JPWO2020022475A1 - 抗体−薬物コンジュゲートの薬物部位を認識する蛋白質 - Google Patents
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Abstract
Description
[1]
式
[2]
抗体−薬物コンジュゲートにおける薬物リンカーが、
式
で示される、[1]に記載の蛋白質。
[3]
抗体−薬物コンジュゲートにおける薬物リンカーが、
式
で示される、[1]に記載の蛋白質。
[4]
抗体−薬物コンジュゲートにおける薬物リンカーが、
式
で示される、[1]に記載の蛋白質。
[5]
抗体−薬物コンジュゲートが、式
で示される、[1]に記載の蛋白質。
[6]
抗体−薬物コンジュゲートが、式
で示される、[1]に記載の蛋白質。
[7]
抗体−薬物コンジュゲートが、式
で示される、[1]に記載の蛋白質。
[8]
抗体−薬物コンジュゲートにおける1抗体あたりの薬物リンカーの平均結合数が2から8の範囲である、[1]〜[7]のいずれか1項に記載の蛋白質。
[9]
抗体−薬物コンジュゲートにおける抗体が、抗HER2抗体、抗HER3抗体、抗TROP2抗体、抗B7−H3抗体、抗GPR20抗体、又は抗CDH6抗体である、[1]〜[8]のいずれか1項に記載の蛋白質。
[10]
抗体−薬物コンジュゲートにおける1抗体あたりの薬物リンカーの平均結合数の違いによって該抗体−薬物コンジュゲートに対する認識性が実質的に異ならない、[1]〜[9]のいずれか1項に記載の蛋白質。
[11]
式
[12]
式
[13]
式
[14]
式
[15]
抗体であることを特徴とする、[1]〜[14]のいずれか1項に記載の蛋白質。
[16]
a)配列番号1に示されるアミノ酸配列からなるCDRH1、配列番号2に示されるアミノ酸配列からなるCDRH2、及び配列番号3に示されるアミノ酸配列からなるCDRH3を含む重鎖、並びに、配列番号4に示されるアミノ酸配列からなるCDRL1、配列番号5に示されるアミノ酸配列からなるCDRL2、及び配列番号6に示されるアミノ酸配列からなるCDRL3を含む軽鎖からなる抗体、
b)配列番号7に示されるアミノ酸配列からなるCDRH1、配列番号8に示されるアミノ酸配列からなるCDRH2、及び配列番号3に示されるアミノ酸配列からなるCDRH3を含む重鎖、並びに、配列番号4に示されるアミノ酸配列からなるCDRL1、配列番号5に示されるアミノ酸配列からなるCDRL2、及び配列番号6に示されるアミノ酸配列からなるCDRL3を含む軽鎖からなる抗体、
c)配列番号9に示されるアミノ酸配列からなるCDRH1、配列番号10に示されるアミノ酸配列からなるCDRH2、及び配列番号3に示されるアミノ酸配列からなるCDRH3を含む重鎖、並びに、配列番号4に示されるアミノ酸配列からなるCDRL1、配列番号5に示されるアミノ酸配列からなるCDRL2、及び配列番号6に示されるアミノ酸配列からなるCDRL3を含む軽鎖からなる抗体、又は、
d)配列番号11に示されるアミノ酸配列からなるCDRH1、配列番号12に示されるアミノ酸配列からなるCDRH2、及び配列番号13に示されるアミノ酸配列からなるCDRH3を含む重鎖、並びに、配列番号14に示されるアミノ酸配列からなるCDRL1、WASで示されるトリペプチドからなるCDRL2、及び配列番号6に示されるアミノ酸配列からなるCDRL3を含む軽鎖からなる抗体であることを特徴とする、[15]に記載の蛋白質。
[17]
配列番号15においてアミノ酸番号20乃至141に記載のアミノ酸配列からなる重鎖可変領域を含む重鎖、及び配列番号16においてアミノ酸番号21乃至127に記載のアミノ酸配列からなる軽鎖可変領域を含む軽鎖からなる抗体であることを特徴とする、[16]に記載の蛋白質。
[18]
マウス抗体であることを特徴とする、[17]に記載の蛋白質。
[19]
配列番号15においてアミノ酸番号20乃至477に記載のアミノ酸配列からなる重鎖及び配列番号16においてアミノ酸番号21乃至234に記載のアミノ酸配列からなる軽鎖からなる抗体であることを特徴とする、[17]に記載の蛋白質。
[20]
キメラ抗体であることを特徴とする、[17]に記載の蛋白質。
[21]
ウサギキメラ化抗体であることを特徴とする、[17]に記載の蛋白質。
配列番号19においてアミノ酸番号20乃至464に記載のアミノ酸配列からなる重鎖及び配列番号20においてアミノ酸番号21乃至233に記載のアミノ酸配列からなる軽鎖からなる抗体であることを特徴とする、[17]に記載の蛋白質。
[23]
[19]又は[22]に記載の抗体の重鎖カルボキシル末端のリシン残基が欠失している抗体であることを特徴とする、[15]に記載の蛋白質。
[24]
[19]又は[22]に記載の抗体のアミノ酸配列と少なくとも95%の同一性を持つアミノ酸配列からなる抗体であることを特徴とする、[15]に記載の蛋白質。
[25]
[19]又は[22]に記載の抗体のアミノ酸配列と少なくとも99%の同一性を持つアミノ酸配列からなる抗体であることを特徴とする、[15]に記載の蛋白質。
[26]
薬物への認識性について、[19]又は[22]に記載の抗体と競合する抗体であることを特徴とする、[15]に記載の蛋白質。
[27]
[15]〜[26]のいずれか1項に記載の抗体の抗原結合断片であることを特徴とする、[1]〜[14]のいずれか1項に記載の蛋白質。
[28]
抗体の抗原結合断片が、Fab、F(ab’)2、Fab’又はFvである、[27]に記載の蛋白質。
[29]
[1]〜[28]のいずれか1項に記載の蛋白質を用いて、抗体−薬物コンジュゲートを投与された哺乳動物における、該抗体−薬物コンジュゲートの血漿中濃度を定量する方法。
[30]
(1)抗体−薬物コンジュゲートの標的抗原が固相化されたプレートに血漿中の抗体−薬物コンジュゲートを接触させ複合体を形成させるステップ、(2)マーカーで標識化された、[1]〜[28]のいずれか1項に記載の蛋白質を接触させ、さらなる複合体を形成させるステップ、次いで(3)該マーカーを検出するステップ、を含むことを特徴とする、[29]に記載の方法。
[31]
(1)[1]〜[28]のいずれか1項に記載の蛋白質が固相化されたプレートに血漿中の抗体−薬物コンジュゲートを接触させ複合体を形成させるステップ、(2)該抗体−薬物コンジュゲートの抗体部位を認識することができ、マーカーで標識化された第二の蛋白質を接触させ、さらなる複合体を形成させるステップ、次いで(3)該マーカーを検出するステップ、を含むことを特徴とする、[29]に記載の方法。
[32]
[1]〜[28]のいずれか1項に記載の蛋白質を用いて、抗体−薬物コンジュゲートを投与された哺乳動物における、該抗体−薬物コンジュゲートから遊離した薬物の血漿中濃度を定量する方法。
[33]
(1)[1]〜[28]のいずれか1項に記載の蛋白質が固相化されたプレートに、マーカーで標識化された競合薬物の存在下で、血漿中の抗体−薬物コンジュゲートから遊離した薬物を接触させ複合体を形成させるステップ、(2)該マーカーを検出するステップ、を含むことを特徴とする、[32]に記載の方法。
[34]
[1]〜[28]のいずれか1項に記載の蛋白質を用いて、抗体−薬物コンジュゲートを投与された哺乳動物における、該抗体−薬物コンジュゲート及び/又は該抗体−薬物コンジュゲートから遊離した薬物の組織分布を確認する方法。
[35]
(1)組織中の抗体−薬物コンジュゲート及び/又は該抗体−薬物コンジュゲートから遊離した薬物を[1]〜[28]のいずれか1項に記載の蛋白質と接触させ複合体を形成させるステップ、(2)[1]〜[28]のいずれか1項に記載の蛋白質を認識することができ、マーカーで標識化された第二の蛋白質を接触させ、さらなる複合体を形成させるステップ、次いで(3)該マーカーを検出するステップ、を含むことを特徴とする、[34]に記載の方法。
(1)組織中の抗体−薬物コンジュゲート及び/又は該抗体−薬物コンジュゲートから遊離した薬物を、マーカーで標識化された[1]〜[28]のいずれか1項に記載の蛋白質と接触させ複合体を形成させるステップ、次いで(2)該マーカーを検出するステップ、を含むことを特徴とする、[34]に記載の方法。
[37]
