KR102673550B1 - 실시간 중합 효소 연쇄 반응을 이용한 ｈｌａ 대립유전자 검사 키트 - Google Patents
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Abstract
HLA-A, HLA-B, HLA-DRB1, HLA-C, HLA-DQB1, HLA-DQA1 중 선택되는 1개 이상의 유전자에 대한 HLA 대립 유전자를 실시간 중합효소연쇄반응에 의해 특이적으로 증폭할 수 있는 시발체 세트; 및 상기 실시간 중합효소연쇄반응에 의해 증폭된 산물을 탐침할 수 있는 탐침자를 포함하는, HLA 대립 유전자 검사 키트 및 이를 이용한 HLA 대립 유전자 판별 방법이 제공된다.
Description
본 발명은 실시간 중합 효소 연쇄 반응을 이용한 HLA 대립유전자 검사 키트에 관한 것이다. 보다 상세하게는, 본 발명은 HLA-A, HLA-B, HLA-DRB1, HLA-C, HLA-DQB1, HLA-DQA1 중 선택되는 1개 이상의 HLA 대립 유전자를 검출할 수 있게 하는 HLA 대립유전자 검사 키트에 관한 것이다.
사람의 백혈구 항원 (Human Leukocyte Antigen; 이하 HLA라 함)은 사람에서 발견되는 가장 다형성을 지닌 유전적 시스템으로 장기 및 조혈모세포이식의 성공에 있어서 주요한 인자로 알려져 있다. HLA 분자는 외래항원을 CD8+ T세포와 CD4+ T세포에 전달해주는 역할을 하고 있다. HLA 분자의 형별은 혈청학적 방법을 이용하여 형별을 분석하였으나 중합효소연쇄반응이 개발되면서 DNA 수준에서의 형별분석이 이루어지게 되었다. 이러한 DNA 수준의 HLA 형별검사가 이루어지면서 많은 수의 새로운 HLA 대립유전자가 밝혀지게 되어 현재 HLA-A는 3,968종류, HLA-B는 4,828종류, HLA-C는 3,579종류, HLA-DRB은 2,376종류, HLA-DQB1은 1,142종류, HLA-DQA1은 94종류가 밝혀져 있다.(IMGT/HLA Database, Relelase 3.29.0)
HLA 검사 방법으로는 항체-항원 반응에 의한 혈청학적 방법(Serotyping)과 HLA 유전자 염기서열 차이를 판별하는 분자생물학적 방법(DNA typing)이 있다. 혈청학적 방법은 검사 방법의 복잡함과 결과의 신뢰도가 분자생물학적 방법보다 상대적으로 낮아 현재 전 세계적으로 분자생물학적 방법을 많이 사용하고 있다.
분자생물학적 방법으로는 크게 세 종류의 방법을 사용하는 데 첫 번째로 중합효소연쇄반응을 실시한 후 그 결과를 전기영동으로 확인하여 분석하는 PCR-SSP(sequence specific primers)방법, 두 번째로 중합효소연쇄반응을 실시한 후 탐침자를 이용하여 그 결과를 분석하는 PCR-SSOP(sequence specific oligonucleotide probes)방법, 세 번째로 중합효소연쇄반응을 실시한 후 염기서열분석에 의해 그 결과를 분석하는 PCR-SBT(sequence based typing)방법이 있고 이들 방법을 이용한 제품들이 개발되어 판매되고 있다. 그러나 종래의 방법은 사용자가 중합효소 연쇄반응을 기본적으로 실시하고 이후 다른 여러 반응 즉 혼성화 반응(hybridization)과 전기영동을 하여야 HLA 검사를 할 수 있는 불편함과 시간적인 소모가 요구되었다.
따라서, 중합효소연쇄반응만으로 HLA 검사를 할 수 있는 실시간 중합효소 연쇄반응에 대한 방법이 계속적으로 요구되고 있다. 본 기술과 유사한 PCR-SSP법은 한 튜브에서 하나의 단일염기만을 볼 수 있는 방법으로 HLA 검사를 하는데 많은 수의 튜브를 이용하여야 하는 단점을 가지고 있어 한 튜브에서 여러 유전자를 증폭하는 multiplex PCR 법에 대한 요구 또한 계속적으로 요구되었다.
특히, HLA 대립유전자 중 HLA-A, HLA-B, HLA-DRB1 유전자를 검출할 수 있는 기술은 많이 개발되어 있으나 HLA-C, HLA-DQB1, HLA-DQA1 유전자를 검출할 수 있는 기술은 아직 많이 개발되지 않았다.
본 발명의 배경 기술은 한국공개특허 제2014-0034969호 등에 개시되어 있다.
본 발명의 목적은 키트의 한 웰에서 HLA 대립유전자 HLA-A, HLA-B, HLA-DRB1, HLA-C, HLA-DQB1 또는 HLA-DQA1을 동시에 실시간 PCR법에 의해 검출할 수 있는, HLA 대립유전자 검사 키트를 제공하는 것이다.
본 발명의 다른 목적은 키트의 한 웰에서 HLA 대립유전자 HLA-A, HLA-B, HLA-DRB1 중 2개 이상을 실시간 PCR에 의해 검출할 수 있는, HLA 대립유전자 검사 키트를 제공하는 것이다.
본 발명의 다른 목적은 HLA-C, HLA-DQB1, HLA-DQA1를 검출할 수 있는, HLA 대립유전자 검사 키트를 제공하는 것이다.
본 발명의 HLA 대립 유전자 검사 키트는 HLA-A, HLA-B, HLA-DRB1, HLA-C, HLA-DQB1, HLA-DQA1 중 선택되는 1개 이상의 유전자에 대한 HLA 대립 유전자를 실시간 중합효소연쇄반응에 의해 특이적으로 증폭할 수 있는 시발체 세트; 및 상기 실시간 중합효소연쇄반응에 의해 증폭된 산물을 탐침할 수 있는 탐침자를 포함할 수 있다.
본 발명의 HLA 대립 유전자 판별 방법은 시료로부터 DNA를 얻는 단계, 상기 DNA를 본 발명에 따른 HLA 대립 유전자 검사 키트를 사용해서 실시간 중합효소연쇄반응을 하는 단계, 및 상기 실시간 중합효소연쇄반응의 결과를 판독하여 HLA 대립 유전자를 판별하는 단계를 포함할 수 있다.
본 발명은 키트의 한 웰에서 HLA 대립유전자 HLA-A, HLA-B, HLA-DRB1, HLA-C, HLA-DQB1, HLA-DQA1 중 2개 이상을 실시간 PCR에 의해 검출할 수 있는, HLA 대립유전자 검사 키트를 제공하였다.
본 발명은 키트의 한 웰에서 HLA 대립유전자 HLA-A, HLA-B, HLA-DRB1 중 2개 이상을 실시간 PCR에 의해 검출할 수 있는, HLA 대립유전자 검사 키트를 제공하였다.
본 발명은 HLA-C, HLA-DQB1, HLA-DQA1를 검출할 수 있는, HLA 대립유전자 검사 키트를 제공하였다.
도 1은 본 발명의 실시예에 따른 실시간 중합 효소 연쇄 반응에 의한 유전자 증폭 이미지를 나타낸 것이다.
도 2는 본 발명의 실시예에 따른 자동 분석 프로그램 이미지를 나타낸 것이다.
도 2는 본 발명의 실시예에 따른 자동 분석 프로그램 이미지를 나타낸 것이다.
이하, 본 발명의 구성을 구체적으로 설명한다.
본 발명의 HLA 대립 유전자 검사 키트는 HLA-A, HLA-B, HLA-DRB1, HLA-C, HLA-DQB1, HLA-DQA1 중 선택되는 1개 이상의 유전자에 대한 HLA 대립 유전자를 실시간 PCR에 의해 특이적으로 증폭할 수 있는 시발체 세트; 및 상기 실시간 PCR에 의해 증폭된 산물을 탐침할 수 있는 탐침자 세트를 포함할 수 있다.
일 구체예에서, HLA 대립 유전자 검사 키트는 HLA-C, HLA-DQB1, HLA-DQA1 중 선택되는 1개 이상의 유전자에 대한 HLA 대립 유전자를 실시간 PCR에 의해 특이적으로 증폭하는 시발체 세트를 포함할 수 있다. 바람직하게는, 상기 HLA 대립 유전자 검사 키트는 HLA-A, HLA-B, HLA-DRB1 중 선택되는 1개 이상의 유전자에 대한 HLA 대립 유전자를 실시간 PCR에 의해 특이적으로 더 증폭하는 시발체 세트를 더 포함할 수 있다.
다른 구체예에서, HLA 대립 유전자 검사 키트는 HLA-A, HLA-B, HLA-DRB1 중 선택되는 1개 이상의 유전자에 대한 HLA 대립 유전자를 실시간 PCR에 의해 특이적으로 증폭하는 시발체 세트를 포함할 수 있다. 바람직하게는, 상기 HLA 대립 유전자 검사 키트는 HLA-C, HLA-DQB1, HLA-DQA1 중 선택되는 1개 이상의 유전자에 대한 HLA 대립 유전자를 실시간 PCR에 의해 특이적으로 증폭하는 시발체 세트를 더 포함할 수 있다.
본 발명에서 사용되는 프라이머 시발체 세트는 하기와 같다:
세트 1-1; 서열번호 1: GACGCCGCGAGCCAGAA
서열번호 2: TCTGTGAGTGGGCCTTCAT
세트 1-2; 서열번호 3: GGGTCTCACACCCTCCAGT
서열번호 4: CCTTCCCGTTCTCCAGGTG
세트 2-1; 서열번호 5: GCCCCGCTTCATCGCA
서열번호 6: CCGTCCCAATACTCCGGA
세트 2-2; 서열번호 7: GCCTCCTCCGCGGGCATA
서열번호 8: TAGCGCGCTCCAGCTTGT
세트 3-1; 서열번호 9: TGGCTGCGACGTGGGGT
서열번호 10: CCACTCCACGCACGTGCCA
세트 3-2; 서열번호 11: CCCACTCCATGAGGTATTTCGA
서열번호 12: CAGTCTGTGTGTTGGTCTTGA
세트 4-1; 서열번호 13: GTTCTCACACCATCCAGATA
서열번호 14: GCCCTCCAGGTAGGCTCTCT
세트 4-2; 서열번호 15: CGCGAGTCCGAGGACGGA
서열번호 16: CAGTCTGTGTGTTGGTCTTGA
세트 5-1; 서열번호 17: CACACCCTCCAGATGATGTT
서열번호 18: CCTCCAGGTAGGCTCTCTG
세트 5-2; 서열번호 19: CTACGTGGACGACACGCT
서열번호 20: GTCAGTCTGTGCCTTGGC
세트 6; 서열번호 21: CCCATGAGGTATTTCTACACC
서열번호 22: CGCGATCCGCAGGCTCT
세트 7-1; 서열번호 23: GGAGTATTGGGACCGGAAC
서열번호 24: CCGGGGTCACTCACCGT
세트 7-2; 서열번호 25: CCGCGGGCATGACCAGTC
서열번호 26: CCAGGTATCTGCGGAGCGA
세트 8-1; 서열번호 27: CCACTCCATGAGGTATTTCAC
서열번호 28: CTTCACATTCCGTGTCTGCA
세트 8-2; 서열번호 29: GGTCTCACACTTGGCAGAG
서열번호 30: CCTCCAGGTAGGCTCTGTCC
세트 9-1; 서열번호 31: GACGCCGCGAGCCAGAG
서열번호 32: CCGGGGTCACTCACCGT
세트 9-2; 서열번호 33: CACACCATCCAGAGGATGTC
서열번호 34: CCTCCAGGTAGGCTCTGTCC
세트 10-1; 서열번호 35: CGTGTCCCGGCCCGGCAGT
서열번호 36: TCTGTGAGTGGGCCTTCAC
세트 10-2; 서열번호 37: TCCGCGGGTATGACCAGGA
서열번호 38: CCAGGTATCTGCGGAGCGA
세트 11; 서열번호 39: CCCACTCCATGAGGTATTTCTT
서열번호 40: GCGCGATCCGCAGGCTCT
세트 12-1; 서열번호 41: CCACTCCATGAGGTATTTCAC
서열번호 42: CTTCACATTCCGTGTGTTCCG
세트 12-2; 서열번호 43: CCGCGGGTACCACCAGGA
서열번호 44: GGAGCCACTCCACGCACAG
세트 13-1; 서열번호 45: CGGGTACCAGCAGGACGCT
서열번호 46: CTCCGCCTCATGGGCCGT
세트 13-2; 서열번호 47: CCCACTCCATGAGGTATTTCC
서열번호 48: CTTGTAGTAGCGGAGCGCGA
세트 14-1; 서열번호 49: CCCACTCCATGAGGTATTTCA
서열번호 50: GGTCCCAATACTCAGGCCT
세트 14-2; 서열번호 51: GTCTCACACCCTCCAGAGC
서열번호 52: CCTCCAGGTAGGCTCTGTCC
세트 15-1; 서열번호 53: CCTCCGCGGGTACCGG
서열번호 54: GAGCCACTCCACGCACGT
세트 15-2; 서열번호 55: GGAGCCCCGCTTCATTG
서열번호 56: CTTGTAGTAGCGGAGCGCGA
세트 16-1; 서열번호 57: TCCTCCGCGGGTACCGGC
서열번호 58: GGTATCTGCGGAGCCCG
세트 16-2; 서열번호 59: GAGGTATTTCTACACCGCCA
서열번호 60: GAGGTATTTCCACACCGCCA
서열번호 61: CGCTGTCGAACCTCACGAACA
세트 17; 서열번호 62: CTCCATGAGGTATTTCTACTCC
서열번호 63: ACGACGGCAAGGATTACA
서열번호 64: CCTTCATATTCCGTGTCTGCA
서열번호 65: GAGCCACTCCACGCACGT
서열번호 66: GAGCCCGTCCACGCACGT
세트 18-1; 서열번호 67: GCGACGTGGGGTCGGACT
서열번호 68: CCTCCAGGTAGGCTCTCAA
세트 18-2; 서열번호 69: GAGGTATTTCTACACCGCCA
서열번호 70: GAGCAGGGTCCGCAGGTC
세트 19-1; 서열번호 71: CGCAGTTCGTGCGGTTT
서열번호 72: CAGGGTCCCCAGGTCCA
세트 19-2; 서열번호 73: GTCTCACACCCTCCAGAGC
서열번호 74: CCTCCAACTTGCGCTGGGA
세트 20-1; 서열번호 75: GAGCCCCGCTTCATCGCA
서열번호 76: TCCCCAGGTTCGCTCGGTT
세트 20-2; 서열번호 77: AGATCACCCAGCGCAAGTG
서열번호 78: AGCGCGCTCCAGCTTGT
세트 21-1; 서열번호 79: CACACCCTCCAGATGATGTT
서열번호 80: TCTCAACTGCTCCGCCACAC
세트 21-2; 서열번호 81: CATGAGGTATTTCCACACCT
서열번호 82: CTCCTTCCTCGGACTCGT
서열번호 83: GGCTCCTTCCTCGGACTCGT
세트 22-1; 서열번호 84: CCCATGAGGTATTTCTACACC
서열번호 85: CCACTCGGTCAGTCTGTGAC
세트 22-2; 서열번호 86: CTGCGACCTGGGGCCC
서열번호 87: CCTCCAGGTAGGCTCTGTC
세트 23-1; 서열번호 88: CTTGTGGCAGCTTAAGTTTGAA
서열번호 89: CCGCCTCTGCTCCAGGAG
서열번호 90: CCGCTCGTCTTCCAGGAT
세트 23-2; 서열번호 91: CTACGTGGACGACACGCA
서열번호 92: AGTCTGTGTGTTGGTCTTGC
세트 24-1; 서열번호 93: CCTGTGGCAGCCTAAGAGG
서열번호 94: TCCACCGCGGCCCGCGC
세트 24-2; 서열번호 95: CGCGAGTCCGAGGATGGC
서열번호 96: CTGTGCCTGGCGCTTGTACT
세트 25-1; 서열번호 97: CCTGTGGCAGCCTAAGAGG
서열번호 98: TAGGTGTCCACCGCGGCG
세트 25-2; 서열번호 99: GCCGCGAGTCCGAGAGA
서열번호 100: TGTGCCTGGGCCTTGTA
세트 26-1; 서열번호 101: GTTTCTTGGAGTACTCTACGTC
서열번호 102: GCAGTAGTTGTCCACCCGGC
세트 26-2; 서열번호 103: GCCGCGAGTCCGAGGAT
서열번호 104: GGTCTTGTAGATCTGTGTGTTC
서열번호 105: GGTCTTGAAGATCTGTGTGTTC
서열번호 106: GGTCTTGGAGATCTGTGTGTTC
서열번호 107: GGTCTTGCAGATCTGTGTGTTC
세트 27-1; 서열번호 108: GTTTCTTGGAGCAGGTTAAACA
서열번호 109: CTGGCTGTTCCAGTACTCGG
세트 27-2; 서열번호 110: CGCGAGTCCGAGGATGGC
서열번호 111: CACGAGTCCGAGGATGGC
서열번호 112: TGGTCTTGGAGATCTGTGTCTC
세트 28-1; 서열번호 113: TCCTGTGGCAGGGTAAGTATA
서열번호 114: CCCGTAGTTGTGTCTGCACAC
세트 28-2; 서열번호 115: ATGAGGTATTTCTACACCTCCG
서열번호 116: TGGTTGTAGTAGCGGAGCGC
세트 29-1; 서열번호 117: AGTACTCTACGGGTGAGTGTT
서열번호 118: TGCAGTAGGTGTCCACCAG
서열번호 119: CTGTTCCAGTACTCGGCGCT
세트 29-2; 서열번호 120: GCCGCGAGTCCGAGGAC
서열번호 121: AGTCTGTGTGTTGGTCTTGG
세트 30-1; 서열번호 122: GACGGAGCGGGTGCGGTA
서열번호 123: ACCCCGTAGTTGTGTCTGCACAC
세트 30-2; 서열번호 124: CGCGAGTCCGAGGATGGC
서열번호 125: GTCTGTGTGTTGGTCTTGTAG
세트 31-1: 서열번호 126: GCGGTTGCTGGAAAGACGCG
서열번호 127: GCTGCACTGTGAAGCTCTCAC
세트 31-2: 서열번호 128: GACGCCGCGAGTCCGACAGG
서열번호 129: TCTGTGCCTGGGCCTTGTA
