86T) mutein (SEQ ID NO: 685) is fused to a GGGGSGGGGSGGGGS peptide linker, which corresponds to residues 234-450 of the Trastuzumab Fc region (SEQ ID NO: 26; also sequence number: see 27) is fused to the N-terminus. The TNF(R32W/S86T)-GGGGSGGGGSGGGGS-Trastuzumab Fc fusion protein has the following sequence (SEQ ID NO: 742):
대안적으로, GGGGSGGGGSGGGGS 링커는 Gly-Ser 링커, 예컨대 (GSGS)n 또는 (GGGGS)n 링커(여기서 n = 1, 2, 3, 4, 또는 5) 또는 본 명세서에 기재되거나 당업계에 공지된 바와 같은 임의의 다른 적합한 짧은 펩티드 링커로 대체된다.Alternatively, the GGGGSGGGGSGGGGS linker can be a Gly-Ser linker, such as a (GSGS) n or (GGGGS) n linker where n = 1, 2, 3, 4, or 5, or as described herein or known in the art. Replaced with any other suitable short peptide linker such as
2c) TNF(R32W/S86T) - GGGGSGGGGSGGGGS- SCDKTH - 트라스투주맙 Fc 2c) TNF (R32W/S86T) - GGGGSGGGGSGGGGS - SCDKTH - Trastuzumab Fc
서열번호: 2에 제시된 가용성 TNF의 서열과 관련하여 돌연변이 R32W/S86T를 갖는 TNFR1 선택적 길항제 TNF 뮤테인을 함유하는 TNFR1 길항제 융합 단백질이 본 명세서에 제공된다. TNF(R32W/S86T) 뮤테인 (서열번호:685)의 C-말단은 트라스투주맙 Fc 영역(서열번호: 26의 잔기 234-450에 상응함; 또한 서열번호: 27 참조)의 N-말단에 융합되는 잔기 SCDKTH(서열번호: 26의 잔기 222-227에 상응함)를 적어도 함유하는 트라스투주맙의 힌지 서열의 일부에 융합되는 GGGGSGGGGSGGGGS 펩티드 링커에 융합된다. TNF(R32W/S86T)-GGGGSGGGGSGGGGS-DKTH-트라스투주맙 Fc 융합 단백질은 하기 서열을 갖는다 (서열번호: 743):Provided herein is a TNFR1 antagonist fusion protein containing a TNFR1 selective antagonist TNF mutein having mutations R32W/S86T with respect to the sequence of soluble TNF set forth in SEQ ID NO:2. The C-terminus of the TNF(R32W/S86T) mutein (SEQ ID NO:685) is at the N-terminus of the Trastuzumab Fc region (corresponding to residues 234-450 of SEQ ID NO:26; see also SEQ ID NO:27) GGGGSGGGGSGGGGS peptide linker that is fused to a portion of the hinge sequence of Trastuzumab that contains at least the residues SCDKTH (corresponding to residues 222-227 of SEQ ID NO: 26) to which it is fused. The TNF(R32W/S86T)-GGGGSGGGGSGGGGS-DKTH-Trastuzumab Fc fusion protein has the following sequence (SEQ ID NO: 743):
대안적으로, GGGGSGGGGSGGGGS 링커는 Gly-Ser 링커, 예컨대 (GSGS)n 또는 (GGGGS)n 링커(여기서 n = 1, 2, 3, 4, 또는 5) 또는 본 명세서에 기재되거나 당업계에 공지된 바와 같은 임의의 다른 적합한 짧은 펩티드 링커로 대체된다. 대안적으로 또는 추가로, SCDKTH 힌지 서열은 서열 EPKSCDKTHTCPPCP (서열번호: 26의 잔기 219-233에 상응함), 또는 적어도 5, 6, 7, 8, 9, 10, 또는 11개의 인접 잔기를 함유하는 그의 일부를 함유하는 트라스투주맙의 힌지 영역으로 대체된다.Alternatively, the GGGGSGGGGSGGGGS linker can be a Gly-Ser linker, such as a (GSGS) n or (GGGGS) n linker where n = 1, 2, 3, 4, or 5, or as described herein or known in the art. Replaced with any other suitable short peptide linker such as Alternatively or additionally, the SCDKTH hinge sequence contains the sequence EPKSCDKTHTCPPCP (corresponding to residues 219-233 of SEQ ID NO: 26), or at least 5, 6, 7, 8, 9, 10, or 11 contiguous residues. It is replaced with the hinge region of trastuzumab containing a portion thereof.
2d) TNF(V1M/R31C/C69V/Y87H/C101A/A145R) - SCDKTH - 트라스투주맙 Fc2d) TNF (V1M/R31C/C69V/Y87H/C101A/A145R) - SCDKTH - Trastuzumab Fc
서열번호: 2에 제시된 가용성 TNF의 서열과 관련하여 돌연변이 V1M, R31C, C69V, Y87H, C101A 및 A145R을 갖는 TNFR1 선택적 길항제 TNF 뮤테인을 함유하는 인간 TNFR1 길항제 융합 단백질이 본 명세서에 제공된다. TNF(V1M/R31C/C69V/Y87H/C101A/A145R) 뮤테인(서열번호: 701)의 C-말단은 트라스투주맙 Fc 영역(서열번호: 26의 잔기 234-450에 상응함; 또한 서열번호: 27 참조)의 N-말단에 융합되는 잔기 SCDKTH(서열번호: 26의 잔기 222-227에 상응함)을 적어도 함유하는 트라스투주맙의 힌지 서열의 일부에 융합된다. TNF(V1M/R31C/C69V/Y87H/C101A/A145R)-SCDKTH-트라스투주맙 Fc 융합 단백질은 하기 서열을 갖는다 (서열번호: 744):Provided herein is a human TNFR1 antagonist fusion protein containing a TNFR1 selective antagonist TNF mutein with mutations V1M, R31C, C69V, Y87H, C101A and A145R with respect to the sequence of soluble TNF set forth in SEQ ID NO:2. The C-terminus of the TNF (V1M/R31C/C69V/Y87H/C101A/A145R) mutein (SEQ ID NO: 701) corresponds to residues 234-450 of the Trastuzumab Fc region (SEQ ID NO: 26; also SEQ ID NO: 26). 27) is fused to at least a portion of the hinge sequence of Trastuzumab containing residues SCDKTH (corresponding to residues 222-227 of SEQ ID NO: 26). The TNF(V1M/R31C/C69V/Y87H/C101A/A145R)-SCDKTH-Trastuzumab Fc fusion protein has the following sequence (SEQ ID NO: 744):
대안적으로, SCDKTH 힌지 서열은 서열 EPKSCDKTHTCPPCP (서열번호: 26의 잔기 219-233에 상응함), 또는 적어도 5, 6, 7, 8, 9, 10, 또는 11개의 인접 잔기를 함유하는 그의 일부를 함유하는 트라스투주맙의 힌지 영역으로 대체된다.Alternatively, the SCDKTH hinge sequence is the sequence EPKSCDKTHTCPPCP (corresponding to residues 219-233 of SEQ ID NO: 26), or a portion thereof containing at least 5, 6, 7, 8, 9, 10, or 11 contiguous residues. It is replaced with the hinge region of trastuzumab containing
2e) 2e) TNFTNF (( V1MV1M // R31CR31C // C69VC69V // Y87HY87H // C101AC101A // A145RA145R ) - ) - GGGGSGGGGSGGGGSGGGGSGGGGSGGGGS - 트라스투주맙 Fc - Trastuzumab Fc
서열번호: 2에 제시된 가용성 TNF의 서열과 관련하여 돌연변이 V1M, R31C, C69V, Y87H, C101A 및 A145R을 갖는 TNFR1 선택적 길항제 TNF 뮤테인을 함유하는 TNFR1 길항제 융합 단백질이 본 명세서에 제공된다. TNF(V1M/R31C/C69V/Y87H/C101A/A145R) 뮤테인 (서열번호:701)의 C-말단은 GGGGSGGGGSGGGGS 펩티드 링커에 융합되는데, 이 링커는 트라스투주맙 Fc 영역 (서열번호: 26의 잔기 234-450에 상응함; 또한 서열번호: 27 참조)의 N-말단에 융합된다. TNF(V1M/R31C/C69V/Y87H/C101A/A145R)-GGGGSGGGGSGGGGS-트라스투주맙 Fc 융합 단백질은 하기 서열을 갖는다 (서열번호: 745):Provided herein is a TNFR1 antagonist fusion protein containing a TNFR1 selective antagonist TNF mutein with mutations V1M, R31C, C69V, Y87H, C101A and A145R with respect to the sequence of soluble TNF set forth in SEQ ID NO: 2. The C-terminus of the TNF (V1M/R31C/C69V/Y87H/C101A/A145R) mutein (SEQ ID NO: 701) is fused to the GGGGSGGGGSGGGGS peptide linker, which binds to the Trastuzumab Fc region (residue 234 of SEQ ID NO: 26). corresponds to -450; see also SEQ ID NO: 27). The TNF(V1M/R31C/C69V/Y87H/C101A/A145R)-GGGGSGGGGSGGGGS-Trastuzumab Fc fusion protein has the following sequence (SEQ ID NO: 745):
대안적으로, GGGGSGGGGSGGGGS 링커는 Gly-Ser 링커, 예컨대 (GSGS)n 또는 (GGGGS)n 링커(여기서 n = 1, 2, 3, 4 또는 5) 또는 본 명세서에 기재되거나 당업계에 공지된 바와 같은 임의의 다른 적합한 짧은 펩티드 링커로 대체된다. Alternatively, the GGGGSGGGGSGGGGS linker can be a Gly-Ser linker, such as a (GSGS) n or (GGGGS) n linker, where n = 1, 2, 3, 4, or 5, or as described herein or known in the art. Replaced with any other suitable short peptide linker.
2f) TNF ( V1M / R31C / C69V / Y87H / C101A / A145R ) - GGGGSGGGGSGGGGS- SCDKTH - 트라스투주맙 Fc 2f) TNF ( V1M / R31C / C69V / Y87H / C101A / A145R ) - GGGGSGGGGSGGGGS - SCDKTH - Trastuzumab Fc
서열번호: 2에 제시된 가용성 TNF의 서열과 관련하여 돌연변이 V1M, R31C, C69V, Y87H, C101A 및 A145R을 갖는 TNFR1 선택적 길항제 TNF 뮤테인을 함유하는 TNFR1 길항제 융합 단백질이 본 명세서에 제공된다. TNF(V1M/R31C/C69V/Y87H/C101A/A145R) 뮤테인 (서열번호:701)의 C-말단은 트라스투주맙 Fc 영역(서열번호: 26의 잔기 234-450에 상응함; 또한 서열번호: 27 참조)의 N-말단에 융합되는 잔기 SCDKTH(서열번호: 26의 잔기 222-227에 상응함)를 적어도 함유하는 트라스투주맙의 힌지 서열의 일부에 융합되는 GGGGSGGGGSGGGGS 펩티드 링커에 융합된다. TNF(V1M/R31C/C69V/Y87H/C101A/A145R)-GGGGSGGGGSGGGGS-SCDKTH-트라스투주맙 Fc 융합 단백질은 하기 서열을 갖는다 (서열번호: 746):Provided herein is a TNFR1 antagonist fusion protein containing a TNFR1 selective antagonist TNF mutein with mutations V1M, R31C, C69V, Y87H, C101A and A145R with respect to the sequence of soluble TNF set forth in SEQ ID NO: 2. The C-terminus of the TNF (V1M/R31C/C69V/Y87H/C101A/A145R) mutein (SEQ ID NO:701) corresponds to the Trastuzumab Fc region (residues 234-450 of SEQ ID NO: 26; also SEQ ID NO: 26). 27) to a GGGGSGGGGGSGGGGS peptide linker that is fused to at least a portion of the hinge sequence of Trastuzumab that contains residues SCDKTH (corresponding to residues 222-227 of SEQ ID NO: 26) that are fused to the N-terminus of . The TNF(V1M/R31C/C69V/Y87H/C101A/A145R)-GGGGSGGGGSGGGGS-SCDKTH-trastuzumab Fc fusion protein has the following sequence (SEQ ID NO: 746):
대안적으로, GGGGSGGGGSGGGGS 링커는 Gly-Ser 링커, 예컨대 (GSGS)n 또는 (GGGGS)n 링커(여기서 n = 1, 2, 3, 4, 또는 5) 또는 본 명세서에 기재되거나 당업계에 공지된 바와 같은 임의의 다른 적합한 짧은 펩티드 링커로 대체된다. 대안적으로 또는 추가로, SCDKTH 힌지 서열은 서열 EPKSCDKTHTCPPCP (서열번호: 26의 잔기 219-233에 상응함)를 함유하는 트라스투주맙의 힌지 영역의 전체 서열까지 적어도 5, 6, 7, 8, 9, 10 또는 11개의 인접 잔기를 함유하는 부분으로 대체된다.Alternatively, the GGGGSGGGGSGGGGS linker can be a Gly-Ser linker, such as a (GSGS) n or (GGGGS) n linker where n = 1, 2, 3, 4, or 5, or as described herein or known in the art. Replaced with any other suitable short peptide linker such as Alternatively or additionally, the SCDKTH hinge sequence is at least 5, 6, 7, 8, 9 up to the entire sequence of the hinge region of Trastuzumab containing the sequence EPKSCDKTHTCPPCP (corresponding to residues 219-233 of SEQ ID NO: 26). , is replaced with a moiety containing 10 or 11 adjacent residues.
2g) TNF(A84S/V85T/S86T/Y87H/Q88N/T89Q) - SCDKTH - 트라스투주맙 Fc2g) TNF (A84S/V85T/S86T/Y87H/Q88N/T89Q) - SCDKTH - Trastuzumab Fc
서열번호: 2에 제시된 가용성 TNF의 서열과 관련하여 돌연변이 A84S, V85T, S86T, Y87H, Q88N 및 T89Q를 갖는 TNFR1 선택적 길항제 TNF 뮤테인을 함유하는 인간 TNFR1 길항제 융합 단백질이 본 명세서에 제공된다. TNF(A84S/V85T/S86T/Y87H/Q88N/T89Q) 뮤테인(서열번호: 703)의 C-말단은 트라스투주맙 Fc 영역(서열번호: 26의 잔기 234-450에 상응함; 또한 서열번호: 27 참조)의 N-말단에 융합되는 잔기 SCDKTH(서열번호: 26의 잔기 222-227에 상응함)을 적어도 함유하는 트라스투주맙의 힌지 서열의 일부에 융합된다. TNF(A84S/V85T/S86T/Y87H/Q88N/T89Q)-SCDKTH-트라스투주맙 Fc 융합 단백질은 하기 서열을 갖는다 (서열번호: 747):Provided herein is a human TNFR1 antagonist fusion protein containing a TNFR1 selective antagonist TNF mutein with mutations A84S, V85T, S86T, Y87H, Q88N and T89Q with respect to the sequence of soluble TNF set forth in SEQ ID NO: 2. The C-terminus of the TNF (A84S/V85T/S86T/Y87H/Q88N/T89Q) mutein (SEQ ID NO: 703) corresponds to residues 234-450 of the trastuzumab Fc region (SEQ ID NO: 26; also SEQ ID NO: 703). 27) is fused to at least a portion of the hinge sequence of Trastuzumab containing residues SCDKTH (corresponding to residues 222-227 of SEQ ID NO: 26). The TNF(A84S/V85T/S86T/Y87H/Q88N/T89Q)-SCDKTH-trastuzumab Fc fusion protein has the following sequence (SEQ ID NO: 747):
대안적으로, SCDKTH 힌지 서열은 서열 EPKSCDKTHTCPPCP (서열번호: 26의 잔기 219-233에 상응함)를 함유하는 트라스투주맙의 힌지 영역의 전체 서열까지 적어도 5, 6, 7, 8, 9, 10 또는 11개의 인접 잔기를 함유하는 부분으로 대체된다.Alternatively, the SCDKTH hinge sequence is at least 5, 6, 7, 8, 9, 10 or replaced by a moiety containing 11 adjacent residues.
2h) 2h) TNFTNF (( A84SA84S // V85TV85T // S86TS86T // Y87HY87H // Q88NQ88N // T89QT89Q ) - ) - GGGGSGGGGSGGGGSGGGGSGGGGSGGGGS - 트라스투주맙 Fc - Trastuzumab Fc
서열번호: 2에 제시된 가용성 TNF의 서열과 관련하여 돌연변이 A84S, V85T, S86T, Y87H, Q88N 및 T89Q를 갖는 TNFR1 선택적 길항제 TNF 뮤테인을 함유하는 TNFR1 길항제 융합 단백질이 본 명세서에 제공된다. TNF(A84S/V85T/S86T/Y87H/Q88N/T89Q) 뮤테인 (서열번호:703)의 C-말단은 GGGGSGGGGSGGGGS 펩티드 링커에 융합되는데, 이 링커는 트라스투주맙 Fc 영역 (서열번호: 26의 잔기 234-450에 상응함; 또한 서열번호: 27 참조)의 N-말단에 융합된다. TNF(A84S/V85T/S86T/Y87H/Q88N/T89Q)-GGGGSGGGGSGGGGS-트라스투주맙 Fc 융합 단백질은 하기 서열을 갖는다 (서열번호: 748):Provided herein is a TNFR1 antagonist fusion protein containing a TNFR1 selective antagonist TNF mutein with mutations A84S, V85T, S86T, Y87H, Q88N and T89Q with respect to the sequence of soluble TNF set forth in SEQ ID NO: 2. The C-terminus of the TNF (A84S/V85T/S86T/Y87H/Q88N/T89Q) mutein (SEQ ID NO: 703) is fused to the GGGGSGGGGSGGGGS peptide linker, which binds to the trastuzumab Fc region (residue 234 of SEQ ID NO: 26). corresponds to -450; see also SEQ ID NO: 27). The TNF(A84S/V85T/S86T/Y87H/Q88N/T89Q)-GGGGSGGGGSGGGGS-Trastuzumab Fc fusion protein has the following sequence (SEQ ID NO: 748):
대안적으로, GGGGSGGGGSGGGGS 링커는 Gly-Ser 링커, 예컨대 (GSGS)n 또는 (GGGGS)n 링커(여기서 n = 1, 2, 3, 4, 또는 5) 또는 본 명세서에 기재되거나 당업계에 공지된 바와 같은 임의의 다른 적합한 짧은 펩티드 링커로 대체된다.Alternatively, the GGGGSGGGGSGGGGS linker can be a Gly-Ser linker, such as a (GSGS) n or (GGGGS) n linker where n = 1, 2, 3, 4, or 5, or as described herein or known in the art. Replaced with any other suitable short peptide linker such as
2i) TNF ( A84S / V85T / S86T / Y87H / Q88N / T89Q ) - GGGGSGGGGSGGGGS- SCDKTH - 트라스투주맙 Fc 2i) TNF ( A84S / V85T / S86T / Y87H / Q88N / T89Q ) - GGGGSGGGGSGGGGS - SCDKTH - Trastuzumab Fc
서열번호: 2에 제시된 가용성 TNF의 서열과 관련하여 돌연변이 A84S, V85T, S86T, Y87H, Q88N 및 T89Q를 갖는 TNFR1 선택적 길항제 TNF 뮤테인을 함유하는 TNFR1 길항제 융합 단백질이 본 명세서에 제공된다. TNF(A84S/V85T/S86T/Y87H/Q88N/T89Q) 뮤테인 (서열번호:703)의 C-말단은 트라스투주맙 Fc 영역(서열번호: 26의 잔기 234-450에 상응함; 또한 서열번호: 27 참조)의 N-말단에 융합되는 잔기 SCDKTH(서열번호: 26의 잔기 222-227에 상응함)를 적어도 함유하는 트라스투주맙의 힌지 서열의 일부에 융합되는 GGGGSGGGGSGGGGS 펩티드 링커에 융합된다. TNF(A84S/V85T/S86T/Y87H/Q88N/T89Q)-GGGGSGGGGSGGGGS-SCDKTH-트라스투주맙 Fc 융합 단백질은 하기 서열을 갖는다 (서열번호: 749):Provided herein is a TNFR1 antagonist fusion protein containing a TNFR1 selective antagonist TNF mutein with mutations A84S, V85T, S86T, Y87H, Q88N and T89Q with respect to the sequence of soluble TNF set forth in SEQ ID NO: 2. The C-terminus of the TNF (A84S/V85T/S86T/Y87H/Q88N/T89Q) mutein (SEQ ID NO:703) corresponds to the trastuzumab Fc region (residues 234-450 of SEQ ID NO:26; also SEQ ID NO: 27) to a GGGGSGGGGGSGGGGS peptide linker that is fused to at least a portion of the hinge sequence of Trastuzumab that contains residues SCDKTH (corresponding to residues 222-227 of SEQ ID NO: 26) that are fused to the N-terminus of . The TNF(A84S/V85T/S86T/Y87H/Q88N/T89Q)-GGGGSGGGGSGGGGS-SCDKTH-trastuzumab Fc fusion protein has the following sequence (SEQ ID NO: 749):
대안적으로, GGGGSGGGGSGGGGS 링커는 Gly-Ser 링커, 예컨대 (GSGS)n 또는 (GGGGS)n 링커(여기서 n = 1, 2, 3, 4, 또는 5) 또는 본 명세서에 기재되거나 당업계에 공지된 바와 같은 임의의 다른 적합한 짧은 펩티드 링커로 대체된다. 대안적으로 또는 추가로, SCDKTH 힌지 서열은 서열 EPKSCDKTHTCPPCP (서열번호: 26의 잔기 219-233에 상응함), 또는 적어도 5, 6, 7, 8, 9, 10, 또는 11개의 인접 잔기를 함유하는 그의 일부를 함유하는 트라스투주맙의 힌지 영역으로 대체된다.Alternatively, the GGGGSGGGGSGGGGS linker can be a Gly-Ser linker, such as a (GSGS) n or (GGGGS) n linker where n = 1, 2, 3, 4, or 5, or as described herein or known in the art. Replaced with any other suitable short peptide linker such as Alternatively or additionally, the SCDKTH hinge sequence contains the sequence EPKSCDKTHTCPPCP (corresponding to residues 219-233 of SEQ ID NO: 26), or at least 5, 6, 7, 8, 9, 10, or 11 contiguous residues. It is replaced with the hinge region of trastuzumab containing a portion thereof.
2j) TNF(I97T/A145R) - SCDKTH - 트라스투주맙 Fc2j) TNF (I97T/A145R) - SCDKTH - Trastuzumab Fc
서열번호: 2에 제시된 가용성 TNF의 서열과 관련하여 돌연변이 I97T/A145R을 갖는 TNFR1 선택적 길항제 TNF 뮤테인을 함유하는 인간 TNFR1 길항제 융합 단백질이 본 명세서에 제공된다. TNF(I97T/A145R) 뮤테인(서열번호: 702)의 C-말단은 트라스투주맙 Fc 영역(서열번호: 26의 잔기 234-450에 상응함; 또한 서열번호: 27 참조)의 N-말단에 융합되는 잔기 SCDKTH(서열번호: 26의 잔기 222-227에 상응함)을 적어도 함유하는 트라스투주맙의 힌지 서열의 전부 또는 일부에 융합된다. TNF(I97T/A145R)-SCDKTH-트라스투주맙 Fc 융합 단백질은 하기 서열을 갖는다 (서열번호: 750):Provided herein is a human TNFR1 antagonist fusion protein containing a TNFR1 selective antagonist TNF mutein with mutations I97T/A145R with respect to the sequence of soluble TNF set forth in SEQ ID NO:2. The C-terminus of the TNF (I97T/A145R) mutein (SEQ ID NO: 702) is at the N-terminus of the trastuzumab Fc region (corresponding to residues 234-450 of SEQ ID NO: 26; see also SEQ ID NO: 27) It is fused to all or part of the hinge sequence of Trastuzumab, which contains at least the residues SCDKTH (corresponding to residues 222-227 of SEQ ID NO: 26) to which it is fused. The TNF(I97T/A145R)-SCDKTH-Trastuzumab Fc fusion protein has the following sequence (SEQ ID NO: 750):
대안적으로, SCDKTH 힌지 서열은 서열 EPKSCDKTHTCPPCP (서열번호: 26의 잔기 219-233에 상응함), 또는 적어도 5, 6, 7, 8, 9, 10, 또는 11개의 인접 잔기를 함유하는 그의 일부를 함유하는 트라스투주맙의 힌지 영역으로 대체된다.Alternatively, the SCDKTH hinge sequence is the sequence EPKSCDKTHTCPPCP (corresponding to residues 219-233 of SEQ ID NO: 26), or a portion thereof containing at least 5, 6, 7, 8, 9, 10, or 11 contiguous residues. It is replaced with the hinge region of trastuzumab containing
2k) TNF(I97T/A145R) - GGGGSGGGGSGGGGS - 트라스투주맙 Fc2k) TNF (I97T/A145R) - GGGGSGGGGSGGGGS - Trastuzumab Fc
서열번호: 2에 제시된 가용성 TNF의 서열과 관련하여 돌연변이 I97T/A145R을 갖는 TNFR1 선택적 길항제 TNF 뮤테인을 함유하는 TNFR1 길항제 융합 단백질이 본 명세서에 제공된다. TNF(I97T/A145R) 뮤테인 (서열번호:702)의 C-말단은 GGGGSGGGGSGGGGS 펩티드 링커에 융합되는데, 이 링커는 트라스투주맙 Fc 영역 (서열번호: 26의 잔기 234-450에 상응함; 또한 서열번호: 27 참조)의 N-말단에 융합된다. TNF(I97T/A145R)-GGGGSGGGGSGGGGS-트라스투주맙 Fc 융합 단백질은 하기 서열을 갖는다 (서열번호: 751):Provided herein is a TNFR1 antagonist fusion protein containing a TNFR1 selective antagonist TNF mutein having mutations I97T/A145R with respect to the sequence of soluble TNF set forth in SEQ ID NO:2. The C-terminus of the TNF(I97T/A145R) mutein (SEQ ID NO:702) is fused to the GGGGSGGGGSGGGGS peptide linker, which corresponds to residues 234-450 of the trastuzumab Fc region (SEQ ID NO: 26; also sequence number: see 27) is fused to the N-terminus. The TNF(I97T/A145R)-GGGGSGGGGSGGGGS-Trastuzumab Fc fusion protein has the following sequence (SEQ ID NO: 751):
대안적으로, GGGGSGGGGSGGGGS 링커는 Gly-Ser 링커, 예컨대 (GSGS)n 또는 (GGGGS)n 링커(여기서 n = 1, 2, 3, 4, 또는 5) 또는 본 명세서에 기재되거나 당업계에 공지된 바와 같은 임의의 다른 적합한 짧은 펩티드 링커로 대체된다. Alternatively, the GGGGSGGGGSGGGGS linker can be a Gly-Ser linker, such as a (GSGS) n or (GGGGS) n linker where n = 1, 2, 3, 4, or 5, or as described herein or known in the art. Replaced with any other suitable short peptide linker such as
2l) TNF(I97T/A145R) - GGGGSGGGGSGGGGS - SCDKTH - 트라스투주맙 Fc2l) TNF (I97T/A145R) - GGGGSGGGGSGGGGS - SCDKTH - Trastuzumab Fc
서열번호: 2에 제시된 가용성 TNF의 서열과 관련하여 돌연변이 I97T/A145R을 갖는 TNFR1 선택적 길항제 TNF 뮤테인을 함유하는 TNFR1 길항제 융합 단백질이 본 명세서에 제공된다. TNF(I97T/A145R) 뮤테인 (서열번호:702)의 C-말단은 트라스투주맙 Fc 영역(서열번호: 26의 잔기 234-450에 상응함; 또한 서열번호: 27 참조)의 N-말단에 융합되는 잔기 SCDKTH(서열번호: 26의 잔기 222-227에 상응함)를 적어도 함유하는 트라스투주맙의 힌지 서열의 일부에 융합되는 GGGGSGGGGSGGGGS 펩티드 링커에 융합된다. TNF(I97T/A145R)-GGGGSGGGGSGGGGS-SCDKTH-트라스투주맙 Fc 융합 단백질은 하기 서열을 갖는다 (서열번호: 752):Provided herein is a TNFR1 antagonist fusion protein containing a TNFR1 selective antagonist TNF mutein having mutations I97T/A145R with respect to the sequence of soluble TNF set forth in SEQ ID NO:2. The C-terminus of the TNF(I97T/A145R) mutein (SEQ ID NO:702) is at the N-terminus of the trastuzumab Fc region (corresponding to residues 234-450 of SEQ ID NO:26; see also SEQ ID NO:27) GGGGSGGGGSGGGGS peptide linker that is fused to a portion of the hinge sequence of Trastuzumab that contains at least the residues SCDKTH (corresponding to residues 222-227 of SEQ ID NO: 26) to which it is fused. The TNF(I97T/A145R)-GGGGSGGGGSGGGGS-SCDKTH-Trastuzumab Fc fusion protein has the following sequence (SEQ ID NO: 752):
대안적으로, GGGGSGGGGSGGGGS 링커는 Gly-Ser 링커, 예컨대 (GSGS)n 또는 (GGGGS)n 링커(여기서 n = 1, 2, 3, 4, 또는 5) 또는 본 명세서에 기재되거나 당업계에 공지된 바와 같은 임의의 다른 적합한 짧은 펩티드 링커로 대체된다. 대안적으로 또는 추가로, SCDKTH 힌지 서열은 서열 EPKSCDKTHTCPPCP (서열번호: 26의 잔기 219-233에 상응함), 또는 적어도 5, 6, 7, 8, 9, 10, 또는 11개의 인접 잔기를 함유하는 그의 일부를 함유하는 트라스투주맙의 힌지 영역으로 대체된다.Alternatively, the GGGGSGGGGSGGGGS linker can be a Gly-Ser linker, such as a (GSGS) n or (GGGGS) n linker where n = 1, 2, 3, 4, or 5, or as described herein or known in the art. Replaced with any other suitable short peptide linker such as Alternatively or additionally, the SCDKTH hinge sequence contains the sequence EPKSCDKTHTCPPCP (corresponding to residues 219-233 of SEQ ID NO: 26), or at least 5, 6, 7, 8, 9, 10, or 11 contiguous residues. It is replaced with the hinge region of trastuzumab containing a portion thereof.
2m) TNF(R32W/S86T) - ESKYGPPCPPCP - 니볼루맙 Fc2m) TNF (R32W/S86T) - ESKYGPPCPPCP - Nivolumab Fc
서열번호: 2에 제시된 가용성 TNF의 서열과 관련하여 돌연변이 R32W/S86T를 갖는 TNFR1 선택적 길항제 TNF 뮤테인을 함유하는 인간 TNFR1 길항제 융합 단백질 작제물이 본 명세서에 제공된다. TNF(R32W/S86T) 뮤테인 (서열번호:685)의 C-말단은 니볼루맙 Fc 영역 서열번호: 29의 잔기 224-440에 상응함; 참조, 또한, 서열번호:30)의 N-말단에 융합된 잔기 ESKYGPPCPPCP (서열번호: 29의 잔기 212-223에 상응함)을 함유하는 니볼루맙의 힌지 서열에 융합된다. TNF(R32W/S86T)-ESKYGPPCPPCP-니볼루맙 Fc 융합 단백질은 하기 서열을 갖는다 (서열번호: 753):Provided herein is a human TNFR1 antagonist fusion protein construct containing a TNFR1 selective antagonist TNF mutein having mutations R32W/S86T with respect to the sequence of soluble TNF set forth in SEQ ID NO:2. The C-terminus of the TNF(R32W/S86T) mutein (SEQ ID NO:685) corresponds to residues 224-440 of the nivolumab Fc region SEQ ID NO:29; Reference, also to the hinge sequence of nivolumab containing residues ESKYGPPCPPCP (corresponding to residues 212-223 of SEQ ID NO: 29) fused to the N-terminus of SEQ ID NO: 30). The TNF(R32W/S86T)-ESKYGPPCPPCP-Nivolumab Fc fusion protein has the following sequence (SEQ ID NO: 753):
대안적으로, ESKYGPPCPPCP 힌지 서열(서열번호: 29의 잔기 212-223에 상응함)의 적어도 5, 6, 7, 8, 9, 10, 또는 11개의 인접 잔기를 함유하는 니볼루맙 힌지 서열의 전부 또는 일부가 포함된다.Alternatively, all or some are included
2n) TNF(R32W/S86T) - GGGGSGGGGSGGGGS - 니볼루맙 Fc2n) TNF (R32W/S86T) - GGGGSGGGGSGGGGS - Nivolumab Fc
서열번호: 2에 제시된 가용성 TNF의 서열과 관련하여 돌연변이 R32W/S86T를 갖는 TNFR1 선택적 길항제 TNF 뮤테인을 함유하는 TNFR1 길항제 융합 단백질이 본 명세서에 제공된다. TNF(R32W/S86T) 뮤테인 (서열번호:685)의 C-말단은 GGGGSGGGGSGGGGS 펩티드 링커에 융합되는데, 이 링커는 니볼루맙 Fc 영역 (서열번호: 29의 잔기 224-440에 상응함; 또한 서열번호: 30 참조)의 N-말단에 융합된다. TNF(R32W/S86T)-GGGGSGGGGSGGGGS-니볼루맙 Fc 융합 단백질은 하기 서열을 갖는다 (서열번호: 754):Provided herein is a TNFR1 antagonist fusion protein containing a TNFR1 selective antagonist TNF mutein having mutations R32W/S86T with respect to the sequence of soluble TNF set forth in SEQ ID NO:2. The C-terminus of the TNF (R32W/S86T) mutein (SEQ ID NO: 685) is fused to the GGGGSGGGGSGGGGS peptide linker, which corresponds to residues 224-440 of the nivolumab Fc region (SEQ ID NO: 29; also SEQ ID NO: 29). : 30 reference) is fused to the N-terminus. The TNF(R32W/S86T)-GGGGSGGGGSGGGGS-Nivolumab Fc fusion protein has the following sequence (SEQ ID NO: 754):
대안적으로, GGGGSGGGGSGGGGS 링커는 Gly-Ser 링커, 예컨대 (GSGS)n 또는 (GGGGS)n 링커(여기서 n = 1, 2, 3, 4, 또는 5) 또는 본 명세서에 기재되거나 당업계에 공지된 바와 같은 임의의 다른 적합한 짧은 펩티드 링커로 대체된다. Alternatively, the GGGGSGGGGSGGGGS linker can be a Gly-Ser linker, such as a (GSGS) n or (GGGGS) n linker where n = 1, 2, 3, 4, or 5, or as described herein or known in the art. Replaced with any other suitable short peptide linker such as
2o) TNF(R32W/S86T) - GGGGSGGGGSGGGGS- ESKYGPPCPPCP - 니볼루맙 Fc 2o) TNF (R32W/S86T) - GGGGSGGGGSGGGGS - ESKYGPPCPPCP - Nivolumab Fc
서열번호: 2에 제시된 가용성 TNF의 서열과 관련하여 돌연변이 R32W/S86T를 갖는 TNFR1 선택적 길항제 TNF 뮤테인을 함유하는 TNFR1 길항제 융합 단백질이 본 명세서에 제공된다. TNF(R32W/S86T) 뮤테인 (서열번호:685)의 C-말단은 니볼루맙 Fc 영역 서열번호: 29의 잔기 224-440에 상응함; 참조, 또한, 서열번호:30)의 N-말단에 융합된 서열 ESKYGPPCPPCP (서열번호: 29의 잔기 212-223에 상응함)을 함유하는 니볼루맙의 힌지 서열에 융합된 GGGGSGGGGSGGGGS 펩티드 링커에 융합된다. TNF(R32W/S86T)-GGGGSGGGGSGGGGS-ESKYGPPCPPCP-니볼루맙 Fc 융합 단백질은 하기 서열을 갖는다 (서열번호: 755):Provided herein is a TNFR1 antagonist fusion protein containing a TNFR1 selective antagonist TNF mutein having mutations R32W/S86T with respect to the sequence of soluble TNF set forth in SEQ ID NO:2. The C-terminus of the TNF(R32W/S86T) mutein (SEQ ID NO:685) corresponds to residues 224-440 of the nivolumab Fc region SEQ ID NO:29; Reference, also fused to the GGGGSGGGGSGGGGS peptide linker fused to the hinge sequence of nivolumab containing the sequence ESKYGPPCPPCP (corresponding to residues 212-223 of SEQ ID NO: 29) fused to the N-terminus of SEQ ID NO: 30). The TNF(R32W/S86T)-GGGGSGGGGSGGGGS-ESKYGPPCPPCP-Nivolumab Fc fusion protein has the following sequence (SEQ ID NO: 755):
대안적으로, GGGGSGGGGSGGGGS 링커는 Gly-Ser 링커, 예컨대 (GSGS)n 또는 (GGGGS)n 링커(여기서 n = 1, 2, 3, 4, 또는 5) 또는 본 명세서에 기재되거나 당업계에 공지된 바와 같은 임의의 다른 적합한 짧은 펩티드 링커로 대체된다. 대안적으로 또는 추가로, ESKYGPPCPPCP 힌지 서열(서열번호: 29의 잔기 212-223에 상응함)의 적어도 5, 6, 7, 8, 9, 10, 또는 11개의 인접 잔기를 함유하는 니볼루맙 힌지 서열의 일부가 포함된다.Alternatively, the GGGGSGGGGSGGGGS linker can be a Gly-Ser linker, such as a (GSGS) n or (GGGGS) n linker where n = 1, 2, 3, 4, or 5, or as described herein or known in the art. Replaced with any other suitable short peptide linker such as Alternatively or additionally, a nivolumab hinge sequence containing at least 5, 6, 7, 8, 9, 10, or 11 contiguous residues of the ESKYGPPCPPCP hinge sequence (corresponding to residues 212-223 of SEQ ID NO: 29) part of is included.
2p) TNF(V1M/R31C/C69V/Y87H/C101A/A145R) - ESKYGPPCPPCP - 니볼루맙 Fc2p) TNF (V1M/R31C/C69V/Y87H/C101A/A145R) - ESKYGPPCPPCP - Nivolumab Fc
서열번호: 2에 제시된 가용성 TNF의 서열과 관련하여 돌연변이 V1M, R31C, C69V, Y87H, C101A 및 A145R을 갖는 TNFR1 선택적 길항제 TNF 뮤테인을 함유하는 인간 TNFR1 길항제 융합 단백질이 본 명세서에 제공된다. TNF(V1M/R31C/C69V/Y87H/C101A/A145R) 뮤테인 (서열번호:701)의 C-말단은 니볼루맙 Fc 영역 서열번호: 29의 잔기 224-440에 상응함; 참조, 또한, 서열번호:30)의 N-말단에 융합된 서열 ESKYGPPCPPCP (서열번호: 29의 잔기 212-223에 상응함)을 함유하는 니볼루맙의 힌지 서열에 융합된다. TNF(V1M/R31C/C69V/Y87H/C101A/A145R)-ESKYGPPCPPCP-니볼루맙 Fc 융합 단백질은 하기 서열을 갖는다 (서열번호: 756):Provided herein is a human TNFR1 antagonist fusion protein containing a TNFR1 selective antagonist TNF mutein with mutations V1M, R31C, C69V, Y87H, C101A and A145R with respect to the sequence of soluble TNF set forth in SEQ ID NO:2. The C-terminus of the TNF (V1M/R31C/C69V/Y87H/C101A/A145R) mutein (SEQ ID NO:701) corresponds to residues 224-440 of the nivolumab Fc region SEQ ID NO:29; reference, also to the hinge sequence of nivolumab containing the sequence ESKYGPPCPPCP (corresponding to residues 212-223 of SEQ ID NO: 29) fused to the N-terminus of SEQ ID NO: 30). The TNF(V1M/R31C/C69V/Y87H/C101A/A145R)-ESKYGPPCPPCP-Nivolumab Fc fusion protein has the following sequence (SEQ ID NO: 756):
대안적으로, ESKYGPPCPPCP 힌지 서열(서열번호: 29의 잔기 212-223에 상응함)의 적어도 5, 6, 7, 8, 9, 10, 또는 11개의 인접 잔기를 함유하는 니볼루맙 힌지 서열의 전부 또는 일부가 포함된다.Alternatively, all or some are included
2q) TNF(V1M/R31C/C69V/Y87H/C101A/A145R) - GGGGSGGGGSGGGGS - 니볼루맙 Fc2q) TNF (V1M/R31C/C69V/Y87H/C101A/A145R) - GGGGSGGGGSGGGGS - Nivolumab Fc
서열번호: 2에 제시된 가용성 TNF의 서열과 관련하여 돌연변이 V1M, R31C, C69V, Y87H, C101A 및 A145R을 갖는 TNFR1 선택적 길항제 TNF 뮤테인을 함유하는 TNFR1 길항제 융합 단백질이 본 명세서에 제공된다. TNF(V1M/R31C/C69V/Y87H/C101A/A145R) 뮤테인 (서열번호:701)의 C-말단은 GGGGSGGGGSGGGGS 펩티드 링커에 융합되는데, 이 링커는 니볼루맙 Fc 영역 (서열번호: 29의 잔기 224-440에 상응함; 또한 서열번호: 30 참조)의 N-말단에 융합된다. TNF(V1M/R31C/C69V/Y87H/C101A/A145R)-GGGGSGGGGSGGGGS-니볼루맙 Fc 융합 단백질은 하기 서열을 갖는다 (서열번호: 757):Provided herein is a TNFR1 antagonist fusion protein containing a TNFR1 selective antagonist TNF mutein with mutations V1M, R31C, C69V, Y87H, C101A and A145R with respect to the sequence of soluble TNF set forth in SEQ ID NO: 2. The C-terminus of the TNF (V1M/R31C/C69V/Y87H/C101A/A145R) mutein (SEQ ID NO: 701) is fused to a GGGGSGGGGSGGGGS peptide linker, which is linked to the nivolumab Fc region (residues 224-29 of SEQ ID NO: 29). 440; see also SEQ ID NO: 30). The TNF(V1M/R31C/C69V/Y87H/C101A/A145R)-GGGGSGGGGSGGGGS-Nivolumab Fc fusion protein has the following sequence (SEQ ID NO: 757):
대안적으로, GGGGSGGGGSGGGGS 링커는 Gly-Ser 링커, 예컨대 (GSGS)n 또는 (GGGGS)n 링커(여기서 n = 1, 2, 3, 4, 또는 5) 또는 본 명세서에 기재되거나 당업계에 공지된 바와 같은 임의의 다른 적합한 짧은 펩티드 링커로 대체된다. Alternatively, the GGGGSGGGGSGGGGS linker can be a Gly-Ser linker, such as a (GSGS) n or (GGGGS) n linker where n = 1, 2, 3, 4, or 5, or as described herein or known in the art. Replaced with any other suitable short peptide linker such as
2r) TNF ( V1M / R31C / C69V / Y87H / C101A / A145R ) - GGGGSGGGGSGGGGS- ESKYGPPCPPCP - 니볼루맙 Fc 2r) TNF ( V1M / R31C / C69V / Y87H / C101A / A145R ) - GGGGSGGGGSGGGGS - ESKYGPPCPPCP - Nivolumab Fc
서열번호: 2에 제시된 가용성 TNF의 서열과 관련하여 돌연변이 V1M, R31C, C69V, Y87H, C101A 및 A145R을 갖는 TNFR1 선택적 길항제 TNF 뮤테인을 함유하는 TNFR1 길항제 융합 단백질이 본 명세서에 제공된다. TNF(V1M/R31C/C69V/Y87H/C101A/A145R) 뮤테인 (서열번호:701)의 C-말단은 니볼루맙 Fc 영역 서열번호: 29의 잔기 224-440에 상응함; 참조, 또한, 서열번호:30)의 N-말단에 융합된 서열 ESKYGPPCPPCP (서열번호: 29의 잔기 212-223에 상응함)을 함유하는 니볼루맙의 힌지 서열에 융합된 GGGGSGGGGSGGGGS 펩티드 링커에 융합된다. TNF(V1M/R31C/C69V/Y87H/C101A/A145R)-GGGGSGGGGSGGGGS-ESKYGPPCPPCP-니볼루맙 Fc 융합 단백질은 하기 서열을 갖는다 (서열번호: 758):Provided herein is a TNFR1 antagonist fusion protein containing a TNFR1 selective antagonist TNF mutein with mutations V1M, R31C, C69V, Y87H, C101A and A145R with respect to the sequence of soluble TNF set forth in SEQ ID NO: 2. The C-terminus of the TNF (V1M/R31C/C69V/Y87H/C101A/A145R) mutein (SEQ ID NO:701) corresponds to residues 224-440 of the nivolumab Fc region SEQ ID NO:29; Reference, also fused to the GGGGSGGGGSGGGGS peptide linker fused to the hinge sequence of nivolumab containing the sequence ESKYGPPCPPCP (corresponding to residues 212-223 of SEQ ID NO: 29) fused to the N-terminus of SEQ ID NO: 30). The TNF(V1M/R31C/C69V/Y87H/C101A/A145R)-GGGGSGGGGSGGGGS-ESKYGPPCPPCP-Nivolumab Fc fusion protein has the following sequence (SEQ ID NO: 758):
대안적으로, GGGGSGGGGSGGGGS 링커는 Gly-Ser 링커, 예컨대 (GSGS)n 또는 (GGGGS)n 링커(여기서 n = 1, 2, 3, 4, 또는 5) 또는 본 명세서에 기재되거나 당업계에 공지된 바와 같은 임의의 다른 적합한 짧은 펩티드 링커로 대체된다. 대안적으로 또는 추가로, ESKYGPPCPPCP 힌지 서열(서열번호: 29의 잔기 212-223에 상응함)의 적어도 5, 6, 7, 8, 9, 10, 또는 11개의 인접 잔기를 함유하는 니볼루맙 힌지 서열의 전부 또는 일부가 포함된다.Alternatively, the GGGGSGGGGSGGGGS linker can be a Gly-Ser linker, such as a (GSGS) n or (GGGGS) n linker where n = 1, 2, 3, 4, or 5, or as described herein or known in the art. Replaced with any other suitable short peptide linker such as Alternatively or additionally, a nivolumab hinge sequence containing at least 5, 6, 7, 8, 9, 10, or 11 contiguous residues of the ESKYGPPCPPCP hinge sequence (corresponding to residues 212-223 of SEQ ID NO: 29) includes all or part of
2s) TNF(A84S/V85T/S86T/Y87H/Q88N/T89Q) - ESKYGPPCPPCP - 니볼루맙 Fc2s) TNF (A84S/V85T/S86T/Y87H/Q88N/T89Q) - ESKYGPPCPPCP - Nivolumab Fc
서열번호: 2에 제시된 가용성 TNF의 서열과 관련하여 돌연변이 A84S, V85T, S86T, Y87H, Q88N 및 T89Q를 갖는 TNFR1 선택적 길항제 TNF 뮤테인을 함유하는 인간 TNFR1 길항제 융합 단백질이 본 명세서에 제공된다. TNF(A84S/V85T/S86T/Y87H/Q88N/T89Q) 뮤테인 (서열번호:703)의 C-말단은 니볼루맙 Fc 영역 서열번호: 29의 잔기 224-440에 상응함; 참조, 또한, 서열번호:30)의 N-말단에 융합된 서열 ESKYGPPCPPCP (서열번호: 29의 잔기 212-223에 상응함)을 함유하는 니볼루맙의 힌지 서열에 융합된다. TNF(A84S/V85T/S86T/Y87H/Q88N/T89Q)-ESKYGPPCPPCP-니볼루맙 Fc 융합 단백질은 하기 서열을 갖는다 (서열번호: 759):Provided herein is a human TNFR1 antagonist fusion protein containing a TNFR1 selective antagonist TNF mutein with mutations A84S, V85T, S86T, Y87H, Q88N and T89Q with respect to the sequence of soluble TNF set forth in SEQ ID NO: 2. The C-terminus of the TNF (A84S/V85T/S86T/Y87H/Q88N/T89Q) mutein (SEQ ID NO:703) corresponds to residues 224-440 of the nivolumab Fc region SEQ ID NO:29; reference, also to the hinge sequence of nivolumab containing the sequence ESKYGPPCPPCP (corresponding to residues 212-223 of SEQ ID NO: 29) fused to the N-terminus of SEQ ID NO: 30). The TNF(A84S/V85T/S86T/Y87H/Q88N/T89Q)-ESKYGPPCPPCP-Nivolumab Fc fusion protein has the following sequence (SEQ ID NO: 759):
대안적으로, ESKYGPPCPPCP 힌지 서열(서열번호: 29의 잔기 212-223에 상응함)의 적어도 5, 6, 7, 8, 9, 10, 또는 11개의 인접 잔기를 함유하는 니볼루맙 힌지 서열의 전부 또는 일부가 포함된다.Alternatively, all or some are included
2t) TNF(A84S/V85T/S86T/Y87H/Q88N/T89Q) - GGGGSGGGGSGGGGS - 니볼루맙 Fc2t) TNF (A84S/V85T/S86T/Y87H/Q88N/T89Q) - GGGGSGGGGSGGGGS - Nivolumab Fc
서열번호: 2에 제시된 가용성 TNF의 서열과 관련하여 돌연변이 A84S, V85T, S86T, Y87H, Q88N 및 T89Q를 갖는 TNFR1 선택적 길항제 TNF 뮤테인을 함유하는 TNFR1 길항제 융합 단백질이 본 명세서에 제공된다. TNF(A84S/V85T/S86T/Y87H/Q88N/T89Q) 뮤테인 (서열번호:703)의 C-말단은 GGGGSGGGGSGGGGS 펩티드 링커에 융합되는데, 이 링커는 니볼루맙 Fc 영역 (서열번호: 29의 잔기 224-440에 상응함; 또한 서열번호: 30 참조)의 N-말단에 융합된다. TNF(A84S/V85T/S86T/Y87H/Q88N/T89Q)-GGGGSGGGGSGGGGS-니볼루맙 Fc 융합 단백질은 하기 서열을 갖는다 (서열번호: 760):Provided herein is a TNFR1 antagonist fusion protein containing a TNFR1 selective antagonist TNF mutein with mutations A84S, V85T, S86T, Y87H, Q88N and T89Q with respect to the sequence of soluble TNF set forth in SEQ ID NO: 2. The C-terminus of the TNF (A84S/V85T/S86T/Y87H/Q88N/T89Q) mutein (SEQ ID NO: 703) is fused to a GGGGSGGGGSGGGGS peptide linker, which is linked to the nivolumab Fc region (residues 224-29 of SEQ ID NO: 29). 440; see also SEQ ID NO: 30). The TNF(A84S/V85T/S86T/Y87H/Q88N/T89Q)-GGGGSGGGGSGGGGS-Nivolumab Fc fusion protein has the following sequence (SEQ ID NO: 760):
대안적으로, GGGGSGGGGSGGGGS 링커는 Gly-Ser 링커, 예컨대 (GSGS)n 또는 (GGGGS)n 링커(여기서 n = 1, 2, 3, 4, 또는 5) 또는 본 명세서에 기재되거나 당업계에 공지된 바와 같은 임의의 다른 적합한 짧은 펩티드 링커로 대체된다.Alternatively, the GGGGSGGGGSGGGGS linker can be a Gly-Ser linker, such as a (GSGS) n or (GGGGS) n linker where n = 1, 2, 3, 4, or 5, or as described herein or known in the art. Replaced with any other suitable short peptide linker such as
2u) TNF ( A84S / V85T / S86T / Y87H / Q88N / T89Q ) - GGGGSGGGGSGGGGS- ESKYGPPCPPCP - 니볼루맙 Fc 2u) TNF ( A84S / V85T / S86T / Y87H / Q88N / T89Q ) - GGGGSGGGGSGGGGS - ESKYGPPCPPCP - Nivolumab Fc
서열번호: 2에 제시된 가용성 TNF의 서열과 관련하여 돌연변이 A84S, V85T, S86T, Y87H, Q88N 및 T89Q를 갖는 TNFR1 선택적 길항제 TNF 뮤테인을 함유하는 TNFR1 길항제 융합 단백질이 본 명세서에 제공된다. TNF(A84S/V85T/S86T/Y87H/Q88N/T89Q) 뮤테인 (서열번호:703)의 C-말단은 니볼루맙 Fc 영역 서열번호: 29의 잔기 224-440에 상응함; 참조, 또한, 서열번호:30)의 N-말단에 융합된 서열 ESKYGPPCPPCP (서열번호: 29의 잔기 212-223에 상응함)을 함유하는 니볼루맙의 힌지 서열에 융합된 GGGGSGGGGSGGGGS 펩티드 링커에 융합된다. TNF(A84S/V85T/S86T/Y87H/Q88N/T89Q)-GGGGSGGGGSGGGGS-ESKYGPPCPPCP-니볼루맙 Fc 융합 단백질은 하기 서열을 갖는다 (서열번호: 761):Provided herein is a TNFR1 antagonist fusion protein containing a TNFR1 selective antagonist TNF mutein with mutations A84S, V85T, S86T, Y87H, Q88N and T89Q with respect to the sequence of soluble TNF set forth in SEQ ID NO: 2. The C-terminus of the TNF (A84S/V85T/S86T/Y87H/Q88N/T89Q) mutein (SEQ ID NO:703) corresponds to residues 224-440 of the nivolumab Fc region SEQ ID NO:29; Reference, also fused to the GGGGSGGGGSGGGGS peptide linker fused to the hinge sequence of nivolumab containing the sequence ESKYGPPCPPCP (corresponding to residues 212-223 of SEQ ID NO: 29) fused to the N-terminus of SEQ ID NO: 30). The TNF(A84S/V85T/S86T/Y87H/Q88N/T89Q)-GGGGSGGGGSGGGGS-ESKYGPPCPPCP-Nivolumab Fc fusion protein has the following sequence (SEQ ID NO: 761):
대안적으로, GGGGSGGGGSGGGGS 링커는 Gly-Ser 링커, 예컨대 (GSGS)n 또는 (GGGGS)n 링커(여기서 n = 1, 2, 3, 4, 또는 5) 또는 본 명세서에 기재되거나 당업계에 공지된 바와 같은 임의의 다른 적합한 짧은 펩티드 링커로 대체된다. 대안적으로 또는 추가로, ESKYGPPCPPCP 힌지 서열(서열번호: 29의 잔기 212-223에 상응함)의 적어도 5, 6, 7, 8, 9, 10, 또는 11개의 인접 잔기를 함유하는 니볼루맙 힌지 서열의 전부 또는 일부가 포함된다.Alternatively, the GGGGSGGGGSGGGGS linker can be a Gly-Ser linker, such as a (GSGS) n or (GGGGS) n linker where n = 1, 2, 3, 4, or 5, or as described herein or known in the art. Replaced with any other suitable short peptide linker such as Alternatively or additionally, a nivolumab hinge sequence containing at least 5, 6, 7, 8, 9, 10, or 11 contiguous residues of the ESKYGPPCPPCP hinge sequence (corresponding to residues 212-223 of SEQ ID NO: 29) includes all or part of
2v) TNF(I97T/A145R) - ESKYGPPCPPCP - 니볼루맙 Fc2v) TNF (I97T/A145R) - ESKYGPPCPPCP - Nivolumab Fc
서열번호: 2에 제시된 가용성 TNF의 서열과 관련하여 돌연변이 I97T/A145R을 갖는 TNFR1 선택적 길항제 TNF 뮤테인을 함유하는 인간 TNFR1 길항제 융합 단백질이 본 명세서에 제공된다. TNF(I97T/A145R) 뮤테인 (서열번호:702)의 C-말단은 니볼루맙 Fc 영역 서열번호: 29의 잔기 224-440에 상응함; 참조, 또한, 서열번호:30)의 N-말단에 융합된 서열 ESKYGPPCPPCP (서열번호: 29의 잔기 212-223에 상응함)을 함유하는 니볼루맙의 힌지 서열에 융합된다. TNF(I97T/A145R)-ESKYGPPCPPCP-니볼루맙 Fc 융합 단백질은 하기 서열을 갖는다 (서열번호: 762):Provided herein is a human TNFR1 antagonist fusion protein containing a TNFR1 selective antagonist TNF mutein with mutations I97T/A145R with respect to the sequence of soluble TNF set forth in SEQ ID NO:2. The C-terminus of the TNF(I97T/A145R) mutein (SEQ ID NO:702) corresponds to residues 224-440 of the nivolumab Fc region SEQ ID NO:29; reference, also to the hinge sequence of nivolumab containing the sequence ESKYGPPCPPCP (corresponding to residues 212-223 of SEQ ID NO: 29) fused to the N-terminus of SEQ ID NO: 30). The TNF(I97T/A145R)-ESKYGPPCPPCP-Nivolumab Fc fusion protein has the following sequence (SEQ ID NO: 762):
대안적으로, ESKYGPPCPPCP 힌지 서열(서열번호: 29의 잔기 212-223에 상응함)의 적어도 5, 6, 7, 8, 9, 10, 또는 11개의 인접 잔기를 함유하는 니볼루맙 힌지 서열의 전부 또는 일부가 포함된다.Alternatively, all or some are included
2w) TNF(I97T/A145R) - GGGGSGGGGSGGGGS - 니볼루맙 Fc 2w) TNF (I97T/A145R) - GGGGSGGGGSGGGGS - Nivolumab Fc
서열번호: 2에 제시된 가용성 TNF의 서열과 관련하여 돌연변이 I97T/A145R을 갖는 TNFR1 선택적 길항제 TNF 뮤테인을 함유하는 TNFR1 길항제 융합 단백질이 본 명세서에 제공된다. TNF(I97T/A145R) 뮤테인 (서열번호:702)의 C-말단은 GGGGSGGGGSGGGGS 펩티드 링커에 융합되는데, 이 링커는 니볼루맙 Fc 영역 (서열번호: 29의 잔기 224-440에 상응함; 또한 서열번호: 30 참조)의 N-말단에 융합된다. TNF(I97T/A145R)-GGGGSGGGGSGGGGS-니볼루맙 Fc 융합 단백질은 하기 서열을 갖는다 (서열번호: 763):Provided herein is a TNFR1 antagonist fusion protein containing a TNFR1 selective antagonist TNF mutein having mutations I97T/A145R with respect to the sequence of soluble TNF set forth in SEQ ID NO:2. The C-terminus of the TNF(I97T/A145R) mutein (SEQ ID NO:702) is fused to the GGGGSGGGGSGGGGS peptide linker, which corresponds to residues 224-440 of the nivolumab Fc region (SEQ ID NO: 29; also SEQ ID NO: : 30 reference) is fused to the N-terminus. The TNF(I97T/A145R)-GGGGSGGGGSGGGGS-Nivolumab Fc fusion protein has the following sequence (SEQ ID NO: 763):
대안적으로, GGGGSGGGGSGGGGS 링커는 Gly-Ser 링커, 예컨대 (GSGS)n 또는 (GGGGS)n 링커(여기서 n = 1, 2, 3, 4, 또는 5) 또는 본 명세서에 기재되거나 당업계에 공지된 바와 같은 임의의 다른 적합한 짧은 펩티드 링커로 대체된다.Alternatively, the GGGGSGGGGSGGGGS linker can be a Gly-Ser linker, such as a (GSGS) n or (GGGGS) n linker where n = 1, 2, 3, 4, or 5, or as described herein or known in the art. Replaced with any other suitable short peptide linker such as
2x) TNF(I97T/A145R) - GGGGSGGGGSGGGGS - ESKYGPPCPPCP - 니볼루맙 Fc 2x) TNF (I97T/A145R) - GGGGSGGGGSGGGGS - ESKYGPPCPPCP - Nivolumab Fc
서열번호: 2에 제시된 가용성 TNF의 서열과 관련하여 돌연변이 I97T/A145R을 갖는 TNFR1 선택적 길항제 TNF 뮤테인을 함유하는 TNFR1 길항제 융합 단백질이 본 명세서에 제공된다. TNF(I97T/A145R) 뮤테인 (서열번호:702)의 C-말단은 니볼루맙 Fc 영역 서열번호: 29의 잔기 224-440에 상응함; 참조, 또한, 서열번호:30)의 N-말단에 융합된 서열 ESKYGPPCPPCP (서열번호: 29의 잔기 212-223에 상응함)을 함유하는 니볼루맙의 힌지 서열에 융합된 GGGGSGGGGSGGGGS 펩티드 링커에 융합된다. TNF(I97T/A145R)-GGGGSGGGGSGGGGS-ESKYGPPCPPCP-니볼루맙 Fc 융합 단백질은 하기 서열을 갖는다 (서열번호: 764):Provided herein is a TNFR1 antagonist fusion protein containing a TNFR1 selective antagonist TNF mutein having mutations I97T/A145R with respect to the sequence of soluble TNF set forth in SEQ ID NO:2. The C-terminus of the TNF(I97T/A145R) mutein (SEQ ID NO:702) corresponds to residues 224-440 of the nivolumab Fc region SEQ ID NO:29; Reference, also fused to the GGGGSGGGGSGGGGS peptide linker fused to the hinge sequence of nivolumab containing the sequence ESKYGPPCPPCP (corresponding to residues 212-223 of SEQ ID NO: 29) fused to the N-terminus of SEQ ID NO: 30). The TNF(I97T/A145R)-GGGGSGGGGSGGGGS-ESKYGPPCPPCP-Nivolumab Fc fusion protein has the following sequence (SEQ ID NO: 764):
대안적으로, GGGGSGGGGSGGGGS 링커는 Gly-Ser 링커, 예컨대 (GSGS)n 또는 (GGGGS)n 링커(여기서 n = 1, 2, 3, 4, 또는 5) 또는 본 명세서에 기재되거나 당업계에 공지된 바와 같은 임의의 다른 적합한 짧은 펩티드 링커로 대체된다. 대안적으로 또는 추가로, ESKYGPPCPPCP 힌지 서열(서열번호: 29의 잔기 212-223에 상응함)의 적어도 5, 6, 7, 8, 9, 10, 또는 11개의 인접 잔기를 함유하는 니볼루맙 힌지 서열의 전부 또는 일부가 포함된다.Alternatively, the GGGGSGGGGSGGGGS linker can be a Gly-Ser linker, such as a (GSGS) n or (GGGGS) n linker where n = 1, 2, 3, 4, or 5, or as described herein or known in the art. Replaced with any other suitable short peptide linker such as Alternatively or additionally, a nivolumab hinge sequence containing at least 5, 6, 7, 8, 9, 10, or 11 contiguous residues of the ESKYGPPCPPCP hinge sequence (corresponding to residues 212-223 of SEQ ID NO: 29) includes all or part of
실시예 6Example 6
항체의 맥락에서의 제시는 표적 수용체의 억제의 맥락에서 어려움을 나타낸다. 2가 항체는 표적 수용체의 이량체화를 유도하여 활성화될 가능성이 높다. 일부 경우에 이것이 바람직하지만 TNFR1의 억제제에는 매우 바람직하지 않는다. TNFR1의 일시적 활성화조차도 사이토카인 폭풍과 심각한 독성을 유발할 수 있다. 따라서 1가 억제제가 필요하다. 이를 달성하기 위해, 1가 작제물이 본 명세서에 제공된다(전체 설명 및 상기 실시예 5 참조). 이 실시예는 단쇄 dAb와 인간 혈청 알부민과의 N-말단 융합 단백질인 예시적인 작제물의 활성 및 특성을 예시한다.Presentation in the context of antibodies presents difficulties in the context of inhibition of target receptors. Bivalent antibodies are more likely to activate by inducing dimerization of target receptors. In some cases this is desirable, but highly undesirable for inhibitors of TNFR1. Even transient activation of TNFR1 can induce a cytokine storm and severe toxicity. Therefore, monovalent inhibitors are needed. To achieve this, monovalent constructs are provided herein (see full description and Example 5 above). This example illustrates the activity and properties of an exemplary construct that is an N-terminal fusion protein of a single chain dAb with human serum albumin.
이 실시예는 예시적인 나노바디를 제공한다. Vhh 도메인 함유 단백질인 나노바디는 중쇄만을 포함하며, 인간 및 마우스의 경우와 같이 경쇄로부터의 협동성을 필요로 하지 않는다(Harmsen and De Haard, Appl Microbiol Biotechnol. 77:13-22 (2007)). 이들은 단쇄이기 때문에 자체적으로 작은 단백질(~13-15KDa)로 짧은 반감기 때문에 항체 형식의 이식된 CDR과 같은 융합 단백질로 제시되어야 한다. This example provides exemplary Nanobodies. Nanobodies, which are Vhh domain-containing proteins, contain only heavy chains and do not require cooperativity from light chains as is the case in humans and mice (Harmsen and De Haard, Appl . Microbiol Biotechnol . 77:13-22 (2007)). Since they are single chains, they are themselves small proteins (~13-15 KDa) and, because of their short half-lives, should be presented as fusion proteins, such as grafted CDRs in antibody format.
파아지 라이브러리는 문헌[Sabir et al. ((2014) Comptes Rendus Biologies 337:244-249]에 기재된 방법을 사용하여 준비되었다. 종양 괴사 인자 수용체-1(TNFR1)에 대한 고친화도 결합을 갖는 파아지를 회수하여 TNFR1에 결합하는 능력 및 미국 공개 출원 제US20140112929호에 기재된 TNFR1에 대한 인간 종양 괴사 인자-알파(TNF-a)의 결합과 경쟁하는 능력에 대해 시험하였다. Phage libraries are described in Sabir et al. ((2014) Comptes Rendus Biologies 337 :244-249]. Ability to recover phage with high affinity binding to tumor necrosis factor receptor-1 (TNFR1) and bind to TNFR1 and binding of human tumor necrosis factor-alpha (TNF-a) to TNFR1 described in US Published Application No. US20140112929 tested for their ability to compete with
단쇄를 함유하는 각각의 Vhh 항체를 인코딩하는 핵산을 CHO 세포에서 발현시키고(발현 벡터의 설명에 대한 문헌[Sokolowska- Wedzina et al. (2014) Protein Expression and Purification 99:50-57] 참조), 각각을 HPLC 크로마토그래피로 정제하였다. 샘플 1은 대조군 항-TNFR1 항체(ThermoFisher의 H398)이고, Vhh1-4는 dAb를 함유하는 Vhh 항체였다. 서열(서열번호: 54, 1478, 58 및 59 참조)은 다음과 같다:Nucleic acids encoding the respective Vhh antibodies containing single chains were expressed in CHO cells (see Sokolowska- Wedzina et al. (2014) Protein Expression and Purification 99:50-57 for description of expression vectors), respectively. was purified by HPLC chromatography.
강조되고 밑줄 친 Vhh-4의 시스테인(C) 및 다른 Vhh 사슬의 상응하는 시스테인은 루프를 형성하며, 여기서 Vhh는 구속된 폴리펩티드이다. 아미노산 잔기 14의 프롤린은 알라닌으로 대체될 수 있다.The highlighted and underlined cysteine (C) of Vhh-4 and the corresponding cysteines of the other Vhh chains form a loop, where Vhh is a constrained polypeptide. Proline at amino acid residue 14 can be replaced with alanine.
Vhh 도메인 항체 단편을 인코딩하는 발현 카세트를 제조 및 발현하고 HPLC 크로마토그래피로 정제하였다. 아래 표는 각 테스트 Vhh 항체의 발현 수준을 보여준다. 두 분자는 정제를 위해 His 태그가 필요하였다. 결과는 다음 표에 제시된다.Expression cassettes encoding Vhh domain antibody fragments were prepared and expressed and purified by HPLC chromatography. The table below shows the expression level of each tested Vhh antibody. Both molecules required a His tag for purification. Results are presented in the following table.
Vhh 1-4 각각은 이어서 표면 플라스몬 공명(SPR) 방법을 사용하여 결합 연구에서 테스트되었다 (Sciences GL. Biacore Assay Handbook. General Electric Company (2012); 및 Richter et al. (2019) MAbs 11:166-177). TNFR1 세포외 도메인에 대한 TNF-a 결합의 Vhh 억제의 경쟁 검정도 문헌[Richter et al(2019)]에 기재된 바와 같이 수행되었다. 비교 가능한 검정인 VCAM 또는 IL8의 TNF 유도 발현의 억제는 문헌[Lin et al., (2015) J Biomed Sci 22: 53; 및 Sonnier et al. ( 2010) Journal of Gastrointestinal Surgery 14:1592-1599]에 각각 기재된 바와 같이 수행되었다. Each of Vhh 1-4 was then tested in binding studies using surface plasmon resonance (SPR) methods (Sciences GL. Biacore Assay Handbook. General Electric Company (2012); and Richter et al. (2019) MAbs 11:166-177). A competition assay of Vhh inhibition of TNF-a binding to the TNFR1 extracellular domain was also performed as described by Richter et al (2019). Inhibition of TNF-induced expression of VCAM or IL8, a comparable assay, was reported by Lin et al., (2015) J Biomed. Sci 22:53 ; and Sonnier et al. (2010) Journal of Gastrointestinal Surgery 14 :1592-1599].
결과 요약은 아래 표에 제시된다. 결과는 Vhh-4가 TNFR-1의 세포외 도메인에 대해 매우 높은 친화도(6.6 x 10-13 M)를 갖고; 이는 TNFR1에 대한 TNF 결합에 대해 100% 경쟁적이었고(IC50 ~1nM), TNF 유래된 VCAM-1 합성(0.3nM)을 억제하는 데 4개의 후보 중에서 가장 효율적이었다. 테스트된 이들 Vhh dAb 항체 중, Vhh-4가 가장 잘 수행되었고 Vhh-4 및 HSA를 포함하는 작제물이 제조되었다.A summary of the results is presented in the table below. The results show that Vhh-4 has a very high affinity (6.6 x 10 -13 M) for the extracellular domain of TNFR-1; It was 100% competitive for TNF binding to TNFR1 (IC50 ~1 nM) and the most efficient of the four candidates to inhibit TNF-derived VCAM-1 synthesis (0.3 nM). Of these Vhh dAb antibodies tested, Vhh-4 performed best and produced constructs comprising Vhh-4 and HSA.
아래 서열은 Vhh-4:dAb 부분을 함유하는 작제물 (서열번호: 1475)가 Gly-Ser 링커 (서열번호: 1475의 잔기 139-147)를 통해 인간 혈청 알부민 (HSA; 서열번호: 1475의 잔기 148-732)에 연결된 서열번호: 1475의 잔기 20-138임을 나타낸다.The sequence below shows that a construct containing the Vhh-4:dAb portion (SEQ ID NO: 1475) is linked to human serum albumin (HSA; SEQ ID NO: 1475 residues 139-147) via a Gly-Ser linker (SEQ ID NO: 1475). 148-732) and residues 20-138 of SEQ ID NO: 1475.
HSA에 연결된 Vhh-4 항체를 함유하는 작제물은 TNFR1 길항제로서 활성을 갖는 것으로 나타났다. 그것은 LPS로 자극된 THP1 세포에서 IL-6 및 IL-8 유전자 발현의 현저한 감소로 나타난 바와 같이 TNFR1을 차단하였다. 3x105개의 THP1 세포를 작제물의 대조군으로 5 μg 및 20 μg, 및 0 μg을 30분 동안 처리한 후, LPS(10 ng/ml) 자극을 4시간 동안 수행하였다. RNA 샘플을 수집하고, 하우스키핑 유전자 하이포크산틴-구아닌 포스포리보실트랜스퍼라제 (HPRT)를 내부 대조군으로 사용하여 IL-6 및 IL-8 유전자 발현을 분석하기 위해 qPCR 분석을 수행하였다. 결과는 두 용량 모두 IL-6 및 IL-8 발현을 유의하게 감소시켰음을 보여준다(n = 3, 평균 ± SEM; *p < 0.05, **p < 0.01, ***p < 0.001). Constructs containing Vhh-4 antibodies linked to HSA have been shown to have activity as TNFR1 antagonists. It blocked TNFR1 as shown by a significant decrease in IL-6 and IL-8 gene expression in THP1 cells stimulated with LPS. 3x10 5 THP1 cells were treated with 5 μg, 20 μg, and 0 μg for 30 minutes as a control of the construct, and then LPS (10 ng/ml) stimulation was performed for 4 hours. RNA samples were collected and qPCR analysis was performed to analyze IL-6 and IL-8 gene expression using the housekeeping gene hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase (HPRT) as an internal control. Results show that both doses significantly reduced IL-6 and IL-8 expression (n = 3, mean ± SEM; *p < 0.05, **p < 0.01, ***p < 0.001).
변형은 당업자에게 명백할 것이기 때문에, 본 발명은 첨부된 청구범위에 의해서만 제한되는 것으로 의도된다.Since variations will be apparent to those skilled in the art, it is intended that this invention be limited only by the scope of the appended claims.
SEQUENCE LISTING
<110> ENOSI LIFE SCIENCES CORP.
Shepard, H. Michael
<120> Methods and Compositions to Treat
Autoimmune Diseases and Cancer
<130> 04555-5301PC
<140> PCT/US21/48074
<141> 2021-08-27
<150> 63/071,313
<151> 2020-08-27
<160> 1479
<170> FastSEQ for Windows Version 4.0
<210> 1
<211> 233
<212> PRT
<213> Homo sapiens
<220>
<223> TNF alpha (TNF)
<400> 1
Met Ser Thr Glu Ser Met Ile Arg Asp Val Glu Leu Ala Glu Glu Ala
1 5 10 15
Leu Pro Lys Lys Thr Gly Gly Pro Gln Gly Ser Arg Arg Cys Leu Phe
20 25 30
Leu Ser Leu Phe Ser Phe Leu Ile Val Ala Gly Ala Thr Thr Leu Phe
35 40 45
Cys Leu Leu His Phe Gly Val Ile Gly Pro Gln Arg Glu Glu Phe Pro
50 55 60
Arg Asp Leu Ser Leu Ile Ser Pro Leu Ala Gln Ala Val Arg Ser Ser
65 70 75 80
Ser Arg Thr Pro Ser Asp Lys Pro Val Ala His Val Val Ala Asn Pro
85 90 95
Gln Ala Glu Gly Gln Leu Gln Trp Leu Asn Arg Arg Ala Asn Ala Leu
100 105 110
Leu Ala Asn Gly Val Glu Leu Arg Asp Asn Gln Leu Val Val Pro Ser
115 120 125
Glu Gly Leu Tyr Leu Ile Tyr Ser Gln Val Leu Phe Lys Gly Gln Gly
130 135 140
Cys Pro Ser Thr His Val Leu Leu Thr His Thr Ile Ser Arg Ile Ala
145 150 155 160
Val Ser Tyr Gln Thr Lys Val Asn Leu Leu Ser Ala Ile Lys Ser Pro
165 170 175
Cys Gln Arg Glu Thr Pro Glu Gly Ala Glu Ala Lys Pro Trp Tyr Glu
180 185 190
Pro Ile Tyr Leu Gly Gly Val Phe Gln Leu Glu Lys Gly Asp Arg Leu
195 200 205
Ser Ala Glu Ile Asn Arg Pro Asp Tyr Leu Asp Phe Ala Glu Ser Gly
210 215 220
Gln Val Tyr Phe Gly Ile Ile Ala Leu
225 230
<210> 2
<211> 157
<212> PRT
<213> Homo sapiens
<220>
<223> Soluble form of TNF alpha (solTNF)
<400> 2
Val Arg Ser Ser Ser Arg Thr Pro Ser Asp Lys Pro Val Ala His Val
1 5 10 15
Val Ala Asn Pro Gln Ala Glu Gly Gln Leu Gln Trp Leu Asn Arg Arg
20 25 30
Ala Asn Ala Leu Leu Ala Asn Gly Val Glu Leu Arg Asp Asn Gln Leu
35 40 45
Val Val Pro Ser Glu Gly Leu Tyr Leu Ile Tyr Ser Gln Val Leu Phe
50 55 60
Lys Gly Gln Gly Cys Pro Ser Thr His Val Leu Leu Thr His Thr Ile
65 70 75 80
Ser Arg Ile Ala Val Ser Tyr Gln Thr Lys Val Asn Leu Leu Ser Ala
85 90 95
Ile Lys Ser Pro Cys Gln Arg Glu Thr Pro Glu Gly Ala Glu Ala Lys
100 105 110
Pro Trp Tyr Glu Pro Ile Tyr Leu Gly Gly Val Phe Gln Leu Glu Lys
115 120 125
Gly Asp Arg Leu Ser Ala Glu Ile Asn Arg Pro Asp Tyr Leu Asp Phe
130 135 140
Ala Glu Ser Gly Gln Val Tyr Phe Gly Ile Ile Ala Leu
145 150 155
<210> 3
<211> 455
<212> PRT
<213> Homo sapiens
<220>
<223> TNFR1
<400> 3
Met Gly Leu Ser Thr Val Pro Asp Leu Leu Leu Pro Leu Val Leu Leu
1 5 10 15
Glu Leu Leu Val Gly Ile Tyr Pro Ser Gly Val Ile Gly Leu Val Pro
20 25 30
His Leu Gly Asp Arg Glu Lys Arg Asp Ser Val Cys Pro Gln Gly Lys
35 40 45
Tyr Ile His Pro Gln Asn Asn Ser Ile Cys Cys Thr Lys Cys His Lys
50 55 60
Gly Thr Tyr Leu Tyr Asn Asp Cys Pro Gly Pro Gly Gln Asp Thr Asp
65 70 75 80
Cys Arg Glu Cys Glu Ser Gly Ser Phe Thr Ala Ser Glu Asn His Leu
85 90 95
Arg His Cys Leu Ser Cys Ser Lys Cys Arg Lys Glu Met Gly Gln Val
100 105 110
Glu Ile Ser Ser Cys Thr Val Asp Arg Asp Thr Val Cys Gly Cys Arg
115 120 125
Lys Asn Gln Tyr Arg His Tyr Trp Ser Glu Asn Leu Phe Gln Cys Phe
130 135 140
Asn Cys Ser Leu Cys Leu Asn Gly Thr Val His Leu Ser Cys Gln Glu
145 150 155 160
Lys Gln Asn Thr Val Cys Thr Cys His Ala Gly Phe Phe Leu Arg Glu
165 170 175
Asn Glu Cys Val Ser Cys Ser Asn Cys Lys Lys Ser Leu Glu Cys Thr
180 185 190
Lys Leu Cys Leu Pro Gln Ile Glu Asn Val Lys Gly Thr Glu Asp Ser
195 200 205
Gly Thr Thr Val Leu Leu Pro Leu Val Ile Phe Phe Gly Leu Cys Leu
210 215 220
Leu Ser Leu Leu Phe Ile Gly Leu Met Tyr Arg Tyr Gln Arg Trp Lys
225 230 235 240
Ser Lys Leu Tyr Ser Ile Val Cys Gly Lys Ser Thr Pro Glu Lys Glu
245 250 255
Gly Glu Leu Glu Gly Thr Thr Thr Lys Pro Leu Ala Pro Asn Pro Ser
260 265 270
Phe Ser Pro Thr Pro Gly Phe Thr Pro Thr Leu Gly Phe Ser Pro Val
275 280 285
Pro Ser Ser Thr Phe Thr Ser Ser Ser Thr Tyr Thr Pro Gly Asp Cys
290 295 300
Pro Asn Phe Ala Ala Pro Arg Arg Glu Val Ala Pro Pro Tyr Gln Gly
305 310 315 320
Ala Asp Pro Ile Leu Ala Thr Ala Leu Ala Ser Asp Pro Ile Pro Asn
325 330 335
Pro Leu Gln Lys Trp Glu Asp Ser Ala His Lys Pro Gln Ser Leu Asp
340 345 350
Thr Asp Asp Pro Ala Thr Leu Tyr Ala Val Val Glu Asn Val Pro Pro
355 360 365
Leu Arg Trp Lys Glu Phe Val Arg Arg Leu Gly Leu Ser Asp His Glu
370 375 380
Ile Asp Arg Leu Glu Leu Gln Asn Gly Arg Cys Leu Arg Glu Ala Gln
385 390 395 400
Tyr Ser Met Leu Ala Thr Trp Arg Arg Arg Thr Pro Arg Arg Glu Ala
405 410 415
Thr Leu Glu Leu Leu Gly Arg Val Leu Arg Asp Met Asp Leu Leu Gly
420 425 430
Cys Leu Glu Asp Ile Glu Glu Ala Leu Cys Gly Pro Ala Ala Leu Pro
435 440 445
Pro Ala Pro Ser Leu Leu Arg
450 455
<210> 4
<211> 461
<212> PRT
<213> Homo sapiens
<220>
<223> TNFR2
<400> 4
Met Ala Pro Val Ala Val Trp Ala Ala Leu Ala Val Gly Leu Glu Leu
1 5 10 15
Trp Ala Ala Ala His Ala Leu Pro Ala Gln Val Ala Phe Thr Pro Tyr
20 25 30
Ala Pro Glu Pro Gly Ser Thr Cys Arg Leu Arg Glu Tyr Tyr Asp Gln
35 40 45
Thr Ala Gln Met Cys Cys Ser Lys Cys Ser Pro Gly Gln His Ala Lys
50 55 60
Val Phe Cys Thr Lys Thr Ser Asp Thr Val Cys Asp Ser Cys Glu Asp
65 70 75 80
Ser Thr Tyr Thr Gln Leu Trp Asn Trp Val Pro Glu Cys Leu Ser Cys
85 90 95
Gly Ser Arg Cys Ser Ser Asp Gln Val Glu Thr Gln Ala Cys Thr Arg
100 105 110
Glu Gln Asn Arg Ile Cys Thr Cys Arg Pro Gly Trp Tyr Cys Ala Leu
115 120 125
Ser Lys Gln Glu Gly Cys Arg Leu Cys Ala Pro Leu Arg Lys Cys Arg
130 135 140
Pro Gly Phe Gly Val Ala Arg Pro Gly Thr Glu Thr Ser Asp Val Val
145 150 155 160
Cys Lys Pro Cys Ala Pro Gly Thr Phe Ser Asn Thr Thr Ser Ser Thr
165 170 175
Asp Ile Cys Arg Pro His Gln Ile Cys Asn Val Val Ala Ile Pro Gly
180 185 190
Asn Ala Ser Met Asp Ala Val Cys Thr Ser Thr Ser Pro Thr Arg Ser
195 200 205
Met Ala Pro Gly Ala Val His Leu Pro Gln Pro Val Ser Thr Arg Ser
210 215 220
Gln His Thr Gln Pro Thr Pro Glu Pro Ser Thr Ala Pro Ser Thr Ser
225 230 235 240
Phe Leu Leu Pro Met Gly Pro Ser Pro Pro Ala Glu Gly Ser Thr Gly
245 250 255
Asp Phe Ala Leu Pro Val Gly Leu Ile Val Gly Val Thr Ala Leu Gly
260 265 270
Leu Leu Ile Ile Gly Val Val Asn Cys Val Ile Met Thr Gln Val Lys
275 280 285
Lys Lys Pro Leu Cys Leu Gln Arg Glu Ala Lys Val Pro His Leu Pro
290 295 300
Ala Asp Lys Ala Arg Gly Thr Gln Gly Pro Glu Gln Gln His Leu Leu
305 310 315 320
Ile Thr Ala Pro Ser Ser Ser Ser Ser Ser Leu Glu Ser Ser Ala Ser
325 330 335
Ala Leu Asp Arg Arg Ala Pro Thr Arg Asn Gln Pro Gln Ala Pro Gly
340 345 350
Val Glu Ala Ser Gly Ala Gly Glu Ala Arg Ala Ser Thr Gly Ser Ser
355 360 365
Asp Ser Ser Pro Gly Gly His Gly Thr Gln Val Asn Val Thr Cys Ile
370 375 380
Val Asn Val Cys Ser Ser Ser Asp His Ser Ser Gln Cys Ser Ser Gln
385 390 395 400
Ala Ser Ser Thr Met Gly Asp Thr Asp Ser Ser Pro Ser Glu Ser Pro
405 410 415
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Gln Leu Glu Thr Pro Glu Thr Leu Leu Gly Ser Thr Glu Glu Lys Pro
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<211> 235
<212> PRT
<213> Mus musculus
<220>
<223> Mouse TNF alpha (TNF)
<400> 5
Met Ser Thr Glu Ser Met Ile Arg Asp Val Glu Leu Ala Glu Glu Ala
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Leu Pro Gln Lys Met Gly Gly Phe Gln Asn Ser Arg Arg Cys Leu Cys
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Leu Ser Leu Phe Ser Phe Leu Leu Val Ala Gly Ala Thr Thr Leu Phe
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Cys Leu Leu Asn Phe Gly Val Ile Gly Pro Gln Arg Asp Glu Lys Phe
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Pro Asn Gly Leu Pro Leu Ile Ser Ser Met Ala Gln Thr Leu Thr Leu
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Arg Ser Ser Ser Gln Asn Ser Ser Asp Lys Pro Val Ala His Val Val
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Gln Leu Ser Ala Glu Val Asn Leu Pro Lys Tyr Leu Asp Phe Ala Glu
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<211> 156
<212> PRT
<213> Mus musculus
<220>
<223> Soluble form of mouse TNF alpha (TNF)
<400> 6
Leu Arg Ser Ser Ser Gln Asn Ser Ser Asp Lys Pro Val Ala His Val
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<213> Mus musculus
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<223> Mouse TNFR1
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Cys Arg Glu Cys Glu Lys Gly Thr Phe Thr Ala Ser Gln Asn Tyr Leu
85 90 95
Arg Gln Cys Leu Ser Cys Lys Thr Cys Arg Lys Glu Met Ser Gln Val
100 105 110
Glu Ile Ser Pro Cys Gln Ala Asp Lys Asp Thr Val Cys Gly Cys Lys
115 120 125
Glu Asn Gln Phe Gln Arg Tyr Leu Ser Glu Thr His Phe Gln Cys Val
130 135 140
Asp Cys Ser Pro Cys Phe Asn Gly Thr Val Thr Ile Pro Cys Lys Glu
145 150 155 160
Thr Gln Asn Thr Val Cys Asn Cys His Ala Gly Phe Phe Leu Arg Glu
165 170 175
Ser Glu Cys Val Pro Cys Ser His Cys Lys Lys Asn Glu Glu Cys Met
180 185 190
Lys Leu Cys Leu Pro Pro Pro Leu Ala Asn Val Thr Asn Pro Gln Asp
195 200 205
Ser Gly Thr Ala Val Leu Leu Pro Leu Val Ile Leu Leu Gly Leu Cys
210 215 220
Leu Leu Ser Phe Ile Phe Ile Ser Leu Met Cys Arg Tyr Pro Arg Trp
225 230 235 240
Arg Pro Glu Val Tyr Ser Ile Ile Cys Arg Asp Pro Val Pro Val Lys
245 250 255
Glu Glu Lys Ala Gly Lys Pro Leu Thr Pro Ala Pro Ser Pro Ala Phe
260 265 270
Ser Pro Thr Ser Gly Phe Asn Pro Thr Leu Gly Phe Ser Thr Pro Gly
275 280 285
Phe Ser Ser Pro Val Ser Ser Thr Pro Ile Ser Pro Ile Phe Gly Pro
290 295 300
Ser Asn Trp His Phe Met Pro Pro Val Ser Glu Val Val Pro Thr Gln
305 310 315 320
Gly Ala Asp Pro Leu Leu Tyr Glu Ser Leu Cys Ser Val Pro Ala Pro
325 330 335
Thr Ser Val Gln Lys Trp Glu Asp Ser Ala His Pro Gln Arg Pro Asp
340 345 350
Asn Ala Asp Leu Ala Ile Leu Tyr Ala Val Val Asp Gly Val Pro Pro
355 360 365
Ala Arg Trp Lys Glu Phe Met Arg Phe Met Gly Leu Ser Glu His Glu
370 375 380
Ile Glu Arg Leu Glu Met Gln Asn Gly Arg Cys Leu Arg Glu Ala Gln
385 390 395 400
Tyr Ser Met Leu Glu Ala Trp Arg Arg Arg Thr Pro Arg His Glu Asp
405 410 415
Thr Leu Glu Val Val Gly Leu Val Leu Ser Lys Met Asn Leu Ala Gly
420 425 430
Cys Leu Glu Asn Ile Leu Glu Ala Leu Arg Asn Pro Ala Pro Ser Ser
435 440 445
Thr Thr Arg Leu Pro Arg
450
<210> 8
<211> 474
<212> PRT
<213> Mus musculus
<220>
<223> Mouse TNFR2
<400> 8
Met Ala Pro Ala Ala Leu Trp Val Ala Leu Val Phe Glu Leu Gln Leu
1 5 10 15
Trp Ala Thr Gly His Thr Val Pro Ala Gln Val Val Leu Thr Pro Tyr
20 25 30
Lys Pro Glu Pro Gly Tyr Glu Cys Gln Ile Ser Gln Glu Tyr Tyr Asp
35 40 45
Arg Lys Ala Gln Met Cys Cys Ala Lys Cys Pro Pro Gly Gln Tyr Val
50 55 60
Lys His Phe Cys Asn Lys Thr Ser Asp Thr Val Cys Ala Asp Cys Glu
65 70 75 80
Ala Ser Met Tyr Thr Gln Val Trp Asn Gln Phe Arg Thr Cys Leu Ser
85 90 95
Cys Ser Ser Ser Cys Thr Thr Asp Gln Val Glu Ile Arg Ala Cys Thr
100 105 110
Lys Gln Gln Asn Arg Val Cys Ala Cys Glu Ala Gly Arg Tyr Cys Ala
115 120 125
Leu Lys Thr His Ser Gly Ser Cys Arg Gln Cys Met Arg Leu Ser Lys
130 135 140
Cys Gly Pro Gly Phe Gly Val Ala Ser Ser Arg Ala Pro Asn Gly Asn
145 150 155 160
Val Leu Cys Lys Ala Cys Ala Pro Gly Thr Phe Ser Asp Thr Thr Ser
165 170 175
Ser Thr Asp Val Cys Arg Pro His Arg Ile Cys Ser Ile Leu Ala Ile
180 185 190
Pro Gly Asn Ala Ser Thr Asp Ala Val Cys Ala Pro Glu Ser Pro Thr
195 200 205
Leu Ser Ala Ile Pro Arg Thr Leu Tyr Val Ser Gln Pro Glu Pro Thr
210 215 220
Arg Ser Gln Pro Leu Asp Gln Glu Pro Gly Pro Ser Gln Thr Pro Ser
225 230 235 240
Ile Leu Thr Ser Leu Gly Ser Thr Pro Ile Ile Glu Gln Ser Thr Lys
245 250 255
Gly Gly Ile Ser Leu Pro Ile Gly Leu Ile Val Gly Val Thr Ser Leu
260 265 270
Gly Leu Leu Met Leu Gly Leu Val Asn Cys Ile Ile Leu Val Gln Arg
275 280 285
Lys Lys Lys Pro Ser Cys Leu Gln Arg Asp Ala Lys Val Pro His Val
290 295 300
Pro Asp Glu Lys Ser Gln Asp Ala Val Gly Leu Glu Gln Gln His Leu
305 310 315 320
Leu Thr Thr Ala Pro Ser Ser Ser Ser Ser Ser Leu Glu Ser Ser Ala
325 330 335
Ser Ala Gly Asp Arg Arg Ala Pro Pro Gly Gly His Pro Gln Ala Arg
340 345 350
Val Met Ala Glu Ala Gln Gly Phe Gln Glu Ala Arg Ala Ser Ser Arg
355 360 365
Ile Ser Asp Ser Ser His Gly Ser His Gly Thr His Val Asn Val Thr
370 375 380
Cys Ile Val Asn Val Cys Ser Ser Ser Asp His Ser Ser Gln Cys Ser
385 390 395 400
Ser Gln Ala Ser Ala Thr Val Gly Asp Pro Asp Ala Lys Pro Ser Ala
405 410 415
Ser Pro Lys Asp Glu Gln Val Pro Phe Ser Gln Glu Glu Cys Pro Ser
420 425 430
Gln Ser Pro Cys Glu Thr Thr Glu Thr Leu Gln Ser His Glu Lys Pro
435 440 445
Leu Pro Leu Gly Val Pro Asp Met Gly Met Lys Pro Ser Gln Ala Gly
450 455 460
Trp Phe Asp Gln Ile Ala Val Lys Val Ala
465 470
<210> 9
<211> 330
<212> PRT
<213> Homo sapiens
<220>
<223> IgG1 Heavy Chain Constant Domain
<220>
<221> DOMAIN
<222> (1)...(98)
<223> CH1
<220>
<221> DOMAIN
<222> (99)...(113)
<223> Hinge region
<220>
<221> DOMAIN
<222> (114)...(223)
<223> CH2
<220>
<221> DOMAIN
<222> (224)...(230)
<223> CH3
<400> 9
Ala Ser Thr Lys Gly Pro Ser Val Phe Pro Leu Ala Pro Ser Ser Lys
1 5 10 15
Ser Thr Ser Gly Gly Thr Ala Ala Leu Gly Cys Leu Val Lys Asp Tyr
20 25 30
Phe Pro Glu Pro Val Thr Val Ser Trp Asn Ser Gly Ala Leu Thr Ser
35 40 45
Gly Val His Thr Phe Pro Ala Val Leu Gln Ser Ser Gly Leu Tyr Ser
50 55 60
Leu Ser Ser Val Val Thr Val Pro Ser Ser Ser Leu Gly Thr Gln Thr
65 70 75 80
Tyr Ile Cys Asn Val Asn His Lys Pro Ser Asn Thr Lys Val Asp Lys
85 90 95
Lys Val Glu Pro Lys Ser Cys Asp Lys Thr His Thr Cys Pro Pro Cys
100 105 110
Pro Ala Pro Glu Leu Leu Gly Gly Pro Ser Val Phe Leu Phe Pro Pro
115 120 125
Lys Pro Lys Asp Thr Leu Met Ile Ser Arg Thr Pro Glu Val Thr Cys
130 135 140
Val Val Val Asp Val Ser His Glu Asp Pro Glu Val Lys Phe Asn Trp
145 150 155 160
Tyr Val Asp Gly Val Glu Val His Asn Ala Lys Thr Lys Pro Arg Glu
165 170 175
Glu Gln Tyr Asn Ser Thr Tyr Arg Val Val Ser Val Leu Thr Val Leu
180 185 190
His Gln Asp Trp Leu Asn Gly Lys Glu Tyr Lys Cys Lys Val Ser Asn
195 200 205
Lys Ala Leu Pro Ala Pro Ile Glu Lys Thr Ile Ser Lys Ala Lys Gly
210 215 220
Gln Pro Arg Glu Pro Gln Val Tyr Thr Leu Pro Pro Ser Arg Asp Glu
225 230 235 240
Leu Thr Lys Asn Gln Val Ser Leu Thr Cys Leu Val Lys Gly Phe Tyr
245 250 255
Pro Ser Asp Ile Ala Val Glu Trp Glu Ser Asn Gly Gln Pro Glu Asn
260 265 270
Asn Tyr Lys Thr Thr Pro Pro Val Leu Asp Ser Asp Gly Ser Phe Phe
275 280 285
Leu Tyr Ser Lys Leu Thr Val Asp Lys Ser Arg Trp Gln Gln Gly Asn
290 295 300
Val Phe Ser Cys Ser Val Met His Glu Ala Leu His Asn His Tyr Thr
305 310 315 320
Gln Lys Ser Leu Ser Leu Ser Pro Gly Lys
325 330
<210> 10
<211> 217
<212> PRT
<213> Homo sapiens
<220>
<223> IgG1 Fc (CH2 and CH3 domains)
<400> 10
Ala Pro Glu Leu Leu Gly Gly Pro Ser Val Phe Leu Phe Pro Pro Lys
1 5 10 15
Pro Lys Asp Thr Leu Met Ile Ser Arg Thr Pro Glu Val Thr Cys Val
20 25 30
Val Val Asp Val Ser His Glu Asp Pro Glu Val Lys Phe Asn Trp Tyr
35 40 45
Val Asp Gly Val Glu Val His Asn Ala Lys Thr Lys Pro Arg Glu Glu
50 55 60
Gln Tyr Asn Ser Thr Tyr Arg Val Val Ser Val Leu Thr Val Leu His
65 70 75 80
Gln Asp Trp Leu Asn Gly Lys Glu Tyr Lys Cys Lys Val Ser Asn Lys
85 90 95
Ala Leu Pro Ala Pro Ile Glu Lys Thr Ile Ser Lys Ala Lys Gly Gln
100 105 110
Pro Arg Glu Pro Gln Val Tyr Thr Leu Pro Pro Ser Arg Asp Glu Leu
115 120 125
Thr Lys Asn Gln Val Ser Leu Thr Cys Leu Val Lys Gly Phe Tyr Pro
130 135 140
Ser Asp Ile Ala Val Glu Trp Glu Ser Asn Gly Gln Pro Glu Asn Asn
145 150 155 160
Tyr Lys Thr Thr Pro Pro Val Leu Asp Ser Asp Gly Ser Phe Phe Leu
165 170 175
Tyr Ser Lys Leu Thr Val Asp Lys Ser Arg Trp Gln Gln Gly Asn Val
180 185 190
Phe Ser Cys Ser Val Met His Glu Ala Leu His Asn His Tyr Thr Gln
195 200 205
Lys Ser Leu Ser Leu Ser Pro Gly Lys
210 215
<210> 11
<211> 326
<212> PRT
<213> Homo sapiens
<220>
<223> Human IgG2 Heavy chain constant domain
<220>
<221> DOMAIN
<222> (1)...(98)
<223> CH1
<220>
<221> DOMAIN
<222> (99)...(110)
<223> hinge region
<220>
<221> DOMAIN
<222> (111)...(219)
<223> CH2
<220>
<221> DOMAIN
<222> (220)...(326)
<223> CH3
<400> 11
Ala Ser Thr Lys Gly Pro Ser Val Phe Pro Leu Ala Pro Cys Ser Arg
1 5 10 15
Ser Thr Ser Glu Ser Thr Ala Ala Leu Gly Cys Leu Val Lys Asp Tyr
20 25 30
Phe Pro Glu Pro Val Thr Val Ser Trp Asn Ser Gly Ala Leu Thr Ser
35 40 45
Gly Val His Thr Phe Pro Ala Val Leu Gln Ser Ser Gly Leu Tyr Ser
50 55 60
Leu Ser Ser Val Val Thr Val Pro Ser Ser Asn Phe Gly Thr Gln Thr
65 70 75 80
Tyr Thr Cys Asn Val Asp His Lys Pro Ser Asn Thr Lys Val Asp Lys
85 90 95
Thr Val Glu Arg Lys Cys Cys Val Glu Cys Pro Pro Cys Pro Ala Pro
100 105 110
Pro Val Ala Gly Pro Ser Val Phe Leu Phe Pro Pro Lys Pro Lys Asp
115 120 125
Thr Leu Met Ile Ser Arg Thr Pro Glu Val Thr Cys Val Val Val Asp
130 135 140
Val Ser His Glu Asp Pro Glu Val Gln Phe Asn Trp Tyr Val Asp Gly
145 150 155 160
Val Glu Val His Asn Ala Lys Thr Lys Pro Arg Glu Glu Gln Phe Asn
165 170 175
Ser Thr Phe Arg Val Val Ser Val Leu Thr Val Val His Gln Asp Trp
180 185 190
Leu Asn Gly Lys Glu Tyr Lys Cys Lys Val Ser Asn Lys Gly Leu Pro
195 200 205
Ala Pro Ile Glu Lys Thr Ile Ser Lys Thr Lys Gly Gln Pro Arg Glu
210 215 220
Pro Gln Val Tyr Thr Leu Pro Pro Ser Arg Glu Glu Met Thr Lys Asn
225 230 235 240
Gln Val Ser Leu Thr Cys Leu Val Lys Gly Phe Tyr Pro Ser Asp Ile
245 250 255
Ala Val Glu Trp Glu Ser Asn Gly Gln Pro Glu Asn Asn Tyr Lys Thr
260 265 270
Thr Pro Pro Met Leu Asp Ser Asp Gly Ser Phe Phe Leu Tyr Ser Lys
275 280 285
Leu Thr Val Asp Lys Ser Arg Trp Gln Gln Gly Asn Val Phe Ser Cys
290 295 300
Ser Val Met His Glu Ala Leu His Asn His Tyr Thr Gln Lys Ser Leu
305 310 315 320
Ser Leu Ser Pro Gly Lys
325
<210> 12
<211> 216
<212> PRT
<213> Homo sapiens
<220>
<223> IgG2 Fc (CH2 and CH3 domains)
<400> 12
Ala Pro Pro Val Ala Gly Pro Ser Val Phe Leu Phe Pro Pro Lys Pro
1 5 10 15
Lys Asp Thr Leu Met Ile Ser Arg Thr Pro Glu Val Thr Cys Val Val
20 25 30
Val Asp Val Ser His Glu Asp Pro Glu Val Gln Phe Asn Trp Tyr Val
35 40 45
Asp Gly Val Glu Val His Asn Ala Lys Thr Lys Pro Arg Glu Glu Gln
50 55 60
Phe Asn Ser Thr Phe Arg Val Val Ser Val Leu Thr Val Val His Gln
65 70 75 80
Asp Trp Leu Asn Gly Lys Glu Tyr Lys Cys Lys Val Ser Asn Lys Gly
85 90 95
Leu Pro Ala Pro Ile Glu Lys Thr Ile Ser Lys Thr Lys Gly Gln Pro
100 105 110
Arg Glu Pro Gln Val Tyr Thr Leu Pro Pro Ser Arg Glu Glu Met Thr
115 120 125
Lys Asn Gln Val Ser Leu Thr Cys Leu Val Lys Gly Phe Tyr Pro Ser
130 135 140
Asp Ile Ala Val Glu Trp Glu Ser Asn Gly Gln Pro Glu Asn Asn Tyr
145 150 155 160
Lys Thr Thr Pro Pro Met Leu Asp Ser Asp Gly Ser Phe Phe Leu Tyr
165 170 175
Ser Lys Leu Thr Val Asp Lys Ser Arg Trp Gln Gln Gly Asn Val Phe
180 185 190
Ser Cys Ser Val Met His Glu Ala Leu His Asn His Tyr Thr Gln Lys
195 200 205
Ser Leu Ser Leu Ser Pro Gly Lys
210 215
<210> 13
<211> 377
<212> PRT
<213> Homo sapiens
<220>
<223> IgG3 heavy chain constant domain
<220>
<221> DOMAIN
<222> (1)...(98)
<223> CH1
<220>
<221> DOMAIN
<222> (99)...(160)
<223> Hinge region
<220>
<221> DOMAIN
<222> (161)...(270)
<223> CH2
<220>
<221> DOMAIN
<222> (271)...(377)
<223> CH3
<400> 13
Ala Ser Thr Lys Gly Pro Ser Val Phe Pro Leu Ala Pro Cys Ser Arg
1 5 10 15
Ser Thr Ser Gly Gly Thr Ala Ala Leu Gly Cys Leu Val Lys Asp Tyr
20 25 30
Phe Pro Glu Pro Val Thr Val Ser Trp Asn Ser Gly Ala Leu Thr Ser
35 40 45
Gly Val His Thr Phe Pro Ala Val Leu Gln Ser Ser Gly Leu Tyr Ser
50 55 60
Leu Ser Ser Val Val Thr Val Pro Ser Ser Ser Leu Gly Thr Gln Thr
65 70 75 80
Tyr Thr Cys Asn Val Asn His Lys Pro Ser Asn Thr Lys Val Asp Lys
85 90 95
Arg Val Glu Leu Lys Thr Pro Leu Gly Asp Thr Thr His Thr Cys Pro
100 105 110
Arg Cys Pro Glu Pro Lys Ser Cys Asp Thr Pro Pro Pro Cys Pro Arg
115 120 125
Cys Pro Glu Pro Lys Ser Cys Asp Thr Pro Pro Pro Cys Pro Arg Cys
130 135 140
Pro Glu Pro Lys Ser Cys Asp Thr Pro Pro Pro Cys Pro Arg Cys Pro
145 150 155 160
Ala Pro Glu Leu Leu Gly Gly Pro Ser Val Phe Leu Phe Pro Pro Lys
165 170 175
Pro Lys Asp Thr Leu Met Ile Ser Arg Thr Pro Glu Val Thr Cys Val
180 185 190
Val Val Asp Val Ser His Glu Asp Pro Glu Val Gln Phe Lys Trp Tyr
195 200 205
Val Asp Gly Val Glu Val His Asn Ala Lys Thr Lys Pro Arg Glu Glu
210 215 220
Gln Tyr Asn Ser Thr Phe Arg Val Val Ser Val Leu Thr Val Leu His
225 230 235 240
Gln Asp Trp Leu Asn Gly Lys Glu Tyr Lys Cys Lys Val Ser Asn Lys
245 250 255
Ala Leu Pro Ala Pro Ile Glu Lys Thr Ile Ser Lys Thr Lys Gly Gln
260 265 270
Pro Arg Glu Pro Gln Val Tyr Thr Leu Pro Pro Ser Arg Glu Glu Met
275 280 285
Thr Lys Asn Gln Val Ser Leu Thr Cys Leu Val Lys Gly Phe Tyr Pro
290 295 300
Ser Asp Ile Ala Val Glu Trp Glu Ser Ser Gly Gln Pro Glu Asn Asn
305 310 315 320
Tyr Asn Thr Thr Pro Pro Met Leu Asp Ser Asp Gly Ser Phe Phe Leu
325 330 335
Tyr Ser Lys Leu Thr Val Asp Lys Ser Arg Trp Gln Gln Gly Asn Ile
340 345 350
Phe Ser Cys Ser Val Met His Glu Ala Leu His Asn Arg Phe Thr Gln
355 360 365
Lys Ser Leu Ser Leu Ser Pro Gly Lys
370 375
<210> 14
<211> 217
<212> PRT
<213> Homo sapiens
<220>
<223> IgG3 Fc (CH2 and CH3 domains)
<400> 14
Ala Pro Glu Leu Leu Gly Gly Pro Ser Val Phe Leu Phe Pro Pro Lys
1 5 10 15
Pro Lys Asp Thr Leu Met Ile Ser Arg Thr Pro Glu Val Thr Cys Val
20 25 30
Val Val Asp Val Ser His Glu Asp Pro Glu Val Gln Phe Lys Trp Tyr
35 40 45
Val Asp Gly Val Glu Val His Asn Ala Lys Thr Lys Pro Arg Glu Glu
50 55 60
Gln Tyr Asn Ser Thr Phe Arg Val Val Ser Val Leu Thr Val Leu His
65 70 75 80
Gln Asp Trp Leu Asn Gly Lys Glu Tyr Lys Cys Lys Val Ser Asn Lys
85 90 95
Ala Leu Pro Ala Pro Ile Glu Lys Thr Ile Ser Lys Thr Lys Gly Gln
100 105 110
Pro Arg Glu Pro Gln Val Tyr Thr Leu Pro Pro Ser Arg Glu Glu Met
115 120 125
Thr Lys Asn Gln Val Ser Leu Thr Cys Leu Val Lys Gly Phe Tyr Pro
130 135 140
Ser Asp Ile Ala Val Glu Trp Glu Ser Ser Gly Gln Pro Glu Asn Asn
145 150 155 160
Tyr Asn Thr Thr Pro Pro Met Leu Asp Ser Asp Gly Ser Phe Phe Leu
165 170 175
Tyr Ser Lys Leu Thr Val Asp Lys Ser Arg Trp Gln Gln Gly Asn Ile
180 185 190
Phe Ser Cys Ser Val Met His Glu Ala Leu His Asn Arg Phe Thr Gln
195 200 205
Lys Ser Leu Ser Leu Ser Pro Gly Lys
210 215
<210> 15
<211> 327
<212> PRT
<213> Homo sapiens
<220>
<223> IgG4 Heavy chain constant domain
<220>
<221> DOMAIN
<222> (1)...(98)
<223> CH1
<220>
<221> DOMAIN
<222> (99)...(110)
<223> Hinge region
<220>
<221> DOMAIN
<222> (111)...(220)
<223> CH2
<220>
<221> DOMAIN
<222> (221)...(327)
<223> CH3
<400> 15
Ala Ser Thr Lys Gly Pro Ser Val Phe Pro Leu Ala Pro Cys Ser Arg
1 5 10 15
Ser Thr Ser Glu Ser Thr Ala Ala Leu Gly Cys Leu Val Lys Asp Tyr
20 25 30
Phe Pro Glu Pro Val Thr Val Ser Trp Asn Ser Gly Ala Leu Thr Ser
35 40 45
Gly Val His Thr Phe Pro Ala Val Leu Gln Ser Ser Gly Leu Tyr Ser
50 55 60
Leu Ser Ser Val Val Thr Val Pro Ser Ser Ser Leu Gly Thr Lys Thr
65 70 75 80
Tyr Thr Cys Asn Val Asp His Lys Pro Ser Asn Thr Lys Val Asp Lys
85 90 95
Arg Val Glu Ser Lys Tyr Gly Pro Pro Cys Pro Ser Cys Pro Ala Pro
100 105 110
Glu Phe Leu Gly Gly Pro Ser Val Phe Leu Phe Pro Pro Lys Pro Lys
115 120 125
Asp Thr Leu Met Ile Ser Arg Thr Pro Glu Val Thr Cys Val Val Val
130 135 140
Asp Val Ser Gln Glu Asp Pro Glu Val Gln Phe Asn Trp Tyr Val Asp
145 150 155 160
Gly Val Glu Val His Asn Ala Lys Thr Lys Pro Arg Glu Glu Gln Phe
165 170 175
Asn Ser Thr Tyr Arg Val Val Ser Val Leu Thr Val Leu His Gln Asp
180 185 190
Trp Leu Asn Gly Lys Glu Tyr Lys Cys Lys Val Ser Asn Lys Gly Leu
195 200 205
Pro Ser Ser Ile Glu Lys Thr Ile Ser Lys Ala Lys Gly Gln Pro Arg
210 215 220
Glu Pro Gln Val Tyr Thr Leu Pro Pro Ser Gln Glu Glu Met Thr Lys
225 230 235 240
Asn Gln Val Ser Leu Thr Cys Leu Val Lys Gly Phe Tyr Pro Ser Asp
245 250 255
Ile Ala Val Glu Trp Glu Ser Asn Gly Gln Pro Glu Asn Asn Tyr Lys
260 265 270
Thr Thr Pro Pro Val Leu Asp Ser Asp Gly Ser Phe Phe Leu Tyr Ser
275 280 285
Arg Leu Thr Val Asp Lys Ser Arg Trp Gln Glu Gly Asn Val Phe Ser
290 295 300
Cys Ser Val Met His Glu Ala Leu His Asn His Tyr Thr Gln Lys Ser
305 310 315 320
Leu Ser Leu Ser Leu Gly Lys
325
<210> 16
<211> 217
<212> PRT
<213> Homo sapiens
<220>
<223> IgG4 Fc (CH2 and CH3 domains)
<400> 16
Ala Pro Glu Phe Leu Gly Gly Pro Ser Val Phe Leu Phe Pro Pro Lys
1 5 10 15
Pro Lys Asp Thr Leu Met Ile Ser Arg Thr Pro Glu Val Thr Cys Val
20 25 30
Val Val Asp Val Ser Gln Glu Asp Pro Glu Val Gln Phe Asn Trp Tyr
35 40 45
Val Asp Gly Val Glu Val His Asn Ala Lys Thr Lys Pro Arg Glu Glu
50 55 60
Gln Phe Asn Ser Thr Tyr Arg Val Val Ser Val Leu Thr Val Leu His
65 70 75 80
Gln Asp Trp Leu Asn Gly Lys Glu Tyr Lys Cys Lys Val Ser Asn Lys
85 90 95
Gly Leu Pro Ser Ser Ile Glu Lys Thr Ile Ser Lys Ala Lys Gly Gln
100 105 110
Pro Arg Glu Pro Gln Val Tyr Thr Leu Pro Pro Ser Gln Glu Glu Met
115 120 125
Thr Lys Asn Gln Val Ser Leu Thr Cys Leu Val Lys Gly Phe Tyr Pro
130 135 140
Ser Asp Ile Ala Val Glu Trp Glu Ser Asn Gly Gln Pro Glu Asn Asn
145 150 155 160
Tyr Lys Thr Thr Pro Pro Val Leu Asp Ser Asp Gly Ser Phe Phe Leu
165 170 175
Tyr Ser Arg Leu Thr Val Asp Lys Ser Arg Trp Gln Glu Gly Asn Val
180 185 190
Phe Ser Cys Ser Val Met His Glu Ala Leu His Asn His Tyr Thr Gln
195 200 205
Lys Ser Leu Ser Leu Ser Leu Gly Lys
210 215
<210> 17
<211> 107
<212> PRT
<213> Homo sapiens
<220>
<223> Human Ig kappa light chain constant domain (CL)
<400> 17
Arg Thr Val Ala Ala Pro Ser Val Phe Ile Phe Pro Pro Ser Asp Glu
1 5 10 15
Gln Leu Lys Ser Gly Thr Ala Ser Val Val Cys Leu Leu Asn Asn Phe
20 25 30
Tyr Pro Arg Glu Ala Lys Val Gln Trp Lys Val Asp Asn Ala Leu Gln
35 40 45
Ser Gly Asn Ser Gln Glu Ser Val Thr Glu Gln Asp Ser Lys Asp Ser
50 55 60
Thr Tyr Ser Leu Ser Ser Thr Leu Thr Leu Ser Lys Ala Asp Tyr Glu
65 70 75 80
Lys His Lys Val Tyr Ala Cys Glu Val Thr His Gln Gly Leu Ser Ser
85 90 95
Pro Val Thr Lys Ser Phe Asn Arg Gly Glu Cys
100 105
<210> 18
<211> 106
<212> PRT
<213> Homo sapiens
<220>
<223> Immunoglobulin lambda constant 1 light chain
domain (chain C)
<400> 18
Gly Gln Pro Lys Ala Asn Pro Thr Val Thr Leu Phe Pro Pro Ser Ser
1 5 10 15
Glu Glu Leu Gln Ala Asn Lys Ala Thr Leu Val Cys Leu Ile Ser Asp
20 25 30
Phe Tyr Pro Gly Ala Val Thr Val Ala Trp Lys Ala Asp Gly Ser Pro
35 40 45
Val Lys Ala Gly Val Glu Thr Thr Lys Pro Ser Lys Gln Ser Asn Asn
50 55 60
Lys Tyr Ala Ala Ser Ser Tyr Leu Ser Leu Thr Pro Glu Gln Trp Lys
65 70 75 80
Ser His Arg Ser Tyr Ser Cys Gln Val Thr His Glu Gly Ser Thr Val
85 90 95
Glu Lys Thr Val Ala Pro Thr Glu Cys Ser
100 105
<210> 19
<211> 106
<212> PRT
<213> Homo sapiens
<220>
<223> Immunoglobulin lambda CONSTANT 2 light chain
domain (chain C)
<400> 19
Gly Gln Pro Lys Ala Ala Pro Ser Val Thr Leu Phe Pro Pro Ser Ser
1 5 10 15
Glu Glu Leu Gln Ala Asn Lys Ala Thr Leu Val Cys Leu Ile Ser Asp
20 25 30
Phe Tyr Pro Gly Ala Val Thr Val Ala Trp Lys Ala Asp Ser Ser Pro
35 40 45
Val Lys Ala Gly Val Glu Thr Thr Thr Pro Ser Lys Gln Ser Asn Asn
50 55 60
Lys Tyr Ala Ala Ser Ser Tyr Leu Ser Leu Thr Pro Glu Gln Trp Lys
65 70 75 80
Ser His Arg Ser Tyr Ser Cys Gln Val Thr His Glu Gly Ser Thr Val
85 90 95
Glu Lys Thr Val Ala Pro Thr Glu Cys Ser
100 105
<210> 20
<211> 106
<212> PRT
<213> Homo sapiens
<220>
<223> Immunoglobulin lambda CONSTANT 3 light chain
domain (chain C)
<400> 20
Gly Gln Pro Lys Ala Ala Pro Ser Val Thr Leu Phe Pro Pro Ser Ser
1 5 10 15
Glu Glu Leu Gln Ala Asn Lys Ala Thr Leu Val Cys Leu Ile Ser Asp
20 25 30
Phe Tyr Pro Gly Ala Val Thr Val Ala Trp Lys Ala Asp Ser Ser Pro
35 40 45
Val Lys Ala Gly Val Glu Thr Thr Thr Pro Ser Lys Gln Ser Asn Asn
50 55 60
Lys Tyr Ala Ala Ser Ser Tyr Leu Ser Leu Thr Pro Glu Gln Trp Lys
65 70 75 80
Ser His Lys Ser Tyr Ser Cys Gln Val Thr His Glu Gly Ser Thr Val
85 90 95
Glu Lys Thr Val Ala Pro Thr Glu Cys Ser
100 105
<210> 21
<211> 106
<212> PRT
<213> Homo sapiens
<220>
<223> Immunoglobulin lambda CONSTANT 6 light chain
domain (chain C)
<400> 21
Gly Gln Pro Lys Ala Ala Pro Ser Val Thr Leu Phe Pro Pro Ser Ser
1 5 10 15
Glu Glu Leu Gln Ala Asn Lys Ala Thr Leu Val Cys Leu Ile Ser Asp
20 25 30
Phe Tyr Pro Gly Ala Val Lys Val Ala Trp Lys Ala Asp Gly Ser Pro
35 40 45
Val Asn Thr Gly Val Glu Thr Thr Thr Pro Ser Lys Gln Ser Asn Asn
50 55 60
Lys Tyr Ala Ala Ser Ser Tyr Leu Ser Leu Thr Pro Glu Gln Trp Lys
65 70 75 80
Ser His Arg Ser Tyr Ser Cys Gln Val Thr His Glu Gly Ser Thr Val
85 90 95
Glu Lys Thr Val Ala Pro Ala Glu Cys Ser
100 105
<210> 22
<211> 106
<212> PRT
<213> Homo sapiens
<220>
<223> Immunoglobulin lambda CONSTANT 7 light chain
domain (chain C)
<400> 22
Gly Gln Pro Lys Ala Ala Pro Ser Val Thr Leu Phe Pro Pro Ser Ser
1 5 10 15
Glu Glu Leu Gln Ala Asn Lys Ala Thr Leu Val Cys Leu Val Ser Asp
20 25 30
Phe Asn Pro Gly Ala Val Thr Val Ala Trp Lys Ala Asp Gly Ser Pro
35 40 45
Val Lys Val Gly Val Glu Thr Thr Lys Pro Ser Lys Gln Ser Asn Asn
50 55 60
Lys Tyr Ala Ala Ser Ser Tyr Leu Ser Leu Thr Pro Glu Gln Trp Lys
65 70 75 80
Ser His Arg Ser Tyr Ser Cys Arg Val Thr His Glu Gly Ser Thr Val
85 90 95
Glu Lys Thr Val Ala Pro Ala Glu Cys Ser
100 105
<210> 23
<211> 214
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Adalimumab Light Chain
<400> 23
Asp Ile Gln Met Thr Gln Ser Pro Ser Ser Leu Ser Ala Ser Val Gly
1 5 10 15
Asp Arg Val Thr Ile Thr Cys Arg Ala Ser Gln Gly Ile Arg Asn Tyr
20 25 30
Leu Ala Trp Tyr Gln Gln Lys Pro Gly Lys Ala Pro Lys Leu Leu Ile
35 40 45
Tyr Ala Ala Ser Thr Leu Gln Ser Gly Val Pro Ser Arg Phe Ser Gly
50 55 60
Ser Gly Ser Gly Thr Asp Phe Thr Leu Thr Ile Ser Ser Leu Gln Pro
65 70 75 80
Glu Asp Val Ala Thr Tyr Tyr Cys Gln Arg Tyr Asn Arg Ala Pro Tyr
85 90 95
Thr Phe Gly Gln Gly Thr Lys Val Glu Ile Lys Arg Thr Val Ala Ala
100 105 110
Pro Ser Val Phe Ile Phe Pro Pro Ser Asp Glu Gln Leu Lys Ser Gly
115 120 125
Thr Ala Ser Val Val Cys Leu Leu Asn Asn Phe Tyr Pro Arg Glu Ala
130 135 140
Lys Val Gln Trp Lys Val Asp Asn Ala Leu Gln Ser Gly Asn Ser Gln
145 150 155 160
Glu Ser Val Thr Glu Gln Asp Ser Lys Asp Ser Thr Tyr Ser Leu Ser
165 170 175
Ser Thr Leu Thr Leu Ser Lys Ala Asp Tyr Glu Lys His Lys Val Tyr
180 185 190
Ala Cys Glu Val Thr His Gln Gly Leu Ser Ser Pro Val Thr Lys Ser
195 200 205
Phe Asn Arg Gly Glu Cys
210
<210> 24
<211> 451
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Adalimumab Heavy Chain
<400> 24
Glu Val Gln Leu Val Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly Arg
1 5 10 15
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Asp Asp Tyr
20 25 30
Ala Met His Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val
35 40 45
Ser Ala Ile Thr Trp Asn Ser Gly His Ile Asp Tyr Ala Asp Ser Val
50 55 60
Glu Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Ala Lys Asn Ser Leu Tyr
65 70 75 80
Leu Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys
85 90 95
Ala Lys Val Ser Tyr Leu Ser Thr Ala Ser Ser Leu Asp Tyr Trp Gly
100 105 110
Gln Gly Thr Leu Val Thr Val Ser Ser Ala Ser Thr Lys Gly Pro Ser
115 120 125
Val Phe Pro Leu Ala Pro Ser Ser Lys Ser Thr Ser Gly Gly Thr Ala
130 135 140
Ala Leu Gly Cys Leu Val Lys Asp Tyr Phe Pro Glu Pro Val Thr Val
145 150 155 160
Ser Trp Asn Ser Gly Ala Leu Thr Ser Gly Val His Thr Phe Pro Ala
165 170 175
Val Leu Gln Ser Ser Gly Leu Tyr Ser Leu Ser Ser Val Val Thr Val
180 185 190
Pro Ser Ser Ser Leu Gly Thr Gln Thr Tyr Ile Cys Asn Val Asn His
195 200 205
Lys Pro Ser Asn Thr Lys Val Asp Lys Lys Val Glu Pro Lys Ser Cys
210 215 220
Asp Lys Thr His Thr Cys Pro Pro Cys Pro Ala Pro Glu Leu Leu Gly
225 230 235 240
Gly Pro Ser Val Phe Leu Phe Pro Pro Lys Pro Lys Asp Thr Leu Met
245 250 255
Ile Ser Arg Thr Pro Glu Val Thr Cys Val Val Val Asp Val Ser His
260 265 270
Glu Asp Pro Glu Val Lys Phe Asn Trp Tyr Val Asp Gly Val Glu Val
275 280 285
His Asn Ala Lys Thr Lys Pro Arg Glu Glu Gln Tyr Asn Ser Thr Tyr
290 295 300
Arg Val Val Ser Val Leu Thr Val Leu His Gln Asp Trp Leu Asn Gly
305 310 315 320
Lys Glu Tyr Lys Cys Lys Val Ser Asn Lys Ala Leu Pro Ala Pro Ile
325 330 335
Glu Lys Thr Ile Ser Lys Ala Lys Gly Gln Pro Arg Glu Pro Gln Val
340 345 350
Tyr Thr Leu Pro Pro Ser Arg Asp Glu Leu Thr Lys Asn Gln Val Ser
355 360 365
Leu Thr Cys Leu Val Lys Gly Phe Tyr Pro Ser Asp Ile Ala Val Glu
370 375 380
Trp Glu Ser Asn Gly Gln Pro Glu Asn Asn Tyr Lys Thr Thr Pro Pro
385 390 395 400
Val Leu Asp Ser Asp Gly Ser Phe Phe Leu Tyr Ser Lys Leu Thr Val
405 410 415
Asp Lys Ser Arg Trp Gln Gln Gly Asn Val Phe Ser Cys Ser Val Met
420 425 430
His Glu Ala Leu His Asn His Tyr Thr Gln Lys Ser Leu Ser Leu Ser
435 440 445
Pro Gly Lys
450
<210> 25
<211> 214
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Trastuzumab light chain
<400> 25
Asp Ile Gln Met Thr Gln Ser Pro Ser Ser Leu Ser Ala Ser Val Gly
1 5 10 15
Asp Arg Val Thr Ile Thr Cys Arg Ala Ser Gln Asp Val Asn Thr Ala
20 25 30
Val Ala Trp Tyr Gln Gln Lys Pro Gly Lys Ala Pro Lys Leu Leu Ile
35 40 45
Tyr Ser Ala Ser Phe Leu Tyr Ser Gly Val Pro Ser Arg Phe Ser Gly
50 55 60
Ser Arg Ser Gly Thr Asp Phe Thr Leu Thr Ile Ser Ser Leu Gln Pro
65 70 75 80
Glu Asp Phe Ala Thr Tyr Tyr Cys Gln Gln His Tyr Thr Thr Pro Pro
85 90 95
Thr Phe Gly Gln Gly Thr Lys Val Glu Ile Lys Arg Thr Val Ala Ala
100 105 110
Pro Ser Val Phe Ile Phe Pro Pro Ser Asp Glu Gln Leu Lys Ser Gly
115 120 125
Thr Ala Ser Val Val Cys Leu Leu Asn Asn Phe Tyr Pro Arg Glu Ala
130 135 140
Lys Val Gln Trp Lys Val Asp Asn Ala Leu Gln Ser Gly Asn Ser Gln
145 150 155 160
Glu Ser Val Thr Glu Gln Asp Ser Lys Asp Ser Thr Tyr Ser Leu Ser
165 170 175
Ser Thr Leu Thr Leu Ser Lys Ala Asp Tyr Glu Lys His Lys Val Tyr
180 185 190
Ala Cys Glu Val Thr His Gln Gly Leu Ser Ser Pro Val Thr Lys Ser
195 200 205
Phe Asn Arg Gly Glu Cys
210
<210> 26
<211> 450
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Trastuzumab heavy chain
<220>
<221> DOMAIN
<222> (1)...(120)
<223> VH
<220>
<221> DOMAIN
<222> (121)...(218)
<223> CH1
<220>
<221> DOMAIN
<222> (219)...(233)
<223> hinge region
<220>
<221> DOMAIN
<222> (234)...(343)
<223> CH2
<220>
<221> DOMAIN
<222> (344)...(450)
<223> CH3
<400> 26
Glu Val Gln Leu Val Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly Gly
1 5 10 15
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Asn Ile Lys Asp Thr
20 25 30
Tyr Ile His Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val
35 40 45
Ala Arg Ile Tyr Pro Thr Asn Gly Tyr Thr Arg Tyr Ala Asp Ser Val
50 55 60
Lys Gly Arg Phe Thr Ile Ser Ala Asp Thr Ser Lys Asn Thr Ala Tyr
65 70 75 80
Leu Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys
85 90 95
Ser Arg Trp Gly Gly Asp Gly Phe Tyr Ala Met Asp Tyr Trp Gly Gln
100 105 110
Gly Thr Leu Val Thr Val Ser Ser Ala Ser Thr Lys Gly Pro Ser Val
115 120 125
Phe Pro Leu Ala Pro Ser Ser Lys Ser Thr Ser Gly Gly Thr Ala Ala
130 135 140
Leu Gly Cys Leu Val Lys Asp Tyr Phe Pro Glu Pro Val Thr Val Ser
145 150 155 160
Trp Asn Ser Gly Ala Leu Thr Ser Gly Val His Thr Phe Pro Ala Val
165 170 175
Leu Gln Ser Ser Gly Leu Tyr Ser Leu Ser Ser Val Val Thr Val Pro
180 185 190
Ser Ser Ser Leu Gly Thr Gln Thr Tyr Ile Cys Asn Val Asn His Lys
195 200 205
Pro Ser Asn Thr Lys Val Asp Lys Lys Val Glu Pro Lys Ser Cys Asp
210 215 220
Lys Thr His Thr Cys Pro Pro Cys Pro Ala Pro Glu Leu Leu Gly Gly
225 230 235 240
Pro Ser Val Phe Leu Phe Pro Pro Lys Pro Lys Asp Thr Leu Met Ile
245 250 255
Ser Arg Thr Pro Glu Val Thr Cys Val Val Val Asp Val Ser His Glu
260 265 270
Asp Pro Glu Val Lys Phe Asn Trp Tyr Val Asp Gly Val Glu Val His
275 280 285
Asn Ala Lys Thr Lys Pro Arg Glu Glu Gln Tyr Asn Ser Thr Tyr Arg
290 295 300
Val Val Ser Val Leu Thr Val Leu His Gln Asp Trp Leu Asn Gly Lys
305 310 315 320
Glu Tyr Lys Cys Lys Val Ser Asn Lys Ala Leu Pro Ala Pro Ile Glu
325 330 335
Lys Thr Ile Ser Lys Ala Lys Gly Gln Pro Arg Glu Pro Gln Val Tyr
340 345 350
Thr Leu Pro Pro Ser Arg Glu Glu Met Thr Lys Asn Gln Val Ser Leu
355 360 365
Thr Cys Leu Val Lys Gly Phe Tyr Pro Ser Asp Ile Ala Val Glu Trp
370 375 380
Glu Ser Asn Gly Gln Pro Glu Asn Asn Tyr Lys Thr Thr Pro Pro Val
385 390 395 400
Leu Asp Ser Asp Gly Ser Phe Phe Leu Tyr Ser Lys Leu Thr Val Asp
405 410 415
Lys Ser Arg Trp Gln Gln Gly Asn Val Phe Ser Cys Ser Val Met His
420 425 430
Glu Ala Leu His Asn His Tyr Thr Gln Lys Ser Leu Ser Leu Ser Pro
435 440 445
Gly Lys
450
<210> 27
<211> 217
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Trastuzumab Fc (CH2 and CH3 domains)
<400> 27
Ala Pro Glu Leu Leu Gly Gly Pro Ser Val Phe Leu Phe Pro Pro Lys
1 5 10 15
Pro Lys Asp Thr Leu Met Ile Ser Arg Thr Pro Glu Val Thr Cys Val
20 25 30
Val Val Asp Val Ser His Glu Asp Pro Glu Val Lys Phe Asn Trp Tyr
35 40 45
Val Asp Gly Val Glu Val His Asn Ala Lys Thr Lys Pro Arg Glu Glu
50 55 60
Gln Tyr Asn Ser Thr Tyr Arg Val Val Ser Val Leu Thr Val Leu His
65 70 75 80
Gln Asp Trp Leu Asn Gly Lys Glu Tyr Lys Cys Lys Val Ser Asn Lys
85 90 95
Ala Leu Pro Ala Pro Ile Glu Lys Thr Ile Ser Lys Ala Lys Gly Gln
100 105 110
Pro Arg Glu Pro Gln Val Tyr Thr Leu Pro Pro Ser Arg Glu Glu Met
115 120 125
Thr Lys Asn Gln Val Ser Leu Thr Cys Leu Val Lys Gly Phe Tyr Pro
130 135 140
Ser Asp Ile Ala Val Glu Trp Glu Ser Asn Gly Gln Pro Glu Asn Asn
145 150 155 160
Tyr Lys Thr Thr Pro Pro Val Leu Asp Ser Asp Gly Ser Phe Phe Leu
165 170 175
Tyr Ser Lys Leu Thr Val Asp Lys Ser Arg Trp Gln Gln Gly Asn Val
180 185 190
Phe Ser Cys Ser Val Met His Glu Ala Leu His Asn His Tyr Thr Gln
195 200 205
Lys Ser Leu Ser Leu Ser Pro Gly Lys
210 215
<210> 28
<211> 214
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Nivolumab light chain
<400> 28
Glu Ile Val Leu Thr Gln Ser Pro Ala Thr Leu Ser Leu Ser Pro Gly
1 5 10 15
Glu Arg Ala Thr Leu Ser Cys Arg Ala Ser Gln Ser Val Ser Ser Tyr
20 25 30
Leu Ala Trp Tyr Gln Gln Lys Pro Gly Gln Ala Pro Arg Leu Leu Ile
35 40 45
Tyr Asp Ala Ser Asn Arg Ala Thr Gly Ile Pro Ala Arg Phe Ser Gly
50 55 60
Ser Gly Ser Gly Thr Asp Phe Thr Leu Thr Ile Ser Ser Leu Glu Pro
65 70 75 80
Glu Asp Phe Ala Val Tyr Tyr Cys Gln Gln Ser Ser Asn Trp Pro Arg
85 90 95
Thr Phe Gly Gln Gly Thr Lys Val Glu Ile Lys Arg Thr Val Ala Ala
100 105 110
Pro Ser Val Phe Ile Phe Pro Pro Ser Asp Glu Gln Leu Lys Ser Gly
115 120 125
Thr Ala Ser Val Val Cys Leu Leu Asn Asn Phe Tyr Pro Arg Glu Ala
130 135 140
Lys Val Gln Trp Lys Val Asp Asn Ala Leu Gln Ser Gly Asn Ser Gln
145 150 155 160
Glu Ser Val Thr Glu Gln Asp Ser Lys Asp Ser Thr Tyr Ser Leu Ser
165 170 175
Ser Thr Leu Thr Leu Ser Lys Ala Asp Tyr Glu Lys His Lys Val Tyr
180 185 190
Ala Cys Glu Val Thr His Gln Gly Leu Ser Ser Pro Val Thr Lys Ser
195 200 205
Phe Asn Arg Gly Glu Cys
210
<210> 29
<211> 440
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Nivolumab heavy chain
<220>
<221> DOMAIN
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<223> VH
<220>
<221> DOMAIN
<222> (114)...(221)
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<220>
<221> DOMAIN
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<223> Hinge region
<220>
<221> DOMAIN
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<220>
<221> DOMAIN
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<223> CH3
<400> 29
Gln Val Gln Leu Val Glu Ser Gly Gly Gly Val Val Gln Pro Gly Arg
1 5 10 15
Ser Leu Arg Leu Asp Cys Lys Ala Ser Gly Ile Thr Phe Ser Asn Ser
20 25 30
Gly Met His Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val
35 40 45
Ala Val Ile Trp Tyr Asp Gly Ser Lys Arg Tyr Tyr Ala Asp Ser Val
50 55 60
Lys Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Ser Lys Asn Thr Leu Phe
65 70 75 80
Leu Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys
85 90 95
Ala Thr Asn Asp Asp Tyr Trp Gly Gln Gly Thr Leu Val Thr Val Ser
100 105 110
Ser Ala Ser Thr Lys Gly Pro Ser Val Phe Pro Leu Ala Pro Cys Ser
115 120 125
Arg Ser Thr Ser Glu Ser Thr Ala Ala Leu Gly Cys Leu Val Lys Asp
130 135 140
Tyr Phe Pro Glu Pro Val Thr Val Ser Trp Asn Ser Gly Ala Leu Thr
145 150 155 160
Ser Gly Val His Thr Phe Pro Ala Val Leu Gln Ser Ser Gly Leu Tyr
165 170 175
Ser Leu Ser Ser Val Val Thr Val Pro Ser Ser Ser Leu Gly Thr Lys
180 185 190
Thr Tyr Thr Cys Asn Val Asp His Lys Pro Ser Asn Thr Lys Val Asp
195 200 205
Lys Arg Val Glu Ser Lys Tyr Gly Pro Pro Cys Pro Pro Cys Pro Ala
210 215 220
Pro Glu Phe Leu Gly Gly Pro Ser Val Phe Leu Phe Pro Pro Lys Pro
225 230 235 240
Lys Asp Thr Leu Met Ile Ser Arg Thr Pro Glu Val Thr Cys Val Val
245 250 255
Val Asp Val Ser Gln Glu Asp Pro Glu Val Gln Phe Asn Trp Tyr Val
260 265 270
Asp Gly Val Glu Val His Asn Ala Lys Thr Lys Pro Arg Glu Glu Gln
275 280 285
Phe Asn Ser Thr Tyr Arg Val Val Ser Val Leu Thr Val Leu His Gln
290 295 300
Asp Trp Leu Asn Gly Lys Glu Tyr Lys Cys Lys Val Ser Asn Lys Gly
305 310 315 320
Leu Pro Ser Ser Ile Glu Lys Thr Ile Ser Lys Ala Lys Gly Gln Pro
325 330 335
Arg Glu Pro Gln Val Tyr Thr Leu Pro Pro Ser Gln Glu Glu Met Thr
340 345 350
Lys Asn Gln Val Ser Leu Thr Cys Leu Val Lys Gly Phe Tyr Pro Ser
355 360 365
Asp Ile Ala Val Glu Trp Glu Ser Asn Gly Gln Pro Glu Asn Asn Tyr
370 375 380
Lys Thr Thr Pro Pro Val Leu Asp Ser Asp Gly Ser Phe Phe Leu Tyr
385 390 395 400
Ser Arg Leu Thr Val Asp Lys Ser Arg Trp Gln Glu Gly Asn Val Phe
405 410 415
Ser Cys Ser Val Met His Glu Ala Leu His Asn His Tyr Thr Gln Lys
420 425 430
Ser Leu Ser Leu Ser Leu Gly Lys
435 440
<210> 30
<211> 217
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Nivolumab Fc (CH2 and CH3 domains)
<400> 30
Ala Pro Glu Phe Leu Gly Gly Pro Ser Val Phe Leu Phe Pro Pro Lys
1 5 10 15
Pro Lys Asp Thr Leu Met Ile Ser Arg Thr Pro Glu Val Thr Cys Val
20 25 30
Val Val Asp Val Ser Gln Glu Asp Pro Glu Val Gln Phe Asn Trp Tyr
35 40 45
Val Asp Gly Val Glu Val His Asn Ala Lys Thr Lys Pro Arg Glu Glu
50 55 60
Gln Phe Asn Ser Thr Tyr Arg Val Val Ser Val Leu Thr Val Leu His
65 70 75 80
Gln Asp Trp Leu Asn Gly Lys Glu Tyr Lys Cys Lys Val Ser Asn Lys
85 90 95
Gly Leu Pro Ser Ser Ile Glu Lys Thr Ile Ser Lys Ala Lys Gly Gln
100 105 110
Pro Arg Glu Pro Gln Val Tyr Thr Leu Pro Pro Ser Gln Glu Glu Met
115 120 125
Thr Lys Asn Gln Val Ser Leu Thr Cys Leu Val Lys Gly Phe Tyr Pro
130 135 140
Ser Asp Ile Ala Val Glu Trp Glu Ser Asn Gly Gln Pro Glu Asn Asn
145 150 155 160
Tyr Lys Thr Thr Pro Pro Val Leu Asp Ser Asp Gly Ser Phe Phe Leu
165 170 175
Tyr Ser Arg Leu Thr Val Asp Lys Ser Arg Trp Gln Glu Gly Asn Val
180 185 190
Phe Ser Cys Ser Val Met His Glu Ala Leu His Asn His Tyr Thr Gln
195 200 205
Lys Ser Leu Ser Leu Ser Leu Gly Lys
210 215
<210> 31
<211> 444
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> ATROSAB heavy chain
<220>
<221> DOMAIN
<222> (1)...(115)
<223> VH
<220>
<221> DOMAIN
<222> (116)...(218)
<223> CH1
<220>
<221> DOMAIN
<222> (219)...(234)
<223> Hinge region
<220>
<221> DOMAIN
<222> (235)...(337)
<223> CH2
<220>
<221> DOMAIN
<222> (338)...(444)
<223> CH3
<400> 31
Gln Val Gln Leu Val Gln Ser Gly Ala Glu Val Lys Lys Pro Gly Ser
1 5 10 15
Ser Val Lys Val Ser Cys Lys Ala Ser Gly Tyr Thr Phe Thr Asp Phe
20 25 30
Tyr Ile Asn Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Gln Gly Leu Glu Trp Ile
35 40 45
Gly Glu Ile Tyr Pro Tyr Ser Gly His Ala Tyr Tyr Asn Glu Lys Phe
50 55 60
Lys Ala Arg Val Thr Ile Thr Ala Asp Lys Ser Thr Ser Thr Ala Tyr
65 70 75 80
Met Glu Leu Ser Ser Leu Arg Ser Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys
85 90 95
Ala Arg Trp Asp Phe Leu Asp Tyr Trp Gly Gln Gly Thr Thr Val Thr
100 105 110
Val Ser Ser Ala Ser Thr Lys Gly Pro Ser Val Phe Pro Leu Ala Pro
115 120 125
Ser Ser Lys Ser Thr Ser Gly Gly Thr Ala Ala Leu Gly Cys Leu Val
130 135 140
Lys Asp Tyr Phe Pro Glu Pro Val Thr Val Ser Trp Asn Ser Gly Ala
145 150 155 160
Leu Thr Ser Gly Val His Thr Phe Pro Ala Val Leu Gln Ser Ser Gly
165 170 175
Leu Tyr Ser Leu Ser Ser Val Val Thr Val Pro Ser Ser Ser Leu Gly
180 185 190
Thr Gln Thr Tyr Ile Cys Asn Val Asn His Lys Pro Ser Asn Thr Lys
195 200 205
Val Asp Lys Lys Val Glu Pro Lys Ser Cys Asp Lys Thr His Thr Cys
210 215 220
Pro Pro Cys Pro Ala Pro Pro Val Ala Gly Pro Ser Val Phe Leu Phe
225 230 235 240
Pro Pro Lys Pro Lys Asp Thr Leu Met Ile Ser Arg Thr Pro Glu Val
245 250 255
Thr Cys Val Val Val Asp Val Ser His Glu Asp Pro Glu Val Lys Phe
260 265 270
Asn Trp Tyr Val Asp Gly Val Glu Val His Asn Ala Lys Thr Lys Pro
275 280 285
Arg Glu Glu Gln Tyr Asn Ser Thr Tyr Arg Val Val Ser Val Leu Thr
290 295 300
Val Leu His Gln Asp Trp Leu Asn Gly Lys Glu Tyr Lys Cys Lys Val
305 310 315 320
Ser Asn Lys Gly Leu Pro Ser Ser Ile Glu Lys Thr Ile Ser Lys Ala
325 330 335
Lys Gly Gln Pro Arg Glu Pro Gln Val Tyr Thr Leu Pro Pro Ser Arg
340 345 350
Asp Glu Leu Thr Lys Asn Gln Val Ser Leu Thr Cys Leu Val Lys Gly
355 360 365
Phe Tyr Pro Ser Asp Ile Ala Val Glu Trp Glu Ser Asn Gly Gln Pro
370 375 380
Glu Asn Asn Tyr Lys Thr Thr Pro Pro Val Leu Asp Ser Asp Gly Ser
385 390 395 400
Phe Phe Leu Tyr Ser Lys Leu Thr Val Asp Lys Ser Arg Trp Gln Gln
405 410 415
Gly Asn Val Phe Ser Cys Ser Val Met His Glu Ala Leu His Asn His
420 425 430
Tyr Thr Gln Lys Ser Leu Ser Leu Ser Pro Gly Lys
435 440
<210> 32
<211> 219
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> ATROSAB light chain
<220>
<221> DOMAIN
<222> (1)...(113)
<223> VL
<220>
<221> DOMAIN
<222> (114)...(219)
<223> CL
<400> 32
Asp Ile Val Met Thr Gln Ser Pro Leu Ser Leu Pro Val Thr Pro Gly
1 5 10 15
Glu Pro Ala Ser Ile Ser Cys Arg Ser Ser Gln Ser Leu Leu His Ser
20 25 30
Asn Gly Asn Thr Tyr Leu His Trp Tyr Leu Gln Lys Pro Gly Gln Ser
35 40 45
Pro Gln Leu Leu Ile Tyr Thr Val Ser Asn Arg Phe Ser Gly Val Pro
50 55 60
Asp Arg Phe Ser Gly Ser Gly Ser Gly Thr Asp Phe Thr Leu Lys Ile
65 70 75 80
Ser Arg Val Glu Ala Glu Asp Val Gly Val Tyr Tyr Cys Ser Gln Ser
85 90 95
Thr His Val Pro Tyr Thr Phe Gly Gly Gly Thr Lys Val Glu Ile Lys
100 105 110
Arg Thr Val Ala Ala Pro Ser Val Phe Ile Phe Pro Pro Ser Asp Glu
115 120 125
Gln Leu Lys Ser Gly Thr Ala Ser Val Val Cys Leu Leu Asn Asn Phe
130 135 140
Tyr Pro Arg Glu Ala Lys Val Gln Trp Lys Val Asp Asn Ala Leu Gln
145 150 155 160
Ser Gly Asn Ser Gln Glu Ser Val Thr Glu Gln Asp Ser Lys Asp Ser
165 170 175
Thr Tyr Ser Leu Ser Ser Thr Leu Thr Leu Ser Lys Ala Asp Tyr Glu
180 185 190
Lys His Lys Val Tyr Ala Cys Glu Val Thr His Gln Gly Leu Ser Ser
195 200 205
Pro Val Thr Lys Ser Phe Asn Arg Gly Glu Cys
210 215
<210> 33
<211> 115
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> H398 VH domain
<400> 33
Gln Val Gln Leu Gln Glu Ser Gly Ala Glu Leu Ala Arg Pro Gly Ala
1 5 10 15
Ser Val Lys Leu Ser Cys Lys Ala Ser Gly Tyr Thr Phe Thr Asp Phe
20 25 30
Tyr Ile Asn Trp Val Lys Gln Arg Thr Gly Gln Gly Leu Glu Trp Ile
35 40 45
Gly Glu Ile Tyr Pro Tyr Ser Gly His Ala Tyr Tyr Asn Glu Lys Phe
50 55 60
Lys Ala Lys Ala Thr Leu Thr Ala Asp Lys Ser Ser Ser Thr Ala Phe
65 70 75 80
Met Gln Leu Asn Ser Leu Thr Ser Glu Asp Ser Ala Val Tyr Phe Cys
85 90 95
Val Arg Trp Asp Phe Leu Asp Tyr Trp Gly Gln Gly Thr Thr Leu Thr
100 105 110
Val Ser Ser
115
<210> 34
<211> 113
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> H398 VL domain
<400> 34
Asp Ile Val Met Thr Gln Ser Pro Leu Ser Leu Pro Val Ser Leu Gly
1 5 10 15
Asp Gln Ala Ser Ile Ser Cys Arg Ser Ser Gln Ser Leu Leu His Ser
20 25 30
Asn Gly Asn Thr Tyr Leu His Trp Tyr Val Gln Lys Pro Gly Gln Ser
35 40 45
Pro Lys Leu Leu Ile Tyr Thr Val Ser Asn Arg Phe Ser Gly Val Pro
50 55 60
Asp Arg Phe Ser Gly Ser Gly Ser Gly Thr Asp Phe Thr Leu Lys Ile
65 70 75 80
Ser Arg Val Glu Ala Glu Asp Leu Gly Val Tyr Phe Cys Ser Gln Ser
85 90 95
Thr His Val Pro Tyr Thr Phe Gly Gly Gly Thr Lys Leu Glu Ile Lys
100 105 110
Arg
<210> 35
<211> 609
<212> PRT
<213> Homo sapiens
<220>
<223> Human Serum Albumin (HSA)
<220>
<221> SIGNAL
<222> (1)...(18)
<223> Signal peptide
<220>
<221> PROPEP
<222> (19)...(24)
<223> Propeptide
<220>
<221> PEPTIDE
<222> (25)...(609)
<223> Albumin
<400> 35
Met Lys Trp Val Thr Phe Ile Ser Leu Leu Phe Leu Phe Ser Ser Ala
1 5 10 15
Tyr Ser Arg Gly Val Phe Arg Arg Asp Ala His Lys Ser Glu Val Ala
20 25 30
His Arg Phe Lys Asp Leu Gly Glu Glu Asn Phe Lys Ala Leu Val Leu
35 40 45
Ile Ala Phe Ala Gln Tyr Leu Gln Gln Cys Pro Phe Glu Asp His Val
50 55 60
Lys Leu Val Asn Glu Val Thr Glu Phe Ala Lys Thr Cys Val Ala Asp
65 70 75 80
Glu Ser Ala Glu Asn Cys Asp Lys Ser Leu His Thr Leu Phe Gly Asp
85 90 95
Lys Leu Cys Thr Val Ala Thr Leu Arg Glu Thr Tyr Gly Glu Met Ala
100 105 110
Asp Cys Cys Ala Lys Gln Glu Pro Glu Arg Asn Glu Cys Phe Leu Gln
115 120 125
His Lys Asp Asp Asn Pro Asn Leu Pro Arg Leu Val Arg Pro Glu Val
130 135 140
Asp Val Met Cys Thr Ala Phe His Asp Asn Glu Glu Thr Phe Leu Lys
145 150 155 160
Lys Tyr Leu Tyr Glu Ile Ala Arg Arg His Pro Tyr Phe Tyr Ala Pro
165 170 175
Glu Leu Leu Phe Phe Ala Lys Arg Tyr Lys Ala Ala Phe Thr Glu Cys
180 185 190
Cys Gln Ala Ala Asp Lys Ala Ala Cys Leu Leu Pro Lys Leu Asp Glu
195 200 205
Leu Arg Asp Glu Gly Lys Ala Ser Ser Ala Lys Gln Arg Leu Lys Cys
210 215 220
Ala Ser Leu Gln Lys Phe Gly Glu Arg Ala Phe Lys Ala Trp Ala Val
225 230 235 240
Ala Arg Leu Ser Gln Arg Phe Pro Lys Ala Glu Phe Ala Glu Val Ser
245 250 255
Lys Leu Val Thr Asp Leu Thr Lys Val His Thr Glu Cys Cys His Gly
260 265 270
Asp Leu Leu Glu Cys Ala Asp Asp Arg Ala Asp Leu Ala Lys Tyr Ile
275 280 285
Cys Glu Asn Gln Asp Ser Ile Ser Ser Lys Leu Lys Glu Cys Cys Glu
290 295 300
Lys Pro Leu Leu Glu Lys Ser His Cys Ile Ala Glu Val Glu Asn Asp
305 310 315 320
Glu Met Pro Ala Asp Leu Pro Ser Leu Ala Ala Asp Phe Val Glu Ser
325 330 335
Lys Asp Val Cys Lys Asn Tyr Ala Glu Ala Lys Asp Val Phe Leu Gly
340 345 350
Met Phe Leu Tyr Glu Tyr Ala Arg Arg His Pro Asp Tyr Ser Val Val
355 360 365
Leu Leu Leu Arg Leu Ala Lys Thr Tyr Glu Thr Thr Leu Glu Lys Cys
370 375 380
Cys Ala Ala Ala Asp Pro His Glu Cys Tyr Ala Lys Val Phe Asp Glu
385 390 395 400
Phe Lys Pro Leu Val Glu Glu Pro Gln Asn Leu Ile Lys Gln Asn Cys
405 410 415
Glu Leu Phe Glu Gln Leu Gly Glu Tyr Lys Phe Gln Asn Ala Leu Leu
420 425 430
Val Arg Tyr Thr Lys Lys Val Pro Gln Val Ser Thr Pro Thr Leu Val
435 440 445
Glu Val Ser Arg Asn Leu Gly Lys Val Gly Ser Lys Cys Cys Lys His
450 455 460
Pro Glu Ala Lys Arg Met Pro Cys Ala Glu Asp Tyr Leu Ser Val Val
465 470 475 480
Leu Asn Gln Leu Cys Val Leu His Glu Lys Thr Pro Val Ser Asp Arg
485 490 495
Val Thr Lys Cys Cys Thr Glu Ser Leu Val Asn Arg Arg Pro Cys Phe
500 505 510
Ser Ala Leu Glu Val Asp Glu Thr Tyr Val Pro Lys Glu Phe Asn Ala
515 520 525
Glu Thr Phe Thr Phe His Ala Asp Ile Cys Thr Leu Ser Glu Lys Glu
530 535 540
Arg Gln Ile Lys Lys Gln Thr Ala Leu Val Glu Leu Val Lys His Lys
545 550 555 560
Pro Lys Ala Thr Lys Glu Gln Leu Lys Ala Val Met Asp Asp Phe Ala
565 570 575
Ala Phe Val Glu Lys Cys Cys Lys Ala Asp Asp Lys Glu Thr Cys Phe
580 585 590
Ala Glu Glu Gly Lys Lys Leu Val Ala Ala Ser Gln Ala Ala Leu Gly
595 600 605
Leu
<210> 36
<211> 365
<212> PRT
<213> Homo sapiens
<220>
<223> Human FcRn (IgG receptor FcRn large subunit p51)
<220>
<221> SIGNAL
<222> (1)...(23)
<223> signal peptide
<220>
<221> DOMAIN
<222> (24)...(297)
<223> extracellular domain
<220>
<221> DOMAIN
<222> (298)...(321)
<223> transmembrane domain
<220>
<221> DOMAIN
<222> (322)...(365)
<223> cytoplasmic domain
<400> 36
Met Gly Val Pro Arg Pro Gln Pro Trp Ala Leu Gly Leu Leu Leu Phe
1 5 10 15
Leu Leu Pro Gly Ser Leu Gly Ala Glu Ser His Leu Ser Leu Leu Tyr
20 25 30
His Leu Thr Ala Val Ser Ser Pro Ala Pro Gly Thr Pro Ala Phe Trp
35 40 45
Val Ser Gly Trp Leu Gly Pro Gln Gln Tyr Leu Ser Tyr Asn Ser Leu
50 55 60
Arg Gly Glu Ala Glu Pro Cys Gly Ala Trp Val Trp Glu Asn Gln Val
65 70 75 80
Ser Trp Tyr Trp Glu Lys Glu Thr Thr Asp Leu Arg Ile Lys Glu Lys
85 90 95
Leu Phe Leu Glu Ala Phe Lys Ala Leu Gly Gly Lys Gly Pro Tyr Thr
100 105 110
Leu Gln Gly Leu Leu Gly Cys Glu Leu Gly Pro Asp Asn Thr Ser Val
115 120 125
Pro Thr Ala Lys Phe Ala Leu Asn Gly Glu Glu Phe Met Asn Phe Asp
130 135 140
Leu Lys Gln Gly Thr Trp Gly Gly Asp Trp Pro Glu Ala Leu Ala Ile
145 150 155 160
Ser Gln Arg Trp Gln Gln Gln Asp Lys Ala Ala Asn Lys Glu Leu Thr
165 170 175
Phe Leu Leu Phe Ser Cys Pro His Arg Leu Arg Glu His Leu Glu Arg
180 185 190
Gly Arg Gly Asn Leu Glu Trp Lys Glu Pro Pro Ser Met Arg Leu Lys
195 200 205
Ala Arg Pro Ser Ser Pro Gly Phe Ser Val Leu Thr Cys Ser Ala Phe
210 215 220
Ser Phe Tyr Pro Pro Glu Leu Gln Leu Arg Phe Leu Arg Asn Gly Leu
225 230 235 240
Ala Ala Gly Thr Gly Gln Gly Asp Phe Gly Pro Asn Ser Asp Gly Ser
245 250 255
Phe His Ala Ser Ser Ser Leu Thr Val Lys Ser Gly Asp Glu His His
260 265 270
Tyr Cys Cys Ile Val Gln His Ala Gly Leu Ala Gln Pro Leu Arg Val
275 280 285
Glu Leu Glu Ser Pro Ala Lys Ser Ser Val Leu Val Val Gly Ile Val
290 295 300
Ile Gly Val Leu Leu Leu Thr Ala Ala Ala Val Gly Gly Ala Leu Leu
305 310 315 320
Trp Arg Arg Met Arg Ser Gly Leu Pro Ala Pro Trp Ile Ser Leu Arg
325 330 335
Gly Asp Asp Thr Gly Val Leu Leu Pro Thr Pro Gly Glu Ala Gln Asp
340 345 350
Ala Asp Leu Lys Asp Val Asn Val Ile Pro Ala Thr Ala
355 360 365
<210> 37
<211> 690
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> DMS5541
<400> 37
gaggtgcagc tgttggagtc tgggggaggc ttggtacagc ctggggggtc cctgcgtctc 60
tcctgtgcag cctccggatt cacctttgat aagtattcga tggggtgggt ccgccaggct 120
ccagggaagg gtctagagtg ggtctcacag atttcggata ctgctgatcg tacatactac 180
gcacacgcgg tgaagggccg gttcaccatc tcccgcgaca attccaagaa cacgctgtat 240
ctgcaaatga acagcctgcg tgctgaggac accgcggtat attactgtgc gatatatact 300
gggcgttggg tgccttttga gtactggggt cagggaaccc tggtcaccgt ctcgagcgct 360
agcaccgaca tccagatgac ccagtctcca tcctccctgt ctgcatctgt aggagaccgt 420
gtcaccatca cttgccgggc aagtcgtccg attgggacga cgttaagttg gtaccagcag 480
aaaccaggga aagcccctaa gctcctgatc ctgtggaatt cccgtttgca aagtggggtc 540
ccatcacgtt tcagtggcag tggatctggg acagatttca ctctcaccat cagcagtctg 600
caacctgaag attttgctac gtactactgt gcgcaggctg ggacgcatcc tacgacgttc 660
ggccaaggga ccaaggtgga aatcaaacgg 690
<210> 38
<211> 230
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> DMS5541
<400> 38
Glu Val Gln Leu Leu Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly Gly
1 5 10 15
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Asp Lys Tyr
20 25 30
Ser Met Gly Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val
35 40 45
Ser Gln Ile Ser Asp Thr Ala Asp Arg Thr Tyr Tyr Ala His Ala Val
50 55 60
Lys Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Ser Lys Asn Thr Leu Tyr
65 70 75 80
Leu Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys
85 90 95
Ala Ile Tyr Thr Gly Arg Trp Val Pro Phe Glu Tyr Trp Gly Gln Gly
100 105 110
Thr Leu Val Thr Val Ser Ser Ala Ser Thr Asp Ile Gln Met Thr Gln
115 120 125
Ser Pro Ser Ser Leu Ser Ala Ser Val Gly Asp Arg Val Thr Ile Thr
130 135 140
Cys Arg Ala Ser Arg Pro Ile Gly Thr Thr Leu Ser Trp Tyr Gln Gln
145 150 155 160
Lys Pro Gly Lys Ala Pro Lys Leu Leu Ile Leu Trp Asn Ser Arg Leu
165 170 175
Gln Ser Gly Val Pro Ser Arg Phe Ser Gly Ser Gly Ser Gly Thr Asp
180 185 190
Phe Thr Leu Thr Ile Ser Ser Leu Gln Pro Glu Asp Phe Ala Thr Tyr
195 200 205
Tyr Cys Ala Gln Ala Gly Thr His Pro Thr Thr Phe Gly Gln Gly Thr
210 215 220
Lys Val Glu Ile Lys Arg
225 230
<210> 39
<211> 231
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> DMS5540 (mouse specific)
<400> 39
Glu Val Gln Leu Leu Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly Gly
1 5 10 15
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Asn Arg Tyr
20 25 30
Ser Met Gly Trp Leu Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val
35 40 45
Ser Arg Ile Asp Ser Tyr Gly Arg Gly Thr Tyr Tyr Glu Asp Pro Val
50 55 60
Lys Gly Arg Phe Ser Ile Ser Arg Asp Asn Ser Lys Asn Thr Leu Tyr
65 70 75 80
Leu Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys
85 90 95
Ala Lys Ile Ser Gln Phe Gly Ser Asn Ala Phe Asp Tyr Trp Gly Gln
100 105 110
Gly Thr Gln Val Thr Val Ser Ser Ala Ser Thr Asp Ile Gln Met Thr
115 120 125
Gln Ser Pro Ser Ser Leu Ser Ala Ser Val Gly Asp Arg Val Thr Ile
130 135 140
Thr Cys Arg Ala Ser Arg Pro Ile Gly Thr Met Leu Ser Trp Tyr Gln
145 150 155 160
Gln Lys Pro Gly Lys Ala Pro Lys Leu Leu Ile Leu Phe Gly Ser Arg
165 170 175
Leu Gln Ser Gly Val Pro Ser Arg Phe Ser Gly Ser Gly Ser Gly Thr
180 185 190
Asp Phe Thr Leu Thr Ile Ser Ser Leu Gln Pro Glu Asp Phe Ala Thr
195 200 205
Tyr Tyr Cys Ala Gln Ala Gly Thr His Pro Thr Thr Phe Gly Gln Gly
210 215 220
Thr Lys Val Glu Ile Lys Arg
225 230
<210> 40
<211> 1210
<212> PRT
<213> Homo sapiens
<220>
<223> human EGFR (HER1) precursor
<220>
<221> SIGNAL
<222> (1)...(24)
<223> signal peptide
<220>
<221> DOMAIN
<222> (25)...(645)
<223> Extracellular domain (ECD)
<220>
<221> DOMAIN
<222> (646)...(668)
<223> transmembrane region
<220>
<221> DOMAIN
<222> (669)...(1210)
<223> cytoplasmic domain
<220>
<221> DOMAIN
<222> (712)...(979)
<223> Protein kinase
<400> 40
Met Arg Pro Ser Gly Thr Ala Gly Ala Ala Leu Leu Ala Leu Leu Ala
1 5 10 15
Ala Leu Cys Pro Ala Ser Arg Ala Leu Glu Glu Lys Lys Val Cys Gln
20 25 30
Gly Thr Ser Asn Lys Leu Thr Gln Leu Gly Thr Phe Glu Asp His Phe
35 40 45
Leu Ser Leu Gln Arg Met Phe Asn Asn Cys Glu Val Val Leu Gly Asn
50 55 60
Leu Glu Ile Thr Tyr Val Gln Arg Asn Tyr Asp Leu Ser Phe Leu Lys
65 70 75 80
Thr Ile Gln Glu Val Ala Gly Tyr Val Leu Ile Ala Leu Asn Thr Val
85 90 95
Glu Arg Ile Pro Leu Glu Asn Leu Gln Ile Ile Arg Gly Asn Met Tyr
100 105 110
Tyr Glu Asn Ser Tyr Ala Leu Ala Val Leu Ser Asn Tyr Asp Ala Asn
115 120 125
Lys Thr Gly Leu Lys Glu Leu Pro Met Arg Asn Leu Gln Glu Ile Leu
130 135 140
His Gly Ala Val Arg Phe Ser Asn Asn Pro Ala Leu Cys Asn Val Glu
145 150 155 160
Ser Ile Gln Trp Arg Asp Ile Val Ser Ser Asp Phe Leu Ser Asn Met
165 170 175
Ser Met Asp Phe Gln Asn His Leu Gly Ser Cys Gln Lys Cys Asp Pro
180 185 190
Ser Cys Pro Asn Gly Ser Cys Trp Gly Ala Gly Glu Glu Asn Cys Gln
195 200 205
Lys Leu Thr Lys Ile Ile Cys Ala Gln Gln Cys Ser Gly Arg Cys Arg
210 215 220
Gly Lys Ser Pro Ser Asp Cys Cys His Asn Gln Cys Ala Ala Gly Cys
225 230 235 240
Thr Gly Pro Arg Glu Ser Asp Cys Leu Val Cys Arg Lys Phe Arg Asp
245 250 255
Glu Ala Thr Cys Lys Asp Thr Cys Pro Pro Leu Met Leu Tyr Asn Pro
260 265 270
Thr Thr Tyr Gln Met Asp Val Asn Pro Glu Gly Lys Tyr Ser Phe Gly
275 280 285
Ala Thr Cys Val Lys Lys Cys Pro Arg Asn Tyr Val Val Thr Asp His
290 295 300
Gly Ser Cys Val Arg Ala Cys Gly Ala Asp Ser Tyr Glu Met Glu Glu
305 310 315 320
Asp Gly Val Arg Lys Cys Lys Lys Cys Glu Gly Pro Cys Arg Lys Val
325 330 335
Cys Asn Gly Ile Gly Ile Gly Glu Phe Lys Asp Ser Leu Ser Ile Asn
340 345 350
Ala Thr Asn Ile Lys His Phe Lys Asn Cys Thr Ser Ile Ser Gly Asp
355 360 365
Leu His Ile Leu Pro Val Ala Phe Arg Gly Asp Ser Phe Thr His Thr
370 375 380
Pro Pro Leu Asp Pro Gln Glu Leu Asp Ile Leu Lys Thr Val Lys Glu
385 390 395 400
Ile Thr Gly Phe Leu Leu Ile Gln Ala Trp Pro Glu Asn Arg Thr Asp
405 410 415
Leu His Ala Phe Glu Asn Leu Glu Ile Ile Arg Gly Arg Thr Lys Gln
420 425 430
His Gly Gln Phe Ser Leu Ala Val Val Ser Leu Asn Ile Thr Ser Leu
435 440 445
Gly Leu Arg Ser Leu Lys Glu Ile Ser Asp Gly Asp Val Ile Ile Ser
450 455 460
Gly Asn Lys Asn Leu Cys Tyr Ala Asn Thr Ile Asn Trp Lys Lys Leu
465 470 475 480
Phe Gly Thr Ser Gly Gln Lys Thr Lys Ile Ile Ser Asn Arg Gly Glu
485 490 495
Asn Ser Cys Lys Ala Thr Gly Gln Val Cys His Ala Leu Cys Ser Pro
500 505 510
Glu Gly Cys Trp Gly Pro Glu Pro Arg Asp Cys Val Ser Cys Arg Asn
515 520 525
Val Ser Arg Gly Arg Glu Cys Val Asp Lys Cys Asn Leu Leu Glu Gly
530 535 540
Glu Pro Arg Glu Phe Val Glu Asn Ser Glu Cys Ile Gln Cys His Pro
545 550 555 560
Glu Cys Leu Pro Gln Ala Met Asn Ile Thr Cys Thr Gly Arg Gly Pro
565 570 575
Asp Asn Cys Ile Gln Cys Ala His Tyr Ile Asp Gly Pro His Cys Val
580 585 590
Lys Thr Cys Pro Ala Gly Val Met Gly Glu Asn Asn Thr Leu Val Trp
595 600 605
Lys Tyr Ala Asp Ala Gly His Val Cys His Leu Cys His Pro Asn Cys
610 615 620
Thr Tyr Gly Cys Thr Gly Pro Gly Leu Glu Gly Cys Pro Thr Asn Gly
625 630 635 640
Pro Lys Ile Pro Ser Ile Ala Thr Gly Met Val Gly Ala Leu Leu Leu
645 650 655
Leu Leu Val Val Ala Leu Gly Ile Gly Leu Phe Met Arg Arg Arg His
660 665 670
Ile Val Arg Lys Arg Thr Leu Arg Arg Leu Leu Gln Glu Arg Glu Leu
675 680 685
Val Glu Pro Leu Thr Pro Ser Gly Glu Ala Pro Asn Gln Ala Leu Leu
690 695 700
Arg Ile Leu Lys Glu Thr Glu Phe Lys Lys Ile Lys Val Leu Gly Ser
705 710 715 720
Gly Ala Phe Gly Thr Val Tyr Lys Gly Leu Trp Ile Pro Glu Gly Glu
725 730 735
Lys Val Lys Ile Pro Val Ala Ile Lys Glu Leu Arg Glu Ala Thr Ser
740 745 750
Pro Lys Ala Asn Lys Glu Ile Leu Asp Glu Ala Tyr Val Met Ala Ser
755 760 765
Val Asp Asn Pro His Val Cys Arg Leu Leu Gly Ile Cys Leu Thr Ser
770 775 780
Thr Val Gln Leu Ile Thr Gln Leu Met Pro Phe Gly Cys Leu Leu Asp
785 790 795 800
Tyr Val Arg Glu His Lys Asp Asn Ile Gly Ser Gln Tyr Leu Leu Asn
805 810 815
Trp Cys Val Gln Ile Ala Lys Gly Met Asn Tyr Leu Glu Asp Arg Arg
820 825 830
Leu Val His Arg Asp Leu Ala Ala Arg Asn Val Leu Val Lys Thr Pro
835 840 845
Gln His Val Lys Ile Thr Asp Phe Gly Leu Ala Lys Leu Leu Gly Ala
850 855 860
Glu Glu Lys Glu Tyr His Ala Glu Gly Gly Lys Val Pro Ile Lys Trp
865 870 875 880
Met Ala Leu Glu Ser Ile Leu His Arg Ile Tyr Thr His Gln Ser Asp
885 890 895
Val Trp Ser Tyr Gly Val Thr Val Trp Glu Leu Met Thr Phe Gly Ser
900 905 910
Lys Pro Tyr Asp Gly Ile Pro Ala Ser Glu Ile Ser Ser Ile Leu Glu
915 920 925
Lys Gly Glu Arg Leu Pro Gln Pro Pro Ile Cys Thr Ile Asp Val Tyr
930 935 940
Met Ile Met Val Lys Cys Trp Met Ile Asp Ala Asp Ser Arg Pro Lys
945 950 955 960
Phe Arg Glu Leu Ile Ile Glu Phe Ser Lys Met Ala Arg Asp Pro Gln
965 970 975
Arg Tyr Leu Val Ile Gln Gly Asp Glu Arg Met His Leu Pro Ser Pro
980 985 990
Thr Asp Ser Asn Phe Tyr Arg Ala Leu Met Asp Glu Glu Asp Met Asp
995 1000 1005
Asp Val Val Asp Ala Asp Glu Tyr Leu Ile Pro Gln Gln Gly Phe Phe
1010 1015 1020
Ser Ser Pro Ser Thr Ser Arg Thr Pro Leu Leu Ser Ser Leu Ser Ala
1025 1030 1035 1040
Thr Ser Asn Asn Ser Thr Val Ala Cys Ile Asp Arg Asn Gly Leu Gln
1045 1050 1055
Ser Cys Pro Ile Lys Glu Asp Ser Phe Leu Gln Arg Tyr Ser Ser Asp
1060 1065 1070
Pro Thr Gly Ala Leu Thr Glu Asp Ser Ile Asp Asp Thr Phe Leu Pro
1075 1080 1085
Val Pro Glu Tyr Ile Asn Gln Ser Val Pro Lys Arg Pro Ala Gly Ser
1090 1095 1100
Val Gln Asn Pro Val Tyr His Asn Gln Pro Leu Asn Pro Ala Pro Ser
1105 1110 1115 1120
Arg Asp Pro His Tyr Gln Asp Pro His Ser Thr Ala Val Gly Asn Pro
1125 1130 1135
Glu Tyr Leu Asn Thr Val Gln Pro Thr Cys Val Asn Ser Thr Phe Asp
1140 1145 1150
Ser Pro Ala His Trp Ala Gln Lys Gly Ser His Gln Ile Ser Leu Asp
1155 1160 1165
Asn Pro Asp Tyr Gln Gln Asp Phe Phe Pro Lys Glu Ala Lys Pro Asn
1170 1175 1180
Gly Ile Phe Lys Gly Ser Thr Ala Glu Asn Ala Glu Tyr Leu Arg Val
1185 1190 1195 1200
Ala Pro Gln Ser Ser Glu Phe Ile Gly Ala
1205 1210
<210> 41
<211> 1186
<212> PRT
<213> Homo sapiens
<220>
<223> Mature human EGFR/HER1 (minus the signal peptide)
<220>
<221> DOMAIN
<222> (1)...(621)
<223> Extracellular domain (ECD)
<220>
<221> DOMAIN
<222> (1)...(165)
<223> domain I of ECD
<220>
<221> DOMAIN
<222> (166)...(313)
<223> domain II of ECD
<220>
<221> DOMAIN
<222> (314)...(481)
<223> domain III of ECD
<220>
<221> DOMAIN
<222> (482)...(621)
<223> domain IV of ECD
<400> 41
Leu Glu Glu Lys Lys Val Cys Gln Gly Thr Ser Asn Lys Leu Thr Gln
1 5 10 15
Leu Gly Thr Phe Glu Asp His Phe Leu Ser Leu Gln Arg Met Phe Asn
20 25 30
Asn Cys Glu Val Val Leu Gly Asn Leu Glu Ile Thr Tyr Val Gln Arg
35 40 45
Asn Tyr Asp Leu Ser Phe Leu Lys Thr Ile Gln Glu Val Ala Gly Tyr
50 55 60
Val Leu Ile Ala Leu Asn Thr Val Glu Arg Ile Pro Leu Glu Asn Leu
65 70 75 80
Gln Ile Ile Arg Gly Asn Met Tyr Tyr Glu Asn Ser Tyr Ala Leu Ala
85 90 95
Val Leu Ser Asn Tyr Asp Ala Asn Lys Thr Gly Leu Lys Glu Leu Pro
100 105 110
Met Arg Asn Leu Gln Glu Ile Leu His Gly Ala Val Arg Phe Ser Asn
115 120 125
Asn Pro Ala Leu Cys Asn Val Glu Ser Ile Gln Trp Arg Asp Ile Val
130 135 140
Ser Ser Asp Phe Leu Ser Asn Met Ser Met Asp Phe Gln Asn His Leu
145 150 155 160
Gly Ser Cys Gln Lys Cys Asp Pro Ser Cys Pro Asn Gly Ser Cys Trp
165 170 175
Gly Ala Gly Glu Glu Asn Cys Gln Lys Leu Thr Lys Ile Ile Cys Ala
180 185 190
Gln Gln Cys Ser Gly Arg Cys Arg Gly Lys Ser Pro Ser Asp Cys Cys
195 200 205
His Asn Gln Cys Ala Ala Gly Cys Thr Gly Pro Arg Glu Ser Asp Cys
210 215 220
Leu Val Cys Arg Lys Phe Arg Asp Glu Ala Thr Cys Lys Asp Thr Cys
225 230 235 240
Pro Pro Leu Met Leu Tyr Asn Pro Thr Thr Tyr Gln Met Asp Val Asn
245 250 255
Pro Glu Gly Lys Tyr Ser Phe Gly Ala Thr Cys Val Lys Lys Cys Pro
260 265 270
Arg Asn Tyr Val Val Thr Asp His Gly Ser Cys Val Arg Ala Cys Gly
275 280 285
Ala Asp Ser Tyr Glu Met Glu Glu Asp Gly Val Arg Lys Cys Lys Lys
290 295 300
Cys Glu Gly Pro Cys Arg Lys Val Cys Asn Gly Ile Gly Ile Gly Glu
305 310 315 320
Phe Lys Asp Ser Leu Ser Ile Asn Ala Thr Asn Ile Lys His Phe Lys
325 330 335
Asn Cys Thr Ser Ile Ser Gly Asp Leu His Ile Leu Pro Val Ala Phe
340 345 350
Arg Gly Asp Ser Phe Thr His Thr Pro Pro Leu Asp Pro Gln Glu Leu
355 360 365
Asp Ile Leu Lys Thr Val Lys Glu Ile Thr Gly Phe Leu Leu Ile Gln
370 375 380
Ala Trp Pro Glu Asn Arg Thr Asp Leu His Ala Phe Glu Asn Leu Glu
385 390 395 400
Ile Ile Arg Gly Arg Thr Lys Gln His Gly Gln Phe Ser Leu Ala Val
405 410 415
Val Ser Leu Asn Ile Thr Ser Leu Gly Leu Arg Ser Leu Lys Glu Ile
420 425 430
Ser Asp Gly Asp Val Ile Ile Ser Gly Asn Lys Asn Leu Cys Tyr Ala
435 440 445
Asn Thr Ile Asn Trp Lys Lys Leu Phe Gly Thr Ser Gly Gln Lys Thr
450 455 460
Lys Ile Ile Ser Asn Arg Gly Glu Asn Ser Cys Lys Ala Thr Gly Gln
465 470 475 480
Val Cys His Ala Leu Cys Ser Pro Glu Gly Cys Trp Gly Pro Glu Pro
485 490 495
Arg Asp Cys Val Ser Cys Arg Asn Val Ser Arg Gly Arg Glu Cys Val
500 505 510
Asp Lys Cys Asn Leu Leu Glu Gly Glu Pro Arg Glu Phe Val Glu Asn
515 520 525
Ser Glu Cys Ile Gln Cys His Pro Glu Cys Leu Pro Gln Ala Met Asn
530 535 540
Ile Thr Cys Thr Gly Arg Gly Pro Asp Asn Cys Ile Gln Cys Ala His
545 550 555 560
Tyr Ile Asp Gly Pro His Cys Val Lys Thr Cys Pro Ala Gly Val Met
565 570 575
Gly Glu Asn Asn Thr Leu Val Trp Lys Tyr Ala Asp Ala Gly His Val
580 585 590
Cys His Leu Cys His Pro Asn Cys Thr Tyr Gly Cys Thr Gly Pro Gly
595 600 605
Leu Glu Gly Cys Pro Thr Asn Gly Pro Lys Ile Pro Ser Ile Ala Thr
610 615 620
Gly Met Val Gly Ala Leu Leu Leu Leu Leu Val Val Ala Leu Gly Ile
625 630 635 640
Gly Leu Phe Met Arg Arg Arg His Ile Val Arg Lys Arg Thr Leu Arg
645 650 655
Arg Leu Leu Gln Glu Arg Glu Leu Val Glu Pro Leu Thr Pro Ser Gly
660 665 670
Glu Ala Pro Asn Gln Ala Leu Leu Arg Ile Leu Lys Glu Thr Glu Phe
675 680 685
Lys Lys Ile Lys Val Leu Gly Ser Gly Ala Phe Gly Thr Val Tyr Lys
690 695 700
Gly Leu Trp Ile Pro Glu Gly Glu Lys Val Lys Ile Pro Val Ala Ile
705 710 715 720
Lys Glu Leu Arg Glu Ala Thr Ser Pro Lys Ala Asn Lys Glu Ile Leu
725 730 735
Asp Glu Ala Tyr Val Met Ala Ser Val Asp Asn Pro His Val Cys Arg
740 745 750
Leu Leu Gly Ile Cys Leu Thr Ser Thr Val Gln Leu Ile Thr Gln Leu
755 760 765
Met Pro Phe Gly Cys Leu Leu Asp Tyr Val Arg Glu His Lys Asp Asn
770 775 780
Ile Gly Ser Gln Tyr Leu Leu Asn Trp Cys Val Gln Ile Ala Lys Gly
785 790 795 800
Met Asn Tyr Leu Glu Asp Arg Arg Leu Val His Arg Asp Leu Ala Ala
805 810 815
Arg Asn Val Leu Val Lys Thr Pro Gln His Val Lys Ile Thr Asp Phe
820 825 830
Gly Leu Ala Lys Leu Leu Gly Ala Glu Glu Lys Glu Tyr His Ala Glu
835 840 845
Gly Gly Lys Val Pro Ile Lys Trp Met Ala Leu Glu Ser Ile Leu His
850 855 860
Arg Ile Tyr Thr His Gln Ser Asp Val Trp Ser Tyr Gly Val Thr Val
865 870 875 880
Trp Glu Leu Met Thr Phe Gly Ser Lys Pro Tyr Asp Gly Ile Pro Ala
885 890 895
Ser Glu Ile Ser Ser Ile Leu Glu Lys Gly Glu Arg Leu Pro Gln Pro
900 905 910
Pro Ile Cys Thr Ile Asp Val Tyr Met Ile Met Val Lys Cys Trp Met
915 920 925
Ile Asp Ala Asp Ser Arg Pro Lys Phe Arg Glu Leu Ile Ile Glu Phe
930 935 940
Ser Lys Met Ala Arg Asp Pro Gln Arg Tyr Leu Val Ile Gln Gly Asp
945 950 955 960
Glu Arg Met His Leu Pro Ser Pro Thr Asp Ser Asn Phe Tyr Arg Ala
965 970 975
Leu Met Asp Glu Glu Asp Met Asp Asp Val Val Asp Ala Asp Glu Tyr
980 985 990
Leu Ile Pro Gln Gln Gly Phe Phe Ser Ser Pro Ser Thr Ser Arg Thr
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1010 1015 1020
Cys Ile Asp Arg Asn Gly Leu Gln Ser Cys Pro Ile Lys Glu Asp Ser
1025 1030 1035 1040
Phe Leu Gln Arg Tyr Ser Ser Asp Pro Thr Gly Ala Leu Thr Glu Asp
1045 1050 1055
Ser Ile Asp Asp Thr Phe Leu Pro Val Pro Glu Tyr Ile Asn Gln Ser
1060 1065 1070
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Gly Ser His Gln Ile Ser Leu Asp Asn Pro Asp Tyr Gln Gln Asp Phe
1140 1145 1150
Phe Pro Lys Glu Ala Lys Pro Asn Gly Ile Phe Lys Gly Ser Thr Ala
1155 1160 1165
Glu Asn Ala Glu Tyr Leu Arg Val Ala Pro Gln Ser Ser Glu Phe Ile
1170 1175 1180
Gly Ala
1185
<210> 42
<211> 1255
<212> PRT
<213> Homo sapiens
<220>
<223> Human HER2 (ErbB2) precursor
<220>
<221> SIGNAL
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<220>
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<220>
<221> DOMAIN
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<220>
<221> DOMAIN
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<220>
<221> DOMAIN
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195 200 205
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210 215 220
Ala Arg Cys Lys Gly Pro Leu Pro Thr Asp Cys Cys His Glu Gln Cys
225 230 235 240
Ala Ala Gly Cys Thr Gly Pro Lys His Ser Asp Cys Leu Ala Cys Leu
245 250 255
His Phe Asn His Ser Gly Ile Cys Glu Leu His Cys Pro Ala Leu Val
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275 280 285
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Ser Thr Asp Val Gly Ser Cys Thr Leu Val Cys Pro Leu His Asn Gln
305 310 315 320
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325 330 335
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340 345 350
Val Arg Ala Val Thr Ser Ala Asn Ile Gln Glu Phe Ala Gly Cys Lys
355 360 365
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370 375 380
Pro Ala Ser Asn Thr Ala Pro Leu Gln Pro Glu Gln Leu Gln Val Phe
385 390 395 400
Glu Thr Leu Glu Glu Ile Thr Gly Tyr Leu Tyr Ile Ser Ala Trp Pro
405 410 415
Asp Ser Leu Pro Asp Leu Ser Val Phe Gln Asn Leu Gln Val Ile Arg
420 425 430
Gly Arg Ile Leu His Asn Gly Ala Tyr Ser Leu Thr Leu Gln Gly Leu
435 440 445
Gly Ile Ser Trp Leu Gly Leu Arg Ser Leu Arg Glu Leu Gly Ser Gly
450 455 460
Leu Ala Leu Ile His His Asn Thr His Leu Cys Phe Val His Thr Val
465 470 475 480
Pro Trp Asp Gln Leu Phe Arg Asn Pro His Gln Ala Leu Leu His Thr
485 490 495
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500 505 510
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645 650 655
Ala Val Val Gly Ile Leu Leu Val Val Val Leu Gly Val Val Phe Gly
660 665 670
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675 680 685
Arg Leu Leu Gln Glu Thr Glu Leu Val Glu Pro Leu Thr Pro Ser Gly
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740 745 750
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785 790 795 800
Met Pro Tyr Gly Cys Leu Leu Asp His Val Arg Glu Asn Arg Gly Arg
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820 825 830
Met Ser Tyr Leu Glu Asp Val Arg Leu Val His Arg Asp Leu Ala Ala
835 840 845
Arg Asn Val Leu Val Lys Ser Pro Asn His Val Lys Ile Thr Asp Phe
850 855 860
Gly Leu Ala Arg Leu Leu Asp Ile Asp Glu Thr Glu Tyr His Ala Asp
865 870 875 880
Gly Gly Lys Val Pro Ile Lys Trp Met Ala Leu Glu Ser Ile Leu Arg
885 890 895
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915 920 925
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980 985 990
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995 1000 1005
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1025 1030 1035 1040
Gly Met Val His His Arg His Arg Ser Ser Ser Thr Arg Ser Gly Gly
1045 1050 1055
Gly Asp Leu Thr Leu Gly Leu Glu Pro Ser Glu Glu Glu Ala Pro Arg
1060 1065 1070
Ser Pro Leu Ala Pro Ser Glu Gly Ala Gly Ser Asp Val Phe Asp Gly
1075 1080 1085
Asp Leu Gly Met Gly Ala Ala Lys Gly Leu Gln Ser Leu Pro Thr His
1090 1095 1100
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1185 1190 1195 1200
Gly Gly Ala Ala Pro Gln Pro His Pro Pro Pro Ala Phe Ser Pro Ala
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Phe Asp Asn Leu Tyr Tyr Trp Asp Gln Asp Pro Pro Glu Arg Gly Ala
1220 1225 1230
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1235 1240 1245
Leu Gly Leu Asp Val Pro Val
1250 1255
<210> 43
<211> 1233
<212> PRT
<213> Homo sapiens
<220>
<223> Mature human HER2 (ErbB2) Protein (minus the
signal peptide)
<220>
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<220>
<221> DOMAIN
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<220>
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<220>
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<220>
<221> DOMAIN
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35 40 45
Leu Ser Phe Leu Gln Asp Ile Gln Glu Val Gln Gly Tyr Val Leu Ile
50 55 60
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65 70 75 80
Arg Gly Thr Gln Leu Phe Glu Asp Asn Tyr Ala Leu Ala Val Leu Asp
85 90 95
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100 105 110
Gly Gly Leu Arg Glu Leu Gln Leu Arg Ser Leu Thr Glu Ile Leu Lys
115 120 125
Gly Gly Val Leu Ile Gln Arg Asn Pro Gln Leu Cys Tyr Gln Asp Thr
130 135 140
Ile Leu Trp Lys Asp Ile Phe His Lys Asn Asn Gln Leu Ala Leu Thr
145 150 155 160
Leu Ile Asp Thr Asn Arg Ser Arg Ala Cys His Pro Cys Ser Pro Met
165 170 175
Cys Lys Gly Ser Arg Cys Trp Gly Glu Ser Ser Glu Asp Cys Gln Ser
180 185 190
Leu Thr Arg Thr Val Cys Ala Gly Gly Cys Ala Arg Cys Lys Gly Pro
195 200 205
Leu Pro Thr Asp Cys Cys His Glu Gln Cys Ala Ala Gly Cys Thr Gly
210 215 220
Pro Lys His Ser Asp Cys Leu Ala Cys Leu His Phe Asn His Ser Gly
225 230 235 240
Ile Cys Glu Leu His Cys Pro Ala Leu Val Thr Tyr Asn Thr Asp Thr
245 250 255
Phe Glu Ser Met Pro Asn Pro Glu Gly Arg Tyr Thr Phe Gly Ala Ser
260 265 270
Cys Val Thr Ala Cys Pro Tyr Asn Tyr Leu Ser Thr Asp Val Gly Ser
275 280 285
Cys Thr Leu Val Cys Pro Leu His Asn Gln Glu Val Thr Ala Glu Asp
290 295 300
Gly Thr Gln Arg Cys Glu Lys Cys Ser Lys Pro Cys Ala Arg Val Cys
305 310 315 320
Tyr Gly Leu Gly Met Glu His Leu Arg Glu Val Arg Ala Val Thr Ser
325 330 335
Ala Asn Ile Gln Glu Phe Ala Gly Cys Lys Lys Ile Phe Gly Ser Leu
340 345 350
Ala Phe Leu Pro Glu Ser Phe Asp Gly Asp Pro Ala Ser Asn Thr Ala
355 360 365
Pro Leu Gln Pro Glu Gln Leu Gln Val Phe Glu Thr Leu Glu Glu Ile
370 375 380
Thr Gly Tyr Leu Tyr Ile Ser Ala Trp Pro Asp Ser Leu Pro Asp Leu
385 390 395 400
Ser Val Phe Gln Asn Leu Gln Val Ile Arg Gly Arg Ile Leu His Asn
405 410 415
Gly Ala Tyr Ser Leu Thr Leu Gln Gly Leu Gly Ile Ser Trp Leu Gly
420 425 430
Leu Arg Ser Leu Arg Glu Leu Gly Ser Gly Leu Ala Leu Ile His His
435 440 445
Asn Thr His Leu Cys Phe Val His Thr Val Pro Trp Asp Gln Leu Phe
450 455 460
Arg Asn Pro His Gln Ala Leu Leu His Thr Ala Asn Arg Pro Glu Asp
465 470 475 480
Glu Cys Val Gly Glu Gly Leu Ala Cys His Gln Leu Cys Ala Arg Gly
485 490 495
His Cys Trp Gly Pro Gly Pro Thr Gln Cys Val Asn Cys Ser Gln Phe
500 505 510
Leu Arg Gly Gln Glu Cys Val Glu Glu Cys Arg Val Leu Gln Gly Leu
515 520 525