マーカーが発色試薬であり、該マーカーの検出が該マーカーの発色を感知することにより行われる、[30]、[31]、[33]、[35]又は[36]に記載の方法。
[38]
マーカーが酵素であり、該マーカーの検出が該酵素と基質との反応により生じた発光又は発色を感知することにより行われる、[30]、[31]、[33]、[35]又は[36]に記載の方法。
[39]
マーカーが発光物質であり、該マーカーの検出が電気化学反応に基づく該マーカーの発光を感知することにより行われる、[30]、[31]、[33]、[35]又は[36]に記載の方法。
[40]
[1]〜[28]のいずれか1項に記載の蛋白質をコードするポリヌクレオチド。
[41]
[40]に記載のポリヌクレオチドを含むベクター。
[42]
[40]に記載のポリヌクレオチドを含む形質転換宿主細胞。
[43]
[41]に記載のベクターを含む形質転換宿主細胞。
[44]
[42]又は[43]に記載の宿主細胞を培養する工程、次いで、前記培養工程で得られた培養産物から蛋白質を精製する工程、を含む、[1]〜[28]のいずれか1項に記載の蛋白質の製造方法。
[45]
[1]〜[28]のいずれか1項に記載の蛋白質を含む組成物。
[46]
[1]〜[28]のいずれか1項に記載の蛋白質、又は[45]に記載の組成物を含むキット。
[47]
抗体−薬物コンジュゲートを投与された哺乳動物における、抗体−薬物コンジュゲート及び/又は該抗体−薬物コンジュゲートから遊離した薬物の血漿中濃度を定量するための、[46]に記載のキット。
[48]
抗体−薬物コンジュゲートを投与された哺乳動物における、抗体−薬物コンジュゲート及び/又は該抗体−薬物コンジュゲートから遊離した薬物の組織分布を確認するための、[46]に記載のキット。
[49]
配列番号15においてアミノ酸番号20乃至141に記載のアミノ酸配列からなる重鎖可変領域を含む重鎖、及び配列番号16においてアミノ酸番号21乃至127に記載のアミノ酸配列からなる軽鎖可変領域を含む軽鎖を含んでなる抗体。
[50]
配列番号15においてアミノ酸番号20乃至477に記載のアミノ酸配列からなる重鎖及び配列番号16においてアミノ酸番号21乃至234に記載のアミノ酸配列からなる軽鎖を含んでなる、[49]に記載の抗体。
[51]
配列番号19においてアミノ酸番号20乃至464に記載のアミノ酸配列からなる重鎖及び配列番号20においてアミノ酸番号21乃至233に記載のアミノ酸配列からなる軽鎖を含んでなる、[49]に記載の抗体。
本発明において、「蛋白質」とは、「ペプチド」又は「ポリペプチド」と同義である。
本発明において「抗体−薬物コンジュゲート」とは、抗体と薬物とが、リンカーを介して結合した結合体を意味する。
式
で示される薬物リンカーを有する抗体−薬物コンジュゲート(以下、「抗体−薬物コンジュゲート(I)」と呼ぶ)、
式
で示される薬物リンカーを有する抗体−薬物コンジュゲート(以下、「抗体−薬物コンジュゲート(II)」と呼ぶ)、又は、
式
で示される薬物リンカーを有する抗体−薬物コンジュゲート(以下、「抗体−薬物コンジュゲート(III)」と呼ぶ)の、薬物部位を特異的に認識することを特徴とする。
式
式
式
式
より好適には、配列番号23においてアミノ酸番号1乃至117に記載のアミノ酸配列からなる重鎖可変領域を含む重鎖、及び配列番号24においてアミノ酸番号1乃至113に記載のアミノ酸配列からなる軽鎖可変領域を含む軽鎖、を含む抗体であり、
更により好適には、配列番号23に記載のアミノ酸配列からなる重鎖及び配列番号24に記載のアミノ酸配列からなる軽鎖を含んでなる抗体、又は、該抗体の重鎖カルボキシル末端のリシン残基が欠失している抗体である。
より好適には、配列番号25においてアミノ酸番号20乃至140に記載のアミノ酸配列からなる重鎖可変領域を含む重鎖、及び配列番号26においてアミノ酸番号21乃至129に記載のアミノ酸配列からなる軽鎖可変領域を含む軽鎖、を含む抗体であり、
更により好適には、配列番号25においてアミノ酸番号20乃至470に記載のアミノ酸配列からなる重鎖及び配列番号26においてアミノ酸番号21乃至234に記載のアミノ酸配列からなる軽鎖を含んでなる抗体、又は、該抗体の重鎖カルボキシル末端のリシン残基が欠失している抗体である。
より好適には、配列番号27においてアミノ酸番号20乃至141に記載のアミノ酸配列からなる重鎖可変領域を含む重鎖、及び配列番号28においてアミノ酸番号21乃至128に記載のアミノ酸配列からなる軽鎖可変領域を含む軽鎖、を含む抗体であり、
更により好適には、配列番号27においてアミノ酸番号20乃至471に記載のアミノ酸配列からなる重鎖及び配列番号28においてアミノ酸番号21乃至233に記載のアミノ酸配列からなる軽鎖を含んでなる抗体、又は、該抗体の重鎖カルボキシル末端のリシン残基が欠失している抗体である。
より好適には、配列番号32においてアミノ酸番号20乃至142に記載のアミノ酸配列からなる重鎖可変領域を含む重鎖、及び配列番号33においてアミノ酸番号21乃至129に記載のアミノ酸配列からなる軽鎖可変領域を含む軽鎖、を含む抗体であり、
更により好適には、配列番号32においてアミノ酸番号20乃至472に記載のアミノ酸配列からなる重鎖及び配列番号33においてアミノ酸番号21乃至234に記載のアミノ酸配列からなる軽鎖を含んでなる抗体、又は、該抗体の重鎖カルボキシル末端のリシン残基が欠失している抗体である。
より好適には、配列番号34においてアミノ酸番号20乃至141に記載のアミノ酸配列からなる重鎖可変領域を含む重鎖、及び配列番号35においてアミノ酸番号21乃至128に記載のアミノ酸配列からなる軽鎖可変領域を含む軽鎖、を含む抗体であり、
更により好適には、配列番号34においてアミノ酸番号20乃至471に記載のアミノ酸配列からなる重鎖及び配列番号35においてアミノ酸番号21乃至233に記載のアミノ酸配列からなる軽鎖を含んでなる抗体、又は、該抗体の重鎖カルボキシル末端のリシン残基が欠失している抗体である。
本発明の蛋白質は、好適には抗体(以下、「本発明の抗体」と呼ぶ)として取得することができる。本発明の抗体は、化合物(1)又はその誘導体とキャリア蛋白とがリンカーを介して結合した抗原蛋白質を動物に免疫し、生体内に産生される抗体を採取、精製することによって得ることができる。
式
式
式
本発明の蛋白質は、ELISA(Enzyme−Linked ImmunoSorbent Assay)法、ECL(Electrochemiluminescence)法、RIA(Radio Immunoassay)法、ELISPOT(Enzyme−Linked ImmunoSpot)法、ドットブロット法、オクタロニー法、CIE(Counterimmunoelectrophoresis)法、CLIA(Chemiluminescent immuno assay)、及びFCM(Flow Cytometry)などの検出方法、並びに免疫組織化学(immunohistochemistry:IHC)法に利用することができ、好適には、ELISA法、ECL法、並びにIHC法に利用することができる。
i) 8−[(2,5−ジオキソピロリジン−1−イル)オキシ]−N−(4−{[(1S,9S)−9−エチル−5−フルオロ−9−ヒドロキシ−4−メチル−10,13−ジオキソ−2,3,9,10,13,15−ヘキサヒドロ−1H,12H−ベンゾ[de]ピラノ[3’,4’:6,7]インドリジノ[1,2−b]キノリン−1−イル]アミノ}−4−オキソブチル)−8−オキソオクタンアミド(化合物(6))の合成
1H−NMR (400MHz,DMSO−d6) δ:0.87(3H,t,J=7.6Hz),1.18−1.37(4H,m),1.40−1.50(2H,m),1.54−1.64(2H,m),1.65−1.74(2H,m),1.78−1.93(2H,m),2.02(2H,t,J=7.6Hz),2.09−2.20(4H,m),2.40(3H,s),2.60−2.68(2H,m),2.80(4H,s),3.00−3.08(2H,m),3.13−3.21(2H,m),5.19(2H,dd,J =32.0,18.0Hz),5.37−5.47(2H,m),5.53−5.60(1H,m),6.52(1H,s),7.30(1H,s),7.74−7.82(2H,m),8.44(1H,d,J=8.5Hz).