세트 32-1: 서열번호 130: GTTTCTTGGAGTACTCTACGTC
서열번호 131: CTGGCTGTTCCAGTACTCCT
세트 32-2: 서열번호 132: GCCGCGAGTCCGAGAGA
서열번호 133: TGGTCTTGGAGATCTGTGTCTC
서열번호 134: TGGCCTTGCAGATCTGTGTCTC
세트 33-1; 서열번호 135: AGTACTCTACGGGTGAGTGTT
서열번호 136: CTGTTCCAGGACTCGGCGA
세트 33-2; 서열번호 137: GGGGAGCCCCGCTTCATCT
서열번호 138: GTTCCGCAGGCTCTCTCGGTA
세트 34-1; 서열번호 139: GTTTCTTGGAGTACTCTACGTC
서열번호 140: CCCGCTCGTCTTCCAGGAT
서열번호 141: CCCGCTTGTCTTCCAGGAT
세트 34-2; 서열번호 142: CTACGTGGACGACACGCT
서열번호 143: TGTAGTAGCCGCGCAGGT
세트 35-1; 서열번호 144: GTTTCTTGGAGTACTCTACGTC
서열번호 145: CCCGCCTGTCTTCCAGGAA
서열번호 146: CCCGCTCGTCTTCCAGGAA
세트 35-2; 서열번호 147: CGCGAGTCCGAGGATGGC
서열번호 148: GTTGTAGTAGCGGAGCGCGG
서열번호 149: GTTGTAGTAGCGGAGCGCGA
세트 36-1; 서열번호 150: GTTTCTTGGAGTACTCTACGTC
서열번호 151: CTGGCTGTTCCAGTACTCGG
세트 36-2; 서열번호 152: CGCGAGTCCGAGGACGGA
서열번호 153: TCTGCGCGGAGGCCTTCAT
세트 37-1; 서열번호 154: GGTTCCTGGACAGATACTTCC
서열번호 155: CACCTCGGCCCGCCTCC
세트 37-2; 서열번호 156: GGTCTCACACTTGGCAGAG
서열번호 157: GGAGCCACTCCACGCACGT
세트 38-1; 서열번호 158: GGTTCCTGGAGAGATACTTCC
서열번호 159: CACCGCGGCCCGCCTCT
세트 38-2; 서열번호 160: CTCAGTGGGTACGTGGACGG
서열번호 161: CCCAATACTCCGGCCCCTCT
세트 39-1; 서열번호 162: GTTTCTTGGAGTACTCTACGTC
서열번호 163: CTGTTCCAGTGCTCCGCAG
세트 39-2; 서열번호 164: CCGCGGGCATAACCAGTTA
서열번호 165: CCGCGGGTATAACCAGTTA
서열번호 166: AGCCACTCCACGCACAG
서열번호 167: AGCGACTCCACGCACAG
세트 40-1; 서열번호 168: GGTTCCTGGACAGATACTTCC
서열번호 169: CTGTTCCAGTGCTCCGCAG
세트 40-2; 서열번호 170: AGTACGCCTACGACGGCAAA
서열번호 171: GGAGCCACTCCACGCACAG
세트 41-1; 서열번호 172: GTTTCTTGGAGCAGGTTAAACA
서열번호 173: GCTYACCTCGCCKCTGCAC
세트 41-2; 서열번호 174: GGCCAGGGTCTCACACTTGG
서열번호 175: GGAGCCACTCCACGCACGT
세트 42-1; 서열번호 176: GTTTCTTGGAGTACTCTACGTC
서열번호 177: TCTGCAGTAGGTGTCCACCAG
세트 42-2; 서열번호 178: CGCGGGCATAACCAGTTC
서열번호 179: CGCGGGCATGACCAGTTC
서열번호 180: CACGTGCCCTCCAGGTAGGT
세트 43-1; 서열번호 181: GTACTCTACGTCTGAGTGTCAA
서열번호 182: GCTGCACTGTGAAGCTCTCCA
세트 43-2; 서열번호 183: GGGTCTCACATCATCCAGGT
서열번호 184: GGAGCCACTCCACGCACAG
세트 44-1; 서열번호 185: CCACAGCACGTTTCTTGGAGCT
서열번호 186: GCAGTAATTGTCCACCCGGC
서열번호 187: GCAGTAATTGTCCACCTGGC
세트 44-2; 서열번호 188: TGAGGTATTTCTACACCGCCA
서열번호 189: TGAGGTATTTCCACACCGCCA
서열번호 190: TGAGGTATTTCGACACCGCCA
서열번호 191: TGTAGTAGCCGCGCAGGT
세트 45-1; 서열번호 192: GAGCGAGTGTGGAACCTGAT
서열번호 193: CTGCACTGTGAAGCTCTCCA
세트 45-2; 서열번호 194: CGCGGGCATGACCAGTC
서열번호 195: CGCGGGTATGACCAGTC
서열번호 196: GAGCCACTCCACGCACAG
서열번호 197: GAGCCCGTCCACGCACAG
세트 46-1; 서열번호 198: GTTTCTTGCAGCAGGATAAGTA
서열번호 199: CCGCTGCACTGTGAAGCTCT
세트 46-2; 서열번호 200: GAGGTATTTCYACACCGCCA
서열번호 201: TGTGCCTGGGCCTTGTA
세트 47; 서열번호 202: GACGACACGCAGTTCGTGA
서열번호 203: GACGACACGCTGTTCGTGA
서열번호 204: GACGACACCCAGTTCGTGA
서열번호 205: GACGGCACCCAGTTCGTGA
서열번호 206: CGCTCTGGTTGTAGTAGCG
세트 48; 서열번호 207: GACGACACGCAGTTCGTGA
서열번호 208: GACGACACGCTGTTCGTGA
서열번호 209: GACGACACCCAGTTCGTGA
서열번호 210: GACGGCACCCAGTTCGTGA
서열번호 211: CGCTCTGGTTGTAGTAGCC
세트 49; 서열번호 212: CATCCGTGTCCCGGCCT
서열번호 213: CGCAGGTTCCGCAGGCW
세트 50; 서열번호 214: ACCGCCGCGGACACA
서열번호 215: AGCCACTCCACGCACTC
세트 51; 서열번호 216: CCGCGGGTATGACCAGTC
서열번호 217: AGCGTCTCCTTCCCATTCTT
세트 52; 서열번호 218: TACAACCAGAGCGAGGCCA
서열번호 219: AGCCATACATCCTCTGGAT
세트 53; 서열번호 220: ATGAGGTATTTCTACACCGCT
서열번호 221: CCGGGGTCACTCACCGG
세트 54; 서열번호 222: GGCCAGGGTCTCACATCA
서열번호 223: AGCGTCTCCTTCCCATTCTT
세트 55; 서열번호 224: TATTTCTCCACATCCGTGTCCT
서열번호 225: CTGCTCCACCCACGGCT
세트 56; 서열번호 226: CAAGGATTACATCGCCCTGAAT
서열번호 227: CGCGCGCTGCAGCGTCTT
세트 57; 서열번호 228: GACACGCAGTTCGTGCG
서열번호 229: GCGCAGTTTCCGCAGGT
세트 58; 서열번호 230: CCACTCCATGAGGTATTTCG
서열번호 231: GCGCAGTTTCCGCAGGT
세트 59; 서열번호 232: GGTCTCACACCCTCCAGA
서열번호 233: CCACTGCCCCTGGTACCT
세트 60; 서열번호 234: GCCTCCTCCGCGGGTATA
서열번호 235: TCTCAGCTGCTCCGCCGT
세트 61; 서열번호 236: CACCCTCCAGAGGATGTAC
서열번호 237: CACCCTCCAGTGGATGTGT
서열번호 238: GAGCCGCCGTGTCCGCA
세트 62; 서열번호 239: ACCTGCGCTCCTGGACT
서열번호 240: AGGACCTGCGCTCCTGGATT
서열번호 241: CCTCCAGGTAGGCTCTCCA
세트 63; 서열번호 242: CCACTCCATGAGGTATTTCTC
서열번호 243: CCTGCTCCACCCATGGCG
세트 64; 서열번호 244: CATGAGGTATTTCTACACCGCT
서열번호 245: CTGTGCCTGGCGCTTGTAG
세트 65; 서열번호 246: ACACCCTCCAGTGGATGTA
서열번호 247: GCCCTCCTGGTAGGCTCTCT
세트 66; 서열번호 248: CTCCGCGGGTATAACCAGTT
서열번호 249: TCCCGTTCTCCAGGTATCC
세트 67; 서열번호 250: CGACACGCAGTTCGTGCA
서열번호 251: GCGCAGTTTCCGCAGGT
세트 68; 서열번호 252: GCCAGGGTCTCACACCT
서열번호 253: CCCACTGCCCCTGGTACCC
세트 69; 서열번호 254: CGCCCTGAACGAGGAT
서열번호 255: CCAGGTATCTGCGGAGCCA
세트 70; 서열번호 256: CACGTGACCCACCATCT
서열번호 257: GCTCTTCTCCAGAAGGCACCAC
세트 71; 서열번호 258: GTGCGTCTTGTGAGCAGAAG
서열번호 259: CGTGCGGAGCTCCAACTG
세트 72; 서열번호 260: GCTACTTCACCAACGGGACC
서열번호 261: TGGTAGTTGTGTCTGCATACG
세트 73; 서열번호 262: ACGGAGCGCGTGCGGGG
서열번호 263: CCCGCGGTACGCCACCTC
세트 74; 서열번호 264: TTTCGTGCTCCAGTTTAAGGC
서열번호 265: CCGCGGAACGCCACCTC
세트 75; 서열번호 266: GACGTGGGGGTGTACCGC
서열번호 267: CCGCGGAACGCCACCTC
세트 76; 서열번호 268: GGAGCGCGTGCGTCTTGTA
서열번호 269: TGCACACCCTGTCCACCG
서열번호 270: TGCACACCGTGTCCAACTC
세트 77; 서열번호 271: GACGGAGCGCGTGCGTTA
서열번호 272: CGTGCGGAGCTCCAACTG
세트 78; 서열번호 273: GTGCGTCTTGTGACCAGATA
서열번호 274: CTGTTCCAGTACTCGGCGG
세트 79; 서열번호 275: GACGGAGCGCGTGCGTCT
서열번호 276: CTGTTCCAGTACTCGGCGT
세트 80; 서열번호 277: GGAGCGCGTGCGTCTTGTA
서열번호 278: CCCCTGCGGCGTCACCGCG
세트 81; 서열번호 279: ACCGAGCGCGTGCGGGG
서열번호 280: TGGTAGTTGTGTCTGCATACG
세트 82; 서열번호 281: GTGCGTCTTGTGAGCAGAAG
서열번호 282: CTGTTCCAGTACTCGGCGG
세트 83; 서열번호 283: GAGCGCGTGCGTCTTGTG
서열번호 284: TGCACACCGTGTCCAACTC
세트 84; 서열번호 285: GCGACGTGGGGGTGTAT
서열번호 286: TGCACACCGTGTCCAACTC
세트 85; 서열번호 287: GTGGTGTAAACTTGTACCAGTT
서열번호 288: GTTTTGCCACAGCCATGTTTC
세트 86; 서열번호 289: CCATGAATTTGATGGAGATGAGC
서열번호 290: ATGATGTTCAAGTTGTGTTTTGCC
세트 87; 서열번호 291: TTTACGGTCCCTCTGGCCAGTT
서열번호 292: TGTTCAAGTTGTGTTTTGCC
세트 88; 서열번호 293: AGAGGAAGGAGACTGTCTGGAA
서열번호 294: CAGGATGTTCAAGTTATGTTTTAGC
세트 89; 서열번호 295: TGGTCCCTCTGGGCAGTACAG
서열번호 296: TAGAGTTGGAGCGTTTAATCAC
세트 90; 서열번호 297: CTTACGGTCCCTCTGGCCAGTA
서열번호 298: CAGGATGTTCAAGTTGTGTTTTGT
세트 91; 서열번호 299: CTTACGGTCCCTCTGGCCAGTA
서열번호 300: GAGTTGGAGCGTTTAATCAGAC
세트 92; 서열번호 301: CTTACGGTCCCTCTGGCCAGTT
서열번호 302: CAGGATGTTCAAGTTGTGTTTTGT
본 발명의 키트에 의해 분석 가능한 HLA-A 대립 유전자는 HLA-A*01, HLA-A*02, HLA-A*03, HLA-A*11, HLA-A*23, HLA-A*24, HLA-A*25, HLA-A*26, HLA-A*29, HLA-A*30, HLA-A*31, HLA-A*32, HLA-A*33, HLA-A*34, HLA-A*36, HLA-A*43, HLA-A*66, HLA-A*68, HLA-A*69, HLA-A*74, HLA-A*80 중 하나 이상을 포함할 수 있다.
본 발명의 키트에 의해 분석 가능한 HLA-B 대립 유전자는 HLA-B*07, HLA-B*08, HLA-B*13, HLA-B*14, HLA-B*15, HLA-B*18, HLA-B*27, HLA-B*35, HLA-B*37, HLA-B*38, HLA-B*39, HLA-B*40, HLA-B*41, HLA-B*42, HLA-B*44, HLA-B*45, HLA-B*46, HLA-B*47, HLA-B*48, HLA-B*49, HLA-B*50, HLA-B*51, HLA-B*52, HLA-B*53, HLA-B*54, HLA-B*55, HLA-B*56, HLA-B*57, HLA-B*58, HLA-B*59, HLA-B*67, HLA-B*73, HLA-B*78, HLA-B*81, HLA-B*82, HLA-B*83 중 하나 이상을 포함할 수 있다.
본 발명의 키트에 의해 분석 가능한 HLA-DRB1 대립 유전자는 HLA-DRB1*01, HLA-DRB1*03, HLA-DRB1*04, HLA-DRB1*07, HLA-DRB1*08, HLA-DRB1*09, HLA-DRB1*10, HLA-DRB1*11, HLA-DRB1*12, HLA-DRB1*13, HLA-DRB1*14, HLA-DRB1*15, HLA-DRB1*16 중 하나 이상을 포함할 수 있다.
본 발명의 키트에 의해 분석 가능한 HLA-C 대립 유전자는 HLA-C*01, HLA-C*02, HLA-C*03, HLA-C*04, HLA-C*05, HLA-C*06, HLA-C*07, HLA-C*08, HLA-C*12, HLA-C*14, HLA-C*15, HLA-C*16, HLA-C*17, HLA-C*18 중 하나 이상을 포함할 수 있다.
본 발명의 키트에 의해 분석 가능한 HLA-DQB1 대립 유전자는 HLA-DQB1*02, HLA-DQB1*03, HLA-DQB1*04, HLA-DQB1*05, HLA-DQB1*06 중 하나 이상을 포함할 수 있다.
본 발명의 키트에 의해 분석 가능한 HLA-DQA1 대립 유전자는 HLA-DQA1*01, HLA-DQA1*02, HLA-DQA1*03, HLA-DQA1*04, HLA-DQA1*05, HLA-DQA1*06 중 하나 이상을 포함할 수 있다.
<HLA-A 유전자 분석>
HLA-A 유전자 분석을 위한 시발체 세트는 세트 1-1, 세트 2-1, 세트 3-1, 세트 4-1, 세트 5-1, 세트 6, 세트 7-1, 세트 8-1, 세트 9-1, 세트 10-1, 세트 11, 세트 12-1, 세트 13-1, 세트 14-1, 세트 15-1, 세트 16-1, 세트 17, 세트 18-1, 세트 19-1, 세트 20-1, 세트 21-1, 세트 22-1 중 하나 이상을 포함할 수 있다.
HLA-A*01의 분석을 위한 시발체 세트는 세트 1-1, 세트 4-1, 세트 7-1, 세트 9-1, 세트 16-1, 세트 17 중 하나 이상을 포함할 수 있다. 바람직하게는, HLA-A*01의 분석을 위한 시발체 세트는 하기 조합 중 하나 이상을 포함할 수 있다.
세트 1-1과 세트 16-1;
세트 16-1;
세트 1-1, 세트 4-1, 세트 16-1 및 세트 17;
세트 1-1, 세트 16-1 및 세트 17;
세트 1-1, 세트 4-1 및 세트 16-1;
세트 7-1과 세트 16-1;
세트 9-1과 세트 16-1.
HLA-A*02의 분석을 위한 시발체 세트는 세트 2-1, 세트 3-1, 세트 5-1, 세트 9-1, 세트 11, 세트 13-1, 세트 15-1, 세트 17, 세트 18-1, 세트 22-1 중 하나 이상을 포함할 수 있다. 바람직하게는, HLA-A*02의 분석을 위한 시발체 세트는 하기 조합 중 하나 이상을 포함할 수 있다.
세트 2-1과 세트 17;
세트 2-1;
세트 2-1과 세트 18-1;
세트 17과 세트 18-1;
세트 2-1, 세트 17, 세트 18-1과 세트 22-1;
세트 2-1, 세트 11, 세트 17과 세트 18-1;
세트 2-1, 세트 15-1과 세트 17;
세트 2-1, 세트 13-1과 세트 17;
세트 2-1, 세트 3-1과 세트 18-1;
세트 2-1, 세트 15-1, 세트 17과 세트 18-1;
세트 2-1, 세트 9-1, 세트 17과 세트 18-1;
세트 2-1, 세트 9-1과 세트 17;
세트 2-1, 세트 5-1과 세트 17;
세트 7-1, 세트 9-1, 세트 17과 세트 18-1.
