JP7542822B2 - T細胞受容体の改変体 - Google Patents
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Description
T細胞は、細菌やウイルスなどの外来の病原体や癌細胞などの異常な細胞に対する免疫システムにおいて中心的な役割を果たしている。なかでも、細胞傷害性T細胞(CTL)は、その細胞表面上に存在するT細胞受容体(TCR)を介して、抗原提示細胞のクラス1主要組織適合抗原と共に提示された、ウイルスや腫瘍等由来の抗原ペプチドを認識し、異物である該抗原ペプチドを提示する細胞に対して特異的に細胞傷害活性を発揮する。
[1] α鎖、β鎖、γ鎖及びδ鎖からなる群から選択されるT細胞受容体鎖の定常領域を含むポリペプチドを2つ組み合わせてなる、T細胞受容体の改変体であって、該ポリペプチドが該T細胞受容体鎖の相補性決定領域(CDR)、α鎖の相補性決定領域(CDR)およびβ鎖の相補性決定領域(CDR)を含まないことを特徴とする、改変体。
[2] 前記ポリペプチドの一方がT細胞受容体α鎖又はβ鎖の定常領域を含み、他方がT細胞受容体α鎖又はβ鎖の定常領域を含む、[1]に記載の改変体。
[2a] 前記ポリペプチドの少なくとも一方が、T細胞受容体γ鎖の相補性決定領域(CDR)、及び/又はT細胞受容体δ鎖の相補性決定領域(CDR)を含む、[2]に記載の改変体。
[2b] 前記ポリペプチドの少なくとも一方に含まれる定常領域がα鎖の定常領域であり、かつ相補性決定領域(CDR)がγ鎖の相補性決定領域(CDR)である、[2a]に記載の改変体。
[2c] 前記ポリペプチドの少なくとも一方に含まれる定常領域がβ鎖の定常領域であり、かつ相補性決定領域(CDR)がδ鎖の相補性決定領域(CDR)である、[2a]又は[2b]に記載の改変体。
[3] 2つのポリペプチドが1つ以上のジスルフィド結合で結合された、[1]~[2c]のいずれかに記載の改変体。
[3a] 前記ポリペプチドがさらに1つ以上のシグナルペプチドを含む、[1]~[3]のいずれかに記載の改変体。
[3b] 前記シグナルペプチドが、T細胞受容体鎖の定常領域のN末端に結合している、[3a]に記載の改変体。
[3c] 前記シグナルペプチドが、CD8および/またはIGHのシグナルペプチドである、[3a]に記載の改変体。
[4] [1]~[3c]のいずれかに記載の改変体をコードする核酸分子。
[5] [4]に記載の核酸分子を含む、ベクター。
[6] [5]に記載のベクターを導入する工程を含む、細胞の製造方法。
[6a] [1]~[3c]のいずれかに記載の改変体をコードする核酸を含む多能性幹細胞。
[6b] 前記多能性幹細胞が人工多能性幹細胞(iPS細胞)である、[6a]に記載の細胞。
[7] [1]~[3c]のいずれかに記載の改変体を発現する細胞。
1.T細胞受容体の改変体
本発明は、α鎖、β鎖、γ鎖及びδ鎖からなる群から選択されるT細胞受容体(TCR)鎖の定常領域を含むポリペプチドを2つ組み合わせてなる、T細胞受容体の改変体(以下「本発明の改変体」と称する場合がある)を提供する。本発明の改変体は、TCRα鎖及びβ鎖の相補性決定領域(CDR)、又は同一種類の鎖の相補性決定領域(CDR)(好ましくは該CDRを含む可変領域の一部又は全部)をいずれも含まないこと、および、定常領域が由来するT細胞受容体鎖の相補性決定領域(CDR)、又は同一種類の鎖の相補性決定領域(CDR)(好ましくは該CDRを含む可変領域の一部又は全部)を含まないことを特徴とする。従って、本発明の改変体には、天然型又は人工型(例えば、定常領域と可変領域の由来となる動物種が異なる)のαβTCR、γδTCR、あるいはこれらのTCRにアミノ酸がさらに付加されたTCR改変体は包含されない。