MS(APCI)m/z:774(M+H)+
tert−ブチル(4−{[(1S,9S)−9−エチル−5−フルオロ−9−ヒドロキシ−4−メチル−10,13−ジオキソ−2,3,9,10,13,15−ヘキサヒドロ−1H,12H−ベンゾ[de]ピラノ[3’,4’:6,7]インドリジノ[1,2−b]キノリン−1−イル]アミノ}−4−オキソブチル)カーバメート(0.092g、0.148mmoL)(国際公開第2014/057687号に記載の実施例1工程1にて得られる化合物)をメタノール(1.6mL)に溶解し、氷冷した。水素化ホウ素ナトリウム(0.028g、0.740mmoL)を加え氷冷下にて20分間攪拌した。メタノール(10mL)及びクロロホルム(50mL)で希釈し、10%クエン酸水溶液を加え、クロロホルムで抽出した。得られた有機層を10%クエン酸水溶液、続いて飽和食塩水で洗浄し、硫酸ナトリウムで乾燥し、ろ過した。溶媒を減圧留去し、得られた残留物をシリカゲルカラムクロマトグラフィ−[クロロホルム:メタノール=100:0〜95:5(v/v)]にて精製し、薄黄色固体のtert−ブチル(4−{[(1S,9S)−9−エチル−5−フルオロ−9−ヒドロキシ−4−メチル−13−オキソ−2,3,9,10,13,15−ヘキサヒドロ−1H,12H−ベンゾ[de]ピラノ[3’,4’:6,7]インドリジノ[1,2−b]キノリン−1−イル]アミノ}−4−オキソブチル)カーバメート(0.078g、85%)を得た。
1H−NMR (400MHz,DMSO−d6) δ:0.89(3H,t,J=7.4Hz),1.31(9H,s),1.62−1.73(4H,m),2.08−2.18(4H,m), 2.39(3H,s),2.91(2H,q,J=6.5Hz),3.12−3.20(2H,m),4.49(1H,d,J=17.2Hz),4.61(1H,d,J=17.2Hz),4.97(1H,s),4.99(1H,d,J=4.7Hz),5.10(2H,d,J=18.8Hz),5.21(2H,d,J=18.8Hz),5.54−5.58(1H,m),6.74−6.82(2H,m),7.33(1H,s),7.78(1H,d,J=11.0Hz),8.40(1H,d,J=8.6Hz).
工程2:
上記工程1で得た化合物(0.078g、0.125mmoL)をジクロロメタン(2mL)を加え、氷冷し、トリフルオロ酢酸(2mL)を加え、40分間攪拌した。溶媒を減圧留去し、得られた残留物をシリカゲルカラムクロマトグラフィー[クロロホルム〜クロロホルム:メタノール:水=7:3:1(v/v/v)の分配有機層]にて精製した。得られた固体をメタノールに溶解し、エーテルを加えて生成した沈殿を濾取、真空乾燥し、黄色固体の標記化合物(0.045g、56%)を得た。
1H−NMR (400MHz,DMSO−d6) δ:0.89(3H,t,J=7.4Hz),1.71(2H,q,J=7.4Hz),1.80−1.88(2H,m),2.09−2.19(2H,m),2.27(2H,t,J=7.0Hz),2.40(3H,s),2.84(2H,t,J=7.6Hz),3.13−3.20(2H,m),4.50(1H,d,J=17.2Hz),4.62(1H,d,J=17.2Hz),4.97−5.02(2H,m),5.09(1H,d,J=18.8Hz),5.21(1H,d,J=18.8Hz),5.55−5.59(1H,m),6.79(1H,d,J=4.7Hz),7.34(1H,s),7.64−7.75(3H,m),7.79(1H,d,J=11.3Hz),8.53(1H,d,J=8.6Hz).
MS(APCI)m/z:523(M+H)+
4−(tert−ブトキシカルボニルアミノ)ブタン酸(0.492g、2.42mmoL)をジクロロメタン(15mL)及びN, N-ジメチルホルムアミド(2mL)に溶解し、N−ヒドロキシスクシンイミド(0.279g、2.42mmoL)及び、EDCI(1−Ethyl−3−(3−dimethylaminopropyl)carbodiimide Hydrochloride)(0.464g、2.42mmoL)を加え室温にて30分間攪拌した。その反応溶液をシクロヘキシルアミン(0.200g、2.02mmoL)のジクロロメタン溶液(2mL)に滴下し、室温にて20分間攪拌した。反応液をジクロロメタンで希釈し、10%クエン酸水溶液を加え、ジクロロメタンで抽出した。得られた有機層を飽和重曹水で洗浄し、硫酸ナトリウムで乾燥し、ろ過した。溶媒を減圧留去し、得られた残留物をシリカゲルカラムクロマトグラフィ−[ヘキサン:酢酸エチル=50:50〜25:75(v/v)]にて精製し、無色油状のtert−ブチル N-[4−(シクロヘキシルアミノ)−4−オキソ−ブチル]カーバメート(0.308g、54%)を得た。
1H−NMR (400MHz,CDCl3) δ:1.08−1.23(4H,m),1.29−1.42(2H,m),1.44(9H,s),1.66−1.75(2H,m),1.77−1.83(2H,m),1.86−1.95(2H,m),2.17(2H,t, J=7.0Hz),3.11−3.21(2H,m),3.69−3.82(1H,m),4.75(1H,brs),5.89(1H,brs).
工程2:
上記工程1で得た化合物(0.200g、0.703mmoL)を酢酸エチル(50mL)及びジオキサン(10mL)に溶解した。4N塩酸ジオキサン(10mL)を加え2時間攪拌した。生成した沈殿を濾取、真空乾燥し、無色固体の標記化合物(0.098g、63%)を得た。
1H−NMR (400MHz,DMSO−d6) δ:1.06−1.30(5H,m),1.50−1.58(1H,m),1.62−1.82(6H,m),2.16(2H,t,J= 7.2Hz),2.69−2.79(2H,m),3.45−3.58(1H,m),4.73(1H,brs),7.89(1H,d,J=7.8Hz),7.96−8.10(2H,m).
MS(APCI)m/z:185(M+H)+
i) 抗B7−H3抗体−薬物コンジュゲートの製造(1)
国際公開第2014/057687号に記載の製造方法に従って、抗B7−H3抗体(配列番号27においてアミノ酸番号20乃至471に記載のアミノ酸配列からなる重鎖及び配列番号28においてアミノ酸番号21乃至233に記載のアミノ酸配列からなる軽鎖を含んでなる抗体)を用いて、式
で示される薬物リンカーと、抗B7−H3抗体とがチオエーテル結合によって結合した抗B7−H3抗体−薬物コンジュゲート(本発明において「B7−H3−ADC(I)」と称する)を製造した。
国際公開第2014/057687号に記載の製造方法に従って、抗B7−H3抗体(配列番号27においてアミノ酸番号20乃至471に記載のアミノ酸配列からなる重鎖及び配列番号28においてアミノ酸番号21乃至233に記載のアミノ酸配列からなる軽鎖を含んでなる抗体)を用いて、式
で示される薬物リンカーと、抗B7−H3抗体とがチオエーテル結合によって結合した抗B7−H3抗体−薬物コンジュゲート(本発明において「B7−H3−ADC(II)」と称する)を製造した。
国際公開第2014/057687号に記載の製造方法に従って、抗B7−H3抗体(配列番号27においてアミノ酸番号20乃至471に記載のアミノ酸配列からなる重鎖及び配列番号28においてアミノ酸番号21乃至233に記載のアミノ酸配列からなる軽鎖を含んでなる抗体)を用いて、式
で示される薬物リンカーと、抗B7−H3抗体とがチオエーテル結合によって結合した抗B7−H3抗体−薬物コンジュゲート(本発明において「B7−H3−ADC(III)」と称する)を製造した。
国際公開第2015/115091号に記載の製造方法に従って、抗HER2抗体(配列番号21においてアミノ酸番号1乃至449に記載のアミノ酸配列からなる重鎖及び配列番号22においてアミノ酸番号1乃至214に記載のアミノ酸配列からなる軽鎖を含んでなる抗体)を用いて、式
で示される薬物リンカーと、抗HER2抗体とがチオエーテル結合によって結合した抗HER2抗体−薬物コンジュゲート(本発明において「HER2−ADC(I)」と称する)を製造した。
国際公開第2015/155998号に記載の製造方法に従って、抗HER3抗体(配列番号23に記載のアミノ酸配列からなる重鎖及び配列番号24に記載のアミノ酸配列からなる軽鎖を含んでなる抗体)を用いて、式
で示される薬物リンカーと、抗HER3抗体とがチオエーテル結合によって結合した抗HER3抗体−薬物コンジュゲート(本発明において「HER3−ADC(I)」と称する)を製造した。
国際公開第2015/098099号に記載の製造方法に従って、抗TROP2抗体(配列番号25においてアミノ酸番号20乃至470に記載のアミノ酸配列からなる重鎖及び配列番号26においてアミノ酸番号21乃至234に記載のアミノ酸配列からなる軽鎖を含んでなる抗体)を用いて、式
で示される薬物リンカーと、抗TROP2抗体とがチオエーテル結合によって結合した抗TROP2抗体−薬物コンジュゲート(本発明において「TROP2−ADC(I)」と称する)を製造した。
i) 抗原蛋白質の調製
抗原蛋白質は化合物(6)にキャリア蛋白としてウシサイログロブリンを付加したもの(以下、「抗原蛋白質(1)」と呼ぶ)及びBSAを付加したもの(以下、「抗原蛋白質(2)」と呼ぶ)を使用した。
