JP7570432B2 - TGFβR2細胞外ドメイン短縮分子、TGFβR2細胞外ドメイン短縮分子と抗EGFR抗体との融合タンパク質、及び融合タンパク質の抗腫瘍使用 - Google Patents
TGFβR2細胞外ドメイン短縮分子、TGFβR2細胞外ドメイン短縮分子と抗EGFR抗体との融合タンパク質、及び融合タンパク質の抗腫瘍使用 Download PDFInfo
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Description
本出願は、2021年4月28日に出願された中国特許出願202010351280.6の利益を主張するものであり、その内容は参照により本明細書に組み込まれる。
a)少なくともその6~16位におけるアミノ酸残基が欠失し、更に任意選択で、その17~17+n位、(式中、nは1~10の整数であり;好ましくは、nは2、4、8、9、若しくは10であり;最も好ましくは、nは9である)におけるアミノ酸残基が欠失している;又は
b)6~26位におけるそのアミノ酸残基の欠失に基づいて、更に、5、4~5、3~5、2~5、1、1~2、1~3、若しくは1~4位におけるそのアミノ酸残基が欠失している;又は
c)7~26位におけるアミノ酸残基が欠失している、
短縮TGFβR2細胞外ドメイン分子を提供する。
a)短縮TGFβR2細胞外ドメイン分子、及び
b)標的化部分
を含む。
(a)それぞれ配列番号19、20、及び21を含む重鎖CDR1、重鎖CDR2、及び重鎖CDR3ドメインを含む重鎖可変領域、並びに/又は
(b)それぞれ配列番号16、17、及び18を含む軽鎖CDR1、軽鎖CDR2、及び軽鎖CDR3ドメインを含む軽鎖可変領域
を含む、EGFRへの単離された結合抗体又はその抗原結合フラグメントを提供する。
a)配列番号28を含む配列又はそれと少なくとも85%、88%、90%、95%、98%、若しくは99%の配列同一性を有する配列を含む重鎖可変領域;及び/或いは
b)配列番号29を含む配列又はそれと少なくとも85%、88%、90%、95%、98%、若しくは99%の配列同一性を有する配列を含む軽鎖可変領域
を含む。
a)配列番号30を含む配列又はそれと少なくとも85%、88%、90%、95%、98%、若しくは99%の配列同一性を有する配列を含む重鎖定常領域;及び/或いは
b)配列番号31を含む配列又はそれと少なくとも85%、88%、90%、95%、98%、若しくは99%の配列同一性を有する配列を含む軽鎖定常領域
を更に含む。
a)配列番号141を含む重鎖のアミノ酸配列又はそれと少なくとも85%、88%、90%、95%、98%、若しくは99%の配列同一性を有する配列;及び
b)配列番号23を含む軽鎖のアミノ酸配列又はそれと少なくとも85%、88%、90%、95%、98%、若しくは99%の配列同一性を有する配列
を含み、
それは2本の重鎖及び2本の軽鎖を含み;ジスルフィド結合は、その第1の軽鎖と第1の重鎖との間で形成され、ジスルフィド結合は、その第2の軽鎖と第2の重鎖との間で形成され、ジスルフィド結合は、その第1の重鎖と第2の重鎖との間で形成される。
ヒトTGF-β1タンパク質への結合アフィニティーに関して、23pM~288.3pM、好ましくは64pM~144pM、最も好ましくは96.1pMのKD値を有する。
配列番号32~39のいずれか1つ;
配列番号67~84のいずれか1つ;若しくは
配列番号148~163のいずれか1つ、又はその機能的バリアント
を含む。
a)本明細書に記載される短縮TGFβR2細胞外ドメイン分子、本明細書に記載される融合タンパク質、本明細書に記載される抗体若しくはその抗原結合フラグメント、本明細書に記載されるコンジュゲート、本明細書に記載される核酸、又は本明細書に記載される発現ベクター;及び
b)薬学的に許容される担体;任意選択で、
c)1種又は複数の他の治療剤
を含む医薬組成物を提供する。
別様に記述されない限り、本明細書において使用されるすべての技術的及び科学的用語は、本発明が属する技術分野における当業者によって共通して理解される意味を有する。本発明の目的上、以下の用語が更に定義される。
全長TGFβR2細胞外ドメインのN末端部位7~15の間には、複数の感受性部位が存在する。融合タンパク質の構造的安定性を向上させるために、本発明者らは、種々の(deferent)数のアミノ酸の欠失によって、TGFβR2の細胞外ドメインのN末端アミノ酸配列を改変した。15種の短縮TGFβR2細胞外ドメイン分子を獲得した。
本発明は、本発明の短縮TGFβR2細胞外ドメイン分子、短縮分子と標的化部分とを含む融合タンパク質を含む分子、又はそれらの一部分をコードする核酸にも関する。これらの核酸分子の一部の例となる配列は、配列(sequential)表に示される。
本発明は、本発明の1種又は複数のヌクレオチド配列を含む組み換え構築物も提供する。本発明の組み換え構築物は、ベクター、例えばプラスミド、ファージミド、ファージ、又はウイルスベクターとともに使用され得、本発明の抗体をコードする核酸分子はベクターに挿入される。
本発明の短縮TGFβR2細胞外ドメイン分子、抗体、及び融合タンパク質を使用して、胃癌等の癌を治療し得る。