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530 535 540
Cys Gln Pro Gln Asn Gly Ser Val Thr Cys Phe Gly Pro Glu Ala Asp
545 550 555 560
Gln Cys Val Ala Cys Ala His Tyr Lys Asp Pro Pro Phe Cys Val Ala
565 570 575
Arg Cys Pro Ser Gly Val Lys Pro Asp Leu Ser Tyr Met Pro Ile Trp
580 585 590
Lys Phe Pro Asp Glu Glu Gly Ala Cys Gln Pro Cys Pro Ile Asn Cys
595 600 605
Thr His Ser Cys Val Asp Leu Asp Asp Lys Gly Cys Pro Ala Glu Gln
610 615 620
Arg Ala Ser Pro Leu Thr Ser Ile Ile Ser Ala Val Val Gly Ile Leu
625 630 635 640
Leu Val Val Val Leu Gly Val Val Phe Gly Ile Leu Ile Lys Arg Arg
645 650 655
Gln Gln Lys Ile Arg Lys Tyr Thr Met Arg Arg Leu Leu Gln Glu Thr
660 665 670
Glu Leu Val Glu Pro Leu Thr Pro Ser Gly Ala Met Pro Asn Gln Ala
675 680 685
Gln Met Arg Ile Leu Lys Glu Thr Glu Leu Arg Lys Val Lys Val Leu
690 695 700
Gly Ser Gly Ala Phe Gly Thr Val Tyr Lys Gly Ile Trp Ile Pro Asp
705 710 715 720
Gly Glu Asn Val Lys Ile Pro Val Ala Ile Lys Val Leu Arg Glu Asn
725 730 735
Thr Ser Pro Lys Ala Asn Lys Glu Ile Leu Asp Glu Ala Tyr Val Met
740 745 750
Ala Gly Val Gly Ser Pro Tyr Val Ser Arg Leu Leu Gly Ile Cys Leu
755 760 765
Thr Ser Thr Val Gln Leu Val Thr Gln Leu Met Pro Tyr Gly Cys Leu
770 775 780
Leu Asp His Val Arg Glu Asn Arg Gly Arg Leu Gly Ser Gln Asp Leu
785 790 795 800
Leu Asn Trp Cys Met Gln Ile Ala Lys Gly Met Ser Tyr Leu Glu Asp
805 810 815
Val Arg Leu Val His Arg Asp Leu Ala Ala Arg Asn Val Leu Val Lys
820 825 830
Ser Pro Asn His Val Lys Ile Thr Asp Phe Gly Leu Ala Arg Leu Leu
835 840 845
Asp Ile Asp Glu Thr Glu Tyr His Ala Asp Gly Gly Lys Val Pro Ile
850 855 860
Lys Trp Met Ala Leu Glu Ser Ile Leu Arg Arg Arg Phe Thr His Gln
865 870 875 880
Ser Asp Val Trp Ser Tyr Gly Val Thr Val Trp Glu Leu Met Thr Phe
885 890 895
Gly Ala Lys Pro Tyr Asp Gly Ile Pro Ala Arg Glu Ile Pro Asp Leu
900 905 910
Leu Glu Lys Gly Glu Arg Leu Pro Gln Pro Pro Ile Cys Thr Ile Asp
915 920 925
Val Tyr Met Ile Met Val Lys Cys Trp Met Ile Asp Ser Glu Cys Arg
930 935 940
Pro Arg Phe Arg Glu Leu Val Ser Glu Phe Ser Arg Met Ala Arg Asp
945 950 955 960
Pro Gln Arg Phe Val Val Ile Gln Asn Glu Asp Leu Gly Pro Ala Ser
965 970 975
Pro Leu Asp Ser Thr Phe Tyr Arg Ser Leu Leu Glu Asp Asp Asp Met
980 985 990
Gly Asp Leu Val Asp Ala Glu Glu Tyr Leu Val Pro Gln Gln Gly Phe
995 1000 1005
Phe Cys Pro Asp Pro Ala Pro Gly Ala Gly Gly Met Val His His Arg
1010 1015 1020
His Arg Ser Ser Ser Thr Arg Ser Gly Gly Gly Asp Leu Thr Leu Gly
1025 1030 1035 1040
Leu Glu Pro Ser Glu Glu Glu Ala Pro Arg Ser Pro Leu Ala Pro Ser
1045 1050 1055
Glu Gly Ala Gly Ser Asp Val Phe Asp Gly Asp Leu Gly Met Gly Ala
1060 1065 1070
Ala Lys Gly Leu Gln Ser Leu Pro Thr His Asp Pro Ser Pro Leu Gln
1075 1080 1085
Arg Tyr Ser Glu Asp Pro Thr Val Pro Leu Pro Ser Glu Thr Asp Gly
1090 1095 1100
Tyr Val Ala Pro Leu Thr Cys Ser Pro Gln Pro Glu Tyr Val Asn Gln
1105 1110 1115 1120
Pro Asp Val Arg Pro Gln Pro Pro Ser Pro Arg Glu Gly Pro Leu Pro
1125 1130 1135
Ala Ala Arg Pro Ala Gly Ala Thr Leu Glu Arg Pro Lys Thr Leu Ser
1140 1145 1150
Pro Gly Lys Asn Gly Val Val Lys Asp Val Phe Ala Phe Gly Gly Ala
1155 1160 1165
Val Glu Asn Pro Glu Tyr Leu Thr Pro Gln Gly Gly Ala Ala Pro Gln
1170 1175 1180
Pro His Pro Pro Pro Ala Phe Ser Pro Ala Phe Asp Asn Leu Tyr Tyr
1185 1190 1195 1200
Trp Asp Gln Asp Pro Pro Glu Arg Gly Ala Pro Pro Ser Thr Phe Lys
1205 1210 1215
Gly Thr Pro Thr Ala Glu Asn Pro Glu Tyr Leu Gly Leu Asp Val Pro
1220 1225 1230
Val
<210> 44
<211> 1342
<212> PRT
<213> Homo sapiens
<220>
<223> Human HER3 (ErbB3) precursor
<220>
<221> SIGNAL
<222> (1)...(19)
<223> signal peptide
<220>
<221> DOMAIN
<222> (20)...(643)
<223> Extracellular domain (ECD)
<220>
<221> DOMAIN
<222> (644)...(664)
<223> transmembrane region
<220>
<221> DOMAIN
<222> (665)...(1342)
<223> cytoplasmic domain
<220>
<221> DOMAIN
<222> (709)...(966)
<223> protein kinase
<400> 44
Met Arg Ala Asn Asp Ala Leu Gln Val Leu Gly Leu Leu Phe Ser Leu
1 5 10 15
Ala Arg Gly Ser Glu Val Gly Asn Ser Gln Ala Val Cys Pro Gly Thr
20 25 30
Leu Asn Gly Leu Ser Val Thr Gly Asp Ala Glu Asn Gln Tyr Gln Thr
35 40 45
Leu Tyr Lys Leu Tyr Glu Arg Cys Glu Val Val Met Gly Asn Leu Glu
50 55 60
Ile Val Leu Thr Gly His Asn Ala Asp Leu Ser Phe Leu Gln Trp Ile
65 70 75 80
Arg Glu Val Thr Gly Tyr Val Leu Val Ala Met Asn Glu Phe Ser Thr
85 90 95
Leu Pro Leu Pro Asn Leu Arg Val Val Arg Gly Thr Gln Val Tyr Asp
100 105 110
Gly Lys Phe Ala Ile Phe Val Met Leu Asn Tyr Asn Thr Asn Ser Ser
115 120 125
His Ala Leu Arg Gln Leu Arg Leu Thr Gln Leu Thr Glu Ile Leu Ser
130 135 140
Gly Gly Val Tyr Ile Glu Lys Asn Asp Lys Leu Cys His Met Asp Thr
145 150 155 160
Ile Asp Trp Arg Asp Ile Val Arg Asp Arg Asp Ala Glu Ile Val Val
165 170 175
Lys Asp Asn Gly Arg Ser Cys Pro Pro Cys His Glu Val Cys Lys Gly
180 185 190
Arg Cys Trp Gly Pro Gly Ser Glu Asp Cys Gln Thr Leu Thr Lys Thr
195 200 205
Ile Cys Ala Pro Gln Cys Asn Gly His Cys Phe Gly Pro Asn Pro Asn
210 215 220
Gln Cys Cys His Asp Glu Cys Ala Gly Gly Cys Ser Gly Pro Gln Asp
225 230 235 240
Thr Asp Cys Phe Ala Cys Arg His Phe Asn Asp Ser Gly Ala Cys Val
245 250 255
Pro Arg Cys Pro Gln Pro Leu Val Tyr Asn Lys Leu Thr Phe Gln Leu
260 265 270
Glu Pro Asn Pro His Thr Lys Tyr Gln Tyr Gly Gly Val Cys Val Ala
275 280 285
Ser Cys Pro His Asn Phe Val Val Asp Gln Thr Ser Cys Val Arg Ala
290 295 300
Cys Pro Pro Asp Lys Met Glu Val Asp Lys Asn Gly Leu Lys Met Cys
305 310 315 320
Glu Pro Cys Gly Gly Leu Cys Pro Lys Ala Cys Glu Gly Thr Gly Ser
325 330 335
Gly Ser Arg Phe Gln Thr Val Asp Ser Ser Asn Ile Asp Gly Phe Val
340 345 350
Asn Cys Thr Lys Ile Leu Gly Asn Leu Asp Phe Leu Ile Thr Gly Leu
355 360 365
Asn Gly Asp Pro Trp His Lys Ile Pro Ala Leu Asp Pro Glu Lys Leu
370 375 380
Asn Val Phe Arg Thr Val Arg Glu Ile Thr Gly Tyr Leu Asn Ile Gln
385 390 395 400
Ser Trp Pro Pro His Met His Asn Phe Ser Val Phe Ser Asn Leu Thr
405 410 415
Thr Ile Gly Gly Arg Ser Leu Tyr Asn Arg Gly Phe Ser Leu Leu Ile
420 425 430
Met Lys Asn Leu Asn Val Thr Ser Leu Gly Phe Arg Ser Leu Lys Glu
435 440 445
Ile Ser Ala Gly Arg Ile Tyr Ile Ser Ala Asn Arg Gln Leu Cys Tyr
450 455 460
His His Ser Leu Asn Trp Thr Lys Val Leu Arg Gly Pro Thr Glu Glu
465 470 475 480
Arg Leu Asp Ile Lys His Asn Arg Pro Arg Arg Asp Cys Val Ala Glu
485 490 495
Gly Lys Val Cys Asp Pro Leu Cys Ser Ser Gly Gly Cys Trp Gly Pro
500 505 510
Gly Pro Gly Gln Cys Leu Ser Cys Arg Asn Tyr Ser Arg Gly Gly Val
515 520 525
Cys Val Thr His Cys Asn Phe Leu Asn Gly Glu Pro Arg Glu Phe Ala
530 535 540
His Glu Ala Glu Cys Phe Ser Cys His Pro Glu Cys Gln Pro Met Glu
545 550 555 560
Gly Thr Ala Thr Cys Asn Gly Ser Gly Ser Asp Thr Cys Ala Gln Cys
565 570 575
Ala His Phe Arg Asp Gly Pro His Cys Val Ser Ser Cys Pro His Gly
580 585 590
Val Leu Gly Ala Lys Gly Pro Ile Tyr Lys Tyr Pro Asp Val Gln Asn
595 600 605
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610 615 620
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625 630 635 640
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645 650 655
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660 665 670
Asn Lys Arg Ala Met Arg Arg Tyr Leu Glu Arg Gly Glu Ser Ile Glu
675 680 685
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705 710 715 720
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725 730 735
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740 745 750
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755 760 765
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770 775 780
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820 825 830
Arg Asn Leu Ala Ala Arg Asn Val Leu Leu Lys Ser Pro Ser Gln Val
835 840 845
Gln Val Ala Asp Phe Gly Val Ala Asp Leu Leu Pro Pro Asp Asp Lys
850 855 860
Gln Leu Leu Tyr Ser Glu Ala Lys Thr Pro Ile Lys Trp Met Ala Leu
865 870 875 880
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885 890 895
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900 905 910
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915 920 925
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930 935 940
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945 950 955 960
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Gly Ser Ser Glu Arg Cys Pro Arg Pro Val Ser Leu His Pro Met Pro
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Arg Gly Cys Leu Ala Ser Glu Ser Ser Glu Gly His Val Thr Gly Ser
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Glu Ala Glu Leu Gln Glu Lys Val Ser Met Cys Arg Ser Arg Ser Arg
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Ser Arg Ser Pro Arg Pro Arg Gly Asp Ser Ala Tyr His Ser Gln Arg
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1220 1225 1230
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1235 1240 1245
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1250 1255 1260
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1315 1320 1325
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1330 1335 1340
<210> 45
<211> 1323
<212> PRT
<213> Homo sapiens
<220>
<223> Mature human HER3 (ErbB3) protein (minus the
signal peptide)
<220>
<221> DOMAIN
<222> (1)...(621)
<223> Extracellular domain (ECD)
<220>
<221> DOMAIN
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<220>
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<220>
<221> DOMAIN
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<220>
<221> DOMAIN
<222> (481)...(621)
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<400> 45
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Leu Ser Val Thr Gly Asp Ala Glu Asn Gln Tyr Gln Thr Leu Tyr Lys
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35 40 45
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100 105 110
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115 120 125
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130 135 140
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210 215 220
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225 230 235 240
Pro Gln Pro Leu Val Tyr Asn Lys Leu Thr Phe Gln Leu Glu Pro Asn
245 250 255
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260 265 270
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275 280 285
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290 295 300
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305 310 315 320
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325 330 335
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340 345 350
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355 360 365
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370 375 380
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385 390 395 400
Gly Arg Ser Leu Tyr Asn Arg Gly Phe Ser Leu Leu Ile Met Lys Asn
405 410 415
Leu Asn Val Thr Ser Leu Gly Phe Arg Ser Leu Lys Glu Ile Ser Ala
420 425 430
Gly Arg Ile Tyr Ile Ser Ala Asn Arg Gln Leu Cys Tyr His His Ser
435 440 445
Leu Asn Trp Thr Lys Val Leu Arg Gly Pro Thr Glu Glu Arg Leu Asp
450 455 460
Ile Lys His Asn Arg Pro Arg Arg Asp Cys Val Ala Glu Gly Lys Val
465 470 475 480
Cys Asp Pro Leu Cys Ser Ser Gly Gly Cys Trp Gly Pro Gly Pro Gly
485 490 495
Gln Cys Leu Ser Cys Arg Asn Tyr Ser Arg Gly Gly Val Cys Val Thr
500 505 510
His Cys Asn Phe Leu Asn Gly Glu Pro Arg Glu Phe Ala His Glu Ala
515 520 525
Glu Cys Phe Ser Cys His Pro Glu Cys Gln Pro Met Glu Gly Thr Ala
530 535 540
Thr Cys Asn Gly Ser Gly Ser Asp Thr Cys Ala Gln Cys Ala His Phe
545 550 555 560
Arg Asp Gly Pro His Cys Val Ser Ser Cys Pro His Gly Val Leu Gly
565 570 575
Ala Lys Gly Pro Ile Tyr Lys Tyr Pro Asp Val Gln Asn Glu Cys Arg
580 585 590
Pro Cys His Glu Asn Cys Thr Gln Gly Cys Lys Gly Pro Glu Leu Gln
595 600 605
Asp Cys Leu Gly Gln Thr Leu Val Leu Ile Gly Lys Thr His Leu Thr
610 615 620
Met Ala Leu Thr Val Ile Ala Gly Leu Val Val Ile Phe Met Met Leu
625 630 635 640
Gly Gly Thr Phe Leu Tyr Trp Arg Gly Arg Arg Ile Gln Asn Lys Arg
645 650 655
Ala Met Arg Arg Tyr Leu Glu Arg Gly Glu Ser Ile Glu Pro Leu Asp
660 665 670
Pro Ser Glu Lys Ala Asn Lys Val Leu Ala Arg Ile Phe Lys Glu Thr
675 680 685
Glu Leu Arg Lys Leu Lys Val Leu Gly Ser Gly Val Phe Gly Thr Val
690 695 700
His Lys Gly Val Trp Ile Pro Glu Gly Glu Ser Ile Lys Ile Pro Val
705 710 715 720
Cys Ile Lys Val Ile Glu Asp Lys Ser Gly Arg Gln Ser Phe Gln Ala
725 730 735
Val Thr Asp His Met Leu Ala Ile Gly Ser Leu Asp His Ala His Ile
740 745 750
Val Arg Leu Leu Gly Leu Cys Pro Gly Ser Ser Leu Gln Leu Val Thr
755 760 765
Gln Tyr Leu Pro Leu Gly Ser Leu Leu Asp His Val Arg Gln His Arg
770 775 780
Gly Ala Leu Gly Pro Gln Leu Leu Leu Asn Trp Gly Val Gln Ile Ala
785 790 795 800
Lys Gly Met Tyr Tyr Leu Glu Glu His Gly Met Val His Arg Asn Leu
805 810 815
Ala Ala Arg Asn Val Leu Leu Lys Ser Pro Ser Gln Val Gln Val Ala
820 825 830
Asp Phe Gly Val Ala Asp Leu Leu Pro Pro Asp Asp Lys Gln Leu Leu
835 840 845
Tyr Ser Glu Ala Lys Thr Pro Ile Lys Trp Met Ala Leu Glu Ser Ile
850 855 860
His Phe Gly Lys Tyr Thr His Gln Ser Asp Val Trp Ser Tyr Gly Val
865 870 875 880
Thr Val Trp Glu Leu Met Thr Phe Gly Ala Glu Pro Tyr Ala Gly Leu
885 890 895
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900 905 910
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915 920 925
Trp Met Ile Asp Glu Asn Ile Arg Pro Thr Phe Lys Glu Leu Ala Asn
930 935 940
Glu Phe Thr Arg Met Ala Arg Asp Pro Pro Arg Tyr Leu Val Ile Lys
945 950 955 960
Arg Glu Ser Gly Pro Gly Ile Ala Pro Gly Pro Glu Pro His Gly Leu
965 970 975
Thr Asn Lys Lys Leu Glu Glu Val Glu Leu Glu Pro Glu Leu Asp Leu
980 985 990
Asp Leu Asp Leu Glu Ala Glu Glu Asp Asn Leu Ala Thr Thr Thr Leu
995 1000 1005
Gly Ser Ala Leu Ser Leu Pro Val Gly Thr Leu Asn Arg Pro Arg Gly
1010 1015 1020
Ser Gln Ser Leu Leu Ser Pro Ser Ser Gly Tyr Met Pro Met Asn Gln
1025 1030 1035 1040
Gly Asn Leu Gly Glu Ser Cys Gln Glu Ser Ala Val Ser Gly Ser Ser
1045 1050 1055
Glu Arg Cys Pro Arg Pro Val Ser Leu His Pro Met Pro Arg Gly Cys
1060 1065 1070
Leu Ala Ser Glu Ser Ser Glu Gly His Val Thr Gly Ser Glu Ala Glu
1075 1080 1085
Leu Gln Glu Lys Val Ser Met Cys Arg Ser Arg Ser Arg Ser Arg Ser
1090 1095 1100
Pro Arg Pro Arg Gly Asp Ser Ala Tyr His Ser Gln Arg His Ser Leu
1105 1110 1115 1120
Leu Thr Pro Val Thr Pro Leu Ser Pro Pro Gly Leu Glu Glu Glu Asp
1125 1130 1135
Val Asn Gly Tyr Val Met Pro Asp Thr His Leu Lys Gly Thr Pro Ser
1140 1145 1150
Ser Arg Glu Gly Thr Leu Ser Ser Val Gly Leu Ser Ser Val Leu Gly
1155 1160 1165
Thr Glu Glu Glu Asp Glu Asp Glu Glu Tyr Glu Tyr Met Asn Arg Arg
1170 1175 1180
Arg Arg His Ser Pro Pro His Pro Pro Arg Pro Ser Ser Leu Glu Glu
1185 1190 1195 1200
Leu Gly Tyr Glu Tyr Met Asp Val Gly Ser Asp Leu Ser Ala Ser Leu
1205 1210 1215
Gly Ser Thr Gln Ser Cys Pro Leu His Pro Val Pro Ile Met Pro Thr
1220 1225 1230
Ala Gly Thr Thr Pro Asp Glu Asp Tyr Glu Tyr Met Asn Arg Gln Arg
1235 1240 1245
Asp Gly Gly Gly Pro Gly Gly Asp Tyr Ala Ala Met Gly Ala Cys Pro
1250 1255 1260
Ala Ser Glu Gln Gly Tyr Glu Glu Met Arg Ala Phe Gln Gly Pro Gly
1265 1270 1275 1280
His Gln Ala Pro His Val His Tyr Ala Arg Leu Lys Thr Leu Arg Ser
1285 1290 1295
Leu Glu Ala Thr Asp Ser Ala Phe Asp Asn Pro Asp Tyr Trp His Ser
1300 1305 1310
Arg Leu Phe Pro Lys Ala Asn Ala Gln Arg Thr
1315 1320
<210> 46
<211> 1308
<212> PRT
<213> Homo sapiens
<220>
<223> Human HER4 (ErbB4) precursor
<220>
<221> SIGNAL
<222> (1)...(25)
<223> signal peptide
<220>
<221> DOMAIN
<222> (26)...(651)
<223> extracellular domain (ECD)
<220>
<221> DOMAIN
<222> (652)...(675)
<223> transmembrane region
<220>
<221> DOMAIN
<222> (676)...(1308)
<223> cytoplasmic domain
<220>
<221> DOMAIN
<222> (718)...(985)
<223> protein kinase
<400> 46
Met Lys Pro Ala Thr Gly Leu Trp Val Trp Val Ser Leu Leu Val Ala
1 5 10 15
Ala Gly Thr Val Gln Pro Ser Asp Ser Gln Ser Val Cys Ala Gly Thr
20 25 30
Glu Asn Lys Leu Ser Ser Leu Ser Asp Leu Glu Gln Gln Tyr Arg Ala
35 40 45
Leu Arg Lys Tyr Tyr Glu Asn Cys Glu Val Val Met Gly Asn Leu Glu
50 55 60
Ile Thr Ser Ile Glu His Asn Arg Asp Leu Ser Phe Leu Arg Ser Val
65 70 75 80
Arg Glu Val Thr Gly Tyr Val Leu Val Ala Leu Asn Gln Phe Arg Tyr
85 90 95
Leu Pro Leu Glu Asn Leu Arg Ile Ile Arg Gly Thr Lys Leu Tyr Glu
100 105 110
Asp Arg Tyr Ala Leu Ala Ile Phe Leu Asn Tyr Arg Lys Asp Gly Asn
115 120 125
Phe Gly Leu Gln Glu Leu Gly Leu Lys Asn Leu Thr Glu Ile Leu Asn
130 135 140
Gly Gly Val Tyr Val Asp Gln Asn Lys Phe Leu Cys Tyr Ala Asp Thr
145 150 155 160
Ile His Trp Gln Asp Ile Val Arg Asn Pro Trp Pro Ser Asn Leu Thr
165 170 175
Leu Val Ser Thr Asn Gly Ser Ser Gly Cys Gly Arg Cys His Lys Ser
180 185 190
Cys Thr Gly Arg Cys Trp Gly Pro Thr Glu Asn His Cys Gln Thr Leu
195 200 205
Thr Arg Thr Val Cys Ala Glu Gln Cys Asp Gly Arg Cys Tyr Gly Pro
210 215 220
Tyr Val Ser Asp Cys Cys His Arg Glu Cys Ala Gly Gly Cys Ser Gly
225 230 235 240
Pro Lys Asp Thr Asp Cys Phe Ala Cys Met Asn Phe Asn Asp Ser Gly
245 250 255
Ala Cys Val Thr Gln Cys Pro Gln Thr Phe Val Tyr Asn Pro Thr Thr
260 265 270
Phe Gln Leu Glu His Asn Phe Asn Ala Lys Tyr Thr Tyr Gly Ala Phe
275 280 285
Cys Val Lys Lys Cys Pro His Asn Phe Val Val Asp Ser Ser Ser Cys
290 295 300
Val Arg Ala Cys Pro Ser Ser Lys Met Glu Val Glu Glu Asn Gly Ile
305 310 315 320
Lys Met Cys Lys Pro Cys Thr Asp Ile Cys Pro Lys Ala Cys Asp Gly
325 330 335
Ile Gly Thr Gly Ser Leu Met Ser Ala Gln Thr Val Asp Ser Ser Asn
340 345 350
Ile Asp Lys Phe Ile Asn Cys Thr Lys Ile Asn Gly Asn Leu Ile Phe
355 360 365
Leu Val Thr Gly Ile His Gly Asp Pro Tyr Asn Ala Ile Glu Ala Ile
370 375 380
Asp Pro Glu Lys Leu Asn Val Phe Arg Thr Val Arg Glu Ile Thr Gly
385 390 395 400
Phe Leu Asn Ile Gln Ser Trp Pro Pro Asn Met Thr Asp Phe Ser Val
405 410 415
Phe Ser Asn Leu Val Thr Ile Gly Gly Arg Val Leu Tyr Ser Gly Leu
420 425 430
Ser Leu Leu Ile Leu Lys Gln Gln Gly Ile Thr Ser Leu Gln Phe Gln
435 440 445
Ser Leu Lys Glu Ile Ser Ala Gly Asn Ile Tyr Ile Thr Asp Asn Ser
450 455 460
Asn Leu Cys Tyr Tyr His Thr Ile Asn Trp Thr Thr Leu Phe Ser Thr
465 470 475 480
Ile Asn Gln Arg Ile Val Ile Arg Asp Asn Arg Lys Ala Glu Asn Cys
485 490 495
Thr Ala Glu Gly Met Val Cys Asn His Leu Cys Ser Ser Asp Gly Cys
500 505 510
Trp Gly Pro Gly Pro Asp Gln Cys Leu Ser Cys Arg Arg Phe Ser Arg
515 520 525
Gly Arg Ile Cys Ile Glu Ser Cys Asn Leu Tyr Asp Gly Glu Phe Arg
530 535 540
Glu Phe Glu Asn Gly Ser Ile Cys Val Glu Cys Asp Pro Gln Cys Glu
545 550 555 560
Lys Met Glu Asp Gly Leu Leu Thr Cys His Gly Pro Gly Pro Asp Asn
565 570 575
Cys Thr Lys Cys Ser His Phe Lys Asp Gly Pro Asn Cys Val Glu Lys
580 585 590
Cys Pro Asp Gly Leu Gln Gly Ala Asn Ser Phe Ile Phe Lys Tyr Ala
595 600 605
Asp Pro Asp Arg Glu Cys His Pro Cys His Pro Asn Cys Thr Gln Gly
610 615 620
Cys Asn Gly Pro Thr Ser His Asp Cys Ile Tyr Tyr Pro Trp Thr Gly
625 630 635 640
His Ser Thr Leu Pro Gln His Ala Arg Thr Pro Leu Ile Ala Ala Gly
645 650 655
Val Ile Gly Gly Leu Phe Ile Leu Val Ile Val Gly Leu Thr Phe Ala
660 665 670
Val Tyr Val Arg Arg Lys Ser Ile Lys Lys Lys Arg Ala Leu Arg Arg
675 680 685
Phe Leu Glu Thr Glu Leu Val Glu Pro Leu Thr Pro Ser Gly Thr Ala
690 695 700
Pro Asn Gln Ala Gln Leu Arg Ile Leu Lys Glu Thr Glu Leu Lys Arg
705 710 715 720
Val Lys Val Leu Gly Ser Gly Ala Phe Gly Thr Val Tyr Lys Gly Ile
725 730 735
Trp Val Pro Glu Gly Glu Thr Val Lys Ile Pro Val Ala Ile Lys Ile
740 745 750
Leu Asn Glu Thr Thr Gly Pro Lys Ala Asn Val Glu Phe Met Asp Glu
755 760 765
Ala Leu Ile Met Ala Ser Met Asp His Pro His Leu Val Arg Leu Leu
770 775 780
Gly Val Cys Leu Ser Pro Thr Ile Gln Leu Val Thr Gln Leu Met Pro
785 790 795 800
His Gly Cys Leu Leu Glu Tyr Val His Glu His Lys Asp Asn Ile Gly
805 810 815
Ser Gln Leu Leu Leu Asn Trp Cys Val Gln Ile Ala Lys Gly Met Met
820 825 830
Tyr Leu Glu Glu Arg Arg Leu Val His Arg Asp Leu Ala Ala Arg Asn
835 840 845
Val Leu Val Lys Ser Pro Asn His Val Lys Ile Thr Asp Phe Gly Leu
850 855 860
Ala Arg Leu Leu Glu Gly Asp Glu Lys Glu Tyr Asn Ala Asp Gly Gly
865 870 875 880
Lys Met Pro Ile Lys Trp Met Ala Leu Glu Cys Ile His Tyr Arg Lys
885 890 895
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900 905 910
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915 920 925
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930 935 940
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945 950 955 960
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965 970 975
Met Ala Arg Asp Pro Gln Arg Tyr Leu Val Ile Gln Gly Asp Asp Arg
980 985 990
Met Lys Leu Pro Ser Pro Asn Asp Ser Lys Phe Phe Gln Asn Leu Leu
995 1000 1005
Asp Glu Glu Asp Leu Glu Asp Met Met Asp Ala Glu Glu Tyr Leu Val
1010 1015 1020
Pro Gln Ala Phe Asn Ile Pro Pro Pro Ile Tyr Thr Ser Arg Ala Arg
1025 1030 1035 1040
Ile Asp Ser Asn Arg Ser Glu Ile Gly His Ser Pro Pro Pro Ala Tyr
1045 1050 1055
Thr Pro Met Ser Gly Asn Gln Phe Val Tyr Arg Asp Gly Gly Phe Ala
1060 1065 1070
Ala Glu Gln Gly Val Ser Val Pro Tyr Arg Ala Pro Thr Ser Thr Ile
1075 1080 1085
Pro Glu Ala Pro Val Ala Gln Gly Ala Thr Ala Glu Ile Phe Asp Asp
1090 1095 1100
Ser Cys Cys Asn Gly Thr Leu Arg Lys Pro Val Ala Pro His Val Gln
1105 1110 1115 1120
Glu Asp Ser Ser Thr Gln Arg Tyr Ser Ala Asp Pro Thr Val Phe Ala
1125 1130 1135
Pro Glu Arg Ser Pro Arg Gly Glu Leu Asp Glu Glu Gly Tyr Met Thr
1140 1145 1150
Pro Met Arg Asp Lys Pro Lys Gln Glu Tyr Leu Asn Pro Val Glu Glu
1155 1160 1165
Asn Pro Phe Val Ser Arg Arg Lys Asn Gly Asp Leu Gln Ala Leu Asp
1170 1175 1180
Asn Pro Glu Tyr His Asn Ala Ser Asn Gly Pro Pro Lys Ala Glu Asp
1185 1190 1195 1200
Glu Tyr Val Asn Glu Pro Leu Tyr Leu Asn Thr Phe Ala Asn Thr Leu
1205 1210 1215
Gly Lys Ala Glu Tyr Leu Lys Asn Asn Ile Leu Ser Met Pro Glu Lys
1220 1225 1230
Ala Lys Lys Ala Phe Asp Asn Pro Asp Tyr Trp Asn His Ser Leu Pro
1235 1240 1245
Pro Arg Ser Thr Leu Gln His Pro Asp Tyr Leu Gln Glu Tyr Ser Thr
1250 1255 1260
Lys Tyr Phe Tyr Lys Gln Asn Gly Arg Ile Arg Pro Ile Val Ala Glu
1265 1270 1275 1280
Asn Pro Glu Tyr Leu Ser Glu Phe Ser Leu Lys Pro Gly Thr Val Leu
1285 1290 1295
Pro Pro Pro Pro Tyr Arg His Arg Asn Thr Val Val
1300 1305
<210> 47
<211> 1283
<212> PRT
<213> Homo sapiens
<220>
<223> Mature human HER4 (ErbB4) protein (minus the
signal peptide)
<220>
<221> DOMAIN
<222> (1)...(625)
<223> Extracellular domain (ECD)
<220>
<221> DOMAIN
<222> (1)...(163)
<223> domain I of ECD
<220>
<221> DOMAIN
<222> (164)...(308)
<223> domain II of ECD
<220>
<221> DOMAIN
<222> (309)...(477)
<223> domain III of ECD
<220>
<221> DOMAIN
<222> (478)...(625)
<223> domain IV of ECD
<400> 47
Gln Ser Val Cys Ala Gly Thr Glu Asn Lys Leu Ser Ser Leu Ser Asp
1 5 10 15
Leu Glu Gln Gln Tyr Arg Ala Leu Arg Lys Tyr Tyr Glu Asn Cys Glu
20 25 30
Val Val Met Gly Asn Leu Glu Ile Thr Ser Ile Glu His Asn Arg Asp
35 40 45
Leu Ser Phe Leu Arg Ser Val Arg Glu Val Thr Gly Tyr Val Leu Val
50 55 60
Ala Leu Asn Gln Phe Arg Tyr Leu Pro Leu Glu Asn Leu Arg Ile Ile
65 70 75 80
Arg Gly Thr Lys Leu Tyr Glu Asp Arg Tyr Ala Leu Ala Ile Phe Leu
85 90 95
Asn Tyr Arg Lys Asp Gly Asn Phe Gly Leu Gln Glu Leu Gly Leu Lys
100 105 110
Asn Leu Thr Glu Ile Leu Asn Gly Gly Val Tyr Val Asp Gln Asn Lys
115 120 125
Phe Leu Cys Tyr Ala Asp Thr Ile His Trp Gln Asp Ile Val Arg Asn
130 135 140
Pro Trp Pro Ser Asn Leu Thr Leu Val Ser Thr Asn Gly Ser Ser Gly
145 150 155 160
Cys Gly Arg Cys His Lys Ser Cys Thr Gly Arg Cys Trp Gly Pro Thr
165 170 175
Glu Asn His Cys Gln Thr Leu Thr Arg Thr Val Cys Ala Glu Gln Cys
180 185 190
Asp Gly Arg Cys Tyr Gly Pro Tyr Val Ser Asp Cys Cys His Arg Glu
195 200 205
Cys Ala Gly Gly Cys Ser Gly Pro Lys Asp Thr Asp Cys Phe Ala Cys
210 215 220
Met Asn Phe Asn Asp Ser Gly Ala Cys Val Thr Gln Cys Pro Gln Thr
225 230 235 240
Phe Val Tyr Asn Pro Thr Thr Phe Gln Leu Glu His Asn Phe Asn Ala
245 250 255
Lys Tyr Thr Tyr Gly Ala Phe Cys Val Lys Lys Cys Pro His Asn Phe
260 265 270
Val Val Asp Ser Ser Ser Cys Val Arg Ala Cys Pro Ser Ser Lys Met
275 280 285
Glu Val Glu Glu Asn Gly Ile Lys Met Cys Lys Pro Cys Thr Asp Ile
290 295 300
Cys Pro Lys Ala Cys Asp Gly Ile Gly Thr Gly Ser Leu Met Ser Ala
305 310 315 320
Gln Thr Val Asp Ser Ser Asn Ile Asp Lys Phe Ile Asn Cys Thr Lys
325 330 335
Ile Asn Gly Asn Leu Ile Phe Leu Val Thr Gly Ile His Gly Asp Pro
340 345 350
Tyr Asn Ala Ile Glu Ala Ile Asp Pro Glu Lys Leu Asn Val Phe Arg
355 360 365
Thr Val Arg Glu Ile Thr Gly Phe Leu Asn Ile Gln Ser Trp Pro Pro
370 375 380
Asn Met Thr Asp Phe Ser Val Phe Ser Asn Leu Val Thr Ile Gly Gly
385 390 395 400
Arg Val Leu Tyr Ser Gly Leu Ser Leu Leu Ile Leu Lys Gln Gln Gly
405 410 415
Ile Thr Ser Leu Gln Phe Gln Ser Leu Lys Glu Ile Ser Ala Gly Asn
420 425 430
Ile Tyr Ile Thr Asp Asn Ser Asn Leu Cys Tyr Tyr His Thr Ile Asn
435 440 445
Trp Thr Thr Leu Phe Ser Thr Ile Asn Gln Arg Ile Val Ile Arg Asp
450 455 460
Asn Arg Lys Ala Glu Asn Cys Thr Ala Glu Gly Met Val Cys Asn His
465 470 475 480
Leu Cys Ser Ser Asp Gly Cys Trp Gly Pro Gly Pro Asp Gln Cys Leu
485 490 495
Ser Cys Arg Arg Phe Ser Arg Gly Arg Ile Cys Ile Glu Ser Cys Asn
500 505 510
Leu Tyr Asp Gly Glu Phe Arg Glu Phe Glu Asn Gly Ser Ile Cys Val
515 520 525
Glu Cys Asp Pro Gln Cys Glu Lys Met Glu Asp Gly Leu Leu Thr Cys
530 535 540
His Gly Pro Gly Pro Asp Asn Cys Thr Lys Cys Ser His Phe Lys Asp
545 550 555 560
Gly Pro Asn Cys Val Glu Lys Cys Pro Asp Gly Leu Gln Gly Ala Asn
565 570 575
Ser Phe Ile Phe Lys Tyr Ala Asp Pro Asp Arg Glu Cys His Pro Cys
580 585 590
His Pro Asn Cys Thr Gln Gly Cys Asn Gly Pro Thr Ser His Asp Cys
595 600 605
Ile Tyr Tyr Pro Trp Thr Gly His Ser Thr Leu Pro Gln His Ala Arg
610 615 620
Thr Pro Leu Ile Ala Ala Gly Val Ile Gly Gly Leu Phe Ile Leu Val
625 630 635 640
Ile Val Gly Leu Thr Phe Ala Val Tyr Val Arg Arg Lys Ser Ile Lys
645 650 655
Lys Lys Arg Ala Leu Arg Arg Phe Leu Glu Thr Glu Leu Val Glu Pro
660 665 670
Leu Thr Pro Ser Gly Thr Ala Pro Asn Gln Ala Gln Leu Arg Ile Leu
675 680 685
Lys Glu Thr Glu Leu Lys Arg Val Lys Val Leu Gly Ser Gly Ala Phe
690 695 700
Gly Thr Val Tyr Lys Gly Ile Trp Val Pro Glu Gly Glu Thr Val Lys
705 710 715 720
Ile Pro Val Ala Ile Lys Ile Leu Asn Glu Thr Thr Gly Pro Lys Ala
725 730 735
Asn Val Glu Phe Met Asp Glu Ala Leu Ile Met Ala Ser Met Asp His
740 745 750
Pro His Leu Val Arg Leu Leu Gly Val Cys Leu Ser Pro Thr Ile Gln
755 760 765
Leu Val Thr Gln Leu Met Pro His Gly Cys Leu Leu Glu Tyr Val His
770 775 780
Glu His Lys Asp Asn Ile Gly Ser Gln Leu Leu Leu Asn Trp Cys Val
785 790 795 800
Gln Ile Ala Lys Gly Met Met Tyr Leu Glu Glu Arg Arg Leu Val His
805 810 815
Arg Asp Leu Ala Ala Arg Asn Val Leu Val Lys Ser Pro Asn His Val
820 825 830
Lys Ile Thr Asp Phe Gly Leu Ala Arg Leu Leu Glu Gly Asp Glu Lys
835 840 845
Glu Tyr Asn Ala Asp Gly Gly Lys Met Pro Ile Lys Trp Met Ala Leu
850 855 860
Glu Cys Ile His Tyr Arg Lys Phe Thr His Gln Ser Asp Val Trp Ser
865 870 875 880
Tyr Gly Val Thr Ile Trp Glu Leu Met Thr Phe Gly Gly Lys Pro Tyr
885 890 895
Asp Gly Ile Pro Thr Arg Glu Ile Pro Asp Leu Leu Glu Lys Gly Glu
900 905 910
Arg Leu Pro Gln Pro Pro Ile Cys Thr Ile Asp Val Tyr Met Val Met
915 920 925
Val Lys Cys Trp Met Ile Asp Ala Asp Ser Arg Pro Lys Phe Lys Glu
930 935 940
Leu Ala Ala Glu Phe Ser Arg Met Ala Arg Asp Pro Gln Arg Tyr Leu
945 950 955 960
Val Ile Gln Gly Asp Asp Arg Met Lys Leu Pro Ser Pro Asn Asp Ser
965 970 975
Lys Phe Phe Gln Asn Leu Leu Asp Glu Glu Asp Leu Glu Asp Met Met
980 985 990
Asp Ala Glu Glu Tyr Leu Val Pro Gln Ala Phe Asn Ile Pro Pro Pro
995 1000 1005
Ile Tyr Thr Ser Arg Ala Arg Ile Asp Ser Asn Arg Ser Glu Ile Gly
1010 1015 1020
His Ser Pro Pro Pro Ala Tyr Thr Pro Met Ser Gly Asn Gln Phe Val
1025 1030 1035 1040
Tyr Arg Asp Gly Gly Phe Ala Ala Glu Gln Gly Val Ser Val Pro Tyr
1045 1050 1055
Arg Ala Pro Thr Ser Thr Ile Pro Glu Ala Pro Val Ala Gln Gly Ala
1060 1065 1070
Thr Ala Glu Ile Phe Asp Asp Ser Cys Cys Asn Gly Thr Leu Arg Lys
1075 1080 1085
Pro Val Ala Pro His Val Gln Glu Asp Ser Ser Thr Gln Arg Tyr Ser
1090 1095 1100
Ala Asp Pro Thr Val Phe Ala Pro Glu Arg Ser Pro Arg Gly Glu Leu
1105 1110 1115 1120
Asp Glu Glu Gly Tyr Met Thr Pro Met Arg Asp Lys Pro Lys Gln Glu
1125 1130 1135
Tyr Leu Asn Pro Val Glu Glu Asn Pro Phe Val Ser Arg Arg Lys Asn
1140 1145 1150
Gly Asp Leu Gln Ala Leu Asp Asn Pro Glu Tyr His Asn Ala Ser Asn
1155 1160 1165
Gly Pro Pro Lys Ala Glu Asp Glu Tyr Val Asn Glu Pro Leu Tyr Leu
1170 1175 1180
Asn Thr Phe Ala Asn Thr Leu Gly Lys Ala Glu Tyr Leu Lys Asn Asn
1185 1190 1195 1200
Ile Leu Ser Met Pro Glu Lys Ala Lys Lys Ala Phe Asp Asn Pro Asp
1205 1210 1215
Tyr Trp Asn His Ser Leu Pro Pro Arg Ser Thr Leu Gln His Pro Asp
1220 1225 1230
Tyr Leu Gln Glu Tyr Ser Thr Lys Tyr Phe Tyr Lys Gln Asn Gly Arg
1235 1240 1245
Ile Arg Pro Ile Val Ala Glu Asn Pro Glu Tyr Leu Ser Glu Phe Ser
1250 1255 1260
Leu Lys Pro Gly Thr Val Leu Pro Pro Pro Pro Tyr Arg His Arg Asn
1265 1270 1275 1280
Thr Val Val
<210> 48
<211> 16
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> cyclic FcRnBP
<400> 48
Gln Arg Phe Cys Thr Gly His Phe Gly Gly Leu Tyr Pro Cys Asn Gly
1 5 10 15
<210> 49
<211> 16
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> cyclic FcRnBP
<400> 49
Gln Arg Phe Cys Thr Gly His Phe Gly Gly Leu His Pro Cys Asn Gly
1 5 10 15
<210> 50
<211> 16
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> linear FcRnBP
<400> 50
Gln Arg Phe Val Thr Gly His Phe Gly Gly Leu Tyr Pro Ala Asn Gly
1 5 10 15
<210> 51
<211> 16
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> linear FcRnBP
<400> 51
Gln Arg Phe Val Thr Gly His Phe Gly Gly Leu His Pro Ala Asn Gly
1 5 10 15
<210> 52
<211> 108
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> DOM7h-11-3 (albumin-binding dAb)
<400> 52
Asp Ile Gln Met Thr Gln Ser Pro Ser Ser Leu Ser Ala Ser Val Gly
1 5 10 15
Asp Arg Val Thr Ile Thr Cys Arg Ala Ser Arg Pro Ile Gly Thr Thr
20 25 30
Leu Ser Trp Tyr Gln Gln Lys Pro Gly Lys Ala Pro Lys Leu Leu Ile
35 40 45
Leu Trp Asn Ser Arg Leu Gln Ser Gly Val Pro Ser Arg Phe Ser Gly
50 55 60
Ser Gly Ser Gly Thr Asp Phe Thr Leu Thr Ile Ser Ser Leu Gln Pro
65 70 75 80
Glu Asp Phe Ala Thr Tyr Tyr Cys Ala Gln Ala Gly Thr His Pro Thr
85 90 95
Thr Phe Gly Gln Gly Thr Lys Val Glu Ile Lys Arg
100 105
<210> 53
<211> 120
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> DOM1m-21-23 (mouse anti-TNFR1 dAb from DMS5540)
<400> 53
Glu Val Gln Leu Leu Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly Gly
1 5 10 15
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Asn Arg Tyr
20 25 30
Ser Met Gly Trp Leu Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val
35 40 45
Ser Arg Ile Asp Ser Tyr Gly Arg Gly Thr Tyr Tyr Glu Asp Pro Val
50 55 60
Lys Gly Arg Phe Ser Ile Ser Arg Asp Asn Ser Lys Asn Thr Leu Tyr
65 70 75 80
Leu Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys
85 90 95
Ala Lys Ile Ser Gln Phe Gly Ser Asn Ala Phe Asp Tyr Trp Gly Gln
100 105 110
Gly Thr Gln Val Thr Val Ser Ser
115 120
<210> 54
<211> 119
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> DOM1h-574-208 (human anti-TNFR1 dAb from DMS5541)
<400> 54
Glu Val Gln Leu Leu Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly Gly
1 5 10 15
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Asp Lys Tyr
20 25 30
Ser Met Gly Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val
35 40 45
Ser Gln Ile Ser Asp Thr Ala Asp Arg Thr Tyr Tyr Ala His Ala Val
50 55 60
Lys Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Ser Lys Asn Thr Leu Tyr
65 70 75 80
Leu Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys
85 90 95
Ala Ile Tyr Thr Gly Arg Trp Val Pro Phe Glu Tyr Trp Gly Gln Gly
100 105 110
Thr Leu Val Thr Val Ser Ser
115
<210> 55
<211> 119
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> GSK1995057 (anti-TNFR1 antagonistic dAb)
<400> 55
Glu Val Gln Leu Leu Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly Gly
1 5 10 15
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Ala His Glu
20 25 30
Thr Met Val Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val
35 40 45
Ser His Ile Pro Pro Asp Gly Gln Asp Pro Phe Tyr Ala Asp Ser Val
50 55 60
Lys Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Ser Lys Asn Thr Leu Tyr
65 70 75 80
Leu Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Val Tyr His Cys
85 90 95
Ala Leu Leu Pro Lys Arg Gly Pro Trp Phe Asp Tyr Trp Gly Gln Gly
100 105 110
Thr Leu Val Thr Val Ser Ser
115
<210> 56
<211> 120
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> GSK2862277 (anti-TNFR1 antagonistic dAb)
<400> 56
Glu Val Gln Leu Leu Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly Gly
1 5 10 15
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Ala His Glu
20 25 30
Thr Met Val Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val
35 40 45
Ser His Ile Pro Pro Asp Gly Gln Asp Pro Phe Tyr Ala Asp Ser Val
50 55 60
Lys Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Ser Lys Asn Thr Leu Tyr
65 70 75 80
Leu Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Val Tyr His Cys
85 90 95
Ala Leu Leu Pro Lys Arg Gly Pro Trp Phe Asp Tyr Trp Gly Gln Gly
100 105 110
Thr Leu Val Thr Val Ser Ser Ala
115 120
<210> 57
<211> 119
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> DOMlh-574-16 anti-TNFR1 dAb
<400> 57
Glu Val Gln Leu Leu Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly Gly
1 5 10 15
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Val Lys Tyr
20 25 30
Ser Met Gly Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Pro Glu Trp Val
35 40 45
Ser Gln Ile Ser Asn Thr Gly Asp Arg Thr Tyr Tyr Ala Asp Ser Val
50 55 60
Lys Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Ser Lys Asn Thr Leu Tyr
65 70 75 80
Leu Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys
85 90 95
Ala Ile Tyr Thr Gly Arg Trp Glu Pro Phe Asp Tyr Trp Gly Gln Gly
100 105 110
Thr Leu Val Thr Val Ser Ser
115
<210> 58
<211> 119
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> DOMlh-549 anti-TNFR1 dAb
<400> 58
Glu Val Gln Leu Leu Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly Gly
1 5 10 15
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Val Asp Tyr
20 25 30
Glu Met His Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val
35 40 45
Ser Ser Ile Ser Glu Ser Gly Thr Thr Thr Tyr Tyr Ala Asp Ser Val
50 55 60
Lys Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Ser Lys Asn Thr Leu Tyr
65 70 75 80
Leu Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys
85 90 95
Ala Lys Arg Arg Phe Ser Ala Ser Thr Phe Asp Tyr Trp Gly Gln Gly
100 105 110
Thr Leu Val Thr Val Ser Ser
115
<210> 59
<211> 119
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> DOM1h-131-206 anti-TNFR1 dAb
<400> 59
Glu Val Gln Leu Leu Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly Gly
1 5 10 15
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Ala His Glu
20 25 30
Thr Met Val Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val
35 40 45
Ser His Ile Pro Pro Asp Gly Gln Asp Pro Phe Tyr Ala Asp Ser Val
50 55 60
Lys Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Ser Lys Asn Thr Leu Tyr
65 70 75 80
Leu Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Val Tyr His Cys
85 90 95
Ala Leu Leu Pro Lys Arg Gly Pro Trp Phe Asp Tyr Trp Gly Gln Gly
100 105 110
Thr Leu Val Thr Val Ser Ser
115
<210> 60
<211> 119
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> DOM1h-131-511 anti-TNFR1 dAb
<400> 60
Glu Val Gln Leu Leu Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly Gly
1 5 10 15
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Ala His Glu
20 25 30
Thr Met Val Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val
35 40 45
Ser His Ile Pro Pro Val Gly Gln Asp Pro Phe Tyr Ala Asp Ser Val
50 55 60
Lys Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Ser Lys Asn Thr Leu Tyr
65 70 75 80
Leu Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys
85 90 95
Ala Leu Leu Pro Lys Arg Gly Pro Trp Phe Asp Tyr Trp Gly Gln Gly
100 105 110
Thr Leu Val Thr Val Ser Ser
115
<210> 61
<211> 119
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> variant 1-1 of DOM1h-131-511 anti-TNFR1 dAb
<400> 61
Glu Val Gln Leu Leu Glu Ser Gly Gly Gly Met Val Gln Pro Gly Gly
1 5 10 15
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Ala His Glu
20 25 30
Thr Met Val Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val
35 40 45
Ser His Ile Pro Pro Val Gly Gln Asp Pro Phe Tyr Ala Asp Ser Val
50 55 60
Lys Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Ser Lys Asn Thr Leu Tyr
65 70 75 80
Leu Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys
85 90 95
Ala Leu Leu Pro Lys Arg Gly Pro Trp Phe Asp Tyr Trp Gly Gln Gly
100 105 110
Thr Leu Val Thr Val Ser Ser
115
<210> 62
<211> 119
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> variant 1-2 of DOM1h-131-511 anti-TNFR1 dAb
<400> 62
Glu Val Gln Leu Leu Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly Gly
1 5 10 15
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Ala Phe Ala His Glu
20 25 30
Thr Met Val Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val
35 40 45
Ser His Ile Pro Pro Val Gly Gln Asp Pro Phe Tyr Ala Asp Ser Val
50 55 60
Lys Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Ser Lys Asn Thr Leu Tyr
65 70 75 80
Leu Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys
85 90 95
Ala Leu Leu Pro Lys Arg Gly Pro Trp Phe Asp Tyr Trp Gly Gln Gly
100 105 110
Thr Leu Val Thr Val Ser Ser
115
<210> 63
<211> 119
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> variant 1-3 of DOM1h-131-511 anti-TNFR1 dAb
<400> 63
Glu Val Gln Leu Leu Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly Gly
1 5 10 15
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Asn Phe Ala His Glu
20 25 30
Thr Met Val Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val
35 40 45
Ser His Ile Pro Pro Val Gly Gln Asp Pro Phe Tyr Ala Asp Ser Val
50 55 60
Lys Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Ser Lys Asn Thr Leu Tyr
65 70 75 80
Leu Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys
85 90 95
Ala Leu Leu Pro Lys Arg Gly Pro Trp Phe Asp Tyr Trp Gly Gln Gly
100 105 110
Thr Leu Val Thr Val Ser Ser
115
<210> 64
<211> 119
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> DOM1h-131-201 anti-TNFR1 dAb
<400> 64
Glu Val Gln Leu Leu Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly Gly
1 5 10 15
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Ala His Glu
20 25 30
Thr Met Val Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val
35 40 45
Ser His Ile Pro Pro Val Gly Gln Asp Pro Phe Tyr Ala Asp Ser Val
50 55 60
Lys Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asp Ser Lys Asn Thr Leu Tyr
65 70 75 80
Leu Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys
85 90 95
Ala Leu Leu Pro Lys Arg Gly Pro Trp Phe Asp Tyr Trp Gly Gln Gly
100 105 110
Thr Leu Val Thr Val Ser Ser
115
<210> 65
<211> 119
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> variant 1-5 of DOM1h-131-511 anti-TNFR1 dAb
<400> 65
Glu Val Gln Leu Leu Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly Gly
1 5 10 15
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Ala His Glu
20 25 30
Thr Met Val Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val
35 40 45
Ser His Ile Pro Pro Val Gly Gln Asp Pro Phe Tyr Ala Asp Ser Val
50 55 60
Lys Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Ser Lys Asn Thr Leu Tyr
65 70 75 80
Leu Gln Met Asn Asn Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys
85 90 95
Ala Leu Leu Pro Lys Arg Gly Pro Trp Phe Asp Tyr Trp Gly Gln Gly
100 105 110
Thr Leu Val Thr Val Ser Ser
115
<210> 66
<211> 119
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> variant 1-6 of DOM1h-131-511 anti-TNFR1 dAb
<400> 66
Glu Val Gln Leu Leu Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly Gly
1 5 10 15
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Ala His Glu
20 25 30
Thr Met Val Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val
35 40 45
Ser His Ile Pro Pro Ala Gly Gln Asp Pro Phe Tyr Ala Asp Ser Val
50 55 60
Lys Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Ser Lys Ser Thr Leu Tyr
65 70 75 80
Leu Gln Met Asn Gly Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys
85 90 95
Ala Leu Leu Pro Lys Arg Gly Pro Trp Phe Asp Tyr Trp Gly Gln Gly
100 105 110
Thr Leu Val Thr Val Ser Ser
115
<210> 67
<211> 119
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> variant 1-7 of DOM1h-131-511 anti-TNFR1 dAb
<400> 67
Glu Val Gln Leu Leu Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Lys Pro Gly Gly
1 5 10 15
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Ala His Glu
20 25 30
Thr Met Val Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val
35 40 45
Ser His Ile Pro Pro Ala Gly Gln Asp Pro Phe Tyr Ala Asp Ser Val
50 55 60
Lys Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Ser Lys Asn Thr Leu Tyr
65 70 75 80
Leu Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys
85 90 95
Ala Leu Leu Pro Lys Arg Gly Pro Trp Phe Asp Tyr Trp Gly Gln Gly
100 105 110
Thr Leu Val Thr Val Ser Ser
115
<210> 68
<211> 119
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> DOM1h-131-202 anti-TNFR1 dAb
<400> 68
Glu Val Gln Leu Leu Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly Gly
1 5 10 15
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Ala His Glu
20 25 30
Thr Met Val Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val
35 40 45
Ser His Ile Pro Pro Asp Gly Gln Asp Pro Phe Tyr Ala Asp Ser Val
50 55 60
Lys Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Ser Lys Asn Thr Leu Tyr
65 70 75 80
Leu Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys
85 90 95
Ala Leu Leu Pro Lys Arg Gly Pro Trp Phe Asp Tyr Trp Gly Gln Gly
100 105 110
Thr Leu Val Thr Val Ser Ser
115
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<211> 119
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> DOM1h-131-203 anti-TNFR1 dAb
<400> 69
Glu Val Gln Leu Trp Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly Gly
1 5 10 15
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Ala His Glu
20 25 30
Thr Met Val Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val
35 40 45
Ser His Ile Pro Pro Asp Gly Gln Asp Pro Phe Tyr Ala Asp Ser Val
50 55 60
Lys Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Ser Lys Asn Thr Leu Tyr
65 70 75 80
Leu Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys
85 90 95
Ala Leu Leu Pro Lys Arg Gly Pro Trp Ile Asp Tyr Trp Gly Gln Gly
100 105 110
Thr Leu Val Thr Val Ser Ser
115
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<211> 119
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> DOM1h-131-204 anti-TNFR1 dAb
<400> 70
Glu Val Gln Leu Ser Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly Gly
1 5 10 15
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Ala His Glu
20 25 30
Thr Met Val Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val
35 40 45
Ser His Ile Pro Pro Asp Gly Gln Asp Pro Phe Tyr Ala Asp Ser Val
50 55 60
Lys Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Ser Lys Asn Thr Leu Tyr
65 70 75 80
Leu Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys
85 90 95
Ala Leu Leu Pro Asn Arg Gly Pro Trp Phe Asp Tyr Trp Gly Gln Gly
100 105 110
Thr Leu Val Thr Val Ser Ser
115
<210> 71
<211> 119
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> DOM1h-131-205 anti-TNFR1 dAb
<400> 71
Glu Val Gln Leu Leu Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly Gly
1 5 10 15
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Ala His Glu
20 25 30
Thr Met Val Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val
35 40 45
Ser His Ile Pro Pro Asp Gly Gln Asp Pro Phe Tyr Ala Asp Ser Val
50 55 60
Lys Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Ser Lys Asn Thr Leu Tyr
65 70 75 80
Leu Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys
85 90 95
Ala Leu Leu Pro Lys Arg Gly Pro Trp Phe Asp Tyr Trp Gly Gln Gly
100 105 110
Thr Gln Val Thr Val Ser Ser
115
<210> 72
<211> 119
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> variant 1-12 of DOM1h-131-511 anti-TNFR1 dAb
<400> 72
Glu Val Arg Leu Leu Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly Gly
1 5 10 15
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Thr Ala Ser Gly Phe Thr Phe Ala His Glu
20 25 30
Thr Met Val Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val
35 40 45
Ser His Ile Pro Pro Asp Gly Gln Asp Pro Phe Tyr Ala Asp Ser Val
50 55 60
Lys Ser Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Ser Lys Asn Thr Leu Tyr
65 70 75 80
Leu Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys
85 90 95
Ala Leu Leu Pro Lys Arg Gly Pro Trp Phe Asp Tyr Trp Gly Gln Gly
100 105 110
Thr Gln Val Thr Val Ser Ser
115
<210> 73
<211> 119
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> variant 1-13 of DOM1h-131-511 anti-TNFR1 dAb
<400> 73
Glu Val Arg Leu Leu Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Glu Gly
1 5 10 15
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Ala His Glu
20 25 30
Thr Met Val Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val
35 40 45
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50 55 60
Lys Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Ser Lys Asn Thr Leu Tyr
65 70 75 80
Leu Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys
85 90 95
Gly Leu Leu Pro Lys Arg Gly Pro Trp Phe Asp Tyr Arg Gly Gln Gly
100 105 110
Thr Leu Val Thr Val Ser Ser
115
<210> 74
<211> 119
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> variant 1-14 of DOM1h-131-511 anti-TNFR1 dAb
<400> 74
Glu Val Gln Leu Leu Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly Gly
1 5 10 15
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Ile Ala His Glu
20 25 30
Thr Met Val Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val
35 40 45
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50 55 60
Lys Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Ser Lys Asn Thr Leu Tyr
65 70 75 80
Leu Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys
85 90 95
Ala Leu Leu Pro Lys Arg Gly Pro Trp Phe Asp Tyr Arg Gly Gln Gly
100 105 110
Thr Leu Val Thr Val Ser Ser
115
<210> 75
<211> 119
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> variant 1-15 of DOM1h-131-511 anti-TNFR1 dAb
<400> 75
Glu Val Gln Leu Leu Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly Gly
1 5 10 15
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Ala His Glu
20 25 30
Thr Met Val Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val
35 40 45
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50 55 60
Lys Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Ser Lys Asn Thr Leu Tyr
65 70 75 80
Leu Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys
85 90 95
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100 105 110
Thr Leu Val Thr Val Ser Ser
115
<210> 76
<211> 119
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> variant 1-18 of DOM1h-131-511 anti-TNFR1 dAb
<400> 76
Glu Val Gln Leu Leu Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly Gly
1 5 10 15
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Ala His Glu
20 25 30
Thr Met Val Trp Val Arg Arg Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val
35 40 45
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50 55 60
Lys Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Ser Lys Asn Thr Leu Tyr
65 70 75 80
Leu Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys
85 90 95
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100 105 110
Thr Leu Val Thr Val Ser Ser
115
<210> 77
<211> 119
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> variant 1-19 of DOM1h-131-511 anti-TNFR1 dAb
<400> 77
Glu Val Gln Leu Leu Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly Gly
1 5 10 15
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Thr Gly Phe Thr Phe Ala His Glu
20 25 30
Thr Met Val Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Arg Gly Leu Glu Trp Val
35 40 45
Ser His Ile Pro Pro Asp Gly Gln Asp Pro Phe Tyr Ala Asp Ser Val
50 55 60
Lys Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Ser Lys Asn Thr Leu Tyr
65 70 75 80
Leu Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys
85 90 95
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100 105 110
Thr Leu Val Thr Val Ser Ser
115
<210> 78
<211> 119
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> variant 1-20 of DOM1h-131-511 anti-TNFR1 dAb
<400> 78
Glu Val Gln Leu Leu Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly Gly
1 5 10 15
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Ala His Glu
20 25 30
Thr Met Val Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Arg Gly Leu Glu Trp Val
35 40 45
Ser His Ile Pro Ser Asp Gly Gln Asp Pro Phe Tyr Ala Asp Ser Val
50 55 60
Lys Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Ser Lys Asn Thr Leu Tyr
65 70 75 80
Leu Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys
85 90 95
Ala Leu Leu Pro Lys Arg Gly Pro Trp Phe Asp Tyr Trp Gly Gln Gly
100 105 110
Thr Leu Val Thr Val Ser Ser
115
<210> 79
<211> 119
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> variant 1-21 of DOM1h-131-511 anti-TNFR1 dAb
<400> 79
Glu Val Gln Leu Leu Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly Gly
1 5 10 15
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Ala His Glu
20 25 30
Thr Met Val Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val
35 40 45
Ser His Ile Pro Pro Asp Gly Gln Asp Pro Phe Tyr Ala Asp Ser Val
50 55 60
Lys Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Ser Lys Asn Thr Leu Tyr
65 70 75 80
Leu Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys
85 90 95
Ala Leu Leu Pro Lys Lys Gly Pro Trp Phe Asp Tyr Trp Gly Gln Gly
100 105 110
Thr Leu Val Thr Val Ser Ser
115
<210> 80
<211> 119
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> variant 1-22 of DOM1h-131-511 anti-TNFR1 dAb
<400> 80
Glu Val Gln Leu Leu Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly Gly
1 5 10 15
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Ala Arg Glu
20 25 30
Thr Met Val Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val
35 40 45
Ser His Ile Pro Pro Val Gly Gln Asp Pro Phe Tyr Ala Asp Ser Val
50 55 60
Lys Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Ser Lys Asn Thr Leu Tyr
65 70 75 80
Leu Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys
85 90 95
Ala Leu Leu Pro Lys Arg Gly Pro Trp Phe Asp Tyr Trp Gly Gln Gly
100 105 110
Thr Leu Val Thr Val Ser Ser
115
<210> 81
<211> 119
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> variant 1-23 of DOM1h-131-511 anti-TNFR1 dAb
<400> 81
Glu Val Gln Leu Leu Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly Gly
1 5 10 15
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Ala Gln Glu
20 25 30
Thr Met Val Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val
35 40 45
Ser His Ile Pro Pro Val Gly Gln Asp Pro Phe Tyr Ala Asp Ser Val
50 55 60
Lys Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Ser Lys Asn Thr Leu Tyr
65 70 75 80
Leu Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys
85 90 95
Ala Arg Leu Pro Lys Arg Gly Pro Trp Phe Asp Tyr Trp Gly Gln Gly
100 105 110
Thr Leu Val Thr Val Ser Ser
115
<210> 82
<211> 119
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> variant 1-24 of DOM1h-131-511 anti-TNFR1 dAb
<400> 82
Glu Val Gln Leu Leu Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly Gly
1 5 10 15
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Ala His Glu
20 25 30
Thr Met Val Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val
35 40 45
Ser His Ile Pro Pro Val Gly Gln Asp Pro Phe Tyr Ala Asp Ser Val
50 55 60
Lys Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Ser Lys Asn Thr Leu Tyr
65 70 75 80
Leu Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys
85 90 95
Ala Leu Leu Pro Lys Lys Gly Pro Trp Phe Asp Tyr Trp Gly Gln Gly
100 105 110
Thr Leu Val Thr Val Ser Ser
115
<210> 83
<211> 119
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> variant 1-25 of DOM1h-131-511 anti-TNFR1 dAb
<400> 83
Glu Val Gln Leu Leu Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly Gly
1 5 10 15
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Ala His Glu
20 25 30
Thr Met Val Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val
35 40 45
Ser His Ile Pro Pro Ala Gly Gln Asp Pro Phe Tyr Ala Asp Ser Val
50 55 60
Lys Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Ser Lys Asn Thr Leu Tyr
65 70 75 80
Leu Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys
85 90 95
Ala Arg Leu Pro Lys Arg Gly Pro Trp Phe Asp Tyr Trp Gly Gln Gly
100 105 110
Thr Leu Val Thr Val Ser Ser
115
<210> 84
<211> 357
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Codon Optimized Sequence 1 of DOM1h-131-206
anti-TNFR1 dAb
<400> 84
gaggttcaat tgttggaatc cggtggtgga ttggttcaac ctggtggttc tttgagattg 60
tcctgtgctg cttccggttt tactttcgct cacgagacta tggtttgggt tagacaggct 120
ccaggtaaag gattggaatg ggtttcccac attccaccag atggtcaaga tccattctac 180
gctgactccg ttaagggaag attcactatc tccagagaca actccaagaa cactttgtac 240
ttgcagatga actccttgag agctgaggat actgctgttt accactgtgc tttgttgcca 300
aagagaggac cttggtttga ttactgggga cagggaactt tggttactgt ttcttcc 357
<210> 85
<211> 366
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Codon Optimized Sequence 2 of DOM1h-131-206
anti-TNFR1 dAb
<400> 85
gagaaaagag aggttcaatt gcttgaatct ggaggaggtt tggtccagcc aggagggtcc 60
cttcgactaa gttgtgctgc cagtgggttt acgtttgctc atgaaactat ggtatgggtc 120
cgacaggcac ctggtaaagg tcttgaatgg gtttcacata tccctccaga cggtcaagac 180
ccattttacg ctgattccgt gaaaggcaga tttacaattt cacgagataa ttctaaaaac 240
accttgtact tacaaatgaa ctcattgaga gctgaggaca ctgcagttta tcactgcgct 300
ttactaccaa aacgtggacc ttggtttgat tattggggcc aaggtacgtt agtgactgtt 360
agttct 366
<210> 86
<211> 357
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Codon Optimized Sequence 3 of DOM1h-131-206
anti-TNFR1 dAb
<400> 86
gaagtgcagc ttcttgaaag tggtggaggg ctagtgcagc cagggggatc tttaagatta 60
tcatgcgctg ccagtggatt tacttttgct cacgagacga tggtctgggt gagacaagct 120
cctggaaaag gtttagagtg ggtttctcac attccacctg atggtcaaga tcctttctac 180
gcagattccg tcaaaggaag atttactatc tccagagata atagtaaaaa cactttgtac 240
ctacagatga actcacttag agccgaagat accgctgtgt accactgcgc cttgttgcca 300
aagagaggtc cttggttcga ttactggggt cagggtactc tggttacagt ctcatct 357
<210> 87
<211> 357
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Codon Optimized Sequence 4 of DOM1h-131-206
anti-TNFR1 dAb
<400> 87
gaggttcaac tgctggaatc tggtggtggt ctggtacaac cgggtggttc cctgcgtctg 60
agctgtgcag cctctggttt caccttcgct catgagacca tggtttgggt acgccaggct 120
ccgggtaaag gcctggagtg ggtaagccat atccctcctg atggtcagga cccgttctat 180
gctgattccg tcaaaggccg ttttaccatt tctcgtgaca acagcaaaaa cactctgtac 240
ctgcaaatga actccctgcg tgcagaagac acggcggttt atcactgtgc actgctgcca 300
aaacgcggcc cttggttcga ctactggggc cagggtactc tggtcactgt atcttct 357
<210> 88
<211> 119
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Codon Optimized Sequence 5 of DOM1h-131-206
anti-TNFR1 dAb
<400> 88
Glu Val Gln Leu Leu Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly Gly
1 5 10 15
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Ala His Glu
20 25 30
Thr Met Val Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val
35 40 45
Ser His Ile Pro Pro Asp Gly Gln Asp Pro Phe Tyr Ala Asp Ser Val
50 55 60
Lys Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Ser Lys Asn Thr Leu Tyr
65 70 75 80
Leu Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Val Tyr His Cys
85 90 95
Ala Leu Leu Pro Lys Arg Gly Pro Trp Phe Asp Tyr Trp Gly Gln Gly
100 105 110
Thr Leu Val Thr Val Ser Ser
115
<210> 89
<211> 120
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> TAR2h-10 anti-TNFR1 dAb
<400> 89
Glu Val Gln Leu Leu Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly Gly
1 5 10 15
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Glu Trp Tyr
20 25 30
Trp Met Gly Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val
35 40 45
Ser Ala Ile Ser Gly Ser Gly Gly Ser Thr Tyr Tyr Ala Asp Ser Val
50 55 60
Lys Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Ser Lys Asn Thr Leu Tyr
65 70 75 80
Leu Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys
85 90 95
Ala Lys Val Lys Leu Gly Gly Gly Pro Asn Phe Asp Tyr Trp Gly Gln
100 105 110
Gly Thr Leu Val Thr Val Ser Ser
115 120
<210> 90
<211> 122
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> TAR2h-12 anti-TNFR1 dAb
<400> 90
Glu Val Gln Leu Leu Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly Gly
1 5 10 15
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Val Ala Tyr
20 25 30
Asn Met Gly Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val
35 40 45
Ser Phe Ile Asp Met Tyr Gly Ala Lys Thr Tyr Tyr Ala Asp Ser Val
50 55 60
Lys Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Ser Lys Asn Thr Leu Tyr
65 70 75 80
Leu Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys
85 90 95
Ala Lys Leu Cys Leu Met Asp Cys Ser Gly Asp Ile Phe Asp Tyr Trp
100 105 110
Gly Gln Gly Thr Leu Val Thr Val Ser Ser
115 120
<210> 91
<211> 116
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> TAR2h-13 anti-TNFR1 dAb
<400> 91
Glu Val Gln Leu Leu Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly Gly
1 5 10 15
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Pro Ala Asp
20 25 30
Glu Met Tyr Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val
35 40 45
Ser Ser Ile Gly Trp Pro Gly Gly Ala Thr Tyr Tyr Ala Asp Ser Val
50 55 60
Lys Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Ser Lys Asn Thr Leu Tyr
65 70 75 80
Leu Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys
85 90 95
Ala Lys Tyr Gly Arg Asn Phe Asp Tyr Trp Gly Gln Gly Thr Leu Val
100 105 110
Thr Val Ser Ser
115
<210> 92
<211> 122
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> TAR2h-14 anti-TNFR1 dAb
<400> 92
Glu Val Gln Leu Leu Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly Gly
1 5 10 15
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Asp Gln Tyr
20 25 30
Asp Met Ser Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val
35 40 45
Ser Leu Ile Asp Pro Ser Gly Gly His Thr Tyr Tyr Ala Asp Ser Val
50 55 60
Lys Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asn Asn Ser Lys Asn Thr Leu Tyr
65 70 75 80
Leu Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys
85 90 95
Ala Lys Pro Val Phe Ser Asp Trp Pro Ala Val Glu Phe Asp Tyr Trp
100 105 110
Gly Gln Gly Thr Leu Val Thr Val Ser Ser
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<220>
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1 5 10 15
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20 25 30
Asp Met Gln Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val
35 40 45
Ser Ser Ile Asp Gly Thr Gly Gly Thr Thr Tyr Tyr Ala Asp Ser Val
50 55 60
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65 70 75 80
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100 105 110
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<213> Artificial Sequence
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<223> TAR2h-10-2 anti-TNFR1 dAb
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<213> Artificial Sequence
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<223> TAR2h-10-3 anti-TNFR1 dAb
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<213> Artificial Sequence
<220>
<223> TAR2h-10-5 anti-TNFR1 dAb
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<213> Artificial Sequence
<220>
<223> TAR2h-10-6 anti-TNFR1 dAb
<400> 114
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<213> Artificial Sequence
<220>
<223> TAR2h-10-7 anti-TNFR1 dAb
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<213> Artificial Sequence
<220>
<223> TAR2h-10-8 anti-TNFR1 dAb
<400> 116
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<210> 117
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<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> TAR2h-10-9 anti-TNFR1 dAb
<400> 117
Glu Val Gln Leu Leu Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly Gly
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<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> TAR2h-10-10 anti-TNFR1 dAb
<400> 118
Glu Val Gln Leu Leu Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly Gly
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Lys Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Ser Lys Asn Thr Leu Tyr
65 70 75 80
Leu Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys
85 90 95
Ala Lys Val Lys Leu Gly Gly Gly Pro Asn Phe Asp Asp Arg Gly Gln
100 105 110
Gly Thr Leu Val Thr Val Ser Ser
115 120
<210> 119
<211> 120
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> TAR2h-10-11 anti-TNFR1 dAb
<400> 119
Glu Val Gln Leu Leu Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly Gly
1 5 10 15
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Glu Trp Tyr
20 25 30
Trp Met Gly Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val
35 40 45
Ser Ala Ile Ser Gly Ser Gly Gly Ser Lys Tyr Tyr Ala Asp Ser Val
50 55 60
Lys Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Ser Lys Asn Thr Leu Tyr
65 70 75 80
Leu Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys
85 90 95
Ala Lys Val Lys Leu Gly Gly Gly Pro Asn Phe Asp Tyr Arg Gly Gln
100 105 110
Gly Thr Leu Val Thr Val Ser Ser
115 120
<210> 120
<211> 120
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> TAR2h-10-12 anti-TNFR1 dAb
<400> 120
Glu Val Gln Leu Leu Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly Gly
1 5 10 15
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Gly Trp Tyr
20 25 30
Trp Met Gly Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Ala
35 40 45
Ser Ala Ile Ser Gly Ser Gly Gly Asn Thr Tyr Tyr Ala Asp Ser Val
50 55 60
Lys Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Ser Lys Asn Thr Leu Tyr
65 70 75 80
Leu Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys
85 90 95
Ala Lys Val Lys Leu Gly Gly Gly Pro Asn Phe Asp Tyr Trp Gly Gln
100 105 110
Gly Thr Leu Val Thr Val Ser Ser
115 120
<210> 121
<211> 120
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> TAR2h-10-13 anti-TNFR1 dAb
<400> 121
Glu Val Gln Leu Leu Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly Gly
1 5 10 15
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Glu Trp Tyr
20 25 30
Trp Met Gly Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Gly Trp Val
35 40 45
Ser Ala Ile Ser Gly Ser Gly Gly Ser Thr Tyr Tyr Ala Asp Ser Val
50 55 60
Arg Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Ser Lys Asn Thr Leu Tyr
65 70 75 80
Leu Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys
85 90 95
Ala Lys Val Lys Leu Gly Gly Gly Pro Asn Phe Asp Tyr Arg Gly Gln
100 105 110
Gly Thr Leu Val Thr Val Ser Ser
115 120
<210> 122
<211> 120
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> TAR2h-10-14 anti-TNFR1 dAb
<220>
<221> VARIANT
<222> (20)...(20)
<223> Xaa = any amino acid
<400> 122
Glu Val Gln Leu Leu Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly Gly
1 5 10 15
Ser Leu Arg Xaa Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Glu Trp Tyr
20 25 30
Trp Met Gly Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Pro Glu Trp Val
35 40 45
Ser Ala Ile Ser Gly Ser Gly Gly Ser Thr Tyr Tyr Ala Asp Ser Val
50 55 60
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65 70 75 80
Leu Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys
85 90 95
Ala Lys Val Lys Leu Gly Gly Gly Pro Asn Phe Asp Tyr Trp Gly Gln
100 105 110
Gly Thr Leu Val Thr Val Ser Ser
115 120
<210> 123
<211> 120
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> TAR2h-10-15 anti-TNFR1 dAb
<400> 123
Glu Val Gln Leu Leu Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly Gly
1 5 10 15
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Glu Trp Tyr
20 25 30
Trp Met Gly Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val
35 40 45
Ser Ala Ile Ser Gly Ser Gly Gly Ser Thr Tyr Tyr Ala Asp Ser Val
50 55 60
Lys Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Ser Lys Asn Thr Leu Tyr
65 70 75 80
Leu Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys
85 90 95
Ala Lys Val Lys Leu Gly Gly Gly Pro Asn Phe Asp Tyr Arg Gly Arg
100 105 110
Gly Thr Leu Val Thr Val Ser Ser
115 120
<210> 124
<211> 120
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> TAR2h-10-16 anti-TNFR1 dAb
<400> 124
Glu Val Gln Leu Leu Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly Gly
1 5 10 15
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Glu Trp Tyr
20 25 30
Trp Met Gly Trp Ile Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val
35 40 45
Ser Ala Ile Ser Gly Ser Gly Gly Ser Thr Tyr Tyr Ala Asp Ser Val
50 55 60
Lys Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Ser Lys Asn Thr Leu Tyr
65 70 75 80
Leu Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Lys Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys
85 90 95
Ala Lys Val Lys Leu Gly Gly Gly Pro Asn Phe Asp Tyr Arg Gly Gln
100 105 110
Gly Thr Leu Val Thr Val Ser Ser
115 120
<210> 125
<211> 120
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> TAR2h-10-17 anti-TNFR1 dAb
<400> 125
Glu Val Gln Leu Leu Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly Gly
1 5 10 15
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Glu Trp Tyr
20 25 30
Trp Met Gly Trp Ile Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Gly Trp Val
35 40 45
Ser Ala Ile Ser Gly Ser Gly Gly Ser Thr Tyr Tyr Ala Asp Ser Val
50 55 60
Arg Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Ser Lys Asn Thr Leu Tyr
65 70 75 80
Leu Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys
85 90 95
Ala Lys Val Lys Leu Gly Gly Gly Pro Asn Phe Asp Tyr Arg Gly Gln
100 105 110
Gly Thr Leu Val Thr Val Ser Ser
115 120
<210> 126
<211> 120
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> TAR2h-10-18 anti-TNFR1 dAb
<400> 126
Glu Val Gln Leu Leu Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly Gly
1 5 10 15
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Gly Trp Tyr
20 25 30
Trp Met Gly Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Ala
35 40 45
Ser Ala Ile Ser Gly Ser Gly Gly Asn Thr Tyr Tyr Ala Asp Ser Val
50 55 60
Lys Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Ser Lys Asn Thr Leu Tyr
65 70 75 80
Leu Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys
85 90 95
Ala Lys Val Lys Leu Gly Gly Gly Pro Asn Phe Asp Tyr Trp Gly Gln
100 105 110
Gly Thr Leu Val Thr Val Ser Ser
115 120
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<211> 120
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> TAR2h-10-19 anti-TNFR1 dAb
<400> 127
Glu Val Gln Leu Leu Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly Gly
1 5 10 15
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Glu Trp Tyr
20 25 30
Trp Met Gly Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Gly Trp Val
35 40 45
Ser Ala Ile Ser Gly Ser Gly Gly Ser Thr Tyr Tyr Ala Asp Ser Val
50 55 60
Arg Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Ser Lys Asn Thr Leu Tyr
65 70 75 80
Leu Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Lys Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys
85 90 95
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100 105 110
Gly Thr Leu Val Thr Val Ser Ser
115 120
<210> 128
<211> 120
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> TAR2h-10-20 anti-TNFR1 dAb
<400> 128
Glu Val Gln Leu Leu Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly Gly
1 5 10 15
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Gly Trp Tyr
20 25 30
Trp Met Gly Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Ala
35 40 45
Ser Ala Ile Ser Gly Ser Gly Gly Asn Thr Tyr Tyr Ala Asp Ser Val
50 55 60
Lys Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Ser Lys Asn Thr Leu Tyr
65 70 75 80
Leu Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Lys Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys
85 90 95
Ala Lys Val Lys Leu Gly Gly Gly Pro Asn Phe Asp Tyr Trp Gly Gln
100 105 110
Gly Thr Leu Val Thr Val Ser Ser
115 120
<210> 129
<211> 120
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> TAR2h-10-21 anti-TNFR1 dAb
<400> 129
Glu Val Gln Leu Leu Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly Gly
1 5 10 15
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Gly Trp Tyr
20 25 30
Trp Met Gly Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val
35 40 45
Ser Ala Ile Ser Gly Ser Gly Gly Ser Thr Tyr Tyr Ala Asp Ser Val
50 55 60
Lys Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Ser Lys Asn Thr Leu Tyr
65 70 75 80
Leu Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Lys Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys
85 90 95
Ala Lys Val Lys Leu Gly Gly Gly Pro Asn Phe Asp Tyr Arg Gly Gln
100 105 110
Gly Thr Leu Val Thr Val Ser Ser
115 120
<210> 130
<211> 120
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> TAR2h-10-22 anti-TNFR1 dAb
<400> 130
Glu Val Gln Leu Leu Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly Gly
1 5 10 15
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Gly Trp Tyr
20 25 30
Trp Met Gly Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Gly Trp Val
35 40 45
Ser Ala Ile Ser Gly Ser Gly Gly Ser Thr Tyr Tyr Ala Asp Ser Val
50 55 60
Arg Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Ser Lys Asn Thr Leu Tyr
65 70 75 80
Leu Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys
85 90 95
Ala Lys Val Lys Leu Gly Gly Gly Pro Asn Phe Asp Tyr Arg Gly Gln
100 105 110
Gly Thr Leu Val Thr Val Ser Ser
115 120
<210> 131
<211> 120
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> TAR2h-10-27 anti-TNFR1 dAb
<400> 131
Glu Val Gln Leu Leu Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly Gly
1 5 10 15
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Glu Trp Tyr
20 25 30
Trp Met Gly Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val
35 40 45
Ser Ala Ile Ser Gly Ser Gly Gly Ser Thr Tyr Tyr Ala Asp Ser Val
50 55 60
Lys Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Ser Lys Asn Thr Leu Tyr
65 70 75 80
Leu Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Ala Ala Val Tyr Tyr Cys
85 90 95
Ala Lys Val Lys Leu Gly Gly Gly Pro Asn Phe Gly Tyr Arg Gly Gln
100 105 110
Gly Thr Leu Val Thr Val Ser Ser
115 120
<210> 132
<211> 120
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> TAR2h-10-29 anti-TNFR1 dAb
<400> 132
Glu Val Gln Leu Leu Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly Gly
1 5 10 15
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Asp Phe Glu Trp Tyr
20 25 30
Trp Met Gly Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val
35 40 45
Ser Ala Ile Ser Gly Ser Gly Gly Ser Thr Tyr Tyr Ala Asp Ser Val
50 55 60
Lys Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Ser Lys Asn Thr Leu Tyr
65 70 75 80
Leu Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Ala Ala Val Tyr Tyr Cys
85 90 95
Ala Lys Val Lys Leu Gly Gly Gly Pro Asn Phe Gly Tyr Arg Gly Gln
100 105 110
Gly Thr Leu Val Thr Val Ser Ser
115 120
<210> 133
<211> 120
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> TAR2h-10-31 anti-TNFR1 dAb
<400> 133
Glu Val Gln Leu Leu Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly Gly
1 5 10 15
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Glu Trp Tyr
20 25 30
Trp Met Gly Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val
35 40 45
Ser Ala Ile Ser Gly Ser Gly Gly Ser Thr Tyr Tyr Ala Asp Ser Val
50 55 60
Lys Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Ser Lys Ser Thr Leu Tyr
65 70 75 80
Leu Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Ala Ala Val Tyr Tyr Cys
85 90 95
Ala Lys Val Lys Leu Gly Gly Gly Pro Asn Phe Gly Tyr Arg Gly Gln
100 105 110
Gly Thr Leu Val Thr Val Ser Ser
115 120
<210> 134
<211> 120
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> TAR2h-10-35 anti-TNFR1 dAb
<400> 134
Glu Val Gln Leu Leu Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly Gly
1 5 10 15
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Asp Phe Glu Trp Tyr
20 25 30
Trp Met Gly Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val
35 40 45
Ser Ala Ile Ser Gly Ser Gly Gly Ser Thr Tyr Tyr Ala Asp Ser Val
50 55 60
Lys Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Ser Lys Asn Thr Leu Tyr
65 70 75 80
Leu Gln Met Asn Ser Leu His Ala Glu Asp Ala Ala Val Tyr Tyr Cys
85 90 95
Ala Lys Val Lys Leu Gly Gly Gly Pro Asn Phe Gly Tyr Arg Gly Gln
100 105 110
Gly Thr Leu Val Thr Val Ser Ser
115 120
<210> 135
<211> 120
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> TAR2h-10-36 anti-TNFR1 dAb
<400> 135
Glu Val Gln Leu Leu Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly Gly
1 5 10 15
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Val Ser Gly Leu Thr Phe Glu Trp Tyr
20 25 30
Trp Met Gly Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val
35 40 45
Ser Ala Ile Ser Gly Ser Gly Gly Ser Thr Tyr Tyr Ala Asp Ser Val
50 55 60
Lys Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Ser Lys Asn Thr Leu Tyr
65 70 75 80
Leu Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Ala Ala Val Tyr Tyr Cys
85 90 95
Ala Lys Val Lys Leu Gly Gly Gly Pro Asn Phe Gly Tyr Arg Gly Gln
100 105 110
Gly Thr Leu Val Thr Val Ser Ser
115 120
<210> 136
<211> 120
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> TAR2h-10-37 anti-TNFR1 dAb
<400> 136
Glu Val Gln Leu Leu Gly Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly Gly
1 5 10 15
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Ala Trp Tyr
20 25 30
Trp Met Gly Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val
35 40 45
Ser Ala Ile Ser Gly Ser Gly Gly Ser Thr Tyr Tyr Ala Asp Ser Val
50 55 60
Lys Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Ser Lys Asn Thr Leu Tyr
65 70 75 80
Leu Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Ala Ala Val Tyr Tyr Cys
85 90 95
Ala Lys Val Lys Leu Gly Gly Gly Pro Asn Phe Gly Tyr Arg Gly Gln
100 105 110
Gly Thr Leu Val Thr Val Ser Ser
115 120
<210> 137
<211> 120
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> TAR2h-10-38 anti-TNFR1 dAb
<400> 137
Glu Val Gln Leu Leu Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly Gly
1 5 10 15
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Glu Trp Tyr
20 25 30
Trp Met Gly Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val
35 40 45
Ser Ala Ile Ser Gly Ser Gly Gly Ser Thr Tyr Tyr Ala Asp Ser Val
50 55 60
Lys Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Ser Lys Asn Thr Leu Tyr
65 70 75 80
Leu Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Lys Asp Ala Ala Val Tyr Tyr Cys
85 90 95
Ala Lys Val Lys Leu Gly Gly Gly Pro Asn Phe Gly Tyr Arg Gly Gln
100 105 110
Gly Thr Leu Val Thr Val Ser Ser
115 120
<210> 138
<211> 120
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> TAR2h-10-45 anti-TNFR1 dAb
<400> 138
Glu Val Gln Leu Leu Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly Gly
1 5 10 15
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Glu Pro Tyr
20 25 30
Trp Met Gly Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val
35 40 45
Ser Ala Ile Ser Gly Ser Gly Gly Ser Thr Tyr Tyr Ala Asp Ser Val
50 55 60
Lys Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Ser Lys Asn Thr Leu Tyr
65 70 75 80
Leu Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Ala Ala Val Tyr Tyr Cys
85 90 95
Ala Lys Val Lys Leu Gly Gly Gly Pro Asn Phe Gly Tyr Arg Gly Gln
100 105 110
Gly Thr Leu Val Thr Val Ser Ser
115 120
<210> 139
<211> 120
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> TAR2h-10-47 anti-TNFR1 dAb
<400> 139
Glu Val Gln Leu Leu Glu Ser Gly Gly Gly Phe Val Gln Pro Gly Gly
1 5 10 15
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Glu Trp Tyr
20 25 30
Trp Met Ser Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val
35 40 45
Ser Ala Ile Ser Gly Ser Gly Gly Ser Thr Tyr Tyr Ala Asp Ser Val
50 55 60
Lys Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Ser Lys Asn Thr Leu Tyr
65 70 75 80
Leu Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Ala Ser Val Tyr Tyr Cys
85 90 95
Ala Lys Val Lys Leu Gly Gly Gly Pro Asn Phe Gly Tyr Arg Gly Gln
100 105 110
Gly Thr Leu Val Thr Val Ser Ser
115 120
<210> 140
<211> 120
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> TAR2h-10-48 anti-TNFR1 dAb
<400> 140
Glu Val Gln Leu Leu Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly Gly
1 5 10 15
Ser Leu Arg Leu Pro Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Glu Trp Tyr
20 25 30
Trp Met Thr Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val
35 40 45
Ser Ala Ile Ser Gly Ser Gly Gly Ser Thr Tyr Tyr Ala Asp Ser Val
50 55 60
Lys Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Ser Lys Asn Thr Leu Tyr
65 70 75 80
Leu Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Ala Ala Val Tyr Tyr Cys
85 90 95
Ala Lys Val Lys Leu Gly Gly Gly Pro Asn Phe Gly Tyr Arg Gly Gln
100 105 110
Gly Thr Leu Val Thr Val Ser Ser
115 120
<210> 141
<211> 120
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> TAR2h-10-57 anti-TNFR1 dAb
<400> 141
Glu Val Gln Leu Leu Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly Gly
1 5 10 15
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Leu Thr Phe Glu Trp Tyr
20 25 30
Trp Met Gly Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val
35 40 45
Ser Ala Ile Ser Gly Ser Gly Gly Ser Thr Tyr Tyr Ala Asp Ser Val
50 55 60
Lys Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Ser Lys Asn Thr Leu Tyr
65 70 75 80
Leu Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Ala Ala Val Tyr Tyr Cys
85 90 95
Ala Lys Val Lys Leu Gly Gly Gly Pro Asn Phe Gly Tyr Arg Gly Gln
100 105 110
Gly Thr Leu Val Thr Val Ser Ser
115 120
<210> 142
<211> 120
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> TAR2h-10-56 anti-TNFR1 dAb
<400> 142
Glu Val Gln Leu Leu Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly Gly
1 5 10 15
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Leu Thr Phe Glu Trp Tyr
20 25 30
Trp Met Gly Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val
35 40 45
Ser Ala Val Ser Gly Ser Gly Gly Ser Thr Tyr Tyr Ala Asp Ser Val
50 55 60
Lys Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Ser Lys Asn Thr Leu Tyr
65 70 75 80
Leu Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Ala Ala Val Tyr Tyr Cys
85 90 95
Ala Lys Val Lys Leu Gly Gly Gly Pro Asn Phe Gly Tyr Arg Gly Gln
100 105 110
Gly Thr Leu Val Thr Val Ser Ser
115 120
<210> 143
<211> 120
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> TAR2h-10-58 anti-TNFR1 dAb
<400> 143
Glu Val Gln Leu Leu Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly Gly
1 5 10 15
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Leu Thr Phe Glu Trp Tyr
20 25 30
Trp Met Gly Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val
35 40 45
Ser Ala Ile Ser Gly Ser Gly Asp Ser Thr Tyr Tyr Ala Asp Ser Val
50 55 60
Lys Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Ser Lys Asn Thr Leu Tyr
65 70 75 80
Leu Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Ala Ala Val Tyr Tyr Cys
85 90 95
Ala Lys Val Lys Leu Gly Gly Gly Pro Asn Phe Gly Tyr Arg Gly Gln
100 105 110
Gly Thr Leu Val Thr Val Ser Ser
115 120
<210> 144
<211> 120
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> TAR2h-10-66 anti-TNFR1 dAb
<400> 144
Glu Val Gln Leu Leu Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly Gly
1 5 10 15
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Glu Trp Tyr
20 25 30
Trp Met Gly Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val
35 40 45
Ser Ala Met Ser Gly Ser Gly Gly Ser Thr Tyr Tyr Ala Asp Ser Val
50 55 60
Lys Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Ser Lys Asn Thr Leu Tyr
65 70 75 80
Leu Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Ala Ala Val Tyr Tyr Cys
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20 25 30
Gly Met Ala Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val
35 40 45
Ser Phe Ile Asp Leu Ala Gly Leu His Thr Tyr Tyr Ala Asp Ser Val
50 55 60
Arg Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Ser Lys Asn Thr Leu Tyr
65 70 75 80
Leu Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys
85 90 95
Ala Lys Phe Ala Thr Tyr Ser Ser Gly Asn Glu Glu Gln Pro Phe Asp
100 105 110
Tyr Trp Gly Gln Gly Thr Leu Val Thr Val Ser Ser
115 120
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<211> 123
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> TAR2h-50 anti-TNFR1 dAb
<400> 172
Glu Val Gln Leu Leu Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly Gly
1 5 10 15
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Ser Ala Tyr
20 25 30
Asn Met Ala Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val
35 40 45
Ser Phe Ile Ala Gln Ser Gly Gly His Thr Tyr Tyr Ala Asp Ser Val
50 55 60
Lys Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Ser Lys Asn Thr Leu Tyr
65 70 75 80
Leu Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys
85 90 95
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100 105 110
Trp Gly Gln Gly Thr Leu Val Thr Val Ser Ser
115 120
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<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
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<400> 173
Glu Val Gln Leu Leu Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly Gly
1 5 10 15
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Ala Thr Tyr
20 25 30
Asn Met Ser Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val
35 40 45
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65 70 75 80
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100 105 110
Thr Val Ser Ser
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<213> Artificial Sequence
<220>
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<220>
<221> VARIANT
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<400> 174
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1 5 10 15
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20 25 30
Xaa Met Gly Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val
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<213> Artificial Sequence
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1 5 10 15
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Glu Asp Tyr
20 25 30
Pro Met Ala Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val
35 40 45
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Glu Val Gln Leu Leu Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly Gly
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<213> Artificial Sequence
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<213> Artificial Sequence
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<223> TAR2h-75 anti-TNFR1 dAb
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<213> Artificial Sequence
<220>
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<213> Artificial Sequence
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<223> TAR2h-78 anti-TNFR1 dAb
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Glu Val Gln Leu Leu Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly Gly
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Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Lys Leu Tyr
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35 40 45
Ser Phe Ile Ala Ala Ala Gly Pro Glu Thr Tyr Tyr Ala Asp Ser Val
50 55 60
Lys Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Ser Lys Asn Thr Leu Tyr
65 70 75 80
Leu Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys
85 90 95
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100 105 110
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<211> 119
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
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<223> TAR2h-79 anti-TNFR1 dAb
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Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Gly Lys Tyr
20 25 30
Thr Met Thr Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val
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<211> 119
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> TAR2h-131-8 anti-TNFR1 dAb
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Lys Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Ser Lys Asn Thr Leu Tyr
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Leu Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys
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<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> TAR2h-131-24 anti-TNFR1 dAb
<400> 189
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<213> Artificial Sequence
<220>
<223> TAR2h-15-8 anti-TNFR1 dAb
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115 120
<210> 191
<211> 121
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> TAR2h-15-8-1 anti-TNFR1 dAb
<400> 191
Glu Val Arg Leu Leu Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly Gly
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<210> 192
<211> 121
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> TAR2h-15-8-2 anti-TNFR1 dAb
<400> 192
Glu Val Arg Leu Leu Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly Gly
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Thr Met Thr Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val
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<210> 193
<211> 122
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> TAR2h-185-23 anti-TNFR1 dAb
<220>
<221> VARIANT
<222> (62)...(62)
<223> Xaa = any amino acid
<400> 193
Glu Val Gln Leu Leu Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly Gly
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Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Ala Arg Tyr
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Gly Lys Pro Val Phe Ser Asp Trp Pro Ala Val Glu Phe Asp Tyr Trp
100 105 110
Gly Gln Gly Thr Leu Val Thr Val Ser Ser
115 120
<210> 194
<211> 119
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> TAR2h-154-10-5 anti-TNFR1 dAb
<400> 194
Glu Val Gln Leu Leu Glu Ser Gly Gly Gly Met Val Gln Pro Gly Gly
1 5 10 15
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Pro Gly Phe Thr Phe Glu His Glu
20 25 30
Gly Met Val Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val
35 40 45
Ser His Ile Gly Glu Asp Gly Gln Ser Thr Tyr Tyr Ala Asp Ser Val
50 55 60
Lys Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Ser Lys Asn Thr Leu Tyr
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Leu Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys
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Thr Leu Val Thr Val Ser Ser
115
<210> 195
<211> 122
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> TAR2h-14-2 anti-TNFR1 dAb
<400> 195
Glu Val Gln Leu Leu Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly Gly
1 5 10 15
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Ser Thr Phe Asp Gln Tyr
20 25 30
Asp Met Ser Trp Val Arg Arg Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val
35 40 45
Ser Leu Ile Asp Pro Ser Gly Gly His Thr Tyr Tyr Ala Asp Ser Val
50 55 60
Lys Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asn Asn Thr Lys Asn Thr Leu Tyr
65 70 75 80
Leu Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys
85 90 95
Ala Lys Pro Val Phe Ser Asp Trp Pro Ala Val Glu Phe Asp Tyr Trp
100 105 110
Gly Gln Gly Thr Leu Val Thr Val Ser Ser
115 120
<210> 196
<211> 121
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> TAR2h-151-8 anti-TNFR1 dAb
<400> 196
Glu Val Gln Leu Leu Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly Gly
1 5 10 15
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Asp Tyr Gly
20 25 30
Asn Met Phe Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Ile
35 40 45
Ser Ala Ile Ser Gly Ser Gly Gly Ser Thr Tyr Tyr Ala Asp Ser Val
50 55 60
Lys Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Ser Lys Asn Thr Leu Tyr
65 70 75 80
Leu Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys
85 90 95
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100 105 110
Gln Gly Thr Leu Val Thr Val Ser Ser
115 120
<210> 197
<211> 122
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> TAR2h-152-7 anti-TNFR1 dAb
<400> 197
Glu Val Gln Leu Leu Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly Gly
1 5 10 15
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Lys Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Ser Lys Asn Thr Leu Tyr
65 70 75 80
Leu Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys
85 90 95
Ala Lys Pro Arg Phe Ser Tyr Tyr Pro Arg Val Ser Phe Asp Tyr Arg
100 105 110
Gly Gln Gly Thr Leu Val Thr Val Ser Ser
115 120
<210> 198
<211> 116
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> TAR2h-35-4 anti-TNFR1 dAb
<400> 198
Glu Val Gln Leu Leu Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly Gly
1 5 10 15
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Asp Ala Tyr
20 25 30
Asn Met Phe Trp Phe Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Pro Glu Trp Val
35 40 45
Ser Ala Ile Gly Pro Ser Gly Arg Glu Thr Tyr Tyr Ala Asp Ser Val
50 55 60
Lys Gly Arg Phe Thr Ile Thr Arg Asp Asn Ser Lys Asn Thr Leu Tyr
65 70 75 80
Leu Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys
85 90 95
Ala Lys Arg Tyr Pro Asp Phe Asp Tyr Trp Gly Gln Gly Thr Leu Val
100 105 110
Thr Val Ser Ser
115
<210> 199
<211> 119
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> TAR2h-154-7 anti-TNFR1 dAb
<400> 199
Glu Val Gln Leu Leu Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly Gly
1 5 10 15
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Glu His Glu
20 25 30
Gly Met Val Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val
35 40 45
Ser His Ile Gly Glu Asp Gly Gln Ser Thr Tyr Tyr Ala Asp Ser Val
50 55 60
Lys Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Ser Arg Asn Thr Leu Tyr
65 70 75 80
Leu Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys
85 90 95
Ala Asn Ile Pro Lys Ala Gly Pro Ser Phe Asp Tyr Trp Gly Gln Gly
100 105 110
Thr Leu Val Thr Val Ser Ser
115
<210> 200
<211> 123
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> TAR2h-80 anti-TNFR1 dAb
<400> 200
Glu Val Gln Leu Leu Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly Gly
1 5 10 15
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Lys Leu Tyr
20 25 30
Asn Met Ala Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val
35 40 45
Ser Phe Ile Ala Ala Ala Gly Pro Glu Thr Tyr Tyr Ala Asp Ser Val
50 55 60
Lys Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Ser Lys Asn Thr Leu Tyr
65 70 75 80
Leu Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys
85 90 95
Ala Lys Leu Gly Asp Ile Ser Ser Ile Pro Gln His Pro Phe Asp Tyr
100 105 110
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115 120
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<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> TAR2h-81 anti-TNFR1 dAb
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Glu Val Gln Leu Leu Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly Gly
1 5 10 15
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Ser Arg Glu
20 25 30
Asn Met His Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val
35 40 45
Ser Gly Ile Gly Pro Arg Gly Met Pro Thr Tyr Tyr Ala Asp Ser Val
50 55 60
Lys Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Ser Lys Asn Thr Leu Tyr
65 70 75 80
Leu Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys
85 90 95
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100 105 110
Thr Leu Val Thr Val Ser Ser
115
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<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> TAR2h-82 anti-TNFR1 dAb
<400> 202
Glu Val Gln Leu Leu Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly Gly
1 5 10 15
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Asp Ala Ser
20 25 30
Glu Met Asp Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val
35 40 45
Ser Ala Ile Ser Pro Ser Gly Ser Ala Thr Tyr Tyr Ala Asp Ser Val
50 55 60
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65 70 75 80
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85 90 95
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100 105 110
Gln Gly Thr Leu Val Thr Val Ser Ser
115 120
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<211> 123
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> TAR2h-83 anti-TNFR1 dAb
<400> 203
Glu Val Gln Leu Leu Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly Gly
1 5 10 15
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Ser Ala Tyr
20 25 30
Asn Met Ala Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val
35 40 45
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50 55 60
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65 70 75 80
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<211> 120
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> TAR2h-84 anti-TNFR1 dAb
<400> 204
Glu Val Gln Leu Leu Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly Gly
1 5 10 15
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Ala Asp Tyr
20 25 30
Gln Met Ala Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val
35 40 45
Ser Arg Ile Asp Arg Gly Gly Phe His Thr Tyr Tyr Ala Asp Ser Val
50 55 60
Lys Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Ser Lys Asn Thr Leu Tyr
65 70 75 80
Leu Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys
85 90 95
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100 105 110
Gly Thr Leu Val Thr Val Ser Ser
115 120
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<211> 120
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> TAR2h-85 anti-TNFR1 dAb
<400> 205
Glu Val Gln Leu Leu Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly Gly
1 5 10 15
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Lys Asp Tyr
20 25 30
Asn Met Met Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val
35 40 45
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50 55 60
Lys Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Ser Lys Asn Thr Leu Tyr
65 70 75 80
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85 90 95
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20 25 30
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50 55 60
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65 70 75 80
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<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> TAR2h-87 anti-TNFR1 dAb
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<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> TAR2h-88 anti-TNFR1 dAb
<400> 208
Glu Val Gln Leu Leu Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly Gly
1 5 10 15
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Glu Arg Tyr
20 25 30
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115 120
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<211> 122
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> TAR2h-89 anti-TNFR1 dAb
<220>
<221> VARIANT
<222> (30)...(30)
<223> Xaa= Any Amino Acid
<400> 209
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1 5 10 15
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20 25 30
Asn Met Val Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val
35 40 45
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50 55 60
Lys Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Ser Lys Asn Thr Leu Tyr
65 70 75 80
Leu Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys
85 90 95
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100 105 110
Gly Gln Gly Thr Leu Val Thr Val Ser Ser
115 120
<210> 210
<211> 122
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> TAR2h-90 anti-TNFR1 dAb
<400> 210
Glu Val Gln Leu Leu Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly Gly
1 5 10 15
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Lys Gln Tyr
20 25 30
Asn Met Tyr Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val
35 40 45
Ser Phe Ile Ser Pro Ser Gly Gly Glu Thr Tyr Tyr Ala Asp Ser Val
50 55 60
Lys Gly Arg Phe Thr Thr Ser Arg Asp Asn Ser Lys Asn Thr Leu Tyr
65 70 75 80
Leu Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys
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100 105 110
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<211> 120
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> TAR2h-91 anti-TNFR1 dAb
<400> 211
Glu Val Gln Leu Leu Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly Gly
1 5 10 15
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Ala Asp Tyr
20 25 30
Gln Met Ala Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val
35 40 45
Ser Arg Ile Asp Arg Gly Gly Phe His Thr Tyr Tyr Ala Asp Ser Val
50 55 60
Lys Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Ser Lys Asn Thr Leu Tyr
65 70 75 80
Leu Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys
85 90 95
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Gly Thr Leu Val Thr Val Ser Ser
115 120
<210> 212
<211> 120
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> TAR2h-92 anti-TNFR1 dAb
<400> 212
Glu Val Gln Leu Leu Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly Gly
1 5 10 15
Ser Leu Arg Leu Thr Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Asp Asp Val
20 25 30
Asn Met Thr Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val
35 40 45
Ser Ala Ile Gly Pro Ser Gly Thr Glu Thr Tyr Tyr Ala Asp Ser Val
50 55 60
Lys Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Ser Lys Asn Thr Leu Tyr
65 70 75 80
Leu Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys
85 90 95
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100 105 110
Gly Thr Leu Val Thr Val Ser Ser
115 120
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<211> 119
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> TAR2h-93 anti-TNFR1 dAb
<400> 213
Glu Val Gln Leu Leu Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly Gly
1 5 10 15
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Gly Asn Gly
20 25 30
Asn Met Val Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val
35 40 45
Ser His Ile Asp Glu Tyr Gly Thr Asn Thr Tyr Tyr Ala Asp Ser Val
50 55 60
Lys Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Ser Lys Asn Thr Leu Tyr
65 70 75 80
Leu Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys
85 90 95
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100 105 110
Thr Leu Val Thr Val Ser Ser
115
<210> 214
<211> 119
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> TAR2h-94 anti-TNFR1 dAb
<400> 214
Glu Val Gln Leu Leu Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly Gly
1 5 10 15
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Ser Arg Glu
20 25 30
Asn Met His Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val
35 40 45
Ser Gly Ile Gly Pro Arg Gly Met Pro Thr Tyr Tyr Ala Asp Ser Val
50 55 60
Lys Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Ser Lys Asn Thr Leu Tyr
65 70 75 80
Leu Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys
85 90 95
Ala Lys Gly Met Asn Ser His Asp Gly Phe Asp Tyr Trp Gly Gln Gly
100 105 110
Thr Leu Val Thr Val Ser Ser
115
<210> 215
<211> 117
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> TAR2h-95 anti-TNFR1 dAb
<400> 215
Glu Val Gln Leu Leu Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly Gly
1 5 10 15
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Lys Gly Ser
20 25 30
Asn Met Gly Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val
35 40 45
Ser Leu Ile Asp Gly Arg Gly Gln His Thr Tyr Tyr Ala Asp Ser Val
50 55 60
Lys Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Ser Lys Asn Thr Leu Tyr
65 70 75 80
Leu Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys
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Ala Lys Pro Ser Val Arg Glu Phe Asp Tyr Arg Gly Gln Gly Thr Leu
100 105 110
Val Thr Val Ser Ser
115
<210> 216
<211> 121
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> TAR2h-96 anti-TNFR1 dAb
<400> 216
Glu Val Gln Leu Leu Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly Gly
1 5 10 15
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Ser Arg Glu
20 25 30
Asn Met His Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val
35 40 45
Ser Gly Ile Gly Pro Arg Gly Met Pro Thr Tyr Tyr Ala Asp Ser Val
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Lys Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Ser Lys Asn Thr Leu Tyr
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Leu Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys
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100 105 110
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<210> 217
<211> 116
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> TAR2h-97 anti-TNFR1 dAb
<400> 217
Glu Val Gln Leu Leu Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly Gly
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Thr Val Ser Ser
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<210> 218
<211> 117
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> TAR2h-99 anti-TNFR1 dAb
<400> 218
Glu Val Gln Leu Leu Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly Gly
1 5 10 15
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<210> 219
<211> 124
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> TAR2h-100 anti-TNFR1 dAb
<400> 219
Glu Val Gln Leu Leu Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly Gly
1 5 10 15
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20 25 30
Asn Met Tyr Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val
35 40 45
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Lys Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Ser Lys Asn Thr Leu Tyr
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85 90 95
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100 105 110
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115 120
<210> 220
<211> 122
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> TAR2h-101 anti-TNFR1 dAb
<400> 220
Glu Val Gln Leu Leu Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly Gly
1 5 10 15
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Asp Gln Tyr
20 25 30
Asp Met Ser Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val
35 40 45
Ser Leu Ile Asp Pro Ser Gly Gly His Thr Tyr Tyr Ala Asp Ser Val
50 55 60
Lys Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asn Asn Ser Lys Asn Thr Leu Tyr
65 70 75 80
Leu Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys
85 90 95
Ala Lys Pro Val Phe Ser Asp Trp Pro Ala Val Glu Phe Asp Tyr Trp
100 105 110
Gly Gln Gly Thr Leu Val Thr Val Ser Ser
115 120
<210> 221
<211> 122
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> TAR2h-102 anti-TNFR1 dAb
<400> 221
Glu Val Gln Leu Leu Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly Gly
1 5 10 15
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Asp Gln Tyr
20 25 30
Asp Met Ser Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val
35 40 45
Ser Leu Ile Asp Pro Ser Gly Gly His Thr Tyr Tyr Ala Asp Ser Val
50 55 60
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65 70 75 80
Leu Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys
85 90 95
Ala Lys Pro Val Phe Ser Asp Trp Pro Ala Val Glu Phe Asp Tyr Trp
100 105 110
Gly Gln Gly Thr Leu Val Thr Val Ser Ser
115 120
<210> 222
<211> 120
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> TAR2h-103 anti-TNFR1 dAb
<400> 222
Glu Val Gln Leu Leu Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly Gly
1 5 10 15
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Thr Arg Tyr
20 25 30
Ser Met Gly Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val
35 40 45
Ser Met Ile Asp Val Pro Gly Leu His Thr Tyr Tyr Ala Asp Ser Val
50 55 60
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65 70 75 80
Leu Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys
85 90 95
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100 105 110
Gly Thr Leu Val Thr Val Ser Ser
115 120
<210> 223
<211> 120
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> TAR2h-104 anti-TNFR1 dAb
<220>
<221> VARIANT
<222> (62)...(62)
<223> Xaa= Any Amino Acid
<220>
<221> VARIANT
<222> (104)...(104)
<223> Xaa= Any Amino Acid
<400> 223
Glu Val Gln Leu Leu Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly Gly
1 5 10 15
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Glu Trp Tyr
20 25 30
Trp Met Gly Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val
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100 105 110
Gly Thr Leu Val Thr Val Ser Ser
115 120
<210> 224
<211> 120
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> TAR2h-105 anti-TNFR1 dAb
<400> 224
Glu Val Gln Leu Leu Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly Gly
1 5 10 15
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Thr Arg Tyr
20 25 30
Ser Met Gly Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val
35 40 45
Ser Phe Ile Asp Pro Pro Ser Val His Thr Tyr Tyr Ala Asp Ser Val
50 55 60
Lys Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Ser Lys Asn Thr Leu Tyr
65 70 75 80
Leu Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys
85 90 95
Ala Lys Ile Ser Gln Phe Gly Ser Asn Ala Phe Asp Tyr Trp Gly Gln
100 105 110
Gly Thr Leu Val Thr Val Ser Ser
115 120
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<212> PRT
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<220>
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<400> 225
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Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Thr Arg Tyr
20 25 30
Ser Met Gly Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val
35 40 45
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50 55 60
Lys Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Ser Lys Asn Thr Leu Tyr
65 70 75 80
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85 90 95
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100 105 110
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<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
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<220>
<221> VARIANT
<222> (62)...(62)
<223> Xaa= Any Amino Acid
<400> 226
Glu Val Gln Leu Leu Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly Gly
1 5 10 15
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Thr Arg Tyr
20 25 30
Ser Met Gly Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val
35 40 45
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1 5 10 15
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35 40 45
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20 25 30
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20 25 30
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<220>
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<400> 242
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<213> Artificial Sequence
<220>
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<400> 243
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<220>
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<220>
<223> TAR2h-126 anti-TNFR1 dAb
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Glu Val Gln Leu Leu Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly Gly
1 5 10 15
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<210> 246
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<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> TAR2h-127 anti-TNFR1 dAb
<400> 246
Glu Val Gln Leu Leu Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Arg Pro Gly Gly
1 5 10 15
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Pro Glu Tyr
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<210> 247
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<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> TAR2h-128 anti-TNFR1 dAb
<400> 247
Glu Val Gln Leu Leu Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly Gly
1 5 10 15
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Ala Lys Tyr
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<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> TAR2h-129 anti-TNFR1 dAb
<400> 248
Glu Val Gln Leu Leu Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly Gly
1 5 10 15
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100 105 110
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<210> 249
<211> 119
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> TAR2h-130 anti-TNFR1 dAb
<400> 249
Glu Val Gln Leu Leu Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly Gly
1 5 10 15
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Leu Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys
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100 105 110
Thr Leu Val Thr Val Ser Ser
115
<210> 250
<211> 119
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> TAR2h-131 anti-TNFR1 dAb
<400> 250
Glu Val Gln Leu Leu Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly Gly
1 5 10 15
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Ala His Glu
20 25 30
Pro Met Val Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val
35 40 45
Ser His Ile Asp Arg Val Gly Gln Asp Thr Tyr Tyr Ala Asp Ser Val
50 55 60
Lys Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Ser Lys Asn Thr Leu Tyr
65 70 75 80
Leu Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys
85 90 95
Ala Lys Leu Pro Lys Arg Gly Pro Arg Phe Asp Tyr Trp Gly Gln Gly
100 105 110
Thr Leu Val Thr Val Ser Ser
115
<210> 251
<211> 121
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> TAR2h-132 anti-TNFR1 dAb
<400> 251
Glu Val Gln Leu Leu Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly Gly
1 5 10 15
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Glu Glu Ser
20 25 30
Val Met Gly Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val
35 40 45
Ser Ala Ile Ser Pro Gly Gly Ser Glu Thr Tyr Tyr Ala Asp Ser Val
50 55 60
Lys Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Ser Lys Asn Thr Leu Tyr
65 70 75 80
Leu Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Ala Ala Val Tyr Tyr Cys
85 90 95
Ala Lys Arg Thr Gly Pro Pro Gly Ser Thr Val Phe Asp Tyr Trp Gly
100 105 110
Gln Gly Thr Leu Val Thr Val Ser Ser
115 120
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<211> 116
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> TAR2h-133 anti-TNFR1 dAb
<400> 252
Glu Val Gln Leu Leu Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly Gly
1 5 10 15
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Gly Asp Glu
20 25 30
Pro Met His Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val
35 40 45
Ser Gly Ile Gly Lys Glu Gly Gln Pro Thr Tyr Tyr Ala Asp Ser Val
50 55 60
Lys Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Ser Lys Asn Thr Leu Tyr
65 70 75 80
Leu Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys
85 90 95
Ala Lys Leu Gly Gly Pro Phe Asp Tyr Trp Gly Gln Gly Thr Leu Val
100 105 110
Thr Val Ser Ser
115
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<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> TAR2h-151 anti-TNFR1 dAb
<400> 253
Glu Val Gln Leu Leu Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly Gly
1 5 10 15
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Asp Tyr Gly
20 25 30
Asn Met Phe Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val
35 40 45
Ser Ala Ile Ser Gly Ser Gly Gly Ser Thr Tyr Tyr Ala Asp Ser Val
50 55 60
Lys Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Ser Lys Asn Thr Leu Tyr
65 70 75 80
Leu Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys
85 90 95
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100 105 110
Gln Gly Thr Leu Val Thr Val Ser Ser
115 120
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<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> TAR2h-152 anti-TNFR1 dAb
<400> 254
Glu Val Gln Leu Leu Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly Gly
1 5 10 15
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Ala Lys Glu
20 25 30
Thr Met Ser Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val
35 40 45
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50 55 60
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65 70 75 80
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100 105 110
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115 120
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<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> TAR2h-153 anti-TNFR1 dAb
<400> 255
Glu Val Gln Leu Leu Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly Gly
1 5 10 15
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Gly Asn Gly
20 25 30
Asn Met Val Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val
35 40 45
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50 55 60
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65 70 75 80
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100 105 110
Thr Leu Val Thr Val Ser Ser
115
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<211> 119
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<213> Artificial Sequence
<220>
<223> TAR2h-154 anti-TNFR1 dAb
<220>
<221> VARIANT
<222> (53)...(53)
<223> Xaa = Any Amino Acid
<400> 256
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Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Gly Asn Gly
20 25 30
Asn Met Val Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val
35 40 45
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50 55 60
Lys Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Ser Lys Asn Thr Leu Tyr
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Leu Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Gly Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys
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100 105 110
Thr Leu Val Thr Val Ser Ser
115
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<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> TAR2h-159 anti-TNFR1 dAb
<400> 257
Glu Val Gln Leu Leu Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly Gly
1 5 10 15
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Ala Gly Gln
20 25 30
Asp Met Arg Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val
35 40 45
Ser Ser Ile Pro Ser Ser Gly Phe Asn Thr Tyr Tyr Ala Asp Ser Val
50 55 60
Lys Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Ser Lys Asn Thr Leu Tyr
65 70 75 80
Leu Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys
85 90 95
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<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> TAR2h-165 anti-TNFR1 dAb
<400> 258
Glu Val Gln Leu Leu Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly Gly
1 5 10 15
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20 25 30
Asp Met Val Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val
35 40 45
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50 55 60
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65 70 75 80
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100 105 110
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115 120
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<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> TAR2h-166 anti-TNFR1 dAb
<400> 259
Glu Val Gln Leu Leu Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly Gly
1 5 10 15
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Ser Ser Tyr
20 25 30
Ala Met Ser Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val
35 40 45
Ser Ala Ile Ser Gly Ser Gly Gly Ser Thr Tyr Tyr Ala Asp Ser Val
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Lys Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Ser Lys Asn Thr Leu Tyr
65 70 75 80
Leu Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys
85 90 95
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100 105 110
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115 120
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<211> 120
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> TAR2h-168 anti-TNFR1 dAb
<400> 260
Glu Val Gln Leu Leu Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly Gly
1 5 10 15
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe His Asp Asp
20 25 30
Asp Met Val Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val
35 40 45
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50 55 60
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100 105 110
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115 120
<210> 261
<211> 116
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> TAR2h-171 anti-TNFR1 dAb
<400> 261
Glu Val Gln Leu Leu Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly Gly
1 5 10 15
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Gly Asp Asp
20 25 30
Trp Met Thr Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val
35 40 45
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50 55 60
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65 70 75 80
Leu Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Ala Ala Val Tyr Tyr Cys
85 90 95
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100 105 110
Thr Val Ser Ser
115
<210> 262
<211> 120
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> TAR2h-172 anti-TNFR1 dAb
<400> 262
Glu Val Gln Leu Leu Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly Gly
1 5 10 15
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Val Glu Arg
20 25 30
Pro Met Asp Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val
35 40 45
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50 55 60
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65 70 75 80
Leu Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys
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100 105 110
Gly Thr Leu Val Thr Val Ser Ser
115 120
<210> 263
<211> 119
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> TAR2h-173 anti-TNFR1 dAb
<400> 263
Glu Val Gln Leu Leu Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly Gly
1 5 10 15
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Thr Gly Gln
20 25 30
Asp Met Gln Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val
35 40 45
Ser Gly Ile Asn Ala Asp Gly Met Ala Thr Tyr Tyr Ala Asp Ser Val
50 55 60
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<210> 264
<211> 118
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> TAR2h-174 anti-TNFR1 dAb
<400> 264
Glu Val Gln Leu Leu Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly Gly
1 5 10 15
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Gly Glu Glu
20 25 30
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100 105 110
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115
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<211> 120
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> TAR2h-176 anti-TNFR1 dAb
<400> 265
Glu Val Gln Leu Leu Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly Gly
1 5 10 15
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe His Arg Cys
20 25 30
Lys Met Gly Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val
35 40 45
Ser Phe Ile Glu Tyr Asp Gly Arg Asp Thr Tyr Tyr Ala Asp Ser Val
50 55 60
Lys Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Ser Lys Asn Thr Leu Tyr
65 70 75 80
Leu Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys
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100 105 110
Gly Thr Leu Val Thr Val Ser Ser
115 120
<210> 266
<211> 120
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> TAR2h-178 anti-TNFR1 dAb
<400> 266
Glu Val Gln Leu Leu Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly Gly
1 5 10 15
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Asn Arg Tyr
20 25 30
Ser Met Gly Trp Leu Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val
35 40 45
Ser Phe Ile Asp Lys Val Gly His His Thr Trp Tyr Glu Asp Pro Val
50 55 60
Lys Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Ser Lys Asn Thr Leu Tyr
65 70 75 80
Leu Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys
85 90 95
Ala Lys Ile Ser Gln Phe Gly Pro Asn Ala Phe Asp Tyr Trp Gly Gln
100 105 110
Gly Thr Gln Val Thr Val Ser Ser
115 120
<210> 267
<211> 120
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> TAR2h-201 anti-TNFR1 dAb
<220>
<221> VARIANT
<222> (101)...(101)
<223> Xaa = Any Amino Acid
<400> 267
