KR20180041717A - 항-dll3 항체 약물 컨쥬게이트 및 그의 이용 방법 - Google Patents
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Abstract
본 발명은 신규 항-DLL3 항체 및 항체 약물 컨쥬게이트, 및 암 치료를 위한 그러한 항-DLL3 항체 및 항체 약물 컨쥬게이트의 사용 방법을 제공한다.
Description
관련 출원의 상호 참조
본 출원은 2015년 8월 20일에 출원된 미국 가출원 62/207,830, 2016년 4월 18일에 출원된 미국 가출원 62/323,998 및 2016년 8월 11일에 출원된 미국 가출원 62/373,906의 이익을 청구하며, 이들 각각은 그 전체로서 본 명세서에 참조로 포함된다.
서열 목록
본 출원은 EFS-Web을 통하여 ASCII 포맷으로 제출된 서열 목록을 포함하며, 그 전체가 참고로서 본 명세서에 통합된다. 상기 ASCII 카피는 2016년 8월 8일 제작되어, sc1607_p3_Sequence_Listing_08082016로 명명되고, 크기는 591 KB (605,521 바이트)이다.
발명의 분야
본 출원은 일반적으로 신규 화합물 및 조성물, 및 암 및 그의 임의의 재발 또는 전이의 치료, 진단 또는 예방을 위해 동일한 것을 포함하는, 항-DLL3 항체 또는 항체 약물 컨쥬게이트 (ADC)를 포함하는 그의 면역반응성 단편을 투여하는 방법에 관한 것이다.
줄기 세포 및 간 세포의 분화 및 증식은, 기관형성, 세포 복구 및 세포 대체 동안 조직 성장을 뒷받침하도록 협력하여 작용하는 통상적인 진행중 과정이다. 시스템은 유기체의 필요에 기초하여 단지 적절한 신호가 생성되는 것을 보장하도록 엄격하게 조절된다. 세포 증식 및 분화는 통상적으로, 손상된 또는 죽어가는 세포의 대체를 위해 또는 성장을 위해 단지 필요에 따라 일어난다. 그러나, 이들 과정의 파괴는 다양한 신호전달 화학물질의 부족 또는 과다, 변경된 미세환경의 존재, 유전적 돌연변이 또는 이들의 조합을 포함하는 많은 인자에 의해 촉발될 수 있다. 정상적인 세포 증식 및/또는 분화의 파괴는, 증식성 질환, 예컨대 암을 포함하는 다양한 장애를 일으킬 수 있다.
암에 대한 종래의 치료 요법은 화학요법, 방사선요법 및 면역요법을 포함한다. 종종 이들 치료는 효과적이지 않고, 수술적 절제는 실행가능한 임상적 대안을 제공하지 않을 수 있다. 현재의 관리 표준에서의 한계는, 환자가 첫번째 치료를 받고 이어서 악화되는 경우에 특히 분명하다. 이러한 경우, 종종 공격적이고 불치성인 난치성 종양이 빈번히 발생한다. 많은 고형 종양에 대한 전체적 생존율은, 적어도 부분적으로, 악화, 종양 재발 및 전이를 막는 기존의 요법의 실패로 인해, 수 년간 주로 변하지 않고 남아있다. 따라서, 증식성 장애를 위한 보다 표적화되고 강력한 요법의 개발에 대한 많은 필요성이 남아있다. 본 발명은 이러한 필요성을 다루는 것이다.
줄기 세포 및 간 세포의 분화 및 증식은, 기관형성, 세포 복구 및 세포 대체 동안 조직 성장을 뒷받침하도록 협력하여 작용하는 통상적인 진행중 과정이다. 시스템은 유기체의 필요에 기초하여 단지 적절한 신호가 생성되는 것을 보장하도록 엄격하게 조절된다. 세포 증식 및 분화는 통상적으로, 손상된 또는 죽어가는 세포의 대체를 위해 또는 성장을 위해 단지 필요에 따라 일어난다. 그러나, 이들 과정의 파괴는 다양한 신호전달 화학물질의 부족 또는 과다, 변경된 미세환경의 존재, 유전적 돌연변이 또는 이들의 조합을 포함하는 많은 인자에 의해 촉발될 수 있다. 정상적인 세포 증식 및/또는 분화의 파괴는, 증식성 질환, 예컨대 암을 포함하는 다양한 장애를 일으킬 수 있다.
암에 대한 종래의 치료 요법은 화학요법, 방사선요법 및 면역요법을 포함한다. 종종 이들 치료는 효과적이지 않고, 수술적 절제는 실행가능한 임상적 대안을 제공하지 않을 수 있다. 현재의 관리 표준에서의 한계는, 환자가 첫번째 치료를 받고 이어서 악화되는 경우에 특히 분명하다. 이러한 경우, 종종 공격적이고 불치성인 난치성 종양이 빈번히 발생한다. 많은 고형 종양에 대한 전체적 생존율은, 적어도 부분적으로, 악화, 종양 재발 및 전이를 막는 기존의 요법의 실패로 인해, 수 년간 주로 변하지 않고 남아있다. 따라서, 증식성 장애를 위한 보다 표적화되고 강력한 요법의 개발에 대한 많은 필요성이 남아있다. 본 발명은 이러한 필요성을 다루는 것이다.
광범위한 양태에서, 본 발명은 분리된 항체, 및/또는 상응 항체 약물 컨쥬게이트를 포함하는 신규 화합물 및 조성물을 제공하며, 이는 인간 DLL3 결정인자에 특이적으로 결합한다. 다른 구현예에서 DLL3 결정인자는 종양 개시 세포 상에서 발현되는 한편, 특정 구현예에서 DLL3 결정인자는 종양 세포 상에서 발현된 DLL3 단백질이다. 선택된 양태에서, DLL3 ADC 조성물은 동결건조된 조성물을 포함할 것이다. 다른 양태에서, 본 발명은, 본 명세서에서 설명된 바와 같이 확인된 소정의 환자 부차집단(subpopulation)의 특히 효과적인 투약 방식(dosing regimen) 및 투약을 포함하는 개시된 화합물 또는 조성물을 투여하는 신규 방법을 제공한다. 아래에서 더욱 상세히 논의되는 바와 같이, 환자 선정 및 환자 투약에 관한 개시된 방법론은, 적어도 부분적으로는, 초래되는 양호한 치료 지수 및 치료 감수성 집단으로 인해 특히 효과적임을 입증할 수 있다. 또다른 구현예에서, 본 발명은 DLL3 ADC 및 체크포인트(checkpoint) 억제제를 포함하는 면역치료 화합물의 조합을 포함하는 특정 치료 섭생을 제공하며, 이는 특히 효과적인 것으로 보인다.
선택된 양태에서, 본 발명의 항체는 DLL3 단백질에 결합하고, 인간 DLL3 단백질 상에서 에피토프에 결합하는 참조 항체와의 결합에 대해 경쟁한다. 특정 구현예에서, 본 발명은 DLL3 항체 또는 ADC를 포함하며, 여기서 상기 항체 또는 ADC 결합 도메인은 인간 DLL3 (hDLL3)에 특이적으로 결합하고, 다음을 포함하는 항체와의 결합에 대해 포함하거나 또는 경쟁한다: 서열번호 21의 경쇄 가변 영역 (VL) 및 서열번호 23의 중쇄 가변 영역 (VH); 또는 서열번호 25의 VL 및 서열번호 27의 VH; 또는 서열번호 29의 VL 및 서열번호 31의 VH; 또는 서열번호 33의 VL 및 서열번호 35의 VH; 또는 서열번호 37의 VL 및 서열번호 39의 VH; 또는 서열번호 41의 VL 및 서열번호 43의 VH; 또는 서열번호 45의 VL 및 서열번호 47의 VH; 또는 서열번호 49의 VL 및 서열번호 51의 VH; 또는 서열번호 53의 VL 및 서열번호 55의 VH; 또는 서열번호 57의 VL 및 서열번호 59의 VH; 또는 서열번호 61의 VL 및 서열번호 63의 VH; 또는 서열번호 65의 VL 및 서열번호 67의 VH; 또는 서열번호 69의 VL 및 서열번호 71의 VH; 또는 서열번호 73의 VL 및 서열번호 75의 VH; 또는 서열번호 77의 VL 및 서열번호 79의 VH; 또는 서열번호 81의 VL 및 서열번호 83의 VH; 또는 서열번호 85의 VL 및 서열번호 87의 VH; 또는 서열번호 89의 VL 및 서열번호 91의 VH; 또는 서열번호 93의 VL 및 서열번호 95의 VH; 또는 서열번호 97의 VL 및 서열번호 99의 VH; 또는 서열번호 101의 VL 및 서열번호 103의 VH; 또는 서열번호 105의 VL 및 서열번호 107의 VH; 또는 서열번호 109의 VL 및 서열번호 111의 VH; 또는 서열번호 113의 VL 및 서열번호 115의 VH; 또는 서열번호 117의 VL 및 서열번호 119의 VH; 또는 서열번호 121의 VL 및 서열번호 123의 VH; 또는 서열번호 125의 VL 및 서열번호 127의 VH; 또는 서열번호 129의 VL 및 서열번호 131의 VH; 또는 서열번호 133의 VL 및 서열번호 135의 VH; 또는 서열번호 137의 VL 및 서열번호 139의 VH; 또는 서열번호 141의 VL 및 서열번호 143의 VH; 또는 서열번호 145의 VL 및 서열번호 147의 VH; 또는 서열번호 149의 VL 및 서열번호 151의 VH; 또는 서열번호 153의 VL 및 서열번호 155의 VH; 또는 서열번호 157의 VL 및 서열번호 159의 VH; 또는 서열번호 161의 VL 및 서열번호 163의 VH; 또는 서열번호 165의 VL 및 서열번호 167의 VH; 또는 서열번호 169의 VL 및 서열번호 171의 VH; 또는 서열번호 173의 VL 및 서열번호 175의 VH; 또는 서열번호 177의 VL 및 서열번호 179의 VH; 또는 서열번호 181의 VL 및 서열번호 183의 VH; 또는 서열번호 185의 VL 및 서열번호 187의 VH; 또는 서열번호 189의 VL 및 서열번호 191의 VH; 또는 서열번호 193의 VL 및 서열번호 195의 VH; 또는 서열번호 197의 VL 및 서열번호 199의 VH; 또는 서열번호 201의 VL 및 서열번호 203의 VH; 또는 서열번호 205의 VL 및 서열번호 207의 VH; 또는 서열번호 209의 VL 및 서열번호 211의 VH; 또는 서열번호 213의 VL 및 서열번호 215의 VH; 또는 서열번호 217의 VL 및 서열번호 219의 VH; 또는 서열번호 221의 VL 및 서열번호 223의 VH; 또는 서열번호 225의 VL 및 서열번호 227의 VH; 또는 서열번호 229의 VL 및 서열번호 231의 VH; 또는 서열번호 233의 VL 및 서열번호 235의 VH; 또는 서열번호 237의 VL 및 서열번호 239의 VH; 또는 서열번호 241의 VL 및 서열번호 243의 VH; 또는 서열번호 245의 VL 및 서열번호 247의 VH; 또는 서열번호 249의 VL 및 서열번호 251의 VH; 또는 서열번호 253의 VL 및 서열번호 255의 VH; 또는 서열번호 257의 VL 및 서열번호 259의 VH; 또는 서열번호 261의 VL 및 서열번호 263의 VH; 또는 서열번호 265의 VL 및 서열번호 267의 VH; 또는 서열번호 269의 VL 및 서열번호 271의 VH; 또는 서열번호 273의 VL 및 서열번호 275의 VH; 또는 서열번호 277의 VL 및 서열번호 279의 VH; 또는 서열번호 281의 VL 및 서열번호 283의 VH; 또는 서열번호 285의 VL 및 서열번호 287의 VH; 또는 서열번호 289의 VL 및 서열번호 291의 VH; 또는 서열번호 293의 VL 및 서열번호 295의 VH; 또는 서열번호 297의 VL 및 서열번호 299의 VH ; 또는 서열번호 301의 VL 및 서열번호 303의 VH; 또는 서열번호 305의 VL 및 서열번호 307의 VH; 또는 서열번호 309의 VL 및 서열번호 311의 VH; 또는 서열번호 313의 VL 및 서열번호 315의 VH; 또는 서열번호 317의 VL 및 서열번호 319의 VH; 또는 서열번호 321의 VL 및 서열번호 323의 VH; 또는 서열번호 325의 VL 및 서열번호 327의 VH; 또는 서열번호 329의 VL 및 서열번호 331의 VH; 또는 서열번호 333의 VL 및 서열번호 335의 VH; 또는 서열번호 337의 VL 및 서열번호 339의 VH; 또는 서열번호 341의 VL 및 서열번호 343의 VH; 또는 서열번호 345의 VL 및 서열번호 347의 VH; 또는 서열번호 349의 VL 및 서열번호 351의 VH; 또는 서열번호 353의 VL 및 서열번호 355의 VH; 또는 서열번호 357의 VL 및 서열번호 359의 VH; 또는 서열번호 361의 VL 및 서열번호 363의 VH; 또는 서열번호 365의 VL 및 서열번호 367의 VH; 또는 서열번호 369의 VL 및 서열번호 371의 VH; 또는 서열번호 373의 VL 및 서열번호 375의 VH; 또는 서열번호 377의 VL 및 서열번호 379의 VH; 또는 서열번호 381의 VL 및 서열번호 383의 VH; 또는 서열번호 385의 VL 및 서열번호 387의 VH; 또는 서열번호 389의 VL 및 서열번호 391의 VH; 또는 서열번호 393의 VL 및 서열번호 395의 VH; 또는 서열번호 397의 VL 및 서열번호 399의 VH; 또는 서열번호 401의 VL 및 서열번호 403의 VH; 또는 서열번호 405의 VL 및 서열번호 407의 VH. 일 양태에서, 본 발명은 본 발명의 항-DLL3 항체를 암호화하는 핵산 또는 이의 면역반응성 단편을 포함한다. 다른 구현예에서, 본 발명은 상기 기재된 핵산을 하나 이상 포함하는 벡터 및/또는 상기 벡터를 포함하는 숙주 세포를 포함한다.
본 발명의 일부 양태에서, 항체는 키메라성, CDR 그래프트된, 인간화 또는 인간 항체 또는 이의 면역반응성 단편을 포함한다. 본 발명의 다른 양태에서, 바람직하게는 상기 언급된 서열의 전부 또는 일부를 포함하는 항체는, 내재화(internalizing) 항체이다. 또다른 구현예에서, 항체는 위치 특이적 항체를 포함할 것이다. 다른 선택된 구현예에서, 본 발명은 상기 언급된 임의의 항체를 포함하는 항체 약물 컨쥬게이트를 포함한다.
특정 구현예에서, 본 발명은 화학식 Ab-[L-D]n의 항체 약물 컨쥬게이트 또는 이의 약학적으로 허용가능한 염을 포함하고, 식에서 Ab는 항-DLL3 항체를 포함하고; L은 임의의 링커를 포함하고; D는 약물을 포함하고; 그리고 n은 1 내지 20의 정수이다. 일 양태에서, 본 발명의 ADC는 상기 기재된 바와 같은 항-DLL3 항체 또는 이의 면역반응성 단편을 포함한다. 다른 구현예에서 본 발명의 ADC는 칼리케아마이신, 피롤로벤조디아제핀, 오리스타틴, 듀오카마이신, 마이탄시노이드 또는 본 명세서에 설명된 바와 같은 임의의 하나의 상용가능한 치료 모이어티(moiety)로부터 선택된 세포독성 화합물을 포함한다. 특정 구현예에서, 본 발명은 상기 기재된 바와 같은 ADC를 포함하는 약학 조성물을 포함한다.
여전히 다른 선택된 구현예에서, 본 발명의 ADC는 증진된 치료 지수를 제공하고 투약 방식의 최적화를 가능하게 하는 개선된 약동학적 및 약력학적 특성을 갖는다. 이와 관련하여, 개시된 ADC는, 본 명세서에서 설명된 바에 따라 측정 시, 6 일 초과의 최종 반감기, 7 일 초과의 최종 반감기 또는 8 일 초과의 최종 반감기를 가질 것이다. 본 발명의 여전히 다른 양태는 9 일 초과의 최종 반감기, 10 일 초과의 최종 반감기, 11 일 초과의 최종 반감기, 12 일 초과의 최종 반감기를 갖는 ADC를 포함할 것이다 (각각 인간 대상체에서 측정된 바와 같음). 여전히 다른 구현예에서, 개시된 ADC는 인간 대상체에서 13 일 초과의 최종 반감기, 약 14 일 초과의 최종 반감기, 15 일 초과의 최종 반감기, 약 16 일 초과의 최종 반감기, 약 17 일 초과의 최종 반감기, 18 일 초과의 최종 반감기, 약 19 일 초과의 최종 반감기, 약 20 일 초과의 최종 반감기 또는 3 주 초과의 최종 반감기를 가질 것이다. 또다른 구현예에서, 본 발명의 ADC는 약 6 일의 최종 반감기, 약 7 일의 최종 반감기, 약 8 일의 최종 반감기, 약 9 일의 최종 반감기, 약 10 일의 최종 반감기, 약 11 일의 최종 반감기, 약 12 일의 최종 반감기, 약 13 일의 최종 반감기, 약 14 일의 최종 반감기, 약 15 일의 최종 반감기, 약 16 일의 최종 반감기, 약 17 일의 최종 반감기, 약 18 일의 최종 반감기, 약 19 일의 최종 반감기, 약 20 일의 최종 반감기, 또는 약 3 주의 최종 반감기를 나타낼 것이다. 당업자는 그러한 연장된 반감기는 개시된 ADC의 적은 투약 빈도를 가능하게 할 것이며, 이에 의해 유사하거나 감소된 독성을 나타내면서 원하는 효능을 제공함을 인식하게 될 것이다.
이러한 목적을 위한 본 발명의 다른 양태는 본 명세서에 설명된 것과 같은 약학 조성물을 그를 필요로 하는 대상체에 투여하는 것을 포함하는 암의 치료 방법에 관한 것이다. 선택된 구현예에서, 본 방법은 약 6 일 초과의 최종 반감기, 약 7 일 초과의 최종 반감기, 약 8 일 초과의 최종 반감기, 약 9 일 초과의 최종 반감기, 약 10 일 초과의 최종 반감기, 약 11 일 초과의 최종 반감기, 약 12 일 초과의 최종 반감기, 약 13 일 초과의 최종 반감기, 약 14 일 초과의 최종 반감기, 약 15 일 초과의 최종 반감기, 약 16 일 초과의 최종 반감기, 약 17 일 초과의 최종 반감기, 약 18 일 초과의 최종 반감기, 약 19 일 초과의 최종 반감기, 약 20 일 초과의 최종 반감기, 또는 약 3 주 초과의 최종 반감기를 갖는 ADC를 투여하는 것을 포함할 것이다.
다른 특정 구현예에서, 암은 부신, 간, 신장, 방광, 유방, 위, 난소, 자궁경부, 자궁, 식도, 결장직장, 전립선, 췌장, 폐 (소세포 및 비-소세포 둘 모두), 갑상선, 암종, 육종, 교모세포종 및 각종 두경부(head and neck) 종양을 포함하나 이에 제한되지는 않는 고형 종양을 포함할 것이다. 여전히 다른 선택된 양태에서, 암은 폐암 (소세포 폐암 또는 대세포 신경내분비 암종 포함), 전립선 암, 결장직장암 및 피부암, 예컨대 흑색종 (예를 들어, 야생형 또는 돌연변이된 BRAF를 발현하는 피부암)을 포함하는 군으로부터 선택된다. 일부 구현예에서, 상기 기재된 암의 치료 방법은, 개시된 약학 조성물에 추가하여 적어도 하나의 추가의 치료 모이어티를 대상체에 투여하는 것을 포함한다. 바람직한 양태에서, 추가의 치료 모이어티는 항-PD-1 항체 또는 항-PD-L1 항체를 포함할 것이다.
상기 언급된 방법에 관하여 특정 구현예에서, 본 발명은 암 치료에서의 이용을 위한 항-DLL3 항체 약물 컨쥬게이트를 제공하며, 상기 치료는 유효량의 항-DLL3 항체 약물 컨쥬게이트 (DLL3 ADC)를, 매 주 적어도 1 회 (QW), 2 주마다 적어도 1 회 (Q2W), 3 주마다 적어도 1 회 (Q3W), 4 주마다 적어도 1 회 (Q4W), 5 주마다 적어도 1 회 (Q5W), 6 주마다 적어도 1 회 (Q6W), 7 주마다 적어도 1 회 (Q7W), 8 주마다 적어도 1 회 (Q8W), 9 주마다 적어도 1 회 (Q9W), 10 주마다 적어도 1 회 (Q10W), 11 주마다 적어도 1 회 (Q11W) 또는 12 주마다 적어도 1 회 (Q12W) 투여하는 것을 포함할 수 있다. 선택된 구현예에서, DLL3 ADC는 3 주마다 적어도 1 회 (Q3W), 4 주마다 적어도 1 회 (Q4W), 5 주마다 적어도 1 회 (Q5W) 또는 6 주마다 적어도 1 회 (Q6W) 투여될 것이다. 다른 선택된 구현예에서, DLL3 ADC는 약 0.01 mg/kg, .025 mg/kg, 0.05 mg/kg, 0.075 mg/kg, 0.1 mg/kg, 0.15 mg/kg, 0.2 mg/kg, 0.25 mg/kg, 0.3 mg/kg, 0.4 mg/kg, 0.5 mg/kg, 0.6 mg/kg, 0.7 mg/kg, 0.8 mg/kg, 0.9 mg/kg 또는 1.0 mg/kg의 투여량으로 투여될 것이다. 선택된 구현예는 환자를 DLL3 ADC의 1 회 투여로 처리하는 것을 포함할 것이다. 소정의 다른 구현예는 환자를 2 회 사이클 (×2) 동안, 3 회 사이클 (×3) 동안, 4 회 사이클 (×4) 동안, 5 회 사이클 (×5) 동안, 6 회 사이클 (×6) 동안, 7 회 사이클 (×7) 동안, 8 회 사이클 (×8) 동안, 9 회 사이클 (×9) 동안, 10 회 사이클 (×10) 동안 특정 간격으로 처리하는 것을 포함할 것이다 (즉, Q2W, Q3W, Q4W, Q5W, Q6W, 등). 다른 구현예에서, 초기 DLL3 ADC 처리 (× 사이클)가 완료될 수 있고, 추가의 DLL3 ADC 처리는 암이 진전의 표시를 나타낼 때까지 수행되지 않는다 (진행 중 처리). 또다른 구현예에서, 초기 DLL3 ADC 처리 (× 사이클)가 완료될 수 있고, 이후 환자는 유지 치료법 (예를 들어, 무기한으로 0.1 mg/kg DLL3 ADC Q6W)에 놓인다. 그러한 유지 세팅에서, DLL3 ADC는 연동 펌프를 통한 연속적 또는 주기적 (예를 들어, 매 시간) 주입으로서 비교적 낮은 수준으로 투입될 수 있다. 여전히 다른 구현예에서, 환자는 초기 DLL3 ADC 처리 (× 사이클)를 받을 것이고, 이후 진행까지 (즉, 진행 중 처리) 동일하거나 관련된 암에 대해 (개시된 ADC 또는 또 다른 작용제로) 다시 처리되지 않을 것이다. 그러한 경우, 제2 처리 사이클 (예를 들어, DLL3 ADC 이용)은 제1 처리 사이클의 결정 후, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15 또는 16 주 이상 후까지 유효하지 않을 것이다.
일 구현예에서, 본 발명은 종양 세포 집단에서 종양 개시 세포를 감소시키는 방법을 포함하며, 여기에서 본 방법은 (예를 들어, 시험관 내 또는 생체 내) 종양 개시 세포 집단을 본 명세서에서 설명된 바와 같은 ADC와 접촉시키는 것을 포함하며, 이에 의해 종양 개시 세포의 빈도가 감소된다.
일 양태에서, 본 발명은 세포를 상기 기재된 임의의 ADC와 접촉시키는 것을 포함하는, 세포독소를 세포로 전달하는 방법을 포함한다.
또 다른 양태에서, 본 발명은 대상체에서 암 (예를 들어, 폐암, 전립선암 또는 흑색종)을 검출, 진단, 또는 모니터링하는 방법을 포함하며, 상기 방법은 (예를 들어, 시험관 내 또는 생체 내) 종양 세포를 DLL3 검출제와 접촉시키는 단계 및 종양 세포와 연관된 DLL3 검출제를 검출하는 단계를 포함한다. 선택된 구현예에서, 검출제는 DLL3 유전형 결정인자와 연관된 항-DLL3 항체 또는 핵산 프로브를 포함할 것이다. 관련 구현예에서, 진단 방법은 면역조직화학적 분석 (IHC) 또는 원위치 혼성화 (ISH)를 포함할 것이다.
이러한 목적을 위하여, 본 발명의 특정 양태는 DLL3 항체의 면역조직화학에 대한 사용을 포함함을 이해할 것이다. 더욱 구체적으로, DLL3 IHC는 각종 증식성 질환의 진단을 보조하고, DLL3 항체 치료법을 포함하는 치료에 대한 잠재적 반응을 모니터하는 데 진단 도구로서 사용될 수 있다. 이와 관련하여, 그리고 아래 실시예에 나타낸 바와 같이, 면역조직화학 기술이 당 기술에 알려진 바와 같은 H-스코어를 유도하는 데 사용될 수 있다. 이러한 H-스코어 (즉, 300점 척도에서 90 이상)는, 환자가 본 발명의 조성물을 이용한 치료를 잘 받아들일 수 있는지를 표시하는 데 사용될 수 있으며, 또한 치료 결정을 안내하고 투약 방식 및 타이밍을 결정하는 데 사용될 수 있다. 다른 구현예에서, 종양에서 양성 염색된 DLL3 세포의 백분율은 환자가 개시된 DLL3 ADC를 이용한 처리에 감수성 있는지를 표시하는 데 사용될 수 있다.
비슷한 맥락에서, 본 발명은 암과 같이 DLL3 관련된 질환의 진단, 모니터링 또는 치료에 유용한 키트 또는 장치 및 관련 방법을 또한 제공한다. 이 목적을 위하여, 본 발명은 바람직하게는 DLL3 ADC를 함유하는 용기, 그리고 DLL3 관련 질환의 검출, 진단 또는 치료에 DLL3 ADC를 사용하기 위한 지시 자료를 포함하는, DLL3 관련 질환을 치료, 모니터 또는 진단하는 데 유용한 제조 물품을 제공한다. 선택된 구현예에서, 장치 및 관련 방법은 적어도 하나의 순환 종양 세포를 접촉시키는 단계를 포함할 것이다. 다른 구현예에서, 개시된 키트는 키트 또는 장치가 DLL3 관련 암의 진단, 모니터링 또는 치료를 위해 사용됨을 표시하는 지시사항, 라벨, 삽입물, 판독기 등을 포함할 것이다.
상기 설명은 요약이며, 따라서 필요에 따라 상세사항의 간략화, 일반화, 및 생략을 함유하며; 그 결과, 당업자는 요약이 단지 예시적인 것이며 어떠한 방식으로든 제한적인 것으로 의도되지 않음을 인지할 것이다. 본원에 기재된 방법, 조성물 및/또는 장치 및/또는 기타 다른 주제의 기타 다른 양태, 특징, 및 이점은 본원에 기재된 교시내용에서 명백해질 것이다. 요약은 하기 상세한 설명에 추가로 기재되는 간략화된 형태에서의 개념의 선택을 도입하기 위해 제공된 것이다.
도 1a 및 도 1b는, 표 형태로, 본 명세서의 실시예에서 기재된 바와 같이 분리, 클로닝 및 조작된, 개시된 DLL3 ADC와 양립가능한 다수의 뮤린 및 인간화된 예시적인 DLL3 항체의 경쇄 및 중쇄 가변 영역의 연속 아미노산 서열 (서열번호 21-407, 홀수)을 제공한다;
도 2는, 도식적 형태로, 본 명세서의 실시예에서 기재된 바와 같이 분리, 클로닝 및 조작된 예시적인 DLL3 항체의 도메인 수준 맵핑 분석 결과를 도시한다;
도 3a 및 도 3b는 DLL3 발현이 표준 케어 치료법의 임상적 결과와 상관되지 않으며 (도 3a), DLL3 발현이 나이브 및 화학치료 불응성 SCLC 환자 모두에서 상승됨 (도 3b)을 보여주는 면역조직화학법 데이터를 제공한다;
도 4a 내지 도 4f는 제1상 연구에 관련된 각종 데이터를 제공하며, 여기에서 도 4a는 연구 설계 및 결과를 요약하고, 도 4b는 DLL3 ADC의 임상적 약동학을 나타내고, 도 4c는 DLL3 ADC에 의해 제공된 반응 기간을 보여주고, 도 4d 및 도 4e는 모든 처리된 환자 및 DLL3+ 양성 환자의 반응을 보여주고, 도 4f는 보고된 부작용의 요약한 표를 제공한다;
도 5a 내지 도 5c는 개시된 DLL3 ADC의 동결건조된 구현예가 3 개의 상이한 온도에서 안정함을 나타내는 데이터를 표 형태로 제공한다; 및
도 6a 및 도 6b는 DLL3 ADC와 항-PD-1 항체가, 조합 투여된 경우, 면역적격 마우스에서 종양 성장을 억제한다는 것을 예시한다.
도 2는, 도식적 형태로, 본 명세서의 실시예에서 기재된 바와 같이 분리, 클로닝 및 조작된 예시적인 DLL3 항체의 도메인 수준 맵핑 분석 결과를 도시한다;
도 3a 및 도 3b는 DLL3 발현이 표준 케어 치료법의 임상적 결과와 상관되지 않으며 (도 3a), DLL3 발현이 나이브 및 화학치료 불응성 SCLC 환자 모두에서 상승됨 (도 3b)을 보여주는 면역조직화학법 데이터를 제공한다;
도 4a 내지 도 4f는 제1상 연구에 관련된 각종 데이터를 제공하며, 여기에서 도 4a는 연구 설계 및 결과를 요약하고, 도 4b는 DLL3 ADC의 임상적 약동학을 나타내고, 도 4c는 DLL3 ADC에 의해 제공된 반응 기간을 보여주고, 도 4d 및 도 4e는 모든 처리된 환자 및 DLL3+ 양성 환자의 반응을 보여주고, 도 4f는 보고된 부작용의 요약한 표를 제공한다;
도 5a 내지 도 5c는 개시된 DLL3 ADC의 동결건조된 구현예가 3 개의 상이한 온도에서 안정함을 나타내는 데이터를 표 형태로 제공한다; 및
도 6a 및 도 6b는 DLL3 ADC와 항-PD-1 항체가, 조합 투여된 경우, 면역적격 마우스에서 종양 성장을 억제한다는 것을 예시한다.
본 발명은 많은 상이한 형태로 구현될 수 있다. 본 명세서에서는 이의 원리를 예시하는 본 발명의 비제한적이며 예시적인 구현예가 개시된다. 본 명세서에서 사용된 임의의 섹션 제목은 단지 조직적 목적을 위한 것이며, 기재된 주제를 제한하는 것으로 해석되어서는 안된다. 본 개시 내용의 목적상, 모든 식별 서열 등록 번호는 달리 언급되지 않는 한 NCBI 참조 서열 (RefSeq) 데이터베이스 및/또는 NCBI GenBank® 기록 보관 서열 데이터베이스에서 찾아볼 수 있다.
DLL3 발현은 놀랍게도 다수의 종양 유형과 상관있는 것으로 발견되며, 이는 결정인자로서, 그러한 종양의 치료에서 이용될 수 있다. DLL3 발현이 종양형성(tumorigenic) 세포와 관련되며, 그와 같이 이는 그러한 세포를 억제 또는 제거하는 데 효과적으로 이용될 수 있음이 또한 예기치않게 발견되었다. 아래에 더욱 상세히 기재되는, 종양형성 세포는 많은 통상의 치료에 대해 내성을 나타내는 것으로 알려져 있다. 선행 기술의 교시에 대조적으로, 개시된 화합물 및 방법은 이러한 고유의 내성을 효과적으로 극복한다.
본 발명은 항-DLL3 항체 (항체 약물 컨쥬게이트를 포함), 및 임의의 특별한 작용 메커니즘 또는 특이적으로 표적된 세포 또는 분자 성분에 관계없이 각종 DLL3-관련 암의 예후, 진단, 테라그노시스(theragnosis), 치료 및/또는 예방에서의 이의 용도를 제공한다. 놀랍게도, 소정의 개시된 DLL3 ADC는 비교적 긴 생체 내 반감기를 가져서, 예기치 않게 강한 치료 지수를 제공하는 신규 투약 방식을 가능하게 하는 것으로 발견된다. 나아가, 특정 수준의 DLL3를 발현하는 종양으로 고통받는 환자는 본 명세서에 첨부된 임상적 시험 데이터에 의해 증명되는 바와 같이, 본 항체 및 ADC를 이용한 치료에 특히 수용적이다. 다른 구현예는, 종양 성장의 억제에 놀랍게 효과적인 것으로 보이는 PD-1에 대한 항체를 포함하는 특정 면역치료 화합물과 조합된 개시된 DLL3 ADC의 사용을 포함한다. 여전히 다른 구현예에서, 개시된 ADC는 동결건조된 형태로 특이한 안정성을 나타내는 것으로 발견된다. 이러한 진보는 일반적으로 개시된 조성물의 더욱 효과적인 투여 및 궁극적으로 표준 케어 치료법에 의해 제공되는 것보다 더욱 양호한 환자 결과를 위해 제공한다는 것이 이해될 것이다.
I. DLL3 생리학
DLL3 표현형 결정인자는, 신경내분비 특징을 나타내는 신생물형성(neoplasia)을 포함하는 다양한 증식성 질환과 임상적으로 관련되고, DLL3 단백질 및 변형체 또는 이의 아이소폼(isoform)이 관련 질병의 치료에 사용될 수 있는 유용한 종양 마커를 제공한다는 것이 발견되었다. 이와 관련하여, 본 발명은 항-DLL3 항체 표적제 및 페이로드(payload) (예를 들어, PBD 탄두를 포함하는 페이로드)를 포함하는 다수의 항체 약물 컨쥬게이트를 제공한다. 아래에서 더욱 상세히 논의되고 첨부된 실시예에서 설명되는 바와 같이, 개시된 항-DLL3 ADC는 종양형성 세포의 제거에 특히 효과적이며, 따라서 특정 증식성 질환 또는 그의 진전 또는 재발의 치료 및 예방에 유용하다. 추가로, 특정 개시된 ADC 조성물 (예를 들어, 위치 특이적 구조물)은, 동일 성분을 포함하는 통상의 ADC 조성물에 비교 시, 개선된 치료 지수를 제공할 수 있는 예측되지 않은 안정성 및 상대적으로 높은 DAR=2 백분율을 나타낼 수 있다. 추가적으로, 개시된 ADC는 치료 지수를 추가로 증가시킬 수 있는 신규 투약 방식의 이용을 가능하게 하는 연장된 최종 반감기를 나타낼 수 있다.
나아가, 세포 표면 DLL3 단백질과 같은 DLL3 마커 또는 결정인자는 암 줄기 세포와 치료적으로 관련되고 (또한 종양 지속 세포로서도 알려짐), 그의 제거 또는 사일런싱에 효과적으로 사용될 수 있음이 발견된다. 본 명세서에 개시된 바와 같은 항-DLL3 컨쥬게이트의 이용을 통하여 암 줄기 세포를 선택적으로 감소 또는 제거하는 능력은, 그러한 세포가 많은 통상의 치료에 대한 내성으로 일반적으로 알려져 있다는 점에서 놀라운 것이다. 즉, 전통적인 또한 더욱 최근의 표적된 치료 방법의 유효함은, 이들 다양한 치료 방법에도 불구하고 종양 성장을 지속할 수 있는 내성 암 줄기 세포의 존재 및/또는 출현에 의해 종종 제한된다. 나아가, 암 줄기 세포와 관련된 결정인자는, 낮은 또는 일관성 없는 발현, 종양형성 세포와 연관되어 유지하는 것의 실패 또는 세포 표면에 존재하는 것의 실패로 인해, 약한 치료 표적을 만든다. 선행 기술의 교시에 극명하게 대조적으로, 여기 개시된 ADC 및 방법은 이러한 고유의 내성을 효과적으로 극복하고, 구체적으로 그러한 암 줄기 세포의 분화를 제거, 고갈, 사일런싱 또는 촉진하여 이에 의해 근본적인 종양 성장을 유지 또는 재유도하는 이들의 능력을 무효화시킨다. 나아가, 본 명세서에 나타낸 바와 같이, 개시된 ADC 및 상대적으로 균질한 DAR 제조에 의해 제공된 예측되지 않은 안정성이, 특히 효과적일 수 있는 신규 투약 방식을 허용한다.
따라서, 본 명세서에 개시된 것들과 같은 DLL3 컨쥬게이트는 선택된 증식성 (예를 들어, 신생물성) 질환 또는 이의 진전 또는 재발의 치료 및/또는 예방에 유리하게 사용될 수 있다. 본 발명의 바람직한 구현예가 아래에서 광범위하게 논의될 것인 한편, 특히 특정 도메인, 영역 또는 에피토프 면에서, 또는 암 줄기 세포 또는 신경내분비 특징을 포함하는 종양 및 개시된 항체 약물 컨쥬게이트와 이들의 상호작용 맥락에서, 당업자는 본 발명의 범주가 그러한 예시적인 구현예에 의해 제한되지 않음을 이해할 것임이 이해될 것이다. 그보다는, 본 발명의 가장 확장적 구현예 및 첨부된 청구범위는 광범위하게 그리고 명확하게, 개시된 항-DLL3 컨쥬게이트, 및, 임의의 특정 작용 메커니즘 또는 특이적으로 표적된 종양, 세포 또는 분자 성분에 관계없이, 신생물형성 또는 세포 증식성 질환을 포함하는 각종 DLL3 관련 또는 매개 질환의 치료 및/또는 예방에서 이들의 사용에 관한 것이다.
초파리(Drosophila)에서, 노치(Notch) 신호화는 하나의 노치 수용체 유전자 및 세레이트(Serrate) 및 델타(Delta)로 알려진 두 개의 리간드 유전자에 의해 우선적으로 매개된다 (문헌 [Wharton et al, 1985; Rebay et al., 1991]). 인간에서는, 4 개의 알려진 노치 수용체 및 5 개의 DSL (델타-세레이트 LAG2) 리간드 (Jagged1 및 Jagged 2로 알려진, 세레이트의 두 개의 동족체, 및 델타-유사 리간드 또는 DLL1, DLL3 및 DLL4로 명명된 델타의 세 개의 동족체)가 있다. 일반적으로, 신호-수령 세포의 표면 상에서 노치 수용체는 반대의, 신호-발송 세포 (트랜스-상호작용이라 칭함)의 표면 상에서 발현된 리간드와 상호작용함으로써 활성화된다. 이들 트랜스-상호작용은 노치 수용체의 프로테아제 매개된 분열의 서열을 이끈다. 결과적으로, 노치 수용체 세포 내 도메인은 막에서 핵으로 이동이 자유로우며, 여기에서 이는 CSL 족의 전사 인자 (인간에서 RBPJ)와 짝을 이루고, 이들을 전사 억제제에서 노치 반응성 유전자의 활성화제로 전환시킨다.
인간 노치 리간드 중, DLL3는 트랜스-상호작용을 통해 노치 수용체를 활성화할 수 없는 것으로 보인다는 점에서 상이하다 (문헌 [Ladi et al., 2005]). 노치 리간드는 또한, 시스-억제의 그 정확한 메커니즘은 불명확하게 남아있으며 리간드에 따라 변화될 수 있지만, 시스(cis) 형태의 노치 수용체와 (동일 세포 상에서) 상호작용하여 노치 신호의 억제를 일으킬 수 있다 (예를 들어, 문헌 [Klein et al., 1997; Ladi et al., 2005; Glittenberg et al., 2006] 참조). 억제의 두 개의 가정된 모드는, 트랜스-상호작용을 방지함으로써, 또는 수용체의 가공을 교란함에 의해 또는 소포체 또는 골지체에서 수용체의 보유를 물리적으로 유발함에 의해 세포의 표면 상에서 노치 수용체의 양을 감소시킴으로써 세포 표면에서 노치 신호화를 변조하는 것을 포함한다 (문헌 [Sakamoto et al., 2002; Dunwoodie,2009]). 그러나, 이웃 세포 상에서 노치 수용체 및 리간드의 발현에서 추계적 상이함은 전사 및 비-전사 공정 모두를 통해 증폭될 수 있다는 것과 시스- 및 트랜스-상호작용의 미묘한 균형이 이웃하는 조직에서의 분기 세포 운명의 노치 매개된 묘사의 미세 조정을 초래할 수 있다는 것은 명백하다 (문헌 [Sprinzak et al., 2010]).
DLL3는 노치 DSL 리간드의 델타-유사 족의 원이다. 대표적인 DLL3 단백질 오솔로그 (ortholog)는 인간 (등록 번호 NP_058637 및 NP_982353), 침팬지 (등록 번호 XP_003316395), 마우스 (등록 번호 NP_031892), 및 래트 (등록 번호 NP_446118)를 포함하지만 이로 한정되지는 않는다. 인간에서, DLL3 유전자는 염색체 19q13 상에 위치된 9.5 kBp 범위의 8 개의 엑손으로 이루어진다. 최종 엑손 내 교번하는 스플라이싱(splicing)은, 2389 염기 하나 (등록 번호 NM_016941) 및 2052 염기 하나 (등록 번호 NM_203486)의 두 개의 가공된 전사물을 유발한다. 앞의 전사물은 618 아미노산 단백질 (등록 번호 NP_058637; 서열번호 1)을 암호화하는 반면, 뒤의 것은 587 아미노산 단백질 (등록 번호 NP_982353; 서열번호 2)을 암호화한다. DLL3의 이들 두 개의 단백질 아이소폼은 그의 세포외 도메인 및 그의 막관통 도메인에 걸쳐 전체 100% 동일성을 가지며, 더 긴 아이소폼이 단백질의 카르복시 말단에서 32 개의 추가 잔기를 함유하는 연장된 세포질성 꼬리를 함유한다는 점에서만 상이하다. 아이소폼들의 생물학적 관련성은 불명확하지만, 두 아이소폼 모두 종양 세포에서 검출될 수 있다.
DLL3 단백질의 세포외 영역은 6 개의 EGF-유사 도메인, 단일 DSL 도메인 및 N-말단 도메인을 포함한다. 일반적으로, EGF 도메인은, hDLL3의, 아미노산 잔기 약 216-249 (도메인 1), 274-310 (도메인 2), 312-351 (도메인 3), 353-389 (도메인 4), 391-427 (도메인 5) 및 429-465 (도메인 6)에서 나타나고, DSL 도메인은 아미노산 잔기 약 176-215 및 N-말단 도메인은 아미노산 잔기 약 27-175에서 나타나는 (서열번호 1 및 2) 것으로 인식된다. 본 명세서에서 더욱 상세하게 논의되고 아래 실시예에서 나타낸 바와 같이, EGF-유사 도메인, DSL 도메인 및 N-말단 도메인 각각은 별개의 아미노산 서열에 의해 정의된 바와 같은 DLL3 단백질의 부분을 포함한다. 본 개시 내용의 목적을 위해, 개별적인 EFG-유사 도메인은 EGF1 내지 EGF6로 명명될 수 있으며, EGF1이 단백질의 N-말단부에 가장 가까움을 유의한다. 단백질의 구조적 조성에 관하여, 본 발명의 중요한 한 양태는 개시된 DLL3 조절자(modulator)가 생성, 제작, 조작 또는 선택되어, 선택된 도메인, 모티프(motif) 또는 에피토프와 반응할 수 있다는 것이다. 특정 경우에서, 그러한 항체 또는 ADC는, 그의 1차 작용 모드에 따라 증진된 반응성 및/또는 효능을 제공할 수 있다. 특히 바람직한 구현예에서, 항-DLL3 ADC는 DSL 도메인에 결합할 것이며, 더더욱 바람직한 구현예에서, 이는 DSL 도메인 내에 G203, R205, P206 (서열번호 4)을 포함하는 에피토프에 결합할 것이다.
II. 암 줄기 세포
현 모델에 따라, 종양은 비-종양형성 세포 및 종양형성 세포를 포함한다. 비-종양형성 세포는, 과다한 세포 수로 면역손상된 마우스 내로 이식된 경우에도, 자가-갱신하는 능을 갖지 않으며, 재생적으로 종양을 형성할 수 없다. 종양형성 세포는 본 명세서에서 "종양 개시 세포" (TIC)로서도 언급되며, 이는 종양의 세포 집단의 0.1-40% (더욱 통상적으로 0.1-10% 또는 0.01-1.0%)를 구성하고, 종양을 형성하는 능력을 갖는다. 종양형성 세포는 암 줄기 세포 (CSC)로서도 상호교환가능하게 언급되는 종양 지속 세포 (TPC) 및 종양 전구(progenitor) 세포 (TProg)를 모두 포함한다.
CSC는, 정상 조직 내에서 세포의 계층을 지지하는 정상 줄기 세포와 같이, 다중계통 분화능을 유지하면서 무기한적으로 자가-복제할 수 있다. 이와 관련하여, CSC는 종양형성성 자손 및 비-종양형성성 자손 모두를 생성할 수 있고, 연속 분리 및 적은 수의 분리된 CSC의 면역손상된 마우스 내로의 이식에 의해 증명되는 바와 같이 부모 종양의 이질성 세포 조성을 완전히 재현할 수 있다. 이들 "시드 세포"가 제거되지 않는 경우, 종양은 더욱 전이 또는 재발생할 가능성이 있어 질병의 재발 및 궁극적인 진전을 일으킬 수 있음을 표시하는 증거가 있다.
TProg는 CSC처럼 일차 이식에서 종양 성장을 촉진시키는(fuel) 능력을 갖는다. 그러나, CSC와 달리, 이들은 부모 종양의 세포 이질성을 재현할 수 없으며, 이후의 이식에서 종양형성을 재개시하는 데 있어 덜 효율적인데, 이는 고도로 정제된 적은 수의 TProg의 면역손상된 마우스 내로의 순차적 이식에 의해 증명되는 바와 같이 TProg는 통상적으로 유한한 횟수의 세포 분열만이 가능하기 때문이다. TProg는 초기 TProg 및 후기 Tprog로 추가로 분류될 수 있으며, 이는 표현형 (예를 들어, 세포 표면 마커) 및 이들의 종양 세포 건축을 재현하는 상이한 능력에 의해 구분될 수 있다. 종양을 CSC와 동일한 정도로 재현할 수 없지만, 초기 TProg는 후기 TProg보다 부모 종양의 특징을 재현하는 더욱 큰 능력을 갖는다. 상기 구분에도 불구하고, 일부 TProg 집단은 드문 경우에, 정상적으로는 CSC에 속한 자가-갱신 능력을 획득할 수 있고, 그 자신이 CSC가 될 수 있는 것으로 나타난다.
CSC는 더욱 높은 종양형성성을 나타내며, (i) TProg (초기 및 후기 TProg 모두); 및 (ii) CSC로부터 유도될 수 있고 통상적으로 종양 덩어리를 포함하는 종양-침투 세포, 예를 들어 섬유아세포/기질, 내피 및 조혈 세포와 같은 비-종양형성 세포에 비교하여 더욱 잠잠하다. 통상의 치료법 및 섭생은 대부분 종양을 감량시키고(debulk) 신속하게 증식하는 세포를 공격하도록 설계됨을 고려하면, CSC는 통상의 치료법 및 섭생에 대해, 보다 빠른 증식 TProg 및 비-종양형성 세포와 같은 기타 벌크 종양 세포 집단보다 더욱 내성이다. CSC를 통상의 치료법에 대해 상대적으로 화학치료법내성으로 만들 수 있는 기타 특징은 다중-약물 내성 운반체의 증가된 발현, 증진된 DNA 보수 메커니즘 및 항-세포사멸 유전자 발현이다. 그러한 CSC 특성은, 표준 화학치료법이 계속된 종양 성장 및 재발을 실제로 촉진하는 CSC를 효과적으로 표적하지 않음에 따라, 표준 치료 섭생의 실패에 연루되어 진행된 단계의 신생물 형성을 갖는 환자에서 지속적인 반응을 제공한다. 종양 성장을 전파하고 개시된 화합물 및 조성물을 퍼뜨리는 이들 시드 세포의 능력을 억제 또는 제거함으로써
DLL3 발현은 각종 종양형성 세포 부차집단과, 이들이 본 명세서에 설명된 바와 같은 치료에 감수성 있게 만드는 방식으로 연관된다는 것이 놀랍게도 발견되었다. 본 발명은 종양형성 세포를 표적하는 데 특히 유용할 수 있고, 종양형성 세포를 사일런스, 민감화, 중화, 빈도 감소, 차단, 폐지, 방해, 감소, 저해, 제지, 제어, 고갈, 완화, 매개, 축소, 재프로그램화, 제거, 사멸 또는 다르게는 억제 (종합적으로 "억제")하는 데 사용될 수 있는 항-DLL3 항체를 제공하여, 증식성 질환 (예를 들어 암)의 치료, 관리 및/또는 예방을 촉진한다. 유리하게는, 본 발명의 신규 항-DLL3 항체는, 이들이 바람직하게는 DLL3 결정 인자의 형태 (예를 들어, 표현형 또는 유전자형)에 관계없이 대상체에 투여 시 종양형성 세포의 빈도 또는 종양형성성을 감소시키도록 선택될 수 있다. 종양형성 세포 빈도에서의 감소는 (i) 종양형성 세포의 억제 또는 근절; (ii) 종양형성 세포의 성장, 확장 또는 재발의 제어; (iii) 종양형성 세포의 개시, 전파, 유지 또는 증식의 방해; 또는 (iv) 다르게는 종양형성 세포의 생존, 재생 및/또는 전이의 저해에 의한 결과로서 일어날 수 있다. 일부 구현예에서, 종양형성 세포의 억제는 하나 이상의 생리학적 경로에서 변화를 결과로서 일으킬 수 있다. 종양형성 세포의 저해, 그의 (예를 들어, 유도된 분화 또는 틈새 붕괴에 의한) 잠재력의 변경 또는 다르게는 종양형성 세포가 종양 환경 또는 기타 세포에 영향을 미치는 능력의 방해에 의한 것인지의 여부에 관계없이, 경로에서의 변화는 종양형성, 종양 유지 및/또는 전이 및 재발을 억제함으로써 DLL3 관련 질환의 더욱 효과적인 치료를 가능하게 한다. 개시된 항체의 동일한 특징은 이들을 표준 치료 섭생에 대해 내성 또는 난치성을 입증한 재발성 종양 치료에서 특히 효과적으로 만든다는 것이 추가로 이해될 것이다.
종양형성 세포의 빈도에서의 감소를 평가하기 위해 사용될 수 있는 방법은, 바람직하게는 시험관 내 또는 생체 내 제한 희석 분석에 의한, 혈구계산 또는 면역조직화학적 분석을 포함하지만 이에 한정되지는 않는다 (문헌 [Dylla et al. 2008, PMID: PMC2413402 및 Hoey et al. 2009, PMID: 19664991]).
시험관 내 제한 희석 분석은 분별된 또는 분별되지 않은 종양 세포 (예를 들어, 각각 처리 및 미처리된 종양)를 콜로니 형성을 조성하는 고체 매질 상에서 배양하고, 성장하는 콜로니들을 계수하고 특징화함으로써 수행될 수 있다. 대안적으로, 종양 세포는 액체 매질을 담은 웰이 있는 플레이트 상에 순차 희석될 수 있으며, 각각의 웰은 접종 후 임의의 시기에, 그러나 바람직하게는 접종 후 10 일 초과 후에 콜로니 형성에 대해 양성 또는 음성으로 스코어될 수 있다.
생체 내 제한 희석은 미처리된 대조군 또는 선택된 치료제에 노출된 종양 중 어느 하나로부터의 종양 세포를 면역손상된 마우스 내로 순차 희석하여 이식하고, 이어서 각각의 마우스를 종양 형성에 대하여 양성 또는 음성으로 스코어매김으로써 수행된다. 스코어매김은 이식된 종양이 검출되는 이후의 임의의 시간에 할 수 있지만 바람직하게는, 이식 후 60 일 이상 되었을 때 수행된다. 종양형성 세포의 빈도를 결정하기 위한 제한 희석 실험의 결과 분석은 바람직하게는 프와송 분포 통계를 이용하거나 생체 내에서 종양을 생성하거나 하지 않는 능력과 같은 예정된 결정적 이벤트의 빈도를 평가함으로써 수행된다 (문헌 [Fazekas et al., 1982, PMID: 7040548]).
유세포분석 및 면역조직화학은 종양형성 세포 빈도를 결정하는 데 사용될 수도 있다. 두 기술 모두 당 분야에서 종양형성 세포에 대해 풍부한 것으로 알려진 인식된 세포 표면 단백질 또는 마커에 결합하는 하나 이상의 항체 또는 시약을 사용한다 (WO 2012/031280 참조). 당 분야에서 알려진 바와 같이, 유세포분석 (예를 들어, 형광 활성 세포 분류 (FACS)) 또한 종양형성 세포를 포함하는 각종 세포 집단의 특징화, 분리, 정제, 풍부화 또는 분류에 사용할 수 있다. 유세포분석은, 세포의 혼합된 집단이 현탁된 유체 스트림을, 초당 수천 개에 달하는 입자들의 물리적 및/또는 화학적 특징을 측정할 수 있는 전자 검출 장치에 통과시킴으로써 종양형성 세포 수준을 측정한다. 면역조직화학은 조직 샘플을 종양형성 세포 마커에 결합하는 시약 또는 라벨된 항체로 염색함으로써 원 위치에서 (예를 들어, 조직 부분에서) 종양형성 세포의 시각화를 가능하게 한다는 점에서 추가의 정보를 제공한다.
이와 같이, 본 발명의 항체는, 예를 들어 유세포분석, 자기 활성된 세포 분류 (MACS), 레이저 매개 구획화 또는 FACS와 같은 방법을 통하여, 종양형성 세포의 집단 또는 부차집단을 동정, 특징화, 모니터링, 분리, 구역화 또는 풍부화하는 데에 유용할 수 있다. FACS는 특이적 세포 표면 마커에 기초하여 99.5% 초과의 세포 부차집단을 분리하는 데 사용되는 신뢰성 있는 방법이다. CSC를 포함하는 종양형성 세포의 특징화 및 조작을 위한 다른 상용가능한 기술은 예를 들어, U.S.P.N. 12/686,359, 12/669,136 및 12/757,649에서 볼 수 있다.
CSC 집단과 연관되고, CSC를 분리 또는 특징화하는 데 사용되는 마커들이 아래 열거된다: ABCA1, ABCA3, ABCG2, ADAM9, ADCY9, ADORA2A, AFP, AXIN1, B7H3, BCL9, Bmi-1, BMP-4, C20orf52, C4.4A, 카르복시펩티다제 M, CAV1, CAV2, CD105, CD133, CD14, CD16, CD166, CD16a, CD16b, CD2, CD20, CD24, CD29, CD3, CD31, CD324, CD325, CD34, CD38, CD44, CD45, CD46, CD49b, CD49f, CD56, CD64, CD74, CD9, CD90, CEACAM6, CELSR1, CPD, CRIM1, CX3CL1, CXCR4, DAF, 데코린, easyh1, easyh2, EDG3, eed, EGFR, ENPP1, EPCAM, EPHA1, EPHA2, FLJ10052, FLVCR, FZD1, FZD10, FZD2, FZD3, FZD4, FZD6, FZD7, FZD8, FZD9, GD2, GJA1, GLI1, GLI2, GPNMB, GPR54, GPRC5B, IL1R1, IL1RAP, JAM3, Lgr5, Lgr6, LRP3, LY6E, MCP, mf2, mllt3, MPZL1, MUC1, MUC16, MYC, N33, Nanog, NB84, 네스틴, NID2, NMA, NPC1, 온코스타틴 M, OCT4, OPN3, PCDH7, PCDHA10, PCDHB2, PPAP2C, PTPN3, PATIENTS, RARRES1, SEMA4B, SLC19A2, SLC1A1, SLC39A1, SLC4A11, SLC6A14, SLC7A8, smarcA3, smarcD3, smarcE1, smarcA5, Sox1, STAT3, STEAP, TCF4, TEM8, TGFBR3, TMEPAI, TMPRSS4, 트랜스페린 수용체, TrkA, WNT10B, WNT16, WNT2, WNT2B, WNT3, WNT5A, YY1 및 β-카테닌. 예를 들어, 문헌 [Schulenburg et al., 2010, PMID: 20185329], U.S.P.N. 7,632,678 및 U.S.P.N. 2007/0292414, 2008/0175870, 2010/0275280, 2010/0162416 및 2011/0020221 참조.
유사하게, 특정 종양 유형의 CSC과 관련된 세포 표면 표현형의 비제한적인 예는 CD44hiCD24low, ALDH+, CD133+, CD123+, CD34+CD38-, CD44+CD24-, CD46hiCD324+CD66c-, CD133+CD34+CD10-CD19-, CD138-CD34-CD19+, CD133+RC2+, CD44+α2β1 hiCD133+, CD44+CD24+ESA+, CD271+, ABCB5+ 및 당 분야에 알려진 기타 CSC 표면 표현형을 포함한다. 예를 들어, 문헌 [Schulenburg et al., 2010, supra,Visvader et al., 2008, PMID: 18784658] 및 U.S.P.N. 2008/0138313 참조. 본 발명과 관련되어, CD46hiCD324+ 표현형을 포함하는 CSC 제제가 특히 유리하다.
마커 또는 마커 표현형에 적용되는 바와 같은 "양성", "낮음" 및 "음성" 이라는 표현 수준은 아래와 같이 정의된다. 음성 표현을 갖는 세포 (즉, "-")는, 추가의 형광 발광 채널에서 기타 관심 대상의 단백질에 대한 완전한 항체 염색 칵테일 라벨링 존재 하에서 형광 채널 내 아이소타입 대조구 항체를 이용하여 관찰된 발현의 95 번째 백분위수 이하를 발현하는 세포로서 본 명세서에서 정의된다. 당업자는 음성 이벤트를 정의하기 위한 이러한 절차가 "형광 마이너스 일", 또는 "FMO" 염색으로서 지칭됨을 이해할 것이다. 상기 기재된 FMO 염색 절차를 이용하여 아이소타입 대조구 항체를 이용하여 관찰된 발현의 95 번째 백분위수보다 큰 발현을 갖는 세포는 본 명세서에서 "양성" (즉, "+")으로서 정의된다. 본 명세서에서 정의된 바와 같이, "양성"으로서 광범위하게 정의된 세포의 각종 집단이 존재한다. 항원의 평균 관찰된 발현이 상기 기재된 바와 같은 아이소타입 대조구 항체를 이용한 FMO 염색을 이용하여 결정된 95 번째 백분위수를 초과하는 경우, 세포는 양성으로 정의된다. 평균 관찰된 발현이 FMO 염색에 의해 결정된 95 번째 백분위수를 초과하고, 95 번째 백분위수의 1의 표준 편차 내에 존재하는 경우, 양성 세포는 저발현 (즉, "lo")을 갖는 세포로 칭해질 수 있다. 그렇지 않으면, 평균 관찰된 발현이 FMO 염색에 의해 결정된 95 번째 백분위수를 초과하고, 95 번째 백분위수 초과에서 1의 표준 편차보다 큰 경우, 양성 세포는 고발현 (즉, "hi")을 갖는 세포로 칭해질 수 있다. 다른 구현예에서, 99 번째 백분위수는 음성 및 양성 FMO 염색간의 경계점으로서 바람직하게 사용될 수 있으며, 일부 구현예에서, 백분위수는 99% 초과일 수 있다.
CD46hiCD324+마커 표현형 및 바로 위에서 예시된 것들은 표준 유세포 분석 및 세포 분류 기술과 함께 사용되어, 추가의 분석을 위해 TIC 및/또는 TPC 세포 또는 세포 집단을 특징화, 분리, 정제 또는 풍부화할 수 있다.
본 발명의 항체의 종양형성 세포의 빈도를 감소시키는 능력은, 따라서 상기 기재된 기술 및 마커를 이용하여 결정될 수 있다. 일부 경우에서, 항-DLL3 항체는 종양형성 세포의 빈도를 10%, 15%, 20%, 25%, 30% 또는 심지어는 35% 감소시킬 수 있다. 다른 구현예에서, 종양형성 세포의 빈도에서의 감소는 순서대로 약 40%, 45%, 50%, 55%, 60% 또는 65%일 수 있다. 특정 구현예에서, 개시된 화합물은 종양형성 세포의 빈도를 70%, 75%, 80%, 85%, 90% 또는 심지어 95% 감소시킬 수 있다. 종양형성 세포의 빈도의 임의의 감소는 신생물형성의 종양형성성, 지속성, 재발 및 공격성에서 상응하는 감소를 초래하기 쉽다는 것이 이해될 것이다.
III. 항체
A. 항체 구조
항체 및 그의 변이체 및 유도체(허용된 명명법 및 번호부여 시스템 포함)는, 광범위하게 기재되어 있다(예를 들어, 문헌 [Abbas et al. (2010), Cellular and Molecular Immunology (6th Ed.), W.B. Saunders Company; 또는 Murpheyetal. (2011), Janeway's Immunobiology (8th Ed.), Garland Science]).
"항체" 또는 "무손상 항체"는 통상적으로, 공유 디술피드 결합 및 비-공유 상호작용에 의해 함께 합쳐진 2 개의 중쇄(H) 및 2 개의 경쇄(L) 폴리펩티드 사슬을 포함하는 Y형 사량체 단백질을 지칭한다. 각각의 경쇄는 1 개의 가변 도메인(VL) 및 1 개의 불변 도메인(CL)으로 구성된다. 각각의 중쇄는 1 개의 가변 도메인(VH) 및 IgG, IgA, 및 IgD 항체의 경우, CH1, CH2, 및 CH3이라 불리는 3 개의 도메인을 포함하는(IgM 및 IgE는 제4 도메인, CH4를 가짐) 불변 영역을 포함한다. IgG, IgA, 및 IgD 부류에서, CH1 및 CH2 도메인은, 가변 길이(다양한 IgG 하위부류에서 약 10 개 내지 약 60 개의 아미노산)를 갖는 프롤린 및 시스테인 풍부 세그먼트는 유연성 힌지 영역에 의해 분리된다. 경쇄 및 중쇄 둘 다에서 가변 도메인은 약 12 개 이상의 아미노산의 "J" 영역에 의해 불변 도메인에 연결되고, 중쇄는 또한 약 10 개의 추가의 아미노산의 "D" 영역을 갖는다. 항체의 각각의 부류는 쌍을 이룬 시스테인 잔기에 의해 형성된 사슬간 및 사슬내 디술피드 결합을 추가로 포함한다.
본원에서 사용되는 바와 같이 용어 "항체"는 폴리클로날 항체, 멀티클로날 항체, 모노클로날 항체, 키메라 항체, 인간화된 및 영장류화된 항체, CDR 그래프팅된 항체, 인간 항체(재조합 생성된 인간 항체 포함), 재조합 생성된 항체, 세포내항체, 다중특이적 항체, 이중특이적 항체, 1가 항체, 다가 항체, 항유전자형 항체, 합성 항체(이들의 돌연변이 단백질 및 변이체 포함), 면역특이적 항체 단편, 예컨대 Fd, Fab, F(ab')2, F(ab') 단편, 단일쇄 단편(예를 들어, ScFv 및 ScFvFc); 및 Fc 융합 및 기타 다른 변형을 포함하는 이들의 유도체, 및 결정인자와의 우세한 회합 또는 결합을 나타내는 한 임의의 기타 다른 면역반응성 분자를 포함한다. 또한, 문맥적 제약에 의해 달리 언급되지 않는 한 상기 용어는 항체의 모든 부류(즉, IgA, IgD, IgE, IgG, 및 IgM) 및 모든 하위부류(즉, IgG1, IgG2, IgG3, IgG4, IgA1, 및 IgA2)를 추가로 포함한다. 상이한 부류의 항체에 상응하는 중쇄 불변 도메인은 통상적으로 각각 상응하는 소문자 그리스문자 α, δ, ε, γ, 및 μ로 나타내어진다. 임의의 척추동물 종으로부터 항체의 임의의 경쇄는, 이들의 불변 도메인의 아미노산 서열에 기초하여, 카파(κ) 및 람다(λ)라 불리는 두가지 명백히 별개의 유형 중 하나로 배정될 수 있다.
항체의 가변 도메인은 하나의 항체로부터 또 다른 항체까지 아미노산 조성의 상당한 변화를 나타내고, 이는 주로 항원 인식 및 결합에 대한 원인이 된다. 각각의 경쇄/중쇄 쌍의 가변 영역은, 무손상 IgG 항체가 2 개의 결합 자리를 갖도록 하는 항체 결합 자리를 형성한다(즉, 이는 2가임). VH 및 VL 도메인은, 골격 영역(FR)으로서 공지된 4 개의 보다 덜 가변성인 영역에 의해 프레임화되고 분리된, 극심한 가변성을 갖는 3 개의 영역(이들은 초가변 영역이라 불림), 또는 보다 통상적으로는, 상보성-결정 영역(CDR)을 포함한다. VH와 VL 영역 사이의 비-공유 회합은 항체의 2 개의 항원-결합 자리 중 하나를 함유하는 Fv 단편("가변성 단편")을 형성한다. 유전 공학에 의해 얻어질 수 있는 ScFv 단편(가변성 단일쇄 단편)은 단일 폴리펩티드 사슬 내에서 회합되고, 여기서 항체의 VH 및 VL 영역은 펩티드 링커에 의해 분리된다.
본원에서 사용되는 바와 같이 각각의 도메인, 골격 영역 및 CDR로의 아미노산의 배정은, 달리 언급되지 않는 한, 문헌 [Kabat et al. (1991) Sequences of Proteins of Immunological Interest (5th Ed.), US Dept. of Health and HumanServices,PHS, NIH, NIH Publicationno.91-3242]; [Chothia et al., 1987, PMID: 3681981]; [Chothia et al., 1989, PMID: 2687698]; [McCallum et al.,1996, PMID: 8876650]; 또는 [Dubel, Ed. (2007) Handbook of Therapeutic Antibodies, 3rd Ed., Wily-VCH Verlag GmbH and Co or AbM (Oxford Molecular/MSI Pharmacopia)]에 의해 제공되는 체계 중 하나에 따를 수 있다. 당 분야에서 공지된 바와 같이, 가변 영역 잔기 넘버링은 Chothia 또는 Kabat에 통상적으로 설명된 바와 같다. Abysis 웹사이트 데이터베이스 (하기 참조)로부터 수득되는 바와 같은 Kabat, Chothia, MacCallum (Contact로서도 알려짐) 및 AbM에 의해 정의된 바와 같은 CDR을 포함하는 아미노산 잔기를 아래 표 1에 나타낸다. MacCallum은 Chothia 넘버링 체계를 이용함에 유의한다.
Kabat | Chothia | MacCallum | AbM | |
VH CDR1 | 31-35 | 26-32 | 30-35 | 26-35 |
VH CDR2 | 50-65 | 52-56 | 47-58 | 50-58 |
VH CDR3 | 95-102 | 95-102 | 93-101 | 95-102 |
VL CDR1 | 24-34 | 24-34 | 30-36 | 24-34 |
VL CDR2 | 50-56 | 50-56 | 46-55 | 50-56 |
VL CDR3 | 89-97 | 89-97 | 89-96 | 89-97 |
항체 서열에서 가변 영역 및 CDR은, 당업계에서 개발된 일반적 법칙에 따라(상기에 기재된 바와 같음, 예컨대 카바트 명명법 시스템) 또는 공지된 가변 영역의 데이터베이스에 대하여 서열을 정렬시킴으로써 식별될 수 있다. 이들 영역의 식별 방법은 문헌 [Kontermann and Dubel,eds.,Antibody Engineering, Springer, New York, NY, 2001] 및 [Dinarello et al., CurrentProtocolsin Immunology, John Wiley and Sons Inc., Hoboken, NJ, 2000]에 기재되어 있다. 항체 서열의 예시적 데이터베이스는, www.bioinf.org.uk/abs의 "아비시스" 웹사이트(마틴(A.C. Martin)(Department of Biochemistry & Molecular Biology University College London; 영국 런던)에 의해 유지됨) 및 www.vbase2.org의 VBASE2 웹사이트(문헌 [Retter et al., Nucl.AcidsRes., 33 (Database issue): D671 -D674 (2005)]에 기재됨)에 기재되어 있고, 이를 통해 접근될 수 있다. 바람직하게는 서열은, 카바트, IMGT 및 단백질 데이터 뱅크(PDB)로부터의 서열 데이터를 PDB으로부터의 구조 데이터와 통합하는 아비시스 데이터베이스를 사용하여 분석된다. 문헌 [Dr. Andrew C. R. Martin's book chapter Protein Sequence and Structure Analysis of Antibody Variable Domains. In: Antibody Engineering Lab Manual (Ed.: Duebel,S.and Kontermann, R., Springer-Verlag, Heidelberg, ISBN-13: 978-3540413547, 웹사이트 bioinforg.uk/abs 상에서도 이용가능함)] 참조. 아비시스 데이터베이스 웹사이트는 추가로, 본원의 교시내용에 따라 사용될 수 있는 CDR의 식별을 위해 개발된 일반적 법칙을 포함한다. 달리 기재되지 않는 한, 본원에 기재된 모든 CDR은 카바트 등에 따른 아비시스 데이터베이스 웹사이트에 따라 유래된 것이다.