HLA-A*03의 분석을 위한 시발체 세트는 세트 2-1, 세트 3-1, 세트 4-1, 세트 9-1, 세트 15-1, 세트 16-1, 세트 17, 세트 19-1, 세트 22-1 중 하나 이상을 포함할 수 있다. 바람직하게는, HLA-A*03의 분석을 위한 시발체 세트는 하기 조합 중 하나 이상을 포함할 수 있다;
세트 3-1과 세트 15-1;
세트 3-1, 세트 15-1, 세트 17과 세트 19-1;
세트 3-1, 세트 15-1과 세트 17;
세트 3-1, 세트 4-1, 세트 15-1과 세트 17;
세트 4-1, 세트 15-1과 세트 17;
세트 3-1, 세트 15-1, 세트 17과 세트 22-1;
세트 3-1, 세트 9-1, 세트 15-1과 세트 17;
세트 3-1, 세트 4-1과 세트 17;
세트 9-1, 세트 15-1과 세트 17;
세트 2-1, 세트 3-1, 세트 15-1과 세트 17;
세트 3-1, 세트 16-1과 세트 17;
세트 3-1;
세트 16-1과 세트 17;
세트 4-1, 세트 16-1과 세트 17;
세트 3-1, 세트 15-1, 세트 17과 세트 18-1;
HLA-A*11의 분석을 위한 시발체 세트는 세트 4-1, 세트 5-1, 세트 7-1, 세트 9-1, 세트 15-1, 세트 17, 세트 22-1 중 하나 이상을 포함할 수 있다. 바람직하게는, HLA-A*11의 분석을 위한 시발체 세트는 하기 조합 중 하나 이상을 포함할 수 있다;
세트 4-1, 세트 9-1과 세트 22-1;
세트 4-1, 세트 9-1, 세트 15-1, 세트 17과 세트 22-1;
세트 9-1과 세트 22-1;
세트 4-1, 세트 7-1, 세트 9-1과 세트 22-1;
세트 4-1, 세트 9-1, 세트 17과 세트 22-1;
세트 4-1과 세트 22-1;
세트 4-1;
세트 4-1과 세트 9-1;
세트 4-1, 세트 9-1, 세트 16-1, 세트 17과 세트 22-1;
세트 4-1, 세트 9-1, 세트 16-1과 세트 22-1;
세트 9-1, 세트 16-1과 세트 22-1;
세트 5-1, 세트 9-1과 세트 22-1.
HLA-A*23의 분석을 위한 시발체 세트는 세트 16-1, 세트 17, 세트 21-1 중 하나 이상을 포함할 수 있다. 바람직하게는, HLA-A*23의 분석을 위한 시발체 세트는 하기 조합 중 하나 이상을 포함할 수 있다;
세트 17과 세트 21-1;
세트 21-1;
세트 16-1, 세트 17과 세트 21-1.
HLA-A*24의 분석을 위한 시발체 세트는 세트 3-1, 세트 4-1, 세트 5-1, 세트 9-1, 세트 17, 세트 21-1 중 하나 이상을 포함할 수 있다. 바람직하게는, HLA-A*24의 분석을 위한 시발체 세트는 하기 조합 중 하나 이상을 포함할 수 있다;
세트 17과 세트 21-1;
세트 5-1;
세트 5-1, 세트 16-1과 세트 17;
세트 3-1과 세트 17;
세트 5-1, 세트 9-1과 세트 17;
세트 4-1과 세트 17;
세트 3-1, 세트 5-1과 세트 17.
HLA-A*25의 분석을 위한 시발체 세트는 세트 6, 세트 7-1, 세트 9-1, 세트 11, 세트 13-1, 세트 17, 세트 22-1 중 하나 이상을 포함할 수 있다. 바람직하게는, HLA-A*25의 분석을 위한 시발체 세트는 하기 조합 중 하나 이상을 포함할 수 있다;
세트 6, 세트 7-1, 세트 9-1과 세트 13-1;
세트 6, 세트 7-1과 세트 9-1;
세트 6, 세트 7-1, 세트 9-1, 세트 13-1과 세트 22-1;
세트 7-1, 세트 9-1, 세트 11, 세트 13-1;
세트 6, 세트 7-1, 세트 9-1, 세트 13-1과 세트 17;
세트 6과 세트 13-1;
세트 7-1, 세트 9-1과 세트 13-1.
HLA-A*26의 분석을 위한 시발체 세트는 세트 7-1, 세트 9-1, 세트 13-1, 세트 17, 세트 22-1 중 하나 이상을 포함할 수 있다. 바람직하게는, HLA-A*26의 분석을 위한 시발체 세트는 하기 조합 중 하나 이상을 포함할 수 있다;
세트 9-1과 세트 13-1;
세트 7-1, 세트 9-1, 세트 13-1과 세트 17;
세트 7-1과 세트 9-1;
세트 9-1, 세트 13-1과 세트 22-1;
세트 7-1과 세트 13-1.
HLA-A*29의 분석을 위한 시발체 세트는 세트 8-1, 세트 9-1, 세트 15-1, 세트 16-1, 세트 17, 세트 19-1, 세트 21-1 중 하나 이상을 포함할 수 있다. 바람직하게는, HLA-A*29의 분석을 위한 시발체 세트는 하기 조합 중 하나 이상을 포함할 수 있다;
세트 8-1, 세트 15-1과 세트 17;
세트 8-1과 세트 15-1;
세트 8-1과 세트 17;
세트 8-1, 세트 16-1과 세트 17;
세트 8-1, 세트 15-1, 세트 17과 세트 21-1;
세트 8-1, 세트 15-1, 세트 17과 세트 19-1;
세트 15-1, 세트 17과 세트 19-1;
세트 8-1, 세트 9-1, 세트 15-1과 세트 17;
세트 8-1.
HLA-A*30의 분석을 위한 시발체 세트는 세트 2-1, 세트 3-1, 세트 4-1, 세트 10-1, 세트 15-1, 세트 17, 세트 22-1 중 하나 이상을 포함할 수 있다. 바람직하게는, HLA-A*30의 분석을 위한 시발체 세트는 하기 조합 중 하나 이상을 포함할 수 있다;
세트 10-1과 세트 17;
세트 10-1;
세트 10-1, 세트 17-1과 세트 22-1;
세트 2-1, 세트 10-1과 세트 17;
세트 10-1, 세트 15-1과 세트 17;
세트 3-1, 세트 10-1과 세트 17;
세트 4-1, 세트 10-1과 세트 17.
HLA-A*31의 분석을 위한 시발체 세트는 세트 9-1, 세트 14-1, 세트 15-1, 세트 17, 세트 21-1 중 하나 이상을 포함할 수 있다. 바람직하게는, HLA-A*31의 분석을 위한 시발체 세트는 하기 조합 중 하나 이상을 포함할 수 있다;
세트 14-1과 세트 17;
세트 9-1, 세트 14-1, 세트 15-1과 세트 17;
세트 14-1, 세트 15-1과 세트 17;
세트 17;
세트 14-1;
세트 14-1, 세트 17과 세트 21-1.
HLA-A*32의 분석을 위한 시발체 세트는 세트 3-1, 세트 6, 세트 9-1, 세트 11, 세트 15-1, 세트 17 중 하나 이상을 포함할 수 있다. 바람직하게는, HLA-A*32의 분석을 위한 시발체 세트는 하기 조합 중 하나 이상을 포함할 수 있다;
세트 11과 세트 17;
세트 3-1, 세트 11, 세트 15-1과 세트 17;
세트 11;
세트 11, 세트 15-1과 세트 17;
세트 9-1, 세트 11, 세트 17;
세트 6과 세트 17.
HLA-A*33의 분석을 위한 시발체 세트는 세트 5-1, 세트 7-1, 세트 9-1, 세트 10-1, 세트 12-1, 세트 15-1, 세트 17 중 하나 이상을 포함할 수 있다. 바람직하게는, HLA-A*33의 분석을 위한 시발체 세트는 하기 조합 중 하나 이상을 포함할 수 있다;
세트 12-1과 세트 17;
세트 12-1;
세트 7-1, 세트 9-1, 세트 12-1과 세트 17;
세트 12-1, 세트 15-1과 세트 17;
세트 5-1, 세트 12-1과 세트 17;
세트 10-1, 세트 12-1과 세트 17;
HLA-A*34의 분석을 위한 시발체 세트는 세트 7-1, 세트 9-1, 세트 13-1, 세트 15-1, 세트 17, 세트 22-1 중 하나 이상을 포함할 수 있다. 바람직하게는, HLA-A*34의 분석을 위한 시발체 세트는 하기 조합 중 하나 이상을 포함할 수 있다;
세트 7-1, 세트 9-1, 세트 13-1과 세트 17;
세트 7-1, 세트 9-1, 세트 13-1, 세트 15-1, 세트 17과 세트 22-1;
세트 7-1, 세트 9-1, 세트 15-1, 세트 17과 세트 22-1;
세트 7-1, 세트 9-1, 세트 17과 세트 22-1;
세트 7-1, 세트 9-1, 세트 13-1, 세트 15-1과 세트 17;
세트 13-1, 세트 15-1, 세트 17과 세트 22-1.
HLA-A*36의 분석을 위한 시발체 세트는 세트 1-1, 세트 15-1, 세트 17 중 하나 이상을 포함할 수 있다. 바람직하게는, HLA-A*36의 분석을 위한 시발체 세트는 하기 조합 중 하나 이상을 포함할 수 있다;
세트 1-1, 세트 15-1과 세트 17;
세트 1-1.
HLA-A*43의 분석을 위한 시발체 세트는 세트 9-1, 세트 13-1, 세트 17 중 하나 이상을 포함할 수 있다. 바람직하게는 HLA-A*36의 분석을 위한 시발체 세트는 세트 9-1, 세트 13-1과 세트 17을 포함할 수 있다.
HLA-A*66의 분석을 위한 시발체 세트는 세트 7-1, 세트 9-1, 세트 13-1, 세트 22-1 중 하나 이상을 포함할 수 있다. 바람직하게는, HLA-A*66의 분석을 위한 시발체 세트는 하기 조합 중 하나 이상을 포함할 수 있다;
세트 13-1과 세트 22-1;
세트 13-1;
세트 22-1;
세트 7-1과 세트 9-1.
HLA-A*68의 분석을 위한 시발체 세트는 세트 15-1, 세트 16-1, 세트 17, 세트 19-1, 세트 22-1 중 하나 이상을 포함할 수 있다. 바람직하게는, HLA-A*68의 분석을 위한 시발체 세트는 하기 조합 중 하나 이상을 포함할 수 있다;
세트 15-1, 세트 17과 세트 22-1;
세트 15-1과 세트 17;
세트 15-1, 세트 17, 세트 19-1과 세트 22-1;
세트 17과 세트 22-1;
세트 15-1;
세트 16-1, 세트 17과 세트 22-1.
HLA-A*69의 분석을 위한 시발체 세트는 세트 7-1, 세트 9-1, 세트 17, 세트 18-1, 세트 22-1, 중 하나 이상을 포함할 수 있다. 바람직하게는, HLA-A*69의 분석을 위한 시발체 세트는 하기 조합 중 하나 이상을 포함할 수 있다;
세트 17, 세트 18-1과 세트 22-1;
세트 7-1, 세트 9-1, 세트 17, 세트 18-1과 세트 22-1.
HLA-A*74의 분석을 위한 시발체 세트는 세트 9-1, 세트 17, 세트 19-1 중 하나 이상을 포함할 수 있다. 바람직하게는, HLA-A*74의 분석을 위한 시발체 세트는 하기 조합 중 하나 이상을 포함할 수 있다;
세트 17과 세트 19-1;
세트 9-1과 세트 17.
HLA-A*80의 분석을 위한 시발체 세트는 세트 9-1, 세트 16-1, 세트 17, 세트 20-1 중 하나 이상을 포함할 수 있다. 바람직하게는, HLA-A*80의 분석을 위한 시발체 세트는 하기 조합 중 하나 이상을 포함할 수 있다;
세트 9-1, 세트 16-1과 세트 20-1;
세트 9-1, 세트 16-1, 세트 17과 세트 20-1.
상기 조합에 있어서, 상기 세트는 검사 키트에서 동일 웰(well)에 포함될 수도 있으나, 바람직하게는 각각 서로 다른 웰(well)에 포함될 수 있다.
웰은 실시간 PCR에 의해 증폭된 산물을 탐침할 수 있도록 형광 탐침자를 포함할 수 있다. 형광 탐침자는 HLA-A 대립 유전자의 증폭 유무를 확인할 수 있으며, 하기 서열 중 하나 이상을 포함할 수 있다:
서열번호 305: FAM 5'-CGTGGATAGAGCAGGAGGGGCCGGAGT-3' BHQ-1
서열번호 306: FAM 5'-CGACACGCAGTTCGTGCGGTTCGACAGC-3' BHQ-1
서열번호 307: FAM 5'-TGAAGGCCCASTCACAGACTSACCGA-3' BHQ-1
서열번호 308: AM 5'-TGAAGGCCCACTCACAGACTGACCGA-3' BHQ-1
서열번호 309: FAM 5'-AGGACCTGCGCTCTTGGACCGCGGCGGAC-3' BHQ-1
서열번호 310: FAM 5'-TCTTGGACCGCGGCGGACATGG-3' BHQ-1
일 구체예에서, 서열번호 305의 탐침자는 세트 1-1와 조합될 수 있다.
일 구체예에서, 서열번호 306의 탐침자는 세트 2-1, 세트 6-1, 세트 8-1, 세트 10-1, 세트 11-1, 세트 12-1, 세트 14-1, 세트 20-1, 세트 22-1 또는 세트 17과 조합될 수 있다.
일 구체예에서, 서열번호 307의 탐침자는 세트 9-1와 조합될 수 있다.
일 구체예에서, 서열번호 308의 탐침자는 세트 7-1, 세트 19-1과 조합될 수 있다.
일 구체예에서, 서열번호 309의 탐침자는 세트 3-1, 세트 4-1, 세트 5-1, 세트 13-1, 세트 15-1, 세트 16-1, 세트 18-1 또는 세트 21-1과 조합될 수 있다.
일 구체예에서, 서열번호 310의 탐침자는 서열번호 17과 조합될 수 있다.
웰은 HLA-A 증폭 유무의 동작 여부를 확인하기 위하여 양성 대조군의 증폭 유무를 확인하기 위하여 하기 서열번호 303과 서열번호 304의 시발체 세트와, 이를 검출할 수 있는 서열번호 330의 형광 탐침자 세트를 더 포함할 수 있다:
서열번호 303: ATGATGTTGACCTTTCCAGGG
서열번호 304: CTGTAACTTTTCATCAGTTGC
서열번호 330: Cal-Red610 5'-ACTAACCTCCAACCAACAATCAGC-3' BHQ2
<HLA-B 유전자 분석>
HLA-B 유전자 분석을 위한 시발체 세트는 세트 1-2, 세트 2-2, 세트 3-2, 세트 4-2, 세트 5-2, 세트 7-2, 세트 8-2, 세트 9-2, 세트 10-2, 세트 12-2, 세트 13-2, 세트 14-2, 세트 15-2, 세트 16-2, 세트 18-2, 세트 19-2, 세트 20-2, 세트 21-2, 세트 22-2, 세트 23-2, 세트 24-2, 세트 25-2, 세트 26-2, 세트 27-2, 세트 28-2, 세트 29-2, 세트 30-2, 세트 31-2, 세트 32-2, 세트 33-2, 세트 34-2, 세트 35-2, 세트 36-2, 세트 37-2, 세트 38-2, 세트 39-2, 세트 40-2, 세트 41-2, 세트 42-2, 세트 43-2, 세트 44-2, 세트 45-2, 세트 46-2, 세트 47, 세트 48 중 하나 이상을 포함할 수 있다.
HLA-B*07의 분석을 위한 시발체 세트는 세트 2-2, 세트 14-2, 세트 19-2, 세트 20-2, 세트 25-2, 세트 28-2, 세트 31-2, 세트 32-2, 세트 33-2, 세트 34-2, 세트 44-2, 세트 45-2, 세트 46-2, 세트 47, 세트 48 중 하나 이상을 포함할 수 있다. 바람직하게는, HLA-B*07의 분석을 위한 시발체 세트는 하기 조합 중 하나 이상을 포함할 수 있다;
세트 20-2, 세트 25-2와 세트 48;
세트 20-2와 세트 48;
세트 14-2, 세트 20-2, 세트 25-2와 세트 48;
세트 2-2, 세트 20-2, 세트 25-2와 세트 48;
세트 20-2와 세트 25-2;
세트 20-2와 세트 47;
세트 20-2, 세트 25-2, 세트 44-2, 세트 46-2와 세트 48;
세트 2-2, 세트 20-2와 세트 48;
세트 25-2와 세트 48;
세트 20-2, 세트 25-2, 세트 28-2와 세트 47;
세트 20-2, 세트 33-2와, 세트 48;
세트 20-2, 세트 28-2와 세트 47;
세트 20-2, 세트 25-2, 세트 32-2, 세트 48;
세트 20-2, 세트 44-2, 세트 46-2와 세트 48;
세트 20-2, 세트 25-2, 세트 34-2와 세트 48;
세트 20-2, 세트 25-2와 세트 47;
세트 20-2, 세트 25-2, 세트 33-2와 세트 48;
세트 2-2, 세트 20-2, 세트 25-2, 세트 32-2와 세트 48;
세트 19-2, 세트 20-2, 세트 25-2와 세트 48;
세트 19-2, 세트 25-2와 세트 48;
세트 2-2, 세트 20-2, 세트 33-2와 세트 48;
세트 2-2, 세트 19-2, 세트 20-2, 세트 25-2와 세트 48;
세트 25-2, 세트 45-2와 세트 48;
세트 20-2, 세트 31-2와 세트 48;
세트 2-2, 세트 20-2, 세트 31-2와 세트 48;
HLA-B*08의 분석을 위한 시발체 세트는 세트 2-2, 세트 3-2, 세트 4-2, 세트 9-2, 세트 14-2, 세트 16-2, 세트 18-2, 세트 20-2, 세트 22-2, 세트 23-2, 세트 25-2, 세트 32-2, 세트 33-2, 세트 34-2, 세트 41-2, 세트 44-2, 세트 46-2, 세트 47, 세트 48 중 하나 이상을 포함할 수 있다. 바람직하게는, HLA-B*08의 분석을 위한 시발체 세트는 하기 조합 중 하나 이상을 포함할 수 있다;
세트 3-2, 세트 14-2, 세트 44-2와 세트 48;
세트 3-2, 세트 14-2와 세트 44-2;
세트 3-2, 세트 14-2와 세트 47;
세트 14-2, 세트 44-2와 세트 48;
세트 3-2, 세트 41-2, 세트 44-2와 세트 48;
세트 3-2, 세트 44-2와 세트 48;
세트 14-2, 세트 32-2, 세트 44-2와 세트 48;
세트 3-2, 세트 14-2, 세트 33-2, 세트 44-2와 세트 48;
세트 3-2, 세트 4-2, 세트 14-2, 세트 44-2와 세트 48;
세트 3-2, 세트 14-2, 세트 32-3, 세트 44-2와 세트 48;
세트 3-2, 세트 9-2, 세트 44-2와 세트 48;
세트 14-2, 세트 32-2, 세트 33-2, 세트 44-2와 세트 48;
세트 14-2, 세트 23-2, 세트 44-2와 세트 48;
세트 3-2, 세트 14-2와 세트 48;
세트 2-2, 세트 3-2, 세트 20-2, 세트 44-2와 세트 48;
세트 3-2, 세트 14-2, 세트 16-2, 세트 34-2, 세트 44-2와 세트 48;
세트 14-2와 세트 48;
세트 22-2, 세트 44-2와 세트 48;
세트 14-2, 세트 33-2, 세트 44-2와 세트 48;
세트 14-2, 세트 25-2, 세트 44-2, 세트 46-2와 세트 48;
세트 3-2, 세트 14-2, 세트 18-2와 세트 47;
세트 3-2, 세트 14-2, 세트 18-2와 세트 48;
세트 3-2, 세트 4-2, 세트 14-2, 세트 33-2, 세트 44-2와 세트 48;
세트 3-2, 세트 20-2, 세트 44-2와 세트 48.