Glu Val Gln Leu Leu Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly Gly
1 5 10 15
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Thr Arg Tyr
20 25 30
Ser Met Gly Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val
35 40 45
Ser Met Ile Ala His Ala Gly Pro Glu Arg Tyr Tyr Ala Asp Ser Val
50 55 60
Lys Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Ser Lys Asn Thr Leu Tyr
65 70 75 80
Leu Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys
85 90 95
Ala Lys Ile Ser Xaa Phe Gly Ser Asn Ala Phe Asp Tyr Trp Gly Gln
100 105 110
Gly Thr Leu Val Thr Val Ser Ser
115 120
<210> 268
<211> 120
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> TAR2h-202 anti-TNFR1 dAb
<400> 268
Glu Val Gln Leu Leu Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly Gly
1 5 10 15
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Thr Arg Tyr
20 25 30
Asn Met Gly Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val
35 40 45
Ser Phe Ile Asp Pro Pro Ser Val His Thr Tyr Tyr Ala Asp Ser Val
50 55 60
Lys Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Ser Lys Asn Thr Leu Tyr
65 70 75 80
Leu Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys
85 90 95
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100 105 110
Gly Thr Leu Val Thr Val Ser Ser
115 120
<210> 269
<211> 120
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> TAR2h-203 anti-TNFR1 dAb
<220>
<221> VARIANT
<222> (96)...(96)
<223> Xaa = Any Amino Acid
<400> 269
Glu Val Gln Leu Leu Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly Gly
1 5 10 15
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Thr Arg Tyr
20 25 30
Ser Met Gly Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val
35 40 45
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Leu Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Xaa
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100 105 110
Gly Thr Leu Val Thr Val Ser Ser
115 120
<210> 270
<211> 120
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> TAR2h-204 anti-TNFR1 dAb
<400> 270
Glu Val Gln Leu Phe Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly Gly
1 5 10 15
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Thr Arg Tyr
20 25 30
Ser Met Gly Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val
35 40 45
Ser Met Ile Ala His Ala Gly Pro Glu Thr Tyr Tyr Ala Asp Ser Val
50 55 60
Lys Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Ser Lys Asn Thr Leu Tyr
65 70 75 80
Leu Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys
85 90 95
Ala Lys Ile Ser Gln Phe Gly Ser Asn Ala Leu Asp Tyr Trp Gly Arg
100 105 110
Gly Thr Leu Val Thr Val Ser Ser
115 120
<210> 271
<211> 122
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> TAR2h-185-25 anti-TNFR1 dAb
<400> 271
Glu Val Gln Leu Leu Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly Gly
1 5 10 15
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Ala Arg Tyr
20 25 30
Asn Met Gly Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val
35 40 45
Ser Leu Ile Asp Pro Ser Gly Gly His Thr Tyr Tyr Ala Asp Ser Val
50 55 60
Lys Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asn Asn Ser Lys Asn Thr Leu Tyr
65 70 75 80
Leu Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys
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Gly Lys Pro Val Phe Ser Asp Trp Pro Ala Val Glu Phe Asp Tyr Trp
100 105 110
Gly Gln Gly Thr Val Val Thr Val Ser Ser
115 120
<210> 272
<211> 119
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> TAR2h-154-10 anti-TNFR1 dAb
<400> 272
Glu Val Gln Leu Leu Glu Ser Gly Gly Gly Met Val Gln Pro Gly Gly
1 5 10 15
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Glu His Glu
20 25 30
Gly Met Val Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val
35 40 45
Ser His Ile Gly Glu Asp Gly Gln Ser Thr Tyr Tyr Ala Asp Ser Val
50 55 60
Lys Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Ser Lys Asn Thr Leu Tyr
65 70 75 80
Leu Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys
85 90 95
Ala Asn Ile Pro Lys Ala Gly Pro Ser Phe Asp Tyr Trp Gly Gln Gly
100 105 110
Thr Leu Val Thr Val Ser Ser
115
<210> 273
<211> 119
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> TAR2h-205 anti-TNFR1 dAb
<400> 273
Glu Val Gln Leu Leu Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly Gly
1 5 10 15
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Val Lys Tyr
20 25 30
Ser Met Gly Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val
35 40 45
Ser Gln Ile Ser Asn Thr Gly Gly His Thr Tyr Tyr Ala Asp Ser Val
50 55 60
Lys Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Ser Lys Asn Thr Leu Tyr
65 70 75 80
Leu Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys
85 90 95
Ala Lys Tyr Thr Gly Arg Trp Glu Pro Phe Asp Tyr Trp Gly Gln Gly
100 105 110
Thr Leu Val Thr Val Ser Ser
115
<210> 274
<211> 119
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> TAR2h-5d1 anti-TNFR1 dAb
<400> 274
Glu Val Gln Leu Leu Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly Gly
1 5 10 15
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Pro Val Tyr
20 25 30
Met Met Gly Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val
35 40 45
Ser Ser Ile Asp Ala Leu Gly Gly Arg Thr Gly Tyr Ala Asp Ser Val
50 55 60
Lys Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Ser Lys Asn Thr Leu Tyr
65 70 75 80
Leu Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys
85 90 95
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100 105 110
Gly Thr Leu Val Thr Val Ser
115
<210> 275
<211> 114
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> TAR2h-5d2 anti-TNFR1 dAb
<400> 275
Glu Val Gln Leu Leu Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly Gly
1 5 10 15
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Val Ala Tyr
20 25 30
Asn Met Thr Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val
35 40 45
Ser Ser Ile Asn Thr Phe Gly Asn Thr Arg Tyr Ala Asp Ser Val Lys
50 55 60
Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Ser Lys Asn Thr Leu Tyr Leu
65 70 75 80
Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys Ala
85 90 95
Lys Gly Ser Arg Pro Phe Asp Tyr Trp Gly Gln Gly Thr Leu Val Thr
100 105 110
Val Ser
<210> 276
<211> 118
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> TAR2h-5d3 anti-TNFR1 dAb
<400> 276
Glu Val Gln Leu Leu Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly Gly
1 5 10 15
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Gly Tyr Arg
20 25 30
Met Gly Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val Ser
35 40 45
Trp Ile Thr Arg Thr Gly Gly Thr Thr Gln Tyr Ala Asp Ser Val Lys
50 55 60
Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Ser Lys Asn Thr Leu Tyr Leu
65 70 75 80
Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys Ala
85 90 95
Lys Pro Ala Lys Leu Val Gly Val Gly Phe Asp Tyr Trp Gly Gln Gly
100 105 110
Thr Leu Val Thr Val Ser
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<212> PRT
<213> Artificial Sequence
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1 5 10 15
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Arg Lys Tyr
20 25 30
Met Gly Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val Ser
35 40 45
Gln Ile Gly Ala Lys Gly Gln Ser Thr Asp Tyr Ala Asp Ser Val Lys
50 55 60
Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Ser Lys Asn Thr Leu Tyr Leu
65 70 75 80
Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys Ala
85 90 95
Lys Lys Lys Arg Gly Glu Asn Tyr Phe Phe Asp Tyr Trp Gly Gln Gly
100 105 110
Thr Leu Val Thr Val Ser
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1 5 10 15
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Arg Arg Tyr
20 25 30
Ser Met Ser Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val
35 40 45
Ser Asp Ile Ser Arg Ser Gly Arg Tyr Thr His Tyr Ala Asp Ser Val
50 55 60
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65 70 75 80
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100 105 110
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20 25 30
Met Phe Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val Ser
35 40 45
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50 55 60
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65 70 75 80
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100 105 110
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20 25 30
Ala Met Trp Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val
35 40 45
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50 55 60
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65 70 75 80
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100 105 110
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20 25 30
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65 70 75 80
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100 105 110
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20 25 30
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100 105 110
Thr Leu Val Thr Val Ser
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Glu Val Gln Leu Leu Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly Gly
1 5 10 15
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Arg Arg Tyr
20 25 30
Lys Met Gly Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val
35 40 45
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50 55 60
Lys Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Ser Lys Asn Thr Leu Tyr
65 70 75 80
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85 90 95
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20 25 30
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20 25 30
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50 55 60
Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Ser Lys Asn Thr Leu Tyr Leu
65 70 75 80
Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys Ala
85 90 95
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100 105 110
Thr Leu Val Thr Val Ser
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<223> TAR2h-5d1 variant anti-TNFR1 dAb
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20 25 30
Met Met Gly Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val
35 40 45
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20 25 30
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100 105 110
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20 25 30
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Glu Val Gln Leu Leu Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly Gly
1 5 10 15
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Arg Lys Tyr
20 25 30
Xaa Met Gly Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val
35 40 45
Ser Gln Ile Gly Ala Lys Gly Gln Ser Thr Asp Tyr Ala Asp Ser Val
50 55 60
Lys Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Ser Lys Asn Thr Leu Tyr
65 70 75 80
Leu Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys
85 90 95
Ala Lys Lys Lys Arg Gly Glu Asn Tyr Phe Phe Asp Tyr Trp Gly Gln
100 105 110
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20 25 30
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50 55 60
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65 70 75 80
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100 105 110
Thr Val Ser
115
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<213> Artificial Sequence
<220>
<223> TAR2h-5d9 variant anti-TNFR1 dAb
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<221> VARIANT
<222> (33)...(33)
<223> Xaa = Any Amino Acid
<400> 292
Glu Val Gln Leu Leu Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly Gly
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Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Lys Lys Tyr
20 25 30
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Ser Ala Ile Ser Gly Ser Gly Gly Ser Thr Tyr Tyr Ala Asp Ser Val
50 55 60
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<223> Xaa = Any Amino Acid
<400> 293
Glu Val Gln Leu Leu Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly Gly
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Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Xaa Ser Tyr
20 25 30
Arg Met Gly Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val
35 40 45
Ser Ser Ile Ser Ser Arg Gly Arg His Thr Ser Tyr Ala Asp Ser Val
50 55 60
Lys Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Ser Lys Asn Thr Leu Tyr
65 70 75 80
Leu Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys
85 90 95
Ala Lys Arg Val Pro Gly Arg Gly Arg Ser Phe Asp Tyr Trp Gly Gln
100 105 110
Gly Thr Leu Val Thr Val Ser
115
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<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> TAR2h-5d13 variant anti-TNFR1 dAb
<220>
<221> VARIANT
<222> (30)...(30)
<223> Xaa = Any Amino Acid
<400> 294
Glu Val Gln Leu Leu Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly Gly
1 5 10 15
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Xaa Arg Tyr
20 25 30
Gly Met Val Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val
35 40 45
Ser Ala Ile Ser Gly Ser Gly Gly Ser Thr Tyr Tyr Ala Asp Ser Val
50 55 60
Lys Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Ser Lys Asn Thr Leu Tyr
65 70 75 80
Leu Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys
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Gly Thr Leu Val Thr Val Ser
115
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<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Tar2h-131-1 anti-TNFR1 dAb
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Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Ala His Glu
20 25 30
Pro Met Val Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val
35 40 45
Ser His Ile Asp Arg Val Gly Gln Asp Thr Tyr Tyr Ala Asp Ser Val
50 55 60
Lys Gly Arg Phe Ile Ile Ser Arg Asp Asn Ser Lys Asn Thr Leu Tyr
65 70 75 80
Leu Gln Met Tyr Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys
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100 105 110
Thr Leu Val Thr Val Ser Ser
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<211> 119
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Tar2h-131-2 anti-TNFR1 dAb
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Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Ala His Glu
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Pro Met Val Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val
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Ala Arg Leu Pro Lys Arg Gly Pro Arg Phe Asp Tyr Trp Gly His Gly
100 105 110
Thr Leu Val Thr Val Ser Ser
115
<210> 297
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<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Tar2h-131-3 anti-TNFR1 dAb
<400> 297
Glu Val Gln Leu Leu Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly Gly
1 5 10 15
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Ala His Glu
20 25 30
Pro Met Val Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val
35 40 45
Ser His Ile Asp Arg Val Gly Gln Asp Thr Tyr Tyr Ala Asp Ser Val
50 55 60
Lys Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Ser Lys Asn Thr Leu Tyr
65 70 75 80
Leu Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys
85 90 95
Ala Ile Leu Pro Lys Arg Gly Pro Arg Phe Asp Tyr Trp Gly Gln Gly
100 105 110
Thr Leu Val Thr Val Ser Ser
115
<210> 298
<211> 119
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Tar2h-131-4 anti-TNFR1 dAb
<400> 298
Glu Val Gln Leu Leu Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly Gly
1 5 10 15
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Thr Ala Ser Gly Phe Thr Phe Ala His Glu
20 25 30
Pro Met Val Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val
35 40 45
Ser His Ile Asp Arg Val Gly Gln Asp Thr Tyr Tyr Ala Asp Ser Val
50 55 60
Lys Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Ser Lys Asn Thr Leu Tyr
65 70 75 80
Leu Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys
85 90 95
Ala Arg Leu Pro Lys Arg Gly Pro Arg Phe Asp Tyr Trp Gly Leu Gly
100 105 110
Thr Leu Val Thr Val Ser Ser
115
<210> 299
<211> 119
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Tar2h-131-5 anti-TNFR1 dAb
<400> 299
Glu Val Lys Leu Leu Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly Gly
1 5 10 15
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Ala His Glu
20 25 30
Pro Met Val Trp Ile Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val
35 40 45
Ser His Ile Asp Arg Val Gly Gln Asp Thr Tyr Tyr Ala Asp Ser Val
50 55 60
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65 70 75 80
Leu Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys
85 90 95
Ala Arg Leu Pro Lys Arg Gly Pro Arg Phe Asp Tyr Trp Gly Gln Gly
100 105 110
Thr Leu Val Thr Val Ser Ser
115
<210> 300
<211> 119
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Tar2h-131-6 anti-TNFR1 dAb
<400> 300
Glu Val Gln Leu Leu Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly Gly
1 5 10 15
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Ala His Glu
20 25 30
Pro Met Val Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val
35 40 45
Ser His Ile Asp Arg Val Gly Gln Asp Thr Tyr Tyr Ala Asp Ser Val
50 55 60
Lys Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Ser Lys Asn Thr Leu Tyr
65 70 75 80
Leu Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys
85 90 95
Ala Arg Leu Pro Lys Arg Gly Pro Arg Phe Asp Tyr Trp Gly Leu Gly
100 105 110
Thr Leu Val Thr Val Ser Ser
115
<210> 301
<211> 119
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Tar2h-131-7 anti-TNFR1 dAb
<400> 301
Glu Val Gln Leu Leu Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly Gly
1 5 10 15
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Ala His Glu
20 25 30
Pro Met Val Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val
35 40 45
Ser His Ile Asp Arg Ala Gly Gln Asp Thr Tyr Tyr Ala Asp Ser Val
50 55 60
Lys Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Ser Lys Asn Thr Leu Tyr
65 70 75 80
Leu Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys
85 90 95
Ala Arg Leu Pro Lys Arg Gly Pro Arg Phe Asp Tyr Trp Gly Leu Gly
100 105 110
Thr Leu Val Thr Val Ser Ser
115
<210> 302
<211> 119
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Tar2h-131-9 anti-TNFR1 dAb
<400> 302
Glu Val Gln Leu Leu Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Arg Pro Gly Gly
1 5 10 15
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Ala His Glu
20 25 30
Pro Met Val Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val
35 40 45
Ser His Ile Asp Arg Val Gly Gln Asp Thr Tyr Tyr Ala Asp Ser Val
50 55 60
Lys Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Ser Lys Asn Thr Leu Tyr
65 70 75 80
Leu Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys
85 90 95
Ala Arg Leu Pro Lys Arg Gly Pro Arg Phe Asp Tyr Trp Gly Leu Gly
100 105 110
Thr Leu Val Thr Val Ser Ser
115
<210> 303
<211> 119
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Tar2h-131-10 anti-TNFR1 dAb
<400> 303
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1 5 10 15
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Ala His Glu
20 25 30
Pro Met Val Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val
35 40 45
Ser His Ile Asp Arg Val Gly Gln Asp Thr Tyr Tyr Ala Asp Ser Val
50 55 60
Lys Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Ser Lys Asn Thr Leu Tyr
65 70 75 80
Leu Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Ile Tyr Tyr Cys
85 90 95
Ala Arg Leu Pro Lys Arg Gly Pro Arg Phe Asp Tyr Trp Gly Leu Gly
100 105 110
Thr Leu Val Thr Val Ser Ser
115
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<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Tar2h-131-11 anti-TNFR1 dAb
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1 5 10 15
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20 25 30
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35 40 45
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50 55 60
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65 70 75 80
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85 90 95
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100 105 110
Thr Leu Val Thr Val Ser Ser
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<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Tar2h-131-12 anti-TNFR1 dAb
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20 25 30
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35 40 45
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50 55 60
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65 70 75 80
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100 105 110
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<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Tar2h-131-13 anti-TNFR1 dAb
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1 5 10 15
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20 25 30
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35 40 45
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50 55 60
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65 70 75 80
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100 105 110
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115
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<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Tar2h-131-14 anti-TNFR1 dAb
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20 25 30
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35 40 45
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50 55 60
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65 70 75 80
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100 105 110
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<211> 119
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Tar2h-131-15 anti-TNFR1 dAb
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20 25 30
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35 40 45
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65 70 75 80
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85 90 95
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100 105 110
Thr Leu Val Thr Val Ser Ser
115
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<211> 119
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Tar2h-131-16 anti-TNFR1 dAb
<400> 309
Glu Val Gln Leu Leu Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly Gly
1 5 10 15
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Ala His Glu
20 25 30
Pro Met Val Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val
35 40 45
Ser His Ile Asp Arg Val Gly Gln Asp Thr Tyr Tyr Ala Asp Ser Val
50 55 60
Lys Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Ser Lys Asn Thr Leu Tyr
65 70 75 80
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85 90 95
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100 105 110
Thr Leu Val Thr Val Ser Ser
115
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<211> 119
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Tar2h-131-17 anti-TNFR1 dAb
<400> 310
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1 5 10 15
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20 25 30
Pro Met Val Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val
35 40 45
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50 55 60
Lys Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Ser Lys Asn Thr Leu Tyr
65 70 75 80
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85 90 95
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100 105 110
Thr Leu Val Thr Val Ser Ser
115
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<211> 119
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Tar2h-131-18 anti-TNFR1 dAb
<400> 311
Glu Val Gln Leu Leu Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly Gly
1 5 10 15
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Ala His Glu
20 25 30
Pro Met Val Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val
35 40 45
Ser His Ile Asp Arg Val Gly Gln Asp Thr Tyr Tyr Ala Asp Ser Ala
50 55 60
Lys Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Ser Lys Asn Thr Leu Tyr
65 70 75 80
Leu Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Ile Tyr Tyr Cys
85 90 95
Ala Arg Leu Pro Lys Arg Gly Pro Arg Phe Asp Tyr Trp Gly Leu Gly
100 105 110
Thr Leu Val Thr Val Ser Ser
115
<210> 312
<211> 119
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Tar2h-131-19 anti-TNFR1 dAb
<400> 312
Glu Val Gln Leu Leu Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly Gly
1 5 10 15
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Ala His Glu
20 25 30
Pro Met Val Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val
35 40 45
Ser His Ile Asp Arg Val Gly Gln Asp Thr Tyr Tyr Ala Asp Ser Val
50 55 60
Lys Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Ser Lys Asn Thr Leu Tyr
65 70 75 80
Pro Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Ile Tyr Tyr Cys
85 90 95
Ala Arg Leu Pro Lys Arg Gly Pro Arg Phe Asp Tyr Trp Gly Leu Gly
100 105 110
Thr Leu Val Thr Val Ser Ser
115
<210> 313
<211> 119
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Tar2h-131-20 anti-TNFR1 dAb
<400> 313
Glu Val Gln Leu Leu Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly Gly
1 5 10 15
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Ala His Glu
20 25 30
Pro Met Val Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val
35 40 45
Ser His Ile Asp Arg Val Gly Gln Asp Thr Tyr Tyr Ala Asp Ser Val
50 55 60
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65 70 75 80
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85 90 95
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100 105 110
Thr Leu Val Thr Val Ser Ser
115
<210> 314
<211> 119
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Tar2h-131-21 anti-TNFR1 dAb
<400> 314
Glu Val Gln Leu Leu Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly Gly
1 5 10 15
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Ala His Glu
20 25 30
Pro Met Val Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val
35 40 45
Ser His Ile Asp Arg Val Gly Gln Asp Thr Tyr Tyr Ala Asp Ser Val
50 55 60
Lys Gly Arg Phe Ile Ile Ser Arg Asp Asn Ser Lys Asn Thr Leu Tyr
65 70 75 80
Leu Gln Met Tyr Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys
85 90 95
Ala Met Leu Pro Lys Arg Gly Pro Arg Phe Gly Tyr Trp Gly Gln Gly
100 105 110
Thr Leu Val Thr Val Ser Ser
115
<210> 315
<211> 119
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Tar2h-131-22 anti-TNFR1 dAb
<400> 315
Glu Val Gln Leu Leu Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly Gly
1 5 10 15
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Ala His Glu
20 25 30
Pro Met Val Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val
35 40 45
Ser His Ile Asp Arg Val Gly Gln Asp Thr Tyr Tyr Ala Asp Ser Val
50 55 60
Lys Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Ser Lys Asn Thr Leu Tyr
65 70 75 80
Leu Gln Met Asn Ser Leu Cys Ala Glu Asp Thr Ala Ile Tyr Tyr Cys
85 90 95
Ala Arg Leu Pro Lys Arg Gly Pro Arg Phe Asp Tyr Trp Gly Leu Gly
100 105 110
Thr Leu Val Thr Val Ser Ser
115
<210> 316
<211> 119
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Tar2h-131-23 anti-TNFR1 dAb
<400> 316
Glu Val Gln Leu Leu Glu Ser Gly Gly Gly Leu Ile Gln Pro Gly Gly
1 5 10 15
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Ala His Glu
20 25 30
Thr Met Val Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val
35 40 45
Ser His Ile Asp Arg Val Gly Gln Asp Thr Tyr Tyr Ala Asp Ser Val
50 55 60
Lys Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Ser Lys Asn Thr Leu Tyr
65 70 75 80
Leu Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys
85 90 95
Ala Gly Leu Pro Lys Arg Gly Pro Trp Phe Asp Tyr Arg Gly Gln Gly
100 105 110
Thr Leu Val Thr Val Ser Ser
115
<210> 317
<211> 119
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Tar2h-131-25 anti-TNFR1 dAb
<400> 317
Glu Val Gln Leu Leu Glu Ser Gly Gly Gly Leu Ile Gln Pro Gly Gly
1 5 10 15
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Ala His Glu
20 25 30
Thr Met Val Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val
35 40 45
Ser His Ile Asp Arg Val Gly Gln Asp Thr Tyr Tyr Ala Asp Ser Val
50 55 60
Lys Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Ser Lys Asn Thr Leu Tyr
65 70 75 80
Leu Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys
85 90 95
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100 105 110
Thr Leu Val Thr Val Ser Ser
115
<210> 318
<211> 119
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Tar2h-131-26 anti-TNFR1 dAb
<400> 318
Glu Val Gln Leu Leu Glu Ser Gly Gly Gly Leu Ile Gln Pro Gly Gly
1 5 10 15
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Ala His Glu
20 25 30
Thr Met Val Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val
35 40 45
Ser His Ile Asp Arg Val Gly Gln Asp Thr Tyr Tyr Ala Asp Ser Val
50 55 60
Lys Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Ser Lys Asn Thr Leu Tyr
65 70 75 80
Leu Gln Met Asn Ser Leu Arg Val Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys
85 90 95
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100 105 110
Thr Leu Val Thr Val Ser Ser
115
<210> 319
<211> 119
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Tar2h-131-27 anti-TNFR1 dAb
<400> 319
Glu Val Gln Leu Leu Glu Ser Gly Gly Gly Leu Tyr Gln Pro Gly Gly
1 5 10 15
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Ala His Glu
20 25 30
Thr Met Val Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val
35 40 45
Ser His Ile Asp Arg Val Gly Gln Asp Thr Tyr Tyr Ala Asp Ser Val
50 55 60
Lys Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Ser Lys Asn Thr Leu Tyr
65 70 75 80
Leu Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys
85 90 95
Ala Lys Leu Pro Lys Arg Gly Pro Trp Phe Asp Tyr Arg Gly Gln Gly
100 105 110
Thr Leu Val Thr Val Ser Ser
115
<210> 320
<211> 119
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Tar2h-131-28 anti-TNFR1 dAb
<400> 320
Glu Val Gln Leu Leu Glu Ser Gly Gly Gly Leu Gly Gln Pro Gly Gly
1 5 10 15
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Ala His Glu
20 25 30
Thr Met Val Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val
35 40 45
Ser His Ile Asp Arg Val Gly Gln Asp Thr Tyr Tyr Ala Asp Ser Val
50 55 60
Lys Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Ser Lys Asn Thr Leu Tyr
65 70 75 80
Leu Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys
85 90 95
Ala Lys Leu Pro Lys Arg Gly Pro Trp Phe Asp Tyr Arg Gly Gln Gly
100 105 110
Thr Leu Val Thr Val Ser Ser
115
<210> 321
<211> 119
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Tar2h-131-29 anti-TNFR1 dAb
<220>
<221> VARIANT
<222> (12)...(12)
<223> Xaa = Any Amino Acid
<400> 321
Glu Gly Gln Leu Leu Glu Ser Gly Gly Gly Leu Xaa Gln Pro Gly Gly
1 5 10 15
Ser Leu Leu Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Ala His Glu
20 25 30
Thr Met Val Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val
35 40 45
Ser His Ile Asp Arg Val Gly Gln Asp Thr Tyr Tyr Ala Asp Ser Val
50 55 60
Lys Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Ser Lys Asn Thr Leu Tyr
65 70 75 80
Leu Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys
85 90 95
Ala Lys Leu Pro Lys Arg Gly Pro Trp Phe Asp Tyr Arg Gly Gln Gly
100 105 110
Thr Leu Val Thr Val Ser Ser
115
<210> 322
<211> 119
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Tar2h-131-30 anti-TNFR1 dAb
<400> 322
Glu Val Gln Leu Leu Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly Gly
1 5 10 15
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Ala His Glu
20 25 30
Thr Met Val Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val
35 40 45
Ser His Ile Asp Arg Val Gly Gln Asp Thr Tyr Tyr Ala Asp Ser Val
50 55 60
Lys Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Ser Lys Asn Thr Leu Tyr
65 70 75 80
Leu Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys
85 90 95
Ala Lys Leu Pro Lys Arg Gly Pro Trp Phe Asp Tyr Arg Gly Gln Gly
100 105 110
Thr Leu Val Thr Val Ser Ser
115
<210> 323
<211> 119
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Tar2h-131-31 anti-TNFR1 dAb
<400> 323
Glu Val Gln Leu Leu Glu Ser Gly Gly Gly Leu Ile Gln Pro Gly Gly
1 5 10 15
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Ala His Glu
20 25 30
Thr Met Val Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val
35 40 45
Ser His Ile Asp Arg Val Gly Gln Asp Pro Tyr Tyr Ala Asp Ser Val
50 55 60
Lys Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Ser Lys Asn Thr Leu Tyr
65 70 75 80
Leu Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys
85 90 95
Ala Lys Leu Pro Lys Arg Gly Pro Trp Phe Asp Tyr Arg Gly Gln Gly
100 105 110
Thr Leu Val Thr Val Ser Ser
115
<210> 324
<211> 119
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Tar2h-131-32 anti-TNFR1 dAb
<400> 324
Glu Gly Gln Leu Leu Glu Ser Gly Gly Gly Leu Ile Gln Pro Gly Gly
1 5 10 15
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Gly Ala Ser Gly Phe Thr Phe Ala His Glu
20 25 30
Thr Met Val Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val
35 40 45
Ser His Ile Asp Arg Val Gly Gln Asp Pro Tyr Tyr Ala Asp Ser Val
50 55 60
Lys Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Ser Lys Asn Thr Leu Tyr
65 70 75 80
Leu Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys
85 90 95
Ala Lys Leu Pro Lys Arg Gly Pro Trp Phe Asp Tyr Arg Gly Gln Gly
100 105 110
Thr Leu Val Thr Val Ser Ser
115
<210> 325
<211> 119
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Tar2h-131-33 anti-TNFR1 dAb
<400> 325
Glu Val Gln Leu Leu Glu Ser Gly Gly Gly Leu Ile Gln Pro Gly Gly
1 5 10 15
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Ala His Glu
20 25 30
Thr Met Val Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val
35 40 45
Ser His Ile Asp Arg Val Gly Gln Asp Asn Tyr Tyr Ala Asp Ser Val
50 55 60
Lys Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Ser Lys Asn Thr Leu Tyr
65 70 75 80
Leu Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys
85 90 95
Ala Lys Leu Pro Lys Arg Gly Pro Trp Phe Asp Tyr Arg Gly Gln Gly
100 105 110
Thr Leu Val Thr Val Ser Ser
115
<210> 326
<211> 119
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Tar2h-131-34 anti-TNFR1 dAb
<400> 326
Glu Val Gln Leu Leu Glu Ser Gly Gly Gly Leu Ile Gln Pro Gly Gly
1 5 10 15
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Ala His Glu
20 25 30
Thr Met Val Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val
35 40 45
Ser His Ile Asp Arg Val Gly Gln Asp Thr Tyr Tyr Ala Asp Ser Val
50 55 60
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65 70 75 80
Leu Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys
85 90 95
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100 105 110
Thr Leu Val Thr Val Ser Ser
115
<210> 327
<211> 119
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Tar2h-131-35 anti-TNFR1 dAb
<400> 327
Glu Val Gln Leu Leu Glu Ser Gly Gly Gly Leu Ile Gln Pro Gly Gly
1 5 10 15
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Ala His Glu
20 25 30
Thr Met Val Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val
35 40 45
Ser His Ile Asp Arg Val Gly Gln Asp Thr Tyr Tyr Ala Asp Ser Val
50 55 60
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65 70 75 80
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100 105 110
Thr Leu Val Thr Val Ser Ser
115
<210> 328
<211> 119
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Tar2h-131-36 anti-TNFR1 dAb
<400> 328
Glu Val Gln Leu Leu Glu Ser Gly Gly Gly Leu Ile Gln Pro Gly Gly
1 5 10 15
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Ala His Glu
20 25 30
Thr Met Val Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val
35 40 45
Ser His Ile Asp Arg Val Gly Gln Asp Thr Tyr Tyr Ala Asp Ser Val
50 55 60
Lys Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Ser Lys Asn Thr Leu Tyr
65 70 75 80
Leu Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys
85 90 95
Ala Lys Leu Pro Lys Arg Gly Pro Trp Phe Asp Tyr Tyr Gly Gln Gly
100 105 110
Thr Leu Val Thr Val Ser Ser
115
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<211> 119
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Tar2h-131-37 anti-TNFR1 dAb
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1 5 10 15
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20 25 30
Thr Met Val Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val
35 40 45
Ser His Ile Asp Arg Val Gly Gln Asp Thr Tyr Tyr Ala Asp Ser Val
50 55 60
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65 70 75 80
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85 90 95
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100 105 110
Thr Leu Val Thr Val Ser Ser
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20 25 30
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35 40 45
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50 55 60
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65 70 75 80
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100 105 110
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20 25 30
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35 40 45
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100 105 110
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<213> Artificial Sequence
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<220>
<221> VARIANT
<222> (32)...(32)
<223> Xaa = Any Amino Acid
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100 105 110
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<213> Artificial Sequence
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100 105 110
Thr Leu Val Thr Val Ser Ser
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<211> 119
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<213> Artificial Sequence
<220>
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<211> 119
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<213> Artificial Sequence
<220>
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<211> 119
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Tar2h-131-57 anti-TNFR1 dAb
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<213> Artificial Sequence
<220>
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100 105 110
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<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Tar2h-131-59 anti-TNFR1 dAb
<400> 351
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85 90 95
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100 105 110
Thr Leu Val Thr Val Ser Ser
115
<210> 352
<211> 119
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Tar2h-131-60 anti-TNFR1 dAb
<400> 352
Glu Val Gln Leu Leu Glu Ser Gly Gly Gly Leu Ile Gln Pro Gly Gly
1 5 10 15
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Ala His Glu
20 25 30
Thr Met Val Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val
35 40 45
Ser His Ile Asp Arg Val Gly Gln Asp Thr Tyr Tyr Ala Asp Ser Val
50 55 60
Lys Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Ser Lys Asn Thr Leu Phe
65 70 75 80
Leu Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys
85 90 95
Ala Arg Leu Pro Lys Arg Gly Pro Trp Phe Asp Tyr Arg Gly Arg Gly
100 105 110
Thr Leu Val Thr Val Ser Ser
115
<210> 353
<211> 119
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Tar2h-131-61 anti-TNFR1 dAb
<400> 353
Glu Val Gln Leu Leu Glu Ser Gly Gly Gly Leu Ile Gln Pro Gly Gly
1 5 10 15
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20 25 30
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35 40 45
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<210> 354
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<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Tar2h-131-62 anti-TNFR1 dAb
<400> 354
Glu Val Gln Leu Leu Glu Ser Gly Gly Gly Leu Ile Gln Pro Gly Gly
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65 70 75 80
Leu Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys
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100 105 110
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100 105 110
Thr Leu Val Thr Val Ser Ser
115
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<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Tar2h-131-195 anti-TNFR1 dAb
<400> 435
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1 5 10 15
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20 25 30
Thr Met Val Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val
35 40 45
Ser His Ile Pro Pro Val Gly Gln Asp Pro Phe Tyr Ala Asp Ser Val
50 55 60
Lys Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Ser Lys Asn Thr Leu Tyr
65 70 75 80
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85 90 95
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100 105 110
Thr Leu Val Thr Val Ser Ser
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<213> Artificial Sequence
<220>
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1 5 10 15
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20 25 30
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35 40 45
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50 55 60
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65 70 75 80
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20 25 30
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1 5 10 15
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20 25 30
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65 70 75 80
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Thr Leu Val Thr Val Ser Ser
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<213> Artificial Sequence
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<223> Tar2h-131-505 anti-TNFR1 dAb
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1 5 10 15
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35 40 45
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50 55 60
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65 70 75 80
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<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Tar2h-131-506 anti-TNFR1 dAb
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Glu Val Gln Leu Leu Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly Gly
1 5 10 15
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Ala His Glu
20 25 30
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35 40 45
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<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Tar2h-131-507 anti-TNFR1 dAb
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Glu Val Gln Leu Leu Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly Gly
1 5 10 15
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Ala His Glu
20 25 30
Thr Met Val Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val
35 40 45
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50 55 60
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65 70 75 80
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<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Tar2h-131-508 anti-TNFR1 dAb
<400> 447
Glu Val Gln Leu Leu Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly Gly
1 5 10 15
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Ala His Glu
20 25 30
Thr Met Val Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val
35 40 45
Ser His Ile Asp Gly Gly Gly Leu Gly Thr Tyr Tyr Ala Asp Ser Val
50 55 60
Lys Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Ser Lys Asn Thr Leu Tyr
65 70 75 80
Leu Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys
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Ala Leu Leu Pro Lys Arg Gly Pro Trp Phe Asp Tyr Trp Gly Gln Gly
100 105 110
Thr Leu Val Thr Val Ser Ser
115
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<211> 119
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Tar2h-131-509 anti-TNFR1 dAb
<400> 448
Glu Val Gln Leu Leu Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly Gly
1 5 10 15
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Ala His Glu
20 25 30
Thr Met Val Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val
35 40 45
Ser His Ile Asp Arg Val Gly Gln Asp Thr Tyr Tyr Ala Asp Ser Val
50 55 60
Lys Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Ser Lys Asn Thr Leu Tyr
65 70 75 80
Leu Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys
85 90 95
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100 105 110
Thr Leu Val Thr Val Ser Ser
115
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<211> 119
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Tar2h-131-510 anti-TNFR1 dAb
<400> 449
Glu Val Gln Leu Leu Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly Gly
1 5 10 15
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Asn Asn Lys
20 25 30
Thr Met Val Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val
35 40 45
Ser His Ile Asp Gly Arg Gly Glu Arg Thr Tyr Tyr Ala Asp Ser Val
50 55 60
Lys Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Ser Lys Asn Thr Leu Tyr
65 70 75 80
Leu Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys
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Ala Leu Leu Pro Lys Arg Gly Pro Trp Phe Asp Tyr Trp Gly Gln Gly
100 105 110
Thr Leu Val Thr Val Ser Ser
115
<210> 450
<211> 119
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Tar2h-131-511 anti-TNFR1 dAb
<400> 450
Glu Val Gln Leu Leu Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly Gly
1 5 10 15
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Ala His Glu
20 25 30
Thr Met Val Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val
35 40 45
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50 55 60
Lys Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Ser Lys Asn Thr Leu Tyr
65 70 75 80
Leu Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys
85 90 95
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100 105 110
Thr Leu Val Thr Val Ser Ser
115
<210> 451
<211> 119
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Tar2h-131-512 anti-TNFR1 dAb
<400> 451
Glu Val Gln Leu Leu Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly Gly
1 5 10 15
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Ala His Glu
20 25 30
Thr Met Val Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Arg Gly Leu Glu Trp Val
35 40 45
Ser His Ile Asp Arg Val Gly Gln Asp Thr Tyr Tyr Ala Asp Ser Val
50 55 60
Lys Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Ser Lys Asn Thr Leu Tyr
65 70 75 80
Leu Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys
85 90 95
Ala Leu Leu Pro Lys Arg Gly Pro Trp Phe Asp Tyr Trp Gly Gln Gly
100 105 110
Thr Leu Val Thr Val Ser Ser
115
<210> 452
<211> 119
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Tar2h-131-513 anti-TNFR1 dAb
<400> 452
Glu Val Gln Leu Leu Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly Gly
1 5 10 15
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Ala His Glu
20 25 30
Thr Met Val Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val
35 40 45
Ser His Ile Asp Arg Val Gly Gln Asp Thr Tyr Tyr Ala Asp Ser Val
50 55 60
Lys Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Ser Lys Asn Thr Leu Tyr
65 70 75 80
Leu Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys
85 90 95
Ala Arg Leu Pro Arg Arg Gly Pro Trp Phe Asp Tyr Trp Gly Gln Gly
100 105 110
Thr Leu Val Thr Val Ser Ser
115
<210> 453
<211> 119
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Tar2h-131-514 anti-TNFR1 dAb
<220>
<221> VARIANT
<222> (4)...(4)
<223> Xaa = any amino acid
<400> 453
Glu Val Gln Xaa Leu Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly Gly
1 5 10 15
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Ala His Glu
20 25 30
Thr Met Val Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val
35 40 45
Ser His Ile Asp Arg Val Gly Gln Asp Thr Tyr Tyr Ala Asp Ser Val
50 55 60
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65 70 75 80
Leu Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys
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100 105 110
Thr Leu Val Thr Val Ser Ser
115
<210> 454
<211> 119
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Tar2h-131-515 anti-TNFR1 dAb
<400> 454
Glu Val Gln Leu Leu Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly Gly
1 5 10 15
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Ala His Glu
20 25 30
Thr Met Val Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val
35 40 45
Ser His Ile Ser Asp Asp Gly Asn Ser Thr Tyr Tyr Ala Asp Ser Val
50 55 60
Lys Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Ser Lys Asn Thr Leu Tyr
65 70 75 80
Leu Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys
85 90 95
Ala Arg Leu Pro Lys Arg Gly Pro Trp Phe Asp Tyr Trp Gly Gln Gly
100 105 110
Thr Leu Val Thr Val Ser Ser
115
<210> 455
<211> 119
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Tar2h-131-516 anti-TNFR1 dAb
<400> 455
Glu Val Gln Leu Leu Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly Gly
1 5 10 15
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Ala His Glu
20 25 30
Ala Met Val Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val
35 40 45
Ser His Ile Asp Gly Gly Gly Glu Ser Thr Tyr Tyr Ala Asp Ser Val
50 55 60
Lys Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Ser Lys Asn Thr Leu Tyr
65 70 75 80
Leu Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys
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100 105 110
Thr Leu Val Thr Val Ser Ser
115
<210> 456
<211> 119
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Tar2h-131-517 anti-TNFR1 dAb
<400> 456
Glu Val Gln Leu Leu Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly Gly
1 5 10 15
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe His Asn Lys
20 25 30
Asp Met Val Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val
35 40 45
Ser His Ile Asp Gly Gly Gly Glu Ser Thr Tyr Tyr Ala Asp Ser Val
50 55 60
Lys Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Ser Lys Asn Thr Leu Tyr
65 70 75 80
Leu Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys
85 90 95
Ala Arg Leu Pro Leu Leu Leu Pro Trp Phe Asp Tyr Trp Gly Gln Gly
100 105 110
Thr Leu Val Thr Val Ser Ser
115
<210> 457
<211> 119
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Tar2h-131-518 anti-TNFR1 dAb
<400> 457
Glu Val Gln Leu Leu Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly Gly
1 5 10 15
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Ala Met Arg
20 25 30
Thr Met Val Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val
35 40 45
Ser His Ile Asp Gly Gly Gly Glu Ser Thr Tyr Tyr Ala Asp Ser Val
50 55 60
Lys Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Ser Lys Asn Thr Leu Tyr
65 70 75 80
Leu Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys
85 90 95
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100 105 110
Thr Leu Val Thr Val Ser Ser
115
<210> 458
<211> 119
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Tar2h-131-519 anti-TNFR1 dAb
<400> 458
Glu Val Gln Leu Leu Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly Gly
1 5 10 15
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Ala His Glu
20 25 30
Thr Met Val Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val
35 40 45
Ser His Ile Asp Gly Gly Gly Glu Ser Thr Tyr Tyr Ala Asp Ser Val
50 55 60
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65 70 75 80
Leu Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys
85 90 95
Ala Arg Leu Pro Lys Arg Gly Pro Trp Phe Asp Tyr Trp Gly Gln Gly
100 105 110
Thr Leu Val Thr Val Ser Ser
115
<210> 459
<211> 119
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Tar2h-131-520 anti-TNFR1 dAb
<400> 459
Glu Val Gln Leu Leu Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly Gly
1 5 10 15
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Ala His Glu
20 25 30
Thr Met Val Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val
35 40 45
Ser His Ile Asp Gly Gly Gly Leu Val Thr Tyr Tyr Thr Asp Ser Val
50 55 60
Lys Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Ser Lys Asn Thr Leu Tyr
65 70 75 80
Leu Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys
85 90 95
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100 105 110
Thr Leu Val Thr Val Ser Ser
115
<210> 460
<211> 119
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Tar2h-131-521 anti-TNFR1 dAb
<400> 460
Glu Val Gln Leu Leu Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly Gly
1 5 10 15
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Asn Asn Thr
20 25 30
Thr Met Val Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val
35 40 45
Ser His Ile Asp Gly Val Gly Gly Asp Thr Tyr Tyr Ala Asp Pro Val
50 55 60
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100 105 110
Thr Leu Val Thr Val Ser Ser
115
<210> 461
<211> 119
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Tar2h-131-522 anti-TNFR1 dAb
<400> 461
Glu Val Gln Leu Leu Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly Gly
1 5 10 15
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Ala Asn Lys
20 25 30
Thr Met Val Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val
35 40 45
Ser His Ile Asp Gly Leu Gly Leu Val Thr Tyr Tyr Ala Asp Ser Val
50 55 60
Glu Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Ser Lys Asn Thr Leu Tyr
65 70 75 80
Leu Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys
85 90 95
Ala Leu Leu Pro Lys Arg Gly Pro Trp Phe Asp Tyr Trp Gly Gln Gly
100 105 110
Thr Leu Val Thr Val Ser Ser
115
<210> 462
<211> 119
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Tar2h-131-523 anti-TNFR1 dAb
<400> 462
Glu Val Gln Leu Leu Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly Gly
1 5 10 15
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Asn Thr Thr
20 25 30
Asn Met Val Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val
35 40 45
Ser Glu Ile Arg Val Gly Gly Gly Asp Thr Tyr Tyr Ala Asp Ser Val
50 55 60
Lys Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Ser Lys Asn Thr Leu Tyr
65 70 75 80
Leu Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys
85 90 95
Ala Leu Leu Pro Lys Arg Gly Pro Trp Phe Asp Tyr Trp Gly Gln Gly
100 105 110
Thr Leu Val Thr Val Ser Ser
115
<210> 463
<211> 119
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Tar2h-131-524 anti-TNFR1 dAb
<400> 463
Glu Val Gln Leu Leu Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly Gly
1 5 10 15
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Lys Asn Lys
20 25 30
Thr Met Val Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val
35 40 45
Ser His Ile Asp Gln Glu Gly Glu Gly Thr Tyr Tyr Ala Asp Ser Val
50 55 60
Lys Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Ser Lys Asn Thr Leu Tyr
65 70 75 80
Leu Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys
85 90 95
Ala Leu Leu Pro Lys Arg Gly Pro Trp Phe Asp Tyr Arg Gly Gln Gly
100 105 110
Thr Leu Val Thr Val Ser Ser
115
<210> 464
<211> 119
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Tar2h-131-525 anti-TNFR1 dAb
<400> 464
Glu Val Gln Leu Leu Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly Gly
1 5 10 15
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Asn Asn Thr
20 25 30
Thr Met Val Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val
35 40 45
Ser His Ile Asp Gly Glu Gly Ser Val Thr Tyr Tyr Ala Asp Ser Val
50 55 60
Lys Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Ser Lys Asn Thr Leu Tyr
65 70 75 80
Leu Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys
85 90 95
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100 105 110
Thr Leu Val Thr Val Ser Ser
115
<210> 465
<211> 119
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Tar2h-131-526 anti-TNFR1 dAb
<400> 465
Glu Val Gln Leu Leu Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly Gly
1 5 10 15
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Glu Asn Lys
20 25 30
Thr Met Val Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val
35 40 45
Ser His Ile Asp Ala Thr Gly Thr Ile Thr Tyr Tyr Ala Asp Ser Val
50 55 60
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65 70 75 80
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85 90 95
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100 105 110
Thr Leu Val Thr Val Ser Ser
115
<210> 466
<211> 119
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Tar2h-131-527 anti-TNFR1 dAb
<400> 466
Glu Val Gln Leu Leu Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly Gly
1 5 10 15
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20 25 30
Thr Met Val Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val
35 40 45
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50 55 60
Lys Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Ser Lys Asn Thr Leu Tyr
65 70 75 80
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85 90 95
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100 105 110
Thr Leu Val Thr Val Ser Ser
115
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<211> 119
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Tar2h-131-528 anti-TNFR1 dAb
<220>
<221> VARIANT
<222> (4)...(4)
<223> Xaa = any amino acid
<400> 467
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100 105 110
Thr Leu Val Thr Val Ser Ser
115
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<211> 119
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Tar2h-131-529 anti-TNFR1 dAb
<400> 468
Glu Val Gln Leu Leu Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly Gly
1 5 10 15
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Ala His Glu
20 25 30
Thr Met Val Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val
35 40 45
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50 55 60
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100 105 110
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<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Tar2h-131-530 anti-TNFR1 dAb
<400> 469
Glu Val Gln Leu Leu Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly Gly
1 5 10 15
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20 25 30
Thr Met Val Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val
35 40 45
Ser His Ile Asp Gly Gly Gly Glu Ser Thr Tyr Tyr Ala Asp Pro Val
50 55 60
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65 70 75 80
Leu Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys
85 90 95
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100 105 110
Thr Leu Val Thr Val Ser Ser
115
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<211> 119
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Tar2h-131-531 anti-TNFR1 dAb
<400> 470
Glu Val Gln Leu Leu Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly Gly
1 5 10 15
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Glu Asn Lys
20 25 30
Thr Met Val Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val
35 40 45
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50 55 60
Glu Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Ser Lys Asn Thr Leu Tyr
65 70 75 80
Leu Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys
85 90 95
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100 105 110
Thr Leu Val Thr Val Ser Ser
115
<210> 471
<211> 119
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Tar2h-131-532 anti-TNFR1 dAb
<400> 471
Glu Val Gln Leu Leu Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly Gly
1 5 10 15
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Asn Lys Lys
20 25 30
Thr Met Val Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val
35 40 45
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50 55 60
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65 70 75 80
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100 105 110
Thr Leu Val Thr Val Ser Ser
115
<210> 472
<211> 119
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Tar2h-131-533 anti-TNFR1 dAb
<400> 472
Glu Val Gln Leu Leu Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly Gly
1 5 10 15
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Asn Lys Lys
20 25 30
Thr Met Val Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val
35 40 45
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50 55 60
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65 70 75 80
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100 105 110
Thr Leu Val Thr Val Ser Ser
115
<210> 473
<211> 119
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Tar2h-131-534 anti-TNFR1 dAb
<400> 473
Glu Val Gln Leu Leu Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly Gly
1 5 10 15
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Ala His Glu
20 25 30
Thr Met Val Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val
35 40 45
Ser His Ile Asp Gly Gly Gly Leu Val Thr Tyr Tyr Thr Asp Pro Val
50 55 60
Lys Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Ser Lys Asn Thr Leu Tyr
65 70 75 80
Leu Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys
85 90 95
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100 105 110
Thr Leu Val Thr Val Ser Ser
115
<210> 474
<211> 119
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Tar2h-131-535 anti-TNFR1 dAb
<400> 474
Glu Val Gln Leu Leu Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly Gly
1 5 10 15
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Ala His Glu
20 25 30
Thr Met Val Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val
35 40 45
Ser His Ile Asp Gly Gly Gly Leu Val Thr Tyr Tyr Thr Asp Ser Val
50 55 60
Glu Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Ser Lys Asn Thr Leu Tyr
65 70 75 80
Leu Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys
85 90 95
Ala Leu Leu Pro Lys Arg Gly Pro Trp Phe Asp Tyr Trp Gly Gln Gly
100 105 110
Thr Leu Val Thr Val Ser Ser
115
<210> 475
<211> 119
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Tar2h-131-536 anti-TNFR1 dAb
<400> 475
Glu Val Gln Leu Leu Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly Gly
1 5 10 15
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Ala His Glu
20 25 30
Thr Met Val Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val
35 40 45
Ser His Ile Asp Gly Gly Gly Leu Val Thr Tyr Tyr Thr Asp Pro Val
50 55 60
Glu Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Ser Lys Asn Thr Leu Tyr
65 70 75 80
Leu Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys
85 90 95
Ala Leu Leu Pro Lys Arg Gly Pro Trp Phe Asp Tyr Trp Gly Gln Gly
100 105 110
Thr Leu Val Thr Val Ser Ser
115
<210> 476
<211> 119
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Tar2h-131-537 anti-TNFR1 dAb
<400> 476
Glu Val Gln Leu Leu Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly Gly
1 5 10 15
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Ala His Glu
20 25 30
Thr Met Val Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val
35 40 45
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50 55 60
Glu Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Ser Lys Asn Thr Leu Tyr
65 70 75 80
Leu Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys
85 90 95
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100 105 110
Thr Leu Val Thr Val Ser Ser
115
<210> 477
<211> 119
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Tar2h-131-538 anti-TNFR1 dAb
<400> 477
Glu Val Gln Leu Leu Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly Gly
1 5 10 15
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Ala His Glu
20 25 30
Thr Met Val Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val
35 40 45
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50 55 60
Lys Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Ser Lys Asn Thr Leu Tyr
65 70 75 80
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85 90 95
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100 105 110
Thr Leu Val Thr Val Ser Ser
115
<210> 478
<211> 119
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Tar2h-131-539 anti-TNFR1 dAb
<400> 478
Glu Val Gln Leu Leu Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly Gly
1 5 10 15
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Ala His Glu
20 25 30
Thr Met Val Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val
35 40 45
Ser His Ile Pro Pro Val Gly Gln Asp Pro Phe Tyr Thr Asp Ser Val
50 55 60
Lys Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Ser Lys Asn Thr Leu Tyr
65 70 75 80
Leu Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys
85 90 95
Ala Leu Leu Pro Lys Arg Gly Pro Trp Phe Asp Tyr Trp Gly Gln Gly
100 105 110
Thr Leu Val Thr Val Ser Ser
115
<210> 479
<211> 119
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Tar2h-131-540 anti-TNFR1 dAb
<400> 479
Glu Val Gln Leu Leu Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly Gly
1 5 10 15
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Thr Met Val Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val
35 40 45
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50 55 60
Glu Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Ser Lys Asn Thr Leu Tyr
65 70 75 80
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100 105 110
Thr Leu Val Thr Val Ser Ser
115
<210> 480
<211> 119
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Tar2h-131-541 anti-TNFR1 dAb
<400> 480
Glu Val Gln Leu Leu Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly Gly
1 5 10 15
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Ala His Glu
20 25 30
Thr Met Val Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val
35 40 45
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65 70 75 80
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85 90 95
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100 105 110
Thr Leu Val Thr Val Ser Ser
115
<210> 481
<211> 119
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Tar2h-131-542 anti-TNFR1 dAb
<400> 481
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1 5 10 15
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<210> 482
<211> 119
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Tar2h-131-543 anti-TNFR1 dAb
<400> 482
Glu Val Gln Leu Leu Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly Gly
1 5 10 15
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20 25 30
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100 105 110
Thr Leu Val Thr Val Ser Ser
115
<210> 483
<211> 119
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Tar2h-131-544 anti-TNFR1 dAb
<400> 483
Glu Val Gln Leu Leu Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly Gly
1 5 10 15
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Thr Met Val Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val
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100 105 110
Thr Leu Val Thr Val Ser Ser
115
<210> 484
<211> 119
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Tar2h-131-545 anti-TNFR1 dAb
<400> 484
Glu Val Gln Leu Leu Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly Gly
1 5 10 15
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Asn Lys Lys
20 25 30
Thr Met Val Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val
35 40 45
Ser His Ile Asp Gly Lys Gly Gln Ala Thr Tyr Tyr Thr Asp Ser Val
50 55 60
Glu Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Ser Lys Asn Thr Leu Tyr
65 70 75 80
Leu Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys
85 90 95
Ala Leu Leu Pro Lys Arg Gly Pro Trp Phe Asp Tyr Trp Gly Gln Gly
100 105 110
Thr Leu Val Thr Val Ser Ser
115
<210> 485
<211> 119
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Tar2h-131-546 anti-TNFR1 dAb
<400> 485
Glu Val Gln Leu Leu Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly Gly
1 5 10 15
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Asn Lys Lys
20 25 30
Thr Met Val Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val
35 40 45
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50 55 60
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65 70 75 80
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85 90 95
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100 105 110
Thr Leu Val Thr Val Ser Ser
115
<210> 486
<211> 119
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Tar2h-131-547 anti-TNFR1 dAb
<400> 486
Glu Val Gln Leu Leu Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly Gly
1 5 10 15
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Ala His Glu
20 25 30
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35 40 45
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100 105 110
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115
<210> 487
<211> 119
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Tar2h-131-548 anti-TNFR1 dAb
<400> 487
Glu Val Gln Leu Leu Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly Gly
1 5 10 15
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Ala His Glu
20 25 30
Thr Met Val Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val
35 40 45
Ser His Ile Pro Pro Val Gly Gln Asp Pro Phe Tyr Ala Asp Pro Val
50 55 60
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100 105 110
Val Ser Ser Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Ser
115 120 125
Ala Gln Asp Ile Val Met Thr Gln Ser Pro Leu Ser Leu Pro Val Thr
130 135 140
Pro Gly Glu Pro Ala Ser Ile Ser Cys Arg Ser Ser Gln Ser Leu Leu
145 150 155 160
His Ser Asn Gly Asn Thr Tyr Leu His Trp Tyr Leu Gln Lys Pro Gly
165 170 175
Gln Ser Pro Gln Leu Leu Ile Tyr Thr Val Ser Asn Arg Phe Ser Gly
180 185 190
Val Pro Asp Arg Phe Ser Gly Ser Gly Ser Gly Thr Asp Phe Thr Leu
195 200 205
Lys Ile Ser Arg Val Glu Ala Glu Asp Val Gly Val Tyr Tyr Cys Ser
210 215 220
Gln Ser Thr His Val Pro Tyr Thr Phe Gly Gly Gly Thr Lys Val Glu
225 230 235 240
Ile Lys Arg Gly Gly Ser Gly Gly Ala Ala Ala
245 250
<210> 674
<211> 243
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> scFV IG11
<400> 674
Gln Val Gln Leu Val Gln Ser Gly Ala Glu Val Lys Lys Pro Gly Ser
1 5 10 15
Ser Val Lys Val Ser Cys Lys Ala Ser Gly Tyr Thr Phe Thr Asp Phe
20 25 30
Tyr Ile Asn Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Gln Gly Leu Glu Trp Ile
35 40 45
Gly Glu Ile Val Pro Thr Gln Gly Glu Ala Lys Tyr Asn Asp Lys Phe
50 55 60
Lys Ala Arg Val Thr Ile Thr Ala Asp Lys Ser Thr Ser Thr Ala Tyr
65 70 75 80
Met Glu Leu Ser Ser Leu Arg Ser Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys
85 90 95
Ala Arg Trp Asp Phe Leu Asp Tyr Trp Gly Gln Gly Thr Thr Val Thr
100 105 110
Val Ser Ser Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Ser
115 120 125
Ala Gln Asp Ile Val Met Thr Gln Ser Pro Leu Ser Leu Pro Val Thr
130 135 140
Pro Gly Glu Pro Ala Ser Ile Ser Cys Arg Ser Ser Gln Ser Leu Leu
145 150 155 160
His Ser Asn Gly Asn Thr Tyr Leu His Trp Tyr Leu Gln Lys Pro Gly
165 170 175
Gln Ser Pro Gln Leu Leu Ile Tyr Thr Val Ser Asn Arg Phe Ser Gly
180 185 190
Val Pro Asp Arg Phe Ser Gly Ser Gly Ser Gly Thr Asp Phe Thr Leu
195 200 205
Lys Ile Ser Arg Val Glu Ala Glu Asp Val Gly Val Tyr Tyr Cys Ser
210 215 220
Gln Ser Thr His Val Pro Tyr Thr Phe Gly Gly Gly Thr Lys Val Glu
225 230 235 240
Ile Lys Arg
<210> 675
<211> 243
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> scFV T12B
<400> 675
His Val Gln Leu Val Gln Ser Gly Ala Glu Val Lys Lys Pro Gly Ser
1 5 10 15
Ser Val Lys Val Ser Cys Lys Ala Ser Gly Tyr Thr Phe Thr Asp Phe
20 25 30
Tyr Ile Asn Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Gln Gly Leu Glu Trp Ile
35 40 45
Gly Glu Ile Val Pro Ser Gln Gly Glu Ala Lys Tyr Asn Asp Lys Phe
50 55 60
Lys Ala Arg Val Thr Ile Thr Ala Asp Lys Ser Thr Ser Thr Ala Tyr
65 70 75 80
Met Glu Leu Ser Ser Leu Arg Ser Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys
85 90 95
Ala Arg Trp Asp Phe Leu Asp Tyr Trp Gly Gln Gly Thr Thr Val Thr
100 105 110
Val Ser Ser Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Ser
115 120 125
Ala Gln Asp Ile Val Met Thr Gln Ser Pro Leu Ser Leu Pro Val Thr
130 135 140
Pro Gly Glu Pro Ala Ser Ile Ser Cys Arg Ser Ser Gln Ser Leu Leu
145 150 155 160
His Ser Asn Gly Asn Thr Tyr Leu His Trp Tyr Leu Gln Lys Pro Gly
165 170 175
Gln Ser Pro Gln Leu Leu Ile Tyr Thr Val Ser Asn Arg Phe Ser Gly
180 185 190
Val Pro Asp Arg Phe Ser Gly Ser Gly Ser Gly Thr Asp Phe Thr Leu
195 200 205
Lys Ile Ser Arg Val Glu Ala Glu Asp Val Gly Val Tyr Tyr Cys Ser
210 215 220
Gln Gly Thr His Val Pro Tyr Thr Phe Gly Gly Gly Thr Lys Val Glu
225 230 235 240
Ile Lys Arg
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<211> 242
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> scFV 13.7
<400> 676
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20 25 30
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35 40 45
Gly Glu Ile Val Pro Ser Gln Gly Glu Ala Lys Tyr Asn Asp Lys Phe
50 55 60
Lys Ala Arg Val Thr Ile Thr Ala Asp Lys Ser Thr Ser Thr Ala Tyr
65 70 75 80
Met Glu Leu Ser Ser Leu Arg Ser Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys
85 90 95
Ala Arg Trp Asp Phe Leu Asp Tyr Trp Gly Gln Gly Thr Thr Val Thr
100 105 110
Val Ser Ser Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly
115 120 125
Gly Ser Asp Val Gln Met Thr Gln Ser Pro Ser Ser Leu Ser Ala Ser
130 135 140
Val Gly Asp Arg Val Thr Ile Thr Cys Arg Ser Ser Gln Ser Leu Leu
145 150 155 160
His Ser Asn Gly Asn Thr Tyr Leu His Trp Tyr Gln Gln Lys Pro Gly
165 170 175
Lys Ala Pro Lys Leu Leu Ile Tyr Thr Val Ser Asn Arg Phe Ser Gly
180 185 190
Val Pro Ser Arg Phe Ser Gly Ser Gly Ser Gly Thr Asp Phe Thr Leu
195 200 205
Thr Ile Ser Ser Leu Gln Pro Glu Asp Phe Ala Thr Tyr Tyr Cys Ser
210 215 220
Gln Ser Thr His Val Pro Tyr Thr Phe Gly Gly Gly Thr Lys Val Glu
225 230 235 240
Ile Lys
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<211> 231
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
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1 5 10 15
Ser Val Lys Leu Ser Cys Lys Ala Ser Gly Tyr Thr Phe Thr Asp Phe
20 25 30
Tyr Ile Asn Trp Val Lys Gln Arg Thr Gly Gln Gly Leu Glu Trp Ile
35 40 45
Gly Glu Ile Tyr Pro Tyr Ser Gly His Ala Tyr Tyr Asn Glu Lys Phe
50 55 60
Lys Ala Lys Ala Thr Leu Thr Ala Asp Lys Ser Ser Ser Thr Ala Phe
65 70 75 80
Met Gln Leu Asn Ser Leu Thr Ser Glu Asp Ser Ala Val Tyr Phe Cys
85 90 95
Val Arg Trp Asp Phe Leu Asp Tyr Trp Gly Gln Gly Thr Thr Leu Thr
100 105 110
Val Ser Ser Ala Ser Thr Asp Ile Val Met Thr Gln Ser Pro Leu Ser
115 120 125
Leu Pro Val Ser Leu Gly Asp Gln Ala Ser Ile Ser Cys Arg Ser Ser
130 135 140
Gln Ser Leu Leu His Ser Asn Gly Asn Thr Tyr Leu His Trp Tyr Val
145 150 155 160
Gln Lys Pro Gly Gln Ser Pro Lys Leu Leu Ile Tyr Thr Val Ser Asn
165 170 175
Arg Phe Ser Gly Val Pro Asp Arg Phe Ser Gly Ser Gly Ser Gly Thr
180 185 190
Asp Phe Thr Leu Lys Ile Ser Arg Val Glu Ala Glu Asp Leu Gly Val
195 200 205
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210 215 220
Thr Lys Leu Glu Ile Lys Arg
225 230
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<211> 243
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> H398 scFv w/ (GGGGS)3 linker
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1 5 10 15
Ser Val Lys Leu Ser Cys Lys Ala Ser Gly Tyr Thr Phe Thr Asp Phe
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Gly Glu Ile Tyr Pro Tyr Ser Gly His Ala Tyr Tyr Asn Glu Lys Phe
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100 105 110
Val Ser Ser Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly
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Gly Ser Asp Ile Val Met Thr Gln Ser Pro Leu Ser Leu Pro Val Ser
130 135 140
Leu Gly Asp Gln Ala Ser Ile Ser Cys Arg Ser Ser Gln Ser Leu Leu
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Gln Ser Pro Lys Leu Leu Ile Tyr Thr Val Ser Asn Arg Phe Ser Gly
180 185 190
Val Pro Asp Arg Phe Ser Gly Ser Gly Ser Gly Thr Asp Phe Thr Leu
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Lys Ile Ser Arg Val Glu Ala Glu Asp Leu Gly Val Tyr Phe Cys Ser
210 215 220
Gln Ser Thr His Val Pro Tyr Thr Phe Gly Gly Gly Thr Lys Leu Glu
225 230 235 240
Ile Lys Arg
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<211> 219
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
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<400> 679
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Glu Pro Ala Ser Ile Ser Cys Arg Ser Ser Gln Ser Leu Leu His Ser
20 25 30
Asn Gly Asn Thr Tyr Leu His Trp Tyr Leu Gln Lys Pro Gly Gln Ser
35 40 45
Pro Gln Leu Leu Ile Tyr Thr Val Ser Asn Arg Phe Ser Gly Val Pro
50 55 60
Asp Arg Phe Ser Gly Ser Gly Ser Gly Thr Asp Phe Thr Leu Lys Ile
65 70 75 80
Ser Arg Val Glu Ala Glu Asp Val Gly Val Tyr Tyr Cys Ser Gln Ser
85 90 95
Thr His Val Pro Tyr Thr Phe Gly Gly Gly Thr Lys Val Glu Ile Lys
100 105 110
Arg Thr Val Ala Ala Pro Ser Val Phe Ile Phe Pro Pro Ser Asp Glu
115 120 125
Gln Leu Lys Ser Gly Thr Ala Ser Val Val Cys Leu Leu Asn Asn Phe
130 135 140
Tyr Pro Arg Glu Ala Lys Val Gln Trp Lys Val Asp Asn Ala Leu Gln
145 150 155 160
Ser Gly Asn Ser Gln Glu Ser Val Thr Glu Gln Asp Ser Lys Asp Ser
165 170 175
Thr Tyr Ser Leu Ser Ser Thr Leu Thr Leu Ser Lys Ala Asp Tyr Glu
180 185 190
Lys His Lys Val Tyr Ala Cys Glu Val Thr His Gln Gly Leu Ser Ser
195 200 205
Pro Val Thr Lys Ser Phe Asn Arg Gly Glu Cys
210 215
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<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> FabATR (ATROSAB Fab) heavy chain
<400> 680
Gln Val Gln Leu Val Gln Ser Gly Ala Glu Val Lys Lys Pro Gly Ser
1 5 10 15
Ser Val Lys Val Ser Cys Lys Ala Ser Gly Tyr Thr Phe Thr Asp Phe
20 25 30
Tyr Ile Asn Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Gln Gly Leu Glu Trp Ile
35 40 45
Gly Glu Ile Tyr Pro Tyr Ser Gly His Ala Tyr Tyr Asn Glu Lys Phe
50 55 60
Lys Ala Arg Val Thr Ile Thr Ala Asp Lys Ser Thr Ser Thr Ala Tyr
65 70 75 80
Met Glu Leu Ser Ser Leu Arg Ser Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys
85 90 95
Ala Arg Trp Asp Phe Leu Asp Tyr Trp Gly Gln Gly Thr Thr Val Thr
100 105 110
Val Ser Ser Ala Ser Thr Lys Gly Pro Ser Val Phe Pro Leu Ala Pro
115 120 125
Ser Ser Lys Ser Thr Ser Gly Gly Thr Ala Ala Leu Gly Cys Leu Val
130 135 140
Lys Asp Tyr Phe Pro Glu Pro Val Thr Val Ser Trp Asn Ser Gly Ala
145 150 155 160
Leu Thr Ser Gly Val His Thr Phe Pro Ala Val Leu Gln Ser Ser Gly
165 170 175
Leu Tyr Ser Leu Ser Ser Val Val Thr Val Pro Ser Ser Ser Leu Gly
180 185 190
Thr Gln Thr Tyr Ile Cys Asn Val Asn His Lys Pro Ser Asn Thr Lys
195 200 205
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<211> 219
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Fab 13.7 light chain
<400> 681
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1 5 10 15
Asp Arg Val Thr Ile Thr Cys Arg Ser Ser Gln Ser Leu Leu His Ser
20 25 30
Asn Gly Asn Thr Tyr Leu His Trp Tyr Gln Gln Lys Pro Gly Lys Ala
35 40 45
Pro Lys Leu Leu Ile Tyr Thr Val Ser Asn Arg Phe Ser Gly Val Pro
50 55 60
Ser Arg Phe Ser Gly Ser Gly Ser Gly Thr Asp Phe Thr Leu Thr Ile
65 70 75 80
Ser Ser Leu Gln Pro Glu Asp Phe Ala Thr Tyr Tyr Cys Ser Gln Ser
85 90 95
Thr His Val Pro Tyr Thr Phe Gly Gly Gly Thr Lys Val Glu Ile Lys
100 105 110
Arg Thr Val Ala Ala Pro Ser Val Phe Ile Phe Pro Pro Ser Asp Glu
115 120 125
Gln Leu Lys Ser Gly Thr Ala Ser Val Val Cys Leu Leu Asn Asn Phe
130 135 140
Tyr Pro Arg Glu Ala Lys Val Gln Trp Lys Val Asp Asn Ala Leu Gln
145 150 155 160
Ser Gly Asn Ser Gln Glu Ser Val Thr Glu Gln Asp Ser Lys Asp Ser
165 170 175
Thr Tyr Ser Leu Ser Ser Thr Leu Thr Leu Ser Lys Ala Asp Tyr Glu
180 185 190
Lys His Lys Val Tyr Ala Cys Glu Val Thr His Gln Gly Leu Ser Ser
195 200 205
Pro Val Thr Lys Ser Phe Asn Arg Gly Glu Cys
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<211> 218
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Fab 13.7 heavy chain
<400> 682
His Val Gln Leu Val Gln Ser Gly Ala Glu Val Lys Lys Pro Gly Ser
1 5 10 15
Ser Val Lys Val Ser Cys Lys Ala Ser Gly Tyr Thr Phe Thr Asp Phe
20 25 30
Tyr Ile Asn Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Gln Gly Leu Glu Trp Ile
35 40 45
Gly Glu Ile Val Pro Ser Gln Gly Glu Ala Lys Tyr Asn Asp Lys Phe
50 55 60
Lys Ala Arg Val Thr Ile Thr Ala Asp Lys Ser Thr Ser Thr Ala Tyr
65 70 75 80
Met Glu Leu Ser Ser Leu Arg Ser Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys
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Ala Arg Trp Asp Phe Leu Asp Tyr Trp Gly Gln Gly Thr Thr Val Thr
100 105 110
Val Ser Ser Ala Ser Thr Lys Gly Pro Ser Val Phe Pro Leu Ala Pro
115 120 125
Ser Ser Lys Ser Thr Ser Gly Gly Thr Ala Ala Leu Gly Cys Leu Val
130 135 140
Lys Asp Tyr Phe Pro Glu Pro Val Thr Val Ser Trp Asn Ser Gly Ala
145 150 155 160
Leu Thr Ser Gly Val His Thr Phe Pro Ala Val Leu Gln Ser Ser Gly
165 170 175
Leu Tyr Ser Leu Ser Ser Val Val Thr Val Pro Ser Ser Ser Leu Gly
180 185 190
Thr Gln Thr Tyr Ile Cys Asn Val Asn His Lys Pro Ser Asn Thr Lys
195 200 205
Val Asp Lys Lys Val Glu Pro Lys Ser Cys
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<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Nb 70 nanobody
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Gln Val Gln Leu Gln Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Ala Gly Gly
1 5 10 15
Pro Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Val Arg Thr Phe Ser Ser Tyr
20 25 30
Ala Met Gly Trp Phe Arg Gln Ala Pro Gly Lys Glu Arg Glu Phe Val
35 40 45
Ala Ala Ile Ser Trp Ser Gly Gly Ser Thr Tyr Tyr Ala Asp Ser Val
50 55 60
Lys Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Ala Lys Asn Thr Val Tyr
65 70 75 80
Leu Gln Met Asn Ser Leu Lys Pro Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys
85 90 95
Ala Val Leu His Glu Asp Leu Tyr Glu Tyr Asp Tyr Trp Gly Gln Gly
100 105 110
Thr Gln Val Thr Val Ser Ser
115
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<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Nb 96 nanobody
<400> 684
Gln Val Gln Leu Gln Glu Ser Gly Gly Gly Val Val Gln Pro Gly Gly
1 5 10 15
Ser Leu Thr Leu Ser Cys Thr Arg Thr Gly Phe Thr Ala Ser Thr Asn
20 25 30
Ala Tyr Gly Trp Tyr Arg Gln Gly Pro Gly Lys Lys Cys Glu Trp Val
35 40 45
Ser Tyr Met Thr Ile Pro Ser Gly Arg Thr Thr Tyr Ala Asp Ala Val
50 55 60
Lys Gly Arg Phe Ala Met Ser Arg Asp Lys Ala Lys Ser Thr Val Phe
65 70 75 80
Leu Gln Met Asn Ser Leu Lys Pro Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys
85 90 95
Gly Asp Val Pro Phe Ser Thr Leu Pro Ala Met Cys Thr Asn Asp Gly
100 105 110
Pro Trp Gly Gln Gly Thr Gln Val Thr Val Ser Ser
115 120
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<211> 157
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> TNFR1-selective antagonist TNF mutein R32W/S86T
<400> 685
Val Arg Ser Ser Ser Arg Thr Pro Ser Asp Lys Pro Val Ala His Val
1 5 10 15
Val Ala Asn Pro Gln Ala Glu Gly Gln Leu Gln Trp Leu Asn Arg Trp
20 25 30
Ala Asn Ala Leu Leu Ala Asn Gly Val Glu Leu Arg Asp Asn Gln Leu
35 40 45
Val Val Pro Ser Glu Gly Leu Tyr Leu Ile Tyr Ser Gln Val Leu Phe
50 55 60
Lys Gly Gln Gly Cys Pro Ser Thr His Val Leu Leu Thr His Thr Ile
65 70 75 80
Ser Arg Ile Ala Val Thr Tyr Gln Thr Lys Val Asn Leu Leu Ser Ala
85 90 95
Ile Lys Ser Pro Cys Gln Arg Glu Thr Pro Glu Gly Ala Glu Ala Lys
100 105 110
Pro Trp Tyr Glu Pro Ile Tyr Leu Gly Gly Val Phe Gln Leu Glu Lys
115 120 125
Gly Asp Arg Leu Ser Ala Glu Ile Asn Arg Pro Asp Tyr Leu Asp Phe
130 135 140
Ala Glu Ser Gly Gln Val Tyr Phe Gly Ile Ile Ala Leu
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<211> 157
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> TNFR1-selective antagonist TNF mutein L29S
<400> 686
Val Arg Ser Ser Ser Arg Thr Pro Ser Asp Lys Pro Val Ala His Val
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20 25 30
Ala Asn Ala Leu Leu Ala Asn Gly Val Glu Leu Arg Asp Asn Gln Leu
35 40 45
Val Val Pro Ser Glu Gly Leu Tyr Leu Ile Tyr Ser Gln Val Leu Phe
50 55 60
Lys Gly Gln Gly Cys Pro Ser Thr His Val Leu Leu Thr His Thr Ile
65 70 75 80
Ser Arg Ile Ala Val Ser Tyr Gln Thr Lys Val Asn Leu Leu Ser Ala
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Ile Lys Ser Pro Cys Gln Arg Glu Thr Pro Glu Gly Ala Glu Ala Lys
100 105 110
Pro Trp Tyr Glu Pro Ile Tyr Leu Gly Gly Val Phe Gln Leu Glu Lys
115 120 125
Gly Asp Arg Leu Ser Ala Glu Ile Asn Arg Pro Asp Tyr Leu Asp Phe
130 135 140
Ala Glu Ser Gly Gln Val Tyr Phe Gly Ile Ile Ala Leu
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<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> TNFR1-selective antagonist TNF mutein
L29G
<400> 687
Val Arg Ser Ser Ser Arg Thr Pro Ser Asp Lys Pro Val Ala His Val
1 5 10 15
Val Ala Asn Pro Gln Ala Glu Gly Gln Leu Gln Trp Gly Asn Arg Arg
20 25 30
Ala Asn Ala Leu Leu Ala Asn Gly Val Glu Leu Arg Asp Asn Gln Leu
35 40 45
Val Val Pro Ser Glu Gly Leu Tyr Leu Ile Tyr Ser Gln Val Leu Phe
50 55 60
Lys Gly Gln Gly Cys Pro Ser Thr His Val Leu Leu Thr His Thr Ile
65 70 75 80
Ser Arg Ile Ala Val Ser Tyr Gln Thr Lys Val Asn Leu Leu Ser Ala
85 90 95
Ile Lys Ser Pro Cys Gln Arg Glu Thr Pro Glu Gly Ala Glu Ala Lys
100 105 110
Pro Trp Tyr Glu Pro Ile Tyr Leu Gly Gly Val Phe Gln Leu Glu Lys
115 120 125
Gly Asp Arg Leu Ser Ala Glu Ile Asn Arg Pro Asp Tyr Leu Asp Phe
130 135 140
Ala Glu Ser Gly Gln Val Tyr Phe Gly Ile Ile Ala Leu
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<211> 157
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> TNFR1-selective antagonistTNF mutein
L29Y
<400> 688
Val Arg Ser Ser Ser Arg Thr Pro Ser Asp Lys Pro Val Ala His Val
1 5 10 15
Val Ala Asn Pro Gln Ala Glu Gly Gln Leu Gln Trp Tyr Asn Arg Arg
20 25 30
Ala Asn Ala Leu Leu Ala Asn Gly Val Glu Leu Arg Asp Asn Gln Leu
35 40 45
Val Val Pro Ser Glu Gly Leu Tyr Leu Ile Tyr Ser Gln Val Leu Phe
50 55 60
Lys Gly Gln Gly Cys Pro Ser Thr His Val Leu Leu Thr His Thr Ile
65 70 75 80
Ser Arg Ile Ala Val Ser Tyr Gln Thr Lys Val Asn Leu Leu Ser Ala
85 90 95
Ile Lys Ser Pro Cys Gln Arg Glu Thr Pro Glu Gly Ala Glu Ala Lys
100 105 110
Pro Trp Tyr Glu Pro Ile Tyr Leu Gly Gly Val Phe Gln Leu Glu Lys
115 120 125
Gly Asp Arg Leu Ser Ala Glu Ile Asn Arg Pro Asp Tyr Leu Asp Phe
130 135 140
Ala Glu Ser Gly Gln Val Tyr Phe Gly Ile Ile Ala Leu
145 150 155
<210> 689
<211> 157
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> TNFR1-selective antagonist TNF mutein R31E
<400> 689
Val Arg Ser Ser Ser Arg Thr Pro Ser Asp Lys Pro Val Ala His Val
1 5 10 15
Val Ala Asn Pro Gln Ala Glu Gly Gln Leu Gln Trp Leu Asn Glu Arg
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Ala Asn Ala Leu Leu Ala Asn Gly Val Glu Leu Arg Asp Asn Gln Leu
35 40 45
Val Val Pro Ser Glu Gly Leu Tyr Leu Ile Tyr Ser Gln Val Leu Phe
50 55 60
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100 105 110
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Gly Asp Arg Leu Ser Ala Glu Ile Asn Arg Pro Asp Tyr Leu Asp Phe
130 135 140
Ala Glu Ser Gly Gln Val Tyr Phe Gly Ile Ile Ala Leu
145 150 155
<210> 690
<211> 157
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> TNFR1-selective antagonist TNF mutein R31N
<400> 690
Val Arg Ser Ser Ser Arg Thr Pro Ser Asp Lys Pro Val Ala His Val
1 5 10 15
Val Ala Asn Pro Gln Ala Glu Gly Gln Leu Gln Trp Leu Asn Asn Arg
20 25 30
Ala Asn Ala Leu Leu Ala Asn Gly Val Glu Leu Arg Asp Asn Gln Leu
35 40 45
Val Val Pro Ser Glu Gly Leu Tyr Leu Ile Tyr Ser Gln Val Leu Phe
50 55 60
Lys Gly Gln Gly Cys Pro Ser Thr His Val Leu Leu Thr His Thr Ile
65 70 75 80
Ser Arg Ile Ala Val Ser Tyr Gln Thr Lys Val Asn Leu Leu Ser Ala
85 90 95
Ile Lys Ser Pro Cys Gln Arg Glu Thr Pro Glu Gly Ala Glu Ala Lys
100 105 110
Pro Trp Tyr Glu Pro Ile Tyr Leu Gly Gly Val Phe Gln Leu Glu Lys
115 120 125
Gly Asp Arg Leu Ser Ala Glu Ile Asn Arg Pro Asp Tyr Leu Asp Phe
130 135 140
Ala Glu Ser Gly Gln Val Tyr Phe Gly Ile Ile Ala Leu
145 150 155
<210> 691
<211> 157
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> TNFR1-selective antagonist TNF mutein R32W
<400> 691
Val Arg Ser Ser Ser Arg Thr Pro Ser Asp Lys Pro Val Ala His Val
1 5 10 15
Val Ala Asn Pro Gln Ala Glu Gly Gln Leu Gln Trp Leu Asn Arg Trp
20 25 30
Ala Asn Ala Leu Leu Ala Asn Gly Val Glu Leu Arg Asp Asn Gln Leu
35 40 45
Val Val Pro Ser Glu Gly Leu Tyr Leu Ile Tyr Ser Gln Val Leu Phe
50 55 60
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Gly Asp Arg Leu Ser Ala Glu Ile Asn Arg Pro Asp Tyr Leu Asp Phe
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65 70 75 80
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100 105 110
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R31N/R32T/S86T
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<211> 475
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
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protein
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65 70 75 80
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Val Ser Ser Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly
115 120 125
Gly Ser Asp Ile Val Met Thr Gln Ser Pro Leu Ser Leu Pro Val Ser
130 135 140
Leu Gly Asp Gln Ala Ser Ile Ser Cys Arg Ser Ser Gln Ser Leu Leu
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His Ser Asn Gly Asn Thr Tyr Leu His Trp Tyr Val Gln Lys Pro Gly
165 170 175
Gln Ser Pro Lys Leu Leu Ile Tyr Thr Val Ser Asn Arg Phe Ser Gly
180 185 190
Val Pro Asp Arg Phe Ser Gly Ser Gly Ser Gly Thr Asp Phe Thr Leu
195 200 205
Lys Ile Ser Arg Val Glu Ala Glu Asp Leu Gly Val Tyr Phe Cys Ser
210 215 220
Gln Ser Thr His Val Pro Tyr Thr Phe Gly Gly Gly Thr Lys Leu Glu
225 230 235 240
Ile Lys Arg Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly
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Gly Ser Ala Pro Glu Leu Leu Gly Gly Pro Ser Val Phe Leu Phe Pro
260 265 270
Pro Lys Pro Lys Asp Thr Leu Met Ile Ser Arg Thr Pro Glu Val Thr
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Glu Glu Gln Tyr Asn Ser Thr Tyr Arg Val Val Ser Val Leu Thr Val
325 330 335
Leu His Gln Asp Trp Leu Asn Gly Lys Glu Tyr Lys Cys Lys Val Ser
340 345 350
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Gly Gln Pro Arg Glu Pro Gln Val Tyr Thr Leu Pro Pro Ser Arg Glu
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<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> H398 scFv-GGGGSGGGGSGGGGS-SCDKTH-Trastuzumab Fc
fusion protein
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<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> TNF(I97T/A145R)-GGGGSGGGGSGGGGS-SCDKTH-Trastuzumab
Fc fusion protein
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<213> Artificial Sequence
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protein
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<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
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protein
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<213> Artificial Sequence
<220>
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mab Fc fusion protein
<400> 755
Val Arg Ser Ser Ser Arg Thr Pro Ser Asp Lys Pro Val Ala His Val
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<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> TNF(V1M/R31C/C69V/Y87H/C101A/A145R)-ESKYGPPCPPCP-N
ivolumab Fc fusion protein
<400> 756
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Ala Asn Ala Leu Leu Ala Asn Gly Val Glu Leu Arg Asp Asn Gln Leu
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385
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<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
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S-Nivolumab Fc fusion protein
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<220>
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S-ESKYGPPCPPCP-Nivolumab Fc fusion protein
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Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser Glu Ser Lys Tyr
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Gly Pro Pro Cys Pro Pro Cys Pro Ala Pro Glu Phe Leu Gly Gly Pro
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<213> Artificial Sequence
<220>
<223> TNF(A84S/V85T/S86T/Y87H/Q88N/T89Q)-ESKYGPPCPPCP-Ni
volumab Fc fusion protein
<400> 759
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<213> Artificial Sequence
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<223> TNF(A84S/V85T/S86T/Y87H/Q88N/T89Q)-GGGGSGGGGSGGGGS
-Nivolumab Fc fusion protein
<400> 760
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<213> Artificial Sequence
<220>
<223> TNF(A84S/V85T/S86T/Y87H/Q88N/T89Q)-GGGGSGGGGSGGGGS
-ESKYGPPCPPCP-Nivolumab Fc fusion protein
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<223> TNFR2-selective agonist TNF mutein A145W
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<220>
<223> TNFR2-selective agonist TNF mutein E146Q
<400> 777
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A145R/E146T/S147D
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<223> TNFR2-selective agonist TNF mutein
D143V/F144L/A145S
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Val Arg Ser Ser Ser Arg Thr Pro Ser Asp Lys Pro Val Ala His Val
1 5 10 15
Val Ala Asn Pro Gln Ala Glu Gly Gln Leu Gln Trp Leu Asn Arg Arg
20 25 30
Ala Asn Ala Leu Leu Ala Asn Gly Val Glu Leu Arg Asp Asn Gln Leu
35 40 45
Val Val Pro Ser Glu Gly Leu Tyr Leu Ile Tyr Ser Gln Val Leu Phe
50 55 60
Lys Gly Gln Gly Cys Pro Ser Thr His Val Leu Leu Thr His Thr Ile
65 70 75 80
Ser Arg Ile Ala Val Ser Tyr Gln Thr Lys Val Asn Leu Leu Ser Ala
85 90 95
Ile Lys Ser Pro Cys Gln Arg Glu Thr Pro Glu Gly Ala Glu Ala Lys
100 105 110
Pro Trp Tyr Glu Pro Ile Tyr Leu Gly Gly Val Phe Gln Leu Glu Lys
115 120 125
Gly Asp Arg Leu Ser Ala Glu Ile Asn Arg Pro Asp Tyr Leu Val Leu
130 135 140
Ser Glu Ser Gly Gln Val Tyr Phe Gly Ile Ile Ala Leu
145 150 155
<210> 799
<211> 157
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> TNFR2-selective agonist TNF mutein D143V/A145S
<400> 799
Val Arg Ser Ser Ser Arg Thr Pro Ser Asp Lys Pro Val Ala His Val
1 5 10 15
Val Ala Asn Pro Gln Ala Glu Gly Gln Leu Gln Trp Leu Asn Arg Arg
20 25 30
Ala Asn Ala Leu Leu Ala Asn Gly Val Glu Leu Arg Asp Asn Gln Leu
35 40 45
Val Val Pro Ser Glu Gly Leu Tyr Leu Ile Tyr Ser Gln Val Leu Phe
50 55 60
Lys Gly Gln Gly Cys Pro Ser Thr His Val Leu Leu Thr His Thr Ile
65 70 75 80
Ser Arg Ile Ala Val Ser Tyr Gln Thr Lys Val Asn Leu Leu Ser Ala
85 90 95
Ile Lys Ser Pro Cys Gln Arg Glu Thr Pro Glu Gly Ala Glu Ala Lys
100 105 110
Pro Trp Tyr Glu Pro Ile Tyr Leu Gly Gly Val Phe Gln Leu Glu Lys
115 120 125
Gly Asp Arg Leu Ser Ala Glu Ile Asn Arg Pro Asp Tyr Leu Val Phe
130 135 140
Ser Glu Ser Gly Gln Val Tyr Phe Gly Ile Ile Ala Leu
145 150 155
<210> 800
<211> 157
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> TNF07 (TNFR2-selective agonist TNF mutein
S95C/G148C)
<400> 800
Val Arg Ser Ser Ser Arg Thr Pro Ser Asp Lys Pro Val Ala His Val
1 5 10 15
Val Ala Asn Pro Gln Ala Glu Gly Gln Leu Gln Trp Leu Asn Arg Arg
20 25 30
Ala Asn Ala Leu Leu Ala Asn Gly Val Glu Leu Arg Asp Asn Gln Leu
35 40 45
Val Val Pro Ser Glu Gly Leu Tyr Leu Ile Tyr Ser Gln Val Leu Phe
50 55 60
Lys Gly Gln Gly Cys Pro Ser Thr His Val Leu Leu Thr His Thr Ile
65 70 75 80
Ser Arg Ile Ala Val Ser Tyr Gln Thr Lys Val Asn Leu Leu Cys Ala
85 90 95
Ile Lys Ser Pro Cys Gln Arg Glu Thr Pro Glu Gly Ala Glu Ala Lys
100 105 110
Pro Trp Tyr Glu Pro Ile Tyr Leu Gly Gly Val Phe Gln Leu Glu Lys
115 120 125
Gly Asp Arg Leu Ser Ala Glu Ile Asn Arg Pro Asp Tyr Leu Asp Phe
130 135 140
Ala Glu Ser Cys Gln Val Tyr Phe Gly Ile Ile Ala Leu
145 150 155
<210> 801
<211> 157
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> TNFR2-selective TNF mutein A145T
<400> 801
Val Arg Ser Ser Ser Arg Thr Pro Ser Asp Lys Pro Val Ala His Val
1 5 10 15
Val Ala Asn Pro Gln Ala Glu Gly Gln Leu Gln Trp Leu Asn Arg Arg
20 25 30
Ala Asn Ala Leu Leu Ala Asn Gly Val Glu Leu Arg Asp Asn Gln Leu
35 40 45
Val Val Pro Ser Glu Gly Leu Tyr Leu Ile Tyr Ser Gln Val Leu Phe
50 55 60
Lys Gly Gln Gly Cys Pro Ser Thr His Val Leu Leu Thr His Thr Ile
65 70 75 80
Ser Arg Ile Ala Val Ser Tyr Gln Thr Lys Val Asn Leu Leu Ser Ala
85 90 95
Ile Lys Ser Pro Cys Gln Arg Glu Thr Pro Glu Gly Ala Glu Ala Lys
100 105 110
Pro Trp Tyr Glu Pro Ile Tyr Leu Gly Gly Val Phe Gln Leu Glu Lys
115 120 125
Gly Asp Arg Leu Ser Ala Glu Ile Asn Arg Pro Asp Tyr Leu Asp Phe
130 135 140
Thr Glu Ser Gly Gln Val Tyr Phe Gly Ile Ile Ala Leu
145 150 155
<210> 802
<211> 157
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> DN-TNF L57Y
<400> 802
Val Arg Ser Ser Ser Arg Thr Pro Ser Asp Lys Pro Val Ala His Val
1 5 10 15
Val Ala Asn Pro Gln Ala Glu Gly Gln Leu Gln Trp Leu Asn Arg Arg
20 25 30
Ala Asn Ala Leu Leu Ala Asn Gly Val Glu Leu Arg Asp Asn Gln Leu
35 40 45
Val Val Pro Ser Glu Gly Leu Tyr Tyr Ile Tyr Ser Gln Val Leu Phe
50 55 60
Lys Gly Gln Gly Cys Pro Ser Thr His Val Leu Leu Thr His Thr Ile
65 70 75 80
Ser Arg Ile Ala Val Ser Tyr Gln Thr Lys Val Asn Leu Leu Ser Ala
85 90 95
Ile Lys Ser Pro Cys Gln Arg Glu Thr Pro Glu Gly Ala Glu Ala Lys
100 105 110
Pro Trp Tyr Glu Pro Ile Tyr Leu Gly Gly Val Phe Gln Leu Glu Lys
115 120 125
Gly Asp Arg Leu Ser Ala Glu Ile Asn Arg Pro Asp Tyr Leu Asp Phe
130 135 140
Ala Glu Ser Gly Gln Val Tyr Phe Gly Ile Ile Ala Leu
145 150 155
<210> 803
<211> 472
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> scTNFR2 (human TNFR2-selective single chain
agonist TNF mutein trimer D143N/A145R)
<400> 803
Ser Ser Arg Thr Pro Ser Asp Lys Pro Val Ala His Val Val Ala Asn
1 5 10 15
Pro Gln Ala Glu Gly Gln Leu Gln Trp Leu Asn Arg Arg Ala Asn Ala
20 25 30
Leu Leu Ala Asn Gly Val Glu Leu Arg Asp Asn Gln Leu Val Val Pro
35 40 45
Ser Glu Gly Leu Tyr Leu Ile Tyr Ser Gln Val Leu Phe Lys Gly Gln
50 55 60
Gly Cys Pro Ser Thr His Val Leu Leu Thr His Thr Ile Ser Arg Ile
65 70 75 80
Ala Val Ser Tyr Gln Thr Lys Val Asn Leu Leu Ser Ala Ile Lys Ser
85 90 95
Pro Cys Gln Arg Glu Thr Pro Glu Gly Ala Glu Ala Lys Pro Trp Tyr
100 105 110
Glu Pro Ile Tyr Leu Gly Gly Val Phe Gln Leu Glu Lys Gly Asp Arg
115 120 125
Leu Ser Ala Glu Ile Asn Arg Pro Asp Tyr Leu Asn Phe Arg Glu Ser
130 135 140
Gly Gln Val Tyr Phe Gly Ile Ile Ala Leu Gly Gly Gly Gly Ser Ser
145 150 155 160
Ser Arg Thr Pro Ser Asp Lys Pro Val Ala His Val Val Ala Asn Pro
165 170 175
Gln Ala Glu Gly Gln Leu Gln Trp Leu Asn Arg Arg Ala Asn Ala Leu
180 185 190
Leu Ala Asn Gly Val Glu Leu Arg Asp Asn Gln Leu Val Val Pro Ser
195 200 205
Glu Gly Leu Tyr Leu Ile Tyr Ser Gln Val Leu Phe Lys Gly Gln Gly
210 215 220
Cys Pro Ser Thr His Val Leu Leu Thr His Thr Ile Ser Arg Ile Ala
225 230 235 240
Val Ser Tyr Gln Thr Lys Val Asn Leu Leu Ser Ala Ile Lys Ser Pro
245 250 255
Cys Gln Arg Glu Thr Pro Glu Gly Ala Glu Ala Lys Pro Trp Tyr Glu
260 265 270
Pro Ile Tyr Leu Gly Gly Val Phe Gln Leu Glu Lys Gly Asp Arg Leu
275 280 285
Ser Ala Glu Ile Asn Arg Pro Asp Tyr Leu Asn Phe Arg Glu Ser Gly
290 295 300
Gln Val Tyr Phe Gly Ile Ile Ala Leu Gly Gly Gly Gly Ser Ser Ser
305 310 315 320
Arg Thr Pro Ser Asp Lys Pro Val Ala His Val Val Ala Asn Pro Gln
325 330 335
Ala Glu Gly Gln Leu Gln Trp Leu Asn Arg Arg Ala Asn Ala Leu Leu
340 345 350
Ala Asn Gly Val Glu Leu Arg Asp Asn Gln Leu Val Val Pro Ser Glu
355 360 365
Gly Leu Tyr Leu Ile Tyr Ser Gln Val Leu Phe Lys Gly Gln Gly Cys
370 375 380
Pro Ser Thr His Val Leu Leu Thr His Thr Ile Ser Arg Ile Ala Val
385 390 395 400
Ser Tyr Gln Thr Lys Val Asn Leu Leu Ser Ala Ile Lys Ser Pro Cys
405 410 415
Gln Arg Glu Thr Pro Glu Gly Ala Glu Ala Lys Pro Trp Tyr Glu Pro
420 425 430
Ile Tyr Leu Gly Gly Val Phe Gln Leu Glu Lys Gly Asp Arg Leu Ser
435 440 445
Ala Glu Ile Asn Arg Pro Asp Tyr Leu Asn Phe Arg Glu Ser Gly Gln
450 455 460
Val Tyr Phe Gly Ile Ile Ala Leu
465 470
<210> 804
<211> 1808
<212> PRT
<213> Gallus gallus
<220>
<223> chicken tenascin C (TNC)
<220>
<221> DOMAIN
<222> (110)...(139)
<223> trimerization domain
<400> 804
Met Gly Leu Pro Ser Gln Val Leu Ala Cys Ala Ile Leu Gly Leu Leu
1 5 10 15
Tyr Gln His Ala Ser Gly Gly Leu Ile Lys Arg Ile Ile Arg Gln Lys
20 25 30
Arg Glu Thr Gly Leu Asn Val Thr Leu Pro Glu Asp Asn Gln Pro Val
35 40 45
Val Phe Asn His Val Tyr Asn Ile Lys Leu Pro Val Gly Ser Leu Cys
50 55 60
Ser Val Asp Leu Asp Thr Ala Ser Gly Asp Ala Asp Leu Lys Ala Glu
65 70 75 80
Ile Glu Pro Val Lys Asn Tyr Glu Glu His Thr Val Asn Glu Gly Asn
85 90 95
Gln Ile Val Phe Thr His Arg Ile Asn Ile Pro Arg Arg Ala Cys Gly
100 105 110
Cys Ala Ala Ala Pro Asp Ile Lys Asp Leu Leu Ser Arg Leu Glu Glu
115 120 125
Leu Glu Gly Leu Val Ser Ser Leu Arg Glu Gln Cys Ala Ser Gly Ala
130 135 140
Gly Cys Cys Pro Asn Ser Gln Thr Ala Glu Gly Arg Leu Asp Thr Ala
145 150 155 160
Pro Tyr Cys Ser Gly His Gly Asn Tyr Ser Thr Glu Ile Cys Gly Cys
165 170 175
Val Cys Glu Pro Gly Trp Lys Gly Pro Asn Cys Ser Glu Pro Ala Cys
180 185 190
Pro Arg Asn Cys Leu Asn Arg Gly Leu Cys Val Arg Gly Lys Cys Ile
195 200 205
Cys Glu Glu Gly Phe Thr Gly Glu Asp Cys Ser Gln Ala Ala Cys Pro
210 215 220
Ser Asp Cys Asn Asp Gln Gly Lys Cys Val Asp Gly Val Cys Val Cys
225 230 235 240
Phe Glu Gly Tyr Thr Gly Pro Asp Cys Gly Glu Glu Leu Cys Pro His
245 250 255
Gly Cys Gly Ile His Gly Arg Cys Val Gly Gly Arg Cys Val Cys His
260 265 270
Glu Gly Phe Thr Gly Glu Asp Cys Asn Glu Pro Leu Cys Pro Asn Asn
275 280 285
Cys His Asn Arg Gly Arg Cys Val Asp Asn Glu Cys Val Cys Asp Glu
290 295 300
Gly Tyr Thr Gly Glu Asp Cys Gly Glu Leu Ile Cys Pro Asn Asp Cys
305 310 315 320
Phe Asp Arg Gly Arg Cys Ile Asn Gly Thr Cys Phe Cys Glu Glu Gly
325 330 335
Tyr Thr Gly Glu Asp Cys Gly Glu Leu Thr Cys Pro Asn Asn Cys Asn
340 345 350
Gly Asn Gly Arg Cys Glu Asn Gly Leu Cys Val Cys His Glu Gly Phe
355 360 365
Val Gly Asp Asp Cys Ser Gln Lys Arg Cys Pro Lys Asp Cys Asn Asn
370 375 380
Arg Gly His Cys Val Asp Gly Arg Cys Val Cys His Glu Gly Tyr Leu
385 390 395 400
Gly Glu Asp Cys Gly Glu Leu Arg Cys Pro Asn Asp Cys His Asn Arg
405 410 415
Gly Arg Cys Ile Asn Gly Gln Cys Val Cys Asp Glu Gly Phe Ile Gly
420 425 430
Glu Asp Cys Gly Glu Leu Arg Cys Pro Asn Asp Cys His Asn Arg Gly
435 440 445
Arg Cys Val Asn Gly Gln Cys Glu Cys His Glu Gly Phe Ile Gly Glu
450 455 460
Asp Cys Gly Glu Leu Arg Cys Pro Asn Asp Cys Asn Ser His Gly Arg
465 470 475 480
Cys Val Asn Gly Gln Cys Val Cys Asp Glu Gly Tyr Thr Gly Glu Asp
485 490 495
Cys Gly Glu Leu Arg Cys Pro Asn Asp Cys His Asn Arg Gly Arg Cys
500 505 510
Val Glu Gly Arg Cys Val Cys Asp Asn Gly Phe Met Gly Glu Asp Cys
515 520 525
Gly Glu Leu Ser Cys Pro Asn Asp Cys His Gln His Gly Arg Cys Val
530 535 540
Asp Gly Arg Cys Val Cys His Glu Gly Phe Thr Gly Glu Asp Cys Arg
545 550 555 560
Glu Arg Ser Cys Pro Asn Asp Cys Asn Asn Val Gly Arg Cys Val Glu
565 570 575
Gly Arg Cys Val Cys Glu Glu Gly Tyr Met Gly Ile Asp Cys Ser Asp
580 585 590
Val Ser Pro Pro Thr Glu Leu Thr Val Thr Asn Val Thr Asp Lys Thr
595 600 605
Val Asn Leu Glu Trp Lys His Glu Asn Leu Val Asn Glu Tyr Leu Val
610 615 620
Thr Tyr Val Pro Thr Ser Ser Gly Gly Leu Asp Leu Gln Phe Thr Val
625 630 635 640
Pro Gly Asn Gln Thr Ser Ala Thr Ile His Glu Leu Glu Pro Gly Val
645 650 655
Glu Tyr Phe Ile Arg Val Phe Ala Ile Leu Lys Asn Lys Lys Ser Ile
660 665 670
Pro Val Ser Ala Arg Val Ala Thr Tyr Leu Pro Ala Pro Glu Gly Leu
675 680 685
Lys Phe Lys Ser Val Arg Glu Thr Ser Val Gln Val Glu Trp Asp Pro
690 695 700
Leu Ser Ile Ser Phe Asp Gly Trp Glu Leu Val Phe Arg Asn Met Gln
705 710 715 720
Lys Lys Asp Asp Asn Gly Asp Ile Thr Ser Ser Leu Lys Arg Pro Glu
725 730 735
Thr Ser Tyr Met Gln Pro Gly Leu Ala Pro Gly Gln Gln Tyr Asn Val
740 745 750
Ser Leu His Ile Val Lys Asn Asn Thr Arg Gly Pro Gly Leu Ser Arg
755 760 765
Val Ile Thr Thr Lys Leu Asp Ala Pro Ser Gln Ile Glu Ala Lys Asp
770 775 780
Val Thr Asp Thr Thr Ala Leu Ile Thr Trp Ser Lys Pro Leu Ala Glu
785 790 795 800
Ile Glu Gly Ile Glu Leu Thr Tyr Gly Pro Lys Asp Val Pro Gly Asp
805 810 815
Arg Thr Thr Ile Asp Leu Ser Glu Asp Glu Asn Gln Tyr Ser Ile Gly
820 825 830
Asn Leu Arg Pro His Thr Glu Tyr Glu Val Thr Leu Ile Ser Arg Arg
835 840 845
Gly Asp Met Glu Ser Asp Pro Ala Lys Glu Val Phe Val Thr Asp Leu
850 855 860
Asp Ala Pro Arg Asn Leu Lys Arg Val Ser Gln Thr Asp Asn Ser Ile
865 870 875 880
Thr Leu Glu Trp Lys Asn Ser His Ala Asn Ile Asp Asn Tyr Arg Ile
885 890 895
Lys Phe Ala Pro Ile Ser Gly Gly Asp His Thr Glu Leu Thr Val Pro
900 905 910
Lys Gly Asn Gln Ala Thr Thr Arg Ala Thr Leu Thr Gly Leu Arg Pro
915 920 925
Gly Thr Glu Tyr Gly Ile Gly Val Thr Ala Val Arg Gln Asp Arg Glu
930 935 940
Ser Ala Pro Ala Thr Ile Asn Ala Gly Thr Asp Leu Asp Asn Pro Lys
945 950 955 960
Asp Leu Glu Val Ser Asp Pro Thr Glu Thr Thr Leu Ser Leu Arg Trp
965 970 975
Arg Arg Pro Val Ala Lys Phe Asp Arg Tyr Arg Leu Thr Tyr Val Ser
980 985 990
Pro Ser Gly Lys Lys Asn Glu Met Glu Ile Pro Val Asp Ser Thr Ser
995 1000 1005
Phe Ile Leu Arg Gly Leu Asp Ala Gly Thr Glu Tyr Thr Ile Ser Leu
1010 1015 1020
Val Ala Glu Lys Gly Arg His Lys Ser Lys Pro Thr Thr Ile Lys Gly
1025 1030 1035 1040
Ser Thr Glu Glu Glu Pro Glu Leu Gly Asn Leu Ser Val Ser Glu Thr
1045 1050 1055
Gly Trp Asp Gly Phe Gln Leu Thr Trp Thr Ala Ala Asp Gly Ala Tyr
1060 1065 1070
Glu Asn Phe Val Ile Gln Val Gln Gln Ser Asp Asn Pro Glu Glu Thr
1075 1080 1085
Trp Asn Ile Thr Val Pro Gly Gly Gln His Ser Val Asn Val Thr Gly
1090 1095 1100
Leu Lys Ala Asn Thr Pro Tyr Asn Val Thr Leu Tyr Gly Val Ile Arg
1105 1110 1115 1120
Gly Tyr Arg Thr Lys Pro Leu Tyr Val Glu Thr Thr Thr Gly Ala His
1125 1130 1135
Pro Glu Val Gly Glu Leu Thr Val Ser Asp Ile Thr Pro Glu Ser Phe
1140 1145 1150
Asn Leu Ser Trp Thr Thr Thr Asn Gly Asp Phe Asp Ala Phe Thr Ile
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Glu Ile Ile Asp Ser Asn Arg Leu Leu Glu Pro Met Glu Phe Asn Ile
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Ser Gly Asn Ser Arg Thr Ala His Ile Ser Gly Leu Ser Pro Ser Thr
1185 1190 1195 1200
Asp Phe Ile Val Tyr Leu Tyr Gly Ile Ser His Gly Phe Arg Thr Gln
1205 1210 1215
Ala Ile Ser Ala Ala Ala Thr Thr Glu Ala Glu Pro Glu Val Asp Asn
1220 1225 1230
Leu Leu Val Ser Asp Ala Thr Pro Asp Gly Phe Arg Leu Ser Trp Thr
1235 1240 1245
Ala Asp Asp Gly Val Phe Asp Ser Phe Val Leu Lys Ile Arg Asp Thr
1250 1255 1260
Lys Arg Lys Ser Asp Pro Leu Glu Leu Ile Val Pro Gly His Glu Arg
1265 1270 1275 1280
Thr His Asp Ile Thr Gly Leu Lys Glu Gly Thr Glu Tyr Glu Ile Glu
1285 1290 1295
Leu Tyr Gly Val Ser Ser Gly Arg Arg Ser Gln Pro Ile Asn Ser Val
1300 1305 1310
Ala Thr Thr Val Val Gly Ser Pro Lys Gly Ile Ser Phe Ser Asp Ile
1315 1320 1325
Thr Glu Asn Ser Ala Thr Val Ser Trp Thr Pro Pro Arg Ser Arg Val
1330 1335 1340
Asp Ser Tyr Arg Val Ser Tyr Val Pro Ile Thr Gly Gly Thr Pro Asn
1345 1350 1355 1360
Val Val Thr Val Asp Gly Ser Lys Thr Arg Thr Lys Leu Val Lys Leu
1365 1370 1375
Val Pro Gly Val Asp Tyr Asn Val Asn Ile Ile Ser Val Lys Gly Phe
1380 1385 1390
Glu Glu Ser Glu Pro Ile Ser Gly Ile Leu Lys Thr Ala Leu Asp Ser
1395 1400 1405
Pro Ser Gly Leu Val Val Met Asn Ile Thr Asp Ser Glu Ala Leu Ala
1410 1415 1420
Thr Trp Gln Pro Ala Ile Ala Ala Val Asp Asn Tyr Ile Val Ser Tyr
1425 1430 1435 1440
Ser Ser Glu Asp Glu Pro Glu Val Thr Gln Met Val Ser Gly Asn Thr
1445 1450 1455
Val Glu Tyr Asp Leu Asn Gly Leu Arg Pro Ala Thr Glu Tyr Thr Leu
1460 1465 1470
Arg Val His Ala Val Lys Asp Ala Gln Lys Ser Glu Thr Leu Ser Thr
1475 1480 1485
Gln Phe Thr Thr Gly Leu Asp Ala Pro Lys Asp Leu Ser Ala Thr Glu
1490 1495 1500
Val Gln Ser Glu Thr Ala Val Ile Thr Trp Arg Pro Pro Arg Ala Pro
1505 1510 1515 1520
Val Thr Asp Tyr Leu Leu Thr Tyr Glu Ser Ile Asp Gly Arg Val Lys
1525 1530 1535
Glu Val Ile Leu Asp Pro Glu Thr Thr Ser Tyr Thr Leu Thr Glu Leu
1540 1545 1550
Ser Pro Ser Thr Gln Tyr Thr Val Lys Leu Gln Ala Leu Ser Arg Ser
1555 1560 1565
Met Arg Ser Lys Met Ile Gln Thr Val Phe Thr Thr Thr Gly Leu Leu
1570 1575 1580
Tyr Pro Tyr Pro Lys Asp Cys Ser Gln Ala Leu Leu Asn Gly Glu Val
1585 1590 1595 1600
Thr Ser Gly Leu Tyr Thr Ile Tyr Leu Asn Gly Asp Arg Thr Gln Pro
1605 1610 1615
Leu Gln Val Phe Cys Asp Met Ala Glu Asp Gly Gly Gly Trp Ile Val
1620 1625 1630
Phe Leu Arg Arg Gln Asn Gly Lys Glu Asp Phe Tyr Arg Asn Trp Lys
1635 1640 1645
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Leu Glu Asn Leu His Lys Ile Ser Ser Gln Gly Gln Tyr Glu Leu Arg
1665 1670 1675 1680
Val Asp Leu Arg Asp Arg Gly Glu Thr Ala Tyr Ala Val Tyr Asp Lys
1685 1690 1695
Phe Ser Val Gly Asp Ala Lys Thr Arg Tyr Arg Leu Arg Val Asp Gly
1700 1705 1710
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1715 1720 1725
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1730 1735 1740
Leu Ser Tyr Lys Gly Ala Phe Trp Tyr Lys Asn Cys His Arg Val Asn
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Leu Met Gly Arg Tyr Gly Asp Asn Asn His Ser Gln Gly Val Asn Trp
1765 1770 1775
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Leu Arg Pro Ser Ser Phe Arg Asn Leu Glu Gly Arg Arg Lys Arg Ala
1795 1800 1805
<210> 805
<211> 30
<212> PRT
<213> Gallus gallus
<220>
<223> trimerization domain of Chicken Tenascin C (TNC)
<400> 805
Ala Cys Gly Cys Ala Ala Ala Pro Asp Ile Lys Asp Leu Leu Ser Arg
1 5 10 15
Leu Glu Glu Leu Glu Gly Leu Val Ser Ser Leu Arg Glu Gln
20 25 30
<210> 806
<211> 2201
<212> PRT
<213> homo sapiens
<220>
<223> human tenascin C (TNC)
<220>
<221> DOMAIN
<222> (110)...(139)
<223> trimerization domain
<400> 806
Met Gly Ala Met Thr Gln Leu Leu Ala Gly Val Phe Leu Ala Phe Leu
1 5 10 15
Ala Leu Ala Thr Glu Gly Gly Val Leu Lys Lys Val Ile Arg His Lys
20 25 30
Arg Gln Ser Gly Val Asn Ala Thr Leu Pro Glu Glu Asn Gln Pro Val
35 40 45
Val Phe Asn His Val Tyr Asn Ile Lys Leu Pro Val Gly Ser Gln Cys
50 55 60
Ser Val Asp Leu Glu Ser Ala Ser Gly Glu Lys Asp Leu Ala Pro Pro
65 70 75 80
Ser Glu Pro Ser Glu Ser Phe Gln Glu His Thr Val Asp Gly Glu Asn
85 90 95
Gln Ile Val Phe Thr His Arg Ile Asn Ile Pro Arg Arg Ala Cys Gly
100 105 110
Cys Ala Ala Ala Pro Asp Val Lys Glu Leu Leu Ser Arg Leu Glu Glu
115 120 125
Leu Glu Asn Leu Val Ser Ser Leu Arg Glu Gln Cys Thr Ala Gly Ala
130 135 140
Gly Cys Cys Leu Gln Pro Ala Thr Gly Arg Leu Asp Thr Arg Pro Phe
145 150 155 160
Cys Ser Gly Arg Gly Asn Phe Ser Thr Glu Gly Cys Gly Cys Val Cys
165 170 175
Glu Pro Gly Trp Lys Gly Pro Asn Cys Ser Glu Pro Glu Cys Pro Gly
180 185 190
Asn Cys His Leu Arg Gly Arg Cys Ile Asp Gly Gln Cys Ile Cys Asp
195 200 205
Asp Gly Phe Thr Gly Glu Asp Cys Ser Gln Leu Ala Cys Pro Ser Asp
210 215 220
Cys Asn Asp Gln Gly Lys Cys Val Asn Gly Val Cys Ile Cys Phe Glu
225 230 235 240
Gly Tyr Ala Gly Ala Asp Cys Ser Arg Glu Ile Cys Pro Val Pro Cys
245 250 255
Ser Glu Glu His Gly Thr Cys Val Asp Gly Leu Cys Val Cys His Asp
260 265 270
Gly Phe Ala Gly Asp Asp Cys Asn Lys Pro Leu Cys Leu Asn Asn Cys
275 280 285
Tyr Asn Arg Gly Arg Cys Val Glu Asn Glu Cys Val Cys Asp Glu Gly
290 295 300
Phe Thr Gly Glu Asp Cys Ser Glu Leu Ile Cys Pro Asn Asp Cys Phe
305 310 315 320
Asp Arg Gly Arg Cys Ile Asn Gly Thr Cys Tyr Cys Glu Glu Gly Phe
325 330 335
Thr Gly Glu Asp Cys Gly Lys Pro Thr Cys Pro His Ala Cys His Thr
340 345 350
Gln Gly Arg Cys Glu Glu Gly Gln Cys Val Cys Asp Glu Gly Phe Ala
355 360 365
Gly Val Asp Cys Ser Glu Lys Arg Cys Pro Ala Asp Cys His Asn Arg
370 375 380
Gly Arg Cys Val Asp Gly Arg Cys Glu Cys Asp Asp Gly Phe Thr Gly
385 390 395 400
Ala Asp Cys Gly Glu Leu Lys Cys Pro Asn Gly Cys Ser Gly His Gly
405 410 415
Arg Cys Val Asn Gly Gln Cys Val Cys Asp Glu Gly Tyr Thr Gly Glu
420 425 430
Asp Cys Ser Gln Leu Arg Cys Pro Asn Asp Cys His Ser Arg Gly Arg
435 440 445
Cys Val Glu Gly Lys Cys Val Cys Glu Gln Gly Phe Lys Gly Tyr Asp
450 455 460
Cys Ser Asp Met Ser Cys Pro Asn Asp Cys His Gln His Gly Arg Cys
465 470 475 480
Val Asn Gly Met Cys Val Cys Asp Asp Gly Tyr Thr Gly Glu Asp Cys
485 490 495
Arg Asp Arg Gln Cys Pro Arg Asp Cys Ser Asn Arg Gly Leu Cys Val
500 505 510
Asp Gly Gln Cys Val Cys Glu Asp Gly Phe Thr Gly Pro Asp Cys Ala
515 520 525
Glu Leu Ser Cys Pro Asn Asp Cys His Gly Gln Gly Arg Cys Val Asn
530 535 540
Gly Gln Cys Val Cys His Glu Gly Phe Met Gly Lys Asp Cys Lys Glu
545 550 555 560
Gln Arg Cys Pro Ser Asp Cys His Gly Gln Gly Arg Cys Val Asp Gly
565 570 575
Gln Cys Ile Cys His Glu Gly Phe Thr Gly Leu Asp Cys Gly Gln His
580 585 590
Ser Cys Pro Ser Asp Cys Asn Asn Leu Gly Gln Cys Val Ser Gly Arg
595 600 605
Cys Ile Cys Asn Glu Gly Tyr Ser Gly Glu Asp Cys Ser Glu Val Ser
610 615 620
Pro Pro Lys Asp Leu Val Val Thr Glu Val Thr Glu Glu Thr Val Asn
625 630 635 640
Leu Ala Trp Asp Asn Glu Met Arg Val Thr Glu Tyr Leu Val Val Tyr
645 650 655
Thr Pro Thr His Glu Gly Gly Leu Glu Met Gln Phe Arg Val Pro Gly
660 665 670
Asp Gln Thr Ser Thr Ile Ile Gln Glu Leu Glu Pro Gly Val Glu Tyr
675 680 685
Phe Ile Arg Val Phe Ala Ile Leu Glu Asn Lys Lys Ser Ile Pro Val
690 695 700
Ser Ala Arg Val Ala Thr Tyr Leu Pro Ala Pro Glu Gly Leu Lys Phe
705 710 715 720
Lys Ser Ile Lys Glu Thr Ser Val Glu Val Glu Trp Asp Pro Leu Asp
725 730 735
Ile Ala Phe Glu Thr Trp Glu Ile Ile Phe Arg Asn Met Asn Lys Glu
740 745 750
Asp Glu Gly Glu Ile Thr Lys Ser Leu Arg Arg Pro Glu Thr Ser Tyr
755 760 765
Arg Gln Thr Gly Leu Ala Pro Gly Gln Glu Tyr Glu Ile Ser Leu His
770 775 780
Ile Val Lys Asn Asn Thr Arg Gly Pro Gly Leu Lys Arg Val Thr Thr
785 790 795 800
Thr Arg Leu Asp Ala Pro Ser Gln Ile Glu Val Lys Asp Val Thr Asp
805 810 815
Thr Thr Ala Leu Ile Thr Trp Phe Lys Pro Leu Ala Glu Ile Asp Gly
820 825 830
Ile Glu Leu Thr Tyr Gly Ile Lys Asp Val Pro Gly Asp Arg Thr Thr
835 840 845
Ile Asp Leu Thr Glu Asp Glu Asn Gln Tyr Ser Ile Gly Asn Leu Lys
850 855 860
Pro Asp Thr Glu Tyr Glu Val Ser Leu Ile Ser Arg Arg Gly Asp Met
865 870 875 880
Ser Ser Asn Pro Ala Lys Glu Thr Phe Thr Thr Gly Leu Asp Ala Pro
885 890 895
Arg Asn Leu Arg Arg Val Ser Gln Thr Asp Asn Ser Ile Thr Leu Glu
900 905 910
Trp Arg Asn Gly Lys Ala Ala Ile Asp Ser Tyr Arg Ile Lys Tyr Ala
915 920 925
Pro Ile Ser Gly Gly Asp His Ala Glu Val Asp Val Pro Lys Ser Gln
930 935 940
Gln Ala Thr Thr Lys Thr Thr Leu Thr Gly Leu Arg Pro Gly Thr Glu
945 950 955 960
Tyr Gly Ile Gly Val Ser Ala Val Lys Glu Asp Lys Glu Ser Asn Pro
965 970 975
Ala Thr Ile Asn Ala Ala Thr Glu Leu Asp Thr Pro Lys Asp Leu Gln
980 985 990
Val Ser Glu Thr Ala Glu Thr Ser Leu Thr Leu Leu Trp Lys Thr Pro
995 1000 1005
Leu Ala Lys Phe Asp Arg Tyr Arg Leu Asn Tyr Ser Leu Pro Thr Gly
1010 1015 1020
Gln Trp Val Gly Val Gln Leu Pro Arg Asn Thr Thr Ser Tyr Val Leu
1025 1030 1035 1040
Arg Gly Leu Glu Pro Gly Gln Glu Tyr Asn Val Leu Leu Thr Ala Glu
1045 1050 1055
Lys Gly Arg His Lys Ser Lys Pro Ala Arg Val Lys Ala Ser Thr Glu
1060 1065 1070
Gln Ala Pro Glu Leu Glu Asn Leu Thr Val Thr Glu Val Gly Trp Asp
1075 1080 1085
Gly Leu Arg Leu Asn Trp Thr Ala Ala Asp Gln Ala Tyr Glu His Phe
1090 1095 1100
Ile Ile Gln Val Gln Glu Ala Asn Lys Val Glu Ala Ala Arg Asn Leu
1105 1110 1115 1120
Thr Val Pro Gly Ser Leu Arg Ala Val Asp Ile Pro Gly Leu Lys Ala
1125 1130 1135
Ala Thr Pro Tyr Thr Val Ser Ile Tyr Gly Val Ile Gln Gly Tyr Arg
1140 1145 1150
Thr Pro Val Leu Ser Ala Glu Ala Ser Thr Gly Glu Thr Pro Asn Leu
1155 1160 1165
Gly Glu Val Val Val Ala Glu Val Gly Trp Asp Ala Leu Lys Leu Asn
1170 1175 1180
Trp Thr Ala Pro Glu Gly Ala Tyr Glu Tyr Phe Phe Ile Gln Val Gln
1185 1190 1195 1200
Glu Ala Asp Thr Val Glu Ala Ala Gln Asn Leu Thr Val Pro Gly Gly
1205 1210 1215
Leu Arg Ser Thr Asp Leu Pro Gly Leu Lys Ala Ala Thr His Tyr Thr
1220 1225 1230
Ile Thr Ile Arg Gly Val Thr Gln Asp Phe Ser Thr Thr Pro Leu Ser
1235 1240 1245
Val Glu Val Leu Thr Glu Glu Val Pro Asp Met Gly Asn Leu Thr Val
1250 1255 1260
Thr Glu Val Ser Trp Asp Ala Leu Arg Leu Asn Trp Thr Thr Pro Asp
1265 1270 1275 1280
Gly Thr Tyr Asp Gln Phe Thr Ile Gln Val Gln Glu Ala Asp Gln Val
1285 1290 1295
Glu Glu Ala His Asn Leu Thr Val Pro Gly Ser Leu Arg Ser Met Glu
1300 1305 1310
Ile Pro Gly Leu Arg Ala Gly Thr Pro Tyr Thr Val Thr Leu His Gly
1315 1320 1325
Glu Val Arg Gly His Ser Thr Arg Pro Leu Ala Val Glu Val Val Thr
1330 1335 1340
Glu Asp Leu Pro Gln Leu Gly Asp Leu Ala Val Ser Glu Val Gly Trp
1345 1350 1355 1360
Asp Gly Leu Arg Leu Asn Trp Thr Ala Ala Asp Asn Ala Tyr Glu His
1365 1370 1375
Phe Val Ile Gln Val Gln Glu Val Asn Lys Val Glu Ala Ala Gln Asn
1380 1385 1390
Leu Thr Leu Pro Gly Ser Leu Arg Ala Val Asp Ile Pro Gly Leu Glu
1395 1400 1405
Ala Ala Thr Pro Tyr Arg Val Ser Ile Tyr Gly Val Ile Arg Gly Tyr
1410 1415 1420
Arg Thr Pro Val Leu Ser Ala Glu Ala Ser Thr Ala Lys Glu Pro Glu
1425 1430 1435 1440
Ile Gly Asn Leu Asn Val Ser Asp Ile Thr Pro Glu Ser Phe Asn Leu
1445 1450 1455
Ser Trp Met Ala Thr Asp Gly Ile Phe Glu Thr Phe Thr Ile Glu Ile
1460 1465 1470
Ile Asp Ser Asn Arg Leu Leu Glu Thr Val Glu Tyr Asn Ile Ser Gly
1475 1480 1485
Ala Glu Arg Thr Ala His Ile Ser Gly Leu Pro Pro Ser Thr Asp Phe
1490 1495 1500
Ile Val Tyr Leu Ser Gly Leu Ala Pro Ser Ile Arg Thr Lys Thr Ile
1505 1510 1515 1520
Ser Ala Thr Ala Thr Thr Glu Ala Leu Pro Leu Leu Glu Asn Leu Thr
1525 1530 1535
Ile Ser Asp Ile Asn Pro Tyr Gly Phe Thr Val Ser Trp Met Ala Ser
1540 1545 1550
Glu Asn Ala Phe Asp Ser Phe Leu Val Thr Val Val Asp Ser Gly Lys
1555 1560 1565
Leu Leu Asp Pro Gln Glu Phe Thr Leu Ser Gly Thr Gln Arg Lys Leu
1570 1575 1580
Glu Leu Arg Gly Leu Ile Thr Gly Ile Gly Tyr Glu Val Met Val Ser
1585 1590 1595 1600
Gly Phe Thr Gln Gly His Gln Thr Lys Pro Leu Arg Ala Glu Ile Val
1605 1610 1615
Thr Glu Ala Glu Pro Glu Val Asp Asn Leu Leu Val Ser Asp Ala Thr
1620 1625 1630
Pro Asp Gly Phe Arg Leu Ser Trp Thr Ala Asp Glu Gly Val Phe Asp
1635 1640 1645
Asn Phe Val Leu Lys Ile Arg Asp Thr Lys Lys Gln Ser Glu Pro Leu
1650 1655 1660
Glu Ile Thr Leu Leu Ala Pro Glu Arg Thr Arg Asp Ile Thr Gly Leu
1665 1670 1675 1680
Arg Glu Ala Thr Glu Tyr Glu Ile Glu Leu Tyr Gly Ile Ser Lys Gly
1685 1690 1695
Arg Arg Ser Gln Thr Val Ser Ala Ile Ala Thr Thr Ala Met Gly Ser
1700 1705 1710
Pro Lys Glu Val Ile Phe Ser Asp Ile Thr Glu Asn Ser Ala Thr Val
1715 1720 1725
Ser Trp Arg Ala Pro Thr Ala Gln Val Glu Ser Phe Arg Ile Thr Tyr
1730 1735 1740
Val Pro Ile Thr Gly Gly Thr Pro Ser Met Val Thr Val Asp Gly Thr
1745 1750 1755 1760
Lys Thr Gln Thr Arg Leu Val Lys Leu Ile Pro Gly Val Glu Tyr Leu
1765 1770 1775
Val Ser Ile Ile Ala Met Lys Gly Phe Glu Glu Ser Glu Pro Val Ser
1780 1785 1790
Gly Ser Phe Thr Thr Ala Leu Asp Gly Pro Ser Gly Leu Val Thr Ala
1795 1800 1805
Asn Ile Thr Asp Ser Glu Ala Leu Ala Arg Trp Gln Pro Ala Ile Ala
1810 1815 1820
Thr Val Asp Ser Tyr Val Ile Ser Tyr Thr Gly Glu Lys Val Pro Glu
1825 1830 1835 1840
Ile Thr Arg Thr Val Ser Gly Asn Thr Val Glu Tyr Ala Leu Thr Asp
1845 1850 1855
Leu Glu Pro Ala Thr Glu Tyr Thr Leu Arg Ile Phe Ala Glu Lys Gly
1860 1865 1870
Pro Gln Lys Ser Ser Thr Ile Thr Ala Lys Phe Thr Thr Asp Leu Asp
1875 1880 1885
Ser Pro Arg Asp Leu Thr Ala Thr Glu Val Gln Ser Glu Thr Ala Leu
1890 1895 1900
Leu Thr Trp Arg Pro Pro Arg Ala Ser Val Thr Gly Tyr Leu Leu Val
1905 1910 1915 1920
Tyr Glu Ser Val Asp Gly Thr Val Lys Glu Val Ile Val Gly Pro Asp
1925 1930 1935
Thr Thr Ser Tyr Ser Leu Ala Asp Leu Ser Pro Ser Thr His Tyr Thr
1940 1945 1950
Ala Lys Ile Gln Ala Leu Asn Gly Pro Leu Arg Ser Asn Met Ile Gln
1955 1960 1965
Thr Ile Phe Thr Thr Ile Gly Leu Leu Tyr Pro Phe Pro Lys Asp Cys
1970 1975 1980
Ser Gln Ala Met Leu Asn Gly Asp Thr Thr Ser Gly Leu Tyr Thr Ile
1985 1990 1995 2000
Tyr Leu Asn Gly Asp Lys Ala Glu Ala Leu Glu Val Phe Cys Asp Met
2005 2010 2015
Thr Ser Asp Gly Gly Gly Trp Ile Val Phe Leu Arg Arg Lys Asn Gly
2020 2025 2030
Arg Glu Asn Phe Tyr Gln Asn Trp Lys Ala Tyr Ala Ala Gly Phe Gly
2035 2040 2045
Asp Arg Arg Glu Glu Phe Trp Leu Gly Leu Asp Asn Leu Asn Lys Ile
2050 2055 2060
Thr Ala Gln Gly Gln Tyr Glu Leu Arg Val Asp Leu Arg Asp His Gly
2065 2070 2075 2080
Glu Thr Ala Phe Ala Val Tyr Asp Lys Phe Ser Val Gly Asp Ala Lys
2085 2090 2095
Thr Arg Tyr Lys Leu Lys Val Glu Gly Tyr Ser Gly Thr Ala Gly Asp
2100 2105 2110
Ser Met Ala Tyr His Asn Gly Arg Ser Phe Ser Thr Phe Asp Lys Asp
2115 2120 2125
Thr Asp Ser Ala Ile Thr Asn Cys Ala Leu Ser Tyr Lys Gly Ala Phe
2130 2135 2140
Trp Tyr Arg Asn Cys His Arg Val Asn Leu Met Gly Arg Tyr Gly Asp
2145 2150 2155 2160
Asn Asn His Ser Gln Gly Val Asn Trp Phe His Trp Lys Gly His Glu
2165 2170 2175
His Ser Ile Gln Phe Ala Glu Met Lys Leu Arg Pro Ser Asn Phe Arg
2180 2185 2190
Asn Leu Glu Gly Arg Arg Lys Arg Ala
2195 2200
<210> 807
<211> 30
<212> PRT
<213> Homo sapiens
<220>
<223> trimerization domain of human tenascin C (TNC)
<400> 807