본 발명에서 논의된 중쇄 불변 영역 아미노산 위치에 대하여, 번호부여는, 보고에 따르면 최초 인간 IgG1 서열화된 골수종 단백질 Eu의아미노산 서열을 기재하는 문헌 [Edelman et al., 1969, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 63(1): 78-85]에 최초로 기재된 Eu인덱스에 따른다. 에델만(Edelman)의 Eu인덱스는 또한 카바트 등의 1991년 문헌(상기 참조)에 기재되어 있다. 따라서, 중쇄와 관련하여 용어 "카바트에 기재된 Eu인덱스" 또는 "카바트의 Eu인덱스" 또는 "Eu 인덱스" 또는 "Eu 번호부여"는 카바트 등의 1991년 문헌(상기 참조)에 기재된 에델만 등의 인간 IgG1 Eu항체에 기초한 잔기 번호부여 시스템을 지칭한다. 경쇄 불변 영역 아미노산 서열에 사용되는 번호부여 시스템도 카바트 등의 문헌(상기 참조)에 유사하게 기재되어 있다. 본 발명과 상용성인 예시적 카파 경쇄 불변 영역 아미노산 서열을 하기에 기재하였다.
RTVAAPSVFIFPPSDEQLKSGTASVVCLLNNFYPREAKVQWKVDNALQSGNSQESVTEQDSKDSTYSLSSTLTLSKADYEKHKVYACEVTHQGLSSPVTKSFNRGEC (서열번호 5).
유사하게, 본 발명에 상용가능한 예시적인 IgG1 중쇄 불변 영역 아미노산 서열이 바로 아래에 설명된다:
ASTKGPSVFPLAPSSKSTSGGTAALGCLVKDYFPEPVTVSWNSGALTSGVHTFPAVLQSSGLYSLSSVVTVPSSSLGTQTYICNVNHKPSNTKVDKKVEPKSCDKTHTCPPCPAPELLGGPSVFLFPPKPKDTLMISRTPEVTCVVVDVSHEDPEVKFNWYVDGVEVHNAKTKPREEQYNSTYRVVSVLTVLHQDWLNGKEYKCKVSNKALPAPIEKTISKAKGQPREPQVYTLPPSRDELTKNQVSLTCLVKGFYPSDIAVEWESNGQPENNYKTTPPVLDSDGSFFLYSKLTVDKSRWQQGNVFSCSVMHEALHNHYTQKSLSLSPG (서열번호 6).
개시된 불변 영역 서열, 또는 당 분야에 알려진 이의 변형체 또는 유도체는 표준 분자 생물학 기술을 이용하여 개시된 중쇄 및 경쇄 가변 영역과 작동적으로 연결되어, 그와 같이 사용될 수 있거나 본 발명의 항-DLL3 ADC 내에 혼입될 수 있는 전장 항체를 제공할 수 있다. 이와 관련하여, 예시의 목적을 위해, 예시적인 항체 hSC16.56에 대한 전장 중쇄 (서열번호 7) 및 경쇄 (서열번호 8) 아미노산 서열이 바로 아래에 설명된다:
QVQLVQSGAEVKKPGASVKVSCKASGYTFTNYGMNWVRQAPGQGLEWMGWINTYTGEPTYADDFKGRVTMTTDTSTSTAYMELRSLRSDDTAVYYCARIGDSSPSDYWGQGTLVTVSSASTKGPSVFPLAPSSKSTSGGTAALGCLVKDYFPEPVTVSWNSGALTSGVHTFPAVLQSSGLYSLSSVVTVPSSSLGTQTYICNVNHKPSNTKVDKKVEPKSCDKTHTCPPCPAPELLGGPSVFLFPPKPKDTLMISRTPEVTCVVVDVSHEDPEVKFNWYVDGVEVHNAKTKPREEQYNSTYRVVSVLTVLHQDWLNGKEYKCKVSNKALPAPIEKTISKAKGQPREPQVYTLPPSRDELTKNQVSLTCLVKGFYPSDIAVEWESNGQPENNYKTTPPVLDSDGSFFLYSKLTVDKSRWQQGNVFSCSVMHEALHNHYTQKSLSLSPG (서열번호 7).
EIVMTQSPATLSVSPGERATLSCKASQSVSNDVVWYQQKPGQAPRLLIYYASNRYTGIPARFSGSGSGTEFTLTISSLQSEDFAVYYCQQDYTSPWTFGQGTKLEIKRTVAAPSVFIFPPSDEQLKSGTASVVCLLNNFYPREAKVQWKVDNALQSGNSQESVTEQDSKDSTYSLSSTLTLSKADYEKHKVYACEVTHQGLSSPVTKSFNRGEC (서열번호 8).
본 발명의 항체 또는 면역글로불린 (및 ADC)는 임의의 DLL3 결정인자를 특이적으로 인식하거나 그와 연결되는 항체로부터 발생될 수 있다는 것이 이해될 것이다. 본 명세서에서 사용된 바와 같은 "결정인자" 또는 "표적"은, 특정 세포, 세포 집단 또는 조직과 확인가능하게 연결되거나, 또는 그 안에서 또는 그 위에서 특이적으로 발견되는 임의의 검출가능한 형질, 특성, 마커 또는 인자를 의미한다. 결정인자 또는 표적은 본래 형태학적, 작용적 또는 생화학적일 수 있으며, 바람직하게는 표현형이다. 일부 구현예에서, 결정인자는 특정 조건 (예를 들어, 특정 틈새에서의 세포 또는 세포 사이클의 특이적 지점 동안) 하에서 특이적 세포 유형 또는 세포에 의해 상이하게 발현되는 (과잉발현 또는 저하발현(under-expression)) 단백질이다. 본 발명의 목적을 위하여, 결정인자는 바람직하게는 이상 암세포 상에서 별도로 발현되고, DLL3 단백질, 또는 이의 스플라이스 변형체, 아이소폼, 동족체 또는 패밀리 멤버 중 임의의 것, 또는 이의 특이적 도메인, 영역 또는 에피토프를 포함할 수 있다. "항원", "면역원성 결정인자", "항원성 결정인자" 또는 "면역원"은, 면역적격 동물 내로 도입된 경우 면역 반응을 자극할 수 있고, 면역 반응으로부터 생산된 항체에 의해 인식되는 임의의 단백질 또는 이의 임의의 단편, 영역 또는 도메인을 의미한다. 본 명세서에서 고려되는 DLL3 결정인자의 존재 또는 부재는 세포, 세포 부차집단 또는 조직 (예를 들어, 종양, 종양형성 세포 또는 CSC)을 확인하는 데 사용될 수 있다.
면역글로불린 분자 내에는 두가지 유형의 디술피드 브릿지 또는 결합: 사슬간 및 사슬내 디술피드 결합이 존재한다. 널리 공지된 바와 같이, 사슬간 디술피드 결합의 위치 및 수는 면역글로불린 부류 및 종에 따라 달라진다. 본 발명은 임의의 특정 부류 또는 하위부류의 항체로 제한되지 않지만, 예시 목적을 위해 본 개시내용 전반에 걸쳐 IgG1 면역글로불린이 사용될 것이다. 야생형 IgG1 분자에서는, 12 개의 사슬내 디술피드 결합(4 개는 각각의 중쇄 상에, 또한 2 개는 각각의 경쇄 상에) 및 4 개의 사슬간 디술피드 결합이 존재한다. 사슬내 디술피드 결합은 일반적으로 어느 정도 보호되고, 사슬간 결합에 비해 환원에 대해 비교적 덜 민감하다. 역으로, 사슬간 디술피드 결합은 면역글로불린의 표면 상에 위치하고, 용매에 접근가능하며, 통상적으로 비교적 쉽게 환원된다. 2 개의 사슬간 디술피드 결합이 중쇄 사이에 존재하고, 각각의 중쇄로부터의 것이 그의 각각의 경쇄에 대하여 존재한다. 사슬간 디술피드 결합은 회합에 있어 필수적이지 않음이 입증되었다. IgG1 힌지 영역은, Fab 운동을 용이하게 하는 유연성과 함께 구조적 지지를 제공하는, 사슬간 디술피드 결합을 형성하는 중쇄 내 시스테인을 함유한다. 증쇄/중쇄 IgG1 사슬간 디술피드 결합은 잔기 C226 및 C229(Eu 번호부여)에 존재하며, IgG1의 경쇄와 중쇄 사이의 IgG1 사슬간 디술피드 결합(중쇄/경쇄)은 카파 또는 람다 경쇄의 C214와 중쇄의 상부 힌지 영역의 C220 사이에 형성된다.
B. 항체 생성 및 제조
본 발명의 항체는 당업계에 공지된 각종 방법을 사용하여 생성될 수 있다.
1. 숙주 동물에서의 폴리클로날 항체의 생성
다양한 숙주 동물에서의 폴리클로날 항체의 생성은 당업계에 널리 공지되어 있다(예를 들어, 문헌 [Harlow and Lane (Eds.) (1988) Antibodies: A Laboratory Manual, CSH Press]; 및 [Harlow et al. (1989) Antibodies, NY, Cold Spring Harbor Press] 참조). 폴리클로날 항체를 생성하기 위해, 면역적격 동물(예를 들어, 마우스, 래트, 토끼, 염소, 비-인간 영장류 등)을 항원 단백질 또는 항원 단백질을 포함하는 세포 또는 제조물로 면역화한다. 일정 기간 후, 폴리클로날 항체-함유 혈청을 동물의 출혈 또는 희생에 의해 얻는다. 혈청은 동물로부터 얻은 형태로 사용할 수 있거나, 또는 항체를 부분 또는 완전 정제하여 면역글로불린 분획 또는 단리된 항체 제조물을 얻을 수 있다.
임의의 형태의 항원, 또는 항원을 함유하는 세포 또는 제조물을 사용하여 결정인자에 대해 특이적인 항체를 생성할 수 있다. 용어 "항원"은 광범위한 의미로 사용되고, 단일 에피토프, 다중 에피토프, 단일 또는 다중 도메인 또는 전체 세포외 도메인(ECD)을 포함하는 선택된 표적의 임의의 면역성 단편 또는 결정인자를 포함할 수 있다. 항원은 단리된 전장 단백질, 세포 표면 단백질(예를 들어, 표면 상에서 항원의 적어도 일부를 발현하는 세포로 면역화됨), 또는 가용성 단백질(예를 들어, 단백질의 단지 ECD 부분으로 면역화됨)일 수 있다. 항원은 유전적으로 변형된 세포에서 생성될 수 있다. 상기 언급된 항원 중 임의의 것이 단독으로 또는 당업계에 공지된 하나 이상의 면역성 증대 애주번트와 조합되어 사용될 수 있다. 항원을 코딩하는 DNA는 게놈형 또는 비-게놈형(예를 들어, cDNA)일 수 있고, 이는 면역 반응을 유도하기에 충분한 ECD의 적어도 일부를 코딩할 수 있다. 아데노바이러스 벡터, 렌티바이러스 벡터, 플라스미드, 및 비-바이러스 벡터, 예컨대 양이온성 지질을 포함하나 이에 제한되지는 않는 임의의 벡터를 사용하여 항원이 발현되는 세포를 형질전환시킬 수 있다.
2. 모노클로날 항체
선택된 구현예에서, 본 발명은 모노클로날 항체의 사용을 고려한다. 당 기술분야에 알려진 바와 같이, 용어 "모노클로날 항체" 또는 "mAb"는 실질적으로 균질한 항체의 개체군으로부터 얻어진 항체를 지칭하며, 즉 개체군을 구성하는 개개의 항체는 미량으로 존재할 수 있는 가능한 돌연변이(예를 들어, 천연 돌연변이)를 제외하고는 동일하다.
모노클로날 항체는 하이브리도마 기법, 재조합 기법, 파지 디스플레이 기법, 트랜스제닉 동물(예를 들어, 제노마우스(XenoMouse)®) 또는 이들의 조합을 포함하는 당 기술분야에 알려진 매우 다양한 기법을 사용하여 제조될 수 있다. 예를 들어, 모노클로날 항체는, 문헌 [An, Zhigiang (ed.) Therapeutic Monoclonal Antibodies: From Bench to Clinic, John Wiley and Sons, 1st ed. 2009]; [Shire et. al. (eds.) CurrentTrendsin Monoclonal Antibody Development and Manufacturing, Springer Science + BusinessMediaLLC, 1st ed. 2010]; [Harlow et al., Antibodies: A Laboratory Manual, Cold Spring Harbor Laboratory Press, 2nd ed. 1988]; [Hammerling, et al., in: Monoclonal Antibodies and T-Cell Hybridomas 563-681 (Elsevier, N.Y., 1981)]에 보다 상세히 기재된 바와 같은 하이브리도마 및 생화학 및 유전 공학 기법을 사용하여 생성될 수 있다. 결정인자에 특이적으로 결합되는 다중 모노클로날 항체의 생산에 따라, 특히 효과적인 항체는, 예를 들어, 내재화의 속도 또는 결정인자에 대한 그의 친화성에 기초하여, 다양한 스크리닝 방법을 통해 선택될 수 있다. 본원에 기재된 바와 같이 생성된 항체는 "공급원" 항체로서 사용될 수 있고, 이는, 예를 들어, 표적에 대한 친화성의 개선, 세포 배양에서의 그의 생성 개선, 생체 내 면역성 감소, 다중특이적 구성체 생성 등을 위해 추가로 변형될 수 있다. 모노클로날 항체 생산 및 스크리닝의 더욱 상세한 기재가 하기 및 첨부된 실시예에 설명된다.
3. 인간 항체
또다른 구현예에서, 항체는 완전한 인간 항체를 포함할 수 있다. 용어 "인간 항체"는 인간에 의해 생산되고/되거나 아래 기재된 인간 항체를 만드는 임의의 기술을 이용하여 제조된 항체의 아미노산 서열에 상응하는 아미노산 서열을 소유하는 항체를 지칭한다.
인간 항체는 당 분야에서 알려진 각종 기술을 이용하여 생산될 수 있다. 일 구현예에*, 재조합 인간 항체는 파지 디스플레이를 이용하여 제조된 재조합 조합성 항체 라이브러리를 스크리닝함으로써 분리될 수 있다. 일 구현예에서, 라이브러리는, B-세포로부터 분리된 mRNA로부터 제조된 인간 VL 및 VH cDNA를 이용하여 생성된, scFv 파지 또는 효모 디스플레이 라이브러리이다. 그러한 기술은 많은 수의 후보 항체의 스크리닝을 유리하게 가능하게 하며 (예를 들어, 친화도 성숙 또는 재조합 셔플링에 의해) 후보 서열의 상대적으로 용이한 조작을 제공한다.
인간 항체는 또한, 인간 면역글로불린 유전자좌를 트랜스제닉 동물, 예를 들어, 내인성 면역글로불린 유전자가 부분적으로 또는 완전히 불활성화되고 인간 면역글로불린 유전자가 도입된 마우스 내로 도입함으로써 제조될 수 있다. 시험감염에 따라, 유전자 재배열, 어셈블리, 및 완전한 인간 항체 레퍼토리를 포함하여, 모든 면에서 인간에서 나타나는 것과 가깝게 닮은 인간 항체 생산이 나타난다. 이러한 접근은, 예를 들어, U.S.P.N. 5,545,807; 5,545,806; 5,569,825; 5,625,126; 5,633,425; 5,661,016, 및 U.S.P.N. 6,075,181 및 6,150,584(제노마우스® 기술 관련); 및 문헌 [Lonberg and Huszar,1995,PMID: 7494109]에 기재되어 있다. 대안적으로, 인간 항체는 표적 항원에 대항하여 지향된 항체를 생성하는 인간 B 림프구의 불멸화를 통해 제조될 수 있다(이러한 B 림프구는 신생 장애를 갖는 개체로부터 회수될 수 있거나, 또는 시험관내에서 면역화될 수 있음). 예를 들어, 문헌 [Cole et al., Monoclonal Antibodies and Cancer Therapy, Alan R. Liss, p. 77 (1985)]; [Boerner et al., 1991, PMID: 2051030]; 및 U.S.P.N. 5,750,373 참조. 기타 다른 모노클로날 항체와 같이, 이러한 인간 항체가 공급원 항체로서 사용될 수 있다.
또한, 그러한 항체는, 선정된 숙주 세포가 원하는 인간 중쇄 및 경쇄를 암호화하는 (바로 위에 기재된 것들을 포함하는 임의의 공급원으로부터의) 유전자 재료 로 형질전환되거나 형질감염된 후에 재조합적으로 생산될 수 있다. 그러한 자연발생적이지 않은 재조합적으로 제조된 완전 인간 항체 조성물은 명시적으로 본 발명의 범위 내에 속하며, 개시된 항-DLL3 ADC를 제공하는 데 사용될 수 있다.
4. 유도된 항체:
상기에 기재된 바와 같이 일단 공급원 항체가 생성되고 선택되고 단리되면, 이들은 개선된 제약학적 특징을 갖는 항-DLL3 항체를 제공하도록 추가로 변경될 수 있다. 바람직하게는 요망되는 치료 특성을 갖는 유도 항체를 제공하도록 공지된 분자 공학 기법을 사용하여 공급원 항체를 변형 또는 변경시킬 수 있다.
4.1. 키메라성 및 인간화 항체
본 발명의 선택된 구현예는 DLL3에 면역특이적으로 결합하고, "공급원" 항체로 고려될 수 있는 뮤린 모노클로날 항체를 포함한다. 특정 구현예에서, 본 발명의 항체는 공급원 항체의 불변 영역 및/또는 에피토프 결합 아미노산 서열의 선택적 변형을 통해 이러한 공급원 항체로부터 유도될 수 있다. 다양한 구현예에서, 공급원 항체 중의 선택된 아미노산이 결실, 돌연변이, 치환, 통합 또는 조합을 통해 변경되는 경우, 공급원 항체로부터 항체가 유도된다. 또 다른 구현예에서, "유도" 항체는, 유도체 항체(예를 들어, 키메라 또는 인간화된 항체)를 제공하도록 공급원 항체의 단편(예를 들어, 하나 이상의 CDR 또는 전체 중쇄 및 경쇄 가변 영역)이 수용체 항체 서열과 조합되거나 이들로 혼입된 것이다. 이들 유도 항체는, 결정인자에 대한 친화성 개선; 항체 안정성 개선; 세포 배양에서의 생산 및 수율 개선; 생체 내 면역성 감소; 독성 감소; 활성 모이어티의 컨쥬게이션 용이화; 또는 다중특이적 항체 생성 등을 위해 하기에 기재되는 바와 같은 표준 분자 생물 기법을 사용하여 생성될 수 있다. 이러한 항체는 또한, 화학적 수단 또는 번역후 변형에 의한 성숙 분자의 변형(예를 들어, 글리코실화 또는 페길화)을 통해 공급원 항체로부터 유도될 수 있다.
하나의 구현예에서, 본 발명의 항체는, 공유 연결된 적어도 두가지 상이한 종 또는 부류의 항체로부터의 단백질 세그먼트로부터 유도된 키메라 항체를 포함한다. 용어 "키메라" 항체는, 중쇄 및/또는 경쇄의 일부가 특정 종으로부터의 또는 특정 항체 부류 또는 하위부류에 속하는 항체에서 상응하는 서열과 동일하거나 상동성인 구성체에 관한 것이며, 사슬(들)의 나머지 부분은 또 다른 종으로부터의 또는 또 다른 항체 부류 또는 하위부류에 속하는 항체뿐만 아니라, 이러한 항체의 단편에서 상응하는 서열과 동일하거나 상동성이다(U.S. P.N. 4,816,567; Morrison et al., 1984, PMID: 6436822). 일부 구현예에서, 본 발명의 키메라 항체는 인간 경쇄 및 중쇄 불변 영역에 작동가능하게 연결된 선택된 뮤린 중쇄 및 경쇄 가변 영역의 전부 또는 대부분을 포함할 수 있다. 다른 선택된 구현예에서, 키메라 항-DLL3 항체는 본원에 개시된 마우스 항체로부터 "유도될" 수 있다.
다른 구현예에서, 본 발명의 키메라 항체는 "CDR-그래프팅된" 항체이고, 여기서 CDR(카바트, 코티아, 맥칼럼 등을 사용하여 정의됨)은 특정 종으로부터 유래되거나 특정 항체 부류 또는 하위부류에 속하며, 항체의 나머지 부분은 주로 또 다른 종으로부터의 또는 또 다른 항체 부류 또는 하위부류에 속하는 항체로부터 유래된다. 인간에서의 사용을 위해, 하나 이상의 선택된 설치류 CDR(예를 들어, 마우스 CDR)을 인간 수용체 항체 내로 그래프팅하여, 인간 항체의 천연 CDR 중 하나 이상을 대체할 수 있다. 이들 구성체는 일반적으로, 전강도 인간 항체 기능, 예를 들어, 보체 의존적 세포독성(CDC) 및 항체-의존적 세포-매개 세포독성(ADCC)을 제공하면서 대상체에 의한 항체에 대한 원치않는 면역 반응을 감소시킨다는 이점을 갖는다. 일 구현예에서, CDR 그래프팅된 항체는 인간 골격 서열 내에 혼입된 마우스로부터 얻어진 하나 이상의 CDR을 포함할 것이다.
"인간화된" 항체는 CDR-그래프팅된 항체와 유사하다. 본원에서 사용되는 바와 같이 "인간화된" 항체는, 하나 이상의 비-인간 항체(공여체 또는 공급원 항체)로부터 유래된 하나 이상의 아미노산 서열(예를 들어, CDR 서열)을 포함하는 인간 항체(수용체 항체)이다. 특정 구현예에서, "역 돌연변이"가 인간화된 항체 내로 도입될 수 있으며, 여기서는 수용자 인간 항체의 가변 영역의 하나 이상의 프레임워크 도메인 (framework domain, FR) 내의 잔기가 비-인간 종 공여체 항체부터 상응하는 잔기로 대체된다. 이러한 역 돌연변이는 그래프팅된 CDR(들)의 적절한 3차원 구성을 유지하도록 돕고, 이로써 친화성 및 항체 안정성을 개선시킬 수 있다. 비-제한적으로 마우스, 래트, 토끼, 또는 비-인간 영장류를 포함하는 다양한 공여체 종으로부터의 항체가 사용될 수 있다. 또한, 인간화된 항체는, 예를 들어, 항체 성능을 추가로 세밀화하기 위해, 추가의 수용자 항체 또는 공여체 항체에서 나타나지 않는 새로운 잔기를 포함할 수 있다. 공급원 항체로부터의 뮤린 성분 및 수용체(acceptor) 항체로부터의 인간 성분을 포함하는 본 발명과 상용가능한 CDR 그래프트되고 인간화된 항체가, 아래 실시예에 설명된 바와 같이 제공된다.
당 분야에 인식되어 있는 다양한 기법을 사용하여, 본 발명에 따른 인간화된 구성체를 제공하기 위해 수용체 항체로서 어떠한 인간 서열을 사용할지를 결정할 수 있다. 상용성 인간 생식라인 서열의 종합 및 수용체 서열로서의 이들의 적합성을 결정하는 방법은, 예를 들어, 문헌 [Dubel and Reichert (Eds.) (2014) Handbook of Therapeutic Antibodies, 2nd Edition, Wiley-Blackwell GmbH; Tomlinson, I. A. et al. (1992) J. Mol. Biol. 227:776-798]; [Cook, G. P. et al. (1995) Immunol. Today 16: 237-242]; [Chothia, D. et al. (1992) J. Mol. Biol. 227:799-817]; 및 [Tomlinson et al. (1995) EMBO J 14:4628-4638]에 개시되어 있다. 인간 면역글로불린 가변 영역 서열의 포괄적 디렉토리(톰린슨(Tomlinson, I. A.) 등(MRC Centre for Protein Engineering, Cambridge, UK)에 의해 종합됨)를 제공하는 V-BASE 디렉토리(VBASE2 - Retter et al., NucleicAcidRes. 33; 671-674, 2005)를 사용하여 상용성 수용체 서열을 식별할 수도 있다. 추가로, 예를 들어, U.S.P.N. 6,300,064에 기재된 공통 인간 골격 서열이 또한 상용성 수용체 서열인 것으로 판명될 수 있고, 이것이 본 교시내용에 따라 사용될 수 있다. 일반적으로, 인간 골격 수용체 서열은, 공급원 및 수용체 항체의 CDR 정준 구조의 분석과 함께 뮤린 공급원 골격 서열과의 상동성에 기초하여 선택된다. 이에 따라, 유도 항체의 중쇄 및 경쇄 가변 영역의 유도 서열을 관련 분야에 인식된 기법을 사용하여 합성할 수 있다.
예를 들어 CDR 그래프팅된 및 인간화된 항체, 및 연관 방법은 U.S.P.N. 6,180,370 및 5,693,762에 기재되어 있다. 추가의 상세사항에 대해서는, 예를 들어, 문헌 [Jones et al., 1986, (PMID: 3713831)]; 및 U.S.P.N. 6,982,321 및7,087,409를 참조한다.
인간 수용체 가변 영역에 대한 CDR 그래프팅된 또는 인간화된 항체 가변 영역의 서열 동일성 또는 상동성은 본원에서 논의된 바와 같이 측정될 수 있고, 이와 같이 측정시, 이는 바람직하게는 적어도 60% 또는 65% 서열 동일성, 보다 바람직하게는 적어도 70%, 75%, 80%, 85%, 또는 90% 서열 동일성, 훨씬 더 바람직하게는 적어도 93%, 95%, 98% 또는 99% 서열 동일성을 공유할 것이다. 바람직하게는, 동일하지 않은 잔기 위치는 보존적 아미노산 치환에 의해 상이하다. "보존적 아미노산 치환"은, 아미노산 잔기가 유사한 화학적 특성(예를 들어, 전하 또는 소수성)을 갖는 측쇄(R 기)를 갖는 또 다른 아미노산 잔기로 치환된 것이다. 일반적으로, 보존적 아미노산 치환은 단백질의 기능적 특성을 실질적으로 변화시키지 않을 것이다. 2 개 이상의 아미노산 서열이 보존적 치환에 의해 서로 상이한 경우, 치환의 보존적 성질에 대한 보정을 위해 퍼센트 서열 동일성 또는 유사도를 상향 조정할 수 있다.
첨부된 도 1a 및 도 1b에 제공된 바와 같이 주석표시된 CDR 및 프레임워크 서열은 등록 Abysis 데이터베이스를 이용하여 Kabat 등에 따라 정의되는 것이 이해될 것이다. 그러나, 본 명세서에서 논의된 바와 같이, 당업자는 Chothia 등, ABM 또는 MacCallum 등 뿐만 아니라 Kabat 등에 의해 제공되는 정의에 따라 CDR을 쉽게 확인할 수 있을 것이다. 이와 같이, 임의의 상기 언급된 시스템을 따라 유도된 하나 이상의 CDR을 포함하는 항-DLL3 인간화 항체는 본 발명의 범주 내에 명확하게 속한다.
4.2. 위치 특이적 항체
본 발명의 항체는 세포독소 또는 기타 항암제에 대한 컨쥬게이션을 촉진하도록 조작될 수 있다 (하기에 더욱 상세히 논의되는 바와 같음). 항체 약물 컨쥬게이트 제제는 항체에서 세포독소의 위치 및 약물 대 항체 비율(DAR) 면에서 ADC 분자의 상동성 집단을 포함하는 것이 유리하다. 본 개시내용에 기초하여, 당업자는 본 명세서에서 설명된 바에 따라, 위치 특이적으로 조작된 구축물을 쉽게 제작할 수 있을 것이다. 본 명세서에 사용된 바와 같이, "위치 특이적 항체" 또는 "위치 특이적 구축물"은 항체, 또는 이의 이의 면역반응성 단편을 의미하며, 여기서 중쇄 또는 경쇄 중 어느 하나에 있는 적어도 하나의 아미노산은 결실, 변경 또는 치환되어 (바람직하게는 또 다른 아미노산을 이용하여) 적어도 하나의 자유 시스테인을 제공한다. 유사하게, "위치 특이적 컨쥬게이트"는 위치 특이적 항체 및 적어도 하나의 세포독소 또는 쌍을 형성하지 않거나 자유 시스테인(들)에 컨쥬게이트된 다른 화합물을 포함하는 ADC를 의미하는 것이다. 특정 구현예에서, 쌍을 형성하지 않은 시스테인 잔기는 쌍을 형성하지 않은 사슬 간 잔기를 포함할 것이다. 다른 구현예에서, 자유 시스테인 잔기는 쌍을 형성하지 않은 사슬 내 시스테인 잔기를 포함할 것이다. 여전히 다른 구현예에서, 자유 시스테인은 항체 (예를 들어, CH3 도메인)의 아미노산 서열 내로 조작될 수 있다. 어쨌든, 위치 특이적 항체는 각종 아이소타입, 예를 들어 IgG, IgE, IgA 또는 IgD일 수 있으며; 그러한 부류 내에서 항체는 각종 하위부류일 수 있으며, 예를 들어 IgG1, IgG2, IgG3 또는 IgG4일 수 있다. IgG 구축물의 경우, 항체의 경쇄는, 선택된 구현예에서 IgG1 중쇄 내 C220 잔기의 부족으로 인하여 쌍을 형성하지 않을 수 있는 C214를 각각 포함하는 카파 또는 람다 아이소타입 중 어느 하나를 포함할 수 있다.
따라서, 본 명세서에서 사용된 바와 같은 용어 "자유 시스테인" 또는 "쌍을 형성하지 않은 시스테인"은, 문맥에 의해 달리 지시되지 않는 한 상호교환가능하게 사용될 수 있으며, 선택된 잔기 위치에 자연적으로 존재하거나 분자 조작 기술을 이용하여 특이적으로 혼입되었는지 여부에 관계없이, 항체의 임의의 시스테인 (또는 티올 함유) 구성성분을 의미할 수 있다. 선택된 특정 구현예에서, 유리 시스테인은, 생리학적 조건 하에 천연 디술피드 브릿지를 파괴하여 쌍을 이루지 않은 시스테인이 자리-특이적 컨쥬게이션에 적합하게 되도록 하기 위해 고유적 사슬간 또는 사슬내 디술피드 브릿지 파트너가 치환되거나 제거되거나 또는 다른 방식으로 변경된 천연 시스테인을 포함할 수 있다. 다른 바람직한 구현예에서, 유리 또는 쌍을 이루지 않은 시스테인은 항체 중쇄 또는 경쇄 아미노산 서열 내의 미리 정해진 자리에 선택적으로 위치하는 시스테인 잔기를 포함할 것이다. 컨쥬게이션 전에, 유리 또는 쌍을 이루지 않은 시스테인은, 시스템의 산화 상태에 따라 동일한 항체 상의 또 다른 유리 시스테인과 함께 티올로서(환원된 시스테인), 캡핑된 시스테인으로서(산화된) 또는 비-천연 분자내 디술피드 결합으로서 (산화된) 존재할 수 있음을 인지할 것이다. 하기에서 보다 상세히 논의되는 바와 같이, 이러한 항체 구성체의 온화한 환원은 자리-특이적 컨쥬게이션에 이용가능한 티올을 제공할 것이다. 특히 바람직한 구현예에서, 유리 또는 쌍을 이루지 않은 시스테인(천연이든 혼입된 것이든)은 선택적 환원 및 후속 컨쥬게이션에 적용되어 균질한 DAR 조성물을 제공할 것이다.
개시된 조작된 컨쥬게이트 제제에 의해 나타낸 선호되는 특성은, 적어도 부분적으로, 컨쥬게이션을 특이적으로 지시하고, 컨쥬게이션 위치 및 조성물의 절대 DAR 면에서 제작된 컨쥬게이트를 크게 제한하는 능력에 입각한다는 것이 이해될 것이다. 대부분의 통상적인 ADC 제제와 달리, 본 발명은 랜덤 컨쥬게이션 위치 및 DAR 종의 상대적으로 제어되지 않은 생성을 제공하기 위하여 항체의 부분적인 또는 총 감소에 전적으로 의존할 필요가 없다. 그보다는, 특정 양태에서 본 발명은 바람직하게는, 하나 이상의 자연발생적인 (즉, "천연") 사슬내 또는 사슬간 이황화물 브릿지(bridge)를 파괴하거나 임의의 위치에서 시스테인 잔기를 도입하도록 표적 항체를 조작함으로써 하나 이상의 예정된 쌍을 형성하지 않은 (또는 자유) 시스테인 위치를 제공한다. 이를 위하여, 선택된 구현예에서, 시스테인 잔기는 항체 (또는 이의 면역반응성 단편) 중쇄 또는 경쇄를 따라 임의의 장소에 포함될 수 있거나, 표준 분자 조작 기술을 이용하여 그에 부착될 수 있다. 다른 바람직한 구현예에서, 천연 이황화물 결합의 붕괴는 이후 컨쥬게이션 위치로서 사용될 수 있는 (자유 시스테인을 이후 포함할 것인) 비천연 시스테인의 도입과 조합하여 영향을 미칠 수 있다.
일 구현예에서, 조작된 항체는 사슬 내 또는 사슬간 시스테인 잔기의 적어도 하나의 아미노산의 결실 또는 치환을 포함한다. 본 명세서에서 사용된 바와 같은 "사슬내 시스테인 잔기"는 항체의 경쇄와 중쇄 사이 또는 항체의 두 개의 중쇄 사이 중 어느 하나에서의 천연 이황화물 결합에 수반된 시스테인 잔기를 의미하는 한편 "사슬간 시스테인 잔기"는 동일한 중쇄 또는 경쇄 내 또다른 시스테인과 천연적으로 쌍을 이룬 것이다. 일 구현예에서, 결실 또는 치환된 사슬내 시스테인 잔기는 경쇄와 중쇄 사이의 이황화물 결합의 형성에 수반된다. 또다른 구현예에서, 결실 또는 치환된 시스테인 잔기는 두 개의 중쇄 사이의 이황화물 결합에 수반된다. 항체의 상보적 구조로 인하여, 경쇄가 중쇄의 VH 및 CH1 도메인과 쌍을 형성하고, 하나의 중쇄의 CH2 및 CH3 도메인이 상보적 중쇄의 CH2 및 CH3 도메인과 쌍을 형성하는, 통상적인 구현예에서, 경쇄 또는 중쇄 중 어느 하나의 하나의 시스테인의 돌연변이 또는 결실은 조작된 항체 내에서 두 개의 쌍을 형성하지 않은 시스테인 잔기를 결과로서 초래할 것이다.
일부 구현예에서는, 사슬간 시스테인 잔기가 결실된다. 다른 구현예에서는, 사슬간 시스테인이 또 다른 아미노산(예를 들어, 천연 아미노산)에 대해 치환된다. 예를 들어, 아미노산 치환은 중성(예를 들어, 세린, 트레오닌 또는 글리신) 또는 친수성(예를 들어, 메티오닌, 알라닌, 발린, 류신 또는 이소류신) 잔기로의 사슬간 시스테인의 대체를 제공할 수 있다. 하나의 구현예에서, 사슬간 시스테인은 세린으로 대체된다.
일부 구현예에서는, 결실된 또는 치환된 시스테인 잔기가 경쇄(카파 또는 람다) 상에 있고, 이로써 유리 시스테인을 중쇄 상에 남기는 것이 본 발명에 의해 고려된다. 다른 구현예에서, 결실된 또는 치환된 시스테인 잔기는 중쇄 상에 있어 유리 시스테인을 경쇄 불변 영역 상에 남긴다. 어셈블리시, 무손상 항체의 경쇄 또는 중쇄 내의 단일 시스테인의 결실 또는 치환은 2 개의 쌍을 이루지 않은 시스테인 잔기를 갖는 자리-특이적 항체를 형성함을 인지할 것이다.
하나의 구현예에서는, IgG 경쇄 (카파 또는 람다)의 위치 214의 시스테인(C214)이 결실되거나 치환된다. 또 다른 구현예에서는, IgG 중쇄 상의 위치 220의 시스테인(C220)이 결실되거나 치환된다. 추가의 구현예에서, 중쇄 상의 위치 226 또는 위치 229의 시스테인이 결실되거나 치환된다. 하나의 구현예에서, 중쇄 상의 C220이 세린(C220S)으로 치환되어 경쇄 내에 요망되는 유리 시스테인을 제공한다. 또 다른 구현예에서, 경쇄 내의 C214는 세린(C214S)으로 치환되어 중쇄 내의 요망되는 유리 시스테인을 제공한다. 이러한 위치 특이적 구성체는 실시예 15에서 제공되었다. 이들 구성체의 요약을 하기 표 2에 나타내었고, 여기서 번호부여는 일반적으로 카바트에 기재된 바와 같은 Eu인덱스에 따르고, WT는 변경이 없는 "야생형" 또는 고유적 불변 영역 서열을 나타내고, 델타(Δ)는 아미노산 잔기의 결실을 나타낸다(예를 들어, C214Δ는 위치 214의 시스테인이 결실되었음을 나타냄).
명명 | 항체 성분 | 변경 |
ss1 |
중쇄 경쇄 |
C220S WT |
ss2 |
중쇄 경쇄 |
C220Δ WT |
ss3 |
중쇄 경쇄 |
WT C214Δ |
ss4 |
중쇄 경쇄 |
WT C214S |
이와 관련하여 예시 목적을 위하여, 예시적인 항체 hSC16.56ss1를 위한 전장 중쇄 (서열번호 9) 및 경쇄 (서열번호 8) 아미노산 서열이 바로 아래에 설명된다. 카파 경쇄는 hSC16.56 항체에서 발견되는 경쇄와 동일한 한편, hSC16.56ss1 중쇄 (서열번호 9)는 hSC16.56 항체 (서열번호 7)에서의 중쇄와, 아래 서열에서 밑줄 및 진하게 표시된 C220S 돌연변이를 함유한다는 점에서 상이하다는 것에 유의한다.
QVQLVQSGAEVKKPGASVKVSCKASGYTFTNYGMNWVRQAPGQGLEWMGWINTYTGEPTYADDFKGRVTMTTDTSTSTAYMELRSLRSDDTAVYYCARIGDSSPSDYWGQGTLVTVSSASTKGPSVFPLAPSSKSTSGGTAALGCLVKDYFPEPVTVSWNSGALTSGVHTFPAVLQSSGLYSLSSVVTVPSSSLGTQTYICNVNHKPSNTKVDKKVEPKS S DKTHTCPPCPAPELLGGPSVFLFPPKPKDTLMISRTPEVTCVVVDVSHEDPEVKFNWYVDGVEVHNAKTKPREEQYNSTYRVVSVLTVLHQDWLNGKEYKCKVSNKALPAPIEKTISKAKGQPREPQVYTLPPSRDELTKNQVSLTCLVKGFYPSDIAVEWESNGQPENNYKTTPPVLDSDGSFFLYSKLTVDKSRWQQGNVFSCSVMHEALHNHYTQKSLSLSPG (서열번호 9).
EIVMTQSPATLSVSPGERATLSCKASQSVSNDVVWYQQKPGQAPRLLIYYASNRYTGIPARFSGSGSGTEFTLTISSLQSEDFAVYYCQQDYTSPWTFGQGTKLEIKRTVAAPSVFIFPPSDEQLKSGTASVVCLLNNFYPREAKVQWKVDNALQSGNSQESVTEQDSKDSTYSLSSTLTLSKADYEKHKVYACEVTHQGLSSPVTKSFNRGEC (서열번호 8).
(고유적 디술피드 결합의 파괴와 대조적으로) 유리 시스테인을 제공하기 위한 시스테인 잔기(들)의 도입 또는 첨가와 관련하여, 항체 또는 항체 단편 상의 상용성 위치(들)는 당업자에 의해 쉽게 파악될 수 있다. 따라서, 선택된 구현예에서, 시스테인(들)은, 요망되는 DAR, 항체 구성체, 선택된 페이로드 및 항체 표적에 따라 CH1 도메인, CH2 도메인 또는 CH3 도메인 또는 임의의 이들의 조합에 도입될 수 있다. 다른 바람직한 구현예에서, 시스테인은 카파 또는 람다 CL 도메인 내로, 또한 특히 바람직한 구현예에서, CL 도메인의 c-말단 영역에 도입될 수 있다. 각 경우에, 분자 안정성, 컨쥬게이션 효율을 용이하게 하거나 또는 부착시 페이로드에 대한 보호 환경을 제공하도록 시스테인 삽입 자리에 근접한 기타 다른 아미노산 잔기가 변경, 제거 또는 치환될 수 있다. 특정 구현예에서, 치환된 잔기는 항체의 임의의 접근가능한 자리에서 나타난다. 이러한 표면 잔기를 시스테인으로 치환함으로써, 반응성 티올 기는 항체 상의 쉽게 접근가능한 자리에 배치되고, 본원에 추가로 기재된 바와 같이 선택적으로 환원될 수 있다. 특정 구현예에서, 치환된 잔기는 항체의 접근가능한 자리에서 나타난다. 이들 잔기를 시스테인으로 치환함으로써, 반응성 티올 기는 항체의 접근가능한 자리에 배치되고, 항체를 선택적으로 컨쥬게이션시키는 데 사용될 수 있다. 특정 구현예에서, 하기 잔기 중 임의의 하나 이상이 시스테인으로 치환될 수 있다: 경쇄의 V205(카바트 번호부여); 중쇄의 A118(Eu 번호부여); 및 중쇄 Fc 영역의 S400(Eu 번호부여). 추가의 치환 위치 및 상용성 자리-특이적 항체의 제작 방법은 그 전문이 본원에 참조로 포함되는 U.S.P.N. 7,521,541에 기재되어 있다.
약물 부하의 정의된 위치 및 화학양론으로 항체-약물 컨쥬게이트를 생성하는 전략은, 이는 일차적으로 항체의 보존된 불변 도메인의 조작을 포함함에 따라, 본 명세서에 개시된 바와 같이, 모든 항-DLL3 항체에 광범위하게 적용가능하다. 항체의 각 부류 및 하위 부류의 아미노산 서열 및 천연 이황화물 브릿지는 관련 증거가 많으며, 당업자는 과도한 실험 없이 각종 DLL3 항체의 조작된 구축물을 쉽게 제작할 수 있을 것이며, 이에 따라 그러한 구축물은 본 발명의 범주 내에 속하는 것으로 명시적으로 고려된다. 이는 본 개시 내용에 설명된 바와 같은 중쇄 및 경쇄 가변 영역 아미노산 서열을 포함하는 위치 특이적 구축물에 대해 특히 적용된다.
4.3 불변 영역 변형 및 변경된 글리코실화
본 발명의 선택된 구현예는 또한, 변경된 약동학, 증가된 혈청 반감기, 증가된 결합 친화성, 감소된 면역성, 증가된 생성, 변경된 Fc 수용체(FcR)에 대한 Fc 리간드 결합, 증대된 또는 감소된 ADCC 또는 CDC, 변경된 글리코실화 및/또는 디술피드 결합 및 변형된 결합 특이성을 포함하나 제한되지는 않는 특징을 갖는 화합물을 제공하는, 비-제한적으로 아미노산 잔기 치환, 돌연변이 및/또는 변형을 포함하는, 불변 영역(즉, Fc 영역)의 치환 또는 변형을 포함할 수 있다.
개선된 Fc 작동체 기능을 갖는 화합물은, 예를 들어, 증가된 세포독성 및/또는 변경된 약동학, 예컨대 증가된 혈청 반감기로 이어질 수 있는, Fc 도메인과 Fc 수용체(예를 들어, FcγRI, FcγRIIA 및 B, FcγRIII 및 FcRn) 사이의 상호작용에 참여하는 아미노산 잔기의 변화를 통해 생성될 수 있다(예를 들어, 문헌 [Ravetch and Kinet, Annu. Rev. Immunol 9:457-92 (1991)]; [Capel et al., Immunomethods 4:25-34 (1994)]; 및 [de Haas et al., J. Lab. Clin. Med. 126:330-41 (1995)] 참조).
선택된 구현예에서, 증가된 생체 내 반감기를 갖는 항체는, Fc 도메인과 FcRn 수용체 사이의 상호작용에 참여하는 것으로 식별된 아미노산 잔기의 개질(예를 들어, 치환, 결실 또는 부가)에 의해 생성될 수 있다(예를 들어, 국제 특허출원 공개 번호 WO 97/34631; WO 04/029207; U.S.P.N. 6,737,056 및 U.S.P.N. 2003/0190311 참조). 이러한 구현예와 관련하여, Fc 변이체는 포유류, 바람직하게는 인간에서, 5 일 초과, 10 일 초과, 15 일 초과, 바람직하게는 20 일 초과, 25 일 초과, 30 일 초과, 35 일 초과, 40 일 초과, 45 일 초과, 2 개월 초과, 3 개월 초과, 4 개월 초과, 또는 5 개월 초과의 반감기를 제공할 수 있다. 증가된 반감기는 보다 높은 혈청 역가(titer)를 제공하고, 그에 따라 이는 항체의 투여 빈도수를 감소시키거나 및/또는 투여되는 항체의 농도를 감소시킨다. 생체 내에서 인간 FcRn에 대한 결합 및 인간 FcRn 고친화성 결합 폴리펩티드의 혈청 반감기는, 예를 들어, 인간 FcRn을 발현하는 트랜스제닉 마우스 또는 트랜스펙션된 인간 세포주에서, 또는 변이체 Fc 영역을 갖는 폴리펩티드가 투여되는 영장류에서 분석될 수 있다. WO 2000/42072에는 FcRn에 대한 개선된 또는 약화된 결합을 갖는 항체 변이체가 기재되어 있다. 또한, 예를 들어, 문헌 [Shields et al. J. Biol. Chem. 9(2):6591-6604 (2001)]을 참조한다. 놀랍게도, 본 발명의 특정 ADC는, 선택적인 위치 특이적 컨쥬게이트를 제공하기 위하여 사용되는 것 외에 임의의 항체 불변 영역 변형 없이, 연장된 최종 반감기 (예를 들어, 약 2주)를 나타낸다.
다른 구현예에서, Fc 변경은 증대된 또는 감소된 ADCC 또는 CDC 활성을 초래할 수 있다. 당업계에 공지된 바와 같이, CDC는 보체의 존재 하에서의 표적 세포의 용해를 지칭하고, ADCC는 특정 세포독성 세포(예를 들어, 천연 킬러 세포, 호중구, 및 매크로파지) 상에 존재하는 FcR 상에 결합된 분비된 Ig가 이들 세포독성 작동체 세포가 항원-보유 표적 세포에 특정적으로 결합되고, 이어서 세포독소로 표적 세포를 사멸시킬 수 있도록 하는 세포독성 형태를 지칭한다. 본 발명과 관련하여 항체 변이체에는, 모항체 또는 변형되지 않은 항체 또는 고유적 서열 FcR을 포함하는 항체에 비해 증대된 또는 약화된 결합인 "변경된" FcR 결합 친화성이 제공된다. 감소된 결합을 나타내는 이러한 변이체는, 예를 들어 당업계에 널리 공지된 기법에 의해 측정시, FcR에 대해 거의 또는 전혀 감지가능하지 않은 결합, 예를 들어 고유적 서열에 비해 0% 내지 20% 결합을 가질 수 있다. 다른 구현예에서, 변이체는 고유적 면역글로불린 Fc 도메인에 비해 증대된 결합을 나타낼 것이다. 개시된 항체의 효과적인 항종양 특성을 증대시키기 위해 이들 유형의 Fc 변이체가 유리하게 사용될 수 있음을 인지할 것이다. 또 다른 구현예에서, 이러한 변경은 증가된 결합 친화성, 감소된 면역성, 증가된 생성, 변경된 글리코실화 및/또는 디술피드 결합(예를 들어, 컨쥬게이션 자리에 대해), 변형된 결합 특이성, 증가된 식균작용; 및/또는 세포 표면 수용체(예를 들어, B 세포 수용체; BCR)의 하향 조절 등을 제공할 수 있다.
또 다른 구현예는 하나 이상의 조작된 당형태(glycoform), 예를 들어, 단백질(예를 들어, Fc 도메인 내)에 공유 부착된 변경된 글리코실화 패턴 또는 변경된 탄수화물 조성을 포함하는 자리-특이적 항체를 포함한다. 예를 들어, 문헌 [Shields, R. L. et al. (2002) J. Biol. Chem. 277:26733-26740] 참조. 조작된 당형태는, 작동체 기능의 증대 또는 감소, 표적에 대한 항체의 친화성 증가 또는 항체의 생성 용이화를 포함하나 이에 제한되지는 않는 각종 목적상 유용할 수 있다. 특정 구현예에서, 감소된 작동체 기능이 요망되는 경우, 분자를 아글리코실화된 형태를 발현하도록 조작할 수 있다. 하나 이상의 가변 영역 골격 글리코실화 자리의 제거를 초래할 수 있는 치환(이로써 그 자리에서의 글리코실화가 제거됨)은 널리 공지되어 있다(예를 들어, U.S.P.N. 5,714,350 및 6,350,861 참조). 역으로, 하나 이상의 추가의 글리코실화 자리에서의 조작에 의해 Fc 함유 분자에 증대된 작동체 기능 또는 개선된 결합이 부여될 수 있다.
다른 구현예는 변경된 글리코실화 조성을 갖는 Fc 변이체, 예컨대 감소된 양의 푸코실 잔기를 갖는 하이포푸코실화된 항체 또는 증가된 양분화 GlcNAc 구조를 갖는 항체를 포함한다. 이러한 변경된 글리코실화 패턴은, 항체의 ADCC 능력을 증가시키는 것으로 입증되었다. 조작된 당형태는 당업자에게 공지된 임의의 방법에 의해, 예를 들어 조작된 또는 변이체 발현 변형력 사용에 의해, 하나 이상의 효소(예를 들어, N-아세틸글루코사미닐트랜스퍼라제 III(GnTIII))와의 공동-발현에 의해, 다양한 유기체 또는 다양한 유기체로부터의 세포주에서의 Fc 영역을 포함하는 분자의 발현에 의해 또는 Fc 영역을 포함하는 분자 발현 후 탄수화물(들)의 변형에 의해 생성될 수 있다(예를 들어, WO 2012/117002 참조).
4.4 단편
본 발명의 실행을 위해 어떠한 형태의 항체(예를 들어, 키메라, 인간화된 등)가 선택되는지에 관계 없이, 항체 약물 컨쥬게이트 단독으로 또는 부분으로서, 그의 면역반응성 단편이 본원의 교시내용에 따라 사용될 수 있음을 인지할 것이다. "항체 단편"은 무손상 항체의 적어도 일부를 포함한다. 본원에서 사용되는 바와 같이 항체 분자의 "단편"이라는 용어는 항체의 항원-결합 단편을 포함하고, 용어 "항원-결합 단편"은 선택된 항원 또는 그의 면역성 결정인자와 면역특이적으로 결합되거나 반응하는 또는 특이적 항원 결합에 대해 단편이 유래된 무손상 항체와 경쟁하는 면역글로불린 또는 항체의 폴리펩티드 단편을 지칭한다.
예시적 자리-특이적 단편은, 가변 경쇄 단편(VL), 가변 중쇄 단편(VH), scFv, F(ab')2 단편, Fab 단편, Fd 단편, Fv 단편, 단일 도메인 항체 단편, 디아바디(diabody), 선형 항체, 단일쇄 항체 분자 및 항체 단편으로부터 형성된 다중특이적 항체를 포함한다. 추가로, 활성 자리-특이적 단편은, 항원/기질 또는 수용체와 상호작용하고 무손상 항체와 유사한 방식으로(어느 정도 낮은 효율성을 가질 수는 있지만) 이를 변형시키는 능력을 보유하는 항체의 부분을 포함한다. 이러한 항체 단편은 본 명세서에 기재된 바와 같은 하나 이상의 유리 시스테인을 포함하도록 추가로 조작될 수 있다.
다른 구현예에서, 항체 단편은, Fc 영역을 포함하고, FcRn 결합, 항체 반감기 조절, ADCC 기능 및 보체 결합과 같은, 무손상 항체 중에 존재시 Fc 영역과 통상적으로 연관되는 생물학적 기능 중 적어도 하나를 보유하는 것이다. 하나의 구현예에서, 항체 단편은 무손상 항체와 실질적으로 유사한 생체 내 반감기를 갖는 1가 항체이다. 예를 들어, 이러한 항체 단편은, 단편에 생체 내 안정성을 제공할 수 있는 적어도 하나의 유리 시스테인을 포함하는 Fc 서열에 연결된 항원 결합 아암(arm)을 포함할 수 있다.
당업자에 의해 널리 인식되는 바와 같이, 단편은 분자 공학에 의해 또는 무손상 또는 완전 항체 또는 항체 사슬의 화학적 또는 효소적 처리(예컨대, 파파인 또는 펩신)에 의해 또는 재조합 수단에 의해 얻어질 수 있다. 항체 단편에 대한 보다 상세한 설명에 대해서는, 예를 들어, 문헌 [Fundamental Immunology, W. E. Paul, ed., Raven Press, N.Y. (1999)]을 참조한다.
4.5 다가 구성체
다른 구현예에서, 본 발명의 항체 및 컨쥬게이트는 1가 또는 다가(예를 들어, 2가, 3가 등)일 수 있다. 본원에서 사용되는 바와 같이 용어 "-가"는 항체와 회합되는 잠재적인 표적 결합 자리의 수를 지칭한다. 각각의 표적 결합 자리는 하나의 표적 분자 또는 표적 분자 상의 특정 위치 또는 장소에 특이적으로 결합된다. 항체가 1가인 경우, 분자의 각각의 결합 자리는 단일 항원 위치 또는 에피토프에 특정적으로 결합할 것이다. 항체가 1 개 초과의 표적 결합 자리를 포함하는 경우(다가), 각각의 표적 결합 자리는 동일한 또는 상이한 분자에 특정적으로 결합할 수 있다(예를 들어, 상이한 리간드 또는 상이한 항원, 또는 동일한 항원 상의 상이한 에피토프 또는 위치에 결합할 수 있음). 예를 들어, U.S.P.N. 2009/0130105를 참조한다.
하나의 구현예에서, 항체는, 문헌 [Millstein et al., 1983, Nature, 305:537-539]에 기재된 바와 같이, 2 개의 사슬이 상이한 특이성을 갖는 이중특이적 항체이다. 다른 구현예는 추가의 특이성을 갖는 항체, 예컨대 삼중특이적 항체를 포함한다. 기타 다른 보다 정교한 상용성 다중특이적 구성체 및 그의 제작 방법은 U.S.P.N. 2009/0155255뿐만 아니라, WO 94/04690; 문헌 [Suresh et al., 1986, Methods in Enzymology, 121:210]; 및 WO 96/27011에 기재되어 있다.
다가 항체는 요망되는 표적 분자의 상이한 에피토프에 면역특이적으로 결합할 수 있거나, 또는 표적 분자뿐만 아니라 이종 에피토프, 예컨대 이종 폴리펩티드 또는 고체 지지체 물질에 면역특이적으로 결합할 수 있다. 선택된 구현예는 단지 2 개의 항원에 결합될 수 있지만(즉, 이중특이적 항체), 삼중특이적 항체와 같은 추가의 특이성을 갖는 항체 또한 본 발명에 포함된다. 이중특이적 항체는 또한 가교된 또는 "헤테로컨쥬게이트" 항체를 포함한다. 예를 들어, 헤테로컨쥬게이트 내의 항체 중 하나는 아비딘에, 또한 기타 다른 것은 비오틴에 커플링될 수 있다. 이러한 항체는, 예를 들어, 원치않는 세포에 대해 면역 시스템 세포를 표적화하기 위해(U.S.P.N. 4,676,980), 또한 HIV 감염의 치료를 위해(WO 91/00360, WO 92/200373, 및 EP 03089) 제안되었다. 헤테로컨쥬게이트 항체는 임의의 편리한 가교 방법을 사용하여 제조될 수 있다. 적합한 가교제는 당업계에 널리 공지되어 있고, 많은 가교 기법과 함께 U.S. P.N. 4,676,980에 개시되어 있다.
5. 항체의 재조합 생성
항체 및 그의 단편은 항체 생성 세포로부터 얻어진 유전 물질 및 재조합 기술을 사용하여 생성하거나 변형시킬 수 있다(예를 들어, 문헌 [Dubel and Reichert (Eds.) (2014) Handbook of Therapeutic Antibodies, 2nd Edition, Wiley-Blackwell GmbH]; [Sambrook and Russell(Eds.)(2000) Molecular Cloning: A Laboratory Manual (3rd Ed.), NY, Cold Spring Harbor Laboratory Press]; [Ausubel et al. (2002) Short Protocols in Molecular Biology: A Compendium of Methods from CurrentProtocolsin Molecular Biology, Wiley, John & Sons, Inc.]; 및 U.S.P.N. 7,709,611 참조).
본 발명의 또다른 양태는 본 발명의 항체를 암호화하는 핵산 분자에 관한 것이다. 핵산은 전체 세포 내에, 세포 용해물 내에, 또는 부분 정제된 또는 실질적으로 순수한 형태로 존재할 수 있다. 핵산은, 알칼리/SDS 치료, CsCl 밴딩, 컬럼 크로마토그래피, 아가로스 겔 전기영동 및 당업계에 널리 공지된 다른 것들을 포함하는 표준 기법에 의해, 기타 다른 세포 성분 또는 기타 다른 오염물, 예를 들어, 기타 다른 세포 핵산 또는 단백질로부터 분리시, "단리"되거나 또는 실질적으로 순수해진다. 본 발명의 핵산은, 예를 들어, DNA(예를 들어, 게놈 DNA, cDNA), RNA 및 그의 인공 변이체(예를 들어, 펩티드 핵산)(단일-스트랜드형이든 이중-스트랜드형이든 RNA이든), RNA일 수 있고, 이는 인트론을 함유하거나 함유하지 않을 수 있다. 선택된 구현예에서, 핵산은 cDNA 분자이다.
본 발명의 핵산은 표준 분자 생물학 기술을 이용하여 수득될 수 있다. 하이브리도마에 의해 발현된 항체의 경우 (예를 들어, 하기 실시예에 기재된 바와 같이 제조된 하이브리도마), 항체의 경쇄 및 중쇄를 암호화하는 cDNA는 표준 PCR 증폭 또는 cDNA 클로닝 기술에 의해 수득될 수 있다. (예를 들어, 파지 디스플레이 기술을 이용하여) 면역글로불린 유전자 라이브러리로부터 수득된 항체의 경우, 항체를 암호화하는 핵산이 라이브러리로부터 회수될 수 있다.
VH 및 VL 세그먼트를 코딩하는 DNA 단편은, 예를 들어 가변 영역 유전자를 전장 항체 사슬 유전자로, Fab 단편 유전자로 또는 scFv 유전자로 전환시키기 위해, 표준 재조합 DNA 기법에 의해 추가로 조작될 수 있다. 이들 조작에서, VL- 또는 VH-코딩 DNA 단편은 또 다른 단백질 또는 단백질 단편을 코딩하는 또 다른 DNA 단편, 예컨대 항체 불변 영역 또는 유연성 링커에 작동가능하게 연결된다. 이와 관련하여 사용되는 바와 같이 용어 "작동가능하게 연결된"은, 2 개의 DNA 단편에 의해 코딩된 아미노산 서열이 골격내(in-frame) 유지되도록 2 개의 DNA 단편이 접합됨을 의미한다.
VH 영역을 코딩하는 단리된 DNA는, VH-코딩 DNA를 중쇄 불변 영역(IgG1의 경우에 CH1, CH2 및 CH3)을 코딩하는 또 다른 DNA 분자에 작동가능하게 연결함으로써 전장 중쇄 유전자로 전환될 수 있다. 인간 중쇄 불변 영역 유전자의 서열은 당업계에 공지되어 있고(예를 들어, 카바트 등의 1991년 문헌(상기 참조) 참조), 이들 영역을 포함하는 DNA 단편은 표준 PCR 증폭에 의해 얻을 수 있다. 중쇄 불변 영역은 IgG1, IgG2, IgG3, IgG4, IgA, IgE, IgM 또는 IgD 불변 영역일 수 있으나, 가장 바람직하게는 IgG1 또는 IgG4 불변 영역이다. 예시적 IgG1 불변 영역은 서열번호 2에 기재되어 있다. Fab 단편 중쇄 유전자에 대해, VH-코딩 DNA는 단지 중쇄 CH1 불변 영역을 코딩하는 또 다른 DNA 분자에 작동가능하게 연결될 수 있다.
VL 영역을 코딩하는 단리된 DNA는, VL-코딩 DNA를 경쇄 불변 영역, CL을 코딩하는 또 다른 DNA 분자에 작동가능하게 연결함으로써 전장 경쇄 유전자(뿐만 아니라 Fab 경쇄 유전자)로 전환될 수 있다. 인간 경쇄 불변 영역 유전자의 서열은 당업계에 공지되어 있고(예를 들어, 카바트 등의 1991년 문헌(상기 참조) 참조), 이들 영역을 포함하는 DNA 단편은 표준 PCR 증폭에 의해 얻을 수 있다. 경쇄 불변 영역은 카파 또는 람다 불변 영역일 수 있으나, 가장 바람직하게는 카파 불변 영역이다. 예시적 상용성 카파 경쇄 불변 영역은 서열번호 5에 기재되어 있다.
본 발명의 폴리펩티드에 대해 "서열 동일성", "서열 유사성" 또는 "서열 상동성"을 나타내는 특정 폴리펩티드 (예를 들어, 항원 또는 항체)가 본 명세서에서 고려된다. 예를 들어, 유도된 인간화 항체 VH 또는 VL 도메인은 공급원 (예를 들어, 뮤린) 또는 억셉터 (예를 들어, 인간) VH 또는 VL 도메인와 서열 유사성을 나타낼 수 있다. "상동성" 폴리펩티드는 65%, 70%, 75%, 80%, 85%, 또는 90%의 서열 동일성을 나타낼 수 있다. 다른 구현예에서, "상동성" 폴리펩티드는 93%, 95% 또는 98% 서열 동일성을 나타낼 수 있다. 본 명세서에서 사용된 바와 같이, 두 개의 아미노산 서열 간의 퍼센트 상동성은 두 개의 서열 간의 퍼센트 동일성에 균등하다. 두 개의 서열 간의 퍼센트 동일성은, 갭의 수 및 각각의 갭의 길이를 고려하여, 서열에 의해 공유된 동일한 위치의 수의 함수로 (즉, % 상동성= 동일한 위치의 수/위치의 총 수×100), 이는 두 개의 서열의 최적 배열을 위해 도입될 필요가 있다. 서열의 비교 및 두 개의 서열들 간의 퍼센트 동일성의 결정은, 아래의 비제한적 실시예에 기재된 바와 같이, 수학적 알고리즘을 이용하여 달성될 수 있다.
두 개의 아미노산 서열들 간의 퍼센트 동일성은, ALIGN 프로그램 내에 통합되어 있는, E. Meyers 및 W. Miller (문헌 [Comput. Appl. Biosci.,4:11-17 (1988)])의 알고리즘을 이용하여, PAM120 중량 잔기 표, 12의 갭 길이 페널티 및 4의 갭 페널티를 사용하여 결정될 수 있다. 추가적으로, 두 개의 아미노산 서열들 간의 퍼센트 동일성은, GCG 소프트웨어 패키지 내 GAP 프로그램 (www.gcg.com에서 입수가능) 내에 통합되어 있는 Needleman 및 Wunsch(문헌 [J. Mol. Biol. 48:444-453 (1970)])의 알고리즘을 이용하여, Blossum 62 매트릭스 또는 PAM250 매트릭스 중 어느 하나 및 16, 14, 12, 10, 8, 6, 또는 4의 갭 중량 및 1, 2, 3, 4, 5, 또는 6의 갭 길이를 사용하여 결정될 수 있다.
추가적으로 또는 대안적으로, 본 발명의 단백질 서열은 예를 들어 관련 서열을 동정하기 위하여 공공 데이터베이스에 대한 조사를 수행하기 위한 추가로 "쿼리 서열"로서 사용될 수 있다. 그러한 조사는 문헌 [Altschul, et al.(1990) J. Mol. Biol. 215:403-10]의 XBLAST 프로그램 (버전 2.0)을 이용하여 수행될 수 있다. BLAST 단백질 조사는 XBLAST 프로그램, 스코어=50, 워드렝쓰(wordlength)=3을 이용하여 수행하여 본 발명의 항체 분자에 대해 상동성인 아미노산 서열을 수득할 수 있다. 비교 목적을 위한 갭드(gapped) 배열을 수득하기 위하여, Gapped BLAST는 문헌 [Altschul et al., (1997) NucleicAcidsRes. 25(17):3389-3402]에 기재된 바와 같이 사용될 수 있다. BLAST 및 Gapped BLAST 프로그램을 이용하는 경우, 각각의 프로그램 (예를 들어, XBLAST 및 NBLAST)의 디폴트(default) 파라미터가 사용될 수 있다.
동일하지 않은 잔기 위치는 보존적 아미노산 치환에 의해 또는 비보존적 아미노산 치환에 의해 상이할 수 있다. "보존적 아미노산 치환"은 아미노산이 유사한 화학 특성 (예를 들어, 하전 또는 소수성)을 갖는 측쇄를 갖는 또다른 아미노산 잔기에 의해 치환된 것이다. 일반적으로, 보존적 아미노산 치환은 단백질의 작용적 특성을 실질적으로 변화시키지 않을 것이다. 둘 이상의 아미노산이 보존적 치환에 의해 서로 상이한 경우, 퍼센트 서열 동일성 또는 유사도는 치환의 보존적 성질에 대한 수정을 위해 상향조절될 수 있다. 비보존적 아미노산을 이용한 치환이 있는 경우, 구현예에서, 서열 동일성을 나타내는 폴리펩티드는 본 발명의 폴리펩티드 (예를 들어, 항체)의 원하는 작용 또는 활성을 보유할 것이다.
본 발명의 핵산에 대해 "서열 동일성", "서열 유사성" 또는 "서열 상동성"을 나타내는 핵산이 본 명세서에서 또한 고려된다. "상동성 서열"은 적어도 약 65%, 70%, 75%, 80%, 85%, 또는 90% 서열 동일성을 나타내는 핵산 분자의 서열을 의미한다. 다른 구현예에서, 핵산의 "상동성 서열"은 참조 핵산에 대해 93%, 95% 또는 98%의 서열 동일성을 나타낼 수 있다.
본 발명은 상기 기재된 그러한 핵산을 포함하는 벡터를 또한 제공하며, 이는 프로모터(예를 들어, WO 86/05807; WO 89/01036; 및 U.S.P.N. 5,122,464 참조); 및 진핵성 분비 경로의 다른 전사 조절 및 가공 제어 요소에 작동적으로 연결될 수 있다. 본 발명은 또한 그러한 벡터 및 숙주-발현 시스템을 품고 있는 숙주 세포를 제공한다.
본원에서 사용되는 바와 같이 용어 "숙주-발현 시스템"은, 본 발명의 핵산 또는 폴리펩티드 및 항체를 생성하도록 조작될 수 있는 임의의 유형의 세포 시스템을 포함한다. 이러한 숙주-발현 시스템은, 재조합 박테리오파지 DNA 또는 플라스미드 DNA로 형질전환되거나 트랜스펙션된 미생물(예를 들어, 이. 콜라이(E. coli) 또는 비. 서브틸리스(B. subtilis));재조합 이스트 발현 벡터로 트랜스펙션된 이스트(예를 들어, 사카로미세스(Saccharomyces)); 포유류 세포 또는 바이러스의 게놈으로부터 유래된 프로모터(예를 들어, 아데노바이러스 후기 프로모터)를 함유하는 재조합 발현 구성체를 보유하는 포유류 세포(예를 들어, COS, CHO-S, HEK293T, 3T3 세포)를 포함하나 이에 제한되지는 않는다. 숙주 세포는 2 개의 발현 벡터, 예를 들어, 중쇄 유래 폴리펩티드를 코딩하는 제1 벡터 및 경쇄 유래 폴리펩티드를 코딩하는 제2 벡터로 공동-트랜스펙션될 수 있다. 본 발명의 특히 바람직한 양태에서, 개시된 항체는 조작된 CHO 세포를 이용하여 생산될 것이다.
포유류 세포의 형질전환 방법은 당업계에 널리 공지되어 있다. 예를 들어, U.S.P.N. 4,399,216, 4,912,040, 4,740,461, 및 4,959,455를 참조한다. 숙주 세포는 또한, 다양한 특징(예를 들어, 변형된 당형태 또는 GnTIII 활성을 갖는 단백질)을 갖는 항원 결합 분자의 생성을 가능하게 하도록 조작될 수 있다.
재조합 단백질의 장기간 고수율 생성을 위해, 안정적 발현이 바람직하다. 따라서, 관련 분야에 인식된 표준 기법을 사용하여 선택된 항체를 안정적으로 발현하는 세포주를 조작할 수 있고, 이는 본 발명의 일부를 형성한다. 복제의 바이러스 근원을 함유하는 발현 벡터를 사용하기보다는, 숙주 세포는 적절한 발현 제어 요소(예를 들어, 프로모터 또는 인핸서 서열, 전사 종결자, 폴리아데닐화 자리 등), 및 선택가능 마커에 의해 제어된 DNA로 형질전환될 수 있다. 선택된 조건 하에 발현을 증대시키기에 효율적인 접근을 제공하는 글루타민 신테타제 유전자 발현 시스템(GS 시스템)을 포함하는, 당업계에 널리 공지된 임의의 선택 시스템이 사용될 수 있다. GS 시스템은 EP 0 216 846, EP 0 256 055, EP 0 323 997 및 EP 0 338 841 및 U.S.P.N. 5,591,639 및 5,879,936과 관련하여 전체적으로 또는 부분적으로 논의되어 있다. 안정적인 세포주의 발달을 위한 또 다른 상용가능한 발현 시스템은 프리덤(Freedom)™ CHO-S 키트(라이프 테크놀로지스(Life Technologies))이다.
본 발명의 항체가 재조합 발현 또는 개시된 기법 중 임의의 기타 다른 것에 의해 생성되면, 이는 당업계에 공지된 방법에 의해 정제 또는 단리될 수 있으며, 이는 그의 자연 환경으로부터 식별 및 분리 및/또는 회수되고, 항체 또는 관련 ADC에 대한 진단 또는 치료적 사용을 방해하는 오염물로부터 분리된다. 단리된 항체는 재조합 세포 내의 계내 항체를 포함한다.
이들 단리된 제조물을 다양한 관련 분야에 인식된 기법, 예컨대 이온 교환 및 크기 배제 크로마토그래피, 투석, 희석여과, 및 친화성 크로마토그래피, 특히 단백질 A 또는 단백질 G 친화성 크로마토그래피를 사용하여 정제할 수 있다. 상용성 방법이 아래 실시예에서 더욱 완전히 논의된다.