例えば、本発明の改変体の少なくとも一方の鎖に該当するポリペプチドが、T細胞受容体α鎖の定常領域を含む場合には、該ポリペプチドには、T細胞受容体α鎖のCDR、好ましくは該CDRを含む可変領域の一部又は全部、を含まないが、α鎖およびβ鎖以外、の異なるTCR鎖、例えばγ鎖、δ鎖のCDRや可変領域は含んでいてもよい。同様に、本発明の改変体の少なくとも一方の鎖に該当するポリペプチドが、T細胞受容体β鎖の定常領域を含む場合には、該ポリペプチドには、T細胞受容体β鎖のCDR、好ましくは該CDRを含む可変領域の一部又は全部、を含まないが、α鎖およびβ鎖以外、の異なるTCR鎖、例えばγ鎖、δ鎖のCDRや可変領域は含んでいてもよい。γ鎖及びδ鎖についても同様である。本発明の一態様において、T細胞受容体β鎖は、T細胞受容体β1鎖(配列番号2)またはT細胞受容体β2鎖(配列番号3)を含む。本発明の一態様において、T細胞受容体β鎖はT細胞受容体β1鎖(配列番号2)およびT細胞受容体β2鎖(配列番号3)を含む。
本発明の好ましい実施態様において、本発明の改変体は、前記シグナルペプチド5がポリペプチド1のN末端に付加した、配列番号8もしくは11で示されるポリペプチド(以下、「ポリペプチド8」および「ポリペプチド11」と称する)、および前記シグナルペプチド4がポリペプチド2のN末端に付加した、配列番号7もしくは10で示されるポリペプチド(以下、「ポリペプチド7」および「ポリペプチド10」と称する)からなる。
また、本発明の別の好ましい実施態様において、ポリペプチド8もしくはポリペプチド11、および前記シグナルペプチド4がポリペプチド3のN末端に付加した、配列番号13もしくは15で示されるポリペプチド(以下、「ポリペプチド13」および「ポリペプチド15」と称する)からなる。
本発明は、上述した本発明のTCRをコードする核酸(以下「本発明の核酸」と称する場合がある)を提供する。本発明の核酸としては、本発明の改変体を構成する一方のポリペプチドをコードする核酸と、他方のポリペプチドをコードする核酸とは、別の分子に含まれていてもよく、両方のポリペプチドをコードする核酸が単一の分子に含まれていてもよい。
本発明は、本発明の核酸又はベクターが導入された細胞(以下「本発明の細胞」と称する場合がある)を提供する。本発明の細胞は、本発明の改変体を発現していることが好ましい。
本発明の一形態において、T細胞はCD3に加えて、CD5および/またはCD7を発現する場合がある。CD5および/またはCD7は生体内のT細胞においてもその細胞表面に発現する場合がある。T細胞がCD5および/またはCD7を発現する場合、CD3はT細胞において、TCRと複合体を形成することにより細胞表面に発現するのに対し、CD5およびCD7はTCR分子と複合体を形成することなく発現する。
本発明は、本発明の核酸又はベクターを細胞に導入する工程を含む、細胞の製造方法(以下「本発明の製法」と称する場合がある)を提供する。本発明の核酸又はベクターが導入される細胞、導入方法等は、上記3.に記載の通りである。前記細胞は、本発明の改変体を発現していることが好ましい。本発明の改変体の発現は、上記3.に記載の方法により検出又は測定することができる。
多能性幹細胞から造血前駆細胞への分化方法としては、造血前駆細胞へ分化できる限り特に制限されないが、例えば、国際公開第2013/075222号、国際公開第2016/076415号及びLiu S. et al., Cytotherapy, 17 (2015);344-358などに記載されているように、造血前駆細胞への誘導培地中で多能性幹細胞を培養する方法が挙げられる。
造血前駆細胞からT細胞への分化方法としては、造血前駆細胞をT細胞へ分化できる限り特に制限されないが、例えば、国際公開第2016/076415号などに記載されているような、(2-1)造血前駆細胞からCD4CD8両陽性T細胞を誘導する工程、及び(2-2)CD4CD8両陽性T細胞からCD8陽性T細胞を誘導する工程を含む方法が挙げられる。造血前駆体は、工程(1)により得られた細胞集団から、造血前駆細胞のマーカーを用いてあらかじめ単離することが好ましい。該マーカーとしては、CD43、CD34、CD31及びCD144からなる群から選択される少なくとも1つが挙げられる。