本発明の短縮分子、融合タンパク質、抗体及び抗原結合フラグメント、短縮分子-医薬コンジュゲート、融合タンパク質-医薬コンジュゲート、コンジュゲート、核酸、並びに担体のうちの1種又は複数の種類を、少なくとも1種の他の化学的作用物質を用いて調製して、上で記載される前述の活性成分、及び1種又は複数の医薬に許容される担体、希釈剤、又は賦形剤を含む;任意選択で、1種又は複数の他の治療剤も含み得る、医薬組成物を形成し得る。
本発明は、1つ又は複数の容器を含む薬学的パッケージング及びキットであって、容器は、上で言及される本発明の医薬組成物を含有する、薬学的パッケージング及びキットにも関する。そのような容器と関連付けられるものは、医薬又は生物学的製品の製造、使用、又は流通を取り締まる政府機関によって指示された形態で助言され(tip)得、それは、該製品が製造される、使用される、又は流通する、機関によるヒト投与の承認を反映する。
本発明の医薬組成物は、当技術分野において公知の様式で、例えば混合、溶解、顆粒化、粉砕、乳化、カプセル化、カプセル化、又は凍結乾燥の従来の方法によって調製され得る。
上で記載される本発明の抗体を含む組み合わせ物は、1種又は複数の他の治療剤とも組み合わされ、結果として生じた組み合わせ物は、許容されない悪影響を引き起こさない。
ファージ抗体ディスプレイライブラリーを使用した、EGFRへのEGFの結合を遮断するマウス抗体についてのスクリーニング
1.1 マウス免疫付与及びファージ抗体ライブラリースクリーニング
マウスに、核酸プラスミドpCMV3-mFlt3L(Sinocelltech Limited社によって構築されたG12FE5S01-D、配列番号142)及びpCMV3-mCSF2(Sinocelltech Limited社によって構築されたG12FE5S02-D、配列番号143)を用いて免疫付与した。具体的な方法は以下のとおりである:最初の免疫付与の2日前に、マウスに、筋肉内へのカルディオトキシン10Mを用いて免疫付与した。1:1の質量比を有する20g/脚のpCMV3-mFlt3L及びpCMV3-mCSF2混合物を筋肉内に注射し、各免疫付与に対して3日後に30g/脚のpGS6-EGFR-TT-WPRE(Sinocelltech Limited社によって構築された、配列番号144)を筋肉内に注射した(第4及び第5の免疫付与に関しては、順番に2週間、2週間、2週間、及び2週間の免疫付与間隔で、EGFRを過剰発現する5×106個の昆虫細胞の腹腔内注射)。第3の免疫付与以降、各免疫付与の7日後に、目の内眼角神経叢(medial canthal plexus)を介して血液を収集した。組み換えヒトEGFRタンパク質(供給元:Sino Biological, Inc.社、Cat. 10001-H08B、以後同じ)をコートして、マウスにおける抗EGFRの血清力価を検出した。第5の免疫付与(immzation)血清は、免疫血清力価が8000倍且つ血清力価OD>1に到達する基準を達成し、次いで、5×106個のMDA-MB468細胞を使用した腹腔内ブースター注射を20日間の間隔で実施し、7日後にマウスを屠殺し、脾臓組織を液体窒素中で凍結した。
TCTAGTGGTGGCGGTGGTTCGGGCGGTGGTGGAGGTGGTAGTTCTAGATCTTCC(配列番号2)
によって連結し[25]、次いで、制限エンドヌクレアーゼSfi I(供給元:Fermentas社)によってファージベクターpComb3x(供給元:Sino Biological, Inc.社)にライゲートし、X-Blueコンピテント細胞を電気的に形質転換する(electrotransforming)ことによって、免疫付与マウスに対するファージディスプレイscFv抗体ライブラリーを構築した。組み換えヒトEGFRタンパク質をELISAプレートにコートし、抗EGFR陽性抗体富化ファージライブラリーを、ファージ抗体パンニングプロセスによって獲得した。その後、上記ライブラリーをMDA-MB-468細胞(供給元:Cell Resource Center、中国科学院上海生命科学研究院)と混合し、MDA-MB-468細胞に対する陽性抗体について富化されたファージライブラリーを、ファージ抗体パンニングプロセスに従って上記ライブラリーからスクリーニングした(O'Brien, P. M., & Aitken, R.(編)、Springer Science & Business Media. 2002; ISBN: 9780896037113)。ファージのコロニーを富化ライブラリーから選択し、発現させ、組み換えヒトEGFRタンパク質への結合をELISAによって検出し、組み換えヒトEGFRへの特異的結合を有する高結合性抗体EGFR-mhPA8 scFv抗体クローンをスクリーニングし、シーケンシングのためにシーケンシング企業に送って、EGFR-mhPA8 scFv抗体のヌクレオチド配列(配列番号3)を獲得した。
1.2.1 マウス抗体結合及びリガンド競合機能