免疫にはBALB/cAnNCrlCrlj(BALB/c)マウス(4個体)及びB6D2F1/Crlj(BDF1)マウス(4個体)の雌(日本チャールス・リバー株式会社)を使用した。初回は抗原蛋白質(1)とFreund’s Complete Adjuvant(和光純薬社製)を混合したものを、2回目以降は抗原蛋白質(1)とFreund’s Incomplete Adjuvant(和光純薬社製)を混合したものを皮下及び皮内に投与した。7日毎に合計4回投与した。
免疫前及び4回投与後のBALB/cマウス(4個体)及びBDF1マウス(4個体)の血清をそれぞれ200倍から204800倍まで希釈して、陽性対照として抗原蛋白質(2)及びB7−H3−ADC(II)、陰性対照としてBSAに対する抗体価を確認した。抗原蛋白質(2)、B7−H3−ADC(II)、及びBSAをELISA用イムノプレートに固相化し、希釈した免疫前及び4回投与後のマウス血清を37℃で30分間反応させた。洗浄後、horseradish peroxidase−conjugated anti−mouse IgG(anti−mouse IgG−HRP)を37℃で30分間反させた。洗浄後、o−phenylenediamine dihydrochloride(OPD)溶液を添加し、発色停止後に490nmの吸光度を測定した。すべての個体において、陽性対照に対する抗体価が上昇していることを確認した。
4回投与後のBALB/cマウス(4個体)及びBDF1マウス(4個体)の血清に、陽性対照として化合物(6)、化合物(7)及び化合物(1)、陰性対象として化合物(8)を添加し、抗原蛋白質(2)に対する未吸収率を算出した。50000倍希釈したマウスの血清と12.5、25、50、100μg/mLに調製した化合物(6)、化合物(8)、化合物(7)及び化合物(1)を混合し、4℃で一晩反応させたのち、抗原蛋白質(2)を固相化したELISA用イムノプレートにし添加し、37℃で30分間反応させた。洗浄後、anti−mouse IgG−HRPを37℃で30分間反応させた。洗浄後、OPD溶液を添加し、発色停止後に490nmの吸光度を測定した。以下式により未吸収率を算出した。
未吸収率 (%) =(a/b)×100
a:陽性対照又は陰性対象の添加濃度12.5μg/mLの吸光度
b:陽性対照又は陰性対象無添加の吸光度
いずれのマウス血清も陽性対照の化合物(6)及び化合物(1)に、個体によっては化合物(7)に高いinhibition効果が認められた。また、陰性対象の化合物(8)にはいずれの血漿にも高いinhibition効果が認められなかった。その中でも化合物(7)に高いinhibition効果が認められ且つ化合物(8)に高いinhibition効果が認めらなかった血清を有するBALB/cマウス及びBDF1マウスからそれぞれ1個体を選択し、リンパ節及び脾臓を採取してハイブリドーマ作製に用いた。
iv)で選択した個体のリンパ節細胞及び脾臓細胞とマウスミエローマをPEG法にて細胞融合した。出現したハイブリドーマの培養上清を用いて抗体産生ハイブリドーマのスクリーニングを行った。
抗原蛋白質(2)をELISA用イムノプレートに固相化し、2倍希釈した抗体産生ハイブリドーマ上清を37℃で120分反応させた。洗浄後、anti−mouse IgG−HRPを37℃で30分間反応させた。洗浄後、OPD溶液を添加し、発色停止後に490nmの吸光度を測定した。OD値が0.2以上の数値を示す培養上清を産生するハイブリドーマ11株を陽性として選択した。
vi)で陽性として選択した11株について、陽性対照として化合物(6)、化合物(1)、B7−H3−ADC(II)、B7−H3−ADC(I)及びB7−H3−ADC(III)、並びに反応性確認用化合物として化合物(8)及び化合物(7)を用いて、inhibition ELISAを実施した。2倍希釈したvi)で陽性として選択した11株の培養上清に、陽性対照及び反応性確認用化合物を最終濃度が25μg/mLになるように添加した。4℃で一晩反応させた後、抗原蛋白質(2)を固相化したELISA用イムノプレートに添加し、37℃で30分間反応させた。洗浄後、anti−mouse IgG−HRPを37℃で30分間反応させた。洗浄後、OPD溶液を添加し、発色停止後に490nmの吸光度を測定した。抗原蛋白質(2)に対する反応性が高く、陽性対照によるinhibition効果が認められた8株を選択して一次クローニングに供した。
vii)で選択した8株を限界希釈法でクローニングした。ハイブリドーマを60細胞/96穴プレートになるように播種し、マウス胸腺細胞を5×106細胞/穴ずつ添加し、10%FBS含有TIL(株式会社免疫生物研究所)を用いて培養した。vii)と同様なinhibition ELISAを行い、特異性が確認された8株x6サブクローンを選択した。
viii)で選択した8株x6サブクローンのB7−H3−ADC(II)及びB7−H3−ADC(I)に対する反応性を確認した。B7−H3 C1 domain LotB7_OmJ1をimmobilized bufferで1μg/mLに希釈し、Maxi−Sorpプレートに100μLずつ添加後、4℃で一晩固相化した。翌日、プレートの培地を除き、5%BSA含有PBSを180μLずつ添加し、室温で3時間静置した。0.05%Tween20含有PBSで2回洗浄後、0.1μg/mLに調製したB7−H3−ADC(II)、及びB7−H3−ADC(I)を100μLずつ添加後、室温でおよそ1時間静置した。0.05%Tween20含有PBSで2回洗浄後、900μg/mLから公比3で7段階に希釈したハイブリドーマ上清を50μLずつ添加後、室温で1時間静置した。0.05%Tween20含有PBSで2回洗浄後、5000倍希釈したPeroxidase AffiniPure Goat Anti−Mouse IgG, Fcγ Fragment Specific(Jackson Immuno Research LABORATORIES,INC.)を100μLずつ添加し、室温で1時間静置した。0.05%Tween20含有PBSで3回洗浄後、HRP基質(OPD tablet)を100μLずつ添加して発色反応を行い、1M HClを100μLずつ添加して発色反応を停止させた後、ARVO(PerkinElmer社)で450nmの吸光度を測定した。8株x6サブクローンの全てにおいてB7−H3−ADC(II)及びB7−H3−ADC(I)に対する反応性が確認された。その中でも反応性の高かった4株x6サブクローンを一次検量線確認へ供した。
ix)で選択した4株x6サブクローンのB7−H3−ADC(I)(DAR7)とB7−H3−ADC(I)(DAR5)への反応性をELISAで確認した。AffiniPure Goat Anti−Mouse IgG,Fcγ fragment specific(Jackson ImmunoResearch Inc.)をCoating Bufferで1μg/mLに希釈し、Maxi−Sorpプレートに100μLずつ添加後、4℃で一晩固相化した。翌日、プレートの培地を除き、PBSで洗浄後に10%BSA含有PBSを100μLずつ添加し、37℃で2.5時間静置した。プレートの培地を除き、ハイブリドーマ4株x6サブクローンを2%BSA、0.2%Polysorbate20(以下、「PS20」と呼ぶ)含有PBSで10、25及び100ng/mLに希釈し、プレートに100μLずつ添加し、37℃で1時間静置した。0.05%PS20含有PBSで4回洗浄後、2%BSA、0.2%Tween20含有PBSでB7−H3−ADC(I)(DAR7)及びB7−H3−ADC(I)(DAR5)を1、2.5、10、25、100、250ng/mLに希釈し、プレートに100μLずつ添加し、37℃で1時間静置した。0.05%PS20含有PBSで4回洗浄後、2%BSA、0.2%PS20含有PBSで7500倍希釈したGoat Anti−Human kappa−HRP(Southern Biotechnology Associates, Inc.)を100μLずつ添加し、室温で1時間静置した。0.05%PS20含有PBSで4回洗浄後、TMB soluble reagent(ScyTek Laboratories)を100μL/ウェルで添加して発色反応を行い、TMB stop buffer(ScyTek Laboratories)を100μL/ウェルを添加して発色反応を停止させた後、VersaMax(Molecular Devices社製)で450nmの吸光度(reference 650nm)を測定し、以下式により相対誤差を算出し、値の小さいクローンを選択した。
相対誤差(%) ={(DAR7の測定値)/(DAR5の測定値)−1}×100
その中から、4株x2サブクローンを二次クローニングへ供した。
x)で選択した4株x2サブクローンの二次クローニングを行い、各クローンで陽性ウェルの中から3ウェルを選抜することにより合計24クローンを選択し、抗原蛋白質(2)に対する抗体価の確認をvi)と同様に実施した。さらに陽性対照として化合物(6)、化合物(1)、B7−H3−ADC(II)、B7−H3−ADC(I)及びB7−H3−ADC(III)、並びに反応性確認用化合物として化合物(8)及び化合物(7)を用いて、vii)と同様にinhibition ELISAを実施した。