HLA-B*13의 분석을 위한 시발체 세트는 세트 26-2, 세트 27-2, 세트 28-2, 세트 32-2, 세트 35-2, 세트 39-2, 세트 40-2, 세트 41-2, 세트 45-2, 세트 47 중 하나 이상을 포함할 수 있다. 바람직하게는, HLA-B*13의 분석을 위한 시발체 세트는 하기 조합 중 하나 이상을 포함할 수 있다;
세트 27-2, 세트 35-2와 세트 47;
세트 27-2와 세트 35-2;
세트 27-2, 세트 35-2, 세트 39-2와 세트 47;
세트 27-2, 세트 35-2, 세트 45-2와 세트 47;
세트 27-2와 세트 47;
세트 27-2, 세트 28-2, 세트 35-2와 세트 47;
세트 26-2, 세트 35-2와 세트 47;
세트 27-2, 세트 35-2, 세트 41-2와 세트 47;
세트 27-2, 세트 35-2, 세트 40-2와 세트 47;
세트 32-2와 세트 47.
HLA-B*14의 분석을 위한 시발체 세트는 세트 1-2, 세트 23-2, 세트 25-2, 세트 33-2, 세트 37-2, 세트 41-2, 세트 44-2, 세트 48 중 하나 이상을 포함할 수 있다. 바람직하게는, HLA-B*14의 분석을 위한 시발체 세트는 하기 조합 중 하나 이상을 포함할 수 있다;
세트 1-2, 세트 23-2와 세트 48;
세트 1-2와 세트 48;
세트 23-2와 세트 48;
세트 1-2, 세트 23-2, 세트 44-2와 세트 48;
세트 1-2, 세트 23-2, 세트 33-2와 세트 48;
세트 1-2, 세트 25-2와 세트 48;
세트 23-2, 세트 37-2, 세트 41-2와 세트 48.
HLA-B*15의 분석을 위한 시발체 세트는 세트 3-2, 세트 7-2, 세트 12-2, 세트 16-2, 세트 18-2, 세트 20-2, 세트 23-2, 세트 26-2, 세트 27-2, 세트 30-2, 세트 32-2, 세트 33-2, 세트 34-2, 세트 35-2, 세트 39-2, 세트 40-2, 세트 44-2, 세트 45-2, 세트 47, 세트 48 중 하나 이상을 포함할 수 있다. 바람직하게는, HLA-B*15의 분석을 위한 시발체 세트는 하기 조합 중 하나 이상을 포함할 수 있다;
세트 27-2, 세트 44-2, 세트 45-2와 세트 48;
세트 27-2, 세트 40-2, 세트 44-2, 세트 45-2와 세트 48;
세트 27-2, 세트 44-2와 세트 45-2;
세트 26-2, 세트 44-2, 세트 45-2와 세트 48;
세트 32-2, 세트 33-2, 세트 44-2, 세트 45-2와 세트 48;
세트 23-2, 세트 33-2, 세트 40-2, 세트 44-2와 세트 48;
세트 23-2, 세트 33-2, 세트 44-2와 세트 48;
세트 33-2, 세트 44-2와 세트 48;
세트 26-2, 세트 30-2, 세트 44-2, 세트 45-2와 세트 48;
세트 26-2, 세트 35-2, 세트 45-2와 세트 47;
세트 7-2, 세트 27-2, 세트 44-2, 세트 45-2와 세트 48;
세트 27-2, 세트 44-2, 세트 45-2와 세트 48;
세트 35-2, 세트 45-2와 세트 47;
세트 12-2, 세트 35-2와 세트 47;
세트 23-2, 세트 33-2, 세트 44-2, 세트 45-2와 세트 48;
세트 23-3, 세트 45-2와 세트 47;
세트 33-2, 세트 44-2, 세트 45-2와 세트 48;
세트 27-2, 세트 44-2와 세트 48;
세트 27-2, 세트 41-2, 세트 44-2와 세트 48;
세트 18-2, 세트 27-2, 세트 45-2와 세트 47;
세트 26-2, 세트 44-2와 세트 48;
세트 32-2, 세트 33-2, 세트 44-2와 세트 48;
세트 44-2, 세트 45-2와 세트 48;
세트 16-2, 세트 34-2, 세트 44-2, 세트 45-2와 세트 48;
세트 32-2, 세트 44-2, 세트 45-2와 세트 48;
세트 27-2, 세트 45-2와 세트 48;
세트 27-2, 세트 39-2, 세트 44-2와 세트 48;
세트 26-2, 세트 44-2, 세트 45-2, 세트 46-2와 세트 48;
세트 7-2, 세트 32-2, 세트 33-2, 세트 44-2, 세트 45-2와 세트 48;
세트 27-2, 세트 44-2, 세트 45-2, 세트 46-2와 세트 48;
세트 20-2, 세트 27-2, 세트 44-2와 세트 48;
세트 30-2, 세트 44-2, 세트 45-2와 세트 48;
세트 27-2, 세트 30-2, 세트 44-2, 세트 45-2와 세트 48;
세트 32-2, 세트 33-2, 세트 44-2, 세트 45-2와 세트 48;
세트 7-2, 세트 23-2, 세트 33-2, 세트 44-2, 세트 45-2와 세트 48;
세트 12-2와 세트 35-2;
세트 3-2, 세트 44-2, 세트 45-2와 세트 48;
세트 12-2, 세트 20-2, 세트 35-2와 세트 47;
세트 23-2, 세트 32-2, 세트 33-2, 세트 40-2, 세트 44-2와 세트 48;
세트 27-2, 세트 33-2, 세트 44-2, 세트 45-2와 세트 48;
세트 25-2, 세트 32-2, 세트 44-2, 세트 45-2, 세트 46-2와 세트 48;
세트 27-2, 세트 40-2, 세트 45-2와 세트 48;
세트 23-2, 세트 44-2, 세트 45-2와 세트 48;
세트 20-2, 세트 26-2, 세트 44-2, 세트 45-2와 세트 48;
세트 26-2, 세트 30-2, 세트 39-2, 세트 44-2와 세트 48;
세트 16-2, 세트 27-2, 세트 34-2, 세트 44-2, 세트 45-2와 세트 48;
세트 12-2, 세트 27-2, 세트 35-2와 세트 47;
세트 12-2, 세트 27-2, 세트 44-2와 세트 48;
세트 35-2, 세트 40-2와 세트 47;
세트 27-2와 세트 45-2.
HLA-B*18의 분석을 위한 시발체 세트는 세트 1-2, 세트 4-2, 세트 7-2, 세트 13-2, 세트 20-2, 세트 28-2, 세트 29-2, 세트 33-2, 세트 38-2, 세트 44-2, 세트 45-2, 세트 47, 세트 48 중 하나 이상을 포함할 수 있다. 바람직하게는, HLA-B*18의 분석을 위한 시발체 세트는 하기 조합 중 하나 이상을 포함할 수 있다;
세트 29-2, 세트 33-2, 세트 38-2와 세트 48;
세트 29-2, 세트 38-2와 세트 48;
세트 29-2, 세트 33-2와 세트 48;
세트 29-2, 세트 33-2와 세트 38-2;
세트 29-2, 세트 38-2, 세트 44-2와 세트 48;
세트 4-2, 세트 33-2, 세트 38-2와 세트 48;
세트 4-2, 세트 33-2와 세트 48;
세트 28-2, 세트 29-2, 세트 38-2와 세트 47;
세트 29-2, 세트 33-2, 세트 38-2, 세트 44-2와 세트 48;
세트 4-2와 세트 48;
세트 33-2, 세트 38-2와 세트 48.
세트 20-2, 세트 29-2, 세트 33-2, 세트 38-2와 세트 48;
세트 29-2, 세트 33-2, 세트 38-2, 세트 45-2와 세트 48;
세트 33-2와 세트 48;
세트 1-2, 세트 29-2, 세트 33-2, 세트 38-2와 세트 48;
세트 29-2, 세트 38-2와 세트 47;
세트 7-2, 세트 29-2, 세트 33-2, 세트 38-2, 세트 45-2와 세트 48;
세트 13-2, 세트 28-2, 세트 29-3, 세트 33-2, 세트 38-2와 세트 47;
세트 29-2와 세트 33-2;
세트 4-2, 세트 38-2와 세트 48;
세트 29-2, 세트 34-2와 세트 48;
세트 38-2, 세트 44-2와 세트 48.
HLA-B*27의 분석을 위한 시발체 세트는 세트 2-2, 세트 5-2, 세트 10-2, 세트 12-2, 세트 13-2, 세트 16-2, 세트 19-2, 세트 25-2, 세트 27-2, 세트 28-2, 세트 32-2, 세트 34-2, 세트 40-2, 세트 47, 세트 48 중 하나 이상을 포함할 수 있다. 바람직하게는, HLA-B*27의 분석을 위한 시발체 세트는 하기 조합 중 하나 이상을 포함할 수 있다;
세트 5-2, 세트 28-2, 세트 32-2와 세트 47;
세트 5-2, 세트 13-2, 세트 28-2, 세트 32-2와 세트 47;
세트 5-2, 세트 32-2와 세트 47;
세트 5-2, 세트 32-2, 세트 34-2와 세트 48;
세트 32-2, 세트 34-2와 세트 48;
세트 47;
세트 5-2, 세트 19-2, 세트 32-2와 세트 47;
세트 5-2, 세트 12-2, 세트 32-2와 세트 47;
세트 5-2와 세트 47;
세트 5-2, 세트 27-2와 세트 47;
세트 13-2, 세트 28-2, 세트 32-2와 세트 47;
세트 5-2, 세트 16-2, 세트 32-2와 세트 47;
세트 5-2와 세트 32-2;
세트 2-2, 세트 5-2, 세트 32-2와 세트 47-2;
세트 5-2, 세트 10-2, 세트 32-2와 세트 47;
세트 32-2, 세트 34-2, 세트 40-2와 세트 48;
세트 13-2, 세트 25-2, 세트 28-2와 세트 47.
HLA-B*35의 분석을 위한 시발체 세트는 세트 3-2, 세트 4-2, 세트 7-2, 세트 12-2, 세트 14-2, 세트 16-2, 세트 18-2, 세트 20-2, 세트 22-2, 세트 29-2, 세트 33-2, 세트 34-2, 세트 39-2세트 40-2, 세트 41-2, 세트 42-2, 세트 44-2, 세트 45-2, 세트 46-2, 세트 48 중 하나 이상을 포함할 수 있다. 바람직하게는, HLA-B*35의 분석을 위한 시발체 세트는 하기 조합 중 하나 이상을 포함할 수 있다;
세트 4-2, 세트 44-2, 세트 45-2와 세트 48;
세트 4-2, 세트 44-2와 세트 48;
세트 29-2, 세트 44-2, 세트 45-2와 세트 48;
세트 4-2와 세트 44-2;
세트 4-2, 세트 22-2, 세트 44-2와 세트 48;
세트 4-2, 세트 7-2, 세트 44-2, 세트 45-2와 세트 48;
세트 4-2, 세트 41-2, 세트 44-2와 세트 48;
세트 4-2, 세트 20-2, 세트 44-2와 세트 48;
세트 44-2, 세트 45-2, 세트 46-2와 세트 48;
세트 44-2와 세트 48;
세트 4-2, 세트 14-2, 세트 44-2와 세트 48;
세트 29-2, 세트 44-2와 세트 48;
세트 4-2, 세트 22-2, 세트 44-2, 세트 45-2와 세트 48;
세트 4-2, 세트 33-2, 세트 44-2, 세트 45-2와 세트 48;
세트 4-2, 세트 16-2, 세트 34-2, 세트 44-2, 세트 45-2와 세트 48;
세트 4-2, 세트 18-2, 세트 44-2, 세트 45-2와 세트 48;
세트 3-2, 세트 4-2, 세트 44-2, 세트 45-2와 세트 48;
세트 4-2, 세트 12-2, 세트 44-2와 세트 48;
세트 4-2, 세트 42-2, 세트 44-2와 세트 48;
세트 3-2, 세트 4-2, 세트 44-2와 세트 48;
세트 4-2, 세트 41-2, 세트 42-2, 세트 44-2와 세트 48;
세트 4-2, 세트 39-2, 세트 44-2와 세트 48;
세트 4-2와 세트 45-2;
세트 16-2, 세트 34-2, 세트 43-2, 세트 44-2, 세트 45-2와 세트 48;
세트 4-2, 세트 33-2, 세트 44-2와 세트 48.
HLA-B*37의 분석을 위한 시발체 세트는 세트 4-2, 세트 9-2, 세트 13-2, 세트 14-2, 세트 18-2, 세트 20-2, 세트 27-2, 세트 28-2, 세트 29-2, 세트 32-2, 세트 33-2, 세트 42-2, 세트 47, 세트 48 중 하나 이상을 포함할 수 있다. 바람직하게는, HLA-B*37의 분석을 위한 시발체 세트는 하기 조합 중 하나 이상을 포함할 수 있다;
세트 9-2, 세트 29-2와 세트 47;
세트 9-2와 세트 29-2;
세트 9-2와 세트 47;
세트 29-2와 세트 47;
세트 9-2, 세트 29-2와 세트 48;
세트 20-2, 세트 29-2와 세트 47;
세트 14-2, 세트 29-2와 세트 47;
세트 9-2, 세트 28-2, 세트 29-2와 세트 47;
세트 9-2, 세트 29-2, 세트 33-2와 세트 48;
세트 9-2, 세트 29-2, 세트 33-2와 세트 47;
세트 4-2, 세트 9-2와 세트 47;
세트 9-2, 세트 32-2와 세트 47;
세트 9-2, 세트 13-2, 세트 28-2, 세트 29-2와 세트 47;
세트 29-2, 세트 42-2와 세트 47;
세트 9-2, 세트 18-2, 세트 29-2와 세트 47;
세트 9-2, 세트 27-2와 세트 47.
HLA-B*38의 분석을 위한 시발체 세트는 세트 4-2, 세트 23-2, 세트 25-2, 세트 28-2, 세트 32-2, 세트 42-2, 세트 47 중 하나 이상을 포함할 수 있다. 바람직하게는, HLA-B*38의 분석을 위한 시발체 세트는 하기 조합 중 하나 이상을 포함할 수 있다;
세트 23-2, 세트 28-2, 세트 42-2와 세트 47;
세트 28-2, 세트 42-2와 세트 47;
세트 28-2, 세트 32-2, 세트 42-2와 세트 47;
세트 23-2, 세트 28-2, 세트 32-2, 세트 42-2와 세트 47;
세트 4-2, 세트 28-2, 세트 42-2와 세트 47;
세트 23-2, 세트 28-2와 세트 47;
세트 25-2, 세트 28-2, 세트 42-2와 세트 47;
세트 23-2, 세트 28-2와 세트 42-2;
세트 23-2, 세트 28-2와 세트 47.
HLA-B*39의 분석을 위한 시발체 세트는 세트 23-2, 세트 32-2, 세트 33-2, 세트 41-2, 세트 44-2, 세트 42-2, 세트 48 중 하나 이상을 포함할 수 있다. 바람직하게는, HLA-B*39의 분석을 위한 시발체 세트는 하기 조합 중 하나 이상을 포함할 수 있다;
세트 23-2, 세트 42-2와 세트 48;
세트 32-2, 세트 42-2와 세트 48;
세트 23-2, 세트 42-2, 세트 44-2와 세트 48;
세트 23-2, 세트 33-2, 세트 42-2와 세트 48;
세트 23-2, 세트 41-2, 세트 42-2와 세트 48;
세트 23-2, 세트 33-2와 세트 48;
세트 42-2와 세트 48;
세트 23-2, 세트 32-2, 세트 42-2와 세트 48;
세트 23-2, 세트 41-2와 세트 48;
세트 42-2, 세트 44-2와 세트 48;
세트 23-2, 세트 41-2와 세트 42-2;
세트 41-2, 세트 42-2와 세트 48;
세트 23-2와 세트 42.
HLA-B*40의 분석을 위한 시발체 세트는 세트 2-2, 세트 13-2, 세트 16-2, 세트 18-2, 세트 19-2, 세트 21-2, 세트 27-2, 세트 32-2, 세트 33-2, 세트 34-2, 세트 40-2, 세트 42-2, 세트 44-2, 세트 47, 세트 48 중 하나 이상을 포함할 수 있다. 바람직하게는, HLA-B*40의 분석을 위한 시발체 세트는 하기 조합 중 하나 이상을 포함할 수 있다;
세트 2-2, 세트 16-2, 세트 34-2, 세트 44-2와 세트 48;
세트 2-2, 세트 34-2와 세트 48;
세트 21-2, 세트 34-2와 세트 48;
세트 21-2와 세트 48;
세트 34-2와 세트 48;
세트 2-2, 세트 44-2와 세트 48;
세트 2-2, 세트 32-2, 세트 33-2, 세트 44-2와 세트 48;
세트 2-2, 세트 16-2, 세트 20-2, 세트 34-2, 세트 44-2와 세트 48;
세트 13-2, 세트 21-2, 세트 28-2와 세트 47;
세트 2-2, 세트 27-2, 세트 44-2와 세트 48;
세트 21-2, 세트 34-2, 세트 40-2와 세트 48;
세트 16-2, 세트 19-2, 세트 34-2, 세트 44-2와 세트 48;
세트 16-2, 세트 20-2, 세트 34-2, 세트 44-2와 세트 48;
세트 2-2, 세트 16-2, 세트 19-2, 세트 20-2, 세트 34-2, 세트 44-2와 세트 48;
세트 2-2, 세트 16-2, 세트 32-2, 세트 34-2, 세트 44-2와 세트 48;
세트 2-2, 세트 16-2와 세트 47;
세트 21-2, 세트 34-2, 세트 39-2와 세트 48;
세트 2-2, 세트 21-2, 세트 34-2와 세트 48;
세트 2-2, 세트 16-2와 세트 48;
세트 2-2, 세트 16-2, 세트 34-2와 세트 44-2;
세트 2-2, 세트 16-2, 세트 19-2, 세트 34-2, 세트 44-2와 세트 48;
세트 21-2;
세트 21-2, 세트 28-2와 세트 47;
세트 20-2, 세트 21-2, 세트 34-2와 세트 48;
세트 2-2, 세트 13-2, 세트 16-2와 세트 47;
세트 2-2, 세트 33-2, 세트 34-2와 세트 48;
세트 2-2, 세트 16-2, 세트 34-2, 세트 44-2, 세트 46-2와 세트 48;
세트 21-2, 세트 34-2, 세트 42-2와 세트 48;
세트 2-2, 세트 29-2, 세트 44-2와 세트 48;
세트 2-2, 세트 16-2, 세트 18-2와 세트 47;
세트 21-2와 세트 34-2;
세트 29-2와 세트 48;
세트 2-2, 세트 16-2와 세트 44-2;
세트 2-2, 세트 16-2, 세트 29-2, 세트 34-2, 세트 44-2와 세트 48;
세트 2-2, 세트 16-2, 세트 44-2와 세트 48;
세트 21-2, 세트 29-2, 세트 34-2와 세트 48.