ELISAを使用して、組み換えヒトEGFRタンパク質へのマウス抗体の結合能を検出した。種々の濃度(1.37ng/mL、4.12ng/mL、12.35ng/mL、37.04ng/mL、111.11ng/mL、333.33ng/mL、1000ng/mL、及び3000ng/mL)で組み換えヒトEGFR-Hisタンパク質(供給元:Sino Biological, Inc.社、以後同じ)を96ウェルプレートにコートし、ウェルあたり100Lを4℃で一晩コートした。プレートを翌日洗浄し、室温で1時間ブロッキングした。EGFR-mhPA8及び陰性対照抗体H7N9-R1(供給元:Sinocelltech Limited社、以下同じ)を13.89nMで添加し、1時間インキュベートし、その後にプレートを洗浄して、結合していない抗体を除去した。二次抗体ヤギ抗hIgG F(ab)2/HRP(供給元:Jackson ImmunoResearch社、Cat. 109-036-006、以下と同じ)を添加し、1時間インキュベートし、プレートを繰り返し洗浄し、発色現像のために基質発色溶液を添加し、停止後にOD450をマイクロプレートリーダーによって読み取る。水平座標として組み換えヒトEGFR-Hisタンパク質濃度、及び垂直座標としてOD450読み取りを使用して、S曲線をフィットさせ、組み換えヒトEGFR-Hisタンパク質への抗体結合のEC50を、GraphPad Prism 6.0ソフトウェアを使用して分析した。結果は図1に示される。ヒト-マウスキメラ抗体EGFR-mhPA8は、128.7ng/mLのEC50及びR2=1.000を有して、組み換えヒトEGFR-Hisに有効に結合し得る。陰性対照H7N9-R1は、組み換えヒトEGFR-Hisタンパク質に結合しなかった。
乳癌MDA-MB-468細胞は、EGFRを高発現し、EGFRの多様なリガンド因子も自己分泌する。本実施例では、MDA-MB-468細胞に対するマウス抗体の成長阻害機能をWST-8アッセイによって判定した。
マウス抗体EGFR-mhPA8のヒト化、及びヒト化抗体のエクスビボ特徴付け
2.1 マウス抗体mhPA8のヒト化及び産生
EGFR-mhPA8抗体のヌクレオチド配列を推測して、EGFR-mhPA8 scFv抗体の重鎖(配列番号8)及び軽鎖可変領域アミノ酸配列(配列番号9)を獲得した。それぞれEGFR-mhPA8 scFv軽鎖及び重鎖に対する3つのCDRのアミノ酸配列を、Kabat[26]及びIMGT番号付け手法を参照して判定した、配列番号10~15を参照されたい。Kabat番号付けに従って、LCDR2における52位でのNのDへの変異を除いて、上で言及される軽鎖及び重鎖のそれぞれ3つのCDRを、後続のヒト化工程において移植し、最終ヒト化抗体EGFR-HPA8 scFvにおいて保持した。
2.2.1 ヒト化抗体特異的結合及びリガンド競合アッセイ
実施例1.2.1を参照して、組み換えヒトEGFRタンパク質へのヒト抗体の結合能を、ELISAを適用することによって検出し、同時にSCT200(中国特許出願200610012002.8において実証された、以下同じ)、アービタックス(Erbitux)(MERCK、201621、以下同じ)、及び陰性対照を設定した。図4に示されるように、組み換えヒトEGFR-Hisに特異的に結合するヒト化EGFR-HPA8抗体に対するEC50は116.6ng/mL、R2=1.000;SCT200に対するEC50は166.5ng/mL、R2=1.000;アービタックスに対するEC50は253.6ng/mL、R2=1.000であり;陰性対照H7N9-R1は結合しなかった。結果は、EGFR-HPA8が、SCT200及びアービタックスよりも、組み換えヒトEGFR-hisに結合するより優れた能力を有することを示した。
2.2.2.1 MDA-MB-468細胞の増殖を阻害するヒト化抗体の能力
MDA-MB-468細胞を、96ウェルプレートに5×103個/ウェルで均一に接種した。細胞をCO2インキュベーターにおいて3時間インキュベートし、種々の濃度のヒト化抗体EGFR-HPA8(666.7nM、222.2nM、74.1nM、24.7nM、8.23nM、2.74nM、0.91nM、0.31nM、及び0.1nM)を添加し、SCT200及びアービタックスを対照として使用した。次いで、リガンド、8ng/mLの最終濃度のHB-EGF(供給元:Sino Biological, Inc社.、以下同じ)、200ng/mLの最終濃度のBTC-Fc(供給元:Sino Biological, Inc.社、以下同じ)、又は1μg/mLの最終濃度のFc-EREG(供給元:Sino Biological, Inc.社、以下同じ)をそれぞれ添加した。細胞を37℃及び5% CO2でCO2インキュベーターにおいて5日間インキュベートし、次いでWST-8を15μL/ウェルで添加した。240分間のインキュベーションの後、OD450~OD630をマイクロプレートリーダーによって測定し、抗体による細胞の成長阻害率を算出した。抗体なしのリガンドの添加をM群として使用した。阻害率=(M群のOD-サンプルのOD)/(M群のOD)×100%、定量的な効力曲線を、GraphPad Prismソフトウェアを使用して分析し且つプロットし、水平座標は抗体濃度であり、垂直座標は阻害率である。