xi)で選択した24クローンのうち、化合物(1)に比較して化合物(7)への反応性が特に高い6クローンを除いた18クローンについて、HER2−ADC(I)(DAR8)、HER2−ADC(I)(DAR4)、及びHER2−ADC(I)(DAR2)に対する反応性及び検量線をGyrolab xP workstation(GYROS PROTEIN Technologies)で確認した。キャプチャー試薬はBiotin−SP−conjugated AffiniPure Goat Anti−Mouse IgG, Fcγ specific(Jackson Immuno Research LABORATORIES、INC.)を用い、0.01%PS20含有PBSで172.5nMに調製した。細胞培養上清はRexxip CCS(GYROS PROTEIN Technologies)で200ng/mLに調製した。HER2−ADC(I)(DAR8)、HER2−ADC(I)(DAR4)、及びHER2−ADC(I)(DAR2)は0.01%PS20含有PBSでいずれも1000ng/mLから4倍公比で6段階に希釈し調製した。検出試薬はGoat Anti Human kappa(Southern Biotechnology Associates,Inc.)をAlexa Fluor(登録商標)647ラベリングキット(Thermo Fisher Scientific Inc.)で標識したものを用い、Rexxip Fで10nMに調製した。上記に調製した試薬、細胞培養上清及び検量線試料を96ウェルPCRプレートに入れ、Gyrolab Bioaffy 200とともに Gyrolab xP workstationにセットして、4−Step(2xC)−A−D(wizard method)で測定した。検量線はGyrolab Evaluator Software を用いて4−パラメータロジスティックモデル(重み付け;Response)で回帰した。評価した18クローンはいずれもHER2−ADC(I)のDARに依存せず、また、株間の反応性の違いも認められなかったため、同一株でIgG濃度が高い3クローン(1A3、8B2、11B1)を選択して、少量生産を行った。
xii)で選択した3クローン(1A3、8B2、11B1)について、無血清培地(ASF104(N))でローラーボトル培養し、培養上清を回収後に0.45μmのフィルターでろ過してProteinAカラムで精製した。抗原蛋白質(2)を50ng/well/50μL添加して固相化したELISA用イムノプレートに、ProteinA精製した3クローンを5μg/mLから2倍公比で10段階希釈した溶液50μLを添加して37℃で30分間反応させた。洗浄後、anti−mouse IgG−HRPを37℃で30分間反応させた。洗浄後、OPD溶液を添加し、発色停止後に490nmの吸光度を測定した。いずれのProteinA精製抗体も抗原蛋白質(2)と良好な反応性を示した。
xiii)でProteinA精製した3クローン(1A3、8B2、11B1)について、HER2−ADC(I)(DAR8)、及びHER2−ADC(I)(DAR4)、並びに、B7−H3−ADC(I)(DAR8)、及びB7−H3−ADC(I)(DAR4)に対する反応性をGyrolab xP workstationを用いて確認した。
xiv)で取得したクローン1A3に係るマウスモノクローナル抗体(以下、「マウス抗体1A3」と呼ぶ)のアイソタイプは、Mouse monoclonal isotyping test kit(AbD Serotec社製)により決定された。その結果、アイソタイプはIgG2b、κ鎖であることが確認された。
マウス抗体1A3産生ハイブリドーマより、TRIzol Reagent(LIFE TECHNOLOGIES)を用いてtotal RNAを調製した。精製したマウス抗体1A3のN末端アミノ酸配列解析(Edman分解法)を実施した。さらに抗体遺伝子クローニングにより、クローン1A3のヌクレオチド配列を解析した。抗体遺伝子クローニングの結果、重鎖可変領域・軽鎖可変領域ともにそれぞれ1種類の配列が得られ、精製したマウス抗体1A3のN末端アミノ酸配列解析の結果と抗体遺伝子クローニングにより得られたクローン1A3のヌクレオチド配列のN末端アミノ酸配列は一致することが確認された。
実施例2で取得したマウス抗体1A3を使用して、HER2−ADC(I)のマウス血漿中濃度、並びにHER3−ADC(I)、TROP2−ADC(I)、及びB7−H3−ADC(I)のサル血漿中濃度測定法を構築した。マウス抗体1A3は検出試薬としてDyLight650(登録商標)又はAlexa Fluor(登録商標)647標識して使用することが可能で、どちらを使用しても本発明に係る抗体−薬物コンジュゲートの血漿中濃度を測定することができる。さらにDAR並びに抗体部分の違いに依存せず検量線が作成でき、本発明に係る抗体−薬物コンジュゲートの血漿中濃度測定に使用可能である。
HER2−ADC(I)のマウス血漿中濃度測定法をGyrolab xP workstationで構築した。キャプチャー試薬としてBiotinylated Mouse Anti−(Anti−HER2 Ab) idiotype Ab(ここで、「(Anti−HER2 Ab)」は、配列番号21においてアミノ酸番号1乃至449に記載のアミノ酸配列からなる重鎖及び配列番号22においてアミノ酸番号1乃至214に記載のアミノ酸配列からなる軽鎖を含んでなる抗体を示す)(13C1)(IBL) を用い、0.1%PS20含有PBSで350 nMに調製した。検量線試料はRexxip HNで100倍希釈したマウス血漿でHER2−ADC(I)の濃度が0、 0.150、0.200、0.600、1.60、4.00、16.0、40.0、100、140μg/mL になるように調製した。検出試薬はマウス抗体1A3をDyLight650(登録商標)ラベリングキットでラベル化したものを用い、Rexxip Fで10nM に調製した。これら調製した試薬及び検量線試料を96ウェルPCRプレートに入れ、Gyrolab Bioaffy 200とともに Gyrolab xP workstationにセットした。測定wizardは200−3W−002−A(PMT1)を使用した。回帰解析はGyrolab Evaluator 3.3.9.175を用いて5−パラメータロジスティックモデルで行った。検量線を図24に示す。
HER3−ADC(I)のサル血漿中濃度測定法をGyrolab xP workstationで構築し、バリデーションを取得した。キャプチャー試薬としてEZ−Link Sulfo−NHS−LC−Biotin(Thermo Fisher Scientific Inc.)でビオチン標識したHER3(Recombinant Human ErbB−3/HER3 Protein、ACRObiosystems)を用い、0.1%PS20含有PBSで700 nMに調製した。検量線試料はサル血漿でHER3−ADC(I)の濃度が0、0.0750、0.l00、0.250、0.750、2.25、6.75、20.0、38.0、48.0μg/mLになるように調製したものを用い、さらにPolysorbate 20含有PBS及びRexxip AN(GYROS PROTEIN Technologies)で100倍希釈した。検出試薬はマウス抗体1A3をAlexa Fluor(登録商標)647ラベリングキットでラベル化したものを用い、Rexxip Fで10nM に調製した。これら調製した試薬及び検量線試料を96ウェルPCRプレートに入れ、Gyrolab xP workstationにセットした。測定wizardは200−3W−002−A(PMT5)を使用した。回帰解析はGyrolab Evaluator 3.3.7.171を用いて4−パラメータロジスティックモデル(重み:Response)で行った。検量線を図25に示す。
TROP2−ADC(I)のサル血漿中濃度測定法をGyrolab xP workstationで構築し、バリデーションを取得した。キャプチャー試薬としてEZ−Link Sulfo−NHS−LC−Biotinでビオチン標識したnew hTrop2(Lot番号V35、第一三共(株))を用い、0.1%PS20含有PBSで350nMに調製した。検量線試料はサル血漿でTROP2−ADC(I)の濃度が0、0.00750、0.0100、0.0250、0.0750、0.250、0.750、2.50、7.50、10.0μg/mLになるように調製したものを用い、さらにRexxip HN(GYROS PROTEIN Technologies)で10倍希釈した。検出試薬はマウス抗体1A3をAlexa Fluor(登録商標)647ラベリングキットでラベル化したものを用い、Rexxip Fで10nM に調製した。これら調製した試薬及び検量線試料を96ウェルPCRプレートに入れ、Gyrolab xP workstationにセットした。測定wizardは200−3W−002−A(PMT1)を使用した。回帰解析はGyrolab Evaluator 3.3.7.171を用いて4−パラメータロジスティックモデル(重み:Response)で行った。検量線を図26に示す。