6. 생성후 선택
어떻게 얻어지든, 항체-생성 세포(예를 들어, 하이브리도마, 이스트 콜로니 등)를, 예를 들어, 강건한 성장, 높은 항체 생성 및 바람직한 항체 특징, 예컨대 관심 항원에 대한 높은 친화성을 포함하는 바람직한 특징을 위해 선택하고, 클로닝하고, 추가로 스크리닝할 수 있다. 하이브리도마를 세포 배양에서 시험관 내 또는 공통유전자 면역손상된 동물에서 생체 내 확장시킬 수 있다. 하이브리도마 및/또는 콜로니의 선택, 클로닝 및 확장 방법은 당업자에게 널리 공지되어 있다. 요망되는 항체가 식별되면, 관련 분야에 인식된 통상의 분자 생물학 및 생화학 기법을 사용하여 관련 유전 물질을 단리하고, 조작하고, 발현시킬 수 있다.
나이브(naive) 라이브러리(천연 또는 합성)에 의해 생성된 항체는 중간 정도의 친화성 (약 106 M-1 내지 107 M-1의 Ka)을 가질 수 있다. 친화성 증대를 위해, 항체 라이브러리를 구성하고(예를 들어, 오류 유발 폴리머라제를 사용하여 랜덤 돌연변이를 시험관 내 도입), 이들 제2 라이브러리로부터 항원에 대한 높은 친화성을 갖는 항체를 재선택(예를 들어, 파지 또는 이스트 디스플레이 사용)함으로써 친화성 성숙을 시험관 내에서 모방할 수 있다. WO 9607754에, 경쇄 유전자의 라이브러리를 생성하도록 면역글로불린 경쇄의 CDR에서 돌연변이생성을 유도하는 방법이 기재되어 있다.
파지 또는 이스트 디스플레이를 포함하나 이에 제한되지는 않는 다양한 기법을 사용하여 항체를 선택할 수 있으며, 여기서는 인간 복합적 항체 또는 scFv 단편의 라이브러리를 파지 또는 이스트 상에서 합성하고, 라이브러리를 관심 항원 또는 그의 항체-결합 부분으로 스크리닝하고, 항원에 결합된 파지 또는 이스트를 단리하고, 이로부터 항체 또는 면역반응성 단편을 얻을 수 있다(Vaughan et al., 1996, PMID: 9630891; Sheets et al., 1998, PMID: 9600934; Boder et al., 1997, PMID: 9181578; Pepper et al., 2008, PMID: 18336206). 파지 또는 이스트 디스플레이 라이브러리의 생성을 위한 키트는 상업적으로 입수가능하다. 또한, 항체 디스플레이 라이브러리를 생성하고 스크리닝하는 데 사용될 수 있는 기타 다른 방법 및 시약이 존재한다(U.S.P.N. 5,223,409; WO 92/18619, WO 91/17271, WO 92/20791, WO 92/15679, WO 93/01288, WO 92/01047, WO 92/09690; 및 문헌 [Barbas et al., 1991, PMID: 1896445] 참조). 이러한 기법은 유리하게, 다수의 후보 항체의 스크리닝을 가능하게 하고, 서열의 비교적 용이한 조작을 제공한다(예를 들어, 재조합 셔플링에 의해).
IV. 항체의 특징
특정 구현예에서, 항체-생성 세포(예를 들어, 하이브리도마, 이스트 콜로니 등)를, 유리한 성질, 예를 들어, 강건한 성장, 높은 항체 생성, 및 하기에서 보다 상세히 논의되는 바와 같은, 바람직한 위치 특이적 항체 특징을 위해 선택하고, 클로닝하고, 추가로 스크리닝할 수 있다. 다른 경우, 항체의 특징은, 특정 항원(예를 들어, 특이적 DLL3 아이소폼) 또는 동물 접종을 위한 표적 항원의 면역반응성 단편을 선택함으로써 부여될 수 있다. 또 다른 구현예에서, 선택된 항체를, 친화성 또는 약동학과 같은 면역화학적 특징을 증대시키거나 세밀화하기 위해 상기에 기재된 바와 같이 조작할 수 있다.
A. 중화 항체
특정 구현예에서, 컨쥬게이트는 "중화" 항체 또는 그의 유도체 또는 단편을 포함할 것이다. 즉, 본 발명은 특정 도메인, 모티프 또는 에피토프에 결합하고, DLL3의 생물학적 활성을 차단, 감소 또는 억제할 수 있는 항체 분자를 포함할 수 있다. 더욱 일반적으로, 용어 "중화 항체"는 표적 분자 또는 리간드와 결합하거나 상호작용하고, 표적 분자의 수용체 또는 기질과 같은 결합 파트너의 결합 또는 연합을 방지하여, 그렇지 않은 경우 분자의 상호작용으로부터 초래될 수 있는 생물학적 반응을 방해하는 항체를 지칭한다.
당 기술 분야에 알려진 경쟁적 결합 분석을 사용하여 항체의 결합 및 특이성 또는 면역학적으로 작용성인 이의 단편 또는 유도체를 평가할 수 있음이 이해될 것이다. 본 발명과 관련하여, 항체 또는 단편이, 과량의 항체가 DLL3에 결합된 결합 파트너의 양을, 예를 들어 노치 수용체 활성에 의해 또는 시험관 내 경쟁적 결합 분석으로 측정시 적어도 약 20%, 30%, 40%, 50%, 60%, 70%, 80%, 85%, 90%, 95%, 97%, 99% 이상 감소시키는 경우, DLL3의 결합 파트너 또는 기질로의 결합을 억제 또는 감소하도록 의도될 것이다. DLL3에 대한 항체의 경우, 예를 들어 중화 항체 또는 길항제는 바람직하게는 노치 수용체 활성을 적어도 약 20%, 30%, 40%, 50%, 60%, 70%, 80%, 85%, 90%, 95%, 97%, 99% 이상 변경시킬 것이다. 이러한 변경된 활성은 당 분야에서 인식된 기술을 이용하여 직접 측정될 수 있거나, 변경된 활성이 하류에 갖는 영향 (예를 들어, 종양발생, 세포 생존 또는 노치 반응성 유전자의 활성화 또는 저해)에 의해 측정될 수 있음이 이해될 것이다. 바람직하게는, DLL3 활성을 중화하는 항체의 능력은, 노치 수용체에 결합하는 DLL3의 억제에 의해 또는 노치 신호화의 DLL3 매개된 저해를 완화시키는 그의 능력을 평가함에 의해 평가된다.
B. 내재화 항체
특정 구현예에서, 항체가 결정인자에 결합하고, 종양형성 세포를 포함하는 선택된 표적 세포 내로 (임의의 컨쥬게이트된 약학적으로 활성인 모이어티를 따라) 내재화되도록, 항체는 내재화 항체를 포함할 수 있다. 내재화된 항체 분자의 수는 항원-발현 세포, 특히 항원-발현 종양형성성 세포를 사멸시키기에 충분할 수 있다. 항체 또는 일부 경우에서 항체 약물 컨쥬게이트의 효능에 따라, 단일 항체 분자의 세포 내로의 흡수는 항체에 결합하는 표적 세포를 사멸시키기에 충분할 수 있다. 본 발명에 관하여, 발현된 DLL3 단백질의 상당한 부분은 종양형성 세포 표면과 연결되어 잔류하여, 이에 의해 개시된 항체 또는 ADC의 국소화 및 내재화를 허용한다는 증거가 존재한다. 선택된 구현예에서, 그러한 항체는 내재화시 세포를 사멸시키는 하나 이상의 약물과 연결 또는 그에 컨쥬게이트될 것이다. 일부 구현예에서, 본 발명의 ADC는 내재화 자리-특이적 ADC를 포함할 것이다.
본 명세서에 사용된 바와 같이, "내재화하는" 항체는 연관된 결정인자에 대한 결합시 표적 세포에 의해 (임의의 컨쥬게이트된 세포독소를 따라) 취득되는 것이다. 내재화된 그러한 ADC의 수는 바람직하게는 결정인자-발현 세포, 특히 결정인자-발현 암 줄기 세포를 사멸시키기에 충분할 것이다. 세포독소 또는 ADC 전체의 효능에 따라, 일부 경우들에서, 몇몇 항체 분자의 세포 내로의 흡수는 항체가 결합하는 표적 세포를 사멸시키는데 충분하다. 예를 들어, PBD 또는 칼리케아마이신과 같은 소정의 약물은 강해서, 항체에 컨쥬게이트된 독소의 적은 분자의 내재화도 표적 세포를 사멸시키기에 충분하다. 포유류 세포에 결합시 항체가 내재화되는지의 여부는, 다양한 관련 분야에 인식된 분석(예를 들어, 사포린 분석, 예컨대 Mab-Zap 및 Fab-Zap; 고급 표적화 시스템)에 의해 결정될 수 있다. 항체가 세포 내로 내재화되는지의 여부를 검출하는 방법은 또한 U.S.P.N. 7,619,068에 기재되어 있다.
C. 감손 항체
다른 구현예에서, 본 발명의 항체는 감손 항체이다. 용어 "감손" 항체는, 바람직하게 세포 표면 상의 또는 그 근처의 항원에 결합되고, 세포의 사멸을 유도, 촉진 또는 유발하는(예를 들어, CDC, ADCC 또는 세포독성제의 도입에 의해) 항체를 지칭한다. 구현예에서, 선택된 감손 항체는 세포독소에 컨쥬게이션될 것이다.
바람직하게는 감손 항체는, 한정된 세포 개체군에서 적어도 20%, 30%, 40%, 50%, 60%, 70%, 80%, 85%, 90%, 95%, 97%, 또는 99%의 DLL3-발현 세포를 사멸시킬 수 있다. 일부 구현예에서, 세포 개체군은 암 줄기 세포를 포함하는, 풍부화된, 구역화된, 정제된 또는 단리된 종양형성 세포를 포함할 수 있다. 다른 구현예에서, 세포 개체군은 전체 종양 샘플 또는 암 줄기 세포를 포함하는 이질 종양 추출물을 포함할 수 있다. 표준 생화학 기법을 사용하여 본원의 교시내용에 따른 종양형성 세포의 감손을 모니터링하고 정량할 수 있다.
D. 결합 친화성
특이적 결정인자, 예를 들어 DLL3에 대한 높은 결합 친화도를 갖는 항체가 본 명세서에 개시된다. 용어 "KD"는 특정 항체-항원 상호작용의 해리 상수 또는 겉보기 친화도를 지칭한다. 본 발명의 항체는, 해리 상수 KD(k오프(off)/k온(on))가 ≤≤ 10-7 M인 경우에 그의 표적 항원에 면역특이적으로 결합될 수 있다. 항체는, KD가 ≤≤ 5×10-9 M인 경우에 높은 친화성으로, 또한 KD가 ≤≤ 5×10-10 M인 경우에 매우 높은 친화성으로 항원에 특이적으로 결합된다. 본 발명의 하나의 구현예에서, 항체는 ≤≤ 10-9 M의 KD 및 약 1×10-4/초의 오프-속도를 갖는다. 본 발명의 하나의 구현예에서, 오프-속도는 < 1x10-5 /초이다. 본 발명의 다른 구현예에서, 항체는 약 10-7 M 내지 10-10 M의 KD로 결정인자에 결합될 것이고, 또한 또 다른 구현예에서, 이는 KD ≤≤ 2×10-10 M로 결합될 것이다. 본 발명의 또 다른 선택된 구현예는, 10-6 M 미만, 5x10-6 M 미만, 10-7 M 미만, 5x10-7 M 미만, 10-8 M 미만, 5×10-8 M 미만, 10-9 M 미만, 5x10-9 M 미만, 10-10 M 미만, 5×10-10 M 미만, 10-11 M 미만, 5×10-11 M 미만, 10-12 M 미만, 5x10-12 M 미만, 10-13 M 미만, 5×10-13 M 미만, 10-14 M 미만, 5×10-14 M 미만, 10-15 M 미만 또는 5×10-15 M 미만의 KD(k오프/k온)를 갖는 항체를 포함한다.
특정 구현예에서, 결정인자 예를 들어 DLL3에 면역특이적으로 결합되는 본 발명의 항체는, 적어도 105 M-ls-l, 적어도 2×105 M-ls-l, 적어도 5×105 M-ls-l, 적어도 106 M-ls-l, 적어도 5×106 M-ls-l, 적어도 107 M-ls-l, 적어도 5×107 M-ls-l, 또는 적어도 108 M-ls-l의 회합 속도 상수 또는 k온(또는 ka) 속도(항체 + 항원(Ag)k 온←항체-Ag)를 가질 수 있다.
또 다른 구현예에서, 결정인자 예를 들어 DLL3에 면역특이적으로 결합되는 본 발명의 항체는, 10-1s-1 미만, 5×10-1s-1 미만, 10-2s-1 미만, 5×10-2s-1 미만, 10-3s-1 미만, 5×10-3s-1 미만, 10-4s-1 미만, 5×104s-1 미만, 10-5s-1 미만, 5×10-5s-1 미만, 10-6s-1 미만, 5×10-6s-1 미만, 10-7s-1 미만, 5×10-7s-1 미만, 10-8s-1 미만, 5×10-8s-1 미만, 10-9s-1 미만, 5×10-9s-1 미만 또는 10-10s-1 미만의 해리 속도 상수 또는 k오프(또는 kd) 속도(항체 + 항원(Ag)k 오프←항체-Ag)로 결정인자에 면역특이적으로 결합된다.
결합 친화성은 당업계에 공지된 다양한 기법, 예를 들어, 표면 플라즈몬 공명, 바이오-층 간섭측정법, 이중 편파 간섭측정법, 정적 광 산란, 동적 광 산란, 등온 적정 열량측정법, ELISA, 분석 초원심분리, 및 유동 세포측정법을 사용하여 측정될 수 있다.
E. 비닝(Binning) 및 에피토프 맵핑
본 명세서에 개시된 항체는 이들이 연결되는 별개의 에피토프 면에서 특징될 수 있다. "에피토프"는 항체 또는 면역반응성 단편이 특이적으로 결합하는 결정인자의 부분(들)이다. 면역특이적 결합은, 상기 기재된 바와 같이, 결합 친화도에 근거하여, 또는 단백질 및/또는 거대분자의 복합 혼합물에 그의 표적 항원의 항체에 의한 우선적 인식에 의해 (예를 들어, 경쟁 분석에서) 확인 및 규정될 수 있다. "선형 에피토프"는 항체의 면역특이적 결합을 허용하는 항원에서 연속적인 아미노산에 의해 형성된다. 선형 에피토프에 우선적으로 결합하는 능력은, 항원이 변질된 경우에도 통상적으로 유지된다. 역으로, "구조적(conformational) 에피토프"는 일반적으로 항원의 아미노산 서열에서 비연속적 아미노산을 포함하지만, 항원의 2차, 3차 또는 4차 구조의 맥락에서, 충분히 가까와서 단일 항체에 의해 부수적으로 결합된다. 구조적 에피토프를 갖는 항원이 변성된 경우, 항체는 통상적으로 항원을 더이상 인식하지 않을 것이다. (연속적 또는 비연속적) 에피토프는 독특한 공간 형태에서 통상적으로 적어도 3 개, 그리고 더욱 일반적으로 적어도 5 개 또는 8-10 개 또는 12-20 개의 아미노산을 포함한다.
기 또는 항체가 속하는 "빈(bin)" 면에서 본 발명의 항체를 특징짓는 것이 또한 가능하다. "비닝(binning)"은 면역원성 결정인자를 동시에 사용할 수 없는 항체의 쌍을 동정하기 위한 경쟁적 항체 결합 분석의 이용을 지칭하며, 이에 의해 결합에 대해 "경쟁하는" 항체가 동정된다. 시험되는 항체 또는 면역학적으로 작용성인 단편이 참조 항체의 일반 항원으로의 특이적 결합을 방지 또는 억제하는 분석에 의해, 경쟁 항체가 결정될 수 있다. 통상적으로, 이러한 분석은, 비-표지된 시험 항체, 표지된 기준 항체, 및 고체 표면 또는 세포에 결합된 정제된 항원(예를 들어 DLL3 또는 그의 도메인 또는 단편)의 사용을 포함한다. 경쟁적 억제는, 시험 항체의 존재 하에 고체 표면 또는 세포에 결합된 표지의 양을 결정함으로써 측정된다. 경쟁적 결합을 측정하는 방법에 대한 추가의 상세사항은 본원 실시예에서 제공된다. 통상적으로, 경쟁 항체가 과량으로 존재하는 경우, 이는 공통 항원에 대한 기준 항체의 특이적 결합을 적어도 30%, 40%, 45%, 50%, 55%, 60%, 65%, 70% 또는 75%만큼 억제할 것이다. 일부 경우, 결합은 적어도 80%, 85%, 90%, 95%, 또는 97% 또는 그 이상만큼 억제된다. 역으로, 기준 항체가 결합되는 경우, 이는 바람직하게는 후속 첨가된 시험 항체(즉, DLL3 항체)의 결합을 적어도 30%, 40%, 45%, 50%, 55%, 60%, 65%, 70% 또는 75%만큼 억제할 것이다. 일부 경우, 시험 항체의 결합은 적어도 80%, 85%, 90%, 95%, 또는 97% 또는 그 이상만큼 억제된다.
일반적으로 비닝 또는 경쟁적 결합은 관련 분야에 인식된 다양한 기법, 예컨대 면역분석, 예컨대 웨스턴 블롯, 방사면역분석, 효소 연결 면역흡착 분석(ELISA), "샌드위치" 면역분석, 면역침전 분석, 침전소 반응, 겔 확산 침전소 반응, 면역확산 분석, 응집 분석, 보체-결합 분석, 면역방사측정 분석, 형광 면역분석 및 단백질 A 면역분석을 사용하여 측정할 수 있다. 이러한 면역분석은 일상적인 것이며, 당업계에 널리 공지되어 있다(문헌 [Ausubel et al, eds, (1994) CurrentProtocols in Molecular Biology, Vol. 1, John Wiley & Sons, Inc., New York] 참조). 추가로, 교차-블록킹 분석이 사용될 수 있다(예를 들어, WO 2003/48731; 및 문헌 [Harlow et al. (1988) Antibodies, A Laboratory Manual, Cold Spring Harbor Laboratory, Ed Harlow and David Lane] 참조).
경쟁적 억제(또한 그에 따라 "빈")의 측정에 사용되는 다른 기술은, 예를 들어, 비아코어(BIAcore)™ 2000 시스템(지이 헬쓰케어(GE Healthcare))을 사용하는 표면 플라즈몬 공명; 예를 들어, 포르테바이오(ForteBio)® 옥텟(Octet) RED(포르테바이오)를 사용하는 바이오-층 간섭측정법; 예를 들어, 팍스칸토(FACSCanto) II(비디 바이오사이언스(BD Biosciences)) 또는 복합 루미넥스(LUMINEX)™ 검출 분석(루미넥스)을 사용하는 유동 세포측정 비드 어레이를 포함한다.
루미넥스는, 대규모 복합 항체 쌍 형성을 가능하게 하는 비드에 기초한 면역분석 플랫폼이다. 분석은 표적 항원에 대한 항체 쌍의 동시 결합 패턴을 비교한다. 쌍에서 하나의 항체(캡쳐 mAb)는 루미넥스 비드에 결합되고, 여기서 각각의 캡쳐 mAb는 상이한 색의 비드에 결합된다. 기타 다른 항체(디텍터 mAb)는 형광 신호(예를 들어, 피코에리트린(PE))에 결합된다. 분석에서는, 항원에 대한 항체의 동시 결합(쌍 형성)을 분석하고, 유사한 쌍 형성 프로파일을 갖는 항체를 함께 그룹화한다. 디텍터 mAb 및 캡쳐 mAb의 유사한 프로파일은, 두 항체가 동일한 또는 가깝게 관련되는 에피토프에 결합됨을 나타낸다. 하나의 구현예에서, 쌍 형성 프로파일은, 시험되는 항체의 패널 상에서 임의의 특정 항체에 가장 가깝게 상관되는 항체를 식별하는 피어슨(Pearson) 상관 계수를 사용하여 측정될 수 있다. 구현예에서, 항체 쌍의 피어슨 상관 계수가 적어도 0.9인 경우, 시험/디텍터 mAb는 기준/캡쳐 mAb와 동일한 빈 내에 있는 것으로 결정될 것이다. 다른 구현예에서, 피어슨 상관 계수는 적어도 0.8, 0.85, 0.87 또는 0.89이다. 추가의 구현예에서, 피어슨 상관 계수는 적어도 0.91, 0.92, 0.93, 0.94, 0.95, 0.96, 0.97, 0.98, 0.99 또는 1이다. 루미넥스 분석으로부터 얻어진 데이터를 분석하는 기타 다른 방법은 U.S.P.N. 8,568,992에 기재되어 있다. 루미넥스가 100 개의 상이한 유형의 비드(또는 그 이상)를 분석하는 능력은, 거의 무제한의 항원 및/또는 항체 표면을 동시에 제공하고, 이는 바이오센서 분석 상에서 항체 에피토프 프로파일링에 있어 개선된 처리량 및 해상도를 제공한다(Miller, et al., 2011, PMID: 21223970).
유사하게, 표면 플라즈몬 공명을 포함하는 비닝 기술은 본 발명과 상용성이다. 본 명세서에서 사용된 바와 같은 "표면 플라즈몬 공명"은, 바이오센서 매트릭스 내 단백질 농도에서의 변경의 검출에 의한 실시간 특이적 상호작용의 분석을 허용하는 광학 현상을 지칭한다. BIAcore™ 2000 시스템과 같은 상업적으로 이용가능한 설비를 이용하여, 선택된 항체가 정의된 항원에 대한 결합에 대해 서로 경쟁하는 경우 이는 쉽게 결정될 수 있다.
다른 구현예에서, 시험 항체가 기준 항체와 결합에 있어 "경쟁"하는지의 여부를 결정하는 데 사용될 수 있는 기법은, 2 개의 표면: 바이오센서 팁 상의 부동화된 단백질의 층, 및 내부 기준 층으로부터 반사된 백색광의 간섭 패턴을 분석하는 광학 분석 기법, "바이오-층 간섭측정법"이다. 바이오센서 팁에 결합된 분자 수의 임의의 변화는 간섭 패턴에서의 변위를 일으키고, 이는 실시간으로 측정될 수 있다. 이러한 바이오층 간섭측정법 분석은 하기와 같이 포르테바이오® 옥텟 RED 기계를 사용하여 수행할 수 있다. 기준 항체(Ab1)를 항마우스 캡쳐 칩 상에 캡쳐링하고, 이어서 고농도의 비-결합 항체를 사용하여 칩을 블록킹하고, 기준선을 수집한다. 이어서, 단량체, 재조합 표적 단백질을 특정 항체(Ab1)에 의해 캡쳐링하고, 팁을 대조군과 동일한 항체(Ab1)를 갖는 웰 내에 또는 상이한 시험 항체(Ab2)를 갖는 웰 내에 침지시킨다. 대조군 Ab1와의 결합 수준 비교에 의해 측정시, 추가의 결합이 나타나지 않는 경우, Ab1 및 Ab2는 "경쟁" 항체인 것으로 결정된다. Ab2에서 추가의 결합이 나타나는 경우, Ab1 및 Ab2는 서로 경쟁하지 않는 것으로 결정된다. 이 과정을 확장시켜 독특한 빈을 나타내는 96-웰 플레이트 내의 항체의 전체 행(row)을 사용하여 독특한 항체의 큰 라이브러리를 스크리닝할 수 있다. 구현예에서, 기준 항체가 공통 항원에 대한 시험 항체의 특이적 결합을 적어도 40%, 45%, 50%, 55%, 60%, 65%, 70% 또는 75%만큼 억제하는 경우, 시험 항체는 기준 항체와 경쟁할 것이다. 다른 구현예에서, 결합은 적어도 80%, 85%, 90%, 95%, 또는 97% 또는 그 이상만큼 억제된다.
경쟁 항체의 그룹을 포함하는 빈이 한정되면, 항체 군이 결합되는 항원 상의 특정 도메인 또는 에피토프를 측정하기 위해 추가의 특성화가 수행될 수 있다. 문헌 [Cochran et al., 2004, PMID: 15099763]에 기재된 프로토콜의 변형을 사용하여 도메인-수준 에피토프 맵핑을 수행할 수 있다. 미세 에피토프 맵핑은, 항체가 결합되는 결정인자의 에피토프를 포함하는 항원 상의 특정 아미노산을 측정하는 방법이다.
특정 구현예에서, 미세(fine) 에피토프 맵핑은 파지 또는 이스트 디스플레이를 이용하여 수행될 수 있다. 다른 상용성 에피토프 맵핑 기술은 알라닌 주사 돌연변이체, 펩티드 블롯 (문헌 [Reineke, 2004, PMID: 14970513]), 또는 펩티드 분열 분석을 포함한다. 추가적으로, 단백 분해 효소와 같은 효소 (예를 들어, 트립신, 엔도프로테나아제 Glu-C, 엔도프로테나아제 Asp-N, 키모트립신, 등); 숙신이미딜 에스테르와 같은 화학 작용제 및 이의 유도체, 일차 아민-함유 화합물, 하이드라진 및 카보하이드라진, 자유 아미노산, 등을 이용하여 에피토프 절제, 에피토프 추출 및 항원의 화학적 변형과 같은 방법이 사용될 수 있다 (Tomer, 2000, PMID: 10752610). 또다른 구현예에서, 항원 구조-기반 항체 프로파일링 (ASAP)로도 알려진, 변형-보조된 프로파일링을 사용하여, 화학적으로 또는 효소적으로 변형된 항원 표면에 대한 각각의 항체의 결합 프로파일의 유사성에 따라, 동일한 항원에 대하여 다수의 모노클로날 항체를 분류할 수 있다 (U.S.P.N. 2004/0101920).
항원 상에서 원하는 에피토프가 일단 결정되면, 예를 들어 본 명세서에 기재된 기술을 이용하여 선택된 에피토프를 포함하는 펩티드를 이용하여 면역화함으로써 그 에피토프에 대한 추가의 항체를 생성하는 것이 가능하다.
V. 항체 컨쥬게이트
일부 구현예에서, 본 발명의 항체는 약학적으로 활성이거나 진단적인 모이어티와 컨쥬게이트될 수 있어서 "항체 약물 컨쥬게이트" (ADC) 또는 "항체 컨쥬게이트"를 형성한다. 용어 "컨쥬게이트"는 광범위하게 사용되며, 연결 방법에 관계없이, 임의의 약학적으로 활성이거나 진단적인 모이어티의 본 발명의 항체와의 공유 또는 비공유 연결을 의미한다. 특정 구현예에서 연결은 항체의 리신 또는 시스테인 잔기를 통하여 실행된다. 일부 구현예에서 약학적으로 활성 또는 진단적인 모이어티는 하나 이상의 위치 특이적 자유 시스테인(들)을 통하여 항체에 컨쥬게이트될 수 있다. 개시된 ADC는 치료 및 진단 목적을 위해 사용될 수 있다.
본 발명의 ADC는 표적 위치로 세포독소 또는 기타 페이로드를 전달하는 데 사용될 수 있다 (예를 들어, 종양형성 세포 및/또는 DLL3를 발현하는 세포). 본 명세서에서 사용된 바와 같은 용어 "약물" 또는 "탄두"는 상호교환가능하게 사용될 수 있으며, 생물학적으로 활성이거나 검출가능한 분자 또는 약물을 의미할 것이며, 아래 기재되는 바와 같은 항암제 및 세포독소를 포함한다. "페이로드"는 선택적인 링커 화합물과 조합된 약물 또는 "탄두"를 포함할 수 있다. 컨쥬게이트 상 "탄두"는 펩티드, 단백질 또는 전구약물을 포함할 수 있으며, 이들은 생체 내 활성제, 중합체, 핵산 분자, 소분자, 결합제, 모방제, 합성 약물, 무기 분자, 유기 분자 및 방사성동위원소로 대사된다. 유리한 구현예에서, 개시된 ADC는 탄두를 방출 및 활성화하기 전에 상대적으로 비반응성, 비독성 상태로 결합된 페이로드를 표적 위치로 유도할 것이다. 탄두의 이러한 표적된 방출은 바람직하게는 페이로드 및 과잉-컨쥬게이트된 독성 ADC 종을 최소화하는 ADC 제제의 상대적으로 균질한 조성물의 안정한 컨쥬게이션을 통하여 (예를 들어, 항체 상에서 하나 이상의 시스테인을 통해)달성된다. 종양 위치로 일단 전달되면 탄두를 대량 방출하도록 설계된 약물 링커와 커플링되어, 본 발명의 컨쥬게이트는 바람직하지 않은 비특이적 독성을 실질적으로 감소시킬 수 있다. 이는 종양 위치에서 상대적으로 높은 수준의 활성 세포독소를 유리하게 제공하는 한편, 비표적된 세포 및 조직의 노출을 최소화하여 증진된 치료 지수를 제공한다.
본 발명의 일부 구현예가 치료 모이어티를 포함하는 페이로드 (예를 들어, 세포독소)를 포함하는 한편, 진단제 및 생체적합성 변형제를 포함하는 기타 페이로드는 개시된 컨쥬게이트에 의해 제공되는 표적된 방출로부터 이익을 얻을 수 있다는 것이 이해될 수 있다. 따라서, 예시적인 치료 페이로드에 관한 임의의 개시 내용은, 문맥에 의해 달리 지시되지 않는 한, 본 명세서에서 논의된 바와 같은 진단제 또는 생체적합성 변형제를 포함하는 페이로드에 또한 적용가능하다. 선택된 페이로드는 공유결합적으로 또는 비공유결합적으로 항체에 결합될 수 있고, 적어도 부분적으로 컨쥬게이션을 실행하기 위해 사용된 방법에 따라 다양한 화학양론적 몰 비율을 나타낼 수 있다. 본 발명의 컨쥬게이트는 일반적으로 다음 식에 의해 표시될 수 있다:
Ab-[L-D]n 또는 이의 약학적으로 허용가능한 염으로, 식에서
a) Ab는 항-DLL3 항체를 포함하고;
b) L은 선택적 링커를 포함하고;
c) D는 약물을 포함하고; 및
d) n은 약 1 내지 약 20의 정수이다.
당업자는 상기 언급된 식에 따른 컨쥬게이트가 다수의 상이한 링커 및 약물을 이용하여 제작될 수 있음과 컨쥬게이션 방법론은 성분의 선택에 따라 달라질 것임을 이해할 것이다. 그와 같이, 개시된 항체의 반응성 잔기 (예를 들어, 시스테인 또는 리신)와 연결되는 임의의 약물 또는 약물 링커 화합물은 본 명세서에서의 교시와 상용가능하다. 유사하게, 선택된 약물의 항체로의 컨쥬게이션 (위치 특이적 컨쥬게이션 포함)을 허용하는 임의의 반응 조건은 본 발명의 범주 내에 속한다. 상기 내용에도 불구하고, 본 발명의 일부 구현예는, 본 명세서에서 설명된 바와 같은 약한 환원제와 함께 안정화제를 이용하여, 약물 또는 약물 링커의 자유 시스테인으로의 선택적 컨쥬게이션을 포함한다. 그러한 반응 조건은 덜 비특이적인 컨쥬게이션 및 오염물을 갖고, 그에 따라 덜 독성인 더욱 균질한 제제를 제공하는 경향이 있다.
A. 페이로드 및 탄두
1. 치료제
본 발명의 항체는 세포독성제 (또는 세포독소), 세포증식억제제, 항-혈관형성제, 감량제, 화학치료제, 방사성치료제, 표적된 항암제, 생물학적 반응 변형제, 암 백신, 시토카인, 호르몬 요법, 항-전이제 및 면역치료제를 포함하지만 이에 한정되지 않는 항암제와 같은, 치료 모이어티 또는 약물인 약학적으로 활성인 모이어티와, 컨쥬게이트, 연결 또는 융합 또는 다르게는 연관될 수 있다.
예시적인 항암제 또는 세포독소 (동족체 및 이의 유도체를 포함)는, 1-디하이드로테스토스테론, 안트라마이신, 악티노마이신 D, 블레오마이신, 칼리케아마이신 (n-아세틸 칼리케아마이신 포함), 콜히친, 시클로포스파미드, 시토칼라신 B, 닥티노마이신 (이전에는 악티노마이신), 다이히드록시 안트라신, 다이온, 듀오카마이신, 에메틴, 에피루비신, 에티디움 브로마이드, 에토포시드, 글루코코르티코이드, 그라마이시딘 D, 리도카인, 마이탄시노이드, 예컨대 DM-1 및 DM-4 (Immunogen), 미트라마이신, 마이토마이신, 마이토잔트론, 파클리탁셀, 프로카인, 프로프라놀올, 퓨로마이신, 테노포사이드, 테트라카인 및 약학적으로 허용가능한 염 또는 용매화물, 산 또는 상기의 임의의 유도체를 포함한다.
추가적인 상용성 세포독소는 돌라스타틴 및 모노메틸 오리스타틴 E (MMAE) 및 모노메틸 오리스타틴 F (MMAF) (Seattle Genetics)를 포함하는 오리스타틴, 아마니틴, 예컨대 알파-아마니틴, 베타-아마니틴, 감마-아마니틴 또는 엡실론-아마니틴 (Heidelberg Pharma), DNA 작은 그루브(groove) 결합제, 예컨대 듀오카마이신 유도체 (Syntarga), 알킬화제, 예컨대 변형된 또는 이량체성 피롤로벤조디아제핀 (PBD), 메클로에타민, 티오에파(thioepa), 클로람부실, 멜팔란, 카무스틴 (BCNU), 로무스틴 (CCNU), 시클로토스파미드(cyclothosphamide), 부설판, 다이브로모만니톨, 스트렙토조토신, 마이토마이신 C 및 시스디클로로다이아민 백금 (II) (DDP) 시스플라틴, 스플라이싱 억제제, 예컨대 메야마이신 유사체 또는 유도체 (예를 들어, U.S.P.N. 7,825,267에 설명된 바와 같은 FR901464), 관형 결합제, 예컨대 에포틸론 유사체 및 튜불리신, 파클리탁셀 및 DNA 손상제, 예컨대 칼리케아마이신 및 에스페라마이신, 항대사제, 예컨대 메토트랙세이트, 6-머캡토퓨린, 6-티오구아닌, 시타라빈, 및 5-플루오로우라실 데카바진, 항-유사분열제, 예컨대 빈블라스틴 및 빈크리스틴 및 안트라사이클린, 예컨대 다우노루비신 (이전에 다우노루비신) 및 독소루비신 및 약학적으로 허용가능한 염 또는 용매화물, 산 또는 상기 임의의 유도체를 포함한다.
선택된 구현예에서, 본 발명의 항체는 항-CD3 결합 분자와 연결되어 세포독성 T-세포를 구성하고 이들이 종양형성 세포를 표적하도록 할 수 있다 (BiTE technology; 예를 들어, 문헌 [Fuhrmann et. al. (2010) Annual Meeting of AACR Abstract No. 5625] 참조).
추가의 구현예에서, 본 발명의 ADC는 적절한 링커를 이용하여 컨쥬게이트된 치료적 방사성동위원소를 포함하는 세포독소를 포함할 수 있다. 그러한 구체예와 상용성일 수 있는 예시적인 방사성동위원소는 요오드 (131I, 125I, 123I, 121I,), 탄소 (14C), 구리 (62Cu,64Cu,67Cu),황 (35S), 라듐 (223R), 트리튬 (3H), 인듐 (115In, 113In, 112In, 111In,), 비스무트 (212Bi, 213Bi), 테크네튬 (99Tc), 탈륨 (201Ti), 갈륨 (68Ga, 67Ga), 팔라듐 (103Pd), 몰리브데늄 (99Mo), 제논 (133Xe), 불소 (18F), 153Sm, 177Lu,159Gd, 149Pm, 140La, 175Yb, 166Ho, 90Y, 47Sc, 186Re, 188Re, 142Pr, 105Rh, 97Ru,68Ge, 57Co, 65Zn, 85Sr, 32P, 153Gd, 169Yb, 51Cr, 54Mn, 75Se, 113Sn, 117Sn, 225Ac, 76Br, 및 211At를 포함하지만 이로 한정되지는 않는다. 기타 방사성핵종, 특히 60 내지 4,000 keV의 에너지 범위 내의 것들 또한 진단제 및 치료제로 이용가능하다.
다른 선택된 구현예에서, 본 발명의 ADC는 세포독성 벤조다이아제핀 유도체 탄두에 컨쥬게이트될 것이다. 개시된 항체에 컨쥬게이트될 수 있는 상용성 벤조다이아제핀 유도체 (및 선택적 링커)는, 예를 들어 U.S.P.N. 8,426,402 및 PCT 출원 WO2012/128868 및 WO2014/031566에 기재되어 있다. 아래 논의되는 PBD와 같이, 상용성 벤조다이아제핀 유도체는 DNA의 작은 그루브에 결합하고, 핵산 합성을 억제하는 것으로 생각된다. 그러한 화합물은 강력한 항종양 특성을 갖는 것으로 보고되며, 이와 같이, 본 발명의 ADC에서의 사용에 특히 적합하다.
특정 구현예에서, 본 발명의 ADC는 PBD, 및 약학적으로 허용가능한 염 또는 용매화물, 산 또는 이의 유도체를 탄두로서 포함할 수 있다. PBD는 작은 그루브 내 DNA에 공유결합하고 핵산 합성을 억제함으로써 항종양 활성을 나타내는 알킬화제이다. PBD는 최소 골수 억제를 나타내는 한편 강력한 항종양 특성을 갖는 것으로 나타난다. 본 발명과 상용성인 PBD는 몇몇 유형의 링커를 이용하여 항체에 연결될 수 있고 (예를 들어, 자유 설프히드릴을 갖는 말레이미도 모이어티를 포함하는 펩티딜 링커), 특정 구현예에서 이량체 형태이다 (즉, PBD 이량체). 개시된 항체에 컨쥬게이트될 수 있는 상용성 PBD (및 선택적인 링커)는 예를 들어, U.S.P.N. 6,362,331, 7,049,311, 7,189,710, 7,429,658, 7,407,951, 7,741,319, 7,557,099, 8,034,808, 8,163,736, 2011/0256157 및 PCT 출원 WO2011/130613, WO2011/128650, WO2011/130616, WO2014/057073 및 WO2014/057074에 기재되어 있다. 본 발명과 상용성인 PBD 화합물의 예는 아래에 나타내었다.
이러한 점에서, PBD는 최소의 골수 억제를 나타내는 한편 강력한 항종양 특성을 갖는 것으로 나타났다. 본 발명과 상용성인 PBD는 몇몇 유형의 링커 중 임의의 하나를 이용하여 DLL3 조절자에 연결될 수 있고 (예를 들어, 자유 설프히드릴을 갖는 말레이미도 모이어티를 포함하는 펩티딜 링커), 특정 구현예에서 이량체 형태이다 (즉, PBD 이량체). PBD는 하기 일반 구조이다:
이들은 방향족 A 고리 및 피롤로 C 고리에서, 및 C 고리의 포화도 모두에 있어서, 치환체의 수, 유형 및 위치 면에서 상이하다. B-고리에서, DNA 알킬화의 원인이 되는 친전자성 중심인 N10-C11 위치에서 이민 (N=C), 카비놀아민 (NH-CH(OH)), 또는 카비놀아민 메틸 에테르 (NH-CH(OMe)) 중 하나가 존재한다. 알려진 모든 천연 생성물은, C 고리에서 A 고리를 향하여 볼 때, 이들에 오른손 방향 꼬임을 제공하는 키랄 C11a 위치에서 (S) 구조를 갖는다. 이는 B-형태 DNA의 작은 그루브와의 이소헬리시티(isohelicity)를 위해 적절한 3차원 형태를 이들에 제공하여, 결합 위치에 딱 맞도록 한다 (문헌 [Kohn, In Antibiotics III. Springer-Verlag, New York, pp. 3-11 (1975); Hurleyand Needham-VanDevanter, Acc. Chem. Res., 19, 230-237 (1986)]). 작은 그루브에서 부가물을 형성하는 이들의 능력은, 이들이 DNA 가공을 방해하는 것을 가능하게 하며, 이에 따라 이들의 세포독성제로서의 이용을 가능하게 한다. 상기 시사된 바와 같이, 이들의 효능을 증가시키기 위하여, PBD는 본 명세서에서 설명된 바와 같은 항-DLL3 항체에 컨쥬게이트될 수 있는 이량체 형태로 종종 사용된다.
특히 바람직한 구현예에서, 개시된 조절자에 컨쥬게이트될 수 있는 상용성 PBD가 U.S.P.N. 2011/0256157에 기재되어 있다. 이 개시내용에서, PBD 이량체, 즉 두 개의 PBD 모이어티를 포함하는 것들이 바람직할 수 있다. 따라서, 본 발명의 바람직한 컨쥬게이트는 아래 화학식 (AB) 또는 (AC)를 갖는 것들이 있다:
식에서,
점선은 C1과 C2 사이 또는 C2와 C3 사이의 이중 결합의 선택적 존재를 표시하고;
R2는 H, OH, =O, =CH2, CN, R, OR, =CH-RD, =C(RD)2, O-SO2-R, CO2R 및 COR로부터 독립적으로 선택되고, 선택적으로 할로 또는 다이할로로부터 추가로 선택되고;
RD는 R, CO2R, COR, CHO, CO2H, 및 할로로부터 독립적으로 선택되고;
R6 및 R9는 H, R, OH, OR, SH, SR, NH2, NHR, NRR', NO2, Me3Sn 및 할로로부터 독립적으로 선택되고;
R7은 H, R, OH, OR, SH, SR, NH2, NHR, NRR', NO2, Me3Sn 및 할로로부터 독립적으로 선택되고;
R10은, 본 명세서에서 설명된 바와 같은, DLL3 항체 또는 이의 단편 또는 유도체에 연결된 링커이고;
Q는 O, S 및 NH로부터 독립적으로 선택되고;
R11은 H 또는 R 중 하나, 또는 식에서 Q는 O이고, R11은 SO3M일 수 있고, 식에서 M은 금속 양이온이고;
X는 O, S, 또는 N(H)로부터 선택되고, 선택된 구현예에서 O를 포함하고;
R"는 C3-12 알킬렌 기이고, 사슬은 하나 이상의 헤테로원자 (예를 들어, O, S, N(H), NMe 및/또는 방향족 고리, 예를 들어 벤젠 또는 피리딘으로 그 고리는 선택적으로 치환됨)에 의해 방해될 수 있고;
R 및 R'는 선택적으로 치환된 C1-12 알킬, C3-20 헤테로시클릴 및 C5-20 아릴 기로부터 각각 독립적으로 선택되고, 선택적으로 NRR' 기와 관련하여, R과 R'는 그들이 결합되는 질소 원자와 함께 선택적으로 치환된 4-, 5-, 6- 또는 7-원 헤테로시클릭 고리를 형성하고; 및
식에서, R2", R6", R7", R9", X", Q" 및 R11" (존재하는 경우)는 각각 R2, R6, R7, R9, X, Q 및 R11에 따라 정의된 바와 같으며, RC는 캡핑 기이다.
상기 언급된 구조를 포함하는 선택된 구현예가 바로 아래에서 상세히 기재된다.
이중 결합
일 구현예에서, C1과 C2, 및 C2과 C3 사이에는 이중 결합이 존재하지 않는다.
일 구현예에서, 점선은 아래 나타낸 바와 같이, C2와 C3 사이에 있는 이중 결합의 선택적 존재를 표시한다:
일 구현예에서, R2가 C5-20 아릴 또는 C1-12 알킬인 경우, 이중 결합이 C2와 C3 사이에 존재한다.
일 구현예에서, 점선은 아래 나타낸 바와 같이, C1과 C2 사이에 있는 이중 결합의 선택적 존재를 표시한다:
일 구현예에서, R2가 C5-20 아릴 또는 C1-12 알킬인 경우, 이중 결합이 C1과 C2 사이에 존재한다.
R
2
일 구현예에서, R2는 H, OH, =O, =CH2, CN, R, OR, =CH-RD, =C(RD)2, O-SO2-R, CO2R 및 COR로부터 독립적으로 선택되고, 선택적으로 할로 또는 다이할로로부터 추가로 선택된다.
일 구현예에서, R2는 H, OH, =O, =CH2, CN, R, OR, =CH-RD, =C(RD)2, O-SO2-R, CO2R 및 COR로부터 독립적으로 선택된다.
일 구현예에서, R2는 H, =O, =CH2, R, =CH-RD, 및 =C(RD)2.로부터 독립적으로 선택된다.
일 구현예에서, R2는 독립적으로 H이다.
일 구현예에서, R2는 독립적으로 R이고, 여기서 R은 CH3를 포함한다.
일 구현예에서, R2는 독립적으로 =O이다.
일 구현예에서, R2는 독립적으로 =CH2이다.
일 구현예에서, R2는 독립적으로 =CH-RD이다. PBD 화합물 내에서, =CH-RD 기는 아래 나타낸 구조 중 하나를 가질 수 있다:
일 구현예에서, 구조는 구조 (I)이다.
일 구현예에서, R2는 독립적으로 =C(RD)2이다.
일 구현예에서, R2는 독립적으로 =CF2이다.
일 구현예에서, R2는 독립적으로 R이다.
일 구현예에서, R2는 독립적으로 선택적으로 치환된 C5-20 아릴이다.
일 구현예에서, R2는 독립적으로 선택적으로 치환된 C1-12 알킬이다.
일 구현예에서, R2는 독립적으로 선택적으로 치환된 C5-20 아릴이다.
일 구현예에서, R2는 독립적으로 선택적으로 치환된 C5-7 아릴이다.
일 구현예에서, R2는 독립적으로 선택적으로 치환된 C8-10 아릴이다.
일 구현예에서, R2는 독립적으로 선택적으로 치환된 페닐이다.
일 구현예에서, R2는 독립적으로 선택적으로 치환된 나프틸이다.
일 구현예에서, R2는 독립적으로 선택적으로 치환된 피리딜이다.
일 구현예에서, R2는 독립적으로 선택적으로 치환된 퀴놀리닐 또는 이소퀴놀리닐이다.
일 구현예에서, R2는 1 내지 3 개의 치환기를 가지며, 1 개 및 2 개가 더욱 바람직하고, 단일 치환된 기가 가장 바람직하다. 치환체는 임의의 위치일 수 있다.
R2가 C5-7 아릴 기인 경우, 단일 치환체는 바람직하게는 화합물의 나머지 부분에 대한 결합에 인접하지 않은 고리 원자 상에 있으며, 즉 이는 바람직하게는 화합물의 나머지에 대한 결합에 대해 β 또는 γ이다. 따라서, C5-7 아릴 기가 페닐인 경우, 치환체는 바람직하게는 메타- 또는 파라- 위치에 존재하며, 더욱 바람직하게는 파라-위치에 존재한다.
일 구현예에서, R2는:
로부터 선택되고, 식에서 별표는 부착점을 표시한다.
식에서, R2는 C8-10 아릴 기, 예를 들어 퀴놀리닐 또는 아이소퀴놀리닐이고, 퀴놀린 또는 아이소퀴놀린 고리의 임의의 위치에서 임의의 수의 치환체를 포함할 수 있다. 일부 구현예에서, 이는 1 개, 2 개 또는 3 개의 치환체를 포함하고, (치환체가 1 개 초과인 경우)이들은 근위 및 원위 고리 또는 이들 모두 중 어느 하나 위에 존재할 수 있다.
일 구현예에서, R2가 선택적으로 치환된 경우, 치환체는 아래 치환체 섹션에 나타낸 그러한 치환체들로부터 선택된다.
R이 선택적으로 치환된 경우, 치환체는 바람직하게는 할로, 히드록시, 에테르, 포르밀, 아실, 카르복실, 에스테르, 아실옥시, 아미노, 아미도, 아실아미도, 아미노카르보닐옥시, 우레이도, 니트로, 시아노 및 티오에테르로부터 선택된다.
일 구현예에서, R 또는 R2가 선택적으로 치환된 경우, 치환체는 R, OR, SR, NRR', NO2, 할로, CO2R, COR, CONH2, CONHR, 및 CONRR'로 이루어진 군으로부터 선택된다.
R2가 C1-12 알킬인 경우, 선택적인 치환체는 추가적으로 C3-20 헤테로시클릴 및 C5-20 아릴 기를 포함할 수 있다.
R2가 C3-20 헤테로시클릴인 경우, 선택적인 치환체는 C1-12 알킬 및 C5-20 아릴 기를 추가적으로 포함할 수 있다.
R2가 C5-20 아릴 기인 경우, 선택적인 치환체는 C3-20 헤테로시클릴 및 C1-12 알킬 기를 추가적으로 포함할 수 있다.
용어 "알킬"은 하위군 알케닐 및 알키닐 및 시클로알킬을 포괄한다는 것이 이해되어야 한다. 따라서, R2가 선택적으로 치환된 C1-12 알킬인 경우, 알킬 기는 하나 이상의 탄소-탄소 이중 결합 또는 삼중 결합을 선택적으로 함유하며, 이는 컨쥬게이트된 시스템의 일부를 형성할 수 있음이 이해되어야 한다. 일 구현예에서, 선택적으로 치환된 C1-12 알킬 기는 적어도 하나의 탄소-탄소 이중 결합 또는 삼중 결합을 함유하며, 이 결합은 C1과 C2, 또는 C2와 C3 사이에 존재하는 이중 결합과 컨쥬게이트된다. 일 구현예에서, C1-12 알킬 기는 포화된 C1-12 알킬, C2-12 알케닐, C2-12 알키닐 및 C3-12 시클로알킬로부터 선택된 기이다.
R2 상의 치환체가 할로인 경우, 이는 바람직하게는 F 또는 Cl, 더욱 바람직하게는 Cl이다.
R2 상의 치환체가 에테르인 경우, 일부 구현예에서 이는 알콕시 기, 예를 들어 C1-7 알콕시 기 (예를 들어, 메톡시, 에톡시)이거나, 이는 일부 구현예에서 C5-7 아릴옥시 기 (예를 들어, 페녹시, 피리딜옥시, 푸라닐옥시)일 수 있다.
R2 상의 치환체가 C1-7 알킬인 경우, 이는 바람직하게는 C1-4 알킬 기 (예를 들어, 메틸, 에틸, 프로필, 부틸)일 수 있다.
R2 상의 치환체가 C3-7 헤테로시클릴인 경우, 일부 구현예에서 이는 C6 질소 함유 헤테로시클릴 기, 예를 들어, 모르폴리노, 티오모르폴리노, 피페리디닐, 피페라지닐일 수 있다. 이들 기는 질소 원자를 통해 PBD 모이어티의 나머지에 결합될 수 있다. 이들 기는 예를 들어, C1-4 알킬 기에 의해 추가로 치환될 수 있다.
R2 상의 치환체가 비스-옥시-C1-3 알킬렌인 경우, 이는 바람직하게는 비스-옥시-메틸렌 또는 비스-옥시-에틸렌이다.
R2에 대한 특히 바람직한 치환체는 메톡시, 에톡시, 플루오로, 클로로, 시아노, 비스-옥시-메틸렌, 메틸-피페라지닐, 모르폴리노 및 메틸-티에닐을 포함한다.
특히 바람직한 치환된 R2 기는 4-메톡시-페닐, 3-메톡시페닐, 4-에톡시-페닐, 3-에톡시-페닐, 4-플루오로-페닐, 4-클로로-페닐, 3,4-비스옥시메틸렌-페닐, 4-메틸티에닐, 4-시아노페닐, 4-페녹시페닐, 퀴놀린-3-일 및 퀴놀린-6-일, 아이소퀴놀린-3-일 및 아이소퀴놀린-6-일, 2-티에닐, 2-푸라닐, 메톡시나프틸, 및 나프틸을 포함하지만 이에 한정되지는 않는다.
일 구현예에서, R2는 할로 또는 다이할로이다. 일 구현예에서, R2는 -F 또는 -F2이며, 치환체는 (III) 및 (IV)로 각각 아래에 예시된다:
R
D
일 구현예에서, RD는 R, CO2R, COR, CHO, CO2H, 및 할로로부터 독립적으로 선택된다.
일 구현예에서, RD는 독립적으로 R이다.
일 구현예에서, RD는 독립적으로 할로이다.
R
6
일 구현예에서, R6는 H, R, OH, OR, SH, SR, NH2, NHR, NRR', NO2, Me3Sn- 및 할로로부터 독립적으로 선택된다.
일 구현예에서, R6는 H, OH, OR, SH, NH2, NO2 및 할로로부터 독립적으로 선택된다.
일 구현예에서, R6는 H 및 할로로부터 독립적으로 선택된다.
일 구현예에서, R6는 독립적으로 H이다.
일 구현예에서, R6 및 R7은 함께 기 -O-(CH2)p-O-를 형성하고, 식에서 p는 1 또는 2이다.
R
7
R7은 H, R, OH, OR, SH, SR, NH2, NHR, NRR', NO2, Me3Sn 및 할로로부터 독립적으로 선택된다.
일 구현예에서, R7은 독립적으로 OR이다.
일 구현예에서, R7은 독립적으로 OR7A이고, 식에서 R7A는 독립적으로 선택적으로 치환된 C1-6 알킬이다.
일 구현예에서, R7A는 독립적으로 선택적으로 치환된 포화된 C1-6 알킬이다.
일 구현예에서, R7A는 독립적으로 CH3이다.
일 구현예에서, R7A는 독립적으로 선택적으로 치환된 C2-4 알케닐이다.
일 구현예에서, R7A는 독립적으로 Me이다.
일 구현예에서, R7A는 독립적으로 CH2Ph이다.
일 구현예에서, R7A는 독립적으로 알릴이다.
일 구현예에서, 화합물은 각각의 단량체의 R7 기가 단량체를 연결하는 화학식 X-R"-X를 갖는 이량체 브릿지를 함께 형성하는 이량체이다.
R
9
일 구현예에서, R9는 독립적으로 H, R, OH, OR, SH, SR, NH2, NHR, NRR', NO2, Me3Sn- 및 할로로부터 선택된다.
일 구현예에서, R9는 독립적으로 H이다.
일 구현예에서, R9는 독립적으로 R 또는 OR이다.
R
10
바람직하게는, 본 명세서에 설명된 바와 같은 상용성 링커는 R10 위치에서 공유 결합(들)을 통하여 DLL3 항체를 PBD 약물 모이어티에 부착시킨다 (즉, N10).
Q
특정 구현예에서 Q는 독립적으로 O, S 및 NH로부터 선택된다.
일 구현예에서, Q는 독립적으로 O이다.
일 구현예에서, Q는 독립적으로 S이다.
일 구현예에서, Q는 독립적으로 NH이다.
R
11
선택된 구현예에서, R11은 H, 또는 R이며, 식에서 Q는 O, R11은 SO3M (M은 금속 양이온)일 수 있다. 양이온은 Na+일 수 있다.
특정 구현예에서 R11은 H이다.
특정 구현예에서 R11은 R이다.
특정 구현예에서, Q는 O이고, R11은 SO3M (M은 금속 양이온)이다. 양이온은 Na+일 수 있다.
특정 구현예에서 Q는 O이고, R11은 H이다.
특정 구현예에서 Q는 O이고, R11은 R이다.
X
일 구현예에서, X는 O, S, 또는 N(H)로부터 선택된다.
바람직하게는, X는 O이다.
R"
R"는 C3-12 알킬렌 기이고, 그 사슬은 하나 이상의 헤테로 원자, 예를 들어, O, S, N(H), NMe 및/또는 그 고리가 선택적으로 치환되는 방향족 고리, 예를 들어 벤젠 또는 피리딘에 의해 간섭될 수 있다.
일 구현예에서, R"는 C3-12 알킬렌 기이고, 그 사슬은 하나 이상의 헤테로 원자 및/또는 방향족 고리, 예를 들어 벤젠 또는 피리딘에 의해 간섭될 수 있다.
일 구현예에서, 알킬렌 기는 O, S, 및 NMe 및/또는, 그 고리가 선택적으로 치환되는 방향족 고리로부터 선택된 하나 이상의 헤테로 원자에 의해 선택적으로 간섭된다.
일 구현예에서, 방향족 고리는 C5-20 아릴렌 기이고, 여기서 아릴렌은, 모이어티가 5 내지 20 개의 고리 원자를 갖는, 방향족 화합물의 두 개의 방향족 고리 원자로부터 수소 원자 두 개를 제거함으로써 수득되는 2가 모이어티와 관련된다.
일 구현예에서, R"는 C3-12 알킬렌 기이고, 그 사슬은 하나 이상의 헤테로 원자, 예를 들어, O, S, N(H), NMe 및/또는 그 고리가 NH2에 의해 선택적으로 치환된 방향족 고리, 예를 들어 벤젠 또는 피리딘에 의해 간섭될 수 있다.
일 구현예에서, R"는 C3-12 알킬렌 기이다.
일 구현예에서, R"는 C3, C5, C7, C9 및 C11 알킬렌 기로부터 선택된다.
일 구현예에서, R"는 C3, C5 및 C7 알킬렌 기로부터 선택된다.
일 구현예에서, R"는 C3 및 C5 알킬렌 기로부터 선택된다.
일 구현예에서, R"는 C3 알킬렌 기이다.
일 구현예에서, R"는 C5 알킬렌 기이다.
상기 열거된 알킬렌 기는 하나 이상의 헤테로 원자 및/또는 그 고리가 선택적으로 치환되는 방향족 고리, 예를 들어 벤젠 또는 피리딘에 의해 선택적으로 간섭될 수 있다.
상기 열거된 알킬렌 기는 하나 이상의 헤테로 원자 및/또는 방향족 고리, 예를 들어 벤젠 또는 피리딘에 의해 선택적으로 간섭될 수 있다.
상기 열거된 알킬렌 기는 비치환된 선형 지방족 알킬렌 기일 수 있다.
R 및 R'
일 구현예에서, R은 선택적으로 치환된 C1-12 알킬, C3-20 헤테로시클릴 및 C5-20 아릴기로부터 독립적으로 선택된다. 이들 기는 아래 치환체 섹션에서 각각 정의된다.
일 구현예에서, R은 독립적으로 선택적으로 치환된 C1-12 알킬이다.
일 구현예에서, R은 독립적으로 선택적으로 치환된 C3-20 헤테로시클릴이다.
일 구현예에서, R은 독립적으로 선택적으로 치환된 C5-20 아릴이다.
일 구현예에서, R은 독립적으로 선택적으로 치환된 C1-12 알킬이다.
R2와 관련하여 바람직한 알킬 및 아릴 기, 및 선택적 치환체의 동일성과 수에 관한 다양한 구현예가 상기 기재된다. R에 적용되는 바와 같이 R2에 대한 선호도는, 적절한 경우에, 예를 들어 R6, R7, R8 또는 R9가 R인 경우의 모든 다른 기의 R에 적용가능하다.
R에 대한 선호도는 R'에도 적용된다.
본 발명의 일부 구현예에서, 치환체 기 -NRR'를 갖는 화합물이 제공된다. 일 구현예에*, R 및 R'는 그들이 부착되는 질소 원자와 함께 선택적으로 치환된 4-, 5-, 6- 또는 7-원 헤테로시클릭 고리를 형성한다. 고리는 추가의 헤테로 원자, 예를 들어 N, O 또는 S를 추가로 함유할 수 있다.
일 구현예에서, 헤테로시클릭 고리는 그 자신이 R기로 치환된다. 추가의 N 헤테로원자가 존재하는 경우, 치환체는 N 헤테로원자 상에 있을 수 있다.
상기 언급된 PBD에 추가하여, 특정 이량체성 PBD는 특히 활성인 것으로 나타났으며, 본 발명과 함께 사용될 수 있다. 이 목적을 위하여, 본 발명의 항체 약물 컨쥬게이트 (즉, 본 명세서에 개시된 바와 같은 ADC 1-6)는 PBD 1-5로서 바로 아래에 설명된 바와 같이 PBD 화합물을 포함할 수 있다. 약물-링커 화합물의 성분으로서 PBD 1-5 각각의 합성은 그와 같은 합성에 대하여 참고로서 본 명세서에 통합된 WO 2014/13087호에 매우 상세히 안내되어 있다. WO 2014/130879를 고려해서, 본 발명의 ADC의 선택된 탄두를 포함할 수 있는 세포독성 화합물은 본 명세서에 설명된 바와 같이 쉽게 생성 및 사용될 수 있었다. 이에 따라 링커의 분열 시 개시된 ADC로부터 유리될 수 있는 선택된 PBD 화합물이 바로 아래에 설명된다:
및
상기 언급된 이량체성 PBD 탄두 각각은 바람직하게는 표적 세포의 내재화 및 링커의 분열 시 방출될 것임이 이해될 것이다. 아래 더욱 상세히 기재된 바와 같이, 바람직한 링커는 링커의 임의의 부분의 보유 없이 활성 PBD 탄두의 방출을 가능하게 하는 자가-희생 모이어티를 포함하는 분열성 링커를 포함할 것이다. 방출 시 PBD 탄두는 이후 표적 세포의 DNA와 결합 및 가교결합할 것이다. 그러한 결합은 겉보기에는 그의 DNA 나선의 왜곡없이 표적 암 세포의 분할을 차단하며, 이에 따라 나타나는 약물 내성의 일반 현상을 잠재적으로 회피한다.
종양 위치(들)에서 그러한 화합물의 전달 및 방출은 본 개시 내용에 따라 증식성 질환을 치료 또는 관리하는 데 있어서 임상적으로 유효함을 입증할 수 있다. 화합물과 관련하여, 개시된 PBD 각각은 각각의 C-고리에 있어서 두 개의 sp2 중심을 갖고, 각각의 C-고리에서 단지 하나의 sp2 중심을 갖는 화합물의 경우보다 DNA의 작은 그루브에서 더욱 강한 결합 (그에 따라 더욱 큰 독성)을 가능하게 할 수 있다. 따라서, 본 명세서에서 설명된 바와 같은 DLL3 ADC에 사용된 경우, 개시된 PBD는 증식성 질환의 치료에 대해 특히 효과적인 것으로 입증될 수 있다.
상기 내용은 본 발명과 상용성인 예시적인 PBD 화합물을 제공하며, 본 명세서의 교시에 따른 항-DLL3 컨쥬게이트에 성공적으로 포함될 수 있는 다른 PBD에 관하여 제한하고자 의도하지 않는다. 그보다는, 본 명세서에서 설명된 바와 같은 항체에 컨쥬게이트될 수 있고 아래 실시예에 설명된 임의의 PBD는 개시된 컨쥬게이트와 상용성이고, 본 발명의 범주 내에 명확히 속한다.
상기 언급된 작용제에 추가하여, 본 발명의 항체 또한 생물학적 반응 변형제에 컨쥬게이트될 수 있다. 예를 들어, 일부 구현예에서 약물 모이어티는 원하는 생물학적 활성을 소유하는 폴리펩티드일 수 있다. 그러한 단백질은 예를 들어 독소, 예컨대 아브린(abrin), 리신(ricin) A, 온코나제 (또는 다른 세포독성 RN아제), 슈도모나스 외독소, 콜레라 독소, 디프테리아 독소; 세포사멸제, 예컨대 종양 괴사 인자 예를 들어, TNF-α 또는 TNF-β, α-인터페론, β-인터페론, 신경 성장 인자, 혈소판 유도된 성장 인자, 조직 플라스미노겐 활성화제, AIM I (WO 97/33899), AIM II (WO 97/34911), 파스 리간드(Fas Ligand) (문헌 [Takahashi et al., 1994, PMID: 7826947]), 및 VEGI (WO 99/23105), 혈전제, 항-혈관형성제, 예를 들어, 안지오스타틴 또는 엔도스타틴, 림포카인, 예를 들어 인터류킨-1 (IL-1), 인터류킨-2 (IL-2), 인터류킨-6 (IL-6), 과립구 마크로파지 콜로니 자극 인자 (GM-CSF), 및 과립구 콜로니 자극 인자 (G-CSF), 또는 성장 인자 예를 들어, 성장 호르몬 (GH)을 포함할 수 있다.
2. 진단제 또는 검출제
다른 구현예에서, 본 발명의 항체 또는 이의 단편 또는 유도체는 예를 들어 생물학적 분자 (예를 들어, 펩티드 또는 뉴클레오티드), 소분자, 플루오로포어, 또는 방사성동위원소일 수 있는 진단제 또는 검출제, 마커 또는 리포터에 컨쥬게이트된다. 라벨된 항체는 초증식성 질환의 발생 또는 발전을 모니터링하는 데 유용할 수 있거나 개시된 항체를 포함하는 특정 테라피의 효능을 결정하거나 (즉 테라그노시스) 앞으로의 치료 과정을 결정하기 위한 임상 시험 절차의 일부로서 유용할 수 있다. 그러한 마커 또는 리포터는 또한 선택된 항체의 정제에 있어서, 항체 분석론에서의 이용에 있어서 (예를 들어, 에피토프 결합 또는 항체 비닝), 종양형성 세포를 분리 또는 단리하는 데 있어, 또는 증상발현 전 절차 또는 독성학 연구에서 유용할 수 있다.
그러한 진단, 분석 및/또는 검출은 항체를, 이에 한정되지는 않지만, 예를 들어 서양고추냉이 퍼옥시다제, 알칼리성 포스파타제, 베타-갈락토시다제, 또는 아세틸콜린에스테라제를 포함하는 각종 효소; 이에 한정되지는 않지만, 스트렙트아비디닐비오틴(streptavidinlbiotin) 및 아비딘/비오틴과 같은 보조단(prosthetic group); 이에 제한되지는 않지만, 움벨리페론(umbelliferone), 플루오레신, 플루오레신 아이소티오시네이트, 로다민, 다이클로롤트라이아지닐아민 플루오레신, 단실 클로라이드 또는 파이코에리트린과 같은 형광 재료; 이에 제한되지는 않지만, 루미놀과 같은 발광 재료; 이에 제한되지는 않지만, 루시퍼라제, 루시페린, 및 아쿠오린과 같은 생물발광 재료; 이에 제한되지는 않지만, 요오드 (131I, 125I, 123I, 121I,), 탄소 (14C), 황 (35S), 트리튬 (3H), 인듐 (115In, 113In, 112In, 111In,), 및 테크튬 (99Tc), 탈륨 (201Ti), 갈륨 (68Ga, 67Ga), 팔라듐 (103Pd), 몰리브데늄 (99Mo), 크세논 (133Xe), 불소 (18F), 153Sm, 177Lu,159Gd, 149Pm, 140La, 175Yb, 166Ho, 90Y, 47Sc, 186Re, 188Re, 142Pr, 105Rh, 97Ru,68Ge, 57Co, 65Zn, 85Sr, 32P, 89Zr, 153Gd, 169Yb, 51Cr, 54Mn, 75Se, 113Sn, 및 117Tin과 같은 방사성 재료; 각종 포지트론 방출 단층촬영기를 이용하는 포지트론 방출 금속, 비-방사성 상자성체 금속 이온, 및 특정 방사성동위원소에 방사성라벨되거나 컨쥬게이트된 분자를 포함하는 검출가능한 물질에 커플링시킴으로써 달성될 수 있다. 그러한 구현예에서 적절한 검출 방법은 당 기술 분야에 널리 공지되어 있으며, 많은 상업적 공급원으로부터 쉽게 입수가능하다.
다른 구현예에서 항체 또는 이의 단편은 마커 서열 또는 화합물, 예컨대 펩티드 또는 플루오로포어에 융합 또는 컨쥬게이트되어 면역조직화학, 생물층 간섭측정, 표면 플라즈몬 공명, 유세포분석, 경쟁적 ELISA, FAC, 등과 같은 정제 또는 진단 또는 분석 절차를 촉진할 수 있다. 일부 구현예에서, 마커는 pQE 벡터 (Qiagen)에 의해 제공되는 바와 같은 히스티딘 태그를 포함하며, 이들 중 다수는 상업적으로 입수가능하다. 정제에 유용한 기타 펩티드 태그는 이에 한정되지는 않지만, 헤마글루티닌 "HA" 태그를 포함하며, 이는 인플루엔자 헤마글루티닌 단백질로부터 유도된 에피토프 (문헌 [Wilson et al., 1984, Cell 37:767]) 및 "플래그(flag)" 태그 (U.S.P.N. 4,703,004)에 상응한다.
3. 생체적합성 변형제
선택된 구현예에서, 본 발명의 항체는 원하는 바에 따라, 항체 특징을 조절, 변경, 개선 또는 완화하는 데 사용될 수 있는 생체적합성 변형제와 컨쥬게이트될 수 있다. 예를 들어, 증가된 생체 내 반감기를 갖는 항체 또는 융합 구축물은 상업적으로 입수가능한 폴리에틸렌 글리콜 (PEG) 또는 유사한 생체적합성 중합체와 같은 상대적으로 고분자량 중합체 분자를 부착시킴으로써 생성될 수 있다. 당업자는 PEG가, 항체에 특이적 특성을 부여하도록 선택될 수 있는 분자 구조 및 많은 다른 분자량으로 수득될 수 있음을 이해할 것이다 (예를 들어, 반감기가 조절될 수 있음). PEG는 다작용성 링커 없이 또는 링커를 이용하여, PEG의 상기 항체 또는 항체 단편의 N-말단 또는 C-말단에 대한 컨쥬게이션 또는 리신 잔기 상에 존재하는 엡실론-아미노기를 통해 항체 또는 항체 단편 또는 유도체에 부착될 수 있다. 생물학적 활성의 최소 손실을 결과로서 초래하는 선형 또는 분지된 중합체 유도체화가 사용될 수 있다. 컨쥬게이션 정도는 SDS-PAGE 및 질량 분광법에 의해 가깝게 모니터되어 항체 분자에 대한 PEG 분자의 최적 컨쥬게이션을 보장할 수 있다. 미반응된 PEG는 예를 들어 크기 배제 또는 이온-교환 크로마토그래피에 의해 항체-PEG 컨쥬게이트로부터 분리될 수 있다. 유사한 방식으로, 개시된 항체는, 항체 또는 항체 단편이 생체 내에서 더욱 안정하게 되도록 하거나 생체 내에서 더욱 긴 반감기를 갖도록 하기 위하여 알부민에 컨쥬게이트될 수 있다. 기술은 당 분야에 공지되어 있으며, 예를 들어, WO 93/15199, WO 93/15200, 및 WO 01/77137; 및 EP 0 413, 622를 참조한다. 기타 생체적합성 컨쥬게이트는 일반적인 숙련자에게는 명백하며, 본 명세서에서의 교시에 따라 쉽게 동정될 수 있다.