結果は図6A及びTable 3(表5)に示される。EGFR-HPA8は、リガンドなしの条件下で、SCT200及びセツキシマブ対照抗体よりもMDA-MB-468細胞の優れた成長阻害を示した。EGFR-HPA8は、SCT200と同様の最大阻害率を有したが、より低い成長阻害EC50を有した。実施例2.2.1の結果は、MDA-MB-468細胞上のEGFRへのEGF-Fcタンパク質の結合を遮断するEGFR-HPA8の能力が、SCT200及びアービタックスよりも強かったことを示す。本実施例では、MDA-MB-468細胞成長阻害アッセイにおいてEGFRの種々のリガンドを添加して、細胞の機能的レベルでEGFRリガンド-受容体結合を遮断するEGFR-HPA8の能力を更に検証した。結果は図6B~図6D及びTable 3(表5)に示される。EGFR-HPA8は、種々のリガンド条件下で、SCT200及びセツキシマブよりも優れてMDA-MB-468細胞の増殖を阻害した。
Faduは、EGFRを高発現し、EGFRの多様なリガンド因子も自己分泌する、ヒト咽頭扁平上皮癌腫細胞系統である。実施例2.2.2.1を参照して、種々のリガンド条件下での、EGFR-HPA8抗体によるFadu細胞(供給元:Cell Resource Center、中国科学院上海生命科学研究院)の増殖の阻害を、WST-8アッセイによって測定した。結果は図7及びTable 4(表6)に示される。Fadu細胞に対するEGFR-HPA8の成長阻害能は、リガンドなしの条件下で、SCT200のものと同様であり、セツキシマブのものよりも優れており、一方でFadu細胞に対するEGFR-HPA8の成長阻害能は、種々のリガンド条件下で、SCT200及びセツキシマブのものよりも有意に優れていた。結果は、EGFR-HPA8抗体が、SCT200及びセツキシマブと比較して、EGFRリガンド-受容体結合を遮断するより優れた能力を有することを示した。
本実施例は、組み換えCD16aレポーター遺伝子システムを使用して、ヒト化抗体EGFR-HPA8媒介性ADCC効果を検出する。組み換えCD16aレポーター遺伝子システムは、エフェクター細胞Jurkat-NFAT-Luc2p-CD16A、及びEGFRを発現する標的細胞を含む。2種の細胞を共培養し、EGFR抗体を同時に添加した場合、EGFR抗体のFabフラグメント(fragement)は、標的細胞の表面に発現したEGFRに結合し、そのFcフラグメントは、Fcγ受容体CD16aを過剰発現するエフェクター細胞に結合し得、それによってエフェクター細胞Jurkat-NFAT-Luc2p-CD16Aを活性化し、NFAT-RE媒介性生物発光を促進する。
対数成長期のSNU-5細胞(ATCC細胞バンク)をPBSで洗浄し、0.25%トリプシンで消化し、消化物を収集し、その後に800r/分で5分間の遠心分離が続いた。細胞をPBSに再懸濁し、細胞濃度を5.0×107個の細胞/mLに調整した(50%のマトリックスゲルによる)。Balb/cヌードマウス(Beijing Viton Lever Laboratory Animal Technology Co.社)に、5.0×106個のSNU-5細胞懸濁液100μL/マウスを右背に皮下接種した。腫瘍体積が約170mm3に到達した後、各群において5匹のマウスで、マウスを腫瘍体積に従って7つの群に無作為に分けた。医薬を、グループ分けの日に腹腔内注射(I.P.)によって投与し、1週間に2回で連続7投薬与えた。具体的な投薬レジメンは、下のTable 5(表7)に示される。
TGFβR2の種々の短縮形態を含有するEGFR抗体/TGFβR2融合タンパク質の設計及び検査
3.1 TGFβR2の種々の短縮形態のEGFR抗体/TGFβR2融合タンパク質発現ベクターの設計、タンパク質発現、及び精製
本実施例は、融合タンパク質の標的化部分として抗EGFR抗体、及び融合タンパク質の免疫調節部としてTGFβR2細胞外ドメインを使用する。TGFβR2細胞外ドメインは、相同組み換えによってEGFR抗体の重鎖のC末端に連結され、EGFR抗体/TGFβR2細胞外ドメイン融合タンパク質(EGFR/TGFβR2)は、軽鎖及び重鎖の2本の鎖によって形成される。融合タンパク質の構造は図13に示される。質量分析結果は、全長TGFβR2細胞外ドメインのN末端7~15部位の間に複数の感受性部位が存在することを示した。融合タンパク質の構造的安定性を向上させるために、本実施例において、TGFβR2の細胞外ドメインのN末端アミノ酸配列を、種々のアミノ酸残基数のアミノ酸欠失を用いて改変した(配列番号47~65)。EGFR抗体/TGFβR2融合タンパク質は、(G4S)4リンカー(配列番号66)を介して、種々のアミノ酸欠失形態を有するTGFβR2の細胞外ドメインにEGFR抗体の重鎖C末端のアミノ酸を連結する。加えて、EGFR抗体の重鎖C末端リジンを除去して、タンパク質分解のリスクを低下させた。EGFR抗体/TGFβR2融合タンパク質設計の具体的なプロトコールは、Table 11(表13)に示される。