B7−H3−ADC(I)のサル血漿中濃度測定法をGyrolab xP workstationで構築し、バリデーションを取得した。キャプチャー試薬としてEZ−Link Sulfo−NHS−LC−Biotin(Thermo Fisher Scientific Inc.)でビオチン標識したB7−H3 C1 domain(Lot番号B7_OmJ1、第一三共(株))を用い、0.1%PS20含有PBSで700nMに調製した。検量線試料はサル血漿でB7−H3−ADC(I)の濃度が0、0.0750、0.l00、0.250、0.750、2.25、6.75、20.0、38.0、48.0μg/mLになるように調製したものを用い、さらにPolysorbate 20含有PBS及びRexxip HN(GYROS PROTEIN Technologies)で50倍希釈した。検出試薬はマウス抗体1A3をAlexa Fluor(登録商標)647ラベリングキットでラベル化したものを用い、Rexxip Fで10nM に調製した。これら調製した試薬及び検量線試料を96ウェルPCRプレートに入れ、Gyrolab xP workstationにセットした。測定wizardは200−3W−001−A(PMT5)を使用した。回帰解析はGyrolab Evaluator 3.3.7.171を用いて4−パラメータロジスティックモデル(重み:Response)で行った。検量線を図27に示す。
i) ヒト由来皮下移植腫瘍を用いた染色性の確認
高度免疫不全マウス(NOGマウス)にヒト由来腫瘍を皮下移植する。本発明に係る抗体−薬物コンジュゲート投与後にその腫瘍組織を採取してパラフィン包埋標本を作製し、マウス抗体1A3の染色性を検討する。本発明に係る抗体−薬物コンジュゲート未投与のNOGマウスより採取した腫瘍組織を陰性対照とする。脱パラフィン及び抗原賦活はAutostainer Link用前処理システム(PT Link:DAKO社製)及び、抗原賦活液(Target Retrieval Solution Low pH:DAKO社製)を用いて実施する。その後の染色作業は自動染色装置(ダコ Autostainer Link48:DAKO社製)を用いて実施する。EnVision FLEX WASH BUFFER(DAKO社製)で洗浄した後、Peroxidase Block 3% H2O2(DAKO社製)を加えインキュベートし、EnVision FLEX WASH BUFFERで洗浄する。Protein Block serum free(DAKO社製)を加え、インキュベートし、Air blowで液を除去する。マウス抗体1A3をREAL Antibody Diluent(DAKO社製)で希釈し、反応させる。EnVision FLEX WASH BUFFERで洗浄後、EnVision+ System−HRP Labelled Polymer Anti−Mouse #K4000(DAKO社製)を加え、インキュベートした後、EnVision FLEX WASH BUFFERで洗浄する。
マウス抗体1A3を化合物(2)又はSN−38とあらかじめ混合した後、免疫染色に用いる。混合比は分子量に基づいて抗体1A3:化合物(2):SN−38=0.1:0.04:0.03とする。染色はi)と同様の方法で実施する。
i) マウス抗体1A3のウサギキメラ化抗体のデザイン
マウス抗体1A3のウサギキメラ化抗体(以下、「ウサギキメラ化抗体1A3」と呼ぶ)を以下の通りデザインした。ウサギキメラ化抗体の配列は、ウサギの重鎖定常領域IGHG*02とウサギの軽鎖定常領域IGKC2*01をIMGT(登録商標)から参照して、クローン1A3のそれぞれの可変領域につなげることで設計した。
プラスミドpcDNA3.3−TOPO/LacZ(Invitrogen社)を制限酵素XbaI及びPmeIで消化して得られる約5.4kbのフラグメントと、ヒト軽鎖シグナル配列及びヒトκ鎖定常領域のアミノ酸配列をコードするヌクレオチド配列(配列番号29)を有するDNA断片をIn−Fusion Advantage PCRクローニングキット(CLONTECH社)を用いて結合して、pcDNA3.3/LKを作製した。
ウサギキメラ化抗体1A3重鎖のアミノ酸配列(配列番号19)をコードするヌクレオチド配列(配列番号30)を有するDNA断片を合成した(GENEART社)。配列番号30においてヌクレオチド番号26乃至82に記載のヌクレオチド配列はシグナル配列を示し、ヌクレオチド番号83乃至448に記載のヌクレオチド配列は重鎖可変領域のアミノ酸配列をコードし、ヌクレオチド番号449乃至1417に記載のヌクレオチド配列は定常領域のアミノ酸配列をコードする。
ウサギキメラ化抗体1A3軽鎖のアミノ酸配列(配列番号20)をコードするヌクレオチド配列(配列番号31)を有するDNA断片を合成した(GENEART社)。配列番号31においてヌクレオチド番号26乃至85に記載のヌクレオチド配列はシグナル配列を示し、ヌクレオチド番号86乃至406に記載のヌクレオチド配列は軽鎖可変領域のアミノ酸配列をコードし、ヌクレオチド番号407乃至724に記載のヌクレオチド配列は定常領域のアミノ酸配列をコードする。iii)と同様の方法でウサギキメラ化抗体1A3軽鎖発現ベクターを構築した。
FreeStyle 293F細胞(Invitrogen社)はマニュアルに従い、継代、培養をおこなった。対数増殖期の2.4×109個のFreeStyle 293F細胞(Invitrogen社)をOptimum Growth 5L Flask(Thomson社)に播種し、FreeStyle293 expression medium (Invitrogen社)で希釈して1.88×106細胞/mLに調製した。40mLのOpti−Pro SFM培地(Invitrogen社)に0.48mgのウサギキメラ化抗体1A3重鎖発現ベクターと0.72mgのウサギキメラ化抗体1A3軽鎖発現ベクターと3.6mgのPolyethyleneimine(Polyscience #24765)を加えて穏やかに攪拌し、さらに5分間放置した後にFreeStyle 293F細胞に添加した。37℃、8%CO2インキュベーターで4時間、90rpmで振とう培養後に1200mLのEX−CELL VPRO培地(SAFC Biosciences社)、18mLのGlutaMAX I(GIBCO社)、及び60mLのYeastolate Ultrafiltrate(GIBCO社)を添加し、37℃、8%CO2インキュベーターで7日間、90rpmで振とう培養して得られた培養上清をDisposable Capsule Filter (Advantec #CCS−045−E1H)でろ過することにより、ウサギキメラ化抗体1A3を含む培養上清を得た。
v)で得られた培養上清をrProtein Aアフィニティークロマトグラフィーの1段階工程で精製した。培養上清をPBSで平衡化したMabSelectSuReが充填されたカラム(GE Healthcare Bioscience社製)にアプライしたのちに、カラム容量の2倍以上のPBSでカラムを洗浄した。次に2Mアルギニン塩酸塩溶液(pH4.0)で溶出し、抗体の含まれる画分を集めた。その画分を透析(Thermo Scientific社、Slide−A−Lyzer Dialysis Cassette)によりPBSへのバッファー置換を行った。Centrifugal UF Filter Device VIVASPIN20(分画分子量UF10K,Sartorius社)で抗体を濃縮し、IgG濃度を2mg/mL以上に調製した。最後にMinisart−Plus filter(Sartorius社)でろ過し、ウサギキメラ化抗体1A3の精製サンプルを得た。
i) 抗GPR20抗体−薬物コンジュゲートの製造(1)
国際公開第2018/135501号に記載の製造方法に従って、抗GPR20抗体(配列番号32においてアミノ酸番号20乃至472に記載のアミノ酸配列からなる重鎖及び配列番号33においてアミノ酸番号21乃至234に記載のアミノ酸配列からなる軽鎖を含んでなる抗体)を用いて、式
で示される薬物リンカーと、抗GPR20抗体とがチオエーテル結合によって結合した抗GPR20抗体−薬物コンジュゲート(本発明において「GPR20−ADC(I)」と称する)を製造した。
国際公開第2018/212136号に記載の製造方法に従って、抗CDH6抗体(配列番号34においてアミノ酸番号20乃至471に記載のアミノ酸配列からなる重鎖及び配列番号35においてアミノ酸番号21乃至233に記載のアミノ酸配列からなる軽鎖を含んでなる抗体)を用いて、式
で示される薬物リンカーと、抗CDH6抗体とがチオエーテル結合によって結合した抗CDH6抗体−薬物コンジュゲート(本発明において「CDH6−ADC(I)」と称する)を製造した。
i) ヒト由来皮下移植腫瘍を用いたTROP2−ADC(I)投与後の染色性の確認