Ala Cys Gly Cys Ala Ala Ala Pro Asp Val Lys Glu Leu Leu Ser Arg
1 5 10 15
Leu Glu Glu Leu Glu Asn Leu Val Ser Ser Leu Arg Glu Gln
20 25 30
<210> 808
<211> 106
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> EHD2 dimerization domain
<400> 808
Asp Phe Thr Pro Pro Thr Val Lys Ile Leu Gln Ser Ser Cys Asp Gly
1 5 10 15
Gly Gly His Phe Pro Pro Thr Ile Gln Leu Leu Cys Leu Val Ser Gly
20 25 30
Tyr Thr Pro Gly Thr Ile Asn Ile Thr Trp Leu Glu Asp Gly Gln Val
35 40 45
Met Asp Val Asp Leu Ser Thr Ala Ser Thr Thr Gln Glu Gly Glu Leu
50 55 60
Ala Ser Thr Gln Ser Glu Leu Thr Leu Ser Gln Lys His Trp Leu Ser
65 70 75 80
Asp Arg Thr Tyr Thr Cys Gln Val Thr Tyr Gln Gly His Thr Phe Glu
85 90 95
Asp Ser Thr Lys Lys Cys Ala Asp Ser Asn
100 105
<210> 809
<211> 27
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Peptide linker between EHD2 and scTNFR2 in
EHD2-scTNFR2
<400> 809
Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Ser
1 5 10 15
Gly Gly Gly Ser Gly Gly Ser Glu Phe Leu Ala
20 25
<210> 810
<211> 605
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> EHD2-scTNFR2
<400> 810
Asp Phe Thr Pro Pro Thr Val Lys Ile Leu Gln Ser Ser Cys Asp Gly
1 5 10 15
Gly Gly His Phe Pro Pro Thr Ile Gln Leu Leu Cys Leu Val Ser Gly
20 25 30
Tyr Thr Pro Gly Thr Ile Asn Ile Thr Trp Leu Glu Asp Gly Gln Val
35 40 45
Met Asp Val Asp Leu Ser Thr Ala Ser Thr Thr Gln Glu Gly Glu Leu
50 55 60
Ala Ser Thr Gln Ser Glu Leu Thr Leu Ser Gln Lys His Trp Leu Ser
65 70 75 80
Asp Arg Thr Tyr Thr Cys Gln Val Thr Tyr Gln Gly His Thr Phe Glu
85 90 95
Asp Ser Thr Lys Lys Cys Ala Asp Ser Asn Gly Gly Gly Ser Gly Gly
100 105 110
Gly Ser Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Ser Gly Gly
115 120 125
Ser Glu Phe Leu Ala Ser Ser Arg Thr Pro Ser Asp Lys Pro Val Ala
130 135 140
His Val Val Ala Asn Pro Gln Ala Glu Gly Gln Leu Gln Trp Leu Asn
145 150 155 160
Arg Arg Ala Asn Ala Leu Leu Ala Asn Gly Val Glu Leu Arg Asp Asn
165 170 175
Gln Leu Val Val Pro Ser Glu Gly Leu Tyr Leu Ile Tyr Ser Gln Val
180 185 190
Leu Phe Lys Gly Gln Gly Cys Pro Ser Thr His Val Leu Leu Thr His
195 200 205
Thr Ile Ser Arg Ile Ala Val Ser Tyr Gln Thr Lys Val Asn Leu Leu
210 215 220
Ser Ala Ile Lys Ser Pro Cys Gln Arg Glu Thr Pro Glu Gly Ala Glu
225 230 235 240
Ala Lys Pro Trp Tyr Glu Pro Ile Tyr Leu Gly Gly Val Phe Gln Leu
245 250 255
Glu Lys Gly Asp Arg Leu Ser Ala Glu Ile Asn Arg Pro Asp Tyr Leu
260 265 270
Asn Phe Arg Glu Ser Gly Gln Val Tyr Phe Gly Ile Ile Ala Leu Gly
275 280 285
Gly Gly Gly Ser Ser Ser Arg Thr Pro Ser Asp Lys Pro Val Ala His
290 295 300
Val Val Ala Asn Pro Gln Ala Glu Gly Gln Leu Gln Trp Leu Asn Arg
305 310 315 320
Arg Ala Asn Ala Leu Leu Ala Asn Gly Val Glu Leu Arg Asp Asn Gln
325 330 335
Leu Val Val Pro Ser Glu Gly Leu Tyr Leu Ile Tyr Ser Gln Val Leu
340 345 350
Phe Lys Gly Gln Gly Cys Pro Ser Thr His Val Leu Leu Thr His Thr
355 360 365
Ile Ser Arg Ile Ala Val Ser Tyr Gln Thr Lys Val Asn Leu Leu Ser
370 375 380
Ala Ile Lys Ser Pro Cys Gln Arg Glu Thr Pro Glu Gly Ala Glu Ala
385 390 395 400
Lys Pro Trp Tyr Glu Pro Ile Tyr Leu Gly Gly Val Phe Gln Leu Glu
405 410 415
Lys Gly Asp Arg Leu Ser Ala Glu Ile Asn Arg Pro Asp Tyr Leu Asn
420 425 430
Phe Arg Glu Ser Gly Gln Val Tyr Phe Gly Ile Ile Ala Leu Gly Gly
435 440 445
Gly Gly Ser Ser Ser Arg Thr Pro Ser Asp Lys Pro Val Ala His Val
450 455 460
Val Ala Asn Pro Gln Ala Glu Gly Gln Leu Gln Trp Leu Asn Arg Arg
465 470 475 480
Ala Asn Ala Leu Leu Ala Asn Gly Val Glu Leu Arg Asp Asn Gln Leu
485 490 495
Val Val Pro Ser Glu Gly Leu Tyr Leu Ile Tyr Ser Gln Val Leu Phe
500 505 510
Lys Gly Gln Gly Cys Pro Ser Thr His Val Leu Leu Thr His Thr Ile
515 520 525
Ser Arg Ile Ala Val Ser Tyr Gln Thr Lys Val Asn Leu Leu Ser Ala
530 535 540
Ile Lys Ser Pro Cys Gln Arg Glu Thr Pro Glu Gly Ala Glu Ala Lys
545 550 555 560
Pro Trp Tyr Glu Pro Ile Tyr Leu Gly Gly Val Phe Gln Leu Glu Lys
565 570 575
Gly Asp Arg Leu Ser Ala Glu Ile Asn Arg Pro Asp Tyr Leu Asn Phe
580 585 590
Arg Glu Ser Gly Gln Val Tyr Phe Gly Ile Ile Ala Leu
595 600 605
<210> 811
<211> 111
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> MHD2 (IgM dimerization domain)
<400> 811
Ala Glu Leu Pro Pro Lys Val Ser Val Phe Val Pro Pro Arg Asp Gly
1 5 10 15
Phe Phe Gly Asn Pro Arg Lys Ser Lys Leu Ile Cys Gln Ala Thr Gly
20 25 30
Phe Ser Pro Arg Gln Ile Gln Val Ser Trp Leu Arg Glu Gly Lys Gln
35 40 45
Val Gly Ser Gly Val Thr Thr Asp Gln Val Gln Ala Glu Ala Lys Glu
50 55 60
Ser Gly Pro Thr Thr Tyr Lys Val Thr Ser Thr Leu Thr Ile Lys Glu
65 70 75 80
Ser Asp Trp Leu Gly Gln Ser Met Phe Thr Cys Arg Val Asp His Arg
85 90 95
Gly Leu Thr Phe Gln Gln Asn Ala Ser Ser Met Cys Val Pro Asp
100 105 110
<210> 812
<211> 31
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> stalk region of TNF that can be used as a linker
in scTNFR2-Fc
<400> 812
Gly Pro Gln Arg Glu Glu Phe Pro Arg Asp Leu Ser Leu Ile Ser Pro
1 5 10 15
Leu Ala Gln Ala Val Arg Ser Ser Ser Arg Thr Pro Ser Asp Lys
20 25 30
<210> 813
<211> 6
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> partial trastuzumab hinge sequence
<400> 813
Ser Cys Asp Lys Thr His
1 5
<210> 814
<211> 15
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> trastuzumab hinge sequence
<400> 814
Glu Pro Lys Ser Cys Asp Lys Thr His Thr Cys Pro Pro Cys Pro
1 5 10 15
<210> 815
<211> 12
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> nivolumab hinge sequence
<400> 815
Glu Ser Lys Tyr Gly Pro Pro Cys Pro Pro Cys Pro
1 5 10
<210> 816
<211> 4
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> GS linker
<400> 816
Gly Ser Gly Ser
1
<210> 817
<211> 5
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> GS linker
<400> 817
Gly Gly Gly Gly Ser
1 5
<210> 818
<211> 15
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> GS linker
<400> 818
Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser
1 5 10 15
<210> 819
<211> 20
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> GS linker
<400> 819
Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser Gly
1 5 10 15
Gly Gly Gly Ser
20
<210> 820
<211> 8
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> GS linker
<400> 820
Gly Ser Gly Gly Ser Ser Gly Gly
1 5
<210> 821
<211> 12
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> GS linker
<400> 821
Gly Ser Ser Ser Gly Ser Gly Ser Gly Ser Ser Gly
1 5 10
<210> 822
<211> 13
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> GS linker
<400> 822
Gly Ser Ser Ser Gly Ser Gly Ser Gly Ser Ser Gly Gly
1 5 10
<210> 823
<211> 6
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> GS linker
<400> 823
Gly Gly Ser Ser Gly Gly
1 5
<210> 824
<211> 13
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> GS linker
<400> 824
Gly Gly Ser Ser Gly Gly Ser Gly Gly Ser Ser Ser Gly
1 5 10
<210> 825
<211> 18
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> GS linker
<400> 825
Gly Ser Ser Ser Gly Ser Gly Ser Gly Gly Ser Ser Ser Gly Ser Gly
1 5 10 15
Ser Gly
<210> 826
<211> 18
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> GS linker
<400> 826
Gly Gly Ser Ser Gly Gly Ser Ser Gly Gly Gly Ser Ser Gly Gly Ser
1 5 10 15
Ser Gly
<210> 827
<211> 6
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> GS linker
<400> 827
Gly Ser Ser Ser Gly Ser
1 5
<210> 828
<211> 12
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> linker sequence
<400> 828
Gly Ser Ala Gly Ser Ala Ala Gly Ser Gly Glu Phe
1 5 10
<210> 829
<211> 18
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> linker sequence
<400> 829
Lys Glu Ser Gly Ser Val Ser Ser Glu Gln Leu Ala Gln Phe Arg Ser
1 5 10 15
Leu Asp
<210> 830
<211> 14
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> linker sequence
<400> 830
Glu Gly Lys Ser Ser Gly Ser Gly Ser Glu Ser Lys Ser Thr
1 5 10
<210> 831
<211> 5
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Alpha helix-forming linker, (EAAAK)n
<220>
<221> REPEAT
<222> (1)...(5)
<223> occuring n times, where n= 1 to 10
<400> 831
Glu Ala Ala Ala Lys
1 5
<210> 832
<211> 7
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> rigid linker, A(EAAAK)nA, where n = 2 to 5
<220>
<221> REPEAT
<222> (2)...(6)
<223> occurring 2, 3, 4, or 5 times
<400> 832
Ala Glu Ala Ala Ala Lys Ala
1 5
<210> 833
<211> 18
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> C-terminal extension from human IgG linker
<400> 833
Glu Leu Gln Leu Glu Glu Ser Ser Ala Glu Ala Gln Asp Gly Glu Leu
1 5 10 15
Asp Gly
<210> 834
<211> 14
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> C-terminal extension from human IgG variant linker
<400> 834
Glu Leu Gln Leu Glu Glu Ser Ser Ala Glu Ala Gln Gly Gly
1 5 10
<210> 835
<211> 20
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> human immunoglobulin light chain kappa leader
signal peptide sequence; human Ig kappa chain
V-III region signal peptide (IgGkSP)
<400> 835
Met Glu Thr Asp Thr Leu Leu Leu Trp Val Leu Leu Leu Trp Val Pro
1 5 10 15
Gly Ser Thr Gly
20
<210> 836
<211> 6
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Gly Ser Ser Glu Ile Phe Phe Lys Ile Lys Lys Thr Thr Pro Leu Arg
35 40 45
Arg Leu Met Glu Ala Phe Ala Lys Arg Gln Gly Lys Glu Met Asp Ser
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50 55 60
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Arg
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Arg Lys Cys Arg Pro Gly Phe Gly Val
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represents epitope that TNFR2 agonist antibodies
or fragments thereof can bind to
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represents epitope that TNFR2 agonist antibodies
or fragments thereof can bind to
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represents epitope that TNFR2 agonist antibodies
or fragments thereof can bind to
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represents epitope that TNFR2 agonist antibodies
or fragments thereof can bind to
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represents epitope that TNFR2 agonist antibodies
or fragments thereof can bind to
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represents epitope that TNFR2 agonist antibodies
or fragments thereof can bind to
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represents epitope that TNFR2 agonist antibodies
or fragments thereof can bind to
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represents epitope that TNFR2 agonist antibodies
or fragments thereof can bind to
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represents epitope that TNFR2 agonist antibodies
or fragments thereof can bind to
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represents epitope that TNFR2 agonist antibodies
or fragments thereof can bind to
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represents epitope that TNFR2 agonist antibodies
or fragments thereof can bind to
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represents epitope that TNFR2 agonist antibodies
or fragments thereof can bind to
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represents epitope that TNFR2 agonist antibodies
or fragments thereof can bind to
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group
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<223> Xaa is Cys residue protected with ACM protecting
group
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<213> Artificial Sequence
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represents epitope that TNFR2 agonist antibodies
or fragments thereof can bind to
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represents epitope that TNFR2 agonist antibodies
or fragments thereof can bind to
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group
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group
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represents epitope that TNFR2 agonist antibodies
or fragments thereof can bind to
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represents epitope that TNFR2 agonist antibodies
or fragments thereof can bind to
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group
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group
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represents epitope that TNFR2 agonist antibodies
or fragments thereof can bind to
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group
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group
<220>
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<223> Xaa is Cys residue protected with ACM protecting
group
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represents epitope that TNFR2 agonist antibodies
or fragments thereof can bind to
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group
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group
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represents epitope that TNFR2 agonist antibodies
or fragments thereof can bind to
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or fragments thereof can bind to
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group
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group
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represents epitope that TNFR2 agonist antibodies
or fragments thereof can bind to
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or fragments thereof can bind to
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or fragments thereof can bind to
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represents epitope that TNFR2 agonist antibodies
or fragments thereof can bind to
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or fragments thereof can bind to
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or fragments thereof can bind to
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group
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<212> PRT
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represents epitope that TNFR2 agonist antibodies
or fragments thereof can bind to
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group
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<213> Artificial Sequence
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represents epitope that TNFR2 agonist antibodies
or fragments thereof can bind to
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group
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group
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represents epitope that TNFR2 agonist antibodies
or fragments thereof can bind to
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<222> (7)...(7)
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group
<400> 882
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1 5 10 15
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20 25
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<220>
<223> peptide sequence within human TNFR2 that
represents epitope that TNFR2 agonist antibodies
or fragments thereof can bind to
<400> 883
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<220>
<223> peptide sequence within human TNFR2 that
represents epitope that TNFR2 agonist antibodies
or fragments thereof can bind to
<400> 884
Leu Trp Asn Trp Val Pro Glu Cys Leu Ser Ala Ala Ser Arg Cys
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<213> Artificial Sequence
<220>
<223> peptide sequence within human TNFR2 that
represents epitope that TNFR2 agonist antibodies
or fragments thereof can bind to
<400> 885
Gln Thr Ala Gln Met Cys Cys Ser Lys Cys Ser Pro Gly Gln His
1 5 10 15
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<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> peptide sequence within human TNFR2 that
represents epitope that TNFR2 agonist antibodies
or fragments thereof can bind to
<220>
<221> VARIANT
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group
<220>
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group
<220>
<221> VARIANT
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<223> Xaa is Cys residue protected with ACM protecting
group
<400> 886
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Arg Glu Gln Asn Arg Ile Cys Thr Xaa Arg Pro
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<220>
<223> peptide sequence within human TNFR2 that
represents epitope that TNFR2 agonist antibodies
or fragments thereof can bind to
<220>
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group
<220>
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group
<220>
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group
<220>
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group
<400> 887
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1 5 10 15
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20 25 30
Cys
<210> 888
<211> 27
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> peptide sequence within human TNFR2 that
represents epitope that TNFR2 agonist antibodies
or fragments thereof can bind to
<220>
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group
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group
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group
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<213> Artificial Sequence
<220>
<223> peptide sequence within human TNFR2 that
represents epitope that TNFR2 agonist antibodies
or fragments thereof can bind to
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group
<220>
<221> VARIANT
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<223> Xaa is Cys residue protected with ACM protecting
group
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Gln Ala Cys Thr Arg Glu Gln Asn Arg Ile Xaa
20 25
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<211> 27
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> peptide sequence within human TNFR2 that
represents epitope that TNFR2 agonist antibodies
or fragments thereof can bind to
<220>
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group
<400> 890
Leu Trp Asn Trp Val Pro Glu Xaa Leu Ser Cys Gly Gly Ser Gly Gly
1 5 10 15
Thr Gln Ala Cys Thr Arg Glu Gln Asn Arg Ile
20 25
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<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> peptide sequence within human TNFR2 that
represents epitope that TNFR2 agonist antibodies
or fragments thereof can bind to
<220>
<221> VARIANT
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group
<220>
<221> VARIANT
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<223> Xaa is Cys residue protected with ACM protecting
group
<220>
<221> VARIANT
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<223> Xaa is Cys residue protected with ACM protecting
group
<400> 891
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1 5 10 15
Gln Ala Xaa Thr Arg Glu Gln Asn Arg Ile Cys
20 25
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<213> Artificial Sequence
<220>
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represents epitope that TNFR2 agonist antibodies
or fragments thereof can bind to
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group
<220>
<221> VARIANT
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group
<400> 892
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1 5 10 15
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20 25
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<213> Artificial Sequence
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<223> peptide sequence within human TNFR2 that
represents epitope that TNFR2 agonist antibodies
or fragments thereof can bind to
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group
<220>
<221> VARIANT
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<223> Xaa is Cys residue protected with ACM protecting
group
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<223> peptide sequence within human TNFR2 that
represents epitope that TNFR2 agonist antibodies
or fragments thereof can bind to
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represents epitope that TNFR2 agonist antibodies
or fragments thereof can bind to
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group
<220>
<221> VARIANT
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<223> Xaa is Cys residue protected with ACM protecting
group
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Ser Xaa Gly Ser Arg Cys Ser Ser Asp Gln Val Gly Gly Ser Gly Gly
1 5 10 15
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20 25
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<213> Artificial Sequence
<220>
<223> peptide sequence within human TNFR2 that
represents epitope that TNFR2 agonist antibodies
or fragments thereof can bind to
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Pro Leu Arg Lys Cys Arg Pro Gly Phe Gly Ala Gly Arg Pro Gly
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<213> Artificial Sequence
<220>
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represents epitope that TNFR2 agonist antibodies
or fragments thereof can bind to
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<213> Artificial Sequence
<220>
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represents epitope that TNFR2 agonist antibodies
or fragments thereof can bind to
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Gly Trp Tyr Cys Ala Leu Ser Lys Gln Glu Gly Cys Arg Leu Cys
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<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
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represents epitope that TNFR2 agonist antibodies
or fragments thereof can bind to
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<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> peptide sequence within human TNFR2 that
represents epitope that TNFR2 agonist antibodies
or fragments thereof can bind to
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Trp Asn Trp Val Pro Glu Cys Leu Ser Cys Gly Ser Arg Cys Ser
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<212> PRT
<213> Artificial Sequence
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represents epitope that TNFR2 agonist antibodies
or fragments thereof can bind to
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group
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group
<220>
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<223> Xaa is Cys residue protected with ACM protecting
group
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1 5 10 15
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<212> PRT
<213> Artificial Sequence
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represents epitope that TNFR2 agonist antibodies
or fragments thereof can bind to
<220>
<221> VARIANT
<222> (4)...(4)
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group
<220>
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group
<220>
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<223> Xaa is Cys residue protected with ACM protecting
group
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1 5 10 15
Gln Ala Cys Thr Arg Glu Gln Asn Arg Ile Xaa
20 25
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<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> peptide sequence within human TNFR2 that
represents epitope that TNFR2 agonist antibodies
or fragments thereof can bind to
<220>
<221> VARIANT
<222> (1)...(1)
<223> Xaa is Cys residue protected with ACM protecting
group
<220>
<221> VARIANT
<222> (4)...(4)
<223> Xaa is Cys residue protected with ACM protecting
group
<220>
<221> VARIANT
<222> (25)...(25)
<223> Xaa is Cys residue protected with ACM protecting
group
<400> 903
Xaa Leu Ser Xaa Gly Ser Arg Cys Ser Ser Asp Gly Gly Ser Gly Gly
1 5 10 15
Arg Glu Gln Asn Arg Ile Cys Thr Xaa Arg Pro
20 25
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<211> 27
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> peptide sequence within human TNFR2 that
represents epitope that TNFR2 agonist antibodies
or fragments thereof can bind to
<220>
<221> VARIANT
<222> (6)...(6)
<223> Xaa is Cys residue protected with ACM protecting
group
<400> 904
Glu Gly Cys Arg Leu Xaa Ala Pro Leu Arg Lys Gly Gly Ser Gly Gly
1 5 10 15
Cys Arg Pro Gly Phe Gly Val Ala Arg Pro Gly
20 25
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<211> 27
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> peptide sequence within human TNFR2 that
represents epitope that TNFR2 agonist antibodies
or fragments thereof can bind to
<220>
<221> VARIANT
<222> (19)...(19)
<223> Xaa is Cys residue protected with ACM protecting
group
<220>
<221> VARIANT
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<223> Xaa is Cys residue protected with ACM protecting
group
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1 5 10 15
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<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> peptide sequence within human TNFR2 that
represents epitope that TNFR2 agonist antibodies
or fragments thereof can bind to
<220>
<221> VARIANT
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<223> Xaa is Cys residue protected with ACM protecting
group
<220>
<221> VARIANT
<222> (25)...(25)
<223> Xaa is Cys residue protected with ACM protecting
group
<220>
<221> VARIANT
<222> (27)...(27)
<223> Xaa is Cys residue protected with ACM protecting
group
<400> 906
Leu Trp Asn Trp Val Pro Glu Xaa Leu Ser Cys Gly Gly Ser Gly Gly
1 5 10 15
Cys Thr Arg Glu Gln Asn Arg Ile Xaa Thr Xaa
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<211> 27
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> peptide sequence within human TNFR2 that
represents epitope that TNFR2 agonist antibodies
or fragments thereof can bind to
<220>
<221> VARIANT
<222> (8)...(8)
<223> Xaa is Cys residue protected with ACM protecting
group
<400> 907
Lys Gln Glu Gly Cys Arg Leu Xaa Ala Pro Leu Gly Gly Ser Gly Gly
1 5 10 15
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20 25
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<211> 27
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> peptide sequence within human TNFR2 that
represents epitope that TNFR2 agonist antibodies
or fragments thereof can bind to
<220>
<221> VARIANT
<222> (1)...(1)
<223> Xaa is Cys residue protected with ACM protecting
group
<400> 908
Xaa Ala Leu Ser Lys Gln Glu Gly Cys Arg Leu Gly Gly Ser Gly Gly
1 5 10 15
Cys Arg Pro Gly Phe Gly Val Ala Arg Pro Gly
20 25
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<211> 27
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> peptide sequence within human TNFR2 that
represents epitope that TNFR2 agonist antibodies
or fragments thereof can bind to
<220>
<221> VARIANT
<222> (3)...(3)
<223> Xaa is Cys residue protected with ACM protecting
group
<400> 909
Trp Tyr Xaa Ala Leu Ser Lys Gln Glu Gly Cys Gly Gly Ser Gly Gly
1 5 10 15
Cys Arg Pro Gly Phe Gly Val Ala Arg Pro Gly
20 25
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<211> 27
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> peptide sequence within human TNFR2 that
represents epitope that TNFR2 agonist antibodies
or fragments thereof can bind to
<220>
<221> VARIANT
<222> (10)...(10)
<223> Xaa is Cys residue protected with ACM protecting
group
<400> 910
Leu Ser Lys Gln Glu Gly Cys Arg Leu Xaa Ala Gly Gly Ser Gly Gly
1 5 10 15
Cys Arg Pro Gly Phe Gly Val Ala Arg Pro Gly
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<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> peptide sequence within human TNFR2 that
represents epitope that TNFR2 agonist antibodies
or fragments thereof can bind to
<220>
<221> VARIANT
<222> (24)...(24)
<223> Xaa is Cys residue protected with ACM protecting
group
<400> 911
Gly Ser Arg Cys Ser Ser Asp Gln Val Glu Thr Gly Gly Ser Gly Gly
1 5 10 15
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20 25
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<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> peptide sequence within human TNFR2 that
represents epitope that TNFR2 agonist antibodies
or fragments thereof can bind to
<220>
<221> VARIANT
<222> (11)...(11)
<223> Xaa is Cys residue protected with ACM protecting
group
<400> 912
Ala Leu Ser Lys Gln Glu Gly Cys Arg Leu Xaa Gly Gly Ser Gly Gly
1 5 10 15
Cys Arg Pro Gly Phe Gly Val Ala Arg Pro Gly
20 25
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<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> peptide sequence within human TNFR2 that
represents epitope that TNFR2 agonist antibodies
or fragments thereof can bind to
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<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> peptide sequence within human TNFR2 that
represents epitope that TNFR2 agonist antibodies
or fragments thereof can bind to
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<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> peptide sequence within human TNFR2 that
represents epitope that TNFR2 agonist antibodies
or fragments thereof can bind to
<220>
<221> VARIANT
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<223> Xaa is Cys residue protected with ACM protecting
group
<400> 915
Arg Cys Ser Ser Asp Gln Val Glu Thr Gln Ala Gly Gly Ser Gly Gly
1 5 10 15
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<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> peptide sequence within human TNFR2 that
represents epitope that TNFR2 agonist antibodies
or fragments thereof can bind to
<220>
<221> VARIANT
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<223> Xaa is Cys residue protected with ACM protecting
group
<220>
<221> VARIANT
<222> (26)...(26)
<223> Xaa is Cys residue protected with ACM protecting
group
<400> 916
Trp Asn Trp Val Pro Glu Xaa Leu Ser Cys Gly Gly Gly Ser Gly Gly
1 5 10 15
Ala Cys Thr Arg Glu Gln Asn Arg Ile Xaa Thr
20 25
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<211> 27
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> peptide sequence within human TNFR2 that
represents epitope that TNFR2 agonist antibodies
or fragments thereof can bind to
<220>
<221> VARIANT
<222> (6)...(6)
<223> Xaa is Cys residue protected with ACM protecting
group
<400> 917
Thr Ser Asp Val Val Xaa Lys Pro Cys Ala Pro Gly Gly Ser Gly Gly
1 5 10 15
Thr Thr Ser Ser Thr Asp Ile Cys Arg Pro His
20 25
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<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> peptide sequence within human TNFR2 that
represents epitope that TNFR2 agonist antibodies
or fragments thereof can bind to
<400> 918
Ile Cys Arg Pro His Gln Ile Cys Asn Val Val Ala Ile Pro Gly
1 5 10 15
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<211> 27
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> peptide sequence within human TNFR2 that
represents epitope that TNFR2 agonist antibodies
or fragments thereof can bind to
<220>
<221> VARIANT
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<223> Xaa is Cys residue protected with ACM protecting
group
<220>
<221> VARIANT
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<223> Xaa is Cys residue protected with ACM protecting
group
<400> 919
Arg Leu Cys Ala Pro Leu Arg Lys Xaa Arg Pro Gly Gly Ser Gly Gly
1 5 10 15
Cys Lys Pro Xaa Ala Pro Gly Thr Phe Ser Asn
20 25
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<211> 15
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> peptide sequence within human TNFR2 that
represents epitope that TNFR2 agonist antibodies
or fragments thereof can bind to
<400> 920
Pro Thr Arg Ser Met Ala Pro Gly Ala Val His Leu Pro Gln Pro
1 5 10 15
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<211> 27
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> peptide sequence within human TNFR2 that
represents epitope that TNFR2 agonist antibodies
or fragments thereof can bind to
<220>
<221> VARIANT
<222> (19)...(19)
<223> Xaa is Cys residue protected with ACM protecting
group
<220>
<221> VARIANT
<222> (22)...(22)
<223> Xaa is Cys residue protected with ACM protecting
group
<400> 921
Tyr Ala Pro Glu Pro Gly Ser Thr Cys Arg Leu Gly Gly Ser Gly Gly
1 5 10 15
Met Cys Xaa Ser Lys Xaa Ser Pro Gly Gln His
20 25
<210> 922
<211> 27
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> peptide sequence within human TNFR2 that
represents epitope that TNFR2 agonist antibodies
or fragments thereof can bind to
<220>
<221> VARIANT
<222> (5)...(5)
<223> Xaa is Cys residue protected with ACM protecting
group
<220>
<221> VARIANT
<222> (27)...(27)
<223> Xaa is Cys residue protected with ACM protecting
group
<400> 922
Trp Val Pro Glu Xaa Leu Ser Cys Gly Ser Arg Gly Gly Ser Gly Gly
1 5 10 15
Gln Ala Cys Thr Arg Glu Gln Asn Arg Ile Xaa
20 25
<210> 923
<211> 27
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> peptide sequence within human TNFR2 that
represents epitope that TNFR2 agonist antibodies
or fragments thereof can bind to
<220>
<221> VARIANT
<222> (3)...(3)
<223> Xaa is Cys residue protected with ACM protecting
group
<220>
<221> VARIANT
<222> (6)...(6)
<223> Xaa is Cys residue protected with ACM protecting
group
<220>
<221> VARIANT
<222> (18)...(18)
<223> Xaa is Cys residue protected with ACM protecting
group
<400> 923
Pro Glu Xaa Leu Ser Xaa Gly Ser Arg Cys Ser Gly Gly Ser Gly Gly
1 5 10 15
Ala Xaa Thr Arg Glu Gln Asn Arg Ile Cys Thr
20 25
<210> 924
<211> 27
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> peptide sequence within human TNFR2 that
represents epitope that TNFR2 agonist antibodies
or fragments thereof can bind to
<220>
<221> VARIANT
<222> (2)...(2)
<223> Xaa is Cys residue protected with ACM protecting
group
<220>
<221> VARIANT
<222> (5)...(5)
<223> Xaa is Cys residue protected with ACM protecting
group
<220>
<221> VARIANT
<222> (24)...(24)
<223> Xaa is Cys residue protected with ACM protecting
group
<400> 924
Glu Xaa Leu Ser Xaa Gly Ser Arg Cys Ser Ser Gly Gly Ser Gly Gly
1 5 10 15
Glu Gln Asn Arg Ile Cys Thr Xaa Arg Pro Gly
20 25
<210> 925
<211> 27
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> peptide sequence within human TNFR2 that
represents epitope that TNFR2 agonist antibodies
or fragments thereof can bind to
<220>
<221> VARIANT
<222> (3)...(3)
<223> Xaa is Cys residue protected with ACM protecting
group
<220>
<221> VARIANT
<222> (10)...(10)
<223> Xaa is Cys residue protected with ACM protecting
group
<220>
<221> VARIANT
<222> (27)...(27)
<223> Xaa is Cys residue protected with ACM protecting
group
<400> 925
Pro Glu Xaa Leu Ser Cys Gly Ser Arg Xaa Ser Gly Gly Ser Gly Gly
1 5 10 15
Gln Ala Cys Thr Arg Glu Gln Asn Arg Ile Xaa
20 25
<210> 926
<211> 27
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> peptide sequence within human TNFR2 that
represents epitope that TNFR2 agonist antibodies
or fragments thereof can bind to
<220>
<221> VARIANT
<222> (5)...(5)
<223> Xaa is Cys residue protected with ACM protecting
group
<220>
<221> VARIANT
<222> (26)...(26)
<223> Xaa is Cys residue protected with ACM protecting
group
<400> 926
Trp Val Pro Glu Xaa Leu Ser Cys Gly Ser Arg Gly Gly Ser Gly Gly
1 5 10 15
Ala Cys Thr Arg Glu Gln Asn Arg Ile Xaa Thr
20 25
<210> 927
<211> 27
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> peptide sequence within human TNFR2 that
represents epitope that TNFR2 agonist antibodies
or fragments thereof can bind to
<220>
<221> VARIANT
<222> (19)...(19)
<223> Xaa is Cys residue protected with ACM protecting
group
<220>
<221> VARIANT
<222> (22)...(22)
<223> Xaa is Cys residue protected with ACM protecting
group
<400> 927
Pro Gly Ser Thr Cys Arg Leu Arg Glu Tyr Tyr Gly Gly Ser Gly Gly
1 5 10 15
Met Cys Xaa Ser Lys Xaa Ser Pro Gly Gln His
20 25
<210> 928
<211> 15
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> peptide sequence within human TNFR2 that
represents epitope that TNFR2 agonist antibodies
or fragments thereof can bind to
<400> 928
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represents epitope that TNFR2 agonist antibodies
or fragments thereof can bind to
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represents epitope that TNFR2 agonist antibodies
or fragments thereof can bind to
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group
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represents epitope that TNFR2 agonist antibodies
or fragments thereof can bind to
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group
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represents epitope that TNFR2 agonist antibodies
or fragments thereof can bind to
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represents epitope that TNFR2 agonist antibodies
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represents epitope that TNFR2 agonist antibodies
or fragments thereof can bind to
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group
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group
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or fragments thereof can bind to
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or fragments thereof can bind to
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group
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represents epitope that TNFR2 agonist antibodies
or fragments thereof can bind to
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or fragments thereof can bind to
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group
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or fragments thereof can bind to
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group
<220>
<221> VARIANT
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<223> Xaa is Cys residue protected with ACM protecting
group
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1 5 10 15
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or fragments thereof can bind to
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group
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group
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<223> Xaa is Cys residue protected with ACM protecting
group
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<213> Artificial Sequence
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or fragments thereof can bind to
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group
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<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> peptide sequence within human TNFR2 that
represents epitope that TNFR2 agonist antibodies
or fragments thereof can bind to
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<221> VARIANT
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<223> Xaa is Cys residue protected with ACM protecting
group
<220>
<221> VARIANT
<222> (4)...(4)
<223> Xaa is Cys residue protected with ACM protecting
group
<220>
<221> VARIANT
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<223> Xaa is Cys residue protected with ACM protecting
group
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or fragments thereof can bind to
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group
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or fragments thereof can bind to
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group
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group
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group
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or fragments thereof can bind to
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group
<220>
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group
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<213> Artificial Sequence
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or fragments thereof can bind to
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group
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group
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<220>
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group
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Cys
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<220>
<223> peptide sequence within human TNFR2 that
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or fragments thereof can bind to
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group
<220>
<221> VARIANT
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<223> Xaa is Cys residue protected with ACM protecting
group
<400> 953
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1 5 10 15
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Cys
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<220>
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or fragments thereof can bind to
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<220>
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or fragments thereof can bind to
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group
<220>
<221> VARIANT
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group
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<211> 27
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<213> Artificial Sequence
<220>
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or fragments thereof can bind to
<220>
<221> VARIANT
<222> (19)...(19)
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group
<220>
<221> VARIANT
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group
<400> 956
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<213> Artificial Sequence
<220>
<223> peptide sequence within human TNFR2 that
represents epitope that TNFR2 agonist antibodies
or fragments thereof can bind to
<220>
<221> VARIANT
<222> (3)...(3)
<223> Xaa is Cys residue protected with ACM protecting
group
<220>
<221> VARIANT
<222> (6)...(6)
<223> Xaa is Cys residue protected with ACM protecting
group
<220>
<221> VARIANT
<222> (24)...(24)
<223> Xaa is Cys residue protected with ACM protecting
group
<400> 957
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<213> Artificial Sequence
<220>
<223> peptide sequence within human TNFR2 that
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or fragments thereof can bind to
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group
<400> 958
Gly Ser Arg Cys Ser Ser Asp Gln Val Glu Thr Gly Gly Ser Gly Gly
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Gln Asn Arg Ile Cys Thr Xaa Arg Pro Gly Trp
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<210> 959
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<213> Artificial Sequence
<220>
<223> peptide sequence within human TNFR2 that
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or fragments thereof can bind to
<220>
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group
<220>
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<220>
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group
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<213> Artificial Sequence
<220>
<223> peptide sequence within human TNFR2 that
represents epitope that TNFR2 agonist antibodies
or fragments thereof can bind to
<220>
<221> VARIANT
<222> (7)...(7)
<223> Xaa is Cys residue protected with ACM protecting
group
<220>
<221> VARIANT
<222> (27)...(27)
<223> Xaa is Cys residue protected with ACM protecting
group
<400> 960
Leu Ser Cys Gly Ser Arg Xaa Ser Ser Asp Gln Gly Gly Ser Gly Gly
1 5 10 15
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<213> Artificial Sequence
<220>
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or fragments thereof can bind to
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1 5 10 15
Thr Thr Ser Ser Thr Asp Ile Cys Arg Pro His
20 25
<210> 962
<211> 33
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> peptide sequence within human TNFR2 that
represents epitope that TNFR2 agonist antibodies
or fragments thereof can bind to
<220>
<221> VARIANT
<222> (4)...(4)
<223> Xaa is Cys residue protected with ACM protecting
group
<220>
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<222> (12)...(12)
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group
<220>
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<223> peptide sequence within human TNFR2 that
represents epitope that TNFR2 agonist antibodies
or fragments thereof can bind to
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Cys Gln Ala Ala Thr Arg Glu Gln Asn Arg Ile Gly Ala Ala Arg Pro
1 5 10 15
Cys
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represents epitope that TNFR2 agonist antibodies
or fragments thereof can bind to
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group
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Cys
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represents epitope that TNFR2 agonist antibodies
or fragments thereof can bind to
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group
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group
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group
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group
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represents epitope that TNFR2 agonist antibodies
or fragments thereof can bind to
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group
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group
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or fragments thereof can bind to
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group
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1 5 10 15
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group
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Cys
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group
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group
<220>
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group
<220>
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group
<220>
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group
<220>
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group
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or fragments thereof can bind to
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or fragments thereof can bind to
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<221> VARIANT
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group
<220>
<221> VARIANT
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group
<400> 992
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20 25
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Pro Ser Thr Ser Phe Leu Leu Pro Met Gly Ala Ala Pro Pro Ala
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<213> Artificial Sequence
<220>
<223> peptide sequence within human TNFR2 that
represents epitope that TNFR2 agonist antibodies
or fragments thereof can bind to
<220>
<221> VARIANT
<222> (6)...(6)
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group
<400> 994
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20
<210> 995
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<220>
<223> peptide sequence within human TNFR2 that
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or fragments thereof can bind to
<220>
<221> VARIANT
<222> (2)...(2)
<223> Xaa is Cys residue protected with ACM protecting
group
<220>
<221> VARIANT
<222> (5)...(5)
<223> Xaa is Cys residue protected with ACM protecting
group
<220>
<221> VARIANT
<222> (18)...(18)
<223> Xaa is Cys residue protected with ACM protecting
group
<400> 995
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20 25
<210> 996
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<213> Artificial Sequence
<220>
<223> peptide sequence within human TNFR2 that
represents epitope that TNFR2 agonist antibodies
or fragments thereof can bind to
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<221> VARIANT
<222> (2)...(2)
<223> Xaa is Cys residue protected with ACM protecting
group
<220>
<221> VARIANT
<222> (5)...(5)
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group
<220>
<221> VARIANT
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group
<400> 996
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group
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<221> VARIANT
<222> (19)...(19)
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group
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<213> Artificial Sequence
<220>
<223> peptide sequence within human TNFR2 that
represents epitope that TNFR2 agonist antibodies
or fragments thereof can bind to
<220>
<221> VARIANT
<222> (19)...(19)
<223> Xaa is Cys residue protected with ACM protecting
group
<220>
<221> VARIANT
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<223> Xaa is Cys residue protected with ACM protecting
group
<400> 998
Gly Ser Thr Cys Arg Leu Arg Glu Tyr Tyr Asp Gly Gly Ser Gly Gly
1 5 10 15
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<213> Artificial Sequence
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represents epitope that TNFR2 agonist antibodies
or fragments thereof can bind to
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<223> peptide sequence within human TNFR2 that
represents epitope that TNFR2 agonist antibodies
or fragments thereof can bind to
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group
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<213> Artificial Sequence
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<223> peptide sequence within human TNFR2 that
represents epitope that TNFR2 agonist antibodies
or fragments thereof can bind to
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group
<220>
<221> VARIANT
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group
<400> 1001
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<213> Artificial Sequence
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<223> peptide sequence within human TNFR2 that
represents epitope that TNFR2 agonist antibodies
or fragments thereof can bind to
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20 25
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represents epitope that TNFR2 agonist antibodies
or fragments thereof can bind to
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group
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group
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20 25 30
Cys
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<223> peptide sequence within human TNFR2 that
represents epitope that TNFR2 agonist antibodies
or fragments thereof can bind to
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group
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group
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Thr Pro Tyr Ala Pro Glu Pro Gly Ser Thr Cys Gly Gly Ser Gly Gly
1 5 10 15
Met Cys Xaa Ser Lys Xaa Ser Pro Gly Gln His
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<213> Artificial Sequence
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<223> peptide sequence within human TNFR2 that
represents epitope that TNFR2 agonist antibodies
or fragments thereof can bind to
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group
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group
<220>
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<223> Xaa is Cys residue protected with ACM protecting
group
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represents epitope that TNFR2 agonist antibodies
or fragments thereof can bind to
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represents epitope that TNFR2 agonist antibodies
or fragments thereof can bind to
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group
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group
<220>
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<223> Xaa is Cys residue protected with ACM protecting
group
<400> 1007
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<211> 27
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<213> Artificial Sequence
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represents epitope that TNFR2 agonist antibodies
or fragments thereof can bind to
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group
<220>
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<223> Xaa is Cys residue protected with ACM protecting
group
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represents epitope that TNFR2 agonist antibodies
or fragments thereof can bind to
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group
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group
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<223> Xaa is Cys residue protected with ACM protecting
group
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<213> Artificial Sequence
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represents epitope that TNFR2 agonist antibodies
or fragments thereof can bind to
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group
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group
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<212> PRT
<213> Artificial Sequence
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<223> peptide sequence within human TNFR2 that
represents epitope that TNFR2 agonist antibodies
or fragments thereof can bind to
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<221> VARIANT
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group
<220>
<221> VARIANT
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group
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Ser Lys Gln Glu Gly Cys Arg Leu Xaa Ala Pro Gly Gly Ser Gly Gly
1 5 10 15
Leu Xaa Ala Pro Leu Arg Lys Cys Arg Pro Gly
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<213> Artificial Sequence
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represents epitope that TNFR2 agonist antibodies
or fragments thereof can bind to
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1 5 10 15
Thr Thr Ser Ser Thr Asp Ile Cys Arg Pro His
20 25
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<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> peptide sequence within human TNFR2 that
represents epitope that TNFR2 agonist antibodies
or fragments thereof can bind to
<220>
<221> VARIANT
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<223> Xaa is Cys residue protected with ACM protecting
group
<220>
<221> VARIANT
<222> (26)...(26)
<223> Xaa is Cys residue protected with ACM protecting
group
<400> 1013
Xaa Gly Ser Arg Cys Ser Ser Asp Gln Val Glu Gly Gly Ser Gly Gly
1 5 10 15
Thr Arg Glu Gln Asn Arg Ile Cys Thr Xaa Arg
20 25
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<213> Artificial Sequence
<220>
<223> peptide sequence within human TNFR2 that
represents epitope that TNFR2 agonist antibodies
or fragments thereof can bind to
<220>
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group
<220>
<221> VARIANT
<222> (23)...(23)
<223> Xaa is Cys residue protected with ACM protecting
group
<400> 1014
Cys Ala Pro Leu Arg Lys Xaa Arg Pro Gly Phe Gly Val Ala Arg Pro
1 5 10 15
Cys Ala Pro Leu Arg Lys Xaa Arg Pro Gly Phe Gly Val Ala Arg Pro
20 25 30
Cys
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<213> Artificial Sequence
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<223> peptide sequence within human TNFR2 that
represents epitope that TNFR2 agonist antibodies
or fragments thereof can bind to
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group
<220>
<221> VARIANT
<222> (7)...(7)
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group
<220>
<221> VARIANT
<222> (23)...(23)
<223> Xaa is Cys residue protected with ACM protecting
group
<400> 1015
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1 5 10 15
Gln Asn Arg Ile Cys Thr Xaa Arg Pro Gly Trp
20 25
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<211> 27
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> peptide sequence within human TNFR2 that
represents epitope that TNFR2 agonist antibodies
or fragments thereof can bind to
<220>
<221> VARIANT
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<223> Xaa is Cys residue protected with ACM protecting
group
<400> 1016
Val Xaa Lys Pro Cys Ala Pro Gly Thr Phe Ser Gly Gly Ser Gly Gly
1 5 10 15
Thr Thr Ser Ser Thr Asp Ile Cys Arg Pro His
20 25
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<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> peptide sequence within human TNFR2 that
represents epitope that TNFR2 agonist antibodies
or fragments thereof can bind to
<220>
<221> VARIANT
<222> (7)...(7)
<223> Xaa is Cys residue protected with ACM protecting
group
<400> 1017
Trp Asn Trp Val Pro Glu Xaa Leu Ser Cys Gly Gly Gly Ser Gly Gly
1 5 10 15
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20 25
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<211> 15
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> peptide sequence within human TNFR2 that
represents epitope that TNFR2 agonist antibodies
or fragments thereof can bind to
<400> 1018
Asp Gln Val Glu Thr Gln Ala Cys Thr Arg Glu Gln Asn Arg Ile
1 5 10 15
<210> 1019
<211> 33
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> peptide sequence within human TNFR2 that
represents epitope that TNFR2 agonist antibodies
or fragments thereof can bind to
<220>
<221> VARIANT
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group
<220>
<221> VARIANT
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<223> Xaa is Cys residue protected with ACM protecting
group
<220>
<221> VARIANT
<222> (28)...(28)
<223> Xaa is Cys residue protected with ACM protecting
group
<220>
<221> VARIANT
<222> (30)...(30)
<223> Xaa is Cys residue protected with ACM protecting
group
<400> 1019
Cys Ala Pro Leu Arg Lys Xaa Arg Pro Gly Phe Gly Val Ala Arg Pro
1 5 10 15
Cys Gln Ala Xaa Thr Arg Glu Gln Asn Arg Ile Xaa Thr Xaa Arg Pro
20 25 30
Cys
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<213> Artificial Sequence
<220>
<223> peptide sequence within human TNFR2 that
represents epitope that TNFR2 agonist antibodies
or fragments thereof can bind to
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<220>
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represents epitope that TNFR2 agonist antibodies
or fragments thereof can bind to
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<223> Xaa is Cys residue protected with ACM protecting
group
<220>
<221> VARIANT
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<223> Xaa is Cys residue protected with ACM protecting
group
<400> 1021
Leu Ser Xaa Gly Ser Arg Cys Ser Ser Asp Gln Gly Gly Ser Gly Gly
1 5 10 15
Thr Arg Glu Gln Asn Arg Ile Cys Thr Xaa Arg
20 25
<210> 1022
<211> 33
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<213> Artificial Sequence
<220>
<223> peptide sequence within human TNFR2 that
represents epitope that TNFR2 agonist antibodies
or fragments thereof can bind to
<220>
<221> VARIANT
<222> (3)...(3)
<223> Xaa is Cys residue protected with ACM protecting
group
<220>
<221> VARIANT
<222> (6)...(6)
<223> Xaa is Cys residue protected with ACM protecting
group
<220>
<221> VARIANT
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<223> Xaa is Cys residue protected with ACM protecting
group
<220>
<221> VARIANT
<222> (20)...(20)
<223> Xaa is Cys residue protected with ACM protecting
group
<220>
<221> VARIANT
<222> (28)...(28)
<223> Xaa is Cys residue protected with ACM protecting
group
<220>
<221> VARIANT
<222> (30)...(30)
<223> Xaa is Cys residue protected with ACM protecting
group
<400> 1022
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1 5 10 15
Cys Gln Ala Xaa Thr Arg Glu Gln Asn Arg Ile Xaa Thr Xaa Arg Pro
20 25 30
Cys
<210> 1023
<211> 15
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> peptide sequence within human TNFR2 that
represents epitope that TNFR2 agonist antibodies
or fragments thereof can bind to
<400> 1023
Ser Asn Thr Thr Ser Ser Thr Asp Ile Cys Arg Pro His Gln Ile
1 5 10 15
<210> 1024
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<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> peptide sequence within human TNFR2 that
represents epitope that TNFR2 agonist antibodies
or fragments thereof can bind to
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1 5 10 15
<210> 1025
<211> 33
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<213> Artificial Sequence
<220>
<223> peptide sequence within human TNFR2 that
represents epitope that TNFR2 agonist antibodies
or fragments thereof can bind to
<220>
<221> VARIANT
<222> (9)...(9)
<223> Xaa is Cys residue protected with ACM protecting
group
<220>
<221> VARIANT
<222> (25)...(25)
<223> Xaa is Cys residue protected with ACM protecting
group
<400> 1025
Cys Ala Pro Glu Pro Gly Ser Thr Xaa Arg Leu Arg Glu Tyr Tyr Asp
1 5 10 15
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20 25 30
Cys
<210> 1026
<211> 27
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> peptide sequence within human TNFR2 that
represents epitope that TNFR2 agonist antibodies
or fragments thereof can bind to
<220>
<221> VARIANT
<222> (7)...(7)
<223> Xaa is Cys residue protected with ACM protecting
group
<220>
<221> VARIANT
<222> (26)...(26)
<223> Xaa is Cys residue protected with ACM protecting
group
<400> 1026
Arg Glu Gln Asn Arg Ile Xaa Thr Cys Arg Pro Gly Gly Ser Gly Gly
1 5 10 15
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20 25
<210> 1027
<211> 33
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> peptide sequence within human TNFR2 that
represents epitope that TNFR2 agonist antibodies
or fragments thereof can bind to
<220>
<221> VARIANT
<222> (4)...(4)
<223> Xaa is Cys residue protected with ACM protecting
group
<220>
<221> VARIANT
<222> (14)...(14)
<223> Xaa is Cys residue protected with ACM protecting
group
<220>
<221> VARIANT
<222> (23)...(23)
<223> Xaa is Cys residue protected with ACM protecting
group
<400> 1027
Cys Ser Arg Xaa Ser Ser Asp Gln Val Glu Thr Gln Ala Xaa Thr Arg
1 5 10 15
Cys Ala Pro Leu Arg Lys Xaa Arg Pro Gly Phe Gly Val Ala Arg Pro
20 25 30
Cys
<210> 1028
<211> 27
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> peptide sequence within human TNFR2 that
represents epitope that TNFR2 agonist antibodies
or fragments thereof can bind to
<220>
<221> VARIANT
<222> (3)...(3)
<223> Xaa is Cys residue protected with ACM protecting
group
<400> 1028
Val Val Xaa Lys Pro Cys Ala Pro Gly Thr Phe Gly Gly Ser Gly Gly
1 5 10 15
Thr Ser Ser Thr Asp Ile Cys Arg Pro His Gln
20 25
<210> 1029
<211> 22
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> peptide sequence within human TNFR2 that
represents epitope that TNFR2 agonist antibodies
or fragments thereof can bind to
<220>
<221> VARIANT
<222> (1)...(1)
<223> Xaa is Cys residue protected with ACM protecting
group
<400> 1029
Xaa Lys Pro Cys Ala Pro Gly Thr Phe Ser Asn Thr Thr Ser Ser Thr
1 5 10 15
Asp Ile Cys Arg Pro His
20
<210> 1030
<211> 27
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> peptide sequence within human TNFR2 that
represents epitope that TNFR2 agonist antibodies
or fragments thereof can bind to
<220>
<221> VARIANT
<222> (8)...(8)
<223> Xaa is Cys residue protected with ACM protecting
group
<400> 1030
Thr Glu Thr Ser Asp Val Val Xaa Lys Pro Cys Gly Gly Ser Gly Gly
1 5 10 15
Thr Thr Ser Ser Thr Asp Ile Cys Arg Pro His
20 25
<210> 1031
<211> 27
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> peptide sequence within human TNFR2 that
represents epitope that TNFR2 agonist antibodies
or fragments thereof can bind to
<220>
<221> VARIANT
<222> (19)...(19)
<223> Xaa is Cys residue protected with ACM protecting
group
<400> 1031
Arg Cys Ser Ser Asp Gln Val Glu Thr Gln Ala Gly Gly Ser Gly Gly
1 5 10 15
Gln Ala Xaa Thr Arg Glu Gln Asn Arg Ile Cys
20 25
<210> 1032
<211> 27
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> peptide sequence within human TNFR2 that
represents epitope that TNFR2 agonist antibodies
or fragments thereof can bind to
<220>
<221> VARIANT
<222> (11)...(11)
<223> Xaa is Cys residue protected with ACM protecting
group
<220>
<221> VARIANT
<222> (19)...(19)
<223> Xaa is Cys residue protected with ACM protecting
group
<400> 1032
Cys Ser Ser Asp Gln Val Glu Thr Gln Ala Xaa Gly Gly Ser Gly Gly
1 5 10 15
Gln Ala Xaa Thr Arg Glu Gln Asn Arg Ile Cys
20 25
<210> 1033
<211> 27
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> peptide sequence within human TNFR2 that
represents epitope that TNFR2 agonist antibodies
or fragments thereof can bind to
<220>
<221> VARIANT
<222> (4)...(4)
<223> Xaa is Cys residue protected with ACM protecting
group
<220>
<221> VARIANT
<222> (7)...(7)
<223> Xaa is Cys residue protected with ACM protecting
group
<220>
<221> VARIANT
<222> (17)...(17)
<223> Xaa is Cys residue protected with ACM protecting
group
<220>
<221> VARIANT
<222> (27)...(27)
<223> Xaa is Cys residue protected with ACM protecting
group
<400> 1033
Val Pro Glu Xaa Leu Ser Xaa Gly Ser Arg Cys Gly Gly Ser Gly Gly
1 5 10 15
Xaa Thr Arg Glu Gln Asn Arg Ile Cys Thr Xaa
20 25
<210> 1034
<211> 27
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> peptide sequence within human TNFR2 that
represents epitope that TNFR2 agonist antibodies
or fragments thereof can bind to
<220>
<221> VARIANT
<222> (8)...(8)
<223> Xaa is Cys residue protected with ACM protecting
group
<220>
<221> VARIANT
<222> (25)...(25)
<223> Xaa is Cys residue protected with ACM protecting
group
<400> 1034
Thr Arg Glu Gln Asn Arg Ile Xaa Thr Cys Arg Gly Gly Ser Gly Gly
1 5 10 15
Cys Ala Leu Ser Lys Gln Glu Gly Xaa Arg Leu
20 25
<210> 1035
<211> 27
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> peptide sequence within human TNFR2 that
represents epitope that TNFR2 agonist antibodies
or fragments thereof can bind to
<220>
<221> VARIANT
<222> (8)...(8)
<223> Xaa is Cys residue protected with ACM protecting
group
<220>
<221> VARIANT
<222> (26)...(26)
<223> Xaa is Cys residue protected with ACM protecting
group
<400> 1035
Thr Arg Glu Gln Asn Arg Ile Xaa Thr Cys Arg Gly Gly Ser Gly Gly
1 5 10 15
Tyr Cys Ala Leu Ser Lys Gln Glu Gly Xaa Arg
20 25
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<211> 15
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> peptide sequence within human TNFR2 that
represents epitope that TNFR2 agonist antibodies
or fragments thereof can bind to
<400> 1036
Val Cys Thr Ser Thr Ser Pro Thr Arg Ser Ala Gly Pro Gly Ala
1 5 10 15
<210> 1037
<211> 33
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> peptide sequence within human TNFR2 that
represents epitope that TNFR2 agonist antibodies
or fragments thereof can bind to
<220>
<221> VARIANT
<222> (4)...(4)
<223> Xaa is Cys residue protected with ACM protecting
group
<220>
<221> VARIANT
<222> (12)...(12)
<223> Xaa is Cys residue protected with ACM protecting
group
<220>
<221> VARIANT
<222> (14)...(14)
<223> Xaa is Cys residue protected with ACM protecting
group
<220>
<221> VARIANT
<222> (23)...(23)
<223> Xaa is Cys residue protected with ACM protecting
group
<400> 1037
Cys Gln Ala Xaa Thr Arg Glu Gln Asn Arg Ile Xaa Thr Xaa Arg Pro
1 5 10 15
Cys Ala Pro Leu Arg Lys Xaa Arg Pro Gly Phe Gly Val Ala Arg Pro
20 25 30
Cys
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<211> 27
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> peptide sequence within human TNFR2 that
represents epitope that TNFR2 agonist antibodies
or fragments thereof can bind to
<220>
<221> VARIANT
<222> (5)...(5)
<223> Xaa is Cys residue protected with ACM protecting
group
<400> 1038
Ser Asp Val Val Xaa Lys Pro Cys Ala Pro Gly Gly Gly Ser Gly Gly
1 5 10 15
Thr Thr Ser Ser Thr Asp Ile Cys Arg Pro His
20 25
<210> 1039
<211> 17
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> peptide sequence within human TNFR2 that
represents epitope that TNFR2 agonist antibodies
or fragments thereof can bind to
<400> 1039
Cys Ala Ala Thr Arg Glu Gln Asn Arg Ile Ala Ala Gly Arg Pro Gly
1 5 10 15
Cys
<210> 1040
<211> 33
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> peptide sequence within human TNFR2 that
represents epitope that TNFR2 agonist antibodies
or fragments thereof can bind to
<220>
<221> VARIANT
<222> (9)...(9)
<223> Xaa is Cys residue protected with ACM protecting
group
<220>
<221> VARIANT
<222> (23)...(23)
<223> Xaa can be any naturally occurring amino acid
<400> 1040
Cys Asp Gln Val Glu Thr Gln Ala Xaa Thr Arg Glu Gln Asn Arg Ile
1 5 10 15
Cys Ala Pro Leu Arg Lys Xaa Arg Pro Gly Phe Gly Val Ala Arg Pro
20 25 30
Cys
<210> 1041
<211> 27
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> peptide sequence within human TNFR2 that
represents epitope that TNFR2 agonist antibodies
or fragments thereof can bind to
<220>
<221> VARIANT
<222> (26)...(26)
<223> Xaa is Cys residue protected with ACM protecting
group
<400> 1041
Ser Arg Cys Ser Ser Asp Gln Val Glu Thr Gln Gly Gly Ser Gly Gly
1 5 10 15
Thr Arg Glu Gln Asn Arg Ile Cys Thr Xaa Arg
20 25
<210> 1042
<211> 15
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> peptide sequence within human TNFR2 that
represents epitope that TNFR2 agonist antibodies
or fragments thereof can bind to
<400> 1042
Ser Thr Ala Pro Ser Thr Ser Phe Leu Leu Pro Met Gly Pro Ser
1 5 10 15
<210> 1043
<211> 27
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> peptide sequence within human TNFR2 that
represents epitope that TNFR2 agonist antibodies
or fragments thereof can bind to
<220>
<221> VARIANT
<222> (3)...(3)
<223> Xaa is Cys residue protected with ACM protecting
group
<220>
<221> VARIANT
<222> (18)...(18)
<223> Xaa is Cys residue protected with ACM protecting
group
<400> 1043
Leu Ser Xaa Gly Ser Arg Cys Ser Ser Asp Gln Gly Gly Ser Gly Gly
1 5 10 15
Ala Xaa Thr Arg Glu Gln Asn Arg Ile Cys Thr
20 25
<210> 1044
<211> 33
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> peptide sequence within human TNFR2 that
represents epitope that TNFR2 agonist antibodies
or fragments thereof can bind to
<220>
<221> VARIANT
<222> (8)...(8)
<223> Xaa is Cys residue protected with ACM protecting
group
<220>
<221> VARIANT
<222> (11)...(11)
<223> Xaa is Cys residue protected with ACM protecting
group
<220>
<221> VARIANT
<222> (30)...(30)
<223> Xaa is Cys residue protected with ACM protecting
group
<400> 1044
Cys Leu Ser Lys Gln Glu Gly Xaa Arg Leu Xaa Ala Pro Leu Arg Lys
1 5 10 15
Cys Ala Phe Thr Pro Tyr Ala Pro Glu Pro Gly Ser Thr Xaa Arg Leu
20 25 30
Cys
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<211> 24
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> peptide sequence within human TNFR2 that
represents epitope that TNFR2 agonist antibodies
or fragments thereof can bind to
<400> 1045
Cys Asn Trp Val Pro Glu Ala Leu Ser Ala Gly Pro Gly Ala Ser Ser
1 5 10 15
Asp Gln Val Glu Thr Gln Ala Cys
20
<210> 1046
<211> 27
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> peptide sequence within human TNFR2 that
represents epitope that TNFR2 agonist antibodies
or fragments thereof can bind to
<220>
<221> VARIANT
<222> (7)...(7)
<223> Xaa is Cys residue protected with ACM protecting
group
<400> 1046
Glu Thr Ser Asp Val Val Xaa Lys Pro Cys Ala Gly Gly Ser Gly Gly
1 5 10 15
Thr Thr Ser Ser Thr Asp Ile Cys Arg Pro His
20 25
<210> 1047
<211> 27
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> peptide sequence within human TNFR2 that
represents epitope that TNFR2 agonist antibodies
or fragments thereof can bind to
<220>
<221> VARIANT
<222> (2)...(2)
<223> Xaa is Cys residue protected with ACM protecting
group
<400> 1047
Val Xaa Lys Pro Cys Ala Pro Gly Thr Phe Ser Gly Gly Ser Gly Gly
1 5 10 15
Thr Ser Ser Thr Asp Ile Cys Arg Pro His Gln
20 25
<210> 1048
<211> 33
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> peptide sequence within human TNFR2 that
represents epitope that TNFR2 agonist antibodies
or fragments thereof can bind to
<220>
<221> VARIANT
<222> (14)...(14)
<223> Xaa is Cys residue protected with ACM protecting
group
<220>
<221> VARIANT
<222> (23)...(23)
<223> Xaa is Cys residue protected with ACM protecting
group
<400> 1048
Cys Val Ala Ile Pro Gly Asn Ala Ser Met Asp Ala Val Xaa Thr Ser
1 5 10 15
Cys Ala Pro Leu Arg Lys Xaa Arg Pro Gly Phe Gly Val Ala Arg Pro
20 25 30
Cys
<210> 1049
<211> 27
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> peptide sequence within human TNFR2 that
represents epitope that TNFR2 agonist antibodies
or fragments thereof can bind to
<220>
<221> VARIANT
<222> (5)...(5)
<223> Xaa is Cys residue protected with ACM protecting
group
<400> 1049
Ser Asp Val Val Xaa Lys Pro Cys Ala Pro Gly Gly Gly Ser Gly Gly
1 5 10 15
Thr Ser Ser Thr Asp Ile Cys Arg Pro His Gln
20 25
<210> 1050
<211> 27
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> peptide sequence within human TNFR2 that
represents epitope that TNFR2 agonist antibodies
or fragments thereof can bind to
<400> 1050
Gln Ile Cys Asn Val Val Ala Ile Pro Gly Asn Gly Gly Ser Gly Gly
1 5 10 15
Cys Thr Ser Thr Ser Pro Thr Arg Ser Met Ala
20 25
<210> 1051
<211> 15
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> peptide sequence within human TNFR2 that
represents epitope that TNFR2 agonist antibodies
or fragments thereof can bind to
<400> 1051
Asp Ile Cys Arg Pro His Gln Ile Cys Asn Val Val Ala Ile Pro
1 5 10 15
<210> 1052
<211> 17
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> peptide sequence within human TNFR2 that
represents epitope that TNFR2 agonist antibodies
or fragments thereof can bind to
<400> 1052
Cys Leu Trp Asn Trp Val Pro Glu Ala Leu Ser Ala Gly Ser Arg Ala
1 5 10 15
Cys
<210> 1053
<211> 33
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> peptide sequence within human TNFR2 that
represents epitope that TNFR2 agonist antibodies
or fragments thereof can bind to
<220>
<221> VARIANT
<222> (9)...(9)
<223> Xaa is Cys residue protected with ACM protecting
group
<220>
<221> VARIANT
<222> (23)...(23)
<223> Xaa is Cys residue protected with ACM protecting
group
<400> 1053
Cys Ala Pro Glu Pro Gly Ser Thr Xaa Arg Leu Arg Glu Tyr Tyr Asp
1 5 10 15
Cys Ala Pro Leu Arg Lys Xaa Arg Pro Gly Phe Gly Val Ala Arg Pro
20 25 30
Cys
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<211> 27
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> peptide sequence within human TNFR2 that
represents epitope that TNFR2 agonist antibodies
or fragments thereof can bind to
<220>
<221> VARIANT
<222> (19)...(19)
<223> Xaa is Cys residue protected with ACM protecting
group
<220>
<221> VARIANT
<222> (22)...(22)
<223> Xaa is Cys residue protected with ACM protecting
group
<400> 1054
Ser Thr Cys Arg Leu Arg Glu Tyr Tyr Asp Gln Gly Gly Ser Gly Gly
1 5 10 15
Met Cys Xaa Ser Lys Xaa Ser Pro Gly Gln His
20 25
<210> 1055
<211> 27
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> peptide sequence within human TNFR2 that
represents epitope that TNFR2 agonist antibodies
or fragments thereof can bind to
<220>
<221> VARIANT
<222> (4)...(4)
<223> Xaa is Cys residue protected with ACM protecting
group
<220>
<221> VARIANT
<222> (11)...(11)
<223> Xaa is Cys residue protected with ACM protecting
group
<400> 1055
Val Pro Glu Xaa Leu Ser Cys Gly Ser Arg Xaa Gly Gly Ser Gly Gly
1 5 10 15
Thr Gln Ala Cys Thr Arg Glu Gln Asn Arg Ile
20 25
<210> 1056
<211> 27
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> peptide sequence within human TNFR2 that
represents epitope that TNFR2 agonist antibodies
or fragments thereof can bind to
<220>
<221> VARIANT
<222> (7)...(7)
<223> Xaa is Cys residue protected with ACM protecting
group
<220>
<221> VARIANT
<222> (26)...(26)
<223> Xaa is Cys residue protected with ACM protecting
group
<400> 1056
Leu Ser Cys Gly Ser Arg Xaa Ser Ser Asp Gln Gly Gly Ser Gly Gly
1 5 10 15
Ala Cys Thr Arg Glu Gln Asn Arg Ile Xaa Thr
20 25
<210> 1057
<211> 33
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> peptide sequence within human TNFR2 that
represents epitope that TNFR2 agonist antibodies
or fragments thereof can bind to
<220>
<221> VARIANT
<222> (2)...(2)
<223> Xaa is Cys residue protected with ACM protecting
group
<220>
<221> VARIANT
<222> (20)...(20)
<223> Xaa is Cys residue protected with ACM protecting
group
<400> 1057
Cys Xaa Glu Asp Ser Thr Tyr Thr Gln Leu Trp Asn Trp Val Pro Glu
1 5 10 15
Cys Gln Ile Xaa Asn Val Val Ala Ile Pro Gly Asn Ala Ser Met Asp
20 25 30
Cys
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<211> 27
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> peptide sequence within human TNFR2 that
represents epitope that TNFR2 agonist antibodies
or fragments thereof can bind to
<220>
<221> VARIANT
<222> (6)...(6)
<223> Xaa is Cys residue protected with ACM protecting
group
<220>
<221> VARIANT
<222> (27)...(27)
<223> Xaa is Cys residue protected with ACM protecting
group
<400> 1058
Ser Cys Gly Ser Arg Xaa Ser Ser Asp Gln Val Gly Gly Ser Gly Gly
1 5 10 15
Gln Ala Cys Thr Arg Glu Gln Asn Arg Ile Xaa
20 25
<210> 1059
<211> 27
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> peptide sequence within human TNFR2 that
represents epitope that TNFR2 agonist antibodies
or fragments thereof can bind to
<220>
<221> VARIANT
<222> (19)...(19)
<223> Xaa is Cys residue protected with ACM protecting
group
<400> 1059
Ser Arg Cys Ser Ser Asp Gln Val Glu Thr Gln Gly Gly Ser Gly Gly
1 5 10 15
Gln Ala Xaa Thr Arg Glu Gln Asn Arg Ile Cys
20 25
<210> 1060
<211> 33
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> peptide sequence within human TNFR2 that
represents epitope that TNFR2 agonist antibodies
or fragments thereof can bind to
<220>
<221> VARIANT
<222> (23)...(23)
<223> Xaa is Cys residue protected with ACM protecting
group
<400> 1060
Cys Thr Ser Pro Thr Arg Ser Met Ala Pro Gly Ala Val His Leu Pro
1 5 10 15
Cys Ala Pro Leu Arg Lys Xaa Arg Pro Gly Phe Gly Val Ala Arg Pro
20 25 30
Cys
<210> 1061
<211> 27
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> peptide sequence within human TNFR2 that
represents epitope that TNFR2 agonist antibodies
or fragments thereof can bind to
<220>
<221> VARIANT
<222> (2)...(2)
<223> Xaa is Cys residue protected with ACM protecting
group
<220>
<221> VARIANT
<222> (19)...(19)
<223> Xaa is Cys residue protected with ACM protecting
group
<400> 1061
Ser Xaa Gly Ser Arg Cys Ser Ser Asp Gln Val Gly Gly Ser Gly Gly
1 5 10 15
Gln Ala Xaa Thr Arg Glu Gln Asn Arg Ile Cys
20 25
<210> 1062
<211> 27
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> peptide sequence within human TNFR2 that
represents epitope that TNFR2 agonist antibodies
or fragments thereof can bind to
<220>
<221> VARIANT
<222> (8)...(8)
<223> Xaa is Cys residue protected with ACM protecting
group
<220>
<221> VARIANT
<222> (18)...(18)
<223> Xaa is Cys residue protected with ACM protecting
group
<400> 1062
Lys Gln Glu Gly Cys Arg Leu Xaa Ala Pro Leu Gly Gly Ser Gly Gly
1 5 10 15
Leu Xaa Ala Pro Leu Arg Lys Cys Arg Pro Gly
20 25
<210> 1063
<211> 17
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> peptide sequence within human TNFR2 that
represents epitope that TNFR2 agonist antibodies
or fragments thereof can bind to
<400> 1063
Cys Ala Ala Thr Arg Glu Gln Asn Arg Ile Ala Thr Ala Arg Pro Gly
1 5 10 15
Cys
<210> 1064
<211> 33
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> peptide sequence within human TNFR2 that
represents epitope that TNFR2 agonist antibodies
or fragments thereof can bind to
<220>
<221> VARIANT
<222> (2)...(2)
<223> Xaa is Cys residue protected with ACM protecting
group
<220>
<221> VARIANT
<222> (3)...(3)
<223> Xaa is Cys residue protected with ACM protecting
group
<220>
<221> VARIANT
<222> (6)...(6)
<223> Xaa is Cys residue protected with ACM protecting
group
<220>
<221> VARIANT
<222> (16)...(16)
<223> Xaa is Cys residue protected with ACM protecting
group
<220>
<221> VARIANT
<222> (23)...(23)
<223> Xaa is Cys residue protected with ACM protecting
group
<400> 1064
Cys Xaa Xaa Ser Lys Xaa Ser Pro Gly Gln His Ala Lys Val Phe Xaa
1 5 10 15
Cys Ala Pro Leu Arg Lys Xaa Arg Pro Gly Phe Gly Val Ala Arg Pro
20 25 30
Cys
<210> 1065
<211> 33
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> peptide sequence within human TNFR2 that
represents epitope that TNFR2 agonist antibodies
or fragments thereof can bind to
<220>
<221> VARIANT
<222> (5)...(5)
<223> Xaa is Cys residue protected with ACM protecting
group
<220>
<221> VARIANT
<222> (8)...(8)
<223> Xaa is Cys residue protected with ACM protecting
group
<220>
<221> VARIANT
<222> (25)...(25)
<223> Xaa is Cys residue protected with ACM protecting
group
<400> 1065
Cys Asp Val Val Xaa Lys Pro Xaa Ala Pro Gly Thr Phe Ser Asn Thr
1 5 10 15
Cys Asn Ala Ser Met Asp Ala Val Xaa Thr Ser Thr Ser Pro Thr Arg
20 25 30
Cys
<210> 1066
<211> 27
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> peptide sequence within human TNFR2 that
represents epitope that TNFR2 agonist antibodies
or fragments thereof can bind to
<220>
<221> VARIANT
<222> (1)...(1)
<223> Xaa is Cys residue protected with ACM protecting
group
<220>
<221> VARIANT
<222> (4)...(4)
<223> Xaa is Cys residue protected with ACM protecting
group
<220>
<221> VARIANT
<222> (18)...(18)
<223> Xaa is Cys residue protected with ACM protecting
group
<400> 1066
Xaa Leu Ser Xaa Gly Ser Arg Cys Ser Ser Asp Gly Gly Ser Gly Gly
1 5 10 15
Ala Xaa Thr Arg Glu Gln Asn Arg Ile Cys Thr
20 25
<210> 1067
<211> 27
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> peptide sequence within human TNFR2 that
represents epitope that TNFR2 agonist antibodies
or fragments thereof can bind to
<220>
<221> VARIANT
<222> (2)...(2)
<223> Xaa is Cys residue protected with ACM protecting
group
<220>
<221> VARIANT
<222> (9)...(9)
<223> Xaa is Cys residue protected with ACM protecting
group
<400> 1067
Glu Xaa Leu Ser Cys Gly Ser Arg Xaa Ser Ser Gly Gly Ser Gly Gly
1 5 10 15
Thr Gln Ala Cys Thr Arg Glu Gln Asn Arg Ile
20 25
<210> 1068
<211> 33
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> peptide sequence within human TNFR2 that
represents epitope that TNFR2 agonist antibodies
or fragments thereof can bind to
<220>
<221> VARIANT
<222> (12)...(12)
<223> Xaa is Cys residue protected with ACM protecting
group
<220>
<221> VARIANT
<222> (15)...(15)
<223> Xaa is Cys residue protected with ACM protecting
group
<220>
<221> VARIANT
<222> (25)...(25)
<223> Xaa is Cys residue protected with ACM protecting
group
<400> 1068
Cys Tyr Thr Gln Leu Trp Asn Trp Val Pro Glu Xaa Leu Ser Xaa Gly
1 5 10 15
Cys Asn Ala Ser Met Asp Ala Val Xaa Thr Ser Thr Ser Pro Thr Arg
20 25 30
Cys
<210> 1069
<211> 27
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> peptide sequence within human TNFR2 that
represents epitope that TNFR2 agonist antibodies
or fragments thereof can bind to
<220>
<221> VARIANT
<222> (3)...(3)
<223> Xaa is Cys residue protected with ACM protecting
group
<220>
<221> VARIANT
<222> (17)...(17)
<223> Xaa is Cys residue protected with ACM protecting
group
<220>
<221> VARIANT
<222> (27)...(27)
<223> Xaa is Cys residue protected with ACM protecting
group
<400> 1069
Leu Ser Xaa Gly Ser Arg Cys Ser Ser Asp Gln Gly Gly Ser Gly Gly
1 5 10 15
Xaa Thr Arg Glu Gln Asn Arg Ile Cys Thr Xaa
20 25
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<213> Artificial Sequence
<220>
<223> peptide sequence within human TNFR2 that
represents epitope that TNFR2 agonist antibodies
or fragments thereof can bind to
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group
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group
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group
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<223> Xaa is Cys residue protected with ACM protecting
group
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Cys Xaa Leu Ser Xaa Gly Ser Arg Xaa Ser Ser Asp Gln Val Glu Thr
1 5 10 15
Cys Ala Pro Leu Arg Lys Xaa Arg Pro Gly Phe Gly Val Ala Arg Pro
20 25 30
Cys
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represents epitope that TNFR2 agonist antibodies
or fragments thereof can bind to
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group
<400> 1071
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1 5 10 15
Thr Gln Ala Cys Thr Arg Glu Gln Asn Arg Ile
20 25
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<223> peptide sequence within human TNFR2 that
represents epitope that TNFR2 agonist antibodies
or fragments thereof can bind to
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group
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group
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group
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Xaa Thr Arg Glu Gln Asn Arg Ile Xaa Thr Cys Gly Gly Ser Gly Gly
1 5 10 15
Cys Ala Leu Ser Lys Gln Glu Gly Xaa Arg Leu
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<223> peptide sequence within human TNFR2 that
represents epitope that TNFR2 agonist antibodies
or fragments thereof can bind to
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Ser Asp Gln Val Glu Thr Gln Ala Cys Thr Arg Glu Gln Asn Arg
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represents epitope that TNFR2 agonist antibodies
or fragments thereof can bind to
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group
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Xaa Gly Ser Arg Cys Ser Ser Asp Gln Val Glu Gly Gly Ser Gly Gly
1 5 10 15
Gln Ala Xaa Thr Arg Glu Gln Asn Arg Ile Cys
20 25
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represents epitope that TNFR2 agonist antibodies
or fragments thereof can bind to
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group
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group
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Asn Arg Ile Xaa Thr Cys Arg Pro Gly Trp Tyr Gly Gly Ser Gly Gly
1 5 10 15
Cys Ala Leu Ser Lys Gln Glu Gly Xaa Arg Leu
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represents epitope that TNFR2 agonist antibodies
or fragments thereof can bind to
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group
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group
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group
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group
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group
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Cys Gly Xaa Arg Leu Xaa Ala Pro Leu Arg Lys Xaa Arg Pro Gly Phe
1 5 10 15
Cys Arg Glu Tyr Tyr Asp Gln Thr Ala Gln Met Xaa Xaa Ser Lys Xaa
20 25 30
Cys
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represents epitope that TNFR2 agonist antibodies
or fragments thereof can bind to
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Gly Thr Phe Ser Asn Thr Thr Ser Ser Thr Ala Ala Cys Arg Pro
1 5 10 15
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represents epitope that TNFR2 agonist antibodies
or fragments thereof can bind to
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group
<220>
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<223> Xaa is Cys residue protected with ACM protecting
group
<220>
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<223> Xaa is Cys residue protected with ACM protecting
group
<400> 1078
Cys Thr Val Xaa Asp Ser Xaa Glu Asp Ser Thr Tyr Thr Gln Leu Trp
1 5 10 15
Cys Asn Ala Ser Met Asp Ala Val Xaa Thr Ser Thr Ser Pro Thr Arg
20 25 30
Cys
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represents epitope that TNFR2 agonist antibodies
or fragments thereof can bind to
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group
<220>
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<223> Xaa is Cys residue protected with ACM protecting
group
<400> 1079
Pro Gly Ser Thr Cys Arg Leu Arg Glu Tyr Tyr Gly Gly Ser Gly Gly
1 5 10 15
Gln Met Cys Xaa Ser Lys Xaa Ser Pro Gly Gln
20 25
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represents epitope that TNFR2 agonist antibodies
or fragments thereof can bind to
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<223> Xaa is Cys residue protected with ACM protecting
group
<400> 1080
Trp Val Pro Glu Xaa Leu Ser Cys Gly Ser Arg Gly Gly Ser Gly Gly
1 5 10 15
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20 25
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<211> 27
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<213> Artificial Sequence
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<223> peptide sequence within human TNFR2 that
represents epitope that TNFR2 agonist antibodies
or fragments thereof can bind to
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<223> Xaa is Cys residue protected with ACM protecting
group
<400> 1081
Leu Ser Cys Gly Ser Arg Xaa Ser Ser Asp Gln Gly Gly Ser Gly Gly
1 5 10 15
Thr Gln Ala Cys Thr Arg Glu Gln Asn Arg Ile
20 25
<210> 1082
<211> 27
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> peptide sequence within human TNFR2 that
represents epitope that TNFR2 agonist antibodies
or fragments thereof can bind to
<220>
<221> VARIANT
<222> (2)...(2)
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group
<220>
<221> VARIANT
<222> (5)...(5)
<223> Xaa is Cys residue protected with ACM protecting
group
<220>
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group
<220>
<221> VARIANT
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<223> Xaa is Cys residue protected with ACM protecting
group
<400> 1082
Glu Xaa Leu Ser Xaa Gly Ser Arg Cys Ser Ser Gly Gly Ser Gly Gly
1 5 10 15
Xaa Thr Arg Glu Gln Asn Arg Ile Cys Thr Xaa
20 25
<210> 1083
<211> 27
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> peptide sequence within human TNFR2 that
represents epitope that TNFR2 agonist antibodies
or fragments thereof can bind to
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<221> VARIANT
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group
<220>
<221> VARIANT
<222> (4)...(4)
<223> Xaa is Cys residue protected with ACM protecting
group
<220>
<221> VARIANT
<222> (26)...(26)
<223> Xaa is Cys residue protected with ACM protecting
group
<400> 1083
Xaa Leu Ser Xaa Gly Ser Arg Cys Ser Ser Asp Gly Gly Ser Gly Gly
1 5 10 15
Thr Arg Glu Gln Asn Arg Ile Cys Thr Xaa Arg
20 25
<210> 1084
<211> 15
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> peptide sequence within human TNFR2 that
represents epitope that TNFR2 agonist antibodies
or fragments thereof can bind to
<400> 1084
Pro Tyr Ala Pro Glu Pro Gly Ser Thr Cys Arg Leu Arg Glu Tyr
1 5 10 15
<210> 1085
<211> 33
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> peptide sequence within human TNFR2 that
represents epitope that TNFR2 agonist antibodies
or fragments thereof can bind to
<220>
<221> VARIANT
<222> (2)...(2)
<223> Xaa is Cys residue protected with ACM protecting
group
<220>
<221> VARIANT
<222> (3)...(3)
<223> Xaa is Cys residue protected with ACM protecting
group
<220>
<221> VARIANT
<222> (6)...(6)
<223> Xaa is Cys residue protected with ACM protecting
group
<220>
<221> VARIANT
<222> (16)...(16)
<223> Xaa is Cys residue protected with ACM protecting
group
<220>
<221> VARIANT
<222> (25)...(25)
<223> Xaa is Cys residue protected with ACM protecting
group
<400> 1085
Cys Xaa Xaa Ser Lys Xaa Ser Pro Gly Gln His Ala Lys Val Phe Xaa
1 5 10 15
Cys Asn Ala Ser Met Asp Ala Val Xaa Thr Ser Thr Ser Pro Thr Arg
20 25 30
Cys
<210> 1086
<211> 33
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> peptide sequence within human TNFR2 that
represents epitope that TNFR2 agonist antibodies
or fragments thereof can bind to
<220>
<221> VARIANT
<222> (8)...(8)
<223> Xaa is Cys residue protected with ACM protecting
group
<220>
<221> VARIANT
<222> (14)...(14)
<223> Xaa is Cys residue protected with ACM protecting
group
<220>
<221> VARIANT
<222> (25)...(25)
<223> Xaa is Cys residue protected with ACM protecting
group
<400> 1086
Cys Thr Ser Ser Thr Asp Ile Xaa Arg Pro His Gln Ile Xaa Asn Val
1 5 10 15
Cys Asn Ala Ser Met Asp Ala Val Xaa Thr Ser Thr Ser Pro Thr Arg
20 25 30
Cys
<210> 1087
<211> 33
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> peptide sequence within human TNFR2 that
represents epitope that TNFR2 agonist antibodies
or fragments thereof can bind to
<220>
<221> VARIANT
<222> (2)...(2)
<223> Xaa is Cys residue protected with ACM protecting
group
<220>
<221> VARIANT
<222> (3)...(3)
<223> Xaa is Cys residue protected with ACM protecting
group
<220>
<221> VARIANT
<222> (6)...(6)
<223> Xaa is Cys residue protected with ACM protecting
group
<220>
<221> VARIANT
<222> (16)...(16)
<223> Xaa is Cys residue protected with ACM protecting
group
<220>
<221> VARIANT
<222> (20)...(20)
<223> Xaa is Cys residue protected with ACM protecting
group
<400> 1087
Cys Xaa Xaa Ser Lys Xaa Ser Pro Gly Gln His Ala Lys Val Phe Xaa
1 5 10 15
Cys Ala Val Xaa Thr Ser Thr Ser Pro Thr Arg Ser Met Ala Pro Gly
20 25 30
Cys
<210> 1088
<211> 27
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> peptide sequence within human TNFR2 that
represents epitope that TNFR2 agonist antibodies
or fragments thereof can bind to
<220>
<221> VARIANT
<222> (3)...(3)
<223> Xaa is Cys residue protected with ACM protecting
group
<220>
<221> VARIANT
<222> (10)...(10)
<223> Xaa is Cys residue protected with ACM protecting
group
<400> 1088
Pro Glu Xaa Leu Ser Cys Gly Ser Arg Xaa Ser Gly Gly Ser Gly Gly
1 5 10 15
Thr Gln Ala Cys Thr Arg Glu Gln Asn Arg Ile
20 25
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<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> peptide sequence within human TNFR2 that
represents epitope that TNFR2 agonist antibodies
or fragments thereof can bind to
<220>
<221> VARIANT
<222> (26)...(26)
<223> Xaa is Cys residue protected with ACM protecting
group
<400> 1089
Gly Ser Arg Cys Ser Ser Asp Gln Val Glu Thr Gly Gly Ser Gly Gly
1 5 10 15
Thr Arg Glu Gln Asn Arg Ile Cys Thr Xaa Arg
20 25
<210> 1090
<211> 27
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> peptide sequence within human TNFR2 that
represents epitope that TNFR2 agonist antibodies
or fragments thereof can bind to
<220>
<221> VARIANT
<222> (5)...(5)
<223> Xaa is Cys residue protected with ACM protecting
group
<220>
<221> VARIANT
<222> (20)...(20)
<223> Xaa is Cys residue protected with ACM protecting
group
<400> 1090
Lys Gln Glu Gly Xaa Arg Leu Cys Ala Pro Leu Gly Gly Ser Gly Gly
1 5 10 15
Cys Lys Pro Xaa Ala Pro Gly Thr Phe Ser Asn
20 25
<210> 1091
<211> 27
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> peptide sequence within human TNFR2 that
represents epitope that TNFR2 agonist antibodies
or fragments thereof can bind to
<400> 1091
Pro His Gln Ile Cys Asn Val Val Ala Ile Pro Gly Gly Ser Gly Gly
1 5 10 15
Cys Thr Ser Thr Ser Pro Thr Arg Ser Met Ala
20 25
<210> 1092
<211> 33
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> peptide sequence within human TNFR2 that
represents epitope that TNFR2 agonist antibodies
or fragments thereof can bind to
<220>
<221> VARIANT
<222> (23)...(23)
<223> Xaa is Cys residue protected with ACM protecting
group
<400> 1092
Cys Leu Pro Met Gly Pro Ser Pro Pro Ala Glu Gly Ser Thr Gly Asp
1 5 10 15
Cys Ala Pro Leu Arg Lys Xaa Arg Pro Gly Phe Gly Val Ala Arg Pro
20 25 30
Cys
<210> 1093
<211> 27
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> peptide sequence within human TNFR2 that
represents epitope that TNFR2 agonist antibodies
or fragments thereof can bind to
<220>
<221> VARIANT
<222> (1)...(1)
<223> Xaa is Cys residue protected with ACM protecting
group
<220>
<221> VARIANT
<222> (8)...(8)
<223> Xaa is Cys residue protected with ACM protecting
group
<220>
<221> VARIANT
<222> (25)...(25)
<223> Xaa is Cys residue protected with ACM protecting
group
<220>
<221> VARIANT
<222> (27)...(27)
<223> Xaa is Cys residue protected with ACM protecting
group
<400> 1093
Xaa Leu Ser Cys Gly Ser Arg Xaa Ser Ser Asp Gly Gly Ser Gly Gly
1 5 10 15
Cys Thr Arg Glu Gln Asn Arg Ile Xaa Thr Xaa
20 25
<210> 1094
<211> 27
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> peptide sequence within human TNFR2 that
represents epitope that TNFR2 agonist antibodies
or fragments thereof can bind to
<220>
<221> VARIANT
<222> (1)...(1)
<223> Xaa is Cys residue protected with ACM protecting
group
<400> 1094
Xaa Lys Pro Cys Ala Pro Gly Thr Phe Ser Asn Gly Gly Ser Gly Gly
1 5 10 15
Thr Thr Ser Ser Thr Asp Ile Cys Arg Pro His
20 25
<210> 1095
<211> 33
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> peptide sequence within human TNFR2 that
represents epitope that TNFR2 agonist antibodies
or fragments thereof can bind to
<220>
<221> VARIANT
<222> (7)...(7)
<223> Xaa is Cys residue protected with ACM protecting
group
<220>
<221> VARIANT
<222> (8)...(8)
<223> Xaa is Cys residue protected with ACM protecting
group
<220>
<221> VARIANT
<222> (11)...(11)
<223> Xaa is Cys residue protected with ACM protecting
group
<220>
<221> VARIANT
<222> (30)...(30)
<223> Xaa is Cys residue protected with ACM protecting
group
<400> 1095
Cys Gln Thr Ala Gln Met Xaa Xaa Ser Lys Xaa Ser Pro Gly Gln His
1 5 10 15
Cys Ala Phe Thr Pro Tyr Ala Pro Glu Pro Gly Ser Thr Xaa Arg Leu
20 25 30
Cys
<210> 1096
<211> 15
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> peptide sequence within human TNFR2 that
represents epitope that TNFR2 agonist antibodies
or fragments thereof can bind to
<400> 1096
Thr Ser Ser Thr Asp Ile Cys Arg Pro His Gln Ile Cys Asn Val
1 5 10 15
<210> 1097
<211> 17
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> peptide sequence within human TNFR2 that
represents epitope that TNFR2 agonist antibodies
or fragments thereof can bind to
<400> 1097
Cys Glu Gly Ala Arg Leu Ala Ala Pro Leu Arg Ala Gly Arg Pro Gly
1 5 10 15
Cys
<210> 1098
<211> 33
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> peptide sequence within human TNFR2 that
represents epitope that TNFR2 agonist antibodies
or fragments thereof can bind to
<220>
<221> VARIANT
<222> (4)...(4)
<223> Xaa is Cys residue protected with ACM protecting
group
<220>
<221> VARIANT
<222> (12)...(12)
<223> Xaa is Cys residue protected with ACM protecting
group
<220>
<221> VARIANT
<222> (14)...(14)
<223> Xaa is Cys residue protected with ACM protecting
group
<220>
<221> VARIANT
<222> (30)...(30)
<223> Xaa is Cys residue protected with ACM protecting
group
<400> 1098
Cys Gln Ala Xaa Thr Arg Glu Gln Asn Arg Ile Xaa Thr Xaa Arg Pro
1 5 10 15
Cys Ala Phe Thr Pro Tyr Ala Pro Glu Pro Gly Ser Thr Xaa Arg Leu
20 25 30
Cys
<210> 1099
<211> 27
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> peptide sequence within human TNFR2 that
represents epitope that TNFR2 agonist antibodies
or fragments thereof can bind to
<220>
<221> VARIANT
<222> (2)...(2)
<223> Xaa is Cys residue protected with ACM protecting
group
<220>
<221> VARIANT
<222> (23)...(23)
<223> Xaa is Cys residue protected with ACM protecting
group
<400> 1099
Ser Xaa Gly Ser Arg Cys Ser Ser Asp Gln Val Gly Gly Ser Gly Gly
1 5 10 15
Gln Asn Arg Ile Cys Thr Xaa Arg Pro Gly Trp
20 25
<210> 1100
<211> 33
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> peptide sequence within human TNFR2 that
represents epitope that TNFR2 agonist antibodies
or fragments thereof can bind to
<220>
<221> VARIANT
<222> (9)...(9)
<223> Xaa is Cys residue protected with ACM protecting
group
<220>
<221> VARIANT
<222> (22)...(22)
<223> Xaa is Cys residue protected with ACM protecting
group
<220>
<221> VARIANT
<222> (23)...(23)
<223> Xaa can be any naturally occurring amino acid
<400> 1100
Cys Asp Gln Val Glu Thr Gln Ala Xaa Thr Arg Glu Gln Asn Arg Ile
1 5 10 15
Cys Ala Pro Leu Arg Xaa Xaa Arg Pro Gly Phe Gly Val Ala Arg Pro
20 25 30
Cys
<210> 1101
<211> 27
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> peptide sequence within human TNFR2 that
represents epitope that TNFR2 agonist antibodies
or fragments thereof can bind to
<220>
<221> VARIANT
<222> (2)...(2)
<223> Xaa is Cys residue protected with ACM protecting
group
<220>
<221> VARIANT
<222> (25)...(25)
<223> Xaa is Cys residue protected with ACM protecting
group
<400> 1101
Val Xaa Lys Pro Cys Ala Pro Gly Thr Phe Ser Gly Gly Ser Gly Gly
1 5 10 15
Asp Ile Cys Arg Pro His Gln Ile Xaa Asn Val
20 25
<210> 1102
<211> 27
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> peptide sequence within human TNFR2 that
represents epitope that TNFR2 agonist antibodies
or fragments thereof can bind to
<220>
<221> VARIANT
<222> (1)...(1)
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group
<220>
<221> VARIANT
<222> (8)...(8)
<223> Xaa is Cys residue protected with ACM protecting
group
<220>
<221> VARIANT
<222> (26)...(26)
<223> Xaa is Cys residue protected with ACM protecting
group
<400> 1102
Xaa Leu Ser Cys Gly Ser Arg Xaa Ser Ser Asp Gly Gly Ser Gly Gly
1 5 10 15
Ala Cys Thr Arg Glu Gln Asn Arg Ile Xaa Thr
20 25
<210> 1103
<211> 27
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> peptide sequence within human TNFR2 that
represents epitope that TNFR2 agonist antibodies
or fragments thereof can bind to
<220>
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<223> Xaa is Cys residue protected with ACM protecting
group
<400> 1103
Gly Ser Arg Cys Ser Ser Asp Gln Val Glu Thr Gly Gly Ser Gly Gly
1 5 10 15
Gln Ala Xaa Thr Arg Glu Gln Asn Arg Ile Cys
20 25
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<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> peptide sequence within human TNFR2 that
represents epitope that TNFR2 agonist antibodies
or fragments thereof can bind to
<220>
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group
<220>
<221> VARIANT
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group
<220>
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<223> Xaa is Cys residue protected with ACM protecting
group
<220>
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<222> (20)...(20)
<223> Xaa is Cys residue protected with ACM protecting
group
<220>
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<222> (28)...(28)
<223> Xaa is Cys residue protected with ACM protecting
group
<220>
<221> VARIANT
<222> (30)...(30)
<223> Xaa is Cys residue protected with ACM protecting
group
<400> 1104
Cys Gln Thr Ala Gln Met Xaa Xaa Ser Lys Xaa Ser Pro Gly Gln His
1 5 10 15
Cys Gln Ala Xaa Thr Arg Glu Gln Asn Arg Ile Xaa Thr Xaa Arg Pro
20 25 30
Cys
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<213> Artificial Sequence
<220>
<223> peptide sequence within human TNFR2 that
represents epitope that TNFR2 agonist antibodies
or fragments thereof can bind to
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<223> Xaa is Cys residue protected with ACM protecting
group
<400> 1105
Tyr Xaa Ala Leu Ser Lys Gln Glu Gly Cys Arg Gly Gly Ser Gly Gly
1 5 10 15
Lys Cys Arg Pro Gly Phe Gly Val Ala Arg Pro
20 25
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<211> 27
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> peptide sequence within human TNFR2 that
represents epitope that TNFR2 agonist antibodies
or fragments thereof can bind to
<220>
<221> VARIANT
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<223> Xaa is Cys residue protected with ACM protecting
group
<400> 1106
Pro Cys Ala Pro Gly Thr Phe Ser Asn Thr Thr Gly Gly Ser Gly Gly
1 5 10 15
Thr Asp Ile Cys Arg Pro His Gln Ile Xaa Asn
20 25
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<213> Artificial Sequence
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<223> peptide sequence within human TNFR2 that
represents epitope that TNFR2 agonist antibodies
or fragments thereof can bind to
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<223> Xaa is Cys residue protected with ACM protecting
group
<400> 1107
Asp Ile Xaa Arg Pro His Gln Ile Cys Asn Val Gly Gly Ser Gly Gly
1 5 10 15
Val Cys Thr Ser Thr Ser Pro Thr Arg Ser Met
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<213> Artificial Sequence
<220>
<223> peptide sequence within human TNFR2 that
represents epitope that TNFR2 agonist antibodies
or fragments thereof can bind to
<400> 1108
Cys Tyr Thr Gln Leu Trp Asn Trp Val Pro Glu Gly Ala Ser Ala Gly
1 5 10 15
Cys
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<211> 27
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> peptide sequence within human TNFR2 that
represents epitope that TNFR2 agonist antibodies
or fragments thereof can bind to
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group
<220>
<221> VARIANT
<222> (23)...(23)
<223> Xaa is Cys residue protected with ACM protecting
group
<400> 1109
Gly Ser Thr Cys Arg Leu Arg Glu Tyr Tyr Asp Gly Gly Ser Gly Gly
1 5 10 15
Gln Met Cys Xaa Ser Lys Xaa Ser Pro Gly Gln
20 25
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<211> 27
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> peptide sequence within human TNFR2 that
represents epitope that TNFR2 agonist antibodies
or fragments thereof can bind to
<220>
<221> VARIANT
<222> (7)...(7)
<223> Xaa is Cys residue protected with ACM protecting
group
<400> 1110
Gln Glu Gly Cys Arg Leu Xaa Ala Pro Leu Arg Gly Gly Ser Gly Gly
1 5 10 15
Lys Cys Arg Pro Gly Phe Gly Val Ala Arg Pro
20 25
<210> 1111
<211> 33
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> peptide sequence within human TNFR2 that
represents epitope that TNFR2 agonist antibodies
or fragments thereof can bind to
<220>
<221> VARIANT
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group
<220>
<221> VARIANT
<222> (23)...(23)
<223> Xaa is Cys residue protected with ACM protecting
group
<400> 1111
Cys Asn Ala Ser Met Asp Ala Val Xaa Thr Ser Thr Ser Pro Thr Arg
1 5 10 15
Cys Ala Pro Leu Arg Lys Xaa Arg Pro Gly Phe Gly Val Ala Arg Pro
20 25 30
Cys
<210> 1112
<211> 33
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> peptide sequence within human TNFR2 that
represents epitope that TNFR2 agonist antibodies
or fragments thereof can bind to
<220>
<221> VARIANT
<222> (12)...(12)
<223> Xaa is Cys residue protected with ACM protecting
group
<220>
<221> VARIANT
<222> (13)...(13)
<223> Xaa is Cys residue protected with ACM protecting
group
<220>
<221> VARIANT
<222> (16)...(16)
<223> Xaa is Cys residue protected with ACM protecting
group
<220>
<221> VARIANT
<222> (25)...(25)
<223> Xaa is Cys residue protected with ACM protecting
group
<400> 1112
Cys Arg Glu Tyr Tyr Asp Gln Thr Ala Gln Met Xaa Xaa Ser Lys Xaa
1 5 10 15
Cys Asn Ala Ser Met Asp Ala Val Xaa Thr Ser Thr Ser Pro Thr Arg
20 25 30
Cys
<210> 1113
<211> 27
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> peptide sequence within human TNFR2 that
represents epitope that TNFR2 agonist antibodies
or fragments thereof can bind to
<220>
<221> VARIANT
<222> (5)...(5)
<223> Xaa is Cys residue protected with ACM protecting
group
<220>
<221> VARIANT
<222> (27)...(27)
<223> Xaa is Cys residue protected with ACM protecting
group
<400> 1113
Cys Gly Ser Arg Xaa Ser Ser Asp Gln Val Glu Gly Gly Ser Gly Gly
1 5 10 15
Gln Ala Cys Thr Arg Glu Gln Asn Arg Ile Xaa
20 25
<210> 1114
<211> 33
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> peptide sequence within human TNFR2 that
represents epitope that TNFR2 agonist antibodies
or fragments thereof can bind to
<220>
<221> VARIANT
<222> (25)...(25)
<223> Xaa is Cys residue protected with ACM protecting
group
<400> 1114
Cys Leu Pro Ala Gln Val Ala Phe Thr Pro Tyr Ala Pro Glu Pro Gly
1 5 10 15
Cys Asn Ala Ser Met Asp Ala Val Xaa Thr Ser Thr Ser Pro Thr Arg
20 25 30
Cys
<210> 1115
<211> 24
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> peptide sequence within human TNFR2 that
represents epitope that TNFR2 agonist antibodies
or fragments thereof can bind to
<400> 1115
Cys Leu Trp Asn Trp Val Pro Glu Ala Leu Ser Pro Gly Ser Arg Ala
1 5 10 15
Ser Ser Asp Gln Val Glu Thr Cys
20
<210> 1116
<211> 27
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> peptide sequence within human TNFR2 that
represents epitope that TNFR2 agonist antibodies
or fragments thereof can bind to
<220>
<221> VARIANT
<222> (2)...(2)
<223> Xaa is Cys residue protected with ACM protecting
group
<220>
<221> VARIANT
<222> (18)...(18)
<223> Xaa is Cys residue protected with ACM protecting
group
<400> 1116
Ser Xaa Gly Ser Arg Cys Ser Ser Asp Gln Val Gly Gly Ser Gly Gly
1 5 10 15
Ala Xaa Thr Arg Glu Gln Asn Arg Ile Cys Thr
20 25
<210> 1117
<211> 17
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> peptide sequence within human TNFR2 that
represents epitope that TNFR2 agonist antibodies
or fragments thereof can bind to
<400> 1117
Cys Ser Thr Ala Pro Ser Thr Ser Phe Leu Leu Pro Met Gly Pro Ser
1 5 10 15
Cys
<210> 1118
<211> 33
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> peptide sequence within human TNFR2 that
represents epitope that TNFR2 agonist antibodies
or fragments thereof can bind to
<220>
<221> VARIANT
<222> (4)...(4)
<223> Xaa is Cys residue protected with ACM protecting
group
<220>
<221> VARIANT
<222> (12)...(12)
<223> Xaa is Cys residue protected with ACM protecting
group
<220>
<221> VARIANT
<222> (14)...(14)
<223> Xaa is Cys residue protected with ACM protecting
group
<220>
<221> VARIANT
<222> (30)...(30)
<223> Xaa is Cys residue protected with ACM protecting
group
<400> 1118
Cys Gln Ala Xaa Thr Arg Glu Gln Asn Arg Ile Xaa Thr Xaa Arg Pro
1 5 10 15
Cys Ala Phe Thr Pro Tyr Ala Pro Glu Pro Gly Ser Thr Xaa Arg Leu
20 25 30
Cys
<210> 1119
<211> 33
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> peptide sequence within human TNFR2 that
represents epitope that TNFR2 agonist antibodies
or fragments thereof can bind to
<220>
<221> VARIANT
<222> (4)...(4)
<223> Xaa is Cys residue protected with ACM protecting
group
<220>
<221> VARIANT
<222> (23)...(23)
<223> Xaa is Cys residue protected with ACM protecting
group
<400> 1119
Cys Ala Val Xaa Thr Ser Thr Ser Pro Thr Arg Ser Met Ala Pro Gly
1 5 10 15
Cys Ala Pro Leu Arg Lys Xaa Arg Pro Gly Phe Gly Val Ala Arg Pro
20 25 30
Cys
<210> 1120
<211> 22
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> peptide sequence within human TNFR2 that
represents epitope that TNFR2 agonist antibodies
or fragments thereof can bind to
<220>
<221> VARIANT
<222> (5)...(5)
<223> Xaa is Cys residue protected with ACM protecting
group
<220>
<221> VARIANT
<222> (21)...(21)
<223> Xaa is Cys residue protected with ACM protecting
group
<400> 1120
Gln Asn Arg Ile Xaa Thr Cys Arg Pro Gly Trp Tyr Cys Ala Leu Ser
1 5 10 15
Lys Gln Glu Gly Xaa Arg
20
<210> 1121
<211> 27
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> peptide sequence within human TNFR2 that
represents epitope that TNFR2 agonist antibodies
or fragments thereof can bind to
<220>
<221> VARIANT
<222> (4)...(4)
<223> Xaa is Cys residue protected with ACM protecting
group
<220>
<221> VARIANT
<222> (7)...(7)
<223> Xaa is Cys residue protected with ACM protecting
group
<220>
<221> VARIANT
<222> (26)...(26)
<223> Xaa is Cys residue protected with ACM protecting
group
<400> 1121
Val Pro Glu Xaa Leu Ser Xaa Gly Ser Arg Cys Gly Gly Ser Gly Gly
1 5 10 15
Thr Arg Glu Gln Asn Arg Ile Cys Thr Xaa Arg
20 25
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<211> 27
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> peptide sequence within human TNFR2 that
represents epitope that TNFR2 agonist antibodies
or fragments thereof can bind to
<220>
<221> VARIANT
<222> (1)...(1)
<223> Xaa is Cys residue protected with ACM protecting
group
<400> 1122
Xaa Lys Pro Cys Ala Pro Gly Thr Phe Ser Asn Gly Gly Ser Gly Gly
1 5 10 15
Thr Ser Ser Thr Asp Ile Cys Arg Pro His Gln
20 25
<210> 1123
<211> 27
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> peptide sequence within human TNFR2 that
represents epitope that TNFR2 agonist antibodies
or fragments thereof can bind to
<220>
<221> VARIANT
<222> (6)...(6)
<223> Xaa is Cys residue protected with ACM protecting
group
<220>
<221> VARIANT
<222> (25)...(25)
<223> Xaa is Cys residue protected with ACM protecting
group
<220>
<221> VARIANT
<222> (27)...(27)
<223> Xaa is Cys residue protected with ACM protecting
group
<400> 1123
Asn Trp Val Pro Glu Xaa Leu Ser Cys Gly Ser Gly Gly Ser Gly Gly
1 5 10 15
Cys Thr Arg Glu Gln Asn Arg Ile Xaa Thr Xaa
20 25
<210> 1124
<211> 33
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> peptide sequence within human TNFR2 that
represents epitope that TNFR2 agonist antibodies
or fragments thereof can bind to
<220>
<221> VARIANT
<222> (12)...(12)
<223> Xaa is Cys residue protected with ACM protecting
group
<220>
<221> VARIANT
<222> (13)...(13)
<223> Xaa is Cys residue protected with ACM protecting
group
<220>
<221> VARIANT
<222> (16)...(16)
<223> Xaa is Cys residue protected with ACM protecting
group
<220>
<221> VARIANT
<222> (23)...(23)
<223> Xaa is Cys residue protected with ACM protecting
group
<400> 1124
Cys Arg Glu Tyr Tyr Asp Gln Thr Ala Gln Met Xaa Xaa Ser Lys Xaa
1 5 10 15
Cys Ala Pro Leu Arg Lys Xaa Arg Pro Gly Phe Gly Val Ala Arg Pro
20 25 30
Cys
<210> 1125
<211> 27
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> peptide sequence within human TNFR2 that
represents epitope that TNFR2 agonist antibodies
or fragments thereof can bind to
<220>
<221> VARIANT
<222> (1)...(1)
<223> Xaa is Cys residue protected with ACM protecting
group
<220>
<221> VARIANT
<222> (4)...(4)
<223> Xaa is Cys residue protected with ACM protecting
group
<220>
<221> VARIANT
<222> (17)...(17)
<223> Xaa is Cys residue protected with ACM protecting
group
<220>
<221> VARIANT
<222> (27)...(27)
<223> Xaa is Cys residue protected with ACM protecting
group
<400> 1125
Xaa Leu Ser Xaa Gly Ser Arg Cys Ser Ser Asp Gly Gly Ser Gly Gly
1 5 10 15
Xaa Thr Arg Glu Gln Asn Arg Ile Cys Thr Xaa
20 25
<210> 1126
<211> 27
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> peptide sequence within human TNFR2 that
represents epitope that TNFR2 agonist antibodies
or fragments thereof can bind to
<220>
<221> VARIANT
<222> (4)...(4)
<223> Xaa is Cys residue protected with ACM protecting
group
<220>
<221> VARIANT
<222> (20)...(20)
<223> Xaa is Cys residue protected with ACM protecting
group
<400> 1126
Gln Glu Gly Xaa Arg Leu Cys Ala Pro Leu Arg Gly Gly Ser Gly Gly
1 5 10 15
Cys Lys Pro Xaa Ala Pro Gly Thr Phe Ser Asn
20 25
<210> 1127
<211> 33
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> peptide sequence within human TNFR2 that
represents epitope that TNFR2 agonist antibodies
or fragments thereof can bind to
<220>
<221> VARIANT
<222> (7)...(7)
<223> Xaa is Cys residue protected with ACM protecting
group
<220>
<221> VARIANT
<222> (25)...(25)
<223> Xaa is Cys residue protected with ACM protecting
group
<400> 1127
Cys Ala Pro Leu Arg Lys Xaa Arg Pro Gly Phe Gly Val Ala Arg Pro
1 5 10 15
Cys Asn Ala Ser Met Asp Ala Val Xaa Thr Ser Thr Ser Pro Thr Arg
20 25 30
Cys
<210> 1128
<211> 27
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> peptide sequence within human TNFR2 that
represents epitope that TNFR2 agonist antibodies
or fragments thereof can bind to
<220>
<221> VARIANT
<222> (3)...(3)
<223> Xaa is Cys residue protected with ACM protecting
group
<400> 1128
Asp Ile Xaa Arg Pro His Gln Ile Cys Asn Val Gly Gly Ser Gly Gly
1 5 10 15
Cys Thr Ser Thr Ser Pro Thr Arg Ser Met Ala
20 25
<210> 1129
<211> 33
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> peptide sequence within human TNFR2 that
represents epitope that TNFR2 agonist antibodies
or fragments thereof can bind to
<220>
<221> VARIANT
<222> (4)...(4)
<223> Xaa is Cys residue protected with ACM protecting
group
<220>
<221> VARIANT
<222> (12)...(12)
<223> Xaa is Cys residue protected with ACM protecting
group
<220>
<221> VARIANT
<222> (14)...(14)
<223> Xaa is Cys residue protected with ACM protecting
group
<220>
<221> VARIANT
<222> (20)...(20)
<223> Xaa is Cys residue protected with ACM protecting
group
<220>
<221> VARIANT
<222> (28)...(28)
<223> Xaa is Cys residue protected with ACM protecting
group
<220>
<221> VARIANT
<222> (30)...(30)
<223> Xaa is Cys residue protected with ACM protecting
group
<400> 1129
Cys Gln Ala Xaa Thr Arg Glu Gln Asn Arg Ile Xaa Thr Xaa Arg Pro
1 5 10 15
Cys Gln Ala Xaa Thr Arg Glu Gln Asn Arg Ile Xaa Thr Xaa Arg Pro
20 25 30
Cys
<210> 1130
<211> 33
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> peptide sequence within human TNFR2 that
represents epitope that TNFR2 agonist antibodies
or fragments thereof can bind to
<220>
<221> VARIANT
<222> (8)...(8)
<223> Xaa is Cys residue protected with ACM protecting
group
<220>
<221> VARIANT
<222> (14)...(14)
<223> Xaa is Cys residue protected with ACM protecting
group
<220>
<221> VARIANT
<222> (20)...(20)
<223> Xaa is Cys residue protected with ACM protecting
group
<220>
<221> VARIANT
<222> (28)...(28)
<223> Xaa is Cys residue protected with ACM protecting
group
<220>
<221> VARIANT
<222> (30)...(30)
<223> Xaa is Cys residue protected with ACM protecting
group
<400> 1130
Cys Thr Ser Ser Thr Asp Ile Xaa Arg Pro His Gln Ile Xaa Asn Val
1 5 10 15
Cys Gln Ala Xaa Thr Arg Glu Gln Asn Arg Ile Xaa Thr Xaa Arg Pro
20 25 30
Cys
<210> 1131
<211> 32
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> peptide sequence within human TNFR2 that
represents epitope that TNFR2 agonist antibodies
or fragments thereof can bind to
<220>
<221> VARIANT
<222> (23)...(23)
<223> Xaa is Cys residue protected with ACM protecting
group
<400> 1131
Cys Leu Pro Ala Gln Val Ala Phe Thr Pro Tyr Ala Pro Glu Pro Gly
1 5 10 15
Cys Ala Pro Leu Arg Lys Xaa Arg Pro Gly Phe Gly Val Ala Arg Pro
20 25 30
<210> 1132
<211> 27
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> peptide sequence within human TNFR2 that
represents epitope that TNFR2 agonist antibodies
or fragments thereof can bind to
<220>
<221> VARIANT
<222> (4)...(4)
<223> Xaa is Cys residue protected with ACM protecting
group
<220>
<221> VARIANT
<222> (11)...(11)
<223> Xaa is Cys residue protected with ACM protecting
group
<400> 1132
Val Pro Glu Xaa Leu Ser Cys Gly Ser Arg Xaa Gly Gly Ser Gly Gly
1 5 10 15
Glu Thr Gln Ala Cys Thr Arg Glu Gln Asn Arg
20 25
<210> 1133
<211> 33
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> peptide sequence within human TNFR2 that
represents epitope that TNFR2 agonist antibodies
or fragments thereof can bind to
<220>
<221> VARIANT
<222> (14)...(14)
<223> Xaa is Cys residue protected with ACM protecting
group
<220>
<221> VARIANT
<222> (23)...(23)
<223> Xaa is Cys residue protected with ACM protecting
group
<400> 1133
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Cys
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Cys
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or fragments thereof can bind to
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Cys Asn Ala Ser Met Asp Ala Val Xaa Thr Ser Thr Ser Pro Thr Arg
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Cys
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Cys
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or fragments thereof can bind to
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20 25 30
Cys
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group
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or fragments thereof can bind to
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group
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group
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Cys
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group
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group