B. 링커 화합물
다수의 링커 화합물이 본 발명의 항체를 관련 탄두에 컨쥬게이트하는 데 사용될 수 있다. 링커는 단지 항체 상에서 반응성 잔기 (바람직하게는 시스테인 또는 리신) 및 선택된 약물 화합물에 공유결합될 필요가 있다. 따라서, 선택된 항체 잔기와 반응하고, 본 발명의 (위치 특이적으로 또는 다르게) 비교적 안정한 컨쥬게이트를 제공하는 데 사용될 수 있는 임의의 링커는 본 명세서에서의 교시와 상용가능하다.
상용성 링커가 유리하게 친핵성인 환원된 시스테인 및 리신에 결합될 수 있다. 환원된 시스테인 및 리신을 포함하는 컨쥬게이션 반응은, 티올-말레이미드, 티올-할로게노(아실 할라이드), 티올-엔, 티올-인, 티올- 비닐술폰, 티올-비술폰, 티올-티오술포네이트, 티올-피리딜 디술피드 및 티올-파라플루오로 반응을 포함하나 이에 제한되지는 않는다. 본원에서 추가로 논의되는 바와 같이, 티올-말레이미드 바이오컨쥬게이션은, 그의 빠른 반응 및 온화한 컨쥬게이션 조건으로 인해 가장 폭넓게 사용되는 접근 중 하나이다. 이 접근에서의 한 가지 문제는 역-마이클 반응 및 혈장, 예컨대 인간 혈청 알부민에서의 항체로부터 기타 다른 단백질로의 말레이미도-연결된 페이로드의 손실 또는 전달의 가능성이다. 그러나, 일부 구현예에서, 본원에 기재된 바와 같은 선택적 환원 및 자리-특이적 항체의 사용은 컨쥬게이트를 안정화시키고 이러한 원치않는 전달을 감소시키는 데 사용될 수 있다. 티올-아실 할라이드 반응은 역-마이클 반응이 일어날 수 없고 따라서 보다 안정적인 바이오컨쥬게이트를 제공한다. 그러나, 티올-할라이드 반응은 일반적으로 말레이미드 기재의 컨쥬게이션에 비해 더 느린 반응 속도를 갖고, 따라서 원치않는 약물 대 항체 비율을 제공함에 있어 효율적인 것이 아니다. 티올-피리딜 디술피드 반응은 또 다른 통상적 바이오컨쥬게이션 경로이다. 피리딜 디술피드는 유리 티올과 빠르게 교환되어 혼합 디술피드를 생성하고 피리딘-2-티온을 방출시킨다. 혼합 디술피드는 환원적 세포 환경에서 절단되어 페이로드를 방출시킬 수 있다. 바이오컨쥬게이션에서 보다 관심이 모아지는 기타 다른 접근은 티올-비닐술폰 및 티올-비술폰 반응이고, 이들은 각각 본원의 교시내용과 상용성이고, 명시적으로 본 발명의 범위 내에 포함된다.
일부 구현예에서 상용성 링커는 세포외 환경에서 ADC에 안정성을 부여하고, ADC 분자의 응집을 방지하고, ADC를 수성 매질 내에서 자유롭게 용해성으로 유지 및 단량체성 상태로 유지할 것이다. 세포 내로의 운송 또는 전달 전에, ADC는 바람직하게는 안정하고 온전하게 유지되며, 즉 항체는 약물 모이어티에 연결된 채로 유지된다. 링커는 표적 세포 외부에서 안전한 한편, 이들은 세포 내부에서는 효과적인 일정 속도로 분열 또는 분해되도록 설계된다. 이에 따라, 효과적인 링커는: (i) 항체의 특이적 결합 특성을 유지하고; (ii) 컨쥬게이트 또는 약물 모이어티의 세포내 전달을 가능하게 하고; (iii) 컨쥬게이트가 그의 표적된 위치로 전달 또는 운송될 때까지 안정하고 온전하게 유지, 즉 분열 또는 분해되지 않고; (iv) 약물 모이어티의 세포독성, 세포-사멸 효과 또는 세포분열억제 효과를 유지한다 (일부 경우에, 임의의 방관자 효과 포함). ADC의 안정성은 표준 분석 기술, 예컨대 HPLC/UPLC, 질량 분광법, HPLC, 및 분리/분석 기술 LC/MS 및 LC/MS/MS에 의해 측정될 수 있다. 상기 설명된 바와 같이, 항체 및 약물 모이어티의 공유 부착은 두 개의 반응성 작용기를 갖기 위해, 즉 반응성 의미에서 2가를 갖는 링커를 필요로 한다. 둘 이상의 작용적 또는 생물학적 활성 모이어티, 예컨대 MMAE 및 항체를 부착시키는 데 유용한 2가 링커 시약은 알려져 있으며, 그의 결과의 컨쥬게이트를 제공하기 위한 방법이 기재되어 있다.
본 발명과 상용가능한 링커는 분열성 및 비분열성 링커로서 광범위하게 분류될 수 있다. 산-불안정성 링커 (예를 들어, 옥심 및 하이드로존), 프로테아제 분열성 링커 및 이황화물 링커를 포함할 수 있는 분열성 링커는 표적 세포 내로 내재화되고, 세포 내부에 엔도좀성-리소좀성 경로에서 분열된다. 세포독소의 방출 및 활성화는 하이드라존 또는 옥심과 같은 산불안정성 화학 연결의 분열을 촉진하는 엔도좀/리소좀 산 구획에 의존한다. 리소좀-특이적 프로테아제 분열 위치가 링커 내로 조작될 경우, 세포독소는 세포내 표적에 대해 가깝게 방출될 것이다. 대안적으로, 혼합된 이황화물을 함유하는 링커는, 이들이 세포의 환원 환경 내에서는 선택적으로 분열되지만 혈류 내 산소-풍부 환경에서는 분열되지 않음에 따라, 세포독성 페이로드가 세포 내에 방출되도록 하는 방법을 제공한다. 대조로써, 아미드 연결된 폴리에틸렌글리콜을 함유하는 상용성 비분열성 링커 또는 알킬 스페이서는 표적 세포 내에서 ADC의 리소좀성 분해 동안 독성 페이로드를 자유롭게한다. 어느 점에서는, 링커의 선택은 컨쥬게이션에 사용된 특정 약물, 특정 징후 및 항체 표적에 따라 달라질 것이다.
따라서, 본 발명의 소정의 구현예는 세포 내 환경 (예를 들어, 리소좀 또는 엔도좀 또는 포낭)에 존재하는 분열제에 의해 분열가능한 링커를 포함한다. 링커는 예를 들어, 이에 한정되지는 않지만 리소좀성 또는 엔도좀성 프로테아제를 포함하는, 세포 내 펩티다제 또는 프로테아제 효소에 의해 분열된 펩티딜 링커일 수 있다. 일부 구현예에서, 펩티딜 링커는 적어도 두 개의 아미노산 길이 또는 적어도 세 개의 아미노산 길이이다. 분열제는 카텝신 B와 D 및 플라스민을 포함할 수 있으며, 이들 각각은 디펩티드 약물 유도체를 가수분해하여 표적 세포 내에서 활성 약물의 방출을 초래하는 것으로 알려져 있다. 티올-의존성 프로테아제 카텝신-B에 의해 분열가능한 예시적인 펩티딜 링커는, 카텝신-B가 암 조직 내에서 고도로 발현되는 것이 발견되기 때문에, Phe-Leu를 포함하는 펩티드이다. 그러한 링커의 다른 예는, 예를 들어 U.S.P.N. 6,214,345에 기재되어 있다. 특이적 구현예에서, 세포내 프로테아제에 의해 분열가능한 펩티딜 링커는 Val-Cit 링커, Val-Ala 링커 또는 Phe-Lys 링커이다. 치료제의 세포내 단백분해성 방출을 이용하는 하나의 장점은 컨쥬게이트된 경우 작용제는 통상적으로 약화되고, 컨쥬게이트의 혈청 안정성이 비교적 높다는 것이다.
다른 구현예에서, 분열성 링커는 pH-민감성이다. 통상적으로, pH-민감성 링커는 산성 조건 하에서 가수분해가능할 것이다. 예를 들어, 리소자임 내에서 가수분해가능한 산-불안정성 링커 (예를 들어, 하이드라존, 옥심, 세미카바존, 티오세미카바존, 시스-아코니트산 아미드, 오르토에스테르, 아세탈, 케탈 등)가 사용될 수 있다 (예를 들어, U.S.P.N. 5,122,368; 5,824,805; 5,622,929 참조). 그러한 링커는, 혈액 내의 pH 조건과 같이, 중성 pH 조건 하에서는 비교적 안정하지만, 리소좀의 근사 pH인 pH 5.5 또는 5.0 미만에서 불안정하다 (예를 들어, 분열성).
또다른 구현예에서, 링커는 환원 조건 하에서 분열성이다 (예를 들어, 이황화물 링커). 각종 이황화물 링커는 당 분야에 알려져 있으며, 예를 들어 SATA (N-숙신이미딜-S-아세틸티오아세테이트), SPDP (N-숙신이미딜-3-(2-피리딜다이티오)프로피오네이트), SPDB (N-숙신이미딜-3-(2-피리딜다이티오)부티레이트) 및 SMPT (N-숙신이미딜-옥시카르보닐-알파-메틸-알파-(2-피리딜-다이티오)톨루엔)을 이용하여 형성될 수 있는 것들을 포함한다. 여전히 다른 특정 구현예에서, 링커는 말로네이트 링커 (문헌 [Johnson et al., 1995, Anticancer Res. 15:1387-93]), 말레이미도벤조일 링커 (문헌 [Lau et al., 1995, Bioorg-Med-Chem. 3(10):1299-1304]), 또는 3'-N-아미드 유사체 (문헌 [Lau et al., 1995, Bioorg-Med-Chem. 3(10):1305-12])이다.
선택된 양태에서, 선택된 링커는 다음 화학식의 화합물을 포함할 것이다:
식에서, 별표는 약물에 대한 부착점을 표시하며, CBA (즉, 세포 결합제)는 항-DLL3 항체를 포함하고, L1은 링커 및 선택적으로 분열성 링커를 포함하고, A는 L1을 항체 상의 반응성 잔기에 연결하는 연결기 (선택적으로 스페이서를 포함)이고, L2는 바람직하게는 공유 결합이고, 존재하거나 존재하지 않을 수 있는 U는 종양 위치에서 탄두로부터 링커의 깨끗한 분리를 촉진하는 자가-희생 단위의 전부 또는 일부를 포함할 수 있다.
일부 구현예에서 (예컨대, U.S.P.N. 2011/0256157에 설명된 것들), 상용성 링커는 다음을 포함할 수 있다:
식에서, 별표는 약물에 대한 부착점을 표시하며, CBA (즉, 세포 결합제)는 항-DLL3 항체를 포함하고, L1은 링커 및 선택적으로 분열성 링커를 포함하고, A는 L1을 항체 상에서 반응성 잔기에 연결하는 연결 기 (선택적으로 스페이서를 포함)이고, L2는 공유 결합이거나 -OC(=O)-와 함께 자가-희생 모이어티를 형성한다.
존재하는 경우 L1 및 L2의 성질은 광범위하게 변화할 수 있음이 이해될 것이다. 이들 기는 그의 분열성 특징을 기반으로 선택되며, 이는 컨쥬게이트가 전달되는 위치에서의 조건에 의해 지시될 수 있다. pH (예를 들어, 산 또는 염기 불안정성), 온도 또는 방사선조사 (예를 들어 광불안정성) 시 변화에 의해 분열가능한 링커 또한 사용될 수 있지만, 효소의 작용에 의해 분열되는 그러한 링커가 바람직하다. 환원 또는 산화 조건 하에서 분열가능한 링커 또한 본 발명에서 사용될 수 있다.
특정 구현예에서 L1은 아미노산의 연속적 서열을 포함할 수 있다. 아미노산 서열은 효소적 분열을 위한 표적 기질일 수 있으며, 이에 의해 약물의 방출을 가능하게 한다.
일 구현예에서, L1은 효소의 작용에 의해 분열가능하다. 일 구현예에, 효소는 에스테라제 또는 펩티다제이다.
또다른 구현예에서, L1은 카텝신 불안정성 링커로서 존재한다.
일 구현예에서, L1은 디펩티드를 포함한다. 디펩티드는 -NH-X1-X2-CO-로서 표시될 수 있으며, 식에서 -NH- 및 -CO-는 아미노산 기 X1 및 X2 각각의 N-말단 및 C-말단을 나타낸다. 디펩티드 내 아미노산은 천연 아미노산의 임의의 조합일 수 있다. 링커가 카텝신 불안정성 링커인 경우, 디펩티드는 카텝신-매개 분열에 대한 작용 위치일 수 있다
추가적으로, 카르복실 또는 아미노 측쇄 작용성, 예를 들어 Glu 및 Lys 각각을 갖는 아미노산 기의 경우, CO 및 NH는 그 측쇄 작용성을 나타낼 수 있다.
일 구현예에서, 디펩티드, -NH-X1-X2-CO-에서 기 -X1-X2-는: -Phe-Lys-, -Val-Ala-, -Val-Lys-, -Ala-Lys-, -Val-Cit-, -Phe-Cit-, -Leu-Cit-, -Ile-Cit-, -Phe-Arg- 및 -Trp-Cit- (여기서, Cit는 시트룰린)로부터 선택된다.
바람직하게는, 디펩티드, -NH-X1-X2-CO-에서 기 -X1-X2-는: -Phe-Lys-, -Val-Ala-, -Val-Lys-, -Ala-Lys-, 및 -Val-Cit-로부터 선택된다.
가장 바람직하게는, 디펩티드, -NH-X1-X2-CO-에서 기 -X1-X2-는, -Phe-Lys- 또는 -Val-Ala- 또는 Val-Cit이다. 소정의 선택된 구현예에서, 디펩티드는 -Val-Ala-를 포함할 것이다.
일 구현예에서, L2가 존재하며, -C(=O)O-와 함께 자가-희생 링커를 형성한다.
일 구현예에서, L2는 효소 활성에 대한 기질이고, 이에 의해 탄두의 방출을 가능하게 한다.
일 구현예에서, L1은 효소의 작용에 의해 분열가능하고, L2가 존재하며, 효소는 L1 및 L2 간의 결합을 분열시킨다.
L1 및 L2는, 존재하는 경우, -C(=O)NH-, -C(=O)O-, -NHC(=O)-, -OC(=O)-, -OC(=O)O-, -NHC(=O)O-, -OC(=O)NH-, 및 -NHC(=O)NH-로부터 선택된 결합에 의해 연결될 수 있다.
L2에 연결된 L1의 아미노기는 아미노산의 N-말단일 수 있거나, 아미노산 측쇄, 예를 들어 리신 아미노산 측쇄의 아미노 기로부터 유도될 수 있다.
L2에 연결된 L1의 카르복실 기는 아미노산의 C-말단일 수 있거나, 아미노산 측쇄, 예를 들어 글루탐산 아미노산 측쇄의 카르복실 기로부터 유도될 수 있다.
L2에 연결된 L1의 히드록실 기는 아미노산 측쇄, 예를 들어 세린 아미노산 측쇄의 히드록실 기로부터 유도될 수 있다.
용어 "아미노산 측쇄"는 다음에서 발견되는 기들을 포함한다: (i) 자연발생 아미노산, 예컨대 알라닌, 아르기닌, 아스파라긴, 아스파르트산, 시스테인, 글루타민, 글루탐산, 글리신, 히스티딘, 이소류신, 류신, 리신, 메티오닌, 페닐알라닌, 프롤린, 세린, 트레오닌, 트립토판, 티로신, 및 발린; (ii) 적은 수의 아미노산, 예컨대 오르니틴 및 시트룰린; (iii) 비천연 아미노산, 베타-아미노산, 합성 유사체 및 자연발생 아미노산의 유도체; 및 (iv) 모든 거울상이성질체, 부분입체이성질체, 이성질체 풍부화된, 동위원소 라벨된 (예를 들어, 2H, 3H, 14C, 15N), 보호된 형태, 및 이의 라세미 혼합물.
일 구현예에서, -C(=O)O- 및 L2는 함께 다음 기를 형성한다:
식에서, 별표는 약물 또는 세포독성제 위치에 대한 부착점을 표시하며, 파형 선은 링커 L1에 대한 부착점을 표시하고, Y는 -N(H)-, -O-, -C(=O)N(H)- 또는 -C(=O)O-, 및 n은 0 내지 3이다. 페닐 고리는 1, 2 또는 3 개의 치환기로 선택적으로 치환된다. 일 구현예에서, 페닐렌 기는 할로, NO2, 알킬 또는 히드록시알킬로 선택적으로 치환된다.
일 구현예에서, Y는 NH이다.
일 구현예에서, n은 0 또는 1이다. 바람직하게는, n은 0이다.
Y는 NH이고 n은 0인 경우, 자가-희생 링커는 p-아미노벤질카르보닐 링커 (PABC)로서 지칭될 수 있다.
다른 구현예에서, 링커는 자가-희생 링커를 포함할 수 있고, 이 디펩티드는 함께 -NH-Val-Cit-CO-NH-PABC- 기를 형성한다. 다른 선택된 구현예에서, 링커는 -NH-Val-Ala-CO-NH-PABC- 기를 포함할 수 있고, 이는 아래 예시된다:
식에서, 별표는 선택된 세포독성 모이어티에 대한 부착점을 나타내고, 파형 선은 항체에 컨쥬게이트될 수 있는 링커의 남은 부분에 대한 부착점을 나타낸다 (예를 들어, 스페이서-항체 결합 절편). 디펩티드의 효소적 분열 시, 자가-희생 링커는, 먼 위치가 활성화되는 경우 아래 나타낸 선을 따라 진행되는, 보호된 화합물 (즉, 세포독소)의 깨끗한 방출을 허용할 것이다:
식에서, 별표는 선택된 세포독성 모이어티에 대한 부착점을 나타내고, L*은 이제 분열된 펩티딜 단위를 포함하는 링커의 잔류 부분의 활성화된 형태이다. 탄두의 깨끗한 방출은 이것이 원하는 독소 활성을 유지할 것을 보장한다.
일 구현예에서, A는 공유 결합이다. 따라서, L1 및 항체는 직접 연결된다. 예를 들어, L1은 연속적인 아미노산 서열을 포함하고, 서열의 N-말단은 항체 잔기에 직접 연결될 수 있다.
또다른 구현예에서, A는 스페이서 기이다. 따라서, L1 및 항체는 간접적으로 연결된다.
특정 구현예에서 L1 및 A는: -C(=O)NH-, -C(=O)O-, -NHC(=O)-, -OC(=O)-, -OC(=O)O-, -NHC(=O)O-, -OC(=O)NH-, 및 -NHC(=O)NH-로부터 선택된 결합에 의해 연결될 수 있다.
아래에서 더욱 상세하게 논의되는 바와 같이, 본 발명의 약물 링커는 바람직하게는, 자유 시스테인을 포함하는, 시스테인 상에서 반응성 티올 친핵체에 연결될 것이다. 이를 위하여, 항체의 시스테인은, DTT 또는 TCEP와 같은 각종 환원제 또는 본 명세서에서 설명된 바와 같은 약한 환원제를 이용한 처리에 의해 링커 시약과의 컨쥬게이션에 대해 반응성이 될 수 있다. 다른 구현예에서 본 발명의 약물 링커는 바람직하게는 리신에 연결될 것이다.
바람직하게는, 링커는 항체 상에서 친핵성 작용기와의 반응을 위한 친전자성 작용기를 함유한다. 항체에 대한 친핵성 기는, (i) N-말단 아민 기, (ii) 측쇄 아민 기, 예를 들어 리신, (iii) 측쇄 티올 기, 예를 들어 시스테인, 및 (iv) 항체가 글리코실화된 당 히드록실 또는 아미노 기를 포함하지만 이로 한정되지는 않는다. 아민, 티올, 및 히드록실 기는 친핵성이고 링커 모이어티 및 다음을 포함하는 링커 시약 상의 친전자성 기와 반응하여 공유 결합을 형성할 수 있다: (i) 말레이미드 기 (ii) 활성화된 이황화물, (iii) 활성 에스테르, 예컨대 NHS (N-히드록시숙신이미드) 에스테르, HOBt (N-히드록시벤조트라이아졸) 에스테르, 할로포르메이트, 및 산 할라이드; (iv) 알킬 및 벤질 할라이드, 예컨대 할로아세트아미드; 및 (v) 알데히드, 케톤 및 카르복실 기.
본 발명과 상용성인 예시적인 작용기가 바로 아래에 예시된다:
일부 구현예에서, 시스테인 (위치 특이적 항체의 자유 시스테인을 포함)과 약물-링커 모이어티 간의 연결은 링커 상에 존재하는 티올 잔기 및 말단 말레이미드 기를 통한다. 그러한 구현예에서, 항체와 약물-링커 간의 연결은:
일 수 있으며,
식에서 별표는 약물-링커의 남아있는 부분에 대한 부착점을 나타내고, 파형 선은 항체의 남아있는 부분에 대한 부착점을 나타낸다. 이러한 구현예에서, S 원자는 바람직하게는 위치 특이적 자유 시스테인으로부터 유도된다.
다른 상용성 링커에 관하여, 결합 모이어티는 항체 상에서 활성화된 잔기와 반응하여 원하는 컨쥬게이트를 제공할 수 있는 최종 요오도아세트아미드를 포함할 수 있다. 어쨌든 당업자는 개시된 약물-링커 화합물 각각을, 본 개시 내용의 관점에서, 상용성 항-DLL3 항체 (위치 특이적 항체 포함)와 쉽게 컨쥬게이트할 수 있다.
본 개시 내용에 따라, 본 발명은 항-DLL 항체를 하기로 이루어진 군으로부터 선택된 약물-링커 화합물과 컨쥬게이트하는 것을 포함하는 상용성 항체 약물 컨쥬게이트의 제조 방법을 제공한다:
및
본 출원의 목적을 위해, DL은 "약물-링커"에 대한 약어로서 사용될 것이며, 이는 상기 나타낸 바와 같이, 약물 링커 1-6 (즉, DL1, DL2, DL3, DL4, DL5 및 DL6) 을 포함할 것이다. DL1 및 DL6은 동일한 탄두 및 동일한 디펩티드 서브유닛을 포함하지만, 연결기 스페이서에서는 상이함에 유의한다. 따라서, 링커의 분열 시 DL1 및 DL6은 모두 PBD1을 방출할 것이다.
링커에 첨부된 말단 말레이미도 모이어티 (DL1-DL4 및 DL6) 또는 요오도아세트아미드 모이어티 (DL5)는, 당 분야에서 인식된 기술을 이용하여, 선택된 DLL3 항체 상에서 자유 설프히드릴(들)에 컨쥬게이트될 수 있음이 이해될 것이다. 상기 언급된 화합물에 대한 합성 경로는 본 명세서에 참고로서 포함된 WO2014/130879에 설명되어 있는 한편, 그러한 PBD를 컨쥬게이트하는 특이적 방법은 아래 실시예에 설명되어 있다.
따라서, 선택된 양태에서 본 발명은, 바로 아래에서 ADC 1-6으로 실질적으로 설명된, 개시된 피롤로벤조디아제핀에 컨쥬게이트되어 DLL3 면역컨쥬게이트를 제공하는 DLL3 항체에 관한 것이다. 따라서, 특정 양태에서 본 발명은 하기로 이루어진 군으로부터 선택되는 항체 약물 컨쥬게이트에 관한 것이다:
및
식에서, Ab는 항-DLL3 항체 또는 이의 면역반응성 단편을 포함한다. 본 개시 내용의 목적을 위해, ADC1이 hSC16.56 항체 (서열번호 7 및 8)를 포함하는 경우, 이는 SC16LD6.5 또는 hSC16.56PBD1 (이는 DL1 또는 DL6을 포함할 수 있음) 또는 hSC16.56DL1 또는 로발피투주맙 테시린 (Rovalpituzumab Tesirine)(Rova-T)로서도 지칭될 수 있음에 유의한다. 유사하게, ADC6이 hSC16.56ss1 항체 (서열번호 8 및 9)를 포함하는 경우, 이는 본 개시 내용의 목적을 위해 hSC16.56ss1PBD1 (이는 DL1 또는 DL6을 포함할 수 있음) 또는 hSC16.56ss1DL6을 지칭할 수 있다.
C. 컨쥬게이션
다수의 공지의 상이한 반응들이 약물 모이어티 및/또는 링커를 선택된 항체에 부착시키는 데 사용될 수 있다는 것이 이해될 것이다. 예를 들어, 시스테인의 술프히드릴 기를 사용하는 다양한 반응을 요망되는 모이어티의 컨쥬게이션에 사용할 수 있다. 일부 구현예는 하기에서 상세히 논의되는 바와 같은 하나 이상의 유리 시스테인을 포함하는 항체의 컨쥬게이션을 포함할 것이다. 다른 구현예에서, 본 발명의 ADC는 선택된 항체 중에 존재하는 리신 잔기의 용매-노출 아미노 기에 대한 약물의 컨쥬게이션을 통해 생성될 수 있다. 또 다른 구현예는, 이후에 개시된 페이로드를 항체에 부착시키는 데 사용될 수 있는 N-말단 트레오닌 및 세린 잔기의 활성화를 포함한다. 선택된 컨쥬게이션 방법은 바람직하게는 항체에 부착된 약물의 수를 최적화하고 비교적 높은 치료 지수를 제공하는 데에 맞게 조정될 것이다.
시스테인 잔기에 대한 치료 화합물의 컨쥬게이션을 위한 다양한 방법이 당업계에 공지되어 있고, 이는 당업자에게 명백할 것이다. 염기성 조건 하에, 시스테인 잔기는 탈양성자화되어 티올레이트 친핵체를 생성할 것이고, 이는 연성 친전자체, 예컨대 말레이미드 및 아이오도아세트아미드와 반응할 수 있다. 일반적으로 이러한 컨쥬게이션을 위한 시약은 시스테인 티올과 직접 반응하여 컨쥬게이션된 단백질을 형성하거나, 또는 링커-약물과 반응하여 링커-약물 중간체를 형성할 수 있다. 링커의 경우, 유기 화학 반응, 조건, 및 시약을 사용하는 여러 경로가 당업자에게 공지되어 있고, 이는 (1) 본 발명의 단백질의 시스테인 기와 링커 시약의 반응으로부터, 공유 결합을 통한, 단백질-링커 중간체의 형성 후, 활성화된 화합물과의 반응; 및 (2) 화합물의 친핵성 기와 링커 시약과의 반응으로부터, 공유 결합을 통한, 약물-링커 중간체의 형성 후, 본 발명의 단백질의 시스테인 기와의 반응을 포함한다. 숙련자에게는 상기로부터 명백한 것과 같이, 2작용성 (또는 2가) 링커가 본 발명에 유용하다. 예를 들어, 2작용성 링커는 시스테인 잔기(들)에 대한 공유 결합을 위한 티올 변형 기 및 화합물에 대한 공유 또는 비공유 결합을 위한 적어도 하나의 부착 모이어티 (예를 들어, 제2 티올 변형 모이어티)를 포함할 수 있다.
컨쥬게이션 전에, 항체는, 환원제, 예컨대 디티오트레이톨(DTT) 또는 (트리스(2-카르복시에틸)포스핀(TCEP)로의 처리에 의해 링커 시약과의 컨쥬게이션을 위해 반응성으로 만들어질 수 있다. 다른 구현예에서, 추가의 친핵성 기가, 2-이미노티올란(트라우트(Traut) 시약), SATA, SATP 또는 SAT(PEG)4를 포함하나 이에 제한되지는 않는 시약과 리신의 반응을 통해 항체 내로 도입될 수 있고, 이는 아민을 티올로 전환시킨다
이러한 컨쥬게이션과 관련하여, 시스테인 티올 또는 리신 아미노 기는 친핵성이고, 술피드 교환을 통해, (i) 활성 에스테르, 예컨대 NHS 에스테르, HOBt 에스테르, 할로포르메이트, 및 산 할라이드; (ii) 알킬 및 벤질 할라이드, 예컨대 할로아세트아미드; (iii) 알데히드, 케톤, 카르복실, 및 말레이미드 기; 및 (iv) 피리딜 디술피드를 포함하는 디술피드를 포함하는 링커 시약 또는 화합물-링커 중간체 또는 약물 상의 친전자성 기와 공유 결합을 형성하도록 반응할 수 있다. 화합물 또는 링커 상의 친핵성 기는, 링커 모이어티 및 링커 시약 상의 친전자성 기와 공유 결합을 형성하도록 반응할 수 있는 아민, 티올, 히드록실, 히드라지드, 옥심, 히드라진, 티오세미카르바존, 히드라진 카르복실레이트, 및 아릴히드라지드 기를 포함하나 이에 제한되지는 않는다.
컨쥬게이션 시약은 통상적으로 말레이미드, 할로아세틸, 아이오도아세트아미드 숙신이미딜 에스테르, 이소티오시아네이트, 술포닐 클로라이드, 2,6-디클로로트리아지닐, 펜타플루오로페닐 에스테르, 및 포스포르아미다이트를 포함하나, 기타 다른 관능기도 사용될 수 있다. 특정 구현예에서, 방법은, 예를 들어, 말레이미드, 아이오도아세트이미드 또는 할로아세틸/알킬 할라이드, 아지리딘, 아크릴로일 유도체를 사용하여 시스테인의 티올과 반응시켜 화합물과 반응성인 티오에테르를 생성하는 것을 포함한다. 활성화된 피리딜디술피드와 유리 티올의 디술피드 교환 또한, 컨쥬게이트 생성에 유용하다(예를 들어, 5-티오-2-니트로벤조(TNB) 산의 사용). 바람직하게는, 말레이미드가 사용된다.
상기 나타낸 바와 같이, 리신은 본 명세서에 설명된 바와 같이 컨쥬게이션을 실행하기 위한 반응성 잔기로서 사용될 수도 있다. 친핵성 리신 잔기는 흔히 아민-반응성 숙신이미딜에스테르를 통하여 표적된다. 탈양자화된 리신 잔기의 최적 수를 수득하기 위하여, 수용액의 pH는 약 10.5인 리신 암모늄 기의 pKa 미만이어서 반응의 통상적인 pH는 약 8 및 9이다. 커플링 반응에 대한 일반 시약은 NHS-에스테르로, 이는 리신 아실화 메커니즘을 통해 친핵체 리신과 반응한다. 유사한 반응에 처하는 기타 상용성 시약은 아이소시아네이트 및 아이소티오시아네이트를 포함하며, 이는 또한 본 명세서의 교시와 연결되어 사용되어 ADC를 제공할 수 있다. 일단 리신이 활성화되면, 상기 언급된 연결 기의 다수는 탄두를 항체에 공유결합시키는 데 사용될 수 있다.
화합물을 트레오닌 또는 세린 잔기(바람직하게는 N-말단 잔기)에 컨쥬게이션시키는 방법이 또한 당업계에 공지되어 있다. 예를 들어 카르보닐 전구체를 세린 또는 트레오닌의 1,2-아미노알콜로부터 유도하고, 이를 퍼아이오데이트 산화에 의해 선택적으로 빠르게 알데히드 형태로 전환시킬 수 있는 방법이 기재되었다. 본 발명의 단백질에 부착되는 화합물 중의 시스테인의 1,2-아미노티올과 알데히드의 반응은 안정적인 티아졸리딘 생성물을 형성한다. 이 방법은 N-말단 세린 또는 트레오닌 잔기에서의 단백질 표지에 특히 유용하다.
일부 구현예에서, 반응성 티올 기는, 1 개, 2 개, 3 개, 4 개, 또는 그 이상의 유리 시스테인 잔기의 도입에 의해 선택된 항체(또는 그의 단편) 내로 도입될 수 있다(예를 들어, 하나 이상의 유리 비-고유적 시스테인 아미노산 잔기를 포함하는 항체 제조). 이러한 자리-특이적 항체 또는 조작된 항체는, 적어도 부분적으로, 조작된 유리 시스테인 자리(들)의 제공 및/또는 본원에 기재된 신규한 컨쥬게이션 절차로 인해, 증대된 안정성 및 상당한 균질성을 나타내는 컨쥬게이트 제조를 가능하게 한다. 사슬내 또는 사슬간 항체 디술피드 결합 각각을 완전히 또는 부분적으로 환원시켜 컨쥬게이션 자리를 제공하는(또한 본 발명과 완전히 상용성인) 종래의 컨쥬게이션 방법과 달리, 본 발명은 추가로, 제조된 특정 유리 시스테인 자리의 선택적 환원 및 이것으로의 약물-링커의 지향을 제공한다.
이와 관련하여 조작된 자리 및 선택적 환원에 의해 촉진된 컨쥬게이션 특이성은 요망되는 위치에서의 높은 백분율의 자리 지향된 컨쥬게이션을 가능하게 함이 이해될 것이다. 중요하게, 이들 컨쥬게이션 자리 중 일부, 예컨대 경쇄 불변 영역의 말단 영역에 존재하는 부분은 통상적으로, 이들이 기타 다른 유리 시스테인과 교차-반응하는 경향이 있기 때문에, 효과적으로 컨쥬게이션되기 어렵다. 그러나, 분자 공학 및 생성된 유리 시스테인의 선택적 환원을 통해, 효율적인 컨쥬게이션 속도가 얻어질 수 있고, 이는 원치않는 고-DAR 오염물 및 비-특이적 독성을 상당히 감소시킨다. 보다 일반적으로, 조작된 구성체 및 선택적 환원을 포함하는 개시된 신규한 컨쥬게이션 방법은, 개선된 약동학 및/또는 약역학 및, 잠재적으로, 개선된 치료 지수를 갖는 ADC 제조물을 제공한다.
특정 구현예에서 자리-특이적 구성체는, 환원시, 친핵성이고, 상기에 개시된 것들과 같은 링커 모이어티 상의 친전자성 기와 공유 결합을 형성하도록 반응할 수 있는 티올 기를 포함하는 유리 시스테인(들)을 제시한다. 상기 논의된 바와 같은 본 발명의 항체는 환원가능한 쌍을 이루지 않은 사슬간 또는 사슬내 시스테인 또는 도입된 비천연 시스테인, 즉 이러한 친핵성 기를 제공하는 시스테인을 가질 수 있다. 따라서, 특정 구현예에서, 환원된 유리 시스테인의 유리 술프히드릴 기 및 개시된 약물-링커의 말단 말레이미도 또는 할로아세트아미드 기의 반응은 요망되는 컨쥬게이션을 형성할 것이다. 이러한 경우, 항체의 유리 시스테인은, 환원제, 예컨대 디티오트레이톨(DTT) 또는 (트리스 (2-카르복시에틸)포스핀(TCEP)로의 처리에 의해 링커 시약과의 컨쥬게이션을 위해 반응성으로 만들어질 수 있다. 따라서, 각각의 유리 시스테인은 이론적으로 반응성 티올 친핵체를 제시할 것이다. 이러한 시약이 상용성이지만, 일반적으로 당업자에게 공지된 다양한 반응, 조건 및 시약을 사용하여 자리-특이적 항체의 컨쥬게이션을 수행할 수 있음을 인지할 것이다.
추가로, 조작된 항체의 유리 시스테인은 선택적으로 환원되어 증대된 자리-지향된 컨쥬게이션 및 원치않는 잠재적으로 독성인 오염물의 감소를 제공할 수 있는 것으로 나타났다. 보다 구체적으로 "안정화제", 예컨대 아르기닌은 단백질에서의 분자내 및 분자간 상호작용을 조절하는 것으로 나타났고, 이는 선택된 환원제(바람직하게는 비교적 온화한)와 함께 사용되어 유리 시스테인을 선택적으로 환원시키고 본원에 기재된 바와 같은 자리-특이적 컨쥬게이션을 용이하게 할 수 있다. 본원에서 사용되는 바와 같이 용어 "선택적 환원" 또는 "선택적으로 환원되는"은 상호교환가능하게 사용되고, 조작된 항체 중에 존재하는 고유적 디술피드 결합을 실질적으로 파괴하지 않으면서 유리 시스테인(들)을 환원시키는 것을 의미할 것이다. 선택된 구현예에서, 이 환원은 특정 환원제에 의해 전적으로 영향을 미칠 수 있다. 다른 구현예에서, 조작된 구성체의 선택적 환원은 환원제(온화한 환원제 포함)와 조합된 안정화제의 사용을 포함할 것이다. 용어 "선택적 컨쥬게이션"은 본원에 기재된 바와 같은 세포독소와 선택적으로 환원된 조작된 항체의 컨쥬게이션을 의미할 것임을 인지할 것이다. 이와 관련하여, 선택되는 환원제와 조합된 이러한 안정화제의 사용은, 항체 중쇄 및/또는 경쇄 상의 선택된 위치에의 컨쥬게이션 정도 및 제조물의 DAR 분포에 의해 측정되는 바와 같은 자리-특이적 컨쥬게이션의 효율을 현저히 개선시킬 수 있다. 상용성 항체 구축물 및 선택적 컨쥬게이션 기술 및 시약은 그러한 방법론 및 구축물에 대해 본 명세서에 그 전체로 포함된 WO2015/031698호에 광범위하게 개시된다.
임의의 특정 이론에 의해 국한되길 바라지는 않지만, 이러한 안정화제는 정전 미세환경을 조절하고/조절하거나 요망되는 컨쥬게이션 자리에서의 형태적 변화를 조절하도록 작용함으로써, 비교적 온화한 환원제(무손상 고유적 디술피드 결합을 실질적으로 환원시키지 않음)가 요망되는 유리 시스테인 자리에서의 컨쥬게이션을 용이하게 할 수 있게 한다. 이러한 작용제(예를 들어, 특정 아미노산)은 염 브릿지를 형성(수소 결합 및 정전 상호작용을 통해)하는 것으로 공지되어 있고, 이는 유리한 형태 변화를 일으킬 수 있고/있거나 불리한 단백질-단백질 상호작용을 감소시키는 안정화 효과를 부여하는 방식으로 단백질-단백질 상호작용을 조절할 수 있다. 또한, 이러한 작용제는 환원 후 원치않는 분자내(및 분자간) 시스테인-시스테인 결합의 형성을 억제하도록 작용하여, 조작된 자리-특이적 시스테인이 약물에 결합(바람직하게는 링커를 통해)되는 요망되는 컨쥬게이션 반응을 용이하게 할 수 있다. 선택적 환원 조건은 무손상 고유적 디술피드 결합의 유의한 환원을 제공하지 않기 때문에, 후속 컨쥬게이션 반응은 유리 시스테인 상의 비교적 소수의 반응성 티올(예를 들어, 바람직하게는 항체 당 2 개의 유리 티올)로 자연적으로 유도된다. 앞서 시사된 바와 같이, 그러한 기술은 본 개시 내용에 따라 제작된 컨쥬게이트 제제 내의 비특이적 컨쥬게이션의 수준 및 상응하는 불순물을 상당히 감소시키는 데 사용될 수 있다. 결과적으로, 이들 위치 특이적 ADC 조성물은 감소된 독소를 나타낼 수 있다.
선택된 구현예에서, 본 발명과 상용성인 안정화제는 일반적으로 염기성 pKa를 갖는 적어도 하나의 모이어티를 갖는 화합물을 포함할 것이다. 특정 구현예에서, 모이어티는 1급 아민을 포함할 것이며, 다른 구현예에서, 아민 모이어티는 2급 아민을 포함할 것이다. 또 다른 구현예에서, 아민 모이어티는 3급 아민 또는 구아니디늄 기를 포함할 것이다. 다른 선택된 구현예에서, 아민 모이어티는 아미노산을 포함할 것이며, 다른 상용성 구현예에서, 아민 모이어티는 아미노산 측쇄를 포함할 것이다. 또 다른 구현예에서, 아민 모이어티는 단백질성(proteinogenic) 아미노산을 포함할 것이다. 또 다른 구현예에서, 아민 모이어티는 비-단백질성 아미노산을 포함한다. 일부 구현예에서, 상용성 안정화제는 아르기닌, 리신, 프롤린 및 시스테인을 포함할 수 있다. 추가로, 상용성 안정화제는 구아니딘 및 염기성 pKa를 갖는 질소 함유 헤테로사이클을 포함할 수 있다.
특정 구현예에서, 상용성 안정화제는 약 7.5 초과의 pKa를 갖는 적어도 하나의 아민 모이어티를 갖는 화합물을 포함하고, 다른 구현예에서, 대상 아민 모이어티는 약 8.0 초과의 pKa를 가질 것이고, 또 다른 구현예에서, 아민 모이어티는 약 8.5 초과의 pKa를 가질 것이고, 또 다른 구현예에서, 안정화제는 약 9.0 초과의 pKa를 갖는 아민 모이어티를 포함할 것이다. 다른 구현예는 아민 모이어티가 약 9.5 초과의 pKa를 가질 것인 안정화제를 포함할 것이며, 특정 다른 구현예에서는 약 10.0 초과의 pKa를 갖는 적어도 하나의 아민 모이어티를 나타내는 안정화제를 포함할 것이다. 또 다른 구현예에서, 안정화제는 약 10.5 초과의 pKa를 갖는 아민 모이어티를 갖는 화합물을 포함할 것이고, 다른 구현예에서, 안정화제는 약 11.0 초과의 pKa를 갖는 아민 모이어티를 갖는 화합물을 포함할 것이며, 또 다른 구현예에서, 안정화제는 약 11.5 초과의 pKa를 갖는 아민 모이어티를 포함할 것이다. 또 다른 구현예에서, 안정화제는 약 12.0 초과의 pKa를 아민 모이어티를 갖는 화합물을 포함할 것이며, 또 다른 구현예에서, 안정화제는 약 12.5 초과의 pKa를 아민 모이어티를 포함할 것이다. 당업자는, 표준 기법을 사용하여 관련 pKa가 쉽게 계산되거나 측정될 수 있으며, 이것이 안정화제로서 선택된 화합물의 사용에 있어 응용가능성을 결정하는 데 사용될 수 있음을 이해할 것이다.
개시된 안정화제는, 특정 환원제와 조합시 유리 자리-특이적 시스테인에 대한 표적화 컨쥬게이션에 있어 특히 효과적인 것으로 나타났다. 본 발명의 목적상, 상용성 환원제는, 조작된 항체의 고유적 디술피드 결합을 유의하게 파괴하지 않으면서 컨쥬게이션을 위한 환원된 유리 자리-특이적 시스테인을 생성하는 임의의 화합물을 포함할 수 있다. 선택된 안정화제 및 환원제의 조합에 의해 바람직하게 제공되는 이러한 조건 하에, 활성화된 약물-링커는 요망되는 유리 자리-특이적 시스테인 자리(들)에 대한 결합으로 주로 제한한다. 비교적 온화한 환원제 또는 온화한 조건을 제공하도록 비교적 저농도로 사용되는 환원제가 특히 바람직하다. 본원에서 사용되는 바와 같이 용어 "온화한 환원제" 또는 "온화한 환원 조건"은, 조작된 항체 중에 존재하는 고유적 디술피드 결합을 실질적으로 파괴하지 않으면서 유리 시스테인 자리(들)에서 티올을 제공하는 환원제에 의해 생성되는(선택적으로 안정화제의 존재 하에) 임의의 작용제 또는 상태를 의미하는 것으로 의도될 것이다. 즉, 약한 환원제 또는 조건 (바람직하게는 안정화제와 조합)은, 단백질의 천연 이황화물 결합을 현저히 파괴하지 않으면서 자유 시스테인(들)을 효과적으로 감소 (티올을 제공)할 수 있다. 원하는 환원 조건은 선택적인 컨쥬게이션을 위한 적절한 환경을 수립하는 다수의 설프히드릴계 화합물에 의해 제공될 수 있다. 일부 구현예에서 약한 환원제는 단일 자유 티올을 갖는 화합물을 포함하는 한편, 구현예에서 약한 환원제는 하나 이상의 자유 티올을 갖는 화합물을 포함할 수 있다. 본 발명의 선택적 환원 기술과 상용가능한 환원제의 비제한적인 예는 글루타티온, n-아세틸 시스테인, 시스테인, 2-아미노에탄-1-티올 및 2-히드록시에탄-1-티올을 포함한다.
상기에 기재된 선택적 환원 방법은 유리 시스테인에 대한 표적화된 컨쥬게이션에 있어 특히 효과적임을 인지할 것이다. 이와 관련하여, 자리-특이적 항체 내의 요망되는 표적 자리의 컨쥬게이션 정도(본원에서 "컨쥬게이션 효율"로서 정의됨)는, 관련 분야에서 허용되는 다양한 기법에 의해 측정될 수 있다. 항체에 대한 약물의 자리-특이적 컨쥬게이션의 효율은, 모든 기타 다른 컨쥬게이션된 자리에 대한 표적 컨쥬게이션 자리(들)(예를 들어 각 경쇄의 c-말단 상의 유리 시스테인) 상의 컨쥬게이션의 백분율을 평가함으로써 측정될 수 있다. 특정 구현예에서, 본원에서의 방법은 유리 시스테인을 포함하는 항체에 대한 약물의 효율적 컨쥬게이션을 제공한다. 일부 구현예에서, 컨쥬게이션 효율은, 모든 기타 다른 컨쥬게이션 자리에 대한 표적 컨쥬게이션의 백분율에 의해 측정시, 적어도 5%, 적어도 10%, 적어도 15%, 적어도 20%, 적어도 25%, 적어도 30%, 적어도 35%, 적어도 40%, 적어도 45%, 적어도 50%, 적어도 55%, 적어도 60%, 적어도 70%, 적어도 75%, 적어도 80%, 적어도 85%, 적어도 90%, 적어도 95%, 적어도 98% 또는 그 이상이다.
추가로, 컨쥬게이션 가능한 조작된 항체는, 항체가 생성되거나 저장됨에 따라 블록킹되거나 캡핑되는 술프히드릴 기를 포함하는 유리 시스테인 잔기를 함유할 수 있음을 인지할 것이다. 이러한 캡은 술프히드릴 기와 상호작용하고 컨쥬게이트 형성을 막거나 억제하는 소분자, 단백질, 펩티드, 이온 및 기타 다른 물질을 포함한다. 일부 경우, 비-컨쥬게이션된 조작된 항체는 동일한 또는 상이한 항체 상의 기타 다른 유리 시스테인에 결합되는 유리 시스테인을 포함할 수 있다. 본원에서 논의된 바와 같이, 이러한 교차-반응성은 제작 절차 동안 다양한 오염물을 초래할 수 있다. 일부 구현예에서, 조작된 항체는 컨쥬게이션 반응 전에 언캡핑을 필요로 할 수 있다. 구체적 구현예에서, 본원에서의 항체는 언캡핑되고, 컨쥬게이션 가능한 유리 술프히드릴 기를 나타낸다. 다른 구체적 구현예에서, 본원에서의 항체는 천연 디술피드 결합을 파괴하거나 재배열시키지 않는 언캡핑 반응에 적용된다. 대부분의 경우에 언캡핑 반응은 통상적 환원 반응(환원 및 선택적 환원) 동안 일어날 것임을 인지할 것이다.
D. DAR 분포 및 정제
선택된 구현예에서, 본 발명과 상용가능한 컨쥬게이션 및 정제 방법론은 유리하게는 좁은 DAR 분포를 포함하는 상대적으로 균질한 ADC 제제를 생성하는 능력을 제공한다. 이와 관련하여, 개시된 구축물 (예를 들어, 위치 특이적 구축물) 및/또는 선택적 컨쥬게이션은 약물과 조작된 항체간의 화학양론적 비율 면과 독소 위치에 대하여 샘플 내 ADC 종의 동종성을 제공한다. 상기 간략하게 논의된 바와 같은 용어 "약물 대 항체의 비율" 또는 "DAR"은 항체에 대한 약물의 몰 비율을 지칭한다. 특정 구현예에서 컨쥬게이트 제제는 그의 DAR 분포와 관련하여 실질적으로 균질할 수 있으며, 이는 ADC 제제 내에 부하 위치 (즉, 자유 시스테인 상)에 대해서도 균일한 특정 DAR (예를 들어, 2 또는 4의 DAR)을 갖는 우세한 화학종의 위치 특이적 ADC가 존재함을 의미한다. 본 발명의 다른 특정 구현예에서, 위치 특이적 항체 및/또는 선택적 환원 및 컨쥬게이션의 이용을 통하여 원하는 동종성을 달성하는 것이 가능하다. 다른 구현예에서, 원하는 동종성은 선택적 환원과 조합된 위치 특이적 구축물의 이용을 통하여 달성될 수 있다. 또다른 구현예에서 상용성 제제는 원하는 동종성을 제공하기 위하여 분석용 또는 분취용 크로마토그래피 기술을 이용하여 추가로 정제될 수 있다. 이들 구현예 각각에서, ADC 샘플의 동종성은 당 기술 분야에 알려진 각종 기술을 이용하여 분석될 수 있으며, 질량 분석법, HPLC (예를 들어, 크기 배제 HPLC, RP-HPLC, HIC-HPLC 등) 또는 모세관 전기영동을 포함하지만 이로 한정되지는 않는다.
ADC 제조물의 정제와 관련하여, 요망되는 순도를 얻기 위해 표준 제약 제조 방법이 사용될 수 있음을 인지할 것이다. 본원에서 논의된 바와 같이, 액체 크로마토그래피 방법, 예컨대 역상(RP) 및 소수성 상호작용 크로마토그래피(HIC)는 혼합물 중의 화합물을 약물 로딩 값에 의해 분리할 수 있다. 일부 경우, 이온-교환(IEC) 또는 혼합식 크로마토그래피(MMC)를 사용하여 특정 약물 로드를 갖는 종을 단리할 수 있다.
개시된 ADC 및 그의 제조물은, 약물 및 항체 모이어티를, 항체의 구성 및, 적어도 부분적으로, 컨쥬게이션 수행을 위해 사용되는 방법에 따라 다양한 화학량론적 몰비로 포함할 수 있다. 특정 구현예에서, ADC 당 약물 로딩은 1 개 내지 20 개의 탄두(즉, n이 1 내지 20)를 포함할 수 있다. 다른 선택된 구현예는 1 개 내지 15 개의 탄두의 약물 로딩을 갖는 ADC를 포함할 수 있다. 또 다른 구현예에서, ADC는 1 개 내지 12 개의 탄두 또는, 보다 바람직하게는, 1 개 내지 10 개의 탄두를 포함할 수 있다. 일부 구현예에서, ADC는 1 개 내지 8 개의 탄두를 포함할 것이다.
이론적 약물 로딩은 비교적 높을 수 있지만, 유리 시스테인 교차 반응성 및 탄두 소수성과 같은 실용적 제한은 응집물 및 기타 다른 오염물로 인한 이러한 DAR을 포함하는 균질한 제조물의 생성을 제한하는 경향이 있다. 즉, 보다 높은 약물 로딩, 예를 들어 > 6 또는 8은, 페이로드에 따라 응집, 불용성, 독성, 또는 특정 항체-약물 컨쥬게이트의 세포 투과성 손실을 초래할 수 있다. 이러한 고려사항에 비추어, 본 발명에 의해 제공되는 실용적 약물 로딩은 바람직하게는 컨쥬게이트 당 1 개 내지 8 개의 약물 범위이고, 즉 여기서는 1 개, 2 개, 3 개, 4 개, 5 개, 6 개, 7 개, 또는 8 개의 약물이 각각의 항체에 공유 부착된다(예를 들어, IgG1의 경우, 기타 다른 항체는 디술피드 결합의 수에 따라 상이한 로딩능을 가질 수 있음). 바람직하게는 본 발명의 조성물의 DAR은 대략 2, 4 또는 6일 것이고, 일부 구현예에서, DAR은 대략 2를 포함할 것이다.
본 발명에 의해 제공된 비교적 높은 수준의 동종성에도 불구하고, 개시된 조성물은 컨쥬게이트와 여러 가지 약물 화합물과의 혼합물을 실제로 포함한다 (예를 들어, IgG1의 경우, 잠재적으로 1 내지 8). 이와 같이, 개시된 ADC 조성물은, 대부분의 구성성분 항체가 하나 이상의 약물 모이어티에 공유 결합되고, (조작된 구축물 및 선택적 환원에 의해 제공되는 상대적인 컨쥬게이트 특이성에도 불구하고) 약물 모이어티가 각종 티올 기에 의해 항체에 부착될 수 있는, 컨쥬게이트의 혼합물을 포함한다. 즉, 컨쥬게이션 후, 본 발명의 ADC 조성물은 (주로 유리 시스테인 교차 반응성에 의해 발생되는 특정 반응 오염물과 함께) 다양한 농도로 상이한 약물 로드(예를 들어, IgG1 항체 당 1 개 내지 8 개의 약물)를 갖는 컨쥬게이트의 혼합물을 포함할 것이다. 그러나 선택적 환원 및 제작후 정제를 사용하여, 컨쥬게이트 조성물을, 이들이, 비교적 낮은 수준의 기타 다른 ADC 종(예를 들어, 1 개, 4 개, 6 개 등의 약물 로딩을 가짐)을 가지면서 단일의 우세한 요망되는 ADC 종(예를 들어, 2 개의 약물 로딩을 가짐)을 주로 함유하는 시점까지 유도할 수 있다. 평균 DAR 값은 전체적 조성(즉, 모든 ADC 종을 함께 합친 것)에 대한 약물 로딩의 가중 평균을 나타낸다. 사용되는 정량 방법에서의 본래의 불확정성 및 상업적 셋팅에서 비-우세 ADC 종을 완전히 제거하는 것의 어려움으로 인해, 허용가능한 DAR 값 또는 규격은 종종 평균, 범위 또는 분포(즉, 2 +/- 0.5의 평균 DAR)로서 제시된다. 바람직하게는, 범위(즉, 1.5 내지 2.5) 내의 측정 평균 DAR을 포함하는 조성물이 제약 셋팅에 사용될 것이다.
따라서, 일부 구현예에서, 본 발명은 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7 또는 8(각각 +/- 0.5)의 평균 DAR을 갖는 조성물을 포함할 것이다. 다른 구현예에서, 본 발명은 2, 4, 6 또는 8 +/- 0.5의 평균 DAR을 포함할 것이다. 마지막으로, 선택된 구현예에서, 본 발명은 2 +/- 0.5 또는 4 +/- 0.5의 평균 DAR을 포함할 것이다. 일부 구현예에서 범위 또는 편차는 0.4 미만일 수 있음을 인지할 것이다. 따라서, 다른 구현예에서, 조성물은 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7 또는 8(각각 +/- 0.3)의 평균 DAR, 2, 4, 6 또는 8 +/- 0.3의 평균 DAR, 훨씬 더 바람직하게는 2 또는 4 +/- 0.3의 평균 DAR 또는 심지어 2 +/- 0.3의 평균 DAR을 포함할 것이다. 다른 구현예에서, IgG1 컨쥬게이트 조성물은 바람직하게는 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7 또는 8(각각 +/- 0.4)의 평균 DAR 및 비교적 낮은 수준(즉, 30% 미만)의 비-우세 ADC 종을 갖는 조성물을 포함할 것이다. 다른 구현예에서, ADC 조성물은 2, 4, 6 또는 8(각각 +/- 0.4)의 평균 DAR과 비교적 낮은 수준(< 30%)의 비-우세 ADC 종을 포함할 것이다. 일부 구현예에서, ADC 조성물은 2 +/- 0.4의 평균 DAR과 비교적 낮은 수준(< 30%)의 비-우세 ADC 종을 포함할 것이다. 또 다른 구현예에서, 우세 ADC 종(예를 들어, 2의 DAR 또는 4의 DAR)은, 기타 다른 DAR 종에 대하여 측정시, 65% 초과의 농도, 70% 초과의 농도, 75% 초과의 농도, 80% 초과의 농도, 85% 초과의 농도, 90% 초과의 농도, 93% 초과의 농도, 95% 초과의 농도 또는 심지어 97% 초과의 농도로 존재할 것이다.
당업자는 컨쥬게이션 반응으로부터의 ADC의 제제에서 항체 당 약물의 분포는 UV-Vis 분광법, 역상 HPLC, HIC, 질량 분광법, ELISA, 및 전기영동과 같은 통상의 수단에 의해 특징지어질 수 있음을 이해할 것이다. 예로써, 항체 당 약물의 측면에서 ADC의 정량적 분포는 HIC 및 RP 크로마토그래피의 조합을 이용하여 결정될 수도 있다. 유사하게, 항체-항원 결합 및 검출 한계로 인하여, 항체 당 약물 값의 분포가 쉽게 식별가능하지는 않지만, ADC의 특정 제제 내 항체 당 약물의 평균 값은, EILSA를 이용하여 결정될 수 있다. 또한, ELISA 분석은 약물 모이어티가 항체 상에 부착된 경우에 대해서는 정보를 제공하지 못한다. 그러나, 상기에서 시사된 바와 같이, 그러한 데이터는 당 기술 분야에서 공지된 각종 크로마토그래피 및 전기영동 기술을 이용하여 쉽게 수득가능하다.
VI. 진단 및 스크리닝
A. 진단
본 발명은 시험관 내 및 생체 내에서 증식성 질환을 검출, 진단, 또는 모니터링하는 방법 및 종양형성 세포를 포함한 종양 세포를 확인하기 위한 환자로부터의 세포 스크리닝 방법을 제공한다. 이러한 방법은 암의 치료 또는 그 진행을 모니터링하기 위해 암을 가진 개체를 식별하는 단계, 환자 또는 환자로부터 (시험관 내 또는 생체 내에서) 수득된 샘플을 특히 DLL3 결정인자를 인식 및 연결시킬 수 있는 검출제 (예를 들어, 항체나 핵산 프로브)와 접촉시키는 단계, 및 샘플 내에서 검출제의 존재나 부재, 또는 연결 정도를 검출하는 단계를 포함한다. 선택된 구현예에서, 검출제는 본 명세서에 기재된 바와 같이 검출가능한 라벨 또는 리포터 분자와 연결된 항체를 포함할 것이다. 소정의 다른 구현예에서 DLL3 항체는 투여되고, 이차적으로 라벨된 항체 (예를 들어, 항-뮤린 항체)를 이용해 검출될 것이다. 또다른 구현예에서 (예를 들어, 원위치(in situ) 혼성화 또는 ISH) 게놈성(genomic) DLL3 결정인자와 반응하는 핵산 프로브는 증식성 질환을 발견, 진단, 또는 모니터링하는 데 사용될 것이다.
보다 일반적으로 DLL3 결정인자의 존재 및/또는 수준은 단백질 또는 핵산 분석을 위해 당업자가 이용할 수 있는 다수의 임의의 기술, 예를 들어, 직접적인 물리적 측정 (예를 들어, 질량 분석법), 결합 분석법 (예를 들어, 면역 분석, 응집 분석, 및 면역 크로마토그래피 분석), 중합효소 연쇄 반응(PCR, RT-PCR; RT-qPCR) 기술, 분지형 올리고뉴클레오티드 기술, 노던 블롯 기술, 올리고뉴클레오티드 혼성화 기술 및 원위치 혼성화 기술을 이용하여 측정될 수 있다. 본 방법은 또한 화학반응, 예를 들어, 광학 흡광도에서의 변화, 형광성에서의 변화, 전기화학적 발광 또는 화학적 발광의 발생, 반사율에서의 변화, 굴절률 또는 광 산란, 표면으로부터 검출가능한 라벨의 축적 또는 방출, 산화-환원 종의 산화 또는 환원, 전류 또는 전위, 자기장에서의 변화 등으로 인해 초래되는 신호를 측정하는 것을 포함할 수 있다. 적합한 검출 기술은 광 발광 (예를 들어, 형광 발광의 측정, 시간-분해(time-resolved) 형광, 감쇄파(evanescent wave) 형광, 상향-전환(up-converting) 인광체, 다광자 형광 등), 화학 발광, 전기화학적 발광, 광 산란, 광학 흡광도, 방사능, 자기장, 효소 활성 (예를 들어, 광학 흡광도 또는 형광 발광에서의 변화를 발생시키거나 화학 발광의 방출을 발생시키는 효소 반응을 통해 효소 활성을 측정하는 것)을 통한 라벨의 측정을 통해 라벨된 결합 시약의 참여를 측정함으로써 결합 이벤트를 검출할 수 있다. 대안적으로, 라벨의 이용을 필요로 하지 않는 검출 기술, 예를 들어 양(mass) (예를 들어, 표면 음파 측정), 굴절률 (예를 들어, 표면 플라스몬 공명 측정), 또는 피분석물의 고유 발광을 측정하는 것을 기반으로 하는 기술이 사용될 수 있다.
일부 구현예에서, 샘플 내에서의 특정 세포 또는 세포 구성 요소와 검출제의 결합은 샘플이 종양형성 세포를 함유할 수 있고, 이에 따라 암을 갖는 각 개체가 본 명세서에 기재된 바와 같은 항체 또는 ADC를 이용해서 효과적으로 치료될 수 있음을 나타낸다.
소정의 적합한 구현예에서, 분석은 면역조직화학적(IHC) 분석 또는 이의 변형 (예를 들어, 형광, 색원체, 표준 ABC, 표준 LSAB 등), 면역세포화학 또는 이의 변형 (예를 들어, 직접, 간접, 형광, 색원체 등), 또는 원위치 혼성화(ISH) 또는 이의 변형 (예를 들어, 색원체 원위치 혼성화(CISH) 또는 형광 원위치 혼성화 (DNA-FISH 또는 RNA-FISH]))을 포함할 수 있다.
이와 관련하여, 본 발명의 특정 양태는 면역조직화학(IHC)을 위해 라벨된 DLL3 항체의 사용을 포함한다. 다른 구현예에서 DLL3 항체는 이차적으로 라벨된 항체를 이용해 검출될 것이다. 더욱 구체적으로 DLL3 IHC는 다양한 증식성 질환의 진단을 돕고, DLL3 항체 요법을 포함한 치료에 대한 가능한 반응을 모니터하는 진단 도구로서 사용될 수 있다. 본 명세서에서 논의되고 아래 실시예에서 나타낸 바와 같이, 상용성 진단 분석은 화학적으로 고정되고 (상용성 기술은: 포름알데히드, 글루타르알데히드, 오스뮴 테트록사이드, 중크롬산칼륨, 아세트산, 알코올, 아연염, 염화 수은, 크롬 테트록사이드 및 피크린산을 포함하지만 이에 한정되지는 않음), 매립된 (상용성 방법은: 글리콜 메타크릴레이트, 파라핀 및 수지를 포함하지만 이에 한정되지는 않음) 또는 냉동 보존된 조직에 수행될 수 있다. 이러한 분석은 치료 결정을 가이드하고, 투약 요법과 시기를 결정하는 데 사용될 수 있다.
하기 실시예에 나타낸 바와 같이, 면역조직화학 기술은 당 기술분야에서 알려진 바와 같이 H-스코어를 유도하는 데 사용될 수 있다. 이러한 H-스코어는 어떤 환자가 본 발명의 조성물을 이용한 치료를 잘 받아들일 수 있는지를 나타내는 데 사용될 수 있다. 아래 실시예를 기준으로, 300점 척도 상에서 약 90, 약 100, 약 110, 약 120, 약 130, 약 140, 약 150, 약 160, 약 170, 약 180, 약 190, 또는 약 200 이상의 H-스코어는 선택된 구현예에서, 어느 환자가 본 발명의 치료 방법에 양호하게 반응할 수 있는지의 여부를 나타내기 위해 사용될 수 있다. 따라서, 일 구현예에* 본 발명의 DLL3 ADC로 처리될 환자는 300점 척도 상에서 적어도 90의 H-스코어를 (즉, 종양은 DLL3+임) 가질 것이다. 다른 구현예에서 본 발명의 DLL3 ADC로 처리될 환자는 적어도 120의 H-스코어를 지닐 것이다. 또다른 구현예에서 본 발명의 DLL3 ADC로 처리될 환자는 적어도 180의 H-스코어를 지닐 것이다. 본 개시 내용의 목적을 위해, 300점 척도 상에서 90 이상의 H-스코어를 나타내는 임의의 종양은 DLL3+ 종양으로 간주되고, 개시된 항체 또는 ADC를 이용한 처리의 대상이 될 것이다.
다른 구현예에서, 환자의 선택은 종양 샘플에서 양성으로 염색된 DLL3 세포의 백분율의 더욱 간단한 측정을 기반으로 할 수 있다. 이와 관련하여, 항-DLL3 항체를 이용한 조사에서 IHC 샘플 중 특정 백분율의 양성으로 염색된 세포를 나타내는 환자는 DLL3+로 간주되고, 본 명세서의 교시에 따른 치료에 선택될 것이다. 이러한 구현예에서 10% 초과, 20% 초과, 30% 초과, 40% 초과, 또는 50% 초과의 양성 세포 염색을 나타내는 종양 샘플은 DLL3+로 분류될 수 있다. 다른 구현예에서 60% 초과, 70% 초과, 80% 초과, 90% 초과, 또는 95% 초과의 양성 세포 염색을 나타내는 종양 샘플은 DLL3+로 분류될 수 있다. 특정의 바람직일 양태에서, DLL3+ 종양은 그 구성세포의 50% 이상에서 DLL3를 발현할 것이다. 상기의 각 구현예에서 DLL3+ 양성 종양으로 고통받는 환자들은 본 명세서에서 설명된 바와 같은 개시된 조성물로 치료될 수 있다.
본 발명의 특히 상용성인 다른 양태는 DLL3 결정인자를 검출 또는 모니터하기 위한 원위치 혼성화의 사용을 포함한다. 원위치 혼성화 기술 또는 ISH는 당업자에게 공지된 것이다. 간단하게는, 세포들은 고정되고, 특이적 뉴클레오티드 서열을 함유한 검출가능한 프로브가 고정된 세포에 첨가된다. 그 세포가 상보적인 뉴클레오티드 서열을 함유하는 경우, 검출될 수 있는 프로브가 세포에 혼성화될 것이다. 본 명세서에 설명된 서열 정보를 이용하여, 프로브는 유전형 DLL3 결정인자를 발현하는 세포를 동정하도록 설계될 수 있다. 프로브는 바람직하게는 그러한 결정인자에 상응하는 뉴클레오티드 서열에 혼성화한다. 혼성화 조건은, 바람직하게는 프로브가 선택된 DLL3 결정인자에 대해 완전히 상보적이지만, 완전하지 않은 상보적 혼성화에 의한 백그라운드 신호를 최소화하기 위해 일상적으로 최적화될 수 있다. 선택된 구현예에서 프로브는 표준 형광분석법에 의해 쉽게 검출가능한 프로브에 부착된 형광 염료로 라벨된다.
상용성인 생체 내 테라그노시스 또는 진단 분석법은 당업자에게 알려진 바와 같이, 자기 공명 영상, 컴퓨터 단층 촬영 (예를 들어, CAT 스캔), 양전자 단층 촬영 (예를 들어, PET 스캔), 방사선, 초음파 등과 같은 당 분야에서 인식된 이미징 또는 모니터링 기술을 포함할 수 있다.
특정 구현예에서 본 발명의 항체들은 환자 샘플 (예를 들어, 혈장 또는 혈액) 내 특정 결정인자 (예를 들어, DLL3 단백질)의 수준을 검출 및 정량하는 데 사용될 수 있고, 이는 결국 관련 결정인자와 연관된 증식성 질환을 검출, 진단, 또는 모니터하는 데 사용될 수 있다. 관련 구현예에서 본 발명의 항체는 순환 종양 세포를 시험관 내 또는 생체 내에서 검출, 모니터, 및/또는 정량하는 데 사용될 수 있다(WO 2012/0128801). 여전히 다른 구현예에서 순환 종양 세포는 종양형성 세포를 포함할 수 있다.
본 발명의 특정 구현예에서, 대상체 내 종양형성 세포 또는 대상체로부터의 샘플은 기준치를 수립하기 위해, 치료법 또는 섭생에 앞서, 개시된 항체들을 사용하여 평가되거나 특징지어질 수 있다. 다른 예에서, 종양형성 세포는 치료를 받은 대상체로부터 유도된 샘플로부터 평가될 수 있다.
또다른 구현예에서, 본 발명은 생체 내 암의 진행 및/또는 발병을 분석하는 방법을 제공한다. 또다른 구현예에서, 생체 내 암의 진행 및/또는 발병의 분석은 종양 진행의 정도를 결정하는 것을 포함한다. 또다른 구현예에서, 분석은 종양의 동정을 포함한다. 또다른 구현예에서, 종양 진행 분석은 1차 종양에 대해 수행된다. 또다른 구현예에서, 분석은 당업자에게 알려진 바와 같이 암의 종류에 따라 시간 경과에 걸쳐 수행된다. 또다른 구현예에서, 1차 종양의 전이 세포로부터 유래되는 2차 종양에 대한 추가적인 분석은 생체 내에서 수행된다. 또다른 구현예에서, 2차 종양의 크기와 모양이 분석된다. 일부 구현예에서, 추가적인 생체 외 분석이 수행된다.
또다른 구현예에서, 본 발명은 세포 전이를 결정하거나, 순환 종양 세포의 수준을 검출 및 정량하는 것을 포함하는 암의 생체 내 진행 및/또는 발병을 분석하는 방법을 제공한다. 또다른 구현예에서, 세포 전이의 분석은 1차 종양과 분리된 위치에서 세포의 진행성 성장의 결정을 포함한다. 일부 구현예에서, 혈관계, 림프계, 체강 내, 또는 이들의 조합을 통해 분산되는 종양 세포를 모니터하기 위한 절차를 거칠 수 있다. 또다른 구현예에서, 세포 전이 분석은 세포 이동, 파종(dissemination), 혈관외 유출, 증식 또는 이들의 조합의 관점에서 수행된다.