免疫不全マウス(ヌードマウス)にヒト頭頸部がん細胞株FaDuを皮下移植した。TROP2−ADC(I)投与後にその腫瘍組織を採取してパラフィン包埋標本を作製し、ウサギキメラ化抗体1A3の染色性を検討した。また、抗TROP2抗体(配列番号25においてアミノ酸番号20乃至470に記載のアミノ酸配列からなる重鎖及び配列番号26においてアミノ酸番号21乃至234に記載のアミノ酸配列からなる軽鎖を含んでなる抗体、以下、「Anti−TROP2 Ab」と称する。)を投与したヌードマウスより採取した腫瘍組織を陰性対照とした。脱パラフィンおよび抗原賦活はAutostainer Link用前処理システム(PT Link:DAKO社製)を用いて、抗原賦活液(Target Retrieval Solution Low pH:DAKO社製)を用いて、97℃で40分間実施した。その後の染色作業は自動染色装置(ダコ Autostainer Link48:DAKO社製)を用いて室温で実施した。EnVision FLEX WASH BUFFER(DAKO社製)で1回洗浄した後、REAL Peroxidase−Blocking Solution(DAKO社製)を加え5分間インキュベートし、EnVision FLEX WASH BUFFERで1回洗浄した。Protein Block serum free(DAKO社製)を加え、30分間インキュベートし、Air blowで液を除去した。ウサギキメラ化抗体1A3をREAL Antibody Diluent(DAKO社製)で0.1μg/mLに希釈し、30分間反応させた。EnVision FLEX WASH BUFFERで3回洗浄後、EnVision+ System−HRP Labelled Polymer Anti−Rabbit (DAKO社製)を加え、30分インキュベートした後、EnVision FLEX WASH BUFFERで2回洗浄した。
免疫不全マウス(ヌードマウス)にGPR20過剰発現ヒト消化管間質腫瘍細胞株GIST−T1/GPR20を皮下移植した。GPR20−ADC(I)投与後にその腫瘍組織を採取してパラフィン包埋標本を作製し、ウサギキメラ化抗体1A3の染色性を検討した。また、GPR20−ADC(I)非投与マウスより採取した腫瘍組織を陰性対照とした。i)と同様の方法で染色を行った。
i) ヒト由来皮下移植腫瘍を用いたCDH6−ADC(I)投与後の染色性の確認
高度免疫不全マウス(NOGマウス)に淡明細胞型腎細胞癌患者より採取された腫瘍組織を皮下移植した。CDH6−ADC(I)投与後にその腫瘍組織を採取してパラフィン包埋標本を作製し、マウス抗体1A3の染色性を検討した。また、CDH6−ADC(I)未投与のNOGマウスより採取した腫瘍組織を陰性対照とした。脱パラフィンおよび抗原賦活はAutostainer Link用前処理システム(PT Link:DAKO社製)を用いて、抗原賦活液(Target Retrieval Solution Low pH:DAKO社製)、97℃で40分間実施した。その後の染色作業は自動染色装置(ダコ Autostainer Link48:DAKO社製)を用いて室温で実施した。EnVision FLEX WASH BUFFER(DAKO社製)で1回洗浄した後、Peroxidase Block 3% H2O2(DAKO社製)を加え5分間インキュベートし、EnVision FLEX WASH BUFFERで1回洗浄した。Protein Block serum free(DAKO社製)を加え、30分間インキュベートし、Air blowで液を除去した。マウス抗体1A3をREAL Antibody Diluent(DAKO社製)で0.03μg/mL〜0.3μg/mLに希釈し、60分間反応させた。EnVision FLEX WASH BUFFERで3回洗浄後、EnVision+ System−HRP Labelled Polymer Anti−Mouse #K4000(DAKO社製)を加え、30分インキュベートした後、EnVision FLEX WASH BUFFERで2回洗浄した。
マウス抗体1A3を化合物(2)又はSN−38とあらかじめ混合した後、免疫染色に用いた。
SN−38は、式
GPR20−ADC(I)のマウス血漿中濃度測定法をGyrolab xP workstation(GYROS PROTEIN Technologies)で構築した。キャプチャー試薬としてマウス抗体1A3をラベリングキット(ChromaLink Biotin Protein Labeling Kit、Solulink)でビオチンラベル化したものを用い、0.1%PS20含有PBSで700nMに調製した。検量線試料はマウス血漿でGPR20−ADC(I)の濃度が、0、5、10、20、50、l00、200、500、1000、2000、5000、10000ng/mLになるように調製したものをRexxip AN(GYROS PROTEIN Technologies)で10倍希釈した。検出試薬はMouse Anti−(Anti−GPR20 Ab)(ここで、「(Anti−GPR20 Ab)」は、配列番号32においてアミノ酸番号20乃至472に記載のアミノ酸配列からなる重鎖及び配列番号33においてアミノ酸番号21乃至234に記載のアミノ酸配列からなる軽鎖を含んでなる抗体を示す)idiotype Ab(71C1)(IBL)をDyLight650(登録商標)ラベリングキットでラベル化したものを用い、Rexxip F(GYROS PROTEIN Technologies)で10nM に調製した。これら調製した試薬及び検量線試料を96ウェルPCRプレートに入れ、Gyrolab xP workstationにセットした。Bioaffy200を使用し、wizardは200−3W−002−A(PMT1)で測定した。回帰解析はGyrolab Evaluator 3.3.9.175を用いて4−パラメータロジスティックモデル(重み:Response)で行った。検量線を図39に示す。
ECLを使用したHER2−ADC(I)のヒト血清中濃度測定法を構築した。マウス抗体1A3をHigh Bind plate(Meso Scale Diagnostics、LLC:MSD)にコーティング後にプレートを洗浄した。ブロッキング緩衝液(BSA入りのPS20含有PBS)でブロッキング後に0、200、400、800、1600、3200、6400、12800、20000および25600ng/mLに調製したHER2−ADC(I)をアッセイ希釈液で1000倍に希釈して検量線試料とした。さらに、EZ−Link Sulfo−NHS−LC−LC Biotin(Thermo Fisher Scientific Inc.)でビオチン標識したBiotinylated Mouse Anti−(Anti−HER2)idiotype Ab(13C1)(IBL)とスルホタグストレプトアビジン(MSD)をプレインキュベートして検出溶液を調製した。検量線試料添加後にインキュベートおよび洗浄したプレートに検出溶液を加え、複合体を形成させた。4×Read Buffer T(MSD)を精製水で2倍希釈し、洗浄後のプレートに添加してMSD SECTOR Imager 6000(コントロールソフト:MSD Discovery Workbench Version 3.0.18)で測定した。回帰解析は4−パラメータロジスティックモデル(重み:1/Response2)で行った。検量線を図40に示す。
マウス抗体1A3が認識する化学構造をGyrolab xP workstation(GYROS PROTEIN Technologies)を用いてHER2−ADC(I)の競合阻害により検証した。競合阻害用化合物としては、化合物(1)、化合物(2)、化合物(7)、化合物(8)、化合物(9)、化合物(10)、化合物(11)、Topotecan、及びRubitecanを選定した。
化合物(2)は、式
化合物(7)は、式
化合物(8)は、式
化合物(9)は、式
化合物(10)は、式
化合物(11)は、式
Topotecanは、式
Rubitecanは、式
配列番号2:CDRH2
配列番号3:CDRH3
配列番号4:CDRL1
配列番号5:CDRL2
配列番号6:CDRL3
配列番号7:CDRH1
配列番号8:CDRH2
配列番号9:CDRH1
配列番号10:CDRH2
配列番号11:CDRH1
配列番号12:CDRH2
配列番号13:CDRH3
配列番号14:CDRL1
配列番号15:マウス抗体1A3重鎖のアミノ酸配列
配列番号16:マウス抗体1A3軽鎖のアミノ酸配列
配列番号17:マウス抗体1A3重鎖可変領域のアミノ酸配列をコードするヌクレオチド配列
配列番号18:マウス抗体1A3軽鎖可変領域のアミノ酸配列をコードするヌクレオチド配列
配列番号19:ウサギキメラ化抗体1A3重鎖のアミノ酸配列
配列番号20:ウサギキメラ化抗体1A3軽鎖のアミノ酸配列
配列番号21:抗HER2抗体重鎖のアミノ酸配列
配列番号22:抗HER2抗体軽鎖のアミノ酸配列
配列番号23:抗HER3抗体重鎖のアミノ酸配列
配列番号24:抗HER3抗体軽鎖のアミノ酸配列
配列番号25:抗TROP2抗体重鎖のアミノ酸配列
配列番号26:抗TROP2抗体軽鎖のアミノ酸配列
配列番号27:抗B7−H3抗体重鎖のアミノ酸配列
配列番号28:抗B7−H3抗体軽鎖のアミノ酸配列
配列番号29:ヒト軽鎖シグナル配列及びヒトκ鎖定常領域のアミノ酸配列をコードするヌクレオチド配列
配列番号30:ウサギキメラ化抗体1A3重鎖のアミノ酸配列をコードするヌクレオチド配列
配列番号31:ウサギキメラ化抗体1A3軽鎖のアミノ酸配列をコードするヌクレオチド配列
配列番号32:抗GPR20抗体重鎖のアミノ酸配列
配列番号33:抗GPR20抗体軽鎖のアミノ酸配列
配列番号34:抗CDH6抗体重鎖のアミノ酸配列
配列番号35:抗CDH6抗体軽鎖のアミノ酸配列
Claims (51)
- 抗体−薬物コンジュゲートにおける1抗体あたりの薬物リンカーの平均結合数が2から8の範囲である、請求項1〜7のいずれか1項に記載の蛋白質。