発現産物の純度並びに分解を、還元SDS-PAGEによって分析した。実施例3.1において精製された種々の短縮EGFR抗体/TGFβR2融合タンパク質1~16を、還元SDS-PAGEに供した。還元SDS-PAGEの具体的な工程:(1)SDS-PAGE調製:3.9%濃縮ゲル、13%分離ゲル;(2)サンプルを100℃で2分間煮沸し、遠心分離し、次いで8μgをサンプル化(sample)した;(3)40mAの定電流、1時間の電気泳動時間。結果は図14に示される。EGFR抗体/TGFβR2融合タンパク質の軽鎖の分子量は約25KDaであり、重鎖の分子量は約66KDaであり、切り取り種(clipping species)の分子量は45~66KDaであった。結果は、TGFβR2の細胞外ドメインに明らかな切り取り種が存在し、一方でTGFβR2細胞外ドメインの種々の短縮形態融合タンパク質は、TGFβR2細胞外ドメインの全長形態融合タンパク質よりも、分解により生じる実質的により少ないバンドを有することを示した。故に、本発明において調製されたTGFβR2細胞外ドメインの種々の短縮形態は、TGF-β受容体含有抗体融合タンパク質の安定性を有意に増強した。
融合タンパク質プロセシングを加速させる293E細胞上清を使用して、EGFR抗体/TGFβR2融合タンパク質の種々の短縮形態の安定性を更に評価する。抗体を発現させるためにしばしば使用される293E細胞発現システムは、細胞成長に要される多様な宿主細胞タンパク質(HCP)及びプロテアーゼを発現する。それ故、293E細胞の上清における融合タンパク質の分解傾向を観察することによって、抗体の安定性を査定し得る。
100ng/mL TGF-β1及び40ng/mL EGFR-Hisタンパク質を、それぞれ100μL/ウェルで96ウェルプレートに4℃で一晩コートした。プレートを翌日洗浄し、室温で1時間ブロッキングし、2μg/mLのTGFβR2の種々の短縮形態のEGFR抗体/TGFβR2融合タンパク質を100μL/ウェルで添加した。1時間のインキュベーションの後にプレートを洗浄して、結合していない抗体を除去し、二次抗体ヤギ抗hIgG Fc/HRPを添加し、インキュベートし、洗浄を繰り返した。最後に、発色現像のために基質発色溶液を添加し、停止後にOD450をマイクロプレートリーダーによって読み取った。結果は図16に示される。TGF-β1への、TGFβR2の種々の短縮形態を有するEGFR抗体/TGFβR2融合タンパク質の結合能は異なったが、EGFRへの結合能は同様であった。
TGF-βは、複数の標的遺伝子の転写を調節することによって細胞機能を調節する。プラスミノーゲンアクチベーター阻害因子1(PAI-1)は、TGF-β1/Smadシグナル伝達経路下流の重要な標的であり、Smad3がPAI-1プロモーター領域のシス作用性エレメントに結合してPAI-1の発現を調節するように活性化する。PAI-1プロモーター領域を含有するエレメントを、ルシフェラーゼ含有ベクターに特異的形態で挿入し、HepG2細胞に移す。このレポーター遺伝子システムにおいて、外因性TGF-βタンパク質の添加は、ルシフェラーゼレポーター遺伝子の発現及び基質の存在下における発光を始動する。外因性TGF-β抗体が添加される場合、それは、TGF-βタンパク質を中和し、TGFβR2へのTGF-βの結合を遮断し、下流シグナル伝達経路を阻害し、ルシフェラーゼレポーター遺伝子の発現を最終的に阻害する。それ故、TGF-βを中和するTGF-β抗体のインビトロ効力は、光シグナルの強度を検出することによって判定され得る。
TGFβR2短縮形態のEGFR抗体/TGFβR2融合タンパク質である融合タンパク質6のインビトロ生物学的特性
4.1 EGFR抗体/TGFβR2融合タンパク質の結合能のアッセイ
4.1.1 TGF-βに対する、EGFR抗体/TGFβR2融合タンパク質結合及び競合の特性
2μg/mLの最終濃度のTGF-β1タンパク質及びTGF-β3タンパク質を、それぞれ100μL/ウェルで96ウェルプレートにコートし、4℃で一晩コートした。プレートを翌日洗浄し、室温で1時間ブロッキングし、種々の濃度(1.22pM、4.88pM、19.53pM、78.13pM、312.5pM、1250pM、500pM、2000pM)のEGFR抗体/TGFβR2融合タンパク質6とともに1時間インキュベートした。その後、プレートを洗浄して、結合していない抗体を除去し、二次抗体ヤギ抗hIgG50 2 F(ab)2/HRPとともにインキュベートし、繰り返し洗浄し、発色現像のために基質発色溶液を添加し、停止後にOD450をマイクロプレートリーダーによって読み取った。結果は図19に示される。TGF-β1及びTGF-β3タンパク質に対する融合タンパク質6の結合能は、TGF-β1タンパク質への結合に関して91pMのEC50及びR2=0.998を有して、並びにTGF-β3タンパク質への結合に関して102pMのEC50及びR2=0.998を有して、融合タンパク質1のものと同様であった。
実施例1.2.1を参照して、組み換えヒトEGFRタンパク質への融合タンパク質の結合能をELISAによって測定した。図21に示されるように、EGFRへの融合タンパク質6の結合能、及びEGFRに結合するEGFと競合する能力は、133.1ng/mLのEC50及びR2=1.000を有して、EGFR-HPA8のものと同様であった。