本発明において、CD4CD8両陽性T細胞への分化方法としては、例えば、CD4CD8両陽性T細胞への誘導培地中で造血前駆細胞を培養する方法が挙げられる。
工程(2-1)により得られたCD4/CD8DPT細胞を、CD8陽性T細胞に分化誘導する工程に付すことにより、CD8陽性T細胞へ分化誘導することができる。
N末端にCD8分子の膜移行シグナルペプチドを付加した各α鎖(TRAC)と、N末端にIGH分子の膜移行シグナルペプチドを付加した各β鎖(TRBC1もしくはTRBC2)のアミノ酸をP2A配列で繋ぐポリペプチド鎖を設計した(表1AB5-AB8)。設計したポリペプチド鎖をコードするオリゴDNAを人工合成(GenScript)して、レンチウイルスベクタープラスミドのマルチクローニングサイトに挿入した。レンチウイルスベクタータープラスミドは、pCDH-CMV-MCS-EF1a-Puro(SystemBioscience)のCMVプロモーターをヒトユビキチンプロモーターに置換したものを使用した。ウイルスベクター作製は、SIRION社に委託した。
レトロネクチン(タカラバイオ社)でコートした24ウェルプレートを用いて、4種類のCD3遺伝子(γ、δ、εおよびζ)を強制発現させたK562細胞(K562-CD3細胞、国立癌研究センター植村先生に御供与いただいた)に、表1に示す各改変体をコードする遺伝子を搭載したレンチウイルスベクターを感染させ、各改変体をコードする遺伝子を形質導入した。レンチウイルスベクターに感染させた後、37℃、5%CO2条件下で3日間培養した。
[実施例2]で得られた、表1に示す各改変体を発現するT細胞について、抗CD3抗体(APC/Cy7, UCHT1, BioLegend)で染色した後、LSRFortessaTMX-20 (BD Bioscience社)フローサイトメトリーを用いて、細胞膜表面上のCD3分子の発現を、フローサイトメトリーを用いて検出した(図1)。AB5により得られた細胞およびAB7により得られた細胞においても、細胞膜表面上にCD3の発現が認められた。またAB6により得られた細胞およびAB8により得られた細胞において、細胞膜表面上により強くCD3の発現が認められた。
1.iPS細胞の準備
iPS細胞には、京都大学iPS細胞研究所(CiRA)から供与されたiPS細胞(Ff-I01s04株:健常人末梢血単核球由来)を使用した。iPS細胞培養は、CiRAが配布するプロトコール「フィーダーフリーでのヒトiPS 細胞の培養」に準じて行った。
pLVSIN-CMV Neo(クロンテック社)からネオマイシン耐性遺伝子をコードする配列を除去し、CMVプロモーターをヒトユビキチンプロモーターに置換したpLVSIN-Ubを用いたレンチウイルスベクターを作製した。上記で合成したAB6をコードする人工オリゴDNAをpLVSIN-Ubレンチウイルスベクターのマルチクローニングサイトに組込んだ。このプラスミドとクロンテック社のLenti-XTM 293T細胞株およびLenti-XTMPackaging Single Shots (VSV-G)を用いてレンチウイルスベクターを作製した。
[実施例1]で作成したAB6を組み込んだレンチウイルスベクターを、iPS細胞に感染させることで、改変型T細胞受容体遺伝子の該細胞への導入を行った。
作製したレンチウイルスベクターを、[実施例3]1.で準備したiPS細胞に感染させることにより、改変TCR遺伝子をiPS細胞に導入した。以下、改変TCR遺伝子が導入されたiPS細胞を「tTCR-iPSC」ということがある。