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group
<220>
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group
<400> 1155
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<400> 1157
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group
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<210> 1160
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<213> Artificial Sequence
<220>
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group
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group
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group
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20 25 30
Cys
<210> 1161
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<223> peptide sequence within human TNFR2 that
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or fragments thereof can bind to
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group
<220>
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group
<220>
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group
<220>
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group
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group
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group
<220>
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<223> peptide sequence within human TNFR2 that
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group
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<220>
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Cys
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<220>
<223> peptide sequence within human TNFR2 that
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group
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group
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<222> (28)...(28)
<223> Xaa is Cys residue protected with ACM protecting
group
<220>
<221> VARIANT
<222> (30)...(30)
<223> Xaa is Cys residue protected with ACM protecting
group
<400> 1163
Cys Leu Ser Lys Gln Glu Gly Xaa Arg Leu Xaa Ala Pro Leu Arg Lys
1 5 10 15
Cys Gln Ala Xaa Thr Arg Glu Gln Asn Arg Ile Xaa Thr Xaa Arg Pro
20 25 30
Cys
<210> 1164
<211> 33
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> peptide sequence within human TNFR2 that
represents epitope that TNFR2 agonist antibodies
or fragments thereof can bind to
<220>
<221> VARIANT
<222> (8)...(8)
<223> Xaa is Cys residue protected with ACM protecting
group
<220>
<221> VARIANT
<222> (14)...(14)
<223> Xaa is Cys residue protected with ACM protecting
group
<220>
<221> VARIANT
<222> (23)...(23)
<223> Xaa is Cys residue protected with ACM protecting
group
<400> 1164
Cys Thr Ser Ser Thr Asp Ile Xaa Arg Pro His Gln Ile Xaa Asn Val
1 5 10 15
Cys Ala Pro Leu Arg Lys Xaa Arg Pro Gly Phe Gly Val Ala Arg Pro
20 25 30
Cys
<210> 1165
<211> 27
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> peptide sequence within human TNFR2 that
represents epitope that TNFR2 agonist antibodies
or fragments thereof can bind to
<220>
<221> VARIANT
<222> (1)...(1)
<223> Xaa is Cys residue protected with ACM protecting
group
<220>
<221> VARIANT
<222> (8)...(8)
<223> Xaa is Cys residue protected with ACM protecting
group
<400> 1165
Xaa Leu Ser Cys Gly Ser Arg Xaa Ser Ser Asp Gly Gly Ser Gly Gly
1 5 10 15
Thr Gln Ala Cys Thr Arg Glu Gln Asn Arg Ile
20 25
<210> 1166
<211> 33
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> peptide sequence within human TNFR2 that
represents epitope that TNFR2 agonist antibodies
or fragments thereof can bind to
<220>
<221> VARIANT
<222> (9)...(9)
<223> Xaa is Cys residue protected with ACM protecting
group
<220>
<221> VARIANT
<222> (30)...(30)
<223> Xaa is Cys residue protected with ACM protecting
group
<400> 1166
Cys Asp Gln Val Glu Thr Gln Ala Xaa Thr Arg Glu Gln Asn Arg Ile
1 5 10 15
Cys Ala Phe Thr Pro Tyr Ala Pro Glu Pro Gly Ser Thr Xaa Arg Leu
20 25 30
Cys
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<211> 33
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> peptide sequence within human TNFR2 that
represents epitope that TNFR2 agonist antibodies
or fragments thereof can bind to
<220>
<221> VARIANT
<222> (9)...(9)
<223> Xaa is Cys residue protected with ACM protecting
group
<220>
<221> VARIANT
<222> (20)...(20)
<223> Xaa is Cys residue protected with ACM protecting
group
<220>
<221> VARIANT
<222> (28)...(28)
<223> Xaa is Cys residue protected with ACM protecting
group
<220>
<221> VARIANT
<222> (30)...(30)
<223> Xaa is Cys residue protected with ACM protecting
group
<400> 1167
Cys Asn Ala Ser Met Asp Ala Val Xaa Thr Ser Thr Ser Pro Thr Arg
1 5 10 15
Cys Gln Ala Xaa Thr Arg Glu Gln Asn Arg Ile Xaa Thr Xaa Arg Pro
20 25 30
Cys
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<211> 27
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> peptide sequence within human TNFR2 that
represents epitope that TNFR2 agonist antibodies
or fragments thereof can bind to
<220>
<221> VARIANT
<222> (20)...(20)
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group
<220>
<221> VARIANT
<222> (23)...(23)
<223> Xaa is Cys residue protected with ACM protecting
group
<400> 1168
Pro Glu Pro Gly Ser Thr Cys Arg Leu Arg Glu Gly Gly Ser Gly Gly
1 5 10 15
Gln Met Cys Xaa Ser Lys Xaa Ser Pro Gly Gln
20 25
<210> 1169
<211> 27
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> peptide sequence within human TNFR2 that
represents epitope that TNFR2 agonist antibodies
or fragments thereof can bind to
<220>
<221> VARIANT
<222> (20)...(20)
<223> Xaa is Cys residue protected with ACM protecting
group
<220>
<221> VARIANT
<222> (23)...(23)
<223> Xaa is Cys residue protected with ACM protecting
group
<400> 1169
Ser Thr Cys Arg Leu Arg Glu Tyr Tyr Asp Gln Gly Gly Ser Gly Gly
1 5 10 15
Gln Met Cys Xaa Ser Lys Xaa Ser Pro Gly Gln
20 25
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<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> peptide sequence within human TNFR2 that
represents epitope that TNFR2 agonist antibodies
or fragments thereof can bind to
<400> 1170
Leu Arg Lys Cys Arg Pro Gly Phe Gly Val Gly Ala Pro Gly Thr
1 5 10 15
<210> 1171
<211> 33
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> peptide sequence within human TNFR2 that
represents epitope that TNFR2 agonist antibodies
or fragments thereof can bind to
<220>
<221> VARIANT
<222> (8)...(8)
<223> Xaa is Cys residue protected with ACM protecting
group
<220>
<221> VARIANT
<222> (11)...(11)
<223> Xaa is Cys residue protected with ACM protecting
group
<220>
<221> VARIANT
<222> (28)...(28)
<223> Xaa is Cys residue protected with ACM protecting
group
<220>
<221> VARIANT
<222> (29)...(29)
<223> Xaa is Cys residue protected with ACM protecting
group
<220>
<221> VARIANT
<222> (32)...(32)
<223> Xaa is Cys residue protected with ACM protecting
group
<400> 1171
Cys Leu Ser Lys Gln Glu Gly Xaa Arg Leu Xaa Ala Pro Leu Arg Lys
1 5 10 15
Cys Arg Glu Tyr Tyr Asp Gln Thr Ala Gln Met Xaa Xaa Ser Lys Xaa
20 25 30
Cys
<210> 1172
<211> 33
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> peptide sequence within human TNFR2 that
represents epitope that TNFR2 agonist antibodies
or fragments thereof can bind to
<220>
<221> VARIANT
<222> (5)...(5)
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group
<220>
<221> VARIANT
<222> (13)...(13)
<223> Xaa is Cys residue protected with ACM protecting
group
<220>
<221> VARIANT
<222> (16)...(16)
<223> Xaa is Cys residue protected with ACM protecting
group
<220>
<221> VARIANT
<222> (25)...(25)
<223> Xaa is Cys residue protected with ACM protecting
group
<400> 1172
Cys Gly Trp Tyr Xaa Ala Leu Ser Lys Gln Glu Gly Xaa Arg Leu Xaa
1 5 10 15
Cys Asn Ala Ser Met Asp Ala Val Xaa Thr Ser Thr Ser Pro Thr Arg
20 25 30
Cys
<210> 1173
<211> 33
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> peptide sequence within human TNFR2 that
represents epitope that TNFR2 agonist antibodies
or fragments thereof can bind to
<220>
<221> VARIANT
<222> (13)...(13)
<223> Xaa is Cys residue protected with ACM protecting
group
<220>
<221> VARIANT
<222> (25)...(25)
<223> Xaa is Cys residue protected with ACM protecting
group
<400> 1173
Cys Thr Phe Ser Asn Thr Thr Ser Ser Thr Asp Ile Xaa Arg Pro His
1 5 10 15
Cys Asn Ala Ser Met Asp Ala Val Xaa Thr Ser Thr Ser Pro Thr Arg
20 25 30
Cys
<210> 1174
<211> 27
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> peptide sequence within human TNFR2 that
represents epitope that TNFR2 agonist antibodies
or fragments thereof can bind to
<220>
<221> VARIANT
<222> (6)...(6)
<223> Xaa is Cys residue protected with ACM protecting
group
<400> 1174
Ser Cys Gly Ser Arg Xaa Ser Ser Asp Gln Val Gly Gly Ser Gly Gly
1 5 10 15
Thr Gln Ala Cys Thr Arg Glu Gln Asn Arg Ile
20 25
<210> 1175
<211> 27
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> peptide sequence within human TNFR2 that
represents epitope that TNFR2 agonist antibodies
or fragments thereof can bind to
<220>
<221> VARIANT
<222> (6)...(6)
<223> Xaa is Cys residue protected with ACM protecting
group
<220>
<221> VARIANT
<222> (18)...(18)
<223> Xaa is Cys residue protected with ACM protecting
group
<400> 1175
Glu Gly Cys Arg Leu Xaa Ala Pro Leu Arg Lys Gly Gly Ser Gly Gly
1 5 10 15
Leu Xaa Ala Pro Leu Arg Lys Cys Arg Pro Gly
20 25
<210> 1176
<211> 15
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> peptide sequence within human TNFR2 that
represents epitope that TNFR2 agonist antibodies
or fragments thereof can bind to
<400> 1176
Thr Ser Ser Thr Asp Ile Cys Arg Pro His Ala Ala Cys Asn Val
1 5 10 15
<210> 1177
<211> 33
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> peptide sequence within human TNFR2 that
represents epitope that TNFR2 agonist antibodies
or fragments thereof can bind to
<220>
<221> VARIANT
<222> (23)...(23)
<223> Xaa is Cys residue protected with ACM protecting
group
<400> 1177
Cys Arg Ser Gln His Thr Gln Pro Thr Pro Glu Pro Ser Thr Ala Pro
1 5 10 15
Cys Ala Pro Leu Arg Lys Xaa Arg Pro Gly Phe Gly Val Ala Arg Pro
20 25 30
Cys
<210> 1178
<211> 33
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> peptide sequence within human TNFR2 that
represents epitope that TNFR2 agonist antibodies
or fragments thereof can bind to
<220>
<221> VARIANT
<222> (9)...(9)
<223> Xaa is Cys residue protected with ACM protecting
group
<220>
<221> VARIANT
<222> (20)...(20)
<223> Xaa is Cys residue protected with ACM protecting
group
<220>
<221> VARIANT
<222> (28)...(28)
<223> Xaa is Cys residue protected with ACM protecting
group
<220>
<221> VARIANT
<222> (30)...(30)
<223> Xaa is Cys residue protected with ACM protecting
group
<400> 1178
Cys Asp Gln Val Glu Thr Gln Ala Xaa Thr Arg Glu Gln Asn Arg Ile
1 5 10 15
Cys Gln Ala Xaa Thr Arg Glu Gln Asn Arg Ile Xaa Thr Xaa Arg Pro
20 25 30
Cys
<210> 1179
<211> 33
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> peptide sequence within human TNFR2 that
represents epitope that TNFR2 agonist antibodies
or fragments thereof can bind to
<220>
<221> VARIANT
<222> (25)...(25)
<223> Xaa is Cys residue protected with ACM protecting
group
<400> 1179
Cys Thr Ser Pro Thr Arg Ser Met Ala Pro Gly Ala Val His Leu Pro
1 5 10 15
Cys Asn Ala Ser Met Asp Ala Val Xaa Thr Ser Thr Ser Pro Thr Arg
20 25 30
Cys
<210> 1180
<211> 22
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> peptide sequence within human TNFR2 that
represents epitope that TNFR2 agonist antibodies
or fragments thereof can bind to
<220>
<221> VARIANT
<222> (5)...(5)
<223> Xaa is Cys residue protected with ACM protecting
group
<400> 1180
Cys Gly Ser Arg Xaa Ser Ser Asp Gln Val Glu Thr Gln Ala Cys Thr
1 5 10 15
Arg Glu Gln Asn Arg Ile
20
<210> 1181
<211> 27
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> peptide sequence within human TNFR2 that
represents epitope that TNFR2 agonist antibodies
or fragments thereof can bind to
<220>
<221> VARIANT
<222> (20)...(20)
<223> Xaa is Cys residue protected with ACM protecting
group
<220>
<221> VARIANT
<222> (23)...(23)
<223> Xaa is Cys residue protected with ACM protecting
group
<400> 1181
Ala Pro Glu Pro Gly Ser Thr Cys Arg Leu Arg Gly Gly Ser Gly Gly
1 5 10 15
Gln Met Cys Xaa Ser Lys Xaa Ser Pro Gly Gln
20 25
<210> 1182
<211> 27
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> peptide sequence within human TNFR2 that
represents epitope that TNFR2 agonist antibodies
or fragments thereof can bind to
<220>
<221> VARIANT
<222> (2)...(2)
<223> Xaa is Cys residue protected with ACM protecting
group
<220>
<221> VARIANT
<222> (9)...(9)
<223> Xaa is Cys residue protected with ACM protecting
group
<220>
<221> VARIANT
<222> (25)...(25)
<223> Xaa is Cys residue protected with ACM protecting
group
<220>
<221> VARIANT
<222> (27)...(27)
<223> Xaa is Cys residue protected with ACM protecting
group
<400> 1182
Glu Xaa Leu Ser Cys Gly Ser Arg Xaa Ser Ser Gly Gly Ser Gly Gly
1 5 10 15
Cys Thr Arg Glu Gln Asn Arg Ile Xaa Thr Xaa
20 25
<210> 1183
<211> 27
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> peptide sequence within human TNFR2 that
represents epitope that TNFR2 agonist antibodies
or fragments thereof can bind to
<400> 1183
Ile Cys Asn Val Val Ala Ile Pro Gly Asn Ala Gly Gly Ser Gly Gly
1 5 10 15
Asp Ala Val Cys Thr Ser Thr Ser Pro Thr Arg
20 25
<210> 1184
<211> 15
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> peptide sequence within human TNFR2 that
represents epitope that TNFR2 agonist antibodies
or fragments thereof can bind to
<400> 1184
Ala Pro Ser Thr Ser Phe Leu Leu Pro Met Ala Ala Ser Pro Pro
1 5 10 15
<210> 1185
<211> 17
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> peptide sequence within human TNFR2 that
represents epitope that TNFR2 agonist antibodies
or fragments thereof can bind to
<400> 1185
Cys Glu Gln Asn Arg Ile Ala Thr Ala Arg Pro Ala Ala Tyr Ala Ala
1 5 10 15
Cys
<210> 1186
<211> 18
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> peptide sequence within human TNFR2 that
represents epitope that TNFR2 agonist antibodies
or fragments thereof can bind to
<400> 1186
Cys Gln Val Ala Phe Thr Pro Tyr Pro Gly Glu Pro Gly Ser Thr Ala
1 5 10 15
Arg Cys
<210> 1187
<211> 27
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> peptide sequence within human TNFR2 that
represents epitope that TNFR2 agonist antibodies
or fragments thereof can bind to
<400> 1187
Arg Pro His Gln Ile Cys Asn Val Val Ala Ile Gly Gly Ser Gly Gly
1 5 10 15
Cys Thr Ser Thr Ser Pro Thr Arg Ser Met Ala
20 25
<210> 1188
<211> 15
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> peptide sequence within human TNFR2 that
represents epitope that TNFR2 agonist antibodies
or fragments thereof can bind to
<400> 1188
Thr Arg Ser Met Ala Pro Gly Ala Val His Leu Pro Gln Pro Val
1 5 10 15
<210> 1189
<211> 27
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> peptide sequence within human TNFR2 that
represents epitope that TNFR2 agonist antibodies
or fragments thereof can bind to
<220>
<221> VARIANT
<222> (5)...(5)
<223> Xaa is Cys residue protected with ACM protecting
group
<220>
<221> VARIANT
<222> (25)...(25)
<223> Xaa is Cys residue protected with ACM protecting
group
<400> 1189
Gln Asn Arg Ile Xaa Thr Cys Arg Pro Gly Trp Gly Gly Ser Gly Gly
1 5 10 15
Cys Ala Leu Ser Lys Gln Glu Gly Xaa Arg Leu
20 25
<210> 1190
<211> 27
<212> PRT
<213> Artificial sequence
<220>
<223> peptide sequence within TNFR2 that represents
epitopes that TNFR2 agonist antibodies can bind to
<220>
<221> VARIANT
<222> (8)...(8)
<223> Xaa is Cys residue protected with ACM protecting
group
<220>
<221> VARIANT
<222> (20)...(20)
<223> Xaa is Cys residue protected with ACM protecting
group
<400> 1190
Ala Leu Ser Lys Gln Glu Gly Xaa Arg Leu Cys Gly Gly Ser Gly Gly
1 5 10 15
Cys Lys Pro Xaa Ala Pro Gly Thr Phe Ser Asn
20 25
<210> 1191
<211> 33
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> peptide sequence within human TNFR2 that
represents epitope that TNFR2 agonist antibodies
or fragments thereof can bind to
<220>
<221> VARIANT
<222> (15)...(15)
<223> Xaa is Cys residue protected with ACM protecting
group
<220>
<221> VARIANT
<222> (23)...(23)
<223> Xaa is Cys residue protected with ACM protecting
group
<400> 1191
Cys Gly Val Ala Arg Pro Gly Thr Glu Thr Ser Asp Val Val Xaa Lys
1 5 10 15
Cys Ala Pro Leu Arg Lys Xaa Arg Pro Gly Phe Gly Val Ala Arg Pro
20 25 30
Cys
<210> 1192
<211> 27
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> peptide sequence within human TNFR2 that
represents epitope that TNFR2 agonist antibodies
or fragments thereof can bind to
<400> 1192
Pro Cys Ala Pro Gly Thr Phe Ser Asn Thr Thr Gly Gly Ser Gly Gly
1 5 10 15
Thr Ser Ser Thr Asp Ile Cys Arg Pro His Gln
20 25
<210> 1193
<211> 33
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> peptide sequence within human TNFR2 that
represents epitope that TNFR2 agonist antibodies
or fragments thereof can bind to
<220>
<221> VARIANT
<222> (14)...(14)
<223> Xaa is Cys residue protected with ACM protecting
group
<220>
<221> VARIANT
<222> (20)...(20)
<223> Xaa is Cys residue protected with ACM protecting
group
<220>
<221> VARIANT
<222> (28)...(28)
<223> Xaa is Cys residue protected with ACM protecting
group
<220>
<221> VARIANT
<222> (30)...(30)
<223> Xaa is Cys residue protected with ACM protecting
group
<400> 1193
Cys Ala Phe Thr Pro Tyr Ala Pro Glu Pro Gly Ser Thr Xaa Arg Leu
1 5 10 15
Cys Gln Ala Xaa Thr Arg Glu Gln Asn Arg Ile Xaa Thr Xaa Arg Pro
20 25 30
Cys
<210> 1194
<211> 33
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> peptide sequence within human TNFR2 that
represents epitope that TNFR2 agonist antibodies
or fragments thereof can bind to
<220>
<221> VARIANT
<222> (10)...(10)
<223> Xaa is Cys residue protected with ACM protecting
group
<220>
<221> VARIANT
<222> (13)...(13)
<223> Xaa is Cys residue protected with ACM protecting
group
<220>
<221> VARIANT
<222> (23)...(23)
<223> Xaa is Cys residue protected with ACM protecting
group
<400> 1194
Cys Gly Thr Glu Thr Ser Asp Val Val Xaa Lys Pro Xaa Ala Pro Gly
1 5 10 15
Cys Ala Pro Leu Arg Lys Xaa Arg Pro Gly Phe Gly Val Ala Arg Pro
20 25 30
Cys
<210> 1195
<211> 185
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> peptide derived from human TNFR2 with affinity for
binding agonistic antibody MR2-1
<400> 1195
Tyr Tyr Asp Gln Thr Ala Gln Met Cys Cys Ser Lys Cys Ser Pro Gly
1 5 10 15
Gln His Ala Lys Val Phe Cys Thr Lys Thr Ser Asp Thr Val Cys Asp
20 25 30
Ser Cys Glu Asp Ser Thr Tyr Thr Gln Leu Trp Asn Trp Val Pro Glu
35 40 45
Cys Leu Ser Cys Gly Ser Arg Cys Ser Ser Asp Gln Val Glu Thr Gln
50 55 60
Ala Cys Thr Arg Glu Gln Asn Arg Ile Cys Thr Cys Arg Pro Gly Trp
65 70 75 80
Tyr Cys Ala Leu Ser Lys Gln Glu Gly Cys Arg Leu Cys Ala Pro Leu
85 90 95
Arg Lys Cys Arg Pro Gly Phe Gly Val Ala Arg Pro Gly Thr Glu Thr
100 105 110
Ser Asp Val Val Cys Lys Pro Cys Ala Pro Gly Thr Phe Ser Asn Thr
115 120 125
Thr Ser Ser Thr Asp Ile Cys Arg Pro His Gln Ile Cys Asn Val Val
130 135 140
Ala Ile Pro Gly Asn Ala Ser Met Asp Ala Val Cys Thr Ser Thr Ser
145 150 155 160
Pro Thr Arg Ser Met Ala Pro Gly Ala Val His Leu Pro Gln Pro Val
165 170 175
Ser Thr Arg Ser Gln His Thr Gln Pro
180 185
<210> 1196
<211> 20
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> peptide sequence within human TNFR2 that
represents epitope that TNFR2 agonist antibodies
and fragments thereof can bind to
<400> 1196
Gln Thr Ala Gln Met Cys Cys Ser Lys Cys Ser Pro Gly Gln His Ala
1 5 10 15
Lys Val Phe Cys
20
<210> 1197
<211> 20
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> peptide derived from human TNFR2 with affinity for
binding agonistic antibody MR2-1
<400> 1197
Arg Glu Gln Asn Arg Ile Cys Thr Cys Arg Pro Gly Trp Tyr Cys Ala
1 5 10 15
Leu Ser Lys Gln
20
<210> 1198
<211> 20
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> peptide derived from human TNFR2 with affinity for
binding agonistic antibody MR2-1
<400> 1198
Cys Arg Pro Gly Trp Tyr Cys Ala Leu Ser Lys Gln Glu Gly Cys Arg
1 5 10 15
Leu Cys Ala Pro
20
<210> 1199
<211> 20
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> peptide derived from human TNFR2 with affinity for
binding agonistic antibody MR2-1
<400> 1199
Leu Ser Lys Gln Glu Gly Cys Arg Leu Cys Ala Pro Leu Arg Lys Cys
1 5 10 15
Arg Pro Gly Phe
20
<210> 1200
<211> 20
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> peptide derived from human TNFR2 with affinity for
binding agonistic antibody MR2-1
<400> 1200
Lys Gln Glu Gly Cys Arg Leu Cys Ala Pro Leu Arg Lys Cys Arg Pro
1 5 10 15
Gly Phe Gly Val
20
<210> 1201
<211> 5
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> peptide sequence within human TNFR2 that
represents epitope that TNFR2 agonist antibodies
and fragments thereof can bind to
<400> 1201
Lys Cys Ser Pro Gly
1 5
<210> 1202
<211> 7
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> human TNFR2 epitope to which agonist antibody
MR2-1 binds
<400> 1202
Ser Ser Asp Gln Val Glu Thr
1 5
<210> 1203
<211> 28
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> peptide sequence within human TNFR2 that
represents epitope that TNFR2 agonist antibodies
and fragments thereof can bind to
<400> 1203
Asn Arg Ile Cys Thr Cys Arg Pro Gly Trp Tyr Cys Ala Leu Ser Lys
1 5 10 15
Gln Glu Gly Cys Arg Leu Cys Ala Pro Leu Arg Lys
20 25
<210> 1204
<211> 40
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> human TNFR2 epitope to which agonist antibody
MR2-1 binds
<400> 1204
Thr Arg Glu Gln Asn Arg Ile Cys Thr Cys Arg Pro Gly Trp Tyr Cys
1 5 10 15
Ala Leu Ser Lys Gln Glu Gly Cys Arg Leu Cys Ala Pro Leu Arg Lys
20 25 30
Cys Arg Pro Gly Phe Gly Val Ala
35 40
<210> 1205
<211> 59
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> peptide sequence within human TNFR2 that
represents epitope that TNFR2 agonist antibodies
and fragments thereof can bind to
<400> 1205
Cys Gly Ser Arg Cys Ser Ser Asp Gln Val Glu Thr Gln Ala Cys Thr
1 5 10 15
Arg Glu Gln Asn Arg Ile Cys Thr Cys Arg Pro Gly Trp Tyr Cys Ala
20 25 30
Leu Ser Lys Gln Glu Gly Cys Arg Leu Cys Ala Pro Leu Arg Lys Cys
35 40 45
Arg Pro Gly Phe Gly Val Ala Arg Pro Gly Thr
50 55
<210> 1206
<211> 17
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> epitope within human TNFR2 that may bind agonistic
TNFR2 antibodies and fragments thereof
<400> 1206
Cys Gly Ser Arg Cys Ser Ser Asp Gln Val Glu Thr Gln Ala Cys Thr
1 5 10 15
Arg
<210> 1207
<211> 39
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> epitope within human TNFR2 that may bind agonistic
TNFR2 antibodies and fragments thereof
<400> 1207
Cys Thr Arg Glu Gln Asn Arg Ile Cys Thr Cys Arg Pro Gly Trp Tyr
1 5 10 15
Cys Ala Leu Ser Lys Gln Glu Gly Cys Arg Leu Cys Ala Pro Leu Arg
20 25 30
Lys Cys Arg Pro Ser Gly Phe
35
<210> 1208
<211> 50
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> epitope within human TNFR2 that may bind agonistic
TNFR2 antibodies and fragments thereof
<400> 1208
Glu Thr Gln Ala Cys Thr Arg Glu Gln Asn Arg Ile Cys Thr Cys Arg
1 5 10 15
Pro Gly Trp Tyr Cys Ala Leu Ser Lys Gln Glu Gly Cys Arg Leu Cys
20 25 30
Ala Pro Leu Arg Lys Cys Arg Pro Gly Phe Gly Val Ala Arg Pro Gly
35 40 45
Thr Glu
50
<210> 1209
<211> 5
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> epitope within human TNFR2 that may bind agonistic
TNFR2 antibodies and fragments thereof
<400> 1209
Lys Cys Arg Pro Gly
1 5
<210> 1210
<211> 8
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> epitope within human TNFR2 that may bind agonistic
TNFR2 antibodies and fragments thereof
<400> 1210
Cys Ala Pro Leu Arg Lys Cys Arg
1 5
<210> 1211
<211> 8
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> epitope within human TNFR2 that may bind agonistic
TNFR2 antibodies and fragments thereof
<400> 1211
Lys Cys Arg Pro Gly Phe Gly Val
1 5
<210> 1212
<211> 123
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> TNFRAB1 (human TNFR2 antagonist antibody) heavy
chain
<220>
<221> VARIANT
<222> (26)...(32)
<223> CDR-H1 = GFTFSSY
<220>
<221> VARIANT
<222> (52)...(57)
<223> CDR-H2 = SSGGSY
<220>
<221> VARIANT
<222> (99)...(112)
<223> CDR-H3 = QRVDGYSSYWYFDV
<400> 1212
Glu Val Gln Leu Gln Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Lys Pro Gly Gly
1 5 10 15
Ser Leu Lys Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Ser Ser Tyr
20 25 30
Val Met Ser Trp Val Arg Gln Thr Pro Glu Lys Arg Leu Glu Trp Val
35 40 45
Ala Thr Ile Ser Ser Gly Gly Ser Tyr Thr Tyr Tyr Pro Asp Ser Val
50 55 60
Lys Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Ala Lys Asn Thr Leu Tyr
65 70 75 80
Leu Gln Met Ser Ser Leu Arg Ser Glu Asp Thr Ala Met Tyr Tyr Cys
85 90 95
Ala Arg Gln Arg Val Asp Gly Tyr Ser Ser Tyr Trp Tyr Phe Asp Val
100 105 110
Trp Gly Ala Gly Thr Ala Val Thr Val Ser Ser
115 120
<210> 1213
<211> 108
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> TNFRAB1 (human TNFR2 antagonist antibody) light
chain
<220>
<221> VARIANT
<222> (24)...(33)
<223> CDR-L1 = SASSSVYYMY
<220>
<221> VARIANT
<222> (49)...(55)
<223> CDR-L2 = STSNLAS
<220>
<221> VARIANT
<222> (88)...(96)
<223> CDR-L3 = QQRRNYPYT
<400> 1213
Asp Ile Val Leu Thr Gln Ser Pro Ala Ile Met Ser Ala Ser Pro Gly
1 5 10 15
Glu Lys Val Thr Ile Thr Cys Ser Ala Ser Ser Ser Val Tyr Tyr Met
20 25 30
Tyr Trp Phe Gln Gln Lys Pro Gly Thr Ser Pro Lys Leu Trp Ile Tyr
35 40 45
Ser Thr Ser Asn Leu Ala Ser Gly Val Pro Val Arg Phe Ser Gly Ser
50 55 60
Gly Ser Gly Thr Ser Tyr Ser Leu Thr Ile Ser Arg Met Glu Ala Glu
65 70 75 80
Asp Ala Ala Thr Tyr Tyr Cys Gln Gln Arg Arg Asn Tyr Pro Tyr Thr
85 90 95
Phe Gly Gly Gly Thr Lys Leu Glu Ile Lys Arg Ala
100 105
<210> 1214
<211> 8
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> TNFRAB2 (human TNFR2 antagonist antibody) heavy
chain CDR-H1 variant 1
<400> 1214
Gly Tyr Thr Phe Thr Asp Tyr Leu
1 5
<210> 1215
<211> 8
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> TNFRAB2 (human TNFR2 antagonist antibody) heavy
chain CDR-H1 variant 2
<400> 1215
Gly Tyr Thr Phe Thr Asp Tyr Ile
1 5
<210> 1216
<211> 8
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> TNFRAB2 (human TNFR2 antagonist antibody) heavy
chain CDR-H2
<400> 1216
Val Asp Pro Glu Tyr Gly Ser Thr
1 5
<210> 1217
<211> 14
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> TNFRAB2 (human TNFR2 antagonist antibody) heavy
chain CDR-H3
<400> 1217
Ala Arg Asp Asp Gly Ser Tyr Ser Pro Phe Asp Tyr Trp Gly
1 5 10
<210> 1218
<211> 6
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> TNFRAB2 (human TNFR2 antagonist antibody) light
chain CDR-L1
<400> 1218
Gln Asn Ile Asn Lys Tyr
1 5
<210> 1219
<211> 3
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> TNFRAB2 (human TNFR2 antagonist antibody) light
chain CDR-L2 variant 1
<400> 1219
Thr Tyr Ser
1
<210> 1220
<211> 3
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> TNFRAB2 (human TNFR2 antagonist antibody) light
chain CDR-L2 variant 2
<400> 1220
Tyr Thr Ser
1
<210> 1221
<211> 9
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> TNFRAB2 (human TNFR2 antagonist antibody) light
chain CDR-L3 variant 1
<400> 1221
Cys Leu Gln Tyr Val Asn Leu Leu Thr
1 5
<210> 1222
<211> 9
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> TNFRAB2 (human TNFR2 antagonist antibody) light
chain CDR-L3 variant 2
<400> 1222
Cys Leu Gln Tyr Val Asn Leu Ile Thr
1 5
<210> 1223
<211> 14
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> TNFR2A3 (human TNFR2 antagonist antibody) heavy
chain CDR-H3
<400> 1223
Ala Arg Asp Asp Gly Ser Tyr Ser Pro Phe Asp Tyr Phe Gly
1 5 10
<210> 1224
<211> 8
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> CDR-H2 of human TNFR2 antagonist antibody (or
antigen-binding fragment thereof)
<220>
<221> VARIANT
<222> (6)...(6)
<223> Xaa is Gly or Ala
<220>
<221> VARIANT
<222> (7)...(7)
<223> Xaa is Asn, Gln, Ser, or Thr
<400> 1224
Val Asp Pro Glu Tyr Xaa Xaa Thr
1 5
<210> 1225
<211> 14
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> CDR-H3 of human TNFR2 antagonist antibody (or
antigen-binding fragment thereof)
<220>
<221> VARIANT
<222> (2)...(2)
<223> Xaa is Arg, Lys, or His
<220>
<221> VARIANT
<222> (4)...(4)
<223> Xaa is Asp or Glu
<220>
<221> VARIANT
<222> (5)...(5)
<223> Xaa is Gly or Ala
<220>
<221> VARIANT
<222> (7)...(7)
<223> Xaa is Asn, Gln, Ser, or Thr
<220>
<221> VARIANT
<222> (9)...(9)
<223> Xaa is Ala, Val, Leu, Ile, Pro, Met, Trp, Phe, or
Tyr
<220>
<221> VARIANT
<222> (12)...(12)
<223> Xaa is Ala, Val, Leu, Ile, Pro, Met, Trp, Phe, or
Tyr
<220>
<221> VARIANT
<222> (13)...(13)
<223> Xaa is Asp or Glu
<220>
<221> VARIANT
<222> (14)...(14)
<223> Xaa is Ala, Val, Leu, Ile, Pro, Met, Trp, Phe, or
Tyr
<400> 1225
Gln Xaa Val Xaa Xaa Tyr Xaa Ser Xaa Trp Tyr Xaa Xaa Xaa
1 5 10
<210> 1226
<211> 14
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> CDR-H3 of human TNFR2 antagonist antibody (or
antigen-binding fragment thereof)
<220>
<221> VARIANT
<222> (2)...(2)
<223> Xaa is Lys, Arg, or His
<220>
<221> VARIANT
<222> (4)...(4)
<223> Xaa is Asp or Glu
<220>
<221> VARIANT
<222> (5)...(5)
<223> Xaa is Gly or Ala
<220>
<221> VARIANT
<222> (6)...(6)
<223> Xaa is Asn, Gln, Ser, or Thr
<220>
<221> VARIANT
<222> (7)...(7)
<223> Xaa is Ala, Val, Leu, Ile, Pro, Met, Trp, Phe, or
Tyr
<220>
<221> VARIANT
<222> (10)...(10)
<223> Xaa is Ala, Val, Leu, Ile, Pro, Met, Trp, Phe, or
Tyr
<220>
<221> VARIANT
<222> (11)...(11)
<223> Xaa is Asp or Glu
<220>
<221> VARIANT
<222> (12)...(12)
<223> Xaa is Ala, Val, Leu, Ile, Pro, Met, Trp, Phe, or
Tyr
<400> 1226
Ala Xaa Asp Xaa Xaa Xaa Xaa Ser Pro Xaa Xaa Xaa Trp Gly
1 5 10
<210> 1227
<211> 14
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> CDR-H3 of human TNFR2 antagonist antibody (or
antigen-binding fragment thereof)
<220>
<221> VARIANT
<222> (1)...(1)
<223> Xaa is any amino acid
<220>
<221> VARIANT
<222> (3)...(3)
<223> Xaa is any amino acid
<220>
<221> VARIANT
<222> (6)...(6)
<223> Xaa is any amino acid
<220>
<221> VARIANT
<222> (8)...(8)
<223> Xaa is any amino acid
<220>
<221> VARIANT
<222> (10)...(10)
<223> Xaa is any amino acid
<220>
<221> VARIANT
<222> (11)...(11)
<223> Xaa is any amino acid
<220>
<221> VARIANT
<222> (14)...(14)
<223> Xaa is any amino acid
<400> 1227
Xaa Arg Xaa Asp Gly Xaa Ser Xaa Tyr Xaa Xaa Phe Asp Xaa
1 5 10
<210> 1228
<211> 14
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> CDR-H3 of human TNFR2 antagonist antibody (or
antigen-binding fragment thereof)
<220>
<221> VARIANT
<222> (1)...(1)
<223> Xaa is any amino acid
<220>
<221> VARIANT
<222> (3)...(3)
<223> Xaa is any amino acid
<220>
<221> VARIANT
<222> (8)...(8)
<223> Xaa is any amino acid
<220>
<221> VARIANT
<222> (9)...(9)
<223> Xaa is any amino acid
<220>
<221> VARIANT
<222> (12)...(12)
<223> Xaa is any amino acid
<220>
<221> VARIANT
<222> (13)...(13)
<223> Xaa is any amino acid
<220>
<221> VARIANT
<222> (14)...(14)
<223> Xaa is any amino acid
<400> 1228
Xaa Arg Xaa Asp Gly Ser Tyr Xaa Xaa Phe Asp Xaa Xaa Xaa
1 5 10
<210> 1229
<211> 14
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> CDR-H3 of human TNFR2 antagonist antibody (or
antigen-binding fragment thereof)
<400> 1229
Gln Arg Val Asp Gly Tyr Ser Ser Tyr Trp Tyr Phe Asp Val
1 5 10
<210> 1230
<211> 6
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> CDR-H2 of human TNFR2 antagonist antibody (or
antigen-binding fragment thereof)
<400> 1230
Ser Ser Gly Gly Ser Tyr
1 5
<210> 1231
<211> 7
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> CDR-H1 of human TNFR2 antagonist antibody (or
antigen-binding fragment thereof)
<400> 1231
Gly Phe Thr Phe Ser Ser Tyr
1 5
<210> 1232
<211> 8
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> CDR-H1 of human TNFR2 antagonist antibody (or
antigen-binding fragment thereof)
<220>
<221> VARIANT
<222> (2)...(2)
<223> Xaa is any amino acid
<220>
<221> VARIANT
<222> (5)...(5)
<223> Xaa is any amino acid
<220>
<221> VARIANT
<222> (6)...(6)
<223> Xaa is any amino acid
<220>
<221> VARIANT
<222> (8)...(8)
<223> Xaa is any amino acid
<400> 1232
Gly Xaa Thr Phe Xaa Xaa Tyr Xaa
1 5
<210> 1233
<211> 8
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> CDR-H1 of human TNFR2 antagonist antibody (or
antigen-binding fragment thereof)
<220>
<221> VARIANT
<222> (8)...(8)
<223> Xaa is Leu or Ile
<400> 1233
Gly Tyr Thr Phe Thr Asp Tyr Xaa
1 5
<210> 1234
<211> 6
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> CDR-L1 of human TNFR2 antagonist antibody (or
antigen-binding fragment thereof)
<220>
<221> VARIANT
<222> (6)...(6)
<223> Xaa is Ala, Val, Leu, Ile, Pro, Met, Trp, Phe, or
Tyr
<400> 1234
Gln Asn Ile Asn Lys Xaa
1 5
<210> 1235
<211> 10
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> CDR-L1 of human TNFR2 antagonist antibody (or
antigen-binding fragment thereof)
<400> 1235
Ser Ala Ser Ser Ser Val Tyr Tyr Met Tyr
1 5 10
<210> 1236
<211> 15
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> CDR-L1 of human TNFR2 antagonist antibody (or
antigen-binding fragment thereof)
<400> 1236
Arg Ala Ser Lys Ser Val Ser Thr Ser Gly Tyr Ser Tyr Met His
1 5 10 15
<210> 1237
<211> 7
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> CDR-L2 of human TNFR2 antagonist antibody (or
antigen-binding fragment thereof)
<400> 1237
Ser Thr Ser Asn Leu Ala Ser
1 5
<210> 1238
<211> 7
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> CDR-L2 of human TNFR2 antagonist antibody (or
antigen-binding fragment thereof)
<400> 1238
Leu Ala Ser Asn Leu Glu Ser
1 5
<210> 1239
<211> 4
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> framework region bound to the N-terminus of CDR-L2
of human TNFR2 antagonist antibody (or
antigen-binding fragment thereof)
<400> 1239
Leu Leu Ile Arg
1
<210> 1240
<211> 3
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> framework region bound to the C-terminus of CDR-L2
of human TNFR2 antagonist antibody (or
antigen-binding fragment thereof)
<400> 1240
Thr Leu Glu
1
<210> 1241
<211> 9
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> CDR-L3 of human TNFR2 antagonist antibody (or
antigen-binding fragment thereof)
<220>
<221> VARIANT
<222> (4)...(4)
<223> Xaa is Ala, Val, Leu, Ile, Pro, Met, Trp, Phe, or
Tyr
<220>
<221> VARIANT
<222> (8)...(8)
<223> Xaa is Leu or Ile
<220>
<221> VARIANT
<222> (9)...(9)
<223> Xaa is Asn, Gln, Ser, or Thr
<400> 1241
Cys Leu Gln Xaa Val Asn Leu Xaa Xaa
1 5
<210> 1242
<211> 9
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> CDR-L3 of human TNFR2 antagonist antibody (or
antigen-binding fragment thereof)
<400> 1242
Gln Gln Arg Arg Asn Tyr Pro Tyr Thr
1 5
<210> 1243
<211> 9
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> CDR-L3 of human TNFR2 antagonist antibody (or
antigen-binding fragment thereof)
<220>
<221> VARIANT
<222> (8)...(8)
<223> Xaa is Leu or Ile
<400> 1243
Cys Leu Gln Tyr Val Asn Leu Xaa Thr
1 5
<210> 1244
<211> 9
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> CDR-L3 of human TNFR2 antagonist antibody (or
antigen-binding fragment thereof)
<400> 1244
Gln His Ser Arg Glu Leu Pro Arg Thr
1 5
<210> 1245
<211> 120
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> exemplary consensus sequence of a human antibody
heavy chain variable domain
<220>
<221> VARIANT
<222> (26)...(35)
<223> CDR-H1 that can be replaced = GFTFSDYAMS
<220>
<221> VARIANT
<222> (50)...(66)
<223> CDR-H2 that can be replaced = VISENGSDTYYADSVKG
<220>
<221> VARIANT
<222> (99)...(110)
<223> CDR-H3 that can be replaced = DRGGAVSYFDVW
<400> 1245
Glu Val Gln Leu Val Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly Gly
1 5 10 15
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Ser Asp Tyr
20 25 30
Ala Met Ser Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val
35 40 45
Ala Val Ile Ser Glu Asn Gly Ser Asp Thr Tyr Tyr Ala Asp Ser Val
50 55 60
Lys Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asp Ser Lys Asn Thr Leu Tyr
65 70 75 80
Leu Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys
85 90 95
Ala Arg Asp Arg Gly Gly Ala Val Ser Tyr Phe Asp Val Trp Gly Gln
100 105 110
Gly Thr Leu Val Thr Val Ser Ser
115 120
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<213> Artificial Sequence
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<223> exemplary consensus sequence of human antibody
light chain variable domain
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1 5 10 15
Asp Arg Val Thr Ile Thr Cys Arg Ala Ser Gln Asp Val Ser Ser Tyr
20 25 30
Leu Ala Trp Tyr Gln Gln Lys Pro Gly Lys Ala Pro Lys Leu Leu Ile
35 40 45
Tyr Ala Ala Ser Ser Leu Glu Ser Gly Val Pro Ser Arg Phe Ser Gly
50 55 60
Ser Gly Ser Gly Thr Asp Phe Thr Leu Thr Ile Ser Ser Leu Gln Pro
65 70 75 80
Glu Asp Phe Ala Thr Tyr Tyr Cys Gln Gln Tyr Asn Ser Leu Pro Tyr
85 90 95
Thr Phe Gly Gln Gly Thr Lys Val Glu Ile Lys Arg Thr
100 105
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<212> PRT
<213> Artificial Sequence
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antibodies or fragments thereof bind to
<400> 1247
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<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Epitope within human TNFR2 that antagonistic
antibodies or fragments thereof bind to
<400> 1248
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1 5
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<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Epitope within human TNFR2 that antagonistic
antibodies or fragments thereof bind to
<400> 1249
Arg Ile Cys Thr Cys Arg Pro Gly
1 5
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<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Epitope within human TNFR2 that antagonistic
antibodies or fragments thereof bind to
<400> 1250
Cys Ala Pro Leu Arg Lys Cys Arg
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<213> Artificial Sequence
<220>
<223> epitope within human TNFR2 to which antagonistic
TNFR2 antibodies or fragments thereof can bind (at
least 5 continuous or discontinuous residues)
<400> 1251
Cys Asp Ser Cys Glu Asp Ser Thr Tyr Thr Gln Leu Trp Asn Trp Val
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Pro Glu Cys Leu Ser Cys Gly Ser Arg Cys Ser Ser Asp Gln Val Glu
20 25 30
Thr Gln Ala Cys Thr Arg Glu Gln Asn Arg Ile Cys Thr Cys Arg Pro
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Gly Trp Tyr Cys Ala Leu
50
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<213> Artificial Sequence
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TNFR2 antibodies or fragments thereof can bind (at
least 5 continuous or discontinuous residues)
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<213> Artificial Sequence
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<223> epitope within human TNFR2 to which antagonistic
TNFR2 antibodies or fragments thereof can bind (at
least 5 continuous or discontinuous residues)
<400> 1253
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<213> Artificial Sequence
<220>
<223> epitope within human TNFR2 to which antagonistic
TNFR2 antibodies or fragments thereof can bind (at
least 5 continuous or discontinuous residues)
<400> 1254
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<213> Artificial Sequence
<220>
<223> epitope within human TNFR2 to which antagonistic
TNFR2 antibodies or fragments thereof can bind (at
least 5 continuous or discontinuous residues)
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<213> Artificial Sequence
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<223> epitope within human TNFR2 to which antagonistic
TNFR2 antibodies or fragments thereof bind
<400> 1256
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<223> epitope within human TNFR2 to which antagonistic
antibodies or fragments thereof bind
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antibodies (such as TNFRAB1) or fragments thereof
bind
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TNFR2 antibodies or fragments thereof can bind (at
least 5 continuous or discontinuous residues)
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Ala Arg Pro Gly Thr Glu Thr Ser Asp Val Val Cys Lys Pro Cys Ala
1 5 10 15
Pro Gly Thr Phe Ser Asn Thr Thr Ser Ser Thr Asp Ile Cys Arg Pro
20 25 30
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35 40
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antibodies or fragments thereof bind
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group
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<220>
<221> VARIANT
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<223> Xaa is Cys residue protected with ACM protecting
group
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antibodies or fragments thereof bind
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group
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group
<220>
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<223> Xaa is Cys residue protected with ACM protecting
group
<400> 1261
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1 5 10 15
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antibodies or fragments thereof bind
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group
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group
<220>
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<223> Xaa is Cys residue protected with ACM protecting
group
<400> 1262
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1 5 10 15
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20 25
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antibodies or fragments thereof bind
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group
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group
<400> 1263
Leu Ser Xaa Gly Ser Arg Cys Ser Ser Asp Gln Gly Gly Ser Gly Gly
1 5 10 15
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20 25
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antibodies or fragments thereof bind
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group
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group
<400> 1264
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1 5 10 15
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20 25
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antibodies or fragments thereof bind
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group
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<223> Xaa is Cys residue protected with ACM protecting
group
<400> 1265
Ser Xaa Gly Ser Arg Cys Ser Ser Asp Gln Val Gly Gly Ser Gly Gly
1 5 10 15
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20 25
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group
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group
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group
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20 25
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antibodies or fragments thereof bind
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group
<220>
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group
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1 5 10 15
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group
<220>
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<223> Xaa is Cys residue protected with ACM protecting
group
<400> 1269
Xaa Leu Ser Xaa Gly Ser Arg Cys Ser Ser Asp Gly Gly Ser Gly Gly
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Cys Thr Xaa Arg Pro Gly Trp Tyr Xaa Ala Leu
20 25
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<211> 27
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<213> Artificial Sequence
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antibodies or fragments thereof bind
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group
<220>
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group
<220>
<221> VARIANT
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<223> Xaa is Cys residue protected with ACM protecting
group
<400> 1270
Cys Ser Ser Asp Gln Val Glu Thr Gln Ala Xaa Gly Gly Ser Gly Gly
1 5 10 15
Arg Ile Cys Thr Xaa Arg Pro Gly Trp Tyr Xaa
20 25
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<212> PRT
<213> Artificial Sequence
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<223> epitope within human TNFR2 to which antagonistic
antibodies or fragments thereof bind
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group
<220>
<221> VARIANT
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<223> Xaa is Cys residue protected with ACM protecting
group
<400> 1271
Gly Ser Arg Cys Ser Ser Asp Gln Val Glu Thr Gly Gly Ser Gly Gly
1 5 10 15
Arg Ile Cys Thr Xaa Arg Pro Gly Trp Tyr Xaa
20 25
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<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
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antibodies or fragments thereof bind
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<221> VARIANT
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group
<220>
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group
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antibodies or fragments thereof bind
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group
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group
<220>
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<223> Xaa is Cys residue protected with ACM protecting
group
<220>
<221> VARIANT
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group
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Pro Glu Xaa Leu Ser Xaa Gly Ser Arg Cys Ser Gly Gly Ser Gly Gly
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20 25
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group
<220>
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<223> Xaa is Cys residue protected with ACM protecting
group
<400> 1275
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Gln Asn Arg Ile Cys Thr Xaa Arg Pro Gly Trp
20 25
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<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> epitope within human TNFR2 to which antagonistic
antibodies or fragments thereof bind
<220>
<221> VARIANT
<222> (7)...(7)
<223> Xaa is Cys residue protected with ACM protecting
group
<220>
<221> VARIANT
<222> (17)...(17)
<223> Xaa is Cys residue protected with ACM protecting
group
<400> 1276
Gln Glu Gly Cys Arg Leu Xaa Ala Pro Leu Arg Gly Gly Ser Gly Gly
1 5 10 15
Xaa Ala Pro Leu Arg Lys Cys Arg Pro Gly Phe
20 25
<210> 1277
<211> 27
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> epitope within human TNFR2 to which antagonistic
antibodies or fragments thereof bind
<220>
<221> VARIANT
<222> (21)...(21)
<223> Xaa is Cys residue protected with ACM protecting
group
<220>
<221> VARIANT
<222> (27)...(27)
<223> Xaa is Cys residue protected with ACM protecting
group
<400> 1277
Ser Arg Cys Ser Ser Asp Gln Val Glu Thr Gln Gly Gly Ser Gly Gly
1 5 10 15
Arg Ile Cys Thr Xaa Arg Pro Gly Trp Tyr Xaa
20 25
<210> 1278
<211> 27
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> epitope within human TNFR2 to which antagonistic
antibodies or fragments thereof bind
<220>
<221> VARIANT
<222> (11)...(11)
<223> Xaa is Cys residue protected with ACM protecting
group
<220>
<221> VARIANT
<222> (17)...(17)
<223> Xaa is Cys residue protected with ACM protecting
group
<400> 1278
Ala Leu Ser Lys Gln Glu Gly Cys Arg Leu Xaa Gly Gly Ser Gly Gly
1 5 10 15
Xaa Ala Pro Leu Arg Lys Cys Arg Pro Gly Phe
20 25
<210> 1279
<211> 27
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> epitope within human TNFR2 to which antagonistic
antibodies or fragments thereof bind
<220>
<221> VARIANT
<222> (7)...(7)
<223> Xaa is Cys residue protected with ACM protecting
group
<400> 1279
Gln Glu Gly Cys Arg Leu Xaa Ala Pro Leu Arg Gly Gly Ser Gly Gly
1 5 10 15
Pro Leu Arg Lys Cys Arg Pro Gly Phe Gly Val
20 25
<210> 1280
<211> 27
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> epitope within human TNFR2 to which antagonistic
antibodies or fragments thereof bind
<220>
<221> VARIANT
<222> (2)...(2)
<223> Xaa is Cys residue protected with ACM protecting
group
<400> 1280
Tyr Xaa Ala Leu Ser Lys Gln Glu Gly Cys Arg Gly Gly Ser Gly Gly
1 5 10 15
Ala Pro Leu Arg Lys Cys Arg Pro Gly Phe Gly
20 25
<210> 1281
<211> 27
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> epitope within human TNFR2 to which antagonistic
antibodies or fragments thereof bind
<220>
<221> VARIANT
<222> (3)...(3)
<223> Xaa is Cys residue protected with ACM protecting
group
<220>
<221> VARIANT
<222> (21)...(21)
<223> Xaa is Cys residue protected with ACM protecting
group
<220>
<221> VARIANT
<222> (27)...(27)
<223> Xaa is Cys residue protected with ACM protecting
group
<400> 1281
Leu Ser Xaa Gly Ser Arg Cys Ser Ser Asp Gln Gly Gly Ser Gly Gly
1 5 10 15
Arg Ile Cys Thr Xaa Arg Pro Gly Trp Tyr Xaa
20 25
<210> 1282
<211> 27
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> epitope within human TNFR2 to which antagonistic
antibodies or fragments thereof bind
<220>
<221> VARIANT
<222> (3)...(3)
<223> Xaa is Cys residue protected with ACM protecting
group
<220>
<221> VARIANT
<222> (6)...(6)
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group
<220>
<221> VARIANT
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<223> Xaa is Cys residue protected with ACM protecting
group
<400> 1282
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20 25
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antibodies or fragments thereof bind
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<400> 1284
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1 5 10 15
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group
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<223> Xaa is Cys residue protected with ACM protecting
group
<400> 1290
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Ser Lys Gln Glu Gly Cys Arg Leu Xaa Ala Pro Gly Gly Ser Gly Gly
1 5 10 15
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1 5 10 15
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<223> Xaa is Cys residue protected with ACM protecting
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<400> 1294
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1 5 10 15
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group
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<223> Xaa is Cys residue protected with ACM protecting
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group
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group
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<220>
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group
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group
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group
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<223> Xaa is Cys residue protected with ACM protecting
group
<400> 1302
Leu Ser Lys Gln Glu Gly Cys Arg Leu Xaa Ala Gly Gly Ser Gly Gly
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<223> epitope within human TNFR2 to which antagonistic
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group
<400> 1303
Gly Ser Arg Cys Ser Ser Asp Gln Val Glu Thr Gly Gly Ser Gly Gly
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<223> epitope within human TNFR2 to which antagonistic
antibodies or fragments thereof bind
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<221> VARIANT
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<223> Xaa is Cys residue protected with ACM protecting
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<220>
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group
<220>
<221> VARIANT
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<223> Xaa is Cys residue protected with ACM protecting
group
<400> 1304
Ser Xaa Gly Ser Arg Cys Ser Ser Asp Gln Val Gly Gly Ser Gly Gly
1 5 10 15
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20 25
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<212> PRT
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<223> epitope within human TNFR2 to which antagonistic
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<220>
<221> VARIANT
<222> (19)...(19)
<223> Xaa is Cys residue protected with ACM protecting
group
<220>
<221> VARIANT
<222> (25)...(25)
<223> Xaa is Cys residue protected with ACM protecting
group
<400> 1305
Gly Ser Arg Cys Ser Ser Asp Gln Val Glu Thr Gly Gly Ser Gly Gly
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20 25
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<211> 27
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> epitope within human TNFR2 to which antagonistic
antibodies or fragments thereof bind
<220>
<221> VARIANT
<222> (2)...(2)
<223> Xaa is Cys residue protected with ACM protecting
group
<400> 1306
Tyr Xaa Ala Leu Ser Lys Gln Glu Gly Cys Arg Gly Gly Ser Gly Gly
1 5 10 15
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20 25
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<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> epitope within human TNFR2 to which antagonistic
antibodies or fragments thereof bind
<220>
<221> VARIANT
<222> (8)...(8)
<223> Xaa is Cys residue protected with ACM protecting
group
<400> 1307
Lys Gln Glu Gly Cys Arg Leu Xaa Ala Pro Leu Gly Gly Ser Gly Gly
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<220>
<223> epitope within human TNFR2 to which antagonistic
antibodies or fragments thereof bind
<220>
<221> VARIANT
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<223> Xaa is Cys residue protected with ACM protecting
group
<400> 1308
Ala Leu Ser Lys Gln Glu Gly Cys Arg Leu Xaa Gly Gly Ser Gly Gly
1 5 10 15
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20 25
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<211> 27
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> epitope within human TNFR2 to which antagonistic
antibodies or fragments thereof bind
<220>
<221> VARIANT
<222> (2)...(2)
<223> Xaa is Cys residue protected with ACM protecting
group
<220>
<221> VARIANT
<222> (5)...(5)
<223> Xaa is Cys residue protected with ACM protecting
group
<220>
<221> VARIANT
<222> (20)...(20)
<223> Xaa is Cys residue protected with ACM protecting
group
<220>
<221> VARIANT
<222> (26)...(26)
<223> Xaa is Cys residue protected with ACM protecting
group
<400> 1309
Glu Xaa Leu Ser Xaa Gly Ser Arg Cys Ser Ser Gly Gly Ser Gly Gly
1 5 10 15
Ile Cys Thr Xaa Arg Pro Gly Trp Tyr Xaa Ala
20 25
<210> 1310
<211> 27
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> epitope within human TNFR2 to which antagonistic
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<220>
<221> VARIANT
<222> (11)...(11)
<223> Xaa is Cys residue protected with ACM protecting
group
<220>
<221> VARIANT
<222> (20)...(20)
<223> Xaa is Cys residue protected with ACM protecting
group
<220>
<221> VARIANT
<222> (26)...(26)
<223> Xaa is Cys residue protected with ACM protecting
group
<400> 1310
Cys Ser Ser Asp Gln Val Glu Thr Gln Ala Xaa Gly Gly Ser Gly Gly
1 5 10 15
Ile Cys Thr Xaa Arg Pro Gly Trp Tyr Xaa Ala
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<213> Artificial Sequence
<220>
<223> epitope within human TNFR2 to which antagonistic
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<221> VARIANT
<222> (6)...(6)
<223> Xaa is Cys residue protected with ACM protecting
group
<400> 1311
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1 5 10 15
Pro Leu Arg Lys Cys Arg Pro Gly Phe Gly Val
20 25
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<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> epitope within human TNFR2 to which antagonistic
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<220>
<221> VARIANT
<222> (11)...(11)
<223> Xaa is Cys residue protected with ACM protecting
group
<400> 1312
Ala Leu Ser Lys Gln Glu Gly Cys Arg Leu Xaa Gly Gly Ser Gly Gly
1 5 10 15
Pro Leu Arg Lys Cys Arg Pro Gly Phe Gly Val
20 25
<210> 1313
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<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> epitope within human TNFR2 to which antagonistic
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<220>
<221> VARIANT
<222> (1)...(1)
<223> Xaa is Cys residue protected with ACM protecting
group
<400> 1313
Xaa Ala Leu Ser Lys Gln Glu Gly Cys Arg Leu Gly Gly Ser Gly Gly
1 5 10 15
Arg Lys Cys Arg Pro Gly Phe Gly Val Ala Arg
20 25
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<211> 27
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> epitope within human TNFR2 to which antagonistic
antibodies or fragments thereof bind
<220>
<221> VARIANT
<222> (1)...(1)
<223> Xaa is Cys residue protected with ACM protecting
group
<220>
<221> VARIANT
<222> (17)...(17)
<223> Xaa is Cys residue protected with ACM protecting
group
<400> 1314
Xaa Ala Leu Ser Lys Gln Glu Gly Cys Arg Leu Gly Gly Ser Gly Gly
1 5 10 15
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20 25
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<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> epitope within human TNFR2 to which antagonistic
antibodies or fragments thereof bind
<220>
<221> VARIANT
<222> (1)...(1)
<223> Xaa is Cys residue protected with ACM protecting
group
<220>
<221> VARIANT
<222> (4)...(4)
<223> Xaa is Cys residue protected with ACM protecting
group
<220>
<221> VARIANT
<222> (21)...(21)
<223> Xaa is Cys residue protected with ACM protecting
group
<220>
<221> VARIANT
<222> (27)...(27)
<223> Xaa is Cys residue protected with ACM protecting
group
<400> 1315
Xaa Leu Ser Xaa Gly Ser Arg Cys Ser Ser Asp Gly Gly Ser Gly Gly
1 5 10 15
Arg Ile Cys Thr Xaa Arg Pro Gly Trp Tyr Xaa
20 25
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<213> Artificial Sequence
<220>
<223> epitope within human TNFR2 to which antagonistic
antibodies or fragments thereof bind
<220>
<221> VARIANT
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group
<400> 1316
Leu Ser Lys Gln Glu Gly Cys Arg Leu Xaa Ala Gly Gly Ser Gly Gly
1 5 10 15
Pro Leu Arg Lys Cys Arg Pro Gly Phe Gly Val
20 25
<210> 1317
<211> 27
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> epitope within human TNFR2 to which antagonistic
antibodies or fragments thereof bind
<220>
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<222> (9)...(9)
<223> Xaa is Cys residue protected with ACM protecting
group
<400> 1317
Ser Lys Gln Glu Gly Cys Arg Leu Xaa Ala Pro Gly Gly Ser Gly Gly
1 5 10 15
Arg Lys Cys Arg Pro Gly Phe Gly Val Ala Arg
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<212> PRT
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<220>
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antibodies or fragments thereof bind
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group
<400> 1318
Lys Gln Glu Gly Cys Arg Leu Xaa Ala Pro Leu Gly Gly Ser Gly Gly
1 5 10 15
Arg Lys Cys Arg Pro Gly Phe Gly Val Ala Arg
20 25
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<212> PRT
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antibodies or fragments thereof bind
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group
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Gln Glu Gly Cys Arg Leu Xaa Ala Pro Leu Arg Gly Gly Ser Gly Gly
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Arg Lys Cys Arg Pro Gly Phe Gly Val Ala Arg
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<220>
<223> epitope within human TNFR2 to which antagonistic
antibodies or fragments thereof bind
<220>
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<223> Xaa is Cys residue protected with ACM protecting
group
<400> 1320
Xaa Ala Leu Ser Lys Gln Glu Gly Cys Arg Leu Gly Gly Ser Gly Gly
1 5 10 15
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20 25
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<213> Artificial Sequence
<220>
<223> epitope within human TNFR2 to which antagonistic
antibodies or fragments thereof bind
<220>
<221> VARIANT
<222> (1)...(1)
<223> Xaa is Cys residue protected with ACM protecting
group
<400> 1321
Xaa Ala Leu Ser Lys Gln Glu Gly Cys Arg Leu Gly Gly Ser Gly Gly
1 5 10 15
Pro Leu Arg Lys Cys Arg Pro Gly Phe Gly Val
20 25
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<223> epitope within human TNFR2 to which antagonistic
antibodies or fragments thereof bind
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group
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group
<400> 1322
Gly Ser Arg Cys Ser Ser Asp Gln Val Glu Thr Gly Gly Ser Gly Gly
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20 25
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group
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<223> epitope within human TNFR2 to which antagonistic
antibodies or fragments thereof bind
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<221> VARIANT
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group
<220>
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<223> Xaa is Cys residue protected with ACM protecting
group
<220>
<221> VARIANT
<222> (26)...(26)
<223> Xaa is Cys residue protected with ACM protecting
group
<400> 1324
Xaa Gly Ser Arg Cys Ser Ser Asp Gln Val Glu Gly Gly Ser Gly Gly
1 5 10 15
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group
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group
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20 25
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<212> PRT
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<221> VARIANT
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group
<220>
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group
<400> 1326
Ser Arg Cys Ser Ser Asp Gln Val Glu Thr Gln Gly Gly Ser Gly Gly
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<213> Artificial Sequence
<220>
<223> epitope within human TNFR2 to which antagonistic
antibodies or fragments thereof bind
<220>
<221> VARIANT
<222> (2)...(2)
<223> Xaa is Cys residue protected with ACM protecting
group
<400> 1327
Tyr Xaa Ala Leu Ser Lys Gln Glu Gly Cys Arg Gly Gly Ser Gly Gly
1 5 10 15
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20 25
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<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> epitope within human TNFR2 to which antagonistic
antibodies or fragments thereof bind
<220>
<221> VARIANT
<222> (20)...(20)
<223> Xaa is Cys residue protected with ACM protecting
group
<220>
<221> VARIANT
<222> (26)...(26)
<223> Xaa is Cys residue protected with ACM protecting
group
<400> 1328
Arg Cys Ser Ser Asp Gln Val Glu Thr Gln Ala Gly Gly Ser Gly Gly
1 5 10 15
Ile Cys Thr Xaa Arg Pro Gly Trp Tyr Xaa Ala
20 25
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<211> 27
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> epitope within human TNFR2 to which antagonistic
antibodies or fragments thereof bind
<220>
<221> VARIANT
<222> (9)...(9)
<223> Xaa is Cys residue protected with ACM protecting
group
<400> 1329
Ser Lys Gln Glu Gly Cys Arg Leu Xaa Ala Pro Gly Gly Ser Gly Gly
1 5 10 15
Pro Leu Arg Lys Cys Arg Pro Gly Phe Gly Val
20 25
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<211> 27
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> epitope within human TNFR2 to which antagonistic
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<221> VARIANT
<222> (2)...(2)
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group
<220>
<221> VARIANT
<222> (23)...(23)
<223> Xaa is Cys residue protected with ACM protecting
group
<400> 1330
Ser Xaa Gly Ser Arg Cys Ser Ser Asp Gln Val Gly Gly Ser Gly Gly
1 5 10 15
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20 25
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<211> 27
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> epitope within human TNFR2 to which antagonistic
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<220>
<221> VARIANT
<222> (6)...(6)
<223> Xaa is Cys residue protected with ACM protecting
group
<400> 1331
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1 5 10 15
Arg Lys Cys Arg Pro Gly Phe Gly Val Ala Arg
20 25
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<211> 27
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> epitope within human TNFR2 to which antagonistic
antibodies or fragments thereof bind
<220>
<221> VARIANT
<222> (1)...(1)
<223> Xaa is Cys residue protected with ACM protecting
group
<220>
<221> VARIANT
<222> (4)...(4)
<223> Xaa is Cys residue protected with ACM protecting
group
<220>
<221> VARIANT
<222> (23)...(23)
<223> Xaa is Cys residue protected with ACM protecting
group
<400> 1332
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20 25
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<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> epitope within human TNFR2 to which antagonistic
antibodies or fragments thereof bind
<220>
<221> VARIANT
<222> (3)...(3)
<223> Xaa is Cys residue protected with ACM protecting
group
<400> 1333
Trp Tyr Xaa Ala Leu Ser Lys Gln Glu Gly Cys Gly Gly Ser Gly Gly
1 5 10 15
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20 25
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<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> epitope within human TNFR2 to which antagonistic
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<220>
<221> VARIANT
<222> (7)...(7)
<223> Xaa is Cys residue protected with ACM protecting
group
<400> 1334
Gln Glu Gly Cys Arg Leu Xaa Ala Pro Leu Arg Gly Gly Ser Gly Gly
1 5 10 15
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20 25
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<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> epitope within human TNFR2 to which antagonistic
antibodies or fragments thereof bind
<220>
<221> VARIANT
<222> (3)...(3)
<223> Xaa is Cys residue protected with ACM protecting
group
<220>
<221> VARIANT
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<223> Xaa is Cys residue protected with ACM protecting
group
<400> 1335
Trp Tyr Xaa Ala Leu Ser Lys Gln Glu Gly Cys Gly Gly Ser Gly Gly
1 5 10 15
Xaa Ala Pro Leu Arg Lys Cys Arg Pro Gly Phe
20 25
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<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> epitope within human TNFR2 to which antagonistic
antibodies or fragments thereof bind
<220>
<221> VARIANT
<222> (11)...(11)
<223> Xaa is Cys residue protected with ACM protecting
group
<400> 1336
Ala Leu Ser Lys Gln Glu Gly Cys Arg Leu Xaa Gly Gly Ser Gly Gly
1 5 10 15
Ala Pro Leu Arg Lys Cys Arg Pro Gly Phe Gly
20 25
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<211> 27
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> epitope within human TNFR2 to which antagonistic
antibodies or fragments thereof bind
<220>
<221> VARIANT
<222> (6)...(6)
<223> Xaa is Cys residue protected with ACM protecting
group
<400> 1337
Glu Gly Cys Arg Leu Xaa Ala Pro Leu Arg Lys Gly Gly Ser Gly Gly
1 5 10 15
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20 25
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<213> Artificial Sequence
<220>
<223> epitope within human TNFR2 to which antagonistic
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<221> VARIANT
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<223> Xaa is Cys residue protected with ACM protecting
group
<220>
<221> VARIANT
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<223> Xaa is Cys residue protected with ACM protecting
group
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<223> epitope within human TNFR2 to which antagonistic
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<221> VARIANT
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<223> Xaa is Cys residue protected with ACM protecting
group
<220>
<221> VARIANT
<222> (23)...(23)
<223> Xaa is Cys residue protected with ACM protecting
group
<400> 1339
Leu Ser Xaa Gly Ser Arg Cys Ser Ser Asp Gln Gly Gly Ser Gly Gly
1 5 10 15
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<212> PRT
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<220>
<223> epitope within human TNFR2 to which antagonistic
antibodies or fragments thereof bind
<220>
<221> VARIANT
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<223> Xaa is Cys residue protected with ACM protecting
group
<400> 1340
Leu Ser Lys Gln Glu Gly Cys Arg Leu Xaa Ala Gly Gly Ser Gly Gly
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20 25
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<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> epitope within human TNFR2 to which antagonistic
antibodies or fragments thereof bind
<220>
<221> VARIANT
<222> (22)...(22)
<223> Xaa is Cys residue protected with ACM protecting
group
<400> 1341
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20 25
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<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> epitope within human TNFR2 to which antagonistic
antibodies or fragments thereof bind
<220>
<221> VARIANT
<222> (8)...(8)
<223> Xaa is Cys residue protected with ACM protecting
group
<400> 1342
Lys Gln Glu Gly Cys Arg Leu Xaa Ala Pro Leu Gly Gly Ser Gly Gly
1 5 10 15
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20 25
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<211> 27
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> epitope within human TNFR2 to which antagonistic
antibodies or fragments thereof bind
<220>
<221> VARIANT
<222> (9)...(9)
<223> Xaa is Cys residue protected with ACM protecting
group
<400> 1343
Ser Lys Gln Glu Gly Cys Arg Leu Xaa Ala Pro Gly Gly Ser Gly Gly
1 5 10 15
Ala Pro Leu Arg Lys Cys Arg Pro Gly Phe Gly
20 25
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<211> 27
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> epitope within human TNFR2 to which antagonistic
antibodies or fragments thereof bind
<220>
<221> VARIANT
<222> (26)...(26)
<223> Xaa is Cys residue protected with ACM protecting
group
<400> 1344
Ser Arg Cys Ser Ser Asp Gln Val Glu Thr Gln Gly Gly Ser Gly Gly
1 5 10 15
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20 25
<210> 1345
<211> 27
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> epitope within human TNFR2 to which antagonistic
antibodies or fragments thereof bind
<220>
<221> VARIANT
<222> (26)...(26)
<223> Xaa is Cys residue protected with ACM protecting
group
<400> 1345
Arg Cys Ser Ser Asp Gln Val Glu Thr Gln Ala Gly Gly Ser Gly Gly
1 5 10 15
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20 25
<210> 1346
<211> 27
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> epitope within human TNFR2 to which antagonistic
antibodies or fragments thereof bind
<220>
<221> VARIANT
<222> (11)...(11)
<223> Xaa is Cys residue protected with ACM protecting
group
<220>
<221> VARIANT
<222> (26)...(26)
<223> Xaa is Cys residue protected with ACM protecting
group
<400> 1346
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1 5 10 15
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20 25
<210> 1347
<211> 27
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> epitope within human TNFR2 to which antagonistic
antibodies or fragments thereof bind
<220>
<221> VARIANT
<222> (4)...(4)
<223> Xaa is Cys residue protected with ACM protecting
group
<220>
<221> VARIANT
<222> (7)...(7)
<223> Xaa is Cys residue protected with ACM protecting
group
<220>
<221> VARIANT
<222> (25)...(25)
<223> Xaa is Cys residue protected with ACM protecting
group
<400> 1347
Val Pro Glu Xaa Leu Ser Xaa Gly Ser Arg Cys Gly Gly Ser Gly Gly
1 5 10 15
Arg Glu Gln Asn Arg Ile Cys Thr Xaa Arg Pro
20 25
<210> 1348
<211> 27
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> epitope within human TNFR2 to which antagonistic
antibodies or fragments thereof bind
<220>
<221> VARIANT
<222> (3)...(3)
<223> Xaa is Cys residue protected with ACM protecting
group
<220>
<221> VARIANT
<222> (6)...(6)
<223> Xaa is Cys residue protected with ACM protecting
group
<220>
<221> VARIANT
<222> (25)...(25)
<223> Xaa is Cys residue protected with ACM protecting
group
<400> 1348
Pro Glu Xaa Leu Ser Xaa Gly Ser Arg Cys Ser Gly Gly Ser Gly Gly
1 5 10 15
Arg Glu Gln Asn Arg Ile Cys Thr Xaa Arg Pro
20 25
<210> 1349
<211> 27
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> epitope within human TNFR2 to which antagonistic
antibodies or fragments thereof bind
<220>
<221> VARIANT
<222> (2)...(2)
<223> Xaa is Cys residue protected with ACM protecting
group
<220>
<221> VARIANT
<222> (5)...(5)
<223> Xaa is Cys residue protected with ACM protecting
group
<220>
<221> VARIANT
<222> (25)...(25)
<223> Xaa is Cys residue protected with ACM protecting
group
<400> 1349
Glu Xaa Leu Ser Xaa Gly Ser Arg Cys Ser Ser Gly Gly Ser Gly Gly
1 5 10 15
Arg Glu Gln Asn Arg Ile Cys Thr Xaa Arg Pro
20 25
<210> 1350
<211> 27
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> epitope within human TNFR2 to which antagonistic
antibodies or fragments thereof bind
<220>
<221> VARIANT
<222> (1)...(1)
<223> Xaa is Cys residue protected with ACM protecting
group
<220>
<221> VARIANT
<222> (4)...(4)
<223> Xaa is Cys residue protected with ACM protecting
group
<220>
<221> VARIANT
<222> (25)...(25)
<223> Xaa is Cys residue protected with ACM protecting
group
<400> 1350
Xaa Leu Ser Xaa Gly Ser Arg Cys Ser Ser Asp Gly Gly Ser Gly Gly
1 5 10 15
Arg Glu Gln Asn Arg Ile Cys Thr Xaa Arg Pro
20 25
<210> 1351
<211> 27
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> epitope within human TNFR2 to which antagonistic
antibodies or fragments thereof bind
<220>
<221> VARIANT
<222> (3)...(3)
<223> Xaa is Cys residue protected with ACM protecting
group
<220>
<221> VARIANT
<222> (25)...(25)
<223> Xaa is Cys residue protected with ACM protecting
group
<400> 1351
Leu Ser Xaa Gly Ser Arg Cys Ser Ser Asp Gln Gly Gly Ser Gly Gly
1 5 10 15
Arg Glu Gln Asn Arg Ile Cys Thr Xaa Arg Pro
20 25
<210> 1352
<211> 27
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> epitope within human TNFR2 to which antagonistic
antibodies or fragments thereof bind
<220>
<221> VARIANT
<222> (2)...(2)
<223> Xaa is Cys residue protected with ACM protecting
group
<220>
<221> VARIANT
<222> (25)...(25)
<223> Xaa is Cys residue protected with ACM protecting
group
<400> 1352
Ser Xaa Gly Ser Arg Cys Ser Ser Asp Gln Val Gly Gly Ser Gly Gly
1 5 10 15
Arg Glu Gln Asn Arg Ile Cys Thr Xaa Arg Pro
20 25
<210> 1353
<211> 27
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> epitope within human TNFR2 to which antagonistic
antibodies or fragments thereof bind
<220>
<221> VARIANT
<222> (1)...(1)
<223> Xaa is Cys residue protected with ACM protecting
group
<220>
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<223> Xaa is Cys residue protected with ACM protecting
group
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<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> epitope within human TNFR2 to which antagonistic
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<223> epitope within human TNFR2 to which antagonistic
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group
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<210> 1413
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group
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group
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<223> Xaa is Cys residue protected with ACM protecting
group
<400> 1414
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<210> 1415
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<213> Artificial Sequence
<220>
<223> epitope within human TNFR2 to which antagonistic
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<220>
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<222> (2)...(2)
<223> Xaa is Cys residue protected with ACM protecting
group
<220>
<221> VARIANT
<222> (19)...(19)
<223> Xaa is Cys residue protected with ACM protecting
group
<220>
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<223> Xaa is Cys residue protected with ACM protecting
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<400> 1415
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<223> epitope within human TNFR2 to which antagonistic
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<220>
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group
<220>
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<222> (25)...(25)
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group
<400> 1416
Xaa Gly Ser Arg Cys Ser Ser Asp Gln Val Glu Gly Gly Ser Gly Gly
1 5 10 15
Cys Thr Xaa Arg Pro Gly Trp Tyr Xaa Ala Leu
20 25
<210> 1417
<211> 27
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> epitope within human TNFR2 to which antagonistic
antibodies or fragments thereof bind
<220>
<221> VARIANT
<222> (19)...(19)
<223> Xaa is Cys residue protected with ACM protecting
group
<220>
<221> VARIANT
<222> (25)...(25)
<223> Xaa is Cys residue protected with ACM protecting
group
<400> 1417
Gly Ser Arg Cys Ser Ser Asp Gln Val Glu Thr Gly Gly Ser Gly Gly
1 5 10 15
Cys Thr Xaa Arg Pro Gly Trp Tyr Xaa Ala Leu
20 25
<210> 1418
<211> 27
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> epitope within human TNFR2 to which antagonistic
antibodies or fragments thereof bind
<220>
<221> VARIANT
<222> (19)...(19)
<223> Xaa is Cys residue protected with ACM protecting
group
<220>
<221> VARIANT
<222> (25)...(25)
<223> Xaa is Cys residue protected with ACM protecting
group
<400> 1418
Ser Arg Cys Ser Ser Asp Gln Val Glu Thr Gln Gly Gly Ser Gly Gly
1 5 10 15
Cys Thr Xaa Arg Pro Gly Trp Tyr Xaa Ala Leu
20 25
<210> 1419
<211> 27
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> epitope within human TNFR2 to which antagonistic
antibodies or fragments thereof bind
<220>
<221> VARIANT
<222> (19)...(19)
<223> Xaa is Cys residue protected with ACM protecting
group
<220>
<221> VARIANT
<222> (25)...(25)
<223> Xaa is Cys residue protected with ACM protecting
group
<400> 1419
Arg Cys Ser Ser Asp Gln Val Glu Thr Gln Ala Gly Gly Ser Gly Gly
1 5 10 15
Cys Thr Xaa Arg Pro Gly Trp Tyr Xaa Ala Leu
20 25
<210> 1420
<211> 27
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> epitope within human TNFR2 to which antagonistic
antibodies or fragments thereof bind
<220>
<221> VARIANT
<222> (11)...(11)
<223> Xaa is Cys residue protected with ACM protecting
group
<220>
<221> VARIANT
<222> (19)...(19)
<223> Xaa is Cys residue protected with ACM protecting
group
<220>
<221> VARIANT
<222> (25)...(25)
<223> Xaa is Cys residue protected with ACM protecting
group
<400> 1420
Cys Ser Ser Asp Gln Val Glu Thr Gln Ala Xaa Gly Gly Ser Gly Gly
1 5 10 15
Cys Thr Xaa Arg Pro Gly Trp Tyr Xaa Ala Leu
20 25
<210> 1421
<211> 27
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> epitope within human TNFR2 to which antagonistic
antibodies or fragments thereof bind
<220>
<221> VARIANT
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<223> Xaa is Cys residue protected with ACM protecting
group
<220>
<221> VARIANT
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<223> Xaa is Cys residue protected with ACM protecting
group
<400> 1421
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1 5 10 15
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20 25
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<211> 27
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> epitope within human TNFR2 to which antagonistic
antibodies or fragments thereof bind
<220>
<221> VARIANT
<222> (8)...(8)
<223> Xaa is Cys residue protected with ACM protecting
group
<400> 1422
Thr Arg Glu Gln Asn Arg Ile Xaa Thr Cys Arg Gly Gly Ser Gly Gly
1 5 10 15
Arg Pro Gly Trp Tyr Cys Ala Leu Ser Lys Gln
20 25
<210> 1423
<211> 27
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> epitope within human TNFR2 to which antagonistic
antibodies or fragments thereof bind
<220>
<221> VARIANT
<222> (7)...(7)
<223> Xaa is Cys residue protected with ACM protecting
group
<400> 1423
Arg Glu Gln Asn Arg Ile Xaa Thr Cys Arg Pro Gly Gly Ser Gly Gly
1 5 10 15
Arg Pro Gly Trp Tyr Cys Ala Leu Ser Lys Gln
20 25
<210> 1424
<211> 27
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> epitope within human TNFR2 to which antagonistic
antibodies or fragments thereof bind
<220>
<221> VARIANT
<222> (6)...(6)
<223> Xaa is Cys residue protected with ACM protecting
group
<400> 1424
Glu Gln Asn Arg Ile Xaa Thr Cys Arg Pro Gly Gly Gly Ser Gly Gly
1 5 10 15
Arg Pro Gly Trp Tyr Cys Ala Leu Ser Lys Gln
20 25
<210> 1425
<211> 27
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> epitope within human TNFR2 to which antagonistic
antibodies or fragments thereof bind
<220>
<221> VARIANT
<222> (5)...(5)
<223> Xaa is Cys residue protected with ACM protecting
group
<400> 1425
Gln Asn Arg Ile Xaa Thr Cys Arg Pro Gly Trp Gly Gly Ser Gly Gly
1 5 10 15
Arg Pro Gly Trp Tyr Cys Ala Leu Ser Lys Gln
20 25
<210> 1426
<211> 27
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> epitope within human TNFR2 to which antagonistic
antibodies or fragments thereof bind
<220>
<221> VARIANT
<222> (4)...(4)
<223> Xaa can be any naturally occurring amino acid
<400> 1426
Asn Arg Ile Xaa Thr Cys Arg Pro Gly Trp Tyr Gly Gly Ser Gly Gly
1 5 10 15
Arg Pro Gly Trp Tyr Cys Ala Leu Ser Lys Gln
20 25
<210> 1427
<211> 27
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> epitope within human TNFR2 to which antagonistic
antibodies or fragments thereof bind
<220>
<221> VARIANT
<222> (3)...(3)
<223> Xaa is Cys residue protected with ACM protecting
group
<220>
<221> VARIANT
<222> (17)...(17)
<223> Xaa is Cys residue protected with ACM protecting
group
<400> 1427
Trp Tyr Xaa Ala Leu Ser Lys Gln Glu Gly Cys Gly Gly Ser Gly Gly
1 5 10 15
Xaa Ala Pro Leu Arg Lys Cys Arg Pro Gly Phe
20 25
<210> 1428
<211> 27
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> epitope within human TNFR2 to which antagonistic
antibodies or fragments thereof bind
<220>
<221> VARIANT
<222> (2)...(2)
<223> Xaa is Cys residue protected with ACM protecting
group
<220>
<221> VARIANT
<222> (17)...(17)
<223> Xaa is Cys residue protected with ACM protecting
group
<400> 1428
Tyr Xaa Ala Leu Ser Lys Gln Glu Gly Cys Arg Gly Gly Ser Gly Gly
1 5 10 15
Xaa Ala Pro Leu Arg Lys Cys Arg Pro Gly Phe
20 25
<210> 1429
<211> 27
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> epitope within human TNFR2 to which antagonistic
antibodies or fragments thereof bind
<220>
<221> VARIANT
<222> (1)...(1)
<223> Xaa is Cys residue protected with ACM protecting
group
<220>
<221> VARIANT
<222> (17)...(17)
<223> Xaa is Cys residue protected with ACM protecting
group
<400> 1429
Xaa Ala Leu Ser Lys Gln Glu Gly Cys Arg Leu Gly Gly Ser Gly Gly
1 5 10 15
Xaa Ala Pro Leu Arg Lys Cys Arg Pro Gly Phe
20 25
<210> 1430
<211> 27
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> epitope within human TNFR2 to which antagonistic
antibodies or fragments thereof bind
<220>
<221> VARIANT
<222> (11)...(11)
<223> Xaa is Cys residue protected with ACM protecting
group
<220>
<221> VARIANT
<222> (17)...(17)
<223> Xaa is Cys residue protected with ACM protecting
group
<400> 1430
Ala Leu Ser Lys Gln Glu Gly Cys Arg Leu Xaa Gly Gly Ser Gly Gly
1 5 10 15
Xaa Ala Pro Leu Arg Lys Cys Arg Pro Gly Phe
20 25
<210> 1431
<211> 27
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> epitope within human TNFR2 to which antagonistic
antibodies or fragments thereof bind
<220>
<221> VARIANT
<222> (10)...(10)
<223> Xaa is Cys residue protected with ACM protecting
group
<220>
<221> VARIANT
<222> (17)...(17)
<223> Xaa is Cys residue protected with ACM protecting
group
<400> 1431
Leu Ser Lys Gln Glu Gly Cys Arg Leu Xaa Ala Gly Gly Ser Gly Gly
1 5 10 15
Xaa Ala Pro Leu Arg Lys Cys Arg Pro Gly Phe
20 25
<210> 1432
<211> 27
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> epitope within human TNFR2 to which antagonistic
antibodies or fragments thereof bind
<220>
<221> VARIANT
<222> (9)...(9)
<223> Xaa is Cys residue protected with ACM protecting
group
<220>
<221> VARIANT
<222> (17)...(17)
<223> Xaa is Cys residue protected with ACM protecting
group
<400> 1432
Ser Lys Gln Glu Gly Cys Arg Leu Xaa Ala Pro Gly Gly Ser Gly Gly
1 5 10 15
Xaa Ala Pro Leu Arg Lys Cys Arg Pro Gly Phe
20 25
<210> 1433
<211> 27
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> epitope within human TNFR2 to which antagonistic
antibodies or fragments thereof bind
<220>
<221> VARIANT
<222> (8)...(8)
<223> Xaa is Cys residue protected with ACM protecting
group
<220>
<221> VARIANT
<222> (17)...(17)
<223> Xaa is Cys residue protected with ACM protecting
group
<400> 1433
Lys Gln Glu Gly Cys Arg Leu Xaa Ala Pro Leu Gly Gly Ser Gly Gly
1 5 10 15
Xaa Ala Pro Leu Arg Lys Cys Arg Pro Gly Phe
20 25
<210> 1434
<211> 27
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> epitope within human TNFR2 to which antagonistic
antibodies or fragments thereof bind
<220>
<221> VARIANT
<222> (7)...(7)
<223> Xaa is Cys residue protected with ACM protecting
group
<220>
<221> VARIANT
<222> (17)...(17)
<223> Xaa is Cys residue protected with ACM protecting
group
<400> 1434
Gln Glu Gly Cys Arg Leu Xaa Ala Pro Leu Arg Gly Gly Ser Gly Gly
1 5 10 15
Xaa Ala Pro Leu Arg Lys Cys Arg Pro Gly Phe
20 25
<210> 1435
<211> 27
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> epitope within human TNFR2 to which antagonistic
antibodies or fragments thereof bind
<220>
<221> VARIANT
<222> (6)...(6)
<223> Xaa is Cys residue protected with ACM protecting
group
<220>
<221> VARIANT
<222> (17)...(17)
<223> Xaa is Cys residue protected with ACM protecting
group
<400> 1435
Glu Gly Cys Arg Leu Xaa Ala Pro Leu Arg Lys Gly Gly Ser Gly Gly
1 5 10 15
Xaa Ala Pro Leu Arg Lys Cys Arg Pro Gly Phe
20 25
<210> 1436
<211> 27
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> epitope within human TNFR2 to which antagonistic
antibodies or fragments thereof bind
<220>
<221> VARIANT
<222> (3)...(3)
<223> Xaa is Cys residue protected with ACM protecting
group
<400> 1436
Trp Tyr Xaa Ala Leu Ser Lys Gln Glu Gly Cys Gly Gly Ser Gly Gly
1 5 10 15
Ala Pro Leu Arg Lys Cys Arg Pro Gly Phe Gly
20 25
<210> 1437
<211> 27
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> epitope within human TNFR2 to which antagonistic
antibodies or fragments thereof bind
<220>
<221> VARIANT
<222> (2)...(2)
<223> Xaa is Cys residue protected with ACM protecting
group
<400> 1437
Tyr Xaa Ala Leu Ser Lys Gln Glu Gly Cys Arg Gly Gly Ser Gly Gly
1 5 10 15
Ala Pro Leu Arg Lys Cys Arg Pro Gly Phe Gly
20 25
<210> 1438
<211> 27
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> epitope within human TNFR2 to which antagonistic
antibodies or fragments thereof bind
<220>
<221> VARIANT
<222> (1)...(1)
<223> Xaa is Cys residue protected with ACM protecting
group
<400> 1438
Xaa Ala Leu Ser Lys Gln Glu Gly Cys Arg Leu Gly Gly Ser Gly Gly
1 5 10 15
Ala Pro Leu Arg Lys Cys Arg Pro Gly Phe Gly
20 25
<210> 1439
<211> 27
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> epitope within human TNFR2 to which antagonistic
antibodies or fragments thereof bind
<220>
<221> VARIANT
<222> (11)...(11)
<223> Xaa is Cys residue protected with ACM protecting
group
<400> 1439
Ala Leu Ser Lys Gln Glu Gly Cys Arg Leu Xaa Gly Gly Ser Gly Gly
1 5 10 15
Ala Pro Leu Arg Lys Cys Arg Pro Gly Phe Gly
20 25
<210> 1440
<211> 27
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> epitope within human TNFR2 to which antagonistic
antibodies or fragments thereof bind
<220>
<221> VARIANT
<222> (10)...(10)
<223> Xaa is Cys residue protected with ACM protecting
group
<400> 1440
Leu Ser Lys Gln Glu Gly Cys Arg Leu Xaa Ala Gly Gly Ser Gly Gly
1 5 10 15
Ala Pro Leu Arg Lys Cys Arg Pro Gly Phe Gly
20 25
<210> 1441
<211> 27
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> epitope within human TNFR2 to which antagonistic
antibodies or fragments thereof bind
<220>
<221> VARIANT
<222> (9)...(9)
<223> Xaa is Cys residue protected with ACM protecting
group
<400> 1441
Ser Lys Gln Glu Gly Cys Arg Leu Xaa Ala Pro Gly Gly Ser Gly Gly
1 5 10 15
Ala Pro Leu Arg Lys Cys Arg Pro Gly Phe Gly
20 25
<210> 1442
<211> 27
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> epitope within human TNFR2 to which antagonistic
antibodies or fragments thereof bind
<220>
<221> VARIANT
<222> (8)...(8)
<223> Xaa is Cys residue protected with ACM protecting
group
<400> 1442
Lys Gln Glu Gly Cys Arg Leu Xaa Ala Pro Leu Gly Gly Ser Gly Gly
1 5 10 15
Ala Pro Leu Arg Lys Cys Arg Pro Gly Phe Gly
20 25
<210> 1443
<211> 27
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> epitope within human TNFR2 to which antagonistic
antibodies or fragments thereof bind
<220>
<221> VARIANT
<222> (7)...(7)
<223> Xaa is Cys residue protected with ACM protecting
group
<400> 1443
Gln Glu Gly Cys Arg Leu Xaa Ala Pro Leu Arg Gly Gly Ser Gly Gly
1 5 10 15
Ala Pro Leu Arg Lys Cys Arg Pro Gly Phe Gly
20 25
<210> 1444
<211> 27
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> epitope within human TNFR2 to which antagonistic
antibodies or fragments thereof bind
<220>
<221> VARIANT
<222> (6)...(6)
<223> Xaa is Cys residue protected with ACM protecting
group
<400> 1444
Glu Gly Cys Arg Leu Xaa Ala Pro Leu Arg Lys Gly Gly Ser Gly Gly
1 5 10 15
Ala Pro Leu Arg Lys Cys Arg Pro Gly Phe Gly
20 25
<210> 1445
<211> 27
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> epitope within human TNFR2 to which antagonistic
antibodies or fragments thereof bind
<220>
<221> VARIANT
<222> (3)...(3)
<223> Xaa is Cys residue protected with ACM protecting
group
<400> 1445
Trp Tyr Xaa Ala Leu Ser Lys Gln Glu Gly Cys Gly Gly Ser Gly Gly
1 5 10 15
Pro Leu Arg Lys Cys Arg Pro Gly Phe Gly Val
20 25
<210> 1446
<211> 27
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> epitope within human TNFR2 to which antagonistic
antibodies or fragments thereof bind
<220>
<221> VARIANT
<222> (2)...(2)
<223> Xaa is Cys residue protected with ACM protecting
group
<400> 1446
Tyr Xaa Ala Leu Ser Lys Gln Glu Gly Cys Arg Gly Gly Ser Gly Gly
1 5 10 15
Pro Leu Arg Lys Cys Arg Pro Gly Phe Gly Val
20 25
<210> 1447
<211> 27
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> epitope within human TNFR2 to which antagonistic
antibodies or fragments thereof bind
<220>
<221> VARIANT
<222> (1)...(1)
<223> Xaa is Cys residue protected with ACM protecting
group
<400> 1447
Xaa Ala Leu Ser Lys Gln Glu Gly Cys Arg Leu Gly Gly Ser Gly Gly
1 5 10 15
Pro Leu Arg Lys Cys Arg Pro Gly Phe Gly Val
20 25
<210> 1448
<211> 27
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> epitope within human TNFR2 to which antagonistic
antibodies or fragments thereof bind
<220>
<221> VARIANT
<222> (11)...(11)
<223> Xaa is Cys residue protected with ACM protecting
group
<400> 1448
Ala Leu Ser Lys Gln Glu Gly Cys Arg Leu Xaa Gly Gly Ser Gly Gly
1 5 10 15
Pro Leu Arg Lys Cys Arg Pro Gly Phe Gly Val
20 25
<210> 1449
<211> 27
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> epitope within human TNFR2 to which antagonistic
antibodies or fragments thereof bind
<220>
<221> VARIANT
<222> (10)...(10)
<223> Xaa is Cys residue protected with ACM protecting
group
<400> 1449
Leu Ser Lys Gln Glu Gly Cys Arg Leu Xaa Ala Gly Gly Ser Gly Gly
1 5 10 15
Pro Leu Arg Lys Cys Arg Pro Gly Phe Gly Val
20 25
<210> 1450
<211> 27
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> epitope within human TNFR2 to which antagonistic
antibodies or fragments thereof bind
<220>
<221> VARIANT
<222> (9)...(9)
<223> Xaa is Cys residue protected with ACM protecting
group
<400> 1450
Ser Lys Gln Glu Gly Cys Arg Leu Xaa Ala Pro Gly Gly Ser Gly Gly
1 5 10 15
Pro Leu Arg Lys Cys Arg Pro Gly Phe Gly Val
20 25
<210> 1451
<211> 27
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> epitope within human TNFR2 to which antagonistic
antibodies or fragments thereof bind
<220>
<221> VARIANT
<222> (8)...(8)
<223> Xaa is Cys residue protected with ACM protecting
group
<400> 1451
Lys Gln Glu Gly Cys Arg Leu Xaa Ala Pro Leu Gly Gly Ser Gly Gly
1 5 10 15
Pro Leu Arg Lys Cys Arg Pro Gly Phe Gly Val
20 25
<210> 1452
<211> 27
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> epitope within human TNFR2 to which antagonistic
antibodies or fragments thereof bind
<220>
<221> VARIANT
<222> (7)...(7)
<223> Xaa is Cys residue protected with ACM protecting
group
<400> 1452
Gln Glu Gly Cys Arg Leu Xaa Ala Pro Leu Arg Gly Gly Ser Gly Gly
1 5 10 15
Pro Leu Arg Lys Cys Arg Pro Gly Phe Gly Val
20 25
<210> 1453
<211> 27
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> epitope within human TNFR2 to which antagonistic
antibodies or fragments thereof bind
<220>
<221> VARIANT
<222> (6)...(6)
<223> Xaa is Cys residue protected with ACM protecting
group
<400> 1453
Glu Gly Cys Arg Leu Xaa Ala Pro Leu Arg Lys Gly Gly Ser Gly Gly
1 5 10 15
Pro Leu Arg Lys Cys Arg Pro Gly Phe Gly Val
20 25
<210> 1454
<211> 27
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> epitope within human TNFR2 to which antagonistic
antibodies or fragments thereof bind
<220>
<221> VARIANT
<222> (3)...(3)
<223> Xaa is Cys residue protected with ACM protecting
group
<400> 1454
Trp Tyr Xaa Ala Leu Ser Lys Gln Glu Gly Cys Gly Gly Ser Gly Gly
1 5 10 15
Leu Arg Lys Cys Arg Pro Gly Phe Gly Val Ala
20 25
<210> 1455
<211> 27
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> epitope within human TNFR2 to which antagonistic
antibodies or fragments thereof bind
<220>
<221> VARIANT
<222> (2)...(2)
<223> Xaa is Cys residue protected with ACM protecting
group
<400> 1455
Tyr Xaa Ala Leu Ser Lys Gln Glu Gly Cys Arg Gly Gly Ser Gly Gly
1 5 10 15
Arg Lys Cys Arg Pro Gly Phe Gly Val Ala Arg
20 25
<210> 1456
<211> 27
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> epitope within human TNFR2 to which antagonistic
antibodies or fragments thereof bind
<220>
<221> VARIANT
<222> (1)...(1)
<223> Xaa is Cys residue protected with ACM protecting
group
<400> 1456
Xaa Ala Leu Ser Lys Gln Glu Gly Cys Arg Leu Gly Gly Ser Gly Gly
1 5 10 15
Arg Lys Cys Arg Pro Gly Phe Gly Val Ala Arg
20 25
<210> 1457
<211> 27
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> epitope within human TNFR2 to which antagonistic
antibodies or fragments thereof bind
<220>
<221> VARIANT
<222> (11)...(11)
<223> Xaa is Cys residue protected with ACM protecting
group
<400> 1457
Ala Leu Ser Lys Gln Glu Gly Cys Arg Leu Xaa Gly Gly Ser Gly Gly
1 5 10 15
Arg Lys Cys Arg Pro Gly Phe Gly Val Ala Arg
20 25
<210> 1458
<211> 27
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> epitope within human TNFR2 to which antagonistic
antibodies or fragments thereof bind
<220>
<221> VARIANT
<222> (10)...(10)
<223> Xaa is Cys residue protected with ACM protecting
group
<400> 1458
Leu Ser Lys Gln Glu Gly Cys Arg Leu Xaa Ala Gly Gly Ser Gly Gly
1 5 10 15
Arg Lys Cys Arg Pro Gly Phe Gly Val Ala Arg
20 25
<210> 1459
<211> 27
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> epitope within human TNFR2 to which antagonistic
antibodies or fragments thereof bind
<220>
<221> VARIANT
<222> (9)...(9)
<223> Xaa is Cys residue protected with ACM protecting
group
<400> 1459
Ser Lys Gln Glu Gly Cys Arg Leu Xaa Ala Pro Gly Gly Ser Gly Gly
1 5 10 15
Arg Lys Cys Arg Pro Gly Phe Gly Val Ala Arg
20 25
<210> 1460
<211> 27
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> epitope within human TNFR2 to which antagonistic
antibodies or fragments thereof bind
<220>
<221> VARIANT
<222> (8)...(8)
<223> Xaa is Cys residue protected with ACM protecting
group
<400> 1460
Lys Gln Glu Gly Cys Arg Leu Xaa Ala Pro Leu Gly Gly Ser Gly Gly
1 5 10 15
Arg Lys Cys Arg Pro Gly Phe Gly Val Ala Arg
20 25
<210> 1461
<211> 27
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> epitope within human TNFR2 to which antagonistic
antibodies or fragments thereof bind
<220>
<221> VARIANT
<222> (7)...(7)
<223> Xaa is Cys residue protected with ACM protecting
group
<400> 1461
Gln Glu Gly Cys Arg Leu Xaa Ala Pro Leu Arg Gly Gly Ser Gly Gly
1 5 10 15
Arg Lys Cys Arg Pro Gly Phe Gly Val Ala Arg
20 25
<210> 1462
<211> 27
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> epitope within human TNFR2 to which antagonistic
antibodies or fragments thereof bind
<220>
<221> VARIANT
<222> (6)...(6)
<223> Xaa is Cys residue protected with ACM protecting
group
<400> 1462
Glu Gly Cys Arg Leu Xaa Ala Pro Leu Arg Lys Gly Gly Ser Gly Gly
1 5 10 15
Arg Lys Cys Arg Pro Gly Phe Gly Val Ala Arg
20 25
<210> 1463
<211> 11
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> epitope within human TNFR2 to which antagonistic
antibodies or fragments thereof bind
<400> 1463
Leu Arg Lys Cys Arg Pro Gly Phe Gly Val Ala
1 5 10
<210> 1464
<211> 13
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> epitope within human TNFR2 to which antagonistic
antibodies or fragments thereof bind
<400> 1464
Val Val Cys Lys Pro Cys Ala Pro Gly Thr Phe Ser Asn
1 5 10
<210> 1465
<211> 645
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> RB242 human EGFR ECD w/ modifications T15S and
G564S (residue numbering does not include signal
peptide)
<220>
<221> SIGNAL
<222> (1)...(24)
<223> signal peptide
<220>
<221> DOMAIN
<222> (25)...(645)
<223> EGFR/HER1 extracellular domain (ECD)
<400> 1465
Met Arg Pro Ser Gly Thr Ala Gly Ala Ala Leu Leu Ala Leu Leu Ala
1 5 10 15
Ala Leu Cys Pro Ala Ser Arg Ala Leu Glu Glu Lys Lys Val Cys Gln
20 25 30
Gly Thr Ser Asn Lys Leu Ser Gln Leu Gly Thr Phe Glu Asp His Phe
35 40 45
Leu Ser Leu Gln Arg Met Phe Asn Asn Cys Glu Val Val Leu Gly Asn
50 55 60
Leu Glu Ile Thr Tyr Val Gln Arg Asn Tyr Asp Leu Ser Phe Leu Lys
65 70 75 80
Thr Ile Gln Glu Val Ala Gly Tyr Val Leu Ile Ala Leu Asn Thr Val
85 90 95
Glu Arg Ile Pro Leu Glu Asn Leu Gln Ile Ile Arg Gly Asn Met Tyr
100 105 110
Tyr Glu Asn Ser Tyr Ala Leu Ala Val Leu Ser Asn Tyr Asp Ala Asn
115 120 125
Lys Thr Gly Leu Lys Glu Leu Pro Met Arg Asn Leu Gln Glu Ile Leu
130 135 140
His Gly Ala Val Arg Phe Ser Asn Asn Pro Ala Leu Cys Asn Val Glu
145 150 155 160
Ser Ile Gln Trp Arg Asp Ile Val Ser Ser Asp Phe Leu Ser Asn Met
165 170 175
Ser Met Asp Phe Gln Asn His Leu Gly Ser Cys Gln Lys Cys Asp Pro
180 185 190
Ser Cys Pro Asn Gly Ser Cys Trp Gly Ala Gly Glu Glu Asn Cys Gln
195 200 205
Lys Leu Thr Lys Ile Ile Cys Ala Gln Gln Cys Ser Gly Arg Cys Arg
210 215 220
Gly Lys Ser Pro Ser Asp Cys Cys His Asn Gln Cys Ala Ala Gly Cys
225 230 235 240
Thr Gly Pro Arg Glu Ser Asp Cys Leu Val Cys Arg Lys Phe Arg Asp
245 250 255
Glu Ala Thr Cys Lys Asp Thr Cys Pro Pro Leu Met Leu Tyr Asn Pro
260 265 270
Thr Thr Tyr Gln Met Asp Val Asn Pro Glu Gly Lys Tyr Ser Phe Gly
275 280 285
Ala Thr Cys Val Lys Lys Cys Pro Arg Asn Tyr Val Val Thr Asp His
290 295 300
Gly Ser Cys Val Arg Ala Cys Gly Ala Asp Ser Tyr Glu Met Glu Glu
305 310 315 320
Asp Gly Val Arg Lys Cys Lys Lys Cys Glu Gly Pro Cys Arg Lys Val
325 330 335
Cys Asn Gly Ile Gly Ile Gly Glu Phe Lys Asp Ser Leu Ser Ile Asn
340 345 350
Ala Thr Asn Ile Lys His Phe Lys Asn Cys Thr Ser Ile Ser Gly Asp
355 360 365
Leu His Ile Leu Pro Val Ala Phe Arg Gly Asp Ser Phe Thr His Thr
370 375 380
Pro Pro Leu Asp Pro Gln Glu Leu Asp Ile Leu Lys Thr Val Lys Glu
385 390 395 400
Ile Thr Gly Phe Leu Leu Ile Gln Ala Trp Pro Glu Asn Arg Thr Asp
405 410 415
Leu His Ala Phe Glu Asn Leu Glu Ile Ile Arg Gly Arg Thr Lys Gln
420 425 430
His Gly Gln Phe Ser Leu Ala Val Val Ser Leu Asn Ile Thr Ser Leu
435 440 445
Gly Leu Arg Ser Leu Lys Glu Ile Ser Asp Gly Asp Val Ile Ile Ser
450 455 460
Gly Asn Lys Asn Leu Cys Tyr Ala Asn Thr Ile Asn Trp Lys Lys Leu
465 470 475 480
Phe Gly Thr Ser Gly Gln Lys Thr Lys Ile Ile Ser Asn Arg Gly Glu
485 490 495
Asn Ser Cys Lys Ala Thr Gly Gln Val Cys His Ala Leu Cys Ser Pro
500 505 510
Glu Gly Cys Trp Gly Pro Glu Pro Arg Asp Cys Val Ser Cys Arg Asn
515 520 525
Val Ser Arg Gly Arg Glu Cys Val Asp Lys Cys Lys Leu Leu Glu Gly
530 535 540
Glu Pro Arg Glu Phe Val Glu Asn Ser Glu Cys Ile Gln Cys His Pro
545 550 555 560
Glu Cys Leu Pro Gln Ala Met Asn Ile Thr Cys Thr Gly Arg Gly Pro
565 570 575
Asp Asn Cys Ile Gln Cys Ala His Tyr Ile Asp Ser Pro His Cys Val
580 585 590
Lys Thr Cys Pro Ala Gly Val Met Gly Glu Asn Asn Thr Leu Val Trp
595 600 605
Lys Tyr Ala Asp Ala Gly His Val Cys His Leu Cys His Pro Asn Cys
610 615 620
Thr Tyr Gly Cys Thr Gly Pro Gly Leu Glu Gly Cys Pro Thr Asn Gly
625 630 635 640
Pro Lys Ile Pro Ser
645
<210> 1466
<211> 621
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> RB242 human EGFR ECD (without the signal peptide),
with modifications T15S and G564S
<400> 1466
Leu Glu Glu Lys Lys Val Cys Gln Gly Thr Ser Asn Lys Leu Ser Gln
1 5 10 15
Leu Gly Thr Phe Glu Asp His Phe Leu Ser Leu Gln Arg Met Phe Asn
20 25 30
Asn Cys Glu Val Val Leu Gly Asn Leu Glu Ile Thr Tyr Val Gln Arg
35 40 45
Asn Tyr Asp Leu Ser Phe Leu Lys Thr Ile Gln Glu Val Ala Gly Tyr
50 55 60
Val Leu Ile Ala Leu Asn Thr Val Glu Arg Ile Pro Leu Glu Asn Leu
65 70 75 80
Gln Ile Ile Arg Gly Asn Met Tyr Tyr Glu Asn Ser Tyr Ala Leu Ala
85 90 95
Val Leu Ser Asn Tyr Asp Ala Asn Lys Thr Gly Leu Lys Glu Leu Pro
100 105 110
Met Arg Asn Leu Gln Glu Ile Leu His Gly Ala Val Arg Phe Ser Asn
115 120 125
Asn Pro Ala Leu Cys Asn Val Glu Ser Ile Gln Trp Arg Asp Ile Val
130 135 140
Ser Ser Asp Phe Leu Ser Asn Met Ser Met Asp Phe Gln Asn His Leu
145 150 155 160
Gly Ser Cys Gln Lys Cys Asp Pro Ser Cys Pro Asn Gly Ser Cys Trp
165 170 175
Gly Ala Gly Glu Glu Asn Cys Gln Lys Leu Thr Lys Ile Ile Cys Ala
180 185 190
Gln Gln Cys Ser Gly Arg Cys Arg Gly Lys Ser Pro Ser Asp Cys Cys
195 200 205
His Asn Gln Cys Ala Ala Gly Cys Thr Gly Pro Arg Glu Ser Asp Cys
210 215 220
Leu Val Cys Arg Lys Phe Arg Asp Glu Ala Thr Cys Lys Asp Thr Cys
225 230 235 240
Pro Pro Leu Met Leu Tyr Asn Pro Thr Thr Tyr Gln Met Asp Val Asn
245 250 255
Pro Glu Gly Lys Tyr Ser Phe Gly Ala Thr Cys Val Lys Lys Cys Pro
260 265 270
Arg Asn Tyr Val Val Thr Asp His Gly Ser Cys Val Arg Ala Cys Gly
275 280 285
Ala Asp Ser Tyr Glu Met Glu Glu Asp Gly Val Arg Lys Cys Lys Lys
290 295 300
Cys Glu Gly Pro Cys Arg Lys Val Cys Asn Gly Ile Gly Ile Gly Glu
305 310 315 320
Phe Lys Asp Ser Leu Ser Ile Asn Ala Thr Asn Ile Lys His Phe Lys
325 330 335
Asn Cys Thr Ser Ile Ser Gly Asp Leu His Ile Leu Pro Val Ala Phe
340 345 350
Arg Gly Asp Ser Phe Thr His Thr Pro Pro Leu Asp Pro Gln Glu Leu
355 360 365
Asp Ile Leu Lys Thr Val Lys Glu Ile Thr Gly Phe Leu Leu Ile Gln
370 375 380
Ala Trp Pro Glu Asn Arg Thr Asp Leu His Ala Phe Glu Asn Leu Glu
385 390 395 400
Ile Ile Arg Gly Arg Thr Lys Gln His Gly Gln Phe Ser Leu Ala Val
405 410 415
Val Ser Leu Asn Ile Thr Ser Leu Gly Leu Arg Ser Leu Lys Glu Ile
420 425 430
Ser Asp Gly Asp Val Ile Ile Ser Gly Asn Lys Asn Leu Cys Tyr Ala
435 440 445
Asn Thr Ile Asn Trp Lys Lys Leu Phe Gly Thr Ser Gly Gln Lys Thr
450 455 460
Lys Ile Ile Ser Asn Arg Gly Glu Asn Ser Cys Lys Ala Thr Gly Gln
465 470 475 480
Val Cys His Ala Leu Cys Ser Pro Glu Gly Cys Trp Gly Pro Glu Pro
485 490 495
Arg Asp Cys Val Ser Cys Arg Asn Val Ser Arg Gly Arg Glu Cys Val
500 505 510
Asp Lys Cys Lys Leu Leu Glu Gly Glu Pro Arg Glu Phe Val Glu Asn
515 520 525
Ser Glu Cys Ile Gln Cys His Pro Glu Cys Leu Pro Gln Ala Met Asn
530 535 540
Ile Thr Cys Thr Gly Arg Gly Pro Asp Asn Cys Ile Gln Cys Ala His
545 550 555 560
Tyr Ile Asp Ser Pro His Cys Val Lys Thr Cys Pro Ala Gly Val Met
565 570 575
Gly Glu Asn Asn Thr Leu Val Trp Lys Tyr Ala Asp Ala Gly His Val
580 585 590
Cys His Leu Cys His Pro Asn Cys Thr Tyr Gly Cys Thr Gly Pro Gly
595 600 605
Leu Glu Gly Cys Pro Thr Asn Gly Pro Lys Ile Pro Ser
610 615 620
<210> 1467
<211> 643
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> RB242 human HER3 ECD with modification Y246A
(residue numbering does not include signal
peptide)
<220>
<221> SIGNAL
<222> (1)...(19)
<223> signal peptide
<220>
<221> DOMAIN
<222> (20)...(643)
<223> HER3 extracellular domain (ECD)
<400> 1467
Met Arg Ala Asn Asp Ala Leu Gln Val Leu Gly Leu Leu Phe Ser Leu
1 5 10 15
Ala Arg Gly Ser Glu Val Gly Asn Ser Gln Ala Val Cys Pro Gly Thr
20 25 30
Leu Asn Gly Leu Ser Val Thr Gly Asp Ala Glu Asn Gln Tyr Gln Thr
35 40 45
Leu Tyr Lys Leu Tyr Glu Arg Cys Glu Val Val Met Gly Asn Leu Glu
50 55 60
Ile Val Leu Thr Gly His Asn Ala Asp Leu Ser Phe Leu Gln Trp Ile
65 70 75 80
Arg Glu Val Thr Gly Tyr Val Leu Val Ala Met Asn Glu Phe Ser Thr
85 90 95
Leu Pro Leu Pro Asn Leu Arg Val Val Arg Gly Thr Gln Val Tyr Asp
100 105 110
Gly Lys Phe Ala Ile Phe Val Met Leu Asn Tyr Asn Thr Asn Ser Ser
115 120 125
His Ala Leu Arg Gln Leu Arg Leu Thr Gln Leu Thr Glu Ile Leu Ser
130 135 140
Gly Gly Val Tyr Ile Glu Lys Asn Asp Lys Leu Cys His Met Asp Thr
145 150 155 160
Ile Asp Trp Arg Asp Ile Val Arg Asp Arg Asp Ala Glu Ile Val Val
165 170 175
Lys Asp Asn Gly Arg Ser Cys Pro Pro Cys His Glu Val Cys Lys Gly
180 185 190
Arg Cys Trp Gly Pro Gly Ser Glu Asp Cys Gln Thr Leu Thr Lys Thr
195 200 205
Ile Cys Ala Pro Gln Cys Asn Gly His Cys Phe Gly Pro Asn Pro Asn
210 215 220
Gln Cys Cys His Asp Glu Cys Ala Gly Gly Cys Ser Gly Pro Gln Asp
225 230 235 240
Thr Asp Cys Phe Ala Cys Arg His Phe Asn Asp Ser Gly Ala Cys Val
245 250 255
Pro Arg Cys Pro Gln Pro Leu Val Ala Asn Lys Leu Thr Phe Gln Leu
260 265 270
Glu Pro Asn Pro His Thr Lys Tyr Gln Tyr Gly Gly Val Cys Val Ala
275 280 285
Ser Cys Pro His Asn Phe Val Val Asp Gln Thr Ser Cys Val Arg Ala
290 295 300
Cys Pro Pro Asp Lys Met Glu Val Asp Lys Asn Gly Leu Lys Met Cys
305 310 315 320
Glu Pro Cys Gly Gly Leu Cys Pro Lys Ala Cys Glu Gly Thr Gly Ser
325 330 335
Gly Ser Arg Phe Gln Thr Val Asp Ser Ser Asn Ile Asp Gly Phe Val
340 345 350
Asn Cys Thr Lys Ile Leu Gly Asn Leu Asp Phe Leu Ile Thr Gly Leu
355 360 365
Asn Gly Asp Pro Trp His Lys Ile Pro Ala Leu Asp Pro Glu Lys Leu
370 375 380
Asn Val Phe Arg Thr Val Arg Glu Ile Thr Gly Tyr Leu Asn Ile Gln
385 390 395 400
Ser Trp Pro Pro His Met His Asn Phe Ser Val Phe Ser Asn Leu Thr
405 410 415
Thr Ile Gly Gly Arg Ser Leu Tyr Asn Arg Gly Phe Ser Leu Leu Ile
420 425 430
Met Lys Asn Leu Asn Val Thr Ser Leu Gly Phe Arg Ser Leu Lys Glu
435 440 445
Ile Ser Ala Gly Arg Ile Tyr Ile Ser Ala Asn Arg Gln Leu Cys Tyr
450 455 460
His His Ser Leu Asn Trp Thr Lys Val Leu Arg Gly Pro Thr Glu Glu
465 470 475 480
Arg Leu Asp Ile Lys His Asn Arg Pro Arg Arg Asp Cys Val Ala Glu
485 490 495
Gly Lys Val Cys Asp Pro Leu Cys Ser Ser Gly Gly Cys Trp Gly Pro
500 505 510
Gly Pro Gly Gln Cys Leu Ser Cys Arg Asn Tyr Ser Arg Gly Gly Val
515 520 525
Cys Val Thr His Cys Asn Phe Leu Asn Gly Glu Pro Arg Glu Phe Ala
530 535 540
His Glu Ala Glu Cys Phe Ser Cys His Pro Glu Cys Gln Pro Met Glu
545 550 555 560
Gly Thr Ala Thr Cys Asn Gly Ser Gly Ser Asp Thr Cys Ala Gln Cys
565 570 575
Ala His Phe Arg Asp Gly Pro His Cys Val Ser Ser Cys Pro His Gly
580 585 590
Val Leu Gly Ala Lys Gly Pro Ile Tyr Lys Tyr Pro Asp Val Gln Asn
595 600 605
Glu Cys Arg Pro Cys His Glu Asn Cys Thr Gln Gly Cys Lys Gly Pro
610 615 620
Glu Leu Gln Asp Cys Leu Gly Gln Thr Leu Val Leu Ile Gly Lys Thr
625 630 635 640
His Leu Thr
<210> 1468
<211> 624
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> RB242 human HER3 ECD (without signal peptide),
with modification Y246A
<400> 1468
Ser Glu Val Gly Asn Ser Gln Ala Val Cys Pro Gly Thr Leu Asn Gly
1 5 10 15
Leu Ser Val Thr Gly Asp Ala Glu Asn Gln Tyr Gln Thr Leu Tyr Lys
20 25 30
Leu Tyr Glu Arg Cys Glu Val Val Met Gly Asn Leu Glu Ile Val Leu
35 40 45
Thr Gly His Asn Ala Asp Leu Ser Phe Leu Gln Trp Ile Arg Glu Val
50 55 60
Thr Gly Tyr Val Leu Val Ala Met Asn Glu Phe Ser Thr Leu Pro Leu
65 70 75 80
Pro Asn Leu Arg Val Val Arg Gly Thr Gln Val Tyr Asp Gly Lys Phe
85 90 95
Ala Ile Phe Val Met Leu Asn Tyr Asn Thr Asn Ser Ser His Ala Leu
100 105 110
Arg Gln Leu Arg Leu Thr Gln Leu Thr Glu Ile Leu Ser Gly Gly Val
115 120 125
Tyr Ile Glu Lys Asn Asp Lys Leu Cys His Met Asp Thr Ile Asp Trp
130 135 140
Arg Asp Ile Val Arg Asp Arg Asp Ala Glu Ile Val Val Lys Asp Asn
145 150 155 160
Gly Arg Ser Cys Pro Pro Cys His Glu Val Cys Lys Gly Arg Cys Trp
165 170 175
Gly Pro Gly Ser Glu Asp Cys Gln Thr Leu Thr Lys Thr Ile Cys Ala
180 185 190
Pro Gln Cys Asn Gly His Cys Phe Gly Pro Asn Pro Asn Gln Cys Cys
195 200 205
His Asp Glu Cys Ala Gly Gly Cys Ser Gly Pro Gln Asp Thr Asp Cys
210 215 220
Phe Ala Cys Arg His Phe Asn Asp Ser Gly Ala Cys Val Pro Arg Cys
225 230 235 240
Pro Gln Pro Leu Val Ala Asn Lys Leu Thr Phe Gln Leu Glu Pro Asn
245 250 255
Pro His Thr Lys Tyr Gln Tyr Gly Gly Val Cys Val Ala Ser Cys Pro
260 265 270
His Asn Phe Val Val Asp Gln Thr Ser Cys Val Arg Ala Cys Pro Pro
275 280 285
Asp Lys Met Glu Val Asp Lys Asn Gly Leu Lys Met Cys Glu Pro Cys
290 295 300
Gly Gly Leu Cys Pro Lys Ala Cys Glu Gly Thr Gly Ser Gly Ser Arg
305 310 315 320
Phe Gln Thr Val Asp Ser Ser Asn Ile Asp Gly Phe Val Asn Cys Thr
325 330 335
Lys Ile Leu Gly Asn Leu Asp Phe Leu Ile Thr Gly Leu Asn Gly Asp
340 345 350
Pro Trp His Lys Ile Pro Ala Leu Asp Pro Glu Lys Leu Asn Val Phe
355 360 365
Arg Thr Val Arg Glu Ile Thr Gly Tyr Leu Asn Ile Gln Ser Trp Pro
370 375 380
Pro His Met His Asn Phe Ser Val Phe Ser Asn Leu Thr Thr Ile Gly
385 390 395 400
Gly Arg Ser Leu Tyr Asn Arg Gly Phe Ser Leu Leu Ile Met Lys Asn
405 410 415
Leu Asn Val Thr Ser Leu Gly Phe Arg Ser Leu Lys Glu Ile Ser Ala
420 425 430
Gly Arg Ile Tyr Ile Ser Ala Asn Arg Gln Leu Cys Tyr His His Ser
435 440 445
Leu Asn Trp Thr Lys Val Leu Arg Gly Pro Thr Glu Glu Arg Leu Asp
450 455 460
Ile Lys His Asn Arg Pro Arg Arg Asp Cys Val Ala Glu Gly Lys Val
465 470 475 480
Cys Asp Pro Leu Cys Ser Ser Gly Gly Cys Trp Gly Pro Gly Pro Gly
485 490 495
Gln Cys Leu Ser Cys Arg Asn Tyr Ser Arg Gly Gly Val Cys Val Thr
500 505 510
His Cys Asn Phe Leu Asn Gly Glu Pro Arg Glu Phe Ala His Glu Ala
515 520 525
Glu Cys Phe Ser Cys His Pro Glu Cys Gln Pro Met Glu Gly Thr Ala
530 535 540
Thr Cys Asn Gly Ser Gly Ser Asp Thr Cys Ala Gln Cys Ala His Phe
545 550 555 560
Arg Asp Gly Pro His Cys Val Ser Ser Cys Pro His Gly Val Leu Gly
565 570 575
Ala Lys Gly Pro Ile Tyr Lys Tyr Pro Asp Val Gln Asn Glu Cys Arg
580 585 590
Pro Cys His Glu Asn Cys Thr Gln Gly Cys Lys Gly Pro Glu Leu Gln
595 600 605
Asp Cys Leu Gly Gln Thr Leu Val Leu Ile Gly Lys Thr His Leu Thr
610 615 620
<210> 1469
<211> 227
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Human IgG1 Fc with knob mutations S354C and T366W
(by EU numbering)
<220>
<221> SITE
<222> (1)...(10)
<223> DKTHTCPPCP = portion of hinge region of human IgG1
<220>
<221> DOMAIN
<222> (11)...(227)
<223> CH2 and CH3 domains of human IgG1
<400> 1469
Asp Lys Thr His Thr Cys Pro Pro Cys Pro Ala Pro Glu Leu Leu Gly
1 5 10 15
Gly Pro Ser Val Phe Leu Phe Pro Pro Lys Pro Lys Asp Thr Leu Met
20 25 30
Ile Ser Arg Thr Pro Glu Val Thr Cys Val Val Val Asp Val Ser His
35 40 45
Glu Asp Pro Glu Val Lys Phe Asn Trp Tyr Val Asp Gly Val Glu Val
50 55 60
His Asn Ala Lys Thr Lys Pro Arg Glu Glu Gln Tyr Asn Ser Thr Tyr
65 70 75 80
Arg Val Val Ser Val Leu Thr Val Leu His Gln Asp Trp Leu Asn Gly
85 90 95
Lys Glu Tyr Lys Cys Lys Val Ser Asn Lys Ala Leu Pro Ala Pro Ile
100 105 110
Glu Lys Thr Ile Ser Lys Ala Lys Gly Gln Pro Arg Glu Pro Gln Val
115 120 125
Tyr Thr Leu Pro Pro Cys Arg Asp Glu Leu Thr Lys Asn Gln Val Ser
130 135 140
Leu Trp Cys Leu Val Lys Gly Phe Tyr Pro Ser Asp Ile Ala Val Glu
145 150 155 160
Trp Glu Ser Asn Gly Gln Pro Glu Asn Asn Tyr Lys Thr Thr Pro Pro
165 170 175
Val Leu Asp Ser Asp Gly Ser Phe Phe Leu Tyr Ser Lys Leu Thr Val
180 185 190
Asp Lys Ser Arg Trp Gln Gln Gly Asn Val Phe Ser Cys Ser Val Met
195 200 205
His Glu Ala Leu His Asn His Tyr Thr Gln Lys Ser Leu Ser Leu Ser
210 215 220
Pro Gly Lys
225
<210> 1470
<211> 227
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Human IgG1 Fc with hole mutations Y349C, T366S,
L368A and Y407V (by EU numbering)
<220>
<221> SITE
<222> (1)...(10)
<223> DKTHTCPPCP = portion of hinge region of human IgG1
<220>
<221> DOMAIN
<222> (11)...(227)
<223> CH2 and CH3 domains of human IgG1
<400> 1470
Asp Lys Thr His Thr Cys Pro Pro Cys Pro Ala Pro Glu Leu Leu Gly
1 5 10 15
Gly Pro Ser Val Phe Leu Phe Pro Pro Lys Pro Lys Asp Thr Leu Met
20 25 30
Ile Ser Arg Thr Pro Glu Val Thr Cys Val Val Val Asp Val Ser His
35 40 45
Glu Asp Pro Glu Val Lys Phe Asn Trp Tyr Val Asp Gly Val Glu Val
50 55 60
His Asn Ala Lys Thr Lys Pro Arg Glu Glu Gln Tyr Asn Ser Thr Tyr
65 70 75 80
Arg Val Val Ser Val Leu Thr Val Leu His Gln Asp Trp Leu Asn Gly
85 90 95
Lys Glu Tyr Lys Cys Lys Val Ser Asn Lys Ala Leu Pro Ala Pro Ile
100 105 110
Glu Lys Thr Ile Ser Lys Ala Lys Gly Gln Pro Arg Glu Pro Gln Val
115 120 125
Cys Thr Leu Pro Pro Ser Arg Asp Glu Leu Thr Lys Asn Gln Val Ser
130 135 140
Leu Ser Cys Ala Val Lys Gly Phe Tyr Pro Ser Asp Ile Ala Val Glu
145 150 155 160
Trp Glu Ser Asn Gly Gln Pro Glu Asn Asn Tyr Lys Thr Thr Pro Pro
165 170 175
Val Leu Asp Ser Asp Gly Ser Phe Phe Leu Val Ser Lys Leu Thr Val
180 185 190
Asp Lys Ser Arg Trp Gln Gln Gly Asn Val Phe Ser Cys Ser Val Met
195 200 205
His Glu Ala Leu His Asn His Tyr Thr Gln Lys Ser Leu Ser Leu Ser
210 215 220
Pro Gly Lys
225
<210> 1471
<211> 5
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> GS linker
<220>
<221> REPEAT
<222> (1)...(5)
<223> occurring 1, 2, 3, 4 or 5 times
<400> 1471
Gly Gly Gly Gly Ser
1 5
<210> 1472
<211> 5
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> GS linker
<220>
<221> REPEAT
<222> (1)...(5)
<223> occurring 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9 or 10 times
<400> 1472
Gly Gly Gly Gly Ser
1 5
<210> 1473
<211> 6
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Gly linker
<400> 1473
Gly Gly Gly Gly Gly Gly
1 5
<210> 1474
<211> 8
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Gly linker
<400> 1474
Gly Gly Gly Gly Gly Gly Gly Gly
1 5
<210> 1475
<211> 732
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Construct containing Vhh-4
<220>
<221> SIGNAL
<222> (1)...(19)
<223> mouse immunoglobulin heavy-chain leader sequence
<220>
<221> DOMAIN
<222> (20)...(138)
<223> anti-TNFR1 dAb
<220>
<221> PEPTIDE
<222> (139)...(147)
<223> Linker
<220>
<221> DOMAIN
<222> (148)...(732)
<223> Human Serum Albumin (HSA)
<400> 1475
Met Glu Trp Ser Trp Val Phe Leu Phe Phe Leu Ser Val Thr Thr Gly
1 5 10 15
Val His Ser Glu Val Gln Leu Leu Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln
20 25 30
Pro Gly Gly Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe
35 40 45
Ala His Glu Thr Met Val Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu
50 55 60
Glu Trp Val Ser His Ile Pro Pro Asp Gly Gln Asp Pro Phe Tyr Ala
65 70 75 80
Asp Ser Val Lys Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Ser Lys Asn
85 90 95
Thr Leu Tyr Leu Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Val
100 105 110
Tyr His Cys Ala Leu Leu Pro Lys Arg Gly Pro Trp Phe Asp Tyr Trp
115 120 125
Gly Gln Gly Thr Leu Val Thr Val Ser Ser Gly Gly Gly Gly Ser Gly
130 135 140
Gly Gly Gly Asp Ala His Lys Ser Glu Val Ala His Arg Phe Lys Asp
145 150 155 160
Leu Gly Glu Glu Asn Phe Lys Ala Leu Val Leu Ile Ala Phe Ala Gln
165 170 175
Tyr Leu Gln Gln Cys Pro Phe Glu Asp His Val Lys Leu Val Asn Glu
180 185 190
Val Thr Glu Phe Ala Lys Thr Cys Val Ala Asp Glu Ser Ala Glu Asn
195 200 205
Cys Asp Lys Ser Leu His Thr Leu Phe Gly Asp Lys Leu Cys Thr Val
210 215 220
Ala Thr Leu Arg Glu Thr Tyr Gly Glu Met Ala Asp Cys Cys Ala Lys
225 230 235 240
Gln Glu Pro Glu Arg Asn Glu Cys Phe Leu Gln His Lys Asp Asp Asn
245 250 255
Pro Asn Leu Pro Arg Leu Val Arg Pro Glu Val Asp Val Met Cys Thr
260 265 270
Ala Phe His Asp Asn Glu Glu Thr Phe Leu Lys Lys Tyr Leu Tyr Glu
275 280 285
Ile Ala Arg Arg His Pro Tyr Phe Tyr Ala Pro Glu Leu Leu Phe Phe
290 295 300
Ala Lys Arg Tyr Lys Ala Ala Phe Thr Glu Cys Cys Gln Ala Ala Asp
305 310 315 320
Lys Ala Ala Cys Leu Leu Pro Lys Leu Asp Glu Leu Arg Asp Glu Gly
325 330 335
Lys Ala Ser Ser Ala Lys Gln Arg Leu Lys Cys Ala Ser Leu Gln Lys
340 345 350
Phe Gly Glu Arg Ala Phe Lys Ala Trp Ala Val Ala Arg Leu Ser Gln
355 360 365
Arg Phe Pro Lys Ala Glu Phe Ala Glu Val Ser Lys Leu Val Thr Asp
370 375 380
Leu Thr Lys Val His Thr Glu Cys Cys His Gly Asp Leu Leu Glu Cys
385 390 395 400
Ala Asp Asp Arg Ala Asp Leu Ala Lys Tyr Ile Cys Glu Asn Gln Asp
405 410 415
Ser Ile Ser Ser Lys Leu Lys Glu Cys Cys Glu Lys Pro Leu Leu Glu
420 425 430
Lys Ser His Cys Ile Ala Glu Val Glu Asn Asp Glu Met Pro Ala Asp
435 440 445
Leu Pro Ser Leu Ala Ala Asp Phe Val Glu Ser Lys Asp Val Cys Lys
450 455 460
Asn Tyr Ala Glu Ala Lys Asp Val Phe Leu Gly Met Phe Leu Tyr Glu
465 470 475 480
Tyr Ala Arg Arg His Pro Asp Tyr Ser Val Val Leu Leu Leu Arg Leu
485 490 495
Ala Lys Thr Tyr Glu Thr Thr Leu Glu Lys Cys Cys Ala Ala Ala Asp
500 505 510
Pro His Glu Cys Tyr Ala Lys Val Phe Asp Glu Phe Lys Pro Leu Val
515 520 525
Glu Glu Pro Gln Asn Leu Ile Lys Gln Asn Cys Glu Leu Phe Glu Gln
530 535 540
Leu Gly Glu Tyr Lys Phe Gln Asn Ala Leu Leu Val Arg Tyr Thr Lys
545 550 555 560
Lys Val Pro Gln Val Ser Thr Pro Thr Leu Val Glu Val Ser Arg Asn
565 570 575
Leu Gly Lys Val Gly Ser Lys Cys Cys Lys His Pro Glu Ala Lys Arg
580 585 590
Met Pro Cys Ala Glu Asp Tyr Leu Ser Val Val Leu Asn Gln Leu Cys
595 600 605
Val Leu His Glu Lys Thr Pro Val Ser Asp Arg Val Thr Lys Cys Cys
610 615 620
Thr Glu Ser Leu Val Asn Arg Arg Pro Cys Phe Ser Ala Leu Glu Val
625 630 635 640
Asp Glu Thr Tyr Val Pro Lys Glu Phe Asn Ala Glu Thr Phe Thr Phe
645 650 655
His Ala Asp Ile Cys Thr Leu Ser Glu Lys Glu Arg Gln Ile Lys Lys
660 665 670
Gln Thr Ala Leu Val Glu Leu Val Lys His Lys Pro Lys Ala Thr Lys
675 680 685
Glu Gln Leu Lys Ala Val Met Asp Asp Phe Ala Ala Phe Val Glu Lys
690 695 700
Cys Cys Lys Ala Asp Asp Lys Glu Thr Cys Phe Ala Glu Glu Gly Lys
705 710 715 720
Lys Leu Val Ala Ala Ser Gln Ala Ala Leu Gly Leu
725 730
<210> 1476
<211> 19
<212> PRT
<213> Mus musculus
<220>
<223> mouse immunoglobulin heavy-chain leader sequence
Uniprot: A0N1R4
<400> 1476
Met Glu Trp Ser Trp Val Phe Leu Phe Phe Leu Ser Val Thr Thr Gly
5 10 15
Val His Ser
<210> 1477
<211> 7
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Linker
<400> 1477
Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly
1 5
<210> 1478
<211> 116
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Vhh-2
<400> 1478
Glu Val Gln Leu Leu Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly Gly
1 5 10 15
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Ser Gln Tyr
20 25 30
Arg Met His Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Ser Leu Glu Trp Val
35 40 45
Ser Ser Ile Asp Thr Arg Gly Ser Ser Thr Tyr Tyr Ala Asp Pro Val
50 55 60
Lys Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Ser Lys Asn Thr Leu Tyr
65 70 75 80
Leu Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys
85 90 95
Ala Lys Ala Val Thr Met Phe Ser Pro Phe Phe Asp Tyr Trp Gly Gln
100 105 110
Gly Thr Leu Val
115
<210> 1479
<211> 122
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Vhh
<400> 1479
Glu Glu Val Gln Leu Leu Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Ala Gly
1 5 10 15
Gly Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Ala His
20 25 30
Glu Thr Met Val Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp
35 40 45
Val Ser His Ile Pro Pro Asp Gly Gln Asp Pro Phe Tyr Ala Asp Ser
50 55 60
Val Lys Gly Arg Phe Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Ser Lys Asn Thr
65 70 75 80
Leu Tyr Leu Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Val Tyr
85 90 95
His Cys Ala Leu Leu Pro Lys Arg Gly Pro Trp Phe Asp Tyr Trp Gly
100 105 110
Gln Gly Thr Leu Tyr Thr Val Ser Ser Ala
115 120
SEQUENCE LISTING
<110> ENOSI LIFE SCIENCES CORP.