특정 예에서, 대상체 내 종양형성 세포 또는 대상체로부터의 샘플은 기준치를 수립하기 위하여, 치료에 앞서, 개시된 항체를 사용하여 평가되거나 특징지어질 수 있다. 다른 예에서, 샘플은 처리된 대상체로부터 유도된다. 일부 예에서, 샘플은 그 대상체의 처리가 시작 또는 종료된 후 적어도 약 1, 2, 4, 6, 7, 8, 10, 12, 14, 15, 16, 18, 20, 30, 60, 90 일, 6 개월, 9 개월, 12 개월, 또는 12 개월 초과 지난 후 취해진다. 특정 예에서, 종양형성 세포는 특정 횟수의 도스(dose) (예를 들어, 2, 5, 10, 20, 30 이상의 치료 도스) 후에 평가되거나 특징지어진다. 다른 예에서, 종양형성 세포는 일 회 이상의 치료를 받은 지 1 주, 2 주, 1 개월, 2 개월, 1 년, 2 년, 3 년, 4 년 이상 지난 후 평가되거나 특징지어진다.
B. 스크리닝
특정 구현예에서, 본 발명의 항체들은 결정인자와 상호작용함으로써 종양 세포의 작용이나 활성을 변경시키는 화합물 또는 작용제 (예를 들어, 항체 또는 ADC)를 동정하기 위해 샘플을 스크리닝하는 데 사용될 수 있다. 일 구현예에서, 종양세포는 항체 또는 ADC에 접촉되고, 그 항체 또는 ADC는 이에 한정되지는 않지만, 진단 목적을 포함하는 목적을 위해 그러한 세포를 동정하기 위하여 특정 표적 (예를 들어, DLL3)을 발현하는 세포에 대해 종양을 스크리닝하고, 치료 효능을 결정하기 위하여 그러한 세포를 모니터하거나, 그러한 표적-발현 세포를 위한 세포 집단을 풍부화하는 데 사용될 수 있다.
또다른 구현예에서, 방법은 종양세포와 시험 작용제 또는 화합물과의 직접적으로 또는 간접적으로 접촉시키고, 시험 작용제 또는 화합물이 결정인자와 연관된 종양세포의 활성 또는 그 작용, 예를 들어 세포의 형태 또는 생존력, 마커의 발현, 분화 또는 탈분화, 세포 호흡, 미토콘드리아 활성, 막 온전성, 성숙, 증식, 생존력, 세포자멸 또는 세포사의 변화를 조절하는지의 여부를 결정하는 것을 포함한다. 직접 상호작용의 일례로는 물리적 상호작용이 있는 한편, 간접적인 상호작용은 예를 들어, 결국 기준 개체 (예를 들어 세포 또는 세포 배양물)에 대해 작용하는 중간 분자에 대한 조성물의 작용을 포함한다.
스크리닝 방법은 선택적으로 예정된 장소, 예를 들어 배양 접시, 튜브, 플라스크, 회전 배양병 또는 플레이트 상에 배치되거나 위치된 세포의 배열 (예를 들어, 마이크로어레이)를 포함할 수 있는, 고속대량 스크리닝을 포함한다. 고속대량 자동 또는 수동 취급 방법은 단시간에 화학적 상호작용을 탐색하고 많은 유전자의 발현 정도를 결정할 수 있다. 예를 들어 형광단 또는 마이크로어레이 (문헌 [Mocellin and Rossi 2007, PMID: 17265713]) 및 매우 빠른 속도로 정보를 가공하는 자동화 분석 (예를 들어, 문헌 [Pinhasov et al., 2004, PMID: 15032660] 참조)을 통해 분자 신호를 활용하는 기술이 개발되었다. 스크리닝될 수 있는 라이브러리는 예를 들어, 소분자 라이브러리, 파지 디스플레이 라이브러리, 완전 인간 항체 효모 디스플레이 라이브러리 (Adimab), siRNA 라이브러리, 및 아데노바이러스성 형질감염 벡터를 포함한다.
VII. 제약 제조물 및 치료 용도
A. 제형 및 투여 경로
본 발명의 항체 또는 ADC는 관련 분야에서 인식되는 기법을 사용하여 다양한 방식으로 제형화될 수 있다. 일부 구현예에서, 본 발명의 치료 조성물은 용매 없이 또는 최소량의 추가 성분과 함께 투여될 수 있으며, 다른 것들은 선택적으로 적합한 제약상 허용되는 담체를 함유하도록 제형화될 수 있다. 본원에서 사용되는 바와 같이 "제약상 허용되는 담체"는 당업계에 널리 공지된 부형제, 비히클, 애주번트 및 희석제를 포함하고, 이들은 제약 제조물에서의 사용을 위해 상업적 공급원으로부터 입수가능할 수 있다(예를 들어, 문헌 [Gennaro (2003) Remington: The Science and Practice of Pharmacy with Facts and Comparisons: Drugfacts Plus, 20th ed., Mack Publishing];[Anselet al. (2004) Pharmaceutical Dosage Forms and Drug Delivery Systems, 7th ed., Lippencott Williams and Wilkins]; [Kibbe et al.(2000) Handbook of Pharmaceutical Excipients, 3rd ed., Pharmaceutical Press] 참조).
적합한 제약상 허용되는 담체는 비교적 불활성이며 항체 또는 ADC의 투여를 용이하게 할 수 있거나 또는 활성 화합물의 작용 자리로의 전달을 위해 제약학적으로 최적화된 제조물로의 가공을 도울 수 있는 물질을 포함한다.
이러한 제약상 허용되는 담체는, 제형의 형태, 컨시스턴시(consistency), 점도, pH, 독성, 안정성, 삼투성, 약동학, 단백질 응집 또는 용해도를 변경할 수 있는 작용제를 포함하고, 이는 완충제, 습윤제, 유화제, 희석제, 캡슐화제 및 피부 침투 개선제를 포함한다. 담체의 특정 비-제한적 예는, 식염수, 완충 식염수, 덱스트로스, 아르기닌, 수크로스, 물, 글리세롤, 에탄올, 소르비톨, 덱스트란, 나트륨 카르복시메틸 셀룰로스 및 이들의 조합을 포함한다. 전신 투여용 항체는 장관, 비경구 또는 국소 투여를 위해 제형화될 수 있다. 특정 구현예에서, 개시된 조성물들은 정맥내 투여를 위해 조제될 것이고, 바람직하게는 IV 컨테이너 (예를 들어, IV 점적 백)를 이용해 주입될 것이다. 실제로, 제형의 세 가지 유형 모두를 동시에 사용하여 활성 성분의 전신 투여를 달성할 수 있다. 부형제뿐만 아니라 비경구 및 비-비경구 약물 전달을 위한 제형이 문헌 [Remington: The Science and Practice of Pharmacy (2000) 20th Ed. Mack Publishing]에기재되어있다.
장관 투여에 적합한 제형은 경질 또는 연질 젤라틴 캡슐, 환제, 정제(코팅 정제 포함), 엘릭시르, 현탁액, 시럽 또는 흡입제 및 이들의 제어 방출 형태를 포함한다.
비경구 투여(예를 들어, 주사 또는 주입에 의한)에 적합한 제형은, 활성 성분이 용해되거나, 현탁되거나 또는 다른 방식으로 제공되어 있는(예를 들어, 리포좀 또는 기타 다른 마이크로미립자 내에) 수성 또는 비-수성, 등장성, 무-발열원, 멸균 액체(예를 들어, 용액, 현탁액)을 포함한다. 이러한 액체는 기타 다른 제약상 허용되는 담체, 예컨대 항산화제, 완충제, 보존제, 안정화제, 정균제, 현탁화제, 증점제, 및 제형이 의도된 수용자의 혈액(또는 기타 다른 관련 체액)과 등장성이 되게 하는 용질을 추가로 함유할 수 있다. 부형제의 예는, 예를 들어, 물, 알콜, 폴리올, 글리세롤, 식물성 오일 등을 포함한다. 이러한 제형에서의 사용에 적합한 등장성의 제약상 허용되는 담체는 염화나트륨 주사제, 링거액, 또는 락트산 링거액을 포함한다.
특히 바람직한 구현예에서, 본 발명의 제형화된 조성물은, 이후에 재구성된 후 투여될 수 있는 항체 또는 ADC의 분말화된 형태를 제공하도록 동결건조될 수 있다. 주사액의 제조를 위한 멸균 분말은, 개시된 항체 또는 ADC를 포함하는 용액을 동결건조시켜 임의의 선택적 공동-가용화된 생체적합성 성분과 함께 활성 성분을 포함하는 분말을 얻음으로써 생성될 수 있다. 일반적으로, 분산액 또는 용액은, 활성 화합물을 염기성 분산 매질 또는 용매(예를 들어, 희석제), 및 선택적으로 기타 다른 생체적합성 성분을 함유하는 멸균 비히클 내로 혼입시킴으로써 제조된다. 상용성 희석제는 제약상 허용되고(인간에게 투여하기에 안전하고 비-독성임) 액체 제형, 예컨대 동결건조 후 재구성된 제형의 제조에 유용할 것이다. 예시적 희석제는, 멸균수, 주사용 정균수(BWFI), pH 완충 용액(예를 들어, 포스페이트-완충 식염수), 멸균 식염수, 링거액 또는 덱스트로스 용액을 포함한다. 대안적 구현예에서, 희석제는 완충제 및/또는 염의 수용액을 포함할 수 있다.
바람직한 특정 구현예에서, 항-DLL3 항체 또는 ADC는 제약상 허용되는 당과 조합되어 동결건조될 것이다. "제약상 허용되는 당"은, 관심 단백질과 조합시, 저장에 따른 단백질의 화학적 및/또는 물리적 불안정성을 현저히 막거나 감소시키는 분자이다. 제형이 동결건조되고 이어서 재구성되는 것으로 의도된 경우 그러한 당은 특히 상용가능하다. 본원에서 사용되는 바와 같이 제약상 허용되는 당은 또한 "동결건조보호제"로서 언급될 수 있다. 예시적 당 및 이들의 상응하는 당 알콜은, 아미노산, 예컨대 일나트륨 글루타메이트 또는 히스티딘; 메틸아민, 예컨대 베타인; 친액성 염, 예컨대 황산마그네슘; 폴리올, 예컨대 3가 또는 보다 높은 분자량의 당 알콜, 예를 들어 글리세린, 덱스트란, 에리트리톨, 글리세롤, 아라비톨, 크실리톨, 소르비톨, 및 만니톨; 프로필렌 글리콜; 폴리에틸렌 글리콜; 플루로닉스(PLURONICS)®; 및 이들의 조합을 포함한다. 추가의 예시적 동결건조보호제는 글리세린 및 젤라틴, 및 당 멜리비오스, 멜레지토스, 라피노스, 만노트리오스 및 스타키오스를 포함한다. 환원 당의 예는 글루코스, 말토스, 락토스, 말툴로스, 이소-말툴로스 및 락툴로스를 포함한다. 비-환원 당의 예는 당 알콜 및 기타 다른 직쇄 폴리알콜로부터 선택되는 폴리히드록시 화합물의 비-환원 글리코시드를 포함한다. 바람직한 당 알콜은 모노글리코시드, 특히 디사카라이드, 예컨대 락토스, 말토스, 락툴로스 및 말툴로스의 환원에 의해 얻어진 화합물이다. 글리코시드 측기는 글루코시드 또는 갈락토시드 측기일 수 있다. 당 알콜의 추가의 예는, 글루시톨, 말티톨, 락티톨, 및 이소-말툴로스이다. 바람직한 제약상 허용되는 당은 비-환원 당 트레할로스 또는 수크로스이다. 제약상 허용되는 당은 "보호량"으로 제형에 첨가되고(예를 들어, 예비-동결건조), 이는 단백질이 저장 동안(예를 들어, 재구성 및 저장 후) 그의 물리적 및 화학적 안정성 및 일체성을 본질적으로 유지함을 의미한다.
당업자는, 상용성 동결건조보호제는, 약 1 mM 내지 약 1000 mM, 약 25 mM 내지 약 750 mM, 약 50 mM 내지 약 500 mM, 약 100 mM 내지 약 300 mM, 약 125 mM 내지 약 250 mM, 약 150 mM 내지 약 200 mM 또는 약 165 mM 내지 약 185 mM 범위의 농도로 액체 또는 동결건조된 제형에 첨가될 수 있음을 인지할 것이다. 특정 구현예에서, 동결건조보호제(들)는, 약 10 mM, 약 25 mM, 약 50 mM, 약 75 mM, 약 100 mM, 약 125 mM, 약 130 mM, 약 140 mM, 약 150 mM, 약 160 mM, 약 165 mM, 약 170 mM, 약 175 mM, 약 180 mM, 약 185 mM 약 190 mM, 약 200 mM, 약 225 mM, 약 250 mM, 약 300 mM, 약 400 mM, 약 500 mM, 약 600 mM, 약 700 mM, 약 800 mM 약 900 mM, 또는 약 1000 mM의 농도를 제공하도록 첨가될 수 있다. 바람직한 특정 구현예에서, 동결건조보호제(들)는 제약상 허용되는 당을 포함할 수 있다. 특히 바람직한 양태에서, 제약상 허용되는 당은 트레할로스 또는 수크로스를 포함할 수 있다.
다른 선택된 구현예에서, 본 발명의 액체 및 동결건조된 제형은, 안정화제 또는 완충제로서 작용하도록, 아미노산 또는 그의 제약상 허용되는 염을 포함하는 특정 화합물을 포함할 수 있다. 이러한 화합물은 약 1 mM 내지 약 100 mM, 약 5 mM 내지 약 75 mM, 약 5 mM 내지 약 50 mM, 약 10 mM 내지 약 30 mM 또는 약 15 mM 내지 약 25 mM 범위의 농도로 첨가될 수 있다. 특정 구현예에서, 완충제(들)는 약 1 mM, 약 5 mM, 약 10 mM, 약 15 mM, 약 20 mM, 약 25 mM, 약 30 mM, 약 35 mM, 약 40 mM, 약 50 mM, 약 60 mM, 약 70 mM, 약 80 mM, 약 90 mM 또는 약 100 mM의 농도를 제공하도록 첨가될 수 있다. 다른 선택된 구현예에서, 완충제는 약 5 mM, 약 10 mM, 약 15 mM, 약 20 mM, 약 25 mM, 약 30 mM, 약 35 mM, 약 40 mM, 약 50 mM, 약 60 mM, 약 70 mM, 약 80 mM, 약 90 mM 또는 약 100 mM의 농도를 제공하도록 첨가될 수 있다. 바람직한 특정 구현예에서, 완충제는 히스티딘 히드로클로라이드(예를 들어, L-histidine HCL)를 포함할 것이다.
또 다른 선택된 구현예에서, 본 발명의 액체 및 동결건조된 제형은 비-이온성 계면활성제, 예컨대 폴리소르베이트 20, 폴리소르베이트 40, 폴리소르베이트 60 또는 폴리소르베이트 80을 안정화제로서 포함할 수 있다. 이러한 화합물은 약 0.1 mg/ml 내지 약 2.0 mg/ml, 약 0.1 mg/ml 내지 약 1.0 mg/ml, 약 0.2 mg/ml 내지 약 0.8 mg/ml, 약 0.2 mg/ml 내지 약 0.6 mg/ml 또는 약 0.3 mg/ml 내지 약 0.5 mg/ml 범위의 농도로 첨가될 수 있다. 특정 구현예에서, 계면활성제는 약 0.1 mg/ml, 약 0.2 mg/ml, 약 0.3 mg/ml, 약 0.4 mg/ml, 약 0.5 mg/ml, 약 0.6 mg/ml, 약 0.7 mg/ml, 약 0.8 mg/ml, 약 0.9 mg/ml 또는 약 1.0 mg/ml의 농도를 제공하도록 첨가될 수 있다. 다른 선택된 구현예에서, 계면활성제는 약 1.1 mg/ml, 약 1.2 mg/ml, 약 1.3 mg/ml, 약 1.4 mg/ml, 약 1.5 mg/ml, 약 1.6 mg/ml, 약 1.7 mg/ml, 약 1.8 mg/ml, 약 1.9 mg/ml 또는 약 2.0 mg/ml의 농도를 제공하도록 첨가될 수 있다. 바람직한 특정 구현예에서, 계면활성제는 폴리소르베이트 20 또는 폴리소르베이트 40을 포함할 것이다. 특히 바람직일 양태에서, 계면활성제는 폴리소르베이트 20을 포함할 것이다.
동결건조된 분말으로부터 재구성되든 원래 용액으로부터 재구성되든, 비경구 투여(예를 들어, 정맥내 주사)를 위한 개시된 항체 또는 ADC의 상용성 제형은 약 10 ㎍/mL 내지 약 100 mg/mL의 ADC 또는 항체 농도를 포함할 수 있다. 선택된 특정 구현예에서, 항체 또는 ADC 농도는 20 ㎍/mL, 40 ㎍/mL, 60 ㎍/mL, 80 ㎍/mL, 100 ㎍/mL, 200 ㎍/mL, 300 ㎍/mL, 400 ㎍/mL, 500 ㎍/mL, 600 ㎍/mL, 700 ㎍/mL, 800 ㎍/mL, 900 ㎍/mL 또는 1 mg/mL를 포함할 것이다. 다른 구현예에서, ADC 농도는 2 mg/mL, 3 mg/mL, 4 mg/mL, 5 mg/mL, 6 mg/mL, 8 mg/mL, 10 mg/mL, 12 mg/mL, 14 mg/mL, 16 mg/mL, 18 mg/mL, 20 mg/mL, 25 mg/mL, 30 mg/mL, 35 mg/mL, 40 mg/mL, 45 mg/mL, 50 mg/mL, 60 mg/mL, 70 mg/mL, 80 mg/mL, 90 mg/mL 또는 100 mg/mL를 포함할 것이다.
특정의 바람직한 양태에서, 본 발명의 조성물은 pH 6.0에서 DLL3 ADC (예를 들어, hSC16.56DL1, hSC16.56ss1DL6 등) 10 mg/ml, 염산 히스티딘 20mM, 수크로스 0.175M, 폴리소르베이트 20 0.4 mg/mL을 포함하는 액체 제제를 포함할 것이다. 일 양태에서, 본 발명의 조성물은 pH 6.0에서 hSC16.56DL1 (예를 들어, Rova-T) 10 mg/ml, 염산 히스티딘 20mM, 수크로스 0.175M, 폴리소르베이트 20 0.4 mg/mL을 포함한다. 또다른 양태에서, 본 발명의 조성물은 pH 6.0에서 hSC16.56ss1DL6 10 mg/ml, 염산 히스티딘 20mM, 수크로스 0.175M, 폴리소르베이트 20 0.4 mg/mL을 포함한다. 본 명세서에서 논의되고, 아래 실시예에 나타낸 바와 같이, 이러한 액체 제제들은 사용 전에 약학적으로 상용성인 (예를 들어, 수용성) 담체와 함께 재구성될 수 있는 분말화된 조성물을 제공하기 위해 동결건조될 수 있다. 액체 용액에서 이러한 조성물은 바람직하게는 -70℃에 저장되고 빛으로부터 보호되어야 한다. 동결건조의 경우, DLL3 ADC 분말화 제제는 바람직하게는 2-8℃에 저장되고 빛으로부터 보호되어야 한다. 상기 언급된 용액 또는 분말 각각은 바람직하게는 살균된 유리 바이알 (예를 들어, USP 타입 I 10ml)에 담기고, 10 mg/mL DLL3 ADC (원래의 용액 또는 재구성된 용액)의 설정 부피 (예를 들어, 3 또는 5 mL)를 일정하게 제공하도록 조정될 수 있다.
동결건조된 분말로부터 재구성되었는지와 무관하게, 액체 DLL3 ADC 제제 (예를 들어, 바로 위에 기재된 바와 같은)는, 투여 전에 추가로 (바람직하게는 수용성 담체에) 희석될 수 있다. 예를 들어, 상기 언급된 액체 제제는 투여를 위해 원하는 도스 수준을 달성하기 위하여 0.9% 염화나트륨 주사제, USP, 또는 균등물 (필요시 변경하여)을 담은 주입 백 내로 추가로 희석될 수 있다. 특정 양태에서, 완전 희석된 DLL3 ADC 용액은 IV 장치를 이용해서 정맥내 주입을 통해 투여될 것이다. 바람직하게는, 투여된 DLL3 ADC 약물 용액은 (정맥내 (IV) 주입 또는 주사에 의한 것인지에 무관하게) 투명하고 무색이며 가시적인 입자가 없다.
보다 일반적으로 어떤 경우에도, 본 발명의 화합물 및 조성물은, 이를 필요로 하는 대상체에게 경구, 정맥내, 동맥내, 피하, 비경구, 비강내, 근육내, 심장내, 심실내, 기관내, 구강, 직장, 복강내, 피내, 국소, 경피, 및 경막내, 또는 다른 방식의 이식 또는 흡입을 포함하나 이에 제한되지는 않는 다양한 경로에 의해 생체 내 투여될 수 있음을 인지할 것이다. 대상 조성물은, 정제, 캡슐, 분말, 과립, 연고, 용액, 좌제, 관장제, 주사제, 흡입제, 및 에어로졸을 포함하나 이에 제한되지는 않는 고체, 반-고체, 액체, 또는 기체 형태의 제조물로 제형화될 수 있다. 적절한 제형 및 투여 경로는 의도된 응용 및 치료 방식에 따라 선택될 수 있다.
B. 투여량 및 투여 방식
특정 투여량 방식, 즉, 용량, 시기 및 반복은 개별 대상체뿐만 아니라, 경험적 고려사항, 예컨대 약동학(예를 들어, 반감기, 제거율 등)에 따라 달라질 것이다. 투여 빈도수의 결정은 당업자, 예컨대 담당의에 의해 병태 및 치료되는 병태의 중증도, 치료되는 대상체의 연령 및 일반적 건강 상태 등의 고려사항에 기초하여 이루어질 수 있다. 투여 빈도수는 선택된 조성물의 효능 평가 및 투여 방식에 기초하여 치료 과정에 걸쳐 조정될 수 있다. 이러한 평가는 특정 질병, 질환 또는 상태의 마커, 또는 개인 웰빙 (삶의 질에 대한 평가, 일상 활동, 등에 의해 측정된 것)에 대한 평가에 기초하여 이루어질 수 있다. 개체가 암을 갖는 구현예에서, 이들은 촉진(palpation) 또는 가시적 관찰을 통한 종양 크기의 직접적 측정; x선 또는 기타 다른 이미징 기법에 의한 종양 크기의 간접적 측정; 직접적 종양 생검 및 종양 샘플의 현미경 검사에 의해 평가된 개선; 본원에 기재된 방법에 따라 식별된 간접적 종양 마커(예를 들어, 전립선암에 대한 PSA) 또는 항원의 측정; 증식성 또는 종양형성 세포의 수 감소, 이러한 신생 세포의 감소 유지; 신생 세포의 증식 감소; 또는 전이 발생의 지연을 포함한다.
본 발명의 DLL3 ADC는 다양한 범위로 투여될 수 있다. 이들은 용량 당 약 5 ㎍/체중 kg 내지 약 100 mg/체중 kg; 용량 당 약 50 ㎍/체중 kg 내지 약 5 mg/체중 kg; 용량 당 약 100 ㎍/체중 kg 내지 약 10 mg/체중 kg을 포함한다. 기타 다른 범위는 용량 당 약 100 ㎍/체중 kg 내지 약 20 mg/체중 kg 및 용량 당 약 0.5 mg/체중 kg 내지 약 20 mg/체중 kg을 포함한다. 특정 구현예에서, 투여량은 적어도 약 100 ㎍/체중 kg, 적어도 약 250 ㎍/체중 kg, 적어도 약 750 ㎍/체중 kg, 적어도 약 3 mg/체중 kg, 적어도 약 5 mg/체중 kg, 적어도 약 10 mg/체중 kg을 포함한다.
선택된 구현예에서, DLL3 항체 또는 ADC는 용량 당 대략 5, 10, 20, 30, 40, 50, 60, 70, 80, 90 또는 100 ㎍/체중 kg으로 투여(바람직하게는 정맥내)될 것이다. 다른 구현예는 용량 당 약 200, 250, 300, 350, 400, 450, 500, 550, 600, 650, 700, 750, 800, 850, 900, 950, 1000, 1100, 1200, 1300, 1400, 1500, 1600, 1700, 1800, 1900 또는 2000 ㎍/체중 kg의 항체 또는 ADC 투여를 포함할 수 있다. 다른 구현예에서, 개시된 컨쥬게이트는 2.5, 3, 3.5, 4, 4.5, 5, 5.5, 6, 6.5, 7, 7.5, 8, 9 또는 10 mg/kg으로 투여될 것이다. 또 다른 구현예에서, 컨쥬게이트는 용량 당 12, 14, 16, 18 또는 20 mg/체중 kg으로 투여될 수 있다. 또 다른 구현예에서, 컨쥬게이트는 용량 당 25, 30, 35, 40, 45, 50, 55, 60, 65, 70, 75, 80, 90 또는 100 mg/체중 kg으로 투여될 수 있다. 본원의 교시내용에서, 당업자는 임상전 동물 연구, 임상 관찰 및 표준 의학 및 생화학 기법 및 측정에 기초하여 각종 DLL3 항체 또는 ADC에 대한 적절한 투여량을 쉽게 결정할 수 있다.
다른 투여 방식은 U.S.P.N. 7,744,877에 개시된 바와 같은 체표면적(BSA) 계산으로 설명될 수 있다. 널리 공지된 바와 같이, BSA는 환자의 신장 및 체중을 사용하여 계산되고, 이는 대상체 신체의 표면적으로 나타내어지는 바와 같이 대상체의 크기에 대한 척도를 제공한다. 특정 구현예에서, 컨쥬게이트는 1 mg/㎡ 내지 800 mg/㎡, 50 mg/㎡ 내지 500 mg/㎡의 투여량으로, 또한 100 mg/㎡, 150 mg/㎡, 200 mg/㎡, 250 mg/㎡, 300 mg/㎡, 350 mg/㎡, 400 mg/㎡ 또는 450 mg/㎡의 투여량으로 투여될 수 있다. 또한, 관련 분야에 인식된 및 경험적 기법을 사용하여 적절한 투여량을 결정할 수 있음을 인지할 것이다.
다른 구현예에서, 항-DLL3 항체 또는 ADC는 특정 일정으로 투여될 수 있다. 일반적으로, DLL3 컨쥬게이트의 유효 도스는 대상체에게 1 회 이상 투여될 수 있다. 더욱 구체적으로, 항체 또는 ADC의 유효 도스는 대상체에게 1 주에 1 회, 2 주마다 1 회, 3 주마다 1 회, 1 개월에 1 회 또는 1 개월에 1 회 미만 투여된다. 특정 구현예에서, DLL3 항체 또는 ADC의 유효 도스는 적어도 1 개월, 적어도 6 개월, 적어도 1 년, 적어도 2 년 또는 몇 년의 기간을 포함하여 다회 투여될 수 있다. 또다른 구현예에서, 개시된 항체나 ADC의 투여 사이에는 며칠 (2, 3, 4, 5, 6 또는 7 일), 몇 주 (1, 2, 3, 4, 5, 6, 7 또는 8 주) 또는 몇 달 (1, 2, 3, 4, 5, 6, 7 또는 8 개월) 또는 심지어 일 년 또는 몇 년의 공백을 가질 수 있다.
일부 구현예에서, 컨쥬게이트된 항체를 포함한 치료 과정은 선택된 약품의 몇 주 또는 몇 개월에 걸친 다중 투여 (사이클)를 포함할 것이다. 더욱 구체적으로, 본 발명의 항체 또는 ADC는 매일, 매 2 일, 매 4 일, 매주, 매 10 일, 매 2 주, 매 3 주, 매 4 주, 매 5 주, 매 6 주, 매 8 주, 매 10 주 또는 매 12 주 1 회 투여될 수 있다. 이러한 점에서, 환자의 반응 및 임상 실험에 기초하여 용량은 변경될 수 있거나, 간격이 조정될 수 있음이 이해될 것이다. 본 발명은 불연속 투여 또는 수 회 부분 투여로 나누어진 1 일 도스를 또한 고려한다. 본 발명의 조성물 및 항암제는 격일 또는 격주로 상호 교환적으로 투여될 수 있으며; 일련의 항체 처리가 제공될 수 있고, 항암제 치료의 1 회 이상의 처리가 뒤따를 수 있다. 임의의 경우에, 당업자가 알 수 있는 바와 같이, 화학 치료제의 적절한 도스는 일반적으로 화학 치료제가 단독으로 또는 다른 화학 치료제와 병용하여 투여된 임상 요법에서 이미 사용된 수준일 것이다.
특정 구현예에서, 본 발명은 암의 치료에 사용하기 위한 항-DLL3 항체 약제 컨쥬게이트를 제공하며, 여기서 치료는 적어도 매주 1 회(QW), 적어도 2 주마다 1 회(Q2W), 적어도 3 주마다 1회(Q3W), 적어도 4 주마다 1 회(Q4W), 적어도 5 주마다 1 회(Q5W), 적어도 6 주마다 1 회(Q6W), 적어도 7 주마다 1 회(Q7W), 적어도 8 주마다 1 회(Q8W), 적어도 9 주마다 1 회(Q9W) 또는 적어도 10 주마다 1 회(Q10W) 항-DLL3 항체 약물 컨쥬게이트 (DLL3 ADC) 유효량의 투여를 포함할 수 있다. 선택된 구현예에서, DLL3 ADC는 적어도 3 주마다 1 회(Q3W), 적어도 4 주마다 1 회(Q4W), 적어도 5 주마다 1 회(Q5W) 또는 적어도 6 주마다 1 회(Q6W) 투여될 것이다. 특정의 다른 구현예에서, DLL3 ADC는 적어도 7 주마다 1 회(Q7W), 적어도 8 주마다 1 회(Q8W), 적어도 9 주마다 1 회(Q9W) 또는 적어도 10 주마다 1 회(Q10W) 투여될 것이다. 다른 선택된 구현예에서, DLL3 ADC는 약 0.05 mg/kg, 0.1 mg/kg, 0.2 mg/kg, 0.3 mg/kg, 0.4 mg/kg, 0.5 mg/kg, 0.6 mg/kg, 0.7 mg/kg 또는 0.8 mg/kg의 도스로 투여될 것이다. 특정 구현예는 DLL3 ADC의 일 회 투여로 환자를 치료하는 것을 포함할 것이다. 또다른 구현예는 2 사이클 (×2), 3 사이클 (×3), 4 사이클 (×4), 5 사이클 (×5), 6 사이클 (×6), 7 사이클 (×7), 8 사이클(×8), 9 사이클 (×9), 또는 10 사이클 (×10)의 특정된 간격 (즉, Q2W, Q3W, Q4W, Q5W, Q6W 등)으로 환자를 치료하는 것을 포함할 것이다. 본 발명의 여전히 다른 양태는 환자의 반응 및 임의의 독성에 따른 무기한 사이클의 DLL3 ADC 투여를 포함할 것이다. 다른 구현예에서, (× 사이클의) 초기 DLL3 ADC 치료는 완료될 수 있으며, 더 이상의 DLL3 ADC 치료는 암의 진행 (진행 중인 치료)의 표시를 보일 때까지 중단될 수 있다. 또다른 구현예에서, (× 사이클의) 초기 DLL3 ADC 치료는 완료될 수 있으며, 이후 해당 환자는 유지 치료법 (예를 들어, 무기한 DLL3 ADC 0.1 mg/kg Q6W)에 들어갈 수 있다.
본 발명과 상용성인 예시적인 투약 방식(dosing regimen)은 아래 표 3에 기재되어 있다. 아래에 상세히 논의되는 바와 같이, 개시된 예시적인 투약 방식은 단일 제제로서 또는 다른 화학치료제 또는 암 치료 (예를 들어, 수술 또는 빔 방사선)와 조합하여 DLL3 ADC를 사용하는 것과 상용성이다.
본 발명의 일부 양태에서, DLL3 ADC는 PBD를 포함할 것이다. 다른 양태에서, DLL3는 SC16LD6.5 (예를 들어, hSC16.56DL1 또는 ADC1)을 포함할 것이다. 다른 양태에서, DLL3 ADC는 위치 특이적 ADC를 포함하고, 특정 바람직한 양태에서는 hSC16.56ss1PBD1 (예를 들어, hSC16.56ss1DL6 또는 ADC6)을 포함할 것이다. 또다른 양태에서, DLL3 ADC는 정맥 주사로 투여될 것이다. 다른 특정 양태에서, 치료될 암은 신경내분비 암종을 포함할 것이다. 다른 양태에서, 치료될 암은 소세포 폐암(SCLC), 대세포 신경내분비 암(LCNEC)을 포함할 것이다. 특정 구현예는 제1선 환자 (즉, 특정 암이 아직 치료되지 않은 환자)를 치료하기 위해서 개시된 조성물의 사용을 포함할 것이다. 선택된 구현예에서, 제1선 환자들은 광범위한 단계의 SCLC 또는 한정된 단계의 SCLC를 나타낼 것이다. 다른 선택된 양태에서, 치료될 암 환자들은 제2선 환자 (즉, 기존에 치료를 받은 환자)들을 포함할 것이다. 또다른 구현예에서, 치료될 암 환자들은 제3선 환자 (즉, 기존에 두 번의 치료를 받은 환자)들을 포함할 것이다. 또다른 구현예에서 암 환자들은 제4선 환자 (즉, 기존에 세 번의 치료를 받은 환자)들을 포함할 것이다.
본 발명의 특정의 바람직한 구현예는 환자를 3 주마다 DLL3 ADC 0.2 mg/kg으로 3 사이클 (0.2 mg/kg Q3W×3) 동안 치료하는 것을 포함할 것이다. 선택된 구현예에서, 0.2 mg/kg Q3W×3으로 치료될 환자는 SCLC로 고통받고 있을 것이다. 다른 구현예에서, 0.2 mg/kg Q3W×3으로 치료될 환자는 LCNEC로 고통받고 있을 것이다. 일부 양태에서, 환자는 암 치료를 받은 적이 없다. 특정 양태에서, 환자는 제2선 환자를 포함할 것이다. 또다른 구현예에서, 환자는 제3선 환자를 포함할 것이다. 다른 양태에서, 환자는 0.2 mg/kg Q3W×3 치료 사이클에 따라 진행 중 치료될 것이다. 또다른 양태에서, 환자는 0.2 mg/kg Q3W×3 치료 사이클에 따라서 DLL3 ADC 유지 치료법으로 변경될 것이다. 또다른 구현예에서 DLL3 ADC는 SC16LD6.5 (예를 들어, ADC1)를 포함하는 반면에 여전히 다른 구현예에서 DLL3 ADC는 h16.56ss1DL6을 포함할 것이다.
이러한 치료에서 (및 아래에서 논의되는 바와 같이), DLL3 ADC는 환자 반응을 개선하기 위해 선택된 항암제(들)와 조합될 수 있다. 특정 대상체에게 DLL3 ADC는 1 회 이상의 항암제 투여 전 또는 투여 후에 2 이상의 사이클 동안 3 주마다 (예를 들어, 0.2 mg/kg Q3W×2 또는 0.2 mg/kg Q3W×3 등) 투여될 수 있다. 선택된 구현예에서, 대상체는 SCLC로 고통받고 있을 것이고, 항암제는 시스플라틴, 카보플라틴 및/또는 에토포시드가 될 것이다. 따라서, 하나의 예시적인 투약 방식은 예를 들어, 0.2 mg/kg Q3W×2 또는 0.2 mg/kg Q3W×3의 DLL3 ADC에 이어 각각 Q3W×4로 투여될 수 있는 시스플라틴 (예를 들어, 80 mg/m2) 및 에토포시드 (예를 들어, 100 mg/m2)를 포함할 수 있다. 따라서, 그러한 예에서, 한 요법은 0.2 mg/kg Q3W×2 또는 0.2 mg/kg Q3W×3의 DLL3 ADC를 포함할 것이고; CDDP/ETP 요법에서 CDDP 및 ETP는 Q3W×4로 1 주, 2 주, 3 주, 4 주, 5 주, 6 주 또는 그 후에 DLL3 ADC 사이클의 결과에 따라 시작될 수 있다. 다른 상용성 구현예에서, CDDP/ETP는 DLL3 ADC 치료에 앞서 주어질 수 있다 (즉, Q3W×4에서 CDDP/ETP; 0.2 mg/kg Q3W×2 또는 0.2 mg/kg Q3W×3의 DLL3 ADC, 여기서 DLL3 ADC는 CDDP/ETP 사이클이 완료되고 1 주, 2 주, 3 주, 4 주, 5 주, 6 주 또는 그 후에 시작될 수 있음). 또다른 구현예에서, CDDP/ETP 섭생 및 DLL3 ADC 섭생은 (실질적으로 상기 기재된 바와 같이, 그러나 선택적으로 투약량 0.1 mg/kg의 DLL3 ADC와 함께) 동시에 제공될 수 있다 (즉, 두 섭생 모두 1 주차에 시작됨). 특정 구현예에서, 앞서 언급된 섭생에 따라 치료될 대상체는 제1선 환자일 것이다. 다른 바람직한 구현예에서, 제1선 환자들은 SCLC 또는 LCNEC로 고통받고 있을 것이다. 또다른 구현예에서 60 mg/m2의 시스플라틴이 투여되는 반면에 여전히 다른 구현예에서는 시스플라틴/에토포시드 조합이 3 주마다 (백금 D1, 에토포시드 D1, 2, 3을 3 주마다 ×4 또는 ×6) 제공될 수 있다. 여전히 다른 구현예에서 카보플라틴 (5 AUC)/에토포시드는 CDDP/E Q21d×4-6 사이클과 유사한 빈도로 투여될 수 있다. 또다른 구현예에서, DLL3 ADC는 환자에게 민감제로서 작용하고 치료 조합의 효과를 강화하기 위해서 (카보플라틴, 시스틴 및/또는 에토포시드를 포함하는) 임의의 화학치료제에 앞서 투여될 수 있다.
상기에 논의된 바와 같이, 본 발명의 선택된 구현예는 증진된 치료 지수를 제공하고 투약 방식의 최적화를 가능하게 하는 개선된 약동학 및 약력학적 특성을 갖는 ADC를 포함한다. 이러한 점에서, 개시된 ADC는 본 명세서에 설명된 바와 같이 측정된 경우 6 일 초과의 최종 반감기, 7 일 초과의 최종 반감기 또는 8 일 초과의 최종 반감기를 가질 것이다. 여전히 다른 본 발명의 양태는 (각각 인간 대상체에게서 측정된) 9 일 초과의 최종 반감기, 10 일 초과의 최종 반감기, 11 일 초과의 최종 반감기, 12 일 초과의 최종 반감기를 지닌 ADC를 포함할 것이다. 여전히 또다른 구현예에서, 개시된 ADC는 인간 대상체 내에서 13 일 초과의 최종 반감기, 14 일 초과의 최종 반감기, 15 일 초과의 최종 반감기, 약 16 일 초과의 최종 반감기, 약 17 일 초과의 최종 반감기, 18 일 초과의 최종 반감기, 약 19 일 초과의 최종 반감기, 약 20 일 초과의 최종 반감기 또는 3 주일 초과의 최종 반감기를 가질 것이다. 또다른 구현예에서 본 발명의 ADC는 약 6 일의 최종 반감기, 약 7 일의 최종 반감기, 약 8 일의 최종 반감기, 약 9 일의 최종 반감기, 약 10 일의 최종 반감기, 약 11 일의 최종 반감기, 약 12 일의 최종 반감기, 약 13 일의 최종 반감기, 약 14 일의 최종 반감기, 약 15 일의 최종 반감기, 약 16 일의 최종 반감기, 약 17 일의 최종 반감기, 약 18 일의 최종 반감기, 약 19 일의 최종 반감기, 약 20 일의 최종 반감기 또는 약 3 주일의 최종 반감기를 나타낼 것이다. 당업자는 이러한 연장된 반감기가 개시된 ADC를 적은 빈도로 투약하는 것을 가능하게 함으로써 유사하거나 감소된 독성을 나타내면서 원하는 효율을 제공할 것임을 이해할 것이다.
따라서, 본 발명의 특정 바람직한 구현예는 2 이상의 사이클을 6 주마다 0.3 mg/kg의 DLL3 ADC를 사용하여 환자를 치료하는 것 (예를 들어, 0.3 mg/kg Q6W×2)을 포함할 것이다. 아래 실시예에 나타낸 바와 같이, 본 발명의 DLL3 ADC의 상대적으로 긴 반감기 때문에 이러한 섭생이 특히 효과적일 (효과적인 치료 지수를 보일) 수 있다. 선택된 구현예에서, 0.3 mg/kg Q6W×2로 치료될 환자는 SCLC로부터 고통받고 있을 것이다. 다른 구현예에서, 0.3 mg/kg Q6W×2로 치료될 환자는 LCNEC로부터 고통받고 있을 것이다. 여전히 다른 구현예는 3 사이클(×3), 4 사이클(×4), 5 사이클(×5), 6 사이클(×6) 이상을 위해 0.3 mg/kg Q6W의 DLL3 ADC 투여를 포함할 것이다. 이러한 구현예에서, 그 사이클은 연속적 (6 주마다) 또는 간헐적 (세 번째 사이클마다 건너뛰고 다시 시작)일 수 있다. 일부 양태에서 환자는 암을 치료 받은 적이 없다 (제1선). 특정 양태에서 환자는 제2선 환자를 포함할 것이다. 또다른 구현예에서 환자는 제3선 환자를 포함할 것이다. 다른 양태에서 환자는 0.3 mg/kg Q6W×2 치료 사이클에 따라 진행 중 치료될 것이다. 또다른 양태에서, 환자는 0.3 mg/kg Q6W×2 치료 사이클에 따라 DLL3 ADC 유지 치료법으로 변경될 것이다. 다른 바람직한 양태에서 DLL3 ADC는 hSC16.56ss1DL6 (예를 들어, ADC6)을 포함할 것인 한편, 특정 구현예에서 DLL3 ADC는 SC16LD6.5 (예를 들어, ADC1)를 포함할 것이다.
아래에 상세히 논의되는 바와 같이, DLL3 ADC는 환자의 반응을 개선시키기 위해 선택된 항암제(들)와 조합될 것이다. 특정 대상체의 경우, DLL3 ADC는 하나 이상의 항암제(들) 투여 전 또는 후에 2 사이클 동안 6 주마다 (예를 들어, 0.3 mg/kg Q6W×2) 투여될 수 있다. 선택된 구현예에서 대상체는 SCLC로 고통받고 있을 것이며, 그 항암제는 시스플라틴, 카보플라틴 및/또는 에토포시드가 될 것이다. 따라서, 하나의 예시적인 투약 방식은 0.3 mg/kg Q6W×2의 DLL3 ADC에 이어, 예를 들어, 각각 Q3W×4로 투여되는 시스플라틴 (예를 들어, 80 mg/m2) 및 에토포시드 (예를 들어, 100 mg/m2)를 포함할 것이다. 따라서, 이러한 예에서 한 사이클은 0.3 mg/kg Q6W×2의 DLL3 ADC를 포함할 것이며; DLL3 ADC 사이클의 결과에 따라서 1 주, 2 주, 3 주, 4 주, 5 주, 6 주 또는 그 후에 시작될 수 있는 CDDP/ETP 섭생의 Q3W×4의 CDDP 및 ETP를 포함할 것이다. 다른 적합한 구현예에서, CDDP/ETP는 DLL3 ADC를 이용한 치료에 앞서 (즉, Q3W×4로 CDDP/ETP; 0.3 mg/kg Q6W×2의 DLL3 ADC, 여기서 DLL3 ADC 섭생은 CDDP/ETP 사이클의 완료 후 1 주, 2 주, 3 주, 4 주, 5 주, 6 주 또는 그 후에 시작할 수 있음) 제공될 수 있다. 여전히 다른 구현예에서, CDDP/ETP 섭생 및 DLL3 ADC 섭생은 (실질적으로 상기 기재된 바와 같이 그러나 선택적으로 0.1 mg/kg 투약량의 DLL3 ADC와 함께) 동시에 제공될 수 있다 (즉, 둘 모두 1 주차에 시작). 특정 구현예에서, 상기 언급된 섭생에 따라 치료될 대상체는 제1선 환자일 것이다. 다른 바람직한 구현예에서 제1선 환자는 SCLC 또는 LCNEC로 고통받고 있을 것이다. 다른 구현예에서 시스플라틴/에토포시드 조합이 3 주마다 (백금 D1, 에토포시드 D1, 2, 3을 3 주마다 ×4 또는 ×6) 제공될 수 있는 한편, 또다른 구현예에서 시스플라틴은 60 mg/m2으로 투여될 것이다. 여전히 다른 구현예에서, 카보플라틴(5 AUC)/에토포시드는 CDDP/E Q21d×4-6 사이클과 유사한 빈도로 투여될 수 있다. 또다른 구현예에서, DLL3 ADC는 민감제로서 작용하고 화학적치료 조합의 효과를 강화하기 위해서 (카보플라틴, 시스플라틴 및/또는 에토포시드를 포함하는) 임의의 화학치료제에 앞서 환자에게 투여될 수 있다.
추가의 구현예에서, 본 발명의 DLL3 ADC는 임의의 한 사이클에서 상이한 투약량으로 투여될 수 있다. 예를 들어, 상대적으로 높은 도스 (예를 들어, 0.5 mg/kg)로 투여 (즉, 부하된 또는 약물 부하)되고, 이어서 보다 낮은 도스의 DLL3 ADC (예를 들어, 0.2 mg/kg)가 4 주 후(Q4W) 동일한 사이클의 일부로서 투여될 수 있다. 다시, 그러한 사이클은 반복 (2×, 3×, 등) 또는 진행 (진행 중 치료) 또는 DLL3 ADC 유지 (예를 들어, 무기한의 0.1 mg/kg Q4W 또는 무기한의 0.1 mg/kg Q6W)가 뒤따르기까지 지연될 수 있다. 이러한 관점에서, 본 발명의 DLL3 항체 또는 ADC는 질병에 초기 제시 후의 종양 재발의 기회를 감소시키거나 제거하기 위한 유지 치료법 설정에 사용될 수 있다. 이러한 유지 치료법은 첫 치료가 DLL3 ADC를 이용했는지 다른 항신생물제 또는 치료 (예를 들어, 방사선, 수술, 화학요법 등)을 이용했는지와 무관하게 사용될 수 있다. 바람직하게는, 질환이 치료되고 초기 종양 덩어리가 제거, 감소 또는 다르게는 개선되어 환자가 증상을 나타내지 않거나 차도를 보이게 될 것이다. 이러한 시기에, 표준 진단 절차를 이용하여, 대상체가 질병의 징후가 거의 또는 전혀 없더라도 개시된 ADC의 약학적 유효량을 1 회 이상 투여할 수 있다. 바람직한 구현예에서, DLL3 ADC는 PBD를 포함할 것이고, 선택된 구현예에서는 SC16LD6.5 또는 SC16.56ss1DL6을 포함할 것이다.
특정 구현예에서, 유지 치료법은 케어 기준 (SOC) 화학요법 치료를 포함한 화학요법 후의 DLL3 ADC의 투여를 포함할 것이다. 선택된 양태에서 이 유지 치료법은 DLL3 ADC 유지 섭생이 뒤따르는 시스플라틴/에토포시드 같은 SOC 화학요법으로 초기 치료를 받은 제1선 환자들을 포함할 것이다. 예로써, 환자는 1 사이클 이상의 DLL3 ADC 투여가 뒤따르는 1 사이클 이상의 제1선 화학 요법 (예를 들어, 4 사이클의 백금 기재 화학요법)으로 치료될 수 있다. 특정 구현예에서, DLL3 ADC는 0.3 mg/kg Q6W로 3 사이클마다 생략되어 투여될 수 있다. 이러한 유지 치료 섭생은 환자가 응하고 질병의 진행 또는 부작용이 나타나지 않는한 지속될 수 있다.
다른 적합한 구현예에서, 본 발명의 항체 또는 ADC는 감량 절차 후에 종양 전이의 확률을 방지 또는 감소시키기 위한 보조 요법으로서 또는 예방적으로 사용될 수 있다. 본 개시 내용에서 사용된 바와 같이, "감량 절차"는 종양의 질량을 감소시키거나 종양의 크기 또는 증식성을 개선시키는 임의의 절차, 기술, 또는 방법을 의미한다. 예시적인 감량 절차는 수술, 방사선 치료 (즉, 빔 방사선), 화학요법, 면역요법 또는 절제술을 포함하지만 이에 한정되지는 않는다. 당업자가 본 개시 내용의 관점을 고려하여 쉽게 결정된 적절한 시기에, 개시된 ADC는 종양 전이 및 종양 재발의 가능성을 감소시키기 위해 임상적, 진단적, 또는 테라그노시스 절차에 의해 제안된 바와 같이 투여될 수 있다.
본 발명의 또다른 구현예는 증상이 없으나 암 발생의 위험이 있는 대상체에게 개시된 항체 또는 ADC를 투여하는 것을 포함한다. 즉, 본 발명의 항체 또는 ADC는 엄밀히 예방적인 의미로 사용될 수 있고, 검사 또는 시험되고 1 회 이상의 주목되는 위험 인자를 (예를 들어, 유전적 지표, 가족 내력, 생체 내 또는 시험관 내 실험 결과 등) 지니고 있지만 신생물이 형성되지 않은 환자에게 제공될 수 있다.
투여량 및 방식은 또한 하나 이상의 투여(들)를 받은 개체에서 개시된 치료 조성물에 대하여 경험적으로 결정될 수 있다. 예를 들어, 개체는 점증적 투여량의 본원에 기재된 바와 같이 제조된 치료 조성물을 받을 수 있다. 선택된 구현예에서, 투여량은 각각 경험적으로 측정된 또는 관찰된 부작용 또는 독성에 기초하여 점차 증가되거나 감소 또는 희박화될 수 있다. 선택된 조성물의 효능을 평가하기 위해, 특정 질환, 장애 또는 병태의 마커가 상기에 기재된 바에 따를 수 있다. 암에 대하여, 이들은 촉진 또는 또는 가시적 관찰을 통한 종양 크기의 직접적 측정; x선 또는 기타 다른 이미징 기법에 의한 종양 크기의 간접적 측정; 직접적 종양 생검 및 종양 샘플의 현미경 검사에 의해 평가된 개선; 본원에 기재된 방법에 따라 식별된 간접적 종양 마커(예를 들어, 전립선암에 대한 PSA) 또는 종양형성 항원의 측정, 통증 또는 마비의 감소; 개선된 언어능력, 시력, 호흡 또는 기타 다른 종양 연관 장애; 증가된 식욕; 허용 시험에 의해 측정된 삶의 질 개선 또는 생존 연장을 포함한다. 투여량은 개체, 신생 병태의 유형, 신생 병태의 단계, 신생 병태가 개체에서 기타 다른 위치로 전이되기 시작했는지의 여부, 및 사용되는 과거 및 동시 치료에 따라 달라질 것임이 당업자에게 명백할 것이다.
C. 조합 요법
상기에서 언급된 조합 요법은 원치않는 신생 세포 증식의 감소 또는 억제, 암 발병의 감소, 암 재발의 감소 또는 방지, 또는 암 확산 또는 전이의 감소 또는 방지에 특히 유용할 수 있다. 이러한 경우, 본 발명의 항체 또는 ADC는, 다른 경우에는 종양 덩어리를 받쳐주거나 영속시킬 것인 CSC를 제거함으로써 감작제 또는 화학감작제로서 기능하고, 이로써 현재의 관리 기준 용적축소제 또는 항암제의 보다 효과적인 사용을 가능하게 할 수 있다. 즉, 개시된 항체 또는 ADC는, 특정 구현예에서, 또 다른 투여 치료제의 작용 방식을 강력화하는 증대된 효과(예를 들어, 성질상 부가적 또는 상승작용적 효과)를 제공한다. 본 발명의 문맥에서, "조합 요법"은 광범위하게 해석될 것이며, 이는 단지 항-DLL3 항체 또는 ADC, 및 세포독성제, 세포정지제, 항혈관형성제, 용적축소제, 화학요법제, 방사선요법 및 방사선요법제, 표적화 항암제(모노클로날 항체 및 소분자 실체), BRM, 치료 항체, 암 백신, 시토킨, 호르몬 요법, 방사선 요법 및 항전이제 및 면역요법제(특이적 및 비-특이적 접근 둘 다 포함)를 포함하나 이에 제한되지는 않는 하나 이상의 항암제의 투여를 지칭한다.
조합 결과가, 각각의 치료(예를 들어, DLL3 ADC 및 항암제)가 별도로 수행되는 경우에 나타나는 효과에 부가적이 되어야 한다는 요건은 없다. 적어도 부가적 효과가 일반적으로 바람직하지만, 단일 요법 중 하나를 초과하는 임의의 증가된 항종양 효과가 유리하다. 또한, 본 발명은 조합 치료가 상승작용적 효과를 나타낼 것을 필요로 하지 않는다. 그러나, 당업자는, 바람직한 구현예를 포함하는 선택된 특정 조합으로 상승작용이 나타날 수 있음을 인지할 것이다.
이와 같이, 특정 측면에서, 조합 요법은, (i) 항-DLL3 항체 또는 ADC 단독 사용, 또는 (ii) 치료 모이어티 단독 사용, 또는 (iii) 항-DLL3 항체 또는 ADC가 첨가되지 않은 또 다른 치료 모이어티와 조합된 치료 모이어티의 사용에 비해, 치료 상승작용을 갖거나 암 치료에서 측정가능한 치료 효과를 개선시킨다. 본원에서 사용되는 바와 같이 용어 "치료 상승작용"은, 항-DLL3 항체 또는 ADC 및 하나 이상의 치료 모이어티(들)의 조합의 부가적 효과보다 더 큰 치료 효과를 갖는 항-DLL3 항체 또는 ADC 및 하나 이상의 치료 모이어티(들)의 조합을 의미한다.
개시된 조합의 요망되는 결과는 대조군 또는 기준선 측정과 비교하여 정량된다. 본원에서 사용되는 바와 같이 "개선", "증가" 또는 "감소"와 같은 상대적 용어는 대조군, 예컨대 본원에 기재된 치료 개시 전 동일한 개체에서의 측정, 또는 본원에 기재된 항-DLL3 항체 또는 ADC는 부재하지만 기타 다른 치료 모이어티(들), 예컨대 관리 표준 치료제가 존재하는 대조군 개체(또는 다수의 대조군 개체)에서의 측정에 대해 상대적인 값을 나타낸다. 대표적 대조군 개체는, 치료되는 개체와 동일한 형태의 암을 겪고, 치료되는 개체와 대략 동일한 연령인 개체(치료 개체와 대조군 개체에서의 질환 단계가 유사하도록 보장하기 위해)이다.
치료에 대한 반응의 변화 또는 개선은 (첨가 또는 상승에 관계없이) 통계적으로 유의하게 입증될 수 있다. 본 명세서에서 사용된 바와 같은 용어 "유의성" 또는 "유의하게"는 2 회 이상의 측정된 반응 사이에 임의적이지 않은 연관이 존재하는 가능성에 대한 통계학적 분석과 관련된다. 그 관계가 "유의"한지 또는 "유의성"을 갖는지의 여부를 결정하기 위해, "p값 (p-value)"을 계산할 수 있다. 사용자 정의된 컷-오프(cut-off) 미만으로 떨어지는 p값은 유의한 것으로 간주된다. 본 발명의 목적을 위해서, 0.1 이하, 0.05 미만, 0.01 미만, 0.005 미만, 또는 0.001 미만의 p값은 유의한 것으로 간주될 수 있다.
상승작용적 치료 효과는, 단일 치료 모이어티 또는 항-DLL3 항체 또는 ADC에 의해 유도된 치료 효과, 또는 주어진 조합의 항-DLL3 항체 또는 ADC 또는 단일 치료 모이어티(들)에 의해 유도된 치료 효과의 합계의 적어도 약 2 배 초과, 또는 적어도 약 5 배 초과, 또는 적어도 약 10 배 효과, 또는 적어도 약 20 배 초과, 또는 적어도 약 50 배 초과, 또는 적어도 약 100 배 초과의 효과일 수 있다. 상승작용적 치료 효과는 또한, 단일 치료 모이어티 또는 항-DLL3 항체 또는 ADC에 의해 유도된 치료 효과, 또는 주어진 조합의 항-DLL3 항체 또는 ADC 또는 단일 치료 모이어티(들)에 의해 유도된 치료 효과의 합계에 비해 적어도 10%, 또는 적어도 20%, 또는 적어도 30%, 또는 적어도 40%, 또는 적어도 50%, 또는 적어도 60%, 또는 적어도 70%, 또는 적어도 80%, 또는 적어도 90%, 또는 적어도 100%, 또는 그 이상의 치료 효과 증가로서 나타날 수 있다. 상승작용적 효과는 또한, 치료제의 조합 사용시 치료제의 감소된 투여를 허용하는 효과이다.
조합 요법의 실시에서, 항-DLL3 항체 또는 ADC 및 치료 모이어티(들)는 동시에, 단일 조성물로, 또는 둘 이상의 별개의 조성물로서 동일한 또는 상이한 투여 경로를 사용하여 대상체에게 투여될 수 있다. 대안적으로, 항-DLL3 항체 또는 ADC로의 치료는, 예를 들어 수분 내지 수주 범위의 간격으로, 치료 모이어티 치료 이전에 또는 이후에 수행될 수 있다. 하나의 구현예에서는, 치료 모이어티 및 항체 또는 ADC 둘 다 서로 약 5분 내지 약 2주 이내에 투여된다. 또 다른 구현예에서는, 항체 및 치료 모이어티의 투여 사이에 수 일(2 일, 3 일, 4 일, 5 일, 6 일 또는 7 일), 수 주(1 주, 2 주, 3 주, 4 주, 5 주, 6 주, 7 주 또는 8 주) 또는 수 개월(1 개월, 2 개월, 3 개월, 4 개월, 5 개월, 6 개월, 7 개월 또는 8 개월)이 경과할 수 있다.
조합 요법은 다양한 스케쥴로, 예컨대 1 일 1 회, 2 회 또는 3 회, 2 일에 1 회, 3 일에 1 회, 매주 1 회, 2 주에 1 회, 매월 1 회, 2 개월에 1 회, 3 개월에 1 회, 6 개월에 1 회로 병태가 치료되거나, 경감되거나 또는 치유될 때까지 투여될 수 있거나, 또는 연속 투여될 수 있다. 항체 및 치료적 모이어티는 격일 또는 격주로 투여될 수 있고; 일련의 항-DLL3 항체 또는 ADC 치료가 제공될 수 있고, 이어서 추가의 치료 모이어티를 이용한 1 회 이상의 치료가 뒤따른다. 일 구현예에서 항-DLL3 항체 또는 ADC는 단기간의 치료 사이클 동안 하나 또는 그 이상의 치료적 모이어티와 조합하여 투여된다. 다른 구현예에서 조합 치료는 장기간의 치료 사이클 동안 또는 유지 치료법 유형 설정으로 투여된다.
선택된 구현예에서, 본 발명의 화합물 및 조성물은 체크포인트 억제제, 예컨대 PD-1 억제제 또는 PD-L1 억제제와 함께 사용될 수 있다. PD-1은, 그의 리간드 PD-L1과 함께, 항종양 T 림프구 반응의 네거티브 조절제이다. 하나의 구현예에서, 조합 요법은 항PD-1 항체(예를 들어, 펨브롤리주맵, 니볼루맵, 피딜리주맙) 및 선택적으로 하나 이상의 기타 다른 치료 모이어티(들)와 함께 항-DLL3 항체 또는 ADC의 투여를 포함할 수 있다. 또 다른 구현예에서, 조합 요법은 항PD-L1 항체(예를 들어, 아벨루맵, 아테졸리주맵, 두르발루맙) 및 선택적으로 하나 이상의 기타 다른 치료 모이어티(들)와 함께 항-DLL3 항체 또는 ADC의 투여를 포함할 수 있다. 또한 또 다른 구현예에서, 조합 요법은, 체크포인트 억제제 및/또는 표적화된 BRAF 조합 요법(예를 들어, 베무라페닙 또는 다브라피닙)으로의 치료에 따르는 진전을 계속하고 있는 환자에게 투여된 항PD-1 항체 또는 항PD-L1와 함께 항-DLL3 항체 또는 ADC의 투여를 포함할 수 있다. 본 명세서에서 논의되고 아래 실시예에서 설명된 바와 같은 이러한 치료적 조합은 종양 성장 및 번식을 억제하는 데 놀랍게 효과적임이 입증될 수 있다.
임의의 특정 이론에 구애되고자 하는 것은 아니지만, 본 명세서에 설명된 결과는 DLL3 ADC가, T-림프구를 포함한 면역적격 세포를 종양 위치로 활성화 및/또는 유인하는 방식으로, DLL3 발현 종양 세포에 결합 및 사멸시킬 수 있음을 제시한다. 또한, (예를 들어, 세포 분열에 의한) DLL3 ADC의 투여를 통한 DLL3+ 암 줄기 세포의 제거 또는 분열은, 대상체의 면역 반응을 종양의 배아 "씨드 세포"로 집중시키는 CSC 특이적 항원을 방출할 수 있다. 암 줄기 세포에 대한 이러한 환자-매개 중심의 면역 공격은 종양형성 세포의 증진된 제거 및 상응하는 종양 성장의 억제 또는 유지를 위한 메커니즘을 제공할 수 있는 것으로 이해될 수 있다. 이후 PD-1 항체의 존재는 새롭게 활성화된 T-림프구가 그 표면 상에서 (예를 들어, PD-L1 또는 PD-L2 리간드에 결합함으로써) PD-1 수용체를 통해 억제 신호를 받는 것을 방지하고 집중된 면역 반응을 유지 또는 증진시키는 역할을 할 수 있다. 따라서, DLL3 ADC를 이용한 치료는 종양 부위에서 암 줄기 세포를 제거하기 위하여 새로이 활성화된 T 세포를 생성 또는 유도함으로써 투여된 PD-1 항체의 항종양형성 효과를 증진할 수 있는 한편, 동시에 또는 이후에 PD-1 항체는 CSC 활성화된 T-림프구의 항종양 효과를 증진시킴으로써, 다르게는 체크포인트 억제제의 부재 속에서 가능했을 것보다 더 많은 종양세포를 제거할 수 있다.
이러한 DLL3 ADC/체크포인트 억제제 (예를 들어, 항-PD-1 항체) 조합은 특히 유익한 치료 프로필을 제공하기 위해 투약량 및 상응하는 투약 요법이 약화되는 것을 허용한다는 것이 이해될 것이다. 보다 구체적으로, 이러한 조합은 단일 제제로서의 사용과 비교했을 때 두 약물 중 하나 또는 두 약물의 보다 적은 (또는 덜 빈번한) 도스로 종양형성 세포의 효과적인 억제 또는 제거를 가능하게 할 수 있다. 따라서, 본 발명의 특정 양태에서 (단일 제제로서의 사용과 비교했을 때) 항-PD-1 항체와 함께 개시된 DLL3 ADC를 상대적으로 적은 도스로 사용하는 것이 가능할 수 있고, 또한 독성이 적은 치료 반응을 제공할 수 있다. 예를 들어, 상기 논의된 바와 같이 0.2 mg/kg Q3W×3 또는 0.3 mg/kg Q6W×2의 개시된 DLL3 ADC 투약 방식을 사용하기보다는, 더 적은 투약량 (예를 들어, 0.1 mg/kg, 0.05 mg/kg 등)의 DLL3 ADC를 PD-1 항체와 조합하여 사용하여 균등한 치료 결과를 얻는 것이 가능할 수 있다. 유사하게, 더 적은 DLL3 ADC 사이클 (예를 들어, 0.2 mg/kg Q3W×2) 또는 DLL3 ADC 투약 (예를 들어, 0.2 mg/kg Q4W×2) 상의 연장된 시간과 같이 감소 또는 약화된 섭생과 DLL3 ADC/항-PD-1과의 조합을 사용함으로써 효과적인 치료 결과가 수득될 수 있다. 이러한 각각의 시나리오 (즉, 보다 낮은 도스 또는 연장된 투약)에서, 개시된 치료 조합에 의해 제공된 예상치못한 이익이 비교적 적은 독성으로 환자의 효과적인 치료를 가능하게 함을 알 수 있을 것이다. 이는 결국, 필요한 치료를 더 잘 견딜 수 있고/있거나 긍정적 반응의 가능성을 높이기 위해 치료 요법을 연장시킬 수 있는 더욱 건강한 환자를 제공한다.
다른 구현예에서, 항-DLL3 항체 또는 ADC는 다양한 승인된 제1선 항암 치료와 조합하여 사용될 수 있다. 선택된 구현예에서 병용 요법은 항-DLL3 항체 또는 ADC 및 이포스파미드, 마이토마이신 C, 빈데신, 빈블라스틴, 에토포시드, 이로니테칸, 젬시타빈, 탁산, 비노렐빈, 메토트렉세이트 및 페메트렉시드와 같은 세포독성제, 그리고 선택적으로 하나 이상의 다른 치료적 모이어티의 이용을 포함한다.
다른 구현예에서 병용요법은 항-DLL3 항체 또는 ADC 및 백금 기재의 약물 (예를 들어, 카보플라틴 또는 시스플라틴), 그리고 선택적으로 하나 이상의 다른 치료적 모이어티 (예를 들어, 비노렐빈; 젬시타빈, 탁산 같은, 예를 들어, 도세탁셀 또는 파클리탁셀; 이리노티칸; 또는 페메트렉시드)의 이용을 포함한다.
특정 구현예에서, 예를 들어 BR-ERPR, BR-ER 또는 BR-PR 암의 치료에서, 병용 요법은 항-DLL3 항체 또는 ADC 및 "호르몬 요법"이라고 설명되는 하나 이상의 치료적 모이어티의 이용을 포함한다. 본 명세서에 사용된 바와 같은, "호르몬 요법"은 예를 들어, 타목시펜; 성선 자극 호르몬(gonadotropin) 또는 황체 형성 방출 호르몬 (GnRH 또는 LHRH); 에베로리무스 및 엑스메스탄; 토레미펜; 또는 아로마타제 억제제 (예를 들어, 아나스트로졸, 레트로졸, 엑스메스탄 또는 풀베스트란)을 지칭한다.
또 다른 구현예에서, 예를 들어, BR-HER2의 치료에서, 조합 요법은 항-DLL3 항체 또는 ADC 및 트라스투주맙 또는 아도-트라스투주맙 엠탄신(Kadcyla®) 및 선택적으로 하나 이상의 기타 다른 치료 모이어티(들)(예를 들어, 페르투주맙 및/또는 도세탁셀)의 사용을 포함한다.
일부 구현예에서, 예를 들어, 전이성 유방암의 치료에서, 조합 요법은 항-DLL3 항체 또는 ADC 및 탁산(예를 들어, 도세탁셀 또는 파클리탁셀) 및 선택적으로 추가의 치료 모이어티(들), 예를 들어, 안트라사이클린(예를 들어, 독소루비신 또는 에피루비신) 및/또는 에리불린의 사용을 포함한다.
또 다른 구현예에서, 예를 들어, 전이성 또는 재발성 유방암 또는 BRCA-돌연변이 유방암의 치료에서, 조합 요법은 항-DLL3 항체 또는 ADC 및 메게스트롤 및 선택적으로 추가의 치료 모이어티(들)의 사용을 포함한다.
추가의 구현예에서, 예를 들어, BR-TNBC의 치료에서, 조합 요법은 항-DLL3 항체 또는 ADC 및 폴리 ADP 리보스 폴리머라제(PARP) 억제제(예를 들어, BMN-673, 올라파립, 루카파립 및 벨리파립) 및 선택적으로 추가의 치료 모이어티(들)의 사용을 포함한다.
또 다른 구현예에서, 병용 요법은 항-DLL3 항체 또는 ADC 및 PARP 억제제 그리고 선택적으로 하나 이상의 다른 치료적 모이어티의 이용을 포함한다.
또 다른 구현예에서, 예를 들어, 유방암의 치료에서, 조합 요법은 항-DLL3 항체 또는 ADC 및 시클로포스파미드 및 선택적으로 추가의 치료 모이어티(들)(예를 들어, 독소루비신, 탁산, 에피루비신, 5-FU 및/또는 메토트렉세이트의 사용을 포함한다.
또 다른 구현예에서, EGFR-포지티브 NSCLC의 치료를 위한 조합 요법은 항-DLL3 항체 또는 ADC 및 아파티닙 및 선택적으로 하나 이상의 기타 다른 치료 모이어티(들)(예를 들어, 에를로티닙 및/또는 베바시주맙)의 사용을 포함한다.
또 다른 구현예에서, EGFR-포지티브 NSCLC의 치료를 위한 조합 요법은 항-DLL3 항체 또는 ADC 및 에를로티닙 및 선택적으로 하나 이상의 기타 다른 치료 모이어티(들)(예를 들어, 베바시주맙)의 사용을 포함한다.
또 다른 구현예에서, ALK-포지티브 NSCLC의 치료를 위한 조합 요법은 항-DLL3 항체 또는 ADC 및 세리티닙(Zykadia) 및 선택적으로 하나 이상의 기타 다른 치료 모이어티(들)의 사용을 포함한다.
또 다른 구현예에서, ALK-포지티브 NSCLC의 치료를 위한 조합 요법은 항-DLL3 항체 또는 ADC 및 크리조티닙(Xalcori) 및 선택적으로 하나 이상의 기타 다른 치료 모이어티(들)의 사용을 포함한다.
또 다른 구현예에서, 조합 요법은 항-DLL3 항체 또는 ADC 및 베바시주맙 및 선택적으로 하나 이상의 기타 다른 치료 모이어티(들)(예를 들어, 젬시타빈 또는 탁산, 예컨대 도세탁셀 또는 파클리탁셀; 및/또는 백금 유사체)의 사용을 포함한다.
또다른 구현예에서, 병용요법은 항-DLL3 항체 또는 ADC 및 베바시주맙 및 선택적으로 시클로포스파미드의 사용을 포함한다.
특정 구현예에서, 백금-내성 종양의 치료를 위한 조합 요법은 항-DLL3 항체 또는 ADC 및 독소루비신 및/또는 에토포시드 및/또는 겜시타빈 및/또는 비노렐빈 및/또는 이포스파미드 및/또는 류코보린-조절된 5-플루오로우실 및/또는 베바시주맙 및/또는 타목시펜; 및 선택적으로 하나 이상의 기타 다른 치료 모이어티(들)의 사용을 포함한다.