- 抗体−薬物コンジュゲートにおける抗体が、抗HER2抗体、抗HER3抗体、抗TROP2抗体、抗B7−H3抗体、抗GPR20抗体、又は抗CDH6抗体である、請求項1〜8のいずれか1項に記載の蛋白質。
- 抗体−薬物コンジュゲートにおける1抗体あたりの薬物リンカーの平均結合数の違いによって該抗体−薬物コンジュゲートに対する認識性が実質的に異ならない、請求項1〜9のいずれか1項に記載の蛋白質。
- 抗体であることを特徴とする、請求項1〜14のいずれか1項に記載の蛋白質。
- a)配列番号1に示されるアミノ酸配列からなるCDRH1、配列番号2に示されるアミノ酸配列からなるCDRH2、及び配列番号3に示されるアミノ酸配列からなるCDRH3を含む重鎖、並びに、配列番号4に示されるアミノ酸配列からなるCDRL1、配列番号5に示されるアミノ酸配列からなるCDRL2、及び配列番号6に示されるアミノ酸配列からなるCDRL3を含む軽鎖を含んでなる抗体、
b)配列番号7に示されるアミノ酸配列からなるCDRH1、配列番号8に示されるアミノ酸配列からなるCDRH2、及び配列番号3に示されるアミノ酸配列からなるCDRH3を含む重鎖、並びに、配列番号4に示されるアミノ酸配列からなるCDRL1、配列番号5に示されるアミノ酸配列からなるCDRL2、及び配列番号6に示されるアミノ酸配列からなるCDRL3を含む軽鎖を含んでなる抗体、
c)配列番号9に示されるアミノ酸配列からなるCDRH1、配列番号10に示されるアミノ酸配列からなるCDRH2、及び配列番号3に示されるアミノ酸配列からなるCDRH3を含む重鎖、並びに、配列番号4に示されるアミノ酸配列からなるCDRL1、配列番号5に示されるアミノ酸配列からなるCDRL2、及び配列番号6に示されるアミノ酸配列からなるCDRL3を含む軽鎖を含んでなる抗体、又は、
d)配列番号11に示されるアミノ酸配列からなるCDRH1、配列番号12に示されるアミノ酸配列からなるCDRH2、及び配列番号13に示されるアミノ酸配列からなるCDRH3を含む重鎖、並びに、配列番号14に示されるアミノ酸配列からなるCDRL1、WASで示されるトリペプチドからなるCDRL2、及び配列番号6に示されるアミノ酸配列からなるCDRL3を含む軽鎖を含んでなる抗体であることを特徴とする、請求項15に記載の蛋白質。 - 配列番号15においてアミノ酸番号20乃至141に記載のアミノ酸配列からなる重鎖可変領域を含む重鎖、及び配列番号16においてアミノ酸番号21乃至127に記載のアミノ酸配列からなる軽鎖可変領域を含む軽鎖を含んでなる抗体であることを特徴とする、請求項16に記載の蛋白質。
- マウス抗体であることを特徴とする、請求項17に記載の蛋白質。
- 配列番号15においてアミノ酸番号20乃至477に記載のアミノ酸配列からなる重鎖及び配列番号16においてアミノ酸番号21乃至234に記載のアミノ酸配列からなる軽鎖を含んでなる抗体であることを特徴とする、請求項17に記載の蛋白質。
- キメラ抗体であることを特徴とする、請求項17に記載の蛋白質。
- ウサギキメラ化抗体であることを特徴とする、請求項17に記載の蛋白質。
- 配列番号19においてアミノ酸番号20乃至464に記載のアミノ酸配列からなる重鎖及び配列番号20においてアミノ酸番号21乃至233に記載のアミノ酸配列からなる軽鎖を含んでなる抗体であることを特徴とする、請求項17に記載の蛋白質。
- 請求項19又は22に記載の抗体の重鎖カルボキシル末端のリシン残基が欠失している抗体であることを特徴とする、請求項15に記載の蛋白質。
- 請求項19又は22に記載の抗体のアミノ酸配列と少なくとも95%の同一性を持つアミノ酸配列からなる抗体であることを特徴とする、請求項15に記載の蛋白質。
- 請求項19又は22に記載の抗体のアミノ酸配列と少なくとも99%の同一性を持つアミノ酸配列からなる抗体であることを特徴とする、請求項15に記載の蛋白質。
- 薬物への認識性について、請求項19又は22に記載の抗体と競合する抗体であることを特徴とする、請求項15に記載の蛋白質。
- 請求項15〜26のいずれか1項に記載の抗体の抗原結合断片であることを特徴とする、請求項1〜14のいずれか1項に記載の蛋白質。
- 抗体の抗原結合断片が、Fab、F(ab’)2、Fab’又はFvである、請求項27に記載の蛋白質。
- 請求項1〜28のいずれか1項に記載の蛋白質を用いて、抗体−薬物コンジュゲートを投与された哺乳動物における、該抗体−薬物コンジュゲートの血漿中濃度を定量する方法。
- (1)抗体−薬物コンジュゲートの標的抗原が固相化されたプレートに血漿中の抗体−薬物コンジュゲートを接触させ複合体を形成させるステップ、(2)マーカーで標識化された、請求項1〜28のいずれか1項に記載の蛋白質を該複合体と接触させ、さらなる複合体を形成させるステップ、次いで(3)該マーカーを検出するステップ、を含むことを特徴とする、請求項29に記載の方法。
- (1)請求項1〜28のいずれか1項に記載の蛋白質が固相化されたプレートに血漿中の抗体−薬物コンジュゲートを接触させ複合体を形成させるステップ、(2)該抗体−薬物コンジュゲートの抗体部位を認識することができ、マーカーで標識化された第二の蛋白質を該複合体と接触させ、さらなる複合体を形成させるステップ、次いで(3)該マーカーを検出するステップ、を含むことを特徴とする、請求項29に記載の方法。
- 請求項1〜28のいずれか1項に記載の蛋白質を用いて、抗体−薬物コンジュゲートを投与された哺乳動物における、該抗体−薬物コンジュゲートから遊離した薬物の血漿中濃度を定量する方法。
- (1)請求項1〜28のいずれか1項に記載の蛋白質が固相化されたプレートに、マーカーで標識化された競合薬物の存在下で、血漿中の抗体−薬物コンジュゲートから遊離した薬物を接触させ複合体を形成させるステップ、(2)該マーカーを検出するステップ、を含むことを特徴とする、請求項32に記載の方法。
- 請求項1〜28のいずれか1項に記載の蛋白質を用いて、抗体−薬物コンジュゲートを投与された哺乳動物における、該抗体−薬物コンジュゲート及び/又は該抗体−薬物コンジュゲートから遊離した薬物の組織分布を確認する方法。
- (1)組織中の抗体−薬物コンジュゲート及び/又は該抗体−薬物コンジュゲートから遊離した薬物を請求項1〜28のいずれか1項に記載の蛋白質と接触させ複合体を形成させるステップ、(2)請求項1〜28のいずれか1項に記載の蛋白質を認識することができ、マーカーで標識化された第二の蛋白質を該複合体と接触させ、さらなる複合体を形成させるステップ、次いで(3)該マーカーを検出するステップ、を含むことを特徴とする、請求項34に記載の方法。
- (1)組織中の抗体−薬物コンジュゲート及び/又は該抗体−薬物コンジュゲートから遊離した薬物を、マーカーで標識化された請求項1〜28のいずれか1項に記載の蛋白質と接触させ複合体を形成させるステップ、次いで(2)該マーカーを検出するステップ、を含むことを特徴とする、請求項34に記載の方法。
- マーカーが蛍光物質であり、該マーカーの検出が該マーカーの発する蛍光を感知することにより行われる、請求項30、31、33、35又は36に記載の方法。
- マーカーが酵素であり、該マーカーの検出が該酵素と基質との反応により生じる発光又は発色を感知することにより行われる、請求項30、31、33、35又は36に記載の方法。
- マーカーが発光物質であり、該マーカーの検出が電気化学反応に基づく該マーカーの発光を感知することにより行われる、請求項30、31、33、35又は36に記載の方法。
- 請求項1〜28のいずれか1項に記載の蛋白質をコードするポリヌクレオチド。
- 請求項40に記載のポリヌクレオチドを含むベクター。
- 請求項40に記載のポリヌクレオチドを含む形質転換宿主細胞。
- 請求項41に記載のベクターを含む形質転換宿主細胞。
- 請求項42又は43に記載の宿主細胞を培養する工程、次いで、前記培養工程で得られた培養産物から蛋白質を精製する工程、を含む、請求項1〜28のいずれか1項に記載の蛋白質の製造方法。
- 請求項1〜28のいずれか1項に記載の蛋白質を含む組成物。
- 請求項1〜28のいずれか1項に記載の蛋白質、又は請求項45に記載の組成物を含むキット。
- 抗体−薬物コンジュゲートを投与された哺乳動物における、抗体−薬物コンジュゲート及び/又は該抗体−薬物コンジュゲートから遊離した薬物の血漿中濃度を定量するための、請求項46に記載のキット。
- 抗体−薬物コンジュゲートを投与された哺乳動物における、抗体−薬物コンジュゲート及び/又は該抗体−薬物コンジュゲートから遊離した薬物の組織分布を確認するための、請求項46に記載のキット。
- 配列番号15においてアミノ酸番号20乃至141に記載のアミノ酸配列からなる重鎖可変領域を含む重鎖、及び配列番号16においてアミノ酸番号21乃至127に記載のアミノ酸配列からなる軽鎖可変領域を含む軽鎖を含んでなる抗体。
- 配列番号15においてアミノ酸番号20乃至477に記載のアミノ酸配列からなる重鎖及び配列番号16においてアミノ酸番号21乃至234に記載のアミノ酸配列からなる軽鎖を含んでなる、請求項49に記載の抗体。
- 配列番号19においてアミノ酸番号20乃至464に記載のアミノ酸配列からなる重鎖及び配列番号20においてアミノ酸番号21乃至233に記載のアミノ酸配列からなる軽鎖を含んでなる、請求項49に記載の抗体。
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