HLA-B*41의 분석을 위한 시발체 세트는 세트 8-2, 세트 13-2, 세트 14-2, 세트 16-2, 세트 22-2, 세트 34-2, 세트 37-2, 세트 41-2, 세트 44-2, 세트 47, 세트 48 중 하나 이상을 포함할 수 있다. 바람직하게는, HLA-B*41의 분석을 위한 시발체 세트는 하기 조합 중 하나 이상을 포함할 수 있다;
세트 8-2, 세트 16-2, 세트 34-2, 세트 37-, 세트 41-2, 세트 44-2와 세트 48;
세트 14-2, 세트 16-2, 세트 34-2, 세트 44-2와 세트 48;
세트 14-2, 세트 16-2, 세트 34-2, 세트 44-2와 세트 48;
세트 14-2, 세트 16-2, 세트 22-2, 세트 34-2, 세트 44-2와 세트 48;
세트 8-2, 세트 16-2, 세트 37-2, 세트 41-2와 세트 48;
세트 8-2, 세트 37-2, 세트 41-2, 세트 44-2와 세트 48;
세트 8-2, 세트 16-2, 세트 34-2, 세트 37-2, 세트 41-2와 세트 44-2;
세트 8-2, 세트 16-2, 세트 34-2, 세트 44-2와 세트 48;
세트 8-2, 세트 16-2, 세트 33-2, 세트 34-2, 세트 37-2, 세트 41-2, 세트 44-2와 세트 48;
세트 13-2, 세트 14-2, 세트 16-2와 세트 47.
HLA-B*42의 분석을 위한 시발체 세트는 세트 2-2, 세트 14-2, 세트 20-2, 세트 25-2, 세트 32-2, 세트 33-2, 세트 48 중 하나 이상을 포함할 수 있다. 바람직하게는, HLA-B*42의 분석을 위한 시발체 세트는 하기 조합 중 하나 이상을 포함할 수 있다;
세트 14-2, 세트 25-2와 세트 48;
세트 14-2와 세트 25;
세트 2-2, 세트 14-2, 세트 20-2, 세트 25-2와 세트 48;
세트 14-2, 세트 32-2, 세트 33-2와 세트 48.
HLA-B*44의 분석을 위한 시발체 세트는 세트 4-2, 세트 5-2, 세트 7-2, 세트 8-2, 세트 10-2, 세트 13-2, 세트 14-2, 세트 15-2, 세트 16-2, 세트 18-2, 세트 20-2, 세트 21-2, 세트 22-2, 세트 27-2, 세트 29-2, 세트 32-2, 세트 34-2, 세트 35-2, 세트 39-2, 세트 40-2, 세트 43-2, 세트 44-2, 세트 45-2, 세트 47, 세트 48 중 하나 이상을 포함할 수 있다. 바람직하게는, HLA-B*44의 분석을 위한 시발체 세트는 하기 조합 중 하나 이상을 포함할 수 있다;
세트 10-2, 세트 16-2와 세트 47;
세트 10-2, 세트 16-2, 세트 40-2와 세트 47;
세트 16-2와 세트 47;
세트 4-2, 세트 10-2, 세트 15-2와 세트 47;
세트 10-2, 세트 16-2, 세트 27-2, 세트 35-2와 세트 47;
세트 10-2, 세트 16-2, 세트 34-2, 세트 44-2와 세트 48;
세트 8-2, 세트 16-2, 세트 22-2, 세트 39-2와 세트 47;
세트 7-2, 세트 16-2, 세트 45-2와 세트 47;
세트 8-2, 세트 13-2, 세트 16-2, 세트 22-2, 세트 39-2와 세트 47;
세트 10-2와 세트 47;
세트 10-2;
세트 10-2, 세트 16-2, 세트 32-2와 세트 47;
세트 10-2, 세트 27-2, 세트 35-2와 세트 47;
세트 16-2, 세트 40-2와 세트 47;
세트 10-2, 세트 29-2와 세트 47;
세트 10-2, 세트 16-2, 세트 34-2, 세트 44-2, 세트 46-2와 세트 48;
세트 5-2, 세트 10-2, 세트 16-2와 세트 47;
세트 8-2, 세트 10-2, 세트 16-2와 세트 47;
세트 10-2, 세트 21-2, 세트 28-2와 세트 47;
세트 10-2, 세트 14-2, 세트 16-2와 세트 47;
세트 10-2와 세트 16-2;
세트 10-2, 세트 28-2, 세트 32-2와 세트 47;
세트 10-2, 세트 21-2, 세트 34-2와 세트 48;
세트 16-2, 세트 29-2와 세트 47;
세트 16-2, 세트 22-2, 세트 39-2와 세트 47;
세트 16-2, 세트 20-2와 세트 47;
세트 10-2, 세트 16-2, 세트 43-2와 세트 47;
세트 10-2, 세트 32-2와 세트 47;
세트 14-2, 세트 16-2와 세트 47;
세트 10-2, 세트 28-2와 세트 47;
세트 14-2, 세트 16-2와 세트 47;
세트 10-2, 세트 28-2와 세트 47;
세트 10-2, 세트 16-2, 세트 18-2와 세트 47.
HLA-B*45의 분석을 위한 시발체 세트는 세트 7-2, 세트 8-2, 세트 16-2, 세트 22-2, 세트 34-2, 세트 37-2, 세트 39-2, 세트 41-2, 세트 44-2, 세트 45-2, 세트 46-2, 세트 48 중 하나 이상을 포함할 수 있다. 바람직하게는, HLA-B*45의 분석을 위한 시발체 세트는 하기 조합 중 하나 이상을 포함할 수 있다;
세트 8-2, 세트 16-2, 세트 22-2, 세트 34-2, 세트 39-2, 세트 44-2와 세트 48;
세트 8-2, 세트 16-2, 세트 22-2, 세트 34-2, 세트 44-2와 세트 48;
세트 8-2, 세트 16-2, 세트 22-2, 세트 34-2, 세트 39-2, 세트 44-2, 세트 46-2와 세트 48;
세트 8-2, 세트 16-2, 세트 22-2, 세트 34-2, 세트 37-2, 세트 41-2, 세트 44-2와 세트 48;
세트 7-2, 세트 8-2, 세트 16-2, 세트 22-2, 세트 34-2, 세트 44-2, 세트 45-2와 세트 48;
세트 8-2, 세트 16-2, 세트 34-2, 세트 39-2, 세트 44-2와 세트 48;
HLA-B*46의 분석을 위한 시발체 세트는 세트 7-2, 세트 24-2, 세트 39-2, 세트 41-2, 세트 44-2, 세트 45-2, 세트 48 중 하나 이상을 포함할 수 있다. 바람직하게는, HLA-B*46의 분석을 위한 시발체 세트는 하기 조합 중 하나 이상을 포함할 수 있다;
세트 24-2, 세트 44-2, 세트 45-2와 세트 48;
세트 24-2, 세트 44-2와 세트 48;
세트 24-2, 세트 45-2와 세트 48;
세트 24-2, 세트 39-2, 세트 44-2와 세트 48;
세트 7-2, 세트 24-2, 세트 44-2, 세트 45-2와 세트 48;
세트 24-2, 세트 41-2, 세트 44-2와 세트 48;
세트 24-2, 세트 44-2와 세트 45-2.
HLA-B*47의 분석을 위한 시발체 세트는 세트 16-2, 세트 18-2, 세트 34-2, 세트 44-2, 세트 47 중 하나 이상을 포함할 수 있다. 바람직하게는, HLA-B*47의 분석을 위한 시발체 세트는 하기 조합 중 하나 이상을 포함할 수 있다;
세트 16-2, 세트 18-2와 세트 47;
세트 18-2와 세트 47;
세트 16-2, 세트 34-2, 세트 44-2와 세트 48;
세트 16-2, 세트 34-2, 세트 44-2와 세트 47;
세트 18-2;
HLA-B*48의 분석을 위한 시발체 세트는 세트 2-2, 세트 19-2, 세트 20-2, 세트 28-2, 세트 32-2, 세트 33-2, 세트 44-2, 세트 45-2, 세트 48 중 하나 이상을 포함할 수 있다. 바람직하게는, HLA-B*47의 분석을 위한 시발체 세트는 하기 조합 중 하나 이상을 포함할 수 있다;
세트 2-2, 세트 19-2, 세트 32-2, 세트 33-2와 세트 48;
세트 32-2, 세트 33-2, 세트 45-2와 세트 48;
세트 32-2, 세트 45-2와 세트 48;
세트 2-2, 세트 32-2, 세트 33-2와 세트 48;
세트 19-2, 세트 32-2, 세트 33-2와 세트 48;
세트 2-2, 세트 20-2, 세트 32-2, 세트 33-2와 세트 48;
세트 20-2, 세트 32-2, 세트 33-2와 세트 48;
세트 2-2, 세트 19-2, 세트 28-2, 세트 32-2, 세트 33-2와 세트 47;
세트 2-2, 세트 19-2, 세트 32-2, 세트 33-2, 세트 44-2와 세트 48.
HLA-B*49의 분석을 위한 시발체 세트는 세트 13-2, 세트 15-2, 세트 16-2, 세트 21-2, 세트 28-2, 세트 29-2, 세트 39-2, 세트 40-2, 세트 45-2, 세트 47 중 하나 이상을 포함할 수 있다. 바람직하게는, HLA-B*49의 분석을 위한 시발체 세트는 하기 조합 중 하나 이상을 포함할 수 있다;
세트 13-2, 세트 16-2, 세트 39-2와 세트 47;
세트 16-2, 세트 39-2와 세트 47;
세트 13-2, 세트 15-2, 세트 29-2, 세트 39-2와 세트 47;
세트 13-2, 세트 16-2, 세트 45-2와 세트 47;
세트 13-2, 세트 16-2와 세트 47;
세트 13-2, 세트 16-2, 세트 40-2와 세트 47;
세트 13-2, 세트 16-2와 세트 39-2;
세트 39-2와 세트 47;
세트 21-2, 세트 28-2, 세트 39-2와 세트 47.
HLA-B*50의 분석을 위한 시발체 세트는 세트 12-2, 세트 16-2, 세트 34-2, 세트 37-2, 세트 39-2, 세트 40-2, 세트 41-2, 세트 44-2, 세트 48 중 하나 이상을 포함할 수 있다. 바람직하게는, HLA-B*50의 분석을 위한 시발체 세트는 하기 조합 중 하나 이상을 포함할 수 있다;
세트 16-2, 세트 34-2, 세트 39-2, 세트 44-2와 세트 48;
세트 16-2, 세트 34-2, 세트 40-2, 세트 44-2와 세트 48;
세트 12-2, 세트 16-2, 세트 34-2, 세트 44-2와 세트 48;
세트 16-2, 세트 34-2, 세트 37-2, 세트 41-2, 세트 44-2와 세트 48.
HLA-B*51의 분석을 위한 시발체 세트는 세트 3-2, 세트 4-2, 세트 12-2, 세트 13-2, 세트 15-2, 세트 16-2, 세트 26-2, 세트 28-2, 세트 35-2, 세트 39-2, 세트 40-2, 세트 41-2, 세트 45-2, 세트 47 중 하나 이상을 포함할 수 있다. 바람직하게는, HLA-B*51의 분석을 위한 시발체 세트는 하기 조합 중 하나 이상을 포함할 수 있다;
세트 4-2, 세트 15-2, 세트 40-2와 세트 47;
세트 4-2, 세트 15-2와 세트 40-2;
세트 4-2, 세트 40-2와 세트 47;
세트 4-2, 세트 15-2와 세트 47;
세트 4-2, 세트 39-2와 세트 47;
세트 4-2, 세트 15-2, 세트 41-2와 세트 47;
세트 15-2, 세트 40-2와 세트 47;
세트 4-2, 세트 15-2, 세트 40-2, 세트 45-2와 세트 47;
세트 4-2, 세트 15-2, 세트 45-2와 세트 47;
세트 4-2, 세트 15-2, 세트 28-2, 세트 40-2와 세트 47;
세트 4-2, 세트 15-2, 세트 39-2와 세트 47;
세트 3-2, 세트 4-2, 세트 15-2, 세트 40-2와 세트 47;
세트 4-2, 세트 12-2, 세트 15-2, 세트 40-2와 세트 47;
세트 4-2, 세트 13-2, 세트 28-2, 세트 40-2와 세트 47;
세트 15-2, 세트 26-2, 세트 35-2, 세트 40-2와 세트 47;
세트 4-2, 세트 15-2, 세트 39-2, 세트 40-2와 세트 47;
세트 4-2, 세트 13-2, 세트 15-2, 세트 40-2와 세트 47;
세트 3-2, 세트 4-2, 세트 40-2와 세트 47;
세트 4-2, 세트 15-2, 세트 16-2, 세트 40-2와 세트 47;
세트 29-2, 세트 40-2와 세트 47;
세트 15-2, 세트 29-2, 세트 40-2와 세트 47.
HLA-B*52의 분석을 위한 시발체 세트는 세트 13-2, 세트 15-2, 세트 27-2, 세트 29-2, 세트 32-3, 세트 35-2, 세트 39-2, 세트 40-2, 세트 41-2, 세트 45-2, 세트 47 중 하나 이상을 포함할 수 있다. 바람직하게는, HLA-B*52의 분석을 위한 시발체 세트는 하기 조합 중 하나 이상을 포함할 수 있다;
세트 15-2, 세트 27-2, 세트 35-2, 세트 40-2와 세트 47;
세트 32-2, 세트 40-2와 세트 47;
세트 29-2, 세트 39-2와 세트 47;
세트 29-2, 세트 39-2, 세트 40-2와 세트 47;
세트 40-2와 세트 47;
세트 29-2, 세트 41-2와 세트 47;
세트 29-2, 세트 40-2, 세트 45-2와 세트 47;
세트 29-2와 세트 40;
세트 13-2, 세트 29-2, 세트 40-2와 세트 47.
HLA-B*53의 분석을 위한 시발체 세트는 세트 4-2, 세트 7-2, 세트 16-2, 세트 18-2, 세트 22-2, 세트 28-2, 세트 29-2, 세트 45-2, 세트 47 중 하나 이상을 포함할 수 있다. 바람직하게는, HLA-B*53의 분석을 위한 시발체 세트는 하기 조합 중 하나 이상을 포함할 수 있다;
세트 4-2, 세트 45-2와 세트 47;
세트 45-2와 세트 47;
세트 4-2, 세트 18-2, 세트 45-2와 세트 47;
세트 4-2와 세트 47;
세트 29-2, 세트 45-2와 세트 47;
세트 4-2, 세트 28-2, 세트 45-2와 세트 47;
세트 4-2, 세트 7-2, 세트 22-2, 세트 45-2와 세트 47;
세트 16-2, 세트 45-2와 세트 47.
HLA-B*54의 분석을 위한 시발체 세트는 세트 31-2, 세트 39-2, 세트 41-2, 세트 44-2, 세트 45-2, 세트 46-2 중 하나 이상을 포함할 수 있다. 바람직하게는, HLA-B*54의 분석을 위한 시발체 세트는 하기 조합 중 하나 이상을 포함할 수 있다;
세트 31-2, 세트 41-2, 세트 44-2와 세트 46-2;
세트 41-2, 세트 44-2와 세트 46-2;
세트 31-2와 세트 41-2;
세트 31-2, 세트 39-2, 세트 44-2와 세트 46-2;
세트 31-2, 세트 44-2, 세트 45-2, 세트 46-2;
세트 41-2와 세트 44-2;
세트 44-2와 세트 46-2;
세트 31-2, 세트 41-2와 세트 46-2.
HLA-B*55의 분석을 위한 시발체 세트는 세트 25-2, 세트 26-2, 세트 31-2, 세트 32-2, 세트 41-2, 세트 44-2, 세트 46-2, 세트 48 중 하나 이상을 포함할 수 있다. 바람직하게는, HLA-B*55의 분석을 위한 시발체 세트는 하기 조합 중 하나 이상을 포함할 수 있다;
세트 25-2, 세트 41-2, 세트 44-2, 세트 46-2와 세트 48;
세트 25-2, 세트 41-2, 세트 44-2와 세트 46-2;
세트 25-2, 세트 44-2, 세트 46-2와 세트 48;
세트 31-2, 세트 41-2, 세트 44-2, 세트 46-2와 세트 48;
세트 25-2, 세트 41-2와 세트 48;
세트 32-2, 세트 41-2, 세트 44-2와 세트 48;
세트 26-2, 세트 41-2, 세트 44-2, 세트 46-2와 세트 48;
세트 25-2, 세트 32-2, 세트 41-2, 세트 44-2, 세트 46-2와 세트 48;
세트 41-2, 세트 44-2와 세트 48.
HLA-B*56의 분석을 위한 시발체 세트는 세트 23-2, 세트 25-2, 세트 26-2, 세트 39-2, 세트 40-2, 세트 44-2, 세트 45-2, 세트 46-2, 세트 47, 세트 48 중 하나 이상을 포함할 수 있다. 바람직하게는, HLA-B*56의 분석을 위한 시발체 세트는 하기 조합 중 하나 이상을 포함할 수 있다;
세트 25-2, 세트 39-2, 세트 44-2, 세트 46-2와 세트 48;
세트 25-2, 세트 39-2와 세트 48;
세트 25-2, 세트 44-2, 세트 45-2, 세트 46-2와 세트 48;
세트 25-2, 세트 40-2, 세트 44-2, 세트 46-2와 세트 48;
세트 40-2, 세트 44-2, 세트 46-2와 세트 48;
세트 25-2, 세트 39-2, 세트 46-2와 세트 47;
세트 39-2, 세트 44-2와 세트 48;
세트 25-2, 세트 40-2, 세트 46-2와 세트 47;
세트 23-2, 세트 39-2, 세트 44-2와 세트 48;
세트 26-2, 세트 39-2, 세트 44-2, 세트 46-2와 세트 48;
세트 39-2, 세트 44-2, 세트 46-2와 세트 48.