Shepard, H. Michael
<120> Methods and Compositions to Treat
Autoimmune Diseases and Cancer
<130> 04555-5301PC
<140> PCT/US21/48074
<141> 2021-08-27
<150> 63/071,313
<151> 2020-08-27
<160> 1479
<170> FastSEQ for Windows Version 4.0
<210> 1
<211> 233
<212> PRT
<213> Homo sapiens
<220>
<223> TNF alpha (TNF)
<400> 1
Met Ser Thr Glu Ser Met Ile Arg Asp Val Glu Leu Ala Glu Glu Ala
1 5 10 15
Leu Pro Lys Lys Thr Gly Gly Pro Gln Gly Ser Arg Arg Cys Leu Phe
20 25 30
Leu Ser Leu Phe Ser Phe Leu Ile Val Ala Gly Ala Thr Thr Leu Phe
35 40 45
Cys Leu Leu His Phe Gly Val Ile Gly Pro Gln Arg Glu Glu Phe Pro
50 55 60
Arg Asp Leu Ser Leu Ile Ser Pro Leu Ala Gln Ala Val Arg Ser Ser
65 70 75 80
Ser Arg Thr Pro Ser Asp Lys Pro Val Ala His Val Val Ala Asn Pro
85 90 95
Gln Ala Glu Gly Gln Leu Gln Trp Leu Asn Arg Arg Ala Asn Ala Leu
100 105 110
Leu Ala Asn Gly Val Glu Leu Arg Asp Asn Gln Leu Val Val Pro Ser
115 120 125
Glu Gly Leu Tyr Leu Ile Tyr Ser Gln Val Leu Phe Lys Gly Gln Gly
130 135 140
Cys Pro Ser Thr His Val Leu Leu Thr His Thr Ile Ser Arg Ile Ala
145 150 155 160
Val Ser Tyr Gln Thr Lys Val Asn Leu Leu Ser Ala Ile Lys Ser Pro
165 170 175
Cys Gln Arg Glu Thr Pro Glu Gly Ala Glu Ala Lys Pro Trp Tyr Glu
180 185 190
Pro Ile Tyr Leu Gly Gly Val Phe Gln Leu Glu Lys Gly Asp Arg Leu
195 200 205
Ser Ala Glu Ile Asn Arg Pro Asp Tyr Leu Asp Phe Ala Glu Ser Gly
210 215 220
Gln Val Tyr Phe Gly Ile Ile Ala Leu
225 230
<210> 2
<211> 157
<212> PRT
<213> Homo sapiens
<220>
<223> Soluble form of TNF alpha (solTNF)
<400> 2
Val Arg Ser Ser Ser Arg Thr Pro Ser Asp Lys Pro Val Ala His Val
1 5 10 15
Val Ala Asn Pro Gln Ala Glu Gly Gln Leu Gln Trp Leu Asn Arg Arg
20 25 30
Ala Asn Ala Leu Leu Ala Asn Gly Val Glu Leu Arg Asp Asn Gln Leu
35 40 45
Val Val Pro Ser Glu Gly Leu Tyr Leu Ile Tyr Ser Gln Val Leu Phe
50 55 60
Lys Gly Gln Gly Cys Pro Ser Thr His Val Leu Leu Thr His Thr Ile
65 70 75 80
Ser Arg Ile Ala Val Ser Tyr Gln Thr Lys Val Asn Leu Leu Ser Ala
85 90 95
Ile Lys Ser Pro Cys Gln Arg Glu Thr Pro Glu Gly Ala Glu Ala Lys
100 105 110
Pro Trp Tyr Glu Pro Ile Tyr Leu Gly Gly Val Phe Gln Leu Glu Lys
115 120 125
Gly Asp Arg Leu Ser Ala Glu Ile Asn Arg Pro Asp Tyr Leu Asp Phe
130 135 140
Ala Glu Ser Gly Gln Val Tyr Phe Gly Ile Ile Ala Leu
145 150 155
<210> 3
<211> 455
<212> PRT
<213> Homo sapiens
<220>
<223> TNFR1
<400> 3
Met Gly Leu Ser Thr Val Pro Asp Leu Leu Leu Pro Leu Val Leu Leu
1 5 10 15
Glu Leu Leu Val Gly Ile Tyr Pro Ser Gly Val Ile Gly Leu Val Pro
20 25 30
His Leu Gly Asp Arg Glu Lys Arg Asp Ser Val Cys Pro Gln Gly Lys
35 40 45
Tyr Ile His Pro Gln Asn Asn Ser Ile Cys Cys Thr Lys Cys His Lys
50 55 60
Gly Thr Tyr Leu Tyr Asn Asp Cys Pro Gly Pro Gly Gln Asp Thr Asp
65 70 75 80
Cys Arg Glu Cys Glu Ser Gly Ser Phe Thr Ala Ser Glu Asn His Leu
85 90 95
Arg His Cys Leu Ser Cys Ser Lys Cys Arg Lys Glu Met Gly Gln Val
100 105 110
Glu Ile Ser Ser Cys Thr Val Asp Arg Asp Thr Val Cys Gly Cys Arg
115 120 125
Lys Asn Gln Tyr Arg His Tyr Trp Ser Glu Asn Leu Phe Gln Cys Phe
130 135 140
Asn Cys Ser Leu Cys Leu Asn Gly Thr Val His Leu Ser Cys Gln Glu
145 150 155 160
Lys Gln Asn Thr Val Cys Thr Cys His Ala Gly Phe Phe Leu Arg Glu
165 170 175
Asn Glu Cys Val Ser Cys Ser Asn Cys Lys Lys Ser Leu Glu Cys Thr
180 185 190
Lys Leu Cys Leu Pro Gln Ile Glu Asn Val Lys Gly Thr Glu Asp Ser
195 200 205
Gly Thr Thr Val Leu Leu Pro Leu Val Ile Phe Phe Gly Leu Cys Leu
210 215 220
Leu Ser Leu Leu Phe Ile Gly Leu Met Tyr Arg Tyr Gln Arg Trp Lys
225 230 235 240
Ser Lys Leu Tyr Ser Ile Val Cys Gly Lys Ser Thr Pro Glu Lys Glu
245 250 255
Gly Glu Leu Glu Gly Thr Thr Thr Lys Pro Leu Ala Pro Asn Pro Ser
260 265 270
Phe Ser Pro Thr Pro Gly Phe Thr Pro Thr Leu Gly Phe Ser Pro Val
275 280 285
Pro Ser Ser Thr Phe Thr Ser Ser Ser Thr Tyr Thr Pro Gly Asp Cys
290 295 300
Pro Asn Phe Ala Ala Pro Arg Arg Glu Val Ala Pro Pro Tyr Gln Gly
305 310 315 320
Ala Asp Pro Ile Leu Ala Thr Ala Leu Ala Ser Asp Pro Ile Pro Asn
325 330 335
Pro Leu Gln Lys Trp Glu Asp Ser Ala His Lys Pro Gln Ser Leu Asp
340 345 350
Thr Asp Asp Pro Ala Thr Leu Tyr Ala Val Val Glu Asn Val Pro Pro
355 360 365
Leu Arg Trp Lys Glu Phe Val Arg Arg Leu Gly Leu Ser Asp His Glu
370 375 380
Ile Asp Arg Leu Glu Leu Gln Asn Gly Arg Cys Leu Arg Glu Ala Gln
385 390 395 400
Tyr Ser Met Leu Ala Thr Trp Arg Arg Arg Thr Pro Arg Arg Glu Ala
405 410 415
Thr Leu Glu Leu Leu Gly Arg Val Leu Arg Asp Met Asp Leu Leu Gly
420 425 430
Cys Leu Glu Asp Ile Glu Glu Ala Leu Cys Gly Pro Ala Ala Leu Pro
435 440 445
Pro Ala Pro Ser Leu Leu Arg
450 455
<210> 4
<211> 461
<212> PRT
<213> Homo sapiens
<220>
<223> TNFR2
<400> 4
Met Ala Pro Val Ala Val Trp Ala Ala Leu Ala Val Gly Leu Glu Leu
1 5 10 15
Trp Ala Ala Ala His Ala Leu Pro Ala Gln Val Ala Phe Thr Pro Tyr
20 25 30
Ala Pro Glu Pro Gly Ser Thr Cys Arg Leu Arg Glu Tyr Tyr Asp Gln
35 40 45
Thr Ala Gln Met Cys Cys Ser Lys Cys Ser Pro Gly Gln His Ala Lys
50 55 60
Val Phe Cys Thr Lys Thr Ser Asp Thr Val Cys Asp Ser Cys Glu Asp
65 70 75 80
Ser Thr Tyr Thr Gln Leu Trp Asn Trp Val Pro Glu Cys Leu Ser Cys
85 90 95
Gly Ser Arg Cys Ser Ser Asp Gln Val Glu Thr Gln Ala Cys Thr Arg
100 105 110
Glu Gln Asn Arg Ile Cys Thr Cys Arg Pro Gly Trp Tyr Cys Ala Leu
115 120 125
Ser Lys Gln Glu Gly Cys Arg Leu Cys Ala Pro Leu Arg Lys Cys Arg
130 135 140
Pro Gly Phe Gly Val Ala Arg Pro Gly Thr Glu Thr Ser Asp Val Val
145 150 155 160
Cys Lys Pro Cys Ala Pro Gly Thr Phe Ser Asn Thr Thr Ser Ser Thr
165 170 175
Asp Ile Cys Arg Pro His Gln Ile Cys Asn Val Val Ala Ile Pro Gly
180 185 190
Asn Ala Ser Met Asp Ala Val Cys Thr Ser Thr Ser Pro Thr Arg Ser
195 200 205
Met Ala Pro Gly Ala Val His Leu Pro Gln Pro Val Ser Thr Arg Ser
210 215 220
Gln His Thr Gln Pro Thr Pro Glu Pro Ser Thr Ala Pro Ser Thr Ser
225 230 235 240
Phe Leu Leu Pro Met Gly Pro Ser Pro Pro Ala Glu Gly Ser Thr Gly
245 250 255
Asp Phe Ala Leu Pro Val Gly Leu Ile Val Gly Val Thr Ala Leu Gly
260 265 270
Leu Leu Ile Ile Gly Val Val Asn Cys Val Ile Met Thr Gln Val Lys
275 280 285
Lys Lys Pro Leu Cys Leu Gln Arg Glu Ala Lys Val Pro His Leu Pro
290 295 300
Ala Asp Lys Ala Arg Gly Thr Gln Gly Pro Glu Gln Gln His Leu Leu
305 310 315 320
Ile Thr Ala Pro Ser Ser Ser Ser Ser Ser Ser Leu Glu Ser Ser Ala Ser
325 330 335
Ala Leu Asp Arg Arg Ala Pro Thr Arg Asn Gln Pro Gln Ala Pro Gly
340 345 350
Val Glu Ala Ser Gly Ala Gly Glu Ala Arg Ala Ser Thr Gly Ser Ser
355 360 365
Asp Ser Ser Pro Gly Gly His Gly Thr Gln Val Asn Val Thr Cys Ile
370 375 380
Val Asn Val Cys Ser Ser Ser Asp His Ser Ser Gln Cys Ser Ser Gln
385 390 395 400
Ala Ser Ser Thr Met Gly Asp Thr Asp Ser Ser Pro Ser Glu Ser Pro
405 410 415
Lys Asp Glu Gln Val Pro Phe Ser Lys Glu Glu Cys Ala Phe Arg Ser
420 425 430
Gln Leu Glu Thr Pro Glu Thr Leu Leu Gly Ser Thr Glu Glu Lys Pro
435 440 445
Leu Pro Leu Gly Val Pro Asp Ala Gly Met Lys Pro Ser
450 455 460
<210> 5
<211> 235
<212> PRT
213 <213>
<220>
<223> Mouse TNF alpha (TNF)
<400> 5
Met Ser Thr Glu Ser Met Ile Arg Asp Val Glu Leu Ala Glu Glu Ala
1 5 10 15
Leu Pro Gln Lys Met Gly Gly Phe Gln Asn Ser Arg Arg Cys Leu Cys
20 25 30
Leu Ser Leu Phe Ser Phe Leu Leu Val Ala Gly Ala Thr Thr Leu Phe
35 40 45
Cys Leu Leu Asn Phe Gly Val Ile Gly Pro Gln Arg Asp Glu Lys Phe
50 55 60
Pro Asn Gly Leu Pro Leu Ile Ser Ser Met Ala Gln Thr Leu Thr Leu
65 70 75 80
Arg Ser Ser Ser Gln Asn Ser Ser Asp Lys Pro Val Ala His Val Val
85 90 95
Ala Asn His Gln Val Glu Glu Gln Leu Glu Trp Leu Ser Gln Arg Ala
100 105 110
Asn Ala Leu Leu Ala Asn Gly Met Asp Leu Lys Asp Asn Gln Leu Val
115 120 125
Val Pro Ala Asp Gly Leu Tyr Leu Val Tyr Ser Gln Val Leu Phe Lys
130 135 140
Gly Gln Gly Cys Pro Asp Tyr Val Leu Leu Thr His Thr Val Ser Arg
145 150 155 160
Phe Ala Ile Ser Tyr Gln Glu Lys Val Asn Leu Leu Ser Ala Val Lys
165 170 175
Ser Pro Cys Pro Lys Asp Thr Pro Glu Gly Ala Glu Leu Lys Pro Trp
180 185 190
Tyr Glu Pro Ile Tyr Leu Gly Gly Val Phe Gln Leu Glu Lys Gly Asp
195 200 205
Gln Leu Ser Ala Glu Val Asn Leu Pro Lys Tyr Leu Asp Phe Ala Glu
210 215 220
Ser Gly Gln Val Tyr Phe Gly Val Ile Ala Leu
225 230 235
<210> 6
<211> 156
<212> PRT
213 <213>
<220>
<223> Soluble form of mouse TNF alpha (TNF)
<400> 6
Leu Arg Ser Ser Ser Gln Asn Ser Ser Asp Lys Pro Val Ala His Val
1 5 10 15
Val Ala Asn His Gln Val Glu Glu Gln Leu Glu Trp Leu Ser Gln Arg
20 25 30
Ala Asn Ala Leu Leu Ala Asn Gly Met Asp Leu Lys Asp Asn Gln Leu
35 40 45
Val Val Pro Ala Asp Gly Leu Tyr Leu Val Tyr Ser Gln Val Leu Phe
50 55 60
Lys Gly Gln Gly Cys Pro Asp Tyr Val Leu Leu Thr His Thr Val Ser
65 70 75 80
Arg Phe Ala Ile Ser Tyr Gln Glu Lys Val Asn Leu Leu Ser Ala Val
85 90 95
Lys Ser Pro Cys Pro Lys Asp Thr Pro Glu Gly Ala Glu Leu Lys Pro
100 105 110
Trp Tyr Glu Pro Ile Tyr Leu Gly Gly Val Phe Gln Leu Glu Lys Gly
115 120 125
Asp Gln Leu Ser Ala Glu Val Asn Leu Pro Lys Tyr Leu Asp Phe Ala
130 135 140
Glu Ser Gly Gln Val Tyr Phe Gly Val Ile Ala Leu
145 150 155
<210> 7
<211> 454
<212> PRT
213 <213>
<220>
<223> Mouse TNFR1
<400> 7
Met Gly Leu Pro Thr Val Pro Gly Leu Leu Leu Ser Leu Val Leu Leu
1 5 10 15
Ala Leu Leu Met Gly Ile His Pro Ser Gly Val Thr Gly Leu Val Pro
20 25 30
Ser Leu Gly Asp Arg Glu Lys Arg Asp Ser Leu Cys Pro Gln Gly Lys
35 40 45
Tyr Val His Ser Lys Asn Asn Ser Ile Cys Cys Thr Lys Cys His Lys
50 55 60
Gly Thr Tyr Leu Val Ser Asp Cys Pro Ser Pro Gly Arg Asp Thr Val
65 70 75 80
Cys Arg Glu Cys Glu Lys Gly Thr Phe Thr Ala Ser Gln Asn Tyr Leu
85 90 95
Arg Gln Cys Leu Ser Cys Lys Thr Cys Arg Lys Glu Met Ser Gln Val
100 105 110
Glu Ile Ser Pro Cys Gln Ala Asp Lys Asp Thr Val Cys Gly Cys Lys
115 120 125
Glu Asn Gln Phe Gln Arg Tyr Leu Ser Glu Thr His Phe Gln Cys Val
130 135 140
Asp Cys Ser Pro Cys Phe Asn Gly Thr Val Thr Ile Pro Cys Lys Glu
145 150 155 160
Thr Gln Asn Thr Val Cys Asn Cys His Ala Gly Phe Phe Leu Arg Glu
165 170 175
Ser Glu Cys Val Pro Cys Ser His Cys Lys Lys Asn Glu Glu Cys Met
180 185 190
Lys Leu Cys Leu Pro Pro Pro Leu Ala Asn Val Thr Asn Pro Gln Asp
195 200 205
Ser Gly Thr Ala Val Leu Leu Pro Leu Val Ile Leu Leu Gly Leu Cys
210 215 220
Leu Leu Ser Phe Ile Phe Ile Ser Leu Met Cys Arg Tyr Pro Arg Trp
225 230 235 240
Arg Pro Glu Val Tyr Ser Ile Ile Cys Arg Asp Pro Val Pro Val Lys
245 250 255
Glu Glu Lys Ala Gly Lys Pro Leu Thr Pro Ala Pro Ser Pro Ala Phe
260 265 270
Ser Pro Thr Ser Gly Phe Asn Pro Thr Leu Gly Phe Ser Thr Pro Gly
275 280 285
Phe Ser Ser Pro Val Ser Ser Thr Pro Ile Ser Pro Ile Phe Gly Pro
290 295 300
Ser Asn Trp His Phe Met Pro Pro Val Ser Glu Val Val Pro Thr Gln
305 310 315 320
Gly Ala Asp Pro Leu Leu Tyr Glu Ser Leu Cys Ser Val Pro Ala Pro
325 330 335
Thr Ser Val Gln Lys Trp Glu Asp Ser Ala His Pro Gln Arg Pro Asp
340 345 350
Asn Ala Asp Leu Ala Ile Leu Tyr Ala Val Val Asp Gly Val Pro Pro
355 360 365
Ala Arg Trp Lys Glu Phe Met Arg Phe Met Gly Leu Ser Glu His Glu
370 375 380
Ile Glu Arg Leu Glu Met Gln Asn Gly Arg Cys Leu Arg Glu Ala Gln
385 390 395 400
Tyr Ser Met Leu Glu Ala Trp Arg Arg Arg Thr Pro Arg His Glu Asp
405 410 415
Thr Leu Glu Val Val Gly Leu Val Leu Ser Lys Met Asn Leu Ala Gly
420 425 430
Cys Leu Glu Asn Ile Leu Glu Ala Leu Arg Asn Pro Ala Pro Ser Ser
435 440 445
Thr Thr Arg Leu Pro Arg
450
<210> 8
<211> 474
<212> PRT
213 <213>
<220>
<223> Mouse TNFR2
<400> 8
Met Ala Pro Ala Ala Leu Trp Val Ala Leu Val Phe Glu Leu Gln Leu
1 5 10 15
Trp Ala Thr Gly His Thr Val Pro Ala Gln Val Val Leu Thr Pro Tyr
20 25 30
Lys Pro Glu Pro Gly Tyr Glu Cys Gln Ile Ser Gln Glu Tyr Tyr Asp
35 40 45
Arg Lys Ala Gln Met Cys Cys Ala Lys Cys Pro Pro Gly Gln Tyr Val
50 55 60
Lys His Phe Cys Asn Lys Thr Ser Asp Thr Val Cys Ala Asp Cys Glu
65 70 75 80
Ala Ser Met Tyr Thr Gln Val Trp Asn Gln Phe Arg Thr Cys Leu Ser
85 90 95
Cys Ser Ser Ser Cys Thr Thr Asp Gln Val Glu Ile Arg Ala Cys Thr
100 105 110
Lys Gln Gln Asn Arg Val Cys Ala Cys Glu Ala Gly Arg Tyr Cys Ala
115 120 125
Leu Lys Thr His Ser Gly Ser Cys Arg Gln Cys Met Arg Leu Ser Lys
130 135 140
Cys Gly Pro Gly Phe Gly Val Ala Ser Ser Arg Ala Pro Asn Gly Asn
145 150 155 160
Val Leu Cys Lys Ala Cys Ala Pro Gly Thr Phe Ser Asp Thr Thr Ser
165 170 175
Ser Thr Asp Val Cys Arg Pro His Arg Ile Cys Ser Ile Leu Ala Ile
180 185 190
Pro Gly Asn Ala Ser Thr Asp Ala Val Cys Ala Pro Glu Ser Pro Thr
195 200 205
Leu Ser Ala Ile Pro Arg Thr Leu Tyr Val Ser Gln Pro Glu Pro Thr
210 215 220
Arg Ser Gln Pro Leu Asp Gln Glu Pro Gly Pro Ser Gln Thr Pro Ser
225 230 235 240
Ile Leu Thr Ser Leu Gly Ser Thr Pro Ile Ile Glu Gln Ser Thr Lys
245 250 255
Gly Gly Ile Ser Leu Pro Ile Gly Leu Ile Val Gly Val Thr Ser Leu
260 265 270
Gly Leu Leu Met Leu Gly Leu Val Asn Cys Ile Ile Leu Val Gln Arg
275 280 285
Lys Lys Lys Pro Ser Cys Leu Gln Arg Asp Ala Lys Val Pro His Val
290 295 300
Pro Asp Glu Lys Ser Gln Asp Ala Val Gly Leu Glu Gln Gln His Leu
305 310 315 320
Leu Thr Thr Ala Pro Ser Ser Ser Ser Ser Ser Ser Leu Glu Ser Ser Ala
325 330 335
Ser Ala Gly Asp Arg Arg Ala Pro Pro Gly Gly His Pro Gln Ala Arg
340 345 350
Val Met Ala Glu Ala Gln Gly Phe Gln Glu Ala Arg Ala Ser Ser Arg
355 360 365
Ile Ser Asp Ser Ser His Gly Ser His Gly Thr His Val Asn Val Thr
370 375 380
Cys Ile Val Asn Val Cys Ser Ser Ser Ser Asp His Ser Ser Gln Cys Ser
385 390 395 400
Ser Gln Ala Ser Ala Thr Val Gly Asp Pro Asp Ala Lys Pro Ser Ala
405 410 415
Ser Pro Lys Asp Glu Gln Val Pro Phe Ser Gln Glu Glu Cys Pro Ser
420 425 430
Gln Ser Pro Cys Glu Thr Thr Glu Thr Leu Gln Ser His Glu Lys Pro
435 440 445
Leu Pro Leu Gly Val Pro Asp Met Gly Met Lys Pro Ser Gln Ala Gly
450 455 460
Trp Phe Asp Gln Ile Ala Val Lys Val Ala
465 470
<210> 9
<211> 330
<212> PRT
<213> Homo sapiens
<220>
<223> IgG1 Heavy Chain Constant Domain
<220>
<221> DOMAIN
<222> (1)...(98)
<223> CH1
<220>
<221> DOMAIN
<222> (99)...(113)
<223> Hinge region
<220>
<221> DOMAIN
<222> (114)...(223)
<223> CH2
<220>
<221> DOMAIN
<222> (224)...(230)
<223> CH3
<400> 9
Ala Ser Thr Lys Gly Pro Ser Val Phe Pro Leu Ala Pro Ser Ser Lys
1 5 10 15
Ser Thr Ser Gly Gly Thr Ala Ala Leu Gly Cys Leu Val Lys Asp Tyr
20 25 30
Phe Pro Glu Pro Val Thr Val Ser Trp Asn Ser Gly Ala Leu Thr Ser
35 40 45
Gly Val His Thr Phe Pro Ala Val Leu Gln Ser Ser Gly Leu Tyr Ser
50 55 60
Leu Ser Ser Val Val Thr Val Pro Ser Ser Ser Leu Gly Thr Gln Thr
65 70 75 80
Tyr Ile Cys Asn Val Asn His Lys Pro Ser Asn Thr Lys Val Asp Lys
85 90 95
Lys Val Glu Pro Lys Ser Cys Asp Lys Thr His Thr Cys Pro Pro Cys
100 105 110
Pro Ala Pro Glu Leu Leu Gly Gly Pro Ser Val Phe Leu Phe Pro Pro
115 120 125
Lys Pro Lys Asp Thr Leu Met Ile Ser Arg Thr Pro Glu Val Thr Cys
130 135 140
Val Val Val Asp Val Ser His Glu Asp Pro Glu Val Lys Phe Asn Trp
145 150 155 160
Tyr Val Asp Gly Val Glu Val His Asn Ala Lys Thr Lys Pro Arg Glu
165 170 175
Glu Gln Tyr Asn Ser Thr Tyr Arg Val Val Ser Val Leu Thr Val Leu
180 185 190
His Gln Asp Trp Leu Asn Gly Lys Glu Tyr Lys Cys Lys Val Ser Asn
195 200 205
Lys Ala Leu Pro Ala Pro Ile Glu Lys Thr Ile Ser Lys Ala Lys Gly
210 215 220
Gln Pro Arg Glu Pro Gln Val Tyr Thr Leu Pro Pro Ser Arg Asp Glu
225 230 235 240
Leu Thr Lys Asn Gln Val Ser Leu Thr Cys Leu Val Lys Gly Phe Tyr
245 250 255
Pro Ser Asp Ile Ala Val Glu Trp Glu Ser Asn Gly Gln Pro Glu Asn
260 265 270
Asn Tyr Lys Thr Thr Pro Pro Val Leu Asp Ser Asp Gly Ser Phe Phe
275 280 285
Leu Tyr Ser Lys Leu Thr Val Asp Lys Ser Arg Trp Gln Gln Gly Asn
290 295 300
Val Phe Ser Cys Ser Val Met His Glu Ala Leu His Asn His Tyr Thr
305 310 315 320
Gln Lys Ser Leu Ser Leu Ser Pro Gly Lys
325 330
<210> 10
<211> 217
<212> PRT
<213> Homo sapiens
<220>
<223> IgG1 Fc (CH2 and CH3 domains)
<400> 10
Ala Pro Glu Leu Leu Gly Gly Pro Ser Val Phe Leu Phe Pro Pro Lys
1 5 10 15
Pro Lys Asp Thr Leu Met Ile Ser Arg Thr Pro Glu Val Thr Cys Val
20 25 30
Val Val Asp Val Ser His Glu Asp Pro Glu Val Lys Phe Asn Trp Tyr
35 40 45
Val Asp Gly Val Glu Val His Asn Ala Lys Thr Lys Pro Arg Glu Glu
50 55 60
Gln Tyr Asn Ser Thr Tyr Arg Val Val Ser Val Leu Thr Val Leu His
65 70 75 80
Gln Asp Trp Leu Asn Gly Lys Glu Tyr Lys Cys Lys Val Ser Asn Lys
85 90 95
Ala Leu Pro Ala Pro Ile Glu Lys Thr Ile Ser Lys Ala Lys Gly Gln
100 105 110
Pro Arg Glu Pro Gln Val Tyr Thr Leu Pro Pro Ser Arg Asp Glu Leu
115 120 125
Thr Lys Asn Gln Val Ser Leu Thr Cys Leu Val Lys Gly Phe Tyr Pro
130 135 140
Ser Asp Ile Ala Val Glu Trp Glu Ser Asn Gly Gln Pro Glu Asn Asn
145 150 155 160
Tyr Lys Thr Thr Pro Pro Val Leu Asp Ser Asp Gly Ser Phe Phe Leu
165 170 175
Tyr Ser Lys Leu Thr Val Asp Lys Ser Arg Trp Gln Gln Gly Asn Val
180 185 190
Phe Ser Cys Ser Val Met His Glu Ala Leu His Asn His Tyr Thr Gln
195 200 205
Lys Ser Leu Ser Leu Ser Pro Gly Lys
210 215
<210> 11
<211> 326
<212> PRT
<213> Homo sapiens
<220>
<223> Human IgG2 Heavy chain constant domain
<220>
<221> DOMAIN
<222> (1)...(98)
<223> CH1
<220>
<221> DOMAIN
<222> (99)...(110)
<223> hinge region
<220>
<221> DOMAIN
<222> (111)...(219)
<223> CH2
<220>
<221> DOMAIN
<222> (220)...(326)
<223> CH3
<400> 11
Ala Ser Thr Lys Gly Pro Ser Val Phe Pro Leu Ala Pro Cys Ser Arg
1 5 10 15
Ser Thr Ser Glu Ser Thr Ala Ala Leu Gly Cys Leu Val Lys Asp Tyr
20 25 30
Phe Pro Glu Pro Val Thr Val Ser Trp Asn Ser Gly Ala Leu Thr Ser
35 40 45
Gly Val His Thr Phe Pro Ala Val Leu Gln Ser Ser Gly Leu Tyr Ser
50 55 60
Leu Ser Ser Val Val Thr Val Pro Ser Ser Asn Phe Gly Thr Gln Thr
65 70 75 80
Tyr Thr Cys Asn Val Asp His Lys Pro Ser Asn Thr Lys Val Asp Lys
85 90 95
Thr Val Glu Arg Lys Cys Cys Val Glu Cys Pro Pro Cys Pro Ala Pro
100 105 110
Pro Val Ala Gly Pro Ser Val Phe Leu Phe Pro Pro Lys Pro Lys Asp
115 120 125
Thr Leu Met Ile Ser Arg Thr Pro Glu Val Thr Cys Val Val Val Asp
130 135 140
Val Ser His Glu Asp Pro Glu Val Gln Phe Asn Trp Tyr Val Asp Gly
145 150 155 160
Val Glu Val His Asn Ala Lys Thr Lys Pro Arg Glu Glu Gln Phe Asn
165 170 175
Ser Thr Phe Arg Val Val Ser Val Leu Thr Val Val His Gln Asp Trp
180 185 190
Leu Asn Gly Lys Glu Tyr Lys Cys Lys Val Ser Asn Lys Gly Leu Pro
195 200 205
Ala Pro Ile Glu Lys Thr Ile Ser Lys Thr Lys Gly Gln Pro Arg Glu
210 215 220
Pro Gln Val Tyr Thr Leu Pro Pro Ser Arg Glu Glu Met Thr Lys Asn
225 230 235 240
Gln Val Ser Leu Thr Cys Leu Val Lys Gly Phe Tyr Pro Ser Asp Ile
245 250 255
Ala Val Glu Trp Glu Ser Asn Gly Gln Pro Glu Asn Asn Tyr Lys Thr
260 265 270
Thr Pro Pro Met Leu Asp Ser Asp Gly Ser Phe Phe Leu Tyr Ser Lys
275 280 285
Leu Thr Val Asp Lys Ser Arg Trp Gln Gln Gly Asn Val Phe Ser Cys
290 295 300
Ser Val Met His Glu Ala Leu His Asn His Tyr Thr Gln Lys Ser Leu
305 310 315 320
Ser Leu Ser Pro Gly Lys
325
<210> 12
<211> 216
<212> PRT
<213> Homo sapiens
<220>
<223> IgG2 Fc (CH2 and CH3 domains)
<400> 12
Ala Pro Pro Val Ala Gly Pro Ser Val Phe Leu Phe Pro Pro Lys Pro
1 5 10 15
Lys Asp Thr Leu Met Ile Ser Arg Thr Pro Glu Val Thr Cys Val Val
20 25 30
Val Asp Val Ser His Glu Asp Pro Glu Val Gln Phe Asn Trp Tyr Val
35 40 45
Asp Gly Val Glu Val His Asn Ala Lys Thr Lys Pro Arg Glu Glu Gln
50 55 60
Phe Asn Ser Thr Phe Arg Val Val Ser Val Leu Thr Val Val His Gln
65 70 75 80
Asp Trp Leu Asn Gly Lys Glu Tyr Lys Cys Lys Val Ser Asn Lys Gly
85 90 95
Leu Pro Ala Pro Ile Glu Lys Thr Ile Ser Lys Thr Lys Gly Gln Pro
100 105 110
Arg Glu Pro Gln Val Tyr Thr Leu Pro Pro Ser Arg Glu Glu Met Thr
115 120 125
Lys Asn Gln Val Ser Leu Thr Cys Leu Val Lys Gly Phe Tyr Pro Ser
130 135 140
Asp Ile Ala Val Glu Trp Glu Ser Asn Gly Gln Pro Glu Asn Asn Tyr
145 150 155 160
Lys Thr Thr Pro Pro Met Leu Asp Ser Asp Gly Ser Phe Phe Leu Tyr
165 170 175
Ser Lys Leu Thr Val Asp Lys Ser Arg Trp Gln Gln Gly Asn Val Phe
180 185 190
Ser Cys Ser Val Met His Glu Ala Leu His Asn His Tyr Thr Gln Lys
195 200 205
Ser Leu Ser Leu Ser Pro Gly Lys
210 215
<210> 13
<211> 377
<212> PRT
<213> Homo sapiens
<220>
<223> IgG3 heavy chain constant domain
<220>
<221> DOMAIN
<222> (1)...(98)
<223> CH1
<220>
<221> DOMAIN
<222> (99)...(160)
<223> Hinge region
<220>
<221> DOMAIN
<222> (161)... (270)
<223> CH2
<220>
<221> DOMAIN
<222> (271)...(377)
<223> CH3
<400> 13
Ala Ser Thr Lys Gly Pro Ser Val Phe Pro Leu Ala Pro Cys Ser Arg
1 5 10 15
Ser Thr Ser Gly Gly Thr Ala Ala Leu Gly Cys Leu Val Lys Asp Tyr
20 25 30
Phe Pro Glu Pro Val Thr Val Ser Trp Asn Ser Gly Ala Leu Thr Ser
35 40 45
Gly Val His Thr Phe Pro Ala Val Leu Gln Ser Ser Gly Leu Tyr Ser
50 55 60
Leu Ser Ser Val Val Thr Val Pro Ser Ser Ser Leu Gly Thr Gln Thr
65 70 75 80
Tyr Thr Cys Asn Val Asn His Lys Pro Ser Asn Thr Lys Val Asp Lys
85 90 95
Arg Val Glu Leu Lys Thr Pro Leu Gly Asp Thr Thr His Thr Cys Pro
100 105 110
Arg Cys Pro Glu Pro Lys Ser Cys Asp Thr Pro Pro Pro Cys Pro Arg
115 120 125
Cys Pro Glu Pro Lys Ser Cys Asp Thr Pro Pro Pro Cys Pro Arg Cys
130 135 140
Pro Glu Pro Lys Ser Cys Asp Thr Pro Pro Pro Cys Pro Arg Cys Pro
145 150 155 160
Ala Pro Glu Leu Leu Gly Gly Pro Ser Val Phe Leu Phe Pro Pro Lys
165 170 175
Pro Lys Asp Thr Leu Met Ile Ser Arg Thr Pro Glu Val Thr Cys Val
180 185 190
Val Val Asp Val Ser His Glu Asp Pro Glu Val Gln Phe Lys Trp Tyr
195 200 205
Val Asp Gly Val Glu Val His Asn Ala Lys Thr Lys Pro Arg Glu Glu
210 215 220
Gln Tyr Asn Ser Thr Phe Arg Val Val Ser Val Leu Thr Val Leu His
225 230 235 240
Gln Asp Trp Leu Asn Gly Lys Glu Tyr Lys Cys Lys Val Ser Asn Lys
245 250 255
Ala Leu Pro Ala Pro Ile Glu Lys Thr Ile Ser Lys Thr Lys Gly Gln
260 265 270
Pro Arg Glu Pro Gln Val Tyr Thr Leu Pro Pro Ser Arg Glu Glu Met
275 280 285
Thr Lys Asn Gln Val Ser Leu Thr Cys Leu Val Lys Gly Phe Tyr Pro
290 295 300
Ser Asp Ile Ala Val Glu Trp Glu Ser Ser Gly Gln Pro Glu Asn Asn
305 310 315 320
Tyr Asn Thr Thr Pro Pro Met Leu Asp Ser Asp Gly Ser Phe Phe Leu
325 330 335
Tyr Ser Lys Leu Thr Val Asp Lys Ser Arg Trp Gln Gln Gly Asn Ile
340 345 350
Phe Ser Cys Ser Val Met His Glu Ala Leu His Asn Arg Phe Thr Gln
355 360 365
Lys Ser Leu Ser Leu Ser Pro Gly Lys
370 375
<210> 14
<211> 217
<212> PRT
<213> Homo sapiens
<220>
<223> IgG3 Fc (CH2 and CH3 domains)
<400> 14
Ala Pro Glu Leu Leu Gly Gly Pro Ser Val Phe Leu Phe Pro Pro Lys
1 5 10 15
Pro Lys Asp Thr Leu Met Ile Ser Arg Thr Pro Glu Val Thr Cys Val
20 25 30
Val Val Asp Val Ser His Glu Asp Pro Glu Val Gln Phe Lys Trp Tyr
35 40 45
Val Asp Gly Val Glu Val His Asn Ala Lys Thr Lys Pro Arg Glu Glu
50 55 60
Gln Tyr Asn Ser Thr Phe Arg Val Val Ser Val Leu Thr Val Leu His
65 70 75 80
Gln Asp Trp Leu Asn Gly Lys Glu Tyr Lys Cys Lys Val Ser Asn Lys
85 90 95
Ala Leu Pro Ala Pro Ile Glu Lys Thr Ile Ser Lys Thr Lys Gly Gln
100 105 110
Pro Arg Glu Pro Gln Val Tyr Thr Leu Pro Pro Ser Arg Glu Glu Met
115 120 125
Thr Lys Asn Gln Val Ser Leu Thr Cys Leu Val Lys Gly Phe Tyr Pro
130 135 140
Ser Asp Ile Ala Val Glu Trp Glu Ser Ser Gly Gln Pro Glu Asn Asn
145 150 155 160
Tyr Asn Thr Thr Pro Pro Met Leu Asp Ser Asp Gly Ser Phe Phe Leu
165 170 175
Tyr Ser Lys Leu Thr Val Asp Lys Ser Arg Trp Gln Gln Gly Asn Ile
180 185 190
Phe Ser Cys Ser Val Met His Glu Ala Leu His Asn Arg Phe Thr Gln
195 200 205
Lys Ser Leu Ser Leu Ser Pro Gly Lys
210 215
<210> 15
<211> 327
<212> PRT
<213> Homo sapiens
<220>
<223> IgG4 Heavy chain constant domain
<220>
<221> DOMAIN
<222> (1)...(98)
<223> CH1
<220>
<221> DOMAIN
<222> (99)...(110)
<223> Hinge region
<220>
<221> DOMAIN
<222> (111)...(220)
<223> CH2
<220>
<221> DOMAIN
<222> (221)...(327)
<223> CH3
<400> 15
Ala Ser Thr Lys Gly Pro Ser Val Phe Pro Leu Ala Pro Cys Ser Arg
1 5 10 15
Ser Thr Ser Glu Ser Thr Ala Ala Leu Gly Cys Leu Val Lys Asp Tyr
20 25 30
Phe Pro Glu Pro Val Thr Val Ser Trp Asn Ser Gly Ala Leu Thr Ser
35 40 45
Gly Val His Thr Phe Pro Ala Val Leu Gln Ser Ser Gly Leu Tyr Ser
50 55 60
Leu Ser Ser Val Val Thr Val Pro Ser Ser Ser Leu Gly Thr Lys Thr
65 70 75 80
Tyr Thr Cys Asn Val Asp His Lys Pro Ser Asn Thr Lys Val Asp Lys
85 90 95
Arg Val Glu Ser Lys Tyr Gly Pro Pro Cys Pro Ser Cys Pro Ala Pro
100 105 110
Glu Phe Leu Gly Gly Pro Ser Val Phe Leu Phe Pro Pro Lys Pro Lys
115 120 125
Asp Thr Leu Met Ile Ser Arg Thr Pro Glu Val Thr Cys Val Val Val
130 135 140
Asp Val Ser Gln Glu Asp Pro Glu Val Gln Phe Asn Trp Tyr Val Asp
145 150 155 160
Gly Val Glu Val His Asn Ala Lys Thr Lys Pro Arg Glu Glu Gln Phe
165 170 175
Asn Ser Thr Tyr Arg Val Val Ser Val Leu Thr Val Leu His Gln Asp
180 185 190
Trp Leu Asn Gly Lys Glu Tyr Lys Cys Lys Val Ser Asn Lys Gly Leu
195 200 205
Pro Ser Ser Ile Glu Lys Thr Ile Ser Lys Ala Lys Gly Gln Pro Arg
210 215 220
Glu Pro Gln Val Tyr Thr Leu Pro Pro Ser Gln Glu Glu Met Thr Lys
225 230 235 240
Asn Gln Val Ser Leu Thr Cys Leu Val Lys Gly Phe Tyr Pro Ser Asp
245 250 255
Ile Ala Val Glu Trp Glu Ser Asn Gly Gln Pro Glu Asn Asn Tyr Lys
260 265 270
Thr Thr Pro Pro Val Leu Asp Ser Asp Gly Ser Phe Phe Leu Tyr Ser
275 280 285
Arg Leu Thr Val Asp Lys Ser Arg Trp Gln Glu Gly Asn Val Phe Ser
290 295 300
Cys Ser Val Met His Glu Ala Leu His Asn His Tyr Thr Gln Lys Ser
305 310 315 320
Leu Ser Leu Ser Leu Gly Lys
325
<210> 16
<211> 217
<212> PRT
<213> Homo sapiens
<220>
<223> IgG4 Fc (CH2 and CH3 domains)
<400> 16
Ala Pro Glu Phe Leu Gly Gly Pro Ser Val Phe Leu Phe Pro Pro Lys
1 5 10 15
Pro Lys Asp Thr Leu Met Ile Ser Arg Thr Pro Glu Val Thr Cys Val
20 25 30
Val Val Asp Val Ser Gln Glu Asp Pro Glu Val Gln Phe Asn Trp Tyr
35 40 45
Val Asp Gly Val Glu Val His Asn Ala Lys Thr Lys Pro Arg Glu Glu
50 55 60
Gln Phe Asn Ser Thr Tyr Arg Val Val Ser Val Leu Thr Val Leu His
65 70 75 80
Gln Asp Trp Leu Asn Gly Lys Glu Tyr Lys Cys Lys Val Ser Asn Lys
85 90 95
Gly Leu Pro Ser Ser Ile Glu Lys Thr Ile Ser Lys Ala Lys Gly Gln
100 105 110
Pro Arg Glu Pro Gln Val Tyr Thr Leu Pro Pro Ser Gln Glu Glu Met
115 120 125
Thr Lys Asn Gln Val Ser Leu Thr Cys Leu Val Lys Gly Phe Tyr Pro
130 135 140
Ser Asp Ile Ala Val Glu Trp Glu Ser Asn Gly Gln Pro Glu Asn Asn
145 150 155 160
Tyr Lys Thr Thr Pro Pro Val Leu Asp Ser Asp Gly Ser Phe Phe Leu
165 170 175
Tyr Ser Arg Leu Thr Val Asp Lys Ser Arg Trp Gln Glu Gly Asn Val
180 185 190
Phe Ser Cys Ser Val Met His Glu Ala Leu His Asn His Tyr Thr Gln
195 200 205
Lys Ser Leu Ser Leu Ser Leu Gly Lys
210 215
<210> 17
<211> 107
<212> PRT
<213> Homo sapiens
<220>
<223> Human Ig kappa light chain constant domain (CL)
<400> 17
Arg Thr Val Ala Ala Pro Ser Val Phe Ile Phe Pro Pro Ser Asp Glu
1 5 10 15
Gln Leu Lys Ser Gly Thr Ala Ser Val Val Cys Leu Leu Asn Asn Phe
20 25 30
Tyr Pro Arg Glu Ala Lys Val Gln Trp Lys Val Asp Asn Ala Leu Gln
35 40 45
Ser Gly Asn Ser Gln Glu Ser Val Thr Glu Gln Asp Ser Lys Asp Ser
50 55 60
Thr Tyr Ser Leu Ser Ser Thr Leu Thr Leu Ser Lys Ala Asp Tyr Glu
65 70 75 80
Lys His Lys Val Tyr Ala Cys Glu Val Thr His Gln Gly Leu Ser Ser
85 90 95
Pro Val Thr Lys Ser Phe Asn Arg Gly Glu Cys
100 105
<210> 18
<211> 106
<212> PRT
<213> Homo sapiens
<220>
<223> Immunoglobulin lambda constant 1 light chain
domain (chain C)
<400> 18
Gly Gln Pro Lys Ala Asn Pro Thr Val Thr Leu Phe Pro Pro Ser Ser
1 5 10 15
Glu Glu Leu Gln Ala Asn Lys Ala Thr Leu Val Cys Leu Ile Ser Asp
20 25 30
Phe Tyr Pro Gly Ala Val Thr Val Ala Trp Lys Ala Asp Gly Ser Pro
35 40 45
Val Lys Ala Gly Val Glu Thr Thr Lys Pro Ser Lys Gln Ser Asn Asn
50 55 60
Lys Tyr Ala Ala Ser Ser Tyr Leu Ser Leu Thr Pro Glu Gln Trp Lys
65 70 75 80
Ser His Arg Ser Tyr Ser Cys Gln Val Thr His Glu Gly Ser Thr Val
85 90 95
Glu Lys Thr Val Ala Pro Thr Glu Cys Ser
100 105
<210> 19
<211> 106
<212> PRT
<213> Homo sapiens
<220>
<223> Immunoglobulin lambda CONSTANT 2 light chain
domain (chain C)
<400> 19
Gly Gln Pro Lys Ala Ala Pro Ser Val Thr Leu Phe Pro Pro Ser Ser
1 5 10 15
Glu Glu Leu Gln Ala Asn Lys Ala Thr Leu Val Cys Leu Ile Ser Asp
20 25 30
Phe Tyr Pro Gly Ala Val Thr Val Ala Trp Lys Ala Asp Ser Ser Pro
35 40 45
Val Lys Ala Gly Val Glu Thr Thr Thr Thr Pro Ser Lys Gln Ser Asn Asn
50 55 60
Lys Tyr Ala Ala Ser Ser Tyr Leu Ser Leu Thr Pro Glu Gln Trp Lys
65 70 75 80
Ser His Arg Ser Tyr Ser Cys Gln Val Thr His Glu Gly Ser Thr Val
85 90 95
Glu Lys Thr Val Ala Pro Thr Glu Cys Ser
100 105
<210> 20
<211> 106
<212> PRT
<213> Homo sapiens
<220>
<223> Immunoglobulin lambda CONSTANT 3 light chain
domain (chain C)
<400> 20
Gly Gln Pro Lys Ala Ala Pro Ser Val Thr Leu Phe Pro Pro Ser Ser
1 5 10 15
Glu Glu Leu Gln Ala Asn Lys Ala Thr Leu Val Cys Leu Ile Ser Asp
20 25 30
Phe Tyr Pro Gly Ala Val Thr Val Ala Trp Lys Ala Asp Ser Ser Pro
35 40 45
Val Lys Ala Gly Val Glu Thr Thr Thr Thr Pro Ser Lys Gln Ser Asn Asn
50 55 60
Lys Tyr Ala Ala Ser Ser Tyr Leu Ser Leu Thr Pro Glu Gln Trp Lys
65 70 75 80
Ser His Lys Ser Tyr Ser Cys Gln Val Thr His Glu Gly Ser Thr Val
85 90 95
Glu Lys Thr Val Ala Pro Thr Glu Cys Ser
100 105
<210> 21
<211> 106
<212> PRT
<213> Homo sapiens
<220>
<223> Immunoglobulin lambda CONSTANT 6 light chain
domain (chain C)
<400> 21
Gly Gln Pro Lys Ala Ala Pro Ser Val Thr Leu Phe Pro Pro Ser Ser
1 5 10 15
Glu Glu Leu Gln Ala Asn Lys Ala Thr Leu Val Cys Leu Ile Ser Asp
20 25 30
Phe Tyr Pro Gly Ala Val Lys Val Ala Trp Lys Ala Asp Gly Ser Pro
35 40 45
Val Asn Thr Gly Val Glu Thr Thr Thr Pro Ser Lys Gln Ser Asn Asn
50 55 60
Lys Tyr Ala Ala Ser Ser Tyr Leu Ser Leu Thr Pro Glu Gln Trp Lys
65 70 75 80
Ser His Arg Ser Tyr Ser Cys Gln Val Thr His Glu Gly Ser Thr Val
85 90 95
Glu Lys Thr Val Ala Pro Ala Glu Cys Ser
100 105
<210> 22
<211> 106
<212> PRT
<213> Homo sapiens
<220>
<223> Immunoglobulin lambda CONSTANT 7 light chain
domain (chain C)
<400> 22
Gly Gln Pro Lys Ala Ala Pro Ser Val Thr Leu Phe Pro Pro Ser Ser
1 5 10 15
Glu Glu Leu Gln Ala Asn Lys Ala Thr Leu Val Cys Leu Val Ser Asp
20 25 30
Phe Asn Pro Gly Ala Val Thr Val Ala Trp Lys Ala Asp Gly Ser Pro
35 40 45
Val Lys Val Gly Val Glu Thr Thr Lys Pro Ser Lys Gln Ser Asn Asn
50 55 60
Lys Tyr Ala Ala Ser Ser Tyr Leu Ser Leu Thr Pro Glu Gln Trp Lys
65 70 75 80
Ser His Arg Ser Tyr Ser Cys Arg Val Thr His Glu Gly Ser Thr Val
85 90 95
Glu Lys Thr Val Ala Pro Ala Glu Cys Ser
100 105
<210> 23
<211> 214
<212> PRT
<213> artificial sequence
<220>
<223> Adalimumab Light Chain
<400> 23
Asp Ile Gln Met Thr Gln Ser Pro Ser Ser Leu Ser Ala Ser Val Gly
1 5 10 15
Asp Arg Val Thr Ile Thr Cys Arg Ala Ser Gln Gly Ile Arg Asn Tyr
20 25 30
Leu Ala Trp Tyr Gln Gln Lys Pro Gly Lys Ala Pro Lys Leu Leu Ile
35 40 45
Tyr Ala Ala Ser Thr Leu Gln Ser Gly Val Pro Ser Arg Phe Ser Gly
50 55 60
Ser Gly Ser Gly Thr Asp Phe Thr Leu Thr Ile Ser Ser Leu Gln Pro
65 70 75 80
Glu Asp Val Ala Thr Tyr Tyr Cys Gln Arg Tyr Asn Arg Ala Pro Tyr
85 90 95
Thr Phe Gly Gln Gly Thr Lys Val Glu Ile Lys Arg Thr Val Ala Ala
100 105 110
Pro Ser Val Phe Ile Phe Pro Pro Ser Asp Glu Gln Leu Lys Ser Gly
115 120 125
Thr Ala Ser Val Val Cys Leu Leu Asn Asn Phe Tyr Pro Arg Glu Ala
130 135 140
Lys Val Gln Trp Lys Val Asp Asn Ala Leu Gln Ser Gly Asn Ser Gln
145 150 155 160
Glu Ser Val Thr Glu Gln Asp Ser Lys Asp Ser Thr Tyr Ser Leu Ser
165 170 175
Ser Thr Leu Thr Leu Ser Lys Ala Asp Tyr Glu Lys His Lys Val Tyr
180 185 190
Ala Cys Glu Val Thr His Gln Gly Leu Ser Ser Pro Val Thr Lys Ser
195 200 205
Phe Asn Arg Gly Glu Cys
210
<210> 24
<211> 451
<212> PRT
<213> artificial sequence
<220>
<223> Adalimumab Heavy Chain
<400> 24
Glu Val Gln Leu Val Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly Arg
1 5 10 15
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Asp Asp Tyr
20 25 30
Ala Met His Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val
35 40 45
Ser Ala Ile Thr Trp Asn Ser Gly His Ile Asp Tyr Ala Asp Ser Val
50 55 60
Glu Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Ala Lys Asn Ser Leu Tyr
65 70 75 80
Leu Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys
85 90 95
Ala Lys Val Ser Tyr Leu Ser Thr Ala Ser Ser Leu Asp Tyr Trp Gly
100 105 110
Gln Gly Thr Leu Val Thr Val Ser Ser Ala Ser Thr Lys Gly Pro Ser
115 120 125
Val Phe Pro Leu Ala Pro Ser Ser Lys Ser Thr Ser Gly Gly Thr Ala
130 135 140
Ala Leu Gly Cys Leu Val Lys Asp Tyr Phe Pro Glu Pro Val Thr Val
145 150 155 160
Ser Trp Asn Ser Gly Ala Leu Thr Ser Gly Val His Thr Phe Pro Ala
165 170 175
Val Leu Gln Ser Ser Gly Leu Tyr Ser Leu Ser Ser Val Val Thr Val
180 185 190
Pro Ser Ser Ser Leu Gly Thr Gln Thr Tyr Ile Cys Asn Val Asn His
195 200 205
Lys Pro Ser Asn Thr Lys Val Asp Lys Lys Val Glu Pro Lys Ser Cys
210 215 220
Asp Lys Thr His Thr Cys Pro Pro Cys Pro Ala Pro Glu Leu Leu Gly
225 230 235 240
Gly Pro Ser Val Phe Leu Phe Pro Pro Lys Pro Lys Asp Thr Leu Met
245 250 255
Ile Ser Arg Thr Pro Glu Val Thr Cys Val Val Val Asp Val Ser His
260 265 270
Glu Asp Pro Glu Val Lys Phe Asn Trp Tyr Val Asp Gly Val Glu Val
275 280 285
His Asn Ala Lys Thr Lys Pro Arg Glu Glu Gln Tyr Asn Ser Thr Tyr
290 295 300
Arg Val Val Ser Val Leu Thr Val Leu His Gln Asp Trp Leu Asn Gly
305 310 315 320
Lys Glu Tyr Lys Cys Lys Val Ser Asn Lys Ala Leu Pro Ala Pro Ile
325 330 335
Glu Lys Thr Ile Ser Lys Ala Lys Gly Gln Pro Arg Glu Pro Gln Val
340 345 350
Tyr Thr Leu Pro Pro Ser Arg Asp Glu Leu Thr Lys Asn Gln Val Ser
355 360 365
Leu Thr Cys Leu Val Lys Gly Phe Tyr Pro Ser Asp Ile Ala Val Glu
370 375 380
Trp Glu Ser Asn Gly Gln Pro Glu Asn Asn Tyr Lys Thr Thr Pro Pro
385 390 395 400
Val Leu Asp Ser Asp Gly Ser Phe Phe Leu Tyr Ser Lys Leu Thr Val
405 410 415
Asp Lys Ser Arg Trp Gln Gln Gly Asn Val Phe Ser Cys Ser Val Met
420 425 430
His Glu Ala Leu His Asn His Tyr Thr Gln Lys Ser Leu Ser Leu Ser
435 440 445
Pro Gly Lys
450
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<211> 214
<212> PRT
<213> artificial sequence
<220>
<223> Trastuzumab light chain
<400> 25
Asp Ile Gln Met Thr Gln Ser Pro Ser Ser Leu Ser Ala Ser Val Gly
1 5 10 15
Asp Arg Val Thr Ile Thr Cys Arg Ala Ser Gln Asp Val Asn Thr Ala
20 25 30
Val Ala Trp Tyr Gln Gln Lys Pro Gly Lys Ala Pro Lys Leu Leu Ile
35 40 45
Tyr Ser Ala Ser Phe Leu Tyr Ser Gly Val Pro Ser Arg Phe Ser Gly
50 55 60
Ser Arg Ser Gly Thr Asp Phe Thr Leu Thr Ile Ser Ser Leu Gln Pro
65 70 75 80
Glu Asp Phe Ala Thr Tyr Tyr Cys Gln Gln His Tyr Thr Thr Pro Pro
85 90 95
Thr Phe Gly Gln Gly Thr Lys Val Glu Ile Lys Arg Thr Val Ala Ala
100 105 110
Pro Ser Val Phe Ile Phe Pro Pro Ser Asp Glu Gln Leu Lys Ser Gly
115 120 125
Thr Ala Ser Val Val Cys Leu Leu Asn Asn Phe Tyr Pro Arg Glu Ala
130 135 140
Lys Val Gln Trp Lys Val Asp Asn Ala Leu Gln Ser Gly Asn Ser Gln
145 150 155 160
Glu Ser Val Thr Glu Gln Asp Ser Lys Asp Ser Thr Tyr Ser Leu Ser
165 170 175
Ser Thr Leu Thr Leu Ser Lys Ala Asp Tyr Glu Lys His Lys Val Tyr
180 185 190
Ala Cys Glu Val Thr His Gln Gly Leu Ser Ser Pro Val Thr Lys Ser
195 200 205
Phe Asn Arg Gly Glu Cys
210
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<212> PRT
<213> artificial sequence
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<223> Trastuzumab heavy chain
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<221> DOMAIN
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<223> VH
<220>
<221> DOMAIN
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<221> DOMAIN
<222> (219)...(233)
<223> hinge region
<220>
<221> DOMAIN
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<220>
<221> DOMAIN
<222> (344)... (450)
<223> CH3
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Glu Val Gln Leu Val Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly Gly
1 5 10 15
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Asn Ile Lys Asp Thr
20 25 30
Tyr Ile His Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val
35 40 45
Ala Arg Ile Tyr Pro Thr Asn Gly Tyr Thr Arg Tyr Ala Asp Ser Val
50 55 60
Lys Gly Arg Phe Thr Ile Ser Ala Asp Thr Ser Lys Asn Thr Ala Tyr
65 70 75 80
Leu Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys
85 90 95
Ser Arg Trp Gly Gly Asp Gly Phe Tyr Ala Met Asp Tyr Trp Gly Gln
100 105 110
Gly Thr Leu Val Thr Val Ser Ser Ala Ser Thr Lys Gly Pro Ser Val
115 120 125
Phe Pro Leu Ala Pro Ser Ser Lys Ser Thr Ser Gly Gly Thr Ala Ala
130 135 140
Leu Gly Cys Leu Val Lys Asp Tyr Phe Pro Glu Pro Val Thr Val Ser
145 150 155 160
Trp Asn Ser Gly Ala Leu Thr Ser Gly Val His Thr Phe Pro Ala Val
165 170 175
Leu Gln Ser Ser Gly Leu Tyr Ser Leu Ser Ser Val Val Thr Val Pro
180 185 190
Ser Ser Ser Leu Gly Thr Gln Thr Tyr Ile Cys Asn Val Asn His Lys
195 200 205
Pro Ser Asn Thr Lys Val Asp Lys Lys Val Glu Pro Lys Ser Cys Asp
210 215 220
Lys Thr His Thr Cys Pro Pro Cys Pro Ala Pro Glu Leu Leu Gly Gly
225 230 235 240
Pro Ser Val Phe Leu Phe Pro Pro Lys Pro Lys Asp Thr Leu Met Ile
245 250 255
Ser Arg Thr Pro Glu Val Thr Cys Val Val Val Asp Val Ser His Glu
260 265 270
Asp Pro Glu Val Lys Phe Asn Trp Tyr Val Asp Gly Val Glu Val His
275 280 285
Asn Ala Lys Thr Lys Pro Arg Glu Glu Gln Tyr Asn Ser Thr Tyr Arg
290 295 300
Val Val Ser Val Leu Thr Val Leu His Gln Asp Trp Leu Asn Gly Lys
305 310 315 320
Glu Tyr Lys Cys Lys Val Ser Asn Lys Ala Leu Pro Ala Pro Ile Glu
325 330 335
Lys Thr Ile Ser Lys Ala Lys Gly Gln Pro Arg Glu Pro Gln Val Tyr
340 345 350
Thr Leu Pro Pro Ser Arg Glu Glu Met Thr Lys Asn Gln Val Ser Leu
355 360 365
Thr Cys Leu Val Lys Gly Phe Tyr Pro Ser Asp Ile Ala Val Glu Trp
370 375 380
Glu Ser Asn Gly Gln Pro Glu Asn Asn Tyr Lys Thr Thr Pro Pro Val
385 390 395 400
Leu Asp Ser Asp Gly Ser Phe Phe Leu Tyr Ser Lys Leu Thr Val Asp
405 410 415
Lys Ser Arg Trp Gln Gln Gly Asn Val Phe Ser Cys Ser Val Met His
420 425 430
Glu Ala Leu His Asn His Tyr Thr Gln Lys Ser Leu Ser Leu Ser Pro
435 440 445
Gly Lys
450
<210> 27
<211> 217
<212> PRT
<213> artificial sequence
<220>
<223> Trastuzumab Fc (CH2 and CH3 domains)
<400> 27
Ala Pro Glu Leu Leu Gly Gly Pro Ser Val Phe Leu Phe Pro Pro Lys
1 5 10 15
Pro Lys Asp Thr Leu Met Ile Ser Arg Thr Pro Glu Val Thr Cys Val
20 25 30
Val Val Asp Val Ser His Glu Asp Pro Glu Val Lys Phe Asn Trp Tyr
35 40 45
Val Asp Gly Val Glu Val His Asn Ala Lys Thr Lys Pro Arg Glu Glu
50 55 60
Gln Tyr Asn Ser Thr Tyr Arg Val Val Ser Val Leu Thr Val Leu His
65 70 75 80
Gln Asp Trp Leu Asn Gly Lys Glu Tyr Lys Cys Lys Val Ser Asn Lys
85 90 95
Ala Leu Pro Ala Pro Ile Glu Lys Thr Ile Ser Lys Ala Lys Gly Gln
100 105 110
Pro Arg Glu Pro Gln Val Tyr Thr Leu Pro Pro Ser Arg Glu Glu Met
115 120 125
Thr Lys Asn Gln Val Ser Leu Thr Cys Leu Val Lys Gly Phe Tyr Pro
130 135 140
Ser Asp Ile Ala Val Glu Trp Glu Ser Asn Gly Gln Pro Glu Asn Asn
145 150 155 160
Tyr Lys Thr Thr Pro Pro Val Leu Asp Ser Asp Gly Ser Phe Phe Leu
165 170 175
Tyr Ser Lys Leu Thr Val Asp Lys Ser Arg Trp Gln Gln Gly Asn Val
180 185 190
Phe Ser Cys Ser Val Met His Glu Ala Leu His Asn His Tyr Thr Gln
195 200 205
Lys Ser Leu Ser Leu Ser Pro Gly Lys
210 215
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<211> 214
<212> PRT
<213> artificial sequence
<220>
<223> Nivolumab light chain
<400> 28
Glu Ile Val Leu Thr Gln Ser Pro Ala Thr Leu Ser Leu Ser Pro Gly
1 5 10 15
Glu Arg Ala Thr Leu Ser Cys Arg Ala Ser Gln Ser Val Ser Ser Tyr
20 25 30
Leu Ala Trp Tyr Gln Gln Lys Pro Gly Gln Ala Pro Arg Leu Leu Ile
35 40 45
Tyr Asp Ala Ser Asn Arg Ala Thr Gly Ile Pro Ala Arg Phe Ser Gly
50 55 60
Ser Gly Ser Gly Thr Asp Phe Thr Leu Thr Ile Ser Ser Leu Glu Pro
65 70 75 80
Glu Asp Phe Ala Val Tyr Tyr Cys Gln Gln Ser Ser Asn Trp Pro Arg
85 90 95
Thr Phe Gly Gln Gly Thr Lys Val Glu Ile Lys Arg Thr Val Ala Ala
100 105 110
Pro Ser Val Phe Ile Phe Pro Pro Ser Asp Glu Gln Leu Lys Ser Gly
115 120 125
Thr Ala Ser Val Val Cys Leu Leu Asn Asn Phe Tyr Pro Arg Glu Ala
130 135 140
Lys Val Gln Trp Lys Val Asp Asn Ala Leu Gln Ser Gly Asn Ser Gln
145 150 155 160
Glu Ser Val Thr Glu Gln Asp Ser Lys Asp Ser Thr Tyr Ser Leu Ser
165 170 175
Ser Thr Leu Thr Leu Ser Lys Ala Asp Tyr Glu Lys His Lys Val Tyr
180 185 190
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195 200 205
Phe Asn Arg Gly Glu Cys
210
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<212> PRT
<213> artificial sequence
<220>
<223> Nivolumab heavy chain
<220>
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<221> DOMAIN
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<221> DOMAIN
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Gln Val Gln Leu Val Glu Ser Gly Gly Gly Val Val Gln Pro Gly Arg
1 5 10 15
Ser Leu Arg Leu Asp Cys Lys Ala Ser Gly Ile Thr Phe Ser Asn Ser
20 25 30
Gly Met His Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val
35 40 45
Ala Val Ile Trp Tyr Asp Gly Ser Lys Arg Tyr Tyr Ala Asp Ser Val
50 55 60
Lys Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Ser Lys Asn Thr Leu Phe
65 70 75 80
Leu Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys
85 90 95
Ala Thr Asn Asp Asp Tyr Trp Gly Gln Gly Thr Leu Val Thr Val Ser
100 105 110
Ser Ala Ser Thr Lys Gly Pro Ser Val Phe Pro Leu Ala Pro Cys Ser
115 120 125
Arg Ser Thr Ser Glu Ser Thr Ala Ala Leu Gly Cys Leu Val Lys Asp
130 135 140
Tyr Phe Pro Glu Pro Val Thr Val Ser Trp Asn Ser Gly Ala Leu Thr
145 150 155 160
Ser Gly Val His Thr Phe Pro Ala Val Leu Gln Ser Ser Gly Leu Tyr
165 170 175
Ser Leu Ser Ser Val Val Thr Val Pro Ser Ser Ser Leu Gly Thr Lys
180 185 190
Thr Tyr Thr Cys Asn Val Asp His Lys Pro Ser Asn Thr Lys Val Asp
195 200 205
Lys Arg Val Glu Ser Lys Tyr Gly Pro Pro Cys Pro Pro Cys Pro Ala
210 215 220
Pro Glu Phe Leu Gly Gly Pro Ser Val Phe Leu Phe Pro Pro Lys Pro
225 230 235 240
Lys Asp Thr Leu Met Ile Ser Arg Thr Pro Glu Val Thr Cys Val Val
245 250 255
Val Asp Val Ser Gln Glu Asp Pro Glu Val Gln Phe Asn Trp Tyr Val
260 265 270
Asp Gly Val Glu Val His Asn Ala Lys Thr Lys Pro Arg Glu Glu Gln
275 280 285
Phe Asn Ser Thr Tyr Arg Val Val Ser Val Leu Thr Val Leu His Gln
290 295 300
Asp Trp Leu Asn Gly Lys Glu Tyr Lys Cys Lys Val Ser Asn Lys Gly
305 310 315 320
Leu Pro Ser Ser Ile Glu Lys Thr Ile Ser Lys Ala Lys Gly Gln Pro
325 330 335
Arg Glu Pro Gln Val Tyr Thr Leu Pro Pro Ser Gln Glu Glu Met Thr
340 345 350
Lys Asn Gln Val Ser Leu Thr Cys Leu Val Lys Gly Phe Tyr Pro Ser
355 360 365
Asp Ile Ala Val Glu Trp Glu Ser Asn Gly Gln Pro Glu Asn Asn Tyr
370 375 380
Lys Thr Thr Pro Pro Val Leu Asp Ser Asp Gly Ser Phe Phe Leu Tyr
385 390 395 400
Ser Arg Leu Thr Val Asp Lys Ser Arg Trp Gln Glu Gly Asn Val Phe
405 410 415
Ser Cys Ser Val Met His Glu Ala Leu His Asn His Tyr Thr Gln Lys
420 425 430
Ser Leu Ser Leu Ser Leu Gly Lys
435 440
<210> 30
<211> 217
<212> PRT
<213> artificial sequence
<220>
<223> Nivolumab Fc (CH2 and CH3 domains)
<400> 30
Ala Pro Glu Phe Leu Gly Gly Pro Ser Val Phe Leu Phe Pro Pro Lys
1 5 10 15
Pro Lys Asp Thr Leu Met Ile Ser Arg Thr Pro Glu Val Thr Cys Val
20 25 30
Val Val Asp Val Ser Gln Glu Asp Pro Glu Val Gln Phe Asn Trp Tyr
35 40 45
Val Asp Gly Val Glu Val His Asn Ala Lys Thr Lys Pro Arg Glu Glu
50 55 60
Gln Phe Asn Ser Thr Tyr Arg Val Val Ser Val Leu Thr Val Leu His
65 70 75 80
Gln Asp Trp Leu Asn Gly Lys Glu Tyr Lys Cys Lys Val Ser Asn Lys
85 90 95
Gly Leu Pro Ser Ser Ile Glu Lys Thr Ile Ser Lys Ala Lys Gly Gln
100 105 110
Pro Arg Glu Pro Gln Val Tyr Thr Leu Pro Pro Ser Gln Glu Glu Met
115 120 125
Thr Lys Asn Gln Val Ser Leu Thr Cys Leu Val Lys Gly Phe Tyr Pro
130 135 140
Ser Asp Ile Ala Val Glu Trp Glu Ser Asn Gly Gln Pro Glu Asn Asn
145 150 155 160
Tyr Lys Thr Thr Pro Pro Val Leu Asp Ser Asp Gly Ser Phe Phe Leu
165 170 175
Tyr Ser Arg Leu Thr Val Asp Lys Ser Arg Trp Gln Glu Gly Asn Val
180 185 190
Phe Ser Cys Ser Val Met His Glu Ala Leu His Asn His Tyr Thr Gln
195 200 205
Lys Ser Leu Ser Leu Ser Leu Gly Lys
210 215
<210> 31
<211> 444
<212> PRT
<213> artificial sequence
<220>
<223> ATROSAB heavy chain
<220>
<221> DOMAIN
<222> (1)...(115)
<223> VH
<220>
<221> DOMAIN
<222> (116)...(218)
<223> CH1
<220>
<221> DOMAIN
<222> (219)...(234)
<223> Hinge region
<220>
<221> DOMAIN
<222> (235)...(337)
<223> CH2
<220>
<221> DOMAIN
<222> (338)... (444)
<223> CH3
<400> 31
Gln Val Gln Leu Val Gln Ser Gly Ala Glu Val Lys Lys Pro Gly Ser
1 5 10 15
Ser Val Lys Val Ser Cys Lys Ala Ser Gly Tyr Thr Phe Thr Asp Phe
20 25 30
Tyr Ile Asn Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Gln Gly Leu Glu Trp Ile
35 40 45
Gly Glu Ile Tyr Pro Tyr Ser Gly His Ala Tyr Tyr Asn Glu Lys Phe
50 55 60
Lys Ala Arg Val Thr Ile Thr Ala Asp Lys Ser Thr Ser Thr Ala Tyr
65 70 75 80
Met Glu Leu Ser Ser Leu Arg Ser Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys
85 90 95
Ala Arg Trp Asp Phe Leu Asp Tyr Trp Gly Gln Gly Thr Thr Val Thr
100 105 110
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115 120 125
Ser Ser Lys Ser Thr Ser Gly Gly Thr Ala Ala Leu Gly Cys Leu Val
130 135 140
Lys Asp Tyr Phe Pro Glu Pro Val Thr Val Ser Trp Asn Ser Gly Ala
145 150 155 160
Leu Thr Ser Gly Val His Thr Phe Pro Ala Val Leu Gln Ser Ser Gly
165 170 175
Leu Tyr Ser Leu Ser Ser Val Val Val Thr Val Pro Ser Ser Ser Leu Gly
180 185 190
Thr Gln Thr Tyr Ile Cys Asn Val Asn His Lys Pro Ser Asn Thr Lys
195 200 205
Val Asp Lys Lys Val Glu Pro Lys Ser Cys Asp Lys Thr His Thr Cys
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Pro Pro Cys Pro Ala Pro Pro Val Ala Gly Pro Ser Val Phe Leu Phe
225 230 235 240
Pro Pro Lys Pro Lys Asp Thr Leu Met Ile Ser Arg Thr Pro Glu Val
245 250 255
Thr Cys Val Val Val Asp Val Ser His Glu Asp Pro Glu Val Lys Phe
260 265 270
Asn Trp Tyr Val Asp Gly Val Glu Val His Asn Ala Lys Thr Lys Pro
275 280 285
Arg Glu Glu Gln Tyr Asn Ser Thr Tyr Arg Val Val Ser Val Leu Thr
290 295 300
Val Leu His Gln Asp Trp Leu Asn Gly Lys Glu Tyr Lys Cys Lys Val
305 310 315 320
Ser Asn Lys Gly Leu Pro Ser Ser Ile Glu Lys Thr Ile Ser Lys Ala
325 330 335
Lys Gly Gln Pro Arg Glu Pro Gln Val Tyr Thr Leu Pro Pro Ser Arg
340 345 350
Asp Glu Leu Thr Lys Asn Gln Val Ser Leu Thr Cys Leu Val Lys Gly
355 360 365
Phe Tyr Pro Ser Asp Ile Ala Val Glu Trp Glu Ser Asn Gly Gln Pro
370 375 380
Glu Asn Asn Tyr Lys Thr Thr Pro Pro Val Leu Asp Ser Asp Gly Ser
385 390 395 400
Phe Phe Leu Tyr Ser Lys Leu Thr Val Asp Lys Ser Arg Trp Gln Gln
405 410 415
Gly Asn Val Phe Ser Cys Ser Val Met His Glu Ala Leu His Asn His
420 425 430
Tyr Thr Gln Lys Ser Leu Ser Leu Ser Pro Gly Lys
435 440
<210> 32
<211> 219
<212> PRT
<213> artificial sequence
<220>
<223> ATROSAB light chain
<220>
<221> DOMAIN
<222> (1)...(113)
<223> VL
<220>
<221> DOMAIN
<222> (114)...(219)
<223> CL
<400> 32
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1 5 10 15
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20 25 30
Asn Gly Asn Thr Tyr Leu His Trp Tyr Leu Gln Lys Pro Gly Gln Ser
35 40 45
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50 55 60
Asp Arg Phe Ser Gly Ser Gly Ser Gly Thr Asp Phe Thr Leu Lys Ile
65 70 75 80
Ser Arg Val Glu Ala Glu Asp Val Gly Val Tyr Tyr Cys Ser Gln Ser
85 90 95
Thr His Val Pro Tyr Thr Phe Gly Gly Gly Thr Lys Val Glu Ile Lys
100 105 110
Arg Thr Val Ala Ala Pro Ser Val Phe Ile Phe Pro Pro Ser Asp Glu
115 120 125
Gln Leu Lys Ser Gly Thr Ala Ser Val Val Cys Leu Leu Asn Asn Phe
130 135 140
Tyr Pro Arg Glu Ala Lys Val Gln Trp Lys Val Asp Asn Ala Leu Gln
145 150 155 160
Ser Gly Asn Ser Gln Glu Ser Val Thr Glu Gln Asp Ser Lys Asp Ser
165 170 175
Thr Tyr Ser Leu Ser Ser Thr Leu Thr Leu Ser Lys Ala Asp Tyr Glu
180 185 190
Lys His Lys Val Tyr Ala Cys Glu Val Thr His Gln Gly Leu Ser Ser
195 200 205
Pro Val Thr Lys Ser Phe Asn Arg Gly Glu Cys
210 215
<210> 33
<211> 115
<212> PRT
<213> artificial sequence
<220>
<223> H398 VH domain
<400> 33
Gln Val Gln Leu Gln Glu Ser Gly Ala Glu Leu Ala Arg Pro Gly Ala
1 5 10 15
Ser Val Lys Leu Ser Cys Lys Ala Ser Gly Tyr Thr Phe Thr Asp Phe
20 25 30
Tyr Ile Asn Trp Val Lys Gln Arg Thr Gly Gln Gly Leu Glu Trp Ile
35 40 45
Gly Glu Ile Tyr Pro Tyr Ser Gly His Ala Tyr Tyr Asn Glu Lys Phe
50 55 60
Lys Ala Lys Ala Thr Leu Thr Ala Asp Lys Ser Ser Ser Thr Ala Phe
65 70 75 80
Met Gln Leu Asn Ser Leu Thr Ser Glu Asp Ser Ala Val Tyr Phe Cys
85 90 95
Val Arg Trp Asp Phe Leu Asp Tyr Trp Gly Gln Gly Thr Thr Leu Thr
100 105 110
Val Ser Ser
115
<210> 34
<211> 113
<212> PRT
<213> artificial sequence
<220>
<223> H398 VL domain
<400> 34
Asp Ile Val Met Thr Gln Ser Pro Leu Ser Leu Pro Val Ser Leu Gly
1 5 10 15
Asp Gln Ala Ser Ile Ser Cys Arg Ser Ser Gln Ser Leu Leu His Ser
20 25 30
Asn Gly Asn Thr Tyr Leu His Trp Tyr Val Gln Lys Pro Gly Gln Ser
35 40 45
Pro Lys Leu Leu Ile Tyr Thr Val Ser Asn Arg Phe Ser Gly Val Pro
50 55 60
Asp Arg Phe Ser Gly Ser Gly Ser Gly Thr Asp Phe Thr Leu Lys Ile
65 70 75 80
Ser Arg Val Glu Ala Glu Asp Leu Gly Val Tyr Phe Cys Ser Gln Ser
85 90 95
Thr His Val Pro Tyr Thr Phe Gly Gly Gly Thr Lys Leu Glu Ile Lys
100 105 110
Arg
<210> 35
<211> 609
<212> PRT
<213> Homo sapiens
<220>
<223> Human Serum Albumin (HSA)
<220>
<221> SIGNAL
<222> (1)...(18)
<223> signal peptide
<220>
<221> PROPEP
<222> (19)...(24)
<223> propeptide
<220>
<221> PEPTIDE
<222> (25)...(609)
<223> albumin
<400> 35
Met Lys Trp Val Thr Phe Ile Ser Leu Leu Phe Leu Phe Ser Ser Ala
1 5 10 15
Tyr Ser Arg Gly Val Phe Arg Arg Asp Ala His Lys Ser Glu Val Ala
20 25 30
His Arg Phe Lys Asp Leu Gly Glu Glu Asn Phe Lys Ala Leu Val Leu
35 40 45
Ile Ala Phe Ala Gln Tyr Leu Gln Gln Cys Pro Phe Glu Asp His Val
50 55 60
Lys Leu Val Asn Glu Val Thr Glu Phe Ala Lys Thr Cys Val Ala Asp
65 70 75 80
Glu Ser Ala Glu Asn Cys Asp Lys Ser Leu His Thr Leu Phe Gly Asp
85 90 95
Lys Leu Cys Thr Val Ala Thr Leu Arg Glu Thr Tyr Gly Glu Met Ala
100 105 110
Asp Cys Cys Ala Lys Gln Glu Pro Glu Arg Asn Glu Cys Phe Leu Gln
115 120 125
His Lys Asp Asp Asn Pro Asn Leu Pro Arg Leu Val Arg Pro Glu Val
130 135 140
Asp Val Met Cys Thr Ala Phe His Asp Asn Glu Glu Thr Phe Leu Lys
145 150 155 160
Lys Tyr Leu Tyr Glu Ile Ala Arg Arg His Pro Tyr Phe Tyr Ala Pro
165 170 175
Glu Leu Leu Phe Phe Ala Lys Arg Tyr Lys Ala Ala Phe Thr Glu Cys
180 185 190
Cys Gln Ala Ala Asp Lys Ala Ala Cys Leu Leu Pro Lys Leu Asp Glu
195 200 205
Leu Arg Asp Glu Gly Lys Ala Ser Ser Ala Lys Gln Arg Leu Lys Cys
210 215 220
Ala Ser Leu Gln Lys Phe Gly Glu Arg Ala Phe Lys Ala Trp Ala Val
225 230 235 240
Ala Arg Leu Ser Gln Arg Phe Pro Lys Ala Glu Phe Ala Glu Val Ser
245 250 255
Lys Leu Val Thr Asp Leu Thr Lys Val His Thr Glu Cys Cys His Gly
260 265 270
Asp Leu Leu Glu Cys Ala Asp Asp Arg Ala Asp Leu Ala Lys Tyr Ile
275 280 285
Cys Glu Asn Gln Asp Ser Ile Ser Ser Lys Leu Lys Glu Cys Cys Glu
290 295 300
Lys Pro Leu Leu Glu Lys Ser His Cys Ile Ala Glu Val Glu Asn Asp
305 310 315 320
Glu Met Pro Ala Asp Leu Pro Ser Leu Ala Ala Asp Phe Val Glu Ser
325 330 335
Lys Asp Val Cys Lys Asn Tyr Ala Glu Ala Lys Asp Val Phe Leu Gly
340 345 350
Met Phe Leu Tyr Glu Tyr Ala Arg Arg His Pro Asp Tyr Ser Val Val
355 360 365
Leu Leu Leu Arg Leu Ala Lys Thr Tyr Glu Thr Thr Leu Glu Lys Cys
370 375 380
Cys Ala Ala Ala Asp Pro His Glu Cys Tyr Ala Lys Val Phe Asp Glu
385 390 395 400
Phe Lys Pro Leu Val Glu Glu Pro Gln Asn Leu Ile Lys Gln Asn Cys
405 410 415
Glu Leu Phe Glu Gln Leu Gly Glu Tyr Lys Phe Gln Asn Ala Leu Leu
420 425 430
Val Arg Tyr Thr Lys Lys Val Pro Gln Val Ser Thr Pro Thr Leu Val
435 440 445
Glu Val Ser Arg Asn Leu Gly Lys Val Gly Ser Lys Cys Cys Lys His
450 455 460
Pro Glu Ala Lys Arg Met Pro Cys Ala Glu Asp Tyr Leu Ser Val Val
465 470 475 480
Leu Asn Gln Leu Cys Val Leu His Glu Lys Thr Pro Val Ser Asp Arg
485 490 495
Val Thr Lys Cys Cys Thr Glu Ser Leu Val Asn Arg Arg Pro Cys Phe
500 505 510
Ser Ala Leu Glu Val Asp Glu Thr Tyr Val Pro Lys Glu Phe Asn Ala
515 520 525
Glu Thr Phe Thr Phe His Ala Asp Ile Cys Thr Leu Ser Glu Lys Glu
530 535 540
Arg Gln Ile Lys Lys Gln Thr Ala Leu Val Glu Leu Val Lys His Lys
545 550 555 560
Pro Lys Ala Thr Lys Glu Gln Leu Lys Ala Val Met Asp Asp Phe Ala
565 570 575
Ala Phe Val Glu Lys Cys Cys Lys Ala Asp Asp Lys Glu Thr Cys Phe
580 585 590
Ala Glu Glu Gly Lys Lys Leu Val Ala Ala Ser Gln Ala Ala Leu Gly
595 600 605
Leu
<210> 36
<211> 365
<212> PRT
<213> Homo sapiens
<220>
<223> Human FcRn (IgG receptor FcRn large subunit p51)
<220>
<221> SIGNAL
<222> (1)...(23)
<223> signal peptide
<220>
<221> DOMAIN
<222> (24)...(297)
<223> extracellular domain
<220>
<221> DOMAIN
<222> (298)...(321)
<223> transmembrane domain
<220>
<221> DOMAIN
<222> (322)... (365)
<223> cytoplasmic domain
<400> 36
Met Gly Val Pro Arg Pro Gln Pro Trp Ala Leu Gly Leu Leu Leu Phe
1 5 10 15
Leu Leu Pro Gly Ser Leu Gly Ala Glu Ser His Leu Ser Leu Leu Tyr
20 25 30
His Leu Thr Ala Val Ser Ser Pro Ala Pro Gly Thr Pro Ala Phe Trp
35 40 45
Val Ser Gly Trp Leu Gly Pro Gln Gln Tyr Leu Ser Tyr Asn Ser Leu
50 55 60
Arg Gly Glu Ala Glu Pro Cys Gly Ala Trp Val Trp Glu Asn Gln Val
65 70 75 80
Ser Trp Tyr Trp Glu Lys Glu Thr Thr Asp Leu Arg Ile Lys Glu Lys
85 90 95
Leu Phe Leu Glu Ala Phe Lys Ala Leu Gly Gly Lys Gly Pro Tyr Thr
100 105 110
Leu Gln Gly Leu Leu Gly Cys Glu Leu Gly Pro Asp Asn Thr Ser Val
115 120 125
Pro Thr Ala Lys Phe Ala Leu Asn Gly Glu Glu Phe Met Asn Phe Asp
130 135 140
Leu Lys Gln Gly Thr Trp Gly Gly Asp Trp Pro Glu Ala Leu Ala Ile
145 150 155 160
Ser Gln Arg Trp Gln Gln Gln Asp Lys Ala Ala Asn Lys Glu Leu Thr
165 170 175
Phe Leu Leu Phe Ser Cys Pro His Arg Leu Arg Glu His Leu Glu Arg
180 185 190
Gly Arg Gly Asn Leu Glu Trp Lys Glu Pro Pro Ser Met Arg Leu Lys
195 200 205
Ala Arg Pro Ser Ser Pro Gly Phe Ser Val Leu Thr Cys Ser Ala Phe
210 215 220
Ser Phe Tyr Pro Pro Glu Leu Gln Leu Arg Phe Leu Arg Asn Gly Leu
225 230 235 240
Ala Ala Gly Thr Gly Gln Gly Asp Phe Gly Pro Asn Ser Asp Gly Ser
245 250 255
Phe His Ala Ser Ser Ser Leu Thr Val Lys Ser Gly Asp Glu His His
260 265 270
Tyr Cys Cys Ile Val Gln His Ala Gly Leu Ala Gln Pro Leu Arg Val
275 280 285
Glu Leu Glu Ser Pro Ala Lys Ser Ser Val Leu Val Val Gly Ile Val
290 295 300
Ile Gly Val Leu Leu Leu Thr Ala Ala Ala Val Gly Gly Ala Leu Leu
305 310 315 320
Trp Arg Arg Met Arg Ser Gly Leu Pro Ala Pro Trp Ile Ser Leu Arg
325 330 335
Gly Asp Asp Thr Gly Val Leu Leu Pro Thr Pro Gly Glu Ala Gln Asp
340 345 350
Ala Asp Leu Lys Asp Val Asn Val Ile Pro Ala Thr Ala
355 360 365
<210> 37
<211> 690
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> DMS5541
<400> 37
gaggtgcagc tgttggagtc tgggggaggc ttggtacagc ctggggggtc cctgcgtctc 60
tcctgtgcag cctccggatt cacctttgat aagtattcga tggggtgggt ccgccaggct 120
ccagggaagg gtctagagtg ggtctcacag atttcggata ctgctgatcg tacatactac 180
gcacacgcgg tgaagggccg gttcaccatc tcccgcgaca attccaagaa cacgctgtat 240
ctgcaaatga acagcctgcg tgctgaggac accgcggtat attactgtgc gatatatact 300
gggcgttggg tgccttttga gtactggggt cagggaaccc tggtcaccgt ctcgagcgct 360
agcaccgaca tccagatgac ccagtctcca tcctccctgt ctgcatctgt aggagaccgt 420
gtcaccatca cttgccgggc aagtcgtccg attgggacga cgttaagttg gtaccagcag 480
aaaccaggga aagcccctaa gctcctgatc ctgtggaatt cccgtttgca aagtggggtc 540
ccatcacgtt tcagtggcag tggatctggg acagatttca ctctcaccat cagcagtctg 600
caacctgaag attttgctac gtactactgt gcgcaggctg ggacgcatcc tacgacgttc 660
ggccaaggga ccaaggtgga aatcaaacgg 690
<210> 38
<211> 230
<212> PRT
<213> artificial sequence
<220>
<223> DMS5541
<400> 38
Glu Val Gln Leu Leu Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly Gly
1 5 10 15
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Asp Lys Tyr
20 25 30
Ser Met Gly Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val
35 40 45
Ser Gln Ile Ser Asp Thr Ala Asp Arg Thr Tyr Tyr Ala His Ala Val
50 55 60
Lys Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Ser Lys Asn Thr Leu Tyr
65 70 75 80
Leu Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys
85 90 95
Ala Ile Tyr Thr Gly Arg Trp Val Pro Phe Glu Tyr Trp Gly Gln Gly
100 105 110
Thr Leu Val Thr Val Ser Ser Ala Ser Thr Asp Ile Gln Met Thr Gln
115 120 125
Ser Pro Ser Ser Leu Ser Ala Ser Val Gly Asp Arg Val Thr Ile Thr
130 135 140
Cys Arg Ala Ser Arg Pro Ile Gly Thr Thr Leu Ser Trp Tyr Gln Gln
145 150 155 160
Lys Pro Gly Lys Ala Pro Lys Leu Leu Ile Leu Trp Asn Ser Arg Leu
165 170 175
Gln Ser Gly Val Pro Ser Arg Phe Ser Gly Ser Gly Ser Gly Thr Asp
180 185 190
Phe Thr Leu Thr Ile Ser Ser Leu Gln Pro Glu Asp Phe Ala Thr Tyr
195 200 205
Tyr Cys Ala Gln Ala Gly Thr His Pro Thr Thr Phe Gly Gln Gly Thr
210 215 220
Lys Val Glu Ile Lys Arg
225 230
<210> 39
<211> 231
<212> PRT
<213> artificial sequence
<220>
<223> DMS5540 (mouse specific)
<400> 39
Glu Val Gln Leu Leu Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly Gly
1 5 10 15
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Asn Arg Tyr
20 25 30
Ser Met Gly Trp Leu Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val
35 40 45
Ser Arg Ile Asp Ser Tyr Gly Arg Gly Thr Tyr Tyr Glu Asp Pro Val
50 55 60
Lys Gly Arg Phe Ser Ile Ser Arg Asp Asn Ser Lys Asn Thr Leu Tyr
65 70 75 80
Leu Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys
85 90 95
Ala Lys Ile Ser Gln Phe Gly Ser Asn Ala Phe Asp Tyr Trp Gly Gln
100 105 110
Gly Thr Gln Val Thr Val Ser Ser Ala Ser Thr Asp Ile Gln Met Thr
115 120 125
Gln Ser Pro Ser Ser Leu Ser Ala Ser Val Gly Asp Arg Val Thr Ile
130 135 140
Thr Cys Arg Ala Ser Arg Pro Ile Gly Thr Met Leu Ser Trp Tyr Gln
145 150 155 160
Gln Lys Pro Gly Lys Ala Pro Lys Leu Leu Ile Leu Phe Gly Ser Arg
165 170 175
Leu Gln Ser Gly Val Pro Ser Arg Phe Ser Gly Ser Gly Ser Gly Thr
180 185 190
Asp Phe Thr Leu Thr Ile Ser Ser Leu Gln Pro Glu Asp Phe Ala Thr
195 200 205
Tyr Tyr Cys Ala Gln Ala Gly Thr His Pro Thr Thr Phe Gly Gln Gly
210 215 220
Thr Lys Val Glu Ile Lys Arg
225 230
<210> 40
<211> 1210
<212> PRT
<213> Homo sapiens
<220>
<223> human EGFR (HER1) precursor
<220>
<221> SIGNAL
<222> (1)...(24)
<223> signal peptide
<220>
<221> DOMAIN
<222> (25)...(645)
<223> Extracellular domain (ECD)
<220>
<221> DOMAIN
<222> (646)...(668)
<223> transmembrane region
<220>
<221> DOMAIN
<222> (669)...(1210)
<223> cytoplasmic domain
<220>
<221> DOMAIN
<222> (712)...(979)
<223> protein kinases
<400> 40
Met Arg Pro Ser Gly Thr Ala Gly Ala Ala Leu Leu Ala Leu Leu Ala
1 5 10 15
Ala Leu Cys Pro Ala Ser Arg Ala Leu Glu Glu Lys Lys Val Cys Gln
20 25 30
Gly Thr Ser Asn Lys Leu Thr Gln Leu Gly Thr Phe Glu Asp His Phe
35 40 45
Leu Ser Leu Gln Arg Met Phe Asn Asn Cys Glu Val Val Leu Gly Asn
50 55 60
Leu Glu Ile Thr Tyr Val Gln Arg Asn Tyr Asp Leu Ser Phe Leu Lys
65 70 75 80
Thr Ile Gln Glu Val Ala Gly Tyr Val Leu Ile Ala Leu Asn Thr Val
85 90 95
Glu Arg Ile Pro Leu Glu Asn Leu Gln Ile Ile Arg Gly Asn Met Tyr
100 105 110
Tyr Glu Asn Ser Tyr Ala Leu Ala Val Leu Ser Asn Tyr Asp Ala Asn
115 120 125
Lys Thr Gly Leu Lys Glu Leu Pro Met Arg Asn Leu Gln Glu Ile Leu
130 135 140
His Gly Ala Val Arg Phe Ser Asn Asn Pro Ala Leu Cys Asn Val Glu
145 150 155 160
Ser Ile Gln Trp Arg Asp Ile Val Ser Ser Asp Phe Leu Ser Asn Met
165 170 175
Ser Met Asp Phe Gln Asn His Leu Gly Ser Cys Gln Lys Cys Asp Pro
180 185 190
Ser Cys Pro Asn Gly Ser Cys Trp Gly Ala Gly Glu Glu Asn Cys Gln
195 200 205
Lys Leu Thr Lys Ile Ile Cys Ala Gln Gln Cys Ser Gly Arg Cys Arg
210 215 220
Gly Lys Ser Pro Ser Asp Cys Cys His Asn Gln Cys Ala Ala Gly Cys
225 230 235 240
Thr Gly Pro Arg Glu Ser Asp Cys Leu Val Cys Arg Lys Phe Arg Asp
245 250 255
Glu Ala Thr Cys Lys Asp Thr Cys Pro Pro Leu Met Leu Tyr Asn Pro
260 265 270
Thr Thr Tyr Gln Met Asp Val Asn Pro Glu Gly Lys Tyr Ser Phe Gly
275 280 285
Ala Thr Cys Val Lys Lys Cys Pro Arg Asn Tyr Val Val Thr Asp His
290 295 300
Gly Ser Cys Val Arg Ala Cys Gly Ala Asp Ser Tyr Glu Met Glu Glu
305 310 315 320
Asp Gly Val Arg Lys Cys Lys Lys Cys Glu Gly Pro Cys Arg Lys Val
325 330 335
Cys Asn Gly Ile Gly Ile Gly Glu Phe Lys Asp Ser Leu Ser Ile Asn
340 345 350
Ala Thr Asn Ile Lys His Phe Lys Asn Cys Thr Ser Ile Ser Gly Asp
355 360 365
Leu His Ile Leu Pro Val Ala Phe Arg Gly Asp Ser Phe Thr His Thr
370 375 380
Pro Pro Leu Asp Pro Gln Glu Leu Asp Ile Leu Lys Thr Val Lys Glu
385 390 395 400
Ile Thr Gly Phe Leu Leu Ile Gln Ala Trp Pro Glu Asn Arg Thr Asp
405 410 415
Leu His Ala Phe Glu Asn Leu Glu Ile Ile Arg Gly Arg Thr Lys Gln
420 425 430
His Gly Gln Phe Ser Leu Ala Val Val Ser Leu Asn Ile Thr Ser Leu
435 440 445
Gly Leu Arg Ser Leu Lys Glu Ile Ser Asp Gly Asp Val Ile Ile Ser
450 455 460
Gly Asn Lys Asn Leu Cys Tyr Ala Asn Thr Ile Asn Trp Lys Lys Leu
465 470 475 480
Phe Gly Thr Ser Gly Gln Lys Thr Lys Ile Ile Ser Asn Arg Gly Glu
485 490 495
Asn Ser Cys Lys Ala Thr Gly Gln Val Cys His Ala Leu Cys Ser Pro
500 505 510
Glu Gly Cys Trp Gly Pro Glu Pro Arg Asp Cys Val Ser Cys Arg Asn
515 520 525
Val Ser Arg Gly Arg Glu Cys Val Asp Lys Cys Asn Leu Leu Glu Gly
530 535 540
Glu Pro Arg Glu Phe Val Glu Asn Ser Glu Cys Ile Gln Cys His Pro
545 550 555 560
Glu Cys Leu Pro Gln Ala Met Asn Ile Thr Cys Thr Gly Arg Gly Pro
565 570 575
Asp Asn Cys Ile Gln Cys Ala His Tyr Ile Asp Gly Pro His Cys Val
580 585 590
Lys Thr Cys Pro Ala Gly Val Met Gly Glu Asn Asn Thr Leu Val Trp
595 600 605
Lys Tyr Ala Asp Ala Gly His Val Cys His Leu Cys His Pro Asn Cys
610 615 620
Thr Tyr Gly Cys Thr Gly Pro Gly Leu Glu Gly Cys Pro Thr Asn Gly
625 630 635 640
Pro Lys Ile Pro Ser Ile Ala Thr Gly Met Val Gly Ala Leu Leu Leu
645 650 655
Leu Leu Val Val Ala Leu Gly Ile Gly Leu Phe Met Arg Arg Arg His
660 665 670
Ile Val Arg Lys Arg Thr Leu Arg Arg Leu Leu Gln Glu Arg Glu Leu
675 680 685
Val Glu Pro Leu Thr Pro Ser Gly Glu Ala Pro Asn Gln Ala Leu Leu
690 695 700
Arg Ile Leu Lys Glu Thr Glu Phe Lys Lys Ile Lys Val Leu Gly Ser
705 710 715 720
Gly Ala Phe Gly Thr Val Tyr Lys Gly Leu Trp Ile Pro Glu Gly Glu
725 730 735
Lys Val Lys Ile Pro Val Ala Ile Lys Glu Leu Arg Glu Ala Thr Ser
740 745 750
Pro Lys Ala Asn Lys Glu Ile Leu Asp Glu Ala Tyr Val Met Ala Ser
755 760 765
Val Asp Asn Pro His Val Cys Arg Leu Leu Gly Ile Cys Leu Thr Ser
770 775 780
Thr Val Gln Leu Ile Thr Gln Leu Met Pro Phe Gly Cys Leu Leu Asp
785 790 795 800
Tyr Val Arg Glu His Lys Asp Asn Ile Gly Ser Gln Tyr Leu Leu Asn
805 810 815
Trp Cys Val Gln Ile Ala Lys Gly Met Asn Tyr Leu Glu Asp Arg Arg
820 825 830
Leu Val His Arg Asp Leu Ala Ala Arg Asn Val Leu Val Lys Thr Pro
835 840 845
Gln His Val Lys Ile Thr Asp Phe Gly Leu Ala Lys Leu Leu Gly Ala
850 855 860
Glu Glu Lys Glu Tyr His Ala Glu Gly Gly Lys Val Pro Ile Lys Trp
865 870 875 880
Met Ala Leu Glu Ser Ile Leu His Arg Ile Tyr Thr His Gln Ser Asp
885 890 895
Val Trp Ser Tyr Gly Val Thr Val Trp Glu Leu Met Thr Phe Gly Ser
900 905 910
Lys Pro Tyr Asp Gly Ile Pro Ala Ser Glu Ile Ser Ser Ile Leu Glu
915 920 925
Lys Gly Glu Arg Leu Pro Gln Pro Pro Ile Cys Thr Ile Asp Val Tyr
930 935 940
Met Ile Met Val Lys Cys Trp Met Ile Asp Ala Asp Ser Arg Pro Lys
945 950 955 960
Phe Arg Glu Leu Ile Ile Glu Phe Ser Lys Met Ala Arg Asp Pro Gln
965 970 975
Arg Tyr Leu Val Ile Gln Gly Asp Glu Arg Met His Leu Pro Ser Pro
980 985 990
Thr Asp Ser Asn Phe Tyr Arg Ala Leu Met Asp Glu Glu Asp Met Asp
995 1000 1005
Asp Val Val Asp Ala Asp Glu Tyr Leu Ile Pro Gln Gln Gly Phe Phe
1010 1015 1020
Ser Ser Pro Ser Thr Ser Arg Thr Pro Leu Leu Ser Ser Leu Ser Ala
1025 1030 1035 1040
Thr Ser Asn Asn Ser Thr Val Ala Cys Ile Asp Arg Asn Gly Leu Gln
1045 1050 1055
Ser Cys Pro Ile Lys Glu Asp Ser Phe Leu Gln Arg Tyr Ser Ser Asp
1060 1065 1070
Pro Thr Gly Ala Leu Thr Glu Asp Ser Ile Asp Asp Thr Phe Leu Pro
1075 1080 1085
Val Pro Glu Tyr Ile Asn Gln Ser Val Pro Lys Arg Pro Ala Gly Ser
1090 1095 1100
Val Gln Asn Pro Val Tyr His Asn Gln Pro Leu Asn Pro Ala Pro Ser
1105 1110 1115 1120
Arg Asp Pro His Tyr Gln Asp Pro His Ser Thr Ala Val Gly Asn Pro
1125 1130 1135
Glu Tyr Leu Asn Thr Val Gln Pro Thr Cys Val Asn Ser Thr Phe Asp
1140 1145 1150
Ser Pro Ala His Trp Ala Gln Lys Gly Ser His Gln Ile Ser Leu Asp
1155 1160 1165
Asn Pro Asp Tyr Gln Gln Asp Phe Phe Pro Lys Glu Ala Lys Pro Asn
1170 1175 1180
Gly Ile Phe Lys Gly Ser Thr Ala Glu Asn Ala Glu Tyr Leu Arg Val
1185 1190 1195 1200
Ala Pro Gln Ser Ser Glu Phe Ile Gly Ala
1205 1210
<210> 41
<211> 1186
<212> PRT
<213> Homo sapiens
<220>
<223> Mature human EGFR/HER1 (minus the signal peptide)
<220>
<221> DOMAIN
<222> (1)...(621)
<223> Extracellular domain (ECD)
<220>
<221> DOMAIN
<222> (1)...(165)
<223> domain I of ECD
<220>
<221> DOMAIN
<222> (166)...(313)
<223> domain II of ECD
<220>
<221> DOMAIN
<222> (314)... (481)
<223> domain III of ECD
<220>
<221> DOMAIN
<222> (482)...(621)
<223> domain IV of ECD
<400> 41
Leu Glu Glu Lys Lys Val Cys Gln Gly Thr Ser Asn Lys Leu Thr Gln
1 5 10 15
Leu Gly Thr Phe Glu Asp His Phe Leu Ser Leu Gln Arg Met Phe Asn
20 25 30
Asn Cys Glu Val Val Leu Gly Asn Leu Glu Ile Thr Tyr Val Gln Arg
35 40 45
Asn Tyr Asp Leu Ser Phe Leu Lys Thr Ile Gln Glu Val Ala Gly Tyr
50 55 60
Val Leu Ile Ala Leu Asn Thr Val Glu Arg Ile Pro Leu Glu Asn Leu
65 70 75 80
Gln Ile Ile Arg Gly Asn Met Tyr Tyr Glu Asn Ser Tyr Ala Leu Ala
85 90 95
Val Leu Ser Asn Tyr Asp Ala Asn Lys Thr Gly Leu Lys Glu Leu Pro
100 105 110
Met Arg Asn Leu Gln Glu Ile Leu His Gly Ala Val Arg Phe Ser Asn
115 120 125
Asn Pro Ala Leu Cys Asn Val Glu Ser Ile Gln Trp Arg Asp Ile Val
130 135 140
Ser Ser Asp Phe Leu Ser Asn Met Ser Met Asp Phe Gln Asn His Leu
145 150 155 160
Gly Ser Cys Gln Lys Cys Asp Pro Ser Cys Pro Asn Gly Ser Cys Trp
165 170 175
Gly Ala Gly Glu Glu Asn Cys Gln Lys Leu Thr Lys Ile Ile Cys Ala
180 185 190
Gln Gln Cys Ser Gly Arg Cys Arg Gly Lys Ser Pro Ser Asp Cys Cys
195 200 205
His Asn Gln Cys Ala Ala Gly Cys Thr Gly Pro Arg Glu Ser Asp Cys
210 215 220
Leu Val Cys Arg Lys Phe Arg Asp Glu Ala Thr Cys Lys Asp Thr Cys
225 230 235 240
Pro Pro Leu Met Leu Tyr Asn Pro Thr Thr Tyr Gln Met Asp Val Asn
245 250 255
Pro Glu Gly Lys Tyr Ser Phe Gly Ala Thr Cys Val Lys Lys Cys Pro
260 265 270
Arg Asn Tyr Val Val Thr Asp His Gly Ser Cys Val Arg Ala Cys Gly
275 280 285
Ala Asp Ser Tyr Glu Met Glu Glu Asp Gly Val Arg Lys Cys Lys Lys
290 295 300
Cys Glu Gly Pro Cys Arg Lys Val Cys Asn Gly Ile Gly Ile Gly Glu
305 310 315 320
Phe Lys Asp Ser Leu Ser Ile Asn Ala Thr Asn Ile Lys His Phe Lys
325 330 335
Asn Cys Thr Ser Ile Ser Gly Asp Leu His Ile Leu Pro Val Ala Phe
340 345 350
Arg Gly Asp Ser Phe Thr His Thr Pro Pro Leu Asp Pro Gln Glu Leu
355 360 365
Asp Ile Leu Lys Thr Val Lys Glu Ile Thr Gly Phe Leu Leu Ile Gln
370 375 380
Ala Trp Pro Glu Asn Arg Thr Asp Leu His Ala Phe Glu Asn Leu Glu
385 390 395 400
Ile Ile Arg Gly Arg Thr Lys Gln His Gly Gln Phe Ser Leu Ala Val
405 410 415
Val Ser Leu Asn Ile Thr Ser Leu Gly Leu Arg Ser Leu Lys Glu Ile
420 425 430
Ser Asp Gly Asp Val Ile Ile Ser Gly Asn Lys Asn Leu Cys Tyr Ala
435 440 445
Asn Thr Ile Asn Trp Lys Lys Leu Phe Gly Thr Ser Gly Gln Lys Thr
450 455 460
Lys Ile Ile Ser Asn Arg Gly Glu Asn Ser Cys Lys Ala Thr Gly Gln
465 470 475 480
Val Cys His Ala Leu Cys Ser Pro Glu Gly Cys Trp Gly Pro Glu Pro
485 490 495
Arg Asp Cys Val Ser Cys Arg Asn Val Ser Arg Gly Arg Glu Cys Val
500 505 510
Asp Lys Cys Asn Leu Leu Glu Gly Glu Pro Arg Glu Phe Val Glu Asn
515 520 525
Ser Glu Cys Ile Gln Cys His Pro Glu Cys Leu Pro Gln Ala Met Asn
530 535 540
Ile Thr Cys Thr Gly Arg Gly Pro Asp Asn Cys Ile Gln Cys Ala His
545 550 555 560
Tyr Ile Asp Gly Pro His Cys Val Lys Thr Cys Pro Ala Gly Val Met
565 570 575
Gly Glu Asn Asn Thr Leu Val Trp Lys Tyr Ala Asp Ala Gly His Val
580 585 590
Cys His Leu Cys His Pro Asn Cys Thr Tyr Gly Cys Thr Gly Pro Gly
595 600 605
Leu Glu Gly Cys Pro Thr Asn Gly Pro Lys Ile Pro Ser Ile Ala Thr
610 615 620
Gly Met Val Gly Ala Leu Leu Leu Leu Leu Val Val Ala Leu Gly Ile
625 630 635 640
Gly Leu Phe Met Arg Arg Arg His Ile Val Arg Lys Arg Thr Leu Arg
645 650 655
Arg Leu Leu Gln Glu Arg Glu Leu Val Glu Pro Leu Thr Pro Ser Gly
660 665 670
Glu Ala Pro Asn Gln Ala Leu Leu Arg Ile Leu Lys Glu Thr Glu Phe
675 680 685
Lys Lys Ile Lys Val Leu Gly Ser Gly Ala Phe Gly Thr Val Tyr Lys
690 695 700
Gly Leu Trp Ile Pro Glu Gly Glu Lys Val Lys Ile Pro Val Ala Ile
705 710 715 720
Lys Glu Leu Arg Glu Ala Thr Ser Pro Lys Ala Asn Lys Glu Ile Leu
725 730 735
Asp Glu Ala Tyr Val Met Ala Ser Val Asp Asn Pro His Val Cys Arg
740 745 750
Leu Leu Gly Ile Cys Leu Thr Ser Thr Val Gln Leu Ile Thr Gln Leu
755 760 765
Met Pro Phe Gly Cys Leu Leu Asp Tyr Val Arg Glu His Lys Asp Asn
770 775 780
Ile Gly Ser Gln Tyr Leu Leu Asn Trp Cys Val Gln Ile Ala Lys Gly
785 790 795 800
Met Asn Tyr Leu Glu Asp Arg Arg Leu Val His Arg Asp Leu Ala Ala
805 810 815
Arg Asn Val Leu Val Lys Thr Pro Gln His Val Lys Ile Thr Asp Phe
820 825 830
Gly Leu Ala Lys Leu Leu Gly Ala Glu Glu Lys Glu Tyr His Ala Glu
835 840 845
Gly Gly Lys Val Pro Ile Lys Trp Met Ala Leu Glu Ser Ile Leu His
850 855 860
Arg Ile Tyr Thr His Gln Ser Asp Val Trp Ser Tyr Gly Val Thr Val
865 870 875 880
Trp Glu Leu Met Thr Phe Gly Ser Lys Pro Tyr Asp Gly Ile Pro Ala
885 890 895
Ser Glu Ile Ser Ser Ile Leu Glu Lys Gly Glu Arg Leu Pro Gln Pro
900 905 910
Pro Ile Cys Thr Ile Asp Val Tyr Met Ile Met Val Lys Cys Trp Met
915 920 925
Ile Asp Ala Asp Ser Arg Pro Lys Phe Arg Glu Leu Ile Ile Glu Phe
930 935 940
Ser Lys Met Ala Arg Asp Pro Gln Arg Tyr Leu Val Ile Gln Gly Asp
945 950 955 960
Glu Arg Met His Leu Pro Ser Pro Thr Asp Ser Asn Phe Tyr Arg Ala
965 970 975
Leu Met Asp Glu Glu Asp Met Asp Asp Val Val Asp Ala Asp Glu Tyr
980 985 990
Leu Ile Pro Gln Gln Gly Phe Phe Ser Ser Pro Ser Thr Ser Arg Thr
995 1000 1005
Pro Leu Leu Ser Ser Leu Ser Ala Thr Ser Asn Asn Ser Thr Val Ala
1010 1015 1020
Cys Ile Asp Arg Asn Gly Leu Gln Ser Cys Pro Ile Lys Glu Asp Ser
1025 1030 1035 1040
Phe Leu Gln Arg Tyr Ser Ser Asp Pro Thr Gly Ala Leu Thr Glu Asp
1045 1050 1055
Ser Ile Asp Asp Thr Phe Leu Pro Val Pro Glu Tyr Ile Asn Gln Ser
1060 1065 1070
Val Pro Lys Arg Pro Ala Gly Ser Val Gln Asn Pro Val Tyr His Asn
1075 1080 1085
Gln Pro Leu Asn Pro Ala Pro Ser Arg Asp Pro His Tyr Gln Asp Pro
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His Ser Thr Ala Val Gly Asn Pro Glu Tyr Leu Asn Thr Val Gln Pro
1105 1110 1115 1120
Thr Cys Val Asn Ser Thr Phe Asp Ser Pro Ala His Trp Ala Gln Lys
1125 1130 1135
Gly Ser His Gln Ile Ser Leu Asp Asn Pro Asp Tyr Gln Gln Asp Phe
1140 1145 1150
Phe Pro Lys Glu Ala Lys Pro Asn Gly Ile Phe Lys Gly Ser Thr Ala
1155 1160 1165
Glu Asn Ala Glu Tyr Leu Arg Val Ala Pro Gln Ser Ser Glu Phe Ile
1170 1175 1180
Gly Ala
1185
<210> 42
<211> 1255
<212> PRT
<213> Homo sapiens
<220>
<223> Human HER2 (ErbB2) precursor
<220>
<221> SIGNAL
<222> (1)...(22)
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<220>
<221> DOMAIN
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<223> extracellular domain (ECD)
<220>
<221> DOMAIN
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<223> transmembrane region
<220>
<221> DOMAIN
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<223> cytoplasmic domain
<220>
<221> DOMAIN
<222> (720)...(987)
<223> protein kinase
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Met Glu Leu Ala Ala Leu Cys Arg Trp Gly Leu Leu Leu Ala Leu Leu
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130 135 140
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165 170 175
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225 230 235 240
Ala Ala Gly Cys Thr Gly Pro Lys His Ser Asp Cys Leu Ala Cys Leu
245 250 255
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260 265 270
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275 280 285
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290 295 300
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305 310 315 320
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325 330 335
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340 345 350
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355 360 365
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370 375 380
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420 425 430
Gly Arg Ile Leu His Asn Gly Ala Tyr Ser Leu Thr Leu Gln Gly Leu
435 440 445
Gly Ile Ser Trp Leu Gly Leu Arg Ser Leu Arg Glu Leu Gly Ser Gly
450 455 460
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465 470 475 480
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485 490 495
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500 505 510
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Pro Cys Pro Ile Asn Cys Thr His Ser Cys Val Asp Leu Asp Asp Lys
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645 650 655
Ala Val Val Gly Ile Leu Leu Val Val Val Leu Gly Val Val Phe Gly
660 665 670
Ile Leu Ile Lys Arg Arg Gln Gln Lys Ile Arg Lys Tyr Thr Met Arg
675 680 685
Arg Leu Leu Gln Glu Thr Glu Leu Val Glu Pro Leu Thr Pro Ser Gly
690 695 700
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705 710 715 720
Arg Lys Val Lys Val Leu Gly Ser Gly Ala Phe Gly Thr Val Tyr Lys
725 730 735
Gly Ile Trp Ile Pro Asp Gly Glu Asn Val Lys Ile Pro Val Ala Ile
740 745 750
Lys Val Leu Arg Glu Asn Thr Ser Pro Lys Ala Asn Lys Glu Ile Leu
755 760 765
Asp Glu Ala Tyr Val Met Ala Gly Val Gly Ser Pro Tyr Val Ser Arg
770 775 780
Leu Leu Gly Ile Cys Leu Thr Ser Thr Val Gln Leu Val Thr Gln Leu
785 790 795 800
Met Pro Tyr Gly Cys Leu Leu Asp His Val Arg Glu Asn Arg Gly Arg
805 810 815
Leu Gly Ser Gln Asp Leu Leu Asn Trp Cys Met Gln Ile Ala Lys Gly
820 825 830
Met Ser Tyr Leu Glu Asp Val Arg Leu Val His Arg Asp Leu Ala Ala
835 840 845
Arg Asn Val Leu Val Lys Ser Pro Asn His Val Lys Ile Thr Asp Phe
850 855 860
Gly Leu Ala Arg Leu Leu Asp Ile Asp Glu Thr Glu Tyr His Ala Asp
865 870 875 880
Gly Gly Lys Val Pro Ile Lys Trp Met Ala Leu Glu Ser Ile Leu Arg
885 890 895
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900 905 910
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915 920 925
Arg Glu Ile Pro Asp Leu Leu Glu Lys Gly Glu Arg Leu Pro Gln Pro
930 935 940
Pro Ile Cys Thr Ile Asp Val Tyr Met Ile Met Val Lys Cys Trp Met
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965 970 975
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980 985 990
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995 1000 1005
Leu Glu Asp Asp Asp Met Gly Asp Leu Val Asp Ala Glu Glu Tyr Leu
1010 1015 1020
Val Pro Gln Gln Gly Phe Phe Cys Pro Asp Pro Ala Pro Gly Ala Gly
1025 1030 1035 1040
Gly Met Val His His Arg His Arg Ser Ser Ser Thr Arg Ser Gly Gly
1045 1050 1055
Gly Asp Leu Thr Leu Gly Leu Glu Pro Ser Glu Glu Glu Ala Pro Arg
1060 1065 1070
Ser Pro Leu Ala Pro Ser Glu Gly Ala Gly Ser Asp Val Phe Asp Gly
1075 1080 1085
Asp Leu Gly Met Gly Ala Ala Lys Gly Leu Gln Ser Leu Pro Thr His
1090 1095 1100
Asp Pro Ser Pro Leu Gln Arg Tyr Ser Glu Asp Pro Thr Val Pro Leu
1105 1110 1115 1120
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1125 1130 1135
Pro Glu Tyr Val Asn Gln Pro Asp Val Arg Pro Gln Pro Pro Ser Pro
1140 1145 1150
Arg Glu Gly Pro Leu Pro Ala Ala Arg Pro Ala Gly Ala Thr Leu Glu
1155 1160 1165
Arg Pro Lys Thr Leu Ser Pro Gly Lys Asn Gly Val Val Lys Asp Val
1170 1175 1180
Phe Ala Phe Gly Gly Ala Val Glu Asn Pro Glu Tyr Leu Thr Pro Gln
1185 1190 1195 1200
Gly Gly Ala Ala Pro Gln Pro His Pro Pro Pro Ala Phe Ser Pro Ala
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Phe Asp Asn Leu Tyr Tyr Trp Asp Gln Asp Pro Pro Glu Arg Gly Ala
1220 1225 1230
Pro Pro Ser Thr Phe Lys Gly Thr Pro Thr Ala Glu Asn Pro Glu Tyr
1235 1240 1245
Leu Gly Leu Asp Val Pro Val
1250 1255
<210> 43
<211> 1233
<212> PRT
<213> Homo sapiens
<220>
<223> Mature human HER2 (ErbB2) Protein (minus the
signal peptide)
<220>
<221> DOMAIN
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<223> Extracellular domain (ECD)
<220>
<221> DOMAIN
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<220>
<221> DOMAIN
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<220>
<221> DOMAIN
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<220>
<221> DOMAIN
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<223> domain IV of ECD
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35 40 45
Leu Ser Phe Leu Gln Asp Ile Gln Glu Val Gln Gly Tyr Val Leu Ile
50 55 60
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65 70 75 80
Arg Gly Thr Gln Leu Phe Glu Asp Asn Tyr Ala Leu Ala Val Leu Asp
85 90 95
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100 105 110
Gly Gly Leu Arg Glu Leu Gln Leu Arg Ser Leu Thr Glu Ile Leu Lys
115 120 125
Gly Gly Val Leu Ile Gln Arg Asn Pro Gln Leu Cys Tyr Gln Asp Thr
130 135 140
Ile Leu Trp Lys Asp Ile Phe His Lys Asn Asn Gln Leu Ala Leu Thr
145 150 155 160
Leu Ile Asp Thr Asn Arg Ser Arg Ala Cys His Pro Cys Ser Pro Met
165 170 175
Cys Lys Gly Ser Arg Cys Trp Gly Glu Ser Ser Glu Asp Cys Gln Ser
180 185 190
Leu Thr Arg Thr Val Cys Ala Gly Gly Cys Ala Arg Cys Lys Gly Pro
195 200 205
Leu Pro Thr Asp Cys Cys His Glu Gln Cys Ala Ala Gly Cys Thr Gly
210 215 220
Pro Lys His Ser Asp Cys Leu Ala Cys Leu His Phe Asn His Ser Gly
225 230 235 240
Ile Cys Glu Leu His Cys Pro Ala Leu Val Thr Tyr Asn Thr Asp Thr
245 250 255
Phe Glu Ser Met Pro Asn Pro Glu Gly Arg Tyr Thr Phe Gly Ala Ser
260 265 270
Cys Val Thr Ala Cys Pro Tyr Asn Tyr Leu Ser Thr Asp Val Gly Ser
275 280 285
Cys Thr Leu Val Cys Pro Leu His Asn Gln Glu Val Thr Ala Glu Asp
290 295 300
Gly Thr Gln Arg Cys Glu Lys Cys Ser Lys Pro Cys Ala Arg Val Cys
305 310 315 320
Tyr Gly Leu Gly Met Glu His Leu Arg Glu Val Arg Ala Val Thr Ser
325 330 335
Ala Asn Ile Gln Glu Phe Ala Gly Cys Lys Lys Ile Phe Gly Ser Leu
340 345 350
Ala Phe Leu Pro Glu Ser Phe Asp Gly Asp Pro Ala Ser Asn Thr Ala
355 360 365
Pro Leu Gln Pro Glu Gln Leu Gln Val Phe Glu Thr Leu Glu Glu Ile
370 375 380
Thr Gly Tyr Leu Tyr Ile Ser Ala Trp Pro Asp Ser Leu Pro Asp Leu
385 390 395 400
Ser Val Phe Gln Asn Leu Gln Val Ile Arg Gly Arg Ile Leu His Asn
405 410 415
Gly Ala Tyr Ser Leu Thr Leu Gln Gly Leu Gly Ile Ser Trp Leu Gly
420 425 430
Leu Arg Ser Leu Arg Glu Leu Gly Ser Gly Leu Ala Leu Ile His His
435 440 445
Asn Thr His Leu Cys Phe Val His Thr Val Pro Trp Asp Gln Leu Phe
450 455 460
Arg Asn Pro His Gln Ala Leu Leu His Thr Ala Asn Arg Pro Glu Asp
465 470 475 480
Glu Cys Val Gly Glu Gly Leu Ala Cys His Gln Leu Cys Ala Arg Gly
485 490 495
His Cys Trp Gly Pro Gly Pro Thr Gln Cys Val Asn Cys Ser Gln Phe
500 505 510
Leu Arg Gly Gln Glu Cys Val Glu Glu Cys Arg Val Leu Gln Gly Leu
515 520 525
Pro Arg Glu Tyr Val Asn Ala Arg His Cys Leu Pro Cys His Pro Glu
530 535 540
Cys Gln Pro Gln Asn Gly Ser Val Thr Cys Phe Gly Pro Glu Ala Asp
545 550 555 560
Gln Cys Val Ala Cys Ala His Tyr Lys Asp Pro Pro Phe Cys Val Ala
565 570 575
Arg Cys Pro Ser Gly Val Lys Pro Asp Leu Ser Tyr Met Pro Ile Trp
580 585 590
Lys Phe Pro Asp Glu Glu Gly Ala Cys Gln Pro Cys Pro Ile Asn Cys
595 600 605
Thr His Ser Cys Val Asp Leu Asp Asp Lys Gly Cys Pro Ala Glu Gln
610 615 620
Arg Ala Ser Pro Leu Thr Ser Ile Ile Ser Ala Val Val Gly Ile Leu
625 630 635 640
Leu Val Val Val Leu Gly Val Val Phe Gly Ile Leu Ile Lys Arg Arg
645 650 655
Gln Gln Lys Ile Arg Lys Tyr Thr Met Arg Arg Leu Leu Gln Glu Thr
660 665 670
Glu Leu Val Glu Pro Leu Thr Pro Ser Gly Ala Met Pro Asn Gln Ala
675 680 685
Gln Met Arg Ile Leu Lys Glu Thr Glu Leu Arg Lys Val Lys Val Leu
690 695 700
Gly Ser Gly Ala Phe Gly Thr Val Tyr Lys Gly Ile Trp Ile Pro Asp
705 710 715 720
Gly Glu Asn Val Lys Ile Pro Val Ala Ile Lys Val Leu Arg Glu Asn
725 730 735
Thr Ser Pro Lys Ala Asn Lys Glu Ile Leu Asp Glu Ala Tyr Val Met
740 745 750
Ala Gly Val Gly Ser Pro Tyr Val Ser Arg Leu Leu Gly Ile Cys Leu
755 760 765
Thr Ser Thr Val Gln Leu Val Thr Gln Leu Met Pro Tyr Gly Cys Leu
770 775 780
Leu Asp His Val Arg Glu Asn Arg Gly Arg Leu Gly Ser Gln Asp Leu
785 790 795 800
Leu Asn Trp Cys Met Gln Ile Ala Lys Gly Met Ser Tyr Leu Glu Asp
805 810 815
Val Arg Leu Val His Arg Asp Leu Ala Ala Arg Asn Val Leu Val Lys
820 825 830
Ser Pro Asn His Val Lys Ile Thr Asp Phe Gly Leu Ala Arg Leu Leu
835 840 845
Asp Ile Asp Glu Thr Glu Tyr His Ala Asp Gly Gly Lys Val Pro Ile
850 855 860
Lys Trp Met Ala Leu Glu Ser Ile Leu Arg Arg Arg Phe Thr His Gln
865 870 875 880
Ser Asp Val Trp Ser Tyr Gly Val Thr Val Trp Glu Leu Met Thr Phe
885 890 895
Gly Ala Lys Pro Tyr Asp Gly Ile Pro Ala Arg Glu Ile Pro Asp Leu
900 905 910
Leu Glu Lys Gly Glu Arg Leu Pro Gln Pro Pro Ile Cys Thr Ile Asp
915 920 925
Val Tyr Met Ile Met Val Lys Cys Trp Met Ile Asp Ser Glu Cys Arg
930 935 940
Pro Arg Phe Arg Glu Leu Val Ser Glu Phe Ser Arg Met Ala Arg Asp
945 950 955 960
Pro Gln Arg Phe Val Val Ile Gln Asn Glu Asp Leu Gly Pro Ala Ser
965 970 975
Pro Leu Asp Ser Thr Phe Tyr Arg Ser Leu Leu Glu Asp Asp Asp Met
980 985 990
Gly Asp Leu Val Asp Ala Glu Glu Tyr Leu Val Pro Gln Gln Gly Phe
995 1000 1005
Phe Cys Pro Asp Pro Ala Pro Gly Ala Gly Gly Met Val His His Arg
1010 1015 1020
His Arg Ser Ser Ser Thr Arg Ser Gly Gly Gly Asp Leu Thr Leu Gly
1025 1030 1035 1040
Leu Glu Pro Ser Glu Glu Glu Ala Pro Arg Ser Pro Leu Ala Pro Ser
1045 1050 1055
Glu Gly Ala Gly Ser Asp Val Phe Asp Gly Asp Leu Gly Met Gly Ala
1060 1065 1070
Ala Lys Gly Leu Gln Ser Leu Pro Thr His Asp Pro Ser Pro Leu Gln
1075 1080 1085
Arg Tyr Ser Glu Asp Pro Thr Val Pro Leu Pro Ser Glu Thr Asp Gly
1090 1095 1100
Tyr Val Ala Pro Leu Thr Cys Ser Pro Gln Pro Glu Tyr Val Asn Gln
1105 1110 1115 1120
Pro Asp Val Arg Pro Gln Pro Pro Ser Pro Arg Glu Gly Pro Leu Pro
1125 1130 1135
Ala Ala Arg Pro Ala Gly Ala Thr Leu Glu Arg Pro Lys Thr Leu Ser
1140 1145 1150
Pro Gly Lys Asn Gly Val Val Lys Asp Val Phe Ala Phe Gly Gly Ala
1155 1160 1165
Val Glu Asn Pro Glu Tyr Leu Thr Pro Gln Gly Gly Ala Ala Pro Gln
1170 1175 1180
Pro His Pro Pro Pro Ala Phe Ser Pro Ala Phe Asp Asn Leu Tyr Tyr
1185 1190 1195 1200
Trp Asp Gln Asp Pro Pro Glu Arg Gly Ala Pro Pro Ser Thr Phe Lys
1205 1210 1215
Gly Thr Pro Thr Ala Glu Asn Pro Glu Tyr Leu Gly Leu Asp Val Pro
1220 1225 1230
Val
<210> 44
<211> 1342
<212> PRT
<213> Homo sapiens
<220>
<223> Human HER3 (ErbB3) precursor
<220>
<221> SIGNAL
<222> (1)...(19)
<223> signal peptide
<220>
<221> DOMAIN
<222> (20)...(643)
<223> Extracellular domain (ECD)
<220>
<221> DOMAIN
<222> (644)...(664)
<223> transmembrane region
<220>
<221> DOMAIN
<222> (665)...(1342)
<223> cytoplasmic domain
<220>
<221> DOMAIN
<222> (709)...(966)
<223> protein kinase
<400> 44
Met Arg Ala Asn Asp Ala Leu Gln Val Leu Gly Leu Leu Phe Ser Leu
1 5 10 15
Ala Arg Gly Ser Glu Val Gly Asn Ser Gln Ala Val Cys Pro Gly Thr
20 25 30
Leu Asn Gly Leu Ser Val Thr Gly Asp Ala Glu Asn Gln Tyr Gln Thr
35 40 45
Leu Tyr Lys Leu Tyr Glu Arg Cys Glu Val Val Met Gly Asn Leu Glu
50 55 60
Ile Val Leu Thr Gly His Asn Ala Asp Leu Ser Phe Leu Gln Trp Ile
65 70 75 80
Arg Glu Val Thr Gly Tyr Val Leu Val Ala Met Asn Glu Phe Ser Thr
85 90 95
Leu Pro Leu Pro Asn Leu Arg Val Val Arg Gly Thr Gln Val Tyr Asp
100 105 110
Gly Lys Phe Ala Ile Phe Val Met Leu Asn Tyr Asn Thr Asn Ser Ser
115 120 125
His Ala Leu Arg Gln Leu Arg Leu Thr Gln Leu Thr Glu Ile Leu Ser
130 135 140
Gly Gly Val Tyr Ile Glu Lys Asn Asp Lys Leu Cys His Met Asp Thr
145 150 155 160
Ile Asp Trp Arg Asp Ile Val Arg Asp Arg Asp Ala Glu Ile Val Val
165 170 175
Lys Asp Asn Gly Arg Ser Cys Pro Pro Cys His Glu Val Cys Lys Gly
180 185 190
Arg Cys Trp Gly Pro Gly Ser Glu Asp Cys Gln Thr Leu Thr Lys Thr
195 200 205
Ile Cys Ala Pro Gln Cys Asn Gly His Cys Phe Gly Pro Asn Pro Asn
210 215 220
Gln Cys Cys His Asp Glu Cys Ala Gly Gly Cys Ser Gly Pro Gln Asp
225 230 235 240
Thr Asp Cys Phe Ala Cys Arg His Phe Asn Asp Ser Gly Ala Cys Val
245 250 255
Pro Arg Cys Pro Gln Pro Leu Val Tyr Asn Lys Leu Thr Phe Gln Leu
260 265 270
Glu Pro Asn Pro His Thr Lys Tyr Gln Tyr Gly Gly Val Cys Val Ala
275 280 285
Ser Cys Pro His Asn Phe Val Val Asp Gln Thr Ser Cys Val Arg Ala
290 295 300
Cys Pro Pro Asp Lys Met Glu Val Asp Lys Asn Gly Leu Lys Met Cys
305 310 315 320
Glu Pro Cys Gly Gly Leu Cys Pro Lys Ala Cys Glu Gly Thr Gly Ser
325 330 335
Gly Ser Arg Phe Gln Thr Val Asp Ser Ser Asn Ile Asp Gly Phe Val
340 345 350
Asn Cys Thr Lys Ile Leu Gly Asn Leu Asp Phe Leu Ile Thr Gly Leu
355 360 365
Asn Gly Asp Pro Trp His Lys Ile Pro Ala Leu Asp Pro Glu Lys Leu
370 375 380
Asn Val Phe Arg Thr Val Arg Glu Ile Thr Gly Tyr Leu Asn Ile Gln
385 390 395 400
Ser Trp Pro Pro His Met His Asn Phe Ser Val Phe Ser Asn Leu Thr
405 410 415
Thr Ile Gly Gly Arg Ser Leu Tyr Asn Arg Gly Phe Ser Leu Leu Ile
420 425 430
Met Lys Asn Leu Asn Val Thr Ser Leu Gly Phe Arg Ser Leu Lys Glu
435 440 445
Ile Ser Ala Gly Arg Ile Tyr Ile Ser Ala Asn Arg Gln Leu Cys Tyr
450 455 460
His His Ser Leu Asn Trp Thr Lys Val Leu Arg Gly Pro Thr Glu Glu
465 470 475 480
Arg Leu Asp Ile Lys His Asn Arg Pro Arg Arg Asp Cys Val Ala Glu
485 490 495
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500 505 510
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<220>
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<223> domain IV of ECD
<400> 47
Gln Ser Val Cys Ala Gly Thr Glu Asn Lys Leu Ser Ser Leu Ser Asp
1 5 10 15
Leu Glu Gln Gln Tyr Arg Ala Leu Arg Lys Tyr Tyr Glu Asn Cys Glu
20 25 30
Val Val Met Gly Asn Leu Glu Ile Thr Ser Ile Glu His Asn Arg Asp
35 40 45
Leu Ser Phe Leu Arg Ser Val Arg Glu Val Thr Gly Tyr Val Leu Val
50 55 60
Ala Leu Asn Gln Phe Arg Tyr Leu Pro Leu Glu Asn Leu Arg Ile Ile
65 70 75 80
Arg Gly Thr Lys Leu Tyr Glu Asp Arg Tyr Ala Leu Ala Ile Phe Leu
85 90 95
Asn Tyr Arg Lys Asp Gly Asn Phe Gly Leu Gln Glu Leu Gly Leu Lys
100 105 110
Asn Leu Thr Glu Ile Leu Asn Gly Gly Val Tyr Val Asp Gln Asn Lys
115 120 125
Phe Leu Cys Tyr Ala Asp Thr Ile His Trp Gln Asp Ile Val Arg Asn
130 135 140
Pro Trp Pro Ser Asn Leu Thr Leu Val Ser Thr Asn Gly Ser Ser Gly
145 150 155 160
Cys Gly Arg Cys His Lys Ser Cys Thr Gly Arg Cys Trp Gly Pro Thr
165 170 175
Glu Asn His Cys Gln Thr Leu Thr Arg Thr Val Cys Ala Glu Gln Cys
180 185 190
Asp Gly Arg Cys Tyr Gly Pro Tyr Val Ser Asp Cys Cys His Arg Glu
195 200 205
Cys Ala Gly Gly Cys Ser Gly Pro Lys Asp Thr Asp Cys Phe Ala Cys
210 215 220
Met Asn Phe Asn Asp Ser Gly Ala Cys Val Thr Gln Cys Pro Gln Thr
225 230 235 240
Phe Val Tyr Asn Pro Thr Thr Phe Gln Leu Glu His Asn Phe Asn Ala
245 250 255
Lys Tyr Thr Tyr Gly Ala Phe Cys Val Lys Lys Cys Pro His Asn Phe
260 265 270
Val Val Asp Ser Ser Ser Cys Val Arg Ala Cys Pro Ser Ser Lys Met
275 280 285
Glu Val Glu Glu Asn Gly Ile Lys Met Cys Lys Pro Cys Thr Asp Ile
290 295 300
Cys Pro Lys Ala Cys Asp Gly Ile Gly Thr Gly Ser Leu Met Ser Ala
305 310 315 320
Gln Thr Val Asp Ser Ser Asn Ile Asp Lys Phe Ile Asn Cys Thr Lys
325 330 335
Ile Asn Gly Asn Leu Ile Phe Leu Val Thr Gly Ile His Gly Asp Pro
340 345 350
Tyr Asn Ala Ile Glu Ala Ile Asp Pro Glu Lys Leu Asn Val Phe Arg
355 360 365
Thr Val Arg Glu Ile Thr Gly Phe Leu Asn Ile Gln Ser Trp Pro Pro
370 375 380
Asn Met Thr Asp Phe Ser Val Phe Ser Asn Leu Val Thr Ile Gly Gly
385 390 395 400
Arg Val Leu Tyr Ser Gly Leu Ser Leu Leu Ile Leu Lys Gln Gln Gly
405 410 415
Ile Thr Ser Leu Gln Phe Gln Ser Leu Lys Glu Ile Ser Ala Gly Asn
420 425 430
Ile Tyr Ile Thr Asp Asn Ser Asn Leu Cys Tyr Tyr His Thr Ile Asn
435 440 445
Trp Thr Thr Leu Phe Ser Thr Ile Asn Gln Arg Ile Val Ile Arg Asp
450 455 460
Asn Arg Lys Ala Glu Asn Cys Thr Ala Glu Gly Met Val Cys Asn His
465 470 475 480
Leu Cys Ser Ser Asp Gly Cys Trp Gly Pro Gly Pro Asp Gln Cys Leu
485 490 495
Ser Cys Arg Arg Phe Ser Arg Gly Arg Ile Cys Ile Glu Ser Cys Asn
500 505 510
Leu Tyr Asp Gly Glu Phe Arg Glu Phe Glu Asn Gly Ser Ile Cys Val
515 520 525
Glu Cys Asp Pro Gln Cys Glu Lys Met Glu Asp Gly Leu Leu Thr Cys
530 535 540
His Gly Pro Gly Pro Asp Asn Cys Thr Lys Cys Ser His Phe Lys Asp
545 550 555 560
Gly Pro Asn Cys Val Glu Lys Cys Pro Asp Gly Leu Gln Gly Ala Asn
565 570 575
Ser Phe Ile Phe Lys Tyr Ala Asp Pro Asp Arg Glu Cys His Pro Cys
580 585 590
His Pro Asn Cys Thr Gln Gly Cys Asn Gly Pro Thr Ser His Asp Cys
595 600 605
Ile Tyr Tyr Pro Trp Thr Gly His Ser Thr Leu Pro Gln His Ala Arg
610 615 620
Thr Pro Leu Ile Ala Ala Gly Val Ile Gly Gly Leu Phe Ile Leu Val
625 630 635 640
Ile Val Gly Leu Thr Phe Ala Val Tyr Val Arg Arg Lys Ser Ile Lys
645 650 655
Lys Lys Arg Ala Leu Arg Arg Phe Leu Glu Thr Glu Leu Val Glu Pro
660 665 670
Leu Thr Pro Ser Gly Thr Ala Pro Asn Gln Ala Gln Leu Arg Ile Leu
675 680 685
Lys Glu Thr Glu Leu Lys Arg Val Lys Val Leu Gly Ser Gly Ala Phe
690 695 700
Gly Thr Val Tyr Lys Gly Ile Trp Val Pro Glu Gly Glu Thr Val Lys
705 710 715 720
Ile Pro Val Ala Ile Lys Ile Leu Asn Glu Thr Thr Gly Pro Lys Ala
725 730 735
Asn Val Glu Phe Met Asp Glu Ala Leu Ile Met Ala Ser Met Asp His
740 745 750
Pro His Leu Val Arg Leu Leu Gly Val Cys Leu Ser Pro Thr Ile Gln
755 760 765
Leu Val Thr Gln Leu Met Pro His Gly Cys Leu Leu Glu Tyr Val His
770 775 780
Glu His Lys Asp Asn Ile Gly Ser Gln Leu Leu Leu Asn Trp Cys Val
785 790 795 800
Gln Ile Ala Lys Gly Met Met Tyr Leu Glu Glu Arg Arg Leu Val His
805 810 815
Arg Asp Leu Ala Ala Arg Asn Val Leu Val Lys Ser Pro Asn His Val
820 825 830
Lys Ile Thr Asp Phe Gly Leu Ala Arg Leu Leu Glu Gly Asp Glu Lys
835 840 845
Glu Tyr Asn Ala Asp Gly Gly Lys Met Pro Ile Lys Trp Met Ala Leu
850 855 860
Glu Cys Ile His Tyr Arg Lys Phe Thr His Gln Ser Asp Val Trp Ser
865 870 875 880
Tyr Gly Val Thr Ile Trp Glu Leu Met Thr Phe Gly Gly Lys Pro Tyr
885 890 895
Asp Gly Ile Pro Thr Arg Glu Ile Pro Asp Leu Leu Glu Lys Gly Glu
900 905 910
Arg Leu Pro Gln Pro Pro Ile Cys Thr Ile Asp Val Tyr Met Val Met
915 920 925
Val Lys Cys Trp Met Ile Asp Ala Asp Ser Arg Pro Lys Phe Lys Glu
930 935 940
Leu Ala Ala Glu Phe Ser Arg Met Ala Arg Asp Pro Gln Arg Tyr Leu
945 950 955 960
Val Ile Gln Gly Asp Asp Arg Met Lys Leu Pro Ser Pro Asn Asp Ser
965 970 975
Lys Phe Phe Gln Asn Leu Leu Asp Glu Glu Asp Leu Glu Asp Met Met
980 985 990
Asp Ala Glu Glu Tyr Leu Val Pro Gln Ala Phe Asn Ile Pro Pro Pro
995 1000 1005
Ile Tyr Thr Ser Arg Ala Arg Ile Asp Ser Asn Arg Ser Glu Ile Gly
1010 1015 1020
His Ser Pro Pro Pro Ala Tyr Thr Pro Met Ser Gly Asn Gln Phe Val
1025 1030 1035 1040
Tyr Arg Asp Gly Gly Phe Ala Ala Glu Gln Gly Val Ser Val Pro Tyr
1045 1050 1055
Arg Ala Pro Thr Ser Thr Ile Pro Glu Ala Pro Val Ala Gln Gly Ala
1060 1065 1070
Thr Ala Glu Ile Phe Asp Asp Ser Cys Cys Asn Gly Thr Leu Arg Lys
1075 1080 1085
Pro Val Ala Pro His Val Gln Glu Asp Ser Ser Thr Gln Arg Tyr Ser
1090 1095 1100
Ala Asp Pro Thr Val Phe Ala Pro Glu Arg Ser Pro Arg Gly Glu Leu
1105 1110 1115 1120
Asp Glu Glu Gly Tyr Met Thr Pro Met Arg Asp Lys Pro Lys Gln Glu
1125 1130 1135
Tyr Leu Asn Pro Val Glu Asn Pro Phe Val Ser Arg Arg Lys Asn
1140 1145 1150
Gly Asp Leu Gln Ala Leu Asp Asn Pro Glu Tyr His Asn Ala Ser Asn
1155 1160 1165
Gly Pro Pro Lys Ala Glu Asp Glu Tyr Val Asn Glu Pro Leu Tyr Leu
1170 1175 1180
Asn Thr Phe Ala Asn Thr Leu Gly Lys Ala Glu Tyr Leu Lys Asn Asn
1185 1190 1195 1200
Ile Leu Ser Met Pro Glu Lys Ala Lys Lys Ala Phe Asp Asn Pro Asp
1205 1210 1215
Tyr Trp Asn His Ser Leu Pro Pro Arg Ser Thr Leu Gln His Pro Asp
1220 1225 1230
Tyr Leu Gln Glu Tyr Ser Thr Lys Tyr Phe Tyr Lys Gln Asn Gly Arg
1235 1240 1245
Ile Arg Pro Ile Val Ala Glu Asn Pro Glu Tyr Leu Ser Glu Phe Ser
1250 1255 1260
Leu Lys Pro Gly Thr Val Leu Pro Pro Pro Pro Tyr Arg His Arg Asn
1265 1270 1275 1280
Thr Val Val
<210> 48
<211> 16
<212> PRT
<213> artificial sequence
<220>
<223> cyclic FcRnBP
<400> 48
Gln Arg Phe Cys Thr Gly His Phe Gly Gly Leu Tyr Pro Cys Asn Gly
1 5 10 15
<210> 49
<211> 16
<212> PRT
<213> artificial sequence
<220>
<223> cyclic FcRnBP
<400> 49
Gln Arg Phe Cys Thr Gly His Phe Gly Gly Leu His Pro Cys Asn Gly
1 5 10 15
<210> 50
<211> 16
<212> PRT
<213> artificial sequence
<220>
<223> linear FcRnBP
<400> 50
Gln Arg Phe Val Thr Gly His Phe Gly Gly Leu Tyr Pro Ala Asn Gly
1 5 10 15
<210> 51
<211> 16
<212> PRT
<213> artificial sequence
<220>
<223> linear FcRnBP
<400> 51
Gln Arg Phe Val Thr Gly His Phe Gly Gly Leu His Pro Ala Asn Gly
1 5 10 15
<210> 52
<211> 108
<212> PRT
<213> artificial sequence
<220>
<223> DOM7h-11-3 (albumin-binding dAb)
<400> 52
Asp Ile Gln Met Thr Gln Ser Pro Ser Ser Leu Ser Ala Ser Val Gly
1 5 10 15
Asp Arg Val Thr Ile Thr Cys Arg Ala Ser Arg Pro Ile Gly Thr Thr
20 25 30
Leu Ser Trp Tyr Gln Gln Lys Pro Gly Lys Ala Pro Lys Leu Leu Ile
35 40 45
Leu Trp Asn Ser Arg Leu Gln Ser Gly Val Pro Ser Arg Phe Ser Gly
50 55 60
Ser Gly Ser Gly Thr Asp Phe Thr Leu Thr Ile Ser Ser Leu Gln Pro
65 70 75 80
Glu Asp Phe Ala Thr Tyr Tyr Cys Ala Gln Ala Gly Thr His Pro Thr
85 90 95
Thr Phe Gly Gln Gly Thr Lys Val Glu Ile Lys Arg
100 105
<210> 53
<211> 120
<212> PRT
<213> artificial sequence
<220>
<223> DOM1m-21-23 (mouse anti-TNFR1 dAb from DMS5540)
<400> 53
Glu Val Gln Leu Leu Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly Gly
1 5 10 15
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Asn Arg Tyr
20 25 30
Ser Met Gly Trp Leu Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val
35 40 45
Ser Arg Ile Asp Ser Tyr Gly Arg Gly Thr Tyr Tyr Glu Asp Pro Val
50 55 60
Lys Gly Arg Phe Ser Ile Ser Arg Asp Asn Ser Lys Asn Thr Leu Tyr
65 70 75 80
Leu Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys
85 90 95
Ala Lys Ile Ser Gln Phe Gly Ser Asn Ala Phe Asp Tyr Trp Gly Gln
100 105 110
Gly Thr Gln Val Thr Val Ser Ser
115 120
<210> 54
<211> 119
<212> PRT
<213> artificial sequence
<220>
<223> DOM1h-574-208 (human anti-TNFR1 dAb from DMS5541)
<400> 54
Glu Val Gln Leu Leu Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly Gly
1 5 10 15
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Asp Lys Tyr
20 25 30
Ser Met Gly Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val
35 40 45
Ser Gln Ile Ser Asp Thr Ala Asp Arg Thr Tyr Tyr Ala His Ala Val
50 55 60
Lys Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Ser Lys Asn Thr Leu Tyr
65 70 75 80
Leu Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys
85 90 95
Ala Ile Tyr Thr Gly Arg Trp Val Pro Phe Glu Tyr Trp Gly Gln Gly
100 105 110
Thr Leu Val Thr Val Ser Ser
115
<210> 55
<211> 119
<212> PRT
<213> artificial sequence
<220>
<223> GSK1995057 (anti-TNFR1 antagonistic dAb)
<400> 55
Glu Val Gln Leu Leu Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly Gly
1 5 10 15
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Ala His Glu
20 25 30
Thr Met Val Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val
35 40 45
Ser His Ile Pro Pro Asp Gly Gln Asp Pro Phe Tyr Ala Asp Ser Val
50 55 60
Lys Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Ser Lys Asn Thr Leu Tyr
65 70 75 80
Leu Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Val Tyr His Cys
85 90 95
Ala Leu Leu Pro Lys Arg Gly Pro Trp Phe Asp Tyr Trp Gly Gln Gly
100 105 110
Thr Leu Val Thr Val Ser Ser
115
<210> 56
<211> 120
<212> PRT
<213> artificial sequence
<220>
<223> GSK2862277 (anti-TNFR1 antagonistic dAb)
<400> 56
Glu Val Gln Leu Leu Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly Gly
1 5 10 15
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Ala His Glu
20 25 30
Thr Met Val Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val
35 40 45
Ser His Ile Pro Pro Asp Gly Gln Asp Pro Phe Tyr Ala Asp Ser Val
50 55 60
Lys Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Ser Lys Asn Thr Leu Tyr
65 70 75 80
Leu Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Val Tyr His Cys
85 90 95
Ala Leu Leu Pro Lys Arg Gly Pro Trp Phe Asp Tyr Trp Gly Gln Gly
100 105 110
Thr Leu Val Thr Val Ser Ser Ala
115 120
<210> 57
<211> 119
<212> PRT
<213> artificial sequence
<220>
<223> DOMlh-574-16 anti-TNFR1 dAb
<400> 57
Glu Val Gln Leu Leu Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly Gly
1 5 10 15
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Val Lys Tyr
20 25 30
Ser Met Gly Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Pro Glu Trp Val
35 40 45
Ser Gln Ile Ser Asn Thr Gly Asp Arg Thr Tyr Tyr Ala Asp Ser Val
50 55 60
Lys Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Ser Lys Asn Thr Leu Tyr
65 70 75 80
Leu Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys
85 90 95
Ala Ile Tyr Thr Gly Arg Trp Glu Pro Phe Asp Tyr Trp Gly Gln Gly
100 105 110
Thr Leu Val Thr Val Ser Ser
115
<210> 58
<211> 119
<212> PRT
<213> artificial sequence
<220>
<223> DOMlh-549 anti-TNFR1 dAb
<400> 58
Glu Val Gln Leu Leu Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly Gly
1 5 10 15
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Val Asp Tyr
20 25 30
Glu Met His Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val
35 40 45
Ser Ser Ile Ser Glu Ser Gly Thr Thr Thr Tyr Tyr Ala Asp Ser Val
50 55 60
Lys Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Ser Lys Asn Thr Leu Tyr
65 70 75 80
Leu Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys
85 90 95
Ala Lys Arg Arg Phe Ser Ala Ser Thr Phe Asp Tyr Trp Gly Gln Gly
100 105 110
Thr Leu Val Thr Val Ser Ser
115
<210> 59
<211> 119
<212> PRT
<213> artificial sequence
<220>
<223> DOM1h-131-206 anti-TNFR1 dAb
<400> 59
Glu Val Gln Leu Leu Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly Gly
1 5 10 15
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Ala His Glu
20 25 30
Thr Met Val Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val
35 40 45
Ser His Ile Pro Pro Asp Gly Gln Asp Pro Phe Tyr Ala Asp Ser Val
50 55 60
Lys Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Ser Lys Asn Thr Leu Tyr
65 70 75 80
Leu Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Val Tyr His Cys
85 90 95
Ala Leu Leu Pro Lys Arg Gly Pro Trp Phe Asp Tyr Trp Gly Gln Gly
100 105 110
Thr Leu Val Thr Val Ser Ser
115
<210> 60
<211> 119
<212> PRT
<213> artificial sequence
<220>
<223> DOM1h-131-511 anti-TNFR1 dAb
<400> 60
Glu Val Gln Leu Leu Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly Gly
1 5 10 15
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Ala His Glu
20 25 30
Thr Met Val Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val
35 40 45
Ser His Ile Pro Pro Val Gly Gln Asp Pro Phe Tyr Ala Asp Ser Val
50 55 60
Lys Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Ser Lys Asn Thr Leu Tyr
65 70 75 80
Leu Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys
85 90 95
Ala Leu Leu Pro Lys Arg Gly Pro Trp Phe Asp Tyr Trp Gly Gln Gly
100 105 110
Thr Leu Val Thr Val Ser Ser
115
<210> 61
<211> 119
<212> PRT
<213> artificial sequence
<220>
<223> variant 1-1 of DOM1h-131-511 anti-TNFR1 dAb
<400> 61
Glu Val Gln Leu Leu Glu Ser Gly Gly Gly Met Val Gln Pro Gly Gly
1 5 10 15
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Ala His Glu
20 25 30
Thr Met Val Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val
35 40 45
Ser His Ile Pro Pro Val Gly Gln Asp Pro Phe Tyr Ala Asp Ser Val
50 55 60
Lys Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Ser Lys Asn Thr Leu Tyr
65 70 75 80
Leu Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys
85 90 95
Ala Leu Leu Pro Lys Arg Gly Pro Trp Phe Asp Tyr Trp Gly Gln Gly
100 105 110
Thr Leu Val Thr Val Ser Ser
115
<210> 62
<211> 119
<212> PRT
<213> artificial sequence
<220>
<223> variant 1-2 of DOM1h-131-511 anti-TNFR1 dAb
<400> 62
Glu Val Gln Leu Leu Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly Gly
1 5 10 15
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Ala Phe Ala His Glu
20 25 30
Thr Met Val Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val
35 40 45
Ser His Ile Pro Pro Val Gly Gln Asp Pro Phe Tyr Ala Asp Ser Val
50 55 60
Lys Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Ser Lys Asn Thr Leu Tyr
65 70 75 80
Leu Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys
85 90 95
Ala Leu Leu Pro Lys Arg Gly Pro Trp Phe Asp Tyr Trp Gly Gln Gly
100 105 110
Thr Leu Val Thr Val Ser Ser
115
<210> 63
<211> 119
<212> PRT
<213> artificial sequence
<220>
<223> variant 1-3 of DOM1h-131-511 anti-TNFR1 dAb
<400> 63
Glu Val Gln Leu Leu Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly Gly
1 5 10 15
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Asn Phe Ala His Glu
20 25 30
Thr Met Val Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val
35 40 45
Ser His Ile Pro Pro Val Gly Gln Asp Pro Phe Tyr Ala Asp Ser Val
50 55 60
Lys Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Ser Lys Asn Thr Leu Tyr
65 70 75 80
Leu Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys
85 90 95
Ala Leu Leu Pro Lys Arg Gly Pro Trp Phe Asp Tyr Trp Gly Gln Gly
100 105 110
Thr Leu Val Thr Val Ser Ser
115
<210> 64
<211> 119
<212> PRT
<213> artificial sequence
<220>
<223> DOM1h-131-201 anti-TNFR1 dAb
<400> 64
Glu Val Gln Leu Leu Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly Gly
1 5 10 15
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Ala His Glu
20 25 30
Thr Met Val Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val
35 40 45
Ser His Ile Pro Pro Val Gly Gln Asp Pro Phe Tyr Ala Asp Ser Val
50 55 60
Lys Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asp Ser Lys Asn Thr Leu Tyr
65 70 75 80
Leu Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys
85 90 95
Ala Leu Leu Pro Lys Arg Gly Pro Trp Phe Asp Tyr Trp Gly Gln Gly
100 105 110
Thr Leu Val Thr Val Ser Ser
115
<210> 65
<211> 119
<212> PRT
<213> artificial sequence
<220>
<223> variant 1-5 of DOM1h-131-511 anti-TNFR1 dAb
<400> 65
Glu Val Gln Leu Leu Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly Gly
1 5 10 15
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Ala His Glu
20 25 30
Thr Met Val Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val
35 40 45
Ser His Ile Pro Pro Val Gly Gln Asp Pro Phe Tyr Ala Asp Ser Val
50 55 60
Lys Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Ser Lys Asn Thr Leu Tyr
65 70 75 80
Leu Gln Met Asn Asn Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys
85 90 95
Ala Leu Leu Pro Lys Arg Gly Pro Trp Phe Asp Tyr Trp Gly Gln Gly
100 105 110
Thr Leu Val Thr Val Ser Ser
115
<210> 66
<211> 119
<212> PRT
<213> artificial sequence
<220>
<223> variant 1-6 of DOM1h-131-511 anti-TNFR1 dAb
<400> 66
Glu Val Gln Leu Leu Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly Gly
1 5 10 15
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Ala His Glu
20 25 30
Thr Met Val Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val
35 40 45