선택된 구현예에서, 개시된 항체 및 ADC는 잠재적으로 치료 과정을 더 효과적으로 만들고 염증, 메스꺼움 및 과민증과 같은 부작용을 줄이기 위해 특정 스테로이드와 함께 조합되어 사용될 수 있다. 예시적으로 본 발명의 ADC와 함께 사용될 수 있는 스테로이드는 히드로코르티손, 덱사메타손, 프레드니손, 메틸프레드니손 및 프레드니솔론을 포함하지만 이에 한정되지는 않는다. 특히 바람직한 양태에서 스테로이드는 덱사메타손을 포함할 것이다. 다른 바람직한 양태에서, 스테로이드는 프레드니손을 포함할 것이다.
병용요법은 또한 항-DLL3 항체 또는 ADC 및 돌연변이되거나 비정상적으로 발현된 유전자 또는 단백질 (예를 들어, BRAF V600E)을 포함하는 종양 (예를 들어, 흑색종)에 효과적인 화학요법의 모이어티를 포함할 수 있다.
T 림프구(예를 들어, 세포독성 림프구(CTL))는 악성 종양에 대한 숙주 방어에 있어 중요한 역할을 한다. CTL은 항원 제시 세포 상의 종양 연관 항원의 제시에 의해 활성화된다. 활성 특이적 면역요법은, 환자에게 공지된 암 연관 항원으로부터 유래된 펩티드를 백신접종합으로써 암에 대한 T 림프구 반응을 증대시키는 데 사용될 수 있는 방법이다. 하나의 구현예에서, 조합 요법은 항-DLL3 항체 또는 ADC 및 암 연관 항원에 대한 백신(예를 들어, 멜라노사이트-계통 특이적 항원 티로시나제, gp100, Melan-A/MART-1 또는 gp75)을 포함할 수 있다. 다른 구현예에서, 조합 요법은 자가조직 CTL 또는 천연 킬러 세포의 시험관 내 확장, 활성화, 및 채택 재도입과 함께 항-DLL3 항체 또는 ADC의 투여를 포함할 수 있다. CTL 활성화는 또한, 항원 제시 세포에 의한 종양 항원 제시를 증대시키는 전략에 의해 촉진될 수 있다. 과립구 대식세포 콜로니 자극 인자(GM-CSF)는 수지상 세포의 점증 및 수지상 세포 교차-프라이밍의 활성화를 촉진시킨다. 하나의 구현예에서, 조합 요법은, 항-DLL3 항체 또는 ADC 및 선택적으로 하나 이상의 상이한 치료 모이어티(들)의 사용과 조합된 항원 제시 세포의 단리, 자극성 시토킨(예를 들어, GM-CSF)로의 이러한 세포의 활성화, 종양-연관 항원으로의 프라이밍, 및 이어서 환자로의 항원 제시 세포의 채택 재도입을 포함할 수 있다.
일부 구현예에서, 항-DLL3 항체 또는 ADC는 다양한 제1선 흑색종 치료와 함께 사용될 수 있다. 일 구현예에서, 병용요법은 항-DLL3 항체 또는 ADC와 다카바진 및 선택적으로 하나 이상의 다른 치료적 모이어티(들)의 사용을 포함한다. 추가의 구현예에서 병용요법은 항-DLL3 항체 또는 ADC와 테모졸라미드 및 선택적으로 하나 이상의 다른 치료적 모이어티(들)의 이용을 포함한다. 또다른 구현예에서 병용요법은 항-DLL3 항체 또는 ADC와 백금 기재의 치료적 모이어티 (예를 들어, 카보플라틴 또는 시스플라틴) 및 선택적으로 하나 이상의 다른 치료적 모이어티(들)의 이용을 포함한다. 일부 구현예에서, 병용요법은 항-DLL3 항체 또는 ADC와 빈카 알칼로이드 치료적 모이어티 (예를 들어, 빈블라스틴, 비노렐빈, 빈크리스틴, 또는 빈데신) 및 선택적으로 하나 이상의 다른 치료적 모이어티(들)의 이용을 포함한다. 일 구현예에서 병용요법은 항-DLL3 항체 또는 ADC와 인터루킨-2 및 선택적으로 하나 이상의 다른 치료적 모이어티(들)의 이용을 포함한다. 또다른 구현예에서 병용요법은 항-DLL3 항체 또는 ADC와 인터페론-알파 및 선택적으로 하나 이상의 다른 치료적 모이어티(들)의 이용을 포함한다.
다른 구현예에서, 항-DLL3 항체 또는 ADC는 보조적 흑생종 치료 및/또는 외과적 절차 (예를 들어, 종양 절제술)와 조합되어 사용될 수 있다. 일 구현예에서 병용요법은 항-DLL3 항체 또는 ADC와 인터페론 알파 및 선택적으로 하나 이상의 다른 치료적 모이어티(들)의 이용을 포함한다.
본 발명은 또한 항-DLL3 항체 또는 ADC와 방사선 치료의 조합을 제공한다. 본 명세서에서 사용된 바와 같은 용어 "방사선 치료"는, 감마선 조사, X선, UV 조사, 마이크로파, 전자 방출 등과 같이, 종양 세포 내에서 국소적으로 DNA 손상을 유도하기 위한 임의의 메커니즘을 의미한다. 종양 세포에 대한 방사선 동위 원소의 유도된 전달을 이용하는 병용요법이 또한 고려되고, 본 명세서에서 개시된 항-DLL3 항체의 조합 또는 컨쥬게이트로서 사용될 수 있다. 통상적으로, 방사선 요법은 약 1 주에서 약 2 주의 기간에 걸쳐 맥동적으로 투여된다. 선택적으로, 방사선 요법은 단일 도스 또는 다중의 연속 도스로 투여될 수 있다.
다른 구현예에서, 항-DLL3 항체 또는 ADC는 하나 이상의 아래 기재된 항암제와 함께 사용될 수 있다.
D. 항암제
본원에서 사용되는 바와 같이 용어 "항암제"는, 또한 "제약 활성 모이어티"로서 기재된 작용제의 서브세트인, "치료 모이어티"의 하나의 서브세트이다. 보다 구체적으로, "항암제"는 암과 같은 세포증식성 장애를 치료하는 데 사용될 수 있는 임의의 작용제 (또는 약학적으로 허용가능한 이의 염)를 의미하고, 세포독성제, 세포정지제, 항혈관형성제, 용적축소제, 화학요법제, 방사선치료제, 표적화된 항암제, 생체 반응 조절제, 치료 항체, 암 백신, 시토킨, 호르몬 요법, 항전이제 및 면역요법제를 포함하나 이에 제한되지는 않는다. 상기 항암제의 분류는 서로 배타적이지 않고, 선택된 작용제는 하나 이상의 분류에 속할 수 있음에 유의한다. 예를 들어, 상용가능한 항암제는 세포독성제 및 화학치료제로 분류될 수 있다. 따라서, 상기 용어들 각각은 본 개시 내용의 관점에서, 그리고 그 다음 의학 분야에서의 이들의 용도에 따라 해석되어야 한다.
바람직한 구현예에서 항암제는 암성 세포 또는 암성이 되거나 종양형성 자손 (예를 들어, 종양형성세포)을 생성할 수 있는 세포를 억제 또는 제거하거나, 억제 또는 제거하도록 설계된 임의의 화학적 작용제 (예를 들어, 화학치료제)를 포함할 수 있다. 이와 관련하여, 선택된 화학적 작용제 (세포사이클 의존성 작용제)는 세포 성장 또는 분열에 필요한 세포 내 과정으로 종종 들어가서, 일반적으로 빠르게 성장 및 분열하는 암세포에 대해 특히 효과적이다. 예를 들어, 빈크리스틴은 미세소관을 해중합시키고(depolymerize), 따라서 빠르게 분열하는 종양세포가 유사분열에 돌입하는 것을 억제한다. 다른 경우에서, 선택된 화학적 작용제는 그 생애주기의 임의의 시점에 세포 생존을 방해하는 세포 사이클 독립 작용제이고, 지시된 치료 (예를 들어, ADC)에 효과적일 수 있다. 예로서, 특정 피롤로벤조디아제핀은 세포 DNA의 작은 그루브에 결합하고, 세포핵으로 전달 시 전사를 억제한다. 병용요법 또는 ADC 구성요소의 선택과 관련하여, 당업자는 본 개시 내용의 관점에서 상용성 세포-사이클 의존성 작용제 및 세포-사이클 독립 제제를 용이하게 동정할 수 있음을 이해할 것이다.
임의의 경우에, 상기에 시사된 바와 같이, 선택된 항암제는 본 명세서에 개시된 항-DLL3 항체 및 ADC에 추가하여 서로 조합하여 (예를 들어, CHOP 요법) 투여될 수 있음이 이해될 것이다. 나아가, 일부 구현예에서, 이러한 항암제가 컨쥬게이트를 포함할 수 있고, 투여에 앞서 항체와 연결될 수 있음이 추가로 이해될 것이다. 일부 양태에서, 개시된 항암제는 본 명세서에 개시된 바와 같은 ADC를 제공하기 위해 항-DLL3 항체에 연결될 것이다.
본원에 사용된 용어 "세포독성제 (또는 세포독소)"는 일반적으로 세포 기능을 감소시키거나 억제하고 및/또는 종양 세포의 파괴를 야기한다는 점에서 세포에 대해 독성인 물질을 의미한다. 특정 구현예에서, 상기 물질은 생물 또는 (천연 원료로부터 정제되거나 합성 제조된) 그 유사체에서 유도된 자연 발생적인 분자이다. 세포독성제의 예는, 소분자 독소 또는 박테리아의 효소 활성화 독소 (예를 들어, 칼리케아마이신, 디프테리아 독소, 슈도모나스 내독소 및 외독소, 스태필로코커스 장독소 A), 균류 (예를 들어, 알파 사르신(α-sarcin), 레스트릭토신), 식물 (예를 들어, 아브린, 리신, 모데신, 비스쿠민, 억새풀 항바이러스 단백질(pokeweed anti-viral protein), 사포린, 겔로닌, 모모리딘, 트리코산틴, 보리 독소, 유동(Aleurites fordii) 단백질, 다이안틴 단백질, 미국자리공(Phytolacca mericana) 단백질 [PAPI, PAPII 및 PAP-S], 여주 (Momordica charantia) 억제제, 쿠르신, 크로틴, 비누풀 억제제, 마이트젤린, 레스트릭토신, 페노마이신, 네오마이신, 및 트리코세신) 또는 동물 (예를 들어, 세포외 췌장 RN아제 같은 세포독성 RN아제; 그 변종 및/또는 파편을 포함한 DN아제 I (DNase I))을 포함하지만 이에 한정되지는 않는다. 특정 방사선동위원소, 마이탄시노이드, 오리스타틴, 돌라스타틴, 듀오카마이신, 아마니틴 및 피롤로벤조디아제핀을 포함하는 추가적인 상용성 세포독성제가 본 명세서에 제시되어 있다.
더욱 일반적으로, 본 발명의 항체와 조합하여 (또는 컨쥬게이트되어) 사용할 수 있는 세포독성제 또는 항암제의 예시는, 하기를 포함하지만 이로 한정되지는 않는다: 알킬화제, 알킬 술포네이트, 아나스트로졸, 아마니틴, 아지리딘, 에틸렌이민 및 메틸아멜라민, 아세토게닌, 캄프토테신, BEZ-235, 보르테조밉, 브리요스타틴, 칼리스타틴, CC-1065, 세리티닙, 크리조티닙, 크립토파이신, 돌라스타틴, 듀오카르마이신, 엘류테로빈, 에를로티닙, 판크라티스타틴, 사르코딕티인, 스폰지스타틴, 질소 머스타드, 항생제, 엔디인 다이네미신, 비스포스포네이트, 에스페라미신, 크로모단백질 엔디인 항생 크로모포어, 아클라시노마이신, 악티노마이신, 아우트라마이신, 아자세린, 블레오마이신, 칵티노마이신, 칸포스파미드, 카라비신, 카르미노마이신, 카르지노필린, 크로모마이시니스, 시클로스포스파미드, 닥티노마이신, 다우노루비신, 데토루비신, 6-디아조-5-옥소-L-노르류신, 독소루비신, 에피루비신, 에소루비신, 엑세메스탄, 플루오로우라실, 풀베스트란트, 게피티닙, 이다루비신, 라파티닙, 레트로졸, 로나파르닙, 마르셀로마이신, 메게스트롤 아세테이트, 미토마이신, 미코페놀산, 노갈라마이신, 올리보마이신, 파조파닙, 페플로마이신, 포트피로마이신, 푸로마이신, ?"라마이신, 라파마이신, 로도루비신, 소라페닙, 스트렙토니그린, 스트렙토조신, 타목시펜, 타목시펜 시트레이트, 테모졸로미드, 테포디나, 티피파르닙, 투베르시닌, 우베니멕스, 반데타닙, 보로졸, XL-147, 지노스타틴, 조루비신; 항대사물질, 폴산 유사체, 퓨린 유사체, 안드로겐, 항부신제, 폴산 보충제, 예컨대 프롤린산, 아세글라톤, 알도포스파미드 글리코시드, 아미노레불린산, 에닐우라실, 암사크린, 베스트라부실, 비산트렌, 에다트락세이트, 데포파민, 데메콜신, 디아지쿠온, 엘포르니틴, 엘리프티늄 아세테이트, 에포틸론, 에토글루시드, 갈륨 니트레이트, 히드록시우레아, 렌티난, 로니다이닌, 마이탄시노이드, 미토구아존, 미톡산트론, 모피단몰, 니트라에린, 펜토스타틴, 페나메트, 피라루비신, 로속산트론, 포도필린산, 2-에틸히드라지드, 프로카르바진, 폴리사카라이드 복합체, 라족산; 리족신; SF-1126, 시조피란; 스피로게르마늄; 테누아존산; 트리아지쿠온; 2,2',2"-트리클로로트리에틸아민; 트리코테센(T-2 독소, 베라쿠린 A, 로리딘 A 및 안구이딘); 우레탄; 빈데신; 다카르바진; 만노무스틴; 미토브로니톨; 미톨락톨; 피포브로만; 가시토신; 아라비노시드; 시클로포스파미드; 티오테파; 탁소이드, 클로란부실; 겜시타빈; 6-티오구아닌; 메르캅토퓨린; 메토트렉세이트; 백금 유사체, 빈블라스틴; 백금; 에토포시드; 이포스파미드; 미톡산트론; 빈크리스틴; 비노렐빈; 노반트론; 테니포시드; 에다트렉세이트; 다우노마이신; 아미노프테린; 크셀로다; 이반드로네이트; 이리노테칸, 토포이소머라제 억제제 RFS 2000; 디플루오로메틸오르니틴; 레티노이드; 카페시타빈; 콤브레타스타틴; 류코보린; 옥살리플라틴; 세포 증식을 감소시키는 PKC-알파, Raf, H-Ras, EGFR 및 VEGF-A의 억제제, XL518 및 이들 중 임의의 것의 제약상 허용되는 염 또는 용매화물, 산 또는 유도체를 포함하나 이에 제한되지는 않는다. 또한, 이 정의에는, 종양에 대한 호르몬 작용을 조절하거나 억제하도록 작용하는 항호르몬제, 예컨대 항에스트로겐 및 선택적 에스트로겐 수용체 항체, 부신에서의 에스트로겐 생성을 조절하는, 효소 아로마타제를 억제하는 아로마타제 억제제, 및 항안드로겐; 뿐만 아니라 트록사시타빈(1,3-디옥솔란 뉴클레오시드 시토신 유사체); 안티센스 올리고뉴클레오티드, 리보자임, 예컨대 VEGF 발현 억제제 및 HER2 발현 억제제; 백신, 프롤류킨(PROLEUKIN)® rIL-2; 루르토테칸(LURTOTECAN)® 토포이소머라제 1 억제제; 아바렐릭스(ABARELIX)® rmRH; 비노렐빈 및 에스페라미신(Esperamicin) 및 이들 중 임의의 것의 제약상 허용되는 염 또는 용매화물, 산 또는 유도체가 포함된다.
상용가능한 세포독소제 또는 항암제는 또한 상업적으로 또는 임상적으로 이용가능한 화합물, 예컨대 에를로티닙(타르세바(TARCEVA)®, 제넨텍(Genentech)/오에스아이 파마슈티칼즈(OSI Pharm.)), 도세탁셀(탁소테레(TAXOTERE)®, 사노피-아벤티스(Sanofi-Aventis)), 5-FU(플루오로우라실, 5-플루오로우라실, CAS No. 51-21-8), 겜시타빈(겜자르(GEMZAR)®, 릴리(Lilly)), PD-0325901(CAS No. 391210-10-9, 화이자(Pfizer)), 시스플라틴(시스-디아민, 디클로로백금(II), CAS No. 15663-27-1), 카르보플라틴(CAS No. 41575-94-4), 파클리탁셀(탁솔(TAXOL)®, 브리스톨-마이어스 스큅 온콜로지(Bristol-Myers Squibb Oncology, 미국 뉴저지주 프린스톤)), 트라스투주맙(헤르셉틴(HERCEPTIN)®, 제넨텍), 테모졸로미드(4-메틸-5-옥소-2,3,4,6,8-펜타자비시클로 [4.3.0] 노나-2,7,9-트리엔-9-카르복사미드, CAS No. 85622-93-1, 테모다르(TEMODAR)®, 테모달(TEMODAL)®, 쉐링 플로우(Schering Plough)), 타목시펜((Z)-2-[4-(1,2-디페닐부트-1-에닐)페녹시]-N,N-디메틸에탄아민, 놀바덱스(NOLVADEX)®, 이스투발(ISTUBAL)®, 발로덱스(VALODEX)®), 및 독소루비신(아드리아마이신(ADRIAMYCIN)®)을 포함한다. 추가의 상업적으로 또는 임상적으로 이용가능한 항암제는 옥살리플라틴(엘록사틴(EL옥사TIN)®, 사노피), 보르테조밉(벨카데(VELCADE)®, 밀레니엄 파마슈티칼즈(Millennium Pharm.)), 수텐트(수니티닙(SUNITINIB)®, SU11248, 화이자), 레트로졸(페마라(FEMARA)®, 노바티스(Novartis)), 이마티닙 메실레이트(글리벡(GLEEVEC)®, 노바티스), XL-518(Mek 억제제, 엑셀릭시스(Exelixis), WO 2007/044515), ARRY-886 (Mek 억제제, AZD6244, 어레이 바이오파마(Array BioPharma), 아스트라 제네카(Astra Zeneca)), SF-1126(PI3K 억제제, 세마포레 파마슈티칼즈(Semafore Pharmaceuticals)), BEZ-235(PI3K 억제제, 노바티스), XL-147 (PI3K 억제제, 엑셀릭시스), PTK787/ZK 222584(노바티스), 풀베스트란트(파슬로덱스(FASLODEX)®, 아스트라제네카), 류코보린(폴린산), 라파마이신(시롤리무스, 라파뮨(RAPAMUNE)®, 와이어스(Wyeth)), 라파티닙(티케르브(TYKERB)®, GSK572016, 글락소 스미스 클라인(Glaxo Smith Kline)), 로나파르닙(사라사르(SARASAR)™, SCH 66336, 쉐링 플로우), 소라페닙(넥사바르(NEXAVAR)®, BAY43-9006, 바이엘 랩스(Bayer Labs)), 게피티닙(이레사(IRESSA)®, 아스트라제네카), 이리노테칸(캄프토사르(CAMPTOSAR)®, CPT-11, 화이자), 티피파르닙(자르네스트라(ZARNESTRA)™, 존슨 앤 존슨(Johnson & Johnson)), 아브락산(ABRAXANE)™(크레모포르-무함유), 파클리탁셀의 알부민-조작된 나노입자 제형(아메리칸 파마슈티칼 파트너스(American Pharmaceutical Partners, 미국 일리노이주 샴버그), 반데타닙(rINN, ZD6474, 작티마(ZACTIMA)®, 아스트라제네카), 클로람부실, AG1478, AG1571(SU 5271; 수겐(Sugen)), 템시롤리무스(토리셀(TORISEL)®, 와이어스), 파조파닙(글락소 스미스 클라인), 칸포스파미드(텔시타(TELCYTA)®, 텔릭(Telik)), 티오테파 및 시클로스포스파미드(시톡산(CYTOXAN)®, 네오사르(NEOSAR)®); 비노렐빈(나벨빈(NAVELBINE)®); 카페시타빈(크셀로다(XELODA)®, 로셰(Roche)), 타목시펜(놀바덱스(NOLVADEX)® 포함); 타목시펜 시트레이트, 파레스톤(FARESTON)®(토레미핀 시트레이트) 메가세(MEGASE)®(메게스트롤 아세테이트), 아로마신(AROMASIN)®(엑세메스탄; 화이자), 포르메스타니, 파드로졸, 리비소르(RIVISOR)®(보로졸), 페마라(FEMARA)®(레트로졸; 노바티스), 및 아리미덱스(ARIMIDEX)®(아나스트로졸; 아스트라제네카)를 포함할 수 있다.
용어 "약학적으로 허용가능한 염" 또는 "염"은 분자 또는 거대분자의 유기 또는 무기 염을 의미한다. 산 부가 염은 아미노기를 사용하여 형성될 수 있다. 예시적인 염은 술페이트, 시트레이트, 아세테이트, 옥살레이트, 클로라이드, 브로마이드, 아이오다이드, 니트레이트, 비술페이트, 포스페이트, 산 포스페이트, 이소니코티네이트, 락테이트, 살리실레이트, 산 시트레이트, 타르트레이트, 올레에이트, 탄네이트, 판토테네이트, 비타르트레이트, 아스코르베이트, 숙시네이트, 말레에이트, 겐티시네이트, 푸마레이트, 글루코네이트, 글루쿠로네이트, 사카레이트, 포르메이트, 벤조에이트, 글루타메이트, 메탄술포네이트, 에탄술포네이트, 벤젠술포네이트, p-톨루엔술포네이트, 및 파모에이트 (즉, 1,1'-메틸렌 비스-(2-히드록시 3-나프토에이트)) 염을 포함하지만 이에 한정되지는 않는다. 약학적으로 허용가능한 염은 아세테이트 이온, 숙시네이트 이온 또는 다른 반대이온 같은 다른 분자의 포함을 포함할 수 있다. 반대이온은 임의의 모 화합물의 전하를 안정화시키는 유기 또는 무기 모이어티일 수 있다. 나아가, 약학적으로 허용가능한 염은 그 구조 내에 하나 초과의 하전된 원자를 가질 수 있다. 다수의 하전된 원자가 약학적으로 허용가능한 염의 일부인 경우, 염은 다수의 반대이온을 가질 수 있다. 따라서, 약학적으로 허용가능한 염은 하나 이상의 하전된 원자 및/또는 하나 이상의 반대이온을 가질 수 있다.
유사하게, "약학적으로 허용가능한 용매화물" 또는 "용매화물"은 하나 이상의 용매화물 분자들 및 분자 또는 거대분자의 연결을 지칭한다. 약학적으로 허용가능한 용매화물을 구성하는 용매화물의 예는 물, 아이소프로판올, 에탄올, 메탄올, DMSO, 에틸 아세테이트, 아세트산, 및 에탄올아민을 포함하지만 이에 한정되지는 않는다.
다른 구현예에서, 본 발명의 항체 또는 ADC는 현재 임상 시험에서 또는 상업적으로 입수가능한 다수의 항체 (또는 면역치료제) 중 임의의 하나와 조합하여 사용될 수 있다. 개시된 항체는 아바고보맙(abagovomab), 아데카투무맙(adecatumumab), 아푸투주맙(afutuzumab), 알렘투주맙(alemtuzumab), 알투모맙(altumomab), 아마투시맙(amatuximab), 아나투모맙(anatumomab), 알시투모맙(arcitumomab), 아테졸리주맙(atezolizumab), 아벨루맙(avelumab), 바비투시맙(bavituximab), 벡투모맙(bectumomab), 베바시주맙(bevacizumab), 비바투주맙(bivatuzumab), 블리나투모맙(blinatumomab), 브렌투시맙(brentuximab), 칸투주맙(cantuzumab), 카투막소맙(catumaxomab), 세툭시맙(cetuximab), 시타투주맙(citatuzumab), 시수투무맙(cixutumumab), 클리바투주맙(clivatuzumab), 코나투무맙(conatumumab), 다세투주맙(dacetuzumab), 달로투주맙(dalotuzumab), 다라투무맙(daratumumab), 데투모맙(detumomab), 드로지투맙(drozitumab), 둘리고투맙(duligotumab), 두라발루맙(durvalumab), 두시기투맙(dusigitumab), 에크로멕시맙(ecromeximab), 엘로투주맙(elotuzumab), 엔시툭시맙(ensituximab), 에르투막소맙(ertumaxomab), 에타라시주맙(etaracizumab), 팔레투주맙(farletuzumab), 피클라투주맙(ficlatuzumab), 피기투무맙(figitumumab), 플란보투맙(flanvotumab), 푸툭시맙(futuximab), 가니투맙(ganitumab), 젬투주맙(gemtuzumab), 지렌툭시맙(girentuximab), 글렘바투무맙(glembatumumab), 이브리투모맙(ibritumomab), 이고보맙(igovomab), 임가투주맙(imgatuzumab), 인다툭시맙(indatuximab), 이노투주맙(inotuzumab), 인테투무맙(intetumumab), 이필리무맙(ipilimumab), 이라투무맙(iratumumab), 라베투주맙(labetuzumab), 람브롤리주맙(lambrolizumab), 렉사투무맙(lexatumumab), 린투주맙(lintuzumab), 로르보투주맙(lorvotuzumab), 루카투무맙(lucatumumab), 마파투무맙(mapatumumab), 마투주맙(matuzumab), 밀라투주맙(milatuzumab), 민레투모맙(minretumomab), 미투모맙(mitumomab), 모제투모맙(moxetumomab), 나르나투맙(narnatumab), 납투모맙(naptumomab), 네시투무맙(necitumumab), 니모투주맙(nimotuzumab), 니볼루맙(nivolumab), 노페투모맙(nofetumomab), 오비누투주맙(obinutuzumab), 오카라투주맙(ocaratuzumab), 오파투무맙(ofatumumab), 올라라투맙(olaratumab), 올라파립(olaparib), 오나르투주맙(onartuzumab), 오포르투주맙(oportuzumab), 오레고보맙(oregovomab), 파니투무맙(panitumumab), 파르사투주맙(parsatuzumab), 파트리투맙(patritumab), 펨브롤리주맙(pembrolizumab), 펨투모맙(pemtumomab), 페르투주맙(pertuzumab), 피딜리주맙(pidilizumab), 핀투모맙(pintumomab), 프리투무맙(pritumumab), 락코투모맙(racotumomab), 라드레투맙(radretumab), 라무시루맙(ramucirumab), 릴로투무맙(rilotumumab), 리툭시맙(rituximab), 로바투무맙(robatumumab), 사투모맙(satumomab), 셀루메티닙(selumetinib), 시브로투주맙(sibrotuzumab), 실툭시맙(siltuximab), 심투주맙(simtuzumab), 솔리토맙(solitomab), 타카투주맙(tacatuzumab), 타플리투모맙(taplitumomab), 테나투모맙(tenatumomab), 테프로투무맙(teprotumumab), 티가투주맙(tigatuzumab), 토시투모맙(tositumomab), 트라스투주맙(trastuzumab), 투코투주맙(tucotuzumab), 우블리툭시맙(ublituximab), 벨투주맙(veltuzumab), 보르세투주맙(vorsetuzumab), 보투무맙(votumumab), 잘루투맙(zalutumumab), CC49, 3F8, MEDI0680, MDX-1105 및 이들의 조합으로 이루어진 군으로부터 선택되는 항체와 조합되어 사용될 수 있다.
다른 구현예는, 리툭시맵, 겜투주맵 오조감신, 알렘투주맵, 이브리투모맵 티욱세탄, 토시투모맵, 베바시주맵, 세툭시맵, 파티투무맵, 오파투무맵, 이필리무맵 및 브렌툭시맵 베도틴을 포함하나 이에 제한되지는 않는 암 치료에 대해 승인된 항체의 사용을 포함한다. 당업자는 본원의 교시내용과 상용성인 추가의 항암제를 쉽게 식별할 수 있을 것이다.
E. 방사선요법
상기에서 간단히 논의한 바와 같이, 본 발명은 또한 항체 또는 ADC와 방사선요법(즉, 종양 세포 내에서 국소적으로 DNA 손상을 유도하는 임의의 메커니즘, 예컨대 감마-광조사, X선, UV-광조사, 마이크로파, 전자 방출 등)의 조합을 제공한다. 종양 세포에 대한 방사성동위원소의 지향 전달을 사용한 조합 요법 또한 고려되고, 개시된 항체 또는 ADC는 표적화 항암제 또는 기타 다른 표적화 수단과 함께 사용될 수 있다. 통상적으로, 방사선 요법은 약 1주 내지 약 2주의 기간에 걸쳐 펄스로 투여된다. 방사선 요법은 두부 및 경부 암을 갖는 대상체에게 약 6주 내지 7주 동안 투여될 수 있다. 선택적으로, 방사선 요법은 단일 용량으로서 또는 다중 순차적 용량으로서 투여될 수 있다.
VIII. 지시
본 발명은, 증식성 질환, 신생, 염증, 혈관형성 및 면역 장애 및 병원균 유발 장애를 포함하는 다양한 장애의 진단, 테라그노시스, 치료 및/또는 예방을 위한 본 발명의 항체 및 ADC의 용도를 제공한다. 특정 구현예에서, 치료될 질환은 신생물 질환을 포함하며, 다른 특정 양태에서는 고형종양을 포함한다. 다른 구현예에서, 치료될 질병은 혈액암을 포함한다. 여전히 다른 구현예에서, 본 발명의 항체 또는 ADC는 DLL3 결정인자를 발현하는 종양 또는 종양형성 세포를 치료하는 데 사용될 것이다. 바람직하게는 치료될 "대상체" 또는 "환자"는, 용어는 임의의 포유동물 종을 명확히 포함하고자 하지만 본 명세서에서 사용된 바와 같이 인간일 것이다.
본 발명의 화합물 및 조성물은 질환의 다양한 단계에서, 또한 이들의 치료 사이클에서 상이한 시점에 대상체를 치료하기 위해 사용될 수 있음을 인지할 것이다. 따라서, 특정 구현예에서, 본 발명의 항체 및 ADC는 최전선 요법으로서 사용되고, 암 병태에 대하여 이전에 치료되지 않았던 대상체에게 투여될 것이다. 다른 구현예에서, 본 발명의 항체 및 ADC는 제2 및 제3선 환자(즉, 동일한 병태에 대하여 이전에 각각 1 회 또는 2 회 치료받은 적 있는 환자)의 치료에 사용될 것이다. 또 다른 구현예는, 동일한 또는 관련 병태에 대하여 개시된 DLL3 ADC 또는 상이한 치료제로 3회 이상 치료받은 적이 있는 제4선 또는 그 이상의 환자(예를 들어, SCLC 환자)의 치료를 포함할 것이다. 다른 구현예에서, 본 발명의 화합물 및 조성물은 이전에 치료받은(본 발명의 항체 또는 ADC로 또는 기타 다른 항암제로) 적이 있고 재발되거나 이전 치료에 대해 난치성인 것으로 결정된 대상체의 치료에 사용될 것이다. 선택된 구현예에서, 본 발명의 화합물 및 조성물은 재발성 종양을 갖는 대상체의 치료에 사용될 수 있다.
상기 논의되고, 첨부된 실시예에 나타낸 바와 같이, 본 발명의 화합물 및 조성물은 바람직하게는 본 명세서에 설명된 바와 같은 IHC 및/또는 H-스코어를 사용해서 결정된 DLL3+ 종양 (예를 들어, DLL-3 H-스코어가 90 이상인 종양 및/또는 세포의 20% 이상에서 DLL3를 발현하는 종양)으로 고통받는 임의의 대상체를 치료하기 위해 사용될 수 있다. 이와 관련하여, 본 발명의 한 구현예는 개시된 적어도 90의 H-스코어를 갖는 환자의, DLL3 ADC를 이용한 치료를 포함한다. 다른 구현예에서, 본 발명의 DLL3 ADC로 치료될 환자는 적어도 120의 DLL3 H-스코어를 지닐 것이다. 또다른 구현예에서, 본 발명의 DLL3 ADC로 치료될 환자는 적어도 150의 DLL3 H-스코어를 가질 것이며, 더욱 바람직하게는 적어도 180의 DLL3 H-스코어를 가질 것이다. 또다른 구현예는 DLL3+ 종양을 포함할 것이며, 여기서 종양은 염색에 의해 결정됨에 따라 구성 세포의 적어도 20 %, 30 %, 40 %, 또는 적어도 50 %에서 DLL3+를 발현한다. 특정 바람직한 구현예에서, 염색된 세포의 H-스코어 또는 백분율은 SCLC 종양에서 수득된 샘플을 사용해서 측정될 것이다. 다른 구현예에서, 염색된 세포의 H-스코어 또는 백분율은 대세포 신경내분비암, 교아종, 흑색종 또는 갑상선 수질 종양에서 수득된 샘플을 사용해서 측정될 것이다. 또다른 구현예에서, 염색된 세포의 H-스코어 또는 백분율은 신경내분비계 특징을 나타내는 종양으로부터 수득된 샘플을 사용해서 측정될 것이다.
특정 양태에서, 증식성 장애는, 부신, 간, 신장, 방광, 유방, 위, 난소, 자궁경부, 자궁, 식도, 결장직장, 전립선(예를 들어, 전립선 선암종), 췌장, 폐(소세포 및 비-소세포 둘 다), 갑상선, 암종, 육종, 교모세포종 및 다양한 두부 및 경부 종양을 포함하나 이에 제한되지는 않는 고형 종양을 포함할 것이다. 다른 바람직한 구현예에서, 또한 하기 실시예에 나타난 바와 같이, 개시된 ADC는 특히 소세포 폐암(SCLC) 및 비-소세포 폐암(NSCLC)(예를 들어, 편평 세포 비-소세포 폐암 또는 편평 세포 소세포 폐암)의 치료에 효과적이다. 특정 구현예에서, 폐암은 백금 기재의 작용제(예를 들어, 카르보플라틴, 시스플라틴, 옥살리플라틴, 토포테칸) 및/또는 탁산(예를 들어, 도세탁셀, 파클리탁셀, 라로탁셀 또는 카바지탁셀)에 대해 난치성, 재발성 또는 내성을 갖는다. 또 다른 구현예에서, 치료되는 대상체는 대세포 신경내분비 암종(LCNEC)을 앓고 있다. 본 발명의 또 다른 양태에서, 개시된 항체 및 ADC는 갑상선 수질 암, 교모세포종, 신경내분비 전립선암(NEPC), 고등급 위장췌장암(GEP) 및 악성 흑색종의 치료에 사용될 수 있다.
본 발명에 따라 치료가 적용되는 보다 일반적으로 예시적 신생 병태는, 양성 또는 악성; 고형 종양 또는 혈액암일 수 있고; 부신 종양, AIDS-연관 암, 포상 연부 육종, 성상세포 종양, 자율 신경절 종양, 방광 암(편평 세포 암종 및 이행 세포 암종), 포배강 장애, 골암(법랑종, 동맥류 골 낭종, 골연골종, 골육종), 뇌 및 척수 암, 전이성 뇌 종양, 유방암, 경동맥체 종양, 자궁경부 암, 연골육종, 척삭종, 혐색소성 신장 세포 암종, 투명 세포 암종, 결장암, 결장직장암, 피부 양성 섬유 조직구종, 결합조직성 소원형세포 종양, 뇌실막종, 상피성 장애, 유잉(Ewing) 종양, 골외 점액성 연골육종, 골성 불완전 섬유원증, 뼈의 섬유 이형성증, 담낭 및 담관 암, 위암, 위장, 임신 영양막 질환, 생식 세포 종양, 샘 장애, 두부 및 경부 암, 시상하부, 장암, 도세포 종양, 카포시 육종(Kaposi's Sarcoma), 신장암(신아종, 유두상 신장 세포 암종), 백혈병, 지방종/양성 지방종성 종양, 지방육종/악성 지방종성 종양, 간암(간아종, 간세포 암종), 림프종, 폐암(소세포 암종, 선암, 편평 세포 암종, 대세포 암종 등), 대식세포 장애, 수모세포종, 흑색종, 수막종, 갑상선 수질암, 다발성 내분비샘 종양, 다발성 골수종, 골수이형성 증후군, 신경아세포종, 신경내분비 종양, 난소 암, 췌장암, 유두상 갑상선 암종, 부갑상선 종양, 소아암, 말초 신경 초종, 크롬친화세포종, 뇌하수체 종양, 전립선암, 후방 포도막 흑색종, 희귀 혈액학적 장애, 신장 전이성 암, 횡문근양 종양, 횡문근육종, 육종, 피부암, 연조직 육종, 편평 세포 암, 위암, 간질 장애, 활막 육종, 고환암, 흉선 암종, 흉선종, 갑상선 전이성 암, 및 자궁암(자궁경관의 암종, 자궁내막 암종, 및 평활근종)을 포함하나 이에 제한되지는 않는 군으로부터 선택될 수 있다.
여전히 다른 바람직한 구현예에서, 화합물 또는 조성물은 흑색종으로 고통받고 있는 대상체에게 투여될 것이다. 보다 일반적으로, 본 명세서에 개시된 조성물 및 방법은 흑색종을 진단, 모니터, 치료 또는 예방하기 위해 사용될 것이다. 본 명세서에서 사용된 바와 같은 용어 "흑색종"은 원발성 흑색종, 악성 흑색종, 피부 흑색종, 피부외 흑색종, 표재 확산 흑색종, 폴립 흑색종, 흑색암, 멜라노에피트종, 흑색육종, 제자리흑색종, 결절성 악성 흑색종, 악성 흑색점 흑색종, 흑색점 흑색종, 흑색점 악성 흑색종, 점막 흑색점 흑색종, 점막 흑색종, 말단 흑색점 흑색종, 연조직 흑색종, 안구 흑색종, 침습성 흑색종, 가족성 비정형 두드러기 및 흑색종(FAM-M) 증후군, 결합조직형성 악성 흑색종 또는 포도막 흑색종을 포함하는 모든 유형의 흑생종을 포함하지만 이에 한정되지는 않는다.
전이성 흑색종은 멜라닌세포, 멜라닌세포모반 또는 이형성모반에서 유도될 수 있고, 종양 진행의 상이한 상 (예를 들어, 방사 성장 상 또는 수직 성장 상)을 통해 발달할 수 있다. 흑색종은 염색체 이상, 퇴행성 성장 및/또는 발달 질환, 유사분열촉진제, 자외선, 바이러스 감염, 발암물질, 다양한 유전적 변이 또는 유전자의 비정상적 발현에서 야기될 수 있다.
상기 시사된 바와 같이, 개시된 항체 및 ADC는 다음 아형: 소세포폐암 및 비소세포폐암 (예를 들어, 편평상피세포 비소세포폐암 또는 편평상피세포 소세포폐암) 및 대세포 신경내분비암을 포함하는 폐암의 치료에 특히 효과적이다. 선택된 구현예에서, 항체 및 ADC는 제한된 병기 또는 광범위한 병기를 나타내는 환자에게 투여될 수 있다. 다른 구현예에서, 개시된 컨쥬게이트된 항체는 난치성 환자 (즉, 초기 치료 동안 또는 완료 직후 질병이 재발한 환자); 민감성 환자 (즉, 일차 치료 후 2-3 개월 초과 후에 재발한 환자); 또는 백금 기재의 작용제 (예를 들어, 카보플라틴, 시스플라틴, 옥살리플라틴) 및/또는 탁산 (예를 들어, 도세탁셀, 파클리탁셀, 라로탁셀 또는 카바지탁셀)에 내성을 나타내는 환자에게 투여될 것이다. 특정 바람직한 구현예에서, 본 발명의 DLL3 ADC는 제1선 환자 (즉, 폐암으로 치료받은 적이 없는 환자)에게 투여될 것이다. 다른 구현예에서, 본 발명의 DLL3 ADC는 제2선 폐암 환자에게 투여될 것이다. 또다른 구현예에서, 본 발명의 DLL3 ADC는 제3선 또는 제4선의 폐암 환자에게 투여될 것이다.
특히 바람직한 구현예에서, 개시된 ADC는 소세포폐암을 치료하기 위해 사용될 수 있다. 이러한 구현예와 관련하여, 컨쥬게이트된 항체는 제한기 질병을 나타내는 환자에게 투여될 수 있다. 다른 구현예에서, 개시된 ADC는 확장기 질병을 보이는 환자에게 투여될 것이다. 다른 바람직한 구현예에서, 개시된 ADC는 난치성 환자 (즉, 초기 치료 과정 동안 또는 완료 직후 재발한 환자) 또는 재발성 소세포폐암 환자에게 투여될 수 있다. 여전히 다른 구현예는 민감성 환자 (즉, SCLC의 일차 치료 후 2-3 개월 초과 후에 재발한 환자)에 대해 개시된 ADC의 투여를 포함한다. 각각의 경우에, 상용성 ADC는 선택된 투약 방식 및 임상적 진단에 따라서 다른 항암제(예를 들어, 백금 기재 작용제 또는 탁산 또는 PD-1 또는 PD-L1에 대한 항체)와 조합되어 이용될 수 있음이 이해될 것이다.
본 명세서에 설명된 바와 같이, 개시된 ADC는 신경내분비계 종양을 포함하여, 신경내분비계 특성 또는 표현형을 갖는 종양을 예방, 치료 또는 진단하기 위해 추가로 사용될 수 있다. 분산된 내분비계에서 발생하는 참 또는 정상 신경내분비 종양(NET)은 100,000 명당 2-5 명 정도의 발생으로 비교적 드물지만, 매우 공격적이다. 신경내분비 종양은 신장, 비뇨생식관 (방광, 전립선, 난소, 자궁 경관 및 자궁 내막), 위장관 (결장, 위), 갑상선 (갑상선 수질암), 및 폐 (소세포 폐암 및 대세포 신경내분비암)에서 발생한다. 이러한 종양들은 카르시노이드 증후군(carcinoid syndrome)으로 알려진 쇠약 증상을 야기할 수 있는 세로토닌 및/또는 크로모그라닌 A를 포함한 몇몇 호르몬을 분비할 수 있다. 이러한 종양은 뉴런 특이적 에놀라제 (NSE, 감마 에놀라제, 유전자 기호 = EN02로도 알려져 있음), CD56 (또는 NCAM1), 크로모그라닌 A (CHGA), 및 시냅토파이신 (SYP) 같은 양성 면역조직화학 마커에 의해 또는 ASCL1과 같은 상승된 발현을 나타내는 것으로 알려진 유전자에 의해 나타낼 수 있다. 유감스럽게도, 전통적인 화학요법은 NET의 치료에 특히 효과적이지 못하며, 간 전이는 일반적인 결과이다.
개시된 ADC는 신경내분비 종양을 치료하는 데 유리하게 사용될 수 있는 한편, 유전적 또는 표현형적으로 표준 신경내분비계 종양과 공통된 특성을 모방하거나, 유사하거나 또는 나타내는 가성(pseudo) 신경내분비 종양 (pNETs)을 치료, 예방 또는 진단하는 데도 사용될 수 있다. 가성 신경내분비 종양 또는 신경내분비적 특징을 나타내는 종양은, 분산 신경내분비계 세포로부터 또는 신경내분비적 분화 캐스캐이드가 종양 발생 과정 동안 비정상적으로 재활성화된 세포로부터 발생하는 종양이다. 이러한 pNET는 일반적으로 특정 표현형적 또는 생화학적 특징을 전통적으로 정의된 신경내분비계 종양 (즉, 신경내분비적 특징을 보이는 것)과 공유하며, 이는 생물학적으로 활성화된 아민, 신경 전달 물질, 및 펩타이드 호르몬의 부분 집합을 생산할 수 있는 능력을 포함한다. 조직학적으로, 이러한 종양들(NETs 및 pNETs)은 밀집되어 연결된, 단조로운 세포 병리학의 최소 세포질 및 타원형 반점 핵을 갖는 소세포들을 종종 나타내는 공통된 외관을 공유한다. 본 발명의 목적을 위해, 신경내분비적 및 가성 신경내분비적 종양을 정의하는 데 사용될 수 있는 일반적으로 발현된 조직학적 마커 또는 유전적 마커는 크로모그라닌 A, CD56, 시냅토피신(synaptophysin), PGP9.5, ASCL1 및 뉴런특이적 에놀라제(NSE)를 포함하지만 이에 한정되지는 않는다.
따라서, 본 발명의 ADC는 가성 신경내분비계 종양 및 표준 신경내분비계 종양을 치료하는 데 유리하게 이용될 수 있다. 이와 관련하여, ADC는 본원에 기재된 바와 같이 신장, 비뇨생식관 (방광, 전립선, 난소, 자궁 경관, 및 자궁 내막), 위장관 (결장, 위), 갑상선 (갑상선 수질암), 및 폐 (소세포 폐암 및 대세포 신경내분비 암종)에서 발생하는 신경내분비계 종양 (NET 및 pNET 모두) 치료에 사용될 수 있다. 나아가, 본 발명의 ADC는 NSE, CD56, 시냅토피신, 크로모그라닌 A, ASCL1 및 PGP9.5(UCHL1)로 이루어진 군으로부터 선택된 하나 이상의 마커를 발현하는 종양을 치료하는 데 사용될 수 있다. 즉, 본 발명은 NSE+ 또는 CD56+ 또는 PGP9.5+ 또는 ASCL1+ 또는 SYP+ 또는 CHGA+ 또는 이들의 일부 조합인 종양으로 고통받는 대상체를 치료하는 데 사용될 수 있다.
앞서 시사된 바와 같이, 본 발명의 DLL3 ADC는, 특히 이들이 상기 언급된 마커를 나타내는 경우, 1 회 또는 2 회의 치료를 받은 후 질병의 진행을 보이는 SCLC 환자 (즉, 제2선 또는 제3선 SCLC 환자)를 치료하는 데 사용될 수 있다.
혈액암과 관련하여, 본 발명의 화합물 및 방법은 저급/NHL 난포세포 림프종 (FCC), 외투세포 림프종 (MCL), 광범위 대세포 림프종 (DLCL), 소세포 림프성 (SL) NHL, 중간 등급/난포 NHL, 중간단계 광범위 NHL, 고급 면역모세포성 NHL, 고급 림프구성 NHL, 고급 소형 비분열 세포 NHL, 거대 종양(bulky disease) NHL, 발텐스트롬 마크로글로불린혈증(Waldenstrom's Macroglobulinemia), 림프상피세포모양 림프종 (LPL), 외투세포 림프종 (MCL), 난포 림프종(FL), 광범위 대세포림프종(DLCL), 버킷 림프종 (BL), AIDS-관련 림프종, 단핵구성 B세포 림프종, 혈관면역모세포 림프종, 소형 림프구, 난포, 광범위 대세포, 광범위 소형 분열 세포, 대세포 면역모세포 림프아세포종, 소형의, 비분열된, 버킷 및 비버킷의, 난포, 대체적으로 대세포; 대체적으로 작게 분열된 세포인, 난포; 및 작은 분열된 세포 및 대세포 림프종이 섞여있는 난포를 포함하는 다양한 B-세포 림프종을 치료하는 데 특히 효과적일 수 있음이 추가로 이해될 것이다. 문헌 [Gaidono et al., "Lymphomas", IN CANCER: PRINCIPLES & PRACTICE OF ONCOLOGY, Vol. 2: 2131-2145(DeVita et al., eds., 5.sup.th ed. 1997] 을 참조한다. 이러한 림프종들이 분류 체계의 변화에 의해 종종 다른 이름을 지닐 것이며, 다른 이름으로 분류된 림프종을 지닌 환자들 또한 본 발명의 병용 치료 섭생으로부터의 이익을 얻을 수 있을 것이라는 점은 당업자에게 명백할 것이다.
IX. 제조 물품
본 발명은 본 발명의 항체 또는 ADC의 1 회 이상의 도스를 포함할 수 있는, 하나 이상의 컨테이너 또는 용기를 포함하는 약학적 팩 및 키트를 포함한다. 이러한 키트 또는 팩은 사실상 진단적 또는 치료적일 수 있다. 일부 구현예에서, 해당 팩 또는 키트는, 예를 들어, 본 발명의 항체 또는 ADC를 하나 이상의 첨가제와 함께 또는 첨가제 없이, 그리고 선택적으로 하나 이상의 항암제를 포함하는 조성물의, 예정된 양을 의미하는 단위 투약량을 담고 있다. 다른 특정 구현예에서, 팩 또는 키트는 검출가능한 양의 항-DLL 항체 또는 ADC, 존재 또는 부재하는 관련 리포터 분자, 및 선택적으로 암 세포의 검출, 정량화, 염색 및/또는 가시화를 위한 하나 이상의 첨가제를 담고 있다.
임의의 경우, 본 발명의 키트는 약학적으로 허용된 제제 및 선택적으로, 하나 이상의 항암제를 동일한 또는 별도의 컨테이너 내에 포함하는 적합한 컨테이너 또는 용기 내에 본 발명의 항체 또는 ADC를 일반적으로 포함할 것이다. 키트는 또한 진단 또는 병용요법 중 하나를 위해서 약학적으로 허용 가능한 다른 제제 또는 장치를 포함할 수 있다. 진단 장치 또는 기구의 예는 증식성 질환과 연관된 세포나 마커를 (이러한 예시적 마커의 목록은 상기 참조) 검출, 조사, 모니터, 정량화 또는 프로파일하는 데 사용될 수 있는 것들을 포함한다. 일부 구현예에서, 그 장치는 생체 내 또는 시험관 내 중 하나에서 순환 종양 세포를 (예를 들어, WO2012/0128801 참조) 검출, 모니터 및/또는 정량화하는 데 사용될 수 있다. 여전히 또다른 구현예에서, 순환 종양 세포는 종양형성 세포를 포함할 수 있다. 본 발명에 의해 고려되는 키트는 또한 본 발명의 항체 또는 ADC를 항암제 또는 진단제와 조합하기 위한 적합한 시약을 담을 수 있다.
키트의 성분이 하나 이상의 액체 용액 중에 제공되는 경우, 액체 용액은 비-수성일 수 있지만, 통상적으로 수용액이 바람직하고, 멸균 수용액이 특히 바람직하다. 키트 내의 제형은 또한 건조 분말(들)로서 또는 동결건조된 형태로 제공될 수 있고, 이는 적절한 액체의 첨가시 재구성될 수 있다. 재구성에 사용되는 액체는 별도의 용기 내에 함유될 수 있다. 이러한 액체는 제약상 허용되는 멸균 완충제(들) 또는 기타 다른 희석제(들), 예컨대 주사용 정균수, 주사용 멸균수, 포스페이트-완충 식염수, 링거액 또는 덱스트로스 용액을 포함할 수 있다. 키트가 본 발명의 항체 또는 ADC를 추가의 치료제 또는 작용제와 조합하여 포함하는 경우, 용액은, 몰 당량 조합으로 또는 하나의 성분을 기타 다른 성분에 비해 과량으로 예비-혼합될 수 있다. 대안적으로, 본 발명의 항체 또는 ADC 및 임의의 선택적 항암제 또는 기타 다른 작용제는 환자에게 투여되기 전에 별개의 용기 내에서 별도로 유지될 수 있다.
특정 바람직한 구현예에서, 본 발명의 키트는 동결건조된 DLL3 ADC를 담은 바이알 또는 병을 포함할 것이다. 바람직하게는, 동결건조된 ADC는 ADC1, ADC2, ADC3, ADC4, ADC5 및 ADC6로 이루어진 군에서 선택된 DLL3 ADC를 포함할 것이며, 더욱 바람직하게는, 동결건조된 DLL3 ADC는 hSC16.56DL1 또는 hSC16.56ss1DL6을 포함할 것이다. 특정 구현예에서, 동결건조된 DLL3 ADC는 동결건조보호제를 추가로 포함할 것이다. 다른 양태에서, 해당 키트는 동결건조된 DLL3 ADC를 재구성하는 데 사용될 수 있는 수용액을 담은 컨테이너를 선택적으로 포함할 수 있다. 여전히 또다른 구현예에서, 키트는 동결건조된 DLL3이 2-8℃(예를 들어, 4℃)에서 3 개월, 6 개월, 1 년, 18 개월, 2 년, 30 개월 또는 3 년 동안 안정하게 유지되는 삽입물 또는 지시사항을 포함할 수 있다. 선택된 바람직한 구현예에서, 삽입물 또는 지시사항은 동결건조된 ADC가 2-8℃(예를 들어, 4℃)에서 2 년 동안 안정하게 유지될 것임을 표시할 것이다. 특정 바람직한 구현예에서, 상기 언급된 동결건조된 DLL3 ADC를 포함하는 키트는 키트의 내용물이 암의 치료, 예방 및/또는 진단을 위해 사용될 수 있음을 나타내는 라벨, 마커, 패키지 삽입물, 바코드 및/또는 판독기를 포함할 것이다. 특히 바람직한 양태에서, 라벨, 마커, 패키지 삽입물, 바코드 및/또는 판독기는 해당 키트의 내용물이 소세포 폐암의 치료, 예방 및/또는 진단을 위해 사용될 수 있음을 표시한다. 특히 바람직한 다른 양태에서, 라벨, 마커, 패키지 삽입물, 바코드 및/또는 판독기는 키트의 내용물이 대세포 신경내분비 암종, 흑색종, 갑상선암, 또는 교아종의 치료, 예방 또는 진단에 사용될 수 있음을 나타낸다.
보다 일반적으로 키트는, 포함된 조성물이 선택된 질병 상태 (예를 들어, 암)의 진단 또는 치료를 위해 사용됨을 표시하는, 하나 또는 다수의 컨테이너 또는 용기 및 컨테이너(들) 내의, 위의 또는 컨테이너와 결합된 라벨 또는 패키지 삽입물을 포함할 수 있다. 적합한 컨테이너는 예를 들어, 병, 바이알, 주사기, 주입 백 (IV 백), 등을 포함한다. 컨테이너는 유리 또는 약학적으로 상용성인 플라스틱과 같은 다양한 재료로 만들어질 수 있다. 특정 구현예에서, 컨테이너(들)는 예를 들어, 피하주사기 바늘이 꽂힐 수 있는 마개를 가진 바이알 또는 정맥주사제 백과 같이 멸균 접근 포트를 포함할 수 있다.
일부 구현예에서, 키트는, 항체 및 임의의 선택적 성분을 환자에게 투여하는 수단, 예를 들어, 하나 이상의 니들 또는 시린지(예비-충전된 또는 비어 있는), 점안기, 피펫, 또는 그로부터 제형을 대상체 내로 주입하거나 도입할 수 있는 또는 신체의 질환 부위로 적용할 수 있는 기타 다른 유사 장치를 함유할 수 있다. 본 발명의 키트는 또한 통상적으로, 바이알, 또는 유사물, 및 기타 다른 성분을 시판을 위해 밀폐 한정 공간 내에 함유시키기 위한 수단, 예컨대 요망되는 바이알 및 기타 다른 장치가 내부에 배치되어 유지되는 취입 성형 플라스틱 용기를 포힘할 것이다.
X. 기타
본원에서 달리 정의되지 않는 한, 본 발명과 관련하여 사용된 과학적 및 기술적 용어는 당업자에 의해 통상적으로 이해되는 의미를 가질 것이다. 또한, 문맥에서 달리 요구되지 않는 한, 단수형 용어는 복수형을 포함할 것이고, 복수형 용어는 단수형을 포함할 것이다. 추가로, 명세서 및 첨부된 청구범위에 제공된 범위는 양쪽 종점 및 종점 사이의 모든 점을 포함한다. 따라서, 2.0 내지 3.0의 범위는 2.0, 3.0, 및 2.0과 3.0 사이의 모든 점을 포함한다.
일반적으로, 본원에 기재된 세포 및 조직 배양 기법, 분자 생물학, 면역학, 미생물학, 유전학 및 화학은 당업계에 널리 공지되고 통상적으로 사용되는 것들이다. 이러한 기법과 연관하여 본원에서 사용된 명명법 또한 당업계에서 통상적으로 사용된다. 본 발명의 방법 및 기법은, 달리 기재되지 않는 한, 일반적으로 당업계에 널리 공지된 종래의 방법에 따라, 또한 본 명세서 전반에 걸쳐 인용된 다양한 참조문헌에 기재된 바와 같이 수행된다.
XI. 참조문헌
본원에서 인용된 모든 특허, 특허 출원, 및 공개 문헌, 및 전자 이용가능 자료(예를 들어, 뉴클레오티드 서열 기탁(예를 들어, GenBank 및 RefSeq), 및 아미노산 서열 기탁(예를 들어, SwissProt, PIR, PRF, PBD, 및 GenBank 및 RefSeq에서의 주석이 달린 코딩 영역으로부터의 번역) 포함)의 전체 개시내용은, 어구 "참조로 포함됨"이 특정 참조문헌과 관련하여 사용되었는지의 여부에 관계 없이, 참조로 포함된다. 상기 상세한 설명 및 하기 실시예는 단지 이해의 명확성을 위해 제공된 것이다. 이로부터의 불필요한 제한은 없음을 이해하여야 한다. 본 발명은, 나타내고 기재된 정확한 상세사항으로 제한되지 않는다. 당업자에게 명백한 변화가 청구범위에 의해 한정되는 본 발명에 포함된다. 본원에서 사용된 임의의 섹션 제목은 단지 조직적 목적을 위한 것이며, 기재된 주제를 제한하는 것으로 해석되어선 안된다.
XII. 서열 목록 요약
다수의 핵산 및 아미노산 서열을 포함하는 도면 및 서열 목록이 본 출원에 첨부된다. 하기 표 4는 포함된 서열의 요약을 제공한다.
서열번호 | 설명 |
1 | DLL3 아이소형 1 단백질 |
2 | DLL3 아이소형 2 단백질 |
3 | 에피토프 단백질 - SC16.23 |
4 | 에피토프 단백질 - SC16.34 및 SC 16.56 |
5 | 카파 불변 영역 단백질 |
6 | IgG1 불변 영역 단백질 |
7 | hSC16.56 전장 중쇄 단백질 |
8 | hSC16.56 및 hSC16.56ss1 전장 경쇄 단백질 |
9 | hSC16.56ss1 전장 중쇄 단백질 |
10-19 | 보존됨 |
20 | SC16.3 VL DNA(암호화된 단백질과 배열됨) |
21 | SC16.3 VL 단백질 |
22 | SC16.3 VH DNA(암호화된 단백질과 배열됨) |
23 | SC16.3 VH 단백질 |
24-387 | 서열번호 20-23에서와 같은 추가적인 뮤린 클론 |
388-407 | 서열번호 20-23에서와 같은 인간화된 클론 |
408, 409, 410 | hSC16.13 CDRL1, CDRL2, CDRL3 |
411, 412, 413 | hSC16.13 CDRH1, CDRH2, CDRH3 |
414, 415, 416 | hSC16.15 CDRL1, CDRL2, CDRL3 |
417, 418, 419 | hSC16.15 CDRH1, CDRH2, CDRH3 |
420, 421, 422 | hSC16.25 CDRL1, CDRL2, CDRL3 |
423, 424, 425 | hSC16.25 CDRH1, CDRH2, CDRH3 |
426, 427, 428 | hSC16.34 CDRL1, CDRL2, CDRL3 |
429, 430, 431 | hSC16.34 CDRH1, CDRH2, CDRH3 |
432, 433, 434 | hSC16.56 CDRL1, CDRL2, CDRL3 |
435, 436, 437 | hSC16.56 CDRH1, CDRH2, CDRH3 |
아래 실시예 2에서 논의된 바와 같이, 상기 표 4는, 도 1a 및 도 1b에서 기재된 예시적인 카밧 CDR에 대해 서열번호를 지명하는 데 추가로 사용될 수 있다. 보다 구체적으로, 도 1a 및 도 1b는 중쇄(CDRH) 및 경쇄(CDRL) 가변 영역 서열의 각 3 개의 카밧 CDR을 나타내고, 상기 표 4는 경쇄의 각각의 CDRL1, CDRL2 및 CDRL3 및 중쇄의 각각의 CDRH1, CDRH2 및 CDRH3에 적용될 수 있는 서열번호 명칭의 배정을 제공한다. 이러한 방법론을 이용하여, 도 1a 및 도 1b에 설명된 각각의 고유한 CDR은 순차적인 서열번호를 배정받을 수 있고, 본 발명의 유도된 항체를 제공하기 위해 사용될 수 있다.
XIII. 종양 목록
PDX 종양 세포 유형은 약어 후에 숫자로 나타내었고, 이는 특정 종양 세포주를 나타낸다. 시험 샘플의 통과 수는 p0-p#를 샘플 명칭에 부속시켜 나타내었고, 여기서 p0은 환자 종양으로부터 직접 얻어진 비-통과 샘플의 표시이고, p#는 시험 전에 마우스로 종양이 통과된 횟수의 표시이다. 본원에서 사용되는 바와 같이, 종양 유형 및 서브유형의 약어를 하기 표 5에 나타내었다:
종양 유형
|
약어 | 종양 하위 유형 | 약어 | |||
유방 | BR | |||||
에스트로겐 수용체 양성 및/또는 프로게스테론 수용체 양성 | BR-ERPR | |||||
ERBB2/Neu 양성 | BR- ERBB2/Neu | |||||
HER2 양성 | BR-HER2 | |||||
삼중-음성 | TNBC | |||||
삼중-음성의 클라우딘 아형 | TNBC-CLDN | |||||
결장 | CR | |||||
자궁내막 | EN | |||||
위 | GA | |||||
분산형 선암종 | GA-Ad-Dif/Muc | |||||
장내 선암종 | GA-Ad-Int | |||||
간질 종양 | GA-GIST | |||||
교아종 | GB | |||||
두경부 | HN | |||||
신장 | KDY | |||||
투명 신장 세포 암종 | KDY-CC | |||||
유두상 신장 세포 암종 | KDY-PAP | |||||
이행세포 또는 요로상피세포 암종 | KDY-URO | |||||
알려지지 않음 | KDY-UNK | |||||
간 | LIV | |||||
간세포 암종 | LIV-HCC | |||||
담관 암종 | LIV-CHOL | |||||
림프종 | LN | |||||
폐암 | LU | |||||
선암종 | LU-Ad | |||||
유암종 | LU-CAR | |||||
대세포 신경내분비 | LU-LCC | |||||
비-소세포 | NSCLC | |||||
편평 세포 | LU-SCC | |||||
소세포 | SCLC | |||||
방추세포 | LU-SPC | |||||
흑색종 | MEL | |||||
난소 | OV | |||||
투명세포 | OV-CC | |||||
자궁내막 | OV-END | |||||
혼합 아형 | OV-MIX | |||||
악성 혼합 흑색종 | OV-MMMT | |||||
점액 | OV-MUC | |||||
신경내분비 | OV-NET | |||||
유두상 혈청 | OV-PS | |||||
혈청 | OV-S | |||||
소세포 | OV-SC | |||||
이행세포 암종 | OV-TCC | |||||
췌장 | PA | |||||
세엽세포 암종 | PA-ACC | |||||
십이지장 암종 | PA-DC | |||||
점액선암종 | PA-MAD | |||||
신경내분비 | PA-NET | |||||
선암종 | PA-PAC | |||||
외분비선암종 | PA-PACe | |||||
도관선암종 | PA-PDAC | |||||
팽대샘암종 | PA-AAC | |||||
전립선 | PR | |||||
피부 | SK | |||||
흑색종 | MEL | |||||
편평세포암종 | SK-SCC |
실시예
상기에 일반적으로 논의된 본 발명은 하기의 실시예를 참조하여 보다 용이하게 이해될 것이며, 이는 예시로서 제공되고, 본 발명에 대한 제한을 의도하는 것은 아니다. 실시예는 하기 실험이 수행된 전부 또는 유일한 실험임을 나타내고자 하는 것은 아니다. 별도의 언급이 없을 경우, 부분은 중량의 일부이며, 분자량은 평균 분자량을 의미하고, 온도는 섭씨로 표기되었으며, 압력은 대기압 또는 그에 유사하다.
실시예 1
뮤린 항-DLL3 항체의 생성
항-DLL3 뮤린 항체는 아래와 같이 생성되었다. 제 1 면역화 캠페인(campaign)에서, 3 마리의 마우스 (각각 다음 계통 중 하나: Balb/c, CD-1, FVB)에게 동량의 TiterMax® 또는 알륨 보조제로 유화된 인간 DLL3-fc 단백질 (hDLL3-Fc)을 접종하였다. hDLL3-Fc 융합 구축물은 Adipogen International (카달로그 번호 AG-40A-0113)에서 구매하였다. 초기 면역화는 마우스 한 마리 당 10 ㎍ hDLL3-Fc의 TiterMax 내 유화액으로 수행되었다. 이후, 마우스들은 격주로 한 마리 당 알륨 보조제 내 5 ㎍ hDLL3-Fc로 부스팅되었다. 융합 전 최종 주사는 마우스 한 마리 당 PBS 내 5 ㎍ hDLL3-Fc였다.
제 2 면역화 캠페인에서 6 마리의 마우스 (각각 다음 계통 중 둘 씩: Balb/c, CD-1, FVB)에게 동량의 TiterMax® 또는 알륨 보조제로 유화된 인간 DLL3-His 단백질 (hDLL3-His)을 접종하였다. 재조합 hDLL3-His 단백질을 hDLL3-His 과발현을 위해 조작된 CHO-S 세포의 상청액으로 정제하였다. 초기 면역화는 마우스 한 마리 당 TiterMax 내 10 ㎍ hDLL3-His의 유화액으로 수행되었다. 이후, 마우스들은 격주로 한 마리 당 알륨 보조제 내 5 ㎍ hDLL3-His로 부스팅되었다. 최종 주사는 hDLL3 과발현을 위해 조작된 2×105 HEK-293T 세포를 이용하였다.
인간 DLL3에 특이적인 마우스 IgG 항체에 대한 마우스 혈청을 스크리닝하는 데 고체상 ELISA 분석을 사용하였다. 백그라운드를 초과하는 양성 신호는 DLL3에 특이적인 항체를 표시하였다. 간략하게, 96 웰 플레이트(VWR International, Cat. #610744)를 ELISA 코팅 완충제 중에서 0.5 ㎍/ml의 재조합 DLL3-His로 하룻밤 동안 코팅하였다. 0.02%(v/v) Tween 20을 함유하는 PBS로 세척 후, 웰들을 PBS 중 3%(w/v) BSA를 이용하여 200 ㎕/웰로 실온(RT)에서 1 시간 동안 차단했다. 마우스 혈청을 적정하고 (1:100, 1:200, 1:400, 및 1:800), 50 ㎕/웰로 DLL3 코팅된 플레이트에 첨가하고, 실온에서 1 시간 동안 배양하였다. 플레이트를 세척한 후, 3% BSA-PBS 또는 PBS 내 2% FCS에서 1:10,000으로 희석된 50 ㎕/웰 HRP-라벨된 염소 항-마우스 IgG와 함께 실온에서 1 시간 동안 배양하였다. 다시, 플레이트를 세척하고 40 ㎕/웰 TMB 기질 용액 (Thermo Scientific 34028)을 실온에서 15 분 동안 첨가하였다. 전개 후, 동량의 2N H2SO4를 첨가하여 기질 전개를 중단시켰고, 플레이트는 OD 450에서 분광광도계를 이용하여 분석되었다.
혈청-양성 면역화된 마우스를 희생시켜 유출 림프절 (슬와, 서혜부, 및 중앙 장골)을 절제하고, 항체 생성 세포를 위한 공급원으로 사용하였다. B 세포의 세포 현탁액 (hDLL3-Fc 면역화된 마우스로부터 약 299×106의 세포, 및 hDLL3-His 면역화된 마우스로부터 510×106의 세포)을 비분비 P3×63Ag8.653 골수종 세포와 1:1의 비율로, 모델 BTX Hybrimmune System(BTX Harvard Apparatus)을 이용한 전기 세포 융합에 의해 혼합하였다. 세포들을 아자세린으로 보충된 DMEM 배지, 15% 태아 클론 I 혈청, 10% BM Condimed (Roche Applied Sciences), 1 mM 비필수 아미노산, 1mM HEPES, 100 IU 페니실린-스트렙토마이신, 및 50 μM 2-머캡토에탄올로 구성된 하이브리도마 선발 배지에 재현탁시키고, 4 개의 T225 플라스크에서 플라스크 당 100mL 선발 배지에 배양시켰다. 플라스크들은 5% 이산화탄소 및 95% 산소를 함유한 가습된 37℃의 인큐베이터에 6 일 내지 7 일 동안 두었다.
융합 후 6 일 또는 7 일 째에, 하이브리도마 라이브러리 세포를 플라스크로부터 수집하고, 보충된 하이브리도마 선발 배지 (상기된 바와 같은) 200㎕ 중 웰 당 1 개 세포로 (FACSAria I 세포 분류기를 이용) 64 Falcon 96-웰 플레이트, 및 hDLL3-His 면역화 캠페인을 위한 48 96-웰 플레이트에 놓았다. 나머지 라이브러리는 액체 질소에 저장되었다.