本実施例において、ビオチン化組み換えヒトEGFRタンパク質及びTGF-β1タンパク質へのEGFR抗体/TGFβR2融合タンパク質結合のアフィニティーを、陰性対照としてそれぞれEGFR-HPA8及びH7N9-R1を用いて、生体分子相互作用分析システム(モデル:OctetRED96e、メーカー:Fortebio社)を使用して判定した。複数の濃度点の結合及び解離曲線をフィットさせることによって、アフィニティーパラメーターを導き出し、結果はTable 13(表15)及びTable 14(表16)に示され、具体的な速度論的特徴のあるパラメーター曲線は図22及び図23に示される。
TGF-β1は、Mv-1-1u細胞の増殖を阻害し得、そのため、TGF-β1を中和するEGFR抗体/TGFβR2融合タンパク質の能力は、WST-8アッセイを使用して検出され得る。
MDA-MB-468細胞の成長に対するEGFR抗体/TGFβR2融合タンパク質阻害を、実施例1.2.2に従ってWST-8法によってアッセイして、そのEGFR部分特性を判定した。図26に示されるように、MDA-MB-468細胞の増殖を阻害する融合タンパク質6の能力は、EGFR-HPA8のものと同様であり、阻害率は、「S」曲線で、医薬濃度の増加とともに増加した。TGFβR2機能を有する対照産物H7N9-R1-43-IgG1(L9)は、MDA-MB-468細胞の増殖を阻害せず、融合タンパク質6が、そのEGFR部分によって腫瘍細胞の増殖を阻害することを示した。
EGFR発現細胞に対するEGFR抗体/TGFβR2融合タンパク質によって媒介されるADCC効果を、実施例2.2.3を参照してアッセイした。結果は図27に示される。0.00004~3nMの濃度域において、融合タンパク質6及び抗EGFR抗体EGFR-HPA8は、EGFR発現腫瘍細胞A431に対して同様のADCC効果を媒介し得る。TGFβR2機能を有する対照産物H7N9-R1-43-IgG1(L9)は、A431細胞に対してADCC効果を有せず、この実験システムにおいてADCC機能を媒介するのは、融合タンパク質6のEGFR部分であることを示した。
NCI-H1975皮下グラフト腫瘍モデルにおけるTGFβR2短縮形態(融合タンパク質6)EGFR抗体/TGFβR2融合タンパク質に関する薬力学的調査
Balb/c-nuマウスに、1×106個のNCI-H1975細胞を胸郭の右側に皮下接種した。腫瘍体積が約300mm3に到達した時点で、各群において6匹の動物に、動物を腫瘍体積によって無作為にグループ分けし、投与した。投薬をグループ分けの日に開始し、医薬を、1週間に2回で連続10投薬、腹腔内注射(I.P.)によって投与し、最後の投薬後に中止して腫瘍再発を観察した。具体的な投薬レジメンは、下のTable 15(表17)に示される。
TGFβR2短縮形態(融合タンパク質6)EGFR抗体/TGFβR2融合タンパク質の安定性分析
6.1 EGFR抗体/TGFβR2融合タンパク質の限外濾過安定性分析
EGFR抗体/TGFβR2融合タンパク質サンプルを、100mMグリシン、10mM NaCl、50mM Tris、pH7.5バッファーにおける限外濾過を使用して約10mg/mLの濃度に濃縮した。濃縮サンプルを、限外濾過されたサンプルの純度及び安定性について、還元SDS-PAGE及び分子ふるいクロマトグラフィー(SEC-HPLC、Agilent 1260液体クロマトグラフィーシステム、TSK-G3000SWXLカラム)によって検査した。EC-HPLC運転工程:(1)移動相:200mM NaH2PO4、100mMアルギニン、pH6.5;(2)負荷体積は80μgであった;(3)分析時間は30分間であり、流速は0.5mL/分であり、カラム温度は25℃であった;(4)純度を、ピーク面積の正規化法に従って算出した。
サンプルの熱安定性を、UNcleシステム(Unchained Labs社、モデル:UNCLE-0330)を使用して示差走査蛍光定量法(differential scanning fluorimetry)(DSF)によって測定した。運転工程:(1)サンプル体積は9μLであった;(2)実験パラメーターを設定した:温度域は25℃~95℃であり、加熱速度は0.3℃/分であった;(3)UNcle分析ソフトウェアを適用してデータを分析し、UV266下での内部蛍光変化曲線の中点値をTmとして選び、UV266/Blue473の下で静的光散乱シグナルによって形成される凝集変化曲線の凝集発生温度をTagg266及びTagg473として選んだ。
サンプルを45℃で1週間保管した後、サンプルの加速安定性をSEC-HPLC及びSDS-PAGEによって分析し、手順は6.1と同じであった。
サンプルを-80℃で3時間保管し、次いで45℃に1時間移して融解し、5回繰り返しの凍結融解に対してそうした。サンプルの凍結融解安定性をSEC-HPLCによって分析し、手順は6.1においてと同じであった。