iPS細胞の造血前駆細胞(HPC)への分化は、公知の方法(例えば、Cell Reports 2(2012)1722-1735や国際公開第2017/221975号に記載された方法)に準じて行った。具体的には、[実施例3]3.で得られたtTCR-iPSCを、それぞれ超低接着処理された6 well plateに3 x 105cells/wellで播種し、EB培地(StemPro34に10 μg/mlヒトインスリン、5.5 μg/mlヒトトランスフェリン、5 ng/ml 亜セレン酸ナトリウム、2 mM L-グルタミン、45 mM α-モノチオグリセロー ル、および50 μg/ml Ascorbic acid 2-phosphate を添加)に10 ng/ml BMP4、50 ng/ml bFGF、15 ng/ml VEGF、2 μM SB431542、を加えて、低酸素条件下(5% O2) にて5日間培養を行った。続いて、50 ng/ml SCF、30 ng/ml TPO、10 ng/ml Flt3Lを添加し、さらに5~9日間培養を行い、浮遊細胞集団を得た。なお、培養期間中は2日または3日ごとに培地交換を行った。HPCを含む上記浮遊細胞集団を、表2の抗体セットを用いて染色した。上記染色を行った細胞集団を、FACSAriaによるソーティングに供した。
[実施例3]4.で得られた細胞分画を、公知の方法(例えば、Journal of Leukocyte Biology 96(2016)1165-1175や国際公開第2017/221975号に記載された方法)に準じて、リンパ球系細胞へ分化させた。具体的には、造血前駆細胞集団を、2000 cells/wellで、Recombinant h-DLL4/Fc chimera(SinoBiological)とRetronectin(タカラバイオ)をコートした48-well-plateに2000cells/wellで播種し、5%CO2、37℃条件下に培養した。培養期間中は2日または3日ごとに培地交換を行った。なお、培地には、15% FBSと2 mM L-グルタミン、100 U/mlペニシリン、100 ng/mlストレプトマイシン、55 μΜ 2-メルカプトエタノール、50 μg/ml Ascorbic acid 2-phosphate、10 μg/mlヒトインスリン、5.5 μg/mlヒトトランスフェリン、 5 ng/ml亜セレン酸ナトリウム、50 ng/ml SCF、50 ng/ml IL-7、50 ng/ml Flt3L、100 ng/ml TPO、15μM SB203580、30 ng/ml SDF-1αを添加したαMEM培地を用いた。培養開始から7日目および14日目に同様のコートをした48-well-plateに継代した。培養開始21日目にすべての細胞を回収した。回収した細胞は、表3の抗体セットを用いて染色した。
[実施例3]5.で得られた細胞について、細胞膜表面上のCD3、CD5、CD7、およびαβTCRの発現をフローサイトメーターで測定した(図2)。
Claims (6)
- 以下のT細胞受容体の改変体。
T細胞受容体鎖の定常領域からなるポリペプチドの2つの組み合わせからなり、
前記ポリペプチドの一方がT細胞受容体α鎖の定常領域からなり、他方がT細胞受容体β鎖の定常領域からなり、
該ポリペプチドが該T細胞受容体鎖の相補性決定領域(CDR)、α鎖の相補性決定領域(CDR)およびβ鎖の相補性決定領域(CDR)を含まない、T細胞受容体の改変体。 - 2つのポリペプチドが1つ以上のジスルフィド結合で結合された、請求項1に記載の改変体。
- 請求項1又は2に記載の改変体をコードする核酸分子。
- 請求項3に記載の核酸分子を含む、ベクター。
- 請求項4に記載のベクターを導入する工程を含む、細胞の製造方法。
- 請求項1又は2に記載の改変体を発現する細胞。
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