하이브리도마를 10 일 동안 배양하고, 하기와 같이 수행된 유세포분석을 사용하여 hDLL3에 특이적인 항체에 대해 상청액을 스크리닝하였다. 인간 DLL3 과발현을 위해 조작된 HEK-293T 세포, 마우스 DLL3 (염료로 미리 염색됨), 또는 시노물구스 원숭이(cynomolgus) DLL3 (Dylight800으로 미리 염색됨)의 1×105/웰을 25 ㎕ 하이브리도마 상청액에서 30 분 동안 인큐베이션하였다. 세포들을 PBS/2%FCS로 세척한 후, PBS/2%FCS에서 1:300으로 2차 희석된 Fc 단편에 특이적인 염소-항-마우스 IgG 라벨된 DyeLight 649 샘플 당 25 ㎕와 인큐베이션하였다. 15 분 동안 인큐베이션 후, 세포를 PBS/2%FCS로 2 회 세척하고, PBS/2%FCS와 DAPI에 재현탁하였으며, 아이소타입 대조구 항체로 염색된 세포의 형광을 초과하는 형광에 대해 유세포분석으로 분석하였다. 남은 미사용 하이브리도마 라이브러리 세포는 차후 라이브러리 시험 및 스크리닝을 위해 액체 질소에 냉동되었다.
hDLL3-His 면역화 캠페인은 약 50 뮤린 항-hDLL3 항체를 산출했으며, hDLL3-Fc 면역화 캠페인은 약 90 뮤린 항-hDLL3 항체를 산출했다.
실시예 2
항-DLL3 항체의 서열분석
상기 내용에 기초하여, 명백하게 높은 친화도를 갖는 고정된 인간 DLL3 또는 h293-hDLL3 세포와 결합하는 예시적으로 상이한 다수의 모노클로날 항체가 서열분석 및 차후 분석을 위해 선택되었다. 실시예 1에서 생성된 선택된 모노클로날 항체로부터의 경쇄 가변 영역 및 중쇄 가변 영역의 서열 분석은 다수가 새로운 상보성 결정 부위를 가지며 종종 새로운 VDJ 배열을 보임을 확인하였다.
원하는 항체를 발현하는 초기 선택된 하이브리도마 세포를, 항체를 암호화하는 RNA를 조제하기 위해 Trizol® 시약 (Trizol® Plus RNA PurificationSystem,Life Technologies)에 용해시켰다. 104 내지 105의 세포들은 1 mL 트리졸에 재현탁되었으며, 200 ㎕의 클로로폼의 첨가 후 격렬히 진탕하였다. 이후 샘플을 4℃에서 10 분간 원심분리하고, 그 수상을 새로운 마이크로원심분리관(microfuge tube)에옮기고, 동량의 70 % 에탄올을 첨가하였다. 샘플은 RNeasy Mini spin 컬럼에 부하하고, 2 mL 수집 튜브에 놓고, 제조자 지시사항에 따라서 가공하였다. 총 RNA는, 직접적으로 스핀 컬럼 막에 100 ㎕ RN아제-비함유 물을 이용하여, 용리에 의해 추출되었다. 사용되기까지 -80℃에 저장되기 전에, RNA 제제의 품질을 1 % 아가로오스겔에서 3 ㎕를 분별화함으로써 결정하였다.
각각의 하이브리도마의 Ig 중쇄의 가변 영역을, 모든 마우스 Ig 아이소타입에 특이적인 3' 마우스 Cγ 프라이머와 조합하여, 완전한 마우스 VH 레파토리를 표적하도록 설계된 32 마우스 특이적 리더 서열 프라이머를 포함하는 5' 프라이머 믹스를 사용해 증폭시켰다. 유사하게, 각 Vκ 마우스 패밀리를 증폭시키도록 설계된 32 개의 5' Vκ 리더 서열을 포함하는 프라이머 믹스를, 카파 경쇄의 증폭 및 서열 분석을 위해 마우스 카파 불변 영역에 특이적인 단일 역전 프라이머와 조합하여 사용하였다. 람다 경쇄를 함유하는 항체의 경우, 증폭은 마우스 람다 불변 영역에 특이적인 1 개의 역전 프라이머와 함께, 3 개의 5' VL 리더 서열을 사용하여 수행되었다. VH 및 VL 전사체는 하기와 같이 Qiagen One Step RT-PCR 키트를 사용해서 100 ng 총 RNA로부터 증폭되었다. 총 8 개의 RT-PCR 반응을 각각의 하이브리도마에 대해, Vκ 경쇄에 대해 4 회, Vκ 중쇄에 대해 4 회 수행하였다. PCR 반응 혼합물은 RNA 3 ㎕, 중쇄 또는 카파 경쇄 프라이머 (Integrated Data Technologies에 의해 맞춤 합성됨) 100 μM 중 0.5 ㎕, 5× RT-PCR 완충액 5 ㎕, dNTP 1 ㎕, 역전사효소 및 DNA 폴리머라제를 함유하는 효소 믹스 1 ㎕, 및 리보뉴클레아제 억제제 RNasin (1 단위) 0.4 ㎕을 포함한다. 열 순환기 프로그램은 RT 단계 50℃에서 30 분, 95℃에서 15 분, 이어서 30 사이클 (95℃에서 30 초, 48℃에서 30 초, 72℃에서 1 분)이었다. 이어서, 최종 인큐베이션은 72℃에서 10 분이었다.
추출된 PCR 생성물을 상기 기재된 바와 같이, 가변 영역의 증폭을 위한, 동일한 특이적 가변 영역 프라이머를 사용하여 서열 분석하였다. 직접 DNA 서열 분석을 위한 PCR 생성물을 제조하기 위해서, 이들을 제조자 프로토콜에 따라 QIAquick™ PCR 정제 키트 (Qiagen)를 이용해 정제하였다. DNA는 스핀 컬럼으로부터 50 ㎕의 멸균수를 사용해 용리된 후, 양 가닥으로부터 (MCLAB) 직접적으로 서열 분석되었다.
선택된 뉴클레오티드 서열을 가장 높은 서열 상동성을 갖는 생식세포(germline) V, D 및 J 유전자 원을 확인하기 위해서 IMGT 서열 분석 도구 (http://www.imgt.org/IMGTmedical/ sequence_analysis.html)를 사용해 분석하였다. 이들 유도된 서열은 등록 항체 서열 데이터베이스를 사용하여 마우스 생식세포 데이터베이스에 대하여, VH 및 VL 유전자의 정렬에 의해 Ig V- 및 J-영역의 알려진 생식세포 DNA 서열과 비교하였다.
도 1a는 (하기 실시예 3에서와 같이) 대표적인 뮤린 항-DLL3 항체의 가변 경쇄에서 유도된 예시적인 인간화된 경쇄 가변 영역 및 항-DLL3 항체로부터의 다수의 신규 뮤린 경쇄 가변 영역의 인접 아미노산 서열을 나타낸다. 도 1b는 (하기 실시예 3에서와 같이) 인간화 경쇄를 제공하는, 동일한 뮤린 항체로부터 유도된 인간화된 항체 중쇄 가변 영역 및 동일한 항-DLL3 항체로부터의 신규 뮤린 중쇄 가변 영역의 인접 아미노산 서열을 나타낸다. 뮤린 경쇄 및 중쇄 가변 영역 아미노산 서열은 서열번호 21-387에서 홀수 번호로 제공되는 한편, 인간화 경쇄 및 중쇄 가변 영역 아미노산 서열은 서열번호 389-407에서 홀수 번호로 제공된다.
따라서, 도 1a 및 도 1b를 종합하면, SC16.3, SC16.4, SC16.5, SC16.7, SC16.8, SC16.10, SC16.11, SC16.13, SC16.15, SC16.18, SC16.19, SC16.20, SC16.21, SC16.22, SC16.23, SC16.25, SC16.26, SC16.29, SC16.30, SC16.31, SC16.34, SC16.35, SC16.36, SC16.38, SC16.41, SC16.42, SC16.45, SC16.47, SC16.49, SC16.50, SC16.52, SC16.55, SC16.56, SC16.57, SC16.58, SC16.61, SC16.62, SC16.63, SC16.65, SC16.67, SC16.68, SC16.72, SC16.73, SC16.78, SC16.79, SC16.80, SC16.81, SC16.84, SC16.88, SC16.101, SC16.103, SC16.104, SC16.105, SC16.106, SC16.107, SC16.108, SC16.109, SC16.110, SC16.111, SC16.113, SC16.114, SC16.115, SC16.116, SC16.117, SC16.118, SC16.120, SC16.121, SC16.122, SC16.123, SC16.124, SC16.125, SC16.126, SC16.129, SC16.130, SC16.131, SC16.132, SC16.133, SC16.134, SC16.135, SC16.136, SC16.137, SC16.138, SC16.139, SC16.140, SC16.141, SC16.142, SC16.143, SC16.144, SC16.147, SC16.148, SC16.149 및 SC16.150로 명명된 다수의 뮤린 항-DLL3 결합 및 표적 도메인, 및 hSC16.13, hSC16.15, hSC16.25, hSC16.34 및 hSC16.56로 명명된 인간화 항체의 주석 서열을 제공한다.
본 발명의 특정 양태에서, ADC 결합 도메인은 hDLL3에 특이적으로 결합하고 하기를 포함하는 항체와의 결합을 포함 또는 결합에 경쟁한다: 서열번호 21의 경쇄 가변 영역(VL) 및 서열번호 23의 중쇄 가변 영역(VH); 또는 서열번호 25의 VL 및 서열번호 27의 VH; 또는 서열번호 29의 VL 및 서열번호 31의 VH; 또는 서열번호 33의 VL 및 서열번호 35의 VH; 또는 서열번호 37의 VL 및 서열번호 39의 VH; 또는 서열번호 41의 VL 및 서열번호 43의 VH; 또는 서열번호 45의 VL 및 서열번호 47의 VH; 또는 서열번호 49의 VL 및 서열번호 51의 VH; 또는 서열번호 53의 VL 및 서열번호 55의 VH; 또는 서열번호 57의 VL 및 서열번호 59의 VH; 또는 서열번호 61의 VL 및 서열번호 63의 VH; 또는 서열번호 65의 VL 및 서열번호 67의 VH; 또는 서열번호 69의 VL 및 서열번호 71의 VH; 또는 서열번호 73의 VL 및 서열번호 75의 VH; 또는 서열번호 77의 VL 및 서열번호 79의 VH; 또는 서열번호 81의 VL 및 서열번호 83의 VH; 또는 서열번호 85의 VL 및 서열번호 87의 VH; 또는 서열번호 89의 VL 및 서열번호 91의 VH; 또는 서열번호 93 VL 및 서열번호 95의 VH; 또는 서열번호 97의 VL 및 서열번호 99의 VH; 또는 서열번호 101의 VL 및 서열번호 103의 VH; 또는 서열번호 105의 VL 및 서열번호 107의 VH; 또는 서열번호 109의 VL 및 서열번호 111의 VH; 또는 서열번호 113의 VL 및 서열번호 115의 VH; 또는 서열번호 117의 VL 및 서열번호 119의 VH; 또는 서열번호 121의 VL 및 서열번호 123의 VH; 서열번호 125의 VL 및 서열번호 127의 VH; 또는 서열번호 129의 VL 및 서열번호 131의 VH; 또는 서열번호 133의 VL 및 서열번호 135의 VH; 또는 서열번호 137의 VL 및 서열번호 139의 VH; 또는 서열번호 141의 VL 및 서열번호 143의 VH; 또는 서열번호 145의 VL 및 서열번호 147의 VH; 또는 서열번호 149의 VL 및 서열번호 151의 VH; 또는 서열번호 153의 VL 및 서열번호 155의 VH; 또는 서열번호 157의 VL 및 서열번호 159의 VH; 또는 서열번호 161의 VL 및 서열번호 163의 VH; 또는 서열번호 165의 VL 및 서열번호 167의 VH; 또는 서열번호 169의 VL 및 서열번호 171의 VH; 또는 서열번호 173의 VL 및 서열번호 175의 VH; 또는 서열번호 177의 VL 및 서열번호 179의 VH; 또는 서열번호 181의 VL 및 서열번호 183의 VH; 또는 서열번호 185의 VL 및 서열번호 187의 VH; 또는 서열번호 189의 VL 및 서열번호 191의 VH; 또는 서열번호 193의 VL 및 서열번호 195의 VH; 또는 서열번호 197의 VL 및 서열번호 199의 VH; 또는 서열번호 201의 VL 및 서열번호 203의 VH; 또는 서열번호 205의 VL 및 서열번호 207의 VH; 또는 서열번호 209의 VL 및 서열번호 211의 VH; 또는 서열번호 213의 VL 및 서열번호 215의 VH; 또는 서열번호 217의 VL 및 서열번호 219의 VH; 또는 서열번호 221의 VL 및 서열번호 223의 VH; 또는 서열번호 225의 VL 및 서열번호 227의 VH; 또는 서열번호 229의 VL 및 서열번호 231의 VH; 또는 서열번호 233의 VL 및 서열번호 235의 VH; 또는 서열번호 237의 VL 및 서열번호 239의 VH; 또는 서열번호 241의 VL 및 서열번호 243의 VH; 또는 서열번호 245의 VL 및 서열번호 247의 VH; 또는 서열번호 249의 VL 및 서열번호 251의 VH; 또는 서열번호 253의 VL 및 서열번호 255의 VH; 또는 서열번호 257의 VL 및 서열번호 259의 VH; 또는 서열번호 261의 VL 및 서열번호 263의 VH; 또는 서열번호 265의 VL 및 서열번호 267의 VH; 또는 서열번호 269의 VL 및 서열번호 271의 VH; 또는 서열번호 273의 VL 및 서열번호 275의 VH; 또는 서열번호 277의 VL 및 서열번호 279의 VH; 또는 서열번호 281의 VL 및 서열번호 283의 VH; 또는 서열번호 285의 VL 및 서열번호 287의 VH; 또는 서열번호 289의 VL 및 서열번호 291의 VH; 또는 서열번호 293의 VL 및 서열번호 295의 VH; 또는 서열번호 297의 VL 및 서열번호 299의 VH; 또는 서열번호 301의 VL 및 서열번호 303의 VH; 또는 서열번호 305의 VL 및 서열번호 307의 VH; 또는 서열번호 309의 VL 및 서열번호 311의 VH; 또는 서열번호 313의 VL 및 서열번호 315의 VH; 또는 서열번호 317의 VL 및 서열번호 319의 VH; 또는 서열번호 321의 VL 및 서열번호 323의 VH; 또는 서열번호 325의 VL 및 서열번호 327의 VH; 또는 서열번호 329의 VL 및 서열번호 331의 VH; 또는 서열번호 333의 VL 및 서열번호 335의 VH; 또는 서열번호 337의 VL 및 서열번호 339의 VH; 또는 서열번호 341의 VL 및 서열번호 343의 VH; 또는 서열번호 345의 VL 및 서열번호 347의 VH; 또는 서열번호 349의 VL 및 서열번호 351의 VH; 또는 서열번호 353의 VL 및 서열번호 355의 VH; 또는 서열번호 357의 VL 및 서열번호 359의 VH; 또는 서열번호 361의 VL 및 서열번호 363의 VH; 또는 서열번호 365의 VL 및 서열번호 367의 VH; 또는 서열번호 369의 VL 및 서열번호 371의 VH; 또는 서열번호 373의 VL 및 서열번호 375의 VH; 또는 서열번호 377의 VL 및 서열번호 379의 VH; 또는 서열번호 381의 VL 및 서열번호 383의 VH; 또는 서열번호 385의 VL 및 서열번호 387의 VH; 또는 서열번호 389의 VL 및 서열번호 391의 VH; 또는 서열번호 393의 VL 및 서열번호 395의 VH; 또는 서열번호 397의 VL 및 서열번호 399의 VH; 또는 서열번호 401의 VL 및 서열번호 403의 VH; 또는 서열번호 405의 VL 및 서열번호 407의 VH.
본 출원의 목적을 위해, 각각의 특정 항체의 서열번호는 순차적 홀수 번호로 한다. 따라서, 모노클로날 항-DLL3 항체, SC16.3은 경쇄 및 중쇄 가변 영역 각각에 대해 아미노산 서열번호 21 및 23을 포함하고; SC16.4는 서열번호 25 및 27을 포함하며; SC16.5는 서열번호 29 및 31을 포함하는 등이다. 각각의 항체 아미노산 서열에 상응하는 핵산 서열은 첨부된 서열 목록에 포함되며 상응하는 아미노산 서열번호 바로 앞의 서열번호를 갖는다. 따라서, 예를 들어, SC16.3 항체의 VL 및 VH의 서열번호는 각각 21 및 23이고, SC 16.3 항체의 VL 및 VH를 암호화하는 핵산 서열의 서열번호는 각각 20 및 22이다. 도 1a 및 도 1b의 CDR은 Kabat et al. (상기)에 따라 Abysis 데이터베이스의 독점판을 사용해서 정의된다.
실시예 3
키메라 및 인간화 항-DLL3 항체의 생성
본 발명과 상용성인 인간화 결합 도메인의 벤치마크(benchmark)를 제공하기 위해서, 키메라 항-DLL3 항체를 하기와 같이 당 분야에 알려진 기술을 사용하여 생성하였다. 총 RNA를 실시예 1에 기재된 바와 같이 하이브리도마로부터 추출 및 증폭시켰다. 뮤린 항체의 VH 및 VL 사슬의 V, D 및 J 유전자 절편에 관한 데이터는 유도된 핵산서열로부터 수득되었다. 항체의 VH 및 VL 사슬의 리더 서열에 특이적인 프라이머 세트는 다음 제한효소 위치: VH 단편에 대해 AgeI 및 XhoI, 및 VL 단편에 대해 XmaI 및 DraIII를 사용하여 설계되었다. PCR 생성물은 QIAquick PCR 정제 키트 (Qiagen)로 정제되었고, 이어서 VH 단편에 대한 제한효소 AgeI 및 XhoI 및 VL 단편에 대한 제한효소 XmaI 및 DraIII로 분해되었다. VL 및 VH 분해된 PCR 생성물을 정제하고, 카파 CL (서열번호 5) 인간형 경쇄 불변 영역 발현 벡터 또는 IgG1 (서열번호 6) 인간화 중쇄 불변 영역 발현 벡터에 각각 결찰시켰다.
결찰 반응은 총량 10 ㎕의 200U T4-DNA 리가아제 (New England Biolabs), 7.5 ㎕의 분해 및 정제된 유전자 특이적 PCR 생성물 및 25 ng 선형화 벡터 DNA를 이용하여 수행되었다. 적격 대장균 (E. coli) DH10B 박테리아 (Life Technologies)를 42℃에서 열충격을 통해 3 ㎕ 결찰 생성물로 변형시키고, 100 ㎍/mL 농도로 암피실린과 함께 플레이트 상에 놓았다. 증폭된 결찰 생성물의 정제 및 분해 후, VH 단편은 pEE6.4HuIgG1 발현 벡터 (Lonza)의 AgeI-XhoI 제한효소 위치로 클로닝되었고, VL 단편은 pEE12.4Hu-카파 발현 벡터 (Lonza Ltd.)의 XmaI-DraIII 제한효소 위치로 복제되었다.
키메라 항체는 HEK-293T 세포와 pEE6.4HuIgG1 및 pEE12.4Hu-카파 발현 벡터의 공동 형질감염에 의해 발현되었다. 형질감염에 앞서, HEK-293T 세포는 10% 열불활성화 FCS, 100 ㎍/mL 스트렙토마이신 및 100 U/mL 페니실린 G로 보충된 둘베코 변형 이글 배지(Dulbecco's Modified Eagle's Medium (DMEM)) 내 표준 환경에서 150 mm 플레이트에 배양되었다. 일시적인 형질감염을 위해, 세포를 80%의 컨플루언시(confluency)로 성장시켰다. 각각 12.5 ㎍의 pEE6.4HuIgG1 및 pEE12.4Hu-카파 벡터 DNA를 1.5 mL Opti-MEM 내 50 ㎕의 HEK-293T 형질감염 시약에 첨가하였다. 혼합물을 실온에서 30 분 동안 인큐베이션하고 플레이트하였다. 상청액은 형질감염한지 3 일 내지 6 일 후에 수확되었다. 재조합 키메라 항체를 함유하는 배양 상청액을 세포 찌꺼기로부터 800×g에서 10 분 동안 원심분리에 의해 세정하고 4℃에 저장하였다. 재조합 키메라 항체는 단백질 A 친화 크로마토그래피에 의해 정제되었다.
동일한 뮤린 항-DLL3 항체 (예를 들어, SC16.13, SC16.15, SC16.25, SC16.34 및 SC16.56) 또한 CDR-그래프트된 또는 인간화된 결합 도메인을 유도하기 위해 사용되었다. 뮤린 항체는 하기와 같은 등록 컴퓨터 지원 CDR-그래프팅 방법 (Abysis 데이터베이스, UCL Business)및표준 분자 공학 기술을 이용하여 인간화되었다. 가변 영역의 인간 프레임워크 영역은 프레임워크 서열과 인간 생식세포 항체 서열의 CDR 표준 구조 및 프레임워크 서열과 관련 마우스 항체의 CDR 사이의 가장 높은 상동성에 기반하여 설계되었다. 분석을 위해, 각각의 CDR 도메인의 아미노산 배정은 Kabat et al.에 따라서 이루어졌다. 일단 가변 영역이 선택되면, 이들은 합성 유전자 절편으로부터 (Integrated DNA Technologies) 생성되었다. 인간화 항체는 키메라 항체에 대해 상기 기재된 분자적 방법을 사용하여 클로닝 및 발현되었다.
선택된 인간 수용체 가변 영역에 대한 유전적 조성은 바로 아래의 표 6에서 각각의 인간화 항체에 대해 나타낸다. 표 6에 나타낸 서열은 서열번호 389 및 391(hSC16.13), 서열번호 393 및 935(hSC16.15), 서열번호 397 및 399(hSC16.25), 서열번호 401 및 403(hSC16.34) 및 서열번호 405 및 407(hSC16.56)에 설명된 인접 가변 영역 서열에 상응한다. 표 6은 선택된 항체의 유리한 결합 특성을 유지하기 위해서 프레임워크 변화나 역돌연변이가 필요로 하지 않음을 보여준다.
프레임워크 영역에서 잔기가 변경되지는 않았지만, 인간화 클론 중 하나(hSC16.13)에서, 안정성 문제를 다루기 위해 돌연변이가 중쇄 CDR2에 도입되었다. 변경된 CDR과 항체의 결합 친화도는 상응하는 키메라 또는 뮤린 항체 중 어느 하나와 균등하였음을 보장하기 위해 평가되었다.
인간화 후에, 생성된 VL 및 VH 사슬 아미노산 서열은 뮤린 공여체 및 인간 수용체 경쇄 및 중쇄 가변 영역과 관련된 이들의 상동성을 결정하기 위해 분석되었다. 바로 아래의 표 7에서 보이는 결과는 인간화 구축물이 뮤린 공여체 서열보다는 인간 수용체 서열에 대해 더 높은 상동성을 일관되게 나타냈음을 보인다. 뮤린 경쇄 및 중쇄 가변 영역은, 인간화 항체 및 공여체 하이브리도마 단백질 서열의 상동성 (74%-83%)과 비교하여 인간 생식세포 유전자에 가장 가까운 매치에 대해 전체적으로 유사한 상동성 백분율 (85%-93%)을 나타낸다.
mAb | 인간에 대한 상동성 (CDR 수용체) |
뮤린 모체에 대한 상동성 (CDR 공여체) |
hSC16.13 HC hSC16.13 LC |
93% 87% |
81% 77% |
hSC16.15 HC hSC16.15 LC |
85% 85% |
83% 83% |
hSC16.25 HC hSC16.25 LC |
91% 85% |
83% 79% |
hSC16.34 HC hSC16.34 LC |
87% 85% |
79% 81% |
hSC16.56 HC hSC16.56 LC |
87% 87% |
74% 76% |
키메라 항체와 같이, 인간화 VL 및 VH 소화된 PCR 생성물을 정제하고, 카파 CL (서열번호 5) 인간 경쇄 불변 영역 발현 벡터 또는 IgG1 (서열번호 6) 인간 중쇄 불변 영역 발현 벡터에 각각 결찰시켰다. 발현에 이어, 각각의 유도된 인간화 구축물을, CDR 그래프팅 공정이 DLL3 단백질에 대한 그 겉보기 친화성을 눈에 띄게 변경하였는지를 결정하기 위해 표면 플라스몬 공명을 사용하여 분석하였다. 인간화 구축물은 뮤린 부모체 (또는 공여체) 중쇄 및 경쇄 가변 도메인 및 인간화 구축물 에서 사용된 것과 실질적으로 균등한 인간 불변 영역을 포함하는 키메라 항체와 비교되었다. 인간화 항-DLL3 항체는 키메라 부모 항체에 의해 나타낸 것들에 대략 필적할만한 결합 특징을 나타내었다 (데이터 미도시).
실시예 4
위치 특이적 항체의 생성
조작된 인간 IgG1/카파 항-DLL3 위치 특이적 항체는 천연 경쇄 (LC) 불변 영역 및 중쇄 (HC) 불변 영역을 포함해서 제조되었고, LC에서 시스테인 214 (C214)와 사슬간 이황화물 결합을 형성하는 HC의 상부 경첩 영역 내의 시스테인 220(C220)은 세린 (C220S)으로 치환되었다. 조립된 경우, HC 및 LC는 치료제와의 컨쥬게이션에 적합한 두 개의 자유 시스테인을 포함하는 항체를 형성한다. 별도로 명시되지 않는 한, 불변 영역 잔기의 모든 번호는 Kabat et al.에 설명된 바와 같이 EU 번호 부여 기법에 따른다.
조작된 항체는 다음과 같이 생성되었다. 전장 인간화 항-DLL3 항체 hSC16.56을 암호화하는 발현 벡터를 PCR 증폭 및 위치선택적(site directed) 돌연변이를 위한 주형으로 사용하였다. 위치선택적 돌연변이는 제조자의 지시사항에 따라 퀵 Quick-change® 시스템 (Agilent Technologies)을 사용하여 수행되었다.
hSC16.56의 돌연변이 C220S 중쇄를 암호화하는 벡터는 CHO-S 세포 내 천연 전장 카파 경쇄와 함께 형질감염되었고, 포유동물 일시 발현계를 사용해서 발현되었다. C220S 돌연변이를 포함하는 조작된 항-DLL3 위치 특이적 항체는 hSC16.56ssl (서열번호 8 및 9)로 명명되었다. 일단 발현되면, 조작된 항-DLL3 항체는 올바른 돌연변이가 생성되었는지 확인하기 위해 SDS-PAGE에 의해서 특징지어졌다. SDS-PAGE는 DTT (디티오트레이톨) 같은 환원제의 존재 및 부재에서 Life technologes의 예비-캐스트(pre-cast) 10% 트리스-글리신 미니 겔 상에서 수행되었다. 전기영동법에 따라서, 겔은 콜로이드성 쿠마씨(Coomassie) 용액으로 염색되었다. 환원조건 하에서, 자유 LC 및 자유 HC에 상응하는 두 개의 밴드가 관찰되었다 (데이터 미도시). 본 패턴은 환원조건 내에서 IgG 분자의 전형이다. 비환원조건 하에서, 밴드 패턴은 천연 IgG 분자와 상이하였으며, 이는 HC와 LC 사이의 이황화물 결합이 부재함을 나타낸다. HC-HC 이량체에 상응하는 약 98 kD의 밴드가 관찰되었다. 추가적으로, 자유 LC에 상응하는 희미한 밴드 및 LC-LC 이량체에 상응하는 약 48 kD의 우세한 밴드가 관찰되었다. 각 LC의 C-말단(C-terminus) 상 자유 시스테인으로 인해서 어느 정도 양의 LC-LC 종의 형성이 예상된다.
실시예 5
항-DLL3 항체의 도메인 및 에피토프 맵핑
개시된 항-DLL3 항체가 결합하는 에피토프를 특징짓고 위치시키기 위해서, 도메인 수준의 에피토프 맵핑은 Cochran et al., 2004(상기)에 기재된 프로토콜의 변형을 사용해서 수행되었다. 특정 아미노산 서열을 포함하는 DLL3의 개별 도메인을 효모 표면에 발현시키고, 각각의 항-DLL3 항체에 의한 결합을 유세포분석법을 통해 측정하였다.
효모 디스플레이 플라스미드 구축물은 하기 구축물의 발현을 위해 생성되었다: DLL3 세포 외 도메인(아미노산 27-466); N-말단 영역 및 DLL3의 EGF-유사 도메인 1에서 6까지(아미노산 220-466)에 융합된 DLL1 (아미노산 22-225)의 DSL 도메인으로 이루어진 DLL1-DLL3 키메라; N-말단 영역 및 DLL1의 EGF-유사 도메인 1에서 8까지(아미노산 222-518)에 융합된 DLL3 (아미노산 27-214)의 DSL 도메인으로 이루어진 DLL3-DLL1 키메라; EFG1(아미노산 215-249); EGF2(아미노산 274-310); EGF1 및 EGF2(아미노산 215-310); EGF3(아미노산 312-351); EGF4(아미노산 353-389); EGF5(아미노산 391-427); 및 EGF6(아미노산 429-465). 도메인 정보는 일반적으로 UniProtKB/Swiss-Prot 데이터베이스 항목 Q9NYJ7를 참조한다. 아미노산 넘버링은 서열번호 1에 기재된 서열 세트에 포함된 리더 서열과 미가공된 DLL3 단백질을 참조한다. N-말단 영역 또는 EGF 도메인 전체의 분석을 위해, 가족 구성원 DLL1 (DLL1-DLL3 및 DLL3-DLL)을 지닌 키메라는 단백질 접힘의 잠재적 문제를 최소화하기 위한 단편과 반대로 사용하였다. 도메인 맵핑된 항체는 DLL1과 이전에 교차 반응하지 않았음을 보여주며, 이는 이 구축물과의 임의의 결합이 구축물의 DLL3 부분과 연결을 통해 발생하였음을 나타낸다. 이들 플라스미드를 Cochran et al.에 기술된 대로 성장 및 유도된 효모로 형질전환시켰다.
특정 구축물에 대한 결합을 시험하기 위해서, 원하는 구축물을 발현하는 200,000 개의 유도된 효모 세포는 PBS + 1 mg/mL BSA (PBSA) 내에서 2 회 세척되었고, 0.1 ㎍/mL에 비오티닐화된 항-HA 클론 3F10 (Roche Diagnostics) 50 ㎕의 PBSA및 50 nM의 정제된 항체 또는 7 일간 배양된 하이브리도마로부터 1:2 비율로 희석된 비정제 상층액 내에 인큐베이션되었다. 세포는 90 분동안 얼음 위에서 인큐베이션된 후, PBSA에서 2 회 세척되었다. 이후, 세포는 적절한 2차 항체를 지닌 50 ㎕ PBSA에서 인큐베이션되었다: 뮤린 항체에 대해서는 알렉사(Alexa) 488 컨쥬게이트된 스트렙트아비딘 및 알렉사 647 컨쥬게이트된 염소 항 마우스 (Life Technologies)가 각각 1 ㎍/mL 첨가되었고; 및 인간 또는 키메라 항체에 대해서는 알렉사 647 컨쥬게이트된 스트렙트아비딘 (Life Technologies) 및 R-파이코에리트린 컨쥬게이트된 염소 항 인간 (Jackson Immunoresearch)이 각각 1 ㎍/mL 첨가되었다. 얼음 위에서 20 분간 인큐베이션한 후, 세포를 PBSA로 2 회 세척하고, FACS 칸토 (Canto) II 상에서 분석하였다. DLL3-DLL1 키메라에 결합된 항체들은 N-말단 부위 + DSL에 대한 결합으로 지정되었다. 특정 EGF-유사 도메인에 존재하는 에피토프에 특이적으로 결합되는 항체는 각각의 도메인에 대한 결합으로 지정되었다 (도 2).
에피토프를 입체배좌형 (예를 들어, 비연속성) 또는 선형으로 분류하기 위하여, DLL3 ECD를 디스플레이하는 효모를 80℃에서 30 분 동안 열처리하여 DLL3 ECD를 변성시킨 후, 빙냉된 PBSA 내에서 2 회 세척하였다. 변성된 효모에 결합하는 항-DLL3 항체의 능력은 상기와 기재된 바와 같은 동일한 염색 프로토콜을 사용하여 FACS에 의해 시험하였다. 변성된 효모와 천연 효모 양쪽 모두에 결합하는 항체는 선형 에피토프에 대한 결합으로 분류된 반면, 변성된 효모에는 결합하지 않고 천연 효모에만 결합하는 항체는 입체배좌 특이적으로 분류되었다.
시험된 항체의 도메인 수준 에피토프 맵핑 데이터의 도해된 요약을 도 2에 나타내며, 선형 에피토프에 결합하는 항체는 밑줄 처리하고, 결정된 경우 상응하는 빈은 괄호 안에 표기하여 나타낸다. 도 2의 검토는 DLL3의 N-말단/DSL 영역 또는 EGF2 중 어느 하나에서 발견되는 대부분의 항-DLL3 항체들이 에피토프를 맵핑하는 경향이 있음을 보여준다. 도 2는 다양한 항-DLL3 항체의 빈 결정 및 도메인 맵핑에 대한 유사한 데이터를 표 형식으로 나타낸다.
선택된 항체에 대해 2 가지 중 하나의 방법을 사용하여 추가적으로 미세 에피토프 맵핑을 수행하였다. 첫 번째 방법은, 제조자 지시사항에 따라 사용된 Ph.D-12 파지 디스플레이 펩타이드 라이브러리 키트 (New England Biolabs)를 사용하였다. 에피토프 맵핑을 위한 항체는 NuncMaxiSorp튜브 (Nunc) 상에 3mL의 0.1M 중탄산 나트륨 용액 내에서, pH 8에서 50 ㎍/mL로 하룻밤 동안 코팅되었다. 튜브는 중탄산 용액 내에서 3% BSA 용액으로 차단되었다. 이후, PBS + 0.1% Tween-20 내의 1011 입력 파지가 결합되고, 비결합 파지를 씻어내기 위해 0.1% Tween-20으로 연이어 10 회 세척되었다. 잔여 파지는 1mL의 0.2M 글리신을 이용하여 실온에서 약하게 교반하며 10 분 동안 용리시켰고, 이어서 150 ㎕의 1M Tris-HCI pH 9를 이용하여 중성화하였다. 용리된 파지는 증폭되었고, 선택의 엄격성을 증가시키기 위해 세척 단계 중에 0.5% Tween-20을 이용하여 1011의 입력 파지와 함께 재전개 되었다. Qiaprep M13 스핀 키트 (Qiagen)를 사용하여 2 라운드에서 용리된 파지의 24 개의 플라크로부터 DNA를 분리 및 서열분석하였다. 클론성 파지의 결합은, 맵핑된 항체 또는 대조구 항체가 ELISA 플레이트 위에서 코팅, 차단 및 각각의 파지 클론에 노출되는 ELISA 분석을 사용하여 확인되었다. 파지 결합은 고추냉이 퍼옥시다제 컨쥬게이트된 항-M13 항체 (GE Healthcare), 및 제 1-Step TurboTMBELISA 용액 (Pierce)를 사용하여 검출되었다. 특히 결합 파지로부터 나온 파지 펩타이드 서열은 결합의 에피토프를 결정하기 위하여 항원 ECD 펩타이드 서열에 대항하여 Vector NTI (Life Technologies)를 이용하여 정렬되었다.
대안적으로, 선택된 항체의 에피토프를 맵핑하기 위해 효모 디스플레이 방법 (Chao et al., 2007, PMID: 17406305)이 사용되었다. DLL3 ECD 돌연변이의 라이브러리는 클론 당 하나의 아미노산 돌연변이의 표적 돌연변이유발 비율에 대하여 뉴클레오티드 유사체 8-옥소-2'데옥시구아노신-5'-삼인산염 및 2'-데옥시-p-뉴클레오시드-5'-삼인산염 (TriLink Bio)을 사용하여 오류 발생이 쉬운 PCR로 생성되었다. 이들은 효모 디스플레이 형식으로 형질변형되었다. 도메인 수준 맵핑에 대해 상기기재된 기술을 사용하여, 라이브러리는 50 nM에서 HA와 항체의 결합에 대해 염색되었다. FACS Aria (BD)를 사용하여, 야생형 DLL3 ECD에 비교해서 결합의 손실을 나타내는 클론은 분류되었다. 이들 클론들을 재성장시키고, 표적 항체에 대한 결합의 손실에 대한 FACS 분류의 다른 라운드의 대상이 되었다. Zymoprep Yeast Plasmid Miniprep 키트 (Zymo Research)를 이용하여, 각각의 ECD 클론을 분리하고 서열화하였다. 필요한 경우, 돌연변이는 Quikchange위치선택적 돌연변이 키트 (Agilent)를 사용하여 단일 돌연변이 ECD 클론으로 재포맷하였다.
개별적인 ECD 클론은 이어서 결합의 손실이 에피토프에서의 돌연변이, 또는 미스폴딩(misfolding)을 야기한 돌연변이 때문인지의 여부를 확인하기 위해 스크리닝되었다. 시스테인, 프롤린, 및 종결 코돈을 포함한 돌연변이는 미스폴딩 돌연변이의 높은 가능성 때문에 자동적으로 폐기되었다. 그 다음 잔여 ECD 클론은 비경쟁, 입체배좌 특이적 항체에 결합을 위해 스크리닝되었다. 비경쟁, 입체배좌 특이적 항체에 결합하지 못한 ECD 클론은 미스폴딩 돌연변이를 함유하는 것으로 나타난 반면, 야생형 DLL3 ECD에 균등한 결합을 유지한 ECD 클론은 적절하게 접힌 결과를 나타냈다. 후자에 속하는 ECD 클론에서의 돌연변이들은 에피토프에 속하는 것으로 결정되었다.
선택된 항체와 항체 결합에 관련된 아미노산 잔기를 포함하는 그의 유도된 에피토프의 요약이 아래 표 8에 열거된다. 항체 SC16.34 및 SC16.56은 도 2에 나타낸 비닝 정보 및 도메인 맵핑 결과와 일치하는 일반적인 아미노산 잔기와 상호작용한다. 나아가, SC16.23은 구별된 인접 에피토프와 상호작용하는 것으로 발견되었으며, SC16.34 또는 SC16.56과는 비닝하지 않는 것으로 발견되었다. 첨부된 서열 목록의 목적을 위해, 서열번호 4 위치 204에서 자리표시자(placeholder) 아미노산을 포함함에 유의한다.
항체 클론 | 에피토프 | 서열번호: |
SC16.23 | Q93, P94, G95, A96, P97 | 3 |
SC16.34 | G203, R205, P206 | 4 |
SC16.56 | G203, R205, P206 | 4 |
실시예 6
항-DLL3의 컨쥬게이션
피롤로벤조디아제핀(PBD)에 대한 항체
인간화 항-DLL3 항체(hSC16.56) 및 인간화 위치 특이적 항-DLL3 항체(hSC16.56ss1)는 hSC16.56DL1 및 hSC16.56ss1DL6으로 명명된 ADC를 생성하기 위해 자유 설프하이드릴 기를 갖는 말단 말레이미도 모이어티를 통해 피롤로벤조디아제핀 약물 링커 (각각 DL1 및 DL6, 그 각각은 PBD1을 포함)에 컨쥬게이트되었다. hSC16.56PDL1 (즉, SC16LD6.5) 및 hSC16.56ss1DL6은 임상 시험에 사용하기 위한 의도로서 GMP 조건 하에서 제조되었다.
인간화 DLL3 (hSC16.56) 항체 약물 컨쥬게이트 (ADC)는 두 개의 다른 단계; 환원 단계 및 PBD1 (DL1)을 hSC16.56에 컨쥬게이트시키기 위한 컨쥬게이션 단계로 제조되었다. ADC는 양이온 교환 (CEX) 크로마토그래피를 통해 처리되었고, 이어서 약물 물질을 생산하기 위한 정용 여과(diafiltration) 및 조제 단계가 뒤따랐다. 해당 과정은 하기에 상세히 기재되어 있다.
항체는 200 mM의 트리스(Tris) 염기, 32 mM EDTA pH 8.5의 첨가로 pH 7.5로 조정되었다. pH 조절된 DLL3 항체의 시스테인 결합은, 항체 1 몰 당 20℃에서 90 분 동안 트리스(2-카르복시에틸)-포스핀 (TCEP)의 예정된 몰 양의 추가를 이용하여 부분적으로 환원되었다. 결과의 부분적으로 환원된 제제는 이어서 말레이미드 링커를 통해 20℃에서 최소 30 분 동안 PBD1에 (상기 설명된 바와 같이) 접합시켰다. 이후, 반응은 물에서 제조된 10 mM 저장 용액을 사용한 링커 약물에 비교해 과도한 N-아세틸 시스테인 (NAC) 첨가로 급냉되었다. 20 분의 최소 급냉 시간 후, 0.5 M 아세트산을 첨가하여 pH를 5.5로 조정하였다. ADC의 제조는 컨쥬게이션 단계 동안 형성된 응집물을 제거하기 위한 단계 용리를 이용하여 결합 및 용리 모드에서 양이온 교환 (CEX) 크로마토그래피를 통해 진행되었다. 이어서 CEX 정제 ADC는 30 kDa 막을 사용하여 정용 여과에 의해 정용 여과 완충제로 완충제가 교환되었다. 정용 여과된 항-DLL3 ADC는 수크로스 및 폴리소르베이트-20을 이용하여 표적 최종 농도로 제형화하여 약물 물질을 생성하였다.
위치 특이적 인간화 항-DLL3 (hSC16.56ss1) ADC는 변경된 부분 환원 과정을 사용하여 DL6에 컨쥬게이트되었다. 이러한 관점에서, 의도된 생산물은 각각의 LC 불변 영역에 짝 짓지 않은 시스테인 (C214)에 최대한으로 컨쥬게이트되고, 2를 초과하는 (DAR>2) 약물 대 항체 비율 (DAR)을 가진 ADC를 최소화하는 한편 2의 DAR (DAR=2)을 가진 ADC를 최대화하는 ADC이다. 컨쥬게이션의 특이성을 더 개선하기 위해, 항체는 링커-약물과의 컨쥬게이션에 앞서 안정화제 (예를 들어, L-아르기닌) 및 약한 환원제 (예를 들어, 글루타티온)을 포함한 공정을 이용해 선택적으로 환원되었다. 그 후, ADC는 분취용 소수성 상호작용 크로마토그래피 (HIC)를 통해 가공되었고, 약물 물질을 생성하기 위한 정용 여과 및 조제 단계가 이어졌다. 해당 공정은 아래에 상세하게 기재된다.
위치 특이적 항체 구축물은 실온에서 최소 2 시간 동안 선결된 농도의 환원된 글루타티온 (GSH), pH 8.0을 갖는 1 M L-아르기닌/5 mM EDTA를 함유한 완충제 내에서 부분적으로 환원되었다. 그 후 모든 제제는 환원 완충제를 제거하기 위해 30 kDa 막을 사용하여 20 mM Tris/3.2 mM EDTA, pH 7.0 완충제로 완충제를 교환하였다. 이어서 결과의 부분적으로 환원된 생성물은 20℃에서 최소 30 분 동안 말레이미드 링커를 통해 PBD1 (상기 설명된 바와 같은 DL6)에 컨쥬게이션되었다. 해당 반응은 그 후 물에서 제조된 10 mM 저장 용액을 사용한 링커 약물에 비교해 과도한 NAC 첨가로 급냉되었다. 최소 20 분 동안 급냉시킨 후, pH는 0.5 M 아세트산의 첨가로 6.0으로 조정되었다. 이후 pH 조절된 ADC는 DAR 2 종을 추가로 정제하기 위한 단계 용리를 이용하여 결합 및 용리 모드에서 분취용 소수성 상호작용 크로마토그래피 (HIC) (부틸세파로스 FF)를 통해 가공되었다. 정제된 ADC는 이후 30 kDa 막을 사용한 정용 여과 작용에 의해 정용 여과 완충제로 완충제가 교환되었다. 정용 여과된 항-DLL3 ADC는 이후 수크로스 및 폴리소르베이트-20으로 표적 최종 농도로 조제되어 위치 특이적 약물 물질을 생성하였다.
실시예 7
면역조직화학
면역조직화학(IHC)은 종양 세포 내 DLL3의 발현 및 위치를 평가하기 위해 1차 인간 종양 조직 부위에 수행되었다.
IHC 상용성 항-DLL3 항체를 동정하기 위해서, IHC는 본 발명의 수 많은 항-DLL3 항체를 사용하여 HEK293T 부모 세포 펠렛 또는 DLL3-발현 HEK293T 세포 펠렛 상에서 수행되었다. 몇몇 뮤린 항-DLL3 (SC16.65를 포함하는) 항체는, 시험된 (데이터 미도시) 본 발명의 다른 항-DLL3 항체보다 특히 DLL3-과발현 HEK293T 세포 펠렛을 더욱 효과적으로 검출할 수 있었다. 이들 항체들의 DLL3를 특이적으로 검출하는 능력은, 관련된 항-DLL3 항체를 5× 몰 비율 과량의 hDLL3-His 단백질과 혼합하고, 이어서 DLL3-발현 HEK293T 포르말린 고정 및 파라핀 매립 (FFPE) 부분과 함께 인큐베이션한 경쟁 실험에 의해 확인되었다. 양성 염색의 부재는 hDLL3-His 단백질이 항-DLL3 항체의 DLL3-과발현 HEK293T 세포에 결합하는 것을 방해하였음을 증명하였다 (데이터 미도시).
IHC는 아래 기재된 바와 같이 당 기술분야의 표준에서와 같이 포르말린 고정 및 파라핀 매립 (FFPE)된 조직 상에 수행되었다. 조직의 평면 부분을 잘라 유리 현미경 슬라이드에 올려놓았다. 자일렌 파라핀제거 후, 5 ㎛ 부분을 항원 회수 약물 (Antigen Retrieval Solution)(Dako)을 이용하여 99℃에서 20 분 동안 예비처리하고, 75℃로 냉각시킨 후, PBS 내에서 0.3%의 과산화수소로, 이어서 아비딘/비오틴 차단 용액 (Vector Laboratories)으로 처리되었다. 그 후, FFPE 슬라이드를 PBS 완충액 내 3 % BSA 내 10 % 말 혈청으로 차단시키고, 3% BSA/PBS 내 10 ㎍/ml으로 희석된 본 발명의 주요 항-DLL3 항체와 함께 실온에서 30 분 동안 인큐베이션하였다. 이어서, FFPE 슬라이드를 3 % BSA/PBS 내 2.5 ㎍/ml로 희석된 비오틴-컨쥬게이트된 말 항-마우스 항체 (Vector Laboratories)와 함께 실온에서 30 분 동안 인큐베이션하고, 스트렙트아비딘-HRP (ABC Elite 키트; Vector Laboratories) 내에서 인큐베이션하였다. 주요 인간 종양의 FFPE 슬라이드는 비오티닐 티라미드 내에서 인큐베이션된 후, TSA 증폭 키트 (Perkin Elmer) 제조자의 지시사항에 따라 스트렙트아비딘-HRP 내에서 인큐베이션하였다. 발색 검출은 3,3'-다이아미노벤지딘 (Thermo Scientific)을 이용하여 5 분 동안 실온에서 전개되었고, 조직은 마이어 헤마톡실린 (Meyer's hematoxylin) (IHC World)으로 대조염색되고, 알코올로 세척되었으며, 자일렌에 침지시켰다. PDX 종양은 TSA 증폭을 받지 않았다. 절단 부분은 명시야 현미경으로 관찰되었고, 종양 상피 상 DLL3 막 발현은 H-스코어로 표시되었다. H-스코어는 다음 공식에 의해 수득되었다: 0 에서 300 까지의 주어진 범위 내에서, 3×강하게 염색된 막 표면의 백분율 + 2×적절히 염색된 막 표면의 백분율 + 약하게 염색된 막 표면의 백분율. 연구 결과는 도 3a 및 도 3b에 나타낸다.
도 3a 및 도 3b는 DLL3 단백질의 발현 대 전체 생존율(overall survival;OS)및 제한된 SCLC 종양 대 광범위 SCLC 종양 (도 3a) 또는 나이브(naive)하고 화학요법 불응성인 SCLC 종양을 도표로 나타낸다. 도 3a의 시험은 DLL3 발현이 (선행 기술의 표준 치료제로 치료된 환자에서) 전체 생존율의 표시는 아님을 보여주며, 제한된 SCLC 종양 및 광범위 SCLC 종양 모두가 다양한 수준의 DLL3를 발현함을 보여준다. DLL3의 발현이 환자의 생존과 반비례하는 흑색종과는 달리, 신경 내분비적 특징을 나타내는 종양에서 DLL3 발현은 표준 케어 치료법과 관련하여 사망률을 나타내지 않는 것으로 보인다. 유사하게, 도 3b는 DLL3 발현 수준이 나이브하고 표준 케어 치료된 종양에서와 대략적으로 동일하다는 것을 증명한다. 도 3b는 나아가 300 점 척도에서 경험적으로 유도된 DLL3의 H-스코어 약 90 점 (점선) 및 180 점 (실선)을 나타낸다. 90 내지 180 사이의 다른 DLL3 H-스코어 (예를 들어, 120) 또한 유도되었다 (미도시). 이러한 H-스코어는 실시예 8에 기재된 제 I상 실험에 따라 시험되고, 본 발명의 DLL3 ADC로 치료하여 양호한 반응을 나타낼 수 있는 환자를 나타내는 것으로 발견되었다. 따라서, 일 구현예에서, 본 발명의 DLL3 ADC로 처리될 환자는 적어도 90의 DLL3 H-스코어를 가질 것이다. 다른 구현예에서, 본 발명의 DLL3 ADC로 치료될 환자는 적어도 120의 DLL3 H-스코어를 가질 것이다. 또다른 구현예에서, 본 발명의 DLL3 ADC로 치료될 환자는 적어도 150의 DLL3 H-스코어를 가질 것이며, 더욱 바람직하게는 적어도 180의 DLL3 H-스코어를 가질 것이다. 본 개시 내용의 목적을 위해, 90 이상의 DLL3 H-스코어를 나타내는 (또는, 상기 기재된 바와 같이 구성세포의 10 % 이상이 DLL3를 발현하는) 임의의 종양은 DLL3+로 간주되며 개시된 화합물 및 조성물로 잠재적으로 치료가능한 것으로 간주될 것이다.
다른 연구에서는 200 점 척도의 H-스코어 또한 개발되었음에 유의한다. 이러한 200 점 척도에서, 120 점의 H-스코어는 300 점의 H-스코어 척도에서 180 점의 H-스코어와 거의 균등하다. 두 경우 모두에서 (예를 들어, 120/200 또는 180/300), 이러한 H-스코어는 바이오마커 양성 (BM+) 또는 DLL3+ (즉, 상기의 두 경우 모두 300 점 척도에서 90 점 초과의 H-스코어 및/또는 10 % 이상의 구성세포가 DLL3를 발현)로 분류될 수 있고, 본 발명의 치료 방법에 양호하게 반응할 수 있는 환자를 암시한다.
실시예 8
SC16.56PBD1(SC16LD6.5) 연구 요약 및 결과
제I 상의 임상 연구는 소세포 폐암 (SCLC) 및 대세포 신경내분비 암종 (LCNEC) 재발 환자를 치료하기 위한 개시된 DLL3 표적된 ADC의 사용 가능성을 탐구하고자 수행되었다. 본 임상 시험의 요약은 도 4A에 제공된다.
배경: 로발피투주맙 테시린 (즉, 본원에 기재된 Rova-T, SC16LD6.5, hSC16.56PBD1 또는 hSC16.56DL1)은 인간화 모노클로날 항체, 디펩티드 링커, 및 2의 약물 대 항체 비율을 갖는 피롤로벤조디아제핀 (PBD) 이량체 독소로 구성된 델타-유사 단백질 3 (DLL3) 표적된 항체 약물 컨쥬게이트 (ADC)이다. SC16LD6.5는 실시예 6에 설명된 바와 같이 GMP 조건 하에 실질적으로 조제될 수 있다. DLL3는 인간 신경내분비 종양 및 약 2/3의 SCLC 및 LCNEC 종양을 포함하는 그 종양 개시 세포 내에서 높게 발현된다. DLL3 단백질은 일반 조직 내 탐지 가능한 수준에서는 발현되지 않는다. 로발피투주맙 테시린은 DLL3-발현 SCLC 및 LCNEC 환자-유도된 이종 이식 (PDX) 종양 모델에서 시스플라틴/에토포시드를 현저히 능가하는 종양 퇴화 및 진행 지연 시간을 유도했다. 이러한 유망한 활성에 기초하여, SCLC 재발 환자에서 사람을 대상으로 하는 제I상 임상시험 (NCT01901653)이 개시되었고, 초기 결과는 하기에 보고되어 있다.
방법: 앞선 제1선 또는 제2선 치료 후 진행성 질환을 지닌 SCLC 환자는 (즉, 제2선 또는 제3선 환자) 도스 제한 독성(DLT)을 보일 때까지 3 주 마다 1 회(Q3W) 1-3 pt 코호트(cohort)에서 단일 작용제로 증가되는 도스의 로발피투주맙 테시린을 받았다. 그 도스는 0.05, 0.1, 0.2, 0.4 및 0.8 mg/kg Q3W였다. 발생을 거쳐 중기까지, 약동학적 데이터 (도 4b 및 하기 실시예 9에 더욱 상세히 기재됨)는 Q6W 일정의 평가를 촉진시키며 예상했던 ~11 일의 ADC 반감기보다 더 긴 것으로 드러났다. 이전의 실시예에 기재된 바와 같이, DLL3 항체는 보존된 종양 표본 내 항원 발현을 평가하기 위해 개발 및 활용되었다. 본 연구의 목적을 위해, 바이오마커 양성 (BM+) 종양들은 120 이상의 IHC 세포막 연관 H-스코어 (200 점 H-스코어 척도) 의해 정의되었다.
결과: 79 명의 환자가 처리되었다: 34 Q3W 및 45 Q6W; 33F/46M; 평균 연령 61 세 (44-81). 혈소판감소증 및 장막 누출의 급성 및 만성 DLT는 (제I상 시험에서 조사자들의 실수로 모세관 누수 증후군 "CLS"로 지목한 전문가를 포함한 데이터 모니터링 위원회에 따라서) 각각 0.8 및 0.4 mg/kg Q3W에서 관찰되었다. 0.2 mg/kg Q3Wx3 사이클 및 0.3 mg/kg Q6Wx2 사이클의 최대 허용 도스 (MTD)는 확장 코호트에서 추가로 평가되었다. 모든 환자들 중 임의의 단계에서 가장 흔한 (20% 이상) 치료 유발 AE는 피로 (47%), 호흡곤란 (24%), 메스꺼움 (24%), 및 식욕 부진 (22%)이었다. 가장 흔한 연관된 치료 유발 SAE는 11 명 (14%) 및 3 명 (4%)의 환자에게서 각각 보고된 장막 누출 및 혈소판 감소였다 (도 4f).
등록 환자로부터 접수된 49 개의 종양 종류 중에서, 34 개 (69%)는 DLL3 BM+였다. 27 명의 확인된 DLL3 BM+ 환자는 MTD로 치료되었고, 11 명 (41%)의 환자는 부분적 반응 (PR)을 가졌으며, 12 명 (44%)의 환자는 85%의 조합된 임상적 이익률 (CBR)에 대해 안정된 질병 (SD)을 달성했다 (도 4e). DLL3 바이오마커 상태에 관계없이 MTD로 처리된 모든 평가 가능한 환자들 (n=59)에서, 80%의 CBR에 대해 (도 4d) ORR 20% (n=12PR) 및 SD 59% (n=35)였다. 특히, MTD로 치료된 PR을 갖는 모든 환자 및 가장 내구적인 임상적 이점 (569 일 OS까지)을 갖는 것들은 BM+였다. 유사한 반응 비율은 제1선 치료법에 대해 민감하고 불응성이며, 현재 존재하는 표준 케어가 없는 제3선에 놓여있는 환자들 중에서 관찰되었다.
흥미롭게도, ADC에 대한 유사한 전반적 노출에도 불구하고, 0.3 mg/kg Q6W×2는 0.2 mg/kg Q3W×3 코호트 (도 4c)에 비교해서 평균적으로 각각 175 일 초과 대 88 일로 우수한 반응 지속기간을 보였다. 도 4c는 나아가 동일한 0.3 mg/kg Q6W×2 코호트가 0.2 mg/kg Q3W×3 코호트보다 더 나은 평균 OS를 가졌음을 보여준다.
결론: 최초의 DLL3-표적 ADC, 로발피투주맙 테시린 (Rova-T)는 다룰 수 있는 독성을 지니고, 제2선 및 제3선 DLL3 BM+ SCLC 재발 환자들에게서 단일 작용제로서 유의한 항-종양 활성 (41% ORR 및 80% CBR)을 증명하였다.
실시예 9
SC16.56PBD1(SC16LD6.5) 약동학
이전의 실시예에서 시사된 바와 같이, SC16LD6.5의 약동학 (PK)은 상기 기재된 제1a/1b상 임상 시험에서 평가되었다. SCLC 또는 LCNEC 환자에게 이미 특정된 도스의 SC16LD6.5 투여 후에 사람 혈청 내 SC16LD6.5의 농도가 평가되었다. 혈청 수준에 대한 혈액 샘플은 연구에 참여한 모든 대상체로부터 SC16LD6.5의 첫 복용 직전 및 1 일째 (1일 째는 투여일임)에 여러 번 수집되었다. 혈청 측정을 위한 추가 혈액은 사이클 1의 2, 3, 5, 8, 및 15일에 한 번씩 채혈하였다. 사이클 2 및 3에서, 혈액은 1 일 째의 투여 직전 (트로프) 및 직후 (피크)에 채혈하였다. 예상된 정상-상태 또는 근사치 (사이클 4)에서, 추가적인 샘플은 1, 8 및 15 일에 수집되었다. 채혈 후, 검체를 혈청으로 처리하고 동결하였다.
SC16LD6.5의 혈청 농도는 중간규모 발견 (MSD) 플랫폼 상 화학 발광 탐지를 이용한 효소결합 면역흡착 측정법 (ELISA)에서 측정되었다. 이 분석은 한 쌍의 하나 이상의 컨쥬게이트된 독소로 특히 SC16LD6.5를 포착 및 검출하는 항-특발성 항체를 사용하였다. 이 분석은 SC16LD6.5 상의 수많은 독소 컨쥬게이트를 구분할 수 없다. 농도-시간 프로파일을 이 측정된 농도들에 기반하여 생성하였다(도 4b).
SC16LD6.5의 혈청 농도에 기반하여, SC16LD6.5의 PK는 소프트웨어 패키지 Phoenix WinNonlin을 이용하여 비분할분석에 의해 추정되었다. PK는 노출 내에서 선형 도스-비례 증가를 보였다. 최종 속도 계수 (람다)를 결정하기 위하여, 최종 반감기는 농도-시간 프로파일의 최종 상 로그-선형 회귀에 의해 추정되었다. 자연 로그 2의 값과 람다는 최종 반감기를 추정하기 위해 계산되었다. SC16LD6.5의 최종 반감기는 SC16LD6.5를 3 주마다 0.2 mg/kg 투여 후 약 10.1 일 및 SC16LD6.5를 6 주마다 0.3 mg/kg 투여 후 약 12.1 일로 추정되었다. 이 추정 반감기는 브렌툭시맙 베도틴 및 아도-트랜스투주맙 엠탄신과 같은 다른 항-약물 컨쥬게이트의 추정 반감기를 초과한다. 이러한 예기치못한 긴 반감기는 새로운 투약 방식 (예를 들어, 0.2 mg/kg Q3W×3 및 0.3 mg/kg Q6W×2)을 이용한 견고한 치료 지수의 달성을 허용한다.
실시예 10
항-DLL3 ADC 동결 건조
장기 저장 및 후속 상업 활동을 위한 옵션을 제공하기 위해, 본 발명의 예시적인 DLL3-ADC는 동결건조되었다. 약학적으로 상용 가능한 바이알에 보관된 동결건조된 샘플은 이후 PBD를 포함하는 ADC에 대한 기술의 적용 가능성을 판단하기 위하여 안정성 연구를 수행하는 데 사용되었다. PBD 약물 링커 컨쥬게이트가 크고 비교적 소수성이기 때문에, 장기간 안정성을 나타내는 이러한 동결건조된 조성물을 제공할 가능성은 불분명하였다.
본 연구를 위해, SC16LD6.5 항-약물 컨쥬게이트 제제 (상기 실시예 6에서 실질적으로 제조됨)를 10 mg/mL SC16LD6.5, 175 mM 수크로스, 20mM L-히스티딘 염산염 (pH 6.0), 및 0.4 mg/mL 폴리소르베이트 20으로 조제하였다. 이러한 예시적인 제형은 동결된 액체로서 제I/II상 임상 실험을 위해 의도된 영하 70℃ 미만의 조건에서 장기 보관에 적합하고, 적절한 조건 하에서 동결건조된 형태로 잠재적으로 안정된 것으로 선택되었다. 동일한 제제를 사용하여 냉장 조건 (2-8℃) 하에 보관하기 위해 의도된 동결건조된 제형 (30 mg/바이알, 10 mL 유리 바이알 내 약 3 mL)은 추후 임상 실험 및 잠재적인 상업적 이용을 위해 개발되었다.
동결 건조 공정 및 조건은 개발 규모의 동결건조기를 사용하여 유도되었다. 본 공정은 다음의 단계: 동결 램프(ramp), 동결 유지, 1차 건조, 및 2차 건조를 포함한다. 본 공정을 사용하여, 임상 재료의 생산용 장비 내에서 한 배치의 동결 건조 바이알이 제조되었다. 동결 건조 후, 분말화된 DLL3-ADC를 포함하는 마개가 있는 바이알은 장기간 동안 다른 온도 (5℃, 25℃ 및 40℃)에 저장되었다. 예정된 시기에, 선택된 바이알은 재구성되었으며, 결과의 제제를 출발 제제로부터 임의의 재료 편차에 대해 분석하였다. 6 개월까지의 시점에 대한 분석의 결과를 도 5a 내지 도 5c에 나타낸다.
데이터를 검토한 결과, 동결건조된 ADC는 선택된 온도 어디에서도 거의 열화되지 않음이 증명된다. 따라서, 개발 규모로 생성된 동결건조된 바이알은 실시간, 스트레스, 및 가속 저장 조건 하에서 안정한 것으로 증명되었다.
실시예 11
항-DLL3 ADC와 항-PD-1 항체의 조합
생체 내 소세포폐암 종양 성장 억제
상기 논의된 바와 같이, 본 발명의 DLL3 ADC는 다양한 DLL3 발현 종양을 효과적으로 치료하기 위해 항-PD-1 항체와 조합될 수 있다. 본 발명의 치료능을 증명하기 위해서, hSC16.56DL1 (Rova-T)은 PD-1과 그 리간드 PDL1의 상호작용을 억제하는 항-PD-1 항체와의 조합으로 소세포폐암 (SCLC)의 동질유전자적 생체 내 모델 내에서 시험되었다.
Rova-T는 본 출원에서 증명되는 바와 같이, 임상 환경에서 SCLC에 대한 활성을 나타내는 DLL3-특이적 항체-약물 컨쥬게이트이다. 활성 T 세포에서 주로 발현하는 PD-1과 그 리간드 PD-L1 및 PD-L2의 상호작용을 차단하는 PD-1에 대항하는 항체는 여러 암 징후에서 임상적 유용성을 보였다. 현재, 항-PD-1 항체 약물 Opdivo® (니볼루맙) 및 Keytruda® (펨브롤리주맙)은 흑색종, 비소세포폐암 (NSCLC), 두경부 편평세포암종 및 호지킨 림프종의 특정 환자의 사용을 위해 승인되었으며, 또한 SCLC 환자의 하위 집합에서의 일부 활성이 증명되어 왔다. Rova-T 및 항 PD-1 항체가 조합되어 사용될 경우 억제성, 중성, 부가성 또는 상승효과를 갖는지를 판단하기 위해서, 단일 작용제로서 및 조합으로서의 이들의 활성은 SCLC의 동물 모델에서 시험되었다.
항-PD-1 항체의 작용의 메커니즘은 면역적격 숙주를 필요로 하기 때문에, DLL3 발현 마우스 세포주 KP1이 면역 상용성 동질유전자적 마우스와 결합하여 사용되었다. KP1 세포주는 RB1 및 TP53 유전자를 갖지 않은 마우스의 폐에서 발견되는 자발적인 소세포 폐암 종양 (PMID: 2193857)에서 유도되었다. Rova-T는 필적할만한 친화도 및 DLL3 발현 세포에 대한 시험관 내 세포 독성 활성을 갖는 인간 및 뮤린 DLL3 단백질과 결합할 수 있기 때문에, 약물이 마우스 모델에 사용될 수 있다. 그러나, 니볼루맙과 펨브롤리주맙이 뮤린 PD-1과 상호작용하는 데 충분하지 않기 때문에, 항-마우스 PD-1 대리 항체 클론이 선택되었다. 이와 관련하여, BioLegend (San Diego, USA)의 항-마우스 PD-1 항체 클론 EH12.2H7은 임상 환경에서 사용된 항-인간 항체와 유사하게 PD-1과 PD-L1 사이의 상호작용을 억제하고, 그들의 T 세포 강화 및 항암 활성을 모방하는 것으로 나타났다.
KP1 세포는 B6129SF1/J 마우스 (The Jackson laboratory #101043, USA)의 옆구리에서 피하 종양으로서 성장되었다. 종양의 부피는 주 2 회 캘리퍼스(calipers)로 측정되었다. 평균 종양 부피가 약 200 ㎣일 때, 마우스는 5 마리마다 코호트로 무작위로 선택되었다. 복강 내 주사로, 마우스는 SC16LD6.5 ("Rova-T", 치료 1 일째에만, 0.1 mg/kg) 또는 HuIgG1.DL1("HuIgG1.PBD",치료 1 일째에만, 0.5 mg/kg)로 치료되고, 동일한 마우스는 또한 항-마우스 PD-1 항체 ("항-PD-1", 치료 1, 3, 7 일째, 200 ug/마우스; BioLegend, USA) 또는 래트 IgG2a 항체 ("Rat IgG2a", 치료 1, 3, 7일 째, 200 ug/마우스; BioLegend, USA)로 치료되었다. 종양의 부피는 주 2 회 지속적으로 측정되었고, 마우스는 종양 부피가 1500 ㎣을 초과하면 안락사되었다. 연구 결과는 본원에 첨부된 도 6a 및 도 6b에 나타난다.
도 6a에 보여지는 바와 같이, 항-PD-1 항체와 HuIgG1.PBD대조구의조합은 KP1 종양 성장을 유의하게 억제하지 않는다. 유사하게 래트 IgG2a (항-PD-1에 대한 아이소타입 제어)와 HuIgG1.PBD대조구또는 Rova-T의 조합은 생체 내 KP1 종양의 성장을 상당한 시간 동안 실질적으로 억제하지 못하였다 (도 6a). 지연이 광범위하지는 않았던 한편, 본질적으로 단일 작용제로서 작용하는 이들 Rova-T 투약량에서는 종양 성장의 어느 정도의 억제가 명백히 나타나는 것으로 평가될 것이다.
마찬가지로, 도 6b에서 보여지는 바와 같이, 조합 대조구 치료 HuIgG1.PBD+래트 IgG2a 및 HuIgG1.PBD+항-PD-1은KP1 종양의 부피가 300 ㎣ 을 초과하여 성장하기 전의 시간을 실질적으로 연장하지 못하였다. 더욱이, 도 6b에 보여지는 투약량에서, Rova-T + 아이소타입 대조구 (래트 IgG2a) 조합은 HuIgG1.PBD를사용한치료에 비교해서 KP1 종양의 성장을 유의하게 억제하지 못한다. 본질적으로 유일 활성제로 작용하는 Rova-T(hSC16.56DL1)는 KP1 종양을 0.5 mg/kg (데이터 미도시)의 투약량으로 완전히 제거하는 한편, 이 종양 세포주에 대해서 상대적으로 낮은 0.1 mg/kg의 투약량은 거의 효과를 보이지 않는다.
대조구 조합과 대조적으로, Rova-T 및 항-PD-1 항체를 조합하여 이용한 치료는, 두 활성 작용제 중 하나만 사용한 치료에 비교하여 (도 6a 및 도 6b) 생체 내에서 KP1 종양 성장의 유의한 억제를 보였다. 도 6a 및 도 6b 모두에서 보여지는 바와 같이, 평균 종양 성장은 많이 지연되었다. 병용 대조구 치료군의 마우스는 모두 17 일 후 300 ㎣보다 큰 종양을 보인 반면, 병용 군의 마우스 중에서는 5 마리 중 2 마리(40%)만이 300 ㎣보다 큰 종양을 보였다 (도 6b). 유사하게, 도 6a는 Rova-T 및 항-PD-1 항체로 치료된 마우스에게서 평균 종양 부피가, Rova-T + 아이소타입 대조구로 치료된 마우스에 비해 두 배 이상의 기간 동안 1000 ㎣ 미만으로 유지되었음을 보여준다. 더욱이, Rova-T + 항-PD-1으로 치료된 군의 종양 성장 억제 중앙값 백분율 (치료 후 측정된 종양 부피의 최소 측정값이 초기 종양 부피보다 작았던 백분율)은, "HuIgG1.PBD + 래트 IgG21"의 경우 0%, "HuIgG1.PBD + 항-PD-1"의 경우 0%, 및 "Rova-T + 래트 IgG2a" 치료 군의 경우 0%를 보이는 것과 비교하여, 69%를 나타냈다. 이러한 종양 성장 억제 데이터는 DLL3 ADC와 항-PD-1 항체의 조합이 자연적인 상승효과를 낼 수 있음을 강력히 시사한다.
어떠한 경우에도, 본 실시예에서 기재된 데이터는 DLL3 ADC와 항-PD-1 항체의 조합이 SCLC에 대해 종양의 부피를 감소시키고 종양 보유 마우스의 장기 지속 생존을 촉진시킴으로써, 상승 효과, 아니면 적어도 부가적인 효과를 입증함을 명백하게 보여준다. PD-1 항체와의 조합된 아이소타입 PBD ADC를 이용한 치료가 비히클(vehicle) 제어에 대한 개선된 효과를 보이지 않음에 따라, 관찰된 효과는 Rova-T에 의한 DLL3 인식에 특이적이고 의존적이다. 또한, Rova-T와 조합된 아이소타입 대조구 Ab가 동일한 결과를 내는 데 실패함에 따라, 측정된 효과는, 적어도 부분적으로 PD-1 결합 및 억제로 인한다.