HLA-B*57의 분석을 위한 시발체 세트는 세트 12-2, 세트 13-2, 세트 15-2, 세트 16-2, 세트 28-2, 세트 35-2, 세트 43-2, 세트 44-2, 세트 45-2, 세트 47, 세트 48 중 하나 이상을 포함할 수 있다. 바람직하게는, HLA-B*57의 분석을 위한 시발체 세트는 하기 조합 중 하나 이상을 포함할 수 있다;
세트 35-2, 세트 43-2, 세트 45-2와 세트 47;
세트 15-2, 세트 35-2, 세트 43-2, 세트 45-2와 세트 47;
세트 35-2, 세트 43-2와 세트 47;
세트 35-2, 세트 43-2와 세트 47;
세트 35-2, 세트 43-2와 세트 45-2;
세트 28-2, 세트 35-2, 세트 43-2, 세트 45-2와 세트 47;
세트 43-2, 세트 44-2와 세트 48;
세트 12-2, 세트 35-2, 세트 43-2와 세트 47;
세트 13-2, 세트 35-2, 세트 43-2와 세트 47;
세트 13-2, 세트 16-2, 세트 43-2, 세트 54-2와 세트 47;
세트 16-2, 세트 43-2, 세트 45-2와 세트 47;
세트 13-2, 세트 35-2, 세트 43-2, 세트 45-2와 세트 47.
HLA-B*58의 분석을 위한 시발체 세트는 세트 7-2, 세트 15-2, 세트 36-2, 세트 39-2, 세트 40-2, 세트 42-2, 세트 43-2, 세트 44-2, 세트 45-2, 세트 47, 세트 48, 중 하나 이상을 포함할 수 있다. 바람직하게는, HLA-B*58의 분석을 위한 시발체 세트는 하기 조합 중 하나 이상을 포함할 수 있다;
세트 36-2, 세트 45-2와 세트 47;
세트 36-2와 세트 45-2;
세트 7-2, 세트 36-2, 세트 45-2와 세트 47;
세트 15-2, 세트 36-2, 세트 40-2와 세트 47;
세트 36-2, 세트 36-2, 세트 40-2와 세트 47;
세트 36-2, 세트 43-2, 세트 45-2와 세트 47;
세트 36-2, 세트 42-2와 세트 47;
세트 13-2, 세트 36-2, 세트 45-2와 세트 47;
세트 36-2, 세트 44-2, 세트 45-2와 세트 48;
세트 36-2, 세트 39-2와 세트 47.
HLA-B*59의 분석을 위한 시발체 세트는 세트 23-2, 세트 41-2, 세트 47 중 하나 이상을 포함할 수 있다. 바람직하게는, HLA-B*59의 분석을 위한 시발체 세트는 하기 조합 중 하나 이상을 포함할 수 있다;
세트 41-2와 세트 47;
세트 23-2, 세트 41-2와 세트 47.
HLA-B*67의 분석을 위한 시발체 세트는 세트 25-2, 세트 42-2와 세트 48을 포함할 수 있다.
HLA-B*73의 분석을 위한 시발체 세트는 세트 48을 포함할 수 있다.
HLA-B*78의 분석을 위한 시발체 세트는 세트 4-2, 세트 29-2, 세트 40-2, 세트 44-2, 세트 48 중 하나 이상을 포함할 수 있다. 바람직하게는, HLA-B*78의 분석을 위한 시발체 세트는 하기 조합 중 하나 이상을 포함할 수 있다;
세트 4-2, 세트 40-2, 세트 44-2와 세트 48;
세트 40-2, 세트 44-2와 세트 48;
세트 29-2, 세트 40-2, 세트 44-2와 세트 48.
HLA-B*81의 분석을 위한 시발체 세트는 세트 2-2, 세트 29-2, 세트 33-2, 세트 40-2, 세트 44-2, 세트 48 중 하나 이상을 포함할 수 있다. 바람직하게는, HLA-B*81의 분석을 위한 시발체 세트는 하기 조합 중 하나 이상을 포함할 수 있다;
세트 2-2, 세트 19-2, 세트 25-2와 세트 48;
세트 2-2, 세트 19-2와 세트 48;
세트 2-2, 세트 19-2, 세트 25-2, 세트 33-2와 세트 48.
HLA-B*82의 분석을 위한 시발체 세트는 세트 22-2, 세트 25-2, 세트 39-2, 및 세트 48로 구성될 수 있다.
HLA-B*83의 분석을 위한 시발체 세트는 세트 10-2, 세트 25-2, 세트 44-2, 세트 46-2와 세트 48로 구성될 수 있다.
상기 조합에 있어서, 상기 세트는 검사 키트에서 동일 웰에 포함될 수도 있으나, 바람직하게는 각각 서로 다른 웰에 포함될 수 있다.
웰은 실시간 PCR에 의해 증폭된 산물을 탐침할 수 있도록 형광 탐침자를 포함할 수 있다. 형광 탐침자는 HLA-B 대립 유전자의 증폭 유무를 확인할 수 있으며, 하기 서열 중 하나 이상을 포함할 수 있다:
서열번호 311: JOE 5'-CAARGATTACATCGCCCTGAACGAGGACC-3' BHQ-2
서열번호 312: JOE 5'-AGAGCARGAGGGGCCGGARTATTGGGAC-3' BHQ-2
서열번호 313: JOE 5'-CCCGGCCGCGGGGAGCCCCGCTTCATC-3' BHQ-2
서열번호 314: JOE 5'-TGGAGTGGCTCCGCAGATACCTGGAGAACG-3' BHQ-2
서열번호 315: JOE 5'-CGTGAGGTTCGACAGCGACGCCGCGAGTCC-3' BHQ-2
서열번호 316: JOE 5'-ACCGTGGGCTACGTGGACGACACGCTGTT-3' BHQ-2
일 구체예에서, 서열번호 311의 탐침자는 세트 1-2, 세트 2-2, 세트 7-2, 세트 8-2, 세트 9-2, 세트 10-2, 세트 12-2, 세트 14-2, 세트 19-2, 세트 22-2, 세트 37-2, 세트 39-2, 세트 40-2, 세트 41-2, 세트 42-2, 세트 43-2 또는 세트 45-2와 조합될 수 있다.
일 구체예에서, 서열번호 312의 탐침자는 세트 3-2, 세트 4-2, 세트 5-2, 세트 13-2, 세트 15-2, 세트 18-2, 세트 23-2, 세트 24-2, 세트 25-2, 세트 26-2, 세트 27-2, 세트 28-2, 세트 29-2, 세트 30-2, 세트 31-2, 세트 32-2, 세트 33-2, 세트 34-2, 세트 44-2, 세트 47-2 또는 세트 48-2와 조합될 수 있다.
일 구체예에서, 서열번호 313의 탐침자는 세트 16-2 또는 세트 46-2와 조합될 수 있다.
일 구체예에서, 서열번호 314의 탐침자는 세트 20-2와 조합될 수 있다.
일 구체예에서, 서열번호 315의 탐침자는 세트 38-2와 조합될 수 있다.
일 구체예에서, 서열번호 316의 탐침자는 세트 21-2와 조합될 수 있다.
웰은 HLA-B 증폭 유무의 동작 여부를 확인하기 위하여 상기 서열번호 303과 서열번호 304의 시발체 세트와, 이를 검출할 수 있는 상기 서열번호 330의 형광 탐침자 세트를 더 포함할 수 있다:
<HLA-DRB1 유전자 분석>
HLA-DRB1 유전자 분석을 위한 시발체 세트는 세트 23-1, 세트 24-1, 세트 25-1, 세트 26-1, 세트 27-1, 세트 28-1, 세트 29-1, 세트 30-1, 세트 31-1, 세트 32-1, 세트 33-1, 세트 34-1, 세트 35-1, 세트 36-1, 세트 37-1, 세트 38-1, 세트 39-1, 세트 40-1, 세트 41-1, 세트 42-1, 세트 43-1, 세트 44-1, 세트 45-1, 세트 46-1 중 하나 이상을 포함할 수 있다.
HLA-DRB1*01의 분석을 위한 시발체 세트는 세트 23-1이 될 수 있다.
HLA-DRB1*03의 분석을 위한 시발체 세트는 세트 26-1, 세트 36-1, 세트 44-1, 세트 39-1, 세트 40-1 중 하나 이상을 포함할 수 있다. 바람직하게는, HLA-DRB1*03의 분석을 위한 시발체 세트는 하기 조합 중 하나 이상을 포함할 수 있다;
세트 26-1, 세트 36-1과 세트 44-1;
세트 26-1과 세트 44-1;
세트 26-1, 세트 39-1, 세트 40-1과 세트 44-1;
세트 44-1.
HLA-DRB1*04의 분석을 위한 시발체 세트는 세트 27-1, 세트 45-1, 세트 41-1, 세트 38-1 중 하나 이상을 포함할 수 있다. 바람직하게는, HLA-DRB1*04의 분석을 위한 시발체 세트는 하기 조합 중 하나 이상을 포함할 수 있다;
세트 27-1과 세트 45-1;
세트 41-1과 세트 45-1;
세트 45-1;
세트 27-1, 세트 38-1, 세트 41-1과 세트 45-1;
세트 27-1, 세트 41-1과 세트 45-1.
HLA-DRB1*07의 분석을 위한 시발체 세트는 세트 28-1과 세트 45-1로 구성될 수 있다.
HLA-DRB1*08의 분석을 위한 시발체 세트는 세트 29-1, 세트 33-1, 세트 35-1, 세트 36-1, 세트 42-1 중 하나 이상을 포함할 수 있다. 바람직하게는, HLA-DRB1*08의 분석을 위한 시발체 세트는 하기 조합 중 하나 이상을 포함할 수 있다;
세트 29-1;
세트 29-1과 세트 33-1;
세트 35-1, 세트 36-1과 세트 42-1;
세트 33-1.
HLA-DRB1*09의 분석을 위한 시발체 세트는 세트 30-1, 세트 45-1, 세트 46-1 중 하나 이상을 포함할 수 있다. 바람직하게는 HLA-DRB1*09의 분석을 위한 시발체 세트는 하기 조합 중 하나 이상을 포함할 수 있다;
세트 30-1과 세트 45-1;
세트 30-1, 세트 45-1과 세트 46-1.
HLA-DRB1*10의 분석을 위한 시발체 세트는 세트 31-1이 될 수 있다.
HLA-DRB1*11의 분석을 위한 시발체 세트는 세트 32-1, 세트 35-1, 세트 44-1, 세트 34-1, 세트 26-1, 세트 37-1, 세트 41-1, 세트 35-1, 세트 42-1, 세트 29-1 중 하나 이상을 포함할 수 있다. 바람직하게는 HLA-DRB1*11의 분석을 위한 시발체 세트는 하기 조합 중 하나 이상을 포함할 수 있다;
세트 32-1, 세트 35-1과 세트 44-1;
세트 32-1, 세트 34-1과 세트 44-1;
세트 26-1, 세트 32-1과 세트 44-1;
세트 32-1과 세트 44-1;
세트 32-1, 세트 37-1과 세트 44-1;
세트 41-1과 세트 44-1;
세트 32-1, 세트 35-1, 세트 42-1과 세트 44-1;
세트 32-1, 세트 34-1, 세트 42-1과 세트 44-1;
세트 32-1, 세트 42-1과 세트 44-1;
세트 34-1과 세트 44-1;
세트 29-1과 세트 44-1.
HLA-DRB1*12의 분석을 위한 시발체 세트는 세트 33-1과 세트 44-1로 구성될 수 있다.
HLA-DRB1*13의 분석을 위한 시발체 세트는 세트 34-1, 세트 36-1, 세트 44-1, 세트 35-1, 세트 42-1, 세트 39-1, 세트 40-1, 세트 43-1 중 하나 이상을 포함할 수 있다. 바람직하게는 HLA-DRB1*13의 분석을 위한 시발체 세트는 하기 조합 중 하나 이상을 포함할 수 있다;
세트 34-1, 세트 36-1과 세트 44-1;
세트 35-1, 세트 36-1과 세트 44-1;
세트 36-1과 세트 44-1;
세트 34-1, 세트 36-1, 세트 42-1과 세트 44-1;
세트 35-1, 세트 36-1, 세트 42-1과 세트 44-1;
세트 35-1과 세트 44-1;
세트 39-1, 세트 40-1과 세트 44-1;
세트 34-1, 세트 39-1과 세트 44-1;
세트 34-1, 세트 43-1과 세트 44-1.
HLA-DRB1*14의 분석을 위한 시발체 세트는 세트 36-1, 세트 42-1, 세트 44-1, 세트 37-1, 세트 39-1, 세트 40-1, 세트 44-1, 세트 36-1, 세트 38-1, 세트 43-1, 세트 41-1, 세트 34-1, 세트 35-1 중 하나 이상을 포함할 수 있다. 바람직하게는 HLA-DRB1*14의 분석을 위한 시발체 세트는 하기 조합 중 하나 이상을 포함할 수 있다;
세트 36-1, 세트 42-1과 세트 44-1;
세트 37-1, 세트 39-1, 세트 40-1과 세트 44-1;
세트 36-1, 세트 38-1과 세트 44-1;
세트 36-1, 세트 42-1과 세트 44-1;
세트 37-1, 세트 40-1과 세트 44-1;
세트 37-1, 세트 43-1과 세트 44-1;
세트 36-1, 세트 37-1, 세트 43-1과 세트 44-1;
세트 37-1과 세트 44-1;
세트 37-1, 세트 40-1, 세트 41-1과 세트 44-1;
세트 36-1, 세트 37-1과 세트 44-1;
세트 35-1, 세트 39-1, 세트 40-1과 세트 44-1;
세트 35-1, 세트 39-1과 세트 44-1;
세트 43-1과 세트 44-1;
세트 38-1과 세트 44-1;
세트 38-1, 세트 39-1, 세트 40-1과 세트 44-1;
세트 39-1과 세트 44-1;
세트 39-1, 세트 40-1, 세트 42-1과 세트 44-1;
세트 40-1, 세트 41-1과 세트 44-1;
세트 40-1과 세트 44-1;
세트 36-1, 세트 42-1, 세트 43-1과 세트 44-1;
세트 42-1, 세트 43-1과 세트 44-1.
HLA-DRB1*15의 분석을 위한 시발체 세트는 세트 24-1과 세트 46-1 중 하나 이상을 포함할 수 있다.
HLA-DRB1*16의 분석을 위한 시발체 세트는 세트 25-1과 세트 46-1 중 하나 이상을 포함할 수 있다.
상기 조합에 있어서, 상기 세트는 검사 키트에서 동일 웰에 포함될 수도 있으나, 바람직하게는 각각 서로 다른 웰에 포함될 수 있다.
웰은 실시간 PCR에 의해 증폭된 산물을 탐침할 수 있도록 형광 탐침자를 포함할 수 있다. 형광 탐침자는 HLA-DRB1 대립 유전자의 증폭 유무를 확인할 수 있으며, 하기 서열 중 하나 이상을 포함할 수 있다:
서열번호 317: FAM 5'-CGCTTCGACAGCGACGTGGGGGAGTWCCG-3' BHQ-1
서열번호 318: FAM 5'-ACTGGAACAGCCAGAAGGACCTCCT-3' BHQ-1
서열번호 319: FAM 5'-TCATTTCTTCAACGGGACGGAGCGGGTGC-3' BHQ-1.
일 구체예에서, 서열번호 317은 세트 23-1, 세트 24-1, 세트 25-1, 세트 26-1, 세트 28-1, 세트 29-1, 세트 30-1, 세트 31-1, 세트 32-1, 세트 32-1, 세트 33-1, 세트 34-1, 세트 35-1, 세트 36-1, 세트 37-1, 세트 38-1, 세트 39-1, 세트 40-1, 세트 41-1, 세트 42-1, 세트 43-1, 세트 44-1 또는 세트 46-1과 조합될 수 있다.
일 구체예에서, 서열번호 318은 세트 45-1과 조합될 수 있다.
일 구체예에서, 서열번호 319는 세트 27-1과 조합될 수 있다.
웰은 HLA-DRB1 증폭 유무의 동작 여부를 확인하기 위하여 상기 서열번호 303과 서열번호 304의 시발체 세트와, 이를 검출할 수 있는 상기 서열번호 330의 형광 탐침자 세트를 더 포함할 수 있다:
< HLA-C 유전자 분석>
HLA-C 유전자 분석을 위한 시발체 세트는 세트 49, 세트 50, 세트 51, 세트 52, 세트 53, 세트 54, 세트 55, 세트 56, 세트 57, 세트 58, 세트 59, 세트 60, 세트 61, 세트 62, 세트 63, 세트 64, 세트 65, 세트 66, 세트 67, 세트 68, 세트 69, 세트 70 중 하나 이상을 포함할 수 있다.
HLA-C*01의 분석을 위한 시발체 세트는 세트 49, 세트 61, 세트 69, 세트 54, 세트 57 중 하나 이상을 포함할 수 있다. 바람직하게는 HLA-C*01의 분석을 위한 시발체 세트는 하기 조합 중 하나 이상을 포함할 수 있다;
세트 49;
세트 49와 세트 61;
세트 49와 세트 69;
세트 49, 세트 54와 세트 69;
세트 57.
HLA-C*02의 분석을 위한 시발체 세트는 세트 50, 세트 53, 세트 57, 세트 59, 세트 58, 세트 68, 세트 67 중 하나 이상을 포함할 수 있다. 바람직하게는 HLA-C*02의 분석을 위한 시발체 세트는 하기 조합 중 하나 이상을 포함할 수 있다;
세트 50, 세트 53과 세트 57;
세트 50, 세트 53, 세트 57과 세트 59;
세트 50과 세트 57;
세트 53과 세트 57;
세트 53;
세트 53, 세트 57과 세트 58;
세트 50과 세트 53;
세트 50, 세트 53, 세트 57과 세트 68;
세트 50;
세트 53과 세트 67;
세트 50, 세트 57과 세트 58.