Ser His Ile Pro Pro Ala Gly Gln Asp Pro Phe Tyr Ala Asp Ser Val
50 55 60
Lys Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Ser Lys Ser Thr Leu Tyr
65 70 75 80
Leu Gln Met Asn Gly Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys
85 90 95
Ala Leu Leu Pro Lys Arg Gly Pro Trp Phe Asp Tyr Trp Gly Gln Gly
100 105 110
Thr Leu Val Thr Val Ser Ser
115
<210> 67
<211> 119
<212> PRT
<213> artificial sequence
<220>
<223> variant 1-7 of DOM1h-131-511 anti-TNFR1 dAb
<400> 67
Glu Val Gln Leu Leu Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Lys Pro Gly Gly
1 5 10 15
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Ala His Glu
20 25 30
Thr Met Val Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val
35 40 45
Ser His Ile Pro Pro Ala Gly Gln Asp Pro Phe Tyr Ala Asp Ser Val
50 55 60
Lys Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Ser Lys Asn Thr Leu Tyr
65 70 75 80
Leu Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys
85 90 95
Ala Leu Leu Pro Lys Arg Gly Pro Trp Phe Asp Tyr Trp Gly Gln Gly
100 105 110
Thr Leu Val Thr Val Ser Ser
115
<210> 68
<211> 119
<212> PRT
<213> artificial sequence
<220>
<223> DOM1h-131-202 anti-TNFR1 dAb
<400> 68
Glu Val Gln Leu Leu Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly Gly
1 5 10 15
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Ala His Glu
20 25 30
Thr Met Val Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val
35 40 45
Ser His Ile Pro Pro Asp Gly Gln Asp Pro Phe Tyr Ala Asp Ser Val
50 55 60
Lys Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Ser Lys Asn Thr Leu Tyr
65 70 75 80
Leu Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys
85 90 95
Ala Leu Leu Pro Lys Arg Gly Pro Trp Phe Asp Tyr Trp Gly Gln Gly
100 105 110
Thr Leu Val Thr Val Ser Ser
115
<210> 69
<211> 119
<212> PRT
<213> artificial sequence
<220>
<223> DOM1h-131-203 anti-TNFR1 dAb
<400> 69
Glu Val Gln Leu Trp Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly Gly
1 5 10 15
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Ala His Glu
20 25 30
Thr Met Val Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val
35 40 45
Ser His Ile Pro Pro Asp Gly Gln Asp Pro Phe Tyr Ala Asp Ser Val
50 55 60
Lys Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Ser Lys Asn Thr Leu Tyr
65 70 75 80
Leu Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys
85 90 95
Ala Leu Leu Pro Lys Arg Gly Pro Trp Ile Asp Tyr Trp Gly Gln Gly
100 105 110
Thr Leu Val Thr Val Ser Ser
115
<210> 70
<211> 119
<212> PRT
<213> artificial sequence
<220>
<223> DOM1h-131-204 anti-TNFR1 dAb
<400> 70
Glu Val Gln Leu Ser Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly Gly
1 5 10 15
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Ala His Glu
20 25 30
Thr Met Val Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val
35 40 45
Ser His Ile Pro Pro Asp Gly Gln Asp Pro Phe Tyr Ala Asp Ser Val
50 55 60
Lys Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Ser Lys Asn Thr Leu Tyr
65 70 75 80
Leu Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys
85 90 95
Ala Leu Leu Pro Asn Arg Gly Pro Trp Phe Asp Tyr Trp Gly Gln Gly
100 105 110
Thr Leu Val Thr Val Ser Ser
115
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<211> 119
<212> PRT
<213> artificial sequence
<220>
<223> DOM1h-131-205 anti-TNFR1 dAb
<400> 71
Glu Val Gln Leu Leu Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly Gly
1 5 10 15
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Ala His Glu
20 25 30
Thr Met Val Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val
35 40 45
Ser His Ile Pro Pro Asp Gly Gln Asp Pro Phe Tyr Ala Asp Ser Val
50 55 60
Lys Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Ser Lys Asn Thr Leu Tyr
65 70 75 80
Leu Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys
85 90 95
Ala Leu Leu Pro Lys Arg Gly Pro Trp Phe Asp Tyr Trp Gly Gln Gly
100 105 110
Thr Gln Val Thr Val Ser Ser
115
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<211> 119
<212> PRT
<213> artificial sequence
<220>
<223> variant 1-12 of DOM1h-131-511 anti-TNFR1 dAb
<400> 72
Glu Val Arg Leu Leu Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly Gly
1 5 10 15
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Thr Ala Ser Gly Phe Thr Phe Ala His Glu
20 25 30
Thr Met Val Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val
35 40 45
Ser His Ile Pro Pro Asp Gly Gln Asp Pro Phe Tyr Ala Asp Ser Val
50 55 60
Lys Ser Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Ser Lys Asn Thr Leu Tyr
65 70 75 80
Leu Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys
85 90 95
Ala Leu Leu Pro Lys Arg Gly Pro Trp Phe Asp Tyr Trp Gly Gln Gly
100 105 110
Thr Gln Val Thr Val Ser Ser
115
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<211> 119
<212> PRT
<213> artificial sequence
<220>
<223> variant 1-13 of DOM1h-131-511 anti-TNFR1 dAb
<400> 73
Glu Val Arg Leu Leu Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Glu Gly
1 5 10 15
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Ala His Glu
20 25 30
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35 40 45
Ser His Ile Pro Pro Asp Ser Gln Asp Pro Phe Tyr Ala Asp Ser Val
50 55 60
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65 70 75 80
Leu Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys
85 90 95
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100 105 110
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115
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<212> PRT
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<220>
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Glu Val Gln Leu Leu Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly Gly
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20 25 30
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35 40 45
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50 55 60
Lys Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Ser Lys Asn Thr Leu Tyr
65 70 75 80
Leu Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys
85 90 95
Ala Leu Leu Pro Lys Arg Gly Pro Trp Phe Asp Tyr Arg Gly Gln Gly
100 105 110
Thr Leu Val Thr Val Ser Ser
115
<210> 75
<211> 119
<212> PRT
<213> artificial sequence
<220>
<223> variant 1-15 of DOM1h-131-511 anti-TNFR1 dAb
<400> 75
Glu Val Gln Leu Leu Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly Gly
1 5 10 15
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Ala His Glu
20 25 30
Thr Met Val Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val
35 40 45
Ser His Ile Pro Pro Val Gly Gln Asp Pro Phe Tyr Ala Asp Ser Val
50 55 60
Lys Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Ser Lys Asn Thr Leu Tyr
65 70 75 80
Leu Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys
85 90 95
Ala Arg Leu Pro Lys Arg Gly Pro Trp Phe Asp Tyr Trp Gly Gln Gly
100 105 110
Thr Leu Val Thr Val Ser Ser
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<213> artificial sequence
<220>
<223> variant 1-18 of DOM1h-131-511 anti-TNFR1 dAb
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Glu Val Gln Leu Leu Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly Gly
1 5 10 15
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Ala His Glu
20 25 30
Thr Met Val Trp Val Arg Arg Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val
35 40 45
Ser His Ile Pro Pro Asp Gly Gln Asp Pro Phe Tyr Ala Asp Ser Val
50 55 60
Lys Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Ser Lys Asn Thr Leu Tyr
65 70 75 80
Leu Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys
85 90 95
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100 105 110
Thr Leu Val Thr Val Ser Ser
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<213> artificial sequence
<220>
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<400> 77
Glu Val Gln Leu Leu Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly Gly
1 5 10 15
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20 25 30
Thr Met Val Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Arg Gly Leu Glu Trp Val
35 40 45
Ser His Ile Pro Pro Asp Gly Gln Asp Pro Phe Tyr Ala Asp Ser Val
50 55 60
Lys Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Ser Lys Asn Thr Leu Tyr
65 70 75 80
Leu Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys
85 90 95
Ala Leu Leu Pro Lys Arg Gly Pro Trp Phe Asp Tyr Trp Gly Gln Gly
100 105 110
Thr Leu Val Thr Val Ser Ser
115
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<211> 119
<212> PRT
<213> artificial sequence
<220>
<223> variant 1-20 of DOM1h-131-511 anti-TNFR1 dAb
<400> 78
Glu Val Gln Leu Leu Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly Gly
1 5 10 15
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Ala His Glu
20 25 30
Thr Met Val Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Arg Gly Leu Glu Trp Val
35 40 45
Ser His Ile Pro Ser Asp Gly Gln Asp Pro Phe Tyr Ala Asp Ser Val
50 55 60
Lys Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Ser Lys Asn Thr Leu Tyr
65 70 75 80
Leu Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys
85 90 95
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100 105 110
Thr Leu Val Thr Val Ser Ser
115
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<212> PRT
<213> artificial sequence
<220>
<223> variant 1-21 of DOM1h-131-511 anti-TNFR1 dAb
<400> 79
Glu Val Gln Leu Leu Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly Gly
1 5 10 15
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20 25 30
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35 40 45
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50 55 60
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65 70 75 80
Leu Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys
85 90 95
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100 105 110
Thr Leu Val Thr Val Ser Ser
115
<210> 80
<211> 119
<212> PRT
<213> artificial sequence
<220>
<223> variant 1-22 of DOM1h-131-511 anti-TNFR1 dAb
<400> 80
Glu Val Gln Leu Leu Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly Gly
1 5 10 15
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20 25 30
Thr Met Val Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val
35 40 45
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50 55 60
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65 70 75 80
Leu Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys
85 90 95
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100 105 110
Thr Leu Val Thr Val Ser Ser
115
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<211> 119
<212> PRT
<213> artificial sequence
<220>
<223> variant 1-23 of DOM1h-131-511 anti-TNFR1 dAb
<400> 81
Glu Val Gln Leu Leu Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly Gly
1 5 10 15
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Ala Gln Glu
20 25 30
Thr Met Val Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val
35 40 45
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50 55 60
Lys Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Ser Lys Asn Thr Leu Tyr
65 70 75 80
Leu Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys
85 90 95
Ala Arg Leu Pro Lys Arg Gly Pro Trp Phe Asp Tyr Trp Gly Gln Gly
100 105 110
Thr Leu Val Thr Val Ser Ser
115
<210> 82
<211> 119
<212> PRT
<213> artificial sequence
<220>
<223> variant 1-24 of DOM1h-131-511 anti-TNFR1 dAb
<400> 82
Glu Val Gln Leu Leu Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly Gly
1 5 10 15
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Ala His Glu
20 25 30
Thr Met Val Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val
35 40 45
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50 55 60
Lys Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Ser Lys Asn Thr Leu Tyr
65 70 75 80
Leu Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys
85 90 95
Ala Leu Leu Pro Lys Lys Gly Pro Trp Phe Asp Tyr Trp Gly Gln Gly
100 105 110
Thr Leu Val Thr Val Ser Ser
115
<210> 83
<211> 119
<212> PRT
<213> artificial sequence
<220>
<223> variant 1-25 of DOM1h-131-511 anti-TNFR1 dAb
<400> 83
Glu Val Gln Leu Leu Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly Gly
1 5 10 15
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Ala His Glu
20 25 30
Thr Met Val Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val
35 40 45
Ser His Ile Pro Pro Ala Gly Gln Asp Pro Phe Tyr Ala Asp Ser Val
50 55 60
Lys Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Ser Lys Asn Thr Leu Tyr
65 70 75 80
Leu Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys
85 90 95
Ala Arg Leu Pro Lys Arg Gly Pro Trp Phe Asp Tyr Trp Gly Gln Gly
100 105 110
Thr Leu Val Thr Val Ser Ser
115
<210> 84
<211> 357
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> Codon Optimized Sequence 1 of DOM1h-131-206
anti-TNFR1 dAbs
<400> 84
gaggttcaat tgttggaatc cggtggtgga ttggttcaac ctggtggttc tttgagattg 60
tcctgtgctg cttccggttt tactttcgct cacgagacta tggtttgggt tagacaggct 120
ccaggtaaag gattggaatg ggtttcccac attccaccag atggtcaaga tccattctac 180
gctgactccg ttaagggaag attcactatc tccagagaca actccaagaa cactttgtac 240
ttgcagatga actccttgag agctgaggat actgctgttt accactgtgc tttgttgcca 300
aagagaggac cttggtttga ttactgggga cagggaactt tggttactgt ttcttcc 357
<210> 85
<211> 366
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> Codon Optimized Sequence 2 of DOM1h-131-206
anti-TNFR1 dAbs
<400> 85
gagaaaagag aggttcaatt gcttgaatct ggaggaggtt tggtccagcc aggagggtcc 60
cttcgactaa gttgtgctgc cagtgggttt acgtttgctc atgaaactat ggtatgggtc 120
cgacaggcac ctggtaaagg tcttgaatgg gtttcacata tccctccaga cggtcaagac 180
ccattttacg ctgattccgt gaaaggcaga tttacaattt cacgagataa ttctaaaaac 240
accttgtact tacaaatgaa ctcattgaga gctgaggaca ctgcagttta tcactgcgct 300
ttactaccaa aacgtggacc ttggtttgat tattggggcc aaggtacgtt agtgactgtt 360
agttct 366
<210> 86
<211> 357
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> Codon Optimized Sequence 3 of DOM1h-131-206
anti-TNFR1 dAbs
<400> 86
gaagtgcagc ttcttgaaag tggtggaggg ctagtgcagc cagggggatc tttaagatta 60
tcatgcgctg ccagtggatt tacttttgct cacgagacga tggtctgggt gagacaagct 120
cctggaaaag gtttagagtg ggtttctcac attccacctg atggtcaaga tcctttctac 180
gcagattccg tcaaaggaag atttactatc tccagagata atagtaaaaa cactttgtac 240
ctacagatga actcacttag agccgaagat accgctgtgt accactgcgc cttgttgcca 300
aagagaggtc cttggttcga ttactggggt cagggtactc tggttacagt ctcatct 357
<210> 87
<211> 357
<212> DNA
<213> artificial sequence
<220>
<223> Codon Optimized Sequence 4 of DOM1h-131-206
anti-TNFR1 dAbs
<400> 87
gaggttcaac tgctggaatc tggtggtggt ctggtacaac cgggtggttc cctgcgtctg 60
agctgtgcag cctctggttt caccttcgct catgagacca tggtttgggt acgccaggct 120
ccgggtaaag gcctggagtg ggtaagccat atccctcctg atggtcagga cccgttctat 180
gctgattccg tcaaaggccg ttttaccatt tctcgtgaca acagcaaaaa cactctgtac 240
ctgcaaatga actccctgcg tgcagaagac acggcggttt atcactgtgc actgctgcca 300
aaacgcggcc cttggttcga ctactggggc cagggtactc tggtcactgt atcttct 357
<210> 88
<211> 119
<212> PRT
<213> artificial sequence
<220>
<223> Codon Optimized Sequence 5 of DOM1h-131-206
anti-TNFR1 dAbs
<400> 88
Glu Val Gln Leu Leu Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly Gly
1 5 10 15
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Ala His Glu
20 25 30
Thr Met Val Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val
35 40 45
Ser His Ile Pro Pro Asp Gly Gln Asp Pro Phe Tyr Ala Asp Ser Val
50 55 60
Lys Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Ser Lys Asn Thr Leu Tyr
65 70 75 80
Leu Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Val Tyr His Cys
85 90 95
Ala Leu Leu Pro Lys Arg Gly Pro Trp Phe Asp Tyr Trp Gly Gln Gly
100 105 110
Thr Leu Val Thr Val Ser Ser
115
<210> 89
<211> 120
<212> PRT
<213> artificial sequence
<220>
<223> TAR2h-10 anti-TNFR1 dAb
<400> 89
Glu Val Gln Leu Leu Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly Gly
1 5 10 15
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Glu Trp Tyr
20 25 30
Trp Met Gly Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val
35 40 45
Ser Ala Ile Ser Gly Ser Gly Gly Ser Thr Tyr Tyr Ala Asp Ser Val
50 55 60
Lys Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Ser Lys Asn Thr Leu Tyr
65 70 75 80
Leu Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys
85 90 95
Ala Lys Val Lys Leu Gly Gly Gly Pro Asn Phe Asp Tyr Trp Gly Gln
100 105 110
Gly Thr Leu Val Thr Val Ser Ser
115 120
<210> 90
<211> 122
<212> PRT
<213> artificial sequence
<220>
<223> TAR2h-12 anti-TNFR1 dAb
<400> 90
Glu Val Gln Leu Leu Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly Gly
1 5 10 15
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Val Ala Tyr
20 25 30
Asn Met Gly Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val
35 40 45
Ser Phe Ile Asp Met Tyr Gly Ala Lys Thr Tyr Tyr Ala Asp Ser Val
50 55 60
Lys Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Ser Lys Asn Thr Leu Tyr
65 70 75 80
Leu Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys
85 90 95
Ala Lys Leu Cys Leu Met Asp Cys Ser Gly Asp Ile Phe Asp Tyr Trp
100 105 110
Gly Gln Gly Thr Leu Val Thr Val Ser Ser
115 120
<210> 91
<211> 116
<212> PRT
<213> artificial sequence
<220>
<223> TAR2h-13 anti-TNFR1 dAb
<400> 91
Glu Val Gln Leu Leu Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly Gly
1 5 10 15
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Pro Ala Asp
20 25 30
Glu Met Tyr Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val
35 40 45
Ser Ser Ile Gly Trp Pro Gly Gly Ala Thr Tyr Tyr Ala Asp Ser Val
50 55 60
Lys Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Ser Lys Asn Thr Leu Tyr
65 70 75 80
Leu Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys
85 90 95
Ala Lys Tyr Gly Arg Asn Phe Asp Tyr Trp Gly Gln Gly Thr Leu Val
100 105 110
Thr Val Ser Ser
115
<210> 92
<211> 122
<212> PRT
<213> artificial sequence
<220>
<223> TAR2h-14 anti-TNFR1 dAb
<400> 92
Glu Val Gln Leu Leu Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly Gly
1 5 10 15
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Asp Gln Tyr
20 25 30
Asp Met Ser Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val
35 40 45
Ser Leu Ile Asp Pro Ser Gly Gly His Thr Tyr Tyr Ala Asp Ser Val
50 55 60
Lys Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asn Asn Ser Lys Asn Thr Leu Tyr
65 70 75 80
Leu Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys
85 90 95
Ala Lys Pro Val Phe Ser Asp Trp Pro Ala Val Glu Phe Asp Tyr Trp
100 105 110
Gly Gln Gly Thr Leu Val Thr Val Ser Ser
115 120
<210> 93
<211> 116
<212> PRT
<213> artificial sequence
<220>
<223> TAR2h-16 anti-TNFR1 dAb
<400> 93
Glu Val Gln Leu Leu Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly Gly
1 5 10 15
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Gly Asn Tyr
20 25 30
Asp Met Gln Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val
35 40 45
Ser Ser Ile Asp Gly Thr Gly Gly Thr Thr Tyr Tyr Ala Asp Ser Val
50 55 60
Lys Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Ser Lys Asn Thr Leu Tyr
65 70 75 80
Leu Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys
85 90 95
Ala Gln Glu Thr Asn Ala Phe Asp Tyr Trp Gly Gln Gly Thr Leu Val
100 105 110
Thr Val Ser Ser
115
<210> 94
<211> 124
<212> PRT
<213> artificial sequence
<220>
<223> TAR2h-17 anti-TNFR1 dAb
<400> 94
Glu Val Gln Leu Leu Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly Gly
1 5 10 15
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Gly Gly Tyr
20 25 30
Gln Met Gly Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val
35 40 45
Ser Phe Ile Asp Phe Thr Gly Ala His Thr Tyr Tyr Ala Asp Ser Val
50 55 60
Lys Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Ser Lys Asn Thr Leu Tyr
65 70 75 80
Leu Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys
85 90 95
Ala Lys Leu Ser Asp Asp Leu Thr Leu Pro Glu Arg Phe Pro Phe Asp
100 105 110
Tyr Trp Gly Gln Gly Thr Leu Val Thr Val Ser Ser
115 120
<210> 95
<211> 123
<212> PRT
<213> artificial sequence
<220>
<223> TAR2h-18 anti-TNFR1 dAb
<400> 95
Glu Val Gln Leu Leu Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly Gly
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<223> TAR2h-10-68 anti-TNFR1 dAb
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1 5 10 15
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20 25 30
Trp Met Gly Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val
35 40 45
Ser Ala Ile Ser Gly Ser Gly Gly Ser Thr Tyr Tyr Ala Asp Ser Val
50 55 60
Lys Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Ser Lys Asn Thr Leu Tyr
65 70 75 80
Leu Gln Met Asn Ser Leu Arg Pro Glu Asp Ala Ala Val Tyr Tyr Cys
85 90 95
Ala Lys Val Lys Leu Gly Gly Gly Pro Asn Phe Gly Pro Arg Gly Gln
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1 5 10 15
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20 25 30
Trp Met Gly Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val
35 40 45
Ser Ala Ile Ser Gly Ser Gly Gly Ser Thr Tyr Tyr Ala Asp Ser Val
50 55 60
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Trp Met Gly Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val
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Ser Ala Ile Ser Gly Ser Gly Gly Ser Thr Tyr Tyr Ala Asp Ser Val
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Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Ile Gly Tyr
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Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Gly Ser Tyr
20 25 30
Asp Met Gly Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val
35 40 45
Ser Phe Ile Asp Val Ser Gly Thr Leu Thr Tyr Tyr Ala Asp Ser Val
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Glu Val Gln Leu Leu Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly Gly
1 5 10 15
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Ala Asp Tyr
20 25 30
Asp Met Gly Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val
35 40 45
Ser Phe Ile Asp Ser Ser Gly Ser Arg Thr Tyr Tyr Ala Asp Ser Val
50 55 60
Lys Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Ser Lys Asn Thr Leu Tyr
65 70 75 80
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<220>
<223> TAR2h-41 anti-TNFR1 dAb
<400> 165
Glu Val Gln Leu Leu Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly Gly
1 5 10 15
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Asp Lys Tyr
20 25 30
Gln Met Gly Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val
35 40 45
Ser Phe Ile Asp Ser Asn Gly His His Thr Tyr Tyr Ala Asp Ser Val
50 55 60
Lys Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Ser Lys Asn Thr Leu Tyr
65 70 75 80
Leu Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys
85 90 95
Ala Glu Leu Asp Asn Leu Ser Ile Thr Pro Phe Asp Tyr Trp Gly Gln
100 105 110
Gly Thr Leu Val Thr Val Ser Ser
115 120
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<211> 120
<212> PRT
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<220>
<223> TAR2h-42 anti-TNFR1 dAb
<400> 166
Glu Val Gln Leu Leu Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly Gly
1 5 10 15
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Ala Lys Tyr
20 25 30
Asn Met Tyr Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val
35 40 45
Ser Ala Ile Ser Pro Lys Gly Gln His Thr Tyr Tyr Ala Asp Ser Val
50 55 60
Lys Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Ser Lys Asn Thr Leu Tyr
65 70 75 80
Leu Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys
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Ala Glu Gly Met Gly Ser Asp Ala Ile Thr Phe Asp Tyr Trp Gly Gln
100 105 110
Gly Thr Leu Val Thr Val Ser Ser
115 120
<210> 167
<211> 122
<212> PRT
<213> artificial sequence
<220>
<223> TAR2h-43 anti-TNFR1 dAb
<400> 167
Glu Val Gln Leu Leu Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly Gly
1 5 10 15
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Ser Asp Tyr
20 25 30
Thr Met Gly Trp Ala Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val
35 40 45
Ser Phe Ile Asp Ser Asp Gly Leu His Thr Tyr Tyr Ala Asp Ser Val
50 55 60
Lys Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Ser Lys Asn Thr Leu Tyr
65 70 75 80
Leu Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys
85 90 95
Ala Gln Asn Pro Gln Tyr Ala Tyr Glu Ser Ser Arg Phe Asp Tyr Trp
100 105 110
Gly Gln Gly Thr Leu Val Thr Val Ser Ser
115 120
<210> 168
<211> 121
<212> PRT
<213> artificial sequence
<220>
<223> TAR2h-44 anti-TNFR1 dAb
<400> 168
Glu Val Gln Leu Leu Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly Gly
1 5 10 15
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Leu Gln Tyr
20 25 30
Pro Met Val Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val
35 40 45
Ser Ser Ile Leu Ala Pro Gly Gly Pro Thr Tyr Tyr Ala Asp Ser Val
50 55 60
Lys Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Ser Lys Asn Ser Leu Tyr
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Ala Lys His Pro Thr His Thr Pro His Pro Asn Phe Asp Tyr Trp Gly
100 105 110
Gln Gly Thr Leu Val Thr Val Ser Ser
115 120
<210> 169
<211> 122
<212> PRT
<213> artificial sequence
<220>
<223> TAR2h-45 anti-TNFR1 dAb
<400> 169
Glu Val Gln Leu Leu Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly Gly
1 5 10 15
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Gly Gly Tyr
20 25 30
Arg Met Ala Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val
35 40 45
Ser Phe Ile Asp Ser Glu Gly Val Leu Thr Tyr Tyr Ala Asp Ser Val
50 55 60
Lys Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Ser Lys Asn Thr Leu Tyr
65 70 75 80
Leu Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys
85 90 95
Ala Lys Leu Cys Ser Ser Asn Cys Asn Met Arg Asn Phe Asp Tyr Trp
100 105 110
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115 120
<210> 170
<211> 124
<212> PRT
<213> artificial sequence
<220>
<223> TAR2h-47 anti-TNFR1 dAb
<400> 170
Glu Val Gln Leu Leu Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly Gly
1 5 10 15
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Pro Val Tyr
20 25 30
Asn Met Ala Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val
35 40 45
Ser Phe Ile Ala Gly Asn Gly Gln Gln Thr Tyr Tyr Ala Asp Ser Val
50 55 60
Lys Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Ser Lys Asn Thr Leu Tyr
65 70 75 80
Leu Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys
85 90 95
Ala Lys Phe Ala Ser Lys Val Ser Pro Met Ser Leu Thr Asp Phe Asp
100 105 110
Tyr Trp Gly Gln Gly Thr Leu Val Thr Val Ser Ser
115 120
<210> 171
<211> 124
<212> PRT
<213> artificial sequence
<220>
<223> TAR2h-48 anti-TNFR1 dAb
<400> 171
Glu Val Gln Leu Leu Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly Gly
1 5 10 15
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe His Lys Tyr
20 25 30
Gly Met Ala Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val
35 40 45
Ser Phe Ile Asp Leu Ala Gly Leu His Thr Tyr Tyr Ala Asp Ser Val
50 55 60
Arg Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Ser Lys Asn Thr Leu Tyr
65 70 75 80
Leu Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys
85 90 95
Ala Lys Phe Ala Thr Tyr Ser Ser Gly Asn Glu Glu Gln Pro Phe Asp
100 105 110
Tyr Trp Gly Gln Gly Thr Leu Val Thr Val Ser Ser
115 120
<210> 172
<211> 123
<212> PRT
<213> artificial sequence
<220>
<223> TAR2h-50 anti-TNFR1 dAb
<400> 172
Glu Val Gln Leu Leu Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly Gly
1 5 10 15
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Ser Ala Tyr
20 25 30
Asn Met Ala Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val
35 40 45
Ser Phe Ile Ala Gln Ser Gly Gly His Thr Tyr Tyr Ala Asp Ser Val
50 55 60
Lys Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Ser Lys Asn Thr Leu Tyr
65 70 75 80
Leu Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys
85 90 95
Ala Lys Phe Ser His Pro Asp Glu Glu Gly Thr Gln Met Phe Asp Tyr
100 105 110
Trp Gly Gln Gly Thr Leu Val Thr Val Ser Ser
115 120
<210> 173
<211> 116
<212> PRT
<213> artificial sequence
<220>
<223> TAR2h-51 anti-TNFR1 dAb
<400> 173
Glu Val Gln Leu Leu Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly Gly
1 5 10 15
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Ala Thr Tyr
20 25 30
Asn Met Ser Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val
35 40 45
Ser Ala Ile Asp Ala Gly Gly Met His Thr Tyr Tyr Ala Asp Ser Val
50 55 60
Lys Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Ser Lys Asn Thr Leu Tyr
65 70 75 80
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100 105 110
Thr Val Ser Ser
115
<210> 174
<211> 116
<212> PRT
<213> artificial sequence
<220>
<223> TAR2h-66 anti-TNFR1 dAb
<220>
<221> VARIANT
<222> (33)...(33)
<223> Xaa = any amino acid
<400> 174
Glu Val Gln Leu Leu Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly Gly
1 5 10 15
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Asp Glu Tyr
20 25 30
Xaa Met Gly Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val
35 40 45
Ser Leu Ile Ser Pro Arg Gly Ser Lys Thr Tyr Tyr Ala Asp Ser Val
50 55 60
Lys Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Ser Lys Asn Thr Leu Tyr
65 70 75 80
Leu Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys
85 90 95
Ala Lys Tyr Lys Pro Pro Phe Asp Tyr Trp Gly Gln Gly Thr Leu Val
100 105 110
Thr Val Ser Ser
115
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<213> artificial sequence
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<223> TAR2h-67 anti-TNFR1 dAb
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Glu Val Gln Leu Leu Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly Gly
1 5 10 15
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Glu Asp Tyr
20 25 30
Pro Met Ala Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val
35 40 45
Ser Phe Ile Gly Leu Lys Gly Ile His Thr Tyr Tyr Ala Asp Ser Val
50 55 60
Lys Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Ser Lys Asn Thr Leu Tyr
65 70 75 80
Leu Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys
85 90 95
Ala Lys Asp Leu Asn Asn Phe Asp Tyr Trp Gly Gln Gly Thr Leu Val
100 105 110
Thr Val Ser Ser
115
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Glu Val Gln Leu Leu Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly Gly
1 5 10 15
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Gly Asn Gly
20 25 30
Asn Met Val Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val
35 40 45
Ser His Ile Asp Glu Tyr Gly Thr Asn Thr Tyr Tyr Ala Asp Ser Val
50 55 60
Lys Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Ser Lys Asn Thr Leu Tyr
65 70 75 80
Leu Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys
85 90 95
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100 105 110
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1 5 10 15
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Pro Thr Glu
20 25 30
His Met Tyr Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val
35 40 45
Ser Gly Ile Asp Thr Gly Gly Ser His Thr Tyr Tyr Ala Asp Ser Val
50 55 60
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65 70 75 80
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85 90 95
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100 105 110
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20 25 30
Asp Met His Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val
35 40 45
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50 55 60
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65 70 75 80
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Pro Met Ala Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val
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Lys Met Ala Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val
35 40 45
Ser Ser Ile Asp Glu Arg Gly Ile Met Thr Tyr Tyr Ala Asp Ser Val
50 55 60
Lys Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Ser Lys Asn Thr Leu Tyr
65 70 75 80
Leu Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys
85 90 95
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100 105 110
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Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Ser Arg Glu
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Ser Gly Ile Gly Pro Arg Gly Met Pro Thr Tyr Tyr Ala Asp Ser Val
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65 70 75 80
Leu Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys
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Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Asn Ala Tyr
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Thr Met Ile Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val
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Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Asp Ala Ser
20 25 30
Glu Met Asp Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val
35 40 45
Ser Ala Ile Ser Pro Ser Gly Ser Ala Thr Tyr Tyr Ala Asp Ser Val
50 55 60
Lys Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Ser Lys Asn Thr Leu Tyr
65 70 75 80
Leu Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys
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100 105 110
Thr Leu Val Thr Val Ser Ser
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<223> TAR2h-77 anti-TNFR1 dAb
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Glu Val Gln Leu Leu Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly Gly
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Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Pro Thr Glu
20 25 30
His Met Tyr Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val
35 40 45
Ser Gly Ile Asp Thr Gly Gly Ser His Thr Tyr Tyr Ala Asp Ser Val
50 55 60
Lys Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Ser Lys Asn Thr Leu Tyr
65 70 75 80
Leu Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys
85 90 95
Ala Lys Gly Leu His Trp Ser Ser Asp Ser Gly Pro Val His Phe Asp
100 105 110
Tyr Trp Gly Gln Gly Thr Leu Val Thr Val Ser Ser
115 120
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<212> PRT
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<223> TAR2h-78 anti-TNFR1 dAb
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Glu Val Gln Leu Leu Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly Gly
1 5 10 15
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Lys Leu Tyr
20 25 30
Asn Met Ala Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val
35 40 45
Ser Phe Ile Ala Ala Ala Gly Pro Glu Thr Tyr Tyr Ala Asp Ser Val
50 55 60
Lys Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Ser Lys Asn Thr Leu Tyr
65 70 75 80
Leu Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys
85 90 95
Ala Lys Leu Gly Asp Ile Ser Ser Ile Pro Gln His Pro Phe Asp Tyr
100 105 110
Trp Gly Gln Gly Thr Leu Val Thr Val Ser Ser
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<220>
<223> TAR2h-79 anti-TNFR1 dAb
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Glu Val Gln Leu Leu Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly Gly
1 5 10 15
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Gly Asn Val
20 25 30
Asp Met His Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val
35 40 45
Ser Ala Ile Ser Ser Ala Gly Gly Glu Thr Tyr Tyr Ala Asp Ser Val
50 55 60
Lys Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Ser Lys Asn Thr Leu Tyr
65 70 75 80
Leu Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys
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100 105 110
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<223> TAR2h-15 anti-TNFR1 dAb
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Glu Val Arg Leu Leu Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly Gly
1 5 10 15
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Gly Lys Tyr
20 25 30
Thr Met Thr Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val
35 40 45
Ser His Ile Ser Asp Asp Gly Asn Ser Thr Tyr Tyr Ala Asp Ser Val
50 55 60
Lys Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Ser Lys Asn Thr Leu Tyr
65 70 75 80
Leu Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys
85 90 95
Ala Lys Val Pro Ile Leu Ala Pro Arg Asn Leu Phe Asp Tyr Trp Gly
100 105 110
Gln Gly Thr Leu Val Thr Val Ser Ser
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<223> TAR2h-131-8 anti-TNFR1 dAb
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Glu Val Gln Leu Leu Glu Ser Gly Gly Gly Leu Ile Gln Pro Gly Gly
1 5 10 15
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Ala His Glu
20 25 30
Thr Met Val Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val
35 40 45
Ser His Ile Asp Arg Val Gly Gln Asp Thr Tyr Tyr Ala Asp Ser Val
50 55 60
Lys Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Ser Lys Asn Thr Leu Tyr
65 70 75 80
Leu Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys
85 90 95
Ala Lys Leu Pro Lys Arg Gly Pro Trp Phe Asp Tyr Arg Gly Gln Gly
100 105 110
Thr Leu Val Thr Val Ser Ser
115
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<211> 119
<212> PRT
<213> artificial sequence
<220>
<223> TAR2h-131-24 anti-TNFR1 dAb
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Glu Val Gln Leu Leu Glu Ser Gly Gly Gly Leu Ile Gln Pro Gly Gly
1 5 10 15
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Ala His Glu
20 25 30
Thr Met Val Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val
35 40 45
Ser His Ile Asp Arg Val Gly Gln Asp Thr Tyr Tyr Ala Asp Ser Val
50 55 60
Lys Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Ser Lys Asn Thr Leu Tyr
65 70 75 80
Leu Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys
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Ala Arg Leu Pro Lys Arg Gly Pro Trp Phe Asp Tyr Arg Gly Gln Gly
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Thr Leu Val Thr Val Ser Ser
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<220>
<223> TAR2h-15-8 anti-TNFR1 dAb
<400> 190
Glu Val Arg Leu Leu Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly Gly
1 5 10 15
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Val Ala Ser Gly Phe Thr Phe Gly Lys Ser
20 25 30
Thr Met Thr Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val
35 40 45
Ser His Ile Ser Asp Asp Gly Asn Ser Thr Tyr Tyr Ala Asp Ser Val
50 55 60
Lys Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Ser Lys Asn Thr Leu Tyr
65 70 75 80
Leu Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys
85 90 95
Ala Lys Val Pro Ile Leu Ala Pro Arg Asn Leu Phe Asp Tyr Trp Gly
100 105 110
Gln Gly Thr Leu Val Thr Val Ser Ser
115 120
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<211> 121
<212> PRT
<213> artificial sequence
<220>
<223> TAR2h-15-8-1 anti-TNFR1 dAb
<400> 191
Glu Val Arg Leu Leu Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly Gly
1 5 10 15
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Val Ala Ser Gly Phe Asn Phe Gly Lys Ser
20 25 30
Thr Met Thr Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val
35 40 45
Ser His Ile Ser Asp Asp Gly Asn Ser Thr Tyr Tyr Ala Asp Ser Val
50 55 60
Lys Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Ser Lys Asn Thr Leu Tyr
65 70 75 80
Leu Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys
85 90 95
Ala Lys Val Pro Ile Leu Ala Pro Arg Asn Leu Phe Asp Tyr Trp Gly
100 105 110
Gln Gly Thr Leu Val Thr Val Ser Ser
115 120
<210> 192
<211> 121
<212> PRT
<213> artificial sequence
<220>
<223> TAR2h-15-8-2 anti-TNFR1 dAb
<400> 192
Glu Val Arg Leu Leu Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly Gly
1 5 10 15
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Val Ala Ser Gly Phe Thr Phe Gly Lys Gly
20 25 30
Thr Met Thr Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val
35 40 45
Ser His Ile Ser Asp Asp Gly Asn Ser Thr Tyr Tyr Ala Asp Ser Val
50 55 60
Lys Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Ser Lys Asn Thr Leu Tyr
65 70 75 80
Leu Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys
85 90 95
Ala Lys Val Pro Ile Leu Ala Pro Arg Asn Leu Phe Asp Tyr Trp Gly
100 105 110
Gln Gly Thr Leu Val Thr Val Ser Ser
115 120
<210> 193
<211> 122
<212> PRT
<213> artificial sequence
<220>
<223> TAR2h-185-23 anti-TNFR1 dAb
<220>
<221> VARIANT
<222> (62)...(62)
<223> Xaa = any amino acid
<400> 193
Glu Val Gln Leu Leu Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly Gly
1 5 10 15
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Ala Arg Tyr
20 25 30
Asn Met Gly Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val
35 40 45
Ser Leu Ile Asp Pro Ser Gly Gly His Thr Tyr Tyr Ala Xaa Ser Val
50 55 60
Lys Gly Arg Ser Thr Ile Ser Arg Asn Asn Ser Lys Asn Thr Leu Tyr
65 70 75 80
Leu Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys
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100 105 110
Gly Gln Gly Thr Leu Val Thr Val Ser Ser
115 120
<210> 194
<211> 119
<212> PRT
<213> artificial sequence
<220>
<223> TAR2h-154-10-5 anti-TNFR1 dAb
<400> 194
Glu Val Gln Leu Leu Glu Ser Gly Gly Gly Met Val Gln Pro Gly Gly
1 5 10 15
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Pro Gly Phe Thr Phe Glu His Glu
20 25 30
Gly Met Val Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val
35 40 45
Ser His Ile Gly Glu Asp Gly Gln Ser Thr Tyr Tyr Ala Asp Ser Val
50 55 60
Lys Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Ser Lys Asn Thr Leu Tyr
65 70 75 80
Leu Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys
85 90 95
Ala Ser Ile Pro Lys Ala Gly Pro Ser Phe Asp Tyr Trp Gly Gln Gly
100 105 110
Thr Leu Val Thr Val Ser Ser
115
<210> 195
<211> 122
<212> PRT
<213> artificial sequence
<220>
<223> TAR2h-14-2 anti-TNFR1 dAb
<400> 195
Glu Val Gln Leu Leu Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly Gly
1 5 10 15
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Ser Thr Phe Asp Gln Tyr
20 25 30
Asp Met Ser Trp Val Arg Arg Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val
35 40 45
Ser Leu Ile Asp Pro Ser Gly Gly His Thr Tyr Tyr Ala Asp Ser Val
50 55 60
Lys Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asn Asn Thr Lys Asn Thr Leu Tyr
65 70 75 80
Leu Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys
85 90 95
Ala Lys Pro Val Phe Ser Asp Trp Pro Ala Val Glu Phe Asp Tyr Trp
100 105 110
Gly Gln Gly Thr Leu Val Thr Val Ser Ser
115 120
<210> 196
<211> 121
<212> PRT
<213> artificial sequence
<220>
<223> TAR2h-151-8 anti-TNFR1 dAb
<400> 196
Glu Val Gln Leu Leu Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly Gly
1 5 10 15
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Asp Tyr Gly
20 25 30
Asn Met Phe Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Ile
35 40 45
Ser Ala Ile Ser Gly Ser Gly Gly Ser Thr Tyr Tyr Ala Asp Ser Val
50 55 60
Lys Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Ser Lys Asn Thr Leu Tyr
65 70 75 80
Leu Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys
85 90 95
Ala Lys Asp Met Thr Thr Asp Ser Pro Pro Gly Phe Asp Tyr Trp Gly
100 105 110
Gln Gly Thr Leu Val Thr Val Ser Ser
115 120
<210> 197
<211> 122
<212> PRT
<213> artificial sequence
<220>
<223> TAR2h-152-7 anti-TNFR1 dAb
<400> 197
Glu Val Gln Leu Leu Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly Gly
1 5 10 15
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Ala Lys Glu
20 25 30
Thr Met Ser Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val
35 40 45
Ser Trp Ile Ser Pro His Gly Ala His Thr Phe Tyr Ala Asp Ser Val
50 55 60
Lys Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Ser Lys Asn Thr Leu Tyr
65 70 75 80
Leu Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys
85 90 95
Ala Lys Pro Arg Phe Ser Tyr Tyr Pro Arg Val Ser Phe Asp Tyr Arg
100 105 110
Gly Gln Gly Thr Leu Val Thr Val Ser Ser
115 120
<210> 198
<211> 116
<212> PRT
<213> artificial sequence
<220>
<223> TAR2h-35-4 anti-TNFR1 dAb
<400> 198
Glu Val Gln Leu Leu Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly Gly
1 5 10 15
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Asp Ala Tyr
20 25 30
Asn Met Phe Trp Phe Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Pro Glu Trp Val
35 40 45
Ser Ala Ile Gly Pro Ser Gly Arg Glu Thr Tyr Tyr Ala Asp Ser Val
50 55 60
Lys Gly Arg Phe Thr Ile Thr Arg Asp Asn Ser Lys Asn Thr Leu Tyr
65 70 75 80
Leu Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys
85 90 95
Ala Lys Arg Tyr Pro Asp Phe Asp Tyr Trp Gly Gln Gly Thr Leu Val
100 105 110
Thr Val Ser Ser
115
<210> 199
<211> 119
<212> PRT
<213> artificial sequence
<220>
<223> TAR2h-154-7 anti-TNFR1 dAb
<400> 199
Glu Val Gln Leu Leu Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly Gly
1 5 10 15
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Glu His Glu
20 25 30
Gly Met Val Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val
35 40 45
Ser His Ile Gly Glu Asp Gly Gln Ser Thr Tyr Tyr Ala Asp Ser Val
50 55 60
Lys Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Ser Arg Asn Thr Leu Tyr
65 70 75 80
Leu Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys
85 90 95
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100 105 110
Thr Leu Val Thr Val Ser Ser
115
<210> 200
<211> 123
<212> PRT
<213> artificial sequence
<220>
<223> TAR2h-80 anti-TNFR1 dAb
<400> 200
Glu Val Gln Leu Leu Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly Gly
1 5 10 15
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Lys Leu Tyr
20 25 30
Asn Met Ala Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val
35 40 45
Ser Phe Ile Ala Ala Ala Gly Pro Glu Thr Tyr Tyr Ala Asp Ser Val
50 55 60
Lys Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Ser Lys Asn Thr Leu Tyr
65 70 75 80
Leu Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys
85 90 95
Ala Lys Leu Gly Asp Ile Ser Ser Ile Pro Gln His Pro Phe Asp Tyr
100 105 110
Trp Gly Gln Gly Thr Leu Val Thr Val Ser Ser
115 120
<210> 201
<211> 119
<212> PRT
<213> artificial sequence
<220>
<223> TAR2h-81 anti-TNFR1 dAb
<400> 201
Glu Val Gln Leu Leu Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly Gly
1 5 10 15
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Ser Arg Glu
20 25 30
Asn Met His Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val
35 40 45
Ser Gly Ile Gly Pro Arg Gly Met Pro Thr Tyr Tyr Ala Asp Ser Val
50 55 60
Lys Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Ser Lys Asn Thr Leu Tyr
65 70 75 80
Leu Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys
85 90 95
Ala Lys Gly Met Asn Ser His Asp Gly Phe Asp Tyr Trp Gly Gln Gly
100 105 110
Thr Leu Val Thr Val Ser Ser
115
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<212> PRT
<213> artificial sequence
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Glu Val Gln Leu Leu Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly Gly
1 5 10 15
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Asp Ala Ser
20 25 30
Glu Met Asp Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val
35 40 45
Ser Ala Ile Ser Pro Ser Gly Ser Ala Thr Tyr Tyr Ala Asp Ser Val
50 55 60
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65 70 75 80
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85 90 95
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100 105 110
Gln Gly Thr Leu Val Thr Val Ser Ser
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Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Ser Ala Tyr
20 25 30
Asn Met Ala Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val
35 40 45
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<220>
<223> TAR2h-95 anti-TNFR1 dAb
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Glu Val Gln Leu Leu Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly Gly
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Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Lys Gly Ser
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Asn Met Gly Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val
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20 25 30
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35 40 45
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20 25 30
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Glu Val Gln Leu Leu Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly Gly
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<223> TAR2h-102 anti-TNFR1 dAb
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<220>
<223> TAR2h-103 anti-TNFR1 dAb
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<220>
<223> TAR2h-104 anti-TNFR1 dAb
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<220>
<221> VARIANT
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<223> Xaa = Any Amino Acid
<400> 223
Glu Val Gln Leu Leu Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly Gly
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Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Glu Trp Tyr
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<210> 224
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<212> PRT
<213> artificial sequence
<220>
<223> TAR2h-105 anti-TNFR1 dAb
<400> 224
Glu Val Gln Leu Leu Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly Gly
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<210> 225
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<213> artificial sequence
<220>
<223> TAR2h-106 anti-TNFR1 dAb
<220>
<221> VARIANT
<222> (62)...(62)
<223> Xaa = Any Amino Acid
<400> 225
Glu Val Gln Leu Leu Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly Gly
1 5 10 15
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Thr Arg Tyr
20 25 30
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<210> 226
<211> 120
<212> PRT
<213> artificial sequence
<220>
<223> TAR2h-107 anti-TNFR1 dAb
<220>
<221> VARIANT
<222> (62)...(62)
<223> Xaa = Any Amino Acid
<400> 226
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20 25 30
Asn Met Phe Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val
35 40 45
Ser Ala Ile Ser Gly Ser Gly Gly Ser Thr Tyr Tyr Ala Asp Ser Val
50 55 60
Lys Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Ser Lys Asn Thr Leu Tyr
65 70 75 80
Leu Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys
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20 25 30
Thr Met Ser Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val
35 40 45
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20 25 30
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Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Thr Arg Tyr
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Ser Met Gly Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val
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Ser Met Ile Ala His Ala Gly Pro Glu Thr Tyr Tyr Ala Asp Ser Val
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Lys Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Ser Lys Asn Thr Leu Tyr
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20 25 30
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Gly Met Val Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val
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<223> TAR2h-5d2 anti-TNFR1 dAb
<400> 275
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<223> TAR2h-5d3 anti-TNFR1 dAb
<400> 276
Glu Val Gln Leu Leu Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly Gly
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<220>
<223> TAR2h-5d4 anti-TNFR1 dAb
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<223> TAR2h-5d5 anti-TNFR1 dAb
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Glu Val Gln Leu Leu Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly Gly
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<220>
<223> TAR2h-5d6 anti-TNFR1 dAb
<400> 279
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Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Ser Lys Asn Thr Leu Tyr Leu
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Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys Ala
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Lys Gln Lys Glu Asn Phe Asp Tyr Trp Gly Gln Gly Thr Leu Val Thr
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Val Ser
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Ala Met Trp Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val
35 40 45
Ser Val Ile Ser Ser Asn Gly Gly Ser Thr Phe Tyr Ala Asp Ser Val
50 55 60
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65 70 75 80
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100 105 110
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20 25 30
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35 40 45
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20 25 30
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50 55 60
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50 55 60
Lys Gly Arg Phe Ile Ile Ser Arg Asp Asn Ser Lys Asn Thr Leu Tyr
65 70 75 80
Leu Gln Met Tyr Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys
85 90 95
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100 105 110
Thr Leu Val Thr Val Ser Ser
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Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Ala His Glu
20 25 30
Pro Met Val Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val
35 40 45
Ser His Ile Asp Arg Val Gly Gln Asp Thr Tyr Tyr Ala Asp Ser Val
50 55 60
Lys Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Ser Lys Asn Thr Leu Tyr
65 70 75 80
Leu Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys
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Ser Leu Arg Leu Ser Cys Thr Ala Ser Gly Phe Thr Phe Ala His Glu
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Pro Met Val Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val
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Ser His Ile Asp Arg Val Gly Gln Asp Thr Tyr Tyr Ala Asp Ser Val
50 55 60
Lys Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Ser Lys Asn Thr Leu Tyr
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Leu Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys
85 90 95
Ala Arg Leu Pro Lys Arg Gly Pro Arg Phe Asp Tyr Trp Gly Leu Gly
100 105 110
Thr Leu Val Thr Val Ser Ser
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<213> artificial sequence
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<223> Tar2h-131-6 anti-TNFR1 dAb
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Lys Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Ser Lys Asn Thr Leu Tyr
65 70 75 80
Leu Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys
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Ala Arg Leu Pro Lys Arg Gly Pro Arg Phe Asp Tyr Trp Gly Leu Gly
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<220>
<223> Tar2h-131-12 anti-TNFR1 dAb
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Pro Met Val Trp Ile Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val
35 40 45
Ser His Ile Asp Arg Val Gly Gln Asp Thr Tyr Tyr Ala Asp Ser Val
50 55 60
Lys Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Ser Lys Asn Thr Leu Tyr
65 70 75 80
Leu Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys
85 90 95
Ala Ile Leu Pro Lys Arg Gly Pro Arg Phe Asp Tyr Trp Gly Gln Gly
100 105 110
Thr Leu Val Thr Val Ser Ser
115
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<211> 119
<212> PRT
<213> artificial sequence
<220>
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1 5 10 15
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Ala His Glu
20 25 30
Pro Met Val Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val
35 40 45
Ser His Ile Asp Arg Val Gly Gln Asp Pro Tyr Tyr Ala Asp Ser Val
50 55 60
Lys Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Ser Lys Asn Thr Leu Tyr
65 70 75 80
Leu Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys
85 90 95
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100 105 110
Thr Leu Val Thr Val Ser Ser
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20 25 30
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35 40 45
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50 55 60
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65 70 75 80
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100 105 110
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35 40 45
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65 70 75 80
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Pro Met Val Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val
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65 70 75 80
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65 70 75 80
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Pro Met Val Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val
35 40 45
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50 55 60
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65 70 75 80
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85 90 95
Ala Arg Leu Pro Lys Arg Gly Pro Arg Phe Asp Tyr Trp Gly Leu Gly
100 105 110
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20 25 30
Pro Met Val Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val
35 40 45
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50 55 60
Lys Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Ser Lys Asn Thr Leu Tyr
65 70 75 80
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85 90 95
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100 105 110
Thr Leu Val Thr Val Ser Ser
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100 105 110
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Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Ala His Glu
20 25 30
Thr Met Val Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val
35 40 45
Ser His Ile Asp Arg Val Gly Gln Asp Thr Tyr Tyr Ala Asp Ser Val
50 55 60
Lys Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Ser Lys Asn Thr Leu Tyr
65 70 75 80
Leu Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys
85 90 95
Ala Lys Leu Pro Lys Arg Gly Pro Trp Phe Asp Tyr Arg Gly Gln Gly
100 105 110
Thr Leu Val Thr Val Ser Ser
115
<210> 320
<211> 119
<212> PRT
<213> artificial sequence
<220>
<223> Tar2h-131-28 anti-TNFR1 dAb
<400> 320
Glu Val Gln Leu Leu Glu Ser Gly Gly Gly Leu Gly Gln Pro Gly Gly
1 5 10 15
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Ala His Glu
20 25 30
Thr Met Val Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val
35 40 45
Ser His Ile Asp Arg Val Gly Gln Asp Thr Tyr Tyr Ala Asp Ser Val
50 55 60
Lys Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Ser Lys Asn Thr Leu Tyr
65 70 75 80
Leu Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys
85 90 95
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100 105 110
Thr Leu Val Thr Val Ser Ser
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<211> 119
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<213> artificial sequence
<220>
<223> Tar2h-131-29 anti-TNFR1 dAb
<220>
<221> VARIANT
<222> (12)...(12)
<223> Xaa = Any Amino Acid
<400> 321
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<213> artificial sequence
<220>
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<400> 322
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20 25 30
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35 40 45
Ser His Ile Asp Arg Val Gly Gln Asp Thr Tyr Tyr Ala Asp Ser Val
50 55 60
Lys Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Ser Lys Asn Thr Leu Tyr
65 70 75 80
Leu Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys
85 90 95
Ala Lys Leu Pro Lys Arg Gly Pro Trp Phe Asp Tyr Arg Gly Gln Gly
100 105 110
Thr Leu Val Thr Val Ser Ser
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<211> 119
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<213> artificial sequence
<220>
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<400> 323
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1 5 10 15
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35 40 45
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Lys Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Ser Lys Asn Thr Leu Tyr
65 70 75 80
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100 105 110
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<210> 324
<211> 119
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<213> artificial sequence
<220>
<223> Tar2h-131-32 anti-TNFR1 dAb
<400> 324
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100 105 110
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<211> 119
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<213> artificial sequence
<220>
<223> Tar2h-131-33 anti-TNFR1 dAb
<400> 325
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Thr Met Val Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val
35 40 45
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65 70 75 80
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100 105 110
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<213> artificial sequence
<220>
<223> Tar2h-131-34 anti-TNFR1 dAb
<400> 326
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100 105 110
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<211> 119
<212> PRT
<213> artificial sequence
<220>
<223> Tar2h-131-35 anti-TNFR1 dAb
<400> 327
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1 5 10 15
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20 25 30
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35 40 45
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50 55 60
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65 70 75 80
Leu Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys
85 90 95
Ala Lys Leu Pro Lys Arg Gly Pro Val Phe Asp Tyr Arg Gly Gln Gly
100 105 110
Thr Leu Val Thr Val Ser Ser
115
<210> 328
<211> 119
<212> PRT
<213> artificial sequence
<220>
<223> Tar2h-131-36 anti-TNFR1 dAb
<400> 328
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1 5 10 15
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20 25 30
Thr Met Val Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val
35 40 45
Ser His Ile Asp Arg Val Gly Gln Asp Thr Tyr Tyr Ala Asp Ser Val
50 55 60
Lys Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Ser Lys Asn Thr Leu Tyr
65 70 75 80
Leu Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys
85 90 95
Ala Lys Leu Pro Lys Arg Gly Pro Trp Phe Asp Tyr Tyr Gly Gln Gly
100 105 110
Thr Leu Val Thr Val Ser Ser
115
<210> 329
<211> 119
<212> PRT
<213> artificial sequence
<220>
<223> Tar2h-131-37 anti-TNFR1 dAb
<400> 329
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1 5 10 15
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20 25 30
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35 40 45
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50 55 60
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65 70 75 80
Leu Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys
85 90 95
Ala Lys Leu Pro Lys Arg Gly Pro Trp Phe Asp Tyr Lys Gly Gln Gly
100 105 110
Thr Leu Val Thr Val Ser Ser
115
<210> 330
<211> 119
<212> PRT
<213> artificial sequence
<220>
<223> Tar2h-131-38 anti-TNFR1 dAb
<400> 330
Glu Val Gln Leu Leu Glu Ser Gly Gly Gly Leu Ile Gln Pro Gly Gly
1 5 10 15
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20 25 30
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35 40 45
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50 55 60
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65 70 75 80
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100 105 110
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115
<210> 331
<211> 119
<212> PRT
<213> artificial sequence
<220>
<223> Tar2h-131-39 anti-TNFR1 dAb
<400> 331
Glu Val Gln Leu Leu Glu Ser Gly Gly Gly Leu Ile Gln Pro Gly Gly
1 5 10 15
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20 25 30
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35 40 45
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50 55 60
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65 70 75 80
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85 90 95
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100 105 110
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100 105 110
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<221> VARIANT
<222> (32)...(32)
<223> Xaa = Any Amino Acid
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<223> Tar2h-131-198 anti-TNFR1 dAb
<400> 438
Glu Val Gln Leu Leu Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly Gly
1 5 10 15
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Ala His Glu
20 25 30
Thr Met Val Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val
35 40 45
Ser His Ile Pro Pro Val Gly Gln Asp Pro Phe Tyr Ala Asp Ser Val
50 55 60
Lys Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Ser Lys Asn Ser Leu Tyr
65 70 75 80
Leu Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys
85 90 95
Ala Leu Leu Pro Lys Arg Gly Pro Trp Phe Asp Tyr Trp Gly Gln Gly
100 105 110
Thr Leu Val Thr Val Ser Ser
115
<210> 439
<211> 119
<212> PRT
<213> artificial sequence
<220>
<223> Tar2h-131-500 anti-TNFR1 dAb
<400> 439
Glu Val Gln Leu Leu Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly Gly
1 5 10 15
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe His Asp Gln
20 25 30
His Met Val Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val
35 40 45
Ser His Ile Asp Arg Val Gly Gln Asp Thr Tyr Tyr Ala Asp Ser Val
50 55 60
Lys Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Ser Lys Asn Thr Leu Tyr
65 70 75 80
Leu Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys
85 90 95
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100 105 110
Thr Leu Val Thr Val Ser Ser
115
<210> 440
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<212> PRT
<213> artificial sequence
<220>
<223> Tar2h-131-501 anti-TNFR1 dAb
<400> 440
Glu Val Gln Leu Leu Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly Gly
1 5 10 15
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Ala Asn Asn
20 25 30
Ile Met Val Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val
35 40 45
Ser His Ile Asp Arg Val Gly Gln Asp Thr Tyr Tyr Ala Asp Ser Val
50 55 60
Lys Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Ser Lys Asn Thr Leu Tyr
65 70 75 80
Leu Gln Met Asn Asn Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys
85 90 95
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100 105 110
Thr Leu Val Thr Val Ser Ser
115
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<212> PRT
<213> artificial sequence
<220>
<223> Tar2h-131-502 anti-TNFR1 dAb
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Glu Val Gln Leu Leu Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly Gly
1 5 10 15
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Ser Phe Lys Asn Lys
20 25 30
Thr Met Val Trp Val Arg Gln Ala Gln Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val
35 40 45
Ser His Ile Asp Arg Val Gly Gln Asp Thr Tyr Tyr Ala Asp Ser Val
50 55 60
Lys Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Ser Lys Asn Thr Leu Tyr
65 70 75 80
Leu Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys
85 90 95
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100 105 110
Thr Leu Val Thr Val Ser Ser
115
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<212> PRT
<213> artificial sequence
<220>
<223> Tar2h-131-503 anti-TNFR1 dAb
<400> 442
Glu Val Gln Leu Leu Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly Gly
1 5 10 15
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Asn Lys His
20 25 30
Thr Met Val Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val
35 40 45
Ser His Ile Asp Arg Val Gly Gln Asp Thr Tyr Tyr Ala Asp Ser Val
50 55 60
Lys Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Ser Lys Asn Thr Leu Tyr
65 70 75 80
Leu Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys
85 90 95
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100 105 110
Thr Leu Val Thr Val Ser Ser
115
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<211> 119
<212> PRT
<213> artificial sequence
<220>
<223> Tar2h-131-504 anti-TNFR1 dAb
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Glu Val Gln Leu Leu Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly Gly
1 5 10 15
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20 25 30
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35 40 45
Ser His Ile Asp Arg Val Gly Gln Asp Thr Tyr Tyr Ala Asp Ser Val
50 55 60
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65 70 75 80
Leu Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys
85 90 95
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100 105 110
Thr Leu Val Thr Val Ser Ser
115
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<211> 119
<212> PRT
<213> artificial sequence
<220>
<223> Tar2h-131-505 anti-TNFR1 dAb
<400> 444
Glu Val Gln Leu Leu Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly Gly
1 5 10 15
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Ala His Glu
20 25 30
Thr Met Val Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val
35 40 45
Ser His Ile Asp Gly Arg Gly Gly Gly Thr Tyr Tyr Thr Asp Ser Val
50 55 60
Lys Gly Arg Phe Thr Thr Ser Arg Asp Asn Ser Lys Asn Thr Leu Tyr
65 70 75 80
Leu Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys
85 90 95
Ala Leu Leu Pro Lys Arg Gly Pro Trp Phe Asp Tyr Trp Gly Gln Gly
100 105 110
Thr Leu Val Thr Val Ser Ser
115
<210> 445
<211> 119
<212> PRT
<213> artificial sequence
<220>
<223> Tar2h-131-506 anti-TNFR1 dAb
<400> 445
Glu Val Gln Leu Leu Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly Gly
1 5 10 15
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Ala His Glu
20 25 30
Thr Met Val Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val
35 40 45
Ser His Ile Asp Gln Gln Gly Glu Gly Thr Tyr Tyr Thr Asp Ser Val
50 55 60
Lys Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Ser Lys Asn Thr Leu Tyr
65 70 75 80
Leu Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys
85 90 95
Ala Leu Leu Pro Lys Arg Gly Pro Trp Phe Asp Tyr Trp Gly Gln Gly
100 105 110
Thr Leu Val Thr Val Ser Ser
115
<210> 446
<211> 119
<212> PRT
<213> artificial sequence
<220>
<223> Tar2h-131-507 anti-TNFR1 dAb
<400> 446
Glu Val Gln Leu Leu Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly Gly
1 5 10 15
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Ala His Glu
20 25 30
Thr Met Val Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val
35 40 45
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50 55 60
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65 70 75 80
Leu Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys
85 90 95
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100 105 110
Thr Leu Val Thr Val Ser Ser
115
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<211> 119
<212> PRT
<213> artificial sequence
<220>
<223> Tar2h-131-508 anti-TNFR1 dAb
<400> 447
Glu Val Gln Leu Leu Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly Gly
1 5 10 15
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Ala His Glu
20 25 30
Thr Met Val Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val
35 40 45
Ser His Ile Asp Gly Gly Gly Leu Gly Thr Tyr Tyr Ala Asp Ser Val
50 55 60
Lys Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Ser Lys Asn Thr Leu Tyr
65 70 75 80
Leu Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys
85 90 95
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100 105 110
Thr Leu Val Thr Val Ser Ser
115
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<211> 119
<212> PRT
<213> artificial sequence
<220>
<223> Tar2h-131-509 anti-TNFR1 dAb
<400> 448
Glu Val Gln Leu Leu Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly Gly
1 5 10 15
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Ala His Glu
20 25 30
Thr Met Val Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val
35 40 45
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50 55 60
Lys Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Ser Lys Asn Thr Leu Tyr
65 70 75 80
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100 105 110
Thr Leu Val Thr Val Ser Ser
115
<210> 449
<211> 119
<212> PRT
<213> artificial sequence
<220>
<223> Tar2h-131-510 anti-TNFR1 dAb
<400> 449
Glu Val Gln Leu Leu Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly Gly
1 5 10 15
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Asn Asn Lys
20 25 30
Thr Met Val Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val
35 40 45
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50 55 60
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65 70 75 80
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85 90 95
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100 105 110
Thr Leu Val Thr Val Ser Ser
115
<210> 450
<211> 119
<212> PRT
<213> artificial sequence
<220>
<223> Tar2h-131-511 anti-TNFR1 dAb
<400> 450
Glu Val Gln Leu Leu Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly Gly
1 5 10 15
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Ala His Glu
20 25 30
Thr Met Val Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val
35 40 45
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50 55 60
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65 70 75 80
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100 105 110
Thr Leu Val Thr Val Ser Ser
115
<210> 451
<211> 119
<212> PRT
<213> artificial sequence
<220>
<223> Tar2h-131-512 anti-TNFR1 dAb
<400> 451
Glu Val Gln Leu Leu Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly Gly
1 5 10 15
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Ala His Glu
20 25 30
Thr Met Val Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Arg Gly Leu Glu Trp Val
35 40 45
Ser His Ile Asp Arg Val Gly Gln Asp Thr Tyr Tyr Ala Asp Ser Val
50 55 60
Lys Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Ser Lys Asn Thr Leu Tyr
65 70 75 80
Leu Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys
85 90 95
Ala Leu Leu Pro Lys Arg Gly Pro Trp Phe Asp Tyr Trp Gly Gln Gly
100 105 110
Thr Leu Val Thr Val Ser Ser
115
<210> 452
<211> 119
<212> PRT
<213> artificial sequence
<220>
<223> Tar2h-131-513 anti-TNFR1 dAb
<400> 452
Glu Val Gln Leu Leu Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly Gly
1 5 10 15
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Ala His Glu
20 25 30
Thr Met Val Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val
35 40 45
Ser His Ile Asp Arg Val Gly Gln Asp Thr Tyr Tyr Ala Asp Ser Val
50 55 60
Lys Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Ser Lys Asn Thr Leu Tyr
65 70 75 80
Leu Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys
85 90 95
Ala Arg Leu Pro Arg Arg Gly Pro Trp Phe Asp Tyr Trp Gly Gln Gly
100 105 110
Thr Leu Val Thr Val Ser Ser
115
<210> 453
<211> 119
<212> PRT
<213> artificial sequence
<220>
<223> Tar2h-131-514 anti-TNFR1 dAb
<220>
<221> VARIANT
<222> (4)...(4)
<223> Xaa = any amino acid
<400> 453
Glu Val Gln Xaa Leu Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly Gly
1 5 10 15
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Ala His Glu
20 25 30
Thr Met Val Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val
35 40 45
Ser His Ile Asp Arg Val Gly Gln Asp Thr Tyr Tyr Ala Asp Ser Val
50 55 60
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65 70 75 80
Leu Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys
85 90 95
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100 105 110
Thr Leu Val Thr Val Ser Ser
115
<210> 454
<211> 119
<212> PRT
<213> artificial sequence
<220>
<223> Tar2h-131-515 anti-TNFR1 dAb
<400> 454
Glu Val Gln Leu Leu Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly Gly
1 5 10 15
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Ala His Glu
20 25 30
Thr Met Val Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val
35 40 45
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50 55 60
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100 105 110
Thr Leu Val Thr Val Ser Ser
115
<210> 455
<211> 119
<212> PRT
<213> artificial sequence
<220>
<223> Tar2h-131-516 anti-TNFR1 dAb
<400> 455
Glu Val Gln Leu Leu Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly Gly
1 5 10 15
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Ala His Glu
20 25 30
Ala Met Val Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val
35 40 45
Ser His Ile Asp Gly Gly Gly Glu Ser Thr Tyr Tyr Ala Asp Ser Val
50 55 60
Lys Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Ser Lys Asn Thr Leu Tyr
65 70 75 80
Leu Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys
85 90 95
Ala Arg Leu Pro Pro Pro Gly Pro Trp Phe Asp Tyr Trp Gly Gln Gly
100 105 110
Thr Leu Val Thr Val Ser Ser
115
<210> 456
<211> 119
<212> PRT
<213> artificial sequence
<220>
<223> Tar2h-131-517 anti-TNFR1 dAb
<400> 456
Glu Val Gln Leu Leu Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly Gly
1 5 10 15
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe His Asn Lys
20 25 30
Asp Met Val Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val
35 40 45
Ser His Ile Asp Gly Gly Gly Glu Ser Thr Tyr Tyr Ala Asp Ser Val
50 55 60
Lys Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Ser Lys Asn Thr Leu Tyr
65 70 75 80
Leu Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys
85 90 95
Ala Arg Leu Pro Leu Leu Leu Pro Trp Phe Asp Tyr Trp Gly Gln Gly
100 105 110
Thr Leu Val Thr Val Ser Ser
115
<210> 457
<211> 119
<212> PRT
<213> artificial sequence
<220>
<223> Tar2h-131-518 anti-TNFR1 dAb
<400> 457
Glu Val Gln Leu Leu Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly Gly
1 5 10 15
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Ala Met Arg
20 25 30
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35 40 45
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50 55 60
Lys Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Ser Lys Asn Thr Leu Tyr
65 70 75 80
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85 90 95
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100 105 110
Thr Leu Val Thr Val Ser Ser
115
<210> 458
<211> 119
<212> PRT
<213> artificial sequence
<220>
<223> Tar2h-131-519 anti-TNFR1 dAb
<400> 458
Glu Val Gln Leu Leu Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly Gly
1 5 10 15
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Ala His Glu
20 25 30
Thr Met Val Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val
35 40 45
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50 55 60
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65 70 75 80
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100 105 110
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115
<210> 459
<211> 119
<212> PRT
<213> artificial sequence
<220>
<223> Tar2h-131-520 anti-TNFR1 dAb
<400> 459
Glu Val Gln Leu Leu Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly Gly
1 5 10 15
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Ala His Glu
20 25 30
Thr Met Val Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val
35 40 45
Ser His Ile Asp Gly Gly Gly Leu Val Thr Tyr Tyr Thr Asp Ser Val
50 55 60
Lys Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Ser Lys Asn Thr Leu Tyr
65 70 75 80
Leu Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys
85 90 95
Ala Leu Leu Pro Lys Arg Gly Pro Trp Phe Asp Tyr Trp Gly Gln Gly
100 105 110
Thr Leu Val Thr Val Ser Ser
115
<210> 460
<211> 119
<212> PRT
<213> artificial sequence
<220>
<223> Tar2h-131-521 anti-TNFR1 dAb
<400> 460
Glu Val Gln Leu Leu Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly Gly
1 5 10 15
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Asn Asn Thr
20 25 30
Thr Met Val Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val
35 40 45
Ser His Ile Asp Gly Val Gly Gly Asp Thr Tyr Tyr Ala Asp Pro Val
50 55 60
Lys Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Ser Lys Asn Thr Leu Tyr
65 70 75 80
Leu Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys
85 90 95
Ala Leu Leu Pro Lys Arg Gly Pro Trp Phe Asp Tyr Trp Gly Gln Gly
100 105 110
Thr Leu Val Thr Val Ser Ser
115
<210> 461
<211> 119
<212> PRT
<213> artificial sequence
<220>
<223> Tar2h-131-522 anti-TNFR1 dAb
<400> 461
Glu Val Gln Leu Leu Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly Gly
1 5 10 15
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Ala Asn Lys
20 25 30
Thr Met Val Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val
35 40 45
Ser His Ile Asp Gly Leu Gly Leu Val Thr Tyr Tyr Ala Asp Ser Val
50 55 60
Glu Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Ser Lys Asn Thr Leu Tyr
65 70 75 80
Leu Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys
85 90 95
Ala Leu Leu Pro Lys Arg Gly Pro Trp Phe Asp Tyr Trp Gly Gln Gly
100 105 110
Thr Leu Val Thr Val Ser Ser
115
<210> 462
<211> 119
<212> PRT
<213> artificial sequence
<220>
<223> Tar2h-131-523 anti-TNFR1 dAb
<400> 462
Glu Val Gln Leu Leu Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly Gly
1 5 10 15
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Asn Thr Thr
20 25 30
Asn Met Val Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val
35 40 45
Ser Glu Ile Arg Val Gly Gly Gly Asp Thr Tyr Tyr Ala Asp Ser Val
50 55 60
Lys Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Ser Lys Asn Thr Leu Tyr
65 70 75 80
Leu Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys
85 90 95
Ala Leu Leu Pro Lys Arg Gly Pro Trp Phe Asp Tyr Trp Gly Gln Gly
100 105 110
Thr Leu Val Thr Val Ser Ser
115
<210> 463
<211> 119
<212> PRT
<213> artificial sequence
<220>
<223> Tar2h-131-524 anti-TNFR1 dAb
<400> 463
Glu Val Gln Leu Leu Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly Gly
1 5 10 15
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Lys Asn Lys
20 25 30
Thr Met Val Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val
35 40 45
Ser His Ile Asp Gln Glu Gly Glu Gly Thr Tyr Tyr Ala Asp Ser Val
50 55 60
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65 70 75 80
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85 90 95
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100 105 110
Thr Leu Val Thr Val Ser Ser
115
<210> 464
<211> 119
<212> PRT
<213> artificial sequence
<220>
<223> Tar2h-131-525 anti-TNFR1 dAb
<400> 464
Glu Val Gln Leu Leu Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly Gly
1 5 10 15
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20 25 30
Thr Met Val Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val
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Lys Ala Arg Val Thr Ile Thr Ala Asp Lys Ser Thr Ser Thr Ala Tyr
65 70 75 80
Met Glu Leu Ser Ser Leu Arg Ser Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys
85 90 95
Ala Arg Trp Asp Phe Leu Asp Tyr Trp Gly Gln Gly Thr Thr Val Thr
100 105 110
Val Ser Ser Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Ser
115 120 125
Ala Gln Asp Ile Val Met Thr Gln Ser Pro Leu Ser Leu Pro Val Thr
130 135 140
Pro Gly Glu Pro Ala Ser Ile Ser Cys Arg Ser Ser Gln Ser Leu Leu
145 150 155 160
His Ser Asn Gly Asn Thr Tyr Leu His Trp Tyr Leu Gln Lys Pro Gly
165 170 175
Gln Ser Pro Gln Leu Leu Ile Tyr Thr Val Ser Asn Arg Phe Ser Gly
180 185 190
Val Pro Asp Arg Phe Ser Gly Ser Gly Ser Gly Thr Asp Phe Thr Leu
195 200 205
Lys Ile Ser Arg Val Glu Ala Glu Asp Val Gly Val Tyr Tyr Cys Ser
210 215 220
Gln Gly Thr His Val Pro Tyr Thr Phe Gly Gly Gly Thr Lys Val Glu
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Ile Lys Arg
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<212> PRT
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1 5 10 15
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20 25 30
Tyr Ile Asn Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Gln Gly Leu Glu Trp Ile
35 40 45
Gly Glu Ile Val Pro Ser Gln Gly Glu Ala Lys Tyr Asn Asp Lys Phe
50 55 60
Lys Ala Arg Val Thr Ile Thr Ala Asp Lys Ser Thr Ser Thr Ala Tyr
65 70 75 80
Met Glu Leu Ser Ser Leu Arg Ser Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys
85 90 95
Ala Arg Trp Asp Phe Leu Asp Tyr Trp Gly Gln Gly Thr Thr Val Thr
100 105 110
Val Ser Ser Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly
115 120 125
Gly Ser Asp Val Gln Met Thr Gln Ser Pro Ser Ser Leu Ser Ala Ser
130 135 140
Val Gly Asp Arg Val Thr Ile Thr Cys Arg Ser Ser Gln Ser Leu Leu
145 150 155 160
His Ser Asn Gly Asn Thr Tyr Leu His Trp Tyr Gln Gln Lys Pro Gly
165 170 175
Lys Ala Pro Lys Leu Leu Ile Tyr Thr Val Ser Asn Arg Phe Ser Gly
180 185 190
Val Pro Ser Arg Phe Ser Gly Ser Gly Ser Gly Thr Asp Phe Thr Leu
195 200 205
Thr Ile Ser Ser Leu Gln Pro Glu Asp Phe Ala Thr Tyr Tyr Cys Ser
210 215 220
Gln Ser Thr His Val Pro Tyr Thr Phe Gly Gly Gly Thr Lys Val Glu
225 230 235 240
Ile Lys
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20 25 30
Tyr Ile Asn Trp Val Lys Gln Arg Thr Gly Gln Gly Leu Glu Trp Ile
35 40 45
Gly Glu Ile Tyr Pro Tyr Ser Gly His Ala Tyr Tyr Asn Glu Lys Phe
50 55 60
Lys Ala Lys Ala Thr Leu Thr Ala Asp Lys Ser Ser Ser Thr Ala Phe
65 70 75 80
Met Gln Leu Asn Ser Leu Thr Ser Glu Asp Ser Ala Val Tyr Phe Cys
85 90 95
Val Arg Trp Asp Phe Leu Asp Tyr Trp Gly Gln Gly Thr Thr Leu Thr
100 105 110
Val Ser Ser Ala Ser Thr Asp Ile Val Met Thr Gln Ser Pro Leu Ser
115 120 125
Leu Pro Val Ser Leu Gly Asp Gln Ala Ser Ile Ser Cys Arg Ser Ser
130 135 140
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145 150 155 160
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165 170 175
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180 185 190
Asp Phe Thr Leu Lys Ile Ser Arg Val Glu Ala Glu Asp Leu Gly Val
195 200 205
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210 215 220
Thr Lys Leu Glu Ile Lys Arg
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20 25 30
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50 55 60
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100 105 110
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Gly Ser Asp Ile Val Met Thr Gln Ser Pro Leu Ser Leu Pro Val Ser
130 135 140
Leu Gly Asp Gln Ala Ser Ile Ser Cys Arg Ser Ser Gln Ser Leu Leu
145 150 155 160
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165 170 175
Gln Ser Pro Lys Leu Leu Ile Tyr Thr Val Ser Asn Arg Phe Ser Gly
180 185 190
Val Pro Asp Arg Phe Ser Gly Ser Gly Ser Gly Thr Asp Phe Thr Leu
195 200 205
Lys Ile Ser Arg Val Glu Ala Glu Asp Leu Gly Val Tyr Phe Cys Ser
210 215 220
Gln Ser Thr His Val Pro Tyr Thr Phe Gly Gly Gly Thr Lys Leu Glu
225 230 235 240
Ile Lys Arg
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20 25 30
Asn Gly Asn Thr Tyr Leu His Trp Tyr Leu Gln Lys Pro Gly Gln Ser
35 40 45
Pro Gln Leu Leu Ile Tyr Thr Val Ser Asn Arg Phe Ser Gly Val Pro
50 55 60
Asp Arg Phe Ser Gly Ser Gly Ser Gly Thr Asp Phe Thr Leu Lys Ile
65 70 75 80
Ser Arg Val Glu Ala Glu Asp Val Gly Val Tyr Tyr Cys Ser Gln Ser
85 90 95
Thr His Val Pro Tyr Thr Phe Gly Gly Gly Thr Lys Val Glu Ile Lys
100 105 110
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115 120 125
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130 135 140
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195 200 205
Pro Val Thr Lys Ser Phe Asn Arg Gly Glu Cys
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Ser Val Lys Val Ser Cys Lys Ala Ser Gly Tyr Thr Phe Thr Asp Phe
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Tyr Ile Asn Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Gln Gly Leu Glu Trp Ile
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Gly Glu Ile Tyr Pro Tyr Ser Gly His Ala Tyr Tyr Asn Glu Lys Phe
50 55 60
Lys Ala Arg Val Thr Ile Thr Ala Asp Lys Ser Thr Ser Thr Ala Tyr
65 70 75 80
Met Glu Leu Ser Ser Leu Arg Ser Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys
85 90 95
Ala Arg Trp Asp Phe Leu Asp Tyr Trp Gly Gln Gly Thr Thr Val Thr
100 105 110
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115 120 125
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130 135 140
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Leu Thr Ser Gly Val His Thr Phe Pro Ala Val Leu Gln Ser Ser Gly
165 170 175
Leu Tyr Ser Leu Ser Ser Val Val Val Thr Val Pro Ser Ser Ser Leu Gly
180 185 190
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195 200 205
Val Asp Lys Lys Val Glu Pro Lys Ser Cys
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Ser Ser Leu Gln Pro Glu Asp Phe Ala Thr Tyr Tyr Cys Ser Gln Ser
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100 105 110
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Ser Gly Asn Ser Gln Glu Ser Val Thr Glu Gln Asp Ser Lys Asp Ser
165 170 175
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180 185 190
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Pro Val Thr Lys Ser Phe Asn Arg Gly Glu Cys
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<220>
<223> Fab 13.7 heavy chain
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Gly Glu Ile Val Pro Ser Gln Gly Glu Ala Lys Tyr Asn Asp Lys Phe
50 55 60
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65 70 75 80
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100 105 110
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115 120 125
Ser Ser Lys Ser Thr Ser Gly Gly Thr Ala Ala Leu Gly Cys Leu Val
130 135 140
Lys Asp Tyr Phe Pro Glu Pro Val Thr Val Ser Trp Asn Ser Gly Ala
145 150 155 160
Leu Thr Ser Gly Val His Thr Phe Pro Ala Val Leu Gln Ser Ser Gly
165 170 175
Leu Tyr Ser Leu Ser Ser Val Val Val Thr Val Pro Ser Ser Ser Leu Gly
180 185 190
Thr Gln Thr Tyr Ile Cys Asn Val Asn His Lys Pro Ser Asn Thr Lys
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Pro Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Val Arg Thr Phe Ser Ser Tyr
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35 40 45
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65 70 75 80
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Ala Val Leu His Glu Asp Leu Tyr Glu Tyr Asp Tyr Trp Gly Gln Gly
100 105 110
Thr Gln Val Thr Val Ser Ser
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<220>
<223> Nb 96 nanobody
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Gln Val Gln Leu Gln Glu Ser Gly Gly Gly Val Val Gln Pro Gly Gly
1 5 10 15
Ser Leu Thr Leu Ser Cys Thr Arg Thr Gly Phe Thr Ala Ser Thr Asn
20 25 30
Ala Tyr Gly Trp Tyr Arg Gln Gly Pro Gly Lys Lys Cys Glu Trp Val
35 40 45
Ser Tyr Met Thr Ile Pro Ser Gly Arg Thr Thr Tyr Ala Asp Ala Val
50 55 60
Lys Gly Arg Phe Ala Met Ser Arg Asp Lys Ala Lys Ser Thr Val Phe
65 70 75 80
Leu Gln Met Asn Ser Leu Lys Pro Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys
85 90 95
Gly Asp Val Pro Phe Ser Thr Leu Pro Ala Met Cys Thr Asn Asp Gly
100 105 110
Pro Trp Gly Gln Gly Thr Gln Val Thr Val Ser Ser
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Val Ala Asn Pro Gln Ala Glu Gly Gln Leu Gln Trp Leu Asn Arg Trp
20 25 30
Ala Asn Ala Leu Leu Ala Asn Gly Val Glu Leu Arg Asp Asn Gln Leu
35 40 45
Val Val Pro Ser Glu Gly Leu Tyr Leu Ile Tyr Ser Gln Val Leu Phe
50 55 60
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Ser Arg Ile Ala Val Thr Tyr Gln Thr Lys Val Asn Leu Leu Ser Ala
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Ala Asn Ala Leu Leu Ala Asn Gly Val Glu Leu Arg Asp Asn Gln Leu
35 40 45
Val Val Pro Ser Glu Gly Leu Tyr Leu Ile Tyr Ser Gln Val Leu Phe
50 55 60
Lys Gly Gln Gly Cys Pro Ser Thr His Val Leu Leu Thr His Thr Ile
65 70 75 80
Ser Arg Ile Ala Val Ser Tyr Gln Thr Lys Val Asn Leu Leu Ser Ala
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Ile Lys Ser Pro Cys Gln Arg Glu Thr Pro Glu Gly Ala Glu Ala Lys
100 105 110
Pro Trp Tyr Glu Pro Ile Tyr Leu Gly Gly Val Phe Gln Leu Glu Lys
115 120 125
Gly Asp Arg Leu Ser Ala Glu Ile Asn Arg Pro Asp Tyr Leu Asp Phe
130 135 140
Ala Glu Ser Gly Gln Val Tyr Phe Gly Ile Ile Ala Leu
145 150 155
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L29G
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1 5 10 15
Val Ala Asn Pro Gln Ala Glu Gly Gln Leu Gln Trp Gly Asn Arg Arg
20 25 30
Ala Asn Ala Leu Leu Ala Asn Gly Val Glu Leu Arg Asp Asn Gln Leu
35 40 45
Val Val Pro Ser Glu Gly Leu Tyr Leu Ile Tyr Ser Gln Val Leu Phe
50 55 60
Lys Gly Gln Gly Cys Pro Ser Thr His Val Leu Leu Thr His Thr Ile
65 70 75 80
Ser Arg Ile Ala Val Ser Tyr Gln Thr Lys Val Asn Leu Leu Ser Ala
85 90 95
Ile Lys Ser Pro Cys Gln Arg Glu Thr Pro Glu Gly Ala Glu Ala Lys
100 105 110
Pro Trp Tyr Glu Pro Ile Tyr Leu Gly Gly Val Phe Gln Leu Glu Lys
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Gly Asp Arg Leu Ser Ala Glu Ile Asn Arg Pro Asp Tyr Leu Asp Phe
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Ala Glu Ser Gly Gln Val Tyr Phe Gly Ile Ile Ala Leu
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L29Y
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Ala Asn Ala Leu Leu Ala Asn Gly Val Glu Leu Arg Asp Asn Gln Leu
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50 55 60
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<220>
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Val Ala Asn Pro Gln Ala Glu Gly Gln Leu Gln Trp Leu Asn Asn Arg
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Ala Asn Ala Leu Leu Ala Asn Gly Val Glu Leu Arg Asp Asn Gln Leu
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50 55 60
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145 150 155
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<220>
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Lys Gly Gln Gly Cys Pro Ser Thr His Val Leu Leu Thr His Thr Ile
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100 105 110
Pro Trp Tyr Glu Pro Ile Tyr Leu Gly Gly Val Phe Gln Leu Glu Lys
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Gly Asp Arg Leu Ser Ala Glu Ile Asn Arg Pro Asp Tyr Leu Asp Phe
130 135 140
Ala Glu Ser Gly Gln Val Tyr Phe Gly Ile Ile Ala Leu
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<212> PRT
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<220>
<223> TNFR1-selective antagonist TNF mutein R32Y
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<220>
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<220>
<223> TNFR1-selective antagonist TNF mutein R31N/R32T
<400> 694
Val Arg Ser Ser Ser Arg Thr Pro Ser Asp Lys Pro Val Ala His Val
1 5 10 15
Val Ala Asn Pro Gln Ala Glu Gly Gln Leu Gln Trp Leu Asn Asn Thr
20 25 30
Ala Asn Ala Leu Leu Ala Asn Gly Val Glu Leu Arg Asp Asn Gln Leu
35 40 45
Val Val Pro Ser Glu Gly Leu Tyr Leu Ile Tyr Ser Gln Val Leu Phe
50 55 60
Lys Gly Gln Gly Cys Pro Ser Thr His Val Leu Leu Thr His Thr Ile
65 70 75 80
Ser Arg Ile Ala Val Ser Tyr Gln Thr Lys Val Asn Leu Leu Ser Ala
85 90 95
Ile Lys Ser Pro Cys Gln Arg Glu Thr Pro Glu Gly Ala Glu Ala Lys
100 105 110
Pro Trp Tyr Glu Pro Ile Tyr Leu Gly Gly Val Phe Gln Leu Glu Lys
115 120 125
Gly Asp Arg Leu Ser Ala Glu Ile Asn Arg Pro Asp Tyr Leu Asp Phe
130 135 140
Ala Glu Ser Gly Gln Val Tyr Phe Gly Ile Ile Ala Leu
145 150 155
<210> 695
<211> 157
<212> PRT
<213> artificial sequence
<220>
<223> TNFR1-selective antagonist TNF mutein L29S/R32W
<400> 695
Val Arg Ser Ser Ser Arg Thr Pro Ser Asp Lys Pro Val Ala His Val
1 5 10 15
Val Ala Asn Pro Gln Ala Glu Gly Gln Leu Gln Trp Ser Asn Arg Trp
20 25 30
Ala Asn Ala Leu Leu Ala Asn Gly Val Glu Leu Arg Asp Asn Gln Leu
35 40 45
Val Val Pro Ser Glu Gly Leu Tyr Leu Ile Tyr Ser Gln Val Leu Phe
50 55 60
Lys Gly Gln Gly Cys Pro Ser Thr His Val Leu Leu Thr His Thr Ile
65 70 75 80
Ser Arg Ile Ala Val Ser Tyr Gln Thr Lys Val Asn Leu Leu Ser Ala
85 90 95
Ile Lys Ser Pro Cys Gln Arg Glu Thr Pro Glu Gly Ala Glu Ala Lys
100 105 110
Pro Trp Tyr Glu Pro Ile Tyr Leu Gly Gly Val Phe Gln Leu Glu Lys
115 120 125
Gly Asp Arg Leu Ser Ala Glu Ile Asn Arg Pro Asp Tyr Leu Asp Phe
130 135 140
Ala Glu Ser Gly Gln Val Tyr Phe Gly Ile Ile Ala Leu
145 150 155
<210> 696
<211> 157
<212> PRT
<213> artificial sequence
<220>
<223> TNFR1-selective antagonist TNF mutein L29S/S86T
<400> 696
Val Arg Ser Ser Ser Arg Thr Pro Ser Asp Lys Pro Val Ala His Val
1 5 10 15
Val Ala Asn Pro Gln Ala Glu Gly Gln Leu Gln Trp Ser Asn Arg Arg
20 25 30
Ala Asn Ala Leu Leu Ala Asn Gly Val Glu Leu Arg Asp Asn Gln Leu
35 40 45
Val Val Pro Ser Glu Gly Leu Tyr Leu Ile Tyr Ser Gln Val Leu Phe
50 55 60
Lys Gly Gln Gly Cys Pro Ser Thr His Val Leu Leu Thr His Thr Ile
65 70 75 80
Ser Arg Ile Ala Val Thr Tyr Gln Thr Lys Val Asn Leu Leu Ser Ala
85 90 95
Ile Lys Ser Pro Cys Gln Arg Glu Thr Pro Glu Gly Ala Glu Ala Lys
100 105 110
Pro Trp Tyr Glu Pro Ile Tyr Leu Gly Gly Val Phe Gln Leu Glu Lys
115 120 125
Gly Asp Arg Leu Ser Ala Glu Ile Asn Arg Pro Asp Tyr Leu Asp Phe
130 135 140
Ala Glu Ser Gly Gln Val Tyr Phe Gly Ile Ile Ala Leu
145 150 155
<210> 697
<211> 157
<212> PRT
<213> artificial sequence
<220>
<223> TNFR1-selective antagonist TNF mutein
L29S/R32W/S86T
<400> 697
Val Arg Ser Ser Ser Arg Thr Pro Ser Asp Lys Pro Val Ala His
Claims (286)
(TNFR1 억제제)n-링커p-(활성 변형제)q, 여기서:
n 및 q는 각각 정수이고, 각각 독립적으로 1, 2 또는 3이고;
p는 0, 1, 2 또는 3이고;
TNFR1 억제제는 TNFR1에 결합하여 TNFR1의 활성을 억제(길항)하는 분자이고;
활성 변형제는 활성 변형제가 없는 작제물과 비교하여 작제물의 활성 또는 약리학적 특성을 조정하거나 변경하는 모이어티이고; 그리고
링커는 작제물의 가요성을 증가시키고/시키거나 작제물의 입체 효과 또는 수용체와의 상호작용을 조절하거나 감소시키고/시키거나 작제물의 수성 매질에서 용해도를 증가시킨다. A construct that is a tumor necrosis factor receptor 1 (TNFR1) antagonist construct of Formula 1:
(TNFR1 inhibitor) n -linker p - (active modifier) q , where:
n and q are each an integer and are each independently 1, 2 or 3;
p is 0, 1, 2 or 3;
A TNFR1 inhibitor is a molecule that binds to and inhibits (antagonizes) the activity of TNFR1;
An active modifier is a moiety that modulates or alters the activity or pharmacological properties of a construct compared to a construct without the active modifier; and
The linker increases the flexibility of the construct, modulates or reduces the construct's steric effect or interaction with a receptor, and/or increases the construct's solubility in aqueous media.
(TNFR1 억제제)n ― (활성 변형제)r1 ― (링커 (L))p ― (활성 변형제)r2 ― (TNFR2 효능제)q, 또는
(TNFR1 억제제)n - (활성 변형제)r1 ― (링커 (L))p ― (활성 변형제)r2 ― (Treg 확장제)q,
여기서:
n은 1, 2 또는 3이고, p는 1, 2 또는 3이고, q는 0, 1 또는 2이고, r1 및 r2는 각각 독립적으로 0, 1 또는 2이고; 그리고
성분은 작제물이 TNFR1 및 TNFR2와 상호작용하여 TNFR1을 길항하고 TNFR2를 작용하거나 Treg 확장제 활성을 갖는 한 명시된 순서 또는 임의의 다른 순서일 수 있다.The construct of any one of claims 12 to 16, having formula 2:
(TNFR1 inhibitor) n - (active modifier) r1 - (linker (L)) p - (active modifier) r2 - (TNFR2 agonist) q , or
(TNFR1 inhibitor) n - (active modifier) r1 - (linker (L)) p - (active modifier) r2 - (Treg expander) q ,
here:
n is 1, 2 or 3, p is 1, 2 or 3, q is 0, 1 or 2, r1 and r2 are each independently 0, 1 or 2; and
The components may be in the order specified or in any other order as long as the construct interacts with and antagonizes TNFR1 and TNFR2, agonizes TNFR2, or has Treg expander activity.
(TNFR2 효능제 또는 Treg 확장제)n ― 링커p ― (활성 변형제)q, 식 3a, 또는
(활성 변형제)q ― 링커p ― (TNFR2 효능제 또는 Treg 확장제)n, 식 3b, 여기서:
n 및 q는 각각 정수이고, 각각 독립적으로 1, 2 또는 3이고; p는 0, 1, 2 또는 3이고;
활성 변형제는 작제물의 약리학적 특성을 변경하는 모이어티이고;
TNFR2 효능제는 TNRFR2와 상호작용하여 TNFR2 활성을 초래하고;
Treg 확장제는 TNFR2 효능제를 포함하고 Treg 세포를 증가시키는 분자이고; 그리고
링커는 가요성을 증가시키고/시키거나 작제물의 입체 효과 또는 수용체와의 상호작용을 조절하거나 감소시키고/시키거나; 작제물의 용해도를 변경한다.Constructs of Formula 3a or 3b:
(TNFR2 agonist or Treg expander) n - linker p - (active modifier) q , formula 3a, or
(active modifier) q - linker p - (TNFR2 agonist or Treg expander) n , formula 3b, where:
n and q are each an integer and are each independently 1, 2 or 3; p is 0, 1, 2 or 3;
Active modifiers are moieties that alter the pharmacological properties of a construct;
TNFR2 agonists interact with TNRFR2 to result in TNFR2 activity;
Treg expanders are molecules that include TNFR2 agonists and increase Treg cells; and
The linker increases flexibility and/or modulates or reduces the steric effect or interaction of the construct with a receptor; alter the solubility of the construct.
링커는 힌지 영역을 포함하거나 G 및 S 잔기를 포함하는 링커인, 작제물.20. The method according to any one of claims 1 to 19, wherein the active modifier is an Fc region or a modified Fc region or short FcRnBP; and
wherein the linker is a linker comprising a hinge region or comprising G and S residues.
TNFR1 억제제는 하기 열거된 서열 목록에 정의되거나 당업계에 공지된 임의의 것이고;
Treg 확장제는 당업계에 공지되어 있거나, TNFR2 효능제이거나, 또는 하기 열거된 서열 목록에 제시된 임의의 Treg 확장제이거나, 당업계에 공지되어 있고;
링커는 서열 목록에 열거되거나 하기에 열거되거나 당업계에 공지된 임의의 것이고; 그리고
활성 변형제는 당업계에 공지된 서열 목록에 제시되고/되거나 하기에 제시된 임의의 것인, 작제물.26. The method of any one of claims 1 to 25,
TNFR1 inhibitors are any defined in the sequence listing listed below or known in the art;
The Treg expander is known in the art, is a TNFR2 agonist, or any Treg expander set forth in the sequence listing listed below, or is known in the art;
The linker is any listed in the Sequence Listing or below or known in the art; and
The construct, wherein the active modifier is any of those set forth in the Sequence Listing known in the art and/or set forth below.
놉 돌연변이(들)는 EU 넘버링에 의해 S354C, T366Y, T366W 및 T394W 중에서 선택되며; 그리고
홀 돌연변이(들)는 EU 넘버링에 의해 Y349C, T366S, L368A, F405A, Y407T, Y407A 및 Y407V 중에서 선택되고,
Fc 단량체는 이종이량체를 형성하는, 작제물.The method of claim 35,
Knob mutation(s) are selected from among S354C, T366Y, T366W and T394W by EU numbering; and
the hole mutation(s) is selected from Y349C, T366S, L368A, F405A, Y407T, Y407A and Y407V by EU numbering;
wherein the Fc monomers form heterodimers.