요약하면, 제시된 데이터는 Rova-T에 의해 DLL3 발현 암의 표적 세포 살상은 PD-1 및/또는 PD-L1 항체의 사용을 포함하는 면역 요법을 포함해서, 면역 요법의 효과를 추가로 증진시킬 수 있음을 보여준다.
모든 특허, 특허 출원서 및 간행물 및 전자적으로 입수가능한 자료 (예를 들어, GenBank 및 RefSeq 내 뉴클레오티드 서열의 제출 및 예를 들어, 스위스 프로, PIR, PRF, PBD 내 아미노산 서열의 제출, 및 본 명세서에 인용된 GenBank 및 RefSeq 내 주석된 코딩 영역의 번역)의 전체 개시 내용은 참고 문헌으로 포함된다. 상기된 상세한 설명 및 예는 단지 이해의 명확성을 위해 제공되었다. 그로부터 불필요한 제한은 없는 것으로 이해되어야 한다. 본 발명은 도시 및 기재된 세부 사항에 한정되지 않으며, 당업자에게 명확한 변형들이 본 청구범위에 의해 정의된 발명의 범주 내에 포함될 것이다.
SEQUENCE LISTING
<110> ABBVIE STEMCENTRX LLC
<120> ANTI-DLL3 ANTIBODY DRUG CONJUGATES AND METHODS OF USE
<130> S69697 1280US.P3 / sc1607.p3
<150> US 62/207,830
<151> 2015-08-20
<150> US 62/323,998
<151> 2016-04-18
<150> US 62/373,906
<151> 2016-08-11
<160> 437
<170> KopatentIn 1.71
<210> 1
<211> 618
<212> PRT
<213> Homo sapiens
<400> 1
Met Val Ser Pro Arg Met Ser Gly Leu Leu Ser Gln Thr Val Ile Leu
1 5 10 15
Ala Leu Ile Phe Leu Pro Gln Thr Arg Pro Ala Gly Val Phe Glu Leu
20 25 30
Gln Ile His Ser Phe Gly Pro Gly Pro Gly Pro Gly Ala Pro Arg Ser
35 40 45
Pro Cys Ser Ala Arg Leu Pro Cys Arg Leu Phe Phe Arg Val Cys Leu
50 55 60
Lys Pro Gly Leu Ser Glu Glu Ala Ala Glu Ser Pro Cys Ala Leu Gly
65 70 75 80
Ala Ala Leu Ser Ala Arg Gly Pro Val Tyr Thr Glu Gln Pro Gly Ala
85 90 95
Pro Ala Pro Asp Leu Pro Leu Pro Asp Gly Leu Leu Gln Val Pro Phe
100 105 110
Arg Asp Ala Trp Pro Gly Thr Phe Ser Phe Ile Ile Glu Thr Trp Arg
115 120 125
Glu Glu Leu Gly Asp Gln Ile Gly Gly Pro Ala Trp Ser Leu Leu Ala
130 135 140
Arg Val Ala Gly Arg Arg Arg Leu Ala Ala Gly Gly Pro Trp Ala Arg
145 150 155 160
Asp Ile Gln Arg Ala Gly Ala Trp Glu Leu Arg Phe Ser Tyr Arg Ala
165 170 175
Arg Cys Glu Pro Pro Ala Val Gly Thr Ala Cys Thr Arg Leu Cys Arg
180 185 190
Pro Arg Ser Ala Pro Ser Arg Cys Gly Pro Gly Leu Arg Pro Cys Ala
195 200 205
Pro Leu Glu Asp Glu Cys Glu Ala Pro Leu Val Cys Arg Ala Gly Cys
210 215 220
Ser Pro Glu His Gly Phe Cys Glu Gln Pro Gly Glu Cys Arg Cys Leu
225 230 235 240
Glu Gly Trp Thr Gly Pro Leu Cys Thr Val Pro Val Ser Thr Ser Ser
245 250 255
Cys Leu Ser Pro Arg Gly Pro Ser Ser Ala Thr Thr Gly Cys Leu Val
260 265 270
Pro Gly Pro Gly Pro Cys Asp Gly Asn Pro Cys Ala Asn Gly Gly Ser
275 280 285
Cys Ser Glu Thr Pro Arg Ser Phe Glu Cys Thr Cys Pro Arg Gly Phe
290 295 300
Tyr Gly Leu Arg Cys Glu Val Ser Gly Val Thr Cys Ala Asp Gly Pro
305 310 315 320
Cys Phe Asn Gly Gly Leu Cys Val Gly Gly Ala Asp Pro Asp Ser Ala
325 330 335
Tyr Ile Cys His Cys Pro Pro Gly Phe Gln Gly Ser Asn Cys Glu Lys
340 345 350
Arg Val Asp Arg Cys Ser Leu Gln Pro Cys Arg Asn Gly Gly Leu Cys
355 360 365
Leu Asp Leu Gly His Ala Leu Arg Cys Arg Cys Arg Ala Gly Phe Ala
370 375 380
Gly Pro Arg Cys Glu His Asp Leu Asp Asp Cys Ala Gly Arg Ala Cys
385 390 395 400
Ala Asn Gly Gly Thr Cys Val Glu Gly Gly Gly Ala His Arg Cys Ser
405 410 415
Cys Ala Leu Gly Phe Gly Gly Arg Asp Cys Arg Glu Arg Ala Asp Pro
420 425 430
Cys Ala Ala Arg Pro Cys Ala His Gly Gly Arg Cys Tyr Ala His Phe
435 440 445
Ser Gly Leu Val Cys Ala Cys Ala Pro Gly Tyr Met Gly Ala Arg Cys
450 455 460
Glu Phe Pro Val His Pro Asp Gly Ala Ser Ala Leu Pro Ala Ala Pro
465 470 475 480
Pro Gly Leu Arg Pro Gly Asp Pro Gln Arg Tyr Leu Leu Pro Pro Ala
485 490 495
Leu Gly Leu Leu Val Ala Ala Gly Val Ala Gly Ala Ala Leu Leu Leu
500 505 510
Val His Val Arg Arg Arg Gly His Ser Gln Asp Ala Gly Ser Arg Leu
515 520 525
Leu Ala Gly Thr Pro Glu Pro Ser Val His Ala Leu Pro Asp Ala Leu
530 535 540
Asn Asn Leu Arg Thr Gln Glu Gly Ser Gly Asp Gly Pro Ser Ser Ser
545 550 555 560
Val Asp Trp Asn Arg Pro Glu Asp Val Asp Pro Gln Gly Ile Tyr Val
565 570 575
Ile Ser Ala Pro Ser Ile Tyr Ala Arg Glu Val Ala Thr Pro Leu Phe
580 585 590
Pro Pro Leu His Thr Gly Arg Ala Gly Gln Arg Gln His Leu Leu Phe
595 600 605
Pro Tyr Pro Ser Ser Ile Leu Ser Val Lys
610 615
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<212> PRT
<213> Homo sapiens
<400> 2
Met Val Ser Pro Arg Met Ser Gly Leu Leu Ser Gln Thr Val Ile Leu
1 5 10 15
Ala Leu Ile Phe Leu Pro Gln Thr Arg Pro Ala Gly Val Phe Glu Leu
20 25 30
Gln Ile His Ser Phe Gly Pro Gly Pro Gly Pro Gly Ala Pro Arg Ser
35 40 45
Pro Cys Ser Ala Arg Leu Pro Cys Arg Leu Phe Phe Arg Val Cys Leu
50 55 60
Lys Pro Gly Leu Ser Glu Glu Ala Ala Glu Ser Pro Cys Ala Leu Gly
65 70 75 80
Ala Ala Leu Ser Ala Arg Gly Pro Val Tyr Thr Glu Gln Pro Gly Ala
85 90 95
Pro Ala Pro Asp Leu Pro Leu Pro Asp Gly Leu Leu Gln Val Pro Phe
100 105 110
Arg Asp Ala Trp Pro Gly Thr Phe Ser Phe Ile Ile Glu Thr Trp Arg
115 120 125
Glu Glu Leu Gly Asp Gln Ile Gly Gly Pro Ala Trp Ser Leu Leu Ala
130 135 140
Arg Val Ala Gly Arg Arg Arg Leu Ala Ala Gly Gly Pro Trp Ala Arg
145 150 155 160
Asp Ile Gln Arg Ala Gly Ala Trp Glu Leu Arg Phe Ser Tyr Arg Ala
165 170 175
Arg Cys Glu Pro Pro Ala Val Gly Thr Ala Cys Thr Arg Leu Cys Arg
180 185 190
Pro Arg Ser Ala Pro Ser Arg Cys Gly Pro Gly Leu Arg Pro Cys Ala
195 200 205
Pro Leu Glu Asp Glu Cys Glu Ala Pro Leu Val Cys Arg Ala Gly Cys
210 215 220
Ser Pro Glu His Gly Phe Cys Glu Gln Pro Gly Glu Cys Arg Cys Leu
225 230 235 240
Glu Gly Trp Thr Gly Pro Leu Cys Thr Val Pro Val Ser Thr Ser Ser
245 250 255
Cys Leu Ser Pro Arg Gly Pro Ser Ser Ala Thr Thr Gly Cys Leu Val
260 265 270
Pro Gly Pro Gly Pro Cys Asp Gly Asn Pro Cys Ala Asn Gly Gly Ser
275 280 285
Cys Ser Glu Thr Pro Arg Ser Phe Glu Cys Thr Cys Pro Arg Gly Phe
290 295 300
Tyr Gly Leu Arg Cys Glu Val Ser Gly Val Thr Cys Ala Asp Gly Pro
305 310 315 320
Cys Phe Asn Gly Gly Leu Cys Val Gly Gly Ala Asp Pro Asp Ser Ala
325 330 335
Tyr Ile Cys His Cys Pro Pro Gly Phe Gln Gly Ser Asn Cys Glu Lys
340 345 350
Arg Val Asp Arg Cys Ser Leu Gln Pro Cys Arg Asn Gly Gly Leu Cys
355 360 365
Leu Asp Leu Gly His Ala Leu Arg Cys Arg Cys Arg Ala Gly Phe Ala
370 375 380
Gly Pro Arg Cys Glu His Asp Leu Asp Asp Cys Ala Gly Arg Ala Cys
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Ala Asn Gly Gly Thr Cys Val Glu Gly Gly Gly Ala His Arg Cys Ser
405 410 415
Cys Ala Leu Gly Phe Gly Gly Arg Asp Cys Arg Glu Arg Ala Asp Pro
420 425 430
Cys Ala Ala Arg Pro Cys Ala His Gly Gly Arg Cys Tyr Ala His Phe
435 440 445
Ser Gly Leu Val Cys Ala Cys Ala Pro Gly Tyr Met Gly Ala Arg Cys
450 455 460
Glu Phe Pro Val His Pro Asp Gly Ala Ser Ala Leu Pro Ala Ala Pro
465 470 475 480
Pro Gly Leu Arg Pro Gly Asp Pro Gln Arg Tyr Leu Leu Pro Pro Ala
485 490 495
Leu Gly Leu Leu Val Ala Ala Gly Val Ala Gly Ala Ala Leu Leu Leu
500 505 510
Val His Val Arg Arg Arg Gly His Ser Gln Asp Ala Gly Ser Arg Leu
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Leu Ala Gly Thr Pro Glu Pro Ser Val His Ala Leu Pro Asp Ala Leu
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Asn Asn Leu Arg Thr Gln Glu Gly Ser Gly Asp Gly Pro Ser Ser Ser
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<212> PRT
<213> Homo sapiens
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1 5
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<211> 4
<212> PRT
<213> Homo sapiens
<220>
<221> misc_feature
<222> (2)..(2)
<223> Xaa can be any naturally occurring amino acid
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Gly Xaa Arg Pro
1
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<212> PRT
<213> Homo sapiens
<400> 5
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1 5 10 15
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Lys His Lys Val Tyr Ala Cys Glu Val Thr His Gln Gly Leu Ser Ser
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Pro Val Thr Lys Ser Phe Asn Arg Gly Glu Cys
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<211> 329
<212> PRT
<213> Homo sapiens
<400> 6
Ala Ser Thr Lys Gly Pro Ser Val Phe Pro Leu Ala Pro Ser Ser Lys
1 5 10 15
Ser Thr Ser Gly Gly Thr Ala Ala Leu Gly Cys Leu Val Lys Asp Tyr
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35 40 45
Gly Val His Thr Phe Pro Ala Val Leu Gln Ser Ser Gly Leu Tyr Ser
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65 70 75 80
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85 90 95
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Lys Ala Leu Pro Ala Pro Ile Glu Lys Thr Ile Ser Lys Ala Lys Gly
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Leu Thr Lys Asn Gln Val Ser Leu Thr Cys Leu Val Lys Gly Phe Tyr
245 250 255
Pro Ser Asp Ile Ala Val Glu Trp Glu Ser Asn Gly Gln Pro Glu Asn
260 265 270
Asn Tyr Lys Thr Thr Pro Pro Val Leu Asp Ser Asp Gly Ser Phe Phe
275 280 285
Leu Tyr Ser Lys Leu Thr Val Asp Lys Ser Arg Trp Gln Gln Gly Asn
290 295 300
Val Phe Ser Cys Ser Val Met His Glu Ala Leu His Asn His Tyr Thr
305 310 315 320
Gln Lys Ser Leu Ser Leu Ser Pro Gly
325
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<211> 447
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> hSC16.56 full length heavy chain protein
<400> 7
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Ser Val Lys Val Ser Cys Lys Ala Ser Gly Tyr Thr Phe Thr Asn Tyr
20 25 30
Gly Met Asn Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Gln Gly Leu Glu Trp Met
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Gly Trp Ile Asn Thr Tyr Thr Gly Glu Pro Thr Tyr Ala Asp Asp Phe
50 55 60
Lys Gly Arg Val Thr Met Thr Thr Asp Thr Ser Thr Ser Thr Ala Tyr
65 70 75 80
Met Glu Leu Arg Ser Leu Arg Ser Asp Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys
85 90 95
Ala Arg Ile Gly Asp Ser Ser Pro Ser Asp Tyr Trp Gly Gln Gly Thr
100 105 110
Leu Val Thr Val Ser Ser Ala Ser Thr Lys Gly Pro Ser Val Phe Pro
115 120 125
Leu Ala Pro Ser Ser Lys Ser Thr Ser Gly Gly Thr Ala Ala Leu Gly
130 135 140
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Ser Gly Ala Leu Thr Ser Gly Val His Thr Phe Pro Ala Val Leu Gln
165 170 175
Ser Ser Gly Leu Tyr Ser Leu Ser Ser Val Val Thr Val Pro Ser Ser
180 185 190
Ser Leu Gly Thr Gln Thr Tyr Ile Cys Asn Val Asn His Lys Pro Ser
195 200 205
Asn Thr Lys Val Asp Lys Lys Val Glu Pro Lys Ser Cys Asp Lys Thr
210 215 220
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225 230 235 240
Val Phe Leu Phe Pro Pro Lys Pro Lys Asp Thr Leu Met Ile Ser Arg
245 250 255
Thr Pro Glu Val Thr Cys Val Val Val Asp Val Ser His Glu Asp Pro
260 265 270
Glu Val Lys Phe Asn Trp Tyr Val Asp Gly Val Glu Val His Asn Ala
275 280 285
Lys Thr Lys Pro Arg Glu Glu Gln Tyr Asn Ser Thr Tyr Arg Val Val
290 295 300
Ser Val Leu Thr Val Leu His Gln Asp Trp Leu Asn Gly Lys Glu Tyr
305 310 315 320
Lys Cys Lys Val Ser Asn Lys Ala Leu Pro Ala Pro Ile Glu Lys Thr
325 330 335
Ile Ser Lys Ala Lys Gly Gln Pro Arg Glu Pro Gln Val Tyr Thr Leu
340 345 350
Pro Pro Ser Arg Asp Glu Leu Thr Lys Asn Gln Val Ser Leu Thr Cys
355 360 365
Leu Val Lys Gly Phe Tyr Pro Ser Asp Ile Ala Val Glu Trp Glu Ser
370 375 380
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385 390 395 400
Ser Asp Gly Ser Phe Phe Leu Tyr Ser Lys Leu Thr Val Asp Lys Ser
405 410 415
Arg Trp Gln Gln Gly Asn Val Phe Ser Cys Ser Val Met His Glu Ala
420 425 430
Leu His Asn His Tyr Thr Gln Lys Ser Leu Ser Leu Ser Pro Gly
435 440 445
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<213> Artificial Sequence
<220>
<223> hSC16.56 and hSC16.56ss1 full length light chain protein
<400> 8
Glu Ile Val Met Thr Gln Ser Pro Ala Thr Leu Ser Val Ser Pro Gly
1 5 10 15
Glu Arg Ala Thr Leu Ser Cys Lys Ala Ser Gln Ser Val Ser Asn Asp
20 25 30
Val Val Trp Tyr Gln Gln Lys Pro Gly Gln Ala Pro Arg Leu Leu Ile
35 40 45
Tyr Tyr Ala Ser Asn Arg Tyr Thr Gly Ile Pro Ala Arg Phe Ser Gly
50 55 60
Ser Gly Ser Gly Thr Glu Phe Thr Leu Thr Ile Ser Ser Leu Gln Ser
65 70 75 80
Glu Asp Phe Ala Val Tyr Tyr Cys Gln Gln Asp Tyr Thr Ser Pro Trp
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115 120 125
Thr Ala Ser Val Val Cys Leu Leu Asn Asn Phe Tyr Pro Arg Glu Ala
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Lys Val Gln Trp Lys Val Asp Asn Ala Leu Gln Ser Gly Asn Ser Gln
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Glu Ser Val Thr Glu Gln Asp Ser Lys Asp Ser Thr Tyr Ser Leu Ser
165 170 175
Ser Thr Leu Thr Leu Ser Lys Ala Asp Tyr Glu Lys His Lys Val Tyr
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<213> Artificial Sequence
<220>
<223> hSC16.56ss1 full length heavy chain protein
<400> 9
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Ser Val Lys Val Ser Cys Lys Ala Ser Gly Tyr Thr Phe Thr Asn Tyr
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Gly Met Asn Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Gln Gly Leu Glu Trp Met
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Gly Trp Ile Asn Thr Tyr Thr Gly Glu Pro Thr Tyr Ala Asp Asp Phe
50 55 60
Lys Gly Arg Val Thr Met Thr Thr Asp Thr Ser Thr Ser Thr Ala Tyr
65 70 75 80
Met Glu Leu Arg Ser Leu Arg Ser Asp Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys
85 90 95
Ala Arg Ile Gly Asp Ser Ser Pro Ser Asp Tyr Trp Gly Gln Gly Thr
100 105 110
Leu Val Thr Val Ser Ser Ala Ser Thr Lys Gly Pro Ser Val Phe Pro
115 120 125
Leu Ala Pro Ser Ser Lys Ser Thr Ser Gly Gly Thr Ala Ala Leu Gly
130 135 140
Cys Leu Val Lys Asp Tyr Phe Pro Glu Pro Val Thr Val Ser Trp Asn
145 150 155 160
Ser Gly Ala Leu Thr Ser Gly Val His Thr Phe Pro Ala Val Leu Gln
165 170 175
Ser Ser Gly Leu Tyr Ser Leu Ser Ser Val Val Thr Val Pro Ser Ser
180 185 190
Ser Leu Gly Thr Gln Thr Tyr Ile Cys Asn Val Asn His Lys Pro Ser
195 200 205
Asn Thr Lys Val Asp Lys Lys Val Glu Pro Lys Ser Ser Asp Lys Thr
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His Thr Cys Pro Pro Cys Pro Ala Pro Glu Leu Leu Gly Gly Pro Ser
225 230 235 240
Val Phe Leu Phe Pro Pro Lys Pro Lys Asp Thr Leu Met Ile Ser Arg
245 250 255
Thr Pro Glu Val Thr Cys Val Val Val Asp Val Ser His Glu Asp Pro
260 265 270
Glu Val Lys Phe Asn Trp Tyr Val Asp Gly Val Glu Val His Asn Ala
275 280 285
Lys Thr Lys Pro Arg Glu Glu Gln Tyr Asn Ser Thr Tyr Arg Val Val
290 295 300
Ser Val Leu Thr Val Leu His Gln Asp Trp Leu Asn Gly Lys Glu Tyr
305 310 315 320
Lys Cys Lys Val Ser Asn Lys Ala Leu Pro Ala Pro Ile Glu Lys Thr
325 330 335
Ile Ser Lys Ala Lys Gly Gln Pro Arg Glu Pro Gln Val Tyr Thr Leu
340 345 350
Pro Pro Ser Arg Asp Glu Leu Thr Lys Asn Gln Val Ser Leu Thr Cys
355 360 365
Leu Val Lys Gly Phe Tyr Pro Ser Asp Ile Ala Val Glu Trp Glu Ser
370 375 380
Asn Gly Gln Pro Glu Asn Asn Tyr Lys Thr Thr Pro Pro Val Leu Asp
385 390 395 400
Ser Asp Gly Ser Phe Phe Leu Tyr Ser Lys Leu Thr Val Asp Lys Ser
405 410 415
Arg Trp Gln Gln Gly Asn Val Phe Ser Cys Ser Val Met His Glu Ala
420 425 430
Leu His Asn His Tyr Thr Gln Lys Ser Leu Ser Leu Ser Pro Gly
435 440 445
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<400> 10
000
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<400> 11
000
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<400> 12
000
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<400> 13
000
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<400> 14
000
<210> 15
<400> 15
000
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<400> 16
000
<210> 17
<400> 17
000
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<400> 18
000
<210> 19
<400> 19
000
<210> 20
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<220>
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<220>
<221> CDS
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caa att gtt ctc acc cag tct cca gca atc atg tct gta tct cta ggg 48
Gln Ile Val Leu Thr Gln Ser Pro Ala Ile Met Ser Val Ser Leu Gly
1 5 10 15
gaa cgg gtc acc atg acc tgc act gcc agc tca agt gta agt tcc agt 96
Glu Arg Val Thr Met Thr Cys Thr Ala Ser Ser Ser Val Ser Ser Ser
20 25 30
tac ttg cac tgg tac caa caa aag cca gga tcc tcc ccc aaa ctc tgg 144
Tyr Leu His Trp Tyr Gln Gln Lys Pro Gly Ser Ser Pro Lys Leu Trp
35 40 45
att tat agc aca tcc aac ctg gct tct gga gtc cca gct cgc ttc agt 192
Ile Tyr Ser Thr Ser Asn Leu Ala Ser Gly Val Pro Ala Arg Phe Ser
50 55 60
ggc agt ggg tct ggg acc tct tat ttt ttc aca atc agc agc atg gag 240
Gly Ser Gly Ser Gly Thr Ser Tyr Phe Phe Thr Ile Ser Ser Met Glu
65 70 75 80
gct gaa gat gct gcc act tat tac tgc cac cag tat cat cgt tcc cca 288
Ala Glu Asp Ala Ala Thr Tyr Tyr Cys His Gln Tyr His Arg Ser Pro
85 90 95
ttc acg ttc ggc gcg ggg aca aag ttg aaa ata aga 324
Phe Thr Phe Gly Ala Gly Thr Lys Leu Lys Ile Arg
100 105
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<213> Mus musculus
<400> 21
Gln Ile Val Leu Thr Gln Ser Pro Ala Ile Met Ser Val Ser Leu Gly
1 5 10 15
Glu Arg Val Thr Met Thr Cys Thr Ala Ser Ser Ser Val Ser Ser Ser
20 25 30
Tyr Leu His Trp Tyr Gln Gln Lys Pro Gly Ser Ser Pro Lys Leu Trp
35 40 45
Ile Tyr Ser Thr Ser Asn Leu Ala Ser Gly Val Pro Ala Arg Phe Ser
50 55 60
Gly Ser Gly Ser Gly Thr Ser Tyr Phe Phe Thr Ile Ser Ser Met Glu
65 70 75 80
Ala Glu Asp Ala Ala Thr Tyr Tyr Cys His Gln Tyr His Arg Ser Pro
85 90 95
Phe Thr Phe Gly Ala Gly Thr Lys Leu Lys Ile Arg
100 105
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<211> 369
<212> DNA
<213> Mus musculus
<220>
<221> misc_feature
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<223> SC16.3 VH
<220>
<221> CDS
<222> (1)..(369)
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cag gtt act ctg aaa gag tct ggc cct ggg ata ttg cag ccc tcc cag 48
Gln Val Thr Leu Lys Glu Ser Gly Pro Gly Ile Leu Gln Pro Ser Gln
1 5 10 15
acc ctc agt ctg act tgt tct ttc tct ggg ttt tca ctg agc act tct 96
Thr Leu Ser Leu Thr Cys Ser Phe Ser Gly Phe Ser Leu Ser Thr Ser
20 25 30
ggt atg ggt gta ggc tgg att cgt cag cca tca ggg aag ggt ctg gag 144
Gly Met Gly Val Gly Trp Ile Arg Gln Pro Ser Gly Lys Gly Leu Glu
35 40 45
tgg ctg gca cac att tgg tgg gat gat gtc aag cgc tat aac cca gcc 192
Trp Leu Ala His Ile Trp Trp Asp Asp Val Lys Arg Tyr Asn Pro Ala
50 55 60
ctg aag agc cga cta act atc tcc aag gat acc tcc agc agc cag gta 240
Leu Lys Ser Arg Leu Thr Ile Ser Lys Asp Thr Ser Ser Ser Gln Val
65 70 75 80
ttc ctc aag atc gcc agt gtg gac act gca gat act gcc aca tac tac 288
Phe Leu Lys Ile Ala Ser Val Asp Thr Ala Asp Thr Ala Thr Tyr Tyr
85 90 95
tgt gct cga ata gct gac tat ggc gga gat tac tat gct atg gac tac 336
Cys Ala Arg Ile Ala Asp Tyr Gly Gly Asp Tyr Tyr Ala Met Asp Tyr
100 105 110
tgg ggt caa gga acc tca gtc acc gtc tcc tca 369
Trp Gly Gln Gly Thr Ser Val Thr Val Ser Ser
115 120
<210> 23
<211> 123
<212> PRT
<213> Mus musculus
<400> 23
Gln Val Thr Leu Lys Glu Ser Gly Pro Gly Ile Leu Gln Pro Ser Gln
1 5 10 15
Thr Leu Ser Leu Thr Cys Ser Phe Ser Gly Phe Ser Leu Ser Thr Ser
20 25 30
Gly Met Gly Val Gly Trp Ile Arg Gln Pro Ser Gly Lys Gly Leu Glu
35 40 45
Trp Leu Ala His Ile Trp Trp Asp Asp Val Lys Arg Tyr Asn Pro Ala
50 55 60
Leu Lys Ser Arg Leu Thr Ile Ser Lys Asp Thr Ser Ser Ser Gln Val
65 70 75 80
Phe Leu Lys Ile Ala Ser Val Asp Thr Ala Asp Thr Ala Thr Tyr Tyr
85 90 95
Cys Ala Arg Ile Ala Asp Tyr Gly Gly Asp Tyr Tyr Ala Met Asp Tyr
100 105 110
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115 120
<210> 24
<211> 321
<212> DNA
<213> Mus musculus
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(321)
<223> SC16.4 VL
<220>
<221> CDS
<222> (1)..(321)
<400> 24
gat atc cag atg aca cag act aca tct tcc ctg tct gcc tct ctg gga 48
Asp Ile Gln Met Thr Gln Thr Thr Ser Ser Leu Ser Ala Ser Leu Gly
1 5 10 15
gac aga gtc acc atc agt tgc agg gca agt cag gac att agc aat tat 96
Asp Arg Val Thr Ile Ser Cys Arg Ala Ser Gln Asp Ile Ser Asn Tyr
20 25 30
tta aac tgg tat cag cag aaa cca gat gga act gtt aaa ctc ctg atc 144
Leu Asn Trp Tyr Gln Gln Lys Pro Asp Gly Thr Val Lys Leu Leu Ile
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gat gtt gag atg acc cag act cca ctc act ttg tcg gtt acc att gga 48
Asp Val Glu Met Thr Gln Thr Pro Leu Thr Leu Ser Val Thr Ile Gly
1 5 10 15
caa cca gcc tcc atc tct tgc aag tca agt cag agc ctc tca gac agt 96
Gln Pro Ala Ser Ile Ser Cys Lys Ser Ser Gln Ser Leu Ser Asp Ser
20 25 30
gat gga aag aca tat ttg aat tgg atg ttt cag agg cca ggc cgg tct 144
Asp Gly Lys Thr Tyr Leu Asn Trp Met Phe Gln Arg Pro Gly Arg Ser
35 40 45
cca aag cgc cta atc tat ctg gtg tct aaa ctg gac tct gga gtc cct 192
Pro Lys Arg Leu Ile Tyr Leu Val Ser Lys Leu Asp Ser Gly Val Pro
50 55 60
gac agg ttc act ggc agt gga tca ggg aca gat ttc aca ctg aaa atc 240
Asp Arg Phe Thr Gly Ser Gly Ser Gly Thr Asp Phe Thr Leu Lys Ile
65 70 75 80
agc aga gtg gag gct gag gat ttg gga gtt tac tat tgc tgg caa ggt 288
Ser Arg Val Glu Ala Glu Asp Leu Gly Val Tyr Tyr Cys Trp Gln Gly
85 90 95
aaa cat ttt ccg tgg acg ttc ggt gga ggc acc aag ctg gaa atc aaa 336
Lys His Phe Pro Trp Thr Phe Gly Gly Gly Thr Lys Leu Glu Ile Lys
100 105 110
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<213> Mus musculus
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Asp Val Glu Met Thr Gln Thr Pro Leu Thr Leu Ser Val Thr Ile Gly
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Gln Pro Ala Ser Ile Ser Cys Lys Ser Ser Gln Ser Leu Ser Asp Ser
20 25 30
Asp Gly Lys Thr Tyr Leu Asn Trp Met Phe Gln Arg Pro Gly Arg Ser
35 40 45
Pro Lys Arg Leu Ile Tyr Leu Val Ser Lys Leu Asp Ser Gly Val Pro
50 55 60
Asp Arg Phe Thr Gly Ser Gly Ser Gly Thr Asp Phe Thr Leu Lys Ile
65 70 75 80
Ser Arg Val Glu Ala Glu Asp Leu Gly Val Tyr Tyr Cys Trp Gln Gly
85 90 95
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Gln Ile Gln Leu Val Gln Ser Gly Pro Glu Leu Lys Lys Pro Gly Glu
1 5 10 15
aca gtc aag atc tcc tgc aag gct tct ggt tat acc ttc aca gac tat 96
Thr Val Lys Ile Ser Cys Lys Ala Ser Gly Tyr Thr Phe Thr Asp Tyr
20 25 30
tca atg cac tgg gtg aag cag gct cca gga aag ggt tta aag tgg atg 144
Ser Met His Trp Val Lys Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Lys Trp Met
35 40 45
ggc tgg ata aac act gag act gtt gag cca aca tat gca gat gac ttc 192
Gly Trp Ile Asn Thr Glu Thr Val Glu Pro Thr Tyr Ala Asp Asp Phe
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atg gga cgg ttt gcc ttc tct ttg gaa acc tct gcc agc act gcc ttt 240
Met Gly Arg Phe Ala Phe Ser Leu Glu Thr Ser Ala Ser Thr Ala Phe
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ttg cag atc aac aac ctc gaa aat gag gac acg gct aca tat ttc tgt 288
Leu Gln Ile Asn Asn Leu Glu Asn Glu Asp Thr Ala Thr Tyr Phe Cys
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gct aga ttt ggt tcc tat gct atg gac tac tgg ggt caa gga acc tca 336
Ala Arg Phe Gly Ser Tyr Ala Met Asp Tyr Trp Gly Gln Gly Thr Ser
100 105 110
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Gly Ser Gly Thr Ser Tyr Ser Leu Thr Ile Ser Ser Met Glu Ala Glu
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Gln Ile Val Leu Thr Gln Ser Pro Ala Leu Val Ser Ala Ser Pro Gly
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Tyr Trp Tyr Gln Gln Lys Pro Arg Ser Ser Pro Lys Pro Trp Ile Tyr
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Leu Thr Ser Asn Leu Ala Ser Gly Val Pro Ala Arg Phe Ser Gly Ser
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Gly Ser Gly Thr Ser Tyr Ser Leu Thr Ile Ser Ser Met Glu Ala Glu
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Asp Ala Ala Thr Tyr Tyr Cys Gln Gln Trp Arg Ser Asn Pro Phe Thr
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Leu Lys Ser Arg Leu Thr Ile Ser Lys Asp Thr Ser Ser Ser Gln Val
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Gly Met Gly Val Gly Trp Ile Arg Gln Pro Ser Gly Lys Gly Leu Glu
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Asp Ile Gln Met Thr Gln Ser Pro Ala Ser Leu Ala Ala Ser Val Gly
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Leu Ala Trp Tyr Gln Gln Lys Gln Gly Lys Ser Pro Gln Leu Leu Ile
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Tyr Thr Ala Asn Ser Leu Glu Asp Gly Val Pro Ser Arg Phe Ser Gly
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gac aga gtc acc atc agt tgc agg gca agt cag aat att atc aat tat 96
Asp Arg Val Thr Ile Ser Cys Arg Ala Ser Gln Asn Ile Ile Asn Tyr
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tta aac tgg tat cag cag aag cca gat gga act gtt aaa ctc ctg atc 144
Leu Asn Trp Tyr Gln Gln Lys Pro Asp Gly Thr Val Lys Leu Leu Ile
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tac tac aca tca aga tta cac tca gga gtc cca tca agg ttc agt ggc 192
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<213> Mus musculus
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Glu Ile Gln Met Thr Gln Ser Pro Ser Ser Met Ser Ala Ser Leu Gly
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gac aga ata acc atc act tgc cag gca act caa gac att gtt aag aat 96
Asp Arg Ile Thr Ile Thr Cys Gln Ala Thr Gln Asp Ile Val Lys Asn
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tta aac tgg tat cag cag aaa cca ggg aaa ccc cct tca ttc ctg atc 144
Leu Asn Trp Tyr Gln Gln Lys Pro Gly Lys Pro Pro Ser Phe Leu Ile
35 40 45
tat tat gca act gaa ctg gca gaa ggg gtc cca tca agg ttc agt ggc 192
Tyr Tyr Ala Thr Glu Leu Ala Glu Gly Val Pro Ser Arg Phe Ser Gly
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agt ggg tct ggg tca gac tat tct ctg aca atc agg aac ctg gag tct 240
Ser Gly Ser Gly Ser Asp Tyr Ser Leu Thr Ile Arg Asn Leu Glu Ser
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gaa gac ttt gca gac cat tac tgt cta cag ttt tat gag ttt ccg ttc 288
Glu Asp Phe Ala Asp His Tyr Cys Leu Gln Phe Tyr Glu Phe Pro Phe
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acg ttc ggt gct ggg acc aag ctg gag ctg aaa 321
Thr Phe Gly Ala Gly Thr Lys Leu Glu Leu Lys
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65 70 75 80
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Ser Val Arg Val Ser Cys Lys Ala Ser Gly Tyr Ala Phe Gly Asn His
20 25 30
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Leu Ile Glu Trp Val Lys Gln Arg Pro Gly Gln Gly Leu Glu Trp Ile
35 40 45
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Gly Val Ile Asn Pro Gly Thr Gly Gly Thr His Tyr Asn Glu Lys Phe
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Gly Ser Gly Ser Gly Thr Ser Tyr Ser Leu Ile Ile Ser Ser Met Glu
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115 120
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<213> Mus musculus
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Gln Val Thr Leu Lys Glu Ser Gly Pro Gly Ile Leu Gln Pro Ser Gln
1 5 10 15
Thr Leu Ser Leu Thr Cys Ser Phe Ser Gly Phe Ser Leu Ser Thr Ser
20 25 30
Gly Met Gly Val Gly Trp Ile Arg Gln Pro Ser Gly Glu Gly Leu Glu
35 40 45
Trp Leu Thr Asp Ile Trp Trp Asp Asp Asn Lys Tyr Tyr Asn Pro Ser
50 55 60
Leu Lys Ser Arg Leu Thr Ile Ser Lys Asp Thr Ser Ser Asn Gln Val
65 70 75 80
Phe Leu Asn Ile Thr Ser Val Asp Thr Ala Asp Thr Ala Thr Tyr Tyr
85 90 95
Cys Ala Arg Arg Val Asn Tyr Tyr Tyr Asp Pro Tyr Tyr Ala Met Asp
100 105 110
Tyr Trp Gly Gln Gly Thr Ser Val Thr Val Ser Ser
115 120
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gat gtt gag atg acc cag act cca ctc act ttg tcg gtt acc att gga 48
Asp Val Glu Met Thr Gln Thr Pro Leu Thr Leu Ser Val Thr Ile Gly
1 5 10 15
caa cca gcc tcc atc tct tgc aag tca agt cag agc ctc tca gac agt 96
Gln Pro Ala Ser Ile Ser Cys Lys Ser Ser Gln Ser Leu Ser Asp Ser
20 25 30
gat gga aag aca tat ttg aat tgg atg ttt cag agg cca ggc cgg tct 144
Asp Gly Lys Thr Tyr Leu Asn Trp Met Phe Gln Arg Pro Gly Arg Ser
35 40 45
cca aag cgc cta atc tat ctg gtg tct aaa ctg gac tct gga gtc cct 192
Pro Lys Arg Leu Ile Tyr Leu Val Ser Lys Leu Asp Ser Gly Val Pro
50 55 60
gac agg ttc act ggc agt gga tca ggg aca gat ttc aca ctg aaa atc 240
Asp Arg Phe Thr Gly Ser Gly Ser Gly Thr Asp Phe Thr Leu Lys Ile
65 70 75 80
agc aga gtg gag gct gag gat ttg gga gtt tac tat tgc tgg caa ggt 288
Ser Arg Val Glu Ala Glu Asp Leu Gly Val Tyr Tyr Cys Trp Gln Gly
85 90 95
aaa cat ttt ccg tgg acg ttc ggt gga ggc acc aag ctg gaa atc aaa 336
Lys His Phe Pro Trp Thr Phe Gly Gly Gly Thr Lys Leu Glu Ile Lys
100 105 110
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<213> Mus musculus
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Asp Val Glu Met Thr Gln Thr Pro Leu Thr Leu Ser Val Thr Ile Gly
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Gln Pro Ala Ser Ile Ser Cys Lys Ser Ser Gln Ser Leu Ser Asp Ser
20 25 30
Asp Gly Lys Thr Tyr Leu Asn Trp Met Phe Gln Arg Pro Gly Arg Ser
35 40 45
Pro Lys Arg Leu Ile Tyr Leu Val Ser Lys Leu Asp Ser Gly Val Pro
50 55 60
Asp Arg Phe Thr Gly Ser Gly Ser Gly Thr Asp Phe Thr Leu Lys Ile
65 70 75 80
Ser Arg Val Glu Ala Glu Asp Leu Gly Val Tyr Tyr Cys Trp Gln Gly
85 90 95
Lys His Phe Pro Trp Thr Phe Gly Gly Gly Thr Lys Leu Glu Ile Lys
100 105 110
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<221> CDS
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cag atc cag ttg gtg cag tct gga cct gag ctg aag aag cct gga gag 48
Gln Ile Gln Leu Val Gln Ser Gly Pro Glu Leu Lys Lys Pro Gly Glu
1 5 10 15
aca gtc aag atc tcc tgc aag gct tct ggt tat tcc ttc aca gac tat 96
Thr Val Lys Ile Ser Cys Lys Ala Ser Gly Tyr Ser Phe Thr Asp Tyr
20 25 30
tca atg cac tgg gtg aag cag gct cca gga aag ggt tta aag tgg atg 144
Ser Met His Trp Val Lys Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Lys Trp Met
35 40 45
ggc tgg ata aac act gag act gtt gag cca aca tat gca gat gac ttc 192
Gly Trp Ile Asn Thr Glu Thr Val Glu Pro Thr Tyr Ala Asp Asp Phe
50 55 60
atg gga cgg ttt gcc ttc tct ttg gaa acc tct gcc agc act gcc ttt 240
Met Gly Arg Phe Ala Phe Ser Leu Glu Thr Ser Ala Ser Thr Ala Phe
65 70 75 80
ttg cag atc aac aac ctc gaa aat gag gac acg gct aca tat ttc tgt 288
Leu Gln Ile Asn Asn Leu Glu Asn Glu Asp Thr Ala Thr Tyr Phe Cys
85 90 95
gct aga ttt ggt tcc tat gct atg gac tac tgg ggt caa gga acc tca 336
Ala Arg Phe Gly Ser Tyr Ala Met Asp Tyr Trp Gly Gln Gly Thr Ser
100 105 110
gtn acv gtn tcn tcn 351
Val Xaa Val Xaa Xaa
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Gln Ile Gln Leu Val Gln Ser Gly Pro Glu Leu Lys Lys Pro Gly Glu
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Thr Val Lys Ile Ser Cys Lys Ala Ser Gly Tyr Ser Phe Thr Asp Tyr
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Leu Gln Ile Asn Asn Leu Glu Asn Glu Asp Thr Ala Thr Tyr Phe Cys
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Val Xaa Val Xaa Xaa
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Gln Ile Val Leu Thr Gln Ser Pro Ala Ile Met Ser Ala Ser Pro Gly
1 5 10 15
gag aag gtc acc ata acc tgc agt gcc agc tca agt gta agt tac atg 96
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cac tgg ttc cag cag aag cca ggc act tct ccc aaa ctc tgg att tat 144
His Trp Phe Gln Gln Lys Pro Gly Thr Ser Pro Lys Leu Trp Ile Tyr
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Thr Thr Ser Asn Leu Ala Ser Gly Val Pro Ala Arg Phe Ser Gly Ser
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Gly Ser Gly Thr Ser Tyr Ser Leu Thr Val Ser Arg Met Glu Ala Glu
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Gln Ile Val Leu Thr Gln Ser Pro Ala Ile Met Ser Ala Ser Pro Gly
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Glu Lys Val Thr Ile Thr Cys Ser Ala Ser Ser Ser Val Ser Tyr Met
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His Trp Phe Gln Gln Lys Pro Gly Thr Ser Pro Lys Leu Trp Ile Tyr
35 40 45
Thr Thr Ser Asn Leu Ala Ser Gly Val Pro Ala Arg Phe Ser Gly Ser
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Gly Ser Gly Thr Ser Tyr Ser Leu Thr Val Ser Arg Met Glu Ala Glu
65 70 75 80
Asp Ala Ala Thr Tyr Tyr Cys Gln Gln Arg Ser Leu Tyr Pro Tyr Thr
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Gln Val Gln Leu Gln Gln Ser Gly Ala Glu Leu Ala Arg Pro Gly Ala
1 5 10 15
tca gtg aag ctg tcc tgc aag gct tca ggc tac acc ttc act gac cag 96
Ser Val Lys Leu Ser Cys Lys Ala Ser Gly Tyr Thr Phe Thr Asp Gln
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tat ata aac tgg gtg aag cag agg act gga cag ggc ctt gag tgg att 144
Tyr Ile Asn Trp Val Lys Gln Arg Thr Gly Gln Gly Leu Glu Trp Ile
35 40 45
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Gly Glu Ile Tyr Pro Gly Arg Gly Asn Thr Tyr Tyr Asn Glu Lys Phe
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Lys Gly Lys Ala Thr Leu Thr Ala Asp Lys Ser Ser Ser Thr Ala Tyr
65 70 75 80
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Met Gln Leu Ser Ser Leu Thr Ser Glu Asp Ser Ala Val Tyr Phe Cys
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100 105 110
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Gln Val Gln Leu Gln Gln Ser Gly Ala Glu Leu Ala Arg Pro Gly Ala
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Gln Ile Val Leu Thr Gln Ser Pro Thr Ile Met Ser Ala Ser Leu Gly
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Glu Arg Val Thr Met Thr Cys Thr Ala Ser Ser Ser Val Thr Ser Ser
20 25 30
tac ttg cac tgg tac cag cag aag cca gga tcc tcc ccc aaa ctc tgg 144
Tyr Leu His Trp Tyr Gln Gln Lys Pro Gly Ser Ser Pro Lys Leu Trp
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Ile Tyr Ser Thr Ser Asn Leu Ala Ser Gly Val Pro Ala Arg Phe Ser
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Gly Ser Gly Ser Gly Thr Ser Tyr Ser Leu Thr Ile Ser Ser Met Glu
65 70 75 80
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Ala Glu Asp Ala Ala Thr Tyr Tyr Cys His Gln Phe His Arg Ser Pro
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Gln Ile Val Leu Thr Gln Ser Pro Thr Ile Met Ser Ala Ser Leu Gly
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Glu Arg Val Thr Met Thr Cys Thr Ala Ser Ser Ser Val Thr Ser Ser
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Tyr Leu His Trp Tyr Gln Gln Lys Pro Gly Ser Ser Pro Lys Leu Trp
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Gly Ser Gly Ser Gly Thr Ser Tyr Ser Leu Thr Ile Ser Ser Met Glu
65 70 75 80
Ala Glu Asp Ala Ala Thr Tyr Tyr Cys His Gln Phe His Arg Ser Pro
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Gln Val Thr Leu Lys Glu Ser Gly Pro Gly Ile Leu Gln Pro Ser Gln
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acc ctc agt ctg act tgt tct ttc tct ggg ttt tca ctg agc act tct 96
Thr Leu Ser Leu Thr Cys Ser Phe Ser Gly Phe Ser Leu Ser Thr Ser
20 25 30
ggt atg ggt gta ggc tgg att cgt cag cca tca ggg aag ggt ctg gag 144
Gly Met Gly Val Gly Trp Ile Arg Gln Pro Ser Gly Lys Gly Leu Glu
35 40 45
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Trp Leu Ala His Ile Trp Trp Asp Asp Val Lys Arg Tyr Lys Pro Ala
50 55 60
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Leu Lys Ser Arg Leu Thr Val Ser Lys Asp Thr Ser Ser Asn Gln Val
65 70 75 80
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Phe Leu Lys Ile Ala Thr Val Asp Ala Ala Asp Thr Gly Thr Tyr Tyr
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100 105 110
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Gly Thr Leu Val Thr Val Ser Ala
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<213> Mus musculus
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Gln Val Thr Leu Lys Glu Ser Gly Pro Gly Ile Leu Gln Pro Ser Gln
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Thr Leu Ser Leu Thr Cys Ser Phe Ser Gly Phe Ser Leu Ser Thr Ser
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Gly Met Gly Val Gly Trp Ile Arg Gln Pro Ser Gly Lys Gly Leu Glu
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Leu Lys Ser Arg Leu Thr Val Ser Lys Asp Thr Ser Ser Asn Gln Val
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Phe Leu Lys Ile Ala Thr Val Asp Ala Ala Asp Thr Gly Thr Tyr Tyr
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Asp Ile Val Leu Thr Gln Ser Pro Leu Ser Leu Pro Val Asn Ile Gly
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gat gga ttc act tat ttg gac tgg tat ttg cag agg cca ggc cag tct 144
Asp Gly Phe Thr Tyr Leu Asp Trp Tyr Leu Gln Arg Pro Gly Gln Ser
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Pro Gln Phe Leu Ile Tyr Leu Val Ser Asn Arg Phe Ser Gly Val Pro
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Ser Arg Val Glu Ala Glu Asp Leu Gly Val Tyr Tyr Cys Phe Gln Ser
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Ser Val Lys Ile Ser Cys Lys Ala Ser Gly Tyr Ser Phe Ser Arg Phe
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Lys Gly Lys Ala Thr Leu Thr Val Asp Lys Ser Ser Ser Thr Ala Tyr
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Met Gln Leu Lys Ser Leu Thr Ser Glu Glu Ser Ala Val Tyr Tyr Cys
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gac agg gtt acc ata acc tgc aag gcc agt cag agt gtg agt aat gat 96
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gta gct tgg tac caa cag aag cca ggg cag tct cct aaa ctg ctg ata 144
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Ser Gly Tyr Gly Thr Asp Phe Thr Phe Thr Ile Ser Thr Val Gln Ala
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Ser Ile Val Met Thr Gln Thr Pro Lys Phe Leu Leu Val Ser Ala Gly
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Asp Arg Val Thr Ile Thr Cys Lys Ala Ser Gln Ser Val Ser Asn Asp
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Val Ala Trp Tyr Gln Gln Lys Pro Gly Gln Ser Pro Lys Leu Leu Ile
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Thr Phe Gly Gly Gly Thr Lys Leu Glu Ile Lys
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cag atc cag ttg gtg cag tct gga cct gag ctg aag agg cct gga gag 48
Gln Ile Gln Leu Val Gln Ser Gly Pro Glu Leu Lys Arg Pro Gly Glu
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aca gtc aag atc tcc tgc aag gct tct gga tat acc ttc aca aac tat 96
Thr Val Lys Ile Ser Cys Lys Ala Ser Gly Tyr Thr Phe Thr Asn Tyr
20 25 30
gga atg aac tgg gtg aag cag gct cca gga aag ggt tta aag tgg atg 144
Gly Met Asn Trp Val Lys Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Lys Trp Met
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ggc tgg ata aac acg tac act gga gac cca aca tat gct gat gac ttc 192
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aag gga cgg ttt gcc ttc tct ttg gaa acc tct gcc agc act gcc tat 240
Lys Gly Arg Phe Ala Phe Ser Leu Glu Thr Ser Ala Ser Thr Ala Tyr
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Leu Gln Ile Asn Asn Leu Lys Asn Glu Asp Thr Ala Thr Tyr Phe Cys
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Asp Arg Val Thr Ile Ser Cys Arg Ala Ser Gln Asp Ile Ser Asn Tyr
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aca gtc aag atc tcc tgc aag gct tct ggg tat acc ttc aca act gct 96
Thr Val Lys Ile Ser Cys Lys Ala Ser Gly Tyr Thr Phe Thr Thr Ala
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gga atg cag tgg gtg caa aag atg cca gga aag ggt ttt aag tgg att 144
Gly Met Gln Trp Val Gln Lys Met Pro Gly Lys Gly Phe Lys Trp Ile
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ggc tgg ata aac acc cac tct gga gag cca aaa tat gca gat gac ttc 192
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gaa aca act gtg acc cag tct cca gca tcc ctg tcc atg gct ata gga 48
Glu Thr Thr Val Thr Gln Ser Pro Ala Ser Leu Ser Met Ala Ile Gly
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gaa aaa gtc acc atc aga tgc ata acc agc act gat att gat gat gat 96
Glu Lys Val Thr Ile Arg Cys Ile Thr Ser Thr Asp Ile Asp Asp Asp
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atg atc tgg tac cag cag aag cca ggg gaa cct cct aag ctc ctt att 144
Met Ile Trp Tyr Gln Gln Lys Pro Gly Glu Pro Pro Lys Leu Leu Ile
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tca gaa ggc aat act ctt cgt cct gga gtc cca tcc cga ttc tcc agc 192
Ser Glu Gly Asn Thr Leu Arg Pro Gly Val Pro Ser Arg Phe Ser Ser
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agt ggc tat ggt aca gat ttt gtt ttt aca att gaa aac atg ctc tca 240
Ser Gly Tyr Gly Thr Asp Phe Val Phe Thr Ile Glu Asn Met Leu Ser
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Glu Asp Val Ala Asp Tyr Tyr Cys Leu Lys Arg Asp Asp Leu Pro Tyr
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Met Ile Trp Tyr Gln Gln Lys Pro Gly Glu Pro Pro Lys Leu Leu Ile
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tca aag aag ata tcc tgc aag gct tct ggt tac tca ttc act ggc tac 96
Ser Lys Lys Ile Ser Cys Lys Ala Ser Gly Tyr Ser Phe Thr Gly Tyr
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agt atg aac tgg gtg aag cag agc cat gga aag aac ctt gag tgg att 144
Ser Met Asn Trp Val Lys Gln Ser His Gly Lys Asn Leu Glu Trp Ile
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Lys Gly Lys Ala Thr Leu Thr Val Asp Lys Ser Ser Ser Thr Ala Tyr
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Tyr Leu His Trp Tyr Gln Gln Lys Pro Gly Ser Ser Pro Lys Leu Trp
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Gln Ile Val Leu Ser Gln Ser Pro Ala Ile Leu Ser Ala Ser Pro Gly
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Val Met His Trp Val Lys Gln Lys Pro Gly Gln Gly Leu Glu Trp Ile
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Gly Tyr Ile Asn Pro Tyr Asn Asp Gly Thr Lys Tyr Asn Glu Lys Phe
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ctc aca gtc tcc tca 351
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Ser Leu Lys Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Ser Ser Tyr
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Thr Met Ser Trp Val Arg Gln Thr Pro Glu Lys Arg Leu Glu Trp Val
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Lys Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Ala Lys Asn Thr Leu Tyr
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Tyr Met His Trp Val Lys Gln Ser His Gly Lys Ser Leu Glu Trp Ile
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gga cgt gtt aat cct aac aat ggt ggt act agc tac aac cag aag ttc 192
Gly Arg Val Asn Pro Asn Asn Gly Gly Thr Ser Tyr Asn Gln Lys Phe
50 55 60
aag ggc aag gcc ata tta act gca gac aag tca tcc agc aca gcc tac 240
Lys Gly Lys Ala Ile Leu Thr Ala Asp Lys Ser Ser Ser Thr Ala Tyr
65 70 75 80
atg gag ctc cgc agc ctg aca tct gag gac tct gcg gtc tat tac tgt 288
Met Glu Leu Arg Ser Leu Thr Ser Glu Asp Ser Ala Val Tyr Tyr Cys
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Ala Arg Gly Ser Tyr Asp Tyr Ala Glu Gly Trp Gly Gln Gly Thr Leu
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Ser Val Lys Ile Ser Cys Lys Ala Ser Gly Tyr Ser Phe Thr Gly Tyr
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Tyr Met His Trp Val Lys Gln Ser His Gly Lys Ser Leu Glu Trp Ile
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Gly Arg Val Asn Pro Asn Asn Gly Gly Thr Ser Tyr Asn Gln Lys Phe
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65 70 75 80
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Ser Thr Gln Lys Asn Tyr Leu Ala Trp Tyr Gln Gln Lys Pro Gly Gln
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tct cct aaa ctg ctg att tac tgg gca tcc act agg gaa tct ggg gtc 192
Ser Pro Lys Leu Leu Ile Tyr Trp Ala Ser Thr Arg Glu Ser Gly Val
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Pro Asp Arg Phe Thr Gly Ser Gly Ser Gly Thr Asp Phe Thr Leu Thr
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tat tat agc tat ccg tac acg ttc gga ggg ggg acc aag ctg gaa ata 336
Tyr Tyr Ser Tyr Pro Tyr Thr Phe Gly Gly Gly Thr Lys Leu Glu Ile
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aaa 339
Lys
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gtt atg cac tgg gtg aag cag aag cct ggg cag ggc ctt gag tgg att 144
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Gly Val Ile Trp Ala Gly Gly Ile Thr Asn Tyr Asn Ser Ala Leu Met
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Gly Ile Tyr Asp Gly Tyr Ala Met Asp Tyr Trp Gly Gln Gly Thr Ser
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Gln Ile Val Leu Thr Gln Ser Pro Ala Ile Met Ser Ala Ser Pro Gly
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gag aag gtc acc atg acc tgc agt gcc agc tca agt gta agt tac atg 96
Glu Lys Val Thr Met Thr Cys Ser Ala Ser Ser Ser Val Ser Tyr Met
20 25 30
tac tgg tac cag cag aag cca gga tcc tcc ccc aga ctc ctg att tat 144
Tyr Trp Tyr Gln Gln Lys Pro Gly Ser Ser Pro Arg Leu Leu Ile Tyr
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gac aca tcc aac ctg gct tct gga gtc cct gtt cgc ttc agt ggc agt 192
Asp Thr Ser Asn Leu Ala Ser Gly Val Pro Val Arg Phe Ser Gly Ser
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Gly Ser Gly Thr Ser Tyr Ser Leu Thr Ile Ser Arg Met Glu Ala Glu
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gat act gcc act tat tat tgc cag gag tgg agt aat aat ccg ctc acg 288
Asp Thr Ala Thr Tyr Tyr Cys Gln Glu Trp Ser Asn Asn Pro Leu Thr
85 90 95
ttc ggt gat ggg acc aag ctg gag ctg aaa 318
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Gln Ile Gln Leu Val Gln Ser Gly Pro Glu Leu Lys Lys Pro Gly Glu
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gga atg aac tgg gtg aag cag gct cca gga aag ggt tta aag tgg atg 144
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Gly Trp Ile Asn Thr Tyr Thr Gly Glu Pro Thr Tyr Ala Asp Asp Phe
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Lys Gly Arg Phe Ala Phe Ser Leu Glu Thr Ser Ala Arg Ile Val Tyr
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100 105 110
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aaa 339
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gcg aga ggc ggt agt aac ttc ttt gac tac tgg ggc caa ggc acc act 336
Ala Arg Gly Gly Ser Asn Phe Phe Asp Tyr Trp Gly Gln Gly Thr Thr
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gtc aca gtc tcc tca 351
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Ser Val Lys Val Ser Cys Lys Ala Ser Gly Tyr Thr Phe Thr Arg Tyr
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Trp Ile His Trp Ile Arg Gln Ala Pro Gly Gln Gly Leu Glu Trp Met
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Gly Tyr Ile Asn Pro Thr Thr Val Tyr Thr Glu Phe Asn Gln Asn Phe
50 55 60
Lys Asp Arg Val Thr Met Thr Arg Asp Thr Ser Thr Ser Thr Val Tyr
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Met Glu Leu Ser Ser Leu Arg Ser Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys
85 90 95
Ala Arg Gly Gly Ser Asn Phe Phe Asp Tyr Trp Gly Gln Gly Thr Thr
100 105 110
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cac tgg tac cag cag aaa cca gat cag tct cca aag ctc ctc atc aag 144
His Trp Tyr Gln Gln Lys Pro Asp Gln Ser Pro Lys Leu Leu Ile Lys
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Gly Ser Gly Thr Asp Phe Thr Leu Thr Ile Asn Ser Leu Glu Ala Glu
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1 5 10 15
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<220>
<223> HSC16.56 CDRH3
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Ile Gly Asp Ser Ser Pro Ser Asp Tyr
1 5
Claims (78)
- 300 점 척도에서 적어도 90의 DLL3 H-스코어를 나타내는 종양 및/또는 10% 이상 (≥) 양성 염색된 DLL3 세포를 갖는 대상체를 치료하는 방법으로서, DLL3 ADC를 투여하는 단계를 포함하는, 방법.
- 제1항에 있어서, DLL3 ADC가 PBD, 칼리케아마이신, 오리스타틴, 마이탄시노이드 및 듀오카마이신으로 이루어진 군으로부터 선택되는 세포독소를 포함하는 것인, 방법.
- 제2항에 있어서, 세포독소는 PBD를 포함하는 것인, 방법.
- 제3항에 있어서, PBD는 PBD1을 포함하는 것인, 방법.
- 제1항 내지 제4항 중 어느 한 항에 있어서, DLL3를 발현하는 종양 개시 세포에 결합하는 DLL3 ADC를 포함하는 것인, 방법.
- 제1항 내지 제5항 중 어느 한 항에 있어서, DLL3 ADC가 키메라성, CDR 그래프트된, 인간 또는 인간화 항체, 또는 이들의 단편인 항체를 포함하는 것인, 방법.
- 제6항에 있어서, 항체가 내재화(internalizing) 항체인, 방법.
- 제1항 내지 제7항 중 어느 한 항에 있어서, 종양이 300점 척도에서 적어도 120의 DLL3 H-스코어를 나타내는 것인, 방법.
- 제1항 내지 제8항 중 어느 한 항에 있어서, 종양이 300점 척도에서 적어도 180의 DLL3 H-스코어를 나타내는 것인, 방법.
- 제1항 내지 제9항 중 어느 한 항에 있어서, 종양이 신경내분비 종양을 포함하는 것인, 방법.
- 제1항 내지 제10항 중 어느 한 항에 있어서, 종양이 소세포 폐암 (SCLC) 종양을 포함하는 것인, 방법.
- 제1항 내지 제10항 중 어느 한 항에 있어서, 종양이 대세포 신경내분비암 (LCNEC) 종양을 포함하는 것인, 방법.
- 제1항 내지 제12항 중 어느 한 항에 있어서, 종양이 갑상선 수질암 종양을 포함하는 것인, 방법.
- 제1항 내지 제13항 중 어느 한 항에 있어서, 대상체가 0.2 mg/kg Q3Wx3 투약 방식을 포함하는 DLL3 ADC 섭생(regimen)으로 치료되는 것인, 방법.
- 제1항 내지 제13항 중 어느 한 항에 있어서, 대상체가 0.3 mg/kg Q6Wx2 투약 방식을 포함하는 DLL3 ADC 섭생으로 치료되는 것인, 방법.
- 제14항 또는 제15항에 있어서, 대상체가 DLL3 ADC 섭생을 따라 진행 중(at progression) 치료되는 것인, 방법.
- 제14항 또는 제15항에 있어서, 대상체가 DLL3 ADC 섭생을 따라 DLL3 ADC 유지 치료법으로 변경되는 것인, 방법.
- 제1항 내지 제17항 중 어느 한 항에 있어서, 대상체가 제1선(front line)의 환자인, 방법.
- 제1항 내지 제17항 중 어느 한 항에 있어서, 대상체가 제2선의 환자인, 방법.
- 제1항 내지 제17항 중 어느 한 항에 있어서, 대상체가 제3선의 환자인, 방법.
- 제1항 내지 제20항 중 어느 한 항에 있어서, DLL3 ADC는 SC16LD.5를 포함하는 것인, 방법.
- 제1항 내지 제20항 중 어느 한 항에 있어서, DLL3 ADC는 hSC16.56ss1DL6을 포함하는 것인, 방법.
- 종양을 갖는 대상체의 치료 방법으로,
종양 샘플을 수득하는 단계;
종양 샘플을 조사하여 DLL3 H-스코어를 계산하고/하거나 양성 염색된 DLL3 세포의 백분율을 결정하는 단계;
계산된 DLL3 H-스코어가 300 점 척도 상에서 적어도 90 및/또는 양성 염색된 DLL3 세포가 10% 이상의 종양 세포를 포함하는 경우 환자를 DLL3 ADC로 치료하는 단계
를 포함하는, 방법. - 제23항에 있어서, 조사 단계가 면역조직화학법을 포함하는 것인, 방법.
- 화학식 Ab-[L-D]n의 항체 약물 컨쥬게이트 (ADC) 또는 그의 약학적으로 허용가능한 염을 포함하는 동결건조된 조성물로, 식에서
Ab는 항-DLL3 항체를 포함하고;
L은 선택적 링커를 포함하고;
D는 약물을 포함하고; 및
n은 1 내지 20의 정수인, 조성물. - 제25항에 있어서, D는 PBD를 포함하는 것인, 동결건조된 조성물.
- 제25항에 있어서, 약학적으로 허용가능한 당을 추가로 포함하는 것인, 동결건조된 조성물
- 제26항에 있어서, ADC는 SC16LD6.5를 포함하는 것인, 동결건조된 조성물.
- 제26항에 있어서, ADC는 hSC16.56ss1DL6을 포함하는 것인, 동결건조된 조성물.
- 제25항의 조성물을 포함하는 DLL3 관련 질환의 진단 또는 치료에 유용한 제조 물품.
- 제25항의 동결건조된 조성물을 재구성하여 액체 약학 조성물을 제공하는 단계; 및
액체 약학 조성물을 그를 필요로 하는 대상체에 투여하는 단계
를 포함하는 암의 치료 방법. - 제31항에 있어서, 암은 신경내분비 특징을 나타내는 종양을 포함하는 것인, 방법.
- 제32항에 있어서, 암은 신경내분비 종양을 포함하는 것인, 방법.
- 제30항에 있어서, 암은 소세포 폐암을 포함하는 것인, 방법.
- 제30항에 있어서, 암은 대세포 신경내분비 암을 포함하는 것인, 방법.
- DLL3 관련 질환의 진단 또는 치료에 유용한 제조 물품으로서, 동결건조된 DLL3 ADC를 포함하는 용기 및 DLL3 관련 질환의 치료 또는 진단을 위해 상기 제조 물품을 사용하기 위한 관련 지시 자료를 포함하는 제조 물품.
- 제36항에 있어서, 상기 DLL3 ADC는 PBD를 포함하는 것인, 제조 물품.
- 약 6 일 초과의 최종 반감기를 갖는 DLL3 ADC를 투여하는 단계를 포함하는 종양을 갖는 대상체의 치료 방법.
- 제38항에 있어서, 상기 DLL3 ADC는 약 7 일 초과의 최종 반감기를 갖는 것인, 방법.
- 제38항에 있어서, 상기 DLL3 ADC는 약 8 일 초과의 최종 반감기를 갖는 것인, 방법.
- 제38항에 있어서, 상기 DLL3 ADC는 약 9 일 초과의 최종 반감기를 갖는 것인, 방법.
- 제38항에 있어서, 상기 DLL3 ADC는 약 10 일 초과의 최종 반감기를 갖는 것인, 방법.
- 제38항 내지 제42항 중 어느 한 항에 있어서, DLL3 ADC는 PBD, 칼리케아마이신, 오리스타틴, 마이탄시노이드 및 듀오카마이신으로 이루어진 군으로부터 선택된 세포독소를 포함하는 것인, 방법.
- 제43항에 있어서, 세포독소는 PBD를 포함하는 것인, 방법.
- 제44항에 있어서, PBD는 PBD1를 포함하는 것인, 방법.
- 제38항 내지 제45항 중 어느 한 항에 있어서, DLL3 ADC는 키메라성, CDR 그래프트된, 인간 또는 인간화 항체, 또는 이의 단편인 항체를 포함하는 것인, 방법.
- 제46항에 있어서, 항체는 내재화 항체인, 방법.
- 제38항 내지 제45항 중 어느 한 항에 있어서, 종양은 신경내분비 특징을 나타내는 종양을 포함하는 것인, 방법.
- 제46항에 있어서, 종양은 신경내분비 종양을 포함하는 것인, 방법.
- 제38항 내지 제47항 중 어느 한 항에 있어서, 종양은 소세포 폐암 (SCLC) 종양을 포함하는 것인, 방법.
- 제38항 내지 제47항 중 어느 한 항에 있어서, 종양은 대세포 신경내분비 암 (LCNEC) 종양을 포함하는 것인, 방법.
- 제38항 내지 제51항 중 어느 한 항에 있어서, 대상체는 0.2 mg/kg Q3W 투약 방식을 포함하는 DLL3 ADC 섭생으로 치료되는 것인, 방법.
- 제52항에 있어서, 대상체는 0.2 mg/kg Q3Wx3 투약 방식을 포함하는 DLL3 ADC 섭생으로 치료되는 것인, 방법.
- 제38항 내지 제51항 중 어느 한 항에 있어서, 대상체는 0.3 mg/kg Q6W 투약 방식을 포함하는 DLL3 ADC 섭생으로 치료되는 것인, 방법.
- 제54항에 있어서, 대상체는 0.3 mg/kg Q6Wx2 투약 방식을 포함하는 DLL3 ADC 섭생으로 치료되는 것인, 방법.
- 제52항 내지 제55항 중 어느 한 항에 있어서, 대상체는 DLL3 ADC 섭생을 따라 진행 중 치료되는 것인, 방법.
- 제52항 내지 제55항 중 어느 한 항에 있어서, 대상체가 DLL3 ADC 섭생을 따라 DLL3 ADC 유지 치료법으로 변경되는 것인, 방법.
- 제38항 내지 제57항 중 어느 한 항에 있어서, 대상체가 제1선의 환자인, 방법.
- 제38항 내지 제57항 중 어느 한 항에 있어서, 대상체가 제2선의 환자인, 방법.
- 제38항 내지 제57항 중 어느 한 항에 있어서, 대상체가 제3선의 환자인, 방법.
- 제38항 내지 제60항 중 어느 한 항에 있어서, DLL3 ADC는 SC16LD.5를 포함하는 것인, 방법.
- 제38항 내지 제60항 중 어느 한 항에 있어서, DLL3 ADC는 hSC16.56ss1DL6을 포함하는 것인, 방법.
- 약 6 일 초과의 최종 반감기를 갖는 DLL3 ADC를 투여하는 단계를 포함하는, 그를 필요로 하는 대상체에서 암 줄기 세포의 빈도를 감소시키는 방법.
- 제64항에 있어서, 항-DLL3 항체는 위치 특이적 항체를 포함하는 것인, DLL3 ADC.
- 제64항에 있어서, 항-DLL3 항체는 hSC16.56ss1인, DLL3 ADC.
- DLL3 ADC 및 항-PD-1 항체를 투여하는 단계를 포함하는, 그를 필요로 하는 대상체에서 암 줄기 세포의 빈도를 감소시키는 방법.
- 제67항에 있어서, DLL3 ADC는 SC16LD5를 포함하는 것인, 방법.
- 제67항에 있어서, DLL3 ADC는 hSC16.56ss1DL6을 포함하는 것인, 방법.
- DLL3 ADC 및 항-PD-L1 항체를 투여하는 단계를 포함하는, 그를 필요로 하는 대상체에서 암 줄기 세포의 빈도를 감소시키는 방법.
- 제70항에 있어서, DLL3 ADC는 SC16LD5를 포함하는 것인, 방법.
- 제70항에 있어서, DLL3 ADC는 hSC16.56ss1DL6을 포함하는 것인, 방법.
- DLL3 ADC 및 항-PD-1 항체를 투여하는 단계를 포함하는, 그를 필요로 하는 대상체에서 암을 치료하는 방법.
- 제73항에 있어서, DLL3 ADC는 SC16LD5를 포함하는 것인, 방법.
- 제73항에 있어서, DLL3 ADC는 hSC16.56ss1DL6을 포함하는 것인, 방법.
- DLL3 ADC 및 항-PD-L1 항체를 투여하는 단계를 포함하는, 그를 필요로 하는 대상체에서 암을 치료하는 방법.
- 제76항에 있어서, DLL3 ADC는 SC16LD5를 포함하는 것인, 방법.
- 제76항에 있어서, DLL3 ADC는 hSC16.56ss1DL6을 포함하는 것인, 방법.
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