HLA-C*03의 분석을 위한 시발체 세트는 세트 51, 세트 53, 세트 69, 세트 52, 세트 54, 세트 59, 세트 57, 세트 64, 세트 55 중 하나 이상을 포함할 수 있다. 바람직하게는 HLA-C*03의 분석을 위한 시발체 세트는 하기 조합 중 하나 이상을 포함할 수 있다;
세트 51, 세트 53과 세트 69;
세트 51, 세트 53;
세트 52, 세트 54와 세트 69;
세트 52, 세트 54, 세트 59와 세트 69;
세트 52와 세트 54;
세트 52, 세트 54와 세트 69;
세트 53, 세트 54와 세트 69;
세트 53, 세트 54, 세트 59와 세트 69;
세트 53과 세트 54;
세트 53과 세트 69;
세트 53, 세트 54, 세트 57과 세트 69;
세트 53, 세트 54, 세트 64와 세트 69;
세트 69;
세트 51, 세트 53, 세트 54;
세트 51, 세트 57, 세트 69;
세트 52, 세트 54, 세트 64와 세트 69;
세트 54와 세트 69;
세트 51, 세트 53, 세트 54와 세트 69;
세트 51, 세트 52, 세트 54와 세트 69;
세트 51, 세트 52와 세트 54;
세트 54, 세트 57과 세트 69;
세트 51과 세트 69;
세트 53, 세트 59와 세트 69;
세트 52, 세트 54, 세트 55와 세트 69;
세트 52, 세트 54, 세트 57과 세트 69.
HLA-C*04의 분석을 위한 시발체 세트는 세트 55, 세트 57, 세트 69, 세트 59, 세트 63, 세트 68, 세트 53 중 하나 이상을 포함할 수 있다. 바람직하게는 HLA-C*04의 분석을 위한 시발체 세트는 하기 조합 중 하나 이상을 포함할 수 있다;
세트 55, 세트 57과 세트 69;
세트 55와 세트 57;
세트 55, 세트 57, 세트 59와 세트 69;
세트 57과 세트 69;
세트 57, 세트 63과 세트 69;
세트 55와 세트 69;
세트 55, 세트 57, 세트 68과 세트 69;
세트 53, 세트 57과 세트 69;
세트 55, 세트 67과 세트 69.
HLA-C*05의 분석을 위한 시발체 세트는 세트 56, 세트 59, 세트 67, 세트 57, 세트 58, 세트 53, 세트 60, 세트 63, 세트 68, 세트 65, 세트 69, 세트 62 중 하나 이상을 포함할 수 있다. 바람직하게는 HLA-C*05의 분석을 위한 시발체 세트는 하기 조합 중 하나 이상을 포함할 수 있다;
세트 56, 세트 59와 세트 67;
세트 67;
세트 56과 세트 67;
세트 59와 세트 67;
세트 56, 세트 57;
세트 56, 세트 58과 세트 67;
세트 53, 세트 56과 세트 67;
세트 56, 세트 63과 세트 67;
세트 56, 세트 60과 세트 67;
세트 56, 세트 67과 세트 68;
세트 62와 세트 67;
세트 56, 세트 65와 세트 67;
세트 67과 세트 69.
HLA-C*06의 분석을 위한 시발체 세트는 세트 57, 세트 58, 세트 51, 세트 62, 세트 67, 세트 68 중 하나 이상을 포함할 수 있다. 바람직하게는 HLA-C*06의 분석을 위한 시발체 세트는 하기 조합 중 하나 이상을 포함할 수 있다;
세트 57과 세트 58;
세트 58;
세트 57, 세트 58과 세트 62;
세트 58과 세트 58;
세트 57, 세트 58과 세트 68;
세트 51, 세트 57, 세트 58.
HLA-C*07의 분석을 위한 시발체 세트는 세트 59, 세트 61, 세트 69, 세트 68, 세트 57, 세트 58, 세트 65, 세트 63, 세트 64, 세트 51, 세트 62 중 하나 이상을 포함할 수 있다. 바람직하게는 HLA-C*07의 분석을 위한 시발체 세트는 하기 조합 중 하나 이상을 포함할 수 있다;
세트 59;
세트 59와 세트 61;
세트 59와 세트 69;
세트 68;
세트 61과 세트 68;
세트 57, 세트 58과 세트 59;
세트 59와 세트 65;
세트 59와 세트 63;
세트 59와 세트 64;
세트 51과 세트 59;
세트 62와 세트 68.
HLA-C*08의 분석을 위한 시발체 세트는 세트 56, 세트 60, 세트 69, 세트 59
중 하나 이상을 포함할 수 있다. 바람직하게는 HLA-C*08의 분석을 위한 시발체 세트는 하기 조합 중 하나 이상을 포함할 수 있다;
세트 56과 세트 60;
세트 60;
세트 60과 세트 69;
세트 56;
세트 59와 세트 60;
HLA-C*12의 분석을 위한 시발체 세트는 세트 61, 세트 62, 세트 53, 세트 57, 세트 61, 세트 63 중 하나 이상을 포함할 수 있다. 바람직하게는 HLA-C*12의 분석을 위한 시발체 세트는 하기 조합 중 하나 이상을 포함할 수 있다;
세트 61;
세트 62;
세트 53과 세트 62;
세트 57과 세트 62;
세트 57과 세트 61;
세트 62와 세트 63.
HLA-C*14의 분석을 위한 시발체 세트는 세트 63; 세트 63과 세트 69; 중 하나 이상을 포함할 수 있다.
HLA-C*15의 분석을 위한 시발체 세트는 세트 53, 세트 57, 세트 64, 세트 52, 세트 63, 세트 59 중 하나 이상을 포함할 수 있다. 바람직하게는 HLA-C*15의 분석을 위한 시발체 세트는 하기 조합 중 하나 이상을 포함할 수 있다;
세트 53, 세트 57과 세트 64;
세트 53과 세트 64;
세트 52, 세트 57과 세트 64;
세트 57과 세트 63;
세트 57과 세트 64;
세트 53, 세트 57, 세트 59와 세트 64;
세트 53, 세트 57, 세트 64와 세트 69.
HLA-C*16의 분석을 위한 시발체 세트는 세트 65, 세트 70, 세트 69, 세트 57, 세트 61, 세트 53, 세트 64 중 하나 이상을 포함할 수 있다. 바람직하게는 HLA-C*16의 분석을 위한 시발체 세트는 하기 조합 중 하나 이상을 포함할 수 있다;
세트 65와 세트 70;
세트 65와 세트 69;
세트 57, 세트 65와 세트 70;
세트 57과 세트 65;
세트 57, 세트 61과 세트 65;
세트 70;
세트 65;
세트 53과 세트 65;
세트 53, 세트 57, 세트 64와 세트 65.
HLA-C*17의 분석을 위한 시발체 세트는 세트 57, 세트 66, 세트 67, 세트 58, 세트 52 중 하나 이상을 포함할 수 있다. 바람직하게는 HLA-C*17의 분석을 위한 시발체 세트는 하기 조합 중 하나 이상을 포함할 수 있다;
세트 57과 세트 66;
세트 66과 세트 67;
세트 57, 세트 58과 세트 66;
세트 66;
세트 52, 세트 57과 세트 66.
HLA-C*18의 분석을 위한 시발체 세트는 세트 57, 세트 58, 세트 69로 구성될 수 있다.
상기 조합에 있어서, 상기 세트는 검사 키트에서 동일 웰에 포함될 수도 있으나, 바람직하게는 각각 서로 다른 웰에 포함될 수 있다.
웰은 실시간 PCR에 의해 증폭된 산물을 탐침할 수 있도록 형광 탐침자를 포함할 수 있다. 형광 탐침자는 HLA-C 대립 유전자의 증폭 유무를 확인할 수 있으며, 하기 서열 중 하나 이상을 포함할 수 있다:
서열번호 320: FAM 5'-TTCGACAGCGACGCCGCGAGTCCRAGA-3' BHQ-1
서열번호 321: FAM 5'-CGGCTCAGATCACCCAGCGCAAGTKGGA-3' BHQ-1
서열번호 322: FAM 5'-CCTACGACGGCAAGGATTACATCGCC-3' BHQ-1
서열번호 323: FAM 5'-CATCCCCCACGGACGGCCCGGGTCGCC-3' BHQ-1
서열번호 324: FAM 5'-TTGTGGAGACCAGGCCAGCAGGAGATGGA-3' BHQ-1
일 구체예에서, 서열번호 320은 세트 49, 세트 53, 세트 55, 세트 57, 세트 58, 세트 63, 세트 64 또는 세트 67과 조합될 수 있다.
일 구체예에서, 서열번호 321은 세트 50, 세트 51, 세트 54, 세트 56, 세트 59, 세트 60, 세트 62, 세트 65, 세트 66, 세트 68 또는 세트 69와 조합될 수 있다.
일 구체예에서, 서열번호 322는 세트 61과 조합될 수 있다.
일 구체예에서, 서열번호 323은 세트 52와 조합될 수 있다.
일 구체예에서, 서열번호 324는 세트 70과 조합될 수 있다.
웰은 HLA-C 증폭 유무의 동작 여부를 확인하기 위하여 상기 서열번호 303과 서열번호 304의 시발체 세트와, 이를 검출할 수 있는 상기 서열번호 330의 형광 탐침자 세트를 더 포함할 수 있다:
< HLA-DQB1 유전자 분석>
HLA-DQB1 유전자 분석을 위한 시발체 세트는 세트 71, 세트 72, 세트 73, 세트 74, 세트 75, 세트 76, 세트 77, 세트 78, 세트 79, 세트 80, 세트 81, 세트 82, 세트 83, 세트 84 중 하나 이상을 포함할 수 있다.
HLA-DQB1*02의 분석을 위한 시발체 세트는 세트 73, 세트 84, 세트 81 중 하나 이상을 포함할 수 있다. 바람직하게는 HLA-DQB1*02의 분석을 위한 시발체 세트는 하기 조합 중 하나 이상을 포함할 수 있다;
세트 73과 세트 84;
세트 73;
세트 73과 세트 81;
세트 84.
HLA-DQB1*03의 분석을 위한 시발체 세트는 세트 79, 세트 80, 세트 85, 세트 86, 세트 81 중 하나 이상을 포함할 수 있다. 바람직하게는 HLA-DQB1*03의 분석을 위한 시발체 세트는 하기 조합 중 하나 이상을 포함할 수 있다;
세트 79;
세트 80, 세트 85와 세트 86;
세트 80;
세트 80과 세트 85;
세트 81, 세트 85와 세트 86;
세트 86;
세트 81;
세트 79와 세트 86;
세트 85와 세트 86;
세트 80과 세트 86;
세트 81과 세트 85.
HLA-DQB1*04의 분석을 위한 시발체 세트는 세트 74, 세트 83, 세트 81 중 하나 이상을 포함할 수 있다. 바람직하게는 HLA-DQB1*04의 분석을 위한 시발체 세트는 하기 조합 중 하나 이상을 포함할 수 있다;
세트 74와 세트 83;
세트 83;
세트 74와 세트 81.
HLA-DQB1*05의 분석을 위한 시발체 세트는 세트 75가 될 수 있다.
HLA-DQB1*06의 분석을 위한 시발체 세트는 세트 76, 세트 77, 세트 85, 세트 82, 세트 81, 세트 86, 세트 75, 세트 78 중 하나 이상을 포함할 수 있다. 바람직하게는 HLA-DQB1*06의 분석을 위한 시발체 세트는 하기 조합 중 하나 이상을 포함할 수 있다;
세트 76;
세트 77과 세트 85;
세트 77, 세트 78과 세트 82;
세트 78과 세트 81;
세트 78과 세트 82;
세트 78;
세트 85와 세트 86;
세트 85;
세트 75와 세트 77;
세트 77, 세트 80과 세트 85;
세트 77, 세트 81과 세트 85;
세트 77;
세트 76과 세트 77;
세트 76, 세트 77과 세트 85;
세트 77과 세트 82;
세트 76, 세트 78과 세트 81;
세트 78과 세트 86.
상기 조합에 있어서, 상기 세트는 검사 키트에서 동일 웰에 포함될 수도 있으나, 바람직하게는 각각 서로 다른 웰에 포함될 수 있다.
웰은 실시간 PCR에 의해 증폭된 산물을 탐침할 수 있도록 형광 탐침자를 포함할 수 있다. 형광 탐침자는 HLA-DQB1 대립 유전자의 증폭 유무를 확인할 수 있으며, 하기 서열 중 하나 이상을 포함할 수 있다:
서열번호 325: FAM 5'-CGCTTCGACAGCGACGTGGGGGWGT-3' BHQ-1
서열번호 326: FAM 5'-CCGAGTACTGGAAYAGCCAGAAGGA-3' BHQ-1
서열번호 327: FAM 5'-TGGGGCCGCCTGCCGCCGAGTACTGGAACA-3' BHQ-1.
일 구체예에서, 서열번호 325는 세트 71, 세트 72, 세트 73, 세트 74, 세트 76, 세트 77, 세트 78, 세트 79, 세트 80, 세트 81, 세트 82 또는 세트 83과 조합될 수 있다.
일 구체예에서, 서열번호 326은 세트 75와 조합될 수 있다.
일 구체예에서, 서열번호 327은 세트 84와 조합될 수 있다.
웰은 HLA-DQB1 증폭 유무의 동작 여부를 확인하기 위하여 상기 서열번호 303과 서열번호 304의 시발체 세트와, 이를 검출할 수 있는 상기 서열번호 330의 탐침자 세트를 더 포함할 수 있다:
< HLA-DQA1 유전자 분석>
HLA-DQA1 유전자 분석을 위한 시발체 세트는 세트 85, 세트 86, 세트 87, 세트 88, 세트 89, 세트 90, 세트 91, 세트 92 중 하나 이상을 포함할 수 있다.
HLA-DQA1*01의 분석을 위한 시발체 세트는 세트 85, 세트 86, 세트 87 중 하나 이상을 포함할 수 있다. 바람직하게는 HLA-DQA1*01의 분석을 위한 시발체 세트는 하기 조합 중 하나 이상을 포함할 수 있다;
세트 85;
세트 85와 세트 86;
세트 85, 세트 86과 세트 87.
HLA-DQA1*02의 분석을 위한 시발체 세트는 세트 88일 수 있다.
HLA-DQA1*03의 분석을 위한 시발체 세트는 세트 89일 수 있다.
HLA-DQA1*04의 분석을 위한 시발체 세트는 세트 90일 수 있다.
HLA-DQA1*05의 분석을 위한 시발체 세트는 세트 91일 수 있다.
HLA-DQA1*06의 분석을 위한 시발체 세트는 세트 92일 수 있다.
상기 조합에 있어서, 상기 세트는 검사 키트에서 동일 웰에 포함될 수도 있으나, 바람직하게는 각각 서로 다른 웰에 포함될 수 있다.
웰은 실시간 PCR에 의해 증폭된 산물을 탐침할 수 있도록 형광 탐침자를 포함할 수 있다. 형광 탐침자는 HLA-DQA1 대립 유전자의 증폭 유무를 확인할 수 있으며, 하기 서열 중 하나 이상을 포함할 수 있다:
서열번호 328: FAM 5'-TTGCTGAACTCAGGCCACCGCCAGG-3' BHQ1
서열번호 329: FAM 5'-CCSGCAATTTGCACTGACAAACATCGCT-3' BHQ1
일 구체예에서, 서열번호 328은 세트 85, 세트 86 또는 세트 87과 조합될 수 있다.
일 구체예에서, 서열번호 329는 세트88, 세트 89, 세트 90, 세트 91 또는 세트 92와 조합될 수 있다.
웰은 HLA-DQA1 증폭 유무의 동작 여부를 확인하기 위하여 상기 서열번호 303과 서열번호 304의 시발체 세트와, 이를 검출할 수 있는 상기 서열번호 330의 탐침자 세트를 더 포함할 수 있다.
본 발명의 HLA 대립 유전자 검사 키트는 복수 개의 웰로 구성되어 있다. 각각의 웰에는 HLA 대립 유전자인 HLA-A, HLA-B, HLA-DRB1, HLA-C, HLA-DQB1 또는 HLA-DQA1을 검출할 수 있는 시발체 세트를 포함할 수 있다.
일 구체예에서, 1개의 웰에는 HLA-A, HLA-B, HLA-DRB1 중 2개 이상의 검출 시발체 세트 및 그의 증폭 산물을 검출할 수 있는 탐침자 세트를 포함할 수 있다.
다른 구체에에서, 1개의 웰에는 HLA-A, HLA-B, HLA-DRB1, HLA-C, HLA-DQB1, HLA-DQA1 중 2개 이상의 검출 시발체 세트 및 그의 증폭 산물을 검출할 수 있는 탐침자 세트를 포함할 수 있다.
본 발명의 시발체 세트는 용액혼합방법으로 제조될 수 있지만, 이에 제한되지 않는다.
본 발명의 탐침자 세트는 용액혼합방법으로 제조될 수 있지만, 이에 제한되지 않는다.
본 발명의 키트에서 웰에는 택 중합 효소(Taq polymerase), MgCl2를 포함하는 완충액, dNTP 및 안정화제(stabilizer)로 이루어진 군으로부터 선택된 1종 이상을 더 포함할 수 있다. 그 외에도 당업계에서 알려진 공지된 다른 시약, 실시간 PCR 마스터 믹스를 더 포함할 수 있다.
본 발명의 키트에서 시발체를 통해 증폭될 수 있는 증폭 산물의 크기는 80bp 내지 400bp, 바람직하게는 89bp 내지 298bp일 수 있다.
본 발명의 HLA 대립 유전자 판별 방법은 시료로부터 DNA를 얻는 단계, 상기 DNA를 본 발명에 따른 HLA 대립 유전자 검사 키트를 사용해서 실시간 중합효소연쇄반응을 하는 단계, 및 상기 실시간 중합효소연쇄반응의 결과를 판독하여 HLA 대립 유전자를 판별하는 단계를 포함할 수 있다.
HLA 대립유전자를 형별하는 방법에 있어, 단일 또는 멀티플렉스 실시간 PCR 반응 조건은 통상적인 조건을 취할 수 있다. 또한, 단일 실시간 PCR과 멀티플렉스 실시간 PCR 반응은 동일한 조건으로 수행될 수 있으며, 일 예로 초기 변성(initial denaturation)을 96에서 5분간 수행한 후, 1단계로 변성(denaturation, 96에서 25초), 결합(annealing, 70에서 45초) 및 연장(extension, 72에서 30초) 을 5회 실시하고, 2단계로 변성(denaturation, 95에서 25초), 결합(annealing, 70에서 45초) 및 연장(extension, 72에서 30초) 을 30회 실시하여 총 35회 실시하는 조건을 취할 수 있다. 실시간 PCR 중 2단계의 연장단계에서 형광탐침자에 의해 생성된 형광을 측정한다.