TNFR1 작제물은 짧은 FcRn 결합 펩티드(FcRnBP)를 포함하고; 그리고
짧은 FcRn 결합 펩티드(FcRnBPs)는 작제물과 FcRn과의 상호작용을 제공하고 6-25 또는 10-20개의 아미노산 잔기를 함유하는, 작제물. The method of claim 45,
The TNFR1 construct contains a short FcRn binding peptide (FcRnBP); and
Short FcRn binding peptides (FcRnBPs) provide for interaction of the construct with FcRn and contain 6-25 or 10-20 amino acid residues.
TNFR1 억제제;
Fc 이량체; 및
Treg 확장제, 여기서:
Fc 이량체는 2개의 상보적인 Fc 단량체를 포함하고;
TNFR1 억제제는 Fc 단량체 중 하나에 연결되고 Treg 확장제는 다른 Fc 단량체에 연결된다.51. The construct of any one of claims 1-50, which is a TNFR1 antagonist construct comprising:
TNFR1 inhibitors;
Fc dimer; and
Treg expanders, wherein:
An Fc dimer comprises two complementary Fc monomers;
The TNFR1 inhibitor is linked to one Fc monomer and the Treg expander is linked to the other Fc monomer.
(Treg 확장제)n ― 링커p ― (활성 변형제)q, 식 3a, 또는
(활성 변형제)q ― 링커p ― (Treg 확장제)n, 식 3b, 여기서:
n 및 q는 각각 정수이고, 각각 독립적으로 1, 2 또는 3이고;
p는 0, 1, 2 또는 3이고;
활성 변형제는 활성 변형제가 없는 작제물과 비교하여 작제물의 활성 또는 약리학적 특성을 조정하거나 변경하는 모이어티이고; 그리고
링커는 작제물의 가요성을 증가시키고/시키거나 작제물의 입체 효과 또는 수용체와의 상호작용을 조절하거나 감소시키고/시키거나 작제물의 수성 매질에서 용해도를 증가시킨다.64. The construct of any one of claims 1-63, which is a TNFR2 agonist construct of Formula 3:
(Treg extender) n - linker p - (active modifier) q , Formula 3a, or
(active modifier) q - linker p - (Treg extender) n , formula 3b, where:
n and q are each an integer and are each independently 1, 2 or 3;
p is 0, 1, 2 or 3;
An active modifier is a moiety that modulates or alters the activity or pharmacological properties of a construct compared to a construct without the active modifier; and
The linker increases the flexibility of the construct, modulates or reduces the steric effect or interaction of the construct with a receptor, and/or increases the solubility of the construct in aqueous media.
식 4A:
, 또는
n은 1 내지 5이고;
R1은 H 또는 CH3, 또는 CH2CH3 또는 다른 C1-C5 알킬이고
는 TNFR1 억제제(TNFR1 길항제)이고;
는 Treg 확장제이거나; 또는
식 4B:
는 TNFR1 억제제(TNFR1 길항제)이고
는 Treg 확장제이고;
n은 1 내지 5이거나; 또는
식 4C:
는 TNFR1 억제제(TNFR1 길항제)이거나 Treg 확장제이고; 그리고
n은 1 내지 5이고; 또는
식 4D:
또는
여기서
각각의 는 동일하거나 상이하고 각각 독립적으로 TNFR1 억제제(TNFR1 길항제) 및 TNFR2 효능제로부터 선택되며;
활성 변형제는 선택적이며 분자 내 임의의 적합한 좌위에 연결될 수 있고; 그리고
n은 1 내지 5이다.The construct of claim 70 or 71 , having a structure selected from Formulas 4A-4D:
Equation 4A:
, or
n is 1 to 5;
R 1 is H or CH 3 , or CH 2 CH 3 or another C 1 -C 5 alkyl;
is a TNFR1 inhibitor (TNFR1 antagonist);
is a Treg expander; or
Equation 4B:
is a TNFR1 inhibitor (TNFR1 antagonist);
is a Treg expander;
n is 1 to 5; or
Equation 4C:
is a TNFR1 inhibitor (TNFR1 antagonist) or a Treg expander; and
n is 1 to 5; or
Equation 4D:
or
here
Each are the same or different and are each independently selected from TNFR1 inhibitors (TNFR1 antagonists) and TNFR2 agonists;
Active modifiers are optional and may be linked to any suitable locus in the molecule; and
n is 1 to 5;
활성 변형제는 Fc 영역이거나, 힌지 영역 또는 다른 링커를 포함하는 Fc 영역이고; 그리고
Fc 영역 또는 힌지 영역을 갖는 Fc 영역은 ADCC 및/또는 CDC 활성을 감소시키거나 제거하도록 변형된 Fc인, 작제물.74. The method of any one of claims 1 to 73 comprising an active modifier, wherein:
The active modifier is an Fc region or an Fc region comprising a hinge region or other linker; and
wherein the Fc region or Fc region having a hinge region is an Fc that has been modified to reduce or eliminate ADCC and/or CDC activity.
작제물은 짧은 FcRn 결합 펩티드(FcRnBP)를 포함하고; 그리고
짧은 FcRn 결합 펩티드(FcRnBPs)는 작제물과 FcRn과의 상호작용을 제공하고 6-25, 예컨대 10-20개의 아미노산 잔기를 함유하는, 작제물.77. The method of claim 76,
The construct contains a short FcRn binding peptide (FcRnBP); and
Short FcRn binding peptides (FcRnBPs) provide for interaction of the construct with FcRn and contain 6-25, such as 10-20, amino acid residues.
a) TNFR1 선택적인 TNFR1 억제제 모이어티;
b) 선택적으로 하나 이상의 링커; 및
c) 선택적으로 반감기 연장 모이어티, 여기서
길항제 작제물은 b) 및 c) 중 적어도 하나를 포함한다.81. The construct of any one of claims 1-80, which is a TNFR1 antagonist construct comprising:
a) a TNFR1 selective TNFR1 inhibitor moiety;
b) optionally one or more linkers; and
c) optionally a half-life extending moiety, wherein
The antagonist construct includes at least one of b) and c).
V1M, L29S, L29G, L29Y, R31C, R31E, R31N, R32Y, R32W, C69V, A84S, V85T, S86T, Y87H, Q88N, T89Q, I97T, C101A, A145R, E146R, L29S/R32W, L29S/S86T, R32W/S86T, L29S/R32W/S86T, R31N/R32T, R31E/S86T, R31N/R32T/S86T, I97T/A145R, V1M/R31C/C69V/Y87H/C101A/A145R, 및 A84S/V85T/S86T/Y87H/Q88N/T89Q.92. The method of claim 91, wherein the DN-TNF or TNF mutein is a soluble TNF molecule that confers selective inhibition of TNFR1 and comprises one or more amino acid substitutions selected from the following with respect to the sequence of soluble TNF set forth in SEQ ID NO: 2, Construct:
V1M, L29S, L29G, L29Y, R31C, R31E, R31N, R32Y, R32W, C69V, A84S, V85T, S86T, Y87H, Q88N, T89Q, I97T, C101A, A145R, E146R, L29S/R32W, L29S/S86T, R32W/ S86T, L29S/R32W/S86T, R31N/R32T, R31E/S86T, R31N/R32T/S86T, I97T/A145R, V1M/R31C/C69V/Y87H/C101A/A145R, and A84S/V85T/S86T/Y87H/Q88N /T89Q .
TNFR1 작제물은 짧은 FcRn 결합 펩티드(FcRnBP)를 포함하고; 그리고
짧은 FcRn 결합 펩티드(FcRnBPs)는 작제물과 FcRn과의 상호작용을 제공하고 6-25, 예컨대 10-20개의 아미노산 잔기를 함유하는, 작제물.113. The TNFR1 antagonist construct of any one of claims 1-112, wherein
The TNFR1 construct contains a short FcRn binding peptide (FcRnBP); and
Short FcRn binding peptides (FcRnBPs) provide for interaction of the construct with FcRn and contain 6-25, such as 10-20, amino acid residues.
a) TNFR1을 억제하는 도메인 항체;
b) 가요성을 증가시키고; 입체 효과를 감소시키거나 용해도를 증가시키는 링커; 및
c) 반감기 연장 모이어티.The construct of any one of claims 1 to 116 comprising:
a) domain antibodies that inhibit TNFR1;
b) increase flexibility; linkers that reduce steric effects or increase solubility; and
c) a half-life extending moiety.
a) 서열번호: 52-672 중 어느 하나의 도메인 항체(dAb), 또는 서열번호: 673-678 중 어느 하나의 scFv 또는 서열번호: 679-682 중 어느 하나의 Fab, 또는 서열번호: 683 또는 684의 나노바디, 또는 서열번호: 685-703 중 어느 하나의 TNF 뮤테인;
b) (GlySer)n (여기서 n= 1-10); (GlySer2); (Gly4Ser)n(여기서 n= 1-10); (Gly3Ser)n(여기서 n= 1-5); (SerGly4)n(여기서 n= 1-5); (GlySerSerGly)n(여기서 n= 1-5); GSGGSSGG; GSSSGSGSGSSG; GSSSGSGSGSSGG; GGSSGG; GGSSGGSGGSSSG; GSSSGSGSGGSSSGSGSG; GGSSGGSSGGGSSGGSSG; 및 GSSSGS 중에서 선택되는 GS 링커; 및
c) IgG Fc인 반감기 연장 모이어티. The construct of claim 117 or 118, which is a TNFR1 antagonist comprising:
a) a domain antibody (dAb) of any one of SEQ ID NOs: 52-672, or a scFv of any one of SEQ ID NOs: 673-678 or a Fab of any one of SEQ ID NOs: 679-682, or SEQ ID NOs: 683 or 684 or a TNF mutein of any one of SEQ ID NOs: 685-703;
b) (GlySer) n (where n=1-10); (GlySer 2 ); (Gly 4 Ser) n (where n=1-10); (Gly 3 Ser) n (where n= 1-5); (SerGly 4 ) n (where n=1-5); (GlySerSerGly) n (where n= 1-5); GSGGSSGG; GSSSGSGSGSSG; GSSSGSGSGSSGG; GGSSGG; GGSSGGSGGSSSG; GSSSGSGSGGSSSGSGSG; GGSSGGSSGGGSSGGSSG; and a GS linker selected from GSSSGS; and
c) a half-life extending moiety that is an IgG Fc.
GS 링커는 (GGGGS)3이고; 그리고
IgG Fc는 트라스투주맙의 Fc 또는 니볼루맙의 Fc인, TNFR1 길항제 작제물.The method of any one of claims 117 to 119,
the GS linker is (GGGGS) 3 ; and
The TNFR1 antagonist construct, wherein the IgG Fc is the Fc of Trastuzumab or the Fc of Nivolumab.
a) 서열번호: 52-672 중 어느 하나의 도메인 항체(dAb), 또는 서열번호: 673-678 중 어느 하나의 scFv 또는 서열번호: 679-682 중 어느 하나의 Fab, 또는 서열번호: 683 또는 684의 나노바디, 또는 서열번호: 685-703 중 어느 하나의 TNF 뮤테인;
b) 트라스투주맙의 힌지 서열의 전부 또는 일부 및 니볼루맙의 힌지 서열의 전부 또는 일부 중에서 선택되는 링커; 및
c) IgG Fc인 반감기 연장 모이어티. 121. The construct of any one of claims 1-120, which is a TNFR1 antagonist construct comprising:
a) a domain antibody (dAb) of any one of SEQ ID NOs: 52-672, or a scFv of any one of SEQ ID NOs: 673-678 or a Fab of any one of SEQ ID NOs: 679-682, or SEQ ID NOs: 683 or 684 or a TNF mutein of any one of SEQ ID NOs: 685-703;
b) a linker selected from all or part of the hinge sequence of Trastuzumab and all or part of the hinge sequence of Nivolumab; and
c) a half-life extending moiety that is an IgG Fc.
링커는 트라스투주맙의 힌지 서열의 전부 또는 일부를 포함하고; 그리고
IgG Fc는 트라스투주맙의 Fc인, 작제물. 121. The method of claim 121,
the linker comprises all or part of the hinge sequence of trastuzumab; and
wherein the IgG Fc is the Fc of Trastuzumab.
링커는 니볼루맙의 힌지 서열의 전부 또는 일부를 포함하고; 그리고
IgG Fc는 니볼루맙의 Fc인, 작제물. 121. The method of claim 121,
the linker comprises all or part of the hinge sequence of nivolumab; and
wherein the IgG Fc is the Fc of nivolumab.
a) 서열번호: 52-672 중 어느 하나의 도메인 항체(dAb), 또는 서열번호: 673-678 중 어느 하나의 scFv 또는 서열번호: 679-682 중 어느 하나의 Fab, 또는 서열번호: 683 또는 684의 나노바디, 또는 서열번호: 685-703 중 어느 하나의 TNF 뮤테인;
b) (GlySer)n (여기서 n= 1-10); (GlySer2); (Gly4Ser)n(여기서 n= 1-10); (Gly3Ser)n(여기서 n= 1-5); (SerGly4)n(여기서 n= 1-5); (GlySerSerGly)n(여기서 n= 1-5); GSGGSSGG; GSSSGSGSGSSG; GSSSGSGSGSSGG; GGSSGG; GGSSGGSGGSSSG; GSSSGSGSGGSSSGSGSG; GGSSGGSSGGGSSGGSSG; 및 GSSSGS 중에서 선택되는 GS 링커;
c) 트라스투주맙의 힌지 서열의 전부 또는 일부 및 니볼루맙의 힌지 서열의 전부 또는 일부 중에서 선택되는 제2 링커; 및
d) IgG Fc인 반감기 연장 모이어티. 124. The construct of any one of claims 1-123, which is a TNFR1 antagonist construct comprising:
a) a domain antibody (dAb) of any one of SEQ ID NOs: 52-672, or a scFv of any one of SEQ ID NOs: 673-678 or a Fab of any one of SEQ ID NOs: 679-682, or SEQ ID NO: 683 or 684 or a TNF mutein of any one of SEQ ID NOs: 685-703;
b) (GlySer) n (where n=1-10); (GlySer 2 ); (Gly 4 Ser) n (where n=1-10); (Gly 3 Ser) n (where n= 1-5); (SerGly 4 ) n (where n=1-5); (GlySerSerGly) n (where n= 1-5); GSGGSSGG; GSSSGSGSGSSG; GSSSGSGSGSSGG; GGSSGG; GGSSGGSGGSSSG; GSSSGSGSGGSSSGSGSG; GGSSGGSSGGGSSGGSSG; and a GS linker selected from GSSSGS;
c) a second linker selected from all or part of the hinge sequence of Trastuzumab and all or part of the hinge sequence of Nivolumab; and
d) a half-life extending moiety that is an IgG Fc.
GS 링커는 (GGGGS)3이고;
제2 링커는 서열 SCDKTH(서열번호: 31의 잔기 217-222)를 포함하고; 그리고
IgG Fc는 트라스투주맙의 Fc인, 작제물.124. The method of claim 124,
the GS linker is (GGGGS) 3 ;
the second linker comprises the sequence SCDKTH (residues 217-222 of SEQ ID NO: 31); and
wherein the IgG Fc is the Fc of Trastuzumab.
GS 링커는 (GGGGS)3이고;
제2 링커는 니볼루맙의 힌지 서열의 전부 또는 일부를 포함하고; 그리고
IgG Fc는 니볼루맙의 Fc인, 작제물.124. The method of claim 124,
the GS linker is (GGGGS) 3 ;
the second linker comprises all or part of the hinge sequence of nivolumab; and
wherein the IgG Fc is the Fc of nivolumab.
a) 서열번호: 52-672 중 어느 하나의 도메인 항체(dAb), 또는 서열번호: 673-678 중 어느 하나의 scFv 또는 서열번호: 679-682 중 어느 하나의 Fab, 또는 서열번호: 683 또는 684의 나노바디, 또는 서열번호: 685-703 중 어느 하나의 TNF 뮤테인;
b) (GlySer)n (여기서 n= 1-10); (GlySer2); (Gly4Ser)n(여기서 n= 1-10); (Gly3Ser)n(여기서 n= 1-5); (SerGly4)n(여기서 n= 1-5); (GlySerSerGly)n(여기서 n= 1-5); GSGGSSGG; GSSSGSGSGSSG; GSSSGSGSGSSGG; GGSSGG; GGSSGGSGGSSSG; GSSSGSGSGGSSSGSGSG; GGSSGGSSGGGSSGGSSG; 및 GSSSGS 중에서 선택되는 GS 링커; 및
c) PEG 분자인 반감기 연장 모이어티.A construct, which is a TNFR1 agonist comprising:
a) a domain antibody (dAb) of any one of SEQ ID NOs: 52-672, or a scFv of any one of SEQ ID NOs: 673-678 or a Fab of any one of SEQ ID NOs: 679-682, or SEQ ID NOs: 683 or 684 or a TNF mutein of any one of SEQ ID NOs: 685-703;
b) (GlySer) n (where n=1-10); (GlySer 2 ); (Gly 4 Ser) n (where n=1-10); (Gly 3 Ser) n (where n= 1-5); (SerGly 4 ) n (where n=1-5); (GlySerSerGly) n (where n= 1-5); GSGGSSGG; GSSSGSGSGSSG; GSSSGSGSGSSGG; GGSSGG; GGSSGGSGGSSSG; GSSSGSGSGGSSSGSGSG; GGSSGGSSGGGSSGGSSG; and a GS linker selected from GSSSGS; and
c) a half-life extending moiety that is a PEG molecule.
a) 서열번호: 52-672 중 어느 하나의 도메인 항체(dAb), 또는 서열번호: 673-678 중 어느 하나의 scFv 또는 서열번호: 679-682 중 어느 하나의 Fab, 또는 서열번호: 683 또는 684의 나노바디, 또는 서열번호: 685-703 중 어느 하나의 TNF 뮤테인;
b) (GlySer)n (여기서 n= 1-10); (GlySer2); (Gly4Ser)n(여기서 n= 1-10); (Gly3Ser)n(여기서 n= 1-5); (SerGly4)n(여기서 n= 1-5); (GlySerSerGly)n(여기서 n= 1-5); GSGGSSGG; GSSSGSGSGSSG; GSSSGSGSGSSGG; GGSSGG; GGSSGGSGGSSSG; GSSSGSGSGGSSSGSGSG; GGSSGGSSGGGSSGGSSG; 및 GSSSGS 중에서 선택되는 GS 링커; 및
c) 인간 혈청 알부민인 반감기 연장 모이어티. The construct of any one of claims 1 - 129 , which is a TNFR1 agonist construct comprising:
a) a domain antibody (dAb) of any one of SEQ ID NOs: 52-672, or a scFv of any one of SEQ ID NOs: 673-678 or a Fab of any one of SEQ ID NOs: 679-682, or SEQ ID NOs: 683 or 684 or a TNF mutein of any one of SEQ ID NOs: 685-703;
b) (GlySer) n (where n=1-10); (GlySer 2 ); (Gly 4 Ser) n (where n=1-10); (Gly 3 Ser) n (where n= 1-5); (SerGly 4 ) n (where n=1-5); (GlySerSerGly) n (where n= 1-5); GSGGSSGG; GSSSGSGSGSSG; GSSSGSGSGSSGG; GGSSGG; GGSSGGSGGSSSG; GSSSGSGSGGSSSGSGSG; GGSSGGSSGGGSSGGSSG; and a GS linker selected from GSSSGS; and
c) a half-life extending moiety that is human serum albumin.
a) 놉-인투-홀을 도입하기 위한 변형(들);
b) 신생아 Fc 수용체(FcRn) 재순환을 증가시키거나 강화하기 위한 변형(들); 및
c) 면역 이펙터 기능을 감소시키거나 제거하기 위한 변형(들).133. The construct of any one of claims 1-132, wherein the IgG Fc comprises one or more of the following modifications:
a) deformation(s) to introduce a knob-into-hole;
b) modification(s) to increase or enhance neonatal Fc receptor (FcRn) recycling; and
c) modification(s) to reduce or eliminate immune effector function.
놉 돌연변이는 EU 넘버링에 의해 S354C, T366Y, T366W 및 T394W 중에서 선택되며; 그리고
홀 돌연변이는 EU 넘버링에 의해 Y349C, T366S, L368A, F405A, Y407T, Y407A 및 Y407V 중에서 선택되는, TNFR1 길항제 작제물. 133. The method of claim 133,
Knob mutations are selected from among S354C, T366Y, T366W and T394W by EU numbering; and
wherein the hole mutation is selected from Y349C, T366S, L368A, F405A, Y407T, Y407A and Y407V by EU numbering.
T250Q, T250R, M252F, M252W, M252Y, S254T, T256D, T256E, T256Q, V259I, V308F, E380A, M428L, H433K, N434F, N434A, N434W, N434S, N434Y, Y436H, M252Y/T256Q, M252F/T256D, M252Y/S254T/T256E, H433K/N434F/Y436H, N434F/Y436H, T250Q/M428L, T250R/M428L, M428L/N434S, V259I/V308F, V259I/V308F/M428L, E294del/T307P/N434Y, 및 T256N/A378V/S383N/N434Y. 134. The TNFR1 antagonist construct of claim 133 or 134, wherein the modification(s) to increase or enhance FcRn recycling is selected from one or more of the following by EU numbering:
T250Q, T250R, M252F, M252W, M252Y, S254T, T256D, T256E, T256Q, V259I, V308F, E380A, M428L, H433K, N434F, N434A, N434W, N434S, N434Y, Y436H, M2 52Y/T256Q, M252F/T256D, M252Y/ S254T/T256E, H433K/N434F/Y436H, N434F/Y436H, T250Q/M428L, T250R/M428L, M428L/N434S, V259I/V308F, V259I/V308F/M428L, E294del/T307P/N4 34Y, and T256N/A378V/S383N/N434Y .
IgG1에서: EU 넘버링에 의해 L235E, L234A/L235A, L234E/L235F/P331S, L234F/L235E/P331S, L234A/L235A/P329G, L234A/L235A/G237A/P238S/H268A/A330S/P331S, G236R/L328R, G237A, E318A, D265A, E233P, N297A, N297Q, N297D, N297G, N297G/D265A, A330L, D270A, P329A, P331A, K322A, V264A, 및 F241A; 및
IgG4에서: EU 넘버링에 의해 L235E, F234A/L235A, S228P/L235E, 및 S228P/F234A/L235A. 137. The TNFR1 antagonist construct of claim 136, wherein the modification(s) to reduce or eliminate immune effector function is selected from one or more of the following:
In IgG1: L235E, L234A/L235A, L234E/L235F/P331S, L234F/L235E/P331S, L234A/L235A/P329G, L234A/L235A/G237A/P238S/H268A/A330S/P331 by EU numbering S, G236R/L328R, G237A , E318A, D265A, E233P, N297A, N297Q, N297D, N297G, N297G/D265A, A330L, D270A, P329A, P331A, K322A, V264A, and F241A; and
In IgG4: L235E, F234A/L235A, S228P/L235E, and S228P/F234A/L235A by EU numbering.
a) 놉-인투-홀을 도입하기 위한 변형(들); 여기서
놉 돌연변이는 EU 넘버링에 의해 S354C, T366Y, T366W 및 T394W 중에서 선택되며; 그리고
홀 돌연변이는 EU 넘버링에 의해 Y349C, T366S, L368A, F405A, Y407T, Y407A 및 Y407V 중에서 선택되는 변형;
b) 신생아 Fc 수용체(FcRn) 재순환을 증가시키거나 강화하기 위한 변형(들)로서, 하기 중 하나 이상으로부터 선택되는 변형:
T250Q, T250R, M252F, M252W, M252Y, S254T, T256D, T256E, T256Q, V259I, V308F, E380A, M428L, H433K, N434F, N434A, N434W, N434S, N434Y, Y436H, M252Y/T256Q, M252F/T256D, M252Y/S254T/T256E, H433K/N434F/Y436H, N434F/Y436H, T250Q/M428L, T250R/M428L, M428L/N434S, V259I/V308F, V259I/V308F/M428L, E294del/T307P/N434Y, 및 T256N/A378V/S383N/N434Y; 및
c) 하나 이상의 면역 이펙터 기능을 증가시키거나 강화하기 위한 변형(들)로서,
면역 이펙터 기능(들)은 CDC, ADCC 및 ADCP 중 하나 이상 중에서 선택되며; 그리고
면역 이펙터 기능을 증가시키거나 강화하기 위해 하기 중 하나 이상으로부터 선택되는 변형(들):
IgG1에서: 제1 중쇄에서 S239D, I332E, S239D/I332E, S239D/A330L/I332E, S298A/E333A/K334A; F243L/R292P/Y300L/V305I/P396L; L235V/F243L/R292P/Y300L/P396L; F243L/R292P/Y300L; L234Y/G236W/S298A 및 제2 중쇄에서 S239D/A330L/I332E; 제1 중쇄에서 L234Y/L235Q/G236W/S239M/H268D/D270E/S298A 및 제2 중쇄에서 D270E/K326D/A330M/K334E; A327Q/P329A; D265A/S267A/H268A/D270A/K326A/S337A; T256A/K290A/S298A/E333A/K334A; G236A; G236A/I332E; G236A/S239D/I332E; G236A/S239D/A330L/I332E; 잔기 N297에서 바이안테너리 글리칸의 도입; 잔기 N297; K326W; K326A; E333A; K326A/E333A; K326W/E333S; K326M/E333S; K222W/T223W; K222W/T223W/H224W; D221W/K222W; C220D/D221C; C220D/D221C/K222W/T223W; H268F/S324T; S267E; H268F; S324T; S267E/H268F/S324T; G236A/I332E/S267E/H268F/S324T; E345R; 및 E345R/E430G/S440Y에서 비푸코실화된 글리칸의 도입; EU 넘버링에 의해. 139. The construct of claim 138, wherein the Fc region is a modified IgG Fc and the modified IgG Fc comprises one or more of the following modifications:
a) deformation(s) to introduce a knob-into-hole; here
Knob mutations are selected from among S354C, T366Y, T366W and T394W by EU numbering; and
Hall mutations are variants selected from among Y349C, T366S, L368A, F405A, Y407T, Y407A and Y407V by EU numbering;
b) modification(s) to increase or enhance neonatal Fc receptor (FcRn) recycling, selected from one or more of the following:
T250Q, T250R, M252F, M252W, M252Y, S254T, T256D, T256E, T256Q, V259I, V308F, E380A, M428L, H433K, N434F, N434A, N434W, N434S, N434Y, Y436H, M2 52Y/T256Q, M252F/T256D, M252Y/ S254T/T256E, H433K/N434F/Y436H, N434F/Y436H, T250Q/M428L, T250R/M428L, M428L/N434S, V259I/V308F, V259I/V308F/M428L, E294del/T307P/N4 34Y, and T256N/A378V/S383N/N434Y ; and
c) modification(s) to increase or enhance one or more immune effector functions,
the immune effector function(s) is selected from one or more of CDC, ADCC and ADCP; and
Modification(s) selected from one or more of the following to increase or enhance immune effector function:
In IgG1: S239D, I332E, S239D/I332E, S239D/A330L/I332E, S298A/E333A/K334A in the first heavy chain; F243L/R292P/Y300L/V305I/P396L; L235V/F243L/R292P/Y300L/P396L; F243L/R292P/Y300L; L234Y/G236W/S298A and S239D/A330L/I332E in the second heavy chain; L234Y/L235Q/G236W/S239M/H268D/D270E/S298A in the first heavy chain and D270E/K326D/A330M/K334E in the second heavy chain; A327Q/P329A; D265A/S267A/H268A/D270A/K326A/S337A; T256A/K290A/S298A/E333A/K334A; G236A; G236A/I332E; G236A/S239D/I332E; G236A/S239D/A330L/I332E; introduction of a biantennary glycan at residue N297; residue N297; K326W; K326A; E333A; K326A/E333A; K326W/E333S; K326M/E333S; K222W/T223W; K222W/T223W/H224W; D221W/K222W; C220D/D221C; C220D/D221C/K222W/T223W; H268F/S324T; S267E; H268F; S324T; S267E/H268F/S324T; G236A/I332E/S267E/H268F/S324T; E345R; and introduction of afucosylated glycans at E345R/E430G/S440Y; by EU numbering.
a) Treg 확장제;
b) 작제물의 가요성을 증가시키고/시키거나 작제물의 입체 효과 또는 수용체와의 상호작용을 조절하거나 감소시키고/시키거나 작제물의 수성 매질에서 용해도를 증가키는 링커; 및
c) 활성 변형제가 없는 작제물과 비교하여 작제물의 활성 또는 약리학적 특성을 조정하거나 변경하는 모이어티인 활성 변형제.A construct that is a Treg expander construct, the construct comprising:
a) Treg expanders;
b) a linker that increases the flexibility of the construct and/or modulates or reduces the steric effect or interaction of the construct with a receptor and/or increases the solubility of the construct in aqueous media; and
c) an active modifier, which is a moiety that modulates or alters the activity or pharmacological properties of a construct compared to a construct without the active modifier.
a) TNFR2 효능제;
b) 작제물의 가요성을 증가시키고/시키거나 작제물의 입체 효과 또는 수용체와의 상호작용을 조절하거나 감소시키고/시키거나 작제물의 수성 매질에서 용해도를 증가키는 링커; 및
c) 활성 변형제가 없는 작제물과 비교하여 작제물의 활성 또는 약리학적 특성을 조정하거나 변경하는 모이어티인 활성 변형제.146. The construct of any one of claims 1-145, which is a TNFR2 agonist construct comprising:
a) TNFR2 agonists;
b) a linker that increases the flexibility of the construct and/or modulates or reduces the steric effect or interaction of the construct with a receptor and/or increases the solubility of the construct in aqueous media; and
c) an active modifier, which is a moiety that modulates or alters the activity or pharmacological properties of a construct compared to a construct without the active modifier.
a) 서열번호: 839-865, 1202 및 1204에 제시된 에피토프 중에서 선택되는 인간 TNFR2 내의 하나 이상의 에피토프에 결합하는 TNFR2 효능제;
b) (GlySer)n (여기서 n= 1-10); (GlySer2); (Gly4Ser)n(여기서 n= 1-10); (Gly3Ser)n(여기서 n= 1-5); (SerGly4)n(여기서 n= 1-5); (GlySerSerGly)n(여기서 n= 1-5); GSGGSSGG; GSSSGSGSGSSG; GSSSGSGSGSSGG; GGSSGG; GGSSGGSGGSSSG; GSSSGSGSGGSSSGSGSG; GGSSGGSSGGGSSGGSSG; 및 GSSSGS 중에서 선택되는 GS 링커; 및
c) IgG Fc인 반감기 연장 모이어티인 활성 변형제. The construct of any one of claims 1 - 183 , which is a TNFR2 agonist construct comprising:
a) a TNFR2 agonist that binds to one or more epitopes in human TNFR2 selected from among the epitopes set forth in SEQ ID NOs: 839-865, 1202 and 1204;
b) (GlySer) n (where n=1-10); (GlySer 2 ); (Gly 4 Ser) n (where n=1-10); (Gly 3 Ser) n (where n= 1-5); (SerGly 4 ) n (where n=1-5); (GlySerSerGly) n (where n= 1-5); GSGGSSGG; GSSSGSGSGSSG; GSSSGSGSGSSGG; GGSSGG; GGSSGGSGGSSSG; GSSSGSGSGGSSSGSGSG; GGSSGGSSGGGSSGGSSG; and a GS linker selected from GSSSGS; and
c) an activity modifier that is a half-life extending moiety that is an IgG Fc.
GS 링커는 (GGGGS)3이고; 그리고
IgG Fc는 트라스투주맙의 Fc 또는 니볼루맙의 Fc인, 작제물.184. The method of claim 184,
the GS linker is (GGGGS) 3 ; and
wherein the IgG Fc is the Fc of Trastuzumab or the Fc of Nivolumab.
a) 서열번호: 839-865, 1202 및 1204에 제시된 에피토프 중에서 선택되는 인간 TNFR2 내의 하나 이상의 에피토프에 결합하는 TNFR2 효능제;
b) 트라스투주맙의 힌지 서열의 전부 또는 일부 및 니볼루맙의 힌지 서열의 전부 또는 일부 중에서 선택되는 링커; 및
c) IgG Fc인 반감기 연장 모이어티인 활성 변형제. The construct of any one of claims 1 - 185 , which is a TNFR2 agonist construct comprising:
a) a TNFR2 agonist that binds to one or more epitopes in human TNFR2 selected from among the epitopes set forth in SEQ ID NOs: 839-865, 1202 and 1204;
b) a linker selected from all or part of the hinge sequence of Trastuzumab and all or part of the hinge sequence of Nivolumab; and
c) an activity modifier that is a half-life extending moiety that is an IgG Fc.
링커는 트라스투주맙의 힌지 서열의 전부 또는 일부를 포함하고; 그리고
IgG Fc는 트라스투주맙의 Fc인, 작제물.186. The method of claim 186,
the linker comprises all or part of the hinge sequence of trastuzumab; and
wherein the IgG Fc is the Fc of Trastuzumab.
링커는 니볼루맙의 힌지 서열의 전부 또는 일부를 포함하고; 그리고
IgG Fc는 니볼루맙의 Fc인, 작제물.187. The method of claim 187,
the linker comprises all or part of the hinge sequence of nivolumab; and
wherein the IgG Fc is the Fc of nivolumab.
a) 서열번호: 839-865, 1202 및 1204에 제시된 에피토프 중에서 선택되는 인간 TNFR2 내의 하나 이상의 에피토프에 결합하는 TNFR2 효능제;
b) (GlySer)n (여기서 n= 1-10); (GlySer2); (Gly4Ser)n(여기서 n= 1-10); (Gly3Ser)n(여기서 n= 1-5); (SerGly4)n(여기서 n= 1-5); (GlySerSerGly)n(여기서 n= 1-5); GSGGSSGG; GSSSGSGSGSSG; GSSSGSGSGSSGG; GGSSGG; GGSSGGSGGSSSG; GSSGSGSGGSSSGSGSG; GGSSGGSSGGGSSGGSSG; 및 GSSSGS 중에서 선택되는 GS 링커;
c) 트라스투주맙의 힌지 서열의 전부 또는 일부 및 니볼루맙의 힌지 서열의 전부 또는 일부 중에서 선택되는 제2 링커; 및
d) IgG Fc인 반감기 연장 모이어티인 활성 변형제. The construct of any one of claims 1 - 183 , which is a TNFR2 construct comprising:
a) a TNFR2 agonist that binds to one or more epitopes in human TNFR2 selected from among the epitopes set forth in SEQ ID NOs: 839-865, 1202 and 1204;
b) (GlySer) n (where n=1-10); (GlySer 2 ); (Gly 4 Ser) n (where n=1-10); (Gly 3 Ser) n (where n= 1-5); (SerGly 4 ) n (where n=1-5); (GlySerSerGly) n (where n= 1-5); GSGGSSGG; GSSSGSGSGSSG; GSSSGSGSGSSGG; GGSSGG; GGSSGGSGGSSSG; GSSGSGSGGSSSGSGSG; GGSSGGSSGGGSSGGSSG; and a GS linker selected from GSSSGS;
c) a second linker selected from all or part of the hinge sequence of Trastuzumab and all or part of the hinge sequence of Nivolumab; and
d) an activity modifier that is a half-life extending moiety that is an IgG Fc.
GS 링커는 (GGGGS)3이고;
제2 링커는 서열 SCDKTH(서열번호: 31의 잔기 217-222)를 포함하고; 그리고
IgG Fc는 트라스투주맙의 Fc인, 작제물.189. The method of claim 189,
the GS linker is (GGGGS) 3 ;
the second linker comprises the sequence SCDKTH (residues 217-222 of SEQ ID NO: 31); and
wherein the IgG Fc is the Fc of Trastuzumab.
GS 링커는 (GGGGS)3이고;
제2 링커는 니볼루맙의 힌지 서열의 전부 또는 일부를 포함하고; 그리고
IgG Fc는 니볼루맙의 Fc인, 작제물.189. The method of claim 189,
the GS linker is (GGGGS) 3 ;
the second linker comprises all or part of the hinge sequence of nivolumab; and
wherein the IgG Fc is the Fc of nivolumab.
a) MR2-1 또는 MAB2261로부터 선택된 효능제 인간 항-TNFR2 항체의 항원 결합 단편을 포함하는 TNFR2 효능제;
b) 하기를 포함하는 링커:
i) (GlySer)n (여기서 n= 1-10); (GlySer2); (Gly4Ser)n(여기서 n= 1-10); (Gly3Ser)n(여기서 n= 1-5); (SerGly4)n(여기서 n= 1-5); (GlySerSerGly)n(여기서 n= 1-5); GSGGSSGG; GSSSGSGSGSSG; GSSSGSGSGSSGG; GGSSGG; GGSSGGSGGSSSG; GSSSGSGSGGSSSGSGSG; GGSSGGSSGGGSSGGSSG; 및 GSSSGS 중에서 선택되는 GS 링커; 및/또는
ii) 트라스투주맙의 힌지 서열의 전부 또는 일부 또는 니볼루맙의 힌지 서열의 전부 또는 일부; 및
c) IgG1 또는 IgG4 Fc, PEG 분자 및 인간 혈청 알부민(HSA) 중에서 선택되는 반감기 연장 모이어티인 활성 변형제로서,
IgG1 Fc는 서열번호: 10에 제시된 인간 IgG1의 Fc이거나 서열번호: 27에 제시된 트라스투주맙의 Fc이고; 그리고
PEG 분자는 적어도 또는 적어도 약 30 kDa의 분자량을 갖는, 활성 변형제. The construct of any one of claims 1 - 191 , which is a TNFR2 agonist construct comprising:
a) a TNFR2 agonist comprising an antigen-binding fragment of an agonist human anti-TNFR2 antibody selected from MR2-1 or MAB2261;
b) a linker comprising:
i) (GlySer) n (where n = 1-10); (GlySer 2 ); (Gly 4 Ser) n (where n=1-10); (Gly 3 Ser) n (where n= 1-5); (SerGly 4 ) n (where n=1-5); (GlySerSerGly) n (where n= 1-5); GSGGSSGG; GSSSGSGSGSSG; GSSSGSGSGSSGG; GGSSGG; GGSSGGSGGSSSG; GSSSGSGSGGSSSGSGSG; GGSSGGSSGGGSSGGSSG; and a GS linker selected from GSSSGS; and/or
ii) all or part of the hinge sequence of trastuzumab or all or part of the hinge sequence of nivolumab; and
c) an active modifier which is a half-life extending moiety selected from an IgG1 or IgG4 Fc, a PEG molecule and human serum albumin (HSA);
IgG1 Fc is the Fc of human IgG1 as shown in SEQ ID NO: 10 or the Fc of Trastuzumab as shown in SEQ ID NO: 27; and
wherein the PEG molecule has a molecular weight of at least or at least about 30 kDa.
a) 서열번호: 2와 관련하여 K65W, D143Y, D143F, D143N, D143E, D143W, D143V, A145R, A145H, A145K, A145F, A145W, E146Q, E146H, E146K, E146N, D143N/A145R, A145R/S147T, Q88N/T89S/A145S/E146A/S147D, Q88N/A145I/E146G/S147D, A145H/E146S/S147D, A145H/S147D, L29V/A145D/E146D/S147D, A145N/E146D/S147D, A145T/E146S/S147D, A145Q/E146D/S147D, A145T/E146D/S147D, A145D/E146G/S147D, A145D/S147D, A145K/E146D/S147T, A145R/E146T/S147D, A145R/S147T, E146D/S147D, D143V/F144L/A145S, S95C/G148C, 및 D143V/A145S 중에서 선택된 하나 이상의 TNFR2 선택적 돌연변이를 포함하는 가용성 TNF 변이체인 TNFR2 선택적 TNF 뮤테인;
b) 하기를 포함하는 링커:
i) (GlySer)n (여기서 n= 1-10); (GlySer2); (Gly4Ser)n(여기서 n= 1-10); (Gly3Ser)n(여기서 n= 1-5); (SerGly4)n(여기서 n= 1-5); (GlySerSerGly)n(여기서 n= 1-5); GSGGSSGG; GSSSGSGSGSSG; GSSSGSGSGSSGG; GGSSGG; GGSSGGSGGSSSG; GSSSGSGSGGSSSGSGSG; GGSSGGSSGGGSSGGSSG; 및 GSSSGS 중에서 선택되는 GS 링커; 및/또는
ii) 트라스투주맙의 힌지 서열의 전부 또는 일부 또는 니볼루맙의 힌지 서열의 전부 또는 일부; 및
c) IgG1 또는 IgG4 Fc, PEG 분자 및 인간 혈청 알부민(HSA) 중에서 선택되는 반감기 연장 모이어티인 활성 변형제로서,
IgG1 Fc는 서열번호: 10에 제시된 인간 IgG1의 Fc이거나 서열번호: 27에 제시된 트라스투주맙의 Fc이고; 그리고
PEG 분자는 적어도 또는 적어도 약 30 kDa의 분자량을 갖는, 활성 변형제. 193. The construct of any one of claims 1-192, which is or comprises a TNFR2 agonist construct comprising:
a) K65W, D143Y, D143F, D143N, D143E, D143W, D143V, A145R, A145H, A145K, A145F, A145W, E146Q, E146H, E146K, E146N, D143N/A145R, A145R with respect to SEQ ID NO: 2 /S147T, Q88N /T89S/A145S/E146A/S147D, Q88N/A145I/E146G/S147D, A145H/E146S/S147D, A145H/S147D, L29V/A145D/E146D/S147D, A145N/E146D/S147D, A145 T/E146S/S147D, A145Q/E146D /S147D, A145T/E146D/S147D, A145D/E146G/S147D, A145D/S147D, A145K/E146D/S147T, A145R/E146T/S147D, A145R/S147T, E146D/S147D, D143V/F 144L/A145S, S95C/G148C, and a TNFR2 selective TNF mutein, which is a soluble TNF variant comprising one or more TNFR2 selective mutations selected from D143V/A145S;
b) a linker comprising:
i) (GlySer) n (where n = 1-10); (GlySer 2 ); (Gly 4 Ser) n (where n=1-10); (Gly 3 Ser) n (where n= 1-5); (SerGly 4 ) n (where n=1-5); (GlySerSerGly) n (where n= 1-5); GSGGSSGG; GSSSGSGSGSSG; GSSSGSGSGSSGG; GGSSGG; GGSSGGSGGSSSG; GSSSGSGSGGSSSGSGSG; GGSSGGSSGGGSSGGSSG; and a GS linker selected from GSSSGS; and/or
ii) all or part of the hinge sequence of trastuzumab or all or part of the hinge sequence of nivolumab; and
c) an active modifier which is a half-life extending moiety selected from an IgG1 or IgG4 Fc, a PEG molecule and human serum albumin (HSA);
IgG1 Fc is the Fc of human IgG1 as shown in SEQ ID NO: 10 or the Fc of Trastuzumab as shown in SEQ ID NO: 27; and
wherein the PEG molecule has a molecular weight of at least or at least about 30 kDa.
a) 돌연변이 D143N/A145R을 포함하는 TNFR2 TNF 뮤테인;
b) (GGGGS)3 링커; 및
c) 트라스투주맙의 Fc 또는 니볼루맙의 Fc인 반감기 연장 모이어티인 활성 변형제.194. The construct of any one of claims 1-193, which is or comprises a TNFR2 agonist construct comprising:
a) a TNFR2 TNF mutein comprising the mutations D143N/A145R;
b) (GGGGS) 3 linker; and
c) an active modifier that is a half-life extending moiety that is the Fc of Trastuzumab or the Fc of Nivolumab.
a) 돌연변이 D143N/A145R을 포함하는 TNFR2 선택적 TNF 뮤테인;
b) (GGGGS)3 링커 및 서열 SCDKTH(서열번호: 31의 잔기 217-222)를 포함하는 제2 링커; 및
c) 트라스투주맙의 Fc인 반감기 연장 모이어티인 활성 변형제.195. The construct of any one of claims 1-194, which is a TNFR2 agonist construct comprising:
a) a TNFR2 selective TNF mutein comprising the mutations D143N/A145R;
b) a second linker comprising the (GGGGS) 3 linker and the sequence SCDKTH (residues 217-222 of SEQ ID NO: 31); and
c) an active modifier that is the Fc half-life extending moiety of Trastuzumab.
a) 돌연변이 D143N/A145R을 포함하는 TNFR2 선택적 TNF 뮤테인;
b) (GGGGS)3 링커 및 니볼루맙의 힌지 서열의 전부 또는 일부를 포함하는 제2 링커; 및
c) 니볼루맙의 Fc인 반감기 연장 모이어티인 활성 변형제.A construct, which is a TNFR2 agonist construct comprising:
a) a TNFR2 selective TNF mutein comprising the mutations D143N/A145R;
b) a (GGGGS) 3 linker and a second linker comprising all or part of the hinge sequence of nivolumab; and
c) an active modifier that is a half-life extending moiety that is the Fc of nivolumab.
a) 돌연변이 D143N/A145R을 포함하는 TNFR2 선택적 TNF 뮤테인;
b) 서열번호: 26의 잔기 219-233에 상응하는 트라스투주맙의 힌지 서열의 전부 또는 일부를 포함하는 링커; 및
c) 트라스투주맙의 Fc인 반감기 연장 모이어티.The construct of any one of claims 1 - 196 , which is a TNFR2 agonist construct comprising:
a) a TNFR2 selective TNF mutein comprising the mutations D143N/A145R;
b) a linker comprising all or part of the hinge sequence of Trastuzumab corresponding to residues 219-233 of SEQ ID NO:26; and
c) a half-life extending moiety that is the Fc of Trastuzumab.
a) 돌연변이 D143N/A145R을 포함하는 TNFR2 선택적 TNF 뮤테인;
b) 서열번호: 29의 잔기 212-223에 상응하는 니볼루맙의 힌지 서열의 전부 또는 일부를 포함하는 링커; 및
c) 니볼루맙의 Fc인 반감기 연장 모이어티인 활성 변형제.The construct of any one of claims 1 - 197 , which is or comprises a TNFR2 agonist construct comprising:
a) a TNFR2 selective TNF mutein comprising the mutations D143N/A145R;
b) a linker comprising all or part of the hinge sequence of nivolumab corresponding to residues 212-223 of SEQ ID NO:29; and
c) an active modifier that is a half-life extending moiety that is the Fc of nivolumab.
a) 놉-인투-홀을 도입하기 위한 변형(들);
b) 신생아 Fc 수용체(FcRn) 재순환을 증가시키거나 강화하기 위한 변형(들); 및
c) 보체 의존적 세포독성 (CDC), 항체 의존적 세포 매개 세포독성 (ADCC) 및 항체 의존적 세포 매개 식균작용 (ADCP) 중 하나 이상 중에서 선택된, 면역 이펙터 기능을 감소시키거나 제거하기 위한 변형(들).213. The construct of any one of claims 1-212, which is a TNFR2 agonist construct and comprises a modified IgG Fc, wherein the IgG Fc comprises one or more of the following modifications:
a) deformation(s) to introduce a knob-into-hole;
b) modification(s) to increase or enhance neonatal Fc receptor (FcRn) recycling; and
c) modification(s) to reduce or eliminate an immune effector function selected from one or more of complement dependent cytotoxicity (CDC), antibody dependent cell mediated cytotoxicity (ADCC) and antibody dependent cell mediated phagocytosis (ADCP).
a) 놉-인투-홀을 도입하기 위한 변형(들)은 하기로부터 선택되고:
EU 넘버링에 의해 S354C, T366Y, T366W 및 T394W 중에서 선택되는 하나 이상의 놉 돌연변이; 및
EU 넘버링에 의해 Y349C, T366S, L368A, F405A, Y407T, Y407A 및 Y407V 중에서 선택되는 하나 이상의 홀 돌연변이로서, Fc는 이량체를 형성하는, 하나 이상의 홀 돌연변이로서;
b) FcRn 재순환을 증가시키거나 강화시키기 위한 변형(들)은 EU 넘버링에 의해 T250Q, T250R, M252F, M252W, M252Y, S254T, T256D, T256E, T256Q, V259I, V308F, E380A, M428L, H433K, N434F, N434A, N434W, N434S, N434Y, Y436H, M252Y/T256Q, M252F/T256D, M252Y/S254T/T256E, H433K/N434F/Y436H, N434F/Y436H, T250Q/M428L, T250R/M428L, M428L/N434S, V259I/V308F, V259I/V308F/M428L, E294del/T307P/N434Y, 및 T256N/A378V/S383N/N434Y 중 하나 이상 중에서 선택되고; 그리고
c) 면역 이펙터 기능을 감소시키거나 제거하기 위한 변형(들)은 하기 중 하나 이상 중으로부터 선택된다:
IgG1에서: EU 넘버링에 의해 L235E, L234A/L235A, L234E/L235F/P331S, L234F/L235E/P331S, L234A/L235A/P329G, L234A/L235A/G237A/P238S/H268A/A330S/P331S, G236R/L328R, G237A, E318A, D265A, E233P, N297A, N297Q, N297D, N297G, N297G/D265A, A330L, D270A, P329A, P331A, K322A, V264A, 및 F241A; 및
IgG4에서: EU 넘버링에 의해 L235E, F234A/L235A, S228P/L235E, 및 S228P/F234A/L235A.213. The construct of claim 213, which is:
a) the modification(s) to introduce a knob-into-hole are selected from:
at least one knob mutation selected from among S354C, T366Y, T366W and T394W by EU numbering; and
at least one hole mutation selected from Y349C, T366S, L368A, F405A, Y407T, Y407A and Y407V by EU numbering, wherein Fc forms a dimer;
b) the variant(s) to increase or enhance FcRn recycling are, by EU numbering: N434A, N434W, N434S, N434Y, Y436H, M252Y/T256Q, M252F/T256D, M252Y/S254T/T256E, H433K/N434F/Y436H, N434F/Y436H, T250Q/M428L, T250R/M4 28L, M428L/N434S, V259I/V308F, selected from one or more of V259I/V308F/M428L, E294del/T307P/N434Y, and T256N/A378V/S383N/N434Y; and
c) the modification(s) to reduce or eliminate immune effector function is selected from one or more of the following:
In IgG1: L235E, L234A/L235A, L234E/L235F/P331S, L234F/L235E/P331S, L234A/L235A/P329G, L234A/L235A/G237A/P238S/H268A/A330S/P331 by EU numbering S, G236R/L328R, G237A , E318A, D265A, E233P, N297A, N297Q, N297D, N297G, N297G/D265A, A330L, D270A, P329A, P331A, K322A, V264A, and F241A; and
In IgG4: L235E, F234A/L235A, S228P/L235E, and S228P/F234A/L235A by EU numbering.
a) 놉-인투-홀을 도입하기 위한 변형(들); 여기서
놉 돌연변이는 EU 넘버링에 의해 S354C, T366Y, T366W 및 T394W 중에서 선택되며; 그리고
홀 돌연변이는 EU 넘버링에 의해 Y349C, T366S, L368A, F405A, Y407T, Y407A 및 Y407V 중에서 선택되는 변형;
b) 신생아 Fc 수용체(FcRn) 재순환을 증가시키거나 강화하기 위한 변형(들)로서, 하기 중 하나 이상으로부터 선택되는 변형:
T250Q, T250R, M252F, M252W, M252Y, S254T, T256D, T256E, T256Q, V259I, V308F, E380A, M428L, H433K, N434F, N434A, N434W, N434S, N434Y, Y436H, M252Y/T256Q, M252F/T256D, M252Y/S254T/T256E, H433K/N434F/Y436H, N434F/Y436H, T250Q/M428L, T250R/M428L, M428L/N434S, V259I/V308F, V259I/V308F/M428L, E294del/T307P/N434Y, 및 T256N/A378V/S383N/N434Y; 및
c) 면역 이펙터 기능을 증가시키거나 강화하기 위한 변형(들)로서,
면역 이펙터 기능(들)은 CDC, ADCC 및 ADCP 중 하나 이상 중에서 선택되며; 그리고
면역 이펙터 기능을 증가시키거나 강화하기 위한 변형(들)은 하기 중 하나 이상으로부터 선택된다:
IgG1에서: 제1 중쇄에서 S239D, I332E, S239D/I332E, S239D/A330L/I332E, S298A/E333A/K334A; F243L/R292P/Y300L/V305I/P396L; L235V/F243L/R292P/Y300L/P396L; F243L/R292P/Y300L; L234Y/G236W/S298A 및 제2 중쇄에서 S239D/A330L/I332E; 제1 중쇄에서 L234Y/L235Q/G236W/S239M/H268D/D270E/S298A 및 제2 중쇄에서 D270E/K326D/A330M/K334E; A327Q/P329A; D265A/S267A/H268A/D270A/K326A/S337A; T256A/K290A/S298A/E333A/K334A; G236A; G236A/I332E; G236A/S239D/I332E; G236A/S239D/A330L/I332E; 잔기 N297에서 바이안테너리 글리칸의 도입; 잔기 N297; K326W; K326A; E333A; K326A/E333A; K326W/E333S; K326M/E333S; K222W/T223W; K222W/T223W/H224W; D221W/K222W; C220D/D221C; C220D/D221C/K222W/T223W; H268F/S324T; S267E; H268F; S324T; S267E/H268F/S324T; G236A/I332E/S267E/H268F/S324T; E345R; 및 E345R/E430G/S440Y에서 비푸코실화된 글리칸의 도입; EU 넘버링에 의해. 214. The construct of any one of claims 1-213, wherein the TNFR2 agonist construct contains a modified IgG Fc, wherein the IgG Fc comprises one or more of the following modifications:
a) deformation(s) to introduce a knob-into-hole; here
Knob mutations are selected from among S354C, T366Y, T366W and T394W by EU numbering; and
Hall mutations are variants selected from among Y349C, T366S, L368A, F405A, Y407T, Y407A and Y407V by EU numbering;
b) modification(s) to increase or enhance neonatal Fc receptor (FcRn) recycling, selected from one or more of the following:
T250Q, T250R, M252F, M252W, M252Y, S254T, T256D, T256E, T256Q, V259I, V308F, E380A, M428L, H433K, N434F, N434A, N434W, N434S, N434Y, Y436H, M2 52Y/T256Q, M252F/T256D, M252Y/ S254T/T256E, H433K/N434F/Y436H, N434F/Y436H, T250Q/M428L, T250R/M428L, M428L/N434S, V259I/V308F, V259I/V308F/M428L, E294del/T307P/N4 34Y, and T256N/A378V/S383N/N434Y ; and
c) as modification(s) to increase or enhance immune effector function;
the immune effector function(s) is selected from one or more of CDC, ADCC and ADCP; and
The modification(s) to increase or enhance immune effector function are selected from one or more of the following:
In IgG1: S239D, I332E, S239D/I332E, S239D/A330L/I332E, S298A/E333A/K334A in the first heavy chain; F243L/R292P/Y300L/V305I/P396L; L235V/F243L/R292P/Y300L/P396L; F243L/R292P/Y300L; L234Y/G236W/S298A and S239D/A330L/I332E in the second heavy chain; L234Y/L235Q/G236W/S239M/H268D/D270E/S298A in the first heavy chain and D270E/K326D/A330M/K334E in the second heavy chain; A327Q/P329A; D265A/S267A/H268A/D270A/K326A/S337A; T256A/K290A/S298A/E333A/K334A; G236A; G236A/I332E; G236A/S239D/I332E; G236A/S239D/A330L/I332E; introduction of a biantennary glycan at residue N297; residue N297; K326W; K326A; E333A; K326A/E333A; K326W/E333S; K326M/E333S; K222W/T223W; K222W/T223W/H224W; D221W/K222W; C220D/D221C; C220D/D221C/K222W/T223W; H268F/S324T; S267E; H268F; S324T; S267E/H268F/S324T; G236A/I332E/S267E/H268F/S324T; E345R; and introduction of afucosylated glycans at E345R/E430G/S440Y; by EU numbering.
a) TNFR2 효능제;
b) 하나 이상의 링커; 및
c) 반감기 연장 모이어티인 활성 변형제로서,
TNFR2 효능제 작제물은 다량체화 도메인과 융합된 단쇄 TNFR2 선택적 TNF 뮤테인 삼량체를 포함하는 융합 단백질이며, 하기 식을 포함하고:
MD-L1-TNFmut-L2-TNFmut-L3-TNFmut (식 II); 또는
TNFmut-L1-TNFmut-L2-TNFmut-L3-MD (식 III),
MD는 동일하거나 상이한 다량체화 도메인이고; TNFmut은 TNFR2 선택적 TNF 뮤테인이고; 그리고 L1, L2 및 L3은 동일하거나 상이할 수 있는 링커인, 작제물. 218. The method of any one of claims 1-217, which is or comprises a TNFR2 agonist construct, which selectively activates or agonizes TNFR2 without activating or antagonizing TNFR1, comprising:
a) TNFR2 agonists;
b) one or more linkers; and
c) an active modifier that is a half-life extending moiety,
The TNFR2 agonist construct is a fusion protein comprising a single chain TNFR2 selective TNF mutein trimer fused with a multimerization domain, comprising the formula:
MD-L1-TNFmut-L2-TNFmut-L3-TNFmut (formula II); or
TNFmut-L1-TNFmut-L2-TNFmut-L3-MD (formula III);
MDs are the same or different multimerization domains; TNFmut is a TNFR2 selective TNF mutein; and L1, L2 and L3 are linkers that may be the same or different.
(GlySer)n (여기서 n= 1-10); (GlySer2); (Gly4Ser)n(여기서 n= 1-10); (Gly3Ser)n(여기서 n= 1-5); (SerGly4)n(여기서 n= 1-5); (GlySerSerGly)n(여기서 n= 1-5); GSGGSSGG; GSSSGSGSGSSG; GSSSGSGSGSSGG; GGSSGG; GGSSGGSGGSSSG; GSSSGSGSGGSSSGSGSG; GGSSGGSSGGGSSGGSSG; 및 GSSSGS 중에서 선택되는 GS 링커; 또는
트라스투주맙의 힌지 서열의 전부 또는 일부 및 니볼루맙의 힌지 서열의 전부 또는 일부 중에서 선택되는 링커; 또는
이들의 조합. 224. The TNFR2 agonist construct of any one of claims 218-223, wherein the linker between the TNFR2 agonist and the half-life extending moiety is:
(GlySer) n (where n=1-10); (GlySer 2 ); (Gly 4 Ser) n (where n=1-10); (Gly 3 Ser) n (where n= 1-5); (SerGly 4 ) n (where n=1-5); (GlySerSerGly) n (where n= 1-5); GSGGSSGG; GSSSGSGSGSSG; GSSSGSGSGSSGG; GGSSGG; GGSSGGSGGSSSG; GSSSGSGSGGSSSGSGSG; GGSSGGSSGGGSSGGSSG; and a GS linker selected from GSSSGS; or
a linker selected from all or part of the hinge sequence of Trastuzumab and all or part of the hinge sequence of Nivolumab; or
combination of them.
서열번호: 10에 제시된 인간 IgG1의 Fc 또는 서열번호: 27에 기재된 트라스투주맙의 Fc인 IgG1 Fc;
서열번호: 16에 제시된 인간 IgG4의 Fc 또는 서열번호: 30에 제시된 니볼루맙의 Fc인 IgG4 Fc;
크기가 적어도 또는 적어도 약 30 kDa인 PEG 분자; 및
인간 혈청 알부민(HSA). 225. The TNFR2 agonist construct of any one of claims 218-224, wherein the half-life extending moiety is selected from:
an IgG1 Fc that is the Fc of human IgG1 shown in SEQ ID NO: 10 or the Fc of trastuzumab described in SEQ ID NO: 27;
an IgG4 Fc that is the Fc of human IgG4 as shown in SEQ ID NO: 16 or the Fc of nivolumab as shown in SEQ ID NO: 30;
PEG molecules of at least or at least about 30 kDa in size; and
Human Serum Albumin (HSA).
a) 하기 식을 갖는 작제물:
MD-L1-TNFmut-L2-TNFmut-L3-TNFmut (식 II); 또는
TNFmut-L1-TNFmut-L2-TNFmut-L3-MD (식 III),
MD는 다량체화 도메인이고; TNFmut은 TNFR2 선택적 TNF 뮤테인이고; 그리고 L1, L2 및 L3은 동일하거나 상이한 링커이고, 여기서
i) MD는 EHD2 (서열번호: 808), MHD2 (서열번호: 811), 닭 테나스신 C(TNC)의 삼량체화 도메인 (서열번호: 804의 잔기 110-139; 서열번호: 805), 또는 인간 TNC의 삼량체화 도메인 (서열번호: 806의 잔기 110-139, 서열번호: 807)로부터 선택되고;
ii) L1, L2 및 L3은 각각 (GGGGS)n (여기서 n = 1-5), 또는 TNF(서열번호: 812)의 줄기 영역의 전부 또는 일부, 또는 이들의 혼합물이고; 그리고
iii) TNF 뮤테인은 TNFR2 선택적 돌연변이 D143N/A145R을 포함하고;
b) 하기 중에서 선택되는 반감기 연장 모이어티:
서열번호: 10에 제시된 인간 IgG1의 Fc 또는 서열번호: 27에 기재된 트라스투주맙의 Fc인 IgG1 Fc;
서열번호: 16에 제시된 인간 IgG4의 Fc 또는 서열번호: 30에 제시된 니볼루맙의 Fc인 IgG4 Fc;
크기가 적어도 또는 적어도 약 30 kDa인 PEG 분자; 및
인간 혈청 알부민(HSA); 및
c) TNFR2 선택적 효능제 및 반감기 연장 모이어티 사이의 링커로서, 하기를 포함하는 링커:
(GlySer)n (여기서 n= 1-10); (GlySer2); (Gly4Ser)n(여기서 n= 1-10); (Gly3Ser)n(여기서 n= 1-5); (SerGly4)n(여기서 n= 1-5); (GlySerSerGly)n(여기서 n= 1-5); GSGGSSGG; GSSSGSGSGSSG; GSSSGSGSGSSGG; GGSSGG; GGSSGGSGGSSSG; GSSSGSGSGGSSSGSGSG; GGSSGGSSGGGSSGGSSG; 및 GSSSGS 중에서 선택되는 GS 링커; 또는
트라스투주맙의 힌지 서열의 전부 또는 일부 및 니볼루맙의 힌지 서열의 전부 또는 일부 중에서 선택되는 링커; 또는
또는 이들의 조합. 218. The construct of any one of claims 1-217, which is or comprises a TNFR2 agonist construct comprising:
a) a construct having the formula:
MD-L1-TNFmut-L2-TNFmut-L3-TNFmut (formula II); or
TNFmut-L1-TNFmut-L2-TNFmut-L3-MD (formula III);
MD is the multimerization domain; TNFmut is a TNFR2 selective TNF mutein; and L1, L2 and L3 are the same or different linkers, wherein
i) MD is EHD2 (SEQ ID NO: 808), MHD2 (SEQ ID NO: 811), the trimerization domain of chicken tenascin C (TNC) (residues 110-139 of SEQ ID NO: 804; SEQ ID NO: 805), or is selected from the trimerization domain of human TNC (residues 110-139 of SEQ ID NO: 806, SEQ ID NO: 807);
ii) L1, L2 and L3 are each (GGGGS) n (where n = 1-5), or all or part of the stem region of TNF (SEQ ID NO: 812), or a mixture thereof; and
iii) the TNF mutein comprises the TNFR2 selective mutations D143N/A145R;
b) a half-life extending moiety selected from:
an IgG1 Fc that is the Fc of human IgG1 shown in SEQ ID NO: 10 or the Fc of trastuzumab described in SEQ ID NO: 27;
an IgG4 Fc that is the Fc of human IgG4 as shown in SEQ ID NO: 16 or the Fc of nivolumab as shown in SEQ ID NO: 30;
PEG molecules of at least or at least about 30 kDa in size; and
human serum albumin (HSA); and
c) a linker between the TNFR2 selective agonist and the half-life extending moiety comprising:
(GlySer) n (where n=1-10); (GlySer 2 ); (Gly 4 Ser) n (where n=1-10); (Gly 3 Ser) n (where n= 1-5); (SerGly 4 ) n (where n=1-5); (GlySerSerGly) n (where n= 1-5); GSGGSSGG; GSSSGSGSGSSG; GSSSGSGSGSSGG; GGSSGG; GGSSGGSGGSSSG; GSSSGSGSGGSSSGSGSG; GGSSGGSSGGGSSGGSSG; and a GS linker selected from GSSSGS; or
a linker selected from all or part of the hinge sequence of Trastuzumab and all or part of the hinge sequence of Nivolumab; or
or a combination thereof.
MD-L1-TNFmut-L2-TNFmut-L3-TNFmut (식 II); 또는
TNFmut-L1-TNFmut-L2-TNFmut-L3-MD (식 III),
MD는 다량체화 도메인이고; TNFmut은 TNFR2 선택적 TNF 뮤테인이고; 그리고 L1, L2 및 L3은 동일하거나 상이한 링커이고, 여기서
i) MD는 IgG1 Fc 또는 IgG4 Fc로부터 선택되고;
ii) 식 II에서 L2 및 L3, 및 식 III에서 L1 및 L2는 각각 독립적으로 (GGGGS)n (여기서 n = 1-5), 또는 TNF(서열번호: 812)의 줄기 영역의 전부 또는 일부, 또는 이들의 조합이고;
iii) 식 II에서 L1 및 식 III에서의 L3 각각은 하기 중에서 독립적으로 선택되고:
(GlySer)n (여기서 n= 1-10); (GlySer2); (Gly4Ser)n(여기서 n= 1-10); (Gly3Ser)n(여기서 n= 1-5); (SerGly4)n(여기서 n= 1-5); (GlySerSerGly)n(여기서 n= 1-5); GSGGSSGG; GSSSGSGSGSSG; GSSSGSGSGSSGG; GGSSGG; GGSSGGSGGSSSG; GSSSGSGSGGSSSGSGSG; GGSSGGSSGGGSSGGSSG; 및 GSSSGS 중에서 선택되는 GS 링커; 또는
트라스투주맙의 힌지 서열의 전부 또는 일부 및 니볼루맙의 힌지 서열의 전부 또는 일부 중에서 선택되는 링커; 또는
이들의 조합; 및
iv) TNF 뮤테인은 TNFR2 선택적 돌연변이 D143N/A145R을 포함한다.218. The construct of any one of claims 1-217, which is a TNFR2 agonist construct comprising:
MD-L1-TNFmut-L2-TNFmut-L3-TNFmut (formula II); or
TNFmut-L1-TNFmut-L2-TNFmut-L3-MD (formula III);
MD is the multimerization domain; TNFmut is a TNFR2 selective TNF mutein; and L1, L2 and L3 are the same or different linkers, wherein
i) MD is selected from IgG1 Fc or IgG4 Fc;
ii) L2 and L3 in formula II, and L1 and L2 in formula III are each independently (GGGGS) n (where n = 1-5), or all or part of the stem region of TNF (SEQ ID NO: 812), or a combination thereof;
iii) L1 in Formula II and L3 in Formula III are each independently selected from:
(GlySer) n (where n=1-10); (GlySer 2 ); (Gly 4 Ser) n (where n=1-10); (Gly 3 Ser) n (where n= 1-5); (SerGly 4 ) n (where n=1-5); (GlySerSerGly) n (where n= 1-5); GSGGSSGG; GSSSGSGSGSSG; GSSSGSGSGSSGG; GGSSGG; GGSSGGSGGSSSG; GSSSGSGSGGSSSGSGSG; GGSSGGSSGGGSSGGSSG; and a GS linker selected from GSSSGS; or
a linker selected from all or part of the hinge sequence of Trastuzumab and all or part of the hinge sequence of Nivolumab; or
combinations thereof; and
iv) the TNF mutein comprises the TNFR2 selective mutations D143N/A145R.
서열번호: 10에 제시된 인간 IgG1의 Fc 또는 서열번호: 27에 기재된 트라스투주맙의 Fc인 IgG1 Fc; 또는
서열번호: 16에 제시된 인간 IgG4의 Fc 또는 서열번호: 30에 제시된 니볼루맙의 Fc인 IgG4 Fc.228. The construct of claim 227, wherein MD is selected from:
an IgG1 Fc that is the Fc of human IgG1 shown in SEQ ID NO: 10 or the Fc of trastuzumab described in SEQ ID NO: 27; or
An IgG4 Fc that is the Fc of human IgG4 as shown in SEQ ID NO: 16 or the Fc of nivolumab as shown in SEQ ID NO: 30.
a) 놉-인투-홀을 도입하기 위한 변형(들); 여기서
놉 돌연변이는 EU 넘버링에 의해 S354C, T366Y, T366W 및 T394W 중 하나 이상 중에서 선택되며; 그리고
홀 돌연변이는 EU 넘버링에 의해 Y349C, T366S, L368A, F405A, Y407T, Y407A 및 Y407V 중 하나 이상 중에서 선택되는 변형;
b) 신생아 Fc 수용체(FcRn) 재순환을 증가시키거나 강화하기 위한 변형(들)로서, 하기 중 하나 이상으로부터 선택되는 변형:
EU 넘버링에 의해 T250Q, T250R, M252F, M252W, M252Y, S254T, T256D, T256E, T256Q, V259I, V308F, E380A, M428L, H433K, N434F, N434A, N434W, N434S, N434Y, Y436H, M252Y/T256Q, M252F/T256D, M252Y/S254T/T256E, H433K/N434F/Y436H, N434F/Y436H, T250Q/M428L, T250R/M428L, M428L/N434S, V259I/V308F, V259I/V308F/M428L, E294del/T307P/N434Y, 및 T256N/A378V/S383N/N434Y; 및
c) 면역 이펙터 기능을 감소시키거나 제거하기 위한 변형(들), 여기서
면역 이펙터 기능(들)은 CDC, ADCC 및 ADCP 중 하나 이상 중에서 선택되며; 그리고
면역 이펙터 기능을 감소시키거나 제거하기 위한 변형(들)은 하기 중 하나 이상 중으로부터 선택된다:
IgG1에서: EU 넘버링에 의해 L235E, L234A/L235A, L234E/L235F/P331S, L234F/L235E/P331S, L234A/L235A/P329G, L234A/L235A/G237A/P238S/H268A/A330S/P331S, G236R/L328R, G237A, E318A, D265A, E233P, N297A, N297Q, N297D, N297G, N297G/D265A, A330L, D270A, P329A, P331A, K322A, V264A, 및 F241A; 및
IgG4에서: EU 넘버링에 의해 L235E, F234A/L235A, S228P/L235E, 및 S228P/F234A/L235A.237. The construct of any one of claims 1-236, which is a TNFR2 agonist construct and comprises a modified IgG Fc, wherein the IgG Fc comprises one or more of the following modifications:
a) deformation(s) to introduce a knob-into-hole; here
the knob mutation is selected from one or more of S354C, T366Y, T366W and T394W by EU numbering; and
Hall mutations are variants selected from one or more of Y349C, T366S, L368A, F405A, Y407T, Y407A and Y407V by EU numbering;
b) modification(s) to increase or enhance neonatal Fc receptor (FcRn) recycling, selected from one or more of the following:
T250Q, T250R, M252F, M252W, M252Y, S254T, T256D, T256E, T256Q, V259I, V308F, E380A, M428L, H433K, N434F, N434A, N434W, N434S, N434Y, Y4 by EU numbering 36H, M252Y/T256Q, M252F/ T256D, M252Y/S254T/T256E, H433K/N434F/Y436H, N434F/Y436H, T250Q/M428L, T250R/M428L, M428L/N434S, V259I/V308F, V259I/V308F/M428L, E2 94del/T307P/N434Y, and T256N/A378V /S383N/N434Y; and
c) modification(s) to reduce or eliminate immune effector function, wherein
the immune effector function(s) is selected from one or more of CDC, ADCC and ADCP; and
The modification(s) to reduce or eliminate immune effector function is selected from one or more of the following:
In IgG1: L235E, L234A/L235A, L234E/L235F/P331S, L234F/L235E/P331S, L234A/L235A/P329G, L234A/L235A/G237A/P238S/H268A/A330S/P331 by EU numbering S, G236R/L328R, G237A , E318A, D265A, E233P, N297A, N297Q, N297D, N297G, N297G/D265A, A330L, D270A, P329A, P331A, K322A, V264A, and F241A; and
In IgG4: L235E, F234A/L235A, S228P/L235E, and S228P/F234A/L235A by EU numbering.
a) 놉-인투-홀을 도입하기 위한 변형(들); 여기서
놉 돌연변이는 EU 넘버링에 의해 S354C, T366Y, T366W 및 T394W 중 하나 이상 중에서 선택되며; 그리고
홀 돌연변이는 EU 넘버링에 의해 Y349C, T366S, L368A, F405A, Y407T, Y407A 및 Y407V 중 하나 이상 중에서 선택되는 변형;
b) 신생아 Fc 수용체(FcRn) 재순환을 증가시키거나 강화하기 위한 변형(들)로서, 하기 중 하나 이상으로부터 선택되는 변형:
EU 넘버링에 의해 T250Q, T250R, M252F, M252W, M252Y, S254T, T256D, T256E, T256Q, V259I, V308F, E380A, M428L, H433K, N434F, N434A, N434W, N434S, N434Y, Y436H, M252Y/T256Q, M252F/T256D, M252Y/S254T/T256E, H433K/N434F/Y436H, N434F/Y436H, T250Q/M428L, T250R/M428L, M428L/N434S, V259I/V308F, V259I/V308F/M428L, E294del/T307P/N434Y, 및 T256N/A378V/S383N/N434Y; 및
c) 면역 이펙터 기능을 증가시키거나 강화하기 위한 변형(들)로서,
면역 이펙터 기능(들)은 CDC, ADCC 및 ADCP 중 하나 이상 중에서 선택되며; 그리고
면역 이펙터 기능을 증가시키거나 강화하기 위한 변형(들)은 하기 중 하나 이상으로부터 선택된다:
IgG1에서: 제1 중쇄에서 S239D, I332E, S239D/I332E, S239D/A330L/I332E, S298A/E333A/K334A; F243L/R292P/Y300L/V305I/P396L; L235V/F243L/R292P/Y300L/P396L; F243L/R292P/Y300L; L234Y/G236W/S298A 및 제2 중쇄에서 S239D/A330L/I332E; 제1 중쇄에서 L234Y/L235Q/G236W/S239M/H268D/D270E/S298A 및 제2 중쇄에서 D270E/K326D/A330M/K334E; A327Q/P329A; D265A/S267A/H268A/D270A/K326A/S337A; T256A/K290A/S298A/E333A/K334A; G236A; G236A/I332E; G236A/S239D/I332E; G236A/S239D/A330L/I332E; 잔기 N297에서 바이안테너리 글리칸의 도입; 잔기 N297; K326W; K326A; E333A; K326A/E333A; K326W/E333S; K326M/E333S; K222W/T223W; K222W/T223W/H224W; D221W/K222W; C220D/D221C; C220D/D221C/K222W/T223W; H268F/S324T; S267E; H268F; S324T; S267E/H268F/S324T; G236A/I332E/S267E/H268F/S324T; E345R; 및 E345R/E430G/S440Y에서 비푸코실화된 글리칸의 도입; EU 넘버링에 의해.238. The construct of any one of claims 1-237, which is a TNFR2 agonist construct and comprises a modified IgG Fc, wherein the IgG Fc comprises one or more of the following modifications:
a) deformation(s) to introduce a knob-into-hole; here
the knob mutation is selected from one or more of S354C, T366Y, T366W and T394W by EU numbering; and
Hall mutations are variants selected from one or more of Y349C, T366S, L368A, F405A, Y407T, Y407A and Y407V by EU numbering;
b) modification(s) to increase or enhance neonatal Fc receptor (FcRn) recycling, selected from one or more of the following:
T250Q, T250R, M252F, M252W, M252Y, S254T, T256D, T256E, T256Q, V259I, V308F, E380A, M428L, H433K, N434F, N434A, N434W, N434S, N434Y, Y4 by EU numbering 36H, M252Y/T256Q, M252F/ T256D, M252Y/S254T/T256E, H433K/N434F/Y436H, N434F/Y436H, T250Q/M428L, T250R/M428L, M428L/N434S, V259I/V308F, V259I/V308F/M428L, E2 94del/T307P/N434Y, and T256N/A378V /S383N/N434Y; and
c) as modification(s) to increase or enhance immune effector function;
the immune effector function(s) is selected from one or more of CDC, ADCC and ADCP; and
The modification(s) to increase or enhance immune effector function are selected from one or more of the following:
In IgG1: S239D, I332E, S239D/I332E, S239D/A330L/I332E, S298A/E333A/K334A in the first heavy chain; F243L/R292P/Y300L/V305I/P396L; L235V/F243L/R292P/Y300L/P396L; F243L/R292P/Y300L; L234Y/G236W/S298A and S239D/A330L/I332E in the second heavy chain; L234Y/L235Q/G236W/S239M/H268D/D270E/S298A in the first heavy chain and D270E/K326D/A330M/K334E in the second heavy chain; A327Q/P329A; D265A/S267A/H268A/D270A/K326A/S337A; T256A/K290A/S298A/E333A/K334A; G236A; G236A/I332E; G236A/S239D/I332E; G236A/S239D/A330L/I332E; introduction of a biantennary glycan at residue N297; residue N297; K326W; K326A; E333A; K326A/E333A; K326W/E333S; K326M/E333S; K222W/T223W; K222W/T223W/H224W; D221W/K222W; C220D/D221C; C220D/D221C/K222W/T223W; H268F/S324T; S267E; H268F; S324T; S267E/H268F/S324T; G236A/I332E/S267E/H268F/S324T; E345R; and introduction of afucosylated glycans at E345R/E430G/S440Y; by EU numbering.
(TNFR1 억제제)n ― 링커 (L)p ― (TNFR2 효능제)q (식 I), 또는
(TNFR1 억제제)n ― 링커 (L)p ― (TNFR2 효능제)q, 또는
(TNFR1 억제제)n ― (TNFR2 효능제)q ― 링커 (L)p, 또는
(TNFR2 효능제)q ― (TNFR1 억제제)n ― 링커 (L)p, 또는
선택적 활성 변형제를 포함하는 상기 중 임의의 것, 여기서:
n= 1 또는 2, p= 1, 2 또는 3, q= 1 또는 2;
TNFR1 억제제는 TNFR1과 상호작용하여 그 활성을 억제하고;
활성 변형제는 활성 변형제가 없는 작제물과 비교하여 작제물의 활성 또는 약리학적 특성을 조정하거나 변경하는 모이어티이고; 그리고
링커는 작제물의 용해도를 증가시키거나 가요성을 증가시키거나 구조의 입체 효과를 변경한다.241. The construct of any one of claims 1-240, which is a multispecific TNFR1 inhibitor/TNFR2 agonist construct and is of the formula:
(TNFR1 inhibitor) n - linker (L) p - (TNFR2 agonist) q (Formula I), or
(TNFR1 inhibitor) n - Linker (L) p - (TNFR2 agonist) q , or
(TNFR1 inhibitor) n - (TNFR2 agonist) q - linker (L) p , or
(TNFR2 agonist) q - (TNFR1 inhibitor) n - Linker (L) p , or
Any of the above, including a selective active modifier, wherein:
n = 1 or 2, p = 1, 2 or 3, q = 1 or 2;
TNFR1 inhibitors interact with TNFR1 to inhibit its activity;
An active modifier is a moiety that modulates or alters the activity or pharmacological properties of a construct compared to a construct without the active modifier; and
A linker increases the solubility of a construct, increases flexibility, or alters the steric effect of a structure.
TNFR1 억제제는 TNFR2 신호전달을 억제하거나 길항하지 않고 TNFR1 신호전달을 선택적으로 억제하거나 길항시키고;
TNFR1 억제제는 TNFR2의 활성화 또는 작용을 방해하지 않으며;
TNFR2 효능제는 TNFR1 신호전달을 활성화하거나 작용시키지 않고 TNFR2 신호전달을 선택적으로 활성화하거나 작용시키고;
TNFR2 효능제는 TNFR1의 억제 또는 길항작용을 방해하지 않는다.242. The construct of any one of claims 1-241, which is a multispecific TNFR1 inhibitor/TNFR2 agonist construct:
TNFR1 inhibitors selectively inhibit or antagonize TNFR1 signaling without inhibiting or antagonizing TNFR2 signaling;
TNFR1 inhibitors do not interfere with the activation or action of TNFR2;
TNFR2 agonists selectively activate or agonize TNFR2 signaling without activating or agonizing TNFR1 signaling;
TNFR2 agonists do not interfere with inhibition or antagonism of TNFR1.
a) TNFR1 억제제는 하기 중에서 선택되고:
i) H398 또는 ATROSAB로부터 선택된 인간 항-TNFR1 길항제 단클론성 항체의 항원 결합 단편 또는 그와 적어도 95% 서열 동일성을 갖는 서열을 갖는 폴리펩티드; 또는
ii) 서열번호: 52-672 중 어느 하나의 도메인 항체(dAb), 또는 서열번호: 673-678 중 어느 하나의 scFv 또는 서열번호: 679-682 중 어느 하나의 Fab, 또는 서열번호: 683 또는 684의 나노바디, 또는 서열번호: 701-703 중 어느 하나의 TNF 뮤테인, 또는 임의의 전술한 폴리펩티드와 적어도 95% 서열 동일성을 갖고 TNFR1 억제제인 서열을 갖는 폴리펩티드; 또는
iii) TNFR1의 선택적 억제를 부여하고 하기 중에서 선택되는 하나 이상의 아미노산 치환을 갖는 가용성 TNF 분자를 포함하는 우세한-음성 종양 괴사 인자 (DN-TNF) 또는 TNF 뮤테인:
서열번호: 2에 제시된 가용성 TNF의 서열과 관련하여 V1M, L29S, L29G, L29Y, R31C, R31E, R31N, R32Y, R32W, C69V, A84S, V85T, S86T, Y87H, Q88N, T89Q, I97T, C101A, A145R, E146R, L29S/R32W, L29S/S86T, R32W/S86T, L29S/R32W/S86T, R31N/R32T, R31E/S86T, R31N/R32T/S86T, I97T/A145R, V1M/R31C/C69V/Y87H/C101A/A145R, 및 A84S/V85T/S86T/Y87H/Q88N/T89Q;
b) 링커는 하기로부터 선택되고:
i) (GlySer)n (여기서 n= 1-10); (GlySer2); (Gly4Ser)n(여기서 n= 1-10); (Gly3Ser)n(여기서 n= 1-5); (SerGly4)n(여기서 n= 1-5); (GlySerSerGly)n(여기서 n= 1-5); GSGGSSGG; GSSSGSGSGSSG; GSSSGSGSGSSGG; GGSSGG; GGSSGGSGGSSSG; GSSSGSGSGGSSSGSGSG; GGSSGGSSGGGSSGGSSG; 및 GSSSGS로부터 선택되는 GS 링커; 및/또는
ii) 서열번호: 26의 잔기 219-233에 상응하는 트라스투주맙의 힌지 서열의 전부 또는 일부, 또는 서열번호: 29의 잔기 212-223에 상응하는 니볼루맙의 힌지 서열의 전부 또는 일부; 및
iii) IgG1 또는 IgG4 Fc, 여기서:
IgG1 Fc는 서열번호: 10에 제시된 인간 IgG1의 IgG1 Fc, 또는 서열번호: 27에 기재된 트라스투주맙의 IgG1 Fc로부터 선택되며;
IgG4 Fc는 서열번호: 16에 제시된 인간 IgG4의 IgG4 Fc 또는 서열번호: 30에 제시된 니볼루맙의 IgG4 Fc로부터 선택되며; 그리고
선택적으로, Fc는 놉-인투-홀을 도입하고/하거나 신생아 Fc 수용체(FcRn) 재순환을 증가 또는 강화하고/하거나 면역 이펙터 기능을 감소 또는 제거하기 위한 하나 이상의 변형을 포함하고; 그리고
c) TNFR2 효능제는 하기로부터 선택되고:
i) 서열번호: 839-865, 1202 및 1204에 제시된 에피토프 중에서 선택되는 인간 TNFR2 내의 하나 이상의 에피토프에 결합하는 항원 결합 단편; 또는
ii) MR2-1 또는 MAB2261로부터 선택되는 효능적 인간 항-TNFR2 항체의 항원 결합 단편; 또는
iii) 서열번호: 2와 관련하여 K65W, D143Y, D143F, D143N, D143E, D143W, D143V, A145R, A145H, A145K, A145F, A145W, E146Q, E146H, E146K, E146N, D143N/A145R, A145R/S147T, Q88N/T89S/A145S/E146A/S147D, Q88N/A145I/E146G/S147D, A145H/E146S/S147D, A145H/S147D, L29V/A145D/E146D/S147D, A145N/E146D/S147D, A145T/E146S/S147D, A145Q/E146D/S147D, A145T/E146D/S147D, A145D/E146G/S147D, A145D/S147D, A145K/E146D/S147T, A145R/E146T/S147D, A145R/S147T, E146D/S147D, D143V/F144L/A145S, S95C/G148C, 및 D143V/A145S 중에서 선택된 하나 이상의 TNFR2 선택적 돌연변이를 포함하는 가용성 TNF 변이체인 TNFR2 선택적 TNF 뮤테인; 또는
iv) 돌연변이 D143N/A145R을 포함하는 단쇄 TNFR2 선택적 TNF 뮤테인 삼량체로서, 여기서 TNF 뮤테인은 (GGGGS)n (여기서 n = 1-5) 또는 TNF(서열번호: 812)의 줄기 영역의 전부 또는 일부에 의해 연결되는, 단쇄 TNFR2 선택적 TNF 뮤테인 삼량체; 또는
v) 하기 식을 포함하는 TNFR2 선택적 효능제:
MD-L1-TNFmut-L2-TNFmut-L3-TNFmut (식 II); 또는
TNFmut-L1-TNFmut-L2-TNFmut-L3-MD (식 III);
MD는 다량체화 도메인이고; TNFmut은 TNFR2 선택적 TNF 뮤테인이고; 그리고 L1, L2 및 L3은 동일하거나 상이한 링커이고, 여기서
MD는 EHD2 (서열번호: 808), MHD2 (서열번호: 811), 닭 테나스신 C(TNC)의 삼량체화 도메인 (서열번호: 804의 잔기 110-139; 서열번호: 805), 또는 인간 TNC의 삼량체화 도메인 (서열번호: 806의 잔기 110-139, 서열번호: 807)로부터 선택되고;
L1, L2 및 L3은 각각 (GGGGS)n (여기서 n = 1-5), 또는 TNF(서열번호: 812)의 줄기 영역의 전부 또는 일부, 또는 이들의 혼합물이고; 그리고
TNF 뮤테인은 TNFR2 선택적 돌연변이 D143N/A145R을 포함한다. The construct of claim 241 or 242, which is:
a) the TNFR1 inhibitor is selected from:
i) an antigen-binding fragment of a human anti-TNFR1 antagonist monoclonal antibody selected from H398 or ATROSAB or a polypeptide having a sequence having at least 95% sequence identity thereto; or
ii) a domain antibody (dAb) of any one of SEQ ID NOs: 52-672, or a scFv of any one of SEQ ID NOs: 673-678 or a Fab of any one of SEQ ID NOs: 679-682, or SEQ ID NOs: 683 or 684 or a TNF mutein of any one of SEQ ID NOs: 701-703, or a polypeptide having a sequence that has at least 95% sequence identity to any of the foregoing polypeptides and is a TNFR1 inhibitor; or
iii) a predominantly-negative tumor necrosis factor (DN-TNF) or TNF mutein comprising a soluble TNF molecule conferring selective inhibition of TNFR1 and having one or more amino acid substitutions selected from:
V1M, L29S, L29G, L29Y, R31C, R31E, R31N, R32Y, R32W, C69V, A84S, V85T, S86T, Y87H, Q88N, T89Q, I97T, C101A, A145R with respect to the sequence of soluble TNF set forth in SEQ ID NO: 2 , E146R, L29S/R32W, L29S/S86T, R32W/S86T, L29S/R32W/S86T, R31N/R32T, R31E/S86T, R31N/R32T/S86T, I97T/A145R, V1M/R31C/C69V/Y87H/C101 A/A145R , and A84S/V85T/S86T/Y87H/Q88N/T89Q;
b) the linker is selected from:
i) (GlySer) n (where n = 1-10); (GlySer 2 ); (Gly 4 Ser) n (where n=1-10); (Gly 3 Ser) n (where n= 1-5); (SerGly 4 ) n (where n=1-5); (GlySerSerGly) n (where n= 1-5); GSGGSSGG; GSSSGSGSGSSG; GSSSGSGSGSSGG; GGSSGG; GGSSGGSGGSSSG; GSSSGSGSGGSSSGSGSG; GGSSGGSSGGGSSGGSSG; and a GS linker selected from GSSSGS; and/or
ii) all or part of the hinge sequence of Trastuzumab corresponding to residues 219-233 of SEQ ID NO: 26, or all or part of the hinge sequence of Nivolumab corresponding to residues 212-223 of SEQ ID NO: 29; and
iii) IgG1 or IgG4 Fc, wherein:
the IgG1 Fc is selected from the IgG1 Fc of human IgG1 set forth in SEQ ID NO: 10, or the IgG1 Fc of Trastuzumab set forth in SEQ ID NO: 27;
the IgG4 Fc is selected from the IgG4 Fc of human IgG4 set forth in SEQ ID NO: 16 or the IgG4 Fc of nivolumab set forth in SEQ ID NO: 30; and
Optionally, the Fc comprises one or more modifications to introduce a knob-into-hole, increase or enhance neonatal Fc receptor (FcRn) recycling, and/or reduce or eliminate immune effector function; and
c) the TNFR2 agonist is selected from:
i) an antigen-binding fragment that binds to one or more epitopes in human TNFR2 selected from among the epitopes set forth in SEQ ID NOs: 839-865, 1202 and 1204; or
ii) an antigen-binding fragment of a potent human anti-TNFR2 antibody selected from MR2-1 or MAB2261; or
iii) K65W, D143Y, D143F, D143N, D143E, D143W, D143V, A145R, A145H, A145K, A145F, A145W, E146Q, E146H, E146K, E146N, D143N/A145R, A145 with respect to SEQ ID NO: 2 R/S147T, Q88N /T89S/A145S/E146A/S147D, Q88N/A145I/E146G/S147D, A145H/E146S/S147D, A145H/S147D, L29V/A145D/E146D/S147D, A145N/E146D/S147D, A145 T/E146S/S147D, A145Q/E146D /S147D, A145T/E146D/S147D, A145D/E146G/S147D, A145D/S147D, A145K/E146D/S147T, A145R/E146T/S147D, A145R/S147T, E146D/S147D, D143V/F 144L/A145S, S95C/G148C, and a TNFR2 selective TNF mutein, which is a soluble TNF variant comprising one or more TNFR2 selective mutations selected from D143V/A145S; or
iv) a single chain TNFR2 selective TNF mutein trimer comprising the mutations D143N/A145R, wherein the TNF mutein is (GGGGS) n (where n = 1-5) or all or all of the stem region of TNF (SEQ ID NO: 812) single-chain TNFR2 selective TNF mutein trimers, linked by moieties; or
v) a TNFR2 selective agonist comprising the formula:
MD-L1-TNFmut-L2-TNFmut-L3-TNFmut (formula II); or
TNFmut-L1-TNFmut-L2-TNFmut-L3-MD (formula III);
MD is the multimerization domain; TNFmut is a TNFR2 selective TNF mutein; and L1, L2 and L3 are the same or different linkers, wherein
MD is EHD2 (SEQ ID NO: 808), MHD2 (SEQ ID NO: 811), the trimerization domain of chicken tenascin C (TNC) (residues 110-139 of SEQ ID NO: 804; SEQ ID NO: 805), or human TNC is selected from the trimerization domain of (residues 110-139 of SEQ ID NO: 806, SEQ ID NO: 807);
L1, L2 and L3 are each (GGGGS) n (where n = 1-5), or all or part of the stem region of TNF (SEQ ID NO: 812), or a mixture thereof; and
TNF muteins include the TNFR2 selective mutations D143N/A145R.
a) TNFR1 억제제는 서열번호: 52-672 중 어느 하나의 도메인 항체(dAb), 또는 서열번호: 673-678 중 어느 하나의 scFv 또는 서열번호: 679-682 중 어느 하나의 Fab, 또는 서열번호: 683 또는 684의 나노바디, 또는 서열번호: 701-703 중 어느 하나의 TNF 뮤테인, 또는 그와 적어도 또는 적어도 약 95% 서열 동일성을 갖는 서열을 포함하고;
b) 링커는 (GGGGS)3, 서열 SCDKTH(서열번호: 26의 잔기 222-227)를 포함하는 폴리펩티드, 및 트라스투주맙의 Fc를 포함하고; 그리고
c) TNFR2 효능제는 서열번호: 2와 관련하여 K65W, D143Y, D143F, D143N, D143E, D143W, D143V, A145R, A145H, A145K, A145F, A145W, E146Q, E146H, E146K, E146N, D143N/A145R, A145R/S147T, Q88N/T89S/A145S/E146A/S147D, Q88N/A145I/E146G/S147D, A145H/E146S/S147D, A145H/S147D, L29V/A145D/E146D/S147D, A145N/E146D/S147D, A145T/E146S/S147D, A145Q/E146D/S147D, A145T/E146D/S147D, A145D/E146G/S147D, A145D/S147D, A145K/E146D/S147T, A145R/E146T/S147D, A145R/S147T, E146D/S147D, D143V/F144L/A145S, S95C/G148C, 및 D143V/A145S 중에서 선택된 하나 이상의 TNFR2 선택적 돌연변이를 포함하는 가용성 TNF 변이체인 TNFR2 선택적 TNF 뮤테인을 포함한다.243. The multispecific TNFR1 antagonist/TNFR2 agonist construct of claim 241 or 242:
a) the TNFR1 inhibitor is a domain antibody (dAb) of any one of SEQ ID NOs: 52-672, or a scFv of any one of SEQ ID NOs: 673-678 or a Fab of any one of SEQ ID NOs: 679-682, or SEQ ID NO: a Nanobody of 683 or 684, or a TNF mutein of any one of SEQ ID NOs: 701-703, or a sequence having at least or at least about 95% sequence identity therewith;
b) the linker comprises (GGGGS) 3 , a polypeptide comprising the sequence SCDKTH (residues 222-227 of SEQ ID NO: 26), and the Fc of Trastuzumab; and
c) the TNFR2 agonist is K65W, D143Y, D143F, D143N, D143E, D143W, D143V, A145R, A145H, A145K, A145F, A145W, E146Q, E146H, E146K, E146N, D143N/A145R with respect to SEQ ID NO: 2 , A145R /S147T, Q88N/T89S/A145S/E146A/S147D, Q88N/A145I/E146G/S147D, A145H/E146S/S147D, A145H/S147D, L29V/A145D/E146D/S147D, A145N/E146D /S147D, A145T/E146S/S147D A145Q/E146D/S147D, A145T/E146D/S147D, A145D/E146G/S147D, A145D/S147D, A145K/E146D/S147T, A145R/E146T/S147D, A145R/S147T, E146D S147D, D143V/F144L/A145S, S95C /G148C, and a TNFR2 selective TNF mutein, which is a soluble TNF variant comprising one or more TNFR2 selective mutations selected from D143V/A145S.
a) TNFR1 억제제는 서열번호: 52-672 중 어느 하나의 도메인 항체(dAb), 또는 서열번호: 673-678 중 어느 하나의 scFv 또는 서열번호: 679-682 중 어느 하나의 Fab, 또는 서열번호: 683 또는 684의 나노바디, 또는 서열번호: 701-703 중 어느 하나의 TNF 뮤테인, 또는 그와 적어도 또는 적어도 약 95% 서열 동일성을 갖는 서열을 포함하고;
b) 링커는 (GGGGS)3, 니볼루맙의 힌지 서열 전부 또는 일부, 및 니볼루맙의 Fc를 포함하고; 그리고
c) TNFR2 효능제는 서열번호: 2와 관련하여 K65W, D143Y, D143F, D143N, D143E, D143W, D143V, A145R, A145H, A145K, A145F, A145W, E146Q, E146H, E146K, E146N, D143N/A145R, A145R/S147T, Q88N/T89S/A145S/E146A/S147D, Q88N/A145I/E146G/S147D, A145H/E146S/S147D, A145H/S147D, L29V/A145D/E146D/S147D, A145N/E146D/S147D, A145T/E146S/S147D, A145Q/E146D/S147D, A145T/E146D/S147D, A145D/E146G/S147D, A145D/S147D, A145K/E146D/S147T, A145R/E146T/S147D, A145R/S147T, E146D/S147D, D143V/F144L/A145S, S95C/G148C, 및 D143V/A145S 중에서 선택된 하나 이상의 TNFR2 선택적 돌연변이를 포함하는 가용성 TNF 변이체인 TNFR2 선택적 TNF 뮤테인을 포함한다.The construct of claim 241 or 242, wherein:
a) the TNFR1 inhibitor is a domain antibody (dAb) of any one of SEQ ID NOs: 52-672, or a scFv of any one of SEQ ID NOs: 673-678 or a Fab of any one of SEQ ID NOs: 679-682, or SEQ ID NO: a Nanobody of 683 or 684, or a TNF mutein of any one of SEQ ID NOs: 701-703, or a sequence having at least or at least about 95% sequence identity therewith;
b) the linker comprises (GGGGS) 3 , all or part of the hinge sequence of nivolumab, and the Fc of nivolumab; and
c) the TNFR2 agonist is K65W, D143Y, D143F, D143N, D143E, D143W, D143V, A145R, A145H, A145K, A145F, A145W, E146Q, E146H, E146K, E146N, D143N/A145R with respect to SEQ ID NO: 2 , A145R /S147T, Q88N/T89S/A145S/E146A/S147D, Q88N/A145I/E146G/S147D, A145H/E146S/S147D, A145H/S147D, L29V/A145D/E146D/S147D, A145N/E146D /S147D, A145T/E146S/S147D A145Q/E146D/S147D, A145T/E146D/S147D, A145D/E146G/S147D, A145D/S147D, A145K/E146D/S147T, A145R/E146T/S147D, A145R/S147T, E146D S147D, D143V/F144L/A145S, S95C /G148C, and a TNFR2 selective TNF mutein, which is a soluble TNF variant comprising one or more TNFR2 selective mutations selected from D143V/A145S.
a) TNFR1 억제제는 서열번호: 52-672 중 어느 하나의 도메인 항체(dAb), 또는 서열번호: 673-678 중 어느 하나의 scFv 또는 서열번호: 679-682 중 어느 하나의 Fab, 또는 서열번호: 683 또는 684의 나노바디, 또는 서열번호: 701-703 중 어느 하나의 TNF 뮤테인, 또는 그와 적어도 또는 적어도 약 95% 서열 동일성을 갖는 서열을 포함하고;
b) 링커는 (GGGGS)3 및 트라스투주맙의 Fc를 포함하고; 그리고
c) TNFR2 효능제는 서열번호: 2와 관련하여 K65W, D143Y, D143F, D143N, D143E, D143W, D143V, A145R, A145H, A145K, A145F, A145W, E146Q, E146H, E146K, E146N, D143N/A145R, A145R/S147T, Q88N/T89S/A145S/E146A/S147D, Q88N/A145I/E146G/S147D, A145H/E146S/S147D, A145H/S147D, L29V/A145D/E146D/S147D, A145N/E146D/S147D, A145T/E146S/S147D, A145Q/E146D/S147D, A145T/E146D/S147D, A145D/E146G/S147D, A145D/S147D, A145K/E146D/S147T, A145R/E146T/S147D, A145R/S147T, E146D/S147D, D143V/F144L/A145S, S95C/G148C, 및 D143V/A145S 중에서 선택된 하나 이상의 TNFR2 선택적 돌연변이를 포함하는 가용성 TNF 변이체인 TNFR2 선택적 TNF 뮤테인을 포함한다.The construct of claim 241 or 242, which is:
a) the TNFR1 inhibitor is a domain antibody (dAb) of any one of SEQ ID NOs: 52-672, or a scFv of any one of SEQ ID NOs: 673-678 or a Fab of any one of SEQ ID NOs: 679-682, or SEQ ID NO: a Nanobody of 683 or 684, or a TNF mutein of any one of SEQ ID NOs: 701-703, or a sequence having at least or at least about 95% sequence identity therewith;
b) the linker comprises (GGGGS) 3 and the Fc of Trastuzumab; and
c) the TNFR2 agonist is K65W, D143Y, D143F, D143N, D143E, D143W, D143V, A145R, A145H, A145K, A145F, A145W, E146Q, E146H, E146K, E146N, D143N/A145R with respect to SEQ ID NO: 2 , A145R /S147T, Q88N/T89S/A145S/E146A/S147D, Q88N/A145I/E146G/S147D, A145H/E146S/S147D, A145H/S147D, L29V/A145D/E146D/S147D, A145N/E146D /S147D, A145T/E146S/S147D A145Q/E146D/S147D, A145T/E146D/S147D, A145D/E146G/S147D, A145D/S147D, A145K/E146D/S147T, A145R/E146T/S147D, A145R/S147T, E146D S147D, D143V/F144L/A145S, S95C /G148C, and a TNFR2 selective TNF mutein, which is a soluble TNF variant comprising one or more TNFR2 selective mutations selected from D143V/A145S.
a) TNFR1 억제제는 서열번호: 52-672 중 어느 하나의 도메인 항체(dAb), 또는 서열번호: 673-678 중 어느 하나의 scFv 또는 서열번호: 679-682 중 어느 하나의 Fab, 또는 서열번호: 683 또는 684의 나노바디, 또는 서열번호: 701-703 중 어느 하나의 TNF 뮤테인, 또는 그와 적어도 또는 적어도 약 95% 서열 동일성을 갖는 서열을 포함하고;
b) 링커는 (GGGGS)3 및 니볼루맙의 Fc를 포함하고; 그리고
c) TNFR2 효능제는 서열번호: 2와 관련하여 K65W, D143Y, D143F, D143N, D143E, D143W, D143V, A145R, A145H, A145K, A145F, A145W, E146Q, E146H, E146K, E146N, D143N/A145R, A145R/S147T, Q88N/T89S/A145S/E146A/S147D, Q88N/A145I/E146G/S147D, A145H/E146S/S147D, A145H/S147D, L29V/A145D/E146D/S147D, A145N/E146D/S147D, A145T/E146S/S147D, A145Q/E146D/S147D, A145T/E146D/S147D, A145D/E146G/S147D, A145D/S147D, A145K/E146D/S147T, A145R/E146T/S147D, A145R/S147T, E146D/S147D, D143V/F144L/A145S, S95C/G148C, 및 D143V/A145S, 및 앞의 돌연변이의 임의의 조합 중에서 선택된 하나 이상의 TNFR2 선택적 돌연변이를 포함하는 가용성 TNF 변이체인 TNFR2 선택적 TNF 뮤테인을 포함한다.The construct of claim 241 or 242, which is:
a) the TNFR1 inhibitor is a domain antibody (dAb) of any one of SEQ ID NOs: 52-672, or a scFv of any one of SEQ ID NOs: 673-678 or a Fab of any one of SEQ ID NOs: 679-682, or SEQ ID NO: a Nanobody of 683 or 684, or a TNF mutein of any one of SEQ ID NOs: 701-703, or a sequence having at least or at least about 95% sequence identity therewith;
b) the linker comprises (GGGGS) 3 and the Fc of nivolumab; and
c) the TNFR2 agonist is K65W, D143Y, D143F, D143N, D143E, D143W, D143V, A145R, A145H, A145K, A145F, A145W, E146Q, E146H, E146K, E146N, D143N/A145R with respect to SEQ ID NO: 2 , A145R /S147T, Q88N/T89S/A145S/E146A/S147D, Q88N/A145I/E146G/S147D, A145H/E146S/S147D, A145H/S147D, L29V/A145D/E146D/S147D, A145N/E146D /S147D, A145T/E146S/S147D A145Q/E146D/S147D, A145T/E146D/S147D, A145D/E146G/S147D, A145D/S147D, A145K/E146D/S147T, A145R/E146T/S147D, A145R/S147T, E146D S147D, D143V/F144L/A145S, S95C /G148C, and D143V/A145S, and a TNFR2 selective TNF mutein, which is a soluble TNF variant comprising one or more TNFR2 selective mutations selected from any combination of the foregoing mutations.
a) 놉-인투-홀을 도입하기 위한 변형(들);
b) 신생아 Fc 수용체(FcRn) 재순환을 증가시키거나 강화하기 위한 변형(들); 및
c) 면역 이펙터 기능을 감소시키거나 제거하기 위한 변형(들).The construct of any one of claims 241 - 247 comprising a modified Fc, wherein the IgG Fc comprises one or more of the following modifications:
a) deformation(s) to introduce a knob-into-hole;
b) modification(s) to increase or enhance neonatal Fc receptor (FcRn) recycling; and
c) modification(s) to reduce or eliminate immune effector function.
놉 돌연변이는 EU 넘버링에 의해 S354C, T366Y, T366W 및 T394W 중 하나 이상 중에서 선택되며; 그리고
홀 돌연변이는 EU 넘버링에 의해 Y349C, T366S, L368A, F405A, Y407T, Y407A 및 Y407V 중 하나 이상 중에서 선택된다.249. The construct of claim 248, wherein Fc comprises a knob-into-hole modification:
the knob mutation is selected from one or more of S354C, T366Y, T366W and T394W by EU numbering; and
The hole mutation is selected from one or more of Y349C, T366S, L368A, F405A, Y407T, Y407A and Y407V by EU numbering.
EU 넘버링에 의해 T250Q, T250R, M252F, M252W, M252Y, S254T, T256D, T256E, T256Q, V259I, V308F, E380A, M428L, H433K, N434F, N434A, N434W, N434S, N434Y, Y436H, M252Y/T256Q, M252F/T256D, M252Y/S254T/T256E, H433K/N434F/Y436H, N434F/Y436H, T250Q/M428L, T250R/M428L, M428L/N434S, V259I/V308F, V259I/V308F/M428L, E294del/T307P/N434Y, 및 T256N/A378V/S383N/N434Y.249. The construct of claim 248, wherein the Fc comprises a modification to increase or enhance FcRn recycling, and wherein the modification is selected from one or more of the following:
T250Q, T250R, M252F, M252W, M252Y, S254T, T256D, T256E, T256Q, V259I, V308F, E380A, M428L, H433K, N434F, N434A, N434W, N434S, N434Y, Y4 by EU numbering 36H, M252Y/T256Q, M252F/ T256D, M252Y/S254T/T256E, H433K/N434F/Y436H, N434F/Y436H, T250Q/M428L, T250R/M428L, M428L/N434S, V259I/V308F, V259I/V308F/M428L, E2 94del/T307P/N434Y, and T256N/A378V /S383N/N434Y.
IgG1에서: EU 넘버링에 의해 L235E, L234A/L235A, L234E/L235F/P331S, L234F/L235E/P331S, L234A/L235A/P329G, L234A/L235A/G237A/P238S/H268A/A330S/P331S, G236R/L328R, G237A, E318A, D265A, E233P, N297A, N297Q, N297D, N297G, N297G/D265A, A330L, D270A, P329A, P331A, K322A, V264A, 및 F241A; 및
IgG4에서: EU 넘버링에 의해 L235E, F234A/L235A, S228P/L235E, 및 S228P/F234A/L235A.249. The construct of claim 248, comprising modification(s) to reduce or eliminate an immune effector function selected from one or more of the following:
In IgG1: L235E, L234A/L235A, L234E/L235F/P331S, L234F/L235E/P331S, L234A/L235A/P329G, L234A/L235A/G237A/P238S/H268A/A330S/P331 by EU numbering S, G236R/L328R, G237A , E318A, D265A, E233P, N297A, N297Q, N297D, N297G, N297G/D265A, A330L, D270A, P329A, P331A, K322A, V264A, and F241A; and
In IgG4: L235E, F234A/L235A, S228P/L235E, and S228P/F234A/L235A by EU numbering.
a) 놉-인투-홀을 도입하기 위한 변형(들); 여기서
놉 돌연변이는 EU 넘버링에 의해 S354C, T366Y, T366W 및 T394W 중 하나 이상 중에서 선택되며; 그리고
홀 돌연변이는 EU 넘버링에 의해 Y349C, T366S, L368A, F405A, Y407T, Y407A 및 Y407V 중 하나 이상 중에서 선택되는 변형;
b) 신생아 Fc 수용체(FcRn) 재순환을 증가시키거나 강화하기 위한 변형(들)로서, 하기 중 하나 이상으로부터 선택되는 변형:
EU 넘버링에 의해 T250Q, T250R, M252F, M252W, M252Y, S254T, T256D, T256E, T256Q, V259I, V308F, E380A, M428L, H433K, N434F, N434A, N434W, N434S, N434Y, Y436H, M252Y/T256Q, M252F/T256D, M252Y/S254T/T256E, H433K/N434F/Y436H, N434F/Y436H, T250Q/M428L, T250R/M428L, M428L/N434S, V259I/V308F, V259I/V308F/M428L, E294del/T307P/N434Y, 및 T256N/A378V/S383N/N434Y; 및
c) 면역 이펙터 기능을 증가시키거나 강화하기 위한 변형(들)로서,
면역 이펙터 기능(들)은 CDC, ADCC 및 ADCP 중 하나 이상 중에서 선택되며; 그리고
면역 이펙터 기능을 증가시키거나 강화하기 위한 변형(들)은 하기 중 하나 이상으로부터 선택된다:
IgG1에서: 제1 중쇄에서 S239D, I332E, S239D/I332E, S239D/A330L/I332E, S298A/E333A/K334A; F243L/R292P/Y300L/V305I/P396L; L235V/F243L/R292P/Y300L/P396L; F243L/R292P/Y300L; L234Y/G236W/S298A 및 제2 중쇄에서 S239D/A330L/I332E; 제1 중쇄에서 L234Y/L235Q/G236W/S239M/H268D/D270E/S298A 및 제2 중쇄에서 D270E/K326D/A330M/K334E; A327Q/P329A; D265A/S267A/H268A/D270A/K326A/S337A; T256A/K290A/S298A/E333A/K334A; G236A; G236A/I332E; G236A/S239D/I332E; G236A/S239D/A330L/I332E; 잔기 N297에서 바이안테너리 글리칸의 도입; 잔기 N297; K326W; K326A; E333A; K326A/E333A; K326W/E333S; K326M/E333S; K222W/T223W; K222W/T223W/H224W; D221W/K222W; C220D/D221C; C220D/D221C/K222W/T223W; H268F/S324T; S267E; H268F; S324T; S267E/H268F/S324T; G236A/I332E/S267E/H268F/S324T; E345R; 및 E345R/E430G/S440Y에서 비푸코실화된 글리칸의 도입; EU 넘버링에 의해. The construct of any one of claims 241 - 247 , wherein the IgG Fc comprises one or more of the following modifications:
a) deformation(s) to introduce a knob-into-hole; here
the knob mutation is selected from one or more of S354C, T366Y, T366W and T394W by EU numbering; and
Hall mutations are variants selected from one or more of Y349C, T366S, L368A, F405A, Y407T, Y407A and Y407V by EU numbering;
b) modification(s) to increase or enhance neonatal Fc receptor (FcRn) recycling, selected from one or more of the following:
T250Q, T250R, M252F, M252W, M252Y, S254T, T256D, T256E, T256Q, V259I, V308F, E380A, M428L, H433K, N434F, N434A, N434W, N434S, N434Y, Y4 by EU numbering 36H, M252Y/T256Q, M252F/ T256D, M252Y/S254T/T256E, H433K/N434F/Y436H, N434F/Y436H, T250Q/M428L, T250R/M428L, M428L/N434S, V259I/V308F, V259I/V308F/M428L, E2 94del/T307P/N434Y, and T256N/A378V /S383N/N434Y; and
c) as modification(s) to increase or enhance immune effector function;
the immune effector function(s) is selected from one or more of CDC, ADCC and ADCP; and
The modification(s) to increase or enhance immune effector function are selected from one or more of the following:
In IgG1: S239D, I332E, S239D/I332E, S239D/A330L/I332E, S298A/E333A/K334A in the first heavy chain; F243L/R292P/Y300L/V305I/P396L; L235V/F243L/R292P/Y300L/P396L; F243L/R292P/Y300L; L234Y/G236W/S298A and S239D/A330L/I332E in the second heavy chain; L234Y/L235Q/G236W/S239M/H268D/D270E/S298A in the first heavy chain and D270E/K326D/A330M/K334E in the second heavy chain; A327Q/P329A; D265A/S267A/H268A/D270A/K326A/S337A; T256A/K290A/S298A/E333A/K334A; G236A; G236A/I332E; G236A/S239D/I332E; G236A/S239D/A330L/I332E; introduction of a biantennary glycan at residue N297; residue N297; K326W; K326A; E333A; K326A/E333A; K326W/E333S; K326M/E333S; K222W/T223W; K222W/T223W/H224W; D221W/K222W; C220D/D221C; C220D/D221C/K222W/T223W; H268F/S324T; S267E; H268F; S324T; S267E/H268F/S324T; G236A/I332E/S267E/H268F/S324T; E345R; and introduction of afucosylated glycans at E345R/E430G/S440Y; by EU numbering.
TNFR1 길항제는 1가이고; 그리고
TNFR2 효능제는 1가이다. 256. The construct of any one of claims 1-255, which is a multispecific TNFR1 antagonist/TNFR2 agonist:
TNFR1 antagonists are monovalent; and
TNFR2 agonists are monovalent.
TNFR1 길항제는 1가이고; 그리고
TNFR2 효능제는 2가이다. 256. The construct of any one of claims 1-255, which is a multispecific TNFR1 antagonist/TNFR2 agonist:
TNFR1 antagonists are monovalent; and
TNFR2 agonists are bivalent.
a) TNFR1 길항제는 하기로부터 선택되고:
i) H398 또는 ATROSAB로부터 선택되는 인간 항-TNFR1 길항제 단클론성 항체의 항원 결합 단편; 또는
ii) 서열번호: 52-672 중 어느 하나의 도메인 항체(dAb), 또는 서열번호: 673-678 중 어느 하나의 scFv 또는 서열번호: 679-682 중 어느 하나의 Fab, 또는 서열번호: 683 또는 684의 나노바디, 또는 서열번호: 701-703 중 어느 하나의 TNF 뮤테인, 또는 그와 적어도 또는 적어도 약 95% 서열 동일성을 갖는 서열; 또는
iii) TNFR1의 선택적 억제를 부여하고 하기 중에서 선택되는 하나 이상의 아미노산 치환을 갖는 가용성 TNF 분자를 포함하는 우세한-음성 종양 괴사 인자 (DN-TNF) 또는 TNF 뮤테인:
서열번호: 2에 제시된 가용성 TNF의 서열과 관련하여 V1M, L29S, L29G, L29Y, R31C, R31E, R31N, R32Y, R32W, C69V, A84S, V85T, S86T, Y87H, Q88N, T89Q, I97T, C101A, A145R, E146R, L29S/R32W, L29S/S86T, R32W/S86T, L29S/R32W/S86T, R31N/R32T, R31E/S86T, R31N/R32T/S86T, I97T/A145R, V1M/R31C/C69V/Y87H/C101A/A145R, 및 A84S/V85T/S86T/Y87H/Q88N/T89Q;
b) 링커는 크기가 적어도 또는 적어도 약 30 kDa인 분지쇄 PEG 분자이고; 그리고
c) TNFR2 효능제는 하기로부터 선택되고:
i) 서열번호: 839-865, 1202 및 1204에 제시된 에피토프 중에서 선택되는 인간 TNFR2 내의 하나 이상의 에피토프에 결합하는 항원 결합 단편; 또는
ii) MR2-1 또는 MAB2261로부터 선택되는 효능적 인간 항-TNFR2 항체의 항원 결합 단편; 또는
iii) 서열번호: 2와 관련하여 K65W, D143Y, D143F, D143N, D143E, D143W, D143V, A145R, A145H, A145K, A145F, A145W, E146Q, E146H, E146K, E146N, D143N/A145R, A145R/S147T, Q88N/T89S/A145S/E146A/S147D, Q88N/A145I/E146G/S147D, A145H/E146S/S147D, A145H/S147D, L29V/A145D/E146D/S147D, A145N/E146D/S147D, A145T/E146S/S147D, A145Q/E146D/S147D, A145T/E146D/S147D, A145D/E146G/S147D, A145D/S147D, A145K/E146D/S147T, A145R/E146T/S147D, A145R/S147T, E146D/S147D, D143V/F144L/A145S, S95C/G148C, 및 D143V/A145S 중에서 선택된 하나 이상의 TNFR2 선택적 돌연변이를 포함하는 가용성 TNF 변이체인 TNFR2 선택적 TNF 뮤테인; 또는
iv) 돌연변이 D143N/A145R을 포함하는 단쇄 TNFR2 선택적 TNF 뮤테인 삼량체로서, 여기서 TNF 뮤테인은 (GGGGS)n (여기서 n = 1-5) 또는 TNF(서열번호: 812)의 줄기 영역의 전부 또는 일부에 의해 연결되는, 단쇄 TNFR2 선택적 TNF 뮤테인 삼량체; 또는
v) 하기 식을 포함하는 TNFR2 선택적 효능제:
MD-L1-TNFmut-L2-TNFmut-L3-TNFmut (식 II); 또는
TNFmut-L1-TNFmut-L2-TNFmut-L3-MD (식 III);
MD는 다량체화 도메인이고; TNFmut은 TNFR2 선택적 TNF 뮤테인이고; 그리고 L1, L2 및 L3은 동일하거나 상이한 링커이고, 여기서
MD는 EHD2 (서열번호: 808), MHD2 (서열번호: 811), 닭 테나스신 C(TNC)의 삼량체화 도메인 (서열번호: 804의 잔기 110-139; 서열번호: 805), 또는 인간 TNC의 삼량체화 도메인 (서열번호: 806의 잔기 110-139, 서열번호: 807)로부터 선택되고;
L1, L2 및 L3은 각각 (GGGGS)n (여기서 n = 1-5), 또는 TNF(서열번호: 812)의 줄기 영역의 전부 또는 일부, 또는 이들의 혼합물이고; 그리고
TNF 뮤테인은 TNFR2 선택적 돌연변이 D143N/A145R을 포함한다. The construct of any one of claims 241-257, which is a multispecific TNFR1 antagonist/TNFR2 agonist:
a) the TNFR1 antagonist is selected from:
i) an antigen-binding fragment of a human anti-TNFR1 antagonist monoclonal antibody selected from H398 or ATROSAB; or
ii) a domain antibody (dAb) of any one of SEQ ID NOs: 52-672, or a scFv of any one of SEQ ID NOs: 673-678 or a Fab of any one of SEQ ID NOs: 679-682, or SEQ ID NOs: 683 or 684 or a TNF mutein of any one of SEQ ID NOs: 701-703, or a sequence having at least or at least about 95% sequence identity therewith; or
iii) a predominantly-negative tumor necrosis factor (DN-TNF) or TNF mutein comprising a soluble TNF molecule conferring selective inhibition of TNFR1 and having one or more amino acid substitutions selected from:
V1M, L29S, L29G, L29Y, R31C, R31E, R31N, R32Y, R32W, C69V, A84S, V85T, S86T, Y87H, Q88N, T89Q, I97T, C101A, A145R with respect to the sequence of soluble TNF set forth in SEQ ID NO: 2 , E146R, L29S/R32W, L29S/S86T, R32W/S86T, L29S/R32W/S86T, R31N/R32T, R31E/S86T, R31N/R32T/S86T, I97T/A145R, V1M/R31C/C69V/Y87H/C101 A/A145R , and A84S/V85T/S86T/Y87H/Q88N/T89Q;
b) the linker is a branched chain PEG molecule of at least or at least about 30 kDa in size; and
c) the TNFR2 agonist is selected from:
i) an antigen-binding fragment that binds to one or more epitopes in human TNFR2 selected from among the epitopes set forth in SEQ ID NOs: 839-865, 1202 and 1204; or
ii) an antigen-binding fragment of a potent human anti-TNFR2 antibody selected from MR2-1 or MAB2261; or
iii) K65W, D143Y, D143F, D143N, D143E, D143W, D143V, A145R, A145H, A145K, A145F, A145W, E146Q, E146H, E146K, E146N, D143N/A145R, A145 with respect to SEQ ID NO: 2 R/S147T, Q88N /T89S/A145S/E146A/S147D, Q88N/A145I/E146G/S147D, A145H/E146S/S147D, A145H/S147D, L29V/A145D/E146D/S147D, A145N/E146D/S147D, A145 T/E146S/S147D, A145Q/E146D /S147D, A145T/E146D/S147D, A145D/E146G/S147D, A145D/S147D, A145K/E146D/S147T, A145R/E146T/S147D, A145R/S147T, E146D/S147D, D143V/F 144L/A145S, S95C/G148C, and a TNFR2 selective TNF mutein, which is a soluble TNF variant comprising one or more TNFR2 selective mutations selected from D143V/A145S; or
iv) a single chain TNFR2 selective TNF mutein trimer comprising the mutations D143N/A145R, wherein the TNF mutein is (GGGGS) n (where n = 1-5) or all or all of the stem region of TNF (SEQ ID NO: 812) single-chain TNFR2 selective TNF mutein trimers, linked by moieties; or
v) a TNFR2 selective agonist comprising the formula:
MD-L1-TNFmut-L2-TNFmut-L3-TNFmut (formula II); or
TNFmut-L1-TNFmut-L2-TNFmut-L3-MD (formula III);
MD is the multimerization domain; TNFmut is a TNFR2 selective TNF mutein; and L1, L2 and L3 are the same or different linkers, wherein
MD is EHD2 (SEQ ID NO: 808), MHD2 (SEQ ID NO: 811), the trimerization domain of chicken tenascin C (TNC) (residues 110-139 of SEQ ID NO: 804; SEQ ID NO: 805), or human TNC is selected from the trimerization domain of (residues 110-139 of SEQ ID NO: 806, SEQ ID NO: 807);
L1, L2 and L3 are each (GGGGS) n (where n = 1-5), or all or part of the stem region of TNF (SEQ ID NO: 812), or a mixture thereof; and
TNF muteins include the TNFR2 selective mutations D143N/A145R.
류마티스성 관절염 (RA), 건선, 건선성 관절염, 소아 특발성 관절염 (JIA), 척추관절염, 강직 척추염, 크론병, 궤양성 대장염, 염증성 장 질환 (IBD), 포도막염, 섬유성 질환, 자궁내막증, 루푸스, 다발성 경화증 (MS), 울혈성 심부전, 심혈관 질환, 심근경색 (MI), 죽상동맥경화증, 대사성 질환, 사이토카인 방출 증후군, 패혈성 쇼크, 패혈증, 급성 호흡 곤란 증후군 (ARDS), 중증 급성 호흡기 증후군 (SARS), SARS-CoV-2, 인플루엔자, 급성 및 만성 신경퇴행 질환, 탈수초 질환 및 장애, 뇌졸중, 알츠하이머병, 파킨슨병, 베체트병, 듀피트렌병, 종양 괴사 인자 수용체 연관 주기성 증후군 (TRAPS), 췌장염, I형 당뇨병, 만성적 폐쇄성 폐 질환 (COPD), 만성 기관지염, 폐기종, 이식 거부, 이식편대숙주 질환 (GvHD), 폐 염증, 폐 질환 및 병태, 천식, 낭포성 섬유증, 특발성 폐 섬유증, 급성 전격성 바이러스 또는 박테리아 감염, 폐렴, TNF/TNFR1을 원인 병리 매개체로 하는 유전적 유전 질환, 주기성 발열 증후군, 또는 암.264. The chronic inflammatory, autoimmune, or chronic inflammatory disease of any one of claims 1 to 261, 262, or 263 or 264 characterized by overexpression of TNF or deregulated TNFR1 signaling in its pathogenesis. The neurodegenerative, demyelinating or respiratory disease or disorder, or the disease, condition or disorder is a construct, use, or composition selected from:
Rheumatoid arthritis (RA), psoriasis, psoriatic arthritis, juvenile idiopathic arthritis (JIA), spondyloarthritis, ankylosing spondylitis, Crohn's disease, ulcerative colitis, inflammatory bowel disease (IBD), uveitis, fibrotic disease, endometriosis, lupus , multiple sclerosis (MS), congestive heart failure, cardiovascular disease, myocardial infarction (MI), atherosclerosis, metabolic disease, cytokine release syndrome, septic shock, sepsis, acute respiratory distress syndrome (ARDS), severe acute respiratory syndrome (SARS), SARS-CoV-2, influenza, acute and chronic neurodegenerative diseases, demyelinating diseases and disorders, stroke, Alzheimer's disease, Parkinson's disease, Behcet's disease, Dupuytren's disease, tumor necrosis factor receptor-associated periodic syndrome (TRAPS) , pancreatitis, type I diabetes, chronic obstructive pulmonary disease (COPD), chronic bronchitis, emphysema, transplant rejection, graft-versus-host disease (GvHD), lung inflammation, lung diseases and conditions, asthma, cystic fibrosis, idiopathic pulmonary fibrosis, acute fulminant viral or bacterial infections, pneumonia, hereditary genetic disorders with TNF/TNFR1 as a causative pathological vector, periodic fever syndrome, or cancer.
(TNFR2 길항제)n ― 링커p ― (활성 변형제)q, 또는
링커p ― (활성 변형제)q ― (TNFR2 길항제)n, 여기서:
n 및 q는 각각 정수이고, 각각 독립적으로 1, 2 또는 3이고;
p는 0, 1, 2 또는 3이고;
TNFR2 길항제는 TNFR2와 상호작용하여 TNFR2의 활성을 억제(길항)함으로써 Treg의 증식을 억제 및/또는 그 사멸을 유도하고, 또한 TNFR2 발현 종양 세포의 증식을 억제하고 그 사멸을 유도할 수 있는 분자이고;
활성 변형제는 활성 변형제가 없는 작제물과 비교하여 작제물의 활성 또는 약리학적 특성을 조정하거나 변경하는 모이어티이고; 그리고
링커는 작제물의 가요성을 증가시키고/시키거나 작제물의 입체 효과 또는 수용체와의 상호작용을 조절하거나 감소시키고/시키거나 작제물의 수성 매질에서 용해도를 증가시킨다. 269. The construct of claim 268, comprising Formula 5:
(TNFR2 antagonist) n - linker p - (active modifier) q , or
linker p - (active modifier) q - (TNFR2 antagonist) n , where:
n and q are each an integer and are each independently 1, 2 or 3;
p is 0, 1, 2 or 3;
A TNFR2 antagonist is a molecule capable of inhibiting (antagonizing) the activity of TNFR2 by interacting with TNFR2, thereby inhibiting the proliferation of Treg and/or inducing its death, and also inhibiting the proliferation and inducing the death of TNFR2-expressing tumor cells. ;
An active modifier is a moiety that modulates or alters the activity or pharmacological properties of a construct compared to a construct without the active modifier; and
The linker increases the flexibility of the construct, modulates or reduces the steric effect or interaction of the construct with a receptor, and/or increases the solubility of the construct in aqueous media.
골수 유래 억제 세포(MDSC)의 증식을 감소시키고/시키거나 억제하고/하거나;
종양 미세환경에 존재하는 MDSC의 표면에 발현된 TNFR2를 결합함으로써 MDSC 내에서 세포자멸을 유도하고/하거나;
Treg 확대 및 활성의 억제를 통해 세포독성 CD8+ T 세포를 포함한 T 이펙터 세포의 확대를 유도한다. The construct of any one of claims 268 - 270 , wherein the TNFR2 antagonist is:
reduce and/or inhibit the proliferation of bone marrow derived suppressor cells (MDSCs);
Inducing apoptosis in MDSCs by binding TNFR2 expressed on the surface of MDSCs present in the tumor microenvironment;
Inhibition of Treg expansion and activity induces expansion of T effector cells, including cytotoxic CD8 + T cells.
TNFRAB1(각각 TNFRAB1의 중쇄 및 경쇄 서열에 대해서는 서열번호: 1212 및 1213 참조), TNFRAB2 및 TNFR2A3(예를 들어, 이들 항체에 대한 설명은 미국 특허 공개 제2019/0144556호 참조);
TNFRAB1 (QRVDGYSSYWYFDV; 서열번호: 1212의 잔기 99-112에 상응함), TNFRAB2 (ARDDGSYSPFDYWG; 서열번호: 1217) 또는 TNFR2A3 (ARDDGSYSPFDYFG; 서열번호: 1223), 또는 그와 적어도 약 85% 서열 동일성을 갖는 CDR-H3 서열, 예를 들어, TNFR2의 잔기 KCSPG를 함유하는 잔기 48-67보다 40-배 더 높은 친화도로 TNFR2의 잔기 KCRPG를 함유하는 잔기 130-149에 특이적으로 결합하는 TNFRAB1의 CDR-H3 서열을 함유하는 항체 및 항체 단편 및 단쇄 형태. The construct of any one of claims 268 - 273 , wherein the TNFR2 antagonist is an antibody or fragment or single chain form of an antibody selected from:
TNFRAB1 (see SEQ ID NOs: 1212 and 1213 for the heavy and light chain sequences of TNFRAB1, respectively), TNFRAB2 and TNFR2A3 (see, eg, US Patent Publication No. 2019/0144556 for a description of these antibodies);
TNFRAB1 (QRVDGYSSYWYFDV; corresponding to residues 99-112 of SEQ ID NO: 1212), TNFRAB2 (ARDDGSYSPFDYWG; SEQ ID NO: 1217) or TNFR2A3 (ARDDGSYSPFDYFG; SEQ ID NO: 1223), or a CDR with at least about 85% sequence identity there - a CDR-H3 sequence of TNFRAB1 that specifically binds to residues 130-149 containing residues KCRPG of TNFR2 with 40-fold higher affinity than H3 sequence, e.g., residues 48-67 containing residues KCSPG of TNFR2. Antibodies and antibody fragments and single chain forms containing
잔기 137-144(CAPLRKCR; 서열번호: 851)를 함유하는 에피토프;
인간 TNFR2의 위치 80-86 (DSTYTQL; 서열번호: 1247), 91-98 (PECLSCGS; 서열번호: 1248), 및/또는 116-123 (RICTCRPG; 서열번호: 1249) 내에 하나 이상의 잔기를 포함하는 에피토프; 및
제1 에피토프로부터 선택된 TNFR2A3는 인간 TNFR2의 잔기 140-150 (LRKCRPGFGVA; 서열번호: 1463)을 포함하고 KCRPG 모티프를 함유하는 에피토프, 및/또는 인간 TNFR2의 잔기 159-171 (VVCKPCAPGTFSN; 서열번호: 1464)를 함유하는 제2 에피토프. The construct of any one of claims 268 - 274 , wherein the TNFR2 antagonist binds to one or more epitopes in TNFR2 selected from:
an epitope containing residues 137-144 (CAPLRKCR; SEQ ID NO: 851);
an epitope comprising one or more residues within positions 80-86 (DSTYTQL; SEQ ID NO: 1247), 91-98 (PECLSCGS; SEQ ID NO: 1248), and/or 116-123 (RICTCRPG; SEQ ID NO: 1249) of human TNFR2 ; and
TNFR2A3 selected from the first epitope is an epitope comprising residues 140-150 of human TNFR2 (LRKCRPGFGVA; SEQ ID NO: 1463) and containing a KCRPG motif, and/or residues 159-171 of human TNFR2 (VVCKPCAPGTFSN; SEQ ID NO: 1464) A second epitope containing
(a) 서열번호: 4의 잔기 142-146에 상응하는 잔기 KCRPG, 또는 잔기 130-149, 137-144 또는 142-149, 또는 이들 에피토프 내에 적어도 5개의 연속 또는 불연속 잔기를 함유하는 더 큰 에피토프 중 하나 이상을 함유하고, 서열번호: 4의 잔기 56-60에 상응하는 잔기 KCSPG를 함유하는 에피토프에 결합하지 않는 인간 TNFR2 내의 하나 이상의 에피토프; 및/또는
(b) 하기를 포함하는 아미노산 서열을 포함하는 하나 이상의 TNFR2 에피토프:
서열번호: 4의 잔기 91-98에 상응하는 PECLSCGS, 및/또는 서열번호: 4의 잔기 116-123에 상응하는 RICTCRPG, 및/또는
CAPLRKCR (서열번호: 4의 잔기 137-144에 상응함), 및/또는 LRKCRPGFGVA (서열번호: 4의 잔기 140-150에 상응함), 및/또는 VVCKPCAPGTFSN (서열번호: 4의 잔기 159-171에 상응함), 및/또는
서열번호: 4의 잔기 75-128, 86-103, 111-128, 또는 150-190 내에 적어도 5개의 연속 또는 불연속 잔기를 함유하는 에피토프.The construct of any one of claims 268 - 277 , wherein the TNFR2 antagonist specifically binds to an epitope(s) selected from:
(a) residues KCRPG corresponding to residues 142-146 of SEQ ID NO: 4, or residues 130-149, 137-144 or 142-149, or a larger epitope containing at least 5 contiguous or discontinuous residues within these epitopes; at least one epitope in human TNFR2 that contains at least one that does not bind to an epitope containing residues KCSPG corresponding to residues 56-60 of SEQ ID NO:4; and/or
(b) one or more TNFR2 epitopes comprising an amino acid sequence comprising:
PECLSCGS corresponding to residues 91-98 of SEQ ID NO: 4, and/or RICTCRPG corresponding to residues 116-123 of SEQ ID NO: 4, and/or
CAPLRKCR (corresponding to residues 137-144 of SEQ ID NO: 4), and/or LRKCRPGFGVA (corresponding to residues 140-150 of SEQ ID NO: 4), and/or VVCKPCAPGTFSN (corresponding to residues 159-171 of SEQ ID NO: 4) equivalent), and/or
An epitope containing at least 5 contiguous or discontinuous residues within residues 75-128, 86-103, 111-128, or 150-190 of SEQ ID NO:4.
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