サンプルをディープウェルプレートに置き、800rpmで24時間ボルテックス振とう器で振とうした。サンプルを、6.1においてと同じ手順を用いてSEC-HPLCによって分析した。結果はTable 22(表24)に示され、それは、サンプルのSEC単量体純度が、24時間の振とう後に有意に変化せず、凝集体及びフラグメントのレベルが有意に増加せず、融合タンパク質6が優れた振とう安定性を有することを示す。
TGFβR2部分がTGFβR2の短縮形態(融合タンパク質6)である、固形腫瘍抗原標的化抗体X/TGFβR2融合タンパク質の設計及び特性アッセイ
7.1 TGFβR2 X抗体/短縮TGFβR2融合タンパク質発現ベクターの設計、発現、及び精製
実施例3.2における選出されたTGFβR2短縮形態の構造的安定性及びTGF-β1を中和する能力を更に検証するために、本実施例は、融合タンパク質の標的化部分として多様な固形腫瘍抗原、及び融合タンパク質の免疫調節部分としてTGFβR2細胞外ドメイン(全長及びECD欠失(6~26)融合タンパク質6)を使用して、X抗体/TGFβR2細胞外ドメイン融合タンパク質(X/TGFβR2融合タンパク質)を形成する。同様に、X/TGFβR2融合タンパク質において、X抗体重鎖のC末端アミノ酸は、(G4S)4リンカーを介してTGFβR2細胞外ドメインに連結する。加えて、X抗体重鎖のC末端リジンを除去して、タンパク質分解的切断のリスクを低下させた。X/TGFβR2融合タンパク質の構築プロトコールはTable 23(表25)に示される。
X/TGFβR2融合タンパク質の純度並びに分解を、還元SDS-PAGEによってアッセイした。結果は図31に示される。種々のX/TGFβR2融合タンパク質に関して、TGFβR2細胞外ドメインの選出された短縮形態の発現サンプルは、全長TGFβR2細胞外ドメイン対照サンプルよりも有意に安定であり、より少ない分解バンドを有した。サンプルの安定性は、たとえどんな種類の標的化部分、すなわち抗体が使用されようとも、TGFβR2細胞外ドメインの目下の短縮形態に起因するはずである。
本実施例では、293E細胞上清を融合タンパク質の加速処理に使用し、選出された短縮TGFβR2細胞外ドメインを有するX/TGFβR2融合タンパク質の分解安定性を、実施例3.3にあるように更に判定した。サンプル純度アッセイの結果は図32に示され、サンプル純度及び剪断物(shearer)のパーセンテージはTable 24(表26)に示される。結果は、好ましいTGFβR2細胞外ドメイン短縮形態を有するX/TGFβR2融合タンパク質が、TGFβR2融合タンパク質の全長形態よりも、プロテアーゼ分解に対してより耐性があることを示す。
標的化部分としての標的化固形腫瘍抗原、及び短縮TGFβR2(融合タンパク質6)を有するX/TGFβR2融合タンパク質のインビトロ生物学的特性
8.1 X/TGFβR2融合タンパク質結合TGF-β1アッセイ
TGF-β1へのX/TGFβR2融合タンパク質の結合能を、実施例3.4に従ってELISAによって測定した。図33に示されるように、TGF-β1に結合する、TGFβR2の好ましい短縮形態を有するX/TGFβR2融合タンパク質の能力は、TGFβR2の全長形態を有するX/TGFβR2融合タンパク質のものよりもわずかに低い。
TGF-β1及びTGF-β3を中和するX/TGFβR2融合タンパク質の能力を、実施例3.5を参照して検査した。図34に示されるように、TGF-β1及びTGF-β3の両方を中和する、TGFβR2の好ましい短縮形態を有するX/TGFβR2融合タンパク質の能力は、TGFβR2の全長形態を有するX/TGFβR2融合タンパク質のものよりも秀でていた。
それぞれ10ng/mL、5ng/mL、80ng/mL、80ng/mL、及び40ng/mLの最終濃度の、X部分標的である抗原ERBB2-his、VEGF165、VEGFR2-His、CTLA4-his、及びEGFR-Hisを、100L/ウェルで96ウェルプレートにコートした。プレートに4℃で一晩コートした。プレートを翌日洗浄し、室温で1時間ブロッキングし、13.89nMの最終濃度の100μLのX/TGFβR2融合タンパク質とともに1時間インキュベートした。プレートを洗浄して、結合していない抗体を除去し、二次抗体ヤギ抗hIgG Fc/HRPとともにインキュベートし、洗浄を繰り返した。最後に、発色現像のために基質発色溶液を添加し、停止後にOD450をマイクロプレートリーダーによって読み取った。図35に示されるように、選出された短縮TGFβR2を有するX/TGFβR2融合タンパク質は、TGFβR2の全長形態を含有するX/TGFβR2融合タンパク質と、X側の相当する抗原に結合する同様の能力を有する。
Claims (25)
- アミノ酸配列が配列番号52である、短縮TGFβR2細胞外ドメイン分子。
- a)請求項1に記載の短縮TGFβR2細胞外ドメイン分子;及び
b)標的化部分として抗EGFR抗体
を含む、融合タンパク質であって、前記短縮TGFβR2細胞外ドメイン分子のN末端は、前記標的化部分の重鎖のC末端に連結されており、前記短縮TGFβR2細胞外ドメイン分子のN末端は、リンカーによって連結されている、融合タンパク質。 - 前記リンカーはG4Sフレキシブルペプチドリンカーである、請求項2に記載の融合タンパク質。