이하, 본 발명의 바람직한 실시예를 통해 본 발명의 구성 및 작용을 더욱 상세히 설명하기로 한다. 다만, 이는 본 발명의 바람직한 예시로 제시된 것이며 어떠한 의미로도 이에 의해 본 발명이 제한되는 것으로 해석될 수는 없다.
실시예
1
세트 1 내지 세트 92의 시발체 세트(서열번호 1 내지 서열번호 302)를 증류수와 함께 혼합하여 해당 웰(well)에 분주 하는 방법으로 제조하였다.
실시예
2
형광 탐침자 세트(서열번호 305 내지 329)를 증류수와 함께 혼합하여 해당 웰(well)에 분주하는 방법으로 제조하였다.
실시예
3
양성 대조군 유전자를 검출하기 위한 서열번호 303, 서열번호 304 및 이의 증폭 산물을 검출하기 위한 형광 탐침자 세트 서열번호 330을 증류수와 함께 혼합하여 해당 웰(well)에 분주하는 방법으로 제조하였다.
실시예
4
시발체 세트(서열번호 1 내지 서열번호 302) 및 형광 탐침자 세트(서열번호 305 내지 329), 양성 대조군 유전자를 검출하기 위한 시발체 세트(서열번호 303, 서열번호 304)를 증류수와 함께 혼합하여 해당 웰(well)에 분주 후 건조하는 방법으로 제조하였다.
실시예
5
양성 대조군 유전자를 검출하기 위한 형광 탐침자 세트(서열번호 330)를 중합반응 완충용액, dNTPs, MgCl2, 증류수와 함께 혼합하여 제조하였다.
실시예
6
시발체 세트(서열번호 1 내지 서열번호 302) 및 형광 탐침자 세트(서열번호 305 내지 329), 양성 대조군 유전자를 검출하기 위한 시발체 세트(서열번호 303, 서열번호 304)를 증류수와 함께 혼합하여 제조하였다.
실시예 7: 실시간 중합효소연쇄반응을 이용한 HLA 대립 유전자 형별
본 제품은 HLA 대립 유전자 형별을 확인하기 위해 혈액에서 분리한 DNA와 HLA-A, -B, -DRB1, -C, -DQB1, -DQA1 대립유전자를 증폭할 수 있는 특이 시발체 쌍과 양성대조군 표준유전자를 증폭하기 위한 시발체 쌍, 실시간으로 증폭 유무를 확인 및 측정하기 위한 형광탐침자, dNTPs와 중합반응 완충용액(10xPCR Buffer), MgCl2, 중합반응효소(Taq polymerase)를 96well-plate에 넣고 혼합하여 실시간 중합효소연쇄반응 장비를 이용하여 확인 하였다. 이때 중합효소연쇄반응을 일으키기 위한 조건은 96에서 5분간 1회, 1단계로 변성(denaturation, 96에서 25초), 결합(annealing, 70에서 45초) 및 연장(extension, 72에서 30초) 을 5회 실시하고, 2단계로 변성(denaturation, 96에서 25초), 결합(annealing, 65에서 45초) 및 연장(extension, 72에서 30초) 을 32회 실시하여 총 37회 실시하고 실시간 증폭 유무 측정은 2단계 72에서 30초 되는 단계에서 측정하였다. 실시간 중합효소연쇄반응 기기에서의 증폭 유무 측정은 FAM은 490 nm에서, JOE는 530 nm, ROX는 590 nm 로 측정하였다. 사용된 기기는 Applied Biosystems 7500 Real-Time PCR Instrument System과 Applied Biosystems 7500 Fast Real-Time PCR Instrument System을 사용하였다.
그 결과 각 웰의 증폭양상에 따라 HLA-A, -B, -DRB1, -C, -DQB1, -DQA1의 대립 유전자 형별을 확인할 수 있다.
도 1을 참조하면, 본 제품은 기존 제품에 비해 짧은 시간안에 많은 HLA 유전자를 검사할 수 있는 장점이 있고, 실시간 중합효소연쇄반응법을 이용하여 전기영동을 하지 않고 결과를 확인함으로써 사용자가 편리하게 사용할 수 있게 하였다. 도 2를 참조하면 양성범위 기준을 설정하여 결과 분석에 대한 모호함을 줄여 신뢰성을 높였다.
본 발명의 단순한 변형 내지 변경은 이 분야의 통상의 지식을 가진 자에 의하여 용이하게 실시될 수 있으며, 이러한 변형이나 변경은 모두 본 발명의 영역에 포함되는 것으로 볼 수 있다.
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tctgtgagtg ggccttcat 19
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gggtctcaca ccctccagt 19
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<213> Artificial Sequence
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<223> PRIMER FOR HLA
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ccttcccgtt ctccaggtg 19
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<213> Artificial Sequence
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gccccgcttc atcgca 16
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<212> DNA
<213> Artificial Sequence
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<223> PRIMER FOR HLA
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ccgtcccaat actccgga 18
<210> 7
<211> 18
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
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<223> PRIMER FOR HLA
<400> 7
gcctcctccg cgggcata 18
<210> 8
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<212> DNA
<213> Artificial Sequence
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<223> PRIMER FOR HLA
<400> 8
tagcgcgctc cagcttgt 18
<210> 9
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<223> PRIMER FOR HLA
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tggctgcgac gtggggt 17
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ccactccacg cacgtgcca 19
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<213> Artificial Sequence
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cccactccat gaggtatttc ga 22
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<212> DNA
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<212> DNA
<213> Artificial Sequence
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<223> PRIMER FOR HLA
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<213> Artificial Sequence
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<223> PRIMER FOR HLA
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<213> Artificial Sequence
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<223> PRIMER FOR HLA
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<223> PRIMER FOR HLA
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<223> PRIMER FOR HLA
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<223> PRIMER FOR HLA
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<223> PRIMER FOR HLA
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<223> PRIMER FOR HLA
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<211> 17
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<211> 19
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<223> PRIMER FOR HLA
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<223> PRIMER FOR HLA
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<213> Artificial Sequence
<220>
<223> PRIMER FOR HLA
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<213> Artificial Sequence
<220>
<223> PRIMER FOR HLA
<400> 224
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<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> PRIMER FOR HLA
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<212> DNA
<213> Artificial Sequence
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<223> PRIMER FOR HLA
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<213> Artificial Sequence
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<223> PRIMER FOR HLA
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<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> PRIMER FOR HLA
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<223> PRIMER FOR HLA
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<223> PRIMER FOR HLA
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<223> PRIMER FOR HLA
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<223> PRIMER FOR HLA
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<223> PRIMER FOR HLA
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<223> PRIMER FOR HLA
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<223> PRIMER FOR HLA
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<223> PRIMER FOR HLA
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<223> PRIMER FOR HLA
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<223> PRIMER FOR HLA
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<223> PRIMER FOR HLA
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<213> Artificial Sequence
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<223> PRIMER FOR HLA
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<223> PRIMER FOR HLA
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<213> Artificial Sequence
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<223> PRIMER FOR HLA
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<213> Artificial Sequence
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<223> PRIMER FOR HLA
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<223> PRIMER FOR HLA
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<223> PRIMER FOR HLA
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<213> Artificial Sequence
<220>
<223> PRIMER FOR HLA
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<213> Artificial Sequence
<220>
<223> PRIMER FOR HLA
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<220>
<223> PRIMER FOR HLA
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<223> PRIMER FOR HLA
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<223> PRIMER FOR HLA
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<220>
<223> PRIMER FOR HLA
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<223> PRIMER FOR HLA
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<223> PRIMER FOR HLA
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<223> PRIMER FOR HLA
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<223> PRIMER FOR HLA
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<223> PRIMER FOR HLA
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<223> PRIMER FOR HLA
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<223> PRIMER FOR HLA
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<223> PRIMER FOR HLA
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<223> PRIMER FOR HLA
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<223> PRIMER FOR HLA
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<223> PRIMER FOR HLA
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<223> PRIMER FOR HLA
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<223> PRIMER FOR HLA
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<223> PRIMER FOR HLA
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<223> PRIMER FOR HLA
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<223> PRIMER FOR HLA
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<223> PRIMER FOR HLA
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<223> PRIMER FOR HLA
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<223> PRIMER FOR HLA
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cttacggtcc ctctggccag tt 22
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<220>
<223> PRIMER FOR HLA
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<223> PRIMER FOR HLA
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<211> 21
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<220>
<223> PRIMER FOR HLA
<400> 304
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<213> Artificial Sequence
<220>
<223> PROBE FOR HLA
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<220>
<223> PROBE FOR HLA
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<220>
<223> PROBE FOR HLA
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<211> 26
<212> DNA
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<220>
<223> PROBE FOR HLA
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<220>
<223> PROBE FOR HLA
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<210> 310
<211> 22
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<220>
<223> PROBE FOR HLA
<400> 310
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<210> 311
<211> 29
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> PROBE FOR HLA
<400> 311
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<210> 312
<211> 28
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> PROBE FOR HLA
<400> 312
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<211> 27
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<220>
<223> PROBE FOR HLA
<400> 313
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<212> DNA
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<220>
<223> PROBE FOR HLA
<400> 314
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<211> 30
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<220>
<223> PROBE FOR HLA
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<220>
<223> PROBE FOR HLA
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<220>
<223> PROBE FOR HLA
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<212> DNA
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<220>
<223> PROBE FOR HLA
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<210> 319
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<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> PROBE FOR HLA
<400> 319
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<210> 320
<211> 27
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> PROBE FOR HLA
<400> 320
ttcgacagcg acgccgcgag tccraga 27
<210> 321
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<212> DNA
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<220>
<223> PROBE FOR HLA
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cctacgacgg caaggattac atcgcc 26
<210> 323
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<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> PROBE FOR HLA
<400> 323
catcccccac ggacggcccg ggtcgcc 27
<210> 324
<211> 29
<212> DNA
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<220>
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ttgtggagac caggccagca ggagatgga 29
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<212> DNA
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<220>
<223> PROBE FOR HLA
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<212> DNA
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<220>
<223> PROBE FOR HLA
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<220>
<223> PROBE FOR HLA
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<211> 25
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> PROBE FOR HLA
<400> 328
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<212> DNA
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<220>
<223> PROBE FOR HLA
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ccsgcaattt gcactgacaa acatcgct 28
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<220>
<223> PROBE FOR HLA
<400> 330
actaacctcc aaccaacaat cagc 24
Claims (12)
- HLA-C, HLA-DQB1, HLA-DQA1 중 선택되는 1개 이상의 유전자에 대한 HLA 대립 유전자를 실시간 중합효소연쇄반응에 의해 특이적으로 증폭할 수 있는 시발체 세트; 및
상기 실시간 중합효소연쇄반응에 의해 증폭된 산물을 탐침할 수 있는 탐침자를 포함하는 HLA 대립 유전자 검사 키트로서,
상기 HLA 대립 유전자 검사 키트는 HLA-A, HLA-B, HLA-DRB1 중 선택되는 1개 이상의 유전자를 실시간 중합효소연쇄반응에 의해 특이적으로 추가로 증폭하는 것이고,
상기 탐침자는 서열번호 307, 310, 316, 318, 320 내지 329 중 하나 이상인 것인, HLA 대립 유전자 검사 키트.
- 삭제
- 제1항에 있어서, 상기 HLA 대립 유전자는 HLA-A*01, HLA-A*02, HLA-A*03, HLA-A*11, HLA-A*23, HLA-A*24, HLA-A*25, HLA-A*26, HLA-A*29, HLA-A*30, HLA-A*31, HLA-A*32, HLA-A*33, HLA-A*34, HLA-A*36, HLA-A*43, HLA-A*66, HLA-A*68, HLA-A*69, HLA-A*74, HLA-A*80 중 하나 이상을 포함하는 것인, HLA-A 대립 유전자;
HLA-B*07, HLA-B*08, HLA-B*13, HLA-B*14, HLA-B*15, HLA-B*18, HLA-B*27, HLA-B*35, HLA-B*37, HLA-B*38, HLA-B*39, HLA-B*40, HLA-B*41, HLA-B*42, HLA-B*44, HLA-B*45, HLA-B*46, HLA-B*47, HLA-B*48, HLA-B*49, HLA-B*50, HLA-B*51, HLA-B*52, HLA-B*53, HLA-B*54, HLA-B*55, HLA-B*56, HLA-B*57, HLA-B*58, HLA-B*59, HLA-B*67, HLA-B*73, HLA-B*78, HLA-B*81, HLA-B*82, HLA-B*83 중 하나 이상을 포함하는 것인, HLA-B 대립 유전자;
HLA-DRB1*01, HLA-DRB1*03, HLA-DRB1*04, HLA-DRB1*07, HLA-DRB1*08, HLA-DRB1*09, HLA-DRB1*10, HLA-DRB1*11, HLA-DRB1*12, HLA-DRB1*13, HLA-DRB1*14, HLA-DRB1*15, HLA-DRB1*16 중 하나 이상을 포함하는 것인, HLA-DRB1 대립 유전자;
HLA-C*01, HLA-C*02, HLA-C*03, HLA-C*04, HLA-C*05, HLA-C*06, HLA-C*07, HLA-C*08, HLA-C*12, HLA-C*14, HLA-C*15, HLA-C*16, HLA-C*17, HLA-C*18 중 하나 이상을 포함하는 것인, HLA-C 대립 유전자;
HLA-DQB1*02, HLA-DQB1*03, HLA-DQB1*04, HLA-DQB1*05, HLA-DQB1*06 중 하나 이상을 포함하는 것인, HLA-DQB1 대립 유전자;
HLA-DQA1*01, HLA-DQA1*02, HLA-DQA1*03, HLA-DQA1*04, HLA-DQA1*05, HLA-DQA1*06 중 하나 이상을 포함하는 것인, HLA-DQA1 대립 유전자; 중 하나 이상을 포함하는 것인, HLA 대립 유전자 검사 키트.
- 삭제
- 제1항에 있어서, 상기 HLA-A 유전자 분석을 위한 시발체 세트는 하기 세트들 중 하나 이상을 포함하는 것인, HLA 대립 유전자 검사 키트:
세트 1-1, 세트 2-1, 세트 3-1, 세트 4-1, 세트 5-1, 세트 6, 세트 7-1, 세트 8-1, 세트 9-1, 세트 10-1, 세트 11, 세트 12-1, 세트 13-1, 세트 14-1, 세트 15-1, 세트 16-1, 세트 17, 세트 18-1, 세트 19-1, 세트 20-1, 세트 21-1 및 세트 22-1.
- 제1항에 있어서, 상기 HLA-B 유전자 분석을 위한 시발체 세트는 하기 세트들 중 하나 이상을 포함하는 것인, HLA 대립 유전자 검사 키트:
세트 1-2, 세트 2-2, 세트 3-2, 세트 4-2, 세트 5-2, 세트 7-2, 세트 8-2, 세트 9-2, 세트 10-2, 세트 12-2, 세트 13-2, 세트 14-2, 세트 15-2, 세트 16-2, 세트 18-2, 세트 19-2, 세트 20-2, 세트 21-2, 세트 22-2, 세트 23-2, 세트 24-2, 세트 25-2, 세트 26-2, 세트 27-2, 세트 28-2, 세트 29-2, 세트 30-2, 세트 31-2, 세트 32-2, 세트 33-2, 세트 34-2, 세트 35-2, 세트 36-2, 세트 37-2, 세트 38-2, 세트 39-2, 세트 40-2, 세트 41-2, 세트 42-2, 세트 43-2, 세트 44-2, 세트 45-2, 세트 46-2, 세트 47 및 세트 48.
- 제1항에 있어서, 상기 HLA-DRB1 유전자 분석을 위한 시발체 세트는 하기 세트들 중 하나 이상을 포함하는 것인, HLA 대립 유전자 검사 키트:
세트 23-1, 세트 24-1, 세트 25-1, 세트 26-1, 세트 27-1, 세트 28-1, 세트 29-1, 세트 30-1, 세트 31-1, 세트 32-1, 세트 33-1, 세트 34-1, 세트 35-1, 세트 36-1, 세트 37-1, 세트 38-1, 세트 39-1, 세트 40-1, 세트 41-1, 세트 42-1, 세트 43-1, 세트 44-1, 세트 45-1 및 세트 46-1.
- 제1항에 있어서, 상기 HLA-C 유전자 분석을 위한 시발체 세트는 하기 세트들 중 하나 이상을 포함하는 것인, HLA 대립 유전자 검사 키트:
세트 49, 세트 50, 세트 51, 세트 52, 세트 53, 세트 54, 세트 55, 세트 56, 세트 57, 세트 58, 세트 59, 세트 60, 세트 61, 세트 62, 세트 63, 세트 64, 세트 65, 세트 66, 세트 67, 세트 68, 세트 69 및 세트 70.
- 제1항에 있어서, 상기 HLA-DQB1 유전자 분석을 위한 시발체 세트는 하기 세트들 중 하나 이상을 포함하는 것인, HLA 대립 유전자 검사 키트:
세트 71, 세트 72, 세트 73, 세트 74, 세트 75, 세트 76, 세트 77, 세트 78, 세트 79, 세트 80, 세트 81, 세트 82, 세트 83 및 세트 84.
- 제1항에 있어서, 상기 HLA-DQA1 유전자 분석을 위한 시발체 세트는 하기 세트들 중 하나 이상을 포함하는 것인, HLA 대립 유전자 검사 키트:
세트 85, 세트 86, 세트 87, 세트 88, 세트 89, 세트 90, 세트 91 및 세트 92.
- 제1항에 있어서, 상기 HLA 대립 유전자 검사 키트는 각 웰에 양성 대조군 유전자를 증폭할 수 있는 시발체 세트 서열번호 303 내지 서열번호 304 및 양성 대조군 유전자의 증폭 유무를 탐지할 수 있는 탐침자 서열번호 330을 더 포함하는 것인, HLA 대립 유전자 검사 키트.
- 시료로부터 DNA를 얻는 단계, 상기 DNA를 제1항, 제3항, 제5항 내지 제11항 중 어느 한 항에 따른 HLA 대립 유전자 검사 키트를 사용해서 실시간 중합효소연쇄반응을 하는 단계, 및
상기 실시간 중합효소연쇄반응의 결과를 판독하여 HLA 대립 유전자를 판별하는 단계를 포함하는 것인, HLA 대립 유전자 판별 방법.
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