- 前記リンカーが、(G4S)4ペプチドリンカーである、請求項3に記載の融合タンパク質。
- 前記抗EGFR抗体は、
(a)それぞれ配列番号19、20、及び21を含む重鎖CDR1、重鎖CDR2、及び重鎖CDR3ドメインを含む重鎖可変領域、並びに
(b)それぞれ配列番号16、17、及び18を含む軽鎖CDR1、軽鎖CDR2、及び軽鎖CDR3ドメインを含む軽鎖可変領域
を含む、請求項2から4のいずれか一項に記載の融合タンパク質。 - 前記抗EGFR抗体は、
a)配列番号28を含む配列又はそれと少なくとも90%の配列同一性を有する配列を含む重鎖可変領域;及び/或いは
b)配列番号29を含む配列又はそれと少なくとも90%の配列同一性を有する配列を含む軽鎖可変領域
を含む、請求項5に記載の融合タンパク質。 - 前記抗EGFR抗体は、
a)重鎖定常領域;及び
b)軽鎖定常領域
を更に含む、請求項5又は6に記載の融合タンパク質。 - 前記重鎖定常領域が、配列番号30を含む配列又はそれと少なくとも90%の配列同一性を有する配列を含み、
前記軽鎖定常領域が、配列番号31を含む配列又はそれと少なくとも90%の配列同一性を有する配列を含む、
請求項7に記載の融合タンパク質。 - a)重鎖のアミノ酸配列が、配列番号141又はそれと少なくとも90%の配列同一性を有する配列を含み;及び
b)軽鎖のアミノ酸配列が、配列番号23又はそれと少なくとも90%の配列同一性を有する配列を含み、
前記融合タンパク質は、2本の重鎖及び2本の軽鎖を含み;ジスルフィド結合は、その第1の軽鎖と第1の重鎖との間で形成され、ジスルフィド結合は、その第2の軽鎖と第2の重鎖との間で形成され、ジスルフィド結合は、その第1の重鎖と第2の重鎖との間で形成される、
請求項8に記載の融合タンパク質。 - ヒトEGFRタンパク質への結合アフィニティーに関して、2.92pM~26.3pMのKD値を有し、
ヒトTGF-β1タンパク質への結合アフィニティーに関して、23pM~288.3pMのKD値を有する、
請求項9に記載の融合タンパク質。 - ヒトEGFRタンパク質への結合アフィニティーに関して、7pM~9pMのKD値を有し、
ヒトTGF-β1タンパク質への結合アフィニティーに関して、64pM~144pMのKD値を有する、
請求項10に記載の融合タンパク質。 - ヒトEGFRタンパク質への結合アフィニティーに関して、8.77pMのKD値を有し、
ヒトTGF-β1タンパク質への結合アフィニティーに関して、96.1pMのKD値を有する、
請求項11に記載の融合タンパク質。 - 請求項1に記載の短縮TGFβR2細胞外ドメイン分子、請求項2から12のいずれか一項に記載の融合タンパク質、及び付加的な治療剤を含む、コンジュゲート。
- 前記抗EGFR抗体及び付加的な治療剤はリンカーによって連結されている、請求項13に記載のコンジュゲート。
- 請求項1に記載の短縮TGFβR2細胞外ドメイン分子又は請求項2から12のいずれか一項に記載の融合タンパク質をコードする核酸であって、mRNA又はDNAである、核酸。
- 配列番号32~39のいずれか1つ;又は
配列番号67、73のいずれか1つ;又は
配列番号153
を含む、請求項15に記載の核酸。 - 請求項15又は16に記載の核酸を含む、発現ベクター。
- 請求項15若しくは16に記載の核酸又は請求項17に記載の発現ベクターを含む、宿主細胞。
- a)請求項1に記載の短縮TGFβR2細胞外ドメイン分子、請求項2から12のいずれか一項に記載の融合タンパク質、請求項13若しくは14に記載のコンジュゲート、請求項15若しくは16に記載の核酸、又は請求項17に記載の発現ベクター、並びに
b)薬学的に許容される担体
を含む、医薬組成物。 - c)1種又は複数の付加的な治療剤
を含む、請求項19に記載の医薬組成物。 - 請求項1に記載の短縮TGFβR2細胞外ドメイン分子、請求項2から12のいずれか一項に記載の融合タンパク質、請求項13若しくは14に記載のコンジュゲート、請求項15若しくは16に記載の核酸、請求項17に記載の発現ベクター、又は請求項19若しくは20に記載の医薬組成物を含む、癌の予防及び治療のための医薬。
- 前記癌が胃癌である、請求項21に記載の医薬。
- 請求項1に記載の短縮TGFβR2細胞外ドメイン分子、請求項2から12のいずれか一項に記載の融合タンパク質、請求項13若しくは14に記載のコンジュゲート、請求項15若しくは16に記載の核酸、請求項17に記載の発現ベクター、又は請求項19若しくは20に記載の医薬組成物と、
1種又は複数の付加的な治療剤と
を含む、薬学的組み合わせ物。 - 請求項1に記載の短縮TGFβR2細胞外ドメイン分子、請求項2から12のいずれか一項に記載の融合タンパク質、請求項13若しくは14に記載のコンジュゲート、請求項15若しくは16に記載の核酸、請求項17に記載の発現ベクター、又は請求項19若しくは20に記載の医薬組成物
を含む、キット。 - 医薬を投与するためのデバイスを更に含む、請求項24に記載のキット。
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